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C

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DS 

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CATCTTTTATTACTTTTTTTATTTGAAAAAAAAAAAACCAATTTTTCGCCGGCGAATATT
TACTCTTTCAATATCTATTTAAGTTTGCTGTTTATACCCCGAGGTCTCAGAATCAAAATC
AGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGGTTTATTCCGCCATCCTGTCCAATGAATTAC
TAAGATTTCTTGTTCACTAGAATCCTATATATTCATGGGTTCCGTCGTTCCCATCGCTTC
TTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCTACAATGGAGCTTTTACATGAAATTTTGAATTTCA
TTTTTTTTTT*GAGGCAATTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTT
TTCGGAACAGATTTATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTGATGCTTTATTACATTGC
TTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAAATTGGAATCATATATCATTAATATTCAAT
TTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCC
C

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4BD57JQ 591 0 0
CATCTTTTATTACTTTTTTTATTTGAAAAAAAAAAA*CCAATTTTTCGCCGGCGAATATT
TACTCTTTCAATATCTATTTAAGTTTGCTGTTTATACCCCGAGGTCTCAGAATCAAAATC
AGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGGTTTATTCCGCCATCCTGTCCAATGAATTAC
TAAAATTTCTTGTTCACTAAAATCCTATATATTCATGGGTTCCGTCGTTCCCATCGCTTC
TTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCTACAATGGAGCTTTTACATGAAATTTTGAATTCCA
TTTTTTTTTTTGAGGCAATTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTT
TTCGGAACAGATTTATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTGATGCTTTATTACATTGC
TTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAAATTGGAATCATATATCATTAATATTCAAT
TTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCATAA
CTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTT
TTTAGTCAGTTGCTCC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4C621JQ 589 0 0
GAAA
AAAAAAAAAAACCAATTTTTCGCCGGCGAATATTTACTCTTTCAATGTCTATTTAAGTTT
GCTGTTTATACCCCGAGGTCTCAAAATCAAAATCAAAAATCAAAATAGATAATAAAGTTT
CTGGTTTATTCCGCCATCCTGTCCAATGAATTACTAAAATTTCTTGTTCACTAAAATCCT
ATATATTCATGGGTTCCGTCGTTCCCATCGCTTCTTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCT
GCAATGGAGCTTTTACATGAAATTTTGAATTTCATTTTTTTTT**GAGGCAATTTTCTCA
GTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAAATTTATCTAATTATTA
TGAATGAATCTGTATTGATGCTTTATTACATCGCTTTTCTTACAGTGACCTCATAAATTT
TCCAAATTGGAATCATATATCATTAATATTCAATTTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCC
ATTTATCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCATAACTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTT
TTTTTTTTT***AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATC

QA 5 589 5 589
DS 

RD RR4C621TF 716 0 0
AAAAAAACCAATTTTCGC
GCGAATATTTACTCTTTCAATGTCTATTTAAGTTTGCTGTTTATACCCCGAGGTCTCAGA
ATCAAAATCAGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGGTTTATTCCGCCATCCTGTCCA
ATGAATTACTAAGATTTCTTGTTCACTAGAATCCTATATATTCATGGGTTCCGTCGTTCC
CATCGCTTCTTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCTGCAATGGAGCTTTTACATGAAATTT
TGAATTTCATTTTTTTTT**GAGGCAATTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAA
TTTTTTGTTTTCGGAACAGATTTATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTGATGCTTTA
TTACATCGCTTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAAATTGGAATCATATATCATTA
ATATTCAATTTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTTTGATTAC
CTTTCATAACTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTT***AGTCAGTTGCTCC
AATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCAGATAATGCGAAGC
AATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTTATAGGTAAGTT
CTTTTTTTTTTATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAG

QA 19 716 19 716
DS 

RD RR4BD57TF 767 0 0
TTCGCCGGCGAATATTTACTCTTTCAATATCTATTTAAGTTTGCTGTTTATACCCCGAGG
TCTCAGAATCAAAATCAGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGGTTTATTCCGCCATC
CTGTCCAATGAATTACTAAGATTTCTTGTTCACTAGAATCCTATATATTCATGGGTTCCG
TCGTTCCCATCGCTTCTTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCTACAATGGAGCTTTTACAT
GAAATTTTGAATTCCATTTTTTTTTTTGAGGCAATTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAGG
CTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAGATTTATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTGA
TGCTTTATTACATTGCTTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAAATTGGAATCATAT
ATCATTAATATTCAATTTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTT
TGATTACCTTTCATAACTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTAGTCAG
TTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCAGATAAT
GCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTTATAG
GTAAGTTCTTTTTTTTT*ATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACACTAAGCAT
GGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4CM71JQ 639 0 0
CGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCATAACTTAA
TAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTTT**AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAG
CCTATCATATCTTGACTAATTTTTTTGGATCCAGATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAG
GTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT*ATC
GTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCAAACACTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTT
TTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAATTGCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAA
AGAAAACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTTTTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTAT
ATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTT
CGTCTACGAATATCCAAA*TTTTTATTCCTAAAACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAG
GAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAACTCTGCCTTCTCTGATCCAT
TCAACACGTGCA*TTTCTTTTCCGTCGATACGTCCTGC
C

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4A928JQ 723 0 0
AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCA
GATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTC
TTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT*ATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACACT
AAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAATT
GCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTT
TTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGT
AAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAA*TTTTTATTCCTAAA
ACTCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGT
AAAGGAACTCTGCCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGT
CCTGCAATTTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTT
TTCATTGCTTTTCGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGACCAGCTATAAATTCTGCAAGA
ATATTAGGATGCCCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTG
GC
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4EV50JQ 738 0 0
C
GTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCAG
ATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCT
TATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT*ATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACACTA
AGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAATTG
CTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTTT
TTTATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTA
AAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAAATTTTTATTCCTAAAA
CCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTA
AAGGAACTCTGCCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGTC
CTGCAATTTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTTT
TCATTGCTTTTCGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAA
TATTAGGATGCCCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGG
CACAATTAAGTTCTTTT

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4EV50TF 479 0 0
ATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAA
AGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAAATTTTTATTCCTAAAACCCCATAAATA
GTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAACTCTG
CCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGTCCTGCAATTTGT
ACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTTTTCATTGCTTTT
CGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATGC
CCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGGCACAATTAAGT
TCTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAATA
C

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4EE73JQ 648 0 0
GG
ACTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGA
ATTGCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCT
TTTTTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAA
TGTAAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAA*TTTTTATTCCT
AAAACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTT
TGTAAAGGAACTCTGCCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATA
CGTCCTGCAATTTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCT
TTTTTCATTGCTTTTCGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCA
AGAATATTAGGATGCCCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTA
TTGGCACAATTAAGTTCTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTA
TCTTCAATTAATAATTTAGGAAATCCCATATAGATTATGATCTGAA

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR4AN83JQ 703 0 0
CTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAA
ATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAA*TTTTTATTCCTAAAACCCCATA
AATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAAC
TCTGCCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGTCCTGCAAT
TTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTTTTCATTGC
TTTTCGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGG
ATGCCCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTAAGTTTTCTATTGGCACAATT
AAGTTCTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAA
TAATTTAGGAAATCCCATATAGATTATGATCTGAACGAGATCGATTCTTTTTTGAATTTC
GATACGTGCAATTCCCTCCATACCAGGGGATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTT
AATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTTGGTTGTGC
AAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCAAGTCTGAAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4EW02JQ 724 0 0
ATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAA
AGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAA*TTTTTATTCCTAAAACCCCATAAATA
GTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAACTCTG
CCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGTCCTGCAATTTGT
ACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTTTTCATTGCTTTT
CGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATGC
CCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGGCACAATTAAGT
TCTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAATAAT
TTAGGGAATCCCATATAGATTATGATCTGAACGAGATCGATTCTTTTTTGAATTTCGATA
CGTGCAATTCCCTCCATACCAGAGGATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTTAATA
CAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTTGGTTGTGCAAAC
CAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCAAGTCTGAAACCAAGTGGATTTATTTTTT*G
TCCC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4EE73TF 735 0 0
ACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGT
AAAGGAACTCTGCTTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGT
CCTGCAATTTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTT
TTCATTGCTTTTCGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGA
ATATTAGGATGCCCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTG
GCACAATTAAGTTCTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCT
TCAATTAATAATTTAGGAAATCCCATATAGATTATGATCTGAACGAGATCGATTCTTTTT
TGAATTTCGATACGTGCAATTCCCTCCATACCAGAGGATATTCTTATATTTTTTTGGACA
TAATTTTTAATACAATCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT
GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCAAGTCTGAAACCAAGTGGA
TTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTATG
TTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTTTAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGATAT
AAGGATATATCTTCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4EW02TF 600 0 0
TCGAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATG
CCCATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGGCACAATTAAG
TTCTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAATAA
TTTAGGGAATCCCATATAGATTATGATCTGAACGAGATCGATTCTTTTTTGAATTTCGAT
ACGTGCAATTCCCTCCATACCAGAGGATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTTAAT
ACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTTGGTTGTGCAAA
CCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCAAGTCTGAAACCAAGTGGATTTATTTTTT*
GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTATGTTTTCATTGCT
GCATCCAGGTTTTTTTAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGATATAAGGATATATC
TTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAACTCCGTCCTCGTGC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4AN83TF 812 0 0
TGAATTTCGATACGTGCAATTCCCTCCATACCAGGGGATATTCTTATATTTTTT*GGACA
TAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT
GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCAAGTCTGAAACCAAGTGGA
TTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTATG
TTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTTTAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGATAT
AAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAACTC
CGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTTTA
CTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAGAA
TAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATATCATAAGT
GCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGGATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCAGAC
ATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTTTTCTTCTTT
ATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTTGAATT
CATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAG
GTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCAT
C

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4AF72JQ 755 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTTGGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCAAGTCTGAAACCAA
GTGGATTTATTTTTTTGTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGAT
TTATGTTCTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTTTAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTC
GATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGA
AACTCCGTCATCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAG
CTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTG
CAGAATAAACTAATTTAGAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATATCA
TAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGGATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTGTGGG
CAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTTTTCT
TCTTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTT
GAATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTAT
AGTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4BE64JQ 380 0 0
C
TCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTTGAATTC
ATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGG
TGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTC
CCTT*CCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCC
GGGACCAGGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTA
ATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTTT*AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACT
CCTATTTTTTTTTAAGACG

QA 2 380 2 380
DS 

RD RR4BE64TF 405 0 0
C
TCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTTGAATTC
ATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGG
TGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTC
CCTT*CCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCC
GGGACCAGGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTA
ATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTTT*AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACT
CCTATTTTTTTTTAAGACGAAGAAAGAAATTCTATTTTCTCTCC

QA 2 405 2 405
DS 

RD RR4BA64JQ 707 0 0
CTTCTTTA
TCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTTGAATTC
ATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGG
TGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTC
CCTT*CCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCC
GGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTA
ATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTT**AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACT
CCTATTTTTTTTTAAAACGAAAAAAGAAATTCTATTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGAC
AAAAAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGAT
AACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCAT
GGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTTTACCTAGCCAAC
ATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGA
CTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTC

QA 9 707 9 707
DS 

RD RR4GF29JQ 699 0 0
GAATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTAT
AGTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTAAATAAACGGGTAA
GTGTTCCCTT*CCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAG
ATGCCCGGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTT
TTCTTAATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTTTTAGTGAACGTGTCACAGTTAA
TTAACTCCTATTTTTTTT*AAGACGAAAAAAGAAATTCTATTTTCTCTCCTATTTACTAC
GGCGACGAAAAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCTAGTTCTTCTTCCAAGCG
CGGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCAC
CTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTTTTCCTA
GCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTT
GTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTCCAGAAGGTAATTTTA
ATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCT
C

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4GF29TF 698 0 0
AATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTT*CGCGTGTCCTCGAAAATTTATA
GTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTAAATAAACGGGTAAG
TGTTCCCTT*CCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGA
TGCCCGGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTT
TCTTAATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTTTTAGTGAACGTGTCACAGTTAAT
TAACTCCTATTTTTTTT*AAGACGAAGAAAGAAATTCTATTTTCTCTCCTATTTACTACG
GCGACGAAGAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCTAGTTCTTCTTCCAAGCGC
GGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCACC
TCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTTTTCCTAG
CCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTG
TCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTCCAGAAGGTAATTTTAA
TGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCT
C

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4A641JQ 704 0 0
CGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAG
GTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTCCCTT*CCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAA
TCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCCGGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCT
TTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTAATAAATGATTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTT*
*AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACTCCTATTTTTTTTTAAGACGAAAAAAGAAATTCT
ATTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGACGAAAAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTT
TTCTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAA
TTGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTC
TTACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGT
TTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGA
CCTCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTA
CAGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4BA64TF 858 0 0
A
TAACGACGAGATCTAT*ATCATTTT*CGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGGTGAAAAT
TCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTCCCTTTCC
ATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCCGGGACCA
AGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTAATAAATG
CTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTT**AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACTCCTATTT
TTTTTTAAGACGAAGAAAGAAATTCTATTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGACGAAGAAT
CAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCA
GGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTG
GTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGA
TCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGC
TGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTT
CCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTT
TCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTAGA
TTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCTTCCC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCAT
ACGGCTTTCTGAATGT
C

QA 2 857 2 857
DS 

RD RR4GR42JQ 603 0 0
TTTTTTTCTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTT
CATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACC
CAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTT
GGATATCAAACGGACCTCTCCAAAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGC
AATCAGTTTCGCTACAGCACCTGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGAT
TTCTATATTATGTATGGCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTAAATTCTTCTTTTTG
ATCAATCAAAACCCCTTCCC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCTGA
ATGTAAATGATGATATCTATACGGATGGATCTTATATATATCGTAAAATTCTTCTATATA
TGGTAGAAGTACCACACGAGTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTT
ATGATCTTCTACATACTAGGTCTTCCCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGC
ATT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4H308JQ 646 0 0
AGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGG
AGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTAC
TACAGGACGTTTACCAAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTAC
CCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTC
TCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGC
ACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTCCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGC
CGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGCAAATTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCTTC
CC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCCGAATGTAGATGATGATATCT
ATACGGATGGATCTTATATATATCGTAAAATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACACG
AGTGCATATATGGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATACTA
GGTCTTCCCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGCATTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4A754JQ 817 0 0
CTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATT
GGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTT
ACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTT
ACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACC
TCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACA
GCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATG
GCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTAAATTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCT
TCCC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCTGAATGTAGATGATGATAT
CTATACGGATGGATCTTATATATATCGTAAAATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACA
CGAGTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATAC
TAGGTCTTCCCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGAC
TCTATGAAATTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTT
TTCCCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGACCATCA
AATGAAATGTGAATAACCCGTCCTCCTCTCTTTGAAA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4BP20JQ 784 0 0
AGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTGCCAATTGG
AGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTAC
TACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCTGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTAC
CCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTT*CTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTC
TCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGC
ACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGC
CGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTAAATTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCTTC
CC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCTGAATGTAGATGATGATATCT
ATACGGATGGATCTTATATATATCGTAGAATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACACG
AGTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATACTA
GGTCTTCTCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGACTC
TATGAAATTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTTTT
CCCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGAC*ATCAAA
TGAA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AZ38JQ 798 0 0
CTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATT
GGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTT
ACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTT
ACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACC
TCTCCAAAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACA
GCACCCGCTGCTCTAACTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATG
GCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTAAATTCTTCTTTTTGATCAGTCAAAACCCCT
TCCC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCTGAATGTAAATGATGATAT
CTATACGGATGGATCTTATATATATCGTAAAATTCTTCTATATATGGTAAAAGTACCACA
CGAGTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATAC
TAGGTCTTCCCGTTCCGTCATCTGACTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGAC
TCTATGAAGTTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTT
TTCCCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGACCATCA
AATGAAATGTGAATAACC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4A641TF 801 0 0
TCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGGAGC
CCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTAC
AGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCC
AACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTCC
AGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGCACC
CGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGCCGT
GCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTAGATTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCTTCCC*
AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCTGAATGTAGATGATGATATCTATA
CGGATGGATCTTATATATATCGTAGAATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACACGAGT
GCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATACTAGGT
CTTCCCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGACTCTAT
GAAATTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTTTTCCC
CGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGACCATCAAATGA
AATGTGAATAACCCGTCCTCC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4A754TF 780 0 0
TGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTC
GATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTT
GCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGAT
TTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCC
TTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTTGAAGTA
GATTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCTTCCC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGC
ATACGGCTTTCTGAATGTAGATGATGATATCTATACGGATGGATCTTATATATATCGTAG
AATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACACGAGTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCC
GAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATACTAGGTCTTCCCGTTCCGTCATCTGGCTTAT
GTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGACTCTATGAAATTACGTCGATACTTCCACATA
TTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTTTTCCCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACT
GCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGACCATCAAATGAAATGTGAATAACCCGTCCTCCTCTC
TTTGAAACAAGGGGCGCTTATGGTTCTGTCGGTGCTTGAAACAATTTTGTCTTCTCCATA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4BP20TF 801 0 0
AATGTGGCGATTCCCTC
TTTGCAATCAGTT*CGCTACAGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGT
GTGATTTCTATATTATGTATGGCCGTGC*TAAGGGCATATCGGTTGAAGTAGATTCTTCT
TTT*GATCAATCAAAACCCCTTCCC*AAACTGTACAAGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTT
TCTGAATGTAGATGATGATATCTATACGGATGGATCTTATATATATCGTAGAATTCTTCT
ATATATGGTAGAAGTACCACACGAGTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTT
ATGTTATGATCTTCTACATACTAGGTCTTCTCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCAT
GTAGCATTCAGACCGAATGACTCTATGAAATTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTA
ACGTAGGAGACATCTCTATTTTTCCCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTT
TCAATTCGCCTCTGACCATCAAATGAAATGTGAATAACCCGTCCTCCTCTCTTTGAAACA
AGGGGCGCTTATGGTTCTGTCGGTGCTTGAAACAATTTTGTCTTCTCCATATTACTATAT
CTCTAGAGTCAATAATTTTATATGAGGAACTACTGAACTCAATCACTTGCTGCCGTTACT
CTTCAGTTTTCTGTTGAGGTCTATCCTGCAGAGGTACTCAAATTGGATCAGTGATCGATT
TCTAGGTTTTGTCGTAAACCTAATTGGTTACTTCCAATTACGTAAATCAAATAGTTCAAA
CCGC

QA 18 801 18 801
DS 

RD RR4H308TF 732 0 0
GCTAATTGTCCACCCTCCCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGCCGTGC*TAAGGGC
ATATCGGTTGAAGCAGATTCTTCTTTTTGATCAATCAAAACCCCTTCCCCAAACTGTACA
AGCTTCTTCCAAAGCATACGGCTTTCCGAATGTAGATGATGATATCTATACGGATGGATC
TTATATATATCGTAGAATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACACGAGTGCATATATGG
GAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATACTAGGTCTTCCCGTTC
CGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGACTCTATGAAATTACGT
CGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTTTTCCCCGGGGGAATC
TTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGACCATCAAATGAAATGTAAATA
ACCCGTCCTCCTCTCTTTGAAACAAGGGGCGCTTATGGTTCTGTCGGTGCTTGAAACAAT
TTTGTCTTCTCCATATTACTATATCTCTAGAGTCAATAATTTTATATGAGGAACTACTGA
ACTCAATCACTTGCTGCCGTTACTCTTCAGTTTTCTGTTGAGGTCTATCCTGCAGAGGTA
CTCAAATTGGATCAGTGATCGATTTCTAGGTTTTGTCGTAAACCTAATTGGTTACTTCCA
ATTACGTAAATC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4GR42TF 681 0 0
CCAAACTGTACAAGCT*CTTCCAAAGCATACGGCTTTCTGAATGTAGATGATGATATCTA
TACGGATGGATCTTATATATATCGTAGAATTCTTCTATATATGGTAGAAGTACCACACGA
GTGCATATATAGGAATCAAAATCTGCCGAATAACTTATGTTATGATCTTCTACATACTAG
GTCTTCCCGTTCCGTCATCTGGCTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCGAATGACTCT
ATGAAATTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCTCTATTTTTC
CCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGACCATCAAAT
GAAATGTGAATAACCCGTCCTCCTCTCTTTGAAACAAGGGGCGCTTATGGTTCTGTCGGT
GCTTGAAACAATTTTGTCTTCTCCATATTACTATATCTCTAGAGTCAATAATTTTATATG
AGGAACTACTGAACTCAATCACTTGCTGCCGTTACTCTTCAGTTTTCTGTTGAGGTCTAT
CCTGCAGAGGTACTCAAATTGGATCAGTGATCGATTTCTAGGTTTTGTAGTAAACCTAAT
TGGTTACTTCCAATTACGTAAATCAAATAGTTCAAACCGCACTCAAAGGTAGGGCATTTC
CCATTTTTATAGGAACTTCT
C

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4AZ38TF 860 0 0
ACATACTAGGTCTTCCCGTTCCGTCATCTGACTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGACCG
AATGACTCTATGAAGTTACGTCGATACTTCCACATATTATGGGTAACGTAGGAGACATCT
CTATTTTTCCCCGGGGGAATCTTTAGAATTACCACTGCTTAGCTTTCAATTCGCCTCTGA
CCATCAAATGAAATGTGAATAACCCGTCCTCCTCTCTTTGAAACAAGGGGCGCTTATGGT
TCTGTCGGTGCTTGAAACAATTTTGTCTTCTCCACATTACTATATCTCTAGAGTCAATAA
TTTTATATGAGGAACTACTGAACTCAACCACTTGCTGCCGTTACTCTTCAGTTTTCTGTT
GAGGTCTATCCTGCAGAGGTACTCAAATTGGATCAGTGATCGATTTCTAGGTTTTGTCGT
AAACCTAATTGGTTACTTCCAATTACGTAAATCAAATAGTTCAAACCGCACTCAAAGGTA
GGGCATTTCCCATTTTTATAGGAACTTCTGTACCAGAAACAATGGTATCTCCAATTATAG
CCCCTCTGGGATGCAAAATATATCTCTTCTCACCATCCCCATAGTGTATGAGACAAATGT
ATGCATTTCGATTAGGGTCGTATTCTATGGTTACGATTCTACCATATATGTCTTTTGTAT
TTCGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGACGCTTATGACCTCCCCCTCTATGCCTTACGG
TAATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTACCACAATGATGCTGCCCATAGATCAAATTAT
TTCGTGGATTGGATTTCACTTGGCTGTCTACGGCTCCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAG
TTTTGTATAAATGTATCGCC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4CE36JQ 203 0 0
CGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGACGCTTATGACCTCCCCCTCTATGCCTTACGGTA
ATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTACCACAATGATGCTGCCCATAGATCAAATTATTT
CGTGGATTGGATTTCACTTGACTGTCTACGGCTCCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTT
TTGTATAAATGTATCGCCATGCC

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR4CE36TF 203 0 0
CGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGACGCTTATGACCTCCCCCTCTATGCCTTACGGTA
ATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTACCACAATGATGCTGCCCATAGATCAAATTATTT
CGTGGATTGGATTTCACTTGACTGTCTACGGCTCCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTT
TTGTATAAATGTATCGCC
ATGCC

QA 1 198 1 198
DS 



CO CL1Contig2 649 3 9 U
GCATATATAGAAGAATTCTACGATATATATAAGATCCATCCGTATAGATATCATCATCTA
CATTCAGAAAGCCGTATGCTTTGGAAGAAGCTTGTACAGTTTGGGAAGGGGTTTTGATTG
ATCAAAAAGAAGAATCTACTTCAACCGATATGCCCTTAGGCACGGCCATTCAGGTGAAGG
AAGGTCTGGAGGGAGCTGTTCCTGGCGTCACCGTGACGCTCAACCCTGAAAAGCCAAGGC
GCGGTTGCTTTGAGATCCGAGAGGAAGGTGGTAAAACATTCATCAGTCTTTTGGAGATGA
AACGTCCATTTGCTCCAATGAAGGCTCTTGATATGGAAGAAGTCATCGAGGACATCATTA
AGAAGATCAAATGAGAGGCATCTACAGAACTGCAAATAGGCTCTTCTTTAGCCTAATCTG
TCCCTTTTGTTCCTACCAATCAGAATTATGTAGAAGACTTTCTAGAGAAACTTCGGATTT
GTTAGGTTCCCTTTATTTTTTCGGTATGAGCACTGTAAGTGCTGTCTGGTTGTTTTTGCA
TTGCATGATTGGCTTAGTTTGATCTGTTCTGTTTGTGGGATTAACTCGTATGTGTAAGGC
TACTTTGATTCATCTCGTTGCTTGAAGCAAAACCGATTCGTGTTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE88TF U 1
AF RR4D979JQ C 257
AF RR4D979TF U 257
BS 1 272 RR4EE88TF
BS 273 273 RR4D979TF
BS 274 377 RR4EE88TF
BS 378 378 RR4D979TF
BS 379 398 RR4EE88TF
BS 399 399 RR4D979TF
BS 400 575 RR4EE88TF
BS 576 576 RR4D979TF
BS 577 649 RR4EE88TF

RD RR4EE88TF 649 0 0
GCATATATAGAAGAATTCTACGATATATATAAGATCCATCCGTATAGATATCATCATCTA
CATTCAGAAAGCCGTATGCTTTGGAAGAAGCTTGTACAGTTTGGGAAGGGGTTTTGATTG
ATCAAAAAGAAGAATCTACTTCAACCGATATGCCCTTAGGCACGGCCATTCAGGTGAAGG
AAGGTCTGGAGGGAGCTGTTCCTGGCGTCACCGTGACGCTCAACCCTGAAAAGCCAAGGC
GCGGTTGCTTTGAGATCCGAGAGGAAGGTGGTGAAACATTCATCAGTCTTTTGGAGATGA
AACGTCCATTTGCTCCAATGAAGGCTCTTGATATGGAAGAAGTCATCGAGGACATCATTA
AGAAGATCAAATGAGAGACATCTACAGAACTGCAAATACGCTCTTCTTTAGCCTAATCTG
TCCCTTTTGTTCCTACCAATCAGAATTATGTAGAAGACTTTCTAGAGAAACTTCGGATTT
GTTAGGTTCCCTTTATTTTTTCGGTATGAGCACTGTAAGTGCTGTCTGGTTGTTTTTGCA
TTGCATGATTGGCTTAGTTTGATCTGTTCTGTTTGCGGGATTAACTCGTATGTGTAAGGC
TACTTTGATTCATCTCGTTGCTTGAAGCAAAACCGATTCGTGTTATTCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4D979JQ 388 0 0
G
CGAGAGGAAGGTGGTAAAACATTCATCAGTCTTTTGGAGATGAAACGTCCATTTGCTCCA
ATGAAGGCTCTTGATATGGAAGAAGTCATCGAGGACATCATTAAGAAGATCAAATGAGAG
GCATCTACAGAACTGCAAATAGGCTCTTCTTTAGCCTAATCTGTCCCTTTTGTTCCTACC
AATCAGAATTATGTAGAAGACTTTCTAGAGAAACTTCGGATTTGTTAGGTTCCCTTTATT
TTTTCGGTATGAGCACTGTAAGTGCTGTCTGGTTGTTTTTGCATTGCATGATTGGCTTAG
TTTGATCTGTTCTGTTTGTGGGATTAACTCGTATGTGTAAGGCTACTTTGATTCATCTCG
TTGCTTGAAGCAAAACCGATTC
GTGTT

QA 2 383 2 383
DS 

RD RR4D979TF 387 0 0
G
CGAGAGGAAGGTGGTAAAACATTCATCAGTCTTTTGGAGATGAAACGTCCATTTGCTCCA
ATGAAGGCTCTTGATATGGAAGAAGTCATCGAGGACATCATTAAGAAGATCAAATGAGAG
GCATCTACAGAACTGCAAATAGGCTCTTCTTTAGCCTAATCTGTCCCTTTTGTTCCTACC
AATCAGAATTATGTAGAAGACTTTCTAGAGAAACTTCGGATTTGTTAGGTTCCCTTTATT
TTTTCGGTATGAGCACTGTAAGTGCTGTCTGGTTGTTTTTGCATTGCATGATTGGCTTAG
TTTGATCTGTTCTGTTTGTGGGATTAACTCGTATGTGTAAGGCTACTTTGATTCATCTCG
T*GCTTGAAGCAAAACCGATTC
TGTA

QA 2 383 2 383
DS 



CO CL1Contig3 751 2 3 U
CAAATCCGAAGTTTCTCTAGAAAGTCTTCTACATAATTCTGATTGGTAGGAACAAAAGGG
ACAGATTAGGCTAAAGAAGAGCCTATTTGCAGTTCTGTAGATGTCTCTCATTTGATCTTC
TTAATGATGTCCTCGATGACTTCTTCCATATCAAGAGCCTTCATTGGAGCAAATGGACGT
TTCATCTCCAAAAGACTGATGAATGTTTCACCACCTTCCTCTCGGATCTCAAAGCAACCG
CGCCTTGGCTTTTCAGGGTTGAGCGTCACGGTGACGCCAGGAACAGCTCCCTCCAGACCT
TCCTTCACCTGAATGGCCCTTGTCTTGAACGCATTGCATTGTTTACAGTGCTCTATAACA
ATCTTGGGCTTCGTCGAGTCTCCAACCTCCTCCTCCTCCGCAGCAGCTTCTTCCTCTTCC
TCATCCTTCTCAACTTCCTGAGATGCTTTCTCTTCCTTCTTCGCCTTCTTAGCTCCTCTC
CCAGTCTCAGTCGATGGCTTCTTCCTCTTCGCCGGCGACGCAAGCTTCTTCACCTGCTTG
TTGACGACGGATCCAGCAGCTTTAGCGCCGTTTTGTTGAGTCGCACTTCGAGTTCGGCGA
TCCATGCTCCGAGTCACTCTCGACGAAGTTGGTGCCTTTTCCTCTCCATCTCCCTTACTC
TTCACCGGCGCCATTGTACGGGAAAAGAAAAACAGAACACAAAGCAAAGAGACAGGCTTT
CGTCTGAGGACACAACTCTTGAGACTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV26JQ U 262
AF RR4GV26TF C 1
BS 1 261 RR4GV26TF
BS 262 553 RR4GV26JQ
BS 554 751 RR4GV26TF

RD RR4GV26JQ 292 0 0
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GTCTTGAACGCATTGCATTGTTTACAGTGCTCTATAACAATCTTGGGCTTCGTCGAGTCT
CCAACCTCCTCCTCCTCCGCAGCAGCTTCTTCCTCTTCCTCATCCTTCTCAACTTCCTGA
GATGCTTTCTCTTCCTTCTTCGCCTTCTTAGCTCCTCTCCCAGTCTCAGTCGATGGCTTC
TTCCTCTTCGCCGGCGACGCAAGCTTCTTCACCTGCTTGTTGACGACGGATC

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR4GV26TF 751 0 0
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ACAGATTAGGCTAAAGAAGAGCCTATTTGCAGTTCTGTAGATGTCTCTCATTTGATCTTC
TTAATGATGTCCTCGATGACTTCTTCCATATCAAGAGCCTTCATTGGAGCAAATGGACGT
TTCATCTCCAAAAGACTGATGAATGTTTCACCACCTTCCTCTCGGATCTCAAAGCAACCG
CGCCTTGGCTTTTCAGGGTTGAGCGTCACGGTGACGCCAGGAACAGCTCCCTCCAGACCT
TCCTTCACCTGAATGGCCCTTGTCTTGAACGCATTGCATTGTTTACAGTGCTCTATAACA
ATCTTGGGCTTCGTCGAGTCTCCAACCTCCTCCTCCTCCGCAGCAGCTTCTTCCTCTTCC
TCATCCTTCTCAACTTCCTGAGATGCTTTCTCTTCCTTCTTCGCCTTCTTAGCTCCTCTC
CCAGTCTCAGTCGATGGCTTCTTCCTCTTCGCCGGCGACGCAAGCTTCTTCACCTGCTTG
TTGACGACGGATCCAGCAGCTTTAGCGCCGTTTTGTTGAGTCGCACTTCGAGTTCGGCGA
TCCATGCTCCGAGTCACTCTCGACGAAGTTGGTGCCTTTTCCTCTCCATCTCCCTTACTC
TTCACCGGCGCCATTGTACGGGAAAAGAAAAACAGAACACAAAGCAAAGAGACAGGCTTT
CGTCTGAGGACACAACTCTTGAGACTCTCCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 7 37

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AAGTTTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTTTAACGAGAGAGCTT
GCGGAAGATGGTTACTCAGGCGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATC
ATCAGGGCCACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTG
ACATCTCTTGTCCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAG
AAGGTGACCAACAGAGGTCTCTGCGCCATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTT
CTCGGTGGACTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGT
GGTGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGAGCAGCACGTGCTAAGTCC
ATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGAC
TCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATG
CTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGAT*TTGTCATC
ATCCATGCTCCCAAGGAGGAAGATGTCAACTCTGCACCTGCTCAGTTACTGCTCCGGCTG
CTCTTGCACCGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A203TFB U 1
AF RR4A203JQD C 544
AF RR4FD59TF U 7
BS 1 69 RR4A203TFB
BS 70 70 RR4FD59TF
BS 71 674 RR4A203TFB
BS 675 675 RR4FD59TF
BS 676 688 RR4A203TFB
BS 689 733 RR4FD59TF

RD RR4A203TFB 688 0 0
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AAGTTTGTATCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTTTAACGAGAGAGCTT
GCGGAAGATGGTTACTCAGGCGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATC
ATCAGGGCCACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTG
ACATCTCTTGTCCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAG
AAGGTGACCAACAGAGGTCTCTGCGCCATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTT
CTCGGTGGACTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGT
GGTGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGAGCAGCACGTGCTAAGTCC
ATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGAC
TCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATG
CTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGAT*TTGTCATC
ATCCATGCTCCCAAAGAGGAAGATGTCA

QA 1 688 1 688
DS 

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GCTGTCAGACATGTTTTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTT
GACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGAT*TTGTCATCATC
CATGCTCCCAAGGAGGA

QA 1 137 1 137
DS 

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GG
GCATCAAATCGGCGAGACTTCAAACATGGCGACACAAATCAGCAAGAAGAGAAAGTTTGT
AGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTTTAACGAGAGAGCTTGCGGAAGA
TGGTTACTCAGGCGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCAGGGC
CACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGACATCTCT
TGTCCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTGAC
CAACAGAGGTCTCTGCGCCATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTTCTCGGTGG
ACTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGTGCTAA
GGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGAGCAGCACGTGCTAAGTCCATGAAATT
CAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGACTCTGCTGT
CAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTG
GGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATGC
TCCCAAGGAGGAAGATGTCAACTCTGCACCTGCTCAGTTACTGCTCCGGCTGCTCTTGCA
CCGGA

QA 3 727 3 727
DS 



CO CL2Contig2 824 2 10 U
GGATCTCAGCGCTTTCACCATCATCTCGAGATTACTTCAGGACTTTAGGGTTTTAGTGAT
CCGCAGCTGCACACATCAAACATGGCGACTCAAATTAGCAAGAAGAGAAAGTTTGTAGCT
GACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTCTAACCAGAGAGCTTGCTGAAGATGGT
TACTCTGGTGTGGAAGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCAGGGCCACA
CGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGACATCTCTTGTC
CAGAAGAGATTTAGGTTCCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTTACCAAC
AGGGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAGCTCCTCGGTGGACTT
GCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAAAGTGGTGCTAAAGGA
TGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAG
GACGGGTACATGGTTTCCTCTGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGACTCTGCTGTCAGA
CATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATTAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTGGGAC
CCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATGCTCCC
AAGGAGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGTTACTGCTCCGCTGCCTTGCACCGGAA
GCTCTCTCACAGCAGTAGATACCCTGAGATGATCCAGTCGCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF96TF U 1
AF RR4FA50TF U 37
BS 1 104 RR4DF96TF
BS 105 105 RR4FA50TF
BS 106 159 RR4DF96TF
BS 160 160 RR4FA50TF
BS 161 297 RR4DF96TF
BS 298 298 RR4FA50TF
BS 299 348 RR4DF96TF
BS 349 349 RR4FA50TF
BS 350 568 RR4DF96TF
BS 569 824 RR4FA50TF

RD RR4DF96TF 568 0 0
GGATCTCAGCGCTTTCACCATCATCTCGAGATTACTTCAGGACTTTAGGGTTTTAGTGAT
CCGCAGCTGCACACATCAAACATGGCGACTCAAATTAGCAAGAATAGAAAGTTTGTAGCT
GACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTCTAACCGGAGAGCTTGCTGAAGATGGT
TACTCTGGTGTGGAAGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCAGGGCCACA
CGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGACATCTCTTTTC
CAGAAGAGATTTAGGTTCCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGGAGGTTACCAAC
AGGGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAGCTCCTCGGTGGACTT
GCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAAAGTGGTGCTAAAGGA
TGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAG
GACGGGTACATGGTTTCCTCTGGTCAGC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4FA50TF 788 0 0
GG
AGGACTTTAGGGTTTTAGTGATCCGCAGCTGCACACATCAAACATGGCGACTCAAATTAG
CAAGAAGAGAAAGTTTGTAGCTGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTCTAAC
CAGAGAGCTTGCTGAAGATGGTTACTCTGGTGTGGAAGTTAGGGTTACTCCGATGAGGAG
TGAGATTATCATCAGGGCCACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGAT
CAGAGAGTTGACATCTCTTGTCCAGAAGAGATTTAGGTTCCCTCAAGACAGTGTTGAGCT
TTACGCTGAGAAGGTTACCAACAGGGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTCCG
TTACAAGCTCCTCGGTGGACTTGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGT
CATGGAAAGTGGTGCTAAAGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACG
TGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGGTACATGGTTTCCTCTGGTCAGCCAACCAAGGA
TTACATCGACTCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATTAAGGT
GAAGGTCATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGA
TGTTGTCATCATCCATGCTCCCAAGGAGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGTTACT
GCTCCGCTGCCTTGCACCGGAAGCTCTCTCACAGCAGTAGATACCCTGAGATGATCCAGT
CGCTTA

QA 3 788 3 788
DS 



CO CL2Contig3 812 4 21 U
AGGGTCAGTTGAAAAGACGTTTGGACTTTGGAGAAACGTATTACACTGCAACAATTCATT
ATTCAAGACGAAAAGTTCCAATGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATA
GGTTTCAAAACAACATGAAAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAAACATAAAAACAAGAAGTAT
CTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAAAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCT
AGGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTAAGGGGAGCTTCTGGTAAAAGTG
CAGCCGGAGCAGCAACCTGAGCTGGAGCAAAGCTAACATCTTCTTCCTTGGGAGAATGGA
TGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAA
GCATGACCTTGACCTTGATTCCGAGCACACCCTGTCTGAACAGAACATGTCTGACTGCGG
AGTCAATGTATTCCTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCA
TGGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTTGGCGC
CACTCTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGA
GGAGTTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCT
TCTCAGCATAAAGCCCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAACCTCTTCTGAACAAGAGACG
TCAACTCTCTGATTCTCCTTCCCTTCTCACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB08JQ U 1
AF RR4EM22JQ U 43
AF RR4DB47JQ U 77
AF RR4GN14JQ U 73
BS 1 80 RR4EB08JQ
BS 81 81 RR4EM22JQ
BS 82 93 RR4EB08JQ
BS 94 94 RR4EM22JQ
BS 95 158 RR4EB08JQ
BS 159 159 RR4EM22JQ
BS 160 215 RR4EB08JQ
BS 216 216 RR4EM22JQ
BS 217 340 RR4EB08JQ
BS 341 341 RR4EM22JQ
BS 342 353 RR4EB08JQ
BS 354 354 RR4EM22JQ
BS 355 442 RR4EB08JQ
BS 443 443 RR4EM22JQ
BS 444 462 RR4EB08JQ
BS 463 463 RR4EM22JQ
BS 464 484 RR4EB08JQ
BS 485 485 RR4EM22JQ
BS 486 595 RR4EB08JQ
BS 596 758 RR4EM22JQ
BS 759 812 RR4GN14JQ

RD RR4EB08JQ 595 0 0
AGGGTCAGTTGAAAAGACGTTTGGACTTTGGAGAAACGTATTACACTGCAACAATTCATT
ATTCAAGACGAAAAGTTCCATTGAACTAAACGCGTTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATA
GGTTTCAAAACAACATGAAAAAAAACTTGTCTGCTTCGGAAACATAAAAACAAGAAGTAT
CTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAAAAAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCT
AGGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTAAGGGGAGCTTCTGGTAAAAGTG
CAGCCGGAGCAGCAACCTGAGCTGGAGCAAAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAAAATGGA
TGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAA
GCATGACCTTGACCTTGATTCCAAGCACACCCTGTCTGAACAAAACATGTCTGACTGCGG
AGTCGATGTATTCCTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCA
TGGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4EM22JQ 716 0 0
C
CACTGCAACAATTCATTATTCAAGACGAAAAGTTCCAATGAACTAAACGCATTCAACTGC
CAAAAAAACTGAACATAGGTTTCAAAACAACATGAAAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAAAC
ATAAAAACAAGAAGTATCTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAAAGAGGCATT
CCAACGAGTCATCTTCTAGGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTAAGGGG
AGCTTCTGGTAAAAGTGCAGCCGGAGCAGCAACCTGAGCTGGAGCAAAGCTAACATCTTC
TTCCTTGGGAGAATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCC
CTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTGACCTTGATTCCGAGCACACCCTGTCTGAGCAG
AACATGTCTGACTGCGGAGTCAATGTATTCCTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCATGTA
ACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGAC
CTCACATCCCTTGGCGCCACTCTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCG
AACGGCAAGACCACCGAGGAGTTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACAGAG
ACCTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCATAAAGCCCAACACTGTCTTGAGGGAATCTG

QA 2 716 2 716
DS 

RD RR4DB47JQ 700 0 0
GCCAA
TGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATAGGTTTCAAAACAACATGAGAA
AAAACTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTATCTTAAAGAGACGATGACAAGG
TTTGACAAAAAGGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGCGACAGGGATCATCTCAG
GGTAATCTACGGCTGTAAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGCCGGAGCAGCAACCTGAG
CTGGAGCAGAGCTAACATCTTCTTCCTTGGGAGAATGGATGATGACAACATCAGGCAATG
GTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTGACCTTGATTC
CGAGCACACCCTGTCTGAACAGAACATGTCTGACTGCGGAGT**ATGTATTCCTTGGTAG
GTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGAGCTGCAC
GAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTTGGCGCCACTCTCCATGACAAATCTCA
AGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGTTTGTAACGGAGAGACT
CAGCCTGAGCGATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCATAAAGCCCAACAC
TGTCTTGAGGGAATCTGAACCTCTTCTGAACAAGA

QA 6 700 6 700
DS 

RD RR4GN14JQ 740 0 0
CGGTT
CCAATGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATAGGTTTCAAAACAACATG
AGAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTATCTTAAAGAGACGATGAT
AAGGTTTGACAAAAAAGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGCGACAGGGATCATC
TCAGGGTAATCTACGGCTGTAAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGCCGGAGCAGCAACC
TGAGCTGGAGCAGAGCTAACATCTTCTTCCTTGGGAGAATGGATGATGACAACATCAGGC
AATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCGAGCATGACCTTGACCTTG
ATTCCGAGCACACCCTGTCTGAGCAGAACATGTCTGACTGCGGAGTCAATGTATTCCTTG
GTAGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGAGCT
GCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTTGGCGCCACTCTCCATGACAAAT
CTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGTTTGTAACGGAGA
GACTCAGCCTGAGCGATGACACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCATAAAGCCCA
ACACTGTCTTGAGGGAATCTGAACCTCTTCTGAACAAGAGACGTCAACTCTCTGATTCTC
CTTCCCTTCTCACCG

QA 6 740 6 740
DS 



CO CL2Contig4 953 10 53 U
GGAATTGGAGGGTTTCAGCGGCTTGAACA***TCATGGCGACGCAAATCAGCAAGAAGAG
GAAGTTTGTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGTTGAACGAGGTGCTAACCAGGGAGCT
AGCAGAGGATGGTTACTCAGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCCATGAGGACTGAGATTAT
CATCAGAGCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTT
GACCTCTCTTGTTCAGAAGAGGTTCAGATTCCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGA
GAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACT
CCTCGGTGGTCTTGCCGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAG
TGGCGCCAAGGGATGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTC
CATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCCACCAAAGAGTACATCGA
CTCCGCAGTCAGACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTTGGAATCAAGGTCAAGGTCAT
GCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTATTGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCAT
CATCCATTCTCCCAAGGAAGATGATGTTAGCTCTGCTCCAGCTCAGGTTGCTGCTCCGGC
TGCACTTCTACCAGAAGCTCCCCTTACAGCCGTAGATTACCCTGAGATGATCCCTGTCGC
CTAGAAGATGACTCTTGTTTTTGGTTAAACCTTATCAGCGTCTCTTTAAGATACTTGTTG
TTTTTTTATGTCCTCGAAGCAGACAAGTTTTTTT*CTCATGTTGTTTTTAAAACCTATGT
AAGTTTTTTTTGGATGTTGAATGCGTTTAGTTCAATGGAGTTTTTGTTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 5 10 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
0 45 45 30 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 10 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4GP77TF U 7
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AF RR4GN14TF U 7
AF RR4A332TFB U 7
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AF RR4DA64TF U 447
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AF RR4A332JQ C 78
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TCTTGTTCAGAAGAGGT*CAGATTCCCTCAAGACAGTGTTGGGCTTTATGCTGAGAAGGT
*GCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATCGCTCAGGCTGA*TCTCTCCGT*ACAAACTCC

QA 1 356 1 356
DS 

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GTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGTTGAACGAGGTTCTAACTAGGGAGCTAGCAGAG
GATGGTTACCCAGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCCATGAGGACTGAGATTATCATCAGA
GCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTTGACGTCT
CTTGTTCAGAAGAGGTTCAGATTCCCTCAAGACAGTGTTGGGCTTTATGCTGAGAAGGTT
GCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACTCCTCGGT
GGTCTTGCCGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTTGTCATGGAGAGTGGCGCC
AAGGGATGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAA
TTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGAATACAT**ACTCCGCA
GTCAGACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTCGGAATCAAG
TC

QA 1 582 1 582
DS 

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GAAGTTTGTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGTTGAACGAGGTGCTAACTAGGGAGCT
AGCAGAGGATGGTTACTCGGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCCATGAGGACTGAGATTAT
CATCAGAGCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTT
GACATCCCTTGTCCAGAAGAGATTCAGATTCCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGA
GAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACT
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TGGCGCTAAGGGATGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTC
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CTCCGCAGTCAGACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTTGGAATCAAGGTCAAGGTCAT
GCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTATTGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCAT
CATCCATTCTCC

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DS 

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TGTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGTTGAACGAGGTTCTAACTAGGGAGCTAGCAGA
GGATGGTTACTCAGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCCATGAGGACTGAGATTATCATCAG
AGCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTTGACGTC
TCTTGTTCAGAAGAGGTTCAGATTCCCTCAAGACAGTGTTGGGCTTTATGCTGAGAAGGT
TGCCAACAGAGGTCTCTGTGTCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACTCCTCGG
TGGTCTTGCCGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTTGTCATGGAGAGTGGCGC
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ATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGAATACATTGACTCCGC
AGTCAGACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTCGGAATCAAAGTCAAGGTCATGCTCGA
CTGGGACCCTAAGGGAGTATTGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCAT

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DS 

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GG
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CCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTTGACCTCTC
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GTCTTGCCGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGCGCCA
AGGGATGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAAT
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TCAGACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTTGGAATCAAGGTCAAGGTCATGCTTGACT
GGGACCCTAAGGGAGTATTGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATT
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TACCAGAAGCTCCCCTTACAGCCGTAGATTACCCTGAGATGATCCCTGTCGCCTAGA*GA
TGACTCTTGTTTTTGGTTAAACCTTATCAGCGTCTCTTTA*GATACTTGT*GTTTTTTTA
TGTCCTCGA*GCAGACA*GTTTTTTT*CTCATGTTGTTTTTAAA
CC

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DS 

RD RR4A332JQD 920 0 0
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TCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATCGC
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TGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGCGCCAAGGGATGTGAGGTCATTGTGAGTGG
AAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTC
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TGTGCTTGGAATCAAGGTCAAGGTCATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTATTGGGACC
AAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATTCTCCCAAGGAAGATGATGTTAGCTC
TGCTCCAGCTCAGGTTGCTGCTCCGGCTGCACTTCTACCAGAAGCTCCCCTTACAGCCGT
AGATTACCCTGAGATGATCCCTGTCGCCTAGAAGATGACTCTTGTTTTTGGTTAAACCTT
ATCAGCGTCTCTTTAAGATACTTGTTGTTTTTTTATGTCCTCGAAGCAGACAAGTTTTTT
T*CTCATGTTGTTTTTAAAACCTATGTAAGTTTTTTTTGGATGTTGAATGCGTTTAGTTC
AATGGAGTTTTTGTTTT
AAT

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DS 

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G
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TAGTTCAATG
C

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DS 

RD RR4DA64TF 492 0 0
G
GAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGT
TTCCTCTGGTCAACCCACCAAAGAGTACATCGACTCCGCAGTCAGACATGTTCAGCTCAG
ACAGGGTGTGCTTGGAATCAAGGTCAAGGTCATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTATT
GGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATTCTCCCAAGGAAGATGATGT
TAGCTCTGCTCCAGCTCAGGTTGCTGCTCCGGCTGCACTTCTACCAGAAGCTCCCCTTAC
AGCCGTAGATTACCCTGAGATGATCCCTGTCGCCTAGAAGATGACTCTTGTTTTTGGTTA
AACCTTATCAGCGTCTCTTTAAGATACTTGTTGTTTTTTTATGTCCTCGAAGCAGACAAG
TTTTTTT*CTCATGTTGTTTTTAAAACCTATGTAAGTTTTTTT*GGATGTTGAATGCGTT
TAGTTCAATG
C

QA 2 491 2 491
DS 

RD RR4ER78JQ 699 0 0
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ACAGAGGTCTCTGTGCCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACTCCTCGGTGGTC
TTGCCATTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGCGCTAAGG
GTTGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAATTCA
AGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGAATACATTGACTCCGCAGTCA
GACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTCGGAATCAAGGTCAAGGTCATGCTTGACTGGG
ACCCTAAGGGAGTATTGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATTCTC
CCAAGGAAGATGATGTTAGCTCTGCTCCAGCTCAGGTTGCCGCTCCGGCTGCACTTCTAC
CAGAAGCTCCCCTCACAGCCGTAGATTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCCTAGAAGATGA
CTCTTGTTTTTGGT****CCTTATCAGCGTCTCTTTAAGATACTTGTTGTTTTTTTATGT
CCTCGAAGCAGACAAGTTTTTTTTCTCATGTTGTTTTTAAAACCTATGTAAGTTTTTTTT
GGATGTTGAATGCGTTTAGTTCAATGGAGTTTTTGTTTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4A332JQ 876 0 0
GGTGTG
TCTACGCTGAGTTGAACGAGGTGCTAACCAGGGAGCTAGCAGAGGATGGTTACTCAGGTG
TGGAGGTTAGGGTTACTCCCATGAGGACTGAGATTATCATCAGAGCCACCCGTACTCAAA
ATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTTGACCTCTCTTGTTCAGAAGAGGT
TCAGATTCCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCT
GTGCCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACTCCTCGGTGGTCTTGCCGTTCGCA
GGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGCGCCAAGGGATGTGAGGTCA
TTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACA
TGGTTTCCTCTGGTCAACCCACCAAAGAGTACATCGACTCCGCAGTCAGACATGTTCTGC
TCAGACAGGGTGTGCTTGGAATCAAGGTCAAGGTCATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAG
TATTGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATTCTCCCAAGGAAGATG
ATGTTAGCTCTGCTCCAGCTCAGGTTGCTGCTCCGGCTGCACTTCTACCAGAAGCTCCCC
TTACAGCCGTAGATTACCCTGAGATGTTCCCTGTCGCCTAGAAGATGACTCTTGTTTTTG
GTTAAACCTTATCAGCGTCTCTTTAAGATACTTGTTGTTTTTTTATGTCCTCGAAGCAGA
CAAGTTTTTTT*CTCATGTTGTTTTTAAAACCTATGTAAGTTTTTTTTGGATGTTGAATG
CGTTTAGTTCAATGGAGTTTTTGTTTTAAT

QA 7 876 7 876
DS 



CO CL2Contig5 585 2 7 U
AGGGAGGGTTTTCGCGACTTGAACATCATGGCGACGCAAATCAGCAAGAAGAGGAAGTTT
GTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGTTGAACGAAGTTCTGACTAGGGAGCTAGCAGAG
GATGGTTACTCAGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCCATGAGGACTGAGATTATCATCAGA
GCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGAGAGAAGGGAAGAAGAATCAGAGAGTTGACGTCC
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GCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATCGCTCAGGCTGAGTCTCTCCGTTACAAACTCCTCGGT
GGTCTTGCCATTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGCGCT
AAGGGTTGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCTCGTGCCAAGTCCATGAAA
TTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGAATACATTGACTCCGCA
GTCAGACATGTTCTGCTCAGACAGGGTGTGCTCGGAATCAAGTCA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ44TF U 3
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QA 1 585 1 585
DS 



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BQ
10 10 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 30 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 30 55 55 40 55 55 55 55 55 30 55 35 35 60 
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4H235JQ U 1
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G
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AT
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CACCCTGTCTAAGCAGAACATGTCTGACAGCAAAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGAC
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GAGCAATAGCGCAGAGACCTCTGTTGGTAACCTTCTCAGCGTAA*GCTCAACACTGTCTT
GAGGAAACCTGAATCTCTTCTGGACAAGAGATGTCAACTCTCTGATCCTCCTTCCCTTCT
CACCGAGAAC

QA 1 790 1 790
DS 

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G
GTAGTAATTTTTGTTCTTATTAAGACCAAAAATTCCATTGAACATAAGCATCCAGTCTAA
AAAATAATTCACATAAGTTTGGAACCATGAGAAAAAAAAACTTGTCTAATTGGAGGATAT
AGAAAAACAACTAGTGAGTATCAAGAGACACAGAATAGTTATAACAAAAACAGAAGTATC
CCATGGTAAGAGTAACCAAAGGGTTTCTTTTAAGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAATCT
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GAGTTGACATCTTCCTCCTTGGGAGCATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTT
GGTCCATTTACTCCCTT*AGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTCACCTTAATTCCCAGCAC
ACCCTGTCTAAGCAGAACATGTCTGACAGCAGAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGACC
AGAGGAAACCATGTACCCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTT
TCCACTCACAATCACCTCACATCCTTTAGCACCACTTTCCATGACGAATCTCAAGACACC
ATAGCAAGCCCTGCGGACAGCAAGTCCACCGAGGAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTG
AGCAATAGCGCAGAGACCCCTGTTGGTAACCTTCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTG
AGGGAACCTAAATCTCTTCTGGACAAGAGATGTCAACTCTCTGATCCTCCT*CCCTTCTC
ACCGAGAACATTT

QA 2 794 2 794
DS 

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*CTTGTCTAATTGGAGGATATAGAAAAACAACTACCGAGTATCAAGAGGCACAGAATAGT
TATAACAAAAACAGAAGTATCCCATGGTAAGAGTAACCAAAGGGTTTCTTCTAAGCGACT
GGGATCATCTCAGGGTAATCTACTGCTGTGAGGGGAGCTTCCGGTGCAAGGGCAGCCGGA
GCAGTAACCTGAGCAGGAGCAGAGTTGACATCATCCTCCTTGGGAGCATGGATGATCACA
ACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCATTTATTCCCTT*AGGGTCCCAGTCAAGCATGAC
CTTCACCTTGATTCCGAGAACACCCTGTCTAAGCAGAACATGTCTGACAGCAGAGTCGAT
GCAATCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGTACCCGTCCTTGAATTTCATGAACTT
GGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATCACCTCACATCCTTTAGCACCACTTTC
CATGACGAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACAGCAAGTCCACCGAGCAGCTT
GTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCAATAGCGCAGAGACCTCTGTTGGTAACCTTCTCAGC
GTAAAGCTCAACACTGTCTTGAGGAAACCTGAATCTCTTCTGGACAAGAGATGTCAACTC
TCTGATCCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGTGTGGCTCTAATGATAAT
CTCAGTCCTCATTGGAGTAACCCTAACCTCTACACCAGAGTAACCATCTTCAGCAAGCTC
TCTGGTTAGAACCTCGTTCAACTCGGCGTAGAACACACCGTCAGCTACAAACTTTCTCTT
CTTGCTAATTTGAGTCGCC

QA 1 919 1 919
DS 

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CTCCTTGGGAGCATGGATGATCACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCATTTATTCC
CTTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACTTTCACTTTGATTCCGAGAACACCCTGTCTAAGCA
GAACATGTCTGACAGCAGAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGT
ACCCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATCA
CCTCACATCCTTTAGCACCACTTTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGC
GAACAGCAAGTCCACCGAGCAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCAATAGCGCAGA
GACCTCTGTTGGTAACCTTCTCAGCGTAA*GCTCAACACTGTCTTGAGGAAACCTGAATC
TCTTCTGGACAAGAGATGTCAACTCTCTGATCCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTT
GAGTACGTGTGGCTCTAATGATAATCTCAGTCCTCATTGGAGTAACCCTAACCTCTACAC
CAGA**AACCATCTTCAGCAAGCTCTCTGGTTAGAACCTCGTTCAACTCGGCGTAGAACA
CACCGTCAGCTACAAACTTTCTCTTCTTGCTAATTTGAGTCGCCATGTTTGATGTGTGCA
GCTGCGGATCACTGAAACCCTAAAGTCCTGAAGTAATCTCGAGATGATGGTGAAAGCGCT
GAGATCC

QA 1 787 1 787
DS 

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GACCAGAGGAAACCATGTACCCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAA
GCTTTCCACTCACAATCACCTCACATCCTTTAGCACCACTTTCCATGACGAATCTCAAGA
CACCATAGCAAGCCCTGCGAACAGCAAGTCCACCGAGCAGCTTGTAACGGAGAGACTCAG
CCTGAGCAATAGCGCAGAGACCTCTGTTGGTAACCTTCTCAGCGTAA*GCTCAACACTGT
CTTGAGGAAACCTGAATCTCTTCTGGACAAGAGATGTCAACTCTCTGATCCTCCTTCCCT
TCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGTGTGGCTCTAATGATAATCTCAGTCCTCATTGGAG
TAACCCTAACCTCTACACCAGA**AACCATCTTCAGCAAGCTCTCTGGTTAGAACCTCGT
TCAACTCGGCGTAGAACACACCGTCAGCTACAAACTTTCTCTTCTTGCTAATTTGAGTCG
CCATGTTTGATGTGTGCAGCTGCGGATCACTGAAACCCTAAAGTCCTGAAGTAATCTCGA
GATGATGGTGAAAGCGCTGAGATCC

QA 1 625 1 625
DS 

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TCCCAGTCAAGCATGACCTTCACCTTGATTCCGAGAACACCCTGTCTAAGCAGAACATGT
CTGACAGCAGAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGTACCCGTCC
TTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATCACCTCACAT
CCTTTAGCACCACTTTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACAGCA
AGTCCACCGAGCAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCAATAGCGCAGAGACCTCTG
TTGGTAACCTTCTCAGCGTAAAGCTAAACACTGTCTTGAGGAAACCTGAATCTCTTCTGG
ACAAGAGATGTCAACTCTCTGATCCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGT
GTGGCTCTAATGATAATCTCAGTCCTCATTGGAGTAACCCAAACCTCTACACCAGAGTAA
CCATCTTCAGCAAGCTCTCTGGTTAGAACCTCGTTCAACTCGGCGTAGAACACACCGTCA
GCTACAAACTTTCTCTTCTTGCTAATTTGAGTCGCCATGTTTGATGTGTGCAGCTGCGGA
TCACTGAAACCCTAAAGTCCTGAAGTAATCTCGAGATGATGGTGAAAGCGCTGAGATCCC

QA 1 720 1 720
DS 

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TGTCTGACAGCAGAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGTACCCG
TCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATCACCTCA
CATCCTTTAGCACCACTTTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACA
GCAAGTCCACCGAGCAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCAATAGCGCAGAGACCT
CTGTTGGTAACCTTCTCAGCGTAAAGCTAAACACTGTCTTGAGGAAACCTGAATCTCTTC
TGGACAAGAGATGTCAACTCTCTGATCCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAGTA
CGTGTGGCTCTAATGATAATCTCAGTCCTCATTGGAGTAACCCAAACCTCTACACCAGAG
TAACCATCTTCAGCAAGCTCTCTGGTTAGAACCTCGTTCAACTCGGCGTAGAACACACCG
TCAGCTACAAACTTTCTCTTCTTGCTAATTTGAGTCGCCATGTTTGATGTGTGCAGCTGC
GGATCACTGAAACCCTAAAGTCCTGAAGTAATCTCGAGATGATGGTGAAAGCGCTGAGAT
CC
C

QA 1 662 1 662
DS 



CO CL2Contig7 976 5 12 U
GGAAACTTAAGATAATTTATAGAAATCGATTTGAGGAAAATGAGTTTGATTCGAAGATAC
AAGAAACTAAAACCTGTCAAGAGAGAGGTGAGAAAAGTTGAACAAAAGAAAAAGAACAAA
ACCACATGGAATAGCAGTAAAAGGATTTTTTCTAGGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAAT
CTACAGCAGTGAGGGGAGCTTCCGGCAAAAGAGCAGCAGCAGGAGCCGTAACCTGAGCAG
GTGCAGAGTTAAAATCTTCTTCCTTGGGAGCATGGATGATCACAACATCGGGCAGTGGTG
TCTTTGGTCCCGTTACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTGACCTTGATTCCGA
GCACGCCCTGTCTAAGGAGAACATGTCTGACAGCAGAATCGATGTACTCCTTGGTAGGTT
GACCAGATGAAACCATGTAACCATCCTTGAATTTCATGGATTTGGCACGCGCTGCACGTA
GCTTTCCACTCACAATCACCTCACAGCCCTTAGCTCCACTCTCCATGACGAACCTCAAGA
CACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGCTTGTAACGGAGGGACTCGG
CCTGAGCAATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTTTCAGCGTAAAGCTCAACACTGT
CTTGAGGAAACCTGAATCTCTTCTGTACAAGAGATGTCAACTCCCTGATCCTCCTCCCTT
TCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGTGTGGCTCTGATGATAATCTCAGTCCTCATCGGAG
TAACCCTAACCTCCACACCTGAGTATCCGTCCTCCGCCAGCTCTCTAGTGAGCACCTCGT
TCAACTCGGCGTAGAACACACCGTCCGCTACAAACTTTCTCTTCTTGCTAATCTGAGTCG
CCATATTCGTGGAAATGTAAATCTGCCGACAGAAAAACCCTAACAGTGTAAGAAGAAGAT
GAGCAGTGAATCTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HB69JQB U 1
AF RR4HB69TF C 1
AF RR4G971JQ U 9
AF RR4H615JQB U 14
AF RR4H615TF C 355
BS 1 439 RR4HB69JQB
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C

QA 1 590 1 590
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ACCACATGGAATAGCAGTAAAAGGATTTTTTCTAGGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAAT
CTACAGCAGTGAGGGGAGCTTCCGGCAAAAGAGCAGCAGCAGGAGCCGTAACCTGAGCAG
GTGCAGAGTTAAAATCTTCTTCCTTGGGAGCATGGATGATCACAACATCGGGCAGTGGTG
TCTTTGGTCCCGTTACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTGACCTTGATTCCGA
GCACGCCCTGTCTAAGGAGAACATGTCTGACAGCAGAATCGATGTACTCCTTGGTAGGTT
GACCAGATGAAACCATGTACCCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGCGCTGCACGTA
GCTTTCCACTCACAATCACCTCACAGCCCTTAGCTCCACTCTCCATGACGAATCTCAAGA
CACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGCTTGTAACGG
C

QA 1 590 1 590
DS 

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QA 8 785 8 785
DS 

RD RR4H615JQB 824 0 0
AG
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AGTAAAAGGATTTTTTCTAGGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAATCTACAGCAGTGAGGG
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CTTCTTCCTTGGGAGCATGGATGATCACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCGTTA
CTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTGACCTTGATTCCGAGCACGCCCTGTCTAA
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TCACCTCACAGCCCTTAGCTCCACTCTCCATGACGAACCTCAAGACACCATAGCAAGCCC
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QA 3 824 3 824
DS 

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TCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGCTTGTAACGGAGGG
ACTCGGCCTGAGCAATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTTTCAGCGTAAAGCTCAA
CACTGTCTTGAGGAAACCTGAATCTCTTCTGTACAAGAGATGTCAACTCCCTGATCCTCC
TCCCTTTCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGTGTGGCTCTGATGATAATCTCAGTCCTCA
TCGGAGTAACCCTAACCTCCACACCTGAGTATCCGTCCTCCGCCAGCTCTCTAGTGAGCA
CCTCGTTCAACTCGGCGTAGAACACACCGTCCGCTACAAACTTTCTCTTCTTGCTAATCT
GAGTCGCCATATTCGTGGAAATGTAAATCTGCCGACAGAAAAACCCTAACAGTGTAAGAA
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QA 1 622 1 622
DS 



AS 2 28

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GAAGACAAGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGA
GCTCGATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAG
AGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATA
TCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACA
TAGTACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTG
GAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACA
TCCATGTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCCGG
TGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGT
ATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGA
TATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCT
ACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTCAAGG
TTCTGTCTCTTTTTT*CTATTATGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACAAGTGTTA
GTTAATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTGTTTTCAGTGGCTACCAT
TTTTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAACTTGATAAGCTTACTATA
CTGTGTACCTGATGGTAACAATGAACGGGCTAGTAATTGCAAAACATATTATTCAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 40 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 50 60 90 90 90 90 90 90 90 30 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 50 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 80 95 95 97 97 85 97 97 97 97 
97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 0 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 40 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 60 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 40 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 
85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 65 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 
40 55 55 40 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B643TF U 363
AF RR4GK48TF U 4
AF RR4ET53TF U 4
AF RR4EK89TF U 1
AF RR4GB73TF U 22
AF RR4EV28TF U 1
AF RR4FF30TF U 23
AF RR4DK63TF U 25
AF RR4DL69TF U 25
AF RR4BC40JQ C 23
AF RR4GK48JQ C 160
AF RR4ET53JQ C 257
AF RR4BI36TF U 22
AF RR4DK63JQ C 414
AF RR4DL69JQ C 232
AF RR4EK89JQ C 62
AF RR4FF30JQ C 277
AF RR4EV28JQ C 111
BS 1 392 RR4EK89TF
BS 393 393 RR4GK48TF
BS 394 464 RR4EK89TF
BS 465 465 RR4GK48TF
BS 466 568 RR4EK89TF
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BS 570 641 RR4EK89TF
BS 642 688 RR4EV28TF
BS 689 701 RR4FF30TF
BS 702 707 RR4DK63TF
BS 708 716 RR4DL69TF
BS 717 796 RR4BI36TF
BS 797 797 RR4BC40JQ
BS 798 826 RR4BI36TF
BS 827 827 RR4EK89JQ
BS 828 843 RR4BI36TF
BS 844 844 RR4EK89JQ
BS 845 857 RR4BI36TF
BS 858 959 RR4EK89JQ

RD RR4B643TF 116 0 0
ATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATC
CATGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCC

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR4GK48TF 528 0 0
GG
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CAAGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCG
ATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTAT
GTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTC
TGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGATGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTA
CACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGT**AAGGCTCCAAAAAGTGGAATG
TACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCAT
GTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCCGGTGAAT
GTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTG

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR4ET53TF 596 0 0
GG
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CAAGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCG
ATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTAT
GTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTC
TGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTA
CACACTTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATG
TACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCTTCTCCTTCTACATTCAT
GTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAAT
GTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGTAAAAGTATTTG
AAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTG

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR4EK89TF 641 0 0
GGCTCGAGAAACAAACGGAAAATATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGA
GAAGACAAGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGA
GCTCGATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAG
AGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATA
TCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACA
TAGTACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTG
GAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACGCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACA
TCCATGTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACTAGCATCTGGACCCGG
TGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGT
ATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGCCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGA
TATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GB73TF 628 0 0
GG
ATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAAG
ATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGCA
CTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGAT
AACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCC
GGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAACA
TCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCAC
AACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAAC
GAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTG
AGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGT
CACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTAC
ATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR4EV28TF 695 0 0
GGCTC
GAGAAACAAACGGAAAATATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGA
CAAGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCG
ATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTAT
GTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTC
TGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTA
CACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATG
TACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACGCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCAT
GTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACTAGCATCTGGACCCGGTGAAT
GTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTG
AAAGCACGTGATACCCGTCACCGCCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTC
TACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATC
CGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGT
GCATACA

QA 6 688 6 688
DS 

RD RR4FF30TF 686 0 0
TATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAA
GATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGC
ACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGA
TAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCC
CGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAAC
ATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCA
CAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATTCATGTTGGCCATATCCCCAA
CGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCT
GAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCATGTGATACCCG
TCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTA
CATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAG*TTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAA
GTCG*TTGCATACAACAGG
TTTGATA

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DS 

RD RR4DK63TF 689 0 0
GG
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CATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGCACTA
TCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAAC
GTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGT
TTGGATTTCACAGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAACGTCA
GGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAAC
CCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAACGAG
CATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCCGGTGAATGTTAATATAGCTGAGCTGAGA
GAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCAC
CGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATA
TTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCG
*TTGCATACAACAGGGTTTGA
TATATT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR4DL69TF 692 0 0
GG
GATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAAGATC
CATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGCACTA
TCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAAC
GTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGT
TTGGATTTCACAGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAACGTCA
GGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAAC
CCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAACGAG
CATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCCGGTGAATGTTAATATAGCTGAGCTGAGA
GAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCAC
CGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATA
TTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCG
GTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTC

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR4BC40JQ 803 0 0
TATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAA
GATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGC
ACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCATCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGA
TAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCC
CGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAAC
ATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCA
CAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAA
CGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCT
GAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCG
TCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTA
CATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAA
GTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTCAAGGTTCCGTCTCTTTTTT*CTATTA
TGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAA
TAGCTAAGATCCTTTTTTTTGT
C

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4GK48JQ 663 0 0
GCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACT
TCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGA
TGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTG
AGT**AAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTC
CTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTA
AAGACGAGCATCTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGT
CTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATG
AGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAG
CAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACA
GGGTTTGAATATATTTCAAGGTTCTGTCTCTTTTTT*CTATTATGTGTTGAATTGGTGAA
CACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTT
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4ET53JQ 569 0 0
TCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAA
GGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTG
TTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCTTCTCCTTTTACATTCATGTTGGCCATAT
CCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGC
TGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGTAAAAGTATTTGAAAGCACGTGA
TACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTTTACACAGTAGG
AGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTTTTCAGGTTCTTTACATCCGCAAGCTTTT
CAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTCAAGGTTCTGTTTTTTTTTT*
TTATTATGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTA
ATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTGTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4BI36TF 836 0 0
GG
ATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAAG
ATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGCA
CTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAGGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGAT
AACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCC
GGTTTGGATTTCACGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAACA
TCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCAC
AACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCCCCTTCTACATTCATGTTGGCCATATCCCCAAC
GAGCATGACTTAGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTG
AGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGT
CACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTAC
ATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAGGCTCTTCAGCAAG
TCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTCAAGGTTCTGTCTCTTTTTT*CTATTAT
GTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTA*TATAAT
AGCTAAGATCCTTTTTTTTGTTT*CAGTGGCTACCATTTT*ATTGACTTAAGTT

QA 3 836 3 836
DS 

RD RR4DK63JQ 480 0 0
TTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATCTG
GACCCGGTGAATGTTAATATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAG
CAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAG
CGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAG
GTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATAT
TTCAAGGTTCTGTCTCTTTTTT*CTATTATGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACA
AGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTGTTTTCAGTGG
CTACCATTTTTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAACTTGATAAGC
C

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4DL69JQ 662 0 0
ACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACAGTGACGTCTCCTG
CTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAACGTCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTC
CAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCT
CCTTCTACATCCATGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAGCATC
TGGACCCGGTGAATGTTAATATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTG
AGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAA
AGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTC
AGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATAT
ATTTCAAGGTTCTGTCTCTTTTTT*TTATTATGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAA
CAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTGTTTTCAGT
GGCTACCATTTTTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAACTTGATAAG
C
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4EK89JQ 898 0 0
AGAGAC
AGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTGTACTG*TCGGTCTGATACTAT*GAGCTCGAT
CGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGT
CCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTG
GGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAGTACA
CACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTA
CAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACGCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCCATGT
TGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACTAGCATCTGGACCCGGTGAATGT
TAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAA
AGCACGTGATACCCGTCACCGCCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTA
CACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCG
CAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTCAAGGTTCTGTC
TCTTTTTT*CTATTATGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATT
AAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTGTTTTCAGTGGCTACCATTTTTATT
GACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAACTTGATAAGCTTACTATACTGTGTA
CCTGATGGTAACAATGAACGGGCTAGTAATTGCAAAACATATTATTCAGTGC

QA 7 898 7 898
DS 

RD RR4FF30JQ 644 0 0
CGGTGACGTCGC*TGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGT
TTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTA
CTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATTCATGTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAG
CTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGG
AGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCATGTGATACCCGTCACCGTCATACCA
ATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAG
CAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACA
ACAGGGTTTGAATATATTTCAAGGCTCTGTCTCTTTTTTTCTATTATGTGTTGAATTGGT
GAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTT
TTTTTTGTTTTCAGTGGCTACCATTTTTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATAT
GAAGAACTTGATAAGCTTACTATACTGTGTACCTGATGGTAACA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4EV28JQ 849 0 0
ATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGT*AGCGACGATGAA
TGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTC
GACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCT
GCTGGGAACATAGTACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCT
CCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACGCTACTCCTGAAACCGTC
TCCTTCTACATCCATGTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACTAGCAT
CTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCT
GAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGCCATACCAATGAGAGCACGAGA
AAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTT
CAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATA
TATTTCAAGGTTCTGTCTCTTTTTT*CTATTATGTGTTGAATTGGTGAACACAATTATAA
ACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTGTTTTCAG
TGGCTACCATTTTTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAACTTGATAA
GCTTACTATACTGTGTACCTGATGGTAACAATGAACGGGCTAGTAATTGCAAAACATATT
ATTCAGTGC

QA 1 849 1 849
DS 



CO CL3Contig2 889 10 33 U
TAATCCGAGAGGAGATAAGACTGATGAATAAGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTAATG
TTAAAACTTAAGTATAACTGAACGCCAATGAAAGATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTAGCTA
TTAAAGCTCTTAATTAACTACCACACTTGTGTTCATCAGTTCTAACATAACAACCTTGAT
GGAGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCTTG
CGGATGTAGAGAACCTGAAGACCACTTGCTGCTGCTAGGAATATGTACTCTCCTACTGTG
TAGAATATCACCCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCT
TTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTA
ACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTGGCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCA
ACGTGAATGTAGAAGGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTG
TACATTCCACTTCTCGGTGCCTTGAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACGTC
TGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCC
CAGAAGATTTCATGGTCGACGACTACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGTAAAGG
ACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTGACCGTCACAGAGAGCGAGGAGATTCGCTCG
ATCGAACTCAATAGTATCAGGGCAAGCAATAAGAAGACATGGACCGAGTCCTTGCTCGAT
TGTCTGTTCTCCATCTTCTTCCCTTAGATCTTAACTCTCTTCGATCAAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 40 55 40 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 60 45 60 60 
60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 10 60 60 60 60 60 60 60 10 20 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4GI84JQ U 2
AF RR4GC35JQ U 23
AF RR4GI84TF C 1
AF RR4D937JQ U 12
AF RR4GC35TF C 179
AF RR4CY79JQ U 31
AF RR4CY79TF C 32
AF RR4DG02JQ U 43
AF RR4D937TF C 259
AF RR4GJ24TF C 297
BS 1 2 RR4GI84TF
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BS 32 32 RR4GC35JQ
BS 33 100 RR4GI84JQ
BS 101 101 RR4GC35JQ
BS 102 222 RR4GI84JQ
BS 223 223 RR4D937JQ
BS 224 233 RR4GI84JQ
BS 234 234 RR4D937JQ
BS 235 248 RR4GI84JQ
BS 249 249 RR4GC35JQ
BS 250 259 RR4GI84JQ
BS 260 260 RR4GC35JQ
BS 261 302 RR4GI84JQ
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BS 304 312 RR4GI84JQ
BS 313 313 RR4D937JQ
BS 314 413 RR4GI84JQ
BS 414 414 RR4D937JQ
BS 415 441 RR4GI84JQ
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BS 453 556 RR4GI84JQ
BS 557 617 RR4GC35JQ
BS 618 683 RR4D937JQ
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BS 685 685 RR4D937JQ
BS 686 783 RR4CY79JQ
BS 784 788 RR4DG02JQ
BS 789 829 RR4D937TF
BS 830 830 RR4GJ24TF
BS 831 889 RR4D937TF

RD RR4GI84JQ 555 0 0
A
ATCCGAGAGGAGATAAGACTGATGAATAAAAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTAATGTT
AAAACTTAAGTATAACTGAACGCCAATGAAAGATTGTAAAAAAGGGAGTCTTTAGCTATT
AAAGCTCTTAATTAACTACCACACTTGTGTTCATCAGTTCTAACATAACAACCTTGATGG
AGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAAACTTGCTGAAAAGCTTGCG
GATGTAAAGAACCTGAAAACCACTTGCTGCTGCTAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTA
AAATATCACCAGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTT
CAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCCATCTTAAC
ATTCACCGGGTCCAAGTGTGCATCTTTGGATAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAAC
GTGAATGTAGAAGGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTA
CATTCCACTTCTCG

QA 2 555 2 555
DS 

RD RR4GC35JQ 595 0 0
GATGAATAAGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTAATGTTAAAACTTAAGTATAACTGAA
CGCCAATGAAAGATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTAGCTATTAAAGCTCTTAATTAACTACC
ACACTTGTGTTCATCAGTTCTAACATAACAACCTTGATGGAGGGGTTTTGGTTATGGTTC
AAACCCTGTTGTATGCAACAAACTTGCTGAAAAGCTTGCGGATGTAGAGAACCTGAAGAC
CACTTGCTGCTGCTAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACCAGCTTTCTCG
TGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAA
CAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCCATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTG
CATCTTTGGATAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAGGAGACGG
TTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCT
TGAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACGTCTGTACAATGTTCCCAGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4GI84TF 711 0 0
TAATCCGAGAGGAGATAAGACTGATGAATAAGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTAATG
TTAAAACTTAAGTATAACTGAACGCCAATGAAAGATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTAGCTA
TTAAAGCTCTTAATTAACTACCACACTTGTGTTCATCAGTTCTAACATAACAACCTTGAT
GGAGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCTTG
CGGATGTAGAGAACCTGAAGACCACTTGCTGCTGCTAGGAATATGTACTCTCCTACTGTG
TAGAATATCACCAGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCT
TTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCCATCTTA
ACATTCACCGGGTCCAAGTGTGCATCTTTGGATAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCA
ACGTGAATGTAGAAGGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTG
TACATTCCACTTCTCGGTGCCTTGAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACGTC
TGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCC
CAGAAGATTTCATGGTCGACGACTACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCC
C

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4D937JQ 674 0 0
GAGATAAGACTGATGAATAAGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTAATGTTAAAACTTAA
GTATAACTGAACGCCAATGAAAGATTGTATAAAAGGGAGTCTTTAGCTATTAAATCTCTT
AATTAACTACCACACTTGTGTTCATCAGTTCTAACATAACAACCTTGATGGAGGGGTTTT
GGTTACGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCAGAAGAGCTTGCGGATGTAAAG
AACCTGAAGACCACTAGCTGCTGCTAGGAATATGTATTCTCCTACTGTGTAGAATATCAC
CCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTT
TTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGG
GTCCAAGTGTTCGTCTTTGGCCAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTA
GAAAGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGGTTGTGGAAACAGAACTTGTACATTCCACT
TCTCGGTGCCTTAAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACGTCTGTACAATGTT
CCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTC
ATGGTCGACGACGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GC35TF 533 0 0
ATGGAGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCT
TGCGGATGTAGAGAACCTGAAGACCACTTGCTGCTGCTAGGAATATGTACTCTCCTACTG
TGTAGAATATCACCAGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTG
CTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCCATCT
TAACATTCACCGGGTCCAAGTGTGCATCTTTGGATAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGAC
CAACGTGAATGTAGAAGGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACT
TGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTGAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACG
TCTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATC
CCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACTACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCC
C

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4CY79JQ 753 0 0
AGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTAATGTTAAAACTTAAGTATAACTGAACGCCAATG
AAAGATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTAGCTATTAAAGCTCTTAATTAACTACCACACTTGT
GTTCATCAGTTCTAACATAACAACCTTGATGGAGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTG
TTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATGTAGAGAACCTGAAGACCACTTGCT
GCTGCTAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACCCGCTTTCTCGTGCTCTCA
TTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGAC
TCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTG
GCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAGGAGACGGTTTCAGGA
GTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTGAACTCA
AACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACGTCTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACC
GTGAAATCCAAAACGGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACTACGAAG
TTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTG
ACCGTCACAGAGAGCGAGGAGATTCGCTCGATC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4CY79TF 752 0 0
TAGATAT
AGCTTTTATCAAGT*CTTAATGT**AAACTTAAGTATAACTGAACGCCAATGAAAGAT*G
TAGAAAAGGGAGTCTTTAGCTATTAAAGCTCTTAATTAACTACCACACTTGTGTTCATCA
GTTCTAACATAACAACCTTGATGGAGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTGTTGTATGC
AACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATGTAGAGAACCTGAAGACCACTTGCTGCTGCTAG
GAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACCCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATG
ACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGA
TTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTGGCTAAGTC
ATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAGGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTA
AGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTGAACTCAAACTTATC
TCCTGATGTCCCCTTCAACGTCTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATC
CAAAACGGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACTACGAAGTTACCGGA
GACGGTGTCTCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTGACCGTCAC
AGAGAGCGAGGAGATTCGCTCGATC

QA 8 752 8 752
DS 

RD RR4DG02JQ 746 0 0
TTTATCAAGTTCTTAATGTTAAAACTTAAGTATAACTGAACGCCGATGAAAGATTGTATA
AAAGGGAGTCTTTAGCTATTAAATCTCTTAATTAACTACCACACTTGTGTTCATCAGTTC
TAACATAACAACCTTGATGGAGGGGTTTTGGTTATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACA
GACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATGTAAAGAACCTGAAGAACACTAGCTGCTGCTAGGAAT
ATGTATTCTCCTACTTTGTAGAATATCACCCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGG
TGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCT
CTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCGTCTTTGGCCAAGTCATGC
TCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGG
TTGTGGAAACAGAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTAAACTCAAACTTATCTCCT
GATGTCCCCTTCAACGTCTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAA
CCAGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACGACGAAGTTACCGGAGACG
GTGTCTCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTAACCGTCACCGAG
AGCGAGGAGATTCGCTCGATCGAACT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4D937TF 631 0 0
AGACCACTAGCTGCTGCTAGGAATATGTATTCTCCTACTGTGTAGAATATCACCCGCTTT
CTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCA
GCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAG
TGTTCGTCTTTGGCCAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAG
ACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGGTTGTGGAAACAGAACTTGTACATTCCACTTCTCGGT
GCCTTAAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAACGTCTGTACAATGTTCCCAGCA
GGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTCATGGTCG
ACGACGACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCCCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCAT
TCTTCGTCGCTAACCGTCACCGAGAGCGAGGAGATTCGCTCGATCGAACTCAATAGTATC
AGGGCAAGCAATAAGAAGACATGGACCGAGTTCTTGCTCGATTGTCTGTTCTCCATCTTC
TTCCCTTAGATCTTAACTCTCTTCGATCAAA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4GJ24TF 592 0 0
TGTGTGGAATATCACCCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACG
TGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGCTTTTCTCAGCTCAGCTAT
CTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCGTCTTTGGCTATGTCATGCTCGTTGGGGATATG
ACCAACGTGAATGTAGAAGGGGACGGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAGAA
CTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTAAACTCAAACTTATCTCCTGATGTCCCCTTCAA
CGTCTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGA
TCCCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACTACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGTA
AAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTGACCGTCACAGAGAGCGACGAGATTCG
CTCGATCGAACTCAATAGTATCAGGGCAAGCAATAAGAAGACATGGACCGAGTCCTTGCT
CGATTGTCTGTTCTCCATCTTCTTCCCTTAGATCTTAACTCTCTTCGATC
CC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 2 27

CO CL4Contig1 695 6 27 U
GGAAGAACAACCCTTATTTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTA
ACTGGTTTGGTACATTAAACATCACAT*AATAGAAACAAGAGAATAAAAAAGATTTTAAA
AACGAGCGGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCT
CTGGCTTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAA
TGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCAGTTTGAAGAAGCTCGT
CATCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCCCAGCTC
TGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAA
CCAGAATGTTCCCATTTCCCAGTTTGTTCAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGG
ACCCAACCAAGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCAATTTGGTTCTTCT
GGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTC
CACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACAA
GCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGGTAATGCTC


BQ
10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 0 0 0 0 0 40 0 40 0 40 0 0 0 40 40 10 25 40 40 0 40 0 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4E868JQ U 1
AF RR4H412JQB U 1
AF RR4FS26JQ U -6
AF RR4H412TF C 17
AF RR4GW40TF C 41
AF RR4GW40JQ U 55
BS 1 82 RR4E868JQ
BS 83 83 RR4FS26JQ
BS 84 84 RR4E868JQ
BS 85 86 RR4FS26JQ
BS 87 87 RR4E868JQ
BS 88 88 RR4FS26JQ
BS 89 89 RR4E868JQ
BS 90 90 RR4FS26JQ
BS 91 93 RR4E868JQ
BS 94 94 RR4FS26JQ
BS 95 102 RR4E868JQ
BS 103 103 RR4FS26JQ
BS 104 283 RR4E868JQ
BS 284 284 RR4FS26JQ
BS 285 374 RR4E868JQ
BS 375 455 RR4H412JQB
BS 456 456 RR4FS26JQ
BS 457 502 RR4H412JQB
BS 503 503 RR4FS26JQ
BS 504 526 RR4H412JQB
BS 527 527 RR4FS26JQ
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BS 569 569 RR4FS26JQ
BS 570 571 RR4H412JQB
BS 572 572 RR4FS26JQ
BS 573 679 RR4H412JQB
BS 680 695 RR4GW40JQ

RD RR4E868JQ 374 0 0
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CTGGCTTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAA
TGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCGT
CATCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCCCAGCTC
TGATTATTGTGTAA

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4H412JQB 680 0 0
G
GAAGAACAACCCTTATTTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAA
CTGGTTTGGTACATTAAACATGATTTCAGTAGCAACAAGAGGATAAAAAAGATTTTAAAA
ACGAGCGGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTC
TGGCTTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAAT
GCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCGTC
ATCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCCCAGCTCT
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CAGAATGTTCCCATTTCCCAGTTTGTTCAGAGGAAGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGA
CCCAACCAAGACAATATGCTTCACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTG
GCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTACTGTCCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCC
ACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACAAG
CGCATCGATCCCTTGAAC
C

QA 2 679 2 679
DS 

RD RR4FS26JQ 682 0 0
CGAATTTAGAAA
AACAACCCTTATTTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAACTGG
TTTGGTACATTACACATCCCA**AATGGATTCAA*AGAAAATAAAAGATTTTAAAAACGA
GCGGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGC
TTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAA
ACTTCAGCAACATCAGCCCCGGGGACGGTTTTAGTGTCAGTTTGAAAAAGCTCGTCATCT
TTACCAACTAGGAGCTCTAGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCCCAGCTCTGATT
ATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGA
ATGTTCCCATTTCCCAGTTTGTTCAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCA
ACCAAGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCAATTTGGTTCTTCTGGCCA
ATCCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAGCATGAACTCAGGTCTTCCACCT
TTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACAAGCGCA
TCGATCCCTT

QA 13 682 13 682
DS 

RD RR4H412TF 664 0 0
TTTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAACTGGTTTGGTACATT
AAACATGATTTCAGTAGCAACAAGAGGATAAAAAAGATTTTAAAAACGAGCGGTGACTTG
AGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAG
ATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAGACTTCAGCAAC
ATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCGTCATCTTTACCAACTAG
GAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGG
AGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTCCCATT
TCCCAGTTTGTTCAGAGGAAGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAAT
ATGCTTCACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAAC
CTGTTCAGGGTACTGTCCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATC
AAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACAAGCGCATCGATCCCTTG
AAC
C

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4GW40TF 655 0 0
ACCCG
GGATATTTTATTTTAACTGGTTTGGTACATTACACATCCCA**AATGGATTCA*GAGAAG
ATAAAAGATTTTAAAAACGAGCGGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAG
GAGAACTCGTTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGA
ACAGCAATGCCTGAATGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCAG
TTTGAAGAAGCTCGTCATCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTA
GAAGTCCCCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAG
CTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTCCCATTTCCCAGTTTGTTCAGAGGATGATCCGGAT
TTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCAT
CAATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAACA
TGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGC
TAGTGAGAATCACAAGCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGGTAATGCT
C

QA 6 654 6 654
DS 

RD RR4GW40JQ 641 0 0
ATTTTAACTGGTTTGGTACATTACACATCCCA**AATGGATTCA*GAGAAGATAAAAGAT
TTTAAAAACGAGCGGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCG
TTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATG
CCTGAATGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCAGTTTGAAGAA
GCTCGTCATCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCC
CAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCT
TCCAAACCAAAATGTTCCCATTTCCCAGTTTGTTCAAAGGATGATCCGGATTTGTTCCAC
CCATGGACCCAACCAAGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCAATTTGGT
TCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAG
GTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAA
TCACAAGCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGGTAATGCTC

QA 1 641 1 641
DS 



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GGAAACGCTCTTTAATGGGCTTCGGAGTAAGTCAATTTGGTTGAGTGAGAGTCTTGAGAA
AATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAACCCTCCCACCGTTCTCGT
TACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGA
CAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGA
AGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGG
GATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCC
CACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGA
TTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGT
CTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGG
GAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTA
CACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGT
TGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGC
TGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTCGAGGAAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGG
CTCAAAGCCAGAGGGAACGAGTTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAGT
CACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCATTTGGGATGTAATGTACCAAA
CCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTACACTATGAGTAGAATCAATAAAAATAAGGGTTGTT
CTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 30 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
55 80 80 80 80 80 80 80 65 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 50 85 85 85 85 70 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 20 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
75 90 90 90 75 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 60 95 95 
95 95 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 75 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 80 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 90 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 75 75 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 

AF RR4BM39TF U 105
AF RR4DD61TF U 41
AF RR4E868TF U 1
AF RR4EB36TF U 64
AF RR4DZ04TF U 12
AF RR4EM13TF U 41
AF RR4A273TF U 32
AF RR4EI08TF U 137
AF RR4FS26TF U 65
AF RR4A273TFB U 32
AF RR4CA77TF U 39
AF RR4BN56TF U 41
AF RR4AP79TF U 32
AF RR4A273JQ C 108
AF RR4A273JQD C 253
AF RR4AP79JQ C 190
AF RR4DZ04JQ C 382
AF RR4BM39JQ C 393
AF RR4DD61JQ C 348
AF RR4EI08JQ C 382
AF RR4BN56JQ C 387
BS 1 104 RR4E868TF
BS 105 105 RR4DZ04TF
BS 106 225 RR4E868TF
BS 226 226 RR4DZ04TF
BS 227 231 RR4E868TF
BS 232 232 RR4DZ04TF
BS 233 261 RR4E868TF
BS 262 262 RR4EB36TF
BS 263 357 RR4E868TF
BS 358 358 RR4DZ04TF
BS 359 363 RR4E868TF
BS 364 364 RR4DZ04TF
BS 365 387 RR4E868TF
BS 388 388 RR4DZ04TF
BS 389 520 RR4E868TF
BS 521 521 RR4DZ04TF
BS 522 546 RR4E868TF
BS 547 547 RR4DZ04TF
BS 548 597 RR4E868TF
BS 598 598 RR4DZ04TF
BS 599 636 RR4E868TF
BS 637 732 RR4A273TF
BS 733 735 RR4A273TFB
BS 736 736 RR4AP79TF
BS 737 748 RR4A273TFB
BS 749 749 RR4CA77TF
BS 750 818 RR4A273TFB
BS 819 928 RR4A273JQ
BS 929 964 RR4DD61JQ
BS 965 965 RR4BN56JQ

RD RR4BM39TF 407 0 0
CTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGC
TGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAAGGAAAG
ACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTA
CCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGA
AACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGATAGT
ACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTG
GTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCG

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR4DD61TF 516 0 0
GG
GAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAA
CCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAA
GCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAA
AGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCAT
TACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAAT
GAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACA
GTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGC
TGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTT
GAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGG

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR4E868TF 636 0 0
GGAAACGCTCTTTAATGGGCTTCGGAGTAAGTCAATTTGGTTGAGTGAGAGTCTTGAGAA
AATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAACCTTCCCACCGTTCTCGT
TACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGA
CAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGAGAAGATTGGAGGAGA
AGCTGATGTTTTCATTGGTGACATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGG
GATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGATCC
CACCAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATGTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGA
TTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGT
CTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTCTGAACAAACTGGGAAATGG
GAACATTCTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCTTA
CACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4EB36TF 571 0 0
G
ATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAACCTTCCCACCGTTCTCGTTACC
GGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAG
TTTGTGGCGAAGGGTCTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGAGAAGATTGGAGGAGAAGCT
GATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATC
GACGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTCTGATCCCACC
AAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATGTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGG
ATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCCTG
GTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTCCGAACAAACTGGGAAATGGGAAC
ATTCTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCTTACACA
ATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAA

QA 2 571 2 571
DS 

RD RR4DZ04TF 623 0 0
GG
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ATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAACCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGT
GGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCG
AAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTC
ATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTT
GTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGA
AGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAG
AAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCC
ATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTT
TGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGA
GCTGGGGGACTTCTAGACAAA

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR4EM13TF 593 0 0
GG
GAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAA
CCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAA
GCTGAAGGAGAGGTCAGATAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAA
AGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCAT
TACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAAT
GAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACA
GTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGC
TGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTT
GAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGC
TGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAA

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR4A273TF 701 0 0
GG
AATTTGGTTGAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTC
AATGGTGAACCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGT
GTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCC
TGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGAT*TTTTCATTGGTGATATAAGGGATGC
TGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGT
CCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGA
TGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGC
CAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGA
TCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACA
GTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAA
AGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACAC
TAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCAT

QA 3 701 3 701
DS 

RD RR4EI08TF 594 0 0
G
GAACAGTCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGGGGCGAAGG
GTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTG
GTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGA
TTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGAC
CTGAGTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGA
ACCGAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGG
GTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACGTACTGGTTTGGA
AGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTG
GGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGC
TTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGC

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR4FS26TF 670 0 0
GGATAGAGAGCAT
AGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAACCTTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCA
GAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGG
GTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGACAAGATTGGAGTAGAAGCTGATGTTTTCATTG
GTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGA
TTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGATCCCACCAAAGGTGGAAGAC
CTGAGTTCATGCTCGATGATGGTCAATACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGA
ACCAAATTGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTTAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGG
GTGGAACAAATCCGGATCATCCTCTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATTCTGGTTTGGA
AGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCTTACACAATAATCAGAGCTG
GGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACTAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGC
TTCTTCAAACTGACACTAAAACCGTCCCCGGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTC

QA 14 670 14 670
DS 

RD RR4A273TFB 787 0 0
GG
AATTTGGTTGAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTC
AATGGTGAACCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGT
GTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCC
TGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGAT*TTTTCATTGGTGATATAAGGGATGC
TGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGT
CCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGA
TGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGC
CAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGA
TCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACA
GTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAA
AGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACAC
TAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCACGCATTGCTGTTCTAGGA
AGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAGTTCTCCTACTAA
AGACT

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR4CA77TF 775 0 0
GGG
TGAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGA
ACCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGA
AGCTGAAGGAGAGGTCAGATAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGA
AAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCA
TTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAA
TGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGAC
AGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTG
CTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTT
TGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTG
CTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAG
GTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCG
TCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCACGCATTGCTGTTCGAGGAAGCAAAGA
ATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAGT
CTCTACTAAAG

QA 4 764 4 764
DS 

RD RR4BN56TF 744 0 0
GG
GAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATATAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCGAA
CCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAA
GCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAGGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAA
AGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCAT
TACCCCTGCTGTTCAAGGTATCAATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCTCCAAAAT
GAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACA
GTACCCTAAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGC
TGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTT
GAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGC
TGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAG*AGG
TGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGT
CCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCACGCATTGCTGTTCGAGGAAGCAAG**A
TAAAGCTTTTGATCTGGGCTCA

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR4AP79TF 757 0 0
GG
AATTTGGTTGAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCCAGAGAGTTTCTTCTTC
AATGGTGAACCCTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGT
GTACAAGAAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCC
TGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGAT*TTTTCATTGGTGATATAAGGGATGC
TGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGT
CCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGA
TGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGC
CAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGA
TCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACA
GTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAA
AGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACAC
TAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTCTAGGA
AGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGC

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR4A273JQ 822 0 0
CCACCGTTCTCGTTACCGGCGCTAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAGAAGCTGA
AGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGACA
AGATCGGAGGAGAAGCTGAT*TTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCC
CTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAAC
CTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACAGTACC
CTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTG
TGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACA
AACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATT
CTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCAC
GAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCA
GGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTTTAGGAAGCAAAGAATAAAG
CTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAGTTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTC
TCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCATTTGGGAT
GTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTACAC
C

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4A273JQD 677 0 0
CATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCT
TGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGGTGG
AAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCA
GAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTC
CATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGT
TTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAG
AGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGA
CGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCAT
TCAGGCATTGCTGTTCTAGGAAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGA
GGGAACGAGTTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTT
TTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCATTTGGGATGTAATGTACCAAACCAGTTAAAATA
AAATATCCGGGTACAC
C

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AP79JQ 740 0 0
GGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGGAAAGACAAGATCGGAGGAGAAGCTGAT*T
TTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGCATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGC
GCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAAATGAAACCTGGTTTTGACCCCACTAAAGG
TGGAAGACCTGAGTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGG
CCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGG
GTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACT
GGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAAT
CAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGA
TGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTG
CATTCAGGCATTGCTGTTCTAGGAAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCC
AGAGGGAACGAGTTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCG
TTTTTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCATTTGGGATGTAATGTACCAAACCAGTTAAA
ATAAAATATCCGGGTACAC
C

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4DZ04JQ 536 0 0
GTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCA
AATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGG
AACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAG
GAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGG
ACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCT
TCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATT
GCTGTTCGAGGAAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAG
TTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCT
TTTATCGCTACTGAATCATTTGGTATGTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAAATA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4BM39JQ 558 0 0
ATGATGGATAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTG
CCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGG
ATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAAC
AGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACA
AAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTTTTCAAACAGACA
CTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGTTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTCGAGG
AAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAGTTCTCCTACTA
AAGACTTTAAGGCCCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTATCGCTAC
TGAATCATTTGGGATGTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTACACTATG
AGTAGAATCAATAAAAAT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4DD61JQ 618 0 0
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CTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTG
TGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTTTGAACA
AACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATT
CTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCAC
GAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCA
GGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTCGAGGAAGCAAAGAATAAAG
CTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAGTTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTC
TCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCATTTGGGAT
GTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTACACTATGAGTAGAATCAATAAA
AATAAGGGTTGTTCTTC
T

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4EI08JQ 584 0 0
GTTCATCTTCGATGATGGACAGTACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCG
AATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGG
AACAAATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACGTACTGGTTTGGAAGAG
GAAAGCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGG
ACTTCTAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCT
TCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATT
GCTGTTCGAGGAAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAG
TTCTCCTACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCT
TTTATCGCTACTGAATCATTTGGGATGTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAA*TATCCG
GGTACACTATGAGTAGAATCAATAAAAATAGGGGTTGTTCTTC
C

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4BN56JQ 579 0 0
TCTTCGATGATGGACAGTACCCTAAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAG
ATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAA
ATCCGGATCATCCTTTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATACTGGTTTGGAAGAGGAAAG
CTGAACAGTACCTTGCTGATTTTGGAACTCCGTACACAATAATCAGAGCTGGGGGACTTC
TAGACAAAGAAGGAGGTGCACGAGAGCTCCTAGTTGGTAAAGATGACGAGCTTTTTCAAA
CAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGT
TCGAGGAAGCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACGAGTTTTC
CTACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTAT
CGCTACTGAATCATTTGGGATGTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTAC
ACTATGAGTAGAATCAATAAAAATAAGGGTTGTTCTTCT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 5 27

CO CL5Contig1 650 6 27 U
TTTTGGCAGAAATTGTTGCTCAAATTAACAAAAAGTATTCAACTTCGAAA*CTCTTTCAC
AAAATTCAAAAAAAAAAAAAACATTGGTCTGACAAACTGAAACAAATGAGCCAAAATAAA
CTCAGAGCCTCCTTCCTCTTCTACCACCCTTTCTGCGAGTACTGTCCGTTGGGATCGGAG
TAACATCCTCAATGCGGCCAATCTTCATGCCA**ACGGGCAAGAGCTCTAAGAGCGGACT
GAGCACCAGGACCAGGTGTCTTGGTCTTGTTTCCACCCGTGGCACGGAGCTTAACGTGCA
TAGCGGTGATTCCAAGCTCCTTGCAACGCTGAGCAACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCTG
CGTAAGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATTCCACCAGTGATACGGACAA
GGGTTTCACGTCCAGACAAATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCGTTAAAGGAAGCGAAGA
TGTGGACAACACCGAAGACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGTCCAAGAGTCACTGTCT
CTTCCTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTTTTAGGGCAAGCAAAGGATGTGAGA
GATCGTCTTCTTCCTGTAGTTCCGCCGACGCAGAGATTTGGCAAGAGGCC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4D407JQ U 27
AF RR4A135TF C 5
AF RR4A135TFB C 1
AF RR4D407TF C 32
AF RR4A135JQ U 5
AF RR4A135JQD U 5
BS 1 4 RR4A135TFB
BS 5 26 RR4A135JQ
BS 27 80 RR4D407JQ
BS 81 81 RR4A135JQ
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BS 530 626 RR4A135JQ
BS 627 650 RR4A135TFB

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CGCTGAGCAACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCTGCGTAA

QA 1 339 1 339
DS 

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QA 1 585 1 585
DS 

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AAAATTCAAAAAAAAAAAAAACATTGGTCTGACAAACTGAAACAAATGAGCCAAAATAAA
CTCAGAGCCTCCTTCCTCTTCTACCACCCTTTCTGCGAGTACTGTCCGTTGGGATCGGAG
TAACATCCTCAATGCGGCCAATCTTCATGCCA**ACGGGCAAGAGCTCTAAGAGCGGACT
GAGCACCAGGACCAGGTGTCTTGGTCTTGTTTCCACCCGTGGCACGGAGCTTAACGTGCA
TAGCGGTGATTCCAAGCTCCTTGCAACGCTGAGCAACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCTG
CGTAAGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATTCCACCAGTGATACGGACAA
GGGTTTCACGTCCAGACAAATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCGTTAAAGGAAGCGAAGA
TGTGGACAACACCGAAGACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGTCCAAGAGTCACTGTCT
CTTCCTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTTTTAGGGCAAGCAAAGGATGTGAGA
GATCGTCTTCTTCCTGTAGTTCCGCCGACGCAGAGATTTGGCAAGAGGCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4D407TF 619 0 0
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TCTGCGAGTACTGTCCGTTGGGATCGGAGTAACATCCTCAATGCGGCCAATCTTCATGCC
AGAACGGGCAAGAGCTCTAAGAGCGGACTGAGCACCAGGACCAGGTGTCTTGGTCTTGTT
TCCACCCGTGGCACGGAGCTTAACGTGCATAGCGGTGATTCCAAGCTCCTTGCAACGCTG
AGCAACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCTGCGTAAGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTT
CACCTTCATTCCACCAGTGATACGGACAAGGGTTTCACGTCCAGACAAATCAGTAACGTG
AATGAAAGTGTCGTTAAAGGAAGCGAAGATGTGGACAACACCGAAGACTTGCTCTCCATC
ACGAACAGCTGGTCCAAGAGTCACTGTCTCTTCCTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGA
CATTTTTAGGGCAAGCAAAGGATGTGAGAGATCGTCTTCTTCCTGTAGTTCCGCCGACGC
AGAGATTTGGCAAGAGG
CC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4A135JQ 622 0 0
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TTCAAAAAAAAAAAAAACATTGGTCTGACAAACTGAAACAAATGAGCCAAAATAAACTCA
AAGCCTCCTTCCTCTTCTACCACCCTTTCTGCGAGTACTGTCCGTTGGGATCGGAGTAAC
ATCCTCAATGCGGCCAATCTTCATGCCA**ACGGGCAAGAGCTCTAAAAGCGGACTGAGC
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GGTGATTCCAAGCTCCTTGCAACGCTGAACAACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCTGCGTA
AGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATTCCACCAGTGATACGGACAAGGGT
TTCACGTCCAGACAAATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCGTTAAAGGAAGCGAAAATGTG
GACAACACCGAAAACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGTCCAAAAGTCACTGTCTCTTC
CTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTTTTAGGGCAAGCAAAGGATGTGAGAGATC
GTCTTCTTCCTGTAGTTCCGCC

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DS 

RD RR4A135JQD 622 0 0
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GAGCCTCCTTCCTCTTCTACCACCCTTTCTGCGAGTACTGTCCGTTGGGATCGGAGTAAC
ATCCTCAATGCGGCCAATCTTCATGCCA**ACGGGCAAGAGCTCTAAGAGCGGACTGAGC
ACCAGGACCAGGTGTCTTGGTCTTGTTTCCACCCGTGGCACGGAGCTTAACGTGCATAGC
GGTGATTCCAAGCTCCTTGCAACGCTGAGCAACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCTGCGTA
AGGGGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATTCCACCAGTGATACGGACAAGGGT
TTCACGTCCAGACAAATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCGTTAAAGGAAGCGAAAATGTG
GACAACACCGAAAACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGTCCAAGAGTCACTGTCTCTTC
CTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTTTTAGGGCAAGCAAAGGATGTGAGAGATC
GTCTTCTTCCTGTAGTTCCGCC

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL5Contig2 717 4 23 U
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TGATCGATCTTAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAGGAGACAGTGACA
CTTGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCC
TTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGTATC
ACTGGTGGGATTAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTT
GCTGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACTGGTGGAAACAAGACCAAGACTCCTGGTCCCGGTGCTCAGTCCGCTCTT
AGAGCTCTTGCCCGATCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCT
ACGGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTT
CATTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCGTTTG
TTTCATTTTGTCAGAACAATGTTTATTGTGAACGAGGTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTGT
TAAATTTGAACAACATTTATCTACTACTAGTATTGACCCCATGCCATGCATGGGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DI53TF U 21
AF RR4AR30JQ C 1
AF RR4A605TF U 386
AF RR4AR30TF U 1
BS 1 386 RR4AR30TF
BS 387 392 RR4A605TF
BS 393 393 RR4AR30TF
BS 394 395 RR4A605TF
BS 396 396 RR4AR30TF
BS 397 434 RR4A605TF
BS 435 435 RR4AR30TF
BS 436 437 RR4A605TF
BS 438 438 RR4AR30TF
BS 439 479 RR4A605TF
BS 480 480 RR4AR30TF
BS 481 506 RR4A605TF
BS 507 507 RR4AR30TF
BS 508 541 RR4A605TF
BS 542 542 RR4AR30TF
BS 543 621 RR4A605TF
BS 622 622 RR4AR30TF
BS 623 624 RR4A605TF
BS 625 625 RR4AR30TF
BS 626 666 RR4A605TF
BS 667 667 RR4AR30TF
BS 668 682 RR4A605TF
BS 683 717 RR4AR30TF

RD RR4DI53TF 639 0 0
GG
AAGCCGGAAACTACAGAAGGAAGAAGTGACCTTTGCTGTGATCGATCTTAACAATGTCGA
GGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAGGAGACAGTGACACTTGGACCAGCTGTTCGTGATG
GAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACG
TTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAAG
CTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCACAAGATGTTGCTCAGC
GATGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGTGGAAACA
AGACCAAGACTCCTGGTCCCGGTGCTCAGTCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGATCCGGCA
TGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAACGGACAGTACCCGCAGAAAGG
GTGGTAGAAGAGGAAGGAGGTTCTGAACAATTGTGTTCCATTTTGTCAGAACAATGTTTG
TTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCGTTTGTTTCATTTTGTCAGA*CAATGT
TTATTGTGAACGAGGTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTG

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4AR30JQ 717 0 0
GGATCCTCTTCTTCCTCTACCCAAGCCGGAAACTACAGAAGGAAGAAGTGACCTTTGCTG
TGATCGATCTTAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAGGAGACAGTGACA
CTTGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCC
TTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGTATC
ACTGGTGGGATTAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTT
GCTGCACAAGATGTTGTTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACTGGTGGAAACAAGACCAAGACTCCTGGTCCCGGTGCTCAGTCCGCTCTT
AGAGCTCTTGCCCGATCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCT
ACGGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTT
CATTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCGTTTG
TTTCATTTTGTCAGAACAATGTTTATTGTGAACGAGGTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTGT
TAAATTTGAACAACATTTATCTACTACTAGTATTGACCCCATGCCATGCATGGGACC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4A605TF 297 0 0
G
CAAGACACCCGGTCCCGGTGCTCAGTCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAA
AATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAACGGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGG
GAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTTCGTTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGA
GTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCGTTTGTTTCATTTTGTCAGAACAATGCTTCT
TGTGAACGAGGTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTGTTAAATTCGAACAACATTTATCT

QA 2 297 2 297
DS 

RD RR4AR30TF 717 0 0
GGATCCTCTTCTTCCTCTACCCAAGCCGGAAACTACAGAAGGAAGAAGTGACCTTTGCTG
TGATCGATCTTAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAGGAGACAGTGACA
CTTGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCC
TTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGTATC
ACTGGTGGGATTAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTT
GCTGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACTGGTGGAAACAAGACCAAGACTCCTGGTCCCGGTGCTCAGTCCGCTCTT
AGAGCTCTTGCCCGATCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCT
ACGGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTT
CATTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCGTTTG
TTTCATTTTGTCAGAACAATGTTTATTGTGAACGAGGTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTGT
TAAATTTGAACAACATTTATCTACTACTAGTATTGACCCCATGCCATGCATGGGACC

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL5Contig3 705 6 3 U
AGGGCTCTCCCTCTTGCCAAATCTCTGCGTCGGCGCAACTACAGGAAGAAGAAAGATCTT
TCACATCCTTTCCTTGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAG
ACAGTGACTCTTGGGCCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTGTTCGGTGTTGTCCACATC
TTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTTATTTGTCTGGACGTGAAACCCTT
GTCCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCA
GCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGTAAGGAGCTTGAAATCACCGCTATG
CACGTGAAGCTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAA
TCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACC
CCGATCCCAACGGACAGTATCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCCCTGAGAT
TTTTTTTTT*GGCTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTGTTTTTTGAATTTTGT
GAAAGAGTTT*CGAAGTTGAATGCTTTTTGTTAATTTGATCAACATTTTCTGCTATGATT
AGTCTGGCTTTTGCTAATGATTACTACTTCAATAGTTATTAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A963JQ C 42
AF RR4DU70JQ C 1
AF RR4A603JQ C 412
AF RR4A603TF U 3
AF RR4A963TF U 173
AF RR4DU70TF U 1
BS 1 9 RR4DU70JQ
BS 10 662 RR4A603TF
BS 663 705 RR4DU70TF

RD RR4A963JQ 382 0 0
CAGGAAGAAGAAAGATCTTTCACATCCTTTCCTTGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGAC
GAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGATTCTTGGGCCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGT
GTTCGGTGTTGTCCACATTTTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTATTTATTT
GTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGA
TGAGTCCTCCCCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGTTCAGCGTTGTAAGGA
GCTTGAAATCACCGCTATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGAC
ACCTGGTCCTGGTGCTCAATCC

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4DU70JQ 705 0 0
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TCACATCCTTTCCTTGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAG
ACAGTGACTCTTGGGCCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTGTTCGGTGTTGTCCACATC
TTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATTTGTCTGGACGTGAAACCCTT
GTCCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCA
GCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGTAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATG
CACGTGAAGCTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAA
TCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACC
CCGATCCCAACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGAT
TTTTTTTTTTGGCTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTGTTTTTTGAATTTTGT
GAAAGAGTTT*CGAAGTTGTATGCTTTTTGTTAATTTGATCAACATTTTCTGCTATGATT
AGTCTGGCTTTTGCTAATGATTACTACTTCAATAGTTATTAGTTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4A603JQ 251 0 0
GGTGCTCAATCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCCCATTGAG
GATGTTACCCCGATCCCAACGGACAGTATCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGG
CCCTGAGATTTTTTTTTT*GGTTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTGTTTTTT
GAATTTTGTGAAAGAGTTT*GGAAGTTGAATGCTTTTTGTTAATTTGATCAACATTTTCT
GCTATGATTAG

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR4A603TF 660 0 0
GGCTCTC
CCTCTTGCCAAATCTCTGCGTCGGCGCAACTACAGGAAGAAGAAAGATCTTTCACATCCT
TTCCTTGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACT
CTTGGGCCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTGTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCC
TTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTTATTTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGTATC
ACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTT
GCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGTAAGGAGCTTGAAATCACCGCTATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAATCCGCTCTT
AGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACCCCGATCCCA
ACGGACAGTATCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCCCTGAGATTTTTTTTTT
*GGCTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTGTTTTTTGAATTTTGTGAAAGAGTT
T*CGAAGTTGAATGCTTTTTGTTAATTTGATCAACATTTTCTGCTATGATTAG

QA 8 660 8 660
DS 

RD RR4A963TF 490 0 0
TCCACATCTTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTTATTTGTCTGGACGTG
AAACCCTTGTCCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCAC
CTTACGCAGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGTAAGGAGCTTGAAATCA
CCGCTATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTG
GTGCTCAATCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGG
ATGTTACCCCGATCCCAACGGACAGTATCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGC
CCTGAGATTTTTTTTTT*GGCTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTGTTTTTTG
AATTTTGTGAAAGAGTTTTCGAAGTTGAATGCTTTTTGTTAATTTGATCAACATTTTCTG
CTATGATTAG

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4DU70TF 705 0 0
AGGGCTCTC
CCTCTTGCCAAATCTCTGCGTCGGCGCAACTACAGGAAGAAGAAAGATCTTTCACATCCT
TTCCTTGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACT
CTTGGGCCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTGTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCC
TTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATTTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGTATC
ACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTT
GCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGTAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAATCCGCTCTT
AGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACCCCGATCCCA
ACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGATTTTTTTTTT
TGGCTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTGTTTTTTGAATTTTGTGAAAGAGTT
T*CGAAGTTGTATGCTTTTTGTTAATTTGATCAACATTTTCTGCTATGATTAGTCTGGCT
TTTGCTAATGATTACTACTTCAATAGTTATTAGTTT

QA 10 705 10 705
DS 



CO CL5Contig4 751 9 4 U
GGCTCTTCCTCTAGCCAAGGCTGAAACTACAGAAGGAAGCAGAGACGTTACTGCGATCTT
AAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCCAAGGAGGAGACAGTGACACTTGGACCAG
CTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCCTTCAACGACA
CTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGCATCACTGGTGGAA
TGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCACAAG
ATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTTAAGCTCCGTGCCA
CGGGTGGGAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTG
CTCGTTCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACGGACAGTA
CCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTTTTTTTGGCTATTCAGCTC
ATGTGTTTCATTTTGTCAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAGGGATTTAAAGTTT
AATGTTTTTTTGTTAATTTGAACAATTTTTTTCTAGTATGGTTAGTATCTATGGCCTTTG
CGAATGACTTGATTAGTTTTACTATTAGTTTCAAAATTCATCGATTCATGTCTTAGATTT
TATTTGGCAATCTGGCTATATATAATTTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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AF RR4EE78JQ C 1
AF RR4EE78TF U 1
AF RR4E859TF U 21
AF RR4E859JQ C 21
AF RR4DB72JQ C 11
AF RR4G462TF U 21
AF RR4G462JQ C 145
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CCG

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DS 

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CCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTTTGAGTTTTTTTTTGCTATTCAGCTC
ATGTGTTTCATTTTGTCAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAGGGATTTAAAGTTT
AATGTTTTTTTGTTAATTTGAACAATTTTTTTCTAGTATGGTTAGTATCTATGGCCTTTG
CGAA
CG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4EE78TF 668 0 0
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AAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCCAAGGAGGAGACAGTGACACTTGGACCAG
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TGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCACAAG
ATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTTAAGCTCCGTGCCA
CGGGTGGGAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTG
CTCGTTCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACGGACAGTA
CCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTTTTTTTTGCTATTCAGCTC
ATGTGTTTCATTTTGTCAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAGGGATTTAAAGTTT
AATGTTTTTTTGTTAATTTGAACAATTTTTTTCTAGTATGGTTAGTATCTATGGCCTTTG
CGAA
CGAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4E859TF 646 0 0
GG
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AA

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DS 

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GG
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DS 

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CAAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAA
AATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTGG
TAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTTTTTT*GGCTATTCAGCTCATGTGTTTCATTTTGT
CAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAGGGATTTAAAGTTTAATGTTTTTTTGTTAA
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TGG

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GG
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ACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAAATTGG
CCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCGACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAG
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DS 

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GCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCGACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTGGTAGAAGAG
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AT

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DS 



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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FN32JQ C 1
AF RR4FN32TF U 1
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BS 3 612 RR4FN32TF

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QA 1 612 1 612
DS 

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GG
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TGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGCATCACTGGTGGAATGAAGGTGAAAGCTGA
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CAAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTTAGAGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAA
AATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAACAGACAGCACCCGCTGAAAGGGTGG
TAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTTTTTTTATTTTTGGCTATTTAGCTCATGTGTTGTT
TCATTTTGTCAGAACAATGTTTTGTCAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAAGGGA
TTTAAAGTTC

QA 3 612 3 612
DS 



AS 4 23

CO CL6Contig1 788 8 7 U
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AAAAAAAAAACACAATTCTCTAACAAAAATCCGATTATGAAAGAGATGAAGAAGCAACAA
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CAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCAGCCATGAACTCGACGAGTCTAGATAGAGAAAG
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CTGGGTTCTCCTCACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACAGTGAGCTTGAGGTAGACATCGTC
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TTTATTCC


BQ
10 10 10 10 30 30 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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20 20 20 20 20 20 

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25 25 25 20 20 10 10 

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AF RR4BY04TF C 98
AF RR4AY47TF C 81
BS 1 779 RR4BU57JQ
BS 780 780 RR4BP01TF
BS 781 788 RR4BY04JQ
BS 789 789 RR4BP01TF
BS 790 798 RR4BY04JQ
BS 799 822 RR4BP01TF
BS 823 823 RR4BU57TF
BS 824 848 RR4BP01TF

RD RR4AY47JQ 130 0 0
TAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCTGTCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAA
AGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTTTCTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCCGTGAACCTC
AAGGCAGTAA

QA 1 130 1 130
DS 

RD RR4BU57JQ 786 0 0
CTGAATAAGACTTCGATATTATTAAAGCTTAAGTATATGTAAGTGCACAAATGAGTAATC
TACTCGCGATGATTCCAGTAGAAAACAAACTTAAATCTATTGTCTGAAACAAGCGATGAG
AAGCAACAATTAACTAACAAAGATCCGGTTACGAATACAGTTTTAATTAAAGAAGCAACA
ACACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGGCAGAGACAAATGTTTCTTAAACCTTGAATC
CACGGCTCTTCCTCTTTCATCCGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATACG
GCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACGGCTTCACGTG
AGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCCGTCCCAAAGGAGCTCTGAGAGAAAGCT
GGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTT*CTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCCGTG
AACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTGATG
GTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGAGCCTGGAT
AGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTG
AACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAG
ACATCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGATCAA
TCAATTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4BP01JQ 630 0 0
GCGATGAGAAGCAACAATTAACTAACAAAGATCCGGTTACGAATACAGTTTTAATTAAAG
AAGCAACAACACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGGCAGAGACAAATGTTTCTTAAAC
CTTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCG
AACATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACGGC
TTCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCTATCCCAAAGGAGCTCTGAG
AGCAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTT*ATCAATCCGAGCTCTGGCTC
TCTCCGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCAT
CGGTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGA
GCCTGGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCA
CTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAGCT
TGAGGTAGACATCGTCCGACTTTGGAGCTG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4BY04JQ 798 0 0
CTG
AATAAGACTTCGATATTATTAAAGCTTAAGTATATGTAAGTGCACAAATGAGTAATCTAC
TCGCGATGATTCCAGTAGAAAACAAACTTAAATCTATTGTCTGAAACAAGCGATGAGAAG
CAACAATTAACTAACAAAGATCCGGTTACGAATACAGTTTTAATTAAAGAAGCAACAACA
CTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGGCAGAGACAAATGTTTCTTAAACCTTGAATCCAC
GGCTCTTCCTCTTTCATCCGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATACGGCT
TGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACGGCTTCACGTGAGT
TCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCCGTCCCAAAGGAGCTCTGAGAGAAAGCTGGT
CAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTT*CTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCCGTGAAC
CTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTGATGGTT
CCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGAGCCTGGATAGA
GAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAAC
TTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAGACA
TCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGATCAA*TCA
ATTCC*ATTGTAGCT

QA 4 798 4 798
DS 

RD RR4BP01TF 821 0 0
GCTT
AGTATATGTAAGTGCACAAATGAGTA*TCTACTCGCGATGAT**CAGTAGAAAACAAACT
TAAATCTAT*GTCTGAAACAAGCGATGAGAAGCAACAATTAACTAACAAAGATCCGGGTA
CGAATACAGTTTTA*TTAAAGAAGCAACAACACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGGC
AGAGACAAATGTTTCTTAAAC*TTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCCTTCTC
GAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGC
AGGGCCAAAATGCTTCACGGCTTCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTT
CTATCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTT
*ATCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCCGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGA
TCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCT
TGCCGGTCATGAACTCGACGAGCCTGGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCA
TGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACC
GGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAGACATCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGG
TCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGATCAAATCAATTCCCATTGTAGCTTCCGGGGATGTGG
TGGTGGTGCCGCCGCCGTCGAAGCTTGCGCAAGACCC

QA 5 821 5 821
DS 

RD RR4BU57TF 560 0 0
GA
CGAACATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACG
GCTTCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCCGTCCCAAAGGAGCTCTG
AGAGAAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTT*CTCAATCCGAGCTCTGGC
TCTCTCCGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATC
ATCGGTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGAC
GAGCCTGGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGAT
CACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAG
CTTGAGGTAGACATCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCC
TGCGATCAAATCAATTCCCATTGTAGCTTCCGGGGATGTGGTGGTGGTGCCGACGCCGTC
GAAGCTTGCGCAAGAC
CC

QA 3 558 3 558
DS 

RD RR4BY04TF 751 0 0
TAT*GTCTGAAACAAGCGATGAGAAGCAACAATTAACTAACAAAGATCCGGGTACGAATA
CAGTTTTAATTAAAGAAGCAACAACACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGGCAGAGAC
AAATGTTTCTTAAACCTTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCATCCGGCCTTCTCGAACTT
CCTTCCCTTGGACCGAACATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCC
AAAATGCTTCACGGCTTCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCCGTCC
CAAAGGAGCTCTGAGAGAAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTT*CTCAA
TCCGAGCTCTGGCTCTCTCCGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGT
GTACCCTCAAATCATCGGTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGG
TCATGAACTCGACGAGCCTGGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAA
GCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAA
GCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAGACATCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCT
TGCTCTTACCTCCTGCGATCAAATCAATTCCCATTGTAGCTTCCGGGGATGTGGTGGTGG
TGCCGACGCCGTCGAAGCTTGCGCAAGAC
CC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AY47TF 766 0 0
GAAAACAAACTTAAATCTATTGTCTGAAACAAGCGATGAGAAGCAACAATTAACTAACAA
AGATCCGGTTACGAATACAGTTTTAATTAAAGAAGCAACAAAACTCGAGAATCAAGTTCG
AAGACGCAGGCAGAGACAAATGTTTCTTAAACCTTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCT
CTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGC
ACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACGGCTTCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGA
AGAACAGTGTTCTGTCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCA
CCACCAGCTTT*CTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCCGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTT
GATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAAT
CTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTTGACGAGCCTGGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTT
GACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCT
TACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGGGGTAGACATCGTCCGACTTTGGAGC
TGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGATCAAATCAATTCCCATTGTAGCTCC
CGGGGATGTGGTGGTGGTGCCGCCGCCGTCGAAGCTTGCGCAAG
CC

QA 1 764 1 764
DS 



CO CL6Contig3 725 3 2 U
GGAGGAAGCTTCGACCGCGGCGGCACGATGGGAATTGATTTGATCGCAGGTGGTAAGAGC
AAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCCAAGTCCGACGATGTCTACCTCAAGCTT*CCGTCAAG
CTTTACAGGTTTTTGGTGAGGAGAACACAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGAGG
CTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTTTCCAGGCTCGTCGAATTCATG
ACCGGCAAGGAAGACAAGATTGCTGTTTTGGTTGGAACCATAACCGATGATTTGAGGGTA
CACGAGATCCCAGCTATCAAGGTTACTGCCTTGAGGTTCACTGAGAGAGCCAGAGCTCTC
ATTGATAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACCTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTTTG
GGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAAGCTGTGAAGCACTTT
GGCCCTGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCGTATGTTCGGTCCAAGGGAAGG
AAATTCGAGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGGTTTAAGGACCATTG
TCACCGTCTTTGACTTGCTTCTCGACTTTTGTTATAGAATCTTGGTTTTTTTTTGTGTTT
GCCTGTTTCAGACAATATTTTAAGTTTGTTTCGACTTTGATTAACTGTGTTATTATTGCA
CGTTA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 

AF RR4CG48TF U 1
AF RR4DH75JQ C 1
AF RR4DH75TF U 1
BS 1 4 RR4DH75JQ
BS 5 725 RR4DH75TF

RD RR4CG48TF 581 0 0
GGAGGAG
GCTTCGACCGCGGCGGCACGATGGGAATTGATTTGATCGCAGGTGGTAAGAGCAAGAAGA
CCAAAAGGACAGCTCCCAAGTCCGACGATGTCTACCTCAAGCTTACCGTCAAGCTTTACA
GGTTTTTGGTGAGGAGAACACAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGAGGCTTTTCA
TGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTTTCCAGGCTCGTCGAATTCATGACCGGCA
AGGAAGACAAGATTGCTGTTTTGGTTGGAACCATAACCGATGATTTGGGGGTACACGAGA
TCCCAGCTATCAAGGTTACTGCCTTGAGGTTCACTGAGAGAGCCAGAGCTCGCATTGA*A
AGGCTGGTGGTGAATGCTTAACCTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTTTGGGACAGA
ACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAAGCTGTGAAGCACTTTGGCCCTG
CTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCGTATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAAATTCA
AGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATT

QA 8 581 8 581
DS 

RD RR4DH75JQ 724 0 0
GGAGGAAGCTTCGACCGCGGCGGCACGATGGGAATTGATTTGATCGCAGGTGGTAAGAGC
AAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCCAAGTCCGACGATGTCTACCTCAAGCTT*CCGTCAAG
CTTTACAGGTTTTTGGTGAGGAGAACACAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGAGG
CTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTTTCCAGGCTCGTCGAATTCATG
ACCGGCAAGGAAGACAAGATTGCTGTTTTGGTTGGAACCATAACCGATGATTTGAGGGTA
CACGAGATCCCAGCTATCAAGGTTACTGCCTTGAGGTTCACTGAGAGAGCCAGAGCTCTC
ATTGATAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACCTTTGACCAGCTTGCTTTCAGAGCTCCTTTG
GGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAAGCTGTGAAGCACTTT
GGCCCTGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCGTATGTTCGGTCCAAGGGAAGG
AAATTCGAGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGGTTTAAGGACCATTG
TCACCGTCTTTGACTTGCTTCTCGACTTTTGTTATAGAATCTTGGTTTTTTTTTGTGTTT
GCCTGTTTCAGACAATATTTTAAGTTTGTTTCGACTTTGATTAACTGTGTTATTATTGCA
CGTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4DH75TF 725 0 0
GGAG
GAAGCTTCGACCGCGGCGGCACGATGGGAATTGATTTGATCGCAGGTGGTAAGAGCAAGA
AGACCAAAAGGACAGCTCCCAAGTCCGACGATGTCTACCTCAAGCTT*CCGTCAAGCTTT
ACAGGTTTTTGGTGAGGAGAACACAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGAGGCTTT
TCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTTTCCAGGCTCGTCGAATTCATGACCG
GCAAGGAAGACAAGATTGCTGTTTTGGTTGGAACCATAACCGATGATTTGAGGGTACACG
AGATCCCAGCTATCAAGGTTACTGCCTTGAGGTTCACTGAGAGAGCCAGAGCTCTCATTG
ATAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACCTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTTTGGGAC
AGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAAGCTGTGAAGCACTTTGGCC
CTGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCGTATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAAAT
TCGAGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGGTTTAAGGACCATTGTCAC
CGTCTTTGACTTGCTTCTCGACTTTTGTTATAGAATCTTGGTTTTTTTTTGTGTTTGCCT
GTTTCAGACAATATTTTAAGTTTGTTTCGACTTTGATTAACTGTGTTATTATTGCACGTT
A

QA 5 725 5 725
DS 



CO CL6Contig4 802 4 8 U
GATTATGAATAAGACTTTCATATTATAAAAGCTTAAATGTATGTAAGTGCACACAAATGA
GTAATCAACTCACGATGATTCCAGTAGAAAACAAACTTAAATCTATTGTCTGAAACAAGC
GATGAGAAGCAACAATTCACTAAACAAAGATCCGGTTACGAATAGAGATAGATTTAATTA
AGAAGTAACAAAACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGAGACGATGTTTCTTAAACCTT
GAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAAC
ATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGACCAAAATGCTTCACGGCTTC
ACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCTGTCCCAAAGGAGCTCTGAGAGC
AAGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCGCCAGCTTTCTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTC
TGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGT
GATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGAGCCT
GGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGC
ATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAG
GTAGACATCGTCCGACTTTGGAGATGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGAT
CAAATCAATTCCCATTGTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4H964TF C 51
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AAA
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AAAACAAACTTAAATCTATTGTCTGAAACAAGCGATGAAAAGCAACAATTCACTAAACAA
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GATGAGAAGCAACAATTCACTAAACAAAGATCCGGTTACGAATAGAGATAGATTTAATTA
AGAAGTAACAAAACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGAGACGATGTTTCTTAAACCTT
GAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAAC
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GAC

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GATTTAATTAAGAAGTAACAAAACTCGAGAATCAAGTTCGAAGACGCAGAGACGATGTTT
CTTAAACCT*GAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCT
TGGACCGAACATACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGACCAAAATGCT
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TGGCTCTCTCTGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCA
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CTCCT

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GTTTT
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CTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTGATGGTT
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ATTCCCATTGTAGCT

QA 6 800 6 800
DS 



AS 1 25

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TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
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AGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTC
TACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTA
CTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATA
GAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGAT
CTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAA*CTAAAATA
TTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAAT
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CTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATA
TATAGGTACTCTTGGCCAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATTTTCCTACACGAGTTA
ATGGGAGATTAATTGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTATCTCGTTCTTGAAGTGGTG
AATGCTCTCAATAATTATAATTATACTAATTTACATATGTCTTTAAATTGGTGCTACAGA
AATACCCCTTTCTTTTGCTTGATGAAAAAAGAAAAATAAAACAAAAAGATAACCGAAACC
ATTTTGATCCCCTTGCACAGAAAAAAAAGGGGGAGTTTATGTCTTTTTTTTTATTGAATC
CGCCGGGACTGACGGGGCTCCC


BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
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70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTTTCTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCA

QA 1 189 1 189
DS 

RD RR4C061TF 306 0 0
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAACTATTTTGACTAACCGCTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGA**ATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTTTCTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTC
C

QA 1 305 1 305
DS 

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CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAA

QA 1 331 1 331
DS 

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GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
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QA 1 165 1 165
DS 

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TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAAAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAAATGAATTAAATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
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TACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTA
CTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAAT
CC

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DS 

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TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAAATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
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TACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTA
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GAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGAT
CTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGAT

QA 1 643 1 643
DS 

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TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
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TACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTA
CTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATA
GAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGAT
CTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4A236TF 643 0 0
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TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTC
TACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTA
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GAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGAT
CTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4A236TFB 643 0 0
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTC
TACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTA
CTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATA
GAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGAT
CTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4G770JQ 712 0 0
GATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTATAAG
CAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATATTGAC
TTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTT**CTTTGGAATATCTCGGGATTTAA
TCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTACGATG
ATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGT
CAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGAT
TCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACA
ACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTCC
GATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGA
AAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGATCTTT
TTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAA*CTAAAATATTCC
AAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4DQ17JQ 505 0 0
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TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGGCGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAA

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4D354JQ 664 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAAATTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4G423JQ 629 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4AB30JQ 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATACATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAGTATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCGAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACTAGTCCCGATAA
AAAAA**CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4D354TF 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAAATTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4B718JQ 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCCAATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTT*TTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAAAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4BT77JQ 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GQ94TF 672 0 0
CCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCGATGA
TATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTC
AAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGATT
CCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACAA
CCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTTCG
ATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGAA
AACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGATCTTTT
TGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAA*CTAAAATATTCCA
AAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTTTA
AAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTTTA
CTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATATAG
GTACTCTTGGCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BT77TF 691 0 0
GG
ATATCTCGGGATTTA*TCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGAT
GAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTAT
AAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACC
GAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCAC
CGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAA
AAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAAT
AGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTA
AGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAA
AAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGAC
ATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTT
TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4DQ17TF 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGGCGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTATTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GQ94JQ 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4B718TF 692 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCCAATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
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AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAAAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4G423TF 759 0 0
CCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAAT*AGATT*CGATGAT
ATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTCA
AGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGATTC
CTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACAAC
CTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTTCGA
TTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGAAA
ACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTTGTAAGGGTCTATGATCTTTTT
GTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAA*CTAAAATATTCCAA
AAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTTTAA
AAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTTTAC
TTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATATAGG
TACTCTTGGCAAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATTTTCCTACACGAGTTAATGGGA
GATTAATTGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTATCTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4H827JQB 821 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATAACATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAA*CTATTTATTTATGATTCTTTTT
CACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCAT
AAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAAC
AATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*TTTT
GTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAA
AAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAGTTTTCTTACGAGTTTTTCTTC
GACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA
TTTTTTAAATATCCTCCTTACTTGGTTGGATTCGAACTACTTTAACTTCCTTGACTTCAT
AGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCAAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATT
TTCCTACACGAGTTAATGGGAGATTAATCGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTATCTC
GTTCTTGAAGTGGTGA*TGCTCTCAATAATTATAATTATAC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4G770TF 768 0 0
TATGATC
TTTTCACCGCTTTCTTTTCTACAAC*TATTACTTTC*TTGTACAATCATCTGATGAAATA
TCATAAAAAAC*TTTTCTACTCCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACTTTAAAT
AAACAATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAA*
TTTTGTAAGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCG
ATAAAAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTT*AAATTTTCTTACGAGTTTTT
CTTCGACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATC
TTTATTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACT
TCATAGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCAAGCGTATTATACGCTATCCTATTT
CATTTTCCTACACGAGTTAATGGGAGATTAATTGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTA
TCTCGTTCTTGAAGTGGTGAATGCTCTCAATAATTATAATTATACTAATTTACATATGTC
TTTAAATTGGTGCTACAGAAATACCCCTTTCTTTTGCTTGATGAAAAAAGAAAAATAAAA
CAAAAAGATAACCGAAACCATTTTGATCCCCTTGCACAGAAAAAAAAGGGGGAGTTTATG
TCTTTTTTTTTATTGAATCCGCCGGGACTGACGGGGCTCCC

QA 8 768 8 768
DS 



AS 3 25

CO CL8Contig1 1188 4 2 U
ATTGACATGAAAACCTTATAGTAAAACATTACAAAGTTCATTCAACAAAACATTACATAT
ATTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTATTATAATTGAGTGGTTGATAA
TAGCCAAAAGTAATAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACAAAGATAGAGCTGAATGTTCC
TTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACGAT
CAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGACGAATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATAAG
GTTCACGATACCCCAAGAGTAGGTTCTTCCGTACCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGGTT
ACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGAACATAAATGTACTCATATGC
TCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAGCC
AGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAGTTCCATTTTTTT*CCTCCAAGAGAGAACACAGATG
AGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAAC
TACTGCTGATTGGGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACAC
CAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCAGGTCTTTGAAGGTATCAA
CGGGGAGGACCTGAGAGAAATCCCCACATCGTGTTGAAGGCATTGAATCGAAACCTGACT
TGTCTATTTCTACGTAAAGAGAAACGTAACCCGCACCACCATCCTTTGTGTTCCCATTAA
GGTACACATGGAGAATCCAATTGTATCCACCAACCGTGAAAGGACGAGTTTCAAATTTGT
CTATAACGTTTGTCTCAATCTTGTAAGAATAGGTTGATGGATGAAGATTTCTCATACCTG
TTACCGTCTTCGAATGAGAGACATTATAGTGACGCGATGAGATCTCTTGATGTTTTTGTA
CATAAGGCACTTCTTCTTTTAGATTTGTATTGAAGTCATCGGTGATTTGTCTTATCAAGG
ATTGTGAAGACGCATATGTGATAAAGAGACAAAGAAAGAGATATGTAAGAGAGATAGAGA
TGGTGTTTCTGCAGCGATTTTTCATGTTTTTCTGTGGATGGAGTGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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C
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TTTTCTGTGGATGGAGTGTCC

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 746 1 746
DS 



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BQ
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50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 
65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 5 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 5 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

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C

QA 1 374 1 374
DS 

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CG
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ATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACAAAGA
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CGGTCACATCAACACCAAACTCAC

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR4FL42JQ 666 0 0
G
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TTCTTATTATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCAAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAA
TAACACAAAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGA
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GGGAG

QA 2 666 2 666
DS 

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AA
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AAGTTCATTCAACAAAACATTACATATATTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGA
TTCTTATTATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCAAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAA
TAACACAAAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGA
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ATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATAAGGTTCACGATACCCCAAGAGTAGGTTCTTCCGTA
CCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTT
GACTCGAACATAAATGTACTCATATGCTCTTTTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAA
TGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAGCCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAGTTCCATTT
TTTTCCTCCAAGAGAGAACACAGATGAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTC
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GGGAGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCG

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR4CM45JQ 763 0 0
GCTCTTT
AAAAATGCTTCTTGATTAATAAGAAGGGGATTACAAAGTTCATTCAACAAAACATTACAT
ATATTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTATTATAATTGAGTGGTTGAT
AATAGCCGAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACAAAGATAGAGCTGAATGTT
CCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACG
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AGGTTCACGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGG
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GCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAG
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GAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAA
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CCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCGGGTCTTTGAAGGTATCA
ACGGGGGAGGACCTGAGAGAATCCCCACATCGTGTT

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DS 

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GCTCTTT
AAAAATGCTTCTTGATTAATAAGAAGGGGATTACAAAGTTCATTCAACAAAACATTACAT
ATATTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTATTATAATTGAGTGGTTGAT
AATAGCCGAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACAAAGATAGAGCTGAATGTT
CCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACG
ATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGACGAATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATA
AGGTTCACGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGG
TTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAAATTGACTCGAACATAAATGTACTCATAT
GCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAG
CCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAGTTCCATTTTTTTCCTCCAAGAGAGAACACAGAT
GAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAA
CTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACA
CCAAACTCACAGTGTCCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCGGGTCTTTGAAGGTATCA
ACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCACATCGTGT

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DS 

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AAAAATGCTTCTTGATTAATAAGAAGGGGATTACAAAGTTCATTCAACAAAACATTACAT
ATATTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTATTATAATTGAGTGGTTGAT
AATAGCCGAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACAAAGATAGAGCTGAATGTT
CCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACG
ATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGACGAATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATA
AGGTTCACGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGG
TTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGAACATAAATGTACTCATAT
GCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAG
CCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAGTTCCATTTTTTTCCTCCAAGAGAGAACACAGAT
GAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAA
CTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGGTTCTTCAAAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACA
CCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCGGGTCTTTGAAGGTATCA
ACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCACATCG
AGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4GE81JQ 758 0 0
CG
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ATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACAAAGA
TAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCCTCCA
ATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGACGAATCTCTGAGAT
CATCGAAAGAGATAAGGTTCACGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTCCTTA
GTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGAACAT
AAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACGTATT
TTCCGCTTCCGGAGCCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAGTTCCATTTTTTTCCTCCAA
GAGAGAACACAGATGAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTCCAGG
TGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTAGGAA
CGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCGGGT
CTTTGAAGGTATCAACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCACATCGTGTTGAAGGCATTG
AATCGCCACACATCCGTATCTTGGATGGTAAAATAT

QA 3 758 3 758
DS 

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AACACA
CAATAAAAGAGTTTTATTATTGACATGAAAACCTTAT*****AGTAAAAC****ATTACA
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TTCTTATTATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCAAAAATAATAACACAAAAGGGTTGGTAA
TAACACAAAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGA
AATAGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGACGA
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CCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTT
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TGAAGGCATTGA*TCGCCACACATCCGTATCTTGGAT

QA 7 823 7 823
DS 

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****ATTACAAAGTTCATTCAACAAAACATTACATATATTTACGAATCTTTTTTCTTAGT
TTGACATGGATTCTTATTATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCAAAAATAATAACACAAAA
GGGTTGGTAATAACACAAAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACG
TGGTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAAC
CCTTTGACGAATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATAAGGTTCACGATACCCCAAGAGTAGG
TTCTTCCGTACCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAA
CTCGAAACTTGACTCGAACATAAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTT
GAAGAAACAATGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAGCCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTA
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ATTCTTCAAAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGT
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CTCTCCTTCCTGTTGAAGAT
C

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DS 

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AATAGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGACGA
ATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATAAGGTTCACGATACCCCAAGAGTAGGTTCTTCCGTA
CCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTT
GACTCGAACATAAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGAAGAAACAA
TGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAGCCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAGTTCCATTT
TTTTCCTCCAAGAGAGAACACAGATGAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTC
AATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCAAA
GGGAGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACC
ATTTTTCGGGTCTTTGAAGGTATCAACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCACATCGTGT
TGAAGGCATTGAATCGCCACACATCCGTATCTTGGGTGGTAAAATATTTCCTCTCCTTCC
TGTTGAAGAT
C

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DS 

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GTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCC
TTTGACGAATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATAAGGTTCACGATACCCCAAGAATAGGTT
CTTCCGTACCAATTCCTTAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACT
CGAAACTTGACTCGAACATAAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATTTGTAGAAAGTTGA
AGAAACAATGAAACGTATTTTCCGCTTCCGGAGCCAGAACCAGTTGGAACCATTCTTAAG
TTCCATTTTTTTCCTCCAAGAGAGAACACAGATGAGTAAGCATCTTTGACCAACGTGGAG
AAGTTCTCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGAT
TCTTCAAAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAA
AGGTAACCATTTTTCGGGTCTTTGAAGGTATCAACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCA
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CTCCTTCCTGTTGAAGATG

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DS 

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TCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCA
AAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAA
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CCTGTTGAAGATGTAAAA*CCTGAGA*TCCGCGTAAACCTCTTGATGTGCAGAATCGAAA
CCTGACTTGTCTATTTCTACGTAAAGAGAAA*CGTAA*CCTGCACCACCATCCTTTGTGT
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TCATACCTGTTACCGTCTTCGAATGAGAGACATTATAGTGACGCGATGAGATCTCTTGAT
GTTTTTGTACATAAGGCACTTCTTCTTTTAGATTTGTATTGAAGTCATCGGTGATTTGTC
TTATCAAGGATTGTGAAGACGCATATGTGATAAAGAGACAAAGAAAGAGATATGTAAGAG
AGATAGAGATGGTGTTTCTGCAGTGATTTTTCATGTTTTTCTGTGGATCC

QA 1 770 1 770
DS 

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AGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGGGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTAG
GAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCG
GGTCTTTGAAGGTATCAACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCACATCGTGTTGAAGGCA
TTGAATCGCCACACATCCGTATCTTGGATGGTAAAATATTTCCTCTCCTTCCTGTTGAAG
ATGTAAAA*CCTGAGA*TCCGCGTAAACCTCTTGATGTGCAGAATCGAAACCTGACTTGT
CTATTTCTACGTAAAGAGAAA*CGTAA*CCTGCACCACCATCCTTTGTGTTCCCATTAAG
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TATAACGTTTGTCTCAATCTTGTAAGAATAGGTTGATGGACGAAGATTTCTCATACCTGT
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GTGTC

QA 1 761 1 761
DS 

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*TTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTAGGAACGG
TCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATCGTAAAGGTAACCATTTTTCGGGTCTT
TGAAGGTATCAACGGGG*AGGACCTGAGAGAATCCCCACATCGTGTTGAAGGCATTGAAT
CGCCACACATCCGTATCTTGGATGGTAAAATATTTCCTCTCCTTCCTGTTGAAGATGTAA
AA*CCTGAGA*TCCGCGTAAACCTCTTGATGTGCAGAATCGAAACCTGACTTGTCTATTT
CTACGTAAAGAGAAA*CGTAA*CCTGCACCACCATCCTTTGTGTTCCCATTAAGGTACAC
ATGGAGAATCCAATTGTATCCACCAACCGTGAAAGGACGAGTTTCAAATTTGTCTATAAC
GTTTGTCTCAATCTTGTAAGAATAGGTTGATGGACGAAGATTTCTCATACCTGTTACCGT
CTTCGAATGAGAGACATTATAGTGACGCGATGAGATCTCTTGATGTTTTTGTACATAAGG
CACTTCTTCTTTTAGATTTGTATTGAAGTCATCGGTGATTTGTCTTATCAAGGATTGTGA
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TCTGCAGTGATTTTTCATGTTTTTCTGTGGATGGAGTGTACCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 25

CO CL9Contig1 910 25 14 U
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AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
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TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
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GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTG
GTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGG
CACATATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCAC
CGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCT
CGTTCTGTCC


BQ
50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 70 85 55 70 
95 95 95 95 97 97 97 85 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 85 97 85 97 97 97 85 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 95 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 95 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
55 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 50 90 90 90 85 85 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 70 70 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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BS 816 906 RR4D464TF
BS 907 910 RR4FC05TF

RD RR4BW93JQ 527 0 0
GGGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATAAGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCATAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4CR86JQ 553 0 0
GCCAAAATACAGAAACCAAAAGAACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGA
TACGATCTGATTCGTGTTTCCGGTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAA
ATGGTAAACGTCATGTCATCAATCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTA
GTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTCCTAACAGCCTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTC
GTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAA
ATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATC
AGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCC
TTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTA
AATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATG
CACGATGAATGTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4CY54TF 275 0 0
TT
CTCGCTGCCCA*CCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGC
TCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGA
TTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCT
CTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTG
GCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTC

QA 3 275 3 275
DS 

RD RR4CR86TF 553 0 0
GCCAAAATACAGAAACCAAAAGAACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGA
TACGATCTGATTCGTGTTTCCGGTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAA
ATGGTAAACGTCATGTCATCAATCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTA
GTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTCCTAACAGCCTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTC
GTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAA
ATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATC
AGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCC
TTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTA
AATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATG
CACGATGAATGTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4CY54JQ 553 0 0
GCCAAAATACAGAAACCAAAAGAACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGA
TACGATCTGATTCGTGTTTCCGGTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAA
ATGGTAAACGTCATGTCATCAATCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTA
GTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTCCTAACAGCCTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTC
GTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAA
ATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATC
AGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCC
TTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTA
AATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATG
CACGATGAATGTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4D464JQ 500 0 0
AACCAAAAGAACCATTATAAAGATGAAAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTC
GTGTTTCCGGTCAAGAAATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCA
TGTCATCAATCTGTCTTTTTAAAAAAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTC
CCATCGAAGCATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGT
AAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTG
CGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGT
GCGTGCTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAA
GTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAA
AAAGAAGGTATCCAACTAGG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4BW55JQ 613 0 0
GGGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATAAGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCATAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATCACGT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4BW10JQ 684 0 0
GGGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATAAGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCATAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BW79JQ 716 0 0
GGGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATAAGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCATAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGGGTAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4CO72JQ 718 0 0
GGGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCATTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAATGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAAGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4ED10JQ 685 0 0
GAGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
ATAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4ES06JQ 764 0 0
GAGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*CAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTG
GTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAG
TGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4GM13JQ 697 0 0
GG
CCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCCGGT
CAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAATC
TGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAGACAAGCTCCCATCGAAGCA
TCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTATTTAGCCAGTAAGTATAGTAC
TCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTC
AGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACT
AAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTC
GCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTAT
CCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAACT
AAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGATGA
CACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTGGT
GCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATG

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR4FC05JQ 757 0 0
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AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCCG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
ATAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACCTGTCCTG
GTGCTTGTGTCCC*TTGTCCCGTTAACATTTTCCATG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4E263JQ 815 0 0
GAGCACGTACATTTTGTTATACTTCAAAAACGCAGTTTGCCAAAATACAGAAACCAAAAG
AACCATTATAAAGATGAGAAACTTAAGCAGCAAAAAGATACGATCTGATTCGTGTTTCAG
GTCAAGAGATTAAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGCCATCAA
TCTGTCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCAACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATTACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACTGACATGTCCTG
GTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAG*TGCAACCATGGCTCGAGG
CACATATGGTTT*GGGAGACGATCATCGAGATCAG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4D464TF 811 0 0
AAGAACGATCTGA
TCGTGTTCC**GTCAAGAGAT*AAACAAAGGTTTACTTA*GCAAGAAAA*TGGTAAACGT
CATGTCATCA*TCTGTCTTTT*AGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGC
TCCCATCGAAGCATCTC*TAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCA
GTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGT
TGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTAC
GTGCGTGCTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGT
AAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGG
AAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAGCATGCACGATGAATG
TCAGAAAGAAACTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCG
ATGGG*TAGATGACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACA
GACATGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACC
ATGGCTCGAGGCACATATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTC
TCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTC
GCCATCTCTCTCGTTCT
C

QA 14 810 14 810
DS 

RD RR4FC05TF 790 0 0
GTCAAGAGAT*AAACAAAGGTT*ACTTAAGCAAGAAAAATGGTAAACGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTT*AGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
ATAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACCTGTCCTG
GTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGG
CACATATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCAC
CGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCT
CGTTCTGTCC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4GM13TF 784 0 0
GTCAAGAGAT*AAACAAAGGTTTACTTAAGCAAGAAAA*TGGTAA*CGTCATGTCATCAA
TCTGTCTTTT*AGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAGACAAGCTCCCATCGAAG
CATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTATTTAGCCAGTAAGTATAGT
ACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCC
TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTA
CTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTG
TCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGT
ATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAA
CTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGAT
GACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTG
GTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGG
CACATATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCAC
CGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCT
C
CCT

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4E263TF 792 0 0
TCAGTC
AGAGAT*AAACAAAGGTTTACT*AAGCA*GAAAA*TGGTAAACGTCATGCCATCAATCTG
TCTTTTTAGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATC
TC*TAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTC
CCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAG
TCATTTGCAACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAA
ACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGC
TTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCC
AACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAACTAA
AGATTACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGATGACA
CCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACTGACATGTCCTGGTGC
TTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGGCACA
TATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGA
GCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTT
CTGTCC

QA 7 792 7 792
DS 

RD RR4ED10TF 712 0 0
GCTCTCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTCCTAACAGCTTCT
TTAGATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTA
CTCGCTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGC
TCGTAACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGA
TTTGCTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCT
CTATGGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTG
GCGTAACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAAATAAAGATCACGTTGAAA
CCAAGTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGATGACACCATCACCATCTTG
GTCAAAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACCTGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGT
CCCGTTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGGCACATATGGTTTTGGGAG
ACGATCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCAC
TGTCGCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTTCTGTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4CO72TF 754 0 0
AAATGGTAAACGTCATGTCATCAATCTGTCTTTT*AGAAGAAGCTCTCGACT*GGCGCAG
TAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTCCTAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTC
TCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAG
AAATCGAATGCATTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTA
TCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTT
CCTTCAGTGTCGTAAATGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATG
TAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACA
TGCACGATGAATGTCAGAAAGAAACTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCT
TTGAATGTCTCCGATGGG*TAGATGACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTG
CTGCTGAAGAACAGACATGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCAT
GTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGGCACATATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGT
CGGGACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGA
TCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTTCTGTCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4BW93TF 750 0 0
GGTAAACGTCATGTCATCAATCTGTCTTTT*AGAAGAAGCTCTCGACTTGGCGCAGTAGT
CAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTC*TAACAGCTTCTTTAGATAAGTAGCCATTCTCGT
CTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCAAAGAAAT
CGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGCTTATCAG
GCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATACCTTCCTT
CAGTGTCATAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTGATGTAAA
TCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTAACATGCA
CGATGAATGTCAGAAAGAAACTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAACCTTTGA
ATGTCTCCGATGGG*TAGATGACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAACGTGCTGC
TGAAGAACAGACATGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTCCATGTCA
GGTGCAACCATGGCTCGAGGCACATATGGTTTTGGGAGACGATCATCGAGATCAGTCCGG
ACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTCTGATCCT
GCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTTCTGTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4BW55TF 708 0 0
TCGACTTGGCGCAGTAGTCAAACAAGCTCCCATCGAAGCATCTCCTAACAGCTTCTTTAG
ATAAGTAGCCATTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCG
CTGCCCAGCCAAAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGCCTCAGTCATTTGCCACAGCTCGT
AACGGGTTAGCTTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTG
CTGGAATATACCTTCCTTCAGTGTCATAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTAT
GGATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGT
AACTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAACTAAAGATCACGTTGAAACCAA
GTTCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGATGACACCATCACCATCTTGGTCA
AAGAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCG
TTAACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGGCACATATGGTTTTGGGAGACGA
TCATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCACTGTC
GCCATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTTCTGTCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4ES06TF 637 0 0
TTCTCGTCTTTAGCCAGTAAGTATAGTACTCCCCACTCCATTTTACTCGCTGCCCAGCCA
AAGAAATCGAATGCGTTGCGGTTAGC*TCAGTCATTTGCCACAGCTCGTAACGGGTTAGC
TTATCAGGCACGGTACGTGCGTACTTACTAAACATGTTCTCAAGATTTGCTGGAATATAC
CTTCCTTCAGTGTCGTAAGTGGAAGTGTCGCTTCCATGTTTGGCTCTATGGATGTTCTTG
ATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAACTCATGGTA
ACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAACTAAAGATCACGTTGAAACCAAGTTCTCTAAAA
CCTTTGAATGTCTCCGATGGG*CAGATGACACCATCACCATCTTGGTCAAAGAAGGCAAC
GTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTTAACATTTTC
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AGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGCCATCGTCTC
TGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTTCTGTCC

QA 1 637 1 637
DS 

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ATGTTCTTGATGTAAATCGGGAAGGAAAAAGAAGGTATCCAACTAGGCGATGTGGCGTAA
CTCATGGTAACATGCACGATGAATGTCAGAAAGAAACTAAAGATCACGTTGAAACCAAGT
TCTCTAAAACCTTTGAATGTCTCCGATGGG*TAGATGACACCATCACCATCTTGGTCAAA
GAAGGCAACGTGCTGCTGAAGAACAGACATGTCCTGGTGCTTGTGTCCCCTTGTCCCGTT
AACATTTTCCATGTCAGGTGCAACCATGGCTCGAGGCACATATGGTTTTGGGAGACGATC
ATCGAGATCAGTCCGGACCCTCCTCTCGGCCGTCACCGGAGCCTTTGAAGCCACTGTCGC
CATCGTCTCTGATCCTGCATCTGTCGCCATCTCTCTCGTTCTGTCC

QA 1 466 1 466
DS 



AS 4 21

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TATCTGATGAAGCATTAGCAAGTGTCCCTTTTCTTATCCTTGGAAACAAGATTGATATTC
CTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCACCAATTTCACTACCG
GTGAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGCA
GCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAGT
GAGAAGGAAACCAATCAAAGCATATTGGTGATTTGCGTTGCTTCACGGTTTTATAAATCA
GACATCTCATTTTTTTCTCATTGAAAAGACGTAAAACTGTTTCTCTTCTTGTAGTTTCCT
GTTTAAGTTCTAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACTCTAAAAACAAAAATGTGTTT
CTGATTGTGAAGTAGTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A791TF U 1
AF RR4BB83TF U 1
AF RR4A791JQ C 124
BS 1 63 RR4A791TF
BS 64 64 RR4BB83TF
BS 65 772 RR4A791TF
BS 773 826 RR4BB83TF
BS 827 858 RR4A791JQ

RD RR4A791TF 772 0 0
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QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4BB83TF 841 0 0
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CAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATC
CAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCC
ATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACC
TAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGGAAAGAGAGCTTGACGCTCTCT
TATCTGATGAAGCATTAGCAAGTGTCCCTTTTCTTATCCTTGGAAACAAGATTGATATTC
CTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCACCAATTTCACTACCG
GTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGCA
GCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAGT
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CAAAATGTGTTTCTG

QA 1 826 1 826
DS 

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ATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCACCAATTTCACTACCGGTG
AAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCA
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AAGGAAACCAATCAAAGCATATTGGTGATTTGCGTTGCTTCACGGTTTTATAAATCAGAC
ATCTCATTTTTTTCTCATTGAAAAGACGTAAAACTGTTTCTCTTCTTGTAGTTTCCTGTT
TAAGTTCTAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACTCTAAAAACAAAAATGTGTTTCTG
ATTGTGAAGTAGTAT

QA 1 735 1 735
DS 



CO CL10Contig2 830 10 14 U
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CTGTCTTACTACATCAAGTGAGCAGGAAACCAATCAAAGATTTGCTTCACGGTTTTATGA
ATCAGACATCTCATTTTTTTT*CCTCATTGAAAAGACATAAAACTGTTTCTCTTCATGTA
GTTTCCTCTTTTAAGTTCTAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 20 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 30 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 
55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 15 15 

AF RR4A226TF U 174
AF RR4ET64TF U 1
AF RR4AV50JQ C 272
AF RR4AV47TF U 1
AF RR4AV50TF U 1
AF RR4AZ33JQ C 17
AF RR4ET64JQ C 110
AF RR4A226TFB U 33
AF RR4AZ33TF U 20
AF RR4AV47JQ C 259
BS 1 140 RR4AV47TF
BS 141 141 RR4ET64TF
BS 142 344 RR4AV47TF
BS 345 345 RR4ET64TF
BS 346 387 RR4AV47TF
BS 388 388 RR4ET64TF
BS 389 684 RR4AV47TF
BS 685 685 RR4AV50TF
BS 686 686 RR4A226TFB
BS 687 753 RR4AV50TF
BS 754 754 RR4A226TFB
BS 755 794 RR4AV50TF
BS 795 825 RR4A226TFB
BS 826 830 RR4AZ33JQ

RD RR4A226TF 107 0 0
TCTCGGGCTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATT
AGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCA

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR4ET64TF 595 0 0
CTTTTCTATTTGATTTTTTGTTTGGTTCTTCCTCATCTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAA
TACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACTTAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTC
TATGGAATCCTGGCGACGTCAGGTCTGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGG
CTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAG
CACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAG
GCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAG
GTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAA
AGAGAGCTTGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCTTAGCGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTT
GGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCTTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATCTGGGT
CTCACCAATTTCACAACCGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4AV50JQ 347 0 0
AACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCC
GTAGGGTCTGGAAGGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATTCTT
ACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTTTTTTATTTGATGAAG
CCTTAGGGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTTGGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCTT
TTGAAGATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCCCCAATTTCCCAACCGGTAAAAGCAATG
TGAGTCTTGGAGAATTTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTTTTCATGTGC

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4AV47TF 688 0 0
CTTTTCTATTTGATTTTTTGTTTGGTTCTTCTTCATCTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAA
TACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACTTAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTC
TATGGAATCCTGGCGACGTTGGGTCTGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGG
CTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAG
CACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAG
GCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAGGACTACTATGCCAAG
GTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATTCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAA
AGAGAGCTTGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCTTAGCGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTT
GGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCTTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATCTGGGT
CTCACCAATTTCACAACCGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCC
CTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGG
CTGTCTTACTACATCAAGTGAGCA
CGAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4AV50TF 796 0 0
CTTTTCTATTTGATTTTTTGTTTGGTTCTTCTTCATCTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAA
TACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACTTAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTC
TATGGAATCCTGGCGACGTTGGGTCTGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGG
CTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAG
CACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAG
GCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAGGACTACTATGCCAAG
GTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATTCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAA
AGAGAGCTTGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCTTAGCGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTT
GGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCTTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATCTGGGT
CTCACCAATTTCACAACCGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCC
CTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGG
CTGTCTTACTACATCAAGTGAGCAG*AAACCAATCAAAGATTTGCTTCACGGTTTTATGA
ATCAGACATCTCATTTTTTTT*CCTCATTGAAA*GACATAAAACTGTTTCTCTTCATGTA
GTTTCCTCTTTTAA
AT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4AZ33JQ 814 0 0
TTTGTTTGGTTCTTCTTCATCTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAATACAAAGATCATAAAA
GTTTATTTGAAGACGACTTAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGA
CGTTAGGTCCGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGGCTCGACAATGCCGGGA
AAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGC
ATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTG
GCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGT
ACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTC
TTCTATCTGATGAAGCCTTAGCGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTTGGAAACAAGATTGATA
TTCCTTATGCAGCTTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATCTGGGTCTCACCAATTTCACAA
CCGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAACCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGT
GCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCA
AGTGAGCAGGAAACCAATCAAAGATTTGCTTCACGGTTTTATGAATCAGACATCTCATTT
TTTTT*CCTCATTGAAAAGACATAAAACTGTTTCTCTTCATGTAGTTTCCTCTTTTAAGT
TCTAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACTCT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4ET64JQ 719 0 0
TTGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGTCAGGTCTGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCT
TGTTTCTCGGGCTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGA
GATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAA
TCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACT
ACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTG
TGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCTTAGCGAGTGTCCCTT
TCCTCATCCTTGGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCTTCTGAAGATGAGCTTAGGT
ATCATCTGGGTCTCACCAATTTCACAACCGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTG
GCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGG
GCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAGTGAGCAGGAAACCAATCAAAGATTTGCTTCA
CGGTTTTATGAATCAGACATCTCATTTTTTTT*CCTCATTGAAAAGACATAAAACTGTTT
CTCTTCATGTAGTTTCCTCTTTTAAGTTCTAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4A226TFB 793 0 0
GG
ATCTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAATACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACT
TAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGTTAGGTCTGTGGCAGA
AAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGGCTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACA
TGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAAC
TGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTA
GGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACG
ACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCT
TAGCGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTTGGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCTTCTG
AAGATGAGCTTAGGTATCATCTGGGTCTCACCAATTTCACAACCGGTAAAAGCAATGTGA
GTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAA
TGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAGTGAGCAGGAAACCAAT
CAAAGATTTGCTTCACGGTTTTATGAATCAGACATCTCATTTTTTTTTCCTCATTGAAAA
GACATAAAACTGTTTCTCTTCATGTAGTTTCCTCTTTTAAGTTCTAATGTATGTTAAGTC
GATGGCTTACA

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR4AZ33TF 789 0 0
GTTTGGTTCTTCTTCATCTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAATACAAAGATCATAAAAGTT
TATTTGAAGACGACTTAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGT
TAGGTCCGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGGCTCGACAATGCCGGGAAAA
CAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATC
CAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCC
ATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACC
TAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTCTTC
TATCTGATGAAGCCTTAGCGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTTGGAAACAAGATTGATATTC
CTTATGCAGCTTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATCTGGGTCTCACCAATTTCACAACCG
GTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAACCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGCA
GCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAGT
GAGCAGGAAACCAATCAAAGATTTGCTTCACGGTTTTATGAATCAGACATCTCATTTTTT
TT*CCTCATTGAAAAGACATAAAACTGTTTCTCTTCATGTAGTTTCCTCTTTTAAGTTCT
AATGTATGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4AV47JQ 572 0 0
CCAACATTTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGC
CATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAGGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTAC
CTAGTGGATTCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTTTT
TTATTTGATGAAGCCTTAGGGAGTGTCCCTTTCCTCATCCTTGGAAACAAGATTGATATT
CCTTATGCAGCTTTTGAAGATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCCCCAATTTCCCAACC
GGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCCCTCGAGGTCTTCATGTGC
AGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAG
TGAGCAGGAAACCAATCAAAGATTTGCTTCACGGTTTTATGAATCAGACATTTCATTTTT
TTT*CCTCATTGAAAAGACATAAAACTGTTTTTCTTCATGTAGTTTCCTTTTTTAAATTC
TAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACTCT

QA 1 572 1 572
DS 



CO CL10Contig3 765 2 5 U
TCTTTACCTCTTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTGTCAATCAGATCCGAGGAGTTTTGTT
GTGATGTTTTTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGTTAGGATTGTGGCAGAAA
GAGGCGAAGATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATG
CTCAAAGACGAGAGATTAGTACAGCACCAGCCAACACAGCATCCGACATTTGAGGAACTG
AGCATTGGCAAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGG
GTCTGGAAAGACTATTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTACCTAGTGGACGCTTACGACAA
GGAGAGATTTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGCTCGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCTTAG
CTAGTGTCCCCTTTCCTTATCCTTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGA
AGATGGGCTCAGGTATCGCTTGGGTCTCACCAATTCTCACCACGGGTAAAAGCAATGTGA
GTCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTTCGCAAAA
TGGGATATGGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGCGAACAAAAC
AAGCACGGTTTTATGAATGAGACTTCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGACAAACTCTTT
CTCTCTTGTAGTATATCTTCCAAGTTTTAATATATCTGATTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C762TF U 355
AF RR4C762JQ C 1
BS 1 354 RR4C762JQ
BS 355 658 RR4C762TF
BS 659 659 RR4C762JQ
BS 660 707 RR4C762TF
BS 708 765 RR4C762JQ

RD RR4C762TF 359 0 0
CGACAAGGAGAGATTTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGCTCGACGCTCTTCTATCTGATGAAG
CCTTAGCTAGTGTCCCCTTTCCTTATCCTTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGC
CTCTGAAGATGGGCTCAGGTATCGCTTGGGTCTCACCAATTCTCACCACGGGTAAAAGCA
ATGTGAGTCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTTC
GCAAAATGGGATATGGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGCGAA
CAAA*CAAGCACGGTTTTATGAATGAGACTTCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAA
GACAAC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4C762JQ 765 0 0
TCTTTACCTCTTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTGTCAATCAGATCCGAGGAGTTTTGTT
GTGATGTTTTTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGTTAGGATTGTGGCAGAAA
GAGGCGAAGATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATG
CTCAAAGACGAGAGATTAGTACAGCACCAGCCAACACAGCATCCGACATTTGAGGAACTG
AGCATTGGCAAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGG
GTCTGGAAAGACTATTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTACCTAGTGGACGCTTACGACAA
GGAGAGATTT*GTGGAGTCAAAAAGAGAGCTCGACGCTCTTCTATCTGATGAAGCCTTAG
CTAGTGTCCCCTTTC*TTATCCTT*GGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGA
AGATGGGCTCAGGTATCGCTTGGGTCTCACCAATT*TCACCACGGGTAAAAGCAATGTGA
GTCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTTCGCAAAA
TGGGATATGGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGCGAACAAAAC
AAGCACGGTTTTATGAATGAGACTTCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGACAAACTCTTT
CTCTCTTGTAGTATATCTTCCAAGTTTTAATATATCTGATTAAGT

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL10Contig4 991 6 8 U
GTAGCCATTACGGCCGGGGGACCCTCGTCTGATCAACCAAACCTTTTGTTGTTGATTTGG
TTCTTTCTTCTTCACCTCTTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTCTCAATCAGATCCGAGGA
GTTTGTTT*GGTGATGTTTTTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTAGCGACGTTAGGATT
GTGGCAGAAAGAGGCGAAGATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTT
GCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTACAACACCAGCCAACACAGCATCCAACATC
TGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGAT
TGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGA
TGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCTGA
CGAAGGCTTAGCAAATGTTCCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGC
AGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAG
CAATGTGAATCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGT
CCGCAAAATGGGATATGGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGG
AAACCAAACAAGCACGGTTTTATGAATGAGACTATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGA
CAAACTCTTTCTCTCTTGTAGTATTATCTTCCAAGATTTAATATATCTGAGTAAGTCGAG
GGTTGTGTATTAGTAGTAGTACTCACGTTTCTTTTGTTGAATCAAACTGAACAAGAACAT
CATTCTGATTTCGAGCTAAAACACTATGACCTCGACGTTGTGTCTGTAAGCAAATGAAAT
GTCATTATGATATAAGGACTCAGCTACTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN96TF U 1
AF RR4BW63TF U 19
AF RR4F287TF U 58
AF RR4BW63JQ C 137
AF RR4GN96JQ C 329
AF RR4DC28TF U 422
BS 1 265 RR4GN96TF
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BS 267 446 RR4GN96TF
BS 447 447 RR4BW63TF
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BS 686 724 RR4BW63TF
BS 725 730 RR4F287TF
BS 731 991 RR4DC28TF

RD RR4GN96TF 685 0 0
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TTCTTTCTTCTTCACCTCTTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTCTCAATCAGATCCGAGGA
GTTTGTTT*GGTGATGTTTTTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTAGCGACGTTAGGATT
GTGGCAGAAAGAGGCGAAGATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTT
GCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGACTAGTACAACACCAGCCAACACAGCATCCAACATC
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TGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGA
TGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGGGTCAAAAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCTGA
CGAAGGCTTAGCAAATGTTCCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGC
AGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAG
CAATGTGAATCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGT
CCGCAAAATGGGATATGGCGAGGGC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4BW63TF 711 0 0
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TTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTCTCAATCAGATCCGAGGAGTTTGTTTTGGTGATGTT
TTTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTAGCGACGTTAGGATTGTGGCAGAAAGAGGCGAA
GATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATGCTCAAAGA
CGAGAGATTAGTACAACACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGG
CAAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAA
AGACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAG
ATTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCTGACGAAGGCTTAGCAAATGT
TCCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCT
TAGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAAGA
ATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGG
CGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGAAAC
AAACA

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DS 

RD RR4F287TF 673 0 0
G
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GAGTTTGTTT*GGTGATGTTTTTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTAGCGACGTTAGGA
TTGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACT
TTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTACAACACCAGCCAACACAGCATCCAACA
TCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAG
ATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCAAGTG
GATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCT
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AGCAATGTGAATCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATC
GTCCGCAAAATGGGATATGGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTG
GGAAACCAAACA

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR4BW63JQ 703 0 0
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AAGATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATGCTCAAA
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AAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAG
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GTTCCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAG
CTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAA
GAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATAT
GGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGAAACCAAACAAGCACG
GTTTTATGAATGAGACTATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGACAAACTCTTTCTCTCT
TGTAGTATTATCTTCCAAGATTTAATATATCTGAGTAAGT
CAG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4GN96JQ 587 0 0
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GCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGGG
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ATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCAC
TTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAAGAATCTGGTGTT
CGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGCGAGGGCTTT
AAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGAAACCAAACAAGCACGGTTTTATGAATG
AGACTATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGACAAACTCTTTCTCTCTTGTAGTATTATC
TTCCAAGATTTAATATATCTGAGTAAGTCGAGGGTTGTGTATTAGTAGTAGTACTCACGT
TTCTTTTGTTGAATCAAACTGAACAAGAACATCATTCTGATTTCGAG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4DC28TF 570 0 0
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GAAGGCTTAGCAAATGTTCCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCA
GCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAGC
AATGTGAATCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTC
CGCAAAATGGGATATGGCGAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGA
AACCAAACAAGCACGGTTTTATGAATGAGACTATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGAC
AAACTCTTTCTCTCTTGTAGTATTATCTTCCAAGATTTAATATATCTGAGTAAGTCGAGG
GTTGTGTATTAGTAGTAGTACTCACGTTTCTTTTGTTGAATCAAACTGAACAAGAACATC
ATTCTGATTTCGAGCTAAAACACTATGACCTCGACGTTGTGTCTGTAAGCAAATGAAATG
TCATTATGATATAAGGACTCAGCTACTTGT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 2 24

CO CL11Contig1 750 13 17 U
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CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
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AATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACG
CTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACAT
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TCAACCTTAAGCTTAAATGAAAATCATCCC


BQ
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 35 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 60 60 45 60 60 60 60 30 60 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA94TF U 1
AF RR4GQ66TF U 2
AF RR4BV57TF U 1
AF RR4D524TF U 1
AF RR4FA94JQ C 1
AF RR4BV57JQ C 188
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AF RR4H377TF U 289
AF RR4G124TF U 1
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AF RR4G124JQ C 232
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RD RR4FA94TF 515 0 0
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CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
GACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCAC
TTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAAT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4GQ66TF 542 0 0
GACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAAAAAGTC
TTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACATGAC
TATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCATC
ATCTTCTTCATCGTTTCGATTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACAG
AACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCCG
ACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCA
TCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTA
CGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCATT
TGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGA
TG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4BV57TF 694 0 0
GGACGATTCCAACTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAAAA*GT
CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGCGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAGGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
GACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGGACAGAGGAATTTGAGCCAT
TTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAG
AATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACG
CTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACAT
GAAACTGTCTCGTGAATAAAA*TGTAAATAAAAA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4D524TF 708 0 0
GGACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAA***GT
CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
GACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCAT
TTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAG
AATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACG
CTTGAAGAAGTTGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACAT
GAAACTGTCTCGTGAATAAAA*TGTAA*TAAAGAGTCATTTCTCTCTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4FA94JQ 685 0 0
GGACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAAA**GT
CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
GACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCAC
TTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAG
AATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACG
CTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACAT
AAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4BV57JQ 509 0 0
TTCATCGTTTCGACTGAGGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACAGAACACG
AGTCGTCTGTTTTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCCGACCCGA
TTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGA
TGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATAT
TGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGGACAGAGGAATTTGAGCCATTTGATGT
GTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGAATGGAT
GGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCTTGAAG
AAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACATGAAACTG
TCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4H377JQ 422 0 0
G
ACTTCAGATCCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGC
CAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAAT
CAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGA
ATTTGAGCCATTTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGA
CACGTGGGAAGAATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGT
CAATCCTTACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGA
TGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTG
CC

QA 2 420 2 420
DS 

RD RR4H377TF 422 0 0
G
ACTTCAGATCCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGC
CAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAAT
CAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGA
ATTTGAGCCATTTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGA
CACGTGGGAAGAATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGT
CAATCCTTACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGA
TGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTG
CC

QA 2 420 2 420
DS 

RD RR4G124TF 733 0 0
GGACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAA***GT
CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
GACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCAT
TTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAG
AATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACG
CTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACAT
GAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTGTCATTGTAAATC
TCAACCTTAAGCT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4GK26TF 748 0 0
GGACGATTCCAATTATCGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAA***GT
CTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACC***TTTTTGTGTCTTCAAAACATGA
CTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGATTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCC
GACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCAT
TTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAG
AATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACG
CTTGAAGA***TGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACAT
GAAACTGTCTCGTGAATAAAA*TGTAAATAAA*AGTCATTTCTCTCTGTCATTGTAA*TC
TCAACCTTAAGCTTAA
TGAAATCATCCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4G124JQ 516 0 0
TGCTTAACAGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACAC
TTCAGATCCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCA
AAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCA
ACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAAT
TTGAGCCATTTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACA
CGTGGGAAGAATGGATGGGATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCA
ATCCTTACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATG
TAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTGTCA
TTGTAAATCTCAACCTTAAGCTTAA
ATGAAAATCAT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4H507JQB 646 0 0
TTGTGTCTTCAAAACATGACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTA
TCCGGATCTTCCTTTTCATCATCTTCTTCATCGTTTCGATTGAAGAACAGCAGAAGAAAA
GACACGAAGATGCTTAACAGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCT
TATAAAACACTTCAGATCCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGA
CAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTT
CAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGA
ACAGAGGAATTTGAGCCATTTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCA
GATTGTGACACGTGGGAAGAATGGATGGGATAGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCC
TCTCACGTCAATCCTTACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATA
GAGACTGATGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTT
CTCTCTGTCATTGTAAATCTCAACCTTAAGCTTAA
ATGAAAATCAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4GK26JQ 487 0 0
TCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCCGACCCGATTCATCGGAATACGAG
GTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGC
AACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATA
AAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCATTTGATGTGTATGACGAGGGATTC
AACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGAATGGATGGGATGGGAAGGTGCA
GGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCTTGAAGA***TGATTCGAAGGC
ATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAAT
GTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTGTCATTGTAAATCTCAACCTTAAGCTTAAATGAAAA
TCATCCC

QA 1 487 1 487
DS 



CO CL11Contig2 820 11 13 U
TTTTTTTTTAAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATT
TGCTTTTCTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACT
ATTGCTTTAACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCT
CATCTTCTTCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACA
GGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCC
GACCCGATTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCAT
TCGATGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGG
AATGGATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTAC
GCGTGAAGACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGA
GAGAGGGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAGA
TGTAAATAAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAA
AGCTTTCCTGAATTTGGATCTAATGATAATAATTTGGATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU39TF U 12
AF RR4CX92TF U 1
AF RR4DR73TF U 10
AF RR4F708TF U 10
AF RR4DX43TF U 10
AF RR4C896TF U 1
AF RR4CU39JQ C 64
AF RR4C896JQ C 68
AF RR4DR73JQ C 170
AF RR4DX43JQ C 185
AF RR4CX92JQ C 68
BS 1 348 RR4C896TF
BS 349 349 RR4CX92TF
BS 350 395 RR4C896TF
BS 396 396 RR4CX92TF
BS 397 551 RR4C896TF
BS 552 552 RR4DX43TF
BS 553 555 RR4C896TF
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BS 557 751 RR4C896TF
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BS 811 820 RR4CX92JQ

RD RR4CU39TF 460 0 0
AA
TAAAACTCTCAATCTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATTTGCTTTTCTAGAA
CTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCTTTAACGA
TCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTTCATC
GCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAGTCAT
CTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATTCATC
TGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGTCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTG
CAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGTAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTT
GAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGT

QA 3 460 3 460
DS 

RD RR4CX92TF 551 0 0
TTTTTTTTTAAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATT
TGCTTTTCTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACT
ATTGCTTTAACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCT
CATCTT**TCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACA
GGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCC
GACCCGATTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCAT
TCGATGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGG
AATGGATGGGG

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4DR73TF 544 0 0
AAATTAAAACTCTCAATTTCACTATAT*CCCTAAAAAAAAGAATTCATATTTGCTTTTCT
AGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACACGACTATTGCTTTA
ACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTT
CATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAG
TCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATT
CATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTCT
ATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGG
GG
GT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4F708TF 552 0 0
AAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATTTGCTTTTCT
AGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCTTTA
ACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTT
CATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAG
TCATCTGTTCTTCATCTTCTCTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATT
CATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTCT
ATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGG
GGTGGG*AAGGT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4DX43TF 616 0 0
AAATTAAAACTCTCAATTTCACTATAT*CCCTAAAAAAAAGAATTCATATTTGCTTTTCT
AGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACACGACTATTGCTTTA
ACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTT
CATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAG
TCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATT
CATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTCT
ATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGG
GGTGGG*AAGGTGCAG*AATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGTGAAGA
CGACGGCGACCTACTT

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DS 

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TTTTTTTTTAAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATT
TGCTTTTCTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACT
ATTGCTTTAACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCT
CATCTTCTTCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACA
GGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCC
GACCCGATTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGTCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGTAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCAT
TCGATGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGG
AATGGATGGGGGGGGGAAGGTGCAGGAATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTAC
GCGTGAAGACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGA
GAGAGGGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAGA
TGTAAATAAAGTCATTTCTATGTTATGTAAA*TTCTCAAAG

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DS 

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GCTTTAACGATCGGAGGAAAGTGGGTTCTCTGGTCTACCCCGGATCTTCGTTTTCCTCAT
CTTCTTCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGA
AAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGAC
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CTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGTAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACG
ATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCG
ATGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAAT
GGATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCG
TGAAGACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGAGAG
AGGGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAGATGT
AAATAAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAAAGC
TTTCCTGAATTTGGATCTAATGATAAT
TTGGATTC

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DS 

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TAACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCTCATCTTC
TTCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGG
AGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGA
TTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGTCAAAAAGTATCATCCTGA
TGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGTAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATAT
TGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGT
CTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGAT
GGGGTGGG*AAGGTGCAGGAATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGTGAA
GACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGAGAGAGGG
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AAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAAAGCTTTC
CTGAATTTGGATCTAATGATAAT
TTGGATTC

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DS 

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GATGCTGAACAGGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGAC
CCTTAGGATCCGACCCGATTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGC
CAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAAT
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GTTTCAGCCATTCGATGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGA
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TGAATCCTTACGCGTGAAGACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAAT
AACAACAGAGAGAGAGGGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAA
TGGCTCTTAAATGTAAATAAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTG
ATTAGCTTAAAAGCTTTCCTGAATTTGGATC
C

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DS 

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AGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACC
CGATTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCC
TGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGA
TATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGA
TGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATG
GATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGT
GAAGACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGAGAGA
GGGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAAATGTA
AATAAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAAAGCT
TTCCTGAATTTGGATC
C

QA 1 616 1 616
DS 

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CTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCTT
TAACGATCGGAGGAA*GTGGGTTCTCTGGTCTACCC*GGATCTTCGTTTTCCTCATCTT*
*TCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGG
AGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGA
TTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGA
TGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATAT
TGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGT
CTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGAT
GGGGTGGG*AAGGTGCAGGAATCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGTGAA
GACGACGGCGACCTACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGAGAGAGGG
ACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAAATGTAAAT
AAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAAAGCTTTC
CTGAATTTGGATCTAATGATAATAATTTGGATT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 23

CO CL12Contig1 958 23 12 U
GGGATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAAACAATAATGAAGATCCTCTCACTTTCAC
TTATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGC
TCATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCA
TCAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACT
TCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGT
ACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTT
TGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATG
TTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATA
AGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAA
ACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCG
GAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGACAAATCTTATTT
AAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTG
GTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAA
AGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATCCACTCTACTACAAGAACTAATC
AAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATCCACCTAAATATGAGTCAATGTATTC
TATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGAGTACTTCGTACGTACTTTTTTTT


BQ
10 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 90 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 10 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 5 95 95 95 95 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 70 85 85 85 85 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 25 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 40 25 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

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AF RR4A966TF U 430
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AF RR4A966JQ C 214
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AF RR4DR23JQ C 336
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AF RR4DW05JQ C 214
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CTTCGCTACCTTTGCCTAGGCTCATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCT
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AGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAG
ACTACCTCACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATT
TCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTG
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GACTTT*GCATCTTTACCAAAACATCCA
G

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4CG30TF 647 0 0
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TTATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGC
TCATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCA
TCAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACT
TCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGT
ACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTT
TGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATG
TTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATA
AGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAA
ACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCG
GAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CH80TF 710 0 0
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CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTACGTTGAAGGCTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
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CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
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QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4BQ50TF 708 0 0
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TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
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QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4EN37TF 664 0 0
T
GATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAAACAATAATGAAGATCCTCTCACTTTCACTT
ATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCTC
ATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCATC
AGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTC
CAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCTAACAGTAC
CGTGCT*ACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTG
AAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTT
CCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAG
TGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAAC
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AGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTTAA
GCC

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR4DW05TF 710 0 0
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TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAATGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAGGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
GTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
AAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGACAAATCTTATTTA
AGCCAACGGGTTCAA*CACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAG*AGA
GG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4AQ63TF 770 0 0
GGATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAAACAATAATGAATATCCTCTCACTTTCACT
TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
GTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTCT*GCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
AAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACCTATTGGAGACAAAT*TTATTTA
AGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGG
TG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4DN72TF 748 0 0
GGATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAAACAATAATGAAGATCCTCTCACTTTCACT
TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
GTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
AAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTTA
AGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAG*AGAGGAAGAAGCTGG
TG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DR23TF 780 0 0
GGATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAAACAATAATGAAGATCCTCTCACTTTCACT
TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAATGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAGGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
GTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
AAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGACAAATCTTATTTA
AGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAG*AGAGGAAGAAGCTGG
TG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGA*TATTGGAGAC*AATGGGCTGATTTGGCTAA
G

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4AE24TF 827 0 0
GGATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAA*CAATAATGAAGATCCTCTCACTTTCACT
TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGTTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATTACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
GTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
AAGTCACTCTAAAGA*TCTCGAAGCTGCTGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTTA
AGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGG
CG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAA
GACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATCCACTCTACTA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4GL93TF 800 0 0
GGATCACAACTAAAACAATAACATACCAAAAACAATAATGAAGATCCTCTCACTTTCACT
TATCTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTACCTTTGCCTAGGCT
CATTGAACTCCTCACATCAGCCAACGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCAT
CAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTT
CCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTA
CCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTT
GAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGT
TCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGATGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAA
GTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGG
AAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGGCAAATCTTATTTA
AGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGG
GGGAGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATATTGGAGAC*AATGGGCTGATTTGGCTAAA
GACAGCCCTGGGAGAAG
ACA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4A966TF 369 0 0
ACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGG
AGGCCGGAGAAGCTCCCCGTGCTCCCCAGAGACTTTTGCATCTTTACCAAAACATCCAAG
AACTCGGGATTTGAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACT
CTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGACAAATCTTATTTAAGCCAACG
GGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAG
TGGTCACACTATCATCGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCC
TGGGAGAAG

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4DN72JQ 803 0 0
AACTCTCAGAGGAACAACGACTCTCCATCAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTG
GTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATG
TTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAG
CTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTG
ACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAG
AGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTC
CC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTA
CTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGC
TTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAAC
TTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATAT
TGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCC
TAATCCACTCTACTACAAGATCTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCA
TCCACCTAAATATGAGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCACAAATAAAT
GAGTACTTCGTACGTACTTTTTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4BQ50JQ 734 0 0
GTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATG
TTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAG
CTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTG
ACCTTGACGAGACCCTCCTCTTTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAG
AGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTC
CC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTTTTA
CTCATTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTTTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGC
TTCACCTATTGGAGACAAATTTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAAC
TTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATAT
TGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCC
TAATCCACTTTACTACAAGAACTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCA
TCCACCTAAATATGAGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAAT
GAGTACTTCGTACG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GC67JQ 780 0 0
CAACGACTCTCCATCAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCT
AACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTC
ACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTTTACGCC
AAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACC
CTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCA
AATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*G
CATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTTTTACTCACTGAGCGTTA
CCAAGAGTTGGCGGAAGTCGCTCTAAAGAATCTCGAAGCCGCTGGCTTCACCTATTGGAG
ACAAATTTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGA
GAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGG
CTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATCCACTCTACT
ACAAGAACTAATCAAGCATTTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATCCACCTAAATATG
AGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGAGTACTTCGTACG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AQ63JQ 798 0 0
TCAGAGGAACAACGACTCTCCATCAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTT
GAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAA
GACTACCTCACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTAT
TTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTT
GACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAG
CAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AG
AGACTCT*GCATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCAC
TGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCAC
CTATTGGAGACAAAT*TTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAA
GTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATATTGGAG
ACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATC
CACTCTACTACAAGAACTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATCCAC
CTAAATATGAGTCAATGTATCCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGAGTA
CTTCGTACGTACTTTTTT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4A966JQ 745 0 0
GTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGTCCGCAAATTGCAAAGACTATG
TTTAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGCGCAAAGAAG
CTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGACCTTTG
ACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAG
AGAAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTC
CC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTA
CTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGC
TTCACTTATTGGAGACAAATCTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAAC
TTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATAT
TGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCC
TAATCCACTCTACTACAAGAACTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCA
TCCACCTAAATATGAGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAAT
GAGTACTTCGTGCGTACTTTTTTTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4CH80JQ 623 0 0
TATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGAC
CTTGACGAGACCCTCCTCTTTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAG
AAGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC
*AGAGACTTT*GCTTCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTTTTACT
CACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTTTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTT
CACTTATTGGAGACAAATTTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTT
CAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATATTG
GAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTA
ATCCACTTTACTACAAGAACTAATCAAGCATTTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATC
CACCTAAATATGAGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGA
GTACTTCGTACGTACTTTTTT
TT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DR23JQ 608 0 0
TATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGAC
CTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAG
AGGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC
*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACT
CACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTT
CACTTATTGGAGACAAATTTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTT
CAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATATTG
GAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTA
ATCCACTTTACTACAAGAACTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATC
CACCTAAATATGAGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGA
GTACTTCG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4CG30JQ 653 0 0
TCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAA
GGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTC
CTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCAAAT
GCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCAT
CTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCA
AGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGACA
AATCTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAG
GAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTG
ATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATCCACTCTACTACA
AGAACTAATCAAGCATCTTTCTCATGTATTTGTTGTTCATGCATCCACCTAAATATGAGT
CAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGAGTACTTCG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4DW05JQ 730 0 0
GTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATG
TTGAAGACTACCTCACTTCCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAATGGTGTGCAAAGAAG
CTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTG
ACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAG
AGAGGCAAGACCCAAATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTC
CC*AGAGACTTT*GCATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTA
CTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGC
TTCACTTATTGGAGACAAATTTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAAC
TTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATAT
TGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCC
TAATCCACTTTACTACAAGAACTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCA
TCCACCTAAATATGAGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAAT
GAGTACTTCG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4GL93JQ 712 0 0
TCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTT
CCGAACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAG
GACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCC
TCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGATGCAAGACCCAAATG
CGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*GCATC
TTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTACCAA
GAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACTTATTGGAGGCAA
ATCTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGAGAGG
AAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATCGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGA
TTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATCCACTCTACTACAA
GAACTAATCAAGCATCTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATCCACCTAAATATGAGTC
AATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACCCATAAATAAATGAGTACTTC
C

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4EN37JQ 731 0 0
AACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTC
ACTTCCTAACAGTACCGTGCT*ACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCC
AAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACC
CTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAATATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCA
AATGCGTTCAATAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGCTCCC*GTGCTCCC*AGAGACTTT*G
CATCTTTACCAAAACATCCAAGAACTCGGGATT*GAGCCTGTCTTACTCACTGAGCGTTA
CCAAGAGTTGGCGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCTGGCTTCACCTATTGGAG
ACAAATCTTATTTAAGCCAACGGGTTCAAACACGAAGATATCAAACTTCAAGTCAAAGGA
GAGGAAGAAGCTGGTG*AGGAGTGGTCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGG
CTGATTTGTCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACATTCAAGCTCCCTAATCCACTCTACT
ACAAGAACTAATCAAGCATTTTTTTCATGTATTTGTTGTTCATGCATCCACCTAAATATG
AGTCAATGTATTCTATCGCAACTAAATAAATAACTCATAAATAAATGAGTACTTCGTACG
TACTTTTTT
AT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 2 21

CO CL13Contig1 1234 17 9 U
CGAGTCTGAAATAAATATCATTTTAGACCTATGAAAGGTTGGTGAAGAAGTATTCATTAA
ATATTTTCCCTTATTGCTTACACAGTACTTACAAATCAGAAATCATGTGAAAGGAGATAG
AGAGCTAACATGGAAGATACTTAAATATACAGGCATCAAATCCATTTTTGCTTCTGACAA
AACCCATTCTTTCTTTTTCCATCTTTATCTCACAGGGTTCAAGCTTAGCTTCCTTCTGGC
AATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGGTTCCACAGTTGGTGCATTTG
ACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCCAAAGAAGGAAACATTC
TCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTTAATATCAGGAAGTCTTTGATGATGAGTTTG
GTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAACCAAGTGAATATGAAA
CTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACCTGTTATGTCGTCCAAG
AAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAG
TAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACTGCATCTTGGACCCTCG
CACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATTATCAAATTCTTCATCA
TTGAGGATTGG*ATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCAAGAATCTCTGTTCATC
AGAACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCTTCCCACATGAGCTCTTCTTTAAGGTTATCAAA
CTCCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCATCGTAATAGAACGATTGCATGGCTTGGAGAAA
CTCTTGTTCCATTTCACCAATTGATTTCTTCTCAGCCTTGTTGATGCTACAGTAAGGCAT
GATGTTGCTATCCACGTCTTCTCCTCCCACTTGACCTGATTGCTCTGTGGTGGCTTTTGC
AGGCAACAGGAAGAATCTTTTTCTCAAGGGAACCGATCTTCCAGGGGTGAGCTGAGACCA
TTGAGTCCTCGACGAGAAACAAGGAGGGGTGGTGGGTTTGCGAGAAACAGCGGAGAAGAG
TCGAGGGCTTGTTAAACTGAACAGCATCTTGCTACCCATTTTCCCTGGGAGGAGAAAGGA
GAATCCTTTTTTCCTCTGTTTTCCAGGAACCCCC


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 60 60 60 60 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 85 85 85 85 70 85 85 85 85 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 15 85 85 15 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 40 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 20 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4H178JQ U 56
AF RR4AE04TF C 37
AF RR4A348JQ U 37
AF RR4A348JQD U 37
AF RR4A348TFB C 37
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AF RR4AY76JQ U 1
AF RR4AT26TF C 1
AF RR4AY76TF C 1
AF RR4EJ83JQ U 37
AF RR4ER22JQ U 40
AF RR4B782JQ U 41
AF RR4AZ30JQ U 45
AF RR4AV44JQ U 1
AF RR4B782TF C 229
AF RR4AZ30TF C 389
AF RR4AV44TF C 393
BS 1 166 RR4AT26JQ
BS 167 167 RR4AV44JQ
BS 168 418 RR4AT26JQ
BS 419 419 RR4AV44JQ
BS 420 682 RR4AT26JQ
BS 683 873 RR4AV44JQ
BS 874 1055 RR4B782TF
BS 1056 1232 RR4AZ30TF
BS 1233 1234 RR4AV44TF

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C

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CG
C

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DS 

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CG
C

QA 1 602 1 602
DS 

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GCGGTTCCACAGTTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGA
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AGGAAGTCTTTGATGATGAGTTTGGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACG
GCAGCGAACCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGGAAGCTCCAAGATGTATGTGATC
TCAAAACCTGTAATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGA
ACATTGAGCAAGAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTGCTA
CG
C

QA 1 602 1 602
DS 

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AGAGCTAACATGGAAGATACTTAAATATACAGGCATCAAATCCATTGTTGCTTCTGACAA
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ACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCCAAAGAAGGAAACATTC
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CTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACCTGTTATGTCGTCCAAG
AAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAG
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CACACAATCTCACTACCATCCAC

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DS 

RD RR4AY76TF 683 0 0
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AAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAG
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DS 

RD RR4EJ83JQ 724 0 0
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TCAAAACCTGTAATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGA
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AGCT

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DS 

RD RR4ER22JQ 685 0 0
A
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AAGCTTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGG
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QA 2 685 2 685
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AAGCTTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGG
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DS 

RD RR4AZ30JQ 783 0 0
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ATCAAATTCTTCATCATTGAGGATTGGGATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCA
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CTT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4AV44JQ 873 0 0
CA
AGTCTGAAATAAATATCATTTTAGACCTATGAAAGGTTGGTGAAGAAGTATTCATTAAAT
ATTTTCCCTTATTGCTTACACAGTACTTACAAATCAAAAATCATGTGAAAGGAGATAGAG
AGCTAACATGGAAGATACTTAAATATACAGGCATCAAATCCATTTTTGCTTCTGACAAAA
CCCATTCTTTCTTTTTCCATCTTTATCTCACAGGGTTCAAGCTTAGCTTCCTTCTGGCAA
TGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGGTTCCACAGTTGGTGCATTTGAC
ATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCCAAAGAAGGAAACATTCTC
TGTCCCACAATTTGGACAAGGACCCTTTAATATCAGGAAGTCTTTGATGATGAGTTTGGT
GATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAACCAAGTGAATATGAAACT
AAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACCTGTTATGTCGTCCAAGAA
GAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAGTA
ATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACTGCATCTTGGACACTCGCA
CACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATTATCAAATTCTTCATCATT
GAGGATTGG*ATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCAAGAATCTCTGTTCATCAG
AACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCTTCCCACATGAGCTCTTCTTTAAGGTTATCAAACT
CCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCATCGTA

QA 3 873 3 873
DS 

RD RR4B782TF 828 0 0
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TTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCCAAAG
AAGGAAACATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTTAATATCAGGAAGTCTTTG
ATGATGAGTTTGGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAACCAA
GTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACCTGTT
ATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAAT
AGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACTGCAT
CTTGGACCCTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATTATCA
AATTCTTCATCATTGAGGATTGG*ATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCAAGAA
TCTCTGTTCATCAGAACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCTTCCCACATGAGCTCTTCTTT
AAGGTTATCAAACTCCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCATCGTAATAGAACGATTGCAT
GGCTTGGAGAAACTCTTGTTCCATTTCACCAATTGATTTCTTCTCAGCCTTGTTGATGCT
ACAGTAAGGCATGATGTTGCTATCCACGTCTTCTCCTCCCACTTGACCTGATTGCTCTGT
GGTGGCTTTTGCAGGCAACAGGAAGAATCTTTTTCTCAAGGGAACCG
C

QA 1 827 1 827
DS 

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TTAATATCAGGAAGTCTTTGATGATGAGTTTGGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCA
AAGGCACGGCAGCGAACCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGT
ATGTGATCTCAAAACCTGTTATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGG
ATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCT
TTTTACTACGGAGACTGCATCTTGGACACTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTA
GTTTGAGTTTGAGATTATCAAATTCTTCATCATTGAGGATTGG*ATTTCCAGAAACATAA
GCCATCGAAGCTTCCAAGAATCTCTGTTCATCAGAACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCT
TCCCACATGAGCTCTTCTTTAAGGTTATCAAACTCCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCA
TCGTAATAGAACGATTGCATGGCTTGGAGAAACTCTTGTTCCATTTCACCAATTGATTTC
TTCTCAGCCTTGTTGATGCTACAGTAAGGCATGATGTTGCTATCCACGTCTTCTCCTCCC
ACTTGACCTGATTGCTCTGTGGTGGCTTTTGCAGGCAACAGGAAGAATCTTTTTCTCAAG
GGAACCGATCTTCCAGGGGTGAGCTGAGACCATTGAGTCCTCGACGAGAAACAAGGAGGG
GTGGTGGGTTTGCGAGAAACAGCGGAGAAGAGTCGAGGGCTTGTTAAACTGAACAGCATC
TTGCTACCCATTTTCCCTGGGAGGAGAAAGGAGAATCCTTTTTTCCTCTGTTTTCCAGGA
ACCC
CC

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR4AV44TF 842 0 0
ATATCA
GAAGTCTTTGATGATGAGTTTGGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGC
AGCGAACCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTC
AAAACCTGTTATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAAC
ATTGAGCAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACG
GAGACTGCATCTTGGACACTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTT
GAGATTATCAAATTCTTCATCATTGAGGATTGG*ATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAG
CTTCCAAGAATCTCTGTTCATCAGAACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCTTCCCACATGA
GCTCTTCTTTAAGGTTATCAAACTCCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCATCGTAATAGA
ACGATTGCATGGCTTGGAGAAACTCTTGTTCCATTTCACCAATTGATTTCTTCTCAGCCT
TGTTGATGCTACAGTAAGGCATGATGTTGCTATCCACGTCTTCTCCTCCCACTTGACCTG
ATTGCTCTGTGGTGGCTTTTGCAGGCAACAGGAAGAATCTTTTTCTCAAGGGAACCGATC
TTCCAGGGGTGAGCTGAGACCATTGAGTCCTCGACGAGAAACAAGGAGGGGTGGTGGGTT
TGCGAGAAACAGCGGAGAAGAGTCGAGGGCTTGTTAAACTGAACAGCATCTTGCTACCCA
TTTTCCCTGGGAGGAGAAAGGAGAATCCTTTTTTCCTCTGTTTTCCAGGAACCCCC

QA 7 842 7 842
DS 



CO CL13Contig2 1329 4 11 U
GGGGAAAACAGAGGAAAAAAAAAGAATCTCCTTTCTCCTCCCAGGGAAAATGGGTAGCAA
GATGCTGTTCAGTTTAACAAGCCCTCGACTCTTCTCCGCCGTTTCTCGCAAACCCACCAC
CACTCCTTGTTTCTCGTCGAGGACTCAATGCTCTCAGCTCACCCCTGGCCCTGGAAGATC
GGTTCCCTTGAGAAAAAGATTCTTCCTGTTGCCTGCAAAAGCTACCACAGAGCAATCAGG
TCAAGTGGGAGGAGAAGACGTGGATAGCAACATCATGCCTTACTGTAGCATCAACAAGGC
TGAGAAGAAATCAATTGGTGAAATGGAACAAGAGTTTCTCCAAGCTATGCAATCGTTCTA
TTACGATGGCAAAGCGATCATGTCGAATGAGGAGTTTGATAACCTTAAAGAAGAGCTCAT
GTGGGAAGGAAGCAGCGTTGTCATGCTAAGTTCTGATGAACAGAGATTCTTGGAAGCTTC
GATGGCTTATGTTTCTGGAAATCCAATCCTCAATGATGAAGAATTTGATAATCTCAAACT
CAAACTAAAGATGGATGGTAGCGAGATTGTGTGCGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAG
CAAAAAGGTGTATAGTGATCTCGCTGTAGATTACTTCAAAATGCTCTTGCTCAATGTTCC
AGCATCCGTTGTTGCTCTTGGACTGTTTTTCTTCTTGGACGACATTACAGGTTTTGAGAT
CACATACATCTTGGAGCTTCCAGAGCCATTTAGTTTCATATCCACTTGGTTCGCTGCCGT
GCCTTTGATCGTATACCTGGCTTCAACAATCACCAAACTCATCATCAAAGACTTCCTGAT
CTTGAAGGGTCCTTGTCCAAATTGTGGAACAGAGAATGTTTCCTTCTTTGGAACAATTCT
TTCAATCTCCAGCGGTGGCAAAACCAACAATGTCAAATGCACCAACTGTGGAACCGCGAT
GGAGTATGACTCTGGTTCTAGGTTGATCACATTGCCAGAAGGAAGCTAAGCTTGAAACCT
GTGAGATAAAGATGGAAAAAGAAAGAATGGGTTTTGTCAGAAGCAAAAATGGATTTGATG
CCTGTATATTTAAGATCTTCCATGTTAGCTCTCTATCTCCTTTCACATGATTTCTGATTT
GTACATTTTATTTTCTACCCTGTCCTCAGAGAAGAAGGTTTACAAGCTTTTCTTCCATAT
GCTCAACAACGCACACAAATTTAGGAGTAGCGTATAGTGTGTGGTTGTAAGAGATTCAAA
TGGTATGTAATACAAAGAGATTGATTGATTATGGAGCTAAAGTCAATAACACATAATTAG
ATGACAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER22TF U 1
AF RR4G582TF U 9
AF RR4EJ83TF U 3
AF RR4G582JQ C 600
BS 1 22 RR4ER22TF
BS 23 23 RR4EJ83TF
BS 24 257 RR4ER22TF
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BS 259 439 RR4ER22TF
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BS 441 648 RR4ER22TF
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RD RR4ER22TF 648 0 0
GGGGAAAACAGAGGAAAAAAAA*GAATCTCCTTTCTCCTCCCAGGGAAAATGGGTAGCAA
GATGCTGTTCAGTTTAACAAGCCCTCGACTCTTCTCCGCCGTTTCTCGCAAACCCACCAC
CACTCCTTGTTTCTCGTCGAGGACTCAATGCTCTCAGCTCACCCCTGGCCCTGGAAGATC
GGTTCCCTTGAGAAAAAGATTCTTCCTGTTGCCTGCAAAAGCTACCACAGAGCAATCAGG
TCAAGTGGGAGGAGAAGGCGTGGATAGCAACATCATGCCTTACTGTAGCATCAACAAGGC
TGAGAAGAAATCAATTGGTGAAATGGAACAAGAGTTTCTCCAAGCTATGCAATCGTTCTA
TTACGATGGCAAAGCGATCATGTCGAATGAGGAGTTTGATAACCTTAAAGAAGAGCTCAT
GTGGGAAGGAAGCAGCGTTTTCATGCTAAGTTCTGATGAACAGAGATTCTTGGAAGCTTC
GATGGCTTATGTTTCTGGAAATCCAATCCTCAATGATGAAGAATTTGATAATCTCAAACT
CAAACTAAAGATGGATGGTAGCGAGATTGTGTGCGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAG
CAAAAAGGTGTATAGTGATCTCGCTGTAGATTACTTCAAAATGCTCTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4G582TF 672 0 0
GGGAGGA
AAAAAAAAGAATCTCCTTTCTCCTCCCAGGGAAAATGGGTAGCAAGATGCTGTTCAGTTT
AACAAGCCCTCGACTCTTCTCCGCCGTTTCTCGCAAACCCACCACCACTCCTTGTTTCTC
GTCGAGGACTCAATGCTCTCAGCTCACCCCTGGCCCTGGAAGATCGGTTCCCTTGAGAAA
AAGATTCTTCCTGTTGCCTGCAAAAGCTACCACAGAGCAATCAGGTCAAGTGGGAGGAGA
AGACGTGGATAGCAACATCATGCCTTACTGTAGCATCAACAAGGCTGAGAAGAAATCAAT
TGGTGAAATGGAACAAGAGTTTCTCCAAGCTATGCAATCGTTCTATTACGATGGCAAAGC
TATCATGTCGAATGAGGAGTTTGATAACCTTAAAGAAGAGCTCATGTGGGAAGGAAGCAG
CGTTGTCATGTTAAGTTCTGATTAACAGAGATTCTTGGAAGCTTCGATGGCTTATGTTTC
TGGAAATCCAATCCTCAATGATGAAGAATTTGATAATCTCAAACTCAAACTAAAGATGGA
TGGTAGCGAGATTGTGTGCGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGCAAAAAG*TGTATAG
TGATCTCGCTGTAGATTACTTCAAAATGCTCTTGCTCAATGTTCCAGCATCCGTTGTTGC
TCTTG

QA 8 672 8 672
DS 

RD RR4EJ83TF 793 0 0
GGAAAACA
GAGGAAAAAAAAAGAATCTCCTTTCTCCTCCCAGGGAAAATGGGTAGCAAGATGCTGTTC
AGTTTAACAAGCCCTCGACTCTTCTCCGCCGTTTCTCGCAAACCCACCACCACTCCTTGT
TTCTCGTCGAGGACTCAATGCTCTCAGCTCACCCCTGGCCCTGGAAGATCGGTTCCCTTG
AGAAAAAGATTCTTCCTGTTGCCTGCAAAAGCTACCACAGAGCAATCAGGTCAAGTGGGA
GGAGAAGACGTGGATAGCAACATCATGCCTTACTGTAGCATCAACAAGGCTGAGAAGAAA
TCAATTGGTGAAATGGAACAAGAGTTTCTCCAAGCTATGCAATCGTTCTATTACGATGGC
AAAGCGATCATGTCGAATGAGGAGTTTGATAACCTTAAAGAAGAGCTCATGTGGGAAGGA
AGCAGCGTTGTCATGCTAAGTTCTGATGAACAGAGATTCTTGGAAGCTTCGATGGCTTAT
GTTTCTGGAAATCCAATCCTCAATGATGAAGAATTTGATAATCTCAAACTCAAACTAAAG
ATGGATGGTAGCGAGATTGTGTGCGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGCAAAAAGGTG
TATAGTGATCTCGCTGTAGATTACTTCAAAATGCTCTTGCTCAATGTTCCAGCATCCGTT
GTTGCTCTTGGACTGTTTTTCTTCTTGGACGACATTACAGGTTTTGAGATCACATACATC
TTGGAGCTTCCAGAGCCATTTAGTTTCATATTCACTTGGTTCGCTGCCGTGCCTTTGATC
GTATA

QA 9 793 9 793
DS 

RD RR4G582JQ 730 0 0
GCAAAAAGGTGTATAGTGATCTCGCTGTAGATTACTTCAAAATGCTCTTGCTCAATGTTC
CAGCATCCGTTGTTGCTCTTGGACTGTTTTTCTTCTTGGACGACATTACAGGTTTTGAGA
TCACATACATCTTGGAGCTTCCAGAGCCATTTAGTTTCATATCCACTTGGTTCGCTGCCG
TGCCTTTGATCGTATACCTGGCTTCAACAATCACCAAACTCATCATCAAAGACTTCCTGA
TCTTGAAGGGTCCTTGTCCAAATTGTGGAACAGAGAATGTTTCCTTCTTTGGAACAATTC
TTTCAATCTCCAGCGGTGGCAAAACCAACAATGTCAAATGCACCAACTGTGGAACCGCGA
TGGAGTATGACTCTGGTTCTAGGTTGATCACATTGCCAGAAGGAAGCTAAGCTTGAAACC
TGTGAGATAAAGATGGAAAAAGAAAGAATGGGTTTTGTCAGAAGCAAAAATGGATTTGAT
GCCTGTATATTTAAGATCTTCCATGTTAGCTCTCTATCTCCTTTCACATGATTTCTGATT
TGTACATTTTATTTTCTACCCTGTCCTCAGAGAAGAAGGTTTACAAGCTTTTCTTCCATA
TGCTCAACAACGCACACAAATTTAGGAGTAGCGTATAGTGTGTGGTTGTAAGAGATTCAA
ATGGTATGTAATACAAAGAGATTGATTGATTATGGAGCTAAAGTCAATAACACATAATTA
GATGACAGGC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 4 20

CO CL14Contig1 289 2 2 U
GTGTGTGGTGAAAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGA
TCAAACTGTAGCTGTGGGGGCAGCTGCAGCTGTTAATTGTGGTGTAAATCACATGTATGC
AGGAAAACCGGTGGGAAAAAATGTATTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTGTTTG
AATAAATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCT
TCTATGTGTTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGCTTTCATTTGTAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B979JQ C 1
AF RR4B979TF U 1
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TCTATGTGTTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGCTTTCATTTGTAACTT

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR4B979TF 289 0 0
GTGTGTGGTGAAAGT
TGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGT
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AAAAAATGTATTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTGGCA
TAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTTGATT
GTGTGATTGTCTAATATGCTTTCATTTGTAACTT

QA 16 289 16 289
DS 



CO CL14Contig2 1016 3 8 U
AGAAAACTATCTTCGAGGAAAAAACTCAACAAACTTTTAAATCCAATGCTTGTAAGTTGA
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ATTTGGATTTTACCGCAACTCAAATTTCATCAAAAATACAATAACCATGCCATTGCTGCC
TGCAATTGAAGCAGTGTGTATCAAGACTCAAACTGCGATTACATTTCCCTGAGCTTCGGC
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AGTCTTTTGGTCTGTCTCTTGTTCTATTAAGGACACAGAAGCAATGATCTCTTCTTCTAT
CTTCTTGTCTTTAGGATACTCTGTCTCAGACTCTGGATCAATCACAGACATCTCGCCGAG
TGTGTAGTCTAACAAGAAACTGCTTCTTACAAATCTATCCATCCTATTGAAATGTCTCTG
AAAATAAGGGATTAGACCTTCCAGGAGTTCTCCAATTCCTTTAACCTGAACGATTTCTGT
GGGAGGAAGTATGTTGAAGGTTTGGTAAAGAACAAACTGAGCAATGTGGCATCCGTTTGG
TCTTGTGTTCCATTCTCTGAGATATTCAAAAAGTAAACGGAACTCTTCTTTTTCAAGTCC
TTGAAGAGCTTTCACAATCTGCTCGTCTGATTCTCTTTTCTTGCAGAGGCCAGCAAAGAG
TTCGTAAACTTTGTGAGGCCTACGAAGCTCAAATGCTAATCTTATGGCTTTAGTGTATTC
GGCATCTAACACTGCGTTTTCCAGCTCTTGCCCCCTCAAGATTGTTTCTTCCTCTTTCCG
GAATTCGTCTTCCTTATCAGAAGCGGTGGAATCATGCCATAAATTAATAACTGCATCGCC
TCCACCAGTTGCAACCATTTCTGTTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAGATGTTTCAGTTCG
CCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAACCTCC


BQ
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AF RR4D714JQ U 41
AF RR4BH60JQ U 1
AF RR4D714TF C 204
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BS 458 620 RR4BH60JQ
BS 621 1016 RR4D714TF

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ATCCTATTGAAATGTCTCTGA
GAA

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DS 

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AACGAGTCTCTTCTTGTTCGATCTATCTTTGGACTTCTGAGACTTTCGTTTCCTTGAAGG
AGTCTTTTGGTCTGTCTCTTGTTCTATTAAGGACACAGAAGCAATGATCTCTTCTTCTAT
CTTCTTGTCTTTAGGATACTCTGTCTCAGACTCTGGATAAATCACAGACATCTCGCCGAG
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TCTTGTGTTCCATTCTCTGA

QA 1 620 1 620
DS 

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CAGACTC
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GGACACAGAAGCAATGATCTCTTCTTCTATCTTCTTGTCTTTAGGATACTCTGTCTCAGA
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AAATCTATCCATCCTATTGAAATGTCTCTGAGAATATGGGATTAGACCTTCCAGGAGTTC
TCCAATTCCTTTAACCTGAACGATTTCTGTGGGAGGAAGTATGTTGAAGGTTTGGTAAAG
AACAAACTGAGCAATGTGGCATCGGTTTGGTCTTGTGTTCCATTCTCTGAGATATTCAAA
AAGTAAACGGAACTCTTCTTTTTCAAGTCCTTGAAGAGCTTTCACAATCTGCTCGTCTGA
TTCTCTTTTCTTGCAGAGGCCAGCAAAGAGTTCGTAAACTTTGTGAGGCCTACGAAGCTC
AAATGCTAATCTTATGGCTTTAGTGTATTCGGCATCTAACACTGCGTTTTCCAGCTCTTG
CCCCCTCAAGATTGTTTCTTCCTCTTTCCGGAATTCGTCTTCCTTATCAGAAGCGGTGGA
ATCATGCCATAAATTAATAACTGCATCGCCTCCACCAGTTGCAACCATTTCTGTTTTCTT
TTCCTCTGGCTACTAAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTC
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QA 8 813 8 813
DS 



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ACCACAAGAATCCTGAGTTGGAATGGGATTCCAACTCATCACCTTTTGAGATTTTGAGAA
GAGTTGCTCTTTGGAGAGCACAGTACGATGAAAGTTGTAAGCTGTGTTCGGGGGGGAGTT
CTTGTCTATCGTTGGCCTCTATGGTAGAATCAGTCAGGGGCCTGATAGGCGGTGGTTTAC
CCTGTGGCGGATGTCAGCGGTTCGAGTCCGCTTATCTCCAACTCGTGAACTTAGCCGATA
CAAAGCTATATGATAGCACCCAATTTTTCCGATTCGGCAGTTCGATCTATTATTTTTCAT
TCATGGACGTTGATAAGATCTTTCCATTTAGCAGCACCTTAGGATGGCATAGCCTTAAAG
TTAAGGGCGAGGGTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGA
GGAAGGGCGTAGTAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAG
ATTCCCGAATAGGTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAAC
CTGGCGAACTGAAACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGT
AGCGGCGAGCGAAATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGACAGCACATA
AAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTTAAATCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAA
TGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTGCAGCTGCG
AGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACTGTAGCTGTGGGG
ACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAGGAAAAACTGGGG
GAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGAACTGGG*CGTTATG
TTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTATATGTGTGGTT
GTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 

AF RR4BZ05TF U 1
AF RR4EL65TF U 26
AF RR4BZ05JQ C 27
AF RR4CJ32JQ C 553
AF RR4EO74JQ C 553
AF RR4CJ32TF U 553
AF RR4EO74TF U 553
AF RR4B890TF U 553
AF RR4DC22JQ C 829
AF RR4DC22TF U 829
BS 1 373 RR4BZ05TF
BS 374 552 RR4EL65TF
BS 553 553 RR4B890TF
BS 554 681 RR4EL65TF
BS 682 682 RR4B890TF
BS 683 708 RR4EL65TF
BS 709 709 RR4B890TF
BS 710 733 RR4EL65TF
BS 734 734 RR4B890TF
BS 735 752 RR4EL65TF
BS 753 913 RR4B890TF
BS 914 914 RR4DC22TF
BS 915 1132 RR4B890TF
BS 1133 1133 RR4DC22TF
BS 1134 1223 RR4B890TF
BS 1224 1224 RR4DC22TF

RD RR4BZ05TF 373 0 0
GGGACCGACCATAGAACCCTGTTCGATAAGTGGAATGCATTAGCTGTCCGCTCGCAGGTT
GGGCAGTAAGGGTCGGAGAAGGACAATCACTCATTCTTAAAACCAGCATTCGAAAGAGTT
GGGGCGGAAAAGGGGGGAAAGCTCTCCGTTCCTGGTTCTCCTGTAGCTGGATCCTCTAGA
ACCACAAGAATCCTGAGTTGGAATGGGATTCCAACTCATCACCTTTTGAGATTTTGAGAA
GAGTTGCTCTTTGGAGAGCACAGTACGATGAAAGTTGTAAGCTGTGTTCGGGGGGGAGTT
CTTGTCTATCGTTGGCCTCTATGGTAGAATCAGTCAGGGGCCTGATAGGCGGTGGTTTAC
CCTGTGGCGGATG

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR4EL65TF 727 0 0
G
TAAGTGGAATGCATTAGCTGTCCGCTCGCAGGTTGGGCAGTAAGGGTCGGAGAAGGGCAA
TCACTCATTCTTAAAACCAGCATTCGAAAGGGTTGGGGCGGAAAAGGGGGGAAAGCTCTC
CGTTCCTGGTTCTCCTGTAGCTGGATCCTCCAGAACCACAAGAATCCTGAGTTGGAATGG
GATTCCAACTCATCACCTTTTGAGATTTTGAGAAGAGTTGCTCTTTGGAGAGCACAGTAC
GATGAAAGTTGTAAGCTGTGTTCGGGGGGGAGTTCTTGTCTATCGTTGGCCTCTATGGTA
GAATCAGTCAGGGGCCTGATAGGCGGTGGTTTACCCTGTGGCGGATGTCAGCGGTTCGAG
TCCGCTTATCTCCAACTCGTGAACTTAGCCGATACAAAGCTATATGATAGCACCCAATTT
TTCCGATTCGGCAGTTCGATCTATTATTTTTCATTCATGGACGTTGATAAGATCTTTCCA
TTTAGCAGCACCTTAGGATGGCATAGCCTTAAAGTTAAGGGCGAGGTTCAAACGAGGAAA
GGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGTAAGCGACGAAATG
CTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAGGTTAACCTTCTGAA
CTGCTGCTGAATCCATGGGCAG*CAAGAGACAACCTGGCGAACTGAA*CATCTTAGTAGC
CAGAGG

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR4BZ05JQ 726 0 0
TAAGTGGAATGCATTAGCTGTCCGCTCGCAGGTTGGGCAGTAAGGGTCGGAGAAGGACAA
TCACTCATTCTTAAAACCAGCATTCGAAAGAGTTGGGGCGGAAAAGGGGGGAAAGCTCTC
CGTTCCTGGTTCTCCTGTAGCTGGATCCTCTAGAACCACAAGAATCCTGAGTTGGAATGG
GATTCCAACTCATCACCTTTTGAGATTTTGAGAAGAGTTGCTCTTTGGAGAGCACAGTAC
GATGAAAGTTGTAAGCTGTGTTCGGGGGGGAGTTCTTGTCTATCGTTGGCCTTTATGGTA
GAATCAGTCAGGGGCCTGATAGGCGGTGGTTTACCCTGTGGCGGATGTCAGCGGTTCGAG
TCCGCTTATCTCCAACTCGTGAACTTAGCCGATACAAAGCTATATGATAGCACCCAATTT
TTCCGATTCGGCAGTTCGATCTATTATTTTTCATTCATGGACGTTGATAAGATCTTTCCA
TTTAGCAGCACCTTAGGATGGCATAGCCTTAAAGTTAAGGGCGAGGTTCAAACGAGGAAA
GGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGTAAGCGACGAAATG
CTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAGGTTAACCTTTTGAA
CTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGAAACATCTTAGTAGC
CAGAGG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4CJ32JQ 200 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG
TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG
GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA
AACATCTTAGTAGCCAGAGG

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR4EO74JQ 200 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG
TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG
GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA
AACATCTTAGTAGCCAGAGG

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR4CJ32TF 200 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG
TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG
GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA
AACATCTTAGTAGCCAGAGG

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR4EO74TF 200 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG
TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG
GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA
AACATCTTAGTAGCCAGAGG

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR4B890TF 672 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG
TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGTGATTCCCGAATAG
GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA
AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA
AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGACAGCACATAAAAGCATCAGAA
GAAGAAACAAATTACAAGTTTTAAATCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTA
ATTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACA
ACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCT
GTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAGGAAAAACTGGGGGAATATGTGTTT
GATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGAACTGGGGCGTTATGTTGCCTAATACC
TCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTATATGTGTGGTTGTGTAATGTTTT
CGTTTGTAACC
C

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4DC22JQ 396 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAG
GAAAAACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGAAC
TGGG*CGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTT
ATATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4DC22TF 396 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAG
GAAAAACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGAAC
TGGG*CGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTT
ATATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT

QA 1 396 1 396
DS 



CO CL14Contig4 433 5 7 U
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAAAAGAAACAAATTTGAAGTTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAG
GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCTAAGAAAAAAAGAAAAAATATATAAC
TATTGATTTTTGT


BQ
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C354TF U 1
AF RR4H492JQB C 1
AF RR4H492TF U 1
AF RR4C354JQ C 1
AF RR4EG26TF U 2
BS 1 42 RR4C354TF
BS 43 43 RR4H492TF
BS 44 212 RR4C354TF
BS 213 239 RR4H492TF
BS 240 240 RR4EG26TF
BS 241 395 RR4H492TF
BS 396 433 RR4EG26TF

RD RR4C354TF 212 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAAAAGAAACAAATTTGAAGCTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGA

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR4H492JQB 395 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAAAAGAAACAAATTCGAAGTTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTTTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATTTAACTCACATATATGCAT
GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTTTTTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4H492TF 395 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAAAAGAAACAAATTCGAAGTTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAT
GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4C354JQ 433 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAAAAGAAACAAATTTGAAGCTTTAAATCAAAGAGAAG
TAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAG
GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCTTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCTAAGAAAAAAAGAAAAAATATATAAC
TATTGATTTTTGT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4EG26TF 432 0 0
GACAGCACATAAAAGCATCAGAAAAAGAAACAAATTTGAAGTTTTAAATCAAAGAGAAGT
AAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAATTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTC
TTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACTG
TAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTTTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAGG
AAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTT
GCGCGTTATGTTGTCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTAT
ATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCTAAGAAAAAAAGAAAAAATATATAACT
ATTGATTTTTGT

QA 1 432 1 432
DS 



AS 2 20

CO CL15Contig1 723 7 1 U
GGGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGTTGTCTAGTTATTCAATTTGCTAGG
AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
CCATTCAGCCAGCTGACAAGGATCAAGGTGTGGTACTTGGAACCACCAAGACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCGAGGATGG
CTAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAAAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGA
GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCGCCATTGAATGAAATATTTTTCTTCTAAATAAG
CTCGTTTTGAGTGTTTCAGACAGTGTTTGTAGGTTAAAAGATTGTTCCTGAACAGCTAAA
AGTTTTGTTTGAACCACCTCCCTAGTGCGTGCAAGTGCCAGACTTGTAGCGTTTATGGTT
TATGCTTCACACAGACAAGCAATAATTGCAATCTGATCATAATAAACGTTATTGAGATTT
GTC


BQ
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4EJ41TF U 1
AF RR4BB10TF U 2
AF RR4AR82JQ C 67
AF RR4AR82TF U 1
AF RR4AA94JQ C 1
AF RR4AA94TF U 1
AF RR4AA47TF U 1
BS 1 723 RR4AA47TF

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GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGT

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DS 

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TTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAA
CAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGAC
CATTCAGCCAGCTGACAAGGATCAAGGTGTGGTACTTGGAACCACCAAGACCAAGAAGCA
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TCGTTTTGAGTGTTTCAGACAGTGTTTGTAGGTTAAAAGATTGTTCCTGAACAGCTAA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4AR82JQ 637 0 0
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TGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGTTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAACAACC
TTTGCAACCTCAATTTTTACAAGCACTTTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACCATTC
AGCCAGCTGACAAGGATCAAGGTGTGGTACTTGGAACCACCAAGACCAAGAAGCAAAACA
AGCCAAAGCTTTTTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCGAGGATGGCTAAAG
CTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAAAAGGCAGCGCTTG
CTAGGTTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGAGGAGGA
ACAGA*AGGCTTGAAGAATTCGCCATTGAATGAAATATTTTTTTTTTAAATAAGTTCGTT
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GTTTGAACCACCTCCCTAGTGCGTGCAAGTGCCAGACTTGTAGCGTTTATGGTTTATGCT
TCACACAGACAAGCAATAATTGCAATCTGATCATAAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4AR82TF 672 0 0
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AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
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CCATTCAGCCAGCTGACAAGGATCAAGGTGTGGTACTTGGAACCACCAAGACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCGAGGATGG
CTAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAAAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGA
GGAGGAACAGA*AGGCTTGAAGAATTCGCCATTGAATGAAATATTTTTCTTCTAAATAAG
TTCGTTTTGAGTGTTTCAGACAGTGTTTGTAGGTTAAAAGATTGTTCCTGAACAGCTAAA
AGTTTTGTTTGAACCACCTCCCTAGTGCGTGCAAGTGCCAGACTTGTAGCGTTTATGGTT
TATGCTTCACAC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4AA94JQ 676 0 0
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GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
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AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCGAGGATGG
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GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCGCCATTGAATGAAATATTTTTCTTCTAAATAAG
CTCGTTTTGAGTGTTTCAGACAGTGTTTGTAGGTTAAAAGATTGTTCCTGAACAGCTAAA
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TATGCTTCACACAGAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AA94TF 676 0 0
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GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
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TATGCTTCACACAGAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AA47TF 723 0 0
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AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
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GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCGCCATTGAATGAAATATTTTTCTTCTAAATAAG
CTCGTTTTGAGTGTTTCAGACAGTGTTTGTAGGTTAAAAGATTGTTCCTGAACAGCTAAA
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TATGCTTCACACAGACAAGCAATAATTGCAATCTGATCATAATAAACGTTATTGAGATTT
GTC

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL15Contig2 665 13 28 U
CATAATAATAGTTTTAACTTCATTTTGTGAATAGAAGGATGACAAGGGAGGTGGTTCAAA
CAAAACTTTTAGCTGTTCAGGAATAATCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTCAA
AATGAGCTTATTTAGAAGAAAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTT
CCTCCTCTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGC
AAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGC
TTTGGCCATTCTCGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTT
GTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTG
AATGGTCACGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAG
GTTGTTGCTCTCCTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAA
GAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTC
GATCTCCTAGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCC
GGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 5 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 40 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 
75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 50 75 75 75 75 50 75 
75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 35 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 35 

AF RR4HB03JQB U 69
AF RR4C481JQ U 7
AF RR4H086JQ U 24
AF RR4BA20JQ U 20
AF RR4BA20TF C 1
AF RR4AD30JQ U 20
AF RR4AD42JQ U 20
AF RR4AD30TF C 20
AF RR4AD42TF C 20
AF RR4EZ87TF C 31
AF RR4HB03TF C 69
AF RR4B723JQ U 69
AF RR4B723TF C 69
BS 1 7 RR4BA20TF
BS 8 51 RR4C481JQ
BS 52 52 RR4AD30JQ
BS 53 68 RR4C481JQ
BS 69 137 RR4HB03JQB
BS 138 138 RR4C481JQ
BS 139 233 RR4HB03JQB
BS 234 234 RR4C481JQ
BS 235 238 RR4HB03JQB
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BS 349 349 RR4C481JQ
BS 350 406 RR4HB03JQB
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BS 408 451 RR4HB03JQB
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BS 465 465 RR4HB03JQB
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BS 643 664 RR4AD30JQ
BS 665 665 RR4B723JQ

RD RR4HB03JQB 398 0 0
TTAGCTGTTCAGGAATAATCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTCAAAATGAGCT
TATTTAGAAAAAAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCTCT
TGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAACCTAACAAGCACTG
CCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCA
TTCTCGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAAAGCTTTGGCTTGTTTTGCT
TCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCCTGTCAGCTGGCTGAATGGTCA
CGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAAAATGCTTGTAAAA
A

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR4C481JQ 444 0 0
G
ATAGTTTTAACTTCATTTTGTGAATAGAAGGATGACAAGGGAGGGGGTTCAAACAAAACT
TTTAGCTGTTCAGGAATAATCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTCAAAATGAGC
TTATTTAGAAGAAAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCTC
TTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCT
GCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCC
ATTCTCGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGC
TACTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTC
ACGGTCTTCTTGTTTGCCAAACC

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TATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCTCTTGGGGCCAAACTTGG
CGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACCCTGAACCTAACAAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAG
GCCTGTAGTAATTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATTCTCGGGAACTCCT
TCTTGAGGACAAACTTGTTAACAAAAAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGG
TTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTGTTTG
CCAAACCAAAATGCTTGTAAAAATTGAGGTTGCAAAGGTTGTTGCTCTCCTTGCTGAACT
GAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTC

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AAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCATCCTCTTGGGGCCAGAC
TTG*CGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTGCCTTCTTCAAA
TCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATTCTCGGGAAC
TCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTG
GTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTG
TTTGCCAAACCAAAGTGCTTGTAAAAGTTGAGGTTGCAAAGGTTGTTGCTCTCCTTGCTG
AACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTC
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TAACTAGACAACGGCGGAATAGA

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DS 

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CAAAACTTTTAGCTGTTCAGGAATAATCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTCAA
AATGAGCTTATTTAGAAGAAAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTT
CATCCTCTTGGGGCCAGACTTG*CGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGC
AAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGC
TTTGGCCATTCTCGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTT
GTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTG
AATGGTCACGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAG
GTTGTTGCTCTCCTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAA
GAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTC
GATCTCCTAGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCC
GGCCC

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TTGGCGACTCTGAGGCCCTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTGCCTTCTTCAAA
TCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATTCTCGGGAAC
TCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTG
GTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTG
TTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGCTCTCCTTGCTG
AACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTC
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DS 

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TTGGCGACTCTGAGGCCCTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTGCCTTCTTCAAA
TCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATTCTCGGGAAC
TCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTG
GTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTG
TTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGCTCTCCTTGCTG
AACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTC
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DS 

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TCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTG
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TCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATTCTCGGGAAC
TCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTG
GTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTG
TTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGCTCTCCTTGCTG
AACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTC
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GAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTA
GTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATTCTCGGGAACTCCTTCTTGAG
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TACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTGTTTGCCAAACC
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AGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCA
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TCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCCTGTCAGCTGGCTGAATGGTCA
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TCTCCTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAGCAAT
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TGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTG
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TCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCA
CGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGC
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TGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTG
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TCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCA
CGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGC
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QA 1 597 1 597
DS 



AS 2 21

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GCTACTCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCT
TTCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGT
CCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGT
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TCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTG
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GTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATC
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CATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTG
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TTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTCTA
TTTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCA
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CAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTACTGCAAATGGG
ACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTCTCAGTTT
TGATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAGTTATACACACACATG
ATTATTTAATCGCTGAGTCAAAACCTAGTCGTGACATTATCATTCGGAGTCCCATAATAT
GAACCACACAGCCAGTTTCTGCAGTTGCTATCAACTTTGTACCTCTCTCGTTTAGAAAAA
CAAACTAATGTAATAAGAAAATGCTGAAATGTCTCACCG


BQ
30 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 
65 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 55 85 85 55 85 55 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 75 70 40 70 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO71TF U 4
AF RR4GY38TF U 1
AF RR4AQ30TF U 1
AF RR4CZ62TF U 1
AF RR4D070TF U 1
AF RR4D496TF U 2
AF RR4GL25TF U 1
AF RR4D448TF U 4
AF RR4B366TF U 4
AF RR4GL25JQ C 408
AF RR4FO71JQ C 390
AF RR4D496JQ C 555
AF RR4AQ30JQ C 315
AF RR4B366JQ C 362
AF RR4GY38JQ C 347
AF RR4D070JQ C 601
AF RR4CZ62JQ C 531
BS 1 32 RR4AQ30TF
BS 33 33 RR4CZ62TF
BS 34 47 RR4AQ30TF
BS 48 48 RR4CZ62TF
BS 49 390 RR4AQ30TF
BS 391 391 RR4CZ62TF
BS 392 649 RR4AQ30TF
BS 650 650 RR4D070TF
BS 651 651 RR4CZ62TF
BS 652 676 RR4AQ30TF
BS 677 683 RR4D070TF
BS 684 697 RR4B366TF
BS 698 698 RR4AQ30JQ
BS 699 744 RR4B366TF
BS 745 745 RR4AQ30JQ
BS 746 806 RR4B366TF
BS 807 934 RR4AQ30JQ
BS 935 935 RR4B366JQ
BS 936 1002 RR4AQ30JQ
BS 1003 1003 RR4B366JQ
BS 1004 1147 RR4AQ30JQ
BS 1148 1299 RR4CZ62JQ

RD RR4FO71TF 372 0 0
GG
GCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTT**TCACTCAACGCTAC
TCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCTTTCCC
AAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGTCCATC
TTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGTTTCTA
AGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGCGGAAGCATGAGTTTCTCT
GGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTGAAGGG
ATGTTGTATT

QA 3 372 3 372
DS 

RD RR4GY38TF 453 0 0
GGATTGCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAAC
GCTACTCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCT
TTCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGT
CCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGT
TTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTT
TCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTG
AAGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTCCTTCGTCTCGGTG
GTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTG

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4AQ30TF 676 0 0
GGATTGCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTC*ACTTACCTTTAATCCTCTTCACTCAAC
GCTACTCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCT
TTCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGT
CCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGT
TTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTT
TCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTG
AAGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGATCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTG
GTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATC
CTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTT
CATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTG
CAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGT**AGCCACCAG
AGGTATTGGCTCGGGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4CZ62TF 675 0 0
GGATTGCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAAC
GCTACTCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCT
TTCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGT
CCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGT
TTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTT
TCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTG
AAGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTG
GTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATC
CTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTT
CATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTG
CAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTTAAGCCGCCAG
AGGTATTGGCTCGGG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4D070TF 683 0 0
GGATTGCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAAC
GCTACTCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCT
TTCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGT
CCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGT
TTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTT
TCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTG
AAGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTG
GTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATC
CTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTT
CATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTG
CAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAG
AGGTATTGGCTCGGGACAGGTTG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4D496TF 674 0 0
GATTGCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAACG
CTACTCTCAACCTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCTT
TCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGTC
CATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGTT
TCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTT
CTCTGGACAAAGCTGGGGTCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTGA
AGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTGG
TCTTTGGTTGGTCACTTTCGCTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCC
TTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGGTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTC
ATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGC
AGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGTCACCAGA
GGTATTGGCTCGGG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GL25TF 684 0 0
GGATTGCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAAC
GCTACTCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCT
TTCCCAAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGG*AATTACTATGATTCGTCGT
CCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGAT*AAGAAGGAGCAGATGT
TTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTT
TCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTG
AAGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTG
GTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATC
CTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTT
CATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTG
CAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAG
AGGTATTGGCTCGGGACAG
TTGTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4D448TF 680 0 0
GG
GCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAACGCTAC
TCTCAACTTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCTTTCCC
AAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGTCCATC
TTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGTTTCTA
AGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCT
GGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTGAAGGG
ATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTGGTCTT
TGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCC
AGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATTG
ATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGCAGTT
ATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAGAGGTA
TTGGCTCGGGACAGGTTG

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR4B366TF 803 0 0
GG
GCGAGCCGTCTTTCAGGTGCTCTGCTCCACTTACCTTTAATCTTCTTCACTCAACGCTAC
TCTCAACCTGGAAACTCATTCGAAATGCTCAGATTAAACGCTAATTACCCTTTCTTTCCC
AAGAAACCTCACGGGGTTTGCAACAGAAAGCTCGGGAATTACTATGATTCGTCGTCCATC
TTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGTAATAAGATGAAGAAGGAGCAGGTGTTTCTA
AGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCT
GGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGACCTGAAGGG
ATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTGGTCTT
TGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCC
AGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATTG
ATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGCAGTT
ATTCCATACGAAGAGAGCGGATG*TATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAGAGGTA
TTGACTCGGGACGGGTTGTTAGGTTCTTACAAAGTGAAGCCGGTAATCAAAATGCTCAAA
CAAACATTAATTGGAACAG*AGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTCATCTTTGCA
ACACCAGTCGAGGATTTCTTT

QA 3 803 3 803
DS 

RD RR4GL25JQ 718 0 0
CTTCGTCTCGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCT
GCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACC
TTATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGAT
AGATTACTTTCTGCAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGG
GTGAAGCCACCAGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCG
GTAATCAAAATGCTCAAACAAACATTAATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTC
GTACTATTCATCTTTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAAG
GATGAGGTTTCTATTTCAAGAACCAACAACAACAGATTCAATATGAGGAAAGAACAATTG
CTTCGGTTGCCCACAGGTGTAGTGACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCT
GCTGATGGAAGACCAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAG
TACTGCAAATGGGACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCC
GTTTTCTCAGTTTTGATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4FO71JQ 726 0 0
GGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTT
GGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATA
GCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATCGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGA
TGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGCAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGG
TATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGT
TCTTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAAATGCTCAAACAAACATTAATTGGAACAGGAGCT
TTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTCATCTTTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAA
ACCACTCTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTCTATTTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAAT
ATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCACAGGTGTAGTGACCAATGACGACTTGGCA
GCCGCTGCGGCTGAGGCTGCTGATGGAAGACCAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGT
GCATTGGCCGGTGGTCAGTACTGCAAATGGGACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATAT
AGTATAACAACACTATCCGTTTTCTCAGTTTTGATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATC
ATCACT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4D496JQ 561 0 0
AGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGCAGTTATTCCATAC
GAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGTCACCAGAGGTATTGGCTCGG
GACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAAATGCTCAAACAAACATTA
ATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTCATCTTTGCAACACCAGTC
GAGGATTTCTTTAAAACCACTTTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTTTATTTCAAGAACCAAC
AACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCACAGGTGTAGTGACC
AATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCTGCTGATGGAAGACCAGTTTATTGCAGA
GACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTACTTCAAATGGGACGATCTTGTTAAA
TAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTTTCAGTTTTGATTAAACTGGCT
TAGTAAGCCTAAATCATCAC
C

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4AQ30JQ 836 0 0
TGGGATCCCAGTTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGAC*TGAAGGGATGTTGTAT
TCATGGGGAGAATTGGATCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTGGTCTTTGGTTGGTC
ACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAGCCT
TTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTG
AGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGCAGTTATTCCATAC
GAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGT**AGCCACCAGAGGTATTGGCTCGG
GACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAAATGCTCAAACAAACATTA
ATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTCATCTTTGCAACACCAGTC
GAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTCTATTTCAAGAACCAAC
AACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCACAGGTGTAGTGACC
AATGACGACTTGGCAGCCGCCGCGGCTGAGGCTGCTGATGGAAGACCAGTCTATTGCAGA
GACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGATCAGTACTGCAAATGGGACGATCTTGTTAAA
TAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTCTCAGTTTTGATTAAACTGGCT
TAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAGTTATACACACACATGATTATTT
AAT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4B366JQ 786 0 0
AGGGATGTTGTATTCATGGGGAGAATTGGGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTCTCGGTGG
TCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCC
TTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTC
ATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGATTACTTTCTGC
AGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATG*TATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAGA
GGTATTGACTCGGGACGGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAAATGCT
CAAACAAACATTAATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTCATCTT
TGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTTTAT
TTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCAC
AGGTGTAGTGACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTTCGGCTGAGGCTGCTGATGGAAGACC
AGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTACTGCAAATGGGA
CGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTCTCAGTTTT
GATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAGTTATACACACACATGA
TTAT
CT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4GY38JQ 801 0 0
CGACCAAAGAC*TGAAGGGATGT*GTATTCATGGG*AGAATTGGGTCCAACTCAATTCTT
CCTTCGTCTCGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCAGC
TGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAGCCTTTGAGGGTTTTTATAGCTGCCGGGACTGGAAC
CTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGA
TAGATTACTTTCTGCAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTG
GGTGAAGCCACCAGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCC
GGTAATCAAAATGCTCAAACAAACATTAATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATT
CGTACTATTCATCTTTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAA
GGATGAGGTTTCTATTTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATT
GCTTCGGTTGCCCACAGGTGTAGTGACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGC
TGCTGATGGAAGACCAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCA
GTACTGCAAATGGGACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATC
CGTTTTCTCAGTTTTGATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAGT
TATACACACACATGATTATTT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4D070JQ 656 0 0
CAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCAG
AGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAAATGC
TCAAACAAACATTAATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTCATCT
TTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTCTA
TTTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCA
CAGGTGTAGTGACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCTGCTGATGGAAGAC
CAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTACTGCAAATGGG
ACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTTTCAGTTT
TGATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAGTTATACACACACATG
ATTATTTAATCGCTGAGTCAAAACCTAGTCGTGACATTATCATTCGGAGTCCCATAATAT
GAACCACACAGCCAGTTTCTGCAGTTGCTATCAACTTTGTACCTCTCTCGTTTAGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CZ62JQ 769 0 0
TTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGA
TTACTTTCTGCAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTT
AAGCCGCCAGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGGTA
ATCAAAATGCTCAAACAAACATTAATTGGGACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTA
CTATTCATCTTTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTTTAAGTTCTAAGGAT
GAGGTTTCTATTTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAATATGAGGAAAGAACAATTGCTT
CGGTTGCCCACAGGTGTAGTGACCAATGACGATTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCTGCT
GATGGAAGACCAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTAC
TGCAAATGGGACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTT
TTCTCAGTTTTGATTAAACTGGCTTAGTAAGCCTAAATCATCACTAAATACTGAGTTATA
CACACACATGATTATTTAATCGCTGAGTCAAAACCTAGTCGTGACATTATCATTCGGAGT
CCCATAATATGAACCACACAGCCAGTTTCTGCAGTTGCTATCAACTTTGTACCTCTCTCG
TTTAGAAAAACAAACTAATGTAATAAGAAAATGCTGAAATGTCTCACCG

QA 1 769 1 769
DS 



CO CL16Contig2 867 4 3 U
GTGATATATAGGCATTATAATCAAAACTGAAAAAGAGTACATAGTGCATGTGTGTTGTTG
TATTTCTAGTATGACAATTATTTAACAAGATCTTCCCATTTGCAGTATTGGCCACCGGCC
AATGCACGATAGTAACGGTCTCTACAATAGACCGGTCTTCCATCAGCAGCCTCAGCTGCG
GCCGCTGCTAAGTCATCATATGTCACAACATCTGTGGGCAACCGAAGCAATTGTTCTTTT
CTCATATTGAACTTGTTGTTGGTTCTTGAAATAGAAACCTCCGGTTGGCTACCATTTGAT
CTTAGAGTGGTTTTAAAAAAATCCTCAACAGGTGTTGCAAAAACGAATAGGACGAATGCT
GAAACGAGCAAAGCTCCTGTTCCAACTAATGTTTGTTTCAGCATCTTGATTGCTGGCTTC
ACCTTGTACGAACCTAACAACCTGTCCCGAGCCAATACCTCAGGTGGCTTAACCCACATT
TGGCCATCATACCATCCGCTCTCTTCGTACGGAATAACAGCAGAGAGTAATCTATCTCCA
ACATAGCTCCATCCCAGGTAAATTCTCAAGACAATCAATGAAACCAGGAATAAAGTTCCT
GTCCCTGCAGCTATAACAAACCTCAAAGGTTCTCTGGAAGGATTAAAGCTAGCAGCAGCG
ATGGGAACACCAAGAACAGTGAAAGTGACCAACCAAAGACCACCTATACGAAGAAAGAAT
TGGGTTGGACTCAATTCTCCCCATGAATACAACGTCCCTTCCTTCAAAGCCGAATACTCA
TTCACAGGTCTTTGGTCGGAAGGAACTTGTATCTCTGAGCTAGGATCCCAGCTTTGTCCA
GAGAAACTCATGCTTCCACTTCCGTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4DR83JQ U 5
AF RR4EA73JQ U 1
AF RR4EA73TF C 103
AF RR4DR83TF C 581
BS 1 613 RR4EA73JQ
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BS 867 867 RR4DR83TF

RD RR4DR83JQ 563 0 0
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DS 

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TATTTCTAGTATGACAATTATTTAACAAGATCTTCCCATTTGCAGTATTGGCCACCGGCC
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C

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CCTTCAAAGCCGAATACTCATTCACAGGTCTTTGGTCGGAAGGAACTTGTATCTCTGAGC
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DS 



AS 1 22

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ATGTAAATGTGTGGTTGATAAAAATTATCAGTTCCATGATCC


BQ
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97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
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97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 95 97 95 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 
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97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 
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AF RR4A759TF U 1
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AF RR4GV47JQ C 1
AF RR4GJ20TF U 1
AF RR4GJ20JQ C 1
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AF RR4GV47TF U 1
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AF RR4C183JQ C 27
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AF RR4DH93TF U 1
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TGT

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CT

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GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATG
G

QA 1 587 1 587
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TGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTCTGTT*GCTTTCT
ATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAAT
GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATG
G

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DS 

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TGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTCTGTT*GCTTTCT
ATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAAT
GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTT

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DS 

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TGTCGATCTGAGCTTGTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATG
TGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTCTGTT*GCTTTCT
ATTGCTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAAT
GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAA

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DS 

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GTTGGTTTTCCACCAAAGACCCCTTGTTGTGCACTTTTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAA
GCTGCAGTTTGTCTTTGCACCGCTTTTAAAGCCAATATTTTGGGGATTAATCTCAATGTT
CCTGTCGATTTGAGCTTGTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAA
TGTGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATTTTTTGGTTGTGCTTTGTTCTGTT*GCTTT
TTATTGCTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGA
ATGGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATGTAATAT
TTT

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DS 

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TGTCGATCTGAGCTTGTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATG
TGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTCTGTT*GCTTTCT
ATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAAT
GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATA
ATGTAAATGTGTGGTTGAT

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DS 

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GCT
TTTGTTCTGTTTGCTTTCTATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTT
TTGTTATTTCATATTGAATGGGGTTTTAATGTGAGGGTTGAACTTTGTTAATGAAATCGT
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ATGTGTGGGTAGAT

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ATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAAT
GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATA
ATGTAAATGTGTGGT
AGAT

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TGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTCTGTT*GCTTTCT
ATTGTTATTTTGTTTGTGAGGAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAAT
GGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATA
ATGTAAATGTGTGGTTGA
C

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DS 

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TCTATTGTTATTTTGTTTGTGAGGAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTG
AATGGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTA
ATAATGTA

QA 1 188 1 188
DS 

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ATGTAAATGTGTGGTTG
GC

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DS 

RD RR4C183JQ 588 0 0
TTTT
TATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTCCTTCTCACACTTAATCTTCTTTTCTT
CAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAACCCCAAAATCTCCAAA
GAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAAGCTCGGTGTTTGCGC
AGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAAGACCCCTTGTTGTGC
ACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTGCACCGCTCTTAAAGC
CAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTTGTTATTGAACTATTG
TGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTTTGAAAAGATAAATCT
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ATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAATGGG*TTTTAATGTGAGGGTTGAACTT*GCT
AATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGG

QA 5 588 5 588
DS 

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ATGTAAATGTGTGGTTG
GC

QA 1 617 1 617
DS 

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ATGTAAATGTGTGGTTGAT
A

QA 1 619 1 619
DS 

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ATGTAAATGTGTGGTT

QA 1 616 1 616
DS 

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ATGTAAATGTGTGGTTGATAAAAATTATCAGTTCCATGATCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 3 20

CO CL18Contig1 949 5 12 U
CCAGAAAAAATCATGTGAAATTAAACATAAGACATGGGAAGTAGTGAATGAACATAAAAT
TCATATAAGAGGCAAGAATTCACAGAGTAAAATGCCATGAAATGTATGATTACACACAGC
TTTTACATTATAAGAACATCCATGAAATGTTATTCCCACAAAAGAGTTGTCGCAGAGTTT
TAAGACCACCATGGAGCATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCACGGAACAAATAGA
ACCTTTCCACTATCATCAATATCCGCATGAGCCAAGGCAAGCGACAATGGTGCTGGACCT
CTAACGACTCTGCCTTGGGCGTTGTATTGTGATCCATGGCAAGGACATAGGAACTTGTTC
TCAGCTTTGTTCCATGGAACAACACATCCAAGATGAGTGCACACTGCGTTTATACCGTAG
GTCGCTAGAGTTTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTGG
GTCAATGTTCGATCACCAGGACCATGAGTCTTAAGCCATTCTGCTGCAACGACATCATTT
CCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCCCCACCTCCTGATCCAGGAGGGGCAAAG
AAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCTCCCACAAGAAGA
AGATTCAAAAGCTTCCTCTTCTCCATATCAGGAACGTTGTCTGCTGGAATACTCGTTGCT
TGACAAGCAATTCTCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGATGATTCGTCCTTGTT
GGCTTCACAAACATCCCACGCGACATCGCCAAGATAGCTCTTCTACTCGAACCAAGCTGA
GTAGCAGGAGAAAGGGAGGAGGACGCCATTGATGAAGTCATTGAAAGCTTTAGGTGAAGA
TGTGAAAGGGTTTTGGTGATGGAGCTTTTGATGTTAAGGAGGAGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G260JQ U 43
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AF RR4C239JQ U 45
AF RR4C239TF C 321
AF RR4G260TF C 410
BS 1 174 RR4AS96JQ
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BS 176 391 RR4AS96JQ
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BS 393 526 RR4AS96JQ
BS 527 527 RR4C239JQ
BS 528 655 RR4AS96JQ
BS 656 657 RR4C239JQ
BS 658 735 RR4AS96JQ
BS 736 847 RR4C239JQ
BS 848 903 RR4C239TF
BS 904 949 RR4G260TF

RD RR4G260JQ 484 0 0
AGTGAATGAACATAAAATTCATATAAGAGGCAAGAATTCACAGAGTAAAATGCCATGAAA
TGTATGATTACACACAGCTTTTACATTATAAGAACATCCATGAAATGTTATTCCCACAAA
AGAGTTGTCGCAGAGTTTTAAGACCACCATGGAGCATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCA
ACCCACGGAACAAATAGAACCTTTCCACTATCATCAATATCCGCATGAGCCAAGGCAAGT
GACAATGGTGCTGGACCTCTAACGACTCTGCCTTGGGCGTTGTATTGTGATCCATGGCAA
GGACATAGGAACTTGTTCTCAGCTCTGTTCCATGGAACAACACATCCAAGATGAGTGCAC
ACTGCGTTTATACCGTAGGTCGCTAGAGTTTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGA
TCTCCCTTCAATCCTTGGGTCAATGTTCGATCACCAGGACCATGAGTCTTAAGCCATTCT
GCTG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4AS96JQ 735 0 0
CCAGAAAAAATCATGTGAAATTAAACATAAGACATGGGAAGTAGTGAATGAACATAAAAT
TCATATAAGAGGCAAGAATTCACAGAGTAAAATGCCATGAAATGTATGATTACACACAGC
TTTTACATTATAAGAACATCCATGAAATGTTATTCCCACAAAAGAGTTGTCGCAAAGTTT
TAAGACCACCATGGAGCATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCACGGAACAAATAGA
ACCTTTCCACTATCATCAATATCCGCATGAGCCAAGGCAAGCGACAATGGTGCTGGACCT
CTAACGACTCTGCCTTGGGCGTTGTATTGTGATCCATGGCAAGGACATAGGAACTTGTTC
TCAGCTTTGTTCCATGGAACAACACATCCAAAATGAGTGCACACTGCGTTTATACCGTAG
GTCGCTAGAGTTTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTGG
GTCAATGTTCGATCACCAGGACCATGAGTCTTAAGCCATTCTGCTGTAACGACATCATTT
CCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCCCCACCTCCTGATCCAGGAGGGGCAAAG
AAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCTCCCACAA**AGA
AGATTCAAAAGCTTCCTCTTCTCCATATCAGGAACGTTGTCTGCTGGAATACTCGTTGCT
TGACAAGCAATTCTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4C239JQ 812 0 0
TGAATGAACATAAAATTCATATAAGAGGCAAGAATTCACAGAGTAAAATGCCATGAAATG
TATGATTACACACAGCTTTTACATTATAAGAACATCCATGAAATGTTATTCCCACAAAAG
AGTTGTCGCAGAGTTTTAAGACCACCATGGAGCATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAAC
CCACGGAACAAATAGAACCTTTCCACTATCATCAATATCCGCATGAGCCAAGGCAAGCGA
CAATGGTGCTGGACCTCTAACGACTCTGCCTTGGGCGTTGTATTGTGATCCATGGCAAGG
ACATAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCCATGGAACAACACATCCAAGATGAGTGCACAC
TGCGTTTATACCGTAGGTCGCTAGAGTTTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATC
TCCCTTCAATCCTTGGGTCAATGTTCGATCACCAGGACCATGAGTCTTAAGCCATTCTGC
TGCAACGACATCATTTCCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCCCCACCTCCTGA
TCCAGGAGGGGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAG
AGCTCCCACAAGAAGAAGATTCAAAAGCTTCCTCTTCTCCATATCAGGAACGTTGTCTGC
TGGAATACTCGTTGCTTGGCAAGCAATTCTCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTG
ATGATTCGTCCTTGTTGGCTTCACAAACATCCCACGCGACATCGCCAAGATAGCTCTTCT
ACTCGAACCAAGCTGAGTAGCAG
AGAAAGGAG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4C239TF 584 0 0
GTTGTATTGTGATCCATGGCAAGGACATAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCCATGGAAC
AACACATCCAAGATGAGTGCACACTGCGTTTATACCGTAGGTCGCTAGAGTTTTGTCGTT
CTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTGGGTCAATGTTCGATCACCAGG
ACCATGAGTCTTAAGCCATTCTGCTGCAACGACATCATTTCCAAGTGCATCCTTGGCTGG
AGTACCACCACCCCCACCTCCTGATCCAGGAGGGGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGACAAG
CATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCTCCCACAAGAAGAAGATTCAAAAGCTTCCTCTT
CTCCATATCAGGAACGTTGTCTGCTGGAATACTCGTTGCTTGGCAAGCAATTCTCAGACC
AATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGATGATTCGTCCTTGTTGGCTTCACAAACATCCCACG
CGACATCGCCAAGATAGCTCTTCTACTCGAACCAAGCTGAGTAGCAGGAGAAAGGGAGGA
GGACGCCATTGATGAAGTCATTGAAAGCTTTAGGTGAAGATGT
C

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4G260TF 540 0 0
TTATACCGTAGGTCGCTAGAGTTTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCT
TCAATCCTTGGGTCAATGTTCGATCACCAGGACCATGAGTCTTAAGCCATTCTGCTGCAA
CGACATCATTTCCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCCCCACCTCCTGATCCAG
GAGGGGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCTC
CCACAAGAAGAAGATTCAAAAGCTTCCTCTTCTCCATATCAGGGACGTTGTCTGCTGGAA
TACTCGTTGCTTGACAAGCAATTCTCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGATGAT
TCGTCCTTGTTGGCTTCACAAACATCCCACGCGACATCGCCAAGATAGCTCTTCTGCTCG
AACCAAGCTGAGTAGCAGGAGAAAGGGAGGAGGACGCCATTGATGAAGTCATTGAAAGCT
TTAGGTGAAGATGTGAAAGGGTTTTGGTGATGGAGCTTTTGATGTTAAGGAGGAGGAGCC

QA 1 540 1 540
DS 



CO CL18Contig2 955 9 14 U
GCACAAACCAGATCTTATTACACCGAAATACTTGCACAGATAAAATTGTTAAAATTAAAA
TAAAAGACATAGGAAGTGAATGAACATAAAATTCATATAAAGATGCAAGAATTCACAGAG
TAATTTGCCAAGAAATGTATGAGATTACACACAGCTTTTACATTATAATAACATTCAAAC
ACAAAAAGACAGCCATCCCCCATTCTTCTCCCCACAAAAAGAGTTTGTTGTAAGAGAGAT
TTAAGACCACCAAGGGGCATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCATGGAACAAACAC
AACCTTTCCACCGTCATCAATATCGGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACC
TCTAACGACTCTGCCTTGAGCATTGTATTGGGATCCACGGCAAGGACATAGGAACTTGTT
CTCAGCTTTGTTCCATGGCACAACACATCCTAGATGAGTACACACTGCGTTTATACCGTA
GGTCGCTAGTGTCTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTG
AGTCAAGGTTCGATCACCAGCACCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCGGCAATGACATCGTT
TCCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCCAGGAGGAGCAAA
GAAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCCCCGACAAGAAG
AAGATTCAAAGTTTTCCTCTTTTCCATGTCTGGAACGTTGTCTGCTGGTATACTCGTCGC
CTGACAAGCGATTCTCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGGTGACTCGTCCTCGT
TGGCTTCACAAACATCATCCCACGCGACATGGCCAACATAGTAGCACTTCTGCTCGAACC
AAGCTGAGTAGCAGGGGAAATGGGAGAGGACGCCATTGATGTAGTCCTTCGAAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 40 40 40 0 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK25JQ U 78
AF RR4GK25TF C 78
AF RR4DQ16JQ U 1
AF RR4GT23JQ U 78
AF RR4DV04JQ U 1
AF RR4GK27JQ U 78
AF RR4GT23TF C 226
AF RR4DQ16TF C 252
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BS 1 103 RR4DQ16JQ
BS 104 104 RR4GK27JQ
BS 105 130 RR4DQ16JQ
BS 131 131 RR4GK27JQ
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BS 366 368 RR4GT23JQ
BS 369 660 RR4DQ16JQ
BS 661 743 RR4DV04JQ
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BS 745 840 RR4DV04JQ
BS 841 856 RR4GK27JQ
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RD RR4GK25JQ 285 0 0
GG
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TGAGATTACACACAGCTTTTACATTATAATAACATTCAAACACAAAAAGACAGCCATCCC
CCATTCTTCTCCCCACAAAAAGAGTTTGTTGTAAGAGAGATTTAAGACCACCAAGGGGCA
TCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCATGGAACAAACACAACCTTTCCACCGTCATCA
ATATCCGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACCTC

QA 3 285 3 285
DS 

RD RR4GK25TF 285 0 0
GG
ATGAACATAAAATTCATATGAAGATGCAAGAATTCACAGAGTAATTTGCCAAGAAATGTA
TGAGATTACACACAGCTTTTACATTATAATAACATTCAAACACAAAAAGACAGCCATCCC
CCATTCTTCTCCCCACAAAAAGAGTTTGTTGTAAGAGAGATTTAAGACCACCAAGGGGCA
TCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCATGGAACAAACACAACCTTTCCACCGTCATCA
ATATCCGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACCTC

QA 3 285 3 285
DS 

RD RR4DQ16JQ 660 0 0
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TAAAAGACATAGGAAGTGAATGAACATAAAATTCATATAAAGAGGCAAGAATTCACAGAG
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TCTAA***CTCTGCCTTGAGCATTGTATTGGGATCCACGGCAAGGACATAGGAACTTGTT
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GGTCGCTAGTGTCTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTG
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TCCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCCAGGAGGAGCAAA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4GT23JQ 666 0 0
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TATGAGATTACACACAGCTTTTACATTATAATAACATTCAAACACAAAAAGACAGCCATC
CCCCATTCTTCTCCCCACAAAAAGAGTTTGTTGTAAGAGAGATTTAAGACCACCAAGGGG
CATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCATGGAACAAACACAACCTTTCCACCGTCAT
CAATATCGGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACCTCTAACGACTCTGCCTT
GAGCATTGTATTGGGATCCATGGCAAGGACATAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCCATG
GCACAACACATCCTAGATGAGTGCACACTGCGTTTATACCGTAGGTCGCTAGTGTCTTGT
CGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTGAGTCAAGGTTCGATCAC
CAGCACCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCGGCAATGACATCGTTTCCAAGTGCATCCTTGG
CTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCCAGGAGGAGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGA
CAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCCCCGACAAGAAGAAGATTCAAAGTTTTCC
TCTTTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4DV04JQ 840 0 0
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TAAAAGACATAGGAAGTGAATGAACATAAAATTCATATAAAGAGGCAAGAATTCACAGAG
TAATTTGCCATGAAATGTATGAGATTACACACAGCTTTTACATTATAATAACATTCAAAC
ACAAAAAGACAGCCATCCCCCATTCTTCTCCCCACAAAAAGAGTTTGTTGTAAGAGAGAT
TTAAGACCACCAAGGGGCATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCATGGAACAAACAC
AACCTTTCCACCGTCATCAATATCGGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACC
TCTAA***CTCTGCCTTGAGCATTGTATTGGGATCCACGGCAAGGACATAGGAACTTGTT
CTCAGCTTTGTTCCATGGCACAACACATCCTAAATGAGTACACACTGCGTTTATACCGTA
GGTCGCTAGTGTCTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTG
AGTCAAGGTTCGATCACCAGCACCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCGGCAATGACATCGTT
TCCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCCAGGAGGAGCAAA
GAAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCCCCGACAAGAAG
AAGATTCAAAGTTTTCCTCTTTTTCATGTCTGGAACGTTGTCTGCTGGTATACTCGTCGC
CTGACAAGCGATTCTCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGGTGACTCGTCCTCGT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4GK27JQ 779 0 0
GAATGAACATAAAATTCATATAAAGATGCAAGAATTCACAGAGTAATTTGCCAAGAAATG
TATGAGATTACACACAGCTTTTACATTATAATAACATTCAAACACAAAAAGACAGCCATC
CCCCATTCTTCTCCCCACAAAAAGAGTTTGTTGTAAGAGAGATTTAAGACCACCAAGGGG
CATCACCAGTCCTGAAGTCAGTTTCAACCCATGGAACAAACACAACCTTTCCACCGTCAT
CAATATCCGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACCTCTAACGACTCTGCCTT
GAGCATTGTATTGGGATCCATGGCAAG*ACATAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCCACG
GCACAACACATCCTAGATGAGTGCACACTGCGTTTATACCGTAAGTCGCTAGTGTCTTGT
CGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTTAATCCTTGAGTCAAGGTTCGATCAC
CAGCGCCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCTGCAATGACATCGTTTCCAAGTGCATCCTTGG
CTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCAGATCCAGGAGGAGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGA
CAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCCCCGACAAGAAGAAGATTCAAAGTTTTCC
TCTTTTCCATGTCTGGAACGTTGTCTGCTGGAATACTCGTCGCCTGACAAGCGATTCTCA
GACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGGTGACTCGTCCTCGTTGGCTTCACAAACATC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4GT23TF 730 0 0
TTG
TGTAAGAGAGATT*AAGACCACCAAGGGGCATCACCAGTC*TGAAGTCAGTTTCAACCCA
TGGAACAAACACAAC*TTTCCACCGTCATCAATATCGGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAA
TGGAGCTGGACCTCTAACGACTCTGCCTTGAGCATTGTATTGGGATCCATGGCAAGGACA
TAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCCATGGCACAACACATCCTAGATGAGTGCACACTGC
GTTTATACCGTAGGTCGCTAGTGTCTTGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCC
CTTCAATCCTTGAGTCAAGGTTCGATCACCAGCACCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCGGC
AATGACATCGTTTCCAAGTGCATCCTTGGCTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCC
AGGAGGAGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGC
CCCGACAAGAAGAAGATTCAAAGTTTTCCTCTTTTCCATGTCTGGAACGTTGTCTGCTGG
TATACTCGTCGCCTGACAAGCGATTCTCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGGTG
ACTCGTCCTCGTTGGCTTCACAAACATCATCCCACGCGACATGGCCAACATAGTGGCACT
TCTGCTCGAACCAAGCTGAGTAGCAGGGGAAATGGGAGAGGACGCCATTGATGTAGTCCT
TCGAAAG

QA 4 730 4 730
DS 

RD RR4DQ16TF 709 0 0
CAA
GGGCATCACCAGTC*TGAAGTCAGTT*CAACCCATGGAACAAACACAACCTTTCCAC*GT
CATCAATATCGGCATGTGCCAAGGCAAGCGACAATGGAGCTGGACCTCTAA***CTCTGC
CTTGAGCATTGTATTGGGATCCACGGCAAGGACATAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCC
ATGGCACAACACATCCTAGATGAGTACACACTGCGTTTATACCGTAGGTCGCTAGTGTCT
TGTCGTTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTGAGTCAAGGTTCGAT
CACCAGCACCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCGGCAATGACATCGTTTCCAAGTGCATCCT
TGGCTGGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCCAGGAGGAGCAAAGAAGGTAGCGTAAG
GGACAAGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCCCCGACAAGAAGAAGATTCAAAGTTT
TCCTCTTTTCCATGTCTGGAACGTTGTCTGCTGGTATACTCGTCGCCTGACAAGCGATTC
TCAGACCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGGTGACTCGTCCTCGTTGGCTTCACAAACA
TCATCCCACGCGACATGGCCAACATAGTAGCACTTCTGCTCGAACCAAGCTGAGTAGCAG
GGGAAATGGGAGAGGACGCCATTGATGTAGTC
CTTCGAAAGATTCC

QA 4 695 4 695
DS 

RD RR4DV04TF 581 0 0
GCATTGTATTGGGATCCACGGCAAGGACATAGGAACTTGTTCTCAGCTTTGTTCCATGGC
ACAACACATCCTAGATGAGTACACACTGCGTTTATACCGTAGGTCGCTAGTGTCTTGTCG
TTCTCCACAACTAGGTAAGTTGGATCTCCCTTCAATCCTTGAGTCAAGGTTCGATCACCA
GCACCATGAGTCTTGAGCCATTCTGCGGCAATGACATCGTTTCCAAGTGCATCCTTGGCT
GGAGTACCACCACCTCCACCTCCGGATCCAGGAGGAGCAAAGAAGGTAGCGTAAGGGACA
AGCATGAAGCCAGTAGGGAGAGAAAGAGCCCCGACAAGAAGAAGATTCAAAGTTTTCCTC
TTTTCCATGTCTGGAACGTTGTCTGCTGGTATACTCGTCGCCTGACAAGCGATTCTCAGA
CCAATCTTCTCCTTCCTCACCATCTGGTGACTCGTCCTCGTTGGCTTCACAAACATCATC
CCACGCGACATGGCCAACATAGTAGCACTTCTGCTCGAACCAAGCTGAGTAGCAGGGGAA
ATGGGAGAGGACGCCATTGATGTAGTC
CTTCGAAAGATTCC

QA 1 567 1 567
DS 



CO CL18Contig3 840 6 14 U
GGGGACTTCATCAATGGCGTCCTCCTCCCTTTCTCCTGCTACTCAGCTTGGTACGAGCAG
AGGAGCTATGTTGGCGATGTCGCGTGTGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAACCATCA
GATGTTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATTGCTTGTCAAGCAACGAGTATACCAGC
AGACAACGTTCCGGATATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATCTTCTACTTGTGGGAGCTCT
TTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCCCCTCCTGGATC
AGGAGGTGGGGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAATGATGTCGTTGCAGC
AGAATGGCTTAAGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGACCCAAGGATTGAAGGGAGA
TCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGT
GTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCC
TTGCCATGGATCACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCACCATTGTC
GCTTGCCTTGGCTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGGTTCTATTTGTTCCGTGGGT
TGAAACTGACTTCAG*ACTGGTGATGCTCCATGGTGGTCTTAAAACTCTGCGACAACTCT
TTTGTGGGAATAACATTTCATGGATGTTCTTATAATGTAAAAGCTGTGTGTAATCATACA
TTTCATGGCATTTTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTATATGAATTTTATGTTCATTCACT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4BT91TF U 58
AF RR4H166TF U 1
AF RR4EN85TF U -1
AF RR4CC39TF U 58
AF RR4H166JQ C 68
AF RR4EN85JQ C 162
BS 1 195 RR4H166TF
BS 196 196 RR4EN85TF
BS 197 466 RR4H166TF
BS 467 467 RR4EN85TF
BS 468 695 RR4H166TF
BS 696 696 RR4EN85TF
BS 697 704 RR4H166TF
BS 705 705 RR4EN85TF
BS 706 729 RR4H166TF
BS 730 747 RR4EN85TF
BS 748 754 RR4CC39TF
BS 755 755 RR4H166JQ
BS 756 787 RR4CC39TF
BS 788 840 RR4H166JQ

RD RR4BT91TF 614 0 0
G
AGAGGAGCTATGTTGGCGATGTCGCGTGTGAT*TTTGTTAAGCCAACGAGGACGAACCAT
CAGATGTTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATTGCTTGTCAAGCAACGAGTATACCA
GCAGACAACGTTCCGGATATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATCTTCTACTTGTGGGAGCT
CTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCCCCTCCTGGA
TCAGGAGGTGGGGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAATGATGTCGTTGCA
GCAGAATGGCTTAAGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGACCCAAGGATTGAAGGGA
GATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGACCTACGGTATAAACGCA
GTGTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGT
CCTTGCCATGGATCACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCACCATTG
TCGCTTGCCTTGGCTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGGTTCTATTTGTTCCGTGG
GTTGAAACTGACT

QA 2 614 2 614
DS 

RD RR4H166TF 732 0 0
GGGGACTTCATCAATGGCGTCCTCCTCCCTTTCTCCTGCTACTCAGCTTGGTACGAGCAG
AGGAGCTATGTTGGCGATGTCGCGTGTGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAACCATCA
GATGTTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATTGCTTGTCAAGCAACGAGTATACCAGC
AGACAACGTTCCGGACATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATCTTCTACTTGTGGGAGCTCT
TTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCCCCTCCTGGATC
AGGAGGTGGGGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAATGATGTCGTTGCAGC
AGAATGGCTTAAGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGACCCAAGGATTGAAGGGAGA
TCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGACCTACAGTATAAACGCAGT
GTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCC
TTGCCATGGATCACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCACCATTGTC
GCTTGCCTTGGCTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGGTTCTATTTGTTCCGTGGGT
TGAAACTGACTTCAG*ACTGGTGATGCTCCATGGTAGTCTTAAA*CTCTGCGACAACTCT
TTTGTGGGA
TAC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4EN85TF 749 0 0
GGAAT
GACTTCATCAATGGCGTCCTCCTCCCTTTCTCCTGCTACTCAGCTTGGTACGAGCAGAGG
AGCTATGTTGGCGATGTCGCGTGTGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAACCATCAGAT
GTTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATTGCTTGTCAAGCAACGAGTATACCAGCAGA
CAACGTTCCGGATATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATCTTCTACTTGTGGGAGCTCTTTC
TCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCCCCTCCTGGATCAGG
AGGTGGGGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAATGATGTCGTTGCAGCAGA
ATGGCTTAAGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGACCCAAGGATTGAAGGGAGATCC
AACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTG
CACTCATCTTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTGAGAACAAGTCCCTATGTCCTTG
CCATGGATCACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCACCATTGTCGCT
TGCCTTGGCTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGGTTCTATTTGTTCCGTGGGTTGA
AACTGACTTCAG*ACTGGTGATGCTCCATGGTGGTCTTAAAACTCTGCGACAACTCTTTT
GTGGGAATAACATTTCATGGATGT

QA 6 749 6 749
DS 

RD RR4CC39TF 730 0 0
G
AGAGGAGCTATGTTGGCGATGTCGCGTGTGAT*TTTGTTAAGCCAACGAGGACGAACCAT
CAGATGTTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATTGCTTGTCAAGCAACGAGTATACCA
GCAGACAACGTTCCGGATATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATCTTCTACTTGTGGGAGCT
CTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCCCCTCCTGGA
TCAGGAGGTGGGGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAATGATGTCGTTGCA
GCAGAATGGCTTAAGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGACCCAAGGATTGAAGGGA
GATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGACCTACGGTATAAACGCA
GTGTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGT
CCTTGCCATGGATCACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCACCATTG
TCGCTTGCCTTGGCTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGGTTCTATTTGTTCCGTGG
GTTGAAACTGACTTCAG*ACTGGCGATGCTCCATGGTGGTCTTAAAACTCTGCGACAACT
CTTTTGTGGGAATAACATTTCATGGATGTTCTTATA*TGTAAAAGCTGTGTGTAATCATA
CATTTCATG

QA 2 730 2 730
DS 

RD RR4H166JQ 773 0 0
TATG
TGGCGATGTCGCGTGTGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAACCATCAGATGTTGAGGA
AGGAGAAGATTGGTCTGAGAATTGCTTGTCAAGCAACGAGTATACCAGCAGACAACGTTC
CGGACATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATCTTCTACTTGTGGGAGCTCTTTCTCTCCCTA
CTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCCCCTCCTGGATCAGGAGGTGGGG
GTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAATGATGTCGTTGCAGCAGAATGGCTTA
AGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGACCCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACC
TAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGACCTACAGTATAAACGCAGTGTGCACTCATC
TTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGAT
CACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCACCATTGTCGCTTGCCTTGG
CTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGGTTCTATTTGTTCCGTGGGTTGAAACTGACT
TCAGGACTGGTGATGCTCCATGGTAGTCTTAAAACTTTGCGACAACTCTTTTGTGGGAAT
AACATTTCATGGATGTTCTTATAATGTAAAAGCTGTGTGTAATCATACATTTCATGGCAT
TTTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTATATGAATTTTATGTTCATTCACT

QA 5 773 5 773
DS 

RD RR4EN85JQ 679 0 0
AAGCAACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCGGATATGGAGAAGAGGAAACTTTTGAATC
TTCTACTTGTGGGAGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCT
TCTTTGCCCCTCCTGGATCAGGAGGTGGGGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTG
GAAATGATGTCGTTGCAGCAGAATGGCTTAAGACTCATGGTCCTGGTGATCGAACATTGA
CCCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAAACTCTAGCGA
CCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTTCCATGGAACAAAGCTG
AGAACAAGTCCCTATGTCCTTGCCATGGATCACAATACAACGCCCAAGGCAGAGTCGTTA
GAGGTCCAGCACCATTGTCGCTTGCCTTGGCTCATGCGGATATTGATGATAGTGGAAAGG
TTCTATTTGTTCCGTGGGTTGAAACTGACTTCAGGACTGGTGATGCTCCATGGTGGTCTT
AAAACTCTGCGACAACTCTTTTGTGGGAATAACATTTCATGGATGTTCTTATAATGTAAA
AGCTGTGTGTAATCATACATTTCATGGCATTTTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTATATG
AATTTTATGTTCATTCAC
C

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 21

CO CL19Contig1 852 17 6 U
CTTATCTCCTATCCACTCTCCAAAGAGAGAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAA
TAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAG
AAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCAC
CTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGA
TGATGTTGTTATTCAGTTCACCAACCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATG
GGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAG
CCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAATCTGAGGAAGCTAGCGGAGCAGTTGAAGAAGCA
ACCTACTGGTGAAGGTAATGCCTCAGCAACCATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCC
AGATCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTCC
TGCTCCTGCTGCTGCGTCTTCCTAGACAAAAAAAAAAA*GCACTTGGATTTCTGCGTATC
TTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACT
TTCCCAGATAATGATTTTAAGTTTTTCTTTTTTATCTAATTGATTATTTCATCTGGTTCT
CGTGTCTCCATTTCTTACATGGACTGGATTGGATCTGATGTGACACATTTGTCACTTTTC
TTACCATTTGTCACTTTTCTTACATATCTAGTCACCACCTGTGTTGTTTGAGTTTCTTCT
CAAACTTTCCAG


BQ
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
60 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 80 80 80 80 
80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 75 75 75 75 75 75 45 40 20 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
55 70 70 55 70 70 70 70 70 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4FW49TF U 13
AF RR4EM02TF U 13
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AF RR4BD04JQ C 5
AF RR4FA58TF U 13
AF RR4GW21TF U 53
AF RR4F544JQ C 138
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G

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TTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACT
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G

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C

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QA 1 684 1 684
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TGCGTCTTCCTAGACAAAAAAAAAAA*GCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGTT
TGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATAAT
GATTTTAAGTTTTTCTTTTT*ATC
C

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DS 

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TCAGTTCACCAACCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGG
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TGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATA*T
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QA 1 684 1 684
DS 

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AAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGAT
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CCTGCTGCTGCGTCTTCCTAGACAAAAAAAAAAAAGCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTA
TATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCC
CAGATAATGATTTTAAGTTTTTCTTTTTCATCTAATTGATTATTTCA
CC

QA 1 707 1 707
DS 

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TGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTAT
TCAGTTCACCAACCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTGGCGG
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AGGTAATGCCTCGGCAACCATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGATCTTGTAGC
TGGTGAGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTCCTGCTCCTGCTGC
TGCGTCTTCCTAGACAAAAAAAAAA**GCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGTT
TGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTTCGACCAGATTCTACTT*CCCAGATA*T
GATTTTAAGTTTTTCTTTTT*ATCTAATTGATTATT
CC

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DS 

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G
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CTGCTCCTGCTCCTGCTGCTGCGTCTTCCTAGACAAAAAAAAAA**GCACTTGGATTTCT
GCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGA
TTCTACTTTCCCAGATAATGATTTTAAGTTTTTCTTTTTTATCTAATTGATTATTTCATC
TG

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DS 

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ATGCCTCAGCAACCATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGATCTTGTAGCTGGTG
AGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTCCTTCTCCTGCTGCTGCGT
CTTCCTAGACAAAAAAAAAAA*GCACCTGGATTTTTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTC
TCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGGTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATAATGATTT
TAAGTTTTTCTTTTTTATCTAATTGATTATTTCATCTGGTTCTCGTGTCTCCATTTCTTA
CATGGACTGGATTGGATCTGATGTGACACATTTGTCACTTTTCTTACCATTTGTCACTTT
TCTTACATATCTAGTCACCACCTGTGTTGTTTGAGTTTCTTCTCAAACTTTCCAG

QA 1 715 1 715
DS 



CO CL19Contig2 749 4 6 U
TTTTTTTTCAGATGAAATAATCAATTAGATAAAAAGAAGACCTTAAAATCATTATCTGGG
AAAGTAGAATCTGGTCGGAAACACTACAAAAGAAAAGGATGGAGAGAACAAACATACATA
AAGATACGCAGAAATCCAAGTGCTTTTTTTT*GTCTAGGAAGACGCAGCAGCAGCAGGAG
CAGCTACTTTCTCTTCAGCAGCGGCAGCTTCGAATGTCTCACCAGCTACAAGATCTGGGA
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TCTTCAACTGCTCTGCTAGCTTCCTCAGATTGTCCATGTTGTCTGGCCCGAGTTGGCTGA
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TGTTTGCAGCAATTGAAGCTTGAACCTTAGGATTGGTGAACTGAATAACAACATCATCTT
TAAAGATGTTAACTTCTTCAATTCCTGGAATGGAGTTAACCCCGATTCTCTTCAAGGTGC
TTTGAAGCTTCTTGTCATCAGTTGTATTGGTCTTGTGCACAGCCTTCTTCTTTCTTCTTA
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TCTTGGAGATTTGATTATTAGCTTGTTTCTCTCTTTGAAGAGTGCAAAGGAGATAAGAAT
AAATAAACAGAGAGAGATGCGGGCGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AAC
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DS 



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BQ
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25 25 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED25TF U 282
AF RR4C684TF U 111
AF RR4FL26TF U 1
AF RR4DU42TF U 226
AF RR4GF14TF U 408
AF RR4GP02TF U 317
AF RR4DN30TF U 410
AF RR4DU42JQ C 410
AF RR4DN30JQ C 411
AF RR4BM80JQ C 429
AF RR4C684JQ C 520
AF RR4ED25JQ C 578
AF RR4FL26JQ C 468
AF RR4BE32JQ C 952
AF RR4BE32TF U 952
AF RR4GP02JQ C 1112
AF RR4GF14JQ C 667
AF RR4A718JQ C 706
AF RR4EV02TF U 1050
AF RR4A718TF U 706
AF RR4CE77JQ U 1093
BS 1 341 RR4FL26TF
BS 342 342 RR4C684TF
BS 343 375 RR4FL26TF
BS 376 376 RR4C684TF
BS 377 533 RR4FL26TF
BS 534 534 RR4C684TF
BS 535 606 RR4FL26TF
BS 607 607 RR4C684TF
BS 608 698 RR4FL26TF
BS 699 699 RR4C684TF
BS 700 702 RR4FL26TF
BS 703 703 RR4C684TF
BS 704 719 RR4FL26TF
BS 720 720 RR4C684TF
BS 721 741 RR4FL26TF
BS 742 742 RR4DU42TF
BS 743 791 RR4FL26TF
BS 792 792 RR4DU42TF
BS 793 801 RR4FL26TF
BS 802 887 RR4DU42TF
BS 888 991 RR4GP02TF
BS 992 992 RR4DN30TF
BS 993 1023 RR4GP02TF
BS 1024 1091 RR4DN30TF
BS 1092 1094 RR4EV02TF
BS 1095 1108 RR4DN30TF
BS 1109 1109 RR4EV02TF
BS 1110 1128 RR4DN30TF
BS 1129 1129 RR4EV02TF
BS 1130 1153 RR4DN30TF
BS 1154 1334 RR4EV02TF
BS 1335 1335 RR4A718TF
BS 1336 1363 RR4EV02TF
BS 1364 1364 RR4A718TF
BS 1365 1381 RR4EV02TF
BS 1382 1842 RR4CE77JQ

RD RR4ED25TF 255 0 0
GATGTAACCCCTATGCCACATAATGGTTGTAGACCCCCTAAAAAACGACGTGTATAGAAC
TAAATAAAGGCTGAAAGGGTTTCAAGAGAAATAAATGATTCAATGATCTGATCAAATAAA
ATTACTATGGTTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTT
GAATCAAGAAGAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATG
AAAGGTCAAGCCGAC

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4C684TF 626 0 0
G
CAAGAAGAGGAACACCTTTTGCTGCTCAAACCGCAGCAGGAAATGCTATTCGAGCGGTAG
TGGATCAAGGTATGCAACGAGCTGAAGTAAGGATAAAAGGCCCTGGACTGGGAAGAGATG
CAGCATTACGAGCTATTCGTAGAAGCGGTATACTTTTAAGTTTCGTACGAGATGTAACCC
CTATGCCACATAATGGTTGTAGACCCCCTAAAAAACGACGTGTATAGAACTAAATAAAGG
CTGAAAGGGTTTCAAGAGAAATAAATGATTCAATGATCTGATCAAATAAAATTACTATGG
TTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAGAA
GAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCAAG
CCGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATGTA
TTACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCAAG
AATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATATG
GAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGT

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR4FL26TF 807 0 0
GGGGAGTTATTCATGTTCAAGCAAGTTTCAACAATACCATTGTGACCGTTACAGATGTAC
GGGGTCGGGTAATTTCCTGGTCCTCCGCGGGTACTTGTGGATTCAGGGGTACAAGAAGAG
GAACACCTTTTGCTGCTCAAACCGCAGCAGGAAATGCTATTCGAGCGGTAGTGGATCAAG
GTATGCAACGAGCTGAAGTAAGGATAAAAGGCCCTGGACTGGGAAGAGATGCAGCATTAC
GAGCTATTCGTAGAAGCGGTATACTTTTAAGTTTCGTACGAGATGTAACCCCTATGCCAC
ATAATGGTTGTAGACCCCCTAAAAAACGACGTGTATAGAAC*AAATAAAGGCTGAAAGGG
TTTCAAGAGAAATAAGTGATTCAATGATCTGATCAAATAAAATTACTATGGTTCGAGAGA
AAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAGAAGAGACAGTA
AGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCAAGCCAACACAA
TAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATGTATTACACGTG
CAAAATCTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCAAGAATCAGTAC
ATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAA*GTA*TCTATATGGAACGCGCG
ACGCGCTTATTTGTGTCCAAG*TCCCGGATATATAACTGCTCGAGACATAGTTTTACCGC
CCTCTGTGGAA*TCGTTGATA
TACACA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4DU42TF 665 0 0
GAGATGCAGCATTACGAGCTATTCGTAGAAGCGGTATACTTTTAAGTTTCGTACGAGATG
TAACCCCTATGCCACATAATGGTTGTAGACCCCCTAAAAAACGACGTGTATAGAACTAAA
TAAAGGCTGAAAGGGTTTCAAGGGAAATAAATGATTCGATGATCTGATCAAATAAAATTA
CTATGGTTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAAT
CAAGAAGAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAG
GTCAAGCCGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAA
CATGTATTACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTA
TTCAAGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATC
TATATGGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAG
ACATAGTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAA
CGGAACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAA
AA
TGT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4GF14TF 583 0 0
GG
GGTTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAG
AAGAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCA
AGCCGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATG
TATTACACGTGCAAAATTTGAAAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCA
AGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATA
TGGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACAT
AGTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGA
ACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAAT
GTCAAATGACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAA
TGCGAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAA

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR4GP02TF 708 0 0
G
CCTAAAAAACGACGTGTATAGAACTAAATAAAGGCTGAAAGGGTTTCAAGAGAAATAAAT
GATTCAATGATCTGATCAAATAAAATTACTATGGTTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACT
CGGACACTACAATGGAAGTGTGTTGAATCAAGAAGAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGA
CGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCAAGCCGACACAATAGGCATTGCGATGCGA
AGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATGTATTACACGTGCAAAATTTGAGAACATA
CCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCAAGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAAT
TTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATATGGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTC
CAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACATAGTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTT
GATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGAACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAA
ATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAATGTCAAATAACTTTGAAGACCGAAGTTAT
CCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAATGCGAATCATAGTATTCATTCTTATGGG
AATGGGAATGAAAA*CAAGAGATTCTTTTTCTAGAAATATGGACAA
T

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR4DN30TF 744 0 0
GGTTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAG
AAGAGACAGTAAGCGTCTTTACTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCA
AGCCGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATG
TACTACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCA
AGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATA
TGGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACAT
AGTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGA
ACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAAT
GTCAAATAACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAA
TGCGAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCT
AGAAATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAA
TTTGATTAATTTATTTATTCCTC**CTACATGTAGAAGA*GAAACGTTCTATTTAGAGA*
CAATCAACATCAAGTTACTTTACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DU42JQ 776 0 0
T
GTTCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAGA
AGAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCAA
GCCGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATGT
ATTACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCAA
GAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATAT
GGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACATA
GTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGAA
CCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAATG
TCAAATAACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAAT
GCGAATCATAGTATTCATTTTTATGGGAATGGGAACGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCTA
GAAATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAAT
TTGATTAATTTATTTATTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAGAAC
AATCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTTAACC

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR4DN30JQ 776 0 0
GG
TCGAGAGAAAGTCAAAGTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGT*GAATCAAGAAG
AGACAGTAAGCGTCTTTACTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCAAGC
CGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATGTAC
TACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCAAGA
ATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATATGG
AACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACATAGT
TTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGAACC
AATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAATGTC
AAATAACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAATGC
GAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCTAGA
AATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAATTT
GATTAATTTATTTATTCCTC**CTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAGAACAA
TCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTTAACCT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR4BM80JQ 758 0 0
GTATCTACTCGGACACTACAGTGGAAGTGTGT*GAATCAAGAAGAGACAGTAAGCGTCTT
TATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGTCAAGCCGACACAATAGGCATT
GCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACATGTATTACACGTGCAAAATCT
GAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATTCAAGAATCAGTACATGAAATT
TTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATATGGAACGCGCAACGCGCTT
ATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACATAGTTTTACCGCCCTCTGTG
GAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGAACCAATAAATTTGTGTATT
GGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAATGTCAAATAACTTTGAAGAC
CGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAATGCGAATCATAGTATTCAT
TCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCTAGAAATATGGACAAATGGA
AGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAATTTGATTAATTTATTTATT
CCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAGAACAATCAACATCAAGTTACT
TTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTTAACCT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4C684JQ 667 0 0
TGAAAGGTCAAGCCGACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAG
AAGGAACATGTATTACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAG
TCGGTATTCAAGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAA
GTAATCTATATGGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTG
CTCGAGACATAGTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTA
CCTTAACGGAACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATA
GTCTAAAAATGTCAAATAACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGC
CTGTTCAAAATGCGAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGA
TTCTTTTTCTAGAAATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAG
CCTCCCGGAATTTGATTAATTTATTTATTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCT
ATTTAGAGAACAATCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAG
TTAACCT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4ED25JQ 609 0 0
AGAG
GGAACATGTATTACACGTGCAAAATTTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTC
GGTATTCAAGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGT
AATCTATATGGAACGCGCAACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCT
CGAGACATAGTTTTGCCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACC
TTAACGGAACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGT
CTAAAAATGTCAAATAACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCT
GTTCAAAATGCGAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATT
CTTTTTCTAGAAATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCC
TCCCGGAATTTGATTAATTTATTTATTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTAT
TTAGAGAACAATCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTT
AACCT

QA 5 609 5 609
DS 

RD RR4FL26JQ 719 0 0
AGAAGAGACAGTAAGCGTCTTTATTATGGACGCTTTATTCTGTCTCCACTTATGAAAGGT
CAAGCCAACACAATAGGCATTGCGATGCGAAGAGCTTTACTTGGCGAAATAGAAGGAACA
TGTATTACACGTGCAAAATCTGAGAACATACCACATGACTATTCTAACATAGTCGGTATT
CAAGAATCAGTACATGAAATTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTA
TATGGAACGCGCGACGCGCTTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGAC
ATAGTTTTACCGCCCTCTGTGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACG
GAACCAATAAATTTGTGTATTGGATTAAAAATCGAGATGAATCGCGGATATAGTCTAAAA
ATGTCAAATAACTTTGAAGACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAA
AATGCGAATCATAGTATTCATTTTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTT
CTAGAAATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGG
AATTTGATTAATTTATTTATTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAG
AACAATCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTTAACCT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BE32JQ 238 0 0
G
GAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCTAGA
AATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAATTT
GATTAATTTATTTATTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAGAACAA
TCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTTAACCTAAG

QA 2 238 2 238
DS 

RD RR4BE32TF 238 0 0
G
GAATCATAGTATTCATTCTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCTAGA
AATATGGACAAATGGAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAATTT
GATTAATTTATTTATTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAGAACAA
TCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAATAGATTAGTTAACCTAAG

QA 2 238 2 238
DS 

RD RR4GP02JQ 238 0 0
AACGTTTTATTTAGGGAACAATCAACATCAAGTTACTTTACCCCTTTTTCCTTTTCATAA
TAGATTAGTTAACCTAAGAAAAAAAAAAA***GAACTAGGATTTCAATATATTTTTATTG
ACCAATTAGAATTGCCTCCCAGAATCTATAATTGTCTCAAAAAGTCCAATATACATACAT
TATTGGATTTTTTGAATAACAGTCAAGAAGACCTTATCAAAATGGAACATTTTCACAT

QA 1 238 1 238
DS 

RD RR4GF14JQ 715 0 0
TTTTAATGAATTTGAACGAGATTGTATTAAAAAGTAATCTATATGGAACGCGCAACGCGC
TTATTTGTGTCCAAGGTCCCGGATATATAACTGCTCGAGACATAGTTTTACCGCCCTCTG
TGGAAATCGTTGATAATACACAGCATATAGCTACCTTAACGGAACCAATAAATTTGTGTA
TTGGATTAAAAATCGAGAGGAATCGCGGATATAGTCTAAAAATGTCAAATGACTTTGAAG
ACCGAAGTTATCCTATAGATGCTGTATTCATGCCTGTTCAAAATGCGAATCATAGTATTC
ATTTTTATGGGAATGGGAATGAAAAACAAGAGATTCTTTTTCTAGAAATATGGACAAATG
GAAGTTTAACTCCTAAAGAAGCACTTCATGAAGCCTCCCGGAATTTGATTAATTTATTTA
TTCCTTTTCTACATGTAGAAGAAGAAACGTTCTATTTAGAGAACAATCAACATCAAGTTA
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QA 1 715 1 715
DS 

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G
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QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4EV02TF 332 0 0
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QA 1 332 1 332
DS 

RD RR4A718TF 676 0 0
G
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QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4CE77JQ 750 0 0
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AATCCCGCCGGTACTGAAGCCATTAAAAGAACACCCAATAATTTGTTAGGCACTGCACGA
AGTATTTGAAATACAGGAAAGAAATACCAT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 2 21

CO CL21Contig1 1049 18 43 U
CATCTCATAGTCTGTTTATGTTGCTACTTCTCCTGCGTATCTGAGTACACTTGGCAAACC
AGGAAAGAAAATCCTCAAATTCGATGATTCATTACATCACATCTTAAGAGAGAAGGCAAG
AGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGT
CTCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGCTGGAAGAATGT
GATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGCCGTGAAAGATGATGATGG
CAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGT
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GACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGA
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AAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATTGCCTC
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GTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATATAAAAAAAACTGTTATTATCAG
TGGTTTATCTTTTACTGAAAATTTTAATTCGAATATATTTGCAAAATAAGCCATACACAG
TTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGTTGGTCGTTCCCGATTCTCAGATGTAT
ATTGGAACCCTATACACATAAATCAATTTGAGGCAGTAATGTATTTTATTTTTATTTTGT
GAGAATATATTGATACATAAACTTGGTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 25 0 0 0 25 25 25 0 0 0 0 0 25 25 0 0 25 25 0 25 25 25 0 0 0 25 25 0 25 25 0 25 0 25 0 15 15 40 15 40 40 15 20 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 30 60 60 60 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 85 97 97 97 85 85 85 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
95 95 95 90 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 75 75 90 90 90 65 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 
90 90 90 90 85 5 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 55 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 40 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 5 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 35 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY25TF U 1
AF RR4C870TF U 1
AF RR4FY29TF U 104
AF RR4GX32TF U 62
AF RR4D451TF U 97
AF RR4DI18TF U 97
AF RR4DY89TF U 62
AF RR4A532TF U 97
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AF RR4GK81TF U 395
AF RR4FU89JQ C 341
AF RR4F172JQ C 256
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AF RR4FY29JQ C 256
AF RR4DY89JQ C 212
AF RR4BY25JQ C 215
BS 1 61 RR4BY25TF
BS 62 63 RR4C870TF
BS 64 65 RR4BY25TF
BS 66 66 RR4DY89TF
BS 67 70 RR4BY25TF
BS 71 75 RR4DY89TF
BS 76 81 RR4BY25TF
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BS 89 97 RR4BY25TF
BS 98 100 RR4DY89TF
BS 101 101 RR4BY25TF
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BS 103 104 RR4BY25TF
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BS 108 500 RR4BY25TF
BS 501 501 RR4C870TF
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BS 661 663 RR4C870TF
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A**AACGAAA*****CAAATTGGATG**TCATTACATTCTAACT***GAGAGAAGGCAAG
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TAAAGATTTCATCACCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACAGATATGAGCAA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4C870TF 663 0 0
CATCTCATAGTCTGTTTATGTTGCTACTTCTCCTGCGTATCTGAGTACACTTGGCAAACC
AGGAACGAAA*****CAAATTGGATG**TCATTACATTCTAACT***GAGAGAAGGCAAG
AGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGT
CTCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGCTGGAAGAATGT
GATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGCCGTGAAAGATGATGATGG
CAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGT
GAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGA
TCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGT
GACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGA
AGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGC
TAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAA
AAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FY29TF 622 0 0
GG
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ATTGGGTTCTACTGTCTCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGTCGTATAGATATGAGAGT
TGGCTGGAAGAATGTGATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGCCGT
GAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAA
AGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGG
ACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGT
AGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGC
CAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGA
AAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGC
GACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAG
AAGCGATATTGCCTCCAAAT

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR4GX32TF 756 0 0
GGATATAAAATCCTCACTTTCGATTATTCGTTTCCTCACATCTTAAGAGAGAAGGCAAGA
GGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGTC
TCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGCTGGAAGAATGTG
ATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGCCGTGAAAGATGATGATGGC
AACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTG
AAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGAT
CACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTG
ACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAA
GAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCT
AAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAA
AAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAA*GAAGCGATATTGCCTCC
AAATTCTGAAGA*TAGATTGTATTTGTTTAGAGTCCTAACGTCTAA*CAAATACAA*GTG
TTGATATACAAA*CATACTTTTTATCACGTGAGA
TA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4D451TF 726 0 0
GG
ACATCTTAAGAGAAAAGGCAAGAGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGC
TTAGTGGATTGGGTTCTGCTGTCTCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATA
TGAGAGTTGGCTGGAAGAATGTGATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGG
CCGCCGTGAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCT
CAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCAC
ATGAAGGAC*AGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAG
CTGGTGCAGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGG
AAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTTCG
TAAA**AAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAG
AGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAG
GCAAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAGCCCT
AACGTCTAAACAAATACAA*GTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATA
TAAA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4DI18TF 730 0 0
GG
ACATCTTAAGAGAGAAGGCAAGAGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGC
TTAGTGGATTGGGTTCTACTGTCTCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATA
TGAGAGTTGGCTGGAAGAATGTGATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGG
CCGCCGTGAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCT
CAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCAC
ATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAG
CTGGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAGTGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGG
AAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAGGATTTCG
TAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAG
AGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAAAAAGCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAG
GCAAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTTTGAAGAATAGATTGTATTTGCTTAGAGCCCT
AACGTCTAAACAAATACAA*GTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATA
TAAAAAAA

QA 3 730 3 730
DS 

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GGATATAAAATCCTCACTTTCGATTATTCGTTTCCTCACATCTTAAGAGAGAAGGCAAGA
GGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGTC
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AAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAA
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TTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATATAAAAAAA*CTGTTATTATCAGT
GGTTTATCTTTTACTGAAA
TT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4A532TF 848 0 0
GG
ACATCTTAAGAGAGAAGGCAAGAGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTATGC
TTAGTGGATTGGGTTCTACTGTCTCGATCAAAAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATA
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AAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTTCG
TAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAG
AGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCTAG
GCAAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAGCCCT
AACGTCTAAACAAATACAAAGTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATA
TAAAAAAAACTGTTATTATCAGTGGTTTATCTTTTACTGAAAATTTTAATTCGAATATAT
TTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGTTGGT
CGTTCC

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DS 

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GACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGA
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TAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGGGACGGATATGAGCAA
AAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATTGCCTC
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GTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATATAAAAAAAACTGTTATTATCAG
TGGTTTATCTTTTACTGAAAATTTTAATTCGAATATATTTGCAAAATAAGCCATACACAG
TTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGTTGGTCGTTCCCGATTTTCGGATGTAT
ATTGGAACCCTATACACATAAATCAATTTGAGGCAGTAATGTATTTTATTTTT

QA 1 593 1 593
DS 

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GCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGAT
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ATATTTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGT
TGGTCGTTCCCGATTCTCGGATGTATATTGGAACCCTATACACATAAATCAATTTGAGGC
AGTAATGTATTTTATTTTT

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DS 

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GGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAA
AAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTA
GTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAG
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AAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTTTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAGCCCTAA
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AAAAAAACTGTTATAATCAGTGGTTTATCTTTTACTGAAAATTTTAATTCGAATATATTT
GCAAAATAAGCCATACGCAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGTTGGTCG
TTCCCGATTCTCAGATGTATATTGGAACCCTATACATATAAATCAATTTGAGG

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DS 

RD RR4F172JQ 758 0 0
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CGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATAT
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AGATTGTATTTGTTTAGAGCCCTAACGTCTAAACAAATACAAGGTGTTGATATACAAAAC
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TGAAAATTTTAATTCGAATATATTTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTG
ATATAACTGAAATATGTGTTGGTCGTTCCCGATTCTCAGATGTATATTGGAACCCTATAC
ATATAAATCAATTTGAGGAAGTAATGTATTTTATTTTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4C870JQ 734 0 0
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GGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTG
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CAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAA
AAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAG
CTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGA
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TTAATTCGAATATATTTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACT
GAAATATGTGTTGGTCGTTCCCGATTTTCAGATGTATATTGGAACCCTATACACATAAAT
CAATTTGAGGCAGT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4DI18JQ 667 0 0
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GACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTAT
GGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAGTGCTCACACAGCTTCAGATTT
TGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAA
GGATTTTGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGA
AGCCAAAGAGTTGGGGACGGATATGAGCAAAAAAAAAAGCTATATACATTGGAGAGAAAG
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AGAGCCCTAACGTTTAAACAAATACAAGGTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACG
TGAGAATATAAAAAAAACTGTTATTATCAGTGGTTTATTTTTTACTGAAAATTTTAATTC
GAATATATTTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATAT
GTGTTGGTCGTTCCCGATTTTCAGATGTATATTGGAACCCTATACACATAAATCAATTTG
AGGCAGT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4DH55JQ 757 0 0
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GATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAG
TACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTT
TTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGAC
ATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATG
GAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGT
GAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATG
AGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATT
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AAGGTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAGAATATAAAAAAAACTGTTATA
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CACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGTTGGTCGTTCCCGATTTTCAGA
TGTATATTGGAACCCTATACATATAAATCAATTTGAG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4FY29JQ 757 0 0
GCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGCCGTGAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGA
TCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAG
CGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGC
AAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCA
CACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAAT
TACAGAAAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCAT
CGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATAT
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AGATTGTATTTGTTTAGAGCCCTAACGTCTAAACAAATACAAGGTGTTGATATACAAAAC
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TGAAAATTTTAATTCGAATATATTTGCAAAATAAGCCATACCCAGTTATTTTCAGTTTTG
ATATAACTGAAATATGTGTTGGTCGTTCCCGATTCTCAGATGTATATTGGAACCCTATAC
ACATAAATCAATTTGAGGCAGTAATGTATTTTATTTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4DY89JQ 827 0 0
ATAGATATGAGAGT*GGCTGTAAGAATGTGATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGG
GTCATGGCCGCCGTGAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGAT
GATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTG
ACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATG
GAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTT
GTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAA
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GCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGAGAGAAAGC
AGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTA
GAGCCCTAACGTCTAAACAAATACAAGGT*TTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGT
GAGAATATAAAAAAAACTGTTATTATCAGTGGTTTATCTTTTACTGAAAATTTTAATTCG
AATATATTTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATG
TGTTGGTCGTTCCCGATTCTCAGATGTATATTGGAACCCTATACACATAAATCAATTTGA
GGCAGTAATGTATTTTATTTTTATTTTGTGAGAATATATTGATACAT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4BY25JQ 835 0 0
GATATGAGAGT*GGCTGGAAGAATGTGATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTC
ATGGCCGCCGTGAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGAT
GCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACT
GCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAG
AAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGTTCCAGATTTTGTG
GCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGAT
TTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCACCGAAAAAGCTGGTGAAGCC
AAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACG*GCTATATACATTGGTGAGAAAGCAGC
CGAGGCAAAAGAATCGATATTGCCTCCAAATTTTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAG
CCCTAACGTCTAAACAAATACAAGGTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGAG
AATATAAAAAAAACTGTTATTATCAGTGGTTTATCTTTTACTGAAAATTTTAATTCGAAT
ATATTTGCAAAATAAGCCATACACAGTTATTTTCAGTTTTGATATAACTGAAATATGTGT
TGGTCGTTCCCGATTTTCAGATGTATATTGGAACCCTATACACATAAATCAATTTGAGGC
AGTAATGTATTTTATTTTTATTTTGTGAGAATATATTGATACATAAACTTGGTGG

QA 1 835 1 835
DS 



CO CL21Contig2 748 3 4 U
GGGATCTAAAAACCTCACTTTCGATTATTCGTTTCCTCACGTCTTAGGAGAAAAGGCAAG
AGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTGTGCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGT
CTCGATCAGCAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGTTGGAAGAATGT
GATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCTGCCGTGAAAGGTGATGATGG
CAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGT
GAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGA
TCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGT
GACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGA
AGAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGC
TAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAA
AAAAACGGCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATTGCCTCC
AAATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAGCCCTAACGTCTAACAAATACAAGTGTT
GATATACAAAACATACTTTTTATCACGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F172TF U 1
AF RR4FU89TF U 2
AF RR4DH55TF U 2
BS 1 130 RR4F172TF
BS 131 131 RR4DH55TF
BS 132 562 RR4F172TF
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RD RR4F172TF 562 0 0
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CTCGATCAGCGGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGTTGGAAGAATGT
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AGAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGC
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QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4FU89TF 638 0 0
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AAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGAACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGAT
CACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTG
ACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAA
GAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCT
AAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAA
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CA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4DH55TF 747 0 0
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AACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTG
AAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGAT
CACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTG
ACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAA
GAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCT
AAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAA
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AATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAGCCCTAACGTCTAACAAATACAAGTGTTG
ATATACAAAACATACTTTTTATCACGT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 20

CO CL22Contig1 1144 20 38 U
AATAAAATAGACAATATAATTCTATTAGTTGTAACATAAATTGTTAATAAATTAATATGG
ATAATTGAAAATTAAAAATGTCATCTAATGTGGAACCAAAAAAGATTCTCTAAAATGTCA
ACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTT
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AGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCA
GTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTG
GTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAA
GAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGC
CCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAAT
ATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA
*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAG
CATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCG
ACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATG
TGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGA
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ATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*TTCGTACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCTTT
AGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGATGCTACTAGAAACATCAGACAT
ATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTTTTTTTTT*CTTTAAATGTTTT
TTTGTTTTTTTTGTAATTTTTAGAAATTTCTGATGATTTTAGTTTCTAGGAGAAGGGAGT
TCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 50 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 70 85 70 85 85 85 70 85 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 95 65 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 97 97 95 95 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 50 95 55 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 65 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 90 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 70 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E762JQ U 1
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AF RR4CI48TF C 513
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RD RR4E762JQ 397 0 0
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ATAATTGAAAATTAAAAATGTCATCTAATGTGGAACCAAAAAAAATTCTCTAAAATGTCA
ACTATTAAAAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTT
CTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAAATTTTCCAGTTTAAACAACGG
AGGGGGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAAAACCA
GTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGATTTCTGATCTG
GTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCCCTTT

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR4C731JQ 697 0 0
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ATTGAAAATTAAAAATGTCATCTAATGTGGAACCAAAAAAGATTCTCTAAAATGTCAACT
ATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTA
AAACACGACATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGG
GTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTT
TCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTG
GTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGGAGAA
CCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAACATCAAAGTCAAGCCCT
AGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATA
GCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TG
TCATACTCTGTGAGCCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCAT
*GCATCTCTAAA**TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4FW02JQ 652 0 0
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ATGTGGAACCAAAAAAGATTCTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATA
TATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCT
TCTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTG
TTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATG
TTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAA
ACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCA
TTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTT
CCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACC
ATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCT
T*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4A321JQD 668 0 0
GTTGTAACATAAATTGTTAATAAATTAATATGGATAATTGAAAATTAAAAATGTCATCTA
ATGTGGAACCAAAAAAGATT*TCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATA
TATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCT
TCTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTG
TTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATG
TTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAA
ACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCA
TTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATC*ACTTT
CCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGCCCAATGCACC
ATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCT
T*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTG
ATGGTGCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4D244JQ 726 0 0
CTG
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ATGTGGAACCAAAAAAGATTCTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATA
TATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCT
TCTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTG
TTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATG
TTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGGAGTGGAA
ACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCA
TTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTT
CCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATACACC
ATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCT
T*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTG
ATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTT
GTG

QA 4 726 4 726
DS 

RD RR4A321JQ 695 0 0
GTTGTAACATAAATTGTTAATAAATTAATATGGATAATTGAAAATTAAAAATGTCATCTA
ATGTGGAACCAAAAAAGATT*TCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATA
TATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCT
TCTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAAACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTG
TTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATG
TTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAA
ACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCA
TTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATC*ACTTT
CCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGCCCAATGCACC
ATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCT
T*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTG
ATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4E790JQ 726 0 0
AATAAATTAATATGGATAATTGAAAATTAAAAATGTCATCTAATGTGGAACCAAAAAAGA
TTCTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGA
GAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAGATTTTC
CAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTA
TGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTA
TTGCTTTATGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCG
GTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTA
ACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCACA
GCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*CCC
TTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAAGT
CTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAA
CAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTAT
CTGTGC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4EY24JQ 698 0 0
AC
TGTGGAACCAAAAAAGATTCTCTAAAATGCCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGACAT
ATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCTT
CTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGT
TTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGT
TTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAA
CGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCAT
TTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGCCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTC
CTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCA
TAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT
*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTACCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGA
TGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTG
TGATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGC

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR4CI48JQ 680 0 0
GATTCTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATA
GAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAGATTT
TCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTTTT
TATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAG
TATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTC
CGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGT
TAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCA
CAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*C
CCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAA
GTCTTTCCCATTGACAGCGTTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTT
AACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGT
ATCTGTGCTTTTCGATGTGG

QA 1 680 1 680
DS 

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CTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGAGA
AACAGGGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAGATTTTCCA
GTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTATG
ATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATT
GCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCGGT
GTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAAC
ATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCACAGC
CGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*CCCTT
TCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAAGTCT
TTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACA
GCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATCT
GTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGAA
AAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGAC

QA 1 760 1 760
DS 

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AATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCT
CAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCAC
GACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTC
AA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCT
CTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTG
GTCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGAC
GTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCAC

QA 1 469 1 469
DS 

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TCTT
TTCGACAGAGATTT*CCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTT
TTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTT
TGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGGAGTGGAAAC
GTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATT
TTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCC
TACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATACACCAT
AGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*
CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGAT
GGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGT
GATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACG
TAAGACGTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGA
AGTGTACTCGTCAAAAGTAACATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*T
TCGTACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCT
C

QA 5 753 5 753
DS 

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TTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTT
TTAGTAT*GCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCG
CCTCCGGTGTTGGTGTTTGGAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATG
GAGTTAACATCAAAGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAAC
TCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACC
AA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAGCCACTTTTCTTTCTGCTCAA*T
CAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGC
CTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGGTCT
GTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGA
AGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTCG
TCAAAAGTAACATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCCATTCGTACGAAT
TTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGT

QA 1 706 1 706
DS 

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TGCACCATAGCCACGACCAAACCCTTTCCTTTGCTGAAAATGTCATACTCTGTGAACCAC
TTTTCTT*CTGCTCAAATCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAAATCCG
TATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCAT
CAACTTGTGATGTGTTCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGA
ATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACC
CACGACGAAGTGTACTCGTCAAAAGTAACATACCGTTGCAAGCGAATGGTGTAAAGTCCG
TGGCCC*TTCGTACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCTTTAG

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DS 

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CGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGGGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTT
GACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTG
ATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGT
CGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTT
CAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTA
CTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAG
CCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CT
GCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGG
TGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGA
TGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCAATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTA
AGACGTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGCCGCGGGACACCCACGACGAAG
TGTACTCGTCAAAAGTAACATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*TTC
GTACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCA
CACTTGATGCTACTAGAGACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAA

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DS 

RD RR4A321TFB 834 0 0
TTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATC*TGTTTTA
GTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCT
CCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAG
TTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATC*ACTTTCCTACTCTCAACTCC
ACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGCCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*
CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAA
AGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTT
TAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTG
TATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGA
GTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTCGTCA
AAAGTAACATACCGTTGCAAGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*TTCGTACGAATTTC
CTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGATGCT
ACTAGAAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTTTTT
TTTT*CTTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTTGTAATTTTTAGAAATTTCTGAT
CC

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4EY24TF 773 0 0
GTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCT*CCGGAAGTG*AAACGTCGCTTTCGC*T
CCGGTGTTG*TGTT*GAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCA*CAATGGAG
TTAACATCAACGCCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCC
ACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*
CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAA
AGTCTTTACCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTT
TAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTG
TATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGA
GTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTCGTCA
AAAGTAGCATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*TTCGTACGAATTTC
CTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGATGCT
ACTAGAAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTTTTT
TT***CTTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTTGTAATTTTTAGAAATTTCT
CCCT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4DJ03TF 765 0 0
GATCTGGTGGTTGTGACTCT*CCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGC*TCCGGTGTTGGTG
TT*GAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACG
TCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTC
ACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTG
CTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCAT
TGACAGCATTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTA
ATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTT
TCAATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGAAAAGAATT
TCTTGAACTCTCTAGCCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTCGTCAAAAGTAACATAC
CGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*TTCGTACGAATTTCCTCCTCAAGTAC
ATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGATGCTACTAGAGACATC
AGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTTTTTTTTTTCTTTAAA
TGTTTTTTTGTTTTTTTTGTAATTTTTAGAAATTTCTGATG
ATCC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4H986TF 740 0 0
GAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTT*GAAGAACCAGTTTGGGTTCTT
TCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCC
ATCGACTTTCCTACTATCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTC
CAATGCACCATAGCCACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAAC
CACTTTTCTT*CTGCTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAA*T
CCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGC
CATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGA
TGAATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGAC
ACCCACGACGAAGTGTACTCGTCAAAAGTAACATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGT
CCGTGGCCC*TTCGTACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGC
GCCTCGTACACCACACTTGATGCTACTAGAAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTA
TTAACCATTTTCTTATTCTTTTTTTTTTTCTTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTTGTAATT
TTTAGAAATTTCTGATG
ATC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4CI48TF 632 0 0
TCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGC
CACGACCAA*CCCTTTCCTTTGCTGAAA*TGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTT*CTG
CTCAA*TCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCGTTGCATCTCTAAAA*TCCGTATTTGATGGT
GCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGAT
GTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAA
GACGTGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGT
GTACTCGTCAAAAGTAACATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCC*TTCG
TACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCAC
ACTTGATGCTACTAGAAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTT
ATTCTTTTTTTTT**CTTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTTGTAATTTTTAGAAATTTCTG
ATGATTTTAGTTTCTAGGAGAAGGGAGTTCCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 20

CO CL23Contig1 654 20 14 U
GGAAACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCT
CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCCGGTGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
GTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGT
CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
CAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATG
TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGA
AGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTC
TCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTTATCAAGTTTTAAAAAA


BQ
40 40 40 40 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 75 75 75 75 75 45 75 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 50 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 30 30 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 85 97 95 95 95 85 85 85 85 85 85 85 85 35 60 40 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI31TF U 3
AF RR4B445JQ C 1
AF RR4B445TF U 120
AF RR4B701TF U 1
AF RR4G347JQ C 1
AF RR4G347TF U 1
AF RR4GJ94JQ C 1
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AF RR4BS48JQ C 138
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AF RR4E881TF U 6
AF RR4DH61JQ C 7
AF RR4DH61TF U 7
AF RR4GJ94TF U 1
BS 1 119 RR4B701TF
BS 120 157 RR4B445TF
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RD RR4AI31TF 570 0 0
GG
ACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACT
AACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGG
CAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGC
AAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAA
CGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTT
TTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCAT
CAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAA
G

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR4B445JQ 637 0 0
GGAAACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCT
CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGCCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCATGTGGTAGCAGAGTCAATTTCGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
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CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
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TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGA
AGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTC
TCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACCCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4B445TF 518 0 0
TCTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGCCTTCCCGGACTCTGCATTAGA
GGAGCATGTGGTAGCAGAGTCAATTTCGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAAT
GGTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGG
TCCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTA
GCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAAT
GTCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATG
AAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGT
CTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACCCGTGTAAA
CAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4B701TF 637 0 0
GGAAACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCT
CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGCCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCATGTGGTAGCAGAGTCAATTTCGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
GTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGT
CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
CAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATG
TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGA
AGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTC
TCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACCCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACC

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DS 

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CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCATGTGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
GTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGT
CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
CAGCAAAGCAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATG
TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTACCTAGCTAATGA
AGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTC
CCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATACTTCACTCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTT

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DS 

RD RR4G347TF 638 0 0
GGAAACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCT
CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCATGTGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
GTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGT
CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
CAGCAAAGCAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATG
TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTACCTAGCTAATGA
AGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTC
CCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATACTTCACTCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4GJ94JQ 648 0 0
GGAAACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCT
CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCCGGTGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
GTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGT
CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
CAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATG
TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGA
AGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTC
TCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTTATC
AAGTTTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4CW42JQ 426 0 0
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TACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGAC
AAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATC
CCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATG
ACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAA
TTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATT
AGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTA
CTTA
CC

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DS 

RD RR4CW42TF 426 0 0
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TACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGAC
AAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATC
CCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATG
ACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAA
TTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATT
AGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTA
CTTA
CC

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DS 

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GTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGGCAGGGACAGGACT
GGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTCATGTGATGCA
CTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAAACAACCATCA
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GTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGT
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DS 

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TCAAACACAATAATGTCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAAT
CTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAAT
TAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATAT
TTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAG

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DS 

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ACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCCCTCGTAGCAGCAAAACAACCATC
AACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGATAATTATGA
AGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTG
TCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATG
TTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGGAATAATAAACT
AGTAGAACAACAAATTTTACT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4BS48TF 501 0 0
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GTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGGCAGGGACAGGACT
GGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTCATGTGATGCA
CTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAAACAACCATCA
ACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGATAATTATGAA
GTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGT
CGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGT
TGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTA
GTAGAATAACAAATTTTACTT

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DS 

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TTGCTGGTCCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATC
TCTCGTAGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACA
CAATAATGTCAACGATAATTATGAGGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTA
GCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTC
AATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTC
GTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACA
G

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DS 

RD RR4CD07JQ 612 0 0
GG
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GAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGGCAGGGACAGGA
CTGGTATCAGAGAGGCCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTCATGTGATG
CACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAAACAACCAT
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DS 

RD RR4CD07TF 625 0 0
GG
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GAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGGCAGGGACAGGA
CTGGTATCAGAGAGGCCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTCATGTGATG
CACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAAACAACCAT
CAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGATAATTATG
AAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTT
GTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGAT
GT*GTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAAC
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C

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR4E881TF 624 0 0
GG
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G

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DS 

RD RR4DH61JQ 635 0 0
G
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AAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAGGAGCCGG
TGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGGCAG
GGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTC
ATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAA
ACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGA
TAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTT
AGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAG
ACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAA
TAATAAACTAGTAAAATAACAAATTTTACTTATC

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR4DH61TF 635 0 0
G
ATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACTAAC
ACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGTTGG
AAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAGGAGCCGG
TGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATGGTGGCAG
GGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCCGGCTC
ATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAGCAGCAAA
ACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATGTCAACGA
TAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTT
AGTCTTTTGTCGTTTGAATTTGTAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAG
ACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAA
TAATAAACTAGTAAAATAACAAATTTTACTTATC

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR4GJ94TF 654 0 0
GGAAACTATCAACATAGAAAGCCAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCT
CACTAACACTGTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCCCATAACACAGTCTCTCAGAAATGGT
CTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGACTCTGCATTAGAG
GAGCCGGTGGTAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGCGGAAGAATGCGATACAATG
GTGGCAGGGACAGGACTGGTATCAGAGAGACCATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGT
CCGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTACAAATCTCTCGTAG
CAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAAGATCCCCGAGACGTTCAAACACAATAATG
TCAACGATAATTATGAAGTGCAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGA
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TCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAAC
AGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTTATCAAGTTTTAAAAAA

QA 1 654 1 654
DS 



AS 3 17

CO CL24Contig1 738 5 4 U
GTGGCGAGAAGAAAAAAAAAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAG
AGAGATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGTAGTTGAAGGATCTTC
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AGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTATGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCA
TTCATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGT
TCCATCCCAACATTAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGA
GTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTCTTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAA
ACCCGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGGCTGACAAGAACAAGT
ATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGGATAAGGGA
TCCCAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATGA
TTCAATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTAAAATTTCTGAAGACAGGACCAATGAAGT
AGGTCTTGTTTGTTTGGAAAAAAAAAAACATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGAAATCTTC
CTGGTGTTGTTTGGCCTC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4BL94TF U 152
AF RR4BW84TF U 1
AF RR4BY50TF U 1
AF RR4BW84JQ C 4
AF RR4BY50JQ C 14
BS 1 661 RR4BW84TF
BS 662 662 RR4BW84JQ
BS 663 677 RR4BW84TF
BS 678 738 RR4BW84JQ

RD RR4BL94TF 489 0 0
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TTATGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCC
TCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATTAACAGCAATGGAAGCAT
CTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTCTT
GTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGC
TCATATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAA
GTATGCCATGGGCTGAAAAGGATAAGGGATCCCAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATG
CGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATGATTCAATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTT
GAAATTTCT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4BW84TF 677 0 0
GTGGCGAGAAGAAAAAAAAAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAG
AGAGATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGTAGTTGAAGGATCTTC
AGAAGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGC
AGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTATGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCA
TTCATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGT
TCCATCCCAACATTAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGA
GTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTCTTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAA
ACCCGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGGCTGACAAGAACAAGT
ATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGGATAAGGGA
TCCCAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATGA
TTCAATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTAAAATTTCTGAAGACAGGACCAATGAAGT
ATGTCTTGTTTGTTTGG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4BY50TF 677 0 0
GTG
GCGAGAAGAAAAAAAAAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAGAGA
GATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGTAGTTGAAGGATCTTCAGA
AGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGG
CAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTATGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTC
ATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCC
ATCCCAACATTAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTC
CTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTCTTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACC
CGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGGCTGACAAGAACAAGTATG
AGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGGATAAGGGATCC
CAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATGATTC
AATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTAAAATTTCTGAAGACAG*ACCAATGAAGTATG
TCTTGTTTGTTTGG

QA 4 677 4 677
DS 

RD RR4BW84JQ 735 0 0
GCGAGAAGAAAAAAAAAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAGAGA
GATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGTAGTTGAAGGATCTTCAGA
AGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGG
CAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTATGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTC
ATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCC
ATCCCAACATTAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTC
CTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTCTTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACC
CGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGGCTGACAAGAACAAGTATG
AGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGGATAAGGGATCC
CAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATGATTC
AATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTAAAATTTCTGAAGACAGGACCAATGAAGTAGG
TCTTGTTTGTTTGGAAAAAAAAAAACATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGAAATCTTCCTG
GTGTTGTTTGGCCTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4BY50JQ 725 0 0
AAAAAAAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAGAGAGATCGTAGGT
TTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGTAGTTGAAGGATCTTCAGAAGGATCCACC
CACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAAT
GGGTCCTTCAGACAGTCCTTATGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCC
GGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACAT
TAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCAC
CATTTCCAAGGTGCTCTTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCC
TTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGGCTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGC
ACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGGATAAGGGATCCCAAATCCACT
AAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATGATTCAATAGACGAT
CTCTTTCTGTACTCGTTTAAAATTTCTGAAGACAGGACCAATGAAGTAGGTCTTGTTTGT
TTGGAAAAAAAAAAACATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGAAATCTTCCTGGTGTTGTTTG
G
CCTC

QA 1 721 1 721
DS 



CO CL24Contig2 893 10 16 U
GGATTGATGGTGGACGCGACCACAGAGAACAATTACTAATTCCTCTTACGTCCACCACCC
TTTCTTCAAGTCTTGGCTTCTTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGG
CGAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAAAACCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGA
TATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTC
TTGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACCATAATGGGTCC
TTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTA
CCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAG
CAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTC
CAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGT
GCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAG
CTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCT
TTATGAAGAA*AAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCT
CTCGTGTCCTTTTTAAAGTTTCTTAAAA*CTGGACCAAATGATGTGGGTCTTGTTTAAAA
GAAAACATCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGGTCTTGTGGGTGAATTGTGATT
TGATGTTTTATCTTTCTGATTTGGTGAGCCTATCAATTATTCAATTTATCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 15 55 55 55 55 15 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ95TF U 411
AF RR4GQ07TF U 14
AF RR4AA08JQ C 120
AF RR4AA08TF U 120
AF RR4DM83TF U 1
AF RR4GQ07JQ C 81
AF RR4BC94TF U 91
AF RR4GX35TF U 101
AF RR4DM83JQ C 220
AF RR4EQ95JQ C 411
BS 1 279 RR4DM83TF
BS 280 280 RR4GQ07TF
BS 281 646 RR4DM83TF
BS 647 647 RR4GQ07TF
BS 648 678 RR4DM83TF
BS 679 679 RR4BC94TF
BS 680 740 RR4DM83TF
BS 741 743 RR4BC94TF
BS 744 744 RR4GX35TF
BS 745 748 RR4BC94TF
BS 749 749 RR4GX35TF
BS 750 786 RR4BC94TF
BS 787 787 RR4GX35TF
BS 788 848 RR4BC94TF
BS 849 861 RR4GX35TF
BS 862 893 RR4DM83JQ

RD RR4EQ95TF 229 0 0
G
CATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACT
CACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGA
TCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCAC
TGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTAAAATGGAAACCC

QA 2 229 2 229
DS 

RD RR4GQ07TF 663 0 0
GG
GCGACCACGGAGAACAATTACTAATTCCTCTTACGTCCACCACCCTTTCTTCAAGTCTTG
GCTTCTTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGCCAA
GTCTGATACACGCAAAACCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAAGCG
GATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCTTGTAGCGCAGGACC
TGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACCATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTA
CGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCCCC
TAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTG
CCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTATC
GATCTGTTCTTTGTTGACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCA
TATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTA
TGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCTTTATGAAGAA*AAAA
A

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR4AA08JQ 549 0 0
GG
GAAAACCTCGCCAAGTTTGATACACGCAAAACCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGAT
ATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCT
TGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGGGACGATAATGGGTCCT
TCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTAC
CCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGC
AATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCC
AAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTG
CCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGC
TGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCC*AATCCACAAAACTATCTCTT
TATGAAG

QA 3 549 3 549
DS 

RD RR4AA08TF 549 0 0
GG
GAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAAAACCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGAT
ATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCT
TGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCGACGATAATGGGTCCT
TCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTAC
CCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGC
AATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCC
AAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTG
CCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGC
TGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCC*AATCCACAAAACTATCTCTT
TATGAAG

QA 3 549 3 549
DS 

RD RR4DM83TF 740 0 0
GGATTGATGGTGGACGCGACCACAGAGAACAATTACTAATTCCTCTTACGTCCACCACCC
TTTCTTCAAGTCTTGGCTTCTTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGG
CGAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAAAACCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGA
TATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTC
TTGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGACAGGCAACCATAATGGGTCC
TTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTA
CCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAG
CAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTC
CAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGT
GCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAG
CTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTCCAAAACTATCTCT
TTATGAAGAA*AAAAAAA*GTATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCT
CTCGTGTCCTTTTTAAAGTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4GQ07JQ 769 0 0
TTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGCCAAGTCTG
ATACACGCAAAACCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAAGCGGATCT
TGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCTTGTAGCGCAGGACCTGTTG
CTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACCATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTG
GTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCCCCTAAGG
TTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCG
ACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCT
GTTCTTTGTTGACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGT
ACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTA
TGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCTTTATGAAGAA*AAAAAA**G
TATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAGTT
TCTTAAAA*CTGGACCAAATGATGTGGGTCTTGTTTAAAA**AAACATCATCTTTGTGAA
ACTAGAAACTGGTGTTTGGTCTTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BC94TF 758 0 0
GG
GCCTCTCCTAATTGCGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAAAA
CCAAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCA
AGGATCTGCAGAAGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGT
TTCATTGGCAGGCAACCATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCC
TTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGA
CGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGG
AGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAA
CCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACA
AGAACAAGTATGAGTCCACCGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATG
GAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCTTTATGAAGAA*AAAAAAAAGTATTTCCCTAAG
TTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAATTTCTGAAAAACTG
GACCAAATGATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAAAACTTCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGG
TGTTTGGTCTTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTT

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4GX35TF 761 0 0
G
AATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAAAACCAAAGAGA
TCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTC
AGAAGGATCCACCCACCTCTTGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGC
AGGCAACCATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCA
TTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGT
TCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGA
GTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTACCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAA
ACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGT
ATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCC
AATCTACAAAACTATCTCTTTATGAAGAA*AAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATGTA
TGATTCAGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAGTTTCTTAAAA*CTGGACCAAATG
ATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAAAACATCATCTTTGTGAA*CTAGAAACTGGTGTTTGGTC
TTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTTTATCTTTCTGATT

QA 2 761 2 761
DS 

RD RR4DM83JQ 674 0 0
TCAGAAGGATCCACCCACCTCTTGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTG
ACAGGCAACCATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTAC
CATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGT
GTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATG
GAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCC
AAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAA
GTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCC
CCAATCTCCAAAACTATCTCTTTATGAAGAA*AAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATG
TATGATTCAGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAGTTTCTTAAAA*CTGGACCAAA
TGATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAAAACATCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGG
TCTTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTTTATCTTTCTGATTTGGTGAGCCTATCAATTA
TTCAATTTATCCTG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4EQ95JQ 442 0 0
G
CATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACT
CACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGA
TCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCAC
TGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTAAAATGGAAACCCC*AATCCACAAA
ACTATCTCTTTATGAAGAAGAAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTCAGTA
GACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAGTTTCTTAAAA*CTGGACCAAATGATGTGGGTCT
TGTTTAAAAGAAAACATCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGGTCTTGTGGGTGA
ATTGTGATTTGATGTTTT
ATC

QA 2 439 2 439
DS 



CO CL24Contig3 711 2 3 U
GGAAAAACCACGAGAAGAAAAAGGCGATAACCTCGCCAAATCGGAGATACGCGAGAAAAC
CAAAAGAGATCTCGTAAGGTTTTTGGATTCATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTC
AAGGATCTCCAGAAGGATCCACCCACCTCTTGCAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATG
TTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTACGCGGGAGGTGTTTTC
CTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTGGCCTTTAGG
ACCAAGGTGTTCCATCCCAACATTAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTCGACATCTTGAAG
GAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTATCGATCTGTTCTTTGTTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BQ
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QA 1 772 1 772
DS 

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GCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCGATTGTGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTC
AATCTTTCTCAGAGTTATGAATGCCTGATTGTTTGCAATTGCTTGTCCAATAAGTTGAGC
ACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGATAACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTC
CACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTCCTGCGCAGCCACTCGTTTAGCTTCGATTGCAGC
GGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTCGTGATGGAGACATCGTCGAGAGCA*TGTCGAA
GTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGATTCTCTCTGAGT
GATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGA
AGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCTAGGGTGCGGTAAATATGAGGCAAACGGTC
ACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4CV14JQ 759 0 0
GGTAACACTTGTAGAAAATCTTTAAGCTTCG**GATATAAACTAGTGGAAATTCGTATAC
GTCTTTGTCTTTTTGGAGATGCTCCAAATCAATACACCGACCAATCAAATGGAAGTGTCT
CCAAGTTATATTACATCTTAGGGCTAGGCTCCAAGTTCATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGA
GATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCGATTGTGCAATGGTCTGGGCAATCTCTC
TCGCAGCTTCAATCTTTCTCAGAGTTATGAATGCCTGATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGA
TAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGATAACCGCACTCCTCTTGTCTTGCT
CTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTCCTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTT
CGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTCGTGATGGAGACATCATCGAGAG
CAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGCTT
CTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAACAATAGCTTTTAGAGTTTCAT
GGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAG
GCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGT
CATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4B436JQ 749 0 0
GCTTTAAGCTTCG
GATATAAACTAGTGGAAATTCGTGTACGTCTTTGTCTTTTTGGAGATGCTCCAAATCAAT
ACACCGACCAATCAAATGGAAATGTCTCCAAGTTATATTACATCTTAGGGCTAGGCTCCA
AGTTCATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGAGATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCG
ATTGTGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCTTTCTCAGAGTTATGAATG
TCTGATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCAC
GGATAACCGCACTCCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAG
CTTCCTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGA
GAGTCGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAA
TCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACT
GAGCAACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAAT
TCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCC
TAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGTAATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGATAGG
GTCGTGCACGGACGTC

QA 14 749 14 749
DS 

RD RR4EK52TF 769 0 0
GGATATAAACTAGTGGAAATTCGTGTACGTCTTTGTCTTTT*GGAGATGCTCCAAATCAA
TACACCGACCAATCAAATGGAAATGTCTCCAAGTTATATTACATCTTAGGGCTAGGCTCC
AAGTTCATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGAGATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCC
GATTGTGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCTTTCTCAGAGTTATGAAT
GCCTGATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCA
CGGATAACCGCACTCCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCA
GCTTCCTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTG
AGAGTCGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAA
ATCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTAC
TGAGCAACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTT*CACTGTAA
TTCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACC
CTAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGATAG
GGTCGTGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCATGGCAAC
C

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4EK52JQ 781 0 0
AATCTTTAAGCTTCG
GATATAAACTAGTGGAAATTCGTGTACGTCTTTGTCTTTTTGGAGATGCTCCAAATCAAT
ACACCGACCAATCAAATGGAAATGTCTCCAAGTTATATTACATCTTAGGGCTAGGCTCCA
AGTTCATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGAGATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCG
ATTGTGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCTTTCTCAGAGTTATGAATG
CCTGATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCAC
GGATAACCGCACTCCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAG
CTTCCTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGA
GAGTCGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAA
TCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACT
GAGCAACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTT*CACTGTAAT
TCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCC
TAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGATAGG
GTCGTGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAA
CCATGGCACC

QA 16 771 16 771
DS 

RD RR4B436TF 720 0 0
GCACGGATAACCGCACTCCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGC
TCAGCTTCCTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAAT
GTGAGAGTCGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTC
AAAATCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTG
TACTGAGCAACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTG
TAATTCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGA
ACCCTAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGTAATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGA
TAGGGTCGTGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCATGGCAACATGAAATGC
GTGCCTTCCGGGTACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTGAACATGACAGCACGG
TGTCCACCCTCGACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGGCACCGAGCCCACCAATT
ACGCTGACCTTAAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGTGATCCAGGGACGTTGGGCACTTTGTTG
AAACTCATTTCTTTAACACCT******TAGCTCAGGCTCTTAATCACCGGCGATGTTAGG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4CV14TF 760 0 0
GCACGATA
CGCACT*CTCT*GTCT*GCTCTGCTT*CTC*ACA*TGA*CTTAGCACGCTCAGCTTC*TG
TGCAGCCACT*GTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTCGT
GATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTGCG
TATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAAC
AATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCC
TAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGTCC
AATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTGC
ACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCATGGCAACATGAAATGCGTGCCTTCCGG
GTACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTGAACATGACAGCACGGTGTCCACCCTC
GACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGACACCGAGCCCACCAATGACGCTGACCTT
AAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGTGATCCAGGGACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCATTTC
TGTAAGATCT******TAGCTCAGGCTCTTAATTACCGGCGATGTTAGGGGATCACGATC
AGAGGCAGTCAGCAAAGCTTAGGGTTTT
CCCT

QA 9 756 9 756
DS 

RD RR4B221TF 695 0 0
GCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTCGTG
ATGGAGACATCGTCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTGCGT
ATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAACA
ATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCT
AGGGTGCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGTCCA
ATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCGGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTGCA
CGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCATGGCAACATGAAATGCGTGCCTTCCGGG
TACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTGAACATGACAGCACGGTGTCCGCCCTCG
ACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGACACCGAGCCCACCAATGACGCTGACCTTA
AGAAGCGCAGAGAGAGCTGGTGATCCAGGGACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCATTTCT
TTAACACCTGACACTTAGCTCAGGCTCTTAATCACCGGCGATGTTAGGGGATCACGATCA
GAGGCAGTCGGCAAAGCTTAGGGTTTTAGAACTCC

QA 1 695 1 695
DS 



CO CL25Contig2 856 4 11 U
GGATCACTCACTTGTTCAATTCTAAAACCCTAAGCATCGCCGACGGGATCCGATCGTGAT
CCTTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTTAGCTAAAGCCTCCTCTTAAAGAA
AATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTCAA
GGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGA
GGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCC
GGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGC
ACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGG
ACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAGG
CGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTCAAGGCTGTGGT
GGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACG
CAAGATTCTGACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCAC
GACCCTCACGTTCGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAAGCAAGTCGCTGCGCA
GAAGCTGACGGGCTAAGTTCATTGTGGAGAAAGCCGAGCAGACAGAGAGTGCGGTATCCG
TGCAGAGGGAGAAGCTAAAGTGCTCACTTATCGGACAGCATTGCAACATCAGCATCATAA
CACTGAGAAGATGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY49TF U 44
AF RR4FP19TF U 44
AF RR4CC08TF U 16
AF RR4C826TF U 1
BS 1 121 RR4C826TF
BS 122 122 RR4CY49TF
BS 123 150 RR4C826TF
BS 151 151 RR4CY49TF
BS 152 159 RR4C826TF
BS 160 160 RR4CY49TF
BS 161 389 RR4C826TF
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BS 391 452 RR4C826TF
BS 453 454 RR4CY49TF
BS 455 856 RR4C826TF

RD RR4CY49TF 692 0 0
G
GGGATCCGATCGTGATCCTTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTTAGCTAAA
GCCTCCTCTTAAAGAAAATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTC
TCTCTGCGCTTCTCAAGGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATA
GCCTCTACAATGTCGAGGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCA
AGGAAAAGGTGTACCCGGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCA
TCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTC
AGATGGTGAAAATTGGACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGA
TTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCA**AAA
CCCTCAAGGCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTG
TGAGCAGAGAGATACGCAAGATTCTGACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTG
ATGATGTCTCCATCACGACCCTCACGTTCGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAG*CAA
AGCAAGTCGCTGCGCAGAAGCTGA
CGGGCTA

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4FP19TF 684 0 0
G
GGGATCCGATCGTGATCCTTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTTAGCTAAA
GCCTCCTCTTAAAGAAAATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTC
TCTCTGCGCTTCTCAAGGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATA
GCCTCTACAATGTCGAGGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCA
AGGAAAAGGTGTACCCGGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCA
TCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTC
AGATGGTGAAAATTGGACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGA
TTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCA**AAA
CCCTCAAGGCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTG
TGAGCAGAGAGATACGCAAGATTCTGACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTG
ATGATGTCTCCATCACGACCCTCACGTTCGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAA
AGCAAGTCGCTGCGCAGAAGCTG

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR4CC08TF 733 0 0
GG
AATTCTAAAACCCTAAGCATCGCCGACGGGATCCGATCGTGATCCTTCCTAAACCTAACT
TGGTCGTCGATTTAGAGCTTAGCTAAAGCCTCCTCTTAAAGAAAATGAGTTTCAACAAAG
TGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTCAAGGTCAGCGTTATTGGTG
GGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGAGGGTGGACACCGTGCTG
TCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCCGGAAGGAACACATTTTA
TGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGCCCGTGCACGACCCTATCTTGTTG
AGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGGACTTAGAGTTCTCACTC
GTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTGGGCGAGAACTACAGTGAAA
GGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAGGCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAA
GCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAAGATTCTGACGGAGA
GAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCACGACCCTCACGTTCGGCA
AAGAGTTCACCGCTGCA*TCGAGGCAAAGCGAGTCGCTGCGCAGAAGCTGACGTGCTAAG
TTCGTTGTGGA

QA 3 733 3 733
DS 

RD RR4C826TF 856 0 0
GGATCACTCACTTGTTCAATTCTAAAACCCTAAGCATCGCCGACGGGATCCGATCGTGAT
CCTTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTTAGCTAAAGCCTCCTCTTAAAGAA
A*TGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCGGGATCTCCGGCTCTCTCTGCGCTTCTCAA
GGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGA
GGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCC
GGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGC
ACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGATAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGG
ACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCACTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAGG
CGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTCAAGGCTGTGGT
GGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACG
CAAGATTCTGACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCAC
GACCCTCACGTTCGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAAGCAAGTCGCTGCGCA
GAAGCTGACGGGCTAAGTTCATTGTGGAGAAAGCCGAGCAGACAGAGAGTGCGGTATCCG
TGCAGAGGGAGAAGCTAAAGTGCTCACTTATCGGACAGCATTGCAACATCAGCATCATAA
CACTGAGAAGATGAGC

QA 1 856 1 856
DS 



CO CL25Contig3 1213 4 19 U
CGCCATAAAAAAAAATGTTTGCTATTATTAATTTTTCTCTTAGTTCAGCTCCATCAATTT
TCCGGGAAAACACAAGAAAATATAAACAAATCAGCTCAACTGAACATGATGAACTACTAC
CACTGTCCAAAGCAGCGAATCCGATCAACCAAGATAATGGGCAACATAGTCATTTGGTCA
AAACACTGACCATGTTTAGGAGGAGGATAGAAGTGGATGGAACTTGCTTATTTTACTTCT
TAAAGTTAGAGCTAGGCTCCAAGTTCATCTCTTGGAGGTTAAGCAACAGATCATTGGAGC
TTAGGTAGACCTTGTTAGCTGATTGTGCAATGGTCTGAGCAATCTCCCTCGCAGCTTCAA
TCTTTCTCAGAGTTATGAATGCCTGATTGTTTGCAATAGCTTGTCCGATAAGCTGAGAAC
TTTTAGCTTCTCCCTCCGCACGGATAACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCAGCTTTCTCCA
CAATGAACTTAGCACGTTCAGCTTCCTGAGCAGCGACTTGTTTTGCCTCGATTGCAGCTG
TGAACTCTTTGCCAAAAGTGAGCGTCGTGATGGAGACATCATCAAGAGCGATGTCGAAGT
TCGAAGCTCTCTCAGTCAGAATCTTGCGTATCTCTCAGCTCACAGCTTCTCTCTGGGTGA
TCAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCCACCACAGCTTTTAGGGTTTCATGGATGATGGAAG
GAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCAC
CCATGGGACGAGTGAGAACCCTAAGTCCAACTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCAG
TGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTGCACGGACGTCATAGATTATTGGCCTCTCAAACC
ATGGCAACATGAAATGTGTTCCTTCCGGGTAAACCTTTTCCCTGATACCAGTCAATCGGT
TGAACATGACAGCACGATGTCCACCCTCAACATTGTACAGGCTATTAGTCAAAGCATAGA
CACCGAGCCCACCAATAACGCTGACCTTAAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGAGATCCAGGCA
CGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCATTTCTTAAGACCTTAGCTCAGCTCTAGGTCACCGAC
GATGTCAGGGTTTTAGGGCTTTAGAATTGCGATCTGAGTCAGTCGGCGAAGCTTTAGGGC
TTTAGAATTGCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4EQ36JQ U 2
AF RR4FD48JQ U 1
AF RR4FD48TF C 513
AF RR4EQ36TF C 598
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BS 348 617 RR4FD48JQ
BS 618 636 RR4FD48TF
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BS 638 941 RR4FD48TF
BS 942 942 RR4EQ36TF
BS 943 1075 RR4FD48TF
BS 1076 1076 RR4EQ36TF
BS 1077 1138 RR4FD48TF
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BS 1140 1209 RR4FD48TF
BS 1210 1213 RR4EQ36TF

RD RR4EQ36JQ 367 0 0
GCCATAAAAAAAAATGTTTGCTATTATTAATTTTTCTCTTAGTTCAGCTCCATCAATTTT
CCGGGAAAACACAAGAAAATATAAACAAATCAGCTCAACTGAACATGATGAACTACTACC
ACTGTCCAAAGCAGCGAATCCGATCAACCAAGATAATGGGCAACATAGTCATTTGGTCAA
AACACTGACCATGTTTAGGAGGAGGATAGAAGTGGATGGAACTTGCTTATTTTACTTCTT
AAAGTTAGAGCTAGGCTCCAAGTTCATCTCTTGGAGGTTAAGCAACAGATCATTGGAGCT
TAGGTAGACCTTGTTAGCTGATTGTGCAATGGTCTGAGCAATCTCCCTCGCAGCTTCAAT
CTTTCTC

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4FD48JQ 617 0 0
CGCCATAAAAAAAAATGTTTGCTATTATTAATTTTTCTCTTAGTTCAGCTCCATCAATTT
TCCGGGAAAACACAAGAAAATATAAACAAATCAGCTCAACTGAACATGATGAACTACTAC
CACTGTCCAAAGCAGCGAATCCGATCAACCAAGATAATGGGCAACGTAGTCATTTGGTCA
AAACACTGACCATGTTTAGGAGGAGGATAGAAGTGGATGGAACTTGCTTATTTTACTTCT
TAGAGTTAGAGCTAGGTTCCAAGTTCATCTCTTGGAGGTTAAGCAACAGATCATTGGAGC
TTAGGTAGACCTTGTTAGCTGATTGTGCAATGGTCTGAGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAA
TCTTTCTCAGAGTTATGAATGCCTGATTGTTTGCAATAGCTTGTCCGATAAGCTGAGAAC
TTTTAGCTTCTCCCTCCGCACGGATAACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCAGCTTTCTCCA
CAATGAACTTAGCACGTTCAGCTTCCTGAGCAGCGACTTGTTTTGCCTCGATTGCAGCTG
TGAACTCTTTGCCAAAAGTGAGCGTCGTGATGGAGACATCATCAAGAGCGATGTCGAAGT
TCGAAGCTCTCTCAGTC

QA 1 617 1 617
DS 

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GCGACTTGTTTTGCCTCGATTGCAGCTGTGAACTCTTTGCCAAAAGTGAGCGTCGTGATG
GAGACATCATCAAGAGCGATGTCGAAGTTCGAAGCTCTCTCAGTCAGAATCTTGCGTATC
TCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGGGTGATCAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCCACCACA
GCTTTTAGGGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCTAGG
GTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGAGTGAGAACCCTAAGTCCAACT
TTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCAGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTGCACGG
ACGTCATAGATTATTGGCCTCTCAAACCATGGCAACATGAAATGTGTTCCTTCCGGGTAA
ACCTTTTCCTTGATACCAGTCAATCGGTTGAACATGACAGCACGATGTCCACCCTCAACA
TTGTACAGGCTATTAGTCAAAGCATAGACACCGAGCCCACCAATAACGCTGACCTTAAGA
AGCGCAGAGAGAGCTGGAGATCCGGGCACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCATTTCTTAA
GACCTTAGCTCAGCTCTAGGTCACCGGCGATGTCAGGGTTTTAGGGCTTTAGAATTGCGA
TCTGAGTCAGTCGGCGAAGCTTTAGGGCTTTAGAATT
GCCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4EQ36TF 616 0 0
AGTTCGAAGCTCTCTCAGTCAGAATCTTGCGTATCTCTCAGCTCACAGCTTCTCTCTGGG
TGATCAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCCACCACAGCTTTTAGGGTTTCATGGATGATGG
AAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCTAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGT
CACCCATGGGACGAGTGAGAACCCTAAGTCCAACTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTAC
CAGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTGCACGGACGTCATAGATTATTGGCCTCTCAA
ACCATGGCAACATGAAATGTGTTCCTTCCGGGTAAACCTTTTCCCTGATACCAGTCAATC
GGTTGAACATGACAGCACGATGTCCACCCTCAACATTGTACAGGCTATTAGTCAAAGCAT
AGACACCGAGCCCACCAATAACGCTGACCTTAAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGAGATCCAG
GCACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCATTTCTTAAGACCTTAGCTCAGCTCTAGGTCACC
GACGATGTCAGGGTTTTAGGGCTTTAGAATTGCGATCTGAGTCAGTCGGCGAAGCTTTAG
GGCTTTAGAATTGCCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 2 16

CO CL26Contig1 1693 14 13 U
GGACCGTAACTTCTCCGAGAGAGCTTTCACCGTCGGTATTGGCGGTCCTGTTGGCACAGG
GAAAACAGCATTGATGCTTGCTCTGTGTAGAGTCTTGAGGGACAAATACAGTCTCGCAGC
AGTGACCAATGATATATTCACCAAAGAGGACGGTGAGTTTCTGGTGAAGCATGGAGCTCT
TCCCGAGGAAAGGATCAGGGCCGTTGAAACCGGTGGATGTCCACACGCTGCCATCCGTGA
AGACATCAGTATCAACTTGGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTT
GCTTCTTTGTGAATCTGGTGGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGA
CTACATCATCTACATCATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCC
TGGCATCACTCAAGCTGATCTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCGCAGCAGCTGTTGG
AGCCGACTTATCCGTCATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCATTCGT
CTTTGCTCAGGTGAAGCATGGGATTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTC
ATGGGAGCAAGCAACCGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACA
AAAAAACTGAATAAAACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGT
TTGTTGTTATTGTTGTACTCAAAGACAGCAAGAGAAA*TAAGGGTTTTTGTAATAGAGCA
CGAGACTCATTAGTCATTACATTGTGATTCTAGTCAATGTCCTCCTTTAACAGAAGCAAA
GAGATCCTTGTAGGAACGTTTCGGAGCATCAGCACTAGCAACTATCTCCACAACCTTGAA
AGATGATGATTCCTCCTCAAGCAAAGCTTCCACTGCAACCTCAGCCACCAGGTCTCTCGA
TATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACTACATTCCCCGAAGGAGGATC
GTTCTTAAGACCACCAGGTCTAACTATAGTATAGTTAATCCCAGATCTTTTGATATACTT
CTCGGCTTGAAGCTTAGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACGTTGAGGAAGATGTAAGCAGG
GTTTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGCGAGCTCACGAGAACAAACCT
GTTCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACAAGGTTCACCGTTCCGTAGTTATCGATCTT
CCAAGGAGCGAAGAGATCGAACCCGGGACGGAAACCAGTAGCGCAGATCACGGCTTGTGA
GTCGTCGCCTATGGCTTCTGCTAGCTTCTCTGAGCCTTCTGTCACGTCTGCTTTAACGAA
GTGAAGAGATGGGTCTTGTCTGAAAGATGTTTTTGCTTTGTCTACGTCACGAACACCTGC
TTTGACGGCGAAGCCACGGGATAAGAGCTGTTCCACGATTCTCTTCCCGGTCTGTCCCGT
GGCTCCAGCGACGAACACCTTCTTCTTCTTGGACGCGTTTTGTTCTCCGGCGCTTTCCAT
CTTGATTGAAGCGAAGGAACGAGGAGAGTTGGTGTTCTTCTTGGTGAAGACGAGAGAAGA
AGATGAAGAGAAGAAGACAGCTGAGGAGGAATGCCTGAGAAGCAGAGATGTTGTCATCAT
CGACCGACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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0 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 25 25 
25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 25 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BV10TF U 1
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AF RR4BV10JQ C 30
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AF RR4AJ02TF C 944
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BS 365 665 RR4BV10TF
BS 666 666 RR4BI32TF
BS 667 733 RR4BV10TF
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TCCCGAGGAAAGGATCAGGGCCGTTGAAACCGGTGGATGTCCACACGCTGCCATCCGTGA
AGACATCAGTATCAACTTGGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTT
GCTTCTTTGTGAATCTGGTGGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGA
CTATATCATCTACATCATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCC
TGGCATCACTCAAGCTGATCTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCGCAGCAGCTGTTGG
AGCCGACTTATCCGTCATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCATTCGT
CTTTGCTCAGGTGAAGCATGGGATTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTC
ATGGGAGCAAGCAACCGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACA
AAAAA*CTGAATAAAACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGT
TTGTTGTTATTGT
GTAC

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AAAGGATCAGGGCCGTTGAAACCGGTGGATGTCCACACGCTGCCATCCGTGAAGACATCA
GTATCAACTTGGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTGCTTCTTT
GTGAATCTGGTGGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGACTATATCA
TCTACATCATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCTGGCATCA
CTCAAGCTGATCTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCGCAGCAGCTGTTGGAGCCGACT
TATCCGTCATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCATTCGTCTTTGCTC
AGGTGAAGCATGGGATTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTCATGGGAGC
AAGCAACCGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACAAAAAAACT
GAATAAAACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTTTGTTGTT
ATTGTTGTACTCAAAGACAGCAAGACAAAATAAGGGTTTTTGT

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DS 

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GAGTCTTGAGGGACAAATACAGTCTCGCAGCAGTGACCAATGATATATTCACCAAAGAGG
ACGGTGAGTTTCTGGTGAAGCATGGAGCTCTTCCCGAGGAAAGGATCAGGGCCGTTGAAA
CCGGTGGATGTCCACACGCTGCCATCCGTGAAGACATCAGTATCAACTTGGGTCCTCTTG
AGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTGCTTCTTTGTGAATCTGGTGGAGATAATC
TAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGACTATATCATCTACATCATCGATGTATCGG
CTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCTGGCATCACTCAAGCTGATCTTCTGGTGA
TAAACAAGACAGACCTCGCAGCAGCTGTTGGAGCCGACTTATCCGTCATGGAAAGGGATG
CACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCATTCGTCTTTGCTCAGGTGAAGCATGGGATTGGGG
TTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTCATGGGAGCAAGCAACCGGGAACAAGCGCC
ACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACAAAAAAACTGAATAAAACTATCTCGAACTT
GGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTTTGTTGTTATTGTTGTACTCAAAGACAGC
AAGACAAAATAAGGGTTTTTGT

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DS 

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GTGACCAATGATATATTCACCAAAGAGGACGGTGAGTTTCTGGTGAAGCATGGAGCTCTT
CCCGAGGAAAGGATCAGGGCCGTTGAAACCGGTGGATGTCCACACGCTGCCATCCGTGAA
GACATCAGTATCAACTTGGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTG
CTTCTTTGTGAATCTGGTGGAGATAACTTAGCTGCTAATTTCAGCGGAGAGCTAGCTGAC
TACATCATCTATATTATTGATGTGTCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCT
GGCATCACTCAAGCTGATCTTCTAGTGATAAACAAGA**GACCTCGCAGCAGCTGTTGGG
GCTGACTTATCTGTCATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCTTTCGTC
TTTGCTCAGGTGAAGCATGGGCTTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTCA
TGGGAGCAAGCAACCGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCCCAGAAA***
AAAAACTGAATAAAACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTT
TGTTGTTATTGTTGTACTCAAAGACAGCAAGAGAAA*TAAGGGTTTTTGTAACAGAGCAC
GAGACTCATTAGTCA
C

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DS 

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ATCAGTATCAATCTAGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTGCTT
CTTTGTGAATCTGGTGGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGACTAC
ATCATCTACATCATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCGGGC
ATCACTCAAGCTGATCTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCACAGCAGCTGTTGGGGCT
GACTTATCTGTCATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCTTTCGTCTTT
GCTCAGGTGTAGCATGGGATTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTCATGG
GAGCAAGCAACCGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACAAAAA
AACTGAATAAAACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTTTGT
TGTTATTGTTGTACTCAAAGACAGCAAGAGAAA*TAAGGGTTTTTGTAATAGAGCACGAG
ACTCATTAGTCATTACATTGTGATTC
C

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DS 

RD RR4BI32TF 490 0 0
GG
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ATCTACATCATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCGGGCATC
ACTCAAGCTGATCTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCGCAGCAGCTGTTGGGGCTGAC
TTATCTGTCATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCTTTCGTCTTTGCT
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CAAGCAACCGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACAAAAAAAC
TGAATAAAACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTTTGTTGT
TATTGTTGTACTCAAGGACAGCAAGAGAAA*TAAGGGTTTTTGTAATAGAGCACGAGACT
CATTAGTC

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G
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ACAACCTTGAAAGAAGAAGATTCCTCCTCAAGCAAAGCTTCCACTGCAACCTCAGCCACC
AGGTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACTACGTTTCCT
GAAGGAGGATCGTTCTTAAGACCACCAGGTCTGACTATAGTATAGTTAATCCCAGATCTT
TTGATATACTTCTCGGCTTGAAGCTTGGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACGTTGAGGAAG
ATGTAAGCAGGGTTTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGCGAGCTCACG
AGAACGAACCTGTTCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACCAAGTTCACGGTTCCGTAG
TTATCGATCTTCCAAGGAGCGAAGAGATCGAAACCGGGACGGAAACCAGTAGCGCAGATC
ACGGCTT

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DS 

RD RR4DI69JQ 623 0 0
CA
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AATGTCCTCCTTTAACAGAAGCAAAGAGATCCTTGTAGGAACGTTTCGGAGCATCAGCAC
TAGCAACTATCTCCACAACCTTGAAAGAAGAAGATTCCTCCTCAAGCAAAGCCTCCACTG
CAACCTCAGCCACCAGGTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCA
TGACTACGTTTCCTGAAGGAGGATCGTTCTTAAGACCACCAGGTCTGACTATAGTATAGT
TAATCCCAGATCTTTTGATACACTTCTCGGCTTGAAGCTTGGCGACGAGAGTGAGTCCAA
AGACGTTGAGGAAGATGTAAGCAGGGTTTAAAATCTGTCCCATGGCAACTCCGTTCACCA
AGAGCGAGCTCACGAGAACGAACCTGTTCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACCAAGT
TCACGGTTCCGTAGTTATCGATCTTC**AGGAGCGAAGAGATCGAAACCGGGACGGAAAC
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CTTCTGTCACGTCTGCTTTAA

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR4BN67JQ 735 0 0
C
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ACAGAAGCAAAGAGATCCTTGTAGGAACGTTTCGGAGCATCAGCACTAGCAACTATCTCC
ACAACCTTGAAAGATGATGATTCCTCCTCAAGCAAAGCTTCCACCGCAACCTCAGCCACC
AGGTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGGCAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACTACATTCCCC
GAAGGAGGATCGTTCTTAAGACCACCAGGTCTAACTATAGTATAGTTAATCCCAGATCTT
TTGATATACTTCTCGGCTTGAAGCTTAGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACGTTGAGGAAG
ATGTAAGCAGGGTTTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGCGAGCTCACG
AGAACAAACCTGTTCACCTTTTGTTT**TACACGCATCCACAAGGTTCACCGTTCCGTAG
TTATCGATCTTCCAAGGAGCGAAGAGATCGAACCCGGGACGGAAACCAGTAGCGCAGATC
ACGGCTTGTGAGTCGTCGCCTATGGCTTCTGCTAGCTTCTCTGAGCCTTCTGTCACGTCT
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CGAACACCTGCTTT

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DS 

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CCTCCTTTAACAGAAGCAAAGAGATCCTTGTAGGAACGTTTCGGAGCATCAGCACTAGCA
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TCAGCCACCAGGTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACT
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TCTACGTCACGAACACCTGCTTTGACGGCGAAGCCACGGGATAAGAGCTGTTCCACGATT
CTCTTCCCGGTCTGTCCCGTGGCTCCAG

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DS 

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AGGGTTTTTGTAATAGAGCACGAGACTCATTAGTCATTACATTGTGATTCTAGTCAATGT
CCTCCTTTAACAGAAGCAAAGAGATCCTTGTAGGAACGTTTCGGAGCATCAGCACTAGCA
ACTATCTCCACAACCTTGAAAGATGATGATTCCTCCTCAAGCAAAGCTTCCACTGCAACC
TCAGCCACCAGGTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACT
ACATTCCCCGAAGGAGGATCGTTCTTAAGACCACCAGGTCTAACTATAGTATAGTTAATC
CCAGATCTTTTGATATACTTCTCGGCTTGA*GCTTAGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACG
TTGAGGAAGATGTAAGCAGGGTTTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGC
GAGCTCACGAGAACAAACCTGTTCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACAAGGTTCACC
GTTCCGTAGTTATCGATCTTCCAAGGAGCGAAGAGATCGAACCCGGGACGGAAACCAGTA
GCGCAGATCACGGCTTGTGAGTCGTCGCCTATGGCTTCTGCTAGCTTCTCTGAGCCTTCT
GTCACGTCTGCTTTAACGAAGTGAAGAGATGGGTCTTGTCTGAAAGATGTTTTTGCTTTG
TCTACGTCACGAACACCTGCTTTGACGGCGAAGCCACGGGATAAGAGCTGTTCCACGATT
CTCTTCCCGGTCTGTCCCGTGGCTCCAGCGACGAACACCTTCTTCTTCTTGGACGCGTTT
TGTTCTCCG
CGCTTT

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR4A525TF 862 0 0
AGAAGCAAAGAGATC*TTGTAGGAACGTTTCGGAGCATCAGCACTAGCAACTATCTCCAC
AACCTTGAAAGATGATGATTCCTCCTCAAGCAAAGCTTCCACTGCAAC*TCAGCCACCAG
GTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACTACATTCCCCGA
AGGAGGATCGTTCTTAAGACCACCAGGTCTAACTATAGTATAGTTAATCCCAGATCTTTT
GATATACTTCTCGGCTTGA*GCTTAGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACGTTGAGGAAGAT
GTAAGCAGGGTTTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGCGAGCTCACGAG
AACAAACCTGTTCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACAAGGTTCACCGTTCCGTAGTT
ATCGATCTTCCAAGGAGCGAAGAGATCGAACCCGGGACGGAAACCAGTAGCGCAGATCAC
GGCTTGTGAGTCGTCGCCTATGGCTTCTGCTAGCTTCTCTGAGCCTTCTGTCACGTCTGC
TTTAACGAAGTGAAGAGATGGGTCTTGTCTGAAAGATGTTTTTGCTTTGTCTACGTCACG
AACACCTGCTTTGACGGCGAAGCCACGGGATAAGAGCTGTTCCACGATTCTCTTCCCGGT
CTGTCCCGTGGCTCCAGCGACGAACACCTTCTTCTTCTTGGACGCGTTTTGTTCTCCGGC
GCTTTCCATCTTGATTGAAGCGAAGGAACGAGGAGAGTTGGTGTTCTTCTTGGTGAAGAC
GAGAGAAGAAGATGAAGAGAAGAAGACAGCTGAGGAGGAATGCCTGAGAAGCAGAGATGT
TGTCATCATCGACCGACGATCC

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4CO12TF 671 0 0
TCTTAAGACCACCAGGTCTAACTATAGTATAGTTAATCCCAGATCTTTTGATATACCTCT
CGGCTTGAAGCTTAGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACGTTGAGGAAGATGTAAGCAGGGT
TTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGCGAGCTCACGAGAACAAACCTGT
TCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACAAGGTTCACCGTTCCGTAGTTATCGATCTTCC
AAGGAGCGAAGAGATCGAACCCGGGACGGAAACCAGTAGCGCAGATCACGGCTTGTGAGT
CGTCGCCTATGGCTTCTACTAGCTTCTCTGAGCCTTCTGTCACGTCTGCTTTAACGAAGT
GAAGAGATGGGTCTTGTCTGAAAGATGTTTTTGCTTTGTCTACGTCACGAACACCTGCTT
TGACGGCGAAGCCACGGGATAAGAGCTGTTCCACGATTCTCTTCCCGGTCTGTCCCGTGG
CTCCAGCGACGAACACCTTCTTCTTCTTGGACGCGTTTTGTTCTCCGGCGCTTTCCATCT
TGATTGAAGCGAAGGAACGAGGAGAGTTGGTGTTCTTCTTGGTGAAGACGAGAGAAGAAG
ATGAAGAGAAGAAGACAACTGAGGAGGAATGTCTGAGAAGCAGAGATGTTGTCATCATCG
ACCGACGATCC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4AJ02TF 750 0 0
GCCACCAGGTCTCTCGATATGCTCCCTCCAGACAAAGTATCCTCAGGCTCCATGACTACA
TTCCCCGAAGGAGGATCGTTCTTAAGACCACCAGGTCTAACTATAGTATAGTTAATCCCA
GATCTTTTGATATACTTCTCGGCTTGA*GCTTAGCGACGAGAGTGAGTCCAAAGACGTTG
AGGAAGATGTAAGCAGGGTTTAAAATCTGTCCCATGGCAGCTCCGTTCACCAAGAGCGAG
CTCACGAGAACAAACCTGTTCACCTTTTGTTTCTTACACGCATCCACAAGGTTCACCGTT
CCGTAGTTATCGATCTTCCAAGGAGCGAAGAGATCGAACCCGGGACGGAAACCAGTAGCG
CAGATCACGGCTTGTGAGTCGTCGCCTATGGCTTCTGCTAGCTTCTCTGAGCCTTCTGTC
ACGTCTGCTTTAACGAAGTGAAGAGATGGGTCTTGTCTGAAAGATGTTTTTGCTTTGTCT
ACGTCACGAACACCTGCTTTGACGGCGAAGCCACGGGATAAGAGCTGTTCCACGATTCTC
TTCCCGGTCTGTCCCGTGGCTCCAGCGACGAACACCTTCTTCTTCTTGGACGCGTTTTGT
TCTCCGGCGCTTTCCATCTTGATTGAAGCGAAGGAACGAGGAGAGTTGGTGTTCTTCTTG
GTGAAGACGAGAGAAGAAGATGAAGAGAAGAAGACAGCTGAGGAGGAATGCCTGAGAAGC
AGAGATGTTGTCATCATCGACCGACGATCC

QA 1 750 1 750
DS 



CO CL26Contig2 671 2 13 U
GGATTACACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCT
CCTCTCCAGCCCTCTTCTTCTCCAAGAACACCGACTCTTCTCGTTCCTTCGCTTCAGCCA
AGATGGAAAGCGCCGGAGAACAAAACGCGTCCAAGAAGAAGAAGGTGTTCGTCGCTGGAG
CCACCGGACAGACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAGCTCTTATCCCGTGGCTTCGCCGTCA
AAGCAGGTGTCCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGACAAGACCCTTCTCTTC
ACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAGAAGCCATAGGCGACG
ACTCACAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGTTTCGATCTCTTCGCTCCTT
GGAAGATCGATAACTACGGAACCGTGAACTTGGTGGATGCGTGTAAGAAACAAAAGGTGA
ACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGCTCTTGGTGAACGGAGCTGCCATGGGACAGATTTTAA
ACCCTGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGACTCACTCTCGTCGCCAAGCTTCAAGCCG
AGAAGTATATCAAAAGATCTGGGATTAACTATACTATAGTCAGACCTGGTGGTCTTAAGA
ACGATCCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DI69TF U 1
AF RR4A647TF U 6
BS 1 70 RR4DI69TF
BS 71 71 RR4A647TF
BS 72 117 RR4DI69TF
BS 118 118 RR4A647TF
BS 119 301 RR4DI69TF
BS 302 302 RR4A647TF
BS 303 419 RR4DI69TF
BS 420 421 RR4A647TF
BS 422 519 RR4DI69TF
BS 520 520 RR4A647TF
BS 521 606 RR4DI69TF
BS 607 607 RR4A647TF
BS 608 671 RR4DI69TF

RD RR4DI69TF 671 0 0
GGATTACACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCT
CCTCTCCAGCTCTCTTCTTCTCCAAGAACACCGACTCTTCTCGTTCCTTCGCTTCAGTCA
AGATGGAAAGCGCCGGAGAACAAAACGCGTCCAAGAAGAAGAAGGTGTTCGTCGCTGGAG
CCACCGGACAGACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAGCTCTTATCCCGTGGCTTCGCCGTCA
AAGCAGGTGTCCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGACAAGACCCTTCTCTTC
A*TTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAGAAGCCATAGGCGACG
ACTCACAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGTTTCGATCTCTTCGCTCCT*
*GAAGATCGATAACTACGGAACCGTGAACTTGGTGGATGCGTGTAAGAAACAAAAGGTGA
ACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGCTCTTGGTGAACGGAGTTGCCATGGGACAGATTTTAA
ACCCTGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGACTCACTCTCGTCGCCAAGCTTCAAGCCG
AGAAGTGTATCAAAAGATCTGGGATTAACTATACTATAGTCAGACCTGGTGGTCTTAAGA
ACGATCCTCCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4A647TF 666 0 0
GG
ACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCTCCTCTTC
AGCCCTCTTCTTCTCCAAGAACACCGACTCTTCTCGTTCCTTCGCTTCAGCCAAGATGGA
AAGCGCCGGAGAACAAAACGCGTCCAAGAAGAAGAAGGTGTTCGTCGCTGGAGCCACCGG
ACAGACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAGCTCTTATCCCGTGGCTTCGCCGTCAAAGCAGG
TGTCCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGACAAGACCCTTCTCTTCACTTCGT
TAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAGAAGCCATAGGCGACGACTCACA
AGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGTTTCGATCTCTTCGCTCCTTGGAAGAT
CGATAACTACGGAACCGTGAACTTGGTGGATGCGTGTAAGAAACAAAAGGTGAACAGGTT
CGTTCTCGTGAGCTCGCTCTTGGTGAACGGAGCTGCCATGGGACAGATTTTAAACCCTGC
TTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGACTCACTCTCGTCGCCAAGCTTCAAGCCGAGAAGTA
TATCAAAAGATCTGGGATTAACTATACTATAGTCAGACCTGGTGGTCTTAAGAACGATCC
TCCT

QA 3 666 3 666
DS 



AS 2 20

CO CL27Contig1 949 16 9 U
CCCTTTAAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACTAGAAAC
TGAGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTAAGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGA
GAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGA
AAACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAG
ATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGT
CGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTA
CCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAA
CCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCG
AGCAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTC
AGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAACCTCC
ACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGA
TCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAA
AGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGACGAGAG
ATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTGGAGCTCGAAAGCCACCAG
ACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAGGGTTTACTTAGAGAGATTAGAGAGTGTTTCAG
AGAGAGGACTTGTCGCTTCTTTACGTTTCTATTTTCTCCTCTCTTTTCC


BQ
10 10 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 15 60 60 60 60 25 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 25 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 30 75 75 75 75 75 60 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 40 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 45 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 65 90 90 90 60 10 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 45 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 45 90 90 90 90 90 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 
80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI69JQ U 125
AF RR4BH93JQ U 31
AF RR4ES05JQ U 2
AF RR4BS04JQ U 7
AF RR4CD92JQ U 40
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AF RR4B919TF C 86
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AF RR4FF02TF C 280
BS 1 410 RR4AP82JQ
BS 411 411 RR4BI69JQ
BS 412 774 RR4AP82JQ
BS 775 775 RR4GJ02JQ
BS 776 795 RR4AP82JQ
BS 796 859 RR4BH64JQ
BS 860 937 RR4B919TF
BS 938 939 RR4AP82TF
BS 940 949 RR4B919TF

RD RR4BI69JQ 460 0 0
AGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAAAAACAGAGCAACACCGTAAACTCAAGTGAAAAC
TCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGACACAACTAACCTGAGATCT
CCCATTAAAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCGAG
AGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAAAACAGCATTACCAC
TTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAAATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACCGC
TTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCGAGCA
AAAAGGGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAGTG
CTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAA

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4BH93JQ 553 0 0
AAA
ATACATATTGGAAAGGATACTAAAAACTGAGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTA
AGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGAGAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAAAA
ACAGAGCAACACCGTAAACTCAAGTGAAAACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCT
TACAAGTCCAGACACAACTAACCTGAGATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACA
CATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCG
AACCGGACACAGTGAAAAACAGCATTACCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAA
ATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAAACCACA
GAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCGAGCAAAAAGGGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAA
ACACCAAAAAAGGAAGCCACAAAAGTCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTT
TGTCCTGAGA

QA 4 553 4 553
DS 

RD RR4ES05JQ 696 0 0
G
CTTTAAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACTAGAAACTG
AGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTAAGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGAGA
GAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAA
ACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGGTACAACTAACCTGAGAT
CTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCG
AGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTACC
ACTTACCAAACCGAGAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACC
GCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCGAG
CAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAG
TGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCAC
GCACCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATC
AGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTC

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR4BS04JQ 722 0 0
AAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACCAGAAACTGAGCC
AGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTGAGCCTTATTACACAAAGGGACACAAGAGAGAAG
AAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAAACTC
ATCAAGAAGCACAACCACACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAGATCTCC
CATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCGAGAG
CAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTACCACTT
ACCAAACCGA**AAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACCGCTT
CAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCACTCGTCCCTCGAGCAGA
AAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAGTGCT
CTACCTACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCTTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCACGCGC
CTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATCAGGA
GAAGTACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAAAGGATC
GA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CD92JQ 732 0 0
ATTGGAAAGGATACCAGAAACTGAGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTGAGCCTT
ATTACACAAAGGGACACAAGAGAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAG
CAACACCATAGACTCAAGTGAAAACTCATCAAGAAGCACAACCACACTTTTCCTTACAAG
TCCAGATACAACTAACCTGAGATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGA
ACCTAATGCTTTTGAAACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGG
ACACAGTGAAGAACAGCATTACCACTTACCAAACCGA**AAAAA*CCGTAGCAGATAGAG
CGACAAGAAGGAACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGC
TCCATCTCCACTCGTCCCTCGAGCAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCA
GAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAGTGCTCTACCTACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCTT
GAGAAGAGAGGATAAACCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACC
CAGAACAAGCTAAAATTAAGATCAGGAGAAGTACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCC
CTAGATCTGGAACACCGTAAAAGGATCGAGACGAAATCTACGACTTACCGAAGCTAAAAC
GAACCACACCGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4FF02JQ 749 0 0
AAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACTAGAAACTGAGCC
AGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTAAGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGAGAGAAG
AAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAAACTC
ATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAGATCTCC
CATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCGAGAG
CAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTACCACTT
ACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACCGCTT
CAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCGAGCAGA
AAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGCCAGTGCT
CTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCACGCGC
CTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATCAGGA
GAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAAAGGATC
*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AP82JQ 795 0 0
CCCTTTAAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACTAGAAAC
TGAGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTAAGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGA
GAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGA
AAACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAG
ATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGT
CGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTA
CCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGGACAATGCAA
CCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCG
AGCAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTC
AGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAACCTCC
ACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGA
TCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAA
AGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGATGAGAG
ATGAGACCAAAAGAC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4GJ02JQ 794 0 0
CG
CTTTAAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACCAGAAACTG
AGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTGAGCCTTATTACACAAAGGGACACAAGAGA
GAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAA
ACTCATCAAGAAGCACAACCACACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAGAT
CTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCG
AGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTACC
ACTTACCAAACCGA**AAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACC
GCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCACTCGTCCCTCGAG
CAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAG
TGCTCTACCTACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCTTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCGC
GCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATC
AGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAAAG
GATCGAGACGAAATCTACGACTTACCGAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGACGAGAGAT
GAGACCAAAAGA

QA 3 794 3 794
DS 

RD RR4GB22JQ 786 0 0
G
CTTTAAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACCAGAAACTG
AGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTGAGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGAGA
GAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAA
ACTCATCAAGAAGCACAACCACACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAGAT
CTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCG
AGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTACC
ACTTACCAAACCGA**AAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACC
GCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCTACTCGTCCCTCGAG
CAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAG
TGCTCTACCTACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCTTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCAC
GCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATC
AGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAAAG
GATAGAGACGAAATCTACGACTTACCGAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGACGAGAGAT
GAGAC

QA 2 786 2 786
DS 

RD RR4BH64JQ 858 0 0
A
CTTTAAAACACTTTGATTGATACAGAGAAAGATACATATTGGAAAGGATACTAGAAACTG
AGCCAGAGGAAACAAGCTTCCCCGGAAACTAAGCCCTATTACACAAAGGGACACAAGAGA
GAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAA
ACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGATACAACTAACCTGAGAT
CTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAACCTAATGCTTTTGAAACCGTCG
AGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAAC*GGACACAGTGAAGAACAGCATTACC
ACTTACCAAACCGAAAAAAAAACCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACC
GCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCGAG
CAGAAAA*GGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAG
TGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCAC
GCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATC
AGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAAAG
GATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGACGAGAGAT
GAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTGGAGCTCGAAAGCCACCAGAC
GTTGGCCGAACTAAAGG

QA 2 858 2 858
DS 

RD RR4B919TF 864 0 0
CGG
AACTAAGCCCTAT*ACACAAAGGGACACAAGAGAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACG
AAGAAACAGAGCAACACCATAGACTCAAGTGAAAACTCATCAAGAAGCACAACCATACTT
TTCTTTACAAGTCCAGATACAACTAAC*TGAGATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACA
ACACACATAGAAC*TAATGCTTTTGAAACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTC
AATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAGCATTACCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGT
AGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGA
CCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTCCCTCGAGCAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAAT
CCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAAAAGTCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCG
AACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAACCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCC
ATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAATTAAGATCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCG
ACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACCGTAAAAGGATC*****GAAATCTACGACCTGCC
GAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGACGAGAGATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAA
AAGGCACAACGCTGGAGCTCGAAAGCCACCAGACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAG
GGTTTACTTAGAGAGATTAGAGAGTGTTTCAGAGAGAGGACTTGTCGCTTCTTTACGTTT
CTATTTTCTGGTCTCTTTTCC

QA 4 864 4 864
DS 

RD RR4AP82TF 535 0 0
AGAAGGGACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCAT
CTCCAATCGTCCCTCGAGCAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAA
GGAAGCCACAAAAGTCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAA
GAGAGGATAAACCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAA
CAAGCTAAAATTAAGATCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGA
TCTGGAACACCGTAAAAGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAACC
ACACCGAAGATGAGAGATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTGGA
GCTCGAAAGCCACCAGACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAGGGTTTACTTAGAGAGA
TTAGAGAGTGTTTCAGAGAGAGGACTTGTCGCTTCTTTACGTTTCTATTTTCTCC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4BH64TF 656 0 0
AATGCTTTTGAAACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAAC*GGACAC
AGTGAAGAACAGCATTACCACTTACCAAACCGAAAAAAAAACCGTAGCAGATAGAGCGAC
AAGAAGGAACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCA
TCTCCAATCGTCCCTCGAGCAGAAAA*GGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGA
AGGAAGCCACAAAAGTCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGA
AGAGAGGATAAACCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGA
ACAAGCTAAAATTAAGATCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAG
ATCTGGAACACCGTAAAAGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAAC
CACACCGAAGACGAGAGATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTGG
AGCTCGAAAGCCACCAGACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAGGGTTTACTTAGAGAG
ATTAGAGAGTGTTTCAGAGAGAGGACTTGTCGCTTCTTTACGTTTCTATTTTCTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4BI69TF 830 0 0
GGGACACAAGAGAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACAC*GTA
GACTCAAGTGAAAACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTTTCCTTACAAGTCCAGACACA
ACTAAC*TGAGATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAAC*TAATGCT
TTTGAAACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAA
GAACAGCATTACCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAG
GAACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCA
ATCGTCCCTCGAGCAGAAAGGGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAG
CCACAAAAGTCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAG
GATAAACCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGC
TAAAATTAAGATCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGG
AACACCGTAAAAGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAACCACACC
GAAGACGAGAGATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTGGAGCTCG
AAAGCCACCAGACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAGGGTTTACTTAGAGAGATTAGA
GAGTGTTTCAGAGAGAGGACTTGTCGCTTCTTTACGTTTCTATTTTCTCC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4BH93TF 824 0 0
CAAGAGAGAAGAAACTCTCGACCTAAACTCACGAAGAAACAGAGCAACAC*GTAGACTCA
AGTGAAAACTCATCAAGAAGCACAACCATACTTT*CTTTACAAGTCCAGACACAACTAAC
*TGAGATCTCCCATTAGAATAATCCCAAATACAACACACATAGAAC*TAATGCTTTTGAA
ACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACACAGTGAAGAACAG
CATTACCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGACAAGAAGGAACAA
TGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCCATCTCCAATCGTC
CCTCGAGCAGAAAGGGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAGAAGGAAGCCACAA
AAGTCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAGAAGAGAGGATAAA
CCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAGAACAAGCTAAAAT
TAAGATCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTAGATCTGGAACACC
GTAAAAGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAACCACACCGAAGAC
GAGAGATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTGGAGCTCGAAAGCC
ACCAGACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAGGGTTTACTTAGAGAGATTAGAGAGTGT
TTCAGAGAGAGGACTTGTCGCTTCTTTACGTTTCTATTTTCTCC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4FF02TF 660 0 0
ACA
TAATGCTTTTGAAACCGTCGAGAGCAAGCGACCAATACGCAACCTCAATCGAACCGGACA
CAGTGAAGAACAGCATTACCACTTACCAAACCGAAAAAAAA*CCGTAGCAGATAGAGCGA
CAAGAAGGAACAATGCAACCGCTTCAAAAGAGACAAACACCCAAGACCACAGAAAGCTCC
ATCTCCAATCGTCCCTCGAGCAGAAAGTGGAAGCCGGAAACAGAATCCCAAACACCAGAG
AAGGAAGCCACAAAAGCCAGTGCTCTACCAACATTGAAAACCACCGAACTTTGTCCTGAG
AAGAGAGGATAAACCTCCACGCGCCTTAAGCACTTCTGTGAGGTCCATCAGTCTACCCAG
AACAAGCTAAAATTAAGATCAGGAGAAGCACAGAGGCTCCTCCGCGACTTCACTCCCCTA
GATCTGGAACACCGTAAAAGGATC*****GAAATCTACGACCTGCCGAAGCTAAAACGAA
CCACACCGAAGATGAGAGATGAGACCAAAAGACAAAAAACAGCTAAAAGGCACAACGCTG
GAGCTCGAAAGCCACCAGACGTTGGCCGAACTAAAGGCGGCGTTAGGGTTTACTTAGAGA
GATTAGAGAGTGTTTCAGAGAGAGGACCTGTCGCTTCTTTACGTTTCTATTTTCTCC

QA 4 660 4 660
DS 



CO CL27Contig2 773 4 13 U
GGAATTTCCAGCCGACGACACGACTCTCTCTCTCTGAAACACTCTCTCGTCTCTCTAAGT
AAACCCTAACGCCGCCTTGAGTTCGGCCAACGTCTGGTGGCTTTCGAGCTCCAGCGTTGT
GCCTTTTAGCTGTTTTTTGTCTTTTGGTCTCATCTCTCGTCTTCGGTGTGGTTCGTTTTA
GCTTCGGTAAGTCGTAGATTTCGTCTCGATCCTTTTACGGTGTTCCAGATCTAGGGGAGT
GAAGTCGCGGAGGAGCCTCTGTACTTCTCCTGATCTTAATTTTAGCTTGTTCTGGGTAGA
CTGATGGACCTCACAGAAGTGCTTAAGGCGCGTGGAGGTTTATCCTCTCTTCTCAAGACA
AAGTTCGGTGGTTTTCAATGTAGGTAGAGCACTGACTTTTGTGGCTTCCTTCTCTGGTGT
TTGGGATTCTGTTTCCGGCTTCCACTTTCTGCTCGAGGGACGAGTGGAGATGGAGCTTTC
TGTGGTCTTGGGTGTTTGTCTCTTTTGAAGCGGTTGCATTGTTCCTTCTTGTCGCTCTAT
CTGCTACGGTTTTTTCGGTTTGGTAAGTGGTAATGCTGTTCTTCACTGTGTCCGGTTCGA
TTGAGGTTGCGTATTGGTCGCTTGCTCTCGACGGTTTCAAAAGCATTAGGTTCTATGTGT
GTTGTATTTGGGATTATTCTAATGGGAGATCTCAGTTAGTTGTATCTGGACTTGTAAGAA
AAGTGTGGTTGTGCTTCTTGATGAGTTTTCACTTGAGTCTATGGTGTGCTCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4GJ02TF U 34
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BS 749 749 RR4GJ02TF
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GCTCCAGCGTTGTGCCTTTTAGCTGTTTTTTGTCTTTTGGTCTCATCTCTCGTCTTCGGT
GTGGTTCGTTTTAGCTTCGGTAAGTCGTAGATTTCGTCTCTATCCTTTTACGGTGTTCCA
GATCTAGGGGAGTGAAGTCGCGGAGGAGCCTCTGTGCTTCTCCTGATCTTAATTTTAGCT
TGTTCTGGGTAGACTGATGGACCTCACAGAAGTGCTTAAGGCGCGTGGAGGTTTATCCTC
TCTTCTCAAGACAAAGTTCGGTGGTTTTCAATGTAGGTAGAGCACTGACTTTTGTGGCTT
CCTTCTCTGGTGTTTGGGATTCTGTTTCCGGCTTCCACTTTCTGCTCGAGGGACGAGTAG
AGATGGAGCTTTCTGTGGTCTTGGGTGTTTGTCTCTTTTGAAGCGGTTGCATTGTTCCTT
CTTGTCGCTCTATCTGCTACGGTTTTTTCGGTTTGGTAAGTGGTAATGCTGTTCTTCACT
GTGTCCGGTTCGATTGAGGTTGCGTATTGGTCGCTTGCTCTCGACGGTTTCAAA
GCAT

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DS 

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AAACCCTAACGCCGCCTTGAGTTCGGCCAACGTCTGGTGGCTTTCGAGCTCCAGCGTTGT
GCCTTTTAGCTGTTTTTTGTCTTTTGGTCTCATCTCTCGTCTTCGGTGTGGTTCGTTTTA
GCTTCGGTAAGTCGTAGATTTCGTCTCGATCCTTTTACGGTGTTCCAGATCTAGGGGAGT
GAAGTCGCGGAGGAGCCTCTGTACTTCTCCTGATCTTAATTTTAGCTTGTTCTGGGTAGA
CTGATGGACCTCACAGAAGTGCTTAAGGCGCGTGGAGGTTTATCCTCTCTTCTCAAGACA
AAGTTCGGTGGTTTTCAATGTAGGTAGAGCACTGACTTTTGTGGCTTCCTTCTCTGGTGT
TTGGGATTCTGTTTCCGGCTTCCACTTTCTGCTCGAGGGACGAGTGGAGATGGAGCTTTC
TGTGGTCTTGGGTGTTTGTCTCTTTTGAAGCGGTTGCATTGTTCCTTCTTGTCGCTCTAT
CTGCTACGGTTTTTTCGGTTTGGTAAGTGGTAATGCTGTTCTTCACTGTGTCCGGTTCGA
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GTTGTATTTGGGATTATTCTAATGGGAGAT

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AAACCCTAACGCCGCCTTGAGTTCGGCCAACGTCTGGTGGCTTTCGAGCTCCAGCGTTGT
GCCTTTTAGCTGTTTTTTGTCTTTTGGTCTCATCTCTCGTCTTCGGTGTGGTTCGTTTTA
GCTTCGGTAAGTCGTAGATTTCGTCTCGATCCTTTTACGGTGTTCCAGATCTAGGGGAGT
GAAGTCGCGGAGGAGCCTCTGTACTTCTCCTGATCTTAATTTTAGCTTGTTCTGGGTAGA
CTGATGGACCTCACAGAAGTGCTTAAGGCGCGTGGAGGTTTATCCTCTCTTCTCAAGACA
AAGTTCGGTGGTTTTCAATGTAGGTAGAGCACTGACTTTTGTGGCTTCCTTCTCTGGTGT
TTGGGATTCTGTTTCCGGCTTCCACTTTCTGCTCGAGGGACGAGTGGAGATGGAGCTTTC
TGTGGTCTTGGGTGTTTGTCTCTTTTGAAGCGGTTGCATTGTTCCTTCTTGTCGCTCTAT
CTGCTACGGTTTTTTCGGTTTGGTAAGTGGTAATGCTGTTCTTCACTGTGTCCGGTTCGA
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A*GTGTGGT*GTGCTTCTTGATGAGTTT*CACTTGAGTCTATGGTGTGCTCTG

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GG
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GGTGGCTTTCGAGCTCCAGCGTTGTGCCTTTTAGCTGTTTTTTGTCTTTTGGTCTCATCT
CTCGTCTTCGGTGTGGTTCGTTTTAGCTTCGGTAAGTCGTAGATTTCGTCTCGATCCTTT
TACGGTGTTCCAGATCTAGGGGAGTGAAGTCGCGGAGGAGCCTCTGTGCTTCTCCTGATC
TTAATTTTAGCTTGTTCTGGGTAGACTGATGGACCTCACAGAAGTGCTTAAGGCGCGCGG
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CTTTTGTGGCTTCCTTCTCTGGTGTTTGGGATTCTGTTTCCGGCTTCCACTTTCTGCTCG
AGGGACGAGTGGAGATGGAGCTTTCTGTGGTCTTGGGTGTTTGTCTCTTTTGAAGCGGTT
GCATTGTTCCTTCTTGTCGCTCTATCTGCTACGGTTTTTTCGGTTTGGTAAGTGGTAATG
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TTAGTTGTATCTGGACTTGTAAGAAAAGTGTGGTTGTGCTTCTTGATGAGTTTTCACTTG
AGTCTATGGTG

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DS 



AS 3 18

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GTGAAGGCAACAAAGGCTGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGTCAGCTCATC
GACGAGTTCACCCAGATCTTGGTCGTTGCAGCCGACAACGTCGGGTCGACTCAGCTCCAG
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GATGTGGTTGTCCAACCTGGTAACACTGGTCTCGATCCATCTCAGACATCTTTCTTCCAG
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AGCCCAGAGGTTCTCGATCTTACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATC
TCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCGCAT
ATGTTCATCAATGCCTACAAGAACGCATTGGCCATCTCAGTTGCCACCGAGTACACTTTC
CCACAAGCAGAGAAGGTCAAGGAGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGCA
GCGGCTGTATCTGCCGATGCAGGTGGTGGGGCTTCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAG
AAGAAGGAAGTGGTCGAGGAATCAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGT
GATGAGTAGATCCATTTGTTATATCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAA
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GTGCTATTGTCTTTCTAGTTTGAATATGTTTCGAACTTCGAGTTGTTTTGTTAGTCTTGG
CTCTTTAATTTCCCAAGTGTTATATCACTCTTTATATAGCAAAGATAAAGGCATTGTCTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B005TF U 1
AF RR4B294TF U 1
AF RR4CR19JQ C 680
AF RR4CR19TF U 454
AF RR4B005JQ C 324
AF RR4B294JQ C 437
AF RR4GH27TF U 564
AF RR4BN95JQ C 1022
AF RR4BN95TF U 1022
BS 1 791 RR4B005TF
BS 792 795 RR4B294TF
BS 796 827 RR4CR19TF
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BS 889 974 RR4CR19TF
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BS 1145 1224 RR4GH27TF
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RD RR4B005TF 791 0 0
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ATGTTCATCAA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4B294TF 795 0 0
GGGACTCATCTGCAGACAAAGAGGAAAAAAACGAGTCTCATCCCGTGAGCAACAACAATG
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AACATTAGGAAAGGTCTTCGTGGTGACTCAGTTGTCCTCATGGGCAAGAACACTATGATG
AAGCGTTCCGTTAAGATTCACGCTGAGAACACTGGAAACACTGGAATCCTCAATCTCATG
CCCCTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTTACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGT
GAGGAAGTTGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTTGCGCCAATC
GATGTGGTTGTCCAACCTGGTAACACTGGTCTCGATCCATCTCAGACATCTTTCTTCCAG
GTTCTTAACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAG
CTCATCAAGCAAGGCGACAAGGTCGTTTCTTCCGAGGCTGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGC
ATCAGGCCGTTCTCTTACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCTGTCTTC
AGCCCAGAGGTTCTCGATCTTACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATC
TCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCGCAT
ATGTTCATCAATGCC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4CR19JQ 465 0 0
TTACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGG
CGCTAGCTATTTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCACATATGTTCATCAATGCATACA
AGAACGCATTGGCCATTTCAGTTGCCACTGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGGTCA
AGGAGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTCGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATG
CAGGTGGTGGGGCTTCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTTGAGG
AATCAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAGTAGATCCATTTGT
TATATCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGTGCTGCTTCGTTTGTAGT
ATGATGACTTGTGTTTTCTTGATTTTGTCCATTTCAGATTTGTGC

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4CR19TF 691 0 0
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ACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGTGACAAGGTCGGTTCTTCC
GAGGCTGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCATTCTCGTACGGTCTTGTTGTCCAG
TCTGTTTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCGATCTTACGGAAGATGAC
CTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTATCTCT
TACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCACATATGTTCATCAATGCATACAAGAACGCATTGGCC
ATCTCAGTTGCCACTGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGGTCAAGGAGTACTTGAAG
GATCCTAGCAAGTTCGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATGCAGGTGGTGGGGCT
TCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTTGAGGAATCAGATGAAGAA
GACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAGTAGATCCATTTGTTATATCTCTCCCGA
GTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGTGCTGCTTCGTTTGTAGTATGATGACTTGTGT
TTTCTTGATTTTGTCCATTTCAGATTTGTGC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4B005JQ 883 0 0
TTTGATCTTTACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGTGAGGAAGTTGCCAAGTACAAGGT
TGGTGCTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTTGCGCCAATCGATGTGGTTGTCCAACCTGGTAA
CACTGGTCTCGATCCATCTCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCCAACTAAGAT
TAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGCGACAAGGT
CGTTTCTTCCGAGGCTGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCTTACGGTCT
TGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCGATCTTAC
GGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCT
AGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCGCATATGTTCATCAATGCCTACAAGAA
CGCATTGGCCATCTCAGTTGCCACCGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGGTCAAGGA
GTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATGCAGG
TGGTGGGGCTTCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTCGAGGAATC
AGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAGTAGATCCATTTGTTATA
TCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGCGCTGCTTCGTTTGTAGTGTGA
TGACTTGTGTTTTCT*GATTTTGTCCATTTCAGATTTGTGCTATTGTCTTTCTAGTTTGA
ATATGTTTCGAACTTCGAGTTGTTTTGTTAGTCTTGGCTCTTT

QA 1 883 1 883
DS 

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CTGGTAACACTGGTCTCGATCCATCTCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCCAA
CTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGCG
ACAAGGTCGTTTCTTCCGAGGCTGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCTT
ACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCG
ATCTTACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCT
TGGCGCTAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCGCATATGTTCATCAATGCCT
ACAAGAACGCATTGGCCATCTCAGTTGCCACCGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGG
TCAAGGAGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCG
ATGCAGGTGGTGGGGCTTCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTCG
AGGAATCAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAGTAGATCCATT
TGTTATATCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGCGCTGCTTCGTTTGT
AGTGTGATGACTTGTGTTTTCT*GATTTTGTCCATTTCAGATTTGTGCTATTGTCTTTCT
AGTTTGAATATGTTTCGAACTTCGAGTTGTTTTGTTAGTCTTGGCTCTTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4GH27TF 661 0 0
CGGTTCTTCCGAGGCTGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCTTACGGTCT
TGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCGATCTTAC
GGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCT
AGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCGCATATGTTCATCAATGCCTACAAGAA
CGCATTGGCCATCTCAGTTGCCACCGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGGTCAAGGA
GTACTTGAAGGACCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATGCAGG
TGGTGGGGCTTCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTCGAGGAATC
AGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAGTAGATCCATTTGTTATA
TCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGTGTTGCTTCGTTTGTAGTGTGA
TGACTTGTGTTTTCTTGATTTTGTCCATTTCAGATTTGTGCTATTGTCTTTCTAGTTTGA
ATATGTTTCGAACTTCGAGTTGTTTTGTTAGTCTTGGCTCTTTAATTTCCCAAGTGTTAT
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4BN95JQ 239 0 0
G
TGAGTAGATCCATTTGTTATATCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGT
GCTGCTTCGTTTGTAGTATGATGACTTGTGTTTTCTTGATTTTGTCCGTTTCAGATTTGT
GCCATTGTCTTTCTAGTTTGAATATGTTTCGAACTTCGAGTTGTTTTGTTAGTCTTGGCT
CTTTAATTTCCCAAGTGTTATATCACTCTTTATATAGCAAAGATAAAGGCATTGTCTC

QA 2 239 2 239
DS 

RD RR4BN95TF 239 0 0
G
TGAGTAGATCCATTTGTTATATCTCTCCCGAGTTCCACCTTTTTTGTCGTTGCTATAAGT
GCTGCTTCGTTTGTAGTATGATGACTTGTGTTTTCTTGATTTTGTCCGTTTCAGATTTGT
GCCATTGTCTTTCTAGTTTGAATATGTTTCGAACTTCGAGTTGTTTTGTTAGTCTTGGCT
CTTTAATTTCCCAAGTGTTATATCACTCTTTATATAGCAAAGATAAAGGCATTGTCTC

QA 2 239 2 239
DS 



CO CL28Contig2 1169 7 19 U
TTTTTATAGACACAAAGAGGGGAAACAGAAGCCTTTATCCTGTGAGCAGCAACAATGGTG
AAGGCAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGCCAGCTCATCGAC
GAGTTCACTCAGATCCTGGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCGACTCAGCTACAGAAC
ATCAGGAAGGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAG
CGTTCGGTTAAGATTCACGCTGAGAACACCGGAAACACTGGAATCCTCAACCTCATGCCC
CTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAG
GAAGTTGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATAGAT
GTGGTTGTCCAGCCTGGAAACACCGGTTTAGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTT
CTTAACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTC
ATCAAGCAAGGCGACAAGGTCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATC
AGGCCGTTTTCATACGGTCTTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGC
CCAGAGGTTCTTGATCTGACAGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCC
ATGGTCACTTCCTTGGCTCTAGCCATCTCTTACCCTACACTCGCTGCCGCCCCGCATATG
TTCATCAACGCCTACAAGAATGCATTGGCTATCTCTATTGCCACTGAGTACACTTTCCCA
CAAGCAGAGAAGGTCAAGGAGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGTAGCG
GCAGTGTCTGCAGATGCAGGTGGTGGTGCTTCAGGTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAG
AAGGAAGTTGTTGAGGAATCAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGAT
GAATAGATTAAAAATATATCTATCGAGGCTATGTTTTTGTCGATGCTACACAAGTGTTGC
TTCTTTACAAACGATGTTTTCAATGTTCTTGATTTTGACAAATTCAGATTTATGTTATTG
TCTTTTTAGTATGAAGAAGTTTTCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW51TF U 1
AF RR4EP29TF U 3
AF RR4E606TF U 1
AF RR4DW03TF U 3
AF RR4A229TFB U 8
AF RR4GW51JQ C 438
AF RR4E606JQ C 440
BS 1 20 RR4E606TF
BS 21 21 RR4GW51TF
BS 22 22 RR4DW03TF
BS 23 234 RR4E606TF
BS 235 235 RR4GW51TF
BS 236 631 RR4E606TF
BS 632 632 RR4DW03TF
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BS 634 668 RR4DW03TF
BS 669 669 RR4A229TFB
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BS 770 781 RR4DW03TF
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BS 793 1065 RR4GW51JQ
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BS 1067 1169 RR4GW51JQ

RD RR4GW51TF 598 0 0
TTTTTATAGAC
ACAAAGAGGGAAAACAGAAGCCTTTATCCTGTGAGCAGCAACAATGGTGAAGGCAACA**
GGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGCCAGCTCATCGACGAGTTCACTCA
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TCTTCGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGCGTTCGGTTAA
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AAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAA
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GCCTGGAAACACCGGTTTAGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCC
AACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGG
CGACAAGGTCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAA

QA 12 598 12 598
DS 

RD RR4EP29TF 543 0 0
TTTTTATAG
ACAAAGAGGGGAGACAGAAGCCTTTATCCTGTGAGCAGCAACAATGGTGAAGGCAACAAA
GGCGGAGAAGAAGATAGCTTACGACGCGAAGCTATGTCAGCTCATCGACGAGTTCACTCA
GATCCTTGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCGACTCAGCTGCAGAACATCAGGAAGGG
TCTTCGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACCATGATGAAGCGGTCGGTTAA
GATTCACGCTGAGAATACCGGAAACACTGGAATCCTCAATCTCATGCCCCTCCTTCAGGG
AAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAA
GTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGATTGGTTGCCCCAATTGATGTGGTTGTCCA
GCCTGGAAACACCGGTTTAGATCCTTCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTGAACATCCC
AACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAA

QA 10 543 10 543
DS 

RD RR4E606TF 631 0 0
TTTTTATAGACACAAAGAGGAAAAACAGAAGCCTTTATCCTGTGAGCAGCAACAATGGTG
AAGGCAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGCCAGCTCATCGAC
GAGTTCACTCAGATCCTGGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCGACTCAGCTACAGAAC
ATCAGGAAGGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACTATGTTGAAG
CGTTCGGTTAAGATTCACGCTGAGAACACCGGAAACACTGGAATCCTCAACCTCATGCCC
CTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAG
GAAGTTGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATAGAT
GTGGTTGTCCAGCCTGGAAACACCGGTTTAGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTT
CTTAACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTC
ATCAAGCAAGGCGACAAGGTCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATC
AGGCCGTTTTCATACGGTCTTGTTGTCCAGT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4DW03TF 790 0 0
TTTTTATAG
ACAAAGAGGGGAAACAGAAGCCTTTATCCTGTGAGCAGCAACAATGGTGAAGGCAACAAA
GGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGCCAGCTCATCGACGAGTTCACTCA
GATCCTGGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCGACTCAGCTACGGAACATCAGGAAGGG
TCTTCGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGCGTTCGGTTAA
GATTCACGCTGAGAACACCGGAAACACTGGAATCCTCAACCTCATGCCCCTCCTTCAGGG
AAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAA
GTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATAGATGTGGTTGTCCA
GCCTGGAAACACCGGTTTAGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCC
AACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGG
CGACAAGGTCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATCACGCCGTTTTC
ATACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGT*CT
TGATCTGACAGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTC*ATGGTCACTTC
CTTGGCTCTAGCCATCTCTTACCCTACACTCGCTGCC*CCCCGCATATGT
CATCACGCCTA

QA 10 779 10 779
DS 

RD RR4A229TFB 785 0 0
ATAG
ACAAAGAGGGGAAACAGAAGCCTTTATCCTGTGAGCAGCAACAATGGTGAAGGCAACAAA
GGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGCCAGCTCATCGACGAGTTCACTCA
GATCCTGGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCGACTCAGCTACAGAACATCAGGAAGGG
TCTTCGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGCGTTCGGTTAA
GATTCACGCTGAGAACACCGGAAACACTGGAATCCTCAACCTCATGCCCCTCCTTCAGGG
AAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAA
GTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATAGATGTGGTTGTCCA
GCCTGGAAACACCGGTTTAGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCC
AACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGG
CGACAAGGTCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATCAGGCCGTTTTC
ATACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCT
TGATCTGACAGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCCATGGTCACTTC
CTTGGCTCTAGCCATCTCTTACCCTACACTCGCTGCCGCCCCGCATATGTTCATCAACGC
C

QA 5 785 5 785
DS 

RD RR4GW51JQ 732 0 0
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GATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGCGACAA
GGTCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATCAGGCCGTTTTCATACGG
TCTTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGATCT
GACAGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGC
TCTAGCCATTTCTTACCCTACACTCGCTGCCGCCCCGCATATGTTCATCAACGCCTACAA
GAATGCATTGGCTATCTCTATTGCCACTGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGGTCAA
GGAGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGTAGCGGCAGTGTCTGCAGATGC
AGGTGGTGGTGCTTCAGGTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTTGTTGAGGA
ATCAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAATAGATTAAAAATAT
ATCTATCGAGGCTATGTTTTTGTCGATGTTACACAAGTGTTGCTTCTTTACAAACGATGT
TTTCAATGTTCTTGATTTTGACAAATTCAGATTTATGTTATTGTCTTTTTAGTATGAAGA
AGTTTTCGTTTC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4E606JQ 712 0 0
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TTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGCGACAAGG
TCGGTTCTTCCGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATCAGGCCGTTTTCATACGGTC
TTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGATTTGA
CAGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCTC
TAGCCATTTTTTACCCTACACTCGCTGCCGCCCCGCATATGTTCATCAACGCCTACAAGA
ATGCATTGGCTATCTTTATTGCCACTGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAGGTCAAGG
AGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGTAGCGGCAGTGTCTGCAGATGCAG
GTGGTGGTGCTTCAGGTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTTGTTGAGGAAT
CAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAATAGATTAAAAATATAT
CTATCGAGGCTATGTTTTTGTCGATGCTACACAAGTGTTGCTTCTTTACAAACGATGTTT
TCAATGTTCTTGATTTTGACAAATTCAGATTTATGTTATTGTCTTTTTAG
CG

QA 1 710 1 710
DS 



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CTGACAGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTG
GCTCTAGCCATCTCTTACCCTACACTCGCTGCCGCCCCGCATATGTTCATCAACGCCTAC
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GAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAATGGCAGAAGAGAC
ATTGAAGGAATTGCAGGACGAGTTTGTTGATATTCTAAGGTTCTTGAGGAATAACCAGAG
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AACTCGTTTCTTAATGATGATGGGTGTCATTGTCTCTGTTGTTTAGTATGTAATGTAACG
AGAGAGGTTGTTTAAGTTTCTAAGTATAGATTCCGTCTGTATTATGAAAACGATTAACAT
CGTGAATTATCGTCTACTGCATTCGTCCTGCTGTTAGGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H291TF U 1
AF RR4H291JQ C 181
BS 1 581 RR4H291TF

RD RR4H291TF 581 0 0
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QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4H291JQ 401 0 0
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GAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAATGGCAGAAGAGAC
ATTGAAGGAATTGCAGGACGAGTTTGTTGATATTTTAAGGTTCTTGAGGAATAACCAGAG
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AACTCGTTTTTTAATGATGATGGGTGTCATTGTTTCTGTTGTTTAGTATGTAATGTAACG
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CGTGAATTATCGTTTACTGCATTCGTCCTGCTGTTAGGCAT

QA 1 401 1 401
DS 



AS 3 16

CO CL29Contig1 904 8 18 U
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TTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACTTCCTCTCG
CTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCG
TCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTA
TATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGA
TTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGT
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TCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGT
TGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTC
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TCAG


BQ
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15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 

AF RR4FR70TF U 1
AF RR4EK44TF U 7
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AF RR4B844TF U 64
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TCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACCAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTA
TATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCTGTCTGTACAACTTTAGTTGAG

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4EK44TF 739 0 0
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AGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGTCTGGCTTGGAA
GATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTATATCAGTTTTCT
GCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGATTGGAAGGCTCT
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TCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCTTCCGACAC
GACCCAAGATCAA

QA 7 739 7 739
DS 

RD RR4BS46TF 722 0 0
G
GGCAAGGGATAAGTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCGTGAGCGGTGGACA
ACCTGGTACTGCTCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGGAAAGTCTTCCGTCT
TTTCAATTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACT
TCCTCTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTATATTCTTGTTCCTGGA
TCAAATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACT
TGGACGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCT
TGGTGAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGG
CAACAAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCT
TGCTTTGATCAAATCAGCCATGGACATCGTTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGTTATATCC
GGAGAATATCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTG
CTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAA*GCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGC
TGGCGTTCAAGCGAA*GTTTGAT*ATGTA*TACTATGTTGGTCCGTT
GAGTATTTGCTGCT

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR4B844TF 799 0 0
G
ATCGAGAGCAGAGCTTGGTCTAGTGGTTATGTATCTGAACAAAGCAGAGGCAAGGGATAA
GTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCGTGAGCGGTGGACAACCTGGTACTGC
TCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGGAAAGTCTTCCGTCTTTTCAAGTTTGT
TAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACTTCCTCTCGCTTT
GCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGTCTG
GCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTATATC
AGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGATTGG
AAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGTATCA
AGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGATCAA
ATCAGCCATGGACATCGTTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGTTATATCCGGAGAATATCAC
TCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCT
TCCGACACGACCCAAGATCAAAGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCAAGC
GAAAGTTTGATTATGTAATACTATGTTGGTCCTTTTGAGTAATTTGCTGCTGTTATTAGT
CCT
GTAAAATACTATCTG

QA 2 784 2 784
DS 

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CCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGAACCTTGAA
GCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCAAGAGAAAGTTTAATTATGTAATACTATGTTGGTCC
GTTTGAGTAATTTGCTGCTGTTATTAGTCCTTGTATAAATAC

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4BS46JQ 789 0 0
GGCAAGGGATAAGTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCGTGAGCGGTGGACA
ACCTGGTACTGCTCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGGAAAGTCTTCCGTCT
TTTCAATTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACT
TCCTCTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTATATTCTTGTTCCTGGA
TCAAATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACT
TGGACGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCT
TGGTGAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGG
CAACAAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCT
TGCTTTGATCAAATCAGCCATGGACATCGTTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGTTATATCC
GGAGAATATCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTG
CTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGC
TGGCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTATGTAATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTAATTTGCT
GCTGTTATTAGTCCTTGTAAAAATACTTATCTGCATGAATGATGATTATAATTAAAAAAA
TTTATGCCT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4EQ12JQ 632 0 0
GTTCCCAAAGGGACTCCACTTCCTCTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTG
TCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAAC
AAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTC
TGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATC
GAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAA
CAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGATCAAATCAGCCATGGACATCGTTGTAGCAGCT
GGTTTTTTTCGGTTATATCCGGAGAATATCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTC
ATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACCT
TGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTATGTAATACTATGTTG
GTCCGTTTGAGTAATTTGCTGCTGTTATTAGTCCTTGTAAAAATACTTATCTGCATGAAT
GATGATTATAATTAAAAAAATTTATGCCT
CAG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4EK44JQ 573 0 0
GTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAA
CAAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTATATCAGTTTTTTGCTGGATGGGATCATCCGT
CTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGAT
CGAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAA
ACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGATCAAATCAGCCATGGACATCGTTGTAGCAGC
TGGTTTTTTTCGGTTATATCCGGAGAATATCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATT
CATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACC
TTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTATGTAATACTATGTT
GGTCCGTTTGAGTAATTTGCTGCTGTTATTAGTCCTTGTAAAAATACTTATTTGCATGAA
TGATGATTATAATTAAAAAAATTTATGCCTCAG

QA 1 573 1 573
DS 



CO CL29Contig2 998 6 10 U
CCCAGTGGTAAGAATGTTTAGAATCAGACCAATGATGATTTCAGATACATGGAAACTTGC
ACAACTAGCGTGATATTACCGGTAGATAAGTATTTTATACAAGGACTTCAAACAACATCA
CATTACTCAAAAGGACCAACATAAACATTCTGAAATGACTTTCTCCTGAACGCCTATCTT
TCTTCGATAAGTTTTCAAGGCGCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAA
GAAATGAGGGAGGTGATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTTCTTTGGA
TATAACTGAAGAAGACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAGA
CTCCTCTCGTTCGATTGTTTAAGCTTAGCACGATACTCCTCATCTTGATACTTGGTGCCA
TTCTTAAGCCCCTTTTCGATTTTCTTCATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTCACCAATC
TCAACTAAAGAAGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAATAGTGATATACGTCCTAGT
AACTCAGCTCTCTCTTTGTTCTTATAGATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAATTTGATCC
AAGAACAAGAATGTAGACAAAAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGTAAAACGAGAGGAAGC
GGAGTTCCTTTAGGGACAGGACTGATAAGACCATGCAGATCATTAACAAACTTGAAAAGA
CGAAAGACTTTCCTGGCTAAGCTAGTGGATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACCAGGTTGT
CCACCGCTCAAGAACTTGGAACCGTACTGTATAGCTCTGCATAGCTTATCCCTTGCCTCT
GCTTTGTTCAGATACATAACCACTAGACCAAGCTCTGCTCTCGATACATCTAATAACGTA
CCACTCGCCATCTTCTCTCTTAGGAGATAGTATGAATACGATCTCTGTTTTAAGACTCCT
AGAGATGAGTGAACAGAGAGGGACTCTGTTTTGTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC19JQ U 7
AF RR4GY54JQ U 1
AF RR4H848JQB U 1
AF RR4AI32JQ U 52
AF RR4B708JQ U 60
AF RR4B708TF C 208
BS 1 278 RR4GY54JQ
BS 279 279 RR4DC19JQ
BS 280 513 RR4GY54JQ
BS 514 514 RR4DC19JQ
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BS 791 793 RR4H848JQB
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BS 818 865 RR4AI32JQ
BS 866 998 RR4B708JQ

RD RR4DC19JQ 593 0 0
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AGGGAGGTGATGAGTCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTTCTTTGGATATAAC
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AGCCCCTTTTCGATTTTCTTCATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTCACCAATCTCAACT
AAAGAAGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAATAGTGATATACGTCCTAGTAACTCA
GCTCTCTCTTTGTTCTTATAGATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAATTTGATC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4GY54JQ 790 0 0
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CATTACTCAAAAGGACCAACATAAACATTCTGAAATGACTTTCTCCTGAACGCCTATCTT
TCTTCGATAAGTTTTCAAGGCGCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAA
GAAATGAGGGAGGTGATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACGCGAGGAGTGATCTTCTTTGGA
TATAACTGAAGAAGACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAGA
CTCCTCTCGTTCGATTGTTTAAGCTTAGCACGATACTCCTCATCTTGATACTTGGTGCCA
TTCTTAAGCCCCTTTTCGATTTTCTTCATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTCACCAATC
TCAACTAAAGAAGTACAGACAGATGATCCCATCAAGCAGAATAGTGATATACGTCCTAGT
AACTCAGCTCTCTCTTTGTTCTTATAGATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAATTTGATCC
AAGAACAAGAATGTAGACAAAAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGTAAAACGAGAGGAAGC
GGAGTTCCTTTAGGGACAGGACTGATAAGACCATGCAGATCATTAACAAACTTGAAAAGA
CGAAAGACTTTCCTGGCTAAGCTAGTGGATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACCAGGTTGT
CCACCGCTCA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4H848JQB 817 0 0
CCCAGT
GGTAAGAATGTTTAGAATCAGACCAATGATGATTTCAGATACATGGAAACTTGCACAACT
AGCGTGATATTACCGGTAGATAAGTATTTTATACAAGGACTTCAAACAACATCACATTAC
TCAAAAGGACCAACATAAACATTCTGAAATGACTTTCTCCTGAACGCCTATCTTTCTTCG
ATAAGTTTTCAAGGCGCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAAGAAATG
AGGGAGGTGATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACGCGAGGAGTGATCTTCTTTGGATATAAC
TGAAGAAAACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAGACTCCTC
TCGTTCGATTGTTTAAGCTTAGCACGATACTCCTCATCTTGATACTTGGTGCCATTCTTA
AGCCCCTTTTCGATTTTCTTCATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTCACCAATCTCAACT
AAAGAAGTACAGACAGATGATCCCATCAAGCAGAATAGTGATATACGTCCTAGTAACTCA
GCTCTCTCTTTGTTCTTATAGATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAATTTGATCCAAGAAC
AAGAATGTAGACAAAAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGTAAAACGAGAGGAAGCGGAGTT
CCTTTAGGGACAGGACTGATAAGACCATGCAGATCATTAACAAACTTGAAAAGACGAAAG
ACTTTCCTGGCTAAGCTAGTGGATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACCAGGTTGTCCACCG
CTCAAGA*CTTGGAACCGTACTGTATAGCTC

QA 7 817 7 817
DS 

RD RR4AI32JQ 814 0 0
GG
AACTTGCACAACTAGCGTGATATTACCGGTAGATAAGTATTTTATACAAGGACTTCAAAC
AACATCACATTACTCAAAAGGACCAACATAAACATTCTGAAATGACTTTCTCCTGAACGC
CTATCTTTCTTCGATAAGTTTTCAAGGCGCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTG
GTAGCAAGAAATGAGGGAGGTGATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTT
CTTTGGATATAACTGAAGAAAACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAA
AGCAAGACTCCTCTCGTTCGATTGTTTAAGCTTAGCACGATACTCCTCATCTTGATACTT
GGTGCCATTCTTAAGCCCCTTTTCGATTTTCTTCATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTC
ACCAATCTCAACTAAAGAAGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAATAGTGATATACG
TCCTAGTAACTCAGCTCTCTCTTTGTTCTTATAGATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAAT
TTGATCCAAGAACAAGAATGTAGACAAAAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGTAAAACGAG
AGGAAGCGGAGTTCCTTTAGGGACAGGACTGATAAGACCATGCAGATCATTAACAAACTT
GAAAAGACGAAAGACTTTCCTGGCTAAGCTAGTGGATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACC
AGGTTGTCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCGTACTGTATAGCTCTGCATAGCTTATCCCT
TGCCTCTGCTTTGTTCAGATACATAACCACTA

QA 3 814 3 814
DS 

RD RR4B708JQ 939 0 0
CACAACTAGCGTGATATTACCGGTAGATAAGTATTTTATACAAGGACTTCAAACAACATC
ACATTACTCAAAAGGACCAACATAAACATTCTGAAATGACTTTCTCCTGAACGCCTATCT
TTCTTCGATAAGTTTTCAAGGCGCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCA
AGAAATGAGGGAGGTGATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTTCTTTGG
ATATAACTGAAGAAGACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAG
ACTCCTCTCGTTCGATTGTTTAAGCTTAGCACGATACTCCTCATCTTGATACTTGGTGCC
ATTCTTAAGCCCCTTTTCGATTTTCTTCATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTCACCAAT
CTCAACTAAAGAAGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAATAGTGATATACGTCCTAG
TAACTCAGCTCTCTCTTTGTTCTTATAGATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAATTTGATC
CAAGAACAAGAATGTAGACAAAAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGTAAAACGAGAGGAAG
CGGAGTTCCTTTAGGGACAGGACTGATAAGACCATGCAGATCATTAACAAACTTGAAAAG
ACGAAAGACTTTCCTGGCTAAGCTAGTGGATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACCAGGTTG
TCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCGTACTGTATAGCTCTGCATAGCTTATCCCTTGCCTC
TGCTTTGTTCAGATACATAACCACTAGACCAAGCTCTGCTCTCGATACATCTAATAACGT
ACCACTCGCCATCTTCTCTCTTAGGAGATAGTATGAATACGATCTCTGTTTTAAGACTCC
TAGAGATGAGTGAACAGAGAGGGACTCTGTTTTGTGGCC

QA 1 939 1 939
DS 

RD RR4B708TF 791 0 0
ATCTTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAAGAAATGAGGGAGGTGATGAATCCAAAA
GCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTTCTTTGGATATAACTGAAGAAGACCAGCTGCTACA
ACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAGACTCCTCTCGTTCGATTGTTTAAGCTTA
GCACGATACTCCTCATCTTGATACTTGGTGCCATTCTTAAGCCCCTTTTCGATTTTCTTC
ATGGATGAAGATAGCCTTCCAATCTCACCAATCTCAACTAAAGAAGTACAGACAGATGAT
CCCATCCAGCAGAATAGTGATATACGTCCTAGTAACTCAGCTCTCTCTTTGTTCTTATAG
ATTCCTGATCTCCCAAGCCAGACAATTTGATCCAAGAACAAGAATGTAGACAAAAGTGCG
TTCTTGGACTTTCCAAGTAAAACGAGAGGAAGCGGAGTTCCTTTAGGGACAGGACTGATA
AGACCATGCAGATCATTAACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTCCTGGCTAAGCTAGTG
GATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACCAGGTTGTCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCGTAC
TGTATAGCTCTGCATAGCTTATCCCTTGCCTCTGCTTTGTTCAGATACATAACCACTAGA
CCAAGCTCTGCTCTCGATACATCTAATAACGTACCACTCGCCATCTTCTCTCTTAGGAGA
TAGTATGAATACGATCTCTGTTTTAAGACTCCTAGAGATGAGTGAACAGAGAGGGACTCT
GTTTT
GTGGCC

QA 1 785 1 785
DS 



CO CL29Contig3 728 2 6 U
GATGAGTCTTGTTTCTTCGATCCAAATCGACTCTAAGGTTCAAACTTGTTAGAACTTGCG
AGTTTTGCTGGCTGAAAGGCTGAGACTTTACTGCACTTTCATTAGATTTTCAAAGGCCTC
TTCTTTGTGTGTGTGTTTCAGAGAGAAGATGGCGAGTGGTACGTTATTAGATGTATCGAG
AGCAGAGCTTGGTCTAGTGGTTATGTATCTGAACAAAGCAGAGGCAAGGGATAAGCTATG
CAGAGCTATACAGTACGGTTCCAAGTTCTTGAGCGGTGGACAACCTGGTACTGCTCAAAA
CGTTGATAAATCCACTAGCTTAGCCAGGAAAGTCTTTCGTCTTTTCAAGTTTGTTAATGA
TCTGCATGGTCTTATCAGTCCTGTCCCTAAAGGAACTCCGCTTCCTCTCGTTTTACTTGG
AAAGTCCAAGAACGCACTTTTGTCTACATTCTTGTTCTTGGATCAAATTGTCTGGCTTGG
GAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGAGAGCTGAGTTACTAGGACGTATATCACTATT
CTGCTTGATGGGATCATCTGTCTGTACTTCTTTAGTTGAGATTGGTGAGATTGGAAGGCT
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GGAGTATCGTGCTAAGCTTAAACAATCGAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGATCAAATCAGC
CATGGACA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY54TF U 1
AF RR4H848TF U 1
BS 1 638 RR4GY54TF
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BS 683 714 RR4GY54TF
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TCA

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DS 

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TTCTTTGTGTGTGTGTTTCAGAGAGAAGATGGCGAGTGGTACGTTATTAGATGTATCGAG
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CAGAGCTATACAGTACGGTTCCAAGTTCTTGAGCGGTGGACAACCTGGTACTGCTCAAAA
CGTTGATAAATCCACTAGCTTAGCCAGGAAAGTCTTTCGTCTTTTCAAGTTTGTTAATGA
TCTGCATGGTCTTATCAGTCCTGTCCCTAAAGGAACTCCGCTTCCTCTCGTTTTACTTGG
AAAGTCCAAGAACGCACTTTTGTCTACATTCTTGTTCTTGGATCAAATTGTCTGGCTTGG
GAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGAGAGCTGAGTTACTAGGACGTATATCACTATT
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CATGGACA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 2 19

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TACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAAAAATTATCTCAAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 45 15 45 45 15 15 45 45 15 45 15 45 15 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 40 40 40 40 40 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4DD30TF U 91
AF RR4AZ74JQ C 68
AF RR4AZ74TF U 68
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AF RR4BQ39JQ C 1
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AF RR4CN48TF U 107
AF RR4D824JQ C 32
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CT

QA 1 580 1 580
DS 

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CCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTC
TCTCTCTCTCTCT**TTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATA
AAAACATAACGCCCTTTATTATATCTATCTGGTCTTGTCT
CT

QA 1 580 1 580
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GG
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QA 3 580 3 580
DS 

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TACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAAAAATTATC
TCG

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DS 

RD RR4CN48JQ 598 0 0
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GGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGG
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CCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCT**TTGAATAAGCTTCTTTG
GCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTATATCTATCTGG
TCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAAAAATTATC
CC

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CTCTCTCTCTCT****TTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTAT
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ACAGTGTTTCATCTATTTGAAAAATTATC
CC

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DS 

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GG
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**AGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
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CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGCCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAAC
CTATGAGGACTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTT
CGATTTTGTCACCGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAA
TAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATT
ATATCTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAA
AAA

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR4BQ39TF 706 0 0
GGAAAATAACGCCGAGGAAAAAGGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCA
CCCTCTCTGCGTCTCCTTTCAGC******AGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATTGCTAA
TGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTAGGGTTTCTGGAACTGAAGGC
GAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGT
CGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGA
AGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTCGATTTTGTCACCGCGGAGAATTGCCAGAAGAG
CAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTA
TGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAAGC
AACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAA
ATCTCTCTCTCTCTCTCTCT**TTGAACAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGAC
TGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTATATCTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGT
TACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAAAA*TTATCTC
GAAAAAAAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4CN48TF 591 0 0
TCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAACGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTT
CTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAG
AAGCAAGTGATTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCT
AGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTCGATTTTGTCACCGCGGAG
AATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGA
AGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAA
GTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTC
AATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCT**TTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTA
CAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTATATCTATCTGGTCTTGTC
TTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAAAA*TTATC
CC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4D824JQ 671 0 0
GG
ATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTTTCAGC******AGTA
ATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTG
CAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGAT
CGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGA
GGACTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTCGATTT
TGTCACCGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACGT
AGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACT
TGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTT
CAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCT
TCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTATATCT
GTCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCATCTATTTGAAAAATTA
TCTCAAGTT

QA 3 671 3 671
DS 



CO CL30Contig2 696 8 12 U
GGAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTTTCAGC
AGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATG
ACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACA
AGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCT
ACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTG
ATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTG
ACGTATCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTG
AACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATG
TTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTG
AATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTA
TTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTG
AAAATTATCTCAAGTTTGTGCTATGTGTTTGCATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 25 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4GY69TF U 1
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AF RR4E636TF U 29
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BS 693 696 RR4DX91JQ

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ACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTG
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ACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTG
AACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATG
TTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAA

QA 1 506 1 506
DS 

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TCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGC
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GTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTA
GCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTT
GATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTC
AAAAGCCGTGTCAATTAAAAAA*CAA***TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAA
GCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTA
TCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTACTTGAAAAT
TATCTCAAGTTTGTG

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR4DX91TF 639 0 0
GG
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GCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTATCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATAT
ATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGG
CAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACA
AATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCT
GCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTC
TTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4E636TF 668 0 0
GG
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CGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTG
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AAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGA
GCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTATCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATAT
ATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGG
CAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACA
AATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCT
GCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTC
TTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCTCAAGTTTGTGCTATGTGTTT
GC
ATCC

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DS 

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GG
GCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
TGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTA
CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAAC
CTACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTT
TGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAA**TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT
TGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCCGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTT
TATTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATT
TGAAAATTATCTCAAGTTTGTGCTGTGTGTT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR4DX91JQ 629 0 0
TCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAA
GCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGA
GGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTACGAGGA
GTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGT
CACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTATC
AAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGA
TGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAA
AAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGC
TTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATC
TATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTA
TCTCAAGTTTGTGCTATGTGTTTGCATCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4GY69JQ 146 0 0
TTTTTTT
GCTCCTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACCCCCTTTATTCTATCTATCTGG
TCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTTTATTTGAAAATTATCTCAAG
TTTGTGCTGTGTGTTTGC
T

QA 8 145 8 145
DS 

RD RR4E636JQ 591 0 0
TGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACC
GTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTG
AACCTATTCAAACCTACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATG
CCATTTATGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCA
TTGCATGGTGTCCTGACGTATCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGG
ACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTG
AGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAA
ACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAG
TGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCTCAAGTTTGTGCTATGTGTTTGC
ATCC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 20

CO CL31Contig1 898 20 22 U
TTTTTCTTAATTTAGTAGAAGGATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCT
CCAACTTCTCTCTAGTTCTTCTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTT
GCCACCGGTCGCCACCCCC*TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGG
CTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTC
GCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAAT
CCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACG
AGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTT
AAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGG
CGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTT
TAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAAT
TGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGC
CGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGACGGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTT
GATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATACTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCAACCT
GCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTTCTTT
GTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTGGGCTCTCGTTTAATGAAACGAATGTTGACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 
40 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 95 95 80 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 40 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 65 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 
80 80 80 80 55 80 50 50 80 45 80 60 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 35 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 

AF RR4BX95TF U 1
AF RR4EC15TF U 21
AF RR4GS46JQ C 281
AF RR4EP76TF U 21
AF RR4FS37TF U 21
AF RR4GY08TF U 1
AF RR4H388TF U 21
AF RR4GS46TF U 174
AF RR4DX45TF U 21
AF RR4GX28TF U 21
AF RR4F882TF U 27
AF RR4AF23TF U 15
AF RR4FS37JQ C 146
AF RR4EP76JQ C 198
AF RR4F882JQ C 149
AF RR4BX95JQ C 160
AF RR4DX45JQ C 227
AF RR4EC15JQ C 417
AF RR4GX28JQ C 160
AF RR4H388JQ C 149
BS 1 8 RR4BX95TF
BS 9 9 RR4GY08TF
BS 10 20 RR4BX95TF
BS 21 22 RR4DX45TF
BS 23 105 RR4BX95TF
BS 106 106 RR4GY08TF
BS 107 423 RR4BX95TF
BS 424 424 RR4GY08TF
BS 425 596 RR4BX95TF
BS 597 598 RR4GY08TF
BS 599 599 RR4DX45TF
BS 600 665 RR4GY08TF
BS 666 666 RR4GX28TF
BS 667 676 RR4GY08TF
BS 677 677 RR4DX45TF
BS 678 699 RR4GY08TF
BS 700 722 RR4DX45TF
BS 723 762 RR4GX28TF
BS 763 763 RR4AF23TF
BS 764 772 RR4GX28TF
BS 773 836 RR4AF23TF
BS 837 898 RR4FS37JQ

RD RR4BX95TF 596 0 0
TTTTTCTTGATTTAGTAGAACTATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCT
CCAACTTCTCTCTAGTTCTTCTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGTCGGTGAGCATCTTT
GCCACCGGTCGCCACCCCC*TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGG
CTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTC
GCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAAT
CCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACG
AGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTT
AAAGGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGG
CGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTT
TAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4EC15TF 570 0 0
GGATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTT
CTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCCC
TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCC
GGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTG
TGCGAGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGG
ATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAATGAGAATCAGTCTTTACCGATT
TAGATCAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATG
GATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAA
AGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGG
TCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4GS46JQ 278 0 0
TCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAATC
AACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTT
ACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGA
AAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATTTCTGTCTTCAACCC
GATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATG

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR4EP76TF 607 0 0
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CTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*
TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCC
GGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTG
TGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGG
ATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATT
TAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATG
GATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAA
AGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGG
TCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCA
ACCTAAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FS37TF 639 0 0
GGATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTT
CTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*
TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCC
GGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTG
TGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGG
ATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATT
TAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATG
GATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAA
AGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGG
TCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCA
ACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGAGTGAGTTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4GY08TF 703 0 0
TTTTTCTTAATTTAGTAGAACTATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCT
CCAACTTCTCTCTAGTTCTTCTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTT
GCCACCGGTCGCCACCCCC*TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGG
CTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTC
GCTAGGCGATTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTCTATCACTTCAAT
CCCGTTGATCTATTGACTGGATACTCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACG
AGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTT
AAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGG
CGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTT
TAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGAAA*T
TGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGC
CGCCG*TAGTCTCTTC*TCGCGACGGAGTCAGTGGTGGT
GAGC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4H388TF 641 0 0
GGATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTT
CTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*
TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCCTGTCCGATTGTATATTCC
GGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTG
TGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGG
ATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATT
TAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATG
GATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAA
AGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTACATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGG
TCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAG*AAATTGGAGTACAAGATCTAAGCA
ACCTAAGAAGT*ACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GS46TF 499 0 0
TTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAA
TAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCA
CTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTT
TTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATC
TATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCA
GAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCC
TCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAA
AGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCACCCTAAGAAGT*ACAGTGGCTGGCGTTAGGTGT
GAGTTGCCGCCGGTAGTCT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4DX45TF 702 0 0
GGATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTT
CTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGTATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*
TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCC
GGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTG
TGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGG
ATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATT
TAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATG
GATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAA
AGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGG
TCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCA
ACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCG*TAGTCTCTTCCTCG
CGACG*AGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4GX28TF 766 0 0
GGATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTT
CTCAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*
TTTTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCCTGTCCGATTGTATATTCC
GGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTG
TGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGG
ATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATT
TAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATG
GATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAA
AGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTACATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGG
TCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCA
ACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCG
CGACTGAGTCAGTGGTGGT*GAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGC
ACCAGATACTGCCACGTAGCAA*CTAGTATCT
CCACCTGCACGTGT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4F882TF 717 0 0
TATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTTCTCAAT
CGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*TTTTTT
GTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCAT
CAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTG
TGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCC
TGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATT
AGCCATTTCGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTA
TTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATC
TCTGTCTTCAACCCGA*CTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTC
CGGTTAATCGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTAA
GAAGTTACAGCGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGT**TCTCTTCCTCGCGACG*
AGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGG*CGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AF23TF 822 0 0
GGAGAACT
ATAATATTTGCAAATAAAATATTCTCTCTCTAGAAGCTCCAACTTCTCTCTAGTTCTTCT
CAATCGCAGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCC*TT
TTTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGG
TCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTG
CGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGAT
ACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTA
GATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGA
TTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAG
TATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTC
CCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAAC
CTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCG
ACGGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCAC
CAGATACTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTA
CGTATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTT

QA 9 822 9 822
DS 

RD RR4FS37JQ 753 0 0
TGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCA
TCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGT
GTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACC
CTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGAT
TAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTT
ATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTAT
CTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCT
CCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATTTAAGCAACCTA
AGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGAGTGAGTTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGACG
GAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAG
ATACTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGT
ATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCA
TTGGGCTCTCGTTTAATGAAACGAATGTTGACG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EP76JQ 679 0 0
TCCGGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCG
GTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGAC
TGGATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCG
ATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCG
ATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGG
CAAAGTATCTCTGTTTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCAT
GGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATTTAA
GCAACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTTTTTTCC
TCGCGACGGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTA
TGCACCAGATACTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTA
TGTTACGTATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTA
ATAGCCCATTGGGCTCTCG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4F882JQ 749 0 0
TTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCA
GACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTG
TTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTG
TTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAG
CCATTTCGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATT
AGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTC
TGTCTTCAACCCGA*CTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCG
GTTAATCGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATTTAAGCAACCTAAGA
AGTTACAGCGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGT**TTTCTTCCTCGCGACGGAG
TCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATA
CTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATA
TTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTG
GGCTCTCGTTTAATGAAACGAATGTTGAC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4BX95JQ 738 0 0
TTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTT
CCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCT
TTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAAT
CAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTT
TACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAGGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTG
AAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACC
CGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATC
TTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGG
CTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGACGGAGTCAGTGGTGGT
TGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATACTGCCACGTAG
CAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATATTGCAGTTTGT
GTCGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTGGGCTCTCGTTT
AATGAAACGAATGTTGAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4DX45JQ 671 0 0
TGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCG
TTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTA
GCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTACGGTA
AAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGA
TTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTA
AATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATA
ACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGT
TAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGACGGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAA
AGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATACTGCCACGTAGCAAACTA
GTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATATTGCAGTTTGTGTTGGGT
TTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTGGGCTCTCGTTTAATGAAA
CGAATGTTGAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4EC15JQ 481 0 0
GCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAG
CCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCT
GTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGG
AAATTGGAGTACAAGATTTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAG
TTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGACGGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGG
TGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATACTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCA
ACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTT
CTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTGGGCTCTCGTTTAATGAAACGAATGTTGA
C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR4GX28JQ 738 0 0
TTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCCTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTT
CCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCT
TTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAAT
CAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTT
TACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCACGTTG
AAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTCTGTCTTCAACC
CGATCTACATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATC
TTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATTTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGG
CTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTTTCTTCCTCGCGACTGAGTCAGTGGTGGT
TGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATACTGCCACGTAG
CAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATATTGCAGTTTGT
GTTGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTGGGCTCTCGTTT
AATGAAACGAATGTTG
GC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4H388JQ 749 0 0
TTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCCTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCA
GACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTG
TTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCCGTTGATCTATTGACTGGATACCCTG
TTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAG
CCATTTTGGTTTACGGTAAAGCATCTATGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATT
AGGTCACGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATAACGGTCCGGCAAAGTATCTC
TGTCTTCAACCCGATCTACATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCG
GTTAATTGATCTTGGATAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTAAGA
AGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGACTGAG
TCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATA
CTGCCACGTAGCAAACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTACGTATA
TTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTG
GGCTCTCGTTTAATGAAACGAATGTTG
GC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 19

CO CL32Contig1 843 19 16 U
GGAATAATATAGATCAGAACCACGCGTATATTCTTATGGACGTCATCTTCGGCTCAATTA
AGTCATCTTCAATCTCAAAGG****TGTAACTTGGCTCAACAGCAATGTCAAGAGCTAAT
GATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAGACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCT
GTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTAT
GTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAG
AATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAA
GATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTA
CTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTG
TGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCG
GGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACC
CAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCG
TTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTG
TTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTGATTTTCTTACAAATCG
TTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAATTATTCTTTTTTGTTGGTTACCAA
TAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 20 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 90 90 97 50 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 90 97 90 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 80 97 80 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 35 90 90 90 85 85 55 85 50 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 80 80 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 40 40 40 40 40 40 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL19JQ C 400
AF RR4H713TF U 34
AF RR4FO15TF U 37
AF RR4GW43TF U 38
AF RR4GL19TF U 1
AF RR4AC43TF U 4
AF RR4H578TF U 34
AF RR4FO15JQ C 37
AF RR4GW43JQ C 273
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AF RR4DR38JQ C 123
AF RR4H713JQB C 73
AF RR4DR38TF U 38
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AF RR4E290JQ C 160
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AF RR4EB92TF U 38
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AF RR4GC78JQ C 135
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BS 38 39 RR4FO15TF
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RD RR4GL19JQ 194 0 0
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AACTTGGATTTCTTTTTTTTGTCCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAA
ACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCA
CTTTTTGAACAGAC

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR4H713TF 569 0 0
GG
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CTCAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCT
AGACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGC
TGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCAC
AGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCC*AGGACCT
TCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACA
AGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCT
TGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATT
GGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGG
TTCACTCTCTGAACAGACATTAACCCG

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR4FO15TF 619 0 0
A
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CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACCCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTAT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR4GW43TF 735 0 0
GGACGTCATCTTCGGCTCAATTAAGTCATCTTCAATCTCAAAGG****TGTAACTTGGCT
CAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCCTCTTCTAG
ACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTG
CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTGGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAAT
AGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTT
ATGACTGATTT*CTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GL19TF 788 0 0
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AGTCATCTTCAATCTCAAAGG****TGTAACTTGGCTCAACAGCAATGTCAAGAGCTAAT
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GTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTAT
GTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAG
AATACCATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAA
GATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTA
CTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGTAAGCCCTTGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTG
TGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCG
GGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACC
CAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCG
TTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATGGCCATACCTGAAATTGTTGCTG
TTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTGATT**CTTACAAATCG
TTTACTTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AC43TF 785 0 0
GG
AATATAGATCAGAACCACGCGTATATTCTTATTTACGTCATCTTCGGCTCAATTAAGTCA
TCTTCAATCTCAAAGG****TGTAACTTGGCTCAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTC
TTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAGACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAA
GTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTT
CACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAA
CATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGA
AAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCT
CAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCT
TGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAA
AGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCTCTGAACAGGCATTAACCCAAGC
ATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTA
GCAAAATGATCTTTAATCATGGGGCTTTTAATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCAC
TAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTGATTTTCTTACAAATCGTTTAC
TTG

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR4H578TF 753 0 0
GG
ATTTACGTCATCTTCGGCTCAATTAAGTCATCTTCAATCTCAAAGGCAGGTGTAACTTGG
CTCAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCT
AGACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGC
TGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCAC
AGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCC*AGGACCT
TCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACA
AGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCT
TGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATT
GGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGG
TTCACTCTCTGAACAGACATTAACCCGAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAG
AAGTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTA
ATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATC
TTATGACTGATTTTCTTACAAATCGTTTACT

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR4FO15JQ 799 0 0
A
GGACGTCATCTTCGGCTCAAT*AAGTCATCTTCAATCTCAAAGG****TGTAACTTGGCT
CAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAG
ACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTG
CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTTTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACCCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAAT
AGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTT
ATGACTGATTTTCTTACAAATCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAAT
TATTCTTTTTTGTTGG
CT

QA 2 797 2 797
DS 

RD RR4GW43JQ 563 0 0
CACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGA
CCTTCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCT
ACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTTTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGC
CCTTGAAAACTTGGATTTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGT
ATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAG
TGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGC
AAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTGGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTT
TTAATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGT
ATCTTATGACTGATTTTCTTACAAATCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGA
TCAATTATTCTTTTTTGTTGG
GT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4H578JQB 663 0 0
AGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTT
AGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGA
GATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCC*AGGACCTTCACTTCTT
TGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTT
TGATGCCGTTGCATTACTTTTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAAAACTT
GGATTTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGA
TGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTTTT
TGAACAGACATTAACCCGAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTT
AACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAGCCATA
CCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTG
ATTTTCTTACAAATCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAATTATTCTT
T
AG

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4DR38JQ 702 0 0
TTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAGACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGT
CAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGT
CTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAA
TAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGA
TGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACT
TCTCAGGAACAATGCTGAAAAGATGGAAGCC*TTGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTG
CCTTGATGAGATGGGTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGG
AAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACCCA
AGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCGTT
GTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTT
CACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTGATTTTCTTACAAATCGTT
TACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAATTATTCT
C

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4H713JQB 755 0 0
TCTCAAAGGCAGGTGTAACTTGGCTCAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCT
TTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAGACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTAC
TCGGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAG
ACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTT
GTCTATAAGTTTGCC*AGGACCTTCACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAG
CTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAAC
AATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAG
ATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCA
ATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACCCGAGCATTCGCA
ACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAAT
GATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGAT
GAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTGATTTTCTTACAAATCGTTTACTTGTATT
GTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAATTATTCTTT
AG

QA 1 753 1 753
DS 

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CAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAG
ACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTG
CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGCTGAAAAGATGGAAGCC*TTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGGTGATCAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAAT
AGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTT
ATGACTGATTT*CTTACAA*TCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGA*TTTAGATCA
TTATCTCA

QA 1 778 1 778
DS 

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CAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAG
ACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTG
CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACGAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAAT
AGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTT
ATGACTGATTT*CTTACGAATCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAAT
TATTCTTTTTTGTTGG
CA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4E290JQ 675 0 0
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AAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACGAATGCTCGCACAGAA
GCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCAC
TTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGC
TTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAA
AACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAA
ACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCA
CTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGT
CTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAG
CCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTAT
GACTGATTTTCTTACGAATCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGGAATTTAGATCAATTA
TTCTTTTTTGTTGG
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4DD17JQ 670 0 0
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TAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGG
AGATCACACTGTTGGAGAATAGCATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCACTTCT
TTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAACTCATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTT
TTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAAAACT
TGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAG
ATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTA*CAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCT
CTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTT
TAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAGCCAT
ACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACT
GATTTTCTTACAAATCGTTTACTTGTATTGTTTCCTTTTGAAATTTAGATCAATTATTCT
TTTTTGTT
AG

QA 1 668 1 668
DS 

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CAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAG
ACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTG
CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATT***TCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATTAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAAT
AGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTT
ATGACTGATTT*CTTACAA*TCGTTTACTTGTATTGTTTCCTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4GC78TF 755 0 0
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CAACAGCAATGTCAAGAGCTAATGATTCTTGTCCTTTGGTAAAAAACATCCTTCTTCTAG
ACTCTGAAGGAAAACGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCGGATGATTGGACAACTAATGCTG
CCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGACCTCTAAAACCAATGCTCGCACAG
AAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGTCTATAAGTTTGCCCAGGACCTTC
ACTTCTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCTCATCTTATCATCTGTTCTACAAG
GCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTCTCAGGAACAATGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTG
AAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGATGGTTGATCAGGGGATGGTATTGG
AAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTT
CACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAACGGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAA
GTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGATCTTTAATCATGGG*CTTTTAAT
AGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGAGTGCATGTTTACTCAAGTATCTT
ATGACTGATTTTCTTACAA*TCGTTTACTTGTATT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4GC78JQ 709 0 0
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GGATGATTGGACAACTAATGCTGCCAAGTTAGCTTTTGAAAAGTATGTCTTCACGAAGAC
CTCTAAAACCAATGCTCGCACAGAAGCGGAGATCACACTGTTGGAGAATAACATTGTTGT
CTATAAGTTTGCCCAGGACCTTCACTTTTTTGTTACAGGTGGTGAAGATGAAAACGAGCT
CATCTTATCATCTGTTCTACAAGGCTTTTTTGATGCCGTTGCATTACTTTTCAGGAACAA
TGTTGAAAAGATGGAAGCCCTTGAAAACTTGGATCTCATCTTTTTGTGCCTTGATGAGAT
GGTTGATCAGGGGATGGTATTGGAAACAGATGCCAATGTCATTGCGGGAAAAGTAGCAAT
GCAGAGCACAGAAGCAAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACCCAAGCATTCGCAAC
GGCGAGAGAGCACCTGGCAAGAAGTCTTTTAACATGATTATCATCGTTGTAGCAAAATGA
TCTTTAATCATGGG*CTTTTAATAGCCATACCTGAAATTGTTGCTGTTCACTAGAGATGA
GTGCATGTTTACTCAAGTATCTTATGACTGATTTTCTTACAAATCGTTTACTTGTATTGT
TTCCTTTTGGAATTTAGATCAATTATTCTTTTTTGTTGGTTACCAATAC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 2 19

CO CL33Contig1 869 4 9 U
GGAGCTACTAATTCAGTGCAGCGGCACCATCATTGTTGTTGCAAATTTGTTCACATTTTG
TTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATCCAAACAACATTAGACGCATT
GGCCATTGCATATGATTTGATTATACAGTAAACAAGCAATGTTCATATTCAATTGAAATG
GAAAGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCTTTAGT
ATTCTGTTTCCAGTAGACCATCGATAAGGCCGAACTCAAGCGCCTCAGAAGCCGATAAGA
AACGATCTCTTTCGGTGTACTGCTGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCAT
ACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAATGGCTTCATTCACCTGTCTCCTCACATCCT
CCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTG
CATAGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTC
CAAACGCCACTGTTCCTACTTTAGGCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAACA
CGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAA
TAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTT
GTCCGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATAACACAGAAGAAAGGTCCAAAGGTCCTCCAG
GTGTCATCACTGCTGGCATTACAGGCGGGTTTCCTTTCTTCGCCTCTATCACTCCAAATC
TTGGATCAATGCTACGAGGATCCTTGTTG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF03JQ U 2
AF RR4AN76TF C 1
AF RR4EE46JQ U 2
AF RR4AH26JQ U 37
BS 1 3 RR4AN76TF
BS 4 266 RR4EE46JQ
BS 267 267 RR4AH26JQ
BS 268 475 RR4EE46JQ
BS 476 476 RR4AH26JQ
BS 477 580 RR4EE46JQ
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BS 764 869 RR4AH26JQ

RD RR4FF03JQ 714 0 0
GG
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TGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATCCAAACAACATTAGACGCATTGGC
CATTGCATATGATTTGATTATACAGTAAACAAGCAATGTTCATATTCAATTGAAATGGAA
AGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCTTTAGTATT
CTGTTTCCAGTAGACCATCGATA*GGCCGAACTCAAGCGCCTCAGAAGCCGATAAGAAAC
GATCTCTTTCGGTGTACTGCTGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACA
TCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAATGGCTTCATTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCA
CATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGGATTGCAT
AGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAA
ACGCCACTGTTCCTACTTTAGGCTTTATCCAAGACATGCAGTCATAGATTGCTAACACGG
AGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAATAG
AAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGAT

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR4AN76TF 732 0 0
GGAGCTACTAATTCAGTGCAGCGACACCATCATTGTTGTTACAAATTTGTTCACATTTTG
TTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATCCAAACAACATTAGACGCATT
GGCCATTGCATATGATTTGATTATACAGTAAACAAGCAATGTTCATATTCAATTGAAATG
GAAAGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCTTTAGT
ATTCTGTTTCCAGTAGACCATCGATAAGGCCGAACTCAAGCGCCTCAGAAGCCGATAAGA
AACGATCTCTTTCGGTGTACTGCTGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCAT
ACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAATGGCTTCATTCACCTGTCTCCTCACATCCT
CCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTCATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTG
CATAGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTC
CAAACGCCACTGTTCCTACTTTAGGCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAACA
CGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAA
TAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTT
GTCCGATGAAG
C

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4EE46JQ 765 0 0
GG
GCTACTAATTCAGTGCAGCGGCACCATCATTGTTGTTGCAAATTTGTTCACATTTTGTTC
TGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATCCAAACAACATTAGACGCATTGGC
CATTGCATATGATTTGATTATACAGTAAACAAGCAATGTTCATATTCAATTGAAATGGAA
AGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCTTTAGTATT
CTGTTTCCAGTAGACCATCGATA*GGCCGAACTCAAGCGCCTCAGAAGCCGATAAGAAAC
GATCTCTTTCGGTGTACTGCTGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACA
TCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAATGGCTTCATTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCA
CATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGGATTGCAT
AGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAA
ACGCCACTGTTCCTACTTTAGGCTTTATCCAAGACATGCAGTCATAGATTGCTAACACGG
AGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAATAG
AAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTC
CGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATAACACAGAAGAAAG
TCC

QA 3 762 3 762
DS 

RD RR4AH26JQ 833 0 0
AGTTG
CAAATTTGTTCACATTTTGTTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATCC
AAACAACATTAGACGCATTGGCCATTGCATATGATTTGATTATACAGTAAACAAGCAATG
TTCATATTCAATTGAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTGCATCTATGCATTG
TCTTGCACGTTGCTTTAGTATTCTGTTTCCCGTAAACCATCGATAAGGCCGAACTCAAGC
GCCTCAAAAGCCGATAAGAAACGATCTCTTTCGGTGTACTGCTGCACTGTCTCAAGAGGC
TGTCCAGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAATGGCTTCATTC
ACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGTATCATG
ACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAGTGCT
CCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCCACTGTTCCTACTTTAGGCTTTATCCAAGACATA
CAGTCATAGATTGCTAACACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATATCAAG
ATGTCGGATTTATCATCAATAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTGAGCA
ACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATAACACAGAAGAT
AGGTCCAAAGGTCCTCCAGGTGTCATCACTGCTGGCATTACAGGCGGGTTTCCTTTCTTC
GCCTCTATCACTCCAAATCTTGGATCAATGCTACGAGGATCCTTGTTG

QA 6 833 6 833
DS 



CO CL33Contig2 1164 15 26 U
GGGTCCAAACATTAACCTTGGAGTCTTGCCCTCTGTGTCTATCCACGCCCGAACCTGAAA
AAATTCCGACACAGAGAAAAGCTT*AGAGCTCTGGTTAGTAATGGCGGGATTGGCAATTT
CACCTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTGGAACAAGAAACGCTAAACCC*ACTTCGTAT
CTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTTCTGCTCTTCCGAGTCCTTAT
GGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGCAACAAGGATCCTCGTAGC
ATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAACCCGCCTGTAATGCCATCA
GTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATC
TTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACC
CTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGC
ACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAAAGCCTAAAGTTGGAACA
GTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAGGG
ATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAAACTGGATGCGGA
GGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAGGTGAATGAAGCCATTGAAGCACGACAAAAAA*
TTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGACAGTGCAGCAGTACACCG
AAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCGCTTGAGTTCGGCCTTATCGATGGTCTAC
TGGAAACAGAATACTAAAGCAACGTGCAAGACAATGCATAGATGCAGCTTCATTGCATGT
TCAAACCCTTTCCATTTCAATTGAATATGAACATTACTTGTTTACTATATTCAGTTATGT
AATCAAATCATATGCAAATGCAATGGCCAATGCGCCTATGCTGTTTGGATAGCAATTCTT
TTTAACATTATTACTGTTTTTGTCAGAACAAAATGTGAACAAATTTGCAATAATGATGGT
ATGGCTGCACTGAATTAGTAGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 45 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 35 70 40 70 70 70 70 70 70 
35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 65 40 65 65 40 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FF03TF U 1
AF RR4EE46TF U 1
AF RR4EX78TF U 34
AF RR4FK32TF U 69
AF RR4AX74TF U 39
AF RR4AH26TF U 42
AF RR4A956TF U 294
AF RR4EX78JQ C 351
AF RR4A956JQ C 394
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AF RR4AX74JQ C 153
AF RR4C023TF U 408
AF RR4C067TF U 408
AF RR4C067JQ C 978
AF RR4C023JQ C 985
BS 1 84 RR4EE46TF
BS 85 85 RR4EX78TF
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BS 88 88 RR4EX78TF
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BS 283 569 RR4EE46TF
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BS 571 593 RR4EE46TF
BS 594 594 RR4EX78TF
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BS 675 675 RR4EX78TF
BS 676 708 RR4EE46TF
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BS 723 748 RR4EE46TF
BS 749 869 RR4AX74TF
BS 870 870 RR4A956TF
BS 871 882 RR4AH26TF
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BS 1084 1100 RR4C067TF
BS 1101 1164 RR4C067JQ

RD RR4FF03TF 717 0 0
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AAATTCCGACACAGAGAAAAGCTTTAGGGCTCTGGTTAGTAATGGCGGGATTGGCAATTT
CACCTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTGGAACAAGAAACGCTAAACCC*ACTTCGTAT
CTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTTCTGCTCTTCCGAGTCCTTAT
GGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGTAACAAGGATCCTCGTAGC
ATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAACCCGCCTGTAATGCCATCA
GTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATC
TTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACC
CTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGC
ACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGCATGTCTTGGATAAAGCCTAAAGTAGGAACA
GTGGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAGGG
ATGCGCTATGCAATCCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAAACTGGATGC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EE46TF 755 0 0
GGGTCCAAACATTAACCTTGGAGTCTTGCCCTCTGTGTCTATCCACGCCCGAACCTGAAA
AAATTCCGACACAGAGAAAAGCTTTAGGGCTCTGGTTAGTAATGGCGGGATTGGCAATTT
CACCTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTGGAACAAGAAACGCTAAACCC*ACTTCGTAT
CTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTTCTGCTCTTCCGAGTCCTTAT
GGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGTAACAAGGATCCTCGTAGC
ATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAACCCGCCTGTAATGCCATCA
GTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATC
TTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACC
CTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGC
ACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGCATGTCTTGGATAAAGCCTAAAGTAGGAACA
GTGGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAGGG
ATGCGCTATGCAATCCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAA*CTGGATGCGGA
G*ACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAG
TGAATGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4EX78TF 718 0 0
TGTGTCT
ATCCACGCCCGAACCTGAAAAAATTCCGACACAGAGAAAAGCTT*AGAGCTCTGGTTAGT
AATGGCGGGATTGGCAATTTCACCTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTGGAACAAGAAA
CGCTAAACCC*ACTTCGTATCTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTT
CTGCTCTTCCGAGTCCTTATGGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCG
GCAACAAGGATCCTCGTAGCATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAA
ACCCGCCTGTAATGCCATCAGTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGT
TATTCCGCAACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTG
TCATATCTCAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACT
TGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGA
TAAAGCCTAAAGTTGTAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTC
TTGCTGGAGGTGAGAAAGGGAT*CGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATC
AACCTCAA*CTGGATGCGGAG*ACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAG
TGA

QA 8 715 8 715
DS 

RD RR4FK32TF 768 0 0
GG
ACAGAGAAAAGCTT*AGAGCTCTGGTTAGTAATGGCGGGATTGGCAATTTCACCTCCTCT
CAGTCTCACCTTCTCTTCTGGAACAAGAAACGCTAAACCC*ACTTCGTATCTATCTCACA
ATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTTCTGCTCTTCCGAGTCCTTATGGTGATTCAT
TGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGCAACAAGGATCCTCGTAGCATTGATCCAA
GATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAACCCGCCTGTAATGCCATCAGTGATGACAC
CTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATCTTCATCGGAC
AACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACCCTCGCTTCTA
TTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCTACTCCG
TGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAAAGCCTAAAGTTGGAACAGTAGCGTTTG
GAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAGGGATGCGCTATG
CAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAAACTGGATGCGGAGGACATGTGG
*AGGATGTGAGGAGACAGGTGAATGAAGCCATTGAAGCACGACAAAAA**TTGACAGGAT
GTATGCAGCTTTCACTGGACAGC*TCTTGAGACAGTGCAGCAGTAC

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR4AX74TF 835 0 0
GG
ATCCACGCCCGAACCTGAAAAAATTCCGACACAGAGAAAAGCTT*AGAGCTCTGGTTAGT
AATGGCGGGATTGGCAAGTTCACCTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTGGAACAAGAAA
CGCTAAACCC*ACTTCGTATCTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTT
CTGCTCTTCCGAGTCCTTATGGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCG
GCAACAAGGATCCTCGTAGCATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAA
ACCCGCCTGTAATGCCATCAGTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGT
TATTCCGCAACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTG
TCATATCTCAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACGTCTTGATATACT
TGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGA
TAAAGCCTAAAGTTGGAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTC
TTGCTGGAGGTGAGAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATC
AACCTCAAACTGGATGCGGAGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAGGTGAATGAAGCC
ATTGAAGCACGACAAAAAA*TTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGA
GACAGTGCAGCAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAG
CGCT

QA 3 831 3 831
DS 

RD RR4AH26TF 848 0 0
GG
CACGCCCGAACCTGAGAAAATTCCGGCACAGAGAAAAGCTT*AGAGCTCTGGTTAGTAAT
GGCGGGATTGGCAATTTCACCTCCTCTCAGTCTCGCCTTCTCTTCACGAACAAGAAACGC
TAAACCC*ACTTCGTATCTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCGTATAGTTTCTG
CTCTTCCGAGTCCTTATGGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGCA
ACAAGGATCCTCGTAGCATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAACC
CGCCTGTAATGCCAGCAGTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTATCTTCTGTGTTAT
TCCGCAACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCA
TATCTCAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGA
ATTGTCCGGGAGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAA
AGCCTAAAGTAGGAACAGTGGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTG
CTGGAGGTGAGAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAAC
CTCAAACTGGATGCGGAGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAGGTGAATGAAGCCATT
GAAGCACGACAAAAA**TTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGAC
AGTGCAGCAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAG*CGCTTGAGTTCG
CCTTATC

QA 3 841 3 841
DS 

RD RR4A956TF 585 0 0
TCGTATCATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAACCCGCCTGTAAT
GCCATCAGTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGTTATTCCGCAACCG
CATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCT
TGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGG
AGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAAAGCCTAAAGC
TGGAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGA
GAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAAACTGG
ATGCGGAGGACATGTGGGAGGATGTGAGGAGACAGGTGAATGAAGCCATTGAAGCACGAC
AAAAAA*TTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGACAGTGCAGCAG
TACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCGCTTGAG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4EX78JQ 720 0 0
AATGCCATCAGTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTCTTCTGTGTTATTCCGCAA
CCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCA
GCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCC
GGGAGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAAAGCCTAA
AGTTGTAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGG
TGAGAAAGGGATTCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAAAC
TGGATGCGGAGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAGGTGAATGAAGCCATTGAAGCAC
GACAAAAAA*TTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGACAGTGCAG
CAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCGCTTGAGTTCGGCCTTATC
GATGGTCTACTGGAAACAGAATACTAAAGCAACGTGCAAGACAATGCATAGATGCAGCTT
CATTGCATGTTCAAACCCTTTCCATTTCAATTGAATATGAACATTACTTGTTTACTATAT
TCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAAATGCAATGGCCAATGCGTCTATGCTGTTTGGAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4A956JQ 669 0 0
TCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCT
CAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTG
ATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATG
TCTTGGATAAAGCCTAAAGCTGGAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCA
CTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATG
ATACATCAACCTCAAACTGGATGCGGAGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAGGTGAA
TGAAGCCATTGAAGCACGACAAAAAA*TTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGC
CTCTTGAGACAGTGCAGCAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTTTGAGGCGC
TTGAGTTCGGCCTTATCGATGGTCTACTGGAAACAGAATACTAAAGCAACGTGCAAGACA
ATGCATAGATGCAGCTTCATTGCATGTTCAAACCCTTTCCATTTCAATTGAATATGAACA
TTACTTGTTTACTATATTCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAAATGCAATGGCCAATGC
GTCTATGCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4FK32JQ 282 0 0
TGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGACAGTGCAGCAGTACACCGAAAGAGATC
GTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCGCTTGAGTTCGGCCTTATCGATGGTCTACTGGAAACAG
AATACTAAAGCAACGTGCAAGACAATGCATAGATGCAGCTTCATTGCATGTTCAAACCCT
TTCCATTTCAATTGAATATGAACATTACTTGTTTACTATATTCAGTTATGTAATCAAATC
ATATGCAAATGCAATGGCCAATGCG
TTATGCTGTTGGATAGC

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR4AX74JQ 937 0 0
ACAAGAAACGCTAAACCCCACTTCGTATCTATCTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGCG
TATAGTT*CTGCTCTTCCGAGTCCTTATGGTGATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAA
TGTCTCCGGCAACAAGGATCCTCGTAGCATTGATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAA
GAAAGGAAACCCGCCTGTAATGCCATCAGTGATGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTTTC
TTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGC
TCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACGTCTT
GATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCTACTCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTAT
GTCTTGGATAAAGCCTAAAGTTGGAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGC
ACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCAT
GATACATCAACCTCAAACTGGATGCGGAGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACAGGTGA
ATGAAGCCATTGAAGCACGACAAAAAAATTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAG
CCTCTTGAGACAGTGCAGCAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCG
CTTGAGTTCGGCCTTATCGATGGTCTACTGGAAACAGAATACTAAAGCAACGTGCAAGAC
AATGCATAGATGCAGCTTCATTGCATGTTCAAACCCTTTCCATTTCAATTGAATATGAAC
ATTACTTGTTTACTATATTCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAAATGCAATGGCCAATG
CGTCTATGCTGTTTGGATAGCAATTCTTTT
TAACATC

QA 1 930 1 930
DS 

RD RR4C023TF 679 0 0
G
AACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCT
CAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGT
CCGGGAGGCAGCACCT**TCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAAAGCCT
AAAGTTGGAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGA
GGTGAGAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAA
ACTGGATGCG*AGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACATGTGAATGAAGCCATTGAAGC
ACGACAAAAAAATTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGACAGTGC
AGCAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCGCTTGAGCTCGGCCTTA
TCGATGGTCTACTGGAAACAGAATACTAAAGCAACGTGCAAGACAATGCATAGATGCAGC
TTCATTGCATGTTCAAACCCTTTCCATTTCAATTGAATATGAACATTACTTGTTTACTAT
ATTCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAAATGCAATGGCCAATGCGCCTATGCTGTTTGG
ATAGCAATTCTTTT
AACA

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR4C067TF 706 0 0
G
AACCGCATAATCTTCATCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCT
CAGCTTGTTACCCTCGCTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGT
CCGGGAGGCAGCACCT**TCCGTGTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGATAAAGCCT
AAAGTTGGAACAGTAGCGTTTGGAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGA
GGTGAGAAAGGGATGCGCTATGCAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCTCAA
ACTGGATGCG*AGGACATGTGG*AGGATGTGAGGAGACATGTGAATGAAGCCATTGAAGC
ACGACAAAAAAATTGACAGGATGTATGCAGCTTTCACTGGACAGCCTCTTGAGACAGTGC
AGCAGTACACCGAAAGAGATCGTTTCTTATCGGCTTCTGAGGCGCTTGAGCTCGGCCTTA
TCGATGGTCTACTGGAAACAGAATACTAAAGCAACGTGCAAGACAATGCATAGATGCAGC
TTCATTGCATGTTCAAACCCTTTCCATTTCAATTGAATATGAACATTACTTGTTTACTAT
ATTCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAAATGCAATGGCCAATGCGCCTATGCTGTTTGG
ATAGCAATTCTTTT*AACATTATTACTGTTTT
GTCAGACAAATGT

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR4C067JQ 187 0 0
CAATTGAATATGAACATTACTTGTTTACTATATTCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAA
ATGCAATGGCCAATGCGCCTATGCTGTTTGGATAGCAATTCTTTTTAACATTATTACTGT
TTTTGTCAGAACAAAATGTGAACAAATTTGCAATAATGATGGTATGGCTGCACTGAATTA
GTAGCCC

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR4C023JQ 180 0 0
ATATGAACATTACTTGTTTACTATATTCAGTTATGTAATCAAATCATATGCAAATGCAAT
GGCCAATGCGCCTATGCTGTTTGGATAGCAATTCTTTTTAACATTATTACTGTTTTTGTC
AGAACAAAATGTGAACAAATTTGCAATAATGATGGTATGGCTGCACTGAATTAGTAGCCC

QA 1 180 1 180
DS 



AS 2 17

CO CL34Contig1 1017 15 17 U
GGATATATCAACTACTCTTCCGTCTACCATCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCC
CATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCGTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTC
TAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACTACAAAGGAGATTTCCAACGAG
GAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAA
AGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAA
AACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGC
TGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCA
ACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGA
TTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTC
GTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAA
ATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGA
TGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAAT
GATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGT
GTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCC
CTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATAAAC
ACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGTAATTGAATACGAT
AAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAGAGCTTTACACTTTAATAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 60 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ53TF U 34
AF RR4EK54TF U 20
AF RR4BA62TF U 1
AF RR4AD77JQ C 561
AF RR4AG71TF U 35
AF RR4BH03TF U 41
AF RR4AD77TF U 35
AF RR4BG51TF U 41
AF RR4BA62JQ C 259
AF RR4AM08JQ C 516
AF RR4GX83TF U 699
AF RR4AM08TF U 516
AF RR4DB14JQ C 298
AF RR4EJ53JQ C 401
AF RR4EK54JQ C 392
BS 1 241 RR4BA62TF
BS 242 242 RR4EK54TF
BS 243 363 RR4BA62TF
BS 364 364 RR4EK54TF
BS 365 399 RR4BA62TF
BS 400 400 RR4EK54TF
BS 401 574 RR4BA62TF
BS 575 575 RR4EK54TF
BS 576 739 RR4BA62TF
BS 740 904 RR4AD77TF
BS 905 917 RR4BG51TF
BS 918 918 RR4GX83TF
BS 919 919 RR4AM08TF
BS 920 939 RR4GX83TF
BS 940 940 RR4AM08TF
BS 941 996 RR4GX83TF
BS 997 1017 RR4BA62JQ

RD RR4EJ53TF 603 0 0
GG
AGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCG
CGTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTC
CACTACAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGA
CTCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGA
TGGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAA
AGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGG
TTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGC
TTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTA
AGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACA
GGCTTCAGTTC*AAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGG
G

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR4EK54TF 698 0 0
GG
GTCTACCATCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACAC
CGCCGCTATTTTCGCGTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAG
TTCAACGATTAGTCCACTACAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAA
AGCTGCTGCCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATG
GGCAATGTTCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCC
AACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAA
CGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGA
ACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCA
GATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTG
GGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGA
GTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAAT
ATTTCCCGACTCCA*CATTGTTGCGACACGGTGCAC

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR4BA62TF 739 0 0
GGATATATCAACTACTCTTCCGTCTACCATCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCC
CATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCGTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTC
TAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACTACAAAGGAGATTTCCAACGAG
GAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAA
ATAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAA
AACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGC
TGCCACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCCTTCAACGGAGGTTTTAACCA
ACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGA
TTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTC
GTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACGGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAA
ATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGA
TGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAAT
GATTGCCAACTTGACGGTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AD77JQ 201 0 0
GGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTG
AGTTTTTCAATGAGGGTTTAGGGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGGGAGAGAGCAA
TATTTCCCGACTCCAACATTGTTGGGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGGGG
AA*GGAGGGGATAGATGCAAT

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR4AG71TF 845 0 0
GG
GAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGCCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGC
GTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGGTTAGTCC
ACTACAAAGGATATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGAC
TCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCACGGGCAATGTTCGAGAT
GGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAA
GTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGT
TGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCT
TAAAAAAGATCGAGGCAAAGTCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAA
GCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAG
GCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGG
TCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAA
CATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGGTGAA*GGAGGGGATAGAT
GCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGG
CTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGA
TAGACTGATATATA

QA 3 831 3 831
DS 

RD RR4BH03TF 811 0 0
TTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCGTCT
CCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACTA
CAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTT
GCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGG
AGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTG
AAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCT
TTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAA
AAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCAC
GCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTT
CAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTA
GCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATT
GTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAAAGGAGGGGATAGATGCAA
TCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAA
TGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4AD77TF 870 0 0
GG
GAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGCCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGC
GTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGGTTAGTCC
ACTACAAAGGATATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGAC
TCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCACGGGCAATGTTCGAGAT
GGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAA
GTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGT
TGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCT
TAAAAAAGATCGAGGCAAAGTCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAA
GCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAG
GCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGG
TCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAA
CATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGGTGAA*GGAGGGGATAGAT
GCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGG
CTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGAT
ATATATTCATGTAAATATATAAACACAG

QA 3 870 3 870
DS 

RD RR4BG51TF 877 0 0
TTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCGTCT
CCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACTA
CAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTT
GCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGG
AGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTG
AAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCT
TTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAA
AAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCAC
GCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTT
CAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTA
GCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATT
GTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGATGCAA
TCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAA
TGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGATATAT
ATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATC

QA 1 877 1 877
DS 

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ATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCC
TCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCCACTGAACTCACTCC
TAACGAGGACTATGGGGTTGCCTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGG
GGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTAT
GCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGA
CTGGGACGGTCCATACGGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTAT
TGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGC
AATATTTCCCGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGT
CGAA*GGAGGGGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAG
AACATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATT
CTGATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCA
GTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTT
TTTGTATAGTTATATAAGAGCTTTACACTTTAATAAAAG

QA 1 759 1 759
DS 

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G
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GCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGG
TCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAA
CATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGAT
GCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGG
CTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGAT
ATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGT
ATACATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAG

QA 2 481 2 481
DS 

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G
TGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGATGCA
ATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTA
ATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGATATA
TATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCATTGTGAGTTTGAATATGTATA
TATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAG

QA 2 298 2 298
DS 

RD RR4AM08TF 481 0 0
G
GCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAG
GCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGG
TCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAA
CATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGAT
GCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGG
CTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGAT
ATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGT
ATACATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAG

QA 2 481 2 481
DS 

RD RR4DB14JQ 710 0 0
GAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCC
AGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAA
CCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGC
CGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATT
CTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAA
GAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCA
AGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCAC
AATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTG
GGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTT
GCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCTGATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATA
AACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGTAATTGAATAC
GATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAGAGCTTTACACT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4EJ53JQ 589 0 0
TTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAA
AAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCAC
GCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTT
CAGTTC*AAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTA
GCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATT
GTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGATAGATGCAA
TCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAA
TGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTTTGATGAATAGAACTGATATAT
ATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGTATAC
ATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAG
CT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EK54JQ 605 0 0
GGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCA
ATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATT
CCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTTTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCA
TACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCAAT
GAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCCGAC
TCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAA*GGAGGGGA
TAGATGCAATTTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCC
GTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTTTGATGAATAGAA
CTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAA
TATGTATACATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTAT
ATAAG

QA 1 605 1 605
DS 



CO CL34Contig2 1119 2 6 U
GGGAAACCATATATCAACTACTCTTCCGTCTACCATCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCG
GTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCGTCTCCTTCCCAGCCTTT
ATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACTACAAAGGAGATTTCC
AACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGA
GATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTA
CTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAA
CCCAGCTGCTACTGAGCTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTT
TAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAA
AGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGGTCCGTTTTCTGT
ACAATCAAATCAATATCATTATTTATAATTTATGTGACAAAATAGTTATAAGTAGTGCAG
TTTGATATTTATATATTCCTATGAATGATCAGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAA
TGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAA
CAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTG
CGAGAGAGCAATATTTCCCGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAA
CTTGACGGTCGAAGGAGGGGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATAC
AAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTT
TTCCGATTCTGATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGT
TTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACT
TGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAGAGCTCTACACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH02TF U 1
AF RR4FH02JQ C 431
BS 1 687 RR4FH02TF
BS 688 688 RR4FH02JQ
BS 689 719 RR4FH02TF
BS 720 720 RR4FH02JQ
BS 721 784 RR4FH02TF
BS 785 1119 RR4FH02JQ

RD RR4FH02TF 784 0 0
GGGAAACCATATATCAACTACTCTTCCGTCTACCATCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCG
GTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCGTCTCCTTCCCAGCCTTT
ATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACTACAAAGGAGATTTCC
AACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGA
GATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTA
CTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAA
CCCAGCTGCTACTGAGCTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTT
TAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAA
AGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGGTCCGTTTTCTGT
ACAATCAAATCAATATCATTATTTATAATTTATGTGACAAAATAGTTATAAGTAGTGCAG
TTTGATATTTATATATTCCTATGAATGATCAGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAA
TGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAG*CTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAA*
CAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTG
CGAG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4FH02JQ 689 0 0
ATCATGTGTGGTGGGGAACCACGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCT
CCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGGTCCGTTTTCTGTACAATCAAAT
CAATATCATTATTTATAATTTATGTGACAAAATAGTTATAAGTAGTGCAGTTTGATATTT
ATATATTCCTATGAATGATCAGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGAC
TGGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAAATGGCAAAACAAACCTATT
GAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCA
ATATTTCCCGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTC
GAAGGAGGGGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAA
CATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTCGAGTTTTCCGATTCT
GATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGT
GTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGTAATTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTT
TGTATAGTTATATAAGAGCTCTACACTTT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 19

CO CL35Contig1 1001 19 20 U
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAACTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGG
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTC
CAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATAT
GGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCT
CCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTT
TGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTC
TAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAACTATT
AAGTTTTATCTGCTAATTACATATTTATTTACATTTTTTTTAATTCTATATGCCTGTGGA
TTTTCATCTATATGCCTATACAATCCGAAAACTAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 0 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 75 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 5 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A109TF U 54
AF RR4CI24TF U 1
AF RR4DK10TF U 1
AF RR4DW40TF U 1
AF RR4BI47TF U 5
AF RR4A224TFB U 6
AF RR4BI76TF U 5
AF RR4AQ09TF U 6
AF RR4A109TFB U 6
AF RR4A224TF U 6
AF RR4A109JQ C 110
AF RR4A224JQ C 195
AF RR4DW40JQ C 260
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AF RR4DK10JQ C 165
AF RR4CI24JQ C 282
BS 1 39 RR4CI24TF
BS 40 40 RR4DK10TF
BS 41 57 RR4CI24TF
BS 58 58 RR4DK10TF
BS 59 81 RR4CI24TF
BS 82 82 RR4DK10TF
BS 83 117 RR4CI24TF
BS 118 118 RR4DK10TF
BS 119 307 RR4CI24TF
BS 308 308 RR4DK10TF
BS 309 447 RR4CI24TF
BS 448 448 RR4DK10TF
BS 449 552 RR4CI24TF
BS 553 553 RR4DK10TF
BS 554 568 RR4CI24TF
BS 569 588 RR4DK10TF
BS 589 803 RR4A109TFB
BS 804 804 RR4A224JQ
BS 805 897 RR4A109JQ
BS 898 1001 RR4CI24JQ

RD RR4A109TF 434 0 0
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CTCTACCAAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAG
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ATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGA
TACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAG
GTATACCAAACATCCCTATCCCACAGAACCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGA
TTCCAGGGATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACC
TTCCTGGTCTTGGA

QA 1 434 1 434
DS 

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TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCAAAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGG
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATTCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACCGGGGATAAGTCGAAG
TGTC

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CTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCC
CACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGTATACCAAACA
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CAAACATTCCCATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTG
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QA 6 588 6 588
DS 

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TTTTT
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CAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATG
GAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTC
CTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCC
CACATATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGTATACCAAACA
TCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATAC
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GAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGT
GTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTC

QA 6 588 6 588
DS 

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GG
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CATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTACCAAATCC
AACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATGG
AAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTCC
TCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCC
ACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGTATACCAAACAT
CCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGG
AGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTG
TTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTG
GGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAA
GAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTT

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CCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTGCCAAATC
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GAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTC
CTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCC
CACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACA
TCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATAC
CAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTG
GAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGT
GTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTT
GGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACA
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DS 

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GG
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CATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTGCCAAATCC
AACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATGG
AAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTCC
TCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCC
ACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACAT
CCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGG
AGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTG
TTTGACTGGGGATAAGTCAAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTG
GGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAA
GAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTT

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR4AQ09TF 719 0 0
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CTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCC
CACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACA
TCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATAC
CAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTG
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GTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTT
GGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACA
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QA 1 719 1 719
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CTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCC
CACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGTATACCAAACA
TCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATAC
CAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTG
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GTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTT
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AGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGAT
TTTCTTTCATTTTCATTT
GGTT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4A224TF 789 0 0
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CCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTGCCAAATC
CAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATG
GAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTC
CTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCC
CACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACA
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GGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACA
AGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTC
AGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGAT
TTTCTTTCA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4A109JQ 788 0 0
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CTAGCCAACCACAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTC
TCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCA
GGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATT
CCAGGTATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCA
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AACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCC
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CAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATC
GTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTC
TTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGT
CTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTGGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTT
TTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGT
TTTTAACT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4A224JQ 703 0 0
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CTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATTC
CAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATCCCTATCC
CACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATTC
CTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCAT
TTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTG
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ACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCT
ATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTT
GTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCA
TTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACT
TGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAACC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4DW40JQ 638 0 0
GGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCCACATATTCCAGCG
ATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGTATACCAAACATCCCTATCCCACAG
ATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATTCCTATC
CCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGC
CCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGGAT
AAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGAC
TTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATACGGACAAGAAGTGCTATGGC
CATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCAC
ATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTC
ATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATT
AGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAACC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4BI76JQ 682 0 0
CTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTA
TCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTC
AAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGA
ACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTA
TACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTC
TCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGGATAAGTCAAAGGTGTCAG
AGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGG
AGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGT
TCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGA
AGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTA
GGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATT
AATAAAATAGTAGTTTTTAACC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4A109JQD 764 0 0
GGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATGGAAAGTTT
GGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCA
CCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATT
CCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGTATACCAAACATCCCTATC
CCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATT
CCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCA
TTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGATGAGTTAAAGAAGTGTTTGACT
GGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAG
AACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGC
TATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCT
TGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTC
ATTTTCATTTGGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAAC
TTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAACT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4A224JQD 788 0 0
ATCTCTCTGCCAAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGAC
CTAGCCAACCACAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTC
TCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCA
GGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATT
CCAGGGATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCA
CAGATTCCAGGGATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCT
AACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCC
GGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCG
CAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATC
GTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTC
TTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGT
CTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTT
TTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGT
TTTTAACC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AQ09JQ 760 0 0
CACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATGGAAAGTTTGGTG
ACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTC
CTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAG
CGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATCCCTATCCCAC
AGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATTCCTA
TCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTA
GCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGG
ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACG
ACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATG
GCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTC
ACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTT
TCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGA
TTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAACT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4DK10JQ 733 0 0
CTGACCTAGCCAACCACAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCG
AGGTCTCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACA
TTCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCAC
AGATTCCAGGTATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTA
TCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATTCCCATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACA
TCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGC
AGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTT
TCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTG
AGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCC
ATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAG
CTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTT
TTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATA
GTAGTTTTTAACT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4CI24JQ 720 0 0
ACATTCCAGGGATACCAAACATCCCAAAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCC
CACAGATTCCAGGGATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCC
CTATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATTCCTATCCCACAGATTCCAAGTATACCGA
ACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGT
CGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACCGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAAT
GTTTCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACGAGGAGTGTT
GTGAGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGA
GCCATTTCTTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAACATGCCAAGAAGAACT
AAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTT
GTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAA
ATAGTAGTTTTTAACTATTAAGTTTTATCTGCTAATTACATATTTATTTACATTTTTTTT
AATTCTATATGCCTGTGGATTTTCATCTATATGCCTATACAATCCGAAAACTAGTTTTCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 2 17

CO CL36Contig1 1050 14 20 U
GGAAGCCTTCCATGACTGTGCCATCAAGAAAGTAGCTTTGTTTTCCATCCCAAACTGTCA
AAGGTCTCTCTTCTCCTACACATTAATCAAAGACACTTTCTCTCTCTCATCAATGTTCCT
TTGAGACCAGTGCTCCTCCTTTTCTTCTTCATATAAACCACATATCCTCTCCACCATATC
TTAACAATTTCATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGA
TAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGA
ATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCA
TAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTG
CTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGA
ACCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCA
GGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGC
ATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAA
AAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAAC
AACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGAC
AATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGG
TCATCGATTGATCATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGT
CTTTATGGAATGTGTGTGTCTCCTTT*CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTTAGGC
CTTTTACCTAAGCTTATATGTGTGTTGTTTGCTTATGAAAACTCTATGTATGTGTTGTAT
GCTTAATTAAGCGTTTGAAACGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 75 75 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 
75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 75 60 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C102TF U 150
AF RR4AB11TF U 1
AF RR4CW33TF U 83
AF RR4EC24TF U 107
AF RR4AT95TF U 121
AF RR4A442TF U 106
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AF RR4CW33JQ C 206
AF RR4FF34JQ C 354
AF RR4AB11JQ C 208
AF RR4G228TF U 353
AF RR4AT95JQ C 368
AF RR4G228JQ C 370
BS 1 246 RR4AB11TF
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BS 248 354 RR4AB11TF
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BS 960 1000 RR4AI83TF
BS 1001 1001 RR4CW33JQ
BS 1002 1041 RR4AI83TF
BS 1042 1050 RR4G228TF

RD RR4C102TF 282 0 0
G
ATATAAACCACATATCCTCTCCACCATATCTTAACAATTTCATAGCAAACCCTAAAACTG
AGTAAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACA
ACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCA
CTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAGTGGTAAGATGACTG
ATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGAC

QA 2 282 2 282
DS 

RD RR4AB11TF 658 0 0
GGAAGCCTTCCATGACTGTGCCATCAAGAAAGTAGCTTTGTTTTCCATCCCAAACTGTCA
AAGGTCTCTCTTCTCCTACACATTAATCAAAGACACTTTCTCTCTCTCATCAATGTTCCT
TTGAGACCAGTGCTCCTCCTTTTCTTCTTCATATAAACCACATATCCTCTCCACCATATC
TTAACAATTTCATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGA
TAGAGACAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGA
ATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGTTCTCA
TAGTCTTTGCAAGTAATGGTAGGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTG
CTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGA
ACCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCA
GGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAA*CCTGATGGCCGTAGAGC
ATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGAC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4CW33TF 581 0 0
GG
AATCAAAGACACTTTCTCTCTCTCATCAATGTTCCTTTGAGACCAGTGCTCCTCCTTTTC
TTCTTCATATAAACCACATATCCTCTCCACCATATCTTAACAATTTCATAGCAAACCCTA
AAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACG
CAAACAACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAG
AGATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGA
TGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGT
TATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAGCAATGAGATTGATAGGA
TCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATAC
AGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACA
AAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAA

QA 3 581 3 581
DS 

RD RR4EC24TF 645 0 0
GG
ATCAATGTTCCTTTGAGACCAGTGCTCCTCCTTTTCTCTTTCATATAAACCACATATCCT
CTCCACCATATCTTAACAATTTCATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGG
GTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCT
CAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTTTTTTGCGATGCAA
AAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCA
TGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATG
CTAAGCATGAGAACCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTAC
AACTTGAGCTCAGCCACTTGAAGGGGGAAGATATATAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGA
TGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGT
ACCTCA**AAAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGACGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTT
TCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAG

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR4AT95TF 670 0 0
GG
GAGACCAGTGCTCCTCCTTTTCTTCTTTATATAAACCACATATCCTCTCCACCATATCTT
AACAATTTCATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATA
GAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGAAT
GGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATA
GTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCT
ATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAAC
CTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGG
CACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCAT
GCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAA
AGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAA
CAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAA
TTTGGATA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4A442TF 829 0 0
GCG
ATCAATGTTCCTTTGAGACCAGTGCTCCTCCTTTTCTTCTTCATATAAACCACATATCCT
CTCCACCATATCTTAACAATTTCATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGG
GTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCT
CAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTTCTTTGCGATGCAA
AAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCA
TGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATG
CTAAGCATGAGAACCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGC
AACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGA
TGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGT
ACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTT
TCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGG
ATCATGATGGTCAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGA
TTATGTCTTTGGTCATCGATTGATCATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATC
TATTCCCTTTGTCTTTATGGAATGTGTGTGTCTCCTTT*CAATCTC

QA 4 829 4 829
DS 

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GG
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GAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGAAT
GGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATA
GTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCT
ATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAAC
CTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGG
CACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCAT
GCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAA
AGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAA
CAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAG**GAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAA
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ATCGATTGATCATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGTCT
TTATGGAATGTGTGTGTCTCCTTT*TCATCTCGAGCCGC

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DS 

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GG
AGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAG
GATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACATTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAA
GAAGGCTAAAGATATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAG
TAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCA
ATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAGCAATGA
GATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGG
GGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACA
CGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGA
GAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGC
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AGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATTGATC
ATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGTCTTTATGGAATGT
GTGTGTCTCCTTT*CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTTAG*CCTTTTACCTAAGC
TTATATGTGTGTTGTTTGCTTATGAAA*CTCTATGTATGTGTTGTATGCTTAATTAAGCG
TTTGAAAC

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DS 

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AAACAACAGAGTGGTGACAT*CTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGA
GATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGAT
GACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTT
ATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAGCAATGAGATTGATAGGAT
CAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACA
GTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAA
AGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGC
GGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAA
CGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGAT
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AATCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGTCTTTATGGAATGTGTGTGTCTCCTT
T*CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTTAGGCCTTTTACCTAAGCTTATATGTGTGT
TGTTTGCTTATGAAAACTCTATGTATGTGTTGTATTCTTAATTAAGC

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DS 

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GTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTC
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CTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAG**GAATGATGATGAGGGATCAT
GATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATTTTCAGGAAAAGATTATG
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CCTTTGTCTTTATGGAATGTGTGTGTTTCCTTTTCAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCC
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GTTGTATGCTTAATTAAGC

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DS 

RD RR4AB11JQ 835 0 0
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TCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGTTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAGGATGA
CTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTAT
CTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCA
AGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGT
CTCTCAACTTAAAAA*CCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAG
TCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGG
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AGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATTGATCATCGAGATTTGTAA
TCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGTCTTTATGGAATGTGTGTGTCTCCTTT*
CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTTAGGCCTTTTACCTAAGCTTATATGTGTGTTG
TTTGCTTATGAAAACTCTATGTATGTGTTGTATGCTTAATTAAGCGTTTGAAAC
C

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4G228TF 698 0 0
G
GCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGAT
CTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAG
CATGAGAACCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTC
GAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCC
TTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTC
ATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAG
CTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCAT
GATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATG
TCTTTGGTCATCGATTGATCATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATCTATTC
CCTTTGTCTTTATGGAATGTGTGTGTCTCCTTT*CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCC
TTTAGGCCTTTTACCTAAGCTTATATGTGTGTTGTTTGCTTATGAAA*CTCTATGTATGT
GTTGTATGCTTAATTAAGCGTTTGAAACGAAAAAAAA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4AT95JQ 675 0 0
TGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCT
GGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAG
CAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTT
GAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCAT
TGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAG
AAATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGA
GATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGG
ATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGA
TTGATCATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGTCTTTATG
GAATGTGTGTGTCTCCTTT*CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTTAGGCCTTTTAC
CTAAGCTTATATGTGTGTTGTTTGCTTATGAAAACTCTATGTATGTGTTGTATGCTTAAT
TAAGCGTTTGAAAC
T

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4G228JQ 673 0 0
CAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGG
ACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAGCA
ATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTCGAGCTCAGGCACTTGA
AGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCTTAGAGCATGCCATTG
AACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAA
ATGAGAAAATGTTGGCGGAAGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGA
TGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGGAT
ATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATT
GATCATCGAGATTTGTAATCTCATCACCAATCTACTATCTATTCCCTTTGTCTTTATGGA
ATGTGTGTGTCTCCTTT*CAATCTCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTTAGGCCTTTTACCT
AAGCTTATATGTGTGTTGTTTGCTTATGAAAACTCTATGTATGTGTTGTATGCTTAATTA
AGCGTTTGAAAC
G

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL36Contig2 906 3 2 U
GGAAAAGAGAGCTAGAGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGATAGAGATAAAAAGGATAGA
AAACGCAAACAACAGAGTGGTGACTTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGC
TAAAGAGATCACTGTTCTCTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAATCTTTGCAAGTAATGG
TAAGATGACTGACTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCA
GAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATACTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAAATTGA
TAGGATCAAAAAAGAGAATGACAGCTTACAACTGGAACTCAGGCATTTGAAGGGGGAAGA
TATACAATCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACATGGCCT
CGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTCATGACAAAGAGGAGAAATGAGAAAAT
ATTGGTGGAGGAGAATCGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAAGAGATGGCTATAGC
TAGCAACACAAGAGGAATGATGCTGAGAGATCAAGATGAGCAATTTGGATATAGAGTTCA
GCCGATTCAACCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGACTGATCATCAAG
ATTTGCAAGCTCATAACCCATCTACTACTATTTCATGGTCCCTTAATTTGTCTTTATGAA
TGTGTGTGTCCTATTAATCTCGAGCCACATATAGACTCTCTATCGGACCATTTTAGACTC
TCTATCGGACTTTTACTTATGCTTTTATGTGTGTGGTTTGTTTATGTAGGTGTTAGTCGG
GTTAGTGGATGCATAACTTCAAAAAAATATAAATAAAATGACAAAATTAAGTTTAAACAA
AAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE02TF U 1
AF RR4DE02JQ C 55
AF RR4FN92TF U 364
BS 1 763 RR4DE02TF
BS 764 906 RR4FN92TF

RD RR4DE02TF 763 0 0
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TAAAGAGATCACTGTTCTCTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAATCTTTGCAAGTAATGG
TAAGATGACTGACTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCA
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TAGGATCAAAAAAGAGAATGACAGCTTACAACTGGAACTCAGGCATTTGAAGGGGGAAGA
TATACAATCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACATGGCCT
CGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTCATGACAAAGAGGAGAAATGAGAAAAT
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TAGCAACACAAGAGGAATGATGCTGAGAGATCAAGATGAGCAATTTGGATATAGAGTTCA
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ATTTGCAAGCTCATAACCCATCTACTACTATTTCATGGTCCCTTAATTTGTCTTTATGAA
TGTGTGTGTCCTATTAATCTCGAGCCACATATAGACTCTCTAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4DE02JQ 748 0 0
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GAAGGCTAAAGAGATCACTGTTCTCTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAATCTTTGCAAG
TAATGGTAAGATGACTGACTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCA
ATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATACTAAGCATGAGAACCTCAACAATGA
AATTGATAGGATCAAAAAAGAGAATGACAGCTTACAACTGGAACTCAGGCATTTGAAGGG
GGAAGATATACAATCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACA
TGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTCATGACAAAGAGGAGAAATGA
GAAAATATTGGTGGAGGAGAATCGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAAGAGATGGC
TATAGCTAGCAACACAAGAGGAATGATGCTGAGAGATCAAGATGAGCAATTTGGATATAG
AGTTCAGCCGATTCAACCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGACTGATC
ATCAAGATTTGCAAGCTCATAACCCATCTACTACTATTTCATGGTCCCTTAATTTGTCTT
TATGAATGTGTGTGTCCTATTAATCTCGAGCCACATATAGACTCTCTATCGGACCATTTT
AGACTCTCTATCGGACTTTTACTTATGC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4FN92TF 543 0 0
GCAA
TCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACATGGCCTCGACAAA
GTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTCATGACAAAGAGGAGAAATGAGAAAATATTGGTG
GAGGAGAATCGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAAGAGATGGCTATAGCTAGCAAC
ACAAGAGGAATGATGCTGAGAGATCAAGATGAGCAATTTGGATATAGAGTTCAGCCGATT
CAACCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGACTGATCATCAAGATTTGCA
AGCTCATAACCCATCTACTACTATTTCATGGTCCCTTAATTTGTCTTTATGAATGTGTGT
GTCCTATTAATCTCGAGCCACATATAGACTCTCTATCGGACCATTTTAGACTCTCTATCG
GACTTTTACTTATGCTTTTATGTGTGTGGTTTGTTTATGTAGGTGTTAGTCGGGTTAGTG
GATGCATAACTTCAAAAAAATATAAATAAAATGACAAAATTAAGTTTAAACAAAAAAAA

QA 5 543 5 543
DS 



AS 1 19

CO CL37Contig1 829 19 11 U
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AACTTAAACCGACACAAAGACCAAACTTGTCTCGTTAAGATAGATAAGAAAAAAACGAAA
CATGGTAATCTTCAGTAAGGACATAGTAATGGCTCGGTTAAAGGAACTATATATATAGCA
GCAGAGACTTCCTCAGTATCATTACAACAGCAACAACTATGTTTAGTACTCATAAGCAGC
AGTTCTCTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTC
AGCTTCTTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGC
CATGCGTTTGATATCATCAGCAGATATCTTCCCATTATTGTCAAGATCAATGATCTTGAA
AGCCTTGGTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTA
AAACTCATCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCATTTTCTC
GATTTGCTCTTCCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGC
ATCGATGGTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCT
CTTCTGCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTA
CAGACTCGACATATCTTCTTTTGCCGCAGGCGATGCGAATCGGAGAAGCTCTTTCCGCGT
CAGAGAGTTCTCGAAAAGTAATCTAAACGTTTCTCTCTACTTTCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 70 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 60 60 60 75 55 70 70 30 30 60 60 60 55 55 55 55 45 45 45 45 45 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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C

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TCTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACG
C

QA 1 292 1 292
DS 

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CATGGTAATCTTCAGTAAGGACATAGTAATGGCTCGGTTAAAGGAACTATATATATAGCA
GCAGAGACTTCCTCAGTATCATTACAACAGCAACAACTATGTTTAGTACTCATAAGCAGC
AGTTCTCTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTC
AGCTTCTTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGC
CATGCGTTTGATATCATCAGCAGATATCTTCCCATTATTGTCAAGATCAATGATCTTGAA
AGCCTTGGTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTA
AAACTCATCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCATTTTCTC
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CTTCTGCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTA
CAGACTCGA

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TCTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTCAGCTT
CTTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGC
GTTTGATATCATCAGCAGATATCTTACCATTATTGTCAAGATCAATGATCTTGAAAGCCT
TGGTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACT
CATCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCATTTTCTCGATTT
GCTCTTCCGTCATATCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGA
TGGTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCT
GCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGAC
TCGA

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C
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AAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGCGTTTGATATCATCAGCAGATATCTTCCCATTA
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ATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTCATCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTG
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ATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGATGGTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCA
AAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCTGCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTC
TCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGACTCGACATATCTTCTTTTGCCGCAGGCGATGCG
AATC

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GACTTCCTCAGTATCATTACAACAGCAACAACTATGTTTAGTACTCATAAGCAGCAGTTC
TCTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTCAGCTT
CTTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGC
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TGGTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACT
CATCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCGTTTTCTCGATTT
GCTCTTCCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGA
TGGTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCT
GCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGAC
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AGTTCTCGAAA
GTATCTCC

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CG
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C

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AGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTCATCG
TAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCGTTTTCTCGATTTGCTCT
TCCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGATGGTG
CCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCTGCTGA
TTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGACTCGAC
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TCGAAAAGTAATCT
CC

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CCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGCGTTTGA
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GCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTCATCGT
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CCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGATGGTGC
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TCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGACTCGACA
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CGAAAAGT
CC

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CATTACAACAGCAACAACTATGTTTAGTACTCATAAGCAGCAGTTCTCTTCATCATCCTC
ATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTCAGCTTCTTCAACCATCTCA
CGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGCGTTTGATATCATCA
GCAGATATCTTCCCATTATTGTCAAGATCAATGATCTTGAAAGCCTTGGTGAGCTCTTCT
TTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTCATCGCAATCTATG
GCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCATTTTCTCGATTTGCTCTTCCGTCATC
TCGAAAACAAGCGCCCTCATGGCAGCGTTAAGCTCTTTGGCATCGATGGTGCCAGAGCCA
TCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCTGCTGATTCAACCCA
TGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGACTCGACATATCTTCT
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CC

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A*TCT*CAGTAAGGACATAGTAATGGCTCGGTTAAAGGAACTATATATATAGCAGCAGAG
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CTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTCAGCTTC
TTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGCG
TTTGATATCATCAGCAGATATCTTCCCATTATTGTCAAGATCAATGATCTTGAAAGCCTT
GGTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTC
ATCGCAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCATTTTCTCGATTTG
CTCTTCCGTCATCTCGAAAACAAGCGCCCTCATGGCAGCGTTAAGCTCTTTGGCATCGAT
GGTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCTG
CTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGACT
CGACATATCTTCTTTTGCCGCAGGCGATGCGAATCGGAGAAGCTCTTTCCGCGTCAGAGA
GTTCTCGAAAAGTAATCTAAAC
CC

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DS 

RD RR4B852TF 809 0 0
CG
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ACCGACACAAAGACCAAACTTGTCTCGTTAAGATAGATAAGAAAAAAACGAAACATGGTA
ATCTTCAGTAAGGACATAGTAATGGCTCGGTTAAAGGAACTATATATATAGCAGCAGAGA
CTTCCTCAGTATCATTACAACAGCAACAACTATGTTTAGTACTCATAAGCAGCAGTTCTC
TTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTAACTTCACCATCACGGTCACGGTCAGCTTCT
TCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGCGT
TTGATATCATCAGCAGATATCTTCCCATTATTGTCAAGATCAATGATCTTGAAAGCCTTG
GTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCGATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTCA
TCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTGTCCACATCTGCTATCATTTTCTCGATTTGC
TCTTCCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGATG
GTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCAAAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCTGC
TGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCCCGATACACCTCTGTACAGACTC
GACATATCTTCTTTTGCCGCAGGCGATGCGAATCGGAGAAGCTCTTTCCGCGTCAGAGAG
TTCTCGAAAAGTAGTCTAAACGTTTC
C

QA 3 808 3 808
DS 

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AAAAAACGAAACATGGTAATCTTCAGTAAGGACATAGTAATGGCTCGGTTAAAGGAACTA
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CGGTCACGGTCAGCTTCTTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTGAAGTTTTCACCC
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ATCATTTTCTCGATTTGCTCTTCCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTCATGGCAACGTTA
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ATCTCTTGCCTCTTCTGCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTCTCTTTCCTCGAT
ACACCTCTGTACAGACTCGACATATCTTCTTTTGCCGCAGGCGATGCGAATCGGAGAAGC
TCTTTCCGCGTCAGAGAGTTCTCGAAAAGT
CC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4B035JQ 755 0 0
C
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AGATAGATAAGAAAAAAACGAAACATGGTAATCTTCAGTAAGGACATAGTAATGGCTCGG
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TATGTTTAGTACTCATAAGCAGCAGTTCTCTTCATCATCCTCATGAACTCTTCCATATTA
ACTTCACCATCACGGTCACGGTCAGCTTCTTCAACCATCTCACGAATCTCAGCATCAGTG
AAGTTTTCACCCAAGTCCTTTGCCATGCGTTTGATATCATCAGCAGATATCTTCCCATTA
TTGTCAAGATCAATGATCTTGAAAGCCTTGGTGAGCTCTTCTTTGGTGTCACGTTCACCG
ATCTTAGCAGTCATCATATAGTAAAACTCATCGTAATCTATGGCTCCACTTCCATCTTTG
TCCACATCTGCTATCATTTTCTCGATTTGCTCTTCCGTCATCTCGAAACCAAGCGCCCTC
ATGGCAACGTTAAGCTCTTTGGCATCGATGGTGCCAGAGCCATCAGTGTCGAAGAGATCA
AAAGCTTCCTTGATCTCTTGCCTCTTCTGCTGATTCAACCCATGATGACGTCTGGGTTTC
TCTTTCCTCGATACACCTCTGTACAGACTCGACATATCTTCTTTTGCCGCAGGCGATGCG
AATCGGAGAAGCTCTTTCCGCGTCAGAGAGTTCT

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DS 

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AG
CATTAAAGAAACTTTTGCAAATAGATTCTTTTATACTACAACTTAAACCGACACAAAGAC
CAAACTTGTCTCGTTAAGATAGATAAGAAAAAAACGAAACATGGTAATCTTCAGTAAGGA
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TTACAACAGCAACAACTATGTTTAGTACTCATAAGCAGCAGTTCTCTTCATCATCCTCAT
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QA 2 741 2 741
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DS 

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CC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 2 17

CO CL38Contig1 2012 13 20 U
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BQ
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 20 45 20 
20 45 45 45 45 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DF64TF U 1
AF RR4DF64JQ C 465
AF RR4DY43JQ U 1051
AF RR4EN83JQ U 952
AF RR4DT15JQ U 1051
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AF RR4DX08JQ U 1037
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AF RR4EU18JQ U 1099
AF RR4DY43TF C 1243
AF RR4DT15TF C 1306
AF RR4EN83TF C 1307
BS 1 580 RR4DF64TF
BS 581 951 RR4DF64JQ
BS 952 1367 RR4EN83JQ
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BS 1369 1550 RR4EN83JQ
BS 1551 1552 RR4DX08JQ
BS 1553 1663 RR4EN83JQ
BS 1664 1733 RR4DX08JQ
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BS 1738 1738 RR4B788JQ
BS 1739 1739 RR4DX08JQ
BS 1740 1741 RR4B788JQ
BS 1742 1745 RR4DX08JQ
BS 1746 1747 RR4B788JQ
BS 1748 1791 RR4DX08JQ
BS 1792 1792 RR4B788JQ
BS 1793 1841 RR4DX08JQ
BS 1842 1907 RR4B788JQ
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RD RR4DF64TF 580 0 0
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TCGATCTCTCATCTTTGTGCCGGCTCAGTTTCAGAGGAAGAGCTGATATGGATTGGGACA
ACGTAGCAGCTGAGGATGTGATCGAGGCGCTGAGAGAAGTCGAATGGTCGACGCCTCCTC
GTTCCTTTGGAGAGTTCTTCTCTAGATTCGCTTTCCCTCGCTCTTTCTCTGAGTGGAAGA
GCCGTCTCAAATGCAATCTCTACTATTATCGGACGAATTACTTTATCCTGGTGATTTTCG
TTCTGGGTCTTGCTTTGATTACAAGACCATTGGCTATTGTGGGTGCTGCGTTTACGGCCT
TAAGCATAGCTTTCCTTAACGACAGTTTTGCGGCTACTTTTAATGAGAAGTGTATAAGGA
CTATTAGGCTTTTCTCTCCACACTTGGCCGCAAAAATGAGGCCTCCCCACATGCCAGTCA
TCCGTGGGAGATCAGCGGCAAGAAAGACAGTATACGTCTGTGGCAAACCACGATGGGTCT
TTGTCGTCATTTTCCTGACAGCCAGTCTTGTCATGTGGTT

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DS 

RD RR4DF64JQ 617 0 0
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AAACCACGATGGGTCTTTGTCGTCATTTTCCTGACAGCCAGTCTTGTCATGTGGTTTTCT
TCCTGCGGCTTGTTGTGGGTCCTCTATGCACTTCTCACTTCCCTCATCGTGGTTATAGTT
CATGCAAGCGTGAGAACACCAAATCTCAAGGCACGATTAAACACATTCCGTGAAGAGTTT
CGGGCTGTCTGGCGTAACTACAGTGAACTTTAAGTCACAGTTCGTTACACAATCTAAAAG
CAAACCGAGCAGCCATCATGTTGTCAAGTAACCATGGTCGCAGTTTCTTTTCGTCTCTTT
TCGAGTTAATCTGAAGGTGAACATACCTTTGTGTTTGTCTGCATGATGCAGATACATACA
GAACAGATTCACTTGACCAAGCTACTTTGATTGCTGTAGTGATGCTTATACTTTTCAGAC
TGTGTTAGTGATTTACTCTTTTTATTATAGAAGCAGCATAATCTTTACCTGAATTATAAT
ATTTCAATCATCTCTTCCCATCATTTGTATCTGT*TATACAAACGGGTGCATTGATTTAT
TTATTTAGAAAATTGC
T

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DS 

RD RR4DY43JQ 485 0 0
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TGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCGTC
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CGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAATGGAGTACGCGAAACCACCGCCTC
TTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGC
CACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTG
ATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAAACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGC
CACAG

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4EN83JQ 712 0 0
GTGATTTACTCTTTTTATTATAGAAGCAGCATAATCTTTACCTGAATTATAATATTTCAA
TCATCTATTCCCATCATTTGTATCTGTATATACAAACGGGTGCATTGATTTATTTATTTA
GAAAATTGCAAATGTGAGAATATTATTAATAACAAAGGCAAACAAGACGGATGGGAAGAA
ACCACACGAACGAGTTATTGTTTTATTATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTA
TATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCGTCAACAGAAATGACCTGACCGGT
GATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGGAAAGCAACCAGCGACGAGACTTCCTCTGGTTC
TCCAACGCGCCCAAGTGGAGTACGCGAAACCACCGCCTCTTCAAAACCTTTCTTCTAAAG
TAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTT
GTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGC
ACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAAA
*CTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGGA
TTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTCGTGTACTCCACT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4DT15JQ 674 0 0
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AAACAAGACGGATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTATTGTTTTATTATTAGTAAAAGT
TGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCGTC
AACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGGAAAGCAACCAG
CGACGAAACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAATGGAGTACGCGAAACCACCGCCTC
TTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGC
CACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTG
ATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGC
CACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAAT
TTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACT
CGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAG
CTTGCCGCTAAAGG

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DS 

RD RR4FV09JQ 643 0 0
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AACCACACGAACGAGTTATTGTTTTATTATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACT
ATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCGTCAACAGAAATGACCTGACCGG
TGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGGAAAGCAACCAGCGACGAGACTTCCTCTGGTT
CTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCACCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAA
GTAGCGGTTTCATAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGTGCCACGCAATTGGTTCTGATGT
TGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTG
CACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAACCAGCCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAA
TGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGG
ATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTTGAGTACTCCACTGTTGGTT
TCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAGCTT

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DS 

RD RR4DX08JQ 805 0 0
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TTAATAACAAAGGCAAACAAGACGGATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTATTGTTTTA
TTATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACT
GTGAATCCTCCGTCAACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAG
AGGAAAGCAACCAGCGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGAGTACGC
GAAACCACCGCCTCTTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTG
ATGTACCATGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGG
TTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGA
TGAACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAA
AGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCAGATTCCAAATTGATCGACATGATTTTA
GCATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTT
ATAAGGATGTTGAGCTTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCGATCAAATTCTCCCTC
TGATCTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAA
TCATCCAAGCATGATTTGAGCTCCT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4DX47JQ 799 0 0
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TTAATAACAAAGGCAAACAAGACGGATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTATTGTTTTA
TTATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACT
GTGAATCCTCCGTCAACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAG
AGGAAAGCAACCAGCGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGAGTACGC
GAAACCACCGCCTCTTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTG
ATGTACCATGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGG
TTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGA
TGAACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAA
AGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCAGATTCCAAATTGATCGACATGATTTTA
GCATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTT
ATAAGGATGTTGAGCTTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCGATCAAATTCTCCCTC
TGATCTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAA
TCATCCAAGCATGATTTGA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4B788JQ 829 0 0
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GAACGAGTTATTGTTTTATTATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTG
TAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCGTCAACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAA
GAAGCTGCGGGAAGGCAGAGGAAAGCAACCAGCGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACG
CGCCCAAGTGGAGTACGCGAAACCACCGCCTCTTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGT
TTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGCCCCCT
GCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAG
ACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCA
ACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAG
TTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATA
TTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAGCTTGCCGCTAAAGGCAGACGAAAGTTCT
TGAATCAGCTTCTCCCTCTGATCTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGAACCGGTCGCCACT
AAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGATTTGAGCTCCTCCTGGTTCCTTGAGCAA
GTATGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTCCTCCACTACCGCTCGCC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4EU18JQ 804 0 0
CATAAAGCTGCA
AAACAAGACGGATGGGAAGAAACCACGCGAACGAGTTATTGTTTTATTATTAGTAAAAGT
TGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCGTC
AACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGGAAAGCAACCAG
CGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGAGTACGCGAAACCACCGCCTC
TTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGC
CACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTG
ATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGC
CACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAAT
TTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCACACT
CGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAG
CTTGCCGCTAAAGGCAGACGAAAGTTCTTGAATCAGCTTCTCCCTCTGATCTCTATCCGA
AGCATCGCAAACCGAACCGGTCACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGA
TTTGAGCTCCTCCTGGTTCCTTGAGCAAGTATGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTC
CTCCACTACCGC

QA 13 804 13 804
DS 

RD RR4DY43TF 770 0 0
CTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGGAAAGCAACCAGCGACGAGACT*C
CTCTGGT*CTCCAACGCGCCCAAATGGAGTACGCGAAACCACCGC*TCTTCAAAACCTTT
CTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGCCACGCAATTGGT
TCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCC
TTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGCCACAGAGGAGAT
GAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATG
GAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTCGTGTACTCCAC
TGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAGCTTGCCGCTAAA
GGCAGACGAAAGTTCTTGAATCAGCTTCTCCCTCTGATCTCTATCCGAAGCATCGCAAAC
CGAACCGGTCACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGATTTGAGCTCCTC
CTGGTTCCTTGAGCAAGTATGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTCCTCCACTACCGC
TCGCCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGCGGTTTTTCCGGCGAGGGACCATTT
TTTGTTATTGTTATTCTCCATCGTCAATCTCCTCCACACAATCACACTCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4DT15TF 707 0 0
TGGTTCTCCAACGCGCCCAAATGGAGTACGCGAAACCACCGCCTCTTCAAAAC*TTTCTT
CTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCT
GATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTT
AGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAA
CACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAA
AGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGT
TGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAGCTTGCCGCTAAAGGC
AGACGAAAGTTCTTGAATCAGCTTCTCCCTCTGATCTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGA
ACCGGTCACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGATTTGAGCTCCTCCTG
GTTCCTTGAGCAAGTATGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTCCTCCACTACCGCTCG
CCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGCGGTTTTTCCGGCGAGGGACCATTTTTT
GTTATTGTTATTCTCCATCGTCAATCTCCTCCACACAATCACACTCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EN83TF 706 0 0
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TAAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAGGTCTTGATGTACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCTG
ATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTA
GTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGCACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAAC
ACAAA*CTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAA
GCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTT
GGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAGCTTGCCGCTAAAGGCA
GACGAAAGTTCTTGAATCAGCTTCTCCCTCTGATCTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGAA
CCGGTCACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGATTTGAGCTCCTCCTGG
TTCCTTGAGCAAGTATGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTCCTCCACTACCGCTCGC
CCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGCGGTTTTTCCGGCGAGGGACCATCTTTTG
TTATTGTTATTCTCCATCGTCAATCTCCTCCACACAATCACACTCC

QA 1 706 1 706
DS 



CO CL38Contig2 697 4 5 U
GGGCACAGTTTGATTCGCGGAGTGACGATAGAGAATAACAAAAGATGGTCCCTCGCCGGA
AAAACCGCTCTGGTAACCGGTGGTACTCGCGGAATTGGGCGAGCGGCAGTGGAGGAGCTA
GCGAGATTCGGTGCAACAGTTCACACATGTTCAAGGAACCAGGAGGAGCTCAAATCATGC
TTGGATGATTGGAAGTCCAATGGTTTAGTGGTAACCGGTTCGGTTTGCGATGCTTCGGAT
AGAGATCAGAGGGAGAATTTGATCGAGGAAGTTTCGTCTGCCTTTAGCGGCAAGCTCAAC
ATCCTTATAAACAATGTTGGAACTAATATAAGGAAACCAACAGTGGAGTACACGAGTGAG
GATTATGCTAAAATCATGTCGATCAATTTGGAATCCGCTTTCCATTTTTCCCAAATTGCA
CATCCTCTTTTAAAAGCATCTGGGGTTGGTAGCATTGTGTTCATCTCCTCTGTGGCTGGA
CTGGTTCATCTTAGTAGTGGATCTGTCTATGGTGCAACTAAAGGAGCACTTAATCAGCTT
ACAAGGAACCTAGCTTGCGAATGGGCAGGGGACAACATCAGAACCAATTGCGTGGCGCCA
TGGTACATCAAGACCTCACTTGTGAAACCGCTACTTGAGAAGAAAGGTTTTGAGGAGGCG
GTGGTTTCGCGTACTCCACTTGGGCGCGTTGGAGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4DX47TF U 1
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DS 

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AGAGATCAGAGGGAGAATTTGATCGAGGAAGTTTCGTCTGCCTTTAGCGGCAAGCTCAAC
ATCCTTATAAACAATGTTGGAACTAATATAAGGAAACCAACAGTGGAGTACACGAGTGAG
GATTATGCTAAAATCATGTCGATCAATTTGGAATCTGCTTTCCATTTTTCCCAAATTGCA
CATCCTCTTTTAAAAGCATCTGGGGTTGGTAGCATTGTGTTCATCTCCTCTGTGGCTGGA
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ACAAGGAACCTAGCTTGCGAATGGGCAGGGGACAACATCAGAACCAATTGCGTGGCGCCA
TGGTACATCAAGACCTCACTTGTGAAACCGCTACTTGAGAAGAAAGGTTTTGA

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GGTGGAGGAGAT
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TCAACTTGGAATCCGCTTTCCATTTTTCCCAAATTGCACATCCTCTTTTAAAAGCATCTG
GGGTTGGTAGCATTGTGTTCATCTCCTCTGTGGCTGGGCTGGTTCATCTTAGTAGTGGAT
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GGGCAGGGGACAACATCAGAACCAATTGCGTGGCACCGTGGTACATCAAGACCTCACTTA
TGAAACCGCTACTTGAGAAGAAAGGTTTTGA
G

QA 13 643 13 643
DS 

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GGGGAG
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GTACTCGCGGAATTGGGCGAGCGGTAGTGGAGGAGCTAGCGAGATTCGGTGCAACAGTTC
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GTTTAGTGGTAACCGGTTCGGTTTGCGATGCTTCGGATAGAGATCAGAGGGAGAATTTGA
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CTAATATAAGGAAACCAACAGTGGAGTACACGAGTGAGGATTATGCTAAAATCATGTCGA
TCAATTTGGAATCCGCTTTCCATTTTTCCCAAATTGCACATCCTCTTTTAAAAGCATCTG
GGGTTGGTAGCATTGTGTTCATCTCCTCTGTGGCTGGACTGGTTCATCTTAGTAGTGGAT
CTGTCTATGGTGCAACTAAAGGAGCACTTAATCAGCTTACAAGGAACCTAGCTTGCGAAT
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GGCGCGTTGGAGACC

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DS 



AS 2 19

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TAACATCAGTTTCAATCACACACACATAGTTTGTGTCTGGAATCAGGACTTTGAGCTTCG
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TCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTCCGGCACTACCTTGTCA
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ATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGAT
GTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGGATCTGCCATATTCCCC
TCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGAGGCCTCTCTTT
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GATGATGATGATGATGATGCAAAGCACACAAAGGGAGGTAAGAATCTGGGTTTTTCTCGG
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TGGCAGAATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4FC77JQ U 1
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AF RR4F751JQ U 20
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AF RR4BM07JQ U 1
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ATGCATCTTCAAGCAAGTCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGT
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CTTTGTTCTGCTCATCCATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTA
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ACACACATAGTTTGTGTCTGGAATCAGGACTTTGAGCTTCGCAATGTCAATTTTCAGCCG
TGGTACTGTCCAGCAACGACTCACATGCATCTTCAAGCAAGTCCAACACCTTCTCAAAAC
CTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTCCGGCACTACCTTGTCATTGTGTTTCTTGCAATACG
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CATTGTAAGACTCCAATATGTCCTCTTTGTTCTGCTCATCCATGGCGAGAATGAGATCAA
ACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGATGTTATCTCAACTCCACGAC
GTTTCGCAGCGCCTCTCATCCTTGGATCTGCCATATTCCCCTCGTGATAATCGATGGTTC
CGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGAGGCCTCTCTTTTTGACGATGTCTCTGAAGA
CGCC

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TGTCTGGAATCAGGACTTTGAGCTTCGCAATGTCAATTTTCAGCCGTGATACTGTCCAGC
AACGACTCACATGCATCTTCAAGCAAGTCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCA
TAGTACGGGTCCGGCACTACCTTGTCATTGTGTTTCTTGCAATACGAACACATGAGCTTC
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AATATGTCCTCTTTGTTCTGCTCATCCATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCA
GATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGATGTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTT
CTCATCCTTGGATCTGCCATATTCCCCTCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATG
ATGAAACTGGAGTCGAGGCCTCTCTTTTTGACGATGTCTCTGAAGACGCCTTCAGCTGCG
GGGCTCCGACAGATGTTACCCAGACAGACGA

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TCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTCCGGCACTACCTTGTCA
TTGTGTTTCTTGCAATACGAACACATGAGCTTCACCTTTTTATCAGCATCAGGTGGGTAA
TTGCCTCTGGCTTTCCACACATTGTAAGCCTCCAATATGTCCTCTTTGTTCTGTTCATCC
ATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGAT
GTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGGATCTGCCATATTCCCC
TCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGAGGCCTCTCTTT
TTGACGATGTCTCTGAAGACGCCTTCAGCTGCGGGGCTCCGACAGATGTTACCCAGACAG
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GATGATGATGATGATGATGCAAAGCACACAAAGGGAG*TAAGAATCTGGGTTTT
CTC

QA 1 774 1 774
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TCAATCACACACACATAGTTTGTGTCTGGAATCAGGACTTTGAGCTTCGCAATGTCAATT
TTCAGCCGTGATACTGTCCAGCAACGACTCACATGCATCTTCAAGCAAGTCCAACACCTT
CTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTCCGGCACTACCTTGTCATTGTGTTTCTT
GCAATACGAACACATGAGCTTCACCTTTTTATCAGCATCAGGTGGGTAATTGCCTCTGGC
TTTCCACACATTGTAAGCCTCCAATATGTCCTCTTTGTTCTGCTCATCCATGGCGAGAAT
GAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGATGTTATCTCAAC
TCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGGATCTGCCATATTCCCCTCGTGATAATC
GATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGAGGCCTCTCTTTTTGACGATGTC
TCTGAAGACGCCTTCAGCTGCGGGGCTCCGACAGATGTTACCCAGACAGACGAAAAGGAC
GGAGAAAGGTTTGGTCTCGCTGCTCTGCGTAGGAGTAGCCATTGGAGATGATGATGATGA
TGATGATGCAAAGCACAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4CJ29JQ 776 0 0
GCTTTAAAAATGAGCGTGTGATCATAACAAGGTTTTCTTAAAGAAAACATTCAACAAGAT
TCGAGCTTCACACCATTTCTCACGCTGTTTGGCATCACTGAAGATGTCTTATAAATTTAA
TAACATCAGTTTCAATCACACACACATAGTTTGTGTCTGGAATCAGGACTTTGAGCTTCG
CAATGTCAATTTTCAGCCGTGATACTGTCCAGCAACGACTCACATGCATCTTCAAGCAAG
TCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTCCGGCACTACCTTGTCA
TTGTGTTTCTTGCAATACGAACACATGAGCTTCACCTTTTTATCAGCATCAGGTGGGTAA
TTGCCTCTGGCTTTCCACACATTGTAAGCCTCCAATATGTCCTCTTTGTTCTGTTCATCC
ATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGAT
GTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGGATCTGCCATATTCCCC
TCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGAGGCCTCTCTTT
TTGACGATGTCTCTGAAGACGCCTTCAGCTGCGGGGCTCCGACAGATGTTACCCAGACAG
ACGAAAAGGACGGAGAAAGGTTTGGTCTCGCTGCTCTGCGTAG*AGTAGCCATTGGAGAT
GATGATGATGATGATGATGCAAAGCACACAAAGGGAGGTAAGAATCTGGGTTTTTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4G658JQ 767 0 0
C
TAACAAGGTTTTCTTAAAGAAAACATTCAACAAGATTCGAGCTTCACACCATTTCTCACG
CTGTTTGGCATCACTGAAGATGTCTTATAAATTTAATAACATCAGTTTCAATCACACACA
CATAGTTTGCGTCTGGAATCAGGACTTTGAGCTTTGCAATGTCAATTTTCAGCCGTGATA
CTGTCCAGCAACGACTCGCATGCATCTTCAAGCAAGTCCAATACCTTCTCAAAACCTTGA
GCTCCACCATAATACGGGTCCGGCACTACCTTGTCATTGTGTTTCTTGCAATACGAACAC
ATGAGCTTCACCTTTTTATCAGCATCAGGTGGGTAATTGCCTCTGGCTTTCCACACATTG
TAAGCCTCCAATATGTCCTCTTTGTTCTGCTCATCCATGGCGAGAATGAGATCAAACTCC
CTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATAATGACGTTATCTCAACTCCACGACGTTTC
GCCGCACTTCTCATCCTTGGATCCGCCATGTTCCCCTCGTGATAATCGATGGTGCCGGCG
GAATCAATGATGAAATTGGAGTCGAGGCCTCTCTTTTTGACGATGTCTCTGAAGACGCCT
TCAGCTGCGGGGCTCCGACAGATGTTACCCAGACAGACGAAAAGGACGGAGAAAGGTTTG
GTCTCGCTGCTCTGCGTAGGAGTAGCCATTGGAGATGATGATGATGATGATGATGCAAAG
CACACAAAGGGAGGTAAGAATCTGGGTTTTTCTCGGGAACTCGAAA

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR4BM07TF 747 0 0
TGTCTTATAAATTTAATAACATCAGTTTCAATCACACACACATAGTTTGTGTCTGGA*TC
AGGACTTTGAGCTTCGCAATGTCAATTTTCAGCCGTGATACTGTCCAGCAACGACTCACA
TGCATCTTCAAGCAAGTCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTC
CGGCACTACCTTGTCATTGTGTTTCTTGCAATACGAACACATGAGCTTCACCTTTTTATC
AGCATCAGGTGGGTAATTGCCTCTGGCTTTCCACACATTGTAAGCCTCCAATATGTCCTC
TTTGTTCTGTTCATCCATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTAT
CGGTCTAGATAATGATGTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGG
ATCTGCCATATTCCCCTCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGA
GTCGAGGCCTCTCTTTTTGACGATGTCTCTGAAGACGCCTTCAGCTGCGGGGCTCCGACA
GATGTTACCCAGACAGACGAAAAGGACGGAGAAAGGTTTGGTCTCGCTGCTCTGCGTAGG
AGTAGCCATTGGAGATGATGATGATGATGATGATGCAAAGCACACAAAGGGAGGTAAGAA
TCTGGGTTTTTCTCGGGGACTCGAAACAAGGTTCGGGTTCTTGTGAGAAGAAGGCGGAGG
AAGAAATCGAGGTTGGTGGCAGAATGG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4FU68TF 562 0 0
CTACTTTGTCATTGTGTTTCTTGCAATACGAACACATGAGCTTCACCTTTTTATCAGCAT
CAGGTGGGTAATTGCCTCTGGCTTTCCACACATTGTAAGCCTCCAATATGTCCTCTTTGT
TCTGCTCATCCATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTC
TAGATAATGATGTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGGATCTG
CCATATTCCCCTCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGA
GGCCTCTCTTTTTGACGATGTCTCTGAAGACGCCTTCAGCTGCGGGGCTCCGACAGATGT
TACCCAGACAGACGAAAAGGACGGAGAAAGGTTTGGTCTCGCTGCTCTGCGTAGGAGTAG
CCATTGGAGATGATGATGATGATGATG***CAAAGCACACAAAGGGAGGTAAGAATCTGG
GTTTTTCTCGGGAACTCGAAACAAGGTTCGGGTTCTTGTGAGAAGAAGGCGGAGGAAGAA
ATCGAGGTTGGTGGCAGAATG
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4FV36TF 616 0 0
GCAAGTCCAACACCTTCTCAAAACCTTGAGCTCCACCATAGTACGGGTCCGGCACTACCT
TGTCATTGTGTTTCTTGCAATACGAACACATGAGCTTCACCTTTTTATCAGCATCAGGTG
GGTAATTGCCTCTGGCTTTCCACACATTGTAAGCCTCCAATATGTCCTCTTTGTTCTGCT
CATCCATGGCGAGAATGAGATCAAACTCCCTGAAATCAGATGCCTTTATCGGTCTAGATA
ATGATGTTATCTCAACTCCACGACGTTTCGCAGCGCTTCTCATCCTTGGATCTGCCATAT
TCCCCTCGTGATAATCGATGGTTCCGGCGGAATCAATGATGAAACTGGAGTCGAGGCCTC
TCTTTTTGACGATGTCTCTGAAGACGCCTTCAGCTGCGGGGCTCCGACAGATGTTACCCA
GACAGACGAAAAGGACGGAGAAAGGTTTGGTCTCGCTGCTCTGCGTAGGAGTAGCCATTG
GAGATGATGATGATGATGATG***CAAAGCACACAAAGGGAGGTAAGAATCTGGGTTTTT
CTCGGGAACTCGAAACAAGGTTCGGGTTCTTGTGAGAAGAAGGCGGAGGAAGAAATCGAG
GTTGGTGGCAGAATG
C

QA 1 615 1 615
DS 



CO CL39Contig2 789 8 23 U
GGCAGGCCAGGGGCAAGGAATGATGACTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCC
AACAATCCCTTCCTATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTC
TCACAAGAACCCGAACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTT
TGTGTGCTTTGCATCATCATCATCATCATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAG
CGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGC
AGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAGTTTCATCAT
TGATTCCGCCGGAACCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAAG
CGCTGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACATCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGA
TTTCAGGGAGTTTGATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAGAGGACATATTGGA
GGCTTACAATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAATTACCCACCTGATGCTGATAAAAAGGTGAA
GCTCATGTGTTCGTATTGCAAGAAACACAATGACAAGGTAGTGCCGGACCCGTACTATGG
TGGAGCTCAAGGTTTTGAGAAGTATTGGACTTGCTTGAAGATGCATGCGAGTCGTTGCTG
GACAGTATCACGGCTGAAATTGACATTGCAAAGCTCAAAGTCCTGATCCAGACGCAAACT
ATGTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 
15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H559TF U 15
AF RR4CJ29TF U 73
AF RR4BM13TF U 27
AF RR4FJ32TF U 15
AF RR4F751TF U 15
AF RR4EZ49TF U 15
AF RR4FC77TF U 7
AF RR4G658TF U 1
BS 1 41 RR4G658TF
BS 42 42 RR4FJ32TF
BS 43 98 RR4G658TF
BS 99 99 RR4FJ32TF
BS 100 350 RR4G658TF
BS 351 351 RR4FJ32TF
BS 352 372 RR4G658TF
BS 373 373 RR4FJ32TF
BS 374 396 RR4G658TF
BS 397 397 RR4FJ32TF
BS 398 402 RR4G658TF
BS 403 403 RR4FJ32TF
BS 404 420 RR4G658TF
BS 421 421 RR4FJ32TF
BS 422 423 RR4G658TF
BS 424 424 RR4FJ32TF
BS 425 450 RR4G658TF
BS 451 451 RR4FJ32TF
BS 452 654 RR4G658TF
BS 655 655 RR4EZ49TF
BS 656 671 RR4G658TF
BS 672 672 RR4EZ49TF
BS 673 789 RR4G658TF

RD RR4H559TF 237 0 0
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ATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGAACCCGA
ACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCTTTGCAT
CATCATCATCATCATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCAAAC

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR4CJ29TF 261 0 0
GG
ATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGAACCCGA
ACCTTGTTTCGAGTCCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCTTTGCAT
CATCATCATCATCATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTT
TCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCT
TCAGAGACATCGTCAAAAA

QA 3 261 3 261
DS 

RD RR4BM13TF 377 0 0
CTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCTATTTACCATTCT
GCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGAACCCGAACCTTGCTTCGA
GTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCTTTGCATCATCATCATCAT
CATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTT
TCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCG
TCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAGTTTCATCATTGATTCCGCCGGAACCATCGATTATC
ACGAGGGGAATATGGCA

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR4FJ32TF 629 0 0
AAGGAATGATGACTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCT
ATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGAACCCGA
ACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCCTTGCAT
CATCATCATCATCATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTT
TCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCT
TCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAGTTTCATCATTGATTCCGCCGGAA
CCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAATCGCTGCGAAACGTC
GTGGAGTTGAGATAACATCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTG
ATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAGAGGACATATTGGAGGCTTACAATGTGT
GGAAAGCCAGAG*CAATTACCCACCTGATGCTGATAAAAAG*TGAAGCTCATGTGTTCGT
ATTGCAAGAAACACAATGACAAG
TAGTGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4F751TF 628 0 0
AAGGAATGATGACTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCT
ATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGAACCCGA
ACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCTTTGCAT
CATCATCATCATCATCATCTCAAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCAA*CCTT
TCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCT
TCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAGTTTCATCATTGATTCCGCCGGAA
CCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAGGCGCTGCGAAACGTC
GTGGAGTTGAGATAACATCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTG
ATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAGAGGACATATTGGAGTCTTACAATGTGT
GGAAAGCCAGAG*CAATTACCCACCTGATGCTGATAAAAAG*TGAAGCTCATGTGTTCGT
ATTGCAAGAAACACAATGACAAG
TAGTG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4EZ49TF 664 0 0
AAGGAATGATGACTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCT
ATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGAACCCGA
ACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCTTTGCAT
CATCATCATCATCATCATCTCAAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCAA*CCTT
TCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCT
TCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAGTTTCATCATTGATTCCGCCGGAA
CCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAGGCGCTGCGAAACGTC
GTGGAGTTGAGATAACATCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTG
ATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAGAGGACATATTGGAGTCTTACAATGTGT
GGAAAGCCAGAGGCAATTACCCACCTGATGCTGATAAAAAGGTGAAGCTCATGTGTTCGT
ATTGCAAGAAACACAATGACAAGGTAGTGCCGGACCCGTACTATGGTGGAGCTCAAGGTT
TTGA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4FC77TF 670 0 0
GG
AGGGGCAAGGAATGATGACTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCC
CTTCCTATTTACCATTCTGCCACCAACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTTCTCACAAGA
ACCCGAACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTTTGTGTGCT
TTGCATCATCATCATCATCATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAGCGAGACCA
AACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAG
GCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAGTTTCATCATTGATTCCG
CCGGAACCATCGATTATCGCGAGGGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAAGCGCTGCGA
AACGTCGTGGAGTTGGGATAACATCATTATTTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGG
AGTTTGATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAGAGGACATATTGGAGGCTTACA
ATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAATTACCCACCTGATGCTGATAAAAAGGTGAAGCTCATGT
GTTCGTATTGCAAGAAACACAATGACAAGGTAGTGCCGGACCCGTACTATGGTGGAGCTC
AAG
TTTTG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR4G658TF 789 0 0
GGCAGGCCAGGGGCAAGGAATGATGACTCCGACACAGTACTGCAGGCTCACAACTTCTCC
AACAATCCCTTCCTATTTACCATTCTGCCACCAACCTCAATTTCTTCCTCCGCCTTCTTC
TCACAAGAACCCGAACCTTGTTTCGAGTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCTCCCTT
TGTGTGCTTTGCATCATCATCATCATCATCATCTCCAATGGCTACTCCTACGCAGAGCAG
CGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGC
AGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGACTCCAATTTCATCAT
TGATTCCGCCGGCACCATCGATTATCACGAGGGGAACATGGCGGATCCAAGGATGAGAAG
TGCGGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACGTCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGA
TTTCAGGGAGTTTGATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAGAGGACATATTGGA
GGCTTACAATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAATTACCCACCTGATGCTGATAAAAAGGTGAA
GCTCATGTGTTCGTATTGCAAGAAACACAATGACAAGGTAGTGCCGGACCCGTATTATGG
TGGAGCTCAAG*TTTTGAGAAGTATTGGACTTGCTTGAAGATGCATGCGAGTCGTTGCTG
GACAGTATCACGGCTGAAATTGACATTGCAAAGCTCAAAGTCCTGATCCAGACGCAAACT
ATGTGTGTG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 18

CO CL40Contig1 1050 18 22 U
GGACGATTTCTTTCTGGATCGTCGAAACTTGTAGGGAAGAGAGGGAGAGAAGTGAGAGAG
GGGGAAACCCTAGATTCGATTTGGTTCGCTTCTCGAATCGAAGGCGATGGTGTTCTACTT
CAAGGCACGACCAGATGCTGGGGACTACACCATCTTCATGGGGCTCGATAAGTTCGAGAA
CGAGGAGCTCATCAAGTACGGCTTCCCCGAAGACGTCTGGTTTCACGTTGATAAAATGTC
CTCAGCTCACGTTTACTTGAGGCTTCACAAAGGCCAAGGCTTTGATGACATTAGTGAAGG
TGTGCTGGAGGATTGTGCTCAGCTTGTGAAAGCTAACTCCATTCAAGGCAATAAGGTGAA
CAACGTTGATGTTGTGTACACTCCGTGGTCCAACTTGAAGAAGACTGCCTCCATGGATGT
TGGTCAAGTTGGCTTCCACAATTCAAAGATGGTCCGGACTATCAGAGTGGAGAAGCGAGT
CAATGAAATAATTAACAGATTGAACAAAACAAAAGTTGAGAGAACCCCTGATCTGAGAGC
CGAGAGAGAAGCAGTGAATGCTGCAGAAAGAGCTGAGAGGAAACAACACCTGAGGGAGAA
GAAGAAACGTGAAGATATTGAGAGGCTTGAGAAGGAGAGGCAAGCAGATATGAGGAGTTA
CAAGGGGTTAATGGTAACTGATAAAATGACATCCAACAAAGACATTGCTTCAAGCAACAA
GTCTATTCAAGAACTCGAAGATGATTTCATGTAAGAAATGCGGGCAAAAAAAACCCCAAG
TTGGTAACATTCTGGTGGTGCTGTCCTTCAAAGAAGGTTTATCATGTTGTTTCTACTAGC
CTTGGATATATAATGATGATTGATTTCATTTTTGTTTCAAAGTCTTTGATGAAACCCAAA
ACCCTAGTTTTGTTCTTATACTCTCTCCAGTCCGATGAAATGTTTCAGAGGATTGAAGCT
GAGTTGGGAGAAAAACAGAGAGCATTATATATGATATATGATGTATAACACAGGCGAGCC
AGTGATCTGGTGCGATCATGGTTTACTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 90 85 85 30 85 25 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 60 85 85 85 85 85 
75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 75 75 60 75 75 75 
75 75 30 75 75 75 75 75 75 50 50 50 75 75 75 35 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 50 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 40 10 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

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AF RR4A001JQ C 25
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AF RR4G680JQ C 412
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G
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DS 

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TGGGGACTACACCATCTTCATGGAGCTCGATAAGTTCGAGAACGAGGAGCTCATCAAGTA
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TCAGCTTGTGAAAGCTAACTCCATTCAAGGCAATAAGGTGAACAACGTTGATGTTGTGTA
CACTCCGTGGTCCAACTTGAAGAAGACTGCCTCCATGGATGTTGGTCAAGTTGGCTTCCA
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G
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AACTGATAAAATGACATCCAACAAAGACATTGCTTCAAGCAACAAGTCTATTCAG**ACT
CGA*GATGATTTCATGTAAGAA
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TCGATTTGGTTCGCTTCTCGAATCGAAGGCGATGGTGTTCTACTTCAAGGCACGACCAGA
TGCTGGGGACTACACCATCTTCATGGGGCTCGATAAGTTCGAGAACGAGGAGCTCATCAA
GTACGGCTTCCCCGAAGACGTCTGGTTTCACGTTGATAAAATGTCCTCAGCTCACGTTTA
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TGCTCAGCTTGTGAAAGCTAACTCCATTCAAGGCAATAAGGTGAACAACGTTGATGTTGT
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CCACAATTCAAAGATGGTCCGGACTATCAGAGTGGAGAAGCGAGTCAATGAAATAATTAA
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GAATGCTGCAGAAAGAGCTGAGAGGAAACAACACCTGAGGGAGAAGAAGAAACGTGAAGA
TATTGAGAGGCTTGAGAAGGAGAGGCAAGCAGATATGAGGAGTTACAAGGGGTTAATGGT
AACTGATAAAATGACATCCAACAAAGACATTGCTTCAAGCAACAAGTCTATTCAAGAACT
CGAAGATGATTTCATGTAAGAA*TGCGGGCAAAAAA**CCCCAAGTTGGTAACATTCTGG
TGGTGCTGTCC

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DS 

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CCCCGAAGACGTCTGGTTTCACGTTGATAAAATGTCCTCAGCTCACGTTTACTTGAGGCT
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TTCATTTTTGTT
CC

QA 1 852 1 852
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TGCGGGCAAAAAAA*CCCCAAGTTGGTAACATTCTGGTGGTGCTGTCCTTCAAAGAAGGT
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CC

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AAGGGGTTAATGGTAACTGATAAAATGACATCCAACAAAGACATTGCTTCAAGCAACAAG
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TGGTAACATTTTGGTGGTGCTGTCCTTCAAAGAAGGTTTATCATGTTGTTTTTACTAGCC
TTGGATATATAATGATGATTGATTTCATTT

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DS 

RD RR4DA71JQ 575 0 0
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GAGTCAATGAAATAATTAACAGATTGAACAAAACAAAAGTTGAGAGAACCCCTGATTTGA
GAGCCGAGAGAGAAGCAGTGAATGCTGCAGAAAGAGCTGAGAGGAAACAACACCTGAGGG
AGAAGAAGAAACGTGAAGATATTGAGAGGCTTGAGAAGGAGAGGCAAGCAGATATGGGGA
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DS 

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CC

QA 7 834 7 834
DS 

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QA 1 685 1 685
DS 

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CC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 18

CO CL41Contig1 3048 18 33 U
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TTTT
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TCCCGTAGCTCTTGGGGTTATGGATTTTCAGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGT
AGGGGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTTTTATTTT

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AAAAGACAGGGTTGACTGACGCTATTCAAACAGGTACAGGCCAACTAAATGGTATTCCCG
TAGCTCTTGGGGTTATGGATTTTCAGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCG
AAAAAATAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGT
GTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGCAAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAA
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AAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCAGCTGAATCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATG
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TTTTTCCTTTGAATAAAAATGAAATCAAATAGAACAGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAA
AACCCTGAAAA*TTCATTTTTCTTTCGAATCCTTTTTTTATCGATATTC
CT

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TTCAAACAGGTACAGGTCAACTAAATGGTATTCCCGTAGCTCTTGGGGTTATGGATTTTC
AGTTTATGGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGGCGAAAAAATAACTCGTTTGATCGAGT
ATGCTACCAATCAATGTTTACCTCTTATTTTAGTGTGTTCTTCCGGAGGAGCACGAATGC
AAGAAGGAAGTTTAAGTTTGATGCAAATGGCTAAAATTTCTTCGGTTTTATGTGATTATC
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TTGCGGGTAAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAG
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AAGGTGTTGTGAGTGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAACAAAAATGAAA
TCAAATAGAACAGTTAGTTTATCAGAATTAAACGAAAACCCTGA

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AAAAAGTTATTCTATATATCAATTCTTACATCTCCTACTACCAGTGGGGTGACAGCAAGT
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AAAAGAGTAATTGAACAAACATTGAAAAAAGCCGTGCCTGAAGGTTCACAAGCAGCTGAA
TCTTTATTACGTAAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTC
GTGAGTGAGTTATTTCAGCTCCATGCTTTTTTTCCTTTGAATAAAAATGAAATCAAATAG
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TTTTTTTATCGATATTCCTGTTTACTACTCAGTAAACCTTTATCAACAAGATAAAAAGTG
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TCTTGCTTGCATATGGATAGATAATTCAAATAGAGATATAGATCTATAGAGAGTCTTGCA
TCGTTTTGCATTTCCCGAAAATTACCTGTTGTTGGATCAGATTCCAATAAATTTTGTATA
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AAGAC

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G
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AAGGGCTTATTGGATGCAATTGTACCACGTAATCTTTTAAAAGGTGTTGTGAGTGAGTTA
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TATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTTTATCAACAAGATAAAAAGTGAATTTTTGCTTT
CGGGAAGTTCAAATTCGACTAGAAAAATTAAACAAAGTTTTTTTCCTCTCTTGCTTGCAT
ATGGATAGATAATTCAAATAGAGATATAGATCTATAGAGAGTCTTGCATCGTTTTGCATT
TCCCGAGAATTACCTGTTGTTGGATCAGATTCCAATAAATTTTGTATAAATTTTTAATGG
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ACAAAAAGAATAATAAATCTAACAGGGAGATTATGATAATACATCTATTTGATTTTGAAA
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*TTTTTTTATCGATATTCTTGTTTACTACTCAGTAAACCTTTATCAACAAGATAAAAAGT
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CTCTTGCTTGCATATGGATAGATAATTCAAATAGAGATATAGATCTATAGAGAGTCTTGC
ATCGTTTTGCATTTCCCGAGAATTACCTGTTGTTGGATCAGATTCCAATAAATTTTGTAT
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TTTATTCTATTTTTTATTTTAAAAATTAAAAAAAGTTCTTTTAGTAGTGATCGAAAAAAG
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GATAAAAGGGATTATAGGCTCAATACATTCTATTTGAATTAGAATAGAAACTCATGCTCG
ATAGAAATAGTAGATCTAATAGAATCAACAAATGCGGTAGGTTCATTAACAATTCACAGA
TTCAAAATGGC

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DS 

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G
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CAAAATGGCAAAAAAGAAAGCATTCATTCCTTTTTTTTATTTTACATCTATAGTCTTTTT
GCCCTGGTTGATCTCTCTCTGCTGTAATAAAAATTTGAAAACTTGGATTACTAATTGGTG
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CCGATTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATAC
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TTCTAAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGGTTC
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AAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAG
TCATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCG

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DS 

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G
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TCTTTTTGCCCTGGTTGATCTCTCTCTGCTGTAATAAAAATTTGAAAACTTGGATTACTA
ATTGGTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTCTTGAATGATATTCAAGAAAAAA*GTGTT
CTAGAAAAATTCATACAATTAGAGGAACTATTCCAGCTGGATGAAATGATAAAGGAATAC
CCAGAAACCGATTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATC
AAGATACACAACGAGTATCGTATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCT
TTCGTTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCT
TGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTA
TTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTAT
ATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTCCTACC
TTTCCAGTCATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATCTTTC

QA 2 644 2 644
DS 

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GTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTCTTGAATGATATTCAAGAAAAAAAGTGTTCTAG
AAAAATTCATACAATTAGAGGAACTATTCCAGCTGGATGAAATGATAAAGGAATACCCAG
AAACCGATTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGA
TACACAACGAGTATCGTATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCG
TTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGG
TTCAAGAATTCCTATATAATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAA
CTGATTTATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTT
ACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTCCTACCTTTC
CAGTCATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTC
CGTCACTTGTAGTGATTTATCATGCAATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATT
CTACTCTTTCTTACTTTATGCATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTT
TTACCCACGAGGGATTCCTTGTATATTTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4GM39JQ 605 0 0
G
ATTCCAGCTGGATGAAATGATAAAGGAATACCCAGAAACCGATTTACAACAATTTCGTCT
AGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATACACAACGAGTATCGTATCCATAC
AATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTG
GGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAAG
TGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTC
GCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTTGGTTTGCTCATTA
TGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTGATACAATTTTTAA
ATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATGC
AATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACTCTTTCTTACTTTATACATCA
TAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTCCTTGTATA
TTTC

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR4GM39TF 616 0 0
G
ATTCCAGCTGGATGAAATGATAAAGGAATACCCAGAAACCGATTTACAACAATTTCGTCT
AGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATACACAACGAGTATCGTATCCATAC
AATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCTAAGTGGTTATTCCTTTTG
GGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAAG
TGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTC
GCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTTGGTTTGCTCATTA
TGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTGATACAATTTTTAA
ATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATGC
AATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACTCTTTCTTACTTTATACATCA
TAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTCCTTGTATA
TTTCAATAAAAAAAA

QA 2 616 2 616
DS 

RD RR4F582TF 806 0 0
G
CATACAATTAGAGGAACTATTCCAGCTGGATGAAATGATAAAGGAATACCCAGAAACCGA
TTTACAACAATTTCGTCTAGGAATCCACAAAGAAACGATCCAATTCATCAAGATACACAA
CGAGTATCGTATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCT
AAGTGGTTATTCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGGTTCAAGA
ATTCCTATATAATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTT
ATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGA
TTTTGGGTTTGCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCAT
TCTTGATACAATTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACT
TGTAGTGATTTATCATGTAATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACTCT
TTCTTACTTTATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCA
CGAGGGATTCCTTGTATATTTCAATAAAAAAAA**TTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGC
AGAATTGTGGCTAGGGAAGTATATTATCGACCTACCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGG
*ATAAATGATTGGAC*ATGCAAACTAGAAATACCTTTTCT*GGATAAGG*AAGAGAT*AC
TCGCTC*ATATCTGTCTCACTC
ATG

QA 2 803 2 803
DS 

RD RR4A778TF 804 0 0
CGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATTCGCCTCACGTTTGGGAACTAA
TGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTC
TAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTTATACAATTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATT
TAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATGCAATAAATGACTAAAAAACGA
TTCACTGATCCAATTCTACTCTTTCTTACTTTATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTAT
TTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATCCCTTGTATATTTCAATAAAAAAAAA*TTT
TTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTGGCTAGGGAAGTATATTATCGACCTACCTA
ACTTTATTGTAGAAATTTTCGGGATAAATAATTGGACCATGCAAACTATAAATACCTTTT
CTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCGTGATATATATAATAA
CTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCAATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCAC
GAGAGGCAACTGGGCGTATTGTATGTGCCAATTGCCATTTAGCTAGTAAGCCCGTGGATA
TTGAGGTTCCACAAGCGGTACTTCCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTT
ATGATATGCAGCTAAAACAAGTTCTAGCTAATGGTAAAAAAGGAGCTTTGAATGTGGGAG
CTGTTCTTATTTTACCTGAGGGGT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4GO08JQ 731 0 0
TTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTT
ATCATGCAATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACTCTTTCTTACTTTA
TACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTCC
TTGTATATTTCAATAAAAAAAAAATTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTGGC
TAGGGAAGTATATTATCGACCTACCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGGGATATATGATT
GGACCATGCAAACTAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATAT
CTGTCTCACTCATGATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCAATTT
TTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCAACTGGGCGTATTGTATGTGCCAATT
GCCATTTAGCTAGTAAGCCCGTGGATATTGAGGTTCCACAAGCGGTACTTCCTGATACTG
TATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATGATATGCAGCTAAAACAAGTTCTAGCTAATG
GTAAAAAAGGAGCTTTGAATGTGGGAGCTGTTCTTATTTTACCTGAGGGGTTTGAATTAG
CCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATCAGAGAAAAGATAGGAAATCTGTCTTTTCAGA
ATTATCGCCCC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4F582JQ 629 0 0
CTACTCTTTCTTACTTTATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTT
TTACCCACGAGGGATTCCTTGTATATTTCAATAAAAAAAAA*TTTTTTTTCAGTAAATGT
AAATAGCAGAATTGTGGCTAGGGAAGTATATTATCGACCTACCTAACTTTATTGTAGAAA
TTTTCGGGATAAATGATTGGACCATGCAAACTAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAG
AGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCATGATATATATAATAACTTGGGCATCCATTT
CAAGTGCATATCCAATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCAACTGGGC
GTATTGTATGTGCCAATTGCCATTTAGCTAGTAAGCCCGTGGATATTGAGGTTCCACAAG
CGGTACTTCCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATGATATGCAGCTAA
AACAAGTTCTAGCTAATGGTAAAAAAGGAGCTTTGAATGTGGGAGCTGTTCTTATTTTAC
CTGAGGGGTTTGAATTAGCCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATCAAAGAAAAGATAG
GAAATCTGTCTTTTCAGAATTATCGCCCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4G414JQ 402 0 0
G
GGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCATGATATATATAATAACTT
GGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCAATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAG
AGGCAACTGGGCGTATTGTATGTGCCAATTGCCATTTAGCTAGTAAGC**GTGGATATTG
AGGTTCCACAAGCGGTACTTCCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATG
ATATGCAGCTAAAACAAGTTCTAGCTAATGGTAAAAAAGGAGCTTTGAATGTGGGAGCTG
TTTTTATTTTACCTGAGGGGTTTGAATTAGCCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATCA
AAGAAAAGATAGGAAATCTGTCTTTTCAGAATTATCGCCCC

QA 2 402 2 402
DS 

RD RR4G414TF 402 0 0
G
GGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCATGATATATATAATAACTT
GGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCAATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAG
AGGCAACTGGGCGTATTGTATGTGCCAATTGCCATTTAGCTAGTAAGC**GTGGATATTG
AGGTTCCACAAGCGGTACTTCCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATG
ATATGCAGCTAAAACAAGTTCTAGCTAATGGTAAAAAAGGAGCTTTGAATGTGGGAGCTG
TTCTTATTTTACCTGAGGGGTTTGAATTAGCCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATCA
AAGAAAAGATAGGAAATCTGTCTTTTCAGAATTATCGCCCC

QA 2 402 2 402
DS 

RD RR4A778JQ 850 0 0
TCTTACTTTATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCAC
GAGGGATCCCTTGTATATTTCAATAAAAAAAAA*TTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCA
GAATTGTGGCTAGGGAAGTATATTATCGACCTACCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGGG
ATAAATAATTGGACCATGCAAACTATAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACT
CGCTCCATATCTGTCTCACTCGTGATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCA
TATCCAATTTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCAACTGGGCGTATTGTA
TGTGCCAATTGCCATTTAGCTAGTAAGCCCGTGGATATTGAGGTTCCACAAGCGGTACTT
CCTGATACTGTATTTGAAGCAGTTGTTAAAATTCCTTATGATATGCAGCTAAAACAAGTT
CTAGCTAATGGTAAAAAAGGAGCTTTGAATGTGGGAGCTGTTCTTATTTTACCTGAGGGG
TTTGAATTAGCCCCCCCCGATCGTATTTCACCCGAGATCAAAGAAAAGATAGGAAATCTG
TCTTTTCAGAATTATCACCCCAATAAAAAAAATATTCTTGTGATAGGTCCTGTTCCTGGT
CAAAAATATAGTGAAATAACCTTTCCTATTCTTGCCCCAGACCCCCTACTAATAAAGATG
TTCACTTCTTAAAATATCCTATATACGTAGGTGGAAATAGGGGAAGGGGTCAGATTTATC
CTGATGGTAGCAAAAGTAACAATACAGTTTATAATGCTACGGCAGGAGGGATAATAAGCA
AAATTTTACG

QA 1 850 1 850
DS 



AS 2 19

CO CL42Contig1 609 7 4 U
GGCCTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTCCTGCGAAAATGGTGA
AGGGGCGTCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAA
GGTCGAAGTCAAACCAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAAGGAGTCAACACGA
CAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCA
AGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACA
GCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGG
TGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGTT
TTAGCTGTTGTTTTTT*GCCCTCTAGTTCGTTGTTTTGTATTTGATATTGAAAACATTTT
CCTTTCGTTGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTGAATACCAAGTTAGAATTTTTCTTCCAA
TCTTTTATTGAGTTCCAGCAGATGAAATGTCATGGTTTATGGATATATTCTTCAAATAGG
TTTATTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AT73JQ C 1
AF RR4DI95JQ C 44
AF RR4DI95TF U 44
AF RR4DH96TF U 74
AF RR4AT73TF U 1
AF RR4AG77JQ C 203
AF RR4AG77TF U 203
BS 1 43 RR4AT73TF
BS 44 535 RR4DI95TF
BS 536 538 RR4AT73TF
BS 539 609 RR4AG77TF

RD RR4AT73JQ 539 0 0
GGCCTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTCCTGCGAAAATGGTGA
AGGGGCGTCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAA
GGTCGAAGTCAAACCAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAAGGAGTCAACACGA
CAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCA
AGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGAGAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACA
GCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGG
TGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGTT
TTAGCTGTTGTTTTTT*GCCCTCTAGTTCGTTGTTTTGTATTTGATATTGAAAACATTTT
CCTTTCGTTGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTGAATACCAAGTTAGAATTTTTCTTCC
G

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4DI95JQ 492 0 0
TCCTGCGAAAATGGTGAAGGGGCGTCAAGGAGAACGTGTCAGACTTTACGTCAGAGGAAC
CATCTTGGGATACAAAAGGTGGAAGTCAAACCAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGAT
CGAAGGAGTCAACACGACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACAT
TTACAAGGCCAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTAC
AAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAA
GTCCATGGGAATGAGGGTGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATT
ACAGCATAAACTTTGTTTTAGCTGTTGTTTTTT*GCCCTTTAGTTCGTTGTTTTGTATTT
GATATTGAAAACATTTTCCTTTCGTTGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTGAATACCAAGT
TAGAATTTTTCT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4DI95TF 492 0 0
TCCTGCGAAAATGGTGAAGGGGCGTCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAAC
CATCTTGGGATACAAAAGGTCGAAGTCAAACCAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGAT
CGAAGGAGTCAACACGACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACAT
CTACAAGGCCAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTAC
AAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAA
GTCCATGGGAATGAGGGTGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATT
ACAGCATAAACTTTGTTTTAGCTGTTGTTTTTT*GCCCTCTAGTTCGTTGTTTTGTATTT
GATATTGAAAACATTTTCCTTTCGTTGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTGAATACCAAGT
TAGAATTTTTCT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4DH96TF 462 0 0
G
GAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAAGGTCGAAGTCAAAC
CAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAAGGAGTCAACACGACAGAGGAGGTGACA
TGGTACAAGGGAAAGAGGATGACTTACATCTACAAGGCCAAGACCAAGAAGAACGGTAGC
CACTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGT
GCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTGAGAGTCTTCATG
TATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGTTTTAGCTGTTGTTTT
TT*GCCCTCTAGTTCGTTGTTTTGTATTTGATATTGAAAACATTTTCCTTTCGTTGTTTG
AATCATGGATCTTGTTTTGAATACCAAGTTAGAATTTT
CTT

QA 2 459 2 459
DS 

RD RR4AT73TF 539 0 0
GGCCTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTCCTGCGAAAATGGTGA
AGGGGCGTCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAA
GGTCGAAGTCAAACCAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAAGGAGTCAACACGA
CAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCA
AGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGAGAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACA
GCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGG
TGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGTT
TTAGCTGTTGTTTTTT*GCCCTCTAGTTCGTTGTTTTGTATTTGATATTGAAAACATTTT
CCTTTCGTTGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTGAATACCAAGTTAGAATTTTTCTTCC
G

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4AG77JQ 407 0 0
GGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCG
CTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATT
CACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTGAGAGTCTTCATGTATCCGAG
TAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGTTTTAGCTGTTGTTTTTTTGCCCT
CTAGTTCGTTGTTTTGTATTTGATATTGAAAACATTTTCCTCTCGTTGTTTGAATCATGG
ATCTTGTTTTGAATACCAAGTTAGAATTTTTCTTCCAATCTTTTATTGAGTTCCAGCAGA
TGAAATGTCATGGTTTATGGATATATTCTTCAAATAGGTTTATTGAC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR4AG77TF 407 0 0
GGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCG
CTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATT
CACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTGAGAGTCTTCATGTATCCGAG
TAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGTTTTAGCTGTTGTTTTTTTGCCCT
CTAGTTCGTTGTTTTGTATTTGATATTGAAAACATTTTCCTCTCGTTGTTTGAATCATGG
ATCTTGTTTTGAATACCAAGTTAGAATTTTTCTTCCAATCTTTTATTGAGTTCCAGCAGA
TGAAATGTCATGGTTTATGGATATATTCTTCAAATAGGTTTATTGAC

QA 1 407 1 407
DS 



CO CL42Contig2 568 12 4 U
GGGGCTTCTCCGTCTTCCTCATTTTGCAGTAGCAGTCTTGTGCGTGTTTATCATCCGACT
GAGAAAATGGTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATC
TTGGGATACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAA
GGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTAC
AAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGG
CCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCC
ATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGA
GCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATAC
TGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAA
TATCATGGATCTGGTTTTTAATCTCAAA


BQ
30 40 40 40 40 40 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 

AF RR4CL59TF U 2
AF RR4BC87JQ C 1
AF RR4BC87TF U 1
AF RR4BF90JQ C 1
AF RR4BF90TF U 1
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AF RR4GU24TF U 50
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AF RR4CL59JQ C 10
AF RR4DD80TF U 5
AF RR4DD80JQ C 39
AF RR4BJ09TF U 5
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AGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGGC
CTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCA
TGGGAATGAGGGTC

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TTGGGATACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAA
GGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTAC
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T

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DS 

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GGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTAC
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ATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGA
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TGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAA
T

QA 1 541 1 541
DS 

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CCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCC
ATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGA
GCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATAT
TGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAA
T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4BF90TF 541 0 0
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GGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTAC
AAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGG
CCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCC
ATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGA
GCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATAT
TGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAA
T

QA 1 541 1 541
DS 

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TGGGATACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAAG
GAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACA
AGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGGC
CTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCA
TGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCCACATATGAAGCAAAAGTACAAGAG
CAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACT
GAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAAT
ATCATGGATCTGGTTTTTAATCTCAAA

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DS 

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G
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GGGAACCATCTTGGGATACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTAT
TCAGATTGAAGGAGTCAACACTACAGAGGAGGCGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGC
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AGTTACCAGGCCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCC
TCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAA
AAGTACAAGAGCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGT
ATTTTGATACTGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAAC
GACTTTAAAATATCATGGATCTGGTTTTTAATC
TCC

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DS 

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GG
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TACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAAGGAGTC
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AAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGGCCTCAC
GGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGA
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CGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCAT
GGATCTGGTTTTTAATC
CC

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DS 

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ACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAG
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AACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATG
AGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGAACT
TTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGT
TTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCATGGA
TCTGGTTTTTAATC
AC

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DS 

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GG
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TACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAAGGAGTC
AACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCT
AAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGGCCTCAC
GGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGA
ATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGA
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CGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCAT
GGATCTGGTTTTTAATC
CC

QA 3 559 3 559
DS 

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ATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAA
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TCTTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGT
GATTATCTGAACGACTTTAAAATATC

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DS 

RD RR4BJ09TF 561 0 0
GG
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ATGGTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATCTTGGGA
TACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAAGGAGTC
AACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCT
AAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGGCCTCAC
GGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGA
ATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGA
ACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGAC
CGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCAT
GGATCTGGTTTTTAATC
CC

QA 3 559 3 559
DS 



AS 1 17

CO CL43Contig1 1837 17 31 U
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ACGCCCCAAATAAGCTCACTCACGGGTATCTGAGCAATTTTCCCCGTAGCTTTGACTGAA
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GCTCTAATGGTTACCATGAGTATTGTCCTAATTCTTTTTTGGAAGAAAAAAAAATAATGC
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ATAGCTCCCTGTAAAGCTTGTTGGAAAACCCGTTCACGGACTTGATTAATTGTTCTTTGT
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AAACTACGAAAAAAAAATTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGGATTCGCA
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ACAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAGCCCAACA
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TTAAGTCATCGCTAAGATTCATCCAGCCAAAATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 65 65 65 65 70 70 70 
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ATAGCTCCCTGTAAAGCTTGTTGGAAAACCCGTTCACGGACTTGATTAATTGTTCTTTGT
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C

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TCATCGTACCAAACATACCAATATTTGCATTAATAGTACGTAAATGTAACTCGTTACTCA
AACAACTATTTAAGGTTCCTATAGCTCCCTGTAAAGCTTGTTGGAAAACCCGTTCACGGA
CTTGATTAATTGTTCTTTGTTGCTCAAAAAGAATGGTTTCGTTTTTGTAATTTTCTAATT
GTTTCAAAGTCCTAGAAGTTGAATTAATCAAATTTACTTTTTCTCGTTCGATTTCAGAGT
ATCCATTTACGCGAAACTGATCCGCCTCCGTTTCTACTTTACGCAGGCGAGCTCGGGCGT
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AACTCCCGGCGGATGGCCAGTGACCCAAGTAAACGAAAGAATCGGTTAAATTTTTCATAG
AATCTCCTCTTCTAGCTAAACTATAAAAAAAAGAACTCTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTAT
TCTTTATTTTTTTCAATAAAAAGAAAATTTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCTA
TTTGGATATTTAT

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TTTTCTCGTTCGATTTCAGAGTATCCATTTACGCGAAACTGATCCGCCTCCGTTTCTACT
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GAATCGGTTAAATTTTTCATAGAATCTCCTCTTCTAGCTAAACTATAAAAAAAAGAACTC
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TGAATTAATCAAATTTACTTTTTCTCGTTCGATTTCAGAGTATCCATTTACGCGAAACTG
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DS 

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CCTTCCCAAGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAATAAA
AAAAA*CTACGAAAAAAAA*TTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGGATTC
GCAAAT
CC

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TAAAAAAAA*CTACGAAAAAAAA*TTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGG
ATTCGCAAAT
CC

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C

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DS 

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TTCCTCACACCAAA

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DS 

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AAACAGAATCAAAAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCA
ATAATAATAATGAGACTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAA
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CTAAAAAGAATAAGGGGAAGGAAGAAAGCGAATCGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAAT
TAGTCCTTCCCAAGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAA
TAAAAAAAAACTACGAAAAAAAA*TTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGG
ATTCGCAAATAAAAGCGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAA
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ACCTTCGACAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAG
CCCAACAGCCAACCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAG
TTCCTCACACCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4EP08TF 685 0 0
TTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCTATTTGGATATTTATAAACAGAATCAAAAA
CCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCAATAATAATAATGAGA
CTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAATTTTAAAAAACTTAA
ACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAGTTTCCATTAAACTAAAAAGAATAAGG
GGAAGGAAGAAAGCGAATCGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAATTAGTCCTTCCCAAGG
GTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAATAAAAAAAAACTACG
AAAAAAAA*TTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGGATTCGCAAATAAAAG
CGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAAAGCCAAACTAAGCAA
TAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCGGGTTGTCTCGCGATACCTTCGACAGCTTG
ACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAGCCCAACAGCCAACCC
AGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAGTTCCTCACACCAAAA
TAAAGAAATAGTTAATGATACAATC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FB68JQ 700 0 0
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AAACAGAATCAAAAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCA
ATAATAATAATGAGACTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAA
TTTTAAAAAACTTAAACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAGTTTCCATTAAA
CTAAAAAGAATAAGGGGAAGGAAGAAAGCGAATAGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAAT
TAGTCCTTCCCAAGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAA
TAAAAAAAA*CTACGAAAAAAAAATTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGG
ATTCGCAAATAAAAGCGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAA
AGCCAAACTAAGCAATAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCGGGTTGTCTCGCGAT
ACCTTCGACAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAG
CCCAACAGCCAACCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAG
TTCCTCACACCAAAATAAAGAAATAGTTAATGATACAATC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4FB68TF 692 0 0
AGAAAATTTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCTATTTGGATATTTATAAACAGAA
TCAAAAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCAATAATAAT
AATGAGACTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAATTTTAAAA
AACTTAAACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAGTTTCCATTAAACTAAAAAG
AATAAGGGGAAGGAAGAAAGCGAATAGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAATTAGTCCTT
CCCAAGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAATAAAAAAA
A*CTACGAAAAAAAAATTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGGATTCGCAA
ATAAAAGCGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAAAGCCAAAC
TAAGCAATAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCGGGTTGTCTCGCGATACCTTCGA
CAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAGCCCAACAG
CCAACCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAGTTCCTCAC
ACCAAAATAAAGAAATAGTTAATGATACAATC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GB45JQ 700 0 0
CAATAAAAAGAAAATTTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCTATTTGGATATTTAT
AAACAGAGTCAAAAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCA
ATAATAATAATGAGACTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAA
TTTTAAAAAACTTAAACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAGTTTCCATTAAA
CTAAAAAGAATAAGGGGAAGGAAGAAAGCGAATCGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAAT
TAGTCCTTCCCAAGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAA
TAAAAAAAAACTACGAAAAAAAAATTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGG
ATTCGCAAATAAAAGCGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAA
AGCCAAACTAAGCAATAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCGGGTTGTCTCGCGAC
ACCTTCGACAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAG
CCCAACAGCCAACCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAG
TTCCTCACACCAAAATAAAGAAATAGTTAATGATACAATC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4GB45TF 688 0 0
AATTTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCTATTTGGATATTTATAAACAGAGTCAA
AAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCAATAATAATAATG
AGACTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAATTTTAAAAAACT
TAAACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAGTTTCCATTAAACTAAAAAGAATA
AGGGGAAGGAAGAAAGCGAATCGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAATTAGTCCTTCCCA
AGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAATAAAAAAAAACT
ACGAAAAAAAAATTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGGATTCGCAAATAA
AAGCGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAAAGCCAAACTAAG
CAATAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCGGGTTGTCTCGCGACACCTTCGACAGC
TTGACCCGCAGCTGTACCTTGACCAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAGCCCAACAGCCAA
CCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAGTTCCTCACACCA
AAATAAAGAAATAGTTAATGATACAATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4A936JQ 764 0 0
CAATAAAAAGAAAATTTCGTTTAATAATTTATAATTTAATTTACCTATTTGGATATTTAT
AAACAGAATCAAAAACCTATTCTATTTACAAATTTATTTTCCAAAAATTTTGAATTTTCA
ATAATAATAATGAGACTTAATTAGAATTAAGCTAGAATTTGAGACCAAGTTTTATATAAA
TTTTAAAAAACTTAAACCTCCTTTTTGCGCAACACTCCTTAAAAAAAAGTTTCCATTAAA
CTAAAAAGAATAAGGGGAAGGAAGAAAGCGAATCGATGTGTTAATTCCCCATCCTCAAAT
TAGTCCTTCCCAAGGGTTGTTGTCTCAATGAATAATTGTAGGAGTTAAATCTTGATAGAA
TAAAAAAAAACTACGAAAAAAAAATTCATAATTTTCTTATTTCTAGGATTAAACAAAAGG
ATTCGCAAATAAAAGCGCTAATGCTACAACCAGGCCATAAATTGTTAAAGCTTCCATAAA
AGCCAAACTAAGCAATAAAGTACCTCGTATTTTTCCTTCTGCCTCGGGTTGTCTCGCGAT
ACCTTCGACAGCTTGACCCGCAGCTGTACCTTGACTAACCCCAGGTCCAATAGAAGCAAG
CCCAACAGCCAACCCAGCAGCAATAACCGAAGCAGCAGAAACCAGTGGATTCATGATAAG
TTCCTCACACCAAAATAAAGAAATAGTTAATGATACAATCATCCAATGACTTAGGACTTA
ATTATAATTAAGTCATCGCTAAGATTCATCCAGCCAAAATAACC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 19

CO CL44Contig1 789 19 14 U
GGAGTGAAAAGGAAAGTGTCCTCCCTCCTATAGAAGAAAAAAAAACCGTGAAGAGTAAAG
GAGCCGGAGGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGC
TCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGA
GTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATG
GACAATCGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCA
GGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGC
ACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTC
GTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAG
TTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGG
GAGGTCTCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGAC
CAAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCAT
CACACATTTAAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGG
AATGTCAAACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTACCGGAATCCGAAAT
TCATGCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 
30 30 20 35 35 35 35 20 65 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 
85 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 65 95 95 95 95 95 95 80 80 95 95 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 65 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 45 95 95 95 90 40 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 40 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 70 70 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 35 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
30 30 30 30 30 

AF RR4EY33TF U 369
AF RR4FC32TF U 23
AF RR4EL54TF U 61
AF RR4DC66TF U 1
AF RR4H975TF U 60
AF RR4D507TF U 58
AF RR4FR42JQ C 118
AF RR4BZ30TF U 63
AF RR4FR42TF U 60
AF RR4D507JQ C 170
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AF RR4BZ30JQ C 70
AF RR4EL54JQ C 122
AF RR4AS88JQ C 69
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AF RR4AS88TF U 69
AF RR4AY77TF U 69
BS 1 69 RR4DC66TF
BS 70 70 RR4BZ30TF
BS 71 359 RR4DC66TF
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BS 689 689 RR4D507TF
BS 690 740 RR4DC66TF
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RD RR4EY33TF 170 0 0
ATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCAC
CAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTG
CAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAAC

QA 1 170 1 170
DS 

RD RR4FC32TF 519 0 0
GG
CTCCTATAGAAGAAAAAAAAACCGTGAAGAGTAAAGGAACCGGGGTCATCGCACACCTTG
TATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAA
GATCGCGTGCAAT**GTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAAATCCTCCCACTGG
ATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGATGTGACCGGAGCTCC
GGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCC
TATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACATCCACATATCTACAG
CAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAG
TTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGC
AGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGG

QA 3 519 3 519
DS 

RD RR4EL54TF 627 0 0
GG
GCCGGAG*CATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTC
CCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGT
GGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGA
CAATCGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGG
TTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGAAGTTTTTGTTCCTCCGGCAC
CGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGT
GGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTT
CACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGA
GGTCTCCTAAGGAGACGAGTTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCA
AGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCA
CACATTTAAATGTTTTCTTTGA*CT

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR4DC66TF 765 0 0
GGAGTGAAAAGGAAAGTGTCCTCCCTCCTATAGAAGAAAAAAAAACCGTGAAGAGTAAAG
GAGCCGGAG*CATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGC
TCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGA
GTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATG
GACAATCGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCA
GGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGT
ACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTC
GTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAG
TTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGG
GAGGTCTCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGAC
CAAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCAT
CACACATTTAAATGTTTTCTTTGA*CTTCTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGG
AATGTCAAACTCGCACTTCCAA*TAACTCAGAGAAGAGAA
CATTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4H975TF 683 0 0
GGAGCCGGAG*CATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTCCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCG
CTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCG
AGTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAAT
GGACAATCGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTC
AGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAACCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGG
CACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACT
CGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAA
GTTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACG
GGAGGTCTCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGA
CCAAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGT**AATCA
TCACACATTTAAATGTTTTCTTTGA*CTTCTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATG
GAATGTCAA*CTCGCACTTCCCA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4D507TF 712 0 0
GG
GGAGCCGGAG*CATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCG
CTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGGAAGAGCTTACCG
AGTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAAT
GGACAATTGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTC
AGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGG
CACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACT
CGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAA
GTTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGGATTGTAAGAACG
GGAGGTCCCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGA
CCAAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCA
TCACACATTTAAATGTTTCCTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTATCTATG
GAATGTCAAACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATT
GCCG

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR4FR42JQ 624 0 0
CGCTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGTTTAC
CGAGTGACAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAA
ATGGACAATTGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCT
TCAGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCC
GGCACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGA
CTCGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATC
AAGTTCACCCGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAA
CGGGAGGTCCCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAAC
GACCAATAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAAT
CATCACACACTTAAATGTTTCCTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTATCTA
TGGAATGTCAAACTCGCACTTCCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4BZ30TF 673 0 0
GGGGGG
GGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCAC
GCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAAAAAGAGCTTACCGAGTGGCAAT
TAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCG
ATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAAT
TTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCAC
ATCCACATATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCAC
CAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTG
CAAAGGAACGCCCCGCAAATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTC
CTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAA
ACTCGCA

QA 7 673 7 673
DS 

RD RR4FR42TF 682 0 0
GGAGCCGGAG*CATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCG
CTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGTTTACCG
AGTGACAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAAT
GGACAATTGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTC
AGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGG
CACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACT
CGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAA
GTTCACCCGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACG
GGAGGTCCCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGA
CCAATAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCA
TCACACACTTAAATGTTTCCTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTATCTATG
GAATGTCAAACTCGCACTTCCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4D507JQ 600 0 0
GAGCTTACCGAGTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAAT
CTTCAAAAATGGACAATTGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACT
TACCAGCTTCAGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTT
GTTCCTCCGGCACCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATT
CTATATGACTCGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTTTGCATCAGCATTCTCTCC
ATGCTATCAAGTTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGGAT
TGTAAGAACGGGAGGTCCCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA
**TGCAACGACCAAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAA
TGTCGAATCATCACACATTTAAATGTTTCCTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACT
TTTATCTATGGAATGTCAAACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATT
GCCG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4FC32JQ 680 0 0
CTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGC
GTGCAAT**GTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAG
GCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGATGTGACCGGAGCTCCGGGGAC
GCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGA
AGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACATCCACATATCTACAGCAATGG
ACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGT
CTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAA
TGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTT
CCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGA
AGATGATGACACTTGAAAATGTCTAATCATCACACATTCAAATGTTTTCTTTGA*CTTGT
TGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAAACTCGCACTTCCCAATAACTCA
GAGAAGAGAAACATTACC
AG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4BZ30JQ 701 0 0
GCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACG
CAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATT
AAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGA
TGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTTTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATT
TCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACA
TCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACC
AGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGC
AAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCC
TAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAAG
CCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATTT
AAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAAA
CTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTACCG
T

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4EL54JQ 620 0 0
CCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAG
TGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGG
ACAATCGATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAG
GTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGAAGTTTTTGTTCCTCCGGCA
CCGTCACATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCG
TGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGT
TCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGG
AGGTCTCCTAAGGAGACGAGTTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACC
AAGAGAAGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATC
ACACATTTAAATGTTTTCTTTGA*CTTCTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGA
ATGTCAAACTCGCACTTCCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4AS88JQ 721 0 0
GGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCAC
GCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAAT
TAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCG
ATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAAT
TTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCAC
ATCCACATATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCAC
CAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTG
CAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTC
CTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCC*TCTATCGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAA
ACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTACCGGAATCCGAAATTCATGCAC
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4DC66JQ 661 0 0
CGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAA
TTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATC
GATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAA
TTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGTACCGTCA
CATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCA
CCAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCT
GCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCT
CCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGA
AGCCCCC*TCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACAT
TTAAATGTTTTCTTTGA*CTTCTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCA
AACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTGCCGGAATCCGAAGTTCAT
ATAC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4BC22TF 707 0 0
GG
CTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCAAGGCTTTAAGCAAGATC
GCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAAATCCTCCCACTGGATTT
AGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATTGATGTGACCGGAGCTCCGGGG
ACGCTCTACGCAAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTCCCGTTAATTACCCTATG
GAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACATCCACATATTTACAGCAAT
GGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACCAGCAATGACTGTGAGTTCG
GTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAAAGGAACGCCCCGCAGAT
AATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCCTAAGGAGACGAGGTGGTGG
TTCCATGACGACAAGGCTTGAGATGCAACGACCAAGAGAAGCCCCCCTCTATTGTAATAT
GAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATTTAAATGTTTTCTTTGA*CTT
GTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAAACTCGCACTTCCCAATAACT
CAGAGAAGAGAAACATTACCGGAATCCGAAATTCAT
ACATACTTT

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR4AY77JQ 721 0 0
GGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCAC
GCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAAT
TAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCG
ATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAAT
TTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCAC
ATCCACATATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCAC
CAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTG
CAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTC
CTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCC*TCTATCGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAA
ACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTACCGGAATCCGAAATTCATGCAC
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AS88TF 721 0 0
GGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCAC
GCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAAT
TAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCG
ATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAAT
TTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCAC
ATCCACATATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCAC
CAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTG
CAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTC
CTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCC*TCTATCGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAA
ACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTACCGGAATCCGAAATTCATGCAC
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AY77TF 721 0 0
GGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCAC
GCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAAT
TAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCG
ATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTACGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAAT
TTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCAC
ATCCACATATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCAC
CAGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTG
CAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTC
CTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGA**TGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCC*TCTATCGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTTCTTTGA*CTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAA
ACTCGCACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTACCGGAATCCGAAATTCATGCAC
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 13

CO CL45Contig1 941 10 12 U
GGGAGGTCTCTCCCTCTCTCTCCCCTCTCGTCCGACGAAGAAGATCGCTGAGAGATTACT
ACCGCCGGATTTCCGTTTTACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGTTGGAGATCGATCTAGA
ACCATGAATCCCGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGGGTT
GGCAAATCTTGCTTGCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGT
ACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTC
CAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGA
GGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACCGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTC
AAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTT
GGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTT
GCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAA
GAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGA
GGTGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGT
TGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAGTCTATTTGGATCATAACACACCATTATAA
TCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTCCAATTGACAACTTTCTTTTCCTTCCGTTT
TATAGCTTTTCTCTTCTTTTTCTGATGTATTTCGAAGTTTGAAACCCATAAATTCTATAG
TGAAAGACCATTTATGCAAATAAAGCAGACAAACCTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 35 35 
35 35 0 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 15 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ30TF U 47
AF RR4EN41TF U 1
AF RR4FM93TF U 2
AF RR4DG86TF U 63
AF RR4CD43JQ C 142
AF RR4HA47TF U 307
AF RR4FM93JQ C 477
AF RR4EN41JQ C 233
AF RR4HA47JQB C 387
AF RR4DG86JQ C 277
BS 1 285 RR4EN41TF
BS 286 286 RR4CQ30TF
BS 287 661 RR4EN41TF
BS 662 662 RR4FM93TF
BS 663 675 RR4EN41TF
BS 676 701 RR4FM93TF
BS 702 712 RR4DG86TF
BS 713 750 RR4HA47TF
BS 751 758 RR4CD43JQ
BS 759 822 RR4EN41JQ
BS 823 823 RR4FM93JQ
BS 824 941 RR4EN41JQ

RD RR4CQ30TF 314 0 0
GCTGAGAGATTACTACCGCCGGATTTCCGTTT*ACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGTTG
GAGATCGATCTACAACCATGAATCCCGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTG
GTGACTCTGGT*TTGGTAAATCTTGCTTGCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGG
ATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGACGGAA
AGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCA
GTAGCTACTACAGA

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR4EN41TF 675 0 0
GGGAGGTCTCTCCCTCTCTCTCCCCTCTCGTCCGACGAAGAAGATCGCTGAGAGATTACT
ACCGCCGGATTTCCGTTTTACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGTTGGAGATCGATCTAGA
ACCATGAATCCCGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGGGTT
GGCAAATCTTGCTTGCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGT
ACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAGAGACAATCAAACTC
CAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGA
GGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACCGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTC
AAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTT
GGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTT
GCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAA
GAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGA
G*TGCCAAGCCACCG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4FM93TF 700 0 0
GGAGGTCTCTCCCTCTC
TCTCCCCTCTCGTCCGACGAAGAAGATCGCTGAGAGATTACTACCGCCGGATTTCCGTTT
TACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGTTGGAGATCGATCTAGAACCATGAATCCCGAATAT
GACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGGGTTGGCAAATTTTGCTTGCTT
CTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGACTTT
AAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCA
GGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATT
GTCACCTATGACGTCACCGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAA
ATCGACCGTTATGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTC
ACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATC
CCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGACCATG
ACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCCAAGCCACCGACG
GTCAATATTCGCGGACAGCCAGT

QA 18 700 18 700
DS 

RD RR4DG86TF 650 0 0
G
GCCGGATTTCCGTTTTACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGTTGGAGATCGATCTAGAACC
ATGAATCCCGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGGGTTGGC
AAATCTTGCTTGCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACC
ATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAG
ATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGA
GCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACCGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAA
CAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGG
AACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTTGCA
GATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAA
GCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGT
GCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAAT

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4CD43JQ 617 0 0
TATCTGTTCAAGCTT**GCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGTAAATCTTGCTTGCTTCTA
AGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGACTTTAAA
ATCCGCACAGTTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGC
CAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATTGTC
ACCTATGACGTCACGGACCAAGAGGGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATC
GACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACA
TCGCGGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCT
TTCTTGGAAACAAGTGCCAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACT
GCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCCAAGCCACCGACGGTC
AATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCTTCTTGATTCTATTAG
TCTCAAGAAGTCTATTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4HA47TF 444 0 0
TGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCTCCAGTAGCTACTACAGAGGAGCT
CATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACGGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAA
TGGCTGAATGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAAC
AAAAACGATCTCACATCGCAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTTGCAGAT
GAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCCAAAA*TGCAACCAATGTTGAAGAAGCT
TTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCC
AAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCA
TCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAA

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR4FM93JQ 394 0 0
GGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGC
TTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGT
TGAAGAAGCTTTCATGACCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGC
TGGAGGTGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGG
CTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAGTCTATTTGGATCATAACACACCATT
ATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTCCAATTGACAACTTTCTTT**CTTCC
GTTTTATAGCTTTTCTCTTCTTTTTCTGATGTAT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4EN41JQ 709 0 0
ACATCAGTACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAGAGACAA
TCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCT
ACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACCGACCAAGAGAGCTTCA
ACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATGCCAGTGAGAATGTGAACAAGC
TACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTC
AGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCA
ATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAAC
CAGCTGGAGGTGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAAT
CAGGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAGTCTATTTGGATCATAACACAC
CATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTCCAATTGACAACATTCTTTTCC
TTCCGTTTTATAGCTTTTCTCTTCTTTTTCTGATGTATTTCGAAGTTTGAAACCCATAAA
TTCTATAGTGAAAGACCATTTATGCAAATAAAGCAGACAAACCTTTTTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4HA47JQB 531 0 0
TGACGTCACGGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATCGACCG
TTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACATCGCA
GAAGGTTGTATCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTT
GGAAACAAGTGCCAAAA*TGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGC
TATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCCAAGCCACCGACGGTCAATAT
TCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCA
AGAAGTCTATTTGGATCATAACACACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCAGGTAAGAC
TTCTCCAATTGACAACTTTCTTTTCCTTCCGTTTTATAGCTTTTCTCTTCTTTTTCTGAT
GTATTTCGAAGTTTGAAACCCATAAATTCTATAGTGAAAGACCATTTAT
AC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4DG86JQ 641 0 0
CAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGG
ACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACC
GACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATGCCAGT
GAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTA
TCCACTGAAACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGT
GCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACC
AGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAG
CCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAGTCTAT
TTGGATCATAACACACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTCCAATT
GACAACTTTTTTTTCCTTCCGTTTTATAGCTTTTTTCTTCTTTTTCTGATGTATTTCGAA
GTTTGAAACCCATAAATTCTATAGTGAAAGACCATTTAT
GC

QA 1 639 1 639
DS 



CO CL45Contig2 622 3 2 U
GGACACAGCAGGCCAAGAGCGTTTCAGGACAATCACAAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCA
TGGCATCATTGTCACCTATGATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAGTG
GCTGAATGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAA
AAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGA
ACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCCTT
CATGGCCATGACTGCTGCAATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCATCTGGAGGTGCCAA
GCCACCGACTGTCCAGATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGCTGCTCATC
TTGATTCCCATTAGTTGTCTCAACAAGTTTCTTTGGATCATTACAACAACCATTATAATC
ATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTACAATTGACAACTCGTTGAATCCGTTCTTTTC
TTTTGTTTTTTTCATAGCTTTGCTATTCTTTTCTGATGTATTTTGAAAACTCATACATTC
TCTAGTAAAAGGCCCTTCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4F183JQ C 1
AF RR4DW34TF U 107
AF RR4E496TF U 110
BS 1 107 RR4F183JQ
BS 108 622 RR4DW34TF

RD RR4F183JQ 547 0 0
GGACACAGCAGGCCAAGAGCGTTTCAGGACAATCACAAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCA
TGGCATCATTGTCACCTATGATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAGCAATG
GCTGAACGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAA
AAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTTTCCACTGAGACTGCTCAGGCTTTTGCAGATGA
ACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCCTT
CATGGCCATGACTGCTGCTATCAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCATCTGGAGGTGCCAA
GCCACCGACTGTCCAGATTCGTGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGCTGCTCATC
TTGATTCCCATTAGTCGTCTCAACAAGTCTCTTTGGATCATTACAACAACCATTATAATC
ATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTACAATTGACAACTCGTTGAATCC
TTTTCTTTTGTTTTTG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4DW34TF 516 0 0
G
ACGTCAAACAGTGGCTGAATGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTAC
TGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAGACAGCTCAGG
CTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATG
TTGAAGAAGCCTTCATGGCCATGACTGCTGCAATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAT
CTGGAGGTGCCAAGCCACCGACTGTCCAGATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAG
GCTGCTGCTCATCTTGATTCCCATTAGTTGTCTCAACAAGTTTCTTTGGATCATTACAAC
AACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTACAATTGACAACTCGTTGA
ATCCGTTCTTTTCTTTTGTTTTTTTCATAGCTTTGCTATTCTTTTCTGATGTATTTTGAA
AACTCATACATTCTCTAGTAAAAGGCCCTTCCATG

QA 2 516 2 516
DS 

RD RR4E496TF 512 0 0
GTCAAACAGTGGCTGAATGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTG
GTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAGACAGCTCAGGCT
TTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTT
GAAGAAGCCTTCATGGCCATGACTGCTGCAATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCATCT
GGAGGTGCCAAGCCACCGACTGTCCAGATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGC
TGCTGCTCATCTTGATTCCCATTAGTTGTCTCAACAAGTTTCTTTGGATCATTACAACAA
CCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTACAATTGACAACTCGTTGAAT
CCGTTCTTTTCTTTTGTTTTTTTCATAGCTTTGCTATTCTTTTCTGATGTATTTTGAAAA
CTCATACATTCTCTAGTAAAAGGCCCTTCCAT

QA 1 512 1 512
DS 



AS 3 13

CO CL46Contig1 891 4 14 U
AGGAGAAGAACCAAAGCGCACACCGAAAAACATAAATGTAACAATGTAAGAGCGAATAAT
CTCATTTGCCAAACCCGATTAACCAAAGACAAGTACTGAGTCTCCCCAAATCAGTCATTA
CATTGATAACAAAGCTTTATGGACCTGAAGATCTTTTTCTTTAACAACAAAATGGAAGAG
ACGAGCAATGAGTAAAAGTCCATCTTACACGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAG
AGTCTGGTTGATGAGTTGAAGAGAAGGAATCTCTTTGCAGGGTGCAGTTTCTTTGGCTTT
CTGGAACACAACAAACCCTTCCTTCACTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGT
CAAGAGTTCTTGATCAGAAGAGAAGAGCAACATCTGCTTGGCATCGCTGATAGAGACATA
ATCATAAGCTTTCTCGCTGCATCCAGCTATTTCATCTCTAATGGTCTTCGCCAAGAGGTC
CATGAAATAGACGTAAGTAGCATCAGGTGCGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATA
GGCACCTTCCATGAAGGACTGCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTCTCCAG
AGTAGCAGAGGAGAGCAGCTCGAGCTCGGTGTGGAACTCAGCAATTCTGTTTTGAACAAG
GAGCCTGAGAAGGTTGAGACCAAGGATAAGATTCTCCTGGGGAGATGGTGGAAGACGGTC
CCTGGCATCGACATAGTAGGGTTTGAGCTGGAAGAAATCTCTCTCGAAAGCGTCTTGATC
CTCGGTTTTGACACTTAGAACAACAGCGTGCTCGTAGATATCCCTTGCAAGAGTGAGCTC
GTGAGCAGCATTTGGAGTATTCTCTCTTTTCCCGAACTGGCTTGATTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H582JQB U 40
AF RR4D988JQ U 1
AF RR4AU43JQ U 68
AF RR4AU43TF C 86
BS 1 58 RR4D988JQ
BS 59 59 RR4H582JQB
BS 60 179 RR4D988JQ
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BS 181 239 RR4D988JQ
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BS 263 263 RR4AU43JQ
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BS 278 376 RR4D988JQ
BS 377 891 RR4AU43JQ

RD RR4H582JQB 194 0 0
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CAGCTCTCTGGCGT

QA 1 194 1 194
DS 

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CATTGATAACAAAGCTTTATGGACCTGAAGATCTTTTTCTTTAACAACAAAATGGAAGAA
ACGAGCAATGAGTAAAAGTCCATCTTACACGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAA
AGTCTGGTTGATGAGTTGAAAAAAAGGAATCTCTTTACAGGGTGCAGTTTCTTTGGCTTT
CTGGAACACAACAAACCCTTCCTTCACTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGT
CAAGAGTTCTTGATCA
AAA

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR4AU43JQ 824 0 0
A
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ACAAAGCTTTATGGACCTGAAGATCTTTTTCTTTAACAACAAAATGGAAGAGACGAGCAA
TGAGTAAAAGTCCATCTTACACGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAGAGTCTGGT
TGATGAGTTGAAGAGAAGGAATCTCTTTGCAGGGTGCAGTTTCTTTGGCTTTCTGGAACA
CAACAAACCCTTCCTTCACTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGTCAAGAGTT
CTTGATCAGAAGAGAAGAGCAACATCTGCTTGGCATCGCTGATAGAGACATAATCATAAG
CTTTCTCGCTGCATCCAGCTATTTCATCTCTAATGGTCTTCGCCAAGAGGTCCATGAAAT
AGACGTAAGTAGCATCAGGTGCGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATAGGCACCTT
CCATGAAGGACTGCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTCTCCAGAGTAGCAG
AGGAGAGCAGCTCGAGCTCGGTGTGGAACTCAGCAATTCTGTTTTGAACAAGGAGCCTGA
GAAGGTTGAGACCAAGGATAAGATTCTCCTGGGGAGATGGTGGAAGACGGTCCCTGGCAT
CGACATAGTAGGGTTTGAGCTGGAAGAAATCTCTCTCGAAAGCGTCTTGATCCTCGGTTT
TGACACTTAGAACAACAGCGTGCTCGTAGATATCCCTTGCAAGAGTGAGCTCGTGAGCAG
CATTTGGAGTATTCTCTCTTTTCCCGAACTGGCTTGATTGCCC

QA 2 824 2 824
DS 

RD RR4AU43TF 806 0 0
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TGAAGATCTTTTTCTTTAACAACAAAATGGAAGAGACGAGCAATGAGTAAAAGTCCATCT
TACACGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAGAGTCTGGTTGATGAGTTGAAGAGAA
GGAATCTCTTTGCAGGGTGCAGTTTCTTTGGCTTTCTGGAACACAACAAACCCTTCCTTC
ACTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGTCAAGAGTTCTTGATCAGAAGAGAAG
AGCAACATCTGCTTGGCATCGCTGATAGAGACATAATCATAAGCTTTCTCGCTGCATCCA
GCTATTTCATCTCTAATGGTCTTCGCCAAGAGGTCCATGAAATAGACGTAAGTAGCATCA
GGTGCGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATAGGCACCTTCCATGAAGGACTGCTCA
AGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTCTCCAGAGTAGCAGAGGAGAGCAGCTCGAGC
TCGGTGTGGAACTCAGCAATTCTGTTTTGAACAAGGAGCCTGAGAAGGTTGAGACCAAGG
ATAAGATTCTCCTGGGGAGATGGTGGAAGACGGTCCCTGGCATCGACATAGTAGGGTTTG
AGCTGGAAGAAATCTCTCTCGAAAGCGTCTTGATCCTCGGTTTTGACACTTAGAACAACA
GCGTGCTCGTAGATATCCCTTGCAAGAGTGAGCTCGTGAGCAGCATTTGGAGTATTCTCT
CTTTTCCCGAACTGGCTTGATTGCCC

QA 1 806 1 806
DS 



CO CL46Contig2 1067 4 33 U
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GATCCACAGCTCACAGAAGTATCGCAGCAGTTGGAGAGGTTCAAGGCGGCGTTTGTTAGG
AAGGATTACAGTACCTGCTCTGATCTATTGTCTCGGCTTAAGGTTCTTCTGACGAAATTC
ACAAGCCTTCCTCCATTGTTTGAGAATACTCCAAATGCTGCTCACGAGCTCACTCTTGCA
AGGGATATCTACGAGCACGCTGTTGTTCTAAGTGTCAAAACCGAGGATCAAGACGCTTTC
GAGAGAGATTTCTTCCAGCTCAAACCCTACTATGTCGATGCCAGGAACGGTCTTCCACCG
TCTCCACAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTAAACCTCCTGAGGCTGCTTGTTCAAAACAGA
ATTGCTGAATTCCACACCGAGCTCGAGCTGCTCTCCTCTGCTACTCTGGAGAATCCTTGC
ATCAAGCATGCCGTTGAGCTTGAGCAGTCCTTCATGGAAGGTGCTTATAACCGTGTGCTC
AGTGCTAGACAGACCGCACCTGATGCCACTTACGTCTATTTCATGGATCTCTTGGCGAAG
ACCATTAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGATTATGTCTCTATCAGC
GATGCTCGGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTGATCAAGAACTCTTGACCTATGTCAATGAG
GAGCACCCTGAGTGGGAAGTGAAGGAAGGGTTTGTTGTGTTCCAGAAAGCCAAAGAAACT
GCACCTTGCAAAGAGATTCCGTCTCTTCAACTCATCAACCAGACTTTAAGCTACGCCAGA
GAGCTGGAGCGTATCGTGTAAGAGGTGGACTTTTACTAATTGCTCGTCTCTTCCATTTTG
TTGTTAAAGAAAAAGATCTTCAGGTCATAAAAAGCTTTGTTATCAATGTAATGACTGATT
TGGAGAGACTCAGTACTTGTCTTTGGTTAATCGGGTTTGGCAAATGAGATTATTCGCTCT
TACATTGTTACATTTATGTTCTTCGGTGTGCGCTTTGGTTCTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D988TF U 1
AF RR4H582TF U 4
AF RR4AL13TF U 17
AF RR4DZ75JQ C 345
BS 1 345 RR4D988TF
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BS 367 389 RR4D988TF
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BS 744 787 RR4AL13TF
BS 788 1067 RR4DZ75JQ

RD RR4D988TF 743 0 0
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GATCCACAGCTCACAGAAGTATCGCAGCAGTTGGAGAGGTTCAAGGCGGCGTTTGTTAGG
AAGGATTACAGTACCTGCTCTGATCTATTGTCTCGGCTTAAGGTTCTTCTGACGAAATTC
ACAAGCCTTCCTCCATTGTTTGAGAATACTCCAAATGCTGCTCACGAGCTCACTCTTGCA
AGGGATATCTACGAGCACGCTGTTGTTCTAAGTGTCAAAACCGAGGATCAAGACGCTTTC
GAGAGAGATTTCTTCCAGCTCAAACCCTACTATGTCGATGCCAGGGACCGTCTTCCACCA
TCTCCCCAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTCAACCTTCTCAGGCTCCTTGTTCAAAACAGA
ATTGCTGAGTTCCACACCGAGCTCGAGCTGCTCTCCTCTGCTACTCTGGAGAATCCTTGC
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AGTGCTAGGCAGACCGCACCTGATGCTACTTACGTCTATTTCATGGACCTCTTGGCGAAG
ACCATTAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGATTATGTCTCTATCAGC
GATGCCAAGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTGATCAAGAACTCTTGACCTATGTCAATGAG
*AGCACCCTGAGTGGGAAGTGAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4H582TF 739 0 0
GG
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TATCTACGAGCACGCTGTTGTTCTAAGTGTCAAAACCGAGGATCAAGACGCTTTCGAGAG
AGATTTCTTCCAGCTCAAACCCTACTATGTCGATGCCAGGGACCGTCTTCCACCATCTCC
CCAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTCAACCTTCTCAGGCTCCTTGTTCAAAACAGAATTGC
TGAGTTCCACTCCGAGCTCGAGCTGCTCTCCTCTGCTACTCTGGAGAATCCTTGCATCAA
GCATGCCGTTGAGCTTGAGCAGTCCTTCATGGAAGGTGCCTATAACCGTGTGCTCAGTGC
TAGGCAGACCGCACCTGATGCTACTTACGTCTATTTCATGGACCTCTTGGCGAAGACCAT
TAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGATTATGTCTCTATCAGCGATGC
CAAGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTGATCAAGAACTCTTGACCTATGTCAATGAG*AGCA
CCCTGAGTGGGAAGTGA

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR4AL13TF 771 0 0
GGAAAAAAAAAAGAT
AATCGTCGCCGGAAAAGAAGAAAGGAATGGATCCGCAGCTCACAGAAGTATCGCAGCAGT
TGGAGAGATTCAAGGCGGCGTTTGTTAGGAAGGATTACAATACCTGCTCTGATCTATTGT
CTCGGCTTAAGGTTCTTCTGACGAAATTCACAAGCCTTCCTCCATTGTTTGAGAATACTC
CAAATGCTGCTCACGAGCTCACTCTTGCAAGGGATATTTACGAGCACGCTGTTGTTCTAA
GCGTTAAAACTGAGGATCAAGACGCTTTCGAGAGAGATTTCTTCCAGCTCAAACCCTACT
ATGTCGATGCCAGGAACGGTCTTCCACCGTCTCCACAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTAA
ACCTCCTGAGGCTGCTTGTTCAAAACAGAATTGCTGAATTCCACACCGAGCTCGAGCTGC
TCTCCTCTGCTACTCTGGAGAATCCTTGCATCAAGCATGCCGTTGAGCTTGAGCAGTCCT
TCATGGAAGGTGCTTATAACCGTGAGCTCAGTGCTAGACAGACCGCACCTGATGCCACTT
ACGTCTATTTCATGGATCTCTTGGCGAAGACCATTAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCG
AGAAAGCTTATGATTATGTCTCTATCAGCGATGCTCGGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTG
ATCAAGAACTCTTGACCTATGTCAATGAGGAGCACCCTGAGTGGGAAGTGAAGGAAGGGT
TTGTTGTGTTCCAGAAAGCCAAAGAAACTGCACCTT

QA 16 771 16 771
DS 

RD RR4DZ75JQ 723 0 0
GAACGGTCTTCCACCGTCTCCACAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTAAACCTCCTGAGGCT
GCTTGTTCAAAACAGAATTGCTGAATTCCACACCGAGCTCGAGCTGCTCTCCTCTGCTAC
TCTGGAGAATCCTTGCATCAAGCATGCCGTTGAGCTTGAGCAGTCCTTCATGGAAGGTGC
TTATAACCGTGTGCTCAGTGCTAGACAGACCGCACCTGATGCCACTTACGTCTATTTCAT
GGATCTCTTGGCGAAGACCATTAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGA
TTATGTCTCTATCAGCGATGCTCGGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTGATCAAGAACTCTT
GACCTATGTCAATGAGGAGCACCCTGAGTGGGAAGTGAAGGAAGGGTTTGTTGTGTTCCA
GAAAGCCAAAGAAACTGCACCTTGCAAAGAGATTCCGTCTCTTCAACTCATCAACCAGAC
TTTAAGCTACGCCAGAGAGCTGGAGCGTATCGTGTAAGAGGTGGACTTTTACTAATTGCT
CGTCTCTTCCATTTTGTTGTTAAAGAAAAAGATCTTCAGGTCATAAAAAGCTTTGTTATC
AATGTAATGACTGATTTGGAGAGACTCAGTACTTGTCTTTGGTTAATCGGGTTTGGCAAA
TGAGATTATTCGCTCTTACATTGTTACATTTATGTTCTTCGGTGTGCGCTTTGGTTCTTT
CCG

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL46Contig3 957 5 6 U
AAATCCAATTATCTGAATAATCACTTCTTTGAGAAATACAGAGTCCATTACATGATAAAA
AAAGTTTTATGATCCGAAGATTGTCTTTCCAGAAACAAATTGGAAGTGACGCGTGATGGC
GATCTTACACGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAGAGTCTGGTTGATGAGTTGAA
GAGAGGGAATCTCTTTGCAAGGTGCAGTTTCTTTGGCTTTCTGGAACACAACAAACCCTT
CCTTCACTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGTCAAGAGTTCCTGATCAGAAG
AGAAGAGCAACATCTGCTTGGCATCGCTGATGGAGACATAATCATAAGCTTTCTCGCTGC
ATCCAGCTATTTCATCTCTAATGGTCTTTGCCAAGAGGTCCATGAAATAAACGTAAGTAG
CATCAGGTGCGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATAGGCACCTTCCATGAAGGACT
GCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTGTCCAGAGTAGCAGAGGAGAGTAACT
CGAGCTCGGTGTGGAATTCAGCAATTCGGTTTTGCACAAGCAGCCTGAGGAGATTGAGAC
CAAGGATAAGATTCTCCTGTGGGGATGATGGAAGACGGTTCCTGGCATCGACATAGTAAG
GTTTGAGCTGGAAGAAATCTCTCTCGAAAGCGTCTTGATCCTCAGTTTTAACGCTTAGAA
CAACAGCGTGCTCATAGATATCCCTTGCAAGAGTGAGCTCCTGAGCTGCATTAGGTGTGT
TCTCAAACAACGGAGGAAGACTTGTGAATTTCGTCAGAAGAACCTTAAGCCGGGACAAGA
GATCACTGCAGGTACTGTAATCTTTCCTCACAAACGCTGCCTTGAACCTCTCCAACTGCT
GCGATACTTCCGTTAACTGCGGATCCATCTTCTCTTTTTTCCGGCGACGATTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4ER35TF C 259
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TGT

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GA
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CGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAAAGTCTGGTTGATGAGTTGAAGAGACGGAA
TCTCTTTGCAAGGTGCAGTTTCTTTGGCTTTCTGGAACACAACAAACCCTTCCTTCACTT
CCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGTCAAGAGTTCCTGATCAGAAGAGAAGAGCA
ACATCTGCTTGGCATCGCTGATGGAGACATAATCATAAGCTTTCTCGCTGCATCCAGCTA
TTTCATCTCTAATGGTCTTTGCCAAGAGGTCCATGAAATAAACGTAAGTAGCATCAGGTG
CGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATAGGCACCTTCCATGAAGGACTGCTCAAGTT
CAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTCTCCAGAGTAGCAGAGGAGAGTAACTCGAGCTCGG
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QA 3 839 3 839
DS 

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TGGCATCGCTGATAGAGACATAATCATAAGCTTTCTCGCTGCATCCAGCTATTTCATCTC
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GCTTGATGCAAGGATTGTCCAGAGTAGCAGAGGAGAGTAACTCGAGCTCGGTGTGGAATT
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GTGGGGATGGTGGAAGACGGTTCCTGGCATCGACATAGTAAGGTTTGAGCTGGAAGAAAT
CTCTCTCGAAAGCGTCTTGATCCTCGGTTTTGACACTTAGAACAACAGCGTGCTCATAGA
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AATCTTTCCTCACAAACGCTGCCTTGAACCTCTCCAACTGCTGCGATACTTCCGTTAGCT
GCGG

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TAAGTAGCATCAGGTGCGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATAGGCACCTTCCATG
AAGGACTGCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTGTCCAGAGTAGCAGAGGAG
AGTAACTCGAGCTCGGTGTGGAATTCAGCAATTCGGTTTTGCACAAGCAGCCTGAGGAGA
TTGAGACCAAGGATAAGATTCTCCTGTGGGGATGATGGAAGACGGTTCCTGGCATCGACA
TAGTAAGGTTTGAGCTGGAAGAAATCTCTCTCGAAAGCGTCTTGATCCTCAGTTTTAACG
CTTAGAACAACAGCGTGCTCATAGATATCCCTTGCAAGAGTGAGCTCCTGAGCTGCATTA
GGTGTCTTCTCAAACAACGGAGGAAGACATGTGAATTTCGTCAGAAGAACCTTAAGCCGG
GACAAGAGATCACTGCAGGTACTGTAATCTTTCCTCACAAACGCTGCCTTGAACCTCTCC
AACTGCTGCGATACTTCCGTTAACTGCGGATCCATCTTCTCTTTTTTCCGGCGACGATTC
TCCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 16

CO CL47Contig1 916 14 12 U
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CTCGGTTAGTGAAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTAC
AAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACT
GTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
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GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
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AATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCC*ATTT
AAATAAGTTTTCCTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTTCCTTTGGCGTATTTATT
TGTAAGCGTCATACGTTATTTTGTACCATAGATACATCAAAATGTTATTTTGCTTACGTC
TCTGGACCCGGGTGTA


BQ
30 30 30 30 30 35 35 35 45 45 45 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 60 
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70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 30 65 40 30 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS50TF U 12
AF RR4H860TF U 1
AF RR4D207TF U 7
AF RR4AU20JQ C 1
AF RR4A896TF U 7
AF RR4AU20TF U 1
AF RR4AV30TF U 6
AF RR4AW34TF U 1
AF RR4AW34JQ C 644
AF RR4H860JQB C 153
AF RR4AV30JQ C 13
AF RR4AS50JQ C 60
AF RR4C808TF U 231
AF RR4CB50TF U 133
BS 1 549 RR4H860TF
BS 550 550 RR4A896TF
BS 551 614 RR4H860TF
BS 615 615 RR4A896TF
BS 616 734 RR4H860TF
BS 735 822 RR4A896TF
BS 823 823 RR4C808TF
BS 824 837 RR4AU20TF
BS 838 851 RR4C808TF
BS 852 866 RR4CB50TF
BS 867 867 RR4AV30JQ
BS 868 916 RR4CB50TF

RD RR4AS50TF 448 0 0
GTCGTCTCGCATCTCGTGTATCTCTTAAGCTTCTCTCTCTCTCATATCTCTCGGTTAGTG
AAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGATGAG
GATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTACAAGCTCAAGCT
CGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAA
GAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAG
GCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGACAG
AGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGC
TGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4H860TF 734 0 0
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CTCGGTTAGTGAAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTAC
AAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACT
GTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
CTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACACGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAAGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCT
GCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGTG
AATGTTTTGATTGT

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DS 

RD RR4D207TF 753 0 0
GG
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GTGAAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGAT
GAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTACAAGCTCAA
GCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTA
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GAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGA
CAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGA
TGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAATGCAGCTGA
AATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCAC
ATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACATCGC
TGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGTGAT
GCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGTGAATGTTTT
GATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAA
C

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR4AU20JQ 835 0 0
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CTCGGTTAGTGAAAGATGGGGTCGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTAC
AAGCTTAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTG*AAACT
GTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
CTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCT
GCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGGACCTTTTTGCATATTGGGTATGTG
AATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCCTATTT
AAATAAGTTTTCCTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTTCCTTTGGCGTAT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4A896TF 816 0 0
GG
GTCGTCGTCTCGCATCTCGCGTATCTCTTAAGCTTCTCTCTCTCTCAGATCTCTCGGTTA
GTGGAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGAT
GAGGATTCTGGTGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTACAAGCTCAA
GCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTA
CAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCCTTGTG
GAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGA
CAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGA
TGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAATGCAGCTGA
AATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCAC
ATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACATCGC
TGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGTGAT
GCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGTGAATGTTTT
GATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCC*ATTTAAATAAGT
TTTCCTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTT

QA 3 816 3 816
DS 

RD RR4AU20TF 837 0 0
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CTCGGTTAGTGAAAGATGGGGTCGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTAC
AAGCTTAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTG*AAACT
GTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
CTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCT
GCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGGACCTTTTTGCATATTGGGTATGTG
AATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGACC***ATTT
AAATAAGTTTTCCTGTATTTG**TTGAATATGAATGTTATTT*CCTTTGGCGTATTT

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DS 

RD RR4AV30TF 807 0 0
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GATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTACAAGCT
CAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGA
GTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCCTT
GTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAG
AGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCG
TGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAATGCAGC
TGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAG
CACATGCGCCACTTCGGTTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACAT
CGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGT
GATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGTGAATGT
TTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGACC***ATTTAAATA
AGTTTTCCTGTATTT
GTTGAATATGAA

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DS 

RD RR4AW34TF 808 0 0
GGGGTTTCGTCGTCGTCTCGCATCTCGCGTATCTCTTAAGCTTCTCTCTCTCTCAGATCT
CTCGGTTAGTGAAAGATGGGGTCGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTAC
AAGCTTAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTG*AAACT
GTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
CTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCT
GCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGGACCTTTTTGCATATTGGGTATGTG
AATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGA*GACCC**ATTT
AAATAAGTTTTCCTGTATTT
GTTTGATA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4AW34JQ 183 0 0
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TGCATATTGGGTATGTGAATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTA
CTAGAAGAACCC*ATTTAAATAAGTTTTCCTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTT
CCT

QA 1 183 1 183
DS 

RD RR4H860JQB 681 0 0
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CCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTG
GGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCA
GGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGA
ACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAA
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CTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACACGCGCCACTTCGGGTGAAGGACT
GTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGT
TGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATTTGCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTAT
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TCTAAAACTTACTAGAAGAACCC*ATTTAAATAAGTTTTCCTGTATTTTGTTTGAATATG
AATGTTATTTTCCTTTGGCGT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4AV30JQ 880 0 0
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AAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGATGAGG
ATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACTATTCTCTACAAGCTCAAGCTC
GGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAG
AACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGG
CACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGACAGA
GTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGCT
GTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAATGCAGCTGAAATC
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AAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGTGATGCAA
GAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGTGAATGTTTTGATT
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CTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTTCCTTTGGCGTATTTATTTGTAAGCGTCAT
ACGTTATTTTGTACCATAGATACATCAAAATGTTATTTTG

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DS 

RD RR4AS50JQ 834 0 0
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TGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCG
TCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAA
CGACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGA
GCTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAACGCGATGAA
TGCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACAT
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TGCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGT
GAATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCC*ATT
TAAATAAGTTTTCCTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTTCCTTTGGCGTATTTAT
TTGTAAGCGTCATACGTTATTTTGTACCATAGATACATCAAAATGTTATTTTG
C

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4C808TF 621 0 0
G
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AAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTG
GACAGCAACGACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAAT
GAGGACGAGCTGCGTGATGCTGTGTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCTAAC
GCGATGAATGCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCAC
TGGTACATTCAGAGCACATGCGCCACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGG
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ATTGTATCTGCTGTGATGCAAGAAAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATT
GGGTATGTGAATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGA
ACCC*ATTTAAATAAGTTTTCCTGTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTTCCTTTGGC
GTATTTATTTGTAAGCGTCA

QA 2 621 2 621
DS 

RD RR4CB50TF 784 0 0
GC
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TGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAA
CAT***TTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCA
CTACTTCCAGAT*ACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGTACAGCAACGACAGAGACAGAGT
TGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGCTGT
GTTGCTAGTGTTTGCCAACAAGCAAGACCTTCCTAACGCGATGAATGCAGCTGAAATCAC
AGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGCGC
CACTTCGGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGCAA
GGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGTGATGCAAGA
AAACATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTGCATATTGGGTATGTGAATGTTTTGATTGT
GCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCC*ATTTAAATAAGTTTTCCT
GTATTTTGTTTGAATATGAATGTTATTTTCCTTTGGCGTATTTATTTGTAAGCGTCATAC
GTTATTTTGTAC*ATAGATACATCAAAATGTTATTTTGCTTACGTCTCTGGACCCGGGTG
TA

QA 3 784 3 784
DS 



CO CL47Contig2 792 2 3 U
TCTCAAACAAAATACACGAAAACTTATTTAAATGGGTTCTTCTAGTAAGTTTTAGAGACA
AGACATCTACTTGCACAATCAAAACATTCACATACCCAATATGCAAAAAGGTTCAGATAA
TATTTATAATCTTTTCTTGCATCACAGCAGATACAACCACCTCGATGCAAATGAACATCA
CCCTCATTACGCCTTGCCAGCGATGTTGTTGGACAGCCAGTCCAGACCTTCGTACAGTCC
TTCACCTGAAGTGGCGCATGTACTCTGAATGTACCAGTGACGCTGACGCAGGGAGTGAAG
GCCAAGCTTATCAGTGATTTCAGCTGCATTCATCGCATTAGGAAGATCTTGCTTGTTGGC
AAACACAAGCAGCACAGCATCACGCAGCTCGTCCTCATTGAGCATCCTGTGCAGTTCATC
TCTAGCTTCAACAACTCTGTCTCTGTCGTTGCTGTCCACGACAAAGATCAGACCCTGAGT
GTTCTGGAAGTAATGCCTCCACAAGGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCACAC
AGTGAAACTGATGTTCTTGTACTCCACAGTTTCCACATTGAAACCAATAGTGGGGATGGT
GGTGACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGTACAAGATAGTGGTCTTACCAGCAGCATCAAG
ACCAACCATCAGAATCCTCATCTCCTTCTTTGCAAAGAGCCTGCTAAACAGCTTTGCGAA
ACTCAACCCCATCTTTTACTCTGTAGAATGTAACCGAGAGATCTGAGAGAAACGCGAGAT
GCGAGACGACCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EN62TF C 1
AF RR4EN62JQ U 2
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BS 792 792 RR4EN62TF

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GTTCTGGAAGTAATGCCTCCACAAGGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCACAC
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GCGAGACGACCC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4EN62JQ 790 0 0
C
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TCTGGAAGTAATGCCTCCACAAGGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCACACAG
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TGACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGTACAAGATAGTGGTCTTACCAGCAGCATCAAGAC
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TCAACCCCATCTTTTACTCTGTAGAATGTAACCGAGAGATCTGAGAGAAACGCGAGATGC
GAGACGACC

QA 2 790 2 790
DS 



AS 2 17

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CCATTGAAAAGATGGTGCAAGAGTTCAAGAAGAATCACCCAAATTCTCACTTGCTCAAGA
TAGACAATTTCTCTTTACTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTG
ATATCTGTGGTCGCAAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCT
CCATTTACTTAGAGAATCAAGATCCAGTAGACGTTGAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCG
TAAGTCAGTTAAAGCCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCAT
CACCAAATCCGATTCTACAAGGAATAAAATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAG
GGTTTCTTATTGAAGATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGA
GACCTGGAACAGCTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTT
GGATGATGACCAAGTTCTCCTCTTTCGACCCTGAACAGGCTCATCTCTCCAATCCATTTG
TCGTTGGAAACCGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTATGAG*AAACAGACG
AATCATTCTCTGTGTATTTAGTGGGAGAAGTTTTATCAACAATGAACAAAGCGGAGACTT
TCGTGAAAT


BQ
10 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4EA04TF U 1
AF RR4CD83TF U 2
AF RR4FZ24TF U 2
AF RR4FK95TF U 2
AF RR4HB51TF U 3
AF RR4CE15TF U 2
AF RR4BH24TF U -2
AF RR4G389TF U 11
BS 1 30 RR4EA04TF
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BS 32 309 RR4EA04TF
BS 310 311 RR4CD83TF
BS 312 361 RR4EA04TF
BS 362 362 RR4CD83TF
BS 363 706 RR4EA04TF
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GGATGATGACCAAGTTCTCCTCTTTCGACCCTGAACAGGCTCATCTCTCCAATCCATTTG
TCGTTGGAAACCGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTA

QA 1 706 1 706
DS 

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AGACAATTTCTCTTTACTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGA
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CATTTACTTAGAGAATCAAGATCCAGTAGACGTTGAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGT
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ACCTGGAACAGCTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTTG
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CGTTGG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4HB51TF 716 0 0
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AATTTCTCTTTACTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGATATC
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TACTTAGAGAATCAAGATCCAGTAGACGTTGAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGTAAGT
CAGTTAAAGCCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACCA
AATCCGATTCTACAAGGAATAAGATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTTT
CTTATTGAAGATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACCT
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QA 4 716 4 716
DS 

RD RR4CE15TF 739 0 0
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AGACAATTTCTCTTTACTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGA
TATCTGTGGTCGCAAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCTC
CATTTACTTAGAGAGTCAAGATCCAGTAGACGTTGAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGT
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ACCAAATCCGATTCTACAAGGAATAAAATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGG
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ACCTGGAACAGCTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTTG
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CGTTGGAAACCGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTATGAG*GAACAGACGA
TCATCTCTGTGTATTAGTG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4BH24TF 749 0 0
GGAAAT
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TTGGAAACCGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTATGAGGAAACAGACGAAT
CATTCTCTGTGTATTTAGTGGGA

QA 7 749 7 749
DS 

RD RR4G389TF 779 0 0
GG
AGCCTCACAGAAGAAAAAACTTAAGTTCATATCATTTGCAGCTTGTTAACATGTTACGAC
GACGACTAATACCCACTGAAAGTAACATGTTACGACG***ACCAATACCCATTGAAAAGA
TGGTGCAAGAGTTCAAGAAGAATCACCCAAATTCTCACTTGCTCAAGATAGACAATTTCT
CTTTACTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGATATCTGTGGTC
GCAAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCTCCATTTACTTAG
AGAATCAAGATCCAGTAGACGTTGAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGTAAGTCAGTTAA
AACCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACCAAATCCGA
TTCTACAAGGAATAAAATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTTTCTTATTG
AAGATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACCTGGAACAG
CTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTTGGATGATGACCA
AGTTCTCCTCTTTCGACCCTGAACAGGCTCATCTCTCCAATCCATTTGTCGTTGGAAACC
GCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTATGAG*GAACATACGAATCATTCTCTG
TGTATTTAGTGGGAGAAGTTTTATCAACAATGAACAAAGCGGAGACTTTCGTGAAAT

QA 3 779 3 779
DS 



CO CL48Contig2 923 9 9 U
GACTCCTAAAAGTAGATTGTTTCTTCATTTTTATTCATATATCACAAGGGTAACCATATT
CTCCAGCATTTGTTTTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTT**ACAT
AACATATCATTATTTCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGAC
GATATTCGTACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACT
CCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAAC
TCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCA
ACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCC
TTTGGTTCATTGTTGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTT
TCCTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGA
TTGGAGAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACT
TTGCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTT
TCCTGGTCAGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTC
TTAAGACCACACAGTGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCA
AATTCCATTATTACATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAG
ACCTGAAACTTGAGCTCA*CGTCTACTGGATCTTGATTCTCTAAGTAAATGGAGACATGA
TCTGCATCTGTCATACTCCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 25 50 50 50 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G389JQ U 1
AF RR4EA04JQ U 6
AF RR4FZ24JQ U 14
AF RR4BH24JQ U 61
AF RR4EZ50JQ U 63
AF RR4CD83JQ U 8
AF RR4CA18JQ U 14
AF RR4HB51JQB U 61
AF RR4EZ50TF C 147
BS 1 296 RR4G389JQ
BS 297 297 RR4EA04JQ
BS 298 431 RR4G389JQ
BS 432 549 RR4EA04JQ
BS 550 858 RR4CD83JQ
BS 859 883 RR4CA18JQ
BS 884 888 RR4HB51JQB
BS 889 889 RR4EZ50TF
BS 890 923 RR4HB51JQB

RD RR4G389JQ 431 0 0
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CTCCAGCATTTGTTTTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTT**ACAT
AACATATCATTATTTCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGAC
GATATTCGTACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACT
CCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATAAAC
TCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCA
ACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCC
TTTGGTTCATT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4EA04JQ 544 0 0
CTAG
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TTGTTTTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTT**ACATAACATATCA
TTATTTCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGACGATATTCGT
ACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAA
AGCTTATCCTTCACCGAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAA
CCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTG
CGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCA
TTGTTGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTTTCCTCATAA
CCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGATTGGAGAGA

QA 5 544 5 544
DS 

RD RR4FZ24JQ 556 0 0
G
GATTGTTTCTTCATTTTTATTCATATATCACAAGGGTAACCATATTCTCCAGCATTTGTT
TTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTT**ACATAACATATCATTATT
TCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGACGATATTCGTACATA
CATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCTT
ATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAACCCTT
ATCGGAATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGTT
AACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGTT
GATAAAACATTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTTTCCTCATAACCACT
TGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGATTGGAGAGATGAGC
CTGTTCAGGGTCGAA

QA 2 556 2 556
DS 

RD RR4BH24JQ 619 0 0
CC
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TATTCGTACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAAAAATGACTTCAAACTCAACTCC
CACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTC
ATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAAAACGAATCTGTTTTCTCAAC
ATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTT
TGGTTCATTGTTGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAAAAAATGATTCGTCTGTTTC
CTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGATT
GGAAAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAAAACTTGGTCATCATCCAAGTGACTTT
GCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTC
CTGGTCAGGAAGAGTGG

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4EZ50JQ 736 0 0
CCAGCATTTGTTTTATTACATTACATTACATAACATTAAAAC*TTTTTTTTT**ACATAA
CATATCATTATTTCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGACGA
TATTCGTACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCC
CACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTC
ATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAAC
ATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTT
TGGTTCATTGTTGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTTTC
CTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGATT
GGAGAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACTTT
GCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTC
CTGGTCAGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTT
AAGACCACACAGTGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAA
TTCCATTATTACATTG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4CD83JQ 852 0 0
CGAAGT
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TTTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTT**ACATAACATATCATTAT
TTCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGACGATATTCGTACAT
ACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCT
TATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGGGGCATGAACTCATCAAAACCCT
TATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGT
TAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGT
TGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTTTCCTCATAACCAC
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CCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACTTTGCCATTGAGAG
GCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAA
GAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACA
GTGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTA
CATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAGACCTGAAACTTGA
GCTCA
C

QA 7 851 7 851
DS 

RD RR4CA18JQ 870 0 0
AGATTGTTTCTTCATTTTTATTCATATATCACAAGGGTAACCATATTCTCCAGCATTTGT
TTTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTT**ACATAACATATCATTAT
TTCTTTATTCTTATTTTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGACGATATTCGTACAT
ACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCT
TATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAACCCT
TATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGT
TAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGT
TGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTTTCCTCATAACCAC
TTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGATTGGAGAGATAAG
CCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACTTTGCCATTGAGAG
GCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAA
GA*TGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACA
GTGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTA
CATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAGACCTGAA*CTTGA
GCTCA*CGTCTACTGGATCTTGATTCTCTA

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4HB51JQB 863 0 0
CTCCAGCATTTGTTTTATTACATTACATTACATAACATTAAAACATTTTTTTTTTTACAT
AACATATCATTATTTCTTTATTCTTATTCTATTTGTGTTTCATCCTCACACATATAGGAC
GATATTCGTACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACT
CCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAAC
TCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCA
ACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCC
TTTGGTTCATTGTTGATAAAACCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTT
TCCTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCACTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGA
TTGGAGAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACT
TTGCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTT
TCCTGGTCAGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTC
TTAAGACCACACAGTGACATCAATCTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCA
AATTCCATTATTACATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAG
ACCTGAAACTTGAGCTCA*CGTCTACTGGATCTTGATTCTCTAAGTAA*TGGAGACATGA
TCTGCATCTGTCATACTCCACAT

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4EZ50TF 762 0 0
CTATTTATTGTG
TTCATCCTCACACATATAGGACGATATTCGTACATACATAGCTTAAACATATTTAGTCAC
AGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCTTATC*TTCACCAAATAAGGTTCACA
AAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAAC
CAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTT
AAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGTTGATAAAACCTTCTCCCACTAAATA
CACAGAGAATGATTCGTCTGTTTCCTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTT
GCGGTTTCCAACGACAAATGGATTGGAGAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAA
CTTGGTCATCATCCAAGTGACTTTGCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTC
AGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATC
TTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACAGTGACATCAATTTTATTCCTTGTAG
AATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTACATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGG
CTTTAACTGACTTACGACATAGACCTGAAACTTGAGCTCAACGTCTACTGGATCTTGATT
CTCTAAGTAAATGGAGACATGCTCTGC
CCT

QA 13 759 13 759
DS 



AS 1 17

CO CL49Contig1 990 17 9 U
GACCAACAGTTTTTGAATTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATCC
ATAACAGTAACGTAACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACA
GCCATAAGAAAATTGTATTCGCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAA
ATGCTGAGAAGACATTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTG
GATCTTGACTAGCACTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTA
ACCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCC
CCC*ACATCATCGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTC
ACCTTGTGCGGATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAT
CGTCTACCTTCAGCCCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCC
GCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGC
TCCAGACATTCCGGTATTAAGATACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATG
AGCTCAGCTTGCGCAAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCG
AAACCGAAATCACCAGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAAC
CACATAGGACGGTCCGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGA
ACCACCACCAAACGCTCGCTCGTTCTTCCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCA
TTTTGTACTCTGCTCGTGGATAAAGAGAGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAA
GCCATCTTTGTAAATTTTCTTGTGGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 40 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
60 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 80 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 25 

AF RR4FY07JQ U 158
AF RR4AM94JQ U 13
AF RR4AR62JQ U 13
AF RR4F548JQ U 21
AF RR4F589JQ U 15
AF RR4AN48JQ U 1
AF RR4BY75JQ U 15
AF RR4BY87JQ U 15
AF RR4BY88JQ U 15
AF RR4AM94TF C 132
AF RR4F589TF C 383
AF RR4AR62TF C 339
AF RR4AN48TF C 192
AF RR4BY88TF C 206
AF RR4FY07TF C 238
AF RR4BY87TF C 310
AF RR4BY75TF C 311
BS 1 217 RR4AN48JQ
BS 218 218 RR4AM94JQ
BS 219 552 RR4AN48JQ
BS 553 553 RR4AM94JQ
BS 554 721 RR4AN48JQ
BS 722 755 RR4BY75JQ
BS 756 756 RR4BY88JQ
BS 757 988 RR4AM94TF
BS 989 990 RR4BY88TF

RD RR4FY07JQ 397 0 0
TCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAAAAAACATTGCAGTGACCAGGATCAGCGAG
ATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCACTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAA
CCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTTCTCATAACCAT
GACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGT
AACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTCGTGCGGATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAAC
CCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGCCCACCCCATTAACACTAACTGGA
CCACAAATAAGGGAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR4AM94JQ 601 0 0
TT
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ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAAAAAATT
GTATTCCCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACA
TTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCA
CTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTA
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCG

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR4AR62JQ 590 0 0
TT
GAATTTCCTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATCCATAACAGTAACGTA
ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAAAAAATT
GTATTCCCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACA
TTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCA
CTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTA
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTC

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR4F548JQ 669 0 0
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ACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAGAAAATTGTATTC
GCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACATTGCAG
TGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCACTGTAG
TTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCT
TTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAA
CCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGAGG
CTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGCCCACCC
CATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCC
TGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAA
GATACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGCAAACCA
TC
GAGCCAT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4F589JQ 668 0 0
GAATTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATCCATAACAGTAACGTA
ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAGAAAATT
GTATTCGCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACA
TTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCA
CTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTA
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGG
TATTAAGATACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGC
AAACCATC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4AN48JQ 721 0 0
GACCAACAGTTTTTGAATTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATCC
ATAACAGTAACGTAACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACA
GCCATAAGAAAATTGTATTCGCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAA
ATGCTGAGAAGACATTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGGTGAGCCATGAGATTCTCAATTG
GATCTTGACTAGCACTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTA
ACCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCC
CCC*ACATCATCGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTC
ACCTTGTGCGGATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAT
CGTCTACCTTCAGCCCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCC
GCGAAATACTCG*GTGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGC
TCCAGACATTCCGGTATTAAGATACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATG
AGCTCAGCTTGCGCAAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCG
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4BY75JQ 741 0 0
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ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAAAAAATT
GTATTCGCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACA
TTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCA
CTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTA
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGG
TATTAAGATGCCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGC
AAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAG*ATCGAAACCGAAATCACC
AGGAAGACTACCATCGAGCCA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4BY87JQ 741 0 0
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ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAGAAAATT
GTATTCGCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACA
TTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCA
CTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTA
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGG
TATTAAGATGCCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGC
AAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAG*ATCGAAACCGAAATCACC
AGGAAGACTACCATCGAGCCA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4BY88JQ 742 0 0
GAATTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATCCATAACAGTAACGTA
ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTGCTTAAACAGCCATAAGAAAATT
GTATTCGCCGCAACTAATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACA
TTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCA
CTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTA
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGG
TATTAAGATGCCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGC
AAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAG*ATCGAAACCGAAATCACC
AGGAAGACTACCATCGAGCCAT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4AM94TF 865 0 0
TAGAAATGTATCGCGCACT
ATCTCCATCAATGTGATCACTGTGATGTAAATGCTGAGA*GACATTGCAGTGACCAGGAT
CAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCACTGTAGTTAGCTTGGA
AACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTTCTCA
TAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAACCACAAACCT
CCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGAGGCTCTATGTCA
ACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGCCCACCCCATTAACACT
AACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCATAC
CACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAGATACCGGTT
ACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGCAAACCATCTAAGAGTT
TCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAGGAAGACTACCATCG
AGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGAAGTGGTTCA
CAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTCGCTCGTTCTTCCA
TCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGATAAAGAGAGT
GTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTTGTAAATTTTCTTGTGGCAC
TATTTTCC

QA 20 857 20 857
DS 

RD RR4F589TF 600 0 0
ACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCAC*TTGTGCGGATACTGAGGCT
CTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGCCCACCCCA
TTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCTG
CGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAGA
TACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGCAAACCATC
TAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAGGAAGAC
TACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGAA
GTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTCGCTCG
TTCTTCCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGATA
AAGAGAGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTTGTAAATTTTCTT
C

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4AR62TF 658 0 0
ACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGTA
ACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAACC
CGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGCCCACCCCATTAACACTAACTGGAC
CACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCATACCACGAATA
ATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAGATACCGGTTACTGCCAG
CATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGCAAACCATCTAAGAGTTTCCGGATC
AGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAGGAAGACTACCATCGAGCCATTC
AGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCT
AGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTCGCTCGTTCTTCCATCGACGCG
TGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGATAAAGAGAGTGTGGAAGC
GAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTTGTAAATTTTCTTGTGGCAC
TATTTTCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4AN48TF 804 0 0
ACATTGCAGTGACCAGGATCAGCGAGGTGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTA
GCACTGTAGTTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTT
TTAATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCAT
CGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGG
ATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTC
AGCCCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTC
G*GTGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTC
CGGTATTAAGATACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTG
CGCAAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATC
ACCAGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACG
GTCCGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAA
ACGCTCGCTCGTTCTTCCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCT
GCTCGTGGATAAAGAGAGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTTGT
AAATTTTCTTGTGGCAC
TCTTTCC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4BY88TF 785 0 0
CA
GATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATTGGATCTTGACTAGCACTGTAGTTAGCTT
GGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTA*CCGTCCGTTTTTA*TCTCTTTAGTTC
TCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCCCACATCATCGGGTCGAACCACAAA
CCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGAGGCTCTATG
TCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGCCCACCCCATTAAC
ACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCA
TACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAGATGCCG
GTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGCAAACCATCTAAGA
GTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAG*ATCGAAACCGAAATCACCAGGAAGACTACCA
TCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGAAGTGGT
TCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTCGCTCGTTCTT
CCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGATAAAGAG
AGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTTGTAAATTTTCTTGTGGCA
CCC

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR4FY07TF 753 0 0
ATTGGATC
TGACTAGCACTGTAGTTAGCT*GGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGT
CCGTTTTTAATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCCCA
CATCATCGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTC
GTGCGGATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCT
ACCTTCAGCCCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAA
ATACTCGCGTGACCCCGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAG
ACATTCCGGTATTAAGATACCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTC
AGCTTGCGCAAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACC
GAAATCACCAGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACAT
AGGACAGTCCGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAGCCAC
CACCAAACGCTCGCTCGTTCTTCCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTG
TACTCTGCTCGTGGATAAAGAGAGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCAT
CTTTGTAAATTTTCTTGTGGCACCC

QA 9 753 9 753
DS 

RD RR4BY87TF 681 0 0
TTTTAATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCCCACATC
ATCGGGTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGC
GGATACTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCT
TCAGCCCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATAC
TCGCGTGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACAT
TCCGGTATTAAGATGCCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCT
TGCGCAAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAG*ATCGAAACCGAAA
TCACCAGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGA
CGGTCCGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACC
AAACGCTCGCTCGTTCTTCCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACT
CTGCTCGTGGATAAAGAGAGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTT
GTAAATTTTCTTGTGGCACCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BY75TF 680 0 0
TTTT
ATCTCTTTAGTTCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCCCACATCATCGG
GTCGAACCACAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATA
CTGAGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCATCGTCTACCTTCAGC
CCACCCCATTAACACTAACTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCG
TGACCCTGCGTCATACCACGAATAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGG
TATTAAGATGCCGGTTACTGCCAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGCGC
AAACCATCTAAGAGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAG*ATCGAAACCGAAATCACC
AGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTC
CGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACG
CTCGCTCGTTCTTCCATCGACGCGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCT
CGTGGATAAAGAGAGTGTGGAAGCGAGAGCAGAAGCAATGGCAAAAGCCATCTTTGTAAA
TTTTCTTGTGGCACCC

QA 5 680 5 680
DS 



AS 1 17

CO CL50Contig1 837 17 11 U
GGGGAATTCGAGATATCTCTCTCTCGGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGAC
GGCGACGACAACTGATTTCTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGT
GGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCC
TAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGA
TGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAA
AGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGA
GTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACC
AATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACT
GGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAAT
GAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACA
GAACTTTTTTTTT**GTCTTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGT
TTTGTCTTTATACCGGCAAAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGT
CAGAGAGAAATATTTGAACCCCCTTGTACTTCTTTGAATATCAACAATTTTCTTGAATGC
TCTCTAATCGTGTTTCTGGTTTCCAAATTGTGGAAATGAATAAAGAAGCTTTAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 55 55 55 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 65 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 65 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 30 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 80 80 80 65 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 50 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 40 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DD41TF U 29
AF RR4DK34TF U 8
AF RR4DW65TF U 17
AF RR4EA18TF U 13
AF RR4FL74TF U 24
AF RR4EA18JQ C 130
AF RR4DD41JQ C 406
AF RR4EL53JQ C 96
AF RR4EL53TF U 24
AF RR4AJ81TF U 17
AF RR4FY65JQ C 91
AF RR4FY65TF U 24
AF RR4FL74JQ C 29
AF RR4DK34JQ C 59
AF RR4DW65JQ C 17
AF RR4BC75TF U 1
AF RR4BC75JQ C 79
BS 1 174 RR4BC75TF
BS 175 175 RR4DK34TF
BS 176 255 RR4BC75TF
BS 256 256 RR4DK34TF
BS 257 466 RR4BC75TF
BS 467 467 RR4DK34TF
BS 468 667 RR4BC75TF
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BS 669 757 RR4BC75TF
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BS 759 837 RR4BC75TF

RD RR4DD41TF 469 0 0
G
GGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTTCTTCAAGCCTT
TCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACA
ATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTGT
TCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTA
ATGTGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCTG
TTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTG
TCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAA
TGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACA

QA 2 469 2 469
DS 

RD RR4DK34TF 548 0 0
GGGAGAT
ATCTCTCTCTCGGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTG
ATTTCTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAG
GTAGTAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTC
GTGTTAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGG
CAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTG
TCCAAGTTGAGGCTGTTCTTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATT
GTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATA
TCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCAT
ACAAGGACGCACAGGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCC
A

QA 8 548 8 548
DS 

RD RR4DW65TF 615 0 0
GG
CTCTCTCGGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTT
CTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAG
TAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGT
TAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGG
GATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCA
AGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGA
AGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAGCCAGCGACCAATCCGCACTGATATCAC
TGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAA
GGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAG
CTTATGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT**GTC
TTTATACCCGAAC

QA 3 615 3 615
DS 

RD RR4EA18TF 656 0 0
GG
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ATTTCTTCAAGCCTTTCCTCCCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAG
GTAGTAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTC
GTGTTAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGG
CAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTG
TCCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATT
GTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATA
TCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCAT
ACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCC
AGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT*
*GTCTTTATACTCGAACTTCAG*TATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTT

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR4FL74TF 653 0 0
GG
GGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTTCTTCAAG
CCTTTCCTCTCTCCTTTCTCTAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAG
AACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGT
TTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTT
GGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAG
GCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAG
CTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCA
GCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCA
CATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGC
ATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTTTTGTCTTTATAC
TCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGG

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR4EA18JQ 653 0 0
AGGAGGTAGTAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTC
TCTTCGTGTTAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATC
AAAGGCAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAAT
GGTTGTCCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGG
TTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCAC
TGATATCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGA
AGCATACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCT
TGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTTTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTT
TTTT**GTCTTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTT
ATACCGGCAAAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAA
ATATTTGAACCCCCTTGTACTTCTTTGAATATCAACAATTTTCTTGAAT
GCCC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4DD41JQ 370 0 0
GGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGA
GAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGC
TATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTTTAAGTGA
TGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT**GTCTTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAA
GTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAG
TCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAACCCCCTTGTACTTCTTTGAATATCAAC
AATTTTCT
CG

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4EL53JQ 680 0 0
CTCCTTTCTCTAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACAATAACG
TGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTGTTCGGAG
GTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTAATATGC
AGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCTGTTCGTG
TCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGG
TTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAATGGAAT
TGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACATGCAAAGA
GTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAG
GTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTTTTGTCTTTATACTCGAACTTCA
GGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAAAGAAACTACAACT
CTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAACCCCCTTGTACTTCTTT
GAATATCAACAATTTTCTTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4EL53TF 713 0 0
GG
GGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTTCTTCAAG
CCTTTCCTCTCTCCTTTCTCTAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAG
AACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGT
TTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTT
GGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAG
GCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAG
CTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCA
GCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCA
CATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGC
ATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTTTTGTCTTTATAC
TCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAA*GA
AACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTG

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR4AJ81TF 762 0 0
GG
CTCTCTCGGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTT
CTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAG
TAGACAGAGCAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGT
TAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGG
GATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGCCCA
AGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGA
AGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCAC
TGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAA
GGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAG
CTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTTT*GTC
TTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCA
AAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAA
CCCCCTTGTACTTCTTTGAATATCAACAATTTTCTTGAAT

QA 3 762 3 762
DS 

RD RR4FY65JQ 684 0 0
CT
TCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACAATA
ACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTGTTCG
GAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTAATA
TGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCTGTTC
GTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTTA
AGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAATGG
AATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACATGTAA
AGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCAC
CAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT**GTCTTTATACTCGAACT
TCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAAAGAAACTACA
ACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAACCCCCTTGTACTTC
TTTGAATATCAACAATTTTC
GC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4FY65TF 730 0 0
GG
GGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTTCTTCAAG
CCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAG
AACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGT
TTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTT
GGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAG
GCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAG
CTTGTTAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCA
GCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCA
CATGTAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGC
ATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT**GTCTTTATAC
TCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAA*GA
AACTACAACTCTGTCTCAAGTCA*CTCTAGTGAGTCAGAGAGAA*TATTTGAACCCC
TTGTACTTTTT

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR4FL74JQ 747 0 0
CGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTTCTTCAAGCCT
TTCCTCTCTCCTTTCTCTAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAAC
AATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTG
TTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGT
AATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCT
GTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTT
GTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCA
ATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACAT
GCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATG
CCACCAGGTTTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTTTTGTCTTTATACTCG
AACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAAAGAAAC
TACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAACCCCCTTGTA
CTTCTTTGAATATCAACAATTTTCTTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4DK34JQ 684 0 0
ACGGCGACGACAACTGATTTCTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTC
GTGGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAAC
CCTAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGAT
GATGGCCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAG
AAAGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCTGTTCTTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCC
GAGTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAA
CCAATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTA
CTGGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACAGGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGA
ATGAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTTTAAGTGATGGATTAAAGTAA
CAGAACTTTTTTTTT**GTCTTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTT
GTTTTGTCTTTATACCGGCAAAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGA
GTCAGAGAGAAATATTTGAACCCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4DW65JQ 758 0 0
GG
CTCTCTCGGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAACTGATTT
CTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAG
TAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGT
TAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCAGG
GATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCA
AGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGA
AGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAGCCAGCGACCAATCCGCACTGATATCAC
TGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAA
GGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAG
CTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT**GTC
TTTATACCCGAACTTCGGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTTTATACCGGCA
AAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAA
CCCCCTTGTACTTCTTTGAATATCAACAATTTTCTT

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4BC75TF 837 0 0
GGGGAATTCGAGATATCTCTCTCTCGGACGGAGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGAC
GGCGACGACAACTGATTTCTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGT
GGCGCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAAAACCC
TAACAGGTCTCTTCGTGTTAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGA
TGGCCAATCAAAGGCTGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAA
AGCTCAAATGGTTGTCCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGA
GTTTGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACC
AATCCGCACTGATATCACTGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGGAACTATCACTACT
GGTTACAGAAGCATACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAAT
GAGTGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACA
GAACTTTTTTTTT**GTCTTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGT
TTTGTCTATATACCGGCAAAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGT
CAGAGAGAAATATTTGAACCCCCTTGTACTTCTTTGA*TATCAACAATTTTCTTGAATGC
TCTCTAATCGTGTTTCTGGTTTCCAAATTGTGGAAATGAATAAAGAAGCTTTAAAGA

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4BC75JQ 758 0 0
CTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTCGTGGCGCAACGAGGAGGTAG
TAGACAGAACAATAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAAAACCCTAACAGGTCTCTTCGTGT
TAATGGTTTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGGCTGG
GATACTTGGTAATATGCAGAATCTTTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAAATGGTTGTCCA
AGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCCGAGTTTGATGGTTATTGTGA
AGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATATCAC
TGATGCAGCAATGGAATTGGGTTCCGAGGAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCATACAA
GGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCCAGAG
CTTAGGCATGCCACCAGGTTTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACTTTTTTTTT**GTC
TTTATACTCGAACTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTGTTTTGTCTATATACCGGCA
AAAAAGAAACTACAACTCTGTCTCAAGTCAACTCTAGTGAGTCAGAGAGAAATATTTGAA
CCCCCTTGTACTTCTTTGAATATCAACAATTTTCTTGAATGCTCTCTAATCGTGTTTCTG
GTTTCCAAATTGTGGAAATGAATAAAGAAGCTTTAAAG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 2 18

CO CL51Contig1 649 12 14 U
CAAACACAATAAAAA*GATGCTTTGTATTATATTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTA
AAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGG
CAACAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCC
AACTCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATC
TTGACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCT
CGTTTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATC
AAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCT
CCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAG
AGACGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGT
AGAGATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTC
GTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCCTCCCT


BQ
10 10 10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 
70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 5 5 35 35 35 10 10 

AF RR4A855TF C 1
AF RR4BU42JQ U 137
AF RR4BU42TF C 137
AF RR4F082JQ U 58
AF RR4FX51JQ U 76
AF RR4FX51TF C 76
AF RR4AV01JQ U 2
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AF RR4DT07JQ U 2
AF RR4F082TF C 58
AF RR4DT07TF C 2
AF RR4A855JQ U 6
BS 1 3 RR4A855TF
BS 4 57 RR4AV01JQ
BS 58 101 RR4F082JQ
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BS 137 554 RR4BU42JQ
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BS 648 649 RR4A855JQ

RD RR4A855TF 649 0 0
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AAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGG
CAACAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCC
AACTCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATC
TTGACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCT
CGTTTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATC
AAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCT
CCACACATCCACTTTCCGGCCGGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAG
AGACGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGT
AGAGATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTC
GTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCGATCC
CT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4BU42JQ 508 0 0
GCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTAATTATT
AATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGTT
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ATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCA
ATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTC
CGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCCC
ACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAAA
TGCCCACAGCCACGGGTTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCCAGAGGTTTTCA
AGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4BU42TF 508 0 0
GCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTAATTATT
AATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGTT
TGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTGTAC
ATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCA
ATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTC
CGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCCC
ACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAGA
TGCCCACAGCCACGGGTTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCCAGAGGTTTTCA
AGTACACCCATTCTTTATTTTGCCTCCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4F082JQ 548 0 0
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AGGCAACAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACG
GCCAACTCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAG
ATCTTGACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCT
CCTCGTTTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTT
ATCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACT
TCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGG
TAGAGACGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACC
GGTAGAGATTCGCCTGAAATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGAC
GTCGTCCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4FX51JQ 569 0 0
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TAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGT
TTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTGTA
CATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACC
AATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTT
CCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCG*ACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCC
CACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAA
ATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCATCCCAGAGGTTTTC
AAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4FX51TF 569 0 0
GGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGGCAACAAAGCAAAAAA
AGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTAATTAT
TAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGT
TTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTGTA
CATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACC
AATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTT
CCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCG*ACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCC
CACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAG
ATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCATCCCAGAGGTTTTC
AAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4AV01JQ 644 0 0
AG
ACACAATAAAAA*GATGCTTTGTATTATATTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAA
ACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGGCAA
CAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAAC
TCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTG
ACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGT
TTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAA
GACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCA
CACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGA
CGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGA
GATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTC
CCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC
C

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4AV01TF 644 0 0
AG
ACACAATAAAAA*GATGCTTTGTATTATATTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAA
ACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGGCAA
CAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAAC
TCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTG
ACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGT
TTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAA
GACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCA
CACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGA
CGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGA
GATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTC
CCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC
C

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4DT07JQ 646 0 0
AA
ACACAATAAAAA*GATGCTTTGTATTATATCTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAA
ACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGGCAA
CAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAAC
TCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTG
ACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGT
TTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAA
GACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCA
CACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGA
CGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGA
GATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTC
CCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCGATCC

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR4F082TF 590 0 0
GTAAAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTCATGTTGAGAAGTGAG
AGGCAACAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACG
GCCAACTCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAG
ATCTTGACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCT
CCTCGTTTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTT
ATCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACT
TCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGG
TAGAGACGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACC
GGTAGAGATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGAC
GTCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCGATCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4DT07TF 646 0 0
AA
ACACAATAAAAA*GATGCTTTGTATTATATCTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAA
ACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGGCAA
CAAAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAAC
TCAACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTG
ACTTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGT
TTCGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAA
GACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCA
CACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGA
CGCTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGA
GATTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTC
CCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCGATCC

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR4A855JQ 644 0 0
ACAATAAAAA*GATGCTTTGTATTATATTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAAAC
GTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAGAAGTGAGAGGCAACA
AAGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTC
AACTAATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGAC
TTATTTTAGTTTGACGATCCGTTGATGACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTT
CGCTGCTGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGA
CATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACA
CATCCACTTTCCGGCCGGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACG
CTGATCCGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGA
TTCGCCTGAGATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCC
AGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCGATCCCT

QA 1 644 1 644
DS 



CO CL51Contig2 644 6 4 U
GGGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTC
CTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGACATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCC
TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
CTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTATAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTT
GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTA
ACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGC
ATATTTGACATGAAATATAATACAAAGCATCTTTTTTATCGTGT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4AI84JQ C 1
AF RR4AI84TF U 1
AF RR4BS02TF U 1
AF RR4F513TF U 1
AF RR4CY88JQ C 1
AF RR4CY88TF U 1
BS 1 615 RR4AI84TF
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GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
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AG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4AI84TF 617 0 0
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TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
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GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTA
ACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGC
ATATTTGACATGAAA
AG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4BS02TF 644 0 0
GGGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTC
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CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTG*ATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCAAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
CTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGCATAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTT
GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTA
ACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGC
ATATTTGACATGAAATATAATACAA*GCATCTTTTTTATCGTGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4F513TF 644 0 0
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TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
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CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
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GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTA
ACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGC
ATATTTGACATGAAATATAATACAAAGCATCTTTTTTATCG
TGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4CY88JQ 642 0 0
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TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
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GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTA
ACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGC
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G

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4CY88TF 642 0 0
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CTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGACATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCC
TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
CTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTATAGCAGCGAAACGAG*AGCAAGCACCGTT
GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTA
ACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGC
ATATTTGACATGAAATATAATACAAAGCATCTTTTTTATCG
G

QA 1 641 1 641
DS 



AS 2 18

CO CL52Contig1 695 9 11 U
GGGGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATATCTCTCTCTCTCCGCGACATT
TCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGA
GAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTG
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTGGAT
CTATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATCTCCG


BQ
30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 

AF RR4GR40JQ C 1
AF RR4GR40TF U 1
AF RR4EM28TF U 1
AF RR4AO11TF U 4
AF RR4FX04JQ C 1
AF RR4BT02TF U 172
AF RR4EM28JQ C 56
AF RR4FX04TF U 0
AF RR4AO11JQ C 52
BS 1 38 RR4EM28TF
BS 39 39 RR4FX04TF
BS 40 40 RR4GR40TF
BS 41 184 RR4EM28TF
BS 185 185 RR4AO11TF
BS 186 398 RR4EM28TF
BS 399 399 RR4AO11TF
BS 400 640 RR4EM28TF
BS 641 641 RR4AO11TF
BS 642 691 RR4EM28TF
BS 692 695 RR4FX04JQ

RD RR4GR40JQ 644 0 0
GGGGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCTCTCTCTCTCCGCGACATT
TCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTTTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAATA
GAAGAACAATTTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACT*TGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTG
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4GR40TF 641 0 0
GGGGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCTCTCTCTCTCCGCGACATT
TCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAATA
GAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACT*TGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTG
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4EM28TF 691 0 0
GGGGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTAT**CTCTCTCTCTCCGCGACATT
TCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGA
GAAGGACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTGCTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTG
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACCTGTGTGGGGTTTGTTGGAT
CTATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4AO11TF 669 0 0
GG
GCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTAT**CTCTCTCTCTCCGCGACATTTCACG
GTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACT
GTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGA
ACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGA
CCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGC
AGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGT
CCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTTG
CTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGC
AAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTGAAGAT
TTTGCTGGACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCTCCTTT
TCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTGGATCTATT
TTATCAA

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DS 

RD RR4FX04JQ 695 0 0
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TCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGA
GAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGATAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTG
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTGGAT
CTATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATCTCCG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4BT02TF 520 0 0
G
AGCAAAGAGAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAAC
AAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACC
AAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAA
TTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGAC
TTGAAGAAATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAG
TCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTT
GGAAGTTGAAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAAC
ACTATGCTCCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTT
TGTTGGATCTATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATC

QA 2 520 2 520
DS 

RD RR4EM28JQ 636 0 0
ACATTTCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAG
ACCAACAACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGC
AAAGAGAAGGACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAG
AAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAG
ACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTC
CCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTGCTACAGGCCAGACTTG
AAGAAATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCC
GGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGA
AGTTGAAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACT
ATGCTCCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACCTGTGTGGGGTTTGT
TGGATCTATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FX04TF 696 0 0
GGA
GGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATATCTCTCTCTCTCCGCGACATTTC
ACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACA
ACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGA
AGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAG
TGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGA
AGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGA
TGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGATAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAAT
TTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCA
AGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTGAA
GATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCTCC
TTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTGGATCT
ATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATC
TCCG

QA 4 692 4 692
DS 

RD RR4AO11JQ 643 0 0
CGCGACATTTCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGT
TAAGACCAACAACTGTTTCTTTGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTT
CAGCAAAGAGAAGAACAATTTTTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTTTGGTCTTGCAAA
CAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCAC
CAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTAAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGA
ATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGA
CTTGAAGAAATTTGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAA
GTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTTTTTTTT
TGGAAGTTGAAGATTTTGCTGGACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAA
CACTATGCTCCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTTTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGT
TTGTTGGATCTATTTTATCAAATCAAGAACTTGATAAATC
TTT

QA 1 640 1 640
DS 



CO CL52Contig2 753 9 7 U
GGGGGCGCCACCATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTACCTCTGTCTCTCTCCGCGAAAT
TTCACGGTTTAGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCA
ACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAG
AGAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGA
CAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCA
AGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCA
GGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGA
AATTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTG
CCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTACTTTGGAAGTTG
AAAAGATTTTGTTGAACATGTTTTATCTAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCT
TTTTT*AGGAGTTAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAATCTATTTT
GTCAAATCGAGAACTTGATAAATCCTCTATTAGTCTTGTACAACGAACATGCCTGTGTTG
GTGCAGTGGTTAATATCAGAATACTTGTTTGCC


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D851TF U 2
AF RR4ER01TF U 1
AF RR4FF46TF U 1
AF RR4F946TF U 3
AF RR4D851JQ C 2
AF RR4FF46JQ C 196
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AF RR4GS75JQ C 171
AF RR4GS75TF U 373
BS 1 253 RR4ER01TF
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BS 611 679 RR4FF46TF
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GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCAG
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AAAGATTTTG

QA 1 550 1 550
DS 

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TTCACGGTTTAGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCA
ACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAG
AGAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGA
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AGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCA
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AAAAGATTTTGTTGAACATGTTTTATCTAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCT
TTTTT*AGGA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4FF46TF 679 0 0
G
GGGGCGCCACCATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTACCTCTGTCTCTCTCCGCGAAATT
TCACGGTTTAGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGA
GAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
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AAAGATTTTGTTGAACATGTTTTATCTAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTT
TTTT*AGGAGTTAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAATCTATTTTG
TCAAATCGAGAACTTGAT

QA 2 679 2 679
DS 

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CACGGTTTAGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAAC
AACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAG
AAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACA
GTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAG
AAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCAGG
ATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAA
TTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCC
AAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTACTTTGGAAGTTGAA
AAGATTTTGTTGAACATGTTTTATCTAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTTT
TTTTAGGAGTTAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAATCTATTTTGT
CAAATCGAGAAC

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DS 

RD RR4D851JQ 678 0 0
GGGGCGCCACCATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTACCTCTGTCTCTCTCCGCGAAATT
TCACGGTTTAGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAA
CAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTTGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGA
GAAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCAG
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ATTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTACTTTGGAAGTTGA
AAAGATTTTGTTGAACATGTTTTATCTAGGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTT
TTTT*AGGAGTTAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAATCTATTTTG
TCAAATCGAGAACTTGA
G

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4FF46JQ 484 0 0
GCAACCTTAACTCCTACAAGCACTTTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGC
CAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGC
CTAAGGTTTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTG
TTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCAA
GACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACC
GTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTTTACTTTGGAAGTTGAAAAGATTTTGTTGA
ACATGTTTTATTTAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTTTTTT*AGGAGTTAG
TTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAATCTATTTTGTCAAATCGAGAACT
TGAT

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DS 

RD RR4F946JQ 273 0 0
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GGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATAT
GTTTTACTTTGGAAGTTGAAAAGATTTTGTTGAACATGTTTTATTTAAGTTGTTTTGTTG
AATCATAACACTGCTCCTTTTTT*AGGAGTTAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGGGG
GTTTTTTGAATTTATTTTGTCAAATCGGGAAC
G

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DS 

RD RR4GS75JQ 583 0 0
GC
CAGCAAAGAGAAGAACAATTTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAA
CAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACA**GAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCAC
CAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCTTGAAGAAGGA
ATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGA
CTTGAAGAAATTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAA
GTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTACTTT
GGAAGTTGGAAAGATTTTGTTGAACATGTTTTATCTAAGTTGTTTTGTTTAATCATAACA
CTGCTCCTTTTTT*AGGAGTTAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAA
TCTATTTTGTCAAATCGAGAACTTGATAAATCCTCTATTAGTCTTGTACAACGAACATGC
CTGTGTTGGTGCAGTGGTTAATATCAGAATACTTGTTTGCC

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DS 

RD RR4GS75TF 381 0 0
CTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTG
CAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAA
ACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTACTTTGGAAGTTGGAAAGATTTTGT
TGAACATGTTTTATCTAAGTTGTTTTGTTTAATCATAACACTGCTCCTTTTTT*AGGAGT
TAGTTTTTTATGCTTATGTTACTTGTGTGGGTTTTTTGAATCTATTTTGTCAAATCGAGA
ACTTGATAAATCCTCTATTAGTCTTGTACAACGAACATGCCTGTGTTGGTGCAGTGGTTA
ATATCAGAATACTTGTTTGCC

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DS 



AS 1 17

CO CL53Contig1 858 17 13 U
GGATTCGTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCA
GAGCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAA
GAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCC
TCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAG
GTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAG
CTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTT
GTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATT
AAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGAT
GATCATTAAAGATATGAATCATGATGATGATGATGATGATG*TGTGTTATTGTGTTGAAT
GATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTT
GTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTATATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAAT
GGTATTATTATTTTCATC


BQ
25 25 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 55 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 45 45 10 45 45 45 45 10 45 45 45 
45 45 45 45 15 40 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4DD45TF U 1
AF RR4CN13TF U 1
AF RR4H207TF U 1
AF RR4H814TF U 1
AF RR4GV87TF U -2
AF RR4EB22TF U 5
AF RR4EA46TF U -2
AF RR4A430TF U -2
AF RR4CN13JQ C 10
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AF RR4H814JQB C 40
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AF RR4EE27TF U 450
AF RR4DD45JQ C 145
AF RR4EB22JQ C 195
AF RR4EA46JQ C 77
AF RR4GV87JQ C 188
BS 1 71 RR4CN13TF
BS 72 73 RR4DD45TF
BS 74 544 RR4CN13TF
BS 545 545 RR4DD45TF
BS 546 647 RR4CN13TF
BS 648 701 RR4A430TF
BS 702 702 RR4EA46TF
BS 703 721 RR4A430TF
BS 722 722 RR4EA46TF
BS 723 830 RR4A430TF
BS 831 847 RR4EE27TF
BS 848 853 RR4H814JQB
BS 854 858 RR4GV87JQ

RD RR4DD45TF 596 0 0
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GAGCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTG*AAGAAGAA
GAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCC
TCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAG
GTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAG
CTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTT
GTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCCGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4CN13TF 647 0 0
GGATTCGTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCA
GAGCAAACAAAGTTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAA
GAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCC
TCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAG
GTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAG
CTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTT
GTTGTTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATT
AAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4H207TF 646 0 0
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GAGCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAA
GAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCC
TCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAG***GACAAGAAGAAG
GTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAG
CTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTT
GTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATT
AAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4H814TF 647 0 0
GGATTCGTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCA
GAGCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAA
GAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCC
TCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAG
GTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAG
CTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTT
GTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATT
AAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAATACTGTAGAGGAGGAAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4GV87TF 650 0 0
GGGGAT
TTCGTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAT
CAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAG
GTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGAT
TTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTT
GAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAAGAA
GAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCG
AGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTA
ACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTG
AAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTT
GCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAG
GAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAA

QA 7 650 7 650
DS 

RD RR4EB22TF 644 0 0
GG
GTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAA
ACCAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTA
GAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTC
TTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAG
CAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAAGAAGAG
AAGAAGTGTAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCGAGC
GAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACT
AGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAG
GAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGCT
CCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAG
AAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAG

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR4EA46TF 777 0 0
GGATC
ATTCGTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGA
GCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAA
GGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGA
TTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGTCCGCCATAGCGTCTGAGTT
TGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAAGA
AGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTC
GAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGT
AACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGT
TGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAA
GGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGA
TCATTAAAGATATGAATCATGATGATGATGATGATGATG***TGTTATTGTGTTGAATGA
TGATCATCTTTTGCTTT*GTGTTGTTGGAAGTTTGT
GGCTTTTTATTATTTC

QA 6 761 6 761
DS 

RD RR4A430TF 837 0 0
GGATC
ATTCGTCTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGA
GCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAA
GGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGA
TTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTT
TGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAA*CACGTGGAAGAAGAAGA
AGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTC
GAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGT
AACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGT
TGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAA
GGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGA
TCATTAAAGATATGAATCATGATGATGATGATGATGATGGTGTGTTATTGTGTTGAATGG
TGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGT
TGATTTCAGCTTTCCTTGTTATATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAG
TGTT

QA 6 833 6 833
DS 

RD RR4CN13JQ 816 0 0
TCTCTTACAAT
ATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAAACAAAGTTTTTCCC
GATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATC
ATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAA
AGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGT
CTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATAGTCT
CCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCGAGCGAGGAAGAAGGCGA
AGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGAGGT
GAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGG
ACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGTTCCTCCAGTGGAGGA
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CCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATC
ATGATGATGATGATGATGATGATGTGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTT
GTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTT*ATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTG
TTATATGTGTTGTATATGATGATTT

QA 12 816 12 816
DS 

RD RR4E486JQ 740 0 0
GATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATC
ATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAA
AGATGAAACAAAACCAGAGGAGTCCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGT
CTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATAGTCT
CCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCGAGCGAGGAAGAAGGCGA
AGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGAGGT
GAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGG
ACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGCTCCTCCAGTGGAGGA
AGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTA
CCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATC
ATGATGATGATGATGATGATG***TGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTT
GTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTG
TTAT**GTGTTGTATATTAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4H814JQB 818 0 0
CGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAAACAAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAA
ACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAG
GTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAG
GAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAG
GTTAAACACGTGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATAGTTTCCTCGAGAAGCTTCACCGC
AGCGACAGCTTTTCAAGCTCCTCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAG
AAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAG
AAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAA
GATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAG
AAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAATACTGTAGAG
GAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATCATGATGATGATGATGATGA
TG***TGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTTTTGGAAGTTTGTT
GGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTAT**GTGTTGTATATTA
TGATTTCAAAGGTATTTTTATGGTATGATTATTT
TCAT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4EE27JQ 398 0 0
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GGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAGGCTTCCAGGCTACCATCCCAA
GACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATCATGATGATG
ATGATGATGATGGTGTGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTG
GAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTATATGTG
TTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATTA

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR4EE27TF 398 0 0
GGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAA
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GGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAGGCTTCCAGGCTACCATCCCAA
GACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATCATGATGATG
ATGATGATGATGGTGTGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTG
GAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTATATGTG
TTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATTA

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR4DD45JQ 710 0 0
GCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGAT
GAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCG
GAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTG*AAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTC
GAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCGAGCGAGGAAGAAGGCGAAGAT
GGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGAGGTGAAG
ACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACAC
GGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCG
CATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCAT
CCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATCATGA
TGATGATGATGATGATGATGTGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGT
TGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTAT
ATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATTA
TTATTTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4EB22JQ 653 0 0
GAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGT
TCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGTGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGTG
TAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCGAGCGAGGAAGA
AGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGG
AGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCT
TCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGCTCCTCCAGT
GGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCC
AGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATA
TGAATCATGATGATGATGATGATGATGATGTGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTT
GCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTT
TCCTTGTTATATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATTA

QA 1 653 1 653
DS 

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TTCCCGAT
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DS 

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DS 



AS 1 18

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BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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CCAATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCG
TCTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTTAATAATATCAAGTGCT
ATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGG*CCGGA
GAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAG
AATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCT
GTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCAT
TTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATG
GTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAAC
A

QA 1 635 1 635
DS 

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TTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAATCCACTCCGATTGGAAGTGATTAAGCG
GGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTTGTTTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTT
TTTGGGCATTTTTAATAATATCAAGTGCTATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGG
CTTTATCTCCAATTACGAAGGGG*CCGGAGAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAA
CCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTT
GTTGTTTTTGATGTCGAAACCGTTTTTCTGTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTA
GGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTT
TATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTTTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAA
TAAC

QA 1 544 1 544
DS 

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ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGC
CCAATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCG
TCTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTTAATAATATCAAGTGCT
ATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGG*CCGGA
GAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAG
AATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCT
GTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCAT
TTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATG
GTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATA
GT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EO04TF 635 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGC
CCAATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCG
TCTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTTAATAATATCAAGTGCT
ATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGG*CCGGA
GAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAG
AATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCT
GTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCAT
TTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATG
GTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATA
GT

QA 1 633 1 633
DS 

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GCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCG
TTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 6 102 6 102
DS 

RD RR4ED65TF 102 0 0
GAGAG
GCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCG
TTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 6 102 6 102
DS 

RD RR4EA85TF 620 0 0
G
TAACAAAAAAAAAAAAAAGTAAAAAAAACCATTGAAACAATTATGAATTCCATTAAGTTT
CCCGTACTTGATCGAACAACAAAAAACTCAGTTATTTCAACTACGTTAAATGATCTTTCA
AATTGGTCAAGACTTTCCAGCCTATGGCCGCTTCTTTATGGTACCAGTTGTTGTTTTATT
GAATTTGCCTCATTAATAGGCTCCCGATTTGACTTTGATCGTTATGGGCTAGTACCAAGA
TCAAGTCCTAGGCAGGCGGACCTTATTTTAACAGCAGGTACAGTAACAATGAAAATGGCT
CCTTCTTTAGTGAGATTATATGAACAAATGCCTGAACCAAAGTATGTTATTGCTATGGGA
TCGTGTACAATTACAGGGGGGATGTTCAGTACCGATTCTTATAGTACTGTTCGAGGGGTT
GATAAGCTAATTCCTGTAGATGTCTATTTGCCGGGTTGTCCACCTAAACCAGAGGCTGTT
ATAGACGCTATAACAAAGCTTCGTAAGAAAATAGCTAGAGAAATCTATAAGGATCGAATT
AGACCTCAACGGGGTAATCGGTGTTTTACTACCAATCACAAGTTTTTTGTTGTACGCAGT
ACGCAGACTGGAAA
TTATG

QA 2 615 2 615
DS 

RD RR4BE25TF 842 0 0
GATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCC
GCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGG
CGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAAAA
AAAAAAAAAGTAAAAAAAACCATTGAAACAATTATGAATTCCATTAAGTTTCCCGTACTT
GATCGAACAACAAAAAACTCAGTTATTTCAACTACGTTAAATGATCTTTCAAATTGGTCA
AGACTTTCCAGCCTATGGCCGCTTCTTTATGGTACCAGTTGTTGTTTTATTGAATTTGCC
TCATTAATAGGCTCCCGATTTGACTTTGATCGTTATGGGCTAGTACCAAGATCAAGTCCT
AGGCAGGCGGACCTTATTTTAACAGCAGGTACAGTAACAATGAAAATGGCTCCTTCTTTA
GTGAGATTATATGAACAAATGCCTGAACCAAAGTATGTTATTTCTATGGGAGCGTGTACA
ATTACAGGGGGGATGTTCAGTACCGATTCTTATAGTACTGTTCGAGGGGTTGATAAGCTA
ATTCCTGTAGATGTCTATTTGCCGGGTTGTCCACCTAAACCAGAGGCTGTTATAGACGCT
ATAACAAAGCTTCGTAAGAAAATAGCTAGAGAAATCTATAAGGATCGAATTAGACCTCAA
CGGGGTAATCGGTGTTTTATTACCAATCACAAGTTTTTTGTTGTACGCAGTACGCAGACT
GGAAA*TTATGATCGAGAATTACTCTATCCACCATCATCTACTTCAGAGATCTCTACTGA
AA

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4BF12TF 817 0 0
GATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCC
GCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGG
CGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAAAA
AAAAAAAAAGTAAAAAAAACCATTGAAACAATTATGAATTCCATTAAGTTTCCCGTACTT
GATCGAACAACAAAAAACTCAGTTATTTCAACTACGTTAAATGATCTTTCAAATTGGTCA
AGACTTTCCAGCCTATGGCCGCTTCTTTATGGTACCAGTTGTTGTTTTATTGAATTTGCC
TCATTAATAGGCTCCCGATTTGACTTTGATCGTTATGGGCTAGTACCAAGATCAAGTCCT
AGGCAGGCGGACCTTATTTTAACAGCAGGTACAGTAACAATGAAAATGGCTCCTTCTTTA
GTGAGATTATATGAACAAATGCCTGAACCAAAGTATGTTATTTCTATGGGAGCGTGTACA
ATTACAGGGGGGATGTTCAGTACCGATTCTTATAGTACTGTTCGAGGGGTTGATAAGCTA
ATTCCTGTAGATGTCTATTTGCCGGGTTGTCCACCTAAACCAGAGGCTGTTATAGACGCT
ATAACAAAGCTTCGTAAGAAAATAGCTAGAGAAATCTATAAGGATCGAATTAGACCTCAA
CGGGGTAATCGGTGTTTTATTACCAATCACAAGTTTTTTGTTGTACGCAGTACGCAGACT
GGAAAATTATGATCGAGAATTACTCTATCCACCATCA

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 15

CO CL55Contig1 890 15 14 U
AATCTGCAATTAACTTAATCAAACAACGCCAAACAAGAGGAGCCTTAAAACACAATCAGA
GTGAACTTAACGTGCATAGGTACGACGACGTAGATTAACAAGTAATATGTACACATCACG
CTACATACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTG
TAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATG
ACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATT
TCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCAT
CATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTAT
CAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAG
GTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGT
ACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGC
GAAGGTCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAA
AATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTCACTCTAACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGT
CTACCATCTCCTTAACCACTTGATACATGGTGGGTCTTGCAATCTGGACATTGGTCATTG
CTGCCATAAGTAACACACTAGGCATCTCCAAGACAATAATGGGAAGGAGGAGACCGGTCC
CATCTTCCATCTTCAAGACAATAGCAGGGTGTGGAGCATAGTCAGGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 45 
30 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 75 75 75 75 75 75 75 75 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 70 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 30 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 10 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ45JQ U 63
AF RR4BZ69JQ U 63
AF RR4BZ69TF C 63
AF RR4BM41JQ U 24
AF RR4BN49JQ U 24
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AF RR4FZ31TF C 151
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AF RR4EU54TF C 253
BS 1 5 RR4AO01TF
BS 6 23 RR4E025JQ
BS 24 62 RR4BM41JQ
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BS 163 352 RR4BZ45JQ
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CACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTC
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QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4BZ69JQ 475 0 0
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ACATACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCAGGGACAATGGGTTAAGTGTA
GAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGAC
CACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTC
CTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCGGCTTCATCA
TATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCA
AGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCGGAAGCAGGT
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QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4BZ69TF 475 0 0
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ACATACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCAGGGACAATGGGTTAAGTGTA
GAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGAC
CACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTC
CTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCGGCTTCATCA
TATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCA
AGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCGGAAGCAGGT
GTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCAA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4BM41JQ 506 0 0
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CGTTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAAAAGCATTCTTAAATATCCGA
AAACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACA
GACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTA
AACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCT
TGCATCATGTTGCTCAAAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGT
TTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCT
GACTCGATGACTCTCATTCCATCAC
C

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4BN49JQ 506 0 0
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GACGACGTAAATTAACAAGTAATATGTACACATCACGCTACATACATATTTAACACATTA
CGTTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAAAAGCATTCTTAAATATCCGA
AAACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACA
GACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTA
AACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCT
TGCATCATGTTGCTCAAAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGT
TTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCT
GACTCGATGACTCTCATTCCATCAC
C

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4BN49TF 506 0 0
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AGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACA
GACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTA
AACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCT
TGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGT
TTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCT
GACTCGATGACTCTCATTCCATCAC
C

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4AO01TF 667 0 0
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GTGAACTTAACGTGCATAGGTACGACGACGTAGATTAACAAGTAATATGTACACATCACG
CTACATACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTG
TAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATG
ACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATT
TCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCAT
CATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTAT
CAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAG
GTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGT
ACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGC
GAAGGTCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAA
AATACGC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4E025JQ 745 0 0
GCAATTAACTTAATCAAACAACGCCAAACAAGAGGAGCCTTAAAACACAATCAGAGTGAA
CTTAACGTGCATAGGTACGACGACGTAGATTAACAAGTAATATGTACACATCACGCTACA
TACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAGAA
GCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCAC
CTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTC
AGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATAT
CGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAAAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGG
CAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTC
TGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGTACTTG
TTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCGAAGG
TCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAAAATAC
GCCTCGTGAACTCTTTTGGTCACTCTAACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTCTACC
ATCTCCTTAACCACTTGATACATGG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4DF59JQ 671 0 0
CAGAATGAACTTAACGTGCATAGGTACGACGACGTAGATTAACAAGTAATATGTACACAT
CACGCTACATACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTA
AGTGTAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGAC
AATGACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTG
TATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAGCTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCGGCT
TCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAAAATATTGAACTCTTTC
GTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCGGAA
GCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCA
AGGTACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAA
GGGCGGAGGTCAAAGCTGATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTATAGTTGA
GCAAAATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTGACTCTAACAAGTCTAACTTCGTAACCCATC
TTGTCCACCAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4E694JQ 717 0 0
GCAATTAACTTAATCAAACAACGCCAAACAAGAGGAGCCTTAAAACACAATCAGAGTGAA
CTTAACGTGCATAGGTACGACGACGTAGATTAACAAGTAATATGTACACATCACGCTACA
TACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAGAA
GCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCAC
CTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTC
AGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATAT
CGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGG
CAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTC
TGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGTACTTG
TTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCGAAGG
TCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAAAATAC
GCCTCGTGAACTCTTTTGGTCACTCTAACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTCT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4E025TF 690 0 0
TC
TTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGC
TTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATAC
TTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCA
AGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATG
TTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGC
TCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATG
ACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGTACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTA
ACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCGAAGGTCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTA
CCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAAAATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTCACTCTA
ACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTCTACCATCTCCTTAACCACTTGATACATGGTT
GGTCTTGCAATCTGGACATTGGTCATTGCTGCCATAAGTAACACACTAGGCATCTCCAAG
ACAATAATGGGAAGGAGGAGACCGGTCC

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR4EU54JQ 637 0 0
CTGGGACAATGGGTTAAGTGTAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCT
CCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGAT
CGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTC
TCTCCATTCAGCGGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAA
AATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAA
CAATAAACCATCGGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCATGACTCGATGACTCTCAT
TCCATCACTATATGCAAGGTACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTAT
ATTAATTGCATCTGAAGGGCGGAGGTCAAAGCTGATACAGTCAGATGCATTACCCACCTT
TGAAAGGTATAGTTGAGCAAAATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTGACTCTAACAAGTCT
AACTTCGTAACCCATCTTGTCCACCATCTCCTTAACCACT*GATACATGGTGGGTCTTGC
AATCTGGACATTGGTCATTGCTGCCATAAGTAACACA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4FZ31TF 683 0 0
TC
TTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGC
TTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATAC
TTGTTGATCGAGTTCTCTTACGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCA
AGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATG
TTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGC
TCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATG
ACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGTACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTA
ACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCGAAGGTCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTA
CCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAAAATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTCACTCCA
ACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTCTACCATCTCCTTAACCACTTGATACATGGTT
GGTCTTGCAATCTGGACATTGGTCATTGCTGCCATAAGTAACACACTAGGCATCTCCAAG
ACAATAATGGGAAGGAGGAG
C

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4E694TF 688 0 0
TTTTGTTTCTGGGACAATGGGTTAAGTGTAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGC
TTCTTCCTCCACTTTGATCCCGACAATGACCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATAC
TTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCA
AGCTTGTCTCTCCATTCAGCTGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATG
TTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTTGACCATTTGGTTTGTCTTGC
TCAGTAAACAATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATG
ACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGTACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTA
ACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCGAAGGTCAAAGCTTATACAGTCAGATGCATTA
CCCACCTTTGAAAGGTAAAGTTGTGCAAAATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTCACTCTA
ACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTCTACCATCTCCTTAACCACTTGATACATGGTT
GGTCTTGCAATCTGGACATTGGTCATTGCTGCCATAAGTAACACACTAGGCATCTCCAAG
ACAATAATGGGAAGGAGGAGACCGGTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4EU54TF 638 0 0
TTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTAC
GCTGGGCC*TAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCGGCTTCATCATATCGCTCTT
CATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGAACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCTT
GACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAACCATCGGAAGCAGGTGTCTGTTGTG
ACAGCTTCCATGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATATGCAAGGTACTTGTTCACTT
GGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCGGAGGTCAAAGC
TGATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTATAGTTGAGCAAAATACGCCTCGT
GAACTCTTTTGGTGACTCTAACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTCCACCATCTCCT
TAACCACT*GATACATGGTGGGTCTTGCAATCTGGACATTGGTCATTGCTGCCATAAGTA
ACACACTAGGCATCTCCAAGACAATAATGGGAAGGAGGAGACCGGTCCCATCTTCCATCT
TCAAGACAATAGCAGGGTGTGGAGCATAGTCAGGTAAC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 17

CO CL56Contig1 828 2 2 U
GGGGAAGTTCCTTGGTGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACG
ATCTGCAAGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGCGAGTCCAACATCTCCGGC
GATGACGCTTTCGCTCGTCTCTACGGAGCTTTCGAGACCCAAATCGAGACAGCTCTCGAG
AAAGCTGAAATTGTTACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCTGTTGCGATGAACGCTGAG
ATCCGTCGCACAAAGGCTAGATTGACTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTC
AAGCGGGTAAAGGGCCTTACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTACTTGCG
CTTCCGGCTAGGATCGAAGCTATACCTGATGGGACAGCGGGTGGTCCTAAAAGCACTACT
AGTGCTTGGGCTCCTTCTACAACCTCTCGTCCTGATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGT
TTTGATGATGATTACTTTCAAGAGTCGCATGAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAG
ATGCGCAAAATTAAGCAGGACCAAGGTCTGGACATGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTG
AAGAACATGGCGTCTGATATGAACGAGGAGCTGGATCGGCAAGTTCCTCTGATGGATGAA
ATCGATTCAAAGGTTGACAGAGCAACCTCGGATCTTAAGAACAATGTTGGACTCAAAGAT
ACTGTGAATCAGCTGAGATCAAGCCGGAACTTCTGCATCGATATTGTTCTGTTGTGTATT
GTTCTGGGTATCGCTGCATACTTGTACACGTACTGAAGTGATGAGATG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT01TF U 1
AF RR4B225TF U 1
BS 1 459 RR4AT01TF
BS 460 828 RR4B225TF

RD RR4AT01TF 459 0 0
GGGGAAGTTCCTTGGTGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACG
ATCTGCAAGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGCGAGTCCAACATCTCCGGC
GATGACGCTTTCGCTCGTCTCTACGGAGCTTTCGAGACCCAAATCGAGACAGCTCTCGAG
AAAGCTGAAATTGTTACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCTGTTGCGATGAACGCTGAG
ATCCGTCGCACAAAGGCTAGATTGACTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTC
AAGCGGGTAAAGGGCCTTACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTACTTGCG
CTTCCGGCTAGGATCGAAGCTATACCTGATGGGACAGCGGGTGGTCCTAAAAGCACTACT
AGTGCTTGGGCTCCTTCTACAACCTCTCGTCCTGATATC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR4B225TF 828 0 0
GG
GGAAGTTCCTTGGTGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACGAT
CTGCAAGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGCGAGTCCAACATCTCCGGCGA
TGACGCTTTCGCTCGTCTCTACGGAGCTTTCGAGACCCAAATCGAGACAGCTCTCGAGAA
AGCTGAAATTGTTACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCTGTTGCGATGAACGCTGAGAT
CCGTCGCACAAAGGCTAGATTGACTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTCAA
GCGGGTAAAGGGCCTTACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTACTTGCGCT
TCCGGCTAGGATCGAAGCTATACCTGATGGGACAGCGGGTGGTCCTAAAAGCACTACTAG
TGCTTGGGCTCCTTCTACAACCTCTCGTCCTGATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGTTT
TGATGATGATTACTTTCAAGAGTCGCATGAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGAT
GCGCAAAATTAAGCAGGACCAAGGTCTGGACATGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTGAA
GAACATGGCGTCTGATATGAACGAGGAGCTGGATCGGCAAGTTCCTCTGATGGATGAAAT
CGATTCAAAGGTTGACAGAGCAACCTCGGATCTTAAGAACAATGTTGGACTCAAAGATAC
TGTGAATCAGCTGAGATCAAGCCGGAACTTCTGCATCGATATTGTTCTGTTGTGTATTGT
TCTGGGTATCGCTGCATACTTGTACACGTACTGAAGTGATGAGATG

QA 3 828 3 828
DS 



CO CL56Contig2 1157 15 10 U
GATGAATAGAATTACATAAAATTTGGTAAATTCGGGAAGGAGAATATATATATTCATCAT
GTAATGGACATGAACAACATGGAAATAACTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGA
CACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAAAGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAA
CACACACACACAAACTGACTCGGGTAAGAAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAG
TGATGGGTCCCTTCCTGTTCATCTCATCACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATA
CCCAGAACGATACACAACAGAACAATATCGATGCAGAAGTTCCTGCTTGACCTCAGCTGG
TTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACC
TTTGAGTCTATTTCATCCATCAGAGGAACTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGAT
GCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTA
ATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAA
TCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGA
GCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATC
CTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTGTAAGGCCC
TTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCTCAGACAATCTAGCCTTT
GTGCGACGGATCTCAGCGTTCATCGCAACAGCGGAAGCTCTGTTCTTCTCCTTGGTAACA
ATCTCAGCTTTCTCGAGAGCTGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCTCCGTAGAGACGAGCG
AAAGCATCATCGCCGGAGATGTTGGACTCGCGCTGTTTGTCGACGTCGTACTTGTCGTAC
TTCTTGCAGATCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCATCTTCTCTCACAAA
GGAACTTCCGGATCTCTAATTAAGGGATAGAATCTCTCTGATTCGAAGAAGACTTCTCTA
GTTTATGTCCGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 40 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 40 40 40 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 
60 60 60 60 60 45 65 65 25 65 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 50 65 25 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 75 75 75 75 75 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 70 70 70 
70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR24JQ U 23
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AF RR4GK12JQ U 25
AF RR4E737JQ U 13
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AF RR4B703JQ U 1
AF RR4EN15JQ U 33
AF RR4B703TF C 347
AF RR4GK12TF C 530
AF RR4EN15TF C 355
AF RR4GA07TF C 426
AF RR4AR24TF C 533
AF RR4EH84TF C 532
BS 1 474 RR4B703JQ
BS 475 475 RR4H960JQB
BS 476 823 RR4B703JQ
BS 824 829 RR4EN15JQ
BS 830 830 RR4B703TF
BS 831 836 RR4EN15JQ
BS 837 837 RR4B703TF
BS 838 859 RR4EN15JQ
BS 860 1151 RR4B703TF
BS 1152 1157 RR4GA07TF

RD RR4AR24JQ 183 0 0
TT
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ATAACTCAATAAAAAAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAAAAAAAACTCTCGTCAAA
AGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGG
T

QA 3 183 3 183
DS 

RD RR4H960JQB 632 0 0
GGTAAATTCGGGAAGGAGAATATATATATTCATCATGTAATGGACATGAACAAAATGGAA
ATAACTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAA
AGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGG
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CATCACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACGATACACAACAGAACA
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TTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAGA
GGAACTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGATGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGA
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TTGAACTGGCAGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAA
TCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAG
C

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4H960TF 632 0 0
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AGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGG
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CATCACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACGATACACAACAGAACA
ATATCGATGCAGAAGTTCCTGCTTGACCTCAGCTGGTTCACAGTATCTTTGAGCCTAACA
TTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAGA
GGAACTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGATGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGA
CCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGT
TTGAACTGGCAGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAA
TCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAG
C

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4GK12JQ 678 0 0
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ATAACTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAA
*GATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGG
TAAGAAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAGTGATGGGTCCCTTCCTGTTCATCT
CATCACTTCAGTACATTGTAAAAGTATGCAGCGATACCCAGAACGATACACAACAGAACA
ATATCGATGCAGAAGTTCCTGCTTGACCTCAGCTGGTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACA
TTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTT**TCCATCGGA
GGAACTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGATGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGA
CCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGT
TTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAA
TCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTA
GGACCACCCGCTGTCCCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4E737JQ 690 0 0
C
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ACAACATGGAAATAACTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAA
CTCTCGTCAAAAGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAA
ACTGACTCGGGTAAGAAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAGTGATGGGTCCCTT
CCTGTTCATCTCATCACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACAATAC
ACAACAGAACAATATCGATGCAGAAGTTCCTGCTTGATCTCAGCTGGTTCACAGTATCTT
TGAGTCTAACATTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCGATTT
CATCCATCAGAGGAACTTGCCGATCCAGCTCCTCGTTCATATCAGACGCCATGTTCTTCA
AAGCATCTAGACCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCT
CAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAAC
GCCCAT*TGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAG
TAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCA

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR4EH84JQ 691 0 0
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AGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACATACTGACTCGGG
TAAGAAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAGTGATGGGTCCCTTCCTGTTCATCT
CATCACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACGATACACAACAGAACA
ATATCGATGCAGAAGTTCCTGCTTGACCTCAG***GTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACA
TTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAGA
GGAACTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGATGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGA
CCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGT
TTGAACCGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAA
TCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTA
GGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4GA07JQ 746 0 0
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ATAACTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACCCTTGGAAGAAACTCTCGTCAAA
AGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGG
TAAGAAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAGAGAGTAGTGATGGGTCCTTTCCTGT*CATCT
CATCACTTCAGTACGTTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACAATACACAACAGAACA
ATATCGATGCAGAAGTTCCGGCTTGATCTCAGCTGATTCACAGTATCTTTGAGTCTAACA
TTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCAACCTTTGAATCGATTTCATCCATCAGA
GGAACTTGCCGATCCAGCTCCTCGTTCATATCAGACGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGA
CCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGT
TTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAA
TCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCTCAAGCACTAGTAGTGCTTTTA
GGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATCCTAGCCGGAAGCGCAAGTACCAAA
TCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4B703JQ 823 0 0
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GTAATGGACATGAACAACATGGAAATAACTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGA
CACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAAAGATCACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAA
CACACACACACAAACTGACTCGGGTAAGAAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAG
TGATGGGTCCCTTCCTGTTCATCTCATCACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATA
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TTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGGTGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACC
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GCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTA
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TCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGA
GCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATC
CTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTGTAAGGCCC
TTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4EN15JQ 827 0 0
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ATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAAAGATCACA
CAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGGTAAGAAAC
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GCAGAAGTTCCTGCTTGACCTCAGCTGGTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGGTGTT
CTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAAAGGAACTTG
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AATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTG
GCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTT
GATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACC
CGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATCCTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCT
CGCAGCAAGCTCTTCCGTTGTA*GGCCCTTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTT
GGGA*CTTCCTCAGACA*TCTAGC*TTTGTGCGACGGATCTCAGCGT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4B703TF 805 0 0
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TTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAGAGGAACTTGACGGTCCAGCTCCT
CGTTCATACCAGATGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTTCGGAGATCATGTCCAGAC
CTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCG
ACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAG
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GTATAGCTTCGATCCTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTT
CCGTTGTAAGGCCCTTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCTCAG
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TCTCCTTGGTAACAATCTCAGCTTTCTCGAGAGCTGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCTC
CGTAGAGACGAGCGAAAGCATCATCGCCGGAGATGTTGGACTCGCGCTGTTTGTCGACGT
CGTACTTGTCGTACTTCTTGCAGATCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCA
TCTTCTCTCACAAAGGAACTTCCGGATCTCTAATTAAGGGATAGAATCTCTCTGATTCGA
AGAAGACTTCTCTAGTTTATGTCCG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4GK12TF 619 0 0
GGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCGACT
CTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGG
TTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTA
TAGCTTCGATCCTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCGCTTCCG
TTGTAAGGCCCTTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCTCAGACA
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CCTTGGTAACAATCTCAGCTTTCTCGAGAGCTGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCTCCGT
AGAGACGAGCGAAAGCATCATCGCCGGAGATGTTGGACTCGCGCTGTTTGTCGACGTCGT
ACTTGTCGTACTTCTTGCAGTTCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCATCT
TCTCTCACAAAGGAACTTCCGGATCTCTAATTAAGGGATAGAATCTCTCTGATTCGAAGA
AGACTTCTCTAGTTTAT
CC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4EN15TF 802 0 0
CAGCT
GTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGGTGT*CTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCAC
*TTTGAGTCTATTTCATCCATCAGAGGAACTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGA
TGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTT
AATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTA
ATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGG
AGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGAT
CCTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTGTAAGGCC
CTTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCTCAGACAATCTAGCCTT
TGTGCGACGGATCTCAGCGTTCATCGCAACAGCGGAAGCTATGTTCTTCTCCTTAGTAAC
AATCTCAGCTTTCTCGAGAGCTGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCTCCGTAGAGACGAGC
GAAAGCATCATCGCCGGAGATGTTGGACTCGCGCTGTTTGTCGACGTCGTACTTGTCGTA
CTTCTTGCAGATCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCATCTTCTCTCACAA
AGGAACTTCCGGATCTCTAATTAAGGGATAGAATCTCTCTGATTCGAAGAAGACTTCTCT
AGTTTATGTCCG
AAAAA

QA 6 797 6 797
DS 

RD RR4GA07TF 732 0 0
A
TCGATTTCATCCATCAGAGGAACTTGCCGATCCAGCTCCTCGTTCATATCAGACGCCATG
TTCTTCAAAGCATCTAGACCTTCGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTG
CGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCA
TCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCTCAA
GCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATCCTAGCC
GGAAGCGCAAGTACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTGTAAGGCCCTTTACC
CGCTTGAGAGCAAGTCTCCGCAGCTTGGGAACTTCCTCAGACAATCTAGCCTTTGTGCGA
CGGATCTCAGCGTTCATCGCAACAGCAGAAGCTCTGTTCTTCTCCTTGGTAACAATTTCA
GCTTTCTCGAGAGCTGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCTCCGTAGAGACGAGCGAAAGCG
TCATCGCCGGAGATGTTGGACTCGCGCTGTTTGTCGACGTCGTACTTGTCGTACTTCTTG
CAGATCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCATCTTCTCTCACCAAGGAACT
TCCGGATCTCTAATTAAGG*ACAGAAACTCTCTGATTCGAAGAAGACTTCTCTAGTTTGT
GTCCGAAAAAA

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR4AR24TF 619 0 0
CCTA
CTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAA
GTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGA
AGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTC
GATCCTCGCCGGAAGCGCAAGTACCAAATCGTTTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTGTAAG
GCCCTTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCTCAGACAATCTAGC
CTTTGTGCGACGGATCTCAGCGTTCATCGCAACAGCAGAAGCTCTGTTCTTCTCCTTGGT
AACAATTTCAGCTTTCTCGAGAGCTGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCCCCGTAGAGACG
AGCGAAAGCGTCATCGCCGGAGATGTTGGACTCGCGCTGTTTGTCGACGTCATACTTGTC
GTACTTCTTGCAGATCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCATCTTCTCTCA
CCAAGGAACTTCCGGATCTCTAATTAAGG*ACAGAAACTCTCTGATTCGAAGAAGACTTC
TCTAGTTTGTGTCCG

QA 5 619 5 619
DS 

RD RR4EH84TF 625 0 0
TCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACCGGCTGGATTCATGCGACTCT
TGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTTGATATCAGGACGAGAGGTT
GTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGACCACCCGCTGTCCCATCAGGTATA
GCTTCGATCCTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCTCGCAGTAAGCTCTTCCGTT
GTAAGGCCCTTTACCCGCTTGAGAGCAAGTCTCTGCAGCTTGGGAACTTCCTCAGACAAT
CTAGCCTTTGTGCGACGGATCTCAGCGTTAATCGCAACAGCGGAAGCTCTGTTCTTCTCC
TTGGTAACAATCTCAGCTTTCTCGAGAGATGTCTCGATTTGGGTCTCGAAAGCTCCGTAG
AGACGAGCGAAAGCATCATCGCCGGAGATGTTGGACTCACGCTGTTTGTCGACGTCGTAC
TTGTCGTACTTCTTGCAGATCGTGTCAACTCTGGTCAGAATGTCGATCACTGTCATCTTC
TCTCACAAAGGAACTTCCGGATCTCTAATTAAGGGATAGAATCTCTCTGATTCGAAGAAG
ACTTCTCTAGTTTATGTCCG
AAAAA

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 16

CO CL57Contig1 907 16 7 U
GCGGAATATTTTAGAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCGGGAAAAAGAAA
TGCATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCCGAACATAGTAAACATTCCA
GAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCATCACTCATATGTTACACCGTCAAGTACTTTAGAA
CCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCAT
TAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTTAACAAAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCA
TATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAG
CCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCT
GAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACC
GGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAA
GCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCT
CAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTT
CACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGA
ACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAATATACCTTTCGGATCCCATT
CGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGATTCTTGGGATTGTGCGGACAGTATTCGCGA
AGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTTATTTTTTTCTGGGAGGCTCTCCTTTCAC
TAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 35 60 60 45 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 
80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 65 65 65 35 65 65 65 65 65 60 
60 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 15 50 40 40 40 5 40 5 40 5 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

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BS 817 894 RR4AW19TF
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C

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DS 

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ACTTT
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CCTTTTGCATTTTGTC
C

QA 6 381 6 381
DS 

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CTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAG
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QA 1 575 1 575
DS 

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AGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTT
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ACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGA
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GCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTA
TCCTGCGTTTGA

QA 1 672 1 672
DS 

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AACAAAATAAATATAAATACATTTTACCCGAACATAGTAAACATTCCAGAAATTGAGAAA
TCTTTGTAGACTCATCACTCATATGTTACACCGTCAAGTACTTTAAAACCGAAGCACGCA
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QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4H971JQB 767 0 0
G
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CTTTGTAGACTCATCACTCATATGTTACACCGTCAAGTACTTTAGAACCGAAGCACGTAC
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TGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTC
CTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAG
CTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGAT
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CTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGC
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QA 2 767 2 767
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CCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCT
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GGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAA
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CACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGA
ACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAATATACCTTTCGGACCCCATT
CGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGATTCTTG

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DS 

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CCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTT
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CGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTAT
CTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTT
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DS 

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CCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTT
CATCAAGAAGAGTTAACAAAGATCTGTTGATTTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATG
TTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCT
CCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAA
GCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGA
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CGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTAT
CTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTT
TCAGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAG
CGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAATATACCTTTCGGATCCCATTC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4AW19TF 864 0 0
GATATAAAACATTCGTTCGGGAAAA*GAAATGCATTTTACTCAACAAAATAAATATAAAT
ACATTTTACCCGAACATAGTAAACATTCCAGAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCATCAC
TCATATGTTACACCGTCAAGTACTTTAGAACCGAAGCACGTACTTTCTCCATGTAATCTC
*TGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTTAACA
AAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCCTTGATATCGGTTG
AGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCAT
AAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTT
CATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCG
CAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAG
CTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACT
CTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAG
CCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTG
CTGGTCCTAATATACCTTTCGGACCCCATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGA
TTCTTGGGATTGTGCGGACAGTATTCGCGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTG
TTATTTTTTTCTGGGAGGCTCTCC

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR4AB89TF 682 0 0
GCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTTAACAAA
GATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAG
GTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAGGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAA
GCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCA
TCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCA
AAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCT
TCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCT
CTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCC
TCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCT
GGTCCTAATATACCTTTCGGATCCCATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGATT
CTTGGGATTGTGCGGACAGTATTCGCGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTT
ATTTTTTTCTGGGAGGCTCTCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4D072TF 555 0 0
TCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAG
TTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCG
CGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAACT
CGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGT
CAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAG
CTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGT
CTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTA
ATATACCTTTCGGATCCCATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGATTCTTGGGA
TTGTGCGGACAGTATTCGCGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTTATTTTTT
TCTGGGAGGCTCTCC

QA 1 555 1 555
DS 

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TTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTTAACAAAGA
TCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGT
TAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGC
CTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATC
TTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAA
AAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTC
CGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCT
AAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTC
GGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGG
TCCTAATATACCTTTCGGATCCCATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGATTCT
TGGGATTGTGCGGACAGTATTCGCGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTTAT
TTTTTTCTGGGAGGCTCTCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4FD52TF 344 0 0
GAAGCCTAACGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCA
GCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCT
CTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGACTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTT
TGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAGTATACCTTTGGGATCCC
ATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTAATTCTCGGGACTTTACGGACGGTATTCG
CGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTTATTTTTTT
T

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4A060TF 693 0 0
TTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTTAACAAAGA
TCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGT
TAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGC
CTCAATTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATC
TTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGTGCAAA
AAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTC
CGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCT
AAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTC
GGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGG
TCCTAGTATACCTTTGGGATCCCATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTAATTCT
CGGGACTTTACGGACGGTATTCGCGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTTAT
TTTTTTCTGGGAGGCTCTGCTTTCACTAGCTCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4A060TFB 693 0 0
TTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTTAACAAAGA
TCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGT
TAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGC
CTCAATTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATC
TTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGTGCAAA
AAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTC
CGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCT
AAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTC
GGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGG
TCCTAGTATACCTTTGGGATCCCATTCGCAGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTAATTCT
CGGGACTTTACGGACGGTATTCGCGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTGTTAT
TTTTTTCTGGGAGGCTCTGCTTTCACTAGCTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 2 17

CO CL58Contig1 1002 15 21 U
GGGTCTCTCTATACTCTCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAAA
**TGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAAACCATCTCCGTCTC
ATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAAC
AGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGG
CAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGA
GTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCAC
TAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAA
AGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCT
GAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAG
ATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGA
AGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTG
ATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCTA
TCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACC
TTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCTTGCCTGTGATGATGCTACCACCAGTTTAC
AAATAAATATGACACTCCTGAGAAAACGACATACAGATACTTGTGTCCTTTTTTGAACTT
TTCACATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCGAAGTAAGCTTTTGAAGACATCAAGTTTCAA
TGATCTTTGGGTTTACATTTGAGAATAAATGAGCAATTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 35 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 
75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 60 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 50 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 65 65 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 35 80 80 80 80 80 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 
55 30 50 50 50 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CI39TF U 1
AF RR4FW33TF U 1
AF RR4DB63TF U 24
AF RR4A914TF U 2
AF RR4DB03TF U 24
AF RR4B964TF U 41
AF RR4BY63TF U 37
AF RR4DI85TF U 41
AF RR4E104JQ C 345
AF RR4BN79JQ C 220
AF RR4DI85JQ C 332
AF RR4FW33JQ C 275
AF RR4BY63JQ C 254
AF RR4B964JQ C 461
AF RR4CI39JQ C 666
BS 1 508 RR4CI39TF
BS 509 509 RR4FW33TF
BS 510 593 RR4CI39TF
BS 594 594 RR4FW33TF
BS 595 602 RR4CI39TF
BS 603 603 RR4FW33TF
BS 604 627 RR4CI39TF
BS 628 690 RR4FW33TF
BS 691 700 RR4A914TF
BS 701 704 RR4BY63TF
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BS 763 976 RR4BN79JQ
BS 977 1001 RR4BY63JQ
BS 1002 1002 RR4B964JQ

RD RR4CI39TF 627 0 0
GGGTCTCTCTATACTCTCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAAA
**TGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAAACCATCTCCGTCTC
ATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAAC
AGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGG
CAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGA
GTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCAC
TAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAA
AGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCT
GAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAAATTCATGCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAG
ATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAG*AGTTGA
AG*AGACACTCCAGGAGATAATTGGAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4FW33TF 690 0 0
GGGTCTCTCTATACTC
TCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAAA**TGGCGTTGGCTGGT
CGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAAACCATCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCAC
CTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAG
ACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGG
CTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAG
CTAGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTT
CCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAAAA
CCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTG
ATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGT
TACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGA
GATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGG
AGGGCTAATAGTAG

QA 17 690 17 690
DS 

RD RR4DB63TF 648 0 0
GG
AGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAAA**TGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGA
TCCGGGATCTCCTTCTTCAAAACCATCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGA
GCGCCGCTCATCCCCGCGTTGATAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAAT
GTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATT
GCAGCCGTGAAAATGAACTCTTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAG
GCTATGAAGACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAG
ACGAGGCTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAG
AACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGTTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAA
AAA*TTCATGCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGT
CATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGG
AGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR4A914TF 699 0 0
GGGAATCGGCTTTTA
TCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAAAAATGGCGTTGGCTGGT
CGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCTTCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCAC
CTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCTCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAAAAA
ACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGG
CTGTACATCGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATTGAGTCTGATCTCTCTGAG
CTGGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCCACTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTT
CCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAA
CCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTG
ATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGACAACAGCACATAGAGGGGATGTCAAGGTTTTGGT
TACCACTGTCATGCCGCTTCCCCCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGA
GATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATCTACGG
AGGGCTAATAGTGGAGTTTCAACA

QA 16 699 16 699
DS 

RD RR4DB03TF 648 0 0
GG
AGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAAAAATGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGA
TCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCTTCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGA
GCGCCGCTCATCCCCTCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAAAAAACCGCCAAT
GTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATC
GCAGCTGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATTGAGTCTGATCTCTCTGAGCTGGTCGAG
GCTATGAAGACGAGCCCCACTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAG
ACGAGACTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAG
AACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTTTGAAA
AAA*TTCATGCAGTTGACAACAGCACATAGAGGGGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGT
CATGCCGCTTCCCCCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAAGAGACACTCCAGGAGATAATTGG
AGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR4B964TF 680 0 0
GG
ATCTGCAACAACAAAAAA**TGGCGTTGGTTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTT
CAAAACCATCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCGC
GTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGC
TTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAA
CTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCC
TACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTAT
CGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTT
AGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGA
CGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTG
CTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAA
CTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAA
AGGTGTTGGACATGTCTA

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR4BY63TF 734 0 0
GG
GATTATCTGCAACAACAAAAAA**TGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCT
TCTTCAAAACCATCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTCA*CC
CCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTG
TGGCTTTAGTTGGTGAATCCGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAA
TGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGA
GCCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTG
CTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTC
TGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAG
TTGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCA
CCTTCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAA
GTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAA
CAAAAG*TGTTGGACATGTCTATCAG*ACA**GGCACAGCAGATGGAGAGGCTC*TCCGT
GAGC
TGTTGACT

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4DI85TF 685 0 0
GG
ATCTGCAACAACAAAAAA**TGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTT
CAAAACCATCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCGC
GTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGC
TTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAA
CTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCC
TACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTAT
CGTGGATGTTTGTGTTAAAGCCGAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTT
AGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGA
CGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTG
CTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAA
CTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAA
AG*TGTTGGACATGTCTATCAG
A

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR4E104JQ 614 0 0
T
TTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATCGT
GGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCGGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGC
TGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGACAA
CAGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTG
GGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGATAAGGGAAGAAAGTAACTG
TGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATTTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGG
TGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTG
TTGACTTCACCAACCTT*GAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCTTGCCTGTGATGATG
CTACCACCAGTTTACAAATAAATATGACACTCCTGAGAAAACGACATACAGATACTTGTG
TCCTTTTTTGAACTTTTC*CATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCGAAGTAAGCTTTTGAA
AACATCAAGTTTC

QA 2 614 2 614
DS 

RD RR4BN79JQ 760 0 0
GGCTTTAGTTG*TGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAAT
GAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGAG
CCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGC
TATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCT
GTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGT
TGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCAC
CTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAG
TAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAAC
AAAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTG
AGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCTTGCCTGTG
ATGATGCTACCACCAGTTTACAAATAAATATGACACTCCTGAGAAAACGACATACAGATA
CTTGTGTCCTTTTTTGAACTTTTCACATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCGAAGTAAGCT
TTTGAAGACATCAAGTTTCAATGATCTTTGGGTTTAC
ATT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4DI85JQ 645 0 0
AAGACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGG
CTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGTTAAAGCCGAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTC
CTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TT
CATGCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCC
GCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGG
GAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGA
GTTTCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCT
CCTCCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCT
TGCCTGTGATGATGCTACCACCAGTTTACAAATAAATATGACACTCCTGATAAAACGACA
TACAGATACTTGTGTCCTTTTTTGAACTTTTCACATTTTACAATTGTTGTTTTGCTCCGA
AGTAAGCTTTTGAAGACATCGAGTTTCAATGATCTTTGGGTTTAC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4FW33JQ 700 0 0
AAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCTGAGCTAGTCGAGGCTATGAAG
ACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTC
GCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAAAACCCACCAAGAACTTCCTC
TCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCAT
GCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCT
TCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAA
GAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTT
TCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCT
CCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCTTGC
CTGTGATGATGCTACCACCAGTTTACAAATAAATATGACACTCCTGAGAAAACGACATAC
AGATACTTGTGTCCTTTTTTGAACTTTTCACATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCGAAGT
AAGCTTTTGAAGACATCAAGTTTCAATGATCTTTGGGTTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4BY63JQ 748 0 0
TGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCT
GAGCTAGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTACTTTCTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCT
GTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCA
GAACCCACCAAGAACTTCCTCTTTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGAC
GTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTTGACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTT
GGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTTTTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCA
GGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATCTA
CGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGC
ACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGACTTTC
CCCCTAAAGAAACCTGCTTGCCTGTGATGATGCTACCACCAGTTTACAAATAAATATGAC
ACTCCTGAGAAAACGACATACAGATACTTGTGTCCTTTTTTGAACTTTTCACATTTTACA
ATTGTTGTTTTGCTTCGAAGTAAGCTTTTGAAGACATCAAGTTTCAATGATCTTTGGGTT
TACATTTGAGAATAAATGAGCAATTTGG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4B964JQ 542 0 0
TTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGACGTGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGTT
GACGACTGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCCCC
TGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGT
AACTGTGGAACAAAAGATTGATCCTAGTATTTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACA
AAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGA
GCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCTTGCCTGTGA
TGATGCTACCCCCAGTTTACAAATAAATATGACACTCCTGAGAAAACGACATACAGATAC
TTGTGTCCTTTTTTGAACTTTTCACATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCGAAGTAAGCTT
TTGAAGACATCAAGTTTCAATGATCTTTGGGTTTACATTTGAGAATAAATGAGCAATTTG
GT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4CI39JQ 297 0 0
AGTATTTACGGAGGG*TAATAGTAGAGTTTCA*CAAAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGG
ACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGA
AGACTTTCCCCCTAAAGAAACCTGCTTGCCTGTGATGATGCTACCACCAGTTTACAAATA
AATATGACACTCCCGAGAAAACGACATACAGATACTTGTGTCCTTTTTTGAACTTTTCAC
ATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCGAAGTAAGCTTTTGAAGACATCGAGTTTCAATG

QA 1 297 1 297
DS 



CO CL58Contig2 684 2 5 U
GGAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAATGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGAT
CCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCACCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAG
CGCCGCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGATTCGGCTCAGAAGACCGCCAATG
TTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATAG
CAGCAGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTCGTCGAGG
CTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGA
CGAGACTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCGGAACCCACCAAGA
ACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAA
AATTCATGCAGTTGACAACAGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCA
TGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAG
AAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATCTACGGAGGGCTAATA
GTAGAGTTTCAACAAAAGTGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E104TF U 18
AF RR4EC49TF U 1
BS 1 92 RR4EC49TF
BS 93 93 RR4E104TF
BS 94 602 RR4EC49TF
BS 603 603 RR4E104TF
BS 604 684 RR4EC49TF

RD RR4E104TF 628 0 0
GG
ATCTGCAACAACAAAAATGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAA
GACCACCTCCGTCTCATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTCATCCCCGCGTT
GAGAGATTACGCAACAGATTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTT
AGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATAGCAGCAGTGAAAATGAACTC
CTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTCGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTAT
TTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATCGT
GGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCGGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGC
TGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACAAC
AGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGG
GGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGATAAAGGGAAGAAAGTAACTG
TGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATC

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR4EC49TF 684 0 0
GGAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAACAACAAAAATGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGAT
CCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCACCTCCGTC*CATCCGCTAGATCTCACCTCCGTGGAG
CGCCGCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGATTCGGCTCAGAAGACCGCCAATG
TTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTGTACATAG
CAGCAGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTCGTCGAGG
CTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGA
CGAGACTCGCTGCTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCGGAACCCACCAAGA
ACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAA
AATTCATGCAGTTGACAACAGCACATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCA
TGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAG
AA*GGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATCTACGGAGGGCTAATA
GTAGAGTTTCAACAAAAGTGTTGG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 14

CO CL59Contig1 1352 14 39 U
GCGATAAATATTTAACTCTTTAATGATCAAGTCTAAGTGTAAACAAAGTTGAGAAAGAAG
CAAATTAACCATATTATAATTCTTCATGGGTTGAATTATTTAATGTCTATAACATTTTCA
CGGCGAACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAACACAGA
ATATCTTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAATCTCA
TCTGAACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTCA
TCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCAG
CTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCAA
CCAATAAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCCA
GATTTGTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTTCGACAGGTCCATTCTTG
TAAATCTCAGCCATGATATCTTGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGTAA
TGTTTTGACTCGCTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTGTA
TTGTATGCAGGTTCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACAC
TCTTCAGTGACAACACCACTGTAGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCACCG
TCACAACCGTCACCACAACGGAATCCACAGCATGCTAAGAGATCATTTACTGATAAAGTA
ATGTTCATTCCAAATTGGATACAGAATCTATCAGATAGTGATTCAACAGCACCAAATGCC
CAGCAAGAACCACAATGTCCCTGATCTAAGATTTTTCCAATACTGGTGCATTGAGGCCAA
TGTGTTCTAGCATCGAATGATTTAGGTAACTTCAGAGATTGATCATGGCTTACAACAGGA
ACACCTAAGAGTAACTTCTTAGGTGTTGGTTTAACACCAAGGAGACGCTTAAACTCTGCT
ACAGTTGCGTTAGAGAAACGATCATTAATAGCAGCTTTCCATCCAGCGTTCGGATGTTCG
TTGACCTTCTTCACTATCTCTTCCTGAAGTATCTTCGAGCTCAGTTTCTGTTTGGTAAGA
TTCTCTGCTGCAACTCCCTGCAAGTCGAGAGACGAGGAGACAAGGCCTAAGAGCAAGACA
ACAGAGACCAAACAGAGTTTGGTTGTAGAATCAGCAGCCATGGTTTTGGAATCCCAGAAG
ATTAAAAGATCTCGTTGTAGAAGCAACCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 35 35 35 40 45 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 55 55 55 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 45 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 30 45 30 45 45 45 45 30 30 45 30 30 30 
30 45 45 30 45 30 45 30 45 45 45 30 30 45 30 45 45 30 45 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4DP02JQ U 1
AF RR4AE58TF C 61
AF RR4F443JQ U 51
AF RR4CD26JQ U 58
AF RR4F443TF C 56
AF RR4DP55JQ U 1
AF RR4GD83JQ U 6
AF RR4B636JQ U 73
AF RR4BX60JQ U 58
AF RR4BH22TF C 487
AF RR4DP02TF C 683
AF RR4DP55TF C 857
AF RR4CD26TF C 545
AF RR4B636TF C 560
BS 1 87 RR4DP02JQ
BS 88 88 RR4GD83JQ
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BS 196 523 RR4DP02JQ
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BS 786 786 RR4BX60JQ
BS 787 787 RR4GD83JQ
BS 788 788 RR4BX60JQ
BS 789 791 RR4GD83JQ
BS 792 793 RR4BX60JQ
BS 794 794 RR4GD83JQ
BS 795 795 RR4BX60JQ
BS 796 797 RR4GD83JQ
BS 798 798 RR4BX60JQ
BS 799 800 RR4GD83JQ
BS 801 885 RR4BX60JQ
BS 886 886 RR4BH22TF
BS 887 905 RR4BX60JQ
BS 906 908 RR4BH22TF
BS 909 928 RR4BX60JQ
BS 929 941 RR4BH22TF
BS 942 942 RR4DP02TF
BS 943 1352 RR4BH22TF

RD RR4DP02JQ 523 0 0
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TCTGAACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTCA
TCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCAG
CTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCAA
CCAATAAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCCA
GATTTGTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4AE58TF 442 0 0
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CGGCGAACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAACACAGA
ATATCTTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAATCTCA
TCTGAACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTCA
TCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCAG
CTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCAA
CCAATAAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCCA
GATTTGTAATGAGCAAAGTCC
C

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DS 

RD RR4F443JQ 468 0 0
GG
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CATTTTCACGGCGAACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGT
AACACAGAATATCTTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAG
AAATCTCATCTGAACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCA
CTGGTTCATCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCAT
CACCCCAGCTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAG
TTCCCCAACCAATAAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGT
ACACTCCAGATTTGTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGA

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DS 

RD RR4CD26JQ 508 0 0
GG
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AATATCTTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAATCTC
ATCTGAACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTC
ATCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCA
GCTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCA
ACCAATAAGTTTCACAGCGTGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCC
AGATTTGTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAAACTTCCACAGGTCCATTCTT
GTAAATCTCAGCCATGATATCTTGAG

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DS 

RD RR4F443TF 590 0 0
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TTTCACGGCGAACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAAC
ACAGAATATCTTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAA
TCTCATCTGAACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTG
GTTCATCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCAC
CCCAGCTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTC
CCCAACCAATAAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACA
CTCCAGATTTGTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTTCGACAGGTCCAT
T**TGTAAATCTCAGCCATGATATCTTGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATAC
TGTAATGTTTTGACTCGCTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTC

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DS 

RD RR4DP55JQ 752 0 0
GCGAT
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TAACCATATTATAATTCTTCATAGGTTGAATTATTTAATGTCTATAACATTTTCACGGCG
AACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAACACAGAATATC
TTACAGACAAAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAATCTCATCTGA
ACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTCATCTTC
AATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCAGCTTCT
GTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCAACCAAT
AAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTT
GTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTTCGACAGGTCCATTCTTGTAAAT
CTCAGCCATGATATCTTGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGTAATGTTT
TGACTCGCTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTGTATTGTA
TGCAGGTTCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACACTCTTC
AGTGACAACACCACTGTAGGAAAAGTA

QA 6 752 6 752
DS 

RD RR4GD83JQ 796 0 0
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TAACCATATTATAATTCTTCATGGGTTGAATTATTTAATGTCTATAACATTTTCACGGCG
AACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAACACAGAATATC
TTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAATCTCATCTGA
ACCGGTTGTAACCTTGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTCATCTTC
AATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCAGCTTCT
GTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCAACCAAT
AAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTT
GTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTTCGACAGGTCCATTCTTGTAAAT
CTCAGCCATGATATCTTGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGTAATGTTT
TGACTCGCTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTGTATTGTA
TGCAGGTTCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACACTCTTC
AGTGACAACACCACCGTAGTAATAGTAT****AAGCAGTAC**GCGTAGATAA**ACAAA
CCAGTCGACCCACCGC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4B636JQ 727 0 0
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TCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAACACAGAATATCTTACAGA
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GTAACCTTGAACACATTCT*GGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTTCATCTTCAATTCCA
CATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCCAGCTTCTGTTCCAT
TGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCCAACCAATAAGTTTC
ACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTTGTAATGA
GCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTTCGACAGGTCCATTCTTGTAAATCTCAGCC
ATGATATCTCGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGTAATGTTTTGACTCG
CTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTGTATTGTATGCAGGT
TCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACACTCTTCAGTGACA
ACACCACTGTAGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCACCGTCACAACCGTCA
CCACAAC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4BX60JQ 878 0 0
G
AGCAAATTAACCATATTATAATTCTTCATGGGTTGAATTATTTAATGTCTATAACATTTT
CACGGCGAACAAGTTCCGGTCACCGGAAACAACAACAACAAACCACAACACAGTAACACA
GAATATCTTACAGACACAAACTTCTCCATCTCTTATCTTAAACCGATGCAACAGAAATCT
CATCTGAACCGGTTGTAACCTCGAACACATTCTTGGTTGAAGGCAAACCACCCACTGGTT
CATCTTCAATTCCACATTCATTTGTTCCTCTCCTAATCATGAAATAACCATCATCACCCC
AGCTTCTGTTCCATTGATTTGCCAACAACCAATAATCTTCTCCATCATCAGTAGTTCCCC
AACCAATAAGTTTCACAGCATGACCTCCAATGTTAGAGCCTGTTATGTGCTTGTACACTC
CAGATTTGTAATGAGCAAAGTCCTCATAAACTGTGAAAGAGACTTCGACAGGTCCATTCT
TGTAAATCTCAGCCATGATATCTTGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGT
AATGTTTTGACTCGCTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTG
TATTGTATGCAGGTTCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCAC
ACTCTTCAGTGACAACACCACTGTAGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCAC
CGTCACAACCGTCACCACAACGGAATCCACAGCATGCTAAGAGATCATTTACTGATAAAG
TAATGTTCATTCCAAATTGGATACAGAATCTATCAGATAGTGATTCA*CAGCACCAAATG
CCCAGCAG**ACCACAATGTCCCTGATCTA
GATTTTC

QA 2 871 2 871
DS 

RD RR4BH22TF 866 0 0
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TCAGCCATGATATCTCGAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGTAATGTTTT
GACTCGCTCCATAATTGGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTGTATTGTAT
GCAGGTTCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACACTCTTCA
GTGACAACACCACTGTAGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCACCGTCACAA
CCGTCACCACAACGGAATCCACAGCATGCTAAGAGATCATTTACTGATAAAGTAATGTTC
ATTCCAAATTGGATACAGAATCTATCAGATAGTAATTCAACAGCACCAAATGCCCAGCAA
GAACCACAATGTCCCTGATCTAAGATTTTTCCAATGCTGGTGCATTGAGGCCAATGTGTT
CTAGCATCGAATGATTTAGGTAACTTCAGAGATTGATCATGGCTTACAACAGGAACACCT
AAGAGTAACTTCTTAGGTGTTGGTTTAACACCAAGGAGACGCTTAAACTCTGCTACAGTT
GCGTTAGAGAAACGATCATTAATAGCAGCTTTCCATCCAGCGTTCGGATGTTCGTTGACC
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GCTGCAACTCCCTGCAAGTCGAGAGACGAGGAGACAAGGCCTAAGAGCAAGACAACAGAG
ACCAAACAGAGTTTGGTTGTAGAATCAGCAGCCATGGTTTTGGAATCCCAGAAGATTAAA
AGATCTCGTTGTAGAAGCAACCTCCC

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR4DP02TF 670 0 0
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AGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCACCGTCACAACCGTCACCACAACGGA
ATCCACAGCATGCTAAGAGATCATTTACTGATAAAGTAATGTTCATTCCAAATTGGATAC
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GTGTTGGTTTAACACCAAGGAGACGCTTAAACTCTGCTACAGTTGCGTTAGAGAAACGAT
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TTGTAGAATCAGCAGCCATGGTTTTGGAATCCCAGAAGATTAAAAGATCTCGTTGTAGAA
GCAACCTC
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4DP55TF 496 0 0
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GTCCCTGATCTAAGATTTTTCCAATACTGGTGCATTGAGGCCAATGTGTTCTAGCATCGA
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TCTTAGGTGTTGGTTTAACACCAAGGAGACGCTTAAACTCTGCTACAGTTGCGTTAGAGA
AACGATCATTAATAGCAGCTTTCCATCCAGCGTCCGGATGTTCGTTGACCTTCTTCACTA
TCTCTTCCTGAAGTATCTTCGAGCTCAGTTTCTGTTTGGTAAGATTCTCTGCTGCAACTC
CCTGCAAGTCGAGAGACGAGGAGACAAGGCCTAAGAGCAAGACAACAGAGACCAAACAGA
GTTTGGTTGTAGAATCAGCAGCCATGGTTTTGGAATCCCAGAAGATTAAAAGATCTCGTT
GTAGAAGCAACCTC
CC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4CD26TF 806 0 0
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TTGACTCGCTCCATAATTGGTT*CTGCCAACGCATT*CCTCAGGCATTGCGGTGTAT*GT
ATGCAGGTTCACAGCCAGGGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACACTCTT
CAGTGACAACACCACCGTAGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCACCGTCAC
AACCGTCACCACAACGGAATCCACAGCATGCTAAGAGATCATTTACTGATAAAGTAATGT
TCATTCCAAATTGGATACAGAATCTATCAGATAGTGATTCAACAGCACCAAATGCCCAGC
AAGAACCACAATGTCCCTGATCTAAGATTTTTCCAATACTGGTGCATTGAGGCCAATGTG
TTCTAGCATCGAATGATTTAGGTAACTTCAGAGATTGATCATGGCTTACAACAGGAACAC
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TTGCGTTAGAGAAACGATCATTAATAGCAGCTTTCCATCCAGCGTTCGGATGTTCGTTGA
CCTTCTTCACTATCTCTTCCTGAAGTATCTTCGAGCTCAGTTTCTGTTTGGTAAGATTCT
CTGCTGCAACTCCCTGCAAGTCGAGAGACGAGGAGACAAGGCCTAAGAGCAAGACAACAG
AGACCAAACAGAGTTTGGTTGTAGAATCAGCAGCCATGGTTTTGGAATCCCAGAAGATTA
AAAGATCTCGTTGTAGAAGCAACCTC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4B636TF 783 0 0
CTC
GAGGATTAGACTCGACAACGTATGTATTAATACTGTAATGTTTTGACTCGCTCCATAATT
GGTTTCTGCCAACGCATTTCCTCAGGCATTGCGGTGTATTGTATGCAGGTTCACAGCCAG
GGTGTGAGCATCCGGTTTGATCAAAGTATGGATCACACTCTTCAGTGACAACACCACTGT
AGGAAAAGTATTGCCAAGCAGAAATTGGGTAGCCACCGTCACAACCGTCACCACAACGGA
ATCCACAGCATGCTAAGAGATCATTTACTGATAAAGTAATGTTCATTCCAAATTGGATAC
AGAATCTATCAGATAGTAATTCAACAGCACCAAATGCCCAGCAAGAACCACAATGTCCCT
GATCTAAGATTTTTCCAATGCTGGTGCATTGAGGCCAATGTGTTCTAGCATCGAATGATT
TAGGTAACTTCAGAGATTGATCATGGCTTACAACAGGAACACCTAAGAGTAACTTCTTAG
GTGTTGGTTTAACACCAAGGAGACGCTTAAACTCTGCTACAGTTGCGTTAGAGAAACGAT
CATTAATAGCAGCTTTCCATCCAGCGTTCGGATGTTCGTTGACCTTCTTCACTATCTCTT
CCTGAAGTATCTTCGAGCTCAGTTTCTGTTTGGTAAGATTCTCTGCTGCAACTCCCTGCA
AGTCGAGAGACGAGGAGACAAGGCCTAAGAGCAAGACAACAGAGACCAAACAGAGTTTGG
TTGTAGAATCAGCAGCCATGGTTTTGGAATCCCAGAAGATTAAAAGATCTCGTTGTAGAA

QA 4 783 4 783
DS 



AS 4 14

CO CL60Contig1 1151 2 4 U
TGGGAAACCCTCTCCTCGATATCTCTGCCGTTGTAGACGAGGATTTCCTCACCAAATACG
ACGTGAAGTTGAACAATGCGATTCTCGCTGAGGAGAAACACTTGCCCATGTATGAAGAGA
TGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCCGGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAG
TGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGGGCAACCAGTTACATGGGCTCCATTGGAAAGG
ACAAATACGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTGCTGCTGGTCTCAATGTTCACTACT
ATGAAGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGGAGAAAGGT
CTCTTATTGCTAATCTCTCTGCTGCTAACTGCTACAAGGTTGACCACCTCAAGAAGCCTG
AAAACTGGGAACTAGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTCCTCACTG
TATCCCCTGAATCCATCCAGTTGGTGTCTGAACACGCTGCTGCAAACAACAAGGTGTTCA
CAATGAACCTCTCTGCTCTATTCATCTGTGAATTCTTCAAAGATGCGCAGGAGAAGTTCT
TGCCGTACATGGACTTTGTGTTTGGCAACGAGACAGAGGCAATAACCTTCTCAAGGGTTC
ATGGCTGGGAGACAGAAGATGTAGAGCAAATAGCCATCAAGATTTCACAGCTTCCCAAGG
CCACAGGAACATACAAGAGGACCACCGTGATTACACAAGGCGCAGACCCAGTGGTCGTTG
CTGAAGATGGAAAGGTGACGAAATACCCTGTGATCCCTCTCCCAAAGGAGAAGCTTGTTG
ACACCAACGGTGCAGGTGATGCATTTGTGGGAGGATTCATGTCACAGCTAGTGAAAGAGA
AGTCCATTGAGGAGTGCGTGAAAGCCGGATGCTACGCGTCCAACGTGGTGATCCAAAGAT
CTGGCTGCACCTACCCTGAGAAGCCAGACTTCAACTAAGTTATTGGTCCATGCTCAGTTT
TGTGATATCTTGTTCCAAATAAAAACAATTATTTCTCAAGGATTATTGCTCGAGTGTTTT
TTCACTTTTGGTTTGAATCACCCTTTTATTATCATTGTCAGCATTTATAATGTAATACGT
TATTAACAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E605TF U 1
AF RR4E605JQ C 354
BS 1 590 RR4E605TF
BS 591 591 RR4E605JQ
BS 592 634 RR4E605TF
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RD RR4E605TF 634 0 0
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TGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCCGGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAG
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ACAAATACGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTGCTGCTGGTCTCAATGTTCACTACT
ATGAAGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGGAGAAAGGT
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AAAACTGGGAACTAGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTCCTCACTG
TATCCCCTGAATCCATCCAGTTGGTGTCTGAACACGCTGCTGCAAACAACAAGGTGTTCA
CAATGAACCTCTCTGCTCTATTCATCTGTGAATTCTTCAAAGATGCGCAG*AGAAGTTCT
TGCCGTACATGGACTTTGTGTTTGGCAACGAGAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4E605JQ 798 0 0
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AAGCC*GAAAACTGGGAACTAGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTC
CTCACTGTATCCCCTGAATCCATCCAGTTGGTGTCTGAACACGCTGCTGCAAACAACAAG
GTGTTCACAATGAACCTCTCTGCTCTATTCATCTGTGAATTCTTCAAAGATGCGCAGGAG
AAGTTCTTGCCGTACATGGACTTTGTGTTTGGCAACGAGACAGAGGCAATAACCTTCTCA
AGGGTTCATGGCTGGGAGACAGAAGATGTAGAGCAAATAGCCATCAAGATTTCACAGCTT
CCCAAGGCCACAGGAACATACAAGAGGACCACCGTGATTACACAAGGCGCAGACCCAGTG
GTCGTTGCTGAAGATGGAAAGGTGACGAAATACCCTGTGATCCCTCTCCCAAAGGAGAAG
CTTGTTGACACCAACGGTGCAGGTGATGCATTTGTGGGAGGATTCATGTCACAGCTAGTG
AAAGAGAAGTCCATTGAGGAGTGCGTGAAAGCCGGATGCTACGCGTCCAACGTGGTGATC
CAAAGATCTGGCTGCACCTACCCTGAGAAGCCAGACTTCAACTAAGTTATTGGTCCATGC
TCAGTTTTGTGATATCTTGTTCCAAATAAAAACAATTATTTCTCAAGGATTATTGCTCGA
GTGTTTTTTCACTTTTGGTTTGAATCACCCTTTTATTATCATTGTCAGCATTTATAATGT
AATACGTTATTAACAGTT

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL60Contig2 798 4 3 U
GGAACTTTCTCTGAGCTCTTTGATTATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTTAAACT
TGCCCTCCTCATCAGATCTGAATCTAAACGTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCC
ACTAACAACTACGATGGAATCCTTCTCGGAATGGGGAACCCACTCCTCGACATCTCTGCC
GTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCC
GAGGAGAAACATTTGCCCATGTATGATGAGATGAGTAGCAAGTTCACTGTTGAATACATT
GCCGGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGG
GCAACCAGTTACATGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGAAGGAT
GCTACTGCTGCTGGTCTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTGGAACT
TGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGGAGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTTTCAGCTGCTAAC
TGCTACAAGGTTGAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAAGGCCAAG
TTCTACTACATTGCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTTGGTATCT
GAGCACGCTGCTGCTAACAACAAGGTGTTCACAATGAACCTCTCTGCTCCATTCATCTGT
GAATTCTTCAAAGATGCGCAGAGAAGTTCTTGCCATACATGGACTTTGTTTTTGGCAATG
AGACAGAGGCAAGAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F937TF U 24
AF RR4ER37TF U 1
AF RR4EI04TF U 54
AF RR4FE86TF U 54
BS 1 737 RR4ER37TF
BS 738 769 RR4EI04TF
BS 770 798 RR4FE86TF

RD RR4F937TF 656 0 0
GG
ATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTTAAACTTGCCCTCCTCATCAGATCTGAATCT
AAACGTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCCACTAACAACTACGATGGAATCCTTC
TCGGAATGGGGAACCCACTCCTCGACATCTCTGCCGTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCA
AGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCCGAGGAGAAACATTTGCCCATGTATG
ATGAGATGAGTAGCAAGCTCACTGTTGAATACATTGCCGGAGGTGCTACTCAGAACTCAA
TCAAAGTGGCTCAGTGGATTCTTCAAATTCCTGGGGCAACCAGTTACATGGGTTCCATTG
GAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTGCTGCTGGTCTCAATGTTC
ACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGGAG
AGAGGTCGCTTATTGCTAATCCTTCAGCTGCTAACTGCTACAAGGTTGAGCACCTTAAGA
AGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTCC
TCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTTGGTATCTGAGCACGCTGCTGCTAACA

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR4ER37TF 737 0 0
GGAACTTTCTCTGAGCTCTTTGATTATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTTAAACT
TGCCCTCCTCATCAGATCTGAATCTAAACGTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCC
ACTAACAACTACGATGGAATCCTTCTCGGAATGGGGAACCCACTCCTCGACATCTCTGCC
GTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCC
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GCCGGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGG
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GAATTCTTCAAAGATGC

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GG
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TCGCCGAGGAGAAACATTTGCCCATGTATGATGAGATGAGTAGCAAGTTCACTGTTGAAT
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CTGGGGCAACCAGTTACATGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGA
AGGATGCTACTGCTGCTGGTCTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTG
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TATCTGAGCACGCTGCTGCTAACAACAAGGTGTTCACAATTAACCTCTCTGCTCCATTCA
TCTGTGAATTCTTCAAAGATGCGCAGAGAAGTTCTTGCCGTACATGGACTTTGTTTTTGG
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QA 3 745 3 745
DS 



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AGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTTGACGCGTAACATCCGGCCTTCAC
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ACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATGACTGGGTACTTCGT
CACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGGGTCTGCCCCCTGTGTAATCACTGTTGTCCT
CTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGCAACTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACATC
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AAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAATGG
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 553 1 553
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AG

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GG
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QA 3 671 3 671
DS 

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ACTGGGTACTTCGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGGGTCTGCCCCCTGTGTA
ATCACTGTTGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGCAACTGTGAAATCTTGATGGCT
ATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGGAGAAGGTTCTTGCCTCTGTC
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AACTTGGCCTTCTCACCAAAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAGTGCTCACCTTGTAGCAG
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QA 1 889 1 889
DS 



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GTCTCCCAGCCATGAACTCTGGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAG
TCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAAAATTCACAGATGAAGGGAGTA
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AGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCAGAGAGA
TTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGACACCACAAGTTCCAGTAGGTGCA
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AGGGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTTTTAGAGCCAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG82JQ U 1
AF RR4FY44JQ U 5
AF RR4FG82TF C 526
BS 1 669 RR4FG82JQ
BS 670 670 RR4FY44JQ
BS 671 684 RR4FG82JQ
BS 685 736 RR4FY44JQ
BS 737 737 RR4FG82TF
BS 738 785 RR4FY44JQ
BS 786 1189 RR4FG82TF

RD RR4FG82JQ 684 0 0
TTTAGTAATAACGTCTTACATTATAAATGCTGAAAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAAC
CAAAAGTGAAAAACACTCGAGCAATAAATAATCGTTAAGAGATAATTGTTTTTATTTGGA
ACAAGATATCACAAAACTGAGCATGGACCAATAACTTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGG
TAGGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGTAGCATCCGGCTTTCACGCAT
TCCTCAATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCT
GCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATCACAGGGTATTTCGTCACC
TTTCCATCTTTAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTG
TATGTTCCTGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCT
GTCTCCCAGCCATGAACTCTGGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAG
TCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAAAATTCACAGATGAAGGGAGTA
GAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCATGCTCAGATACCAACTGAATG
GATTCAGGG*ATACAGCGAGGAAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4FY44JQ 781 0 0
G
TAATAACGTCTTACATTATAAATGCTGAAAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAA
GTGAAAAACACTCGAGCAATAAATAATCGTTAAGAGATAATTGTTTTTATTTGGAACAAG
ATATCACAAAACTGAGCATGGACCAATAACTTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGT
GCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGTAGCATCCGGCTTTCACGCATTCCTC
AATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACC
GTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATCACAGGGTATTTCGTCACCTTTCC
ATCTTTAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTATGT
TCCTGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTC
CCAGCCATGAACTCTGGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCAT
GTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCGTCTTTGAAAAATTCACAGATGAAGGGAGCAGAGAG
GTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCATGCTCAGATACCAACTGAATGGATTC
AGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGAGC
CCAGTTTTCAG*CTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCAGAGAGATTAGC

QA 2 781 2 781
DS 

RD RR4FG82TF 664 0 0
TTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCGTGCGCATCTTTGAAAAATTCA
CAGATGAAGGGAGTAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCATGCTCA
GATACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGCGAGGAAGAATCCAGCAATGTAGTAGAAC
TTGGCCTTCTCAACTAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGTAGCAG
TTAGCAGCAGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGACACCACAA
GTTCCAGTAGGTGCAGACTCATCTTCATAGTAGTGAACATTGAGACCAGCAGCAGTAGCA
TCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGGAGCCCATGTAACTGGTCGCC
CCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATTGAGTTCTGAGTAGCACCTCCGGCA
ATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACATGGGCAAATGTTTCTCCTCA
GCGAGAATCGCATTGTTCAACTTCACGTCGTATTTGGTGAGAAAATCCTCGTCTACAACA
GCAGAGATATCGAGGAGGGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTTTTAGAG
CCAG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 15

CO CL61Contig1 799 15 30 U
GCACTTGAATCTCTCCGGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC*CTCTC***
**CTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCTTCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGG
TAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGC
AGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGC
CTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGAAGGATCACCCCAACAACAA
ATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCATTGTCTGACTCTGA
GAAAGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAA
AGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTC
CGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGA
TGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGG*ATGT
TTTTTTCTTTTTT**************ATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCA
CTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAATG
AGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCTCT
TTCTTCACTGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 50 20 65 65 65 20 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 35 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 55 85 85 85 35 85 85 40 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 35 35 
35 35 35 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 70 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 
55 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 75 75 60 75 75 75 75 75 75 
45 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 45 45 40 40 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EM14TF U 18
AF RR4AL60TF U 1
AF RR4DQ39TF U 16
AF RR4E130TF U 17
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AF RR4CN49TF U 16
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AF RR4EL13TF U 18
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AF RR4DA32TF U 17
BS 1 16 RR4AL60TF
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BS 449 747 RR4AL60TF
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RD RR4EM14TF 683 0 0
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CGGCGGCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGG
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ATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAA
GCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAGGATCTCTGGG*ATGTTTTTTTCTTTTTTTTTT
TTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTC
TGATTCTACGTGTAATGGAAAAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4AL60TF 747 0 0
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CTCTCTCTCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTCTTCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGG
TAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCAGCTAAAGC
AGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGC
CTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGAAGGATCACCCCAACAACAA
ATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGTAAATCCTTGTCTGACTCTGA
GAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAA
AGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGCCCAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTC
CGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGA
TGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGG*ATGT
TTTTTTCTTTTTT**************ATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCA
CTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAATG
AGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4DQ39TF 732 0 0
GGG
ACAAACACGTAGTACGATTC*TTTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCAA
AACCTACGATCTTCTCCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACTGAAAC
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GTA
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GG
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G
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G
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G

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TCTAAAATATGTTATCATCTCTTTCTTCACT
G

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TCTTTCTTCACT

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DS 

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DS 

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G
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TGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAA
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TATGTTATCATCTCTTT
A

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ATGTA*CAATTTAGCTTTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCTCTTTCTTCACTGAAAAAA
AAA

QA 1 783 1 783
DS 



AS 2 17

CO CL62Contig1 853 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB29TF U 1
AF RR4CB29JQ C 38
BS 1 635 RR4CB29TF
BS 636 853 RR4CB29JQ

RD RR4CB29TF 635 0 0
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TCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTGAAGGCTAATGGTAAA
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AAGAGCTTAGCTTCTCAGATATCCGAACGAATTGTTGCTCTTTCTGGTGGAGTGCTGTTC
ATTATCTTTGGCATCCAATCGTTTCTTACCTCTGT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4CB29JQ 816 0 0
ATTCTGCG
ATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTATCTGCTCTGATTGTCACGACT
ATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCAT
CACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACA
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AAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAACAGTAAGATTGAAGATGAAAAAAAGAAA
CAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCCTTCTCGATT
AACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGAT
GAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAGTTGTGGCACAGCTTGCGTGTACCTCTGCT
GCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCTTCTCAGATATCCGAACGAATTGTTGCTCTTTCT
GGTGGAGTGCTGTTCATTATCTTTGGCATCCAATCGTTTCTTACCTCTGTTCAGGCCTAA
TGCTTCTTTCTGGGTTGTAGGGAGCGCTGAAGATGACGATGAAGAACTCTGATATCAACA
CTTTCTTTAGATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACGCAAGTCATTACAAAACAAAT
CGGAAAGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACATTAAAAAGGGGCGCTGAAGCAGCCATTTGA
CTTCAATAAAGTTCTGGTAATCTTTGGC

QA 9 816 9 816
DS 



CO CL62Contig2 1078 15 27 U
GGGTTCCGGCCACGCTCGCTCTATATTCTACGTGCGAGTGTCGTCTTCTCTACTCTCTCC
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAAG
ATCTCTGGTTTCGGAGATTGCAGCTGATTCTCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAGC
TCAATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGAC
AAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCT
GGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCT
CCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTC
GGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCC
GAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAAC
AGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCT
CCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAG
CTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATT
GTGGCACAGCTTGTGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAG
ATATCCGAACGAATAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCA
ATCGTTTCTTACTTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGGTTGTAGGGAGAGCTGAA
GATGACGATGAAGAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGATATGTAATCTTGATACTAG
ATGTTTTACGCAAGTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACAT
TTAAAGGGGCGCTGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAGTTCTGGTAATCTTTGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 65 80 55 65 80 
80 50 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 75 70 70 55 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4FY73TF U 50
AF RR4DZ07TF U 1
AF RR4B625TF U 115
AF RR4EX23TF U 50
AF RR4GL46TF U 10
AF RR4GU76TF U 31
AF RR4AS41TF U 35
AF RR4AJ37TF U 52
AF RR4AS41JQ C 223
AF RR4GU76JQ C 253
AF RR4AJ37JQ C 312
AF RR4FY73JQ C 491
AF RR4GL46JQ C 371
AF RR4B625JQ C 340
AF RR4DZ07JQ C 314
BS 1 282 RR4DZ07TF
BS 283 284 RR4GL46TF
BS 285 575 RR4DZ07TF
BS 576 576 RR4GL46TF
BS 577 615 RR4DZ07TF
BS 616 616 RR4GL46TF
BS 617 691 RR4DZ07TF
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BS 693 704 RR4DZ07TF
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BS 706 717 RR4DZ07TF
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BS 720 740 RR4DZ07TF
BS 741 741 RR4AS41TF
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BS 755 755 RR4GL46TF
BS 756 760 RR4DZ07TF
BS 761 794 RR4GL46TF
BS 795 800 RR4AS41TF
BS 801 801 RR4AJ37TF
BS 802 812 RR4AS41TF
BS 813 813 RR4AJ37TF
BS 814 841 RR4AS41TF
BS 842 876 RR4AJ37TF
BS 877 1010 RR4AS41JQ
BS 1011 1076 RR4GU76JQ
BS 1077 1078 RR4AJ37JQ

RD RR4FY73TF 670 0 0
GGACTCTCTC
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CTCAATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGA
CAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGC
TGGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGC
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CGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGC
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TCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCA
GCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTG
AATT

QA 11 666 11 666
DS 

RD RR4DZ07TF 765 0 0
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CTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAAG
ATCTCTGGTTTCGGAGATTGCAGCTGATTCTCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAGC
TCAATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGAC
AAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCA**GAGACTTGTGTTGGCT
GGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCT
CCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTC
GGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCC
GAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAAC
AGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAG*CCATTCCTCACACAATTCTTCTCT
CCTATTTTTCTCAAG*CGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAG
CTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAA*CCCGTTTGGGGT*GTCCTTGGTGGA**T
GTGGCACAGCTTGTGTGTAC*ACTGCTGCTGTGACTGGAG
AAAGA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4B625TF 654 0 0
GG
GAAGATCTCTGGTTTCGGAGATTGCAGCTGATTCTCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCCAT
GAGCTCAATTTTGCAGTGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGG
CGACAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTT
GGCTGGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGC
TGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGG
TTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATT
GGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGA
TAACAGTAAGATTGAAGATGAAAATAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTT
CTCTCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAG
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AATTG**GCACAGCTTGCGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGC

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR4EX23TF 712 0 0
GGACTCTCTC
CCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAA
GATCTCTGGTTTCGGAGATTGCAACTGATTCTCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAG
CTCAATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGA
CAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGC
TGGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGC
TCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTT
CGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGC
CGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAA
CAGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTC
TCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCA
GCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAGCCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAAT
TGTGGCACAGCTTGTGTGTAC*ACTGCTGCTGTGATTGGAGG

QA 11 712 11 712
DS 

RD RR4GL46TF 794 0 0
GG
ACGCTCGCTCTATATTCTACGTGCGAGTGTCGTCTTCTCTACTCTCTCCCTCTCTCTCTC
TCTCTC**GCATTAGATCACTCCGTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAAGATCTCTGGTTT
CGGAGATTGCAGCTGATTCTCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAGCTCAATTTTGCA
GGGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGACAAGACCTTCTT
CGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTCTC
GGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGAT
CTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTC
TTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGC
AGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGA
AGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCCCCTATTTTTCT
CAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAAT
TGGTTTAGCCGCTGATGAAA*CCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGCT
TGTGTGTAC*ACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACG
AAT
GGTGCTCTT

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR4GU76TF 769 0 0
GGTG
CGAGTGTCGTCTTCTCTACTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTC****GCATTAGATCACTCC
GTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAAGATCTCTGGTTTCGGAGATTGCAGCTGATTCTCTG
TTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAGCTCAATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCA
TGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGACAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGC
GTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCC
TCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACA
TAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAG
GAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGG
CTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAA
GGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCT
TTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACC
CGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGA*TTGTGGCACAGCTTGTGTGTAC*ACTGCTGCTGTGA
TTGGAGGAA*GAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACGA
TAGTGCT

QA 5 762 5 762
DS 

RD RR4AS41TF 807 0 0
CGAGTGTCGTCTTCTCTACTCTCTCC*TCTCTCTCTCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCC
GTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAAGATCTCTGGTTTCGGAGATTGCATCTGATTCTCTG
TTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAGCTCAATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCA
TGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGACAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGC
GTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCC
TCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACA
TAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAG
GAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGG
CTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAA
GGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCT
TTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACC
CGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGCTTGTGTGTACCACTGCCGCTGTGA
TTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACGAATAGTTGCGCTTTTTGGTGGGA
GTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4AJ37TF 825 0 0
GGACTCTCTCC
CTCTCTCTCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACTCTGCTTCCACCCGGAGAAGAT
CTCT**TTTCGGAGATTGCAGCTGATTCTCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCCATGAGCTC
AATTTTGCAGGGTTTTACTAAGTCACTCGCCATGACTTTTGTGTCGGAGATTGGCGACAA
GACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCTGG
TTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCC
TAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGG
GCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGA
AGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAG
TAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCC
TATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGCCAGCT
TGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGT
GGCACAGCTTGTGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGAT
ATCCGAACGAATAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAAT
CGTTTCTTACTTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTT

QA 12 825 12 825
DS 

RD RR4AS41JQ 788 0 0
GTGTCGGAGATTGGCGACAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCA
AGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTCTCGGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCT
GCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACC
TTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGG
GATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGT
AAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTC
CTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAA
TTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGG
GTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGCTTGTGTGTACCACTGCCGCTGTGATTGGAGGA
AAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACGAATAGTTGCGCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTT
CATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTTACTTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGG
GTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATGAAGAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGAT
ATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACGCAAGTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTTATT
TAACCTTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4GU76JQ 826 0 0
GCCGCCGCTATTCTGGCTATGCGTTATCCAAGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTCTCG
GCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATC
TCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCT
TTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCA
GAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAA
GATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTC
AAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATT
GGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGCTT
GTGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACGA
ATAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTTAC
TTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGGTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATGAA
GAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTAC*CA
AGTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACATTTAAAGGGGCGC
TGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAGTTCTGGTAATCTTTGGT
TG

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4AJ37JQ 767 0 0
GGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGAT
CTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTC
TTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGC
AGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGA
AGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCT
CAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGCCAGCTTGCTACAAT
TGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGCT
TGTGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACG
AATAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTTA
CTTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGGTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATGA
AGAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACGC
AAGTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACATTTAAAGGGGCG
CTGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAGTTCTGGTAATCTTTGGTTG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4FY73JQ 588 0 0
CAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTG
AAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTC
TCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAA
TTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTG*AATTGTGGCACAGC
TTGTGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAAC
GAATAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTT
ACTTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGGTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATG
AAGAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACG
CAAGTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACATTTAAAGGGGC
GCTGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAGTTCTGGTAATCTTTGGT
TG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4GL46JQ 668 0 0
TCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGT
CTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAG
CAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTG
AAGATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCCCCTATTTTTC
TCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAA
TTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGC
TTGTGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAAC
GAATGGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTT
ACTACTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGGTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATG
AAGAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACG
CAAGTCATTACAAAACAATCGGAAGGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACATTTAAAGGGGC
GCTGAAGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4B625JQ 739 0 0
GCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACA
ACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGA
GGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAAT
GGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAATAAGAAACAGAAAAGGCCA
TTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGT
GAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTT
GGGGTTGTCCTTGGTGGAATTG**GCACAGCTTGCGTGTACCACTGCTGCTGTGATTGGA
GGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACGAATAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCT
TTTCATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTTACTTCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCT
GGGGTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATGAAGAACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTA
GATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACGCAAGTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTT
ATTTAACCTTGAAAAAAACATTTAAAGGGGCGCTGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAG
TTCTGGTAATCTTTGGT
CG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4DZ07JQ 739 0 0
CTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCT
CTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTT
TGTGGGACGGTTTCACAGAAGGAGGAGGGGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAG
AACTGGATTCTGATTTTAAGGCTAATGGTAAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAG
ATGAAAACAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCA
AGGCGTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTG
GTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTTGGTGGAATTGTGGCACAGCTTG
TGTGTACCACTGCTGCTGTGACTGGAGGAAAGAGCTTAGCGTCTCAGATATCCGAACGAA
TAGTTGCTCTTTTTGGTGG*AGTGCTTTTCATTATATTTGGCATCCAATCGTTTCTTACT
TCTGTTGAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGGTTGTAGGGAGAGCTGAAGATGACGATGAAG
AACTTTGCTATCTATACTTTCTTTTAGATATGTAATCTTGATACTAGATGTTTTACGCAA
GTCATTACAAAACAATCGGAAAGTTTATTTAACCTTGAAAAAAACATTTAAAGGGGCGCT
GAAGCAGCCATTCGACTTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 12

CO CL63Contig1 779 12 29 U
GGCTCCGTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAA
GACCAAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATA
CCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTT
TATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGG
CAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGA
GATTCCTGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGA
GAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCA
GAACACGGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCC
AGCTCCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTT
TGAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAG**TCTCTCTG
CTGTTTCGACGGGTGTTATTTTGT**TATGGTA************ATAGCAATTTT*GCT
AGTGAACTCGTGT***TCGTCTTTTCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTAC
TTTTCGTTCTAAACGACAGTTAAATTGTTTGCTTAATAACATTTTAAGAATTTACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 
65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 40 55 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 5 65 
65 65 65 65 5 65 65 65 15 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 20 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4AT66TF U 182
AF RR4AR56TF U 8
AF RR4GZ94JQ C 1
AF RR4GZ94TF U 1
AF RR4AH51TF U 5
AF RR4AT66JQ C 79
AF RR4G859TF U 2
AF RR4CN29TF U 5
AF RR4B430JQ C 8
AF RR4B430TF U 38
AF RR4CN29JQ C 125
AF RR4G859JQ C 177
BS 1 6 RR4GZ94JQ
BS 7 33 RR4GZ94TF
BS 34 34 RR4AH51TF
BS 35 315 RR4GZ94TF
BS 316 316 RR4AH51TF
BS 317 590 RR4GZ94TF
BS 591 592 RR4G859TF
BS 593 632 RR4GZ94TF
BS 633 636 RR4G859TF
BS 637 639 RR4GZ94TF
BS 640 645 RR4G859TF
BS 646 678 RR4GZ94TF
BS 679 679 RR4G859TF
BS 680 684 RR4GZ94TF
BS 685 685 RR4G859TF
BS 686 688 RR4GZ94TF
BS 689 689 RR4G859TF
BS 690 692 RR4GZ94TF
BS 693 693 RR4AH51TF
BS 694 718 RR4GZ94TF
BS 719 719 RR4G859TF
BS 720 723 RR4GZ94TF
BS 724 738 RR4AH51TF
BS 739 751 RR4G859TF
BS 752 755 RR4CN29TF
BS 756 756 RR4B430TF
BS 757 769 RR4CN29TF
BS 770 778 RR4B430TF
BS 779 779 RR4CN29JQ

RD RR4AT66TF 148 0 0
ATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGC
AAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTAGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTTCATGAG
ATTCCTGCTATGAAGGTTACTGCCTTGA

QA 1 148 1 148
DS 

RD RR4AR56TF 692 0 0
GG
GACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAG
GACTGCTCCAAAGTCCGATG***TCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTTT
GGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCCGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAGCAA
AGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTGC
TATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGG
TGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACACGGT
TCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGG
TGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGC
TAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTGCTGTTTCGA
CGGGTGTTATTTTGT**TATGGTTGCT***TTCAGTATAGCAATTTT*GCTAGTGAACTC
GTGT***TCCTCTTTGCCTTTTCCAGACAT

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR4GZ94JQ 741 0 0
GGCTCCGTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGACCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAA
GACCAAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATA
CCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTT
TATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGG
CAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGA
GATTCCTGCTATGAAAGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGA
GAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCA
GAACACGGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCC
AGCTCCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTT
TGAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTG
CTGTTTCGACGGGTGTTATTTTGT**TATGGTTGCT***TTCAGTATAGCAATTTT*GCT
AGTGAACTCGTGT***TCCTCTTTGCCTTTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTTC
TTTTCGTTCTAAACGACAT
TT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GZ94TF 723 0 0
GGCTCC
GTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGACCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAA
AAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTT
TTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAG
CAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGA
TGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCC
TGCTATGAAAGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGC
TGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACAC
GGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCC
TGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAA
AGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTGCTGTTT
CGACGGGTGTTATTTTGT**TATGGTTGCT***TTCAGTATAGCAATTTT*GCTAGTGAA
CTCGTGT***TCCTCTTTGCCTTTTC*AGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTTCTTT

QA 7 723 7 723
DS 

RD RR4AH51TF 735 0 0
GG
GTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAA
AAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTT
TTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAG
CAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGA
TGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCC
TGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGC
TGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACAC
GGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCC
TGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAA
AGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTGCTGTTT
CGACGGGTGTTATTTTGT**TATGGTTGCT***TTCAGTATAGCAATTTT*GCTAGTGAA
CTCGCGT***TCCTCTTTGCCTTTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTTCTTTTCG
TTCTAAACGACAT

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR4AT66JQ 656 0 0
AAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAG
AACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAGCAAAGTCAACAA
AGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAAGATTGC
TGTGTTGGTTAGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTTCATGAGATTCCTGCTATGAAGGT
TACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTG
CTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAACACGGTTCTTCTTAT
AGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCA
CAACCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAA
GCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTCTCTGCTGTTTCGACGGGTGTTA
TTTTGTGTTATGGTTGCTTCTTTCAGTGTAGCAATTTT*GCTAGTGAACTCGTGTTGTTC
CTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTT*CGTTCTAAAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4G859TF 750 0 0
GGTCC
GTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAA
AAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTT
TTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAG
CAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGA
TGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCC
TGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTATGGCTAGAATTGAGAAAGC
TGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACAC
GGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCC
TGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAA
AGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAG**TCTCTCTGCTGTTT
CGACGGGTGTTATTTTGT**TATGGTA************ATAGCAATTTT*GCTAGTGAA
CTCGTGT***TCGTCTTTTCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCG
TTCTAAACGACAGTTAAATTGTTTG

QA 6 750 6 750
DS 

RD RR4CN29TF 777 0 0
GG
GTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAA
AAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTT
TTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAG
CAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGA
TGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGACGATTTGAGAGTGCATGAGATTCC
TGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGC
TGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTCGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACAC
GGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCC
TGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAA
AGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAG**TCTCTCTGCTGTTT
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DS 

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GG
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QA 3 771 3 771
DS 

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CTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGAT
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DS 

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GC
C

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DS 



AS 2 16

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TATGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGTATACATATGTGAGATCACGTGTGTATATAT
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GCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTTAATC
CCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAGAATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAACCTTGTGACTA
TTGCACGTAAATATTGGTTTATCGGTTCCCGTGGCTTTCCAGTAACCAGAAGTTGCTGCC
CGATTCGGCCTAACGCCATTGGGATACTTCCGATCTCTAGGACTAAAGAAGTACCACTCT
TGTTCTCCAAAACTTGCCTTGCTTGGAAGCTCCCAAGGATCAAACTTGTAAAGATCAATC
TCGGCGATGATTGAGACCGGAAGTGGAATAGAAGCAGCTTTCTTCTTGAGGTAATGAACT
ACAAGTTCTTCGTCGGTCGGATGAAACCGAAACCCGGGAGGGAGATGCGGATGACCCGGC
CCTATGGTCGAATCCCCCATGTTTTCCATCAACTAGCTATCTTCAAATGAGTTATTCTAC
GAAGACAGTCTCATGATACTCAAGGGAGAATATGTAGGAAGAGGATTTGATATTTTGGAG
AGTCCAGGTGTATC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 50 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 30 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H742JQB U 2
AF RR4AE74JQ U 2
AF RR4CW72JQ U 115
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TGTGGAAGATGAATT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4AE74JQ 715 0 0
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ATGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGTATACATATGTGAGATCACGTGTGTATATATG
AATTTATCTATATATACTGTATAAACTATAATGTGTGTGCATAAATACATACATACATAG
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QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CW72JQ 567 0 0
GC
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CATAGCTATGTAGATTATGGGTGCCAATTCATGTTAGGAAGCTGAAACGCCTGTCTTAAA
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TCACTCGTATGATGGAACCTCTTGCTCGATAAGAATGACCCGAAAGAAGATGATCCAGTG
GCCTCATGACCTATACGATACTGACCACACAAGGAACGTTTGTCCGATGAAACGGCCATA
CCATCGAAAAAGTGTTCTTCATTGTTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCTAAG
ACCGATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCT
CTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACA
AAGAACCCAATCGTCTAGCCGTA
AT

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4C360JQ 670 0 0
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TGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCTCTTAG
TAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACAAAGAA
CCCAATCGTC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4BR30JQ 787 0 0
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TATGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGTATACATATGTGAGATCACGTGTGTATATAT
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GCTATGTAGATTATGGGTGCCAATTCATGTTAGGAAGCTGAAACGCCTGTCTTAAAACCC
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GAGGAATTTCACTAAGCATCGAGACAAATGAGACATTGTAGTTATCATTATTGAGATCAC
TCGTATGATGGAACCTCTTGCTCGATAAGAATGACCCGAAAGAAGATGATCCAGTGGCCT
CATGACCTATACGATACTGACCACACAAGGAACGTTTGTCCGATGAAACGGCCATACCAT
CGAAAAAGTGTTCTTCATTGTTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTT***GTCTAAGACCG
ATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCTCTTA
GTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACAAAGA
ACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAGGTGGCTTAGCA
GCGGTGTTAAGACTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTTAATC
CCTTTA
A

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4C672JQ 734 0 0
AGAAAGAGACGTATGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGTATACATATGTGAGATCACG
TGTGTATATATGAATTTATCTATATATACTGTATAAACTATAATGTGTGTGCATAAATAC
ATACATACATAGCTATGTAGATTATGGGTGCCAATTCATGTTAGGAAGCTGAAACGCCTG
TCTTAAAACCCCATGATCAGCTAGAGTCGACGTCGTATCGATGACTCCATTTCCATGAAA
CCCCGAACTCTGGGGAATTTCACTAAGCATCGAGACAAATGAGACATTGTAGTTATCATT
ATTGAGATCACTCGTATGATGGAACCTCTTGCTCGATAAAAATGACCCGAAAGAAGATGA
TCCAGTGGCCTCATGACCTATACGATACTGACCACACAAGGAACGTTTGTCCGATGAAAC
GGCCATACCATCGAAAAAGTGTTCTTCATTGCTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTCTAAAACCGATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAA
ATCCTCTCTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGA
TCCTACAAAGAACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAG
GTGGCTTAGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAAT
CAGTTTTAATCCCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4AF43JQ 794 0 0
CG
GACGTATGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGCATACATATGTGAGATCACGTGTGTAT
ATATGAATTTATCTATATATACTGTATAAACTATAATGTGTGTGCATAAATACATACATA
CATAGCTATGTAGATTATGGGTGCCAATTCATGTTAGGAAGCTGAAACGCCTGTCTTAAA
ACCCCATGATCAGCTAGAGTCGACGTCGTATCGATGACTCCATTTCCATGAAACCCCGAA
CTCTGAGGAATTTCACTAAGCATCGAGACAAATGAGACATTGTAGTTATCATTATTGAGA
TCACTCGTATGATGGAACCTCTTGCTCGATAAGAATGACCCGAAAGAAGATGATCCAGTG
GCCTCATGACCTATACGATACTGACCACACAAGGAACGTTTGTCCGATGAAACGGCCATA
CCATCGAAAAAGTGTTCTTCATTGTTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCTAAG
ACCGATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCT
CTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACA
AAGAACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAGG***CTT
AGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTT
AATCCCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAGAATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAACCTTGTG
ACTATTGCACGT

QA 3 794 3 794
DS 

RD RR4AF43TF 820 0 0
GACGTATGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGCATACATATGTGAGATCACGTGTGTAT
ATATGAATTTATCTATATATACTGTATAAACTATAATGTGTGTGCATAAATACATACATA
CATAGCTATGTAGATTATGGGTGCCAATTCATGTTAGGAAGCTGAAACGCCTGTCTTAAA
ACCCCATGATCAGCTAGAGTCGACGTCGTATCGATGACTCCATTTCCATGAAACCCCGAA
CTCTGAGGAATTTCACTAAGCATCGAGACAAATGAGACATTGTAGTTATCATTATTGAGA
TCACTCGTATGATGGAACCTCTTGCTCGATAAGAATGACCCGAAAGAAGATGATCCAGTG
GCCTCATGACCTATACGATACTGACCACACAAGGAACGTTTGTCCGATGAAACGGCCATA
CCATCGAAAAAGTGTTCTTCATTGTTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCTAAG
ACCGATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCT
CTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACA
AAGAACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAGG***CTT
AGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTT
AATCCCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAGAATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAACCTTGTG
ACTATTGCACGTAAATATTGGTTTATCGGTTCCCGTGGC
C

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DS 

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TAAGAATGACCCGAAAGAAGATGATCCAGTGGCCTCATGACCTATACGATACTGACCACA
CAAGGAACGTTTGTCCGATGAAACGGCCATACCATCGAAAAAGTGTTCTTCATTGCTATT
ATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCTAAGACCGATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGA
TTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCTCTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTC
TCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACAAAGAACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGT
TTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAGGTGGCTTAGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGA
GGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTTAATCCCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAGA
ATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAACCTTGTGACTATTGCACGTAAATATTGGTTTATCGG
TTCCCGTGGCTTTCCAGTAACCAGAAGTTGCTGCCCGATTCGGCCTAACGCCATTGGGAT
ACTTCCGATCTCTAGGACTAAAGAAGTACCACTCTTGTTCTCCAAAACTTGCCTTGCTTG
GAAGCTCCCAAGGATCAAACTTGTAAAGATCAATCTCGGCGATGATTGAGACCGGAAGTG
GAATAGAAGCAGCTTTCTTCTTGAGGTAATGAACTACAAGTTCTTCGTCGGTCGGATGAA
ACCGAAACCCGGGAGGGAGATGCGGATGACCCGGCCCTATGGTCGAATCCCCCATGTTTT
CCATCAACTAGCTATCTTCAAATGAGTTATTCTAC
CC

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DS 

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G
TGTCTAAGACCGATGTGGAAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCTTTCCATGA
GATCCTCTCTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAG
ATCCTACAAAGAACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCA
GGTGGCTTAGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATACTCATGCATGATCCAA
TCAGTTTTAATCCCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAGAATACAAGCGCTTTCTTGACCCCA
ACCTTGTGACTATTGCACGTAAATATTGGTTTATCGGTTCCCGTGGCTTTCCAGTAACCA
GAAGTTGCTGCCCGATTCGGCCTAACGCCATTGGGATACTTCCGATCTCTAGGACTAAAG
AAGTACCACTCTTGTTCTCCAAAACTTGCCTTGCTTGGAAGCTCCCAAGGATCAAACTTG
TAAAGATCAATCTCGGCGATGATTGAGACCGGAAGTGGAATAGAAGCAGCTTTCTTCTTG
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GGATGACCCGGCCCTATGGTCGAATCCCCCATGTTTTCCATCAACTAGCTATCTTCAAAT
GAGTTATTCTACGAAGACAGTCTCATGATACTCAAGGGAGAATATGTAGGAAGAGGATTT
CC

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR4AE74TF 851 0 0
TGA
CTATACGATACTGACCACACAAGGAACGTTTGTCCGATGAAACGGCCATACCATCGAAAA
AGTGTTCTTCATTGTTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCTAAGACCGATGTGG
AAGATGAATTAGCAGATGATTTTGAGAGCATTCCTTCCATGAGATCCTCTCTTAGTAATA
CTCTCTCCCATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGATCCTACAAAGAACCCAA
TCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAGGTGGCTTAGCAGCGGTG
TTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTTAATCCCTTTA
GGAGGTTTTCCACCATAGAATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAACCTTGTGACTATTGCAC
GTAAATATTGGTTTATCGGTTCCCGTGGCTTTCCAGTAACCAGAAGTTGCTGCCCGATTC
GGCCTAACGCCATTGG*ATACTTCCGATCTCTAGGACTAAAGAAGTACCACTCTTGTTCC
CCAAAACTTGCCTTGCTTGGAAGCTCCCAAGGATCAAACTTGTAAAGACCAATCTCGGCG
ATGATTGAGACCGGAAGTGGAATAGAAGCAGCTTTCTTCTTGAGGTAATGAACTACAAGT
TCTTCGTCGGTCGGATGAAACCGAAACCCGGGAGGGAGATGCGGATGACCCGGCCCTATG
GTCGAATCCCCCATGTTTTCCATCAACTAGCTATCTTCAAATGAGTTATTCTACGAAGAC
AGTCTCATGATACTCAAGGGAGAATATGTAGGAAGAGGATTTGATATTTTGGAGAGTGAA
GGTGTATC

QA 4 851 4 851
DS 

RD RR4H603TF 676 0 0
ATCCTCTCTTAGTAATACTCTCTCC*ATTGTTGGTCTCTGTGAACTATTCTTCTTATAGA
TC*TACAAAGAACCCAATCGTCTAGCCGTAGTGAGTTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAG
GTGGCTTAGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTGAGGCGATATTCATGCATGATCCAAT
CAGTTTTAATCCCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAGAATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAA
CCTTGTGACTATTGCACGTAAATATTGGTTTATCGGTTCCCGTGGCTTTCCAGTAACCAG
AAGTTGCTGCCCGATTCGGCCTAACGCCATTGGGATACTTCCGATCTCTAGGACTAAAGA
AGTACCACTCTTGTTCTCCAAAACTTGCCTTGCTTGGAAGCTCCCAAGGATCAAACTTGT
AAAGATCAATCTCGGCGATGATTGAGACCGGAAGTGGAATAGAAGCAGCTTTCTTCTTGA
GGTAATGAACTACAAGTTCTTCGTCGGTCGGATGAAACCGAAACCCGGGAGGGAGATGCG
GATGACCCGGCCCTATGGTCGAATCCCCCATGTTTTTCATCGACTAGCTATCTTCAAATG
AGTTATTCTACGAAGACAGTCTCATGATACTCAAGGGAGAATATGTAGGAAGAGGATTTG
ATATTTTGGAGAGTCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4H742TF 581 0 0
TTTTTCCTTGACGTGGTTGAGTCAGGTGGCTTAGCAGCGGTGTTAAGATTACCATCAGTG
AGGCGATATTCATGCATGATCCAATCAGTTTTAATCCCTTTAGGAGGTTTTCCACCATAG
AATACAAGCGCTTTCTTGACCCCAACCTTGTGACTATTGCACGTAAATATTGGTTTATCG
GTTCCCGTGGCTTTCCAGTAACCAGAAGTTGCTGCCCGATTCGGCCTAACGCCATTGGGA
TACTTCCGATCTCTAGGACTAAAGAAGTACCACTCTTGTTCTCCAAAACTTGCCTTGCTT
GGAAGCTCCCAAGGATCAAACTTGTAAAGATCAATCTCGGCGATGATTGAGACCGGAAGT
GGAATAGAAGCAGCTTTCTTCTTGAGGTAATGAACTACAAGTTCTTCGTCGGTCGGATGA
AACCGAAACCCGGGAGGGAGATGCGGATGACCCGGCCCTATGGTCGAATCCCCCATGTTT
TTCATCGACTAGCTATCTTCAAATGAGTTATTCTACGAAGACAGTCTCATGATACTCAAG
GGAGAATATGTAGGAAGAGGATTTGATATTTTGGAGAGTCC

QA 1 581 1 581
DS 



CO CL64Contig2 1235 3 6 U
GGACTCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCCACATATTCTCCCTTGAGTATCATGAGACTG
TCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATGGGGGATTCGACC
ATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCATCCGACCGACGAAGAA
CTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTTCCGGTCTCAATCATC
GCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGA
GAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCCAATGGCGTTAGGCCG
AATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACGGGAACCGATAAACCAATATTTACG
TGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCT
AAAGGGATTAAAACTGACTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAAC
ACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGGATCTATAA
GAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATCTCATGGA
AGGAATGCTCTCAAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGACAACAACAA
CAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCATC
GGACAAACGTTCCTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATCTTC
TTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTCAATAATGATAA
CTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCATGG
AAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGTT
TCAGCTTCCTAACATGAATTGGCACCCATAATCTACACAGCTATGTATGTATGTATTTAT
GCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATACACACGTGATCT
CACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTTTCTACTCCATG
GTTGCAAGATGTTTACTAATAACAGAAGCAGATTA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C360TF U 2
AF RR4CA76TF U 1
AF RR4CA76JQ C 485
BS 1 29 RR4CA76TF
BS 30 30 RR4C360TF
BS 31 650 RR4CA76TF
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BS 711 1235 RR4CA76JQ

RD RR4C360TF 282 0 0
GACTCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCCACATATTCTCCCTTGAGTATCATGAGACTGT
CTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATGGGGGATTCGACCA
TAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCATCCGACCGACGAAGAAC
TTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTTCCGGTCTCAATCATCG
CCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAA

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4CA76TF 710 0 0
GGACTCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCTACATATTCTCCCTTGAGTATCATGAGACTG
TCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATGGGGGATTCGACC
ATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCATCCGACCGACGAAGAA
CTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTTCCGGTCTCAATCATC
GCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGA
GAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCCAATGGCGTTAGGCCG
AATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACGGGAACCGATAAACCAATATTTACG
TGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCT
AAAGGGATTAAAACTGACTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAAC
ACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGGATCTATAA
GAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGG*TCTCATGGA
AGGAATGCTCTCAAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4CA76JQ 751 0 0
AAGGAT
AAACTGACTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAACACCGCTGCTA
AGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGGATCTATAAGAAGAATAGT
TCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGAATGCTC
TCAAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAAC
AACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGT
TCCTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCA
TTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTCAATAATGATAACTACAATGTC
TCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTC
ATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCT
AACATGAATTGGCACCCATAATCTACACAGCTATGTATGTATGTATTTATGCACACACAT
TATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATACACACGTGATCTCACATATGTA
TACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTTTCTACTCCATGGTTGCAAGAT
GTTTACTAATAACAGAAGCAGATTA

QA 7 751 7 751
DS 



AS 2 15

CO CL65Contig1 810 11 9 U
GGGGAAGAGGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCAT
TCTTCTCCTCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAG
GAAACATCAAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTG
GTTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACG
CGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAG
ATCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGT
ATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATC
TACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTA
ACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTA
ATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGC
TCGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAG
GACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTT
TCTGAAGATTGTCAACAAAAGAAAGAATATCCTTTGAAAGTTATATCCTCTTAACATCTT
TGGCTATCATTCTTTATACATTTGTTCGTA


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 60 60 60 60 60 
35 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR60TF U 2
AF RR4BH75TF U 6
AF RR4G170TF U 2
AF RR4EF88TF U 19
AF RR4BJ25TF U 6
AF RR4BJ25JQ C 6
AF RR4G170JQ C 653
AF RR4B465JQ C 1
AF RR4A439TF U 2
AF RR4A439JQ C 627
AF RR4CQ21JQ C 136
BS 1 1 RR4B465JQ
BS 2 126 RR4FR60TF
BS 127 127 RR4BH75TF
BS 128 551 RR4FR60TF
BS 552 552 RR4BH75TF
BS 553 655 RR4FR60TF
BS 656 679 RR4BH75TF
BS 680 716 RR4G170TF
BS 717 810 RR4A439TF

RD RR4FR60TF 654 0 0
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CTTCTCCTCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGG
AAACAACAAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGG
TTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGC
GAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGA
TCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTA
TTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCT
ACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAA
CTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAA
TTCATCTCTAACTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCT
CGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BH75TF 674 0 0
GGG
GGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCATTCTTCTCC
TCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATC
AAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATG
AGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCA
GCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAA
AAGAGGATTGAGGGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGTAG
GATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCT
GCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAACTTGGCT
TTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCT
CTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTC
GTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTC
AAGGGCATCTG

QA 4 674 4 674
DS 

RD RR4G170TF 720 0 0
GGGAAGAGGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCATT
CTTCTCCTCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGG
AAACAACAAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGG
TTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGC
GAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGA
TCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTA
TTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCT
ACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAA
CTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAA
TTCATCTCTAACTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCT
CGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAG*
ACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTA
TTTTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4EF88TF 661 0 0
G
AATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCATTCTTCTCCTCCACTCTCTC
TTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATCAAGAACCAGAC
ATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATGAGCAGCTTTCT
CGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGA
AGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAAGAGGATTGA
GAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTA
CAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGT
TTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTT
GAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCT
TGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGTGTCATCGGC
TAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAG*ACAGCTCAAGGGCATCTG

QA 2 661 2 661
DS 

RD RR4BJ25TF 675 0 0
GGG
GGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCATTCTTCTCC
TCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATC
AAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATG
AGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCA
GCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAA
AAGAGGATTGAGGGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGTAG
GATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCT
GCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAACTTGGCT
TTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCT
CTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTC
GTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTC
AAGGGCATCTGA

QA 4 675 4 675
DS 

RD RR4BJ25JQ 752 0 0
GGG
GGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCATTCTTCTCC
TCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATC
AAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATG
AGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCA
GCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAA
AAGAGGATTGAGGGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGTAG
GATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCT
GCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAACTTGGCT
TTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCT
CTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTC
GTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTC
AAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAAGA
TTGCCAACAAAAGAAAGAATATCCTTTG
T

QA 4 751 4 751
DS 

RD RR4G170JQ 120 0 0
TT
TTTTAGGACAGCTCAAGGGCATTTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTG
TAATTTTTTGAAGATTGTCAACAAAAGAAAGAATATCCTTTGAAAGTTATAT
TTTTTT

QA 3 114 3 114
DS 

RD RR4B465JQ 797 0 0
GGGGAAGAGGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCAT
TCTTCTCCTCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAG
GAAACATCAAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTG
GTTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACG
CGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAG
ATCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGT
ATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATC
TACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTA
ACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGATAATACAGAGGTGGAAACATTTA
ATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGC
TCGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAG
GACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTT
TCTGAAGATTGTCAACAAAAGAAAGAATATCCTTTGAAAGTTATATCCTCTTAACATCTT
TGGCTATCATTCTTTA
C

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4A439TF 809 0 0
GGGAAGAGGACAAGGAACAGTGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCTTCAGCGCTAACCTCATT
CTTCTCCTCCACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGG
AAACATCAAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGG
TTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGC
GAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGA
TCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTA
TTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCT
ACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAA
CTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAA
TTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCT
CGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGG
ACAGTTCAAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTT
CTGAAGATTGTCAACAAAAGAAAGAATATCCTTTGAAAGTTATATCCTCTTAACATCTTT
GGCTATCATTCTTTATACATTTGTTCGTA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4A439JQ 156 0 0
CTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGTTCAAGGGCATTTGATAGGCT
CCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTTTGAAGATTGTCAACAAAAGAAAGA
ATATCCTTTGAAAGTTATATCCTTTTAACATCTTTG

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR4CQ21JQ 650 0 0
G
GACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATGAGCAGCTT
TCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCT
CGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAAGAGGAT
TGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGT
TTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTT
GGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAACTTGGCTTTCACAAA
GTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTC
TCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGTGTCATC
GGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCAT
CTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAAGATTGTCAAC
AAAAGAAAGAATATCCTTTGAAAGTTATATCCTCTTAACATCTTTGGCT

QA 2 650 2 650
DS 



CO CL65Contig2 823 4 10 U
GGATAAACCAAATCTTCCAGCGATGCCAAGTAGAAATTTTGAAGAGAACAAGTAACAATG
GCGAAGTCACTCCCTTTGTTCTTCGGCCCTAAACTCATTCTTCTCCTCCACTCTCTCTTC
ATCAACTTCTTCCAGGAGCAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATCAAGAACCATACATC
GTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGTTGTCGCTTGGTTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGT
TGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGA
TGACGATGAAGAGCTTCTGGAGAAAGTGAAGCAAGACCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACA
AGCTGTTCTTAACTCTGCCGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTT
AAGCAAAGTAGGACAAGCTATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGG
GAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACCGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGC
AAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTAC
ATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGC
ACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGC
TGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATTGTCAACAAAAGAAAG
AATATCCTTTGAAAGTTATATCCTCTTAACATCTTTGGCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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AF RR4BB88TF U 30
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TCTTTGGCTATC

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DS 



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BQ
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30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B665TF C 1
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AF RR4DR64JQ U 27
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AF RR4BA16TF C 504
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AF RR4ES02TF C 657
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BS 28 650 RR4H028JQ
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BS 800 800 RR4A916JQ
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BS 963 1394 RR4BA16TF
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RD RR4B665TF 533 0 0
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TTATCGAAAGATCACTCAAAGTTGAGATATAAAAAGGA*TATAAAACAACACTTCTTTAG
CTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAGCTAGGAAGGAACTT
GGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGAGACAAGAC
CTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTCCC
ACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCCAGCAGTTATTAAATCCAAGACCCTTTAACGTTTT
CGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACGTTGGAACCTCTGTT
GATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTT
CCTCGCGATTCCTTTTACTTTGTTAGGCAGCTCTTCTATTGGAATAGCGATC
C

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4BA16JQ 554 0 0
CTCTCAAAGTTGAGATATAAAAAGGAATATAAAACAACACTTCTTTAGCTAAATGATACA
CATTCTCTTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAGCTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCT
AGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGA
AAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCC
ATCAGTAACGATCCAGCAGTTATTAAATCCAAGACCCTTTAACGTTTTCGCCACTATTTT
AGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACGTTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAG
GTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCC
TTTTACTTTGTTAGGCAGCTATTCTATTGGAATAGCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGA
AGGGAGACGAGGAATCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCATTAC
GTAGTTCTTGGAAC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4DR64JQ 664 0 0
C
CAATGTAAAAGACAAAACAATAATTCGAAAATCTTATCGAAAGATCTCTCAAAGTTGAGA
TATAAAAAGGAATATAAAACAACACTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTT
TCTTTGTTTTCAGTCCGAGCTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGA
AGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATC
AGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCCA
GCAGTTATTAAATCCAAGACCCTTTAACGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTA
CGAGTCCATGATGATGACGTTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAA
CGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACATTGTTAGG
CAGCTCTTCTATTGGAATAGCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGCCGAGGAAT
CCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAACA
GAGAAGATCAAGTGTTTGTGCCGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAAAAGA
TAT

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DS 

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CAACACTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAG
CTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTC
GATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGC
AACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCTAGCAGTTATTAAATCCAAGA
CCCTTTAACGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACG
TTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCA
ACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTAGGCAGCTCTTCTATTGGAATA
GCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGAATCCCAGCTTTTTCCTTCTCT
TTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAACAGAGAAGATCAAGTGTTTGT
GCCGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAAAAGATATAGCAGACCAAACAGGA
GGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAACAACAATGACACTAGGATCA
GCTGAAGATATCGTCTCCAT

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DS 

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ACACTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAGCT
AGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTCGA
TGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGCAA
CCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCCAGCAGTTATTAAATCCAAGACC
CTTTAACGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACGTT
GGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAAC
ACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTAGGCAGCTCTTCTATTGGAATAGC
GATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGAATCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTT
CTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAACAGAGAAGATCAAGTGTTTGTGC
CGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAAAAGATATAGCAGACCAAACAGGAGG
GAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAACAACAATGACACTAGGATCAGC
TGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCAATGGGCTTAGCATCTTCAATAGCTTTT

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DS 

RD RR4H028JQ 875 0 0
CCAT
CAATGTAAAAGACAAAACAATAATTCGAAAATCTTATCGAAAGATCTCTCAAAGTTGAGA
TATAAAAAGGAATATAAAACAACACTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTT
TCTTTGTTTTCAGTCCGAGCTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGA
AGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATC
AGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCCA
GCAGTTATTAAATCCAAGACCCTTTAACGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTA
CGAGTCCATGATGATGACGTTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAA
CGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTAGG
CAGCTCTTCTATTGGAATAGCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGAAT
CCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAACA
GAGAAGATCAAGTGTTTGTGCCG*TGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAAAAGA
TATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAAC
AACAATGACACTAGGATCAGATGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCA*TGGGCTT
AGCATCTTCA*TAGCTTTTGTTGTCTGTTGGGCCACATGTGTTACTGTCTTTGCAGCATT
AAAGACGG*CTCCGCATCGATAC
AGAGCTTT

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DS 

RD RR4GT79JQ 796 0 0
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CAACACTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAG
CTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTC
GATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGC
AACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCCAGCAGTTATTAAATCCAAGA
CCCTTTAACGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACG
TTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCA
ACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTAGGCAGCTCTTCTATTGGAATA
GCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGAATCCCAGCTTTTTCCTTCTCT
TTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAACAGAGAAGATCAAGTGTTTGT
GCCGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAAAAGATATAGCAGACCAAACAGGA
GGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAACAACAATGACACTAGGATCA
GCTGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCAATGGGCTTAGCATCTTCAATAGCTTTT
GTTGTCTGTTGGGCCA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4H028TF 724 0 0
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CAGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCC
AGCAGTTATTAAATCCAAGACCCTTTAACGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGT
ACGAGTCCATGATGATGACGTTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTA
ACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTAG
GCAGCTCTTCTATTGGAATAGCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGAA
TCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAAC
AGAGAAGATCAAGTGTTTGTGCCG*TGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAAAAG
ATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAA
CAACAATGACACTAGGATCAGATGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCAATGGGCT
TAGCATCTTCAATAGCTTTTGTTGTCTGTTGGGCCACATGTGTTACTGTCTTTGCAGCAT
TAAAGACGGGCTCCGCATCGATACCAGAGCTTTGCATTGCTTCTTGAGCTTTCTTCGAAG
C
TCC

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DS 

RD RR4G604TF 736 0 0
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ACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTCCCACCGGAGA
ACCCATCAGTAACGATCCAGCAGTTATTAAATCCAAGACCCTTTAACGTTTTCGCCACTA
TTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACGTTGGAGCCTCTGTTGATTCTCT
TGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCACGA
TTCCTTTTACTTTGTTAGGCAGCTCTTCTATTGGAATAGCGATCATACTGTTCTTAGCAT
TTGAAGGGAGACGAGGAATCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCA
TTACGTAGTTCTTGGAACAGAGAAGATCAAGTGTTTGTGCCGGTGTGAGGTCACCTTTGT
AACCGCGGAAGTTAAAAGATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAGAAGGTAAGCAATAA
AGGCAGCGCCAGCAGCAACAACAATGACACTAGGATCAGCTGAAGATATCGTCTCCATGG
TCGATGAAGCAATGGGCTTAGCATCTTCAATAGCTTTTGTTGTCTGTTGGGCCACATCTG
TTACTGTCTTTGCAGCATTAAAGACGGGCTCCGCATCGATACCAGAGCTTTGCATTGCTT
CTTGAGCTTTCTTCG
C

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DS 

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CAACACTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAG
CTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTC
GATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTACCTAACCGGCTCTGC
AACCATCCTCTCCCACCGGAGAACCCATCAGTAACGATCCAGCAGTTATTAAATCCAAGA
CCCTTTAACGGTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGACG
TTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCA
ACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTAGGCAGCTCTTCTATTGGAATA
GCGATCATACTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGAATCCCAGCTTTTTCCTTCTCT
TTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGGAACAGAGAAGATCAAGTGTTTGT
GCCGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAGGTTAAAAGATATAGCAGACCAAACAGGA
GGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAACAACAATGACACTAGGATCA
GCTGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCAATGGGCTTAGCATCTTCAATAGCTTCT
GTTGTCTGTTGGGCCACATCTGTTACTGTCTTTGCAGCATTAAAGACGGGCTCCGCATCG
ATACCAGAGCTTTGCATTGCTTCTTGAGCTTTCTTCGAAGCCTCTGAGAAAGCGGGAGTG
GCAAGCTTCAAAGCCT

QA 1 916 1 916
DS 

RD RR4BA16TF 893 0 0
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GAATCCCAGCTTTT*CCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCATTACGTAGTTCTTGG
AACAGAGAAGATCAAGTGTTTGTGCCGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCGCGGAAGTTAA
AAGATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAG
CAACAACAATGACACTAGGATCAGCTGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCAATGG
GCTTAGCATCTTCAATAGCTTTTGTTGTCTGTTGGGCCACATCTGTTACTGTCTTTGCAG
CATTAAAGACGGGCTCCGCATCGATACCAGAGCTTTGCATTGCTTCTTGAGCTTTCTTCG
AAGCCTCTGAGAAAGCGGGAGTGGCAAGCTTCAAAGCCTCTTCTCCGGCTTGCTTCGCGA
TGGGCAGAGCAGTGTCCAAGGCTGGTTTAAGCGCGTCTCCTACTACTTGGAAAACACGCT
GCGTTGCGTCGAAAACACTCGAACCTGTTTCTTGAACTTGGTTGATTGTTTTCTCCACTT
CAGTGAGAGAGGAGACGATCTGGTCCTTGGAAATGGAAACGGCAGCTTTGGCTTCAGGAG
GAGGAGATGAGAAGACGGATAGAAGAGAGATTGAGGTGGTTGTTGGAAGTGCGACAGAGA
TTTGCCTAACTCTCTTCTTACAAGACGAAGAAGAGGAAGAAGGAGGAATAGTGAGTTTTG
CAGTTACTGAAGACTTCATTGCCATCTCCGCCATAGCCATGGGTTTCTTCTCTGCCAATC
AATGTGACAGAGAAAAAAAGGAGACTTTATTTAATGGTGCTTCTCCTCTAT
CC

QA 1 891 1 891
DS 

RD RR4GT79TF 778 0 0
AGTCTGG
ACAGAGAAGATCAAGTGTT*GTGCCG*TGTGAGGTCAC*TTTGTAACCGCGGAAGTTAAA
*GATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAGAAGGTAAGCAATAAAGGCAGCGCCAGCAGC
AACAACAATGACACTAGGATCAGCTGAAGATATCGTCTCCATGGTCGATGAAGCAATGGG
CTTAGCATCTTCAATAGCTTTTGTTGTCTGTTGGGCCACATCTGTTACTGTCTTTGCAGC
ATTAAAGACGGGCTCCGCATCGATACCAGAGCTTTGCATTGCTTCTTGAGCTTTCTTCGA
AGCCTCTGAGAAAGCGGGAGTGGCAAGCTTCAAAGCCTCTTCTCCGGCTTGCTTCGCGAT
GGGCAGAGCAGTGTCCAAGGCTGGTTTAAGCGCGTCTCCTACTACTTGGAAAACACGCTG
CGTTGCGTCGAAAACACTCGAACCTGTTTCTTGAACTTGGTTGATTGTTTTCTCCACTTC
AGTGAGAGAGGAGACGATCTGGTCCTTGGAAATGGAAACGGCAGCTTCGGCTTCAGGAGG
AGGAGATGAGAAGACGGATAGAAGAGAGATTGAGGTGGTTGTTGGAAGTGCGACAGAGAT
TTGCCTAACTCTCTTCTTACAAGACGAAGAAGAGGAAGAAGGAGGAATAGTGAGTTTTAC
AGTTACTGAAGACTTCATTGCCATCTCCGCCATAGCCATGGGTTTCTTCTCTGCCAATCA
ATGTGACAGAGAAAAAAAGGAGACTTTATTTAATGGTGCTTCTCCTCTAT
C

QA 8 777 8 777
DS 

RD RR4ES02TF 770 0 0
AGGTCA
CTTTGTAACCGCGGAAGTTAAA*GATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAGAAGGTAAG
CAATAAAGGCAGCGCCAGCAGCAACAACAATGACACTAGGATCAGCTGAAGATATCGTCT
CCATGGTCGATGAAGCAATGGGCTTAGCATCTTCAATAGCTTTTGTTGTCTGTTGGGCCA
CATCTGTTACTGTCTTTGCAGCATTAAAGACGGGCTCCGCATCGATACCAGAGCTTTGCA
TTGCTTCCTGAGCTTTCTTCGAAGCCTCTGAGAAAGCGGGAGTGGCAAGCTTCAAAGCCT
CTTCTCCGGCTTGCTTCGCGATGGGCAGAGCAGTGTCCAAGGCTGGTTTAAGCGCGTCTC
CTACTACTTGGAAAACACGCTGCGTTGCGTCGAAAACACTCGAACCTGTTTCTTGAACTT
GGTTGATTGTTTTCTCCACTTCAGTGAGAGAGGAGACGATCTGGTCCTTGGAAATGGAAA
CGGCAGCTTTGGCTTCAGGAGGAGGAGATGAGAAGACGGATAGAAGAGAGATTGAGGTGG
TTGTTGGAAGTGCGACAGAGATTTGCCTAACTCTCTTCTTACAAGACGAAGAAGAGGAAG
AAGGAGGAATAGTGAGTTTTGCAGTTACTGAAGACTTCATTGCCATCTCCGCCATAGCCA
TGGGTTTCTTCTCTGCCAATCAATGTGACAGAGAAAAAAAGGAGACTTTATTTAATGGTG
CTTCTCCTCTATGTTGTCTGCAAACTGTTTCTTCACATTTTTCC

QA 7 770 7 770
DS 



AS 3 14

CO CL67Contig1 1565 4 7 U
CAGTATCAGACTAGCAGCCAGTATCTCTAAGCTCAGACATATGTATTACTCTGATGCAGT
ACACTTCCATCGCTACCAGAGAAGCTGAAACTTCAGTTCAAGCAGCACCGATCTTGGTTT
ATTGGACATGGCTCGGAACTTAACCAGACATGTGACTTGGTCACCAACTCCAAAAGCTTC
GTGCTTTACAGATGGACAGAAGAAGGTTTGATTTTTTTTTCTTTGGCCGGTTGAAAGCTA
CGTTTTGAGCTGCTCCACTTGATTAAAGCTTCAACCTTGAAAGCCAGATAGGAACAAAAT
CCAGAAGAACAGAACCTTGTATTGGTTCAGCCGTTGAGAAGACGAAAGAAAAGGCTCAGC
TTTGTCGTGAAGAGGGCTTCTTCTACTGCTCTTGTATCAAACTTTGGGCTTCGACTTGTA
TTCAGATGGCCCAGAACAAGTTGATTTGCTGATGCCGTTCTTTTTCTTCTTCGATTGGGT
TATGGCTTCTATGGAAAGCTTTCCAGAGATTTGCATCCATTAACTAGACTGGGACAGTGT
AAGCCGAGGTTGAAGATGAACCAAACAGCCCCATGAACCGACTGAAGCTCTGATACCATG
AGAATATTTGAAGATAAGATAGATTTGTGCTCTAAGAGCTTATTGAAAGACTAATAGCTC
AGAGAGCTTTATTGAAAGACAAAGAAACTAAAGAAAGGAGAAGAGATTAAGTTGTCACCA
AGATCAAAATGATTCTGAAATGATATTAATAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAACGGC
AGCCTTGATTGCATTCATCAAACCACATTACATCATATATATAAGAATCTAAAACCCTAG
TTACATGGGCTACAAAAGCTTCAAAGTGGATAACAAACATGGGCTTTACTTTGGACTTCA
ATACTCCCCCGCAAACTTAGCGTCGGGTGCAACAGAGAGGCTAAGTTTGAACCGCAAATG
AAGATAGCTGTGACAGAAACATGAGTAGCAGAAGAATCCATGTGCAGTAGGCTGAGATTA
CTCTAAAGCTTAGAGATTAGTCATTAGTGTGAGAACATTTTCAGGTTCTTTTGACCTATT
TGTCTCACAATGAGTTGGGGTCTTTTGCCCTCTTTAGCTCAACTACGCCATCCTTTTGCT
CAGAGAATTTGCTTCCCACAACTGTAAGCCTCTACTTACTCTCTGCTTCCCATCAATATA
CTACCGAAACATTGCAGTTTAACAATCAGCTATTCTCTTTGGCATTCCATCGAACAGGTT
GTGTGCACTCAACAAAAAACAGAAACTTGCTACCATAAAATCATCACGATCAAACCCAAG
TGTTGCCTCGCTATCAGACCCAAAGACATCCCTACTGCATTCTAGATTCACGCTTCCAAT
CCAGTAATCAAGAACTAGCAAGCCAGTATCCTTCTAAAGCTCAGACATAATGTATTACCT
CTGATGCAGTAACAACTTCCAATCGCTAACCAGAGAAAGCTTGAAACTTCAGTTCAAGCA
GCACCGATCTTGGTTTATTGGACATGGCTCGGACCTTAACCAGACATGTGACCTTGGTCA
CAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 

AF RR4AA78TF C 472
AF RR4C267TF C 1
AF RR4AA78JQ U 225
AF RR4C267JQ U 721
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AAGCCGAGGTTGAAGATGAACCAAGCAGCCCCATGAACCGACTGAAGCTCTGATACCATG
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AGCCTTGATT
CC

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TGGGCTTCGACTTGTATTCAGATGGCCCAGAACAAGTTGATTTGCTGATGCCGTTCTTTT
TCTTCTTCGATTGGGTTA*GGCTTCTATGGAAAGCTTTCCAGAGATTTGCATCCATTAAC
TAGACTGGGACAGTGTAAGCCGAGGTTGAAGATGAACCAAACAGCCCCATGAACCGACTG
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GGCTGCATCAAACGGCAGCCTTGATT
CC

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DS 

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G
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GCCTTGATTGCATTCATCAAACCACATTACATCATATATATAAGAATCTAAAACCCTAGT
TACATGGGCTACAAAAGCTTCAAAGTGGATAACAAACATGGGCTTTACTTTGGACTTCAA
TACTCCCCCGCAAACTTAGCGTCGGGTGCAACAGAGAGGCTAAGTTTGAACCGCAAATGA
AGATAGCTGTGACAGAAACATGAGTAGCAGAAGAATCCATGTGCAGTAGGCTGAGATTAC
TCTAAAGCTTAGAGATTAGTCATTAGTGTGAGAACATTTTCAGGTTCTTTTGACCTATTT
GTCTCACAATGAGTTGGGGTCTTTTGCCCTCTTTAGCTCAACTACGCCATCCTTTTGCTC
AGAGAATTTGCTTCCCACAACTGTAAGCCTCTACTTACTCTCTGCTTCCCATCAATATAC
TACCGAAACATTGCAGTTTAACAATCAGCTATTCTCTTTGGCATTCCATCGAACAGGTTG
TGTGCACTCAACAAAAAACAGAAACTTGCTACCATAAAATCATCACGATCAAACCCAAGT
GTTGCCTCGCTATCAGACCCAAAGACATCCCTACTGCATTCTAGATTCACGCTTCCAATC
CAGTAATCAAGAACTAGCAAGCCAGTATCCTTCTAAAGCTCAGACATAATGTATTACCTC
TGATGCAGTAACAACTTCCAATCGCTAACCAGAGAAAGCTTGAAACTTCAGTTCAAGCAG
CACCGATCTTGGTTTATTGGACATGGCTCGGACCTTAACCAGACATGTGACCTTGGTCAC
AACT

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DS 



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ACTTTAGTACTTGCTACAGAGAAAGATTCAAGTCCAAACAAACGTTTGTCTCAGCTTCCT
CTTTCTCTTCCTTAGAGCCATTCTTGTTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCAT
TTTCATTGTTGCTGGCCTCTGTTTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAG
GGAATCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCG
CATCTCCCTTGCATTTTTAAGCAATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTT
CTCCATTTTCATCTTCTTTCTATCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTAT
CCTACCCTCTCTCTATCTCTCTCCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAG
AACATTTTAGGACAAGATAGATTTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAA
TGAGCTTTATTATGCAAGGAACAAGAAAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAA
AATGATTCTGAAATGATATTAATAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTC
GTTTTCCC


BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 35 35 35 10 

AF RR4GY43JQ U 5
AF RR4EK18TF C 1
AF RR4EK18JQ U 5
AF RR4GY43TF C 5
AF RR4GL54JQ U 22
AF RR4GL54TF C 22
AF RR4DU63JQ U 27
AF RR4DU63TF C 27
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BS 5 424 RR4EK18JQ
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BS 426 471 RR4EK18JQ
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TAGTACTTGCTACAGAGAAAGATTCAAGTCCAAACAAACGTTTGTCTCAGCTTCCTCTTT
CTCTTCCTTAGAGCCATTCTTGTTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCATTTTC
ATTGTTGCTGGCCTCTGTTTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAA
TCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATC
TCCCTTGCATTTTTAAGCAATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCC
ATTTTCATCTTCTTTCTATCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTA
CCCTCTCTCTATCTCTCTCCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAAAAACTGAAAACA
TTTTAGGACAAGATAGATTTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAG
CTTTATTATGCAAGGAACAAGAAAGGAGAAGA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4EK18TF 666 0 0
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ACTTTAGTACTTGCTACAGAGAAAGATTCAAGTCCAAACAAACGTTTGTCTCAGCTTCCT
CTTTCTCTTCCTTAGAGCCATTCTTGTTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCAT
TTTCATTGTTGCTGGCCTCTGTTTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAG
GGAATCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCG
CATCTCCCTTGCATTTTTAAGCAATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTT
CTCCATTTTCATCTTCTTTCTATCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTAT
CCTAACCTCTCTCTATCTCTCTCCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAG
AACATTTTAGGACAAGATAGATTTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAA
TGAGCTTTATTATGCAAGGAGCAAGAAAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAA
AATGATTCTGAAATGATATTAATAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTC
GTTT
CC

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DS 

RD RR4EK18JQ 662 0 0
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ATTGTTGCTGGCCTCTGTTTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAA
TCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATC
TCCCTTGCATTTTTAAGCAATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCC
ATTTTCATCTTCTTTCTATCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTA
ACCTCTCTCTATCTCTCTCCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAAAAACTGAGAACA
TTTTAGGACAAGATAGATTTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAG
CTTTATTATGCAAGGAGCAAGAAAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAAAATG
ATTCTGAAATGATATTAATAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTCGTTT
CC

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DS 

RD RR4GY43TF 663 0 0
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TAGTACTTGCTACAGAGAAAGATTCAAGTCCAAACAAACGTTTGTCTCAGCTTCCTCTTT
CTCTTCCTTAGAGCCATTCTTGTTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCATTTTC
ATTGTTGCTGGCCTCTGTTTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAA
TCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATC
TCCCTTGCATTTTTAAGCAATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCC
ATTTTCATCTTCTTTCTATCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTA
CCCTCTCTCTATCTCTCTCCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAGAACA
TTTTAGGACAAGATAGATTTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAG
CTTTATTATGCAAGGAACAAGAAAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAAAATG
ATTCTGAAATGATATTAATAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTCGTTT
TCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4GL54JQ 646 0 0
G
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AAGATTCAAGTCCAAACAAACGCTTGTCTCAGCTTCCTCTTTCTCTTCCTTAGAGCCATT
CTTGTTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCATTTTCATTGTTGCTGGCCTCTGT
TTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAATCTGTGAGCCCTCGCTCT
TGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATCTCCCTTGCATTTTTAAGC
AATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCCATTTTCATCTTCTTTCTA
TCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTACCCTCTCTCTATCTCTCT
CCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAGAACATTTTAGGACAAGATAGAT
TTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAGCTTTATTATGCAAGGAAC
AAGAAAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAAAATGATTCTGAAATGATATTAA
TAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTCGTTTTCC

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DS 

RD RR4GL54TF 646 0 0
G
GAATCCAAAGGCAAATTTCTTTTTATTACATAGTTACTACTTTAGTACTTGCTACAGAGA
AAGATTCAAGTCCAAACAAACGCTTGTCTCAGCTTCCTCTTTCTCTTCCTTAGAGCCATT
CTTGTTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCATTTTCATTGTTGCTGGCCTCTGT
TTCATTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAATCTGTGAGCCCTCGCTCT
TGCCTCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATCTCCCTTGCATTTTTAAGC
AATGTGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCCATTTTCATCTTCTTTCTA
TCTCTCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTACCCTCTCTCTATCTCTCT
CCTCTCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAGAACATTTTAGGACAAGATAGAT
TTGTGTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAGCTTTATTATGCAAGGAAC
AAGAAAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAAAATGATTCTGAAATGATATTAA
TAAAGATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTCGTTTTCC

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR4DU63JQ 642 0 0
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TTCAAGTCCAAACAAACGTTTGTCTCAGCTTCCTCTTTCTCTTCCTTAGAGCCATTCTTG
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TTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAATCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCC
TCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATCTCCCTTGCATTTTTAAGCAATG
TGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCCATTTTCATCTTATTTCTACCTC
TCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTACCCTCTCTCTATCTCTCTCCTC
TCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAGAACATTTTAGGACAAGATAGATTTGT
GTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAGCTTTATTATGCAAGGAACAAGA
AAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAAAATGATTCTGAAATGATATTAATAAA
GATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTCGTTTTCCC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4DU63TF 642 0 0
CCAAAGGCAAATTTCTTTTA**TACATAGTTACTACTTTAGTACTTGCTACAGAGAAAGA
TTCAAGTCCAAACAAACGTTTGTCTCAGCT*CCTCTTTCTCTTCGTTAGAGCCATTCTTG
TTGGAGGCTGAAGAGCTCGCATTAGCTACTGCATTTTCATTGTTGCTGGCCTCTGTTTCA
TTCTTGAAAATGAAATCCTCTGGCAGAAACGAAGGGAATCTGTGAGCCCTCGCTCTTGCC
TCTTCTTCTCCATGGAGCTGATGACATGCTTCCGCATCTCCCTTGCATTTTTAAGCAATG
TGTACAACTTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTTTCTCCATTTTCATCTTATTTCTACCTC
TCTCATCCATTCCACCATTCACTAAACAATTTATCCTACCCTCTCTCTATCTCTCTCCTC
TCTTATTTGGTTTGAGTACAGTGCAGAAACTGAGAACATTTTAGGACAAGATAGATTTGT
GTGTTTATTGAAACATAAAATAGAAATAGCTCAATGAGCTTTATTATGCAAGGAACAAGA
AAGGAGAAGAGACTTAAGTTGTCACCAAGATCAAAATGATTCTGAAATGATATTAATAAA
GATGAAGGTTTGGCTGCATCAAATGGCAGCCTTCGTTTTCC
C

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL67Contig3 1106 2 2 U
ATAATGGTTCCCAAAGGTGCAAAGAACACGCTTCTAGAGCGACCTTGGTTCATCGTGCTG
GCTCTAGCTGGTCTTATAGGCGGGGCAGTGCTCATCACCAGTTTCATCCGAGCTACGGAC
AACACTTTATCACTATGCTCCACGGCTGAAACAACTGCAAAATCCATAGCCGAATACACA
GCCACACCAATCCAGCTCCAATCCATCGTCCATTACGCAACCTCACGCACCGTCCCTCAA
CAAACCTTCGCGGAGATCTCTATCTCCTTAGAAGTCCTTAAGGACCTTTTACCTTGCAAT
TTTCTTGTCTTTGGCCTCGGTCGTGACTCCCTCATGGGCCTCCCTCAATCCAGGTGGCAC
CACTGTGTTCATGGAGGAGGATCCTGAGTGGATCGAGGCCGTCCTCAAGGACGCACCGTC
CCTAAGAGCCCACCATGTTCAGTATCGGACCCAACTTTCTCAAGCGGACCGTCTTCTCAA
AACCTACCGGTCTGAACCCAAATGTTTACCAGCCAACGCTTTCCCGATCCGGGACAACCA
AAAGTGTCCATTGGCGTTGACTTCACTTCCTGATGAGTTCTATGATACCGAGTGGGATCT
GATCATGGTGGACGCACCAAAAGGATACTTCGCAACTGCGCCAGGGAGGATGGCAGCCAT
ATTCTCCTCGGCTGTCATGGCACGTAACCGGAAGGGTGCAGGCACGACCCACGTTTTTCT
ACATGATGTTGACCGCAAAGTGGAGAAAGCTTACGCCAACGAGTTCCTATGCGAGAAGTA
CAGAGTCAAATCTGCTGGTAGGCTCTGGCACTTCGAAATACCCAACGCTGCTAACATGAG
CGACCAGCCGGGGGATCGGTTTTGCTAGATTGCTCCGATATGCAGTCAGTTCATGGTTAC
TTTTTTTTTACATTAAACACCGCATACTATTGAAGTCCAAAGTAAAGCCCATGTTTGTTA
TCCACTTTGAAGCTTTTGTAGCCCATGTAACTAGGGTTTTAGATTCTTATATATATGATG
TAATGTGGTTTGATGAATGCAATCAAGGCTGCCGTTTGATGCAGCCAAACCTTCATCTTT
ATTAATATCATTTCAGAATCATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G329TF U 1
AF RR4G329JQ C 407
BS 1 687 RR4G329TF
BS 688 1106 RR4G329JQ

RD RR4G329TF 687 0 0
ATAATGGTTCCCAAAGGTGCAAAGAACACGCTTCTAGAGCGACCTTGGTTCATCGTGCTG
GCTCTAGCTGGTCTTATAGGCGGGGCAGTGCTCATCACCAGTTTCATCCGAGCTACGGAC
AACACTTTATCACTATGCTCCACGGCTGAAACAACTGCAAAATCCATAGCCGAATACACA
GCCACACCAATCCAGCTCCAATCCATCGTCCATTACGCAACCTCACGCACCGTCCCTCAA
CAAACCTTCGCGGAGATCTCTATCTCCTTAGAAGTCCTTAAGGACCTTTTACCTTGCAAT
TTTCTTGTCTTTGGCCTCGGTCGTGACTCCCTCATGGGCCTCCCTCAATCCAGGTGGCAC
CACTGTGTTCATGGAGGAGGATCCTGAGTGGATCGAGGCCGTCCTCAAGGACGCACCGTC
CCTAAGAGCCCACCATGTTCAGTATCGGACCCAACTTTCTCAAGCGGACCGTCTTCTCAA
AACCTACCGGTCTGAACCCAAATGTTTACCAGCCAACGCTTTCCCGATCCGGGACAACCA
AAAGTGTCCATTGGCGTTGACTTCACTTCCTGATGAGTTCTATGATACCGAGTGGGATCT
GATCATGGTGGACGCACCAAAAGGATACTTCGCAACTGCGCCAGGGAGGATGGCAGCCAT
ATTCTCCTCGGCTGTCATGGCACGTAA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4G329JQ 700 0 0
AAGGACGCACCGTCCCTAAGAGCCCACCATGTTCAGTATCGGACCCAACTTTCTCAAGCG
GACCGTCTTCTCAAAACCTACCGGTCTGAACCCAAATGTTTACCAGCCAACGCTTTCCCG
ATCCGGGACAACCAAAAGTGTCCATTGGCGTTGACTTCACTTCCTGATGAGTTCTATGAT
ACCGAGTGGGATCTGATCATGGTGGACGCACCAAAAGGATACTTCGCAACTGCGCCAGGG
AGGATGGCAGCCATATTCTCCTCGGCTGTCATGGCACGTAACCGGAAGGGTGCAGGCACG
ACCCACGTTTTTCTACATGATGTTGACCGCAAAGTGGAGAAAGCTTACGCCAACGAGTTC
CTATGCGAGAAGTACAGAGTCAAATCTGCTGGTAGGCTCTGGCACTTCGAAATACCCAAC
GCTGCTAACATGAGCGACCAGCCGGGGGATCGGTTTTGCTAGATTGCTCCGATATGCAGT
CAGTTCATGGTTACTTTTTTTTTACATTAAACACCGCATACTATTGAAGTCCAAAGTAAA
GCCCATGTTTGTTATCCACTTTGAAGCTTTTGTAGCCCATGTAACTAGGGTTTTAGATTC
TTATATATATGATGTAATGTGGTTTGATGAATGCAATCAAGGCTGCCGTTTGATGCAGCC
AAACCTTCATCTTTATTAATATCATTTCAGAATCATTTTG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 3 14

CO CL68Contig1 1449 6 22 U
GGTCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCTGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGGCTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTC
TCCGGAGCTTCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCT
GCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTT
GATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGATGTC
GTGCCTAAAACCGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTAC
AAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACC
GAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTC
ACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAAT
GGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGC
GCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCACTTGAA
GCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTCCAAGTTATGAT
GGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTC
CTCTTAATCACATGTAAAATTCTTATTTAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCTTGAACCATGGT
TTCAACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTTGTCTTCCCATAA
ATCAGGTATAGCTTCCTTAAGGTTCATGAATGCCGCTTAGTGCATGGTCTATACCTGGAA
CTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTGAGCCCTGCTGCTTTAGCGCTAGCGATGT
TACAAACACTGTCATCGAAAAACATCGTTTTGCGTGGATCAACGATGCCTACTATGCGTA
TGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATTTGAGTGTTAGTGTTAAAAA
AAGGGTTTAGTGTTTCAAAGCAAATGATTCCTTCGAAGCAGTCCTCTAGACCCAAACGGT
TAAGAGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATAATCTTACGGTGAGGCA
TAGAGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ39TF U 18
AF RR4GZ64TF U 7
AF RR4B961TF U 1
AF RR4B961JQ C 208
AF RR4BZ39JQ C 301
AF RR4G767JQ U 890
BS 1 33 RR4B961TF
BS 34 34 RR4GZ64TF
BS 35 505 RR4B961TF
BS 506 507 RR4GZ64TF
BS 508 555 RR4B961TF
BS 556 556 RR4GZ64TF
BS 557 738 RR4B961TF
BS 739 739 RR4B961JQ
BS 740 771 RR4B961TF
BS 772 772 RR4B961JQ
BS 773 802 RR4B961TF
BS 803 803 RR4B961JQ
BS 804 851 RR4B961TF
BS 852 854 RR4B961JQ
BS 855 858 RR4B961TF
BS 859 859 RR4B961JQ
BS 860 872 RR4B961TF
BS 873 873 RR4B961JQ
BS 874 888 RR4B961TF
BS 889 889 RR4BZ39JQ
BS 890 899 RR4B961TF
BS 900 1449 RR4G767JQ

RD RR4BZ39TF 681 0 0
GG
GAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATCAATGGCGTCTC
TGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCTCAGATTGTTGTCAAATCGC
AGTTAGTTTCTGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTCGGCGGTTCTGCATTGTCTT
CGAGGCTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGCTTCTTATGCGA
CCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGC
TAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTG
AAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGCCTAAAACCGTTGAGA
ACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCATC
GTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAG
GTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGAC
CTGGA*TCTTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTT
GCACTGTCCAAACTTCATG

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR4GZ64TF 715 0 0
GG
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCTCAGATTGT
TGTCAAATCGCAGTTAGTTTCTGCAAAGTAAACAACTCAATCAGTTTGTGTCGGCGGTTC
TGCATTGTCTTCGAGGCTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGC
TTCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGA
AGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGA
GATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGCCTAA
AACCGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTC
TTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAA
TGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTCACATTGAA
GCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAATGGAAGCCA
GTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR4B961TF 899 0 0
GGTCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAGAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCTGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGGCTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTC
TCCGGAGCTTCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCT
GCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTT
GATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGATGTC
GTGCCTAAAACCGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTAC
AAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCA**AAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACC
GAGGGAAATGGTACTAGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTC
ACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAAT
GGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTCGGACAAGTCCTTGAACGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAG*AGACACGC
GCCTTCAATGTTCCCAAGAAAG*TTGCAGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCACTTGAA
GCTTGAAGCCT**CATGT*GTATCTTTGTTTT*GCTATTATGAGAGTT*CAAGTTATGA

QA 1 899 1 899
DS 

RD RR4B961JQ 741 0 0
CACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGCTTCTTATGCGACCATCAAG
AACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCT
CCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCT
GGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGCCTAAAACCGTTGAGAACTTCCGT
GTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCA**
AAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTAGAGGTATTAGT
ATCTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATC
TTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTC
CAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAG
CTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGC
AGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTT
GTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATGATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGAT
TACATATGAGTTTGAAAGT
CC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4BZ39JQ 711 0 0
GCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTT
GATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGATGTC
GTGCCTAAAACCGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTAC
AAGGGTTTTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACC
GAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATTTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTC
ACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAAT
GGAAGCCAGTTTTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGA*ACTTGAATCTCAGGAGACACGC
GCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCACTTGAA
GCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTCCAAGTTATGAT
GGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTC
CTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAGTGTCTGTCTTTTAAGC
TTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4G767JQ 560 0 0
CAAGTTATGATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACA
ATGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAAATTCTTATTTAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCT
TGAACCATGGTTTCAACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTTG
TCTTCCCATAAATCAGGTATAGCTTCCTTAAGGTTCATGAATGCCGCTTAGTGCATGGTC
TATACCTGGAACTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTGAGCCCTGCTGCTTTAGC
GCTAGCGATGTTACAAACACTGTCATCGAAAAACATCGTTTTGCGTGGATCAACGATGCC
TACTATGCGTATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATTTGAGTGTT
AGTGTTAAAAAAAGGGTTTAGTGTTTCAAAGCAAATGATTCCTTCGAAGCAGTCCTCTAG
ACCCAAACGGTTAAGAGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATAATCTT
ACGGTGAGGCATAGAGAGAA

QA 1 560 1 560
DS 



CO CL68Contig2 813 5 13 U
GCTTAAAAGACAGACACTTTAAATAAGAATCTTACATGTGATTAAAGAGGAACCTTTCAT
TGTACTTTCAAACTCATGTAATCCATAAATAAATAAAAACATAAGACCATCATAACTTGA
AACTCTCATAATAGCAAAAACAAAGATACAACATTGAAGGCTTCAAGCTTCAAGTGGGAG
CTCTCCACAGGCATAGATTCTGCAACCTTTCTTGGGAACATTGAAGGCGCGTGTCTCCTG
AGATTCAAGTGTCCTCACAAGCTTCATACCTTCAAGGACTTGTCCAAACACAACATGCTT
GTTATCTAACCATGAAGTTTGGACAGTGCAAATGAAGAACTGGCTTCCATTAGTATTAGG
ACCAGCATTGGCCATACTCAAGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAATGTGAAGTTTTCGTC
TTCGAATTTGGCCCCGTAGATACTAATACCTCCAGTACCATTTCCCTCAGTGAAGTCACC
TCCTTGGATCATGAAATCTTTGATGATACGATGGAAGGAAGAACCCTTGTATCCATACTT
CTTCTCACCAGTACACAAGACACGGAAGTTCTCAACGGTTTTAGGCACGACATCACCAAA
CAGACCCATCACAATCCTTCCAGCGACTTCACCACCAATCTCCACATCAAAGTAAACCTT
GAGAGTCACATAAGCTCCGGAGAATTGCTTAAGAGGGAAACTTGCTGCATAGTGTAGTCT
CGAAGACAATGCAGAACCAGAGGAACGAGCTCCGACACAAACTGGTTGAGATGTTCGGTT
TGCTGAACTAACTGCGACTTAACAACAATCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 35 35 20 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 0 15 15 15 0 15 0 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H502TF C 25
AF RR4C983JQ U 1
AF RR4FK59JQ U 21
AF RR4CG01JQ U 1
AF RR4D971JQ U 21
BS 1 181 RR4C983JQ
BS 182 182 RR4D971JQ
BS 183 193 RR4C983JQ
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BS 195 647 RR4C983JQ
BS 648 661 RR4CG01JQ
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BS 670 670 RR4D971JQ
BS 671 671 RR4CG01JQ
BS 672 813 RR4D971JQ

RD RR4H502TF 200 0 0
AAGAATCCTACATGTGATTAAAGAGGAACCTTTCATTGTACTTTCAAACTCATGTAATCC
ATAAATAAATAAAAACATAAGA***TCATAACTTGAAACTCTCATAATAGCAAAAACAAA
GATACAACATTGAAGGCTTCAAGCTTCAAGTGGGAGCTCTCCACAGGCATAGATTCTGCA
ACCTTTCTTGGGAACATTG
C

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR4C983JQ 647 0 0
GCTTAAAAGACAGACACTTTAAATAAGAATCTTACATGTGATTAAAGAGGAACCTTTCAT
TGTACTTTCAAACTCATGTAATCCATAAATAAATAAAAACATAAGACCATCATAACTTGA
AACTCTCATAATAGCAAAAACAAAGATACAACATTGAAGGCTTCAAGCTTCAAGTGGGAG
CCCTCCACAGGCA*AGATTCTGCAACCTTTCTTGGGAACATTGAAGGCGCGTGTCTCCTG
AGATTCAAGTGTCCTCACAAGCTTCATACCTTCAAGGACTTGTCCAAACACAACATGCTT
GTTATCTAACCATGAAGTTTGGACAGTGCAAATGAAGAACTGGCTTCCATTAGTATTAGG
ACCAGCATTGGCCATACTCAAGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAATGTGAAGTTTTCGTC
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TCCTTGGATCATGAAATCTTTGATGATACGATGGAAGGAAGAACCCTTGTATCCATACTT
CTTCTCACCAGTACACAAGACACGGAAGTTCTCAACGGTTTTAGGCACGACATCACCAAA
CAGACCCATCACAATCCTTCCAGCGACTTCACCACCAATCTCCACAT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4FK59JQ 631 0 0
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ATCCATAAATAAATAAAAACATAAGACCATCATAACTTGAAACTCTCATAATAGCAAAAA
CAAAGATACAACATTGAAGGCTTCAAGCTTCAAGTGGGAGCTCTCCACAGGCATAGATTC
TGCAACCTTTCTTGGGAACATTGAAGGCGCGTGTCTCCTGAGATTCAAGTGTCCTCACAA
GCTTCATACCTTCAAGGACTTGTCCAAACACAACATGCTTGTTATCTAACCATGAAGTTT
GGACAGTGCAAATGAAGAACTGGCTTCCATTAGTATTAGGACCAGCATTGGCCATACTCA
AGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAATGTGAAGTTTTCGTCTTCGAATTTGGCCCCGTAGA
TACTAATACCTCCAGTACCATTTCCATCAGTGAAGTCACCTCCTTGGATCATGAAATCTT
TGATGATACGATGGAAGGAAGAACCCTTGTATCCATACTTCTTCTCACCAGTACACAAGA
CACGGAAGTTCTCAACGGTTTTAGGCACGACATCACCAAACAGACCCATCACAATCCTTC
CAGCGACTTCACCACCAATCTCCACATCAAA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4CG01JQ 672 0 0
GCTTAAAAGACAGACACTTTAAATAAAAATCTTACATGTGATTAAAGAGGAACCTTTCAT
TGTACTTTCAAACTCATGTAATCCATAAATAAATAAAAACATAAGACCATCATAACTTGA
AACTCTCATAATAGCAAAAACAAAGATACAACATTGAAGGCTTCAAGCTTCAAGTGGGAG
CCCTCCACAGGCA*AGATTCTGCAACCTTTCTTGGGAACATTGAAGGCGCGTGTCTCCTG
AGATTCAAGTGTCCTCACAAGCTTCATACCTTCAAGGACTTGTCCAAACACAACATGCTT
GTTATCTAACCATGAAGTTTGGACAGTGCAAATGAAGAACTGGCTTCCATTAGTATTAGG
ACCAGCATTGGCCATACTCAAGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAATGTGAAGTTTTCGTC
TTCGAATTTGGCCCCGTAAATACTAATACCTCCAGTACCATTTCCCTCAGTGAAGTCACC
TCCTTGGATCATGAAATCTTTGATGATACGATGGAAGGAAGAACCCTTGTATCCATACTT
CTTCTCACCAGTACACAAGACACGGAAGTTCTCAACGGTTTTAGGCACGACATCACCAAA
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GTGTGTCACTTT

QA 1 672 1 672
DS 

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ATCCATAAATAAATAAAAACATAAGACCATCATAACTTGAAACTCTCATAATAGCAAAAA
CAAAGATACAACATTGAAGGCTTCAAGCTTCAAGTGGGAGCTCTCCACAGGCATAGATTC
TGCAACCTTTCTTGGGAACATTGAAGGCGCGTGTCTCCTGAGATTCAAGTGTCCTCACAA
GCTTCATACCTTCAAGGACTTGTCCAAACACAACATGCTTGTTATCTAACCATGAAGTTT
GGACAGTGCAAATGAAGAACTGGCTTCCATTAGTATTAGGACCAGCATTGGCCATACTCA
AGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAATGTGAAGTTTTCGTCTTCGAATTTGGCCCCGTAGA
TACTAATACCTCCAGTACCATTTCCCTCAGTGAAGTCACCTCCTTGGATCATGAAATCTT
TGATGATACGATGGAAGGAAGAACCCTTGTATCCATACTTCTTCTCACCAGTACACAAGA
CACGGAAGTTCTCAACGGTTTTAGGCACGACATCACCAAACAGACCCATCACAATCCTTC
CAGCGACTTCACCACCAATCTCCACATCAAAGTAAACCTTGATAGTCGCATAAGCTCCGG
AGAATTGCTTAAGAGGGAAACTTGCTGCATAGTGTAGTCTCGAAGACAATGCAGAACCAG
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AACAACAATCTGA

QA 1 793 1 793
DS 



CO CL68Contig3 730 3 1 U
GGCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTC
ACCAATCAATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTA
AGTCGCAGTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCT
CCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCT
CCGGAGCTTATGCGACTATCAAGAAACAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTG
AGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATG
TGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGC
CTAAAACCGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGATACAAGG
GTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACTGAGG
GAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGGGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTCACAT
TGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGTATGGCCAATGCTGGTCCTAATACTAATGGAA
GCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTG
GACAGTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG01TF U 1
AF RR4C983TF U 1
AF RR4FK59TF U 6
BS 1 730 RR4C983TF

RD RR4CG01TF 475 0 0
GGCTCTT
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTAAGTCGCA
GTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCTCCGGTTC
TGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGC
TTATGCGACTATCAAGAAACAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGA
AGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGAT
TGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGCCTAAAAC
CGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGATA

QA 8 475 8 475
DS 

RD RR4C983TF 730 0 0
GGCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTC
ACCAATCAATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTA
AGTCGCAGTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCT
CCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCT
CCGGAGCTTATGCGACTATCAAGAAACAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTG
AGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATG
TGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGC
CTAAAACCGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGATACAAGG
GTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACTGAGG
GAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGGGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTCACAT
TGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGTATGGCCAATGCTGGTCCTAATACTAATGGAA
GCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTG
GACAGTCCTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4FK59TF 719 0 0
GG
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTAAGTCGCA
GTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGCCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTC
TGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGC
TTATGCGACTATCAAGAAACAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGA
AGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGAT
TGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTGCCTAAAAC
CGTTGAGAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGATACAAGGGTTCTTC
CTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACTGATGGAAATGG
TACTGGAGGTATTAGTATCTACGGGGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCA
TACTGGACCTGGAATCTTGAGTATGGCCAATGCTGGTCCTAATACTAATGGAAGCCAGTT
CTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACA

QA 3 719 3 719
DS 



AS 4 17

CO CL69Contig1 889 4 9 U
GGACTCCACATCCCTCTCTACAGAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAA
ACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCA
ACCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGG
TACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGT
CTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACC
AACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACTACTGCGATGATAACGAAGCTCAAAGGAAGGA
ACACGTGGCACTGTGTTTAGTGGGCGCGTGGATTAAATGAAAAACAATAAAACATTACTC
TGTTTTACCATATCAACCACCTTCCTTTATTGTGCATATATGGTTGTACAGCGGCTAGTC
AAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATA
TGGTGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACT
GTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTG
CAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAA
AAAAAAGCTTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCACTGTCCGTCTGTCCCGTTGGATTTTGGT
TGTGAAAATGCCTCTGCTTTTTCTAGTGCTAATAAGATCTTGTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM11TF U 1
AF RR4GM58TF U 4
AF RR4GR84JQ C 652
AF RR4BM11JQ C 265
BS 1 209 RR4BM11TF
BS 210 210 RR4GM58TF
BS 211 258 RR4BM11TF
BS 259 259 RR4GM58TF
BS 260 676 RR4BM11TF
BS 677 744 RR4GM58TF
BS 745 745 RR4BM11JQ
BS 746 774 RR4GM58TF
BS 775 889 RR4BM11JQ

RD RR4BM11TF 676 0 0
GGACTCCACATCCCTCTCTACAGAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAA
ACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCA
ACCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTTGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGG
TACTCCAACTACTCCGACTACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGT
CTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACC
AACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACTACTGCGATGATAACGAAGCTCAAAGGAAGGA
ACACGTGGCACTGTGTTTAGTGGGCGCGTGGATTAAATGAAAAACAATAAAACATTACTC
TGTTTTACCATATCAACCACCTTCCTTTATTGTGCATATATGGTTGTACAGCGGCTAGTC
AAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATA
TGGTGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACT
GTCTTCCACCTATGCA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4GM58TF 771 0 0
GG
CCACATCCCTCTCTACAGAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACCAA
AAAAAA*GATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTG
ACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAG
GAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTC
CAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTA
ATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCC
ACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGCGATGATAACGAAGCTCAAAGGAAGGAACACG
TGGCACTGTGTTTAGTGGGCGCGTGGATTAAATGAAAAACAATAAAACATTACTCTGTTT
TACCATATCAACCACCTTCCTTTATTGTGCATATATGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGA
GTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTG
GTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTT
CCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGT
TTTCCTTTGTGTGTTTTTT*GTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTG

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR4GR84JQ 135 0 0
TACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGC
TGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTTACGGGT
TTGAACCAAAAAAAA

QA 1 135 1 135
DS 

RD RR4BM11JQ 625 0 0
GACAACGCCA
CACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCT
ATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACTACTGC
GATGATAACGAAGCTCAAAGGAAGGAACACGTGGCACTGTGTTTAGTGGGCGCGTGGATT
AAATGAAAAACAATAAAACATTACTCTGTTTTACCATATCAACCACCTTCCTTTATTGTG
CATATATGGTTGTACAGCGGCTAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGG
AGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACG
TGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTT
AACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTA
ACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCACT
GTCCGTCTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTTCTAGTGCTAATA
AGATCTTGTTTATAC

QA 11 625 11 625
DS 



CO CL69Contig2 784 4 10 U
GGACATTCCTCTCACGAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAA
ATAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAGCCTGACC
GTGGCCTTACCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAGCCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAA
GCAACAAGATGGTGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGATGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAA
CTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATC
CTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACC
CAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGCCAGCACCGTT
AAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACC
TTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAA
GTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTT
TTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGCT
GAATCTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTTTTAGTGCTA
ATAAGATCTTGTTTATATAAAATGTTGGTGGTTTTATGGTAGTGAAAAAGTGTTGATTTT
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4EK72TF U 1
AF RR4BY22TF U 3
AF RR4BY22JQ C 3
AF RR4EK72JQ C 130
BS 1 289 RR4EK72TF
BS 290 290 RR4BY22TF
BS 291 617 RR4EK72TF
BS 618 618 RR4BY22TF
BS 619 683 RR4EK72TF
BS 684 685 RR4BY22TF
BS 686 686 RR4BY22JQ
BS 687 696 RR4BY22TF
BS 697 737 RR4BY22JQ
BS 738 784 RR4EK72JQ

RD RR4EK72TF 683 0 0
GGACATTCCTCTCACGAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAA
ATAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAGCCTGACC
GTGGCCTTACCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAGCCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAA
GCAACAAGATGGTGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGATGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAA
CTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGTGTCTTTAATC
CTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACC
CAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGCCAGCACCGTT
AAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACC
TTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAA
GTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTT
TTGTACTTGTAACTTGCGAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGCT
GAATCTTCACTGTCCCGTTGGAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4BY22TF 700 0 0
GGATTCCTCTCACGA
AAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAAGATGGTTCTGCTA
GATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAGCCTGACCGTGGCCTTACCCGCCTC
CGAAAGATCACTACCCAGCCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAACAAGATGGTGCTT
AGGTCGTTGACTATGCCGATGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTACTCCGACCACTCCG
ACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGATGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCC
ACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTC
TACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGCCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGG
AGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGT
CTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAAC
TTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTGTACTTGTAACTTGC
AAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*GCTTGCAAGTGACGGCTGAATCTTCACTGTCCCG
TTGGATTT*GGTTGTGAAA
TGCCTC

QA 16 694 16 694
DS 

RD RR4BY22JQ 736 0 0
GGATTCCTCTCACGA
AAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAAGATGGTTCTGCTA
GATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAGCCTGACCGTGGCCTTACCCGCCTC
CGAAAGATCACTACCCAGCCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAACAAGATGGTGCTT
AGGTCGTTGACTATGCCGATGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTATTCCGACCACTCCG
ACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGATGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCC
ACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTT
TACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGCCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGG
AGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGT
CTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAAC
TTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTGTACTTGTAACTTGC
AAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGCTGAATCTTCACTGTCCCG
TTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTTTTAGTGCTAATAAGATCTTGTTTATA
C

QA 16 735 16 735
DS 

RD RR4EK72JQ 655 0 0
CCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAGCCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAACAAGA
TGGTGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGATGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTACTCCGA
CCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGTGTCTTTAATCCTGGAAGCA
ACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAATTCTC
CATCCGTTTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGCCAGCACCGTTAAAAGCGAG
TCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGT
TCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACG
TTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTGTACTTG
TAACTTGCGAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGCTGAATCTTCA
CTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTTTTAGTGCTAATAAGATCT
TGTTTATATAAAATGTTGGTGGTTTTATGGTAGTGAAAAAGTGTTGATTTTTTTT

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL69Contig3 761 7 12 U
GGACTCCACATCCCTCTCTACAGAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAA
ACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCA
ACCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGG
TACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGT
CTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACC
AACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCA
GCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGT
CTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCAC
CTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTC
CTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAA*GC
TTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCACTGTCCGTCTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAA
TGCCTCTGCTTTTTCTAGTGCTAATAAGATCTTGTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4EG85TF U 6
AF RR4G249JQ C 219
AF RR4G249TF U 6
AF RR4FE64TF U 1
AF RR4AU23TF U 8
AF RR4EG85JQ C 33
AF RR4FE64JQ C 127
BS 1 101 RR4FE64TF
BS 102 102 RR4EG85TF
BS 103 110 RR4FE64TF
BS 111 111 RR4EG85TF
BS 112 708 RR4FE64TF
BS 709 709 RR4AU23TF
BS 710 719 RR4FE64TF
BS 720 720 RR4AU23TF
BS 721 733 RR4FE64TF
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BS 735 757 RR4FE64TF
BS 758 761 RR4FE64JQ

RD RR4EG85TF 652 0 0
GG
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AAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGAC
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ACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAAT
CCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCAC
CCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGT
TAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGCCTAGATC
TACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCA
ATAAGTTGTCACGTTGCTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTG
TGTTTTTT*GTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAA

QA 3 652 3 652
DS 

RD RR4G249JQ 465 0 0
TGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACA
AGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCG
GCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGT
ACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTG
GGTGATGTAAATATGGTGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCT
TGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTT
GGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGAC
GGGTTTGAACCAAAAAAAA*GCTTGCAAGTGACGGTTGAATCT
CC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4G249TF 678 0 0
GG
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AAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGAC
CGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGA
AGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCA
ACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAAT
CCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCAC
CCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGT
TAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGTCTAGATC
TACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCA
ATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTG
TGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA**GCTTGCAAG
TGACGGTTGAATCT
CC

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR4FE64TF 757 0 0
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ACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGGTGTTGTGGTCGGACCTCA
ACCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGG
TACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGT
CTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACC
AACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCA
GCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGT
CTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCAC
CTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTC
CTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAA*GC
TTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCACTGTCCGTCTGTCCCGTTGGATTT*GGTTGTGAAA*
TGCCTCTGCTTTT*CTAGTGCTAATAAGATCTTGTTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4AU23TF 732 0 0
GG
ATCCCTCTCTACAGAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACCAAAAAA
AAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGACCG
TAGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAG
CAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAAC
TACTCCGACCACTCCGACAGCGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCC
TGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCACCC
AAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTA
AAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGTCTAGATCTA
CCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAAT
AAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTTTG
TTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAA*GCTTGCAAGTG
ACGGTTGAATCTTCACTGTCCGTCTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGC
TTTTTCTAGT

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR4EG85JQ 695 0 0
CAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGC
TCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGA
TCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGT
TGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGC
CACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAG
CTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTTTACGACT
GGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACG
CAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGCCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGT
TTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGCTAACTTTC
CATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTT*GTACTTGTAACTTGCA
AGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAA*GCTTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCACTGTCCGT
CTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4FE64JQ 635 0 0
CCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGG
AAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCC
AACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAA
TCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAACCCA
CCCAAATTCTCCATCCGTTTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCG
TTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGTCTAGAT
CTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGC
AATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGT
GTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAAGCTTGCAA
GTGACGGTTGAATCTTCACTGTCCGTCTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTC
TGCTTTTTCTAGTGCTAATAAGATCTTGTTTATAT

QA 1 635 1 635
DS 



CO CL69Contig4 1236 2 2 U
GGACTCCACATCCCTCTCTACAGAAGGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAA
ACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCA
GCCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCACCGG
TACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCT
TTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAA
CCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTGAGTTCGTTATTTATATGTTATTTTCT
GTGAAATCATATACTCAAGACTAAATCTTAGATGTCATAAAAGATAATATTGGGGAACAA
GTCATGTGATCTGGTCAGCTTGTATGATTCTGAGTTTTGGAACGAGTTAAAGACAAAGTA
CTGAACCGTATAAATCTAGGAACGGTTTGGTTCGTTTTGATTTACTGATGTCTTGGTATG
AGTTATTTATGTGTCAGCGATGATAACGAAGCTCAAAGGAAGGAACACGTGGCACTGTGT
TTAGTGGGCGCGTGGATTAAATGAAAAACAATAAAACATTACTCTGTTTTACCATATCAA
CCACCTTCCTTTATTGTGCATATATGGTATAGTCATGAACTCTATAGCTTCGTAGTAACC
AAAGATGGGAAAAGAAGATACTTTTCCTTTTTACTATTTTATATACAACCGTTGGTTGTT
AAACAGCTTCAGAATCGGAGGGCTTAGATCAGAAGTTGATGATTATCTACTTGTCGGTTG
CACGTGTCGCAGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAG
AGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAATATGGTGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTT
CACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCGTTG
TTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTG
TAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCA
CTGTCCGTCAGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ74TF U 1
AF RR4GJ74JQ C 449
BS 1 634 RR4GJ74TF
BS 635 1236 RR4GJ74JQ

RD RR4GJ74TF 634 0 0
GGACTCCACATCCCTCTCTACAGAAGGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAA
ACCAAAAAAAAAGATGGTTCTGCTAGATAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCA
GCCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGAAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCACCGG
TACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCT
TTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCTATCGGCTCCAACATCTTCGATAAACCAA
CCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTGAGTTCGTTATTTATATGTTATTTTCT
GTGAAATCATATACTCAAGACTAAATCTTAGATGTCATAAAAGATAATATTGGGGAACAA
GTCATGTGATCTGGTCAGCTTGTATGATTCTGAGTTTTGGAACGAGTTAAAGACAAAGTA
CTGAACCGTATAAATCTAGGAACGGTTTGGTTCGTTTTGATTTACTGATGTCTTGGTATG
AGTTATTTATGTGTCAGCGATGATAACGAAGCTC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GJ74JQ 788 0 0
TAGATGTCATAAAAGATAATATTGGGGAACAAGTCATGTGATCTG*TCAGCTTGTATGAT
TCTGAGTTTTGGAACGAGTTAAAGACAAAGTACTGAACCGTATAAATCTAGGAACGGTTT
GGTTCGTTTTGATTTACTGATGTCTTGGTATGAGTTATTTATGTGTCAGCGATGATAACG
AAGCTCAAAGGAAGGAACACGTGGCACTGTGTTTAGTGGGCGCGTGGATTAAATGAAAAA
CAATAAAACATTACTCTGTTTTACCATATCAACCACCTTCCTTTATTGTGCATATATGGT
ATAGTCATGAACTCTATAGCTTCGTAGTAACCAAAGATGGGAAAAGAAGATACTTTTCCT
TTTTACTATTTTATATACAACCGTTGGTTGTTAAACAGCTTCAGAATCGGAGGGCTTAGA
TCAGAAGTTGATGATTATCTACTTGTCGGTTGCACGTGTCGCAGGTTGTACAGCGGCGAG
TCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACGCAAGTGGGTGATGTAAA
TATGGTGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAA
CTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCGTTGTTAACTTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTG
CAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAA
AAAAAAGCTTGCAAGTGACGGTTGAATCTTCACTGTCCGTCAGTCCCGTTGGATTTTGGT
TGTGAAAA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 4 14

CO CL70Contig1 714 2 15 U
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TACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTCGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCATCTTTC
TCCACTGCAGTCCCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAAGAGCA
ACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACCCT
GTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAA
AGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACA
TGCTCTTCGACGGTATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGC
TGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAG
AACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAAGAAGC
TTGCCCCGTCGATGCAATCGTCGAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAG
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GCTGAGATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCAGTCTTCCTTTTTGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CF65TF U 1
AF RR4E355TF U 1
BS 1 174 RR4CF65TF
BS 175 175 RR4E355TF
BS 176 227 RR4CF65TF
BS 228 228 RR4E355TF
BS 229 387 RR4CF65TF
BS 388 388 RR4E355TF
BS 389 441 RR4CF65TF
BS 442 442 RR4E355TF
BS 443 498 RR4CF65TF
BS 499 499 RR4E355TF
BS 500 689 RR4CF65TF
BS 690 692 RR4E355TF
BS 693 705 RR4CF65TF
BS 706 706 RR4E355TF
BS 707 714 RR4CF65TF

RD RR4CF65TF 714 0 0
GGGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCTTCGACGCTTGCTCGCAGGTCTCTGGA
TACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTCGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCATCTTTC
TCCACTGCAGTCCCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCA
ACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGATCATAAACACCCT
GTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAA
AGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACA
TGCTCTTCGACGGTATCCTACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGC
TGTGTGTCCAGCTCAAGCAATTACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAG
AACCACAAGGTATGACATTGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAAGAAGC
TTGCCCCGTCGATGCAATCGTCGAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAG
GAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTCGAGAATGGAGATCGATGGGAGACAGAGATC
GCTGAGATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACG**TGAGAGCAGTCTTTCTTTTTGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4E355TF 725 0 0
G
GGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCTTCGATGCTTGCTCGCAGGTCTCTGGAT
GCTCTC*GTGCTCGACATCTCGTTTCGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCATCTTTCT
CCACTGCAGTCCCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAAGAGCAA
CTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACCCTG
TTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAA
GTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACAT
GCTCTTCGACGGTATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCT
GTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGA
ACCACAAG*TATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCT
TGCCCCGTCGATGCAATCGTCGAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGG
AGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTCGAGAATGGAGATCGATGGGAGACAGAGATCG
CTGAGATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCAGTCTTCTTTT
GCTCATGTTAGAATA

QA 2 710 2 710
DS 



CO CL70Contig2 1106 3 6 U
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GAATCCATCGAATCAATGGCTTCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACACTCCGTGCT
CGCCATGTTGTTTTGTCAGGGCAAGCTTTGCAGGGATCTCATCTTTCTGGATTTCAGTCC
CGTCCTATTTCTTACGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAA
ATCTCCAAGGACTGGAATACTGTGTTTGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAA
ATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAAT
TATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGT
TATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCT
CAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTAT
GACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGAT
GCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTAT
GACAAGGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTT
AAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAAAAAAAAACATTCTACAACAGTCTTCGCTTCAAGTTA
TTCCCCGAGAAAACGTTTTTCGGTCGCTTCTGTTAGAAATAAAAAAAATATGAGATGTTA
TGCGTTTGAAAACTCCTCTTTTGTATTCCAGCTTTGTGCTGTGTAATTGAATTGTTTGCT
TCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATTTCCGGTGAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGA
AAACTAGGCCAGGGTGTCCCGGTTATGACCAGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAACATCTG
TTCGGTTCTATTCGGTTAATAATACTTTGGATACATTTATTTTTTTCTAAACTTATTTTG
GATCAGAATTCATTACAGATTTGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E213TF U 1
AF RR4D114TF U 1
AF RR4D114JQ C 270
BS 1 750 RR4D114TF
BS 751 751 RR4D114JQ
BS 752 760 RR4D114TF
BS 761 761 RR4D114JQ
BS 762 775 RR4D114TF
BS 776 1106 RR4D114JQ

RD RR4E213TF 673 0 0
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QA 1 673 1 673
DS 

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CGCCATGTTGTTTTGTCAGGGCAAGCTTTGCAGGGATCTCATCTTTCTGGATTTCAGTCC
CGTCCTATTTCTTACGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAA
ATCTCCAAGGACTGGAATACTGTGTTTGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAA
ATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAAT
TATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGT
TATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCT
CAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTAT
GACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGAT
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GACAAGGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTT
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GTATCCCCGAGAAACGTT

QA 1 775 1 775
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AACATTCTACAACAGTCTTCGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTCGGTCGCTT
CTGTTAGAAATAAAAAAAATATGAGATGTTATGCGTTTGAAAACTCCTCTTTTGTATTCC
AGCTTTGTGCTGTGTAATTGAATTGTTTGCTTCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATTTCCGG
TGAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCAGGGTGTCCCGGTTATGAC
CAGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAACATCTGTTCGGTTCTATTCGGTTAATAATACTTTG
GATACATTTATTTTTTTCTAAACTTATTTTGGATCAGAATTCATTACAGATTTGTTT

QA 1 837 1 837
DS 



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CTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACCCTG
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GTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGA
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GCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTTTGCTTCAT
CGTTTAGAAAAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTG


BQ
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AF RR4H624TF U 1
AF RR4FI68TF U 1
BS 1 74 RR4FI68TF
BS 75 75 RR4H624TF
BS 76 127 RR4FI68TF
BS 128 128 RR4H624TF
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RD RR4H624TF 596 0 0
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QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4FI68TF 756 0 0
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ACTCTCCGTGCTCGGCATCTCGTATTGTCAGGGAAAGGTTTGCAGGGAACTCATCTTTCT
CCACTGCCGTCCCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAA
CTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACCCTG
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GCTCTTCGACGGTATCCTACTGGGGAAGAACGTTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCT
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ACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCT
TGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACACACGAG
GAGCTTCTGTATGACAAGGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGAGACCGAGATC
GCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTTTGCTTCAT
CGTTTAGAAAAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTG

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL70Contig4 1044 7 9 U
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AATGGCATCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGT
ATCAGGGCAAGCTTTGAAGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCGTGCTATTTCTTA
CGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTG
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GTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAA
GGGTCCACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGA
AGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAAT
AGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTATGACATCGACATGAC
AAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGG
ACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTTCTCTATGACAAAGAAAAGCT
TCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCT
CTACCGTTAAAAAAAA*CCATTCTGCAACAGTCTTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAA
ACGTTTTTCGGTTGCTTCTGTTAGAAAATAAATATATGAGATCTTACGCGTTTGAAAACT
CC*CCTCCTTTGTATTCCAGCTTTGTGGTGTGTAATTGAATTGTTTGCCTCTTGTTTCGA
CCTGAGTTTGATTTCCGGTTAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCA
CGGTGTCCCGGTTATGACCAGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAATATATGTTTGGTTCTAT
TCGGTTAATAAATACTTTGGATGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 
5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4GP61TF U 1
AF RR4AM69TF U 1
AF RR4GD44TF U 2
AF RR4AM69JQ C 138
AF RR4GP61JQ C 331
AF RR4GO18JQ C 499
AF RR4GO18TF U 499
BS 1 26 RR4GP61TF
BS 27 27 RR4AM69TF
BS 28 251 RR4GP61TF
BS 252 252 RR4AM69TF
BS 253 518 RR4GP61TF
BS 519 615 RR4AM69TF
BS 616 616 RR4GD44TF
BS 617 728 RR4AM69TF
BS 729 1044 RR4GO18TF

RD RR4GP61TF 518 0 0
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AATGGCATCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGT
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CGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTG
GAATACTGTGT*CGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTT
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GGGTCCACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGA
AGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAAT
AGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACCA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4AM69TF 728 0 0
G
GGTCAATCGCAGTGAAGAAGGAAGGACCCTAAATCGAATCCATCCATCAAATCAAATCAA
ATGGCATCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGTA
TCAGGGCAAGCTTTGAAGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCGTGCTATTTCTTAC
GGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTGG
AATACTGTGTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTG
TCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAG
GGTCCACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAA
GAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATA
GAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTATGACATCGACATGACA
AAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGA
CCTAACTTTGAATTTGCAACCGAGACACACGAGGAACTTCTCTATGACAAAGAAAAGCTT
CTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTC
TACCGTT

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR4GD44TF 727 0 0
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GAAGGAAGGACCCTAAATCGAATCCATC****AAATCAA******TGGCTTCGATGCTGG
CTCGCAGGTCATTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTTTGTCAGGGCAAGCTTTGC
AGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCGCGCTATTTCTTACGGCTCCAAGAAAGATG
ATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAATACTGTGTTTGAAC
GGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGACTCTCAAGT
ACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTC
GTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGTGAAGAGCGCTGCATTGCCT
GCAAACTCTGTGAAGCTGTTTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGG
AAGATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTACGACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTG
GTTTCTGCCAAGAAGCGTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGGCCTAACTTTGAATTCG
CAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAGGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATC
GATGGGAGACTGAGATTGCTGAGA*TCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTT

QA 17 727 17 727
DS 

RD RR4AM69JQ 760 0 0
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ATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTGTTCGAAC
GGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGT
ACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTC
GTTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCT
GCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGG
AAGATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTATGACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTG
GTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTTG
CAACCGAGACACACGAGGAACTTCTCTATGACAAAGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATC
GATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAAAAAAAAA
CCATTCTGCAACAGTCTTTTGCTTCAAGTTACTCCCCGAGAAAACGTTTTTCGGTTGCTT
CTGTTAGAAAATAAATATATGAGATCTTACGCGTTTGAAAACTCC*CCTCCTTTGTATTC
CAGCTTTGTGGTGTGTAATTGAATTGTTTGCTTCTTGTT
C

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4GP61JQ 714 0 0
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ACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGA
AGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCG
TAGAACCACTAGGTATGACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGA
AGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACA
CGAGGAACTTCTCTATGACAAAGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGA
GATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAAAAAAAAACCATTCTGCAACA
GTCTTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTCGGTTGCTTCTGTTAGAAAATA
AATATATGAGGTCTTACGCGTTTGAAAACTCC*CCTCCTTTGTATTCCAGCTTTGTGGTG
TGTAATTGAATTGTTTGCTTCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATTTCCGGTTAAGTTTGTTC
GTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCACGGTGTCCCGGTTATGACCAGGTTTTCAGG
TTGAGTTTCATAATATATGTTTGGTTCTATTCGGTTAATAAATACTTTGGA
TAC

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DS 

RD RR4GO18JQ 543 0 0
G
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TTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTCGCA
ACCGAGACACACGAGGAACTTCTCTATGACAAAGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGA
TGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAAAAAAAA*CC
ATTCTGCAACAGTCTTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTCGGTTGCTTCT
GTTAGAAAATAAATATATGAGATCTTACGCGTTTGAAAACTCCTCCTCCTTTGTATTCCA
GCTTTGTGGTGTGTAATTGAATTGTTTGCCTCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATTTCCGGT
TAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCACGGTGTCCCGGTTATGACC
AGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAATATATGTTTGGTTCTATTCGGTTAATAAATACTTTG
GA

QA 2 543 2 543
DS 

RD RR4GO18TF 546 0 0
G
GATGGAAGCCGTAGAACCACTAGGTATGACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGGGGT
TTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTCGCA
ACCGAGACACACGAGGAACTTCTCTATGACAAAGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGA
TGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAAAAAAAA*CC
ATTCTGCAACAGTCTTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTCGGTTGCTTCT
GTTAGAAAATAAATATATGAGATCTTACGCGTTTGAAAACTCC*CCTCCTTTGTATTCCA
GCTTTGTGGTGTGTAATTGAATTGTTTGCCTCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATTTCCGGT
TAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCACGGTGTCCCGGTTATGACC
AGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAATATATGTTTGGTTCTATTCGGTTAATAAATACTTTG
GATGC

QA 2 546 2 546
DS 



AS 1 17

CO CL71Contig1 782 17 25 U
GGGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA*GAGAGAAAGAAAACAGA
AAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATCTTC
TGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATT
GGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTAC
TATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCC
TGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGC
AACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGC
TGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAA
ACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTG
CGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAA
ACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTT
TTTT**ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCAA
GAGAGCTTTAACTAAAAGTAACACACAGCGAGAAACTTTCGTCAATTTTCAATCATACAA
AA


BQ
10 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 25 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 30 75 75 30 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 20 80 80 80 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 25 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 
95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 80 95 95 95 95 95 95 80 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 
95 95 95 95 80 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 80 80 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 25 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 90 90 90 
90 90 65 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 30 30 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 75 75 75 70 60 60 20 60 55 55 50 
50 50 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4DA73TF U 2
AF RR4EK08TF U 1
AF RR4EL18JQ C 153
AF RR4C984JQ C 13
AF RR4C984TF U 13
AF RR4DA33TF U 99
AF RR4FP77JQ C 152
AF RR4FP77TF U 17
AF RR4D084TF U 2
AF RR4D084JQ C 146
AF RR4DA73JQ C 153
AF RR4DO36TF U -6
AF RR4FI02JQ C 92
AF RR4H365TF U 2
AF RR4H365JQ C 58
AF RR4EL18TF U 0
AF RR4FI02TF U 2
BS 1 42 RR4EK08TF
BS 43 43 RR4FI02TF
BS 44 94 RR4EK08TF
BS 95 95 RR4FI02TF
BS 96 111 RR4EK08TF
BS 112 112 RR4FI02TF
BS 113 114 RR4EK08TF
BS 115 115 RR4FI02TF
BS 116 147 RR4EK08TF
BS 148 148 RR4FI02TF
BS 149 288 RR4EK08TF
BS 289 289 RR4FI02TF
BS 290 376 RR4EK08TF
BS 377 377 RR4D084TF
BS 378 612 RR4EK08TF
BS 613 613 RR4FI02TF
BS 614 663 RR4EK08TF
BS 664 664 RR4D084TF
BS 665 688 RR4EK08TF
BS 689 690 RR4FI02TF
BS 691 694 RR4EK08TF
BS 695 718 RR4D084TF
BS 719 719 RR4FI02TF
BS 720 725 RR4D084TF
BS 726 782 RR4FI02TF

RD RR4DA73TF 657 0 0
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AAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACATCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCT
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GAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCA
GCGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCT
GATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAA
CCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGC
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CAAGAGAACCCCTGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4EK08TF 694 0 0
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AAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACATCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTC
TGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATT
GGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTAC
TATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTCGTGGAGCTGCC
TGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGC
AACGAGTGAGATTATACCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGC
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ACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTG
CGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAA
ACAAGAGAACCCCTGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTT
TTT***ATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4EL18JQ 566 0 0
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GGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATT
TAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAA
ACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATTTCCAATTTTTGGTG
AAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTT
ACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGA
TGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTTTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTTT
TTGTTTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATTTTT
TCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATTTTTTTTT**ATCAGATTTGTATTTTTATACTGTTT
TGGTTAAAGATCATTCGATGAGT
TTC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4C984JQ 704 0 0
G
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CATCTCCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAG
TATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGGAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGT
GACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGT
TCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATT
ATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGC
TTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGTAACCCC
GCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGAC
GCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCA
TGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTTTTATCAGAT
TTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR4C984TF 704 0 0
G
GAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA*GAGAGAAAGAAAACAGAAAAAATGGCACTG
AGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATCTTCTGCATCCAAATCT
CATCTCCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAG
TATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGGAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGT
GACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGT
TCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATT
ATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGC
TTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGTAACCCC
GCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGAC
GCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCA
TGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTTT*ATCAGAT
TTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR4DA33TF 622 0 0
G
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ACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGA
AGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGG
AGCAGTGGAGATTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCAT
CGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGA
TGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCC
AACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTT
TGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTAC
TTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAA
AGATCATTCGATGAGTCTCAA

QA 2 622 2 622
DS 

RD RR4FP77JQ 561 0 0
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TGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGTCCAGGATCAT
TTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAA
AACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGT
GAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCT
TACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTG
ATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTTTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTT
TTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTT
TTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTTTATACTGTT
TTGGTTAAAGATCATTCGATG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4FP77TF 696 0 0
GG
AGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA*GAGAGAAAGAAAACAGATAAAATGGCACTGAGAAT
GTTGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCT
CCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGC
AAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCA
TGTCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGT
GACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATC
TCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGAT
TAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGA
GTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGC
TCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTA
CAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTT**ATCAGATTTGTA
TTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATG

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR4D084TF 724 0 0
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AAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACATCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCT
GCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTG
GAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACT
ATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTCGTGGAGCTGCCT
GAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCA
GCGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCT
GATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAA
CCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGC
GAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAA
CAAGAGAACCCCTGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTT
TTT**ATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCGAG
AGAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4D084JQ 618 0 0
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CATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAG
GATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTCGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAA
GAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAGCGAGTGAGATTATATCTCCAATC
TCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCG
AGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAA
TCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAG
GGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCCTGCTACAGTTTC
AATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTT**ATCAGATTTGTATTTCTAT
ACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCGAGAGAGCTTTAACTAAAAGTAACACA
CAGAGAGAAACTTTCG
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4DA73JQ 611 0 0
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GGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATT
TAGGAGAAGTTGTGTTCGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAA
ACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAGCGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTG
AAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTT
ACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGA
TGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCT
TTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCCTGCTACAGTTTCAATCTTT
TCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTT**ATCAGATTTGTATTTCTATACT**TT
TGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCGAGAGAGCTTTAACTAAAAGTAACACACAGAGAG
AAACTTTCG
CC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4DO36TF 753 0 0
GGATTTTCCC
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AATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACATCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCTGC
ATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGA
AGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTAT
TGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTCGTGGAGCTGCCTGA
AGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAAC
GAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGA
TTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACC
AAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGA
AG**GAAGACGCTGCT***TAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACA
AGAGAACCCCTGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTT
T**ATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCAAGAG
AGCTTTAACTAAAAGTAACACAC

QA 11 753 11 753
DS 

RD RR4FI02JQ 687 0 0
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TCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAG
TGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCAT
TTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGGAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAA
AACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGT
GAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCT
TACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTG
ATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTC
TTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTT
TTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTTT*ATCATATTTGTATTTCTATACTGTT
TTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCAAGAGAGCTTTAACTAAAAGTAACACACAGCGA
GAAACTTTCGTCAATTTTCAATCATAC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4H365TF 738 0 0
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AAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATCTTCT
GCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTG
GAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACT
ATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTACCT
GAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCA
ACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCT
GATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAA
CCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGC
GAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAA
CAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTT
TTT**ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCAAG
AGAGCTTTAA
AACAAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4H365JQ 672 0 0
AGAAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATC
TTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGT
ATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGC
TACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCT
ACCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAA
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CGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
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CTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGC
AAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATC
TTTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCT
CAAGAGAGCTTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4EL18TF 723 0 0
GGCC
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AATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATCTTCTGC
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AGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTAT
TGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGA
AGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAAC
GAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGA
TTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACC
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AGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAACA
AGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTT
***ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCAAGA

QA 5 723 5 723
DS 

RD RR4FI02TF 781 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA*GAGAGAAAGAAAACAGAA
AAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTGTCATCTTCT
GCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCGTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTG
GAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACT
ATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCT
GGAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCA
ACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCT
GATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAA
CCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGC
GAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTGCCAGTATGTCCTAAGCAAAA
CAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTTCGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTT
TTTT*ATCATATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTCAAG
AGAGCTTTAACTAAAAGTAACACACAGCGAGAAACTTTCGTCAATTTTCAATCATACAAA
A

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 17

CO CL72Contig1 849 17 30 U
GGGACAACAACACATTTCTAAGAGACGGATAAAAAAAAAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGA
AGTGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAA
ACTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCT
TCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCAT
TCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCT
CCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACA
GATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTT
GGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTT
CTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTG
TTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGA
ATACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCC
AAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTC
GAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTTG
AACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTATTCTTCTAATAAACAAATT
CATCTTATT


BQ
10 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 50 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 70 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 75 90 90 90 90 90 90 85 85 85 70 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 50 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 70 85 85 70 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 50 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 75 60 75 75 75 75 75 75 60 75 75 60 75 75 75 75 75 75 35 75 30 75 75 60 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 50 50 40 75 75 75 75 60 75 
75 35 70 55 70 45 45 45 70 70 70 55 70 70 70 35 70 70 70 70 70 65 50 65 65 65 65 65 65 25 65 50 65 65 65 65 50 65 65 40 55 55 50 35 50 50 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 35 20 30 25 25 25 10 

AF RR4FU74TF U 2
AF RR4BJ01TF U 2
AF RR4CR43TF U 1
AF RR4GG33TF U 19
AF RR4CM91TF U 2
AF RR4D593TF U 2
AF RR4DZ39TF U 2
AF RR4C842TF U 3
AF RR4CR43JQ C 108
AF RR4C842JQ C 313
AF RR4DZ39JQ C 102
AF RR4GR07JQ C 102
AF RR4DU72JQ C 200
AF RR4DU72TF U 113
AF RR4D593JQ C 233
AF RR4GG33JQ C 354
AF RR4FU74JQ C 278
BS 1 141 RR4CR43TF
BS 142 142 RR4BJ01TF
BS 143 569 RR4CR43TF
BS 570 570 RR4BJ01TF
BS 571 618 RR4CR43TF
BS 619 619 RR4BJ01TF
BS 620 678 RR4CR43TF
BS 679 679 RR4D593TF
BS 680 723 RR4CR43TF
BS 724 724 RR4CM91TF
BS 725 736 RR4CR43TF
BS 737 754 RR4CM91TF
BS 755 755 RR4D593TF
BS 756 756 RR4CM91TF
BS 757 757 RR4DU72TF
BS 758 781 RR4CM91TF
BS 782 782 RR4DU72TF
BS 783 785 RR4D593TF
BS 786 788 RR4C842TF
BS 789 795 RR4D593TF
BS 796 796 RR4DU72TF
BS 797 809 RR4D593TF
BS 810 810 RR4DU72TF
BS 811 819 RR4D593TF
BS 820 820 RR4DU72TF
BS 821 822 RR4D593TF
BS 823 842 RR4DU72TF
BS 843 844 RR4DZ39JQ
BS 845 848 RR4GR07JQ
BS 849 849 RR4D593JQ

RD RR4FU74TF 267 0 0
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GTGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGGGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAAAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATAC

QA 1 267 1 267
DS 

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GTGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTC
CCTGAAGATCCTTACGAGAGACCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAG
ATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTG
GCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTC
TTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGT
TTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAA
TACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4CR43TF 740 0 0
GGGACAACAACACATTTCTAAGAGACGGATAAAAAAAAAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGA
AGTGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAA
ACTCAAAGGCATACCGTACGAGTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCT
TCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCAT
TCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCT
CCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACA
GATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTT
GGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTT
CTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTG
TTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATCGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGA
ATACAGCAGATGGGTGAATAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCC
AAGAGAGAAACATGTTGA*CACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTC
GAA*GTCATATTTGGT
CTGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4GG33TF 714 0 0
G
AAGAGACGGATAAAAAAAAAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAGTGAAGCTTTTGGGAATA
TGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAAAGGCATACCGTAC
GATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATC
CACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATT
CTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAG
AGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTT
GTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGATGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAA
CTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTC
GGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAA
GGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAAG
AACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAA
CACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATT

QA 2 714 2 714
DS 

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GTGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGATCACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTC
CCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAG
ATTATCACTGCGGGTTTAGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTG
GCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTC
TTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGT
TTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAA
TACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAG*TTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCA
AGAGAGAAACATGTTGA*CACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCG
AAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTAA*GTTACTGTCATGTTTGAACTTTGA
C

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4D593TF 822 0 0
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GTGAAGCCTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTC
CCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAG
ATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTG
GCAGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTC
TTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGT
TTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAA
TACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCA
AGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAA*GAATCAGATCCGCTTAGTCG
AAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTA*GTTACTGTCATGTTG**ACTTTGA
*CCT**GTATCTGT*ATGTTTCTCAAAA*GCTTATCTT*AT
C

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4DZ39TF 807 0 0
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GTGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTC
CCTGAAGATCCTTACGATAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAG
ATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTG
GCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTC
TTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGT
TTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAA
TACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAG*TTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCA
AGAGAGAA*CATGTTGA*CACATGAATTATATGGGG*AAAGA*TCA*ATCCGCTTAGTCG
AA*GTCATATTTGGTTCTGTGTTTCA*TGTTTT*A*GT*ACTGTCATGTTG**ACTT*GA
*C*T**GTATCTGT*ATGTT
CTCAAAA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4C842TF 825 0 0
GACAACAACACATTTCTAAGAGACGGATAAAAAAAAAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAG
TGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAAC
TCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTC
TTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTC
TCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCC
CTGAAGATCCTTACGAGAGATCTAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGA
TTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGG
CGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCT
TCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTT
TGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAAT
ACAGCAGATGGGTGAAGA*CTTGGAGAAAGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAA
GAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGA
A*GTCATATTTGGTTCTGTGTT*CAATGTTTT*A*GTTACTGTCATGTTTG*ACTTTGA*
CCTTGTTATCTGT*ATGTTTCTCAAAA*GCTTATCTT
ATTCTTCC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4CR43JQ 713 0 0
AGATGGCTCTCAAACTCAAAGGCATACCGTACGAGTACGTTGAGGAAATACTAGAGCACA
AAAGCCCTTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACA
ATGGCAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAAC
AGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTTTTAGCTAAAC
TCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAG
GAAGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTG
TCGGAAAAGATTTTTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTA
TGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATCGAAAGTGATTACAGAGG
AGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAATAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAG
ATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCA
GATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCA
TGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTT
C

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4C842JQ 516 0 0
TTACGAGAGATCTAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGC
GGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGAC
AAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAA
GAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGG
TTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACAGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATG
GGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACA
TGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATT
TGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATC
TGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTATTCTTC
C

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4DZ39JQ 743 0 0
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TCCACAATGGCAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTT
GGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGATAGATCCAAGGCTCGATTCTTAG
CTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACG
AGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGG
AACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCG
GAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTA
CAGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTG
TGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAA
GAATCAAATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTA
CTGTCATGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGTTTATCTTTA
TTCTTCTAATAAACAAATTCATC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4GR07JQ 748 0 0
GGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACTAG
AGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTG
TCCACAATGGCAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTT
GGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAG
CTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACG
AGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGG
AACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAATAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCG
GAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTA
CAGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTG
TGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAA
GAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTA
CTGTTATGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTA
TTCTTCTAATAAACAAATTCATCTTAT
C

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4DU72JQ 646 0 0
CACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATT
CTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAG
AGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTT
GTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAA
CTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTC
GGGTTCTTGGATTTAATTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAA
GGAATGGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAAG
AACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAA
CACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCT
GTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATG
TTTCTCAAAAAGCTTATCTTTATTCTTCTAATAAACAAATTCATCT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DU72TF 730 0 0
GCTCTCAAACTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAGGAAATACCAGAGCACAAAAGC
CCTTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGC
AAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAAT
CCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTC
GATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGA
GAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGA
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GCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCATGTTT
GAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTATTCTTCTAATA
AACAAATTCA

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CCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTC
GATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGA
GAGGCTTTGGCAGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGA
AAAGATTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATT
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GAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTATTCTTCTAATA
AACAAATTCATCTTATT

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AACTTTGAACCTTGTTATTTGTTATGTTTTTCAAAAAGCTTATTTTTATTTTTTTAATAA
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T

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DS 

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TTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCA
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GTTACTGTCATGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAGGCTTATC
TTTATTCTTCTAATAAACAAATTCATCTTAT
C

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DS 



AS 1 16

CO CL73Contig1 1225 16 10 U
GCTTTGAAGCTCCATAAGAGTAGAAACAATGGATAAACGATACTCATTCACTCACATTCG
ATCGGAAATAGAGGTAATACTCTGTGATCAGGCACACACACATACACATACACATACACA
TACACAGACATAAACACACATTACTCAACCATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACAT
ATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACATTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCG
AAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTGTACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCT
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TGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCG
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GTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATC
ACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGA
CCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACG
TAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAA
GCAGTTTTTGCCGGCTCAACCGCACTTGTTCTGTCCACGTCCGTCCCAAACTCAGACGGC
AAGAATCTCTTGACGTTACCAGCTTCTTTGATAGCAGAAATGATCTTGGTTTGATCCAAG
ATTTGCATGCTTCCAATACTCGATATCACCACATCAACCTGTTGTATTGCCTTCAGTAGG
CTCTCGTGATCGTTCACATCTCCTTGTAGTATTGTCACGCCGAGATCTTTAAAGTTCTGG
ACGGTTTTGCTCTTCACTGGGTCGGAAAGAGAAGCTTCTCTAACGAGAGCGAATGTTTTG
TGGCCAGACTTGGCACTTTCTGCGACGATGAACTTTCCAATGTAACCAGTTCCTCCGATC
ACGAGAATCTTGCTTTTCTCAGTCGCTATGTTTCTTGACAATAAGTGAGTAATGCGATTT
GAATGGTATAGAGAGAATGATTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 70 85 70 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 60 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS04JQ U 17
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GT
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GGACGTTGTACATTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGACTGAAATACTCG
TCAATGCTCGTGTACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAAAGGCTTCAAGACCAAACGAAGGT
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TCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTA

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR4AQ04JQ 586 0 0
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TACACATACACATACACATACACAGACATAAACACACATTACTCAACCATTACAAGTTCG
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ATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTGTACTTAACATCA
GGGTAAAGCTCAAAGGCTTCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAATTGGTCTGATCT
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TGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATC
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TAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATA
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DS 

RD RR4EP47JQ 607 0 0
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ACACACATACACATACACATACACATACACAGACATAAACACACATTACTCAACCATTAC
AAGTTCGAACTTTTACTTTTTACATATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACATTAGG
TGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTGTACTT
AACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCTTCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAATTGGT
CTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAGTGGTTTATGGCGAGAAGAACATTGATAGGAACTGG
AGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTT
GCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATTTCATTCATCGACAAAGTGTTCTTAGGAGG
ATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGC
AGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGAC
TTTCTCT

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DS 

RD RR4DD31JQ 659 0 0
G
GGATAAACGATACTCATTCACTCACATTCGATCGGAAATAGAGGTAATACTCTGTGATCA
GGCACACACACATACACGTACACATACACATACACAGACATAAACACACATTACTCAACC
ATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACATATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACA
TTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTG
TACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCTTCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAA
TTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAGTGGTTTATGGCGAGAAGAACATTGATAGGA
ACTGGAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGA
GACTTGCCGATCTTGGTCTCACACAAGGCGACCATTCCATTCATCGACAAAGTGTTCTTA
GGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTG
TAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATG
GTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAA
CCGCACTTGTTCTGTCCA

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DS 

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ATCGGAAATAGAGGTAATACTCTGTGATCAGGCACACACACATACACATACACATACACA
TACACAGACATAAACACACATTACTCAACCATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACAT
ATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACATTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCG
AAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTGTACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCT
TCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAATTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAG
TGGTTTATGGCGAGAAGAACATTGATAGGAACTGAAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACT
TGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCG
ACCATTTCATTCATCGACAAAGTGTTCTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGA
GTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATC
ACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGA
CCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACG
TAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTT

QA 1 745 1 745
DS 

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C
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AACTCGCCTCTTGGACGTTGTACATTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGA
CTGAAATACTCGTCAATGCTCGTGTACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAAAGGCTTCAAGA
CCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAATTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAGTGGTTT
ATGGCGAGAAGAACATTGATAGGAACTGGAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCC
TCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATT
TCATTCATCGACAAAGTGTTCTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTT
GGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCT
TTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGC
TCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTG
TATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACT
CC

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR4DK08TF 651 0 0
C
GACATAAACACACATTACTCAACCATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACATATATGA
AACTCGCCTCTTGGACGTTGTACATTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGA
CTGAGATACTCGTCAATGCTCGTGTACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCTTCAAGA
CCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAATTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAGTGGTTT
ATGGCGAGAAGAACATTGATAGGAACTGGAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCC
TCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATT
TCATTCATCGACAAAGTGTTCTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTT
GGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCT
TTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGC
TCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTG
TATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACT
CC

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR4E328JQ 752 0 0
GGATAAACGATACTCATTCACTCACATTCGATCGGAAATAGAGGTAATACTCTGTGATCA
GGCACACACACATACACATACACATACACATACACAGACATAAACACACATTACTCAACC
ATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACATATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACA
TTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTG
TACTTAACATCGGGGTAAAGCTCAGGGGCTTCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAA
TTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAGTGGTTTATGGCGAGAAGAACATTGATAGGA
ACTGGAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGA
GACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATTTCATTCATCGACAAAGTGTTCTTA
GGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTG
TAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATG
GTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAG
TAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATG
GCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAA
GCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AP27JQ 813 0 0
GCTTTGAAGCTCCATAAGAGTAGAAACAATGGATAAACGATACTCATTCACTCACATTCG
ATCGGAAATAGAGGTAATACTCTGTGATCAGGCACACACACATACACATACACATACACA
TACACAGACATAAACACACATTACTCAACCATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACAT
ATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACATTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCG
AAGTGACTGAAATACTCGTCAATGCTCGTGTACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCT
TCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAATTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAG
TGGTTTATGGCGAGAAGAACATTGATAGGAACTGAAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACT
TGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCG
ACCATTTCATTCATCGACAAAGTGTTCTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGA
GTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATC
ACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGA
CCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACG
TAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAA
GCAGTTTTTGCCGGCTCAACCGCACTTGTTCTG

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4BT20JQ 813 0 0
GGATAAACGATACTCATTCACTCACATTCGATCGGAAATAGAGGTAATACTCTGTGATCA
GGCACACACACATACACATACACATACACATACACAGACATAAACACACATTACTCAACC
ATTACAAGTTCGAACTTTTACTTTTTACATATATGAAACTCGCCTCTTGGACGTTGTACA
TTAGGTGCTTCTATGAAATCTCTTCAGGCGAAGTGACTGAGATACTCGTCAATGCTCGTG
TACTTAACATCAGGGTAAAGCTCAGAGGCTTCAAGACCAAACGAAGGTTCTATAGTGAAA
TTGGTCTGATCTCCCTTCACAAAAACCGAGTGGTTTATGGCGAGAAGGACATTGATAGGA
ACTGGAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAAGA
GACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATTTCATTCATCGACAAAGTGTTCTTA
GGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTG
TAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATG
GTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAG
TAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATG
GCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAAGCAGTTTTTGCCGGCTCA*CCGCACTTGTT
CTGTCCACGTCCGTCC*AAACTCAGACG
CAAGA

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4AP27TF 814 0 0
AAGAACATTGATAGGAACTGAAGACTCTTGGATGAGTTTAAGGACTTGCTCCTCTGGGAT
GTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATTTCATTCAT
CGACAAAGTGTTCTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATC
CACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATT
TCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAAACTG
AATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTGTATGGTAC
TCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAAGCAGTTTTTGCCGG
CTCAACCGCACTTGTTCTGTCCACGTCCGTCCCAAACTCAGACGGCAAGAATCTCTTGAC
GTTACCAGCTTCTTTGATAGCAGAAATGATCTTGGTTTGATCCAAGATTTGCATGCTTCC
AATACTCGATATCACCACATCAACCTGTTGTATTGCCTTCAGTAGGCTCTCGTGATCGTT
CACATCTCCTTGTAGTATTGTCACGCCGAGATCTTTAAAGTTCTGGACGGTTTTGCTCTT
CACTGGGTCGGAAAGAGAAGCTTCTCTAACGAGAGCGAATGTTTTGTGGCCAGACTTGGC
ACTTTCTGCGACGATGAACTTTCCAATGTAACCAGTTCCTCCGATCACGAGAATCTTGCT
TTTCTCAGTCGCTATGTTTCTTGACAATAAGT
CC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4AQ04TF 605 0 0
CTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTC
TAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAA
AGCAATTGTTAACAACGTAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCT
GAATCTTCACTGAAAAAGCAGTTTTTGCCGGCTCAACCGCACTTGTTCTGTCCACGTCCG
TCCCAAACTCAGACGGCAAGAATCTCTTGACGTTACCAGCTTCTTTGATAGCAGAAATGA
TCTTGGTTTGATCCAAGATTTGCATGCTTCCAATACTCGATATCACCACATCAACCTGTT
GTATTGCCTTCAGTAGGCTCTCGTGATCGTTCACATCTCCTTGTAGTATTGTCACGCCGA
GATCTTTAAAGTTCTGGACGGTTTTGCTCTTCACTGGGTCGGAAAGAGAAGCTTCTCTAA
CGAGAGCGAATGTTTTGTGGCCAGACTTGGCACTTTTTGCGACGATGAACTTTCCAATGT
AACCAGTTCCTCCGATCACGAGAATCTTGCTTTTCTCAGTCGCTATGTTTCTTGACAATA
AGT
CC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4E328TF 787 0 0
GAGAGACATGATA
GAACTGGAGACTCT*GGATGAGTT*AAGGACTTGCTCCTCTGGGATGTGAGTCTTCTCAA
GAGACTTGCCGATCTTG*TCTCCCACAAGGCGACCATTTCATTCATCGACAAAGTGTTCT
TAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTG
TGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTA
TGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCA
AGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGA
TGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAAGCAGTTTTTGCCGGCTCAACCGCACTTG
TTCTGTCCACGTCCGTCCCAAACTCAGACGGCAAGAATCTCTTGACGTTACCAGCTTCTT
TGATAGCAGAAATGATCTTGGTTTGATCCAAGATTTGCATGCTTCCAATACTCGATATCA
CCACATCAACCTGTTTTATTGCCTTCAGTAGGCTCTCGTGATCGTTCACATCTCCTTGTA
GTATTGTCACGCCGAGATCTTTAAAGTTCTGGACGGTTTTGCTCTTCACTGGGTCGGAAA
GAGAAGCTTCTCTAACGAGAGCGAATGTTTTGTGGCCAGACTTGGCGCTTTCTGCGACGA
TGAACTTTCCAATGTAACCAGTTCCTCCGATCACGAGAATATTGCTTTTCTC
CC

QA 14 785 14 785
DS 

RD RR4AR38TF 756 0 0
ATGTGAGTCTTCTCAAGAGACTTGCCGATCTTGGTCTCCCACAAGGCGACCATTTCATTC
ATCGACAAAGTGTTCTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGAGTCCTTGGATCA
TCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATCACAGCTTTGGCA
TTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGACCAGGCTCAAAC
TGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACGTAAGTGTATGGT
ACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAAGCAGTTTTTGCC
GGCTCAACCGCACTTGTTCTGTCCACGTCCGTCCCAAACTCAGACGGCAAGAATCTCTTG
ACGTTACCAGCTTCTTTGATAGCAGAAATGATCTTGGTTTGATCCAAGATTTGCATGCTT
CCAATACTCGATATCACCACATCAACCTGTTGTATTGCCTTCAGTAGGCTCTCGTGATCG
TTCACATCTCCTTGTAGTATTGTCACGCCGAGATCTTTAAAGTTCTGGACGGTTTTGCTC
TTCACTGGGTCGGAAAGAGAAGCTTCTCTAACGAGAGCGAATGTTTTGTGGCCAGACTTG
GCACTTTCTGCGACGATGAACTTTCCAATGTAACCAGTTCCTCCGATCACGAGAATCTTG
CTTTTCTCAGTCGCTATGTTTCTTGACAATAAGT
CC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4BT20TF 807 0 0
AC
TGCTCCTCTGGGATGTGAGTCT*CTCAAGAGACT*GCCGATCTTG*TCTCCCACAAGGCG
ACCATT*CATTCATCGACAAAGTGT*CTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGA
GTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATC
ACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGA
CCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACG
TAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAA
GCAGTTTTTGCCGGCTCAACCGCACTTGTTCTGTCCACGTCCGTCCCAAACTCAGACGGC
AAGAATCTCTTGACGTTACCAGCTTCTTTGATAGCAGAAATGATCTTGGTTTGATCCAAG
ATTTGCATGCTTCCAATAATCGATATCACCACATCAACCTGTTTTATTGCCTTCAGTAGG
CTCTCGTGATCGTTCACATCTCCTTGTAGTATTGTCACGCCGAGATCTTTAAAGTTCTGG
ACGGTTTTGCTCTTCACTGGGTCGGAAAGAGAAGCTTCTCTAACGAAAGCGAATGTTTTG
TGGCCAGACTTGGCGCTTTCTGCGACGATGAACTTTCCAATGTAACCAGTTCCTCCGATC
ACGAGAATCTTGCTTTTCTCAGTCGCCATGTTTCTTGACAATAAGTGAGTAATGCGATTT
GAATGGTATAGAGAGAATGATTCCC

QA 3 807 3 807
DS 

RD RR4EP47TF 802 0 0
AC
TGCTCCTCTGGGATGTGAGTCT*CTCAAGAGACT*GCCGATCT*GGTCTCCCACAAGGCG
ACCATTTCAT*CATCGACAAAGTGT*CTTAGGAGGATTAATGTAAAGGATTTTGTTAAGA
GTCCTTGGATCATCCACCGTCTTGATTGTGTAAGCAGCAATATCTTCCTCCTTGTTGATC
ACAGCTTTGGCATTTCCATCGCCCAGTATGGTGACTTTCTCTCTAGGAGGAGAAGTGAGA
CCAGGCTCAAACTGAATCAACGTGGGCAAGTAATAACCAGCAAAGCAATTGTTAACAACG
TAAGTGTATGGTACTCCTTCTGCTTCGATGGCTCTCCTAATCTGAATCTTCACTGAAAAA
GCAGTTTTTGCCGGCTCAACCGCACTTGTTCTGTCCACGTCCGTCCCAAACTCAGACGGC
AAGAATCTCTTGACGTTACCAGCTTCTTTGATAGCAGAAATGATCTTGGTTTGATCCAAG
ATTTGCATGCTTCCAATACTCGATATCACCACATCAACCTGTTTTATTGCCTTCAGTAGG
CTCTCGTGATCGTTCACATCTCCTTGTAGTATTGTCACGCCGAGATCTTTAAAGTTCTGG
ACGGTTTTGCTCTTCACTGGGTCGGAAAGAGAAGCTTCTCTAACGAGAGCGAATGTTTTG
TGGCCAGACTTGGCGCTTTCTGCGACGATGAACTTTCCAATGTAACCAGTTCCTCCGATC
ACGAGAATCTTGCTTTTCTCAGTCGCCATGTTTCTTGACAATAAGTGAGTAATGCGATTT
GAATGGTATAGAGAGAAT
CC

QA 3 800 3 800
DS 



AS 2 14

CO CL74Contig1 831 3 6 U
CGGTAACGTATCAATAAGCTAGACCCATGCTTCGAGTTGTTTCATGCCATAAATAAACTC
GAACGCTCAAAAAATCCGTTGGACAGGCAGATTCACATCTCTTACAACCAACACAATCCT
CGGTTCTTGGGGCAGAAGCTATTTGCTTAGCTTTACATCCATCCCAAGGTATCATTTCTA
ATACGTCTGTAGGACATGCTCGGACACACTGAGTACATCCTATACAGGTATCATAAATTT
TTACTGAATGTGACATAGGATCTATAGTTTTTTGAATGTCATAAATTTTCAATCTAGTAA
ACTTATAACTAAATGATATATTAAATTAAAATACTAGATGAAGCAATGATTTCCTCTAAT
AGAATTTTTTTAATGAATTCTGGCTCAATTGGTAAAAAATGGGGCTAAAATACTTTGATT
TCTTAGATTTTCACAAATTTAATCTAGTAAGTCATAACCTATCATATATGCAAATTTAAA
CCTATAATTTTTTGATTTATGCTACTTATTTAATAAGGTCGATTGGTTGATGCGAGTTGA
TTTTCTGTTACGATAAATTGACGAGACTATAGCTAATCCAATAGCTGCTTCAGCGGCTGC
AATTGCTATAACAAAAATGCAGAAAATATCCCCTTTTAGTTGGGAATTATCAAAAAAATC
AGCAAATGTTACGAAATTCATATTAACTGCATTGAGTATAAGTTCAAGGCACATAAGAGC
CCTAACCATATTTCGACTCGTGATCAATCCATAAAGACCAATCAAAAATAAATAGGCACT
CAAAACAAGTACATGTTCGAGTATCATTGAGCAACTCCTTATCAATTTTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN38JQ U 1
AF RR4H327JQ U 1
AF RR4H327TF C 180
BS 1 355 RR4DN38JQ
BS 356 356 RR4H327JQ
BS 357 425 RR4DN38JQ
BS 426 426 RR4H327JQ
BS 427 758 RR4DN38JQ
BS 759 831 RR4H327TF

RD RR4DN38JQ 768 0 0
CGGTAACGTATCAATAAGCTAGACCCATGCTTCGAGTTGTTTCATGCCATAAATAAACTC
GAACGCTCAAAAAATCCGTTGGACAGGCAGATTCACATCTCTTACAACCAACACAATCCT
CGGTTCTTGGGGCAGAAGCTATTTGCTTAGCTTTACATCCATCCCAAGGTATCATTTCTA
ATACGTCTGTAGGACATGCTCGGACACACTGAGTACATCCTATACAGGTATCATAAATTT
TTACTGAATGTGACATAGGATCTATAGTTTTTTGAATGTCATAAATTTTCAATCTAGTAA
ACTTATAACTAAATGATATATTAAATTAAAATACTAGATGAAGCAATGATTTCCTTTAAT
AGAATTTTTTTAATGAATTCTGGCTCAATTGGTAAAAAATGGGGCTAAAATACTTTGATT
TCTTAAATTTTCACAAATTTAATCTAGTAAGTCATAACCTATCATATATGCAAATTTAAA
CCTATAATTTTTTGATTTATGCTACTTATTTAATAAGGTCGATTGGTTGATGCGAGTTGA
TTTTCTGTTACGATAAATTGACGAGACTATAGCTAATCCAATAGCTGCTTCAGCGGCTGC
AATTGCTATAACAAAAATGCAGAAAATATCCCCTTTTAGTTGGGAATTATCAAAAAAATC
AGCAAATGTTACGAAATTCATATTAACTGCATTGAGTATAAGTTCAAGGCACATAAGAGC
CCTAACCATATTTCGACTCGTGATCAATCCATAAAGAC
CAATCAAAAT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4H327JQ 762 0 0
CGGTAACGTATCAATAAGCTAGACCCATGCTTCGAGTTGTTTCATGCCATAAATAAACTC
GAACGCTCAAAAAATCCGTTGGACAGGCAGATTCACATCTCTTACAACCAACACAATCCT
CGGTTCTTGGGGCAGAAGCTATTTGCTTAGCTTTACATCCATCCCAAGGTATCATTTCTA
ATACGTCTGTAGGACATGCTCGGACACACTGAGTACATCCTATACAGGTATCATAAATTT
TTACTGAATGTGACATAGGATCTATAGTTTTTTGAATGTCATAAATTTTCAATCTAGTAA
ACTTATAACTAAATGATATATTAAATTAAAATACTAGATGAAGCAATGATTTCCTCTAAT
AGAATTTTTTTAATGAATTCTGGCTCAATTGGTAAAAAATGGGGCTAAAATACTTTGATT
TCTTAGATTTTCACAAATTTAATCTAGTAAGTCATAACCTATCATATATGCAAATTTAAA
CCTATAATTTTTTGATTTATGCTACTTATTTAATAAGGTCGATTGGTTGATGCGAGTTGA
TTTTCTGTTACGATAAATTGACGAGACTATAGCTAATCCAATAGCTGCTTCAGCGGCTGC
AATTGCTATAACAAAAATGCAGAAAATATCCCCTTTTAGTTGGGAATTATCAAAAAAATC
AGCAAATGTTACGAAATTCATATTAACTGCATTGAGTATAAGTTCAAGGCACATAAGAGC
CCTAACCATATTTCGACTCGTGATCAATCCATAAAGAC
AATC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4H327TF 652 0 0
AATACGTCTGTAGGACATGCTCGGACACACTGAGTACATCCTATACAGGTATCATAAATT
TTTACTGAATGTGACATAGGATCTATAGTTTTT*GAATGTCATAAATTTTCAATCTAGTA
AACTTATAACTAAATGATATATTAAATTAAAATACTAGATGAAGCAATGATTTCCTCTAA
TAGAATTTTTTTAATGAATTCTGGCTCAATTGGTAAAAAATGGGGCTAAAATACTTTGAT
TTCTTAGATTTTCACAAATTTAATCTAGTAAGTCATAACCTATCATATATGCAAATTTAA
ACCTATAATTTTTTGATTTATGCTACTTATTTAATAAGGTCGATTGGTTGATGCGAGTTG
ATTTTCTGTTACGATAAATTGACGAGACTATAGCTAATCCAATAGCTGCTTCAGCGGCTG
CAATTGCTATAACAAAAATGCAGAAAATATCCCCTTTTAGTTGGGAATTATCAAAAAAAT
CAGCAAATGTTACGAAATTCATATTAACTGCATTGAGTATAAGTTCAAGGCACATAAGAG
CCCTAACCATATTTCGACTCGTGATCAATCCATAAAGACCAATCAAAAATAAATAGGCAC
TCAAAACAAGTACATGTTCGAGTATCATTGAGCAACTCCTTATCAATTTTGA

QA 1 652 1 652
DS 



CO CL74Contig2 2063 11 33 U
GGGAGTCGTATGAGGCGAAGACCTCATGTACGGTTTTGTAATAGCGGTGAGAATAGTAAT
GTTATCACCGACTAGGATTATCTAACAGTTTAAGTACAGTTGATATAGTTGAGGCACAAT
CAAAATATGGTTTTTGGGGATGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGTTTTATCATTTTTC
TAATTTCTTCCCTAGCAGAATGCGAGAGGTTACCTTTTGATTTACCAGAAGCGGAAGAAG
AATTAATAGCAGGTTATCAAACTGAATATTCCGGTATCAAATTTGGTTTATTTTACGTTG
CTTCTTATCTAAATCTATTAATTTCCTCATTATTTGTAACAGTTCTATACTTAGGCGGTT
GGAATATTTCTATTCCGTATATATCTATTCTGGAGCTATTTGAAAAGGATCAAATTTTTG
GAACAACAATTGGTATCTTTATTACATTAGCTAAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTA
TCGCAACCAGATGGACTTTACCTAGGCTAAGAATGGATCAACTATTAAATCTTGGATGGA
AATTTCTTTTACCGATTTCCCTTGGTAATCTATTATTAACAACTTCTTTCCAACTCTTTT
CACTCTAAATTGAAAATCAATCCAAGATATTCATTACTTGTTTTAAACAAGAGAAAGAAA
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TATCC
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QA 1 785 1 785
DS 

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G
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G
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G
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G
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GTCATGGTACGGGGTTATTTGGACTACAAGATTAAACCAGATTTTAGAACAA

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GGGATTACTTCATTGGTTTGTACAACTATTCTTTTTTCATTAATTTCTACTATTCTCGAT
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QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 17

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C


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 35 35 35 20 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 55 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 35 60 75 75 80 80 80 85 85 60 85 85 85 50 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 35 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 

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CCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATGTAATT
TCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAAAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTA
CTTATTTCTGAAATGCTCATAAATTTTTTGTTTGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCC
TCCATTCCACCAATAGTTGGAAAATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTAC
GTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAAAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATA
GTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAAACTGGCTTC
TACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGG
GACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTA
ATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCT**GTTCTCTGTTTCCTTCTCCATT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EX42JQ 717 0 0
GTAATAATCTTTATATAAATTTTATTGTCTGTTGTGGACATGTACATAAAACATTTTGTC
ATAAAATTTTGAAGCTATTAGTTTTATCAAAAAAATTTTTTGAAGCTATTAGCCGATTAT
CGATATTGTTCCCCACCGATCTAACCTCTTTTGTATTTTTTTTTTTTTGTATTTTATCTT
CCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATGTAATT
TCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTA
CTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTTTGTTTGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCC
TCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTAC
GTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAAAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATA
GTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAAACTGGCTTC
TACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGG
GACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTA
ATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCT**GTTCTCTGTTTCCTTCTCCATT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4GJ62JQ 555 0 0
GC
ATTTTATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACG
TTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCAT
AGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTT
GATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCC
GACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAG
AAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGA
AACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACA
CTCCTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCAT
AAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTATGTTTCCTT
CTCCATTCGC
GAA

QA 3 552 3 552
DS 

RD RR4GM76JQ 547 0 0
ATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATG
TAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTC
ATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATAT
TTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCA
TCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAAAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAAT
GCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAAACTG
GCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTT
ATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTG
TGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCA
TTCGC
GA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4EX42TF 664 0 0
TTTTTGAAGCTATTAGCCGATTATCGATATTGTTCCCCACCGATCTAAC*TCTTTTGTAT
TTTTTTTTTTT*GTATTTTATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATA
TATAATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATC
AGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTTTGTTTGTA
TCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGC
AACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATG
GGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGA
GTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTT
CTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTT
CCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCT**G
TTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTTTTCCATC
GT
AG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4EV66TF 346 0 0
TCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCA
GTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAG
TTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATT
TGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGC
AAGAACCT**GTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATT
GGTTTTCCATCGTAGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCG
C

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR4DC81JQ 630 0 0
ATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATG
TAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTC
ATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATAT
TTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCA
TCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAAT
GCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTG
GCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTT
ATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTG
TGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCA
TTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCG
AAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAAC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4FK77JQ 664 0 0
CCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTAC
TTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATT
TTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGAT
CCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAG
TCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCA
GTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAG
TTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATT
TGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGC
AAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATT
GGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAAC
GAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTC
ATTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4DA67JQ 684 0 0
GG
TAATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAG
TGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATC
CCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATCCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAA
CGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGG
CGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGT
CACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCT
CGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCC
AAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTT
CTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTCTTCCATCGT
TGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAA
AAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGAC
CTGATCCGTAAATGTTCTTGGA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR4A491JQ 792 0 0
GTATTATATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAA
CGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTC
ATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCT
TTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACT
CCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGG
AGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCA
GAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTA
CACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCC
ATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCC
TTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAA
GAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGAC
GACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGGGACCTGATCCGTA
AATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTCTTT
GCCAGAGTGAAG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4H885JQB 748 0 0
ATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATG
TAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTC
ATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATAT
TTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCA
TCTACGTAGCAGCCCGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAAT
GCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAAACTG
GCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTCGTACACTCTT
ATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTG
TGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCA
TTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCG
AAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCA
CCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTC
TTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DA67TF 796 0 0
TCCCTTAGCTTTGATA
TTGCCTCCATCCCACCAATAGTTGGA*GATCCACAAGTGGCAACGT*ATCACTCCGACCA
TCTACGTAGCAGC*TGAGAGGC*GGAGAAGTCTTGGAAATGG*CGATGAAAGGAGAAAAT
GCATAGTTA*TCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTG
GCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTT
ATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTG
TGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCA
TTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTCTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCG
AAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCA
CCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTC
TTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTCTTTGCCAGAG
TGAAGTGTGGAAATATGACCTTGACCCCATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACA
TATTTCTCGACTCCTCTCCCTCCGATAAACCTAGCATCAACCATTGTTATACATAATGCT
ACTGCAAAAACACCAAAGATTTTCGTATGTATCATCTTGGTTTGATTTTTCTCTGAGGT
C

QA 17 795 17 795
DS 

RD RR4GM76TF 786 0 0
GATATTGCTCCA
TCCACCAATAGTTG*AAGATCCACAAGTGGCAACGT*ATCACTCCGACCATCTACGTAGC
AGCGTGAGAGGC*GGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAA
TCTTGGTCCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTT
TCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGT
TGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTT
TGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCGAAGA
TATTTGTCTGTAACGTTATGGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCT
CATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTC
CTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGA
ACCCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTGTTTGCCAGAGTGAAGTGTGG
AAATATGACCTTGACCCCATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGA
CTCCTCTCCCTCTGATAAACCTAGCATCAACCATTGTTATACATAATGCTAATGCAAAAA
CACCAATGATTTTCGTATGCATCATCTTGGTTTGATTTTTCTCTAAGGTACT
CC

QA 13 784 13 784
DS 

RD RR4DC81TF 759 0 0
GATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGC*TGAGAGGCCGGAG
AAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCA
TCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGA
TAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACA
ATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAA
AGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTT
ATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCC
AACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATT
CTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGAC
TGATCCATGTAGAGATCAACTTCTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATGACCTTGACCC
CATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGACTCCTCTCCCTCCGATA
AACCTAGCATCAACCATTGTTATACATAATGCTACTGCAAAAACACCGAAGATTTTCGTA
TGTATCATCTTGGTTTGATTTTTCTCTGAGGTACTATCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4A491TF 709 0 0
GAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGT
CCGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGG
CTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAAC
GTAAAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGG
GTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGT
CTGTAACGTTATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTG
ATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGG
CACTTTGATTCTCATTTGAAAGGGACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAACCCGGC
ACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTCTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATG
ACCTTGACCCCATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGACTCCTCT
CCCTCCGATAAACCTAGCATCAACCATTGTTATACATAATGCTACTGCAAAAACACCAAA
GATTTTCGTATGTATCATCTTGGTTTGATTTTTCTCTGAGGTACTATCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4H885TF 433 0 0
TTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAA
GAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGAC
GACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTA
AATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTCTTT
GCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATGACCTTGACCCCATTTAACAACATAGTTCTGACCGAA
AGTAACATATTTCTCGACTCCTCTCCCTCCGATAAACCTAGCATCAACCATTGTTATACA
TAATGCTACTGCAAAAACACCAAAGATTTTCGTATGTATCATCTTGGTTTGATTTTTCTC
TGAGGTACTATCC

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4FK77TF 710 0 0
GAGA
GCCGGAGAAGTCTTGGAAATGG*CGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCG
ACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTT
TGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTA
AAACACAATTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTT
AAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTG
TAACGTTATTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATT
ACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCAC
TTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACC
TGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTCTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATGACC
TTGACCCCATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGACTCCTCTCCC
TCCGATAAACCTAGCATCAACCGTTGTTATACATAATGCTACTGCAAAAACACCAAAGAT
TTTCATATGTATCATCTTGGTTTGATTTTTCTCTGAGGTACTATCC

QA 5 710 5 710
DS 



AS 2 16

CO CL76Contig1 545 2 1 U
ACCCTTAAACAATTTATCATAATAAATCCTAAACATCTCATTTGTGATTGTACGTGTTTG
CAAATTTATATGAACGAAACAAGTTTGAAAAAAAGCCAAAAAATATTCACTTGATTACAA
ATAAAGTATATTTTAAAAAAAATGGTGGCTCACCAAAAACAAAAAAAAGCAAAAAGCTTT
CTCAAGCTTTACCTATGAACTCAATGTCAAAAAAAAAAACCGAAGCTGGGGGAATGAAAC
ATGAGCCTCCTTTGCAACCGGCGCCTCGATCACCATACCCGAGTTCTGGAGGAATCTTTA
ATGTCCGTTTCCCTCCAGTAAGCATAGCAGGAACTCCATCACAGCCAATGATTCCCTGGT
CCCAACCTTTAATCACCTCACCAACACCTATACGGAAAGTTAAAGGCTTTCCCCGATTAT
AGCTACTATCAAAAACTTTCCCATTCTCCAACTTCCCCACATAATGTGCCTTGATTAATT
GCCCTTTAACAGCTGCAGGACCATATCCAACTACCTTATCACAAAAGGCAAGACCACAAG
GAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 

AF RR4A309JQD U 155
AF RR4A309JQ U 1
BS 1 545 RR4A309JQ

RD RR4A309JQD 386 0 0
AAAA
ACAAAAAAAAGCAAAAAGCTTTCTCAAGCTTTACCTATGAACTCAATGTCAAAAAAAAAA
ACCGAAGCTGGGGGAATGAGACATGAGCCTCCTTTGCAACCGGCGCCTCGATCACCATAC
GCGAGTTCTGGAGGAATCTTTAATGTCCGTTTCCCTCCAGTAAGCATAGCAGGAACTCCA
TCACAGCCAATGATTCCCTGGTCCCAACCTTTAATCACCTCACCAACACCTATACGGAAA
GTTAGAGGCTTTCCCCGATTATAGCTACTATCAAAAACTTTCCCATTCTCCAACTTCCCC
ACATAATGTGCCTTGATTAGTTGCCCTTTAACAGCTGCAGGACCATATCCAACTACCTTA
TCACAGAAGGCAAGACCACAAG

QA 5 386 5 386
DS 

RD RR4A309JQ 545 0 0
ACCCTTAAACAATTTATCATAATAAATCCTAAACATCTCATTTGTGATTGTACGTGTTTG
CAAATTTATATGAACGAAACAAGTTTGAAAAAAAGCCAAAAAATATTCACTTGATTACAA
ATAAAGTATATTTTAAAAAAAATGGTGGCTCACCAAAAACAAAAAAAAGCAAAAAGCTTT
CTCAAGCTTTACCTATGAACTCAATGTCAAAAAAAAAAACCGAAGCTGGGGGAATGAAAC
ATGAGCCTCCTTTGCAACCGGCGCCTCGATCACCATACCCGAGTTCTGGAGGAATCTTTA
ATGTCCGTTTCCCTCCAGTAAGCATAGCAGGAACTCCATCACAGCCAATGATTCCCTGGT
CCCAACCTTTAATCACCTCACCAACACCTATACGGAAAGTTAAAGGCTTTCCCCGATTAT
AGCTACTATCAAAAACTTTCCCATTCTCCAACTTCCCCACATAATGTGCCTTGATTAATT
GCCCTTTAACAGCTGCAGGACCATATCCAACTACCTTATCACAAAAGGCAAGACCACAAG
GAGAC

QA 1 545 1 545
DS 



CO CL76Contig2 893 14 20 U
GGATTTATCGTCTCATTCAGAATATTTTCTGGAGAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATT
TTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAATACAGAAGTTTTGTGAGCAG
TAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGA
GTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGT
CTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTC
TGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGT
TAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*G
ATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT
*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGG
AGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTG
CAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCAT
AGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTT
AAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTC
GTTCATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACAAATGAGATGTTTAGGATCTATTATGAT
AAATTGTTTAAGGGTAGACACGATCCTTTTATGACAAAAGGAATCTTCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 30 55 30 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 70 70 
70 70 70 35 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 20 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 40 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 55 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4GI90TF U 34
AF RR4A309TF U 392
AF RR4FE36TF U 33
AF RR4AL85TF U 1
AF RR4A309TFB U 8
AF RR4B482TF U 249
AF RR4H706TF U 33
AF RR4H706JQB C 175
AF RR4G128JQ C 57
AF RR4G128TF U 36
AF RR4AT21TF U 34
AF RR4AY41TF U 34
AF RR4AY41JQ C 299
AF RR4AT21JQ C 304
BS 1 33 RR4AL85TF
BS 34 34 RR4H706TF
BS 35 99 RR4AL85TF
BS 100 100 RR4A309TFB
BS 101 268 RR4AL85TF
BS 269 269 RR4A309TFB
BS 270 535 RR4AL85TF
BS 536 536 RR4A309TFB
BS 537 559 RR4AL85TF
BS 560 560 RR4A309TFB
BS 561 655 RR4AL85TF
BS 656 656 RR4A309TFB
BS 657 781 RR4AL85TF
BS 782 820 RR4A309TFB
BS 821 848 RR4AT21TF
BS 849 853 RR4AY41TF
BS 854 854 RR4AY41JQ
BS 855 878 RR4AY41TF
BS 879 879 RR4AY41JQ
BS 880 893 RR4AY41TF

RD RR4GI90TF 363 0 0
GGAGAGAA
AAATGACATCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAAT
GCAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAACCAGAGGTTATTAACTTGAGAAGCAAAC
AAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTATAAGAGAAG
CAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAA
CAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTCTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTA*TTG
GATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATT*TGTGGGGAA

QA 9 363 9 363
DS 

RD RR4A309TF 245 0 0
GGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAAC
TTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTTAAAGGTTGGGGACCAGGGAATCATTTGGCT
GTGATGGAGTTCCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAA
CTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCT
TCGGT

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR4FE36TF 703 0 0
G
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AAGAAAATACAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAG
AAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAG
AAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATT
TGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAA
GGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGG
GAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCT**AACTT
T*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGT
GATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACT
CGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTC
GGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTT
TGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAAA*TATACTCTAT

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR4AL85TF 781 0 0
GGATTTATCGTCTCATTCAGAATATTTTCTGGATAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATT
TTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAA*TACAGAAGTTTTGTGAGCAG
TAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGA
GTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGT
CTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCATCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTC
TGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGT
TAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*G
ATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT
*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTGCTGG
AGGGAAACGGACATTAAAGGTTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTG
CAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGCTCAT
AGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTT
AAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4A309TFB 813 0 0
GG
GTCTCATTCAGAATATTTTCTGGATAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGG
CACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAATACAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAAC
CAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTT
TGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGTAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGG
TCTTGTCGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCC
TTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCA
ACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATAGTAGCT
ATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTTG
GG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAACG
GACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAGG
CTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGC
TTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAAA*TATA
CTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATATA
AATTTGCAAACACGTACAATCACAAATGAGA

QA 3 813 3 813
DS 

RD RR4B482TF 575 0 0
GTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTC
CTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGC
AACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATAGTAGC
TATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTT
GGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAAC
GGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGATGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAG
GCTCATGTTTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAG
CTTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAA**TAT
ACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAA*CTTGTTTCGTTCATAT
AAATTTGCAAACACGTACAATCACAAATGAG
CTGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4H706TF 754 0 0
G
GAGAGAAGAAATGACATCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCA
AAGAAAATGCAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAACCAGAGGTTATTAACTTGAG
AAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAG
AAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATT
TGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTCTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAA
GGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGG
GAAGTTGGAGAATGTGAAAGTCTTT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTT
T*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTCT
GATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACT
CGCTTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTC
GGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTCCTT
TGTCTTTGCTGAGCCACCATCCTCTTTAAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATAT
TTTCTGGCTCTTTTTCAA*CTTGTTTCGTTCA
C

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR4H706JQB 610 0 0
TCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTT
TGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGA
ATTTTCTGTCTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGC
AGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGTGAAAGT
CTTT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAG
GTGATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGTTTTGATGGAGTTCC*TGCTATGCT
TACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCTTATGGTGATCGAGGCGC
AGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCCCCAGCTTCGGTTTTTTTCTTTGACATTGA
GTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTCCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATC
CTCTTTAAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACT
TGTTTCGTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4G128JQ 761 0 0
GATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAATACAGAAGTTTTGTGA
GCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATC
ATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTG
GTGTCTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAAT
TCTCTGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAG
CTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCT
TT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGT
GATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTA
CTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCG
GTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTTTTCTCTTTGACATTGAGT
TCATAGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTT
CTTTAAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTG
TTTCGTTCATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACAAATG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4G128TF 788 0 0
GG
GAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGA
AAATACAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGC
AAACAAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGA
GAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATTTGCC
GAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTA
GTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAG
TTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CC
GTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATG
GAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCG
TATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTT
CTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTC
TTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAA**TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTC
TGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACAA
TGAAAAAAA

QA 3 779 3 779
DS 

RD RR4AT21TF 815 0 0
GAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGATCA
AAGAAAATACAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAG
AAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAG
AAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATT
TGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAA
GGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGG
GAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTT
T*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGT
GATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACT
CGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTC
GGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCCTTTCTT
TGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATAT
TTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACA
AATGAGATGTTTAGGATCTATTATGATAAATTGTT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4AY41TF 860 0 0
GAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGATCA
AAGAAAATACAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAG
AAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAG
AAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTCGATAACGTTTCAGCATT
TGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAA
GGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGG
GAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTT
T*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGT
GATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACT
CGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTC
GGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCCTTTCTT
TGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATAT
TTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACA
AATGAGATGTTTAGGATCTATTATGATAAATTGTTTAAGG*TAGACACGATCCTTTTATG
ACAAA*GGAATCTTCATTTT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4AY41JQ 595 0 0
TCTGTGTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCT
GTTAAAGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT
*GATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGA
TT*AAAGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACT
GGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGT
TGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTTTTCTCTTTGACATTGAGTTC
ATAGGTAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCCTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCT
TTAAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTT
TCGTTCATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACAAATGAGATGTTTAGGATCTATTATG
ATAAATTGTTTAAGGGTAGACACGATCCTTTTATGACAAAAGGAATCTTCATTTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4AT21JQ 590 0 0
GTCTCCTTGTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTTAA
AGGGCAACTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTT*GATA
GTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTT*CCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATT*AA
AGGTTGGG*ACCAGGGAATCATT*GGCTGTGATGGAGTTCC*TGCTATGCTTACTGGAGG
GAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCCGGTTGCAA
AGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTTTTTTCTTTGACATTGAGTTCATAGG
TAAAGCTTGAGAAAGCTTTTTGCCTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATTTTCTTTAAA
A*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTT
CATATAAATTTGCAAACACGTACAATCACAAATGAGATGTTTAGGATCTATTATGATAAA
TTGTTTAAGGGTAGACACGATCCTTTTATGACAAAAGGAATCTTCATTTT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 3 14

CO CL77Contig1 881 7 5 U
GAAGAAATGCTCTTCATGAAAATTAAATTATATGAACTTATGTGTATCATAAGCAAACAT
CCATTATTTCTCTATTTTATTGTTTCATCTCAAGAAACCCAACAAA*GAGTGAACATAAG
TTCCCAAAAGAAACAACATGAAAGACAACAACAACAACAAAAAAGAAGAACATAGACTTG
AGAAGAAACAAAACCAA*TAGTATATGTTATGTGGATCGAGGAGTAGAGAGAGACACTAT
AGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAGAGAGGTTGAAACTTTTTTTAAGCAGCA
ACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTATTGTCTCCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCT
TTCTCCTTGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATG
TAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTCCGTGTGTACACTTGAAACAGCTCTTGTGGTAC
AATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAGGATAGACAGTTTTGTCGCAGCCAACGCAT
TTTTCTCGAGTTCCACCAAACATATTCGACACTTTGGTCCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCC
AAAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCTTTGGTGTTCCTTCGAAGCTTTTCTCAAGACTTCCA
GTTCTCTTGAAGTTTTGATCGAAATGTGGTCTGCAATAGAGAACTCCTTCAAATGAGTTG
TAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACAACGGAAACAAGCTTTGTGGTAG
ACCCGGTTATCAGCGGTTAACTTGTCTACGAGGTACACGGTTTTGTCACAAGCCATGCAT
TTCTGGGTTGTTCCTGCGAACGCCATTTTGTGTGTGTTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS89JQ U 1
AF RR4DZ56JQ U 38
AF RR4H085JQ U 47
AF RR4AX73JQ U 2
AF RR4AS89TF C 34
AF RR4AX73TF C 146
AF RR4DG30TF C 84
BS 1 128 RR4AS89JQ
BS 129 129 RR4DZ56JQ
BS 130 808 RR4AS89JQ
BS 809 857 RR4AS89TF
BS 858 881 RR4DG30TF

RD RR4AS89JQ 808 0 0
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CCATTATTTCTCTATTTTATTGTTTCATCTCAAGAAACCCAACAAA*GAGTGAACATAAG
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AGAAGAAACAAAACCAA*TAGTATATGTTATGTGGATCGAGGAGTAGAGAGAGACACTAT
AGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAGAGAGGTTGAAACTTTTTTTAAGCAGCA
ACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTATTGTCTCCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCT
TTCTCCTTGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATG
TAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTCCGTGTGTACACTTGAAACAGCTCTTGTGGTAC
AATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAGGATAGACAGTTTTGTCGCAGCCAACGCAT
TTTTCTCGAGTTCCACCAAACATATTCGACACTTTGGTCCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCC
AAAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCTTTGGTGTTCCTTCGAAGCTTTTCTCAAGACTTCCA
GTTCTCTTGAAGTTTTGATCGAAATGTGGTCTGCAATAGAGAACTCCTTCAAATGAGTTG
TAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACAACGGAAACAAGCTTTGTGGTAG
ACCCGGTTATCAGCGGTTAACTTGTCTA

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4DZ56JQ 771 0 0
A
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CCAACAAA*GAGTGAACATAAGTTCCCAAAAGAAACAACATGAAAGACAACAACAACAAC
AAAAAAGAAGAACATAGACTTGAGAAGAAACAAAACCAA*TAGTATATGTTATGTGGATC
GAGGAGTAGAGAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAGAGAGA
TTGAAACTTTTTTTAAGCAGCAACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTATTGTCTCCTCCTCC
TTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATA
AAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTCCGTGTGTACA
CTTGAAACAGCTCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAGGATAGAC
AGTTTTGTCGCAGCCAACGCATTTTTCTCGAGTTCCACCAAACATATTCGACACTTTGGT
CCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCCAAAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCTTTGGTGTTCCTTC
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GAGAACTCCTTCAAATGAGTTGTAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACA
ACGGAAACAAGCTTTGTGGTAGACCCGGTTATCAGCGGTTAACTTGTCCA

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR4H085JQ 761 0 0
C
CATAAGCAAACATCCATTATTTCTCTATTTTCTTGTTTCATCTCAAGAAACCCAACAAA*
GAGTGAACATAAGTTCCCAAAAGAAACAACATGAAAGACAACAACAACAACAAAAAAGAA
GAACATAGACTTGAGAAGAAACAAAACCAA*TAGTATATGTTATGTGGATCGAGGAGTAG
AGAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAGAGAGATTGAAACTT
TTTTTAAGCAGCAACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTATTGTCTCCTCCTCCTTCGAGCTG
GCTCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCC
CTCGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTCCGTGTGTACACTTGAAACA
GCTCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAGGATAGACAGTTTTGTC
GCAGCCAACGCATTTTTCTCGAGTTCCACCAAACATATTCGACACTTTGGTCCCAGCAGG
TCTCTCTCCCTCCAAAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCTTTGGTGTTCCTTCGAAGCTTTT
CTCAAGACTTCCAGTTCTCTTGAAGTTTTGATCGAAATGTGGTCTGCAATAGAGAACTCC
TTCAAATGAGTTGTAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACAACGGAAACA
AGCTTTGTGGTAGACCCGGTTGTCAGCGGTTAACTTGTCC

QA 2 761 2 761
DS 

RD RR4AX73JQ 807 0 0
AAGAAATGCTCTTCATGAAAATTAAATTATATGAACTTATGTGTATCATAAGCAAACATC
CATTATTTCTCTATTTTATTGTTTCATCTCAAGAAACCCAACAAA*GAGTGAACATAAGT
TCCCAAAGGAAACAACATGAAAGACAACAACAACAACAAAAAAGAAGAACATAGACTTGA
GAAGAAACAAAACCAA*TAGTATATGTTATGTGGATCGAGGAGTAGAGAGAGACACTATA
GTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAGAGAGGTTGAAACTTTTTTTAAGCAGCAA
CGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTATTGTCTCCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCTT
TCTCCTTGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGT
AGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTCCGTGTGTACACTTGAAACAGCTCTTGTGGTACA
ATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAGGATAGACAGTTTTGTCGCAGCCAACGCATT
TTTCTCGAGTTCCACCAAACATATTCGACACTTTGGTCCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCCA
AAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCTTTGGTGTTCCTTCGAAGCTTTTCTCAAGACTTCCAG
TTCTCTTGAAGTTTTGATCGAAATGTGGTCTGCAATAGAGAACTCCTTCAAATGAGTTGT
AATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACAACGGAAACAAGCTTTGTGGTAGA
CCCGGTTATCAGCGGTTAACTTGTCTA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4AS89TF 826 0 0
GAACT
TATGTGTATCATAAGCAAACATCCATTATTTCTCTATTTTATTGTT*CATCTCAAGAAAC
CCAACAAAAGAGTGAACATAAGTTCCCAAAGGAAACAACATGAAAGACAACAACAACAAC
AAAAA*GAAGAACATAGACTTGAGAAGAAACAAAACCAAATAGTATATGTTATGTGGATC
GAGGAGTAGAGAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAGAGAGG
TTGAAACTTTTTTTAAGCAGCAACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTATTGTCTCCTCCTCC
TTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATA
AAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTCCGTGTGTACA
CTTGAAACAGCTCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAGGATAGAC
AGTTTTGTCGCAGCCAACGCATTTTTCTCGAGTTCCACCAAACATATTCGACACTTTGGT
CCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCCAAAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCTTTGGTGTTCCTTC
GAAGCTTTTCTCAAGACTTCCAGTTCTCTTGAAGTTTTGATCGAAATGTGGTCTGCAATA
GAGAACTCCTTCAAATGAGTTGTAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACA
ACGGAAACAAGCTTTGTGGTAGACCCGGTTATCAGCGGTTAACTTGTCTACGAGGTACAC
GGTTTTGTCACAAGCCATGCATTTCTGGGTTGTTCCTGC
CC

QA 6 824 6 824
DS 

RD RR4AX73TF 714 0 0
CAACAACATCAACAAAAAAGTAGAACATAGACTTGAGAAGAAACAAAACCAA*TAGTATA
TGTTATGTGGATCGAGGAGTAGAGAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAA
TCATCCAGAGAGGTTGAAACTTTTTCTAAGCAGCAACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGTAT
TGTCTCCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGAATATGAT
GATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGC
CTCCGTGTGTACACTTGAAACAGCTCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTTCT
CAATAGGATAGACAGTTTTGTCGCAGCCAACGCATTTTTCTCGAGTTCCACCAAACATAT
TCGACACTTTGGTCCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCCAAAGGTCTATCAGGTTTCCCAATCT
TTGGTGTTCCTTCGAAGCTTTTCTCAAGACTTCCAGTTCTCTTGAAGTTTTGATCGAAAT
GTGGTCTGCAATAGAGAACTCCTTCAAATGAGTTGTAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTT
TGCAATGGTGACAACGGAAACAAGCTTTGTGGTAGACCCGGTTATCAGCGGTTAACTTGT
CTACGAGGTACACGGTTTTGTCACAAGCCATGCATTTCTGGGTTGTTCCTGC
CC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4DG30TF 798 0 0
TTCATCTCAAGAAACCCAACAAA*GAGTGAACATAAGT*CCCAAAAGAAACAACATGAAA
GACAACAACAACAACAAAAAAGAAGAACATAGACTTGAGAAGAAACAAAACCAA*TAGTA
TATGTTATGTGGATCGAGGAGTAGAGAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAA
AATCATCCAGAGAGATTGAAACTTTTTTTAAGCAGCAACGTC***GTCCTTGGCGGCGGT
ATTGTCTCCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGAATATG
ATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGCA
GCCTCCGTGTGTACACTTGAAACAGCCCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTT
CTCAATAGGATAGACAGTTTTGTCGCAGCCAACGCATTTTTCTCGAGTTCCACCAAACAT
ATTCGACACTTTGGTCCCAGCAGGTCTCTCTCCCTCCAAAGGTCTATCAGGTTTCCCAAT
CTTTGGTGTTCCTTCGAAGCTTTTCTCAAGACTTCCAGTTCTCTCGAAGTTTTGATCGAA
ATGTGGTCTGCAATAGAGAACTCCTTCAAATGAGTTGTAATTGCTAAGCTTGAGAGTTCC
TTTGCAATGGTGACAACGGAAACAAGCTTTGTGGTAGACCCGGTTATCAGCGGTTAACTT
GTCCACGAGGTACACGGTTTTGTCACAAGCCATGCATTT**GGGTTGTTCCTGCGAACGC
CATTTTGTGTGTGTTCCC

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL77Contig2 867 4 3 U
GGGATCTTTATTTCATCTTCTTCTTACAAGAAACAGAACACACACAAAATGGCGTTCGCA
GGAACAACCCAGAAATGCATGGCTTGTGACAAAACCGTGTACCTCGTGGACAAGTTAACC
GCTGATAACCGGGTCTACCACAAAGCTTGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAACTCTC
AAGCTTAGCAATTACAACTCATTTGAAGGAGTTCTCTATTGCAGACCACATTTCGATCAA
AACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAAAGCTTCGAAGGAACACCAAAGATTGGGAAA
CCTGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCTGCTGGGACCAAAGTGTCGAATATGTTTGGT
GGAACTCGAGAGAAATGCGTTGGCTGCGACAAAACTGTCTATCCTATTGAGATGGTGTCG
GTGAATGGAACATTGTACCACAAGAGCTGTTTCAAGTGTACACACGGAGGCTGCACGATA
AGTCCTTCGAACTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCATCACCATATCCAG
CTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAACTCGAAGGAGGAGACAATGCCGCCGCCAAG
GACAAAGACGTCGCTGCTTAAACAGTTCAATCAATCTCTCTGGATGATTTTGACCATGGA
AGAACCACCACTATAGTGTCTCTCTCTACTTCTCGATCCACATAACATATACCATTGGTT
TTGTTTCTTCTCAAGTCTATGTTCTTCTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTCTTTCATGTTGTT
TCTTTTGGGAACTTATGTTCACTCTTTGTTGGGTTTCTTGAGATAACACAAGAAAATAGA
GAAATAATGGATGTTTGCTTATGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H085TF U 41
AF RR4DQ22TF U 1
AF RR4E442TF U 56
AF RR4DQ22JQ C 127
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BS 751 788 RR4E442TF
BS 789 867 RR4DQ22JQ

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G
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CCTCGTGGACAAGTTAACCGCTGACAACCGGGTCTACCACAAAGCTTGTTTCCGTTGTCA
CCATTGCAAAGGAACTCTCAAGCTTAGCAATTACAACTCATTTGAAGGAGTTCTCTATTG
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AACACCAAAGATTGGGAAACCTGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCTGCTGGGACCAA
AGTGTCGAATATGTTTGGTGGAACTCGAGAAAAATGCGTTGGCTGCGACAAAACTGTCTA
TCCTATTGAGAAGGTGTCGGTGAATGGAACATTGTACCACAAGAGCTGTTTCAAGTGTAC
ACACGGAGGCTGCACGATAAGTCCTTCGAACTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTG
CAAGCATCATCATATTCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAGCT

QA 2 532 2 532
DS 

RD RR4DQ22TF 750 0 0
GGGATCTTTATTTCATCTTCTTCTTACAAGAAACAGAACACACACAAAATGGCGTTCGCA
GGAACAACCCAGAAATGCATGGCTTGTGACAAAACCGTGTACCTCGTGGACAAGTTAACC
GCTGATAACCGGGTCTACCACAAAGCTTGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAACTCTC
AAGCTTAGCAATTACAACTCATTTGAAGGAGTTCTCTATTGCAGACCACATTTCGATCAA
AACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAAAGCTTCGAAGGAACACCAAAGATTGGGAAA
CCTGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCTGCTGGGACCAAAGTGTCGAATATGTTTGGT
GGAACTCGAGAGAAATGCGTTGGCTGCGACAAAACTGTCTATCCTATTGAGATGGTGTCG
GTGAATGGAACATTGTACCACAAGAGCTGTTTCAAGTGTACACACGGAGGCTGCACGATA
AGTCCTTCGAACTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCATCACCATATCCAG
CTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAACTCGAAGGAGGAGACAATGCCGCCGCCAAG
GACAAAGACGTCGCTGCTTAAACAGTTCAATCAATCTCTCTGGATGATTTTGACCATGGA
AGAACCACCACTATAGTGTCTCTCTCTACTTCTCGATCCACATAACATATACCATTGGTT
TTGTTTCTTCTCAAGTCTATGTTCTTCTTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4E442TF 733 0 0
TCGCAGGAACAACCCAGAAATGCATGGCTTGTGACAAAACCGTGTACCTCGTGGACAAGT
TAACCGCTGATAACCGGGTCTACCACAAAGCTTGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAA
CTCTCAAGCTTAGCAATTACAACTCATTTGAAGGAGTTCTCTATTGCATACCACATTTCG
ATCAAAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAAAGCTTCGAAGGAACACCAAAGATTG
GGAAACCTGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCTGCTGGGACCAAAGTGTCGAATATGT
TTGGTGGAACTCGAGAGAAATGCGTTGGCTGCGACAAAACTGTCTATCCTATTGAGAAGG
TGTCGGTGAATGGAACATTGTACCACAAGAGCTGTTTCAAGTGTACACACGTAGGCTGCA
CGATAAGTCCTTCGAACTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCATCACCATA
TCCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAACTCGAAGGAGGAGACAATGCCGCCG
CCAAGGACAAAGACGTCGCTGCTTAAACAGTTCAATCAATCTCTCTGGATGATTTTGACC
ATGGAAGAACCACCACTATAGTGTCTCTCTCTACTTCTCGATCCACATAACATATACTAT
TGGTTTTGTTTCTTCTCAAGTCTATGTTCTTCTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTCTTTCATG
TTGTTTCTTTTGG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4DQ22JQ 741 0 0
AACCGGGTCTACCACAAAGCTTGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAACTCTCAAGCTT
AGCAATTACAACTCATTTGAAGGAGTTCTCTATTGCAGACCACATTTCGATCAAAACTTC
AAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAAAGCTTCGAAGGAACACCAAAGATTGGGAAACCTGAT
AGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCTGCTGGGACCAAAGTGTCGAATATGTTTGGTGGAACT
CGAGAGAAATGCGTTGGCTGCGACAAAACTGTCTATCCTATTGAGATGGTGTCGGTGAAT
GGAACATTGTACCACAAGAGCTGTTTCAAGTGTACACACGGAGGCTGCACGATAAGTCCT
TCGAACTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCATCACCATATCCAGCTTATC
AAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAACTCGAAGGAGGAGACAATGCCGCCGCCAAGGACAAA
GACGTCGCTGCTTAAACAGTTCAATCAATCTCTCTGGATGATTTTGACCATGGAAGAACC
ACCACTATAGTGTCTCTCTCTACTTCTCGATCCACATAACATATACCATTGGTTTTGTTT
CTTCTCAAGTCTATGTTCTTCTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTCTTTCATGTTGTTTCTTTT
GGGAACTTATGTTCACTCTTTGTTGGGTTTCTTGAGATAACACAAGAAAATAGAGAAATA
ATGGATGTTTGCTTATGATAC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL77Contig3 462 3 5 U
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AAAACATAGACTTGAAAAAAAACAAAACCAATAGTATATGTTATGTGGATCGAGAAGTAA
AAAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAAAAAGATTGATTGAA
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TCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGGATATGGGGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCT
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TCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG30JQ U 3
AF RR4E442JQ U 154
AF RR4DW67JQ U 1
BS 1 40 RR4DW67JQ
BS 41 41 RR4DG30JQ
BS 42 335 RR4DW67JQ
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BS 337 462 RR4DW67JQ

RD RR4DG30JQ 226 0 0
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AGTGAACATAAGTTCCCAAAAAAAACAACATGAAAGACAACAACAACAACAAAAAAAAAA
AACATAGACTTGAAAAAAAACAAAACCAATAGTATATGTTATGTGGATCGAGGAGTAAAA
AGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCA
AAA

QA 1 223 1 223
DS 

RD RR4E442JQ 247 0 0
GTATATGTTATGTGGATCGAGAAGTAAAAAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGT
CAAAATCATCCAAAAAGATTGATTGAACTGTTTAAGCAGCGACGTCTTTGTCCTTGGCGG
CGGCATTGTCTCCTCCTTCGAGTTGGCTCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGGATAT
GGGGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGC
A
CCCTAC

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4DW67JQ 462 0 0
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AAAGTGAACATAAGTTCCCAAAAAAAACAACATGAAAGACAACAACAACAACAAAAAAAA
AAAACATAGACTTGAAAAAAAACAAAACCAATAGTATATGTTATGTGGATCGAGAAGTAA
AAAGAGACACTATAGTGGTGGTTCTTCCATGGTCAAAATCATCCAAAAAGATTGATTGAA
CTGTTTAAGCAGCGACGTCTTTGTCCTTGGCGGCGGCATTGTCTCCTCCTTCGAGTTGGC
TCAAGTTTCCTTTCTCCTTGATAAGCTGGATATGGTGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCT
CGTGAGCTATGTAGTTCGAAGGACTTATCGTGCAGCCTACGTGTGTACACTTGAAACAGC
TCTTGTGGTACAATGTTCCATTCACCGACACCTTCTCAATAG

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 15

CO CL78Contig1 1002 15 4 U
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCCCTCCTTTTCTCTGTTTT
CTCGCTAACTGTTCAGTTGATCAAGAGTAACTAACCATGGCTGAAGAGTACAAGAACGCT
TCTGAGGAGTTCAAGAA*CGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAGGA
ACCGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGGAAAAA
GGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGC
CCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGC
CTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTC
TCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTG
AAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGATGAGAAGAAGG
GAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTGATGATTCTC
AAGTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATCCGGAGG
AGAAGAAAGGTATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAGAGCA
CTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATGATATAAAT
AATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTTATCTTTAA
GGTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATATTGTAATTT
CAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTTTCGAGTTATGTGTGT
AATGTAATGTTCATTTGCTATCTCCACAAACTCTCTTCTTGT


BQ
30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 
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75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 50 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AT52TF U 1
AF RR4GF93TF U 1
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AF RR4ET35TF U 1
AF RR4GG65TF U 8
AF RR4A125TFB U 1
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AF RR4A125JQD C 53
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AF RR4A125JQ C 146
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AF RR4FI46JQ C 610
AF RR4EQ67JQ C 291
AF RR4ET35JQ C 293
AF RR4EQ67TF U 291
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BS 779 779 RR4A125TFB
BS 780 841 RR4A125TF
BS 842 1002 RR4EQ67TF

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DS 

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CTCGCTAACTGTTCAGTTGATCAAGAGTAACTAACCATGGCTGAAGAGTACAAGAACGCT
TCTGAGGAGTTCAAGAA*CGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAGGA
ACCGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGGAAAAA
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CCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCA*AAGC
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AAGACGGTGAGAAGAGAAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGGGATGAGAAGAAGG
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AAGTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGAC

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DS 

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GGC
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TGAGGAGTTCAAGAA*CGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAGGAAC
CGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGGAAAAAGG
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TTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCATCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGATGAGAAGAAGGGA
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GTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTG

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DS 

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CTCGCTAACTGTTCAGTTGATCAAGAGTAACTAACCATGGCTGAAGAGTACAAGAACGCT
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GGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGC
CCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGC
CTACTCTCCTCGAGCATCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTC
TCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTG
AAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGGGATGAGAAGAAGG
GAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTGATGATTCTC
AAGTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGACGGAGGA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4GG65TF 714 0 0
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ACTGTTCAGTTGATCAAGAGTAACTAACCATGGCTGAAGAGTACAAGAACGCTTCTGAGG
AGTTCAAGAAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAGGAACCGTCG
GCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGGAAAAAGGAGGAA
GTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGCCCAGAT*
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GAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGG
TGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGATGAGAAGAAGGGAGTGAT
GGAGAAGATCAGGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTGATGATTCTCAAGTCGT
CAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGACGGAGGAAAAG*CGGAGCATCCGGAGGAGAAGAA
AG*TATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGT*ATCACGCTA
GAGCACT

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DS 

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CTCGCTAACTGTTCAGTTGATCAAGAGTAACTAACCATGGCTGAAGAGTACAAGAACGCT
TCTGAGGAGTTCAAGAA*CGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAGGA
ACCGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGGAAAAA
GGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGC
CCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGC
CTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTC
TCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTG
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GAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTGATGATTCTC
AAGTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATCCGGAGG
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CTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATGATATAAAT
AATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTTATCTT

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DS 

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CTCGCTAACTGTTCAGTTGATCAAGAGTAACTAACCATGGCTGAAGAGTACAAGAACGCT
TCTGAGGAGTTCAAGAA*CGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAGGA
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GGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGC
CCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGC
CTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTC
TCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTG
AAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGATGAGAAGAAGG
GAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTGATGATTCTC
AAGTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATCCGGAGG
AGAAGAAAGGTATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAGAGCA
CTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATGATATAA*T
AATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTTATCTTTAA
G
TATTCTTGTAAGATTGT

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DS 

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GAAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTGA
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TCCGGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGC
TAAGAGCACTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATG
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ATCTTTAAGGTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATAT
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AG

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DS 

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GAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGCCCAGAT*CA
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TAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTGTATTGTAATTTCAGTATCTC
TTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGT

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DS 

RD RR4A125JQ 798 0 0
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AAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGGAAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACG
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TGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCA
GAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAA
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GAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGATGAGAAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAA
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GTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTTATCTTTAAGGTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTC
GTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATATTGTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCA
TATGGTTTTTAAGTAA
AG

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DS 

RD RR4AT52JQ 801 0 0
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GTTCGATTTCTTGGGGAAAAAGGAGGAAGCGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGC
TTCGGAGGTCGAGCATAAAGCCCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACG
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AGGAAGAGAACAAGCCAAGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGGTCCAACAGCTCTTCTTCCT
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TTCACCGCTATATTGTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGT
AATGTTTCGAGTTATGTGTGT

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DS 

RD RR4FI46JQ 351 0 0
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GTATTCTTGAAAAAATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAGAGCACTGAAGAGG
GGGGGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTTTGATGCTTAAGAAAGATGATATAAATAATGTTGGA
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TAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTTTTCACCGCTATATTGTAATTTCAGTATTTT
TTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTTTAAGTAATGTTTCGAGTTATG
GGGGT

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR4EQ67JQ 712 0 0
G
GCATAAAGCCCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGG
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ATCCGGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACG
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TATCTTTAAGGTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATA
TTGTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTTTCGAGT
TATGTGTGTAATGTAATGTTCATTTGCTATCTCCACAAACTCTCTTCTTGT

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DS 

RD RR4ET35JQ 686 0 0
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ATATAAATAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTT
ATCTTTAAGGTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATAT
TGTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTTTCGAGTT
ATGTGTGTAATGTAATGTTCATTTGC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4EQ67TF 712 0 0
G
GCATAAAGCCCAGAT*CACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGG
AGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACA
AGCCAAGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGG
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AGAAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCAAAGTGAAAAACCTG
ATGATTCTCAAGTCGTCAACACGGAGGCTGCTGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGC
ATCCGGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACG
CTAAGAGCACTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGAT
GATATAAATAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTT
TATCTTTAAGGTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATA
TTGTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTTTCGAGT
TATGTGTGTAATGTAATGTTCATTTGCTATCTCCACAAACTCTCTTCTTGT

QA 2 712 2 712
DS 



AS 1 15

CO CL79Contig1 622 15 7 U
GGACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTA
TAATCATCTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATATCAC
TTATTGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAACTCAAACAAAAAGAAGGGTTACG
GCAGTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTA
ACCTTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTA
CGTATGGAAACTACGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCC
GCAAGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATAC
TATGTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCAAATAAGTCA
TGAGAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTTTATTAATTGGTCTATTTGTTGCA
AGTTTTTTTATTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAA
ATAAA*GTTATGATGCTTTTAT


BQ
65 65 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 25 25 25 25 25 25 25 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
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85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 50 50 
55 65 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 
60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 55 55 40 

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AF RR4G906TF U 1
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AF RR4BD23TF U 1
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AF RR4B882TF U 1
AF RR4B127TF U -1
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ATG

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AAGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTA
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AAA*GTTATGATGCTTTTA

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G
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A*GTTATGATGCTTTTA

QA 2 618 2 618
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QA 1 622 1 622
DS 

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GG
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DS 

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GAC

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GAC

QA 1 619 1 619
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GG
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QA 3 624 3 624
DS 



AS 1 15

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 35 45 65 20 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 45 85 85 
45 85 85 45 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 40 40 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 
40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 
80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E346JQ U 31
AF RR4CG47TF C 1
AF RR4AM53JQ U 31
AF RR4AM53TF C 31
AF RR4E346TF C 27
AF RR4DU47JQ U 31
AF RR4A980JQ U 33
AF RR4A980TF C 33
AF RR4DU47TF C 34
AF RR4FW26JQ U 76
AF RR4BD69TF C 33
AF RR4H982JQB U 15
AF RR4BD69JQ U 33
AF RR4HA35TF C 28
AF RR4HA35JQB U 33
BS 1 16 RR4CG47TF
BS 17 30 RR4H982JQB
BS 31 31 RR4DU47JQ
BS 32 144 RR4AM53JQ
BS 145 145 RR4DU47JQ
BS 146 661 RR4AM53JQ
BS 662 662 RR4DU47JQ
BS 663 708 RR4AM53JQ
BS 709 713 RR4DU47JQ
BS 714 760 RR4H982JQB
BS 761 769 RR4HA35TF

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AGAGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAAAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACAT
GCTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGAT
GATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACC
GTACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCC
TGTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCA
TGGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAG

QA 1 408 1 408
DS 

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CATTATACATGTCTAGATGATGAACAGTGAAGAGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAA
AGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACATGCTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGT
TGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGATGATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAA
GATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACCGTACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTC
CGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTGTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAAT
AGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCATGGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTC
ATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTGAATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGT
AGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCTCCTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGA
AGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCAGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAA
CATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTAGAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAG
ATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAAGCAGCCATTGTGGAGAGAAAAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4AM53JQ 678 0 0
G
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GAGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAAAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACACCACATG
CTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGATG
ATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACCG
TACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCT
GTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCAT
GGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTT
GAATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCT
CCTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTC
AGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTA
GAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGACGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAA
GCAGCCATTGTGGAGAG

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DS 

RD RR4AM53TF 678 0 0
G
TGAGAAAACAACATTATATTTATTATCATCATTATACATGTCTAGATGATGAACAGTGAA
GAGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAAAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACACCACATG
CTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGATG
ATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACCG
TACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCT
GTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCAT
GGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTT
GAATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCT
CCTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTC
AGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTA
GAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGACGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAA
GCAGCCATTGTGGAGAG

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR4E346TF 687 0 0
TTTT
CTGAGAAAACAACATTATATTTAT*ATCATCATTATACATGTCTAGATGATGAACAGTGA
AGAGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAAAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACAT
GCTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGAT
GATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACC
GTACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCC
TGTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCA
TGGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGT
TGAATCGTTCGCCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCC
TCCTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCT
CAGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTT
AGAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAA
AGCAGCCATTGTGGAGAGAAAAA

QA 5 687 5 687
DS 

RD RR4DU47JQ 683 0 0
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AGAGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAAAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACAT
GCTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGAT
GATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACC
GTACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCC
TGTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCA
TGGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGT
TGAATCGTTCGCCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCC
TCCTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCT
CAGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTT
AGAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAA
AGCAGCCATTGTGGAGAGAAAAA

QA 1 683 1 683
DS 

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TGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCATG
GTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTG
AATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCTC
CTCGTTGTCGTAATTTAGAGTTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCA
GCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTAG
AGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAAG
CAGCCATTGTGGAGAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4A980TF 676 0 0
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ACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTG
TGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCATG
GTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTG
AATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCTC
CTCGTTGTCGTAATTTAGAGTTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCA
GCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTAG
AGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAAG
CAGCCATTGTGGAGAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4DU47TF 680 0 0
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TCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGATGAT
CGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACCGTA
CTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTGT
GTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCATGG
TGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTGA
ATCGTTCGCCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCTCC
TCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCAG
CCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTAGA
GGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAAGC
AGCCATTGTGGAGAGAAAAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4FW26JQ 631 0 0
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AGATCCACATCACATGCTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTT
AGACACCGCGCCGATGATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGG
TATGCTTCTAACACCGTACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAA
GAACTTCATCTTCCCTGTGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTT
GCAGGGTCCACACCATGGTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTAC
AAGAGACTCCCATGTTGAATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTC
ACAGATGATGACCCCTCCTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAA
TGAGACGCGAGTCCTCAGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGA
GAGTGAAACCTTCTTAGAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACA
AGAAGTACAGGTCAAAGCAGCCATTGTGGAG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BD69TF 676 0 0
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TTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGATGA
TCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACCGT
ACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTG
TGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCATG
GTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTG
AATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCTC
CTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCA
GCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTAG
AGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAAG
CAGCCATTGTGGAGAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4H982JQB 746 0 0
CG
TCATAAACTCGTTTCTGAGAAAACAACATTATATTTATTATCATCATTATACATGTCTAG
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GATCCACATCACATGCTTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTA
GACACCGCGCCGATGATCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGG
ATGCTTCTAACACCGTACTGTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAG
AACTTCATCTTCCCTGTGTACTGCTGTGCTAGTTCATTGACGATGGGGTCGATCATTTTG
CAGGGTCCACACCATGGTGCCCAAAAGTCCACGACAACAGGCTCATCTGCCTTGAGTACA
AGAGACTCCCATGTTGAATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCA
CAGATGATGATCCCTCCTCGT***CGTAATCTAGAATTCTTCGAGGAGACCGATGATAAT
GAGACGCGAGTCCTCAGCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGCAGAG
AGTGAAACCTTCTTAGAGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGACATGAATCGGCGGACAA
GAAGTACAGGTGAAAGCAGCCATTGTGGAGAGAAAAACAAGAACCACACGAAAGGTTCTG
TTGCTGAGATTCTTCTGAGACCTC

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR4BD69JQ 712 0 0
GGGAAAACAACATTATATTTATTATCATCATTATACATGTCTAGATGATGAACAGTGAAG
AGTATACGTTAAGTCCAAATACATATAAAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACATGC
TTCACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTAGACACCGCGCCGATGA
TCGTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGTATGCTTCTAACACCGT
ACTTTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTG
TGTACTGCTGTGCTAGTTCACTGACAATAGGATCAATCATTTTGCAGGGTCCACACCATG
GTGCCCAAAAGTCCACAACAACAGGCTCATCAGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTG
AATCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGACCCCTC
CTCGTTGTCGTAATTTAGAATTCTTCGAAGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCA
GCCCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGTAGAGAGTGAAACCTTCTTAG
AGGATGCGATCCTCATCTCTGACCGGAGATGAATCGGCGGACAAGAAGTACAGGTCAAAG
CAGCCATTGTGGAGAGAAAAACAAGAACCACACGATAAGTTCTGTT
CCTGCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4HA35TF 742 0 0
TTTTTGT
GAAAACAACATTATATTTAT*ATCATCATTATACATGTCTAGATGATGAACAGTGAAGAG
TATACGTTAAGTCCAAATACATATAGAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACATGCTT
CACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTGGACACCGCGCCGATGATC
GTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGGATGCTTCTAACACCGTAC
TGTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTGTG
TACTGTTGTGCTAGTTCATTGACGATGGGGTCGATCATTTTGCAGGGTCCACACCACGGT
GCCCAAAAGTCCACGACAACAGGCTCATCTGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTGAA
TCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGATCCCTCCT
CGT***CGTAATCTAGAATTCTTCGAGGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCAGC
CCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGCAGAGAGTGAAACCTTCTTAGAG
GATGCGATCCTCATCTCTGACCGGACATGAATCGGCGGACAAGAAGTGCAGGTGAAAGCA
GCCATTGTGGAGAGAAAAACAAGAACCACACGAAAGGTTCTGTTGCTGAGATTCTTCTGA
GACCTCAAAATGCCC

QA 8 742 8 742
DS 

RD RR4HA35JQB 733 0 0
GT
GAAAACAACATTATATTTATTATCATCATTATACATGTCTAGATGATGAACAGTGAAGAG
TATACGTTAAGTCCAAATACATATAGAGAAATAAAAGAGAGAGATCCACATCACATGCTT
CACTGCAAGAATTTATCAAAGCTTGTTGCTAATGTGGTTTTGGACACCGCGCCGATGATC
GTATCCTTCTTCTCGCCCTTAACAAAGATCATGATGGTTGGGATGCTTCTAACACCGTAC
TGTCCCGGGGTTGCAGGAGACTCGTCCGTGTTTAGTTTGAAGAACTTCATCTTCCCTGTG
TACTGTTGTGCTAGTTCATTGACGATGGGGTCGATCATTTTGCAGGGTCCACACCACGGT
GCCCAAAAGTCCACGACAACAGGCTCATCTGCCTTGAGTACAAGAGACTCCCATGTTGAA
TCGTTCACCAATGGAATCCCTGTAGTAGCTTCCTGAGCTTCACAGATGATGATCCCTCCT
CGT***CGTAATCTAGAATTCTTCGAGGAGACCGATGATAATGAGACGCGAGTCCTCAGC
CCTCCCGATTCCGGTAACACAGAGAACATATGTCGAGCAGAGAGTGAAACCTTCTTAGAG
GATGCGATCCTCATCTCTGACCGGACATGAATCGGCGGACAAGAAGTGCAGGTGAAAGCA
GCCATTGTGGAGAGAAAAACAAGAACCACACGAAAGGTTCTGTTGCTGAGATTCTTCTGA
GACCTC
AAAAT

QA 3 728 3 728
DS 



AS 1 15

CO CL81Contig1 1144 15 11 U
CATATTTCAATCCATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATAC
ATACATACATA****CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTT
CACATAACGGCAATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGA
CAAGAGCCTGACACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTT
GGCCACAAAAGGTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCC
TTTATGAGCCATGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTC
ATTACGGGAGTATAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAA
GTAAAGGGCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAG
ATTAACGCAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAA
CATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAG
GAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA
*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC
**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAAC
TTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACA
CCACTTGTTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAG
AGATTACGGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACTTGT
TGCCTGATTATCTCTTCCGCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAATAATTCATCTCCAGTTCC
GCATTTCCGATATGGAAGATGGAAAATAACTGTAATAACAGACAAAAGAAGGCTAAACGA
CAGAAGGGCATCTTCGCACTCGCCATCTCTCTCTTTCTTTTTCTCTACTTTGTTGATTGG
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 60 85 85 85 85 
85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 65 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4BZ36JQ U 8
AF RR4GN35JQ U 9
AF RR4GP30JQ U 1
AF RR4GN35TF C 54
AF RR4A222TF C 431
AF RR4DH25JQ U 12
AF RR4A222JQ U 16
AF RR4A222JQD U 16
AF RR4A234JQ U 159
AF RR4A234JQD U 16
AF RR4DH25TF C 182
AF RR4A032TFB C 259
AF RR4A222TFB C 418
AF RR4BZ36TF C 476
AF RR4A234TFB C 418
BS 1 375 RR4GP30JQ
BS 376 376 RR4GN35JQ
BS 377 797 RR4GP30JQ
BS 798 825 RR4DH25JQ
BS 826 826 RR4A222JQ
BS 827 889 RR4DH25JQ
BS 890 896 RR4A222JQD
BS 897 912 RR4A234JQD
BS 913 964 RR4DH25TF
BS 965 1086 RR4A032TFB
BS 1087 1144 RR4A222TFB

RD RR4BZ36JQ 576 0 0
CGATC
CATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATACATACATACATA*
***CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAAAGTTCACATAACGGCA
ATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAAAGGGTTGGTCTCGGACAAAAGCCTGAC
ACCGCGTGAAAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTTGGCCACAAAAGG
TGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCAT
GATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTA
TAAAACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTA
ATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAAATTAACGAAATG
GACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAAAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGA
TGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGAT

QA 6 576 6 576
DS 

RD RR4GN35JQ 694 0 0
AATC
CATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATATAAACCTTAACACACATACATACATACATA*
***CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGCA
ATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGAC
ACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTTGGCCACAAAAGG
TGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCAT
GATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTA
TAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTA
ATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATG
GACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGA
TGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCT
GAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATC
TTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATC

QA 5 694 5 694
DS 

RD RR4GP30JQ 804 0 0
CATATTTCAATCCATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATAC
ATACATACATA****CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTT
CACATAACGGCAATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGA
CAAGAGCCTGACACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTT
GGCCACAAAAGGTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCC
TTTATGAGCCATGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTC
ATTACGGGAGTATAAAACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAA
GTAAAGGGCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAG
ATTAACGCAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAA
CATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAG
GAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA
*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC
**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAAC
TTAACGTACTTAAAGTT
CTCATAC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4GN35TF 767 0 0
CACATACATACATACATA****CACATATGTTTAT*ATCTT*CACAGCAT*ATAATCAAT
TAGAGTTCACATAACGGCAATCTT**CTTATCTCCC*TTGATCACCGGTAAGAGGGTTGG
TCTCGGACAAGAGC*TGACACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAG
CCATCTTGGCCACAAAAGGTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAA
GGAGCCCTTTATGAGCCATGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCT
CACGGTCATTACGGGAGTATAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCT
TTTTCAAGTAAAGGGCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGT
GCACTAGATTAACGCAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTG
GCTTCAACATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTG
TGGTTAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCT
GTCTTGA*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGA
GAGCAAC**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTT
GATAAACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTC
C

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4A222TF 380 0 0
TAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAA
TGGACCCTACCAAACGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACC
GATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGT
CTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGAATCATATCTA
TCTTTGGCCCTTTCAACATGACAAATACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAACAAATATCAG
CGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACT
TAAAGTTTCTCATACCAAAA

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4DH25JQ 878 0 0
G
CATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATACATACATACATA*
***CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGCA
ATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGAC
ACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTTGGCCA*AAAAGG
TGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCAT
GATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTA
TAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTA
ATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATG
GACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGA
TGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCT
GAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATC
TTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATATCAGCG
CAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTA
AAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTT*GCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTC
TCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGC

QA 2 878 2 878
DS 

RD RR4A222JQ 873 0 0
AACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATACATACATACATACATA
CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGCAATC
CTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGACACC
GCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGAAGCCATCTTGGCCACAAAAGGTGC
CGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCATGAT
GTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTATAA
GACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTAATT
TGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATGGAC
CCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGATGG
AGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAA
CATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATCTTT
GGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATATCAGCGCAA
GAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAG
TTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCTCA
AGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACG

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR4A222JQD 881 0 0
AACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATACATACATACATACATA
CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGCAATC
CTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGACACC
GCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGAAGCCATCTTGGCCACAAAAGGTGC
CGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCATGAT
GTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTATAA
GACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTAATT
TGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATGGAC
CCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGATGG
AGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAA
CATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATCTTT
GGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATATCAGCGCAA
GAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAG
TTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCTCA
AGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATG

QA 1 881 1 881
DS 

RD RR4A234JQ 731 0 0
CGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGACACCGCGTGAGAATCGCTCATGGAAGT
AACCATTGTCCGAAGCCATCTTGGCCACAAAAGGTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCT
CATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCATGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCA
CAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTATAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTG
GACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCG
TTGGGTATAGCCGGTGCACTAAATTAACGCAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCT
AAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAG
GAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTA
CTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TAC
CATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTT
CTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGT
CGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGA
CTTGACGACGC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4A234JQD 897 0 0
AACAGTTTGATATTTCTTATTGAATTCAAACCTTAACACACATACATACATACATACATA
CACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGCAATC
CTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGACACC
GCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGAAGCCATCTTGGCCACAAAAGGTGC
CGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCATGAT
GTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTATAA
GACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTAATT
TGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATGGAC
CCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGATGG
AGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAA
CATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATCTTT
GGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATATCAGCGCAA
GAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAG
TTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCTCA
AGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAGAGATTACGGAGC

QA 1 897 1 897
DS 

RD RR4DH25TF 783 0 0
CAAGAG
CTGACACCGCGTGAGAAT*GCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTTGGCCA*A
AAAGGTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGA
GCCATGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGG
GAGTATAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGG
GCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACG
CAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGAT
ACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAG
AGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATAT
CTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATAT
CAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGT
ACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTG
TTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAGAGATTAC
GGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACTTGTTGCC

QA 7 783 7 783
DS 

RD RR4A032TFB 828 0 0
CCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTT*ATGAGCCATGATGTC
**TGTAATACATGT*GTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTATAAGAC
TGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTAATTTGG
GTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATGGACCCT
ACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCGATGGAGT
TGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAACAT
CATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGA*TCATATCTATCTTTGGC
CCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAAC**AATATCAGCGCAAGAG
ACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAGTTT
CTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCTCAAGT
AGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAGAGATTACGGAGCCAAGAG
ACGGCTGTGTTGTCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACTTGTTGCCTGATTATCTCTTCC
GCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAATAATTCATCTCCAGTTCCGCATTTCCGATATGGAAG
ATGGAAAATAACTGTAATAACAGACAAAAGAAGGCTAAACGACAGAAG

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4A222TFB 727 0 0
CAAGTAAAGGGCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCAC
TAGATTAACGCAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTT
CAACATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGT
TAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCT
TGA*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGC
AAC**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATA
AACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCC
ACACCACTTGTTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGG
AAGAGATTACGGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACT
TGTTGCCTGATTATCTCTTCCGCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAATAATTCATCTCCAGT
TCCGCATTTCCGATATGGAAGATGGAAAATAACTGTAATAACAGACAAAAGAAGGCTAAA
CGACAGAAGGGCATCTTCGCACTCGCCATCTCTCTCTTTCTTTTTCTCTACTTTGTTGAT
TGGGTCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4BZ36TF 668 0 0
ACTAGATTAACGAAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGC
TTCAACATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTG
GTTAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGT
AT*GA*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGA
GCAAC**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGA
TAAACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATT
CCACACCACTTGTTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCAT
GGAAGAGATTACGGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCA
CTTGTTGCCTGATTATCTCTTCCGCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAATAATTCATCTCCA
GTTCCGCATTTCCGATATGGAAGATGGAAAATAACTGTAATAACAGACAAAAGAAGGCTA
AACGACAGAAGGGCATCTTCGCACTCGCCATCTCTCTCTTTCTTTTTCTCTACTTTGTTG
ATTGGG
CC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4A234TFB 727 0 0
CAAGTAAAGGGCGTAATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCAC
TAGATTAACGCAATGGACCCTACCAA*CGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTT
CAACATCGATACCGATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGT
TAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCT
TGA*TCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAA*TACCATCTCTAGCAGAGAGAGC
AAC**AATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATA
AACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCC
ACACCACTTGTTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGG
AAGAGATTACGGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACT
TGTTGCCTGATTATCTCTTCCGCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAATAATTCATCTCCAGT
TCCGCATTTCCGATATGGAAGATGGAAAATAACTGTAATAACAGACAAAAGAAGGCTAAA
CGACAGAAGGGCATCTTCGCACTCGCCATCTCTCTCTTTCTTTTTCTCTACTTTGTTGAT
TGGG
TCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 11

CO CL82Contig1 958 11 35 U
GGGAAACACTCCACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTAGGGCTCTCAAC
CTTTCCCTCTCTGATCCGTTTCCTTCTCCAAGCTCAGGTAAGAAAAGATGCAAGCTGTGA
TTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAACGTTGTCAGATCGTCTCTGCTCCAACACCTCCGTG
TGATCAACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGC
CTGCTCGTATGGAGGAGCATGGATTCGAGAGCACGACCATTTCTGATGTTATGAGCGCTA
AAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACG
CCGTTAAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGC
AACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAG
GTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCA
CCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCA
GACACATTCCGGTGATCAAAGATAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCAATAGGAGATGTGG
TCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGG
GAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCTTTGC*GTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGC
TTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTT
TTTAAATCTGCTGTTTCAATTGGTTAACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTT
TTCTATGCTACTTGTCTCTGCAAGATAATAAAACCAAAGACTCCCCATTTCTTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 0 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 25 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 35 20 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN60TF U 12
AF RR4FX39TF U 11
AF RR4EE02JQ C 465
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AF RR4AN85TF U 638
AF RR4B628TF U 1
AF RR4DJ27TF U 48
AF RR4DJ27JQ C 128
AF RR4FX39JQ C 324
AF RR4DN60JQ C 247
AF RR4AN73JQ C 456
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BS 146 146 RR4DJ27TF
BS 147 166 RR4B628TF
BS 167 167 RR4DJ27TF
BS 168 169 RR4B628TF
BS 170 170 RR4DJ27TF
BS 171 172 RR4B628TF
BS 173 173 RR4DJ27TF
BS 174 257 RR4B628TF
BS 258 258 RR4FX39TF
BS 259 319 RR4B628TF
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BS 321 376 RR4B628TF
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BS 678 749 RR4B628TF
BS 750 750 RR4DJ27TF
BS 751 845 RR4B628TF
BS 846 846 RR4DJ27JQ
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BS 952 958 RR4AN73JQ

RD RR4DN60TF 580 0 0
G
ACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTAGGGCTCTCAACCTTTCCCTCTCT
GATCCGTTTCCTTCTCCAAGCTCAGGTAAGAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGTTCGTTCG
TGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTGTGATCAACCCTG
CGATTCAGCCCTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCGTATGG
AGGAGCATGGGTTCGAGAGCACGACCATTTCCGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCG
CTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTAAATCCA
TGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTG
CTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGATCATCCA
AATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAG
AGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATA

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR4FX39TF 697 0 0
GG
ACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCACTACTCTAGGGCTCTCAACCTTTCCCTCTCT
GATCCGTTTCCTTCTCCAAGCTCAGGTAAGAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGTTCGTTCG
TGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTGTGATCAACCCTG
CGATTCAGCCCTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCGTATGG
AGGAGCATGGGTTCGAGAGCACGACCATTTCCGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCG
CTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTAAATCCA
TGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTG
CTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGATCATCCA
AATCAACGTAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGTTTATCACCGTGACACCAG
AGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGACACATTCCGG
TGATCAAAGATAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCAATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGG
TGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAA
TG

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR4EE02JQ 359 0 0
AAGATCATTGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAA
GAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATG
ACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTG
TCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACCGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTA
AATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCTTTGCTGTGTGGTGGTTGTT
GATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTTGTCT

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4EE02TF 560 0 0
GGA
TTCGAGAGCACGACCATTTCTGATGTTATGAGCGCTAAAGGCAAAAGCGCTGATGGATCT
TGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTAAATCCATGACGCAACAC
AATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTGCTGGTATCATT
ACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACAAAA
GTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTG
TTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGATCAAAGAC
AAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACCGAGCAT
CGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACC
CTTTGCTGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATAT
GGAGTCTTGGTTGTTTG

QA 4 560 4 560
DS 

RD RR4AN85TF 175 0 0
AATGGTGTCAATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAA
CCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCTTTGC*GTGTGGT
GGTTATTGATGAATCTCTAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGTCTTG

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR4B628TF 870 0 0
GGGAAACACTCCACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTAGGGCTCTCAAC
CTTTCCCTCTCTGATCCGTTTCCTTCTCCAAGCTCAGGTAAGAAAAGATGCAAGCTGTGA
TTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTG
TGATCAACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGC
CTGCTCGTATGGAGGAGTATGGATTCGAGAGCACGACCATTTCTGATGTTATGAGCGCTA
AAGGCAAAAGCGCTGATGGGTCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACG
CCGTTAAATCCATGACGCAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGC
AACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCAAG
GTAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCA
CCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCA
GGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGG
TCCGTGCAGTGGTGACCGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGG
GAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCTTTGCTGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGC
TTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTT
TTTAA*TCTGCTTTTTCA
TTGGTACTTGCC

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR4DJ27TF 807 0 0
GG
GGGCTCTCAACCTTTCCCTCTTTGATCCGTTTTGTTCTCCAACCTCAGGTAAGAAAAGAT
GCAAGCTGTGATTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAACGTTGTCAGATCGTCTCTGCTCCA
ACACCTCCGTGTGATCAACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGA
GTCCACTCAGCCTGCTCGTATGGAGGAGCATGGACTCGAGAGCACGACCATATCTGATGT
TATGAGCGCTAAAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACAC
TGTTTACGATGCCGTTAAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAA
ACCTGGCGAGCAACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGGAAGAT
CATAGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAA
TAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGA
TAACAGGATCAGACACATTCCGGTGATCAAAGATAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCAAT
AGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGC
CTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCTTTGC*GTGTGGTGGTTGTTGATGA
ATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATTTATATATATGGAGTCTTGGTTGTC*GTCTCATGTT
TGTTTGTTGTTTTAAA*TCTGCTGT

QA 3 807 3 807
DS 

RD RR4DJ27JQ 831 0 0
CG
TCGTGTCCGG*GGAAACGTTGTCAGATCGTCTCTGCTCCAACACCTCCGTGTGATCAACC
*TGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCGTA
TGGAGGAGCATGGACTCGAGAGCACGACCATATCTGATGTTATGAGCGCTAAAGGCAAAA
GCGCTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGATGCCGTTAAAT
CCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGCGAGCAACAATCTC
TTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGGAAGATCATAGTGCAAGGTAGATCAT
CCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACAC
CAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGACACATTC
CGGTGATCAAAGATAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCAATAGGAGATGTGGTCCGTGCAG
TGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACT
AGACGCTAGCTACCCTTTGC*GTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGAT
GTATTTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTCGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAAATCT
GCTGTTTCAATTGGTTAACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTCTATGCT
ACTTGTCTCTGCAAGATAATAAAACCAAAGACTCCCCATTTC
TTTATGG

QA 3 824 3 824
DS 

RD RR4FX39JQ 635 0 0
TGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTAAATCCATGACACAACAC
AATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTGCTGGTATCATT
ACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGTAA
GTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGTTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTG
TTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGACACATTCCGGTGATCAAAGAT
AAGGGTATGATAGGAATGGTGTCAATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCAT
CGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACC
CTTTGC*GTGTGGTGGTTATTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATAT
GGAGTCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAAATCTGCTGTTTCAATTGG
TTAACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTCTATGCTACTTGTCTCTGCAA
GATAATAAAACCAAAGACTCCCCATTTC
TTTATGC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4DN60JQ 706 0 0
GTATGGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCACGACCATTTCCGATGTTATGAACGCTAAAGGCA
AAAGCGCTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTA
AATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAAT
CTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGAT
CATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGA
CACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGACACA
TTCCGGTGATCAAAGATAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCAATAGGAGATGTGGTCCGTG
CAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTT
ACTAGACGCTAGCTACCCTTTGC*GTGTGGTGGTAATTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAA
GATGTATGTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAAA
TCTGCTGTTTCAATTGGTTAACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTCTAT
GCTACTTGTCTCTGCAAGATAATAAAACCAAAGACTCCCCATTTC
C

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4AN73JQ 503 0 0
G
ATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTA
TGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGC
AGCTGATGACAGATAACAGGATCAGACACATTCCGGTGATCAAAGATAAGGGTATGATAG
GAATGGTGTCAATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTA
ACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCTTTGC*GTGTGG
TGGTTATTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGTCTTGGTTG
TTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAAATCTGCTGTTTCAATTGGTTAACTTGTCAAG
ACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTCTATGCTACTTGTCTCTGCAAGATAATAAAACCA
AAGACTCCCCATTTCTTTATGG

QA 2 503 2 503
DS 



AS 2 15

CO CL83Contig1 709 3 20 U
GGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAATCTGCTGCTTGTGAGAGAGAATCAAAATGGCTTCAAAG
CTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTTCCGCC
GAGCAAAGACGAAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGT
GAGTACGGCTCAGACATAGCTACTAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTCCTTCTCTTGACC
AGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCG
GGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATT
GCTGAGATATGTCTGCTCGCGGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAG
ATGTGGAACATCGATGCCCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCT
GGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCT
CGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCACCTTACTAAAATGAGTGGAACTGTTTTATCCCT
TCACTGGTTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTAAGCTTTTTGATTAT
CAAGACATTACCTTTTGCGTTTCATTGTATAAATACTTATTTAACATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI11TF U 2
AF RR4C777JQ C 1
AF RR4C777TF U 94
BS 1 4 RR4C777JQ
BS 5 13 RR4DI11TF
BS 14 14 RR4C777JQ
BS 15 15 RR4DI11TF
BS 16 16 RR4C777JQ
BS 17 29 RR4DI11TF
BS 30 30 RR4C777JQ
BS 31 114 RR4DI11TF
BS 115 115 RR4C777TF
BS 116 221 RR4DI11TF
BS 222 222 RR4C777TF
BS 223 308 RR4DI11TF
BS 309 309 RR4C777TF
BS 310 314 RR4DI11TF
BS 315 315 RR4C777TF
BS 316 493 RR4DI11TF
BS 494 494 RR4C777TF
BS 495 545 RR4DI11TF
BS 546 700 RR4C777TF
BS 701 709 RR4C777JQ

RD RR4DI11TF 544 0 0
GAA
AGAGAGAGAGAGAAAAAATCTGCTGTTTGTGAGAGAGAATCAAAATGGCTTCAAAGCTGG
TGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCCGAGC
AAAGACGAAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGTGAGT
ACGGCTCAGACATAGCTACTAGTTATGGAGCTGGTGCCTTTGTCCTTCTCTTGACCAGTC
AAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTG
GTTCTAGAGCTTGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTG
AGATATGTCTGCTCGCGGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGT
GGAACATCGATGCCCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTG
CTTCGTTCGTGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTG
C

QA 4 544 4 544
DS 

RD RR4C777JQ 709 0 0
GGAGAGAGAGAGAAAAAAAATATCTGCTGCTTGTGAGAGAGAATCAAAATGGCTTCAAAG
CTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTTCCGCC
GAGCAAAGACGAAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGT
GAGTACGGTTCAGACATAGCTACTAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTCCTTCTCTTGACC
AGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCG
GGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATT
GCTGAGATATGTCTGCTCGCGGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAG
ATGTGGAACATCGATGCCCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCT
GGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCT
CGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCCCCTTACTAAAATGAGTGGAACTGTTTTATCCCT
TCACTGGTTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTAAGCTTTTTGATTAT
CAAGACATTACCTTTTGCGTTTCATTGTATAAATACTTATTTAACATCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4C777TF 618 0 0
ATCGCCGTCGGTTTAGCCATTTCCGCCGAGCAAAGACGAAGCGTCGGTAAGGTTGTACCG
GATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACTAGTTATGGA
GCTGGTGCTTTTGTCCTTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGC
TTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTC
CTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATATGTCTGCTCGCGGCATCGATCAGA
AACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACATCGATGCCCCTCCTAGCTGTGAA
GTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTC
TCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCACCTTAC
TAAAATGAGTGGAACTGTTTTATCCCTTCACTGGTTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGAT
TGTGTTTCCTTTAAGCTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGCGTTTCATTGTATAAA
TACTTAT
TTACATCCAAA

QA 1 607 1 607
DS 



CO CL83Contig2 1401 12 10 U
GGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAATTTGCTGCT
TGTGAGAGAGAATCAAAATGGCGTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATC
TAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCTGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTAC
CGGATAAGGAAAAGGTGTATGAGTACTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATG
GAGCTGGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCT
GCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCT
TCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCA
GAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTG
AAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCG
TCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCTCCTT
ACTAAAAATGAGTCACTTCACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCT
TTTAAGCTTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATA
TAACATTCAGTATCTAAGATTGTTATTACACTTAACTTTATTTTTAGAGTTCATAACCTG
GAAACAGAGCTTGAGTTGGCTCATTCATGTCGAGAAACATGTAGGCAATTCCTCCTATAC
CTTCAAAGAGAGAGAATGGTCTATCTCCTCCATGCATCTTACCTTCTGAGATGAGCCTCT
CCGACTTATTGAACAGGAAAGATGCGAAAGCCTTTGCTCTGTACAAGTACTCTGGCTTTC
CTGTTAACCGGTACAGAAAAAGAAACACATAAGTGTTTCCACTGATGCCGTGACAGATCC
CTACTCGTTTAAGCAATCCACGGTTCCACACAACGTCTCCTGCTTCCATTGCAGCTTCTA
CAAACTCATCTGTCCTAAAAACCTGAGCTGCCTTTACAAGTGTGAGAGCAACACCAAGAG
CACCGTGACACCAGTGAACAAGACGATCTGATTCACTTCCTTCGCTAGATAGGTAGTTTC
CGCTTGGGAAACGGTGTTGGATCATGTAGCTTAACGTACCTTTAACATCTTCCATCTCAT
CTGGTTCAAGCTCCACATGCATTAGGACATGCATGATTCCAGCTAAACCGTGAGCAGCTC
CCCAATACTTCTTCCCGTGCCACTCGAACATCAATGGACACTTTCCTCTTTCACCCATTT
GTCTTCCTGCCCTGAAGATCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 35 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW43JQ C 220
AF RR4E429JQ C 220
AF RR4FX44TF U 1
AF RR4GX50TF U 4
AF RR4BQ03TF U 15
AF RR4GX50JQ C 27
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AF RR4FX44JQ C 124
AF RR4DJ41JQ U 640
AF RR4EX54JQ U 678
BS 1 123 RR4FX44TF
BS 124 124 RR4GX50TF
BS 125 579 RR4FX44TF
BS 580 580 RR4GX50TF
BS 581 711 RR4FX44TF
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TTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTTTGCTGTGGGAAGTTTTTTAACCCGGGTGGTTCAA
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GTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACA
TCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGT
TCGCGCTTTTCACTGCTATCGTCTTTCAGTTTTACTA

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DS 

RD RR4E429JQ 337 0 0
CAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTGCTTTTCTTGACCAGTCAAGTCA
TTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTTTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCAA
GAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATTT
GTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACA
TCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGT
TCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTTTACTA

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR4FX44TF 711 0 0
GGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAATTTGCTGCT
TGTGAGAGAGAATCAAAATGGCGTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATC
TAAGCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCTGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTAC
CGGATAAGGAAAAGGTGTATGAGTACTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATG
GAGCTGGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCT
GCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCT
TCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCA
GAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTG
AAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCG
TCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGTGCTGATTACAAGAACCCTCCTT
ACTAAAAATGAGTCACTTCACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCT
TTTAAGCTTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAA

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DS 

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GG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAATTTGCTGCTTGTGA
GAGAGAATCAAAATGGCGTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATC
GCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCTGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGAT
AAGGAAAAGGTGTATGAGTACTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCT
GGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTC
TGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGATTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTC
ATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAAC
GCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTG
ATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTTGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCT
CAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCTCCTTACTAA
AAATGAGTCACTTCACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAA
GCTTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATATAACA
TTCAGTATCTAAGATTGTTATTACACT
CA

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DS 

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GGGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAATTTGCTGCTTGTGAGAGAGAATCAAAA
TGGCGTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAG
CCATTGCCGCTGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAAAAGGTGT
ATGAGTACTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTGC
TTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGT
CTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATTTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGT
TTTTCTTGATTGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTA
AGTACAGGAAGATGTGGAACATCGACGAGCCCCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTG
TGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCTCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACG
TCTGCTACTCTCGTGCTCGTGATGATTACAATAACCCTCCTTACTAAAAATGAGTCACTT
CACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAAGCTTTTT*GATTA
TCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAA*TACTTATATAACATTCAGTATCTAAG
ATTGT

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DS 

RD RR4GX50JQ 727 0 0
AG
GAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAA*TTTGCTGCTTGTGAGAGAGAATCAAAATGGCGTCAAA
GCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGC
TGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAAAAGGTGTATGAGTACTG
TGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGAC
CAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCC
GGGTGATTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGAT
TGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAA
GATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGC
TGGTGCTTTGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTC
TCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCTCCTTACTAAAAATGAGTCACTTCACTGATTCG
ATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAAGCTTTTTTGATTATCAAGACATT
ACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATATAACATTCAGTATCTAAGATTGTTATTA
CACT
C

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DS 

RD RR4A671TF 734 0 0
G
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAATTTGCTGCTTGTGAGAGAGAATCAAAA
TGGCGTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAG
CCATTGCCGCTGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAAAAGGTGT
ATGAGTACTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTGC
TTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCCGTGGGAAGT
CTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGT
TTTTCTTGATTGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACTA
AGTACAGGAAGATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTG
TGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACG
TCTGCTACTCTCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCTCCTTACTAAAAATGAGTCACTT
CACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAAGCTTTTTTGATTA
TCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATATAACATTCAGTATCTAAG
ATTGTTATTACAC

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DS 

RD RR4DW43TF 713 0 0
G
GAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAATTTGCTGCTTGTGAGAGAGAATCAAAATGGCGTCAAA
GCTG*TGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGC
TGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAAAAGGTGTATGAGTACCG
TGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGAC
CAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCC
GGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGAT
TGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAA
GATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGC
TGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTC
TCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCTCCTTACTAAAAATGAGTCACTTCACTGATTCG
ATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAAGCTTTTTTGATTATCAAGACATT
ACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATATAACATTCAGTATCTAAGAT

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR4E429TF 663 0 0
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GACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAAAAGGTGTATGAGTACCGTGAGTACG
GCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGACCAGTCAAG
TCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTT
CAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGA
TTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGA
ACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTT
CGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTC
GTGATGATTACAAGAACCCTCCTTACTAAAAATGAGTCACTTCACTGATTCGATAGGATG
TTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAAGCTTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTG
TGTTTCATTGTATAAATACTTATATAACATTCAGTATCTAAGATTGTTATTACACT
TAACTTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4FX44JQ 626 0 0
G
CGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCTGAGCAACGACGTAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGA
TAAGGAAAAGGTGTATGAGTACTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACAAGTTATGGAGC
TGGTGCTTTTGTGCTTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTT
CTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCT
CATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATTTGTCTGCTCGCTGCATCGATCAGAAA
CGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACATCGACGAGCCTCCTAGCTGTGAAGT
GATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTC
TCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGTGCTGATTACAAGAACCCTCCTTACTA
AAAATGAGTCACTTCACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTA
AGCTTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATATAAC
ATTCAGTATCTAAGATTGTTATTAC

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR4DJ41JQ 743 0 0
CAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTTAAGCTTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGTGT
TTCATTGTATAAATACTTATATAACATTCAGTATCTAAGATTGTTATTACACTTAACTTT
ATTTTTAGAGTTCATAACCTGGAAACAGAGCTTGAGTTGGCTCATTCATGTCGAGAAACA
TGTAGGCAATTCCTCCTATACCTTCAAAGAGAGAGAATGGTCTATCTCCTCCATGCATCT
TACCTTCTGAGATGAGCCTCTCCGACTTATTGAACAGGAAAGATGCGAAAGCCTTTGCTC
TGTACAAGTACTCTGGCTTTCCTGTTAACCGGTACAGAAAAAGAAACACATAAGTGTTTC
CACTGATGCCGTGACAGATCCCTACTCGTTTAAGCAATCCACGGTTCCACACAACGTCTC
CTGCTTCCATTGCAGCTTCTACAAACTCATCTGTCCTAAAAACCTGAGCTGCCTTTACAA
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CTTCGCTAGATAGGTAGTTTCCGCTTGGGAAACGGTGTTGGATCATGTAGCTTAACGTAC
CTTTAACATCTTCCATCTCATCTGGTTCAAGCTCCACATGCATTAGGACATGCATGATTC
CAGCTAAACCGTGAGCAGCTCCCCAATACTTCTTCCCGTGCCACTCGAACATCAATGGAC
ACTTTCCTCTTTCACCCATTTGT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4EX54JQ 724 0 0
ATCAAGACATTACCTTTTGTGTTTCATTGTATAAATACTTATATAACATTCAGTATCTAA
GATTGTTATTACACTTAACTTTATTTTTAGAGTTCATAACCTGGAAACAGAGCTTGAGTT
GGCTCATTCATGTCGAGAAACATGTAGGCCATTCCTCCTATACCTTCAAAGAGAGAGAAT
GGTCTATCTCCTCCATGCATCTTACCTTCTGAGATGAGCTTCTCCGACTTATTGAACAGG
AAAGATGCGAAAGCCTTTGCTCTGTACAAGTACTCTGGCTTTCCTGTTAACCGGTACAGA
GAAAGAAGCACATAAGTGTTTCCACTGATGCCGTGACAGATCCCTACTCGTTTAAGCAAT
CCACGGTTCCACACAACGTCTCCTGCTTCCATTGCAGCTTCTACAAACTCATCTGTCCTA
AAAACCTGAGCTGCCTTTACAAGTGTGAGAGCAACACCAAGAGCACCGTGACACCAGTGA
ACAAGACGATCTGATTCACTTCCTTCGCTAGATAGGTAGTTTCCGCTTGGGAAACGGTGT
TGGATCATGTAGCTTAGCGTACCTTTAACATCTTCCATCTCATCTGGTTCAAGCTCCACA
TGCATTAGGACATGCATGATTCCAGCTAAACCGTGAGCAGCTCCCCAATACTTCTTCCCG
TGCCACTCGAACATCAATGGACACTTTCCTCTTTCACCCATTTGTCTTCCTGCCCTGAAG
ATCT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 16

CO CL84Contig1 1051 16 8 U
GAGGAGATTGACTGACAGTGACGATTACACTTCATTGGTAAAAGAAGATGTAGATGGAAA
GTTACAATTGAAGAGTAACAAGGAACTTCAAGAAAAAAAAAGAAACAGAGCGAAATAAAA
AGGGGTTACTTGTTGAAGAAAATGTTTTCGCAGCAAAAGGGGAGCAGGTGGTTTTTAAGA
CTCGGTCCTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCTGCGACCTTCATATTCTGTTCCATT
GAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCAAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCT
GTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACTGGCT
AAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGAGGTTTCCGACATAAACCTT
GTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCT
CTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCATCTCCCGACCACCTACTT
CATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGATAGAACTCATTGTGACAT
AACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGATACCTCGACGGAGATGACAG
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CTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCTTCATCCAGAACTG
ATAATTCTGAAGAAGAAGAAAAGACCTTGAGTTGCAGTCGTTGGCGAGAAAGAGAAGAGA
GATGGAAAGAGGTGGTAGAAGCTTTCAGAGATGGTACGTAAGAGAACGGAGAGATTAGCG
TTTGGCATTTGGGGATGGCATTGGAAGATGATCGAGAAGAAGATAAGGGAACTGCGAAGC
AGGAGGAGGAGGCTGCCATTATCCAACCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 
80 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 70 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ95TF C 1
AF RR4E283TF C 1
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AF RR4EN54JQ U 6
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AF RR4A391TF C 740
AF RR4A391JQD U 36
AF RR4AA96JQ U 38
AF RR4A391JQ U 36
AF RR4A391TFB C 216
AF RR4EN54TF C 362
AF RR4DA79TF C 233
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AF RR4AA96TF C 218
BS 1 13 RR4DZ95TF
BS 14 263 RR4EN54JQ
BS 264 264 RR4DA79JQ
BS 265 416 RR4EN54JQ
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GAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCAAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCT
GTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACTGGCT
AAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGAGGTTTCCGACATAAACCTT
GTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCT
CTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTAC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR4E283TF 511 0 0
GAGGAGA
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TTGAAGAGTAACAAGGAACTTCAAGAAAAAAAA*GAAACAGAGCGAAATAAAAAGGGGTT
ACCTGTTGAAGAAAATGTTTTCGCAGCAAAAGGGGAGCAGGTGGTTTTTAAGACTCGGTC
CTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCTGCGACCTTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAA
AGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCAAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTC
CCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGG
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CTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTT
CCTGGATTCATGTCAACAGAGTAC

QA 8 511 8 511
DS 

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AGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4EN54JQ 655 0 0
GGTTGACT
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AGTAACAAGGAACTTCAAGAAAAAAAAAGAAACAGAGCGAAATAAAAAGGGGTTACTTGT
TGAAGAAAATGTTTTCGCAGCAAAAGGGGAGCAGGTGGTTTTTAAGACTCGGTCCTCTCG
ATACCTTGTCTGACTATGATTCTGCGACCTTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCA
GCATCACGTTATTCAAGGTTCGCAAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTC
TTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTC
AAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGAGGTTTCCGACATAAAACTTGTACGGGCTTTCG
TACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGA
TTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAG
AGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACG
GCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGATACCTCGACGGAGATGACAG

QA 9 655 9 655
DS 

RD RR4D624JQ 648 0 0
C
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TGAAAAAAATGTTTTCGCAGCAAAAGGGGAGCAGGTGGTTTTTAAGACCCGGTCCTCTCG
ATACCTTGTCTGACTATGATTCTGCGACCTTCACATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCA
GCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCAAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTC
TTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTC
AAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGAGGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCG
TACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGA
TTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAG
AGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACG
GCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGATACCTCGACGGAGATGACAG

QA 2 648 2 648
DS 

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AAGGGGAGCAGGTGGTTTTTAAGACTCGGTCCTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCT
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AAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGT
GCTTACGACTGTACCAAACCGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCA
AGGGAGGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGT
TGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAAC
CC*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAG
AGTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTC
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TGTCATAGCTTCTTGGGATATTACAAACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCA
CCACTGGCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATC

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DS 

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AAGGGGAGCAGGGGGTTTTTAAGACTCGGTCCTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCT
GCGACCTTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGC
AAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGT
GCTTACGACTGTACCAAACCGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCA
AGGGAGGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGT
TGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAAC
CC*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAG
AGTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTC
GAGATACCTCGACGGAGATGACAGTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAA
TGTCATAGCTTCTTGGGATATTACAAACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCA
CCACTGGCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAAC

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DS 

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QA 1 112 1 112
DS 

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C
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AAGGGGAGCAGGGGGTTTTTAAGACTCGGTCCTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCT
GCGACCTTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGC
AAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGT
GCTTACGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCA
AGGGAGGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGT
TGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAAC
CC*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAG
AGTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTC
GAGATACCTCGACGGAGATGACAGTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAA
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CCACTGGCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTT
CTACTTTCGCTTCATCCAGAACTGATAATTCTGAAGAA

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DS 

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AGGGGAGCAGGGGGTTTTTAAGACTCGGTCCTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCTG
CGACCTTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCA
AAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTG
CTTACGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAG**AGCCAA
GGGAGGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTT
GAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACC
C*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGA
GTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCG
AGATACCTCGACGGAGATGACAGTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAAT
GTCATAGCTTCTTGGGATATTACAAACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCAC
CACTGGCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTTC
TACTTTCGCTTCATCCAGAACTGATA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4A391JQ 874 0 0
C
GGTAAAAGAAGATGTAGATGGAAAGTTACAATTGAAGAGTAACAAGGAACTTCAAGAAAA
AAAAAGAAACAGAGCGAAATAAAAAGGGGTTACTTGTTGAAGAAAATGTTTTCGCAGCAA
AAGGGGAGCAGGTGGTTTTTAAGACTCGGTCCTCTCGATACCTTGTCTGACTATGATTCT
GCGACCTTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGC
AAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGT
GCTTACGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCA
AGGGAGGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGT
TGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAAC
CC*GCATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAG
AGTTGATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTC
GAGATACCTCGACGGAGATGACAGTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAA
TGTCATAGCTTCTTGGGATATTACAAACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCA
CCACTGGCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTT
CTACTTTCGCTTCATCCAGAACTGATAATTCTGAAGAAGAAGAAAAGACCTTGAGTTGCA
GTCGTTGGCGAGAAAGAGAAGAGAGATGGAAAG

QA 2 874 2 874
DS 

RD RR4A391TFB 836 0 0
CTGCGA
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AAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTA
CGACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGA
GGTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGT
TCAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACCCCGC
ATCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTG
ATAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGAT
ACCTCGACGGAGATGACAGTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAATGTCA
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GGCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTTCTACT
TTCGCTTCATCCAGAACTGATAATTCTGAAGAAGAAGAAAAGACCTTGAGTTGCAGTCGT
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GATAAGGGAACTGCGAAGCAGGAGGAGGAGGCTGCCATTATCCAACCAAG

QA 7 836 7 836
DS 

RD RR4EN54TF 681 0 0
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TACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTCTC
TTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCATCTCCCGACCACCTACTTC
ATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGATAGAACTCATTGTGACATA
ACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGATACCTCGACGGAGATGACAGT
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AACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCACCACTGGCTCCGCTTCGGTTTCTTC
TCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCTTCATCCAGAACTGA
TAATTCTGAAGAAGAAGAAAAGACCTTGAGTTGCAGTCGTTGGCGAGAAAGAGAAGAGAG
ATGGAAAGAGGTGGTAGAAGCTTTCAGAGATGGTACGTAAGAGAACGGAGAGATTAGCGT
TTGGCATTTGGGGATGGCATTGGAAGATGATCGAGAAGAAGATAAGGGAACTGCGAAGCA
GGAGGAGGAGGCTGCCATT
CC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DA79TF 797 0 0
CTGTCCA
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T*TTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACTGGC
TAAAGTG*TCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGAGGTTTCCGACATAAACTT
TGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTC
TCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCATCTCCCGACCACCTACT
TCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGACAGAACTCATTGTGACA
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GTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGGGTAATGTCATAGCTTCTTGGGATATTA
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TCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCTTCATCCAGAACT
GATAATTCTGAAGAAGAAGAAAAGACCTTGAGTTGCAGTCGTTGGCGAGAAAGGGAAGAG
AGATGGAAAGAGGTGGTAGAAGCTTTCAGAGATGGTACGTAAGAGAACGGAGAGATTAGC
GTTTGGCATTTGGGGATGGCATTGGAAGATGATCGAGAAGAAGATAAGGGAACTGCGAAG
CAGGAGGAG
C

QA 8 796 8 796
DS 

RD RR4A337TF 822 0 0
TTCATATTCTGTCCA
TGAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCAAAGGAAAGAAAGGCAAAGACTC
TGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTACGACTGTACCAAACCGGC
TAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAGTGAGCCAAGGGAGGTTTCCGACATAAACCT
TGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTTCAAGGCTGATGTGTTTC
TCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCATCTCCCGACCACCTACT
TCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGATAGAACTCATTGTGACA
TAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGATACCTCGACGGAGATGACA
GTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAATGTCATAGCTTCTTGGGATATTA
CAAACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCACCACTGGCTCCGCTTCGGTTTCT
TCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTTTTCTTCTACTTTCGCTTCATCCAGAACT
GATAATTCTGAAGAAGAAGAAGAGACCTTGAGTTGTAGTCGTTGGCGAGAAAGAGAAGAG
AGATGGAAAGAGGTGGTAGAAGATTTCAGAGATGGTACGTAAGAGAACGGAGAGATTAGC
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CAGGAGGAGGAGGCTGCCATT
ATCCAA

QA 16 816 16 816
DS 

RD RR4AA96TF 834 0 0
GACCT
TTCATATTCTGTTCCATTGAGCGAAAGAGCAGCATCACGTTCTTCAAGGTTCGCAAAGGA
AAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTTCCCAGTCTTGCGGTCGTGCAACACTCTGGTGCTTAC
GACTGTACCAAACTGGCTAAAGTGGTCTCTCAAACCATCAGGCTGAG**AGCCAAGGGAG
GTTTCCGACATAAACCTTGTACGGGCTTTCGTACATGAGAATCTTCTTAGGTGTTGAGTT
CAAGGCTGATGTGTTTCTCTTAGTTCCTGGATTCATGTCAACAGAGTACCTAACCC*GCA
TCTCCCGACCACCTACTTCATTTCCATCAAGAGAAGCAATGGCGTTTTTGGCAGAGTTGA
TAGAACTCATTGTGACATAACCGCTTCCACGGCTCTCTCCAGTCTCTGGATTTCGAGATA
CCTCGACGGAGATGACAGTTCCAAAAGACTGAAACATGTCGAGAAGCTGAGTAATGTCAT
AGCTTCTTGGGATATTACAAACGTATAGCTCGCAAGGTCTCGGTTTCTTCGTCACCACTG
GCTCCGCTTCGGTTTCTTCTCCTGTCTCTCCATCAGCTTTAACTTCTTCTTCTTCTACTT
TCGCTTCATCCAGAACTGATAATTCTGAAGAAGAAGAAAAGACCTTGAGTTGCAGTCGTT
GGCGAGAAAGAGAAGAGAGATGGAAAGAGGTGGTAGAAGCTTTCAGAGATGGTACGTAAG
AGAACGGAGAGATTAGCGTTTGGCATTTGGGGATGGCATTGGAAGATGATCGAGAAGAAG
ATAAGGGAACTGCGAAGCAGGAGGAGGAGGCTGCCATTATCCAA
CCAAG

QA 6 829 6 829
DS 



AS 2 15

CO CL85Contig1 1008 9 6 U
CGGTCTCACTAAGCAGGATATTCTTTTCATTATAGAATACTTCAGTTCTATAATCGTTAA
AACGATTTGTACTTAAAATCTTTACATGTTGAACTTAAGCAATGACAAACACCCTAAGTT
CACCTCTATCCCCACGAGTTATGCGCATGTTCTCATCAACATAGGTGACTTCAAAATCTC
CAGTTCCAGGGTTTGACGGTGGCCTGAAACTATCAGGAAGCCTCGGGATCTCAAAGGGAG
GGATCTGCGCTAAGTTTCC*AGACGTCTTCACAGTTGTTTTCTCAAATGTGATCTTGATC
TTGCAAGTACCTAAGAGTTCAAACTTGTGTGCCAGTGTGGCAGTGGCTTCCAGAGGCGGA
AACGGCCATGGAGCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGTTATCGAAATCTTTACTAAACACA
TCGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAATCAAGCGACCAGTGGGTAAACCA
GGACGGCTACCACCAAGAGAGCGAGAAGAGAAGGCGCTACTATACAAGAGCCTCCACTTC
CCTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCGGTAAGATCCACGGGTCCACCAGCCGATTCAAGT
TGTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTACACTCGCCACCAGTCCTCTGTTC
AATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCGGTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCC
GATCCTGATGTCTCCGGTTCGCGAAAGGACACCTCTCCCACCGTTGATTTCACCACCAGG
CTTCTCCTCCTCTCAGGTGTAGTTGTGAAGCTCAAACGAGACGATCTTGGAGTAGCGATG
AGCACCGGAGAGGAAGAGATGGAACAGCATGGTGGCTGAGAGCGGTTGTTGTTGGAGAGA
AGTGCCGGTGAGAAGAAGGTAGAAGAAGAAGCCGCCATGGGAGAAGAGAAAGGAAGAAAA
GTTTTAGAGATGTTTCTAGAGGAGAAGAAGCATCTTCTTATTATACCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4AH29JQ U 32
AF RR4GA08JQ U 52
AF RR4GA86JQ U 12
AF RR4GM34JQ U 2
AF RR4AX33JQ U 1
AF RR4AH29TF C 208
AF RR4AX33TF C 239
AF RR4GA86TF C 276
AF RR4GM34TF C 276
BS 1 648 RR4AX33JQ
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BS 972 1004 RR4GA86TF
BS 1005 1008 RR4GM34TF

RD RR4AH29JQ 134 0 0
AAAA
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TAAGCAATGACAAACACCCTAAGTTCACCTCTATCCCCCCGAGTTATGCGCATGTTCTCA
TCAACATAGG

QA 5 134 5 134
DS 

RD RR4GA08JQ 453 0 0
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CAAAATCTCCAGTTCCAGGGTTTGACGGGGGCCTGAAACTATCAGGAAGCCTCGGGATCT
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AAAGGCGGAAACGGCCATGGAGCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGTTATCGAAATCTTTA
CTAAACACATCGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAAAGTGACAGGAATCAAGCGACCAGTG
GGTAAACCAGGACGGCTACCACCAAGAGAGCGA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4GA86JQ 717 0 0
G
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TTAAAATCTTTACATGTTGAACTTAAGCAATGACAAACACCCTAAGTTCACCTCTATCCC
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AGTTTCC*AGACGTCTTCACAGTTGTTTTCTCAAATGTGATCTTGATCTTGCAAGTACCT
AAGAGTTCAAACTTGTGTGCCAGTGTGGCAGTGGCTTCCAGAGGCGGAAACGGCCATGGA
GCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGTTATCGAAATCTTTACTAAACACATCGATCCTTTGA
AAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAATCAAGCGACCAGTGGGTAAACCAGGACGGCTACCA
CCAAGAGAGCGAGAAGAGAAGGCGCTACTATACAAGAGCCTCCACTTCCCTTGTAGCTTA
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GTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTACACTCGCCACCAGTCCTCTGTTCAATCCCGAAACC
ACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCGGTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCCGATCCTGA

QA 2 717 2 717
DS 

RD RR4GM34JQ 725 0 0
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ACCTCTATCCCCCCGAGTTATGCGCATGTTCTCATCAACATAGGTGACTTCAAAATCTCC
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ACGGCCATGGAGCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGTTATCGAAATCTTTACTAAACACAT
CGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAATCAAGCGACCAGTGGGTAAACCAG
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CTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCGGTAAGATCCACGGGTCCACCAGCCGATTCAAGTT
GTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTACACTCGCCACCAGTCCTCTGTTCA
ATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCGGTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCCG
ATCCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4AX33JQ 846 0 0
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AACGATTTGTACTTAAAATCTTTACATGTTGAACTTAAGCAATGACAAACACCCTAAGTT
CACCTCTATCCCCACGAGTTATGCGCATGTTCTCATCAACATAGGTGACTTCAAAATCTC
CAGTTCCAGGGTTTGACGGTGGCCTGAAACTATCAGGAAGCCTCGGGATCTCAAAGGGAG
GGATCTGCGCTAAGTTTCC*AGACGTCTTCACAGTTGTTTTCTCAAATGTGATCTTGATC
TTGCAAGTACCTAAGAGTTCAAACTTGTGTGCCAGTGTGGCAGTGGCTTCCAGAGGCGGA
AACGGCCATGGAGCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGTTATCGAAATCTTTACTAAACACA
TCGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAATCAAGCGACCAGTGGGTAAACCA
GGACGGCTACCACCAAGAGAGCGAGAAGAGAAGGCGCTACTATACAAGAGCCTCCACTTC
CCTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCGGTAAGATCCACGGGTCCACCAGCCGATTCAAGT
TGTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTACACTCGCCACCTGTCCTCTGTTC
AATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCGGTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCC
GATCCTGATGTCTCCGGTTCGCGAAAGGACACCTCTCCCACCGTTGATTTCACCACCAGG
CTTCTCCTCCTCTCAGGTGTAGTTGTGAAGCTCAAACGAGACGATCTTGGAGTAGCGATG
AGCACC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4AH29TF 766 0 0
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TTCACAGTTGTTTTCTCAAATGTGATCTTGATCTTGCAAGTACCTAAGAGTTCAAACTTG
TGTGCCAGTGTGGCAGTGGCTTCCAGAGGCGGAAACGGACATGGAGCTCCTATCTCCACT
TCCGCTATGTTATCGAAATCTTTACTAAACACATCGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGA
GTGACAGGAATCAAGCGACCAGTGGGTAAACCAGGACGGCTACCACCAAGAGAGCGAGAA
GAGAAGGCGCTACTATACAAGAGCCTCCACTTCCCTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCG
GTAAGATCCACGGGTCCACCAGCCGATTCAAGTTGTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCT
AGATCATCTACACTCGCCACCAGTCCTCTGTTCAATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTG
AGTTTCAGCGGTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCCGATCCTGATGTCTCCGGTTCGCGAAAG
GACACCTCTCCCACCGTTGATTTCACCACCAGGCTTCTCCTCCTCTCAGGTGTAGTTGTG
AAGCTCAAACGAGACGATCTTGGAGTAGCGATGAGCACCGGAGAGGAAGAGATGGAACAG
CATGGTGGCTGAGAGCGGTTGTTGTTGGAGAGAAGTGCCGGTGAGAAGAAGGTAGAAGAA
GAAGCCGCCATGGGAGAAGAGAAAGGAAGAAAAGTTTTAGAGAT
CC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4AX33TF 735 0 0
AGA
GATCTGCGCTAAGTTTCCCAGACGTCTTCACAGTTGTTTTCTCAAATGTGATCTTGATCT
TGCAAGTACCTAAGAGTTCAAACTTGTGTGCCAGTGTGGCAGTGGCTTCCAGAGGCGGAA
ACGGCCATGGAGCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGTTATCGAAATCTTTACTAAACACAT
CGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAATCAAGCGACCAGTGGGTAAACCAG
GACGGCTACCACCAAGAGAGCGAGAAGAGAAGGCGCTACTATACAAGAGCCTCCACTTCC
CTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCGGTAAGATCCACGGGTCCACCAGCCGATTCAAGTT
GTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTACACTCGCCACCTGTCCTCTGTTCA
ATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCGGTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCCG
ATCCTGATGTCTCCGGTTCGCGAAAGGACACCTCTCCCACCGTTGATTTCACCACCAGGC
TTCTCCTCCTCTCAGGTGTAGTTGTGAAGCTCAAACGAGACGATCTTGGAGTAGCGATGA
GCACCGGAGAGGAAGAGATGGAACAGCATGGTGGCTGAGAGCGGTTGTTGTTGGAGAGAA
GTGCCGGTGAGAAGAAGGTAGAAGAAGAAGCCGCCATGGGAGAAGAGAAAGGAAGAAAAG
TTTTAGAGAT
CC

QA 4 733 4 733
DS 

RD RR4GA86TF 731 0 0
TT
TTTTCTCAAATGTGATCTTGATCT*GCAAGTAC*TAAGAGTTCAAACTTGTGTGCCAGTG
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TATCGAAATCTTTACTAAACACATCGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAA
TCAAGCGACCAGTGGGTAAACCAGGACGGCTACCACCAAGAGAGCGAGAAGAGAAGGCGC
TACTATACAAGAGCCTCCACTTCCCTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCGGTAAGATCCA
CGGGTCCACCAGCCGATTCAAGTTGTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTA
CACTCGCCACCAGTCCTCTGTTCAATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCG
GTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCCGATCCTGATGTCTCCGGTTCGCGAAAGGACACCTCTC
CCACCGTTGATTTCACCACCAGGCTTCTCCTCCTCTCAGGTGTAGTTGTGAAGCTCAAAC
GAGACGATCTTGGAGTAGCGATGAGCACCGGAGAGGAAGAGATGGAACAGCATGGTGGCT
GAGAGCGGTTGTTGTTGGAGAGAAGTGCCGGTGAGAAGAAGGTAGAAGAAGAAGCCGCCA
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TTATTAT
CC

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR4GM34TF 733 0 0
TT
TTTTCTCAAATGTGATCTTGATCTTGCAAGTAC*TAAGAGTTCAAACTTGTGTGCCAGTG
CGGCAGTGGCTTCCAGAGGCGGAAACGGCCATGGAGCTCCTATCTCCACTTCCGCTATGT
TATCGAAATCTTTACTAAACACATCGATCCTTTGAAAAACCTGGCCAAGAGTGACAGGAA
TCAAGCGACCAGTGGGTAAACCAGGACGGCTACCACCAAGAGAGCGAGAAGAGAAGGCGC
TACTATACAAGAGCCTCCACTTCCCTTGTAGCTTATCAAGACCCACCTCGGTAAGATCCA
CGGGTCCACCAGCCGATTCAAGTTGTTTAGCAGCAGTCTCAGCTCTTTCTAGATCATCTA
CACTCGCCACCAGTCCTCTGTTCAATCCCGAAACCACACTCAGTAACTTGAGTTTCAGCG
GTTCGATTCCCTCGTTGTCTCCCGATCCTGATGTCTCCGGTTCGCGAAAGGACACCTCTC
CCACCGTTGATTTCACCACCAGGCTTCTCCTCCTCTCAGGTGTAGCTGTGAAGCTCAAAC
GAGACGATCTTGGAGTAGCGATGAGCACCGGAGAGGAAGAGATGGAACAGCATGGCGGCT
GAGAGCGGTTGTTGTTGGAGAGAAGTGCCGGTGAGAAGAAGGTAGAAGAAGAAGCCGCCA
TGGGAGAAGAGAAAGGAAGAAAAGTTTTAGAGATGTTTCTAGAGGAGAAGAAGCATCTTC
TTATTATACCC

QA 3 733 3 733
DS 



CO CL85Contig2 991 6 11 U
GGGAAACATCTCCAAAACTTCTCTTGTCCCATGGCGGCGGCTTCTTCTACCTTCTTGTTC
TCACCGGCGCTTCTCTCCAACAACCGCTCTCAGCCACCATGCTGTTCCATCTCTTCCTCC
CCGGTGCTCATCGCTACTCCAAGATCGTCTCGTTTGAGCTTGACAAAACCTGAGAGGAGG
AGAAGCCTGGTGGTGAAATCAACGGTGGGAGAGGTCTCATTTCGCGAACCGGAGACATCA
GGATCGGGAGACAAGGAGGGAATCGAATCGCTGAAACTCAAGTTACTAAGTGTGGTTTCG
GGGTTGAACAGAGGACTCGTGGCGAGTGTGGATGATCTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCT
AAACAGCTTGAACCGGCTGGTGGACCCGTGGATCTTACGGAGGTGGGTCTTGATAAGCTC
CAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTATAGCAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTAGGTGGTAGC
CGTCCTGGTTTACCCACTGGTCGTTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGG
ATTGATGTGTTTAGCAAAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCTTGG
CCGCTTCCGCCTCTGGAAGCCACTGCCACATTGGCACACAAATTTGAACTCTTAGGTACT
TGCAAGATCAAGATCACATTTGAGAAAACAACTGTGAAGACGTCTGGAAACTTAGCGCAG
ATTCCTCCCTTTGACATCCCTAGGCTTCCTGATAGTTTCAGGCCACCTTCAAACCCCGGT
ACTGGAGATTTTGAAGTCACCTATGTTGATGAGAACATGCGCATAACTCGTGGGGACAGG
GGTGAACTTAGGGTGTTTGTCATTGCTTAAGTTCAACATGTAAAGATTTAAGTACTCTAC
TTGTGAGTTTTGCACAAATCGTTTTAACGATTATAGAACTAAAGTATTTTATAATGAAAA
GAATATCCTGCTAGTGAGACAAACTTATTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK34TF U 1
AF RR4EJ35JQ C 654
AF RR4EN81TF U 264
AF RR4EN81JQ C 375
AF RR4EJ35TF U 333
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BS 973 991 RR4EJ35TF

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AGAAGCCTGGTGGTGAAATCAACGGTGGGAGAGGTCTCATTTCGCGAACCGGAGACATCA
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GGGTTGAACAGAGGACTCGTGGCGAGTGTGGATGATTTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCT
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CCGCTTCCGCCTCTGGAAGCCACTGCCACATTGGCACACAAATTTGAACTCCTAGGTACT
TGCAAG

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GGACAGGGGTGAACTTAGGGTGTTTGTCATTGCTTAAGTTCAACATGTAAAGATTTAAGT
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GCTCTTGTATAGCAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTAGGTGGTAGCCGTCCTAGTTTACC
CACTGGTCGTTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATTGATGTGTTTAG
CATAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCTTGGCCGCTTCCGCCTCT
GGAAGCCACTGCCACATTGGCACACAAATTTGAACTCTTAGGTACTTGCAAGATCAAGAT
CACATTTGAGAAAACAACTGTGAAGACGTCTGGAAACTTAGCGCAGATTCCTCCCTTTGA
CATCCCTAGGCTTCCTGATAGTTTCAGGCCACCTTCAAACCCCGGTACTGGAGATTTTGA
AGTCACCTATTTTGATGAGAACATGCGCATAACTCGTGGGGACAGGGGTGAACTTAGGGT
GTTTGTCATTGCTTAAGTTCAACATGTAAAGATTTAAGTACTCTACTTGTGAGTTTTGCA
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TAGTGAGACC

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DS 

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G
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CTTACGGAGGTGGGTCTTGATAAGCTCCAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTATAGCAGCGCC
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GTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATTGATGTGTTTAGCAAAGATTTCGATAACATA
GCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCTTGGCCGCTTCCACCTCTGGAAGCCACTGCCACATTG
GCACACAAATTTGAACTCTTAGGTACTTGCAAGATCAAGATCACATTTGAGAAAACAACT
GTGAAGACGTCTGGAAACTTAGCGCAGATTCCTCCCTTTGACATCCCTAGGCTTCCTGAT
AGTTTCAGGCCACCTTCAAACCCCGGTACTGGAGATTTTGAAGTCACCTATGTTGATGAG
AACATGCGCATAACTCGTGGGGACAGGGGTGAACTTAGGGTGTTTGTCATTGCTTAAGTT
CAACATGTAAAGATTTAAGTACTCTACTTGTGAGTTTTGCACAAATCGTTTTAACGATTA
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CAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTATAGCAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTATGTGGTAGC
CGTCCTGGTTTACCCACTGGTCGTTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGG
ATTGATGTGTTTAGCAAAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCTTGG
CCGCTTCCGCCTCTGGAAGCCACTGCCACATTGGCACACAAATTTGAACTCCTAGGTACT
TGCAAGATCAAGATCACATTTGAGAAAACAACTGTGAAGACGTCTGGAAACTTAGCGCAG
ATTCCTCCCTTTGACATCCCTAGGCTTCCTGATAGTTTCAGGCCACCTTCAAACCCCGGT
ACTGGAGATTTTGAAGTCACCTATGTTGATGAGAACATGCGCATAACTCGTGGGGACAGG
GGTGAACTTAGGGTGTTTGTCATTGCTTAAGTTCAACATGTAAAGATTTAAGTACTCTAC
TTGTGAGTTTTGCACAAATCGTTTTAACGATTATAGAACTAAAGTATTTTATAATGAAAA
GAATATCCTGCT
TAGTGAGACC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 2 16

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CTTCATTGTTGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCGCTGAAGAAAAATGTTGGCTATATTTC
ACGAGGCCTTTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCA
AACAGCCCAAACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACA
CTTTCTCCATGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCT
TCTCCGTCCACCAGAGGTTGTTTTGTGGGTTTGATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGA
GCTTGAACAATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGG
CCATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATC
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ATGGATCTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTT
TTGCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAAGGAGGGCTAATGAGCTTTGAGC
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TTTTTTCCGCACTTTCATGTTCCGTTCTTGTTCTTGTCCACTTTTCTTTTTATGGAAGAA
GCCCTGAATAAAACTGTGAATAGCTTTGGAGGTTCTATATAAAAATAAACTTGTTCTGTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 

AF RR4C120TF U 6
AF RR4C235TF U 6
AF RR4EF27TF U 1
AF RR4FZ52TF U 23
AF RR4AQ54TF U 8
AF RR4DS91TF U 8
AF RR4AX48TF U 23
AF RR4DS91JQ C 303
AF RR4AQ54JQ C 213
AF RR4C120JQ C 304
AF RR4EF27JQ C 395
AF RR4C235JQ C 233
BS 1 136 RR4EF27TF
BS 137 137 RR4C120TF
BS 138 143 RR4EF27TF
BS 144 147 RR4C120TF
BS 148 694 RR4EF27TF
BS 695 730 RR4AQ54TF
BS 731 740 RR4DS91TF
BS 741 741 RR4AX48TF
BS 742 756 RR4DS91TF
BS 757 761 RR4AX48TF
BS 762 1021 RR4AQ54JQ

RD RR4C120TF 275 0 0
GG
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GTTGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCGCTGAAGAAAAATGTTGGCTATATTTCACGAGGC
CTTTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCAAACAGCC
CAAACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTC
CATGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTG
TTAT

QA 3 271 3 271
DS 

RD RR4C235TF 282 0 0
GG
CTGCATTCTCCCTTCCCAAGATTCTTATCTTATTATAGAGATACAAAACTCTTCTTCATT
GTTGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCGCTGAAGAAAAATGTTGGCTATATTTCACGAGGC
CTTTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCAAACAGCC
CAAACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTC
CATGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGT

QA 3 282 3 282
DS 

RD RR4EF27TF 694 0 0
GGGTCTTCTGCATTCTTCCTTCCCAAGATTCTTATCTTATTATAGAGATACAAAACTCTT
CTTCATTGTTGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCGCTGAAGAAAAATGTTGGCTATATTTC
ACGAGGCCTTTGCTCATCCGCCG****AACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCA
AACAGCCCAAACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACA
CTTTCTCCATGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCT
TCTCCGTCCACCAGAGGTTGTTTTGTGGGTTTGATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGA
GCTTGAACAATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGG
CCATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATC
AGGTTGTCAAGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTCGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTT
CTGTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTG
ATGGATCTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTT
TTGCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAG

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DS 

RD RR4FZ52TF 672 0 0
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GGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCACACAGCCCAAACTTCCTGAAGA
AACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTCCATGTCTTTCGGAAA
AGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCTTCTCCGTCCACCAGAGGTTGTT
TTGTGGGTTTGATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGCTTAAACAATCTGTGTCAGCT
AAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCCATGTTTGTGATTGAAGCTTA
TAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCGGCTGATCAGGTTGTCAAGGATCTAGACGG
TAGCTTTGCCTTTGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTGTCTTCACGGCTCTGGGATC
TGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGACGGATCTGTTGTGATATCAGA
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TATGTTC
ACAGT

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DS 

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GG
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TGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCGCTGAAGAAAAATGTTGGCTATATTTCACGAGGCCT
TTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCAAACAGCCCA
AACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTCCA
TGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCTTCTCCGTCC
ACCAGAGGTTGTTTTGTGGGTTTGATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGCTTGAACA
ATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCCATGTTTG
TGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAACTGATCAGGTTGTCA
AGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTCGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTGTCTTCA
CGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGATGGATCTG
CTGTGATCTCAGATGATTTGGACGTTATCAAAGGGGGTTGCGCTAAATCTTTTGCTCCGT
TTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAAGGAGGGCTAATGAGCTTTGAGCATCCGATGA
A

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DS 

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GG
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TGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCGCTGAAGAAAAATGTTGGCTATATTTCACGAGGCCT
TTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCAAACAGCCCA
AACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTCCA
TGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCTTCTCCGTCC
ACCAGAGGTTGTTTTGTGGGTTTGATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGCTTGAACA
ATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCCATGTTTG
TGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATCAGGTTGTCA
AGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTCGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGTTTCTGTCTTCA
CGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGATGGATCTG
TTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTTTTGCTCCGT
TTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAACGAGGGCTAATGAGCTTTGAGCATCCGATGA
ACAAGATAAAG*CGATGCCGAGAGTGG

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DS 

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GGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCAGAGAAATGCTCCACACAGCCCAAACTTCCTGAAGA
AACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTCCATGTCTTTCGGAAA
AGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCTTCTCCGTCCACCAGAGGTTGTT
TTGTGGGTTTGATGACACCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGCTTAAACAATCTGTGTCAGCT
AAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCCATGTTTGTGATTGAAGCTTA
TAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCGGCTGATCAGGTTGTCAAGGATCTAGACGG
TAGCTTTGCCTTTGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTGTCTTCACGGCTCTGGGATC
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TGATTTGGATGTCATCAAAGAGGGTTGTGCTAAATCTTTTGCTCCGTTTCCTACTGGATG
TATGTTCCACAGTGAAGGAGGGTTAATGAGCTTTGAGCATCCGATGAACAAGATAAAGGC
GATGCCGAGAGTGGACAGT

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DS 

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TTGAACAATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCC
ATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATCAG
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GTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGAT
GGATCTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTTTT
GCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAAGGAGGGCTAATGAGCTTTGAGCAT
CCGATGAACAAGATAAAGGCGATGCCGAGAGTGGACAGTGAAGGAGTCCTATGTGGTGCT
AACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTTAACAGTATCCCTCGTCGTGGAAGTGAAGCC
AATTGGTCTCTCTGAACAATTGCATTCTCGCGACTTCCTAATGATGATACTTTCTTCCTT
TTTTCCGCACTTTCATGTTCCGTTCTTGTTCTTGTCCACTTTTCTTTTTATGGAAGAAGC
CCTGAATAAAACTGTGAATAGCTTTGGAGGTTCTATATAAAAATAAACTTGTTCTGT
GC

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DS 

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GATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGCTTGAACAATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAA
TATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCCATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTT
AGAGACAGAGGTCCTTATCCAACTGATCAGGTTGTCAAGGATTTAGACGGTAGCTTTGCC
TTCGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTGTCTCCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGA
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GTTATCAAAGGGGGTTGCGCTAAATCTTTTGCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCAC
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GTGGACAGTGAAGGAGTCCTATGTGGTGCTAACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTT
AACAGTATCCCTCGTCGTGGAAGTGAAGCCAATTGGTCTCTCTGAACAATTGCATTCTCG
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DS 

RD RR4C120JQ 718 0 0
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TGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATCAGG
TTGTCAAGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTCGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTG
TCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGAGGAATAGCTGCTGATG
GATTTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTTTTG
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ACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTTAACAGTATCCCTCGTCGTGGAAGTGAAGCCA
ATTGGTCTCTCTGAACAATTGCATTCTCGCGACTTCCTAATGATGATACTTTCTTTCTTT
TTTCCGCACTTTCATGTTCCGTTCTTGTTCTTGTCCACTTTTCTTTTTATGGAAGAAGCC
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QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EF27JQ 627 0 0
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CGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTGTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGT
GAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGATGGATCTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGT
TATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTTTTGCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAG
TGAAGGAGGGCTAATGAGCTTTGAGCATCCGATGAACAAGATAAAGGCGATGCCGAGAGT
GGACAGTGAAGGAGTCCTATGTGGTGCTAACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTTAA
CAGTATCCCTCGTCGTGGAAGTGAAGCCAATTGGTCTCTCTGAACAATTGCATTCTCGCG
ACTTCCTAATGATGATACTTTCTTTCTTTTTTCCGCACTTTCATGTTCCGTTCTTGTTCT
TGTCCACTTTTCTTTTTATGGAAGAAGCCCTGAATAAAACTGTGAATAGCTTTGGAGGTT
CTATATAAAAATAAACTTGTTCTGTTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4C235JQ 789 0 0
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CTTTGGGAGCTTGAACAATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAAC
AAACGAGGCCATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCC
AGCTGATCAGGTTGTCAAGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTCGTTGTTTATGATAGCAA
AGCTGGTTCTGTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGAGGAAT
AGCTGCTGATGGATTTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGC
TAAATCTTTTGCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAAGGAGGGCTAATGAG
CTTTGAGCATCCGATGAACAAGATAAAGGCGATGCCGAGAGTGGACAGTGAAGGAGTCCT
ATGTGGTGCTAACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTTAACAGTATCCCTCGTCGTGG
AAGTGAAGCCAATTGGTCTCTCTGAACAATTGCATTCTCGCGACTTCCTAATGATGATAC
TTTCTTTCTTTTTTCCGCACTTTCATGTTCCGTTCTTGTTCTTGTCCACTTTTCTTTTTA
TGGAAGAAGCCCTGAATAAAACTGTGAATAGCTTTGGAGGTTCTATATAAAAATAAACTT
GTTCTGTTT

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL86Contig2 1068 4 9 U
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GACCAGTTGGCTTCACTTCCACGACGAGGGATACTGTTAACACGCGTGTACACATCCACC
TTGAAGTTAGCACCACATAGGACTCCTTCACTGTCCACTCTCGGCATCGCCTTTATCTTG
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AACGGAGCAAAAGATTTAGCACAACCCTCTTTGATGACATCCAAATCATCTGATATCACA
ACAGATCCGTCAGCAGCTATTCCC*AAAACAGCTTCACTCCTCCATCAGATCCCAGAGCC
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TTGACAACCTGATCAGCCGGATAAGGACCTCTGTCTCTAAGAGTCCTATAAGCTTCAATC
ACAAACATGGCCTCGTTTGTTGTCTTGGTGAGACCATATTGCTTGTTTAGCTGACACAGA
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TGGACGGAGAAGGAAGTAGAAGGACGAACATAAGCAAGAACAGCTGCTTTTCCGAAAGAC
ATGGAGAAAGTGTTTTGAGGGTAACGAGATAAGAAGTCGTTTAAGGTTTCTTCAGGAAGT
TTGGGCTGTGTGGAGCATTTCTCAGACGCTGGACTGTTAAGTTCCTCCGGCGGATGAGCA
AAGGCCTCGTGAAATATAGCCAACATTTTTCTCCAGCGAGAGAGAGAGGAGAACACAACA
ATGAAGAAGAGTTTTCTCTCTCTATATAAGATAAGAATCTTGGAAAGGAAGAATGCAGAA
GCAAGAGTGATGATGTTTTGAGCTTTATATTATTAACTCAAAGCGGTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC34JQ U 13
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AF RR4AX48JQ U 3
AF RR4GC34TF C 391
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BS 695 749 RR4AX48JQ
BS 750 1068 RR4GC34TF

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AGAAAGGAAGTATCATTAGGAAGTTGCGAAAATGCAATTATTCAGAGAGACCAGTTGGCT
TCACTTCCACGACGAGGGATACTGTTAACACGCGCGTACACATCCACCTTGAAGTTAGCA
CCACGTAGGACTCCTTCACTGTCCACTCTCGGCATCGCCTTTATCTTGTTCATCGGATGC
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T

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DS 

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TGGCTTATTCCATAACAAAAGTGAAGAAGAACAAGAACGGAAGAGAGGAAGAACATGAAA
ACGCGAAAAAGAAGAAAGGAAGTATCATTAGGAAGTTGCGAAA*TGCAATTATTCAGAGA
GACCAGTTGGCTTCACTTCCACGACGAGGGATACTGTTAACACGCGTGTACACATCCACC
TTGAAGTTAGCACCACATAGGACTCCTTCACTGTCCACTCTCGGCATCGCCTTTATCTTG
TTCATCGGATGCTCAAAGCTCATTAACCCTCCTTCACTGTG*AACATACATCCAGTAGGA
AACGGAGCAAAAGATTTAGCACAACCCTCTTTGATGACATCCAAATCATCTGATATCACA
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DS 

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GCGAAAAAGAAGAAAGGAAGTATCATTAGGAAGTTGCGAAAATGCAATTATTCAGAGAGA
CCAGTTGGCTTCACTTCCACGACGAGGGATACTGTTAACACGCGTGTACACATCCACCTT
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CATCGGATGCTCAAAGCTCATTAACCCTCCTTCACTGTGGAACATACATCCAGTAGGAAA
CGGAGCAAAAGATTTAGCACAACCCTCTTTGATGACATCCAAATCATCTGATATCACAAC
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GACAACCTGATCAGCCGGATAAGGACCTCTGTCTCTAAGAGTCCTATAAGCTTCAATCAC
AAACATGGCCTCGTTTGTTGTCTTGGTGAGACCATATTGCTTGTTTAGCTGACACAGATT
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GACGGAGAAGGAAGTAGAAGGACGAAC

QA 1 747 1 747
DS 

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AGCTTCACTCCTCCATCAGATCCCAGAGCCGTGAAGACAGAACCAGCTTTGCTATCATAA
ACAACAAAGGCAAAGCTACCGTCTAGATCCTTGACAACCTGATCAGCCGGATAAGGACCT
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ATGTCATCAAACCCACAAAACAACCTCTGGTGGACGGAGAAGGAAGTAGAAGGACGAACA
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AAGAAGTCGTTTAAGGTTTCTTCAGGAAGTTTGGGCTGTGTGGAGCATTTCTCAGACGCT
GGACTGTTAAGTTCCTCCGGCGGATGAGCAAAGGCCTCGTGAAATATAGCCAACATTTTT
CTCCAGCGAGAGAGAGAGGAGAACACAACAATGAAGAAGAGTTTTCTCTCTCTATATAAG
ATAAGAATCTTGGAAAGGAAGAATGCAGAAGCAAGAGTGATGATGTTTTGAGCTTTATAT
TATTAACTCAAAGCGGTC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 15

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AAATCTTATTTCAAAAGTTATCATTATTCGTGTATAGAGAATCATAGGAAGTGCAAATTC
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CAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGG
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ATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGAAGAAGAGAGCCT
TCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAAG
TGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAG
CCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAG
TAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATT
GACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG*TGTTTTTGTCAACAGTTT
GAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATA
TCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGG
TCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTAATGATCTCTATTAGGATCCTGTAGATTAT
ACAAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAAGACGCAAACACACAACG*ATTAAAGATAGAAA
GCTATCGAATTTTCAAGAGAAGGGATCCAGTGCCTTAATATATGGGAAGATCGTGAGCTG
TTCTTTCTTATTATGTCATTATCTTCTTACTCGTTTACGTCATCTAAAGATAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 5 30 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 20 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
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80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 10 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 60 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
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75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GF69JQ 780 0 0
C
CTAATCAAGAGTGTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAAAGTTATCATTAT
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GAGATGAAATATGAATATAAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCT
GCTTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGA
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CAGACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATT
GGATTTCTGAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACC***GAGTTC
CTTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGT
TGTACAGACAGATGATCTAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCG
TTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACGATTTGATCAAGAAACAAGAA
GGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTT
AGACACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTT
TCTAGCCAAGCTGG*TGTCTTTATCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTC

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4GA48JQ 756 0 0
C
CTAATCAAGAGTGTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAAAGTTATCATTAT
TCGTGTATAGAGAATCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGGAGGGAGAAACAGAGGCTTCTGA
GAGATGAAATATGAATATAAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCT
GCTTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGA
GGTGGTAAAACCGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAG
CAGACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATT
GGATTTCTGAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACC***GAGTTC
CTTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGT
TGTACAGACAGATGATCTAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCG
TTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACGATTTGATCAAGAAACAAGAA
GGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTT
AGACACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTT
TCTAGCCAAGCTGG*TGTCTTTATCAACAGTTTGA

QA 2 756 2 756
DS 

RD RR4C960JQ 741 0 0
TGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCGTGTATAGAGA
ATCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATG
AATATGAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTC
TTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACCG
AGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCT
ACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAGC
TTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTC
TTGATAGAAGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGAT
GACCCAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTG
TATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGC
GCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTG
ATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTG
G*TGTTTTTGTCAACAGTTTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4CX85JQ 852 0 0
AA
CAACACAAACTTTTCTAATCAAGAATGTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCA
AAAGTTATCATTATTCGTGTATAGAGAATCATAGGAAGTGCAGATTCTTTGAAGGGAGAA
ACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATGAATATAAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGA
ACCATCTTCTTCCCGCTTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAA
CAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACCGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTT
GGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCT
AGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCA
CCACC***GAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCA
ATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGATCCAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCA
AGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACGATTTGA
TCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTTCCGAGTAAGACAAGAGGA
AGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAA
AGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG*TGTTTTTATCAACAGTTTGAGCAGTACCAGG
CTGCCCACAGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGC
CTCAGCTTTG

QA 3 852 3 852
DS 

RD RR4BC07JQ 824 0 0
ATCAAGAATGTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCG
TGTATAGAGAATCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAG
ATGAAATATGAATATGAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCT
TCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGT
GGTAAAACTGAAAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAG
ACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGA
TTTCTGAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTT
CTCCATCTTCTTGATAGAAGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGT
ACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTC
TTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGT
AGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGG
CACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCT
AGCCAAGCTGG*TGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGA
ACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4H141JQ 818 0 0
GAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCGTGTATAGAGAA
TCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATGA
ATATGAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTCT
TGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACCGA
GAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGGCCAATGGCTA
CAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATATCTGAAGCT
TAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCT
TGATAGAAGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATG
ACCCAGGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGT
ATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCG
CATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGA
TTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG
*TGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCA
TATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4A027JQD 888 0 0
GTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCGTGTATAGAG
AATCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATAT
GAATATGAAACAATTATTCTGCAAGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGT
CTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACC
GAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGC
TACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAG
CTTAGCACGATTCACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTT
CTTGATAGAAGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGA
TGACCCAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTT
GTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAG
CGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCT
GATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCT
GG*TGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAAC
CATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGAACTA
TAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTC

QA 1 888 1 888
DS 

RD RR4A027JQ 731 0 0
GGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGGGGTAAAACCGAGAGCGCCA
GTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACAATG
TCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAGCTTAGCACGA
TTCACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGAA
GAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGC
CAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCG
GATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTG
GACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCG
TGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGGGTGTTTTT
GTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTAT
AGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGAACTATAAGAGCTAG
CTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTAATGATCTCTATTAG*ATC
CTGTAGAT
ATA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4A027TFB 767 0 0
GGACGTGCAGG*AGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACCGAGAGCGCCA
GTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACAATG
TCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAGCTTAGCACGA
TTCACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGAA
GAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGC
CAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCG
GATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTG
GACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCG
TGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG*TGTTTTT
GTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTAT
AGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGAACTATAAGAGCTAG
CTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTAATGATCTCTATTAGGATC
CTGTAGATTATACAAAATGAGATCGATTCGGGTTTCCAAGACGCAAA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4FF50TF 748 0 0
TGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAA*CCGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACA
GTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACC
AAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGC
TTTTCACCACC***GAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGAGCCTTCCAAGC
TCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGATCCAAGCCAGCAGAAAAGTGATATA
CGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACG
ATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACA
AGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAAC
TTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG*TGTTTTTATCAACAGTTTGAGCAGT
ACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATC
TCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAATACAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATC
TAACGTTGTCATCTTCTCTC*TTAATGATCTCTATTAGGATCCTGTAGATTATACAAAAT
GAGATCGATTCAGGTTTCCAAGACGCAA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4BC07TF 819 0 0
TTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGG
TGGTAAAACTGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCA
GACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGG
ATTTCTGAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCT
TCTCCATCTTCTTGATAGAAGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTG
TACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTT
CTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGG
TAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAG
GCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTC
TAGCCAAGCTGG*TGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAG
AACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAG
TACAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCT
TAATGATCTCTATTAGGATCCTGTAGATTATACAAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAAG
ACGCAAACACACAACG*ATTAAAGATAGAAAGCTATC
CG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4H141TF 752 0 0
AACCGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGGCCAA
TGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATATCT
GAAGCTTAGCACGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACCTTTGAGTTCCTTCTCCA
TCTTCTTGATAGAAGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGA
CAGATGACCCAGGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGT
TCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACA
AGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAG
GGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCA
AGCTGG*TGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTG
GAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGA
ACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTAATGA
TCT**ATTAGGATCCTGTAGATTATACAAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAAGACGCAA
ACACACAACG*ATTAAAGATAGAAAGCTATC
C

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4CX85TF 821 0 0
TTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATA*CAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAA*CCGAGAGCG
CCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACA
ATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCTGTCATTGGATTTCTGAAGCTTAGCA
CGATACACCTCATCATGCTGCTTTTCACCACC***GAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATA
GATGAAGAGAGCCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGATCCA
AGCCAGCAGAAAAGTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATG
CCGGATCTACCAAGCCAGACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTC
TTGGACTTTCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGA
CCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG*TGTT
TTTATCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGCCCACAGCTCAAGAACTTGGAACCATATTG
TATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAATACAGAACTATAAGAGC
TAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTC*TTAATGATCTCTATTAGG
ATCCTGTAGATTATACAAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAAGACGCAAACACACAAAGG
ATTAAAGATAGAAAGCTATCGACTTTTCAAGAGAAGGGATC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4C960TF 657 0 0
CAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAAGTG
ATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCC
AAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTA
AGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGA
CAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGG*TGTTTTTGTCAACAGTTTGA
GCAGTACCAGGCTGCCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATC
TTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTC
AAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTAATGATCTCTATTAGGATCCTGTAGATTATAC
AAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAAGACGCAAACACACAACG*ATTAAAGATAGAAAGC
TATCGAATTTTCAAGAGAAGGGATCCAGTGCCTTAATATATGGGAAGATCGTGAGCTGTT
CTTTCTTATTATGTCATTATCTTCTTACTCGTTTACGTCATCTAAAGATAAAAAAAA

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 15

CO CL88Contig1 800 15 10 U
CGGTGTAAATAGAAGATCTCGAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCACTAGTCTACC
TCTAAATCACAAGTCCACTAGAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGG
TGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGG
CAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCT
GGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACC
AACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGA
TCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGT
ACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCG
AGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACA
TGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATT
T*CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CT
TTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGAT
AATGATATTTCTTGCTGGTTTATTTATGTTGTGTCAAAGCTAGTTCCCACTATTCAATAC
ATATCGGAAGAATTAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 35 35 
35 35 35 50 35 50 35 35 35 35 35 65 50 50 50 50 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 65 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 70 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 65 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 15 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 60 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET91TF U 35
AF RR4FE50TF U 1
AF RR4E037TF U 35
AF RR4CP67TF U 18
AF RR4A841JQ C 59
AF RR4A181TF U 130
AF RR4A181JQD C 69
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AF RR4E037JQ C 89
AF RR4A181JQ C 69
AF RR4ET91JQ C 217
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AF RR4CA02TF U 19
AF RR4AA02JQ C 56
AF RR4AA02TF U 147
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BS 71 71 RR4CP67TF
BS 72 442 RR4FE50TF
BS 443 721 RR4CP67TF
BS 722 722 RR4CA02TF
BS 723 735 RR4CP67TF
BS 736 776 RR4CA02TF
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RD RR4ET91TF 298 0 0
GG
ACTATGAAAACCCACTAGTCTACCTCTAAATCACAATTCCACTAGAG*GAGACAGAGAGA
GAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGTAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGG
CAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGA
ATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGC
TCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGAC

QA 3 298 3 298
DS 

RD RR4FE50TF 443 0 0
CGGTGTAAATAGAAGATCTCGAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCACTAGTCTACC
TCTAAATCACGAGTCCACTAGAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGG
TGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGG
CAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCT
GGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACC
AACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGA
TCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGT
ACTATCTACTTGACGGAAGGGG
G

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR4E037TF 633 0 0
GG
ACTATGAAAACCCACTAGTCTACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAG*GAGACAGAGAGA
GAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGG
CAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGA
ATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGC
TCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACG
AGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGATATCG
TCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAG
GCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCA
AAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTG
CCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTT
TTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR4CP67TF 718 0 0
GGG
GAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCACTAGTCTACCTCTAAATCACAAGTCCACTA
GAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTA
CTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGC
GACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTC
CACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTA
AACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGA
GCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGG
GGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCA
AAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGTTTAAAAACAT
CAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGATGATCTTGTTT
CATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACA
TGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATA*TGATATTTCTTGC

QA 4 718 4 718
DS 

RD RR4A841JQ 687 0 0
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAATATGGCGAGATTCAC
GATGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTACCAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGAC
GGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTATACCAC
CTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGGGATTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGA
CCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCC
GATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACA
GTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGT
CGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CA
CATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCA
TTT*CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*
CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATG
ATAATGATATTTCTTGCTGGTTT
GTTC

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DS 

RD RR4A181TF 612 0 0
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ATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGG
GAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACA
TTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACT
ATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTAC
TTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTC
CTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAG
TTTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGA
TGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTT
AGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATT
TCTTGCTGGTTT

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DS 

RD RR4A181JQD 673 0 0
GG
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GGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTA
TTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGG
AAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACAT
TCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTA
TACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATTTACT
TGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCC
TCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGT
TTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGAT
GATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTA
GCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTT
CTTGCTGGTTT

QA 3 673 3 673
DS 

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GG
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GGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTA
TTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGG
AAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACAT
TCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTA
TACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACT
TGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCC
TCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGT
TTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGAT
GATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTA
GCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTT
CTTGCTGGT

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DS 

RD RR4E037JQ 653 0 0
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TCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAA
GTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGG
AGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGAC
CGACTACGAGAGATGTATTTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAG
AGATATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATTTACTTGACGGAAGGGGTGGTTG
TTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATTTGC
ACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT*GA
TT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTT
GTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTC
AAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGGTTT

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DS 

RD RR4A181JQ 672 0 0
GG
AAGTCCACTAGAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGC
GGCAGCAGTACTTGCTTTTTTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTA
TTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGG
AAAGCATTTTTACCTTGGAGATTGGCTTTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACAT
TCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATTTCCGACCATCCGATCCGAAACTA
TACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATTTACT
TGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCC
TCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGT
TTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGAT
GATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTA
GCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTT
CTTGCTGGTT

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR4ET91JQ 524 0 0
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TTTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTTTTGAAGTAAACAAGACCGACTACG
AGAGATGTATTTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCG
TCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATTTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAG
GCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATTTGCACCTGTCA
AAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTG
CCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTT
TTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCT
AAAAATATGGATTTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGGTT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4CA02JQ 782 0 0
GG
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GAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTA
CTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGC
GACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTC
TACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTA
AACAAGACCGACTACGAGAGATGTATTTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGA
GCTGGGAGAGACATCGTCCCTTTCAATGTCACCAAACAGTACTATTTACTTGACGGAAGG
GGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCA
AAATTTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGTTTAAAAACAT
CAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGATGATCTTGTTT
CATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACA
TGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGGTT
TATTTATGTTGTGTCAAAGCTAGTTCCCACTATTCAATACATATCGGA
AGAATTAATATG

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4CA02TF 777 0 0
GG
GAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCACTAGTCTACCTCTAAATCACAAGTCCACTA
GAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTA
CTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGC
GACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTC
TACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTA
AACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGA
GCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGG
GGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCA
AAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*CACATGACAAGAGTTTAAAAACAT
CAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTCATTT*CCGTGGATGATCTTGTTT
CATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACA
TGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGGTT
TATTTATGTTGTGTCAAAGCTAGTTCCCACTATTCA*TACATATCGGA
GATTAAT

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4AA02JQ 745 0 0
GG
ACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAG*GAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCA
CGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGA
CGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACA
CCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAG
ACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATTTCCGACCATC
CGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAAC
AGTACTATTTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAG
TCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTT*C
ACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT*GATT*GTTTGCCTCTCTT*GTCGTGATATTC
ATTT*CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT*ACTTT
*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATAT
GATAATGATATTTCTTGCTGGTTTATTTATGTTGTGTCAAAGCTAGTTCCTACTATTCAA
TACATATCGGAAGAATTAATATG

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR4AA02TF 652 0 0
TTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAA
AAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTT
GGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAG
ACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGACCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGG
AGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGT
TGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCT
GCACCTGTCAAAGAGCACTAGACCAGTTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTT
GATTTGTTTGCCTCTCTTTGTCGTGATATTCATTTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGAT
TTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTTACTTTTCTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATT
TCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGGTTTATTTA
TGTTGTGTCAAAGCTAGTTCCTACTATTCAATACATATCGGA
AGAATTAATA

QA 1 642 1 642
DS 



AS 2 16

CO CL89Contig1 790 2 2 U
GGATCATCACCATCATCATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACT
TTTCGACTCTCCCGCCCCAATCCGATGGCCGCTACATCCGCCCCAAAATCCGTCCATGAT
TTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGCT
CTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTT
GCCCAGCTCTATCAGAAGTACAAGGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAAC
CAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGT
TTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCG
ATCTACAAGTTTCTCAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAGTGGAAC
TTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGCCGTTGACCGCTACGCTCCGACCACT
TCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAA
GAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTT
ATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTAT
CACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATG
GATATTATAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA29TF U 1
AF RR4GA29JQ C 1
BS 1 704 RR4GA29TF
BS 705 790 RR4GA29JQ

RD RR4GA29TF 704 0 0
GGATCATCACCATCATCATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACT
TTTCGACTCTCCCGCCCCAATCCGATGGCCGCTACATCCGCCCCAAAATCCGTCCATGAT
TTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGCT
CTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTT
GCCCAGCTCTATCAGAAGTACAAGGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAAC
CAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGT
TTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCG
ATCTACAAGTTTCTCAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAGTGGAAC
TTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGCCGTTGACCGCTACGCTCCGACCACT
TCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAA
GAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTT
ATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4GA29JQ 790 0 0
GGATCATCACCATCATCATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACT
TTTCGACTCTCCCGCCCCAATCCGATGGCCGCTACATCCGCCCCAAAATCCGTCCATGAT
TTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGCT
CTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTT
GCCCAGCTCTATCAGAAGTACAAGGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAAC
CAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGT
TTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCG
ATCTACAAGTTTCTCAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAGTGGAAC
TTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGCCGTTGACCGCTACGCTCCGACCACT
TCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAA
GAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTT
ATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTAT
CACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATG
GATATTATAG

QA 1 790 1 790
DS 



CO CL89Contig2 814 14 11 U
GGGATTCTGCGAAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCT
TAAGTTTCGAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAA
GGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGC
TTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTA
CAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACC
TGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTAT
TTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATC
AAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGA
CAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAA
GGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTA
CTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCT
CTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCGTTTGTATT
AACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATATTATAGAAAAATGTTG
TTTTAAAAATATTTTAAAACTATATTTACACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G317TF U 193
AF RR4H743TF U 2
AF RR4E884TF U 5
AF RR4E885TF U 7
AF RR4GL81TF U 1
AF RR4E825TF U 2
AF RR4DS38TF U 7
AF RR4GL81JQ C 109
AF RR4G317JQ C 101
AF RR4H743JQB C 95
AF RR4E825JQ C 53
AF RR4DS38JQ C 12
AF RR4E885JQ C 95
AF RR4E884JQ C 165
BS 1 163 RR4GL81TF
BS 164 164 RR4H743TF
BS 165 220 RR4GL81TF
BS 221 221 RR4H743TF
BS 222 458 RR4GL81TF
BS 459 459 RR4H743TF
BS 460 719 RR4GL81TF
BS 720 720 RR4GL81JQ
BS 721 768 RR4GL81TF
BS 769 770 RR4DS38TF
BS 771 814 RR4E884JQ

RD RR4G317TF 344 0 0
G
TTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTCCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATCATGGG
TTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAA
GAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTT
GATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCGGG
CTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAAT
GTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCG

QA 2 344 2 344
DS 

RD RR4H743TF 579 0 0
GGATT
CTGCGAAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTT
TCGAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAA
TGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCA
GTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGA
TCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTC
TAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGA
CAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAA
AGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGA
TGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCT
GAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAA

QA 6 579 6 579
DS 

RD RR4E884TF 666 0 0
GG
CTGCGAAAACACTCTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTT
TCGAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAA
TGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAATGTTGCTTCTCA
GTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGA
TCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTC
TAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGA
CAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAA
AGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGA
TGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCT
GAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTACTCATT
AGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAG
TTCG

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4E885TF 673 0 0
GG
GCGAAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTTTC
GAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATG
AGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGT
GTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATC
ATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTA
ATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACA
AGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAG
GCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATG
GAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGA
AGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAG
GAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTT
CGCAAGTGTCT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4GL81TF 768 0 0
GGGATTCTGCGAAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCT
TAAGTTTCGAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAA
GGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCCTGATTGTCAACGTTGC
TTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTCCCCAGCTCTATCACAAGTA
CAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACC
TGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTAT
TTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATC
AAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAGCTTCTCCAAGTTCTTGGTTGA
CAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAA
GGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTA
CTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCT
CTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCGTTTGTAT*
AACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATATTAT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4E825TF 766 0 0
GGATT
CTGCGAAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTT
TCGAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAA
TGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTTTCAACGTTGCTTCTCA
GTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGA
TCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTC
TAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGA
CAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAA
AGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGA
TGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCT
GAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAATAGGGCATTACTCATT
AGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAG
TTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCGTTTGTAT*AACGGA
TAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATATTA

QA 6 766 6 766
DS 

RD RR4DS38TF 765 0 0
GG
GCGAAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTTTC
GAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATG
AGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGT
GTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATC
ATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTA
ATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACA
AGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAG
GCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATG
GAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGA
AGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAG
GAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTT
CGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCGTTTGTAT*AACGGATA
ATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAA*GATGGATATTATAG
A

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR4GL81JQ 660 0 0
CAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCCTGAT
TGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTCCCCAGCT
CTATCACAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGG
GAATCAAGAACCTGGTTTTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGC
TGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAA
GTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAGCTTCTCCAA
GTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCT
CAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACG
AAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATAC
TGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAA
TTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATATTAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4G317JQ 671 0 0
TTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTT
CTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTT
CCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAAC
CAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGT
TTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCA
ATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAAC
TTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACT
TCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAA
GAACAACGAGGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTT
ATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTAT
CACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATG
GATATTATAG
G

QA 1 670 1 670
DS 

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AAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACT
GAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCT
TGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGT
ACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCT
GCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAG
TGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCG
ACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAA
TAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATT
GTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTATT
TCCTATCACTTAATTTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATA
AAGATGGATATTATAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4E825JQ 718 0 0
CATTAGCTTAAGTTTCGAGGTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAG
GATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTTTC
AACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTAT
CACAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAAT
CAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAG
TACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTT
CTTAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTC
TTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGC
ATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAATA
GGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTA
ATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCG
TTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATATTATAG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4DS38JQ 757 0 0
AAAACACTTTTCGACTCTCAATAATCGGATTCCTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTTTCGAG
GTCCGATGGCTGCTACATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGG
TGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTG
GCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATCATG
GGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATG
AAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGG
TTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCG
GGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAA
ATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGA
AACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAG
TCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGC
AAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATG
TGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATATTAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4E885JQ 674 0 0
CATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGG
AAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACT
GAGCTTGCCCAGCTCTATCACAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCT
TGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGT
ACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCT
GCTCCAATCTACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAG
TGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCG
ACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAA
TAAAAAGAACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATT
GTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTT
TCCTATCACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATA
AAGATGGATATTAT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4E884JQ 650 0 0
TGATTGTCAATGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCC
AGCTCTATCACAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGT
TTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCA
AGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCAATCT
ACAAGTTTCTTAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGTATCAAGTGGAACTTCT
CCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCGACCACTTCTC
CTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAAC
AACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCA
ATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGATTAGTTGTTTCCTATCACT
TAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATGCTCTCCTTTTCATAAAGATGGATA
TTATAGAAAAATGTTGTTTTAAAAATATTTTAAAACTATATTTACACAGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 3 16

CO CL90Contig1 701 4 16 U
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AGGGAACGTTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGGCTCACCTGGCG
ATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCTGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCT
CGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTT
CCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTAGCAGAAGCCATCTTTATCATAAC
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CGGAAGGATATGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACCGA
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TCCAACTCCAAACCCCACACCCTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAATG
TCCAGTTGCTGAATCACTTCTATCGATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTC
GTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATCGG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4A372TFB U 1
AF RR4BT27JQ C 1
AF RR4A372TF U 99
AF RR4BT27TF U 1
BS 1 84 RR4A372TFB
BS 85 85 RR4BT27TF
BS 86 201 RR4A372TFB
BS 202 202 RR4BT27TF
BS 203 322 RR4A372TFB
BS 323 323 RR4BT27TF
BS 324 365 RR4A372TFB
BS 366 366 RR4BT27TF
BS 367 394 RR4A372TFB
BS 395 395 RR4BT27TF
BS 396 419 RR4A372TFB
BS 420 420 RR4BT27TF
BS 421 485 RR4A372TFB
BS 486 486 RR4BT27TF
BS 487 697 RR4A372TFB
BS 698 701 RR4BT27JQ

RD RR4A372TFB 697 0 0
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GAAGGACCAAGAGAGAGATCAAAAAATCATGATCCTTGCAGTGTTGTTCGCTAATTCCGT
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CGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTT
CCTTGTTGGTAAAGACGAGTACTATGAACTTGCTTTAGCAGAAGCCATCTTTATCATAAC
AGGGGCTGTGAAAGACATTTGCGGGAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATA
CGGAAGGATATGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACCGA
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QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4BT27JQ 701 0 0
G
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TTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATCGG

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR4A372TF 599 0 0
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CTGAGGAACGGCTCACCTGGCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGGGCTGAGAATCTCAAAG
GTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAA
TGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACTATGAACTTGCTTTAG
CAGAAGCCATCTTTATCATAACAGGGGCTGTGAAAGACATTTGCGGGAAACCTCCTACAG
AGCGAGTGTTTCTGGACAAATACGGAAGGATATGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGA
ACGGACTTCTCGAGAACACCGACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTC
CTTCTGAGTTTTGAATTCCCTCTCCAACTCCAAACCCCACACCCTTGCAATATGTTTTTT
TTCAACACTTATCAACAGAATGTCCAGTTGCTGAATCACTTCTATCGATCAAGTATTGTA
CTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4BT27TF 701 0 0
G
GAAAGAGAGATCAAATCAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTTAGATAATAAGTAGAAG
AAGGACCAAGAGAGAGATCAAAAGATCATGATCCTTGCAGTGTTGTTCGCTAATTCCGTA
GGGAACGTTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGGCTCACCTGGCGA
TCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCTGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTC
GTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTC
CTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTAGCAGAAGCCATCTTTATCATAACA
GGGGTTGTGAAAGACATTTGCGGGAAACCTCCT*CAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATCC
GGAAGGATATGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACCGAC
AAAGCCAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGAATTCCCTCT
CCAACTCCAAACCCCACACCCTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAATGT
CCAGTTGCTGAATCACTTCTATCGATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCG
TTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTA
TCGG

QA 2 697 2 697
DS 



CO CL90Contig2 715 8 8 U
GGAGCTAAGATTTCAATAAACATTGCCACACTAAAATTGCTTCCAATGTCTGAACGAAGA
ACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGATAGAGAGAAGTGATTCAGATTGATAAGTGTT
GAAAAAACATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGAGGG*AATCAAAA*CTCA
GAAGGAGGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTATCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGT
CCGTTCCAAACGATTTCATCAA*GACACAAA**CAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAAC
ACTCGCTCTGTAGGAGGTTTCCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATG
GCTTCTGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCC
CCTAGCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTC
TTAACACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGCCTT
TCCTCAGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAACGAAC
AACACCGCAAGGATCATGATTTTTTTATCCGTCTCTTCGTCTCTGTCTCCTTCTTCTACT
TATCTACCTCTCAAACTCAAACCATTCGCTTCTCTTTGATTTGATCTCTCTTTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4A062TF C 14
AF RR4DK88JQ U 1
AF RR4DK88TF C 1
AF RR4DL70JQ U 1
AF RR4DL70TF C 1
AF RR4A062JQD U 14
AF RR4A062TFB C 14
AF RR4A062JQ U 160
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CG
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AGTTC

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TCCTCAGCTGG

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DS 

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GAAAAAACATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGAGGG*AATCAAAA*CTCA
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GCTTCTGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCC
CCTAGCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTC
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TCCTCAGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAAC
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TATCTACCTC
CC

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DS 

RD RR4DL70JQ 672 0 0
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GAAAAAACATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGAGGG*AATCAAAA*CTCA
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CCTAGCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTC
TTAACACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGCCTT
TCCTCAGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAAC
AACACCGCAAGGATCATGATTTTTT*ATCCGTCTCTTCGTCTCTGTCTCCTTCTTCTACT
TATCTACCTC
CC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4DL70TF 672 0 0
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GAAAAAACATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGAGGG*AATCAAAA*CTCA
GAAGGAGGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTATCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGT
CCGTTCCAAACGATTTCATCAA*GACACAAA**CAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAAC
ACTCGCTCTGTAGGAGGTTTCCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATG
GCTTCTGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCC
CCTAGCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTC
TTAACACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGCCTT
TCCTCAGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAAC
AACACCGCAAGGATCATGATTTTTT*ATCCGTCTCTTCGTCTCTGTCTCCTTCTTCTACT
TATCTACCTC
CC

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DS 

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CG
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GGTTTCCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCA
AGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTAC
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TTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGCCTTTCCTCAGTTGGCACT
CCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAACGAACAACACCGCAAGGATC
ATGATTTTTTTATCCGTCTCTTCGTCTCTGTCTCCTTCTTCTACTTATCTACCTCTCAAA
CTCAAACCATTCGCTTCTCTTTGATTTGATCTCTCTTT
CC

QA 3 700 3 700
DS 

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CG
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AGTACAATACTTGATAGAGAGAAGTGATTCAGATTGATAAGTGTTGAAAAAACATATTGC
AAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGAGGG*AATCAAAA*CTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTATCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAA*GACACAAA**CAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCTGTAGGA
GGTTTCCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCA
AGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTAC
ACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGA
TTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGCCTTTCCTCAGTTGGCACT
CCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAACGAACAACACCGCAAGGATC
ATGATTTTTTTATCCGTCTCTTCGTCTCTGTCTCCTTCTTCTACTTAT

QA 3 650 3 650
DS 

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TTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATTTCATCAA*GACACAAA**CAAATC
CTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCTGTAGGAGGTTTCCCGCATATGTCTTTCACA
GCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCA
ACAAGGAAAATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAA
GCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAG
AAAGATCGCCAGGTGAGCCTTTCCTCAGTTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACG
TTCCCTACGGAATTAACGAACAACACCGCAAGGATCATGATTTTTTTATCCGTCTCTTCG
TCTCTGTCTCCTTCTTCTACTTATCTACCTCTCAAACTCAAACCATTCGCTTCTCTTTGA
TTTGATCTCTCTTTCC

QA 1 556 1 556
DS 



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AAGGAGATAGAGACGAAGAGACAGATCAATCATGATCCTTGCGGTGTTATTCGCTAATTC
CGTAGGGAACGTTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGGCTCACCTG
GCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAATGAGGAGCT
TCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCAT
CTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCAT
AACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAA
ATACGGAAGGATTTGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACAC
CGACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCC
TCTCACAACTCCAAACCACACACCCTTGCAACATGTTTTTTTTTCCAACACTTATCAACA
GAATGTCAGTTGCTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTT
CTTCGTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATGG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI41JQ C -7
AF RR4AI41TF U -7
AF RR4H395TF U 1
AF RR4H395JQ C 192
BS 1 64 RR4H395TF
BS 65 65 RR4AI41TF
BS 66 677 RR4H395TF
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BS 679 689 RR4H395TF
BS 690 704 RR4H395JQ

RD RR4AI41JQ 658 0 0
GGGAAAGGT
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QA 10 658 10 658
DS 

RD RR4AI41TF 658 0 0
GGGAAAGGT
AAAGAGAGATCAAATCAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTTAGATAATAAGTAGAAGA
AGGAGATAGAGACGAAGAGACAGATCAATCATGATCCTTGCGGTGTTATTCGCTAATTCC
GTAGGGAACGTTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGGCTCACCTGG
CGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAATGAGGAGCTT
CTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATC
TTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCATA
ACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAA
TACGGAAGGATTTGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACC
GACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCT
CTCACAACTCCAAACCACACACCCTTGCAACATGTTTTTTTTTCCAACACTTATCAACAG
AATGTCAGTTGCTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAAC

QA 10 658 10 658
DS 

RD RR4H395TF 692 0 0
GAAAGAGAGATCAAATCAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTTAGATAATAAGTAGAAG
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GCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAATGAGGAGCT
TCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCAT
CTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCAT
AACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAA
ATACGGAAGGATTTGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACAC
CGACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCC
TCTCACAACTCCAAACCACACACCCTTGCAACATGTTTTTTTTTCCAACACTTATCAACA
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CTTCGTTCAGACATTGA*GCAATTTAGTG
GGG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4H395JQ 513 0 0
TGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAATGAGGAGCTTCTCGTTGCTT
GCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCCTTGTTG
GTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCATAACAGGGGCTG
TGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACGGAAGGA
TTTGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACCGACAAAGACA
GGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCTCTCACAACTC
CAAACCACACACCCTTGCAACATGTTTTTTTTTCCAACACTTATCAACAGAATGTCAGTT
GGTGAATCACTTCTCTTTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCAGA
CATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATGG

QA 1 513 1 513
DS 



AS 3 15

CO CL91Contig1 1055 8 6 U
GCGGAAAGAACTCATCTGTCAAAATTAAGTATTCAAGTCTTCCGACTTATCTGCCTAATC
ACAGAAGACTAATAATGTTCATCTCAAAAGCAAAATAGACTCAAAAACAGACAGAAAACA
AAGAAACCTGTGAACTGAAAACAAAGCAACCAGAGACCTTTCTCATGACACAGGACGTGT
ACAGCAACCAGAAACCAAAGCAACAAGAAAACATACTTTTGTTGTCTAAGCAAAGTATCT
ACGCGTGTACAGACACTATCATTACTTCTAGTTCACAAAATAATCAAAGATGAGGATAGT
AGGATACTATCAACCCTGCAAAAAACTCTCTGGATTTGCTAGAAACAAACCATCAATTGC
AAAACCCCTCTTCTTACTCAAAAGCAAAAGATAATAGTTCGTACAAAAAA*GCAGATAAT
ACTCTAGAAGAGAAGGAAAAAATACTGAAATAAAAGGTTCAAACGATAAAAAGGATCAGA
GAAGTCCAGAAAAACCATCATCTGCAGCAAGTAGGCAGGATTTAGTCGACCTCCTCCATC
TTGCTACCTTCAGCATCGGCATCATCCTCAAGCGGAGGCATCTCTGCATCGGCTTCAACT
GCATCATCGTCATCAATGCTCAATCCCAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTCCCGAAG
GTGTTGGGCTCGTCTAAGCTGAAACCTGAAGTGAGAAGGGCAGTCTCGAACAGGAGAAGA
ACAAGATCCTTCACCGACTTGTCATTCTTGTCGGCTTCAGCCCTCTTCCTCAGCTCATCC
ATGATGGCATTCTCTGGGTTGATCTCCATTGTCTTCTTGCTCGACATGTAACCTCCCATG
CTGCTGTCTCTCAAGGCCTGCGCTTTCATGATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCCGTAT
TCACCTGTTACCAGACAGCATGGTGAGTCCACAAAACGGTCGGAGACAATGACCTTCTCG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 
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A

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C

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DS 



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BQ
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15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS64JQ U 1
AF RR4EH44JQ U 62
AF RR4EH44TF C 62
AF RR4E189JQ U 7
AF RR4E189TF C 73
BS 1 318 RR4BS64JQ
BS 319 731 RR4E189JQ
BS 732 838 RR4E189TF

RD RR4BS64JQ 318 0 0
TTACTTAGATAGAAGCAGAAAATAATAGTTCAGAAAAAAACTACATCGCTAATAGCGTAC
TCAAAAACCCCAAAGTAATAGTTCAACGAAAGGAACAACGAGAGATAAGATAAAACCATC
AACTGCGGTCATCATTAAGAAACCATTTAATCAACCTCCTCCATCTTGCTGCCTTCAGCA
TCAGCGTCATCTTCAAGTGGAGGCATCTCTGCATCAGCTTCAACAGCATCATCATCATCA
ATGCTCAGTCCAAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTACCGAAAGTGTTTGGCTCGTCT
AAGCTGAAACCAGAAGTG

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4EH44JQ 417 0 0
CC
AAAACCCCAAAGTAATAGTTCAACGAAAGGAACAACGAGAGATAAGATAAAACCATCAAC
TGCGGTCATCATTAAAAAACCATTTAATCAGCCTCCTCCATCTTGCTGCCTTCAGCATCA
GCGTCATCTTCAAGTGGAGGCATATCTGCATCAGCTTCAACAGCATCATCATCATCAATG
CTCAGTCCAAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTACCGAAAGTGTTTGGCTCGTCTAAG
CTGAAACCAGAAGTGAGAAGGGCTGTCTCAAAGAGGAGCAAAACAAGATCCTTCACCGAC
TTGTCATTCTTGTCGGCTTCAGCCCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATGGCATTCTCTGGA
TTGATCTCCATTGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCACCCATGCTGCTGTCTCTC
C

QA 3 416 3 416
DS 

RD RR4EH44TF 417 0 0
CC
AAAACCCCAAAGTAATAGTTCAACGAAAGGAACAACGAGAGATAAGATAAAACCATCAAC
TGCGGTCATCATTAAGAAACCATTTAATCAGCCTCCTCCATCTTGCTGCCTTCAGCATCA
GCGTCATCTTCAAGTGGAGGCATATCTGCATCAGCTTCAACAGCATCATCATCATCAATG
CTCAGTCCAAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTACCGAAAGTGTTTGGCTCGTCTAAG
CTGAAACCAGAAGTGAGAAGGGCTGTCTCAAAGAGGAGCAGAACAAGATCCTTCACCGAC
TTGTCATTCTTGTCGGCTTCAGCCCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATGGCATTCTCTGGA
TTGATCTCCATTGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCACCCATGCTGCTGTCTCTC
C

QA 3 416 3 416
DS 

RD RR4E189JQ 725 0 0
G
GATAGAAGCAGAAAATAATAGTTCAGAAAAAAACTACATCGCTAATAGCGTACTCAAAAA
CCCCAAAGTAATAGTTCAACGAAAGGAACAACGAGAGATAAGATAAAACCATCAACTGCG
GTCATCATTAAGAAACCATTTAATCAACCTCCTCCATCTTGCTGCCTTCAGCATCAGCGT
CATCTTCAAGTGGAGGCATCTCTGCATCAGCTTCAACAGCATCATCATCATCAATGCTCA
GTCCAAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTACCGAAAGTGTTTGGCTCGTCTAAGCTGA
AACCAGAAGTGAGAAGGGCTGTCTCAAAGAGGAGCAGAACAAGATCCTTCACCGACTTGT
CATTCTTGTCGGCTTCAGCCCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATGGCATTCTCTGGATTGA
TCTCCATTGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCACCCATGCTGCTGTCTCTCAAGGCCTGCG
CTTTCATGATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCCGTATTAACCTGTTACGAGACAGCAAG
GTGAGTCCACAACACGGTCAGAGACAATGACCTTCTCGACTTTGTCTCCGAGAACATCCT
TGATGACTTTGCAGAGTCCTTCGAACTTCTCCTTGAGCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTCGT
CCTCTGTTTCTCCCAGTTTCAATCCTTCCTTGGTTGCAGAGACGAGCTTCTTTCCCTCAA
ACTC

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4E189TF 766 0 0
AAGTAATAGT*CAACGAAAGGAACAACGAGAGATAAGATAAAACCATCAACTGCGGTCAT
CAT*AAGAAACCATT*AATCAAC*TCCTCCATCT*GCTGC*TTCAGCATCAGCGTCATCT
TCAAGTGGAGGCATCTCTGCATCAGCTTCAACAGCATCATCATCATCAATGCTCAGTCCA
AGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTACCGAAAGTGTTTGGCTCGTCTAAGCTGAAACCA
GAAGTGAGAAGGGCTGTCTCAAAGAGGAGCAGAACAAGATCCTTCACCGACTTGTCATTC
TTGTCGGCTTCAGCCCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATGGCATTCTCTGGATTGATCTCC
ATTGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCACCCATGCTGCTGTCTCTCAAGGCCTGCGCTTTC
ATGATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCCGTATTAACCTGTTACGAGACAGCAAGGTGAG
TCCACAACACGGTCAGAGACAATGACCTTCTCGACTTTGTCTCCGAGAACATCCTTGATG
ACTTTGCAGAGTCCTTCGAACTTCTCCTTGAGCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTCGTCCTCT
GTTTCTCCCAGTTTCAATCCTTCCTTGGTTGCAGAGACGAGCTTCTTTCCCTCAAACTCC
TTGAGCTGGCCAATGGCATACTCATCGATAGCATCAACCATGTAGAGAACTTCATACCCT
TTCTTCTTGAGCTTCTCAAGGAATGGAGAGTTCTCCACAGCCTTTT

QA 1 766 1 766
DS 



CO CL91Contig3 940 2 2 U
GGATGAGTTGACCAGCCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGGAGGATAT
CTTCTACATCACGGGTGAGAGCAAAAAGGCTGTGGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAAGCT
CAAGAAGAAAGGGTATGAAGTTCTCTACATGGTTGATGCTATCGATGAGTATGCCATTGG
CCAGCTCAAGGAGTTTGAGGGAAAGAAGCTCGTGTCTGCAACCAAGGAAGGCTTGAAACT
GGGTGAGACGGAGGACGAGAAGAAGAAAAAGGAGGAGCTCAAGGAGAAGTTCGAAGGACT
CTGCAAAGTGATCAAGGATGTTCTCGGGGACAAGGTCGAGAAGGTTATCGTCTCTGACCG
TGTTGTGGACTCACCTTGCTGTCTCGTAACAGGAGAATACGGCTGGACCGCTAACATGGA
GAGGATCATGAAAGCTCAAGCTTTGAGAGACAGTAGCATGGGTGGTTACATGTCTTCCAA
GAAGACAATGGAGATCAATCCAGAGAATGCCATCATGGACGAGCTGAGGAAAAGAGCTGA
AGCCGACAAAAATGACAAATCTGTGAAAGATCTTGTTCTTCTCCTGTTTGAGACTGCCCT
TCTCACTTCAGGTTTCAGCTTAGACGAGCCCAACACCTTCGGAAGCAGAATCCACAGGAT
GTTGAAGCTGGGATTGAGCATTGATGACGATGATGCAGTGGAAGCCGATGCAGAGATGCC
TCCGCTTGAGGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAGGTCGACTAAATCCT
GCCCAGTTGCTGCAGATGATGGTTTTTCTGGACTTCTCTGATCCTTTTTTATCGTTTGAA
CCTTTTATTTCAGTATTTTTTTCCTTTTCTTCTAGAGTATTATCTGCTTTTTTGTACGAA
CTATTATCTTTGGCTTTTGAGTAAGAAGGGGGGTTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP03TF U 1
AF RR4FP03JQ C 355
BS 1 607 RR4FP03TF
BS 608 940 RR4FP03JQ

RD RR4FP03TF 607 0 0
GGATGAGTTGACCAGCCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGGAGGATAT
CTTCTACATCACGGGTGAGAGCAAAAAGGCTGTGGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAAGCT
CAAGAAGAAAGGGTATGAAGTTCTCTACATGGTTGATGCTATCGATGAGTATGCCATTGG
CCAGCTCAAGGAGTTTGAGGGAAAGAAGCTCGTGTCTGCAACCAAGGAAGGCTTGAAACT
GGGTGAGACGGAGGACGAGAAGAAGAAAAAGGAGGAGCTCAAGGAGAAGTTCGAAGGACT
CTGCAAAGTGATCAAGGATGTTCTCGGGGACAAGGTCGAGAAGGTTATCGTCTCTGACCG
TGTTGTGGACTCACCTTGCTGTCTCGTAACAGGAGAATACGGCTGGACCGCTAACATGGA
GAGGATCATGAAAGCTCAAGCTTTGAGAGACAGTAGCATGGGTGGTTACATGTCTTCCAA
GAAGACAATGGAGATCAATCCAGAGAATGCCATCATGGACGAGCTGAGGAAAAGAGCTGA
AGCCGACAAAAATGACAAATCTGTGAAAGATCTTGTTCTTCTCCTGTTTGAGACTGCCCT
TCTCACT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FP03JQ 586 0 0
TGACCGTGTTGTGGACTCACCTTGCTGTCTCGTAACAGGAGAATACGGCTGGACCGCTAA
CATGGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCTTTGAGAGACAGTAGCATGGGTGGTTACATGTC
TTCCAAGAAGACAATGGAGATCAATCCAGAGAATGCCATCATGGACGAGCTGAGGAAAAG
AGCTGAAGCCGACAAAAATGACAAATCTGTGAAAGATCTTGTTCTTCTCCTGTTTGAGAC
TGCCCTTCTCACTTCAGGTTTCAGCTTAGACGAGCCCAACACCTTCGGAAGCAGAATCCA
CAGGATGTTGAAGCTGGGATTGAGCATTGATGACGATGATGCAGTGGAAGCCGATGCAGA
GATGCCTCCGCTTGAGGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAGGTCGACTA
AATCCTGCCCAGTTGCTGCAGATGATGGTTTTTCTGGACTTCTCTGATCCTTTTTTATCG
TTTGAACCTTTTATTTCAGTATTTTTTTCCTTTTCTTCTAGAGTATTATCTGCTTTTTTG
TACGAACTATTATCTTTGGCTTTTGAGTAAGAAGGGGGGTTTTGCC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 15

CO CL92Contig1 969 15 20 U
GGGTTTAAAAGAATGCACTCCGAAGTAGTACAGGAGAGATCAGAAACCTCTCTCTACAAA
ATCTCTCTGCCTTCTCTCTACAACTTTTCTCAGATCTGGTGTGTTCTCCGACTCCGGTTG
CTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTAATTTTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGTTT
GTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCAATTCAACGGATAGCTTTGATTTTAGAT
TTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCGGGATGGAAAGAGTTCTTGTCGATCTTCTCAAT
TATTAGCCTGTCTTTTCCTTGTCTAGCAGCTTCGCTTATCGATTTGATTTCCAGTGACTT
TTTGAATGATTTTGCATGTCGCTTTAGAGGTTTCTTTGTTCTTCTCCGGATCGATCTTTT
GCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATCCGAAGTTGAAAGTACTCGCTCCTTGTCT
ATTACCTACAGATCTGGTCGAGATCTGGGCTCTGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTC
TCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTAGT
TCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTTCTTGTGCTTTATCTGATTGGGCTATTCCACTATAG
GAGGTTTCTGTAATCGATGGATGTCTTGATGTTGGCTTCCTCGGTTTATCTCTCAAAGGA
TCTCACAAGAAGGTTACATGCATTCTGTTCTAAAGAATTTTCTGGGCAATTGATAGTTGC
AGGTCTGTGACTTTTGGTTAAAGATTTGTGCTTTTGTTGTAATTTAAGTTTAATGCTTGT
CTCCCATGTGTGGGCTTGTGTCTCTGGGGATTTCAATGTTGTCCGCCAGCTCTTGGTCTC
CGGGGTTACTGTTCTGTAACCGCTGGCTCATGTATCCGTTTAGTTGTTTAATCAAAATCC
ATTCAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 65 65 65 70 70 
70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 50 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 75 75 75 75 75 75 
75 55 70 70 55 70 70 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 60 60 45 60 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 10 

AF RR4FQ84TF U 35
AF RR4DG04TF U 33
AF RR4AV88TF U 1
AF RR4F985TF U 32
AF RR4DZ08TF U 40
AF RR4A134TF U 424
AF RR4BY38TF U 33
AF RR4D987TF U 33
AF RR4A134TFB U 34
AF RR4DG04JQ C 114
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AF RR4AV88JQ C 176
AF RR4DZ08JQ C 169
AF RR4D987JQ C 175
AF RR4F985JQ C 446
BS 1 32 RR4AV88TF
BS 33 34 RR4F985TF
BS 35 460 RR4AV88TF
BS 461 461 RR4F985TF
BS 462 669 RR4AV88TF
BS 670 714 RR4F985TF
BS 715 716 RR4BY38TF
BS 717 717 RR4D987TF
BS 718 730 RR4BY38TF
BS 731 731 RR4D987TF
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BS 733 733 RR4A134TFB
BS 734 751 RR4BY38TF
BS 752 760 RR4D987TF
BS 761 761 RR4DG04JQ
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G
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CTGGTGTGTTCTCCGACTCCGGTTGCTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTAATT
TTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCAAT
TCAACGGATAGCTTTGATTTTAGATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCGGGATGGA
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TTGTTCTTCTCCGGATCGATCTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGCGAAATCCGA
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T*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGG
AAGAAAGGAAGGAACTTGGA

QA 2 561 2 561
DS 

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ATTTTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTC
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TCTTTGTTCTTCTCCGGATCGATCTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATC
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TGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGACCACATC
CGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTAGTTCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTTCTTGTGC
TTTATCTGATTGGGCTATTCCACT

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ATCTCTCTGCCTTCTCTCTACAACTTTTCTCAGATCTGGTGTGTTCTCCGACTCCGGTTG
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GCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATCCGAAGTTGGAAGTACTCGCTCCTTGTCT
ATTACCTACAGATCTGGTCGAGATCTGGGCTCTGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTC
TCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTAGT
TCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTTCTTGTGCTTTATCTGATTGGGCTATTCCACTATAG
GAGGTTTCT

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DS 

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G
GGAGAGATCAGAAACCTCTCTCTACAAAATCTCTCTGCCTTCTCTCTACAACTTTTCTCA
GATCTGGGGTGTTCTCCGACTCCGGTTGCTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTA
ATTTTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTC
AATTCAACGGATAGCTTTGATTTTAGATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCGGGAT
GGAAAGAGTTCTTGTCGATCTTCTCAATTATTAGCCTGTCTTTTCCTTGTCTAGCAGCTT
CGCTTATCGATTTGATTTCCAGTGACTTTTTGAATGATTTTGCATGTCGCTTTAGAGGTT
TCTTTGTTCTTCTCCGGATCGATCTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATC
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TGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATC
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TTTATCTGATTGGGCTATTCCACTATAGGAGGTT*CTGTAATCGATGGATGTCTTGATGT
TGGCTTCCTCGGTTTATCTCTC

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GG
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TGTTCTCCGACTCCGGTTGCTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTAATTTTATGT
TTTGTTTCCTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCAATTCAACG
GATAGCTTTGATTTTAGATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCGGGATGGAAAGAGT
TCTTGTCGATCTTCTCAATTATTAGCCTGTCTTTTCCTTGTCTAGCAGCTTCGCTTATCG
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AGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAA*
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TTGGGCTATTCCACTATAGGAGGTTTCTGTAATCGATGGATGTCTTGATGTTGGCTTCCT
CGGTTTATCTCTCAAAG
ATCTCACA

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ACCTACAGATCTGGTCGAGATCTGGGCTCTGTTTGTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCA
TGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTAGTTCT
GTCTTGCTGGGTTATGGGAGTTCTTGTGCTTTATCTGATTGGGCTATTCCACTATAGGAG

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DS 

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GATCTGGTGTGTTCTCCGACTCCGGTTGCTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTA
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TGGCTTCCTCGGTTT*TCTCTCAA*GGATCTCACAAGAGG*TTACATGCATTCTGTTCT

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DS 

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GATCTGGTGTGTTCTCCGACTCCGGTTGCTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTA
ATTTTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTC
AATTCAACGGATAGCTTTGATTTTAGATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCAGGAT
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CGCTTATCGATTTGATTTCCAGTGACTTTTTGAATGATTTTGCATGTCGCTTTAGAGGTT
TCTTTGTTCTTCTCCGGATCGGTCTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATC
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TGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATC
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TGGCTTCCTCGGTTTATCTCTCAAAGGATCTCACAAGAAG*TTACATGCATTCTGTTCTA
AAGAATTT

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DS 

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ATCTGGTGTGTTCTCCGACTCCGGTTGCTCTCTCAGAGCCGGAGTCGGGTCTAGGTTTAA
TTTTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCA
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CTTTGTTCTTCTCCGGATCGATCTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATCC
GAAGTTGAAAGTACTCGCTCCTTGTCTATTACCTACAGATCTGGTCGAGATCTGGGCTCT
GTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCC
GGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTAGTTCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTTCTTGTGCT
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TTGTTGTAATTTAAGTTTAATGCTTGTCTCCCATGTGTGGGCTTGTGTCTCTGGGGATTT
CAATGTTGT

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DS 

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TCCGG
TGCTCTCTCAGAGCCG*AGTCGGGTCTAGGTTTAATTTTATGTTTTGTTTCCTTTTGTGT
TTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCAATTCAACGGATAGCTTTGATTTTAG
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TCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGACCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTA
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GTCTCCCATGTGTGGGCTTGTGTCTCTGGGGATTTCAATGTTGTCCGCCAGCTCTTGGTC
TCCGGGGTTACTGTTCTGTAACCGCTGGCTCATGTATCCGTTTAGTTGTTTAATCAAAAT
CCATTCAGAG

QA 6 855 6 855
DS 

RD RR4BY38JQ 718 0 0
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CTTTTCCTTGTCTAGCAGCTTCGCTTATCGATTTGATTTCCAGTGACTTTTTGAATGATT
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GGGCTTGTGTCTCTGGGGATTTCAATGTTGTCCGCCAGCTCTTTGTCTCCGGGGTTACTG
TTCTGTAACCGCTGGCTCATGTATCCGTTTAGTTGTTTAATCAAAATCCATTCAGA
CG

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DS 

RD RR4AV88JQ 793 0 0
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TAGATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCGGGATGGAAAGAGTTCTTGTCGATCTTC
TCAATTATTAGCCTGTCTTTTCCTTGTCTAGCAGCTTCGCTTATCGATTTGATTTCCAGT
GACTTTTTGAATGATTTTGCATGTCGCTTTAGAGGTTTCTTTGTTCTTCTCCGGATCGAT
CTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATCCGAAGTTGGAAGTACTCGCTCCT
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CGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGA
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AATCCATTCAGA
C

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DS 

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T
CTTTTGTGTTTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCAATTCAACGGATAGCTT
TGATTTTAGATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCGGGATGGAAAGAGTTCTTGTCG
ATCTTCTCAATTATTAGCCTGTCTTTTCCTTGTCTAGCAGCTTCGCTTATCGATTTGATT
TCCAGTGACTTTTTGAATGATTTTGCATGTCGCTTTAGAGGTTTCTTTGTTCTTCTCCGG
ATCGATCTTTTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATCCGAAGTTGAAAGTACTC
GCTCCTTGTCTATTACCTACAGATCTGGTCGAGATCTGGGCTCTGTT*GTCAAGCTCCTA
TTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAA
CTTGGAGTAGTTCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTTCTTGTGCTTTATCTGATTGGGCTA
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CTCTTGGTCTCCGGGGTTACTGTTCTGTAACCGCTGGCTCATGTATCCGTTTAGTTGTTT
AATCAAAATCCATTCAGAG
G

QA 2 800 2 800
DS 

RD RR4D987JQ 795 0 0
TGTG
TTGTATGGGTTAGATCTTCTTGGTGGACTCTTTCAATTCAACGGATAGCTTTGATTTTAG
ATTTCGATCTAAGTTTTTCGGCTGGTTCCAGGATGGAAAGAGTTCTTGTCGATCTTCTCA
ATTATTAGCCTGTCTTTTCCTTGTCTAGCAGCTTCGCTTATCGATTTGATTTCCAGTGAC
TTTTTGAATGATTTTGCATGTCGCTTTAGAGGTTTCTTTGTTCTTCTCCGGATCGGTCTT
TTGCCTCCCTCAGTTTGTTGAGTGTGGTGAAATCCGAAGTTGAAAGTACTCGCTCCTTGT
CTATTACCTACAGATCTGGTCGAGATCTGGGCTCTGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGT
TCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGGCCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGTA
GTTCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTTCTTGTGCTTTATCTGATTGGGCTATTCCACTAT
AGGAGGTTTCTGTAATCGATGGATGTCTTGATGTTGGCTTCCTCGGTTTATCTCTCAAAG
GATCTCACAAGAAGGTTACATGCATTCTGTTCTAAAGAATTTTCTGGGCAATTGATAGTT
GCAGGTCTGTGACTTTTGGTTAAAGATTTGTGCTTTTGTTGTAATTTAAGTTTAATGCTT
GTCTCCCATGTGTGGGCTTGTGTCTCTGGGGATTTCAATGTTGTCCGCCAGCTCTTGGTC
TCCGGGGTTACTGTTCTGTAACCGCTGGCTCATGTATCCGTTTAGTTGTTTAATCAAAAT
CCATTCAGAGG

QA 5 795 5 795
DS 

RD RR4F985JQ 524 0 0
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TGGGCTCTGTT*GTCAAGCTCCTATTTAGGCGTTCTCATGTCGCAGTGTGTTCGACGTGG
CCACATCCGGAAGAAAGGAAGGAACTTGGAGCAGTTCTGTCTTGCTGGGTTATGG*AGTT
CTTGTGCTTTATCTGATTGGGCTATTCCACTATAGGAGGTTTCTGTAATCGATGGATGTC
TTGATGTTGGCTTCCTCGGTTTATCTCTCAAAGGATCTCACAAGAAGGTTACATGCATTC
TGTTCTAAAGAATTTTCTGGGCAATTGATAGTTGCAGGTCTGTGACTTTTGGTTAAAGAT
TTGTGCTTCTGTTGTAATTTAAGTTTAATGCTTGTCTCCCATGTGTGGGCTTGTGTCTCT
GGGGATTTCAATGTTGTCCGCCAGCTCTTGGTCTCCGGGGTTACTGTTCTGTAACCGCTG
GCTCATGTATCCGTTTAGTTGTTTAATCAAAATCCATTCAGAG
G

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 15

CO CL93Contig1 746 15 32 U
AGGAAAGAAAAACACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGA*GA
TGAGGAACATTACTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGG
TGATTGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCAC
CATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTA
GCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGA
AGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTA
AATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACT
GAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAA
GAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTAT
ACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTAT
ATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAGTATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTAC
AAGAATATGTTCAAAGATTCATGACGTTTGACAGAGTTGTAGTCATATTGAGCAAACATC
AAATCCAAGGAGAACATATTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 50 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 55 80 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 15 85 70 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 55 55 55 55 55 55 
50 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT66JQ C 35
AF RR4CJ46TF U 26
AF RR4DT66TF U 35
AF RR4ED89TF U 35
AF RR4BD94JQ C 17
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AF RR4DR32JQ C 197
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AF RR4EW07JQ C 17
AF RR4EW30TF U 6
AF RR4CN62JQ C 1
AF RR4CN62TF U 1
BS 1 5 RR4CN62JQ
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BS 17 36 RR4BD94TF
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BS 461 518 RR4CJ46TF
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BS 544 544 RR4BD94TF
BS 545 573 RR4CJ46TF
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RD RR4DT66JQ 561 0 0
GG
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QA 3 561 3 561
DS 

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GCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTCATGG*AGCTA
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CTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTCTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAA
T

QA 12 548 12 548
DS 

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GG
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CGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCT
CTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATA
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AAGTGTGAAAATTCCCACG
AG

QA 3 561 3 561
DS 

RD RR4ED89TF 560 0 0
GG
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TGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAAGGAGAAGCTATATCATGTT
CGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCT
CTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATA
GGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTATCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATG
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GCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTCATGG*AGCTA
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CTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTCTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATA
AAGTGTGAAAATTCCCAC

QA 3 560 3 560
DS 

RD RR4BD94JQ 579 0 0
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QA 1 579 1 579
DS 

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AAGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGC
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AATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCT
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QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4DR32JQ 406 0 0
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AATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCT
GGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATGAACTGAAAAGAGGACTATGT
ATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATG
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CATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATA
C

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4A783JQ 579 0 0
GGATCAAAAAC
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CGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATTTAAGATCTGGAGGAAACCCCT
CTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTTTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATA
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CTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTCTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATA
AAGTTTGAAAATTCCCACATTTATATAT

QA 12 579 12 579
DS 

RD RR4A783TF 579 0 0
GGATCAAAAAC
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CGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCT
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GGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTATCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATG
ACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGA
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CTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTCTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATA
AAGTTTGAAAATTCCCACATTTATATAT

QA 12 579 12 579
DS 

RD RR4EW30JQ 586 0 0
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DS 

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GGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGT
ATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATG
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4EW07JQ 586 0 0
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AATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCT
GGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGT
ATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATG
AACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAAT
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4EW30TF 597 0 0
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AATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAA
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AACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTT
ATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATAT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4CN62JQ 746 0 0
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TGATTGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATACCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCAC
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GCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGA
AGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTA
AATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACT
GAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAA
GAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTAT
ACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTAT
ATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAGTATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTAC
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AAATCCAAGGAGAACATATTTTATTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4CN62TF 725 0 0
AGGAA
AGAAAAACACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGA*GATGAGG
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GCGTATCATGAGGGAGAAGCTATACCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGT
TTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGT
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GTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGT
AATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAA
GAGGACTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCA
AACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTT
ATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATT
CCTCAATCTCCTAGAACGCAGTATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTACAAGAA
TATGTTCAAAGATTCATGACGTTTGACAGAGTTGTAGTCATATTGAGCAAACATCAAATC

QA 6 725 6 725
DS 



AS 2 14

CO CL94Contig1 777 5 32 U
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CAGCCATGGTGAAGTACTCACAAGAACCTGACAATCAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAG
GATCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGGGAAACAGCGCACGCTATAAGGAAGC
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CTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCA
ATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAGTTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACG
CTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCC
AAGTTAACCAGGCCGCAAAACAGAGGAGAAGGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACC
CTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCA
AGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCT
TTGTTTTTT*AGTTTCTACTTTTTGTGTTCGTGAAAGAGATTTTGCTCCCTTTTCTCTCC
CATCTTTGCAAGACAATGGATAGATTTTCGTGGATTATTATT*GTTGGTGTTATGAAAAT
TAAACTATTAATCATTCCGTTTGTAGTATTTAATTCTATCTTTATATTTTTGCTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4B821TF U 1
AF RR4E646JQ C 92
AF RR4E646TF U 41
AF RR4G675TF U 33
AF RR4B821JQ C 90
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QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4E646JQ 643 0 0
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QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4E646TF 694 0 0
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CTTTCTTTGTTTTTTTAGTTTCTACTTTTTGTGTTCGTGAAAGAGATTTTGCTCCCTTTT
CTCTCCCATCTTTGCAAGACAATGGATAGATTTTCGTGGATTATTATT*GTTGGTGTTAT
GAAAATTAAACTATT
GATCT

QA 15 689 15 689
DS 

RD RR4G675TF 699 0 0
GG
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GGAAACAGCGCACGCTATAAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
TGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGTAC
TGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCA
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TGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCCGCAAAACAGAGGAGAAGGAC
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GA

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR4B821JQ 688 0 0
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GAGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTTTGCAGAGGTGTTGGA
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GCTCAGTTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTG
GATGTTGATGCGCTATTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGA
AGGGCTTACCGTGCACATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAG
CTGATTTTGTTTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCC
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QA 1 688 1 688
DS 



CO CL94Contig2 711 9 13 U
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GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAATTTCTTTTTTTTTTTTTGCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATG
TTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTTTGCCTCC


BQ
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 0 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 10 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4EX85TF U 1
AF RR4C191JQ C 1
AF RR4BD07JQ C 1
AF RR4C191TF U 1
AF RR4BD07TF U 1
AF RR4BF80JQ C 1
AF RR4BF80TF U 1
AF RR4H212TF U 1
AF RR4H212JQ C 93
BS 1 35 RR4EX85TF
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BS 37 62 RR4EX85TF
BS 63 63 RR4C191TF
BS 64 570 RR4EX85TF
BS 571 575 RR4C191TF
BS 576 576 RR4BD07TF
BS 577 590 RR4C191TF
BS 591 593 RR4BD07TF
BS 594 668 RR4C191TF
BS 669 693 RR4BD07TF
BS 694 709 RR4H212TF
BS 710 711 RR4H212JQ

RD RR4EX85TF 570 0 0
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CATACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTAT

QA 1 570 1 570
DS 

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GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAA*CAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCT
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTCTTTTTTTTTT***GCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAAT

QA 1 644 1 644
DS 

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GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAATTTCTTTTTTTTTTTTTGCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATG
TTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAG

QA 1 693 1 693
DS 

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GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAA*CAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCT
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTCTTTTTTTTTT***GCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATG
TTGGTCTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4BD07TF 693 0 0
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GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAATTTCTTTTTTTTTTTTTGCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGGGATAGAGTTCAATG
TTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4BF80JQ 693 0 0
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GAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAGGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAATTTCTTTTTTTTTTTTTGCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATG
TTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4BF80TF 693 0 0
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CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAGGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAATTTCTTTTTTTTTTTTTGCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATG
TTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4H212TF 710 0 0
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GAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAATCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCGGCTAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTCTTTTTTTTTTTT*GCGTTTT
TGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATTCTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATG
TTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTTTGCCT
C

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4H212JQ 619 0 0
TCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGGGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATT
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CCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCA
AGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAGTTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAG
CAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAA
TCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACAT
GTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGA
GCCGGAGACCCAGTTGGCGGCTAAGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTT
TCAGTTT*TTTTTTTTTTTTTGCGTTTTTGAACCATATTTTGTTCCCTTTTCTTCATATT
CTCCAAGACAATGG*ATAGAGTTCAATGTTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTA
GAATCTTTCTTTTGCCTCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 2 14

CO CL95Contig1 815 2 2 U
GGGCAAACTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCAATCCCCAAATCT
TCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCA
AAGGACAAGAGAGCCGATCACCACCACCACCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAG
AGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGA
TCTCACAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGA
GAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGTCAAC
TTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTA
GGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCATTGAAG
GTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACA
GCTTGATGTTCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCTTGTACCAAAAGTTACCAG
CTTTTTTGATTTACCGTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATAAAAG
GCTTTGCTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAA
ACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAGTTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAGTGACT
TTGTATTATCATCTTTTAGTTTCTGTGTTATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C615TF U 1
AF RR4C615JQ C 148
BS 1 656 RR4C615TF
BS 657 815 RR4C615JQ

RD RR4C615TF 656 0 0
GGGCAAACTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCAATCCCCAAATCT
TCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCA
AAGGACAAGAGAGCCGATCACCACCACCACCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAG
AGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGA
TCTCACAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGA
GAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGTCAAC
TTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTA
GGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCATTGAAG
GTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACA
GCTTGATGTTCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCTTGTACCAAAAGTTACCAG
CTTTTTTGATTTACCGTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4C615JQ 668 0 0
CCCCCCCCC
CACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCG
CACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCACAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGT
AAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAA
GACATCCTTTCTGGCAAAGTCAACTTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGT
TCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTT
GAGGAAGCAACATACGCATTGAAGGTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGT
GGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATGTTCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTC
CTATCTTGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTGATTTACCGTCTCTTCTTTGACCAAAGAT
AGAAGATGGATAATAAGATAAAAGGCTTTGCTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAA
CCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAGTTTCATAATAA
CGAATTTCTGTTGTGACAGTGACTTTGTATTATCATCTTTTAGTTTCTGTGTTATCATC

QA 10 668 10 668
DS 



CO CL95Contig2 788 12 12 U
GGGGACACTTTTAACTTTCTCCTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCAATCCCCAAATCGT
CGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAATCAA
AGGACAAGAGAGCCGATCACCACC*ACCACCACCATCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAG
AGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGA
TCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGA
GAATCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAAC
TTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTA
GGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAG
GTGGGTGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACA
GCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTT
TTTTTATTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGC
TTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGA
TAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTT
GTGACGAG


BQ
20 20 20 5 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 20 10 10 10 

AF RR4H837TF U 3
AF RR4F561TF U 1
AF RR4EU21TF U 4
AF RR4DC79TF U 1
AF RR4F561JQ C 136
AF RR4EZ20TF U 1
AF RR4DC79JQ C 296
AF RR4D889JQ C 4
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AF RR4FB16JQ C 93
AF RR4EZ20JQ C 90
AF RR4H837JQB C 77
BS 1 3 RR4DC79TF
BS 4 4 RR4H837TF
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G
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AAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCT
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DS 

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DS 

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AAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCT
CGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGAGAA
TCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCAATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTC
GAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGT
CCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTG
GGTGATATAAGCGAGAT*GTGGACACAGACAGT

QA 1 513 1 513
DS 

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TTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTA
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TTTTTATTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATTGAA

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DS 

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TCTTCT

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DS 

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TCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGA
GAATCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAAC
TTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTA
GGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCGGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAG
GTGGGTGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACA
GCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTT
TTTTTATTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGC
TTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGA
TAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAA

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DS 

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CCAACTTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTTTGCTAAACGCGGCGGCG
ATCTAGGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCAC
TGAAGGTGGGTGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGA
GAACAGCTTGATCTGTTTATTTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACC
AGCTTTTTTTATTTACCTTTTTTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATTGAATAATAAGATAA
AAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTTTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACA
TATGATAAAGACAAGAAACTGTATTTTAGTTACTTTTCATAATTT

QA 1 465 1 465
DS 

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AAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCT
CGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGAGAA
TCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTC
GAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGT
CCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTG
GGTGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCCTATCATAAAGAGAACAGCT
TGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTT
T*ATTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTT
GCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAA
AGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTG
ACGAG

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CCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGTGATATAAGCGAGATTGTGGACACA
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CTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTTATTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAA
GATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTT
TATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTT
CT*ATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTG

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DS 

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AGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGAGAATCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCG
TGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTG
TAGCTTTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACC
GTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGTGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGA
CAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCT
CCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTTATTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAAGA
TAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTTA
TATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTTCT
*ATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4EZ20JQ 696 0 0
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CCACCATCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAA
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GGAAGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGAGAATCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGAT
CCGTGAAGACATCCTTTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGA
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ACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGTGATATAAGCGAGATTGTGGACAC
AGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCT
CCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTTATTTACCTTTTCTTCTTTGACCAA
AGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCT
TTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACT
TCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4H837JQB 709 0 0
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TCACCACC*ACCACCACCATCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGA
GAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGT
CGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACTACCACCAGAGAATCAGCCGTCGAAC
AGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCCA
CTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGGCGAG
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AGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATC
TCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCCTTTTTTATTTACCTTCT
CTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTT
TGGTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTG
CATCTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGAC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 2 15

CO CL96Contig1 1150 13 19 U
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TTCGTTTCCGATTCGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAATGTCGGAAGTTCCGC
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TTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACG
GTGTGATACTAGGTGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACT
GTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTG
ACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTG
GCCGAGATTCTCGGGTTATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATC
AAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTC
ACACTATATACCCACACGGCTCAACGGATACTCTACCATTCGCTACAATGGG*TTCCGGG
TCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAA
GGAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCGGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGT
AGCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGGAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATG
GAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAAAGGCTATTCGTTCACCAAGAAAACCGAG
ATTCTTCGCACCAAAATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAA
GCTATGGAAGAGTAAATGAAGAGGGTACTGTGCGTGAGACATATCCGTCTTGTCTTTCTT
TACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCAAAATCTTGTGGCTCTGTCCCATCTTTTTAG
GATTCCACCACTCTCATGAGACTCAGAAATTTTCTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAACC
AAACCGAATCGTTCCGCAAATTACCGCTTATTTACTTTTCATTTGCATATATACATGAGG
TGCATAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 10 45 
10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 40 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP64TF U 15
AF RR4CE45TF U 3
AF RR4DT76JQ C -2
AF RR4DT76TF U -2
AF RR4AX76TF U 145
AF RR4DC60TF U 1
AF RR4FD95TF U 7
AF RR4BC76TF U 5
AF RR4FD95JQ C 329
AF RR4AX76JQ C 517
AF RR4BC76JQ C 227
AF RR4CP64JQ C 334
AF RR4DC60JQ C 542
BS 1 13 RR4DC60TF
BS 14 14 RR4CE45TF
BS 15 580 RR4DC60TF
BS 581 581 RR4CE45TF
BS 582 681 RR4DC60TF
BS 682 682 RR4FD95TF
BS 683 714 RR4DC60TF
BS 715 724 RR4FD95TF
BS 725 749 RR4BC76TF
BS 750 750 RR4BC76JQ
BS 751 772 RR4BC76TF
BS 773 773 RR4BC76JQ
BS 774 814 RR4BC76TF
BS 815 815 RR4BC76JQ
BS 816 846 RR4BC76TF
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BS 938 1078 RR4BC76JQ
BS 1079 1150 RR4DC60JQ

RD RR4CP64TF 408 0 0
GC
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GCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAATGTCGGAAGTTCCGCCAAAGGGTGGGTTCAG
CTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTCTTAAGGCTCCCTCCTT
TTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACGGTGTGATACTAGGTGC
GGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCACTA
CATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGTCAC
TGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGC

QA 3 408 3 408
DS 

RD RR4CE45TF 655 0 0
GGGAACGAAGC
AAAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACTTTCGTTTCCGATT
CGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAATGTCGGAAGTTCCGCCAAAGGGTGGGTT
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CTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACGGTGTGATACTAGG
TGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAATTGTGAGAAAATTCA
CTACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGT
CACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCG
GGTTATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTC
AGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCC
ACACGGCTCAACGGATACTCTACCATTCGCTACAATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTA
TGTCTGTGTTTGAG*CAAAGTACAAAGAAG*TCTAACTAGGGAT

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DS 

RD RR4DT76JQ 660 0 0
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AAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACTTTCGTTTCCGATTC
GAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAA*TGTCGGATGTTCCTCGAAAGGGTGGGTTC
AGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTAATACAAAAGGGTCTTAAAGCTCCCTCC
TTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGATGGTGTGATACTAGGT
GCGGATACGCGAGCAACCGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCAC
TACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTGACACTGAAGCTGTC
ACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGTTTGCATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCGG
GTTATTCCTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTTTCA
GCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCA
CACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCTACAATGG**TTCTGGGTCTCTTGCTGCCAT
GTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAG
AGTG

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DS 

RD RR4DT76TF 659 0 0
GGAGTGAACGAAGCAAA
AAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACTTTCGTTTCCGATTC
GAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAA*TGTCGGATGTTCCTCGAAAGGGTGGGTTC
AGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTAATACAAAAGGGTCTTAAAGCTCCCTCC
TTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGATGGTGTGATACTAGGT
GCGGATACGCGAGCAACCGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCAC
TACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTGACACTGAAGCTGTC
ACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGTTTGCATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCGG
GTTATTCCTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCA
GCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCA
CACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCTACAATGG**TTCTGGGTCTCTTGCTGCCAT
GTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGA*GGTCTAACTAG
AGT

QA 18 656 18 656
DS 

RD RR4AX76TF 496 0 0
TGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTCTTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGA
CCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACGGTGTGATACTAGGTGCGGATACGC
GAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCACTACATGGCTC
CTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGG
TCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCGGGTTATCACTG
CCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCG
TCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCACACGGCTCAA
CGGATACTCTACCATTCGCTACAATGGGGTTCCGGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTT
GAGGCAAAGTACAAA
A

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4DC60TF 714 0 0
GGATTGAACGAAGCAAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACT
TTCGTTTCCGATTCGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAATGTCGGAAGTTCCGC
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TTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACG
GTGTGATACTAGGTGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACT
GTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTG
ACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTG
GCCGAGATTCTCGGGTTATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATC
AAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTC
ACACTATATACCCACACGGCTCAACGGATACTCTACCATTTGCTACAATGGG*TTCCGGG
TCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAA
GGAATTAAGCTGGTCGCTGAG*CCATTTGCTCGGGTATATTCAACGACCTGGGT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FD95TF 718 0 0
GGAAGCA
AAAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACTTTCGTTTCCGATT
CGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAATGTCGGAAGTTCCGCCAAAGGGTGGGTT
CAGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTCTTAAAGCTCCCTC
CTTTTTGAAGACCGGAACCACCGTCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACGGTGTGATACTAGG
TGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCA
CTACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGT
CACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCG
GGTTATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTC
AGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCC
ACACGGCTCAACGGATACTCTACCATTCGCTACAATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTA
TGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAAGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGG
TCGCTGAGGCCATTTGCTCGGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCA

QA 8 718 8 718
DS 

RD RR4BC76TF 842 0 0
GGGAACGAAGC
AAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACTTTCGTTTCCGATTCG
AGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAA*TGTCGGAAGTTCCGCCAAAGGGTGGGTTCA
GCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTCTTAAAGCTCCCTCCT
TTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACGGTGTGATACTAGGTG
CGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCACT
ACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGTCA
CTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCGGG
TTATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAG
CTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCAC
ACGGCTCAACGGATACTCTACCATTCGCTACAATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTATG
TCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGGTC
GCTGAGGCCATTTGCTCGGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATC
TGCGTTATCACTAAAGGGAACAAGGAATATCTGAGGA*CTACATGGAACCAAACCCAAGA
ACCTATGTCAGCAGCAAAG*CTATTCGTTCACCAAGAAAACCGAGATTCTT

QA 12 842 12 842
DS 

RD RR4FD95JQ 656 0 0
CATTTATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAG
CTCACAGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCGGGTTATCACTGCCTT
GACCCTTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCT
TGGTGGAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCACACGGCTCAACGGA
TACTCTACCATTCGCTACAATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGG
CAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTT
GCTCGGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTA
AGGGGAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCA
GCAAAGGCTATTCGTTCACCAAGAAAACCGAGATTCTTCGCACCAAAATCACCCCATTGA
TGGAGCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAGTAAATGAAGAGGGTAC
TGTGCGTGAGACATATCCGTCTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATGTTTTAAGGA
CC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4AX76JQ 465 0 0
TTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCACACGGCTCAACGGATACTCTAC
CATTCGCTACAATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTAC
AAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCGGGT
ATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGGAAC
AAGGAATATCTGAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAAAGGC
TATTCGTTCACCAAGAAAACCGAGATTCTTCGCACCAAAATCCCCCCATTGATGGAGCGA
GTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAGTAAATGAAGAGGGTACTGTGCGTG
AGACATATCCGTCTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATGTTTTAAGG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4BC76JQ 854 0 0
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TGCTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGC
TGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGCTTCA
TCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCGGGTTATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAGAAACA
CCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCAC
TGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCACACGGCTCAACGGATACTCTACCATTCGCTAC
AATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTC
TAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCGGGTATATTCAACG
ACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGGAACAAGGAATATC
TGAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAAAGGCTATTCGTTCA
CCAAGAAAACCGAGATTCTTCGCACCAAAATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAAATTA
CAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAGTAAATGAAGAGGGTACTGTGCGTGGGACATATCC
GTCTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCAAAATCTTGTGGCTCTG
TCCCATCTTTTTAGGATTCCACCACTCTCATGAGACTCAGAAATTTTCTTAAAAGCTAAT
TACATTTCCAAA
TC

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4CP64JQ 747 0 0
ATTGCTGTGGTGCTGGTACTGCTGCTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCAC
AGCTGCGGCTTCATCGTTACCAGACTGGCCGAGATTCTCGGGTTATCACTGCCTTGACCC
TTCTCAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTG
GAGTTGACATCACTGGGCCTCATCTTCACACTATATACCCACACGGCTCAACGGATACTC
TACCATTCGCTACAATGGG*TTCCGGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAG
TACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCG
GGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGG
AACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAAA
GGCTATTCGTTCACCAAGAAAACCGAGATTCTTCGCACCAAAATCACCCCATTGATGGAG
CGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAGTAAATGAAGAGGGTACTGTGC
GTGAGACATATCCGTCTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCAAAA
TCTTGTGGCTCTGTCCCATCTTTT*AGGATTCCACCACTCTCATGAGACTCAGAAATTTT
CTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAA
CC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4DC60JQ 609 0 0
CACTATATACCCACACGGCTCAACGGATACTCTACCATTTGCTACAATGGG*TTCCGGGT
CTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAG
GAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCGGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTA
GCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGGAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGG
AACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAAAGGCTATTCGTTCACCGAGAAAACCGAGA
TTCTTCGCACCAAAATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAG
CTATGGAAGAGTAAATGAAGAGGGTACTGTGCGTTAGACATATCCGTCTTGTCTTTCTTT
ACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCAAAATCTTGTGGCTCTGTCCCATCTTTTTAGG
ATTCCACCACTCTCATGAGACTCAGAAATTTTCTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAACCA
AACCGAATCGTTCCGCAAATTACCGCTTATTTACTTTTCATTTGCATATATACATGAGGT
GCATAACCC

QA 1 609 1 609
DS 



CO CL96Contig2 1081 2 2 U
GGGAACGAAGCAAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACTTTC
GTTTCCGATTCGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAATGTCGGATGTTCCTCGAA
AGGGTGGGTTCAGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTCTTA
AAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGATGGTG
TGATACTAGGTGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGAATTGTG
AGAAAATTCACTACATGGCTCCAAACATTTATTGTTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTGACA
CTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGTTGCATCGTTACCAGACTGGCC
GAGACTCTCGGGTTATTACTGCCTTGACCCTTCTCAAAAAACACCTTTTCAGCTATCAAG
GTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGTCCTCATCTTCATA
CTATATACCCACACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCCACAATGGGTTCTGGTCTCT
TGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAAT
TAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCTGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAA
CGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGGAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGGAACC
AAACTCAAGAACCTATGTCAGCAGCAAAGGCTATTCGTTCGCCAAGAAAACCGAGGTTCT
TCGCACCAAGATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCTAT
GGAAGAGTAAATGAAGAGCGAAGTGTGCGTGAGGCATATCAGTCTTGTCTTTCTTTACCA
ATGAAATGTTTTATGGATCATCCCAAATCTTGTGGCTCTGTCCCATCTTTCTAGTATTCC
ACTCTCGTGAGACTCAGAAATTTTCTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAATCGAATCGAAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4EM84TF U 1
AF RR4EM84JQ C 429
BS 1 632 RR4EM84TF
BS 633 1081 RR4EM84JQ

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AGAAAATTCACTACATGGCTCCAAACATTTATTGTTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTGACA
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CTATATACCCACACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCCACAATGGGTTCTGGTCTCT
TGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACA

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DS 

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TCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGTCCTCATCTTCATACTATATAC
CCACACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCCACAATGGGTTCTGGTCTCTTGCTGCTA
TGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGG
TCGCTGAGGCCATTTGCTCTGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACA
TCTGCGTTATCACTAAGGGGAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGGAACCAAACTCAA
GAACCTATGTCAGCAGCAAAGGCTATTCGTTCGCCAAGAAAACCGAGGTTCTTCGCACCA
AGATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAGT
AAATGAAGAGCGAAGTGTGCGTGAGGCATATCAGTCTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATG
TTTTATGGATCATCCCAAATCTTGTGGCTCTGTCCCATCTTTCTAGTATTCCACTCTCGT
GAGACTCAGAAATTTTCTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAATCGAATCGAACC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 15

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GGATATTATTATTGCTATCTCCTCTCTCTTCTTCTTCCCCTCTTACCAAATCAGAGAAAT
AAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACATGATCGGACAGCTTATGAACCTTAACGCG
ACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGAAAGCCCGGCCAGATCG
TCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCATGCTCAATCTTCAGTGC
AACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAAAGAGAAGACTCTCCTC
AAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCTGTGAGGAAC
TACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGAGGCCAGCAGCGAG
AAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGATGGAGCTCCTTAC
CTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCC
AAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATAGATTTCATG
AACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCTACGAGGAC
AAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGC
AAACGTTTGCGCATCATGAA*GGGAACTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGGA
GAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TATAATAAGAAGAAAAAAAGAACCATCAAT
GTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTATGATTTTTATGTATTTCTATCTCCTATA
TGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGTA
AGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAATATCTCTGTGTTTG
TGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAATGATCAATCACTAATTGACATA
TGCATATATAAACATGTATGTATGTGTCTGTTATTGATCCCTACTAGAGCATGTGTCTGT
CGGTTAATGTCAATCACTACTTGATATATGCATATATAAATGTATGTACATGTGTTTTGA
CC


BQ
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40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4D739TF U 51
AF RR4DK15TF U 273
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AF RR4CF49TF U 479
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AF RR4AT59JQ C 685
AF RR4D062JQ C 767
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GG
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GAACCTTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGAAAG
CCCGGCCAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCATGCT
CAATCTTCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAAAGA
GAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATGGCC
ACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGA
GGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGA
TGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTC
TGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATAGAGCACAAGGAAT
GATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCC
AAGCTACGAGGACAA*GATGGCGATTGGATGCTCG

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR4ES73TF 688 0 0
GG
GAGAAATAAATAACATCTCTAATCTACTAGAAGTAACATGCTCGGACAGCTTATGAACCT
TAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGAAAGCCCGGC
CAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCATGCTCAATCT
TCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAAAGAGAAGAC
TCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCTGT
*AGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGAGGCCAG
CAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGATGGAGC
TCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATGC
TTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATAGA
TTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCTA
CGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCA
GTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGA

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR4AH17TF 793 0 0
GG
ACCAAATCAGAGAAATAAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACCTGATCGGACAGCT
TATGAACCTTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGA
AAGCCCGGCCAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCAT
GCTCAATCTTCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCTAA
AGAGAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATG
GCCACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGA
GGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCAT
GGATGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCT
CTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGG
AATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGT
TCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAAT
GTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAAAGGGGACTGAAGCAATTGGACTTG
CTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TATA********AT
AAGAAGA*A*A

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR4G829TF 770 0 0
GG
ACCAAATCAGAGAAATAAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACATGATCGGACAGCT
TATGAACCTTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGA
AAGCCCGGCCAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCAT
GCTCAATCTTCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAA
AGAGAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATG
GCCACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGA
GGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCAT
GGATGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCT
CTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGG
AATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGT
TCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAAT
GTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGTATCATGAA**GGGACTGAAGCAATTGGACTTG
CTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCA*GAACAGATCATGAATTT*TA

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4G829JQ 769 0 0
ACCAAATCAGAGAAATAAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACATGATCGGACAGCT
TATGAACCTTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGA
AAGCCCGGCCAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCAT
GCTCAATCTTCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAA
AGAGAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATG
GCCACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGA
GGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCAT
GGATGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCT
CTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGG
AATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGT
TCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAAT
GTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGTATCATGAA*GGGAACTGAAGCAATTGGACTTG
CTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TAT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4D062TF 869 0 0
GGATATTATTATTGCTATCTCCTCTCTCTTCTTCTTCCCCTCTTACCAAATCAGAGAAAT
AAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACATGATCGGACAGCTTATGAACCTTAACGCG
ACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGAAAGCCCGGCCAGATCG
TCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCATGCTCAATCTTCAGTGC
AACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAAAGAGAAGACTCTCCTC
AAAGACCCTGCTAAGCCTCCTTCTAAAGCCCTAGTGGTGGGATGGCCACCTGTGAGGAAC
TACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGAGGCCAGCAGCGAG
AAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGATGGAGCTCCTTAC
CTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCC
AAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATAGATTTCATG
AACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCTACGAAGAC
AAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGC
AAACGTTTGCGCATCATGAA**GGAACTGAAGCA*TTGGACTTGCTCCCAGAGCA*TGGA
GA*GTACTGCA**GACAGATCATGATTTA*TATA*******GAGAAAAAGA*C*ATCA*T
GTC*ATATGACGG*T**CTGATCTGCATT

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR4D739TF 826 0 0
GG
AGAGAAATAAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACACGATCGGACAGCTTATGAACC
TTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCACTAAAGCCGTCGAAAGCCCGG
CCAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGGATCTCATGCTCAATC
TTCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAGCTTCCAAAGAGAAGA
CTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCTG
TGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGAGGCCA
GCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGATGGAG
CTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATG
CTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATAG
ATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCT
ACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCC
AGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAA**GGGACTGAAGCAATTGGACTTGCTCC*AGA
GCAATGGAGAAGTACTGCA**GACAGA*CATGATTTTATATA*******GAGAAAAAGA*
CCATCA*TGTC*ATATGACGGGT**CTGATCTGCATT
TATGATT

QA 3 819 3 819
DS 

RD RR4DK15TF 684 0 0
G
ACAGCTTCCAAAGAGAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAA
GTGGTGGGATGGCCACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACA
AGCGCCGAAGAGGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTG
AAGGTATCCATGGATGAAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGC
TATCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTAT
GGAGCACAAGGAATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGT
TCCGAATATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTC
CCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAA*GGGAACTGAAGC
AATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TAT
AATAAGAAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTAT
GATTTTTATGTATTTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATC
TAGGGCAATAGTATTATGTTACC

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DS 

RD RR4CF49JQ 446 0 0
GATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATG
ATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCA
AGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTC
GTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAA*GGGAACTGAAGCAATTGGACTTGCTCC
CAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TATAATAAGAAGAAAAAA
AGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGGTCTGCATTTTATGATTTTTATGTATTT
CTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATT
ATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAA

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4AH17JQ 770 0 0
GATCTTAACAACGCCACAGCTTCTAAAGAGAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCT
CCTGCTAAAGCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATG
ACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGA
GGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGATGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTC
ACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTC
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AATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATG
CTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATG
AA*GGGGACTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAG
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TGATCTGCATTTTATGATTTTTATGTATTTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAA
TACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTA
ATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAATATCTCTGTGTTTGTGTCA
AAG

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DS 

RD RR4CF49TF 587 0 0
G
CCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCGGGATCTCTCTGATGCTTTGGC
CAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATAGATTTCAT
GAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCTACGAGGA
CAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTG
CAAACGTTTGCGCATCATGAA*GGGAACTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGG
AGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TATAATAAGAAGAAAAAAAGAACCATCAA
TGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTATGATTTTTATGTATTTCTATCTCCTAT
ATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGT
AAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAATATCTCTGTGTTT
GTGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAATGATCA
G

QA 2 586 2 586
DS 

RD RR4ES73JQ 592 0 0
TGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGAT
AGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAG
CTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGT
CCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAA*GGGAACTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCA
GAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TATAATAAGAAGAAAAAAAG
AACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTATGATTTTTATGTATTTCT
ATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATTAT
GTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAATATC
TCTGTGTTTGTGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAATGATCAATCATT
AATTGACATATGCATATATAAACATGTATGTATGTGTCTGTTATTGATCCC
C

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4AT59TF 816 0 0
G
CATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCGCCGAAGAGGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAA
TGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGGTATCCATGGATGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGT
TAACCTCACGATGTACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAG
CTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAA
GCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGA
TTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCG
CATCATGAA*GGGAACTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACCGCA
AGAACAGATCATGAATTT*TATAATAAGAAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGAC
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ATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAA
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TTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAATGATCAATCACTAATTGACATATGCATATATAA
ACATGTATGTATGTGTCTGTTATTGATCCCTACTAGAGCATGTGTCTGTCGGTTAATGTC
AATCACTACTTGATATATGCATATATAAATGTATG

QA 2 816 2 816
DS 

RD RR4AT59JQ 491 0 0
GGAGATGTCCCATGGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAA*GGG
AACTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACCGCAAGAACAGATCATG
AATTT*TATAATAAGAAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCT
GCATTTTATGATTTTTATGTATTTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTG
ATGGGTATTTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGA
CCAAAAGAGAGGAAACTGAAAATATCTCTGTGTTTGTGTCATATTTATTGCCCAGCATGT
GTCTGTCGGCTTAATGATCAATCACTAATTGACATATGCATATATAAACATGTATGTATG
TGTCTGTTATTGATCCCTACTAGAGCATGTGTCTGTCGGTTAATGTCAATCACTACTTGA
TATATGCATAT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR4D062JQ 436 0 0
CCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTT*TATAATAAGAAGAAAA
AAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTATGATTTTTATGTAT
TTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTA
TTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAA
TATCTCTGTGTTTGTGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAATGATCAAT
CACTAATTGACATATGCATATATAAACATGTATGTATGTGTCTGTTATTGATCCCTACTA
GAGCATGTGTCTGTCGGTTAATGTCAATCACTACTTGATATATGCATATATAAATGTATG
TACATGTGTTTTGACC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 2 15

CO CL98Contig1 1235 13 22 U
GCTTCGTTTGTTTATCGTCACTGCAACTTTCTCATCTTGATTAAAAAAAAAGACTAGAAA
AGAAGAAAGAGGATGAGGCCGATACTGATGAAGGGACACGAACGTCCATTGACGTTCCTT
AGGTACAACAGAGATGGAGACATGCTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACACTCCCACTCTC
TGGTATGCTGACAACGGCGAACGCCATGGAACCTTCCGTGGTCACAACGGTGCCGTTTGG
TGCTGCGATGTCTCAAGGGACTCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCG
AAGCTGTGGGATGTGAAAACCGGACAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCG
AGGTCTGTTGATTTTTCTCTTGGAGATAAGCTTGCGGTTATCACCACTGATCCCTTCATG
GAGCGTACTTCTGCTATTCATGTCAAACGCATCGCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGT
GAGTCTGTGCTTGTCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGG
GGACCATTGAACCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAGGATCTGGGAT
GCTGAGACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATC
ACGTCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGACT
GCAAAGCTGTGGGACATGAGGACGTTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGGGTTCCT
GTAAATGCCGTCTCCATGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTGGTCAAGAT
GCATCAGCTGTTACAACCACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTCGAGGCTAAATTTTATGAC
AAGATTCTGCAAGAGGAGATTGGTGGTGTGAAAGGTCATTTTGGACCTATAAATGCTTTG
GCATTCAACCCTGATGGAAAGAGTTTCTCAAGTGGAGGTGAAGATGGATACGTCAGATTG
CATCACTTTGACTCTGATTACTTCAACATCAGGATTTAGATCCTTTTTT*ACAACAAGTC
TCTTAATCCGCATTTTGTTTCTGTCTCTTTTCTGGATTATAAATGTTGTTTTTCCCTACT
ATCAATACTTTAATGGTGCTGAGATATGAAGTGTTTGAATTTTGGATCGAATCCTTAGAT
TTTGTACATTTCATACTTTTTGAATTACAAGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 35 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 15 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 20 55 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 15 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F721TF U 1
AF RR4BU59TF U 2
AF RR4D547TF U 4
AF RR4C301TF U 372
AF RR4FR22TF U 12
AF RR4G453TF U 12
AF RR4FC04TF U 12
AF RR4BU59JQ C 468
AF RR4BA15TF U 377
AF RR4FR22JQ C 420
AF RR4C301JQ C 432
AF RR4H433JQB C 468
AF RR4BA15JQ C 523
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BS 145 426 RR4F721TF
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AGGTACAACAGAGATGGAGACATACTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACACTCCCACTCTC
TGGTATGCTGACAACGGCGAACGCCATGGAACCTTCCGTGGTCACAACGGTGCCGTTTGG
TGCTGCGATGTCTCAAGGGACTCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCG
AAGCTGTGGGATGTGAAAACCGGACAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCG
AGGTCTGTTGATTTTTCTCTTGGAGATAAGCTTGCGGTTATCACCACTGATCCCTTCATG
GAGCGTGCTTCTGCTATTCATGTCAAACGCATCGCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGT
GAGTCTGTGCTTGTCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGG
GGACCATTGAACCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAGGATCTGGGAT
GCTGAGACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATC
ACGTCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACA*GACT
GCAAAGCTGTGGGACATGAG*ACGTTGACTCTTCT

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GGGGT
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AAGAGGATGAGGCCGATACTGATGAAGGGACACGAACGTCCATTGACGTTCCTTAGGTAC
AACAGAGATGGAGACATGCTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACACTCCCACTCTCTGGTAT
GCTGACAACGGCGAACGCCATGGAACCTTCCGTGGTCACAACGGTGCCGTTTGGTGCTGC
GATGTCTCAAGGGACTCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCGAAGCTG
TGGGATGTGAAAACCGGACAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCGAGGTCT
GTTGATTTTTCTCTTGGAGATAAGCTTGCGGTTATCACCACTGATCCCTTCATGGAGCGT
ACTTCTGCTATTCATGTCAAACGCATCGCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGTGAGTCT
GTGCTTGTCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCA
TTGAACCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAGGATCTGGGATGCTGAG
ACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACGTCG
CTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGACTGCAAAG
CTGTGGGACATGAG*ACGTTGACTCTTCTCA*GACTTACGTTTCAGGG*T

QA 6 775 6 775
DS 

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GGG
TTTGTTTATCGTCACTGCAACTTTGTCATCTCGATTAAAAAAAA*GACTAGAAAAGAAGA
AAGAGGATGAGGCCGATACTGATGAAGGGACACGAACGTCCATTGACGTTCCTTAGGTAC
AACAGAG**GGAGACATGCTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACACTCCCACTCTCTGGTAT
GCTGACAACGGCGAACGCCATGGAACCTTCCGTGGTCACAACGGTGCCGTTTGGTGCTGC
GATGTCTCAAGGGACTCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCGAAGCTG
TGGGATGTGAAAACCGGACAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCGAGGTCT
GTTGATTTTTCTCTTGGAGATAAGCTTGCGGTTATCACCACTGATCCCTTCATGGAGCGT
ACTTCTGCTATTCATGTCAAACGCATCGCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGTGAGTCT
GTGCTCGTCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCA
TTGAACCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAGGATCTGGGATGCTGAG
ACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACGCCG
CTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACA*GACTGCAAAG
CTGTGGGACA

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DS 

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TGTTCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAA
CCACACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTTAGGATCTGGGATGCTGAGACTGG
AAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACATCGCTCAC
TAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCGCTTGACAAGACTGCAAAGCTGTG
GGACATGAG

QA 1 369 1 369
DS 

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GG
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CAAGGGACTCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCGAAGCTGTGGGATG
TGAAAACCGGACAACAGTTGTCCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCGAGGTCTGTTGATT
TTTCTCTTGGAGATAAGCTTGCGGTTATCACCACTGATCCCTTCATGGAGCGTACTTCTG
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TCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAACC
AGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAG*ATCTGGGATGCTGAGACTGGAA
AATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGA*CACAATCACGTCGCTCACTA
AAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACA*GACTGCAAAGCTGTGGG
ACATGAG*ACGTTGACTCT*CTCA*GACTTACGTTTCAGGG*T
GCC

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR4G453TF 775 0 0
GG
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ATGGAGACATGCTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACACTCCCACTCTCTGGTATGCTGACA
ACGGCGAACGCCATGGAACCTTCCGTGGTCACAACGGTGCCGTTTGGTGCTGCGATGTCT
CAAGGGACCCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCGAAGCTGTGGGATG
TGAAAACCGGACAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCGAGGTCTGTTGATT
TTTCTCTTGGAGATAAGCTTGCGGTTATCACCACTGATCCCTTCATGGAGCGTACTTCTG
CTATTCATGTCAAACGCATCGCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGTGAGTCTGTGCTTG
TCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAACC
AGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAGGATCTGGGATGCTGAGACTGGAA
AATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACGTCGCTCACTA
AAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGG
ACATGAGGACGTTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGG
TGCTGTAAATGC

QA 3 763 3 763
DS 

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GG
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TGAGGCCGATACTGATGAAGGGACACGAACGTCCATTGACGTTCCTTAGGTACAACAGAG
ATGGAGACATGCTCTTCTCCTGCGCCAAGGATCACACTCCCACTCTCTGGTATGCTGACA
ACGGCGAACGCCATGGAACCTTCCGTGGTCACAACGGTGCCGTTTGGTGCTGCGATGTCT
CAAGGGACTCGTTGACGTTGATAACCGGAAGTGCTGATCAGACTGCGAAGCTGTGGGATG
TGAAAACCGGACAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCTCCCGCGAGGTCTGTTGATT
TTTCTCTTGGAGATAAGCTTACGGTTATCACCACTGATCCCTTCATGGAGCGTACTTCTG
CTATTCATGTCAAACGCATCGCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGTGAGTCTGTGCTTG
TCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAACC
AGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTCAGGATCTGGGATGCTGAGACTGGAA
AATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACGTCGCTCACTA
AAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGG
ACATGAGGACGTTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGG*TGCCTGTAAATGCCGTCT
CCATGTCT

QA 3 790 3 790
DS 

RD RR4BU59JQ 598 0 0
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TAAGAACACAATCACGTCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTC
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ATACGTCAGATTGCATCACTTTGACTCTGATTACTTCAACATCAGGATTTAGATCTTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BA15TF 776 0 0
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TTCATGTCAAACGCATCTCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGTGAGTCTGTGCTTGTCC
TTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAACCAGA
CCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTTAGGATCTGGGATGCTGAGACTGGAAAAT
TGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACATCGCTCACTAAAG
CAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCGCTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGGACA
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TGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTGGTCAAGATGCATCAGCTGTTACAA
CCACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTCGAGGCTAAATTTTATGACAAGATTCTGCAAGAGG
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GAAAGAGTTTCTCAAGTGGAGGTGAAGATGGATACGTCAGATTGCATCACTTTGACTCTG
ATTACTTCAACATCAGGATTTAGATCCTTTTTT*ACAACAAGTCTCTTAATCCGCATTTT
GTTTCTGTCTCTTTTCTGGATTATAAATGTTGTTTTTCCCTACTATCAATACTTTA

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DS 

RD RR4FR22JQ 759 0 0
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TGCTGAGACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAAT
CACGTCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGAC
TGCAAAGCTGTGGGACATGAGGACGTTGACTCTCCTCAAGACTTACGTTTCAGGGGTGCC
TGTAAATGCCGTCTCCATGTCTCCCCTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGTGGTGGTCAAGA
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GGCATTCAACCCTGATGGAAAGAGTTTCTCAAGTGGAGGTGAAGATGGATACGTCAGATT
GCATCACTTTGACTCTGATTACTTCAACATCAGGATTTAGATC*TTTTCT*ACAACAAAT
CTCTCAATCCGCATTTTGTTTCTGTTTCTTTTCTGGATTATAAATGTTGTTTTTCCATAC
TATCAATACTTTAATGGTGCTGAGATATGAAGTGTTTGA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4C301JQ 758 0 0
TGCTATTCATGTCAAACGCATCTCTGAAGATCCTGCAGACCAGGTTAGTGAGTCTGTGCT
TGTTCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAA
CCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCTTAGGATCTGGGATGCTGAGACTGG
AAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCATAAGAACACAATCACATCGCTCAC
TAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCGCTTGACAAGACTGCAAAGCTGTG
GGACATGAGGACGTTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGGGTTCCTGTAAATGCCGT
CTCCATGTCTCCACTTTTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTGGTCAAGATGCATCAGCTGT
TACAACCACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTCGAGGCTAAATTTTATGACAAGATTCTGCA
AGAGGCGATTGGTGGTGTGAAAGGTCATTTTGGACCTATAAATGCTTTGGCATTCAACCC
TGATGGAAAGAGTTTCTCAAGTGGAGGTGAAGATGGATACGTCAGATTGCATCACTTTGA
CTCTGATTACTTCAACATCAGGATTTAGATCCTTTTTTTACAACAAGTCTCTTAATCCGC
ATTTTGTTTCTGTCTCTTTTCTGGATTATAAATGTTGTTTTTCCCTACTATCAATACTTT
AATGGTGCTGAGATATGAAGTGTTTGAATTTTGGATC
G

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4H433JQB 696 0 0
AGACCAGGTTAGTGAGTCTGTGCTTGTCCTTGAGAGCCCTAATGGGAGGAAGAGGATAAA
CAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAACCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCTGTGCT
TAGGATCTGGGATGCTGAGACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTGGGGCA
TAAGAACACAATCACATCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTC
GCTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGGACATGAGGACGTTGACTCTTCTCAAGACTTACGC
TTCAGGGGTTCCTGTAAATGCCGTCTCCATGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGG
AGGTGGTCAAGATGCATCAGCTGTTACAACCACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTCGAGGC
TAAATTTTATGACAAGATTCTGCAAGAGGAGATTGGTGGTGTGAAAGGTCATTTTGGACC
TATAAATGCTTTGGCATTCAACCCTGATGGAAAGAGTTTCTCAAGTGGAGGTGAAGATGG
ATACGTCAGATTGCATCACTTTGACTCTGATTACTTCAACATCAGGATTTAGATCCTTTT
TT*ACAACAAGTCTCTTAATCCGCATTTTGTTTCTGTCTCTTTTCTGGATTATAAATGTT
GTTTTTCCCTACTATCGATACTTTAATGGTGCTGAG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4BA15JQ 713 0 0
ATAAACAGAGCTGTTTGGGGACCATTGAACCAGACCATTGTTAGTGGTGGTGAAGATGCT
GTGCTTAGGATCTGGGATGCTGAGACTGGAAAATTGCTCAAGGAGTCAGATGCGGAAGTG
GGGCATAAGAACACAATCACATCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACT
GGTTCGCTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGGACATGAGGACGTTGACTCTTCTCAAGACT
TACGTTTCAGGGGTTCCTGTAAATGCCGTCTCCATGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTG
CTTGGAGGTGGTCAAGATGCATCAGCTGTTACAACCACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTC
GAGGCTAAATTTTATGACAAGATTCTGCAAGAGGAGATTGGTGGTGTGAAAGGTCATTTT
GGACCTATAAATGCTTTGGCATTCA*CCCTGATGGAAAGAGTTTCTCAAGTGGAGGTGAA
GATGGATACGTCAGATTGCATCACTTTGACTCTGATTACTTCAACATCAGGATTTAGATC
CTTTTTT*ACAACAAGTCTCTTAATCCGCATTTTGTTTCTGTCTCTTTTCTGGATTATAA
ATGTTGTTTTTCCCTACTATCAATACTTTAATGGTGCTGAGATATGAAGTGTTTGAATTT
TGGATCGAATCCTTAGATTTTGTACATTTCATACTTTTTGAATTACAAGTTAT

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL98Contig2 726 2 3 U
GGTCGTAGGTTTGTAACTTGTAATTCAAAAAAGTATGAAATGTACAAAATCTAAGGATTC
GATCCAAAATTCAAACACTTCATATCTCAGCACCATTAAAGTATTGATAGTATGGAAAAA
CAACATTTATAATCCAGAAAAGAAACAGAAACAAAATGCGGATTGAGAGATTTGTTGTAA
AAAAGATCTAAATCCTGATGTTGAAGTAATCAGAGTCAAAGTGATGCAATCTGACGTATC
CATCTTCACCTCCACTTGAGAAACTCTTTCCATCAGGGTTGAATGCCAAAGCATTTATAG
GTCCAAAATGACCTTTCACACCACCAATCTCCTCTTGCAGAATCTTGTCATAAAACTTAG
CCTCGAACTTCCCAGCACGATGATCAGTGGTTGTAACAGCTGATGCATCTTGACCACCAC
CAAGCACAACATGGTCAAGAAGGGGAGACATGGAGACGGCATTTACAGGCACCCCTGAAA
CGTAAGTCTTGAGAAGAGTCAACGTCCTCATGTCCCACAGCTTTGCAGTCTTGTCAAGTG
AACCAGTAATGAAGTGAGAATCATCAGCTGCTTTAGTGAGCGACGTGATTGTGTTCTTAT
GCCCCACTTCCGCATCTGACTCCTTGAGCAATTTTCCAGTCTCAGCATCCCAGATCCTGA
GCACAGCATCTTCACCACCACTAACAATGGTCTGGTTCAATGGTCCCCAAACAGCTCTGT
TTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4F721JQ U 61
AF RR4FC04JQ U 1
BS 1 146 RR4FC04JQ
BS 147 147 RR4F721JQ
BS 148 726 RR4FC04JQ

RD RR4F721JQ 652 0 0
GATCCAAAATTCAAACACTTCATATCTCAGCACCATTAAAGTATTGATAGTATGGAAAAA
CAACATTTATAATCCAGAAAAGAAACAGAAACAAAATGCGGATTGAGAGATTTGTTGTAG
AAAAGATCTAAATCCTGATGTTGAAGTAATCAGAGTCAAAGTGATGCAATCTGACGTATC
CATCTTCACCTCCACTTGAGAAACTCTTTCCATCAGGGTTGAATGCCAAAGCATTTATAG
GTCCAAAATGACCTTTCACACCACCAATCTCCTCTTGCAGAATCTTGTCATAAAACTTAG
CCTCGAACTTCCCAGCACGATGATCAGTGGTTGTAACAGCTGATGCATCTTGACCACCAC
CAAGCACAACATGGTCAAGAAGGGGAGACATGGAGACGGCATTTACAGGCACCCCTGAAA
CGTAAGTCTTGAGAAGAGTCAACGTCCTCATGTCCCACAGCTTTGCAGTCTTGTCAAGTG
AACCAGTAATGAAGTGAGAATCATCAGCTGCTTTAGTGAGCGACGTGATTGTGTTCTTAT
GCCCCACTTCCGCATCTGACTCCTTGAGCAATTTTCCAGTCTCAGCATCCCAGATCCTGA
GCACAGCATCTTCACCACCACTAACAATGGTCTGGTTCAATGGTCCCCAAAC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4FC04JQ 726 0 0
GGTCGTAGGTTTGTAACTTGTAATTCAAAAAAGTATGAAATGTACAAAATCTAAGGATTC
GATCCAAAATTCAAACACTTCATATCTCAGCACCATTAAAGTATTGATAGTATGGAAAAA
CAACATTTATAATCCAGAAAAGAAACGGAAACAAAATGCGGATTGAGAGATTTGTTGTAA
AAAAGATCTAAATCCTGATGTTGAAGTAATCAGAGTCAAAGTGATGCAATCTGACGTATC
CATCTTCACCTCCACTTGAGAAACTCTTTCCATCAGGGTTGAATGCCAAAGCATTTATAG
GTCCAAAATGACCTTTCACACCACCAATCTCCTCTTGCAGAATCTTGTCATAAAACTTAG
CCTCGAACTTCCCAGCACGATGATCAGTGGTTGTAACAGCTGATGCATCTTGACCACCAC
CAAGCACAACATGGTCAAGAAGGGGAGACATGGAGACGGCATTTACAGGCACCCCTGAAA
CGTAAGTCTTGAGAAGAGTCAACGTCCTCATGTCCCACAGCTTTGCAGTCTTGTCAAGTG
AACCAGTAATGAAGTGAGAATCATCAGCTGCTTTAGTGAGCGACGTGATTGTGTTCTTAT
GCCCCACTTCCGCATCTGACTCCTTGAGCAATTTTCCAGTCTCAGCATCCCAGATCCTGA
GCACAGCATCTTCACCACCACTAACAATGGTCTGGTTCAATGGTCCCCAAACAGCTCTGT
TTATCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 15

CO CL99Contig1 763 15 11 U
GGACTCGATAACCAACCACCGTGCGTCTCGACCTTTACCTTCCTTCTTTCTTTCTCTCTC
TCTCAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAG
CAATCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGGG
GATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCC
TACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATA
CCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAA
GCTCGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAG
AACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTC
TGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGA
GTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTT
GTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTT
TCTTAAAAAGAAAAAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACT
AAAGAATTGAAGACTCGTTTATCCATGCAAACTAACGTTCTCC


BQ
35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 60 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 55 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 55 80 80 80 80 80 80 80 
65 80 80 80 80 80 80 80 15 15 15 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 45 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 75 75 
75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 45 75 75 75 70 70 45 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 

AF RR4GV02TF U 1
AF RR4GJ55TF U 1
AF RR4CG66JQ C 1
AF RR4H045TF U 35
AF RR4D849JQ C 58
AF RR4CG66TF U 1
AF RR4FY66TF U 1
AF RR4D849TF U 1
AF RR4GJ55JQ C 2
AF RR4GV02JQ C 16
AF RR4EO45TF U 37
AF RR4AJ89JQ C 68
AF RR4H045JQ C 173
AF RR4FY66JQ C 76
AF RR4AJ89TF U 68
BS 1 3 RR4CG66TF
BS 4 548 RR4GV02TF
BS 549 549 RR4H045TF
BS 550 651 RR4GV02TF
BS 652 668 RR4H045TF
BS 669 671 RR4AJ89TF
BS 672 740 RR4H045TF
BS 741 742 RR4CG66TF
BS 743 743 RR4D849TF
BS 744 760 RR4EO45TF
BS 761 763 RR4AJ89TF

RD RR4GV02TF 651 0 0
GGG
CTCGATAACCAACCACCGTGCGTCTCGACCTTTACCTTCCTTCTTTCTTTCTCTCTCTCT
CAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAA
TCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGGGGAT
AAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTAC
CCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCC
TATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCT
CGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAAC
TGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGA
GAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTG
GACTCTTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTC
ATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTG

QA 4 651 4 651
DS 

RD RR4GJ55TF 733 0 0
GGACTCGATAACCAACCACCGTGCGTCTCGACCTTTACCTTCCTTCTTTCTTTCTCTCTC
TCTCAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAG
CAATCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGGG
GATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCC
TACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATA
CCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAA
GCTCGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAG
AACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAA*TGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTC
TGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGA
GTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTT
GTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAAGTTTTCTTATCTGAATCCTTTT
TCTTAAAAG**AAAAACTGGGGAAAA*GATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATA
CTAAAGATTGAAGACT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4CG66JQ 748 0 0
GGACTCGATAACCAACCACCGTGCGTCTCGACCTTTACCTTCCTTCTTTCTTTCTCTCTC
TCTCAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAG
CAATCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGGG
GATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCC
TACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATA
CCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAA
GCTCGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAG
AACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTC
TGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGA
GTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTT
GTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTT
TCTTAAAAAGAAAAAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACT
AAAGAATTGAAGACTCGTTTATCCATGC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4H045TF 706 0 0
GG
ACCTTCCTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCATAA*CCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATC
GAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACG
TCTGCTTAGTGAACCTGCGCCGGGGATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTA
TTTCAATGTCATTATCCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTT
GGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAA
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AGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTTTCTTAAAAG**AAAAACTGGGGAAAAAGATTTGTAC
TCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAAAGAATTGAAGACTCGTTT

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DS 

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GGGGATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGCTATTTCAATGTCATGATCCTTGG
TCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGA
ATACCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGA
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AAGAACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACT
GTCTGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAA
GGAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATC
GTTGTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCT
TTTTCTTAAAAAGAAAAAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATA
ACTAAAGAATTGAAGACTCTTTTATCCAT
AC

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DS 

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GATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCC
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AACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTC
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GTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTT
GTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAG*TTTTCTTATCTGA*TCCTTTT
*CTTAAAAG**AAAAACTGGGGAAAA*GATTTGTACTCTCTGA*TCT*CTTTGTATAACT
AAAGA*TTGA*GACTCGTTTAT
CATGC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4FY66TF 746 0 0
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TCTCAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAG
CAATCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGAG
GATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCC
TACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATA
CCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAA
GCTCGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAG
AACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTC
TGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGA
GTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTT
GTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTT
TCTTAAAAG**AAAAACTGGGGAAAA*GATT*GTACTCTCTGA*TCTTCTTTGTATA*CT
AAAGA*TTGA*GACTCGTTTAT
ACAT

QA 1 742 1 742
DS 

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TCTCAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAG
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GATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGCTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCC
TACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATA
CCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAA
GCTCGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAG
AACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTC
TGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGA
GTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTT
GTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTA*GGTTTTCTTATCTGAATCCTTTT
TCTTAAAAG**AAAAACTGGGGAAAA*GATTTGTACTCTCTGA*TCTTCTTTGTATA*CT
AAAGAATTGAAGACTCTTTTATC
ATACAAAAAAA

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DS 

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CTCAAAAACCCTAAATTCTTCTCAGGAGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGC
AATCTTCCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGGGG
ATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCT
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ACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAA*TGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCT
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TGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTG
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CTTAAAAAGAAAAAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTA
AAGAATTGAAGACTCGTTTATCCATGCAAACTAACGTTCTCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4GV02JQ 748 0 0
ACCA
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GTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGAAGGATCTGCCTT
GACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCCTCTTGAGCATT
CAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACATAGCTAAGCAT
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ATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTTTCTTAAAAAGAAAAAACTG
GGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAAAGAATTGAAGACTCGTT
TATCCATGCAAACTAACGTTCTCC

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DS 

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GG
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AGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGA
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GGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCAC
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GTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAG
GTTTTCTTATCTGA*TCCTTTTTCTTAAAAG**AAAAACTGGGGAAAA*GATTTGTACTC
TCTGAATCTTCTTTGTATAACTAAAGAATTGA*GACTCGTTTATCCATGCAAACTAACGT
TC

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DS 

RD RR4AJ89JQ 696 0 0
G
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GGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCC
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DS 

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GCGCCGGGGATAAGCGCGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATTATC
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GAAGAATACCCTATGGCAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAAC
ATTGACAAGCTCGGAAGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTT
CAAATAAGAACTGTCCTCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGAT
CCACTGTCTGAGAACATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACA
GCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAA
CGATCGTTGTCATTTAAATGACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGA
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QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4FY66JQ 688 0 0
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CCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCCTCTTGAG
CATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACATAGCTAA
GCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATA
TGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAAATAACA
TTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTTTCTTAAAAAGAAAAA
ACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAAAGAATTGAAGACT
CGTTTATACATGCAAACTAACGTTCTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4AJ89TF 696 0 0
G
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CGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCGCCGGGGATAAGCG
CGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAGT
CTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGG
CAGCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGAA
GGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCC
TCTTGAGCATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACA
TAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTC
GTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTA
AATAACATTATATATGGTGAAACTCTTAAGGTTTTCTTATCTGAATCCTTTTTCTTAAAA
AGAAAAAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAAAGAATT
GAAGACTCGTTTATCCATGCAAACTAACGTTCTCC

QA 2 696 2 696
DS 



AS 2 14

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CCCTTGATCGACGGTCAAATCACCAACCTGTTAATCACGGGAGATTTAAGAAGACGATTC
TGACATTTAGATGAGTTGTGCCTTTTTAAGGTCGGACACAACTCCTCTGTCTTGGCTGCT
CCTTTCGTTGTAAACCACCTTATCAATGATTCCATACTCAACAGCCTCACTGGGACTAAA
ATATTTAGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGCGATTTACCAATATGCTTTGA
ATACAGCTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGCCTGATTTCTTTCCTTGCAATTTCAACATC
GGTTGCTTGTCCTTGGAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAA
TGCAGAACGATTTCCTTTAGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGCATT
CCCAACACAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAA
AGCCTCAGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTA
GAGGTAAATAGGCTTTTCCTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAACTCCGCGAGTATCAA
CTCAGTGACTGAAGGCACAAGAGACATTCCCAAATATACAATCCGGTTTTTGAACAGATA
AGATGCCAGATCCGGAGGAGGTTGTTCGTGTGCACTTCCTTTCGAAAAAGGTATAACCAT
GGTGACAACACCGCGCTTAGGCTTGGAGCTAGACATATTCAACGGATTAAGCGATTCGGA
ACGAAGCTTGGCGCCGCAGAAGTCACTAGAGATGCTTCCTCCGGTATACGGGGAGAGTAA
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TGAGACCCCGAAACGATAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO95JQ U 412
AF RR4EF92JQ U 20
AF RR4DP93JQ U 1
AF RR4EG38JQ U 7
AF RR4E573JQ U 1
AF RR4EG38TF C 244
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TTCAACATCCGTTGCTTGTCCTTGGAATCAAGCAATGGGCTGTTT

QA 1 105 1 105
DS 

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CG
TTTGAAATGTTTGAAACATAGTGAAAATACACCGATTCTGTTTCTAGGCATTCACAAGCC
TACACATATGGGTTTGTTCTGTTCAAATAACCCTAAAATTGCAGTACTACAAGTAATGTT
TTCAACACTTTTTTTTTACTTCGGTTCTGTGTCGATGTCCCCTTGATCGACGGTCAAATC
ACCAACCTGTTAATCACGGGAGATTTAAAAAAACGATTCTGACATTTAAATGAGTTGTGC
CTTTTTAAGGTCGGACACAACTCCTCTGTCTTGGCTGCTCCTTTCGTTGTAAACCACCTT
ATCAATGATTCCATACTCAACAGCCTCACTGGGACTAAAATATTTAGGGCGTTTCATGTC
AGCTTCAATCTGCTCCGGCGATTTACCAATATGCTTTGAATACAGCTTGACCATTTCTGT
CTTTATGTGCCTGATTTCTTTCCTTGCAATTTCAACATCGGTTGCTTGTCCTTGGAATCG
AGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAATGCAGAACGATTTCCTTTAGC
ACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGCATTCCCAACACAA

QA 3 591 3 591
DS 

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GTTTCTAGGCATTCACAAGCCTACACATATGGGTTTGTTCTGTTCAAATAACCCTAAAAT
TGCAGTACTACAAGTAATGTTTTCAACACTTTTTTTTTACTTCGGTTCTGTGTCGATGTC
CCCTTGATCGACGGTCAAATCACCAACCTGTTAATCACGGGAGATTTAAGAAGACGATTC
TGACATTTAGATGAGTTGTGCCTTTTTAAGGTCGGACACAACTCCTCTGTCTTGGCTGCT
CCTTTCGTTGTAAACCACCTTATCAATGATTCCATACTCAACAGCCTCACTGGGACTAAA
ATATTTAGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGCGATTTACCAATATGCTTTGA
ATACAGCTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGCCTGATTTCTTTCCTTGCAATTTCAACATC
GGTTGCTTGTCCTTGGAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAA
TGCAGAACGATTTCCTTTAGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGCATT
CCCAACACAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAA
AGCCTCAGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTA
GAGGTAAATAGGCT

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DS 

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AGGCATTCACAAGCCTACACATATGGGTTTGTTCTGTTCAAATAACCCTAAAATTGCAGT
ACTACAAGTAATGTTTTCAACACTTTTTTT**ACTTCGGTTCTGTGTCGATGTCCCCTTG
ATCGACGGTCAAATCACCAACCTGTTAATCACGGGAGATTTAAGAAGACGATTCTGACAT
TTAGATGAGTTGTGCCTTTTTAAGGTCGGACACAACTCCTCTGTCTTGGCTGCTCCTTTC
GTTGTAAACCACCTTATCAATGATTCCATACTCAACAGCCTCACTGGGACTAAAATATTT
AGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGCGATTTACCAATATGCTTTGAATACAG
CTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGCCTGATTTCTTTCCTTGCAATTTCAACATCGGTTGC
TTGTCCTTGGAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAATGCAGG
ACGATTTCCTTTAGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGAATTCCCAAC
ACAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCC*ATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTC
AGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAGGTA
A

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DS 

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ACTAGT
AATGAAATTGATTCATTTGAAATGTTTGAAACATAGTGAAGATACACCGATTCTGTTTCT
AGGCATTCACAAGCCTACACATATGGGTTTGTTCTGTTCAAATAACCCTAAAATTGCAGT
ACTACAAGTAATGTTTTCAACACTTTTTTTTTACTTCGGTTCTGTGTCGATGTCCCCTTG
ATCGACGGTCAAATCACCAACCTGTTAATCACGGGAGATTTAAGAAGACGATTCTGACAT
TTAGATGAGTTGTGCCTTTTTAAGGTCGGACACAACTCCTCTGTCTTGGCTGCTCCTTTC
GTTGTAAACCACCTTATCAATGATTCCATACTCAACAGCCTCACTGGGACTAAAATATTT
AGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGCGATTTACCAATATGCTTTGAATACAG
CTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGCCTGATTTCTTTCCTTGCAATTTCAACATCGGTTGC
TTGTCCTTGGAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAATGCAGA
ACGATTTCCTTTAGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGCATTCCCAAC
ACAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTC
AGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAGGTA
AATAGGCT

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DS 

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TTCGTTGTAAACCAC*TTATCAATGATTCCATACTCAACAGCCTCACTGGGACTAAAATA
TTTAGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGCGATTTACCAATATGCTTTGAATA
CAGCTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGCCTGATTTCTTTCCTTGCAATTTCAACATCGGT
TGCTTGTCCTTGGAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAATGC
AGGACGATTTCCTTTAGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGAATTCCC
AACACAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCC*ATGACATCATAAATTGCAAAAGC
CTCAGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAG
GTAAATAGGCTTTTCCTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAACTCCGCGAGTATCAACTC
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TGCCAGATCCGGAGGAGGTTGTTCGTGTGCACTTCCTTTCGAAAAAGGTATAACCATGGT
GACAACACCGCGCTTAGGCTTGGAGCTAGACATATTCAACGGATTAAGCGATTCGGAACG
AAGCTTGGCGCCGCAGAAGTCACTAGAGATGCTTCCTCCGGT
C

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DS 

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T
CTTGGAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAATGCAGAACGAT
TTCCTTTAGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGCATTCCCAACACAAA
GAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTCAGTAT
CATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAGGTAAATAG
GCTTTTCCTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAACTCCGCGAGTATCAACTCAGTGACTG
AAGGCACAAGAGACATTCCCAAATATACAATCCGGTTTTTGAACAGATAAGATGCCAGAT
CCGGAGGAGGTTGTTCGTGTGCACTTCCTTTCGAAAAAGGTATAACCATGGTGACAACAC
CGCGCTTAGGCTTGGAGCTAGACATATTCAACGGATTAAGCGATTCGGAACGAAGCTTGG
CGCCGCAGAAGTCACTAGAGATGCTTCCTCCGGTATACGGGGAGAGTAAGCCGTTCGAGA
GGGCCGAAGCTCTGAGAGAAGAAGAAGACGAAGAGCATCTCACTTTAGATCTCAGGTTAC
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TCGCTGCTGCTACCTCCATTTTTCGTTTGGTT
GCCC

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DS 

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AAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTCAGT
ATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAGGTAAAT
AGGCTTTTCCTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAACTCCGCGAGTATCAACTCAGTGAC
TGAAGGCACAAGAGACATTCCCAAATAAACAATCCGATTTTTGAACAGATAAGACGCCAG
ATCAGGAGGAGGTTGTTCGTGTGCACTTCCTTTCGAAAACGGTATAACCATGGTGACAAC
ACCGCGCTTAGGCTTGGAGCTAGACATATTCAACGGATTAAGCGATTGGGAACGAAGCTT
GGAGCCGCAGAAGTCACTAGAGATGCTTCCTCCGGTATACGGGGAGAGTAAGCCGTTCGA
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ACGTGTTGGAGACGGGATTATCGCGGGGGAACGAGCTCGGAGCGTT*TGAAGCTCGTCGC
AGTCGCTGCTGCTACCTCCATTTTTCGTTTGGTT
CC

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DS 

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CCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAGGTAAATAGGCTTTT
CCTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAGCTCCGCGAGTATCAACTCAGTGACTGAAGGCA
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GAGGTTGTTCGTGTGCACTTCCTTTCGAAAACGGTATAACCATGGTGACAACACCGCGCT
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AAGCTCTGAGAGAAGAAGAAGACGAAGAGCATCTCACTTTGGATCTCAGGTTACGTGTTG
GAGACGGGATTATCGCGGAGGAACGAGCTCGGAGCGTTGTGAAGCTCGTCGCAGTCGCTG
CTGCTACCTCCATTTTTCGTTTGGTTGGAGAGAGAGAGTCGAGTGAGACCCCGAAACGAT
AACCC

QA 1 665 1 665
DS 

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GATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTCAGTATCATAGCC
CAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCTGTAGAGTTTATGTAGAGGTAAATAGGCTTTTC
CTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAACTCCGCGAGTATCAACTCAGTGACTGAAGGCAC
AAGAGACATTCCCAAATATACAATCCGGTTTTTGAACAGATAAGATGCCAGATCCGGAGG
AGGTTGTTCGTGTGCACTTCCTTTCGAAAAAGGTATAACCATGGTGACAACACCGCGCTT
AGGCTTGGAGCTAGACATATTCAACGGATTAAGCGATTCGGAACGAAGCTTGGCGCCGCA
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AGCTCTGAGAGAAGAAGAAGACGAAGAGCATCTCACTTTAGATCTCAGGTTACGTGTTGG
AGACGGGATTATCGCGGAGGAACGAGCTCGGAGCGTTGTGAAGCTCGTCGCAGTCGCTGC
TGCTACCTCCATTTTTCGTTTGGTTGCAGAGAGAGAGTCGAGTGAGAC

QA 1 648 1 648
DS 



CO CL100Contig2 1213 4 18 U
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TCTAGGCATTCACAAGCCTACACATAATAGGTTTGTCTATGATTGAATAACCCTAAAAAT
TCAACATTAGTAGTAACATTTTTTCACATCTTTCAAGAGTTCACCTCGGTTCTGTGCCAA
CGATAGGTTCAACGATTCCTCCTTTGATCCGCGGTCAAACCAACAACCTGTTAATCATGG
GGGATTTTGGAAGACAATTCTGACATTAGATGAGTTGTGCCTTTTTTAGGTCGGACACAA
CTCCTCTGTCCTGGCTGCTCCTCTCGTTGTAAACAACCTTATCAATGATTCCGTATTCAA
CAGCCTCACTGGGACTAAAATATTTTGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGGG
ATTTACCAATATGCTTTGAATACAGCTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGATTGATTTCTT
TCCTTGCGATTTCAACATCGGTTGCTTGGCCTTGAAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCA
TTATAGTTGATGAGGGCAATGCAGAACGGTTTCCTTTCGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAG
CAGCTTCACCCCAAGCACTCCCAACGCAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCA
TGACATCATAAATTGCAAAAGCCTCGGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCG
TCCCCGTGGAGTTAATGTAGAGGTAAATAGGCTTGTCCTCGTATTCATACTGAAGGTAAA
GAAACTCGGCGAGTATCAACTCAGTGACTGAAGGCACAAGAGACATTCCCAAATATACAA
TTCTGTTTTTGAACAAATACGATGCCAAATCAGGAGGAGGCTGTTCGTGTGCACTCCCTT
TTGAAAAAGGTATAACCATAGTGACAACTCCGCGCTTAGGCTTCGAACTGGAGATATTCA
ACGGATTAAGCGATTCGGAACGAAGCTTGGCGCCGCAGAAGTCACTAGAGATGCTTCCTC
CGATGTACGACGAGAGTAAGCCATTCGAGAGAGAAGCTCTGAGAGAAGAAGAAGAAGACG
AAGAACATCTCACTTTAGATCTCAGATTACGCGTCGAAGACGGGATTATCGCTGACGTAC
GAGCTCGGAGCGTTGTGAAGCTCGTCGCAGTCGCTGCTGCTACCTCCATTTTTTTTCCCC
TTTGTTCACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ36JQ U 1
AF RR4EP32JQ U 18
AF RR4ER59TF C 539
AF RR4EP32TF C 578
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BS 124 124 RR4EP32JQ
BS 125 617 RR4EZ36JQ
BS 618 618 RR4EP32JQ
BS 619 636 RR4EZ36JQ
BS 637 754 RR4EP32JQ
BS 755 952 RR4ER59TF
BS 953 953 RR4EP32TF
BS 954 1022 RR4ER59TF
BS 1023 1023 RR4EP32TF
BS 1024 1029 RR4ER59TF
BS 1030 1031 RR4EP32TF
BS 1032 1103 RR4ER59TF
BS 1104 1104 RR4EP32TF
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RD RR4EZ36JQ 636 0 0
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TCAGCATTAGTAGTAACATTTTTTCACATCTTTCAAGAGTTCACCTCGGTTCTGTGCCAA
CGATAGGTTCAACGATTCCTCCTTTGATCCGCGGTCAAACCAACAACCTGTTAATCATGG
GGGATTTTGGAAGACAATTCTGACATTAGATGAGTTGTGCCTTTTTTAGGTCGGACACAA
CTCCTCTGTCCTGGCTGCTCCTCTCGTTGTAAACAACCTTATCAATGATTCCGTATTCAA
CAGCCTCACTGGGACTAAAATATTTTGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGGG
ATTTACCAATATGCTTTGAATACAGCTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGATTGATTTCTT
TCCTTGCGATTTCAACATCGGTTGCTTGGCCTTGAAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCA
TTATAGTTGATGAGGGCAATGCAGAACGGTTTCCTTTCGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAG
CAGCTTCACCCCAAGCATTCCCAACGCAAAGAGTAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4EP32JQ 737 0 0
CG
TTTAAAAAGTTTAGAACATTGAAAACTACACCAATTCTGTTTCTAGGCATTCACAAGCCT
ACACATAATAGGTTTGTCTATGATTGAATAACCCTAAAAATTCAACATTAGTAGTAACAT
TTTTTCACATCTTTCAAGAGTTCACCTCGGTTCTGTGCCAATGATAGGTTCAACGATTCC
TCCTTTGATCCGCGGTCAAACCAACAACCTGTTAATCATGGGGGATTTTGGAAGACAATT
CTGACATTAGATGAGTTGTGCCTTTTTTAGGTCGGACACAACTCCTCTGTCCTGGCTGCT
CCTCTCGTTGTAAACAACCTTATCAATGATTCCGTATTCAACAGCCTCACTGGGACTAAA
ATATTTTGGGCGTTTCATGTCAGCTTCAATCTGCTCCGGGGATTTACCAATATGCTTTGA
ATACAGCTTGACCATTTCTGTCTTTATGTGATTGATTTCTTTCCTTGCGATTTCAACATC
GGTTGCTTGGCCTTGAAATCGAGCAATGGGCTGTTTTATCATTATAGTTGATGAGGGCAA
TGCAGAACGGTTTCCTTTCGCACCAGCAGTCAGAAGCAAAGCAGCTTCACCCCAAGCACT
CCCAACGCAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAA
AGCCTCGGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCCGTGGAGTTAATGTA
GAGGTAAATAGGCTT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR4ER59TF 672 0 0
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AGCAGCTTCACCCCAAGCATTCCCAACGCAAAGAGTAAAGATTGGTGGTTTGACATACCC
CATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTCGGTATCATAGCCCAACTTCTCACCATTCTTGGT
CGTCCCTGTGGAGTTAATGTAGAGGTAAATAGGCTTGTCCTCGTATTCATACTGAAGGTA
AAGAAACTCGGCGAGTATCAACTCAGTGACTGAAGGCACAAGAGACATTCCCAAATATAC
AATTCTGTTTTTGAACAAATACGATGCCAAATCAGGAGGAGGCTGTTCGTGTGCACTCCC
TTTTGAAAAAGGTATAACCATAGTGACAACTCCGCGCTTAGGCTTCGAACTGGATATATT
CAACGGATTAAGCGATTCGGAACGAAGCTTGGCGCCGCAGAAGTCACTAGAGATGCTTCC
TCCGGTGTACGGGGAGAGTAAGCCATTCGAGAGAGAAGCTCTGAGAGAAGAAGAAGAAGA
CGAAGAACATCTCACTTTAGATCTCGGATTACGTGTCGAAGACGGGATTATCGCTGACGT
ACGAGCTCGGAGCGTTGTGAAGCTCGTCGCAGTCGCTGCTGCTACCTCCATTTTT
TTCCCCTTTGTTCACCC

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DS 

RD RR4EP32TF 636 0 0
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GATTGGTGGTTTGACATACCCCATGACATCATAAATTGCAAAAGCCTCGGTATCATAGCC
CAACTTCTCACCATTCTTGGTCGTCCCCGTGGAGTTAATGTAGAGGTAAATAGGCTTGTC
CTCGTCTTCATACTGAAGGTAAAGAAACTCGGCGAGTATCAACTCAGTGACTGAAGGCAC
AAGAGACATTCCCAAATATACAATTCTGTTTT*GAACAAATACGATGCCAAATCAGGAGG
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AGGCTTCGAGCTGGAGATATTCAACGGATTAAGCGATTCGGAACGAAGCTTGGCGCCGCA
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TCTGAGAGAAGAAGAAGAAGACGACGAACATCTCACTTTAGATCTCAGATTACGCTTCGA
AGACGGGATTATCGCTGACGTACGAGCTCGGAGCGTTGTGAAGCTCGTCGCAGTCGCTGC
TGCTACCTCCATTTTTTTTCCCCTTTGTTCACCCCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 15

CO CL101Contig1 674 15 9 U
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ATCTTCTTCTCACAAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCAC
ATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCAC
AGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGCCGGTGCCAGC
TCCATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCA
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CCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGA
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TAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTAT
TTTGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAG
TTATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTACTCATCTTCTCTTTATATATTTTGTCC
AATATTTAATCACG


BQ
10 10 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 70 70 70 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 10 80 80 85 85 85 85 85 70 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 55 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 35 65 65 65 60 50 40 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EX60TF U 1
AF RR4CX79TF U 3
AF RR4A624TF U 3
AF RR4A624JQ C 67
AF RR4BJ35TF U 5
AF RR4GC16TF U 3
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AF RR4G114TF U 3
AF RR4GC16JQ C 3
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AF RR4FP25TF U 3
AF RR4F685JQ C 5
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AF RR4GB84TF U 5
AF RR4GB84JQ C 72
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BS 85 156 RR4EX60TF
BS 157 157 RR4CX79TF
BS 158 422 RR4EX60TF
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BS 634 635 RR4A624TF
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TTTGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAG
TTATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTA

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DS 

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ATGTT*AAGATATGATAATATTATCTTATT

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DS 

RD RR4A624TF 636 0 0
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CTTCTTCTCACAAAAAAAA***GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACAT
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TGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAATGGCGGGCCGGTGCCAGCTC
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TTCCTGGAAAGTGCCGTGTCAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACA
CCGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATA
AATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTTTCTGGTTTTTATTT
TGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTT
ATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTACT
AAT

QA 1 633 1 633
DS 

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AAAAAAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTCGTTTTGACG
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GCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAATGGCGGGCCGGTGCCAGCTCCATGCTGCGCCGGA
GTTTCAAGATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAACAAGCATGTAAATGC
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TATTTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTTTCTGGTTTTTATTTTGTCGATGAAAAGT
TTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTTATGTTTAAGATATG
ATAATATTATCTTATTACT

QA 11 569 11 569
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RD RR4BJ35TF 630 0 0
GG
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TTCTCACCAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCT
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GAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCATG
CTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGTCAACAAGC
ATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCC
TGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGT
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AAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTTGTC
GATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTTATGT
TTAAGATATGATAATATTATCTTATTA
G

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR4GC16TF 631 0 0
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CTTCTTCTCACCAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACAT
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ATGTTTAAGATATGATAATATTATCAC
AAAA

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DS 

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CTTCACATGCCTTGTTTTAACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATG
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CTGCGACACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGT
CTAGTATAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGT
TTTTATTTTGTCGATGAATAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTG
TCTTAGTTATGTTTAAGATATGATAATATTATCAC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4G114TF 627 0 0
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TGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTC
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AATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTT
TGTCGATGAATAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTT
ATGTTTAAGATATGATAATATTATCAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4GC16JQ 627 0 0
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CTTCTTCTCACCAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACAT
GCCTTGTTTTAACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAG
TGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTC
CATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGTCAAC
AAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCC
TTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACA
CCGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGTATA
AATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTT
TGTCGATGAATAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTT
ATGTTTAAGATATGATAATATTATCAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4FP25JQ 579 0 0
CT
TTATCTTCTTCTCACAAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTC
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C

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CTTCTTCTCACAAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACAT
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C

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CACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTT***ATCTTCTTCTCACAAAAAAA
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TATTATCTTATTACTC

QA 17 632 17 632
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GG
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DS 

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CA
CAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTTTG
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G

QA 3 603 3 603
DS 



AS 2 15

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO57TF U 8
AF RR4EO57JQ C 8
AF RR4D741TF U 1
AF RR4D741JQ C 478
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TTC
CAAAAA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4EO57JQ 604 0 0
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AGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGGAAGAGCAAGCTCT
TAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGGAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGAT
TGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCA
ACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCGGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAA
ATTGGATGTGCAGAAACTAGCAAAGGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGA
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TTC
C

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4D741TF 823 0 0
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AGACCCAACGCATTG

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DS 

RD RR4D741JQ 619 0 0
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GAATATGGTTTTAACTTTA

QA 1 619 1 619
DS 



CO CL102Contig2 659 11 4 U
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AAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
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AGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCA
GAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCA
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GCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATT
ACTTTGCTATTATATGGCCTCTGCTCTTTTCTATGATGGACACATTTTCGTGGACTGTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ22TF U 1
AF RR4EM95JQ C 223
AF RR4GS95TF U 22
AF RR4F496TF U 33
AF RR4D318JQ C 426
AF RR4EJ22JQ C 1
AF RR4EM95TF U 1
AF RR4GS95JQ C 22
AF RR4D318TF U 33
AF RR4G643JQ C 33
AF RR4G643TF U 33
BS 1 481 RR4EJ22TF
BS 482 634 RR4EM95TF
BS 635 654 RR4G643TF
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C

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DS 

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GATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAG
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GATCTCCCTCGTTTT

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DS 

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GG
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AGCTCTTAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGGAAACGAAGAAGCATTGGGTAA
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AGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAA
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TGAGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAACACTACGATATCCCTAAAGTGGG
ACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTA

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ACTGTTGTTGGATCTCCCTCG

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DS 

RD RR4EJ22JQ 634 0 0
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CTCTTTCGATTTCAGCAGAGAGAGATGTCAGCGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTA
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AAACAGAAGAAACAGGAGGAGCAAGCTCTTAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGA
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AGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCA
GAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCA
AACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAA
CACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCT
GCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATT
ACTTTGCTATTATATGGCCTCTGCTCTTTTCTAT

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DS 

RD RR4EM95TF 634 0 0
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CTCTTTCGATTTCAGCAGAGAGAGATGTCAGCGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTA
AAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAACAGAAGAAACAGGAGGAGCAAGCTCTTAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGA
GGAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGATTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGT
AGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCA
GAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCA
AACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAA
CACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCT
GCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATT
ACTTTGCTATTATATGGCCTCTGCTCTTTTCTAT

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DS 

RD RR4GS95JQ 614 0 0
GG
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TGTGAAAGCAGGTGGAGTGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAACAGAAGAAACAGGAGGAGCA
AGCTCTTAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGGAAACGAAGAAGCATTGGGTAA
ATTGATTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAA
AGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAA
GCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCAAACAAGTCTCACCGTAACAGGAT
TGAGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAACACTACGATATCCCTAAAGTGGG
ACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGT
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CTCTTTTCTATG

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DS 

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TGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACT
GGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCAAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTT
CAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAACACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTA
AATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCT
ACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATTACTTTGCTATTATATGGCCTCTGCTCTTTTCT
ATGATGGACACATTTTCGTGGACTGTC

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DS 

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GGGCGGTCGTCTTCTGCAAGCTAAGCTCCTCTTTCGATTTCAGCAGAGAGAGATGTCAGC
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AGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACC
TGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACT
GGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCAAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTT
CAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAACACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTA
AATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCT
ACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATTACTTTGCTATTATATGGCCTCTGCTCTTTTCT
ATGATGGACACATTTTCGTGGA
CTGTC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 15

CO CL103Contig1 640 15 5 U
CGAATATAGTTTTAGCGCTTATTAATTATGTTTATTAATAATGATATTGCAAAGTATGAG
AATCAGATACTTGACACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA
*TGTAAAAAA*TTATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCT
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CCCTCTTGAAGGACCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGAT
AGAATCGACGCCCCGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCT
TCAGCATCATCGGCAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 40 40 40 45 60 60 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
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50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
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85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
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AF RR4AB06TF C 8
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AF RR4GA05JQ U 1
AF RR4GA05TF C 1
AF RR4AB06JQ U 8
AF RR4B183JQ U 14
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AF RR4B183TF C 14
AF RR4F990JQ U 9
AF RR4F990TF C 9
AF RR4AK59JQ U 17
AF RR4DJ11JQ U 14
AF RR4DJ11TF C 208
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RD RR4AB06TF 415 0 0
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TTTGGACGGCGGGACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGA
GGCAAACGAAGATGCTTTGCA*TTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*
TTTTCCCTTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAA
GGTCTTGAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGG

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4AK59TF 532 0 0
GCTTATTAATTATGTTTATTAATAATGATATTGCAAAGTATGAGAATCAGATACTTGACA
CTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TATAAAAAA*TTATA
AACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTTGAACGG
CGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAACGA
AGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCCCTT
GATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTGAA
TCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCTCC
GCAGGCAGGAGATCTAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCC
AACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGA

QA 1 532 1 532
DS 

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AATCAGATACTTGACACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA
*TGTAAAAAA*TTATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCT
TTGTAGTTTTGGACGGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTT
GACGGGAGGCAAACGAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGA
TACTGT*TTTTCCCTTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCAC
AGCCAAAGGTCTTGAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGA
GGGTCATCAAGTCTCCACAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGT
CCCTCTTGAAGGACCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGAT
AGAATCGACGCCCCGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCT
TCAGCATCATCGGCAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4GA05TF 638 0 0
CGAATAT
AGTTTTAGCGCTTATTAATTATGTTTATTAATAATGATATTGCAAAGTATGAGAATCAGA
TACTTGACACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAA
AAA*TTATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGT
TTTGGACGGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGA
GGCAAACGAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*
TTTTCCCTTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAA
GGTCTTGAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCAT
CAAGTCTCCACAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTT
GAAGGACCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCG
ACGCCCCGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCAT
CATCGGCAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTC

QA 8 638 8 638
DS 

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TACTTGGCACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAA
AAA*TTATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGT
TTTGGACGGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGA
GGCAAACGAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*
TTTTCCCTTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAA
GGTCTTGAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCAT
CAAGTCTCCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTT
GAAGGACCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCG
ACGCCCCGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCAT
CATCGGCAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTCC

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DS 

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G
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TAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTTGGAC
GGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAAC
GAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCCC
TTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTG
AATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCT
CCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGAC
CCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCC
GCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATCGGC
AGCGGAGTCTTGCTTTCC

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DS 

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ATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCCTTTAAAA*TGTAAAAAA*TTATAAACCCTC
AA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTTGGACGGCGG*ACT
TGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAACGAAGATGCT
TTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGTCTTTTCCCTTGATCCAT
TCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTGAATCGAGAG
CCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCTCCGCAGGCA
GGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCCAACGTTT
CTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCCGCCGTCGAA
TTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATCGGCAGCGGAGTC
TTGCTTTCC

QA 1 609 1 609
DS 

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CTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAAAAA*TTATA
AACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTATTTGTAGTTTTGGACGG
CGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAACGA
AGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCCCTT
GATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTGAA
TCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCTCC
GCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCC
AACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCCGC
CGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATCGGCAG
CGGAGTCTTGCTTTCC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4B183TF 619 0 0
G
GCGCTTATTAATTATGTTTATTAATAATGATATTGCAAAGTATGAGAATCAGATACTTGA
CACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAAAAA*TTA
TAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTTGGAC
GGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAAC
GAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCCC
TTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTG
AATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCT
CCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGAC
CCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCC
GCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATCGGC
AGCGGAGTCTTGCTTTCC

QA 2 619 2 619
DS 

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GC
TTTAGCGCTTATTAATTATGTTTATTAATAATGATATTGCAAAGTATGAGAATCAGATAC
TTGACACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAAAAA
*TTATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTT
GGACGGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGC
AAACGAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTT
TCCCTTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGT
CTTGAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAA
GTCTCCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAA
GGACCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACG
CCCCGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCAT
CGGCAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTCC

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DS 

RD RR4F990TF 631 0 0
GC
TTTAGCGCTTATTAATTATGTTTATTAATAATGATATTGCAAAGTATGAGAATCAGATAC
TTGACACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAAAAA
*TTATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTT
GGACGGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGC
AAACGAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTT
TCCCTTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGT
CTTGAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAA
GTCTCCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAA
GGACCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACG
CCCCGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCAT
CGGCAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTCC

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR4AK59JQ 624 0 0
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CTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TATAAAAAA*TTATA
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CGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAACGA
AGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCCCTT
GATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTGAA
TCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCTCC
GCAGGCAGGAGATCTAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCC
AACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCCGC
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CGGAGTCTTGCTTTAGGGTTT
TCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DJ11JQ 629 0 0
G
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CACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCCTTTTAAAA*TGTAAAAAA*TTA
TAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTTGGAC
GGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAAC
GAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGTTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCCC
TTGATCCATTCAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTG
AATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCT
CCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGAC
CCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCC
GCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGTATCATCGGC
AGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTT
TCTCC

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR4DJ11TF 435 0 0
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AAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTTGAATCGAGAGTCAG
TGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCTCCGCAGGCAGGAG
ATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCCAACGTTTCTAG
GGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCCCGCCGTCGAATTCC
GTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGTATCATCGGCAGCGGAGTCTTGC
TTTAGGGTTT
TCTCC

QA 1 430 1 430
DS 

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ACACTCGGAGATGCAA*GAAAACACACAGACACCAGTCC*TTTAAAA*TGTAAAAAA*TT
ATAAACCCTCAA*GCCACAGCGGCATCCGCAA*TCGCTTTCTTCTCTTTGTAGTTTTGGA
CGGCGG*ACTTGATAGCATCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAAA
CGAAGATGCTTTGCAATTTCCGCGCTCTTAATGGTAATAACTTCAGATACTGT*TTTTCC
CTTGATCCATTCAAAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCACCACAGCCAAAGGTCTT
GAATCGAGAGTCAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTC
TCCGCAGGCAGGAGATCCAACCAATCCTGTGCCAACGTCGGGATCGTCCCTCTTGAAGGA
CCCAACGTTTCTAGGGTTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGATAGAATCGACGCCC
CGCCGTCGAATTCCGTAGTCCTATAAAAGTCTTCTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATCGG
CAGCGGAGTCTTGCTTTAGGGTTTCCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 2 12

CO CL104Contig1 643 6 11 U
GGAGTCCTTGCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTG
AACAATAGCCATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAA
GGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACAT
TGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAG
AGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTTAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCG
TAGAATCTACGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAG
CGGTGGCGTTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGA
CACCAAAGGAGGAAGGAAAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGG
ACGTATCGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCT
TTGAAACCTATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAAT
ATCATTGCTGAAGACTTGGTCTCATAATGTCCAGAACTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DW24JQ C 1
AF RR4GZ62JQ C 29
AF RR4GZ62TF U 29
AF RR4DW24TF U 1
AF RR4DM43JQ C 8
AF RR4DM43TF U 8
BS 1 9 RR4DW24JQ
BS 10 32 RR4DW24TF
BS 33 84 RR4GZ62TF
BS 85 85 RR4DW24TF
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BS 622 623 RR4DW24TF
BS 624 643 RR4DM43TF

RD RR4DW24JQ 624 0 0
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AACAATAGCCATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAA
GGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACAT
TGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAG
AGCTGCATTTATGGCAAGGAAGGTATACCTTAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCG
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CGGTGGCGTTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGA
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ACGTATCGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCT
TTGAAACCTATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAAT
ATCATTGCTGAAGACTTGGTCTC
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4GZ62JQ 594 0 0
TTTT
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GTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGT
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CTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCTTTGAAACCTATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTA
TCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAAGACTTGGTC
C

QA 5 593 5 593
DS 

RD RR4GZ62TF 594 0 0
TTTT
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AAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCA
AGATCTAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCC
CTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTTA
GGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCA
GTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGT
TGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGGAAAATCACTTCCAGTG
GTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATCGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAAT
CTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCTTTGAAACCTATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTA
TCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAAGACTTGGTC
C

QA 5 593 5 593
DS 

RD RR4DW24TF 624 0 0
GGAGTCCTT
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTTAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGGAAAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATCGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCTTTGAAACCT
ATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCT
GAAGACTTGGTCTC
C

QA 10 623 10 623
DS 

RD RR4DM43JQ 636 0 0
GG
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAATATCGAGCTCCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTTAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGGAAAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGGCGTATCGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTGGATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCTTTGAAACCT
ATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCT
GAAGACTTGGTCTCATAATGTCCAGAACTTGTTC

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR4DM43TF 636 0 0
GG
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAATATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTTAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGGAAAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGGCGTATCGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTGGATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACCTTTGAAACCT
ATGTTCTGTTTTTAGTCGTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCT
GAAGACTTGGTCTCATAATGTCCAGAACTTGTTC

QA 3 636 3 636
DS 



CO CL104Contig2 747 6 6 U
GGTAGCCTTTGTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTGAGCTGCCTTGGGCTAAATCACCAG
TCGAAGGATCGCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAAGCAATGGCAACCGGTAAAACAGT
GAAAGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGG
CAAGATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGC
CCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCT
GAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGG
CAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGG*CATTGCCCGTCACATCCTCCAGC
AGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAA
GTGGACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTG
AATGTTGTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTT
TGTCTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATATCGTTGCTCAAGACTGTTCCCATAA
TGTTCAGAAACCGTCTCTGTTTCGAGTCTTTGAACCTTTAAATCTGCAGCATCATCATCT
AAAACAAAAGAAAATCATTTGGGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GV53JQ C 90
AF RR4GV53TF U 275
AF RR4ET49TF U 2
AF RR4EV76TF U 1
AF RR4A727JQ C 8
AF RR4A727TF U 8
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BS 302 302 RR4ET49TF
BS 303 709 RR4EV76TF
BS 710 710 RR4A727TF
BS 711 723 RR4EV76TF
BS 724 747 RR4A727TF

RD RR4GV53JQ 255 0 0
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AGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCATCATGGACAGACA
CTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTAGTACATCA
GAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCC
GTAGAATCTATGGAG

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4GV53TF 190 0 0
GCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGA
ATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGT
GGGCATTGCCCGTCACATCCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACAC
CAAAGGAGGA

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4ET49TF 668 0 0
GGAGCCTTT
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GCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAAGCAATGGCAACCGGTAAAACAGTGAAAGACGTC
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CCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATATCTGAGGGGAGGT
CTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCA
CCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGG*CATTGCCCGTCACATCCTCCAGCAGTTGGAGAC
TATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGGACAACG
GGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATGTTGTTT
TTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTGTCTTTTTC
TCCCAAAGAACAATTTTTATCAATATCGTTGCTCAAGACTGTTCCCATAATGTTCAGAA

QA 10 668 10 668
DS 

RD RR4EV76TF 742 0 0
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TCGAAGGATCGCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAAGCAATGGCAACCGGTAAAACAGT
GAAAGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGG
CAAGATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGC
CCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCT
GTGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGG
CAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGG*CATTGCCCGTCACATCCTCCAGC
AGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAA
GTGGACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTG
AATGTTGTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTT
TGTCTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATATCGTTGCTCAAGACTGTTCCCATAA
TGTTCAGAAACCGTCTCTGTTTCGAGTCTTTGAACCTTTAAATCTGCAGTATCATCATCT
AAA
CAAAGAAATCATTTGGGAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4A727JQ 740 0 0
GGG
GTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTGAGCTGCCTTGGGCTAAATCACCAGTCGAAGGATC
GCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAAGCAATGGCAACCGGTAAAACAGTGAAAGACGTC
TCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAG
CTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGAT
CCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGT
CTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCA
CCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGG*CATTGCCCGTCACATCCTCCAGCAGTTGGAGAC
TATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGGACAACG
GGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATGTTGTTT
TTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTGTCTTTTTC
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CCGTCTCTGTTTCGAGTCTTTGAACCTTTAAATCTGCAGCATCATCATCTAAAACAAAAG
AAAATCATTTGGGATTG

QA 4 740 4 740
DS 

RD RR4A727TF 740 0 0
GGG
GTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTGAGCTGCCTTGGGCTAAATCACCAGTCGAAGGATC
GCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAAGCAATGGCAACCGGTAAAACAGTGAAAGACGTC
TCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAG
CTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGAT
CCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGT
CTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCA
CCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGG*CATTGCCCGTCACATCCTCCAGCAGTTGGAGAC
TATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGGACAACG
GGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATGTTGTTT
TTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTGTCTTTTTC
TCCCAAAGAACAATTTTTATCAATATCGTTGCTCAAGACTGTTCCCATAATGTTCAGAAA
CCGTCTCTGTTTCGAGTCTTTGAACCTTTAAATCTGCAGCATCATCATCTAAAACAAAAG
AAAATCATTTGGGATTG

QA 4 740 4 740
DS 



AS 1 14

CO CL105Contig1 884 14 10 U
GGGCTAAAACGCAGAAGCTGATAAGGCTTCGTATCCTCTGCAACCATGGCGACTAGCTCT
CATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGA
GTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAAC
CATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAGGAAGAGAAGGGAGTTTATAGCT
AAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCT
GAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCTTGGAAGCCAAGGACCAAG
CTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGA
CCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAAC
AGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCAC
ACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTA
TACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGA
CTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCC
AACATCAGTCTTTTGCTGTCTTAAGTCTCCAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTTGTAA
GAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTATGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAATATTACA
GTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGTTTTGTGAGGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 0 45 45 45 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 60 60 60 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4CG70TF U 39
AF RR4H707TF U 21
AF RR4CU12TF U 39
AF RR4G747TF U 9
AF RR4FL12TF U 23
AF RR4FL12JQ C 254
AF RR4CC07TF U 39
AF RR4EX08TF U 40
AF RR4AM89TF U 1
AF RR4CC07JQ C 108
AF RR4C854TF U 39
AF RR4EX08JQ C 41
AF RR4CG70JQ C 179
AF RR4AM89JQ C 237
BS 1 32 RR4AM89TF
BS 33 33 RR4G747TF
BS 34 37 RR4AM89TF
BS 38 38 RR4G747TF
BS 39 454 RR4AM89TF
BS 455 455 RR4H707TF
BS 456 788 RR4AM89TF
BS 789 851 RR4C854TF
BS 852 881 RR4EX08JQ
BS 882 884 RR4AM89JQ

RD RR4CG70TF 490 0 0
TGCAACCATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAG
AATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATC
ATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAG
GAAGAGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGA
AGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAAC
TCCTTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAAT
TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
CAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTC
TAGGCAAAAC

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DS 

RD RR4H707TF 576 0 0
GGAAGGCTTCGTTTCCTG
TGCAACCATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAG
AATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATC
ATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAG
GAAGAGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGA
AGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAAC
TCCTTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAAT
TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
CAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTC
TAGGCAAAACGCAG*CATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGG
CGTTGAAATCGTCTTTCC

QA 19 576 19 576
DS 

RD RR4CU12TF 599 0 0
TGCAACCATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAG
AATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATC
ATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAG
GAAGAGAAGGGGGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGA
AGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAAC
TCCTTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAAT
TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
CAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTC
TAGGCAAAACGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGG
CGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4G747TF 661 0 0
GG
GCAGAAGCTGATAAGGCTTCGTA**CTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTC
TTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAGAATCCCAAGCAAGAATCTAGGAGTTTCTTCAT
TTATACCATCAGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCT
CGAACTTTGGATTCGCAATCGGTTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAG
AGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAG
AAGACACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATG
TCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAG
AGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGT
TATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTC
GTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTAGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCA
ACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTAT

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR4FL12TF 677 0 0
GGAAGGCTTCGTACTC
TGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAG
AATCCCAAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATCAGTGAACTCTCGGATATC
ATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCTAGCTCGAACTTTGGATTCGCAATCGGTTCCAG
GAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGA
AGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGACACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAAC
TCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAAT
TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
CAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGTTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTC
TAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGG
CGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCA
CAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTAC
T

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DS 

RD RR4FL12JQ 413 0 0
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ACACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCA
TGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGA
TTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGTTAT
CAATCTACAAAGGGATAGTGATGTTTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTA
TCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACA
TAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTAC

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4CC07TF 665 0 0
TGCAACCATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAG
AATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATC
ATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAG
GAAGAGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGA
AGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAAC
TCCTTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAAT
TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
CAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTC
TAGGCAAAACGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGG
CGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCA
CAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTAC
TTTTA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4EX08TF 711 0 0
TG
AACCATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAGAAT
CCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATCATT
GTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAGGAA
GAGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGC
AGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCC
TTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGA
GGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAA
ACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAG
GCAAAACGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGT
TGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAG
GAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTT
TAAATGAG*CACCAAACCCAACATCAGTCTTTTACTGTCTTAAGTCTCC

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR4AM89TF 788 0 0
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CATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGA
GTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAAC
CATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAGGAAGAGAAGGGAGTTTATAGCT
AAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCT
GAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCTTGGAAGCCAAGGACCAAG
CTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGA
CCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGTGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAAC
AGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCAC
ACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTA
TACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGA
CTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCC
AACATCAGTCTTTTGCTGTCTTAAGTCTCCAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTTGTAA
GAATTGTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4CC07JQ 719 0 0
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GGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAGGAAGAGAAG
GGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCC
GGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCTTGGAA
GCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTC
AGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGA
AGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAA
CGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAAT
CGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGT
GAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATG
AGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTGGCTGTCTTAAGTCTCCAGAGGTAGCCTGCTACT
CCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTATGGGATTTTGTTACTCGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4C854TF 817 0 0
TGCAACCATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATACCGAG
AATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATC
ATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAG
GAAGAGAAGGGGGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGA
AGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAAC
TCCTTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAAT
TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
CAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTC
TAGGCAAAACGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGG
CGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCA
CAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTAC
TTTTAAATGAG*CAC*AAACCCAACATCAGTCTTTTGCTGTCT*AAGTCTCCAGAG*TAG
CCTGCTACTCCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTATGGGATTTTG
TTACTCGTCATGTAATATTACAGTGACAATTGA
AAAA

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4EX08JQ 844 0 0
G
AACCATGGCGACTAGCTCTCATCT*CTTCTTC*TCAGGCACTGCATATGATACCGAGAAT
CCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTGATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATCATT
GTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAGGAA
GAGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGC
AGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCC
TTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGA
GGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAA
ACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAG
GCAAAACGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGT
TGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAG
GAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTT
TAAATGAGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTTACTGTCTTAAGTCTCCAGAGGTAGCCT
GCTACTCCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTATGGGATTTTGTTA
CTCGTCATGTAATATTACAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGTTTTGTGAGGCT
TCC

QA 2 841 2 841
DS 

RD RR4CG70JQ 703 0 0
ACCATTCCAGCTCGAACTTTGGAGTCGCAATCGGTTCCAGGAAGAGAAGGGAGTTTATAG
CTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTG
CTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCTTGGAAGCCAAGGACCA
AGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAA
GACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGA
ACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTTTAGGCAAAACGCAGGCATCC
ACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTT
TATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAA
GACTTTACTATTTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTGAATGAGGCACCAAAC
CCAACATCAGTCTTTTGCTGTCTTAAGTCTCCAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTTGT
AAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTATGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAATATTA
CAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGTTTTGTGAGGCT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4AM89JQ 648 0 0
AGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGT
TGCTGAAACAGTAGAAGCCACTGAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCTTGGAAGCCAAGGAC
CAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGT
AAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGTGATCAAACTGGAAGTACCTGA
GAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCAT
CCACACCACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCC
TTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGC
AAGACTTTACTATTTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAA
ACCCAACATCAGTCTTTTGCTGTCTTAAGTCTCCAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTT
GTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTATGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAATAT
TACAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGTTTTGTGAGGCTTCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 2 14

CO CL106Contig1 1107 8 8 U
CCCCCTCTCTCTCTCTCAAGTGCCTCTCGCTCAGACAGATAGGGATCTCAACAACAACAA
CAACAGCAGCAGCACAAACCCTAGAGAGATTCGATTTTGAAGAAAATGGCCTACGCTTCT
CGCTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACAAGGGAGTCTGGGCGTTTTGCAGCAGCACAAT
GCTATTCCAGTCCGCGCTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCCTTCTTTTAAAGGAGATGAG
ATGTTGAAGGGCGTCTTTACGGAGATCAAAAACAAGTTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTC
CGTAAGGAAAAGATCACCCTTGCTCCTGAGGACCCTGCTGCGGTTAAACACTATGCTAAT
GTCATGAAGACCATCAGGCAAAAGGCAAACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATTAAATAT
GATATTGAGAACGAGACTAAAGAGATCCCAGACGCTCGTGCTTACCGGTTGAAGTTGAAG
GACATCCGCACCAGGAGGGGTCTTACTGATGAGCTTGGTGCTGAGGCCATGATGTTCGAG
GCTTTGGAGAAAGTTAAAAAGGATATCAAAAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGA
ATGGATCTTTTGGTTGCCGAGTTCGAAAAAGGCAACAAAAAGCTTGGGATCAGGAAAGAA
GATCTTCCTAAATATGAGGAGAACATGGAGCTAAGCATTGCCAAAGCACAACTGGATGAG
CTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCGATGGAATCTCAGAAAAAGAAGGAGGAATTCAAAGAT
GAAGAAATGCCTGACGTGAAATCTTTGGACATCCGTAACTTTATCTAAGGTCTGATGATC
ATTTTTATTTTGTTGTAAGAAAGGTAGAAGAAAGATCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTGAA
AGGGAAGATCTTTGTTCCCTTTTACTGTTTTTTGGTTTGTCGAGTAATAAGGGATCTCTC
TCTCACCATGGATTTGAAATACCAAATGGTGTCTAACTTTCTCTGTGTTTATTACGCCTG
AGATTTTTTTAGACAGAAGCGTGGTCTTCCATGTTTTTGATAATGGTGATAAATGAATTT
CGAGTACATTTAATTTTTTTTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4CR81TF U 1
AF RR4G594TF U 27
AF RR4GC42JQ C 665
AF RR4CR81JQ C 339
AF RR4FX13JQ C 489
AF RR4FX13TF U 489
AF RR4GQ61TF U 965
AF RR4GC42TF U 489
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BS 441 466 RR4G594TF
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BS 761 1101 RR4FX13TF
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GATATTGAGAACGAGACTAA
AGAG

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GG
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AAAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAGTTCGAAA
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AGCTAAGCATTGCCAAAGCACAACTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCGATGG
AATCTCAGAAAA
GA

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AAGATCTTTGTTCCCTTTTACTGTTTTTTGGTTTGTCGAGTAATAAGGGATCTCTCTCTC
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DS 

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AGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAGTTCGAAAAAGGCAACAAAAAGCTT
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TCTCTCT**TTTGAAAGGGAAGATCTTTGTTCCCTTTTACTGTTTTTTGGTTTGTCGAGT
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GC

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G
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AC

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G
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GATGCTCTTGAAGCGATGGAATCTCAGAAAAAGAAGGAGGAATTCAAAGATGAAGAAATG
CCTGACGTGAAATCTTTGGACATCCGTAACTTTATCTAAGGTCTGATGATCATTTTTATT
TTGTTGTAAGAAAGGTAGAAGAAAGATCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTGAAAGGGAAGAT
CTTTGTTCCCTTTTACTGTTTTTTGGTTTGTCGAGTAATAAGGGATCTCTCTCTCACCAT
GGATTTGAAATACCAAATGGTGTCTAACTTTCTCTGTGTTTATTACGCCTGAGATTTTTT
TAGACAGAAGCGTGGTCTTCCATGTTTTTGATAATGGTGATAAATGAATTTCGAGTACAT
TTAATTTTTTTT

QA 2 613 2 613
DS 



CO CL106Contig2 1078 6 14 U
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TCTTTCTTACAAAGAAATCAAATGCTTCTTCTTAGGATCATCATCAAACCTTACATAAAG
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AATCGAATCTCCTCTTTCTCGAAATTAGGGTTTGTGCTGCTGCGTTGAGATCCCTTCC


BQ
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35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4DZ42JQ U 150
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AF RR4DZ42TF C 598
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TCC

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GAAATCGAATCTCCTCTTTCTCGAAATTAGGGTTTGTGCTGCTGCGTTGAGATCCCT
TCC

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DS 

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GCACGAGCATCTGGGATCTCCTTAGTCTCGTTCTCAATATCATATTTGATGCGTTGAGAT
TCGGAGAACATGTCTGCCTTTTGCCTGATGGTCTTCATGACATTAGCATACTGTTTGACG
GCAGCAGGGTCCTCAGGATCAAGGGTGATCTTTTCCTTACGGAGAATATCAACTGCAGCC
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TGAAATCGAATCTCCTCTTTCTCGAAATTAGGGTTTGTGCTGCTGCGTTGAGATCCCT

QA 1 478 1 478
DS 



AS 3 15

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*AAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCTCTGTATGTGTTGAAATAATTTTAAAATAAGC
TCTGATAGCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 

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AF RR4E150TF U 1
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TA

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GTGGGTTGAATAAA

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DS 

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CCTTGAGCTCTCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTACAC
ATATATAATATCTTATTCAAGGCTAGCTAATAATAATTTAGAGATTTTTTTTTATGTTGG
GTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCATATAGA
CC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4GP18JQ 761 0 0
ATAA
AACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAGCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAAC
TTGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAATTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTC
CACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCA
CAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTG
ATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTTAAAAAA*TCC
ATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGGCACTGCAGGAGTTAGAAGCCATCCACAAG
AAAATCATTGAAGCAAACCAAGGCAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAA
AAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAG
ACTGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTA
CCTTGAGCTCTCTCTCTC**AGAGGCTGCTTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTACAC
ATATATAATATCTTATTCAAGGCTAGCTAATAATAATTTAGAGATTTTTTTA**TGTTGG
GTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCATATAGATCTATGGATCGACCTATT*
AAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCTCTGTATGTG

QA 5 761 5 761
DS 

RD RR4AV92TF 811 0 0
G
CGCATCAGTGACCTTTATGGAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAG***CTCTAGCTC
AACCACAACAGTGTCACAACTTGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAATTCATAAT
GAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCCAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAA
GAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGC
TGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTC
AGCAGAGGTTAAAAAA*TCCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGGCACTGCAGG
AGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGCTAGGTAGAGGGGTCAG
TGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAG
TGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTG
GTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTGAGCTCTCTCCC****AGAGGCTGCTTTATCTACTA
CATTCATTTTGCCACTACACATATATAAAATATTATTCAAGGCTAGCTAATAATAATTTA
GAGACTTTTTTT**TGTTGGGTTGAAATAAAACCAAAGTTGGTATAGGCCAATCATATAG
ATCTATGGATCGACCTATTTAAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCTCTGTATGTGTTG
AAATAATTTTAAAATAAGCTCTGATAGCA
C

QA 2 810 2 810
DS 

RD RR4BM81JQ 575 0 0
TCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGC
AAGTCAGCAGAGGTTAAAAAA*TCCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGGCACT
GCAGGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGCAAGGTAGAGGG
GTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGA
AACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTAC
AGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTGAGCTCTCTCTCTC**AGAGGCTGCTTTATC
TACTACATTCATTTTGCCACTACACATATATAATATCTTATTCAAGGCTAGCTAATAATA
ATTTAGAGATTTTTTTT*ATGTTGGGTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCA
TATAGATCTATGGATCGACCTATT*AAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCTCTGTATG
TGTTGAAATAATTTTAAAATAAGCTCTGGTAGCAT

QA 1 575 1 575
DS 



CO CL107Contig2 748 2 1 U
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TAATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTCTCTCCTCGCATCAGTGACCTTTA
TAAAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAGCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCAC
AACTTGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGAAATTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGT
GTCCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCT
CCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATAT
CTGATGCAGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTTAAAAAAT
CCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGGCACTGCAGGAGTTAGAAGCCATCCACA
AGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGCAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGC
AAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGG
AGACTGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGC
TACCTTGAGCTCTCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTAC
ACATATATAATATCTTATTCACGCTAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP18TF U 1
AF RR4D780TF U 1
BS 1 748 RR4D780TF

RD RR4GP18TF 633 0 0
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AGACTGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4D780TF 748 0 0
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TAAAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAGCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCAC
AACTTGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGAAATTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGT
GTCCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCT
CCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATAT
CTGATGCAGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTTAAAAAAT
CCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGGCACTGCAGGAGTTAGAAGCCATCCACA
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AAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGG
AGACTGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGC
TACCTTGAGCTCTCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTAC
ACATATATAATATCTTATTCACGCTAGC

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL107Contig3 889 5 4 U
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TGCCTTGGTTTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCCTGCAGTGCCTTGG
CCACCTCTTGTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTAACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATT
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TCTCCAGCTTCATTATGAATTCCATGACTTCTTTGGATGTCTCAGTCTCAAGTTGTGCCA
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CTGATGCGAGGAGAAAGGTGAAACATAATAATAACTGAACTCTTGCCATTATTTTTATGT
TATTTTATCTTTTGTATTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DX96JQ U 1
AF RR4E150JQ U 1
AF RR4E505JQ U 1
AF RR4E505TF C 178
AF RR4DX96TF C 250
BS 1 573 RR4DX96JQ
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BS 736 889 RR4E505TF

RD RR4DX96JQ 573 0 0
AGACAAATCTTCTCATCTTATGCTATCAGAGCTTATTTTAAAATTATTTCAACACATACA
GAGCGGTTACAGTCTATCTTTACTTACTTAAATAGGTCGATCCATAGATCTATATGATTG
GCCTATACCAACCTTGGTTTTATTTCAACCCAACAAAAAAAAAAATCTCTAAATTATTAT
TAGCTAGCCTTGAATAATATTTTATATATGTGTAGTGGCAAGATGAATGTAGTAGATAAA
GCAGCCTCTGAGAGAGAGCTCAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTG
AAGCAGCCTCGGTCTGGATAGCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGG
TGATTGTTTGTTTGATCTCTGTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTAACT
TGCCTTGGTTTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCCTGCAGTGCCTTGG
CCACCTCTTGTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTAACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATT
TTGAACCAATGAAAGACACCGCATCAGATATTT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4E150JQ 586 0 0
AGACAAATCTTCTCATCTTATGCTATCAGAGCTTATTTTAAAATTATTTCAACACATACA
GAGCGGTTACAGTCTATCTTTACTTACTTAAATAGGTCGATCCATAGATCTATATGATTG
GCCTATACCAACCTTGGTTTTATTTCAACCCAACAAAAAAAAA**TCTCTAAATTATTAT
TAGCTAGCCTTGAATAATATTTTATATATGTGTAGTGGCAAAATGGATGTAGTAGATAAA
GCAGCCTCTGAGAGAGAGCTCAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTG
AAGCAGCCTCGGTCTGGATAGCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCAATGTTTCCCATCAGG
TGATTGTTTGTTTGATCTCTGTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTACCT
TGCCTTGGTTTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCCTGCAGTGCCTTGG
CCACCTCTTGTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTAACCTCTGCTGACTCGCCAGTAAATT
TTGAACCAATGAAAGACACCGCATCAGATATTTTTCCAGCTGCAGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4E505JQ 735 0 0
AGACAAATCTTCTCATCTTATGCTATCAGAGCTTATTTTAAAATTATTTCAACACATACA
GAGCGGTTACAGTCTATCTTTACTTACTTAAATAGGTCGATCCATAGATCTATATGATTG
GCCTATACCAACCTTGGTTTTATTTCAACCCAACAAAAAAAAAAATCTCTAAATTATTAT
TAGCTAGCCTTGAATAATATTTTATATATGTGTAGTGGCAAGATGAATGTAGTAGATAAA
GCAGCCTCTGAGAGAGAGCTCAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTG
AAGCAGCCTCGGTCTGGATAGCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGG
TGATTGTTTGTTTGATCTCTGTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTAACT
TGCCTTGGTTTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCCTGCAGTGCCTTGG
CCACCTCTTGTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTAACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATT
TTGAACCAATGAAAGACACCGCATCAGATATTTTTCCAGCTGCAGCAGAGAAGGAGGCCA
CCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAGAAAGACTTGTATTCCTCCTTGGGTGGACACTTCT
TCTCCAGCTTCATTATGAATTCCATGACTTCTTTGGATGTCTCAGTCTCAAGTTGTGCCA
CTGTTGTGGTTGAGC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4E505TF 712 0 0
TATATAGCTAG
CTTGAATAATATTT*ATATATGTGTAGTGGCAAGATGAATGTAGTAGATAAAGCAGCCTC
TGAGAGAGAGCTCAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATT*GAAGCAGCC
TCGGTCTGGATAGCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGGTGATTGTT
TGTTTGATCTCTGTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTAACTTGCCTTGG
TTTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCCTGCAGTGCCTTGGCCACCTCT
TGTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTAACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATTTTGAACCA
ATGAAAGACACCGCATCAGATATTTTTCCAGCTGCAGCAGAGAAGGAGGCCACCATGGTA
CTCTTTAGTTTCTCGAAGAAAGACTTGTATTCCTCCTTGGGTGGACACTTCTTCTCCAGC
TTCATTATGAATTCCATGACTTCTTTGGATGTCTCAGTCTCAAGTTGTGCCACTGTTGTG
GTTGAGCTAGAGCTGGCGGTGGTGGCACTTGAAACATGTTCCATAAAGGTCACTGATGCG
AGGAGAAAGGTGAAACATAATAATAACTGAACTCTTGCCATTATTTTTATGTTATTTTAT
CTTTTGTATTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTAAAAA

QA 12 712 12 712
DS 

RD RR4DX96TF 640 0 0
GAGAGAGAGCTCAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTGAAGCAGCCT
CGGTCTGGATAGCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGGTGATTGTTT
GTTTGATCTCTGTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTAACTTGCCTTGGT
TTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCCTGCAGTGCCTTGGCCACCTCTT
GTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTAACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATTTTGAACCAA
TGAAAGACACCGCATCAGATATTTTTCCAGCTGCAGCAGAGAAGGAGGCCACCATGGTAC
TCTTTAGTTTCTCGAAGAAAGACTTGTATTCCTCCTTGGGTGGACACTTCTTCTCCAGCT
TCATTATGAATTCCATGACTTCTTTGGATGTCTCAGTCTCAAGTTGTGCCACTGTTGTGG
TTGAGCTAGAGCTGGCGGTGGTGGCACTTGAAACATGTTCCATAAAGGTCACTGATGCGA
GGAGAAAGGTGAAACATAATAATAACTGAACTCTTGCCATTATTTTTATGTTATTTTATC
TTTTGTATTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 15

CO CL108Contig1 672 13 6 U
GGACCACGGATAGTTGGAAGCATCAAGAGACAGAACAGCAATGGCTCCTTGTTCTTCCAT
CTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACC
AAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGACCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAA
CATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGG
CGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGA
CGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAA
GATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGC
CACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGT
CAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTT
GATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCC
CAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGA
TGAGTAGGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 45 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 60 60 60 60 60 

AF RR4CE73TF U 30
AF RR4AQ85JQ C 1
AF RR4EL43JQ C 129
AF RR4B275JQ C 81
AF RR4B275TF U 30
AF RR4CE73JQ C 90
AF RR4CH70TF U 30
AF RR4BE94JQ C 43
AF RR4BE94TF U 43
AF RR4C817JQ C 30
AF RR4C817TF U 30
AF RR4EL43TF U 4
AF RR4AQ85TF U 1
BS 1 5 RR4AQ85JQ
BS 6 31 RR4EL43TF
BS 32 32 RR4C817TF
BS 33 657 RR4B275TF
BS 658 658 RR4CH70TF
BS 659 672 RR4B275TF

RD RR4CE73TF 580 0 0
GGG
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CCAAACCTATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGACCC
GAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCA
CCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCA
GTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAGTATTTCAATTACATGGGGA
TGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATC
CCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGC
TGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACA
GAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAA
TATCGTCTCCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTG

QA 4 580 4 580
DS 

RD RR4AQ85JQ 672 0 0
GGACCACGGATAGTTGGAAGCATCAAGAGACAGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCAT
CTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACC
AAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAA
CAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAATTTCGGCAAGAACGG
CGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGA
CGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAA
GATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGC
CACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGT
CAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTT
GATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCC
CAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGA
TGAGTAGGTTAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4EL43JQ 544 0 0
TCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCCGAAACTTAACGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCG
GACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATG
CTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTG
AACAATACTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAG
CACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAG
GTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGTTACTCGGTCAAGGATG
CTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAGTAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTG
GCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTT
GTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAGG
TTAT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4B275JQ 592 0 0
CACTCTTCTCCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAAT
TCCTCGGGACCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACG
GTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCG
GAATTTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCA
ATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACC
TAAACATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAA
AGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAA
CCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTC
AGAAGGCTTGAATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGA
ATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCTGATGAGTAGGTTAT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4B275TF 643 0 0
GGG
GAACAGCAATGGCTCCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCA
CCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGACCC
GAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCA
CCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCA
GTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGA
TGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATC
CCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGC
TGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACA
GAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAA
TATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAG
AACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCTGATGAGTAGGTTAT

QA 4 643 4 643
DS 

RD RR4CE73JQ 583 0 0
CCACCAAACCTATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGA
CCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAA
CCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATG
GCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAGTATTTCAATTACATGG
GGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTC
ATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGG
AGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTG
ACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTT
GAATATCGTCTCCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGC
TAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4CH70TF 642 0 0
GGG
GAACAGCAATGGCTCCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCA
CCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGACCC
GAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCA
CCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCA
GCCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGA
TGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATC
CCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATATAGGAGC
TGCTTAGATCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACA
GAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAA
TATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAG
AACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAG
TTAT

QA 4 638 4 638
DS 

RD RR4BE94JQ 630 0 0
GGCTCCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCAT
CAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGACCCGAAACTTAAA
GCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTT
CAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACG
CGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTACAATTACATGGGGATGCTTGCGGT
AGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATAT
TCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGC
TGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAG
CGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTC
TGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGT
CTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4BE94TF 630 0 0
GGCTCCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCAT
CAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGGACCCGAAACTTAAA
GCTTCGGATCCGACCCAACATACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTT
CAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACG
CGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTACAATTACATGGGGATGCTTGCGGT
AGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATAT
TCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGC
TGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAG
CGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTC
TGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGT
CTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4C817JQ 643 0 0
GG
AGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCC
ACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACC
CGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACC
ACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGC
AGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGG
ATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGTACTTCTAAACCTAAACATTCAT
CCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAG
CTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGAC
AGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGA
ATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTA
GAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4C817TF 643 0 0
GG
AGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCC
ACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACC
CGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACC
ACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGC
AGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGG
ATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGTACTTCTAAACCTAAACATTCAT
CCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAG
CTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGAC
AGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGA
ATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTA
GAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4EL43TF 669 0 0
GG
ACGGATAGTTGGAAGCATCAAGAGACAGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCT
TCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGC
TGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCCGAAACTTAACGCTTCGGATCCGACCCAACAGAC
TCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCG
ATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACG
TTGAACAATACTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGG
AAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAG
AAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGTTACTCGGTCAAGG
ATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAGTAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCC
TTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAG
TTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGAGT
AGGTTAT

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR4AQ85TF 663 0 0
GGACC
ACGGATAGTTGGAAGCATCAAGAGACAGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCT
TCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGC
TGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGAC
TCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAATTTCGGCAAGAACGGCGTCG
ATGCTGAAAGTGCCGGAATCTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACG
TTGAACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGG
AAGCACTTCTAAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAG
AAGGTGACAAACCAAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGG
ATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTCGTGACTTGATCC
TTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCGTCTTCTGTCTGAAGTTAATGTCCCAGAG
TTTGTTTTTTTAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTGTGGGTTCCGCGGATGA

QA 6 663 6 663
DS 



CO CL108Contig2 438 2 2 U
GGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTACGGCAGTCAGACACGCTATGACTTCG
ACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGTACCT
ATTCGAAGATGGAAGCACTTCTTAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATCCTACTGATGT
TGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCT
ACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTC
GTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCTTCTTTTGTCTGAAGTT
ATGTCCCAGAGTTTTTTTTTTAAAGAATGTTGTGCTAGAATAAACTGTCTTTATGGGTTC
CGCGGATGAGTAGGTTAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GA57JQ C 1
AF RR4GA57TF U 1
BS 1 1 RR4GA57JQ
BS 2 438 RR4GA57TF

RD RR4GA57JQ 438 0 0
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ACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGTACCT
ATTCGAAGATGGAAGCACTTCTTAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATCCTACTGATGT
TGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCT
ACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTC
GTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCTTCTTTTGTCTGAAGTT
ATGTCCCAGAGTTTTTTTTTTAAAGAATGTTGTGCTAGAATAAACTGTCTTTATGGGTTC
CGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR4GA57TF 438 0 0
G
GAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTACGGCAGTCAGACACGCTATGACTTCGA
CAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGTACCTA
TTCGAAGATGGAAGCACTTCTTAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATCCTACTGATGTT
GGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTA
CTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGCGAAGAGATTCG
TGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCTTCTTTTGTCTGAAGTTA
TGTCCCAGAGTTTTTTTTTTAAAGAATGTTGTGCTAGAATAAACTGTCTTTATGGGTTCC
GCGGATGAGTAGGTTAT

QA 2 438 2 438
DS 



AS 3 11

CO CL109Contig1 721 6 13 U
GGGCTGTTTTAAGGTTTAGACTTGTCGCGTCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAG
GACATGGAGTTCGTGCGAGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTA
CAATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAG
TGAACGGTGCGATCCACAAGGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGTG
TCTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGA
TCATAAAGAAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGG
AGTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGGGGAG
AGACGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTA
TGACCTTGGAGACAGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCT
ATTAGTTCTTACTCTTCTTCCTTGTTCTTGCTGTGTGTTTTGGAACTCTGCAAATGTTTT
TTTTGTAGCGACTTGAACTAAGAATGTGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTT
CATTTTATGTGTAATGTGCGTAATCATTATTCATTTTGTTTATCAGAATCATGATTCAAC
C


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4DF82TF U 37
AF RR4B356TF U 17
AF RR4EH03TF U 8
AF RR4EH03JQ C 8
AF RR4AK93JQ C 1
AF RR4AK93TF U 1
BS 1 1 RR4AK93JQ
BS 2 10 RR4AK93TF
BS 11 17 RR4EH03TF
BS 18 38 RR4B356TF
BS 39 114 RR4DF82TF
BS 115 115 RR4B356TF
BS 116 142 RR4DF82TF
BS 143 543 RR4B356TF
BS 544 544 RR4EH03TF
BS 545 557 RR4B356TF
BS 558 560 RR4EH03TF
BS 561 669 RR4B356TF
BS 670 721 RR4AK93TF

RD RR4DF82TF 106 0 0
GG
GAGAAGACAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCGAGAACGAGGGATCTGTTCGCG
AGGGGGTTCAGGAAGATGGGTACAATCCCATTGTCCACGTACCT

QA 3 106 3 106
DS 

RD RR4B356TF 655 0 0
G
AGACTTGTCGCGTCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCG
AGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCATTGTCCACG
TACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCAC
AAGGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAA
CGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAGAAGAGACTT
CATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGTTCAAACTGAGAAAG
AAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGGGGAGAGACGATAAGCACCAAG
AGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTGGAGACAGTC
ACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATT*GTTCTTACTCTTC
***CTTGTTCTTGCTGTGTGTTTTGGAACTCTGCAAATGTTTTTTTTGTAGCGACTTGAA
CTAAGAATGTGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTTCATTTTATG
TG

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR4EH03TF 666 0 0
AGG
AAGGTTTAGACTTGTCGCGTCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGT
TCGTGCGAGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCATT
GTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGC
GATCCACAAGGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGTGTCTGGAACGT
CACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAGAA
GAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGTTCAAACT
GAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGGGGAGAGACGATAAG
CACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTGGA
GACAGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTCTT
ACTCTTCTTCCTTGTTCTTGCTGTGTGTTTTGGAACTCTGCAAATGTTTTTTTTGTAGCG
ACTTGAACTAAGAATGTGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTTCATTTTA
GAAAAA

QA 4 660 4 660
DS 

RD RR4EH03JQ 661 0 0
AGG
AAGGTTTAGACTTGTCGCGTCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGT
TCGTGCGAGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCATT
GTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGC
GATCCACAAGGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGTGTCTGGAACGT
CACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAGAA
GAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGTTCAAACT
GAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGGGGAGAGACGATAAG
CACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTGGA
GACAGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTCTT
ACTCTTCTTCCTTGTTCTTGCTGTGTGTTTTGGAACTCTGCAAATGTTTTTTTTGTAGCG
ACTTGAACTAAGAATGTGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTTCATTTTA
G

QA 4 660 4 660
DS 

RD RR4AK93JQ 721 0 0
GGGCTGTTTTAAGGTTTAGACTTGTCGCGTCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAG
GACATGGAGTTCGTGCGAGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTA
CAATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAG
TGAACGGTGCGATCCACAAGGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGTG
TCTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGA
TCATAAAGAAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGG
AGTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGGGGAG
AGACGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTA
TGACCTTGGAGACAGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCT
ATTAGTTCTTACTCTTCTTCCTTGTTCTTGCTGTGTGTTTTGGAACTCTGCAAATGTTTT
TTT*GTAGCGACTTGAACTAAGAATGTGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTT
CATTTTATGTGTAATGTGCGTAATCATTATTCATTTTGTTTATCAGAATCATGATTCAAC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AK93TF 721 0 0
G
GGCTGTTTTAAGGTTTAGACTTGTCGCGTCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAGG
ACATGGAGTTCGTGCGAGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTAC
AATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGT
GAACGGTGCGATCCACAAGGGCATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGTGT
CTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGAT
CATAAAGAAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGA
GTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGGGGAGA
GACGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTAT
GACCTTGGAGACAGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTA
TTAGTTCTTACTCTTCTTCCTTGTTCTTGCTGTGTGTTTTGGAACTCTGCAAATGTTTTT
TT*GTAGCGACTTGAACTAAGAATGTGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTTC
ATTTTATGTGTAATGTGCGTAATCATTATTCATTTTGTTTATCAGAATCATGATTCAACC

QA 2 721 2 721
DS 



CO CL109Contig2 667 3 3 U
GGACTTCGGCTGTTTTAAGGTTTAGACTTGTCCCGTCCACCAAAGAGGAAAAAAAATGCC
GGCAGGACATGGAGTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAA
GGGTACAATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGT
TAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGAATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGG
TCGCGTCTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATTGGAAA
CAGGATCATAAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGATGTGC
TGAGGAGTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAG
AGGAGAGACCATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGA
AGGTATGACCTTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGG
AGGCTATTAGTTTCTTACTTTCTTCCTTATTCTGGCTGTGTGTTTTTGCATATGTTTTCT
TTGTAACTCGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTTCGTTT
TATGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB32JQ C 251
AF RR4A128TFB U 6
AF RR4EB32TF U 1
BS 1 145 RR4EB32TF
BS 146 146 RR4A128TFB
BS 147 667 RR4EB32TF

RD RR4EB32JQ 269 0 0
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AAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGAGGAGAGACC
ATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACC
TTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTA
GGA

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR4A128TFB 641 0 0
GG
GGCTGTTTTAAGGTTTAGACTTGTCCCGTCCACCAAATAGGAAAAAAAATGCCGGCAGGA
CATGGAGTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACA
ATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTG
AGCGGTGCGATCCACAAGGGAATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGCGTC
TGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATTGGAAACAGGATC
ATAAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGATGTGCTGAGGAG
TTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGAGGAGAG
ACCAT**GCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATG
ACCTTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTAT
TAGTTTCTTACTTTCTTCCTTATTCTGGCTGTGTGTTTTTGCATATGTTTTCTTTGTAAC
TCGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGAATTTTGCAAT

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR4EB32TF 667 0 0
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GGCAGGACATGGAGTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAA
GGGTACAATCCCATTGTCCACGTACTTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGT
TAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGAATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGG
TCGCGTCTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATTGGAAA
CAGGATCATAAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGATGTGC
TGAGGAGTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAG
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AGGTATGACCTTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGG
AGGCTATTAGTTTCTTACTTTCTTCCTTATTCTGGCTGTGTGTTTTTGCATATGTTTTCT
TTGTAACTCGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTTTCGTTT
TATGCGT

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL109Contig3 624 2 3 U
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AAACATATCAAGGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAAAGAAAGTAGAACTAATAGCCTCCC
TTAAGATCGTTGACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCA
ACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCACCTTTG
GCTTTGGCTGCAGCCTTGAGCTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGTTTGAACTCCTCCGCG
CACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATCCTGTTA
CCAATCTGTTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCA
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TTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGC
ATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE38JQ U 139
AF RR4EE38TF C 1
BS 1 138 RR4EE38TF
BS 139 408 RR4EE38JQ
BS 409 624 RR4EE38TF

RD RR4EE38JQ 270 0 0
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TGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATCCTGTTACCAATCTGTTTGTTCACT
TCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTC

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR4EE38TF 624 0 0
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AAACATATCAAGGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAAAGAAAGTAGAACTAATAGCCTCCC
TTAAGATCGTTGACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCA
ACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCACCTTTG
GCTTTGGCTGCAGCCTTGAGCTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGTTTGAACTCCTCCGCG
CACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATCCTGTTA
CCAATCTGTTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCA
GTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACCTTAACA
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TTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGC
ATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 



AS 2 15

CO CL110Contig1 509 13 8 U
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GCACTGGCTTGTTCTAATCTTTCTCTAGTGAGATCATATCTTCACAATTTGTCGAACCTT
TCTCGTTTCAAGTTATACATTTCCTCTTC


BQ
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 

AF RR4AD53TF U 1
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AF RR4AR53JQ C 1
AF RR4AR53TF U 1
AF RR4AP91JQ C 1
AF RR4AE36TF U 1
AF RR4AP91TF U 1
AF RR4B432JQ C 1
AF RR4FT18JQ C 1
AF RR4FT18TF U 1
AF RR4BH74JQ C 1
AF RR4BH74TF U 1
BS 1 181 RR4AD53TF
BS 182 182 RR4DV19TF
BS 183 302 RR4AD53TF
BS 303 305 RR4DV19TF
BS 306 410 RR4AD53TF
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RD RR4AD53TF 410 0 0
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QA 1 410 1 410
DS 

RD RR4DV19TF 410 0 0
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QA 1 410 1 410
DS 

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TGCTGATGGCATCTACACCGGTCAATTCACTACCTTGGCTCTCTGCGGTTTTGTTCGTGC
CCAGGGAGATGCTGACAGTGGTGTGGACAGGCTGTGGCAGAAAAAGAAGGTCGAAGCCAA
ACAACTCTAAAGAGCCTAATTAAGCTGTCTTTCTTTACTTTGTTCTGAATGTCGGTTATT
TAATTCAGAAGATCATCGGACATAATGATATTTGCTTGACTCTTGGTTTTAATGCTTCTT
GCACTGGCTTGTTCTG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4AR53JQ 435 0 0
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GCACTGGCTTGTTCT

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CC

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CC

QA 1 507 1 507
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TC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4BH74TF 509 0 0
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TC

QA 1 507 1 507
DS 



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TCCTCCAGTGAGATATATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AR87TF U 1
AF RR4AR87JQ C 105
BS 1 443 RR4AR87TF

RD RR4AR87TF 443 0 0
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TCCTCCAGTGAGATATATTTCAC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR4AR87JQ 339 0 0
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QA 1 339 1 339
DS 



AS 2 14

CO CL111Contig1 1112 10 21 U
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TCTTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACA
TCTTAAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCG
CTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGA
CAATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTC
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TCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTCCAAGGG*TTCGTGAACGCAACCGTTATGAAC
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GACTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATCAGTAGTTACATATCT
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AAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAAAGAC
AACTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTATTCCTAGCTTGGCGTTTGTGTCTGTG
ATCTCATCCTTTTGGTTCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGTTAAGATTTGATGAAT
AAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCCAGAAAAAAAAA*TGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTC
AAGCTTTTTTT*CACACAAAAGAACACTTCAAGCTTCACAAACTCTATGGAATAAAGCAA
CAAAATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGATTCAATAAGGGATAAAGAATGTTGTAA
AACTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGATAAGTTTGTAAAAGATTTCAATTGG
CGCAATAAAAGAAAACACAAACTTGCAAGGCC


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4E738TF U 90
AF RR4CH56TF U 1
AF RR4E641TF U 1
AF RR4EO14TF U 1
AF RR4DV66TF U 1
AF RR4BG81TF U -3
AF RR4GV58TF U 265
AF RR4BG81JQ C 303
AF RR4DV66JQ C 455
AF RR4E738JQ C 661
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BS 390 460 RR4CH56TF
BS 461 461 RR4DV66TF
BS 462 524 RR4CH56TF
BS 525 525 RR4DV66TF
BS 526 552 RR4CH56TF
BS 553 716 RR4DV66TF
BS 717 717 RR4BG81TF
BS 718 755 RR4DV66TF
BS 756 756 RR4BG81TF
BS 757 803 RR4DV66TF
BS 804 841 RR4BG81TF
BS 842 875 RR4GV58TF
BS 876 876 RR4BG81JQ
BS 877 910 RR4GV58TF
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BS 921 921 RR4BG81JQ
BS 922 941 RR4GV58TF
BS 942 1112 RR4BG81JQ

RD RR4E738TF 363 0 0
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TTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATA
ACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGACAATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGAC
AACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAGA
AGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTC
CAAGGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGT
TCG

QA 1 363 1 363
DS 

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TCTTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACA
TCTTAAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCG
CTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGA
CAATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTC
TAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCT
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AACGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGTCCTTGACTCTAAGCTTATA
GACTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCT
ATCATGGATCCC

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DS 

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TCTTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACA
TCTTAAACCAGAACAATGAGCTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCG
CTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGA
CAATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTC
TAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCT
TCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTCCAAGGG*TTCGTGAACGCAACCGTTATGAAC
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GACTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATCAGTAGTTACATATTT
ATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4EO14TF 738 0 0
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TCTTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACA
TCTTAAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCG
CTTCCACCATCGACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGA
CAATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTC
TAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCT
TCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTGCAAGGG*TTCGTGAACGCAACCGTTATGAAC
AACGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATA
GACTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCT
ATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAA
CCTCCTGGTGATGATGATTATGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACT
AAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAA*GAC
AACTCAACAACAAGTGGA

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DS 

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TCTTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAT*CA
TCTTAAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCG
CTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGA
CAATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTC
TAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCT
TCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTCCAAGGG*TTCGTGAACGCAACCGTTATGAAC
AACGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATA
GACTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATCAGTAGTTACATATCT
ATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAA
CCTCCTGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACT
AAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAA*GAC
AACTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTAT*CCTAGCTTGGCGTTTGTGTCTGTG
ATCTCATCCTTTTGGTTCTTCAT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4BG81TF 845 0 0
GGAACC
AACCTCATCAACTAATCCACTACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTCACACTCTTCTTC
TTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACATC
TTAAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCGCT
TCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGACA
ATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTA
GACTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTC
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CGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGA
CTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATCAGTAGTTACATATCTAT
CATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACC
TCCTGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAA
GCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAAAGACAA
CTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTATTCCTAGCTTGGCGTTTGTGTCTGTGAT
CTCATCCTTTTGGTTCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGTTAAGATTTGATGAATA

QA 7 845 7 845
DS 

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AAGACAACAATAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTAGACTACTACGACATCAAGAAAC
TCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAG
GCCTGCAAGGG*TTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGGTGACGTTATGTTCGGATCT
GCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGACTCTGTTGCGACACATCCATAT
AACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCTATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAA
GATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCCTGGTGATGATGATTATGAA
TATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACT
GCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAAAGACAACTCAACAACAAGTGGAGTTTCA
GCGATTAGTATTCCTAGCTTGGCGTTTGTGTCTGTGATCTCATCCTTTTGGTTCTTCATG
ACGGTCTGGTGATGTGATGGTTAAGATTTGATGAATAAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGC
CAGAAAAAAAA**TGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTCAAGCTTTTTT**CACACAAA*GAA
CACTTCAAGCTTCACAA
CTCTA

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DS 

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CAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCACCAAGGG*TTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAA
CGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGA
CTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATCAGTAGTTACATATCTAT
CATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACC
TCCTGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTATTAA
GCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGTTAAGCCACCTTTTTCTGCAAAAGACAA
CTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTATTCCTAGCTTGGCGTTTGTGTCTGTGAT
CTCATCCTTTTGGTTCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGTTAAGATTTGATGAATAA
ACCAGATCAGCT****GAAAGCCAGAAAAAAAAA*TGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTCAA
GCTTTTTTT*CACACAAAAGAACACTTCAAGCTTCACAAACTCTATGGAATAAAGCAACA
AAATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGATTCAATAAGGGATAAAGAATGTTGTAAAA
CTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGATAAGTTTGTAAAAGATTTCAATTGGCG
CAATAAAAGAAAACACAAACTTGCAAGGCC

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DS 

RD RR4DV66JQ 657 0 0
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TGCTTCATATCAGTAGTTACATATCTATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTT
CTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCCTGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGC
CACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCG
CTAAGCCCCCTTTTTCTGCAAAAGACAACTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTA
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GATGTGATGGTTAAGATTTGATGAATAAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCCAGAAAAAAA
AAATGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTCAAGCTTTTTTTTCACACAAAAGAACACTTCAAGC
TTCACAAACTCTATGGAATAAAGCAACAAAATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGAT
TCAATAAGGGATAAAGAATGTTGTAAAACTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGG
ATAAGTTTGTAAAAGATTTCAATTGGCGCAATAAAAGAAAACACAAACTTGCAAGGC

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DS 

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AACTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTATTCCTAGCTTGGCGTTTGTGTCTGTG
ATCTCATCCTTTTGGTTCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGTTAAGATTTGATGAAT
AAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCCAGAAAAAAAAAATGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTC
AAGCTTTTTTTTCACACAAAAGAACACTTCAAGCTTCACAAACTCTATGGAATAAAGCAA
CAAAATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGATTCAATAAGGGATAAAGAATGTTGTAA
AACTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGATAAGTTTGTAAAAGATTTCAATTGG
CGCAATAAAAGAAAACACAAACTTGCAAGGC

QA 1 451 1 451
DS 



CO CL111Contig2 782 4 7 U
TCTATTACATGTAATACAACCAAACAACGATGCACCAGAAAAGCCTTGCAAGTTTGTGTT
TTCTTTTATTGGTTCCAATTGAAATCTCTTACAAACTTATCCAAGCTTCCAAATAAATAA
AGAACTTTTGAGTTTTACAACATTCTTCATCCCTTATTATATCATCAATCACTTTATTTC
TTCTTTGGATTTTGTTGCTTTATTCCATAGAGTTTGTGAAGCTTGAAGTGTTCTTTTGTG
TGAAAAAAAGCTTGAAAGCTTTGCTGCTAATCTCCATTTTTTTT*CTGGCTTTCAGAAAG
CTGATCTGGTTTATTCATCAAATCTTAACCATCACATCACCAGACCGTCATGAAGAACCA
AAAGGATGAGATCACAGACACAAACGCCAAGCTAGGAATACTAATCGCTGAAACTCCACT
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AACAAAAGGCTTAGTAGTAGAGGAAGGTGGAGACGGTGGCTCGTCATATTCATAATCATC
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CGCAACAGAGTCTATAAGCTTAGAGTCAAGGCCGGATCCACGAACCGCAGATCCGAACAT
AACGTCACCGTTGTTCATAACGGTTGCGTTCACGAACCCTTGCAGCCTTTAGCTTGACCG
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4BK11TF C 45
AF RR4GV58JQ U 1
AF RR4EO14JQ U 43
AF RR4CH56JQ U 42
BS 1 284 RR4GV58JQ
BS 285 285 RR4EO14JQ
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BS 766 782 RR4CH56JQ

RD RR4BK11TF 587 0 0
CTTGCAAGTTTGTGTTTTCTTTTATTGGTTCCAATTGAAATCTCTTACAAACTTATCCAA
GCTTCCAAATAAATAAAGAACTTTTGAGTTTTACAACATTCTTCATCCCTTATTATATCA
TCAATCACTTTATTTCTTCTTTGGATTTTGTTGCTTTATTCCATAGAGTTTGTGAAGCTT
GAAGTGTTCTTTTGTGTGAAAAAAAGCTTGAAAGCTTTACTGCTAATCTCCATTTTTTTT
*CTGGCTTTCAGAAAGCTGATCTGGTTTATTCATCAAATCTTAACCATCACATCACCAGA
CCGTCATGAAGAACCAAAAGGATGAGATCACAGACACAAACGCCAAGCTAGGAATACTAA
TCGCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGTCTTTTGCAGAAGAAGGTGGCTTAGCGGTAG
CAGCAGTAGCAGCAGCAACAAAAGGCTTAGTAGTAGAGGAAGGTGGAGACGGTGGCTCGT
CATATTCATAATCATCATCACCAGGAGGTTGTACAGGAAGTGGTGAAGATGAAGAACCAT
GATCTTTAGGACCTTCGGGATCCATGATAGATATGTAACTACTAAT
C

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4GV58JQ 764 0 0
TCTATTACATGTAATACAACCAAACAACGATGCACCAGAAAAGCCTTGCAAGTTTGTGTT
TTCTTTTATTGGTTCCAATTGAAATCTCTTACAAACTTATCCAAGCTTCCAAATAAATAA
AGAACTTTTGAGTTTTACAACATTCTTCATCCCTTATTATATCATCAATCACTTTATTTC
TTCTTTGGATTTTGTTGCTTTATTCCATAGAGTTTGTGAAGCTTGAAGTGTTCTTTTGTG
TGAAAAAAAGCTTGAAAGCTTTGCTGCTAATCTCCATTTTTTTTTCTGGCTTTCAGAAAG
CTGATCTGGTTTATTCATCAAATCTTAACCATCACATCACCAGACCGTCATGAAGAACCA
AAAGGATGAGATCACAGACACAAACGCCAAGCTAGGAATACTAATCGCTGAAACTCCACT
TGTTGTTGAGTTGTCTTTTGCAGAAAAAGGTGGCTTAGCGGTAGCAGCAGTAGCAGCAGC
AACAAAAGGCTTAGTAGTAGAGGAAGGTGGAGACGGTGGCTCGTCATATTCATAATCATC
ATCACCAGGAGGTTGTACAGGAAGTGGTGAAGATGAAGAACCATGATCTTTAGGACCTTC
GGGATCCATGATAGATATGTAACTACTAATATGAAGCACCGAGATGTTATATGGATGTGT
CGCAACAGAGTCTATAAGCTTAGAGTCAAGGCCGGATCCACGAACCGCAGATCCGAACAT
AACGTCACCGTTGTTCATAACGGTTGCGTTCACGAACCCTTGCA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4EO14JQ 728 0 0
GCCTTGCAAGTTTGTGTTTTCTTTTATTGGTTCCAATTGAAATCTCTTACAAACTTATCC
AAGCTTCCAAATAAATAAAGAACTTTTGAGTTTTACAACATTCTTCATCCCTTATTATAT
CATCAATCACTTTATTTCTTCTTTGGATTTTGTTGCTTTATTCCATAGAGTTTGTGAAGC
TTGAAGTGTTCTTTTGTGTGAAAAAAAGCTTGAAAGCTTTGCTGCTAATCTCCATTTTTT
TT*CTGGCTTTCAGAAAGTTGATCTGGTTTATTCATCAAATCTTAACCATCACATCACCA
GACCGTCATGAAGAACCAAAAGGATGAGATCACAGACACAAACGCCAAGCTAGGAATACT
AATCGCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGTCTTTTGCAGAAGAAGGTGGCTTAACGGT
AGCAGCAGTAGCAGCAGCAACAAAAGGCTTAGTAGTAGAGGAAGGTGGAGACGGTGGCTC
GTCATATTCATAATCATCATCACCAGGAGGTTGTACAGGAAGTGGTGAAGATGAAGAACC
ATGATCTTTAGGACCTTCGGGATCCATGATAGATATGTAACTACTAATATGAAGCACCGA
GATGTTATATGGATGTGTCGCAACAGAGTCTATAAGCTTAGAGTCAAGGCCGGATCCACG
AACCGCAGATCCGAACATAACGTCACCGTTGTTCATAACGGTTGCGTTCACGAACCCTTG
CAG
CCTTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CH56JQ 741 0 0
AT
CCTTGCAAGTTTGTGTTTTCTTTTATTGGTTCCAATTGAAATCTCTTACAAACTTATCCA
AGCTTCCAAATAAATAAAGAACTTT*GAGTTTTACAACATTCTTCATCCCTTATTATATC
ATCAATCACTTTATTTCTTCTTTGGATTTTGTTGCTTTATTCCATAGAGTTTGTGAAGCT
TGAAGTGTTCTTTTGTGTGAAAAAAAGCTTGAAAGCTTTGCTGCTAATCTCCATTTTTTT
TTCTGGCTTTCAGAAAGCTGATCTGGTTTATTCATCAAATCTTAACCATCACATCACCAG
ACCGTCATGAAGAACCAAAAGGATGAGATCACAGACACAAACGCCAAGCTAGGAATACTA
ATCGCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGTCTTTTGCAGAAGAAGGTGGCTTAGCGGTA
GCAGCAGTAGCAGCAGCAACAAAAGGCTTAGTAGTAGAGGAAGGTGGAGACGGTGGCTCG
TCATATTCATAATCATCATCACCAGGAGGTTGTACAGGAAGTGGTGAAGATGAAGAACCA
TGATCTTTAGGACCTTCGGGATCCATGATAGATATGTAACTACTAATATGAAGCACCGAG
ATGTTATATGGATGTGTCGCAACAGAGTCTATAAGCTTAGAGTCAAGGACGGATCCACGA
ACCGCAGATCCGAACATAACGTCACCGTTGTTCATAACGGTTGCGTTCACGAACCCTTGC
AGCCTTTAGCTTGACCGCT

QA 3 741 3 741
DS 



AS 2 15

CO CL112Contig1 729 11 9 U
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTTGAAGATGGCT
CGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCT
ACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTAC
AGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTC
ATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGAC
CTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTG
GGACTCTTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCC
AAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGT
TTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGA
TTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGT
TGGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATC
TACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGTTG
ACCGACTCC


BQ
10 35 35 35 35 35 10 10 50 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 15 65 65 
65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4DB02TF U 7
AF RR4D825TF U 1
AF RR4D040JQ C 2
AF RR4D825JQ C 81
AF RR4D040TF U 2
AF RR4FS02JQ C 2
AF RR4FS02TF U 2
AF RR4A136TF U 7
AF RR4A136JQD C 7
AF RR4A136JQ C 10
AF RR4A136TFB U 14
BS 1 365 RR4D825TF
BS 366 366 RR4DB02TF
BS 367 618 RR4D825TF
BS 619 619 RR4DB02TF
BS 620 688 RR4D825TF
BS 689 713 RR4D040TF
BS 714 718 RR4FS02TF
BS 719 728 RR4A136TFB
BS 729 729 RR4A136JQ

RD RR4DB02TF 619 0 0
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CTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTA
GATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTT
GCTTGTTTTTTTTCTTATT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4D825TF 688 0 0
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ACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTAC
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CTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTG
GGACT*TTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCC
AAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGT
TTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGA
TTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGT
TGGTTTGCTTGTTTTTTT*CTTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATC
TACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4D040JQ 712 0 0
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CTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACA
GACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCA
TCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACC
TGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGG
GACTCTTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCA
AAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTT
TGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGAT
TTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTT
GGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCT
ACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4D825JQ 628 0 0
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TGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTTT
TCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTATTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCA
GAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGC
GGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACT*TTTGAGGACACTAA
CCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCG
CAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGA
ATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTT
TTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGTTTTTTT*C
TTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTT
TCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4D040TF 712 0 0
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GACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCA
TCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACC
TGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGG
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AAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTT
TGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGAT
TTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTT
GGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCT
ACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4FS02JQ 718 0 0
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GTACCGAGCAAACCGCCCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTA
CTAAGGCGGCACGTAAGTTTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACA
GACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCA
TCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACC
TGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGG
GACTCTTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCA
AAGGCATCCAGCTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTT
TGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGAT
TTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTT
GGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCT
ACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGT
C

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4FS02TF 719 0 0
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GTACCGAGCAAACCGCCCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTA
CTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACA
GACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCA
TCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACC
TGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGG
GACTCTTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCA
AAGGCATCCAGCTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTT
TGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGAT
TTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTT
GGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCT
ACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGT
CA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4A136TF 691 0 0
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTTGAAGATGGCTCGTACC
AAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTACTACTAAG
GCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCT
GGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGG
AAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGT
TTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTATGGGACTC
TTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGAC
ATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGT
CTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTA
GATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTT
GCTTGTTTTTTTTCTTATTT*CGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTG
TTTTGTTAAGCCTTTCGTTGTTTGAATTCTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4A136JQD 723 0 0
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTTGAAGATGGCTCGTACC
AAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTACTACTAAG
GCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCT
GGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGG
AAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGT
TTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTATGGGACTC
TTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGAC
ATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGT
CTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTA
GATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTT
GCTTGTTTTTTTTCTTATTT*CGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTG
TTTTGTTAAGCCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGTTGACCGAC
TC
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4A136JQ 720 0 0
CTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTTGAAGATGGCTCGTACCAAG
CAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTACTACTAAGGCG
GCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGA
ACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAG
CTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTC
CAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTATGGGACTCTTT
GAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATC
CAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTC
GTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTAGAT
AATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTGCT
TGTTTTTTTTCTTATTT*CGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTT
TGTTAAGCCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGTTGACCGACTCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4A136TFB 716 0 0
TCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTTGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAA
CCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTACTACTAAGGCGGCAC
GTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTG
TTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCC
CTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGA
GCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTATGGGACTCTTTGAGG
ACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAAC
TCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTAT
TATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATA
TGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGTT
TTTTTTCTTATTT*CGGTTTTTTGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTT
AAGCCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGTTGACCGACTC
C

QA 1 715 1 715
DS 



CO CL112Contig2 723 4 5 U
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AAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAG
GCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCT
GGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGG
AAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGT
TTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTC
TTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGAC
ATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTC
CTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGAT
AATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGCTG
GTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTT
GTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGTTGAAGTTGACCGACTCTT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 

AF RR4GL12TF U 1
AF RR4FE27TF U 11
AF RR4GL12JQ C 195
AF RR4FE27JQ C 300
BS 1 640 RR4GL12TF
BS 641 689 RR4FE27TF
BS 690 690 RR4GL12JQ
BS 691 718 RR4FE27TF
BS 719 723 RR4FE27JQ

RD RR4GL12TF 640 0 0
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AAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAG
GCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCT
GGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGG
AAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGT
TTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTC
TTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGAC
ATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTC
CTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGAT
AATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGCTG
GTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4FE27TF 713 0 0
GG
ATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTTGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCT
CGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAG
TCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCT
CTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTC
CAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCAT
GCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACT
AACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCT
CGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAA
TGTTGGGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTT
TTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGCTGGTTTTTTTTCTT
ATTTTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTC
GTTGTTTGAATTCTAAA*CAATTAGTATGTTGAAGTTGACCGACTC
TTTCC

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR4GL12JQ 510 0 0
TCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCA
GAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGC
GGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACTAA
CCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCG
CAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATG
TTGGGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTT
TGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGCTGGTTTTTTTTCTTAT
TTTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGT
TGTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGT
CG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4FE27JQ 424 0 0
TTC
CCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTT
TGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACAT
CCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCT
ATTATGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAA
TATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGCTGGT
TTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGT
TAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGTTGAAGTTGACCGACTCTTTC
C

QA 4 424 4 424
DS 



AS 2 14

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CCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAG
AACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGG
AGGCCTAATCAAGCTTCTCACTGCTTCTACAGTTAAAAGAGACCAGAATCTATTGTACTT
CAACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATT
GCCTATCTACCGCTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCC
TTTTAAAC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A025JQ C 1
AF RR4A025TF U 77
AF RR4A025JQD C 1
AF RR4A025TFB U 1
BS 1 1 RR4A025JQ
BS 2 76 RR4A025TFB
BS 77 368 RR4A025TF

RD RR4A025JQ 368 0 0
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CCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAG
AACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGG
AGGCCTAATCAAGCTTCTCACTGCTTCTACAGTTAAAAGAGACCAGAATCTATTGTACTT
CAACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATT
GCCTATCTACCGCTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCC
TTTTAAAC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4A025TF 292 0 0
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GATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTT
CTCACTGCTTCTACAGTTAAAAGAGACCAGAATCTATTGTACTTCAACAATGTAAAGAGA
CTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTGCCTATCTACCGCTCG
TTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTTTTAAAC

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR4A025JQD 368 0 0
G
CAGTGATATTTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTC
CAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGA
ACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGA
GGCCTAATCAAGCTTCTCACTGCTTCTACAGTTAAAAGAGACCAGAATCTATTGTACTTC
AACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTG
CCTATCTACCGCTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCT
TTTAAAC

QA 2 368 2 368
DS 

RD RR4A025TFB 368 0 0
G
CAGTGATATTTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTC
CAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGA
ACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGA
GGCCTAATCAAGCTTCTCACTGCTTCTACAGTTAAAAGAGACCAGAATCTATTGTACTTC
AACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTG
CCTATCTACCGCTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCT
TTTAAAC

QA 2 368 2 368
DS 



CO CL113Contig2 787 10 3 U
GGACACAACTTCAGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAA*TAAACATAACAGAGATG
GGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGC
AGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTG
AAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAG
CAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTC
ACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTT
CTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAG
TCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTG
GAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAG
GCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACC
AAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACT
GCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAG
ATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACCGTAATTATCTATGAACTACATTGAAG
TCGGTTC


BQ
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 
60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4DC94TF U -2
AF RR4AA21JQ C 1
AF RR4AA21TF U 1
AF RR4GX45JQ C 1
AF RR4A366TFB U -2
AF RR4AU01TF U 9
AF RR4GX45TF U 1
AF RR4AU01JQ C 159
AF RR4AC23JQ C 274
AF RR4AC23TF U 274
BS 1 739 RR4AA21TF
BS 740 743 RR4A366TFB
BS 744 787 RR4AC23TF

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GGAAT
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TTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGCAG
AGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAA
GGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGCA
GAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCAC
TGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCT
TATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTC
ACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGA
ACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGC
TGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTACTTCTACTGTTAAAAGAGACCAA
AATCTATTGGCGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCCCACTGC
TCTTACTCT

QA 6 674 6 674
DS 

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GGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGC
AGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTG
AAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTTTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAG
CAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTTTCCTACGGAACCGAGGTC
ACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTT
TTTATTTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAG
TCACCAACCACACTGTTTAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTG
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GCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTTTACTGTTAAAAGAGACC
AAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACT
GCTTTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTTTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAG
ATGTCAAGATCATCCTGTT

QA 1 739 1 739
DS 

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GGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGC
AGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTG
AAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAG
CAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTC
ACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTT
CTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAG
TCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTG
GAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAG
GCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACC
AAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACT
GCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAG
ATGTCAAGATCATCCTGTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GX45JQ 767 0 0
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AGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTG
AAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTTTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAG
CAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTC
ACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTT
TTTATTTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAG
TCACCAACCACACTGTTTAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTG
GAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAG
GCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTTTACTGTTAAAAGAGACC
AAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACT
GCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTTTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAG
ATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACCGTAATTATTTATG

QA 1 767 1 767
DS 

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GGAAT
ACACAACTTCAGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAA*TAAACATAACAGAGATGGG
TTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCTAGATGTACACAGGAGATGAGATATGCAG
AGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAA
GGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGCA
GAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGGACCGAGGTCAC
TGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCT
TATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTC
ACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGA
ACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGC
TGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAA
AATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGC
TCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGAT
GTCAAGATCATCCTGTTAAAC

QA 6 746 6 746
DS 

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AGGG
AGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAAATAAACATAACAGAGATGGGTTTGGTCACA
GAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGCAGAGAGAAGACA
AAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAGGACATTGAA
GAGGTTGGTTATTACAGAGAGTCTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGCAGAGCATCACC
CACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTGCTGTGGTC
CAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTC
TCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACA
CTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAGCCTGCCAAG
GAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTC
AAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGG
TGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTC
ATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCA
TCCTGTTAAAC

QA 5 735 5 735
DS 

RD RR4GX45TF 748 0 0
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GGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAATGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGC
AGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTG
AAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCTGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAG
CAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTC
ACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTT
CTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAG
TCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTG
GAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAG
GCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACC
AAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACT
GCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAG
ATGTCAAGATCATCCTGTTAA
CAAAAAA

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DS 

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TGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGCAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATCGATAAGCT
TGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGCTCAC
TGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTTTTATTTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGA
CAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTTTAGGACTTTCCCTGTCTCAGC
TTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAGCCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAG
TGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCT
GCTTTTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTA
TTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTTTGC
TTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACCGTAA
TTATCTATG

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DS 

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G
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CAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGA
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CCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAG
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GTAATTATCTATGAACTACATTGAAGTCGGTTC

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DS 

RD RR4AC23TF 514 0 0
G
AGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTGCTGTGGTCCAGACCGGAAAGATCAAGAAGC
TCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAG
ATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCT
CAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGA
TCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCT
CCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGGTGTACTTCCACAATGTAAAGAG
ACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTT
CTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACC
GTAATTATCTATGAACTACATTGAAGTCGGTTC

QA 2 514 2 514
DS 



AS 1 12

CO CL114Contig1 1055 12 34 U
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TATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTT
CTTCTCCCGTATCGCTCAAGCTCCATCC*AAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGA
AGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAG
AAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCT
TATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGA
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GTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCC
AAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTC
GGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCC
ATCCAGAAATGGG*ATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGT
GAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAA
GATTCAGCCTGGTTATGTAACGGCTTGGAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAA
GGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAGCGTTTGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAA
GGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATGCGTTGAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGT
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GGACATTTTGTGTTACTATTATGAATATGAAAACTTGTTTCCTGCTTTTGTTCACTCTTA
AACAATAAAATCACTCATCTTATTATTCGGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 35 50 50 50 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4A096JQ C 137
AF RR4BZ72JQ C 297
AF RR4A096JQD C 268
AF RR4AN51JQ C 200
AF RR4F328JQ C 384
BS 1 101 RR4F637TF
BS 102 102 RR4BZ72TF
BS 103 148 RR4F637TF
BS 149 149 RR4A096TF
BS 150 320 RR4F637TF
BS 321 322 RR4BZ72TF
BS 323 344 RR4F637TF
BS 345 346 RR4BZ72TF
BS 347 402 RR4F637TF
BS 403 403 RR4BZ72TF
BS 404 456 RR4F637TF
BS 457 457 RR4BZ72TF
BS 458 615 RR4F637TF
BS 616 616 RR4BZ72TF
BS 617 640 RR4F637TF
BS 641 641 RR4A096TF
BS 642 667 RR4F637TF
BS 668 689 RR4BZ72TF
BS 690 694 RR4F328TF
BS 695 695 RR4A096TF
BS 696 719 RR4F328TF
BS 720 720 RR4A096TF
BS 721 723 RR4F328TF
BS 724 724 RR4A096TF
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BS 733 733 RR4A096TF
BS 734 745 RR4F328TF
BS 746 746 RR4A096TF
BS 747 749 RR4F328TF
BS 750 752 RR4A096TF
BS 753 773 RR4F328TF
BS 774 774 RR4A096TF
BS 775 1006 RR4A096JQ
BS 1007 1055 RR4F328JQ

RD RR4F637TF 667 0 0
GGACACTCGTGGATTTTCAGACTTTCAGAGTAATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGT
TATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTCCATGACTCTCAGATTCTCCCTT
CTTCTCCCGTATCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGA
AGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAG
AAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCT
TATCCACAGCTGGCAGCAGCTGCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCCGTTTACGAAGTTGGA
GAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGTTACTGGGTTTGCTCGGA
GTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCAAGTACTTGTCTGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCC
AAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTC
GGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCC
ATCCAGAAATGGG*ACGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAG*TCTACAACGCTCTTGGAGT
GAGTTAT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BZ72TF 682 0 0
G
GTGGATTTTCAGACTTTCAGAGTAATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTCCA
TCGTCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCC
GTATCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGAAGGACTAA
AGCAGAACTTGCTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACC
GAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACA
GCTGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTT
TGAGCTAGGGATTCAGCTTTCTTATTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTAC
TTTCTATGTCATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACT
ACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGT
GACGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAA
ATGGG*ATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAG*TCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATG
TCCGAGAGGACAAACTGGACA

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR4F328TF 775 0 0
G
GTGGATTTTCAGACTTTCAGAGTAATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTCCA
TCGTCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCC
GTATCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGAAGGACTAA
AGCAGAACTTGCTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACC
GAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACA
GCTGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTT
TGAGCTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTAC
TTTCTATGTCATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACT
ACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGT
GATGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAA
ATGGG*ATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAG*TCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATG
TCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGA*TCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGA*GAT*CAGC
CTGGCTATGTAACGGCT*GGAC**ACCTTGGAGATGCTTACGAGA
GAGAGAGCT

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR4A096TF 750 0 0
GG
AGAGTAATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCAC
CGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCCGTATCGCTCAAGCTCCAT
CC*AAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGAAGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAG
AGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTT
TCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGA
GATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCT
TTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCA
AGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAG
CGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATT
TTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ATGGTGACGATC
AAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGG
ACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTATGTAACGGCTT
GGAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR4FW66TF 701 0 0
GG
ATGCTACTCCATACGTTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTCCATGAC
TCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCCGTATCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACGATATCTTTA
CAGGCAGATACATGGAAGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAA
AAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTT
GTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCTGCAGAGATCGTGAAGCCTGAACC
CGTTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGCT
ACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGA
ACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAAC
AGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAA
GTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ACTGTGACGATCAAGATCTTGCTCAGGTCT
ACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGT
TTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTATGTAACGG

QA 3 701 3 701
DS 

RD RR4A096TFB 699 0 0
GG
AGAGTAATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCAC
CGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCCGTATCGCTCAAGCTCCAT
CC*AAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGAAGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAG
AGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTT
TCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGA
GATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCT
TTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCA
AGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAG
CGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATT
TTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ATGGTGACGATC
AAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGG
ACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGAT

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR4AN51TF 728 0 0
GG
AGAGTAATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCAC
CGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCCGTATCGCTCAAGCTCCAT
CC*AAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGAAGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAG
AGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTT
TCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGA
GATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCT
TTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCA
AGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAG
CGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATT
TTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGGGATGGTGACGATC
AAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGG
ACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTATGTAACGGCTT
GGAACA

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR4A096JQ 870 0 0
CAAGCTCCATCC*AAAACGATATCTTTA****CAGATACATGGAAGGACTAAAGCAGAAC
TTGCTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAG
GATCTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAG
CAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAG
GGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATG
TCATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAAC
AAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGA
GACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*AT
GGTGACGATCAAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAG
GACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTAT
GTAACGGCTTGGAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCG
TTGAAAGCGTTTGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGA
AGAGATGCGTTGAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAG
AAACGGTGACGAAGAAACCAATAAACGGTGATGTTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTAC
TATTATGAATATGAAAACTTGTTTCCTGCT

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4BZ72JQ 710 0 0
TGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGT
TGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCTTTCTTATTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCT
CGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTC
TGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGA
GCTCGGTGCGGTGACGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCA
AGCCATCCAGAAATGGG*ATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTG
GAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGG
TGAAGATTCAGCCTGGTTATGTAACGGCTTGGAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGA
AGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAGCGTTTGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACA
ACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATGCGTTGAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACG
TTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAACGGTGACGAAGAAACCAATAAACGGTGATGTTATTTT
GTAAGGACATTTTGTGTTACTATTATGAATATGAAAACTTGTTTCCTGC
C

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4A096JQD 739 0 0
CTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAG
ATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGATTCAGCTT
TCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCGCCAA
GTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGC
GGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGACGCAAATTT
TATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ATGGTGACGATCA
AGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGGA
CAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTATGTAACGGCTTG
GAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAGCGTT
TGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATGCGTT
GAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAACGGTGACG
AAGAAACCAATAAACGGTGATGTTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTACTATTATGAATA
TGAAAACTTGTTTCCTGCT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AN51JQ 807 0 0
CTGCTAGAGGGTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGAT
CTACCTTTCTGCTGGGGCATAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAG
CGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAGCTAGGGA
TTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCA
TTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAG
TAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGAC
GCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ATGGT
GACGATCAAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGAC
AAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTATGTA
ACGGCTTGGAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTG
AAAGCGTTTGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGA
GATGCGTTGAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAA
CGGTGACGAAGAAACCAATAAACGGTGATGTTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTACTAT
TATGAATATGAAAACTTGTTTCCTGCT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4F328JQ 672 0 0
GCTTTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATTCG
CCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAG
GAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCGGTGATGCTGAGACGCAA
ATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ATGGTGACG
ATCAAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAAC
TGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGCTATGTAACGG
CTTGGAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAG
CGTTTGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATG
CGTTGAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAACGGT
GACGAAGAAACCAATAAACGGTGATGTTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTACTATTATG
AATATGAAAACTTGTTTCCTGCTTTTGTTCACTCTTAAACAATAAAATCACTCATCTTAT
TATTCGGAAACC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 2 13

CO CL115Contig1 896 9 11 U
GGGTAGGAAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCC
GGTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGGACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGAAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAATTGGAGGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAAT
CTCTGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCATCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTG
CAGGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTC
GGTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAA*GGGAAAAGATA
CAGTCTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAACCTCTTGGTGGAGCTCAAGTGGCCAA
ACCGATATCGACATTCAGCAAATGAAATGCTGCATCACAACAAACCTAAACGTTACTCGC
TTACAAACTGGTCAAGCCTTGAGAGATAACCAGACACAGACCGTGATTTCTTCATG


BQ
25 25 25 25 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 15 25 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 
45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 40 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE72TF U 1
AF RR4B632TF U 526
AF RR4EX40TF U -1
AF RR4AQ57TF U 1
AF RR4E839TF U 1
AF RR4EK46TF U 3
AF RR4F066TF U 362
AF RR4BH55TF U 1
AF RR4BI73TF U 1
BS 1 75 RR4AQ57TF
BS 76 76 RR4BH55TF
BS 77 396 RR4AQ57TF
BS 397 397 RR4BH55TF
BS 398 473 RR4AQ57TF
BS 474 474 RR4BH55TF
BS 475 769 RR4AQ57TF
BS 770 782 RR4BH55TF
BS 783 783 RR4BI73TF
BS 784 820 RR4BH55TF
BS 821 896 RR4BI73TF

RD RR4DE72TF 632 0 0
GGGTAGTC
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AATTAGGGTTCCACTGAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGGCTTCTTC
TCTCAGGTTTGCAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTCGATTCTCA
GAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTAGTTAGCAG
CAGAAAGAATTGGAAGAGTTCGTCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAATCTCTGGAC
ACCGGAGACTCCTTCGCCGGAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAGTGCCATC
TTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTTCAAGAGCG
TTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGTTGTGGTGGTGCTGT
GGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTGTTGATCC
TACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGCATGGC
TATATTCGATACTATGAGGCATAT

QA 9 632 9 632
DS 

RD RR4B632TF 180 0 0
CTG
TACCTTGATGCTGTTGATCCCAGTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGA
TCAGTTACAGTTGGCATGGCTATATTCGGCACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCC
ACTGTTTGTGTCGGTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCCGGAACC

QA 4 180 4 180
DS 

RD RR4EX40TF 708 0 0
GACTGTAGTC
AGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCGGTGACGA
AATTAGGGTTCCAT*GAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGGCTTCTTC
TCTCAGGTTTGCAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTCGATTCTCA
GAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTAGTTAGCAG
CAGAAAGAATTGGAAGAGCTCGTCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAATCTCTGGAC
ACCGGAGACTCCTTCGCCGGAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAGTGCCATC
TTCACCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTTCAAGAGCG
TTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGTTGTGGTGGTGCTGT
GGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTGTTGATCC
TACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGCATGGC
TATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTCGGTCTAGC
TGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCA

QA 11 708 11 708
DS 

RD RR4AQ57TF 769 0 0
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GGTGACGAAATTAGGTTTTCGTTGGACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGAAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAATTGGAGGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAAT
CTCTGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCATCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAATGACAAGGACCACCTCCTATGGTG
CAGGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGTTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTC
GGTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAA*GGGAAAAGATA
CAGTCTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAACCTCTTGGTGGAGCT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4E839TF 775 0 0
GGGTAGGAAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCC
GGTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGGACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACTCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGAAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAATTGGAGGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAAT
CTCTGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCATCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTG
CAGGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAGTATAGGATTATTCGCTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTC
GGTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAA**GGGAAAGATA
CAGTCTGCCAAACTCAAG*ATAATGATCCATCAACCTCTTGGTGGAGCTCAAG
TG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4EK46TF 754 0 0
GG
AGGAAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCGGCG
ACGAAATTAGGGTTTCGTTGGACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGGCTT
CTTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGGGTCCCAACGCCTCCTCTTTCGATT
CTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGAAAGACGAAAAAGTTAGTTA
GCGAGAGAAAGAATTGGAGGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAATCTCT
GGACACCTGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTTGTCCATCAGAGATGATTTACAAGTGC
CATCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTGCAGG
AGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTGGTG
CTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTGTTG
ATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGCA
TGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTCGGTC
TAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAA*GGGAAAAGATACAGT
CTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCGTCAACC

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR4F066TF 373 0 0
TGCCATCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTGC
AGGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTG
GTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTG
TTGATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCTG
GCATGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTCG
GTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAA*GGGAAAAGATAC
AGTCTGCCAAACT

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR4BH55TF 820 0 0
GGGTAGGAAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCC
GGTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGGACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGAAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAATTGGAGGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAAT
CTCTGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCATCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTG
CAGGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTC
GGTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAAAGGGAAAAGATA
CAGTCTGCCAAACTCAAG*ATAATGATCCATCAACCTCTTGGTGGAGCTCAAGTGGCCAA
ACTGATATCGACATTCAGCAAATGAAATGCTGCATCACAA

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4BI73TF 896 0 0
GGGTAGGAAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCC
GGTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGGACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGAAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAATTGGAGGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGCAAT
CTCTGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCATCTTTGCCTTACTTTCCTGTGTACGCACAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTG
CAGGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTC
GGTCTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAA*GGGAAAAGATA
CAGTCTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAACCTCTTGGTGGAGCTCAAGTGGCCAA
ACCGATATCGACATTCAGCAAATGAA*TGCTGCATCACAGCAAACCTAAACGTTACTCGC
TTACAAACTGGTCAAGCCTTGAGAGATAACCAGACACAGACCGTGATTTCTTCATG

QA 1 896 1 896
DS 



CO CL115Contig2 828 4 12 U
GATGGCCAATAATTCGATTACAAAGGATCAAAACATTACAAAGTCATTGTTTTTCAATAA
AACAGCAGAAAAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTATGTATCACCTACTGATTTTGATTT
CATTCTAGAAGAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTTAAGTTCAGAAAAGGCCCATCAAAA
ATAAAAGTGCCAAGCCGAAACATTACCTTCAGGCGATCGATCAAGCTGCGGCAAGTGGCT
GAAGAGCTTTAAGAGGGTTCATGATGACACCATCGATAAGCCCGTAATCTTTTGCTTCTT
TAGCACTCATGAAGAAATCACGGTCTGTGTCTTGGTTTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAG
TTTGGTAAGCGAGGTAACCGTTTAGGTTTGCCTTGTGATGCAGCATTTCATTTGCCTGAA
TGTCGATATCGGTTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAAGAGGTTGATGGATCATTATCCTTG
AGTTTGGCAGACTGTATCTTTTCCCTTTGGTTCCAGCACTAAGCAGAAATGCACCCATAC
TAGCAGCTAGACCGACACAAACAGTGGAGACATCAGGTCGGATATGCCTCATAGTGTCGA
ATATAGCCATGCCAGCTGTAACTGATCCACCAGGAGAATTCACATACATGACGATATCCT
TAGTGGGATCAACAGCATCAAGGTAGAGAAGCTGAGCCACGATTATGTTGGCCATATCAT
CATCCACAGCACCACCACAGCGAATAATCCTATATTGGAAGAGCTGGCTTATGATACTCT
GGAAACGCTCCTGCACCATAGGAGGTGGTCCTTGTCCTTGTGCGTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F066JQ U 13
AF RR4E839JQ U 11
AF RR4BH55JQ U 1
AF RR4BI73JQ U 11
BS 1 39 RR4BH55JQ
BS 40 40 RR4BI73JQ
BS 41 69 RR4BH55JQ
BS 70 70 RR4BI73JQ
BS 71 103 RR4BH55JQ
BS 104 104 RR4E839JQ
BS 105 183 RR4BH55JQ
BS 184 184 RR4E839JQ
BS 185 430 RR4BH55JQ
BS 431 431 RR4BI73JQ
BS 432 797 RR4BH55JQ
BS 798 828 RR4BI73JQ

RD RR4F066JQ 452 0 0
TTCGATTACAAAGGATCAAAACATTACAAAGTCATTGTTTTTCAATAAAACAGCAAAAAA
AAAACTTTACTTGTTTTTCATGTATGTATCACCTACTGATTTTGATTTCATTCTAAAAAA
AAAGGCACATTTAATGGAAACCTTAATTTCAAAAAAGGCCCATCAAAAATAAAAGTGCCA
AGCCAAAACATTACCTTCAGGCGATCGATCAAGCTGCGGCAAGTGGCTGAAAAACTTTAA
AAGGGTTCATGATAACACCATCGATAACCCCGTAATCTTTTGCTTCTTTAGCACTCATGA
AAAAATCACGGTCTGTGTCTTGGTTTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAGTTTGGTAAGCGA
GGTAACCGTTTAGGTTTGCCTTGTGATGCAGCATTTCATTTGCCTGAATGTCGATATCGG
TTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAAAAGGTTGA

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4E839JQ 555 0 0
AATTCGATTACAAAGGATCAAAACATTACAAAGTCATTGTTTTTCAATAAAACAGCAGAA
AAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTATGTATCACCTACTGATTTTGATTTCATTCTAGAA
GAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTTAAGTTCAGAAAAGGCCCATCAAAAATAAAAGTGC
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AAGAGGGTTCATGATGACACCATCCATAAGCCCGTAATCTTTTGCTTCTTTAGCACTCAT
GAAGAAATCACGGTCTGTGTCTTGGTTTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAGTTTGGTAAGC
GAGGTAACCGTTTAGGTTTGCCTTGTGATGCAGCATTTCATTTGCCTGAATGTCGATATC
GGTTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAAGAGGTTGATGGATCATTATCCTTGAGTTTGGCAG
ACTGTATCTTTTCCCTTTGGTTCCAGCACTAAGCAGAAATGCACCCATACTAGCAGCTAG
ACCGACACAAACAGT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4BH55JQ 797 0 0
GATGGCCAATAATTCGATTACAAAGGATCAAAACATTACGAAGTCATTGTTTTTCAATAA
AACAGCAGAGAAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTATGTATCAGCTACTGATTTTGATTT
CATTCTAGAAGAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTTAAGTTCAGAAAAGGCCCATCAAAA
ATAGAAGTGCCAAGCCGAAACATTACCTTCAGGCGATCGATCAAGCTGCGGCAAGTGGCT
GAAGAGCTTTAAGAGGGTTCATGATGACACCATCGATAAGCCCGTAATCTTTTGCTTCTT
TAGCACTCATGAAGAAATCACGGTCTGTGTCTTGGTTTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAG
TTTGGTAAGCGAGGTAACCGTTTAGGTTTGCCTTGTGATGCAGCATTTCATTTGCCTGAA
TGTCGATATCAGTTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAAGAGGTTGATGGATCATTATCCTTG
AGTTTGGCAGACTGTATCTTTTCCCTTTGGTTCCAGCACTAAGCAGAAATGCACCCATAC
TAGCAGCTAGACCGACACAAACAGTGGAGACATCAGGTCGGATATGCCTCATAGTGTCGA
ATATAGCCATGCCAGCTGTAACTGATCCACCAGGAGAATTCACATACATGACGATATCCT
TAGTGGGATCAACAGCATCAAGGTAGAGAAGCTGAGCCACGATTATGTTGGCCATATCAT
CATCCACAGCACCACCACAGCGAATAATCCTATATTGGAAGAGCTGGCTTATGATACTCT
GGAAACGCTCCTGCACC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4BI73JQ 818 0 0
AATTCGATTACAAAGGATCAAAACATTACAAAGTCATTGTTTTTCAATAAAACAGCAGAA
AAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTATGTATCAGCTACTGATTTTGATTTCATTCTAGAA
GAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTTAAGTTCAGAAAAGGCCCATCAAAAATAGAAGTGC
CAAGCCGAAACATTACCTTCAGGCGATCGATCAAGCTGCGGCAAGTGGCTGAAGAGCTTT
AAGAGGGTTCATGATGACACCATCGATAAGCCCGTAATCCTTTGCTTCTTTAGCACTCAT
GAAGAAATCACGGTCTGTGTCTTGGTTTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAGTTTGGTAAGC
GAGGTAACCGTTTAGGTTTGCCTTGTGATGCAGCATTTCATTTGCCTGAATGTCGATATC
GGTTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAAGAGGTTGATGGATCATTATCCTTGAGTTTGGCAG
ACTGTATCTTTTCCCTTTGGTTCCAGCACTAAGCAGAAATGCACCCATACTAGCAGCTAG
ACCGACACAAACAGTGGAGACATCAGGTCGGATATGCCTCATAGTGTCGAATATAGCCAT
GCCAGCTGTAACTGATCCACCAGGAGAATTCACATACATGACGATATCCTTAGTGGGATC
AACAGCATCAAGGTAGAGAAGCTGAGCCACGATTATGTTGGCCATATCATCATCCACAGC
ACCACCACAGCGAATAATCCTATATTGGAAGAGCTGGCTTATGATACTCTGGAAACGCTC
CTGCACCATAGGAGGTGGTCCTTGTCCTTGTGCGTACA

QA 1 818 1 818
DS 



AS 2 15

CO CL116Contig1 1027 5 2 U
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AGTATCTTTTCGCTTTGTGTCTTCTACCTTTTCTTTTGGTTGATTCTCTGTGTGTTTCGT
TCAGTGGTAAGTCTGGAACCGGAGATGGTGACGGCAGATGACTGGACCAAGTCAGCGATG
AGAGATGGAGGAGTGGTGGCTGAGCTTCTGGTTAGGCTCAAGAAAGCCAAGGTGAGACCT
GTTCTGTTCTCGTGTCCGACGCTCCAGTGGGGAAACCGGCAGCCACGGTCGAGAAAAGAA
GCTGATTCAGCTAGATGCAGCCCGAGTACACCGCTCTCTTGGAGCGCTTCTTCTTCTCCA
TCTGCTCACCTCGACGGTTACGAGGCCACCAATGGCACTGGCTCATTATTTCCCGTCGGA
TCTAGATCCAAGGTTCTTGTAACCGCAGACTTGGATTTTGGTGTCAAAAGATTGCAGAGC
AAAAAGGACACTGCATTGATCAGATCAGCATTCAGGGAACGAGGAGACATGAAGAACAAG
AACTTTAAGAGAATGAAGCTGAACGCACAAATTTGTAGTTCTCTCTCGGGTTGTAATTTG
GCACAAAATGAAGATGGCAATTTCCTGCTACCTGACTTGAATTT*AGTGCCGTGTGAGGA
AGCAACAGTATGATATAAGGATTGTAAAGTGAAGGAACTCACTTAAAGTGATCAGAGTGA
AGTGATTTGATCATCTTTGGCTCAGCTTCTGAAAAGAGTCTGCATTGCAGGAACTCAAGG
AAAAAAAAATTGCGTATAAATTCCTCAAGGAATTTTCGTCCATATATAAGATAAATATCA
TAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAATATTTGTTGGTTTCTTTGTAGTGTCATTTT
GTAATGTTTTGTCTACATTAGCAGAAGGAGTCATTTTGTAATGTTATTTGATGACTCCTC
GCTTATAAAATCCAAACAACAAAGGAGTAACATGGAACATAAATGTCACTATCAACAACC
ATTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4AX84TF U 1
AF RR4AX84JQ C 183
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AGCAACAGTATGATAT

QA 1 676 1 676
DS 

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AAAGGACACTGCATTGATCAGATCAGCATTCAGGGAACGAGGAGACATGAAGAACAAGAA
CTTTAAGAGAATGAAGCTGAACGCACAAATTTGTAGTTCTCTCTCGGGTTGTAATTTGGC
ACAAAATGAAGATGGCAATTTCCTGCTACCTGACTTGAATTT*AGTGCCGTGTGAGGAAG
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TGATTTGATCATCTTTGGCTCAGCTTCTGAAAAGAGTCTGCATTGCAGGAACTCAAGGAA
AAAAAA*TTGCGTATAAATTCCTCAAGGAGTTTTCGTCCATATATAAGATAAATATCATA
AGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAATATTTGTTGGTTTCTTTGTAGTGTCATTTTGT
AATGTTTTGTCTACATTAGCAGAAGGAGTCATTTTGTAA

QA 1 759 1 759
DS 

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G
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CATATATAAGATAAATATCATAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAATATTTGTTGG
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ATGTTA
AAAA

QA 2 607 2 607
DS 

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G
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AATGGCACTGGCTCATTATTTCCCGTCGGATCTAGATCCAAGGTTCTTGTAACCGCAGAC
TTGGATTTTGGTGTCAAAAGATTGCAGAGCAAAAAGGACACTGCATTGATCAGATCAGCA
TTCAGGGAACGAGGAGACATGAAGAACAAGAACTTTAAGAGAATGAAGCTGAACGCACAA
ATTTGTAGTTCTCTCTCGGGTTGTAATTTGGCACAAAATGAAGATGGCAATTTCCTGCTA
CCTGACTT*AATTT*AGTGCCGTGTGAGGAAGCAACAGTATGATATAAGGATTGTAAAGT
GAAGGAACTCACTTAAAGTGATCAGAGTGAAGTGATTTGATCATCTTTGGCTCAGCTTCT
GAAAAGAGTCTGCATTGCAGGAACTCAAGGAAAAAAAAATTGCGTATAAATTCCTCAAGG
AATTTTCGTCCATATATAAGATAAATATCATAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAA
TATTTGTTGGTTTCTTTGTAGTGTCATTTTGTAATGTTTTGTCTACATTAGCAGAAGGAG
TCATTTTGTAATGTTATTTGATGACTCCTCGCTTATAAAATCCAAACAACAAAGGAGTAA
CATGGAACATAAATGTCACTATCAACAACCATTATCC

QA 2 698 2 698
DS 

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ATTGCGTATAAATTCCTCAAGGAATTTTCGTCCATATATAAGATAAATATCATAAGCAGA
TGTGTAGGATAAAGAAAACAAATATTTGTTGGTTTCTTTGTAGTGTCATTTTGTAATGTT
TTGTCTACATTAGCAGAAGGAGTCATTTTGTAATGTTATTTGATGACTCCTCGCTTATAA
AATCCAAACAACAAAGGAGTAACATGGAACATAAATGTCACTATCAACAACCATTATCC

QA 1 359 1 359
DS 



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AATTTTCGTCCATATATAAGATAAATATCATAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAA
TATTTGTTGGTTTCTTTGTAGTGTCATTTTGTAATGTTTTGTCTACATTAGCAGAAGGAG
TCATTTTGTAATGTTAAAAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTAC
AATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCA
TGAATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGG
TTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTG
TATCTATTAGCATATGGGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTT
CCAAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCA
CAGGAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAA
ATAGTTATTTTCTGACTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAAT
GAGAATAAACCCATTTAAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 15 15 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 30 45 45 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4FD15TF U 191
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AF RR4FQ01JQ C 195
AF RR4FQ01TF U 195
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AF RR4G062TF U 196
AF RR4CS73JQ C 461
AF RR4BZ60TF U 193
BS 1 196 RR4CJ78JQ
BS 197 199 RR4FD15TF
BS 200 227 RR4F968TF
BS 228 228 RR4FD15TF
BS 229 280 RR4F968TF
BS 281 281 RR4FD15TF
BS 282 433 RR4F968TF
BS 434 434 RR4FD15TF
BS 435 519 RR4F968TF
BS 520 520 RR4FD15TF
BS 521 538 RR4F968TF
BS 539 616 RR4FD15TF
BS 617 682 RR4BZ60TF

RD RR4F968TF 346 0 0
GGCTACA
AAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAATGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTT
GCTTTATTTTGTATTGTTCTATTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAA
AGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACT
ACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATCTGGGG
CCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTC
ATAAATTTAAATTTGAATAAAAAATAATAATTCCTATTC

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DS 

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AATTTTCGTCCATATATAAGATAAATATCATAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAA
TATTTGTTGGTTTCTTTGTAGTGTCATTTTGTAATGTTTTGTCTACATTAGCAGAAGGAG
TCATTTTGTAATGTTAAAAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTAC
AATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCA
TGAATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTTTGAAGAACCAAAATTTGG
TTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAGTGTGACAAACATTG
TATCTGGTAGCATCTGGGGCCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTT
CCAAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCA
CAGGAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGGAAGTTCAATAA
ATAGTTATTT*CTGACTTTCTTCAATTGTATTTAA
AAA

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DS 

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CGGGGA
AAAACAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAA
GTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGCGCCAGCCCT
CAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCC
ACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATATG
GGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATAC
TTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAG
TATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGAC
T

QA 7 426 7 426
DS 

RD RR4CS73TF 423 0 0
GGACAA
AAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTT
GCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAA
AGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACT
ACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATATGGGG
CCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTC
ATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTAT
TATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGAC

QA 7 423 7 423
DS 

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GG
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GTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGCGCCAGCCCT
CAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCC
ACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATATG
GGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATAC
TTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAACTAG
TATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTG

QA 3 420 3 420
DS 

RD RR4FQ01TF 420 0 0
GG
AAAACAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAA
GTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGCGCCAGCCCT
CAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCC
ACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATATG
GGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATAC
TTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAACTAG
TATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTG

QA 3 420 3 420
DS 

RD RR4G062JQ 421 0 0
GGAC
AAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTT
GCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAA
AGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAATTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACT
ACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAGTGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGG
CCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTC
ATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTAT
TATATACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGGAAGTTCAATAAATAGTTATTT
CTGACC

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DS 

RD RR4G062TF 421 0 0
GGAC
AAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTT
GCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAA
AGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAATTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACT
ACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAGTGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGG
CCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTC
ATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTAT
TATATACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGGAAGTTCAATAAATAGTTATTT
CTGACC

QA 5 415 5 415
DS 

RD RR4CS73JQ 156 0 0
AATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAAT
AAATAATAATTCCTATTCCACAGGGGGGGCAGCTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAA
TTTTTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTTTGAC

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR4BZ60TF 490 0 0
GGAC
AAAACAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAA
GTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGCGCCAGCCCT
CAAAAAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCC
ACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATATG
GGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATAC
TTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAG
TATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGAC
TTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATAAACCCATTT
AAGACT

QA 5 490 5 490
DS 



AS 4 13

CO CL117Contig1 857 5 5 U
GGTTGAGAAATTGCAGAAATAAGTAATAATGAAAATATTTTTAAGTAAAGAAACAAGTCT
TCATACTGCAATATCCGGTCTTCAAAAATATTCCAGCATTTGCACACATCATTTATTACA
AGATTATTATAAAACCGGGAGACAAATCCCATGAGAGGTCCTCTTCATAGAACATTCTAT
TATGTGTGGGCATGCAATGCATATGAGGTGGGAACTCATGTAAGCAGACTTCTTGCC*AG
ATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAACGTCTGTTCAGAGAGTGAACC*ACTAG
CTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACGTTAGGG*TCTGTTTCAAGAACC
ACCCCCTGATCGACCATTTCATCCAGGCATAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGAGCC
TCCATCTTTTCCACATTGTTCCTCAGAAGAAGCGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGA
ACAGAAGACAAGACGAGCTCGTTTTCATTTTCGCCTCCAGTAACAAAGAAGTGAAGGTCC
TGGGCGAACTTATAGACAATGATATTACTGTCCAACAATGTGATCTCAGCTTCAGTGCGA
GCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAGACATACTTCTCGAAAGTCAACTTGGCAGCATGA
GTAGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGAAGA
AGAATGTTCTTCACCAAAGGACATGAATCATGAGTCCCGTGAAAGCCTGACATTGTTGAG
GTATCGCCAGTTGATCTTTGAGATCCCACAGCAGATTCGTTTCGAAGCTCGATGGATTTG
CTATGAATTGGTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A178TF C 165
AF RR4D142JQ U 1
AF RR4FA34JQ U 27
AF RR4EE91JQ U 28
AF RR4A178TFB C 29
BS 1 80 RR4D142JQ
BS 81 81 RR4FA34JQ
BS 82 660 RR4D142JQ
BS 661 710 RR4FA34JQ
BS 711 857 RR4A178TFB

RD RR4A178TF 190 0 0
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CAGACTTCTTGCCCAGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAATGTCTGTTCAG
AGAGTGAACCCACTAGCTTCAGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCGATGACGTTAGGG
GTCTGTTTCA

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4D142JQ 660 0 0
GGTTGAGAAATTGCAGAAATAAGTAATAATGAAAATATTTTTAAGTAAAGAAACAAGTCT
TCATACTGCAATATCCGGTCCTCAAAAATATTCCAGCATTTGCACACATCATTTATTACA
AGATTATTATAAAACCGGGAGACAAATCCCATGAGAGGTCCTCTTCATAGAACATTCTAT
TATGTGTGGGCATGCAATGCATATGAGGTGGGAACTCATGTAAGCAGACTTCTTGCC*AG
ATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAACGTCTGTTCAGAGAGTGAACC*ACTAG
CTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACGTTAGGG*TCTGTTTCAAGAACC
ACCCCCTGATCGACCATTTCATCCAGGCATAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGAGCC
TCCATCTTTTCCACATTGTTCCTCAGAAGAAGCGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGA
ACAGAAGACAAGACGAGCTCGTTTTCATTTTCGCCTCCAGTAACAAAGAAGTGAAGGTCC
TGGGCGAACTTATAGACAATGATATTACTGTCCAACAATGTGATCTCAGCTTCAGTGCGA
GCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAGACATACTTCTCGAAAGTCAACTTGGCAGCATGA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4FA34JQ 684 0 0
TA
ATGAAAATATTTTTAAGTAAAGAAACAAGTCTTCATACTGCAATATCCGGTCTTCAAAAA
TATTCCAGCATTTGCACACATCATTTATTACAAGATTATTATAAAACCGGGAGACAAATC
CCATGAGAGGTCCTCTTCATAGAACATTCTATTATGTGTGGGCATGCAATGCATATGAGG
TGGGAACTCATGTAAGCAGACTTCTTGCC*AGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGA
GTTAACGTCTGTTCAGAGAGTGAACC*ACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCC
CGCAATGACGTTAGGG*TCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCCAGGC
ATAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGAGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTCAAAA
GAAGCGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAAGACAAGACGAGCTCGTTTTCAT
TTTCGCCTCCAGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATGATATTAC
TGTCCAACAATGTGATCTCGGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAGA
CATACTTCTCGAAAGTCAACTTGGCAGCATGAGTAGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGA
CAGCCACACGCTTCCCTTCAGA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR4EE91JQ 636 0 0
AG
TGAAAATATTTTTAAGTAAAGAAACAAGTCTTCATACTGCAATATCCGGTCTTCAAAAAT
ATTCCAGCATTTGCACACATCATTTATTACAAGATTATTATAAAACCGGGAGACAAATCC
CATGAGAGGTCCTCTTCATAGAACATTCTATTATGTGTGGGCATGCAATGCATATGAGGT
GGGAACTCATGTAAGCAGACTTCTTGCC*AGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAG
TTAACGTCTGTTCAGAGAGTGAACC*ACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCC
GCAATGACGTTAGGG*TCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCCAGGCA
TAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGAGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTCAGAAG
AAGCGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAAGACAAGACGAGCTCGTTTTCATT
TTCGCCTCCAGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATGATATTACT
GTCCAACAATGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCACTGGTTTTAGAGGTCTTGGAGAAGAC
ATACTTCTCGAAAGTCAACTTGGCAGCATGAGTA

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR4A178TFB 829 0 0
ATGAAAATATTTTGAAGTAAAGAAACAAGTCTTCATACTGCAATATCCGGTCTTCAAAAA
TATTCCAGCATTTGCACACATCATT*ATTACAAGATTAT***AAAACCGGGAGACAAATC
CCATGAGAGGTCCTCTTCATAGAACATTCTATTATGTGTGGGCATGCAATGCATATGAGG
TGGGAACTCATGTAAGCAGACTTCTTGCC*AGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGA
GTTAATGTCTGTTCAGAGAGTGAACC*ACTAGCTTCAGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCC
CGCAATGACGTTAGGG*TCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCCAGGC
ATAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGAGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTCAGAA
GAAGCGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAAGACAAGACGAGCTCGTTTTCAT
TTTCGCCTCCAGTAACAAAGAAGTGGAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATGATATTAC
TGTCCAACAATGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAGA
CATACTTCTCGAAAGTCAACTTGGCAGCATGAGTAGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGA
CAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGAAGAAGAATGTTCTTCACCAAAGGACATGAAT
CATGAGTCCCGTGAAAGCCTGACATTGTTGAGGTATCGCCAGTTGATCTTTGAGATCCCA
CAGCAGATTCGTTTCGAAGCTCGATGGATTTGCTATGAATTGGTTACCC

QA 1 829 1 829
DS 



CO CL117Contig2 969 2 4 U
GGAATTCATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTTGTGGGATCTCAAAGATC
AACTGGAGAGAACTCAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGTAAGTCCACTTTTTTC
ATTATAGATCTCTGCTAAAGCCTCCATTTTTATCAATGCTATGTTGTTCTTACCATATGG
GCCCTACATGATCTTTTGTTGCTTTGTTTCTCCCGTGTAATTTGTGAAATAGGATTCATG
TCCTTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTA
TTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTTGAGAAGTATGTCTTCTC
CAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATAT
CATTGTCTATAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAA
CGAGCTCGTCTTGTCTTCGGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAG
GAGCAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGA
TGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGT
AGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACT
GGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTTCCTCATTTGCATT
GCATGCCCACTTCCAACTTCTATGAAGAGTACCTCTCATGGGATTTGTCTCCCGGTTTTA
TAATAATCTTGTAATAAATGATGTGTGCAAATGCTGGAATATTTTTGAAGACCGGATATT
GCAGTATGAAGACTTGTTTCTTTACTTAAAAATATTTTCATTATTACTTATTTCTGCAAT
TTCTCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F955TF U 1
AF RR4F955JQ C 266
BS 1 724 RR4F955TF
BS 725 725 RR4F955JQ
BS 726 743 RR4F955TF
BS 744 969 RR4F955JQ

RD RR4F955TF 743 0 0
GGAATTCATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTTGTGGGATCTCAAAGATC
AACTGGAGAGAACTCAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGTAAGTCCACTTTTTTC
ATTATAGATCTCTGCTAAAGCCTCCATTTTTATCAATGCTATGTTGTTCTTACCATATGG
GCCCTACATGATCTTTTGTTGCTTTGTTTCTCCCGTGTAATTTGTGAAATAGGATTCATG
TCCTTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTA
TTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTTGAGAAGTATGTCTTCTC
CAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATAT
CATTGTCTATAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAA
CGAGCTCGTCTTGTCTTCGGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAG
GAGCAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGA
TGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGT
AGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACT
GGCA*CAGCTCGGGAACATCTGG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4F955JQ 704 0 0
CTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCAT
GCTGCCAAGTTGACTTTTGAGAAGTATGTCTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGC
ACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCATTGTCTATAAGTTCGCCCAGGAC
CTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGAGCTCGTCTTGTCTTCGGTTCTT
CAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAGGAGCAATGTGGAAAAGATGGAGGCT
CTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTT
CTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGT
GGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCA
AGAAGTCTGCTTACATGAGTTTCCTCATTTGCATTGCATGCCCACTTCCAACTTCTATGA
AGAGTACCTCTCATGGGATTTGTCTCCCGGTTTTATAATAATCTTGTAATAAATGATGTG
TGCAAATGCTGGAATATTTTTGAAGACCGGATATTGCAGTATGAAGACTTGTTTCTTTAC
TTAAAAATATTTTCATTATTACTTATTTCTGCAATTTCTCAACC

QA 1 704 1 704
DS 



CO CL117Contig3 802 3 4 U
GGAGTAACAATTCATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTTGTGGGATCTCA
AAGATCAACTGGAGAGAACTCAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCC
TTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTA
CTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGTCTTCTCCAA
GACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCAT
TGTCTATAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGA
GCTCGTCTTGTCTTCTGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAGGAA
CAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGATGA
AATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGTAGC
AATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACTGGC
AACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTCATATGCATT
GCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACTCTCATGGGATTTGTCTCCCGG
TTTTATAATAATCTTGTAATAAATGATGTGTGCAATGCTGGATATTTTGAGGCCGGATAT
TGCAGTATGAGACTTGTTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FA34TF U 1
AF RR4EE91TF U 12
AF RR4D142TF U 4
BS 1 270 RR4FA34TF
BS 271 271 RR4D142TF
BS 272 719 RR4FA34TF
BS 720 802 RR4D142TF

RD RR4FA34TF 719 0 0
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AAGATCAACTGGAGAGAACTCAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCC
TTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTA
CTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGTCTTCTCCAA
GACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCCGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCAT
TGTCTATAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGA
GCTCGTCTTGTCTTCTGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAGGAA
CAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGATGA
AATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGTAGC
AATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACTGGC
AACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTCATATGCATT
GCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACTCTCATGGGATTTGTCTCCCG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4EE91TF 678 0 0
GGATAT
CAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTTGTGGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGA
ACTCAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTC
TTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTA
CTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGTCTTCTCCAAGACCTCTAAAACCAGTG
CTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCATTGTCTATAAGTTCGCCC
AGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGAGCTCGTCTTGTCTTCTG
TTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGG
AGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGG
TGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAG
CTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATC
TGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTCATATGCATTGCATGCCCACACATAAT
AGAATGTTCTAT

QA 7 678 7 678
DS 

RD RR4D142TF 799 0 0
GGAA
CAATTCATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTTGTGGGATCTCAAAGATCA
ACTGGAGAGAACTCAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCCTTTGGTG
AAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGAT
GACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGTCTTCTCCAAGACCTCT
AAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCATTGTCTAT
AAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGAGCTCGTC
TTGTCTTCTGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCTTCTGAGGAACAATGTG
GAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATGCCTGGATGAAATGGTC
GATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAG
AGCACAGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACGTTAACTCAAGCACTGGCAACAGCT
CGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTCATATGCATTGCATGCC
CACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACTCTCATGGGATTTGTCTCCCGGTTTTATA
ATAATCTTGTAATAAATGATGTGTGCAATGCTGGATATTTTGAGGCCGGATATTGCAGTA
TGAGACTTGTTCTTA

QA 5 799 5 799
DS 



CO CL117Contig4 766 3 13 U
GGATCACTCAAAGGAATCTGCTCTCTCTCAAAAAGTGGCGATAACACAGGTTTAACAACA
ATGTCAGGCATTCACGGGAATCATGATTTATGTCCTTTGGTAAAGAACATTCTTCTCCTA
GACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACTAATGCT
GCCAAGTTGAGTTTTGAGAAGTACGTTTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACT
GAAGCGGAGATCACACTCTTGGACAGCAATATTATTGTCTATAAGTTCGCCCAGGACCTT
CACTTCTTTGTTACTGGAGGCGACAATGAAAACGAGCTCGTCTTATCCTCTGTTCTTCAG
GGCTTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTT
GAGAACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTT
GAAACAGACCCGAGCGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGT
TCACTCTCTGAACAGACACTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGCGAACATCTCGCTAGA
AGTCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCATATGCATTATGCATAATAACTGTTGTGGG
GATTTATCTCATAACCTGTGAAAGGCTTCTAATAATTCATGCACATTGCACTTAATCTGG
AGTTTTGGGTATTATATTCTGTGTGCAATGCTGGAATTGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN46TF U 1
AF RR4AZ81TF U 1
AF RR4C686JQ C 364
BS 1 9 RR4GN46TF
BS 10 10 RR4AZ81TF
BS 11 22 RR4GN46TF
BS 23 23 RR4AZ81TF
BS 24 26 RR4GN46TF
BS 27 28 RR4AZ81TF
BS 29 30 RR4GN46TF
BS 31 31 RR4AZ81TF
BS 32 213 RR4GN46TF
BS 214 214 RR4AZ81TF
BS 215 245 RR4GN46TF
BS 246 751 RR4AZ81TF
BS 752 766 RR4C686JQ

RD RR4GN46TF 246 0 0
GGATCACTCTAAGGAATCTGCTTTCT**CAGAAAGTGGCGATAACACAGGTTTAACAACA
ATGTCAGGCATTCACGGGAATCATGATTTATGTCCTTTGGTAAAGAACATTCTTCTCCTA
GACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACTAATGCT
GCCAAGTTGAGTTTTGAGAAGTACGTTTTCTCCTAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACT
GAAGCT

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR4AZ81TF 751 0 0
GGATC
ACTCAAAGGAATCTGCTCTCTCTCAAAAAGTGGCGATAACACAGGTTTAACAACAATGTC
AGGCATTCACGG*AATCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGACTC
TGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACTAATGCTGCCAA
GTTGAGTTTTGAGAAGTACGTTTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGC
GGAGATCACACTCTTGGACAGCAATATTATTGTCTATAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTT
CTTTGTTACTGGAGGCGACAATGAAAACGAGCTCGTCTTATCCTCTGTTCTTCAGGGCTT
TTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTTGAGAA
CTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAAC
AGACCCGAGCGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCACT
CTCTGAACAGACACTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGCGAACATCTCGCTAGAAGTCT
GCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCATATGCATTATGCATAATAACTGTTGTGGGGATTT
ATCTCATAACCTGTGAAAGGCTTCTAATAATTCATGCACATTGCACTTAATCTGGAGTTT
TGGGTATTATATTCTGTGTGCAATGC

QA 6 751 6 751
DS 

RD RR4C686JQ 403 0 0
TTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTTTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTTGAG
AACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAA
ACAGACCCGAGCGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCA
CTCTCTGAACAGACACTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGCGAACATCTCGCTAGAAGT
CTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCATATGCATTATGCATAATAACTGTTGTGGG*AT
TTATCTCATAACCTGTGAAAGGCTTCTAATAATTCATGCACATTGCACTTAATCTGGAGT
TTTGGGTATTATATTCTGTGTGCAATGCTGGAATTGTTTTTTT

QA 1 403 1 403
DS 



AS 1 15

CO CL118Contig1 715 15 12 U
AGGGGCCTCTGAAGTTACAAAATCCGTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCA
GATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAA
TCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCT
GAGTATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTA
CTCTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCT
CCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGA
TGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAA
GAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCG
TGGACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGG
TAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACT
CTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAAC
TTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTCCAT


BQ
10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 40 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 
70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 50 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 

AF RR4BH81JQ C 113
AF RR4B406JQ C 149
AF RR4E281JQ C 318
AF RR4E281TF U 318
AF RR4CS88JQ C 1
AF RR4CS88TF U 1
AF RR4AI16JQ C 3
AF RR4D253JQ C 211
AF RR4AI16TF U 3
AF RR4D253TF U 3
AF RR4BN94TF U 36
AF RR4F125TF U 24
AF RR4F125JQ C 74
AF RR4B406TF U 23
AF RR4BH81TF U 23
BS 1 2 RR4CS88JQ
BS 3 34 RR4CS88TF
BS 35 35 RR4AI16TF
BS 36 198 RR4CS88TF
BS 199 199 RR4AI16TF
BS 200 201 RR4CS88TF
BS 202 202 RR4AI16TF
BS 203 333 RR4CS88TF
BS 334 334 RR4E281TF
BS 335 687 RR4CS88TF
BS 688 712 RR4AI16TF
BS 713 715 RR4B406TF

RD RR4BH81JQ 455 0 0
AAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGTTTTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAG
CAGAGTTTGAGTATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGG
ATTGAGTACTCTTTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTC
GTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATT
TTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATTTGAGGAGATTCAATGCGCTT
GCTATCAAGAGGTTGAAGGAGGTACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTG
CCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTTTTAAAGGCAAGAAAATTGCT
ATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTTTAAGTAACCAAC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4B406JQ 417 0 0
CCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGAGTATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGT
GTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTTTCCAGTACATTCATGGGATTGGC
CGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATTTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGAC
ATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTTTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGT
GATTTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGGTACAGTGTTACCGT
GGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGA
ACTTTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTTTAAGTAACCA

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4E281JQ 339 0 0
G
CACCAAAGACGTGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACAT
GATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACA
GTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAA
CAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCTAA
GTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAG
TTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTG

QA 2 339 2 339
DS 

RD RR4E281TF 339 0 0
G
CACCAAAGACGTGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACAT
GATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACA
GTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAA
CAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCTAA
GTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAG
TTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTG

QA 2 339 2 339
DS 

RD RR4CS88JQ 688 0 0
AGGGGCCTCTGAAGTTACAAAATCCGTACGAAGGGAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCA
GATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAA
TCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCT
GAGTATCAGATGTGCTCGCGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTA
CTCTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCT
CCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGA
TGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAA
GAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCG
TGGACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGG
TAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACT
CTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAAC
TTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAAC
G

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CS88TF 688 0 0
AG
GGGCCTCTGAAGTTACAAAATCCGTACGAAGGGAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGA
TGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGA
GTATCAGATGTGCTCGCGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCC
AGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTT
GGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAAC
G

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR4AI16JQ 711 0 0
GGGCCTCTGAAGTTACAAAATCCGTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGA
TGGTTGCGATGCCCGTAACGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTTTGA
GTATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCC
AGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTTTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATTTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTT
GGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTC
G

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4D253JQ 500 0 0
GGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCG
AACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACAT
GGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGA
TCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGG
TGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAAC
TCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCA
TCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGT
TTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAACTAA
TCTTCAGCTTTGTTATTGTT

QA 1 500 1 500
DS 

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GGGCCTCTGAAGTTACAAAATCCGTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGA
TGGTTGCGATGCCCGTAACGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGA
GTATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCC
AGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTT
GGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTC
G

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4D253TF 708 0 0
GGGCCTCTGAAGTTACAAAATCCGTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGA
TGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGA
GTATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCC
AGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTT
GGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAAACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BN94TF 662 0 0
AGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCC
TCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTA
CTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGAGTATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGA
TTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGCCGAACCA
GGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTG
AGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGA
GGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAA
GGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTA
AAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAATAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGA
ATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGCCTCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAA
ATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTTGGTTCGA*TTGAGCCCTTTCCAA*CTAATCTTC
AG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4F125TF 678 0 0
GG
GTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGGTGCCCGTAGCGCAC
TCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCT
CTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGAGTACCAGATGTGCTCGTGTGGGA
GGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGGATT
GGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAA
GACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAG
GGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTAC
CGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGT
AGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCA
ACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTC
GCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAA
ACTAATCTTCAGCTT
G

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR4F125JQ 612 0 0
CCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATCCTCTCACTCGC
AACACTCTCGCTTTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGAGTACCAGATGT
GCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTAC
ATTCATGGGATTGGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAAC
AAAATCACCAAAGACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTTTTCGTGATGAAGTCTCCAAG
TACATGATCGAGGGTGATTTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAG
ATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACC
AAGAACAACTGTAGAACTTTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTT
TCTAAGTAACCAACTCATTTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTC
TCTAGTTTTTTCGCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTTGGTTCGAATTG
AGCCCTTTCCAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4B406TF 693 0 0
GGG
GTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGTGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCAC
TCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCT
CTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGAGTATCAGATGTGCTCGTGTGGGA
GGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGGATT
GGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAA
GACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAG
GGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGGTACAGTGTTAC
CGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGT
AGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCA
ACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTC
GCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGCCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAA
ACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTCCAT

QA 4 693 4 693
DS 

RD RR4BH81TF 693 0 0
GGG
GTACGAAGGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGTGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCAC
TCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGGCTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCT
CTGCCACCTACTAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTGAGTATCAGATGTGCTCGTGTGGGA
GGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGGATT
GGCCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAA
GACATGGCCGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAG
GGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGGTACAGTGTTAC
CGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGT
AGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCA
ACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTTC
GCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATGCCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAA
ACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTC
CAT

QA 4 690 4 690
DS 



AS 1 13

CO CL119Contig1 793 13 4 U
AAGAAGAAACTAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAAAAAATGGC
GACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCTTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTT
CCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGT
TAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACC
AAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTAT
CTCTGGCCGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCAC
CGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGA
GCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTC
GAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGT
AAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAA
GGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCA
CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGT
GGAACGTATGTTC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 30 30 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 
70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 
75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 25 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 

AF RR4CR11TF U 1
AF RR4GK04TF U 1
AF RR4DH71JQ C 1
AF RR4DA09TF U 11
AF RR4DH71TF U 1
AF RR4DJ32JQ C 1
AF RR4DJ32TF U 1
AF RR4DA09JQ C 20
AF RR4BB07TF U 19
AF RR4BD80JQ C 126
AF RR4GK04JQ C 41
AF RR4BD80TF U 19
AF RR4BB07JQ C 73
BS 1 743 RR4CR11TF
BS 744 755 RR4DA09TF
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CGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGA
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GGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCA
CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4GK04TF 742 0 0
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GACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCTTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTT
CCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGT
TAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACC
AAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTAT
CTCTGGCCGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCAC
CGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGA
GCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTC
GAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGT
AAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAA
GGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCA
CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTAT*AAGTTGCTTCCTTAAGT*ATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4DH71JQ 762 0 0
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GACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCCTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTT
CCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGT
TAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACC
AAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTAT
CTCTGGCCGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCAC
CGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGA
GCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTC
GAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGT
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GGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCA
CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTAC
T

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4DA09TF 745 0 0
G
AGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAAAAAATGGCGACCATGTCTG
CTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCTTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTTCCTCGGCCAGC
GTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCAT
GTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTC
CCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGCCGCG
ACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCA
AAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAA
TTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGG
AGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGA
TCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAAG
ATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATA
TTTGTCTGATGGATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACT
TGTGTTTTATTCTAAACATACATT

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR4DH71TF 742 0 0
AAGAAGAAACTAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAAAAAATGGC
GACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCCTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTT
CCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGT
TAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACC
AAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTAT
CTCTGGCCGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCAC
CGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGA
GCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTC
GAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGT
AAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAA
GGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCA
CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4DJ32JQ 762 0 0
AAGAAGAAACTAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAAAAAATGGC
GACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCCTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTT
CCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGT
TAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACC
AAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTAT
CTCTGGCCGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCAC
CGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGA
GCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTC
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AAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAA
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CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTAC
T

QA 1 761 1 761
DS 

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AAGAAGAAACTAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAAAAAATGGC
GACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCCTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTT
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AAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAA
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CTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATG
GTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTAC
T

QA 1 761 1 761
DS 

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AGCTCTTTCACTTCTCTTTCCTTATCCTCCAACTCCTCTTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTT
TCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTCCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTC
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ATGGATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTTT
ATTCTAAACATACATTTTTTAC

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DS 

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GG
GCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAAGTTGAAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAAA
GCTCTTTCACTTCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTT
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GGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGGGGCTAAAGATAAAGAAA
CTACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGA
TGAATGTATTAAGTTTCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTTTA
TTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAACGTATGTTC

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DS 

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ACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAA*GCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACA
GTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTCATCTCTG
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TCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTG
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ATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGGGG
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GATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTTCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACT
TAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAAC
GTATGTTC

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DS 

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TTATCCTCCAACTCCTCTTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTC
GCTCCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGG
GAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTC
GGAGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGCCGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAG
ATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATG
AAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGC
TCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTC
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GAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCC
TCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTC
CTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTA
CAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAACGTATGTT
TATATCG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4BD80TF 775 0 0
GG
GCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAAGTTGAAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAAA
GCTCTTTCACTTCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTT
CCCCGATTCCCCTCTCCCTCGCTTCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCT
TTGCAAAGCTAA*GCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTC
ACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTCATCTCTGGACGCGACAAGGGTA
AGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTTA
ACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGA
TCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAA
GCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTG
GGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGGGGCTAAAGATAAAGAAA
CTACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGA
TGAATGTATTAAGTTTCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTTTA
TTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAACGTATGTTC

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4BB07JQ 721 0 0
TCTTCAAAGCTCTTTCACTTCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCG
TCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCGCTTCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATG
TCTTGTCTTTGCAAAGCTAA*GCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCC
CATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTCATCTCTGGACGCGA
CAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAA
AGATGTTAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAAT
TGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGA
GGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGAT
CAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGGGGCTAAAGA
TAAAGAAACTACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATAT
TTGTCTGATGAATGTATTAAGTTTCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACTT
GTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAACGTATGTT
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 14

CO CL120Contig1 773 7 8 U
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TATTTTAGTTCTTGGTGACAACTCTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCTTGCACAAT
AAAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAACTCTTATGAGCTCAATCTT
TCTAGTTTCATAAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCC
TCTTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTT
CTTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTT
TCTTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCT
GAGCAAATCCAGTCATGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGACAGAGAAGAAG
CTCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGACACGCTGTCTGAAGAGGAT
AATGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACG
GTAATATCTCTGTTCTTTCATGTGAGGATGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATA
TCGCTGGCTAGGTAGTTGCAATAGCATAGTGTTGGGTTTGAGAATAATGGCAGCAAGTTT
CTATTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTGGTTAAATGTCCAAAGAAAAAAAA


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 20 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
20 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 30 30 30 30 30 20 20 20 5 5 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DJ14TF U 1
AF RR4B624TF U 1
AF RR4DJ14JQ C 174
AF RR4EF20TF U 1
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TCTTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCT
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DS 

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AGAGGATAATGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCT
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AAACATATCGCTGGCTAGGTAGTTGCAATAGCATAGTGTTGGGTTTGAGAATAATGGCAG
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CTTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTT
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TGTCC

QA 1 755 1 755
DS 

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TCTTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTT
CTTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTT
TCTTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCT
GAGCAAATCCAGTCATGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGACAGAGAAGAAG
CTCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGACACGCTGTCTGAAGAGGAT
AATGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACG
GTAATATCTCTGTTCTTTCATGTGAGGATGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATA
TCGCTGGCTA*GTAGTTGCAATAGCATAGTGTTGGGTTTGAGAT**ATGGCAGCAAGTTT
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DS 

RD RR4CG40TF 769 0 0
GGGT
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TTTTAATTCTTGGTGACGACTTTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCCTGCACAATAA
AGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTTTTATGAGCTCAATCTTTC
TAGTTTCATAAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCCTC
TTTCAGAGCTTCTATTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTTCT
TTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTTTC
TTCACAGACGGTTCATAGGATTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCTGA
GCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGACAGAGAAGAAGCT
CGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATAA
TGACTTTTCAAACAAAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACGGT
AATATCTCTGTTCTTTCATGTGA******AAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATATC
GCTGGCTA*GTAGTTGCAATAGGATAGTGTTGGGTTTGAGAT**ATGGCAGTAAGTTTCT
GTTT*GATGAGTGCACACA*GATGTTTGGTTAA
TGTCAGAGAAAA

QA 5 757 5 757
DS 

RD RR4CL25TF 773 0 0
GGAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCGATC
TATTTTAGTTCTTGGTGACAACTCTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCTTGCACAAT
AAAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAACTCTTATGAGCTCAATCTT
TCTAGTTTCATAAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCC
TCTTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTT
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TCTTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCT
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CTCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGACACGCTGTCTGAAGAGGAT
AATGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACG
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CTATTTTGATGAGTGCACACA*GATGTTTGGTTAAATGTCCAAAGAAAAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL120Contig2 1585 7 14 U
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AGCTAAAGTTACATCTTAAGAACAGATAACGACATATATATATGAGTCTATAACCCTAAT
TACATGGTTACCAAACACTTCATATTGGATCATAAGATGGGCCTTGGTGTGGGCTTTAAT
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GATGGTTTTGAAGGAGACATGGCGAGTTGAAGGTCGTGAGAAGAAACATGACATGTGACT
TGGAGAAACTACTAGTTCTGTTTGAAAAGTCATTATCCTCTTCAGACAGCGTGTCCAGCT
TCACCAAAACACCAACTTTGTTTTACCAGGCGAGCTTCTTCTCTGTCTTGGTCACTGCCG
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CTCAACCTTTCTTTGGATTTCGAGTTCAGGAAAGAAACTCTACCAAAACTGATAAGGAAG
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TGAAAGAGGCTGCAATTACAGCAGCCAAAGTTACATCTTAAGAACAGATAACGACATATA
TATATGAGTCTATAACCCTAATTACATGGTTACCAAACACTTCATATTAGATCATAAGAT
GGGCCTTGGTGTGGGCTTTAATACTCCCCCGCAAACTGAGCAGCGGGTGAACACGAAGCT
GCTGAGTTTGAATGCACATGAAGATGGTTTTGAAGGAGACATGGCGAGTTGAAGGTCTAT
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CTCTCTATTTCTTATCCATCTGCCACCAAAAGCTCTTCACTTTCACAGTCTTTTTTTTTT
*CTTTTGGACATTTAACCAAACATCTTGTGTGCACTCATCAAAATAGAAACTTGCTGCCA
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GCGTGGCCAGCTTCACAAAACACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 15 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C331JQ U 1
AF RR4C331TF C 170
AF RR4CL01JQ U 803
AF RR4GL92TF C 806
AF RR4EF20JQ U 796
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AF RR4CG40JQ U 799
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QA 1 821 1 821
DS 

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AGAGGCTGCAATTACAGCAGCCAAAGTTCC

QA 16 705 16 705
DS 

RD RR4CL01JQ 674 0 0
C
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AGCTTGGAGAATAGACGTAAGTGTGAGAACATCTTCAGGTTCTTTTGACCTATTTGTCTC
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TCTTGTGTGCACTCATCAAAATAAAAACTTGCTGCCATTATTCTCAAACCCAACACTATG
CTATTGCAACTACCTAGCCAGCGATATGTTTCCAGTTCTGAAGCTATCTATTTTCATCCT
CACATGAAAGAAC

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR4GL92TF 669 0 0
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CAAAGTTACATCTTAAGAACAGATAACGACATATATATATGAGTCTATAACCCTAATTAC
ATGGTAACCAAACACTTCATATTAGATCATAAGATGGGCCTTGGTGTGGGCTTTAATACT
CCCCCGCAAACTGAGCAGCGGGTGAACACGAAGCTGCTGAGTTTGAATGCACATGAAGAT
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CTTGGAGAATAGACGTAAGTGTGAGAACATCTTCAGGTTCTTTTGACCTATTTGTCTCAC
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TTGTGTGCACTCATCAAAATAGAAACTTGCTGCCATTATTCTCAAACCCAACACTATGCT
ATTGCAACTACCTAGCCAGCGATATGTTTCCAGTTCTGAAGCTATCTATTTTCATCCTCA
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C

QA 1 668 1 668
DS 

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CTCCCCCGCAAACTGAGCAGCGGGTGAACACGAAGCTGCTGAGTTTGAATGCACATGAAG
ATGGTTTTGAAGGAGACATGGCGAGTTGAAGGTCTATAGGAAGTAGGTAGATGAATATTC
AGCTTGGAGAATAGACGTAAGTGTGAGAACATCTTCAGGTTCTTTTGACCTACTTGTCTC
ACAACAAGTTGGGGATTTTTTTTTTT**AATCCTCCTAACTGGACTAAGCTATCTCACGG
CCAAAGAAAAATCATCCTACAAGAGCCTAAACCTCAACTCTCTATTTCTTATCCATCTGC
CACCAAAAGCTCTTCACTTTCACAGTCTTTTTTTTTTTCTTTTGGACATTTAACCAAACA
TCTTGTGTGCACTCATCAAAATAGAAACTTGCTGCCATTATTCTCAAACCCAACACTATG
CTATTGCAACTACTTAGCCAGCGATATGTTTCCAGTTCTGAAGCTATCTATTTTCATCCT
CACATGAAAGAACAGAGATATTACCGTGAGAAGAAACATGACATGTGACTT

QA 9 719 9 719
DS 

RD RR4CL25JQ 734 0 0
C
GAACTAAAATAGATCGATTGATTCATGAAACAGAGTTTGAAAGAGGCTGCAATTACAGCA
GCCAAAGTTACATCTTAAGAACAGATAACGACATATATATATGAGTCTATAACCCTAATT
ACATGGTTACCAAACACTTCATATTAGATCATAAGATGGGCCTTGGTGTGGGCTTTAATA
CTCCCCCGCAAACTGAGCAGCGGGTGAACACGAAGCTGCTGAGTTTGAATGCACATGAAG
ATGGTTTTGAAGGAGACATGGCGAGTTGAAGGTCTATAGGAAGTAGGTAGATGAATATTC
AGCTTGGAAAATAGACGTAAGTGTGAGAACATCTTCAGGTTCTTTTGACCTATTTGTCTC
ACAACAAGTTGGGGATTTTTTTTTTTTTAATCCTCCTAACTGGACTAAGCTATCTCACGG
CCAAAGAAAAATCATCCTACAAGAGCCTAAACCTCAACTCTCTATTTCTTATCCATCTGC
CACCAAAAGCTCTTCACTTTCACAGTCTTTTTTTTTT*CTTTTGGACATTTAACCAAACA
TCTTGTGTGCACTCATCAAAATAAAAACTTGCTGCCATTATTCTCAAACCCAACACTATG
CTATTGCAACTACCTAGCCAGCGATATGTTTCCAGTTCTGAAGCTATCTATTTTCATCCT
CACATGAAAGAACAGAGATATTACCGTGAGAAGAAACATGACATGTGACTTGGAGAAACT
ACTAGTTCTGTTT

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR4CG40JQ 787 0 0
ACCAAGAAT
TAAAATAGATTGATTGATTCATGAAACAGAGTTTGAAAGAGGCTGCAATTACAGCAGCCA
AAGTTACATCTTAAGAACAGATAACGACATATATATATGAGTCTATAACCCTAGTTACAT
GGTTACCAAACACTTCATATTGGATCATGAGATGGGCCTTGGTGTGGGCTTTAATACTCC
CCCGCAAACTGAGCAGCGGATGAACACGAAGCTGCTGAGTTTGAATGCACATGAAGATGG
TTTTGAAGGAGACATGGCGAGTTGAAGGTCTATAGGAAGTAGGTAGATGAATATTCAGCT
TGGAGAATAGACATAAGTGTGAGAACATCTTCAGGTTCTTTTGACCTATTTGTCTCACAA
CAAGTTGGGGATTTTTTTTTT***AATCCTCCTAACTGGACTAAGCTATCTCACAGCCAA
AGAAAAATCATTCTACAAGAGCCTAAACCTCAACTCTCTATTTCCTATCCATCTGCCACC
AAAAGCTCTTCACTTTCACAGTCTGTTTTTTTTTCTCTTGGACATTTAACCAAACATCTT
GTGTGCACTCATCAAAACAGAAACTTACTGCCATTATTCTCAAACCCAACACTATCCTAT
TGCAACTACCTAGCCAGCGATATGTTTCCAGTTCTGAAGCTATCTATTTTCA******CA
TGAAAGAACAGAGATATTACCGTGAGAAGAAACATGACATGTGACTTGGAGAAACTACTA
GTTTTGTTTGAAAGTCATTATCCTCTTCAGACAGCGTGGCCAGCTTCACAAAACACCA

QA 10 787 10 787
DS 



AS 2 15

CO CL121Contig1 858 7 9 U
GGCGACGGAGAGAGAGAGAGAGAG*GGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTA
TACGGCGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCT
GATGATGACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGAC
GAAGCTGCTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGAT
GCTGGTACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTT
GTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGC
GGCACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCT
TATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAG
TTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAG
TTCCGCGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTAT
ATGTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATG
CCATATCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAATGA
CTTCTCGCTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATC
GTTTGGATCAGTGATGATACATTTTTGTTATGTGTTACATTATGCGGATGGGTTTAATAT
CAGTTGAAATTATGTTTG


BQ
10 10 10 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4CE87TF U -2
AF RR4DV51TF U 3
AF RR4EF08TF U 1
AF RR4EW52TF U 3
AF RR4DV51JQ C 4
AF RR4CE87JQ C 2
AF RR4EF08JQ C 133
BS 1 743 RR4EF08TF
BS 744 744 RR4DV51JQ
BS 745 765 RR4EF08TF
BS 766 766 RR4DV51JQ
BS 767 769 RR4EW52TF
BS 770 770 RR4DV51JQ
BS 771 810 RR4EW52TF
BS 811 855 RR4CE87JQ
BS 856 858 RR4EF08JQ

RD RR4CE87TF 643 0 0
GGGCGACGGA
GAGAGAGAGAGAGAGAG*GGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCG
GAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGATGATG
ACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTG
CTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTA
CTGTAGCAGCAGATCAAGCGGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCA
ATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAG
TCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCG
AGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATG
GTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGCG
GTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATT
CTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCA

QA 11 643 11 643
DS 

RD RR4DV51TF 638 0 0
G
GACGGAGAGAGAGAGAGAGAG*GGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATAC
GGCGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGAT
GATGACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAA
GCTGCTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCT
GGTACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTT
GGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGC
ACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTAT
GTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTA
CATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTC
CGCGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATG
TATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCA

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR4EF08TF 775 0 0
GGCGACGGAGAGAGAGAGAGAGAG*GGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTA
TACGGCGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCT
GATGATGACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGAC
GAAGCTGCTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGAT
GCTGGTACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTT
GTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGC
GGCACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCT
TATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAG
TTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAG
TTCCGCGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTAT
ATGTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATG
CCATATCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAATGA
CTTCTCGCTCTCTTTGTTTAAGA*CTTTGCAATCTTGAATTGTTT
ACAGTTTCAT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4EW52TF 808 0 0
G
GACGGAGAGAGAGAGAGAGAG*GGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATAC
GGCGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGGCATGGACATGACTGCCGCTGAT
GATGACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAA
GCTGCTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCT
GGTACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTT
GGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGC
ACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTAT
GTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTA
CATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACATTTC
CGCGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATG
TATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAG*CCAATGCGTTACATGCCA
TATCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCA*TGACTT
CTCGCTCTCTTTGTTTA*GA*CTTTGCAATCTTGA*TTGTTT*ACA*GTTTCATATCGTT
TGGATCAGTGATGATACATTTTTGTTA

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR4DV51JQ 812 0 0
GACGGAGAGAGAGAGAGAGAG*GGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATAC
GGCGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGAT
GATGACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAA
GCTGCTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCT
GGTACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTT
GGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGC
ACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTAT
GTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTA
CATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTC
CGCGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATG
TATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCA
TATCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAATGACTT
CTCGCTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATCGTT
TGGATCAGTGATGATACATTTTTGTTA
TGTGT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4CE87JQ 856 0 0
GGCGAC
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCG
GAGAGAT*CCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGATGATG
ACGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTG
CTGCTCTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTA
CTGTAGCAGCAGATCAAGCGGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCA
ATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAG
TCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCG
AGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATG
GTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGCG
GTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATT
CTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATATC
AATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAATGACTTCTCG
CTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATCGTTTGGA
TCAGTGATGATACATTTTTGTTATGTGTTACATTATGCGGATGGGTTTAATATCAGTTGA
AATTATGT
CT

QA 7 854 7 854
DS 

RD RR4EF08JQ 726 0 0
GCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTGCTGCT
CTTCGCGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGTA
GCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTT
GATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCAC
CGAGTGACAATTTTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTT
GTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGT
CAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGCGGTAGA
AGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCA
TATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATATCAATAA
AACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAATGACTTCTCGCTCTC
TTTGTTTAAGAACTTTGCAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATCGTTTGGATCAGT
GATAATACATTTTTGTTATGTGTTACATTATGCGGATGGGTTTAATATCAGTTGAAATTA
TGTTTG

QA 1 726 1 726
DS 



CO CL121Contig2 867 8 10 U
GGACTATCCAACTCGGCTAAAAGTGCGTGCCCTAAGAGAGTAACGTCGCGACGGAGAGAG
AGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGATTCCCGACGTCG
GAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGCTAAGGAGTTGG
ATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTGCTGCTCTTCGTGAGATGC
AGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGTAGCAGCAGATCAAG
CAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTA
CACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCACCGAGTGACAATTC
TGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAG
CTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGA
TGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAACCCGT
ACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCATATGGATATGGG*
AAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAAACCATCACGGT
TGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTCTCCTTCTCTTTGTTTA
AGAACTTTGCTATAAAACTTTTCGAATCTTGAATTGTTTCACAAGTTTCATATCGTCCTT
TTGATCAGTGATGATACACTTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G031TF U 1
AF RR4H138TF U 4
AF RR4DT51TF U 49
AF RR4DQ83TF U 348
AF RR4DT51JQ C 50
AF RR4DQ83JQ C 465
AF RR4G031JQ C 333
AF RR4H138JQ C 227
BS 1 230 RR4G031TF
BS 231 231 RR4H138TF
BS 232 401 RR4G031TF
BS 402 402 RR4H138TF
BS 403 579 RR4G031TF
BS 580 580 RR4H138TF
BS 581 667 RR4G031TF
BS 668 705 RR4H138TF
BS 706 780 RR4DQ83TF
BS 781 867 RR4DT51JQ

RD RR4G031TF 667 0 0
GGACTATCCAACTCGGCTAAAAGTGCGTGCCCTAAGAGAGTAACGTCGCGACGGAGAGAG
AGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGATTCCCGACGTCG
GAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGCTAAGGAGTTGG
ATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTGCTGCTCTTTGTGAGATGC
AGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGTAGCAGCAGATCAAG
CAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTA
CACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACATTCCACCGAGTGACAATTC
TGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAG
CTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGA
TGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCCTGGTAGAAGATTCAACCCGT
ACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCATATGGATATGGG*
AAAGTTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4H138TF 702 0 0
GG
ATCCAACTCGGCTAAAAGTGCGTGCCCTAAGAGAGTAACGTCGCGACGGAGAGAGAGAGA
GAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGATTCCCGACGTCGGAGAG
ATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGCTAAGGAGTTGGATGAG
ATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTACTGCTCTTCGTGAGATGCAGGCC
AAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGC
AAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCT
GAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACA
GACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATA
CAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCT
AAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATG
GGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCATATGGATATGGGGAAAGT
TCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAA

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DS 

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GGCGACG
GAGAGAGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGATTCCCGA
CGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGCTAAGGA
GTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTGCTGCTCTTCGTGA
GATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGTAGCAGCAGA
TCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGC
TTGTACACCTTAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCACCGAGTGAC
AATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGC
TGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAA
GGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAA
CCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCATATGGATA
TGGG*AAAGTTCC

QA 8 620 8 620
DS 

RD RR4DQ83TF 444 0 0
GATTACGCTTGTACACCTTAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCAC
CGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTT
GTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGT
CAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGA
AGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCA
TATGGATATGGG*AAAGTTCCTAG*TTCAGAAAGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATA
AAACCATCACGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTCTCC
TTCTCTTTGTTTA
GACTTTGCTAT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4DT51JQ 818 0 0
GGCGAC
GAGAGAGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGAT*CCCGA
CGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGCTAAGGA
GTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGAAGCTGCTGCTCTTCGTGA
GATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGTAGCAGCAGA
TCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGC
TTGTACACCTTAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCACCGAGTGAC
AATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGC
TGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAA
GGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAA
CCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCATATGGATA
TGGG*AAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAAACCATC
ACGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTCTCCTTCTCTTT
GTTTAAGAACTTTGCTATAAAACTTTTCGAATCTTGAATTGTTTCACAAGTTTCATATCG
TCCTTTTGATCAGTGATGATACACTTTTTGTT

QA 7 818 7 818
DS 

RD RR4DQ83JQ 397 0 0
TTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGT
CGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGT
AGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCT
CCATATGGATATGGG*AAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCA
ATAAAACCATCACGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTC
TCCTTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCTATAAAACTTTTCGAATCTTGAATTGTTTCACAA
GTTTCATATCGTCCTTTTGATCAGTGATGA
TACACTT

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4G031JQ 518 0 0
TTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCA
TGCGGCACATTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTC
GCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCA
GAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAA
CAGTTCCCTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCG
TATATGTATTCTCCATATGGATATGGG*AAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTA
CATGCCATACCAATAAAACCATCACGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGCT
TTCAGTGACTTCTCCTTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCTATAAAACTTTTCGAATCTTGA
ATTGTTTCACAAGTTTCATATCGTCCTTTTGATCAGTG

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DS 

RD RR4H138JQ 629 0 0
TCTTCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACTGT
AGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGT
TGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGCACAGTCCA
CCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTT
TGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCG
TCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAG
AAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCC
ATATGGATATGGG*AAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAAT
AAAACCATCACGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTCTC
CTTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCTATAAAACTCTTCGAATCTTGAATTGTTTCACAAGT
TTCATATCGTCCTTTTGATCAGTG
ATGAC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 15

CO CL122Contig1 1082 15 10 U
AATTAAATTCTTATATATAGAATTCAGAATTTATTTTTATTCATTTTATAAGTCGGATAG
ATAGTTGAGAAAATGAAGCTTAGCTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAAT
TTAGATGGGAGATCAAGAGTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATA
TATTGGCTCAAACTGGATGAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAG
CTCCCTTAACAAAGTCATAATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT
*CCCTCACAAATGGGTATGTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCA
CATCGGCCACATTGGTCTTCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTT
GCTGGCAAACAGATTTTTACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGA
GCAAATGACATAAGTCCCTTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTC
TCGACCTTAAGGTGCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACC
TGGTCATAAGGAGGAACCATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGG
AAGTTAAGCACGTGTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTT
GGGCTTTGACCTTTGGCAAGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCTTC
TTGAAGGTGACGAAGCCTTGCTTAATTCGTTCCACAGGATCGAATGCTTTGCCGTCCGAT
GACGAGATTGTCTTAAGCTCCGCTGTGAGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACCGTCTTA
AGGTCATCCTTCTCAATGATAAGCTTCTTGAGAGCTTCGATGGCGTCTTCGTATGATTGG
CTTCCCATGTCTTCTTGATACCAGTTGGAGGTGAATATGCTGATGCAGGAACCGGAAGAG
GAGGAACAGGCGATGAGGGAGGGGTGAAGAGAGTAATGGTATTTATAATACACAGATCCA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 60 60 60 
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80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 
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75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 60 60 60 55 55 50 50 50 
50 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4GW13JQ U 1
AF RR4F579JQ U 19
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AF RR4A132JQ U 53
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AF RR4EP46JQ U 21
AF RR4BD34JQ U 19
AF RR4BD83JQ U 19
AF RR4BD83TF C 58
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BS 250 627 RR4A132JQD
BS 628 629 RR4BD34JQ
BS 630 756 RR4A132JQD
BS 757 782 RR4BD34JQ
BS 783 930 RR4BD83TF
BS 931 931 RR4A132TFB
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BS 949 1024 RR4A132TFB
BS 1025 1082 RR4GW13TF

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ATAGTTGAGAAAATGAAGCTTAGCTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAAT
TTAGATGGGAGATCAAGAGTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATA
TATTGGCTCAAACTGGATGAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAG
CTCCCTTAA

QA 1 249 1 249
DS 

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CTTAGCTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAATTTAGATGGGAGATCAAGA
GTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGAT
GAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCAT
AATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT*CCCTCACAAATGGGTAT
GTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCT
TCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAATAGATTTTT
ACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCC
TTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAG
ACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACC
ATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGAT
GGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGC

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DS 

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CTTAACTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAATTTAGATGGGAGATCAAGA
GTAGGGAGCAAGGGGATGAAAACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGAT
GAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCAT
AATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT*CCCTCACAAATGGGTAT
GTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCT
TCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTT
ACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCC
TTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAG
ACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACC
ATATTTGCAGCGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGAT
GGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCTTTGACCTTTGGCA
AGCTCACCGTACAAAGCT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4A132JQ 681 0 0
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CCATTAATTTAAATGGGAGATCAAGAGTAGGGAGCAAGGTGATGAAAACGGTGAGGATGA
TTATGATATATTGGCTCAAACTGGATGAGCGGGAAAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAG
CTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCATAATAACCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGAC
AACTCCTT*CCCTCACAAATGGGTATGTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCT
CCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCTTCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTT
TTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTTACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTC
CGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCCTTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCA
CAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCAT
ATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACCATATTTGCAGCGTTACGAACCACGAAGGCATCTC
CAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCA
TGTACTTTGGGCTTTGACCTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4C593JQ 758 0 0
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CTTAGCTCAAATAAAAAAGCAGTTGTTCGAGTAGCCATTAATTTAGATGGGAGATCAAGA
GTAGAGAGCAAGGTGATGAAAACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGAT
GAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCAT
AATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCATT*CCCTCACAAATGGGTAT
GTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCT
TCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTT
GCC*AATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCC
TTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAG
ACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACC
ATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGAT
GGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCTTTGACCTTTGGCA
AGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTC

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DS 

RD RR4C528JQ 755 0 0
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GTAGAGAGCAAGGTGATGAAAACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGAT
GAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCAT
AATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCATT*CCCTCACAAATGGGTAT
GTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCT
TCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTT
GCC*AATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCC
TTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAG
ACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACC
ATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGAT
GGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCTTTGACCTTTGGCA
AGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4EP46JQ 758 0 0
G
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AGCTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAATTTAGATGGGAGATCAAGAGTA
GAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGATGAG
CGGGAGAGAGGCCGAAATGGAGTTCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCATAAT
AGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT*CCCTCACAAATGGGTATGTT
AATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCTTCA
AATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTTACC
CAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAA*AGCAAATGACATAAGTCCCTTG
ATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACGATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAGACA
GCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACCATA
TTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGATGGG
CACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCTTTGACCTTTGGCAAGC
TCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCT

QA 2 758 2 758
DS 

RD RR4BD34JQ 764 0 0
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CTTAGCTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAATTTAGATGGGAGATCAAGA
GTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGAT
GAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCAT
AATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT*CCCTCACAAATGGGTAT
GTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCT
TCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTT
ACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCC
TTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAG
ACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACC
ATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGAT
GGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCCTTGACCTTTGGCA
AGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCTTCTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4BD83JQ 764 0 0
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CTTAGCTCAAATAAAAAAGCAGTTATTCGAGTAGCCATTAATTTAGATGGGAGATCAAGA
GTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAAACTGGAT
GAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTTAACAAAGTCAT
AATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT*CCCTCACAAATGGGTAT
GTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCT
TCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTT
ACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCC
TTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAG
ACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACC
ATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGAT
GGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCCTTGACCTTTGGCA
AGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCTTCTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4BD83TF 892 0 0
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AATTTAGATGG*AGATCAAGAGTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATG
ATATATTGGCTCAAACTGGATGAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTCCCCAAAGCTCAA
AAGCTCCCTTAACAAAGTCATAATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTC
CTT*CCCTCACAAATGGGTATGTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTT
TCACATCGGCCACATTGGTCTTCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGAC
TTTGCTGGCAAACAGATTTTTACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCA
AGAGCAAATGACATAAGTCCCTTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATG
TTCTCGACCTTAAGGTGCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTG
ACCTGGTCATAAGGAGGAACCATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGA
TGGAAGTTAAGCACGTGTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTAC
TTTGGGCCTTGACCTTTGGCAAGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCC
TTCTTGAAGGTGACGAAGCCTTGCTTAATTCGTTCCACAGGATCGAATGCTTTGCCGTCC
GATGACGAGATTGTCTTAAGCTCCGCTGTGAGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACCGTC
TTAAGGTCATCCTTCTCAATGATAAGCTTCTTGGGAGCTTCGATGGCGTCT
C

QA 1 891 1 891
DS 

RD RR4BD34TF 804 0 0
GAT
GGAGATCAAGAGTAGAGAGCAAGGTGATGAAGACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGC
TCAAACTGGATGAGCGGGAGAGAGGCCGAACTGGAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCTCCCTT
AACAAAGTCATAATAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTGACAACTCCTT*CCCTCA
CAAATGGGTATGTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGC
CACATTGGTCTTCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCA
AACAGATTTTTACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATG
ACATAAGTCCCTTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCT
TAAGGTGCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCAT
AAGGAGGAACCATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAA
GCACGTGTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCCTT
GACCTTTGGCAAGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCTTCTTGAAGG
TGACGAAGCCTTGCTTAATTCGTTCCACAGGATCGAATGCTTTGCCGTCCGATGACGAGA
TTGTCTTAAGCTCCGCTGTGAGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACCGTCTTAAGGTCAT
CCTTCTCAATGATAAGCTTCT

QA 4 804 4 804
DS 

RD RR4A132TFB 877 0 0
AAGGTGATGA*GACGGTGAGGATGATTATGATATATTGGCTCAA*CTGGATGAGCGG*AG
AGAGGCCGAACTGGAGTCCC**AAGCTCAAAAGCTCC*TTAACAAAGTCATAATAGCCTC
CCTTCAAAGCAAGTGTTC*TTTGACAACTCCTTTCCCTCACAAATGGGTATGTTAATAGG
TTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACATTGGTCTTCAAATGCT
GAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGATTTTTACCCAATCC
TCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAAGTCCCTTGATGCCA
CCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAGACAGCATAT
TCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAGGAACCATATTTGCA
GCGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGATGGAAGTTAAGCACGTGTGATGGGCACACA
CGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCTTTGACCTTTGGCAAGCTCACCG
TACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCTTCTTGAAGGTGACGAAGCCTTGCTTAATT
CGTTCCACAGGATCGAATGCTTTGCCGTCCGATGACGAGATTGTCTTAAGCTCCGCTGTG
AGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACCGTCTTAAGGTCATCCTTCTCAATGATAAGCTTC
TTGAGAGCTTCGATGGCGTCTTCGTATGATTGGCTTCCCATGTCTTCTTGATACCAGTTG
GAGGTGAATATGCTGATGCAGGAACCGGAAGAGGAGG

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR4F579TF 562 0 0
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ATGTTCTCGACCTTAAGGTGCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATAT
TTGACCTGGTCATAAGGAGGAACCATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCA
GGATGGAAGTTAAGCACGTGTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATG
TACTTTGGGCTTTGACCTTTGGCAAGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGGATTTC
TCCTTCTTGAAGGTGACGAAGCCTTGCTTAATTCGTTCCACAGGATCGAATGCTTTGCCG
TCCGATGACGAGATTGTCTTAAGCTCCGCTGTGAGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACC
GTCTTAAGGTCATCCTTCTCAATGATAAGCTTCTTGAGAGCTTCGATGGCGTCTTCGTAT
GATTAGCTTCCCATGTCTTCTTGATACCAGATGGAGGTGAATATGCTGATGCAGGAACCG
GAAGAGGAGGAACAGGCGAT
CC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4EP46TF 679 0 0
TCACATCGGCCACATTGGTCTTCAAATGCTGAACTTTCAGCTTCTGCCAAAACTTTTGAC
TTTGCTGGCAAACAGATTTTTACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCA
A*AGCAAATGACATAAGTCCCTTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACGATG
TTCTCGACCTTAAGGTGCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTG
ACCTGGTCATAAGGAGGAACCATATTTGCAATGTTACGAACCACGAAGGCATCTCCAGGA
TGGAAGTTAAGCACGTGTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTAC
TTTGGGCTTTGACCTTTGGCAAGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCC
TTCTTGAAGGTGACGAAGCCTTGCTTAATTCGTTCCACAGGATCGAATGATTTGCCGTCC
GATGACGAGATTGTCTTAAGCTCCGCTGTGAGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACCGTC
TTAAGGTCATCCTTCTCAATGATAAGCTTCTTGAGAGCTTCGATGGCGTCTTCGTATGAT
TGGCTTCCCATGTCTTCTTGATGCCAGTTGGAGGTGAATATGCTGATGCAGGAACCGGAA
GAGGAGGAACAGGCGAT
CC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GW13TF 774 0 0
CAAAT
GGTATGTTAATAGGTTTGCTAGTGACACATTCACTGCCTCC*TTTCACATCGGCCACATT
GGTCT*CAAATGCTGAACTTTCAGCT*CTGCCAAAACTTTTGACTTTGCTGGCAAACAGA
TTTTTACCCAATCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCGTCAAGAGCAAATGACATAA
GTCCCTTGATGCCACCACATGCACTGTGACCTATTATCACAATGTTCTCGACCTTAAGGT
GCAAGACAGCATATTCAATGGCGGCTCCAACTCCTGCATATTTGACCTGGTCATAAGGAG
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GTGATGGGCACACACGTGAGTCCGAACAAGCAAACACCATGTACTTTGGGCTTTGACCTT
TGGCAAGCTCACCGTACAAAGCTGGATTCGTATCGTATTTCTCCTTCTTGAAGGTGACGA
AGCCTTGCTTAATTCGTTCCACAGGATCGAATGCTTTGCCGTCCGATGACGAGATTGTCT
TAAGCTCCGCTGTGAGCTTCTCCACCTTGGCCGCAGCCACCGTCTTAAGGTCATCCTTCT
CAATGATAAGCTTCTTGAGAGCTTCGATGGCGTCTTCGTATGATTGGCTTCCCATGTCTT
CTTGATACCAGTTGGAGGTGAATATGCTGATGCAGGAACCGGAAGAGGAGGAACAGGCGA
TGAGGGAGGGGTGAAGAGAGTAATGGTATTTATAATACACAGATCCACC

QA 6 774 6 774
DS 



AS 1 15

CO CL123Contig1 1384 15 13 U
GATCAACAACATTGCCAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGTGGAGTAGGCGAACG
AACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACAAGGAAATGAAAGAATCTGGAGTCATTAATGAACT
AAACCTTGCGGAATCCAAAGTAGCCCTAGTCTACGGTCAGATGAATGAACCGCCGGGAGC
TCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGATGTTAATAA
GCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTTGTACAAGCAGGATCCGAGGT
ATCCGCTTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTACCAACCCACCCTTAGTACCGA
AATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAAAGGGTCCATAACCTCTATTCA
AGCAGTTTATGTACCTGCAGACGATTTGACTGACCCTGCTCCTGCCACCACATTTGCACA
TTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCTAAAGGTATCTATCCAGCGGT
AGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTTGGCGAGGAA*CATT
ATGAAACTGCGCAACAAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAGGAGCTTCAGGACATTA
TAGCTATCCTGGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACCGTCGCAAGAGCAC
GAAAGATTGAGCGTTTCTTATCACAACCTTTTTTCGTAGCAGAAGTATTTACAGGTTCTC
CGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTGATCCTTTCCGGAG
AATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTG
CGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGT
ACTGACTCCGAATCGAATTGTTTGGGATTCAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAA
TAGTGGACAAATTGGCGTATTACCAAATCACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGATATAGG
TATTTTGAAAATACGCCTTAATAACCAATGGTTAACAATGGCTCTGATGGGCGGTTTTGC
TAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGAAGAATAGTGACAT
TGATCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAACTTGAGAAAAGCTGA
AGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAATCTAGCTCTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGA
GGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAATAGGATCCAAAAG
CGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 10 10 

AF RR4CG53TF U 1
AF RR4GT13TF U 349
AF RR4GL10TF U 159
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AF RR4CG53JQ C 799
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AF RR4FQ73TF U 1127
AF RR4EW54JQ C 799
AF RR4EW54TF U 799
AF RR4GL10JQ C 749
AF RR4GT13JQ C 712
BS 1 290 RR4CG53TF
BS 291 291 RR4GL10TF
BS 292 640 RR4CG53TF
BS 641 836 RR4GL10TF
BS 837 837 RR4E524TF
BS 838 927 RR4GL10TF
BS 928 1075 RR4E524TF
BS 1076 1127 RR4EW54TF
BS 1128 1266 RR4FQ73TF
BS 1267 1307 RR4FQ74TF
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AACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACAAGGAAATGAAAGAATCTGGAGTCATTAATGAACT
AAACCTTGCGGAATCCAAAGTAGCCCTAGTCTACGGTCAGATGAATGAACCGCCGGGAGC
TCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGATGTTAATAA
GCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTTGTACAAGCAG*ATCCGAGGT
ATCCGCTTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTACCAACCCACCCTTAGTACCGA
AATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAAAGGGTCCATAACCTCTATTCA
AGCAGTTTATGTACCTGCAGACGATTTGACTGACCCTGCTCCTGCCACCACATTTGCACA
TTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCTAAAGGTATCTATCCAGCGGT
AGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTTGGCGAGGAA*CATT
ATGAAACTGCGCAACAAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTA

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DS 

RD RR4GT13TF 325 0 0
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AACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGACGATTTGACTGACCCTGCTCCTGCCAC
CACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCTAAAGGTAT
CTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTTGG
CGAGGAAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTTAAGCGAACTTTACAACGTTACAAGGAGC
TTCAGGACATTATAGCTATCC
CTGG

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DS 

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G
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ATATTTCCGAGATGTTAATAAGCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTT
TGTACAAGCAGGATCCGAGGTATCCACTTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTA
CCAACCCACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAA
AGGGTCCATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGACGATTTGACTGACCCTGC
TCCTGCCACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGC
TAAAGGTATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCG
AATCGTTGGCGAGGAA*CATTATGAAACTGCGCAACAAGTTAAGCGAACTTTACAACGTT
ACAAGGAGCTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATC
GCTTAACCGTCGCAAGAGCACGAAAGATTGAGCGTTTCTTATCACAACCTTTTTTCGTAG
CAGAAGTATTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGT
TTAAATTGATCCTTTCCCGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTTAGTGG
GTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGA

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DS 

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G
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CAACCCACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAAA
GGGTCCATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCAGCAGACGATTTGACTGACCCTGCT
CCTGCCACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCT
AAAGGTATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGA
ATCGTTGGCGAGGAA*CATTATGAAACTGCGCAACAAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTA
CAAGGAGCTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATCG
CTTAACCGTCGCAAGAGCACGAAAGATTGAGCGTTTCTTATCACAACCTTTTTTCGTAGC
AGAAGTATTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTT
TAAATTGATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTCAGTGGG
TAACATCGATGAAGCTACTGCGAAAGCTACGAACCTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAA
ATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATTGTTTGGGATTCAGAAGTAAAA
GAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTATTACCAAATCACGCGCCGATT
GCCACAGCTGTTGAT

QA 2 796 2 796
DS 

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G
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AAAGAATTACTTCTACGAAAAAAGGGTCCATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTG
CAGACGATTTGACTGACCCTGCTCCTGCCACCACATTTACACATTTAGATGCGACTACCG
TACTATCAAGAGGATTAGCTGCTAAAGGTATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAA
CGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTTGGCGAGGAA*CATTATGAAACTGCGCAACAA
GTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAGGAGCTTCAGGACATTATAGCCATCCTGGGATTG
GACGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACCGTCGCAAGAGCACGAAAGATTGAGCGTTTC
TTATCACAACCTTTTTTCGTAGCAGAAGTATTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGT
CTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTGATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCT
GAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTA
GAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAA
TTGTTTGGGATTCAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCG
TATTACCAAATCACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGAT

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4CG53JQ 571 0 0
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AAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAAT
TGTTTGGGATTCAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGT
ATTACCAAATCACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGATATAGGTATTTTGAAAATACGCCT
TAATAACCAATGGTTAACAATGGCTTTGATGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGA
AATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGAAGAGTAGTGACATTGATCCACAAGAAGCTCA
GCAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAACTTGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAAT
TGAGGCAAATCTAGCTTTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTG
ATTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAATA

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DS 

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TTTTTCGTAGCAGAAGTATTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACA
ATTAGAGGGTTTAAATTGATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTT
TACTTAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGAGT
AAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATTGTTTGGGATT
CAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTATTACCAAATC
ACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGATATAGGTATTTTGAAAATACGCCTTAATAACCAAT
GGTTAACAATGGCTCTGATGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATTT
TAGTAAATGGTGCAGAGAAGAATAGTGACATTGATCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTTG
AAATAGCAGA*GCGAACTTGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAATC
TAGCTCTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAACT
AGCTGACGTATAAAAAAATAGGATCC

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DS 

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AGGATCGCTTAACCGTCGCAAGAGCACGAAAGATTGAGCGTTTCTTATCACAACCTTTTT
TCGTAGCAGAAGTATTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTA
GAGGGTTTAAATTGATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACT
CAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACCTAGAAATGGAGAGTAAAT
TGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATTGTTTGGGATTCAGA
AGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTATTACCAAATCACGC
GCCGATTGCCACAGCTGTTGATATAGGTATTTTGAAAATACGCCTTAATAACCAATGGTT
AACAATGGCTCTGATGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATTTTAGT
AAATGATGCAGAGAAGAATAGTGACATTGATCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTTGAAAT
AGCAGAAGCGAACTTGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAATCTAGC
TCTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAACTAGCT
GACGTATAAAAAAATAGGATCCAAAAGCGAG

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DS 

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CAATATGATTTGATTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAATAGGATCCAAAAGCG

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR4FQ73JQ 256 0 0
G
TGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGA
AGAATAGTGACATTGATCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAACT
TGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAATCTAGCTTTCAGACGAGCTC
GGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAA
TAGGATCCAAAAGCG

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DS 

RD RR4FQ73TF 256 0 0
G
TGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGA
AGAATAGTGACATTGATCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAACT
TGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAATCTAGCTCTCAGACGAGCTC
GGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAA
TAGGATCCAAAAGCG

QA 2 256 2 256
DS 

RD RR4EW54JQ 584 0 0
G
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ACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGTACTTAGA
AATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATT
GTTTGGGATTCAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTA
TTACCAAATCACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGATATAGGTATTTTGAAAATACGCCTT
AATAACCAATGGTTAACAATGGCTTTGATGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAA
ATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGAAGAATAGTGATATTGATCCACAAGAAGCTCAG
CAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAACTTGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATT
GAGGCAAATCTAGCTTTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGA
TTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAATAGGATCCAAAAGCG

QA 2 584 2 584
DS 

RD RR4EW54TF 584 0 0
G
AGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTGATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGA
ACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGTACTTAGA
AATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATT
GTTTGGGATTCAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTA
TTACCAAATCACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGATATAGGTATTTTGAAAATACGCCTT
AATAACCAATGGTTAACAATGGCTCTGATGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAA
ATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGAAGAATAGTGATATTGATCCACAAGAAGCTCAG
CAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAACTTGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATT
GAGGCAAATCTAGCTCTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGA
TTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAATAGGATCCAAAAGCG

QA 2 584 2 584
DS 

RD RR4GL10JQ 636 0 0
TTTTTTCGTAGCAGAAGTATTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAAC
AATTAGAGGGTTTAAATTGATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTT
TTACTTAGTGGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGAG
TAAATTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATTGTTTGGGAT
TCAGAAGTAAAAGAAATCATTTTATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTATTACCAAAT
CACGCGCCGATTGCCACAGCTGTTGACATAGGTATTTTGAAAATACGCCTTAATAACCAA
TGGTTAATAATGGCTCTGATGGGCGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATT
TTAGTAAATGATGCAGAGAAGAATAGTGACATTGACCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTT
GAAATAGCAGAAGCGAATTTGAGAAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAAT
CTAGCTCTCAGACGAGCTCGGACACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAAC
TAGCTGACGTATAAAAAAATAGGATCCAAAAGCG
AG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GT13JQ 673 0 0
CAAGAGCACGAAAGATTGAGCGTTTCTTATCACAACCTTTTTTCGTAGCAGAAGTATTTA
CAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTGATCC
TTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATCGATG
AAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGACCTTAAA
TCTTTGTGTACTGACTCCGAATCGAATTGTTTGGGATTCAGAAGTAAAAGAAATCATTTT
ATCTACTAATAGTGGACAAATTGGCGTATTACCAAATCACGCGCCGATTGCCACAGCTGT
TGACATAGGTATTTTGAAAATACGCCTTAATAACCAATGGTTAATAATGGCTCTGATGGG
CGGTTTTGCTAGAATAGGCAATAATGAAATTACTATTTTAGTAAATGATGCAGAGAAGAA
TAGTGACATTGACCCACAAGAAGCTCAGCAAACTCTTGAAATAGCAGAAGCGAATTTGAG
AAAAGCTGAAGGCAAGAGACAAACAATTGAGGCAAATCTAGCTCTCAGACGAGCTCGGAC
ACGCGTCGAGGCTCTCAATATGATTTGATTTTGTAACTAGCTGACGTATAAAAAAATAGG
ATCCAAAAGCG
AG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 2 15

CO CL124Contig1 724 4 1 U
GGTCGCACCTTTCTTAACCACACACTGCCTCTATTGTTCACTTTCAACATAAATCAAGAA
CATATCATTTCTTTGTAAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAA
GCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCCA
GAGAAGAGGATCTCGCGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGA
AGGTTCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCAGTATACGAGTCTCTCAATGTTGTCCAGT
ACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCCTACGGGAAAG
CTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGA
TATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGA
AGATTCTTGAAGCTGAACTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATG
TAGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACT
TCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGGAGAAAG
AGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTA
GGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FM60TF U 22
AF RR4FS04TF U 14
AF RR4AN87TF U 1
AF RR4A512TF U 1
BS 1 724 RR4A512TF

RD RR4FM60TF 622 0 0
GG
ACTGCCTCTATTGTTCACTTTCAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTAAAACCA
ATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGA
GTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCGCGAACAAG
AGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGAAGGTTCCGGTTCTGATCCACAAC
GGTAAACCAGTATGCGAGTCTCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGTCTGAC
AAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCCTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGAT
TTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAA
CAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTGAACTTGGA
GACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTGCACTGATTACATTC
TACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCA
AAACTGATTGCTTGGGCTAA

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR4FS04TF 667 0 0
GG
AACCACACACTGCCTCTATTGTTCACTTTCAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTG
TAAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGA
GGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCG
CGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGAAGGTTCCGGTTCTGA
TCCACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTCTCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTT
GGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCCTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTT
GGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAG
GTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTG
AACTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTGCACTGA
TTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAG
AGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGGAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGT
CTCTC

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR4AN87TF 718 0 0
GGTCGCACCTTTCTTAACCACACACTGCCTCTATTGTTCACTTTCAACATAAATCAAGAA
CATATCATTTCTTTGTAAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAA
GCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCCA
GAGAAGAGGATCTCGCGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGA
AGGTTCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCAGTATACGAGTCTCTCAATGTTGTCCAGT
ACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCCTACGGGAAAG
CTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGA
TATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGA
AGATTCTTGAAGCTGAACTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATG
TAGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACT
TCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGGAGAAAG
AGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4A512TF 724 0 0
GGTCGCACCTTTCTTAACCACACACTGCCTCTATTGTTCACTTTCAACATAAATCAAGAA
CATATCATTTCTTTGTAAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAA
GCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCCA
GAGAAGAGGATCTCGCGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGA
AGGTTCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCAGTATACGAGTCTCTCAATGTTGTCCAGT
ACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCCTACGGGAAAG
CTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGA
TATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGA
AGATTCTTGAAGCTGAACTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATG
TAGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACT
TCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGGAGAAAG
AGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTA
GGAA

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL124Contig2 934 11 24 U
ACTTTGTGGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCA
CACAAACACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAAAAACCAAAGCTAAA
AGAGAACGAAAGCAGAGCACAGCATCATCAGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTTATT
CAGTATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCA
GGGAGAGACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTT
GGACTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAG
AATGTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCT
CCAAGTTCAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGT
TCCTCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAA
TCAGCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTATGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTG
TCAGACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCA
TTGTGGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTC
TTGTTCGTGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACCTTTCTCCCTCAACGCGACT
CTAGCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTAATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCCATT
GGTTTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATGATATGTTCTTGATTTATGTTCAAAGTGAA
CAATAGAGGCAGTGTGTGGTTCCGAAAGGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 15 55 55 55 
55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 10 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 0 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 45 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE62JQ U 1
AF RR4A049TFB C 10
AF RR4A396JQ U 8
AF RR4DK22JQ U 6
AF RR4FS04JQ U 7
AF RR4A396JQD U 8
AF RR4FM60JQ U 8
AF RR4DK22TF C 152
AF RR4A396TFB C 203
AF RR4DF84TF C 281
AF RR4FE62TF C 175
BS 1 252 RR4FE62JQ
BS 253 253 RR4DK22JQ
BS 254 412 RR4FE62JQ
BS 413 413 RR4FS04JQ
BS 414 425 RR4FE62JQ
BS 426 426 RR4FS04JQ
BS 427 570 RR4FE62JQ
BS 571 572 RR4DK22JQ
BS 573 573 RR4A396JQ
BS 574 650 RR4DK22JQ
BS 651 651 RR4A396JQ
BS 652 659 RR4DK22JQ
BS 660 660 RR4A396JQ
BS 661 753 RR4DK22JQ
BS 754 754 RR4FS04JQ
BS 755 755 RR4DK22JQ
BS 756 756 RR4FS04JQ
BS 757 800 RR4DK22JQ
BS 801 837 RR4A396JQD
BS 838 909 RR4DK22TF
BS 910 910 RR4A396TFB
BS 911 921 RR4DK22TF
BS 922 923 RR4A396TFB
BS 924 934 RR4FE62TF

RD RR4FE62JQ 570 0 0
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CAGTATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCA
GGGAGAGACTTAAACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTT
GGACTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAG
AATGTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGATTTGTCT
CCAAGCTCAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGT
TCCTCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAA
TCAGCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4A049TFB 696 0 0
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TGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAAAAACCAAAGCTAAAAGAGAACGA
AAGCAGAGCACAGCATCATCAGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTTATTCAGTATCAG
AGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCTGGGAGAGAC
TTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTCT
GCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAATC
AGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTTCA
GCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCACCT
TTCTTTCCC*ATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCAA
AACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTATGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACCAA
GCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCATTGTGCATC
AGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTG
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4A396JQ 769 0 0
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ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAAAAACCAAAGCTAAAAGAGAAC
GAAAGCAGAGCACAGCATCATCAGAAACAGGAGACACAACACAAGGTTTTATTCAGTATC
AGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCTGGGAGAG
ACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCT
CTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAA
TCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTT
CAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCAC
CTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCC
AAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTATGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACC
AAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCATTGTGGA
TCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCG
TGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACCTTTCTCCCTCAACGC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4DK22JQ 795 0 0
GT
GGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAAC
ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAAAAACCAAAGCTAAAAGAGAAC
GAAAGCAGAGCACAGCATCATCAGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTTATTCAGTATC
AGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGGAGAG
ACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCT
CTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAA
TCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGATTTGTCTCCAAGCT
CAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCAC
CTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCC
AAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACC
AAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACTGGTTTACCGTTGTGGA
TCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCG
TGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACACAACACCTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCC
TCATACAGAACAT

QA 3 795 3 795
DS 

RD RR4FS04JQ 778 0 0
G
GGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAAC
ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGAAAACACACAAAAACCAAAGCTAAAAGAGAAC
GAAAGCAGAGCACAGAATCATCAGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTAATTCAGCATC
AGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGGAGAG
ACTTAGACACGCTCTCTTTCTCCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCT
CTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAA
TCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTT
CAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCAC
CTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCC
AAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAGGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACC
AAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGAGACTCGCATACTGGTTTACCGTTGTGGA
TCAGAACCGGAACCTTCTTATGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCG
CGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACCTTTCTCC*TCAACGCGACTCTAG

QA 2 778 2 778
DS 

RD RR4A396JQD 830 0 0
GGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAAC
ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAAAAACCAAAGCTAAAAGAGAAC
GAAAGCAGAGCACAGCATCATCAGAAACAGGAGACACAACACAAGGTTTTATTCAGTATC
AGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCTGGGAGAG
ACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCT
CTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAA
TCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTT
CAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCAC
CTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCC
AAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTATGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACC
AAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCATTGTGGA
TCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCG
TGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACCTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCC
TCATACAGAACATGCTTGGCCAGTAATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4FM60JQ 794 0 0
GGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAAC
ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGAAAACACACAAAAACCAAAGCTAAACGAGAAC
GAAAGCAGAGCACAGAATCATCAGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTAATTCAGCATC
AGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGGAGAG
ACTTAGACACGCTCCCTTTCTCCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCT
CTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAA
TCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTT
CAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCAC
CTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCC
AAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAGGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACC
AAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGAGACTCGCATACTGGTTTACCGTTGTGGA
TCAGAACCGGAACCTTCTTATGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCG
CGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACCTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCC
TCATACAGAACATG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4DK22TF 771 0 0
AAACAGAAGACACAACACAAGGTTT*ATTCAGTATCAGAGATTATTCT*CCTAAACTCAG
CGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTG*TCAGGGAGAGACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCA
TACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAA
ACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAA
AGGTATCTCCACCAAAGTAAGATTTGTCTCCAAGCTCAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCT
CAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATT
GGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGT
AAGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAA
CATTGAGGGACTCGCATACTGGTTTACCGTTGTGGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAA
TCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCGTGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGA
ACACAACACCTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGT
AATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATG
ATATGTTCTTGATTTATGTTCAAAGTGAACAATAGAGGTAGTGTGTGGTT
C

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4A396TFB 722 0 0
TAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCTGGGAGAGACTTAGACACGCTCT
CTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTCTGCCTCGATGCTGA
AGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAATCAGTGCAATGTCTA
CATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTTCAGCTTCAAGAATCT
TCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCACCTTTCTTTCCCCATA
TCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCAAAACCTAGCCTGAG
CTTTCCCGTATGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACCAAGCCTCGTCCACGT
ACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCATTGTGGATCAGAACCGGGACCT
TCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCGTGAGATCCTCTTCTC
TGGCCTCGAACTCCACACCTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATGC
TTGGCCAGTAATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCAC
AAAGAAATGATATGTTCTTGA************GTGAACAATAGAGGCAGTGTGTGGTTC
C
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4DF84TF 643 0 0
TAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCAT
ATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTC
CACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGTTCAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACT
CCTTCACCCCTGCTGCCTGTTCCTCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCAC
TAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTATGGATCAG
AAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGG
ACTCGCATACCGGTTTACCATTGTGGATCAGAACCGGGAACTTCTTGTGAATCGGATTAC
TTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCGTGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACAC
CTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTAATCAAGAA
GAATCGTCGAGTTCGCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATGATATGTTCT
TGA************GTGAACAATAGAGGCAGTGTGTGGTTCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4FE62TF 760 0 0
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TG*TCAGGGAGAGACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACAC*TCTTAGCCCAAGCAATC
AGTTTTGGACTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAA
CTGTAGAATGTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGAT
TTGTCTCCAAGCTCAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCT
GCTTGTTCCTCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCC
ACGAAATCAGCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGAAGGGAAGAATGGG
TTCTTGTCAGACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACTGGT
TTACCGTTGTGGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAA
GGGCTCTTGTTCGTGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACACAACACCTTTCTCCCTCAAC
GCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTAATCAAGAAGAATCGTCGAGTTC
GCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATGATATGTTCTTGATTTATGTTCAA
AGTGAACAATAGAGGTAGTGTGTGGTTAAGAAAGGTGCCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 14

CO CL125Contig1 1054 10 7 U
GGATCAGATCGGTCCTCCACACTCGTTTAATATTATTCCGCCATTATCATCTTCCACTTT
GAAATCTCTTCATCATTCAATGGCGGCCAGAAAGCCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGATGT
CGACGGTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAG
AGAATTGCGCAAGGTGGTTACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATC
TGAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCT
TGTTGCCCATAAAGATGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTTGGAGA
AGATAAGCTCAAGGAGTTGATTAATTTCGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCC
TATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTTCGAAATGGAATGCTTAATGTGTCACCGATTGG
TCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACAT
CCGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTC
TATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTT
GCAGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGTGG
AAACGATTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTACGAGTCCAGA
TGATACGATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCATCTCAAGAA
CACAATATCGGAGTTTGGCTATTCCTTGGCAAAGTTTCACAGCTTTTGATTATTTACATT
ACAAGAAATGGAGATAAGTATGTGTTTACATGCTGATTCCGTATGTTTTGAATTTTTGAT
TTTATAAAATATACAATATTTGGTTATAATTTCTGTTTCAGAGCAAGAACTGGTTTTTAT
AGCTAAGATCAATGAAAGTATACTCTTTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 35 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G718TF U 1
AF RR4CH17TF U 59
AF RR4CD79TF U 28
AF RR4AI23TF U 4
AF RR4B348TF U 4
AF RR4AI23JQ C 352
AF RR4B348JQ C 620
AF RR4CH17JQ C 345
AF RR4H533JQB C 360
AF RR4G718JQ C 595
BS 1 612 RR4G718TF
BS 613 796 RR4AI23TF
BS 797 813 RR4B348TF
BS 814 1015 RR4CH17JQ
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BS 1017 1023 RR4CH17JQ
BS 1024 1054 RR4H533JQB

RD RR4G718TF 612 0 0
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CGACGGTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAG
AGAATTGCGCAAGGTGGTTACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATC
TGAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCT
TGTTGCCCATAAAGATGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTTGGAGA
AGATAAGCTCAAGGAGTTGATTAATTTCGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCC
TATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTTCGAAATGGAATGCTTAATGTGTCACCGATTGG
TCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACAT
CCGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTC
TATTGGAGGACA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4CH17TF 643 0 0
GG
GAAATCTCTTCATCATTCAATGGCGGCCAGAAAGCCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGATGT
CGACGGTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAG
AGAATTGCGCAAGGTGGTTACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATC
TGAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCT
TGTTGCCCATAAAGATGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTTGGAGA
AGATAAGCTCAAGGAGTTGATTAATTTCGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCC
TATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTTCGAAATGGAATGCTTAATGTGTCACCGATTGG
TCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACAT
CCGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTC
TATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTT
GCAGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTCTTCG
TGA

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR4CD79TF 691 0 0
G
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ATCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATCTGAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACC
GACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTTGTTGCCCATAAAGATGGGAAGCCCATT
GGAATCCAGAGCCTGAAGCT*CACCTTGGAGAAGATAAGCTCAAGGAGTTGATTAACTTC
GCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCTATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTT
CGAAATGGAATGCTTAATGTGTCACCGATTGGTCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGAC
GAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATCCGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGT
GAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTCTATTGGAGGACAGATAAGCTTCGATGTC
TTCCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATC
CATTTCTTCG*TGACAAA*CCTATGAGGGT

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DS 

RD RR4AI23TF 793 0 0
GG
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GTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAGAGAAT
TGCGCAAGGTGGTTACTGTTGGAGCCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATCTGAGC
AGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTTGCTG
CCCATAAAGATGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTTGGAGAAGATA
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AAAGGGGAACATTTATAGAATTTCGAAATGGAATGCTTAATGTGTCACCGATTGGTCGCA
ACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATCCGAC
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GAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAGT
ACCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGTGGAAACG
ATTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTACGAGTCCAGATGATA
CGATGGCAAAA

QA 3 793 3 793
DS 

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GG
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CTCTTCATCATTCAATGGCGGCCAGAAAGCCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGATGTCGACG
GTACTCTTACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAGAGAAT
TGCGCAAGGTGGTTACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATCTGAGC
AGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTTGTTG
CCCATAAAGATGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTTGGAGAAGATA
AGCTCAAGGAGTTGATTAATTTCGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCTATCA
AAAGGGGAACATTTATAGAATTTCGAAATGGAATGCTTAATGTGTCACCGATTGGTCGCA
ACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATCTGAC
CAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTCTATTG
GAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAGT
ACCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGTGGAAACG
ATTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTACGAGTCCAGATGATA
CGATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCAT

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DS 

RD RR4AI23JQ 653 0 0
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ACCGATTGGTCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGT
TCAAAACATCCGACCAAAGATGGCGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTACGCATCTTAACCT
TACTTTCTTTATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGGATAAGAC
TTACTGCTTGCAGTCCCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTTTTCGGTGACAAAACCTA
TGAGGGTGGAAACGATTATGAAATTTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTAC
GAGTCCAGATGATACGATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCA
TCTCAAGAACACAATATCGGAGTTTGGCTATTCCTTGGCAAAGTTTCACAGCTTTTGATT
ATTTACATTACAAGAAATGGAGATAAGTATGTGTTTACATGCTGATTCCGTATGTTTTGA
ATTTTTGATTTTATAAAATATACAATATTTGGTTATAATTTCTGTTTCAGAGC

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DS 

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GAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTACGAGTCCAGATGATACGATGGCAAAATGC
AAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACGCTATCCATCTCAAGAACACAATATCGGAGTTTGGC
TATTCCTTGGCAAAGTTTCACAGCTTTTGATTATTTACATTACAAGAAATGGAGATAAGT
ATGTGTTTACATGCTGATTCCGTATGTTTTGAATTTTTGATTTTATAAAATATACAATAT
TTGGTT
TT

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DS 

RD RR4CH17JQ 680 0 0
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ATGTGTCACCGATTGGTCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATG
ATAAGGTTCAAAACATCCGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATC
TTAACCTTACTTTCTCTATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGG
ATAAGACTTACTGCTTGCAGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTCTTCGGTGACA
AAACCTATGAGGGTGGAAACGATTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATT
CAGTTACGAGTCCAGATGATACGATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACA
CTATCCATCTCAAGAACACAATATCGGAGTTTGGCTATTCCTTGGCAAAGTTTCACAGCT
TTTGATTATTTACATTACAAGAAATGGAGATAAGTATGTGTTTACATGCTGATTCCGTAT
GTTTTGAATTTTTGATTTTATAAAATATACAATATTTGGTTATAATTTCTGTTTCAGAGC
AAGAACTGGTTCTTATAGC
C

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DS 

RD RR4H533JQB 695 0 0
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GTCGCAACTTCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACA
TCTGACCAAGGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCT
CTATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGGTTGGGATAATACTTACTGCT
TGCAGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTTTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGCG
GAAACGATTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTACGAGTCCAG
ATGATACGATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCATCTCAAGA
ACACAATATCGGAGTTTGGCTATTCCTTGGCAAAGTTTCACAGCTTTTGATTATTTACAT
TACAAGAAATGGGGATAAGTATGTGTTTACATGCTGATTCCGTATGTTTTGAATTTTTGA
TTTTATAAAATATACAATATTTGGTTATAATTTCTGTTTCAGAGCAAGAACTGGTTTTTA
TAGCTAAGATCAATGAAAGTATACTCTTTTTTTTG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4G718JQ 460 0 0
TTTTTT
TATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTTTTCCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTT
GCAGTCCCTTGAAGACTTCAGTGAAATCCATTTTTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGTGG
AAACGATTATGAAATTTATGAATCACCAAAAACAATTGGCCATTCAGTTACGAGTCCAGA
TGATACGATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCATCTCAAGAA
CACAATATCGGAGTTTGGCTATTCCTTGGCAAAGTTTCACAGCTTTTGATTATTTACATT
ACAAGAAATGGAGATAAGTATGTGTTTACATGCTGATTCCGTATGTTTTGAATTTTTGAT
TTTATAAAATATACAATATTTGGTTATAATTTTTGTTTCAGAGCAAGAACTGGTTTTTAT
AGCTAAGATCAATGAAAGTATACTCTTTTTTTTG

QA 7 460 7 460
DS 



CO CL125Contig2 976 4 2 U
GGAACATTCAATGGCGGCCAAGAAGGCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGACGTGGACGGGAC
TCTCACAGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCAGAACTTCTCGATTTCATCCGAGAATTGCG
CAAGGTCGTCACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCTGAGCAGCT
TGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGTTTCTCTGAGAATGGTCTTGTTGCTCA
TAAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTGGGAGAAGATAAACT
CAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCGTTACATTGCAGACTTGGATATTCCAATCAAAAG
GGGAACATTCATAGAGTTCCGAAATGGCATGCTCAATGTATCACCTATTGGTCGCAACTG
CAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATAAGACCAAA
GATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCCATTGGAGG
ACAGATTAGCTTCGATGCCTTTCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAATACCT
TGAAGACTTTACTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGAGGAAACGACTA
TGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATAGGCCATTCAGTTACCAGTCCAGATGACACAAT
GGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCAGTATCCATCTCAAGAACA
CAAGTGTCAGAGTTTGGTTATTATCGGTGAATTTCTTACAACTTATGATTATTTACATCA
CAAAGAAACAGAGAGAAAAGTATATTTGGGATACTGTTTGATTTTCATAAAAAAATAAAT
GTTTTTTTATAATCTTTTGTTTCATAACAAGAACTGGTTCTCATAGCTAAAGATCAAAGG
ATGTTAAGGGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GZ26TF U 1
AF RR4GZ26JQ C 109
AF RR4BU11JQ C 492
AF RR4BU11TF U 492
BS 1 682 RR4GZ26TF
BS 683 976 RR4BU11TF

RD RR4GZ26TF 686 0 0
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TCTCACAGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCAGAACTTCTCGATTTCATCCGAGAATTGCG
CAAGGTCGTCACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCTGAGCAGCT
TGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGTTTCTCTGAGAATGGTCTTGTTGCTCA
TAAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTGGGAGAAGATAAACT
CAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCGTTACATTGCAGACTTGGATATTCCAATCAAAAG
GGGAACATTCATAGAGTTCCGAAATGGCATGCTCAATGTATCACCTATTGGTCGCAACTG
CAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATAAGACCAAA
GATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCCATTGGAGG
ACAGATTAGCTTCGATGCCTTTCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAATACCT
TGAAGACTTTACTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGAGGAAACGACTA
TGAAATCTATGAATCACCAAAA
CAAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4GZ26JQ 802 0 0
TCCGAG
ATTGCGCAAGGTCGTCACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCTGA
GCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGTTTCTCTGAGAATGGTCTTGT
TGCTCATAAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTGGGAGAAGA
TAAACTCAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCGTTACATTGCAGACTTGGATATTCCAAT
CAAAAGGGGAACATTCATAGAGTTCCGAAATGGCATGCTCAATGTATCACCTATTGGTCG
CAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATAAG
ACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCCAT
TGGAGGACAGATTAGCTTCGATGCCTTTCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCA
ATACCTTGAAGACTTTACTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGAGGAAA
CGACTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATAGGCCATTCAGTTACCAGTCCAGATGA
CACAATGGCAAAATGCAAGGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCAGTATCCATCTCA
AGAACACAAGTGTCAGAGTTTGGTTATTATTGGTGAATTTCTTACAACTTATGATTATTT
ACATCACAAAGAAACAGAGAGAAAAGTATGTTTGGGATACTGTTTGATTTTCATAAAAAA
ATAAATGTTTTTTTAT

QA 7 802 7 802
DS 

RD RR4BU11JQ 485 0 0
G
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CGATGTCTTTCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAATACCTTGAAGACTTTAC
TGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGAGGAAACGACTATGAAATCTATGA
ATCACCAAAAACAATAGGCCATTCAGTTACCAGTCCAGATGACACAATGGCAAAATGCAA
GGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCAGTATCCATCTCAAGAACACAAGTGTCAGAG
TTTGGTTATTATCGGTGAATTTCTTACAACTTATGATTATTTACATCACAAAGAAACAGA
GAGAAAAGTATATTTGGGATACTGTTTGATTTTCATAAAAAAATAAATGTTTTTTTATAA
TCTTTTGTTTCATAACAAGAACTGGTTCTCATAGCTAAAGATCAAAGGATGTTAAGGGTT
TGCC

QA 2 485 2 485
DS 

RD RR4BU11TF 485 0 0
G
ACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCCATTGGAGGACAGATTAGCTT
CGATGTCTTTCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGCAATACCTTGAAGACTTTAC
TGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAAACCTATGAGGGAGGAAACGACTATGAAATCTATGA
ATCACCAAAAACAATAGGCCATTCAGTTACCAGTCCAGATGACACAATGGCAAAATGCAA
GGCTCTGTTCATGTCTTGAAACACTATCCAGTATCCATCTCAAGAACACAAGTGTCAGAG
TTTGGTTATTATCGGTGAATTTCTTACAACTTATGATTATTTACATCACAAAGAAACAGA
GAGAAAAGTATATTTGGGATACTGTTTGATTTTCATAAAAAAATAAATGTTTTTTTATAA
TCTTTTGTTTCATAACAAGAACTGGTTCTCATAGCTAAAGATCAAAGGATGTTAAGGGTT
TGCC

QA 2 485 2 485
DS 



AS 2 14

CO CL126Contig1 777 6 15 U
GGGATTCTGAATCTATCTTTCCCCGAACCGAACCTACATCTCTAGCTTCCAAATCGTTGA
AACATGTCGGATGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTAC
CCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAGGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGC
AAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCAAAGACTGGGAAGCACGGTCACGCAAAGTGTCACTTT
GTTGCCATTGACATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAAT
TGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGC
TTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGAT
GATAGTCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCT
GTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAG
TAAACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAA
CTGTTATAAGAACCAAAAACTTGTTTTTTTT*TCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTT
GTGTTTCTTGTTGTAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATTGCTTAAAAGTTTC
GTGTTTTAAATGGGGAATGTTTTCCTGTGAGATGATTCTTAAATCCCTTTGCTTACC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
10 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F469TF U 2
AF RR4AG02JQ C 1
AF RR4AG02TF U 1
AF RR4A907TF U 3
AF RR4F469JQ C 163
AF RR4A907JQ C 346
BS 1 2 RR4AG02JQ
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BS 402 402 RR4AG02TF
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BS 708 767 RR4A907TF
BS 768 777 RR4A907JQ

RD RR4F469TF 604 0 0
G
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TCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAGGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAA
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TGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGAACTCAAGCTTCCCACCGATGA
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CATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTA
AACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAACT
GTT

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR4AG02JQ 707 0 0
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CCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAGGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGC
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TGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGC
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GATGGTCTGAGTGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCT
GTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAG
TAAACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAT
ATGTTATAAGAACCAAAAACTTGTTTTTT***CCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTT
GTGTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATT

QA 1 707 1 707
DS 

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GG
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CATGTCGGATGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCC
TCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAGGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAA
GGTTGTTGAGGTTTCGACATCAAAGACAGGGAAGCACGGTCACGCAAAGTGTCACTTTGT
TGCCATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTG
TGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTT
TGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGA
TGGTCTGAGTGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGT
CATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTA
AACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCATAT
GTTATAAGAACCAAAAACTTGTTTTTT***CCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTTGT
GTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATT

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR4A907TF 765 0 0
GATTCTGAATCTATCTTTCCCCGAACCGAACCTACATCTCTGGCTTCCAAATCGTTGAAA
CATGTCGGACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGTGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCC
TCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAGGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAA
GGTTGTTGAGGTTTCGACTTCAAAGACTGGGAAGCACGGTCACGCAAAGTGTCACTTTTT
TGCCATTGACATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTG
TGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTT
TGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGA
TAGTCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGT
CATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTA
AACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAACT
GTTATAAGAACCAAAAACTTGTTTTTTTTTTCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTTGT
GTTTCTTGTTGTAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATTGCTTAAAAGTTTCGT
GTTTTAAATGGGGAATGTTTTCCTGTGAGATGATTCTTAAATCCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4F469JQ 583 0 0
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CACGCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGACATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATT
GTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATT
GATATCTCTGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGAC
CTCAAGCTTCCCACCGATGATAGTCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGA
AAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAG
GAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAAT
ATTATTACCAGTGGTCAACTGTTATAAGAACCAAAAACTTGTTTTTTTT*TCTTTTTCTA
ATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGTAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTT
GGATTGCTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAATGGGGAATGTTTTCC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4A907JQ 432 0 0
ATT
TCTGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAG
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GTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATTTGTGCCGTCAAGGAAGTT
GGTGGTGGCAAGTAAACCCAGCCAGTATCATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATT
ACCAGTGGTCAACTGTTATAAGAACCAAAAACTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTAATTTAG
ATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGTAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATTG
CTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAATGGGGAATGTTTTCCTGTGAGATGATTCTTAAATCCCT
TTGCTTACC

QA 4 432 4 432
DS 



CO CL126Contig2 747 8 12 U
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ATATGGTCGTCTCGCAACAAGAAACACACATT*AATGGTCTAAATCAGAGAAAAAAGGAA
GAAAAAAAACATGTTTTTTGTTCTTATAACAACTGGGGTAAGGTAAATAAGATTATCCTC
TGTGTAAAGAGAGAATGATAACACTTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGAC
GGCACAGATCTGCTCCTCTCCCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTC
CTCGAATCCACTCTTCATCAGAGCGCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTC
CTTGGTGCCACCACTGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAG
CTGGTAATCAATACGGTTCACATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATC
CTCGAGCTTCTTAGCAGTGAAGATATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTG
CTTGCCAGTCTTCGAAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGAT
GTGACCACCTTTACGGATGTTACCAGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGCGTC
GGAGGACTCGAAGTGGTGCTCTTCGTCAGACATGTTGTGAGAGAGAGAGATTGGAATTGA
GATTGGATTGTGAGAATGAATGAGCCC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CN21JQ U 1
AF RR4AO25JQ U 249
AF RR4CN21TF C 1
AF RR4AJ32JQ U 2
AF RR4AJ32TF C 2
AF RR4D232TF C 17
AF RR4D232JQ U 25
AF RR4AO25TF C 75
BS 1 297 RR4CN21JQ
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BS 331 623 RR4CN21JQ
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BS 700 700 RR4D232JQ
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BS 703 737 RR4AJ32JQ
BS 738 741 RR4D232JQ
BS 742 747 RR4AO25TF

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TGTGTAAAGAGAGAATGATAACACTTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGAC
GGCACAGATCTGCTCCTCTCCCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCATC
CTCGAATCCACTCTTCATCAGAGCGCTGAAATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTC
CTTGGTGCCACCACTGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAG
CTGGTAATCAATACGGTTCACATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATC
CTCGAGCTTCTTAGCAGTGAAGATATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTG
CTTGCCAGTCTTCGAAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGAT
GTGACCACCTTTACGGATGTTAC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4AO25JQ 409 0 0
TCTGCTCCTCTCCCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTCCTCGAATC
CACTCTTCATCAGAGCGCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTCCTTGGTGC
CACCACTGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAGCTGGTAAT
CAATACGGTTCACATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATCCTCGAGCT
TCTTAGCAGTGAAGACATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTACTTGCCAG
TCTTCGAAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGTGACCAC
CTTTACGGATGTTACCAGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR4CN21TF 743 0 0
GA
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ATGGTCGTCTCGCAACAAGAAACACACATT*AATGGTCTAAATCAGAGAAAAAAGGAAGA
AAAAAAACATGTTTTTTGTTCTTATAACAACTGGGGTAAGGTAAATAAGATTATCCTCTG
TGTAAAGAGAGAATGATAACACTTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGACGG
CACAGATCTGCTCCTCTCCCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCATCCT
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TGGTGCCACCACTGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAGCT
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CGAGCTTCTTAGCAGTGAAGATATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTGCT
TGCCAGTCTTCGAAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGT
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AGGACTCGAAGTGGTGCTCTTCGTCAGACATGTTGTGAGAGAGAGAGATTGGAATTGAGA
TTGGATTGTGAGAATGAAT
CC

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR4AJ32JQ 738 0 0
C
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ATGGTCGTCTCGCAACAAGAAACACACATT*AATGGTCTAAATCAAAGAAAAAAGGAAGA
AAAAAAACATGTTTTTTGTTCTTATAACAACTGGGGTAGGGTAAATAAGATTATCCTCTG
TGTAAAGAGAGAATGATAACACTTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGACGG
CACAGATCTGCTCCTCTCCCATCGAAAACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTCCT
CGAATCCACTCTTCATCAAAGCGCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTCCT
TGGTGCCACCACTGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAAAGATATCAATCAGCT
GGTAATCAATACGGTTCACATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATCCT
CGAGCTTCTTAGCAGTGAAGATATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTGCT
TGCCAGTCTTCGAAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGT
GACCACCTTTACGGATGTTACCAGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGCGTCGG
AGGACTCGAAGTGGTGCTCTTCGTCAGACATGTTGTGGG*GAGAGAGATTGGAATTGAGA
TTGGATTGTGAGAAT
CC

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DS 

RD RR4AJ32TF 738 0 0
C
GGTAGGAAACTTTCACTGTTTTAAAACACCAAATATTTCAACAATCCAAAACCAATAGAT
ATGGTCGTCTCGCAACAAGAAACACACATT*AATGGTCTAAATCAGAGAAAAAAGGAAGA
AAAAAAACATGTTTTTTGTTCTTATAACAACTGGGGTAGGGTAAATAAGATTATCCTCTG
TGTAAAGAGAGAATGATAACACTTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGACGG
CACAGATCTGCTCCTCTCCCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTCCT
CGAATCCACTCTTCATCAGAGCGCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTCCT
TGGTGCCACCACTGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAGCT
GGTAATCAATACGGTTCACATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATCCT
CGAGCTTCTTAGCAGTGAAGATATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTGCT
TGCCAGTCTTCGAAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGT
GACCACCTTTACGGATGTTACCAGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGCGTCGG
AGGACTCGAAGTGGTGCTCTTCGTCAGACATGTTGTGGG*GAGAGAGATTGGAATTGAGA
TTGGATTGTGAGAAT
CC

QA 2 736 2 736
DS 

RD RR4D232TF 731 0 0
TTTT
TTTTTAAACACCAAATATTTCAACAATCCAAAACCAATAGATATGGTCGTCTCGCAACAA
GAAACACACATT*AATGGTCTAAATCAGAGAAAAAAGGAAGAAAAAAAACATGTTTTTTG
TTCTTATAACAACTGGG*TAAGGTAAATAAGATTATCCTCTGTGTAAAGAGAGAATGATA
ACACTTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGACGGCACAGATCTGTTCCTCTC
CCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTCCTCGAATCCACTCTTCATCA
GAGCGCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTACTTGGTGCCACCACTGTCGG
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CATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATCCTCGAGCTTCTTAGCAGTGA
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AAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGTGACCACCTTTACGGATGT
TACCAGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGCGTCGGAGGACTCGAAGTGGTGCT
CTTCGTCAGACATGTTGTGAGAGAGAGAGATTGGAATTGAGATTGGATTGTGAGAATGAA
T
GAGCCC

QA 5 725 5 725
DS 

RD RR4D232JQ 723 0 0
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CACACATT*AATGGTCTAAATCAGAGAAAAAAGGAAGAAAAAAAACATGTTTTTTGTTCT
TATAACAACTGGG*TAAGGTAAATAAGATTATCCTCTGTGTAAAGAGAGAATGATAACAC
TTGTTGGTTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGACGGCACAGATCTGTTCCTCTCCCAT
CGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTCCTCGAATCCACTCTTCATCAGAGC
GCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTACTTGGTGCCACCACTGTCGGTCAA
AAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAGCTGGTAATCAATACGGTTCACATG
AGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATCCTCGAGCTTCTTAGCAGTGAAGAT
ATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTGCTTGCCAGTCTTCGAAGTCGAAAC
CTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGTGACCACCTTTACGGATGTTACC
AGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGCGTCGGAGGACTCGAAGTGGTGCTCTTC
GTCAGACATGTTGTGAGAGAGAGAGATTGGAATTGAGATTGGATTGTGAGAATGAAT
GAGCCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AO25TF 673 0 0
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TTTTTGTTCTTATAACAACTGGGGTAAGGTAAATAAGATTATCCTCTGTGTAAAGAGAGA
ATGATAACACTTGTTGGTTTTACTTGTCACCACCAACTTCCTTGACGGCACAGATCTGCT
CCTCTCCCATCGAAGACATGACAGACACAACCACATCCTTTCCCTCCTCGAATCCACTCT
TCATCAGAGCGCTGAGATTATCATCGGTGGGAAGCTTGAGGTCGTCCTTGGTGCCACCAC
TGTCGGTCAAAAGGCTAACAAAGCCATCCTCAGAGATATCAATCAGCTGGTAATCAATAC
GGTTCACATGAGGAACATCACAATTGTGGGAAGAGGGAACAATATCCTCGAGCTTCTTAG
CAGTGAAGACATCAATAGCAACGAAGTGACACTTCGCGTGACCGTACTTGCCAGTCTTCG
AAGTCGAAACCTCAACAACCTTGCAGGGACGGCCCTTGATGACGATGTGACCACCTTTAC
GGATGTTACCAGCCTGCTGAGGGTAGGTCTTGGAAGCTCCGGCGTCGGAGGACTCGAAGT
GGTGCTCTTCGTCAGACATGTTGTGAGAGAGAGAGATTGGAATTGAGATTGGATTGTGAG
AATGAATGAGCCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 15

CO CL127Contig1 651 15 15 U
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AGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGACGCTCCTTCTCC
TTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGG
TTTGCTTCTCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGTCAGTGCTTC
CTCGACCGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
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GAACCCTTTTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAA
TTATGAGAATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAGTCTGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 75 75 75 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 50 50 50 50 40 40 40 40 40 10 

AF RR4DI60TF U 1
AF RR4D013TF U 1
AF RR4DI60JQ C 54
AF RR4AJ85TF U 13
AF RR4D013JQ C 160
AF RR4CW69TF U 13
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BS 180 288 RR4D013TF
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RD RR4DI60TF 550 0 0
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GAACCCTTTT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4D013TF 625 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAACGAGATAAGTCTTTATTATTTGTTGGTCTGAGAAACAT
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ATCCTCAAGAGCTGGTGCCGTGGTTGCTAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTT
AGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCC
TTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGG
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TTATGAGAATCAGTTACGGCGAATC

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DS 

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AACCCAAATCCTCAAGAGCTGGTGCCGTGGTTGCTAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACT
TTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTC
CTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAA
AGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGTCA
GTGCTTCCTCGACCGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGC
TCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACCCA
ATTATGTGAACCCTTTTTAATGATTTATGTAAATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGC
TTGTGAATTATGAGAATCAGTTACGGCGAATC

QA 1 572 1 572
DS 

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GG
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CCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCG
GAGCTAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGGCAAAGCTTCAAACCCCAATCCTCAAGAGCTG
GTGCCGTGGTTGCTAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTA
ACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGACGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTC
AGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGT
TCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATG
TTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGCCCTAGGGGCAAGCTTT
AAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAAT
GATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGT
TACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAGTCTGC

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DS 

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CAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTA
TGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGC
TGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTT
GCTCACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCA
AGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATTCCTTCAG
AAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAATGATTTATGTAAATGGTTCTGTGTTC
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DS 

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GG
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CCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCG
GAGCTAAGCTCTTTATCAAGCCTTTTCGGCAAAGCTTCAAACCCCAATCCTCAAGAGCTG
GTGCCGTGGTTGCTAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTA
ACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGACGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTC
AGAGCAAGTTCTTTGATACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGT
TCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATG
TTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTT
AAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAAT
GATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGT
TACGACGA

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR4BQ07JQ 605 0 0
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AAGCTTCAAACCCCAATCCTCAAGAGCTGGTGCCGTGGTTGCTAAGTATGGAGACAAAAG
TGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATC
TGACGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCCCC
TTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCAC
TTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAA
GCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTT
TCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCT
TTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAG
TCTGC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4BQ07TF 616 0 0
GGATC
ATTTGTTGGTCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGCAACCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCAC
CGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCGGAGTTAAGCTCTTTATCAAGCCTTC
TCGGCAAAGCTTCAAACCCCAATCCTCAAGAGCTGGTGCCGTGGTTGCTAAGTATGGAGA
CAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTA
TGGATCTGACGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGC
TGCCCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTT
GCTCACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCA
AGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAG
AAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTC
ATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCT
TTCAAGTCTGC

QA 6 616 6 616
DS 

RD RR4ER07TF 643 0 0
GG
AACAACAACGAGATAAGTCTTTATTATTTGTTGGTCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGCAA
CCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCG
GAGCTGAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGGCAAAGCTTCAAACCCCAATCCTCAAGAGCTG
GTGCCGTGGTCGCTAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTA
ACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGACGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTC
AGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGT
TCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATG
TTCCTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTT
AAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAAT
GATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGT
TACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAG
CAAAAAAAAA

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR4ER07JQ 595 0 0
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CTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGACGC
TCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCAC
AAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGT
CAGTGCTTCCTCGACCGGTGATGTTCCTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAA
GCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACC
CAATTATGTGAACCCTTTTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAA
GCTTGTGAATTATGAGAATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAG
C

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4GM72JQ 463 0 0
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CACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTC
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GTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCA
AGCTTTAAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTT
TTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGA
ATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAGTCTGCT

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DS 

RD RR4AJ85JQ 305 0 0
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TTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAA
GCCTAAGCTCGGCCCTAGGGGCAAGCTTTAAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTT
TCTACCCAATTATGTGAACCCTTTTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCT
TTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAG
TCTGC

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR4E079JQ 139 0 0
TTTT
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TGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGAATCAGTTACGACGAATCA
ATGAAGATTGT
TTTT

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DS 

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CTTTTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATG
AGAATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTT

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR4GM72TF 463 0 0
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TGGGTAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGACGCTCCTTCTCCTTATAACC
CACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTC
TCAAGTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCCTTGCTCACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCG
GTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCA
AGCTTTAAATTAGGTTTCTAAATTCCTTCAGAAACTTTCTACCCAATTATGTGAACCCTT
TTTAATGATTTATGTATATGGTTCTGTGTTCATTCCTTTGTAAGCTTGTGAATTATGAGA
ATCAGTTACGACGAATCAATGAAGATTGTCTTTCAAGTCTGC
T

QA 1 462 1 462
DS 



AS 2 15

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TCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGA
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GGTTATGCCTTTTCTTCTTTACTTTCTATATTTTCATATACAATGATGGAGATGGAGTAC
TTGGGATCAGCAGAATTCTAAAACTACGGAACCAACTGCTTTCACACCGGGGGAAGGCCA
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TGGGAAAAAGGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CQ09JQ C 1
AF RR4CQ09TF U 1
BS 1 434 RR4CQ09TF

RD RR4CQ09JQ 434 0 0
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TCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGA
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GGTTATGCCTTTTCTTCTTTACTTTCTATATTTTCATATACAATGATGGAGATGGAGTAC
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TCCAGAGCAAGGACCCCAACAGTTTGGAAGATCTCTTGAGAAAAGGTTTTAGCACTGGTG
TATCCTATGTGTATGCTAGTTTATTCGAAGTATCCCAATGGTGTAAGGCCGTCGACTTAT
TGGGAAAAAGGAGG

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR4CQ09TF 434 0 0
TTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAACTTTCTATAGT
TCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGA
AATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGATAAATTCACTTATTTTTCACAATTCTTCT
GGTTATGCCTTTTCTTCTTTACTTTCTATATTTTCATATACAATGATGGAGATGGAGTAC
TTGGGATCAGCAGAATTCTAAAACTACGGAACCAACTGCTTTCACACCGGGGGAAGGCCA
TCCAGAGCAAGGACCCCAACAGTTTGGAAGATCTCTTGAGAAAAGGTTTTAGCACTGGTG
TATCCTATGTGTATGCTAGTTTATTCGAAGTATCCCAATGGTGTAAGGCCGTCGACTTAT
TGGGAAAAAGGAGG

QA 1 434 1 434
DS 



CO CL128Contig2 1079 13 10 U
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ACTCGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGG
TTAATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTT
ATCTCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTA
ATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCT
CATCTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTT
CTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAG
AAGAAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACC
AACCACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTG
GAGGGAATCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGATAAATTCACT
TATTTTTCACAATTCTCTGGTTATGCCTTTTCTTCTTTACTTTCTATATTTTCATATGCA
AAATCATTGCTGAAGATGGAGCTGATTGCAAGGGTTTGGCAAAGATTTTGGCCTCATTAG
GTAGCGCTGATACTGATGCTGGCTTGGGGTCGATACAGCAGCCAAGCGACTATAATACTC
TTCAACTTGGGGTGGACACATACTCAGATACATTGGGATCGAGTAGAAATTTATTGGGTG
ATATGACTGGAAAGGGAGATTCTCACTCAAAGGAGAAGCACCATCGTTCTTCTTTTTTCA
GTGTGCCTGCTTGCTTCAGAAATCCTTCTTCACCTGATGAATCTCGTGAAGATTCAAGAA
GGTCCAAAAAAGGGTCAAAGCCGTCGAGAAAACGTGATGAATCGTCAAACAGAAGCTATT
ATTCATCTCATGAATATTCTGAAGATTCAGAAGCTCAAGAATCCAACAAGCTCCAAAAA


BQ
10 10 10 50 50 50 50 50 50 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 35 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 
55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU47TF C 4
AF RR4DB09JQ U 4
AF RR4DB09TF C 4
AF RR4CU47JQ U 4
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AF RR4FT10TF C 1
AF RR4GU79JQ U 35
AF RR4GU79TF C 4
AF RR4FG32TF C 131
AF RR4FG32JQ U 4
AF RR4E086JQ U 4
AF RR4E086TF C 10
AF RR4DH54TF U 368
BS 1 3 RR4FT10TF
BS 4 143 RR4DB09JQ
BS 144 144 RR4CU47JQ
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BS 326 337 RR4CU47JQ
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CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGG

QA 1 168 1 168
DS 

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CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATATCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATC
C

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR4DB09TF 323 0 0
CCTTATCAGAGAGGGG*CCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATATCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATC
C

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR4CU47JQ 334 0 0
CCTTATCAGAGAGGGG*CCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGAATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTCCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACC

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4FT10JQ 381 0 0
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AAGCTCTCTGTCTTGGTTAATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGA
GACAGGGGGATCCTTTATCTCCCGTCGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGG
GGTCTTACCGGGCTTAATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATAC
AAAGATCTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCGTACCATAACGT
ATATAGAATCGATTTTCTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACT
ATCAATCTCATAAGAAAAGAA

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR4FT10TF 490 0 0
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ACTCGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGG
TTAATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTT
ATCTCCCGTCGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTA
ATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCT
CATCTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCGTACCATAACGTATATAGAATCGATTTT
CTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAG
AAGAAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACC
AACCACAAC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4GU79JQ 456 0 0
TTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACTCGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCT
CGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTAATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTA
GGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATCTCCCGTCGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGT
CTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGAC
CTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCGT
ACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCG
CGATCAAACTATCAATCTCATAAGAAAAGAAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTC
TCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAAC
C

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4GU79TF 487 0 0
CCTTATCAGAGAGGGG*CCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTCGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCGTACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTT
TTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAG
AAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAAC
CACAAC
C

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4FG32TF 368 0 0
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GTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATCACCTGGG
CATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCATCTTCTTC
TAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTTTTCTGAT
CGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAGAAATCTC
TATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAACT
TTCTATA
C

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DS 

RD RR4FG32JQ 495 0 0
CCTTATCAGAGAGGGG*CCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTT
TTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAG
AAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAAC
CACAACTTTCTATA
C

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4E086JQ 586 0 0
CCTTATCAAAGAGGGG*CCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ACGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTT
TTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAG
AAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAAC
CACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAG
GGAATCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTG
C

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4E086TF 580 0 0
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GCAAAGGAGAGTTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTAACGGTT
CTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATCTCCCGT
TGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATCACCTGG
GCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCATCTTCTT
CTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTTTTCTGA
TCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAGAAATCT
CTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAAC
TTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATC
ATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTG
C

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4DH54TF 712 0 0
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CTCTATGCCCTCTTTTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACA
ACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAA
TCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGATAAATTCACTTATTTTT
CACAATTCTCTGGTTATGCCTTTTCTTCTTTACTTTCTATATTTTCATATGCAAAATCAT
TGCTGAAGATGGAGCTGATTGCAAGGGTTTGGCAAAGATTTTGGCCTCATTAGGTAGCGC
TGATACTGATGCTGGCTTGGGGTCGATACAGCAGCCAAGCGACTATAATACTCTTCAACT
TGGGGTGGACACATACTCAGATACATTGGGATCGAGTAGAAATTTATTGGGTGATATGAC
TGGAAAGGGAGATTCTCACTCAAAGGAGAAGCACCATCGTTCTTCTTTTTTCAGTGTGCC
TGCTTGCTTCAGAAATCCTTCTTCACCTGATGAATCTCGTGAAGATTCAAGAAGGTCCAA
AAAAGGGTCAAAGCCGTCGAGAAAACGTGATGAATCGTCAAACAGAAGCTATTATTCATC
TCATGAATATTCTGAAGATTCAGAAGCTCAAGAATCCAACAAGCTCCAAAAA

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 15

CO CL129Contig1 742 15 13 U
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AACCCATAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACT
GTCCGCACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAAT
ACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCA
GCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAA
GTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
TTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTG
AAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACC
ATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTC
GAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGAC
CACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTC
TTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTTTATC
CAATTGGTCTGTTTTCTTCCCT


BQ
45 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 85 85 85 85 85 70 35 85 85 85 85 85 70 85 85 
85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 70 70 70 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 70 85 85 70 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 60 60 55 
55 35 35 35 35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4GF57TF U 1
AF RR4DP10TF U 1
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AF RR4DX57TF U 1
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AF RR4DA93JQ C 39
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AF RR4DG47TF U 2
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BS 142 142 RR4A707TF
BS 143 271 RR4DP10TF
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BS 273 411 RR4DP10TF
BS 412 412 RR4A707TF
BS 413 700 RR4DP10TF
BS 701 701 RR4DP30TF
BS 702 716 RR4DP10TF
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BS 722 726 RR4DA93TF
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BS 740 742 RR4DG47JQ

RD RR4GF57TF 660 0 0
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AACCCATAATCATCAAATCTCGAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACT
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GTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGTGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
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GAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGAC
CACAAAAGCAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTC

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GTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
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GAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGAC
CACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTC
TTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATA*TGATTTAAAAGTTTT
ATCCAAAAAAAAA

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DS 

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GCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGGTGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAA
GTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
TTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATG*AGAATCTG
AAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACC
ATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTC
GAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGAC
CACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTC
TTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTT
ATCC

QA 1 716 1 716
DS 

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GTCCGCACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAAT
ACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCA
GCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAA
GTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
TTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTG
AAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACC
ATTCAAGAGG*****GAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTC
GAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGAC
CACAAAAACAGCGCTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTC
TTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCC
AG

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DS 

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G
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GATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCAGCTATT
GAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAA
GCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAA
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GAGGATGATGGGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCC
GCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTGAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAAA
AACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTCTTTTTG
TAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAG

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DS 

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G
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AATGTCCCAGCAACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTA
GCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTACTTCTTCTTAAGAC
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TTAAAAGTTTTTAT

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DS 

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GTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
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C

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DS 

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G*AGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGT
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AGCGAGAGACCACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCG
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AGTTTTTATCC

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DS 

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AAGTTTTTATCC

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DS 

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AAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACC
ATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTC
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TTTTTGTAGTGGTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTTTATC
C

QA 1 721 1 721
DS 

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ATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTC
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CAATTG

QA 1 726 1 726
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AATTGGTCTGTTTTCTTCCCT

QA 1 741 1 741
DS 

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TCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTTTTT
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TAATGATTTAAAAGTTTTTATCCAATTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4GF57JQ 696 0 0
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ACATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTA
ATGTCCCAGCAACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAG
CTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACA
AAAGAGCGAGAGACCACAAAAGCAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTG
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CCT

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DS 

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CTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCAG
CTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAG
TGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAAT
TGGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGGCAACATGGAGAATCTGA
AGAGGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCA
TTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCG
AAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACC
ACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTCT
TTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTTTATCC
AATTGGTCTGTTTTCTTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 15

CO CL130Contig1 1060 15 13 U
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CATACAAGCTAAAATCACGCAAGAAACAAAAAGGGTTCCAGCTACCAAGTCCATGATCAT
TGTATTTTTATCATTTTTTGTCGTATTTTTTTCATAAATATCGGGGCTTCGTATCGTAAC
TCGGAAGCTATTAGTGCTTTGGAAGAAAAGACGAGTTTTCTCTCTCTATCGAAAAGCTCC
AACTTCTCTCATCTTCTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTT
TTAGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTTTT*CCGGTTTCGGTGT
TCCGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTC
TGGCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTCCGCGTCAAACTTT
CCGTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCG
GTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTTGGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGA
TGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTGGGTGATTCCAACGTATGTGATG
GCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACATAGGTTGATTGAAGCTCTCTAA
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TTTGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTCGGCGACGTTCTGCATGTCGGTGGAGA
CGATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTTTTAACGTGTTTTGAACACGTGTGCGT
GCGAAGTTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAGCGGGTTGTTTCTTGGACTTTTGGTGGTTT
TATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTTTATGTTTGGGTTTGTATGCCTGTTGTTGGGCTTGT
AAGTTTCCAAAATATATTATCAATAAACGTTTAGATGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 10 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 10 

AF RR4C010TF U 183
AF RR4C022TF U 183
AF RR4EM93TF U 1
AF RR4C046TF U 183
AF RR4G301TF U 158
AF RR4BX44JQ C 455
AF RR4ET61TF U 183
AF RR4C409TF U 274
AF RR4BS52TF U 247
AF RR4C409JQ C 348
AF RR4C010JQ C 880
AF RR4EM93JQ C 399
AF RR4C022JQ C 866
AF RR4G301JQ C 522
AF RR4C046JQ C 875
BS 1 183 RR4EM93TF
BS 184 184 RR4C010TF
BS 185 345 RR4EM93TF
BS 346 346 RR4C010TF
BS 347 469 RR4EM93TF
BS 470 470 RR4G301TF
BS 471 635 RR4EM93TF
BS 636 784 RR4G301TF
BS 785 941 RR4ET61TF
BS 942 942 RR4C409JQ
BS 943 951 RR4ET61TF
BS 952 1059 RR4C409JQ
BS 1060 1060 RR4G301JQ

RD RR4C010TF 332 0 0
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CTTCTCTCATCT*CTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTTTT
AGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTTTT*CCGGTTTCGGTGTTC
CGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCTG
GCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCACCGCGTCAAACTTTCC
GTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATA

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR4C022TF 344 0 0
GGAAGCTATTAGTGCTTTGGAAGAAAAGACGAGTTTTCTCTCTCTATCGAAAAGCTCCAA
CTTCTCTCATCT*CTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTTTT
AGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTTTT*CCGGTTTCGGTGTTC
CGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCTG
GCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTCCGCGTCAAACTTTCC
GTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAA

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR4EM93TF 639 0 0
TTTTTGTTGATAGATTTTGATTTTTTTTTTGGGTGGCGGATAATCACTGAACACTTTTTT
CATACAAGCTAAAATCACGCAAGAAACAAAAAGGGTTCCAGCTACCAAGTCCATGATCAT
TGTATTTTTATCATTTTTTGTCGTATTTTTTTCATAAATATCGGGGCTTCGTATCGTAAC
TCGTAAGCTATTAGTGCTTTGGAAGAAAAGACGAGTTTTCTCTCTCTATCGAAAAGCTCC
AACTTCTCTCATCTTCTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTT
TTAGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTTT**CCGGTTTCGGTGT
TCCGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTC
TGGCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTCCGTGTCAAACTTT
CCGTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCG
GTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTTGGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGA
TGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAG
TGGG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4C046TF 598 0 0
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CTTCTCTCATCT*CTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTTTT
AGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTTTT*CCGGTTTCGGTGTTC
CGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCTG
GCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTCCGCGTCAAACTTTCC
GTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCGGT
CTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTTGGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGATG
AGGTCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCC**GGTGGGTGATTCCAACGTATGTGATGGC
TTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACATAGGCTGATTGAAGCTCTCTAAGG
AATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAGAAGTGGTGCTTTGGATTGAAGT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4G301TF 627 0 0
GG
ATCGGGGCTTCGTATCGTAACTCGTAAGCTATTAGTGCTTTGGAAGAAAAGACGAGTTTT
CTCTCTCTATCGAAAAGCTCCAACTTCTCTCATCTTCTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCT
GACCGACGTTGGAGGGCTCTTTTAGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTT
TTTTTT**CCGGTTTCGGTGTTCCGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTG
GTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCTGGCGTCCTTGT*TTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGC
CTTGTCTCCGCGTCAAACTTTCCGTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACG
GATGTAATCGATTTTCTCTCGGTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTT*GTTGTTCTTGGGTT
ATGATGAGTCGGTGTTGCGGATGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTGG
GTGATTCCAACGTATGTGATGGCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACAT
AGGTTGATTGAAGCTCTCTAAGGAATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAGA
AGTGGTGCTTTGGATTGAAGTTTTG

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR4BX44JQ 423 0 0
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TTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCGGTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTT
GGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGATGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCA
GGTGGGTGATTCCAACGTATGTGATGGCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTC
AACATAGGTTGATTGAAGCTCTCTAAGGAATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGT
GAAGAAGTGGTGCTTTGGATTGAAGTTTTGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTC
GGCGACGCTCTGCATGTCGGTGGAGACGATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTT
TTA

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DS 

RD RR4ET61TF 769 0 0
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CTTCTCTCATCTTCTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTTTT
AGCCTCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTTTT*C*GGTTTCGGTGTTC
CGACCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCTG
GCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTCCGCGTCAAACTTTCC
GTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCGGT
CTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTTGGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGATG
AGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTGGGTGATTCCAACGTATGTGATGGC
TTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACATAGGTTGATTGAAGCTCTCTAAGG
AATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAGAAGTGGTGCTTTGGATTGAAGTTT
TGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTCGGCGACGTTCTGCATGTCGGTGGAGACG
ATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTTTTAACGTGTTTTGAACACGTGTGCGTGC
GAAGTTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAGCGGGTTGTTT*TTGGACTTT

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DS 

RD RR4C409TF 658 0 0
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GTGTTTTTTTTTTTCCGGTTTCGGTGTTCCGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTA
CCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCCGGCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACG
GCCGGCCTTGTCTCCGCGTCAAACTTTCCGTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTAT
ATTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCGGTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTTT
TGGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGATGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGC
AGGTGGGTGATTCCAACGTATGTGATGGCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCT
CAACATAGGTTGATTGAAGCTCTCTAAGGAATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCG
TGAAGAAGTGGTGCTTTGGATTGAAGTTTTGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGT
CGGCGACGTTCTGCATGTCGGTGGAGACGATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCT
TTTAACGTGTTTTGAACACGTGTTCGTGCGAAGTTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4BS52TF 681 0 0
TCTCATCTTCTCCGGTTAAGATCTGTGTAATCTGACCGACGTTGGAGGGCTCTTTTAGCC
TCGACGTCGGTCGGATCTTTCGTCCGTGTGTTTTTTTT***CCGGTTTCGGTGTTCCGAT
CGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGTTTGGTTTTGTCTCTGGCGT
CCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTCCGCGTCAAACTTTCCGTAG
GTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAATCGATTTTCTCTCGGTCTTT
CCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTTGGGTTATGATGAGTCGGTGTTGCGGATGAGAT
CTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTGGGTGATTCCAACGTATGTGATGGCTTCT
TCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACATAGGTTGATTGAAGCTCTCTAAGGAATA
ATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAGAAGTGGTGCTTTGGATTGAAGTTTTGGT
CCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTCGGCGACGTTCTGCATGTCGGTGGAGACGATGG
GTGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTTTTA*CGTGTTTTGA*CACGTGTGCGTGCGAAG
TTGCTGATTTCCTCTT
CGGAT

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DS 

RD RR4C409JQ 712 0 0
CCGGTTTCGGTGTTCCGATCGGCTCTGCCTCCAACGTCTTACCGTACCTGTGGTGGTCGT
TTGGTTTTGTCTCCGGCGTCCTTGTCTTCTTCTCCGGCGATGGACGGCCGGCCTTGTCTC
CGCGTCAAACTTTCCGTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTACGGATGTAAT
CGATTTTCTCTCGGTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTTTTGGGTTATGATGAG
TCGGTGTTGCGGATGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTGGGTGATTCC
AACGTATGTGATGGCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACATAGGTTGAT
TGAAGCTCTCTAAGGAATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAGAAGTGGTGC
TTTGGATTGAAGTTTTGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTCGGCGACGTTCTGC
ATGTCGGTGGAGACGATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTTTTAACGTGTTTTG
AACACGTGTTCGTGCGAAGTTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAGCGGGTTGTTTCTTGGA
CTTTTGGTGGTTTTATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTTTATGTTTGGGTTTGTATGCCTG
TTGTTGGGCTTGTAAGTTTCCAAAATATATTATCAATAAACGTTTAGATGGC

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DS 

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TTCTTGGACTTTTGGTGGTTTTATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTTTATGTTTGGGTTTG
TATGCCTGTTGTTGGGCTTGTAAGTTTCCAAAATATATTATCAATAAACGTTTAGA
GGGC

QA 1 176 1 176
DS 

RD RR4EM93JQ 661 0 0
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CCTTGTCTCCGTGTCAAACTTTCCGTAGGTGAAGACGGCGGCTTTATGTATCTATATTAC
GGATGTAATCGATTTTCTCTCGGTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTTTGTTGTTCTTGGGT
TATGATGAGTCGGTGTTGCGGATGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTG
GGTGATTCCAACGTATGTGATGGCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACA
TAGGTTGATTGAAGCTCTCTAAGGAATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAG
AAGTGGTGCTTTGGATTGAAGTTTTGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTCGGCG
ACGTTCTGCATGTCGGTGGAGACGATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTTTTAA
CGTGTTTTGAACACGTGTGCGTGCGAAGTTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAGCGGGTTG
TTTCTTGGACTTTTGGTGGTTTTATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTTTATGTTTGGGTTT
GTATGCCTGTTGTTGGGCTTGTAAGTTTCCAAAATATATTATCAATAAACGTTTAGATGG
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4C022JQ 194 0 0
GTCTCTCTTTTAACGTGTTTTGAACACGTGTGCGTGCGAAGCTGCTGATTTCCTCTTTCG
GATGAGCGGGTTGTTTCTTGGACTTTTGGTGGTTTTATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTT
TATGTTTGGGTTTGTATGCCTGTTGTTGGGCTTGTAAGTTTCCAAAATATATTATCAATA
AACGTTTAGA
GGGC

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DS 

RD RR4G301JQ 539 0 0
TGTAATCGATTTTCTCTCGGTCTTTCCGATGTGTGGAAAGCTT*GTTGTTCTTGGGTTAT
GATGAGTCGGTGTTGCGGATGAGATCTCGGCTGGCCGTTTGACGCTCTCCGCAGGTGGGT
GATTCCAACGTATGTGATGGCTTCTTCGGCGGGGATGGATTGGATGAGATCTCAACATAG
GTTGATTGAAGCTCTCTAAGGAATAATGCTCTAGCGAGTATGGTAAATGCCGTGAAGAAG
TGGTGCTTTGGATTGAAGTTTTGGTCCCGGATGAGCCGGTGGTTTCCCGTGTCGGCGACG
TTCTGCATGTCGGTGGAGACGATGG*TGTTGAGTGCAAACACGTGTCTCTCTTTTAACGT
GTTTTGAACACGTGTGCGTGCGAAGTTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAGCGGGTTGTTT
CTTGGACTTTTGGTGGTTTTATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTTTATGTTTGGGTTTGTA
TGCCTGTTGTTGGGCTTGTAAGTTTCCAAAATATATTATCAATAAACGTTTAGATGGCG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4C046JQ 185 0 0
TTAACGTGTTTTGAACACGTGTGCGTGCGAAGCTGCTGATTTCCTCTTTCGGATGAGCGG
GTTGTTTCTTGGACTTTTGGTGGTTTTATGTTGTTAGCTGTTTTGGGCTTTTATGTTTGG
GTTTGTATGCCTGTTGTTGGGCTTGTAAGTTTCCAAAATATATTATCAATAAACGTTTAG
ATGGC

QA 1 185 1 185
DS 



AS 1 13

CO CL131Contig1 829 13 11 U
GGGAAACACATTTTCGTTGAGCTCCTCCACTGAATCTCTCCGTCTCTCGTCTCTTCGAAT
CCTAAAGGGTAGGTAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGAC
GGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTAC
GGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCG
GGACTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGA
GGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTC
AATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGC
ATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCT
GGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAG
AAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAG
CTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGT
AAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCA
TCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTAAGTATCTGATATGTGT
TTGCTTCTGTTATTCTCAACTTGGATACTTTATCTGAATGTTTAATGGC


BQ
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 40 40 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 25 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 5 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 15 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 
70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 10 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA59TF U 1
AF RR4F022TF U 0
AF RR4A661TF U 1
AF RR4CY95TF U 17
AF RR4A374TFB U 1
AF RR4A374JQD C 1
AF RR4BN71TF U 102
AF RR4A374TF U 1
AF RR4A374JQ C 17
AF RR4CY95JQ C 45
AF RR4FA59JQ C 134
AF RR4F022JQ C 466
AF RR4BN71JQ C 174
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BS 210 210 RR4F022TF
BS 211 251 RR4FA59TF
BS 252 252 RR4F022TF
BS 253 270 RR4FA59TF
BS 271 672 RR4F022TF
BS 673 700 RR4A661TF
BS 701 782 RR4BN71TF
BS 783 785 RR4A374TF
BS 786 792 RR4CY95JQ
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RD RR4FA59TF 288 0 0
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CCTAAAGGGTAGGTAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGAC
GGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTAC
GGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGT*CCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCG
GGACTCATCAG*ACGCTGAAGATGATGGGA
CCCCGGGCTCACTTTGCT

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR4F022TF 673 0 0
GGGA
AAACACATTTTCGTTGAGCTCCTCCACTGAATCTCTCCGTCTCTCGTCTCTTCGAATCCT
AAAGG*****TAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGC
CCTATGATGA*GACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTACGGA
ACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCGGGA
CTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGAGGC
GTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAAT
GGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATC
CCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGA
GGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAGAAA
ACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAGCTC
CTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGTAAA
ATCACAAAA

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DS 

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CCTAAAGGGTAGGTAGTAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGAC
GGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCAGCCGGGACTATCTAC
GGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGT**AGAGGAACGTGGCTCTTCCG
GGACTCATCAGAACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTTACCTTTGCTGCCATTGGA
GGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTC
AATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGC
ATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCT
GGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAG
AAAACAGCTCAAGCTGACGCCTGATTTCTCTCTTTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAG
CTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTATCTGAGAGGTGT
GAAATCATAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTT

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DS 

RD RR4CY95TF 689 0 0
GG
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ATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGCCCTATGATGAAGACA
ATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCAGCCGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACG
TGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCTCTTCCGGGACTCATCAGAACGCTG
AAGATGATGGGAACCCACGGGCTTACCTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCGGTGTT
GAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTGGG
TTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCT
GCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGA
GTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAGAAAACAGCTCAAGCTGAC
GCCTGATTTCTCTCTTTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAGCTCCTGAGATCATCTCTC
TTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTATCTGAGAGGTGTGAAATCATAAAAGCTCTT
TTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTAT

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR4A374TFB 761 0 0
GGGAAACACATTTTCGTTGAGCTCCTCCACTGAATCTCTCCGTCTCTCGTCTCTTCGAAT
CCTAAAGGGTAGGTAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGAC
GGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTAC
GGAACCATCTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCG
GGACTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGA
GGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTC
AATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGC
ATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCT
GGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAG
AAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAG
CTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGT
AAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCA
TCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTT

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DS 

RD RR4A374JQD 788 0 0
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CCTAAAGGGTAGGTAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGAC
GGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTAC
GGAACCATCTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCG
GGACTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGA
GGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTC
AATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGC
ATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCT
GGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAG
AAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAG
CTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGT
AAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCA
TCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTAGGTATCTGATATGTGT
TTGCT
AAC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4BN71TF 685 0 0
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CGCGGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGA
GAGAAACGTGGCTCTCCCGGGACTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCT
CACTTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAG
AGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCT
TGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTAC
CTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTA
TCCTTACACCCCTGTCGAGAAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTG
AGACTGAAGTTAATAAAAGCTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTT
TGCTGTACCTGAGAGGTGTAAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTT
TTATGGAGGGTGACTTGCATCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTT
CTAAGTATCTGATATGTGTTT
TCTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4A374TF 788 0 0
GGGAAACACATTTTCGTTGAGCTCCTCCACTGAATCTCTCCGTCTCTCGTCTCTTCGAAT
CCTAAAGGGTAGGTAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGAC
GGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTAC
GGAACCATCTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCG
GGACTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGA
GGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTC
AATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGC
ATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCT
GGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAG
AAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAG
CTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGT
AAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCA
TCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTA*GTATCTGATATGTGT
TTGCT
AAC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4A374JQ 772 0 0
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GAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGCCCTATGATGAAGA
CAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGCGGCTGGGACTATCTACGGAACCATCTTGGCCA
CGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCGGGACTCATCAGGACGC
TGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCGGTG
TTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTG
GGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAG
CTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAA
GAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAGAAAACAGCTCAAGCTG
ATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAGCTCCTGAGATCATCTT
TCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGTAAAATCACAAAAGCTC
TTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCATCTTTTTGCTTGAAAT
GTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTAGGTATCTGATATGTGTTTGCT
AAC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4CY95JQ 753 0 0
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CTTGGAAGAAGAGGACGGCCCTATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACTGGCTTCGC
AGCCGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAG
GAACGTGGCTCTTCCGGGACTCATCAGAACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTTAC
CTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGG
CAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGG
CTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTC
TGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCC
TTACACCCCTGTCGAGAAAACAGCTCAAGCTGACGCCTGATTTCTCTCTTTATGGTGAGA
CTGAAGTTAATAAAAGCTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGC
TGTATCTGAGAGGTGTGAAATCATAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTA
TGGAGGGTGACTTGCATCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTA
AGTATCTGATATGTGTTTGCTTCTGTTA
TTCTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4FA59JQ 696 0 0
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CCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCGGGACTCATCAGGA
CGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCG
GTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTG
GTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGA
TAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCA
CAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCTGTCGAGAAAACAGCTCAAG
CTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTAATAAAAGCTCCTGAGATCAT
CTTTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGAGAGGTGTAAAATCACAAAAG
CTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCATCTTTTTGCTTGA
AATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTAAGTATCTGATATGTGTTTGCTTCTGTTAT
TCTCAACTTGGATACTTTATCTGAATGTTTAATGGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4F022JQ 328 0 0
GCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCT
TACACCCCTGTCGAGAAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGAC
TGAAGTTAATAAAAGCTCCTGAGATCATCTTTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCT
GTACCTGAGAGGTGTAAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTAT
GGAGGGTGACTTGCATCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTAA
GTATCTGATATGTGTTTGCTTCTGTTA
C

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DS 

RD RR4BN71JQ 618 0 0
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TCTCCCGGGACTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTTGCTGC
CATTGGAGGCGTTTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGA
TTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGC
AAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGAT
TGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCC
TGTCGAGAAAACAGCTCAAGCTGATGCCTGATTTCTCT**TTATGGTGAGACTGAAGTTA
ATAAAAGCTCCTGAGATCATCTCTCTTCCATGTCATGTCTGTTTTGTTTGCTGTACCTGA
GAGGTGTAAAATCACAAAAGCTCTTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTG
ACTTGCATCTTTTTGCTTGAAATGTTGAATGTAAGAAACGTTACAGTTCTAAGTATTTGA
TATGTGTTTGCTTCTGTT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 2 14

CO CL132Contig1 873 4 6 U
AGAGATAAATACGGAGTAAGGTTAAGTAGGAAGTCGACAATATAATATCATACATAGTCT
TGAAAACATTCCAACCACAAACAGCAAGCTACTGATCACACAATCCATACTTAAGATTGT
AAGAAAACATAATTAAGAAACATGATAGTTTAAGGTTGTAATAGAACAAGCCTTATGCTT
TTCAAGTAGTTATTAAGTAGATAGATAATGATAAATAGCAGCAACCTTTTAACCCTTATT
CATTCAAGAAGGTGGAAGGTAATGATGTCAGAGGCTGATGGTGCATGGAGAGCATGGTTG
GGGTAATGGTGATTATGGTTTTGATGGTAACGAAGAGCATAAGCACGTGATCCTTCGATT
TGATATCCAAGAACCGAGTCGTAGTCGCCTCCATTGTCTACTAGGCCATAGTGAGGATCT
TCCGCTCTTAGCTCCAGCTCATGTATGAGATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTC
TTTTTCTTGGTGGTTTCGATCTGATTCCCAAGGGATTTGAACTTGCGCTCACGAACGAGT
TTGAAAGTGTTTTCCATTTCTTCCTCAAGACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCC
AAACACTCACCTAGCCTCTGCTTAATCTGAGTCCGGAGCTTTCTATTAGTTTCCAACAGC
TTCCTCTTGGTTTCTTGCATTCTCTCATAGTGAGCGCTCCAAACATCAACATCTGAAACC
GTTTGGTACAGATCTATGATCTCCTTTGTTGTGGTGTTAGGGCTTATAAACTCATGAAGC
TTGTTAGAGCTAGAGAACATGATAATGGAAACCCTAGCATCACACAAAACCGTAAGCTCG
TGAGCTTTCTTGAACAAACCATTTCTTCTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ89JQ U 26
AF RR4AR02JQ U 1
AF RR4BE82JQ U 18
AF RR4A809JQ U 13
BS 1 251 RR4AR02JQ
BS 252 252 RR4A809JQ
BS 253 639 RR4AR02JQ
BS 640 640 RR4A809JQ
BS 641 791 RR4AR02JQ
BS 792 873 RR4A809JQ

RD RR4BZ89JQ 730 0 0
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TTGTTGTGGT

QA 1 730 1 730
DS 

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AAGAAAACATAATTAAGAAACATGATAGTTTAAGGTTGTAATAGAACAAGCCTTATGCTT
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TGATATCCAAGAACCGAGTCGTAGTCGCCTCCATTGTCTACTAGGCCATAGTGAGGATCT
TCCGCTCTTAGCTCCAGCTCATGTATGAGATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTC
TTTTTCTTGGTGGTTTCGATCTGATTCCCAAGGGATTTGAACTTGCGCTCACGAACGAGT
TTGAAAGTGTTTTCCATTTCTTCCTCAAGACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCC
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TTGTTAGAGCT

QA 1 791 1 791
DS 

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AAGGTT
AAGTAGGAAGTCGACAATATAATATCATACATAGTCTTGAAAACATTCCAACCACAAACA
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GATAGTTTAAGGCTGTAATAAAACAAGCCTTATGCTTTTCAAGTAGTTATTAAGTAGATA
GATAATGATAAATAGCAGCAACCTTTTAACCCTTATCCATTCAAGAAGGTGGAAGGTAAT
GATGTCAAAGGCTGATGGTGCATGGAGAGCATGGTTGGGGTAATGGTGATTATGGTTTTG
ATGGTAACGAAGAGCATAAGCACGTGATCCTTCGATTTGATATCCAAGAACCGAGTCGTA
GTCCCCTCCATTGTCTACTAGGCCATAGTGAGGATCTTCCGCTCTTAGCTCCAGCTCATG
TATGAGATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTCTTTTTCTTGGTGGTTTCGATCTG
ATTCCCAAGGGATTTGAACTTGCGCTCACGAACGAGTTTGAAAGTGTTTTCCATTTCTTC
CTCAAGACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCCAAACACTCACCTAGCCTCTGCTT
AATCTGAGTCCGGAGCTTTCTATTAGTTTCCAACAGCTTCCTCTTGGTTTCTTGCATTCT
CTCATAGTGAGCGCTCCAAACATCAACATCTGAAACCGTTTGGTACAGATCTATGATCTC
CTTTGTTGTGGTGTTAGGGCTTATAAACTCATGAAGCTTG

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DS 

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GGAGT
AAGGTTAAGTAGGAAGTCGACAATATAATATCATACATAGTCTTGAAAACATTCCAACCA
CAAACAGCAAGCTACTGATCACACAATCCATACTTAAGATTGTAAGAAAACATAATTAAG
AAACATGATAGTTTAAGGTTGTAATAGAACAAGCCTTATGCTTTTCAAGTAGTTATTAAG
TAGATAGATAATGATAAATAGCAGCAACCTTTTAACCCTTATTCATTCAAGAAGGTGGAA
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GTTTTGATGGTAACGAAGAGCATAAGCACGTGATCCTTCGATTTGATATCCAAGAACCGA
GTCGTAGTCGCCTCCATTGTCTACTAGGCCATAGTGAGGATCTTCCGCTCTTAGCTCCAG
CTCATGTATGAGATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTCTTTTTCTTGGTGGTTTC
GATCTGATTCCCAAGGGATTTGAACTTGCGCTCACGAACGAGTTTGAAAGTGTTTTCCAT
TTCTTCCTCAAGACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCCAAACACTCACCTAGCCT
CTGCTTAATCTGAGTCCGGAGCTTTCTATTAGTTTCCAACAGCTTCCTCTTGGTTTCTTG
CATTCTCTCATAGTGAGCGCTCCAAACATCAACATCTGAAACCGTTTGGTACAGATCTAT
GATCACCTTTGTTGTGGTGTTAGGGCTTATAAACTCATGAAGCTTGTTAGAGCTAGAGAA
CATGATAATGGAAACCCTAGCATCACACAAAACCGTAAGCTCGTGAGCTTTCTTGAACAA
ACCATTTCTTCTCTTG

QA 6 861 6 861
DS 



CO CL132Contig2 978 10 18 U
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AAGATCCAGATCAAGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAGA
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ATTATCATGTTCTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACA
AAGGAGATCATAGATCTGTACCAAACGGTTTCCGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTAT
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ATCTCATACATGAGCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATG
GAGGCGACTACGACTCGGTTCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTC
GTTACCATCAAAACCATAATCACCATTACCCCAACCATGCCCTCCATGCACCATCTGCCT
CTGACATCATTACCTTCCACCTTCTTGAATGAATAA*GGGTTAAAAGGTTGCTGTTATTT
ATCATTATCTATCTACTTTATAACTACTTGAAAAGCATAAGGCTGGTTCTACTACAACCT
TAAACTATCATGTTTCTTAATTATGTATTTCTTACTCTTAAGTAAGGATTGTGTGATTAG
TAGCTTGCTGCTTTGACATATTGTGGTTGGAATGTTTTCAAGACTGTGTATGATATTATA
TTGTCGATTTCCTACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 0 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 10 50 50 50 45 45 30 45 30 45 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4F693TF U 12
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AF RR4BE82TF U 1
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AF RR4AR02TF U 20
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AF RR4A809TF U 12
AF RR4G179JQ C 258
AF RR4B552JQ C 101
AF RR4F693JQ C 203
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BS 131 200 RR4BE82TF
BS 201 201 RR4G179TF
BS 202 272 RR4BE82TF
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BS 274 700 RR4BE82TF
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RD RR4F693TF 585 0 0
GG
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TCAAGAAGGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCGATTATCATGTTCT
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GCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGAC

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR4B552TF 323 0 0
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QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4BE82TF 763 0 0
GGAAAATCTTTTCAACAAAAGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGG
AAGATCCAGATCAAGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAGA
AGAAATGGTTTGTTCAAGAAAGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCC
ATTATCATGTTCTCTAGCTCTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACA
AAGGAGATCATAGATCTGTACCAAACGGTTTCAGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTAT
GAGAGAATGCAAGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAG
ATTAAGCAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTT*GATATTCAGGAGCTGCGTAGTCT
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TGGGAATCAGAT*CGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGA
ATCTCATACATGAGCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATG
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GTTACCATCAAAACCATAATCACCATTACCCCAACCATGCTCTCCATGCACCATCAGCCT
CTGACATCATTACCTTCCACCTTCTTGAATGGATAA*GGGTTA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4BZ89TF 657 0 0
G
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TGCTAGGGTTTCCATTATCATGTTCTCTAACTCTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCC
TAACACCACAACAAAGGAGATCATAGATCTGTACCAAACGGTTTCAGATGTTGATGTTTG
GAGCGCTCACTATGAGAGAATGCATGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAA
GCTCCGGATTCAGATTAAGCAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTT*GATATTCAGG
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TTCAAATCCC**TTGGGAATCAGAT*CGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAA
GACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGC
CTAGTAGACAATGGAGGCGACTACGACTCGGTTCTTGGATATCAAATTGAAGGATCACGT
GCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCATAATCACCATTACCCCAACCATGCTCTCCAT
GCACCATCAGCCTCTGACATCATTACCTTCCACCTTCTTGAATGAATAA*GGGTTA

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR4AR02TF 744 0 0
AGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGATCAAGAGAA
TAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAGAAGAAATGGTTTGTTCAAGA
AAGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCCATTATCATGTTCTCTAGCT
CTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACAAAGGAGATCATAGATCTGT
ACCAAACGGTTTCAGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAACCA
AGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAGGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGCTAGGTG
AGTGTTTGGATGAACTT*GATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAAC
ACTTT*CAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCC**TTGGGAATCAGAT*CGAAAC
CACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGA
GCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGGCGACTACGACTCGGT
TCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCATAA
TCACCATTACCCCAACCATGCTCTCCATGCACCATCAGCCTCTGACATCATTACCTTCCA
TCTTCTTGAATGAATAA
AGGGTTA

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DS 

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GGGTTC
AACAAAAGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGATCA
AGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAGAAGAAATGGTCTGT
TCAAGAAGGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCGATTATCATGTTCT
CTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACGCCACAACAAAGGAGATCATAG
ATCTGTACCAAACGGTTTCCGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAG
AAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGC
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GAAAACACTTT*CAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCC**TTGGGAATCAGAT*
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CTCGGTTCTTGGATATCAAATCGAAG*ATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAA
CCATAATCACCATTACCCCAACCATGCCCTCCATGCAC*ATCTGCCTCTGACATCATTAC
CTTCCACCTTCTTGAATG*ATAA*GGTTAAAA**GTTGCTGTTATTTATCATTATCTATC
TACTTTATAACTACTTG

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DS 

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GG
AACAAAAGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGATCA
AGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAGAAGAAATGGTTTGT
TCAAGAAAGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCCATTATCATGTTCT
CTAGCTCTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACAAAGGTGATCATAG
ATCTGTACCAAACGGTTTCAGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAG
AAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGC
TAGGTGAGTGTTTGGATGAACTT*GATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATG
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CGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGA
GCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGGCGACTACGA
CTCGGTTCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAA
CCATAATCACCATTACCCCAACCATGCTCTCCATGCACCATCAGCCTCTGACATCATTAC
CTTCCACCTTCTTGAATGAATAAAGGGTTAAAAGGTTGCTGCTATTTATCATTATCTATC
T

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DS 

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TGAGTGTTTGGATGAACTT*GATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAA
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TTATAACTACTTGAAAAGCATAAGGCTGGTTCTACTACAACCTTAAACTATCATGTTTCT
TAATTATGTATTTCTTACTCTTAAGTAAGGATTGTGTGATTAGTAGCTTGCTGCTTTGAC
ATATTGTGGTTGGAATGTTTTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4B552JQ 875 0 0
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TGTGTGATGCTAGGGTTTCGATTATCATGTTCTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTTA
TAAGCCCTAACACCACAACAAAGGAGATCATAGATCTGTACCAAACGGTTTCCGATGTTG
ATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTA
ATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTT*GAT
ATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACACTTT*CAAACTCGTTCGTGA
GCGCAAGTTCAAATCCC**TTGGGAATCAGAT*CGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAG
TCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCA
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ATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCATAATCACCATTACCCCAACCATGC
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AGTAAGGATTGTGTGATTAGTAGCTTGCTGCTTTGACATATTGTGGTTGGAATGTTTTCA
AGACTGTGTATGATATTATATTGTCGATTTCCTAC

QA 1 875 1 875
DS 

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AAACGGTTTCCGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGATAATGCAAGAAACCAAGA
GGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGCTAGGTGAGT
GTTTGGATGAACTT*GATATTCAGGAGCTGCGTAGACTTGAGGAAGAAATGGAAAACACT
TT*CAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCC**TTGGGAATCAGAT*CGAAACCAC
CAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAGCT
AAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGGCGACTACGACTCGGTTCT
TGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTTTTCGTTACCATCAAAACCATAATCA
CCATTACCCCAACCGTGCCCTCCATGCACCATCTGCCTCTGACATCATTACCTTCCACCT
TCTTGAATGATTAA*GGGTTAAAAGGTTGCTGTTATTTATCATTATCTATCTACTTTATA
ACTACTTGAAAAGCATAAGGCTGGTTTTACTACAACCTTAAACTATCATGTTTCTTAATT
ATGTATTTCTTACTCTTAAGTAAGGATTGTGTGATTAGTAGCTTGCTGCTTTGACATATT
GTGGTTGGAATGTTTTCAAGACTGTGTATGATATTATATTGTCGATTTCCTACTTG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 2 13

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GGACTGATCCTTTCTTTCATCTTCAAACGCTGCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAA
TGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTTAAGGAACAAGA
ACCCTCTCGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTATTC
TACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTG
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAGGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTG
GTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TCGCTGCATCGTTGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATC
TGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCA
CTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCA
CCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGCTCTGCCCTCGGTCTTA
AAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCAAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGG
CACAGTTGGGAATAGCATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGG
CTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCCTCGTCCTCTTAA
ACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGGAAGTTCATTACTGATG
ATGGCGAAGAAAGCTAAACTATTTATGTACTTAAATTTGGTAGTTTGTGAGCCCTCTTCA
TGTTGAGACAAAAGGAAATGGGCAGCTTAAACTGTTGTAATGCTTAAATCCTCTTGTTTT
AACTTGAGTTTTCAGATTATATATAGCTTCATAAATGATTTGAATGATTGATATCTTTTA
GCATCTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY73TF U 1
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AF RR4CY73JQ C 581
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GG
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GCTCAAACCATACTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTTAAGGAACAAGAAC
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CCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTGCT
CCCAAAAAGGTTGAGAAGGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTGGT
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GG
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DS 

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DS 

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ACCCTCTCGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTATTC
TACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTG
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAGGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTG
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TTGCTGCATCGTTGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATC
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AAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCAAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGG
CACAGTTGGGAATAGCATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGG
CTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCCTCGTCCTCTTAA
ACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGGAAGTTCATTACTGATG
ATGGCGA*GAAAGCTAAACTATTTATGTACTT

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DS 

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G
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CGTTGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATCTGGAGACAG
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GAATAGCATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCA
ACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCCTCGTCCTCTTAAACGTTGCTT
TCTTCTTCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGGAAGTTCATTACTGATGATGGCGAAG
AAAGCTAAACTATTTATGTACTTAAATTTGGTAGTTTGTGAGCCCTCTT

QA 2 710 2 710
DS 

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TGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATCTGGAGACAGGGA
TACCGATTTA**AAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTG
CTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTTGAGA
AAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGCTCTGCCCTCGGTCTTAAAGAACAAGGTC
CATTGTTTGGGTTCACGAAGGCAAACGATTTGTTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAA
TAGCATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACA
TTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCCTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCT
TCTTCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGGAAGTTCATTACTGATGATGGCGAAGAAA
GCTAAACTATTTATGTACTTAAATTTGGTAGTTTGTGAGCCCTCTTCATGTTGAGACAAA
AGGAAATGGGCAGCTTAAACTGTTGTAATGCTTAAATCCTCTTGTTTTAACTTGAGTTTT
CAGATTATATATAGCTTCATAAATGATTTGAA
CG

QA 1 692 1 692
DS 

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AAACCAAAGCTGCTCCCAAAA*GGTTGAGAAGGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCT
TCGGAACATCTGGTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTG
CTATGATCGGTTTCGCTGCATCGTTGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAG
CACAGTTGAATCTGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCT
TCATATTGTTCACTCTGTTAGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCG
ACGATCCTCCCACCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGCTCTG
CCCTCGGTCTTAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCAAACGAGTTGTTCG
TAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGA
AAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCC
TCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGGAAGT
TCATTACTGATGATGGCGAAGAAAGCTAAACTATTTATGTACTTAAATTTGGTAGTTTGT
GAGCCCTCTTCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGGCAGCTTAAACTGTTGTAATGCTTAAA
TCCTCTTGTTTTAACTTGAGTTTTCAGATTATATATAGCTTCATAAATGATTTGAATGAT
TGATATCTTTTAGCATCTC

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL133Contig2 997 6 13 U
GACCACAACACTTGACTGATCTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAA
CACACAAAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTC
TTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAAC
TCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCC
AAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATC
TTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTT
GCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTA
GCACAGCTGAATTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTC
TTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTC
GACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCT
GCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTC
GTAGGAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGG
AAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCA
CTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAG
TTCATTACTGATGATGGTGAAGAAAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTATTAGTAG
TTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAA*GGAAATGGACAATTCAAACTATTGTAATA
CTTAAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTGATT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AD81TF U 3
AF RR4GC44TF U 1
AF RR4FO38TF U 263
AF RR4GC44JQ C 239
AF RR4FO38JQ C 541
AF RR4AD81JQ C 304
BS 1 668 RR4GC44TF
BS 669 669 RR4FO38TF
BS 670 710 RR4GC44TF
BS 711 711 RR4FO38TF
BS 712 724 RR4GC44TF
BS 725 725 RR4FO38TF
BS 726 737 RR4GC44TF
BS 738 738 RR4FO38TF
BS 739 742 RR4GC44TF
BS 743 743 RR4FO38TF
BS 744 762 RR4GC44TF
BS 763 928 RR4FO38TF
BS 929 997 RR4GC44JQ

RD RR4AD81TF 639 0 0
GG
ACAACACTTGACTGATCTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACA
CAAAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTGA
GGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCAC
CGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAA
CCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCG
GAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTA
TGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCAC
AGCTGAATTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCA
TATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACG
ATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCC
TCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCAC

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4GC44TF 762 0 0
GACCACAACACTTGACTGATCTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAA
CACACAAAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTC
TTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAAC
TCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCC
AAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATC
TTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTT
GCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTA
GCACAGCTGAATTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTC
TTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTC
GACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCT
GCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTC
GTAGGAAG*TTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGAT*ATTACCGGG
AAAG*AGCATTGGCTCA*CTCA*CATTGAGACTGGTATTCCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4FO38TF 666 0 0
G
GGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGG
ATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATC
GTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAATTTGGAGACAGG
AATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGG
TGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGA
GAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGG
TCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGGTTGGCACAGTTGGG
AATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAGGGAGCATTGGCTCAACTCAA
CATTGAGACTGGTATTCCGATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTT
CTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGATGATGGTGAAGA
AAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTATTAGTAGTTTGGGAGACCATTATCATGTTG
AGACA

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR4GC44JQ 759 0 0
CCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTA
TCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTG
TTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATAT
TAGCACAGCTGAATTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCT
TCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCG
TCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCT
CTGCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGT
TCGTAGGAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCG
GGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAAC
CACTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAA
AGTTCATTACTGATGATGGTGAAGAAAGCTAAACACTTTATGTACTTTCGAGTTATTAGT
AGTTTGGGAGATCATTATCATGTTGAGACAAA*GGAAATGGACAATTCAAACTATTGTAA
TACTTAAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTGATT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4FO38JQ 457 0 0
GACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCT
GCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTC
GTAGGAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGG
AAGGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCGATTCAAGATATCGAACCA
CTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTTTTTTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAG
TTCATTACTGATGATGGTGAAGAAAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTATTAGTAG
TTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAATA
CTTAAATCCTTTTGTTTTAACTTG
CTTTTTTCTGATT

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR4AD81JQ 694 0 0
GGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCT
ATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCA
CAGCTGAATTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTC
ATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGAC
GATCCTCCCCCCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCC
CTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTA
GGAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAA
GGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTC
GTCCTCTTAAACGTTGCTTTTTTTTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTC
ATTACTGATGATGGTGAAGAAAGCCAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTATTAGTAGTTT
GGGAGATCATTATCATGTTGAGACAAA*GGAAATGGACAATTCGAACTATTGTAATACTT
AAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTGATT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 2 10

CO CL134Contig1 605 4 3 U
GGGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTT
TTCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGGGAGTGAAGATC
ATTAAAGGAACAGTGGCATCTGGGTTCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTT
CAACTCAAGGATGGAAGGTCACTAGAAGCCGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAA
CCATTGACAGCCTTATTCAAGGGACAGGTCGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGAT
GCATTCTTCAAAACAAGTGTTCCTGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCC
TTGAAAATGTATGGAGACACGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCA
GAGCAAGCTGTTAAGGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCATCCTTTTT
TATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGTG
TTATTGAATGAGACCTGATTGGCTATTGGTAAACAGTATCATTAAATAGCTTTTTATCTT
TGGGC


BQ
10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 

AF RR4DP68JQ C 1
AF RR4DP68TF U 6
AF RR4DW54JQ C 1
AF RR4DW54TF U 1
BS 1 1 RR4DP68JQ
BS 2 5 RR4DW54TF
BS 6 605 RR4DP68TF

RD RR4DP68JQ 605 0 0
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TTCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGGGAGTGAAGATC
ATTAAAGGAACAGTGGCATCTGGGTTCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTT
CAACTCAAGGATGGAAGGTCACTAGAAGCCGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAA
CCATTGACAGCCTTATTCAAGGGACAGGTCGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGAT
GCATTCTTCAAAACAAGTGTTCCTGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCC
TTGAAAATGTATGGAGACACGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCA
GAGCAAGCTGTTAAGGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCATCCTTTTT
TATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGTG
TTATTGAATGAGACCTGATTGGCTATTGGTAAACAGTATCATTAAATAGCTTTTTATCTT
TGGGC

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DS 

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CGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGGGAGTGAAGATCATTAA
AGGAACAGTGGCATCTGGGTTCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTTCAACT
CAAGGATGGAAGGTCACTAGAAGCCGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAACCATT
GACAGCCTTATTCAAGGGACAGGTCGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGATGCATT
CTTCAAAACAAGTGTTCCTGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCTTGAA
AATGTATGGAGACACGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAGAGCA
AGCTGTTAAGGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCATCCTTTTTTATAT
TCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGTGTTATT
GAATGAGACCTGATTGGCTATTGGTAAACAGTATCATTAAATAGCTTTTTATCTTTGGGC

QA 1 600 1 600
DS 

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G
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TCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGGGAGTGAAGATCA
TTAAAGGAACAGTGGCATCTGGGTTCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTTC
AACTCAAGGATGGAAGGTCACTAGAAGCCGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAAC
CATTGACAGCCTTATTCAAGGGACAGGTCGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGATG
CATTCTTCAAAACAAGTGTTCCTGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCT
TGAAAATGTATGGAGACACGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAG
AGCAAGCTGTTAAGGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCATCCTTTTTT
ATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGTGT
TATTGAATGAGACCTGATTGGCTATTGGTAAACAGTATCATTAAATAGCTTTTTATCTTT
GGGC

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DS 

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G
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TCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGGGAGTGAAGATCA
TTAAAGGAACAGTGGCATCTGGGTTCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTTC
AACTCAAGGATGGAAGGTCACTAGAAGCCGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAAC
CATTGACAGCCTTATTCAAGGGACAGGTCGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGATG
CATTCTTCAAAACAAGTGTTCCTGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCT
TGAAAATGTATGGAGACACGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAG
AGCAAGCTGTTAAGGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCATCCTTTTTT
ATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGTGT
TATTGAATGAGACCTGATTGGCTATTGGTAAACAGTATCATTAAATAGCTTTTTATCTTT
GGGC

QA 2 605 2 605
DS 



CO CL134Contig2 1226 6 31 U
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TAACAAACTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAA*TGGGGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCA
TCCTCGGCGGCGGCGTCTCAGCCGGATACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGAGTTA
AACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTC
TTAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTG
TTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGA
TACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTG
GAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGA
CTGATTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATG
ATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTATAGTTGTTG
GCGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCA
CTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTT
TCTATGAGACTTACTATACAAACAA*GGGAGTGAAGATCATTAAAGGAACAGTGGCATCT
GGGTTCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTACAACTCAAGGATGGAAGGTCA
CTGGAAGCCGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAACCATTGACAGCCTTATTCAAG
GGACAGGTCGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGATGCATTCTTCAAAACAAGTGTT
CCGGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCTTGAAAATGTATGGAGACATG
AGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAGAGCAAGATTTGAGGAGAAAA
AATGGAGAGTTTAACCACCCTTTTTTTTTATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTA
GCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGTGTGTTTGAATGAGACCTGATTGGGTATTGGGAA
ACACTATCATTAAATAGCTTTTTATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB17TF U 28
AF RR4FZ04TF U 1
AF RR4DZ44TF U 28
AF RR4B605TF U 3
AF RR4D746TF U 38
AF RR4DZ44JQ C 369
BS 1 10 RR4FZ04TF
BS 11 11 RR4B605TF
BS 12 66 RR4FZ04TF
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BS 816 1226 RR4DZ44JQ

RD RR4EB17TF 537 0 0
AG
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CTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCATC
ATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGATTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCA
AAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAA

QA 3 537 3 537
DS 

RD RR4FZ04TF 692 0 0
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TAACAACCTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAAATGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCA
TCCTCGGCGGCGGCGTTTCAGCCGGATACGCAGCTATGGAGTTTGCTAGTCAAGGGGTTA
AACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTC
TTAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTG
TTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGA
TACTAAGCACTGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTG
GAGATGTTTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGA
CTGACTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATG
ATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTG
GCGGAGGCTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGAGGATCA*CAATTTTGATGTCA
CTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4DZ44TF 735 0 0
AG
ATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAACAAACTTGTGAAGATCGATCGGATAA
AAA*TGGGGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCTCGGCGGCAGCGTCTCAGCCGGATAC
GCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGAGTTAAACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAA
GAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGG
GCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCT
GAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGAT
CTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCATC
ATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGATTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCA
AAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAA
GCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTATAGTTGTTGGCGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGT
GCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATG
CCTAGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAA**GG
AGTGAAGATCATT

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR4B605TF 813 0 0
GG
GCCTTAAGCTATTTTCCTCACCAGCATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAAC
AAACTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAA*TGGGGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCT
CGGCGGCGGCGTCTCAGCCGGATACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGAGTTAAACC
AGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAG
CAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGG
TAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACT
AAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGA
TGTCTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGA
TTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGC
TGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGGCGG
AGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCACTAT
GGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTTTCTA
TGAGACTTACTATACAAACAAAGGGAGTGAAGATCATTAAAGGAACAGTGGCATCTGGGT
TCACTGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGA

QA 3 813 3 813
DS 

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GG
AAACCAACTTCAGCGACAAGATAACAACCTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAAATGGCGG
AGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCTCGGCGGCGGCGTTTCAGCCGGATACGCAGCTAAGG
AGTTTGCTAGTCAAGGGGTTAAACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGG
CTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGAC
TCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACA
AACAGAAAGGGATTGAGTTGATACTAAGCACTGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCA
AGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTTTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTG
GTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGACTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCC
TCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAG
GTGGAA*GGCTGTAGTTGTTGGCGGAGGCTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGA
GGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTTT
TCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAA*GGGAGTGAAGATC
ATTAAAGGA*CAGTGGCATCTGGGTTCACTGCACAT

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4DZ44JQ 858 0 0
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TTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGATTTT
GGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGAC
AAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTATAGTTGTTGGCGGAGGT
TACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTT
TTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTTTCTATGAG
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TGCACATCCAAATGGAGAGGTGAATGAAGTACAACTCAAGGATGGAAGGTCACTGGAAGC
CGACATTGTGATAGTTGGAGTTGGTGCGAAACCATTGACAGCCTTATTCAAGGGACAGGT
CGAAGAAGACAAAGGTGGAATTAAGACCGATGCATTCTTCAAAACAAGTGTTCCGGATGT
TTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCTTGAAAATGTATGGAGACATGAGAAGGGT
CGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAGAGCAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGA
GTTTAACCACCCTTTTTTTTTATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGAC
GTATGCTGAAATAAGTTGTGTGTTTGAATGAGACCTGATTGGGTATTGGGAAACACTATC
ATTAAATAGCTTTTTATC

QA 1 858 1 858
DS 



AS 2 13

CO CL135Contig1 1133 11 18 U
GGTTTAGAAATCTTATATAATTCACTTGTTACCAAGCTTTTGCATTTGTTACACAAACCA
AAAGAGGTAACATATGGGACTGTTTTAAAAGACGTCTTATTTGGTAAAGGATTAAAATGT
GTTCTTGGCCAAATCATGAGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGT
TTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAG
CAGAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCGG
CTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGT
CCTTCTGCTGATGTTTCAACGGGAACGCTGGTGGGTAACTACTCTTATTCATCGAAGGTC
CTTTCCCTTTGAACATGGGGTTTGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGT
CAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGC
TTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGT
AAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGT
CACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCG
GACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCGTTGATCTTTAACGAGGTCT
CAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAACACGC
CATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGCGGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTGT
ATTTGCATTTCTTGATTACTTCAGCTGGAGTCTCGCATACTGAAGCTCCATGCTCCACAA
GTTCATCACACTTGGAGAGTGTCCTGTTCCAGACGGTTAGCTTGAAACCATGTTTCAGTA
GATTCATTGACATGGCCTTTCCCATGATACCCAAGCCCAGAAACCCAATCTCCATTTTTC
TCTCTCTCTCTCTCTCCTTTGTGTGTTTGAGCGATGATGATGAGGATGAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 20 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 60 
60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 5 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT60JQ U 87
AF RR4DY06JQ U 1
AF RR4D237TF C 83
AF RR4BT60TF C 428
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AATACAAGCCCCTCGGA
AAAG

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4DY06JQ 515 0 0
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DS 

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GAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAA
CTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAGAGAAGTCCAGATCTCCAAG
TCCCATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCGGCTGCAGCTACAGGCATGGAAAC
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GAACGCTGGTGGGTAACTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATGGGGTT
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AGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTT
C

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4BT60TF 284 0 0
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AAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCAT
GACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGA
CTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATTGAAAAGGGACTTGTCACCAGC
AGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTTTGCCGGATTCTTG
TTAC

QA 1 280 1 280
DS 

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GTTCTTGGCCAAATCATGAGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGT
TTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAG
CAAAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCGG
CTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGT
CCTTCTGCTGATGTTTCAACGGGAACGCTGGTGGGTAACTACTCTCATTCATCGAAGGTC
CTTTCCCTTTGAACATGGGGTTTGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGT
CAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGC
TTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGT
AAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGT
CACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCG
GACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCTGTGATTGCCTCGTTGATCTTTAACGAGGTCT
CAGCATCAACAGTTGACATATCGATATA

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4ES31JQ 679 0 0
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GACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCCTGGAGAATT
TCACAGCCTCAATCACAGCAGAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCT
TAAAAGCCTCATTTGCGGCTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAG
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TCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATGGGGTTTGTCATTGCACCAAGATCCA
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AGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGT
TCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATT
CATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCT
TCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCGT
TGATCTTTAACGAGGTCTC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4CM36JQ 837 0 0
ATA
AATTCACTTGTTACCATGCTTTTGCATTTGTTACACAAACCAAAAGAGGTAACATATGGG
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AGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTCCTTTTCCAATAGT
TTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAAAGAAGTCCAGATCTC
CAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCAGCTGCAGCTACAGGCATGG
AAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCTGCTGATGTTTCA
ACGGGAACGCTGGTGGGTAACTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATCG
GGTTTGTCATTGCACCAAGATCCAAAATATCAAGAAAAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCT
TGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAAAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGA
CAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCA
AGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGA
TGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCATCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGAC
CACCTTTCCCGGTGATTGCCTCGTTGATCTTTAACGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACA
TATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAACACGCCATCTTTATCGA

QA 4 837 4 837
DS 

RD RR4B461JQ 778 0 0
GTCTTATTTGGTGAAGGATTAAAATGTGTTCTTGGCCAAATCATGAGTAGAGTAAACTGT
CTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCC
TGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAGAGAAGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTC
TTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCAGCTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCGTTTT**T
CGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCTGCTGATGTTTCAACGGGAACGCTGGTG
GGTAACTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATCGGGTTTGTCATTGCAC
CAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAA
GCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCT
TAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTG
GGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTT
CTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGA
TTGCCTCGTTGATCTTTAACGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTT
TCCCTTCACAGATTTGCTCCAACACGCCGTCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4DY06TF 699 0 0
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TCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGAC
CATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTT
CTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGC
AAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTAC
AAACCGACCACCTTTCCCTGTGATTGCCTCGTTGATCTTTAACGAGGTCTCAGCATCAAC
AGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTACTCCAAAACGCCATCTTTATC
GAAAACAACCGAAAGAGCAGCGGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTGTATTTGCATTT
CTTGATTACTTCAGCTGGAGTCTCGCATACTGAAGCTCCATGCTCCACAAGTTCATCACA
CTTGGAGAGTGTCCTGTTCCAGACGGTTAGCTTGAAACCATGTTTCAGTAGATTCATTGA
CATGGCCTTTCCCATGATACCCAAGCCCAGAAACCCAATCTCCATTTCTCTCTCTCTCTC
CTTT******GTGTGTTTGAGCGATGATGATGAGGAT
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4FL61TF 625 0 0
TCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATG
CTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATTTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAG
TAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTG
TCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACC
GGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCGTTGATCTTTAACGAGGTC
TCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAACACG
CCATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGCAGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTG
TATTTGCATTTCTTGATTACTTCAGCTGGAGTCTCGCATACTGAAGCTCCATGCTCCACA
AGTTCATCACACTTGGAGAGTGTCCTGTTCCAGACGGTTAGTTTGAAACCATGTTTCAGT
AGATTCATTGACATGGCCTTTCCCATGATACCCAAGCCCAGAAACCCGATCTCCATTTTT
CTCTCCCTCTCTCTC
CTTTGTGTCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4ES31TF 612 0 0
GAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCG
TTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGAT
TCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGC
TTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCG
TTGATCTTTAACGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCA
CAATTTTGCTCCAAAACGCCATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGCGGAAGGGTCA
GAGAGCATAGCGATAGTGTATTTGCATTTCTTGATTACTTCAGCTGGAGTCTCGCATACT
GAAGCTCCATGCTCCACAAGTTCATCACACTTGGAGAGTGTCCTGTTCCAGACGGTTAGC
TTGAAACCATGTTTCAGTAGATTCATTGACATGGCCTTTCCCATGATACCCAAGCCCAGA
AACCCAATCTCCATTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTGTGTGTTTGAGCGATGATGAT
GAGGATGAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 



CO CL135Contig2 694 2 3 U
TTTTTCATCCTCATCATCATCGCTCAGACACACAAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAT
GGAGATTGGGTTTCTGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAA
ACATGGTTTCAAGCTAACCGTCTGGAACAGGACACTCTCCAAGTGTGATGAACTTGTGGA
GCATGGAGCTTCAGTATGCGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTAT
CGCTATGCTCTCTGACCCTTCCGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTT
GGAGCAAATCTGTGAAGGGAAAGGCTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTC
GTTATAGATCAACGAGGCAATCACCGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTC
AGGTAGCAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCTAGCTCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTT
TCCATGCCTGTAGCTGCAGCCGCAAATGAGGCTTTTAAGAAGGCAAGAAGCATGGGACTT
GGAGATCTGGACTTCTCTGCTGTGATTGAGGCTGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTA
AACTATTGGAAAAGAAAAAACTAAAATGATTGTTGTCTTCCCAAAGACAGTTTACTCTAC
TCATGATTTGGCCAAGAACACATTTTAATCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4G984JQ C 1
AF RR4G984TF U 1
BS 1 6 RR4G984JQ
BS 7 693 RR4G984TF
BS 694 694 RR4G984JQ

RD RR4G984JQ 694 0 0
TTTTTCATCCTCATCATCATCGCTCAGACACACAAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAT
GGAGATTGGGTTTCTGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAA
ACATGGTTTCAAGCTAACCGTCTGGAACAGGACACTCTCCAAGTGTGATGAACTTGTGGA
GCATGGAGCTTCAGTATGCGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTAT
CGCTATGCTCTCTGACCCTTCCGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTT
GGAGCAAATCTGTGAAGGGAAAGGCTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTC
GTTATAGATCAACGAGGCAATCACCGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTC
AGGTAGCAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCTAGCTCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTT
TCCATGCCTGTAGCTGCAGCCGCAAATGAGGCTTTTAAGAAGGCAAGAAGCATGGGACTT
GGAGATCTGGACTTCTCTGCTGTGATTGAGGCTGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTA
AACTATTGGAAAAGAAAAAACTAAAATGATTGTTGTCTTCCCAAAGACAGTTTACTCTAC
TCATGATTTGGCCAAGAACACATTTTAATCCTTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4G984TF 693 0 0
TTTTTC
ATCCTCATCATCATCGCTCAGACACACAAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAATGGAGAT
TGGGTTTCTGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGG
TTTCAAGCTAACCGTCTGGAACAGGACACTCTCCAAGTGTGATGAACTTGTGGAGCATGG
AGCTTCAGTATGCGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTATCGCTAT
GCTCTCTGACCCTTCCGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTTGGAGCA
AATCTGTGAAGGGAAAGGCTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTCGTTATA
GATCAACGAGGCAATCACCGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAG
CAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCTAGCTCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTTTCCATG
CCTGTAGCTGCAGCCGCAAATGAGGCTTTTAAGAAGGCAAGAAGCATGGGACTTGGAGAT
CTGGACTTCTCTGCTGTGATTGAGGCTGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTAAACTAT
TGGAAAAGAAAAAACTAAAATGATTGTTGTCTTCCCAAAGACAGTTTACTCTACTCATGA
TTTGGCCAAGAACACATTTTAATCCTT

QA 7 693 7 693
DS 



AS 2 14

CO CL136Contig1 1443 12 50 U
AAAACGTTTGAATGTCTGGTAGATGAAACACTTTTTTCATAACACATATCAAATATAAAA
ATAACTTAGGTTCTTTTCTCAACACACACACAAGAGCTTCTTTTATTGTAGATTAACATG
ATACATAAACAAATCCACCTTAGAATTCAGGTTCAGGTTCTTCTTCAACTGCAGCAATGA
CCCATTCACCATTTTCATCCTTGATCATTCCTTTGTTCTTCTCTACCCACCAAGAACCTG
GAACTAAACACTCATCTTTCAAGAACTCACATGACTTGTTCACTAGTGCAATACTTCTCT
TCACCATCAGCTTAAACTCTCCTTTCTTACCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTG
CCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCTGGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTG
TATCAATCACAAAGTTGGTTCCTATATCAACATACCCCAAGAGTCCTCCTGGATATCGAG
TCAAGAGATCAATCGTGTTCCTCACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTT
CGTCCTTGAACTCCCTGTTACCCACCTGTGGACAGCCGAACACGATCCCAGTGACCGGAA
CATCATCACCGGAAGCGTTCTCAGCTATGTCATAGGCTGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTC
CCAAGCTATGTCCAGTCAACACAATGCTCGGTTTCTCGTCCTTATACTTCAACAAAAGCT
CCTTGATCCTAGTTAGCAACTGTAGCCGCAGACTCAGCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGT
GATCGGAAGTGTAGATAGTGAGCCATCCGAGCATCACCTTACACCCTTCTTCATCTTCAC
TGTCGCTACCATAAGTACTAACAGCTTCAGTTACCTTAGAACCAGAACCGTTCTGTTCCG
GTCCGGTCAGCAGCGGGTCAGCTGAAGTAGGCCTAGCTCCCAAAACATTAATCCACTCAT
AGTTCCTACTCGTCCCTCTAAGAGCGACGTAGATCTCACGGCGTCCCAAAGCCTTGGTAC
GTTCGTCAGACGTTACAGCGATGTAACCGAACCAGTTAGACTCACGGTCCCAAGAGTCTC
GTGACTGTGAGCGGAGAAGCAAACCTTCGGGGAGAGAGACACGAGCCGTGGCGTAGAGGA
AGCTCGTGACTTGGTAGTCAGAAGCTGACTCGAGCATGACCTTGTCGAAGAAGGAAGACT
TGCCGTAACGGCTGGCTCCGCAGTACTTGGAGTTCTGGTCGTTGACGAAAGCGTCGTAGG
TGGCTTGGCAAAAGTCGCCGCAACGGAGGATGAGCTGGCGAAGTGATTGGTCTAGTGGGT
CTAGGAGAGTGTCCCAGTTCTTGGAGCCTAAGAGCTCTTCCCATGGTGGTGTTGTTGTTG
TAGCCATTGGAGTGAAATGGTTTGTGTGAGAAGATAGTAAGCTACTATTGTGGGTTATAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 25 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 30 55 55 40 40 25 55 55 55 55 55 55 30 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 30 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4E828JQ U 14
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AF RR4AC31TF C 38
AF RR4DU86JQ U 14
AF RR4DU86TF C 199
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AF RR4AK77JQ U 1
AF RR4DA80JQ U 18
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AF RR4CL28JQ U 38
AF RR4CL28TF C 725
AF RR4DA80TF C 657
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AGAACTCACATGACTTGTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTC
CTTTCTTACCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCC
CTGGATTCCTTGAATCCTTCAG

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DS 

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TTCTTCTTCAACTGCAGCAATGACCCATTCACCATTTTCATCCTTGATCATTCCTTTGTT
CTTCTCTACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCAAGAACTCACATGACTT
GTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCTTTCTTACCATTCCA
TCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCTGGATTCCTTGAATC
CTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGTTCCTATATCAACATACCC
CAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCTCACATGAAGGATCTT
CAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACCCACCTGTGGACAGCC
GAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCAGCTATGTCATAGGC
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GTCC
C

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DS 

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TTCTTCTTCAACTGCAGCAATGACCCATTCACCATTTTCATCCTTGATCATTCCTTTGTT
CTTCTCTACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCAAGAACTCACATGACTT
GTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCTTTCTTACCATTCCA
TCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCTGGATTCCTTGAATC
CTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGTTCCTATATCAACATACCC
CAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCTCACATGAAGGATCTT
CAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACCCACCTGTGGACAGCC
GAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCAGCTATGTCATAGGC
TGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACACAATGCTCGGTTTCTC
GTCC
C

QA 1 664 1 664
DS 

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GTCTGGTG
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ACACACACACAAGAGCTTCTTTTATTGTAGATTAACATGATACATAAACAAATCCACCTT
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TGATCATTCCTTTGTTCTTCTCTACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCA
AGAACTCACATGACTTGTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTC
CTTTCTTACCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCC
CTGGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGTTC
CTATATCAACATACCCCAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCC
TCACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTAC
CCACCTGTGGACAGCCGAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCT
CAGCTATGTCATAGGCTGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACA
CAATGCTCGGTTTCTCGTCCTTATACTTCAACAAAAGCTCCTTGATCCTAGTTAGCAACT
GTAGCCGCAGACTCAGCTTAGTGAACTT

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DS 

RD RR4DU86TF 611 0 0
T
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CAAGAACTCACATGACTTGTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTC
TCCTTTCTTACCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTC
CCCTGGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGT
TCCTATATCAACATACCCCAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTT
CCTCACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTT
ACCCACCTGTGGACAGCCGAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTT
CTCAGCTATGTCATAGGCTGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAA
CACAATGCTCGGTTTCTCGTCCTTATACTTCAACAAAAGCTCCTTGATCCTAGTTAGCAA
CTGTAGCCGCAGACTCAGCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCGGAAGTGTAGATAGT
GAGCCATCC
C

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DS 

RD RR4E828TF 591 0 0
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TTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCTTTCTTACCATTCCAT
CCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCTGGATTCCTTGAATCC
TTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGTTCCTATATCAACATACCCC
AAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCTCACATGAAGGATCTTC
AAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACCCACCTGTGGACAGCCG
AACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCAGCTATGTCATAGGCT
GCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACACAATGCTCGGTTTCTCG
TCCTTATACTTCAACAAAAGCTCCTTGATCCTAGTTAGCAACTGTAGCCGCAGACTCAGC
TTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCGGAAGTGTAGATAGTGAGCCATCC
C

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4AK77JQ 884 0 0
AAAACGTTTGAATGTCTGGTAGATGAAACACTTTTTTCATAACACATATCAAATATAAAA
ATAACTTAGGTTCTTTTCTCAACACACACA**AGAGCTTCTTTTATTGTAGATTAACATG
ATACATAAACAAATCCACCTTAGAATTCAGGTTCAGGTTCTTCTTCAACTGCAGCAATGA
CCCATTCACCATTTTCATCCTTGATCATTCCTTTGTTCTTCTCCACCCACCAAGAACCTG
GAACTAAACACTCATCTTTCAAGAACTCACATGACTTGTTCACTAATGCAATACTTCTCT
TCACCATCAGCTTAAACTCTCCTTTCCTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTG
CCTGAAGATTGTGTCAGTCCCCTGGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTG
TATCGATCACAAAGTTGGTTCCTATATCAACATACCCCAAGAGTCCTCCTGGATATCGAG
TCAAGAGATCAATCGTGTTCCTCACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTT
CGTCCTTGAACTCCCTGTTCCCCACTTGTGTACAGCCAAATACGATCCCAGTGACCGGAA
AATCATCACCGGAAGCGTTCTCAGCTATGTCATAGGCTGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTC
CCAAGCTATGTCCAGTCAACACAATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTCAACAGAAGCT
CCTTGATCCTAGTTAACAACTGTAGCCGTAGACTTATCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGT
GATCAGAAGTGTAGATTGTGAGCCATCCGAGCATCACCTTACACCCTTCTTCGTCTTCAC
TGTCGCTACCAAAAGTACTACCAGCTTCA
ACTAACTTCGAACCA

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DS 

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AGAATTCAGGTTCAGGTTCTTCTTCAACTGCAGCAATGACCCATTCACCATTTTCATCCT
TGATCATTCCTTTGTTCTTCTCTACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCA
AGAACTCACATGACTTGTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTC
CTTTCTTACCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCC
CTGGATTCCTCGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGTTC
CTATATCAACATACCCCAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCC
TCACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTAC
CCACCTGTGGACAGCCGAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCT
CAGCTATGTCATAGGCTGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACA
CAATGCTCGGTTTCTCGTCCTTATACTTCAACAAAAGCTCCTTGATCCTAGTTAGCAACT
GTAGCCGCAGACTCAGCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCGGAAGTGTAGATAGTGA
GCCATCCGAGCATCACCTTACACCCTTCTTCATCTTCACTGTCGCTAC*ATAAGTACTAA
CAGCTT

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DS 

RD RR4B388JQ 825 0 0
GGTA
GATGAAACACTTTTTTCATAACACATATCAAATATAAAAATAACTTAGGTTCTTTTCTCA
ACACACACACAAGAGCTTCTTTTATTGTAGATTAACATGATACATAAACAAATCCACCTT
AGAATTCAGGTTCAGGTTCTTCTTCAACTGCAGCAATGACCCATTCACCATTTTCATCCT
TGATCATTCCTTTGTTCTTCTCCACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCA
AGAACTCACATGACTTGTTCACTAATGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTC
CTTTCTTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCC
CTGGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCGATCACAAAGTTGGTTC
CTATATCAACATACCCCAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCC
TCACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTCC
CCACTTG***ACAGCCAAATACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCT
CAGCTATGTCATAGGCTGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACA
CAATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTCAACAGAAGCTCCTTGATCCTAGTTAACAACT
GTAGCCGTAGACTTATCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCAGAAGTGTAGATTGTGA
GCCATCCGAGCATCACCTTACACCCTTCTTCGTCTTCACTG

QA 5 825 5 825
DS 

RD RR4CL28JQ 850 0 0
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TTCTTTTATTGTAGATTAACATGATACATAAACAAATCCACCTTAAAATTCAGGTTCAGG
TTCTTCTTCAACTGCAGCAATGACCCATTCACCATTTTCATCCTTGATCATTCCTTTGTT
CTTCTCTACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCAAGAACTCACATGACTT
GTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCTTTCTTACCATTCCA
TCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCTGGATTCCTTGAATC
CTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCAATCACAAAGTTGGTTCCTATATCAACATACCC
CAAGAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCCCACATGAAGGATCTT
CAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACCCACCTGTGGACAGCC
GAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCAGCTATGTCATAGGC
TGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACACAATGCTCGGTTTCTC
GTCCTTATACTTCAACAAAAGCTCCTTGATCCTAGTTAGCAACTGTAGCCGCAGACTCAG
CTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCGGAAGTGTAGATAGTGAGCCATCCGAGCATCAC
CTTACACCCTTCTTCATCTTCACTGTCGCTAC*ATAAGTACTAACAGCTTCA
GTTACTTAGAACAGAACC

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4CL28TF 685 0 0
GATCATAGTTAGCAACTGTAGCCGCAGACTCAGCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATC
GGAAGTGTAGATAGTGAGCCATCCGAGCATCACCTTACACCCTTCTTCATCTTCACTGTC
GCTACCATAAGTACTAACAGCTTCAGTTACCTTAGAACCAGAACCGTTCTGTTCCGGTCC
GGTCAGCAGCGGGTCAGCTGAAGTAGGCCTAGCTCCCAAAACATTAATCCACTCATAGTT
CCTACTCGTCCCTCTAAGAGCGACGTAGATCTCACGGCGTCCCAAAGCCTTGGTACGTTC
GTCAGACGTTACAGCGATGTAACCGAACCAGTTAGACTCACGGTCCCAAGAGTCTCGTGA
CTGTGAGCGGAGAAGCAAACCTTCGGGGAGAGAGACACGAGCCGTGGCGTAGAGGGAGCT
CGTGACTTGGTAGTCAGAAGCTGACTCGAGCATGACCTTGTCGAAGAAGGAAGACTTGCC
GTAACGGCTGGCTCCGCTGTACTTGGAGTTCTGGTCGTTGACGAAAGCGTCGTAGGTGGC
TTGGCAAAAGTCGCCGCAACGGAGGATGAGCTGGCGAAGTGATTGGTCTAGTGGGTCTAG
GAGAGTGTCCCAGTTCTTGGAGCCTAAGAGCTCTTCCCATGGTGGTGTTGTTGTTGTAGC
CATTGGAGTGAAATGGTTTGTGT
CC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4DA80TF 787 0 0
GCTCCCAAGCTATGTCCAGTCA*CACAATGCTCGGTTTCTCGTC*TTATACTTCAACAAA
AGCTCCTTGATC*TAGTTAGCAACTGTAGCCGCAGACTCAGCTTAGTGA*CTTCGATTCT
GAGTGATCGGAAGTGTAGATAGTGAGCCATCCGAGCATCACTTTACACCCTTCTTCATCT
TCACTGTCGCTACCATAAGTACTAACAGCTTCAGTTACCTTAGAACCAGAACCGTTCTGT
TCCGGTCCGGTCAGCAGCGGGTCAGCTGAAGTAGGCCTAGCTCCCAAAACATTAATCCAC
TCATAGTTCCTACTCGTCCCTCTAAGAGCGACGTAGATCTCACGGCGTCCCAAAGCCTTG
GTACGTTCGTCAGACGTTACAGCGATGTAACCGAACCAGTTAGACTCACGGTCCCAAGAG
TCTCGTGACTGTGAGCGGAGAAGCAAACCTTCGGGGAGAGAGACACGAGCCGTGGCGTAG
AGGAAGCTCGTGACTTGGTAGTCAGAAGCTGACTCGAGCATGACCTTGTCGAAGAAGGAA
GACTTGCCGTAACGGCTGGCTCCGCAGTACTTGGAGTTCTGGTCGTTGACGAAAGCGTCG
TAGGTGGCTTGGCAAAAGTCGCCGCAACGGAGGATGAGCTGGCGAAGTGATTGGTCTAGT
GGGTCTAGGAGAGTGTCCCAGTTCTTGGAGCCTAAGAGCTCTTCCCATGGTGGTGTTGTT
GTTGTAGCCATTGGAGTGAAATGGTTTGTGTGAGAAGATAGTAAGCTACTATTGTGGGTT
ATAAAAA

QA 1 787 1 787
DS 



CO CL136Contig2 1044 2 2 U
GGACACAAACCATTTCACTCCAATGGCTACAACAACAACACCACCATGGGAAGAGCTCTT
AGGCTCCAAGAACTGGGACACTCTCCTAGACCCACTAGACCAATCACTTCGACAGCTCAT
TCTCCGTTGCGGTGACTTTTGCCAAGCCACCTACGACTCTTTCGTCAACGACCAGAACTC
CAAGTACTGTGGAGCCAGCCGTTACGGCAAGTCTTCCTTCTTCGACAAGGTCATGCTCGA
GTCAGCTTCTGACTACACGGTCACGAGCTTCCTCTACGCCACGGCTCGTGTCTCTCTCCC
CGAAGGTTTGCTTCTCCGCTCACAGTCACGAGACTCTTGGGACCGTGAGTCTAACTGGTT
CGGTTACATCGCTGTAACGTCTGACGAACGTACCAAGGGCTTTGGGACGCCGTGAGATCT
ACGTCGCTCTTAGAGGGACGAGTAGGAACTATGAGTGGATCAATGTTTTGGGAGCTAGGC
CTACTTCAGCTGACCCGCTGCTGACCGGACCGGAACAGAACGGTTCTGGTTCGAAGTTAG
TTGAAGCTGGTAGTACTTTTGGTAGCGACAGTGAAGACGAAGAAGGGTGTAAGGTGATGC
TCGGATGGCTCACAATCTACACTTCTGATCACTCAGAATCGAAGTTCACTAAGATAAGTC
TACGGCTACAGTTGTTAACTAGGATCAAGGAGCTTCTGTTGAAGTATAAGGACGAGAAGC
CGAGCATTGTGTTGACTGGACATAGCTTGGGAGCCACTGAGGCTGTCCTCGCAGCCTATG
ACATAGCTGAGAACGCTTCCGGTGATGATGTTCCGGTCACTGGGATCGTATTTGGCTGTC
AAGTGGGGAACAGGGAGTTCAAGGACGAAGTAACGCGTCACAAGAACTTGAAGATCCTTC
ATGTGAGGAACACGATTGATCTCTTGACTCGATATCCAGGAGGACTCTTGGGGTATGTTG
ATATAGGAACCAACTTTGTGATCGATACAAAGAAGTCACCTTACCTGAAGGATTCAAGGA
ATCCAGGGGACTGGCACAATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK77TF U 1
AF RR4B388TF U 366
BS 1 793 RR4AK77TF
BS 794 1044 RR4B388TF

RD RR4AK77TF 793 0 0
GGACACAAACCATTTCACTCCAATGGCTACAACAACAACACCACCATGGGAAGAGCTCTT
AGGCTCCAAGAACTGGGACACTCTCCTAGACCCACTAGACCAATCACTTCGACAGCTCAT
TCTCCGTTGCGGTGACTTTTGCCAAGCCACCTACGACTCTTTCGTCAACGACCAGAACTC
CAAGTACTGTGGAGCCAGCCGTTACGGCAAGTCTTCCTTCTTCGACAAGGTCATGCTCGA
GTCAGCTTCTGACTACACGGTCACGAGCTTCCTCTACGCCACGGCTCGTGTCTCTCTCCC
CGAAGGTTTGCTTCTCCGCTCACAGTCACGAGACTCTTGGGACCGTGAGTCTAACTGGTT
CGGTTACATCGCTGTAACGTCTGACGAACGTACCAAGGGCTTTGGGACGCCGTGAGATCT
ACGTCGCTCTTAGAGGGACGAGTAGGAACTATGAGTGGATCAATGTTTTGGGAGCTAGGC
CTACTTCAGCTGACCCGCTGCTGACCGGACCGGAACAGAACGGTTCTGGTTCGAAGTTAG
TTGAAGCTGGTAGTACTTTTGGTAGCGACAGTGAAGACGAAGAAGGGTGTAAGGTGATGC
TCGGATGGCTCACAATCTACACTTCTGATCACTCAGAATCGAAGTTCACTAAGATAAGTC
TACGGCTACAGTTGTTAACTAGGATCAAGGAGCTTCTGTTGAAGTATAAGGACGAGAAGC
CGAGCATTGTGTTGACTGGACATAGCTTGGGAGCCACTGAGGCTGTCCTCGCAGCCTATG
ACATAGCTGAGAA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4B388TF 679 0 0
G
CATCGCTGTAACGTCTGACGAACGTACCAAGG*CTTTGGGACGCCGTGAGATCTACGTCG
CTCTTAGAGGGACGAGTAGGAACTATGAGTGGATCAATGTTTTGGGAGCTAGGCCTACTT
CAGCTGACCCGCTGCTGACCGGACCGGAACAGAACGGTTCTGGTTCGAAGTTAGTTGAAG
CTGGTAGTACTTTTGGTAGCGACAGTGAAGACGAAGAAGGGTGTAAGGTGATGCTCGGAT
GGCTCACAATCTACACTTCTGATCACTCAGAATCGAAGTTCACTAAGATAAGTCTACGGC
TACAGTTGTTAACTAGGATCAAGGAGCTTCTGTTGAAGTATAAGGACGAGAAGCCGAGCA
TTGTGTTGACTGGACATAGCTTGGGAGCCACTGAGGCTGTCCTCGCAGCCTATGACATAG
CTGAGAACGCTTCCGGTGATGATGTTCCGGTCACTGGGATCGTATTTGGCTGTCAAGTGG
GGAACAGGGAGTTCAAGGACGAAGTAACGCGTCACAAGAACTTGAAGATCCTTCATGTGA
GGAACACGATTGATCTCTTGACTCGATATCCAGGAGGACTCTTGGGGTATGTTGATATAG
GAACCAACTTTGTGATCGATACAAAGAAGTCACCTTACCTGAAGGATTCAAGGAATCCAG
GGGACTGGCACAATCTTC

QA 2 679 2 679
DS 



AS 2 14

CO CL137Contig1 940 6 13 U
GGAATAGTTACGTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGATAGCCGAAAG
GTTTGGTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTA
AGAGTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGA
GAAGAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAG
CTTCACACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCC
ATCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAAC
AGCTGTTGCAAAAGCTGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGC
CGAGCCTGACGCGGCAGAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATC
TTCTTCCGCTGCAATTCCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCG
GTGTCTGTGCTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCAC
TTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGC
TGGG*CGTGG*TGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAGCTTCAAAGG
TTCTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTATCTATGGTGTTTGGTCTCTTGTCTTTGTT
TAACTCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGGGT
AAGATGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGAATCGATCAAGTTTGGTTTCTCTATGTC
TCAGTCATCTCTGATGTTTGAATTTGTTTGTTTAAAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BM85TF U 17
AF RR4FD23TF U 2
AF RR4A247TF U 1
AF RR4A247TFB U 1
AF RR4BM85JQ C 317
AF RR4FD23JQ C 223
BS 1 664 RR4A247TF
BS 665 665 RR4A247TFB
BS 666 670 RR4A247TF
BS 671 671 RR4A247TFB
BS 672 717 RR4A247TF
BS 718 718 RR4A247TFB
BS 719 726 RR4A247TF
BS 727 727 RR4A247TFB
BS 728 744 RR4A247TF
BS 745 807 RR4A247TFB
BS 808 871 RR4FD23JQ
BS 872 872 RR4BM85JQ
BS 873 940 RR4FD23JQ

RD RR4BM85TF 683 0 0
CCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGATAGCCGAAAGGTTTGGTTTCTCAGAT
TCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGTTTTAATTCCGA
TAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAGAAATCTCCG
GTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACACAATCATCA
GAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCATCAAACATGGATCTG
TGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGCT
GCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGCCTGACGCGGCA
GAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCCGCTGCAATT
CCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTGCTGCAAC
AAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACAT
CGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGCTGGG*CGTGG*TGAGA
TTGCAAAAGCCAATCCGGTTATT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4FD23TF 688 0 0
GGAT
AGTTACGTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGATAGCCGAAAGGTTTG
GTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGT
TTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGA
AGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCA
CACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCATCAA
ACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTG
TTGCAAAAGCTGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGC
CTGACGCGGCAGAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTT
CCGCTGCAATTCCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTC
TGTGCTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCT
GTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGCTGGG*
CGTGG*TGAGATTGCAAAAGCCAA

QA 5 688 5 688
DS 

RD RR4A247TF 750 0 0
GGAATAGTTACGTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGATAGCCGAAAG
GTTTGGTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTA
AGAGTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGA
GAAGAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAG
CTTCACACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCC
ATCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAAC
AGCTGTTGCAAAAGCTGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGC
CGAGCCTGACGCGGCAGAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATC
TTCTTCCGCTGCAATTCCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCG
GTGTCTGTGCTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCAC
TTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGC
TGGGGCGTGGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAGCTTCAA*GG
TTCTGA*GATTTGTATTGTTGGAA
GCCTAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4A247TFB 807 0 0
GGAAT
AGTTACGTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGATAGCCGAAAGGTTTG
GTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGT
TTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGA
AGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCA
CACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCATCAA
ACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTG
TTGCAAAAGCTGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGC
CTGACGCGGCAGAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTT
CCGCTGCAATTCCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTC
TGTGCTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCT
GTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGCTGGG*
CGTGG*TGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAGCTTCAAAGGTTCTG
AAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTATCTATGGTGTTTGGTCTCTTGTCTTTGTTTAACT
CAAATTGTACTTGAATGGAATA

QA 6 807 6 807
DS 

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GCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGCCTGACGCGGCA
GAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTTTTCCGCTGCAATT
CCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTTTGTGCTGCAAC
AAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTTTGTGGCGAACAT
CGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGCTGGG*CGTGG*TGAGA
TTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAGCTTCAAAGGTTTTGAAGATTTGTAT
TGTTGGAAAGGCCTATCTATGGTGTTTGGTCTCTTGTCTTTGTTTAACTCAAATTGTACT
TGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGGGTAAGATGATGAATTTGG
TTTTATAATAAAAGTGAATCGATCAAGTTTGGTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4FD23JQ 718 0 0
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TGGTTTCTTCGGTTCGCCATCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATG
CGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGCTGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCC
TCCTACCCTCTTCATAGCCGAGCCTGACGCGGCAGAGAAGGCAGTTGCCGCTGCTGTTCT
TGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCCGCTGCAATTCCTGAAGAGAACGAACCATCTAAACC
ACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTGCTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAA
GTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAG
CTTTGATTTCAAAGAAGCTGGG*CGTGG*TGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAA
GCTGATAAGCTTCAAAGGTTCTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTATCTATGGTGTT
TGGTCTCTTGTCTTTGTTTAACTCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGG
AATGTTACCAAAGGGGGTAAGATGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTTAATCGATCAA
GTTTGGTTTCTCTATGTCTCAGTCATCTCTGATGTTTGAATTTGTTTGTTTAAAAGCT

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL137Contig2 889 8 15 U
GGAGTTACGTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTT**TGGTAACGAAAGCCGAAAGGTT
TGGCTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGA
GTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAA
GAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTT
CACACAATCATCAGAGCCGAAGCTATGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCCCCTTC
AAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGC
TGTTGCAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGA
GCCGGATGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATC
TTCTTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAA
CCGGTGTCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAG
CACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGA
AGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAG
GTTCTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTGTTT
AACTCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGGGTA
AGATGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGGATCGATCAAGTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 25 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB38TF U 1
AF RR4G844TF U 5
AF RR4GH39TF U 5
AF RR4CC70TF U 38
AF RR4G844JQ C 82
AF RR4GH39JQ C 405
AF RR4B087TF U 124
AF RR4B181TF U 124
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BS 39 63 RR4EB38TF
BS 64 64 RR4G844TF
BS 65 313 RR4EB38TF
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RD RR4EB38TF 699 0 0
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TGGTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGA
GTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAA
GAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTT
CACACAATCATCAGAGCCGAAGCTATGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCCCCTTC
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GCCGGATGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATC
TTCTTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAATCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAA
CCGGTGTCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAG
CACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGA
AGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAA*GCCAATCCG
TTATT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4G844TF 719 0 0
GG
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GGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGC
AAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCGGA
TGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTC
TTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTG
TCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTT
CTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGG
GCGTGGTGAGATTGCAAA*GCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAA
GGTTC

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DS 

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GG
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CTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGTTTTA
ATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAGAA
ATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACACA
ATCATCAGAGCCGAAGCTATGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCCCCTTCAAACAT
GGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGC
AAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCGGA
TGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTC
TTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTG
TCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTT
CTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATT*CAAAGAAGCTGG
GCGTGGTGAGATTGCAAA*GCCAATCCGGTTATTAAAGCTGAT

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR4CC70TF 688 0 0
GG
GGTAACGAAAGCCGAAAGGTTTGGTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAA
TACATCTTATTCCGATTAAGAGTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTG
TTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGA
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TGGTTTCTTCGGTTCCCCTTCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATG
CGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCC
TCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCGGATGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGT
TCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATC
TAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGG
TTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGA
TTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAA*GCCAATCCG*TTAT
TAAAGCTGATAAACTTCAAAG
TTCTG

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR4G844JQ 749 0 0
ATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGTTTTAATTCCGATAGATCAG
ATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAGAAATCTCCGGTTCCAAC
AGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACACAATCATCAGAGCCGAA
GCTATGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCCCCTTCAAACATGGATCTGTGTTCGAA
ATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGCCGCTGTTGA
GAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCGGATGTGGCAGAGAAGGC
AGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGCTGCAGTTCC
TGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTGTTGCAACAA
GAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACATCG
GTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGC
AAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCTGAAGATTTGTATTGTT
GGAAAGGCCTCTATTGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTGTTTAACTCAAATTGTACTTGAATG
GAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GH39JQ 426 0 0
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TGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAAC
CACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCA
AGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCA
ACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAG
CTGATAAACTTCAAAGGTTCTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTCTATTGTGTTTGG
TCTCTTTTCTTTGTTTAACTCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAAT
GTTACC

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4B087TF 743 0 0
GG
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AATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACAC
AATCATCAGAGCCGAAGCTATGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCCCCTTCAAACA
TGGATCCGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTG
CAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCGG
ATGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCCT
CTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGT
GTCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTT
TCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTG
GGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAGTCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCT
GAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTGTTTAACTC
AAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGGGTAAGATG
ATGAATTTGGTTTTATAATAA

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR4B181TF 766 0 0
GG
AATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAGA
AATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACAC
AATCATCAGAGCCGAAGCTATGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCCCCTTCAAACA
TGGATCCGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTG
CAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCGG
ATGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTGCCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCCT
CTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGT
GTCTGTGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTT
TCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTG
GGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAGTCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCT
GAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTGTTTAACTC
AAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGG*TAAGATG
ATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGGATCGATCAAGTTTGGTT

QA 3 766 3 766
DS 



AS 1 14

CO CL138Contig1 1184 14 24 U
GGTGCTTTAATGTACATATTAAAAAAACAAAAACTGTGAAAACTTAGACATGGACATAAT
TTCCTCACTTTTTCTAGTGAAAATTATATTTATTTTGAACACTCAAGGTTCTTAATTCGT
CAAAGAGAGTGCAAAAACCCAAAATGCATGGTCTCAATTCAACAACAACAAAGCAAACTA
AGTGTATGACATCAAGCATTCGAAGTTATGCAGTAGTACTATGTTGTAGAACGTCAAATA
TCTGAAAAACAT*GATCAAGAAAGACGATAAAATAAAAAAAA*TACACATTTTTCCGAGC
AACGACACTTGCTGTCTTCGGATGCATCAAAGGTCGTTTCTCTTCACACAGAGGATTCAG
TTCTCTTCTTTCGGCTCATCACCTTTGGATTTCTCTTCTCCTTCCTCCGGGAGGTCAGAA
GTCCACAGGGTGAGATTGTCTCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATGAC
TCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAATTGG
CATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCAAG
CCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTG
TATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGCACCAGAACTGAACTCTGCC
AGATAGCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAACAGCGGTA
GAGGAAGGGATGAGGTGTTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTGGCAAGC
TCATCTTCAACCCTCTTTCGGTAATTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCCTTG
GTCTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCCTTGCGCCAATG
ACGTTCTTGTAACCCACAGACACGAGGTTCCTCTCCTCTACCGTGAGCTCCACATCCATC
TCTGCTACTTTCTTCATTGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGGTTTGCTCGGAGAGC
TTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTTTCTTCTCTCTGTCT
GAAACAAACAATGGATGCTCTCTCTATTTTGATCTCGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 25 25 50 50 50 35 50 50 50 55 60 60 60 60 60 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 55 70 70 40 70 70 70 70 70 55 10 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 5 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 55 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 5 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D357JQ U 118
AF RR4GB10JQ U 1
AF RR4EE43JQ U 132
AF RR4DC82JQ U 118
AF RR4FU90JQ U 119
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AF RR4AY56JQ U 197
AF RR4DC82TF C 386
AF RR4GB10TF C 391
AF RR4D357TF C 598
AF RR4FU90TF C 413
AF RR4AX71TF C 408
AF RR4GN54TF C 490
AF RR4EE43TF C 413
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BS 129 129 RR4DC82JQ
BS 130 136 RR4GB10JQ
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BS 182 318 RR4GB10JQ
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BS 320 402 RR4GB10JQ
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BS 904 925 RR4AY56JQ
BS 926 1140 RR4DC82TF
BS 1141 1163 RR4AX71TF
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BS 1177 1184 RR4EE43TF

RD RR4D357JQ 445 0 0
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GTCATCGGATGCATCAAAGGTCGTTTCTCTTCACACAGAGGATTCAGTTCTCTTCTTTCA
GCTCATCACCTTTGGATTTCTCTTCTCCTTCCTCCGGGAGGTCAGAAGTCCACAGGGTGA
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TGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAATTGGCATGCGCTTTCAG
GAGAGTTTA

QA 17 445 17 445
DS 

RD RR4GB10JQ 644 0 0
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TGTGTATGACATCAAGCATTCGAAGTTATGCAGTAGTACTATGTTGTAGAACGTCAAATA
TCTGAAAAACAT*GATCAAGAAAGACGATAAAATAAAAAAAA*TACACATTTTTCCGAGC
AACGACACTTGCTGTCTTGGGATGCATCAAAGGTCGTTTCTCTTCACACAGAGGATTCAG
TTCTCTTCTTTCGGCTCATCACCTTTGGATTTCTCTTCTCCTCCCTCCGGGAGGTCAGAA
GTCCACAGGGTGAGATTGTCTCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATGAC
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DS 

RD RR4EE43JQ 550 0 0
GC
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AAGCATTCGAAGTTATGCAGTAGTACTATGTTGTAGAACGTCAAATAACTGAAAAACAT*
GATCAAGAAAGACAATAAAATAAAAAAAAATACACATTTTTCCGAGCAACGACACTTGCT
GTCTTCGGATGCATCAAAGGTCGTTTCTCTTCACACAGAGGATTCAGTTCTCTTCTTTCG
GCTCATCACCTTTGGATTTCTCT***CCTTCCTCCGGGAGGTCAGAAGTCCACAGGGTGA
GATTGTCTCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATGACTCCTCGTTGAGGC
TGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAATTGGCATGCGCTTTCAG
GAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCAAGCCAAGTCTAACTG
GATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTGTATGCTTCAAGAG
ACTGATCT

QA 3 550 3 550
DS 

RD RR4DC82JQ 624 0 0
C
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GGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCA
GGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCT
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CCAGATAGCGATAATAATCTCCT

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR4FU90JQ 633 0 0
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TAACTGAAAAACAT*GATCAAGAAAGACAATAAAATAAAAAAAAATACACATTTTTCCGA
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AGTTCTCTTCTTTCGGCTCATCACCTTTGGATTTCTCTTCTCCTTCCTCCGGGAGGTCAG
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ACTCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAATT
GGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCA
AGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCT
TGTATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGTACCAGAACCGAACTCTG
CCAGATAGCGATAGTAATCTCCTTTCATTTTGT

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DS 

RD RR4GN54JQ 785 0 0
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TATCTGAAAAACATCGATCAAGAAAGACGATAAAATAAAAAAAA*TACACATTTTTCCGA
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AGTTCTCTTCTTTCGGCTCATCACCTTTGGATTTCTCTTCTCCTTCCTCCGGGAGGTCAG
AAGTCCACAGGGTGAGATTGTCTCTAAGTAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATG
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GGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCA
GGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCT
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GCTCATCTTCAACCCTCTTTCGGTAATTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCCT
TGGTC

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DS 

RD RR4AY56JQ 730 0 0
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CAAGAAAGACAATAAAATAAAAAAAAATACACATTTTTCCGAGCAACGACACTTGCTGTC
TTCGGATGCATCAAAGGTCGTTTCTCTTCACACAGAGGATTCAGTTCTCTTCTTTCGGCT
CATCACCTTTGGATTTCTCT***CCTTCCTCCGGGAGGTCAGAAGTCCACAGGGTGAGAT
TGTCTCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATGACTCCTCGTTGAGGCCGT
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GATATGCAGCTTCCTTGCGTTCAGTACCAGAACTGAACTCTGCCAGATAGCGATAGTAAT
CTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAACAGCGGTAGAGGAAGGAATGAGGT
GCTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTGGCAAGCTCGTCTTCAACCCTCT
TTCGGTAAGTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCCTTGGACTCTTCCTTCTGCT
CGATGGAGG
G

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DS 

RD RR4DC82TF 757 0 0
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GTAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTC*TTGTATGACTCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAG
CGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGA
TCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCAGGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTG
CCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTGTATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAG
CTTCCTTGCGTTCAGCACCAGAACTGAACTCTGCCAGATAGCGATAATAATCTCCTTTCA
TTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAACAGCGGTAGAGGAAGGGATGAGGTGTTTGTCAA
TGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTGGCAAGCTCATCTTCAACCCTCTTTCGGTAAT
TCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCCTTGGTCTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGG
ATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCCTTGCGCCAATGACGTTCTTGTAACCCACAGACACGA
GGTTCCTCTCCTCTACCGTGAGCTCCACATCCATCTCTGCTACTTTCTTCATTGCCTCAA
CCATCTCATCGTATCGTTCGGTTTGCTCGGAGAGCTTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCC
TCTCAGTCTCCATGCCTTCTTTCTTCTCTCTGTCT
CC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4GB10TF 752 0 0
TCTCTTCTCCTCCCCC
CCGGGAGGTCAGAAGTCCACAGGGTGAGATTGTCTCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGC
TGTCTTTGTATGACTCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTT
GCTTAGCTAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAA
AGTTCAAAGCCAAGCCAAGTCTAACTGGATGTGTAGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAG
CAACAGCAGCCTTGTAGGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGTACCAG
AACTGAACTCTGCCAGATAGCGATAGTAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACAGTGG
ACTCAACAGCGGTAGAGGAAGGAATGAGGTGCTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTAC
AAACTTTGGCAAGCTCATCTTCAACCCTCTTTCGGTAATTCTGAATCCTCTTGACATTCT
CCTCGTTCCCCTCGGACTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTC
TCCTTGCGCCAATGACGTTCTTGTATCCCACAGATACGAGGTTTCTCTCCTCTACCGTGA
GCTCCACATCCATCTCTGCTACTTTCTTCATCGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGG
TTTGCTCGGAGAGCTTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTT
TCTTCTCTCTGTCT
CC

QA 17 750 17 750
DS 

RD RR4D357TF 545 0 0
AGGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCC
TTGTATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGCACCAGAACTGAACTCT
GCCAGATAGCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAACAGCG
GTAGAGGAAGGGATGAGGTGTTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTGGCA
AGCTCATCTTCAACCCTCTTTCGGTAATTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCC
TTGGTCTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCCTTGCGCCA
ATGACGTTCTTGTAACCCACAGACACGAGGTTCCTCTCCTCTACCGTGAGCTCCACATCC
ATCTCTGCTACTTTCTTCATTGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGGTTTGCTCGGAG
AGCTTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTTTCTTCTCTCTG
TCT
CC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4FU90TF 725 0 0
A
GTCAGAAGTCCACAGGGTGAGATTGTATCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTC*TT
GTATGACTCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGC
CAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAA
AGCCAAGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGC
AGCCTTGTATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGTACCAGAACCGAA
CTCTGCCAGATAGCGATAGTAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAAC
AGCGGTAGAGGAAGGAATGAGGTGCTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTT
GGCAAGCTCGTCTTCAACCCTCTTTCGGTAAGTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTT
CCCCTTGGACTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCCTTGC
GCCAATGACGTTCTTGTAACCCACAGATACGAGGTTTCTCTCCTCCACGGTGAGCTCCAC
ATCCATCTCTGCTACTTTCTTCATTGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTCCGGTTTGCTC
GGAGAGCTTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTTTCTTCTC
TC
CC

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR4AX71TF 777 0 0
CGGGAGGTCAGAAGTCCACAGGGTGAGATTGTCTCTAAGTAGATGCATGATAAGAGTGCT
GTCCTTGTATGACTCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTG
CTTAGCCAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAA
GTTCAAAGCCAGGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGC
AACAGCAGCCTTGTATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGCACCAGA
ACTGAACTCTGCCAGATAGCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGA
CTCAACAGCGGTAGAGGAAGGGATGAGGTGTTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACA
AACTTTGGCAAGCTCATCTTCAACCCTCTTTCGGTAATTCTGAATCCTCTTGACATTCTC
CTCGTTCCCCTTGGTCTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTCT
CCTTACGCCAATGACGTTCTTGTAACCCACAGACACGAGGTTCCTCTCCTCTACCGTGAG
CTCCACATCCATCTCTGCTACTTTCTTCATTGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGGT
TTGCTCGGAGAGCTTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTTT
CTTCTCTCTGTCTGAAACAAACAATGGATGCTCTCT**ATTTTGATCTC
GAGATTCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4GN54TF 687 0 0
AGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAATTGGCATGCGCTT
TCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAAAGCCAGGCCAAGTCTA
ACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTGTATGCTTCA
AGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGCACCAGAACTGAACTCTGCCAGATAGCGA
TAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAACAGCGGTAGAGGAAGGG
ATGAGGTGTTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTGGCAAGCTCATCTTCA
ACCCTCTTTCGGTAATTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCCTTGGTCTCTTCC
TTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCCTTGCGCCAATGACGTTCTTG
TAACCCACAGACACGAGGTTCCTCTCCTCTACCGTGAGCTCCACATCCATCTCTGCTACT
TTCTTCATTGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGGTTTGCTCGGAGAGCTTCGCCGAG
TAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTTTCTTCTCTCTGTCTGAAACAAAC
AATGGATGCTCTCT
ATTTTGATCTCCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4EE43TF 772 0 0
GGTCAGAAGTCCACAGG*TGAGAT*GTCTCTAAGAAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTC*T
TGTATGACTCCTCGTTGAGGCTGTCAAGTTCAGCGATTGCATCGTCAAATGCTTGCTTAG
CCAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCGTAGTAGAAAACAGAAAAGTTCA
AAGCCAAGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCCAAACCAGTGTCTGCAGCAGCAACAG
CAGCCTTGTATGCTTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCAGTACCAGAACTGA
ACGCTGCCAGATAGCGATAGTAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTGGACTCAA
CAGCGGTAGAGGAAGGAATGAGGTGCTTGTCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTT
TGGCAAGCTCGTCTTCAACCCTCTTTCGGTAAGTCTGAATCCTCTTGACATTCTCCTCGT
TCCCCTTGGACTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCCTTG
CGCCAATGACGTTCTTGTAACCCACAGATACGAGGTTTCTCTCCTCCACGGTGAGCTCCA
CATCCATCTATGCTACTTTCTTCATTGCCTCAACCATCTCATCGTATC*TTCGGTTTGCT
CGGAGAGCTTCGCCGAGTAAACCTGCTTTTCCCTCTCAGTCTCCATGCCTTCTTTCTTCT
CTCTGTCTGAAACAAACAATGGATGCTCTCTCTATTTTGATCTCGAGATTCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 2 14

CO CL139Contig1 580 4 12 U
CGAACATTAAAAAGTTCTTCTCTCTTAATGCAACTCCGACAGACAAACGTTAAGAGATAA
GGAGTGTTTACAACTGGAAATAGTTCAAAGTTGGTTGACAATGAGGGAAGCTTAAATAAA
TACTAATACCACACACGTTCATAGATTGCCAAATCACATTAACCTCTTTACTTGCCACGG
AATCTAGAAAGTCGATCCATTCCAACCAAAGAAGGATCCCTTGGTGTCGTAAAACTTGAG
GAAGAAGCGAGACTTGGGCACAGAGAGCTTAGTCTCAAGGATGGCGGAGACAGCAGCGCT
GAGCTTCTTGTTGACATCGGGATTAAGGCCACCGATGGAGACAAGTTCACCATAAGCGGC
AGGGTCCTCGGTGCCACCAAATGCCATAGGCACTGATCCTTTCAACACAATCATCACATA
GTTCTCAGGCTTGCCGATGATTTTGGCGACGGAGGAGGTAGCTTCGGAGAGAATGGAAGA
GGTATCGACGCCGTCGAGGCTAACGTTGGTGGAGATGTTAAGGCACGGCATCTTCTTTCT
TTTGTTTCTTTCACTCTCTATCACTCGAGTCGATCCTCCC


BQ
10 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4DT22JQ U 1
AF RR4DT22TF C 1
AF RR4BE74JQ U 5
AF RR4BE74TF C 5
BS 1 72 RR4DT22JQ
BS 73 73 RR4BE74JQ
BS 74 155 RR4DT22JQ
BS 156 156 RR4BE74JQ
BS 157 288 RR4DT22JQ
BS 289 289 RR4BE74JQ
BS 290 406 RR4DT22JQ
BS 407 407 RR4BE74JQ
BS 408 449 RR4DT22JQ
BS 450 450 RR4BE74JQ
BS 451 579 RR4DT22JQ
BS 580 580 RR4BE74JQ

RD RR4DT22JQ 579 0 0
CGAACATTAAAAAGTTCTTCTCTCTTAATGCAACTCCGACAGACAAACGTTAAGAGATAA
GGAGTGTTTACAGCTGGAAATAGTTCAAAGTTGGTTGACAATGAGGGAAGCTTAAATAAA
TACTAATACCACACACGTTCATAGATTGCCAAATCGCATTAACCTCTTTACTTGCCACGG
AATCTAGAAAGTCGATCCATTCCAACCAAAGAAGGATCCCTTGGTGTCGTAAAACTTGAG
GAAGAAGCGAGACTTGGGCACAGAGAGCTTAGTCTCAAGGATGGCGGAAACAGCAGCGCT
GAGCTTCTTGTTGACATCGGGATTAAGGCCACCGATGGAGACAAGTTCACCATAAGCGGC
AGGGTCCTCGGTGCCACCAAATGCCATAGGCACTGATCCTTTCAACGCAATCATCACATA
GTTCTCAGGCTTGCCGATGATTTTGGCGATGGAGGAGGTAGCTTCGGAGAGAATGGAAGA
GGTATCGACGCCGTCGAGGCTAACGTTGGTGGAGATGTTAAGGCACGGCATCTTCTTTCT
TTTGTTTCTTTCACTCTCTATCACTCGAGTCGATCCTCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4DT22TF 579 0 0
C
GAACATTAAAAAGTTCTTCTCTCTTAATGCAACTCCGACAGACAAACGTTAAGAGATAAG
GAGTGTTTACAGCTGGAAATAGTTCAAAGTTGGTTGACAATGAGGGAAGCTTAAATAAAT
ACTAATACCACACACGTTCATAGATTGCCAAATCGCATTAACCTCTTTACTTGCCACGGA
ATCTAGAAAGTCGATCCATTCCAACCAAAGAAGGATCCCTTGGTGTCGTAAAACTTGAGG
AAGAAGCGAGACTTGGGCACAGAGAGCTTAGTCTCAAGGATGGCGGAGACAGCAGCGCTG
AGCTTCTTGTTGACATCGGGATTAAGGCCACCGATGGAGACAAGTTCACCATAAGCGGCA
GGGTCCTCGGTGCCACCAAATGCCATAGGCACTGATCCTTTCAACGCAATCATCACATAG
TTCTCAGGCTTGCCGATGATTTTGGCGATGGAGGAGGTAGCTTCGGAGAGAATGGAAGAG
GTATCGACGCCGTCGAGGCTAACGTTGGTGGAGATGTTAAGGCACGGCATCTTCTTTCTT
TTGTTTCTTTCACTCTCTATCACTCGAGTCGATCCTCC

QA 2 579 2 579
DS 

RD RR4BE74JQ 576 0 0
CATTAAAAAGTTCTTCTCTCTTAATGCAACTCCGACAGACAAACGTTAAGAGATAAGGAG
TGTTTACAACTGGAAATAGTTCAAAGTTGGTTGACAATGAGGGAAGCTTAAATAAATACT
AATACCACACACGTTCATAGATTGCCAAATCACATTAACCTCTTTACTTGCCACGGAATC
TAGAAAGTCGATCCATTCCAACCAAAGAAGGATCCCTTGGTGTCGTAAAACTTGAGGAAG
AAGCGAGACTTGGGCACAGAGAGCTTAGTCTCAAGGATGGCGGAGACAGCAGCGCTGAGC
TTCTTGTTGACATCGGGATTAAGGCCACCGATGGAGACAAGTTCACCATAAGCGGCAGGG
TCCTCGGTGCCACCAAATGCCATAGGCACTGATCCTTTCAACACAATCATCACATAGTTC
TCAGGCTTGCCGATGATTTTGGCGACGGAGGAGGTAGCTTCGGAGAGAATGGAAGAGGTA
TCGACGCCGTCGAGGCTAACGTTGGTGGAGATGTTAAGGCACGGCATCTTCTTTCTTTTG
TTTCTTTCACTCTCTATCACTCGAGTCGATCCTCCC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4BE74TF 576 0 0
CATTAAAAAGTTCTTCTCTCTTAATGCAACTCCGACAGACAAACGTTAAGAGATAAGGAG
TGTTTACAACTGGAAATAGTTCAAAGTTGGTTGACAATGAGGGAAGCTTAAATAAATACT
AATACCACACACGTTCATAGATTGCCAAATCACATTAACCTCTTTACTTGCCACGGAATC
TAGAAAGTCGATCCATTCCAACCAAAGAAGGATCCCTTGGTGTCGTAAAACTTGAGGAAG
AAGCGAGACTTGGGCACAGAGAGCTTAGTCTCAAGGATGGCGGAGACAGCAGCGCTGAGC
TTCTTGTTGACATCGGGATTAAGGCCACCGATGGAGACAAGTTCACCATAAGCGGCAGGG
TCCTCGGTGCCACCAAATGCCATAGGCACTGATCCTTTCAACACAATCATCACATAGTTC
TCAGGCTTGCCGATGATTTTGGCGACGGAGGAGGTAGCTTCGGAGAGAATGGAAGAGGTA
TCGACGCCGTCGAGGCTAACGTTGGTGGAGATGTTAAGGCACGGCATCTTCTTTCTTTTG
TTTCTTTCACTCTCTATCACTCGAGTCGATCCTCC
C

QA 1 575 1 575
DS 



CO CL139Contig2 663 10 9 U
GGAGCTTTCCCCAATCAATCAAAACTGAGGATCGAGTGACAGAGAGTGAAAGAAACAAAA
GAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATCTCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCT
CTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCCTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACT
ATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTG
CCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCA
GCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAGACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCC
TCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTC
CGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCA
AGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTTTGAACTATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCT
CTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATATGGTGC
TGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAATGAGATGAACTGATCATATATTAATTTGGGTTAA
GAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4FC90JQ C 1
AF RR4FC90TF U 1
AF RR4A147JQ C 272
AF RR4A147JQD C 272
AF RR4A147TF U 272
AF RR4A147TFB U 272
AF RR4BD79TF U 25
AF RR4B569TF U 79
AF RR4F536TF U 25
AF RR4F536JQ C 25
BS 1 426 RR4FC90TF
BS 427 427 RR4BD79TF
BS 428 515 RR4FC90TF
BS 516 516 RR4BD79TF
BS 517 570 RR4FC90TF
BS 571 571 RR4BD79TF
BS 572 589 RR4FC90TF
BS 590 644 RR4BD79TF
BS 645 663 RR4F536JQ

RD RR4FC90JQ 590 0 0
GGAGCTTTCCCCAATCAATCAAAACTGAGGATCGAGTGACAGAGAGTGAAAGAAACAAAA
GAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATCTCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCT
CTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCCTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACT
ATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTG
CCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCA
GCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAGACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCC
TCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTC
CGTGGCGAGTAAGAGGTTAATGTGATCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCA
AGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTTTGAACTATTCCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCT
CTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGGGAAGAACTTTTTAATGTTC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4FC90TF 590 0 0
GGAGCTTTCCCCAATCAATCAAAACTGAGGATCGAGTGACAGAGAGTGAAAGAAACAAAA
GAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATCTCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCT
CTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCCTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACT
ATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTG
CCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCA
GCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAGACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCC
TCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTC
CGTGGCGAGTAAGAGGTTAATGTGATCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCA
AGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTTTGAACTATTCCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCT
CTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGGGAAGAACTTTTTAATGTTC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4A147JQ 319 0 0
GCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTTTCCGCCATCCTTGAGACTAA
GCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTTTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTTTT
AGGTTGGAATGGATCGACTTTTTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATTTGCC
AATTTATGAACTTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTTTCATT*GTCAACCAACTTTGAAC
TATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGA
GAAGAACTTTTTAATGTTT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4A147JQD 319 0 0
GCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTTTCCGCCATCCTTGAGACTAA
GCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTTTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTTTT
AGGTTGGAATGGATCGACTTTTTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATCTGCC
AATCTATGAACTTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTTTGAAC
TATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGA
GAAGAACTTTTTAATGTTT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4A147TF 319 0 0
GCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAGACTAA
GCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTT
AGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATCTGCC
AATCTATGAACTTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTTTGAAC
TATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGA
GAAGAACTTTTTAATGTTT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4A147TFB 319 0 0
GCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAGACTAA
GCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTT
AGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATCTGCC
AATCTATGAACTTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTTTGAAC
TATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAAGAGA
GAAGAACTTTTTAATGTTT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4BD79TF 621 0 0
GG
GAGGATCGAGTGACAGAGAGTGAAAGAAACAAAAGAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATC
TCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCC
TCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCA
GTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATC
GGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAG
ACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCC
TTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGGGGTTAATGTGAT
CTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTT
TGAACTATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTA
AGAGAGAAGAACTTTTTT*TGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAA
TGAGATGAACTGATCATA
T

QA 3 620 3 620
DS 

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CTACCTCCTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGA
AAGGATCAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTG
TCTCCATCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCA
TCCTTGAGACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCA
AGGGATCCTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTT
AATGTGATCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATTTGTCA
ACCAACTTTGAACTATTTCCAATTTGTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAG
TTCCATTAAGAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCA
AAGATAAATGAGATGAACTGATCATA
TA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4F536TF 620 0 0
GG
GAGGATCGAGTGACAGAGAGTGAAAGAAACAAAAGAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATC
TCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCC
TCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCA
GTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATC
GGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAG
ACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCC
TTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGAT
CTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTT
TGAACTATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTA
AGAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAA
TGAGATGAACTGATCATA

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR4F536JQ 639 0 0
GG
GAGGATCGAGTGACAGAGAGTGAAAGAAACAAAAGAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATC
TCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCC
TCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCA
GTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATC
GGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGAG
ACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCC
TTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGAT
CTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATT*GTCAACCAACTT
TGAACTATTTCCAGTT*GTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTA
AGAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAA
TGAGATGAACTGATCATATATTAATTTGGGTTAAGAG

QA 3 639 3 639
DS 



AS 3 12

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ATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGGTTTGGTTTG
ATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAAT
GGACTTGACACCAAGATTGAGAAGTCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCC
AAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGC
TGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAGCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTGTATCCCTTGTTTAT
GGCCCCATGTTTACTATTAGTTATCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCATTGTCACAC
TCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAAGCTTTAGAGGACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4AS03JQ C 1
AF RR4AS03TF U 1
BS 1 2 RR4AS03JQ
BS 3 643 RR4AS03TF
BS 644 647 RR4AS03JQ

RD RR4AS03JQ 647 0 0
GGAAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAAGTTTGATCTCGGA
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GGGCTTCTCTCCAGGAAACAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTC
TCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGAATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCA
ATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGGTTTGGTTTG
ATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAAT
GGACTTGACACCAAGATTGAGAAGTCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCC
AAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGC
TGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAGCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTGTATCCCTTGTTTAT
GGCCCCATGTTTACTATTAGTTATCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCATTGTCACAC
TCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAAGCTTTAGAGGACC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4AS03TF 647 0 0
GG
AAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAAGTTTGATCTCGGAGG
AATCGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAAGTTCATGACCAACGG
GCTTCTCTCCAGGAAACAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTC
AAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGAATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAAT
CTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGGTTTGGTTTGAT
CTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGG
ACTTGACACCAAGATTGAGAAGTCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAA
GAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTG
AAGAGAGCTTGCAGGAGGAGCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTGTATCCCTTGTTTATGG
CCCCATGTTTACTATTAGTTATCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCATTGTCACACTC
GTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAAGCTTTAGAG
GACC

QA 3 643 3 643
DS 



CO CL140Contig2 653 8 5 U
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TCTCGGAGGAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCTGTCACCATCAGGACCAGGAAGTT
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AGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTGAAGGA
TCCAAATGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGG
ATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCT
CATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGATT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGA
AAGAACAGGGCCAAGAAAATCC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAA
GAAGTAAGGTGTTGAAGACTAGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTCTGCATCATCGCTTCT
TTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTT
AAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATTAAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM57TF U 313
AF RR4BM57JQ C 320
AF RR4CU16JQ C 304
AF RR4DD85TF U 1
AF RR4D762TF U 2
AF RR4DD85JQ C 27
AF RR4D762JQ C 201
AF RR4B407TF U 228
BS 1 429 RR4DD85TF
BS 430 430 RR4D762TF
BS 431 639 RR4DD85TF
BS 640 647 RR4D762TF
BS 648 653 RR4D762JQ

RD RR4BM57TF 142 0 0
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ACTTTGACACCAAGATTTGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCC
AAGAAAATCCCGTGGTGTTAAG

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR4BM57JQ 191 0 0
AATGTGGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GA
CACCAAGATT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCCAAGAAAA
TCC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGGTGTTGAAGAC
TAGCAGCAGCA

QA 1 191 1 191
DS 

RD RR4CU16JQ 207 0 0
TGGTTTGATTTATGACAATGTGGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTCAT
CAGGAATGGACTT*GACACCAAGATT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAG
AACAGGGCCAAGAAAATCC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAA
GTGAGGTGTTGAAGACTAGCAGCAGCA

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4DD85TF 639 0 0
GGAGAAGCCGCAGCGAGAGAGCAAACTCGTCGATTATCACAAACGGAGAGTTCAGTGTGA
TCTCGGAGGAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCTGTCACCATCAGGACCAGGAAGTT
CATGACCAACAGATTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGGAG
AGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTGAAGGA
TCCAAATGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGG
ATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCT
CATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGATT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGA
AAGAACAGGACCAAGAAAATCC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAA
GAAGTAAGGTGTTGAAGACTAGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTCTGCATCATCGCTTCT
TTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTT
AAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4D762TF 646 0 0
GAGAAGCCGCAGCGAGAGAGCGAACTCGTCGATTATCACAAACGGAGAGTTCAGTGTGAT
CTCGGAGGAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCTGTCACCATCAGGATCAGGAAGTTC
ATGACCAACAGACTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGGAGA
GCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTGAAGGAT
CCAAATGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGA
TTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTC
ATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGATT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAA
AGAACAGGGCCAAGAAAATCC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAG
AAGTAAGGTGTTGAAGATTAGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTCTGCATCATCGCTTCTT
TATTTGGATTTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTA
AGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATT

QA 1 646 1 646
DS 

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T
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GCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGGAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAA
GGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTGAAGGATCCAAATGCAATCTTTGTTTTCAAATT
CAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGA
GAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGA
TT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGACCAAGAAAATCC*GTGG
TGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGGTGTTGAAGACTAGCAGCA
GCATTTTGGGTTTTTTTCTGCATCATCGCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTAT
CACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGA
TTTTGCTGAATACATTTATT

QA 2 621 2 621
DS 

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TCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATCTATGACA
ATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GAC
ACCAAGATT*GAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCCAAGAAAAT
CC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGGTGTTGAAGATT
AGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTCTGCATCATCGCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTG
TCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATCATGTG
CTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATTAAAAAA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4B407TF 421 0 0
G
CGAGGTGAAGGATCCAAATGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGG
CAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCC
CAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGATT*GA*AAATCAAGGAAACAG
ATTAAGGAGAAAAAGAACAGGGCCAAGAAAATCC*GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGG
TGACCCCAAGGAGAAGTAAGGTGTTGAAGACTAGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTCTGC
ATCATCGCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTT
GCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATT
T

QA 2 420 2 420
DS 



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CAGGCTTCTCTCCAGGAAACAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAAGAAGAGCCAATGT
CTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGAATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGC
AATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGGTTTGGTTT
GATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAA
TGGACTTGACACCAAGATTGAGAAGTCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGC
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TCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCATTGTCACACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTA
TATGCTTTAAAGCTTTAGAGAACCAATGTGCTAAGATCTTGCTGAATACATTTTCAAACT
TTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GN92TF U 1
AF RR4GN92JQ C 60
BS 1 667 RR4GN92TF

RD RR4GN92TF 667 0 0
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CAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAGC
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TCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCATTGTCACACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTA
TATGCTTTAAAGCTTTAGAGAACCAATGTGCTAAGATCTTGCTGAATACATTTTCAAACT
TTTTCTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4GN92JQ 608 0 0
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TCTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGAATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATG
CAATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGGTTTGGTT
TGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGA
ATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAGTCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAG
CCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAG
CAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTGTATCCCTTGTTTATGGCCCCATGTTTACTATTAGTT
ATCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCATTGTCACACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATT
ATATGCTTTAAAGCTTTAGAGAACCAATGTGCTAAGATCTTGCTGAATACATTTTCAAAC
TTTTTCTC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 2 12

CO CL141Contig1 1101 5 18 U
AAAGAAAAAAAGGAAAAAAAAGAGAGAAAAACGTGGGCCGAACATTATCAAGAGAAGAAG
CATAATAAACCCATCGTTGTGTGACAGAGTGTTGCTGTTGTTGTTGTTCCTTCCCCCTCA
TTGGAGAGAAGCAAGCGAGCGAGTCTCTTACAATCCCAGAGAGAGAGAGAGACGCGTTTG
TTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCGGTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACT
GTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCTTTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAGAATATCAGGAA
TGGATTCATCAACCTATTGTATGCGTAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGAGTGATTTTTGG
GAGTTCTTGACTCGCACGGTTTGGTGGGCAATCCCAACAATCTGGCTTCCAGTTGTCTGC
TACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACATTTCCCCAGATGGGTTTAATAGTT
GCATTTGGCGTATTCACGTGGACATTGCTCGAGTACACACTTCATCGTTTCCTTTTCCAC
ATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCATGGATGCCATCAC
AAGCACCCACAAGACGGCCTTCGTCTTGTTTTCCCTCCCACCGCAACAGCCATCCTCTTG
GTTCCACTATGGAAGCTTCTCCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCTGCTATGCTT
GGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTATCTACACCACGGT
CAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGCATCTCAAGAAATACCATCTGAACCATCACTTCAGA
ATCCAGGACAAAGGATATGGAATCACTTCTTCTCTCTGGGATAGAGTCTTTGGAACACTT
CCCGGTACAAAGGCTGCTCAGAAGAAGAAGCTCTAAACCGGATATCGATTTGCCATTTTC
TGATTCATCACGTGATTCAATGACACTGTTTAACTGATGTTGTATACGATCTGTCACCAT
ATTTTGAACATATCTAGTGGTGTGTGAACCGGTTTTATGGTGTGGTCATAGAAAAATTGA
AATCAAACTGGTTTATTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW34TF U 110
AF RR4D368TF U 110
AF RR4EH85TF U 110
AF RR4BH38TF U 1
AF RR4D670JQ C 425
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BS 139 142 RR4D368TF
BS 143 455 RR4BH38TF
BS 456 456 RR4FW34TF
BS 457 813 RR4BH38TF
BS 814 814 RR4D368TF
BS 815 821 RR4BH38TF
BS 822 822 RR4D368TF
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BS 848 851 RR4BH38TF
BS 852 853 RR4D670JQ
BS 854 861 RR4BH38TF
BS 862 862 RR4D670JQ
BS 863 867 RR4BH38TF
BS 868 1101 RR4D670JQ

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A**CGCGTTTGTTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCGGTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAG
AACGCTTCACTGTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCTTTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAG
AATATCAGGAATGGATTCATCAACCTATTGTATGCGTAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGA
GTGATTTTTGGGAGTTCTTGACTCGCACGGTTTGGTGGGCAATCCCAACAATCTGGCTTC
CAGTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACATTTCCCCAGATGG
GTTTAATAGTTGCATTTGGCGTATTCACGTGGACATTGCTCGAGTACACACTTCATCGTT
TCCTTTTCCACATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCATG
GATGCCATCACAAGCACCCATAAGACGGCCTTCGTCTTGTTTTC

QA 1 524 1 524
DS 

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AGAGGCGTTTGTTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCGGTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAG
AACGCTTCACTGTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCTTTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAG
AATATCAGGAATGGATTCATCAACCTATTGTATGCGTAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGA
GTGATTTTTGGGAGTTCTTGACTCGCACGGTTTGGTGGGCAATCCCAACAATCTGGCTTC
CAGTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACGTTTCCCCAGATGG
GTTTAATAGTTGCATTTGGCGTATTCACGTGGACACTGCTCGAGTACACTCTTCATCGTT
TCCTTTTCCACATAGAAACCAAGAGTTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCACG
GATGCCATCACAAGCACCCACAAGACGGCCTTCGTCTTGTTTTCCCTCCCACCGCAACAG
CCATCCTCTTGGTTCCACTATGGAAGCTTCTCCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTC
CTGCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTATC
TACACCACGGTCAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGCATCTCAAGAAATACCATCTGAACC
ATCACTTCAGA
TCCAGGAC

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DS 

RD RR4EH85TF 731 0 0
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AGAGGCGTTTGTTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCGGTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAG
AACGCTTCACTGTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCTTTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAG
AATATCAGGAATGGATTCATCAACCTATTGTATGCGTAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGA
GTGATTTTTGGGAGTTCTTGACTCGCACGGTTTGGTGGGCAATCCCAACAATCTGGCTTC
CAGTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGGCGTTTCCCCAGATGG
GTTTAATAGTTGCATTTGGCGTATTCACGTGGACACTGCTCGAGTACACTCTTCATCGTT
TCCTTTTCCACATAGAAACCAAGAGTTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCACG
GATGCCATCACAAGCACCCACAAGATGGCCTTCGTCTTGTTTTCCCTCCCACCGCAACAG
CCATCCTCTTGGTTCCACTATGGAAGCTTCTCCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTC
CTGCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTATC
TACACCACGGTCAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGCATCTCAAGAAATACCATCTGAACC
ATCACTTCAGA

QA 1 731 1 731
DS 

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TTGGAGAGAAGCAAGCGA****GTCTCTTACAATCCCAGAGAGAGAGAGAGACGCGTTTG
TTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCGGTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACT
GTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCTTTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAGAATATCAGGAA
TGGATTCATCAACCTATTGTATGCGTAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGAGTGATTTTTGG
GAGTTCTTGACTCGCACGGTTTGGTGGGCAATCCCAACAATCTGGCTTCCAGTTGTCTGC
TACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACGTTTCCCCAGATGGGTTTAATAGTT
GCATTTGGCGTATTCACGTGGACATTGCTCGAGTACACACTTCATCGTTTCCTTTTCCAC
ATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCATGGATGCCATCAC
AAGCACCCACAAGACGGCCTTCGTCTTGTTTTCCCTCCCACCGCAACAGCCATCCTCTTG
GTTCCACTATGGAAGCTTCTCCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCTGCTATGCTT
GGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTATCTACACCACGGT
CAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGCATCTCAAGGAATACCACCTGAACCATCACTTCAGA
*TCCAG*ACAA**GATATGGA*TCACT
TCTTCTTTC

QA 1 867 1 867
DS 

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TTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACATTTCCCCAGATGGGTTTAATAGTTGCAT
TTGGCGTATTCACGTGGACATTGCTCGAGTACACACTTCATCGTTTCCTTTTCCACATAG
AAACCAAGAGCTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCATGGATGCCATCACAAGC
ACCCACAAGACGGCCTTCGTCTTGTTTTCCCTCCCACCGCAACAGCCATCCTCTTGGTTC
CACTATGGAAGCTTCTCCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCTGCTATGCTTGGAG
GCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTATCTACACCACGGTCAAC
CTAAAGAACCAACCTTCAAGCATCTCAAGAAGTACCATCTGAACCACCACTTCAGAATCC
AGGACAAAGGATATGGAATCACTTCTTCTCTCTGGGATAGAGTCTTTGGAACACTTCCCG
GTACAAAGGCTGCTCAGAAGAAGAAGCTCTAAACCGGATATCGATTTGCCATTTTCTGAT
TCATCACGTGATTCAATGACACTGTTTAACTGATGTTGTATACGATCTGTCACCATATTT
TGAACATATCTAGTGGTGTGTGAACCGGTTTTATGGTGTGGTCATAGAAAAATTGAAATC
AAACTGGTTTATTTGCC

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL141Contig2 1011 7 29 U
GAATAGCAAATAAACCAGTTTGATTTCAATTTTTCTATGACCACACCATAAAACCGGTTC
ACACACCACTAGATATGTTCAAAATATGGTGATAGATCGTATACAACATCAGTTAAACAG
TCATTGAATCACATGATGAATCAGAAAATGGCAAATCTGATATCCGGTTTAAAGCTTCTT
CTGAGCAGCTTTCGTACCGGGAAGTGTTCCAAAGACTCTATCCCAGAGAGAAGAAGTGAT
TCCATATCCTTTGTCCTGGATTCTGAAGTGATGGTTCAGATGGTATTTCTTGAGATGCTT
GAAGGTTGGTTCTTTAGGTTGACCGTGGTGTAGATAGAAATGAGTACAATCATACATCAC
ATAGCCAAACAAAATGCCTCCAAGCATAGCAGGAGCTGTAGCAGGAGTAGCTATGAGGTG
GAGAAGCTTCCATAGTGGAACCAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGACG
AAGGCCGTCTTGTGGGTGCTTGTGATGGCATCCATGAAGAAGATAGTGTGCAGTGTTTGC
CCAGTAGCTCTTGGTTTCTATGTGGAAAAGGAAACGATGAAGTGTGTACTCGAGCAATGT
CCACGTGAATACGCCAAATGCAACTATTAAACCCATCTGGGGAAATGTCAGTCCCCTCGC
CGCGGAGATTGAAAGAACGTAGCAGACAACTGGAAGCCAGATAGTTGGGATTGCCCACCA
AACCGTGCGAGTCAAGAACTCCCAAAAATCACTCTGGAAAAAACGAGGACACTCTACGCA
TACAATAGGTTGATGAATCCATTCCTGATATTCTTCCCCAAGATGACCAACCTGAAAGAC
AAGTGGCTTATCCAAATCGACAGTGAAGCGTTCTGCGACCATCTTTGCCACCCAACTGAG
ACTCCTGGCTTAGAGGAAGAACAAACGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGGATTGTAAGAGA
ATCGCTTGCTTCTCTCCAATGAGGGGGAAGGAACAACAACAATAGCAACCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 20 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D368JQ U 1
AF RR4EH85JQ U 1
AF RR4FW34JQ U 5
AF RR4BH38JQ U 6
AF RR4CG80JQ U 22
AF RR4C095TF C 289
AF RR4D670TF C 235
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BS 145 227 RR4D368JQ
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BS 229 232 RR4D368JQ
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BS 234 278 RR4D368JQ
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BS 758 1011 RR4D670TF

RD RR4D368JQ 478 0 0
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ACACACCACTAGATATGTTCAAAATATGGTGATAGATCGTATACAACATCAGTTAAACAG
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CTGAGCAGCTTTCGTACCGGGAAGTGTTCCAAAGACTCTATCCCAGAAAGAAAAAGTGAT
TCCATATCCTTTGTCCTGGATTCTGAAGTGATGGTTCAAATGGTATTTCTTGAGATGCTT
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GAGAAGCTTCCATAGTGGAACCAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGA

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4EH85JQ 678 0 0
GAATA
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CCACTAGATATGTTCAAAATATGGTGATAGATCGTATACAACATCAGTTAAACAGTCATT
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AACTCTTGGTTTCTATGTGGAAAAGGAAACGATGAAGAGTGTACTCGAGCAGTGTCCACG
TGAATACGCCAAATGCAACTATTAAACCCATCTGGGGAAACGCCAGTCCCCTCGCCGCGG
AGATTGAAAGAAC

QA 6 678 6 678
DS 

RD RR4FW34JQ 679 0 0
G
GCAAATAAACCAGTTTGATTTCAATTTTTCTATGACCACACCATAAAACCGGTTCACACA
CCACTAGATATGTTCAAAATATGGTGATAGATCGTATACAACATCAGTTAAACAGTCATT
GAATCACATGATGAATCAGAAAATGGCAAATCTGATATCCGGTTTAAAGCTTCTTCTGAG
CAGCTTTCGTACCGGGAAGTGTTCCAAAGACTCTATCCCAGAGAGAAGAAGTGATTCCAT
ATCCTTTGTCCTGGATTCTGAAGTGATGGTTCAGGTGGTATTTCTTGAGATGCTTGAAGG
TTGGTTCTTTAGGTTGACCGTGGTGTAGATAGAAATGAGTACAATCATACATCACATAGC
CAAACAAAATGCCTCCAAGCATAGCAGGAGCTGTAGCAGGAGTAGCTATGAGGTGGAGAA
GCTTCCATAGTGGAACCAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGACGAAGGC
CGTCTTATGGGTGCTTGTGATGGCATCCATGAAGAAGATAGTGTGCAGTGTTTGCCCAGT
AGCTCTTGGTTTCTATGTGGAAAAGGAAACGATGAAGTGTGTACTCGAGCAATGTCCACG
TGAATACGCCAAATGCAACTATTAAACCCATCTGGGGAAATGTCAGTCCCCTCGCCGCGG
AGATTGAAAGAACGTAGC

QA 2 679 2 679
DS 

RD RR4BH38JQ 752 0 0
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CCACTAGATATGTTCAAAATATGGTGATAGATCGTATACAACATCAGTTAAACAGTCATT
GAATCACATGATGAATCAGAAAATGGCAAATCTGATATCCGGTTTAAAGCTTCTTCTGAG
CAGCTTTCGTACCGGGAAGTGTTCCAAAGACTCTATCCCAGAGAGAAGAAGTGATTCCAT
ATCCTTTGTCCTGGATTCTGAAGTGATGGTTCAGGTGGTATTCCTTGAGATGCTTGAAGG
TTGGTTCTTTAGGTTGACCGTGGTGTAGATAGAAATGAGTACAATCATACATCACATAGC
CAAACAAAATGCCTCCAAGCATAGCAGGAGCTGTAGCAGGAGTAGCTATGAGGTGGAGAA
GCTTCCATAGTGGAACCAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGACGAAGGC
CGTCTTGTGGGTGCTTGTGATGGCATCCATGAAGAAGATAGTGTGCAGTGTTTGCCCAGT
AGCTCTTGGTTTCTATGTGGAAAAGGAAACGATGAAGTGTGTACTCGAGCAATGTCCACG
TGAATACGCCAAATGCAACTATTAAACCCATCTGGGGAAACGTCAGTCCCCTCGCCGCGG
AGATTGAAAGAACGTAGCAGACAACTGGAAGCCAGATTGTTGGGATTGCCCACCAAACCG
TGCGAGTCAAGAACTCCCAAAAATCACTCTGG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4CG80JQ 713 0 0
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AAATATGGTGATAGATCGTATACAACATCAGTTAAACAGTCATTGAATCACATGATGAAT
CAAAAAATGGCAAATCTGATATCCGGTTTAAAGCTTCTTCTGAGCAGCTTTCGTACCGGG
AAGTGTTCCAAAGACTCTATCCCAGAGAGAAGAAGTGATTCCATATCCTTTATCCTGGAT
TCTGAAGTGATGGTTCAGATGGTATTTCTTGAGATGCTTGAAGGTTGGTTCTTTAGGTTG
ACCGTGGTGTAGATAGAAATGAGTACAATCATACATCACATAGCCAAACAAAATGCCTCC
AAGCATAGCAGGAGCTGTAGCAGGAGTAGCTATGAGGTGGAGAAGCTTCCATAGTGGAAC
CAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGACGAAGGCCGTCTTGTGGGTGCTT
GTGATGGCATCCGTGAAGAAGATAGTGTGCAGTGTTTGCCCAGTAACTCTTGGTTTCTAT
GTGGAAAAGGAAACGATGAAGAGTGTACTCGAGCAGTGTCCACGTGAATACGCCAAATGC
AACTATTAAACCCATCTGGGGAAACGTCAGTCCCCTCGCCGCGGAGATTGAAAGAACGTA
GCAGACAACTGGAAGCCAGATTGTTGGGATTGCCCACCAAACCGTGCGAGTCA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4C095TF 440 0 0
TTCTGAGATGC
TGAAGGTTGGT*CTTTAGGT*GACCGTGGTGTAGATAGAAATGAGTACAATCATACATCA
CATAGCCAAACAAAATGCCTCCAAGCATAGCAGGAGCTGTAGCAGGAGTAGCTATGAGGT
GGAGAAGCTTCCATAGTGGAACCAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGAC
GAAGGCCGTCTTGTGGGTGCTTGTGATGGCATCCATGAAGAAGATAGTGTGCAGTGTTTG
CCCAGTAGCTCTTGGTTTCTATGTGGAAAAGGAAACGATGAAGTGCGTACTCGAGCAATG
TCCACGTGAATACGCCAAATGCAACTATTAAACCCATCTGGGGAAATGTCAGTCCCCTCG
CCGCGGAGATTGAAAGAACGTAGCAGACAACTGGAAGCCAGATAGTTGGGATTGCCCACC
AAACCGTGC

QA 12 440 12 440
DS 

RD RR4D670TF 777 0 0
AGAGTGATCCATAT
CTTTGTCCTGGAT*CTGAAGTGGTGGTTCAGATGGTACTTCTTGAGATGCTTGAAGGTTG
GTTCTTTAGGTTGACCGTGGTGTAGATAGAAATGAGTACAATCATACATCACATAGCCAA
ACAAAATGCCTCCAAGCATAGCAGGAGCTGTAGCAGGAGTAGCTATGAGGTGGAGAAGCT
TCCATAGTGGAACCAAGAGGATGGCTGTTGCGGTGGGAGGGAAAACAAGACGAAGGCCGT
CTTGTGGGTGCTTGTGATGGCATCCATGAAGAAGATAGTGTGCAGTGTTTGCCCAGTAGC
TCTTGGTTTCTATGTGGAAAAGGAAACGATGAAGTGTGTACTCGAGCAATGTCCACGTGA
ATACGCCAAATGCAACTATTAAACCCATCTGGGGAAATGTCAGTCCCCTCGCCGCGGAGA
TTGAAAGAACGTAGCAGACAACTGGAAGCCAGATAGTTGGGATTGCCCACCAAACCGTGC
GAGTCAAGAACTCCCAAAAATCACTCTGGAAAAAACGAGGACACTCTACGCATACAATAG
GTTGATGAATCCATTCCTGATATTCTTCCCCAAGATGACCAACCTGAAAGACAAGTGGCT
TATCCAAATCGACAGTGAAGCGTTCTGCGACCATCTTTGCCACCCAACTGAGACTCCTGG
CTTAGAGGAAGAACAAACGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGGATTGTAAGAGAATCGCTTG
CTTCTCTCCAATGAGGGGGAAGGAACAACAACAATAGCAACCC

QA 15 777 15 777
DS 



AS 3 13

CO CL142Contig1 897 3 5 U
GGGGAGAGGATCAGAAGAAGCTTGACGTCGTCTCCAATGAGGTGTTTTCGAACTGCTTGA
GATCAAGTGGAAGAACAGGGATCATCGCGTCAGAGGAAGAGGACGTGCCTGTAGCAGTTG
AAGAGAGTTACTCCGGAAACTACATTGTCGTCTTCGATCCTCTCGACGGCTCCTCCAACA
TCGACGCCGCAGTGTCCACCGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGCA
TAGTAAACGTGTGCCAACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCA
GCTCAGTCATCTTCGTCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAA
TGTACGGCGAGTTCGTCCTGACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCT
ACTCTTTCAACGAAGGGAACTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATG
ATCTCAAGGACCCTGGTCCGAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGG
TCGGAGATTTTCACAGGACGTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGTGACGCCA
AGAGCAAAAACGGGAAGCTTAGGCTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTCATCGTTG
AACAAGCTGGAGGGAAAGGATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCAACCGACCG
AGATACATCAGAGGGTTCCGCTTTACATTGGAAGCAAAGAAGAAGTTGAGAAGCTGGAGA
AATACTTGGCTTGAGTCATGTACCAATCATAAGTCTTTTGATTTCTATTGTAAAACCATT
TTCTAAGTACATGGCACATCCCAATAGATGCATAAATAATAAAAGTTATATTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DJ47TF U 1
AF RR4DJ47JQ C 140
AF RR4GW90TF U 397
BS 1 621 RR4DJ47TF
BS 622 622 RR4GW90TF
BS 623 729 RR4DJ47TF
BS 730 896 RR4GW90TF
BS 897 897 RR4DJ47JQ

RD RR4DJ47TF 729 0 0
GGGGAGAGGATCAGAAGAAGCTTGACGTCGTCTCCAATGAGGTGTTTTCGAACTGCTTGA
GATCAAGTGGAAGAACAGGGATCATCGCGTCAGAGGAAGAGGACGTGCCTGTAGCAGTTG
AAGAGAGTTACTCCGGAAACTACATTGTCGTCTTCGATCCTCTCGACGGCTCCTCCAACA
TCGACGCCGCAGTGTCCACCGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGCA
TAGTAAACGTGTGCCAACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCA
GCTCAGTCATCTTCGTCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAA
TGTACGGCGAGTTCGTCCTGACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCT
ACTCTTTCAACGAAGGGAACTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATG
ATCTCAAGGACCCTGGTCCGAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGG
TCGGAGATTTTCACAGGACGTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGTGACGCCA
AGAGCAAAAACGGGAAGCTTACGCTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTCATCGTTG
AACAAGCTGGAGGGAAAGGATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCAACCGACCG
AGATACATC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4DJ47JQ 758 0 0
CTACATTGTCGTCTTCGATCCTCTCGACGGCTCCTCCAACATCGACGCCGCAGTGTCCAC
CGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGCATAGTAAACGTGTGCCAACC
AGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCAGCTCAGTCATCTTCGTCCT
CACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAATGTACGGCGAGTTCGTCCT
GACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCTACTCTTTCAACGAAGGGAA
CTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATGATCTCAAGGACCCTGGTCC
GAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGGTCGGAGATTTTCACAGGAC
GTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGTGACGCCAAGAGCAAAAACGGGAAGCT
TAGGCTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTCATCGTTGAACAAGCTGGAGGGAAAGG
ATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCAACCGACCGAGATACATCAGAGGGTTCC
GCTTTACATTGGAAGCAAAGAAGAAGTTGAGAAGCTGGAGAAATACTTGGCTTGAGTCAT
GTACCAATCATAAGTCTTTTGATTTCTATTGTAAAACCATTTTCTAAGTACATGGCACAT
CCCAATAGATGCATAAATAATAAAAGTTATATTTTGTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4GW90TF 500 0 0
G
GATCCCCAAAGCCGGGAAAATCTACTCTTTCAACGAAGGGAACTACCAGATGTGGGACGA
TAAACTGAAGAAGTACATGGATGATCTCAAGGACCCTGGTCCGAGCGGGAAGCCTTACTC
TGCAAGGTACATTGGTAGTTTGGTCGGAGATTTTCACAGGACGTTGTTGTACGGTGGGAT
CTACGGGTACCCACGTGACGCCAAGAGCAAAAACGGGAAGCTTAGGCTTTTGTATGAGTG
TGCACCGATGAGTTTCATCGTTGAACAAGCTGGAGGGAAAGGATCAGATGGTCACCAGAG
AGTACTAGATATCCAACCGACCGAGATACATCAGAGGGTTCCGCTTTACATTGGAAGCAA
AGAAGAAGTTGAGAAGCTGGAGAAATACTTGGCTTGAGTCATGTACCAATCATAAGTCTT
TTGATTTCTATTGTAAAACCATTTTCTAAGTACATGGCACATCCCAATAGATGCATAAAT
AATAAAAGTTATATTTTGT

QA 2 500 2 500
DS 



CO CL142Contig2 894 5 11 U
AATAAAACAGCCTATACGTCTTATATTTGACATAAGATACAGAACTTTCATCATTTATGC
ATCTATTGGGATGTGCCATGTACTCAGAAAATAGTTTACAATAGAAATCAAAAGGCTTAG
GTTTGGTACATTGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCCACTTCTTCTTTGCTTCC
AATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGATATCTAGCACTCTCTGGTG
ACCGTCTGATCCTTTCCCTCCAGCTTGCTCAACGATGAAACTCATCGGTGCACACTCATA
CAAAAGCCTAAGCTTCCCGTCTTTGCTCTTGGCGTCACGAGGGTACCCGTAGATCCCACC
GTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCGACCAAACTACCAATGTACCTTGCAGAGTAAGG
CTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCATCCATGTACTTCTTCAGTTTATCGTCCCA
CATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTAGATTTTCCCGGCTTTGGGGATCTCGATGTT
CTCCTGAGTCAGGACGAACTCGCCGTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGAGAAAACGCCTTT
GCCTAAGGTGAGGACGAAGATGACTGAGCTGGAGTACATACAGTAGCCAGCTGCTAGCAA
GTTGTTCCC*TGGTTGGCACACGTTTACTATGCACCTTTGTTCTTCTGACCCAAGAGCGG
AGATATCGTCAGAGTCTTCGACGATGCACTCGTCATTGGGGCTGTAGATACCGAAGATTG
AACCGGTGGACACTGCGGCGTCGATGTTGGAGGAGCCGTCGAGAGGATCGAAGACGACAA
TGTAGTTTCCGGGAGTAACTCTCTTCAACTGCTACAGGCACGTCCTCTTCCTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH01TF C 39
AF RR4GE07JQ U 1
AF RR4FD26JQ U 4
AF RR4FD26TF C 265
AF RR4B914JQ U 613
BS 1 315 RR4GE07JQ
BS 316 316 RR4FD26JQ
BS 317 320 RR4GE07JQ
BS 321 321 RR4FD26JQ
BS 322 351 RR4GE07JQ
BS 352 352 RR4FD26JQ
BS 353 741 RR4GE07JQ
BS 742 831 RR4B914JQ
BS 832 832 RR4FD26TF
BS 833 873 RR4B914JQ
BS 874 894 RR4FD26TF

RD RR4EH01TF 384 0 0
ACAG
AACTTTCATCATTTATGCATCTATTGGGATGTGCCATGTACTCAGAAAATAGTTTACAAT
AGAAATCAAAAGGCTTAGGTTTGGTACATTGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTC
CACTTCCTCTTTGCTTCCAATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGAT
ATCTAGCACTCTCTGGTGACCGTCTGATCCTTTCCCTCCAGCTTGCTCAACGATGAAACT
CATCGGTGCACACTCATACAAAAGCCCAAGCTTCCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCACGAGG
GTACCCGTAGATCCCACCGTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCGACCAAACTACCAAT
GCACCTTGCAGAGTAAGGC
C

QA 5 383 5 383
DS 

RD RR4GE07JQ 741 0 0
AATAAAACAGCCTATACGTCTTATATTTGACATAAGATACAGAACTTTCATCATTTATGC
ATCTATTGGGATGTGCCATGTACTCAGAAAATAGTTTACAATAGAAATCAAAAGGCTTAG
GTTTGGTACATTGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCCACTTCTTCTTTGCTTCC
AATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGATATCTAGCACTCTCTGGTG
ACCGTCTGATCCTTTCCCTCCAGCTTGCTCAACGATGAAACTCATCGGTGCACACTCATA
CAAAAGCCTAAGCTTACCGTTTTTGCTCTTGGCGTCACGAGGGTACCCGTAAATCCCACC
GTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCGACCAAACTACCAATGTACCTTGCAGAGTAAGG
CTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCATCCATGTACTTCTTCAGTTTATCGTCCCA
CATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTAGATTTTCCCGGCTTTGGGGATCTCGATGTT
CTCCTGAGTCAGGACGAACTCGCCGTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGAGAAAACGCCTTT
GCCTAAGGTGAGGACGAAGATGACTGAGCTGGAGTACATACAGTAGCCAGCTGCTAGCAA
GTTGTTCCC*TGGTTGGCACACGTTTACTATGCACCTTTGTTCTTCTGACCCAAGAGCGG
AGATATCGTCAGAGTCTTCGA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4FD26JQ 735 0 0
AAAACAGCTTATACGTCTTATATTTGACATAAGATACAGAACTTTTATCATTTATGCATC
TATTGGGATGTGCCATGTACTCAGAAAATAGTTTACAATAGAAATCAAAAGGCTTAGGTT
TGGTACATTGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCCACTTCTTCTTTGCTTCCAAT
GTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGATATCTAGCACTCTCTGGTGACC
GTCTGATCCTTTCCCTCCAGCTTGCTCAACGATGAAACTCGTCGGTGCACACTCATACAA
AAGCCTAAGCTTCCCGTCTTTGCTCTTGGCGTCACGAGGGTACCCGTAGATCCCACCGTA
CAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCGACCAAACTACCAATGTACCTTGCAGAGTAAGGCTT
CCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCATCCATGTACTTCTTCAGTTTATCGTCCCACAT
CTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTAGATTTTCCCGGCTTTGGGGATCTCGATGTTCTC
CTGAGTCAGGACGAACTCGCCGTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGAGAAAACGCCTTTGCC
TAAGGTGAGGACGAAGATGACTGAGCTGGAGTACATACAGTAGCCAGCTGCTAGCAAGTT
GTTCCC*TGGTTGGCACACGTTTACTATGCACCTTTGTTCTTCTGACCCAAGAGCGGAGA
TATCGTCAGAGTCTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4FD26TF 630 0 0
TTGCTCAACGATGAAACTCGTCGGTGCACACTCATACAAAAGCCTAAGCTTCCCGTCTTT
GCTCTTGGCGTCACGAGGGTACCCGTAGATCCCACCGTACAACAAAGTCCTGTGAAAATC
TCCGACCAAACTACCAATGTACCTTGCAGAGTAAGGCTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTT
GAGATCATCCATGTACTTCTTCAGTTTATCGTCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAA
AGAGTAGATTTTCCCGGCTTTGGGGATCTCGATGTTCTCCTGAGTCAGGACGAACTCGCC
GTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGAGAAAACGCCTTTGCCTAAGGTGAGGACGAAGATGAC
TGAGCTGGAGTACATACAGTAGCCAGCTGCTAGCAAGTTGTTCCC*TGGTTGGCACACGT
TTACTATGCACCTTTGTTCTTCTGACCCAAGAGCGGAGATATCGTCAGAGTCTTCGACGA
TGCACTCGTCATTGGGGCTGTAGATACCGAAGATTGAACCGGTGGACACTGCGGCGTCGA
TGTTGGAGGAGCCGTCGAGAGGATCGAAGACGACAATGTAGTTTCCGG*AGTAACTCTCT
TCAACTGCTACAGGCACGTCCTCTTCCTCC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4B914JQ 261 0 0
GACGAAGATGACTGAGCTGGAGTACATACAGTAGCCAGCTGCTAGCAAGTTGTTCCCCTG
GTTGGCACACGTTTACTATGCACCTTTGTTCTTCTGACCCAAGAGCGGAGATATCGTCAG
AGTCTTCGACGATGCACTCGTCATTGGGGCTGTAGATACCGAAGATTGAACCGGTGGACA
CTGCGGCGTCGATGTTGGAGGAGCCGTCGAGAGGATCGAGGACGACAATGTAGTTTCCGG
GAGTAACTCTCTTCAACTGCT

QA 1 261 1 261
DS 



CO CL142Contig3 1132 5 19 U
GGCTGCAGACGCTGACGAGCTGGTTGCTTAGACAAGAGCAGAAAGTAGAGATAGATACGG
AGCTGACGATAGTGATGTCTAGCATAGCGATGGCTTGTAAGCAGATCGCTTCTCTTGTAC
AGCGCGCTGGAATGTCTAACCTGACCGGCGTTCAAGGAGCCGTTAACGTTCAGGGAGAGG
ATCAGAAGAAGCTTGACGTCGTCTCCAATGAGGTGTTTTCGAACTGCTTGAGATCAAGTG
GAAGAACAGGGATCATCGCGTCAGAGGAAGAGGACGTGCCTGTAGCAGTTGAAGAGAGTT
ACTCCGGAAACTACATTGTCGTCTTCGATCCTCTCGACGGCTCCTCCAACATCGACGCCG
CAGTGTCCACCGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGCATCGTCGAAG
ACTCTGACGATATCTCCGCTCTTGGGCCAGAAGAACAAAGGTGCATAGTAAACGTGTGCC
AACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCAGCTCAGTCATCTTCG
TCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAATGTACGGCGAGTTCG
TCCTTACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCTACTCTTTCAACGAAG
GGAACTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATGATCTCAAGGACCCTG
GTCCGAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGGTCGGAGATTTCCACA
GGACGTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGTGACGCCAAGAGCAAAAACGGGA
AGCTTAGGCTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTCATCGTTGAACAAGCTGGAGGGA
AAGGATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCAACCGACCGAGATACATCAGAGGG
TTCCGCTTTACATTGGAAGCAAAGAAGAAGTTGAGAAGCTGGAGAAATACTTGGCTTGAG
TCATGTACCAATCATAAGTCTTTTGATTTCTATTGTAAAACCATTTTCTAAGTACATGGC
ACATCCCAATAGATGCATAAATAATAAAAGTTATATTTTGTTATCTTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CS91TF U 457
AF RR4GE07TF U 1
AF RR4CQ50TF U 211
AF RR4CS91JQ C 354
AF RR4CQ50JQ C 406
BS 1 446 RR4GE07TF
BS 447 447 RR4CQ50TF
BS 448 604 RR4GE07TF
BS 605 605 RR4CQ50TF
BS 606 663 RR4GE07TF
BS 664 664 RR4CQ50TF
BS 665 735 RR4GE07TF
BS 736 736 RR4CQ50TF
BS 737 772 RR4GE07TF
BS 773 825 RR4CQ50TF
BS 826 826 RR4CS91JQ
BS 827 834 RR4CQ50TF
BS 835 835 RR4CS91JQ
BS 836 847 RR4CQ50TF
BS 848 848 RR4CS91JQ
BS 849 886 RR4CQ50TF
BS 887 887 RR4CS91JQ
BS 888 937 RR4CQ50TF
BS 938 1132 RR4CS91JQ

RD RR4CS91TF 105 0 0
AAAGGTGCATAGTAAACGTGTGCCAACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTA
TGTACTCCAGCTCAGTCATCTTCGTCCTCACCTTAGGCAAAGGCG

QA 1 105 1 105
DS 

RD RR4GE07TF 772 0 0
GGCTGCAGACGCTGACGAGCTGGTTGCTTAGACAAGAGCAGAAAGTAGAGATAGATACGG
AGCTGACGATAGTGATGTCTAGCATAGCGATGGCTTGTAAGCAGATCGCTTCTCTTGTAC
AGCGCGCTGGAATGTCTAACCTGACCGGCGTTCAAGGAGCCGTTAACGTTCAGGGAGAGG
ATCAGAAGAAGCTTGACGTCGTCTCCAATGAGGTGTTTTCGAACTGCTTGAGATCAAGTG
GAAGAACAGGGATCATCGCGTCAGAGGAAGAGGACGTGCCTGTAGCAGTTGAAGAGAGTT
ACTCCGGAAACTACATTGTCGTCTTCGATCCTCTCGACGGCTCCTCCAACATCGACGCCG
CAGTGTCCACCGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGCATCGTCGAAG
ACTCTGACGATATCTCCGCTCTTGGGTCAGAAGAACAAAGGTGCATAGTAAACGTGTGCC
AACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCAGCTCAGTCATCTTCG
TCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAATGTACGGCGAGTTCG
TCCTGACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCTACTCTTTCAACGAAG
GGA*CTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATGATCTCAAGGACCCTG
GTCCGAGCGGGAAGC*TTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGGTCGGAGA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CQ50TF 742 0 0
GGGTGTTT
TCGAACTGCTTGAGATCAAGTGGAAGAACAGGGATCATCGCGTCAGAGGAAGAGGACGTG
CCTGTAGCAGTTGAAGAGATTTACTCCGGAAACTACATTGTCGTCTTCGATCCTCTCGAC
GGCTCCTCCAACATCGACGCCGCAGTGTCCACCGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCC
AATGACGAGTGCATCGTCGAAGACTCTGACGATATCTCCGCTCTTGGGCCAGAAGAACAA
AGGTGCATAGTAAACGTGTGCCAACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATG
TACTCCAGCTCAGTCATCTTCGTCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTC
GACCCAATGTACGGCGAGTTCGTCCTTACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGG
AAAATCTACTCTTTCAACGAAGGGAACTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTAC
ATGGATGATCTCAAGGACCCTGGTCCGAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGT
AGTTTGGTCGGAGATTTCCACAGGACGTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGT
GACGCCA*GAGCAAAA*CGGGAAGCTTAG*CTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTC
ATCGTTGA*CAAGCTGGAGGGAAAGGATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCA
CCGACGAGATACATC

QA 9 727 9 727
DS 

RD RR4CS91JQ 779 0 0
GACGCCGCAGTGTCCACCGGTTCAATCTTCGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGCATC
GTCGAAGACTCTGACGATATCTCCGCTCTTGGGCCAGAAGAACAAAGGTGCATAGTAAAC
GTGTGCCAACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCAGCTCAGTC
ATCTTCGTCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAATGTACGGC
GAGTTCGTCCTTACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCTACTCTTTC
AACGAAGGGAACTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATGATCTCAAG
GACCCTGGTCCGAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGGTCGGAGAT
TTCCACAGGACGTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGTGACGCCAAGAGCAAA
AACGGGAAGCTTAGGCTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTCATCGTTGAACAAGCT
GGAGGGAAAGGATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCAACCGACCGAGATACAT
CAGAGGGTTCCGCTTTACATTGGAAGCAAAGAAGAAGTTGAGAAGCTGGAGAAATACTTG
GCTTGAGTCATGTACCAATCATAAGTCTTTTGATTTCTATTGTAAAACCATTTTCTAAGT
ACATGGCACATCCCAATAGATGCATAAATAATAAAAGTTATATTTTGTTATCTTATTCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4CQ50JQ 727 0 0
AGTGCATCGTCGAAGACTCTGACGATATCTCCGCTCTTGGGCCAGAAGAACAAAGGTGCA
TAGTAAACGTGTGCCAACCAGGGAACAACTTGCTAGCAGCTGGCTACTGTATGTACTCCA
GCTCAGTCATCTTCGTCCTCACCTTAGGCAAAGGCGTTTTCTCCTTCACCCTCGACCCAA
TGTACGGCGAGTTCGTCCTTACTCAGGAGAACATCGAGATCCCCAAAGCCGGGAAAATCT
ACTCTTTCAACGAAGGGAACTACCAGATGTGGGACGATAAACTGAAGAAGTACATGGATG
ATCTCAAGGACCCTGGTCCGAGCGGGAAGCCTTACTCTGCAAGGTACATTGGTAGTTTGG
TCGGAGATTTCCACAGGACGTTGTTGTACGGTGGGATCTACGGGTACCCACGTGACGCCA
AGAGCAAAAACGGGAAGCTTAGGCTTTTGTATGAGTGTGCACCGATGAGTTTCATCGTTG
AACAAGCTGGAGGGAAAGGATCAGATGGTCACCAGAGAGTACTAGATATCCAACCGACCG
AGATACATCAGAGGGTTCCGCTTTACATTGGAAGCAAAGAAGAAGTTGAGAAGCTGGAGA
AATACTTGGCTTGAGTCATGTACCAATCATAAGTCTTTTGATTTCTATTGTAAAACCATT
TTCTAAGTACATGGCACATCCCAATAGATGCATAAATAATAAAAGTTATATTTTGTTATC
TTATTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 12

CO CL143Contig1 1060 12 18 U
GGGAAGCTATTCTGGCTTGAGAAGAAAGAAAACCCCTTTCTCCGATCCTTGTTAAATCGC
GACAGAGAGAGGAGCAAACAACAGTTGAAGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGA
TACGATCTCTCAGTCACGACCTTCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCC
GCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTA
ATGGGTGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATC
CATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAA
ATTGTTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTA
CCTGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGG
TGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAG
TTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAA
GGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAA
GAAGGCGTTATTGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAAGACAAG
GCTTTTGAATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCCAAAAGAGAGCACCAGAAGGTC
CCTGATGATCTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGAT
GCTGACTAAACTGATGAAA*TGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATGATGCATCGTTTGG
TGTTTCTGTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGGGCAAATCGCTGCATTTTCTCA
TGAACCTTTCGGACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTGAACTCTCGAGTTA
TTGTTGTTGCAGTTTTTTCTCAAACGTTCTAGTTTCCACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 25 55 55 40 55 55 55 55 55 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 35 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 25 55 55 55 55 55 40 15 
55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 50 50 50 50 20 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD69TF U 1
AF RR4HA75TF U 1
AF RR4AU75TF U 81
AF RR4CH05TF U 293
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AF RR4GS58TF U 173
AF RR4GS58JQ C 383
AF RR4GU30JQ C 307
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BS 376 395 RR4DD69TF
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BS 397 434 RR4DD69TF
BS 435 437 RR4HA75TF
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BS 450 450 RR4AU75TF
BS 451 535 RR4HA75TF
BS 536 712 RR4AU75TF
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BS 778 855 RR4AW55TF
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BS 957 957 RR4DD69JQ
BS 958 1060 RR4HA75JQB

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GCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTA
ATGGGTGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATC
CATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAA
ATTGTTGCACGTGCCAAATCTGAAGCCAGAAGCTACGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTA
CCTGTGAAGGAACT

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DS 

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GACAGAGAGAGGAGCAAACAACAGTTGAAGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGA
TACGATCTCTCAGTCACGACCTTCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCC
GCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTA
ATGGGTGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATC
CATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAA
ATTGTTGCACGTGCCAAATCTGAAGCCAGAAGCTACGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTA
CCTGTGAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCGAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGG
TGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGAC

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DS 

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GG
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TCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTG
GAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGGTGTGGAGAAGCTCATTG
CATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTG
GCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTG
AAGCCAGAAGCCATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCAGAGC
GTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTG
GAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCG
GTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGG
AAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTTGCAA
AAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCA
GAGA

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DS 

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GGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCG
ACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCAGAACGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGTACTC
TCTATTGGCGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATG
GACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAA
TTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGA
CATGCAAAGAAG*CGTTATTGAAGTTGCAAAA*TCATTTACAAGCTACACGATGAAGC*A
AAGACA**GCTTTG**ATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAG*AGTCAAAA
GAGAGCA

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DS 

RD RR4GU30TF 517 0 0
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TCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATTGTTGCACG
TGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAGGA
ACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCC
TTTTGGTTGTGGAGCCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTACATGAT
TGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGC
TGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTAT
TGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAAGACAAGGCTTTTGAATT
GGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCCAAA
GAGAGC

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DS 

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GGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATG
GGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCG
ACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTC
TCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGCCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATG
GACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAA
TTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGA
CATGCAAAGAAG*CGTTATTGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCA
*AGACAA*GCTTTTGAATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGG

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DS 

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GAGCCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCG
GTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGG
AAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTTGCAA
AAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAAGACAAGGCTTTTGAATTGGAGATGAGCT
GGATTTGCGAGGAGTCCAAAAGAGAGCACCAGAAGGTCCCTGA

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DS 

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GCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTG
AAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCTT
AGGCCTTTTGGTTGTGGAGCCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTAC
ATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAA
CAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGC
GTTATTGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAAGACAAGGCTTTT
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DS 

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GG
AGTTGAAGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGATCTCTCAGTCACGACCT
TCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTG
GAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGGTGTGGAGAAGCTCATTG
CATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTG
GCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTG
AAGCCAGAAGCCATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCAGAGC
GTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTG
GAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCG
GTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGG
AAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTTGCAA
AAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAGAGACAAGGCTTTTGAATTGGAGATGAGCT
GGATTTGCGAGGAGTCCAAAAGAGAGCACCAGAAAGTCCCTGATGATCTTCTAGAAGAAG
CAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTGAT
GAAATGGGTCAA

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DS 

RD RR4EV85JQ 447 0 0
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CATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCGGTAT
TTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAAT
TGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTTGCAAAAAT
CATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAAGACAAGGCTTTTGAATTGGAGATGAGCTGGAT
TTGCGAAGAGTCAAAAAGAGAGCACCAGAAGGTCCCTGATGATCTTCTAGAAGAAGCAAA
GACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTGATAAAAATGGGTC
AAAATTAGATATTGTGTAATGATGCAT

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4HA75JQB 751 0 0
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CGTGCCAAATCTGAAGCCAGAAGCTACGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAG
GAACTTTCGGAGCGTGTTGCGAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCTTAGG
CCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAATTGTACATG
ATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAA
GCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTT
ATTGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACGCGATGAAGCCAAAGACAAGGCTTTTGAA
TTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCCAAAAGAGAGCACCAGAAGGTCCCTGATGAT
CTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGATGCTGACTAA
ACTGATGAAA*TGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATGATGCATCGTTTGGTGTTTCTGT
TGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGGGCAAATCGCTGCATTTTTTCATGAACCTTT
CGGACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTGAACTCTCGAGTTATTGTTGTTG
CAGTTTTTTCTCAAACGTTCTAGTTTCCACC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4DD69JQ 571 0 0
ATA
CACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAA
AGATGGACCCCAATTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGC
TGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGA
GATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGATGA
AGCCAAAGACAATGCTTTTGAATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCCAAAAGAGA
GCACCAGAAGGTCCCTGATGATCTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCT
TGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTGATGAAA*TGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATG
ATGCATCGTTTGGTGTTTCTGTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGGGCAAATCG
CTGCATTTTCTCATGAACCTTTCGGACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTG
AACTCTCGAGTTATTGTTGTTGCAGTT
C

QA 4 570 4 570
DS 



AS 1 14

CO CL144Contig1 793 14 20 U
GGGGGAACGAGTGGCAAGGAAATATCTGAAAGGACGAACATCAAGAAAATCTGAAATTCG
ATCTATAGAGAGGGAAAAAGAATCAGATTTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGTTACTTTCGCG
TTTGATCTTGAAAGACTCAAATGAATCCTCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCG
TTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGG
AACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCT
CTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTG
AGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTG
CTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGT
GCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGGAAGGATCAGACTATT
ACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGTACTGATTCAGAGAGAT
ATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCCCATCATCTTCTTCTCCGTTCTTCT
GTACAATTATCTATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTTTAGTATGATCTTGTTTTTTTTT
T*ACAATACAATAATATAAAAAA*GGATATGACTTTATGCCGAATGTCTTCAGTAAGCTT
TCATGAGATATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 65 40 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 
65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DA65TF U 73
AF RR4GT10TF U 73
AF RR4B473JQ C 95
AF RR4F626TF U 1
AF RR4DA65JQ C 73
AF RR4F626JQ C 84
AF RR4GT10JQ C 73
AF RR4EV79JQ C 105
AF RR4B473TF U 394
AF RR4EV79TF U 105
AF RR4B450JQ C 100
AF RR4B450TF U 279
AF RR4BB60TF U 100
AF RR4BB60JQ C 100
BS 1 72 RR4F626TF
BS 73 74 RR4DA65TF
BS 75 450 RR4F626TF
BS 451 451 RR4GT10TF
BS 452 598 RR4F626TF
BS 599 599 RR4B450TF
BS 600 685 RR4F626TF
BS 686 686 RR4B450TF
BS 687 691 RR4F626TF
BS 692 692 RR4B450TF
BS 693 720 RR4F626TF
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BS 722 725 RR4F626TF
BS 726 726 RR4B450TF
BS 727 730 RR4F626TF
BS 731 731 RR4B450TF
BS 732 745 RR4F626TF
BS 746 746 RR4B450TF
BS 747 756 RR4F626TF
BS 757 793 RR4B450TF

RD RR4DA65TF 283 0 0
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AATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACT
TCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCG*CATCAAGGGTT
G

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DS 

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TTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGA
AATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACT
TCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATT
CGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGAC
AGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGC
TTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGGAAG

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DS 

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GG
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TTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCC
GATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGT
TCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTTTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTT
CTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGCATGGTGCACCGCTTTGTCCTT
GCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTG
TTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTTTTAACTCC*TGACAATGAT
TTCGCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATG
TGAGAAGTACTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCC
CATCATCTTCT

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DS 

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TTTGATCTTGAAAGACTCAAATGAATCCTCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCG
TTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGG
AACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCT
CTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTG
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CTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCTTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGT
GCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGGAAGGATCAGACTATT
ACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGTACTGATTCAGAGAGCT
ATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCCCATCATCTTCTTCTCCGTTCTTCT
GTACAATTATCTATTTCCCTTGTCG*ATAAA*TA*CTTTAGTATGATCTTGTTTTTTTTT
**ACA*TACA*TAATATAAAAAA*G*ATATGACTTT

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DS 

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TTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATAGGAGA
AATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACT
TCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATT
CGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGAC
AGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGC
TTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGGAAGGATCAGACTATTGCCTCAGAGGAA
ATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGTACTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAA
TGCATCCCTGTACATTGATACCCCCATCATCTTCTTCTCCGTTCTTCTGTACAATTATCT
ATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTTTAGTATGATCTTGTTTTTTTTT**ACAATACAAT
AATATAAAAAA*GGATATGACTTTATGCCG

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DS 

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AATCCTCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCC
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ATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGAC
AAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCA
CCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGG
AACTGTCTTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACT
CC*TGACAATGATTTCGCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAAC
AACAGCTCACATGTGAGAAGTACTGATTCAGAGAGCTATGTATCACCAATGCATCCCTGT
ACATTGATACCCCCATCATCTTTTTTTCCGTTTTTCTGTACAATTATCTATTTCCCTTGT
CGGATAAAATA*CTTTAGTATGATCTTGTTTTTTTTTT*ACAATACAATAATATAAAAAA
*GGATATGACTTT

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DS 

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AGACTCAAATGAATCCTCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCAC
TTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGA
AATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACT
TCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATT
CGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGAC
AGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGC
TTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAA
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TGCATCCCTGTACATTGATACCCCCATCATCTTCTTCTCCGTTCTTCTGTACAATTATCT
ATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTTTAGTATGATCTTGTTTTTTTTT**ACAATACAAT
AATATAAAAAA*GGATATGACTTT

QA 1 684 1 684
DS 

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G
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GTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTA
TCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGC
AGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCA
TCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATT
ATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGA
GAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGG
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CTTTTCCGTTTTTCTGTACAATTATCTATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTTTAGTATG
ATCTTGTTTTTTTTTT*ACAATACAATAATATAAAAA**GGATATGACT
GT

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DS 

RD RR4B473TF 363 0 0
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GTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCCCTGACAAT
GATTTCGCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCAC
ATGTGAGAAGTACTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATAC
CCCCATCATCTTCTTCTCCGTTCTTCTGTACAATTATCTATTTCCCTTGTCGGATAAAAA
AACTTTAGTATGATCTTGTTTTTTTTTTTACAATACAATAATATAAAAAA*GGATATGAC
TTT

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR4EV79TF 657 0 0
G
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GTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTA
TCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGC
AGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCA
TCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATT
ATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGA
GAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTCGCTGGG
AAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGTA
CTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCCCATCATCTT
CTTCTCCGTTCTTCTGTACAATTATCTATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTTTAGTATG
ATCTTGTTTTTTTTTT*ACAATACAATAATATAAAAA**GGATATGACT
GTAAAAA

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4B450JQ 694 0 0
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CGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGAT
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GCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGA
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CCGAATGTCTTCAGTAAGCTTTCATGAGATATAG

QA 1 694 1 694
DS 

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GTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGC
AGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTT
CCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTT
CGCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTG
AGAAGTACTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCCCA
TCATCTTCTTCTCCGTTCTTCTGTACAATTATCTATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTT
TAGTATGATCTTGTTTTTTTTTT*ACAATACAATAATATAAAAAAAGGATATGACTTTAT
GCCGAATGTCTTCAGTAAGCTTTCATGAGATATAG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4BB60TF 694 0 0
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CGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGAT
TTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCT
CGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTG
TCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCA
GACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTC
CAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTC
GCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGA
GAAGTACTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCCCAT
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CCGAATGTCTTCAGTAAGCTTTCATGAGATATAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BB60JQ 694 0 0
GAAGAAGAAGTTACTTTCGCGTTTGATCTTGAAAGACTCAAATGAATCCTCAAGCTGTTT
CGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGAT
TTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCT
CGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTG
TCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCA
GACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTC
CAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCC*TGACAATGATTTC
GCTGGGAAGGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGA
GAAGTACTGATTCAGAGAGATATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCCCCAT
CATCTTCTTCTCCGTTTTTCTGTACAATTATCTATTTCCCTTGTCGGATAAAATA*CTTT
AGTATGATCTTGTTTTTTTTTT*ACAATACAATAATATAAAAAA*GGATATGACTTTATG
CCGAATGTCTTCAGTAAGCTTTCATGAGATATAG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 13

CO CL145Contig1 923 13 12 U
GCATACAATAACCGTATGTTTAATTCCATTATAAACCGTTGGTTACATCACAAACTTGGT
GTTGTCACAAGGATTCTTAACATACATACAATAACCACATGTCTTATTTCATATAAACCG
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ATTATTTCACATTTTAGAACAAAGGGAACATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGG
AGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAGAA
CCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGTTGATACACGAAACAGAGG
AGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGC
TATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGT
GGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGC
TGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGGAGAGAAAGTTACTG
GAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGATGTCAAGATTCAGACACGAGTCTT
GTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCACTTCCGGCTCCGATCTTAGCCGGTA
TTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCTGCTATGTCTACGACTGCTTTGC
CTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGACGGCTGAGAGAACGGTGAGAGTGG
TTAAACAGAGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGTTTGTGGTGTGTCTTGTCTAGATAG
CTTATCTTTTGTATGCGTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 0 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 
75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO90JQ U 84
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AF RR4FT55JQ U 84
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AF RR4DY29TF C 283
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AF RR4BF63TF C 227
BS 1 645 RR4BF63JQ
BS 646 646 RR4BT61JQ
BS 647 694 RR4BF63JQ
BS 695 695 RR4BT61JQ
BS 696 815 RR4BF63JQ
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BS 828 828 RR4DY29JQ
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BS 870 897 RR4BT61JQ
BS 898 914 RR4BT61TF
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GGGAACATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTT
TGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCA
TCGATCTCTAGACCCACGTTGATACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGC
TTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCA
CCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAG

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DS 

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TGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAA
GAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGTTGATACACGAAACAG
AGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACG
AGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGG
AGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGA
GGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGG

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DS 

RD RR4A642JQ 474 0 0
G
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ACAAGCATTCTCCAACCATAATACAAGATACAATTATTTCACATTTTAGAACAAAGGGAA
CATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAA
CTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGAT
CTCTAGACCCACGTTGATACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTA
AGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAAT
GCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGG
GCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGA

QA 2 474 2 474
DS 

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GGGAACATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTT
TGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAAAACCAAACGTCCCACTCCAAGATCA
TCGATCTCTAAACCCACGTTGATACACGAAACAAAGGAAATAACCGGACAATACATAAGC
TTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCA
CCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAAAT
TCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAAAGCTGGACA
TCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGGAGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAA

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4BF63JQ 815 0 0
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GTTGTCACAAGGATTCTTAACATACATACAATAACCACATGTCTTATTTCATATAAACCG
TTGGTTACATCACAACTTTGGTATGATCACAAGCATTCTCCAACCATAATACAAGATACA
ATTATTTCACATTTTAGAACAAAGGGAACATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGG
AGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAGAA
CCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGTTGATACACGAAACAGAGG
AGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGC
TATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGT
GGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGC
TGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGGAGAGAAAGTTACTG
GAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGATGTCAAGATCCAGACACGAGTCTT
GTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCGCTTCCGGCTCCGATCTTAGCCGGTA
TTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCTGCTATGTCTACGACTGCTTTGC
CTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAG

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DS 

RD RR4BT61JQ 814 0 0
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TGATCACAAGCATTCTCCAACCATAATACAAGATACAATTATTTCACATTTTAGAACAAA
GGGAACATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTT
TGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAAAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCA
TCGATCTCTAGACCCACGTTGATGCACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGC
TTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCA
CCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAAAT
TCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACA
TCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGGAAAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAAAAAAAAGGAGAT
GATGACTGTATGATGTCAAGATTCAAACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAA
GGGATAAGACCACTTCCGGCTCCGATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGAC
TGAACTGGATGTCCTGCTATGTCTACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAA
GCTGCGGCCAAGACGGCTGAGAGA*CGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTC
ATTAG*TTAGAGTTTGTGGTGTGTCTTGTCTAGA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4DY29JQ 814 0 0
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TGATCACAAGCATTCTCCAACCATAATACAAGATACAATTATTTCACATTTTAGAACAAA
GGGAACATCCTCCAACGAGGCCTGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTT
TGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCA
TCGATCTCTAGACCCACGTTGATACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGC
TTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCA
CCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAAAT
TCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACA
TCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGGAGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGAT
GATGACTGTACGATGTCAAGATTCAGACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAA
GGGATAAGACCACTTCCGGCTCCGATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGAC
TGAACTGGATGTCCTGCTATGTCTACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAA
GCTGCGGCCAAGACGGCTGAGAGAACGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTC
ATTAG*TTAGAGTTTGTGGTGTGTCTTGTCTAGA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4A642TF 674 0 0
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ATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGTTGAT
ACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTTCTTG
AATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCTTCCT
CAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCGTGGA
ATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGG
AGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGATGTCAAGATT
CAGACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCACTTCCGGCTCC
GATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCTGCTATGTC
TACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGACGGCTGAGAG
AACGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGTTTGTGGTGTG
TCTTGTCTAGAT
CC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4DY29TF 618 0 0
ATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGT
TGATACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTT
CTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCT
TCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCG
TGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGA
GCGGAGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGATGTCAA
GATTCAGACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCACTTCCGG
CTCCGATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCTGCTA
TGTCTACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGACGGCTG
AGAGAACGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGTTTGTGG
TGTGTCTTGTCTAGAT
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4BT61TF 788 0 0
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ACATTT*AGAACAAAGGGAACATCCTCCAACGAGGC*TGAGATGACAGTTGGAGTTTGAA
TCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAGCAAAAGATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGT
CGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGTTGATGCACGAAACAGAGGAGATAACC
GGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCT
TTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATT
CTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTA
GTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGGAGAGAAAGTTACTGGAAGGCCT
GAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTATGATGTCAAGATTCAGACACGAGTCTTGTGTGTTT
ACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCACTTCCGGCTCCGATCTTAGCCGGTATTATGTAG
TATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCTGCTATGTCTACGACTGCTTTGCCTGGTAGA
GCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGACGGCTGAGAGAACGGTGAGAGTGGTTAAACAG
AGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGTTTGTGGTGTGTCTTGTCTAGATAGCTTATCTT
TTGTAT
CC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4H155TF 698 0 0
CGAGGC*TGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAGCA
AAAGATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCC
ACGTTGATACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCA
TCTTCTTGAATCTGAAACGAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAG
CTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAA
ACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTG
TTGAGCGGAGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGATG
TCAAGATTCAGACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCACTT
CCGGCTCCGATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCT
GCTATGTCTACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGACG
GCTGAGAGAACGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGTTT
GTGGTGTGTCTTGTCTAGATAGCTTATCTTTTGTAT
CC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FT55TF 765 0 0
TCTCCA*CCATA*TACAAGATACAATA**TTCACATTT*AGAACAAAGGGAACATC*TCC
AACGAGGCGTGAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAG
CAAAAGATTGATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGAC
ACACGTTGATACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTC
CATCTTCTTGAATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAA
AGCTCTTCCTCAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACC
AAACCGTGGAATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGG
TGTTGAGCGGAGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGA
TGTCAAGATTCAGACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCAC
TTCCGGCTCCGATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTC
CTGCTATGTCTACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGA
CGGCTGAGAGAACGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGT
TTGTGGTGTGTCTTGTCTAGATAGCTTATCTTTTGTAT
GCGTCGC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4BF63TF 697 0 0
GAGATGACAGTTGGAGTTTGAATCATCATAAGCCCTTTGAAACTTCACAGCAAAAGATTG
ATCATTGCTAAGAACCAAACGTCGCACTCCAAGATCATCGATCTCTAGACCCACGTTGAT
ACACGAAACAGAGGAGATAACCGGACAATACATAAGCTTGTAAGCATCTCCATCTTCTTG
AATCTGAAACAAGCTATTCCCTTTACCTTTCTCACCACCAATGCTCACAAAGCTCTTCCT
CAGTTGCACGGAGTGGTTGATTCTCCACACTTTAGATTCAGGGCATAACCAAACCGTGGA
ATCAAACTCGAGGCTGAGGCTAGTTGAGAGCTGGACATCCTTGGCTTTGGTGTTGAGCGG
AGAGAAAGTTACTGGAAGGCCTGAGAAAAAAGGAGATGATGACTGTACGATGTCAAGATC
CAGACACGAGTCTTGTGTGTTTACATTTCGGCTTGAAGGGATAAGACCGCTTCCGGCTCC
GATCTTAGCCGGTATTATGTAGTATTGGACATTGGACTGAACTGGATGTCCTGCTATGTC
TACGACTGCTTTGCCTGGTAGAGCATTGGCGGCAGAAGCTGCGGCCAAGACGGCTGAGAG
AACGGTGAGAGTGGTTAAACAGAGAGTAAGCATCTTCATTAGGTTAGAGTTTGTGGTGTG
TCTTGTCTAGATAGCTTATCTTTTGTATGCGTATCCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 14

CO CL146Contig1 859 14 17 U
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACG
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTC
CAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCAC
CTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGG
ATTGTTCTTGTGTTTTCTTTCGGTTTCTCAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAAC
ATCATCTCTTAAAAGTTTTGTTTCTTTCTTATGCTGAGATCCCAAAAACTCATATAGCAA
TAATATCTTACATTGCCAG


BQ
25 40 40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 30 30 30 30 30 30 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 60 60 55 55 55 55 40 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 25 45 45 45 45 25 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CG10TF U 1
AF RR4DM12TF U 1
AF RR4DV42TF U 2
AF RR4DL23TF U 1
AF RR4GT75TF U 7
AF RR4E619TF U 10
AF RR4DM12JQ C 59
AF RR4F734TF U 1
AF RR4DV42JQ C 2
AF RR4E619JQ C 17
AF RR4F734JQ C 272
AF RR4GT75JQ C 29
AF RR4CG10JQ C 27
AF RR4DL23JQ C 268
BS 1 100 RR4CG10TF
BS 101 101 RR4DL23TF
BS 102 184 RR4CG10TF
BS 185 185 RR4DL23TF
BS 186 514 RR4CG10TF
BS 515 531 RR4DL23TF
BS 532 532 RR4DM12TF
BS 533 736 RR4DL23TF
BS 737 742 RR4F734TF
BS 743 743 RR4E619TF
BS 744 773 RR4F734TF
BS 774 774 RR4DV42JQ
BS 775 778 RR4F734TF
BS 779 779 RR4DV42JQ
BS 780 793 RR4F734TF
BS 794 806 RR4DV42JQ
BS 807 859 RR4CG10JQ

RD RR4CG10TF 514 0 0
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACTACGTCGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTAGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACG
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4DM12TF 567 0 0
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACG
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4DV42TF 678 0 0
GGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACG
TTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAGG
AGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGC
TCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGC
TCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACC
GTTACGGTCTTCTCGATGAGA********AAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTG
AGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGA
TTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGA
ACATTCCTTCGTCCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATCGACTTTGCTCTGACCA
GTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAAAGGGATGAGAAGTCTGCCTCC
AAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACC
TGTTTTAGCTATGGAGCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4DL23TF 736 0 0
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGCTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACG
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTACTCTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTC
CAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCAC
CTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGG
ATTGTTCTTGTGTTTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4GT75TF 732 0 0
CCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACGTTTGC
TACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAGGAGCGT
CTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTGG
AGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGCTCGAC
GAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTAC
GGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAAT
TTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCAT
CACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATT
CCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCC
TTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAA
AGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTT
TAGCTATGGAGCA*TCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGCTATTTCTCAGTGGATTGTT
CT*GTGTTTTCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4E619TF 743 0 0
AGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACGTTTGCTAC
TACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTC
GACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTGGAGA
GTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGCTCGACGAG
AAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGT
CTTCTCGATGAGA********AAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTC
CTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCAC
TCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCT
TCGTCCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATCGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTC
GGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGGATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGC
CTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAG
CTATGGAGCA*TCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCT*
GTGTTTTCTTTCGGTT
CTCAAGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4DM12JQ 712 0 0
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AGGAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTG
AGCTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGA
CGCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGA
ACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCG
TTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGT
CGATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGG
TGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGA
CCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCC
TCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTC
ACCTGTTTTAGCTATGAAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTCCTCAGT
GGATTGTTCTTGTGTTTTCTTTCGGTTTCTCAAGTCCAACTTTTTACTTATT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4F734TF 796 0 0
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACG
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGCCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTC
CAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCAC
CTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGG
ATTGTTCTTGTGTTTTCTTTCG*TTTCTCAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTT*ACAA*C
ATCATCTCTTAAA
GTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4DV42JQ 806 0 0
GGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACG
TTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAGG
AGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGC
TCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGC
TCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACC
GTTACGGTCTTCTCGATGAGA********AAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTG
AGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGA
TTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGA
ACATTCCTTCGTCCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATCGACTTTGCTCTGACCA
GTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGGATGAGAAGTCTGCCTCC
AAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACC
TGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGA
TTGTTCT*GTGTTTTCTTTCGGTTTCTCAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAACA
TCATCTCTTAAAAGTTTTGTTTCTT
G

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4E619JQ 791 0 0
CACACAGCCGTTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACGTTTGCTACTACCGCA
ACTATGGAAAAACATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCCG
AGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGTGCAGT
ACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGCTCGACGAGAAGAACC
CCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCG
ATGAGA********AAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGC
GTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCTCGTG
TCCTTATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCGTCCA
TGGTGAGACTTGATTCTCAGAAGCATATCGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTG
GCCGTCCCGGTAGAGTGAAGAGAA*GGGATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGT
GGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTATGGA
GCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCT*GTGTTTT
CTTTCGGTTTCTCAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAAGT
TTTGTTTCTT
G

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4F734JQ 539 0 0
AAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACA
AGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCA
TTGTGTTCAAGCCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGCAGA
GGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATT
CTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTAGAG
TGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGT
GATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTG
ATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCTTGTGTTTTCTTTCGGTTTCTCAA
GTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAAGTTTTGTT
CCTTTCTT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4GT75JQ 777 0 0
TCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACGTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAA
CATTTAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGG
TCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCC
GTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCT
TCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGA
ACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGA
CCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGGC
AGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTG
ATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTA
GAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGAT
GGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTT
TTGATCATTTGTAGTTTGCTATTTCTCAGTGGATTGTTCT*GTGTTTTCTTTCGGTTTCT
CAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAAGTTTTGTTTC
G

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4CG10JQ 833 0 0
TTTCTATCACAGAGAAGGCGACAGTATGGTGCACGTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAA
AACATTTAAGGGACTACGTCGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCT
GGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTAGAGAGTGCAGTACTCTCTTAG
CCGTATCCGTAACGCCGCTAGAGATCTTCTGACGCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGAT
CTTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCA
GAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCA
GACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAG
GCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACT
TGATTCTCAGAAGCATATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGG
TAGAGCGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAG
ATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCC
TTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCTTGTGTTTTCTTTCGGTTT
CTCAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAAGTTTTGTTTCTT
TCTTATGCTGAGATCCCAAAAACTCATATAGCAATAATATCTTACATTGCCAG

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4DL23JQ 590 0 0
TTCGAAGGTGAGGCGCTCCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAG
AACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAG
ACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCTCGTGTCCTTATCAGG
CAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTT
GATTTTCAGAAGCATATTGACTTTACTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGT
AGAGTGAAGAGAA*GGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGA
TGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCT
TTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCTTGTGTTTTCTTTCGGTTTC
TCAAGTCCAACTTTTTACTTATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAAGTTTTGTTTCTTT
CTTATGCTGAGATCCCAAAAACTCATATAGCAATAATATCTTACATTGCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 13

CO CL147Contig1 911 13 10 U
GCAGAGGAACAAGAGAAGGTTTATGTTCATATCATTTCAAAGGATTA*CATCAAATCAAG
CTCCAGGTACAAACTTTGTTGCGAAAGCCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGAT
GGTCAAGGAGATTCTCCAAGGGACCCTTTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAAGCCAA
ACATTGAGAACATAGCCAACCTTCCATTCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGG
TAACTGGATCATCTGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCAT
TGCCTTCACCAACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGA
TAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACTAGGTTTGGGTTGCCTA
AGTAGTCCAAACCTCCTTCAGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCT
TGAAGTCCACACGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGCAACCTAGTGCTCCCA
ACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGT
CTGCGGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCCGGTGAGGTAAG
ACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCCGTACCAAAGAT
CATTGCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGAAGAGGGTTGAACG
TGGAGCCTTTGGTCTGGCCAAGAAATGGTGTTGGGCTCAGAATACTGCTTGAGCTTGTGA
ATGTTGATGCCATTGCTCTCTCTGAGATTTTGAGCGTTGATTTTCTCTGTGGTGTTTTTA
TTGTTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 35 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 60 60 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 45 75 75 35 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 60 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 30 70 40 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK62JQ U 252
AF RR4E917JQ U 28
AF RR4EC60JQ U 25
AF RR4DH84JQ U 6
AF RR4GU20JQ U 18
AF RR4GU20TF C 226
AF RR4BO86JQ U 1
AF RR4AK85JQ U 11
AF RR4E917TF C 165
AF RR4EK62TF C 228
AF RR4BL96TF C 230
AF RR4DH84TF C 226
AF RR4BO86TF C 181
BS 1 207 RR4BO86JQ
BS 208 208 RR4DH84JQ
BS 209 253 RR4BO86JQ
BS 254 254 RR4DH84JQ
BS 255 441 RR4BO86JQ
BS 442 442 RR4DH84JQ
BS 443 787 RR4BO86JQ
BS 788 879 RR4AK85JQ
BS 880 894 RR4E917TF
BS 895 911 RR4BO86TF

RD RR4EK62JQ 166 0 0
TCTGCGAAACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAATCATTGCCTTCACCA
ACACCATCAAAACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGATAACTTGGAAG
CCAAAAACGGCTAAAATGCTTTGGGCATGGACTAGGTTTGGGTTGC

QA 1 166 1 166
DS 

RD RR4E917JQ 418 0 0
CATATCATTTCAAAGGATTA*CATCAAATCAAGCTCCAGGTACAAACTTTGTTGCGAAAG
CCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGATGGTCAAGGAGATTCTCCAAGGGACCCT
TTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAAAAGCCAAACATTGAGAACATAGCCAACCTTCCAT
TCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCGAGACCCAGTG
GGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCAAGACCGT
TGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAA
TGCTTTGGGCGTGGACTAGGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCTCCTTCAGAGAA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4EC60JQ 606 0 0
GTTCATATCATTTCAAAGGATTA*CATCAAATCAAGCTCCAGGTACAAACTTTGTTGCGA
AAGCCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGATGGTCAAGGAGATTCTCCAAGGGAC
CCTTTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAAGCCAAACATTGAGAACATAGCCAACCTTC
CATTCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCGAGACCCA
GTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCAAGAC
CGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTA
AAATGCTTTGGGCGTGGACTAGGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCTCCTTCAGAGA
AGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGGACCCATTTCT
GAAGAACTTCAGGGGTTATGCAACCTAGTGCTCCCAATATTGCCCATCTCCCATGGATAA
CCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGTCTGCGGATAAACCGGCGGTGTCCC
AACCAT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4DH84JQ 742 0 0
GGAACA
AGAGAAGGTTTATGTTCATACCATTTCAAAGGATTA*CATCAAATCAAGCTCCAGGTACA
AACTTTGTTGCGAAAGCCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGATGGTCAAGGAGA
TTCTCCAAGGGACCCTTTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAAGCCAAACATTGAGAAC
ATAGCCAACCTTCCATTCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCA
TCTGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCA
ACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGATAACTTGGAAG
CCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACTGGGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAA
CCTCCTTCAGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACA
CGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGCAACCTAGTGCTCCCAACATTGCCCAT
CTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGTCTGCGGATAAA
CCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCCGGTGAGGTAAGACGGGGTTTGG
ACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCCGTACCAAAGATCATTGCCCATA
GTGTATTTGGGAGTTC

QA 7 742 7 742
DS 

RD RR4GU20JQ 753 0 0
C
GTTTATGTTCATATCATTTCAAAGGATTAACATCAAATCAAGCTCCAGGTACAAACTTTG
TTACGAAAGCCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGATGGTCAAGGAGATTCTCCA
AGGGACCCTTTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAAGCCAAACATTGAGAACATAGCCG
ACCGTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCAA
GACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCAT
CTAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATGAGGATAACTTGGAAGCCAAGAA
CGGCTAAAATGCTTTGGGCATGGACTAGGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCGCCTT
CTGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGAACCC
ATTTCTGAAGAACTTCAGGTGTTATGCAACCTAATGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCAT
GGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGTCTGCCGATAAACCGGCGG
TGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCCTGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAA
ATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCGGTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATT
TGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGAAGA

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR4GU20TF 513 0 0
TGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCAAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGC
CTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCTAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAA
CTAATCCCATGAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCATGGACTA
GGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCGCCTTCTGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGA
ACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGAACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGTGTTATGC
AACCTAATGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGG
CAAAGGCTTCAGGGTCTGCCGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACT
CTCCTGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTG
GTCGGTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR4BO86JQ 787 0 0
GCAGAGGAACAAGAGAAGGTTTATGTTCATATCATTTCAAAGGATTA*CATCAAATCAAG
CTCCAGGTACAAACTTTGTTGCGAAAGCCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGAT
GGTCAAGGAGATTCTCCAAGGGACCCTTTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAAGCCAA
ACATTGAGAACATAGCCAACCTTCCATCCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGG
TAACTGGATCATCCGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCAT
TGCCTTCACCAACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGA
TAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACTAGGTTTGGGTTGCCTA
AGTAGTCCAAACCTCCTTCAGGGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCT
TGAAGTCCACACGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGCAACCTAGTGCTCCCA
ACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGT
CTGCGGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCCGGTGAGGTAAG
ACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCCGTACCAAAGAT
CATTGCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGAAGAGGGTTGAACG
TGGAGCC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4AK85JQ 869 0 0
GAGAGAAG
GTTTATGTTCATATCATTTCAAAGGATTA*CATCAAATCAAGCTCCAGGTACAAACTTTG
TTGCGAAAGCCCAAGCATTGTTAGCAACAGGGTTATCAAGATGGTCAAGGAGATTCTCCA
AGGGACCCTTTCCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAAGCCAAACATTGAGAACATAGCCA
ACCTTCCATTCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCGA
GACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCAT
CAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGAATAACTTGGAAGCCAAGAA
CGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACTAGGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCTCCTT
CAGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGGACCC
ATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGCAACCTAGTGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCAT
GGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGTCTGCGGATAAACCGGCGG
TGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCCGGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAA
ATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCCGTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATT
TGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGAAGAGGGTTGAACGTGGAGCCTTTGGTCTGGC
CAAGAAATGGTGTTGGGCTCAGAATACTGCTTGAGCTTGTGAATGTTGATGCCATTGCTC
TCTCTGAGATTTTGAGCGTTG

QA 9 869 9 869
DS 

RD RR4E917TF 730 0 0
TGAACAAAGAAGCCAAACAT*GAGAACATAGCCAAC*TTCCATTCTTGATCTC*TTCAC*
TTGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCG
CCTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCA
ACTAATCCCATTAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACT
AGGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCTCCTTCAGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTG
AACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATG
CAACCTAGTGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTG
GCAAAGGCTTCAGGGTCTGCGGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAAC
TCTCCGGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCT
GGTCCGTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCA
CGAAGAGGGTTGAACGTGGAGCCTTTGGTCTGGCCAAGGAATGGTGTTGGGCTCAGAATA
CTGCTTGAGCTTGTGAATGTTGATGCCATTGCTCTCTCTGAGATTTTGAGCGTTGATTTT
CTCTGTGGTG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4EK62TF 667 0 0
AGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCT
GGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACT
AATCCCATTAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCATGGACTAGG
TTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCTCCTTCAGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAAC
CAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGCAA
CCTAGTGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCA
AAGGCTTCAGGGTCTGCGGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCT
CCGGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGT
CCGTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGA
AGAGGGTTGAACGTGGAGCCTTTGGTCTGGCCAAGAAATGGTGTTGGGCTCAGAATACTG
CTTGAGCTTGTGAATGTTGATGCCATTGCTCTCTCTGAGATTTTGAGCGTTGATTTTCTC
TGTGGTG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BL96TF 665 0 0
CTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCAAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGG
GTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCTAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAA
TCCCATGAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCATGGACTAGGTT
TGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCGCCTTCTGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCA
GACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGAACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGTGTTATGCAACC
TAATGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAA
GGCTTCAGGGTCTGCCGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCC
TGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCC
GTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGAAG
AGGGTTGAACGTGGAGCCTTTGGTCTGGCCAAGAAATGGTGTTGGGCTCAGAATACTGCT
TGAGCTTGTGAATGTTGATGCCATTGTTCTCTCTGAGATTTTGAGCGTTGATTTTCTCTG
CGGTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4DH84TF 669 0 0
TGAGCTCAGCGAAGGTAACTGGATCATCTGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGC
CTGGGTACAAGTCATTGCCTTCACCAACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAA
CTAATCCCATTAGGATAACTTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACTG
GGTTTGGGTTGCCTAAGTAGTCCAAACCTCCTTCAGAGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGA
ACCAGACCGGCTCCTTGAAGTCCACACGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGC
AACCTAGTGCTCCCAACATTGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGG
CAAAGGCTTCAGGGTCTGCGGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACT
CTCCGGTGAGGTAAGACGGGGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTG
GTCCGTACCAAAGATCATTGCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCAC
GAAGAGGGTTGAACGTGGAGCCTTTGGTCAGGCCAAGAAATGGTGTTGGGCTCAGAATAC
TGCTTGAGCTTGTGAATGTTGATGCCATTGCTCTCTCTGAGATTTTGAGCGTTGATTTTC
TCTGTGGTG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4BO86TF 731 0 0
AACA
TGAGAACATAGCC*ACCTTCCATCCTTGATCTCCTTCACCTTGAGCTCAGCGAAGGTAAC
TGGATCATCCGCGAGACCCAGTGGGTCAAAGTATTGCCCGCCTGGGTACAAGTCATTGCC
TTCACCAACACCATCAAGACCGTTGATGCGGAAACCTTCAACTAATCCCATTAGGATAAC
TTGGAAGCCAAGAACGGCTAAAATGCTTTGGGCGTGGACTAGGTTTGGGTTGCCTAAGTA
GTCCAAACCTCCTTCAGGGAAGATTTGTGAACCGGCTTTGAACCAGACCGGCTCCTTGAA
GTCCACACGGACCCATTTCTGAAGAACTTCAGGGGTTATGCAACCTAGTGCTCCCAACAT
TGCCCATCTCCCATGGATCACCTCAAGAGCTCTGTTCTTGGCAAAGGCTTCAGGGTCTGC
GGATAAACCGGCGGTGTCCCAACCATAGTCGCCGGGAAACTCTCCGGTGAGGTAAGACGG
GGTTTGGACGGAAAATGGTCCCAAGTACTTCACTCTGTCTGGTCCGTACCAAAGATCATT
GCCCATAGTGTATTTGGGAGTTCCGAGAGAGACAACATCACGAAGAGGGTTGAACGTGGA
GCCTTTGGTCTGGCCAAGAAATGGTGTTGGGCTCAGAATACTGCTTGAGCTTGTGAATGT
TGATGCCATTGCTCTCTCTGAGATTTTGAGCGTTGATTTTCTCTGTGGTGTTTTTATTGT
TCTGTCC

QA 5 731 5 731
DS 



AS 1 14

CO CL148Contig1 993 14 32 U
GTGAATAATAGTGGTGGTGGTGAGAAGTTTCTGGAAATAAAATAACAATGCGGACCATTC
TCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTCCTCCTATAAAACTCAGCCACTCGTCCCTTCTCTTCT
CCCCATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACAACCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGA
CAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGG
TTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGAGAG
CCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTC
TCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATG
AATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCA
CCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCT
TCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGC
TAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGT
TCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACT
TGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCA
AGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTTCAGAAACAGTAATGAA
CGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAGT
ATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTCG
TCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 25 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 25 40 40 35 10 10 10 

AF RR4EF21TF U 1
AF RR4EJ34TF U 123
AF RR4DI10TF U 123
AF RR4F654TF U 123
AF RR4EC35TF U 263
AF RR4EC79TF U 263
AF RR4EJ34JQ C 214
AF RR4F654JQ C 661
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AF RR4EC35JQ C 345
AF RR4EC79JQ C 553
AF RR4EF21JQ C 480
AF RR4D774JQ C 400
AF RR4D774TF U 400
BS 1 145 RR4EF21TF
BS 146 146 RR4EJ34TF
BS 147 553 RR4EF21TF
BS 554 609 RR4DI10TF
BS 610 610 RR4EJ34TF
BS 611 674 RR4DI10TF
BS 675 693 RR4F654TF
BS 694 694 RR4EC35TF
BS 695 730 RR4F654TF
BS 731 731 RR4EC35TF
BS 732 742 RR4F654TF
BS 743 743 RR4EC35TF
BS 744 764 RR4F654TF
BS 765 765 RR4EC35TF
BS 766 796 RR4F654TF
BS 797 797 RR4EC35TF
BS 798 812 RR4F654TF
BS 813 813 RR4EC35TF
BS 814 821 RR4F654TF
BS 822 822 RR4EC35TF
BS 823 823 RR4F654TF
BS 824 824 RR4EC35TF
BS 825 829 RR4F654TF
BS 830 830 RR4EC35TF
BS 831 834 RR4F654TF
BS 835 835 RR4EC35TF
BS 836 844 RR4F654TF
BS 845 845 RR4EC35TF
BS 846 865 RR4F654TF
BS 866 954 RR4EC35TF
BS 955 990 RR4D774TF
BS 991 993 RR4EC35JQ

RD RR4EF21TF 553 0 0
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TCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTCCTCCTATAAAACTCAGCCACTCGTCCCTTCTCTTCT
CCCCATCCCATTCTCATCCCAACTTGAAATTCACAACCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGA
CAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGG
TTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGAGAG
CCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTC
TCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATG
AATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCA
CCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCT
TCGAGCGTATCTT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4EJ34TF 512 0 0
GG
ATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACATCCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACAAT
CACCATGGCCAGCATCGAAGTCCATGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGGTTCT
CGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGG
TGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCA
AGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATA
CAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAA
GGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGA
GCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGA
AGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTA

QA 3 512 3 512
DS 

RD RR4DI10TF 552 0 0
GG
ATCCCATTCTCATCCCAACTTGAAATTCACAACCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACAAT
CACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGTTTCT
CGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGG
TGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCA
AGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATA
CAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAA
GGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGA
GCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGA
AGGCAGGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCT
CGCTTGTGAT

QA 3 552 3 552
DS 

RD RR4F654TF 746 0 0
GG
ATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACATCCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACAAT
CACCATGGCCAGCATCGAAGTCCATGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGGTTCT
CGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGG
TGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCA
AGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATA
CAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAA
GGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGA
GCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGA
AGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCT
CGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCCCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGAT
GGGTACCGACTCCAAGGAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG*TTGCCGAGTGGGTCAAGAA
GATCACTGCCAGACCTGCTTGGGCTAAG*TCGTTGAC*TCCAGAAGCAGTGATGAACGAG
*CTTTTGTTTAATTTCTCAAA
AAA

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR4EC35TF 692 0 0
GGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCC
TTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCT
ATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAA
GCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGA
AGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCAT
GTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGT
CTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCAC
TTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGA
CCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGC
TTGGGCTAAGGTCGTTGACCTTCAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTC
AAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTT
CTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTTTGTT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4EC79TF 650 0 0
GGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCC
TTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCT
ATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAA
GCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGA
AGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCAT
GTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGT
CTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCAC
TTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGA
CCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGC
TTGGGCTAAGGTCGTTGACCTTCAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTC
AAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4EJ34JQ 776 0 0
TCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACT
TCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCC
TCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCAC
GAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCC
CAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGT
TCGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGA
CCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCT
ACGAGGCAAGGCTCTCCAAATTTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATC
CCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACCGACTCCAAGGAGCTCTTTGAGT
CTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGACCTGCTTGGGCTAAGG
TCGTTGACCTCCAGAAGCAGTGATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGA
TTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTC
TCCTCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATT
TTG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4F654JQ 323 0 0
TCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCCCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACT
TGATGGGTACCGACTCCAAGGAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCA
AGAAGATCACTGCCAGACCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTCCAGAAGCAGTGATGAA
CGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAGT
ATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTCG
TCGTTTATGTGCAATAAAACAAC

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4DI10JQ 716 0 0
AGTTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCA
ACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAG
CAATCACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAG
GGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTG
ACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCA
CCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAGGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACG
AGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCC
ACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTC
GCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCG
TTGACCTTCAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTG
TACCTCTGCGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCC
TCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGA
TC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4EC35JQ 649 0 0
GGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACA
GAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAA
AAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATC
GCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCA
GCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATTTACGAGGCAAGG
CTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTC
CCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG
GTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTT
CAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTG
TGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTG
TGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGATTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4EC79JQ 441 0 0
TCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGC
TCGTCAGGGTCTTGGATATTTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATTTGAGTTCCTCGCTTGTG
ATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTG
ACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTG
CCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTTCAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGT
TTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTC
TTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGC
AATAAAACAACATTTTG
ATTG

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4EF21JQ 512 0 0
ACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCC
TTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAG
CTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAG
TTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTAC
TTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTC
AAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTTCAGAAACAGTAATGA
ACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTAG
TATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTC
GTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGA
C

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR4D774JQ 593 0 0
G
CACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTG
CAAAAAAGTCAAGGCAATCAC*AAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCC
TATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGA
TCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGC
AAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCA
CCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCC
TAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGA
CCTTCAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACC
TCTGTGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTG
TTTGTGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGA
CT

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR4D774TF 593 0 0
G
CACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTG
CAAAAAAGTCAAGGCAATCAC*AAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCC
TATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGA
TCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGC
AAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCA
CCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCC
TAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGA
CCTTCAGAAACAGTAATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACC
TCTGTGTGTTTTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTG
TTTGTGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGA
CT

QA 2 591 2 591
DS 



AS 3 13

CO CL149Contig1 1062 8 38 U
GAAAGATGAATCAAAGTTTGTCACAAAGTAAGATCTTTTAACTCAATGCGAAAGACTAAT
AAGAAGAGAAGTTGCATACAACAAAGAAGCTTTGTTTGGATATGGATATAGAGATAGAAA
GTTGGAAGACAAAAGTGAAGAAGATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACC
TTTGATGTTATTATCATTCTCTACAACAGCATCA***CTTGGAAGATCAATCCCCTTTGG
AATCTTCCCTGGATAATCAGTCACTGATTTGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGAT
GACCATTGAACGTAGCTCGCAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTT*CTTAACATCTG
GATGGCACTCACTCTGTAGAGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAA
TCGCTATCTCTTTTTCTTTCCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCTG
CAAGTTCTTCGATTGTTTCTCTAACGTCAGC*CTTCCATAACTTGTCTTCATCGCTTTCT
ATCAGTGAAAAATCAACAGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGA
TCGCATGGATGCACTCCCAAATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAG
TTTGAACTGGATATAGCTGCACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTAGAGGTAGC
ACATCGCTCATATCCGTGTAGCCATCTCCACCGAAAACACCGACGGCAGTTTGCATTGTT
CTCATGAGTGGAGACGAGATGACCAACTCAATCTTCTTGTGAAGTCCACTGGAACGAACA
TGCTTACGCAAATTATCAACCTGTTGCCAGCCAAGTTGGGTCAACTCAGCATCAAAGTAG
TCCTGAGACATGTAAGCCTTATAGTTCTTGTCCCCATCAACATTGTGGATCCCTTGAGCA
TGTCTCACTAGGTAGATGGTTTTGCAGCGGTGCAGCGGGTACAAACCTATACCAGCGCCA
GCCTCCATCTCTGCCAAATGAGATTGGTGGAGATGAACCTCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 5 40 40 
40 40 40 5 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 
10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4G067JQ U 1
AF RR4FI24JQ U 20
AF RR4E178JQ U 1
AF RR4BI48JQ U 57
AF RR4GX92JQ U 19
AF RR4EX81TF C 353
AF RR4BI48TF C 252
AF RR4BH36TF C 493
BS 1 235 RR4E178JQ
BS 236 238 RR4G067JQ
BS 239 267 RR4E178JQ
BS 268 269 RR4GX92JQ
BS 270 481 RR4E178JQ
BS 482 482 RR4BI48JQ
BS 483 487 RR4E178JQ
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BS 850 1059 RR4BI48TF
BS 1060 1062 RR4BH36TF

RD RR4G067JQ 384 0 0
A
AAAGATGAATCAAAGTTTGTCACAAAGTAAGATCTTTTAACTCAATGCGAAAGACTAATA
AGAAGAGAAGTTGCATACAACAAAGAAGCTTTGTTTGGATATGGATATAGAGATAGAAAG
TTGGAAGACAAAAGTGAAGAAGATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCT
TTGATGTTATTATCATTCTCTACAACAGCATCA***CTTGGAAGATCAATCCCCTTTGGA
ATCTTCCCTGGATAATCAGTCACTGAAATGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGATG
ACCATTGAACGTAGCTCGCAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTT*CTTAACATCTGG
ATGGCACTCACTCTGTAGAGCGT

QA 2 384 2 384
DS 

RD RR4FI24JQ 608 0 0
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GAAAATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCTTTGATGTTATTATCATTC
TCTACAACAGCATCA***CTTGGAAGATCAATCCCCTTTGGAATCTTCCCTGGATAATCA
GTCACTGATTTGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGATGACCATTGAACGTAGCTCG
CAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTT*CTTAACATCTGGATGGCACTCACTCTGTAG
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CCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCTGCTAGTTCCTCGATTGTTTC
TCTAACGTCGGC*CTTCCATAACTTATCTTCATCGCTCTCTATCAGCGAAAAATCAACTG
CGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATGCACTCCCA
GATGTTCT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4E178JQ 826 0 0
GAAAGATGAATCAAAGTTTGTCACAAAGTAAGATCTTTTAACTCAATGCGAAAGACTAAT
AAGAAGAGAAGTTGCATACAACAAAGAAGCTTTGTTTGGATATGGATATAGAGATAGAAA
GTTGGAAGACAAAAGTGAAGAAGATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACC
TTTGATGTTATTATCATTCTCTACAACAGCATCA***CTTGGAAGATCAATCCCC**CGG
AATCTTCCCTGGATAATCAGTCACTGAAATGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGAT
GACCATTGAACGTAGCTCGCAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTT*CTTAACATCTG
GATGGCACTCACTCTGTAGAGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAA
TCGCTATCTCTTTTTCTTTCCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCTG
CTAGTTCCTCGATTGTTTCTCTAACGTCGGC*CTTCCATAACTTATCTTCATCGCTCTCT
ATCAGCGAAAAATCAACTGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGA
TCGCATGGATGCACTCCCAGATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATAGGTGGGCAG
TTTGAACTGGATATAGCTGCACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTAGAGGTAGT
ACATCGCTCATATCCGTGTAGCCATCTCCACCGAAAACACCGACG*CAGTTTGCATCGTT
CTCATGAGTGGAGGCGAGATGACAA*CTCAATCTTCTTGTGAAGTC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4BI48JQ 737 0 0
GTAATAAAAAGAG
AGTTGCATACAACAAAGAAGCTTTGTTTGGATATGGATA**GAGATAGAAAGTTGGAAGA
CAAATGTGAAGAAGATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCTTTGATGTT
ATTATCATTCTCTACAACAGCATCATCACTTGGAAGATCAATCCCCTTTGGAATCTTCCC
TGGATAATCAGTCACTGATTTGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGATGACCATTGA
GCGTAGCTCGCAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTT*CTTAACATCTGGATGGCACT
CACTCTGTAGAGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAATCGCTATCT
CTTTTTCTTTCCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCCGCAAGTTCTT
CGATTGTTTCTCTAACGTCAGC*CTTCCATAACTCGTCTTCATCGCTTTCTATCAGTGAA
AAATCAACAGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGA
TGCACTCCCAAATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAGTTTGAACTG
GATATAGCTGCACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTAGAGGTAGCACATCGCTC
ATATCCGTGTAGCCATCTCCACCGAAAACACCGACGGCAGTTTGCATTGTTCTCATGAGT
GGAG

QA 14 737 14 737
DS 

RD RR4GX92JQ 831 0 0
C
GTCACAAAGTAAGATCTTTTAACTCAATGCGAAAGACTAATAAGAAGAGAAGTTGCATAC
AACAAAGAAGCTTTGTTTGGATATGGATATAGAGATAGAAAGTTGGAAGACAAAAGTGAA
GAAGATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCTTTGATGTTATTATCATTC
TCTACAACAGCATCA***CTTGGAAGATCAATCCCCTTTGGAATCTTCCCTGGATAATCA
GTCACTGATTTGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGATGACCATTGAACGTAGCTCG
CAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTT*CTTAACATCTGGATGGCACTCACTCTGTAG
AGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAATCGCTATCTCTTTTTCTTT
CCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCTGCTAGTTCCTCGATTGTTTC
TCTAACGTCGGC*CTTCCATAACTTATCTTCATCGCTCTCTATCAGCGAAAAATCAACTG
CGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATGCACTCCCA
GATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATAGGTGGGCAGTTTGAACTGGATATAGCTG
CACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTAGAGGTAGTACATCGCTCATATCCGTGT
AGCCATCTCCACCGAAAACACCAACGGCAGTTTGCATTGTTCTCATGAGTGGAGACGAGA
TGACCA*CTCAATCTTCTTGTGA*GTCCACTGGAACGAACATGCTTACGC

QA 2 831 2 831
DS 

RD RR4EX81TF 642 0 0
AACATCTGGATGGCACTCACTCTGTAGAGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTG
TGTCGCAATCGCTATCTCTTTTTCTTTCCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCC
TCTAGCTGCAAGTTCTTCGATTGTTTCTCTAACGTCAGCTCTTCCATAACTTGTCTTCAT
CGCTTTCTATCAGTGAAAAATCAACAGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTC
TTCTCTGATCGCATGGATGCACTCCCAAATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATTG
GTGGGCAGTTTGAACTGGATATAGCTGCACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTA
GAGGTAGTACATCGCTCATATCCGTGTAGCCATCTCCACCGAAAACACCGACGGCAGTTT
GCATTGTGCTCATGAGTGGAGACGAGATGACCAACTCAATCTTCTTGTGGAGTCCACTGG
AACGAACATGCTTACGCAAATTATCAACCTGTTGCCAGCCAAGTTGGGTCAACTCAGCAT
CAAAGTAGTCCTGAGACATGTAAGCCTTATAGTTCTTGTCCCCATCAACATTGTGGATCC
CTTGAGCATGTCTCACTAGGTAGATGGTTTTGCAGCGGTGCA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4BI48TF 811 0 0
GATAATCAGTCACTGATTTGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGATGACCATTGAGC
GTAGCTCGCAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTTTCTTAACATCTGGATGGCACTCA
CTCTGTAGAGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAATCGCTATCTCT
TTTTCTTTCCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCCGCAAGTTCTTCG
ATTGTTTCTCTAACGTCAGC*CTTCCATAACTCGTCTTCATCGCTTTCTATCAGTGAAAA
ATCAACAGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATG
CACTCCCAAATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAGTTTGAACTGGA
TATAGCTGCACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTAGAGGTAGCACATCGCTCAT
ATCCGTGTAGCCATCTCCACCGAAAACACCGACGGCAGTTTGCATTGTTCTCATGAGTGG
AGACGAGATGACCAACTCAATCTTCTTGTGAAGTCCACTGGAACGAACATGCTTACGCAA
ATTATCAACCTGTTGCCAGCCAAGTTGGGTCAACTCAGCATCAAAGTAGTCCTGAGACAT
GTAAGCCTTATAGTTCTTGTCCCCATCAACATTGTGGATCCCTTGAGCATGTCTCACTAG
GTAGATGGTTTTGCAGCGGTGCAGCGGGTACAAACCTATACCAGCGCCAGCCTCCATCTC
TGCCAAATGAGATTGGTGGAGATGAACC
TCC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4BH36TF 570 0 0
TTGTTTCTCTAACGTCAGC*CTTCCATAACTCGTCTTCATCGCTTTCTATCAGTGAAAAA
TCAACAGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATGC
ACTCCCAAATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAGTTTGAACTGGAT
ATAGCTGCACGGTTGCTGTTTCCTGCATTTGCTACCATTAGAGGTAGCACATCGCTCATA
TCCGTGTAGCCATCTCCACCGAAAACACCGACGGCAGTTTGCATTGTTCTCATGAGTGGA
GACGAGATGACCAACTCAATCTTCTTGTGAAGTCCACTGGAACGAACATGCTTACGCAAA
TTATCAACCTGTTGCCAGCCAAGTTGGGTCAACTCAGCATCAAAGTAGTCCTGAGACATG
TAAGCCTTATAGTTCTTGTCCCCATCAACATTGTGGATCCCTTGAGCATGTCTCACTAGG
TAGATGGTTTTGCAGCGGTGCAGCGGGTACAAACCTATACCAGCGCCAGCCTCCATCTCT
GCCAAATGAGATTGGTGGAGATGAACCTCC

QA 1 570 1 570
DS 



CO CL149Contig2 719 2 8 U
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TAAAAGATCTTTTAACTCAATACGAAAGACTAATAAAAAGAGAGTTGCATACAACAAAGA
AGCTTTGTTTGGATATGGATAGAGATAGAAAGTTGGAAGACAAATGTGAAGAAGATAATA
AGCCTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCTTTGATGTTATTATCATTCTCTACAACAG
CATCATCACTTAAAAGATCAATCCCCTTTGGAATCTTCCCTGGATAATCAGTCACTGATT
TGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGACGACCATTGAGCGTAGCTCGCAATTCGCAA
AGTGGCTGCAAATCTCCTTCTTAACATCTGGATGGCACTCACTCTGTAGAGCGTTCAGCG
TGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAATCGCTATCTCTTTTTCTTTCCTTGTCCATA
GCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCCGCAAGTTCTTCGATTGTTTCTCTAACGTCAG
CCTTCCATAACTCGTCTTCATCGCTTTCTATCAGTGAAAAATCAACAGCGGGGAAAAGAA
ACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATGCACTCCCAAATGTTCTCTGC
AGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAGTTTGAACTGGATATAGCTGCACGGTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX81JQ U 1
AF RR4BH36JQ U 90
BS 1 446 RR4EX81JQ
BS 447 447 RR4BH36JQ
BS 448 508 RR4EX81JQ
BS 509 509 RR4BH36JQ
BS 510 552 RR4EX81JQ
BS 553 553 RR4BH36JQ
BS 554 708 RR4EX81JQ
BS 709 719 RR4BH36JQ

RD RR4EX81JQ 708 0 0
ACAGCATCACTCAAGTCTCAGTTAAGCAAAGATAAAATCAAAGTTTGCCACAAAGTATCT
TAAAAGATCTTTTAACTCAATACGAAAGACTAATAAAAAGAGAGTTGCATACAACAAAGA
AGCTTTGTTTGGATATGGATAGAGATAGAAAGTTGGAAGACAAATGTGAAGAAGATAATA
AGCCTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCTTTGATGTTATTATCATTCTCTACAACAG
CATCATCACTTAAAAGATCAATCCCCTTTGGAATCTTCCCTGGATAATCAGTCACTGATT
TGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGACGACCATTGAGCGTAGCTCGCAATTCGCAA
AGTGGCTGCAAATCTCCTTCTTAACATCTGGATGGCACTCACTCTGTAGAGCGTTCAGCG
TGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCGCAATCGCTATCTCTTTTTCTTTCCTTGTCCATA
GCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCTGCAAGTTCTTCGATTGTTTCTCTAACGTCAG
CCTTCCATAACTTGTCTTCATCGCTTTCTATCAGTGAAAAATCAACAGCGGGGAAAAGAA
ACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATGCACTCCCAAATGTTCTCTGC
AGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAGTTTGAACTGGATATAGCTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BH36JQ 630 0 0
GTAATAAAAAGAG
AGTTGCATACAACAAAGAAGCTTTGTTTGGATATGGATAGAGATAGAAAGTTGGAAGACA
AATGTGAAGAAGATAATAAGCTTAAACAAGAATCATTCATTCATTCACCTTTGATGTTAT
TATCATTCTCTACAACAGCATCATCACTTGGAAGATCAATCCCCTTTGGAATCTTCCCTG
GATAATCAGTCACTGATTTGTCCGATCCTAACATACTTCTATCAACGATGACCATTGAGC
GTAGCTCGCAATTCGCAAAGTGGCTGCAAATCTCCTTCTTAACATCTGGATGGCACTCAC
TCTGTAGAGCGTTCAGCGTGTGAAACAAGAAACCACTGTGTGTCACAATCGCTATCTCTT
TTTCTTTCCTTGTCCATAGCCAGTTGAGGAACTTTTTGCCTCTAGCCGCAAGTTCTTCGA
TTGTTTCTCTAACGTCAGCCTTCCATAACTCGTCTTCATCGCTTTCTATCAGTGAAAAAT
CAACAGCGGGGAAAAGAAACTGATAGTCGCTGATGCTTCTTCTCTGATCGCATGGATGCA
CTCCCAAATGTTCTCTGCAGGACTCCTCTGTGATAATTGGTGGGCAGTTTGAACTGGATA
TAGCTGCACGGTTGCTG

QA 14 630 14 630
DS 



CO CL149Contig3 741 3 4 U
GGGACCATCTCCTACTACTTCATTCCCATCTTCTCTCCTCAGCCTCCTTTTGGTTCATCT
CCACCAATCTCATTTTTGCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGTTGC
ACCGTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGGCATGCTCAAGGGATTCACAATGTTGATGGGG
ACAAGAACTATAAGGCTTACATGTCTCAGGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACTTG
GCTGGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAAGA
TTGAGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGGTGTTTTCG
GTGGAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGGAA
ACAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCCT
GCAGAGAACATCTGGGAGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGT
TTCTTTTCCCCGCAGTTGATTTTTCGCTGATAGAGAGCGATGAAGATAAGTTATGGAAGG
CCGACGTTAGAGAAACAATCGAGGAACTAGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCTCAACTGGC
TATGGACAAGAAAGAAAAGAGATAGCGATTGTGACACACAGTGGTTTCTTGTTTCACACG
CTGACGCTCTACAGAGTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E178TF U 73
AF RR4FI24TF U 73
AF RR4GX92TF U 1
BS 1 645 RR4GX92TF
BS 646 646 RR4E178TF
BS 647 647 RR4FI24TF
BS 648 741 RR4GX92TF

RD RR4E178TF 574 0 0
TTTTT
GCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATAGGTTTGTACCCGCTGCACCGCTGCAAAACCATC
TACCTAGTGAGACATGCTCAAGGGATCCACAATGTTGATGGGGACAAGAACTATAAGGCT
TACATGTCTCAGGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACTTGGCTGGCAACAGGTTGAT
AATTTGCGTAAGC*TGTTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAAGATTGAGTTGGTCATCTCG
CCTCCACTCATGAGAACGATGCAAACTGCCGTCGGTGTTTTCGGTGGAGATGGCTACACG
GATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGGAAACAGCAACCGTGCAGCT
ATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCCTGCAGAGAACATCTGGGA
GTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGTTTCTTTTCCCCGCAGTT
GATTTTTCGCTGATAGAGAGCGATGAAGATAAGTTATGGAAGGCCGACGTTAGAGAAACA
ATCGAGGAACTAGCAGCTAGAGGCAAAAA

QA 6 574 6 574
DS 

RD RR4FI24TF 595 0 0
TTTTT
GCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGTTGCACCGTTGCAAAACAATC
TACCTAGTGAGGCATGCTCAAGGGATTCACAATGTTGATGGGGACAAGAACTATAAGGCT
TACATGTCTCAGGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACTTGGCTGGCAACAGGTAGAT
AATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGAGGACTTCACAAGAAGATTGAGTTGGTCATCTCG
TCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGGGGTTTTCGGTGGAGATGGCTACACG
GATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGGAAACAGCAACCGTGCAGCT
ATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCCTGCAGAGAACATCTGGGA
GTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGTTTCTTTTCCCCGCAGTT
GATTTTTCGCTGATAGAGAGCGATGAAGATAAGTTATGGAAGGCCGACGTTAGAGAAACA
ATCGAGGAACTAGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCTCAACTGGCTATGGAC

QA 6 595 6 595
DS 

RD RR4GX92TF 741 0 0
GGGACCATCTCCTACTACTTCATTCCCATCTTCTCTCCTCAGCCTCCTTTTGGTTCATCT
CCACCAATCTCATTTTTGCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGTTGC
ACCGTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGGCATGCTCAAGGGATTCACAATGTTGATGGGG
ACAAGAACTATAAGGCTTACATGTCTCAGGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACTTG
GCTGGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAAGA
TTGAGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGGTGTTTTCG
GTGGAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGGAA
ACAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCCT
GCAGAGAACATCTGGGAGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGT
TTCTTTTCCCCGCAGTTGATTTTTCGCTGATAGAGAGCGATGAAGATAAGTTATGGAAGG
CCGACGTTAGAGAAACAATCGAGGAACTAGCAGCTAGAGGCAAAAG*TTCCTCAACTGGC
TATGGACAAGAAAGAAAAGAGATAGCGATTGTGACACACAGTGGTTTCTTGTTTCACACG
CTGACGCTCTACAGAGTGAGT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 2 14

CO CL150Contig1 828 8 4 U
GCATGAATACACCCATATTGATTAAGAAGTCATAAACAACTATTATATAGATCATCTGAC
CATACTCATGACTTCTACCATAGCTTAAGTAAAGTCAAAACCAGTATAAGCAAGAACACA
ATATAAAAAATATTTAAAAACAGAATATGTCATTATTAAGCCATCGATAGCTTGATAAGA
CACCTCCATATAGTAACCATATTCTTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCG
ATCTCTAGACCGACGAAAGTTAACTTATATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAG
TCCAGAGAGACATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCT
CCAAACATCCCATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCA
TGACCATAACCATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAA
GGACTGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATC
ATACCCCCGATTCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGT
GCAGGAGGATAACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAA
CCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCA
GGTGGATACCCATGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCATATTTTCTCAGTCAACAAAC
AAAACCCGAGACGAATAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 45 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 

AF RR4CY74JQ U 1
AF RR4CN31TF C 192
AF RR4CY74TF C 27
AF RR4CB33JQ U 192
AF RR4CN31JQ U 192
AF RR4CB33TF C 192
AF RR4C346JQ U 192
AF RR4C346TF C 184
BS 1 692 RR4CY74JQ
BS 693 740 RR4CB33JQ
BS 741 741 RR4CN31JQ
BS 742 828 RR4CB33JQ

RD RR4CY74JQ 692 0 0
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CATACTCATGACTTCTACCATAGCTTAAGTAAAGTCAAAACCAGTATAAGCAAGAACACA
ATATAAAAAATATTTAAAAACAGAATATGTCATTATTAAGCCATCGATAGCTTGATAAGA
CACCTCCATATAGTAACCATATTCTTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCG
ATCTCTAGACCGACGAAAGTTAACTTATATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAG
TCCAGAGAGACATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCT
CCAAACATCCCATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCA
TGACCATAACCATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAA
GGACTGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATC
ATACCCCCGATTCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGT
GCAGGAGGATAACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAA
CCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATA

QA 1 692 1 692
DS 

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ATACCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCC
ATGCCCACGTCTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACC
ATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGA
GCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGAT
TCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATA
ACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCGTGATGTGG
TGGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATA

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4CY74TF 797 0 0
TAGAGTCATAACAACTA
TATATAGATCATCTGACCATACTCATGACT*CTACCATAGCTTAAGTAAAGTCAAA*CCA
GTATAAGCAAGAACACAATATAAAAA*TATT*AAAAACAGAATATGTCATTATTAAGCCA
TCGATAGCTTGATAAGACACCTCCATATAGTAACCATATTCTTTATTAAGTCTGAGTTAT
TCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGTTAACTTATATGTTTGTGATTTAT
TTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACT
TCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCT
TGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCAT
ATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTG
CTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATTCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGAT
AACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATAACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCAC
CAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTAC
CGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATACCCATGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCATAT
TTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGACGATTAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAA

QA 18 797 18 797
DS 

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ATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCC
ATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACC
ATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGA
GCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATGCCCCCGAT
TCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATA
ACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGG
TGGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATACCC
ATGAAACCCCCTGTCTTTGTCACCTCCCATATTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGA
CGAATAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAAGATCC

QA 1 637 1 637
DS 

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ATACCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCC
ATGCCCACGTCTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACC
ATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGA
GCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGAT
TCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATA
ACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCGTGATGTGG
TGGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATACCC
ATGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCATATTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGA
CGAATAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAAGATCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4CB33TF 637 0 0
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GACGAAAGTTAACTTATATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGAC
ATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCC
ATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACC
ATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGA
GCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATGCCCCCGAT
TCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATA
ACCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGG
TGGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATACCC
ATGAAACCCCCTGTCTTTGTCACCTCCCATATTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGA
CGAATAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAAGATCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4C346JQ 637 0 0
G
GTAACCATATTCTTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCG
ACGAAAGTTAACTTATATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACA
TATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCA
TGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCA
TAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAG
CTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATT
CCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATAA
CCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGT
GGGTATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATACCCA
TGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCATATTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGAC
GAATAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAAGATCC

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR4C346TF 645 0 0
TTTTTTTTGGTA
ACCATATTCTTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACG
AAAGTTAACTTATATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATAT
CAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGC
CCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAG
CCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTA
TGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATTCCT
CCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGTAGGTGCAGGAGGATAACCT
CCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGG
TATCCAGCTGGTGGATAACCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCAGGTGGATACCCATGA
AACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCATATTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGACGAA
TAGCGAGAATGTTGAAACTGAATTGGAAGATCC

QA 13 645 13 645
DS 



CO CL150Contig2 722 6 5 U
TTTTTTTCGCAAGAACACAATATAAAAAATATTTAAAAACAGAATATGTCATTGTTAAGC
CATCGATAGCTTGATAGGACACCTCCATATAGTACCATATTATTTATTAAGTCTGAGTTA
TTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGTTAACTTATAATGTTTGTGATTT
ATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCA
CTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATG
CTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACC
ATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGC
TGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATTCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGG
ATAACCAGCATGAGCAGGTGCAGGAGGATAGCCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGC
ACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTTGTGGATAAGCCCCAGT
ACCGGCCGGGTATCCAGCGGGTGGATACCCATGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCAT
GTTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGACGAATAGCGAGAAATGTTGAAACTGAATTG
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 

AF RR4DB06JQ U 39
AF RR4DB06TF C 39
AF RR4A626JQ U 102
AF RR4A626TF C 102
AF RR4F386JQ U 8
AF RR4F386TF C 1
BS 1 8 RR4F386TF
BS 9 38 RR4F386JQ
BS 39 411 RR4DB06JQ
BS 412 719 RR4A626JQ
BS 720 722 RR4F386TF

RD RR4DB06JQ 374 0 0
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ATTATTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGT
TAACTTATAATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAA
GGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCAC
GTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGCCAT
GACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAG
CTATGTGGTGAGC
C

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR4DB06TF 374 0 0
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ATTATTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGT
TAACTTATAATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAA
GGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCAC
GTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGCCAT
GACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAG
CTATGTGGTGAGC
C

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR4A626JQ 620 0 0
G
TTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGTTAAC
TTATAATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAAGGGG
AATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCACGTTT
AAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGACATGACC
ATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAGCTAT
GTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATTCCTCCTGCGTG
TCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGCAGGTGCAGGAGGATAGCCTCCATAACC
ATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGGTATCCAGC
TTGTGGATAAGCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCGGGTGGATACCCATGAAACCCTCT
GTCTTTGTCACCTCCCATGTTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGACGAATAGCGAGA
AATGTTGAAACTGAATT
CC

QA 2 618 2 618
DS 

RD RR4A626TF 620 0 0
G
TTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGTTAAC
TTATAATGTTTGTGATTTATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAAGGGG
AATTTCACATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCACGTTT
AAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGACATGACC
ATGGCCATATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAGCTAT
GTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATTCCTCCTGCGTG
TCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAGCATGAGCAGGTGCAGGAGGATAGCCTCCATAACC
ATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGGTATCCAGC
TTGTGGATAAGCCCCAGTACCGGCCGGGTATCCAGCGGGTGGATACCCATGAAACCCTCT
GTCTTTGTCACCTCCCATGTTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGACGAATAGCGAGA
AATGTTGAAACTGAATT
CC

QA 2 618 2 618
DS 

RD RR4F386JQ 688 0 0
C
GCAAGAACACAATATAAAAAATATTTAAAAACAGAATATGTCATTGTTAAGCCATCGATA
GCTTGATAGGACACCTCCATATAGTACCATATTATTTATTAAGTCTGAGTTATTCCAATT
CGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGTTAACTTATAATGTTTGTGATTTATTTTAAA
CATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCACTTCTTGA
ACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATGCTTGAACT
TACCATGACCATGACCATAACCATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACCATATGCAG
CGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCAG
CACCAGCAATCATACCCCCGATTCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAACCAG
CATGAGCAGGTGCAGGAGGATAGCCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGCACCAGGTG
GTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTTGTGGATAAGCCCCAGTACCGGCCG
GGTATCCAGCGGGTGGATACCCATGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCATGTTTTCTC
AGTCAACAAACAAAACCCGAGACGAAT

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR4F386TF 722 0 0
TTTTTTTCGCAAGAACACAATATAAAAAATATTTAAAAACAGAATATGTCATTGTTAAGC
CATCGATAGCTTGATAGGACACCTCCATATAGTACCATATTATTTATTAAGTCTGAGTTA
TTCCAATTCGAACCAGCGATCTCTAGACCGACGAAAGTTAACTTATAATGTTTGTGATTT
ATTTTAAACATCTGGTCAGTCCAGAGAGACATATCAAAGGGGAATTTCACATCACTTCCA
CTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCCACGTTTAAACTTGCCTCCGTGATG
CTTGAACTTACCATGACCATGACCATAACCATAGCCATGACCATGGCCATATCCGTGACC
ATATGCAGCGTGTCCGTAAGGACTGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGC
TGCTGCAGCACCAGCAATCATACCCCCGATTCCTCCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGG
ATAACCAGCATGAGCAGGTGCAGGAGGATAGCCTCCATAACCATGAGCTGGAGGGTAGGC
ACCAGGTGGTGGAGGATAACCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTTGTGGATAAGCCCCAGT
ACCGGCCGGGTATCCAGCGGGTGGATACCCATGAAACCCTCTGTCTTTGTCACCTCCCAT
GTTTTCTCAGTCAACAAACAAAACCCGAGACGAATAGCGAGAAATGTTGAAACTGAATTG
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 2 14

CO CL151Contig1 763 10 15 U
GGCTGCATCAAGTGGTGAACCATCATCCCACATCATCATCGTCCACTAAGGAAAAGGAGG
AGGAAGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTC
CAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTA
ACCGCCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTGGTAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACG
CTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCA
CGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCT
GCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGGAAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGA
TTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTT
TACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTG
CTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTG
CTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAA
ACACATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTATCAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATC
TAGCAACAGATTTTTATTAATACAAGACTTTGAGCTTTGTGGA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 25 50 50 50 50 25 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4EW11TF U 1
AF RR4BU28TF U 72
AF RR4B772JQ C 4
AF RR4DA38TF U 23
AF RR4GS83JQ C 42
AF RR4GS83TF U 42
AF RR4DA38JQ C 23
AF RR4FD88TF U 30
AF RR4B772TF U 4
AF RR4F470TF U 30
BS 1 365 RR4EW11TF
BS 366 366 RR4BU28TF
BS 367 705 RR4EW11TF
BS 706 725 RR4DA38TF
BS 726 726 RR4GS83TF
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BS 735 735 RR4GS83TF
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BS 740 740 RR4GS83TF
BS 741 744 RR4DA38TF
BS 745 745 RR4GS83TF
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BS 755 755 RR4GS83TF
BS 756 762 RR4B772TF
BS 763 763 RR4F470TF

RD RR4EW11TF 706 0 0
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AGGAAGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTC
CAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTA
ACCGCCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTGGTAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACG
CTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCA
CGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCT
GCAAGTTGGTCTATCCAGCTACGGAAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGA
TTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTT
TACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTG
CTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTG
CTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAA
ACACATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTATCAACCGTTTTGTTA
A

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4BU28TF 618 0 0
GATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCA
GCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATA
CTCTCGTTCAGTTCCGGTGGTAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATA
AGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAA
TCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTC
TATCCAGCTACGGAAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATC
GATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTT
ATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAG
GCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCT
CTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCT
TGAGTTGTGATCTTTATT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4B772JQ 759 0 0
G
GCATCAAGTGGTGAACCATCATCCCACATCATCATCGTCCACCAAGGAAAAGGAGGAGGA
AGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAAT
TCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCG
CCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTTGTAAAAGAACCGGAACACTCTCCACTAACGCTTC
TACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGT
TCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAA
GCTGGTCTATCCAGCTACGGAAGCTTCATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGT
GAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACC
TCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTAT
TACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTA
ATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACAC
ATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTATCAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGC
AACAGATTTTTATTAATACAAGACTTTGAGCTTTGTGG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4DA38TF 735 0 0
GG
ATCCCACATCATCATCGTCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAAGCAATGGATTGTATCGTCT
CCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAAC
CTCTGAGCTCAGCACAGTTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAGTT
CCGGTGGTAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAG
GAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGG
TTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGG
AAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGA
ATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGG
ATGGTAAGGAAGTGCCTGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGG
ACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTA
TTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCTTGAGTTGTGATCT
TTATTATCAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGCA*CAGATTTT*ATTA*TACA
*GACTTTGAG
CTC

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR4GS83JQ 714 0 0
TCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAAGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTT
ATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAG
GTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTGGTAAAAGAACC
AGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGA
GAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTC
GCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGTAAGCTTTATCTCAGGAG
TATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCA
GAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCA
GGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGACGGTCTC
TTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAAC
CACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTATCAACCGTTTT
GTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGATTTTTATTAATACAAGACTTTGAGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GS83TF 714 0 0
TCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAAGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTT
ATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAG
GTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTGGTAAAAGAACC
AGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGA
GAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTC
GCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGTAAGCTTTATCTCAGGAG
TATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCA
GAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCA
GGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGACGGTCTC
TTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAAC
CACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTATCAACCGTTTT
GTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGATTTTTATTAATACAAGACTTTGAGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DA38JQ 735 0 0
GG
ATCCCACATCATCATCGTCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAAGCAATGGATTGTATCGTCT
CCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAAC
CTCTGAGCTCAGCACAGTTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAGTT
CCGGTGGTAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAG
GAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGG
TTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGG
AAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGA
ATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGG
ATGGTAAGGAAGTGCCTGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGG
ACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTA
TTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCTTGAGTTGTGATCT
TTATTATCAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGATTTTTATTAATACA
AGACTTTGAGC
TC

QA 3 733 3 733
DS 

RD RR4FD88TF 718 0 0
GG
ATCATCATCGTCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAATCAATGGATTGTATCGCCTCCAGCTC
GACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAG
CTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTGG
TAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAA
GGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGT
TAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGGAAGCTTT
ATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAA
GTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAA
GGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACAT
TGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTC
ATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTAT
CAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGATTTTTATTAATACAAGA

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4B772TF 759 0 0
G
GCATCAAGTGGTGAACCATCATCCCACATCATCATCGTCCACCAAGGAAAAGGAGGAGGA
AGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAAT
TCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCG
CCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTTGTAAAAGAACCGGAACACTCTCCACTAACGCTTC
TACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGT
TCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAA
GCTGGTCTATCCAGCTACGGAAGCTTCATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGT
GAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACC
TCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTAT
TACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTA
ATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACAC
ATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTATCAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGC
AACAGATTTTTATTAATACAAGACTTTGAGCTTTGTGG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4F470TF 734 0 0
GG
ATCATCATCGTCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAATCAATGGATTGTATCGCCTCCAGCTC
GACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAG
CTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAGTTCCGGTGG
TAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAA
GGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGT
TAATTTCGTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCCAGCTACGGAAGCTTT
ATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAA
GTTAATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAA
GGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACAT
TGATGGTCTCTTGACTTCTATTTCTGTTGCTTAATTGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTC
ATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACATTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATTAT
CAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAA*TCTAGCAACAGATTTTTATTA*TACA*GACTTT
GAGCTTTGTGGA

QA 3 734 3 734
DS 



CO CL151Contig2 728 4 19 U
GGGTCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAAGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTT
CTTATCCGATCACATCTCGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCA
CAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAATTCCAGTGGTAAAAGA
ACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATC
GGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTC
GTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTTTATCCAGCTACGGAAGCTTTATCTCAG
GAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATA
GCAGAGTACGAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTG
CCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGT
CTCTTGACTTCTATATCTGTTGCTTAATGGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTC
AACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACACACTCTCTTGAGTCGTGATCTTTATCAACCGTT
TTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGAATTTTATTAATACAAGACTTTGAGATTTG
TGGATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4FN09JQ C 122
AF RR4FN09TF U 122
AF RR4FR33TF U 1
AF RR4DA96TF U 81
BS 1 225 RR4FR33TF
BS 226 227 RR4FN09TF
BS 228 263 RR4FR33TF
BS 264 264 RR4FN09TF
BS 265 429 RR4FR33TF
BS 430 430 RR4FN09TF
BS 431 540 RR4FR33TF
BS 541 541 RR4FN09TF
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BS 543 544 RR4FN09TF
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BS 641 641 RR4FN09TF
BS 642 691 RR4FR33TF
BS 692 692 RR4FN09TF
BS 693 700 RR4FR33TF
BS 701 701 RR4FN09TF
BS 702 705 RR4FR33TF
BS 706 706 RR4FN09TF
BS 707 728 RR4FR33TF

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G
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AGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCT
CTTGACTTCTATATCTGTTGCTTAATGGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAA
CCACACTGTTTGTCTTGTAAACACACACTCTCTTGAGTCGTGATCTTTATCAACCGTTTT
GTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGAATTTTATTAATACAAGACTTTGAG

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR4FN09TF 594 0 0
G
GGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAATTCCAGTGGTAAAAGAAC
CAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGG
AGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGT
CGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTTTATCCAGCTACGGAAGCTTTATCTCAGGA
GTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATAGC
AGAGTACGAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCC
AGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCT
CTTGACTTCTATATCTGTTGCTTAATGGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAA
CCACACTGTTTGTCTTGTAAACACACACTCTCTTGAGTCGTGATCTTTATCAACCGTTTT
GTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGAATTTTATTAATACAAGACTTTGAG

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR4FR33TF 728 0 0
GGGTCCACTAAGGAAAAGGAGGAGGAAGCAATGGATTGTATCGTCTCCAGCTCGACGGTT
CTTATCCGATCACATCTCGCTCCAATTCGCTCAGCTTCCATCAAACCTCTGAGCTCAGCA
CAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCACATACTCTCGTTCAATTCCAGTGGTAAAAGA
ACCAGAACACTCTCCACTAACGCTTCTACGATAAGATGCGGAGGA**AATCAAGGAGATC
GGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACAGTTCTCGAATCGGACCGGCCGGTTCTGGTTAATTTC
GTCGCCACTTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTTTATCCAGCTACGGAAGCTTTATCTCAG
GAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATCGATCACGACGCGAATCCTAAGTTAATA
GCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGGTAAGGAAGTG
CCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGT
TT**TGACTTCTATATCTGTTGCTTAATGGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTC
AACCACACTGTTTGTCTTGTAAACACACACTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATCAACCGTT
TTGTTACCAAATGTGTAAATCTAGCAACAGA*TTTTATTA*TACA*GACTTTGAGATTTG
TGGATTGG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4DA96TF 643 0 0
G
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AACCGCCACATACTCTCGTTCAATTCCAGTGGTAAAAGAACCAGAACACTCTCCACTAAC
GCTTCTACGATAAGATGCGGAGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGC
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TTACCTCATTTTATACTGTTCAAGGATGATAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGT
GCTATTACAAAGGCCAAGCTTAAGGACTACATTGATGGTCTCTTGACTTCTATATCTGTT
GCTTAATGGTCTCTCTCCACTGGTATTTTCTCATTCCTCAACCACACTGTTTGTCTTGTA
AACACACACTCTCTTGAGTTGTGATCTTTATCAACCGTTTTGTTACCAAATGTGTAAATC
TAGCAACAGAATTTTATTAATACAAGACTTTGAGATTTGTGG

QA 2 643 2 643
DS 



AS 3 14

CO CL152Contig1 806 6 4 U
GATCACTAAATTTTTGTTTTCTCGGCAAAAGCAACATAATATAATATCCACCATATTAGC
ACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCGGACGATTAGGAAAAAGATAACT
AAAACTTGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCGAAAGAG
GATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGATTTCAAGCAGCTGCACTGTGTTTGGCCT
TTGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCACCCAA
ATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGC
TCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGATTCTG
ATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGCTT
CTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGAGT
CATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTCAA
CCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCACTATCAT
CTTCATCCTCATCATCATCTTGCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCAACTGAAAGTTCA
CCTGCTTCACACCTGATTTCGAAACAGCTGGCTCAGCAAGCTCATCGTCATCAGACTCAG
AATCAGATTCATGAGCATCAACTATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT22JQ U 15
AF RR4AF57JQ U 1
AF RR4AF57TF C 1
AF RR4GN73JQ U 41
AF RR4GK59JQ U 41
AF RR4BS51JQ U 233
BS 1 160 RR4AF57JQ
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RD RR4BT22JQ 388 0 0
TT
TTTTTTCGGCAAAAGCAACATAATATAATATCCACCATATTAGCACTAAACATAAAGGGT
TCAGAAAAGTTTCGTCTACCCGGACGATTAGGAAAAAGATAACTAAAACTTGTTCACTCG
CAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCGAAAGAGGATTATGGATAGTCTC
TTTCTTCTTCATCAGATTTCAAGCAGCTGCACTGTGTTTGGCCTTTGTGTGAGACTGCAA
GCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCACCCAAATGCACCTGCAGACTT
GGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGA
TGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGT

QA 3 388 3 388
DS 

RD RR4AF57JQ 710 0 0
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AAAACTTGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAGACATCAAAAGTCGAAAGAG
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CTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGAGT
CATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTCAA
CCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCACTATCAT
CTTCATCCTCATCATCATCTTGCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCA
CC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4AF57TF 710 0 0
GATCACTAAATTTTTGTTTTCTCGGCAAAAGCAACATAATATAATATCCACCATATTAGC
ACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCGGACGATTAGGAAAAAGATAACT
AAAACTTGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAGACATCAAAAGTCGAAAGAG
GATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGATTTCAAGCAGCTGCACTGTGTTTGGCCT
TTGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCACCCAA
ATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGC
TCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGATTCTG
ATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGCTT
CTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGAGT
CATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTCAA
CCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCACTATCAT
CTTCATCCTCATCATCATCTTGCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCA
CC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4GN73JQ 689 0 0
ATAATATCCACCATACTAGCACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCGGA
CGATTAGGAAAAAGATAACTAAAACTTGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAA
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CTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGAC
GTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGC
AGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGG
GGTCTCCTCGTCTGATGAGTCATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATC
ATCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGC
ATCCTCATCATCACTATCATCTTCATCCTCATCATCATCTTGCTCGGCCTTGGCATCATC
ATTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGCTTCA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4GK59JQ 766 0 0
ATAATATCCACCATACTAGCACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCGGA
CGATTAGGAAAAAGATAACTAAAACTTGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAA
AACATCAAAAGTCGAAAGAGGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGATTTCAAGC
AGCTGCACTGTGTTTGGCCTTTGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCT
GTTGCAGGAGCTGCACCCAAATGCACCTGCAGAATTGGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAGGT
CTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGAC
GTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGC
AGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGG
GGTCTCCTCGTCTGATGAGTCATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATC
ATCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGC
ATCCTCATCATCACTATCATCTTCATCCTCATCATCATCTTGCTCGGCCTTGGCATCATC
ATTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGCTTCACACCTGATTTCGAAACAGCTGGCTCAGCAAG
CTCATCGTCATCAGACTCAGAATCAGATTCATGAGCATCAACTATG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BS51JQ 575 0 0
TTTGGCCTTTGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCT
GCACCCAAATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACT
TCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTT
CGATTCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGTAGTCTTCGAGGT
GTTGGCTTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTCCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTC
TGATGAGTCATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTC
AGCTTCAACCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATC
ACTATCATCTTCATCCTCATCATCATCTTGCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCAACTG
AAAGTTCACCTGCTTCACACCTGATTTCGCAACAGCTGGCTCAGCAAGCTCCTCGTCATC
AGACTCAGAATCAGATTCATGAGCATCA
CTATGTA

QA 1 568 1 568
DS 



CO CL152Contig2 789 6 8 U
GGGTCAGCACACTCGGCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCC
GTCGCAACCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGAT*********GGAGTTCTGGGGTGTTGAA
GTTAAGGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCA
CTGGCTGCTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAA
GTTGAAGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGC
ACGGAGATTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTT
TTCTTCACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGAAGAG
CTTGCTGAGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAAT
GATGATGCCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATGATAGTGATGATGAGGAT
GCTGACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGAT
GATGAAGACTCATCTGACGAAGAGGAAGATGAGGAGGATGACTCATCAGACGAGGAGACC
CCAGAGAAGAACGTTGAAGAAGCCAAGAAGAGGCTGAGAAGCAACACCTCGAAGACTGCT
CAAACAGAAGCTAAATTCGTACTCCTCAGAAATCAGAATCGAGAGCCACACGTCTACGTT
GCGACTCGC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 5 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN73TF U 4
AF RR4BS51TF U 1
AF RR4EI66TF U 4
AF RR4GK59TF U 4
AF RR4ET87TF U 5
AF RR4CK26TF U 5
BS 1 307 RR4BS51TF
BS 308 308 RR4EI66TF
BS 309 416 RR4BS51TF
BS 417 417 RR4CK26TF
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BS 658 666 RR4EI66TF
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RD RR4GN73TF 566 0 0
GG
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AACCGTTACCGTC*****GTTACCGAT*********GGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAA
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TGCTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAAGTTGA
AGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGA
GATTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTT
CACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGATGAGCTTGC
TGAGCCAGCTGTTTCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGA
TGCCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATGATAGTGATGATGAGGATGCTGA
CTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAA

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR4BS51TF 657 0 0
GGGTCAGCACACTCGGCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCC
GTCGCAACCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGAT*********GGAGTTCTGGGGTGTTGAA
GTTAAGGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCA
CTGGCTGCTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAA
GTTGAAGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGC
ACGGAGACTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTT
TTCTTCACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGAGGAG
CTTGCTGAGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAAT
GATGATGCCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATGATAGTGATGATGAGGAT
GCTGACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGAT
GATGAAGACTCATCTGACGAAGAGGAAGATGAGGAGGATGACTCATCAGACGAGGAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4EI66TF 663 0 0
GG
AGCACACTCGGCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCCGTCGC
AACCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGAT*********GGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAA
GGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGC
TGCTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAAGTTGA
AGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGA
GATTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGACGGGAGTGTTTTCTT
CACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGC
TGAGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGA
TGCCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATGATAGTGATGATGAGGATGCTGA
CTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGA
AGACTCATCTGACGAAGAGGAAGATGAGGAGGATGACTCATCAGACGAGGAGACCCCAGA
G

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR4GK59TF 687 0 0
GG
AGCACACTCGGCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCCGTCGC
AACCGTTACCGTC*****GTTACCGAT*********GGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAA
GGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGC
TGCTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAAGTTGA
AGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGA
GATTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTT
CACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGATGAGCTTGC
TGAGCCAGCTGTTTCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGA
TGCCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATGATAGTGATGATGAGGATGCTGA
CTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGA
AGACTCATCTGACGAAGAGGAAGATGAGGAGGATGACTCATCAGACGAGGAGACCCCAGA
GAAGAACGTTGAAGAAGCCAAGAAG

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR4ET87TF 658 0 0
GAC
CACACTCGGCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCT*CGCTTCTCCGTCGCAA
CCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGATTGTATCAATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGG
GTGGCGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGCTG
CTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTCCAGCTCTACACGAAAGTTGAAG
ATCAAAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGA
TTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAACTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCA
CCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGAAGAGCTTGCTG
AGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAACAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGATG
CCAAGGCCGAGGAAGATGATGATGA***TGAGGATGATAGTGATGATGAGGATGCTGACT
CTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGAAG
ACTCATCTGACGAAGAGGAAGATGAGGAGGATGACTCATCAGATGAGGAGACCCC

QA 4 658 4 658
DS 

RD RR4CK26TF 785 0 0
GAC
CACACTCGGCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCT*CGCTTCTCCGTCGCAA
CCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGATTGTATCAATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGG
GTGGCGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGCTG
CTCTAGGCGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTCCAGCTCTACACGAAAGTTGAAG
ATCAAAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCCGTGCACGGAGA
TTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAACTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCA
CCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGAAGAGCTTGCTG
AGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAACAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGATG
CCATGGCCGAGGAAGATGATGATGA***TGAGGATGATAGTGATGATGAGGATGCTGACT
CTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGAAG
ACTCATCTGACGAAGAGGAAGATGAGGAGGATGACTCATCAGACGAGGAGACCCCAGA*A
AGAA*GTTGAAGAAGCCAAGAAGAGGCTGAGAAGCAACACCTCGAAGACTGCTCAAACAG
AAGCTAAATTCGTACTCCTCAGAAATCAGAATCGAGAGCCACACGTCTACGTTGCGACTC
GC

QA 4 785 4 785
DS 



CO CL152Contig3 867 2 3 U
ATAATATCCACCATATTAGCACTAAACATAAACGGTTCAGGATAGTTTCGTCTACCCTGA
CGATTAGGAAAAAGATAACTAAAACTGGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAA
AACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAAATTTCAAGC
AGCTGCACTGTGTTTGGCCTTCGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCT
GTTGCAGGAGCTGCACCCAAATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAAGT
CTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGAC
GTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGC
AGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCTCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTTTCTGGG
GTCTCCTCGTCTGATGAGTCATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATCA
TCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCA
TCCTCATCATCACTATCATCCTCATCATCATCATCTTCCTCGGCCATGGCATCATCATTA
GGCAACTGAAAGTTCACCTGTTTCACACCTGATTTCGCAACAGCTGGCTCAGCAAGCTCT
TCGTCATCAGACTCAGAATCAGATTCATGAGCATCAACTATGTAGCCGTGAAGAAAACAC
TCCCATCCTTCCAGCTATGAGACAGTTCAAAGACTTGGCACACATCTCCGTGCACGGCTG
AGAAACTTATCATGCGAGAGCGTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET87JQ U 55
AF RR4CK26JQ U 1
BS 1 170 RR4CK26JQ
BS 171 171 RR4ET87JQ
BS 172 867 RR4CK26JQ

RD RR4ET87JQ 170 0 0
CCCT
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AAAACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAAATTTCAA
GCAGCTGCACTGTGTTTGGCCTTCGTGTGAGACTGCAAGCCCATCT

QA 5 170 5 170
DS 

RD RR4CK26JQ 867 0 0
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CGATTAGGAAAAAGATAACTAAAACTGGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAA
AACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGATTTCAAGC
AGCTGCACTGTGTTTGGCCTTCGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCT
GTTGCAGGAGCTGCACCCAAATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTTCGAAGT
CTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGAC
GTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGC
AGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCTCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTTTCTGGG
GTCTCCTCGTCTGATGAGTCATCCTCCTCATCTTCCTCTTCGTCAGATGAGTCTTCATCA
TCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCA
TCCTCATCATCACTATCATCCTCATCATCATCATCTTCCTCGGCCATGGCATCATCATTA
GGCAACTGAAAGTTCACCTGTTTCACACCTGATTTCGCAACAGCTGGCTCAGCAAGCTCT
TCGTCATCAGACTCAGAATCAGATTCATGAGCATCAACTATGTAGCCGTGAAGAAAACAC
TCCCATCCTTCCAGCTATGAGACAGTTCAAAGACTTGGCACACATCTCCGTGCACGGCTG
AGAAACTTATCATGCGAGAGCGTCCAT

QA 1 867 1 867
DS 



AS 1 13

CO CL153Contig1 1403 13 11 U
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CCTAATGAAGTCTCTGTTGAGACTATCGATGGAGGAAACACTGTTGTGAAGGGCAAGCAC
ATCATTGTTGCTACCGGCTCTGACGTCAAGTCTTTGCCTGGTATTACAATCGATGAGAAG
AAGATTGTTTCGTCGACTGGAGCCTTGTCTTTGTCTCAAGTCCCCAAGAAACTGATTGTG
ATTGGTGCTGGATATATTGGGCTGGAGATGGGTTCTGTTTGGGGAAGGCTTGGATCAGAG
GTCACGGTGGTTGAGTTTGCTGCGGATATTGTTCCTTCTATGGATGGTGAGATCCGTAAG
CAGTTTCAGCGTTCTCTTGAGAAGCAAAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTA
TCCGTGGACGCCTCTGGAGACGGTGTGAAGCTCACGGTGGAGCCAGCTGAAGGTGGAGAG
CAGACCACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACGCCCTTCACTTCT
GGACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGAAGAATTTTGGTGAAC
GAGAGGTTCTTGACCAATGTCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTGATTCCAGGACCA
ATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAA
CACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGC
TTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGAA
GTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAA
GATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACGC
TGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATAT
TGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGGC
CACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAAA
GGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCGGG*TTGGATTTGGT
TCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCG
TTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCTA
CATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTTCTGATTTA
CGTTTAACCCCCAACTTTTATCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D924TF U 1
AF RR4D611TF U 1
AF RR4FG52TF U 419
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AF RR4AL84TF U 526
AF RR4AL84JQ C 560
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AF RR4CE57JQ C 713
BS 1 650 RR4D611TF
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BS 1116 1178 RR4AL84TF
BS 1179 1179 RR4CF95TF
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BS 1298 1384 RR4CE57TF
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CCTAATGAAGTCTCTGTTGAGACTATCGATGGAGGAAACACTGTTGTGAAGGGCAAGCAC
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CAGACCACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACGCCCTTCACTTCT
GGACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAACTGA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4D611TF 650 0 0
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CCTAATGAAGTCTCTGTTGAGACTATCGATGGAGGAAACACTGTTGTGAAGGGCAAGCAC
ATCATTGTTGCTACCGGCTCTGACGTCAAGTCTTTGCCTGGTATTACAATCGATGAGAAG
AAGATTGTTTCGTCGACTGGAGCCTTGTCTTTGTCTCAAGTCCCCAAGAAACTGATTGTG
ATTGGTGCTGGATATATTGGGCTGGAGATGGGTTCTGTTTGGGGAAGGCTTGGATCAGAG
GTCACGGTGGTTGAGTTTGCTGCGGATATTGTTCCTTCTATGGATGGTGAGATCCGTAAG
CAGTTTCAGCGTTCTCTTGAGAAGCAAAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTA
TCCGTGGACGCCTCTGGAGACGGTGTGAAGCTCACGGTGGAGCCAGCTGAAGGTGGAGAG
CAGACCACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACGCCCTTCACTTCT
GGACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGAAGAATTTTGGTGAAC
GAGAGGTTCTTGACCAATGTCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTGAT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4FG52TF 703 0 0
G
ATCCGTGGACGCCTCTGGAGACGGTGTGAAGCTCACGTTGGAGCCAGCTGAAGGTGGAGA
GCAGACCACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACGCCCTTCACTTC
TGGACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGAAGAATTTTGGTGAA
CGAGAGGTTCTTGACCAATGTCTCGAGAGTGTATGCGATTGGAGATGTGATTCCAGGACC
AATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAA
ACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTG
CTTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGA
AGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTA
AGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACG
CTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATA
TTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGG
CCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAA
CAGAAT

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR4CF95TF 668 0 0
G
GACAAAGGTGGAAGAATTTTGGTGAACGAGAGGTTCTTGACCAATGTCTCGGGAGTGTAT
GCGATTGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTT
GCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGG
TGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCTTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAA
AGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTATAGCTAAGGC
CATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTT
GGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGAT
AAACTATGACGCATCAAGTGAAGATATTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAG
TGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGGCCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGC
AAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTC
TATATCTTAACCGGG*TTGGATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATC
CTTTCAT

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR4AL84TF 767 0 0
GCGCCCTTCACTTCTG
GACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGAAGAATTTTGGTGAACG
AGAGGTTCTTGACCAATGTCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTGATTCCAGGACCAA
TGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAAC
ACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCT
TCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGAAG
TTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAG
ATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACTCT
GGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATATT
GCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGGCC
GCCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAAAG
GAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATTTTAACCGGGGTTGGATTTGGTT
CGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCGT
TAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGC

QA 17 767 17 767
DS 

RD RR4AL84JQ 771 0 0
TCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGAAGAATTTTGGTGAACGAGAGGTTCTTGACCAATG
TCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCTTGCTCACAAAGCTG
AAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAACACGGCC*ATGTGGATTAC
GACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCTTCGGTCGGTAAAACCGAA
GAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAAT
AGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAG
ACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACTCTGGAGAGCTGATCCATGAG
GCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATATTGCTCGAGTCTGCCACGCT
CATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGGCCGCCTATGACAAGC*CGAT
TCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGA
TGCAAAGACTATTCTATATTTTAACCGGG*TTGGATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGTTTAT
CCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATG
TTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCTACATTCACTC
C

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4D924JQ 731 0 0
GATGTGATTCCAGGACCAATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTG
GAGTTCATAGCAGGCAAACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTA
CACGCATCCAGAGGTTGCTTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGC
GAGCTATCGTGTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAA
TGCTGAAGGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCCTGGGCGTTCA
CATTATGTCTCCAAACGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGA
CGCATCAAGTGAAGATATTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCT
CAAGGAAGCTGCCATGGCCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAAT
AGGAGGACCGACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTA
ACCGGG*TTGGATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGTT*ATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTT
TCTGGTGGATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGA
TCCGTAATAATACTTCTACATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTC
GGTTCGAGTTC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4AL66JQ 725 0 0
ATGTGATTCCAGGACCAATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGG
AGTTCATAGCAGGCAAACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTAC
ACGCATCCAGAGGTTGCTTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTG
AGCTATCGTGTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAAT
GCTGAAGGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCAC
ATTATGTCTCCAAGCGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGAC
GCACCAAGTGAAGATATTGCTCGAGTTTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTC
AAGGAAGCTGCCATGGCCACCTATGACAAGCTCGATTCACATCTAAATGCAAACAG****
*GAGGACCGACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTTTATATTTTAA
CCGGG*TTGGATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTT
CTGGTGGATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGGTTAGGCCTGAT
CCGTAATAATACTTTTACATTCACTTTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTCG
GTTCG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4D611JQ 589 0 0
GTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGCGAGCTATCGTGTTGGGAAGTTC
CCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAGATT
TTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCCTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACGCTGGA
GAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATATTGCT
CGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGGCCACC
TATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAAAGGAG
AGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCGGG*TTGGATTTGGTTCGG
TTTTCTGTGGTT*ATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCGTTAG
TTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCTACATT
CACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4FG52JQ 726 0 0
AATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAA
ACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTG
CTTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGA
AGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTA
AGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACG
CTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATA
TTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGG
CCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAA
AGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCGGG*TTGGATTTGG
TTCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTC
GTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCT
ACATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTTCTGATTT
ACGTT
T

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4CE57TF 708 0 0
G
GCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGG
TGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCTTCGGTCGGTAAAGCCGAAGAACAGTTGAAGAA
AGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGC
CATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTT
GGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGAT
AAACTATGACGCATCAAGTGAAGATATTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAG
TGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATCGCCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGC
AAACAGAATAGGAGGACCGACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTC
TATATCTTAACCGGG*TTGGATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATC
CTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCT
TAG*CCTGATCCGTAATAATACTTCTACATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAA
ACCAAGTTCGGTTCGAGTTCTGATTTACGTT
AACCCCAACTTTATCT

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR4DM48TF 677 0 0
G
TAGCAGGCAAACACGGCC*ATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTACTACACGCAT
CCAGTGGTTGCTTCGGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTAT
CGTGTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAA
GGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATG
TCTCCAAACGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCA
AGTGAAGATGTTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAA
GCTGCCATGGCCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGA
CCGACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCGGG*
TTGGATTTGATTCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTG
GATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAA
TAATACTTCTACATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGA
GTTCTGATTTACGTT
T

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4CE57JQ 691 0 0
CAGGCAAACACGGCCCATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCA
GAGGTTGCTTCGGTCGGTAAAGCCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGT
GTTGGGAAGTTCCCGTTTATGGCTAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGA
TTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCT
CCAAACGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCTGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGT
GAAGATATTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCT
GCCATCGCCACCTATGACAAGC*CGATTCACATCTAAATGCAAACAGAATAGGAGGACCG
ACCGTAAAGGAGAGAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCGGG*TTG
GATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGAT
TTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAA
TACTTCTACATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATTGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTT
CTGATTTACGTTTAACCCCCAACTTTTATCT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 11

CO CL154Contig1 699 11 10 U
GGGATTGTTGTCGGCCATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCT
CGACGATCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTC
CAGCGAATCCAGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGG
CTCAGAAAACCATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGA
TTCTGAAAGAAATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCT
TACAACACACAAGCGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTG
ATACTGAGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATA
CCATGGAAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGC
TCACAATCCCAATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTAT
GTGAACACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGA
TATACATGTTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGGATGT
TGTTCACTTTTTTTT*CTATGAAACAATGCTCTGCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 10 10 10 

AF RR4DZ84TF U 15
AF RR4F083TF U 2
AF RR4GY23TF U 2
AF RR4F735TF U 1
AF RR4H731TF U 5
AF RR4H731JQB C 5
AF RR4FW21TF U 15
AF RR4F735JQ C 22
AF RR4GY23JQ C 71
AF RR4FW21JQ C 549
AF RR4DZ84JQ C 477
BS 1 317 RR4F735TF
BS 318 318 RR4DZ84TF
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BS 581 581 RR4F083TF
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BS 697 699 RR4GY23JQ

RD RR4DZ84TF 464 0 0
GG
ATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGATCTTCTTCTC
TGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGAATCCAGCAAC
CGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGAAAACCATCAC
TCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGAAAGAAATTGG
ACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAACACACAAGCGC
TTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTGAGACTTTCTT
GAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGGAAGGTCCAGA
TGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGAATGTCA

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR4F083TF 636 0 0
GGATT
GTTGTCGGCCATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGA
CCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGA
ATCCAGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGA
AAACCATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGA
AAGAAATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAAC
ACACAAGCGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTG
AGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGG
AAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGACGTCAGCTCACAA
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ACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACA
TGTTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTT

QA 6 636 6 636
DS 

RD RR4GY23TF 639 0 0
GGATT
GTTGTCGGCCATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGA
TCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGA
ATCCAGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGA
AAACCATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGA
AAGAAATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAAC
ACACAAGCGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTG
AGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGG
AAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGCTCACAA
TCCCAATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAAC
ACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACA
TGTTTAAAGGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACT

QA 6 639 6 639
DS 

RD RR4F735TF 696 0 0
GGGATTGTTGTCGGCCATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCT
CGACGATCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTC
CAGCGAATCCAGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGG
CTCAGAAAACCATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGA
TTCTGAAAGAAATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCT
TACAACACACAAGCGCTCCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTG
ATACTGAGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATA
CCATGGAAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGC
TCACAATCCCAATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTAT
GTGAACACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTTACACTCAATGGAATCTAGA
TATACATGTTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACG*TCTTGTAATGGATGT
TGTTCACTTTTTTTTTCTATGAAACAATGCTCTGCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4H731TF 701 0 0
GG
GTTGTCGGCCATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGA
TCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGA
ATCCAGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGA
AAACCATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGA
AAGAAATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAAC
ACACAAGCGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTG
AGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGG
AAGGTCCGGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGCTCACAA
TCCCAATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAAC
ACCGTGATGCTCCAACAGCACACAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACA
TGTTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACG*TCTTGTAATGGATGTTGTTCA
CTTTTTTTT*CTATGAAACAATGCTCTGC
CAAAAAAAAA

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4H731JQB 692 0 0
GG
GTTGTCGGCCATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGA
TCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGA
ATCCAGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGA
AAACCATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGA
AAGAAATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAAC
ACACAAGCGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTG
AGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGG
AAGGTCCGGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGCTCACAA
TCCCAATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAAC
ACCGTGATGCTCCAACAGCACACAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACA
TGTTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGGATGTTGTTCA
CTTTTTTTT*CTATGAAACAATGCTCTGC
C

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4FW21TF 655 0 0
GG
ATTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGATCTTCTTCTC
TGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGAATCCAGCAAC
CGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGAAAACCATCAC
TCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGAAAGAAATTGG
ACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAACACACAAGCGC
TTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTGAGACTTTCTT
GAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGGAAGGTCCAGA
TGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGCTCACAATCCCAATAAC
AAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAACACCGTGATGC
TCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACATGTTTAA*GG
GCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGGATGTTGTTCACTT

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR4F735JQ 675 0 0
TATTTGGGCTTAAGAGAGAAACAAAAGCTATGCAGAGCTCGACGATCTTCTTCTCTGGTG
TTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGAATCCAGCAACCGATC
GAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGAAAACCATCACTCTTC
CACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGAAAGAAATTGGACAAG
ATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAACACACAAGCGCTCCTC
TTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTGAGACTTTCTTGAACA
CCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGGAAGGTCCAGATGACA
TGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGCTCACAATCCCAATAACAAAAG
GAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAACACCGTGATGCTCCAA
CAGCACGCAAAGTTGTGGTTACACTCAATGGAATCTAGATATACATGTTTAA*GGGCTTT
GTAACCTCGTGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGGATGTTGTTCACTTTTTTTT*CTATG
AAACAATGCTCTGCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4GY23JQ 629 0 0
CTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTACTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAGCGAATCC
AGCAACCGATCGAGTTTCCATGGCGAGTCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTCAGAAAAC
CATCACTCTTCCACCGCAACGCCGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTCTGAAAGA
AATTGGACAAGATCTGTCGGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAACACAC
AAGCGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTGAGAC
TTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGATCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGGAAGG
TCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTTGGATGTCAGCTCACAATCCC
AATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAACACCG
TGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACATGTT
TAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGGATGTTGTTCACTTT
TTTTT*CTATGAAACAATGCTCTGCTAGC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4FW21JQ 123 0 0
CGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAGATATACATG
TTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGGGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGGATGTTGTTCACT
TTT

QA 1 123 1 123
DS 

RD RR4DZ84JQ 221 0 0
CAGCTCACAATCCCAATAACAAAAGGAAAACTTGGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGG
CTATGTGAACACCGGGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATC
TAGATATACATGTTTAA*GGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGGTCTTGTAATGG
ATGTTGTTCACTTTTTTTT*CTATGAAACAATGCTCTGCT
A

QA 1 220 1 220
DS 



AS 2 12

CO CL155Contig1 973 10 19 U
AGAGATTTGTGTCTACTTAAACTATACACACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATG
TAGCACAAACTGCAAATAACTATCACAGAAGAGCTTTTGAAAGTGAATCTGATGACTATA
TTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTTTTTGCTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTC
GCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGA
AAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGA
TATGCGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATG
TATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATT
GCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCA
TACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCA
ACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTTCATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCG
AGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCACAACACTG
CAAATTCTTGAAAACCTTCTCCTAC***CAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAG
AGGCTATGCGAGAAAGCCAATCTTCCGGAGAAACAAGGACCGGAGTAAGTAACCTTATTA
GAAAGTGTTCCTATACCACATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGA
TGACTTGAAACAATGCTCATCATCTCCTAGAAGTTGAGGGATCACGTAAGCTTACCGCCG
TGAGGGAGAGCACGACGGTGATGCGGGAGAGGAGATGAGGAGAAGGAGAAATAAGAGATA
AATAAAGCAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 55 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO61JQ U 15
AF RR4FH51JQ U 98
AF RR4B510JQ U 1
AF RR4FO61TF C 143
AF RR4DS30JQ U 26
AF RR4CG60JQ U 158
AF RR4B510TF C 83
AF RR4DS30TF C 188
AF RR4CG60TF C 257
AF RR4AA10TF C 258
BS 1 149 RR4B510JQ
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BS 151 170 RR4B510JQ
BS 171 171 RR4FO61JQ
BS 172 179 RR4B510JQ
BS 180 180 RR4FO61JQ
BS 181 535 RR4B510JQ
BS 536 536 RR4FO61JQ
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BS 790 850 RR4DS30JQ
BS 851 851 RR4CG60JQ
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BS 867 867 RR4CG60JQ
BS 868 874 RR4DS30JQ
BS 875 875 RR4CG60JQ
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BS 891 944 RR4B510TF
BS 945 962 RR4DS30TF
BS 963 973 RR4AA10TF

RD RR4FO61JQ 572 0 0
G
CTTAAACTATACACACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAA
ATAACTATCACAGAAGAGCTTTTGAGAGTGAATCTGATGACTATATTTTTAGATACAAAA
GGTTTTTTTTTT*GCTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGT
AAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCT
TCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTC
CCC*AGCATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTT
AGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTC
CCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATG
AGTGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGA
TTTGCCCGGTTCATATCGTTCGCTTCCCTTT

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR4FH51JQ 580 0 0
C
GAAAGTGAATCTGATGACTATATTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTTTTTGCTTTCTTTG
GTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCA
CCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTG
GACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTTGC
TACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCT
GTACTTCCACATGACGTTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAG
CTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAGATCTAAGCCGTT
AAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTTCATATCGTTCGC
TTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGAACTATCTGGATT
CATGCCGTCATCCACAACACTGCAAATTCTTGAAAACCT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR4B510JQ 789 0 0
AGAGATTTGTGTCTACTTAAACTATACACACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATG
TAGCACAAACTGCAAATAACTATCACAGAAGAGCTTTTGAAAGTGAATCTGATGACTATA
TTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTTTTTGATTTCTTTGGTTTAGGATTTGCAAACCGGTA
GCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGA
AAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGA
TATGCGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATG
TATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATT
GCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCA
TACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGGCCCA
ACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTTCATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCG
AGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCACAACACTG
CAAATTCTTGAAAACCTTCTCCTAC***CAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAG
AGGCTATGCGAGAAAGCCAATCTTCCGGAGAAACAAGGACCGGAGTAAGTAACCTTATTA
GAAAGTGTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4FO61TF 697 0 0
TTTTTTGCTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGTAAATCCA
TTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTAT
CCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCCCC*AGC
ATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAA
AAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGA
ACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTG
CAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCC
GGTTCATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTAGTCAT
CCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCGCAACACTGCAAAATCTTGAAAACCTTCTCC
TACTACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCCAATC
TTCCGGAGAAACAGGGACCGGAGTAAGGAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTATACCGCATC
GTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGT
C

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4DS30JQ 865 0 0
C
CACACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAATAACTATCAC
AGAAGAGCTTTTGAAAGTGAATCTGATGACTATATTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTTT
TTGCTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCG
TTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTG
GGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCCCC*AGCATTT
CAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGA
CCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTC
CTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAG
ATCTAAGCCGTTAAACGCAAAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTT
CATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGA
ACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCACAACACTGCAAATTCTTGAAAACCTTCTCCTAC*
**CAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATTCGAGAAAGCCAATCTTCC
GGAGAAACAAGGACCGGAGTAAGTAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTATACCACATCGTTG
TTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAA*AATGCTCATCATCTC
*TAGAAGT*GAGGGATCACGTAAG

QA 2 865 2 865
DS 

RD RR4CG60JQ 718 0 0
GGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCC
ACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTT
GGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTTG
CTACATCGTCAAGTATTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTC
TGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGA
GCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAGATCTAAGCCGT
TAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTTCATATCGTTCG
CTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGAACTATCTGGAT
TCATGCCGTCATCCACAACACTGCAAATTCTTGAAAACCTTCTCCTAC***CAGTTTGCT
CCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCCAATCTTCCGGAGAAACAAG
GACCGGAGTAAGTAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTATACCACATCGTTGTTCGTGTGTAA
ACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGCTCATCATCTCCTAGAAGTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4B510TF 862 0 0
TATCACAGAGAGC
TTTGAAAGTGAATCTGATGACTATATTTT*AGATACAAAAGGTTTTTTTTTTTGATTTCT
TTGGTTTAGGATTTGCAAACCGGTAGCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGT
CCAC*TGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATC*TGGGTCGCTCT
TTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTT
TGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTC
TCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGAT
GAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAGATCTAAGCC
GTTAAACGCAGAATCATCCGGCCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTTCATATCGTT
CGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGAACTATCTGG
ATTCATGCCGTCATCCACAACACTGCAAATTCTTGAAAACCTTCTCCTAC***CAGTTTG
CTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCCAATCTTCCGGAGAAACA
AGGACCGGAGTAAGTAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTATACCACATCGTTGTTCGTGTGT
AAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGCTCATCATCTCCTAGAAGTT
GAGGGATCACGTAGGCTTACCGCCGTGAGGGAGAGCACGACGGTGATGCGGGAGAGGAGA
TGAGGAGAA

QA 14 862 14 862
DS 

RD RR4DS30TF 779 0 0
TTACTTGTAAATCCAT*CGTTTGCTCGTCCAC*TGT*GAATCCATGTCTATGAAAATGCT
AACAGC*TTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGA
GACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTT
CTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAA
GATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCT
GCCTGATGAGTGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTC
TTTCAAGATTTGCCCGGTTCATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATT
CCTTTTCCTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCACAACACTGCAAATTC
TTGAAAACCTTCTCCTAC***CAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTAT
TCGAGAAAGCCAATCTTCCGGAGAAACAAGGACCGGAGTAAGTAACCTTATTAGAAAGTG
TTCCTATACCACATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTG
AAACAATGCTCATCATCTCCTAGAAGTTGAGGGATCACGTAAGCTTACCGCCGTGAGGGA
GAGCACGACGGCGATGCGGGAGAGGAGATGAGGAGAAGGAGAAATAAGAGATAAA
AAAA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4CG60TF 710 0 0
CCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCC
CC*AGCATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTATTAATATGTATTCTTCTTCGGTTA
GAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCC
CCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGA
GTGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGAT
TTGCCCGGTTCATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCT
CGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCACAACACTGCAAATTCTTGAAAACC
TTCTCCTAC***CAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAG
CCAATCTTCCGGAGAAACAAGGACCGGAGTAAGTAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTATAC
CACATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGC
TCATCATCTCCTAGAAGTTGAGGGATCACGTAAGCTTACCGCCGTGAGGGAGAGCACGAC
GGTGATGCGGGAGAGGAGATGAGGAGAAGGAGAAATAAGAGATAAA
AAAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4AA10TF 716 0 0
CCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATACGCGAGACCGCTCCC
CCAGCATTTCAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAG
AGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCC
CATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAG
TGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATT
TGCCCGGTTCATATCGTTCGCTCCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTC
GTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCGCAACACTGCAAAATCTTGAAAACCT
TCTCCTACTACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAA*GC
CAATCTTCCGGAGAAACAGGGACCGGAGTAAGGAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTATACC
GCATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGCT
CATCATCTCCTAGAAGTCGAGGGATTACGTAAGCTTACCGCCGTGAGGGAAAGCACGACG
GTGATGCGGGGGAGGAGATGAGGAGAAGGAGAAATAAGAGATAAATAAAGCAGTCC

QA 1 716 1 716
DS 



CO CL155Contig2 768 2 12 U
ACACACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAATAACTATCA
CAGAAGAGCTTTTGAAAGTGAATCTGATGACTATATTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTT
TGTACTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTC
GTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTACGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCT
GGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATACGCGAGACCGCTCCCCAGCATTT
CAACATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGA
CCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTC
CTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAG
ATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTT
CATATCGTTCGCTCCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGA
ACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCGCAACACTGCAAAATCTTGAAAACCTTCTCCTACT
ACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCCAATCTTCC
GGAGAAACAGGGACCGGAGTAAGGAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTAT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CN17JQ U 1
AF RR4AA10JQ U 3
BS 1 122 RR4CN17JQ
BS 123 124 RR4AA10JQ
BS 125 160 RR4CN17JQ
BS 161 161 RR4AA10JQ
BS 162 277 RR4CN17JQ
BS 278 278 RR4AA10JQ
BS 279 322 RR4CN17JQ
BS 323 323 RR4AA10JQ
BS 324 553 RR4CN17JQ
BS 554 554 RR4AA10JQ
BS 555 726 RR4CN17JQ
BS 727 768 RR4AA10JQ

RD RR4CN17JQ 726 0 0
ACACACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAATAACTATCA
CAGAAGAGCTTTTGAAAGTGAATCTGATGACTATATTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTT
TG**CTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTT*GTTACTTGTAAATCCATTC
GTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTACGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCT
GGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGCGAGACCGCTCCCCAGCATTT
CAACATGTTTGCTACATCGTCA*GTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGA
CCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTC
CTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAG
ATCTAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTT
CATATCGTTCGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGA
ACTATCTGGATTCATGCCGTCATCCGCAACACTGCAAAATCTTGAAAACCTTCTCCTACT
ACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCCAATCTTCC
GGAGAA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4AA10JQ 766 0 0
C
CACATGTAATACATGATTTGAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAATAACTATCACAG
AAGAGCTTTTGAAAGTGAATCTGATGACTATATTTTTAGATACAAAAGGTTTTTTTTTTT
ACTTTCTTTGGTTTAGGATTTGTAAACCGGTCGCTTTTGTTACTTGTAAATCCATTCGTT
TGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGG
TCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATACGCGAGACCGCTCCCCAGCATTTCAA
CATGTTTGCTACATCGTCAAGTCTTAATATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCT
CTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTT
CTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTTCCATACTTCTGCCTGATGAGTGTTGCAAGATC
TAAGCCGTTAAACGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGATTTGCCCGGTTCAT
ATCGTTCGCTCCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCCTCGTCATCCGAACT
ATCTGGATTCATGCCGTCATCCGCAACACTGCAAAATCTTGAAAACCTTCTCCTACTACC
AGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAA*GCCAATCTTCCGGA
GAAACAGGGACCGGAGTAAGGAACCTTATTAGAAAGTGTTCCTAT

QA 2 766 2 766
DS 



AS 2 14

CO CL156Contig1 883 11 32 U
GACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACA
ATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTAT
AGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAG
GTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCG
TGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTG
TAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCT
TGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAA
ATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAA
TGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCC
TGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGA
TTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCC
TCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATAT
AATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTG
TCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGTGCTTAT
TTTAGTACCTGGTTTTGGTTACAAAGATATTTCTATTCTTGAG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 50 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 35 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 50 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR92TF U 1
AF RR4FV38TF U 1
AF RR4DS29TF U 3
AF RR4G622TF U 3
AF RR4BR92JQ C 40
AF RR4DS29JQ C 142
AF RR4DL68TF U 8
AF RR4G622JQ C 41
AF RR4DL68JQ C 30
AF RR4B314TF U 263
AF RR4EH40JQ C 163
BS 1 378 RR4BR92TF
BS 379 379 RR4FV38TF
BS 380 606 RR4BR92TF
BS 607 607 RR4FV38TF
BS 608 629 RR4BR92TF
BS 630 632 RR4FV38TF
BS 633 633 RR4G622TF
BS 634 667 RR4FV38TF
BS 668 668 RR4G622TF
BS 669 685 RR4FV38TF
BS 686 688 RR4G622TF
BS 689 703 RR4FV38TF
BS 704 704 RR4G622TF
BS 705 707 RR4FV38TF
BS 708 721 RR4DS29TF
BS 722 722 RR4G622TF
BS 723 726 RR4DS29TF
BS 727 727 RR4G622TF
BS 728 730 RR4DS29TF
BS 731 731 RR4G622TF
BS 732 743 RR4DS29TF
BS 744 744 RR4G622TF
BS 745 747 RR4DS29TF
BS 748 748 RR4B314TF
BS 749 755 RR4DS29TF
BS 756 756 RR4DL68TF
BS 757 764 RR4DS29TF
BS 765 765 RR4B314TF
BS 766 771 RR4DS29TF
BS 772 782 RR4DL68TF
BS 783 876 RR4B314TF
BS 877 883 RR4DL68JQ

RD RR4BR92TF 629 0 0
GACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACA
ATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTAT
AGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAG
GTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCG
TGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTG
TAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCT
TGAGAAAGAGAAGCCAAATGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAA
ATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAA
TGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCC
TGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGA
TTCTGCATTCACAAGATTGCTTAGAGCCA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4FV38TF 710 0 0
GACT
CTTCTGCATAACCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACAATTA
TATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAG
TTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGT
TCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTT
CTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAA
CTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAG
AAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCG
CTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGT
TTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGAT
GGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCT
GCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAG*AACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCG
GAC*ACGAAACAGACTGAAGAT**CATCTCACACAGTTT*ACT
CTA

QA 5 707 5 707
DS 

RD RR4DS29TF 769 0 0
GG
CTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTCGCTACTTGCTAACAATTA
TATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAG
TTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGT
TCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTT
CTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAA
CTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAG
AAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCG
CTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGT
TTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGAT
GGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCT
GCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAG*AACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCG
GAC*ACGAAACAGACTGAAGAT**CATCTCACACAGTTT*ACTTCTATGTACATATA*TT
AT*GTA*TATATCTGTTTT*GTA*TATATCT*CATAATGC*TATAAA

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR4G622TF 751 0 0
GG
CTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACAATTA
TATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAG
TTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGT
TCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTT
CTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAA
CTCGAGGGTGATGACTCTTACAGCAGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAG
AAAGGGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCG
CTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGT
TTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGAT
GGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCT
GCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCCCCG
GACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATT
ATTGTAATATATCTGTTTTTGTA
TATATC

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR4BR92JQ 707 0 0
CTTTCTTGCTACTTGCTAACAATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCT
TCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAA
GTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTT
CAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGAC
CGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGC
TTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAATGTGGAAGTTGAGAATCTAAT
CTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGA
GAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGAC
GAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGA
AGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCATTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCAT
CCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACA
GTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DS29JQ 641 0 0
GTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGT
TCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATT
AATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTC
TTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGT
GGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACA
TGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGA
ATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCA
ACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCT
TAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTG
AAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTT
TTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTG
GC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4DL68TF 775 0 0
GG
GCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACAATTATATCT
TCCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCA
CGGCAAGCCTGAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAG
CACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCA
AGATCCCTCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGA
AGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGTTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGA
GAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAAT
CGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGA
GGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTT
ACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTT
CACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCA
CGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGT
AATATATCTGTTTT*GTA*TATATCTTCATAATGC*TATAAAATATAGTTGTC

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4G622JQ 743 0 0
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CGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAG
TCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTC
AGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACC
GAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAGGGTGATGACTCTTACAGCAGCTGGAGAGCT
TACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGGGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATTTAATC
TTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTTTTCGATGGAG
AAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACG
AAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAA
GAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATC
CCTGCTTGGTTCTCTCACCCCCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAG
TTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATA
ATGCCTATAAAATATAGTTGTC
G

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4DL68JQ 854 0 0
CAAAACCAC
TCTTTCTTGCTACTTGCTAACAAT*ATATCTTCCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTC
TTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTGAGTTCGTCCAAACGTCGA
AGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCT
TCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCTCATTAATAGAAAAAACCGAGA
CCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAG
TTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAA
TCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGG
AGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGA
CGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAG
AAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCA
TCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACAC
AGTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCA
TAATGCCTATAAAATATAGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGT
TGTTTCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTACCTGGTTTTGGTTACAAAGATATTTCTATTC
TTGAG

QA 10 854 10 854
DS 

RD RR4B314TF 614 0 0
ATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCT
TACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTG
GAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACAT
GGAATTTCTTCGATGGAGGAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAA
TCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAA
CAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTT
AGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGA
AGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTT
TTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAAT
GGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTACCTGGTTTTGGTTAC
AAAGATATTTCTAT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4EH40JQ 721 0 0
TTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTC*TAAGCTTGAGCTCTTCAG
CCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGA
ACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTA
CTTCGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAACCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTT
GCAAACAGACGGTGTGAAATCTCTGATCGGGTGTTTACATGGAATCGCTTCAATGGAGAA
GGAACGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGTGACGAA
ACTGCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGA
GAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCC
TGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTT
TTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAAT
GCCTATAAAATATAGTAGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTT
TCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTACCTGGTTTTGGTTACAAAGATATTTCTAT
TCTTGAC

QA 1 714 1 714
DS 



CO CL156Contig2 821 3 4 U
GGATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACAATTATATCT
TTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCA
CGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAG
CACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCA
AGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGA
AGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGA
GAAACCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAACAGACGGTGTGAAATCTCTGAT
CGGGTGTTTACATGGAATCGCTTCAATGGAGAAGGAACGCAAAACCAAGAATGGTTTAGA
GGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGTGACGAAACTGCACGTTCATGTTCCCGATGGTTT
ACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTT
CACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTTTTTCCCCCTCCGGACCC
CGAAACAGACTGAAGAATCCATTTCACCCAGTTTTACTTTTATGTACATATAATTATTGT
AATATATCTGTTTTTGTAATATATTTTCATAATGCCTATAAAATATAGTAGTCAATGTGT
GATGATTTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM54TF U 5
AF RR4EH40TF U 1
AF RR4CM54JQ C 421
BS 1 531 RR4EH40TF
BS 532 532 RR4CM54JQ
BS 533 594 RR4EH40TF
BS 595 821 RR4CM54JQ

RD RR4CM54TF 365 0 0
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GTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGC
AAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACG
AGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGAT
CCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGT
GATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAA
CCAAA

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4EH40TF 594 0 0
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TTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCA
CGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAG
CACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCA
AGATCCCCCATTAATAGAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGA
AGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGA
GAAACCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAACAGACGGTGTGAAATCTCTGAT
CGGGTGTTTACATGGAATCGCTTCAATGGAGAAGGAACGCAAAACCAAGAATGGTTTAGA
GGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGTGACGAAACTGCACGTTCATGTTCCTGATGGTTT
ACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4CM54JQ 401 0 0
CGGGTGTTTACATGGAATCGCTTCAATGGAGAAGGAACGCAAAACCAAGAATGGTTTAGA
GGTTAGATAGGAATCAGATACAGATGTGACGAAACTGCACGTTCATGTTCCCGATGGTTT
ACCAAAATTTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTTTGCTTT
CACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTTTTTCCCCCTCCGGACCC
CGAAACAGACTGAAGAATCCATTTCACCCAGTTTTACTTTTATGTACATATAATTATTGT
AATATATCTGTTTTTGTAATATATTTTCATAATGCCTATAAAATATAGTAGTCAATGTGT
GATGATTTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCC

QA 1 401 1 401
DS 



AS 2 13

CO CL157Contig1 731 2 7 U
GGCTGTTTCTGCAAACACAGCTCAGAGGTTGTTTTTTCTTTTTCAAATTTCTCAAGATGT
TATTAAGATTACAGACATAAACAAATATTATCAGAGATTCAATAACAAAAACAAAGCAAG
ACAAATACACGCATTTTGATGAGTTTCTTTTCATTAAAACTCTCCTTACTGAGGATTGAA
CTTTACTGTTTCACGATATATAAGCTCCTTGATGTTCTCTTCTGACAAAGAAGGTTGTTC
GAAATCGAAATTGAACGGCCTCACACACACCGGTTCCCCGTTTATATCGTGCAGCGGCGC
CAAATAAGGGTGGCACAACGCCTCATCAACTGTGATGCGTCTGCTAGGATCAAAGACGAG
CATTTTCTCCAGCAAATCTGCTGCTCCAGCTGACATGTTTGGGAACCTAGCAGCAAAGTT
CTGTCTCGGGTACTGTGGAAGCTGTTTAACGTATCTCCTAGCGTTGTCGCTCCTTAAGAA
CCCCAAGCTTGAATCATCAGGTGATCCTATAAGCTCAGTGATAAGCCTAAGCTGATGAAC
ATAATCTTTACCGGGAAACAAGGGCTCTCTTGTCATTGTTTCACCGAGAATACAACCGAC
GGACCAAATATCGATGGCTGCGGTGTACTCGGAGCAGTTAAGGAGCAGCTCTGGAGCACG
GTACCAGCAGGTAACAACGTACTCAGTCATGAAGTCAGTCTCGGATTTGGTCCTCACAAG
CCCGAAATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F780JQ U 44
AF RR4AV24JQ U 1
BS 1 156 RR4AV24JQ
BS 157 157 RR4F780JQ
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BS 376 668 RR4AV24JQ
BS 669 669 RR4F780JQ
BS 670 731 RR4AV24JQ

RD RR4F780JQ 669 0 0
CA
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CAAAAATAAAGCAAGACAAATACACGCATTTTGATGAGTTTCTTTTCATTAAAACTCTCC
TTACTGAGGATTGAACTTTACTGTTTCACGATATATAAGCTCCTTGATGTTCTCTTCTGA
CAAAGAAGGTTGTTCGAAATCGAAATTGAACGGCCTCACACACACCGGTTCCTCGTTTAT
ATCGTGCAGCGGCGCCAAATAAGGGTGGCACAACGCCTCATCAACTGTGATGCGTCTGCT
AGGATCAAAGACGAGCATTTTCTCCAGCAAATCTGCTGCTCCAGCTGACATGTTTGGGAA
CCTAGCAGCAAAGTTCTGTCTCGGGTACTGTGGAAGCTGTTTAACGTATCTCCTAGCGTT
GTCGCTCCTTAAGAACCCCAAGCTTGAATCATCAGGTGATCCTATAAGCTCAGTGATAAG
CCTAAGCTGATGAACATAATCTTTACCGGGAAACAAGGGCTCTCTTGTCATTGTTTCACC
GAGAATACAACCGACGGACCAAATATCGATGGCTGCGGTGTACTCGGAGCAGTTAAGGAG
CAGCTCTGGAGCACGGTACCAGCAGGTAACAACGTACTCAGTCATGAAGTCAGTCTCGGA
TTTGGTC

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR4AV24JQ 731 0 0
GGCTGTTTCTGCAAACACAGCTCAGAGGTTGTTTTTTCTTTTTCAAATTTCTCAAGATGT
TATTAAGATTACAGACATAAACAAATATTATCAGAGATTCAATAACAAAAACAAAGCAAG
ACAAATACACGCATTTTGATGAGTTTCTTTTCATTAGAACTCTCCTTACTGAGGATTGAA
CTTTACTGTTTCACGATATATAAGCTCCTTGATGTTCTCTTCTGACAAAGAAGGTTGTTC
GAAATCGAAATTGAACGGCCTCACACACACCGGTTCCCCGTTTATATCGTGCAGCGGCGC
CAAATAAGGGTGGCACAACGCCTCATCAACTGTGATGCGTCTGCTAGGATCAAAGACGAG
CATTTTCTCCAGCAGATCTGCTGCTCCAGCTGACATGTTTGGGAACCTAGCAGCAAAGTT
CTGTCTCGGGTACTGTGGAAGCTGTTTAACGTATCTCCTAGCGTTGTCGCTCCTTAAGAA
CCCCAAGCTTGAATCATCAGGTGATCCTATAAGCTCAGTGATAAGCCTAAGCTGATGAAC
ATAATCTTTACCGGGAAACAAGGGCTCTCTTGTCATTGTTTCACCGAGAATACAACCGAC
GGACCAAATATCGATGGCTGCGGTGTACTCGGAGCAGTTAAGGAGCAGCTCTGGAGCACG
GTACCAGCGGGTAACAACGTACTCAGTCATGAAGTCAGTCTCGGATTTGGTCCTCACAAG
CCCGAAATCAC

QA 1 731 1 731
DS 



CO CL157Contig2 1410 11 27 U
GGATAGCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCAGTTTCAGCGAGCGTGTGTCTTGGGT
CCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGTTTCGGAGGAGGTGGTTCAAG
CGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGCTACGTTCAGTACAATGTTTA
TGGAAATATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCTCTTCGCCCCATCGGCAGAGG
CGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACGGGAGAGGAAGTAGCTATCAA
GAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAAAGGACTTTGAGAGAGATTAA
GCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTTAAGGATATAATAAGACCACC
CCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAGCTTATGGACACTGATCTTCA
CCAGATTATACGCTCTAACCAACCTTTAACTGATGATCATTGTCGGTTCTTCTTGTATCA
GTTGCTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTGTTACACCGTGATTTAAAGCC
CAGCAATTTGCTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTGGTGATTTCGGGCTTGCGAG
GACCAAATCCGAGACCGACTTCATGACTGAGTACGTTGTTACACGCTGGTACCGTGCTCC
AGAGTTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATCGATATTTGGTCCGTCGGTTG
TATTCTCGGTGAAACAATGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCCGGTAAAGATTATGTTCATCA
GCTTAGGCTTATCACTGAGCTTATAGGATCACCTGATGATTCAAGCTTGGGGTTCTTGAG
GAGCGACAACGCTAGGAGATACGTTAAACAGCTTCCACAGTACCCGAGACAGAACTTTGC
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TGATCCTAGCAGACGCATCACAGTTGATGAGGCGTTGTGCCACCCTTATTTGGCGCCGCT
GCACGATATAAACGAGGAACCGGTGTGTGTGAGGCCGTTCAATTTCGATTTCGAACAACC
TTCTTTGTCAGAAGAGAACATCAAGGAGCTTATATATCGTGAAACAGTCAAGTTCAATCC
TCAGTAAGGAGAGTTTTAATGAAAAGAAACTCATCAAAATGCGTGTATTTGTCTTGCTTT
GTTTTTGTTATTGAATCTCTGATAACATCTGTTTATGTCTGTAATATTAATAACATCTTG
AGAAATTGAAAAAAAAAGAAGAACAACCTCTGAGCTGTGTTTGCAGAAACAGCCATATGC
TTTAGAGTTCAATGTACATTTTGTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 5 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H217TF U 1
AF RR4H674TF U 33
AF RR4AV24TF U 35
AF RR4G773TF U 38
AF RR4AX56TF U 35
AF RR4AH18TF U 33
AF RR4F780TF U 464
AF RR4H217JQ C 486
AF RR4AX56JQ C 524
AF RR4H674JQB C 1017
AF RR4AH18JQ C 618
BS 1 52 RR4H217TF
BS 53 53 RR4G773TF
BS 54 291 RR4H217TF
BS 292 292 RR4G773TF
BS 293 468 RR4H217TF
BS 469 469 RR4G773TF
BS 470 544 RR4H217TF
BS 545 545 RR4AV24TF
BS 546 579 RR4H217TF
BS 580 580 RR4G773TF
BS 581 677 RR4H217TF
BS 678 678 RR4AH18TF
BS 679 719 RR4H217TF
BS 720 720 RR4AH18TF
BS 721 755 RR4H217TF
BS 756 796 RR4AH18TF
BS 797 797 RR4AX56TF
BS 798 846 RR4AH18TF
BS 847 847 RR4F780TF
BS 848 900 RR4AH18TF
BS 901 901 RR4F780TF
BS 902 908 RR4AH18TF
BS 909 909 RR4F780TF
BS 910 920 RR4AH18TF
BS 921 1047 RR4F780TF
BS 1048 1328 RR4H217JQ
BS 1329 1410 RR4AH18JQ

RD RR4H217TF 755 0 0
GGATAGCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCAGTTTCAGCGAGCGTGTG*CTTGGGT
CCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGTTTCGGAGGAGGTGGTTCAAG
CGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGCTACGTTCAGTACAATGTTTA
TGGAAATATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCTCTTCGCCCCATCGGCAGAGG
CGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACGGGAGAGGAAGTGGCTATCAA
GAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAAAGGACTTTGAGAGAGATTAA
GCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTTAAGGATATAATAAGACCACC
CCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAGCTTATGGATACTGATCTTCA
CCAGATTATACGCTCTAACCAACCTTTAACTGATGATCATTGTCGGTTCTTCTTGTATCA
GTTGTTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTCTTACACCGTGATTTAAAGCC
CAGCAATTTGCTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTGGTGATTTCGGGCTTGCGAG
GACCAAATCCGAGACCGGCTTCATGACTGAGTACGTTGTTACACGCTGGTACCGTGCTC*
AGAGTTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4H674TF 726 0 0
GGAGTTTC
AGCGAGCGTGTG*CTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTCGGAGGAGGTGGTTCAAGCGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAATATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CCTCGCCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTGGCTATCAAGAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
AGGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTT
AAGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAG
CTTATGGATACTGATCTTCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCTTTAACTGATGATCAT
TGTCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGTTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTC
TTACACCGTGATTTAAAGCCCAGCAATTTGCTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGTGATTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACCGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACACGCTGGTACCGTGCTCCAGAGTTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCA

QA 9 726 9 726
DS 

RD RR4AV24TF 740 0 0
GGAGCG
AGCGAGCGTGTGTCTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTCGGAGGAGG*********CGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAACATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CTTCGCCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAATTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTAGCTATCAAGAAGATCGGGAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
*GGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTT
AAGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAG
CTTATGGACACTGATCTCCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCAT
TGCCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGCTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTG
TTACACCGTGATTTAAAGCCCAGCAATTTGTTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGTGATTTCGGGCTTGTGAGGACCAAATCCGAGACTGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACCCGCTGGTACCGTGCTCCAGAGCTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATC
GATATTTGGTCCGT

QA 7 740 7 740
DS 

RD RR4G773TF 761 0 0
GGG
AGCGAGCGTGTGTCTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTCGGAGGAGGTGGTTCAGGCGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAATATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CTTCGCCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTAGCTATCAAGAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
AGGACTTTGAGAGAGATTAAGCTCCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTT
AAGGATATAATAAGACCACCTCTAAGAGAGAACTTCAATGATGTTTACATTGTTTATGAG
CTTATGGACACTGATCTTCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCAT
TGCCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGTTGCGTGGGCTCAAGTACGTTCACTCAGCCAATGTG
TTACACCGTGATTTAAAGCCAAGCAATTTGCTCCTCAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGGGATTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACCGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACACGCTGGTACCGTGCTCCAGAGTTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATC
GATATTTGGTCCGTCGGTTGTATTC
GTGAAACAATGAC

QA 4 748 4 748
DS 

RD RR4AX56TF 862 0 0
GGAGCG
AGCGAGCGTGTGTCTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTCGGAGGAGG*********CGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAACATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CTTCGCCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAATTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTAGCTATCAAGAAGATCGGGAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
*GGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTT
AAGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAG
CTTATGGACACTGATCTCCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCAT
TGCCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGCTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTG
TTACACCGTGATTTAAAGCCCAGCAATTTGTTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGTGATTTCGGGCTTGTGAGGACCAAATCCGAGACTGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACCCGCTGGTACCGTGCTCCAGAGCTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATC
GATATTTGGTCCGTCGGTTGTATTCTCGGTGAAACAATGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCC
GGTAAAGATTATGTTCATCAGCTTAG*CTTATCACTGAGCTTATAG*ATCACCTGATGAT
TCAAGCTTGGGGTTCT

QA 7 862 7 862
DS 

RD RR4AH18TF 888 0 0
GGAGTTTC
AGCGAGCGTGTG*CTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTCGGAGGAGGTGGTTCAAGCGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAATATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CTTCGCCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTGGCTATCAAGAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
AGGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAATGTTATTGCTGTT
AAGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAG
CTTATGGATACTGATCTTCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCTTTAACTGATGATCAT
TGTCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGTTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTC
TTACACCGTGATTTAAAGCCCAGCAATTTGCTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGTGATTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACCGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACACGCTGGTACCGTGCTCCAGAGTTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATC
GATATTTGGTCCGTCGGTTGTATTCTCGGTGAAACAGTGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCC
GGTAAAGATTATGTTCATCAGCTTAG*CTTATCACTGAGCTTATAGGATCACCTGATGAT
TCAAGCTTGGGGTTCTTGAG*AGCGACA*CGCTAGGAGAT

QA 9 888 9 888
DS 

RD RR4F780TF 584 0 0
GG
GGACACTGATCTCCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCATTGCCG
GTTCTTCTTGTATCAGTTGCTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTGTTACA
CCGTGATTTAAAGCCCAGCAATTTGCTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTGGTGA
TTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACTGACTTCATGACTGAGTACGTTGTTACCTG
CTGGTACCGTGCTCCAGAGCTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATCGATAT
TTGGTCCGTCGGTTGTATTCTCGGTGAAACAATGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCCGGTAA
AGATTATGTTCATCAGCTTAGGCTTATCACTGAGCTTATAGGATCACCTGATGATTCAAG
CTTGGGGTTCTTAAGGAGCGACAACGCTAGGAGATACGTTAAACAGCTTCCACAGTACCC
GAGACAGAACTTTGCTGCTAGGTTCCCAAACATGTCAGCTGGAGCAGCAGATCTGCTGGA
GAAAATGCTCGTCTTTGATCCTAGCAGACGCATCACAGTTGA

QA 3 584 3 584
DS 

RD RR4H217JQ 843 0 0
TTATACGCTCTACCCA*CCTTTAACTGATGATCAT*GTCGGT*CTTCT*GTATCAGTG**
TGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTCTTACACCGTGATTTAAAGCCCAGCA
ATTTGCTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTGGTGATTTCGGGCTTGCGAGGACCA
AATCCGAGACCGGCTTCATGACTGAGTACGTTGTTACACGCTGGTACCGTGCTCCAGAGT
TGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATCGATATTTGGTCCGTCGGTTGTATTC
TCGGTGAAACAATGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCCGGTAAAGATTATGTTCATCAGCTTA
GGCTTATCACTGAGCTTATAGGATCACCTGATGATTCAAGCTTGGGGTTCTTGAGGAGCG
ACAACGCTAGGAGATACGTTAAACAGCTTCCACAGTACCCGAGACAGAACTTTGCTGCTA
GGTTCCCAAACATGTCAGCTGGAGCAGCAGATTTGCTGGAGAAAATGCTCGTCTTTGATC
CTAGCAGACGCATCACAGTTGATGAGGCGTTGTGCCACCCTTATTTGGCGCCGCTGCACG
ATATAAACGAGGAACCGGTGTGTGTGAGGCCGTTCAATTTCGATTTCGAACAACCTTCTT
TGTCAGAAGAGAACATCAAGGAGCTTATATATCGTGAAACAGTCAAGTTCAATCCTCAGT
AAGGAGAGTTTTAATGAAAAGAAACTCATCAAAATGCGTGTATTTGTCTTGCTTTGTTTT
TGTTATTGAATCTCTGATAACATCTGTTTATGTCTGTAATATTAATAACATCTTGAGAAA
TTG

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR4AX56JQ 805 0 0
CGGTTCTTCTTGTATCAGTTGCTGCGTGGGCTCAAGTATGTTCACTCAGCCAATGTGTTA
CACCGTGATTTAAAGCCCAGCAATTTGTTCCTGAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTGGT
GATTTCGGGCTTGTGAGGACCAAATCCGAGACTGACTTCATGACTGAGTACGTTGTTACC
CGCTGGTACCGTGCTCCAGAGCTGCTCCTTAACTGCTCCGAGTACACCGCAGCCATCGAT
ATTTGGTCCGTCGGTTGTATTCTCGGTGAAACAATGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCCGGT
AAAGATTATGTTCATCAGCTTAGGCTTATCACTGAGCTTATAGGATCACCTGATGATTCA
AGCTTGGGGTTCTTAAGGAGCGACAACGCTAGGAGATACGTTAAACAGCTTCCACAGTAC
CCGAGACAGAACTTTGCTGCTAGGTTCCCAAACATGTCAGCTGGAGCAGCAGATCTGCTG
GAGAAAATGCTCGTCTTTGATCCTAGCAGACGCATCACAGTTGATGAGGCGTTGTGCCAC
CCTTATTTGGCGCCGCTGCACGATATAAACGGGGAACCGGTGTGTGTGAGGCCGTTCAAT
TTCGATTTCGAACAACCTTCTTTGTCAGAAGAGAACATCAAGGAGCTTATATATCGTGAA
ACAGTAAAGTTCAATCCTCAGTAAGGAGAGTTCTAATGAAAAGAAACTCATCAAAATGCG
TGTATTTGTCTTGCTTTGTTTTTGTTATTGAATCTCTGATAATATTTGTTTATGTCTGTA
ATCTTAATAACATCTTGAGAAATT
T

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4H674JQB 363 0 0
TCTTTGATCCTAGCAGACGCATCACAGTTGATGAGGCGTTGTGCCACCCTTATTTGGCGC
CGCTGCACGATATAAACGAGGAACCGGTGTGTGTGAGGCCGTTCAATTTCGATTTCGAAC
AACCTTTTTTGTCAGAAGAGAACATCAAGGAGCTTATATATCGTGAAACAGTCAAGTTCA
ATCCTCAGTAAGGAGAGTTTTAATGAAAAGAAACTCATCAAAATGCGTGTATTTGTCTTG
CTTTGTTTTTGTTATTGAATCTTTGATAACATCTGTTTATGTCTGTAATATTAATAACAT
CTTGAGAAATTGAAAAAAAAAGAAGAACAACCTTTGAGCTGTGTTTGCAGAAACAGCC
ATACG

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4AH18JQ 793 0 0
ATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTGGTGATTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACCG
ACTTCATGACTGAGTACGTTGTTACACGCTGGTACCGTGCTCCAGAGTTGCTCCTTAACT
GCTCCGAGTACACCGCAGCCATCGATATTTGGTCCGTCGGTTGTATTCTCGGTGAAACAG
TGACAAGAGAGCCCTTGTTTCCCGGTAAAGATTATGTTCATCAGCTTAGGCTTATCACTG
AGCTTATAGGATCACCTGATGATTCAAGCTTGGGGTTCTTGAGGAGCGACAACGCTAGGA
GATACGTTAAACAGCTTCCACAGTACCCGAGACAGAACTTTGCTGCTAGGTTCCCAAACA
TGTCAGCTGGAGCAGCAGATCTGCTGGAGAAAATGCTCGTCTTTGATCCTAGCAGACGCA
TCACAGTTGATGAGGCGTTGTGCCACCCTTATTTGGCGCCGCTGCACGATATAAACGAGG
AACCGGTGTGTGTGAGGCCGTTCAATTTCGATTTCGAACAACCTTCTTTGTCAGAAGAGA
ACATCAAGGAGCTTATATATCGTGAAACAGTCAAGTTCAATCCTCAGTAAGGAGAGTTTT
AATGAAAAGAAACTCATCAAAATGCGTGTATTTGTCTTGCTTTGTTTTTGTTATTGAATC
TCTGATAACATCTGTTTATGTCTGTAATATTAATAACATCTTGAGAAATTGAAAAAAAAA
GAAGAACAACCTCTGAGCTGTGTTTGCAGAAACAGCCATATGCTTTAGAGTTCAATGTAC
ATTTTGTTTTATT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 12

CO CL158Contig1 1076 12 25 U
TGGCTGTGTGAATTATGTATAAATAACGAAAACAAAATATTAAATAATGTCCATATGGAA
ACAATAACTCATTACAAATTAAATCAAATCTTTGGTCGCAACATTGAATTCAAATCACTC
ACAAACTGATCACCGGAAGATGTTTTTTGTTTTCAAGACTCTGAAACGTCGTTCTCTTCT
TTGGCTTCGACGGCTACCTCTTCAGTGATCTCCGGAGGAAGAGTGTTGCCTGAGGCCGTG
CGACGGTGGTTGGCTGCTTGGAGAACGTGAGCGTAGTTGCCTTTCTCGAGGAAAAGTTGG
TTAAAGTGATGCCGGCAA*TAGA****GAA*CGCCATCC**AGGGAAGCGTACGAGG*AA
TGAGTCAGCGTGCAGCCACCGTGAGCGCACTTGAAACATGTCTTGTGGAAGCATTCTCCT
TCCATTTGCACCTTTTCAAGAGGGTAAACAGTTTTCTCACAAGCAGCACACTTGTCTTGT
GTTCCACAGAAGATTGAAGATATCTTGCTTGGAGTCTTATTCTGCTCCGGCTTCTCAGTT
TTTCCTGGTTGGAAATTTTTGCTGAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGA
GTCTTGCAGTACAAGACTCCATCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTG
CAATGGGTACACTTGAAGCAAGACTTGTGGTAAGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTCC
ATCACATAGACTGTCTTATCGCAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATT
TTTTTTGTTTTCTCTCTCTCTTTCTTCTTTTTGGGATTTTTTTGTTTGTTTGTTGTTTCC
TCCTCTCCAGGATCCTAAATGAACCAGATCAAGAGCTCGTCTGAGGAAGCAATTAAAGAA
GGAAACCCACAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAGAAATTTGACAATGAGTTTTTTTTCTGGTT
ACCTCAGACAAAGGAGGAACCAGCGAAATTTATGTCTTCTTTTATACGAAACTTTGTTGC
AATTGTGAGGCTGTAACGGAACAAACTTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 55 50 15 50 35 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 35 35 35 35 35 35 50 35 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 35 50 50 50 25 35 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 
55 55 30 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ86JQ U 43
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TTCTCGAGGA

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GTTTTTTGTTTTCAAGACTCTGAAACGTCGTTCTCTTCTTTGGCTTCGACGGCTACCTCT
TCAGTGATCTCCGGAGGAAGAGTGTTGCCTGAGGCCGTGCGACGGTGGTTGGCTGCTTGG
AAAACGTGAGCGTAGTTGCCTTTCTCGAGGAAAAGTTGGTTAAAGTGATGCCGGCAA*T

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DS 

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AGTGTTGCCTGAGGCCGTGCGACGGTGGTTGGCTGCTTGGAGAACGTGAGCGTAGTTGCC
TTTCTCGAGGAAGAGTTGGTTAAAGTGATGCCGGCAA*TAGA****GAA*CGCCATCC**
AGGGAAGCGTACGAGG*AATGAGTCAGCGTGCAGCCACCGTGAGCGCACTTGAAACATGT
CTTGTGGAAGCATTCTCCTTCCATTTGCACCTTTTCAAGAGGGTAAACAGTTTTCTCACA
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CTGCTCCGGCTTCTCAGTTTTTCCTGGTTGGAAATTTTTGCTGAA*TTGCCAGATTCCTT
GAAGAGTTGCTCAAAATGAGTCTTGCAGTACAAGACTC

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DS 

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TTGGCTTCGACGGCTACCTCTTCAGTGATCTCCGGAGGAAGAGTGTTGCCTGAGGCCGTG
CGACGGTGGTTGGCTGCTTGGAAAACGTGAGCGTAGTTGCCTTTCTCGAGGAAAAGTTGG
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TCCATTTGCACCTTTTCAAGAGGGTAAACAGTTTTCTCACAAGCAGCACACTTGTCTTGT
GTTCCACAAAAAATTGAAAATATCTTGCTTGGAGTCTTATTCTGCTCCGGCTTCTCAGTT
TTTCCTGGTTGGAAATTTTTGCTGAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGA
GTCTTGCAGTACAAGACTCCATCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTG
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ATCACATAGACTGTCTTATCGCAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTG

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DS 

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G
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GTTTTTTGTTTTCAAGACTCTGAAACGTCGTTCTCTTCTTTGGCTTCGACGGCTACCTCT
TCAGTGATCTCCGGAGGAAGAGTGTTGCCTGAGGCCGTGCGACGGTGGTTGGCTGCTTGG
AAAACGTGAGCGTAGTTGCCTTTCTCGAGGAAAAGTTGGTTAAAGTGATGCCGGCAA*TA
AA****GAA*CGCCATCC**AGGGAAGCGTACGAGG*AATGAGTCAGCGTGCAGCCACCG
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TCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTGCAATGGGTACACTTGAAGCAA
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CAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATTTTTTTTGTTTTCTCTCTCTCT
TTCTTCTTTTTG

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DS 

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AATCAAATCTTTGGTCGCAACATTGAATTCAAATCACTCACAAACTGATCACCGGAAGAT
GTTTTTTGTTTTCAAGACTCTGAAACGTCGTTCTCTTCTTTGGCTTCGACGGCTACCTCT
TCAGTGATCTCCGGAGGAAGAGTGTTGCCTGAGGCCGTGCGACGGTGGTTGGCTGCTTGG
AGAACGTGAGCGTAGTTGCCTTTCTCGAGGAAAAGTTGGTTAAAGTGATGCCGGCAA*TA
GA****GAA*CGCCATCC**AGGGAAGCGTACGAGGGAATGAGTCAGCGTGCAGCCACCG
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GGGTAAACAGTTTTCTCACAAGCAGCACACTTGTCTTGTGTTCCACAGAAGATTGAAGAT
ATCTTGCTTGGAGTCTTATTCTGCTCCGGCTTCTCAGTTTTTCCTGGTTGGAAATTTTTG
CTGAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGAGTCTTGCAGTACAAGACTCCA
TCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTGCAATGGGTACACTTGAAGCAA
GACTTGTGGTAAGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTCCATCACATAGACTGTCTTATCG
CAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATTTTTTTTGTTTTCTCTCTCTCT
TTCTTCTTTTTGG*ATTTTTTTGCTTGTTTGTTGTTTCCTCCTCTC

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DS 

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GTAGTTGCCTTTCTCGAGGAAAAGTTGGTTAAAGTGATGCCGGCAAATAGA****GAA*C
GCCATCC*CAGGGAAGCGTACGAGG*AATGAGTCAGCGTGCAGCCACCGTGAGCGCACTT
GAAACATGTCTTGTGGAAGCATTCTCCTTCCATTTGCACCTTTTCAAGAGGGTAAACAGT
TTTCTCACAAGCAGCACACTTGTCTTGTGTTCCACAGAAGATTGAAGATATCTTGCTTGG
AGTCTTATTCTGCTCCGGCTTCTCAGTTTTTCCTGGTTGGAAATTTTTGCTGAAATTGCC
AGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGAGTCTTGCAGTACAAGACTCCATCCATGGATAA
ATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTGCAATGGGTACACTTGAAGCAAGACTTGTGGTA
AGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTCCATCACATAGACTGTCTTATCGCAAGCATTGCA
TTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATTTTTTTTGTTTTCTCTCTCTCTTTCTTCTTTTT
GGGATTTTTTTGCTTGTTTGTTGTTTCCTCCTCTCC

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DS 

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GTTAAAGTGATGCCGGCAA*TAGA****GAA*CGCCATCC**AGGGAAGCGTACGAGG*A
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TTTTCCTGGTTGGAAATTTTTGCTGAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATG
AGTCTTGCAGTACAAGACTCCATCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCAT*
GCAATGGGTACACTTGAAGCAAGACTTGTGGTAAGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTC
CATCACATAGACTGTCTTATCGCAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACAT
TTTTTTTGTTTTCTCTCTCTCTTTCTTCTTTTTGGGATTTTTTTGTTTGTTTGTTGTTTC
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AGGAAACCC
CC

QA 1 729 1 729
DS 

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TTG
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GAGATATCTTGCTTGGAGTCTTATTCTGCTCCGGCTTCTCAGTTTTTCCTGGTTGGAAAT
TTTTGCTGAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGAGTCTTGCAGTACAAGA
CTCCATCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCCTTGCAATGGGTACACTTGA
AGCAAGACTTGTGGTAAGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTCCATCACATAGACTGTCT
TATCGCAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATTTTTTTTGTTTTCTCTC
TCTCTTTCTTCTTTTTGGGATTTTTTTGTTTGTTTGTTGTTTCCTCCTCTCCAGGATCCT
AAATGAACCAGATCAAGAGCTCGTCTGAGGAAGCAATTAAAGAAGGAAACCCAC

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TCCTGGTTGGAAATTTTTGCTGAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGAGT
CTTGCAGTACAAGACTCCATCCATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTGCA
ATGGGTACACTTGAAGCAAGACTTGTGGTAAGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTCCAT
CACATAGACTGTCTTATCGCAAGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATTTT
TTTTGTTTTCTCTCTCTCTTTCTTCTTTTTGGGATTTTTTTGTTTGTTTGTTGTTTCCTC
CTCTCCAGGATCCTAAATGAACCAGATCAAGAGCTCGTCTGAGGAAGCAATTAAAGAAGG
AAACCCAC

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DS 

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CTTGCTTGGAGTCTTATTCTGCTCCGGCTTCTCAGTTTTTCCTGATTGGAAATTTTTGCT
GAAATTGCCAGATTCCTTGAAGAGTTGCTCAAAATGAGTCTTGCAGTACAAGACTCCATC
CATGGATGAATAGTTGCTCATCACAAGGGTGCCTTTGCAATGGGTACACTTGAAGCAAGA
CTTGTGGTAAGGCATTCCTTCAATGGACAACATGTCCATCACATAGACTGTCTTATCGCA
AGCATTGCATTTGTCAGTAGTTCCTGTGAAAGACATTTTTTTTGTTTTCTCTCTCTCTTT
CTTCTTTTTGGGATTTTTTTGTTTGTTTGTTGTTTCCTCCTCTCCAGGATCCTAAATGAA
CCAGATCAAGAGCTCGTCTGAGGAAGCAATTAAAGAAGGAAACCCACAAAAGAAAAAAAA
GAAAAGAGAAATTTGACAATGAGTTTTTTTTCTGGTTACCTCAGACAAAGGAGGAACCAG
CGAAATTTATGTCTTCTTTTATACGAAACTTTGTTGCAATTGTGAGGCTGTAACGGAACA
AACTTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 12

CO CL159Contig1 955 12 30 U
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TGCCGTTAATAACCATCACCGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGC
GGCGACGACGGTTTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGT
GGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAA
AGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTCTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGC
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TGCATCAGTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATG
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TTGCAATGAAACTGATGTTTTTCTTTTTGTTGATTCATCAATAAGGGTTGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 25 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 5 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 15 55 60 60 60 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 15 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 
65 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AV66TF U 13
AF RR4DF76TF U 11
AF RR4DQ30TF U 10
AF RR4EP22TF U 16
AF RR4B161TF U 13
AF RR4DQ30JQ C 49
AF RR4BG42JQ C 1
AF RR4BG42TF U 8
AF RR4B661TF U 216
AF RR4B661JQ C 98
AF RR4EP22JQ C 219
AF RR4DF76JQ C 330
BS 1 12 RR4BG42JQ
BS 13 19 RR4DF76TF
BS 20 93 RR4AV66TF
BS 94 94 RR4DF76TF
BS 95 129 RR4AV66TF
BS 130 131 RR4DF76TF
BS 132 138 RR4AV66TF
BS 139 139 RR4DF76TF
BS 140 288 RR4AV66TF
BS 289 291 RR4DF76TF
BS 292 330 RR4AV66TF
BS 331 331 RR4DF76TF
BS 332 384 RR4AV66TF
BS 385 497 RR4DF76TF
BS 498 498 RR4DQ30TF
BS 499 601 RR4DF76TF
BS 602 606 RR4DQ30TF
BS 607 607 RR4BG42TF
BS 608 675 RR4DQ30TF
BS 676 760 RR4BG42TF
BS 761 761 RR4BG42JQ
BS 762 813 RR4BG42TF
BS 814 814 RR4BG42JQ
BS 815 846 RR4BG42TF
BS 847 847 RR4BG42JQ
BS 848 865 RR4BG42TF
BS 866 870 RR4BG42JQ
BS 871 871 RR4EP22JQ
BS 872 912 RR4B661JQ
BS 913 955 RR4EP22JQ

RD RR4AV66TF 372 0 0
GGAACAG
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TTCGCCGCCCTTCCCCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCGTTGAAAACA
ACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGCCGTTAATAACCATCAC
CGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGTTTCAGCG
GATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGT***GGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAG
ACGGCGAATCTTTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAG
GCTGA

QA 8 372 8 372
DS 

RD RR4DF76TF 591 0 0
GG
ACTTAACAGAGAGAGAGATTTTAGCTAAACTAAATCGATGGCGGCGATGATAGTAAAGGC
TGGACTTTTCGCCGCCCTTCCTCCCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCACT
GAAAACGACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGCCGTTAATAA
CCATCACCGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAATTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGT
TTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGTTGAGGAGAATGT
GAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACA
CGAGGAGGCTGATTCTCTCTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAAT
CATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGT
GGTGTCGGCTAATCTGAAGCCAAGAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCT
CTGTGCTTCCGACTCATCTCATGAGAATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCA

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR4DQ30TF 666 0 0
GAC
ACTTAACAGAGAGAGAGATTTTAGCTAAACTAAATCAATGGCGGCGATGATAGTAAAGGC
TGGACTTTTCGCCGCCCTTCCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCATT
GAAAACAACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGGCGTTAATAA
CCATCACCGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCAGCGACGACGGT
TTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGT***GGAGGAGGTGGAGGAGAATGT
GAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACA
CGAGGAGGCTGATTCTCTGTATGTGGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCAAGAAT
CATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGT
GGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGGAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGCGGTATGCTTCT
CTGTGCTTCCGACTCATCTCACGA*AATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGG*TCTGT
TCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAA*GAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTG
CAC

QA 4 666 4 666
DS 

RD RR4EP22TF 660 0 0
GGAG
AGAGAGAGAGATTTTAGCTAAACTAAATCAATGGCGGCGATGATAGTAAAGGCTGGACTT
TTCGCCGCCCTTCCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCACTGAAAACG
ACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGCCGTTAATAACCATCAC
CGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGTTTCAGCG
GATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAG
ACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAG
GCTGATTCTCTCTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAATCATCTGC
AGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGTGGTGTTG
GCTAATCTGAAGCCAAGAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCTCTGTGCT
TCCGACTCATCTCATGAGAATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGTTCCTGGG
GATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAA*GAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCAC

QA 5 660 5 660
DS 

RD RR4B161TF 745 0 0
GGAACAG
AGAGAGAGAGATTTTAGCTAAACTAAATCAATGGCGGCGATGATAGTAAAGGCTGGACTT
TTCGCCGCCCTTCCCCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCGTTGAAAACA
ACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGCCGTTAATAACCATCAC
CGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGTTTCAGCG
GATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGT***GGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAG
ACGGCGAATCTTTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAG
GCTGATTCTCTCTATGTGGAAGAAGTCGACATAGGTGAAGCTGAGCCAAGAATCATCTGC
AGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGTGGTGTTG
GCTAATCTGAAGCCAAGGAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCTCTGTGTT
TCCGACTCATCTCATGAGAATGTTGAGCCTCTGGTTCCACCACAAGGGTCTGTTCCTGGG
GATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAA*GAAGATCTTGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCC
TAACAAGGTTCAGAAGAAGAAGATGTGGGAATCGGTTCAACCGCTGTTGAAGACTGATGA
TTCTTGTGTTTCGATGCT

QA 8 745 8 745
DS 

RD RR4DQ30JQ 781 0 0
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CCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCATTGAAAACAACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATC
TCTTGGAATCTCTGGCGTTAATAACCATCACCGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTAC
TTTCTGCACGGCAGCGACGACGGTTTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGT
***GGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGG
AAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTGTATGTGGAAGAAGTCGA
TATAGGTGAAGCTGAGCCAAGAATCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGA
TCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGGAACATGAGAGG
AGTCAAGTCATGCGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCATCTCACGA*AATGTTGAGCC
TTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAA*GAAG
ATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAAGAAGATGTGGG
AATCGGTTCAACCCCTGTTGAAGACTGATGATTCTTGTGTTTCGATGCTTAAGGAGCATT
TGATGCGGACATCTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTGAAAAATGCCAACATTTCTT
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4BG42JQ 873 0 0
GGCCGGGGGAACACTTAACAGAGAGAGAGATTTTAGCTAAACTAAATCAATGGCGGCGAT
GATAGTAAAGGCTGGACTTTTCGCCGCCTTTCCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTT
CTCCTCTTCACTGAAAACGACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTC
TGCCGTTAATAACCATCACCGTCGAAGCTCCT**CCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGC
GGCGACGACGGTTTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGT
GGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAA
AGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTCTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGC
TGAGCCGAGAATCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGG
TGCATCATTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATG
TGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCATCTCATGAGAATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCC
ACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAA*GAAGATCTCGAGCAGC
TTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAAGAAGATGTGGGAATCGGTTCAAC
CGCTGTTGAAGACTGATGATTCTTGTGTTTCGATGCTTAAGGAGCATTTGATGCGGACAT
CTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTGAAAAATGCCAACATTTCTTGATTTACTGTAT
TTGTTTTCAGAGAGAGATTGAGAGAGATAA
GGA

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4BG42TF 858 0 0
GGAAC
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TGGACTTTTCGCCGCCCTTCCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCACT
GAAAACGACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGCCGTTAATAA
CCATCACCGTCGAAGCTCCT**CCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGT
TTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGTGGAGGAGAATGT
GAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACA
CGAGGAGGCTGATTCTCTCTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAAT
CATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCATTTGT
GGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCT
CTGTGCTTCCGACTCATCTCATGAGAATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGT
TCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAA*GAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTG
CACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAAGAAGATGTGGGAATCGGTTCAACCGCTGTTGAAGA
CTGATGATTCTTGTGTTTCGATGCTTAAAGAGCATTTGATGCGGACATCTTCTGGTCTTG
TTACTTCCAACACTTTGAAAA*TGCCAACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTT*CAGAG
AGAGATTGAGAGA

QA 6 858 6 858
DS 

RD RR4B661TF 643 0 0
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AGATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAG
ACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTCTATG
TTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAATCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAAT
ACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCATTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAA
GAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCATCTCATG
AGAATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTG
GTAATGAAAGAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTTCAGAAG
AAGAAGATGTGGGAATCGGTTCAACCGCTGTTGAAGACTGATGATTCTTGTGTTTCGATG
CTTAAAGAGCATTTGATGCGGACATCTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTGAAAA*T
GCCAACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTT*CAGAGAGAGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4B661JQ 815 0 0
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GTTTCTCGATCTCTTGGAATCTCTGCCGTTAATAACCATCACCGTCGAAGCTCCT**CCT
CGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGTTTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAG
ATCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGAC
ATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTCTATGTT
GAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAATCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATAC
GTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCATTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGA
AACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCATCTCATGAG
AATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGT
AATGAA*GAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAA
GAAGATGTGGGAATCGGTTCAACCGCTGTTGAAGACTGATGATTCTTGTGTTTCGATGCT
TAAGGAGCATTTGATGCGGACATCTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTGAAAAATGC
CAACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTTTCAGAGAGAGATTGAGAGAGATAAGGAACAA
GCCACCAGAGCCGAATTTTTTTATTGCAATGAAAC

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4EP22JQ 737 0 0
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TCGAGTCTGTTGAGGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACA
TAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTCTATGTTG
AAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAATCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACG
TACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGAA
ACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCATCTCATGAGA
ATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTA
ATGAA*GAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAAG
AAGATGTGGGAATCGGTTCAACCGCTGTTGAAGACTGATGATTCTTGTGTTTCGATGCTT
AAGGAGCATTTGATGCGGACATCTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTGAAAAATGCC
AACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTTTCAGAGAGAGATTGAGAGAGATAAAGAACAAG
CCACCAGAGCCGAATTTTTTTATTGCAATGAAACTGATGTTTTTCTTTTTGTTGATTCAT
CAATAAGGGTTGTTTAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4DF76JQ 624 0 0
TGTTAGACATAAGAGTAGGAAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTC
TCTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGAAGCTGAGCCGAGAATCATCTGCAGTGGTCTCG
TCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTTCAGGGTGCATCAGTTGTGGTGTCGGCTAATCTGA
AGCCAAGAAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGTGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCAT
CTCATGAGAATGTTGAGCCTTTGGTTCCTCCACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTT
GGTTTGGTAATGAA*GAAGATCTCGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTT
CAGAAGAAGAAGATGTGGGAATCGGTTCAACCGCTGTTGAAGACTGATGATTCTTGTGTT
TCGATGCTTAAGGAGCATTTGATGCGGACATCTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTG
AAAAATGCCAACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTTTCAGAGAGAGATTGAGAGAGATA
AAGAACAAGCCACCAGAGCCGAATTTTTTTATTGCAATGAAACTGATGTTTTTCTTTTTG
TTGATTCATCAATAAGGGTTGTTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 2 12

CO CL160Contig1 779 3 6 U
AGATTTGATATTTATTTCAAATTATAACACCAACTCACAGAGGGAAAAAAGTATACATAA
TAGTTATATCCGAATATTAACAAGACGCATGGATCTTGGTATAGGCTTTCATTTCATCTT
TACACAACATATGTTGAATCCCTCGC**TAGGCTAATAATAACCCCTTAAGAGGTGCTAC
TTGTTGCCGGAACAGAAGACGCCTCCTCTGGCTGAGCCTCACTGGCCGTAGTTTCGGGCA
ATGAAGTTTCTTCCTGAGCCACCGGTGGAGCTTCAGTGAGGGCGGGTGAAGAGGCTTGAA
CAACTTGTGAAGGCTTGAACTTGTTGATGTAGTAGCTAAGAGAGGGTCCACTGTAATCCA
CTGGTTTAGGTCGAGCCGGGGCATCTTTCCCGACTTGGAGAAGTATAGAGGACGCCGCAG
CGATTGCGATAAGGGCAAGGCCTCCTACGATTGCTGCTGTGTTCTCAGCCCCATCAGACG
AAGATCCTGCAGTACCTGAGCTTATGGCACTCTCTGCAACATATACTGCAGGCTCAATAG
AGTAAACATTAGTCTGACCGGCAGTATCTTTCTCAACATAACCAGTCCAACCACGCTTCC
GAGGTGGAAACGTTCCCACCACTTTCGTCTTCTCTCCAGCCAACCATTCCATACTCACTG
TCCCAACCTCTTTGTCGGGAGCACATTCCTCGTCATTACAATCAGGATCATCCGAAGAAG
CTCTAACGACGGATACGAAAAGCTTCCGTCCTACCGACCTGGCGCTGAGGAATCCGCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF09JQ U 78
AF RR4BL04JQ U 1
AF RR4GD06JQ U 17
BS 1 265 RR4BL04JQ
BS 266 266 RR4GF09JQ
BS 267 620 RR4BL04JQ
BS 621 621 RR4GD06JQ
BS 622 701 RR4BL04JQ
BS 702 779 RR4GD06JQ

RD RR4GF09JQ 340 0 0
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ATCCCTCTCCCTAGGCTAATAATAACCCCTTAAGAGGTGCTACTTGTTGCCGGAACAGAA
GACGCCTCCTCTGGCTGAGCCTCACTGGCTGTGGTTTCGGGCAGTGAAGTTTCTTCCTGA
GCCACGGGTGGAGCTTCAGTGAGGGCGGGTGAAGAGGCTTGAACAACTTGTGAAGGCTTG
AACTTGTTGATGTAGTAGCTAAGAGACGGTCCACTGTAATCCACTGGTTTAGGTCGAGCC
GGGGCATCTTTCCCGACTTGGAGAAGTATAGAGGACGCAG

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR4BL04JQ 701 0 0
AGATTTGATATTTATTTCAAATTATAACACCAACTCACAGAGGGAAAAAAGTATACATAA
TAGTTATATCCGAATATTAACAAGACGCATGGATCTTGGTATAGGCTTTCATTTCATCTT
TACACAACATATGTTGAATCCCTCGC**TAGGCTAATAATAACCCCTTAAGAGGTGCTAC
TTGTTGCCGGAACAGAAGACGCCTCCTCTGGCTGAGCCTCACTGGCCGTAGTTTCGGGCA
ATGAAGTTTCTTCCTGAGCCACCGGCGGAGCTTCAGTGAGGGCGGGTGAAGAGGCTTGAA
CAACTTGTGAAGGCTTGAACTTGTTGATGTAGTAGCTAAGAGAGGGTCCACTGTAATCCA
CTGGTTTAGGTCGAGCCGGGGCATCTTTCCCGACTTGGAGAAGTATAGAGGACGCCGCAG
CGATTGCGATAAGGGCAAGGCCTCCTACGATTGCTGCTGTGTTCTCAGCCCCATCAGACG
AAGATCCTGCAGTACCTGAGCTTATGGCACTCTCTGCAACATATACTGCAGGCTCAATAG
AGTAAACATTAGTCTGACCGGCAGTATCTTTCTCAACATAACCAGTCCAACCACGCTTCC
GAGGTGGAAACGTTCCCACCGCTTTCGTCTTCTCTCCAGCCAACCATTCCATACTCACTG
TCCCAACCTCTTTGTCGGGAGCACATTCCTCGTCATTACAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4GD06JQ 763 0 0
ACA
AATTATAACACCAACTCATAGAGGGAAAAAAGTATACATAATAGTTATATCCGAATATTA
ACAAGACGCATGGATCTTGGTATGGGCTTTCATTTCATCTTTACACAACATATGTTGAAT
CCCTCGC**TAGGCTAATAATAACCCCTTAAGAGGTGCTACTTGTTGCCGGAACAGAAGA
CGCCTCCTCTGGCTGAGCCTCACTGGCCGTAGTTTCGGGCAATGAAGTTTCTTCCTGAGC
CACCGGTGGAGCTTCAGTGAGGGCGGGTGAAGAGGCTTGAACAACTTGTGAAGGCTTGAA
CTTGTTGATGTAGTAGCTAAGAGAGGGTCCACTGTAATCCACTGGTTTAGGTCGAGCCGG
GGCATCTTTCCCGACTTGGAGAAGTATAGAGGACGCCGCAGCGATTGCGATAAGGGCAAG
GCCTCCTACGATTGCTGCTGTGTTCTCAGCCCCATTAGACGAAGATCCTGCAGTACCTGA
GCTTATGGCACTCTCTGCAACATATACTGCAGGCTCAATAGAGTAAACATTAGTCTGACC
GGCAGTATCTTTCTCAACATAACCAGTCCAACCACGCTTCCGAGGTGGAAACGTTCCCAC
CACTTTCGTCTTCTCTCCAGCCAACCATTCCATACTCACTGTCCCAACCTCTTTGTCGGG
AGCACATTCCTCGTCATTACAATCAGGATCATCCGAAGAAGCTCTAACGACGGATACGAA
AAGCTTCCGTCCTACCGACCTGGCGCTGAGGAATCCGCTA

QA 4 763 4 763
DS 



CO CL160Contig2 971 9 32 U
GGGAGCCTGAATGAAAAGCCCCACATTACACCACCACAAAAACACATCATCATCATCGTC
TTCTCTCTTTACTCTTTCCATCCTCACATATTATCTTCATTTATCAATTTTTTTTTTTTT
TTATCAAACCTCGAATCTGGTCCAACCATGATGTCTTGCGCTTCCAATGTATTGCTATCC
CCAAACGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCAGGTCG
GTAGGACGGAAGCTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTCCCGATGATCCTGATTGTAAT
GACGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGA
GAGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTT
GAGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCA
GAGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCCTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCA
GCAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAA
GTCGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGC
TACTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCTTT
GAAGCTCCACCCGTGGCTCAGGAAGAAACTCCACTGCCCGAAACTACAGCCAGTGAGGCT
CAGACAGAGGCATCTCCTGTTCCGGCCACAAGTAGCACCTCTTAAGGGGTTATTATTAGC
CTAGGGAGAGGGATTCAACATATGTTTGTGTAAAGATGAAATGGAGCCTATACCAAGATC
ATGCGTCTTGTTAATATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTATGAGTTG
GTGTTATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 20 45 30 45 30 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CS69TF U 165
AF RR4BL04TF U 123
AF RR4EI34TF U 123
AF RR4GD06TF U 1
AF RR4AF47TF U 123
AF RR4CG54TF U 123
AF RR4CG54JQ C 188
AF RR4EI34JQ C 657
AF RR4CS69JQ C 294
BS 1 170 RR4GD06TF
BS 171 171 RR4AF47TF
BS 172 198 RR4GD06TF
BS 199 199 RR4AF47TF
BS 200 216 RR4GD06TF
BS 217 217 RR4AF47TF
BS 218 219 RR4GD06TF
BS 220 220 RR4AF47TF
BS 221 279 RR4GD06TF
BS 280 280 RR4AF47TF
BS 281 281 RR4GD06TF
BS 282 282 RR4AF47TF
BS 283 413 RR4GD06TF
BS 414 414 RR4AF47TF
BS 415 515 RR4GD06TF
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BS 517 519 RR4GD06TF
BS 520 520 RR4BL04TF
BS 521 578 RR4GD06TF
BS 579 579 RR4AF47TF
BS 580 593 RR4GD06TF
BS 594 594 RR4AF47TF
BS 595 717 RR4GD06TF
BS 718 719 RR4AF47TF
BS 720 727 RR4GD06TF
BS 728 737 RR4AF47TF
BS 738 741 RR4CG54TF
BS 742 743 RR4CG54JQ
BS 744 762 RR4CG54TF
BS 763 763 RR4CG54JQ
BS 764 777 RR4CG54TF
BS 778 971 RR4CG54JQ

RD RR4CS69TF 348 0 0
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CCTCAGCGCCAGGTCGGTAGGACGGAAGCTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTCCCGA
TGATCCTGATTGTAATGACGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTAT
GGAATGGTTGGCTGGAGAGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGG
TTGGACTGGCTATGTTGAGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCC
TGCAGTATATGTTGCAGAGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATC

QA 1 348 1 348
DS 

RD RR4BL04TF 467 0 0
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AAACGGCTGCGTTTTGACATCTCCTAAGCCTCTTAGCGGATTCCTCAGCGCCAGGTCGGT
AGGACGGAAGCTTTTCGTACCCGTCGTTAGAGCTTCTTCGGATGATCCTGATTGTAATGA
CGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGA
GAAGACGAAAGCGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGTTATGTTGA
GAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGA
GAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAGC
AATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCGGCGTCCTCTA

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR4EI34TF 544 0 0
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AAACGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCAGGTCGGT
AGGACGGAAGCTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTCCCGATGATCCTGATTGTAATGA
CGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGCATGGAATGGTTGGCTGGAGA
GAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGA
GAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGA
GAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCCTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAGC
AATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAGT
CGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGCTA
CTAC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4GD06TF 727 0 0
GGGAGCCTGAATGAAAAGCCCCACATTACACCACCACAAAAACACATCATCATCATCGTC
TTCTCTCTTTACTCTTTCCATCCTCACATATTATCTTCATTTATCAATTTTTTTTTTTTT
TTATCAAACCTCGAATCTGGTCCAACCATGATGTCTTGCGCTTCCAATGTCTTGCTATCC
CCAAACGGCTGCGTTTTGACATCTCCTAAGCCTCTTAGCGGATTCCTCAGCGCCAGGTCG
GTAGGACGGAAGCTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTTCGGATGATCCTGATTGTAAT
GACGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGA
GAGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGTTATGTT
GAGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCA
GAGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTAATGGGGCTGAGAACACAGCA
GCAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCGGCGTCCTCTATACTTCTCCAA
GTCGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGC
TACTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCACT
GAAGCTC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4AF47TF 615 0 0
ATCAAACCTCGAATCTGGTCCAACCATGATGTCTTGCGCTTCCAATGTATTGCTATCCCC
AAACGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCAGGTCGGT
AGGACGGAAGCTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTCCCGATGATCCTGATTGTAATGA
CGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGA
GAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGA
GAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGA
GAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCCTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAGC
AATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAGT
CGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGCTA
CTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCTTTGA
AGCTCCACCCGTGGC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4CG54TF 659 0 0
ATCAAACCTCGAATCTGGTCCAACCATGATGTCTTGCGCTTCCAATGTATTGCTATCCCC
AAGCGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCAGGTCGGT
AGGACGGAAGCTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTCCCGATGATCCTGATTGTAATGA
CGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGA
GAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGA
GAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGA
GAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCCTCTGGTGGGGCTGAGAACACAGCAGC
AATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAGT
CGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGCTA
CTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCTTTGA
AGCTCCACCCGTGGCTCAG**AGAAACTCCACTGCCCGAA*CTACAGCCAGTGAG
CTCA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4CG54JQ 784 0 0
GGCTGCG
TTTGGCATCTC*TAAGCCTCTTGGCAGAT*CCTCAGCGCCAGGTCGGTAGGACGGAAGCT
TTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTCCCGATGATCCTGATTGTAATGACGAGGAATGTGC
TCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGAGAAGACGAAAGT
GGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGAGAAAGATACTGC
CGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGAGAGTGCCATAAG
CTCAGGTACTGCAGGATCTTCCTTTGGTGGGGCTGAGAACACAGCAGCAATTGTAGGAGG
CCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAGTCGGGAAAGATGC
CCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTTTTAGCTACTACATCAACAA
GTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCTTTGAAGCTCCACCCGT
GGCTCAGGAAGAAACTCCACTGCCCGAAACTACAGCCAGTGAGGCTCAGACAGAGGCATC
TCCTGTTCCGGCCACAAGTAGCACCTCTTAAGGGGTTATTATTAGCCTAGGGAGAGGGAT
TCAACATATGTTTGTGTAAAGATGAAATGGAGCCTATACCAAGATCATGCGTCTTGTTAA
TATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTATGAGTTGGTGTTATAATT

QA 8 784 8 784
DS 

RD RR4EI34JQ 315 0 0
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CTTTGAAGCTCCACCCGTGGCTCAGGAAGAAACTCCACTGCCCGAAACTACAGCCAGTGA
GGTTCAGACAGAGGCATCTCCTGTTCCGGCCACAAGTAGCACCTCTTAAGGGGTTATTAT
TAGCCTAGGGAGAGGGATTCAACATATGTTTGTGTAAAGATGAAATGAAGCCTATACCAA
GATCATGCGTCTTGTTAATATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTATGA
GTTGGTGTTATAATT

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR4CS69JQ 678 0 0
TTGTAATGACGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTT
GGCTGGAGAGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGG
CTATGTTGAGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATA
TGTTGCAGAGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCCTCTGGTGGGGCTGAGAA
CACAGCAGCAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACT
CCTCCAAGTCGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTC
TTTTAGCTACTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGC
CCTCTTTGAAGCTCCACCCGTGGCTCAGGAAGAAACTCCACTGCCCGAAACTACAGCCAG
TGAGGCTCAGACAGAGGCATCTCCTGTTCCGGCCACAAGTAGCACCTCTTAAGGGGTTAT
TATTAGCCTAGGGAGAGGGATTCAACATATGTTTGTGTAAAGATGAAATGGAGCCTATAC
CAAGATCATGCGTCTTGTTAATATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTA
TGAGTTGGTGTTATAATT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 13

CO CL161Contig1 890 13 39 U
GGGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGATA*AACT
CAAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAA
ATCCGAGGAAAAGAAGCGTAACTTTACCGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAA
CTATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACTGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCT
TCCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAA
ACGTAAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTC
TCGACTCCTATCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTGA
GTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACAT
TATAATATGCAATGTTGGATTTTACAATATCGACTCTCCGATTCAGTTTT


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 0 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 0 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
0 70 70 70 70 70 70 0 70 70 65 65 0 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW01TF U 2
AF RR4EW88TF U 1
AF RR4GS11TF U 1
AF RR4FO21TF U 2
AF RR4BD11TF U 2
AF RR4BB61TF U 3
AF RR4FO21JQ C 28
AF RR4BO25JQ C 228
AF RR4BO25TF U 228
AF RR4BD11JQ C 95
AF RR4GS11JQ C 71
AF RR4BB61JQ C 92
AF RR4CD23TF U 618
BS 1 53 RR4EW88TF
BS 54 54 RR4BD11TF
BS 55 55 RR4EW88TF
BS 56 56 RR4BD11TF
BS 57 123 RR4EW88TF
BS 124 124 RR4BD11TF
BS 125 309 RR4EW88TF
BS 310 310 RR4BD11TF
BS 311 365 RR4EW88TF
BS 366 366 RR4GS11TF
BS 367 487 RR4EW88TF
BS 488 488 RR4GS11TF
BS 489 522 RR4EW88TF
BS 523 523 RR4BD11TF
BS 524 525 RR4EW88TF
BS 526 526 RR4BD11TF
BS 527 565 RR4EW88TF
BS 566 566 RR4BD11TF
BS 567 568 RR4EW88TF
BS 569 569 RR4BD11TF
BS 570 601 RR4EW88TF
BS 602 602 RR4BD11TF
BS 603 637 RR4EW88TF
BS 638 638 RR4BD11TF
BS 639 666 RR4EW88TF
BS 667 667 RR4BD11TF
BS 668 687 RR4EW88TF
BS 688 688 RR4GS11TF
BS 689 696 RR4EW88TF
BS 697 697 RR4GS11TF
BS 698 722 RR4EW88TF
BS 723 723 RR4BD11TF
BS 724 732 RR4EW88TF
BS 733 734 RR4GS11TF
BS 735 735 RR4BD11TF
BS 736 759 RR4GS11TF
BS 760 807 RR4BD11TF
BS 808 861 RR4BO25TF
BS 862 890 RR4GS11JQ

RD RR4BW01TF 654 0 0
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AAGATGAGTAAACTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
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TATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGC
CCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATG
GGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTT
AAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGATT
CCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCAC
CAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACTGTGAAGTTCCAGTTGAAG
AAGGTTCTGTGTATGGGGTGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
CCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGA
TTGG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4EW88TF 732 0 0
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CAAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAA
ATCTGAGGAAAAGAAGCGTAACTTTACCGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAA
CTATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGACGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGCCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTCAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCGGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCT
TTCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCTCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAA
ACGTAAAGTGTTTGTACTTGAAGAGCAGCATGGGAC*ACCACAGAGAATCTTTTGAGTTC
TCCACTCCTATC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4GS11TF 761 0 0
G
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAGAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCTGAGGAAAAGAAGCGTAACTTTACCGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGC
CCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATG
GGACTAGACTCTATGGATTTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTT
AAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGATT
CCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCAC
CAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTCAAGTTCCAGTTGAAG
AAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCGGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCTCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAA
CGTAA*GTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCT
C*ACTCCTATCAT*TTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTT
GT

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4FO21TF 752 0 0
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AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGC
CCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATG
GGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTT
AAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGATT
CCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCAC
CAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACTGTGAAGTTCCAGTTGAAG
AAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
CCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAA
CGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGAC*ACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCT
CGACTCCTGTCATCTTGGA*CTTTTGCTTTGT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4BD11TF 806 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGATA*AACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
CATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGC
CCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGTGGCTGAGAAGATG
GGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAGGAACAAGAAGCTTGTT
AAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGATT
CCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCAC
CAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACTGTGAAGTTCCAGTTGAAG
AAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
CCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAA
CGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCT
CGACTCCTGTCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTGAG
TTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4BB61TF 801 0 0
GAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAGAACTCA
AGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CTGAGGAAAAGAAGCGTAACTTTACCGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGCC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGTAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTCAAGTTCCAGTTGAAGA
AGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCGGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTT
CAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCTCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAAC
GTAAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCTC
CACTCCTATCATTTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGTTTCAGAGATCTTGAGT
TATGGTTTTGTTTGATATTAG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4FO21JQ 838 0 0
CAGGTTCAGAGAT*CGTCAACTGAGATA*AACTCAAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGC
TCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAATCCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTAC
GGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACTATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTT
CAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGCCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGG
AGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGGGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGC
TTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGC
TTTCTTGGCTTCTGAGTCTGTCATCAAGCAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAA
CAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAA
CGAGACCAAAGCGACTGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCTG
TCGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACT
TCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCA
CCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCTCGACTCCTGTCATCTTGGAACTTTTG
CTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGA
ACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACATTATAATATGCAATGTTGGATT
CTGT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4BO25JQ 636 0 0
G
GCACATTCCTCGCCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGA
GGCTGAGAAGATGGGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAA
CAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATACTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGT
CATCAAGCAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAAC
ACTGGTGAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACTGTGAA
GTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAG
AGAAGCAGCTCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGA
AGAATTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAA
TCTTTTGAGTTCTCGACTCCTGTCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTT
CAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTT
TTGTTAAGACATTATAATATGCAATGTTGGATT
CT

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR4BO25TF 636 0 0
G
GCACATTCCTCGCCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGA
GGCTGAGAAGATGGGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAA
CAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATACTTTCTTGGCTTCTGAGTCTGT
CATCAAGCAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAAC
ACTGGTGAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACTGTGAA
GTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGG*TGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAG
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CAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTT
TTGTTAAGACATTATAATATGCAATGTTGGATT
CT

QA 2 634 2 634
DS 

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GTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACCATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGA
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CAGCATGTTGAGGTGGCTGAGAAGATGGGACTAGATTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAA
AAGCTCAACAGGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTG
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GTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGG
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CC

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DS 

RD RR4GS11JQ 820 0 0
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TGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTTCTTTTTGTTAAGACATTATAATATGC
AATGTTGGATTTTACAATATCGACTCTCCGATTCAGTTTT

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DS 

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GCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTG
AAAAAGCTCAACAAGAACAAGTAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTC
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GCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAG
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TTAC

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DS 

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G
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TGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCTCCACTCCTATCATTTTG
GAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGTTTCAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTTTTTGAT
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ATT
TTAC

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DS 



AS 2 14

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TCTCAAAGAATCTGAAGCATCAAAGATCAAAGCTTTAAGTAAATATGGAGATGGGTTTCC
AGGAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATGGAGATTGGATCTGGGCATTACGGGTGCTCAC
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ACTGCCACAACGAAGCTAAGGACTCTCTTCAAACTGAACAGCTTCTTAGACATGATCTCC
CTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGC
AGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCT
TTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCAATATCACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGGACCG
GAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGATGTTGCTACTCCAAAGTCATGG
AAGACAAGCACCGATGTGTGGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGT
ATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTAC
AATGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAACCGATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCA
TATGTGACATGTCCAACATGTGGAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGC
CAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGTGTGGATACTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGA
ATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACTAGAC
AGACGCAGAGAGGACCTGATACTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCCTCAGGTTGTTG
GTTCAACCGGTTAATTAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTCGGTGTCTGAATCTCCCAAGGG
AAATTATTTATGTACCTTCTTAACTATATCAGTACATATTCAAATGCCTATGACGACTGT
GTTATAACCACTTCGACTCGCGGGTCTAGATGATCTATAATAAAACGTAAAAATAGATTC
TAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 

AF RR4C916TF U 1
AF RR4FP43TF U 1
AF RR4ET84TF U 48
AF RR4FU86TF U 204
AF RR4FP43JQ C 770
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RD RR4C916TF 735 0 0
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TCTCAAAGAATCTGAAGCATCAAAGATCAAAGCTTTAAGTAAATATGGAGATGGGTTTCC
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CTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCCTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGC
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AAGACAAGCACCGATGCGTGGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGT
ATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTAC
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TATGTGACATGTCCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4FP43TF 772 0 0
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TCTCAAAGAATCTGAAGCATCAAAGATCAAAGCTTTAAGTAAATATGGAGATGGGTTTCC
AGGAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATGGAGATTGGATCTGGGCATTACGGGTGCTCAC
ATTACAGAAGACGATGTAAGATTAGAGCACCTTGTTGTGATGAAGTTTTCGATTGTAGAC
ACTGCCACAACGAAGCTAAGGACTCTCTTCAAACTGAACAGCTTCTTAGACATGATCTCC
CTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGC
AGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCT
TTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCAATATCACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGGACCG
GAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGATGTTGCTACTCCAAAGTCATGG
AAGACAAGTACCGATGTGTGGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGT
ATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTAC
AATGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAACCGATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCA
TATGTGACATGTCCAACATGTGGAAGAA*CTTGATGAAGAGGTTGCTGCATA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4ET84TF 754 0 0
AATCTTTCGTTACTCTCAAAGAATCTGAAGCATCAAAGATCAAAGCTTTAAGTAAATATG
GAGATGGGTTTCCAGGAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATGGAGATTGGATCTGGGCAT
TACGGGTGCTCACATTACAGAAGACGATGTAAGATTAGAGCACCTTGTTGTGATGAAGTT
TTCGATTGTAGACACTGCCACAACGAAGCTAAGGACTCTCTTCAAACTGAACAGCTTCTT
AGACATGATCTCCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGTGAGACAGAA
CAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCA
AAATGCAAGTTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCAATATCACTGCGATGAATGTGGG
ATTTGCAGGACCGGAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGATGTTGCTAC
TCCAAAGTCATGGAAGACAAGCACCGATGTGTGGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCT
GTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCAC
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TGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCA*CATGTGGA*GAA*CTTGATGA*GAG*TTGCT
GCATACCCAATGCCAAA
GTGTACGAGACAGATGG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FU86TF 730 0 0
G
GAGCACCTTGTTGTGATGAAGTTTTCGATTGTAGACACTGCCACAACGAAGCTAAGGACT
CTCTTCAAACTGAACAGCTTCTTAGACATGATCTCCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCA
TTTGCTCGCTTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTAT
GTATGGGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAAGC
AATATCACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGGACCGGAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATT
GCAAAAGATGTCGATGTTGCTACTCCAAAGTCATGGAAGACAAGCACCGATGTGTGGAAG
GCGCAATTCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATA
TCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTACAATGCACCAAAGATATGGGGCTGC
ATAACCTATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTGGA
AGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGG
TGTGGATACTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCG*TTTCATTTGATCGCGC
ATAAGTGCACTAGCTGCGGT*CCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACTA
CTCACTCT
G

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR4FP43JQ 232 0 0
ATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAATATGGTGTGGATACTTTGCAATGACTGTGG
TTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTA
CAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCC
TCAGGTTGTTGGTTCAACCGGTTAATTAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTCGG

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DS 

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ATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAA
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TTGCAAAAGATGTCGATGTTGCTACTCCAAAGTCATGGAAGACAAGCACCGATGCGTGGA
AGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGA
TATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTACAATGCACCAAAGATATGGGGCT
GCATAACCGATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTG
GAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGAT
GGTGTGGATACTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGC
GCATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATAC
TACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCCTCAGGTTGTTGGTTCAACCGGTTAATTAAGACC
TGAACCGGAGCTGGTTCGGTGTCTGAATCTCCCAAGGGAAATTATTTATGTACCTTCCTA
ACTATATCAGTACATATTCAAATGCCTATGACGACTGTGTTATAACCACTTCGACTCGCG
GGTCTAGATGATCTATAATAAAACGTAAAAATAGATT
CCG

QA 1 817 1 817
DS 

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G
CAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAG
TTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCAATATCACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGG
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GAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCAT
TTACAATGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAACCGATACACATGCCCTGTATGCTCTAAA
TCCATATGTGACATGTCCAACATGTGGAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCA
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TTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACT
AGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCCTCAGGTT
GTTGGTTCAACCGGTTAATTAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTCGGTGTCTGAATCTTCCA
AGGGAAATTATTTATGTACCTTCTTAACTATATCAGTACATATTCAAATGCCTATGACGA
CTGTGTTATAACCACTTCGACTCGCGGGTCTAGATGATCTATAATAAAACGT

QA 2 773 2 773
DS 

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TGCAAAAGATGTCGATGTTGCTACTCCAAAGTCATGGAAGACAAGCACCGATGTGTGGAA
GGCGCAATTCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGAT
ATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTACAATGCACCAAAGATATGGGGCTG
CATAACCTATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTGG
AAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATG
GTGTGGATACTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCG
CATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACT
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GAACCGGAGCTGGTTCGGTGTCTGAATCTCCCAAGGGAAATTATTTATGTACCTTCTTAA
CTATATCAGTACATATTCAAATGCCTATGACGACTGTGTTATAACCACTTCGACTCGCGG
GTCTAGATGATCTATAATAAAACGT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4ET84JQ 673 0 0
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CAAAGTCATGGAAGACAAGCACCGATGTGTGGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTGT
TTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACAC
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CTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTGGAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGC
ATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGTGTGGATACTTTGCAATGACTGTGG
TTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATTGCGTATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTA
CAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCC
TCAGGTTGTTGGTTCAACCGGTTAATTAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTCGGTGTTTGAA
TCCCCCAAGGGAAATTATTTATGTACTTTTTTAACTATATCAGTACATATTCAAATGCCT
ATGACGACTGTGTTATAACCACTTCGACTCGCGGGTCTAGATGATCTATAATAAAACGTA
AAAATAGATT
TTG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4AJ09JQ 710 0 0
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CTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGATGTTGCTACTCCAAAGTCATGGAAGACAAGCACCG
ATGTGTGGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTC
CACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTACAATGCACCAAAGA
TATGGGGCTGCATAACCGATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTC
CAACATGTGGAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGA
AGACAAGATGGTGTGGATACTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCA
TTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGG
ACCTGATACTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCCTCAGGTTGTTGGTTCAACCGGTTA
ATTAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTCGGTGTTTGAATCTTCCAAGGGAAATTATTTATGT
ACCTTCTTAACTATATCAGTACATATTCAAATGCCTATGACGACTGTGTTATAACCACTT
CGACTCGCGGGTCTAGATGATCTATAATAAAACGTAAAAATAGATTCTAG

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL162Contig2 1177 4 9 U
GGGGCAACTCCCCCCATTGATTAATAACAAACGTCAAAGCACTTCTTCATTTTACGTTCT
TTTTTTTGCAATCTTTCGTTACTCTCGAAGAATTTGAAGCATCAAAGATCAAAACTTTAA
GTAAATATGGAGATGGGTTTCCAGGAAAATCAGCAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATG
GAGATTGGATCTGGGCATTACGGGTGCTCACATTATAGAAGACGATGTAAGATTAGAGCA
CCTTGTTGTGATGAAGTTTTCGATTGTAGACACTGCCACAACGAAGCCAAGGATTCTCTT
CAAACTGAACAGCTTCTCAGACATGATCTTCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGC
TCGCTTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATG
GGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGATGATGATCTTACCAAGAAGCAATAC
CACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGGACCGGAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAA
AGATGTCGGTGTTGCTACTCCAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGGCGCA
ATGCATCACAATTGCCCTGTTTATTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACG
GTGTTGAGATGTGGTCACACAGTGCATTTACAATGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAAC
CGATACACATGCCCTGTATGTTCTAAATCCATATGTGACATGTCTAACATGTGGAAGAAA
CTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGTATGG
ATTCTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAG
TGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATGCTACTCAC
TCTTGCTCTTCAGGAGTTCCTCAGATTGTTGGTTCAACCGGTTAATCAAGACCTGAACCG
GAGCTGGTTTGGTGTCTGAATTTCCCAAGGGAGATTGCTTGTGTACTTACTTAACTATAC
CAGCACATATTCAAATGCATATGACGACTGTGTTATAACCAATTCGACTCGCGGGTCTAG
ATGATCATCTATAATAAACGTAAAAATAGATTCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4C679TF U 78
AF RR4CT64TF U 1
AF RR4CT64JQ C 315
AF RR4C679JQ C 320
BS 1 112 RR4CT64TF
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RD RR4C679TF 338 0 0
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TTTCCAGGAAAATCAGCAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATGGAGATTGGATCTGGGCA
TTACGGGTGCTCACATTATAGAAGACGATGTAAGATTAGAGCACCTTGTTGTGAT*AAGT
TTTCGATTGTAGACACTGCCACAACGAAGCCAAGGATTCTCTTCAAACTGAACAGCTTCT
CAGACATGATCTTCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGTGAGACAGA
ACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTAT

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR4CT64TF 765 0 0
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TTTTTTTGCAATCTTTCGTTACTCTCGAAGAATTTGAAGCATCAAAGATCAAGACTTTAA
GTAAATATGGAGATGGGTTTCCAGGAAAATCAGCAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATG
GAGATTGGATCTGGGCATTACGGGTGCTCACATTATAGAAGACGATGTAAGATTAGAGCA
CCTTGTTGTGATGAAGTTTTCGATTGTAGACACTGCCACAACGAAGCCAAGGATTCTCTT
CAAACTGAACAGCTTCTCAGACATGATCTTCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGC
TCGCTTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATG
GGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGATGATGATCTTACCAAGAAGCAATAC
CACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGGACCGGAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAA
AGATGTCGGTGTTGCTACTCCAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGGCGCA
ATGCATCACAATTGCCCTGTTTATTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACG
GTGTTGAGATGTGGTCACACAGTGCATTTACA*TGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAAC
CGATACACATGCCCTGTATGTTCTAAATCCATATGTGACATGTC
T

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4CT64JQ 861 0 0
TCTC
AGACATGATCTTCCTCGACATGAT*TTTCAAAG*TCATTTGCTCGCTTTGTGAGACAGAA
CAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCA
AAATGCAAGTTCTTTGATGATGATCTTACCAAGAAGCAATACCACTGCGATGAATGTGGG
ATTTGCAGGACCGGAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGGTGTTGCTAC
TCCAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCT
GTTTATTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCAC
ACAGTGCATTTACAATGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAACCGATACACATGCCCTGTA
TGTTCTAAATCCATATGTGACATGTCTAACATGTGGAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCT
GCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGTATGGATTCTTTGCAATGACTGT
GGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGCTGCGTTTCC
TACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATGCTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTT
CCTCAGATTGTTGGTTCAACCGGTTAATCAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTTGGTGTCTG
AATTTCCCAAGGGAGATTGCTTGTGTACTTACTTAACTATACCAGCACATATTCAAATGC
ATATGACGACTGTGTTATAACCAATTCGACTCGCGGGTCTAGATGATCATCTATAATAAA
CGTAAAAATAGATTC
CC

QA 5 859 5 859
DS 

RD RR4C679JQ 858 0 0
GACATGATCT*CCTCGACATGATGTT*CAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGTGAGACAGAAC
AAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTACTTTTGCTCAA
AATGCAAGTTCTTTGATGATGATCTTACCAAGAAGCAATACCACTGCGATGAGTGTGGGA
TTTGCAGGACCGGAGGAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGGTGTTGCTACT
CCAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGGCGCAATGCATCACAATTGCCCTG
TTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGATGTGGTCACA
CAATGCATTTACAATGCACCAAAGATATGGGGCTGCATAACCGATACACATGCCCTGTAT
GTTCTAAATCCATATGTGACATGTCTAACATGTGGAAGAAACTTGATGAAGAGGTTGCTG
CATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGTATGGATTCTTTGCAATGACTGTG
GTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCT
ACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATGCTACTCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTC
CTCAGATTGTTGGTTCAACCGGTTAATCAAGACCTGAACCGGAGCTGGTTTGGTGTCTGA
ATTTCCCAAGGGAGATTGCTTGTGTACTTACTTAACTATACCAGCACATATTCAAATGCA
TATGACGACTGTGTTATAACCAATTCGGCTCGCGGGTCTAGATGATCATCTATAATAAAC
GTAAAAATAGATTCTGAG

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 13

CO CL163Contig1 1228 13 21 U
GGAAACCGAAAGCACAAAAGAGGCTTATCTAGAATTACAAAATTACCAAAAGACCCATCA
TCCTTCTCTCATCTCTGAAAGTATCGATCATCGAATTTGGGTGTGTGTGGAAATATCTTC
TCTTCTAAAGCATCAAACTTTTCTTTGCTTCTGATCTTCGCCTTCTTCTTCTTCTTCTCA
TCGCTGGAAATTGACGTTCCATGGCAAGAGTTTCGTTCAAGGATTCTCTGAAAGCTCTCG
AAGCAGATATCCAACACGCTAACACTGTAGCTTTAGATTATCCTCGGGAGAAGGATGGAG
CTCGTGTTCAGATGAGGCTATCTTACAACCCGGCAGCTCAGTTTCTACTCTTTCTTGTCC
AGTGGACTGATTGCCACCTGGCAGGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATGA
CCTATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGATT
TCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGAT
GACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGA
GTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATG
AACAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGAC
TGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTCA
GGGGACCTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAGG
GAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAGAAGCTACCTCTAGTGGTTCCAGATCAA
GTGTTTGCTTCTTCTCCTTACGATTGCCATGTCAAGTGAGTAAGATTAATAAGAAGAAGA
AGAAGAGCTTTTTATAAAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTATATGAATGTATATA
TAATGTTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATAATAATAATATAGTAACCATTCTCTTGG
GGAAGTCCATTTCTACTTGCTTGTCTGTTTTTTTTCAAAATGTGCATTTGGCTTTTGGTT
CCCAAACTGTGTTATTTTCCGCTGTGTAGTAAATTCATGACTCTAAAACCCTCTTCTTTG
TGAAGTGGCTTTCAATCATAACAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 45 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 
65 40 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 
70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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5 5 5 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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CTTCTTCTTCTTCTCATCGCTGGAAATTGACGTTCCATGGCAAAAGTTTCGTTCAAGGAT
TCTCTGAAAGCTCTCGAAGCAGATATCCAACACGCTAACACTGTAGCTTTAGATTATCCT
CGGGAGAAGGATGGAGCTCGTGTTCAGATGAGGCTATCTTACAACCCGGCAGCTCAGTTT
CTACTCTTTCTTGTCCAGTGGACTGATTGCCACCTGGCAGGT

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DS 

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TACAACCCGGCAGCTCAGTTTCTACTCTTTCTTGTCCAGTGGACTGATTGCCACCTGGCA
GGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATGACCTATGCGGATGGGAAGACCACA
ATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGATTTCTATGCTGTGATATTTCCATCG
CTGTTTGCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTG
CAAAGTAAGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGG

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DS 

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TCTTCTAAAGCATCAAACTTTTCTTTGCTTCTGATCTTCGCCTTCTTCTTCTTCTTCTCA
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AAGCAGATATCCAACACGCTAACACTGTAGCTTTAGATTATCCTCGGGAGAAGGATGGAG
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AGTGGACTGATTGCCACCTGGCAGGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATTA
CCTATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGATT
TCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGAT
GACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGA
GTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATG
A*CAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCATCAAGTGTTAC*GTGAC
TGGCATGGGAG*TCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGG*ACAGTCTGA
GAGAGTGAC

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DS 

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GGGT
GTGTGGAAATATCTTCTCTTCTAAAGCATCAAACTTTTCTTTGCTTCTGATCTTCGCCTT
CTTCTTCTTCTTCTCATCGCTGGAAATTGACGTTCCATGGCAAGAGTTTCGTTCAAGGAT
TCTCTGAAAGCTCTCGAAGCAGATATCCAACACGCTAACACTGTAGCTTTAGATTATCCT
CGGGAGAAGGATGGAGCTCATGTTCAGATGAGGCTATCTTACAACCCGGCAGCTCAGTTT
CTACTCTTTCTTGTCCAGTGGACTGATTGCCACCTGGCAGGTGCACTCGGTTTGCTCAGA
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ACCAGTATTAAAGATTTCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGG
CATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGTACAGGAACAA
AGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGCGGAGAGAGACGAAGAGTGTGG
TATATGTATGGAGATGAGCAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCAT
CAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCT
GAAGAGAGTGA
CTCAG

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DS 

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GG
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AGCTCAGTTTCTACTCTTTCTTGTCCAGTGGACTGATTGCCACCTGGCAGGTGCACTCGG
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CGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGATTTCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAAC
TAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGT
ACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGACG
AAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATT
TTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCT

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GG
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AGTTTCTACTCTTTCTTGTCCAGTGGACTGATTGCCACCTGGTAGGTGCACTCGGTTTGC
TCAGAGTTCTCATTTACATGACCTATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTTTACGAGA
GAAAAACCAGTATTAAAGATTTCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAA
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AACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGACGAAGAG
TGTGGTATATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTA
TGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGAC
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AGTCTCCATACAGTGGAGAGGGAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAGAAGCTA
CCTCTAGTGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTCTTCTCCTTACGATTGCCATGTCAAGTGA
GTAAGATTAATAAGAAGAAGAA***GA

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DS 

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G
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TTACAACCCGGCAGCTCAGTTTCTACTCTTTCTTGTCCAGTGGACTGATTGCCACCTGGC
AGGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATGACCTATGCGGATGGGAAGACCAC
AATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGGTTTCTATGCTGTGATATTTCCATC
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GCAAAGTAAGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGACG
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ACTGTACGCATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCAT
GCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTCAGGGGACCTGTGGATGTTGATGG
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TGTACATAGAGAAGCTACCTCTAGTGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTCTTCTCCTTACG
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TAAACCGGT
CT

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DS 

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AACCAGTATTAAAGATTTTTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGG
GCATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGTACAGGAACA
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GTATATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCA
TCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTC
TGAAGAGAGTGAACTCAGGGGACCTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTC
TCCATACAGTGGAGAGGGAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAGAAGCTACCTC
TAGTGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTTTTCTCCTTACGATTGCCATGTCAAGTGAGTAA
GATTAATAAGAAGAAGAA***GAGCTTTTTATAAAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCT
TTATATGAATGTATATATAATGTTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATAATAATAATAT
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DS 

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GTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATTACCTATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTTT
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CTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGG
TACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGAC
GAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCAT
TCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGC
AGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTCAGGGGACCTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGAT
ACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAGGGAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAG
AAGCTACCTCTAGTGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTCTTCTCCTTACGATTGCCATGTC
AAGTGAGTAAGATTAATAAGAAGAAGAAGAAGAGCTTTTTATAAAAGGCTAAACCGGCTC
TGGTAAACCTTTATATGAATGTATATATAATGTTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATA
ATAATAATATAGTAACCATTCTCTTGGGG

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DS 

RD RR4GK51JQ 724 0 0
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ACCTATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGAT
TTCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGA
TGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAG
AGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGCGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGAT
GAGCAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGA
CTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTC
AGGGGACCTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAG
GGAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAGAAGCTACCTCTAGTGGTTCCAGATCA
AGTGTTTGCTTCTTCTCCTTACGATTGCCATGTCAAGTGAGTAAGATTAATAAGAAGAAG
AAGAAGAGCTTTTTATAAAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTATATGAATGTATAT
ATAATGTTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATAATAATAATATAGTAACCATTCTCTTG
GGG
C

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DS 

RD RR4B302JQ 765 0 0
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GCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGATGACCG
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GCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATGAACAG
CATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCA
TGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTCAGGGGA
CCTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAGGGAGAA
TAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAGAAGCTACCTCTAGTGGTTCCAGATCAAGTGTT
TGCTTCTTCTCCTTACGATTGCCATGTCAAGTGAGTAAGATTAATAAGAAGAAGAAGAAG
AGCTTTTTATAAAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTATATGAATGTATATATAATG
TTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATAATAATAATATAGTAACCATTCTCTTGGGGAAG
TCCATTTCTACTTGCTTGTCTGTTTTTTTTCAAAATGTGCATTTGGCTTTTGGTTCCCAA
ACTGTGTTATTTTCCGCTGTGTAGTAAATTCATGACTCTAAAACC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4CB53JQ 856 0 0
TCCAGTGACTGATGCCACT
GCAGGTGCACTCGGTT*GCTCAGAGTTCTCATTTACATGAC*TATGCGGATGGGAAGACC
ACAATGTCGGTT*ACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGGTTTCTATGCTGTGATATTTCCA
TCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGT
CTGCAAAGTAAGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGA
CGTGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTCTTCC
CAACTGTACGCATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTC
ATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTCAGGGGACCTGTGGATGTTGAT
GGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAGGGAGAATAAGAAGAGGCTGTT
TGTGTACATAGAGAAGCTACCTCTAGTGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTCTTCTCCTTA
CGATTGCCATGTCAAGTGAGTAAGATTAATAAGAAGAAGAAGAAGAGCTTTTTATAAAAG
GCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTATATGAATGTATATATAATGTTTTTAGAGTAGTAG
TAAGTAAGTAATAATAATAATATAGTAACCATTCTCTTGGGGAAGTCCATTTCTACTTGC
TTGTCTGTTTTTTTTCAAAATGTGCATTTGGCTTTTGGTTCCCAAACTGTGTTATTTTCC
GCTGTGTAGTAAATTCATGACTCTAAAACCCTCTTCTTTGTGAAGTGGCTTTCAA
CC

QA 20 854 20 854
DS 

RD RR4C980JQ 822 0 0
TCTCATTTACATGAC*TATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTT*ACGAGAGAAAAAC
CAGTATTAAAGATTTCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTT*GCAACTAGAAAGGGGCA
TCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTAAGGTACAGGAACAAAG
AGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGGCGAAGAGTGTGGTA
TATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTCTTCCCAACTGTACGCATTCTTTATGCATCA
AGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGA
AGAGAGTGAACTCAGGGGACCTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCC
ATACAGTGGAGAGGGAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATAGAGAAGCTACCTGTAG
TGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTCTTCTCCTTACGATTGCCATGTCAAGTGAGTAAGAT
TAATAAGAAGAAGAAGAAGAGCTTTTTATAAAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTA
TATGAATGTATATATAATGTTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATAATAATAATATAGT
AACCATTCTCTTGGGGAAGTCCATTTCTACTTGCTTGTCTGTTTTTTTTCAAAATGCGCA
TTTGGCTTTTGGTTCCCAAACTTTGTTATTTTCCGCTGTGTAGTAAATTCATGACTCTAA
AACCCTCTTCTTTGTGAAGTGGCTTTCAATCATAACAAATCC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 2 11

CO CL164Contig1 643 3 17 U
GGAGTAATTATTGTTCGTTATTCCCTTTTTTCATAATACTAAACAAGACAAGTAGGCGAA
TGGAAACATAAATAGTCAAAAGAAACCTTACGAAGAATTATACAACACAGAAGACATGAG
TGAAATTTGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTAGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTT
CTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCGATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAA
TATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTC
GGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCCGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAAT
GGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTAC
GTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCAGAGATGTTTGGTACTTCCACGGC
GGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGATTCGACCACCACGAGCAAATCGGGATCC
GAGATTCGTACCAAGACCAGCCGACCGAGTCACCGAACTCCGTCGCGAAGCTTTCAAACC
TCTGAATTCCGGAATCCGCCGTGCGGAAACTGACGGAACCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E266JQ U 12
AF RR4E266TF C 12
AF RR4DW95JQ U 1
BS 1 131 RR4DW95JQ
BS 132 132 RR4E266JQ
BS 133 137 RR4DW95JQ
BS 138 140 RR4E266JQ
BS 141 184 RR4DW95JQ
BS 185 185 RR4E266JQ
BS 186 216 RR4DW95JQ
BS 217 217 RR4E266JQ
BS 218 293 RR4DW95JQ
BS 294 294 RR4E266JQ
BS 295 330 RR4DW95JQ
BS 331 331 RR4E266JQ
BS 332 339 RR4DW95JQ
BS 340 340 RR4E266JQ
BS 341 414 RR4DW95JQ
BS 415 415 RR4E266JQ
BS 416 643 RR4DW95JQ

RD RR4E266JQ 451 0 0
G
GTTCGTTATTCCCTTTTTTCATAATACTAAACAAGACAAGTAGGCGAATGGAAACATAAA
TAGTCAAAAGAAACCTTACGAAGAATTATACAACACAGAAGACATGAGTGAAATTTGTTT
TTTTTTTGTTTTGTTTAGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTC
TTTAGGGACAGCTCCGATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGT
GGGAACGCTGCGTATACCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTT
GTAGAATTTGAACTTGCCCGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCAT
ACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAG
AACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCAGA
AAC

QA 2 448 2 448
DS 

RD RR4E266TF 449 0 0
G
GTTCGTTATTCCCTTTTTTCATAATACTAAACAAGACAAGTAGGCGAATGGAAACATAAA
TAGTCAAAAGAAACCTTACGAAGAATTATACAACACAGAAGACATGAGTGAAATTTGTTT
TTTTTTTGTTTTGTTTAGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTC
TTTAGGGACAGCTCCGATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGT
GGGAACGCTGCGTATACCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTT
GTAGAATTTGAACTTGCCCGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCAT
ACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAG
AACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCAGAG

QA 2 449 2 449
DS 

RD RR4DW95JQ 643 0 0
GGAGTAATTATTGTTCGTTATTCCCTTTTTTCATAATACTAAACAAGACAAGTAGGCGAA
TGGAAACATAAATAGTCAAAAGAAACCTTACGAAGAATTATACAACACAGAAGACATGAG
TGAAATTTGTTGTTTTT***TTTTGTTTAGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTT
CTCCGACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCGATGATACTGTCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAA
TATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCTCTCGTC
GGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTGCGAAATCCTTGGCCAGTTGGTCAACAAT
GGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACCGGTAC
GTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCAGAGATGTTTGGTACTTCCACGGC
GGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGATTCGACCACCACGAGCAAATCGGGATCC
GAGATTCGTACCAAGACCAGCCGACCGAGTCACCGAACTCCGTCGCGAAGCTTTCAAACC
TCTGAATTCCGGAATCCGCCGTGCGGAAACTGACGGAACCTTT

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL164Contig2 772 8 6 U
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AGAATTATACAACACAGAAGACATGAGTGAAATTTGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTAGTT
ACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCGATGA
TACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGT
AACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTG
CGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATG
GTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTG
AATCAGAGATGTTTGGCACTTCCACGGCTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGA
TTCTACCACCACGAGCAAATCGGGATCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGAGTCA
CCGAACTCCGTCGGGAAGCTTTCAAACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAAACTG
ACGGAGCCTTTGAAGCAGACGAAATCGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGGGTAA
CGGTGACTGAATCGAGCAAGGAAGCCATTGAAAGCAGCGAGAGAGAAATTTGAGTGGTGG
AGAGAGAG**ATGTTTAGTTTTGGTTGGCTGTTTGATATGAATGACCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 15 15 15 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 
45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN56JQ U 117
AF RR4G771JQ U 117
AF RR4FN19TF C 1
AF RR4B562JQ U 23
AF RR4B562TF C 25
AF RR4BM22JQ U 117
AF RR4BM22TF C 183
AF RR4G771TF C 66
BS 1 25 RR4FN19TF
BS 26 427 RR4B562JQ
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BS 695 695 RR4BM22JQ
BS 696 772 RR4B562JQ

RD RR4EN56JQ 308 0 0
AGTTACTCCACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCG
ATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATA
CCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTG
CCTGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACAC
CATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCAT
TCTGAATC

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR4G771JQ 594 0 0
AGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCG
ATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATA
CCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTG
CCTGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACAC
CATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCAT
TCTGAATCAGAAATGTTTGGCACTTCCACGGTTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAG
ACGATTCTACCACCACGAGCAAATCGGGATCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGA
GTCACCGAACTCCGTCGGGAAGCTTTCAAACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAA
ACTGACGGAGCCTTTGAAGCAGACGAAATCGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGG
GTAACGGTGACTGAATCGAGCAAGGAAGCCATTGAAAGCAGCGAGAGAGAAATT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4FN19TF 766 0 0
TTCATATACTAACAGACAGTAGGCGAATGGAAACATAAATAGTCAAA*GAAAC*TTACGA
AGAATTATACAACACAGAAGACATGAGTGAAATTTGTTTTTTTTTT*GTTTTGTTTAGTT
ACACGACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCAGATGA
TACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGT
AACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTG
CGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATG
GTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTG
AATCAGAGATGTTTGACACTTCCACGGCTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGA
TTCTACCACCACGAGCAAATCGGGATCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGAGTCA
CCGAACTCTGTCGGGAAGCTTTCAAACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAAACTG
ACGGAGCCTTTGAAGCAGACGAAATCGAGGAGGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGGGTAA
CGGTGACTGAATCGAGCAAGGAAGCCATTGAAAGCAGCGAGAGAGAAATTTGAGTGGTGG
AGAGAGAG**ATGTTTAGTTTTGGTTGGCTGTTTGATATGAAT
GCC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4B562JQ 750 0 0
GCA
AATGGAAACATAAATAGTCAAAAGAGACCTTATGAAGAATTATACAACACAGAAGACATG
AGTGAAATTTGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTAGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGT
TTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCGATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTT
GAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTC
GTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAAC
AATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGG
TACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCAGAAATGTTTGGCACTTCCAC
GGCTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGATTCTACCACCACGAGCAAATCGGGA
TCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGAGTCACCGAACTCCGTCGGGAAGCTTTCAA
ACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAAACTGACGGAGCCTTTGAAGCAGACGAAAT
CGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGGGTAACGGTGACTGAATCGAGCAAGGAAGC
CATTGAAAGTAGCGAGAGAGAAATTTGAGTGGTGGAGAGAGAG**ATGTTTAGTTTTGGT
TGGCTGTTTGATATGAATGACCCCCCC

QA 4 750 4 750
DS 

RD RR4B562TF 748 0 0
A
AATGGAAACATAAATAGTCAAAAGAGACCTTATGAAGAATTATACAACACAGAAGACATG
AGTGAAATTTGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTAGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGT
TTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCGATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTT
GAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTC
GTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAAC
AATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGG
TACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCAGAGATGTTTGGCACTTCCAC
GGCTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGATTCTACCACCACGAGCAAATCGGGA
TCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGAGTCACCGAACTCCGTCGGGAAGCTTTCAA
ACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAAACTGACGGAGCCTTTGAAGCAGACGAAAT
CGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGGGTAACGGTGACTGAATCGAGCAAGGAAGC
CATTGAAAGTAGCGAGAGAGAAATTTGAGTGGTGGAGAGAGAG**ATGTTTAGTTTTGGT
TGGCTGTTTGATATGAAT
GACCCCCCC

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR4BM22JQ 645 0 0
AGTTACTCGACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCG
ATGATACTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGAGTATA
CCGTAACGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTG
CCTGCGAAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGGATCATACGGCAAGGTCCACAC
CATGGTGCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCAT
TCTGAATCAGAGATGTTTGGCACTTCCACGGCTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAG
ACGATTCTACCACCACGAGCAAATCGGGATCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGA
GTCACCGAACTCCGTCGGGAAGCTTTCAAACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAA
ACTGACGGAGCCTTTGAAGCAGACGAAATCGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGG
GTAACGGTGACTGAATCGAGCAAGGAAGCCATTGAAAGCAGCGAGAGAGAAATTTGAGTG
GTGGAGAGAGAG**ATGTTTAGTTTTGGTTGGCTGTTTGATAT
CC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BM22TF 579 0 0
CTATCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGAGTATACCGTAA
CGGTTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTGCG
AAATCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGGATCATACGGCAAGGTCCACACCATGGT
GCCCAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTGAA
TCAGAGATGTTTGGCACTTCCACGGCTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGATT
CTACCACCACGAGCAAATCGGGATCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGAGTCACC
GAACTCCGTCGGGAAGCTTTCAAACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAAACTGAC
GGAGCCTTTGAAGCAGACGAAATCGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGGGTAACG
GTGACTGAATCGAGCAAGGAAGCCATTGAAAGCAGCGAGAGAGAAATTTGAGTGGTGGAG
AGAGAG**ATGTTTAGTTTTGGTTGGCTGTTTGATAT
CC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4G771TF 700 0 0
TATACAACACAGAAGACATGAGTGAAATTTGTTTTTTTTGT****TTGTTTAGTTACTCG
ACCACGAATCTTTCTATAGTTTTCTCCAACGTCTCTTTAGGGACAGCTCCGATGATACTA
TCTTTCTTCTCACCGTCTTTGAATATGATCACCGTGGGAACGCTGCGTATACCGTAACGG
TTGGCTGTGTTTGGGCACTCGTCGGTGTTGATTTTGTAGAATTTGAACTTGCCTGCGAAA
TCTTTGGCCAGTTGGTCAACAATGGGGTGAATCATACGGCAAGGTCCACACCATGGTGCC
CAAAACTCGACCAATACTGGTACGTCTGACTCGAGAACCTGTGTTTGCCATTCTGAATCA
GAGATGTTTGGCACTTCCACGGTTGCGGCAGTGGCGTCCTGAGCCTCGCAGACGATTCTA
CCACCACGAGCAAATCGGGATCCGAGATTCGTACCAAAGCTAGCTGACTGAGTCACCGAA
CTCCGTCGGGAAGCTTTCAAACCTCTGAATTCCGGAATCCGCAGAGCGGAAACTGACGGA
GCCTTTGAAGCAGACGAAATCGAGGAAGTGATCGGGAGAGAAAACACGCGGGTAACGGTG
ACTGAATCGAGCAAGGAAGCCATTGAAAGCAGCGAGAGAGAAATTTGAGTGGTGGAGAGA
GAGAGATGTTTAGTTTTGGTTGGCTGTTTGATATGAAT
CC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 13

CO CL165Contig1 764 13 6 U
GGGAAACACAAACCATTAAACTCAAA*CACCCAATTAAACAAACTTCTGACACAAGAAAA
AAA***CATGAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTC
CTATGTTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGG
CTACATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGT
TGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGG
GATCAATTTTAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCC
TCCTGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACAC
TTCAGAACATGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATCATC***
TCATGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTA
CATCGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCAT
TCTTTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCT
CTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAAGAGTGTCTTGTATC
TGTTTGCTTTATGAATAAGTATTGCTCTCCATGACATTATTTAC


BQ
10 10 10 35 40 40 40 40 40 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 25 65 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 
70 30 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 45 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 45 45 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 
70 70 70 70 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 45 45 45 45 5 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX86TF U 8
AF RR4FD81JQ C 159
AF RR4CI41TF U 47
AF RR4FD81TF U 2
AF RR4ER62JQ C 7
AF RR4ER62TF U 7
AF RR4B362TF U 1
AF RR4B363TF U 1
AF RR4GW06JQ C 1
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AF RR4FX86JQ C 8
AF RR4GW78JQ C 17
AF RR4GW06TF U 1
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GG
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TGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTC
TTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGG*GGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTT
TAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAG
TAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACA
TGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCGTCATCTCATGGGAG
TACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGATTTCCTACATCACAAT
ACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTT
TAT

QA 3 601 3 601
DS 

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GCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCA
AAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTA
AAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCTGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATT
CGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATAGATCAAAAACGGTTCCAGGAC
ATAGGTCATCATCATCATC***TCATGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCCCTTCTTG
CTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTAT
TATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGT
GTTGTAT*ATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTA
GCT

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DS 

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GG
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GCCATGTCTCGGCTACATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCA
GTTGGCTCATGTTGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGC
CCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAA
TGTTCAAACTCCTCCTGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGG
ATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATC
ATCATCATC***TCATGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTC
TGCAACTTCCTACATCGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCT
TTGAAGACGCATTCTTTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGAT
GTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACT

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DS 

RD RR4FD81TF 671 0 0
GG
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***CATGAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTCCTA
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TGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATAGATCAAAAACGGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATCATC***TCA
TGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCCCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
CGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCT
TTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTAT*ATGTACTTTGTGCTCTA
TAAAATCCC

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR4ER62JQ 694 0 0
GGA
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GAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTCCTATGTTTC
TGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCAC
TGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTC
TTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTT
TAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCTGTTAG
TAGCT*CAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACA
TGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATC******TCATGGGAG
CACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCGCAAT
ACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTT*
ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAAT
CCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGC

QA 4 694 4 694
DS 

RD RR4ER62TF 694 0 0
GGA
AAACCATTAAACTCAAA*CACCCAATTAAACAAACTTCTGACACAAGAAAAAAA***CAT
GAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTCCTATGTTTC
TGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCAC
TGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTC
TTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTT
TAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCTGTTAG
TAGCT*CAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACA
TGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATC******TCATGGGAG
CACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCGCAAT
ACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTT*
ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAAT
CCCTACTTCCGGG*TGATATCGGTTTGTAGC

QA 4 694 4 694
DS 

RD RR4B362TF 748 0 0
GGGAAACACAAACCATTAAACTCAAA*CACCCAATTAAACAAACTTCTGACACAAGAAAA
AAA***CATGAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTC
CTATGTTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGG
CTACATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGT
TGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGG
GATCAATTTTAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCC
TCCTGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACAC
TTCAGAACATGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATCATC***
TCATGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTA
CATCGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCAT
TCTTTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGAGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCT
CTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAAGAGTGTCTTGTATC
TGTTTGCTTTATGAATAAGTATTGCTCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4B363TF 750 0 0
GGG
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TGTTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
TGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATCATC***TCA
TGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
CGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCT
TTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGAGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTA
TAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAAGAGTGTCTTGTATCTGT
TTGCTTTATGAATAAGTATTGCTCTCC

QA 4 750 4 750
DS 

RD RR4GW06JQ 764 0 0
GGA
AAACACAAACCATTAAACTCAAA*CACCCAATTAAACAAACTTCTGACACAAGAAAAAAA
***CATGAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTCCTA
TGTTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
TGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAAACAGTTCCAGGACATAGGTCATCATCATCATC***TCA
TGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
CGCAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCT
TTTTT*ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTA
TAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAATGAGTGTCTTGTATCTGT
TTGCTTTATGAATAAGTATTGCTCTCCATGACATTATTTAC

QA 4 764 4 764
DS 

RD RR4DT75TF 726 0 0
GGG
AACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAATTTTTGGCACAAGAAAAAAAA
A*CATGAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGGTGATGTCCGAT
GCTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTAGGCTAC
ATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTC
AGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATC
AATTTTAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCA
GTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCA
GAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCTCAT
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AAA*TCCCTACTTCCGGGGTGACATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTT
TGC

QA 4 726 4 726
DS 

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GG
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CCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTGCTT
TATGAATAAGTATTGCTCTC

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR4GW78JQ 748 0 0
TAAACTCAAA*CACCCAATTAAACAAACTTCTGACACAAGAAAAAAA***CATGAGACCT
GGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTTAATGGCGCTGATGTCCTATGTTTCTGCTCAA
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QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GW06TF 762 0 0
GGA
AAACACAAACCATTAAACTCAAA*CACCCAATTAAACAAACTTCTGACACAAGAAAAAAA
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TGTTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
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TGTTAGTAGCTGCAGCGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
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TGGGAGCACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
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TTGCTT*ATGAATAAGTATTGCTCTCCATGACAT
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QA 4 757 4 757
DS 



AS 1 12

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GCTGTGGAGTGAGACCGGAGCACCAGGGGATCTTCGCCTCCGTTCAGTGCGGAGACATCG
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TGCTGCCATGTACGGGAGGATCTCATGCGTCAAGAAGCTTGCTCAAGTCGGAGCGAATGT
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TGCTGATTGTCTCCAAACCGTTCTCTCTGCTGCTCAGTCAAGCCCCGTTGCTGTTCATTG
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TGAGCCTCTTGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTTAACGAGGAGGCGAA
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CAAACCCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTGT
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CCAGAGTCAGAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTTCAAA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4A223TF U 1
AF RR4A223TFB U 1
AF RR4BS12TF U 586
AF RR4GN88TF U 725
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AF RR4A223JQD C 910
BS 1 855 RR4A223TF
BS 856 1283 RR4BS12TF
BS 1284 1333 RR4GN88TF
BS 1334 1334 RR4EW59TF
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TTTTGGAGAGATTCACGAATCCAGATTTGTTGAATCGTCACAAGCAGACTCGTTGATGCT
TGCTGCCATGTACGGGAGGATCTCATGCGTCAAGAAGCTTGCTCAAGTCGGAGCGAATGT
TCTGATGTTTGATTCCGCCAATCGAAGAACATGTTTGCACTACGCAGCTTACTACGGACA
TGCTGATTGTCTCCAAACCGTTCTCTCTGCTGCTCAGTCAAGCCCCGTTGCTGTTCATTG
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TTTTACTGACTTTTAATTACTTTTTTTTTGTTGCTTCAGGGGATATGCGAGATTTGTGAA
TACCAGGGATGACAAAGGAGCAACAGCCTTGCATCTAGCTGCTAGGCAGAGACGTCCTGA
TTGTGTTAATGTTCTCTTAGACAGTGGCTCTCTTGTTTGTGCTTCCACTAGCCTTTACGG
CTCTCCAGGGAGCACACCTCTTCATTTGGCTGCAAGAAGCGGATCTATCGATTGCGTCAG
AAAGTTACTTGCTTGGGGTGCTGATCGTCTTCAGAGAGACGCTTCTGGGAGGATACCATA
TGTGGTTGCGATGAA

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4A223TFB 843 0 0
GCCCCTAACCTCACATCATCATCGTCATTATCCTTTAGCTGAAGATGGGGCAGAGCATGA
GCTGTGGAGTGAGACCGGAGCACCAGGGGATCTTCGCCTCCGTTCAGTGCGGAGACATCG
CCACTGTGCGGAGAGCGATGTCCACGGATCCGAGTCTTCTGAATCAGACCACTCCTTACG
ATCGCCACTCCCTCCTCCACGTCGCTGCCGCCAGTGGTCAGATCGAGATCTTGTCCTTGC
TTTTGGAGAGATTCACGAATCCAGATTTGTTGAATCGTCACAAGCAGACTCGTTGATGCT
TGCTGCCATGTACGGGAGGATCTCATGCGTCAAGAAGCTTGCTCAAGTCGGAGCGAATGT
TCTGATGTTTGATTCCGCCAATCGAAGAACATGTTTGCACTACGCAGCTTACTACGGACA
TGCTGATTGTCTCCAAACCGTTCTCTCTGCTGCTCAGTCAAGCCCCGTTGCTGTTCATTG
GTGCCTATGACTCACTCTCTTTCCTTGTTTAATGACTTTGCATTTTTAGAAACAAAACTC
TTTTACTGACTTTTAATTACTTTTTTTTTGTTGCTTCAGGGGATATGCGAGATTTGTGAA
TACCAGGGATGACAAAGGAGCAACAGCCTTGCATCTAGCTGCTAGGCAGAGACGTCCTGA
TTGTGTTAATGTTCTCTTAGACAGTGGCTCTCTTGTTTGTGCTTCCACTAGCCTTTACGG
CTCTCCAGGGAGCACACCTCTTCATTTGGCTGCAAGAAGCGGATCTATCGATTGCGTCAG
AAAGTTACTTGCTTGGGGTGCTGATCGTCTTCAGAGAGACGCTTCTGGGAGGATACCATA
TGT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR4BS12TF 698 0 0
G
GCGAGATTTGTGAATACCAGGGATGACAAAGGAGCAACAGCCTTGCATCTAGCTGCTAGG
CAGAGACGTCCTGATTGTGTTAATGTTCTCTTAGACAGTGGCTCTCTTGTTTGTGCTTCC
ACTAGCCTTTACGGCTCTCCAGGGAGCACACCTCTTCATTTGGCTGCAAGAAGCGGATCT
ATCGATTGCGTCAGAAAGTTACTTGCTTGGGGTGCTGATCGTCTTCAGAGAGACGCTTCT
GGGAGGATACCATATGTGGTTGCGATGAAACACAAGCACGGAGCATGCGGGGCGTTGCTT
AACCCCTCTTCTGCTGAGCCTCTTGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTT
AACGAGGAGGCGAAACTGCTCTTGGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGAG
AAAACCATCCTCAAGGGAACTGCTTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCC
TCAGATGATAACATGTCTGAGATGAGTGATTCGGAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAA
GCATGCACGATTGAAGTCAAAGACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCA
CTGTGCTGTCACAACAAACCCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCA
TTCTGTAGAAGTGTTATCTCACGGTTAGTAATCGCCC

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4GN88TF 720 0 0
G
CAGGGAGCACACCTCTTCATTTGGCTGCAAGAAGCGGATCTATCGATTGCGTCAGAAAGT
TACTTGCTTGGGGTGCTGATCGTCTTCAGAGAGACGCTTCTGGGAGGATACCATATGTGG
TTGCGATGAAACACAAGCACGGAGCATGCGGGGCGTTGCTTAACCCCTCTTCTGCTGAGC
CTCTTGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTTAACGAGGAGGCGAAACTGC
TCTTGGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGAGAAAACCATCCTCAAGGGAA
CTGCTTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATAACATGTCTG
AGATGAGTGATTCGTAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGATTGAAGTCA
AAGACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTCACAACAAAC
CCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTGTTATCT
CACGGTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCAAGAGCCAGA
GTCAGAGC*AAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAG*TGATGTCAGCTCTTCAAA*CTCA
GAAAGCATAGAAA*TCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGGGACTATCA

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR4EW59TF 722 0 0
G
CATATGTGGTTGCGATGAAACACAAGCACGGAGCATGCGGGGCGTTGCTTAACCCCTCTT
CTGCCGAGCCTCTTGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTTAACGAGGAGG
CGAAACTGCTCTTGGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGAGAAAACCATCC
TCAAGGGAACTGCTTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATA
ACATGTCTGAGATGAGTGATTCGGAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGA
TTGAAGTCAAAGACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTC
ACAACAAACCCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAA
GTGTTATCTCACGGTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCA
AGAGCCAGAGTCAGAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTT
CAAAACTCAGAAAGCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGG
GACCATCAAGCATTGGATCGTTCGGGAAGATAACCGGCCGTGGCTCGGGAAGGATCGCAG
CCGACAACGAGCTGATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAATGAAAATCAATGATTGA
A

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR4GN88JQ 708 0 0
CTTGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTTAACGAGGAGGCGAAACTGCTC
TTGGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGAGAAAACCATCCTCAAGGGAACT
GCTTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATAACATGTCTGAG
ATGAGTGATTCGTAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGATTGAAGTCAAA
GACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTCACAACAAACCC
AACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTGTTATCTCA
CGGTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCAAGAGCCAGAGT
CAGAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTTCAAAACTCAGA
AAGCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGGGACTATCAAGC
ATTGGATCGTTCGGGAAGATAACCGGCCGTGGCTCGGGAAGGATCGCAGCCGACAACGAG
CTGATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAATGAAAATCAATGATTGAAATAAGGAAAA
GAAGAAGTGAGTTTATGTAATGAAATCAATGATTTGTTGTTTCTTTTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4E516TF 646 0 0
AGGGAACTGCTTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATAACA
TGTCTGAGATGAGTGATTCGGAGCCGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGATTG
AAGTCAAAGACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTCACA
ACAAACCCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTG
TTATCTCACGGTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCAAGA
GCCAGAGTCAGAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTTCAA
AACTCAGAAAGCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGGGAC
TATCAAGCATTGGATCGTTCGGGAAGATAACCGGCCGTGGCTCGGGAAGGATCGCAGCCG
ACAACGAGCTGATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAATGAAAATCAATGATTGAAAT
AAGGAAAAGAAGAAGTGAGTTTATGTAATGAAATCAATGATTTGTTGTTTCTTTTGATCA
ATTTGAAAATGTTTTGTTGTCATTATTTGGTTACTTGTTGATATGA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4E756TF 665 0 0
TGGATGCTAACAGGGAGAGAGAGAAAACCATCCTCAAGGGAACTGCTTTCTCTTTACCAT
CACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATAACATGTCTGAGATGAGTGATTCGGAGC
CGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGATTGAAGTCAAAGACTGTGGTCACCAAA
TGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTCACAACAAACCCAACCCAACTACTTCAA
CCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTGTTATCTCACGGTTAGTAATCGCCC
AGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCAAGAGCCAGAGTCAGAGCCAAGACGAAG
TTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTTCAAAACTCAGAAAGCATAGAAAATCGG
TAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGGGACTATCAAGCATTGGATCGTTCGGGA
AGATAACCGGCCGTGGCTCGGGAAGGATCGCAGCCGACAACGAGCTGATGGACAAACCGA
TACTGTGAGAATGTAATGAAAATCAATGATTGAAATAAGGAAAAGAAGAAGTGAGTTTAT
GTAATGAAATCAATGATTTGTTGTTTCTTTTGATCA*TTTGAAAATGTTTTGT*GTCATT
ATT
TG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4BS12JQ 698 0 0
TAACGAGGAGGCGAAACTGCTCTTGGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGA
GAAAACCATCCTCAAGGGAACTGCTTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGC
CTCAGATGATAACATGTCTGAGATGAGTGATTCGGAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCA
AGCATGCACGATTGAAGTCAAAGACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGC
ACTGTGCTGTCACAACAAACCCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCC
ATTCTGTAGAAGTGTTATCTCACGGTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACAT
CGACAATAGCAAGAGCCAGAGTCAGAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGA
TGCCAGCTCTTCAAAACTCAGAAAGCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAG
CAGTTTCATGGGACTATCAAGCATTGGATCGTTCGGGAAGATAACCGGCCGTGGCTCGGG
AAGGATCGCAGCCGACAACGAGCTGATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAATGAAAA
TCAATGATTGAAATAAGGAAAAGAAGAAGTGAGTTTATGTAATGAAATCAATGATTTGTT
GTTTCTTTTGATCAATTTGAAAATGTTTTGTTGTCAT
C

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4A223JQ 782 0 0
TGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTTAACGAGGAGGCGAAACTGCTCTT
GGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGAGAAAACCATCCTCAAGGGAACTGC
TTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATAACATGTCTGAGAT
GAGTGATTCGGAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGATTGAAGTCAAAGA
CTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTCACAACAAACCCAA
CCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTGTTATCTCACG
GTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCAAGAGCCAGAGTCA
GAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTTCAAAACTCAGAAA
GCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGGGACTATCAAGCAT
TGGATCGTTCGGGAAGATAAC*GGCCGTGGCTCGGGAAGGATCGCAGCCGACAACGAGCT
GATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAATGAAAATCAATGATTGAAATAAGGAAAAGA
AGAAGTGAGTTTATGTAATGAAATCAATGATTTGTTGTTTCTTTTGATCAATTTGAAAAT
GTTTTGTTGTCATTATTCGGTTACTTGTTGATATGAAAGGGAACCCTCATCATCTTCTTG
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4CG19JQ 632 0 0
CACAGCCTCAGATGATAACATGTCTGAGATGAGTGATTCGGAGCTGTGCTGCATTTGCTT
TTAGCAAGCATGCACGATTGAAGTCAAAGACTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCAC
TCTTGCACTGTGCTGTCACAACAAACCCAACCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGT
CTGTCCATTCTGTAGAAGTGTTATCTCACGGTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAA
CGACATCGACAATAGCAAGAGCCAGAGTCAGAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGC
AGGTGATGTCAGCTCTTCAAAACTCAGAAAGCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGA
AGGCAGCAGTTTCATGGGACTATCAAGCATTGGATCGTTCGGGAAGATAACCGGCCGTGG
CTCGGGAAGGATCGCAGCCGACAACGAGCTGATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAA
TGAAAATCAATGATTGAAATAAGGAAAAGAAGAAGTGAGTTTATGTAATGAAATCAATGA
TTTGTTGTTTCTTTTGACCAATTTGAAAATGTTTTGTTGTCATTATTTGGTTACTTGTTG
ATATGAAAGGGAACCCTCATCATCTTCTTG
TC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4A223JQD 782 0 0
TGTCTGGCCATCCCCGTTAAAGTTCATCAGCGAGCTTAACGAGGAGGCGAAACTGCTCTT
GGAGCAAGCTCTGATGGATGCTAACAGGGAGAGAGAGAAAACCATCCTCAAGGGAACTGC
TTTCTCTTTACCATCACCATCTTATTCCGACACAGCCTCAGATGATAACATGTCTGAGAT
GAGTGATTCGGAGCTGTGCTGCATTTGCTTTGAGCAAGCATGCACGATTGAAGTCAAAGA
CTGTGGTCACCAAATGTGTGCACAATGCACTCTTGCACTGTGCTGTCACAACAAACCCAA
CCCAACTACTTCAACCGTGACTCCACCGGTCTGTCCATTCTGTAGAAGTGTTATCTCACG
GTTAGTAATCGCCCAGAACAACAACAACAACGACATCGACAATAGCAAGAGCCAGAGTCA
GAGCCAAGACGAAGTTGTTGATCGTGAGGCAGGTGATGTCAGCTCTTCAAAACTCAGAAA
GCATAGAAAATCGGTAAACCTTGGAGAAGAAAGCAGCAGTTTCATGGGACTATCAAGCAT
TGGATCGTTCGGGAAGATAAC*GGCCGTGGCTCGGGAAGGATCGCAGCCGACAACGAGCT
GATGGACAAACCGATACTGTGAGAATGTAATGAAAATCAATGATTGAAATAAGGAAAAGA
AGAAGTGAGTTTATGTAATGAAATCAATGATTTGTTGTTTCTTTTGATCAATTTGAAAAT
GTTTTGTTGTCATTATTCGGTTACTTGTTGATATGAAAGGGAACCCTCATCATCTTCTTG
CC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 12

CO CL167Contig1 903 12 6 U
GCAAATTTGTAGATTAAACCTACGTTAAATTACATACAAAGATGACATTTCAGTCGTAAT
TACAACTTTGTTGGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGG
ACTAAAATTTCAAGAAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAA
TATCTCACAAAACAAAACAAAAAACTTTATAACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTT
AGATTCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATC
ACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTG
GGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTC
CGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAA
TAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAG
CATAAAGTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGT
CAGTAGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTT
TCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGC
AGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAGCTCGAAGTTGGAGA
AGACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATTTGCCATTGATGAAC
TTCAAATTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTTAGACTTATTGTCTGTGTGACA
TCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 
10 10 10 

AF RR4G059JQ U 1
AF RR4G059TF C 1
AF RR4CM73JQ U 73
AF RR4EB30JQ U 131
AF RR4DO31JQ U 86
AF RR4BF43JQ U 47
AF RR4CM73TF C 96
AF RR4DO31TF C 213
AF RR4A390JQ U 794
AF RR4A390JQD U 307
AF RR4A390TFB C 307
AF RR4EB30TF C 224
BS 1 240 RR4G059JQ
BS 241 241 RR4BF43JQ
BS 242 346 RR4G059JQ
BS 347 849 RR4BF43JQ
BS 850 899 RR4A390JQ
BS 900 903 RR4EB30TF

RD RR4G059JQ 349 0 0
GCAAATTTGTAGATTAAACCTACGTTAAATTACATACAAAGATGACATTTCAGTCGTAAT
TACAACTTTGTTGGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGG
ACTAAAATTTCAAGAAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAA
TATCTCACAAAACAAAACAAAAAACTTTATAACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTT
GGATTCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATC
ACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAA
AAA

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR4G059TF 507 0 0
GCAAATTTGTAGATTAAACCTACGTTAAATTACATACAAAGATGACATTTCAGTCGTAAT
TACAACTTTGTTGGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGG
ACTAAAATTTCAAGAAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAA
TATCTCACAAAACAAAACAAAAAACTTTATAACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTT
GGATTCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATC
ACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTG
GGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTC
CGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAA
TAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGAC
C

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4CM73JQ 604 0 0
GGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCA
AGAAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAAAA
CAAAACAAAAAACTTTATAACTTGCCGTACTATTGTCTTGGCTCTCTTAGATTCACATAA
CAACAAATTCAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAA
ATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTGGGAATCCAAAAC
CTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCTC
CCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAAAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGG
TGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAAACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTT
CAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAGTTGGAA
GCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGT
CGCA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4EB30JQ 647 0 0
CAAGAAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAA
AACAAAACAAAAAACTTTATAACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTTAGATTCACAT
AACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATT
AAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTGGGAATCCAAA
ACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATC
TCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTT
GGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTG
TTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAGTTGG
AAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCC
GTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGCAGTCAAGGCA
AGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAGCTCGAAGTTGG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4DO31JQ 660 0 0
CTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCAAGAAGCCAATAAA
CAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAAAACAAAACAAAAAAC
TTTATAACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTTAGATTCACATAACAACAAATTTAAA
TATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCC
AATGATTGGTAAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGG
AAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGG
GCATGAAAGAGAGTAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGA
CTTAACTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAACATAAAGTTGTTCAGGACCTCCCAA
GATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAGTTGGAAGCACTGACCGGAA
AGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAG
AAACTTAACGCCTGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGCAGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4BF43JQ 803 0 0
ATTTCAGTCGTAATTACAACTTTGTTGGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTG
ATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCGAGAAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAA
CTTATCTTAGTTAATATCTCACAAAACAAAACAAAAAACTTTATAACTTGCCGTATTATT
GTCTTGGCTCTCTTAGATTCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTC
AAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAA
GAAGCTAGCAGGTGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATC
TCCGATCATATTTCCGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAG
TGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAGACCAT
GTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCAT
GGAGTGTTTTTTGTCAGTAGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCAT
TGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAGAAGTC
GAAATCGCTGTGGCAGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAG
CTCGAAGTTGGAGAAGACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATT
TGCCATTGATGAACTTCAAATTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4CM73TF 804 0 0
TCACAAACTTGATACAAAGCAACGGACTAAA*TTTCAAGAAGCCAATAAACAACATTTTT
TATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAAA*CAAAACAAAAA*CTTTATAACTT
GCCGTACTATTGTCTTGGCTCTCTTAGATTCACATAACAACAAATTCAAATATATGAATA
AATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGT
AAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACA
GTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGA
GAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGT
TCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCA
AGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCA
GAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACG
CCTGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGCAGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTT
GAAGCTGAGAGCTCGAAGTTGGAGAAGACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACA
GCTGCTTGATTTGCCATTGACGAACTTCAAATTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGG
ATTTAGACTTATTGTCTGTGTG
CC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4DO31TF 687 0 0
ACTTG
CGTATTATTGTCTTGGCTCTCTTAGATTCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAA
TACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAA
GAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGTGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGT
CTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGA
GTAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTC
AGAGACCATGTTGTGTTTGTGAACATAAAGTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAG
ACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGA
AGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCC
TGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGCAGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGA
AGCTGAGAGCTCGAAGTTGGAGAAGACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGC
TGCTTGATTTGCCATTGATGAACTTCAAATTTAAAA**AGAGTTTATGGATTTGATGGCT
TTAGACTTATTGTCTGTGTG
CC

QA 6 685 6 685
DS 

RD RR4A390JQ 108 0 0
GAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATTTGCCATTGATGAACTTCAAATTTAAAA
CAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTTAGACTTATTGTCTGTGTGAC
CC

QA 1 106 1 106
DS 

RD RR4A390JQD 595 0 0
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CAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACAT
TATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAA
CCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAAAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAA
GTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAG
TTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAAAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCT
CTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAAAAGTCGAAATCGCTGTGGCAGTCAA
GGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAAAGCTCGAAGTTGGAGAAGACAG
CCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATTTGCCATTGATGAACTTCAAA
TTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTTAGACTTATTGTCTGTGTGAC
CC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4A390TFB 595 0 0
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CAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACAT
TATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAA
CCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAA
GTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTGTCAGTAG
TTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCT
CTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGCAGTCAA
GGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAGCTCGAAGTTGGAGAAGACAG
CCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATTTGCCATTGATGAACTTCAAA
TTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTTAGACTTATTGTCTGTGTGAC
CC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4EB30TF 680 0 0
TTATGTC
TGGCTCTCTTAGATTCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGT
CTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAGAAAGGAAAGAAG
CTAGCAGGTGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCG
ATCATATTTCCGACATTATCTCCCGTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGG
TTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAGACCATGTTG
TGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCAGGACCTCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAG
TGTTTTTTGTCAGTAGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCG
GTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAGAAGTCGAAA
TCGCTGTGGCAGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAGCTCG
AAGTTGGAGAAGACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATTTGCC
ATTGATGAACTTCAAATTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTCAGACTTATTGT
CTGTGTGACATCC

QA 8 680 8 680
DS 



AS 1 13

CO CL168Contig1 863 13 7 U
CCAACTGAATTTTATTAAGTGGGTCAAGGCCCAAAGAGCTAAGCCCACACTACAGACAAA
AGCCCAAAGACACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAA
CATTTGACCTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTA
GACTTCATCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCC
CTGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCA
ATCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACA
CACGAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCT
ACCTCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCAC
AATCAACATAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCC
ACCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAG
AGACAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACA
CTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAA
AAGAAAACCCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACACAAAT
CAACCTCTCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCTCTGTACTCGCTCACGTTTCTTTTTTC
AGTACTCTTTCCTATTAGAATCC


BQ
25 35 35 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 30 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 50 20 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DO17JQ U 1
AF RR4DU41JQ U 1
AF RR4E807JQ U 1
AF RR4E565JQ U 1
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BS 1 599 RR4DO17JQ
BS 600 722 RR4DU41JQ
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RD RR4DO17JQ 599 0 0
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ACCTCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCAC
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ACCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4DU41JQ 722 0 0
CCAACTGAATTTTATTAAGTGGGTCAAGGCCCAAAGAGCTAAGCCCACACTACAGACAAA
AGCCCAAAGACACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAA
CATTTGACCTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTA
GACTTCATCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCC
CTGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCA
ATCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACA
CACGAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCT
ACCTCGAACCACCAGCTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCAC
AATCAACATAGATCGGGATAAACCCGAGAAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCC
ACCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAG
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CTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAA
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4E807JQ 722 0 0
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CTGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCA
ATCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACA
CACTAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCT
ACCTCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCAC
AATCAACATAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCC
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CTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAA
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4E565JQ 722 0 0
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AGCCCAAAGACACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAA
CATTTGACCTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTA
GACTTCATCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCC
CTGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCA
ATCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACA
CACGAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCT
ACCTCGAACCACCAGCTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCAC
AATCAACATAGATCGGGATAAACCCGAGAAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCC
ACCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAG
AGACAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACA
CTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAA
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4BE40JQ 776 0 0
G
CAACTGAATTTTATTAAGTGGGTCAAGGCCCAAAGAGCTAAGCCCACACTACAGACAAAA
GCCCAAAGACACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAAC
ATTTGACCGAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTAG
ACTTCATCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCCC
TGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCAA
TCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACAC
ACGAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCTA
CCTCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACA
ATCAACACAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCCA
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GACAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACAC
TAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAA
AGAAAACCCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACAC

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DS 

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GCCCAAAGACACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAAC
ATTTGACCTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTAG
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TGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAAT*ACCAA
TCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACAC
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CCTCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACA
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CCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAGA
GACAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACAC
TAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAA

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DS 

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CG
ACTGAATTTTATTAAGTGGGTCAAGGCCCAAAGAGCTAAGCCCACACTACAGACAAAAGC
CCAAAGATACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAACAT
TTGACCTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTAGAC
TTCATCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCCCTG
TTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCAATC
GAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACACAC
GAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCTACC
TCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACAAT
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CAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACACTA
GAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAAAG
AAAACCCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACACAAATCAA
CCTCTCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCTCTGT

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DS 

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TGAATTTTATTAAGTGGGTCAAGGCCCAAAGAGCTAAGCCCACACTACAGACAAAAGCCC
AAAGATACGGGCCAAAATAGAAACACGGGTCATAGCCCAAATAACAAAACAGCAACATTT
GACCTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACCTTCTTCTCCGATCTAGACTT
CATCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCCCTGTT
GAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCAATCGA
GATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACACACGA
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GAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACAATCA
ACATAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCCACCGT
CTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAGAGACA
ATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACACTAGA
ATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAAAGAA
AACCCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACACAAATCAACC
TCTCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCTCTGTACTCGCTCACGTTTCTTTTTTCAGTAC
CC

QA 1 840 1 840
DS 

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CCATCGAACCCCCTGTTGAAGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAG
CATCAATCACCAATCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGA
AAAGGCCTCACACACGAACGAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAG
ATCTCATTCGCTACCTCGAACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGAC
AAACCATCCCACAATCAACATAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGAT
GCTAAAGAAGCCACCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCC
GCCACTTCCCAGAGACAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAA
ATCCAACAGACACTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAA
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GGAAACACAAATCAACCTCTCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCTCTGTACTCGCTCAC
GTTTCTTTTTTCAGTAC
CC

QA 1 677 1 677
DS 

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ACGG*TCATAGCCCAA*TAACAAA*CAGCAACATTTGACT**ACGTCCACTGCTT*GCCG
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CGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCAATCGAGATCTCATCCAAAACTCTAAATAA
TACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACACACGAACGAACCACCATCCATCGGAGAGC
TTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCTACCTCGAACCACCAGCTCCACCACGAACC
ACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACAATCAACATAGATCGGGATAAACCCGAGA
AAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCCACCGTCTCCCGGAATCTTAAGCCGGCGAA
GTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAGAGACAATAGGGACGACCACCGTAGATATG
GTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACACTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGC
CAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAAAGAAAACCCCTAGCCGGACCGACGGTGG
AGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACACAAATCAACCTCTCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTC
TCTCTCTGTACTCGCTCACGTTTCTTTTTTCAGTACTCTTTCCT
CC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4BE40TF 796 0 0
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CCGAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCACTTTCTTCTCCGATCTAGACTTCA
TCGGACGAAGTAACCTACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCCCTGTTGA
AGGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCAATCGAGA
TCTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACACACGAAC
GAACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCTACCTCGA
ACCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACAATCAAC
ACAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCCACCGTCT
CCCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAGAGACAAT
AGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACACTAGAAT
TTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAAAGAAAA
CCCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACACAAAACAACCTC
TCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCTCTGTACTCGCTCACGTTTCTTTTTTCAGTACTC
TTTCCTATTAGAATCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4DO17TF 390 0 0
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GCCGCCACTTCCCAGAGACAATAGGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCAC
AAAATCCAACAGACACTAGAATTTCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAA
CAACTAAGACACAAAAAGAAAACCCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCATCACCGTCG
GCCGGAAACACAAATCAACCTCTCCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCTCTGTACTCGCT
CACGTTTCTTTTTTCAGTACTCTTTCCT
CC

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DS 

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ATTTGA
CTAACGTCCACTGCTTTGCCGACAACCATCTTTCAC*TTCTTCTTCGATCTAGACTTCAT
CGGACGAAGTAAC*TACCGGGAAAAGATCCCAAACATCAGCCATCGAACCCCCTGTTGAA
GGCATACGCTTTTATCTTCTTCGTTCCGAGTTTAGGAGAGCATCAATCACCAATCGAGAT
CTCATCCAAAACTCTAAATAATACAAACACAGAGAGAAGAAAAGGCCTCACACACTAACG
AACCACCATCCATCGGAGAGCTTCCATCGTCAGCGACGAGATCTCATTCGCTACCTCGAA
CCACCAGTTCCACCACGAACCACCACTTCCATCCCAAGACAAACCATCCCACAATCAACA
TAGATCGGGATAAACCCGAGGAAAAACCGGCGATGACGATGCTAAAGAAGCCACCGTCTC
CCGGAATCTTAAGCCGGCGAAGTAGACTGCTGAACAAGCCGCCACTTCCCAGAGACAATA
GGGACGACCACCGTAGATATGGTGCGTCTCCGAGCACAAAATCCAACAGACACTAGAATT
TCGATCAGAGTTATTTAAAGCCAAACACTAGAACAAACAACTAAGACACAAAAAGAAAAC
CCCTAGCCGGACCGACGGTGGAGGAGCCTCACCGTCGGCCGGAAACACAAATCAACCTCT
CCTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTCT**GTACTCGCTCACGTTTCTTTTTTCAGTACTCT
TTCCTATTAGAATCC

QA 7 741 7 741
DS 



AS 1 13

CO CL169Contig1 727 13 25 U
CTAAATCATTTTAAAGACTTATCAGAAGAAAAAGTTCAGGTAGAATCAAAAATTAGAAGA
CTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGT*TTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAAT
GGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTC
TGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGAGC
TTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATCGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGAC
GACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGAC
AGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTT
CACTCTCGCCGACACTTTGGCTT*GTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*
GTCC*TTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAA
CTTGTAGATTTAAAAAAA**CAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTT
TATAATGTTTCTTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAACTAGAACGACCGCATCTTCA
AGTATGTAACGTGAACCGAAGGCATTGTTCCCTTGATGATAATATTTAATAGATCACATG
AGTCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 
10 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 35 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4CQ18TF U 182
AF RR4AT04TF U 1
AF RR4DF05JQ C 95
AF RR4CT47TF U 455
AF RR4DF05TF U 95
AF RR4H272TF U 10
AF RR4H272JQ C 25
AF RR4GA10TF U 65
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AF RR4GI58TF U 65
AF RR4BK82JQ C 323
AF RR4FO92TF U 46
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BS 34 35 RR4H272TF
BS 36 42 RR4AT04TF
BS 43 43 RR4H272TF
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BS 54 54 RR4H272TF
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BS 62 84 RR4AT04TF
BS 85 85 RR4H272TF
BS 86 119 RR4AT04TF
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BS 121 443 RR4AT04TF
BS 444 444 RR4H272TF
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RD RR4CQ18TF 117 0 0
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DS 

RD RR4AT04TF 551 0 0
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*TGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAAC
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TGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGAGC
TTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATCGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGAC
GACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGAC
AGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTT
CACTCTCGCCGACACTTTGGCTTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTT
GTCCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAA
CTTGTAGATTT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4DF05JQ 484 0 0
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AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGACGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATCGGTTCATCA
ACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGGTTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGATTCGGGT
CTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTT*GTGGTACCGT
TGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC*TTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAA
AAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAA**CAAAGTTCTCAAGA
ACC
G

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4CT47TF 105 0 0
TGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC*TTGGTCTCAAAAACATCGGTGCTATTTAA
AAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTT
TTAAAAAA

QA 1 97 1 97
DS 

RD RR4DF05TF 490 0 0
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CCCATGAGACGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATCGGTTCATCA
ACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGGTTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGATTCGGGT
CTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTT*GTGGTACCGT
TGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC*TTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAA
AAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAA**CAAAGTTCTCAAGA
ACC
GAAAAAA

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4H272TF 624 0 0
GGG
AAAGACTTATCAGAAGAAAAAGTTCAGGTAGAATCAAAAATTAGAAGACTGGTTGCAGAA
GAAAATATAA***TTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGT
GATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGT
GCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGGGTGCAAA
GTGTGACCTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTT
GTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCCGGGCTTAA
GTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGA
CACTTTGGCTT*GTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC*TTGGTCT
CAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTA
AAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATGTTTGC
*ATCGCATTGTATTCCTCTTT

QA 4 624 4 624
DS 

RD RR4H272JQ 609 0 0
GAAGAAAAAGTTCAGGTAGAATCAAAAATTAGAAGACTGGTTGCAGAAGAAAATATAA**
*TTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACT
GCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGC
AACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACCTCAT
TGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAG
ATTCGGACTAGCACCATCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCCGGGCTTAAGTTAGAGGCACG
TGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTT*
GTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC*TTGGTCTCAAAAACATTGG
TGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAA
GTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATGTTTGC*ATCGCATTGTA
TTCCTCTTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4GA10TF 538 0 0
TTGCAGAAGAAAATATAAGT*TTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCG
AGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCA
GCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGAGCTTTG
GGTGCAAAGTGTGACTTCATCGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACT
CTGATGCTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCT
GGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACT
CTCGCCGACACTTTGGCTT*GTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC
*TTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTG
TAGATTTAAAAAAA**CAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTA

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4GH03TF 571 0 0
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T

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T

QA 1 570 1 570
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G
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*GTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*GTCC*TTGGTCTCAAAAACATTG
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GCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGAGCT
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ACTCTCGCCGACACTTTGGCTT*GTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT*G
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ATAATGTTTCTTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAACTAGAACGACCGCATCTTCAA
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GTCATA

QA 17 682 17 682
DS 



AS 1 13

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TCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTT
GCTTCACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTT
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TTCTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTCACAATGTCTTTACA
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AGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTCTTGTGGTCAAAAAAACTTATTGTTGTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 60 60 60 60 60 
60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 25 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 25 20 20 20 20 20 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4G418TF U 52
AF RR4H437TF U 1
AF RR4FY24TF U 52
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AF RR4E005TF U 72
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QA 1 641 1 641
DS 

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C

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DS 

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AGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCACCGACAGACATAGCT
TAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTTCAAGACATTG
TTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGG*TAAAGCCGGTATGCTTAATGAGATCATCAACTAT
GTCCAATCTCTGCAGCAATAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCA
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CTTTCAGAAGCCGTCCCAA*GCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCCGTTACAG
C

QA 1 781 1 781
DS 

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GG
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CTCGAAAGAGTTAATTGGCTGCAACAGCAGCAAATGGTCTCACCAGATTTTTTT*GAGAT
ACTTGGCTCAGATGGGAGAGAAGAGCTCAAAAGGGTTGAGAGTTATTTGGGAAACAATAA
TGATGGGGTGCAGGGTTTCAGACATTATGAAACTATTGATGGTTGCATCTCAAGGACAAG
TAGCTTCCAAATGGAACAAGTGAAGAACCATGAAGAAAACATAGTCATTGCCTTGCAGCC
CAAGAGAAAAACAGAGGGTAAGACAGAAAAAATAGAGAACAAAAAGAAGAAGA***TCAA
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TCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAACAAAGTTACTGGGTAAAGCCGGTATGCTTGATG
AGATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCT
CTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGA
CTTGCTTCACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTT
CTTTTCCGTTACAGCAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCA
CAATTCTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTCACACTGTCTTT
ACA
CACTGAGAACC

QA 3 905 3 905
DS 

RD RR4H516TF 654 0 0
G
AACTCATAGACATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGG
GGTGAAGCCACCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAG
AAGATGAAATGTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGG*TAAAGCCGG
TATGCTTGATGAGATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTC
TATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAA
ACAG******GCTTGCTTCACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGT
GGATGCAAGTTCTTTTCCGTTACAGCAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTC
AAACCAAACCACAATTCTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTC
ACAATGTCTTTACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTA
AAAAAAAACTCTGGATAGGGCTTACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATT
TGAACCAGAAAGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTCTTGTGGT

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR4G418JQ 796 0 0
C
AGGGTAAGACAGAAAAGATAGAGAACAAGAAGAAGAAGAAGATCAAAACAGAGGATGAAA
CAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACATGAGCAACTCAGAGACATCCTCAGAGATTC
AGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCACCGACAGACATAGCT
TAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTTCAAGACATTG
TTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGG*TAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCAACTAT
GTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCA
GAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCACAGAT
CTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCCGTTACAG
CAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCACAATTCTTAGCTCT
AAAGATCAGACATCATCGAGCCGGGAAATTCACTCACAATGTCTTTACAACAACTTGAGA
ACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTAAAAAAGAACTCTGGATAGGGCTTAC
TGAAAAATCTGTCTTATCCATTTTATCTTTAAATTTGAACCAGAAAGACAGAGGAAACCA
ATCCAAAGATCTTTCAACCTCTTGTGGTCAAAAAAACTTATTGTTGTACATTTGTAGTAT
ACATATCATATCTCC

QA 2 796 2 796
DS 

RD RR4AM56JQ 775 0 0
CAGAGGATGAAACAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACATGAGCAACTCAGAGACAT
CCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGACGAGGTGAAGCCACCG
ACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTC
TTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAACAAAGTTACTGG*TAAAGCCGGTATGCTTGATGAG
ATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCT
GTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCT
TGCTTCACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCT
TTTCCGTTACAGCAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCACA
ATTTTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTCACACTGTCTTTAC
AACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTAAAAAAAAACTCTG
GATAGGGCTTACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATTTGAACCAGAAAGA
CAGAGGAAACCAATCCAAAGATCCTTCAACCTCTTGTGGTCAAAAAAACTTATTGTTGTA
CATTTGTAGTATACATATCATATCTCCAAAATACAATCTCACTTGTTATT
ATTTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4FY24JQ 606 0 0
GAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAACAA
AGTTACTGG*TAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGC
AACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATA
TCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCACAGATCCTTCAGAAGCTGTCC
CAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCCGTTACAGCAGCATGGTTCTCTAG
ATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCACAATTCTTAGCTCTAAAGATCAGACATCAT
CGAGCTGGGAAATTCACTCACAATGTCTTTACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAA
GTTTCTTCAGCCTCAAGTAAAAAA*AACTCTGGATAGGGCTTACTGAAAAATCTGTCTTA
TCCATGTTATCTTTAAATTTGAACCAGAAAGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCA
ACCTCTTGTGGTCAAAAAAACTTATTGTTGTACATTTGTAGTATACATATCATATCTCCA
AAAT
GC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4H437JQB 713 0 0
CATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGATGTGAAGCCA
CCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAATAAGATGAAAT
GTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGG*TAAAGCCGGTATGCTTGAT
GAGATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTC
TCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAG
GCTTGCTTCACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGT
TCTTTTCCGTTACAGCAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACC
ACAATTCTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTCACAATGTCTT
TACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTAAAAAAAAACT
CTGGATAGGGCTTACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATTTGAACCAGAA
AGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTCTTGTGGTCAAAAAAACTTATTGTT
GTACATTCGTAGTATACATATCATATCTCCAAAATACAATCTCACTTGTTATT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4H280JQ 734 0 0
G
AACTCATAGACATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGG
GGTGAAGCCACCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAG
AAGATGAAATGTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGG*TAAAGCCGG
TATGCTTGATGAGATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTC
TATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAA
ACAG******GCTTGCTTCACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGT
GGATGCAAGTTCTTTTCCGTTACAGCAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTC
AAACCAAACCACAATTTTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTC
ACAATGTCTTTACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTA
AAAAAAAACTCTGGATAGGGCTTACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATT
TGAACCAGAAAGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTCTTGTGGTCAAAAAA
ACTTATTGTTGTACATTTGTAGTATACATATCATATCTCCAAAATACAATCTCACTTGTT
ATTATTTGATTAC

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR4H516JQB 715 0 0
GAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGGGGTGAAGCCACCGACAGA
CATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTTCAA
GACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGG*TAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCAT
CAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTT
AAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAG******GCTTGCTT
CACAGATCTTTCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCC
GTTACAGCAGCATGGTTCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCACAATTCT
TAGCTCTAAAGATCAGACATCATCGAGCTGGGAAATTCACTCACAATGTCTTTACAACAA
CTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTAAAAAAAAACTCTGGATAG
GGCTTACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATTTGAACCAGAAAGACAGAG
GAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTCTTGTGGTCAAAAAAACTTATTGTTGTACATTT
GTAGTATACATATCATATCTCCAAAATACAATCTCACTTGTTATTATTTG
ATTAC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 2 13

CO CL171Contig1 851 6 10 U
GCCAAGTAGAAACAGATTTTGATCGATTCTGGTCACTAGACTCAACTGAGTTGCAACATA
TTTGTAGTACACAGGAAATACAAGAAGCTCAGTAGTAATACAAAACAAGAAAAGCACTCT
AAGAAAAAGCTGTTGGATCCGGACAATGACAAAAAAGTACTACTATGCTAGAGATTCTTG
TTTTGCTTTGGGCAAGAAGGTTTCCCACCATCCCGGTTCATACTTGGGGTATGGCGCCAC
CCAATTCTTAGGCTTGTCGAACTCTAAAGTAGTAGGAGTGAAGGCCAAGGCTTCATCAAG
AGAGGTAGCTTCAAAGGAATCAGCTAGAACTCGATCCAACCTTAACTTCATGAACGTGAT
CCAGGGACCATTGGTGGAGACAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAGCCTTTGAGTGATGTT
GGGGAACTTGTCGAGGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGCTCCTTTTCATT
CTCTCCGTAGTAACGAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTGTTCCTCTTCGTCAAG
CATGAACTTTGCGTTCGCAACCAGGAAGTAGTACTTACTGCTCTCTCCCTTATTATCAGA
CTGTTGTTCAACGGAGGTGGCAGCGGTTATGAAAGAGGAGGAGGAGAAATGTGAGGATAG
AGACAGAGGCTGCTGCTGTTGCGGAGAGAGATGGAGCTTATTCGTCTGCTTGGGAAGAAG
AGTAGAGGAGACGAGTAACGGTTTCGTACGGCAAGCGGCGGCCGTTGGCACCGCCACACC
CAACGCTCCGGTGACGCTCCACATTTTCTGAACTGAGTGTGTTTTGATCGAGGCAGAGAA
ATCTGGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E720JQ U 50
AF RR4ES75JQ U 1
AF RR4A410JQ U 21
AF RR4A410TF C 118
AF RR4ES75TF C 195
AF RR4E720TF C 286
BS 1 124 RR4ES75JQ
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BS 126 183 RR4ES75JQ
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BS 835 851 RR4E720TF

RD RR4E720JQ 512 0 0
GTTGCAACATATTTGTAGTACACAGGAAATACAAGAAGCTCAGTAGTAATACAAAACAAG
AAAAGCACTCTAAGACAAAGCTGTTGGATCCGGACAATGACAAAAAAGTACTACTATGCT
AGAGATTCTTGTTTTGCTTTGGGCAAGAAGGTTTCCCACCATCCCGGTTCATACTTGGGG
TATGGCGCCACCCAATTCTTAGGCTTGCCGAACTCTAAAGTAGTAGGAGTGAAGGCCAAG
GCTTCATCAAGAGAGGTAGCTTCAAAGGAATCAGCTAGAACTCGATCCAACCTTAACTTC
ATGAAAGTGATCCAGGGACCATTGGTGGAGACAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAGCCTT
TGAGTGATGTTGGGGAACTTATCGAGGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGC
TCCTTTTCATTCTCTCCGTAGTAACGAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTGTTCC
TCTTCGTCAAGCATGAACTTCGCGTTCGCAAC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4ES75JQ 700 0 0
GCCAAGTAGAAACAGATTTTGATCGATTCTGGTCACTAGACTCAACTGAGTTGCAACATA
TTTGTAGTACACAGGAAATACAAGAAGCTCAGTAGTAATACAAAACAAGAAAAGCACTCT
AAGACAAAGCTGTTGGATCCGGACAATGACAAAAAAGTACTACTATGCTAGAGATTCTTG
TTTCGCTTTGGGCAAGAAGGTTTCCCACCATCCCGGTTCATACTTGGGGTATGGCGCCAC
CCAATTCTTAGGCTTGTCGAACTCTAAAGTAGTAGGAGTGAAGGCCAAGGCTTCATCAAG
AGAGGTAGCTTCAAAGGAATCAGCTAGAACTCGATCCAACCTTAACTTCATGAACGTGAT
CCAGGGACCATTGGTGGAGACAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAGCCTTTGAGTGATGTT
GGGGAACTTGTCGAGGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGCTCCTTTTAATT
CTCTCCGTAGTAACGAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTGTTCCTCTTCGTCAAG
CATGAACTTTGCGTTCGCAACCAGGAAGTAGTACTTACTGCTCTCTCCCTTATTATCAGA
CTGTTGTTCAACGGAGGTGGCAGCGGTTATGAAAGAGGAGGAGGAGAAATGTGAGGATAG
AGACAGAGGCTGCTGCTGTTGCGGAGAGAGATGGAGCTTA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4A410JQ 688 0 0
GATCGATTCTGGTCACTAGACTCAACTGAGTTGCAACATATTTGTAGTACACAGGAAATA
CAAGAAGCTCAGTAGTAATACAAAACAAGAAAAGCACTCTAAGAAAAAGCTGTTGGATCC
GGACAATGACAAAAAAGTACTACTATGCTAGAGATTCTTGTTTTGCTTTGGGCAAGAAGG
TTTCCCACCATCCCGGTTCATACTTGGGGTATGGCGCCACCCAATTCTTAGGCTTGTCGA
ACTCTAAAGTAGTAGGAGTGAAGGCCAAGGCTTCATCAAGAGAGGTAGCTTCAAAGGAAT
CGGCTAGAACTCGATCCAACCTTAACTTCATGAACGTGATCCAGGGACCATTGGTGGAGA
CAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAGCCTTTGAGTGATGTTGGGGAACTTGTCGAGGAACT
TAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGCTCCTTTTCATTCTCTCCGTAGTAACGAAGAC
GCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTGTTCCTCTTCGTCAAGCATGAACTTTGCGTTCGCAA
CCAGGAAGTAGTACTTACTGCTCTCTCCCTTATTATCAGACTGTTGTTCAACGGAGGTGG
CAGCGGTTATGAAAGAGGAGGAGGAGAAATGTGAGGATAGAGACAGAGGCTGCTGCTGTT
GCGGAGAGAGATGGAGCTTATTCGTCTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4A410TF 719 0 0
TCTAAGAAAAAGCTGTTGGATCCGGACAATGACAAAAAAGTACTACTATGCTAGAGATTC
TTGTTTTGCTTTGGGCAAGAAGGTTTCCCACCATCCCGGTTCATACTTGGGGTATGGCGC
CACCCAATTCTTAGGCTTGTCGAACTCTAAAGTAGTAGGAGTGAAGGCCAAGGCTTCATC
AAGAGAGGTAGCTTCAAAGGAATCGGCTAGAACTCGATCCAACCTTAACTTCATGAACGT
GATCCAGGGACCATTGGTGGAGACAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAGCCTTTGAGTGAT
GTTGGGGAACTTGTCGAGGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGCTCCTTTTC
ATTCTCTCCGTAGTAACGAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTGTTCCTCTTCGTC
AAGCATGAACTTTGCGTTCGCAACCAGGAAGTAGTACTTACTGCTCTCTCCCTTATTATC
AGACTGTTGTTCAACGGAGGTGGCAGCGGTTATGAAAGAGGAGGAGGAGAAATGTGAGGA
TAGAGACAGAGGCTGCTGCTGTTGCGGAGAGAGATGGAGCTTATTCGTCTGCTTGGGAAG
AAGAGTAGAGGAGACGAGTAACGGTTTCGTACGGCAAGCGGCGGCCGTTGGCACCGCCAC
ACCCAACGCTCCGGTGACGCTCCACATTTTCTGAACTGAGTGTGTTTTGATCGAGGC
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4ES75TF 642 0 0
AGAAGGTTTCCCACCATCCCGGTTCATACTTGGGGTATGGCGCCACCCAATTCTTAGGCT
TGTCGAACTCTAAAGTAGTAGGAGTGAAGGCCAAGGCTTCATCAAGAGAGGTAGCTTCAA
AGGAATCAGCTAGAACTCGATCCAACCTTAACTTCATGAACGTGATCCAGGGACCATTGG
TGGAGACAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAGCCTTTGAGTGATGTTGGGGAACTTGTCGA
GGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGCTCCTTTTAATTCTCTCCGTAGTAAC
GAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTGTTCCTCTTCGTCAAGCATGAACTTTGCGT
TCGCAACCAGGAAGTAGTACTTACTGCTCTCTCCCTTATTATCAGACTGTTGTTCAACGG
AGGTGGCAGCGGTTATGAAAGAGGAGGAGGAGAAATGTGAGGATAGAGACAGAGGCTGCT
GCTGTTGCGGAGAGAGATGGAGCTTATTCGTCTGCTTGGGAAGAAGAGTAGAGGAGACGA
GTAACGGTTTCGTACGGCAAGCGGCGGCCGTTGGCACCGCCACACCCAACGCTACGGTGA
CGCTCCACATTTTCTGAACTGAGTGTGTTTTGATCGAGGC
CC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4E720TF 566 0 0
CAAGGCTTCATCAAGAGAGGTAGCTTCAAAGGAATCAGCTAGAACTCGATCCAACCTTAA
CTTCATGAAAGTGATCCAGGGACCATTGGTGGAGACAAGAGCGACGGCAGGGCGACGGAG
CCTTTGAGTGATGTTGGGGAACTTATCGAGGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTC
TAGCTCCTTTTCATTCTCTCCGTAGTAACGAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAAAGTG
TTCCTCTTCGTCAAGCATGAACTTCGCGTTCGCAACCAGGAAGTAGTACTTACTGCTCTC
TCCCTTATTATCAGACTGTTGTTCAACGGAGGTGGCAGCGGTTATGAAAGAGGAGGAGGA
GAAATGTGAGGATAGAGACAGAGGCTGCTGCTGTTGCGGAGAGAGATGGAGCTTATTCGT
CTGCTTGGGAAGAAGAGTAGAGGAGACGGGTAACGGTTTCGTACGGCAAGCGGCGGCCGT
TGGCACCGCCACACCCAACGCTCCGGTGACGCTCCACATTTTCTGAACTGAGTGTGTTTT
GATCGAGGCAGAGAAATCTGGAAAAA

QA 1 566 1 566
DS 



CO CL171Contig2 898 7 14 U
TTTTTCCAGATTCCTCTGCCTCGATCAAAACACACTACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCG
TCACCGGAGCATTTGGCGTGGTAGCGGTGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGT
TACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAGCAGACGAATAAGCTCCATCCCTCTCCGCAGC
AACAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCT
CCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGTTAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTG
CGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTC
TTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTTGTCATCGAGCCTAAGT
TCCTCGACAAGTTCCCCAAGATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCT
CCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATT
CCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCG
ACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCATACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCT
TCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTTG
TCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTG
TATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCGGTTGTGACCAGAATCGATCAAAATC
TGTTTCTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTTGATCAATCAAGAGTTGTGGTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF65TF U 343
AF RR4G069TF U 1
AF RR4GQ24TF U 20
AF RR4BI35TF U 16
AF RR4BI35JQ C 24
AF RR4GQ24JQ C 246
AF RR4G069JQ C 478
BS 1 676 RR4G069TF
BS 677 677 RR4BI35TF
BS 678 709 RR4G069TF
BS 710 710 RR4BI35TF
BS 711 725 RR4G069TF
BS 726 726 RR4BI35TF
BS 727 730 RR4G069TF
BS 731 731 RR4BI35TF
BS 732 756 RR4G069TF
BS 757 761 RR4BI35TF
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BS 763 834 RR4BI35TF
BS 835 845 RR4BI35JQ
BS 846 898 RR4GQ24JQ

RD RR4EF65TF 265 0 0
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TTGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAAGATCACTCAAAGGCTCCGTCGCC
CTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGG
ATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTC
CTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCC

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR4G069TF 756 0 0
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TCACCGGAGCATTTGGCGTGGTAGCGGTGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGT
TACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAGCAGACGAATAAGCTCCATCCCTCTCCGCAGC
AACAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCT
CCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGTTAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTG
CGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTC
TTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTTGTCATCGAGCCTAAGT
TCCTCGACAAGTTCCCCAAGATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCT
CCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATT
CCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCG
ACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCATACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCT
TCTTGCCCAAAGCAAA*CAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTTTTTTTGTCATTGTTG
TCCGA*TCCA*CAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCT

QA 1 756 1 756
DS 

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GGTCGATC
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AGCAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCCGCA***ACAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATT
TCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATA
AGGGAGAGAGCAGCAAGTACTACTTCCTGGTAGCGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGAAG
AGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGG
AGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTC
AAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCATCAATGGTCCCTGGATCACGTTCA
TGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAG
CCTTGGCCTTCACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGT
ACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTC
TAGCATAGTAGTACTTTTTTT**GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTCGTCTTAGAG
TGCTTTTCTTGTTTTGTAT

QA 9 747 9 747
DS 

RD RR4BI35TF 819 0 0
GG
GCCTCGATCAAAACACACTACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTTGGC
GTGGTAGCGGTGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACT
CTTCTTCCCAAGCAGACGAATAAGCTCCATCCCTCTCCGCAGCAACAGCCTCTGTCTCTA
TCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCTCCGTTGAACAACAG
CCTGATAATAAGGGAGTTAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATG
CTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAG
AATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTTGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCC
AAGATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGG
ATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCT
CTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGG
GTGGCGCCATACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAA
CAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTT
TGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTCGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTAC
AAAATATGTTGCAACTCGGTTGTGACCAGAATCGATC

QA 3 819 3 819
DS 

RD RR4BI35JQ 825 0 0
ATCA
AAACACACTACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTTGGCGTGGTAGCGG
TGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCA
AGCAGACGAATAAGCTCCATCCCTCTCCGCAGCAACAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATT
TCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCTCCGTTGAACAACAGCCTGATAATA
AGGGAGTTAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGAAG
AGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGG
AGCTAGACTTCTGGCTTGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAAGATCACTC
AAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCA
TGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAG
CCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCAT
ACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTC
TAGCATAGTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAG
TGCTTTTCTTGTTTCGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTT
GCAACTCGGTTGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTT
TTG

QA 5 822 5 822
DS 

RD RR4GQ24JQ 653 0 0
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GCAAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGT
TACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTC
GACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCATC
AATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTT
GAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAG
CCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTG
CCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTTGTCCGA
ATCCAACAGCTTCGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTT
CCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCAGTTGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTT
CTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTTGATCAATCAAGAGTTGTGGTTTCTTCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4G069JQ 398 0 0
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ATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGT
TCGACAAGCCTAAGAATTGGGGGGCGCCATACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAA
CCTTTTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATTTCTAGCATAGTAGTACTTTTTTTTTGTCATTG
TTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTC
TTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCAGTTGTGACCAGAATCGATCAAA
ATCTGTTTTTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTTGATC

QA 1 398 1 398
DS 



AS 3 9

CO CL172Contig1 857 2 2 U
GATCATCATCATCATCATCATCATTAGGCATTACAGACAGCTACATGAGATTCGCATTTT
CTATAATAAAGAAATGAGTCGCCTTTTATTAAGTTGTTGAATAAGTTGGATTTGATTTTG
ATTTGATCTCTCAGAGAGAATGGGGTCGTCATCAGGGAAAAGTGGAAACGATCTGTCGTT
TAAGATATTGTTGATTGGAGATTCTGGTGTTGGTAAAAGCAGTTTGCTTGTCAGCTTCAT
TTCCACCTCCGTCGAAGATCTCGCTCCTACCATCGGTGTTGATTTCAAGATTAAACAGTT
GACAGTAGGAGGCAAAAGACTGAAACTCACAATCTGGGACACAGCTGGACAGGAACGGTT
TAGAACATTGACGAGCTCTTACTACAGAGGCGCCCAAGGAAACAAAGTTGATCGAGAATC
TGAGAGAGGAGTTAGCAGAGAAGAAGGGATTGCTCTAGCGAAAGAACTCAAGTGCATGTT
TCTCGAGTGTAGTGCTAGAACTCGACAAAACGTCGAGCAATGTTTCGAAGAGCTGGCGTT
GAAGATAATGGAGGTACCTAGTCTTTTGGAAGAAGGATCAAGTGCTGTGAAGAGAAACAT
CTTGAAGCAGAACACAGATCACCAGACTACTCCCCAAACTGGCTGCTGCAGCTAGTGAGA
CCGAATATCCATGTTCATACAAAAAAAAAAATCGAATTGTTATTCCTTGTGTATTCCAAA
CTCAATCTGATTCTTCTCTCTCTCTCTCTGAGGTTTACCTCTTTTGTGTGTAGTTTCTCT
GTAAATGTGTGAGATTCCTGTTTGCTTCTGAAATGATATTTGTATTAGAATCATATAATA
GAGTGAATAAACCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ85TF U 1
AF RR4AZ85JQ C 336
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CTATAATAAAGAAATGAGTCGCCTTTTATTAAGTTGTTGAATAAGTTGGATTTGATTTTG
ATTTGATCTCTCAGAGAGAATGGGGTCGTCATCAGGGAAAAGTGGAAACGATCTGTCGTT
TAAGATATTGTTGATTGGAGATTCTGGTGTTGGTAAAAGCAGTTTGCTTGTCAGCTTCAT
TTCCACCTCCGTCGAAGATCTCGCTCCTACCATCGGTGTTGATTTCAAGATTAAACAGTT
GACAGTAGGAGGCAAAAGACTGAAACTCACAATCTGGGACACAGCTGGACAGGAACGGTT
TAGAACATTGACGAGCTCTTACTACAGAGGCGCCCAAGGAAACAAAGTTGATCGAGAATC
TGAGAGAGGAGTTAGCAGAGAAGAAGGGATTGCTCTAGCGAAAGAACTCAAGTGCATGTT
TCTCGAGTGTAGTGCTAGAACTCGACAAAACGTCGAGCAATGTTTCGAAGAGCTGGCGTT
GAAGATAATGGAGGTACCTAGTCTTTTGGAAGAAGGATCAAGTGCTGTGAAGAGAAACAT
CTTGAAGCAGAACACAGATCACCAGACTACTCCCCAAACTGGCTGCTGCAGCTAGTGAGA
CCGAATATCCATGTTCATACAAAAAAAAAAATCGAATTGTTATTCCTTGTGTATTCCAAA
CTCAATCTGATTCTTCTCTCTCTCTCTCTGAGGTT

QA 1 755 1 755
DS 

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GATCAAGTGCTGTGAAGAGAAACATCTTGAAGCAGAACACAGATCACCAGACTACTCCCC
AAACTGGCTGCTGCAGCTAGTGAGACCGAATATCCATGTTCATACAAAAAAAAAAATCGA
ATTGTTATTCCTTGTGTATTCCAAACTCAATCTGATTCTTCTCTCTCTCTCTCTGAGGTT
TACCTCTTTTGTGTGTAGTTTCTCTGTAAATGTGTGAGATTCCTGTTTGCTTCTGAAATG
ATATTTGTATTAGAATCATATAATAGAGTGAATAAACCCCCC

QA 1 522 1 522
DS 



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ATTTTTTTTTTTTTGTATGAACATGGATATTCGGTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4EF47JQ U 1
AF RR4EC50JQ U 63
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GAAAAAGCACTTGATAGGGGGTTTATTCACTCTATTATATGATTCTAATACAAATATCAT
TTCAAAAGCAAACAGGAATCTCACACATTTACAGAAAAACTACACACAAAAGAGGTAAAC
CTCAAAAAGAGAGAGAGAAAAATCAAATTGAGTTTGGAATACACAAGGAATAACAATTCG
ATTTTTTTTTTTT*GTATGAACATGGATATTCGGTCTCA

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR4EC50JQ 152 0 0
CAA
AAGCAAACAGGAATCTCACACATTTACAGAAAAACTACACACAAAAAAGGTAAACCTCAA
AAAGAGAGAGAAAAAAATCAAATTGAGTTTGGAATACACAAGGAATAACAATTCGATTTT
TTTTTTTTTGTATGAACATGGATATTCGG

QA 4 152 4 152
DS 



CO CL172Contig3 870 5 24 U
CGATTCTAATACAAATATCATTTCAGAAGCAAACAGGAATCTCACACATTTACAGAGAAA
CTACACACAAAAGAGGTAAACCTCAGAGAGAGAGAGAGAAGAATCAGATTGAGTTTGGAA
TACACAAGGAATAACAATTCGATTTTTTTTTTTTTTT*GTATGAACATGGATATTCGGTC
TCACTAGCTGCAGCAGCCAGTTTGGGGAGTAGTCTGGTGATCTGTGTTCTGCTTCAAGAT
GTTTCTCTTCACAGCACTTGATCCTTCTTCCAAAAGACTAGGTACCTCCATTATCTTCAA
CGCCAGCTCTTCGAAACACTGCTCGACGTTTTGTCGAGTTCTAGCACTACACTCGAGAAA
CATGCACTTGAGTTCTTTCGCTAGAGCAATCCCTTCTTCTCTGCTAACTCCTCTCTCAGA
TTCTCGATCAACTTTGTTTCCAACGAGCATCGTAACGCATTCTTGGTTAGTGGAGTAAAG
CTCAATCTCCTTACCCCACACATCTACTAAGTTTGTAAATGTCTCTCTTCTCGTCACATC
ATACACGAGAATGATTCCTTGGGCGCCTCTGTAGTAAGAGCTCGTCAATGTTCTAAACCG
TTCCTGTCCAGCTGTGTCCCAGATTGTGAGTTTCAGTCTTTTGCCTCCTACTGTCAACTG
TTTAATCTTGAAATCAACACCGATGGTAGGAGCGAGACCTTCGACGGAGGTGGAAATGAA
GCTGACAAGCAAACTGCTTTTACCAACACCAGAATCTCCAATCAAAAATATCTTAAACGA
CAGATCGTTTCCACTTTTCCCTGATGACGACCCCATTCTCTCTCCACAAAAAAAAACAAA
CAAAATTTTCTTGATCTCTCTCTCACTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 0 0 15 0 0 15 15 0 0 15 
0 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G386JQ U 1
AF RR4E812JQ U 2
AF RR4FT28JQ U 8
AF RR4E812TF C 159
AF RR4EF47TF C 159
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CTACACACAAAAGAGGTAAACCTCAGAGAGAGAG****AAGAATCAGATTGAGTTTGGAA
TACACAAGGAATAACAATTCGATTTTTTTTTTTTTTTTGTATGAACATGGATATTCGGTC
TCACTAGCTGCAGCAGCCAGTTTGGGGAGTAGTCTGGGGATCTGTGTTCTGCTTCAAGAT
GTTTCTCTTCACAGCACTTGATCCTTCTTCCAAAAGACTAGGTACCTCCATTATCTTCAA
CGCCAGCTCTTCGAAACATTGCTCGACGTTTTGTCGAGTTCTAGCACTACACTCGAGAAA
CATGCACTTGAGTTCTTTCGCTAGAGCAATCCCTTCTTCTCTGCTAACTCCTCTCTCAAA
TTCTCGATCAACTTTGTTTCCAACGAGCATCGTAACGCATTCTTGGTTAGTGGAGTAAAG
CTCAATCTCCTTACCCCACACATCTACTAAGTTTGTAAATGTCTCTCTTCTCGTCACATC
ATACACGAGAATGATTCCTTGGGCGCCTCTGTAGTAAGAGCTCGTCAATGTTCTAAACCG
TTCCTGTCCAGCTGTGTCCCAGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4E812JQ 625 0 0
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TACACACAAAAGAGGTAAACCTCAGAGAGAGAGAGAGAAGAATCAGATTGAGTCTGGAAT
ACACAAGGAATAACAATTCGATTTTTTTTTTTTTTT*GTATGAACATGGATATTCGGTCT
CACTAGCTGCAGCAGCCAGTTTGGGGAGTAGTCTGGGGATCTGTGTTCTGCTTCAAGATG
TTTCTCTTCACAGCACTTGATCCTTCTTCCAAAAGACTAGGTACCTCCATTATCTTCAAC
GCCAGCTCTTCGAAACACTGCTCGACGTTTTGTCGAGTTCTAGCACTACACTCGAGAAAC
ATGCACTTGAGTTCTTTCGCTAGAGCAATCCCTTCTTCTCTGCTAACTCCTCTCTCAGAT
TCTCGATCAACTTTGTTTCCAACGAGCATCGTAACGCATTCTTGGTTAGTGGAGTAAAGC
TCAATCTCCTTACCCCACACATCTACTAAGTTTGTAAATGTCTCTCTTCTCGTCACATCA
TACACGAGAATGATTCCTTGGGCGCCTCTGTAGTAAGAGCTCGTCAATGTTCTAAACCGT
TCCTGTCCAGCTGTGTCCCAGATTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4FT28JQ 613 0 0
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CAAAAGAGGTAAACCTCAGAGAGAGAGAGAGAAGAATCAGATTGAGTTTGGAATACACAA
GGAATAACAATTCGAGTTTTTTTTT******GTATGAACATGGATATTCGGTCTCACTAG
CTGCAGCAGCCAGTTTGAGGAGTAGTCTGGTGATCTGTGTTCTGCTTCAAGATGTTTCTC
TTCACAGCACTTGATCCTTCTTCCAAAAAACTAGGTACCTCCATAATCTTCAGAGCCAGC
TCTTCGAAACACTGCTCTACGTTTTGTCGAGTTCTAGCACTACACTCAAGAAACATGCAC
TTGAGTTCTTTCGCTAGAGCAGTCCCTTCTTCTCTGCTAACTCCTCTCTCAGATTCTCTA
TCAACTTTGTTTCCAACGAGCATCCTAACGCATTCTTGGTTAGTGGAGTAAAGCTCAATC
TCCTTACCCCACACATCTACTAAGTTTGTAAATGTCTCTCTTCTCGTCACATCATACACG
AGAATGATTCCTTGGGCGCCTCTGTAGTAAGAGCTCGTCAATGTTCTAAACCGTTCCTGT
CCAGCTGTGTCCC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4E812TF 691 0 0
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GATCTGTGTTCTGCTTCAAGATGTTTCTCTTCACAGCACTTGATCCTTCTTCCAAAAGAC
TAGGTACCTCCATTATCTTCAACGCCAGCTCTTCGAAACACTGCTCGACGTTTTGTCGAG
TTCTAGCACTACACTCGAGAAACATGCACTTGAGTTCTTTCGCTAGAGCAATCCCTTCTT
CTCTGCTAACTCCTCTCTCAGATTCTCGATCAACTTTGTTTCCAACGAGCATCGTAACGC
ATTCTTGGTTAGTGGAGTAAAGCTCAATCTCCTTACCCCACACATCTACTAAGTTTGTAA
ATGTCTCTCTTCTCGTCACATCATACACGAGAATGATTCCTTGGGCGCCTCTGTAGTAAG
AGCTCGTCAATGTTCTAAACCGTTCCTGTCCAGCTGTGTCCCAGATTGTGAGTTTCAGTC
TTTTGCCTCCTACTGTCAACTGTTTAATCTTGAAATCAACACCGATGGTAGGAGCGAGAC
CTTCGACGGAGGTGGAAATGAAGCTGACAAGCAAACTGCTTTTACCAACACCAGAATCTC
CAATCAACAATATCTTAAACGACAGATCGTTTCCACTTTTCCCTGATGACGACCCCATTC
TCTCTCCCGTGTATGATGCAAACCAAATT
CC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4EF47TF 712 0 0
GTATGAACATGGATATTCGGTCTCACTAGCTGCAGCAGCCAGTTTGGGGAGTAGTCTGGT
GATCTGTGTTCTGCTTCAAGATGTTTCTCTTCACAGCACTTGATCTTTCTTCCAAAAGAC
TAGGTACCTCCATTATCTTCAACGCCAGCTCTTCGAAACATTGCTCGACGTTTTGTCGAG
TTCTAGCACTACACTCGAGAAACATGCACTTGAGTTCTTTCGCTAGAGCAATCCCTTCTT
CTCTGCTAACTCCTCTCTCAGATTCTCGATCAACTTTGTTTCCAACGAGCATCGTAACGC
ATTCTTGGTTAGTGGAGTAAAGCTCAATCTCCTTACCCCACACATCTACTAAGTTTGTAA
ATGTCTCTCTTCTCGCCACATCATACACGAGAATGATTCCTTGGGCGCCTCTGTAGTAAG
AGCTCGTCAATGTTCTAAACCGTTCCTGTCCAGCTGTGTCCCAGATTGTGAGTTTCAGTC
TTTTGCCTCCTACTGTCAACTGTTTAATCTTGAAATCAACACCGATGGTAGGAGCGAGAT
CTTCGACGGAGGTGGAAATGAAGCTGACAAGCAAACTGCTTTTACCAACACCAGAATCTC
CAATCAAAAATATCTTAAACGACAGATCGTTTCCACTTTTCCCTGATGACGACCCCATTC
TCTCTCTACAAAAAAAAACAC*CAAGATTTTCTTGATCTCTCTCTCACTCCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 13

CO CL173Contig1 911 13 9 U
ACTTTAAAAAAAAATATTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATTCAA
TACACAAGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCAGAATTA
AACAATGAATTTTAAACATAAGAGAACAAATCCAAGACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCAT
TTCACAGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTCTGATGA
GTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGATCTTCTT
GCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGG
ACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCAC
TTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGC
TTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACT
AACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGG
TTTAAGGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACT
GTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAGACGGATAAAAGT
AACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGGACCGGTAGGGCCAGG
AGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCCGTGGAGAGGAAGATGGCGGCGAGGAGGAG
GAGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTTGCCATTGTGTGTTTGAAGTTTGAGTTTAT
GCGTGGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 35 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 45 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4BH77JQ U 2
AF RR4BA14JQ U 41
AF RR4CU42JQ U 23
AF RR4GR38JQ U 6
AF RR4CJ36JQ U 5
AF RR4GQ83JQ U 6
AF RR4GH05JQ U 1
AF RR4BH77TF C 170
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AF RR4GH05TF C 212
AF RR4GR38TF C 181
AF RR4CJ36TF C 234
BS 1 289 RR4GH05JQ
BS 290 290 RR4CJ36JQ
BS 291 512 RR4GH05JQ
BS 513 513 RR4CJ36JQ
BS 514 765 RR4GH05JQ
BS 766 835 RR4BA14TF
BS 836 841 RR4BH77TF
BS 842 910 RR4BA14TF
BS 911 911 RR4CJ36TF

RD RR4BH77JQ 138 0 0
ATTTT
AAAAAAAATATTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATTCAATACACA
AGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCAGAATTAAACAAT
GAATTTTAAACAT

QA 6 138 6 138
DS 

RD RR4BA14JQ 250 0 0
GCATGATACATCATATTCAATACACAAGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAA
AAAATAAAGCAAAAGAATTAAACAATGAATTTTAAACATAAAAAAACAAATCCAAGACCA
AAGCCTAATCCAGCCTTCATTTCACAGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTC
TTAAAGGAGTCGTCTGATGAGTCATCAAAAACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGC
GCCACCGGTG

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR4CU42JQ 501 0 0
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GCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCGGAATTAAACAATGAATTTTAAACATAAA
AAAACAAATCCAAGACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCATTTCACAGGAGCCAGACTTCTGG
GACGGAACCGCCGCTTTCTTAAAGGAGTCGTCTGATGAGTCATCAAAAACAGCAGGAGAT
TTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAAATCTTCTTGCGGTCTCCAAACATCTCTTCA
GGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGGACGTTCTTTTCTCAGTGCATTA
CTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCACTTGGTTCCCTTGACCGGTGAAG
TTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGCTTGTGTTCTGACAGGGTTGCTT
ACGGAGGGAAGATCATCCATT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4GR38JQ 546 0 0
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AAGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCAGAATTAAACAA
TGAATTTTAAACATAAGAGAACAAATCCAAGACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCATTTCAC
AGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTCTGATGAGTCAT
CAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGATCTTCTTGCGGT
CTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGGACGTT
CTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCACTTGGT
TCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGCTTGTG
TTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACTAACAT
GGTAAA

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4CJ36JQ 703 0 0
G
AAAAAAAAATATTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATTCAATACAC
AAGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCAGAATTAAACAA
TGAATTTTAAACATAAGAGAACAAATCCAAGACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCATTTCAC
AGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTCTGATGAGTCAT
CAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGATCTTCTTGCGGT
CTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGGACGTT
CTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCACTTGGT
TCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAG*AGCTTGTG
TTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACTAACAT
GGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGGTTTAA
GGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACTGTTGA
TTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAA

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR4GQ83JQ 702 0 0
AAAAAAAAATATTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATTCAATACAC
AAGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCAGAATTAAACAA
TGAATTTTAAACATAAGAGAACAAATCCAAGACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCATTTCAC
AGGAGCCAGACTTCGGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTCTGATGAGTCAT
CAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGATCTTCTTGCGGT
CTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGGACGTT
CTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCACTTGGT
TCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGCTTGTG
TTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACTAACAT
GGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGGTTTAA
GGTTATGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACTGTTGA
TTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4GH05JQ 765 0 0
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TACACAAGTTTCTTATTACACAGCCCACACAATTAAATAAAAAATAAAGCAGCAGAATTA
AACAATGAATTTTAAACATAAGAGAACAAATCCAAGACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCAT
TTCACAGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTCTGATGA
GTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGT*AGATCTTCTT
GCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGG
ACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCAC
TTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGC
TTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAAATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACT
AACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGG
TTTAAGGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACT
GTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAGACGGATAAAAGT
AACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGG

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DS 

RD RR4BH77TF 726 0 0
TCCAG
CTTCATTTCACAGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTC
TGATGAGTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGAT
CTTCTTGCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGC
AAGTGGACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACAC
GTTCACTTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACC
AGTAGCTTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTT
GGGACTAACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGC
TCCCGGTTTAAGGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGA
TGAACTGTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAGACGGAT
AAAAGTAACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGGACCGGTAGG
GCCAGGAGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCCGTGGAGAGGAAGATGGCGGCGAG
GAGGAGGAGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTTGCCATTGTGTGTTTGAAGTTT
TCC

QA 6 723 6 723
DS 

RD RR4BA14TF 742 0 0
TCCAGCCTTCATTTCACAGGAGCCAGACTTCTGGGACGGAACCGCCGCTTTCTTAGAGGA
GTCGTCTGATGAGTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGG
TGAGATCTTCTTGCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTA
AACCGCAAGTGGACGTTCTTTTCTTAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGT
CGATACGTTCACTTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTC
TCGACCAGTAGCTTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTA
GAACTTGGGACTAACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTT
TAGGGCTCCCGGTTTAAGGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGTGAATACGGTCATGCC
TTCTGATGAACTGTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAG
ACGAATAAAAGTAACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGGACC
GGTAGGGCCAGGAGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCCGTGGAGAGGAAGATGGC
GGCGAGG******AGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTTGCCATTGTGTGTTTGAA
GTTTGAGTTTATGCGTGGATCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4GQ83TF 747 0 0
AAAGCTATCCAGCTTCA
TTCACAGGAGCCAGACTTCTGGGACGGA*CCGCCGCTTTCT*AGAGGAGTCGTCTGATGA
GTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGATCTTCTT
GCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGG
ACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCAC
TTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGC
TTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACT
AACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGG
TTTAAGGTTATGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACT
GTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAGACGGATAAAAGT
AACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGGACCGGTAGGGCCAGG
AGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCCGTGGAGAGGAAGATGGCGGCGAGGAGGAG
GAGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTTGCCATTGTGTGTTTGAAGTTTGAGTTTAT
GCGTGGATCC

QA 18 747 18 747
DS 

RD RR4GH05TF 694 0 0
GCCGCTTTCTTAGAGGAGTCGTCTGATGAGTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTT
GGAGCAGGCGCCACCGGT*AGATCTTCTTGCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAAT
ACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGGACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGT
GTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCACTTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCG
TAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGCTTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGA
AGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACTAACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCG
TCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGGTTTAAGGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGT
GCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACTGTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATT
TGAGTTGTGTTTAGAAGACGGATAAAAGTAACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCT
GTGATGTTGATGGGACCGGTAGGGCCAGGAGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCC
GTGGAGAGGAAGATGGCGGCGAGGAGGAGGAGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTT
GCCATTGTGTGTTTGAAGTTTGAGTTTATGCGT
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4GR38TF 730 0 0
TTCACAGGAGCCAGACT*CTGG*ACGGA*CCGCCGCTTTCT*AGAGGAGTCGTCTGATGA
GTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTT*GGAGCAGGCGCCACCGGTGAGATCTTCTT
GCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCGCAAGTGG
ACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACACGTTCAC
TTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGACCAGTAGC
TTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACTTGGGACT
AACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGGCTCCCGG
TTTAAGGTTATGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTGATGAACT
GTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAGACGGATAAAAGT
AACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGGACCGGTAGGGCCAGG
AGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCCGTGGAGAGGAAGATGGCGGCGAGGAGGAG
GAGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTTGCCATTGTGTGTTTGAAGTTTGAGTTTAT
GCGTGGATCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4CJ36TF 678 0 0
CTGATGAGTCATCAGAGACAGCAGGAGATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGGTGAGA
TCTTCTTGCGGTCTCCAAACATCTCTTCAGGCAACAATACCATGTCCACCACGTAAACCG
CAAGTGGACGTTCTTTTCTCAGTGCATTACTGACACGTGTCTCGATGACACCTGTCGACA
CGTTCACTTGGTTCCCTTGACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACCGCTCCACCGTCTCGAC
CAG*AGCTTGTGTTCTGACAGGGTTGCTTACGGAGAGAAGATCATCCATTGTGTAGAACT
TGGGACTAACATGGTAAAGAATGAGCTTGACTTGGTCGTCCGGGCTTAACTTGTTTAGGG
CTCCCGGTTTAAGGTTTTGGAAAGCGTTGTCCGTTGGTGCGAATACGGTCATGCCTTCTG
ATGAACTGTTGATTTGGATGTTGATTTGGCTTCCGATTTGAGTTGTGTTTAGAAGACGGA
TAAAAGTAACAAACTGACCGCCTTTTTCTAGGATCGCTGTGATGTTGATGGGACCGGTAG
GGCCAGGAGCAGGAGCGGCGGGCTGAGCAGTTACCTCCGTGGAGAGGAAGATGGCGGCGA
GGAGGAGGAGGAGAGGAGCTAGCGTTAGATGAATGGTTGCCATTGTGTGTTTGAAGTTTG
AGTTTATGCGTGGATCCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 13

CO CL174Contig1 1196 13 54 U
GGACTTCAAAAGTCTTCACTCGTCACTTCACTTCACAAACAATCTCTGAATCTCTCTCTC
TCTCAAATCAAATCAAATGACGACACTCTTAGGGTTCTCTCATACCAAGTTACCCCACTG
CAACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCCCATCTTCCTCCACGGTTGTCTCAATGGTGGG
GAGACGCTCTGATTCCAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCACCATGA
TCGCCTACCCTCGACTGGTCGTAGAAGCTCATCAACAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTC
TCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAA
GCAGCATGTGGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGA
AGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAG
ATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGA
GACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATTATACAGAGGAAGCTGAGGAAGAT
CAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAG
AGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAA*GAAGAAG
AGGATGATTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACT
GTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCTCATGATTTCTACGGCTTCCAGAAT
GAAGAAACCGGTGAGATAAATATAGTGTACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTACGGTCTGATA
ATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCTTCCAACTGAGCAATTGAAT
GAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTCTCAGAACCAAAACTGATCTTACTT
CTCTCCCTACAGATGGTTTGCATGTATAAGGGTTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAACTT
GAATCTGTTATGGTTCAGGAAACAGTGTACATAATAATAAAAGGCTAGAGAATTTTTTTT
TAAATGATTCTGTTTTACTCTATTTGAGGTAGAAAGAAAATTGAATCTGAAGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 10 20 20 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 
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75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 45 75 75 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTCGGCCGTATCACTCACCATGA
TCGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGAAGCTCGTCCGCAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTC
TCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAA
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AGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCCAAGATCCTTAG
ATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGA
GACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTTTCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGAT
CAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAG
AGAGCCTGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAAAGGAGAAG
AGGATGATTTGGTCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACC
GTCTCT

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CTCTCATACCAAGTTACCCCACTGCGACGTCTCTATCACTTCTCCAGCATGCCCATCTTC
CTCCACGGTTGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCTGATTCCAAGACTCTCCGGTCAGGCTT
CCTAGGCCGTATCACTCACCATGATCGCCTACCCTCTACTGGTCGTAGAAGCTCATCAAC
AGTGAAAATGTCGTGGGACGGTCCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAA
CCTCGAGCTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTGGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCA
GAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTT
TGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGT
TGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGAT
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AGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGA
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GG
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CTCTCATACCAAGTTACCCCACTGCAACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCCCATCTTC
CTCCACGGTTGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCTGATTCCAAGACTCTCCGGTCAGGCTT
CCTAGGCCGTATCACTCACCATGATCGCCTACCCTCGACTGGTCGTAGAAGCTCATCAAC
AGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAA
CCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTGGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCA
GAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTT
TGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGT
TGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGAT
TATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAA
AGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGA
GGACGTTGCTGGAGAA*GAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAG
TACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCT
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DS 

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GG
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ACGGTTGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCTGATTCCAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTA
GGCCGTATCACTCACCATGATCGCCTACCCTCGACTGGTCGTAGAAGCTCATCAACAGTG
AAAATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTC
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CGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATTATA
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GTTTC

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ACTCTTAGGGTTCTCTCATACCAAGTTACCCCACTGCAACGTCTCTATCACTTCTCCAAC
ATGCCCATCTTCCTCCACGGTTGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCTGATTCCAAGACTCT
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AAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTAT
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GTGTACA
GAGAA

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GG
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CTCTCATACCAAGTTACCCCACTGCAACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCCCATCTTC
CTCCACGGTTGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCTGATTCCAAGACTCTCCGGTCAGGCTT
CCTAGGCCGTATCACTCACCACGATCGCCTACCCTCGACTGGTCGTAGAAGCTCATCAAC
AGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAA
CCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTGGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCA
GAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTT
TGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGT
TGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGAT
TATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAA
AGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGA
GGACGTTGCTGGAGAA*GAAGAGGAGGATGATTTGATCAAAGGAGATTGTGCGTACCAAG
TACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTCTCTGAG*CAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCT
CATGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAATATAGTGTACAAGAGA
A

QA 3 843 3 843
DS 

RD RR4CH44TF 530 0 0
G
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CAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAA
AGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCG
CGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATTATACA
GAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCGCATGAAAGGTTT
CAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGT
TGCTGGAGAA*GAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTT
GAGATGCCACCATTGACTGTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCTCATGAT
TTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAATATAGTGTACA

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DS 

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G
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GTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTA
TACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATTATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAG
AAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCA
GTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAA*GAAGAAGAGGATGA
TTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTCTCTG
AGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCTCATGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAA
CCGGTGAGATAAATATAGTGTACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTACGGTCTGATAATCCCTA
AGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCTTCCAACTGAGCAATTGAATGAACACT
CTTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTCTCGGAACCAAAACTGATCTTACTTCTCTCCC
TACAGATGGTTTGCATGTA

QA 2 620 2 620
DS 

RD RR4B733JQ 796 0 0
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GTCATCTCGTCAGAGAAGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAG
GACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCG
GCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATTATACAGA
GGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCA
ACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTG
CTGGAGAA*GAAGAGGAGGATGATTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGA
GATGCCACCATTGACTGTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCTCATGATTT
CTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAATATAGTGTACAAGAGAAAAGAAGG
AGGGTACGGTCTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCCTCC
AACTGAGCAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTCTCAGAACC
AAAACTGATCTTACTTCTCTCCCTACAGATGGTTTGCATGTATAAGGGTTCTTGAGAGAA
AACAGTGAAAGAACTTGAATCTGTTATGGTTCAGGAAACAGTGTACATAATAATAAAAGG
CTAGAGAATTTTTTTT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4BG14JQ 882 0 0
CGTAGAAGCTCATCAACAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTG
ATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTGGAGGACAAA
GTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGCCAGAGAAGTTGACGTGAGACTCTCT
GTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTT
ACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATC
GACTTGGTATCAACGATTATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGAC
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GTTATGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAA*GAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGG*
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AGCTGGAGTTAGTAGCTCATGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAA
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AGACTTGTGTGTCTGTCTCAGAACCAAAACTGATCTTACTTCTCTCCCTACAGATGGTTT
GCATGTATAAGGGTTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAACTTGAATCTGTTATGGTTCAGG
AAACAGTGTACATAATAATAAAAGGCTAGAGAATTTTTTTTT

QA 1 882 1 882
DS 

RD RR4A667JQ 831 0 0
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AGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGATGTGA
GACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCCAAGATCCTTAGATGCGAGGTAA
CACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACG
CTTGTATCGACTTGGTTTCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGG
ACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCTGTGA
TTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAA*GGAGAAGAGGATGATTTG
GTCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACCGTCTCTGAGGC
AGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCTCATGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGG
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TGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTCTCAGAACCAAAACTGATCTTACTTCTCTCCCTACA
GATGGTTTGCATGTATAAGGGTTTTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAACTTGAATCTGTTAT
GGTTCAGGAAACAGTGTACATAATAATAAAAGGCTAGAGAATTTTTTTTT
T

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DS 

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AGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATG
GTGTTGTGCGCGGCGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAA
CGATTATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACA
TGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATC
CTGAGGACGTTGCTGGAGAA*GAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTAC
CAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGT
AGCTCATGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAATATAGTGTACAA
GAGAAAAGAAGGAGGGTACGGTCTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGT
TGATCCGCTTCCAACTGAGCAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTC
TGTCTCAGAACCAAAACTGATCTTACTTCTCTCCCTACAGATGGTTTGCATGTATAAGGG
TTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAACTTGAATCTGTTATGGTTCAGGAAACAGTGTACAT
AATAATAAAAGGCTAGAGAATTTTTTTTT

QA 1 749 1 749
DS 

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GATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGTGTTGTGCGCGGCGAGGA
AGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATTATACAGAGGAAGCT
GAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTC
GAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGA
A*GAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGG*AGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCCA
CCATTGACTGTTTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTAGCTCATGATTTTTACGGC
TTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAATATAGTGTACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTAC
GGTCTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCCTCCAACTGAG
CAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTTTCAGAACCAAAACTG
ATCTTACTTCTCTCCCTACAGATGGTTTGCATGTATAAGGGTTCTTGAGAGAAAATAGTG
AAAGAACTTGAATCTGTTATGGTTCAGGAAACAGTGTACATAATAATAAAAGGCTAGAGA
ATTTTTTTTTAAATGATTCTGTTTTACTCTATTTGAGGTAGAAAGAAAATTGAATCTGAA
GTTAT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 12

CO CL175Contig1 1012 12 15 U
GGTCATTGGATCTTAATTTGACAACCATACACGCAAACAATTTAAAAGAGGATCTGAGAA
AGAGATGGTGTTCAAATGGAAACAACAAGATTCATAACACAGATGGAAACAAGTTTCTCT
GAAATGTGAATGTTCTTAGAAAGATAATGAAAGCAAAAGGAAGAGAATCC*AAAGTCTGA
TTTCAAA*GTGATCAGTCACGTTCGCTAATGGCAGTCAAATGCTCCTCGATCTCCTCCGT
TTCAAGGGAACGGAAGATCGGGTTATCAGCTCTCACAACTCCAACCTCAATCTCAGTTGC
CTTGAAGTCTTCTTGAAGAACAGATTGCAGGGCAGATATGGCAGTCTGCACAGTTTCATC
ATAAGTGAAGGCAGGGTTCTCTTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGATTGCTTCTTGCTC
TTTCATACCCGCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGGGTCACACTTGTA
AAGCAGGGGTCCTCTCTCTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTACTCCAAGAGGTCT
CATGTAAGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTAGCAAGGATGTC
GGCAGGCATCTCGTATCCGTATTGGAACCTAAACTCAGCTGCCTCATTCCTTGCTTGTGT
GACCAAGGACCTTGAATCAGCTGTCATGCCAGTGGCTAACAAGCCAAGGTACTTAGTGAC
AGGGAAAAGGTGAGATACGCTTGACTGATCTAGAAGCTTGTCGGGAACTTTCTTCTGGGT
GACGACGCATACTGAATCTTTTCCGCGAACACCGATGGAGGTGATTCCTGCTGCTTTGAC
GGCTTTGAATGCATATTCGACTTGGAAGAGACGACCTTCCGGTGAGAAGATCGTGATGTG
ACGATCGTATCCTGCGCCGCTTCCTCTGCTCATCTTTCTCTCGGCCTTAGATTCACTAAT
AAAACCCTTTGCTCCTTTGTTGTTCTGCGATCTATTAAAGACGACGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 
55 60 60 65 65 65 65 65 70 70 70 45 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
40 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4FW42JQ U 1
AF RR4CA86JQ U 44
AF RR4HB42JQB U 44
AF RR4CY35JQ U 49
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BS 124 267 RR4FW42JQ
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BS 383 729 RR4FW42JQ
BS 730 730 RR4CA86JQ
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RD RR4FW42JQ 759 0 0
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TTTCATACCCGCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGGGTCACACTTGTA
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QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4CA86JQ 782 0 0
AAAAG
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TGATT

QA 6 777 6 777
DS 

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ATAAG
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CC*AAAGTCTGATTTCAAA*GTGATCAGTCACGTTCGCTAATGGCAGTCAAATGCTCCTC
GATCTCCTCCGTTTCAAGGGAACGGAAGATCGGGTTATCAGCTCTCACAACTCCAACCTC
AATCTCAGTTGCCTTGAAGTCTTCTTGAAGAACAGATTGCAGGGCAGATATGGCAGTCTG
CACAGTTCCATCATAAGTGAAGGCAGGGTTCTCTTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGAT
TGCTTCTTGCTCTTTCATACCCGCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGG
GTCACACTTGTAAAGCAGGGGTCCTCTCTCTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTAC
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AGCAAGGATGTCGGCAGGCATCTCGTATCCGTATTGGAACCTAAACTCAGCTGCCTCATT
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DS 

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CC*AAAGTCTGATTTCAAA*GTGATCAGTCACGTTCGCTAATGGCAGTCAAATGCTCCTC
GATCTCCTCCGTTTCAAGGGAACGGAAGATCGGGTTATCAGCTCTCACAACTCCAACCTC
AATCTCAGTTGCCTTGAAGTCTTCTTGAAAAACAGATTGCAGGGCAAATATGGCAGTCTG
CACAGTTTCATCATAAGTGAAGGCAGGGTTCTCTTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGAT
TGCTTCTTGCTCTTTCATACCCGCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGG
GTCACACTTGTAAAGCAGGGGTCCTCTCTCTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTAC
TCCAAGAGGTCTCATGTAAGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTT
AGCAAGGATGTCGGCAGGCATCTCGTATCCGTATTGGAACCTAAACTCAGCTGCCTCATT
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QA 1 775 1 775
DS 

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CTGAAATGTGAATGTTCTTAGAAAGATAATGAAAGCAAAAGGAAGAGAATCC*AAAGTCT
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GTTTCAAGGGAACGGAAGATCGGGTTATCAGCTCTCACAACTCCAACCTCAATCTCAGTT
GCCTTGAAGTCTTCTTGAAAAACAGATTGCAGGGCAAATATGGCAGTCTGCACAGTTTCA
TCATAAGTGAAGGCAGGGTTCTCTTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGATTGCTTCTTGC
TCTTTCATACCCGCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGGGTCACACTTG
TAAAGCAGGGGTCCTCTCTCTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTACTCCAAGAGGT
CTCA*GTAAGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTATGCAATCCATTTAGCAAGGATG
TCGGCAGGCATCTCGTATCCGTATTGGAACCTAAACTCAGCTGCCTCATTCCTTGCTTGT
GTGACCAAGGACCTTGAATCAGCTGTCATGCCAGTGGCTAACAAGCCAAGGTACTTAGTG
ACAGGGAAAAGGTGAGATACGCTTGACTGATCTAGAAGCTTGTCGGGAACTTTCTTCTGG
GTGACGA

QA 1 727 1 727
DS 

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AGAAAGATAATGAAAGCAAAAGGAAGAGAATCC*AAAGTCTGATTTCAAA*GTGATCAGT
CACGTTCGCTAATGGCAGTCAAATGCTCCTCGATCTCCTCCGTTTCAAGGGAACGGAAGA
TCGGGTTATCAGCTCTCACAACTCCAACCTCAATCTCAGTTGCCTTGAAGTCTTCTTGAA
GAACAGATTGCAGGGCAGATATGGCAGTCTGCACAGTTTCATCATAAGTGAAGGCAGGGT
TCTCTTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGATTGCTTCTTGCTCTTTCATACCCGCACTAG
TTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGGGTCACACTTGTAAAGCAGGGGTCCTCTCT
CTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTACTCCAAGAGGTCTCATGTAAGCATGTTGAG
TGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTAGCAAGGATGTCGGCAGGCATCTCGTATC
CGTATTGGAACCTAAACTCAGCTGCCTCATTCCTTGCTTGTGTGACCAAGGACCTTGAAT
CAGCTGTCATGCCAGTGGCTAACAAGCCAAGGTACTTAGTGACAGGGAAAAGGTGAGATA
CGCTTGACTGATCTGGAAGCTTGTCGGGAACTTTCTTCTGGGTGACGACGCATACTGAAT
CTTTTCCGCGAACACCGATGGAGGTGATTCCTGCTGCTTTG

QA 1 761 1 761
DS 

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CAA
GGAACGGAAGATCGGGTTATCGGCTCTCACAACTCCAAC*TCAATCTCAGTTGC*TTGAA
GTCTTCTTGAAGAACAGATTGCAGGGCAGATATGGCAGTCTGCACAGTTTCATCATAAGT
GAAGGCAGGGTTCTCCTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGATTGCTTCTTGCTCTTTCAT
ACCCGCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAAAGTGTCCAGCTGGGTCACACTTGTAAAGCAG
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AGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTAGCAAGGATGTCGGCAGG
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CC

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DS 

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AAGGCAGGGTTCTCTTTCATTTTCTTCTCCAAGAAATTGATTGCTTCTTGCTCTTTCATA
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GGTCCTCTCTCTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTACTCCAAGAGGTCTCA*GTAA
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CATACTGAATCTTTTCCGCGAACACCGATGGAGGTGATTCCTGCTGCTTTGACGGCTTTG
AATGCATATTCGACTTGGAAGAGACGACCTTCCGGTGAGAAGATCGTGATGTGACGATCG
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DS 

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GGGGTCCTCTCTCTTCGTCCATACCCAGCACCATGGCAACTACTCCAAGAGGTCTCATGT
AAGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTAGCAAGGATGTCGGCAG
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AGGACCTTGAATCAGCTGTCATGCCAGTGGCTAACAAGCCAAGGTACTTAGTGACAGGGA
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TGAATGCATATTCGACTTGGAAGAGACGACCTTCCGGTGAGAAGATCGTGATGTGACGAT
CGTATCCTGCGCCGCTTCCTCTGCTCATCTTTCTCTCGGCCTTAGATTCACTAATAAAA
A

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DS 

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AAGTC
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GCACTAGTTGCCTTGTGACCGTAAA*GTGTCCAGCTGGGTCACACTTGTAAAGCAGGGGT
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TGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTAGCAAGGATGTCGGCAGGCATC
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TGAGATACGCTTGACTGATCTAGAAGCTTGTCGGGAACTTTCTTCTGGGTGACGACGCAT
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GCATATACGACTTGGAAGAGACGACCTTCCGGTGAGAAGATCGTGATGTGACGATCGTAT
CCTGCGCCGCTTCCTCTGCTCATCTTTCTCTCGGCCTTAGATTCACTAATAAAACCCTTT
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CCAAGAGGTCTCATGTAAGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTA
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GCTGCTTTGACGGCTTTGAATGCATATTCGACTTGGAAGAGACGACCTTCCGGTGAGAAG
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TCC

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DS 

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GTAAGCATGTTGAGTGTAGACCTGTGACTTGTCTGCAATCCATTTAGCAAGGATGTCGGC
AGGCATCTCGTATCCGTATTGGAACCTAAACTCAGCTGCCTCATTCCTTGCTTGTGTGAC
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GACGCATACTGAATCTTTTCCGCGAACACCGATGGAGGTGATTCCTGCTGCTTTGACGGC
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ACCCTTTGCTCCTTTGTTGTTCTGCGATCTATTAAAGACGACGGAATCC

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DS 



AS 2 10

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AAAACGTTGGCCTATCATATTTATTCAGCGGTGCATCCACTTCAAATCTCTTAGGAAGAT
CCGGGTTTGCAAGAAACCACCGACCATAAGCCACAAGATCGGTCCGTCCCTCTGCCACTG
CCTCATTCCCATCTTTCCTCGTGTAACCTCCCGCTGAAATGAAAGTCCCCTGAAAGGCTT
TCCTCATCGGCACTAGCAAGTGAGGACACTCTGTTATCTCTCCCATTGTTTTCATTCTTG
GCTCTATCACATGACAGTAGAGGATACCATATTTGTTTAAAGATTCACCCATGTGAAGGG
CTAACGCTTGTGGGTTAGTGTCTGCTGACTCCATGTAGTCAGCAAAGGGAGAGAGCCTGA
TGCCAACACGGTCTGGTCCTATCTCGGTAGCCACTGCTTCAACTATGTCTAAAGCAAATT
TGCAACGTTTTTGTAATGATCCACCGTATTCATCTGTTCTGTCATTCACAGTATCTTTCA
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CCATGGCGTTTCTTGCTGCGAGCCTAAAGTCGTTGACAATGCTGGGGATTTCTTCAGTAC
TTAGCCGTCTTGGAGGGGTGAACATGGCTTCATCGATGCCATTAGAGCGGATTTGAGGCA
TCAATGGCTTGTCTGAACAAGAGATGGGAGCTTGCCCATTTGGTTGAAAACCTCGGTTAG
AAACACGGCCAACATGCCAGATTTGACAGAAGAATACACCACCTTTGGCATGAACAGCAT
CCACAATAGGCTTCCATGCCTCCACATGCTCTTTAGTCCATATACCAGGAGTATCTTGGT
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TGAGGAGAGGGATGCTCTGTTTCGCTACTGCATTTTCCATTTCCGTGAGTCTCTTCGATT
CTTTTTCTCTCTTAAAACACTTTAAAGTTTTTGGTGAATTGTGTCC


BQ
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 
40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR77JQ U 1
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AF RR4G077JQ U 1
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AF RR4BH76TF C 406
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RD RR4DR77JQ 638 0 0
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QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4FH67JQ 622 0 0
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QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4FG72JQ 614 0 0
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TGGACTGGTCTATC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4G077JQ 612 0 0
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TCCTCATCGGCACTAGCAAGTGAGGACACTCTGTTATCTCTCCCATTGTTTTCATTCTTG
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TGAACTGGTCTA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4BH76JQ 797 0 0
CG
ACGCCAGATAAACTTATTATATGAAAGACGATTACACATTAACATGCTTAATGGCAATGT
CTAAGCTGTTGATTCAAGAAAAGGGTAATCCGTGTAACCAACAACAGGATCAAAAATGTA
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CTCTATCACATGACAGTAGAGGACACCATATTTGTTTAAAGATTCACCCATGTGAAGGGC
TAAAGCTTGTGGGTTAGTGTCTGCTGACTCCATGTAGTCAGCAAAGGGAGAGAGCCTGAT
GCCAACACGGTCTGGTCCTATCTCGGTAGCCACTGCTTCAACTATGTCTAAAGCAAATTT
GCAACGTTTTTGTAATGATCCACCGTATTCATCTGTTCTGTCATTCACAGTATCTTTCAT
GAACTGGTCTATCAGATAGCCGTTAGCACCATGAATATCAACTCCATCAAAGCCAGCTTC
CATGGCGTTTCTTGCTGCGAGCCTAAAGTCGTTGACAATGCTGGGGATTTCTTCAGTACT
TAGCCGTCTTGGAGGGGTGAACATGGCTTCATCGATGCCATTAGAGCGGATTTGAGGCAT
CAATGGCTTGTCTGA

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DS 

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TCACAGTATCTTTCATGAACTGGTCTATCAGATAGCCGTTAGCACCATGAATATCAACTC
CATCAAAGCCAGCTTCCATGGCGTTTCTTGCTGCGAGCCTAAAGTCGTTGACAATGCTGG
GGATTTCTTCAGTACTTAGCCGTCTTGGAGGGGTGAACATGGCTTCATCGATGCCATTAG
AGCGGATTTGAGGCATCAATGGCTTGTCTGAACAAGAGATGGGAGCTTGCCCATTTGGTT
GAAAACCTCGGTTAGAAACACGGCCAACATGCCAGATTTGACAGAAGAATACACCACCTT
TGGCATGAACAGCATCCACAATAGGCTTCCATGCCTCAACATGCTCTTTAGTCCATATAC
CAGGAGTATCTTGGTAGCCTTGAGCTGTGTCTGAAACTCCTGTAGCTTCAGTGACAAGAA
ACCCTCCTGGGCTTGTTCTCTGAGAGTAGTACAAGACAGCGTGAGGCTGAGGAACGTTTC
CGTATGATCTCTGTCTCGTCAGTGGTGCCAGCACAACCCTGTGGGAAAGATTGAATCTTC
CCATCTTGTAGGGAGTGAGGAGAGGGATGCTCTGTTTCGCTACTGCATTTTCCATTTCCG
TGAGTCTCTTCGATTCTTTTTCTCTCTTAAAACACTTTAAAGTTTTTGGT
C

QA 1 830 1 830
DS 

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ACCATGAATCTCAACTCCATCAAAGCCAGCTTCCATGGCGTTTCTTGCTGCGAGCCTAAA
GTCGTTGACAATGCTGGGGATTTCTTCAGTACTTAGCCGTCTTGGAGGGGTGAACATGGC
TTCATCGATGCCATTAGAGCGGATTTGAGGCATCAATGGCTTGTCTGAACAAGAGATGGG
AGCTTGCCCATTTGGTTGAAAACCTCGGTTAGAAACACGGCCAACATGCCAGATTTGACA
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CTCTTTAGTCCATATACCAGGAGTATCTTGGTAGCCTTGAGCTGTGTCTGAAACTCCTGT
AGCTTCAGTGACAAGAAACCCTCCTGGGCTTGTTCTCTGAGAGTAGTACAAGACAGCGTG
AGGCTGAGGAACGTCTCCGTATGATCTCTGTCTCGTCAGTGGTGCCAGCACAACCCTGTG
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TGCATTTTCCATTTCCGTGAGTCTCTTCGATTCTTTTTCTCTCTTAAAACACTTTAAAGT
TTTTGGTGAATTGTGTCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FG72TF 671 0 0
ATCTGTTCTGTCATTCACAGTATCTTTCATGGACTGGTCTATCAGATAGCCATTAGCATC
ATGAATCTCAACTCCATCAAAGCCAGCTTCCATGGCGTTTCTTGCTGCGAGCCTAAAGTC
GTTGACAATGCTGGGGATTTCTTCAGTACTTAGCCGTCTTGGAGGGGTGAACATGGCTTC
ATCGATGCCATTAGAGCGGATTTGAGGCATCAATGGCTTGGCTGAACAAGAGATGGGAGC
TTGCCCATTTGGTTGAAAACCTCGGTTAGAAACACGGCCAACATGCCAGATTTGACAGAA
GAATACACCACCTTTGGCAACAACAGCATCCACAATAGGCTTCCATGCCTCCACATGCTC
TTTAGTCCATATACCAGGAGTATCTTGGTAGCCTTGAGCTGTGTCTGAAACTCCTGTAGC
TTCAGTGACAAGAAACCCTCCTGGGCTTGTTCTCTGAGAGTAGTACAAGACAGCGTGAGG
CTGAGGAACGTTTCCGTATGATCTCTGTCTCGTCAGTGGTGCCAGCACAACCCTGTGGGA
AAGATTGAATCTTCCCATCTTGTAGGGAGTGAGGAGAGGGATGCTCTGTTTCGCTACTGC
ATTTTCCATTTCCGTGAGTCTCTTCGATTCTTTTTCCCTCTTAAAACACTTTAAAGTTTT
TGGT
GAATTCC

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL176Contig2 1113 2 4 U
AGGGTTGTGCTGGCACCAATGACGAGACAGAGATCATACGGAAACGTTCCTCAGCCTCAC
GCTGTCTTGTACTACTCTCAGAGAACGAGCCCAGGAGGGTTTCTTGTCACTGAAGCTACA
GGAGTTTCAGACACAGCTCAAGGTTATCAAGATACTCCTGGGATATGGACTAAAGAGCAT
GTGGAGGCATGGAAACCAATCGTGGAAGCTGTTCACGCCAAAGGTGGTGTCTTCTTCTGT
CAAATCTGGCATGCTGGCCGTGTTTCTAACCGAGGTTTTCAACCAAATGGGCAAGCTCCC
ATCTCTTGTACAGACAAGCCATTGATGCCTCAAATCCGCTCTAATGGCATCGACGAAGCC
ATGTTCACCCCTCCAAGACGGCTAAGTACTGAAGAAATACCCAGCATTGTCAACGACTTT
AGGCTAGCAGCAAGAAACGCCATGGAGGCTGGCTTTGATGGAGTAGAGATTCATGGTGCT
CACGGCTATCTGATCGATCAGTTCATGAAGGACCGGTGAATGACAGAACAGATGAATACG
GTGGATCATTACAAAAACGTTGCAAATTCGCTTTAGAAATAGTTGAAGCAGTGGCTAACG
AGATAGGACCAGACCGTGTTGGCATCACGCTCTCTCCCTTTGCTGACTACTTGGAGTCTG
CAGACACAAACCCACAAGGGTCGGCCCTTCACATGGCGGAATCTTTAAACAAATCCGGAA
TCCTTTACTGTCATGTGGTTGAAGCAAGAATGAAAACAGTGGGAGAAGTAGGAGAGTGTC
CTCCTCACATGCTAGTGCCTATGAGGAAAGCCTTTCATGGCACTTTCATTTCAGCGGGTG
GTTTCACGAGGAAAGATGGGAATGAGGCAGTAGCAGAGGGACATACCGATCTTGTGGCTT
ATGGTCGGTGGTTTCTTGCAAACCCGGATTTGCCTAAGAGGTTTGAAGTGGATGCAGCGT
TGAATAAATATGATAGGCCAACGTTTTACACTTTTGATCCTGTCGTGGGCTACACGGATT
ACCCTTTTTTTGGGCCAACTGATTAATGTGTGTTCCTCTTTCTTTGTAATAAGATATTTC
TGGCATTTAAGATAATGTTGCAAATGTAACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA62TF U 1
AF RR4HA62JQB C 494
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BS 608 658 RR4HA62TF
BS 659 1113 RR4HA62JQB

RD RR4HA62TF 660 0 0
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GTGGATCATTACAAAAACGTTGCAAATTCGCTTTAGAAATAGTTGAAGCAGTGGCTAACG
AGATAG*ACCAGACCGTGTTGGCATCACGCTCTCTCCCTTTGCTGACTACTTGGAGTC
TG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4HA62JQB 620 0 0
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AGTGCCTATGAGGAAAGCCTTTCATGGCACTTTCATTTCAGCGGGTGGTTTCACGAGGAA
AGATGGGAATGAGGCAGTAGCAGAGGGACATACCGATCTTGTGGCTTATGGTCGGTGGTT
TCTTGCAAACCCGGATTTGCCTAAGAGGTTTGAAGTGGATGCAGCGTTGAATAAATATGA
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GCCAACTGATTAATGTGTGTTCCTCTTTCTTTGTAATAAGATATTTCTGGCATTTAAGAT
AATGTTGCAAATGTAACATC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 13

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AGGATTCATGTAAAAAAAACATCATCTATCTGTAGTAATCCTCCGAGGCGAATCGATCAT
ATCCATGGCTTTACCTTCTCTTTTGGTAGAAGATCGTCAAGTTCCGCTTGATGCTACCTC
CGATCTACCTGCTTTGTTCGACGGAACCACGAGGTTGTACATAAGCTACACCTGCCCATT
TGCACAACGTGTTTGGATTACCAGAAACCTCAAGGGTCTGCAAGAGAAGATCAAATTGGT
TCCTATAGACCTTCCTAATAGACCAGCGTGGTTCAAGGAGAAAGTGAACCCTGCAAACAA
GGTGCCTGCTCTTGAACACAATGGCAAAATCATGGGGGAGAGTCTAGATTTAATCAAATA
TGTGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTT
TGGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTT
CAAAGGTGATCCGGCTAAAGATACGGCATCTGTCTTCGATCACTTGGAAAATGCTTTACA
AAAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCATATA
TTCCATTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTGCTG
CTGGACGTCCAAAACTAGCTGCTTGGATTGAGGAAATGGATAAGATGGTTGCATATACGC
AGACCAAAACCGACTCGGAATATGTCATTAATTATTTCAAGAAGTTCATGTAAAATTGTA
TACCGAGTCATCGCGCGGCCATGTTGGCTTATGAAGAAGATCGTGTGTGAACGTTACTAT
GTACGTGTGTGTGCTACAAGTGTCTGGATTTCAACCATTTCGCATCGTTCTTAATAAATG
TTATGTGGAGCATATCATTCAAAAAAATGTTATGTGGAACTTTTGTATACAATGTGTGTA
TCAGTGTATGCAAGTCTCAATGTATAGACATTTTATTTTTAAAAATCCGAATTGGTTCCA
GC


BQ
10 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
30 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 

AF RR4EQ58TF U 2
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AF RR4B347TF U 2
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AF RR4EO38TF U 3
AF RR4C961JQ C 259
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AF RR4F061JQ C 340
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BS 205 673 RR4F061TF
BS 674 746 RR4B347TF
BS 747 759 RR4C961TF
BS 760 760 RR4GU23TF
BS 761 774 RR4C961TF
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BS 778 830 RR4C961TF
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BS 832 834 RR4EO38TF
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BS 1020 1022 RR4F061JQ

RD RR4EQ58TF 591 0 0
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GTGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTTT
GGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTC
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DS 

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CGATCTACCTGCTTTGTTCGACGGAACCACGAGGTTGTACATAAGCTACACCTGCCCATT
TGCACAACGTGTTTGGATTACCA*AAACCTCAAGGGTCTGCAAGAGAAGATCAAATTGGT
TCCTATAGACCTTCCTAATAGACCAGCGTGGTTCAAGGAGAAAGTGAACCCTGCAAACAA
GGTGCCTGCTCTTGAACACAATGGCAAAATCATGGGGGAGAGTCTAGATTTAATCAAATA
TGTGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTT
TGGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTT
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AAAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCATATA
TTCCATTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTGCTG
CTGGACGTCCAAA

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DS 

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GTGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTTT
GGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACCACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTC
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GACCAAAACCGACTCGGAATATGTC

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DS 

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GCACAACGTGTTTGGATTACCAGAAACCTCAAGGGTCTGCAAGAGAAGATCAAATTGGTT
CCTATAGACCTTCCTAATAGACCAGCGTGGTTCAAGGAGAAAGTGAACCCTGCAAACAAG
GTGCCTGCTCTTGAACACAATGGCAAAATCATGGGGGAGAGTCTAGATTTAATCAAATAT
GTGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTTT
GGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTC
AAAGGTGATCCGGCTAAAGATACGGCATCTGTCTTCGATCACTTGGAAAATGCTTTACAA
AAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGGGTTGATGTCGCATATAT
TCCGTTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTGCTGC
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GACCAAA*CCGACTCGGA
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DS 

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GGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACCACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTC
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AAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCATATAT
CCCATTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTACTGC
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DS 

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TCCATGGCTTTACCTTCTCTTTTGGTAGAGGATCGTCAAGTTCCGCTTGATGCTACCTCC
GATCTACCTGCTTTGTTCGACGGAACCACGAGGTTGTACATAAGCTACACCTGCCCATTT
GCACAACGTGTTTGGATTACCAGAAACCTCAAGGGTCTGCAAGAGAAGATCAAATTGGTT
CCTATAGACCTTCCTAATAGACCAGCGTGGTTCAAGGAGAAAGTGAACCCTGCAAACAAG
GTGCCTGCTCTTGAATACAATGGCAAAATCATGGGGGAGAGTCTAGATTTAATCAAATAT
GTGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTTT
GGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTC
AAAGGTGATCCGGCTAAAGATACGGCATCTGTCTTCGATCACTTGGAAAATGCTTTACAA
AAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCATATAT
TCCATTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTGCTGC
TGGACGTCCAAAACTAGCTGCTTGGATTGAGGAA*TGGATAAGATGGTTGCATATACGCA
GACCAAAACCGACTCGGAATATGTCATTAATTATTTCA*GAAGTTCATGTAAA*T*GTAT
ACCGAGTCATCGCGCGGCCATGTTGGCTTATGAAGAAGATCGTGTGTGA
CGT

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DS 

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CCATGGCTTTACCTTCTCTTTTGGTAGAAGATCGTCAAGTTCCGCTTGATGCTACCTCCG
ATCTACCTGCTTTGTTCGACGGAACCACGAGGTTGTACATAAGCTACACCTGCCCATTTG
CACAACGTGTTTGGATTACCAGAAACCTCAAGGGTCTGCAAGAGAAGATCAAATTGGTTC
CTATAGACCTTCCTAATAGACCAGCGTGGTTCAAGGAGAAAGTGAACCCTGCAAACAAGG
TGCCTGCTCTTGAACACAATGGCAAAATCATGGGGGAGAGTCTAGATTTAATCAAATATG
TGGATAGCAATTTCGAGGGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTTTG
GTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTCA
AAGGTGATCCGGCTAAAGATACGGCATCTGTCTTCGATCACTTGGAAAATGCTTTACAAA
AGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCGTATATT
CCATTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTGCTGCT
GGACGTCCAAAACTAGCTGCTTGGATTGAGGAAATGGATAAGATGGTTGCATATACGCAG
ACCAAAACCGACTCGGAATATGTCATTAAT*ATTTCA*GAAGT*CATGTAAA*TTGTATA
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ACGTGTGTGTGCTA

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DS 

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ATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTCAAAGGTGATCCGGCTAA
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CCATGTTGGCTTATGAAGAAGATCGTGTGTGAACGTTACTATGTACGTGTGTGTGCTACA
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TCAAAAAAATGTTATGTGGAACTTTTGTATACAATGTGTGTATCAGTGTATGCAAGTCTC
AATGTATAGACATTTTATTTTTAAAAATCCGAATTGGTTCC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EQ58JQ 596 0 0
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TTGTGTTTGACTCTTTCAAAGGTGATCCGGCTAAAGATACGGCATCTGTCTTCGATCACT
TGGAAAATGCTTTACAAAAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG
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AAGTACGATATTGCTGCTGGACGTCCAAAACTAGCTGCTTGGATTGAGGAAATGGATAAG
ATGGTTGCATATACGCAGACCAAAACCGACTCGGAATATGTCATTAATTATTTCAAGAAG
TTCATGTAAAATTGTATACCGAGTCATCGCGCGGCCATGTTGGCTTATGAAGAAGATCGT
GTGTGAACGTTACTATGTACGTGTGTGTGCTACAAGTGTCTGGATTTCAACCATTTCGCA
TCGTTCTTAATAAATGTTATGTGGAGCATATCATTCAAAAAAATGTTATGTGGAACTTTT
GTATACAATGTGTGTATCAGTGTATGCAAGTCTCAATGTATAGACATTTTATTTT
C

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4EO38JQ 672 0 0
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AAAAGAGAGACTTTGGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTG
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AAAATGCTTTACAAAAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TT
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TACGATATTGCTGCTGGACGTCCAAAACTAGCTGCTTGGATTGAGGAAATGGATAAGATG
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ATGTAAAATTGTATACCGAGTCATCGCGCGGCCATGTTGGCTTATGAAGAAGATCGTGTG
TGAACGTTACTATGTACGTGTGTGTGCTACAAGTGTCTGGATTTCAACCATTTCGCATCG
TTCTTAATAAATGTTATGTGGAGCATATCATTCAAAAAAATGTTATGTGGAACTTTTGTA
TACAATGTGTGTATCAGTGTATGCAAGTCTCAATGTATAGACATTTTATTTTTAAAAATC
CGAATTGGTTCC

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DS 

RD RR4FM80JQ 742 0 0
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ATATGTTGATACAACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTCAAAGGTGATCCGGCTAA
AGATACGGCATCTGTCTTCGATCACTTGGAAAATGCTTTACAAAAGTTTGAGGATGGTCC
ATTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCATATATTCCGTTCGTCCAACGAT
TTCAAGTCTTCCTCGGCGAAGTTTTCAAGTACGATATTGCTGCTGGACGTCCAAAACTAG
CTGCTTGGATTGAGGAAATGGATAAGATGGTTGCATATACGCAGACCAAAACCGACTCGG
AATATGTCATTAATTATTTCAAGAAGTTCATGTAAAATTGTATACCGAGTCATCGCGCGG
CCATGTTGGCTTATGAAGAAGATCGTGTGTGAACGTTACTATGTACGTGTGTGCGCTACA
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TCAAAAAAATGTTATGTGGAACTTTTGTATACAATGTGTGTATCAGTGTATGCAAGTCTC
AATGTATAGACATTTTATTTTT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4B347JQ 760 0 0
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AATGGCAAAATCATGGGGGAGAGTCTAGATTTAATCAAATATGTGGATAGCAATTTCGAG
GGACATTCACTTTACCCCCTGGATCCTGAAAAGAGAGACTTTGGTGAAGACATGTTGAAA
TATGTTGATACCACATTCATTAAAGTTGTGTTTGACTCTTTCAAAGGTGATCCGGCTAAA
GATACGGCATCTGTCTTCGATCACTTGGAAAATGCTTTACAAAAGTTTGAGGATGGTCAA
TTCTTCCTCGGCGACCTTAGCTTGG*TTGATGTCGCATATATCCCATTCGTCCAACGATT
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CAAAAAA*TGTTATGTGGAACTTTTGTATACAATGTGTGTATCAGTGTATGTAAGTCTCA
ATGTATAGACATTTTATTTTTCAAAATCCGAATTGGTTCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4F061JQ 683 0 0
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GGATCCTGAAAAGAGAGACTTTGGTGAAGACATGTTGAAATATGTTGATACAACATTCAT
TAAAGTTGTGTTTGACTCTTTCAAAGGTGATCCGGCTAAAGATACGGCATCTGTCTTCGA
TCACTTGGAAAATGCTTTACAAAAGTTTGAGGATGGTCCATTCTTCCTCGGCGACCTTAG
CTTGG*TTGATGTCGCATATATTCCATTCGTCCAACGATTTCAAGTCTTCCTCGGCGAAG
TTTTCAAGTACGATATTGCTGCTGGACGTCCAAAACTAGCTGCTTGGATTGAGGAAATGG
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AGAAGTTCATGTAAAATTGTATACCGAGTCATCGCGCGGCCATGTTGGCTTATGAAGAAG
ATCGTGTGTGAACGTTACTATGTACGTGTGTGTGCTACAAGTGTCTGGATTTCAACCATT
TCGCATCGTTCTTAATAAATGTTATGTGGAGCATATCATTCAAAAAAATGTTATGTGGAA
CTTTTGTATACAATGTGTGTATCAGTGTATGCAAGTCTCAATGTATAGACATTTTATTTT
TAAAAATCCGAATTGGTTCCAGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 2 12

CO CL178Contig1 900 10 25 U
GGCAGACCTATACTATGTAAATTTCTTGCAAGATCTAAAAAGTTAACAATGTGAGTTGAA
GTTGAGCCAAAAGAAAAAAGAGGATTAAAAAAAGTGAAATAGGTAAAAGGACTAGCAAAT
TGTGTCTCCAAAAACTTCTGCA*AAAGTAAATAAAAATCTCGAACAAAAAGACAAGGGAT
AAGCCGAGTTTTGCAACACCGGTGAGATTTTGGTCTGAAAAACAAACTAAACATTCAAAA
GATGAAGGAGACAT**TTGTCTATTCCTCTTCAACGATCTTGCTCTTCTCGCTAACATAG
ATACCGTCAAGGAACTTCCTGATGTCCTTCTTCTTCACATGACATTTCTGGTTGATAAGA
GCGCATGACCTTGAGACAAGCTCAATGTCATTTCCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACT
TTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCATCCAACATATCTACCTTCCTCACCTTCTTCTCC
CCAAGGAAGTTACGGATCTCAATGGACTTGCTGTCACCGCCGATGGAAGCGTTGATGGGA
AAATGAGCATACACAAACCTCATCTTGTACCTGAACCCTCTGGTGACACCGGTGATGAGG
TTATCGACGTGGCTAAGAGCGGTTCTGATGGATGCACTTGATTTGCGAGATCCGAACCAC
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TTGAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGAGGTCCTTCGACTTCGATCACCTTA
GCGTTAACTTTGATGGTAATGCTTTCGGGGATATCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTC
TTCATCTTCTCCTCACGTTCTTGCTCAACTCTCTCGCTCTGTTTTAGGCTCAGGGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 30 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 
25 55 40 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

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DS 

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C
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GAACAAAAAGACAAGGGATAAGCCGAGTTTTGCAACACCGGTGAGATTTTGGTCTGAAAA
ACAAACTAAACATTCAAAAGATGAAGGAGACAT**TTGTCTATTCCTCTTCAACGATCTT
GCTCTTCTCGCTAACATAGATACCGTCAAGGAACTTCCTGATGTCCTTCTTCTTCACATG
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AACAATCTCATCCTTAGCTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCATCCAACATATCTAC
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GATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCATACACAAACCTCATCTTGTACCTGAACCCTCT
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TTTGCGAGATCCGA*CCACGAGTCGATCT
CAG

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DS 

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GG
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ATCACCTTAGCGTTAACTTTGATGGTAATGCT

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GAA
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TCCCGGTTTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTGAGACGCTTGAAGTCGCGAA
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T**TTGTCTATTCCTCTTCAACGATCTTGCTCTTCTCGCTAACATAGATACCGTCAAGGA
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AGACAAGCTCAATGTCATTTCCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAA
CAATGGTTACACCATCCAACATATCTACCTTCCTCACCTTCTTCTCCCCAAGGAAGTTAC
GGATCTCAATGGACTTGCTGTAACCGCCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCATACA
CAAACCTCATCTTGTACCTGAACCCTCTGGTGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTAGC
TAAGAGCGGTTCTGATGGATGCACTTGATTTGCGAGATCCGAACCACGAGTCGATCTTCA
GCTTCTTCTTCCCGGTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTGAGATGCTTGA
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AC

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CC

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CCTTCTTCTTCACATGACATTTCTGGTTGATAAGAGCGCATGACCTTGAGACAAGCTCAA
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CATCCAACATATCTACCTTCCTCACCTTCTTCTCCCCAAGGAAGTTACGGATCTCAATGG
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CGGTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTGAGATGCTTGAAGTCGCGAACAA
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CGGGGATATCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCTTCTCCTCACGTTCTTGCT
CAACTCTCTCGCTCTGTTTTAAGCTCAGGG
AC

QA 1 750 1 750
DS 

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TCTTCCCGGTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTGAGATGCTTGAAGTCGC
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CTTGCTCAACTCTCTCGCTCTGTTTTAGGCTCAGGGAGCCC

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DS 



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AGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTA
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GTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTA
TCAACCAGAAATGTCATGTGAAGAAGAAGGACATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATG
TTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATGTCTCCTTCATCTTTTGAA
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GTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACT

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GAGACGATGGATATCCCCGAAAGCATTACCACCTCGATAATCTCACCACCGGTGTCACCA
GAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCG
GCGGTGACAGCAAGTCCATTGAGATCCGTGACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGG
TAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTC
TTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTC
ATGTGAAGAAGAAGGACATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATGTTAGCGAGAAGAGCA
AGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATGTCTCCTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTT
TCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAG
ATTTTTATTTACT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 13

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AGATGTCGTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTCTAGATCAGGTCAACATCATCGA
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AGACCGTACGGTGGCCATAGAGCCGGCGCTATCGGAGTTCATCATGAAAGCTCAGATACG
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TTTAATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACAATAACAACAACATAAACAGG
TCCAAGAACATTATTTTAACTGATAAAAGAAGATAGACCTTGAACCACATCATCATCCAT
CAGACAACAGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTT*CAGGGGTTGACCTTATGTTCCCA
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TCCGAGAGCGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCTGAC
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GCAGACTTCGAGAGCCATCTTCTTTTTAATTTTATTTGGAGCGATGGCC


BQ
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40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4C340TF U 13
AF RR4FZ37TF U 5
AF RR4AL74TF U 1
AF RR4C340JQ C 287
AF RR4FZ37JQ C 403
AF RR4BC59JQ U 1068
AF RR4CP70JQ U 1088
AF RR4BO21JQ U 1084
AF RR4BO21TF C 1084
AF RR4CL20JQ U 1084
AF RR4BN28TF C 1267
AF RR4BC59TF C 1082
AF RR4CL20TF C 1267
BS 1 333 RR4AL74TF
BS 334 334 RR4FZ37TF
BS 335 542 RR4AL74TF
BS 543 543 RR4FZ37TF
BS 544 740 RR4AL74TF
BS 741 741 RR4FZ37TF
BS 742 807 RR4AL74TF
BS 808 808 RR4C340JQ
BS 809 833 RR4AL74TF
BS 834 1068 RR4C340JQ
BS 1069 1236 RR4BC59JQ
BS 1237 1237 RR4CP70JQ
BS 1238 1332 RR4BC59JQ
BS 1333 1333 RR4CP70JQ
BS 1334 1349 RR4BC59JQ
BS 1350 1350 RR4CP70JQ
BS 1351 1408 RR4BC59JQ
BS 1409 1409 RR4CP70JQ
BS 1410 1424 RR4BC59JQ
BS 1425 1425 RR4CP70JQ
BS 1426 1572 RR4BC59JQ
BS 1573 1648 RR4CP70JQ
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BS 1650 1654 RR4CP70JQ
BS 1655 1749 RR4BO21JQ
BS 1750 1780 RR4CL20JQ
BS 1781 1909 RR4BC59TF

RD RR4C340TF 182 0 0
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AGAGATGACGAGCAAGACTCTGGTGATCGGGGCGACGGGTTACATAGGAAAAGTCTTCGT
GGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACGCCACTTTCGCTCTGGTCAGAGA*TCCTCTCT**C
TC

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR4FZ37TF 772 0 0
GG
AACTCAAGAAGTCTCCGAAACTCAATATTCAACATCAACGGAGAAGAAAGAAGTAGGAAG
AGAGAAAGAGATGACGAGCAAGACTCTGGCGATCGGGGCGACGTGTTACATAGGAAAAGT
CTTCGTGGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACGCCACTTTCGCTCTGGTCAGAGAATCCTC
TCTCTCCGATCCCGTTAAGGCGAAACTCGTCCAGAGTTTCAAAGACCTTGGCGTCACCAT
ACTCTACGGAAGCTTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAGCGATCAAACAAGTAGATGT
CGTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTCTAGATCAGGTCAACATCATCGACGCCAT
CAAACAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTGCCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCG
TACGGTGGCCATAGAGCCGGCGCTATCGGAGTTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGC
CATAGAGGCCGCGGGGACACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGCTCTTT
CGTTCCTAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTCCTCCTACCGACAAAGTTTC
CATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACAGAAGAGGACATTGTTGCGTA
TACAATGAAAGCTGTGGATGACCCGAGAGCACTTAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACC
CAAGA*CATTGTCTCGCAGA*CGATATGGTCAGTTTGTGGGAGATGA
GAT

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR4AL74TF 834 0 0
GGATTCAACTCAAGAAGTCTCCGAAACTCAATATTCAACATCAACGGAGAAGAAAGAAGT
AGGAAGAGAGAAAGAGATGACGAGCAAGACTCTGGTGATCGGGGCGACGGGTTACATAGG
AAAAGTCTTCGTGGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACGCCACTTTCGCTCTGGTCAGAGA
ATCCTCTCT**CCGATCCCGTTAAGGCGAAACTCGTCCAGAGTTTCAAAGACCTTGGCGT
CACCATACTCTACGGAAGCTTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAGCGATCAAACAAGT
AGATGTCGTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCATATTCTAGATCAGGTCAACATCATCGA
CGCCATCAAACAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTGCCTTCGGAATTTGGAAATGACGT
AGACCGTACGGTGGCCATAGAGCCGGCGCTATCGGAGTTCATCATGAAAGCTCAGATACG
TCGTGCCATAGAGGCCGCGGGGACACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGG
CTTTTTCGTTCCTAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTCCTCCTACCGACAA
AGTTTCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACAGAAGAGGACATTGT
TGCGTATACAATGAAAGCTGTGGATGACCCGAGAACACTTAACAAGATTCTCTACGTCCA
TCCACCCAAGAACATTGTCTAGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGATGAAGATCGG
CAAGACTCTGGAGAAGATTTATGTTTC*GAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCC
C

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4C340JQ 835 0 0
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GTCAACATCATCGACGCCATCAAACAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTGCCTTCGGAA
TTTGGAAATGACGTAGACCGTACGGTGGCCATAGAGCCGGCGCTATCGGAGTTCATCATG
AAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGAGGCCGCGGGGACACCTTATACGTATGTTGTCACA
GGTGGCTTTGCTGGCTTTTTCGTTCCTAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGACTCAGAACT
CCTCCTACCGACAAAGTTTCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACA
GAAGAGGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCTGTGGATGACCCGAGAACACTTAACAAG
ATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGG
GAGATGAAGATCGGCAAGACTCTGGAGAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAA
AGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTA
GTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCACTATAGACCCTTCTGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAG
CTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTGTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGAC
ACAAACAAACCTCCTTCTATGTTGCATTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCGATTTT
TTAGACGCTAATCTTTTAATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACA
G

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4FZ37JQ 760 0 0
GGAATTTGGAAATGACGTAGACCGTACGGTGGCCATAGAGCCGGCGCTATCGGAGTTCAT
CATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGAGGCCGCGGGGACACCTTATACGTATGTTGT
CACAGGTTGCTTTGCTGGCTCTTTCGTTCCTAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGACTCAG
AACTCCTCCTACCGACAAAGTTTCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAA
CACAGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCTGTGGATGACCCGAGAGCACTTAA
CAAGATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTT
GTGGGAGATGAAGATCGGCAAGACTCTGGAGAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCT
CAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGT
ACTAGTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCACTATAGACCCTTCTGTTGGAGTGGAGGCTTC
CGAGCTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTGTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTG
AGACACAAACAAACCTCCTTCTATGTTGCATTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCGA
TTTTTTAGACGCTAATCTTTTAATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACAAT
AACAACAACATAAACAGGTCCAAGAACATTATTTTAACTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4BC59JQ 505 0 0
C
AGACGCTAATCTTTTAATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACAATAACAAC
AACATAAACAGGTCCAAGAACATTATTTTAACTGATAAAAGAAGATAGACCTTGAACCAC
ATCATCATCCATCAGACAACAGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTTTCAGGGGTTGAC
CTTATGTTCCCATCCTGCGATCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTC
GAGAGAGAACAAAGCTTTCATGTACCCATGAACATGAGGCAGGCTCTCGGGGACAGACCA
GCTTTTGTAGTGTCCGAGAGCGACCTTGAGATGGTAAAGCCTTGGTGCTAAGCTAAAATC
CACCGCGCTGACTTTCCCACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGTCTTGAGATGATTCTC
GAGAGCTTCAAGCTCATCGAGCAAGGCCTTCTCGGATCCGTCGCTGGAGTCTTTGCTCTT
CAAGAAAGTGACGAAAGCGCCGAA

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DS 

RD RR4CP70JQ 568 0 0
G
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CATTATTTTAACTGATAAAAGAAGATAGACCTTGAACCACATCATCAT**ATCAGACAAC
AGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTT*CAGGGGTTGACCTTATGTTCCCATCCTGCGA
TCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTCGAGAGAGAACAAAGCTTTCA
TGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGGGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGTCCGAGAG
CGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCTGACTTTCCCAC
CCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGTCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTCATCGA
GCAAGGCCTTCTCGGATCCGTCGCTGGAGTCTTTGCTCTTCAAGAAAGTGACGAAAGCGC
CGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTCAGGGT
ACTTCTCCTCGAGAATGCCGATGATG
C

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR4BO21JQ 667 0 0
G
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CAACAGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTT*CAGGGGTTGACCTTAT***CCCATCCT
GCGATCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTCGAGAGAGAACAAAGCT
TTCATGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGAGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGCCCG
AGAGCGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCCGACTTTC
CCACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGCCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTCA
TCGAGCAAGGCCTTCTCGGATCCGTCGCTGGAGTCTTTGCTCTTCAAGAAAGTGACGAAA
GCGCCGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTCA
GGGTACTTCTCCTCGAGAATGCCGGTGATGACGTCGGAATCAGGCACCCACTTGTCGTCG
TTCTTGAGCACTGGTACTTTCCCTTCAGGACTGATGGCTAAGAACCATTGAGGTTTGTCG
GAGAC
C

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR4BO21TF 667 0 0
G
ATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACAATAACAACAACATAAGCAGGTCCA
AGAACATTATTTTAACTGATAAAAGAAGATAGACCTTGAACCACATCATCATCCATCAGA
CAACAGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTT*CAGGGGTTGACCTTAT***CCCATCCT
GCGATCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTCGAGAGAGAACAAAGCT
TTCATGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGAGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGCCCG
AGAGCGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCCGACTTTC
CCACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGCCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTCA
TCGAGCAAGGCCTTCTCGGATCCGTCGCTGGAGTCTTTGCTCTTCAAGAAAGTGACGAAA
GCGCCGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTCA
GGGTACTTCTCCTCGAGAATGCCGGTGATGACGTCGGAATCAGGCACCCACTTGTCGTCG
TTCTTGAGCACTGGTACTTTCCCTTCAGGACTGATGGCTAAGAACCATTGAGGTTTGTCG
GAGAC
C

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR4CL20JQ 697 0 0
AATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACAATAACAACAACATAAACAGGTCC
AAGAACATTATTTTAACTGATAAAAGAAGATAGACCTTGAACCACATCATCATCCATCAG
ACAACAGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTT*CAGGGGTTGACCTTATGTTCCCATCC
TGCGATCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTCGAGAGAGAACAAAGC
TTTCATGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGGGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGTCC
GAAAGCGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAAATCCACCGCGCTGACTTT
CCCACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGTCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTC
ATCGAGCAAGGCCTTCTCGGATCC**CGCTGGAGTCTTTGCTCTTCAAGAAAGTGACGAA
AGCGCCGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTC
AGGGTACTTCTCCTCGAGAATGCCGGTGATGACGTCGGAATCAGGCACCCACTTGTCGTC
GTTCTTGAGCACTGGTACTCTCCCTTCAGGACTGATGGCTAAGAACCATTGAGGTTTGTC
GGAGACGTTAATGAGATGCATTTTGTAGGGCAGATTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4BN28TF 574 0 0
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CATGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGGGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGTCCGAG
AGCGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCTGACTTTCCC
ACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGTCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTCATC
GAGCAAGGCCTTCTCGGATCCGTCGCTGGAGTCTTTGCCCTTCAAGAAAGTGACGAAAGC
GCCGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTCAGG
GTACTTCTCCTCGAGAATGCCGGTGATGACGTCGGAATCAGGCACCCACTTGTCGTCGTT
CTTGAGCACTGGTACTTTCCCTTCAGGACTGATGGCTAAGAACCATTGAGGTTTGTCGGA
GACGTTAATGAGATGCATTTTGTAGGGCAGATTCTTCTCCTCGAGGGTGAGAAGAACCCG
TTGGCTGAAAGGGCAGCCGCCGAGAACATCAGGG

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4BC59TF 828 0 0
TT
AATTCGAAACGAGGCTTATTATTTGATTTGATACACAATAACAACAACATAAACAGGTCC
AAGAACATTATTTTAACTGATAAAAGAAGATAGACCTTGAACCACATCATCATCCATCAG
ACAACAGATGGAACAACTAGTAGTAGTTTTTTTTCAGGGGTTGACCTTATGTTCCCATCC
TGCGATCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTCGAGAGAGAACAAAGC
TTTCATGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGGGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGTCC
GAGAGCGACCTTGAGATGGTAAAGCCTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCTGACTTT
CCCACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGTCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTC
ATCGAGCAAGGCCTTCTCGGATCCGTCGCTGGAGTCTTTGCTCTTCAAGAAAGTGACGAA
AGCGCCGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTC
AGGGTACTTCTCCTCGAGAATGCCGGTGATGACGTCGGAATCAGGCACCCACTTGTCGTC
GTTCTTGAGCACTGGTACTTTCCCTTCAGGACTGATGGCTAAGAACCATTGAGGTTTGTC
GGAGACGTTAATGAGATGCATTTTGTAGGGCAGATTCTTCTCCTCGAGGGTGAGAAGAAC
CCGTTGGCTGAAAGGGCAGTCGCCGAGAACATCAGGGGCACCAACGGCGGCTTTCACGCA
GACTTCGAGAGCCATCTTCTTTTTAATTTTATTTGGAGCGATGGCC

QA 3 828 3 828
DS 

RD RR4CL20TF 641 0 0
GATCACATACTTCTCCTCGGTCTTTGTTTTCTCAAAAGAGTCGAGAGAGAACAAAGCTTT
CATGTAGCCATGAACATGAGGCAAGCTCTCGGGGACAGACCAGCTTTTGTAGTGTCCGAG
AGCGACCTTGAGATGGTAAAGCTTTGGTGCTAAGCTAAGATCCACCGCGCTGACTTTCCC
ACCCGCGATGAAAGGACCGTCATGAGTCTTGAGATGATTCTCGAGAGCTTCAAGCTCATC
GAGCAAGGCCTTCTCGGATCC**CGCTGGAGTCTTTGCTCTTCAAGAAAGTGACGAAAGC
GCCGAAGATTTTGGATCCGACAGAGGCGAACTCGGGAGGGGTTTTGAGAGATGGCTCAGG
GTACTTCTCCTCGAGAATGCCGGTGATGACGTCGGAATCAGGCACCCACTTGTCGTCGTT
CTTGAGCACTGGTACTCTCCCTTCAGGACTGATGGCTAAGAACCATTGAGGTTTGTCGGA
GACGTTAATGAGATGCATTTTGTAGGGCAGATTCTTCTCCTCGAGGGTGAGAAGAACCCG
TTGGCTGAAAGGGCAGTCGCCGAGAACATCAGGGGCACCAACGGCGGCTTTCACGCAGAC
TTCGAGAGCCATCTTCTTTTTAATTTTATTTGGAGCGAT
CC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 2 11

CO CL180Contig1 924 7 5 U
CCTAATAAAAGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACT
CCACAAACATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCA
CCAGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACA
AGCTTTTCATTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGC
TTTCCCATGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACC
GGTCATTCCAAATGGTTGTGATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCAC
TGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCACAGTAGACACCAACAGACGTAATGTA
CTCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATC
GCCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCAACCGCCACGAAAGATACACCATCATT
GTTCTGTCCGACTTGTATTTTCTTAACTCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCC
TTCATCACCACCTACTGCTGTCAGCTTCTTGCTTGGTTTCAACGGAGTTGAGGCGATGGG
AGCGAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGATGAGTGTCTGCGAACCCATGAAAGCCGACAAT
CTTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATATCTGTACCTTCTTCTCCGGGAAGTTTTTCAAA
CCCATAATATTCTGAAGTCCTTGTGTTGGTTATGAACTCAATTCCGACAATCTTGTTGGA
TGAATTGGACCAACCTTTCACGGACACGAGATACTCGTCGGGATGATTTATCTCAAAAGT
TTTGATGGAAGATCTAGCTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 45 45 45 45 45 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H123TF C 8
AF RR4GO67JQ U 10
AF RR4AC34JQ U 1
AF RR4GP78JQ U 182
AF RR4D555JQ U 7
AF RR4AC34TF C 29
AF RR4ED79TF C 283
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BS 10 10 RR4D555JQ
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RD RR4H123TF 282 0 0
AAC
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CACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAGGCC
TCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTTCAT
TTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCATGG
AACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAAC
C

QA 4 281 4 281
DS 

RD RR4GO67JQ 624 0 0
C
GCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAACAT
CACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAGGCC
TCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTTCAT
TTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCATGG
AACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCATTCCA
AATGGTTGTGATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACACCG
CGTCCCTCTGCATGGATTTTATCACAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCACCATCC
GTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCAACAACT
TTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCAACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTGTCCG
ACTTGTATTTTCTTAACTCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCACCA
CCTACTGCTGTCAGCTTCTTGCT

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR4AC34JQ 776 0 0
CCTAATAAACGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACT
CCACAAACATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCA
CCAGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACA
AGCTTTTCATTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGC
TTTCCCATGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACC
GGTCATTCCAAATGGTTGTGATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCAC
TGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCACAGTAGACACCAACAGACGTAATGTA
CTCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATC
GCCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCAACCGCCACGAAAGATACACCATCATT
GTTCTGTCCGACTTGTATTTTCTTAACTCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCC
TTCATCACCACCTACTGCTGTCAGCTTCTTGCTTGGTTTCAACGGAGTTGAGGCGATGGG
AGCGAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGATGAGTGTCTGCGAACCCATGAAAGCCGACAAT
CTTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATATCTGTACCTTCTTCTCCGGGAAGTTTTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4GP78JQ 576 0 0
GCTTTTCATTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCT
TTCCCATGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCG
GTCATTCCAAATGGTTGTGATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACT
GTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCACAGTAGACACCAACAGACGTAATGTAC
TCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCG
CCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCAACCGCCACGAAAGATACACCATCATTG
TTCTGTCCGACTTGTATTTTCTTAACTCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCT
TCATCACCACCTACTGCTGTCAGCTTCTTGCTTGGTTTCAACGGAGTTGAGGTGATGGGA
GCGAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGATGAGTGTCTGCGAACCCATGAAAGCCGACAATC
TTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATATCTGTACCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4D555JQ 727 0 0
G
AAAGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCTACAAA
CATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGACCTCAATCCACCAGTAG
GCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTT
CATTTGGTGACCGGTGCAACGTAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTTCCA
TGGAATCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTGTTCTCCACCGGTCATT
CCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACA
CCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCACCA
TTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTCCCATGACCATCGCCAACA
ACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTGT
CCAACTTGTATTTTCTTAACACCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCA
CCACCTACTGCTGTCAGCTTCTTGCTTGGTTTCAATGGAGTTGAGGCGATGGGAGCGAAG
TAAGCTCCGAGAGAGTTGAGATGAGTGTCTGCGAACCCATGAAAGCCGACAATCTTCTTG
TCTTTC

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR4AC34TF 827 0 0
AATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAACATCACACTCAAGCACAAACA
GAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTC
ATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTTCATTTGGTGACTGGTGCAACA
TAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCATGGAACCCAACGATCTTGTTA
CCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCATTCCAAATGGTTGTGATACTAGC
TTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATT
TTATCACAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCA
ACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCG
TACTCAACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTGTCCGACTTGTATTTTCTTAACT
CCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCACCACCTACTGCTGTCAGCTTC
TTGCTTGGTTTCAACGGAGTTGAGGCGATGGGAGCGAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGA
TGAGTGTCTGCGAACCCATGAAAGCCGACAATCTTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATA
TCTGTACCTTCTTCTCCGGGAAGTTTTTCAAACCCATAATATTCTGAAGTCCTTGTGTTG
GTTATGAACTCAATTCCGACAATCTTGTTGGATGAATTGGACCAACC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4ED79TF 642 0 0
TTCAACGTATTCTCCACCGGTCATTCCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAA
TACCAAAGACGTCACCACTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGAC
ACCAACAGACGTAATGTACTCACCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGA
TTGTTTCCCATGACCATCGCCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCAC
GAAAGATACACCATCATTGTTCTGTCCAACTTGTATTTTCTTAACACCGTCGAAAGCACC
ATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCACCACCTACTGCTGTCAGCTTCTTGCTTGGTTTCAA
TGGAGTTGAGGCGATGGGAGCGAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGATGAGTGTCTGCGAA
CCCATGAAAGCCGACAATCTTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATATCTGTACCTTCTTC
TCCGGGAAGTTTTTCAAACCCATAATATTCTGAAGTCCTTGTGTTGGTTATGAACTCAAT
TCCGACAATCTTGTTGGATGAATTGGACCAACCTTTCACGGACACGAGATACTCGTCGGG
ATGATTTATCTCAAAAGTTTTGATGGAAGATCTAGCTCCTTC

QA 1 642 1 642
DS 



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CACAAACATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGACCTCAATCCAC
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GCTTTTCATTTGGTGACCGGTGCAACGTAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCT
TTTCCATGGAATCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTATTCTCCACCG
GTCATTCCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACT
GTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGACACCAACAGACGTAATGTAC
TCACCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTCCCATGACCATCG
CCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTG
TTCTGTCCAACTTGTATTTTCTTAACACCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCT
TCATCACCACCTATCGTAATGATAAACGGCTCATCTCGCCGTGACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F155JQ U 49
AF RR4F155TF C 6
AF RR4DB81TF C 1
AF RR4DB81JQ U 3
BS 1 5 RR4DB81TF
BS 6 48 RR4DB81JQ
BS 49 500 RR4F155JQ
BS 501 650 RR4DB81JQ

RD RR4F155JQ 453 0 0
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ACCTCAATCCACCAGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACC
AACCCACAACAAGCTTTTCATTTGGTGACCGGTGCAACGTAGACTCCAATTTGATGAACC
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TATTCTCCACCGGTCATTCCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAA
GACGTCACCACTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGACACCAACA
GACGTAATGTACTCACCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTC
CCATGACCATCGCCAACAACTTTCTGAGAGCC
C

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4F155TF 496 0 0
A
AAAGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAA
CATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGACCTCAATCCACCAGTAG
GCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTT
CATTTGGTGACCGGTGCAACGTAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTTCCA
TGGAATCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTATTCTCCACCGGTCATT
CCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACA
CCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCACCA
TTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTCCCATGACCATCGCCAACA
ACTTTCTGAGAGCC
C

QA 2 495 2 495
DS 

RD RR4DB81TF 650 0 0
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CAGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAGAGAACCAACCCACAACAA
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TTTCCATGGAATCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTATTCTCCACCG
GTCATTCCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACT
GTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGACACCAACAGACGTAATGTAC
TCACCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTCCCATGACCATCG
CCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTG
TTCTGTCCAACTTGTATTTTCTTAACACCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCT
TCATCACCACCTATCGTAATGATAAACGGCTCATCTCGCCGTGACCTTCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DB81JQ 648 0 0
AAT
AAAAGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAA
ACATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGACCTCAATCCACCAGTA
GGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAAAACCAACCCACAACAAGCTTT
TCATTTGGTGACCGGTGCAACGTAAACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTTCC
ATGGAATCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTATTCTCCACCGGTCAT
TCCAAATGGTTGTGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAAACGTCACCACTGTCAC
ACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAAACACCAACAGACGTAATGTACTCACC
ATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTCCCATGACCATCGCCAAC
AACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTG
TCCAACTTGTATTTTCTTAACACCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATC
ACCACCTATCGTAATGATAAACGGCTCATCTCGCCGTGACCTTCC

QA 4 648 4 648
DS 



AS 1 12

CO CL181Contig1 858 12 25 U
AATACAAAAACAGTTATTTTGGCTTTAAAATATTTAAGGTTGACTTTAATTCAAAGACTT
TAGATTAACTTAAAGCTTCCACAGCTTCTAAAGTCAAATCCGCAATCGGAGCCTTAATTA
CTCCTATTACATGTCGATTCAAACTAAGAACTTCAAACATAACTAATTTCAAAAAAAAAA
AAAA*CTTCAGACATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCTCGAGTCGACACACACCA
CAACATATACCTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTATTTATTGCAGCTT
TAAAGACTTAAAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATATTC
ATCGATGTCTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATC
TTCGCTTACTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTT
AGGGGTCACCTGGATTGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTCTAT
AACCCTGAACGTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGACAT
TGCTGCCTCACCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCCCAGTC
GCCTTCTTGTAGCTCACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTGTAG
TCTCCCTGCGAACATTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGCCTC
AAGCTTTCCCACCAAACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTTTACTTTACGAAGACGTT
AGGATTTTTGAAGAGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 30 30 5 45 45 45 45 45 15 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 65 65 50 50 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 

AF RR4DR52JQ U 1
AF RR4DW58JQ U 1
AF RR4A544JQ U 42
AF RR4CH67JQ U 46
AF RR4CX56JQ U 67
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AF RR4CX56TF C 652
AF RR4G779JQ U 256
AF RR4G779TF C 256
AF RR4BO02TF C 255
AF RR4DW58TF C 178
AF RR4DR52TF C 191
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BS 355 513 RR4DW58JQ
BS 514 614 RR4G779JQ
BS 615 615 RR4A544JQ
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BS 808 809 RR4CX56JQ
BS 810 858 RR4G779JQ

RD RR4DR52JQ 287 0 0
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TAAATTAACTTAAAGCTTCCACAGCTTCTAAAGTCAAATCCGCAATCGGAGCCTTAATTA
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AAAA*CTTCAAAAATAACTACCGTAATATTACACATACACGCTCGAGTCGACACACACCA
CAACATATACCTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTA

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DS 

RD RR4DW58JQ 513 0 0
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TAGATTAACTTAAAGCTTCCACAGCTTCTAAAGTCAAATCCGCAATCGGAGCCTTAATTA
CTCCTATTACATGTCGATTCAAACTAAAAACTTCAAACATAACTAATTTCAAAAAAAAAA
AAAA*CTTCAAAAATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCTCGAGTCGACACACACCA
CAACATATACCTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTATTTATTGCAGCTT
TAGAGACTTAAAGACCCACACACGAAAAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAAATATTC
ATCGATGTCTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATC
TTCGCTTACTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTT
AGGGGTCACCTGGATTGTAGATACAAAACTCTT

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DS 

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GG
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TAATTTCAAAAAAAAAAAAA**CTTCAGACATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCT
CGAGTCGACACACACCACAACATATACCTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCAC
ATTATTTATTGCAGCTTTAAAGACTTAAAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCT
TCTGTCAAGAGATATTCATCGATGTCTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTT
TCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTACTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTA
CCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTAAATACAAAACTCTTGTAGTCTTTC
ATCACATCACCTTCTATAACCCTGAACGTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCG
ACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCACCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAA
CCGACTTTGCCCCAGTCGCCTTCTTGTAGCTCACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCT
TTGGGCATGTCCT

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DS 

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G
TAATTCAAAGACTTTAGATTAACTTAAAGCTTCCACAGCTTCTAAAGTCAAATCCGCAAT
CGGAGCCTTAATTACTCCTATTACATGTCGATTCAAACTAAGAACTTCAAACATAACTAA
TTTCAAAAAAAAAAA****CTTCAGACATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCTCGA
GTCGACACACACCACAACATATACCTTTTAC*****TCTGAAACTCGGACACGGCACATT
ATTTATTGCAGCTTTAAAGACTTAAAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCT
GTCAAGAGATATTCATCGATGTCTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCA
GGGGGATCAACATCTTCGCTTACTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCA
GACCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTCATC
ACATCACCTTCTATAACCCTGAACGTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACC
CTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCACCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCG
ACTTTGCCCCAGTCGCCTTCTTGTAGCTCACAACTCTTGATTTCGCCTGGAGTTGCTTTG
GGCATGTCCTGTAGTCTCCCTGCGAACATTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGC
TCCGCATCTGCCTCAA

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR4CX56JQ 772 0 0
GC
CTTAAAGCTTCCACAGCTTCTAAAGTCAAATCCGCAATCGGAGCCTTAATTACTCCTATT
ACATGTCGATTCAAACTAAGAACTTCAAACATAACTAATTTCAAAAAAAAAAAAAAACTT
CAAACATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCTCGAGTCGACACACACCACAACATAT
ACCTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTATTTATTGCAGCTTTAAAGACT
TAAAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATATTCATCGATGT
CTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTA
CTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCA
CCTGGATTGTAAATACAAAACTATTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTCTATAACCCTGA
ACGTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCT
CACCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCCCAGTCGCCTTCTT
GTAGCTCACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTGTAGTCTCCCTG
CGAACATTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGCCTCAAGCTTTC
CCACCAAACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTTTACTTTACGAAGACG

QA 3 772 3 772
DS 

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TTGG
CTTTAATTCAAAGACTTTAGATTAACTTAAAGCTTCCACAGCTTCTAAAGTCAAATCCGC
AATCGGAGCCTTAATTACTCCTATTACATGTCGATTCAAACTAAGAACTTCAAACATAAC
TAATTTCAAAAAAAAAAAAA**CTTCAGACATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCT
CGAGTCGACACACACCACAACATATACCTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCAC
ATTATTTATTGCAGCTTTAAAGACTTAAAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCT
TCTGTCAAGAGATATTCATCGATGTCTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTT
TCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTACTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTA
CCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTC
ATCACATCACCTTCTATAACCCTGAACGTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCG
ACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCACCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAA
CCGACTTTGCCCCAGTCGCCTTCTTGTAGCTCACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCT
TTGGGCATGTCCTGTAGTCTCCCTGCGAACATTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTG
AGCTCCGCATCTGCCTCAAGCTTTCCCACCAAACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTT
TACTTTACGAAGACGTTAGGATTTTTGAAGAGTCC

QA 5 819 5 819
DS 

RD RR4CX56TF 207 0 0
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GTCCTGTAGTCTCCCTGCGAACATTTGATAGA*CTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGC
ATCTGCCTCAAGCTTTCCCACCAAACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTTTACTTTA*
GAAGACGTTAGGATTTT*GAAGAGTCC

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DS 

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CCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATATTCATCGATGTCTTTTAT
TATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTACTTTCTC
GTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGAT
TGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTCTATAACCCTGAACGTGAT
CAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCACCATA
TTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCC*AGTCGCCTTCTTGTAGCTC
ACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTGTAGTCTCCCTGCGAACAT
TTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGCCTCAAGCTTTCCCACCAA
ACTAGTCGCTCCCACCATGATTATTGTTTACTTTACGAAGACGTTAGGATTTTTGAAGAG
TCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4G779TF 603 0 0
ACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTATTTATTGCAGCTTTAAAGACTTAAAGAC
CCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATATTCATCGATGTCTTTTAT
TATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTACTTTCTC
GTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGAT
TGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTCTATAACCCTGAACGTGAT
CAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCACCATA
TTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCC*AGTCGCCTTCTTGTAGCTC
ACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTGTAGTCTCCCTGCGAACAT
TTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGCCTCAAGCTTTCCCACCAA
ACTAGTCGCTCCCACCATGATTATTGTTTACTTTACGAAGACGTTAGGATTTTTGAAGAG
TCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4BO02TF 604 0 0
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CCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATATTCATCGATGTCTTTTA
TTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTACTTTCT
CGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGA
TTGTAGATACAAAACTATTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTCTATAACCCTGAACGTGA
TCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCACCAT
CTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCCCAGTCGCCTTCTTGTAGCT
CACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTGTAGTCTCCCTGCGAACA
TTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGCCTCAAGCTTTCCCACCA
AACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTTTACTTTACGAAGACGTTAGGATTTTTGAAGA
GTCC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4DW58TF 681 0 0
AAAAAAA*CTTCAGACATAACTAC*GTAGTATTACACATACACGCTCGAGTCGACACACA
CCACAACATATAC*TTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTATTTATTGCAG
CTTTAGAGACTTAAAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATA
TTCATCGATGTCTTTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAAC
ATCTTCGCTTACTTTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATG
CTTAGGGGTCACCTGGATTGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTC
TATAACCCTGAACGTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGA
CATTGCTGCCTCACCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCCCA
GTCGCCTTCTTGTAGCTCACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTG
TAGTCTCCCTGCGAACATTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGC
CTCAAGCTTTCCCACCAAACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTTTAATTTACGAAGAC
GTTAGGATTTTTGAAGAGTCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4DR52TF 668 0 0
GACATAACTACCGTAGTATTACACATACACGCTCGAGTCGACACACACCACAACATATAC
CTTTTACCAAACTCTGAAACTCGGACACGGCACATTATTTATTGCAGCTTTAGAGACTTA
AAGACCCACACACGAAGAGTAATCCTCTATTCTTCTGTCAAGAGATATTCATCGATGTCT
TTTATTATTTCAATACTAAGCTGGAGGATAGTTTCAGGGGGATCAACATCTTCGCTTACT
TTCTCGTACTCAATGTGCAAGTTCACAACACTACCAGACCCTCCATGCTTAGGGGTCACC
TGGATTGTAGATACAAAACTCTTGTAGTCTTTCATCACATCACCTTCTATAACCCTGAAC
GTGATCAGGTTTTTCTCCGGCTCCACCGCCTCGACCCTCTCCTTGGACATTGCTGCCTCA
CCATCTTGAACGTAGTTCCAGATGACCACTAAACCGACTTTGCCCCAGTCGCCTTCTTGT
AGCTCACAACTCTTGATTTTGCCTGGAGTTGCTTTGGGCATGTCCTGTAGTCTCCCTGCG
AACATTTGATAGAACTTTCCAGCAGAAGCTTTGAGCTCCGCATCTGCCTCAAGCTTTCCC
ACCAAACTAGTCGCTCCTGCCATGATTATTGTTTAATTTACGAAGACGTTAGGATTTTTG
AAGAGTCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 2 13

CO CL182Contig1 921 10 20 U
GGAATAAAAGTGAACCCTTTAGCTTAGACTGCTTCACTTCCATAGTCTCTTTTCTAGGGT
TTTAAGGTTTCCGCACCGTTTCACGAATCCTCACTACACGTAATCATTCATCATGACTAC
CGAAGACAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCC
TGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGATGATGACTCCGAAGACGATGATAATGATGA
TGATGCAGAGGGGCAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCG
CAAAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACTGTCAA
AAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATC
GGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGCTCCAGTC
CCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTGGTCTCTCAGGGTGAATC
TTCCTCGAGTGCTGCTGCGGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGT
TGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGT
GAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCT
AAACCAAAATCTTTTCAACTTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTT
TTCATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATT
GAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTTTGCGGTTACAGTTAAGGACT
TTATGATACGTCTTTTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
30 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 0 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT30TF U 66
AF RR4E258TF U 1
AF RR4F492TF U 91
AF RR4DI01TF U 40
AF RR4DI01JQ C 81
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AF RR4G058TF U 114
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AF RR4G058JQ C 161
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BS 378 475 RR4E258TF
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BS 715 790 RR4DI01TF
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DS 

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TTTAAGGTTTCCGCACCGTTTCACGAATCCTCACTACACGTAATCATTCATCATGACTAC
CGAAGACAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCC
TGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGATGATGACTCCGAAGACGATGATAATGATGA
TGATGCAGAGGGGCAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCG
CAAAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACTGTCAA
AAAGAGCAAGAACATCGTGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATC
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AACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTA
TCACTGGTGTCAGCCGTGTCACTGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAA
AACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCGGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGA
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ATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCC
AAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGGGATATT
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GT

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GG
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AATCATTCATCATGACTACCGAAGACAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGA
AGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGATGATGACTCCG
AAGACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGGCAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCA
GAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTG
TCAGCCGTGTCACTGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGATG
TGTTCAAGAGCCCTGCATCGGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACT
TAAGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACG
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AGATTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAG*ACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAG
TTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAA*GCTGCTGATGGGG*ATATTGTCTCTGCC
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DS 

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CCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATG
ACAACGATGATGATGACTCCGAAGACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGGCAAGAGG
GAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTG
GGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACTGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGT
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AGGCTCCTGATATCAGCAACGTGGTCTCTCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCGG
TGGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAG*ACATTGAGT
TGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTG
ATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAACCAAAATCTTTTCAACT
TTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTG
ATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGT
TTTG
G

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DS 

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AAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGATGATGACTCCGAAGACGATGATAATGATGATG
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AAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACTGTCAAAA
AGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCGG
ACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGCTCCATTTCC
AGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTGGTCTCTCAGGGTGAATCTT
CCTCGAGTGCTGCTGCGGTGGTTCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTG
ACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGA
AGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAA
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CATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGA
ATTTCAGTTTGATTTGGTTT
GG

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DS 

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G
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GAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCAC
TGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCC
TGCATCGGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGCT
CCAGTACCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTGGTCTCTCAGGG
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GGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAG
AGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTA
CCACCTAAACCAAAATCTTTTCAACTTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTT
TTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAA*CCTCATAG
ATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTGA*TATTGGTAAGTGTTTGCGGTTACAGTTA
AG*ACTTTATGAT
A

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CAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCGGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAA
AGATCGAGGACTCGAGCTTTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTG
ATATCAGCAACGTGGTCTCTCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCGGTGGTGCAAG
ATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGA
CCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGG*AT
ATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAACCAAAATCTTTTCAACTTTAATGTGC
GTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAAT
GTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTGAATAT
TGGTAAGTGTTTGCGGTTACAGTTAAGGACTTTATGATACGTCTTTTGGTCC

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DS 

RD RR4E258JQ 723 0 0
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GCAGAGGGGCAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAA
GCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACTGTCAAAAAG
AGCAAGAACATCGTGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCGGAC
ACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACTTGAGCTTTCAGCTC*AGTCCCAG
GCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGACATCAGCAACGTGGTCTCTCAGGGTGAATCTTCC
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TCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAG
GCGCTTAAGGCTGCTGATGGGG*ATATTGTTTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAAC
CAAAATCTTTTCAACTTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCA
TGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAAT
TTCAGTTTGATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTTTGCGGTTACAGTTAAGGACTTTAT
GAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4G058JQ 752 0 0
AAGATCGATCTTGATAAGCC*GAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGATGATGACTCC
GAAGACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGGCAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGC
AGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGT
GTCAGCCGTGTCACTGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGAT
GTGTTCAAGAGCCCTGCATCGGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGAC
TTGAGCTCTCAGCTCCAGTACCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAAC
GTGGTCTCTCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCGGTGGTGCAAGATGATGATGAG
GAGATTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGA
GTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGG*ATATTGTCTCTGC
CATCATGGAACTTACCACCTAAACCAAAATCTTTTCAACTTTAATGTGCGTGTGTCAGAG
TGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGT
AAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTT
TGCGGTTACAGTTAAGGACTTTATGAT
ACGTC

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL182Contig2 827 3 8 U
CAAAACCAAATCAAACTGAAATTCAATAATCTATGAGGTTTCTTACTGATACAACATCGA
AAATCACTCCCAAGGAAACATGAAAAACAAAAATTTCTGAATCACTCTGACACACGCACA
TTAAGTTGAAAAGATATTGGTTTTAGGTGGTAAGTTCC*ATGATGGCAGAGACAATATCT
CCATCAGCAGCCTTAAGCGCCTTCACGGCCCTTGGCCTAGGAACTCCTGCTTGGGTCATC
ACCAACTCGATGTCCTTTGAGTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCATCATCATCTTGC
ACCACTGCAGCAGCACTCGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGCTGCTGATATCAGG*
AGCCTTGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAGAGCTCAA*GTCCTCGATCTTTG
CCTCTCCAAAGATCACGTACGTGTCCGATGCAGGGCTCTTGAACACATCAGGTTTTGATA
TGACGAACATGATGTTCTTGCTCTTTTTGACGGTGACACGGCTGACACCAGTGATAGGTT
TCATCCCAAGCTTGAGCATGGCTTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTTTGTTTTGACT
TGCCTCCCTCTTGTCCCTCTGCATCATCATCATTATCATCGTCTTCGGAGTCATCATCAT
CGTTGTCATCAACGTCCTCAACTTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGCTCTTCCAATT
TGGCGGCGAGGATCTCTTTCTCTTCGGTAGTCATGATGAATGATTACGTGTAGTGAGGAT
TCGTGAAACGGTGCGGAAACCTTAAAACCCTAGAAAAGAGACTATCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4GF10JQ U 1
AF RR4BD64JQ U 5
AF RR4BD64TF C 5
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BS 653 827 RR4BD64JQ

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ACCAACTCGATGTCCTTTGAGTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCATCATCATCTTGC
ACCACTGCAGCAGCACTCGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGCTGCTGATATCAGG*
AGCCTTGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAGAGCTCAA*GTCCTCGATCTTTG
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QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4BD64JQ 823 0 0
G
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ACTCCCAAGGAAACATGAAAAACAAAAATTTCTGAATCACTCTGACACACGCACATTAAG
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AGCAGCCTTAAGCGCCTTCACGGCCCTTGGCCTAGGAACTCCTGCTTGGGTCATCACCAA
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TGCAGCAGCACTCGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGCTGCTGATATCAGG*AGCCT
TGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAAAGCTCAA*GTCCTCGATCTTTGCCTCT
CCAAAGATCACGTACGTGTCCGATGCAGGGCTCTTGAACACATCAGGTTTTGATATGACG
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CCAAGCTTGAGCATGGCTTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTTTGTTTTGACTTGCCT
CCCTCTTGTCCCTCTGCATCATCATCATTATCATCGTCTTCGGAGTCATCATCATCGTTG
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GCGAGGATCTCTTTCTCTTCGGTAGTCATGATGAATGATTACGTGTAGTGAGGATTCGTG
AAACGGTGCGGAAACCTTAAAACCCTAGAAAAGAGACTATCC

QA 2 823 2 823
DS 

RD RR4BD64TF 823 0 0
G
CCAAATCAAACTGAAATTCAATAATCTATGAGGTT*CTTACTGATACAACATCGAAAATC
ACTCCCAAGGAAACATGAAAAACAAAAATTTCTGAATCACTCTGACACACGCACATTAAG
TTGAAAAGATATTGGTTTTAGGTGGTAAGTTCCCATGATGGCAGAGACAATATCTCCATC
AGCAGCCTTAAGCGCCTTCACGGCCCTTGGCCTAGGAACTCCTGCTTGGGTCATCACCAA
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TGCAGCAGCACTCGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGCTGCTGATATCAGGGAGCCT
TGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAGAGCTCAAAGTCCTCGATCTTTGCCTCT
CCAAAGATCACGTACGTGTCCGATGCAGGGCTCTTGAACACATCAGGTTTTGATATGACG
AACATGATGTTCTTGCTCTTTTTGACGGTGACACGGCTGACACCAGTGATAGGTTTCATC
CCAAGCTTGAGCATGGCTTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTTTGTTTTGACTTGCCT
CCCTCTTGTCCCTCTGCATCATCATCATTATCATCGTCTTCGGAGTCATCATCATCGTTG
TCATCAACGTCCTCAACTTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGCTCTTCCAATTTGGCG
GCGAGGATCTCTTTCTCTTCGGTAGTCATGATGAATGATTACGTGTAGTGAGGATTCGTG
AAACGGTGCGGAAACCTTAAAACCCTAGAAAAGAGACTAT
CC

QA 2 821 2 821
DS 



AS 1 13

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AACTACCTTGCTGTTTAAAATGAAAAAGCAAGAAGTGGAATTCCTACTCTCATCTCTTTT
TACTAAATATAAGGAACAACACCCTTATGATGACATTCCGTCTCTAACGGGTATAAATAT
ACCTAAAGTTTGAAATCTTTTTTTTTATTATTGTTGATACTCCTGCAGAGAATCTCTTAG
GAGCGAACGCGATCTATTTAGACCTGATCTATCAGGGCACGAATAGTCGCTACTTTGCCC
AAGCTCTGGAGTTAGTGCTTTCGTTCAGTTCATAAGGTTGACTTTTTTTTCTAAAGCGGT
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TCAAGCTGGGGAAATGGTTCTTTTTGCCAACGGTGTGAAAGGAATGGCCTTGAATCTTGA
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ACGTGTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAACGTAAATCAGTGCACGAGCCTATGCA
AACAGGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACGAGAACTTCT
AATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATTAAACCAAAA
GCAAATAAACTCAAGGGCCACCTCTGAGAGTGAGACAATGTATTGTGTCTATGTAGCGAT
TGGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATTCAAACTCTTGAAGAAGCGAATGCTTT
GGAATATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCGGATCCTGCTCCTCTGCAATTTTTGGC
CCCATATTCCGGGTGTGCCATGGGGGAATATTTCCGCGATAATGGAATGCACGCATTAAT
AATCTATGATGATCTTAGTAAACAGGCGGTGGCATATCGACAAATGTCATTATTGTTACG
CCGACCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTCCCGTCTCTT
AGAAAGAGCGGCTAAACGAGCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGCCTTACCCGT
CATTGAAACACAAGCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATCTCCATTAC
TGATGGACAAATCTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAA
CGTCGGCTTATCTGTCAGTCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGT
ATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATT
TGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGA
AGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTA
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CGAAAGAAAAATGGAACCAGATGCTTTCTTAAAAGAAAGAGCTTTAGCTTTAATTTAGCT
TTCATCACATTAGGAATCCTCAATCAGT


BQ
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10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 35 
35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4FA89TF U 1
AF RR4AK24TF U 421
AF RR4GX22TF U 515
AF RR4BM61TF U 771
AF RR4DR89JQ C 1340
AF RR4E853JQ C 1340
AF RR4DR89TF U 1340
AF RR4E853TF U 1340
AF RR4BM61JQ C 1003
AF RR4GX22JQ C 1133
AF RR4AK24JQ C 1153
AF RR4D233JQ C 1467
AF RR4D233TF U 1467
BS 1 439 RR4FA89TF
BS 440 440 RR4AK24TF
BS 441 645 RR4FA89TF
BS 646 994 RR4AK24TF
BS 995 995 RR4GX22TF
BS 996 1165 RR4AK24TF
BS 1166 1221 RR4GX22TF
BS 1222 1339 RR4BM61TF
BS 1340 1340 RR4DR89TF
BS 1341 1393 RR4BM61TF
BS 1394 1394 RR4DR89TF
BS 1395 1498 RR4BM61TF
BS 1499 1499 RR4DR89TF
BS 1500 1503 RR4BM61TF
BS 1504 1504 RR4DR89TF
BS 1505 1527 RR4BM61TF
BS 1528 1528 RR4DR89TF
BS 1529 1555 RR4BM61TF
BS 1556 1833 RR4DR89TF
BS 1834 1834 RR4D233TF
BS 1835 1837 RR4DR89TF
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BS 1839 1858 RR4DR89TF
BS 1859 1948 RR4D233TF

RD RR4FA89TF 645 0 0
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AACTACCTTGCTGTTTAAAATGAAAAAGCAAGAAGTGGAATTCCTACTCTCATCTCTTTT
TACTAAATATAAGGAACAACACCCTTATGATGACATTCCGTCTCTAACGGGTATAAATAT
ACCTAAAGTTTGAAATCTTTTTTTTTATTATTGTTGATACTCCTGCAGAGAATCTCTTAG
GAGCGAACGCGATCTATTTAGACCTGATCTATCAGGGCACGAATAGTCGCTACTTTGCCC
AAGCTCTGGAGTTAGTGCTTTCGTTCAGTTCATAAGGTTGACTTTTTTTTCTAAAGCGGT
ATTCCTCCTTGCCTCTGAATTCAAAAATGGAATTATGGAATTATCTCCTAGAGCTGCGGA
ACTAACGAATCTATTCGAAGGTCGAATTAGGAACTTTTACGCGAATTTTCAAGTGGATGA
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TCAAGCTGGGGAAATGGTTCTTTTTGCCAACGGTGTGAAAGGAATGGCCTTGAATCTTGA
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DS 

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G
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ATCGGTCGAGTGGTCTTAGTTGGAGATGGGATTGCACAAGTTTATGGATTGAACGAGATT
CAAGCTGGGGAAATGGTTCTTTTTGCCAACGGTGTGAAAGGAATGGCCTTGAATCTTGAG
AATGAGAATGTCGGGATTGTTGTCTTTGGTGGTGATACCGCTATAAAAGAAGGAGATCTT
GTCAAGCGCACTGGATCTATTGTGGATGTTCCCGCGGGAAAGGCTATGCTAGGGCGTGTG
GTCGACGCGATGGGAGTACCTATTGATGGAAGAGGGGCTCTAAGCGATCACGAGCAAAGA
CGTGTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAACGTAAATCAGTGCACGAGCCTATGCAA
ACAGGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACGAGAACTTCTA
ATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATTAAACCAAAAG
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GGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATTCAAACTCTTGAAGAAGCGAATGCTTTG
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CCATATTCCGGGTGTGCCATGGGG

QA 2 745 2 745
DS 

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GATACCGCTATAAAAGAAGGAGATCTTGTCGAGCGCACTGGATCTATTGTGGATGTTCCC
GCGGGAAAGGCTATGCTAGGGCGTGTGGTCGACGCGATGGGAGTACCTATTGATGGAAGA
GGGGCTCTAAGCGATCACGAGCAAAGACGTGTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAA
CGTAAATCAGTGCACGAGCCTATGCAAACAGGGTTAAAAGCGGTAGACAGCCTGGTTCCT
ATAGGCCGTGGTCAACGAGAACTTCTAATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATT
GCTATCGATACCATATTAAACCAAAAGCAAATAAACTCAAGGGCCACCTCTGAGAGTGAG
ACAATGTATTGTGTCTATGTAGCGATTGGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATT
CAAACTCTTGAAGAAGCGAATGCTTTGGAATATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCG
GATCCTGCTCCTCTGCAATTTTTGGCCCCATATTCCGGGTGTACCATGGGGGAATATTTC
CGCGATAATGGAATGCACGCATTAATAATCTATGATGATCTTAGTAA

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DS 

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G
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GCCTATGCAAACAGGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACG
AGAACTTCTAATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATT
AAACCAAAAGCAAATAAACTCAAGGGCCACCTCTGAGAGTGAGACAATGTATTGTGTCTA
TGTAGCGATTGGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATTCAAACTCTTGAAGAAGC
GAATGCTTTGGAATATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCGGATCCTGCTCCTCTGCA
ATTTTTGGCCCCATATTCCGGGTGTGCCATGGGGGAATATTTCCGCGATAATGGAATGCA
CGCATTAATAATCAATGATGATCTTAGTAAACAGGCGGTGGCATATCGACAAATGTCATT
ATTGTTACGCCGACCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTC
CCGTCTCTTAGAAAGAGCGGCTAAACGATCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGC
CTTACCCGTCATTGAAACACAATCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGAT
CTCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACC
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GAAA
AA

QA 2 785 2 785
DS 

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CGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTG
GAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCT
GCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAA
TATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTC
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DS 

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CGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTG
GAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCT
GCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAA
TATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTC
TGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTC
AAACCTGAATTACTGCAATCCCTTAAAGGTGGATTAACT

QA 1 519 1 519
DS 

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GACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATCTCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTG
GAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAACGTCGGCTTATCTGTCAGT
CGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTG
GAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCT
GCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAA
TATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTC
TGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTC
AAACCTGAATTACTGCAATCCCTTAAAGGTGGATTAACT

QA 1 519 1 519
DS 

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GACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATCTCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTG
GAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAACGTCGGCTTATCTGTCAGT
CGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTG
GAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCT
GCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAA
TATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTC
TGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTC
AAACCTGAATTACTGCAATCCCTTAAAGGTGGATTAACT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4BM61JQ 860 0 0
A
TGTGTCTATGTAGCGATTGGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTA*TTCAAACTCT*
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CCTCTGCAATTTTTGGCCCCATATTCCGGGTGTGCCATGGGGGAATATTTCCGCGATAAT
GGAATGCACGCATTAATAATCAATGATGATCTTAGTAAACAGGCGGTGGCATATCGACAA
ATGTCATTATTGTTACGCCGACCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTAT
TTACATTCCCGTCTCTTAGAAAGAGCGGCTAAACGATCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGC
TTGACCGCCTTACCCGTCATTGAAACACAATCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACC
AATGTGATCTCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGA
ATTAGACCTGCTATTGACGTTGGCTTATCTGTCAGTCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTG
AAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTGGCACAATATCGCGAAGTG
GCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAGA
GGTGCAAGGCTGACTGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAAA
CAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAGA
ATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCTT
AAAGGTGGATTAACTAACG

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DS 

RD RR4GX22JQ 730 0 0
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TTGTTACGCCGACCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTCC
CGTCTCTTAGAAAGAGCGGCTAAACGATCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGCC
TTACCCGTCATTGAAACACAAGCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATC
TCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCT
GCTATTAACGTCGGCTTATCTGTCAGTCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATG
AAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTT
GCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGG
CTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTA
GTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAA
TATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGA
TTAACTAACG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4AK24JQ 796 0 0
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TCTTAGTAAACAGGCGGTGGCATATCGACAAATGTCATTATTGTTACGCCGACCACCAGG
CCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTCCCGTCTCTTAGAAAGAGCGGC
TAAACGATCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGCCTTACCCGTCATTGAAACACA
AGCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATCTCCATTACTGATGGACAAAT
CTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAACGTTGGCTTATC
TGTCAGTCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTT
AAAACTGGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCT
TGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACA
ACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAA
TGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAA
TAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGATTAACTAACGAAAGAAAAAT
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GGAATCCTCAATCAGT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4D233JQ 482 0 0
G
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GTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTGGC
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AATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGA
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T

QA 2 482 2 482
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G
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GGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACC
ACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCG
AATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGA
ATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGATTAACTAACGAAAGAAAAATGGAACCAGATGCTTT
CTTAAAAGAAAGAGCTTTAGCTTTAATTTAGCTTTCATCACATTAGGAATCCTCAATCAG
T

QA 2 482 2 482
DS 



AS 1 13

CO CL184Contig1 1284 13 16 U
GCTCCGAAACCTGTACCACCACCTTCTCCATCGCCAAAACCTAGCCCACATAAGCCACCT
GCCCCATCGCCAAAACCTAGCCCACCCAAGCCACCTGCCCCATCACCACCTAAGCCACAG
AACAAAACCATACCGGCAGTGTTTTTCTTTGGTGATTCGATCTTTGACACAGGAAATAAC
GATGACCTAGACACAAAGCTAAAAAGTAATTATCGTCCCTATGGTATTGATTTTCTTATG
GGAGTCGCCACCGGTAGATTCAGCAACGGAAGGGTCGCTTCCGATTATATATCCAAATAT
TTGGGAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGAA
CTACAACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTT
CCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAA
GACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGC
AAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGT
CGTGCTCAACGCCTCAGAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCT
GCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACA
CCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAATGTAATGAAGAT
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AGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATG
CTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGA
TTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCT
TCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGA
AAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTA
TTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATG
ATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTT
TTTGTAAACAAATTCCTCAACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4DS08TF U 1
AF RR4A753TF U 50
AF RR4A753JQ C 103
AF RR4BE72JQ C 633
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AF RR4GI82JQ C 787
AF RR4GI82TF U 787
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BS 671 717 RR4DS08TF
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BS 719 738 RR4DS08TF
BS 739 759 RR4A753TF
BS 760 767 RR4BE72TF
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BS 769 998 RR4BE72TF
BS 999 1134 RR4H251TF
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BS 1181 1262 RR4FC55TF
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GCCCCATCGCCAAAACCTAGCCCACCCAAGCCACCTGCCCCATCACCACCTAAGCCACAG
AACAAAACCATACCGGCAGTGTTTTTCTTTGGTGATTCGATCTTTGACACAGGAAATAAC
GATGACCTAGACACAAAGCTAAAAAGTAATTATCGTCCCTATGGTATTGATTTTCTTATG
GGAGTCGCCACCGGTAGATTCAGCAACGGAAGGGTCGCTTCCGATTATATATCCAAATAT
TTGGGAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGAA
CTACAACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTT
CCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAA
GACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGC
AAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGT
CGTGCTCAACGCCTCAGAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCT
GCCAGTT***TTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGA*CA
CCACCACTTGGATGTACA

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DS 

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G
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TAAGCCACAGAACAAAACCATACCGGCAGTGTTTTTCTTTGGTGATTCGATCTTTGACAC
AGGAAATAACGATGACCTAGACACAAAGCTAAAAAGTAATTATCGTCCCTATGGTATTGA
TTTTCTTATGGGAGTCGCCACCGGTAGATTCAGCAACGGAAGGGTCGCTTCCGATTATAT
ATCCAAATATTTGGGAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACA
AAACGACGAAGTACAACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTTTGCTTCGGGTGGTGC
TGGCTATCTTCCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAG
ATATTTCCAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACA
TATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACATA
TTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAGAAATGATGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGC
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GGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGG

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ATTTTCTTATGGGAGTCGCCACCGGTAGATTCAGCAACGGAAGGGTCGCTTCCGATTATA
TATCCAAATATTTGGGAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAAC
AAAACGACGAAGTACAACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTTTGCTTCGGGTGGTG
CTGGCTATTTTCCTCAAACATTTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGA
GATATTTCCAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAAC
ATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACAT
ATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAGAAATGATGTCGACTCTTTTACCACCATGATGG
CTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAG
TGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGG

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DS 

RD RR4BE72JQ 250 0 0
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TAAAAGGAAAAAAAA*TGTAATGAAGATTTAAATTATGCTGTTCAGCTTTTCAATGCTAA
GCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTTTACAATTGTTTACGG
AGACAT
TTAC

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DS 

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G
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TATATCCAAATATTTGGGAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACA
ACAAAACGACGAACTACAACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTTTGCTTCGGGTGG
TGCTGGCTATCTTCCTCAGACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTT
GAGATATTTCCAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAA
ACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATAC
ATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAGAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGAT
GGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGG
AGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAA
*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTT
GGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTAT
CTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTG
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G
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ACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGT

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DS 

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AGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACATATTT
TGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAGAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGA
TTCTGCTGCCAGTTT**TTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGT
CGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAATGTAA
TGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCA
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TACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATC
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TATATTATTGG

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DS 

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G
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TATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGG
ACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAAT
ACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTAT
CTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCA
TATT

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR4H458JQB 820 0 0
G
CATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGACTACAAGAAAAGAA
TGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTG
TGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCA
GAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGC
AACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTA
CACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTC
AGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATT
CTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAG
ACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTG
TATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGG
ACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAAT
ACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTAT
CTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACA
AATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACT
AG

QA 2 818 2 818
DS 

RD RR4H251JQ 740 0 0
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TCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAGAAATGACGTCGACTCTTT
TACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAAC
AAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAA
AAGGAAAAAAAAATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCT
CTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGA
CATCTA*TCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGAT
AAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTTTGCAAAAAGAGGAC
ATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCA
GAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATT
AATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTT
TTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTT
GAGATAGTCATGTAAACT
AG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FC55TF 718 0 0
G
AGCAATGATCT*GTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAGAAATGACGTC
GACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGA
TTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAG
AGAGTTAAAAGGAAAAAAAAATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAAT
GCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTT
TACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTT
GAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAA
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ATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAG
GAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAA
CAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTT*GTAA*CAAATTCCTCAACGAT

QA 2 718 2 718
DS 

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G
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TACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAA
GCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGA
AAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCTAATACATCTTCTTATC
TGTCTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTG
TAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAA
TCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATT
TCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAA
ACAAATTCCTCAACG

QA 2 496 2 496
DS 

RD RR4GI82TF 496 0 0
G
ATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCA*TTAGTTTGCGTCAACTGTCCAGAACCC
TACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAA
GCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGA
AAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCTAATACATCTTCTTATC
TGTCTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTG
TAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAA
TCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATT
TCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAA
ACAAATTCCTCAACG

QA 2 496 2 496
DS 



AS 2 12

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TTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAGGACTGCAAGCTAGGGGAATTTGC
ACTCCAGAAAGTACCAAAGATCAAGTTCATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTCAAATC
CACCAAGGTCGCCAAGGATGCGTATTCATCTACCATGGACACTCCCTCCCTCCACTTTCT
AGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAACTGATAGACTTGTTCAAGAATCC
GGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCACACAGTCCCAAGACTTGATGAGAAGAGCTTGGG
AGAAAGTTGCTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGCTAATGGAGGAACTCAAGATTG
GTGAAGAAGCCACTACTAATCAGCCAGAATAGAACAAACACCTTATAGTGGTAATGTATA
AGTAAAACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAAATCATATTCTTCATTACACACTCTTTTA
CCTTTACTACACAAGACAAATAATAAACGTTTCATTCTTTAATTATAACAACAACATTTT
CTTCCTTGACTCGTCACTCTTTCTTGGTACAAACACAACATTCTCTAAGTTTGTCTTCAT
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AGTCCAGCATCCCCAAAAGGACTGTCCCTGATTTCAAGCTTCTCTAGCTTAGGACACCCC
TCGAGTATATATCTCAGACCCATGTCACTGTCCCCTGCAAAAGCTACAGATAACGTACGG
ATCAACTTCCCATACTCTCCTATAAGGCTAAAAGCTTTGTCTGTTAGTAACCCAGATACT
GCAAGTCTGGTTAGCTTCTTGCAGTTTTTGACGATGGCGCCAAATCCATCGTCCATTGGC
TTCCCTGTCACGTGATCGGGCCTATGGCGACCCATTATGCAAAGCCTAAACACGGTAAGC
TGGGGACAGTTCTCAGACATGGCTGTCACAGCTACATTAGTCATCCGCTAGCAAAAGTAC
AGGATAGACTCTAGTTTTCTACAACCTTCTGAAATTGCTTGGAGGCCTAAACCCGAGACA
GGACCTTCGCTGTCTTCACTAGGATCAAAAGGGAAAATCCTAAGCTCACGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE21TF U 1
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TTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAGGACTGCAAGCTAGGGGAATTTGC
ACTCCAGAAAGTACCAAAGATCAAGTTCATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTCAAATC
CACCAAGGTCGCCAAGGATGCGTATTCATCTACCATGGACACTCCCTCCCTCCACTTTCT
AGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAACTGATAGACTTGTTCAAGAATCC
GGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCACACAGTCCCAAGACTTGATGAGAAGAGCTTGGG
AGAAAGTTGCTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGCTAATGGAGGAACTCAAGATTG
GTGAAGAAGCCACTACTAATCAGCCAGAATAGAACAAACACCTTATAGTGGTAATGTATA
AGTAAGACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAAATCATATTCTTCATTACACACTCTTTTA
CCTTTACTACACAAGAC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4E427JQ 491 0 0
AA
AACAAACACCTTATAGTGGTAATGTATAAGTAAAACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAA
ATCATATTCTTCATTACACACTCTTTTACCTTTACTACACAAGACAAATAATAAACGTTT
CATTCTTTAATTAAAACAACAACATTTTCTTCCTTGACTCCCCACTCTTTCTTGGTACAA
ACACAACATTCTCTAAGTTTGTCTTCATAAAATTGTTACAAACTTTGGAGCATCCTTCCT
TGGGCCATCAAGGGACCGATACATGTACAGTATCTCCACATAATCTGCATTGTCCTCATC
GACATCGACATCATCACCATCTGACCCAAATACTTCCACCACCACACTAGGCAGAACGCG
AGCAATATCACTGCAGCTTCCCCGGGACAACCTACATGACGACATCCAAACAAACCTCAT
ATCATTATACCTATGCATACCAGAACGCAGTCCAGCATCCCCAAAAGGACTGTCCCTGAT
TTCAAGCTT

QA 3 491 3 491
DS 

RD RR4FR66JQ 703 0 0
GTGAAATGGCTGTAAAATCATATTCTTCATTACACACTCTTTTACCTTTACTACACAAGA
CAAATAATAAACGTTTCATTCTTTAATTATAACAACAACATTTTCTTCCTTGACTCGTCA
CTCTTTCTTGGTACAAACACAACATTCTCTAAGTTTGTCTTCATAAAATTGTTACAAACT
TTGGAGCATCCTTCCTTGGGCCATCAAGGGACCGATACATGTACAGTATCTCCACATAAT
CTGCATTGTCCTCATCGACATCGACATCATCATCATCTGACCCAAATACTTCCACCACCA
CACTAGGCAGAGCGCGAGCAATATCACTGCAGCTTCCCCGGGACAACCTACATGACGACA
TCCAAACAAACCTCATATCATTATACCTATGCATACCAGAGCGCAGTCCAGCATCCCCAA
AAGGACTGTCCCTGATTTCAAGCTTCTCTAGCTTAGGACACCCCTCGAGTATATATCTCA
GACCCATGTCACTGTCCCCTGCAAAAGCTACAGATAACGTACGGATCAACTTCCCATACT
CTCCTATAAGGCTAAAAGCTTTGTCTGTTAGTAACCCAGATACTGCAAGTCTGGTTAGCT
TCTTGCAGTTTTTGACGATGGCGCCAAATCCATCGTCCATTGGCTTCCCTGTCACGTGAT
CGGGCCTATGGCGACCCATTATGCAAAGCCTAAACACGGTAAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FR66TF 755 0 0
CTGT
AAATCATATTCTTCAT*ACACACTCTTT*ACCTTTACTACACAAGACAAATAATAA*CGT
T*CATTCTTTAATTATAACAACAACATTTTCTTCCTTGACTCGTCACTCTTTCTTGGTAC
AAACACAACATTCTCTAAGTTTGTCTTCATAAAATTGTTACAAACTTTGGAGCATCTTTC
CTTGGGCCATCAAGGGACCGATACATGTACAGTATCTCCACATAATCTGCATTGTCCTCA
TCGACATCGACATCATCATCATCTGACCCAAATACTTCCACCACCACACTAGGCAGAGCG
CGAGCAATATCACTGCAGCTTCCCCGGGACAACCTACATGACGACATCCAAACAAACCTC
ATATCATTATACCTATGCATACCAGAGCGCAGTCCAGCATCCCCAAAAGGACTGTCCCTG
ATTTCAAGCTTCTCTAGCTTAGGACACCCCTCGAGTATATATCTCAGACCCATGTCACTG
TCCCCTGCAAAAGCTACAGATAACGTACGGATCAACTTCCCATACTCTCCTATAAGGCTA
AAAGCTTTGTCTGTTAGTAACCCAGATACTGCAAGTCTGGTTAGCTTCTTGCAGTTTTTG
ACGATGGCGCCAAATCCATCGTCCATTGGCTTCCCTGTCACGTGATCGGGCCTATGGCGA
CCCATTATGCAAAGCCTAAACACGGTAAGCTGGGGACAGTTCTCAGACATGGCTGTCACA
GCTACATTAGTCATCCGCTGGCAAAAGTAC
C

QA 5 754 5 754
DS 

RD RR4E427TF 676 0 0
ATCAAGGGACCGATACATGTACAGTATCTCCACATAATCTGCATTGTCCTCATCGACATC
GACATCATCACCATCTGACCCAAATACTTCCACCACCACACTAGGCAGAGCGCGAGCAAT
ATCACTGCAGCTTCCCCGGGACAACCTACATGACGACATCCAAACAAACCTCATATCATT
ATACCTATGCATACCAGAGCGCAGTCCAGCATCCCCAAAAGGACTGTCCCTGATTTCAAG
CTTCTCTAGCTTAGGACACCCCTCGGGTATATATCTCAGACCCATGTCACTGTCCCCTGC
AAAAGCTACAGATAACGTACGGATCAACTTCCCATACTCTCCTATAAGGCTAAAAGCTTT
GTCTGTTAGTAACCCAGATACTGCAAGTCTGGTTAGCTTCTTGCAGTTTTTGACGATGGC
GCCAAATCCATCGTCCATTGGCTTCCCTGTCACGTGATCGGGCCTATGGCGACCCATTAT
GCAAAGCCTAAACACGGTAAGCTGGGGACAGTTCTCAGACATGGCTGTCACAGCTACATT
AGTCATCCGCTAGCAAAAGTACAGGATAGACTCTAGTTTTCTACAACCTTCTGAAATTGC
TTGGAGGCCTAAACCCGAGACAGGACCTTCGCTGTCTTCACTAGGATCAAAAGGGAAAAT
CCTAAGCTCACGTAGC

QA 1 676 1 676
DS 



CO CL185Contig2 952 7 12 U
GGAAAATGTGAACCACGAACGAGCGAGACACACACACACAGCTTTATAAAGAGAAGACAG
AGAAACCAAAACAAAACACAAACTGTGAATTTATTTATTTTTAATTGAAAAAGAAATGGG
AAGCGAAGGGACGACGATTGTGAGGAAGCCAAGGTTTCTGTGTCTACATGGATTCCGTAC
GAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAAGTGGCCTAAATCTGTTATTGACCGACT
CGATCTCGTGTTCCTCGACGCGCCTTTTCCTTGTCAAGGCAAATCTGATGTCGAAGGCAT
CTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAGTTTAACAAGGAATTTAACGAGTACACGAA
TTTCGAGAACTGTTTGGAGTATTTAGAGGATAGTATGATCAAGCTTGGCCCCTTTGATGG
TCTCATTGGCTTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAGGACTGCAAGCTAG
GGGAATTGCACTCCAGAAAGTACCAAAGATCAAGTTCATCATCATTATTGGAGGAGCTAT
GTTCAAATCCACCAAGGTCGCCAAGGATGCGTATTCATCTACCATGGACACTCCCTCCCT
CCACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAACTGATAGACTTGTT
CAAGAATCCGGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGTCCCAAGACTTGATGAGAA
GAGCTTAGAGAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGCTAATGGAGGAACT
CAAGATTGGTGAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAACAACCACCTTATAGTGGT
AATGTATAAGACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAAATCAAATTCTTCATTACACACTCT
TTTGCCTTTTACTACACAAGACAAATAATAAACGTTTCATTCTTTAATTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 25 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 15 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4AE07TF U 103
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ATCTGATGTCGAAGGCATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAGTTTAACAAGGA
ATTTAACGAGTACACGAATTTCGAGAACTGTTTGGAGTATTTAGAGGATAGTATGATCAA
GCTTGGCCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATT
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CATTATTGGAGGAGCTATGTTCAAGTCCACCAAGGTCGCCAAGGATGCGTATTCATCTAC
CATGGACACTCCCTCCCTCCACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAAC
TGAACTGATAGACTTGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGT
CCCAAGACTTGATGAGAAGAGCTTAGAGAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCA
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TTGACCGACTCGATCTCGTGTTCCTCGACGCGCCTTTTCCTTGTCAAGGCAAATCTGATG
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AGTACACGAATTTCGAGAACTGTTTGGAGTATTTAGAGGATAGTATGATCAAGCTTGGCC
CCTTTGATGGTCTCATTGGCTTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAGGAC
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TTGATGAGAAGAGCTTAGAGAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGCTAA
TGGAGGAACTCAAGATTGGTGAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAACAACCACC
TTATAGTGGTAATGTATAAGACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAAATCAAATTCTTCA
CT

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G
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CTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAACTGATAGACTTGTTCAAGAAT
CCGGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGTCCCAAGACTTGATGAGAAGAGCTTA
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GGTGAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAGCAACCACCTTATAGTGGTAATGTAT
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DS 

RD RR4BQ47JQ 645 0 0
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GGCTTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAGGACTGCAAGCTAGGGGAATT
GCACTCCAGAAAGTACCAAAGATCGAGTTCATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTCAAA
TCCACCAAGGTCGCCAAGGATGCGTATTCATCTACCATGGATACTCCCTCCCTCCACTTT
TTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAGCTGATAGATTCTTTCAAGAGT
CCGGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGTCCCAAGACTTGATGAGAAGAGCTTA
GAGAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGCTAATGGAGGAACTCAAGATT
GGTGAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAACAACCACCTTATAGTGGTAATGTAT
AAGACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAAATCAAATTCTTCATTACACACTCTTTTGCCT
TTTACTACACAAGACAAATAATAAACGTTTCATTCTTTAATTAGC

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DS 

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CTTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAGGACTGCAAGCTAGGGGAATTGC
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AGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAGCTGATAGATTCTTTCAAGAATCC
GGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGTCCCAAGACTTGATGATAAGAGCTTAGA
GAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGCTAATGGAGGAACTCAAGATTGG
TGAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAACAACCACCTTATAGTGGTAATGTATAA
GACAAATAATTGTGAAATGGCTGTAAAATCAAATTTTTCATTACACACTCTTTTGCCTTT
TACTACACAAGACAAATAATAAACGTTTCATTCTTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 13

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TTGGATAAGAACAAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCAGCATTCGC
GAGCAATTCATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAG
TTGTAGTAATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGA
AGTTCCATGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATATT
TAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCG
CTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAG
AATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCG
CTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATG
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TAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTG
AGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCA
CTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTT
GCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTACTCACATCT
GTTTGCAAGTAATGTTGTCCTAAAATGTGGCTGATTCTTGTTCATGAATTGAGCCTATCA
TGAACCGATTTGTCTTGCCACCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATATAAGTTCAC
TTCTCTTCTACGTTGATGCATCATCATCTCACACTACATTAGATTTTCAAAGTATCTTTT
ATTTTCTTATGTTACAAACTTGATTGACTTCAAGCCAATATAAAAGTTGCAGACTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 65 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
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75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BO85TF U 20
AF RR4GA33TF U 58
AF RR4BM35TF U 40
AF RR4BA38TF U 1
AF RR4B048TF U 68
AF RR4FY22TF U 70
AF RR4AT27TF U 68
AF RR4FY22JQ C 292
AF RR4BO85JQ C 292
AF RR4GA33JQ C 292
AF RR4BM35JQ C 293
AF RR4AT27JQ C 292
AF RR4B048JQ C 317
BS 1 774 RR4BA38TF
BS 775 775 RR4GA33TF
BS 776 810 RR4BA38TF
BS 811 811 RR4AT27TF
BS 812 813 RR4BA38TF
BS 814 814 RR4AT27TF
BS 815 828 RR4BA38TF
BS 829 829 RR4B048TF
BS 830 855 RR4BA38TF
BS 856 870 RR4AT27TF
BS 871 871 RR4FY22JQ
BS 872 931 RR4AT27TF
BS 932 932 RR4AT27JQ
BS 933 937 RR4AT27TF
BS 938 938 RR4AT27JQ
BS 939 954 RR4AT27TF
BS 955 1078 RR4AT27JQ

RD RR4BO85TF 629 0 0
GG
GTCCATAGTGGAAAATGATAAAAGTTAGGTTTCCATTGATTGGATAAGAACAAAGACTGG
TTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCAGCATTCGCGAGCAATTCATTTCACACGTA
CACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGGGTTCCGAAG
GACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCATGGAGTTGCTGAAA
ACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGA
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CTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTG
GAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGC
AACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGC
ATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCTG
TTGAAGAGATAACGAAG*CCTTAGAGA

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR4GA33TF 721 0 0
G
GATTGGATAAGAACAAAGACTGGTTGTTAGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCAGCATTC
GCGAGCAATTCATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTG
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GAAGTTCCATGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATA
TTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGAC
CGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAA
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CGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGA
TGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAAC
TGTAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTT
TGAGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATTACCACT
CACTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCG

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR4BM35TF 748 0 0
TAAAAGTTAGGTTTCCATTGATTGGATAAGAACAAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACAT
TTCCTCTCTCTCAGCATTCGCGAGCAATTCATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGAT
TTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGGGTTCCGAAGGACCAACGGCAGTGACAA
TTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCATGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAG
CTAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAA
GCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTAC
AGTCCTCAATCAACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTC
ATTTGGGAGTTAACAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAG
CGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCT
CTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGG
CCTTAGAGAAGAAGG*CTTTGAGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGC
AACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAATACCTATTCACTCTTT
GTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4BA38TF 858 0 0
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TTGGATAAGAACAAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCAGCATTCGC
GAGCAATTCATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAG
TTGTAGTAATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGA
AGTTCCATGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATATT
TAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCG
CTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAG
AATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCG
CTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATG
AAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTG
TAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTG
AGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCA
CTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTCTCGTT
GCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCCCG*CTTCTCTCCTGGAG*TACTCACATCT
GTTTGCAAGTAATGT
GTC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4B048TF 780 0 0
G
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CATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTA
ATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCAT
GGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAG
AATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCAA
GGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAGAATCAGAG
TCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAGCAGTGGCGCTACGAAA
TTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGT
TGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAG
ACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGATA
ACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATT
TGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGGA
CGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTACTCACATCTGTT
GCAA

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR4FY22TF 773 0 0
GGA
AAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCAGCATTCGCGAGCAATTCATT
TCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGG
GTTCTGAAGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCATGGAG
TTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAGAATC
CCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCAAGGAG
CTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAGAATCAGAGTCAG
TGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCGCTACGAAATTCG
CAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGA
AACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCCGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTA
CTCTTCCCGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGATAACTT
CAGATGATGCCCGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATTTGCA
GAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGGACGAG
GAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTC*TGGAGGTACTCACATCTGT

QA 4 773 4 773
DS 

RD RR4AT27TF 887 0 0
G
GAACAAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCAGCATTCGCGAGCAATT
CATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTA
ATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCAT
GGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCTAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAG
AATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCAA
GGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAGAATCAGAG
TCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAGCAGTGGCGCTACGAAA
TTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGT
TGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAG
ACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGATA
ACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTTTGTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATT
TGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGGA
CGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAG*TACTCACATCTGTTTGCAA
GTAATGTTGTCCTAAAATGTGGTTGATTCTTGTTCATGAATTGAGCCTATCATGAACCGA
TTTGTCTTGCCACCAATTATCGC*TATCA*TAAATATGAAATATAA

QA 2 887 2 887
DS 

RD RR4FY22JQ 673 0 0
AAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGC
TTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCA
ACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTA
ACAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTT
GCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCCGATGGTCCAA
TCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCCGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGA
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TACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCT
CTTTTCGTTGCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTA
CTCACATCTGTTTGCAAGTAATGTTGTCCTAAAATGTGGCTGATTCTTGTTCATGAATTG
AGCCTATCATGAACCGATTTGTCTTGCCGCCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATA
TAAGTTCACTTC
C

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BO85JQ 683 0 0
AAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGC
TTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCA
ACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTA
ACAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTT
GCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAA
TCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGA
AGGGCTTTGAGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTAT
TACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAATACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCT
CTTTTCGTTGCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTA
CTCACATCTGTTTGCAAGTAATGTTGTCCTAAAATGTGGCTGATTCTTGTTCATGAATTG
AGCCTATCATGAACCGATTTGTCTTGCCACCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATA
TAAGTTCACTTCTCTTCTACGT
C

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4GA33JQ 677 0 0
AAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGC
TTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCA
ACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTA
ACAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTT
GCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAA
TCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGA
AGGGCTTTGAGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTAT
TACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCT
CTTTTCGTTGCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTA
CTCACATCTGTTTGCAAGTAATGTTGTCCTAAAATGTGGCTGATTCTTGTTCATGAATTG
AGCCTATCATGAACCGATTTGTCTTGCCACCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATA
TAAGTTCACTTCTCTTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4BM35JQ 682 0 0
AGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCT
TGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAA
CACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAA
CAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTG
CCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAAT
CTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAA
GGGCTTTGAGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATT
ACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAATACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTC
TTTTCGTTGCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTAC
TCACATCTGTTTGCAAGTAATGTTGTCCTAAAATGTGGCTGATTCTTGTTCATGAATTGA
GCCTATCATGAACCGATTTGTCTTGCCACCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATAT
AAGTTCACTTCTCTTCTACGT
C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4AT27JQ 787 0 0
AAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGC
TTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCA
ACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTA
GCAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTT
GCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAA
TCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGA
AGGGCTTTGAGGTGATAACTTCAGATGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTAT
TACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCT
CTTTTCGTTGCTGTGGACGAGGAGACTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTA
CTCACATCTGTTTGCAAGTAATGTTGTCCTAAAATGTGGTTGATTCTTGTTCATGAATTG
AGCCTATCATGAACCGATTTGTCTTGCCACCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATA
TAAGTTCACTTCTCTTCTACGTTGATGCATCATCATCTCACACTACATTAGATTTTCAAA
GTATCTTTTATTTTCTTATGTTACAAACTTGATTGACTTCAAGCCAATATAAAAGTTGCA
GACTCCG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4B048JQ 762 0 0
GTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCT
CGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAACACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAG
CTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAGCAGTGGCGCTACGAAATTCGCAAT
TGAGCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACC
TCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCT
TCCTGTTGAAGAGATAACGAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGATAACTTCAGA
TGATGCCGGTCGTTTT*GTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATTTGCAGAAC
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CTCAGATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGGTACTCACATCTGTTTGCAAGTAATGTT
GTCCTAAAATGTGGTTGATTCTTGTTCATGAATTGAGCCTATCATGAACCGATTTGTCTT
GCCACCAATTATCGCCTATCAATAAATATGAAATATAAGTTCACTTCTCTTCTACGTTGA
TGCATCATCATCTCACACTACATTAGATTTTCAAAGTATCTTTTATTTTCTTATGTTACA
AACTTGATTGACTTCAAGCCAATATAAAAGTTGCAGACTCCG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 3 13

CO CL187Contig1 1429 5 12 U
GGAGCACAGACACGAACGAACGAAGGAGAAGGGAGAAGAGATGAACGTGGTTCATGGATT
GAAGAGGGTTCCTCGCATTAAGTTCCCTCAGCGTCACCTCAAACCTTCAGAGGGAACGAA
ACAGGTGGAAAATGAAGCAGTAGATACATTCTTCTTCTCCAACCTGAACACCCCAAAGAC
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GAAACAGACTCAATTTGCTAGTCTTAAAACCTTTTTACTTATATACACTGATTGAGTGCA
TTTTTACTCCCTATTAATGCCTTATGGTTTGGAATTTATTGATTTTTATATTACATGCTG
AAGCTTTTTCTAGAAACCAGTCAGAAACCTTGAAGGTAAACGTTACATACAACACATTTT
AACAGTGAAAGCAAAGAAGAGTAGAGAAAGAGATCCAACTTATGATGCTGCCTACTTTTG
CATCTGTTCGATAAGAGGCTCAAGAACACAAGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGTCCTTT
CTCTCTCCTTTCAAGCTCTTCAAGCCTGAACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTC
GAACAGGACGCCAGCTTTCCCGTCCGTGATCCTCTGCACTATCCCGCAGTACATGTGGTA
AGGACTGTTCGCGTTCTTGACTATAGCGATCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGG
AGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTAGCAATTGTGGACACAACATCATCGCTGCCTCCTCTCTT
CGGTTGTGGTGGTGGTGGTGGGTTTTGTTCAATGAACGTTTTCAGTCCCTTCTCTCCGCC
GGGGAAGCCTCCGGTGAGACCCATCATCTGTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAA
CGACAAGCTATCGTCTCCACTCTCTTTCTTTGTCTGTTTCTCAGTCTTTAATGTATCTTC
CTCTATGTTCCTCTGGAGCTCCTTCTCGATACCTTTCTCTCCGTTGCATAGCCCTCGTCC
TCCCATCACCTCCCATAGGTTGAACTTAGCCATGGCCTTTACTCGATGAACGTTTGATTG
CTGTTTTGAAGGCGGGAGAACCGATCGGTTTGGAGTTGAAAATATATGTGTCTGGCCGAG
AAACTTGGTGCCCCGAATGGTTGGTATAGTGATCGAAGAAGTCGCCATTCTAAAAATTCT
CTCAAGTATTAGCTTAGAGACAAGAAAGACGAGAAGAAGAAGGAAGAAGCGTGATCTGCC
TTGTCATAAAGACCACATATCATGATTTCACTTAGATGAGTTTCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TATCGGCGGGAAGGCGTCGTTGCAGCCCAAGCGCACCCCTGTTTCTAACGAAGAGATGGA
AGCCATTTTGTTGGGAGGCTGCATTTGATCATAGAGATGGTGGACCTCTTCTCTTTCTTC
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AAGCTTTTTCTAG

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CC
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GTTTTGTTCTATGAACGTTTTCAGTCCCTTCTCTCCGCCGGGGAAGCCTCCGGTGAGACC
CATCATCTGTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGACAAGCTATCGTCTCCACT
C

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DS 

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GCC
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CAGAAACCTTGAAGGTAAACGTTACATACAACACATTTTAACAGTGAAAGCAAAGAAGAG
TAGAGAAAGAGATCCAACTTATGATGCTGCCTCCTTTTGCATCTGTTCGATAAGAGGCTC
AAGAACACAAGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGTCCTTTCTCTCTCCTTTCAAGCTCTTC
AAGCCTGAACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTCGAACAGGACGCCAGCTTTTCC
GTCCGTGATCCTCTGCACTATCC*GCAGTACATG**GTAAGGACTGTTCGCGTTCTTGAC
TATAGCGATCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTTCTTCTCTGT
AGCAATTGTGGACACAACATCATCGCTGCCTCCTCTCTTCGGTTGTGGTGGTGGTGGTGG
GTTTTGTTCAATGAACGTTTTCAGTCCCTTCTCTCCGCCGGGGAAGCCTCCGGTGAGACC
CATCATCTGTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGACAAGCTATCGTCTCCACT
CTCTTTCTTTGTCTGTTTCTCAGTCTTTAATGTATCTTCCTCTATGTTCCTCTGGAGCTC
CTTCTCGATACCTTTCTCTCCGTTGCATAGCCCTCGTCCTCCCATCACCTCCCATAGGTT
GAACTTAGCCATGGCCT

QA 4 740 4 740
DS 

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TCCTCTGCACTATCCCGCAGTACATGTGGTAAGGACTGTTCGCGTTCTTGACTATAGCGA
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GTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGACAAGCTATCGTCTCCACTCTCTTTCT
TTGTCTGTTTCTCAGTCTTTGATGTATCTTCCTCTATGTTCCTCTGGAGCTCCTTCTCGA
TACCTTTCTCTCCGTTGCATAGCCCTCGTCCTCCCATCACCTCCCATAGGTTGAACTTAG
CCATGGCCTTTACTCGATGAACGTTTGATTGCTGTTTTGAAGGCGGGAGAACCGATCGGT
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TGATCGAAGAAGTCGCCATTCTAAAAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4DU48TF 709 0 0
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AGGACTGTTCGCGTTCTTGACTATAGCGATCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGG
AGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTAGCAATTGTGGACACAACATCATCGCTGCCTCCTCTCTT
CGGTTGTGGTGGTGGTGGTGGGTTTTGTTCAATGAACGTTTTCAGTCCCTTCTCTCCGCC
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TCCCATCACCTCCCATAGGTTGAACTTAGCCATGGCCTTTACTCGATGAACGTTTGATTG
CTGTTTTGAAGGCGGGAGAACCGATCGGTTTGGAGTTGAAAATATATGTGTCTGGCCGAG
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CTCAAGTATTAGCTTAGAGACAAGAAAGACGAGAAGAAGAAGGAAGAAGCGTGATCTGCC
TTGTCATAAAGACCACATATCATGATTTCACTTAGATGAGTTTCTATCC

QA 1 709 1 709
DS 



CO CL187Contig2 895 4 4 U
ATAATGGCGACTTCGTCTATCACTATACCAACCATTCGGGGGACCAAGTTTCTCGGCCAG
ACACATCTATTTTCAACTCCAAACCGATCGGTTCTCCCGCCTTCAAAACAGCAATCAAAC
GTTCATCGAGTAAAAGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAAGAGGA
TTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAGACA
TCAAAGACTGAGAACGAGACAAAGAAAGAGAGCGATGACGACGACAATAGCTTGTCGTTT
CGAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCCCCGGC
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GCAACCGAAGAGAGGAGGCAGCGATGATGTTGTGTCCATAATTGCAACGGAGAAGAAGCC
GAGAGCTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAA
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CCTGTTCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAG
GAGAGAGAAAGGACCACCGGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGA
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AAGCTTCAGCATGTAATATAAAAAAATTCAATAAAATTCCAAACCATAAAGCACT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4EJ80TF U 28
AF RR4AX67TF U 1
AF RR4AX67JQ C 63
AF RR4EJ80JQ C 393
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BS 399 399 RR4AX67JQ
BS 400 747 RR4AX67TF
BS 748 895 RR4AX67JQ

RD RR4EJ80TF 580 0 0
GG
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GGTTCTCACGCCTTCAAAACAGCAATCAAACGTTCATCGAGTAAAAGCCATGGCTAAGTT
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GGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAGACATCAAAGACTGAGAACGAGACAAAGAAAGA
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CGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTCCTTACCACATGTACTGTGGGATAG
TACAGAGGATCACGGACGGGAAAGCGGGTGTCCTGTTC

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DS 

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ACACATCTATTTTCAACTCCAAACCGATCGGTTCTCCCGCCTTCAAAACAGCAATCAAAC
GTTCATCGAGTAAAAGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAAGAGGA
TTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAGACA
TCAAAGACTGAGAACGAGACAAAGAAAGAGAGCGATGACGACGACAATAGCTTGTCGTTT
CGAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCCCCGGC
GGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCC*ACCACCACCACCACCACCACC
GCAACCGAAGAGAGGAGGCAGCGATGATGTTGTGTCCATAATTGCAACGGAGAAGAAGCC
GAGAGCTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAA
CAGTCCTTACCACATGTACTGTGGGATAGTACAGAGGATCACGGACGGGAAAGCGGGTGT
CCTGTTCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAG
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ACAGATGCAAAACGAGGCAGCATCATA

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DS 

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TCATCGAGTAAAAGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAAGAGGATT
ATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAGACATC
AAAGACTGAGAACGAGACAAAGAAAGAGAGCGATGACGACGACAATAGCTTGTCGTTTCG
AGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCCCCGGCGG
CGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCCACCACCACCACCACCACCACCGC
AACCGAAGAGAGGAGGCAGCGATGATGTTGTGTCCATAATTGCAACGGAGAAGAAGCCGA
GAGCTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACA
GTCCTTACCACATGTACTGTGGGATAGTACAGAGGATCACGGACGGGAAAGCGGGTGTCC
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GAGAGAAAGGACCACCGGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAAC
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TTCACTGTTAAAATGTGTATGTAACGTTACTTTCAAGGTTTCTGACTGGTTCTAGAAAAA
GCTTCAGCATGTAATATAAAAAAATTCAATAAAATTCCAAACCATAAAGCACT

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DS 

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AAAA
CCCACCACCACCACCACCACCACCGCAACCGAAGAGAGGAGGCAGCGATGATGTTGTGTC
CATAATTGCAACGGAGAAGAAGCCGAGAGCTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGAT
GATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTCCTTACCACATGTACTGTGGGATAGTACAGAG
GATCACGGACGGGAAAGCGGGTGTCCTGTTCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAAC
GTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAGAGAAAGGACCACCGGGTAAGAATCCAAAGTC
TTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAACAGATGCAAAACGAGGCAGCATCATAAAGTGGATC
TTTCTCTAATCTCCCTACTCTTTGCTTTCACTGTTAAAATGTGTATGTAACGTTACTTTC
AAGGTTTCTGACTGGTTCTAGAAAAAGCTTCAGCATGTAATATAAAAAAATTCAATAAAA
TTCCAAACCATAAAGC

QA 5 500 5 500
DS 



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AGAACCAGTCAGAAACCTTGAAAGTAACGTTACATACACATTTTAACAGTGAAAGCAAAG
AGTAGGGAGATTAGAGAAAGATCCACTTTATGATGCTGCCTCGTTTTGCATCTGTTCGAT
AAGAGGCTCAAGAACACAAGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGTCCTTTCTCTCTCCTTTC
AAGCTCTTCAAGCCTGAACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTCGAACAGGACACC
CGCTTTCCCGTCCGTGATCCTCTGAACTATCCCGCAGTACATGTGGTAAGGACTGTTCGC
GTTCTTGACTATAGCGATCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTT
CTTCTCTGTACCAACTAAGGATACAACATCATCGCTGCTTCCTCTCTTCGGTTGTGGTGG
TGGTGGTGGTGGGTTTTGTTCGATGAACGTTTTAAGTCCCTTCTCTCCTCCCGGGAAGCC
TCCGGTGAGACCCATCATCTCTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGATAAGCT
ATTCTCGTCGTCATCGCTCTCTTTCTTTGTCTCGTTCTCGGTCTTTGAAGTCTCTTCCTC
TATGTTCCTCTGGAGCTCCTTCTCGATACCTTTCTCTCCGTTGCATAATCCTCTTCCTCC
CATCACCTCCCATAGGTTGAACTTAGCCATGGCCTTTACTCGACGAACGTTTGGTAGGTG
TTTTGAAGGCGGGAGAACCGATCGGTTTGGAGTTGAAAATTGATGTGTCTGGCCGAGAAA
CTTGGTGCCCCGAATGGTTGGTATAGTGATAGAAGAAGTCGCCATTATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4G828JQ U 1
AF RR4F174JQ U 5
AF RR4G828TF C 257
AF RR4F174TF C 289
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AGAACCAGTCAGAAACCTTGAAAGTAACGTTACATACACATTTTAACAGTGAAAGCAAAG
AGTAGGGAGATTAGAGAAAGATCCACTTTATGATGCTGCCTCGTTTTGCATCTGTTCGAT
AAGAGGCTCAAGAACACAAGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGTCCTTTCTCTCTCCTTTC
AAGCTCTTCAAGCCTGAACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTCGAACAGGACACC
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TGGTG

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DS 

RD RR4F174JQ 590 0 0
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GTGAGACCCATCATCTCTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGA

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DS 

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AAGGATACAACATCATCGCTGCTTCCTCTCTTCGGTTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGTTT
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ATCTCTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGATAAGCTATTCTCGTCGTCATCG
CTCTCTTTCTTTGTCTCGTTCTCGGTCTTTGAAGTCTCTTCCTCTATGTTCCTCTGGAGC
TCCTTCTCGATACCTTTCTCTCCGTTGCATAATCCTCTTCCTCCCATCACCTCCCATAGG
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A

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DS 

RD RR4F174TF 606 0 0
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AGCTCTCGGCTTCT*CTCTGTACCAACTAAGGATACAACATCATCGCTGCTTCCTCTCTT
CGGTTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGTTTTGTTCGATGAACGTTTTAAGTCCCTTCTCTCC
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AAACGATAAGCTATTCTCGTCGTCATCGCTCTCTTTCTTTGTCTCGTTCTCGGTCTTTGA
AGTCTCTTCCTCTATGTTCCTCTGGAGCTCCTTCTCGATACCTTTCTCTCCGTTGCATAA
TCCTCTTCCTCCCATCACCTCCCATAGGTTGAACTTAGCCATGGCCTTTACTCGACGAAC
GTTTGGTAGGTGTTTTGAAGGCGGGAGAACCGATCGGTTTGGAGTTGAAAATTGATGTGT
CTGGCCGAGAAACTTGGTGCCCCGAATGGTTGGTATAGTGATAGAAGAAGTCGCCATTAT
AAAAAA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 3 12

CO CL188Contig1 1118 6 16 U
CTATTTCTCTCTAAACCATTCTCTGCAAGAAAACTTCTCTCTAAAACCCATTTCTTTCTC
TCTCGAAAAAGTTCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACGCTCCTTTTTCTCTTCCCGCAATTT
GGTTTCTCAAGGACAATGGCAATAGAGGATCAAGAGAACACAATCCGCGAATTCAAGCCT
AAGAACAGAAGAATCATGGGAGCTGGTGGACCTGAGGAGGAAGATAACAGGTGGCCACCA
TGGCTGAAACCTCTGCTCAAAGAGCAATTCTTTGTTCACTGCAAGTTTCATGTAGACTCT
CATAAGAGTGAATGCAACATGTATTGCCTAGACTGCACCAACGGCCCTCTTTGCTCTCTC
TGTCTTGCCCATCACAAGGATCATCGCACCATTCAGATAAGGAGATCATCTTATCATGAT
GTTATAAGGGTGAATGAGATACAAAAGTATCTTGATATATCAGGGATCCAGACTTATGTG
ATCAATAGTGCTAAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAGGCCAGGGAAAGGT
GTGACCAATACCTGCAAGGTTTGCTATCGCAGCCTCGTTGATGATAGCTTCCGCTTCTGC
TCTCTTGGCTGCAAGATTGCTGGATCATCTAGAGGGTTTGAAAAGGGAAGGAAGAACCTT
CTGACGGAGACAGAGGATTCAGGTAGTTTCAGCCCATCAACACCTCCACTCACTGCATCT
AGTAGTTGCAGAATTGCCAAGCGAAGAAAGGGAATCCCTCACCGATCTCCAATGGGATAA
AAAAAGAAGCAGCAAAAGAGTTAAAGCCAATACAGAAGCTTTTGCCATTTGCTAGTTTCT
TGATCTATAAAGATTACTACACAGAAATGTATAGCTAATACATAAGCTCTGGTCTCTTAT
TTGCTTGTTTTAGCAAAAAACAAAGGCCTTAAGATAGGTTTTGGTATTACTTATGGTAAG
TCTGTGAATATGTAATGTGATGCAAAAAGGGGTAGAAAGGGAAATATAGGGCTTTTAAGG
GTTAAAAGTGGGAATAAAACAAAATTAGCTTTGGTTTTCGTTATGTACAGGTGGTGTAAA
ATGTAAATGTGGTTTGGTTGGTGAATATATGGATCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS44TF U 1
AF RR4H372TF U 11
AF RR4EF72TF U 11
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AF RR4D827JQ C 332
AF RR4GH08JQ C 350
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BS 128 527 RR4BS44TF
BS 528 528 RR4EF72TF
BS 529 557 RR4BS44TF
BS 558 558 RR4EF72TF
BS 559 613 RR4BS44TF
BS 614 614 RR4EF72TF
BS 615 630 RR4BS44TF
BS 631 726 RR4EF72TF
BS 727 728 RR4GH08TF
BS 729 745 RR4EF72TF
BS 746 1060 RR4D827JQ
BS 1061 1118 RR4GH08JQ

RD RR4BS44TF 630 0 0
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TCTCGAAAAAGTTCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACGCTCCTTTTTCTCTTCCCGCAATTT
GGTTTCCCAAGGACAATGGCAATAGAGGATCAAGAGAACACAATCCGCGAATTCAAGCCT
AAGAACAGAAGAATCATGGGAGCTGGTGGACCTGAGGAGGAAGATAACAGGTGGCCACCA
TGGCTGAAACCTCTGCTCAAAGAGCAATTCTTTGTTCACTGCAAGTTTCATGTAGACTCT
CATAAGAGTGAATGCAACATGTATTGCCTAGACTGCACCAACGGCCCTCTTTGCTCTCTC
TGTCTTGCCCATCACAAGGATCATCGCACCATTCAGATAAGGAGATCATCTTATCATGAT
GTTATAAGGGTGAATGAGATACAAAAGTATCTTGATATATCAGGGATCCAGACTTATGTG
ATCAATAGTGCTAAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAG*CCAGGGAAAGGT
GTGACCAATACCTGCAAAGTTTGCTATCGCAGCCTCGTTGATGATAGCTTCCGCTTCTGC
TCTCTTGGCTGCA*GATTGCTGGATCATCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4H372TF 669 0 0
GG
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TCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACGCTCCTTTTTCTCTTCCCGCAATTTGGTTTCTCAAGG
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ATCATGGGAGCTGGTGGACCTGAGGAGGAAGATAACAGGTGGCCACCATGGCTGAAACCT
CTGCTCAAAGAGCAATTCTTTGTTCACTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCATAAGAGTGAA
TGCAACATGTATTGCCTAGACTGCACCAACGGCCCTCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCAT
CACAAGGATCATCGCACCATTCAGATAAGGAGATCATCTTATCATGATGTTATAAGGGTG
AATGAGATACAAAAGTATCTTGATATATCAGGGATCCAGACTTATGTGATCAATAGTGCT
AAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAATACC
TGCAAGGTTTGCTATCGCAGCCTCGTTGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTTGGCTGC
AAGATTGCTGGATCATCTAGAGGGTTTGAAAAGGGAAAGAAGAACCTTCTGACGG*GACA
GAGGATT

QA 3 669 3 669
DS 

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GG
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TCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACGCTCCTTTTTCTCTTCCCGCAATTTGGTTTCTCAAGG
ACAATGGCAATAGAGGATCAAGAGAACACAATCCGCGAATTCAAGCCTAAGAACAGAAGA
ATCATGGGAGCTGGTGGACCTGAGGAGGAAGATATCAGGTGGCCACCATGGCTGAAACCT
CTGCTCAAAGAGCAATTCTTTGTTCACTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCATAAGAGTGAA
TGCAACATGTATTGCCTAGACTGCACCAACGGCCCTCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCAT
CACAAGGATCATCGCACCATTCAGATAAGGAGATCATCTTATCATGATGTTATAAGGGTG
AATGAGATACAAAAGTATCTTGATATATCAGGGATCCAGACTTATGTGATCAATAGTGCT
AAAGTCATCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAATACC
TGCAAGGTTTGCTATCGCAGCCTCGTTGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTTGGCTGC
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GAGGATTCAGGTAGTTTCAGCCCATCAACACCTCCACTCACTGCATCTAGTAGTA*CAGA
ATTGCCAAGCGAA

QA 3 735 3 735
DS 

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GG
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TCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACGCTCCTTTTTCTCTTCCCGCAATTTGGTTTCTCAAGG
ACAATGGCAATAGAGGATCAAGAGAACACAATCCGCGAATTCAAGCCTAAGAACAGAAGA
ATCATGGGAGCTGGTGGACCTGAGGAGGAAGATAACAGGTGGCCACCATGGCTGAAACCT
CTGCTCAAAGAGCAATTCTTTGTTCACTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCATAAGAGTGAA
TGCAACATGTATTGCCTAGACTGCACCAACGGCCCTCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCAT
CACAAGGATCATCGCACCATTCAGATAAGGAGATCATCTTATCATGATGTTATAAGGGTG
AATGAGATACAAAAGTATCTTGGTATATCAGGGATCCAGACTTATGTGATCAATAGTGCT
AAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAAT**C
TGCAAGGTTTGCTATCGCAGCCTCGTTGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCCCTTGGCTGC
AAGATTGCTGGATCATCTAGAGGGTTTGAAAAGGGAAGGAAGA*CCTTCTGACGGAGACA
GAGGATTCACGTAGTTTCAGCCCATCAACACCTCCACTCACTGCATCTAGTAGTTGCAGA
ATTGCTAAGCGAA
G

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR4D827JQ 729 0 0
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TTCAGATAAGGAGATCATCTTATCATGATGTTATAAGGGTGAATGAGATACAAAAGTATC
TTGATATATCAGGGATCCAGACTTATGTGATCAATAGTGCTAAAGTCGTCTTCTTGAACG
AGAGGCCTCAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAATACCTGCAAGGTTTGCTATCGCA
GCCTCGTTGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTTGGCTGCAAGATTGCTGGATCATCTA
GAGGGTTTGAAAAGGGAAGGAAGAACCTTCTGACGGAGACAGAGGATTCAGGTAGTTTCA
GCCCATCAACACCTCCACTCACTGCATCTAGTAGTTGCAGAATTGCCAAGCGAAGAAAGG
GAATCCCTCACCGATCTCCAATGGGATAAAAAAAGAAGCAGCAAAAGAGTTAAAGCCAAT
ACAGAAGCTTTTGCCATTTGCTAGTTTCTTGATCTATAAAGATTACTACACAGAAATGTA
TAGCTAATACATAAGCTCTGGTCTCTTATTTGCTTGTTTTAGCAAAAAACAAAGGCCTTA
AGATAGGTTTTGGTATTACTTATGGTAAGTCTGTGAATATGTAATGTGATGCAAAAAGGG
GTAGAAAGGGAAATATAGGGCTTTTAAGGGTTAAAAGTGGGAATAAAACAAAATTAGCTT
TGGTTTTCG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4GH08JQ 769 0 0
TTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCATCACAAGGATCATCGCACCATTCAGATAAGGAGATCAT
CTTATCATGATGTTATAAGGGTGAATGAGATACAAAAGTATCTTGGTATATCAGGGATCC
AGACTTATGTGATCAATAGTGCTAAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAGGC
CAGGGAAAGGTGTGACCAAT**CTGCAAGGTTTGCTATCGCAGCCTCGTTGATGATAGCT
TCCGCTTCTGCTCCCTTGGCTGCAAGATTGCTGGATCATCTAGAGGGTTTGAAAAGGGAA
GGAAGAACCTTCTGACGGAGACAGAGGATTCAGGTAGTTTCAGCCCATCAACACCTCCAC
TCACTGCATCTAGTAGTTGCAGAATTGCTAAGCGAAGAAAGGGAATCCCTCACCGATCTC
CAATGGGATAAAAAAAGAAGCAGCAAAAGAGTTAAAGCCAATACAGAAGCTTTTGCCATT
TGCTAGTTTCTTGATCTATAAAGATTACTACACAGAAATGTATAGCTAATACATAAGCTC
TGGTCTCTTATTTGCTTGTTTTAGCAAAAAACAAAGGCCTTAAGATAGGTTTTGGTATTA
CTTATGGTAAGTCTGTGAATATGTAATGTGATGCAAAAAGGGGTAGAAAGGGAAATATAG
GGCTTTTAAGGGTTAAAAGTGGGAATAAAACAAAATTAGCTTTGGTTTTCGTTATGTACA
GGTGGTGTAAAATGTAAATGTGGTTTGGTTGGTGAATATATGGATCTGG

QA 1 769 1 769
DS 



CO CL188Contig2 1219 3 19 U
CGGGGGGTCGACTTTGCTAAGATAAGAGAGAGACTGTCTTCTCTCCTTCCTCATTCTTCT
CTCTCTCAAACCTTCTCTGCAACAAAACTCCTCACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATAG
AAAAGTTCGAAGCTTCACTCGAAAAAGACTTTGTCTTGTAGGTTTCTTAACGAAAATGGC
GATCGAGGATCAGGAGAATACCATCCGAGAAATCAAGACTAAGAACAGAAGAATCATGGG
AGCTGGTGGACCGGAGGAGGAAGATAACAGGCAGCCGCCATGGCTGAAACCTCTGCTTCA
AGAGAAATTTTTTGGTCATTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCACAAGAGTGAATGCAATAT
GTACTGCTTAGACTGTACCAACGGTCCGCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCATCACAAGAA
TCATCACACCATTCAGATAAGGAGGTCTTCATATCATGATGTTATAAGGGTGAATGAGAT
ACAAAAACATATTGATATATCAGGGATCCAAACTTATGTGATCAATAGTGCTAAAGTCAT
CTTCTTGAACGAGAGGCCACAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAATACCTGCAAGGC
TTGCTATCGTAGCCTCGTCGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTCGGCTGCAAGATTGC
TGGATCTTCTAGAGGATATGAAAAGGGAAGGAAGAACCTTGTGGTGGAATCAGATGATTC
AAGTAGCAGCATTGGAATTGGGAAGAACATTCAGAGTTTCGGCCCATCAACACCTCCACT
TACTGCATCTAGTCATTGCAGAATCGCCAAGCGAAGAAAGGGAATCCCTCACCGGTCTCC
AATGGGATAAAAGACAGAAGAAGCAAAAGTGTTAAAAGCCAATACAGAAGCTCATTTACC
AGTTTCTTGATCTATAAGATTACACACAAAGGTTTAGCTAAGAGAAGCCTTTGTCTCTTA
TCTTTTATATACCAAGGTATGGTCTTTCGTCTGTGTTAGGTGAAGAAAAGGCCATATAGG
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TGCATAAAGGGTAGAAAGGTAAATATAGGGCTTTGAAGGGGGTAAAAGTGGGAATAAAAC
AAAATTAGTTTTTTGTTGTAAATTTGGTTTGGTTAGGTGCATACATGCATCTGGAATAAC
AAAATAAGTAATGAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D955TF U 1
AF RR4AW02TF U 51
AF RR4AW02JQ C 625
BS 1 110 RR4D955TF
BS 111 116 RR4AW02TF
BS 117 351 RR4D955TF
BS 352 352 RR4AW02TF
BS 353 486 RR4D955TF
BS 487 487 RR4AW02TF
BS 488 599 RR4D955TF
BS 600 600 RR4AW02TF
BS 601 665 RR4D955TF
BS 666 666 RR4AW02TF
BS 667 690 RR4D955TF
BS 691 691 RR4AW02TF
BS 692 757 RR4D955TF
BS 758 851 RR4AW02TF
BS 852 852 RR4AW02JQ
BS 853 858 RR4AW02TF
BS 859 859 RR4AW02JQ
BS 860 881 RR4AW02TF
BS 882 1219 RR4AW02JQ

RD RR4D955TF 757 0 0
CGGGGGGTCGACTTTGCTAAGATAAGAGAGAGACTGTCTTCTCTCCTTCCTCATTCTTCT
CTCTCTCAAACCTTCTCTGCAACAAAACTCCTCACTTTCTCTCTCTCTCT******ATAG
AAAAGTTCGAAGCTTCACTCGAAAAAGACTTTGTCTTGTAGGTTTCTTAACGAAAATGGC
GATCGAGGATCAGGAGAATACCATCCGAGAAATCAAGACTAAGAACAGAAGAATCATGGG
AGCTGGTGGACCGGAGGAGGAAGATAACAGGCAGCCGCCATGGCTGAAACCTCTGCTTCA
AGAGAAATTTTTTGGTCATTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCACAAGAGTGAGTGCAATAT
GTACTGCTTAGACTGTACCAACGGTCCGCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCATCACAAGAA
TCATCACACCATTCAGATAAGGAGGTCTTCATATCATGATGTTATAAGGGTGAATGAGAT
ACAAAAGCATATTGATATATCAGGGATCCAAACTTATGTGATCAATAGTGCTAAAGTCAT
CTTCTTGAACGAGAGGCCACAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAATACCTGCAAGGT
TTGCTATCGTAGCCTCGTCGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTCGGCTGCAAGATTGC
TGGATTTTCTAGAGGATATGAAAAGGGAAG*AAGAACCTTGTGGTGGAATCAGATGATTC
AAGTAGCAGCATTGGAATTGGGAAGAACATTCAGAGT

QA 1 757 1 757
DS 

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GG
ATTCTTCTCTCTCTCAAACCTTCTCTGCAACAAAACTCCTCACTTTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTATAGAAAAGTTCGAAGCTTCACTCGAAAAAGATTTTGTCTTGTAGGTTTCTTAACG
AAAATGGCGATCGAGGATCAGGAGAATACCATCCGAGAAATCAAGACTAAGAACAGAAGA
ATCATGGGAGCTGGTGGACCGGAGGAGGAGGATAACAGGCAGCCGCCATGGCTGAAACCT
CTGCTTCAAGAGAAATTTTTTGGTCATTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCACAAGAGTGAA
TGCAATATGTACTGCTTAGACTGTACCAACGGTCCGCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCAT
CACAAGAATCATCACACCATTCAGATAAGGAGGTCTTCATATCATGATGTTATAAGGGTG
AATGAGATACAAAAACATATTGATATATCAGGGATCCAAACTTATGTGATCAATAGTGCT
AAAGTCATCTTCTTGAACGAGAGGCCACAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACCAATACC
TGCAAGGCTTGCTATCGTAGCCTCGTCGATGATAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTCGGCTGC
AAGATTGCTGGATCTTCTAGAGGATATGAAAAGGGAAGGAAGAACCTTGTGGTGGAATCA
GATGATTCAAGTAGCAGCATTGGAATTGGGAAGAACATTCAGAGTTTCGGCCCATCAACA
CCTCCACTTACTGCATCTAGTCATTGCAGAATCGCCAAGCGAAGAAAGGGAATCCCTCAC
CGGTCTCCAATGGGATAAA*GACAGA*GAAGCAAAAGTGTTAAAAGCCA
TACAGAGC

QA 3 831 3 831
DS 

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TAGCTTCCGCTTCTGCTCTCTCGGCTGCAAGATTGCTGGATCTTCTAGAGGATATGAAAA
GGGAAGGAAGAACCTTGTGGTGGAATCAGATGATTCAAGTAGCAGCATTGGAATTGGGAA
GAACATTCAGAGTTTCGGCCCATCAACACCTCCACTTACTGCATCTAGTCATTGCAGAAT
CGCCAAGCGAAGAAAGGGAATCCCTCACCGGTCTCCAATGGGATAAAAGACAGAAGAAGC
AAAAGTGTTAAAAGCCAATACAGAAGCTCATTTACCAGTTTCTTGATCTATAAGATTACA
CACAAAGGTTTAGCTAAGAGAAGCCTTTGTCTCTTATCTTTTATATACCAAGGTATGGTC
TTTCGTCTGTGTTAGGTGAAGAAAAGGCCATATAGGTTTTGTCCTACTAATGGCAAAAGT
CTGTGAATATGTAATGTGCTTTGTATATTAATGTGATGCATAAAGGGTAGAAAGGTAAAT
ATAGGGCTTTGAAGGGGGTAAAAGTGGGAATAAAACAAAATTAGTTTTTTGTTGTAAATT
TGGTTTGGTTAGGTGCATACATGCATCTGGAATAACAAAATAAGTAATGAGATTC

QA 1 595 1 595
DS 



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ACCACATTTACATTTTACACCACTTGTACATAACGAAAACCAAAGCTAATTTTGTTTTAT
TCCCACTTTTAACCCTTAAAAGCCCTATATTTCCCTTTCTACCCCTTTTTGCATCACATT
ACATATTCACAGACTTACCATAAGTAATACCAAAACCTATCTTAAGGCCTTTGTTTTTTG
CTAAAACAAGCAAATAAGAGACCAAAGCTTATGTATTAGCTATACATTTCTGTGTAGTAA
TCTTTATAGATCAAGAAACTAGCAAATGGCAAAAGCTTCTGTATTGGCTTTAACTCTTTT
GCTGCTTCTTTTTTTATCCCATTGGAGATCGGGGAGGGATTCCCTTTCTTCCCTTG


BQ
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AF RR4BS44JQ U 2
AF RR4EF72JQ U 103
AF RR4H372JQ U 1
BS 1 69 RR4H372JQ
BS 70 70 RR4BS44JQ
BS 71 110 RR4H372JQ
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BS 112 188 RR4H372JQ
BS 189 189 RR4BS44JQ
BS 190 416 RR4H372JQ

RD RR4BS44JQ 260 0 0
GGT
GATAAGTCTCATCATTGTTTATTTGTTATTCCAGATCCATATATTCACCTAACCAAACCA
CATTTACATTTTACACCACTTGTACATAACGAAAACCAAAGCTAATTTTGTTTTATTCCC
ACTTTTAACCCTTAAAAGCCCTATATTTCCCTTTCTACCCCTTTTTGCATCACATTACAT
ATTCACAGACTTACCATAAGTAATACCAAAACCTATCTTAAGGCCTTTGTTTTTTGCTAA
AACAAGCAAATAA
AAAA

QA 4 256 4 256
DS 

RD RR4EF72JQ 156 0 0
AAA
CTAATTTTGTTTTATTCCCACTTTTAACCCTTAAAAGCCCTATATTTCCCTTTCTACCCC
TTTTTGCATCACATTACATATTCACAGACTTACCATAAGTAATACCAAAACCTATCTTAA
GGGCTTTGTTTTTTGCTAAAACAAGCAAATAA
A

QA 4 155 4 155
DS 

RD RR4H372JQ 416 0 0
AGGGGATAAGTCTCATCATTGTTTATTTGTTATTCCAAATCCATATATTCACCTAACCAA
ACCACATTTGCATTTTACACCACTTGTACATAACGAAAACCAAAGCTAATCTTGTTTTAT
TCCCACTTTTAACCCTTAAAAGCCCTATATTTCCCTTTCTACCCCTTTTTGCATCACATT
ACATATTCCCAGACTTACCATAAGTAATACCAAAACCTATCTTAAGGCCTTTGTTTTTTG
CTAAAACAAGCAAATAAGAGACCAAAGCTTATGTATTAGCTATACATTTCTGTGTAGTAA
TCTTTATAGATCAAGAAACTAGCAAATGGCAAAAGCTTCTGTATTGGCTTTAACTCTTTT
GCTGCTTCTTTTTTTATCCCATTGGAGATCGGGGAGGGATTCCCTTTCTTCCCTTG

QA 1 416 1 416
DS 



AS 2 10

CO CL189Contig1 1041 8 9 U
GGACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGGTTTTTATTCATTCATCACTCT
ATCATTCTCCTCTCAACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCT
GCTTCAAAAGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAA
GGACGAGCCGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCA
TCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTC
TTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATG
GAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGAGAGGACTGATATCAGAGATC
ATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCC
AAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTG
TGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATCGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATC
AGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATC
CGTGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAG
ACTGCGAA*GGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAA
CAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAATTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTTTGACA
TCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGTATTAC
GGATACAAACACATACCCGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCGGTTATAAGAGCAGAA
GTTATAATAAGTATGAGAATGAGATTATTGGATACTGAAATTTTTGTTTATTTTGCATGG
AAGATGCAGATTCTACATATT


BQ
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40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA82TF U 257
AF RR4DZ80TF U 54
AF RR4B893TF U 1
AF RR4CW05JQ C 194
AF RR4A437JQ C 655
AF RR4A437TF U 655
AF RR4D528JQ C 280
AF RR4B893JQ C 212
BS 1 728 RR4B893TF
BS 729 729 RR4A437TF
BS 730 782 RR4B893TF
BS 783 784 RR4A437TF
BS 785 809 RR4B893TF
BS 810 811 RR4A437TF
BS 812 825 RR4B893TF
BS 826 995 RR4A437TF
BS 996 1041 RR4B893JQ

RD RR4EA82TF 181 0 0
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CAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATTG
CTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGAGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGAAC
G

QA 1 181 1 181
DS 

RD RR4DZ80TF 683 0 0
GGACTCTATCATTCTC
CTCTCAACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCAAAA
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GTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGTATCTAACTTT
GGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTT
CCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACT
TTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGAGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGA
TTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGATATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTC
GCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTC
CTTAGCTCTGGTCCTGTTATCGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGG
CGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGAT
CTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAAA
G*ATGAG

QA 17 683 17 683
DS 

RD RR4B893TF 825 0 0
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ATCATTCTCCTCTCAACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCT
GCTTCAAAAGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAA
GGACGAGCCGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCA
TCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTC
TTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATG
GAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGAGAGGACTGATATCAGAGATC
ATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCC
AAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTG
TGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATCGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATC
AGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATC
CGTGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAG
ACTGCGAAAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAA
CAT*GCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAT*TAAATTCCTCTTTC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4CW05JQ 800 0 0
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GATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTG
CTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCA
TTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTTG
AACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCAC
ATAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAATACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTA
GCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTA
AACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCAGAGGAGATCTTG
CCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAA*GGAT
GAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGAGAAG
TGGATCTATGGCGACAACTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTTTGACATCCAATAAAATTG
TTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACA****TTACAGATACAAACACA
TTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTATCAGAGCAGAAGTAATAATAAGTA
TGAGAATGAGATTATTGGAT

QA 1 800 1 800
DS 

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G
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CAGAGACTGCGAA*GGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTAC
ACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAATTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTT
TGACATCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGT
ATTACGGATACAAACACATACCCGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCGGTTATAAGAG
CAGAAGTTATAATAAGTATGAGAATGAGATTATTGGATAC
TGG

QA 2 341 2 341
DS 

RD RR4A437TF 344 0 0
G
CAATCCGTGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGAC
CAGAGACTGCGAA*GGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTAC
ACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAATTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTT
TGACATCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGT
ATTACGGATACAAACACATACCCGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCGGTTATAAGAG
CAGAAGTTATAATAAGTATGAGAATGAGATTATTGGATAC
TGG

QA 2 341 2 341
DS 

RD RR4D528JQ 718 0 0
AAGACTTGGATCACTGGACTCTTTGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAA
GAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAG
CGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTTGAACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGT
ATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAGGCATTACCATGATCTCAAGGAA
AGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTA
TGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAG
AAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAATATAATC
CATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCAAA*GGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCA
AGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAACTAAATTCC
TCTTTTTCTCTTCTTTTGACATCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATA
AAAACAAAAGACAGGTATTACGGATACAAACACATTCCCGGTTTTGTATTTTCCCTGGTG
AACTCGGTTATAAGAGCAGAAGTTATAATAAGTATGAGAATGAGATTATTGGATAC
CG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4B893JQ 830 0 0
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CCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTC
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GAGTGCAGAGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGC
TTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATC
TCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATCG
CCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCG
ATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGA
ACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAA*GGATGAGATCAATCTGTGGTTT
AAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAATGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAAT
TAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTTTGACATCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCC
AAACAATAAAAACAAAAGACAGGTATTACGGATACAAACACATACCCGGTTTTGTATTTT
CCCTGGTGAACTCGGTTATAAGAGCAGAAGTTATAATAAGTATGAGAATGAGATTATTGG
ATACTGAAATTTTTGTTTATTTTGCATGGAAGATGCAGATTCTACATATT

QA 1 830 1 830
DS 



CO CL189Contig2 755 2 6 U
GGGACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATCACTCTCTGA
ACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAAAGCAGCA
AGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGCCGTTGGT
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TCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCT
GCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATT
GCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTTGAA
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AAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGC
TCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAA
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GTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAAGATGAGA
TCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGACTTGTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ21TF U 1
AF RR4CW05TF U 33
BS 1 47 RR4GJ21TF
BS 48 48 RR4CW05TF
BS 49 317 RR4GJ21TF
BS 318 318 RR4CW05TF
BS 319 709 RR4GJ21TF
BS 710 755 RR4CW05TF

RD RR4GJ21TF 709 0 0
GGGACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATT*ATCACTCTCTGA
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AGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGCCGTTGGT
GCAGCAGCATCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAGA
TCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCT
GCAGCCTTCATGGTTCAGGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATT
GCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTTGAA
CGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAG
AAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGC
TCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAA
CTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCAGAGGAGATCTTGCC
GTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4CW05TF 723 0 0
AGGGG
GGCTTTTATTCATCACTCTCTGAACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCT
GCAGATCTGCTTCGAAAGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCT
TCTCTGAAGGACGAGCCGTTGGTGCAGCAGCATCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTC
TCTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCA
CTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTG
CTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATAT
CAGAGATCATTTCTCGATTTGAACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTG
TTCCTTCCAAGGATTTCGCACATAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAATACCTTTCTTCA
ATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAG
GTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTG
GGACAATCAGAGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGA*CATAATCCATGGAAGTGATG
GACCAGAGACTGCGAAGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGACTTGTCTCTT

QA 6 723 6 723
DS 



AS 2 10

CO CL190Contig1 937 4 11 U
GGGTCTCGTCTCGTATCGTCTCTCAGATTTCTTCCTCATCTAGAAACTTCTCGTTCGTGA
TGCGTCGTTCTGCAGCATCGAAGAAGAAATCTGATTCAGTCACATCTTCAACCACGGATC
TCTTTCGCTCAGGTTCAAGTAAGGCGACGAGTAGTAAAGAGATGGATCAAATAGATCATT
TGTTTAATCAGTATGCCAATTCTTCTTCCAATCTCATTGACCCTGAAGGAATAGAGGAAC
TATGCTCCAACTTGCAAGTTTCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGGAAAA
TGAAAGCTGAGAAACAAGGTTGCTTTACACAAGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTT
TAAGAGCTGATACAATCAATAAACTCAAGAAAGCCCTTCCCGAGCTTGAGAAAGAGGTCA
GGAGGCAGACAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGTTTAACAGAGG
*AAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTCGATATTGTTATGGGA
TCTACATTCCGTGCCCAAGTTGACTACTTTGTCGAGTATTTAAAGATCCAAAATGACTAC
AAAGTCATAAACATGGACCAGTGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAGTTTC
CCGGAGATGACAGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTCTGGTTCTCGACAGTTTTGTT
GAGTGGATTAGTGAAAAGCAAGCTTGAAAGCTGAAAAACACTCGAGATCGTTGGGCCAAC
AAACAGATTCAGCACAGTTTTTATTTGAGTTCTCATCTTTCAAACTTCAGAAAGACCCAT
TATATGATTTTTGTTACATGTGATCAAATAGAGGGACATACATTACGTTTGAAATATTAT
ATTCAGTTCTAGCAACTAATGAAAGTCTTTGAATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A030JQ C 352
AF RR4AR96TF U 1
AF RR4A030TFB U 11
AF RR4AR96JQ C 222
BS 1 129 RR4AR96TF
BS 130 130 RR4A030TFB
BS 131 168 RR4AR96TF
BS 169 169 RR4A030TFB
BS 170 385 RR4AR96TF
BS 386 386 RR4A030TFB
BS 387 599 RR4AR96TF
BS 600 617 RR4A030TFB
BS 618 618 RR4AR96JQ
BS 619 828 RR4A030TFB
BS 829 937 RR4AR96JQ

RD RR4A030JQ 185 0 0
TTAAGGCTTTAAGAGCTGATACAATCAATAAACTCAAGAAAGCCCTTCCCGAGCTTGAGA
AAGAGGTCAGGAGGCAGACAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGTT
TAACAGAGGGAAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTCGATATT
GTTAT

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR4AR96TF 599 0 0
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TGCGTCGTTCTGCAGCATCGAAGAAGAAATCTGATTCAGTCACATCTTCAACCACGGATC
TCTTTCGCTTAGGTTCAAGTAAGGCGACGAGTAGTAAAGAGATGGATCGAATAGATCATT
TGTTTAATCAGTATGCCAATTCTTCTTCCAATCTCATTGACCCTGAAGGAATAGAGGAAC
TATGCTCCAACTTGCAAGTTTCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGGAAAA
TGAAAGCTGAGAAACAAGGTTGCTTTACACAAGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTT
TAAGAGCTGATACAATCAATAAACTTAAGAAAGCCCTTCCCGAGCTTGAGAAAGAGGTCA
GGAGGCAGACAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGTTTAACAGAGG
*AAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTCGATATTGTTATGGGA
TCTACATTCCGTGCCCAAGTTGACTACTTTGTCGAGTATTTAAAGATCCAAAATGACTA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4A030TFB 818 0 0
GGGTA
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CATCGAAGAAGAAATCTGATTCAGTCACATCTTCAACCACGGATCTCTTTCGCTCAGGTT
CAAGTAAGGCGACGAGTAGTAAAGAGATGGATCAAATAGATCATTTGTTTAATCAGTATG
CCAATTCTTCTTCCAATCTCATTGACCCTGAAGGAATAGAGGAACTATGCTCCAACTTGC
AAGTTTCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGGAAAATGAAAGCTGAGAAAC
AAGGTTACTTTACACAAGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTTAAGAGCTGATACAA
TCAATAAACTCAAGAAAGCCCTTCCCGAGCTTGAGAAAGAGGTCAGGAGGCAGACAAATT
TTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGTTTAACAGAGG*AAAAACAGAAGAGC
ATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTCGATATTGTTATGGGATCTACATTCCGTGCC
CAAGTTGACTACTTTGTCGAGTATTTAAAGATCCAAAATGACTACAAAGTCATAAACATG
GATCAGTGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAGTTTCCCGGAGATGACAGAA
TACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTCTGGTTCTCGACAGTTTTGTTGAGTGGATTAGTGAA
AAGCAAGCTTGAAAGCTGAAAAACACTCGAGATCGTTGGGCCAACAAACAGATTCAGCAC
AGTTTTTATTTGAGTTCTCATCTTTCAAACTTC

QA 6 818 6 818
DS 

RD RR4AR96JQ 716 0 0
CCTGAAGGAATAGAGGAACTATGCTCCAACTTGCAAGTTTCTCATACTGATATCAGAATC
TTGATGCTTGCTTGGAAAATGAAAGCTGAGAAACAAGGTTGCTTTACACAAGAGGAGTGG
AGAAGAGGCCTTAAGGCTTTAAGAGCTGATACAATCAATAAACTTAAGAAAGCCCTTCCC
GAGCTTGAGAAAGAGGTCAGGAGGCAGACAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTC
CGCTATTGTTTAACAGAGG*AAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACT
CCTCGATATTGTTATGGGATCTACATTCCGTGCCCAAGTTGACTACTTTGTCGAGTATTT
AAAGATCCAAAATGACTACAAAGTCATAAACATGGACCAGTGGATGGGCTTTTACAGGTT
CTGCAATGAGATAAGTTTCCCGGAGATGACAGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTCT
GGTTCTCGACAGTTTTGTTGAGTGGATTAGTGAAAAGCAAGTTTGAAAGCTGAAAAACAC
TCGAGATCGTTGGGCCAACAAACAGATTCAGCACAGTTTTTATTTGAGTTCTCATCTTTC
AAACTTCAGAAAGACCCATTATATGATTTTTGTTACATGTGATCAAATAGAGGGACATAC
ATTACGTTTGAAATATTATATTCAGTTCTAGCAACTAATGAAAGTCTTTGAATACT

QA 1 716 1 716
DS 



CO CL190Contig2 943 6 16 U
GGTGTCTCTCATCCAATCAGGTGCCTTGGTCTCTCTCTCTCAGCTTTGGCGTTCGTGATG
CGTCGTTCTGGTGCTGCTGCTGCATCTAAGAAGAAATCGGATTCAATCACATCTTCAGCC
ACGGATCTCTTTCGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAGAGATGGATCGGATAGAC
CATTTGTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGAG
GAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGG
AAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAG
GCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGAG
GTCAGGAGGCAATCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAACA
GAGGAAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCATG
GGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGAC
TACAAAGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAGT
TTCCCGGAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCATTGGTTCTCGACAATTTT
GTCGAGTTGATTCGTGAAAAACAAGCCTGAAAAGCTTTTGCCCCTGTATCGGTCGGTGTT
TGGTTTTTGCAGGATCGTTGGTTCGTTCTCAACAAACAGATTCAGCAAGAATTTTATTTC
AGTTTCTTCAATCCTTCAAAAACATTGTTTAAAAACAAACAACACATTATATGATTTTTG
TTACATGTGATTAACTTCAATAGAGGGGAACACACTATGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F570TF U 1
AF RR4DA05TF U -2
AF RR4AA22TF U -8
AF RR4DA05JQ C 73
AF RR4AA22JQ C 120
AF RR4F570JQ C 307
BS 1 641 RR4F570TF
BS 642 642 RR4AA22TF
BS 643 671 RR4F570TF
BS 672 740 RR4AA22TF
BS 741 741 RR4DA05JQ
BS 742 752 RR4AA22TF
BS 753 753 RR4DA05JQ
BS 754 763 RR4AA22TF
BS 764 764 RR4DA05JQ
BS 765 784 RR4AA22TF
BS 785 825 RR4DA05JQ
BS 826 826 RR4AA22JQ
BS 827 892 RR4DA05JQ
BS 893 893 RR4AA22JQ
BS 894 907 RR4DA05JQ
BS 908 943 RR4AA22JQ

RD RR4F570TF 671 0 0
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CGTCGTTCTGGTGCTGCTGCTGCATCTAAGAAGAAATCGGATTCAATCACATCTTCAGCC
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CATTTGTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGAG
GAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGG
AAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAG
GCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGAG
GTCAGGAGGCAATCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAACA
GAGGAAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCATG
GGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGAC
TACAAAGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAG*TTCTGCAATGAGATAAGT
TTCCCGGAGAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4DA05TF 674 0 0
AGGGGTGG
CTCTCATCCAATCAGGTGCCTTGGTCTCTCTCTCTCAGCTTTGGCGTTCGTGATGCGTCG
TTCTGGTGCTGCTGCTGCATCTAAGAAGAAATCGGATTCAATCACATCTTCAGCCACGGA
TCTCTTTCGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAGAGATGGATCGGATAGACCATTT
GTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGAGGAGCT
CTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGGAAGAT
GAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTT
AAGAGCTGATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGAGGTCAG
GAGGCAATCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAACAGAGGA
AAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCATGGGATC
TACATTCCGACACCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGACTACAA
AGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAG*TTCTGCAATGAGATAAGTTTCCC
GGAGAT

QA 9 674 9 674
DS 

RD RR4AA22TF 793 0 0
GGGTCTCTCTGTGT
CTCTCATCCAATCAGGTGCCTTGGTCTCTCTCTCTCAGCTTTGGCGTTCGTGATGCGTCG
TTCTGGTGCTGCTGCTGCATCTAAGAAGAAATCGGATTCAATCACATCTTCAGCCACGGA
TCTCTTTCGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAGAGATGGATCGGATAGACCATTT
GTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGAGGAGCT
CTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGGAAAAT
GAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTT
AAGAGCTGATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGAGGTCAG
GAGGCAATCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAACAGAGGA
AAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCATGGGATC
TACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGACTACAA
AGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAGTTTCCC
GGAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCATTGGTTCTCGACAATTTTGTCGA
GTTGATTCGTGAAAA*CAAGCCTGAAA*GCTTTTGCCC*TGTATCGGTCGGTGTTTGGT

QA 15 793 15 793
DS 

RD RR4DA05JQ 837 0 0
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CGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAGAGATGGATCGGATAGACCATTTGTTTAAT
CAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGAGGAGCTCTGTTCC
AATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTGGAAGATGAAATCT
GAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTTAAGAGCT
GATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGAGGTCAGGAGGCAA
TCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAACAGAGGAAAAACAG
AAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCATGGGATCTACATTC
CGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGACTACAAAGTCATA
AACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTTTGCAATGAGATAAGTTTCCCGGAGATG
ACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCATTGGTTCTCGACAATTTTGTCGAGTGGATT
CGTGAAAAACAAGCCTGAAAAGCTTTTGCCCCTGTATCGGTCGGTGTTTGGTTTTTGCAG
GATCGTTGGTTCGTTCTCAACAAACAGATTCAGTAAGAATTTTATTTCAGTTTCTTCAAT
CCTTCAAAAACATTGTTTAAAAACAAACAACACATTATATCATTTTTGTTACATG
CG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4AA22JQ 824 0 0
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CCATTTGTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGA
GGAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTG
GAAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAA
GGCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGA
GGTCAGGAGGCAATCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAAC
AGAGGAAAAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCAT
GGGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGA
CTACAAAGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTTTGCAATGAGATAAG
TTTCCCGGAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCATTGGTTCTCGACAATTT
TGTCGAGTTGATTCGTGAAAAACAAGCCTGAAAAGCTTTTGCCCCTGTATCGGTCGGTGT
TTGGTTTTTGCAGGATCGTTGGTTCGTTCTCAACAAACAGATTCAGCAAGAATTTTATTT
CAGTTTCTTCAATCCTTCAAAAACATTGTTTAAAAACAAACAACACATTATATGATTTTT
GTTACATGTGATTAACTTCAATAGAGGGGAACACACTATGTTTG

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4F570JQ 637 0 0
AAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTTA
AGAGCTGATACACTCAGTAAACTAAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGAGGTCAGG
AGGCAATCAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAACAGAGGAA
AAACAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTGGAGATTGTCATGGGATCT
ACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGATCCAAAACGACTACAAA
GTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTTTGCAATGAGATAAGTTTCCCG
GAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCATTGGTTCTCGACAATTTTGTCGAG
TGGATTCGTGAAAAACAAGCCTGAAAAGCTTTTGCCCCTGTATCGGTCGGTGTTTGGTTT
TTGCAGGATCGTTGGTTCGTTCTCAACGAACAGATTCAGCAAGAATTTTATCTCAGTTTC
TTCAATCCTTCAAAAACATTGTTTAAAAACAAACAACACATTATATGATTTTTGTTACAT
GTGATTAACTTCAATAGAGGGGAACACACTATGTTTG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 2 11

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ATACTCATATTTTCTCCTTGTTTGTTTTGTGAAATTATGTTCCCGAATTTATAAATGCTT
TCCATTTCCAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B719JQ C 1
AF RR4B719TF U 1
BS 1 1 RR4B719JQ
BS 2 311 RR4B719TF

RD RR4B719JQ 311 0 0
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TTATTTCTTCCAAGTAAAAGAAAAAGAAAATCATTTTGCTTTTCAAATGATTAGTGGAAG
TCCCTTAACTGCAAAGGATGGAATAAATAAGAAACTTACTTTTCCTCTTTGTTTTATTTG
GGTTGGACTTTGTTTGAATAAATGATTTTGTTGAGTACACAAACCAACATAAAGTTTATT
ATACTCATATTTTCTCCTTGTTTGTTTTGTGAAATTATGTTCCCGAATTTATAAATGCTT
TCCATTTCCAG

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR4B719TF 311 0 0
G
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TATTTCTTCCAAGTAAAAGAAAAAGAAAATCATTTTGCTTTTCAAATGATTAGTGGAAGT
CCCTTAACTGCAAAGGATGGAATAAATAAGAAACTTACTTTTCCTCTTTGTTTTATTTGG
GTTGGACTTTGTTTGAATAAATGATTTTGTTGAGTACACAAACCAACATAAAGTTTATTA
TACTCATATTTTCTCCTTGTTTGTTTTGTGAAATTATGTTCCCGAATTTATAAATGCTTT
CCATTTCCAG

QA 2 311 2 311
DS 



CO CL191Contig2 914 9 16 U
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CATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCT
CCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACCAAGCTCACCGTCAATT
TCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCCG
CAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAAC
CCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTT*GTTAGCAGTGGA
TTCGCATTT*CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*
GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACT
TGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAG
TGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAA
AGGATGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTT
GAATAAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTC
TACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAA
AATTTCATATGCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C533TF U 107
AF RR4EK10TF U 1
AF RR4EI83TF U 1
AF RR4DG21TF U 36
AF RR4FW28JQ C 111
AF RR4EK10JQ C 191
AF RR4AM18TF U 36
AF RR4AM18JQ C 145
AF RR4EW71JQ C 473
BS 1 345 RR4EI83TF
BS 346 346 RR4EK10TF
BS 347 624 RR4EI83TF
BS 625 625 RR4EK10TF
BS 626 647 RR4EI83TF
BS 648 648 RR4EK10TF
BS 649 689 RR4EI83TF
BS 690 690 RR4EK10TF
BS 691 701 RR4EI83TF
BS 702 702 RR4AM18TF
BS 703 722 RR4EI83TF
BS 723 800 RR4AM18TF
BS 801 801 RR4FW28JQ
BS 802 883 RR4AM18TF
BS 884 907 RR4AM18JQ
BS 908 914 RR4EW71JQ

RD RR4C533TF 478 0 0
CTCCGCCGCCGCATCCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTC
GACTATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCC
GCAGACTCCTTCCTCCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACCAA
GCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACAT
GGTCATCATTCCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAAT
CGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTT
TTGTTAGCAGTGGATTCGCATTTTCTACACGCAAATTTCCGTCGCTGACATTATCGCTGT
TTGAGGCCGTGCCCGCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4EK10TF 698 0 0
TTTTTAAAAGCTCCCCTATCTCCTCTCTCTCATCTGCGAGAAAGAGTCATCAAAACCAAA
TCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCCGATCTGTCTCCGCCGCCGCAT
CCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAA
CATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCT
CCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACCAAGCTCACCGTCAATT
TCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCCG
CAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAAC
CCGGTATCATGCCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTT*GTTAGCAGTGGA
TTCGCTTTT*CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*
GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACT
TGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAG
TGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4EI83TF 722 0 0
TTTTTAAAAGCTCCCCTATCTCCTCTCTCTCATCCGCGAGAAAGAGTCATCAAAACCAAA
TCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCCGATCTGTCTCCGCCGCCGCAT
CCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAA
CATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCT
CCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACCAAGCTCACCGTCAATT
TCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACAGGGTCATCATTCCCG
CAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAAC
CCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTT*GTTAGCAGTGGA
TTCGCATTT*CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*
GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACT
TGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAAAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGCCGAAGTTCACAG
TGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAA*GAAGATGATCC*TTATTTACCCTACTACAA
AG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4DG21TF 761 0 0
GGGC
GAAAGTGTCATCAAAACCAAATCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCC
GATCTGTCTCCTTCGCCGCATCCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAG
TTCCGTCGACGATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGG
ACCCGCCGCATACTCCTTCCTCCTTCATGAAGCCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTC
CGACGAAGCTCACCGTCAACTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGAGAAAGAGG
TCGACATGGCCATCATTCCAGCGACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACATTC
CAACGATCGCCGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACACAAAGA
AATACTTT*GTGAGCAGTGGATTCGCATTT*CTCCACGCCAATT*CCGTCGCTGACATTA
TCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTT
AGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCAGAAGCACA
GATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCAGGCTAAAAGAAGATGAT
CTCTTATTTAC*****TACAAAG*ATGGAATAATTTAGAAAA*TGATTTTTGCTTTACTT
AGTTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGT

QA 5 761 5 761
DS 

RD RR4FW28JQ 719 0 0
GCCGCCGCATCCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACT
ATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAG
ACTCCTTCCTCCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACCAAGCTC
ACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTTGACATGGTC
ATCATTCCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCT
GAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTT*GT
TAGCAGTGGATTCGCATTT*CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GA
GGCCGTGCC*GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCA
CGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAAAAAGCAGAAGCACAGATTGGCGTCG
AAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTAC
CCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTT**
********TTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGT
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EK10JQ 639 0 0
GTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCCTTCATGAA
GGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACCAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCC
TTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCCGCAACAACAGG
ACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCAT
GCCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTT*GTTAGCAGTGGATTCGCTTTT*
CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*GCTTGAGAAC
ATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCTTCTGCA
ACAACAGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAAC
GCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGATGGAAT
AATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGA
TTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AM18TF 848 0 0
GG
GAGAAAGAGTCATCAAAACCAAATCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTC
CCGATCTGTCTCCGCCGCCGCATCCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGA
AGTTCCGTCGACTATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACAT
GGACCCTCCGCAGACTCCTTCCTCCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGAT
TCCGACCAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGA
GGTCGACATGGTCATCATTCCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGT
TCCAACAATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAA
GAAGTACTTT*GTTAGCAGTGGATTCGCATTT*CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACAT
TATCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGT
TTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAAGCAGAAGCA
CAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATG
ATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGC
TTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAAGCACAAACCAACAGAG
TTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTA
ATTTCT

QA 3 848 3 848
DS 

RD RR4AM18JQ 769 0 0
CCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAG
TCGCACCGAACATGGACCCTCCGCAGACTCCTTCCTCCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGA
CTGCTTCCTCGATTCCGACCAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAAC
TTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTT
TGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAG
GCACTGACATAAAGAAGTACTTT*GTTAGCAGTGGATTCGCATTT*CTACACGCAAATT*
CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GAGGCCGTGCC*GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCA
AGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGA
GAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGG
CTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAAATG
ATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCA
CAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTA
AGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAAAATTTCA
TATGCC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4EW71JQ 442 0 0
GCAGTGGATTCGCATTT*CTACACGCAAATT*CCGTCGCTGACATTATCGCTGTT*GAGG
CCGTGCC*GCTTGAGAGCATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACG
CAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAA
GTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCC
TACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAA*TGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGAC
TTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTCATA
TTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAA
AGAAATAAAATTTCATATGCCG

QA 1 442 1 442
DS 



AS 2 12

CO CL192Contig1 788 8 22 U
GGGCCTGGGACGAGAGCCATTACTGTTACTAGTTTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAA
AGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATT
CAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTC
CACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTC
TCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATT
GATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCA
AGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAA
GAAGGTCCTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGAT
TGTTACCGTTGAGAAACTCATCGGAGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGT
TATAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAA
GGCCGTTGAGATCCACCACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCACCAGAAGC
TGTGACCATGGCTGCGTAAGAACATGGACACTTGGGACAGTGATAATGGAAATTTGTTTT
TTCTTATAAGAGATCATATGGAACAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATCTGTTT
CTTTATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 20 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 20 35 35 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C173TF U 1
AF RR4C185TF U 1
AF RR4C189TF U 1
AF RR4C185JQ C 17
AF RR4CU63TF U 25
AF RR4CU63JQ C 676
AF RR4C189JQ C 51
AF RR4C173JQ C 26
BS 1 568 RR4C173TF
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RD RR4C173TF 568 0 0
GGGCCTGGGACGAGAGCCATTACTGTTACTAGTTTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAA
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CAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTC
CACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTC
TCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATT
GATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCA
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TGTTACCGTTGAGAAACTCATCGGAGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGT
TATAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4C185TF 598 0 0
GGGCCTGGGACGAGAGCCATTACTGTTACTAGTTTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAA
AGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATT
CAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTC
CACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTC
TCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATT
GATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCA
AGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAA
GAAGGTCCTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGAT
TGTTACCGTTGAGAAACTCATCGGAGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGT
TATAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4C189TF 600 0 0
GGGCCTGGGACGAGAGCCATTACTGTTACTAGTTTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAA
AGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATT
CAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTC
CACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTC
TCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATT
GATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCA
AGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAA
GAAGGTCCTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGAT
TGTTACCGTTGAGAAACTCATCGGAGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGT
TATAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4C185JQ 772 0 0
CCATTACTGTTACTAGTTTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAAAGTGTCCATGGCGACA
ATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTT
AAGGGAGCTTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCG
TCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCCTTC
TCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCT
GCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGT
GTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAAGAAGGTCCTGGAAGCA
CTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTTGAGAAA
CTCATCGGAGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGTTATAGCGCTACACAAG
AACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCAC
CACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCACCAGAAGCTGTGACCATGGCTGCG
TAAGAACATGGACACTTGGGACAGTGATAATGGAAATTTGTTTTTTCTTATAAGAGATCA
TATGGAACAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATCTGTTT
CTTTATGC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4CU63TF 753 0 0
GTTACTAGTTTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAAAGTGTCCATGGCGACAATAGTCCA
GTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGC
TTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGAC
TGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGG
GAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGACAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGAC
GAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAA
CAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAAGAAGGTCCTGGAAGCACTCGATGG
GCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTTGAGAAACTCATCGG
AGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGG
TGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGTTG
GTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTAAGA*CA
TGGACACTTGGGACAGTGATAATGGAAATTTGTTTTT*CTTATA*GAGATCATATGGGAC
A*GATGTGAAAAT*GCTTTCAAA*TCAAATCTG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4CU63JQ 109 0 0
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ATATGGAACAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATTTGTTT
TTTT

QA 1 105 1 105
DS 

RD RR4C189JQ 738 0 0
AGCAGACAAAAGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCA
ATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCATCTCCAACTTCTT
CTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTC
AGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAG
CGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGA
GAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTA
CTCGGATGAAGAAGGTCCTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAAC
CTGACGAGATTGTTACCGTTGAGAAACTCATCGGAGAAGCTTATTCTGCAATTGACAAGG
CAGTGAAGGTTATAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTA
GGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAG
CACCAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTAAGAACATGGACACTTGGGACAGTGATAATGGA
AATTTGTTTTTTCTTATAAGAGATCATATGGAACAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATC
AAATCTGTTT
CTTTATGC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4C173JQ 763 0 0
GTTACTAG
TTACTCCTGTGTAGGCGAGCAGACAAAAGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTC
GTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTC
GTCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTC
CTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATG
GGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGC
TGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAA
GAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAAGAAGGTCCTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAA
GAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTTGAGAAACTCATCGGAGAAGCTTA
TTCTGCAATTGACAAGGCAGTGAAGGTTATAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAG
GAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGTTGGTACGTGCC
AGACACAGCAGCAGCAGCACCAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTAAGAACATGGACACTT
GGGACAGTGATAATGGAAATTTGTTTTTTCTTATAAGAGATCATATGGAACAAGATGTGA
AAATTGCTTTCAAAATCAAATCTGTTTCTTTATGC

QA 9 763 9 763
DS 



CO CL192Contig2 879 4 14 U
GGGGGACGAATTACTAGTTACGGTGTAGGAGAGCAGAGAAAAGTGCCCATGGCGACAATA
GTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTAAAG
GGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGT
GCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCC
TTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAA
GCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGG
CGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAAGAAGGTTTTGGAA
GCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTAGAG
AAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACAC
AAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGAAGGAAAAAGGCAGTTGAGATC
CACCACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAATAGAAGCTGTGACCATGGCT
GCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATTGAAAAAGATGT
GAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATGTATAATTCATTTCGACTTCAGTT
TCTTCTTCCGTACTGTTGAGGCTAAGCATGTTGTCTTCTTCTTCCTTCGGCTTGACCTTG
ATCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTCCTTGGCTCTGGTACC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC24TF U 3
AF RR4FI76TF U 1
AF RR4FC24JQ C 141
AF RR4AV86JQ C 114
BS 1 45 RR4FI76TF
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BS 738 747 RR4FI76TF
BS 748 879 RR4AV86JQ

RD RR4FC24TF 691 0 0
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CCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTAAAGGG
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GTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCCTT
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*AACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGAAGGAAAAAGGCAGTTGAGATCCA
CCACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAATAGAAGCTGTGACCATGGCTGC
GTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FI76TF 747 0 0
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GTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCTAAATTCAAAGTACTTTCTCTAAAG
GGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGT
GCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCC
TTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAA
GCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGG
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GCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTAGAG
AAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACAC
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GCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTCTT*ATAAGAGATCATATTGAAAA*GATGT
GAAAATTGCTTTCAAA*TCAAATATGT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4FC24JQ 636 0 0
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CTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATG
GGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGC
TGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTTTAA
GAAATTTGAAGCCCGTACTCGGATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAA
GAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTAGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTA
TTTTGCAATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACACAT*AACACTGGTGCGCGTAG
GAAGTCTCGCTTGGCTAGAAGGAAAAAGGCAGTTGAGATCCACCACGGTTGGTACGTGCC
AGACACAGCAGCAGCAGCAATAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAA
AATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATTGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCA
AATATGTTTATTTCATGTATAATTCATTTCGACTT
G

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4AV86JQ 766 0 0
TCTAAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCG
TCGTGGTGCGTCTGCGACTGTCTGCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATG
TGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGT
GTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGA
GAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGGATGAAGAAGGT
TTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTAC
CGTAGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGC
GCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCAGT
TGAGATCCACCACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAATAGAAGCTGTGAC
CATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATTGAAA
AAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATGTATAATTCATTTCGAC
TTCAGTTTCTTCTTCCGTACTGTTGAGGCTAAGCATGTTGTCTTCTTCTTCCTTCGGCTT
GACCTTGATCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTCCTTGGCTCTGGTACC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 11

CO CL193Contig1 1040 11 28 U
GGATGTGTGTTTGTATGCTTCTGTATATATAGCTTTGCTCTCCTTCCTCGCTTCTGACTT
TTCAGCGTTGAATCAAATCTCTTCGTGTTCCCCTCTTTCCTTCTTCAGGTAATATTTGAA
CAAAATTGCTTACTACTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAAACAAGGGTGTTAATG
GAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGA
AAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAG
ACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAATATGA
TTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTC
AGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAG
CAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTG
AGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCG
AGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACT
ACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTC
AGGAGGTGAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACA
TATACGGATAAATTGATC********AGGTAGCTGGGTGGGTGGCATCTTCTTTACTGGG
AAGTCTCTGCTTGGCCTTACCTTTTTTCT*ATATAACTATATATGATATGATTACTGTTA
TTATTATACAGATTGTTACCTATTGATATCATTTTTGATTTTGTACTTGATGGGATTTGT
GATTGGCTTTTCTGTAATTTCATAAAACAAATTCATTGGATTTTTCTAATATATACTAAG
ATTAATGGAATCTTTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
40 20 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS72TF U 163
AF RR4CA01TF U 1
AF RR4BD82TF U 55
AF RR4DB89TF U 55
AF RR4CJ02TF U 56
AF RR4EK37TF U 55
AF RR4CS72JQ C 308
AF RR4CJ02JQ C 387
AF RR4DB89JQ C 261
AF RR4BD82JQ C 225
AF RR4EK37JQ C 242
BS 1 55 RR4CA01TF
BS 56 56 RR4BD82TF
BS 57 513 RR4CA01TF
BS 514 514 RR4BD82TF
BS 515 530 RR4CA01TF
BS 531 531 RR4BD82TF
BS 532 590 RR4CA01TF
BS 591 591 RR4BD82TF
BS 592 602 RR4CA01TF
BS 603 603 RR4BD82TF
BS 604 670 RR4CA01TF
BS 671 684 RR4BD82TF
BS 685 685 RR4DB89TF
BS 686 718 RR4BD82TF
BS 719 720 RR4DB89TF
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BS 722 722 RR4BD82JQ
BS 723 727 RR4EK37TF
BS 728 867 RR4BD82JQ
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BS 870 870 RR4EK37JQ
BS 871 875 RR4BD82JQ
BS 876 876 RR4EK37JQ
BS 877 1005 RR4BD82JQ
BS 1006 1006 RR4EK37JQ
BS 1007 1029 RR4BD82JQ
BS 1030 1040 RR4EK37JQ

RD RR4CS72TF 382 0 0
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GTGGCCCAGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACA
CACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAA
CAATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGCACCATCTGAGGTTACAATCAAGC
TTCTGCAGAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTC
GCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGGACCCAAGTTTGTCT
TGTTCTTTGATTGTCCTGAGGA

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4CA01TF 679 0 0
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TTCAGCGTTGAATCAAATCTCTTCGTGTTCCCCTCTTTCCTTCTTCAGGTAATATTTGAA
CAAAATTGCTTACTACTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAAACAAGGGTGTTAATG
GAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGA
AAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAG
ACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAATATGA
TTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTC
AGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAG
CAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAGGTTTGTCTTGTTCTTTTATTGTCCTG
AGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATTACAATATCG
AGGCTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACT
ACGAAGCTAA
AGGGGAAAG

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DS 

RD RR4BD82TF 664 0 0
G
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TTGAACAAAATTGCTTACTACTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAAACAAGGGTGT
TAATGGAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGACCCAGGAAG
TGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGC
TGGAGACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAA
TATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGC
AATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAA
CCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTG
TCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAA
TATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTTAATCTAGCTTGCCTGTTATTCA
GTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAGGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGT
GTT

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DS 

RD RR4DB89TF 666 0 0
G
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TTGAACAAAATTGCTTACTACTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAAACAAGGGTGT
TAATGGAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAG
TGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGC
TGGAGACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAA
TATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGC
AATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAA
CCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTG
TCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAA
TATCGAGACCATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCA
GTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGT
GTTTC

QA 2 666 2 666
DS 

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TAATGGAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAG
TGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGC
TGGAGACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAA
TATGATTAAAGAAGGGAAGATTGCACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGC
AATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAA
CCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGGACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTG
TCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAA
TATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCA
GTACTACGAAGCTAAGGG
AGAGTT

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DS 

RD RR4EK37TF 673 0 0
G
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TTGAACAAAATTGCTTACTACTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAAACAAGGGTGT
TAATGGAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAG
TGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGC
TGGAGACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAA
TATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGC
AATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAA
CCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTG
TCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAA
TATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCTTGTTATTCA
GTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGT
GTTTCACGAGGT

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DS 

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AGGGAAGATTGCACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTCAGGAAAA
CGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTT
TGAAAAAGTTACTGAGATTGGACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGA
GATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTAT
AAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGC
TAAGGGGAGAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGT
GAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACATATACGG
ATAAATTGATC********AGGTAGCTGGGTGGG
GGG

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DS 

RD RR4CJ02JQ 608 0 0
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ATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATT
GGACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTG
GGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTG
TTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAGAGTTAGGAAG
ATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTACTCCT
GAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACATATACGGATAAATTGATC********
AGGTAGCTGGGTGGGTGGCATCTTCTTTACTGGGAAGTTTCTGCTTGGCCTTACCTTTTT
TCT*ATATAACTATATATGATATGATTACTGTTATTATTATACAGATTGTTGCCTATTGA
TATCATTTTTGATTTTGTACTTGATGGGATTTGTGATTGGCTTTTCTGTAATTTCATAAA
ACAAAT
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4DB89JQ 746 0 0
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AAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTA
CCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAATGACAAG
TTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACT
GAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGC
CTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACCATAAGGAAGCGTTTC
AAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTT
AGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTT
ACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACATATACGGATAAATTGATCAG
ATTTGCAGGTAGCTGGGTGGGTGGCATCTTCTTTACTGGGAAGTCTCTGCTTGGCCTTAC
CTTTTTTCT*ATATAACTATATATGATATGATTACTGTTATTATTATACAGATTGTTACC
TATTGATATCATTTTTGATTTTGTACTTGATGGGATTTGTGATTGGCTTTTCTGTAATTT
CATAAAACAAATTCATTGGATTTTT
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4BD82JQ 806 0 0
GA
CCCAGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACA
TCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAAT
GATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCT
GCAGAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAA
TGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTT
CTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGA
GGATGACAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTTAATCTAGCTTGCC
TGTTATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAGGATTCATGCCGCAAAGCCCAT
TGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGC
CTAGGCTGAAGACATATACGGATAAATTGATC********AGGTAGCTGGGTGGGTGGCA
TCTTCTTTACTGGGAAGTCTCTGCTTGGCCTTACCTTTTTTTTTATATATCTATATATGA
TATGATTACTGTTATTATTATACAGATTGTTACCTATTGATATCATTTTTGATTTTGTAC
TTGATGGGATTTGTGATTGGCTTTTCTGTAATTTCATAAAACAAATTCATTGGATTTTTT
TAATATATACTAAGATTAATGGA
G

QA 3 805 3 805
DS 

RD RR4EK37JQ 799 0 0
AGGTACACAGTGTGC*TATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGA
C*TTCTTAGGGCTGAAATTAAATCTGGCTCTGAAAATGGAACAATGATCCAGAATATGAT
TAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTCA
GGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGC
AGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGA
GGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGA
GACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCTTGTTATTCAGTACTA
CGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCA
GGAGGTGAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACAT
ATACGGATAAATTGATC********AGGTAGCTGGGTGGGTGGCATCTTCTTTACTGGGA
AGTCTCTGCTTGGCCTTACCTTTTTTCT*ATATAACTATATATGATATGATTACTGTTAT
TATTATACAGATTGCTACCTATTGATATCATTTTTGATTTTGTACTTGATGGGATTTGTG
ATTGGCTTTTCTGTAATTTCATAAAACAAATTCATTGGATTTTTCTAATATATACTAAGA
TTAATGGAATCTTTGTGCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 4 13

CO CL194Contig1 679 2 1 U
GGACAGCCGCTTTAAAACATATATCACCTCTTGCTCTGCTGCGCTTGCTGCTAATAGCTC
TTTGCACATAGATCATCACCATCTCCATCTAGACACATGGGTAAGACAAGGGGTATGGGA
GCTGGGCGAAAGCTCAAAAGGCTTAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAG
AAGTCACATCAGGGCAATGAATGGAAGAAGCCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAGGGT
ATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTTAGGCTAAGCAACCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGT
GCTAGAGTTCAGCTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGT
TGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGATTTGGGCGTAAAGGT
CATGCTGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTCGTCAAGGTTTCTGGTGTTTCA
CTCTTGGCCCTCTTCAAGGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGGTCTTAAACAGTGCTTTTGAAA
GTGATTTTGATGTTATAAGAGCCTTTTTGGTAGTTGAATTTCAAAGAACTCTAATGTTCT
CTTCTATTCTACTTTAAGATTCCAGAACTATGTGTTTAAACTTTTTTTTCTCAATGAGTC
TTTGAGTTTAGTTTCGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A549JQ C 1
AF RR4A549TF U 1
BS 1 679 RR4A549TF

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GCTAGAGTTCAGCTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGT
TGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGATTTGGGCGTAAAGGT
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TTTGAGTTTAGTTTCGACC

QA 1 679 1 679
DS 

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TTTGCACATAGATCATCACCATCTCCATCTAGACACATGGGTAAGACAAGGGGTATGGGA
GCTGGGCGAAAGCTCAAAAGGCTTAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAG
AAGTCACATCAGGGCAATGAATGGAAGAAGCCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAGGGT
ATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTTAGGCTAAGCAACCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGT
GCTAGAGTTCAGCTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGT
TGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGATTTGGGCGTAAAGGT
CATGCTGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTCGTCAAGGTTTCTGGTGTTTCA
CTCTTGGCCCTCTTCAAGGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGGTCTTAAACAGTGCTTTTGAAA
GTGATTTTGATGTTATAAGAGCCTTTTTGGTAGTTGAATTTCAAAGAACTCTAATGTTCT
CTTCTATTCTACTTTAAGATTCCAGAACTATGTGTTTAAACTTTTTTTTCTCAATGAGTC
TTTGAGTTTAGTTTCGACC

QA 1 679 1 679
DS 



CO CL194Contig2 643 2 3 U
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AAGTAGAGAAGATAAGATAGTATTCTTTAAAACTGAACTAGCAAAAAGTGATTTATAACA
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TCAATGTAGTTCAAGCAACCATCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTTTTG
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ATTTTCTCAAGAACGATGCCCTTGGCGTGGGAAGAGCCAGCGAAAGGCTTCTTCCACTCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW27JQ U 163
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AAAGGCTT

QA 1 308 1 308
DS 

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ATATCTCCCACAGCGTGACCCTTACGACCAAATCCAGCGATCAACACCTCGTCATTTTCC
TCAATGTAGTTCAAGCAACCATCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTTTTG
ATAAGCTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCA
ATTTTCTCAAGAACGATGCCCTTGGCGTGGGAAGAGCCAGCGAAAGGCTTCTTCCACTCA
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AGAGAGGGAGAGAGAATCAACAGCAAAGAGGTACTTGCGGTCC

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL194Contig3 648 6 9 U
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AAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGA
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ATGGTGTGTTGAAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTAGCTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 10 10 10 

AF RR4FD85TF U 11
AF RR4FD85JQ C 11
AF RR4BB28JQ C 1
AF RR4BB28TF U 1
AF RR4GA13TF U 7
AF RR4CC55TF U 10
BS 1 2 RR4BB28JQ
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BS 356 643 RR4BB28TF
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RD RR4FD85TF 287 0 0
G
GCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTC**CTTCCATCGACAAACA
TGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGA
GGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGA*GAAGCCTTTTG
CTGGCTCTTCCCATGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAACAGC
CTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTACAGTCCAGCTTATCAAAAA

QA 2 287 2 287
DS 

RD RR4FD85JQ 570 0 0
G
GCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTC**CTTCCATCGACAAACA
TGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGA
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CTAATTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGATTG
CCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGA
TCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGG
TTGTCAAGGTTTCTGGTGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCTA
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GTTCAGTTTTAAAGAATACTATCTTATCT

QA 2 570 2 570
DS 

RD RR4BB28JQ 643 0 0
GGGCGCTTGTCGCCGCAAGTACCTCCTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCC
ATCGACAAACATGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAG
GATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAA
GAAGCCTTTTGCTGGCTCTTCCCATGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGA
GGCTAAACAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAGCTTATCAAAAACGG
AAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAGAATGA
CGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGT
TAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTCTCTGGTGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAA
GGAGAAGCCTAGATCATAAACAATGCGCCAAGCTTTTGCATTCATTTTGAAGTTATAATC
ACTTTTGGCTAGTTCAGTTTTAAAGAATACTATCTTATCTTCTCTACTTTAAGCCAGAAC
ATGGTGTGTTGAAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BB28TF 643 0 0
GG
GCGCTTGTCGCCGCAAGTACCTCCTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCAT
CGACAAACATGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGA
TTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGA
AGCCTTTTGCTGGCTCTTCCCATGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGG
CTAAACAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAGCTTATCAAAAACGGAA
AGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAGAATGACG
AGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTA
GGTTCAAGGTTGTCAAGGTCTCTGGTGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGG
AGAAGCCTAGATCATAAACAATGCGCCAAGCTTTTGCATTCATTTTGAAGTTATAATCAC
TTTTGGCTAGTTCAGTTTTAAAGAATACTATCTTATCTTCTCTACTTTAAGCCAGAACAT
GGTGTGTTGAAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTT

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4GA13TF 642 0 0
GG
GTCGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTC**CTTCCATCGACAA
ACATGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATC
AGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTT
TTGCTGGCTCTTCCCATGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAAC
AGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGA
TTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGT
TGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCA
AGGTTGTCAAGGTCTCTGGTGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGC
CTAGATCATAAACAATGCGCCAAGCTTTTGCATTCATTTTGAAGTTATAATCACTTTTGG
CTAGTTCAGTTTTAAAGAATACTATCTTACCTTCTCTACTTTAAGCCAGAACATGGTGTG
TTGAAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTAGCTT

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR4CC55TF 634 0 0
GG
GCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTC**CTTCCATCGACAAACA
TGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGA
GGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTTG
CTGGCTCTTCCCATGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAACAGC
CTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGATTG
CCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGA
TCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGG
TTGTCAAGGTCTCTGGTGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCTA
GATCATAAACAATGCGCCAAGCTTTTGCATTCATTTTGAAGTTATAATCACTTTTGGCTA
GTTCAGTTTTAAAGAATACTATCTTATCCTCTCTACTTTAAGCCAGAACATGGTGTGTTG
AAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTT
C

QA 3 633 3 633
DS 



CO CL194Contig4 682 3 2 U
GGGCCGCTTTTAAAACTATTCTCCTCTTCGTAGCTGCGCTTGTCGCCGCAAGTACCTCTT
TGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGACAAGGGG
AATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCA
GTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTTCCCATGC
CAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAACAGCCTAACTCTGCTATCCG
TAAGTGTGCTAGAGTGCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAA
CGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCG
TAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTCTCTGG
TGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGATCATAGACAATGCG
CCAAGCTTTTGCATTCATTTTGATGTTATAAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTTCAAAGA
ATACTATCTTTATCTTCTCTACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGATGAAACGTATTTTTCT
TAATGAATCTTTGAGTTTAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT60TF U 1
AF RR4DP35TF U 1
AF RR4B862TF U 40
BS 1 675 RR4DP35TF
BS 676 682 RR4B862TF

RD RR4DT60TF 607 0 0
GGGCCGCTTTTAAAACTATTCTCCTCTTCGTAGCTGCGCTTGTCGCCGCAAGTACCTCTT
TGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGACAAGGGG
AATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCA
GTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTTCCCATGC
CAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAACAGCCTAACTCTGCTATCCG
TAAGTGTGCTAGAGTGCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAA
CGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCG
TAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTCTCTGG
TGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGATCATAGACAATGCG
CCAAGCTTTTGCATTCATTTTGATGTTATAAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTTCAAAGA
ATACTAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4DP35TF 675 0 0
GGGCCGCTTTTAAAACTATTCTCCTCTTCGTAGCTGCGCTTGTCGCCGCAAGTACCTCTT
TGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGACAAGGGG
AATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCA
GTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTTCCCATGC
CAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAACAGCCTAACTCTGCTATCCG
TAAGTGTGCTAGAGTGCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAA
CGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCG
TAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTCTCTGG
TGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGATCATAGACAATGCG
CCAAGCTTTTGCATTCATTTTGATGTTATAAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTTCAAAGA
ATACTATCTTTATCTTCTCTACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGATGAAACGTATTTTTCT
TAATGAATCTTTGAG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4B862TF 643 0 0
GG
GTCGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCATCGACAA
ACATGGGTAAGACAAGGGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATC
AGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTT
TCGCTGGTTCTTCCCATGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAGGCTAAAC
AGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTGCAGCTTATCAAAAACGGAAAGAAGA
TTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGT
TGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCATGCGGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCA
AGGTTGTCAAGGTCTCTGGTGTTTCACTCCTTGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGC
CTAGATCATAGACAATGCGCCAAGCTTTTGCATTCATTTTGATGTTATAAATCACTTTTT
GCTAGTTCAGTTTCAAAGAATACTATCTTTATCTTCTCTACTTTAAGCAAGAACATGGTG
TGATGAAACGTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTAGCT

QA 3 643 3 643
DS 



AS 1 11

CO CL195Contig1 2271 11 27 U
GGAATCAAAAATCAAACCGCAATAAAACTCTCCACGAACCGAACGAACCTCGAAAAATTG
GCGATTGCCAAAAAACTATGGCTACGTGTGGCCTCTGGACGCCGCCGTCTTTTTCTCCCC
GCCGGAGACTCTGTAACTTCTCATCCAGTCGCCGCTCTCCCTTCTCAGTGATCAGATTCG
ACAGAGAGCGCGTCTCGCGGAGAGTCTCCTGTAGCTACAACAACCAGGAGAACGATCGTC
CTCAATCTTCCGGAATCCAAGTCTACGGCGAGATCGAGAGGTTGCTAACAGAGACTGTGA
AGCAATCTCAAAGTAGCTCCGCTGGATCCGCTGACTGGTCAGAAGTAGAGGGAGCTTGGG
TGCTCAGACCTAGAAACTCGAATCCGAAGATGGTTGCTCATTTCATTGGAGGGATATTCG
TTGGTGCAGCACCTCAGCTTACCTATCGATTGTTTCTTGAGAGATTAGCTGAGAAGGATG
TTTTGGTTATTGCTACACCGTATGCTAGTGGTTTTGACCACTTCGCTATTGCGGATGAAG
TACAATTTAAGTTTGATAGATGCTGCCGATCTCTACATGAATCAGTGCAGGATCTTCCAT
CTTTTGGGATCGGTCATTCATTGGGATCCCTCATTCACCTTCTCATTGGATCACGGTATG
CTGTTCAGCGAAATGGGAATGTATTTATGGCATTTAACAACAAGGAAGCGAGCTTAGCTA
TTCCTTTGTTCTCCCCAGTTCTAGTCCCGATGGCTCAAAGCCCTGGACCACTGTTATCAC
AGGTAGCAACATCCCCGACAGTCCGCCTTGGGGCAGAGATGACCCGAAAGCAATTAGAAA
CTCTCAGCCCTCCCATCATGAAGCAAATTCTACCGCTAGTGGAACAGCTCCCTCCTCTGT
ACATGGACTTGGTAAAAGGAAGAGAAGATTTTATTCCAAAACCAGAAGAAACAAGACGCC
TTATAAGATCCTACTATGGAATCTCTAGGAATATGTTGATAAAGTTCGAGGATGATTCAA
TAGATGAAACATCAATTCTAGCTCAGGTACTTGGCGTGGAATCATCCATAAGCTCAAAGC
TAGACATGTCTATCCGTACACTTCCAGGGGATCACGGTCTTCCTCTGCAACAGGCCCTTC
CAGATGTCCCACCAGCAATGGCTGATGCGGTGAACCGAGGAAGTGAGTTTTTGGCGAATA
TGGCTGTTGGGACACCGTGGGAGTCTGTGGCGAAAGAGGTTGGAGGTACGCTGGGAATGG
ACTCGAAGATCCTTCGTGCAGACATGTCCAAAGATCTTACCCAGCTTGTCGATGCAATAA
CATCTTGGATGGCGTCAAATATGGGTCCAAAACTTCTGAGATCATAATGTTGTTACTCAT
GTACACAAAATAATTTAAGAACACAGGTAAA**TGTATACATAAAAGTTGACGGAATTGT
CATTATATAATTGTTATTATAACTTGATTGTAGACATCATTACATATATTTAGCAATCTA
GAACGCATAAGGGTCTCTCAACAAGTTGATAGACTTGTTCAACCAAAAAAAGGGTAAGCA
CACTTGGCCTACTCTTCGTGATAGAGATACAAGCCGAGACCAAATCGAGCACACGCCCTG
CAAAATGCTATTTCCTCAGCTGCAGCAACTGGATCATCAATGTGGTCATCAGTAATCGTT
ACTGTCCCAGTCGATTCTCGGTGTGCCTCACCATCAGAGCCACGGATGGTAAGACGATAA
ACAACAGTAACATTACCATCCTCTGAGAAAATGACGTCACGAACCTCCCCACACCAACCA
GGTGCGTAGAAGCTGAGCATCCGATTTGCATGAAACCAAGGGATGAAACCAGAGGAAGCT
GCACTGGATCCAGGATCGTGGCTCTTGACGATGTTATCAGGGATCTTCTTGTTGAGATCT
CGAAGTATCTCAATCAGAGGCCGAGTGATCGACGAGGAGGACGAGAACTTGTCCAAAGGC
ACTACATAGTTCGAGTTAGGAACAGCTTTTTTCTTCCCGGCGTCTCCACCAACTCCACCG
CTGCCGCATCTGACTCCTCGCCACACCGTTAACATTTCCCGGCGAACCGCAACCGTTCCC
GGGAAGAATCTTCCGGTGAGCCCATCGGCGGCAGTAGATGGCGTGGGGGTTTTGAAGATC
GTCGTTGAGGTCTGTATTTGCAAAGCCATTTTCTTGTTTCTGGTGAAGAGATGAATGGAG
AAAGGGAGCAAAAACTCTGATTTAAGACAGAACAGGAAAAGAGTGGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GCCGGAGACTCTGTAACTTCTCATCCAGTCGCCGCTCTCCCTTCTCAGTGATCAGATTCG
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CTCAATCTTCCGGAATCCAAGTCTACGGCGAGATCGAGAGGTTGCTAACAGAGACTGTGA
AGCAATCTCAAAGTAGCTCCGCTGGATCCGCTGACTGGTCAGAAGTAGAGGGAGCTTGGG
TGCTCAGACCTAGAAACTCGAATCCGAAGATGGTTGCTCATTTCATTGGAGGGATATTCG
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TTTTGGTTATTGCTACACCGTATGCTAGTGGTTTTGACCACTTCGCTATTGCGGATGAAG
TACAATTTAAGTTTGATAGATGCTGCCGATCTCTACATGAATCAGTGCAGGATCTTCCAT
CTTTTGGGATCGGTCATTCATTGGGATCCCTCATTCACCTTCTCATTGGATCACGGTATG
CTGTTCAGCGAAATGGGAATG

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G
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CTTCTCATTGGATCACGGTATGCTGTTCAGCGAAATGGGAATGTATTTATGGCATTTAAC
AACAAGGAAGCGAGCTTAGCTATTCCTTTGTTCTCCCCAGTTCTAGTCCCGATGGCTCAA
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ATGACCCGGAAGCAATTAGAAACTCTCAGCCCTCCCATCATGAAGCAAATTCTACCGCTA
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ATAAAGTTCGAGGATGATTCAATAGATGAAACATCAATTCTAGCTCAGGTACTTGGCGTG
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CTTCCTCTGCAACAGGCCCTTCCAGATGTCCCACCAGCAATGGCTGATGCGGTGAACCGA
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*TTGGAGGTACGCTGGGAATGGACTCGAAGATCCTTCGTGCAGACATGTCCAAAGATCTT
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GGAAGAGAAGATTTTATTCCAAAACCAGAAGAAACAAGACGCCTTATAAGATCCTACTAT
GGAATCTCTAGGAATATGTTGATAAAGTTCGAGGATGATTCAATAGATGAAACATCAATT
CTAGCTCAGGTGCTTGGCGTGGAATCATCCATAAGCTCAAAGCTAGACATGTCTATCCGT
ACACTTCCAGGGGATCACGGTCTTCCTCTGCAACAGGCCCTTCCAGATGTCCCACCAGCA
ATGGCTGATGCGGTGAACCGAGGAAGTGAATTTTTGGCGAATATGGCTGTTGGGACACCG
TGGGAGTCTGTGGCGAAAGAGGCTGGAGGTACGCTGGGAATGGATTCGAAGATCCTTCGT
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AGAACACAGGTAAAAATGTATACATAAAAGTTGACGG

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G
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ACCGCTAGTGGAACAGCTCCCTCCTCTGTACATGGACTTGGTAAAAGGAAGAGAAGATTT
TATTCCAAAACCAGAAGAAACAAGACGCCTTATAAGATCCTACTATGGAATCCCTAGGAA
TATGTTGATAAGGTTCGAGGATGATTCAATAGATGAAACATCAATTCTAGCTCAGGTACT
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AGACATCATTAC

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TATTCCAAAACCAGAAGAAACAAGACGCCTTATAAGATCCTACTATGGAATCTCTAGGAA
TATGTTGATAAAGTTCGAGGATGATTCAATAGATGAAACATCAATTCTAGCTCAGGTACT
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GAACCGAGGAAGTGAGTTTTTGGCGAATATGGCTGTTGGGACACCGTGGGAGTCTGTGGC
GAAAGAGGTTGGAGGTACGCTGGGAATGGACTCGAAGATCCTTCGTGCAGACATGTCCAA
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**TGTATACATAAAAGTTGACGGAATTGTCATTA

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TCT
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AGGTACGCTGGGAATGGACTCGAAGATCCTTCGTGCAGACATGTCCAAAGAT*TTACCCA
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ATAATGTTGTTACTCATGTACACAAAATAATTTAAGAACACAGGTAAA**TGTATACATA
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G
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TGCAGCAACTGGATCATCAATGTGGTCATCAGTAATCGTTACTGTCCCAGTCGATTCTCG
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CTCTGAGAAAGTGACGTCACGAACCTCCCCACACCAACCAGGTGCGTAGAAGCTGAGCAT
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CCACACCGTTAACATTT

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DS 

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GGA
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AACTTGATTGTAGACATCATTACATATATTTAGCAATCTAGAACGCATAAGGGTCTCTCA
ACAAGTTGATAGACTTGTTCAACCAAAAAAAGGGTAAGCACACTTGGCCTACTCTTCGTG
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CTCTGAGAAAATGACGTCACGAACCTCCCCACACCAACCAGGTGCGTAGAAGCTGAGCAT
CCGATTTGCATGAAACCAAGGGATGAAACCAGAGGAAGCTGCACTGGATCCAGGATCGTG
GCTCTTGACGATGTTATCAGGGATCTTCTTGTTGAGATCTCGAAGTATCTCAATCAGAGA
CCGAGTGATCGACGAGGAGGACGAGAACTTGTCCAAAGGCACTACATAGTTCGAGTTAGG
AACAGCTTTTTTCTTCCCGGCGTCTCCACCAACTCCACCGCTGCCGCATCTGACTCCTCG
CCACACCGTTAACATTTCCCGGCGAACCGCAACCGTTCCTGGGAAGAATCT

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DS 

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C
ATACATAAAAGTTGACGGAATTGTCATTATATAATTGTTATTATAACTTGATTGTAGACA
TCATTACATATATTTAGCAATCGAGAACGCATAAGGGTCTCTCAACAAGTTGATAGACTT
GTTCAACCAAAAAAAGGGTAAGCACACTTGGCCTACTCTTCGTGATAGAGATACAAGCCG
AGACCAAATCGAGCACACGCCCTGCAAAATGCTATTTCCTCAGCTGCAGCAACTGGATCA
TCAATGTGGTCATCAGTAATCGTTACTGTCCCAGTCGATTCTCGGTGTGCCTCACCATCA
GAGCCACGGATGGTAAGACGATAAACAACAGTAACATTACCACTCTCTGAGAAAATGACG
TCACGAACCTCCCCACACCAACCAGGTGCGTAAAAGCTGAGCATCCGATTTGCATGAAAC
CAAGGGATGAAACCAGAGGAAGCTGCACTGGATCCAGGATCGTGGCTCTTGACGATGTTA
TCAGGGATCTTCTTGTTGAGATCTCGAAGTATCTCAATCAGAGGCCGAGTGATCGACGAG
GAGGACGAGAACTTGTCCAAAGGCACTACATAGTTCGAGTTAGGAACAGCTTTTTTCTTC
CCGGCGTCTCCACCAACTCCACCGCTGCCGCATCTGACTCCTCGCCACACCGTTAACATT
TCCCGGCGAACCGCAACCGTTCCCGGGAAGAATCTTCCGGTGAGCCCATCGGCGGCAGTA
GATGGCGTGGGGGTTTTGAAGATCGT

QA 2 747 2 747
DS 

RD RR4DG25TF 758 0 0
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GTTCAACCAAAAAAAGGGTAAGCACACTTGGCATACTCTTCGTGATAGAGATACAAGCCG
AGACCAAATCGAGCACACGCCCTGCAAAATGCTATTTCCTCAGCTGCAGCAACTGGATCA
TCAATGTGGTCATCAGTAATCGTTACTGTCCCAGTCGATTCTCGGTGTGCCTCACCATCA
GAGCCACGGATGGTAAGACGATAAACAACAGTAACATTACCACTCTCTGAGAAAATGACG
TCACGAACCTCCCCACACCAACCAGGTGCGTAGAAGCTGAGCATCCGATTTGCATGAAAC
CAAGGGATGAAACCAGAGGAAGCTGCACTGGATCCAGGATCGTGGCTCTTGACGATGTTA
TCAGGGATCTTCTTGTTGAGATCTCGAAGTATCTCAATCAGAGGCCGAGTGATCGACGAG
GAGGACGAGAACTTGTCCAAAGGCACTACATAGTTCGAGTTAGGAACAGCTTTTTTCTTC
CCGGCGTCTCCACCAACTCCACCGCTGCCGCATCTGACTCCTCGCCACACCGTTAACATT
TCCCGGCGAACCGCAACCGTTCCCGGGAAGAATCTTCCGGTGAGCCCATCGGCGGCAGTA
GATGGCGTGGGGGTTTTGAAGATCGTCGTTGAGGTCTGTATTTGCAAAGCCATTTTCTTG
TTTCTGGTGAAGAGATGAATGGAGAAAGGGAGCAAAAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4GK49TF 650 0 0
AAAATGCTATTTC*TCAGCTGCAGCAACTGGATCATCAATGTGGTCATCAGTAATCGTTA
CTGTCCCAGTCGATTCTCGGTGTGCCTCACCATCAGAGCCACGGATGGTAAGACGATAAA
CAACAGTAACATTACCATCCTCTGAGAAAGTGACGTCACGAACCTCCCCACACCAACCAG
GTGCGTAGAAGCTGAGCATCCGATTTGCATGAAACCAAGGGATGAAACCAGAGGAAGCTG
CACTGGATCCAGGATCGTGGCTCTTGACGATGTTATCAGGGATCTTCTTGTTGAGATCTC
GAAGTATCTCAATCAGAGGCCGAGTGATCGACGAGGAGGACGAGAACTTGTCCAAAGGCA
CTACATAGTTCGAGTTAGGAACAGCTTTTTTCTTCCCGGCGTCTCCACCAGCTCCACCGC
TGCCGCATCTGACTCCTCGCCACACCGTTAACATTTCCCGGCGAACCGCAACCGTTCCTG
GGAAGAATCTTCCGGTGAGCCCATCGGCGGCAGTAGATGGCGTGGGGGTTTTGAAGATCG
TCGTTGAGGTCTGTATTTGCAAAGCCATTTTCTTGTTTCTGGTGAAGAGATGAATGGAGA
AAGGGAGCAAAAACTCTGATTTAAGACAGAACAGGAAAAGAGTGGGACCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 3 10

CO CL196Contig1 852 2 9 U
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TTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACATGTACCCTTGACAACAACC
AACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTACAAATGGCGATGGTGTTGG
CACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAATAGTCATAGATCATATGG
TTAGCTCGAACCCATATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTAAGCTCAAACACAGTCGGC
TCATCCCACCAGAATCTCTGATCTTCTCCACTACACTTGCTTAGGTCAGTTATTGTCGGA
ACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAA
TCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATAGAGCTGTAC
ACTCCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGGTTCTTGTGGACA
CGAATAGGAGTCTCATCCACCATAAACACAACACTACGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAA
GTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACT
CCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGTGTTACCTAGAAAC
TCGAAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTT
CCTGCTGAGTCACCCTCCACGAGCTTAATCTGGATAGAGACTTTACCGAACAAGTACTTG
CTCCTCGACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C687JQ U 42
AF RR4BF74JQ U 1
BS 1 78 RR4BF74JQ
BS 79 79 RR4C687JQ
BS 80 275 RR4BF74JQ
BS 276 276 RR4C687JQ
BS 277 288 RR4BF74JQ
BS 289 289 RR4C687JQ
BS 290 351 RR4BF74JQ
BS 352 352 RR4C687JQ
BS 353 852 RR4BF74JQ

RD RR4C687JQ 705 0 0
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TGTACTCTTGACAACAAC*AACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTA
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TAGCTCAAACACAGTCGGCTCATCCCACCAGAATCTCTGGTCT***CCATTACACTTGCT
TAGGTCAGTTATTGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAAT
GAAAGGAGCGTGAGTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGC
ATTCCAAATAGAGCTGTACACTCCCATCGCTTGGTCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATC
TTCAAGGTTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCCACCATAAACACAACACTGCGTTT
ACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCT
TTGCTCTCTGTTTT*AACTCCGTTCACGTAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCGCC
GGTTGTGTTGCCTAGGAACTCGAAATCAAACTCGTTGTGGTTCG
T

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4BF74JQ 852 0 0
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AACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTACAAATGGCGATGGTGTTGG
CACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAATAGTCATAGATCATATGG
TTAGCTCGAACCCATATAAGCTGATGATTCTGATGGAGGCTAAGCTCAGACACAGTCGGC
TCATCCCACCAGAATCTCTGATCTTCTCCACTACACTTGCTTAGGTCAGTTGTTGTCGGA
ACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAA
TCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATAGAGCTGTAC
ACTCCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGGTTCTTGTGGACA
CGAATAGGAGTCTCATCCACCATAAACACAACACTACGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAA
GTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACT
CCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGTGTTACCTAGAAAC
TCGAAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTT
CCTGCTGAGTCACCCTCCACGAGCTTAATCTGGATAGAGACTTTACCGAACAAGTACTTG
CTCCTCGACTCG

QA 1 852 1 852
DS 



CO CL196Contig2 860 2 30 U
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TGCATGTTGATGATGGTGTATGTGATTTCCTGTGGTGAAGCAGCTCCAGGAGCTAAGTTC
GAGGATCTTTACCGTTCAAGCTGGGCAATGGATCATTGTGTCAACGATGGAGAAGTCACG
AAACTCAAGCTTGACAATTTCTCTGGAGCTGGGTTCGAGTCGAGGAGCAAGTACTTGTTC
GGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTGGAGGGTGACTCAGCAGGAACCGTCACTGCT
TTCTACATGTCTTCAGAAGGTACGAACCACAACGAGTTTGATTTCGAGTTCCTAGGCAAC
ACAACCGGCGAGCCTTACATAGTCCAAACAAACGTCTACGTGAACGGAGTTGGAAACAGA
GAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACACTTACTCTATCCTC
TGGAGTAAACGCAGTGTTGTGTTTATGGTGGATGAGACTCCTATTCGTGTCCACAAGAAC
CTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTGCTAAAGACCAAGCGATGGGGAGTGTACAGCTCTAT
TTGGAATGCAGATGATTGGGCTACACAAGGAGGTCTTGTGAAAACAGATTGGACTCACGC
TCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGTTCCGACAACAAC
TGACCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAGATCAGAGATTCTGGTGGGATGAGCCGACTGTGTC
TGAGCTAAGCCTCCATCAGAATCATCAGCTTATATGGGTTCGAGCTAACCATATGATCTA
TGACTATTGCTATGATGCTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF74TF U 1
AF RR4B631TF U 55
BS 1 63 RR4BF74TF
BS 64 64 RR4B631TF
BS 65 79 RR4BF74TF
BS 80 80 RR4B631TF
BS 81 89 RR4BF74TF
BS 90 90 RR4B631TF
BS 91 321 RR4BF74TF
BS 322 322 RR4B631TF
BS 323 350 RR4BF74TF
BS 351 351 RR4B631TF
BS 352 356 RR4BF74TF
BS 357 357 RR4B631TF
BS 358 368 RR4BF74TF
BS 369 369 RR4B631TF
BS 370 398 RR4BF74TF
BS 399 399 RR4B631TF
BS 400 491 RR4BF74TF
BS 492 492 RR4B631TF
BS 493 572 RR4BF74TF
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BS 585 585 RR4B631TF
BS 586 653 RR4BF74TF
BS 654 654 RR4B631TF
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BS 738 738 RR4B631TF
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AAACTCAAGCTTGACAATTTCTCTGGAGCTGGGTTCGAGTCGAGGAGCAAGTACTTGTTC
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TTCTACATGTCTTCAGAAGGTTCGAACCACAACGAGTTTGATTTCGAGTTTCTAGGTAAC
ACAACCGGTGAGCCTTACATAGTCCAAACAAACGTCTATGTGAACGGAGTTGGAAACAGA
GAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACACTTACTCTATCCTC
TGGAGTAAACGTAGTGTTGTGTTTATGGTGGATGAGACTCCTATTCGTGTCCACAAGAAC
CTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTGCTAAAGATCAAGCGATGGG*AGTGTACAGCTCTAT
TTGGAATGCAGATGATTGGGCTACACAAGGAGGTCTTGTGAAAACAGATTGGAGTCACGC
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DS 

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TTGTTCGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTGGAGGGTGACTCAGCAGGAACCGTC
ACTGCTTTCTACATGTCTTCAGAAGGTACGAACCACAACGAGTTTGATTTCGAGTTCCTA
GGCAACACAACCGGCGAGCCTTACATAGTCCAAACAAACGTCTACGTGAACGGAGTTGGA
AACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCC*CACTTACTCT
ATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTTGTGTTTATGGTGGATGAGACTCCTATTCGTGTCCAC
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CTCTATTTGGAATGCAGATGATTGGGCTACACAAGGAGGTCTTGTGGAAACAGATTGGAC
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AATAACTGACCTAAGCAAGTGTAATGGAGAC***CAGAGATTCTGGTGGGATGAGCCGAC
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GATCTATGACTATTGCTATGATGCTG

QA 1 806 1 806
DS 



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TCTTTGATCACAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACAAAGATGAACTTTTAAGACTAC
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AACTCAGACACAGTTGGCTCATCCCACCAGAATCTCTGGTCTTCTCCATTGCACTTGCTT
AGATCAGTTGTCGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATG
AAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGGGTTGCCCAGTCATCTGCA
TTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATTGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCT
TCAAGATTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAATACAACACTGCGTTTA
CTCCAGAGGATAGAGTAGGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTT
TGCTCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAAACGTTTGTCTGGACTATGTAAGGCTCACCC
GTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCATTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATG
TAGAAAGCAGTGACGGTTCCTGCTGAGTCACCCTCCACGAGCTTAATCTGGATAGAGACT
TTACCGAACAAGTACTTGCCTATCGACTCAAACCCAGCTCCAGAGGAGTTGTCAAGCTTG
AGTTTTGTGACTTCCCCATCGTTGATACAATGATCCATAGCCCAGCTTGAGCGGTAAAGT
TCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCAGCTTCGCCACAAGAAACCACACACACCACAATCATC
ATACACATGAACCAAC******CCATTCCCACCATTTTTTTAAATATTCACTCTACAGTC
TCACACACTTTGACTCAATGTCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4A924JQ U 2
AF RR4GW80JQ U 1
AF RR4CD76JQ U 22
AF RR4A924TF C 221
AF RR4AO50TF C 314
AF RR4GW80TF C 406
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TTGTGTTACCTAA

QA 1 673 1 673
DS 

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DS 

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TTCACATAGACGTTTGTCTGGACTATGTAAGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAGAACTCG
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QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4A924TF 823 0 0
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CTTCTCCATTGCACTTGCTTAGATCAGTTGTCGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGA
AATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTT
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CGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTACAACTCCGTTCACATAAACGTTTGTCT
GGACTATGTAAGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCGTTGTGGT
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TAAATATTCACTCTACAGTCTCACACACTTTGACTCAATGTCC

QA 1 823 1 823
DS 

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TA
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CAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGCGTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTG
TAGACTCCCATTGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGG
ACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAATACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAG
TAGGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCA
ACTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGGACTATGTAAGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAG
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TTGCTTCTCGATTCAAACCCAGCTCCAGAGGAGTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTGACTTCC
CCATCGTTGATACAATGATCCATAGCCCAGCTTGAGCGGTAAAGTTCCTCGAACTTAGCT
CCTGGAGCAGCTTGGCCACAAGAAACCACACACACCACAATCATCATACACATGAACCAA
C******CCATTCCCACCATTTTTTTAAATATTCACTCTACAGTCTCTCACACTTTGACT
CAAT
GTCC

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4GW80TF 637 0 0
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GGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAAT
ACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAGGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAAC
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ATGTAAGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCATCGTGGTTCGAA
CCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTTCCTGCTGAGTCACCCTCGACGAGCTTA
ATCTGGATAGAGACTTTACCGAACAAGTACTTGCCTATCGACTCAAACCCAGCTCCAGAG
GAGTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTGACTTCCCCATCGTTGATACAATGGTCCATAGCCCAG
CTCGAGCGGTAAAGTTCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCAGCTTCCCCACAAGAAATCACA
CACACCGCAATCATCATACACATGAACCAAC******CCATTCCCACCATTTTTTTAAAT
ATTCACTCTACAGTCTCACACACTTTGACTCAAT
GTC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 2 10

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AGACATGCCTGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATTTCATATGAGAAA
AGGTATAAGTGAAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGA
CTTTATAGGCGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCATCACATCAAACAA
GCCACAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCGCACCGGATC
CTCTTCCACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAACACATTTTTT
TAGTTCTTTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTCATCAGATGC
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TGTAGTTGAATCCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAA
AGGAGCGTCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGACGATCACTTCAGTCTC
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GCTACTGCTGTTGCTGCAAGAGCTCTTGTCATGATCGTGGCTTGAATCAGTGATCTCTAT
ACGCTCATCAGTTTCCTTTAAGATTCTGATAGCTTCTTCCTCAGTAGATC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP55JQ U 1
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CTCCTTGACTTCATGGG

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DS 

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C
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QA 2 828 2 828
DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 25 40 40 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4G480JQ U 48
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G
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QA 2 584 2 584
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QA 1 832 1 832
DS 

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AAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGACTTTATAGGCG
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GAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAACACATTTTTTTAGTTCTTTTT
TATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTCATCAGATGCAAGAGAAGCTT
CAGCAGCAGACGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGATCACTAGGTGTAGTCGAAT
CCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAAAACCAATAAAGGGAGCGTCTC
CAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCACTTCAGTCTCCTCCTTGACTT
CATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCAC***TACCACTACCGCTACTGCTGT
TGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGATCTCTATACGCTCATCAG
TTTCTTCTA

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DS 

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GCG
TAGTGATTTAATCATTACATAAATTGGCCAACAACAACAGTCTCAAAGTCTCAGAACCTG
AGAGAACAAAAACAACAATAGACAAGTAATGGTACAGAGCGAAAGGGAAGACTATGCAGA
CATGCCTGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATTTAATATGAGAAAAGG
TATAAGTGAAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGACTT
TATAGGCGACTCAAGTTTCTGAGCTCATCTACTGGATCCTGTCATCACATCAAACAAGCC
ACAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCGCACCGGATCCTC
TTCCACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAACACATTTTTTTAG
TTCTTTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTCATCAGATGCAAG
AGAAGCTTCAGCGGCAGACGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGATCACTAGGTGT
AGTCGAATCCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAAGGG
AGCGTCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCACTTCAGTCTCCTC
CTTGACTTCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCAC***TACCACTACCGCT
ACTGCTGTTGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGATCTCTATACG
CTCATCAGTTTCTTCTACGATTCTGACAGCT

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DS 

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AACAAAAACAACAATAGACAAGTAATGGTACAGAGCGAAAGGGAAGACTATGCAGACATG
CCTGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATTTCATATGAGAAAAGGTATA
AGTGAAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGACTTTATA
GGCGACTCAAGTTTCTGAGCTCATCTACTGGATCCTGTCATCACATCAAACAAGCCACAA
CAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCGCACCGGATCCTCTTCC
ACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAACACATTTTTTTAGTTCT
TTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTCATCAGATGCAAGAGAA
GCTTCAGCGGCAGACGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGATCACTAGGTGTAGTC
GAATCCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAAGGGAGCG
TCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATAACTTCAGTCTCCTCTTTG
ACTTCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCCACCAC***TACCACTACCGCTACTG
CTGTTGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGATCTCTATACGCTCA
TCAGTTTCTTCTACGATTCTGACAGCTTCTTCCTCAGTAGATCC***ATGGTTGGTTGAT
T
GAGAGTA

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4BP55TF 674 0 0
GCA
AGCTTCTGACTTTATAGGCGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCATCAC
ATCAAACAAGCCACAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCG
CACCGGATCCTCTTCCACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAAC
ACATTTTTTTAGTTCTTTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTC
ATCAGATGCAAGAGAAGCTTCAGCAGCAGACGAGGTCGCAACAATGTTCTCAGTCTCTGG
ATCACTAGGTGTAGTTGAATCCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGA
ACCAATAAAAGGAGCGTCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGACGATCAC
TTCAGTCTCCTCCTTGACTTCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCACCACT
ACCACTACCGCTACTGCTGTTGCTGCAAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGT
GATCTCTATACGCTCATCAGTTTCCTTTAAGATTCTGACAGCTTCTTCCTCAGTAGATCC
***ATGGTTGATTGATTTGAGAGTAGAAGAGGCTTCTTGTTGCTGCTTTTTCTTGGCGGC
TTTCCTTTTC
C

QA 4 673 4 673
DS 

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AAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGACTTTATAGGCG
ACTCAAGTTTCTGAGCTCATCTACTGGATC*TGTCATCACATCAAACAAGCCACAACAAC
TTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCGCACCGGATCCTCTTCCACAT
GAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAACACATTTTTTTAGTTCTTTTT
TATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTCATCAGGTGCAAGAGAAGCTT
CAGCGGCAGACGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGATCACTAGGTGTAGTCGAAT
CCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAAGGGAGCGTCTC
CAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCACTTCAGTCTCCTCCTTGACTT
CATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCAC***TACCACTACCGCTACTGCTGT
TGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGATCTCTATACGCTCATCAG
TTTCTTCTACGATTCTGACAGCTTCTTCCTCAGTAGATCCTGCATGGTTGGTTGATTTGA
GAGTAGAAGAGGCTTCTTGTTGCTGCTTTTTCTTGGCGGCTTTCCTTTTCTTAGCACCGG
AAGGCATGATTGATTGATTAGGGTTTTTTTTT*CTTTGTGGGGGATCTATCTATGTACAG
CTATCC

QA 1 786 1 786
DS 

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TTTATAGGCGACTCAAGTTTCTGAGCTCATCTACTGGATC*TGTCATCACATCAAACAAG
CCACAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCGCACCGGATCC
TCTTCCACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTCCCTTCAGGAACACATTTTTTT
AGTTCTTTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCTCATCAGATGCA
AGAGAAGCTTCAGCGGCAGACGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGATCACTAGGT
GTAGTCGAATCCATCAAACCGGCATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAAG
GGAGCGTCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATAACTTCAGTCTCC
TCTTTGACTTCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCCACCAC***TACCACTACCG
CTACTGCTGTTGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGATCTCTATA
CGCTCATCAGTTTCTTCTACGATTCTGACAGCTTCTTCCTCAGTAGATCC***ATGGTTG
GTTGATTTGAGAGTAGAAGAGGCTTCTTGTTGCTGCTTTTTCTTGGCGGCTTTCCTTTTC
TTAGCACCGGAAGGCATGATTGATTGATTAGGGTTTTTTTTTTCTTTGTGGGGGATCTAT
CTATCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 12

CO CL198Contig1 732 12 13 U
GGGTTGGGTGATTGTGTTTCCTCGCTCTCTCCTCTCAGCCGCGTTCACTCTCTGAAACTC
CCAAAGAGAAATGAATTACCGTATTGGATTGATAACGGGTGGATCCAAAGATGTGGTGCG
GAGAACTTTTGCAGCAGCAGCTGGTAAAGCGAAGAAAGGTGGGAAAGGAGGAGGCAGCGA
TGCTCCTAAAGGCTCGTCTCTGAGCAAAGAGATCAAATCCACTACCGTTGTTGGTGCTAA
CACTCTCAAAGACGGGTCTGATCCCAAGATCCTTCCAGACTCTGACTACCCTGATTGGCT
CTGGCGTCTTCTCCATATTCGACCTGCCCTTAGTGAGCTCAGGAGGAAGAACGTCGAGAC
TCTTCCCTACGATGACCTCAAACGTTTTGTCAAGCTTGACACCCGTTCCAAAATCAAGGA
GAACAACTCCATCAAGGCCAAGAACTAAGAGAGATACCTTCCTTTGCCTCTTCTTTGATT
TTGCTTAATCTTCTTTGAATGTAGTTGAGATTATTTGTCATCATCGTGCTCTTACTTCCA
GTTATGTTACATTATCTGAGTCTACAAGTTTTCTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTT
TCATCTTACCGCTC*GCATTTCAGAACTCTTGGGCTATTATTGCTTTTTTTTTAGACCAA
ATGATATGTTCAACAAATGGAACACTATCTACCTTTTGTTAATTTTCTTACGGATAGAGT
TGGATAGTTCTT


BQ
30 30 30 30 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 45 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 65 65 35 60 60 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RR4C669JQ C 202
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TCATCTT

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GG
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T
TCATCTT

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TCATCTT

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TCATCTT

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DS 

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GTCTTCTCCATATTCGACCTGCCCTTAGTGAGCTCAGGAGGAAGAACGTCGAGACTCTTC
CCTACGATGACCTCAAACGTTTTGTCAAGCTTGACACCCGTTCCAAAATCAAGGAGAACA
ACTCCATCAAGGCCAAGAACTAAGAGAGATACCTTCCTTTGCCTCTTCTTTGATTTTGCT
TAATCTTCTTTGAATGTAGTTGAGATTATTTGTCATCATCGTGCTCTTACTTCCAGTTAT
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TTACCGCTC*GCATTTCAGAACTCTTGGGCTATTATTGTTTTTTTTTTAGAC

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DS 

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CTAAAGGCTCGTCTCTGAGCAAAGAGATCAAATCCACTACCGTTGTTGGTGCTAACACTC
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GTCTTCTCCATATTCGACCTGCCCTTAGTGAGCTCAGGAGGAAGAACGTCGAGACTCTTC
CCTACGATGACCTCAAACGTTTTGTCAAGCTTGACACCCGTTCCAAAATCAAGGAGAACA
ACTCCATCAAGGCCAAGAACTAAGAGAGATACCTTCCTTTGCCTCTTCTTTGATTTTGCT
TAATCTTCTTTGAATGTAGTTGAGATTATTTGTCATCATCGTGCTCTTACTTCCAGTTAT
GTTACATTATCTGAGTCTACAAGTTTTCTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTTTCATC
TTACCGCTC*GCATTTCAGA*CTCTTGGGCTATTATTGTTTTTTTTT*AGAC
AAAAA

QA 1 652 1 652
DS 

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G
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CAACTCCATCAAGGCCAAGAACTAAGAGAGATACCTTCCTTTGCCTCTTCTTTGATTTTG
CTTAATCTTCTTTGAATGTAGTTGAGATTATTTGTCATCATCGTGCTCTTACTTCCAGTT
ATGTTACATTATCTGAGTCTACAAGTTTTCTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTTTCA
TCTTACCGCTC*GCATTTCAGAACTCTTGGGCTATTATTGCTTTTTTTTT
TAGACC

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DS 

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CTGAGCAAAGAGATCAAATCCACTACCGTTGTTGGTGCTAACACTCTCAAAGACGGGTCT
GATCCCAAGATCCTTCCAGACTCTGACTACCCTGATTGGCTCTGGCGTCTTCTCCATATT
CGACCTGCCCTTAGTGAGCTCAGGAGGAAGAACGTCGAGACTCTTCCCTACGATGACCTC
AAACGTTTTGTCAAGCTTGACACCCGTTCCAAAATCAAGGAGAACAACTCCATCAAGGCC
AAGAACTAAGAGAGATACCTTCCTTTGCCTCTTCTTTGATTTTGCTTAATCTTCTTTGAA
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GTCTACAAGTTTTCTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTTTCATCTTACCGCTC*GCAT
TTCAGAACTCTTGGGCTATTATTGCTTTTTTTTTAGACCAAATGATATGT
G

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DS 

RD RR4D214TF 531 0 0
GCTGGTAAAGCGAAGAAAGGTGGGAAAGGAGGAGGCAGCGATGCTCCTAAAGGCTCGTCT
CTGAGCAAAGAGATCAAATCCACTACCGTTGTTGGTGCTAACACTCTCAAAGACGGGTCT
GATCCCAAGATCCTTCCAGACTCTGACTACCCTGATTGGCTCTGGCGTCTTCTCCATATT
CGACCTGCCCTTAGTGAGCTCAGGAGGAAGAACGTCGAGACTCTTCCCTACGATGACCTC
AAACGTTTTGTCAAGCTTGACACCCGTTCCAAAATCAAGGAGAACAACTCCATCAAGGCC
AAGAACTAAGAGAGATACCTTCCTTTGCCTCTTCTTTGATTTTGCTTAATCTTCTTTGAA
TGTAGTTGAGATTATTTGTCATCATCGTGCTCTTACTTCCAGTTATGTTACATTATCTGA
GTCTACAAGTTTTCTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTTTCATCTTACCGCTC*GCAT
TTCAGAACTCTTGGGCTATTATTGCTTTTTTTTTAGACCAAATGATATGT
G

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4C669TF 725 0 0
GG
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AATGAATTACCGTATCGGATTGATAACGGGTGGATCCAAGGATGTGGTGCGGAGAACGTT
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AGGATCGTCTCTGAGCAAAGAGATCAAATCCACTTCCGTTGTTGGTGCTAACACTCTCAA
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CTTCTTTGAATGTAGTTGAGATTATTTATCATCATCGTGCTCTTACTTCCAGTTATGTTA
CATTATCTGAGTCTATAAGTTT*CTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTTTCATTTTAC
CGCTCTGCAGTTCAGAACTCTTTGGCTATTATTACTTTTTTTTTAGACCAAATGATATGT
TCAACAAATGGAACACTATCTACCTTTTGTTAATTTTCTTACGGATAGAGTTGGATAGTT
CTT

QA 3 725 3 725
DS 

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ACCTGCCCTTAGTGAGCTCAGGAGGAAGAACGTCGAGACTCTTCCCTACGATGACCTCAA
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CTATAAGTTT*CTTAGTAGACCCAATAAGAATTGCTGTTTCATTTTACCGCTCTGCAGTT
CAGAACTCTTTGGCTATTATTACTTTTTTTTTAGACCAAATGATATGTTCAACAAATGGA
ACACTATCTACCTTTTGTTAATTTTCTTACGGATAGAGTTGGATAGTTCTT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 11

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AAAAAGAAGTTTACACAGTATGGAAGTGAACCATAAAGCGATTATATGAAATTATGGTCC
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TCATATTTTAAAACACATAATTAAGAAAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTT
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GCTGAGTATAGTGGCCACAGGATGGAAAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAA
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GAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCATCACAATTGTGTTCTTGCCACCCATGAATATCTC
TGATGTATACTCATCCATGGCTCGCTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGAC
AACAACATGGTCAGGGTGTTCCCCGGGCTCGAAGAGGATACCGTTGCTAGCAACCATATC
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CATTCCATCGTTGTTCCCTAGGTGATTGTAGCTCACTATTGAAGTAGGCTTGATTCCAGC
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ACCACCGATCAAAACATTGTTCTTGATAGCCAAATCAATAAGACCTGGGACAAAGGTGTT
CTGAGGGCTTCCATTGATGAAGGGGATGCCTTCAAGAACACATGCAATCGCATAAAGCGT
GGAAGGAGAGATCTCAGACTCATCCCTTTCCACAGACTTCATAAGATTCTCCATTGTGTC
GTTTAGCCCCACGATCACATTGCTGTAACGCTCTGTGTTGCCCGTCCACAGAACCACAAC
CTTATCCACCTTGTTCTTCTCCTTAAACTCCCTCATGTCCTTGATGATTTGGTCGACTTG
TTCCTTCTTGGTACCTTTGATGACGTTGTTGGCACGTGACCCCTGATTGGCAGCGACGAA
ATCAGGATCGAAGATACCAGGGAGTGGGACAATGTTCTCCATGAAAGGCCTAAGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4D776JQ U 119
AF RR4D053TF C 5
AF RR4D053JQ U 5
AF RR4EN55JQ U 1
AF RR4D776TF C 83
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ATGTTGTTCTC

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A
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GTATA
C

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DS 

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A
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AAAAACACTTGTACAATAAAACTATATAACCCATCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACT
TCACACCCAACAGAGATCAAACCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATA
TTTTAAAACACATAATTAAGAAAAAAAAACCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATA
ATGAACTCATCGAAGGTTCTTATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGT
TCTCCGGAGCCAGCCCAACGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTGCTTAA
ACAACGCATTAACCACCGGTGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCT

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DS 

RD RR4EN55JQ 730 0 0
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TTACTTCACACCCAACAGAGATCAAACCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCAT
TCATATTTTAAAACACATAATTAAGAAAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTT
ATATAATGAACTCATCGAAGGTTCTTATACGCTTCATGTGCACTTGTACTCCAAGATCAT
GTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAATGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTG
CTTAGACAACGCATTAACCACCGGTGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTA
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GAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCATCACAATTGTGTTCTTGCCACCCATGAATATCTC
TGATGTATACTCATCCATGGCTCGCTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGAC
AACAACATGG

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DS 

RD RR4D776TF 675 0 0
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AAGAAAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTATTTATATAATGAACTCATCGAAGGT
TCTTATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCA
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CGCTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAACAACATGGTCAGGGTGTTCC
CCGGGCTCGAAGAG
C

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DS 

RD RR4DE48JQ 667 0 0
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CAAACCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATATTTTAAAACACATAATT
AAGAAAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATAATGAACTCATCGAAGGT
TCTTATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCA
ATGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTGCTTAGACAACGCATTAACCACC
GGTGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCTGAGTATAGTGGCCACAGGA
TGGAAAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCA
GCGAGGAGAACAAGATCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTG
TGCATCACAATTGTGTTCTTGCCACCCATGAATATCTCTGATGTATACTCATCCATGGCT
CGCTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAACAACATGGTCAGGGTGTTCC
CCGGGCT

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DS 

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CTATATAACCCGTCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACTTCACACCCAACAGAGATCAAA
CCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATATTTTAAAACACATAATTAAGA
AAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATAATGAACTCATCGAAGGTTCTT
ATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAATGC
AGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTGCTTAGACAACGCATTAACCACCGGTG
TTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCTGAGTATAGTGGCCACAGGATGGA
AAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCAGCGA
GGAGAACAAGATCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCA
TCACAATTGTGTTCTTGCCACCCATGAATATCTCTGATGTATACTCATCCATGGCTCGCT
TGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAACAACATGGTCAGGGTGTTCCCCGG
GCTCGAAGAGGATACCGTTGCTAGCAACCATATCATCCACCACATTACTTTTGGAGATCT
CCTTAGAT

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DS 

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AGTGAACCATAAAGCGATTATATGAAATTATGGTCCAACCTAGAAACACTTGTACAATAA
AACTATATAACCCATCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACTTCACACCCAACAGAGATCA
AACCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATATTTTAAAACACATAATTAA
GAAAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATAATGAACTCATCGAAGGTTC
TTATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAAC
GCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCGGCTTAGACAACGCATTAACCACCGG
TGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCTGAGTATAGTGGCCACAGGATG
GAAAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCAGC
GAGGAGAACAAGATCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTG
CATCACAATTGTGTTCTTGCCACCCATGAATATCTCTGATGTATACTCATCCATGGCTCG
CTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAACAACATGGTCAGGGTGTTCCCC
GGGCTCGAAGAGGATACCGTTGCTAGCAACCATATCATCCACCACATTACTTTTGGAGAT
CTCCTTAGATCTGAATGTCTGTGGAGCTGAGAGGTTCATTC

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DS 

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TATTTTAAAACACATAATTAAGAAAAAAA**CCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATA
TAATGAACTCATCGAAGGTTCTTATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTT
GTTCTCCGGAGCCAGCCCAACGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCGGCTT
AGACAACGCATTAACCACCGGTGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCT
GAGTATAGTGGCCACAGGATGGAAAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTG
AATCCTGGTGCTGAGTTCAGCGAGGAGAACAAGATCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAG
AGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCATCACAATTGTGTTCTTGCCACCCATGAATATCTCTGA
TGTATACTCATCCATGGCTCGCTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAAC
AACATGGTCAGGGTGTTCCCCGGGCTCGAAGAGGATACCGTTGCTAGCAACCATATCATC
CACCACATTACTTTTGGAGATCTCCTTAGATCTGAATGTCTGTGGAGCTGAGAGGTTCAT
TCCATCGTTGTTCCCTAGGTGATTGTAGCTCACTATTGAAGTAGGCTTGATTCCAGCACC
AACAAGGAAATCAACCAAGACGGATTTC
C

QA 1 748 1 748
DS 

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CATGGTCAGGGTGTTCCCCGGGCTCGAAGAGGATACCGTTGCTAGCAACCATATCATCCA
CCACATTACTTTTGGAGATCTCCTTAGATCTGAATGTCTGTGGAGCTGAGAGGTTCATTC
CATCGTTGTTCCCTAGGTGATTGTAGCTCACTATTGAAGTAGGCTTGATTCCAGCACCAA
CAAGGAAATCAACCAAGACGGATTTCATCTTGGTTTGACCACTCTTGAAGTCATCACCAC
CGATCAAAACATTGTTCTTGATAGCCAAATCAATAAGACCTGGGACAAAGGTGTTCTGAG
GGCTTCCATTGATGAAGGGGATGCCTTCAAGAACACATGCAATCGCATAAAGCGTGGAAG
GAGAGATCTCAGACTCATCCCTTTCCACAGACTTCATAAGATTCTCCATTGTGTCGTTTA
GCCCCACGATCACATTGCTGTAACGCTCTGTGTTGCCCGTCCACAGAACCACAACCTTAT
CCACCTTGTTCTTCTCCTTAAACTCCCTCATGTCCTTGATGATTTGGTCGACTTGTTCCT
TCTTGGTACCTTTGATGACGTTGTTGGCACGTGACCCCTGATTGGCAGCGACGAAATCAG
GATCGAAGATACCAGGGAGTGGGACAATGTTCTCCATGAAAGGCCTAAGCTGT
C

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DS 

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TCTGAATGTCTGTGGAGCTGAGAGGTTCATTCCATCGTTGTTCCCTAGGTGATTGTAGCT
CACTATTGAAGTAGGCTTGATTCCAGCACCAACAAGGAAATCAACCAAGACGGATTTCAT
CTTGGTTTGACCACTCTTGAAGTCATCACCACCGATCAAAACATTGTTCTTGATAGCCAA
ATCAATAAGACCTGGGACAAAGGTGTTCTGAGGGCTTCCATTGATGAAGGGGATGCCTTC
AAGAACACATGCAATCGCATAAAGCGTGGAAGGAGAGATCTCAGACTCATCCCTTTCCAC
AGACTTCATAAGATTCTCCATTGTGTCGTTTAGCCCCACGATCACATTGCTGTAACGCTC
TGTGTTGCCCGTCCACAGAACCACAACCTTATCCACCTTGTTCTTCTCCTTAAACTCCCT
CATGTCCTTGATGATTTGGTCGACTTGTTCCTTCTTGGTACCTTTGATGACGTTGTTGGC
ACGTGACCCCTGATTGGCAGCGACGAAATCAGGATCGAAGATACCAGGGAGTGGGACAAT
GTTCTCCATGAAAGGCCTAAGCTGTC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 11

CO CL200Contig1 980 11 9 U
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CGATTCAGTTTTACATTGTTAATTGTTTTCCTTAAAATAGATAAGCATGAACCCAAACGA
GCTAGAACATAACATATTTAGATAGTGAACAAAAGATAGACCAGACCATCCATCGTCTTC
AGAGCATCATCAAGACAGAAAACAAGCAGAGGAACAAATTGTTGGAATTACGCAGCACGA
AACCGGTGCTTTCGTTTGAGTAATCCGGGTTTAACCCGGTTCCGGTAGCATCAGTGATAT
TGCCTCCTAGCAGTCCGGTGGTTGGTGTGCCAGTGAATGGACTGCCAGTGTATGGACTGT
TTCCACCGGGAAATGTCGTGATAGGGCTGTTTCCCTTTGGACTGCTTTTACCTGGCGTCA
CGGTGCTGCTGCTACCACCTCCAGTGCCACTAACACTAGAAGGGAATGGACATCCTGAAT
AGCTGGGATCAGTGGTGGTAGGAGTGGCAGTACCAGTGAAGTTACAAGACTCAGAAGCTT
GACTTTTCTTCTGAAAGAAGCTATTGACAGCATAGTTACAATGAGCTCTAACATTGTCAG
GGTTAAAGCAAGACCCTTTTGGGTGAGTTGGGTTACAGTCAGCTCCATTTCCACAAGCAT
AGTCTAGTGTCCTTTGGAGCACTGAGTCACTCAGCCCTGTTTTGCACACACACCATGTGG
CGCTACAATGGCCAGCCATGAGGAGACTGAGAAGATAGAGAAA**GAACAGCCATGAGGG
GAATGCAGATACACAAATGTTCACTGTTGATTAGTCGAAACAGAGAGGGATAGATTATAG
AGAGATGAAGATAGAAATTTTCTCTTCTATTATTGTTATAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAGAGAGAGAGAGTGTGTACAAGCAGACACTAGTGTACTGTACTGAGATTGAG
AACGACAACTTGTTCCGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DL37TF C 35
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C

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CATCAAGACAGAAAACAAGCAGAGGAACAAATTGTTGGAATTACGCAGCACGAAACCGGG
GCTTTCGTTTGAGTAATCCGGGTTTAACCCGGTTCCGGTAGCATCAGTGATATTGCCTCC
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GGGAAATGTCGTGATAGGGCTGTTTCCCTTTGGACTGCTTTTACCTGGCGTCACGGTGCT
GCTGCTACCACCTCCAGTGCCACTAACACTAAAAGGGAATGGACATCCTGAATAGCTGGG
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CTTCTGAAAGAAGCTATTGACAGCATAGTTACAATGAGCTCTAACATTGTCAGGGTTAAA
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DS 

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TAGATAGTGAACAAAAGATAGACCAGACCATCCATCGTCTTCAGAGCATCATCAAGACAG
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AGTAATCCGGGTTTAACCCGGTTCCGGTAGCATCAGTGATATTGCCTCCTAGCAGTCCGG
TGGTTGGTGTGCCAGTGAATGGACTGCCAGTGTATGGACTGTTTCCACCGGGAAATGTCG
TGATAGGGCTGTTTCCCTTTGGACTGCTTTTACCTGGCGTCACGGTGCTGCTGCTACCAC
CTCCAGTGCCACTAACACTAGAAGGGAATGGACATCCTGAATAGCTGGGATCAGTGGTGG
TAGGAGTGGCAGTACCAGTGAAGTTACAAGACTCAGAAGCTTGACTTTTCTTCTGAAAGA
AGCTATTGACAGCATAGTTACAATGAGCTCTAACATTGTCAGGGTTAAAGCAAGACCCTT
TTGGGTGAGTTGGGTTACAGTCAGCTCCATTTCCACAAGCATAGTCTAGTGTCCTTTGGA
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TGAGGAGACTGAGAAGATAGAGAAA**GAACAGCCATGAGGGGAATGCAGATACACAAAT
GTTCACTGTTGATTAGTC
CC

QA 1 798 1 798
DS 

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GAACCCAAACGAGCTAGAACATAACATATTTAGATAGTGAACAAAAGATAGACCAGACCA
TCCATCGTCTTCAGAGCATCATCAAGACAGAAAACAAGCAGAGGAACAAATTGTTGGAAT
TACGCAGCACGAAACCGGTGCTTTCGTTTGAGTAATCCGGGTTTAACCCGGTTCCGGTAG
CATCAGTGATATTGCCTCCTAGCAGTCCGGTGGTTGGTGTGCCAGTGAATGGACTGCCAG
TGTATGGACTGTTTCCACCGGGAAATGTCGTGATAGGGCTGTTTCCCTTTGGACTGCTTT
TACCTGGCGTCACGGTGCTGCTGCTACCACCTCCAGTGCCACTAACACTAGAAGGGAATG
GACATCCTGAATAGCTGGGATCAGTGGTGGTAGGAGTGGCAGTACCAGTGAAGTTACAAG
ACTCAGAAGCTTGACTTTTCTTCTGAAAGAAGCTATTGACAGCATAGTTACAATGAGCTC
TAACATTGTCAGGGTTAAAGCAAGACCCTTTTGGGTGAGTTGGGTTACAGTCAGCTCCAT
TTCCACAAGCATAGTCTAGTGTCCTTTGGAGCACTGAGTCACTCAGCCCTGTTTTGCACA
CACACCATGTGGCGCTACAATGGCCAGCCATGAGGAGACTGAGAAGATAGAGAAA**GAA
CAGCCATGAGGGGAATGCAGATACACAAATGTTCACTGTTGATTAGTC
CC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4C221JQ 775 0 0
G
GATTTAAAGATATTAAATAGAAACCAAATTCGTCCCAAAACGATTCAGTTTTACATTGTT
AATTGTTTTCCTTAAAATAGATAAGCATGAACCCAAACGAGCTAGAACATAACATATTTA
GATAGTGAACAAAAGATAGACCAGACCATCCATCGTCTTCAGAGCATCATCAAGACAGAA
AACAAGCAGAGGAACAAATTGTTGGAATTACGCAGCACGAAACCGGTGCTTTCGTTTGAG
TAATCCGGGTTTAACCCGGTTCCGGTAGCATCAGTGATATTGCCTCCTAGCAGTCCGGTG
GTTGGTGTGCCAGTGAATGGACTGCCAGTGTATGGACTGTTTCCACCGGGAAATGTCGTG
ATAGGGCTGTTTCCCTTTGGACTGCTTCTACCTGGCGTCACGGTGCTGCTGCTACCACCT
CCAGTGCCACTAACACTAGAAGGGAATGGACATCCTGAATAGCTGGGATCAGTGGTGGTA
GGAGTGGCAGTATCAGTGAAGTTACAAGACTCAGAAGCTTGACTTTTCTTCTGAAAGAAG
CTATTGACAGCATAGTTACAATGAGCTCTAACATTGTCAGGGTTAAAGCAAGACCCTTTT
GGGTGAGTTGGGTTACAGTCAGCTCCATTTCCACAAGCATAGTCTAGTGTCCTTTGGAGC
ACTGAGTCACTCAGCCCTGTTTTGCACACACACCATGTGGCGCTACAATGGCCAGCCATG
AGGAGACTGAGAAGATAGAGAAACAGAACAGCCATGAGGGGAATGCAGATACAC

QA 2 775 2 775
DS 

RD RR4B258TF 776 0 0
ACCAAATTCGTCCCAAAACGATTCAGTTTTACATTGTTAATTGTTTTCCTTAAAATAGAT
AAGCATGAACCCAAACGAGCTAGAACATAACATATTTAGATAGTGAACAAAAGATAGACC
AGACCATCCATCGTCTTCAGAGCATCATCAAGACAGAAAACAAGCAGAGGAACAAATTGT
TGGAATTACGCAGCACGAAACCGGTGCTTTCGTTTGAGTAATCCGGGTTTAACCCGGTTC
CGGTAGCATCAGTGATATTGCCTCCTAGCAGTCCGGTGGTTGGTGTGCCAGTGAATGGAC
TGCCAGTGTATGGACTGTTTCCACCGGGAAATGTCGTGATAGGGCTGTTTCCCTTTGGAC
TGCTTTTACCTGGCGTCACGGTGCTGCTGCTACCACCTCCAGTGCCACTAACACTAGAAG
GGAATGGACATCCTGAATAGCTGGGATCAGTGGTGGTAGGAGTGGCAGTACCAGTGAAGT
TACAAGACTCAGAAGCTTGACTTTTCTTCTGAAAGAAGCTATTGACAGCATAGTTACAAT
GAGCTCTAACATTGTCAGGGTTAAAGCAAGACCCTTTTGGGTGAGTTGGGTTACAGTCAG
CTCCATTTCCACAAGCATAGTCTAGTGTCCTTTGGAGCACTGAGTCACTCAGCCCTGTTT
TGCACACACACCATGTGGCGCTACAATGGCCAGCCATGAGGAGACTGAGAAGATAGAGAA
A**GAACAGCCATGAGGGGAATGCAGATACACAAATGTTCACTGTTGATTAGTC
CC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4CT35TF 671 0 0
GCAGTCCGATGGTTGGTGTGCCAGTGAATGGACTGCCAGTGTATGGACTGTTTCCACCGG
GAAATGTCGTGATAGGGCTGTTTCCCTTTGGACTGCTTTTACCTGGCGTCACGGTGCTGC
TGCTACCACCTCCAGTGCCACTAACACTAGAAGGGAATGGACATCCTGAATAGCTGGGAT
CAGTGGTGGTAGGAGTGGCAGTACCAGTGAAGTTACAAGACTCAGAAGCTTGACTTTTCT
TCTGAAAGAAGCTATTGACAGCATAGTTACAATGAGCTCTAACATTGTCAGGGTTAAAGC
AAGACCCTTTTGGGTGAGTTGGGTTACAGTCAGCTCCATTTCCACAAGCATAGTCTAGTG
TCCTTTGGAGCACTGAGTCACTCAGCCCTGTTTTGTACACACACCATGTGGCGCTACAAT
GGCCAGCCATGAGGAGACTGAGAAGATAGAGAAACAGAACAGCCATGAGGGGAATGCAGA
TACACAAATGTTCACTGTTGATTAGTCGAAACAGAGAGGGATAGATTATAGAGAGATGAA
GATAGAAATTTTCTCTTCTATTATTGTTATAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAGAGAGAGAGTGTGTACAAGCAGACACTAGTGTACTGTACTGAGATTGAGAACGACAAC
TTGTTCCGTGA

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 13

CO CL201Contig1 721 13 8 U
GAACAAGAGATATTGATATTTGATGAGACAAATATTTGGAAAATTAAAATAAAATAAAGA
TTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAGAGTAGAATAGAACAG
AAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATAGCATCA
AAACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAG
AGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATC
TCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAAT
GTAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAG
CTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTT
CTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTACC
CTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTTTTGAG
CTTGCGCCCAGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAG
ATCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATAATACTGAAAACCCTC
C


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 40 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
50 50 50 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 0 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR4A169TFB C 137
AF RR4FP74JQ U 46
AF RR4A169JQ U 78
AF RR4CP52JQ U 38
AF RR4GW95JQ U 1
AF RR4GW95TF C 2
AF RR4CP52TF C 252
AF RR4CE91JQ U 55
AF RR4CE91TF C 132
AF RR4A169JQD U 38
AF RR4FP74TF C 132
AF RR4DK93JQ U 46
AF RR4DK93TF C 56
BS 1 60 RR4GW95JQ
BS 61 61 RR4A169JQD
BS 62 206 RR4GW95JQ
BS 207 207 RR4A169JQD
BS 208 609 RR4GW95JQ
BS 610 610 RR4A169JQD
BS 611 719 RR4GW95JQ
BS 720 721 RR4A169JQD

RD RR4A169TFB 168 0 0
AATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATAGCATCAAAACAACTTAAAGCTT
GAAGCGTTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGA
CCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGGGAATATCTCCC

QA 1 168 1 168
DS 

RD RR4FP74JQ 385 0 0
AAAATAAAATAAAGATTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAG
AGTAGAATAGAACAGAAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACCAACAAAAGGG
GGGATTATAGCATCAAAACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCC
TTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTG
ACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTC
GTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTT
TCCGTTCTTGATAAGC
ACTCTAGCA

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR4A169JQ 431 0 0
TTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAGAGTAGAATAGAACAGAAGATACGAGGTTTTTA
ATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGGGGGATTATAGCATCAAAACAACTTAAAGCTTG
AAGCGTTGTCTAAGAACTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGAC
CCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGTGACCCT
TACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGCAACCAT
CGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGCTGCACTCTAGCACACT
TACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGATACCCT
TGGCGTGGGAA

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4CP52JQ 613 0 0
GGAAAATTAAAATAAAATAAAGATTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAA
CCTTAAAGAGTAGAATAGAACAGAAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAA
CAAAAGGTGGGATTATAGCATCAAAACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTG
GCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCT
TGAACCTGACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGTGACCCCTACGACCAAACCCAGCAATC
AACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCA
ATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGCTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAATTAGGC
TGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCA
AAAGGCTTCTTCCATTCGTTACCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTC
TGATTGATACGGAGCCTTTTGAGCTTGCGTCCAGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATG
TTTGTTTGTCGAA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4GW95JQ 721 0 0
GAACAAGAGATATTGATATTTGATGAGACAAATATTTGGAAAATTAAAATAAAATAAAGA
CTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAGAGTAGAATAGAACAG
AAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATAGCATCA
AAACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTATAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAG
AGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATC
TCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAAT
GTAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAG
CTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTT
CTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTACC
CTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTTTTGAG
CTTGCGCCCGGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAG
ATCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATAATACTGAAAACCCT
TC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4GW95TF 720 0 0
AACAAGAGATATTGATATTTGATGAGACAAATATTTGGAAAATTAAAATAAAATAAAGAC
TCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACTTTAAAGAGTAGAATAGAACAGA
AGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATAGCATCAA
AACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTATAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGA
GGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATCT
CCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATG
TAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGC
TGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTTC
TCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTACCC
TGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTTTTGAGC
TTGCGCCCGGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAGA
TCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATAATACTGAAAACCCT
TC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4CP52TF 452 0 0
TGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGT
GACCCCTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGC
AACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGCTGCACTCTAG
CACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGA
TACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTACCCTGATGGGACT
TCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTTTTGAGCTTGCGTCCAG
CTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAGATCAACAGCAA
AGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGAT
CC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4CE91JQ 649 0 0
TAAAGATTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAGAGTAGAATA
GAACAGAAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATA
GCATCAAAACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCC
TTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*
AATATCTCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTC
CTCAATGTAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTT
GATAAGCTGCACCCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACC
GATTTTCTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTC
GTTACCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCT
TTTGAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAG
GAGAAGATCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGAT
CC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CE91TF 572 0 0
TTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATAGCATCAAAACAACTTAA
AGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAG
TGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGT
GACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGC
AACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGCTGCACCCTAG
CACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGA
TACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTACCCTGATGGGACT
TCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTTTTGAGCTTGCGCCCAG
CTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAGATCAACAGCAA
AGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGAT
CC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4A169JQD 684 0 0
GGAAAATTAAAATAAAATAAAGATTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAA
CCTTAAAGAGTAGAATAGAACAGAAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAA
CAAAAGGTGGGATTATAGCATCAAAACAACTTAAAGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTG
GCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCT
TGAACCTGACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATC
AACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCA
ATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGCTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGC
TGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCA
AAAGGCTTCTTCCATTCGTTACCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTC
TGATTGATACGGAGCCTTTAGAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATG
TTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAGATCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGA
TGATAATAATACTGAAAACCCTCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4FP74TF 590 0 0
TTTTTAATAAAAGAAAACTGAACCAACAAAAGGTGGGATTATAGCATCAAAACAACTTAA
AGCTTGAAGCGTTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAG
TGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGT
GACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGC
AACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTGATAAGC***ACTCTAG
CACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGA
TACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTACCCTGATGGGACT
TCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTTTTGAGCTTGCGCCCAG
CTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGGGGAGAAGATCAACAGCAA
AGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATAATACTGAAAACCCTCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4DK93JQ 676 0 0
AAAATAAAATAAAGATTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAG
AGTAGAATAGAACAGAAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGT
GGGATTATAGCATCAAAACAACTTAAAGCTTGAAGCGCTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCC
TTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTG
ACTCCGGG*AATATCTCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTC
GTCATTTTCCTCAATGTAGTTTAAGAAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTT
TCCGTTCTTGATAAGCTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGC
CTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTT
CTTCCATTCGTTACCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGAT
ACGGAGCCTTTTGAGCTTGCGCCC**CTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTG
TCGAAGGAGGAGAAGATCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATA
ATACTGAAAACCCTCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4DK93TF 666 0 0
AAAGATTCATTGAACAAGTGATTTAACACATTAGTTCAGGAACCTTAAAGAGTAGAATAG
AACAGAAGATACGAGGTTTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTGGGATTATAG
CATCAAAACAACTTAAAGCTTGAAGCGCTGTCTAAGATCTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCT
TGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACCCCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGG*A
ATATCTCCCACGGCGTGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCC
TCAATGTAGTTTAAGAAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTG
ATAAGCTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCG
ATTTTCTCAAGAACGATACCCTTGGCGTGGGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCATTCG
TTACCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGGAGCCTT
TTGAGCTTGCGCCC**CTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGTTTGTTTGTCGAAGGAGG
AGAAGATCAACAGCAAAGAGGTTGGTGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATAATACTGAAAA
CCCTCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 13

CO CL202Contig1 1229 13 18 U
CACTGGAAACTTAAATTCTTTTATGAATGTTTAAAAAATCTTTAAACTACATATACCATG
AAATAGTCTAGTACTGGTATGTAAGCGTCAATCCACACCAGACAAGTCTTTTGGAAAAGG
ACACACTTACCACAATACACACACATTGACTACAGTTTTTGCATTACAAACCCATATGCT
TATAATTGGTTTTTATTAAAAGCAGGATTGGACCAAACTGATTCTAAACATCTGAGGTGA
AACGGGCGCTTTCCAAAATATTTGTTGCGTTACCCAAATCAAATCCATCGCGTCTATGGA
ACTCTTTAATCTGGTTATGAGGCAGATCTTTGAACTCTGGAAGAACCAAACGTTGAGTGA
ACTCAATATATGAAGCTGGGATTGTTTCAGTAACCTCATCTGCAAATTCAACGGTAATCT
TCTCCGAGATGGATGACAGTTGTAATAGTAGACCATCTTGACTCACTTTGAGAATTCCTC
CGTCGTTGTTGAGTTCGAATCTCTTTTCTTCTAGATAATTCTTGATGCTTTTGATGTCAC
TGAATTGGTGTTTGAGTCGATGAACAGAAAATGCAAGATGGTTCATCACGTAGCCGTGGA
TAAGTACCCATGCCGCGAATTCACTCTCTTTGGCAAGTTGCTGGAAGTCGGTGGATGTTG
GCTTCTCCCAAATTAAAGACCCCAAAGTACTTGAAAGAACCGCTTGTTTACCTCCTTGCG
GTTTAAGATACTTCCTTATTATCTCCTGTGATTCAGGACTTAGTTCGTCCACAAAA*GCT
CAGCTATAACAAGTCGTGGCAAAGGGCCATTGCCTAGACCATGACCATCATCGGGGACGT
AAATATCCGGAGGAGAAAACGTGAGGACTCTTAGTTTCTTCGTTGGAAAATCAAGCCCAC
CTTCAGCTTTATATCCATAATCCATGAAGAAGCTCGTTAAGGATTCTATTCCGTAACCCT
CCACCTTTAACGTCTGGAAAGTGAAGTGATCATAGCAGACCTTCTCGTTGTCCACTGACT
GAACAAGCTCCCATATGTTCTTCACCGTTGGGTTCTTCCTCAGATACGTCTTCAGTATAT
TTTCAAACACATTCCGAAGAAATGTTTCACTTCCTCCCTTGAAAGATGAAGCGTGGGACA
AGTCTAAAGAACCCATATGTAGAAAGATCTTTGAGTTATGTCTGAGAAACTGAGCCTTAG
TTGTTCTTATTTCTATTGTATTTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 30 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4DN78JQ U 55
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AF RR4C564JQ U 33
AF RR4BW43JQ U 511
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AF RR4BW06JQ U 511
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AF RR4BW80JQ U 511
AF RR4BW07TF C 509
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AF RR4BW06TF C 511
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BS 64 324 RR4BO91JQ
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BS 326 481 RR4BO91JQ
BS 482 482 RR4C564JQ
BS 483 569 RR4BO91JQ
BS 570 570 RR4C564JQ
BS 571 631 RR4BO91JQ
BS 632 632 RR4C564JQ
BS 633 752 RR4BO91JQ
BS 753 776 RR4C564JQ
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BS 1064 1203 RR4BW06JQ
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G
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GTGGATAAGTACCCATGCCGCGAATTCACTCTCTTTGGCAAGTTGCTGGAAGTCGGTGGA
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GTTTAAGATACTTCCTTATTATCTCCTGTGAT

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TCAGGACTTAGTTCGTCCACAAAA
A

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AAT

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CC

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ACTTGAAAGAACCGCTTGTTTACCTCCTTGCGGTTTAAGATACTTCCTTATTATCTCCTG
TGATTCAGGACTTAGTTCGTCCACAAAA*GCTCAGCTATAACAAGTCGTGGCAAAGGGCC
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TGGGTTCTTCCTCAGATACGTCTTCAGTATATTTTCAAACACATTCCGAAGAAATGTTTC
ACTTCCTCCCTTGAAAGATGAAGCGTGGGACAAGTCTAAAGAACCCATATGTAGAAAGAT
CTTTGAGTTATGTCTGAGAAACTGAGCCTTAGTTG

QA 1 695 1 695
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RD RR4BW43TF 697 0 0
TTC
TCTAGATAAT*CTTGATGCTTT*GATGTCACTGAATTGGTGTT*GAGTCGATGAACAGAA
AATGCAAGATGGTTCATCACGTAGCCGTGGATAAGTACCCATGCCGCGAATTCACTCTCT
TTGGCAAGTTGCTGGAAGTCGGTGGATGTTGGCTTCTCCCAAATTAAAGACCCCAAAGTA
CTTGAAAGAACCGCTTGTTTACCTCCTTGCGGTTTAAGATACTTCCTTATTATCTCCTGT
GATTCAGGACTTAGTTCGTCCACAAAA*GCTCAGCTATAACAAGTCGTGGCAAAGGGCCA
TTGCCTAGACCATGACCATCATCGGGGACGTAAATATCCGGAGGAGAAAACGTGAGGACT
CTTAGTTTCTTCGTTGGAAAATCAAGCCCACCTTCAGCTTTATATCCATAATCCATGAAG
AAGCTCGTTAAGGATTCTATTCCGTAACCCTCCACCTTTAACGTCTGGAAAGTGAAGTGA
TCATAGCAGACCTTCTCGTTGTCCACTGACTGAACAAGCTCCCATATGTTCTTCACCGTT
GGGTTCTTCCTCAGATACGTCTTCAGTATATTTTCAAACACATTCCGAAGAAATGTTTCA
CTTCCTCCCTTGAAAGATGAAGCGTGGGACAAGTCTAAAGAACCCATATGTAGAAAGATC
TTTGAGTTATGTCTGAGAAACTGAGCCTTAGTTG

QA 4 697 4 697
DS 

RD RR4BW06TF 693 0 0
CTAGATAAT*CTTGATGCTTTTGATGTCACTGAATTGGTGTT*GAGTCGATGAACAGAAA
ATGCAAGATGGTTCATCACGTAGCCGTGGATAAGTACCCATGCCGCGAATTCACTCTCTT
TGGCAAGTTGCTGGAAGTCGGTGGATGTTGGCTTCTCCCAAATTAAAGACCCCAAAGTAC
TTGAAAGAACCGCTTGTTTACCTCCTTGCGGTTTAAGATACTTCCTTATTATCTCCTGTG
ATTCAGGACTTAGTTCGTCCACAAAA*GCTCAGCTATAACAAGTCGTGGCAAAGGGCCAT
TGCCTAGACCATGACCATCATCGGGGACGTAAATATCCGGAGGAGAAAACGTGAGGACTC
TTAGTTTCTTCGTTGGAAAATCAAGCCCACCTTCAGCTTTATATCCATAATCCATGAAGA
AGCTCGTTAAGGATTCTATTCCGTAACCCTCCACCTTTAACGTCTGGAAAGTGAAGTGAT
CATAGCAGACCTTCTCGTTGTCCACTGACTGAACAAGCTCCCATATGTTCTTCACCGTTG
GGTTCTTCCTCAGATACGTCTTCAGTATATTTTCAAACACATTCCGAAGAAATGTTTCAC
TTCCTCCCTTGAAAGATGAAGCGTGGGACAAGTCTAAAGAACCCATATGTAGAAAGATCT
TTGAGTTATGTCTGAGAAACTGAGCCTTAGTTG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 12

CO CL203Contig1 1073 12 10 U
GGACATAACTCTCTCTCTCTCTGGCTTCACACTAATTCTGTGTTCTTTTCATCACCTCCG
TCTCTTTCGGTTGATTTGCTTTGAGACTTTCCTCATCTAACTATCTTTACCTTAAAAATC
AAAAAATCAGGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAGATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGA
AGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTG
CGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTA
TGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGAT
CGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCT
CACACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTC
GTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGG
CTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATT
CTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAA
CATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTT
CACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGG
AAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGC
TTTATGGTTCTCAGATGCTTTGGGCCGGGCTGCAAAAGCAGCTGCCCATATGGGTGGTGG
TGGTGGAAGCAGTTGATTATGTATCACAATATGAGGTTTTAAGCCATAAAGATGCTGGAA
TAAAAAAACATAAATGTATAATTAATACAATCACATGATTTCCCTGCATGTTATATGAGA
AATTGTAGACAAATTTTATAAATATTAAATAGTTATACATGGAAGGGGAATAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 20 15 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AZ01TF U 1
AF RR4AI30TF U 258
AF RR4FW20TF U 81
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AF RR4C962JQ C 192
AF RR4BT18JQ C 206
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BS 1 425 RR4AZ01TF
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BS 1059 1073 RR4AZ01JQ

RD RR4AZ01TF 869 0 0
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TCTCTTTCGGTTGATTTGCTTTGAGACTTTCCTCATCTAACTATCTTTACCTTAAAAATC
AAAAAATCAGGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAGATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGA
AGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTG
CGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTA
TGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGAT
CGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCT
CACACTAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTC
GTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGG
CTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATT
CTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAA
CATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTT
CACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGG
AAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGC
TTTATGGT*CTCAGATGCTTTGGGC
GGCT

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4AI30TF 596 0 0
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GGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACT
ATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAG
TAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAG
ATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGCCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCA
ACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGG
AAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTC
TTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTG
CTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGCTTTATGGTTCTCA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4FW20TF 769 0 0
GTGAGGC
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GTTAGAGATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGAAGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCAC
TGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCAC
TGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCT
GGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCAT
GTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAAC
GGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGC
TCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGG
TAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGC
AGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAG
GTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGG
CACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCAC*ATTACTGGAAA*GTGGCTGCTGCTGCTGCCACCAC
TGTGGTCA*CAGTCGATACTTTGCTA*CGGGGCTTTATGGTC

QA 8 769 8 769
DS 

RD RR4GS33TF 762 0 0
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GTTAGAGATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGAAGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCAC
TGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCAC
TGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCT
GGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCAT
GTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAAC
GGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGC
TCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGG
TAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGC
AGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAG
GTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGG
CACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCAC*ATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCAC
TGTGGTCA*CAGTCGATACTTTGCTA*CGGGGCTTTATGGTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4B283TF 853 0 0
GGACATAACTCTCTCTCTCTCTGGCTTCACACTAATTCTGTGTTCTTTTCATCACCTCCG
TCTCTTTCGGTTGATTTGCTTTGAGACTTTCCTCATCTAACTATCTTTACCTTAAAAATC
AAAAAATCAGGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAGATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGA
AGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTG
CGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTA
TGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGAT
CGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCT
CACACTAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTC
GTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGG
CTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATT
CTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAA
CATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTT
CACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGG
AAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGC
TTTATGGTTCTCA

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR4BT18TF 770 0 0
GG
ACCTTAAAAATCAAAAAATCAGGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAGATGTATCCCTGTGG
TTACGTTGCTGAAGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTT
CTTCTCTCATTGCGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGC
GTTAACGGCTTATGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAA
CGGAGCTACGATCGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGA
ATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGA
TACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACT
GATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGA
GTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGG
CCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCA
CTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTACTGTGGCTGCAGC
CAC*ATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCA*CAGTCGATACTT
TGCTA*CGGGGCTTTATGGT*CTCAGATGCTTTGGGCCGGGCTGCAAA

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4C962JQ 801 0 0
TGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCGGAATAGTCG
AGCTTGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGACTTATGTAACATTCA
GAGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGA
CCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAG
GAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAG
AAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAA
GCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTTTCAGAGATTCTCAAGCTCGG
TAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCA
GTAAGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAG
CGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTG
CTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGCTTTATGGTTTT
CAGATGCTTTGGGCCGGGCTGCAAAAGCAGCTGCCCATATGGGTGGTGGTGGTGGAAGCA
GTTGATTATGTATCACAATATGAGGTTTTAAGCCATAAAGATGCTGGAATAAAAAAACAT
AAATGTATAATTAATACAA
GC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4BT18JQ 853 0 0
ACTGAGAAAGATGTTCATAGTTC**TCTCTCATTGCGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATC
ACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATGTAACATTCAGAGATGCGTATGCT
CTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGACCGTGTGGATATCC
ATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTA
ACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATT
GCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTTTAAGCAAAGATGCATTC
GGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTTTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTG
GCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTG
AGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACT
GGCACGGCTACTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACC
ACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGCTTTATGGTTTTCAGATGCTTTGGGC
CGGGCTGCAAAAGCAGCTGCCCATATGGGTGGTGGTGGTGGAAGCAGTTGATTATGTATC
ACAATATGAGGTTTTAAGCCGTAAAGATGCTGGAATAAAAAAACATAAATGTATAATTAA
TACAATCACATGATTTCCCTGCATGTTATATGAGAAATTGTAGACAAATTTTATAAATAT
TAAATAGTTAT
GC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4FW20JQ 730 0 0
GATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCATG
TACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAACG
GTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCT
CAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGGT
AAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCA
GAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGG
TCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGC
ACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACT
GTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGCTTTATGGTTCTCAGATGCTTTGGGCCGG
GCTGCAAAAGCAGCTGCCCATATGGGTGGTGGTGGTGGAAGCAGTTGATTATGTATCACA
ATATGAGGTTTTAAGCCATAAAGATGCTGGAATAAAAAAACATAAATGTATAATTAATAC
AATCACATGATTTCCCTGCATGTTATATGAGAAATTGTAGACAAATTTTATAAATATTAA
ATAGTTATAC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4GS33JQ 680 0 0
GATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTA
TACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGT
AACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAGA
TGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAA
CAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGA
AGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCT
TGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGC
TGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGGGCTTTATGGTTCTCAGATGC
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ATGTATCACAATATGAGGTTTTAAGCCATAAAGATGCTGGAATAAAAAAACATAAATGTA
TAATTAATACAATCACATGATTTCCCTGCATGTTATATGAGAAATTGTAGACAAATTTTA
TAAATATTAAATAGTTATAC

QA 1 680 1 680
DS 

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AATCTAACAATCTCACACTAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGG
ATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACAC
TGATATTTAAAGGCTACGTTTTAAGCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTGGACG
AGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTG
GCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATC
ACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAG
CCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACT
TTGCTAACGGGGCTTTATGGTTTTCAGATGCTTTGGGCCGGGCTGCAAAAGTAGCTGCCC
ATATGGGTGGTGGTGGTGGAAGCAGTTGATTATGTATCACAATATGAGGTTTTAAGCCAT
AAAGATGCTGGAATAAAAAAACATAAATGTATAATTAATACAATCACATGATTTCCCTGC
ATGTTATATGAGAAATTGTAGACAAATTTTATAAATATTAAATAGTTATACATGGAAGGG
GAATAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4B283JQ 670 0 0
CACGAATCTAACAATCTCACACTAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCAC
GCGGATACATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAG
ACACTGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAAGATGCATTCGGTAAAGCCAAGGCTTTG
GACGAGTTTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTAC
ATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAG
TATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCT
GCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGA
TACTTTGCTAACGGGGCTTTATGGTTTTCAGATGCTTTGGGCCGGGCTGCAAAAGTAGCT
GCCCATATGGGTGGTGGTGGTGGAAGCAGTTGATTATGTATCACAATATGAGGTTTTAAG
CCATAAAGATGCTGGAATAAAAAAACATAAATGTATAATTAATACAATCACATGATTTCC
CTGCATGTTATATGAGAAATTGTAGACAAATTTTATAAATATTAAATAGTTATACATGGA
AGGGGAATAT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 12

CO CL204Contig1 1127 12 11 U
AGCTCGAGACAAAAAAAGAGTTTATTCGTTACATTTCATCTGCTTACAATGCAATGTTTA
TCACAACAACGTTAAATAATTGAGGCAAAAACTTGTCTCTTTTTTCTTTTCTTTTGATGT
TATTAGATTTTTATGTTTGTAGAAGAAGAAACATTCATCTATACATACGATGAAGAGAGA
CAGAACAAGCGATGGGGGG*TAATGTATGTGTTTGTATGATTGGCTTGCTTCAGAGAGGG
ATTCGATAAGTTGGATCAAACATCTTCAGTATAAACAAATTGCCCTTGTCACCCCTTGAC
AACCGTAGCTCCTCGTCCACATAGGTAATCTCTAATTCACCACGTGCGGTTTCAGGTGCA
TTTACAGGGATAAGGCCGAGAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAGCAACCTTCCTTGAA
TTGAGGGGTCTTATGTCTCCAGTTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTCTCCATGTTTTGA
ACCTTGAGTGTATCCACATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAACCTTGGT
TTCTTAGCCTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATC
AAATCAGATTTCAAAGGCTCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCCACTTTACGCGCCAACTGA
TCGATACGAAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCT
TCGAGAAGGTCTTGCTTCAGCTGCTTCTGCTTCTCTGCTCGACCGTTTCTCGTTAGAAAC
GCCGGAGGAAAGCTGAACACCGCTTGGATTCTCAGCCTCTCTCTATCGCTTTTGCTTTTT
CGAATGCTCTGTGACTTGGTCGGAACGGAGAAGCCACTGTCCGACTTCACAAGACTCCCG
GAAAGATACAATCCGGTGGTCGGAGACATCGGAACTACTCCAGTCTTTAGGCACGAAGTC
AAAGCCATGGAATCGGAAAAAAATAAATAAAGGAGTCGATGCTCTGTTCCGGAACAGAGG
ATGGTTACGAGTCCTACTCTAGAGTATGATGATCAAAGGACTTAGGAATAAATGTGACTT
CATCGGTCTAAACACACATGTAGGAGGAAAGGCAAAGAGGAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 25 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 55 55 55 55 55 60 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ14JQ U 116
AF RR4GS47TF C 74
AF RR4FR56JQ U 116
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AF RR4EK69TF C 488
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BS 381 430 RR4G415JQ
BS 431 431 RR4GA22JQ
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BS 619 619 RR4GA22JQ
BS 620 731 RR4G415JQ
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BS 775 1079 RR4GA22TF
BS 1080 1127 RR4D990TF

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QA 1 113 1 113
DS 

RD RR4GS47TF 426 0 0
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A
C

QA 5 425 5 425
DS 

RD RR4FR56JQ 436 0 0
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GTGCATTTACAGGGATAAGGCCAAAAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAGCACCCTTCC
TTGAATTGAGGGGTCTTATGTCTCCAGTTACCGAGTTGAAAAAAGGCCAAGTCTCCATGT
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TTGGTTTCTTAGCCTG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4EK69JQ 643 0 0
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TGTAGAAAAAGAAACATTCATCTATACATACGATGAAGAGAGACAGAACAAGCGATGGGG
GG*TAATGTATGTGTTTGTATGATTGGCTTGCTTCAGAGAGGGATTCGATAAGTTGGATC
AAACATCTTCAGTATAAACAAATTGCCCTTGTCACCCCTTGACAACCGTAGCTCCTCGTC
CACATAGGTAATCTCTAATTCACCACGTGCGGTTTCAGGTGCATTTACAGGGATAAGGCC
GAAAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAGCAACCTTCCTTGAATTGAGGGGTCTTATGTC
TCCAGTTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTCTCCATGTTTTGAACCTTGAGTGTATCCAC
ATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAACCTTGGTTTCTTAGCCTGCAGAAT
AGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAGATTTCAAAGG
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ATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4D990JQ 696 0 0
GC
TCGTTACATTTCATCTGCTTACAATGCAATGTTTATCACAACAACGTTAAATAATTGAGG
CAAAAACTTGTCTCTTTTTTCTTTTCTTTTGATGTTATTAGATTTTTATGTTTGTAGAAG
AAGAAACATTCATCTATACATACGATGAAGAGAGACAGAACAAGCGATGGGGGG*TAATG
TATGTGTTTGTATGATTGGCTTGCTTCAGAGAGG*ATTCGATAAGTTGGATCAAACATCT
TCAGTATAAACAAATTGCCCTTGTCACCCCTTGACAACCGTAGCTCCTCGTCCACATAGG
TAATCTCTAATTCACCACGTGCGGTTTCAGGTGCATTTACAGGGATAAGGCCGAAAATTT
TGAACACTTTGAGCTGCACAGCAACCTTCCTTGAATTGAGGGGTCTTATGTCTCCAGTTA
CCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTCTCCATGTTTTGAACCTTGAGTGTATCCACATTGATAG
ATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAACCTTGGTTTCTTAGCCTGCAGAATGGAAGCAG
AGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAGATTTCAAAGGCTCCTTCG
TTGGATTCACTGCTTCCACTTTACGCGCCAACTGATCGATACGAAGCTGGTCATCAGGAG
AAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR4G415JQ 774 0 0
AGCTCGAGACAAAAAAAGAGTTTATTCGTTACATTTCATCTGCTTACAATGCAATGTTTA
TCACAACAACGTTAAATAATTGAGGCAAAAACTTGTCTCTTTTTTCTTTTCTTTTGATGT
TATTAGATTTTTATGTTTGTAGAAGAAGAAACATTCATCTATACATACGATGAAGAGAGA
CAGAACAAGCGATGGGGGG*TAATGTATGTGTTTGTATGATTGGCTTGCTTCAGAGAGGG
ATTCGATAAGTTGGATCAAACATCTTCAGTATAAACAAATTGCCCTTGTCACCCCTTGAC
AACCGTAGCTCCTCGTCCACATAGGTAATCTCTAATTCACCACGTGCGGTTTCAGGTGCA
TTTACAGGGATAAGGCCGAAAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAGCAACCTTCCTTGAA
TTGAGGGGTCCTATGTCTCCAGTTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTCTCCATGTTTTGA
ACCTTGAGTGTATCCACATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAACCTTGGT
TTCTTAGCCTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATC
AAATCAGATTTCAAAGGCCCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCCACTTTACGCGCCAACTGA
TCGATACGAAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCT
TCGAGAAGGTCCTGCTTCAGCTGCTTCTGCTTCTCTGCTCGACCGTTTCTCGTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4FR56TF 612 0 0
TTTTTATGTTTGTAGAAGAAGAAACATTCATCTATACATACGATGAAGAGAGACAGAACA
AGCGATGGGGG**TAATGTATGTGTTTGTATGATTGGCTTGCTTCAGAGAGGGATTCGAT
AAGTTGGATCAAACATCTTCAGTATAAACAAATTGCCCTTGTCACCCCTTGACAACCGTA
GCTCCTCGTCCACATAGGTAATCTCTAATTCACCACGTGCGGTTTCAGGTGCATTTACAG
GGATAAGGCCGAGAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAGCAGCCTTCCTTGAATTGAGGG
GTCTTATGTCTCCAGTTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTCTCCATGTTTTGAACCTTGA
GTGTATCCGCATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAACCTTGGTTTCTTAG
CCTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAG
ATTTCAAAGGCTCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCCACTTTAAGCGCCAACTGATCGATAC
GAAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCTTGGAGAA
GGTCTTGCTTC
C

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4GA22JQ 645 0 0
C
AATTGAGGCAAAAACTTGTCTCTTTTTTCTTTTCTTTTGATGTTATTAGATTTTTATGTT
TGTAGAAGAAGAAACATTCATCTATACATACGATGAAGGGAGACAGAACAAGCGATGGGG
GG*TAATGTATGTGTTTGTATGATTGGCTTGCTTCAGAGAGGGATTCGATAAGTTGGATC
AAACATCTTCAGTATAAACAAATTGCCCTTGTCACCCCTTGACAATCGTAGCTCCTCGTC
CACATAGGTAATCTCTAATTCACCACGTGCGGTTTCAGGTGCATTTACAGGGATAAGGCC
GAGAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAGCAACCTTCCTTGAATTGAGGGGTCTTATGTC
TCCAGCTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTCTCCATGTTTTGAACCTTGAGTGTATCCAC
ATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAACCTTGGTTTCTTAGCCTGCAGAAT
AGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAGATTTCAAAGG
CTCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCCACTTTACGCGCCAACTGATCGATACGAAGCTGGTC
ATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCTT

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR4GA22TF 748 0 0
ACCACGTGCGGTTTCAGGTGCATTTACAGGGATAAGGCCGAGAATTTTGAACACTTTGAG
CTGCACAGCAACTTTCCTTGAATTGAGGGGTCTTATGTCTCCAGCTACCGAGTTGAAGAA
AGGCCAAGTCTCCATGTTTTGAACCTTGAGTGTATCCACATTGATAGATTGGTAGTTTGT
TATTGACCTCAACAACCTTGGTTTCTTAGCCTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAAT
GAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAGATTTCAAAGGCTCCTTCGTTGGATTCACTGC
TTCCACTTTACGCGCCAACTGATCGATACGAAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCC
GCGTTCGAGAGGCTCGATGGCTTCGAGAAGGTCTTGCTTCAGCTGCTTCTGCTTCTCTGC
TCGACCGTTTCTCGTTAGAAACGCCGGAGGAAAGCTGAACACCGCTTGGATTCTCAGCCT
CTCTCTATCGCTTTTGCTTTTTCGAATGCTCTGTGACTTGGTCGGAACGGAGAAGCCACT
GTCCGACTTCACAAGACTCCCGGAAAGATACAATCCGGTGGTCGGAGACATCGGAACTAC
TCCAGTCTTTAGGCACGAAGTCAAAGCCATGGAATCGGAAAAAAATAAATAAAGGAGTCG
ATGCTCTGTTCCGGAACAGAGGATGGTTACGAGTCCTACTCTAGAGTATGATGATCAAAG
GACTTAGGAATAAATGTGACT
TCATCCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4G415TF 594 0 0
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CTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAGA
TTTCAAAGGCCCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCCACTTTACGCGCCAACTGATCGATACG
AAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCTTCGAGAAG
GTCCTGCTTCAGCTGCTTCTGCTTCTCTGCTCGACCGTTTCTCGTTAGAAACGCCGGAGG
AAAGCTGAACACCGCTTGGATTCTCAGCCTCTCTCTATCGCTTTTGCTTTTTCGAATGCT
CTGTGACTTGGTCGGAACGGAGAAGCCACTGTCCGACTTCACAAGACTCCCGGAAAGATA
CAATCCGGTGGTCGGAGACATCGGAACTACTCCAGTCTTTAGGCACGAAGTCAAAGCCAT
GGAATCGGAAAAAAATAAATAAAGGAGTCGATGCTCTGTTCCGGAACAGAGGATGGTTAC
GAGTCCTACTCTAGAGTATGATGATCAAAGGACTTAGGAATAAATGTGACT
CCC

QA 1 591 1 591
DS 

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TGAA
CTTGAGTGTATCCACATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAACAAC*TTGGTTT
CTTAGCGTGCAGAATGGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAA
ATCAGATTTCAAAGGCTCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCCACTTTACGCGCCAACTGATC
GATACGAAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCTTC
GAGAAGGTCTTGCTTCAGCTGCTTCTGCTTCTCTGCTCGACCGTTTCTCGTTAGAAACGC
CGGAGGAAAGCTGAACACCGCTTGGATTCTCAGCCTCTCTCTATCGCTTTTGCTTTTTCG
AATGCTCTGTGACTTGGTCGGAACGGAGAAGCCACTGTCCGACTTCACAAGACTCCCGGA
AAGATACAATCCGGTGGTCGGAGACATCGGAGCTACTCCAGTCTTTAGGCACGAAGTCAA
AGCCATGGAATCGGAAAAAAATAAATAAAGGAGTCGATGCTCTGTTCCGGAACAGAGGAT
GGTTACGAGTCCTACTCTAGAGTATGATGATCAAAGGACTTAGGAATAAATGTGACTTCA
TCGGTCTAAACACACATGTAGGAGGAAAGGCAAAGAGGAAAACCC

QA 5 649 5 649
DS 

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CCTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCCATTTCCCATTGATCAAATCAG
ATTTCAAAGGCTCCTTCGTTGGATTCACTGTTTCCACTTTACGCGCCAACTGATCGATAC
GAAGCTGGTCATCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGAGAGGCTCGATGGCTTCGAGAA
GGTCTTGCTTCAGCTGCTTCTGCTTCTCTGCTCGACCGTTTCTCGTTAGAAACGCCGGAG
GAAAGCTGAACACTGCTTGGATTCTCAGCCTCTCTCTATCGCTTTTGCTTTTTCGAATGC
TCTGTGACTTGGTCGGAACGGAGAAGCCACTGTCCGACTTCACAAGACTCCCGGAAAGAT
ACAATCCGGTGGTCGGAGACATCGGAACTACTCCAGTCTTTAGGCACGAAGTCAAAGCCA
TGGAATCGGAAAAAAATAAATAAAGGAGTCGATGCTCTGTTCCGGAACAGAGGATGGTCA
CGAGTCCTACTCTAGAGTATGATGATCAAAGGACTTAGGAATAAATGTGACTTCA
GCGGTCTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 2 13

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TTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGA
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CTACTGCTTCTACTCTTTTGGCTTAGATCAGCTCCCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTG
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TTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAATTGCTTATGTTTG
CGTGTCTTTTCACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BE23JQ C 1
AF RR4BE23TF U 1
BS 1 674 RR4BE23TF

RD RR4BE23JQ 674 0 0
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CGTGTCTTTTCACT

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DS 

RD RR4BE23TF 674 0 0
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GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGA
TTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGA
GGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACC
GTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACAAGTCTA
CTACTGCTTCTACTCTTTTGGCTTAGATCAGCTCCCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTG
ATGTCTTATCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTT
TTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAATTGCTTATGTTTG
CGTGTCTTTTCACT

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL205Contig2 722 11 6 U
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TATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCC
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GGGCTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGT
GAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGA
GATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGA
GAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCA
CCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTC
TACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTT
TTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTT*GATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTTATCTTTTGTCAGAAT
TGCTTATGCTTGCGTGTCTTTTCACTATTATCGTTCAAAGTATTACCCGTTATCAAAAAA
AA


BQ
10 30 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 45 60 60 60 60 55 55 55 55 40 55 45 45 45 45 10 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EJ55TF U 1
AF RR4CI49JQ C 2
AF RR4CI49TF U 2
AF RR4H317TF U 2
AF RR4A940TF U 419
AF RR4A940JQ C 86
AF RR4EJ55JQ C 50
AF RR4FY72TF U -1
AF RR4EF82TF U 22
AF RR4FZ11JQ C 72
AF RR4FZ11TF U 3
BS 1 71 RR4EJ55TF
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BS 73 614 RR4EJ55TF
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RD RR4EJ55TF 614 0 0
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GATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGA
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TACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTT
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ACAATGATGTTTTT

QA 1 614 1 614
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QA 1 627 1 627
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AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTT
TGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTCCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTA
CAATGATGTTTTT*GATGATTTCAAGG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4H317TF 638 0 0
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ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGGTGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGCTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTT
TGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTA
CAATGATGTTTTT*GACGATTTCAATGAACCAACAATG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4A940TF 227 0 0
CACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAG
TCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCCCTTCAAGAACACTACTGTTTCTT
TTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGCTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAG
TTACAATGATGTTTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTT
T

QA 1 226 1 226
DS 

RD RR4A940JQ 559 0 0
TCTGCATTTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTC
GATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGCTTGACACCATCTCAGATTGGT
GTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATC
TTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTG
ATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCC
AAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAG
ACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCT
TAGATCAGCCCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGC
TTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTTTTT*GATGATTTCA
AGGAACCAACAATGTGTTT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4EJ55JQ 595 0 0
AAGATGGGGCGTATGCATTCCATAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAG
CGCTCGCCTCCGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAG
TTTGCGAAGAAGGGCTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGT
ATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGT
CTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGC
AAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAG
AGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGG
AAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTA
CTGTTTCTTTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGT
TTTGTCAAGTTACAATGATGTTTTT*GATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4FY72TF 634 0 0
GGAGC
AGAGTAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTAT
GCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGAC
ATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGG
CTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAA
GAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGAT
TCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAG
GAACAGGAAGGACAATGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCG
TCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTAC
TACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTG
ATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACA
ATGATGTTTTT*GATGATTTCAAGGAACC

QA 6 634 6 634
DS 

RD RR4EF82TF 601 0 0
GAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTATGCATTCCAGAGGAAAGGG
TATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGACATGGCTCAAGACCACGGC
CGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGCTTGACACCATCTCAGAT
TGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAA
GATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCA
CTTGGTCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAGCAGGAAGGACAAAGA
CTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCGCCGTCTTGCTCGTTACTACAA
GAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGT
GGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTGATGTCTTATCTATGAACC
TAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTTTTT*GATGAT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4FZ11JQ 643 0 0
GAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGACATGGCTCA
AGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGCTTGACAC
CATCTCAGATTGGTTTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTA
CCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGG
ATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGA
AGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTC
GTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTT
CTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTGATGTCTTA
TCTATGAACCTAGTTTCTATGCTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTT
TTT*GATGATTTCAAGGAACCGACAATGTGTTTTATCTTTTGTCAGAATTGCTTATGCTT
GCGTGTCTTTTCACTATTATCGTTCAAAGTATTACCCGTTATC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4FZ11TF 720 0 0
GAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTA
TGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGA
CATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGG
GCTTGACACCATCTCAGATTGGTTTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGA
AGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGA
TTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGA
GGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACC
GTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTA
CTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTT
GATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGCTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTAC
AATGATGTTTTT*GATGATTTCAAGGAACCGACAATGTGTTTTATCTTTTGTCAGAATTG
CTTATGCTTGCGTGTCTTTTCACTATTATCGTTCAAAGTATTACCCGTTATCAAAAAAAA

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 12

CO CL206Contig1 1033 12 49 U
AACAGACAACAGCTGATAAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
***TGGCCAACATCAAGATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCAC
TCTCTCTTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGA
GACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACC
GATGATATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTC
CGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTCTC
ATAAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGC
GTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAA
GACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTAGATGTCGAGGTC
TGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGTAACCGT
GGGAGAAGGCACGAACGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAG
TGTTCGGTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGGCAGCCTGCGGTGGCGATAGT
CTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTTCCGAAGTGCAGGTTCTGCAATAAACCCTATTGC
TCAAGTCACAGCAGTCTAAGGCATGATATTGTGACCGCTGATCATTCTGCTCAGCCTATG
TTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTACAAACCC*TTATGACGCTTT*CG
ACTATCAAATTT*AAACAAACATGTT*GCTTTAGCACCAAGCTTATTTCATACTTATT*C
TTCTCTATATCTTTT*GTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAATATATTATGAGACATGC
ATATTGGGTAGAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 25 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 30 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 65 65 65 65 35 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 25 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 15 65 0 65 65 50 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 10 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 5 45 45 45 45 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4GA91TF U 1
AF RR4CR25TF U 15
AF RR4A361TF U 1
AF RR4A361TFB U 1
AF RR4CR10TF U 1
AF RR4D112TF U 1
AF RR4C874TF U 15
AF RR4A361JQD C 296
AF RR4BN27TF U 824
AF RR4GA91JQ C 299
AF RR4CR10JQ C 215
AF RR4B551JQ C 161
BS 1 60 RR4A361TF
BS 61 63 RR4CR10TF
BS 64 344 RR4A361TF
BS 345 345 RR4CR10TF
BS 346 378 RR4A361TF
BS 379 379 RR4CR10TF
BS 380 419 RR4A361TF
BS 420 420 RR4CR10TF
BS 421 444 RR4A361TF
BS 445 445 RR4CR10TF
BS 446 447 RR4A361TF
BS 448 448 RR4CR10TF
BS 449 515 RR4A361TF
BS 516 516 RR4CR10TF
BS 517 609 RR4A361TF
BS 610 610 RR4CR10TF
BS 611 676 RR4A361TF
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BS 687 687 RR4CR10TF
BS 688 699 RR4A361TF
BS 700 700 RR4D112TF
BS 701 747 RR4A361TF
BS 748 749 RR4A361TFB
BS 750 750 RR4C874TF
BS 751 754 RR4A361TFB
BS 755 758 RR4D112TF
BS 759 759 RR4B551JQ
BS 760 766 RR4D112TF
BS 767 767 RR4C874TF
BS 768 773 RR4D112TF
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BS 775 831 RR4D112TF
BS 832 849 RR4C874TF
BS 850 884 RR4BN27TF
BS 885 885 RR4B551JQ
BS 886 897 RR4BN27TF
BS 898 898 RR4B551JQ
BS 899 912 RR4BN27TF
BS 913 913 RR4B551JQ
BS 914 926 RR4BN27TF
BS 927 927 RR4B551JQ
BS 928 958 RR4BN27TF
BS 959 959 RR4B551JQ
BS 960 975 RR4BN27TF
BS 976 976 RR4B551JQ
BS 977 1017 RR4BN27TF
BS 1018 1033 RR4B551JQ

RD RR4GA91TF 662 0 0
AACAGACAACAGCTGATAAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
***TGGCCAACATCAAGATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCAC
TCTCTCTTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGA
GACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACC
GATGATATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTC
CGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTCTC
ATAAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGC
GTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAA
GACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTAGATGTCGATGTC
TGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCGAGAGCGTCATGTAACCGT
GGGAGAAGGCATGAACGGAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAG
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4CR25TF 681 0 0
GGA
AAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA***TGGCCAACATCAAG
ATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCACTCTCTCTTCGAGCTTCT
CTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGAGACGAAACTGCGTTATG
GACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACCGATGATATTCTATGGGA
GATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTCCGTCACTGTCTTAGGAT
CACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTCTCATAAGAAAGATAATTGT
GCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGCGTTGAAAGCTTAACAAA
GATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAAGACCATCTCTCAGCACT
CTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTAGATGTCGAGGTCTGTCCCAAATGCGACCA
AGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCGAGAGCGTCATGTAACCGTGGGAGAAGGCAAGAACG
GAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAGTGTTCGGTGTGCCTAGG
ATCAGACACCGAGAT
CAA

QA 4 678 4 678
DS 

RD RR4A361TF 747 0 0
AACAGACAACAGCTGATAAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAATGGCCAACATCAAGATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCAC
TCTCTCTTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGA
GACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACC
GATGATATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTC
CGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTTGACGCAAATCCTCTC
ATAAGAAAGATAATTGTGTCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGT
GTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGGCATTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAA
GACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCATGAGGGAGCCGTAGATGTCGAGGTC
TGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGTAACCGT
GGGAGAAGGAACGAACGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAG
TGTTCGGTGTGCCTAG*CTCAGACACTGAGATTCAAGAG*CAGCCTGCGGTGGCGATAGT
CTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4A361TFB 754 0 0
AACAGACAACAGCTGATAAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAATGGCCAACATCAAGATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCAC
TCTCTCTTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGA
GACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACC
GATGATATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTC
CGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTTGACGCAAATCCTCTC
ATAAGAAAGATAATTGTGTCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGT
GTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGGCATTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAA
GACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCATGAGGGAGCCGTAGATGTCGAGGTC
TGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGTAACCGT
GGGAGAAGGAACGAACGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAG
TGTTCGGTGTGCCTAGGCTCAGACACTGAGATTCAAGAG*CAGCCTGCGGTGGCGATAGT
CTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTTCCAAAGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4CR10TF 728 0 0
AACAGACAACAGCTGATAAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA***
***TGGCCAACATCAAGATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCAC
TCTCTCTTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGA
GACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTGTTGAACAACCACTAAGCTCTCGTCTAACC
GATGATATTCTATGGGAGATCACTACCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTC
CGACACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCTAATCCTCTC
ATCAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGC
GTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAA
GACCATCTCTCAGCACTCTCCATTCACCTTCCTCACGAGGGAGCTGTAGATGTCGAGGTC
TGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGCAACCGT
GGGAGAAGGCACGAACGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAG
TGTTCG*TGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAG*CAGCCTGCGGTGGCGATAGT
CTGTGTCT

QA 1 728 1 728
DS 

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AACAGACAACAGCTGATAAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAATAAGAAGAA
GAATGGCCAACATCAAGATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCAC
TCTCTCTTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGA
GACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACC
GATGATATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTC
CGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTTGACGCAAATCCTCTC
ATAAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGT
GTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAA
GACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTAGATGTCGAGGTC
TGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGTAACCGT
GGGAGAAGGAACGAGCGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAG
TGTTCGGTGTGCCTAGGCTCAGACACTGAGATTCAAGAGGCAGCCTGCGGTGGCGATAGT
CTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTTCCAAAGTGCAG*TTCTGCA*TAAACCTTATTGC
TCAAGTCACAGCAGTCTAAGGCATGATATTGTGACCGCTGATCATTCTGCT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4C874TF 841 0 0
GGA
AAACATGAGGACGGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA***TGGCCAACATCAAG
ATCAGCTCACGAGGTTTTACTGATTGTTCTTCCTTATCTCCACTCTCTCTTCGAGCTTCT
CTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGAGACGAAACTGCGTTATG
GACAAAGATCGTTCTCGAACCACCGCTGAGCTCTCGTCTAACCGATGATATTCTATGGGA
GATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTCCGTCACTGTCTTAGGAT
CACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTCTCATAAGAAAGATAATTGT
GCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGCGTTGAAAGCTTAACAAA
GATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAAGACCATCTCTCAGCACT
CTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTAGATGTCGAGGTCTGTCCCAAATGCGACCA
AGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCGAGAGCGTCATGTAACCGTGGGAGAAGGCAAGAACG
GAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAGTGTTCGGTGTGCCTAGG
ATCAGACACCGAGATTCAAGAG*CAGCCTGCGGTGGCGATAGTCTGTGTCTTGAATGCTG
GCTTGTGCTTCCGAAGTGCAG*TTCTGCAATAAACCCTATTGCTCAAGTCACAGCAGTCT
AAG*CATGATATTGTGACCGCTGATCATTCTGCTCAGCCTATGTTTGAGTGC
AAGCTT

QA 4 835 4 835
DS 

RD RR4A361JQD 725 0 0
TCCTCCGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTTGACGCAAATC
CTCTCATAAGAAAGATAATTGTGTCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTG
GATGTGTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGGCATTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCA
CTAAAGACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCATGAGGGAGCCGTAGATGTCG
AGGTCTGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGTA
ACCGTGGGAGAAGGAACGAACGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCA
CGGAGTGTTCGGTGTGCCTAGGCTCAGACACTGAGATTCAAGAGGCAGCCTGCGGTGGCG
ATAGTCTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTTCCAAAGTGCAGGTTCTGCAATAAACCTT
ATTGCTCAAGTCACAGCAGTCTAAGGCATGATATTGTGACCGCTGATCATTCTGCTCAGC
CTATGTTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTACAAACCC*TTATGACGCT
TT*CGACTATCAAATTT*AAACAAACATGTT*GCTTTAGCACCAAGCTTATTTCATACTT
ATT*CTTCTCTATATCTTTT*GTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAATATATTATGAGA
CATGC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4BN27TF 194 0 0
ATTCTGCTCAGCCTATGTTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTACAAACC
CCTTATGACGCTTTTCGACTATCAAATTTTAAACAAACATGTTTGCTTTAGCACCAAGCT
TATTTCATACTTATTTCTTCTCTATATCTTTTTGTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAA
TATATTATGAGACA

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR4GA91JQ 722 0 0
TCCGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTC
TCATAAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGAT
GCGTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTA
AAGACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTAGATGTCGATG
TCTGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCGAGAGCGTCATGTAACC
GTGGGAGAAGGCATGAACGGAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGG
AGTGTTCGGTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGGCAGCCTGCGGTGGCGATA
GTCTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTTCCGAAGTGCAGGTTCTGCAATAAACCCTATT
GCTCAAGTCACAGCAGTCTAAGGCATGATATTGTGACCGCTGATCATTCTGCTCAGCCTA
TGTTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTATAAACCC*TTATAACGCTTT*
CGACTATCAAATTT*AAACAAACATGTT*GCTTTAGCACCAAGCTTATTTCATACTTATT
*CTTCTCTATATCTTTT*GTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAATATATTATGAGACAT
GC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CR10JQ 801 0 0
AACAACCACTA
AGCTCTCGTCTAACCGATGATATTCTATGGGAGATCACTACCAAATCCGCCGGAAAATTA
AACACTCTGATCCTCCGACACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTGTTGTG
GACGCTAATCCTCTCATCAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAA
GGAATCATTGGATGCGTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTC
CACCGCTTCACTAAAGACCATCTCTCAGCACTCTCCATTCACCTTCCTCACGAGGGAGCT
GTAGATGTCGAGGTCTGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGA
GCGTCATGCAACCGTGGGAGAAGGCACGAACGAAAGTGCAGGGGATGCTGGTTTTGCGTC
CCTAGATGCACGGAGTGTTCGGTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGGCAGCC
TGCGGTGGCGATAGTCTGTGTCTTGAATGCTGGCTTGTGCTTCCGAAGTGCAGGTTTTGC
AATAAACCCTATTGCTCAAGTCACAGCAGTTTAAGGCATGATATTGTGACCGCTGATCAT
TTTGCTCAGCCTATGTTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTACAAACCC*
TTATGACGCTTT*CGACTATCAAATTT*AAACAAACATGTT*GCTTTAGCACCAAGCTTA
TTTCATACTTATT*TTTCTCTATATCTTTT*GTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAATA
TATTATGAG
G

QA 12 800 12 800
DS 

RD RR4B551JQ 873 0 0
CCTTAAGAGACGCGATCAGAGACGAAACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTCTCTAACCAC
CGCTGAGCTCTCGTCTAACCGATGATATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAA
AATTAAACACTCTGATCCTCCGTCACTGTCTTAGGATCACCGACAAAGGGCTTCGACGTG
TTGTGGACGCAAATCCTCTCATAAGAAAGATAATTGTGCCAGGAT*CACTGAACTGACTC
CAGAAGGAATCATTGGATGCGTTGAAAGCTTAACAAAGATGTAGACACTTCACATCAACG
GCGTCCACCGCTTCACTAAAGACCATCTCTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCACGAGG
GAGCCGTAGATGTCGAGGTCTGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCT
CGAGAGCGTCATGTAACCGTGGGAGAAGGCATGAACGGAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCT
GCGTCCCTAGATGCACGGAGTGTTCGGTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGG
CAGCCTGCGGTGGCGATAGTCTGTGTCTTGAATGCTAGCTTGTGCTTCCGAAGTGCAGGT
TCTGCAATAAACCCTATTGCTCAAGTCACAGCAGTCTAAGGCATGATATTGTGACCGCTG
ATCATTCTGCTCAGCCTATGTTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTACAA
ACCC*TTATGACGCTTT*CGACTATCAAATTT*AAACAAACATGTT*GCTTTAGCACCAA
GCTTATTTCATACTTATT*CTTCTCTATATCTTTT*GTTATGTCCAAACCTTTGATTATG
AAATATATTATGAGACATGCATATTGGGTAGAG

QA 1 873 1 873
DS 



AS 3 9

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GGGGAATCTCTTAATTGTTCGGCAACGAAGCAAAACAAAAGAAAAAAAAGAAAGTTTTTT
CTCAATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTGCAGCCTTGTAAGCTATGGTGACAAT
CCGGAGCGTTTCAGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTGGCTCTGTTTGC
AAACGGGGAAGACAAGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGGAAGAAAGTGTGCACGCA
AGGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAATACTGCTGTAACCAGACCATGAACGTTCTGTA
CGGAGAGTACACGTGTGGTCAAGGCGACATTGAGCCGATGAACAACATAGTCTCGCACTA
CTTGTACTTCCTCGACCTCTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCT
CAGTTGCGCTGAGCAGAAATCATTCAACCCTGCAACTGCACCTACTTCTTCCACTTCGTA
AGTCTCACTCCTCCGTATTTGCGGTTGTTCTCAAGATCCTCTTTGCTTCTTCACTCGACA
AGTGTTTACGTAATAAGTGTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTA
GAATTTATACAAACGAAATTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTAT
TTGCAGAGTGTGTAAAAGTAACTGAAAGCATGTAAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGAT
GTTACTATTCATTTTTATTATATAATAATTTTAAGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4B443JQ C 1
AF RR4BG64JQ C 154
AF RR4B443TF U 139
AF RR4BG64TF U 1
BS 1 138 RR4BG64TF
BS 139 758 RR4B443TF

RD RR4B443JQ 758 0 0
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CTCAATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTGCAGCCTTGTAAGCTATGGTGACAAT
CCGGAGCGTTTCAGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTGGCTCTGTTTGC
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AGGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAATACTGCTGTAACCAGACCATGAACGTTCTGTA
CGGAGAGTACACGTGTGGTCAAGGCGACATTGAGCCGATGAACAACATAGTCTCGCACTA
CTTGTACTTCCTCGACCTCTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCT
CAGTTGCGCTGAGCAGAAATCATTCAACCCTGCAACTGCACCTACTTCTTCCACTTCGTA
AGTCTCACTCCTCCGTATTTGCGGTTGTTCTCAAGATCCTCTTTGCTTCTTCACTCGACA
AGTGTTTACGTAATAAGTGTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTA
GAATTTATACAAACGAAATTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTAT
TTGCAGAGTGTGTAAAAGTAACTGAAAGCATGTAAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGAT
GTTACTATTCATTTTTATTATATAATAATTTTAAGTTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4BG64JQ 605 0 0
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AGTGAAGGGGAAGAAAGTGTGCACGCAAGGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAATACTG
CTGTAACCAGACCATGAACGTTCTGTACGGAGAGTACACGTGTGGTCAAGGGGACATTGA
GCCGATGAACAACATAGTCTCGCACTACTTGTACTTCCTCGACCTCTTGGGTATCGGAAG
AGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCTCAGTTGCGCTGAGCAGAAATCATTCAACCCTGC
AACTGCACCTACTTCTTCCACTTCGTAAGTCTCACTCCTCCGTATTTGCGGTTGTTCTCA
AGATCCTCTTTGCTTTTTCACTCGACAAGTGTTTACGTAATAAGTGTGCTATTTTTCTTT
AGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTAGAATTTATACAAACGAAATTTTATATCTGTATG
TATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTATTTGCAGAGTGTGTAAAAGTAACTGAAAGCATGT
AAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGATGTTACTATTCATTTTTATTATATAATAATTTTA
AGTTT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4B443TF 620 0 0
TATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTGGCTCTGTTTGCAAACGGGGAAGACAAGAC
GATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGGAAGAAAGTGTGCACGCAAGGGTGGGAATGCGTCTG
GTGGTCCGAATACTGCTGTAACCAGACCATGAACGTTCTGTACGGAGAGTACACGTGTGG
TCAAGGCGACATTGAGCCGATGAACAACATAGTCTCGCACTACTTGTACTTCCTCGACCT
CTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCTCAGTTGCGCTGAGCAGAA
ATCATTCAACCCTGCAACTGCACCTACTTCTTCCACTTCGTAAGTCTCACTCCTCCGTAT
TTGCGGTTGTTCTCAAGATCCTCTTTGCTTCTTCACTCGACAAGTGTTTACGTAATAAGT
GTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTAGAATTTATACAAACGAAA
TTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTATTTGCAGAGTGTGTAAAAG
TAACTGAAAGCATGTAAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGATGTTACTATTCATTTTTAT
TATATAATAATTTTAAGTTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4BG64TF 758 0 0
GGGGAATCTCTTAATTGTTCGGCAACGAAGCAAAACAAAAGAAAAAAAAGAAAGTTTTTT
CTCAATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTGCAGCCTTGTAAGCTATGGTGACAAT
CCGGAGCGTTTCAGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTGGCTCTGTTTGC
AAACGGGGAAGACAAGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGGAAGAAAGTGTGCACGCA
AGGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAATACTGCTGTAACCAGACCATGAACGTTCTGTA
CGGAGAGTACACGTGTGGTCAAGGCGACATTGAGCCGATGAACAACATAGTCTCGCACTA
CTTGTACTTCCTCGACCTCTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCT
CAGTTGCGCTGAGCAGAAATCATTCAACCCTGCAACTGCACCTACTTCTTCCACTTCGTA
AGTCTCACTCCTCCGTATTTGCGGTTGTTCTCAAGATCCTCTTTGCTTCTTCACTCGACA
AGTGTTTACGTAATAAGTGTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTA
GAATTTATACAAACGAAATTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTAT
TTGCAGAGTGTGTAAAAGTAACTGAAAGCATGTAAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGAT
GTTACTATTCATTTTTATTATATAATAATTTTAAGTTT

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL207Contig2 1244 3 9 U
GTTCCCCATTGAAGCTCAACTAGTTTTTTCTCTCGGTCTCTCTAGATCTAGCTTATCGGC
ATTGCAGGTTGATACTTTACTCCATAGTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTC
GGTCTTTATTCTAGTTCTGCTCGCTGTCTCAACCCTGGCTTTGGTTGCAAATGGGGAAGA
CAAAACGATTAAAGTGAAGAAGGTGAAGGGAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATG
CGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACGAGACCATCTCCGATTACTTCCAGGTGTATCA
GTTCGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACCCCCATTGCTCATGCTGTCGGTTTCTGGGA
CTACCAGTCTTTCATCACCGCGGCTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGGTTTGGTACCACTGG
TGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAAC
GTCCTGTGGATATGGAGTTGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAG
GGAGATGAGCCCAATGCAATCTTACTGTGACGAGACCTGGAAATACAAGTACCCTTGCAG
CCCTGGAGCTGAATACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGG
TGTAGCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGACCTCCTGAACCACCCGGAGTACATCGAGCAGAA
CGCCACGCTTGCCTTCCAAGCAGCGATCTTGAGATGGATGACACCGACCAAGAAAGCTCA
GCCTTCGGCTCACGATATCTTTGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTC
CAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGG
TCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCTTGATCT
TTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCATAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAA
ACCATTTAACCCTTCGACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTCTCTCCGCATTGCTC
ATTGTTCTCAAGTTTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAGATTGC
TTGTGTGTGTGTGTGGCTTCTTTTTGTTTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTTATATT
TTCCTGTATGTAATACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTGCCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B638TF U 1
AF RR4F730TF U 316
AF RR4F730JQ C 613
BS 1 472 RR4B638TF
BS 473 473 RR4F730TF
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BS 663 876 RR4F730TF
BS 877 1244 RR4F730JQ

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GGTCTTTATTCTAGTTCTGCTCGCTGTCTCAACCCTGGCTTTGGTTGCAAATGGGGAAGA
CAAAACGATTAAAGTGAAGAAGGTGAAGGGAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATG
CGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACGAGACCATCTCCGATTACTTCCAGGTGTATCA
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TGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCGGCAAAAC
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TG
CA

QA 1 662 1 662
DS 

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G
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ACCGCTGCTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGGTTTGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGA
CAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGATATGGA
GTTGCAACAGGAGGGCCTTTGGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATG
CAATCTTACTGTGACGAGACCTGGAAATACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAATAC
TACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGTAGCAGGGGAAGCA
CTAAAAGCTGACCTCCTGAACCACCCGGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCCTTC
CAAGCAGCGATCTTGAGATGGATGACACCGACCAAGAAAGCTCAGCCTTCGGCTCACGAT
ATCTTTGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCGACT
TTTGGTACCACCATGAACGT
CTTG

QA 2 561 2 561
DS 

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A
TACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGTAGCAGGGGAA
GCACTAAAAGCTGACCTCCTGAACCACCCGGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCC
TTCCAAGCAGCGATCTTGAGATGGATGACACCGACCAAGAAAGCTCAGCCTTCGGCTCAC
GATATCTTTGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCG
ACTTTTGGTACCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACATT
GAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCTTGATCTTTTGGGTATTGGA
AGAGAAGACGCGGGGCATAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAACCATTTAACCCT
TCGACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTCTCTCCGCATTGCTCATTGTTCTCAAGT
TTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAGATTGCTTGTGTGTGTGTG
TGGCTTCTTTTTGTTTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTTATATTTTCCTGTATGTAA
TACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTGCCG

QA 2 632 2 632
DS 



CO CL207Contig3 701 2 5 U
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BQ
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AF RR4GJ05JQ U 1
AF RR4DP49JQ U 1
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BS 378 511 RR4DP49JQ
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RD RR4GJ05JQ 553 0 0
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ATCCATCTC
CAGA

QA 1 549 1 549
DS 

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GGTTTCCAGTTACCAACAAAGATGTCGTGAGTCGAGGGCTGAGCTTTCTTGATCGGCGTC
ATCCATCTCCAGATAGCAGCTTGGAAGGCGAGTGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCAGGG
TGGTTAAGGAGATCGGCCTTTAAGGCTTCCCCAGCTGCACCGTAGTTGAAGTTCCAGTAA
ATGGGTAAAGCACCACGTCCGTAGTACTCAGCTCCAGGGCT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 13

CO CL208Contig1 877 13 12 U
GGAAGACCAAACGCTTGCACTTCCCACGGATAAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTG
ACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCC
TTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCT
CCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGA
GTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCC
ACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAA
TCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTA
CTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTAT
AAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGAC
CAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTT
CAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGT
AACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGA
AGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAAAGCTATGTA
TATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTATCATCTGTAAACATTGACATTCTCCAACT
TAAACCCAACGAGTAGCTTGCTTTTGAAGAACAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 45 70 70 55 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 45 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 20 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G624TF U 1
AF RR4EY73TF U 30
AF RR4CJ41TF U 29
AF RR4EY73JQ C 138
AF RR4GS60TF U 24
AF RR4F137TF U 30
AF RR4CN25TF U 11
AF RR4AN17TF U 24
AF RR4CN25JQ C 358
AF RR4F137JQ C 276
AF RR4GS60JQ C 278
AF RR4G624JQ C 126
AF RR4AN17JQ C 338
BS 1 525 RR4G624TF
BS 526 526 RR4CN25TF
BS 527 592 RR4G624TF
BS 593 734 RR4CN25TF
BS 735 735 RR4F137TF
BS 736 771 RR4CN25TF
BS 772 772 RR4AN17TF
BS 773 809 RR4CN25TF
BS 810 810 RR4AN17TF
BS 811 835 RR4CN25TF
BS 836 866 RR4AN17TF
BS 867 877 RR4AN17JQ

RD RR4G624TF 592 0 0
GGAAGACCAAACGCTTGCACTTCCCACGGATAAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTG
ACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCC
TTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCT
CCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGA
GTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCC
ACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAA
TCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTA
CTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTAT
AAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTGTAAGGGGTCTAGAC
CAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4EY73TF 662 0 0
GG
AAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAA
CACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCAT
CGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCT
TCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTC
TCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAG
ACCCTCTCTGCGAGTACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTG
GGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTG
CAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTG
GTGTCAGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTC
CTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTG
AGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATG

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR4CJ41TF 692 0 0
GGG
AAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAA
CACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCAT
CGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTC**CCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCT
TCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTC
TCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTATGCCACTGTTGGAG
ACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTG
GGTTCGGTGACAAAGCACCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTG
CAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTG
GTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAG*AGTACCTC
CTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTG
AGCCTGCAGG*TGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATG
ATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGA

QA 4 692 4 692
DS 

RD RR4EY73JQ 622 0 0
TTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCA
GAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTT
AGCCGCCACGATTCTCTTTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTA
CGCCACTGTTGGAGACCCTCTTTGCGAGTACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTTTG
CGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTA
TACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCT
TACTATGCGGATTGGTGTCAGCAAGGTTATAAGGGGTTTAGACCAAGGGATTCTTGGAGG
CGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTT
AGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTTTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGC
AACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAG
CTCTAATTTCGTTCTGTAAAGG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4GS60TF 709 0 0
GGACA
GATAAGGGAAGAAAAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTT
TAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTT
CATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGA
GCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGA
TTCTCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTG
GAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTG
TTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGT
TTGCAGACGGAACGTTGGTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGA
TTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTAC
CTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGAC
CTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCT
ATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGA

QA 6 709 6 709
DS 

RD RR4F137TF 728 0 0
GG
AAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAA
CACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCAT
CGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCT
TCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGATTC
TCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAG
ACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTG
GGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTG
CAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTG
GTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTC
CTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTG
AGCCTGCAGGGTGCTTTTCAGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATG
ATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTC
TGTAA
G

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR4CN25TF 826 0 0
GG
GCTTGCACTTCCCACGGATAAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACA
ATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACC
ATCTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTC
CAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGC
ATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAG
TACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGA
TTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTT
CACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGA
CCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTT
GGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCT
AAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGC
AATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGA
TGCAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAA*GCTATGTATATGATATATAT
CACCAGATTCTGGATTT*ATCATCTGTAAACATTGACATTCTC
A

QA 3 825 3 825
DS 

RD RR4AN17TF 850 0 0
GGACA
GATAAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTT
TAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTT
CATCGTCGTTCTCGTGCCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGA
GCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGA
TTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTG
GAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTG
TTGGGTTCGGTGACAAAGCTCTTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGT
TTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGA
TTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTAC
CTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGAC
CTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAGCATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCT
ATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCG
TTCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAAAGCTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATT
TTATCATCTGTAAACATTGACATTCTCCAACTTAAACCCAACGAGTAGCTTGCTTTTG
AGACAGA

QA 6 843 6 843
DS 

RD RR4CN25JQ 497 0 0
AAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGC
GTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACC
TATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTA
GACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAG
CTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGAC
TGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCC
GGAAGTAACACAAGATGCAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAAAGCTAT
GTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTATCATCTGTAAACATTGACATTCTCCA
ACTTAAACCCAACGAG
C

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4F137JQ 578 0 0
TCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCC
TCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTT
CGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGA
CGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGT
CGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTAT
GCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCC
TGCAGGGTGCTTTTCAGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATAT
CAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTA
AAGGAAGAAAAAAAAAA*CTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTATCAT
CTGTAAACATTGACATTTTCCAACTTAAACCCAA
TGAG

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4GS60JQ 595 0 0
TGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTC
TTTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCG
GTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACG
GAACGTTGGTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCG
GCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGC
GAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTG
CAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCA
ATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAA
GGAAGAAAAAAAAAA*CTATTTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTATCATCT
GTAAACATTGACATTTTCCAACTTAAACCCAATGAGCAGCTTGCTTTTG
AAGAGG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4G624JQ 741 0 0
ACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCAT
TGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGG
TTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAG
GATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGG
GCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGT
CAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCG
TGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTGTAAGGGGTCTAGACCAAGG
GATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGAT
TCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACAT
ACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAA
CACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAA*GCTATGTATATGA
TATATATCACCAGATTCTGGATTTTATCATCTGTAAACATTGACATTCTCCGACTTAAAC
CCAACGAGTAGCTTGCTTTTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4AN17JQ 540 0 0
TCTGGGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCG
GTGACAAAGCTCTTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACG
GAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCTCTTACTATGCGGATTGGTGTCG
GCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGGGAAGGAGTACCTCCTATGC
GAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTG
CAGGGTGCTTTTTTGGTGACTGTAGCATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCA
ATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAA
GGAAGAAAAAAAAAAGCTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTATCATCT
GTAAACATTGACATTCTCCAACTTAAACCCAACGAGTAGCTTGCTTTTGAAGAACAAGAC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 12

CO CL209Contig1 709 12 12 U
GGAATTTCAAGAACAGCAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCGCGATGTCTCTCCGCCGCT
CTATCCTCGGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCT
GGATGAGTAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAA
GAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAAATCTGGGAATCTCG
CCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCTGATCTCGCCAAATTCGCTCGTC
TCCCACCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTC
ACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGA
ATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGT
TTCTTTTCTTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTCTCTTTTATGA
ATAAGAACAACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAG
GCTTAGGTGGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTTTTCGAATCAG
GTGGATATTAAGAATCTCTCTTTGGATTGAATAAAAGACAAGTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 0 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 55 70 70 70 
70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
60 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 0 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 

AF RR4GP15JQ C 165
AF RR4DX73TF U 1
AF RR4D077TF U 1
AF RR4DZ15TF U 37
AF RR4CJ40TF U 37
AF RR4DX73JQ C 1
AF RR4DZ15JQ C 231
AF RR4FG16TF U 6
AF RR4FG16JQ C 39
AF RR4GP15TF U 7
AF RR4DQ42TF U 7
AF RR4DQ42JQ C 14
BS 1 267 RR4D077TF
BS 268 268 RR4FG16TF
BS 269 272 RR4D077TF
BS 273 273 RR4FG16TF
BS 274 602 RR4D077TF
BS 603 659 RR4FG16TF
BS 660 660 RR4DX73JQ
BS 661 665 RR4FG16TF
BS 666 690 RR4GP15TF
BS 691 691 RR4DQ42TF
BS 692 707 RR4GP15TF
BS 708 709 RR4DQ42JQ

RD RR4GP15JQ 325 0 0
AGGAACCCAATGGAAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCT
AATTCTGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCTGATCTC
GCCAAATTCGCTCGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAG
ATCCCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCAC
CAGGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATC
AAAGATGTCATCGTGTTTCTTTT
TT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4DX73TF 603 0 0
GGAATTTC
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GGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTGGATGAGT
AACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATC
TCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAAATCTGGGAATCTCGCCGCCGCC
GATCGTTCGGTTTCTTCTCTTGGGCAATCTGATCTCGCCAAATT*GCTCGTCTCCCACCG
TCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAAC
GCAGGGATGGAAGAATTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATG
GTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTC
TTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTTTCTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAAC
AACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAG
CTT

QA 9 600 9 600
DS 

RD RR4D077TF 602 0 0
GGAATTTCAAGAACAGCAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCGCGATGTCTCTCCGCCGCT
CTATCCTCGGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCT
GGATGAGTAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAA
GAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAAATCTGGGAATCTCG
CCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCTTGGGCAATCTGATCTCGCCAAATTCGCTCGTC
TCCCACCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTC
ACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGA
ATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGT
TTCTTTTCTTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTCTCTTTTATGA
ATAAGAACAACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAG
GC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4DZ15TF 620 0 0
GG
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CTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTCGATGAGTAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCC
GCCGTGAGGAACTCAATCGGAAGAGAAACCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAG
AAACCTAACTCTGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCT
GATCTCACCAAATTCGCTCGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTA
CGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTAT
GTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATC
GTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTT
TTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAACAACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCC
AAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAG*CTTAG*TGGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTT
ACTTTAAATGTTTTCGAA

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR4CJ40TF 617 0 0
GG
GCCGCGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTCGGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCT
CTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTGGATGAGTAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCC
GCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAG
AAACCTAAATCTGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCTTGGGCAATCT
GATCTCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCACCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTA
CGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTAT
GTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATC
GTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTT
TTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAACAACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCC
AAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAG*CTTAGGTGGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTT
ACTTTAAATGTTTTC

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR4DX73JQ 709 0 0
GGAATTTC
AAGAACAGCAGAACTGGGAATCTCTC*TACGCCGCGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTC
GGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTGGATGAGT
AACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATC
TCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAAATCTGGGAATCTCGCCGCCGCC
GATCGTTCGGTTTCTTCTCTTGGGCAATCTGATCTCGCCAAATT*GCTCGTCTCCCACCG
TCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAAC
GCAGGGATGGAAGAATTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATG
GTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTC
TTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTTTCTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAAC
AACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAGGCTTAGGT
GGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTTTTCGAATCAGGTGGATAT
TAAGAATCTCTCTTTGGATTGAATAAAAGACAAGTTGTT
CC

QA 9 707 9 707
DS 

RD RR4DZ15JQ 479 0 0
GGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCTGATCTCACCAAA
TTCGCTGGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCT
GTTTTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAG
ATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGAT
GTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTC
TCTTTTATGAATAAGAACAACATTGGTGGGATGGCATTTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGG
TTTGTGTAAGGCTTAGGTGGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTT
TTCGAATCAGGTGGATATTAAGAATCTCTCTTTGGATTGAATAAAAGACAAGTTGTT
TC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR4FG16TF 660 0 0
GGG
AAGAACAGCAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCGCGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTC
GGTCTCCACCGGCAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTCGATGAGT
AACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATC
TCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAACTCTGGGAATCTCGCCGCCGCC
GATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCTGATCTCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCATCG
TCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAAC
GCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATG
GTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGCTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTC
TTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAAC
AACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGCTTGCTCGGTTTGTGTAAGGCTTAGGT
GGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTTTTCGAATCACGTGGA

QA 4 660 4 660
DS 

RD RR4FG16JQ 671 0 0
GCCGCGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTCGGTCTCCACCGGCAAACCCACAACCTATCT
CTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTCGATGAGTAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCC
GCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAG
AAACCTAACTCTGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCT
GATCTCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTA
CGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTAT
GTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATC
GCTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTT
TTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAACAACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCC
AAGCTTGCTCGGTTTGTGTAAGGCTTAGGTGGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTT
ACTTTAAATGTTTTCGAATCAGGTGGATATTAAGAATCTCTCTTTGGATTGAATAAAAGA
CAAGTTGTT
TC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4GP15TF 703 0 0
GG
AAGAACAGCAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCGCGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTC
GGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTCGATGAGT
AACATCTCCTCTCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGAAAGAGAAATC
TCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAACTCTGGGAATCTCGCCGCCGCC
GATCGTTCGGTTTCTTCTCCTGGGAAATCTGATCTCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCATCG
TCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAAC
GCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATG
GTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTC
TTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAAC
AACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAGGCTTAGGT
GGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTTTTCGAATCA*GTGGATAT
TAAGAATCTCTCTTTGGATTGA*TAAAAGACAAGTTGTT
TC

QA 3 701 3 701
DS 

RD RR4DQ42TF 689 0 0
GG
AAGAACAGCAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCACGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTC
GGTCTCCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTGGATGAGT
AACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATC
TCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAAATCTGGGAATCTCGCCGCCGCC
GATCGTTCGGTTTCTTCTCTTGGGCAATCTGATCTCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCACCG
TCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAAC
GCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATG
GTGATCTCTCTGGGCTTGCTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTC
TTCTGAGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAAC
AACATTGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAGGCTTAG*T
GGGATTCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTTTTCGAATCA*GTGGATAT
TAAGAATCTCTCTTTGGATTGAA
AAAA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR4DQ42JQ 696 0 0
CAGCAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCACGATGTCTCTCCGCCGCTCTATCCTCGGTCT
CCACCGACAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTTACCTTTCTGGATGAGTAACAT
CTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGTGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCTC
GATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAAATCTGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCG
TTCGGTTTCTTCTCTTGGGCAATCTGATCTCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCACCGTCTCG
AGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGG
GATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGAT
CTCTCTGGGCTTGCTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTG
AGCAAGGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTT*CTTTTTCTCTTTTATGAATAAGAACAACAT
TGGTGCGATGGCATCTTAACCTTCCAAGTTTGCTCGGTTTGTGTAAGGCTTAGGTGGGAT
TCTAAGTGTGTTTGAAAGTCTGTTTACTTTAAATGTTTTCGAATCAGGTGGATATTAAGA
ATCTCTCTTTGGATTGAATAAAAGACAAGTTGTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 13

CO CL210Contig1 781 13 15 U
GGATCCCTTTCTTCTCTCCCAACAATGAACAAACCAAACAATT*AAACCAATAAAAA*CA
TGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCC
TCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCA
CCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAA
CGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAG
TTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGG
GTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGA
GATGCCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTG
GTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGA
CTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCA
TCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATC
ATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAAACGGAAGCTACATTATACATTTGGATTCAGCTTC
AGGCTGGAGAAACAATCCAGAACTACAACAAGTAGGATTGAAAACTAACTATGTTTTTCT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 60 60 60 60 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 
60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 45 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 
75 75 75 75 60 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F636TF U 25
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AF RR4E451JQ C 1
AF RR4E451TF U 123
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AF RR4GV86JQ C 29
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AF RR4DS64TF U 23
AF RR4D153JQ C 199
AF RR4DS64JQ C 201
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BS 27 122 RR4DS64TF
BS 123 518 RR4E451TF
BS 519 519 RR4DS64TF
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BS 581 620 RR4E451TF
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CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
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CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCA

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DS 

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CGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACT
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CTGGTTTTGTTCAGAATCAACAATATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTTTGGTCAGA
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GG

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DS 

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TCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCA
CCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCCCGCTTTTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAA
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TCCAATAGAGCGCGTTTCATATTTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATC
ATACACCATTAGTC
C

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DS 

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CTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGT
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TGCCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGT
TTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCTTGGGGGTAATTCACTTACCTCTGGTCAGAAGACT
GCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCTCTTTTTCCTGCCTTTCTTGAGTGGCTATTTCATC
CAATAGAGCGCGTTTCATATTTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCAT
ACACCATTAGTC
C

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DS 

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G
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CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGC
AGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
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CTTTAAACGGAAGCTACAT

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GG
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CCTATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCCGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGC
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GGGTTCCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCGGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAACGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
*ACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAA
ACGGAAGCTACATTATACATTTGGATTCAGCT

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DS 

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CTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGA
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TGGGGGTAACGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCT
CTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT*A
CTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAAAC
GGAAGCTACATTATAC
G

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DS 

RD RR4GV86TF 677 0 0
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TATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGAC
ACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCCCG
CTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGA
GACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCCGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAG
ATCGTGCGGGTACAT*TACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGG
GTTCCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAG
TTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCGGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCT
TGGGGGTAACGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCT
CTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT*A
CTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAAAC
GGAAGCTACATTATAC
G

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DS 

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TCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTCCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGAC
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CTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGA
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TTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCGGAATCAACAATATGGGCT
TGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCT
CTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTTTA
CTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAAAC
GGAAGCTACATTA

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DS 

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TCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTCCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGAC
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CTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGA
GACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAG
ATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGG
GTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAG
TTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCGGAATCAACAATATGGGCT
TGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCT
CTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTTTA
CTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAAAC
GGAAGCTACATTA

QA 1 673 1 673
DS 

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GAAT
GAACAAACCAAACAATT*AAACCAATAAAAA*CATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCT
CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACAGCAGTTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGC
AGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCGGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
TACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAA
ACGGAAGCTACATTATACATTTGGTTTCAGCTTCACGCTGGAGAAACAATCCAGAACTAC
AACAAGTAGGATTG

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DS 

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TCCCTCCTGGGTTCCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAG
CAGCTCAGAGTTTTTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCGGGTTTTGCTCAGAATCAAC
AATATGGGCTTGGGGGTAACGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGA
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ATGTTTTT*ACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCT
TTTTATAAACGGAAGCTACATTATACATTTGGATTCAGCTTCAGGCTGGAG

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DS 

RD RR4DS64JQ 581 0 0
CCTTCCCGCTTTTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGAT
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CCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCG
GCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAA
TATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGT
CTCCTCCTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCAT
GTTTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTT
TTATAAACGGAAGCTACATTATACATTTGGTTTCAGCTTCAGGCTGGAGAAACAATCCAG
AACTACAACAAGTAGGATTGAAAACTAACTATGTTTTTCTC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 2 9

CO CL211Contig1 1010 6 8 U
ATAACACAAATCATTCAGACAAACGAACAATTGCAATGCCCTCCTCCACATTATTCTTAA
CATGTTACGAACCTGAGAAGGGATAAAAGTATAATACAATCATAATACAGGTGGTACCAT
TGTAGAGATCATTATTTACACAAATGCAAAGAAACGTTTATGGAATGAGTGTGTGTCTAA
ATCCATACATTTTAGACAGTTCAGAAAGTCTGCAAAGATCCGTGCGAATAATACACAGCA
GTTGTGTTCCGGCAACCATCTTTTTTTTTT****AACATTCAAGAGTCAGCCGACCCGGG
CTGCCTTTGAACCATTTCCTCTGCCGCTGGACACGCGCGTAAGAGTGTGCAGACGTCATT
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CTTGCACTTCTTCTCGTAGTTCTTGAATGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACTAT
ATCCAGCTGAGTGTCAGGATCTTGGAGTTTGATGAGAATATCTGAAACAGTCTTGTGGCA
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CATCCTCTTGCAGAAATCTTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTGTATGAAGAAAAGAGGGAC
GTAGTAGTCAACCAAAGTTACGCACTGCTGTGCAAAACCGCGCATATGGGAGCACCGCTC
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AATGATTGGCAGGATCTGGCTTGGAGGAGAAGAAGAAGGTATCAACCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F790JQ U 78
AF RR4BN77JQ U 1
AF RR4AU27JQ U 79
AF RR4AZ10JQ U 79
AF RR4AU27TF C 123
AF RR4AZ10TF C 125
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A
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TCTTTTTTTTTTTTTTAACATTCAAGAGTCAGCCGACCCGGGCTGCCTTTGAACCATTTC
CTCTGCCGCTGGACACCCGCGTAAAAATGTGCAAACGTCATTTTTAACAAGGAAATCGCT
TGCATTAACCAGGATCAGAGGTCCATACTCGAACACAAACTTCTTGCACTTCTTCTCGTA
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ATCTTGGAGTTTGA

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DS 

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CATGTTACGAACCTGAGAAGGGATAAAAGTATAATACAATCATAATACAGGTGGTACCAT
TGTAGAGATCATTATTTACACAAATGCAAAGAAACGTTTATGGAATGAGTGTGTGTCTAA
ATCCATACATTTTAGACAGTTCAGAAAGTCTGCAAAGATCCGTGCGAATAATACACAGCA
GTTGTGTTCCGGCAACCATCTTTTTTTTTTTT**AACATTCAAGAGTCAGCCGACCCGGG
CTGCCTTTGAACCATTTCCTCTGCCGCTGGACACGCGCGTAAGAGTGTGCAGACGTCATT
TTTAACAAGGAAATCGTTTGCATTAACCAGGATCAGAGGTCCATACTCGAACACAAACTT
CTTGCACTTCTTCTCGTAGTTCTTGAATGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACTAT
ATCCAGCTGAGTGTCAGGATCTTGGAGTTTGATGAAAATATCTGAAACAGTCTTGTGGCA
TACAGCGCAGCTATCCTGACGGGCTTCTTCCACAAGAGCTGCCACTTTGTCACAAAGATT
CATCCTCTTGCAGAAATCTTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTGTATGAAGAAAAGAGGGAC
GTAGTAGTCAACCAAAGTTACGCACTGCTGT

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DS 

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QA 1 774 1 774
DS 

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TCTTTTTTTTTT****AACATTCAAGAGTCAGCCGACCCGGGCTGCCTTTGAACCATTTC
CTCTGCCGCTGGACACGCGCGTAAGAGTGTGCAGACGTCATTTTTAACAAGGAAATCGTT
TGCATTAACCAGGATCAGAGGTCCATACTCGAACACAAACTTCTTGCACTTCTTCTCGTA
GTTCTTGAATGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACTATATCCAGCTGAGTGTCAGG
ATCTTGGAGTTTGATGAGAATATCTGAAACAGTCTTGTGGCATACAGCGCAGCTATCCTG
ACGGGCTTCTTCCACAAGAGCTGCCACTTTGTCACAAAGATTCATCCTCTTGCAGAAATC
TTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTGTATGAAGAAAAGAGGGACGTAGTAGTCAACCAAAGT
TACGCACTGCTGTGCAAAACCGCGCATATGGGAGCACCGCTCATGAAGGTCCTCGATAAC
CTGTGCTTGTGTTTCGTTTTTCTCAAGGTAGGTTATAGCAACGTTAACATACTCCTCACA
CAGAGTGCAAACCTTTTCGTTCTTTGATACTTCCTCTGAGTCTAGGGAAGAGTGAAGGAA
GGATCTAGCGTCAGAGAGCAAGGTCAACCCCAGCAAGATAATAA

QA 1 824 1 824
DS 

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TAACAAGGAAATCGTTTGCATTAACCAGGATCAGAGGTCCATACTCGAACACAAACTTCT
TGCACTTCTTCTCGTAGTTCTTGAATGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACTATAT
CCAGCTGAGTGTCAGGATCTTGGAGTTTGATGAGAATATCTGAAACAGTCTTGTGGCATA
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TCCTCTTGCAGAAATCTTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTGTATGAAGAAAAGAGGGACGT
AGTAGTCAACCAAAGTTACGCACTGCTGTGCAAAACCGCGCATATGGGAGCACCGCTCAT
GAAGGTCCTCGATAACCTGTGCTTGTGTTTCGTTTTTCTCAAGGTAGGTTATAGCAACGT
TAACATACTCCTCACACAGAGTGCAAACCTTTTCGTTCTTTGATACTTCCTCTGAGTCTA
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TGATTGGCAGGATCTGGCTTGGAGGAGAAGAAGAAGGTATCAACCACC

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DS 

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CTTTGAACCATTTCCTCTGCCGCTGGACACGCGCGTAAGAGTGTGCAGACGTCATTTTTA
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CACTTCTTCTCGTAGTTCTTGAATGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACTATATCC
AGCTGAGTGTCAGGATCTTGGAGTTTGATGAGAATATCTGAAACAGTCTTGTGGCATACA
GCGCAGCTATCCTGACGGGCTTCTTCCACAAGAGCTGCCACTTTGTCACAAAGATTCATC
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TAGTCAACCAAAGTTACGCACTGCTGTGCAAAACCGCGCATATGGGAGCACCGCTCATGA
AGGTCCTCGATAACCTGTGCTTGTGTTTCGTTTTTCTCAAGGTAGGTTATAGCAACGTTA
ACATACTCCTCACACAGAGTGCAAACCTTTTCGTTCTTTGATACTTCCTCTGAGTCTAGG
GAAGAGTGAAGGAAGGATCTAGCGTCAGAGAGCAAGGTCAACCCCAGCAAGATAATAACC
AACGTTCCAGCTTTTGGTCCCATTGATTCCTATTTTTAAGAACAATCGAGCAACTTAATG
ATTGGCAGGATCTGGCTTGG

QA 1 860 1 860
DS 



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TCTTCTTCTTCCAAGCCAGAGTCTGCGAATCATTAAGTTGCTCGTTCTTTCTGGAAAATA
GGAATCAAATGGGACCAAAAGCTGGAACGTTGGCTATTATCTTGCTGCTGGGGTTGACCT
TACTTTCTGACGCTAGATCTTTCCTTCACTCTTCCCTAGACTCAGAGGAAGTTTCAAAGA
ACGAAAAGGTTTGCACTCTGTGTGAGGAATACGTTGACGTTGCTATCAGCTACCTTGAGA
AAAACGAAACACAAGCACAGGTTATCGAGGACCTCCATGAGCGGTGTTCCCATATGCGCG
GTTTTGCACAGCAGTGCGTAACTTTGGTTGACTACTACGTCCCTCTTTTCTTCATACAAC
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CTCTTGTTGAAGAAGCCCGTCAGGATAGCTGCGCCGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATA
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CTCTGATCCTGGTTAATGCAAACGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTAC
GCGCATGTCCAGCGGCAGAGGAAATGGTTCAACGGCAGCCCGGGTCGGCTGATTCTTGAA
TGTTAATAAAAAGATGGTTTTCGAGAATACAACTGCTGTGTGTTGTGAAAGAACAGTTGC
AGATTTTGTGAACTGTCTGTCTGTATGGACTTAGACACATTCCATTCCGTAAACATTTCT
GTGCGTTTGTGTAAATAATGATTGCTTGCTACAGTTGAAGCTTTATAATAAAAACGATTG
TATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4F911TF U 1
AF RR4BK76TF U 179
AF RR4F911JQ C 564
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BS 298 734 RR4F911TF
BS 735 737 RR4BK76TF
BS 738 966 RR4F911JQ

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TCTTCTTCTTCCAAGCCAGAGTCTGCGAATCATTAAGTTGCTCGTTCTTTCTGGAAAATA
GGAATCAAATGGGACCAAAAGCTGGAACGTTGGCTATTATCTTGCTGCTGGGGTTGACCT
TACTTTCTGACGCTAGATCTTTCCTTCACTCTTCCCTAGACTCAGAGGAAGTTTCAAAGA
ACGAAAAGGTTTGCACTCTGTGTGAGGAATACGTTGACGTTGCTATCAGCTACCTTTAGA
AAAACGAAACACAAGCACAGGTTATCGAGGACCTCCATGAGCGGTGTTCCCATATGCGCG
GTTTTGCACAGCAGTGCGTAACTTTGGTTGACTACTACGTCCCTCTTTTCTTCATACAAC
TTGAGTCGTTTCAACCTGAAGATTTCTGCAAGAGGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAG
CTCTTGTTGAAGAAGCCCGTCAGGATAGCTGCGCCGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATA
TTCTCATCAAACTCCAAGATCCTGACACTCAGCTGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGG
GATGCAAATCATTCAAGAACTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGAC
CTCTGATCCTGGTTAATGCAAACGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTAC
GCGCATGTCCAGCG

QA 1 734 1 734
DS 

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CTTACTT
TCTGACGCTAGATCTTTCCTTCACTCTTCCCTAGACTCAGAGGAAGTTTCAAAGAACGAA
AAGGTTTGCACTCTGTGTGAGGAATACGTTGACGTTGCTATCAGCTACCTTGAGAAAAAC
GAAACACAAGCACAGGTTATCGAGGACCTCCATGAGCGGTGTTCCCATATGCGCGGTTTT
GCACAGCAGTGCGTAACTTTGGTTGACTACTACGTCCCTCTTTTCTTCATACAACTTGAG
TCGTTTCAACCTGAAGATTTCTGCAAGAGGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAGCTCTT
GTTGAAGAAGCCCGTCAGGATAGCTGCGCTGTATGCCGCAAGACTGTTTCAGATATTCTC
ATCAAACTCCAAGATCCTGACACTCAGCTGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGGGATGC
AAATCATTCAAGAACTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTCTG
ATCCTGGTTAATGCAAACGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTACGCGCA
TGTCCAGCGGCA

QA 8 559 8 559
DS 

RD RR4F911JQ 403 0 0
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GAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTCTGATCTTGGTTAATGCAAAC
GATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTTTTACGCGCATGTCCAGCGGCAGAGGAA
ATGGTTCAACGGCAGCCCGGGTCGGCTGATTCTTGAATGTTAATAAAAAGATGGTTTTCG
AGAATACAACTGCTGTGTGTTGTGAAAGAACAGTTGCAGATTTTGTGAACTGTCTGTCTG
TATGGACTTAGACACATTCCATTCCGTAAACATTTCTGTGCGTTTGTGTAAATAATGATT
GCTTGCTACAGTTGAAGCTTTATAATAAAAACGATTGTATCCC

QA 1 403 1 403
DS 



AS 2 12

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CAAACCAGAACATTCTAAAAATTGTGAAAATGTTTTATTTTGATAAATGCAACAATCCCC
CAGATGGCTTCTCTCCCTTTTAAATTGGCTTTTGACTCTATTACCTTCTTGGCGAAAGAA
GGCAAACAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGTTGTAAAACTTTAAGGGTCCCTTTGAT
TTGCTGGAGCTGTCATCAATCGGGTTCACAGGGTTCTTGAAGTCAACGTCAGGCCCTTCA
GTTGAACAGAGCATGAGTCCGATCACCCCACTCGGGTATGTTGGAACACTGGTCCATGCG
TAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGGCAATTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCC
ATGTGAAGCCACAAGCTTTCAGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGTCGAAGAGCTCTC
GCCACAGATTGGAAGAAGGGTTTCTCAAACAACTCCTTTGCAGGACCTGACAAAAACCAG
CAAGCAATGTCAAAAAGGCTGCTTCTCAAAATAACAGCAAGGGCTAATCTAGGCATTGAA
TGGGAAGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CA25TF C 1
AF RR4CA25JQ U 4
BS 1 3 RR4CA25TF
BS 4 608 RR4CA25JQ

RD RR4CA25TF 608 0 0
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GGCAAACAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGTTGTAAAACTTTAAGGGTCCCTTTGAT
TTGCTGGAGCTGTCATCAATCGGGTTCACAGGGTTCTTGAAGTCAACGTCAGGCCCTTCA
GTTGAACAGAGCATGAGTCCGATCACCCCACTCGGGTATGTTGGAACACTGGTCCATGCG
TAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGGCAATTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCC
ATGTGAAGCCACAAGCTTTCAGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGTCGAAGAGCTCTC
GCCACAGATTGGAAGAAGGGTTTCTCAAACAACTCCTTTGCAGGACCTGACAAAAACCAG
CAAGCAATGTCAAAAAGGCTGCTTCTCAAAATAACAGCAAGGGCTAATCTAGGCATTGAA
TGGGAAGC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4CA25JQ 605 0 0
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ATGGCTTCTCTCCCTTTTAAATTGGCTTTTGACTCTATTACCTTCTTGGCGAAAGAAGGC
AAACAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGTTGTAAAACTTTAAGGGTCCCTTTGATTTG
CTGGAGCTGTCATCAATCGGGTTCACAGGGTTCTTGAAGTCAACGTCAGGCCCTTCAGTT
GAACAGAGCATGAGTCCGATCACCCCACTCGGGTATGTTGGAACACTGGTCCATGCGTAG
TTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGGCAATTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCCATG
TGAAGCCACAAGCTTTCAGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGTCGAAGAGCTCTCGCC
ACAGATTGGAAGAAGGGTTTCTCAAACAACTCCTTTGCAGGACCTGACAAAAACCAGCAA
GCAATGTCAAAAAGGCTGCTTCTCAAAATAACAGCAAGGGCTAATCTAGGCATTGAATGG
GAAGC

QA 1 605 1 605
DS 



CO CL212Contig2 1350 10 14 U
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CTTCGCCGAGAAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCGCCACCG
ATCTGAAGCGACCGAGAGAAGAGGAGGATAACGCCGCCGCCTCCATGGAGACAGAGAACG
GAGATCAGACAAAGGAGCCTGCTTGTTTCTCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGA
TGAGTCCCATGTGGCCAGGAGAGGCACACTCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTTGTTTCAAG
GGAAATCAGATTATCAGGATGTCATTGTTTTCCAGTCTGCGACATATGGAAAAGTGTTGG
TTTTGGATGGAGTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGTGCGCTTATCAGGAGATGATCA
CTCATCTTCCTTTGTGCTCCATCCCTAACCCAAAGAAGGTGTTGGTCATTGGAGGAGGAG
ATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGTG
AAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAAGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGAT
TCGAGGATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAATGCTG
CTGAAGGAACATATGATGCAGTTATTGTTGACTCATCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAGG
AGTTGTTTGAGAAACCCTTCTTCCAATCTGTGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGGAGTTG
TGTGCACTCAGGCTGAAAGCTTGTGGCTTCACATGGACATCATCGAAGACATTGCTTCCA
ATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTGAACTACGCATGGACCAGTGTTCCAACATACC
CGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGTTCAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTTCAAGA
ACCCTGTGAACCCGATTGATGACAGCTCCAGCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTTTTACA
ACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGTTTGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAATAGAGT
CAAAAGCCAATTGAAAAGGGAGAGAAGCCATCTGGGGG*ATTGTTGCATTTATCAAAATA
AAACATTTTCACAATTTTTAGAATGTTCTGGTTTGTTTCAAGCATGTTTCTGTGACACTC
ACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTTAGCACAATAGCTCTTTACATATTACTACATT
TAAGCAAGTCGTATTTACCAAGTTTCTTTGATTCTGGCGTACTGCCATTTTTTCATTTAT
ATAAAAGGCTCTATGTAGCCGATCTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C104TF U 24
AF RR4GZ49TF U 101
AF RR4DV71TF U 1
AF RR4FM12TF U 5
AF RR4EB40TF U 1
AF RR4FM12JQ C 450
AF RR4DV71JQ C 416
AF RR4B006JQ C 479
AF RR4B006TF U 479
AF RR4GZ49JQ C 776
BS 1 571 RR4DV71TF
BS 572 572 RR4EB40TF
BS 573 662 RR4DV71TF
BS 663 666 RR4EB40TF
BS 667 667 RR4FM12TF
BS 668 733 RR4EB40TF
BS 734 734 RR4B006TF
BS 735 778 RR4EB40TF
BS 779 779 RR4B006TF
BS 780 791 RR4EB40TF
BS 792 1118 RR4B006TF
BS 1119 1119 RR4DV71JQ
BS 1120 1279 RR4B006TF
BS 1280 1350 RR4GZ49JQ

RD RR4C104TF 261 0 0
GGAATC
CCTCTCTCTCATTTCACCTTCTCCTCCTCTTCTTCGCCGAGAAGAGCAGCAGCAGCAGCA
GCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCGCCACCGATCTGAAGCGACCGAGAGAAGAGGAGGAT
AACGCCGCCGTCTCCATGGAGACAGAGAACGGAGATCAGACAAAGGAGCCTGCTTGTTTC
TCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGATGAGTCCCATGTGGCCAGGAGAGGCACAC
TCTTTGAAGGT
GAGA

QA 7 257 7 257
DS 

RD RR4GZ49TF 508 0 0
G
AAAGAAGCCTCCGCCACCGATCTGAAGCGACCGAGAGAAGAGGAGGATAACGCCGCCGCC
TCCATGGAGACAGAGAACGGAGATCAGACAAAGGAGCCTGCTTGTTTCTCCTCCGTGATT
CCTGGATGGTTCTCCGAGATGAGTCCCATGTGGCCAGGAGAGGCACACTCTTTGAAGGTT
GAGAAGGTTTTGTTTCAAGGGAAATCAGATTATCAGGATGTCATTGTTTTCCAGTCTGCG
ACATATGGAAAAGTGTTGGTTTTGGATGGAGTCATCCAACTCGCGGAGAGAGACGAGTGC
GCTTATCAGGAGATGATCACTCATCTTCCTTTGTGCTCCATCCCTAACCCAAAGAAGGTG
TTGGTCATTGGAGGAGGAGATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTT
GAGCAGATTGACATGTGTGAAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAAGCAGTTTTTC
CCTAATGTAGCAATTGGATTCGAGGAT

QA 2 508 2 508
DS 

RD RR4DV71TF 662 0 0
GGAACTCCCACCCTGCAAAAACCCTAATCCCTCTCTCTCATTTCACCTTCTCCTCCTCTT
CTTCGCCGAGAAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCGCCACCG
ATCTGAAGCGACCGAGAGAAGAGGAGGATAACGCCGCCGCCTCCATGGAGACAGAGAACG
GAGATCAGACAAAGGAGCCTGCTTGTTTCTCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGA
TGAGTCCCATGTGGCCAGGAGAGGCACACTCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTTGTTTCAAG
GGAAATCAGATTATCAGGATGTCATTGTTTTCCAGTCTGCGACATATGGAAAAGTGTTGG
TTTTGGATGGAGTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGTGCGCTTATCAGGAGATGATCA
CTCATCTTCCTTTGTGCTCCATCCCTAACCCAAAGAAGGTGTTGGTCATTGGAGGAGGAG
ATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGTG
AAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAATCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGAT
TCGAGGATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAATGCTG
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4FM12TF 726 0 0
GG
CCCACCCTGCAAAAACCCTAATCCCTCTCTCTCATTTCACCTTCTCCTCCTCTTCTTCGC
CGAGAAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCGCCACCGATCTGA
AGCGACCGAGAGAAGAGGAGGATAACGCCGCCGCCTCCATGGAGACAGAGAACGGAGATC
AGACAAAGGAGCCTGCTTGTTTCTCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGATGAGTC
CCATGTGGCCAGGAGAGGCACACTCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTTGTTTCAAGGGAAAT
CAGATTATCAGGATGTCATTGTTTTCCAGTCTGCGACATATGGAAAAGTGTTGGTTTTGG
ATGGAGTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGTGCGCTTATCAGGAGATGATCACTCATC
TTCCTTTGTGCTCCATCCCTAACCCAAAGAAGGTGTTGGTCATTGGAGGAGGAGATGGAG
GTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGTGAAATTG
ATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAAGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGATTCGAGG
ATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAATGCTGCTGAAG
GAACATATGATGCAGTTATTGTTGACTCATCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAGGAGTTGT
TTGA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4EB40TF 792 0 0
GGAACT
CCCACCCTGCAAAAACCCTAATTCCTCTCTCTCATTTCACCTTCTCCTCCTCTTCTTCGC
CGAGAAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCGCCACCGATCTGA
AGCGACCGAGAGAAGAGGAGGATAACGCCGCCGCCTCCATGGAGACAGAGAACGGAGATC
AGACAAAGGAGCCTGCTTGTTTCTCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGATGAGTC
CCATGTGGCCAGGAGAGGCACACTCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTTGTTTCAAGGGAAAT
CAGATTATCAGGATGTCATTGTTTTCCAGTCTGCGACATATGGAAAAGTGTTGGTTTTGG
ATGGAGTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGTGCGCTTATCAGGAGATGATCACTCATC
TTCCTTTGTGCTCCATCCCTAACCCAAAGAAGGTGTTGGTCATTGGAGGAGGAGATGGAG
GTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGTGAAATTG
ATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAAGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGATTCGAGG
ATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAGTGCTGCTGAAG
*AACATATGATGCAGTTATTGTTGACTCATCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAGGAGTTGT
TTGAGAA*CCCTTCTTCCAATCTGTGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGGAGT*GTGTGCA
CTCAG
C

QA 7 791 7 791
DS 

RD RR4FM12JQ 783 0 0
CCAAAGAAGGTGTTGGTCATTGGAGGAGGAGATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGC
CATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGTGAAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCT
AAGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGATTCGAGGATCCTCGCGTTAACCTCGTCATT
GGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAATGCTGCTGAAGGAACATATGATGCAGTTATTGTT
GACTCATCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAGGAGTTGTTTGAGAAACCCTTCTTCCAATCT
GTGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGGATTTGTGTGCACTCAGGCTGAAAGCTTGTGGCTT
CACATGGACATCATCGAAGACATTGTTTCCAATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTG
AACTACGCATGGACCAGTTTTCCAACATACCCGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGT
TCAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTTCAAGAACCCTGTGAACCCGATTGATGACAGCACC
AGCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTTTTACAACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGT
TTGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAATAGAGTCAAAAGCCAATTGAAAAGGGAGAGAAGCC
ATCTGGGGG*ATTGTTGCATTTATCAAAATAAAACATTTTCACAATTTTTAGAATGTTCT
GGTTTGTTTCAAGCATGTTTCTGTGACACTCACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTT
AGC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4DV71JQ 850 0 0
GATCACTCATCTTCCTTTGTGCTCCATCCCTAACCCAAAGAAGGTGTTGGTCATTGGAGG
AGGAGATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACAT
GTGTGAAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAATCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAAT
TGGATTCGAGGATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAA
TGCTGCTGAAGGAACATATGATGCAGTTATTGTTGACTCATCAGATCCAATTGGTCCTGC
AAAGGAGTTGTTTGAGAAACCCTTCTTCCAATCTGTGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGG
AGTTGTGTGCACTCAGGCTGAAAGCTTGTGGCTTCACATGGACATCATCGAAGACATTGT
TTCCAATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTGAACTACGCATGGACCAGTGTTCCAAC
ATACCCGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGTTCAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTT
CAAGAACCCTGTGAACCCGATTGATGACAGCTCCAGCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTT
TTACAACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGTTTGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAAT
AGAGTCAAAAGCCAATTGAAAAGGGAGAGAAGCCATCTGGGGG*ATTGTTGCATTTATCA
AAATAAAACATTTTCACAATTTTTAGAATGTTCTGGTTTGTTTCAAGCATGTTTCTGTGA
CACTCACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTTAGCACAATAGCTCTTTACATATTACT
ACATTTAAGC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4B006JQ 801 0 0
G
GATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGT
GAAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAAGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGA
TTCGAGGATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAATGCT
GCTGAAGGAACATATGATGCAGTTATTGTTGACTCGTCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAG
GAGTTGTTTGAGAAACCCTTCTTCCAATCTGTGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGGAGTT
GTGTGCACTCAGGCTGAAAGCTTGTGGCTTCACATGGACATCATCGAAGACATTGCTTCC
AATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTGAACTACGCATGGACCAGTGTTCCAACATAC
CCGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGTTCAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTTCAAG
AACCCTGTGAACCCGATTGATGACAGCTCCAGCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTTTTAC
AACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGTTTGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAATAGAG
TCAAAAGCCAATTGAAAAGGGAGAGAAGCCATCTGGGGG*ATTGTTGCATTTATCAAAAT
AAAACATTTTCACAATTTTTAGAATGTTCTGGTTTGTTTCAAGCATGTTTCTGTGACACT
CACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTTAGCACAATAGCTCTTTACATATTACTACAT
TTAAGCAAGTCGTATTTACC

QA 2 801 2 801
DS 

RD RR4B006TF 801 0 0
G
GATGGAGGTGTCTTGCGTGAAGTTGCACGCCATGCTTCTGTTGAGCAGATTGACATGTGT
GAAATTGATAAAATGGTGGTCGATGTCTCTAAGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGA
TTCGAGGATCCTCGCGTTAACCTCGTCATTGGCGATGGTGTTGCTTTTTTGAAGAATGCT
GCTGAAGGAACATATGATGCAGTTATTGTTGACTCGTCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAG
GAGTTGTTTGAGAAACCCTTCTTCCAATCTGTGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGGAGTT
GTGTGCACTCAGGCTGAAAGCTTGTGGCTTCACATGGACATCATCGAAGACATTGCTTCC
AATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTGAACTACGCATGGACCAGTGTTCCAACATAC
CCGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGTTCAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTTCAAG
AACCCTGTGAACCCGATTGATGACAGCTCCAGCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTTTTAC
AACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGTTTGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAATAGAG
TCAAAAGCCAATTGAAAAGGGAGAGAAGCCATCTGGGGGGATTGTTGCATTTATCAAAAT
AAAACATTTTCACAATTTTTAGAATGTTCTGGTTTGTTTCAAGCATGTTTCTGTGACACT
CACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTTAGCACAATAGCTCTTTACATATTACTACAT
TTAAGCAAGTCGTATTTACC

QA 2 801 2 801
DS 

RD RR4GZ49JQ 575 0 0
AGTTGTGTGCACTCAGGCTGAAAGCTTGTGGCTTCACATGGACATCATCGAAGACATTGT
TTCCAATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTGAACTACGCATGGACCAGTGTTCCAAC
ATACCCGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGTTCAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTT
CAAGAACCCTGTGAACTCGATTGATGACAGCTCCAGCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTT
TTACAACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGTTTGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAAT
AGAGTCAAAAGCCAATTGAAAAGGGAGAGAAGCCATCTGGGGG*ATTGTTGCATTTATCA
AAATAAAACATTTTCACAATTTTTAGAATGTTCTGGTTTGTTTCAAGCATGTTTTTGTGA
CACTCACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTTAGCACAATAGCTCTTTACATATTACT
ACATTTAAGCAAGTCGTATTTACCAAGTTTCTTTGATTCTGGCGTACTGCCATTTTTTCA
TTTATATAAAAGGCTCTATGTAGCCGATCTTGAGC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 13

CO CL213Contig1 751 13 26 U
GGGACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAA*CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGT
TTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCC
TTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAG
CCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTT
CTCTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATT
GACCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGA
TCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGG
ATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTT
GCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAAACCTCTCTGTAGT
AGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGCAGACATGATTTGCT
GAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATAC
TCTCTAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAG
TTAGCCCATTAACAACTTTTTCTTTGTCACC


BQ
10 10 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 35 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 55 55 
55 55 40 55 55 55 50 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4CI69TF U 5
AF RR4C888TF U 377
AF RR4A473JQ C 45
AF RR4BZ15TF U 2
AF RR4EY09TF U 1
AF RR4A473TF U 2
AF RR4BZ15JQ C 107
AF RR4EW09JQ C 107
AF RR4BI49JQ C 112
AF RR4BI49TF U 2
AF RR4EY09JQ C 107
AF RR4CI69JQ C 28
AF RR4EW09TF U -1
BS 1 25 RR4EY09TF
BS 26 26 RR4A473TF
BS 27 224 RR4EY09TF
BS 225 225 RR4A473TF
BS 226 248 RR4EY09TF
BS 249 249 RR4A473TF
BS 250 303 RR4EY09TF
BS 304 304 RR4A473TF
BS 305 308 RR4EY09TF
BS 309 309 RR4A473TF
BS 310 341 RR4EY09TF
BS 342 342 RR4A473TF
BS 343 407 RR4EY09TF
BS 408 408 RR4A473TF
BS 409 527 RR4EY09TF
BS 528 528 RR4A473TF
BS 529 575 RR4EY09TF
BS 576 576 RR4A473TF
BS 577 647 RR4EY09TF
BS 648 648 RR4A473TF
BS 649 669 RR4EY09TF
BS 670 670 RR4A473TF
BS 671 718 RR4EY09TF
BS 719 719 RR4A473TF
BS 720 740 RR4EY09TF
BS 741 751 RR4A473TF

RD RR4CI69TF 285 0 0
GG
GTGAATCTCTCTGGAAAAAA*CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTTACGC
AGATCCGCAGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTTTCAT
GGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCCCCTC
AAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTTCTCTGT
GGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCA

QA 3 285 3 285
DS 

RD RR4C888TF 343 0 0
G
GGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCA
AAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAA
GAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAAACCTCTCTGTAGTAGCACCAGTCTACGACT
CTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTT
CCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTCCTCTGGT
CTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAA

QA 2 343 2 343
DS 

RD RR4A473JQ 658 0 0
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GCTTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGA
GGTTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCG
CAAGTCTCACCAGGTTCTCTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAAC
TGGCAAAGAACTCATTGACCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACT
GAGGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAG
TAGACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAA
AAAGGGAAAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTA
AAAACCTCTCTGTAGTAGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAA
GCAGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGA
ACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4BZ15TF 724 0 0
G
GACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTT
ACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTT
TCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGCGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCC
CCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTTCT
CTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGA
CCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGATC
GGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGAGTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGGAT
GCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTAGC
TATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAAACCTCTCTGCAGTAG
CACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGA
GGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATACTC
TCCAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAA
GTAGCCC

QA 2 717 2 717
DS 

RD RR4EY09TF 747 0 0
GGGACCGTGAATCTCTCTGGAAAAA**CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGT
TTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCC
TTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAG
CCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCAGGTT
CTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATT
GACTTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAGCTGAGGAGGCGTGTTGGA
TCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGGCATAGACATGGG
ATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTT
GCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAA*CCTCTCTGTAGT
AGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCT
GAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTAGTTCTGTAATAC
TCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAA*G
TTAGCCCATTAACAACTTTT
CTTTGCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4A473TF 750 0 0
A
GACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAA*CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTT
ACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTT
TCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCC
CCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTTCT
CTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGA
CCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGATC
GGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGGAT
GCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGC
TATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAAACCTCTCTGTAGTAG
CACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGA
GGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATACTC
TCTAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAGTT
AACCCATTAACAACTTTTTCTTTGTCACC

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR4BZ15JQ 621 0 0
TTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGCGGGAAACGCAGAGG
TTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCA
AGTCTCACCAGGTTCTCTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTG
GCAAAGAACTCATTGACCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGA
GGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGAGTGTTACAGAGGAAGTA
GACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAA
AGGGAAAGAGAGTAGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAA
AACCTCTCTGCAGTAGCACCAGTTTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGC
AGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAAC
TTGTTCTGTAATACTCTCCAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAA
CATGGATCAAAAAGTTAGCCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4EW09JQ 624 0 0
TTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGG
TTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCA
AGTCTCACCAGGTTCTCTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTG
GCAAAGAACTCATTGACCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGA
GGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTA
GACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAA
AGGGAAAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAA
AACCTCTCTGTAGTAGCACCAGTTTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGC
AGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAAC
TTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAA
CATGGATCAAAAAGTTAGCCCA
CT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4BI49JQ 637 0 0
AATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCA
AACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCT
CACCAGGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACGAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAA
GAACTCATTGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAGCTGAGGAGG
CGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGGCAT
AGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAAATAATGCTCGCACCAAAAAGGGA
AAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAA*CCT
CTCTGTAGTAGCACCAGTTTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACA
TGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTAGTT
CTGTAATACTCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGG
ATCAAAAAGTTAGCCCATTAACAACTTTTTCTTTG
CC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4BI49TF 747 0 0
G
GACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAA*CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTT
ACGCAGATTCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTT
TCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCC
CCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCAGGTTCT
CTGTGGCCTCGGCATCACCAACGAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGA
CCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAGCTGAGGAGGCGTGTTGGATC
GGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGGCATAGACATGGGAT
GCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGC
TATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAA*CCTCTCTGTAGTAG
CACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGA
GGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTAGTTCTGTAATACTC
TCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAGTT
AGCCCATTAACAACTTTTTCTTTG
CC

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR4EY09JQ 642 0 0
TTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGG
TTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTA
AGTCTCACCAGGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTG
GCAAAGAACTCATTGACTTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAGCTGA
GGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTA
GGCATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAA
AGGGAAAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAA
A*CCTCTCTGTAGTAGCACCAGTTTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGC
AGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAAC
TAGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAA
CATGGATCAAAAAGTTAGCCCATTAACAACTTTTTCTTTG
CC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4CI69JQ 710 0 0
CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTTACGCAGATCCGCAGCGACCTTATTC
GATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATC
CGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTT
TACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTTCTCTGTGGGCTCGGCATCACCAACAAG
CTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGACCTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCAC
CAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTA
GACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAA
ACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCT
CGCAAGTAGAACCCTTAAAAACCTCTCTGTAGTAGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGAT
GAAATTTGGTCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGC
ATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTT
TGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAGTTAGCCCATTAACAAC
C

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4EW09TF 732 0 0
GGTTC
ACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAA*CGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTTA
CGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTTT
CATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCCC
CTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTTCTC
TGTGGGCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGAC
CTCCGCGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGATCG
GAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGGATG
CCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGCT
ATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAAACCTCTCTGTAGTAGC
ACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGGTCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAG
GAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATACTCT
CTAGCTCCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAGTTA
GCCCA
CT

QA 6 730 6 730
DS 



AS 1 11

CO CL214Contig1 1114 11 10 U
AAGTCTAACCGAGTGACAGATAAATGCAAACCGACCATTTCAATTTCCAACTCGACCACA
TCTGAATCAATGCTTACTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTA
TATGTATATAATTAATTACATTTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACT
ATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATG
TTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCC
TCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCG
AGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGT
GGCTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAAC
CCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCA
ATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGT
TTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCGTTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCA
GCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTGAAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCA
TCCACTTTAACCAACGGTGAGATTCTGCGTGAGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGA
TGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTTGAGGAGAAACAGAGCTTCGTTAGGAGCTGGGTT
AGGGTTCTTCCCCTCGAGCTGCGTTATCAGTTCACTGATATCCGCTCTCGTCTCACTCGA
TGCGTTTAAACCTCGATCTATTCCATACAAAGAACCCGCTAACACTCTCTTAAGCCGCTC
CGTCTCCTCCGCAGATTCGATGGCTTCTTCAGCTTCCTTCTCCCCCACCGATGAGTTCGA
TCCTCTCTCGGGACCCCACTCGTCTTCAACGTCACCGCCTCGCCCCTTGGAATCTGGACC
CCACTCGTCATTGACGTCACTGGCTCGGACCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E876JQ U 99
AF RR4BX77JQ U 72
AF RR4AX26JQ U 1
AF RR4E876TF C 99
AF RR4A319JQ U 88
AF RR4A319JQD U 88
AF RR4GU64JQ U 258
AF RR4DZ58JQ U 88
AF RR4DZ58TF C 207
AF RR4AX26TF C 183
AF RR4A319TF C 885
BS 1 813 RR4AX26JQ
BS 814 817 RR4A319JQ
BS 818 824 RR4A319JQD
BS 825 852 RR4DZ58JQ
BS 853 853 RR4AX26TF
BS 854 923 RR4DZ58JQ
BS 924 990 RR4AX26TF
BS 991 991 RR4A319TF
BS 992 1061 RR4AX26TF
BS 1062 1114 RR4A319TF

RD RR4E876JQ 354 0 0
AACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTACATTTATATATCCGGGAGCA
ACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAACACTTGAAACA
CAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTA
AGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCATCGCCTCT
AGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGTGCACTGTCTCC
AGGCAAAGAAAATTTCAACGGTGGCTGGATTGAAATAGTTCTTGCCACTGAAGA

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR4BX77JQ 628 0 0
GCTTACTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAA
TTAATTACATTTATATATCCGGGAGCAACATCCGTCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAG
TACATAACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGG
ATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAG
CACAAAGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGGCTTTGTCGAGATAAGTGGT
GAGCAGCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGA
AATAGTTCTTGCCACTGAAAAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGG
GTTGAGGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGT
TAGTTGTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCG
GACTTCGAATTTAGCGTTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGAC
AGAGTTGTGTACGGTGAAGCTGTCGGAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4AX26JQ 813 0 0
AAGTCTAACCGAGTGACAGATAAATGCAAACCGACCATTTCAATTTCCAACTCGACCACA
TCTGAATCAATGCTTACTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTA
TATGTATATAATTAATTACATTTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACT
ATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATG
TTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCC
TCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCG
AGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGT
GGCTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAAC
CCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCA
ATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGT
TTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCGTTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCA
GCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTGAAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCA
TCCACTTTAACCAACGGTGAGATTCTGCGTGAGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGA
TGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTTGAGGAG

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4E876TF 697 0 0
AACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTACATTTATATATCCGGGAGCA
ACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAACACTTGAAACA
CAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTA
AGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCATCGCCTCT
AGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGTGCACTGTCTCC
AGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGATTGAAATAGTTCTTGCCACTGAAGAAGCCGC
GTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTTTGACCAAGAAC
CTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCGATAATGCCTTG
CTCAAACTTGGCCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCGTTGGTGCTAAG
CGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTGAAGCTGTCGGA
ATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCA*****ACCAACGGTGAGATTCTGCGTGAGAGCAA
CGGG*AACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAAT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4A319JQ 730 0 0
GCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTACATTTATAT
ATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAA
CACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTA
AAGATGACTTAAGGGTTTAAGAAAGAGCTTCCCTCTCTGATGAACACAAAGACGCTTCCA
CCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGT
GCACTGTCTCCAGGCAAAGAAAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACT
GAAAAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTT
TGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCG
ATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCG
TTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTG
AAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCACTTTAACCAACGGTGAGATTCTG
CGTGAGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTT
GAGGAGAAAC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4A319JQD 737 0 0
GCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTACATTTATAT
ATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAA
CACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTA
AAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAACACAAAGACGCTTCCA
CCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGT
GCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACT
GAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTT
TGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCG
ATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCG
TTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTG
AAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCACTTTAACCAACGGTGAGATTCTG
CGTGAGAGCAACGGGGAACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTT
GAGGAGAAACAGAGCTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4GU64JQ 568 0 0
TGAGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAA
GACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAG
CCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGT
TCTTGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAG
GTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTG
TGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTC
GAATTTAGCGTTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTT
GTGTACGGTGAAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGACCTCATCCACTTTAACCAACGG
TGAGATTCTGCGTGAGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCC
ATTTGCCGTTGAGGAGAAACAGAGCTTC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4DZ58JQ 842 0 0
GCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTACATTTATAT
ATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAACAGTTACAA
CACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTA
AAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCA
CCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGT
ACACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACT
GAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTT
TGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCG
ATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCG
TTGGCGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTG
AAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCACTTTAACCAACGGTGAGATTCTG
CGTGAGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTT
GAGGAGAAACAGAGCTTCGTTAGGAGCTGGGTTAGGGTTCTTCCC*TCGAGCTGCGTTAT
CAGTTCACTGATATCCGCTCTCGTCTCACTCGATGCGTTTAAACCTCGATCTATTC
ATACAA

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR4DZ58TF 758 0 0
CACAC
TGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGT*ACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGA
TGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCAT
CGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGTACAC
TGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACTGAAG
AAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTTTGAC
CAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCGATAA
TGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCGTTGG
CGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTGAAGC
TGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCACTTTAACCAACGGTGAGATTCTGCGTG
AGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTTGAGG
AGAAACAGAGCTTCGTTAGGAGCTGGGTTAGGGTTCTTCCCCTCGAGCTGCGTTATCAGT
TCACTGATATCCGCTCTCGTCTCACTCGATGCGTTTAAACCTCGATCTATTCCATACAAA
GAACCCGCTAACACTCTCTTAAGCCGCTCCGTC

QA 6 758 6 758
DS 

RD RR4AX26TF 884 0 0
GTAGTAAAGTACATAACAGTTACA*CACT*GAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTT
ACTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTC
TCTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAG
ATAAGTGGTGAGCAGCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGG
CTGGCTTGAAATAGTTCTTGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCC
TCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAAT
CGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTT
AGGACTTCGGACTTCGAATTTAGCGTTGGTGCTAAGCGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGC
GAACCGGACAGAGTTGTGTACGGTGAAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATC
CACTTTAACCAACGGTGAGATTCTGCGTGAGAGCAACGGG*AACAGACCAACAAACGATG
TATAGGCGAGAATCCATTTGCCGTTGAGGAGAAACAGAGCTTCGTTAGGAGCTGGGTTAG
GGTTCTTCCCCTCGAGCTGCGTTATCAGTTCACTGATCTCCGCTCTCGTCTCACTCGATG
CATT*AAACCTCGATCTATTCCATACAAAGAACCCGCTAACACTCTCTTAAGCCGCTCCG
TCTCCTCCGCAGATTCGATGGCTTCTTCTGCTTCCTTCTCCCCCACCGATGAGTTCGATC
CTCTCTCGGGACCCCACTCGTCTTCAACGTCACCGCCTC
GTCCC

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR4A319TF 230 0 0
CCGCTCTCGTCTCACTC
GCGTTTAAACCTCGATCTATTCCATACAAAGAACCCGTTAACACTCTCTTAAGCCGCTCC
GTCTCCTCCGCAGATTCGATGGCTTCTTCAGCTTCCTTCTCCCCCACCGATGAGTTCGAT
CCTCTCTCGGGACCCCACTCGTCTTCAACGTCACCGCCTCGCCCCTTGGAATCTGGACCC
CACTCGTCATTGACGTCACTGGCTCGGACCTTG

QA 18 230 18 230
DS 



AS 4 12

CO CL215Contig1 493 3 4 U
ATCTGCGCATCTCCCACTCTCTCTAACTCCCTTTATCTTCTCGATTAATTTCACTCAGAA
AAATGTTGACTGAAACTCCGTTTAGGCCACGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGCTGT
TCCAGAGCATCCAAAGGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCCGTTG
CCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAACA
TGTCGAATGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACAGCTTCTTCTTCTTCTTTTTT
TTTTCCTTTTTATGTACGCTTTTGGGGGGTTTATTTCTATGTGTATCCAGTGGCTAGCAT
GATAGGTTGCAGACTAAAGGTTGCACTGGTCTTTTTCTTGCATTTTTGCCAAATAATTGC
AGCAGACAATGTCGAAAGATAAAAAGATGTTTCGTGGTATAAAGTTCCAGAGTTTGGAAA
GTTACTTCATTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO61JQ C 5
AF RR4BO61TF U 1
AF RR4EJ25TF U 5
BS 1 302 RR4BO61TF
BS 303 304 RR4EJ25TF
BS 305 457 RR4BO61TF
BS 458 493 RR4EJ25TF

RD RR4BO61JQ 285 0 0
GCGCATCTCCCACTCTCTCTAACTCCCTTTATCTTCTCGATTAATTTCACTCAGAAAAAT
GTTGACTGAAACTCCGTTTAGGCCACGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGCTGTTCCA
GAGCATCCAAAGGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCCGTTGCCAT
TCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAACATGTC
GAATGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACAGCTT
TTTTT

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4BO61TF 469 0 0
ATCTGCGCATCTCCCACTCTCTCTAACTCCCTTTATCTTCTCGATTAATTTCACTCAGAA
AAATGTTGACTGAAACTCCGTTTAGGCCACGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGCTGT
TCCAGAGCATCCAAAGGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCCGTTG
CCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAACA
TGTCGAATGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACAGCTTCTTCTTCTTCTTTTTT
TT**CCTTTTTATGTACGCTTTTGGGGGGTTTATTTCTATGTGTATCCAGTGGCTAGCAT
GATAGGTTGCAGACTAAAGGTTGCACTGGTCTTTTTCTTGCATTTTTGCCAAATAATTGC
AGCAGACAATGTCGAAAGATAAAAAGATGTTTCGTGG
TATAAAGTTCCA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4EJ25TF 489 0 0
GG
GCATCTCCCACTCTCTCTAACTCCCTTTATCTTCTCGATTAATTTCACTCAGAAAAATGT
TGACTGAAACTCCGTTTAGGCCACGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGCTGTTCCAGA
GCATCCAAAGGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCCGTTGCCATTC
CTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAACATGTCGA
ATGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACAGCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCC
TTTTTATGTACGCTTTTGGGGGGTTTATTTCTATGTGTATCCAGTGGCTAGCATGATAGG
TTGCAGACTAAAGGTTGCACTGGTCTTTTTCTTGCATTTTTGCCAAATAATTGCAGCAGA
CAATGTCGAAAGATAAAAAGATGTTTCGTGGTATAAAGTTCCAGAGTTTGGAAAGTTACT
TCATTTG

QA 3 489 3 489
DS 



CO CL215Contig2 284 2 2 U
GCTCTGTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAA
TCTACAACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTTTTTTTTGAAT
TTTCTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGA
AGGTTGCACTGGTCTTTTTTTTCTGATGCCAAATAATAATTTGCTTAGTCGCAAGACAAT
GTCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATTGCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BQ13JQ C 1
AF RR4BQ13TF U 1
BS 1 1 RR4BQ13JQ
BS 2 284 RR4BQ13TF

RD RR4BQ13JQ 284 0 0
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TCTACAACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTTTTTTTTGAAT
TTTCTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGA
AGGTTGCACTGGTCTTTTTTTTCTGATGCCAAATAATAATTTGCTTAGTCGCAAGACAAT
GTCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATTGCT

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4BQ13TF 284 0 0
G
CTCTGTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAAT
CTACAACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTTTTTTTTGAATT
TTCTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGAA
GGTTGCACTGGTCTTTTTTTTCTGATGCCAAATAATAATTTGCTTAGTCGCAAGACAATG
TCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATTGCT

QA 2 284 2 284
DS 



CO CL215Contig3 483 5 9 U
GGCTCCTCAATCTGCGCTGCGATCTCTCTCTCCCCCTCAGATTCCTTATCTTGTCGATTA
CTTTCTCTGAGATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGA
AGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGG
TCACCTCTGTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCAGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAG
GAATCTACAACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTTTT
TTTTAATTTTCTTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATAT
CAGACTGTAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAATAATAATTTGCTTAGT
CACAAGACAATGTCGAAAGCTGAAAGATGTTTCAATGGTACTTGTTAACGACTAGTTGAA
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR4CC67TF U 1
AF RR4FF54TF U 7
AF RR4FF54JQ C 221
AF RR4GA82TF U 13
AF RR4GA82JQ C 62
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BS 213 284 RR4CC67TF
BS 285 302 RR4FF54TF
BS 303 304 RR4GA82TF
BS 305 421 RR4FF54TF
BS 422 422 RR4GA82TF
BS 423 473 RR4FF54TF
BS 474 483 RR4GA82TF

RD RR4CC67TF 284 0 0
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CTTTCTCTGAGATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGA
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TCACCTCTGTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAG
GAATCTACAACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4FF54TF 467 0 0
GGAATC
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TCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTCGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCTGTTG
CCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAACA
TGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTTTTTT**AATTTTCT
TTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGTAGTT
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TCGAAAGCTGAAAGATGTTTCAATGGTACTTGTTAACGACT

QA 7 467 7 467
DS 

RD RR4FF54JQ 218 0 0
TTTT
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TAATAATTTGTTTAGTCGCAAGACAATGTCGAAA

QA 5 218 5 218
DS 

RD RR4GA82TF 471 0 0
TGCGCTGCGATCTCTCTCTCCCCCTCAGATTCCTTATCTTGTCGATTACTTTCTCTGAGA
TAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGGTTGT
TCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCTGTTG
CCATTCCTCTTGCCTTGGCAGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAACA
TGTCCATCGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTTTTTTTTAATTTTCT
TTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGTAGTT
TGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAATAATAATTTGCTTAGTCACAAGACAATG
TCGAAAGCTGAAAGATGTTTCAATGGTACTTGTTAACGACTAGTTGAATTC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4GA82JQ 422 0 0
TTTT
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AGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACC
TCTGTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCAGCATTTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATT
TACAACATGTCCATCGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTTTTTTTTA
ATTTTCTTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGAC
TGTAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAATAATAATTTGCTTAGTCACAA
GACAATGTCGAAAGCTGAAAGATGTTTCAATGGTACTTGTTAACGACTAGTTGAATTC

QA 5 422 5 422
DS 



CO CL215Contig4 471 2 4 U
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AATGCAAGAAAAAGACCAGTGCAACCTTTAGTCTGCAACCTATCATGCTAGCCACTGGAT
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GAGAAGATAAAGGGAGTTAGAGAGAGTGGGAGATGCGCAAATGGAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EM61TF C 1
AF RR4GS64JQ U 201
BS 1 203 RR4EM61TF
BS 204 404 RR4GS64JQ
BS 405 406 RR4EM61TF
BS 407 471 RR4GS64JQ

RD RR4EM61TF 471 0 0
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AATGCAAGAAAAAGACCAGTGCAACCTTTAGTCTGCAACCTATCATGCTAGCCACTGGAT
ACACAGAGAAAAAAAAACCTCCCAAAGCGTAAAAAAAAGGAAAGAAGAAAGAAGAAGAAG
CTGTTGTTTTTGCTTATTCCTTCTTCCCGATTCCATTCGACATGTTGTAGATTCCTGTTC
CAATCATGTAGAGAGCAGATGCAGCCAAGGCAAGAGGAATGGCAACGGAGGTGACCTTGT
CCATTGGTCCTTTGAGGTAAGTGTGCCTTTGGATGCTCTGGAACAGCCTCTGCTTCTCAA
GAAGCTTCTCTCGTGGCCTAAACGGAGTTTCAGTCAACATTTTTCTGAGTGAAATTAATC
GAGAAGATAAAGGGAGTTAGAGAGAGTGGGAGATGCGCAGATGGAGAATCC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4GS64JQ 271 0 0
TTT
TTCCCGATTCCATTCGACATGTTGTAGATTCCTGTTCCAATCATGTAGAGAGCAGATGCA
GCCAAGGCAAGAGGAATGGCAACGGAGGTGACCTTGTCCATTGGTCCTTTGAGGTAAGTG
TGCCTTTAGATGCTCTGGAACAGCCTCTGCTTCTCAAGAAGCTTCTCTCGTGGCCTAAAC
GGAGTTTCAGTCAACATTTTT**GAGTGAAATTAATCGAGAAGATAAAGGGAGTTAGAGA
GAGTGGGAGATGCGCAAATGGAGAATCC

QA 4 271 4 271
DS 



AS 2 13

CO CL216Contig1 917 11 23 U
GGAACGGAGGATATAAAACCTTTCTTCTTCCCTATTGGCTAAAGTCTCGGAGATTTTATC
CAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAATAAAAAAGAAAACCATTTGTTC
AGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGCCGACTAAAGTTG
ACGTAGAATCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGTGAAGGAACCTACTCCTGCCCCGGTGGAAG
TTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTC
TTACCGTTGTTGAAAAACCTATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGG
TTGATAGAGATGTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAG
CATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATG
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TTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTC
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CTCTCTCCTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGT
CTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATTTTATGTAT
TTTCTGTAATCGTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 
25 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FA47TF U 1
AF RR4DC31TF U 136
AF RR4EZ15TF U 126
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AF RR4GF53TF U 136
AF RR4H048JQ C 728
AF RR4H048TF U 285
AF RR4FA47JQ C 135
AF RR4FJ06JQ C 197
AF RR4EZ15JQ C 230
AF RR4DC31JQ C 234
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BS 492 492 RR4EZ15TF
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BS 610 648 RR4FA47TF
BS 649 649 RR4EZ15TF
BS 650 713 RR4FA47TF
BS 714 714 RR4EZ15TF
BS 715 741 RR4FA47TF
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BS 743 753 RR4FA47TF
BS 754 754 RR4EZ15TF
BS 755 765 RR4FA47TF
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BS 782 782 RR4DC31TF
BS 783 872 RR4EZ15TF
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BS 874 898 RR4GF53TF
BS 899 906 RR4FA47JQ
BS 907 916 RR4EZ15JQ
BS 917 917 RR4DC31JQ

RD RR4FA47TF 778 0 0
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CAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAATAAAAAAGAAAACCATTTGTTC
AGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGCCGACTAAAGTTG
ACGTAGAATCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGTGAAGGAACCTACTCCTGCCCCGGTGGAAG
TTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTC
TTACCGTTGTTGAAAAACCTATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAATTTCAGCTGGTTCGG
TTGATAGAGATGTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAG
CATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATG
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AGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTA
TTCACAAG*AAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGG*AGAAGAGCTTC
TCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAG*CAACCT
GTGGATGTTTCTAAGTCTTTT*ATTTAATATGT*GCTCATGTCAT
GTTTGTATACTTC

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DS 

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GG
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AAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAAC
AGCAAGAAAGCAACCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAA
AAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAA
GAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAGGAGCTTCTCAA*GCTGAAGAAATG
GCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTC
TTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTG
TGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGC
C

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DS 

RD RR4EZ15TF 753 0 0
GG
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AGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCGAAGCTCTTACCGT
TGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAG
AGATGTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGA
AGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGC
TTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACT
AGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGGAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAA
GCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGC
TGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATG
TTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCACTCTC
CTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTT
ATATATTTGGTGATTTTGTATAAAA
GACATC

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DS 

RD RR4FJ06TF 734 0 0
GG
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GTTGTAGCTCCGGTGAAGGAACCTACTCCTGCCCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCG
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CCTATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAG
CTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAG
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AGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAA
AAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAA
GAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATG
GCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTC
TTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTG
TGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGG
TGATTTTGTATA

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DS 

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GG
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GTTGTAGCTCCGGTGAAGGAACCTACTCCTGCCCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCG
GAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAA
CCTATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAG
CTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAG
AAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAAC
AGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAA
AAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAA
GAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATG
GCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTC
TTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTG
TGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGG
TGATTTTGTATAAAA*GACATCAAGGTTAAAGATTTTATGT

QA 3 763 3 763
DS 

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TTTT
TAAGTTTTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTTTCCTTT
TTTGTGTGATTCAGTTATTTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTTTTGTTTATAT
ATTTGGGGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTT

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DS 

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CTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAG
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AAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTC
GTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCA
TTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTT
TTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4FA47JQ 773 0 0
TTT
GGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGCCGACTAAAGTTGACGTAGAATCTCCTGCG
GTTGTAGCTCCGGTGAAGGAACCTACTCCTGCCCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCG
GAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAA
CCTATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAATTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAG
CTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAG
AAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATTTGATGTGCTTGCTTGG*AGAAC
AGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAA
AAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAA
GAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATG
GCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTC
TTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTG
TGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGG
TGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATTTTATGTATTTTCTG
T

QA 4 772 4 772
DS 

RD RR4FJ06JQ 705 0 0
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AGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTTTCAAAGCTGAAGAAAT
GGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTTTAAGT
CTTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGT
GTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTG
GTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATTTTATGTATT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4EZ15JQ 687 0 0
T
CCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAG
TCCGAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCA
GCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCA
TTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAG
ATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGG
AAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGGAGAACAAA
GTGGCGGCTATTCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGA
GAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCC
AAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTT
GTAATACTTCCACTCTCCTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTT
TGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGA
TTTTATGTATTTTCTGTAATCGTATG

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR4DC31JQ 684 0 0
GTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCC
AAAGCTCTTACCGTTTCTGAAAAACCTATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCT
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ATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATA
TCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAACCACTGAAGCTCAACTCAGGAAG
ATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTG
GCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAG
GAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAG
GCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTTGTA
ATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGT
TTGCCGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATTT
TATGTATTTTCTGTAATCGTATGT

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL216Contig2 640 2 4 U
TCCAGAAAATACATAAAATCTTTAACCTTGATGTCTTTTTATACAAAATCACCAAATATA
TAAACAAGACAGCAAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAACTGAATCACACAAAAAA
GGAGAGAGGAAGTATTACAAACAATGGCATGAGCAACATATTAAATAAAAAGACTTAGAA
ACATCCACAGGTTGCCTTGGGAACGACACCAGTGGCTCTATACTTAGCAGCCATTTCTTC
AGCTTTGAGAAGCTCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTCTCTTCTCTTCTGCTTG
CTTGTGAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTC
TAGTTTCTCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCA
AGCAAGCACATCAAATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTC
TTCCCATGCTTTGATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGTCTGCAAGCTTCACATC
TCTATCAACCGAACCAGCTGAACAAATGGTTTCCTTTTTTTTTATTTCCTTCCAGAGAAT
TAAACAAAACTATTTTTGGATAAAATCTCTGAGACTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL44TF C 1
AF RR4GL44JQ U 2
BS 1 5 RR4GL44TF
BS 6 40 RR4GL44JQ
BS 41 41 RR4GL44TF
BS 42 640 RR4GL44JQ

RD RR4GL44TF 640 0 0
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TAAACAAGACAGCAAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAACTGAATCACACAAAAAA
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ACATCCACAGGTTGCCTTGGGAACGACACCAGTGGCTCTATACTTAGCAGCCATTTCTTC
AGCTTTGAGAAGCTCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTCTCTTCTCTTCTGCTTG
CTTGTGAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTC
TAGTTTCTCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCA
AGCAAGCACATCAGATATCTTTTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTC
TTCCCATGCTTTGATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGTCTGCAAGCTTCACATC
TCTATCAACCGAACCAGCTGAACAAATGGTTTCCTTTTTTTTTATTTCCTTCCAGAGAAT
TAAACAAAACTATTTTTGGATAAAATCTCTGAGACTTTCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4GL44JQ 639 0 0
CCAA
AAAATACATAAAATCTTTAACCTTGATGTCTTTTTTTACAAAATCACCAAATATATAAAC
AAGACAGCAAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAACTGAATCACACAAAAAAGGAGA
GAGGAAGTATTACAAACAATGGCATGAGCAACATATTAAATAAAAAGACTTAGAAACATC
CACAGGTTGCCTTGGGAACGACACCAGTGGCTCTATACTTAGCAGCCATTTCTTCAGCTT
TGAGAAGCTCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTCTCTTCTCTTCTGCTTGCTTGT
GAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTCTAGTT
TCTCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCAAGCAA
GCACATCAAATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTCTTCCC
ATGCTTTGATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGTCTGCAAGCTTCACATCTCTAT
CAACCGAACCAGCTGAACAAATGGTTTCCTTTTTTTTTATTTCCTTCCAGAGAATTAAAC
AAAACTATTTTTGGATAAAATCTCTGAGACTTTCC

QA 5 639 5 639
DS 



AS 2 12

CO CL217Contig1 865 10 22 U
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CCGTGTGGCTAGATCTCCGCCGGCGAGGCTCCAACCTGGTGCCCAGAGAGTGACTTTTGG
TGGTAGCCATCAGTTCAGCAGCCTGATTTCATTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTAT
CACCCCTTCCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAA
CGTAGACGCTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCT
TCCAACTGAACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAA
AATTGACCCTTCTACGC*********ATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGA
ACTACTAACTGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTCTCTGTCT
CGAGTTTGGAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACA
ACCCCATGAACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTT
GCAGAAGGCTTTCCACAAGTTTTTGGAGATCAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTT
TTTGGCAGATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGT
CAAGTCTTTTGTTTTGACATGTGAAAACTCTCAATAAGAGTGAAACTTCTAGGTGATTTT
TATGAACTTGTTATCACCATTATCAATAATTGTAAGGAGTTGCTATTGTGTCTTTTGCTA
CACTATTAGATATATTCCACTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 25 50 50 50 50 50 50 25 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 10 10 

AF RR4E119TF U 9
AF RR4BZ54TF U 9
AF RR4C371TF U 1
AF RR4E050TF U 9
AF RR4EL71TF U 9
AF RR4EL71JQ C 100
AF RR4C371JQ C 89
AF RR4CC82TF U 198
AF RR4BZ54JQ C 190
AF RR4C439JQ C 222
BS 1 8 RR4C371TF
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BS 188 606 RR4C371TF
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BS 733 746 RR4C371TF
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BS 755 756 RR4C371TF
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CCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACG
CTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTG
AACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACC
CTTCTACGCCTATTGATGATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTACTAA
CTGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTCTCTGTCTCGAGTTTG
GAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATG
AACCTACCTATCCCT

QA 1 555 1 555
DS 

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CTAGATCTCCGCCGGCGAGGCTCCAACCTGGTGCCCAGAGAGTGACTTTTGGTGTTAGCC
TTCAGTTCATCAGCCTGATTTCATTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTATCACCCCTT
CCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACG
CTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTG
AACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACC
CTTCTACGC*********ATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTACTAA
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GAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATG
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CTTTCCACAAGTTTTTGGAGATCAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAG
ATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCATCTTCGAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4C371TF 761 0 0
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TGGTAGCCATCAGTTCAGCAGCCTGATTTCATTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTAT
CACCCCCTCCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAA
CGTAGACGCTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCT
TCCAACTGAACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAA
AATTGACCCTTCTACGC*********ATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGA
ACTACTAACTGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTCTCTGTCT
CGAGTTTGGAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACA
ACCCCATGAACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTT
GCAGAAAGCTTTCCACAAGTTTTTGGAGATTAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTT
TTTGGCAGATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGT
CAAGTCTTTG**TTTGACATGTGAAA*CTCTCA*TA
GAGTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4E050TF 760 0 0
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CTAGATCTCCGCCGGCGAGGCTCCAACCTGGTGCCCAGAGAGTGACTTTTGGTGGTAGCC
ATCAGTTCAGCAGCCTGATTTCGTTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTATCACCCCTT
CCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACG
CTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTG
AACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACC
CTTCTACGCCTATTGATGATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTACTAA
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GAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATG
AACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAAG
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ATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCTTCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTT
TTGTTTTGACATGTGAAA*CTCTCA*TAAGAGTGAAACTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4EL71TF 776 0 0
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CTAGATCTCCGCCGGCGAGGCTCCAACCTGGTGCCCAGAGAGTGACTTTTGGTGGTAGCC
ATCAGTTCAGCAGCCTGATTTCATTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTATCACCCCTT
CCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACG
CTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTG
AACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACC
CTTCTACGC*********ATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTACTAA
CTGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTCTCTGTCTCGAGTTTG
GAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATG
AACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAGG
CTTTCCACAAGTTTTTGGAGATCAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAG
ATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTT
TTGTTTTGACATGTGAAAACTCTCAATAAGAGTGAA*CTTCTAGGTGATTTTTATG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4EL71JQ 725 0 0
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CACTTGGGCGCTAAGTGCTATCACCCCTTCCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGA
GATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACGCTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTT
TCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTGAACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGG
TGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACCCTTCTACGC*********ATGAACAACCAAA
AGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTACTAACTGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAA
AGATGATGATGGTCTCTGTCTCGAGTTTGGAGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCAT
TGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATGAACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTT
TGATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAGGCTTTCCACAAGTTTTTGGAGATCAGAGGGAT
CAATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAGATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCA
TCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTTTTGTTTTGACATGTGAAAACTCTCAATAAGA
GTGAAACTTCTAGGTGATTTTTATGAACTTGTTATCACCATTATCAATAATTGTAAGGAG
TTGCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4C371JQ 775 0 0
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TCATTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTATCACCCCCTCCTCGAATCTGGTTAGCCTC
CTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACGCTCCTAACAATGACGAGTTG
CCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTGAACGAGTTGTGCAATTGATT
AGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTTTTGTCAAAATTGACCCTTTTACGC*********AT
GAACAACCAAAAGTTTTTCAAGATGATGAAGAACTACTAACTGGGATCCCCATGGTCATC
AGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTTTCTGTCTCGAGTTTGGAGTCAACGCTTTCTCCAAT
GAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATGAACCTACCTATCCCTACCAA
GGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAGGCTTTCCACAAGTTTTTGGAG
ATTAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAGATTATTTGGCCAACAAAGAC
GAGAGAGAGCATTTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTTTTGTTTTGACATGTGAAAAC
TCTCAATAAGAGTGAAACTTCTAGGTGATTTTTATGAACTTGTTATCACCATTATCAATA
ATTGTAAGGAGTTGCTATTGTGTCTTTTGCTACACTATTAGATATATTCCACTTG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4CC82TF 666 0 0
G
GGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACGCTCCTAACAA
TGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTGAACGAGTTGT
GCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACCCTTCTACGC*
********ATGAACAACCAAAAGTTCTTCAATATGATGAAGAACTACTAACTGGGATCCC
CATGGTCATCAGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTCTCTGTCTCGAGTTTGGAGTCAACGC
TTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATGAACCTACCTA
TCCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAGGCTTTCCACAA
GTTTTTGGAGATCAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAGATTATTTGGC
CAACAAAGACGAGAGAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTTTTGTTTTGAC
ATGTGAAGACTCTCAATAAGAGTGAAACTTCTAGGTGATTTTTATGAACTTGTTATCACC
ATTATCAATAATTGTAAGGAGTTGCTATTGTGT*TTTTGCTACACTATTAGATATATTCC
AC
ATG

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4BZ54JQ 663 0 0
CTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACGC
TCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTGA
ACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACCC
TTCTACGC*********ATGAACAACCAAAAGTTTTTCAAGATGATGAAGAACTACTAAC
TGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAAAGATGATGATGGTCTCTGTCTCGAGTTTGG
AGTCAACGCTTTCTCCAATGAGATTGTCATTGACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATGA
ACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAGGC
TTTCCACAAGTTTTTGGAGATCAGAGGGATCAATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAGA
TTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTTT
TGTTTTGACATGTGAAAACTCTCAATAAGAGTGAAACTTCTAGGTGATTTTTATGAACTT
GTTATCACCATTATCAATAATTGTAAGGAGTTGCTATTGTGTCTTTTGCTACACTATTAG
AT
T

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4C439JQ 644 0 0
TCCAAAGCTCCATTGTTAACGTAGACGCTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTC
CTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTGAACGAGTTGTGCAATTGATTAGGAAGTTTGGTG
ATGAAACCATTCTTGTCAAAATTGACCCTTTTACGC*********ATGAACAACCAAAAG
TTTTTCAAGATGATGAAGAACTACTAACTGGGATCCCCATGGTCATCAGTGTGTGGAAAG
ATGATGATGGTTTCTGTCTCGAGTTTGGAGTCAACGCTTTTTCCAATGAGATTGTCATTG
ACAGTCTAGCTGTCCAACAACCCCATGAACCTACCTATCCCTACCAAGGACCTGACTTTG
ATGACTTGGATGAGAATTTGCAGAAGGCTTTCCACAAGTTTTTGGAGATTAGAGGGATCA
ATCCCACCGTCACTGACTTTTTGGCAGATTATTTGGCCAACAAAGACGAGAGAGAGCATT
TTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTTTTGTTTTGACATGTGAAAACTCTCAATAAGAGT
GAAACTTTTAGGTGATTTTTATGAACTTGTTATCACCATTATCAATAATTGTAAGGAGTT
GCTATTGTGTCTTTTGCTACACTATTAGATATATTCCACTTGGT

QA 1 644 1 644
DS 



CO CL217Contig2 675 2 1 U
ACCAAGTGGAATATATCTAATAGTGTAGCAAAAGACACAATAGCAACTCCTTACAATTAT
TGATAATGGTGATAACAAGTTCATAAAAATCACCTAGAAGTTTCACTCTTATTGAGAGTT
TTCACATGTCAAAACAAAAGACTTGACATCCTTGAGCCATCGAAGAAGCTCTCTCTCGTC
TTTGTTGGCCAAATAATCTGCCAAAAAGTCAGTGACGGTGGGATTGATCCCTCTGATCTC
CAAAAACTTGTGGAAAGCCTTCTGCAAATTCTCATCCAAGTCATCAAAGTCAGGTCCTTG
GTAGGGATAGGTAGGTTCATGGGGTTGTTGGACAGCTAGACTGTCAATGACAATCTCATT
GGAGAAAGCGTTGACTCCAAACTCGAGACAGAGACCATCATCATCTTTCCACACACTGAT
GACCATGGGGATCCCAGTTAGTAGTTCTTCATCATCTTGAAGAACTTTTGGTTGTTCATC
ATCAATAGGCGTAGAAGGGTCAATTTTGACAAGAATGGTTTCATCACCAAACTTCCTAAT
CAATTGCACAACTCGTTCAGTTGGAAGATCAATCATTTGGAAAGGAAACCATTCGGGCAA
CTCGTCATTGTTAGGAGCGTCTACGTTAACAATGGAGCTTTGGATCTCAGATTCGAGGAG
GCTAACCAGATTCGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E050JQ U 1
AF RR4E119JQ U 1
BS 1 675 RR4E050JQ

RD RR4E050JQ 675 0 0
ACCAAGTGGAATATATCTAATAGTGTAGCAAAAGACACAATAGCAACTCCTTACAATTAT
TGATAATGGTGATAACAAGTTCATAAAAATCACCTAGAAGTTTCACTCTTATTGAGAGTT
TTCACATGTCAAAACAAAAGACTTGACATCCTTGAGCCATCGAAGAAGCTCTCTCTCGTC
TTTGTTGGCCAAATAATCTGCCAAAAAGTCAGTGACGGTGGGATTGATCCCTCTGATCTC
CAAAAACTTGTGGAAAGCCTTCTGCAAATTCTCATCCAAGTCATCAAAGTCAGGTCCTTG
GTAGGGATAGGTAGGTTCATGGGGTTGTTGGACAGCTAGACTGTCAATGACAATCTCATT
GGAGAAAGCGTTGACTCCAAACTCGAGACAGAGACCATCATCATCTTTCCACACACTGAT
GACCATGGGGATCCCAGTTAGTAGTTCTTCATCATCTTGAAGAACTTTTGGTTGTTCATC
ATCAATAGGCGTAGAAGGGTCAATTTTGACAAGAATGGTTTCATCACCAAACTTCCTAAT
CAATTGCACAACTCGTTCAGTTGGAAGATCAATCATTTGGAAAGGAAACCATTCGGGCAA
CTCGTCATTGTTAGGAGCGTCTACGTTAACAATGGAGCTTTGGATCTCAGATTCGAGGAG
GCTAACCAGATTCGA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4E119JQ 666 0 0
AC
CAAGTGGAATATATCTAATAGTGTAGCAAAAGACACAATAGCAACTCCTTACAATTATTG
ATAATGGTGATAACAAGTTCATAAAAATCACCTAGAAGTTTCACTCTTATTGAGAGTTTT
CACATGTCAAAACAAAAGACTTGACATCCTTGAGCCATCGAAGAAGCTCTCTCTCGTCTT
TGTTGGCCAAATAATCTGCCAAAAAGTCAGTGACGGTGGGATTGATCCCTCTGATCTCCA
AAAACTTGTGGAAAGCCTTCTGCAAATTCTCATCCAAGTCATCAAAGTCAGGTCCTTGGT
AGGGATAGGTAGGTTCATGGGGTTGTTGGACAGCTAGACTGTCAATGACAATCTCATTGG
AGAAAGCGTTGACTCCAAACTCGAGACAGAGACCATCATCATCTTTCCACACACTGATGA
CCATGGGGATCCCAGTTAGTAGTTCTTCATCATCTTGAAGAACTTTTGGTTGTTCATCAT
CAATAGGCGTAGAAGGGTCAATTTTGACAAGAATGGTTTCATCACCAAACTTCCTAATCA
ATTGCACAACTCGTTCAGTTGGAAGATCAATCATTTGGAAAGGAAACCATTCGGGCAACT
CGTCATTGTTAGGAGCGTCTACGTTAACAATGGAGCTTTGGATCTCAGATTCGAGGAGGC
TAAC

QA 3 666 3 666
DS 



AS 1 13

CO CL218Contig1 865 13 26 U
GGAAATTTACACATGGCGAGTCTCTGTATCTCATCGTCCCGGATCGTCTCTCTCCACCAC
CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTCTAACT
CACCGTACGAGTGCTGTTTGCTTCAATCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACT
GCTACGAAGGCTGAGAAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCT
CCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTT
GCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCA
TCAGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTT
CTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTC
TTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTC
ATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTG
CAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTT
GTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTA
ACGTCTGTCTACGAAGAGACGAGAAATAATGGGCTGTATTTATTTACTTAATGTTACTCA
ACTCAATGTGCTTATGTTTATCCGCAGTGTATGAGATGCTTATATTTAGCACTATTAGCT
GGTAACGTACTGGTCTTTTAGTTCT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 35 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH28TF U 7
AF RR4FZ86TF U 1
AF RR4FG37TF U 1
AF RR4H232TF U 389
AF RR4FG37JQ C 1
AF RR4FV04TF U 1
AF RR4GV77TF U 1
AF RR4EH28JQ C 100
AF RR4H232JQ C 389
AF RR4GV77JQ C 73
AF RR4FV04JQ C 128
AF RR4FZ86JQ C 128
AF RR4F383TF U 312
BS 1 102 RR4FZ86TF
BS 103 103 RR4FG37TF
BS 104 114 RR4FZ86TF
BS 115 115 RR4FG37TF
BS 116 128 RR4FZ86TF
BS 129 129 RR4FG37TF
BS 130 131 RR4FZ86TF
BS 132 132 RR4FG37TF
BS 133 146 RR4FZ86TF
BS 147 147 RR4FG37TF
BS 148 195 RR4FZ86TF
BS 196 196 RR4FG37TF
BS 197 323 RR4FZ86TF
BS 324 324 RR4EH28TF
BS 325 362 RR4FZ86TF
BS 363 363 RR4FG37TF
BS 364 533 RR4FZ86TF
BS 534 534 RR4FG37TF
BS 535 592 RR4FZ86TF
BS 593 593 RR4FG37TF
BS 594 615 RR4FZ86TF
BS 616 634 RR4FG37TF
BS 635 711 RR4FV04TF
BS 712 712 RR4F383TF
BS 713 746 RR4FV04TF
BS 747 865 RR4F383TF

RD RR4EH28TF 563 0 0
GG
ACACATGGCGAGTCTCTGTATCTCATCGTCCCGGATCGTCTCTCTCCACCACCACAAACC
GTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAAGTCTCTCCGTTGTAACTCACCGTAC
AAGCGCTGTTTGCTTCAACCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACTGCTACGAA
GGCTGAGGAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCTCCGATGTC
TGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTAGCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAGG
TACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCATCCGGCAT
TATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCG
ACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGAT
TGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGGGCTCTCATTTCTTT
GGCAATATCTTGTTTTCTGGC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR4FZ86TF 615 0 0
GGAAATTTACACATGGCGAGTCTCTGTATCTCATCGTCCCGGATCGTCTCTCTCCACCAC
CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAAGTCTCTCCGTTGTAACT
CACCGTACAAGCGCTGTTTGCTTCAACCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACT
GCTACGAAGGCTGAGGAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCT
CCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTT
GCAAGAGGTACAGGTATCCACAATTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCA
TCCGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTT
CTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTC
TTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGGGCTCTC
ATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAG*CAGCTTG
CAGAAAGCGTTCGAC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4FG37TF 634 0 0
GGAAATTTACACATGGCGAGTCTCTGTATCTCATCGTCCCGGATCGTCTCTCTCCACCAC
CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTCTAACT
CACCGTACGAGTGCTGTTTGCTTCAATCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACT
GCTACGAAGGCTGAGAAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCT
CCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGGTGCTT
GCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCA
TCAGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTT
CTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTC
TTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGTAGGAGCTCTC
ATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTG
CAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4H232TF 333 0 0
G
ATATTGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGG
TGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTAT
GAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTCATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGC
TTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGT
CGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTTTTCTTG*TATAACTATA
CTCGTGTGACTGTCATCTG*AAATCAATG
AAC

QA 2 330 2 330
DS 

RD RR4FG37JQ 757 0 0
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CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTCTAACT
CACCGTACGAGTGCTGTTTGCTTCAATCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACT
GCTACGAAGGCTGAGAAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCT
CCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGGTGCTT
GCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCA
TCAGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTT
CTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTC
TTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGTAGGAGCTCTC
ATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTG
CAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTT
GTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTA
ACGTCTGTCTACGAAGAGACGAGAAATAATGGGCT
AT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4FV04TF 748 0 0
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CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTCTAACT
CACCGTACGAGTGCTGTTTGCTTCAATCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACT
GCTACGAAGGCTGAGAAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCT
CCGATGTCTGTTCATAATTTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTT
GCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCA
TCAGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTT
CTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTC
TTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATTAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTC
ATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTG
CAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTT
GTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAA*TCAATGTA
ACGTCTGTCTACGAAGAGACGAGAAA
AA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4GV77TF 745 0 0
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CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTCTAACT
CACCGTACGAGTGCTGTTTGCTTCAATCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACT
GCTACGAAGGCTGAGAAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCT
CCGATGTCTGTTCATAATTTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTT
GCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCA
TCAGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTT
CTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTC
TTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATTAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTC
ATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTG
CAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTT
GTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAA*TCAATGTA
ACGTCTGTCTACGAAGAGACGAGAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EH28JQ 680 0 0
TCAA
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TAGATCGTCAGCGAACTGCTACGAAGGCTGAGGAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTG
TGGTCTGTTATGCTGCTCCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTA
GCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTAC
TTGCTCTAACCGCACCATCCGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGA
CAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTTTTTTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGC
CATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGA
AGCAAGAAGGGGCTCTCATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCT
CACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCA
TCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTC
ATCTGTAAATCAATGTAACGTCTGTCTACGAAGAGACGAGAAATAATGGGCTGTATTTAT
TTACTTAATTTTACTC

QA 5 680 5 680
DS 

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G
ATATTGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGG
TGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTAT
GAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTCATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGC
TTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTCGACCAGGGCTCAGTTGT
CGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACTATA
CTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTAACGTCTGTCAACGAAGAGACGAGAAATAA
TGGGCTGTATTTATTT

QA 2 377 2 377
DS 

RD RR4GV77JQ 718 0 0
CTCTCTCTTAAACCCCGGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTCTAACTCACCGTACGAGT
GCTGTTTGCTTCAATCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACTGCTACGAAGGCT
GAGAAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCTCCGATGTCTGTT
CATAATTTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAGGTACA
GGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCATCAGGCATTATC
TCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTT
TTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTG
GCGCCATTTCAAGTTATGAGCATTAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTCATTTCTTTGGCA
ATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTC
GACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTT
TTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTAACGTCTGTCTAC
GAAGAGACGAGAAATAATGGGCTGTATTTATTTACTTAATGTTACTCAACTCAATGTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4FV04JQ 665 0 0
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GTACAGGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCATCAGGCA
TTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTC
GACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGA
TTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATTAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTCATTTCTT
TGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAG
CGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTG
TCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTAACGTCTG
TCTACGAAGAGACGAGAAATAATGGGCTGTATTTATTTACTTAATGTTACTCAACTCAAT
GTG
CT

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DS 

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CTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCACAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAG
GTACAGGTATCCACAATTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCATCCGGCA
TTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTC
GACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGA
TTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGGGCTCTCATTTCTT
TGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAG
CGTTCGACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTG
TCCTTTTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTAACGTCTG
TCTACGAAGAGACGAGAAATAATGGGCTGTATTTATTTACTTAATGTTACTCAACTCAAT
GTGCTTATGTTTATCCGCAGTGTATGAGATGCTTATATTTAGCACTATTAGCTGGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4F383TF 554 0 0
G
GGTATCCACAAGTCCTTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCATCAGGCATTATC
TCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTT
CTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTG
GCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGAGCTCTCATTTCTTTGGCA
ATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTC
GACCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTT
TTCTTGATATAACTATACTCGTGTGACTGTCATCTGTAAATCAATGTAACGTCTGTCCAC
GAAGAGACGAGAAATAATGGGCTGTATTTATTTACTTAATGTTACTCAACTCAATGTGCT
TATGTTTATCCGCAGTGTATGAGATGCTTATATTTAGCACTATTAGCTGGTAACGTACTG
GTCTTTTAGTTCT

QA 2 554 2 554
DS 



AS 1 11

CO CL219Contig1 1288 11 34 U
CATTCTAACTTTTGCACTATATTGATAAAAAAGCAGATTAAAGTTTTGAATGATTATACA
ACGGAAACACAGGGTAAGGACACAAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAG
TTTGTTGTGTTCTTAGCAATAATCATACTGAGCTGCAATGTATAGAACTATAGATACTCA
TCCTCAGATACCAAAAGCTTCAGACCAGAAGCTGCCTTTCAGGACAGAATCTCTCCTGAA
TATACTCATCCTCAGATACGAGCTATTCCCGACGACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTCC
AAACGTACATGCGGGACTGTTCTAACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCT
TGAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTG
ATTATGCGTGGCGCTGATCCATCACAGAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATG
ACAATCGGGTGTCGGGTTTCAAGGACTGCCATTTCAGACATTGCTAAATGAAGAATCGAA
AACTCTAGTATTCTTCCAGCTGGTGCACTCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATG
ATGACGACATGACTATCCCATTTATCAGCCACTGCAGCC*AAAAGTTTCTTTGCAAACCT
TAAAA*CAAGTTTGCTGTACACCAGCTTAGGGGGAGCTGAAAGCACTTCTGCTTCAATCT
TGGATTCGTTTTCATCATGGCGCACAAGCTCATCTTCCTCTTCGCTAGTCTCTGTTTTAA
CCGGAGGTCCTCCAAAGCTCATGTGGTTGTATTCCAACAAAGAAGCCTTGTCAAACTCGT
ATCCAGGCTCTCTTCTTGCATTGATCCTCTTCTCAAAGAGACGAATTGGGTCAGAGCCTT
CTAAGCAAGCGGCATAAAGTGTTACAAGAGCGAGCTCGCGTGCGGCGCGGGGACTGCTTA
ATCGACCGCTCTTATCTATCTTCGGCATCGGGACATCTTTCACTTCCTCCGCGGTAAGCG
TCGGCGTACGGAGAGCTCCTCTCGTCGGAGAAATAAACAACCTTCTGTTACCCGTTCGCA
GAGATACCAAGTTCGTCGGCCGGAGCGAATCAACAAACGTAAATCCTAGTGAGCGGTGAG
AGTCTAGTGAGAGATTACTGGAGAAGTAAAACAGACTCGACGAAGAGCGTAGGCAAAGCG
GCGAGATGCTTCCCTCCATTTTTGTGTTTGAGCTCTGTCTCTCTCGCTTCTCCGTGTTTA
GTGAGAAGCAGATAACGATTATCCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 25 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI22JQ U 79
AF RR4BT81JQ U 1
AF RR4FL90JQ U 79
AF RR4CZ93JQ U 23
AF RR4BG34JQ U 21
AF RR4CG52JQ U 76
AF RR4BT81TF C 219
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AF RR4CG52TF C 1005
AF RR4FL90TF C 584
AF RR4CZ93TF C 678
BS 1 35 RR4BT81JQ
BS 36 36 RR4BG34JQ
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BS 166 186 RR4BT81JQ
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BS 188 202 RR4BT81JQ
BS 203 203 RR4BG34JQ
BS 204 205 RR4BT81JQ
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BS 207 207 RR4BT81JQ
BS 208 208 RR4BG34JQ
BS 209 226 RR4BT81JQ
BS 227 227 RR4BG34JQ
BS 228 254 RR4BT81JQ
BS 255 255 RR4BG34JQ
BS 256 273 RR4BT81JQ
BS 274 274 RR4BG34JQ
BS 275 446 RR4BT81JQ
BS 447 447 RR4BG34JQ
BS 448 499 RR4BT81JQ
BS 500 500 RR4BG34JQ
BS 501 516 RR4BT81JQ
BS 517 517 RR4BG34JQ
BS 518 631 RR4BT81JQ
BS 632 730 RR4BG34JQ
BS 731 731 RR4CG52JQ
BS 732 782 RR4BG34JQ
BS 783 882 RR4CG52JQ
BS 883 1133 RR4BG34TF
BS 1134 1134 RR4FL90TF
BS 1135 1255 RR4BG34TF
BS 1256 1272 RR4FL90TF
BS 1273 1288 RR4CZ93TF

RD RR4CI22JQ 436 0 0
GACACAAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAGTTTGTTGTGTTCTTAGCA
ATAATCATACTGAGCTGCAATGTATAGAACTATAGATACTCATCCTCAGATACCAAAAGC
TTCAGACCAGAAGCTGCCTTTCAGGACAGAATCTCTCCTGAATATACTCATCCTCAGATA
CGAGCTATTCCCGACGACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTCCAAACGTACATGCGGGACT
GTTCTAACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCTTGGGGTGTTGGTGCTGGT
GTTGCTGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTGATTATGCGTGGCGCTGAT
CCATCACAGAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGGGTT
TCAAGGACTGCCATTT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4BT81JQ 631 0 0
CATTCTAACTTTTGCACTATATTGATAAAAAAGCAAATTAAAGTTTTGAATGATTATACA
ACGGAAACACAGGGTAAGGACACAAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAG
TTTGTTGTGTTCTTAGCAATAATCATACTGAGCTGCAATGTATAAAACTATAGATACTCA
TCCTCAAATACCAAAAGCTTCAAACAAAAAGCTGCCTTTCAGGACAAAATCTCTCCTGAA
TATACTCATCCTCAAATACGAGCTATTCCCGACAACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTCC
AAACGTACATGCGGGACTGTTCTAACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCT
TGAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTG
ATTATGCGTGGCGCTGATCCATCACAAAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATG
ACAATCGGGTGTCGGGTTTTAAGGACTGCCATTTCAAACATTGCTAAATGAAGAATCGAA
AACTCTAGTATTCTTCCAGCTGGTGCACTCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATG
ATGACGACATGACTATCCCATTTATCAGCCA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4FL90JQ 603 0 0
GG
CACAAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAGTTTGTTGTGTTCTTAGCAAT
AGTCATACTGAGCTGCAATGTATAGAACTATAGATACTCATCCTCAGATACCAAAAGCTT
CAGACCAGAAGCTGCCTTTCAGGACAGAATCTCTCCTGAATATACTCATCCTCAGATACG
AGCTATTCCCGACGACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTCCAAACGTACATGCGGGACTGT
TCTAACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCTTGAGGTGTTGGTGTTGGTGT
TGCTGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTGATTATGCGTGGCGCTGATCC
ATCACAGAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGGGTTTC
AAGGACTGCCATTTCAGACATTGCTAAATGAAGAATCGAAAACTCTAGTATTCTTCCAGC
TGGTGCACTCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATGATGACGACATGACTATCCCA
TTTATCAGCCACTGCAGCC*AAAAGTTTCTTTGCAAACCTTAAAA*CAAGTTTGCTGTAC
A

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR4CZ93JQ 702 0 0
G
GATAAAAAAGCAGATTAAAGTTTTGAATGATTATACAACGGAAACACAGGGTAAGGACAC
AAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAGTTTGTTGTGTTCTTAGCAATAAT
CATACTGAGCTGCAATGTATAGAACTATAGATACTCATCCTCAGATACCAAAAGCTTCAG
ACCAGAAGCTGCCTTTCAGGACAGAATCTATCCTGAATATACTCATCCTCAGATACGAGC
TATTCCCGACGACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTAAAAACGTACATGCGGGACTGTTCT
AACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCTTGAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGC
TGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTGATTATGCGTGGCGCTGATCCATC
ACAGAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGGGTTTCAAG
GACTGCCATTTCAGACATTACTAAATGAAGAATCGAAAACTCTAGTATTCTTCCAGCTGG
TGCACTCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATGATGACGACATGACTATCCCATTT
ATCAGCCACTGCAGCC*AAAAGTTTCTTTGCAAACCTTAAAA*CAAGTTTGCTGTACACC
AGCTTAGGGGGAGCTGAAAGCACTTCTGCTTCAATCTTGGA

QA 2 702 2 702
DS 

RD RR4BG34JQ 762 0 0
ATT
GATAAAAAAGCAGATTAAAGTTTTGAATGATTATACAACGGAAACACAGGGTAAGGACAC
AAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAGTTTGTTGTGTTCTTAGCAATAAT
CATACTGAGCTGCAATGTATAGAACTATAGATACTCATCCTCAGATACCAAAAGCTTCAG
ACCAGAAGCTGCCTTTCAGGACAGAATCTCTCCTGAATATACTCATCCTCAGATACGAGC
TATTCCCGACGACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTCCAAACGTACATGCGGGACTGTTCT
AACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCTTGAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGC
TGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTGATTATGCGTGGCGCTGATCCATC
ACAGAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGGGTTTCAAG
GACTGCCATTTCAGACATTGCTAAATGAAGAATCGAAAACTCTAGTATTCTTCCAGCTAG
TGCACTCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATGATGACGACATGACTATCCCATTT
ATCAGCCACTGCAGCC*AAAAGTTTCTTTGCAAACCTTAAAA*CAAGTTTGCTGTACACC
AGCTTAGGGGGAGCTGAAAGCACTTCTGCTTCAATCTTGGATTCGTTATCATCATGGCGC
ACAAGCTCATCTTCCTCTTCGCTAGTCTCTGTTTTAACC

QA 4 762 4 762
DS 

RD RR4CG52JQ 807 0 0
AAGGACACAAAACGACTACATAAAAATACATTATACAGACATGAGTTTGTTGTGTTCTTA
GCAATAATCATACTGAGCTGCAATGTATAGAACTATAGATACTCATCCTCAGATACCAAA
AGCTTCAGACCAGAAGCTGCCTTTCAGGACAGAATCTCTCCTGAATATACTCATCCTCAG
ATACGAGCTATTCCCGACGACCAAAACCTGAGGTTGCCTGCCTCCAAACGTACATGCGGG
ACTGTTCTAACTTAAACCGACACTTCTTGCTTCAATTCTAAAGCTTGAGGTGTTGGTGTT
GGTGTTGCTGCTCTGTCCTTGACAAATGTCCTAAGGCACCCGTTGATTATGCGTGGCGCT
GATCCATCACAGAACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGG
GTTTCAAGGACTGCCATTTCAGACATTGCTAAATGAAGAATCGAAAACTCTAGTATTCTT
CCAGCTGGTGCACTCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATGATGACGACATGACTA
TCCCATTTATCAGCCACTGCAGCC*AAAAGTTTCTTTGCAAACCTTAAAA*CAAGTTTGC
TGTACACCAGCTTAGGGGGAGCTGAAAGCACTTCTGCTTCAATCTTGGATTCGTTTTCAT
CATGGCGCACAAGCTCATCTTCCTCTTCGCTAGTCTCTGTTTTAACCGGAGGTCCTCCAA
AGCTCATGTGGTTGTATTCCAACAAAGAAGCCTTGTCAAACTCGTATCCAGGCTCTCTTC
TTGCATTGATCCTCTTCTCAAAGAGAC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4BT81TF 665 0 0
TCAGGACAGAATCTCTCGTGAATATACTCATCCTCAGATACGAGCTATTCCCGACGACCA
AAACCTGAGGTTGCCTGCCTCCAAACGTACATGCGGGACTGTTCTAACTTAAACCGACAC
TTCTTGCTTCAATTCTAAAGCTTGAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGCTCTGTCCTTGAC
AAATGTCCTAAGGCACCCGTTGATTATGCGTGGCGCTGATCCATCACAGAACCGTTTCGC
AAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGGGTTTTAAGGACTGCCATTTCAGA
CATTGCTAAATGAAGAATCGAAAACTCTAGTATTCTTCCAGCTGGTGCACTCTTCCAATC
CGGAGGGGAAATTTTCTCGATGATGACGACATGACTATCCCATTTATCAGCCACTGCAGC
C*AAAAGTTTCTTTGCAAACCTTAAAA*CAAGTTTGCTGTACACCAGCTTAGGGGGAGCT
GAAAGCACTTCTGCTTCAATCTTGGATTCGTTTTCATCATGGCGCACAAGCTCATCTTCC
TCTTCGCTAGTCTCTGTTTTAACCGGAGGTCCTCCAAAGCTCATGTGGTTGTATTCCAAC
AAAGAAGCCTTGTCAAACTCGTATCCAGGCTCTCTTCTTGCATTGATCCTCTTCTCAAAG
AGAC
C

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4BG34TF 810 0 0
G
ACCGTTTCGCAAGATCAACAGCCTCGTTGATGACAATCGGGTGTCGGGTTTCAAGGACTG
CCATTTCAGACAT*GCTAAATGAAGAATCGAAAACTCTAGTAT*CTTCCAGCTAGTGCAC
TCTTCCAATCCGGAGGGGAAATTTTCTCGATGATGACGACATGACTATCCCATTTATCAG
CCACTGCAGCCCAAAAGTTTCTTTGCAAACCTTAAAAACAAGTTTGCTGTACACCAGCTT
AGGGGGAGCTGAAAGCACTTCTGCTTCAATCTTGGATTCGTTATCATCATGGCGCACAAG
CTCATCTTCCTCTTCGCTAGTCTCTGTTTTAACCGGAGGTCCTCCAAAGCTCATGTGGTT
GTATTCCAACAAAGAAGCCTTGTCAAACTCGTATCCAGGCTCTCTTCTTGCATTGATCCT
CTTCTCAAAGAGACGAATTGGGTCAGAGCCTTCTAAGCAAGCGGCATAAAGTGTTACAAG
AGCGAGCTCGCGTGCGGCGCGGGGACTGCTTAATCGACCGCTCTTATCTATCTTCGGCAT
CGGGACATCTTTCACTTCCTCCGCGGTAAGCGTCGGCGTACGGAGAGCTCCTCTCGTCGG
AGAAATAAACAACCTTCTGTTACCCGTTCGCAGAGATACCAAGTTCGTCGGCCGGAGCGA
ATCAACAAACGTAAATCCTAGTGAGAGGTGAGAGTCTAGTGAGAGATTACTGGAGAAGTA
AAACAGACTCGACGAAGAGCGTAGGCAAAGCGGCGAGATGCTTCCCTCCATTTTTGTGTT
TGAGCTCTGTCTCTCTCGCTTCTCCGT
CC

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR4CG52TF 241 0 0
TCCTCCGCGGTAAGCGTCGGCGTACGGAGAGCTCCTCTCGTCGGAGAAATAAACA*CCTT
CTGTTACCCGTTCGCAGAGATACCAAGTTCGTCGGCCGGAGCGAATCAACAAACGTAAAT
CCTGGTGAGCGGTGAGAGTCTAGTGAGAGATTACTGGAGAAGTAAAACAGACTCGACGAA
GAGCGTAGGCAAAGCGGCGAGATGCTTCCCTCCATTTTTGTGTTTGAGCTCTGTCTCTC
CC

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR4FL90TF 689 0 0
GGGGAAA
TTTCTCGATGATGACGACATGACTATCCCATTTATCAGCCACTGCAGCC*AAAAGTTTCT
TTGCAAACCTTAAAA*CAAGTTTGCTGTACACCAGCTTAGGGGGAGCTGAAAGCACTTCT
GCTTCAATCTTGGATTCGTTTTCATCATGGCGCACAAGCTCATCTTCCTCTTCGCTAGTC
TCTGTTTTAACCGGAGGTCCTCCAAAGCTCATGTGGTTGTATTCCAACAAAGAAGCCTTG
TCAAACTCGTATCCAGGCTCTCTTCTTGCATTGATCCTCTTCTCAAAGAGACGAATTGGG
TCAGAGCCTTCTAAGCAAGCGGCATAAAGTGTTACAAGAGCGAGCTCGCGTGCGGCGCGG
GGACTGCTTAATCGACCGCTCTTATCTATCTTCGGCATCGGGACATCTTTCACTTCCTCC
GCGGTAAGCGTCGGCGTACGGAGAGCTCCTCTCGTCGGAGAAATAAACAACCTTCTGTTA
CCCGTTCGCAGAGATACCAAGTTCGTCGGCCGGAGCGAATCAACAAACGTAAATCCTAGT
GAGCG***AGAGTCTAGTGAGAGATTACTGGAGAAGTAAAACAGACTCGACGAAGAGCGT
AGGCAAAGCGGCGAGATGCTTCCCTCCATTTTTGTGTTTGAGCTCTGTCTCTCTCGCTTC
TCCGTGTTTAGTGAGAAGCAGA

QA 8 689 8 689
DS 

RD RR4CZ93TF 611 0 0
TACACCAGCTTAGGGGGAGCTGAAAGCACTTCTGCTTCAATCTTGGATTCGTTTTCATCA
TGGCGCACAAGCTCATCTTCCTCTTCGCTAGTCTCTGTTTTAACCGGAGGTCCTCCAAAG
CTCATGTGGTTGTATTCCAACAAAGAAGCCTTGTCAAACTCGTATCCAGGCTCTCTTCTT
GCATTGATCCTCTTCTCAAAGAGACGAATTGGGTCAGAGCCTTCTAAGCAAGCGGCATAA
AGTGTTACAAGAGCGAGCTCGCGTGCGGCGCGGGGACTGCTTAATCGACCGCTCTTATCT
ATCTTCGGCATCGGGACATCTTTCACTTCCTCCGCGGTAAGCGTCGGCGTACGGAGAGCT
CCTCTCGTCGGAGAAATAAACAACCTTCTGTTACCCGTTCGCAGAGATACCAAGTTCGTC
GGCCGGAGCGAATCAACAAACGTAAATCCTAGTGAGCGGTGAGAGTCTAGTGAGAGATTA
CTGGAGAAGTAAAACAGACTCGACGAAGAGCGTAGGCAAAGCGGCGAGATGCTTCCCTCC
ATTTTTGTGTTTGAGCTCTGTCTCTCTCGCTTCTCCGTGTTTAGTGAGAAGCAGATAACG
ATTATCCGTCC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 10

CO CL220Contig1 910 10 9 U
AGGGGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCACTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCT
CTCTTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGG
AGGAACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCG
CTTCGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTG
CCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATG
GAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGGGAAGGGGAAGAGG
AAGAAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTG
GTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTG
ATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATG
GTGGGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGA******AGAAG
ATGAGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCAC
GCTTTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCT
GAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCC
ATGAATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACCATTGCAGTTGAAGCTCCTTTGTTCATC
AGTCAATTTTAGATATCATATATGCATATCTATTTAAGGTTATCAAATATATAAAACAAT
TTCAAGGGTC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP44TF U 1
AF RR4H286TF U 4
AF RR4E424TF U 4
AF RR4EZ06TF U 4
AF RR4AT36TF U 4
AF RR4AT36JQ C 74
AF RR4H286JQ C 103
AF RR4F463JQ C 155
AF RR4GP44JQ C 108
AF RR4B010JQ C 251
BS 1 342 RR4GP44TF
BS 343 343 RR4AT36TF
BS 344 358 RR4GP44TF
BS 359 517 RR4AT36TF
BS 518 520 RR4E424TF
BS 521 813 RR4AT36TF
BS 814 837 RR4H286JQ
BS 838 842 RR4GP44JQ
BS 843 910 RR4B010JQ

RD RR4GP44TF 358 0 0
AGGGGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCACTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCT
CTCTTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGG
AGGAACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCG
CTTCGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTG
CCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATG
GAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG*****GAGGGGAAGGGGAAGA

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4H286TF 344 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGGAGG
AACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTT
CGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCT
TGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGTA
ACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGG

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR4E424TF 551 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCACTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGGAGG
AACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTT
CGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCT
TGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAA
ACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGGGAAGGGGAAGAGGAAG
AAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTG
AGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATG
ATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTG
GGGAAGAAGAT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4EZ06TF 689 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCACTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGGAGG
AACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTT
CGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCT
TGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAA
ACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGGGAAGGGGAAGAGGAAG
AAGGTGGTGATGCAGAAGAATTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTG
AGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATG
ATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTG
GGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGA******AGAAGATG
AGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCT
TTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4AT36TF 810 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCACTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGGAGG
AACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTT
CGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCT
TGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAA
ACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGGGAAGGGGAAGAGGAAG
AAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTG
AGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATG
ATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGA***GGAAGAGGAGGATGAAGATGGTG
GGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGA******AGAAGATG
AGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCT
TTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAA
GAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATG
AATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4AT36JQ 740 0 0
CTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAACAAGGTTT
GAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCGGCTCTAAC
GGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTGAAGGGTGA
TGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGA
CGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGA
TGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGA
AGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGATGA
CAATGGGAACAATGATGATGATGA***GGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGA
TGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGA******AGAAGATGAGGAGGAAGA
GGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCT
AACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTA
AGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAG
ACCTTTGTTTACTGTGTACC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4H286JQ 735 0 0
ATAACATAATGGAGTGGGAGGAACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTT
CGGTGCTAATGCTCACCGCTTCGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGC
TCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTG
ATGCAGAGGAAGGCAATGGTAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGG
GAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGATACAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAG
GATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTG
AACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGATGAGG
AAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGG
AAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGA
AGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACT
TCTTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTCCAC
TGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACCATTGCAGTT
GAAGCTCCTTTGTTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4F463JQ 629 0 0
TAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTT
GCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGA
GGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGA
TGG******AGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGAC
AAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGA
TGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGA
TGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGGGGTGGAGGAAGA
AGAAGAGGAAGAGGA******AGAAGATGAGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAA
GAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGAATTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAAT
CAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAG
CTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4GP44JQ 739 0 0
ATAATGGAGTGGGAGGAACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTG
CTAATGCTCACCGCTTCGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTC
TCTCAGGTGGCTGCCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCA
GAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGG******AGGG
GAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCT
GCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAG
GGTGACGACGGTGATGATGATGATGACAGTGGGAACAATGATGATGATGATGAGGAAGAG
GAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAG
GA******AGAAGATGAGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAA
ACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTG
TGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTCCACTGTAA
TCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACCATTGCAGTTGAAGC
TCCTTTGTTCATCAG
CTAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4B010JQ 660 0 0
TGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGA
AGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGG
TGATACAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGG
TGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGA
TGACAATGGGAACAATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGA
AGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGA
AGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATCT
TCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATC
TTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAA
AAGACCTTTGTTTACTGTGTACCATTGCAGTTGAAGCTCCTTTGTTCATCAGTCAATTTT
AGATATCATATATGCATATCTATTTAAGGTTATCAAATATATAAAACAATTTCAAGGGTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 3 8

CO CL221Contig1 790 2 2 U
GGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGTAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGC
CAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTT
GTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGA
AACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGAT
TCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTCATCTTTGTGGTGTACAG
CAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGA
TGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCAT
GAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTA
CATCCAGAGCACATGTGCAACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTCTTTGTC
CAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGC
AAATCTGGATGCAGGGGCAAACGTTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTTCCTTT
TTTTTGTTTGTTTCGGGTATCTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATTTTTGCAAG
GAGGAGTCTCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGA
TTTATACTCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E249TF U 1
AF RR4E249JQ C 4
BS 1 344 RR4E249TF
BS 345 790 RR4E249JQ

RD RR4E249TF 347 0 0
GGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGTAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGC
CAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTT
GTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGA
AACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGAT
TCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTCATCTTTGTGGTGTACAG
CAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACA
CAA

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR4E249JQ 787 0 0
TCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGTAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAA
GAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTA
CAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAAC
TGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCG
TCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTCATCTTTGTGGTGTACAGCAA
TGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGA
GCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAA
CGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACAT
CCAGAGCACATGTGCAACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTCTTTGTCCAA
CAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAA
TCTGGATGCAGGGGCAAACGTTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTTCCTTTTTT
TTGTTTGTTTCGGGTATCTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATTTTTGCAAGGAG
GAGTCTCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTT
ATACTCT

QA 1 787 1 787
DS 



CO CL221Contig2 787 2 5 U
GGGGGCGTCGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGC
AGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGG
ATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTC
GGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAG
AACATCAGCTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGG
CATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGT
GTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCT
GTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATC
ACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGT
GCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGATCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGC
AAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGATGCAGGG
GCAAACATTACCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTTCTTTTCTTTTTGTTTGTTTCG
GGTATGTGGATTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGAGTCTCTTGCACG
TAAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW82TF U 5
AF RR4F538TF U 1
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BS 14 14 RR4AW82TF
BS 15 660 RR4F538TF
BS 661 661 RR4AW82TF
BS 662 787 RR4F538TF

RD RR4AW82TF 691 0 0
GG
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GGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTG
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ATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATC
AGCTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTAC
TTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTT
GAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTG
CTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGAT
AAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCGCT
TCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCG
TAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGATGCAGGGGCAAAC
ATTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTC

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DS 

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AGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGG
ATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTC
GGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAG
AACATCAGCTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGG
CATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGT
GTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCT
GTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATC
ACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGT
GCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGATCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGC
AAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGATGCAGGG
*CAAACATTACCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTTCTTTTCTTTTTGTTTGTTTCG
GGTATGTGGATTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGAGTCTCTTGCACG
TAAACAT

QA 1 787 1 787
DS 



CO CL221Contig3 840 4 7 U
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GTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGT
TGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGT
CACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTT
CACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCA
GAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGC
TAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTTCTCGT
GTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCT
TGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCCGTGCCACTTCAGG
CGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAG
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CTGATTTTTACTTCTTTATTGTTCTCTTCTTTTTCTTTTTTGTTTGTTTCGGGTATGTGG
ATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAACA
TAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTCTACTTCTTTCTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM63TF U 4
AF RR4EF94TF U 7
AF RR4GM63JQ C 1
AF RR4F538JQ C 103
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TGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCAC
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CGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACT
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GGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCT
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AGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTT
GAGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTT*ACTTCT
TTATTGTT

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DS 

RD RR4EF94TF 774 0 0
GGTCGCGCA
TCTCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCT
GTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGC
TGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAATCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCAC
TATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACAGTGTGGGATGT
CGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACT
CATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCA
CAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTTCTCGTGTTTGCTAACAAACA
GGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCT
CCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGA
AGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTT
GAGTTGATTTTGCTGGGCGGATCTGGATGCAGGG*CAAACATTATCTGATTTTTACTTCT
TTATTGTTCTCTTCTTTTTCTTTTTTGTTTGTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGAT
CGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAACA

QA 10 774 10 774
DS 

RD RR4GM63JQ 826 0 0
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GTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGT
TGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGT
CACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTT
CACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCA
GAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGC
TAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTTCTCGT
GTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCT
TGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCCGTGCCACTTCAGG
CGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAG
GAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGATGCAGGGGCAAACATTAT
CTGATTTTTACTTCTTTATTGTTCTCTTCTTTTTCTTTTTTGTTTGTTTCGGGTATGTGG
ATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAACA
TAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTC
C

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4F538JQ 738 0 0
GATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCT
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GTACAAGAACATCAGCTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTT
GTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAG
AGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCG
TGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGC
TGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAG
CACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGATCTTGACTGGTTGTCCAACAACAT
CGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGA
TGCAGGGGCAAACATTACCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTTCTTTTTCTTTTTTG
TTTGTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGGAG
TCTCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATA
CTCTACTTCTTTCTGCTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 12

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AGGGAGACCATTTCTCTTATCTTTCTTTTGTCTTCTTGGAGTTTCGGGATCTTACACCAC
ACCAAACAACCAAACAACAACAACCATATCTTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCTTT
TCTATACATTTTCAGCAATTAACAAGGAAAGTAAAGTTTGAATCTGAGTAATAATGGGAG
ACAATGAAGGGAAAAGAACATTAATGAATCTTAAGGTTCAAGTGTCGATGAGAGTGTTAA
CCGTCGGCGCTGCACTAGCCTCCATGGGGCTCATGATCACTAACCGTGAAGTGGCCTCTG
TTTATGGCATTGCTTTTGAAGCTAAATACAGCGACTCCTCTGCCTTTAGGTATTTGGTCT
ACGCATATATAGCTATCGCCGCCGTAACGTTGTTTACGCTCGCATGGGCTTGTTTGGCTG
TCCGTAGAGGAGGATTTATTTTTGCACTCTTCGTCATTGATTTGCTTATGGCTTTGACGG
CGTTATCGGCTTTCTCTGCGTCCATGTCGGAGGGTTACATCGGAAAGTATGGTAATACAC
ACGCCGGTTGGCTTCCGATCTGCGGCTATGTTCATAACTATTGCAATCGTGTTACACTCT
CACTCGCTTTTTCCTTCGTCTCTTTTCTACTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCT
CCGCTGCTCGCCGTTCCTGAATATTCTCTTTACATTTTTTACTATACAATTGCTTATTCG
TACTGCTTAAGATCTTTTAATCTTTCTTGTATACTTAGATTTTATCAGAAGAGAAGCATA
AAAAAGAAATTATATTGATTTCGTTTATTTATCTTTGAGACG


BQ
10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 60 60 65 65 65 65 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4F720TF U 3
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AF RR4AN13JQ C 41
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TATACATTTTCAGCAATTAACAAGGAAAGTAAAGTTTGAATCTGAGTAATAATGGGAGAC
AATGAAGGGAAAAGAACATTAATGAATCTTAAGGTTCAAGTGTCGATGAGAGTGTTAACC
GTCGGCGCTGCACTAGCCTCCATGGGGCTCATGATCACTAACCGTGAAGTGGCCTCTGTT
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DS 

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CTGCTCGCCGTTCCTGAATATTCTCTTTACATT

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CAAACAACCAAACAACAAC***CATATCTTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCTTTTC
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TATACATTTTCAGCAATTAACAAGGAAAGTAAAGTTTGAATCTGAGTAATAATGGGAGAC
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GTCGGCGCTGCACTAGCCTCCATGGGGCTCATGATCACTAACCGTGAAGTGGCCTCTGTT
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GCATATATAGCTATCGCCGCCGTAACGTTGTTTACGCTCGCATGGGCTTGTTTGGCTGTC
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CTGCTTAAGATCTTTTAATCTTTCTTGTATACTTAGATTTTATCAGAAGAGAAGCATAAA
AAAGAAATTATAT
CG

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CG

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DS 

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TGTCCCCTTTTCTATACATTTTCAGCAATTAACAAGGAAAGTAAAGTTTGAATCTGAGTA
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DS 

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ATATTGATTTCGTTTATTT

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RD RR4FW39JQ 750 0 0
ACA
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DS 

RD RR4F720JQ 604 0 0
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CGTCGGCGCTGCACTAGCCTCCATGGGGCTCATGATCACTAACCGTGAAGTGGCCTCTGT
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AAAA

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ATC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 11

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4D510TF U 1
AF RR4DH01TF U 1
AF RR4AH87TF U 35
AF RR4GI24TF U 177
AF RR4DH01JQ C 110
AF RR4D510JQ C 296
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AF RR4DM47JQ C 509
AF RR4DM47TF U 509
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BS 660 698 RR4AH87TF
BS 699 699 RR4GI24TF
BS 700 721 RR4AH87TF
BS 722 722 RR4GI24TF
BS 723 759 RR4AH87TF
BS 760 760 RR4GI24TF
BS 761 820 RR4AH87TF
BS 821 821 RR4GI24TF
BS 822 835 RR4AH87TF
BS 836 930 RR4GI24TF
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BS 969 976 RR4GI67TF
BS 977 978 RR4DL11JQ

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CTTACACAGTCGTTCTGTTCGACGAGATAGAGAAAGCCCACCCAGATGTTTTCAACATGA
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AAAACACGCTTCTCATCATGACATCGAACGTCGGAAGCAGTGTGATTGAGAAAGGAGGAA
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GCCTTGTGACCGAGGAGCTGAAACAGTACTTCAGACTGGAGTTCCTCAACAGGCTCGACG
AGATGATTGTGTTCAGACAGCTAACGAAGCTGGAAGTGAAGGAAATTGCAGACATTCTGT
TACAGGAAGTGTTTGAGAGGCTGAAGAAGAAGGAGATCGAGCTTCAGGTGACTGAGAGGT
TCAGAGAGAGAGTGGTGGACGAAGGTTACAACCCCAGCTATGGAGCGAGACCGTTGAGAA
GAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAGCATGGCAGAGAAGATGCTAGCGAGAGAGATC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4DH01TF 658 0 0
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CTCCTGGATACGTGGGTTACACTGAAGGAGGTCAGCTAACAGAAGCAGTTAGACGTCGTC
CTTACACAGTCGTTCTGTTCGACGAGATAGAGAAAGCCCACCCAGATGTTTTCAACATGA
TGCTTCAGATCCTCGAAGACGGTAGACTAACAGACAGCAAAGGAAGAACGGTGGACTTCA
AAAACACGCTTCTCATCATGACATCGAACGTCGGAAGCAGTGTGATTGAGAAAGGAGGAA
GACGTATTGGTTTCGACTTGGACTACGACGAGAAAGACAGCAGCTACAACAGAATCAAGA
GCCTTGTGACCGAGGAGCTGAAACAGTACTTCAGACTGGAGTTCCTCAACAGGCTCGACG
AGATGATTGTGTTCAGACAGCTAACGAAGCTGGAAGTGAAGGAAATTGCAGACATTCTGT
TACAGGAAGTGTTTGAGAGGCTGAAGAAGAAGGAGATCGAGCTTCAGGTGACTGAGAGGT
TCAGAGAGAGAGTGGTGGACGAAGGTTACAACCCCAGCTATGGAGCGAGACCGTTGAGAA
GAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAGCATGGCAGAGAAGATGCTAGCGAGAGAGAT

QA 1 658 1 658
DS 

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G
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GCCCACCCAGATGTTTTCAACATGATGCTTCAGATCCTCGAAGACGGTAGACTAACAGAC
AGCAAAGGAAGAACGGTGGACTTCAAAAACACGCTTCTCATCATGACATCGAACGTCGGA
AGCAGTGTGATTGAGAAAGGAGGAAGACGTATTGGTTTCGACTTGGACTACGACGAGAAA
GACAGCAGCTACAACAGAATCAAGAGCCTTGTGACCGAGGAGCTGAAGCAGTACTTCAGA
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GTGAAGGAAATTGCAGACATTCTGTTACAGGAAGTGTTTGAGAGGCTGAAGAAGAAGGAG
ATCGAGCTTCAGGTGACTGAGAGGTTCAGAGAGAGAGTGGTGGACGAAGGTTACAACCCC
AGCTATGGAGCGAGACCGTTGAGAAGAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAGCATGGCA
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GAAAGTAAAGTGACTGTGCTAAATGGGTGGAAGTGGCACTCCGACAACATCCTTGGAGGA
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TCTTT*GCTTTTCCCCCCTT

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DS 

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GG
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AAGACGTATTGGTTTCGACTTGGACTACGACGAGAAAGACAGCAGCTACAACAGAATCAA
GAGCCTTGTGACCGAGGAGCTGAAACAGTACTTCAGACCGGAGTTCCTCAACAGGCTCGA
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GTTACAGGAAGTGTTTGAGAGGCTGAAGAAGAAGGAGATCGAGCTTCAGGTGACTGAGAG
GTTCAGAGAGAGAGTGGTGGACGAAGGTTACAACCCCAGCTATGGAGCGAGACCGTTGAG
AAGAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAGCATGGCAGAGAAGATGCTAGCGAGAGAGAT
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TGG*TGGAAGTGGCACTCCGACAACATCCTTGGAGGAGCAGGAAGATTCTCTCCCCGTTG
CTTGAAATAAAAAAAGAGAAGTGTGTTTCTTCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTTGAA
CGAATTTGGCAAAAGAAGAGTCTCAATGAGATACCTGGGGGGTTTCGTAATATACATTTC
TATATATGTAACCAATGTAATGTATAGATGAC

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR4DH01JQ 854 0 0
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TT*CAACATGATGCTTCAGATCCTCGAAGACGGTAGACTAACAGACAGCAAAGGAAGAAC
GGTGGACTTCAAAAACACGCTTCTCATCATGACATCGAACGTCGGAAGCAGTGTGATTGA
GAAAGGAGGAAGACGTATTGGTTTCGACTTGGACTACGACGAGAAAGACAGCAGCTACAA
CAGAATCAAGAGCCTTGTGACCGAGGAGCTGAAACAGTACTTCAGACTGGAGTTCCTCAA
CAGGCTCGACGAGATGATTGTGTTCAGACAGCTAACGAAGCTGGAAGTGAAGGAAATTGC
AGACATTCTGTTACAGGAAGTGTTTGAGAGGCTGAAGAAGAAGGAGATCGAGCTTCAGGT
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ACCGTTGAGAAGAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAGCATGGCAGAGAAGATGCTAGC
GAGAGAGATCAAGGAAGGAGACTCGGTGATTGTGGACGTTGACTCTGAAGGTAAAGTGAC
TGTGCTAAATGG*TGGAAGTGGCACTCCGACAACATCCTTGGAGGAGCAGGAAGATTCTC
TCCCCGTTGCTTGAAATAAAAAAAGAGAAGTGTGTTTCTTCTCTCTTCTTTTGCTTTTCC
CCCCTTGAACGAATTTGGCAAAAGAAGAGTCTCAATGAGATACCTGGGGGGTTTCGTAAT
ATACATTTCTATATATGTAACCAATGTAATGTATAGATGACATTGTGTAGCTTCTTTTTC
AATGCTTTTTAAGG

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DS 

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CAAGAGCCTTGTGACCGAGGAGCTGAAACAGTACTTCAGACTGGAGTTCCTCAACAGGCT
CGACGAGATGATTGTGTTCAGACAGCTAACGAAGCTGGAAGTGAAGGAAATTGCAGACAT
TCTGTTACAGGAAGTGTTTGAGAGGCTGAAGAAGAAGGAGATCGAGCTTCAGGTGACTGA
GAGGTTCAGAGAGAGAGTGGTGGACGAAGGTTACAACCCCAGCTATGGAGCGAGACCGTT
GAGAAGAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAGCATGGCAGAGAAGATGCTAGCGAGAGA
GATCAAGGAAGGAGACTCGGTGATTGTGGACGTTGACTCTGAAGGTAAAGTGACTGTGCT
AAATGG*TGGAAGTGGCACTCCGACAACATCCTTGGAGGAGCAGGAAGATTCTCTCCCCG
TTGCTTGAAATAAAAAAAGAGAAGTGTGTTTCTTCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTT
GAACGAATTTGGCAAAAGAAGAGTCTCAATGAGATACCTGGGGGGTTTCGTAATATACAT
TTCTATATATGTAACCAATGTAATGTATAGATGACATTGTGTAGCTTCTTTTTCAATGCT
TTTTAAGG

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DS 

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CTAACGAAGCTGGAAGTGAAGGAAATTGCAGACATTCTGTTACAGGAAGTGTTTGAGAGG
CTGAAGAAGAAGGAGATCGAGCTTCAGGTGACTGAGAGGTTCAGAGAGAGAGTGGTGGAC
GAAGGTTACAACCCCAGCTATGGAGCGAGACCGTTGAGAAGAGCCATCATGAGACTTTTA
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GTGTTTCTTCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTTGAACGAATTTGGCAAAAGAAGAGTC
TCAATGAGATACCTGGGGGGTTTCGTAATATACATTTCTATATATGTAACCAATGTAATG
TATAGATGACATTGTGTAGCTTCTTTTTCAATGCTTTTTAAGGAC

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DS 

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TGGAGGAGCAGGAAGATTCTCTCCCCGTTGCTTGAAATAAAAAAAGAGAAGTGTGTTTCT
TCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTTGAACGAATTTGGCAAAAGAAGAGTCTCAATGAG
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ACATTGTGTAGCTTCCTTTTCAATGCTTTTTAAGGACTTGCTTTGGTGTC

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DS 

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GGCACTCCGACAACATCCTTGGAGGAGCAGGAAGATTCTCTCCCCGTTGCTTGAAATAAA
AAAAGAGAAGTGTGTTTCTTCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTTGAACGAATTTGGCA
AAAGAAGAGTCTCAATGAGATACCTGGGGGGTTTCGTAATATACATTTCTATATATGTAA
CCAATGTAATGTATAGATGACATTGTGTAGCTTCTTTTTCAATGCTTTTTAAGGACTTTC
TTTGGTG
CC

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DS 

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TGACTCTGAAGGTAAAGTTACTGTGCTAAATGG*TGGAAGTGGTACTCCGACAACATCCT
TGGAGGAGCAGGAAGATTCTCTCCCCGTTGCTTGAAATAAAAAAAGAGAAGTGTGTTTCT
TCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTTGAACGAATTTGGCAAAAGAAGAGTCTCAATGAG
ATACTTGGGGG*TTTCGTAATATACATTTCTATATATGTAACCAATGTAATGTATAGATG
ACATTGTGTAGCTTCCTTTTCAATGCTTTTTAAGGACTTGCTTTGGTG
TC

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DS 

RD RR4DM47TF 470 0 0
GAAGGAGATCGAGCTTCAGGTGACTGAGAGGTTCAGAGAGAGAGTAGTGGACGAAGGTTA
CAACCCGAGCTATGGAGCGAGACCGTTGAGAAGAGCCATCATGAGACTTTTAGAGGATAG
TATGGCAGAGAAGATGCTAGCGAGAGGGATCAAGGAAGGAGACTCAGTGATTGTGGACGT
TGACTCTGAAGGTAAAGTTACTGTGCTAAATGG*TGGAAGTGGTACTCCGACAACATCCT
TGGAGGAGCAGGAAGATTCTCTCCCCGTTGCTTGAAATAAAAAAAGAGAAGTGTGTTTCT
TCTCTCTTCTTTTGCTTTTCCCCCCTTGAACGAATTTGGCAAAAGAAGAGTCTCAATGAG
ATACTTGGGGG*TTTCGTAATATACATTTCTATATATGTAACCAATGTAATGTATAGATG
ACATTGTGTAGCTTCCTTTTCAATGCTTTTTAAGGACTTGCTTTGGTG
TC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 12

CO CL224Contig1 1158 12 14 U
GGGTAGTGTATATATATCATCGTTACACTTTCAACAAAAAAATTCAAAACAAAACCCCAT
ACAACATGGATCATAAGACAAACACGACACTGCTTTTCTATTTCTTGTTTTTCATCACGT
ACCTCATCACCATCGCTTCAACGAAAGATCTATGTAACAAAAACGACAAAAACACCCTCC
TCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGTGGGATCCCAAAAGCG
ACTGCTGCTCCTGGTACAGCCTCGAGTGCGGCGACGCTACCGTTAACCACCGCGTCATCT
CCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCTGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTAC
CGTATCTTCAGAATCTTATGTTCCACAAGATCACTAACATCACCGGTCAGATCCCATCCA
CCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGCTCAACCTCACCGGCC
CGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACCTAGACCTTTCCTTCAATC
AGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGATC
TTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGAAC
CTCCTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGGCA
ACATTGATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGATGT
TGTTTGGAGCAAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCG
ATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAACCACAATAAGA
TCACTGGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTGAAAATTCTCTCCAACTCTTAAACGTTAGCT
ATAACAGACTGTGTGGACGCATCCCCACTGGAGGAAGTCTTCAGAGATTTGATTCTTATA
CGTATTTTCACAATAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTAGTTGCAAGTGAAAAAA*C
CAAGCTTATCTCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCAACCTGATGGATTAAATAAA
ACATGTATCACAACTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 30 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 20 50 50 50 35 35 35 50 50 50 
45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 10 

AF RR4D973TF U 1
AF RR4BP74TF U 43
AF RR4DN02TF U 44
AF RR4B354TF U 41
AF RR4H983TF U 146
AF RR4AJ79TF U 43
AF RR4B354JQ C 244
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BS 227 256 RR4D973TF
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BS 258 600 RR4D973TF
BS 601 888 RR4B354TF
BS 889 889 RR4H983TF
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BS 891 891 RR4B354JQ
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BS 908 1157 RR4B354JQ
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ACCTCATCACCATCGCTTCAACGAAAGATCTATGTAACAAAAACGACAAAAACACCCTCC
TCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGTTGGATCCCAAAAGCG
ACTGCTGCTCCTGGTATAGCCTCGAGTGCGGCGACGCTACCGTTAACCACCGCGTCATCT
CCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCTGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTAC
CGTATCTTCAGAATCTTATGTTCCACAAGATCACTAACATCACCGGTCAGATCCCATCCA
CCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGCTCAACCTCACCGGCC
CGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACCTAGACCTTTCCTTCAATC
AGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGATC

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DS 

RD RR4BP74TF 613 0 0
GGG
AAAACAAAACCCCATACAACATGGATCATAAGACAAACACGACACTGCTTTTCTATTTCT
TGTTTTTCATCACGTACCTCATCACCATCGCTTCAACGAAAGATCTATGTAACAAAAACG
ACAAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGT
GGGATCCCAAAAGCGACTGCTGCTCCTGGTACAGCCTCGAGTGCGGCGACGCTACCGTTA
ACCACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCTGGTCAGATCCCGCCTG
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GTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGC
TCAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACCTAG
ACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAAC
TTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGAT
CGTTTCTAGC

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DS 

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GG
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TGTTTTTCATCACGTACCTCATCACCATCGCTTCAACGAAAGATCTATGTAACAAAAACG
ACAAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGT
GGGATCCCAAAAGCGACTGCTGCTCCTGGTACAGCCTCTAGTGCGGCGACGCTACCGTTA
ACCACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCTGGTCAGATCCCGCCTG
AAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAATCTTATGTTCCACAAGATCACTAACACCACCG
GTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGC
TCAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACCTAG
ACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAAC
TTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGAT
CGTTTCTAGCAGAACCTCCTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATAC
CCAAATCA

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DS 

RD RR4B354TF 863 0 0
GATTC
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ACCACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCTGGTCAGATCCCGCCTG
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GTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGC
TCAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACCTAG
ACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAAC
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CGTTTCTAGCAGAACCTCCTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATAC
CCAAATCACTAGGCAACATTGATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAG
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ACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACT
TGA
CACATAGATCACTGG

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DS 

RD RR4H983TF 755 0 0
G
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CCTTACCACCTCGCCTCGTGGGATCCCAAAAGCGACTGCTGCTCCTGGTACAGCCTCGAG
TGCGGCGACGCTACCGTTAACCACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATA
TCTGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAATCTTATGTTCCAC
AAGATCACTAACATCACCGGTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGT
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ATGAACCTCGACAACCTAGACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCT
CTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACA
ATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGAACCTCCTTACCTTCTCTTATCACACAAC
CAGCTCTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGGCAACATTTATTTTAACCACATAGATTTC
TCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCAAAAAAA*CGACGTTT
TCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAG
TCATTTGCCGTCTTGGACTTGAAC*ACAATAAGA

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DS 

RD RR4AJ79TF 871 0 0
GGA
AAAACAAAACCCCATACAACATGGATCATAAGACAAACACGACACTGCTTTTCTATTTCT
TGTTTTTCATCACGTACCTCATTACCATCGCTTCAACGAAAGATCTATGTAACAAAAACG
ACAAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGT
GGGATCCCAAAAGCGACTGCTGCTCCTGGTACAGCCTCGAGTGCGGCGGCGCTACCGTTA
ACCACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCTGGTCAGATCCCGCCTG
AAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAATCTTATGTTCCACAAGATCACTAACATCACCG
GTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTTAAATATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGC
TCAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACCTAG
ACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAAC
TTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGAT
CGTTTCTAGCATAACCTCCTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATAC
CCAAATCACTAGGCAACATTGATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCCCACAG
GCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCAAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAA
ACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACT
TGA*C*ACAT**AGATCACTGG
GAGTAT

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DS 

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TCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCTGGCTCAACCTCACCGGCCCGG
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TCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGATCTTA
GTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGAACCTC
CTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTTTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGGCAACA
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TTGGAGCAAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATC
TGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAACCACAATAAGATCA
CTGGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTGAAAATTCTCTCCAACTCTTAAACGTTAGCTATA
ACAGACTGTGTGGACGCATCCCCACTGGAGGAAGTCTTCAGAGATTTGATTCTTATACGT
ATTTTCACAATAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTAGTTGCAAGTGAAAAAA*CCAA
GCTTATCTCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCAACCTGATGGATTAAATAAAACA
TGTATCACAACTTG

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DS 

RD RR4BP74JQ 631 0 0
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GATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCAAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAAC
ATGTTCCAGCTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGTTGTCTTGGACTTG
AACCACAATAAGATCACTGGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTGAAAATTCTCTCCAACTC
TTAAACGTTAGCTATAACAGACTGTGTGGACGCATCCCCACTGGAGGAAGTCTTCAGAGA
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AAGTGAAAAAAACCAAGCTTATCTCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCCACCTGA
TGGATTAAATAAAACATGTATCACAACTT
AC

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DS 

RD RR4DN02JQ 673 0 0
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TCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGA
TCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGA
ACCTCCTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGG
CAACATTGATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGAT
GTTGTTTGGAGCAAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTT
CGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAACCACAATAA
GATCACTGGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTGAAAATTCTCTCCAACTCTTAAACGTTAG
CTATAACAGACTGTGTGGACGCATCCCCACTGGAGGAAGTCTTCAGAGATTTGATTCTTA
TACGTATTTTCACAATAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTAGTTGCAAGTGAAAAAA
*CCAAGCTTATCTCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCAACCTGATGGATTAAATA
AAACATGTATCA
T

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DS 

RD RR4H983JQB 817 0 0
G
CTGAAGTCGGTGACTTAC*GTATCTTCAGAATCTTATGTTCCACAAGATCACTAACATCA
CCGGTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTTAAGTATCTCCGTTCTCTCAGGCTTAGCT
GGCTCAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACC
TAGACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTA
AACTTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTG
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TACCCAAATCACTAGGCAACATTTATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCA
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GAAACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCCGTCTTGG
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GTTGCAAGTGAAAAAA*CCAAGCTTATCTCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCAA
CCTGATGGATTAAATAAAACATGTATCACAACTTG
T

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DS 

RD RR4AJ79JQ 696 0 0
GGCTCAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAGTCAGCTCATGAACCTCGACAACC
TAGACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTACCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTA
AACTTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGATTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTG
GATCGTTTCTAGCATAACCTCCTTACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTTTCCGGTTCTA
TACCCAAATCACTAGGCAACATTGATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCCCA
CAGGCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCAAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAA
GAAACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGG
ACTTGAACCACAATAAGATCACTGGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTGAAAATTCTCTCC
AACTCTTAAACGTTAGCTATAACAGACTGTGTGGACGCATCCCCACTGGAGGAAGTCTTC
AGAGATTTGATTCTTATACGTATTTTCACAATAAGCGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTA
GTTGCAAGTGAAAAAA*CCAAGCTTATCTCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCAA
CCTGATGGATTAAATAAAACATGTATCACAACTTGC

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DS 

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TAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGC
AAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAG
AGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAACCACAATAAGATCACTGGGAG
TATTCCGGTTCAGTGGACTGAAAATTCTCTCCAACTCTTAAACGTTAGCTATAACAGACT
GTGTGGACGCATCCCCACTGGAGGAAGTCTTCAGAGATTTGATTCTTATACGTATTTTCA
CAATAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTAGTTGCAAGTGAAAAAA*CCAAGCTTATC
TCTTGGTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCAACCTGATGGATTAAATAAAACATGTATCA
CAACTTG
C

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 12

CO CL225Contig1 604 12 19 U
GGGGATATTAACAGCGAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAATATCATGGCCTTATCTCAAGT
ATCTGCGTCTCTCGCCTTTTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATAAAGCTAGGAAGAATCAC
AAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCGCAGCTTGCTGGAAGCCGATCCACCTTCGCTTCTGG
TTCTCCTCTATTGCCATTGAACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGTAAGAAGTGGAAGCAG
AGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGA
CATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGC
TACCGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTT
GGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTAACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAA
AAACTGATAAAAGCTGCCCCCCCATCTGTTTATTGTCATCATTTTGTTGTATCTAAGATT
CTTCGCTCATAAAAACTCTACTTTCATCAGAATGAAATCCCTCATTAGTTTTCTTTTTGC
TCCG


BQ
20 20 10 40 40 10 10 10 20 30 30 30 30 60 60 60 60 60 30 30 30 30 30 60 30 30 30 10 30 60 30 60 60 30 30 65 35 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
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70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 40 35 35 35 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4GF82JQ C 1
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AF RR4FN58TF U 7
AF RR4D845JQ C -6
AF RR4D845TF U 9
AF RR4GF82TF U 1
AF RR4EY66TF U 35
AF RR4EY66JQ C 202
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AF RR4DI43TF U 9
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BS 9 9 RR4D845TF
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BS 28 29 RR4D845TF
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BS 270 312 RR4FN58TF
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BS 457 457 RR4D845TF
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BS 567 588 RR4D845TF
BS 589 595 RR4GF82TF
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CC

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TAAAAACTCTACTTTCA
CC

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AGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGA
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TACCTGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTT
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G
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CTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACCGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAG
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AATCCCTCATTAGTTT
AC

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CG

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TATTGCCATTGAACATGAGAGTGACTCGTTGAAGGGTAAGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAG
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TTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACCGGTA
AAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTA
CAGCATTGGTTGGTGTTCTAACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGAT
AAAAGCTGCCCCCCCATCTGTTTATTGTCATCATTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCGCTC
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DS 



AS 4 10

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GTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATAT
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TGTCAAACATGGAGCTCGTCAGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY04TF U 1
AF RR4BP41TF U 1
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TCAAGGTGT
C

QA 1 729 1 729
DS 

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GTATGAAGCAATCGCAAAGGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATATGACTACTATGCGTCCGG
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GATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCATCCTGAAGG
TGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCGTCTGCCGCTGGAACCATCATGACACTCTCTTCATG
GGCTACTTCCAGCGTTGAAGAAGTTGCTTCCACAGGTCCAGGGATCCGATTCTTCCAGCT
CTATGTATACAAGAACAGGAAAGTGGTTGAGCAGCTCGTGAGAAGAGCAGAGAAGGCAGG
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CGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGA
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TCA*GGTGTTCTTACAGTAGAGATGCAAGATAGCGATCAAGCTGGAGCAGCAGGATCATG
TGTCAAACATGGAGCTCGTCAGC

QA 1 803 1 803
DS 



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CTGCACCCACTTAGTGCCATGGTTAGCTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTT
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CCGGAAGCTCCAAGTGCAAGTGCCTTGAAGACATCAGTTCCACGTCGAACACCACAGTCC
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GCTTGAATCGCTATCCTTGCATCTTCTACTGTAAGAACACCCTTGACAAGAATTGGCATG
CTGGTGATTGTCTGGAGCCACTGGACGTCCTTCCAGCTCAAGGTACGGTCAATTTGACCA
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CTTCTCACGAGCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BP41JQ U 2
AF RR4BM67JQ U 2
AF RR4CY04JQ U 1
BS 1 43 RR4CY04JQ
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BS 568 568 RR4BM67JQ
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RD RR4BP41JQ 704 0 0
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DS 

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QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4CY04JQ 853 0 0
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AAATGGCGTGGAGTCTCCCACTCGGTGATAATGTGGTTCCGAGTGATCTCACTGAGAGAC
CTGCACCCACTTAGTGCCATGGTTAGCTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTT
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GCTGGGACATAGTCAAGCTGACGAGCTCCATGGTTTGACACAATGATCCCTGCTGCTCCA
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GCAACATATGAAGCCAAGCCAGAGTCATTGGCCTCGTCCATCTTTCCGAGGTCGAGACCT
TCAAAGTTCTTCAATGTCAGGTATGGAGGTAAAGTGAATCTGTTCTTGATATCAGACTCT
CTGCGACTAGCCTTGGGGTGTCTACAGTGAGAGCATGGCTTTGAACCCTGCCTCTCTGCT
CTTCTCACGAGCT

QA 1 853 1 853
DS 



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TGAAGCCAAGCCAGAGTCATTGGCCTCGTCCATCTTTCCGAGGTCAAGACCTTCAAAGTT
CTTCAATGTCAGGTTTGGAGGCAAAGTAAATCTGTTCTTGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK49JQ U 1
AF RR4FI84JQ U 26
BS 1 101 RR4DK49JQ
BS 102 102 RR4FI84JQ
BS 103 220 RR4DK49JQ
BS 221 221 RR4FI84JQ
BS 222 503 RR4DK49JQ
BS 504 823 RR4FI84JQ

RD RR4DK49JQ 503 0 0
GTAGAAAAATGCAACTGTTTGTTTACGTAAGAAGAATGGAATGTAGGTAGAAAAGAAGCC
AAATAACATTACAGAATCACTAGGCATCGTTTTGCGATTCAGACATAAAAGGAGAAACAA
GTTTTTGATAGGTAGCAGCAAAGTAGCCCCGATCAGAATATGAGAGAAAGTGTAGGCACA
TATTACATTACATGTTCTCTGGTTGTTTTTGGTGTCTCTCTATAACCTGGCCGAAGGACG
TGGAGTGTCCCATTCGGTGGTGATGTGGTTACGGGTGATTTCCTTGAGAGACCTGCACCC
ACTTAACGCCATTGTCAGCTCGAACTCATCACGTAGCATTTGAAGCACTTTTCTGACTCC
AGCCTCTCCTTCTGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTTCCAATAAATATCCCGGAGGC
TCCAAGAGCAAGTGCCTTGAAAACATCTGTGCCACGTCTAACACCACCATCCAAGAAGAC
AGGGATACGTCCTTGTGTCGCTT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4FI84JQ 798 0 0
CGTAAGAAGAATGGAATGTAGGTAGAAAAGAAGCCAAATAACATTACAGAATCACTAGGC
ATCGTTTTGCGATTCAAACATAAAAGGAGAAACAAGTTTTTGATAGGTAGCAGCAAAGTA
GCCCCGATCAGAATATGAGAGAAAGTGTAGGCACATATTACATTACATGTTCTCTGGTTG
TTTTTGGTGTCTCTCAATAACCTGGCCGAAGGACGTGGAGTGTCCCATTCGGTGGTGATG
TGGTTACGGGTGATTTCCTTGAGAGACCTGCACCCACTTAACGCCATTGTCAGCTCGAAC
TCATCACGTAGCATTTGAAGCACTTTTCTGACTCCAGCCTCTCCTTCTGCAGCAAGTGAG
AATACCACTGGTCTTCCAATAAATATCCCGGAGGCTCCAAGAGCAAGTGCCTTGAAAACA
TCTGTGCCACGTCTAACACCACCATCCAAGAAGACAGGGATACGTCCTTGTGTCGCTTTG
ACAACCTCTTCCAGGGCTGAGATTGTTGCTGGGACATAGTCAAGCTGGCGAGCTCCATGA
TTTGACACAATGATCCCGGCTGCTCCAGCTTGAACCGCTATCCTTGCATCCTCTCCTGTA
ATAACACCCTTGACAAGAATCGGCATTTTGGTAATTGTCTGGAGCCACTGGACATCCTTC
CAGCTCAAGGTACGGTCAATTTGACCAGCAACATATGAAGCCAAGCCAGAGTCATTGGCC
TCGTCCATCTTTCCGAGGTCAAGACCTTCAAAGTTCTTCAATGTCAGGTTTGGAGGCAAA
GTAAATCTGTTCTTGATA

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL226Contig4 754 3 8 U
GGGACAACTTTCATTCTCTCCGGAGAGCTTAGTTCCCCGTCAAAGAATAACATCTGAAAA
TGGAGGTCACAAACGTTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGG
TATACGACTACTATGCCTCTGGAGCAGAGGACCAGTGGACTCTTCAGGAGAACCGAAACG
CTTTTGCAAGGATCCTCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGA
CAACAACCATATTGGGGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGC
AGAAGATGGCTCACCCGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAA
CCATCATGACGCTATCTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGC
CAGGGATTCGTTTTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGG
TGAGAAGAGCTGAGAGAGCAGGGTTTAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGC
TAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGA
AGAACTTTGAAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTT
CATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAGATGTCCAGAGCTCCAGACA
TTACCAAAATGCCGATTCTTGTCAAGGTGTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FI84TF U 1
AF RR4DK49TF U 22
AF RR4E796TF U 14
BS 1 168 RR4FI84TF
BS 169 170 RR4E796TF
BS 171 172 RR4FI84TF
BS 173 173 RR4E796TF
BS 174 634 RR4FI84TF
BS 635 681 RR4E796TF
BS 682 682 RR4DK49TF
BS 683 754 RR4E796TF

RD RR4FI84TF 634 0 0
GGGACAACTTTCATTCTCTCCGGAGAGCTTAGTTCCCCGTCAAAGAATAACATCTGAAAA
TGGAGGTCACAAACGTTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGG
TATACGACTACTATGCCTCTGGAGCAGAGGACCAGTGGACTCTTCAGG**AATCGAAACG
CTTTTGCAAGGATCCTCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGA
CAACAACCATATTGGGGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGC
AGAAGATGGCTCACCCGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAA
CCATCATGACGCTATCTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGC
CAGGGATTCGTTTTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGG
TGAGAAGAGCTGAGAGAGCAGGGTTTAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGC
TAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGA
AGAACTTTGAAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4DK49TF 675 0 0
GGAGAGCTTAGTTCCCCGTCAAAGAATAACATCTGAAAATGGAGGTCACAAACGTTACCG
AGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACTATGCCTCTG
GAGCAGAGGACCAGTGGACTCTTCAGGAGAACCGGAACGTTTTTGCAAGGATCCTCTTTC
GTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATATTGGGGTTCA
AGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACCCGGAAG
GAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGCTATCTTCAT
GGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTTTTTTCCAGC
TCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGGTGAGAAGAGCTGAGAGAGCAG
GGTTTAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATA
TCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAGGTCTTGACC
TCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTG
ACCGTACCTTGAGCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4E796TF 741 0 0
GG
CTCTCCGGAGAGCTAAGTTCCCCGTCAAAGAATAACATCTGAAAATGGAGGTCACAAACG
TTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACTATG
CCTCTGGAGCAGAGGACCAGTGGACTCTTCAGGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGATCC
TCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATATTGG
GGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACC
CGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGCTAT
CTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTTTTT
TCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTTAGCAGCTGGTGAGAAGAGCTGAGA
GAGCAGGGTTTAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGT
CTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAGGTC
TTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTC
AAATTGGCCGTACCTTGAGCTGGAAGATGTCCAGAGCTCCAGACATTACCAAAATGCCGA
TTCTTGTCAAGGTGTTATT

QA 3 741 3 741
DS 



AS 1 8

CO CL227Contig1 1310 8 11 U
GGATATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAAGACCAACGGGA
TTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGAAGGACCTTTGGTTCTGTTACTTCATG
GCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCTAGCCATGGCT
ACCACGTGGTCGCTCCAGATCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTTCCGAGCTACG
AGTCTTACACTGTCAGCCACCTTGTCGCTGATGCCATCGGTTTGCTTGATCACTACGGCA
CTGCTCAGGCATTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCGGTCATAGGTTGGTCTCTATGCT
TGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCGTATTCTCCAAGAG
ATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGTTATACATCACTC
AGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAAGACGGTTA
TGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGA
TCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAGGAGATTC
AGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGG*ATTCACTGGACCGTT*GAATTACTACAG
AGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGGGAAGGCTCCAAGATCCTTGTTCC
GACAAAGTTTATTGCCGGAGACAAGGATATAGGAGCAAATGAAACGATGGGGTATGTGAA
GGGAGAGATGTTCAAGAGTCATGTACCTAACGTTGAAGTTGTTGTAATTGAGGGTGGTCA
TCATTTTATCCAGCAAGAGAAGGCTAAACAAGTCTCGGAGGAGATTCTCTCCTTCTTCAA
CAAGTTATGTACAACAACAGAGTAAAAACACCGTGCCGTTTTTATGGCCTTTATAAAAAG
AAACTACTTTGTTGCTACAACTAATTAAACTACTAGTGTGTATCCAATGATGAAGCCGAT
CACTTGGGCAAAATAATGGTTAAATAAAGCGAGAAAGACAGTATATAGTCGTTGATATTA
TCAAGCATGTGTTTCTTGATCCATAAGTTTCTACAAACTTTTTGTTTACGGTAGAAATGT
TTCTTCTGAATCATGACAATGACGCCATATGTGACCTTGCCGTCTGTAATAAAGAAAGTC
TTTGTTTAATGTATACATTTTGGGCCTATGGGCCTTTTGGTACAGCCCAT


BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF66TF U 1
AF RR4B513TF U 1
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AF RR4AL26TF U 6
AF RR4EK57TF U 472
AF RR4B513JQ C 294
AF RR4FF66JQ C 459
AF RR4HB31JQB C 518
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BS 708 708 RR4B513TF
BS 709 796 RR4AE44TF
BS 797 852 RR4EK57TF
BS 853 853 RR4B513JQ
BS 854 880 RR4EK57TF
BS 881 881 RR4B513JQ
BS 882 1065 RR4EK57TF
BS 1066 1139 RR4B513JQ
BS 1140 1166 RR4FF66JQ
BS 1167 1310 RR4HB31JQB

RD RR4FF66TF 646 0 0
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ACCACGTGGTCGCTCCAGATCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTTCCGAGCTACG
AGTCTTACACTGTCAGCCACCTTGTCGCTGATGCCATCGGTTTGCTTGATCACTACGGCA
CTGCTCAGGCATTTGTGGCTGGACACGACTGGGGATCGGTCATAGGTTGGTCTCTATGCT
TGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCGTATTCTCCAAGAG
ATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGTTATACATCACTC
AGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAAGACGGTTA
TGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGA
TCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTC*AGAGTGGATA
CA

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DS 

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GCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCTAGCCATGGCT
ACCACGTGGTCGCTCCAGATCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTCCTTCCGAGCTACG
AGTCTTACACTGTCAGCCACCTTGTCGCTGATGCCATCGGTTTGCTTGATCACTACGGCA
CTGCTCAGGCATTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCGGTCATAGGTTGGTCTCTATGCT
TGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCGTATTCTCCAAGAG
ATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGTTATACATCACTC
AGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAAGACGGTTA
TGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGA
TCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAGGAGATTC
AGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGGGATTCACTGGACCGTT*GAATTACTACAG
AGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGG

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DS 

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GCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCTAGCCATGGCT
ACCACGTGGTCGCTCCAGATCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTTCCGAGCTACG
AGTCTTACACTGTCAGCCACCTTGTCGCTGATGCCATCGGTTTGCTTGATCACTACGGCA
CTGCTCAGGCATTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCGGTCATAGGTTGGTCTCTATGCT
TGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCGTATTCTCCAAGAG
ATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGTTATACATCACTC
AGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAAGACGGTTA
TGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGA
TCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAGGAGATTC
AGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGG*ATTCACTGGACCGTTTGAATTACTACAG
AGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGGGAAGGCTCCAAGATCCTTGTTCC
GACAAAGTTTATTGCC
CGGAGACA

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DS 

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GG
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AAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGAAGGACCTTTGGTTCTGTTACTTCATGGCTTCCC
CGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCTAGCCATGGCTACCACGT
GGTCGCTCCAGATCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTTCCGAGCTACGAGTCTTA
CACTGTCAGCCACCTTGTCGCTGATGCCATCGGTTTGCTTGATCACTACGGCACTGCTCA
GGCATTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCGGTCATAGGTTGGTCTCTATGCTTGTTTAG
ACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCGTATTCTCCAAGAGATCCAAA
CCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGTTATACATCACTCAGTTTCA
GAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAAGACGGTTATGAAGAA
GTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGATCATCGA
TGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAGTAGATTCAGGTTTA
TGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGG*ATTCACTGGACCGTT*GAATTACTACAGAGCCATG
GATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGGGAAGGCTCCAAGATCCTTGTTCCGACAAAG
TTTATTGCC
CGGAGAC

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DS 

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G
CATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAA
GACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGG
TACAGAGATCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGA
GGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGA*ATTCACTGGACCGTT*GAAT
TACTACAGAGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGGGAAGGCTCCAAGATC
CTTGTTCCGACAAAGTTTATTGCCGGAGACAAGGATATAGGAGCAAATGAAACGATGGGG
TATGTGAAGGGAGAGATGTTTAAGAGTCATGTACCTAACGTTGAAGTTATTGTAATTGAG
GGTGGTCATCATTTTATCCAGCAAGAGAAGGCTAAACAAGTCTCGGAGGAGATTCTCTCC
TTCTTCAACAAGTTATGTACAACAACAGAGTAAAAACACCGTGCCGTTTTTATGGCCTTT
ATAAAAAGAAACTACTTTGTTGCTACAACTAATTAAACTACTAGTGTGTATCC

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DS 

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TACGGCACTGCTCAGGCATTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCGGTCATAGGTTGGTCT
CTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCGTATTCT
CCAAGAGATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGTTATAC
ATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAAGCTGCATTTGCCAAGCATGATTGTAAG
ACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGT
ACAGAGATCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAG
GAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGG*ATTCACTGGACCGTT*GAATT
ACTACAGAGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGGGAAGGCTCCAAGATCC
TTGTTCCGACAAAGTTTATTGCCGGAGACAAGGATATAGGAGCAAATGAAACGATGGGGT
ATGTGAAGGGAGAGATGTTCAAGAGTCATGTACCTAACGTTGAAGTTGTTGTAATTGAGG
GTGGTCATCATTTTATCCAGCAAGAGAAGGCTAAACAAGTCTCGGAGGAGATTCTCTCCT
TCTTCAACAAGTTATGTACAACAACAGAGTAAAAACACCGTGCCGTTTTTATGGCCTTTA
TAAAAAGAAACTACTTTGTTGCTACAACTAATTAAACTACTAGTGTGTATCCAATGATGA
AGCCGATCACTTGGGCAAAATAATGGTTAAATAAAGCGAGAAAGACAGTATATAGTCGTT
GATATT

QA 1 846 1 846
DS 

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AAGCATGATTGTAAGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATG
GTGGCTCCTCCCGGTACAGAGATCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTC*AGAG
TGGATAACAGAAGAGGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGG*ATTCAC
TGGACCGTT*GAATTACTACAGAGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGGG
AAGGCTCCAAGATCCTTGTTCCGACAAAGTTTATTGCCGGAGACAAGGATATAGGAGCAA
ATGAAACGATGGGGTATGTGAAGGGAGAGATGTTCAAGAGTCATGTACCTAACGTTGAAG
TTGTTGTAATTGAGGGTGGTCATCATTTTATTCAACAAGAGAAGGCTAAACAAGTCTCGG
AGGAGATTCTCTCCTTCTTCAACAAGTTATGTACAACAACAGAGTAAAAACACCGTGCCG
TTTTTATGGCCTTTGTAAAAAGAAACTACTTTGTTGCTACAACTAATTAAACTACTAGTG
TGTATCCAATGATGAAGCCGATCACTTGGGCAAAATAATGGTTAAATAAAGCGAGAAAGA
CAGTATATAGTCGTTGATATTATCAAGCATGTGTTTCTTGATCCATAA

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DS 

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CAAGCATGATTGTAAGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCAT
GGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGATCATCGATGATCTCGAGATTCCAACGAAGATTCCAGA
GTGGATAACAGAAGAGGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGG*ATTCA
CTGGACCGTT*GAATTACTACAGAGCCATGGATCTGAATTGGGAGATATTGGCGCCGTGG
GAAGGCTCCAAGATCCTTGTTCCGACAAAGTTTATTGCCGGAGACAAGGATATAGGAGCA
AATGAAACGATGGGGTATGTGAAGGGAGAGATGTTCAAGAGTCATGTACCTAACGTTGAA
GTTGTTGTAATTGAGGGTGGTCATCATTTTATCCAGCAAGAGAAGGCTAAACAAGTCTCG
GAGGAGATTCTCTCCTTCTTCAACAAGTTATGTACAACAACAGAGTAAAAACACCGTGCC
GTTTTTATGGCCTTTATAAAAAGAAACTACTTTGTTGCTACAACTAATTAAACTACTAGT
GTGTATCCAATGATGAAGCCGATCACTTGGGCAAAATAATGGTTAAATAAAGCGAGAAAG
ACAGTATATAGTCGTTGATATTATCAAGCATGTGTTTCTTGATCCATAAGTTTCTACAAA
CTTTTTGTTTACGGTAGAAATGTTTCTTCTGAATCATGACAATGACGCCATATGTGACCT
TGCCGTCTGTAATAAAGAAAGTCTTTGTTTAATGTATACATTTTGGGCCTATGGGCCTTT
TGGTACAGCCCAT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 11

CO CL228Contig1 1278 11 30 U
GCAAGAATTGGGCTTTGACATTGAGATTTTAGTGTGTTGTATATTGTACATATGTACCAA
AACAAGAGAAAAATAGATCACTATGGGTGGCATGTACTAAAAAAGATTCAAGAAACATCG
ATTTTGACAGTTAAGAAATTCATGGCCAACAATGCAGCTCCAACAGCTGGCTCTACCGTT
GGTATGATGGTTTGAGCGCCAGGAAAGTGTTGGTTGATACGCTTTGAGACTTCTTTTCCA
ATATCCCATTTCATATTAGCGTTTAGGACACCGCCCACCATTACAACCGGGAAACAAGCT
TTTCCATCTTTGCCACATAAACCAAGTCTCTGAACAACAGCTTTTACACTTAGAGCTAAA
TCATCAGCTGCATCAACCAAGATCTTATCCGAAATTTCGTCACCAGCTTCTGCACAGGAG
ACTACTTGAGGAACAAGAGCAGCAATACGTGCCCAAGATGGATCAGCGTACGTCCACCCG
ATGAGTTCATCAGGAGAGGAAAGTCCAAGCGCTTTTAAGAAGGTACTTGTGAGCATCGTT
TCTGGACCACGACCATCATGAGCTCTAATCACCGCCGTTAAGGCTTGTGCAGATATCCCA
TAGCCACTTCCCCAATCACCTAAGATAGGTCCAGCACCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACC*
ATCTTCATCAAAGCCATAGGCTATACATCCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAG
CTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCCACTATAGCATCATTCTGAACATATACCTTGAC
ATGACTAGGGAACATGTCCCTAATCCAATTCTGAATCATATCCTGGTCGGAGGGATGATT
AACACCAGAAACACCTAAGCACACACCACGGACATGTGACTTATCTGAACCGGACTCTAC
AAGCGCCTCAGAAATAACTTGCTCTAGTGAATCTCTCGCTGCAGTCTCTCCTACGCTATT
GCGATTGGTGCAGCCGGCGACGGCTCGACCGAGGATCGGAATAGGCTCGGGGAAACGATC
TCCGTAGGGGAAAAACGGCACGCAGACGCAGACAGTTGAGGTGGCGCCACCGTCGAGGCC
CAAGATGAGGCCATCTCCGAAGCCGTTCTCCACCGCTGCTTCTCCTCTTCCTTCTTCTTC
TTCCAGGTTTCCATTGCTATGCGGATTCCTCATTTAATCATACAACAAAAAAAAA*CTGG
GAATTCTCAACAACCCAGATGAGATCAAGGAAGATGGAGCAATGGGTCGTCGGAAAGTTA
GTGCCTTTCGATCGGCCC


BQ
10 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
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35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 0 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4EM16JQ U 90
AF RR4BY64JQ U 1
AF RR4BY28JQ U 1
AF RR4BY52JQ U 6
AF RR4BY40JQ U 1
AF RR4BS59JQ U 93
AF RR4BS59TF C 527
AF RR4BY64TF C 577
AF RR4BY28TF C 621
AF RR4BY40TF C 624
AF RR4BY52TF C 624
BS 1 520 RR4BY28JQ
BS 521 521 RR4BY52JQ
BS 522 756 RR4BY28JQ
BS 757 760 RR4BY40JQ
BS 761 828 RR4BS59TF
BS 829 829 RR4BY64TF
BS 830 861 RR4BS59TF
BS 862 862 RR4BY64TF
BS 863 867 RR4BS59TF
BS 868 868 RR4BY64TF
BS 869 896 RR4BS59TF
BS 897 897 RR4BY64TF
BS 898 909 RR4BS59TF
BS 910 910 RR4BY64TF
BS 911 920 RR4BS59TF
BS 921 921 RR4BY64TF
BS 922 934 RR4BS59TF
BS 935 935 RR4BY64TF
BS 936 1026 RR4BS59TF
BS 1027 1027 RR4BY64TF
BS 1028 1030 RR4BS59TF
BS 1031 1031 RR4BY64TF
BS 1032 1183 RR4BS59TF
BS 1184 1184 RR4BY64TF
BS 1185 1195 RR4BS59TF
BS 1196 1196 RR4BY64TF
BS 1197 1201 RR4BS59TF
BS 1202 1202 RR4BY64TF
BS 1203 1239 RR4BS59TF
BS 1240 1278 RR4BY64TF

RD RR4EM16JQ 290 0 0
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CAATGCAGCTCCAACAGCTGGCTCTACCTTTGGTATGATGGTTTGAGCCCCAGGAAAGTG
TTGGTTGATACCCTTTGAAACTTCTTTTCCAATATCTCATTTCATATTAGCGTTTAGGAC
ACCGCCCACCATTACAACCGGGAAACAAGCTTTTCCATCTTTGCCACATAAACCAAGTCT
CTGAACAACAGCTTTTACACTTAGAGCTAAATAATCAGCTGCATCAACCA

QA 1 290 1 290
DS 

RD RR4BY64JQ 517 0 0
G
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ACAAGAGAAAAATAGATCACTATGGGTGGCATGTACTAAAAAAGATTCAAGAAACATCGA
TTTTGACAGTTAAGAAATTCATGGCCAACAATGCAGCTCCAACAGCTGGCTCTACCGTTG
GTATGATGGTTTGAGCGCCAGGAAAGTGTTGGTTGATACGCTTTGAGACTTCTTTTCCAA
TATCCCATTTCATATTAGCGTTTAGGACACCGCCCACCATTACAACCGGGAAACAAGCTT
TTCCATCTTTGCCACATAAACCAAGTCTCTGAACAACAGCTTTTACACTTAGAGCTAAAT
CATCAGCTGCATCAACCAAGATCTTATCCGAAATTTCGTCACCAGCTTCTGCACAGGAGA
CTACTTGAGGAACAAGAGCAGCAATACGTGCCCAAGATGGATCAGCGTACGTCCACCCGA
TGAGTTCATCAGGAGAGGAAAGTCCAAGCGCTTTTA

QA 2 517 2 517
DS 

RD RR4BY28JQ 756 0 0
GCAAGAATTGGGCTTTGACATTGAGATTTTAGTGTGTTGTATATTGTACATATGTACCAA
AACAAGAGAAAAATAGATCACTATGGGTGGCATGTACTAAAAAAGATTCAAGAAACATCG
ATTTTGACAGTTAAGAAATTCATGGCCAACAATGCAGCTCCAACAGCTGGCTCTACCGTT
GGTATGATGGTTTGAGCGCCAGGAAAGTGTTGGTTGATACGCTTTGAGACTTCTTTTCCA
ATATCCCATTTCATATTAGCGTTTAGGACACCGCCCACCATTACAACCGGGAAACAAGCT
TTTCCATCTTTGCCACATAAACCAAGTCTCTGAACAACAGCTTTTACACTTAGAGCTAAA
TCATCAGCTGCATCAACCAAGATCTTATCCGAAATTTCGTCACCAGCTTCTGCACAGGAG
ACTACTTGAGGAACAAGAGCAGCAATACGTGCCCAAGATGGATCAGCGTACGTCCACCCG
ATGAGTTCATCAGGAGAGGAAAGTCCAAGCGCTTTTAAGATGGTACTTGTGAGCATCGTT
TCTGGACCACGACCATCATGAGCTCTAATCACCGCCGTTAAGGCTTGTGCAGATATCCCA
TAGCCACTTCCCCAATCACCTAAGATAGGTCCAGCACCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACC*
ATCTTCATCAAAGCCATAGGCTATACATCCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAG
CTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCCACTATAGC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4BY52JQ 735 0 0
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GAGAAAAATAGATCACTATGGGTGGCATGTACTAAAAAAGATTCAAGAAACATCGATTTT
GACAGTTAAGAAATTCATGGCCAACAATGCAGCTCCAACAGCTGGCTCTACCGTTGGTAT
GATGGTTTGAGCGCCAGGAAAGTGTTGGTTGATACGCTTTGAGACTTCTTTTCCAATATC
CCATTTCATATTAGCGTTTAGGACACCGCCCACCATTACAACCGGGAAACAAGCTTTTCC
ATCTTTGCCACATAAACCAAGTCTCTGAACAACAGCTTTTACACTTAGAGCTAAATCATC
AGCTGCATCAACCAAGATCTTATCCGAAATTTCGTCACCAGCTTCTGCACAGGAGACTAC
TTGAGGAACAAGAGCAGCAATACGTGCCCAAGATGGATCAGCGTACGTCCACCCGATGAG
TTCATCAGGAGAGGAAAGTCCAAGCGCTTTTAAGAAGGTACTTGTGAGCATCGTTTCTGG
ACCACGACCATCATGAGCTCTAATCACCGCCGTTAAGGCTTGTGCAGATATCCCATAGCC
ACTTCCCCAATCACCTAAGATAGGTCCAGCACCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACC*ATCTT
CATCAAAGCCATAGGCTATACATCCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAGCTTTC
CCATTGTCCCACTAG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4BY40JQ 760 0 0
G
CAAGAATTGGGCTTTGACATTGAGATTTTAGTGTGTTGTATATTGTACATATGTACCAAA
ACAAGAGAAAAATAGATCACTATGGGTGGCATGTACTAAAAAAGATTCAAGAAACATCGA
TTTTGACAGTTAAGAAATTCATGGCCAACAATGCAGCTCCAACAGCTGGCTCTACCGTTG
GTATGATGGTTTGAGCGCCAGGAAAGTGTTGGTTGATACGCTTTGAGACTTCTTTTCCAA
TATCCCATTTCATATTAGCGTTTAGGACACCGCCCACCATTACAACCGGGAAACAAGCTT
TTCCATCTTTGCCACATAAACCAAGTCTCTGAACAACAGCTTTTACACTTAGAGCTAAAT
CATCAGCTGCATCAACCAAGATCTTATCCGAAATTTCGTCACCAGCTTCTGCACAGGAGA
CTACTTGAGGAACAAGAGCAGCAATACGTGCCCAAGATGGATCAGCGTACGTCCACCCGA
TGAGTTCATCAGGAGAGGAAAGTCCAAGCGCTTTTAAGATGGTACTTGTGAGCATCGTTT
CTGGACCACGACCATCATGAGCTCTAATCACCGCCGTTAAGGCTTGTGCAGATATCCCAT
AGCCACTTCCCCAATCACCTAAGATAGGTCCAGCACCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACC*A
TCTTCATCAAAGCCATAGGCTATACATCCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAGC
TTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCCACTATAGCATCA

QA 2 760 2 760
DS 

RD RR4BS59JQ 665 0 0
TCTG
CTAAAAAAGATTCAAGAAACATCGATTTTGACGGTTAAGAAATTCATGGCCAACAATGCA
GCTCCAACAGCTGGCTCTACCTTTGGTATGATGGTTTGAGCGCCAGGAAAGTGTTGGTTG
ATACGCTTTGAGACTTCTTTTCCAATGTCCCATTTCATATTAGCGTTCAGGACACCGCCC
ACCATTACAACCGGGAAACAAGCTTTTCCATCTTTGCCACATAAACCAAGTCTCTGTACA
ACGGCTTTTACACTTAGAGCTAAATCATCAGCTGCATCAACCAAGATCTTATCCGAAATT
TCGTCACCAGCTTCTGCGCAGGGGACTACTTGAGGAACAAGAGCAGCAATACGTGCCCAA
GATGGATCAGCGTACGTCCACCCGATGAGTTCATCAGGAGAGGAAAGTCCAAGCGCTTTT
AAGAAGGTACTTGTGAGCATCGTTTCTGGACCACGACCATCATGAGCTCTAATCACCGCC
GTTAAGGCTTGTGCAGATATCCCATAGCCACTTCCCCAATCACCTAAGATAGGTCCAGCA
CCAGAAGCTCTAGCCTCCCTGCC*ATCTTCATCAAAGCCATAAGCTATACATCCAGTACC
GGCTATCAAAACACATCCATGAAGCTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCCACTATAGC
A

QA 5 665 5 665
DS 

RD RR4BS59TF 713 0 0
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GTGCAGATATCCCATAGCCACTTCCCCAATCAC*TAAGATAGGTCCAGCACCAGAAGCTC
TAGCCTCCCTGCC*ATCTTCATCAAAGCCATAAGCTATACATCCAGTACCGGCTATCAAA
ACACATCCATGAAGCTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCCACTATAGCATCATTCTGA
ACATATACCTTGACATGACTAGGGAACATGTCCCTAATCCAATTCTGAATCATATCCTGG
TCAGAGGGATGATTAACACCAGAAACACCTAAGCATACACCGCGGACATGTGACTTATCT
GAACCGGACTGTACAAGCGCCTCGGAAATAACTTTCTCTAGTGAATCTTTCGCTGCAGTC
TCTCCTACGCTATTGCGATTGGTGCAGCCGGCGACGGCTCGACCGAGGATCGGAATAGGC
TCGGGGAAACGATCTCCGTACGGGGAAAACGGCACGCAGACGCAGACAGTTGAGGTGGCG
CCACCGTCGAGGCCCAAGATGAGGCCATCTCCGAAGCCGTTCTCCACCGCTGCTTCTCCT
CTTCCTTCTTCTTCTTCCAGGTTTCCATTGCTATGCGGATTCCTCATTTAATCATACGAC
AAAAAAAAAACTGGGGATTCTCAACAACCCAGATGAGATCAAGGAAGATGGAG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4BY64TF 702 0 0
GTTAAGGCTTGTGCAGATATCCCATAGCCACTTCCCCAATCAC*TAAGATAGGTCCAGCA
CCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACC*ATCTTCATCAAAGCCATAGGCTATACATCCAGTACC
GGCTATCAAAACACATCCATGAAGCTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCCACTATAGC
ATCATTCTGAACATATACCTTGACATGACTAGGGAACATGTCCCTAATCCAATTCTGAAT
CATATCCTGGTCGGAGGGATGATTAACACCAGAAACACCTAAGCACACACCACGGACATG
TGACTTATCTGAACCGGACTCTACAAGCGCCTCAGAAATAACTTGCTCTAGTGAATCTCT
CGCTGCAGTCTCTCCTACGCTATTGCGATTGGTGCAGCCGGCGACGGCTCGACCGAGGAT
CGGAATAGGCTCGGGGAAACGATCTCCGTAGGGGAAAAACGGCACGCAGACGCAGACAGT
TGAGGTGGCGCCACCGTCGAGGCCCAAGATGAGGCCATCTCCGAAGCCGTTCTCCACCGC
TGCTTCTCCTCTTCCTTCTTCTTCTTCCAGGTTTCCATTGCTATGCGGATTCCTCATTTA
ATCATACAACAAAAAAAAA*CTGGGAATTCTCAACAACCCAGATGAGATCAAGGAAGATG
GAGCAATGGGTCGTCGGAAAGTTAGTGCCTTTCGATCGGCCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BY28TF 658 0 0
TAAGATAGGTCCAGCACCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACC*ATCTTCATCAAAGCCATAGG
CTATACATCCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAGCTTTCCCATTGTCCCACTAG
CTAAAGCCACTATAGCATCATTCTGAACATATACCTTGACATGACTAGGGAACATGTCCC
TAATCCAATTCTGAATCATATCCTGGTCGGAGGGATGATTAACACCAGAAACACCTAAGC
ACACACCACGGACATGTGACTTATCTGAACCGGACTCTACAAGCGCCTCAGAAATAACTT
GCTCTAGTGAATCTCTCGCTGCAGTCTCTCCTACGCTATTGCGATTGGTGCAGCCGGCGA
CGGCTCGACCGAGGATCGGAATAGGCTCGGGGAAACGATCTCCGTAGGGGAAAAACGGCA
CGCAGACGCAGACAGTTGAGGTGGCGCCACCGTCGAGGCCCAAGATGAGGCCATCTCCGA
AGCCGTTCTCCACCGCTGCTTCTCCTCTTCCTTCTTCTTCTTCCAGGTTTCCATTGCTAT
GCGGATTCCTCATTTAATCATACAACAAAAAAAAA*CTGGGAATTCTCAACAACCCAGAT
GAGATCAAGGAAGATGGAGCAATGGGTCGTCGGAAAGTTAGTGCCTTTCGATCGGCCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4BY40TF 655 0 0
AGATA
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CCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAGCTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCC
ACTATAGCATCATTCTGAACATATACCTTGACATGACTAGGGAACATGTCCCTAATCCAA
TTCTGAATCATATCCTGGTCGGAGGGATGATTAACACCAGAAACACCTAAGCACACACCA
CGGACATGTGACTTATCTGAACCGGACTCTACAAGCGCCTCAGAAATAACTTGCTCTAGT
GAATCTCTCGCTGCAGTCTCTCCTACGCTATTGCGATTGGTGCAGCCGGCGACGGCTCGA
CCGAGGATCGGAATAGGCTCGGGGAAACGATCTCCGTAGGGGAAAAACGGCACGCAGACG
CAGACAGTTGAGGTGGCGCCACCGTCGAGGCCCAAGATGAGGCCATCTCCGAAGCCGTTC
TCCACCGCTGCTTCTCCTCTTCCTTCTTCTTCTTCCAGGTTTCCATTGCTATGCGGATTC
CTCATTTAATCATACAACAAAAAAAAA*CTGGGAATTCTCAACAACCCAGATGAGATCAA
GGAAGATGGAGCAATGGGTCGTCGGAAAGTTAGTGCCTTTCGATCGGCCC

QA 6 655 6 655
DS 

RD RR4BY52TF 655 0 0
AGATA
GTCCAGCACCAGAAGCTCTAGCCTCCCTACCCATCTTCATCAAAGCCATAGGCTATACAT
CCAGTACCGGCTATCAAAACACATCCATGAAGCTTTCCCATTGTCCCACTAGCTAAAGCC
ACTATAGCATCATTCTGAACATATACCTTGACATGACTAGGGAACATGTCCCTAATCCAA
TTCTGAATCATATCCTGGTCGGAGGGATGATTAACACCAGAAACACCTAAGCACACACCA
CGGACATGTGACTTATCTGAACCGGACTCTACAAGCGCCTCAGAAATAACTTGCTCTAGT
GAATCTCTCGCTGCAGTCTCTCCTACGCTATTGCGATTGGTGCAGCCGGCGACGGCTCGA
CCGAGGATCGGAATAGGCTCGGGGAAACGATCTCCGTAGGGGAAAAACGGCACGCAGACG
CAGACAGTTGAGGTGGCGCCACCGTCGAGGCCCAAGATGAGGCCATCTCCGAAGCCGTTC
TCCACCGCTGCTTCTCCTCTTCCTTCTTCTTCTTCCAGGTTTCCATTGCTATGCGGATTC
CTCATTTAATCATACAACAAAAAAAAA*CTGGGAATTCTCAACAACCCAGATGAGATCAA
GGAAGATGGAGCAATGGGTCGTCGGAAAGTTAGTGCCTTTCGATCGGCCC

QA 6 655 6 655
DS 



AS 2 12

CO CL229Contig1 820 2 2 U
GGCCTCGCCGTGGGTGTCAGGTAACCAAGTATGTAAAGGTATAATCGGTGATTTGACGGC
AAAAGCAATAAGAAATCCAATATAAAATAGTATTTCGAGTGTGACAGGATAGACTTGATT
CGCTAATAGTTCTAAATTTAATGTTGGTTCGTTCGAACCATATAAACTTATACCTAAAAC
TCCTATTAATAAAAAAATAGAACTTCCTGCAGTGTATAAAATAAATTTTGTAGCTGAATA
CAAACGTTTCTTTCCACTCCACATGGATAAAAGGAGATAAACGGGAATTAATTCTAATTC
CCACATGATGAAAAAAAGTAAAATATCCCGAGAAGAAAATGATCCTATTTGGCCGCTGTA
CATTGCTAACATCAGAAAATAGAATAATCGGGAATCCCGAGTAACTGGAAAAGCCGCTAA
AGTAGCTAAAGTAGTAATAAATCCCGTAAGTAAAATCGTTCCTATAGAAAGTCCATCTAT
TCCCAGTCTCCAATAAAAATCAAAAAAATTGATCCATTTATAATCTTCGGACAGTTGAAT
TAGTGGATCGTCCAGTTTAAAATTATAACAAAAAGCGTAAGTCGTTAGAAGAAGTTCTAA
GATACAAATGCATATAGTATACCACTTATTAACTTTATTTCCCCTATGCGGGAGAAATAA
CATTAATGAACCGGCAGATATTGGAAAAACAACAATTATTGTTAACCAAGGAAAATCATT
CGTGGTAAAGACAAGATACACCAGGTCCAAAGAACGCGTACTCAAAAAAATATATAAATA
AAAAAATATAATTGAACTTTTTTGAGTACGAGTACTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO60TF U 1
AF RR4CO60JQ C 13
BS 1 685 RR4CO60TF
BS 686 820 RR4CO60JQ

RD RR4CO60TF 685 0 0
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CGCTAATAGTTCTAAATTTAATGTTGGTTCGTTCGAACCATATAAACTTATACCTAAAAC
TCCTATTAATAAAAAAATAGAACTTCCTGCAGTGTATAAAATAAATTTTGTAGCTGAATA
CAAACGTTTCTTTCCACTCCACATGGATAAAAGGAGATAAACGGGAATTAATTCTAATTC
CCACATGATGAAAAAAAGTAAAATATCCCGAGAAGAAAATGATCCTATTTGGCCGCTGTA
CATTGCTAACATCAGAAAATAGAATAATCGGGAATCCCGAGTAACTGGAAAAGCCGCTAA
AGTAGCTAAAGTAGTAATAAATCCCGTAAGTAAAATCGTTCCTATAGAAAGTCCATCTAT
TCCCAGTCTCCAATAAAAATCAAAAAAATTGATCCATTTATAATCTTCGGACAGTTGAAT
TAGTGGATCGTCCAGTTTAAAATTATAACAAAAAGCGTAAGTCGTTAGAAGAAGTTCTAA
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CATTAATGAACCGGCAGATATTGGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4CO60JQ 808 0 0
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TAAATTTAATGTTGGTTCGTTCGAACCATATAAACTTATACCTAAAACTCCTATTAATAA
AAAAATAGAACTTCCTGCAGTGTATAAAATAAATTTTGTAGCTGAATACAAACGTTTCTT
TCCACTCCACATGGATAAAAGGAGATAAACGGGAATTAATTCTAATTCCCACATGATGAA
AAAAAGTAAAATATCCCGAGAAGAAAATGATCCTATTTGGCCGCTGTACATTGCTAACAT
CAGAAAATAGAATAATCGGGAATCCCGAGTAACTGGAAAAGCCGCTAAAGTAGCTAAAGT
AGTAATAAATCCCGTAAGTAAAATCGTTCCTATAGAAAGTCCATCTATTCCCAGTCTCCA
ATAAAAATCAAAAAAATTGATCCATTTATAATCTTCGGACAGTTGAATTAGTGGATCGTC
CAGTTTAAAATTATAACAAAAAGCGTAAGTCGTTAGAAGAAGTTTTAAGATACAAATGCA
TATAGTATACCACTTATTAACTTTATTTCCCCTATGCGGGAGAAATAACATTAATGAACC
GGCAGATATTGGAAAAACAACAATTATTGTTAACCAAGGAAAATCATTCGTGGTAAAGAC
AAGATACACCAGGTCCAAAGAACGCGTACTCAAAAAAATATATAAATAAAAAAATATAAT
TGAACTTTTTTGAGTACGAGTACTTGTC

QA 1 808 1 808
DS 



CO CL229Contig2 852 10 9 U
CCTGAAAACTATCCATAAAAATAATTAGATAAAATGGATTCGACCTTGTCACTTGCTAAT
GAGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAA
AGAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTG
TATCCATAGAACATTTGACGTAACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCA
ATTGCCATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATT
ATTCCAAAAAAAACGATTAATTCTGCAATAAAACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAA
GCCATCGATAAGATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCC
ATTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGT
GCAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCC
GTTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGGCTATT
CTCTTTTTT*AAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGT
ACCGACTACCATCAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGCGTGAGGTAATAATTCTATATT
GATTCGAACCAATCCATATGCTCCCATTTTTAATAAGATTCCAGCGAGAAGCATACAGGT
ACTGTAATGTGCCTCGCCGTGGGTGTCAGGTAACCAAGTATGTAAAGGTATAATCGGTAA
TTTGACGGCAAC


BQ
10 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4E830JQ U 1
AF RR4GV78TF C 2
AF RR4E169JQ U 1
AF RR4E169TF C 39
AF RR4GV78JQ U 1
AF RR4E830TF C 6
AF RR4E461TF C 26
AF RR4E461JQ U 1
AF RR4AD78JQ U 2
AF RR4AD78TF C 2
BS 1 331 RR4E169JQ
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BS 810 810 RR4AD78TF
BS 811 852 RR4AD78JQ

RD RR4E830JQ 584 0 0
C
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TTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATAC

QA 2 584 2 584
DS 

RD RR4GV78TF 649 0 0
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GAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGT
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TTGCCATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATTA
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CCATCGATAAGATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCC*
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CAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCG
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TCTTTTTTTAAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4E169JQ 703 0 0
CCTGAAAACTATCCATAAAAATAATTAGATAAAATGGATTCGACCTTGTCACTTGCTAAT
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AGAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTG
TATCCATAGAACATTTGACGTAACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCA
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ATTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGT
GCAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCC
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C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4E169TF 665 0 0
T
TCGAC*TTGTCACTTGCTAATGAGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATG
GGTAGAAGAATAGAGATTGAAAGAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAG
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ATGGAGATAGCCATTCCACCCATTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTA
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GCTCCATTAAGCCCAGGATCCGTTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGA
GATACAGAAGAATAGGCTATTCTCTTTTTT*AAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGC
TGCATAAATTATTTGGATTGTACCGACTACCATCAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGC
GTG
C

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR4GV78JQ 691 0 0
G
CTGAAAACTATCCATAAAAATAATTAGATAAAATGGATTCGACCTTGTCACTTGCTAATG
AGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAAA
GAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGT
ATCCATAGAACATTTGACGTAACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAA
TTGCCATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATTA
TTCCAAAAAAA*CGATTAATTCTGCAATAAAACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAAG
CCATCGATAAGATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCA
TTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTG
CAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCG
TTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGGCTATTC
TCTTTTTTTAAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTA
CCGACTACCATCAACCAAGGAGAAAACAT
C

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR4E830TF 698 0 0
AAACTATCCATAAAAATAAT*AGATAAAATGGATTCGAC*TTGTCACTTGCTAATGAGAG
CACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAAAGAAA
TAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGTATCC
ATAGAACATTTGACGTAACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAATTGC
CATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATTATTCC
AAAAAAAACGATTAATTCTGCAATAACACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAAGCCAT
CGATAAGATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCATTTC
ATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTGCAGC
GCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCGTTAT
AGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGGCTATTCTCTT
TTTT*AAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTACCGA
CTACCATCAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGCGTG
C

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4E461TF 643 0 0
TAGATAAAATGGATTCGAC*TTGTCACTTGCTAATGAGAGCACAAAATCAGGATAAATCC
CAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAAAGAAATAACTCTCGGGGTCCAGAAT
CAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGTATCCATAGAACATTTGACGTAACA
TAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAATTGCCATTACAAAAATAATTAAAA
TTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATTATTCCAAAAAAAACGATTAATTCTG
CAATAAAACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAAGCCATCGATAAGATAGTGAACATTG
TAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCATTTCATCAAGATAAACAAGCCGGA
TTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTGCAGCGCCAATAAATCCATGAGAGA
TTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCGTTATAGAACCAATACCTATAATTA
TAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGGCTATTCTCTTTTTTTAAATTACGTTGACCG
AGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTACCGACTA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4E461JQ 726 0 0
C
CTGAAAACTATCCATAAAAATAATTAGATAAAATGGATTCGACCTTGTCACTTGCTAATG
AGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAAA
GAAATAACTCTCGGGGTCCAAAATCAAAAAAAAAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGT
ATCCATAGAACATTTGACGTAACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAA
TTGCCATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATTA
TTCCAAAAAAAACGATTAATTCTGCAATAAAACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAAG
CCATCGATAAAATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCA
TTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTG
CAGCGCCAATAAATCCATGAAAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCG
TTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGGCTATTC
TCTTTTTTTAAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTA
CCGACTACCATCAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGCGTGAGGTAATAATTCCATATTG
ATTC
C

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4AD78JQ 851 0 0
CTGAAAACTATCCATAAAAATAATTAGATAAAATGGATTCGACCTTGTCACTTGCTAATG
AGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAAA
GAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGT
ATCCATAGAACATTTGACGTGACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAA
TTGCCATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATT*
**CCAAAAAAAACGATTAATTCTGCAATAAAACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAAG
CCATCGATAAGATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCA
TTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTG
CAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCG
TTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGACTATTC
TCTTTTTT*AAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTA
CCGACTACCATCAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGCGTGAGGTAATAATTCTATATTG
ATTCGAACCAATCCATATGCTCCCATTTTTAATAAGATTCCAGCGAGAAGCATACAGGTA
CTGTAATGTGCCTCGCCGTGGGTGTCAG*TAACCAAGTATGTAAAGGTATAATCGGTAAT
TTGACGGCAAC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4AD78TF 846 0 0
CTGAAAACTATCCATAAAAATAAT*AGATAAAATGGAT*CGAC*TTGTCACTTGCTAATG
AGAGCACAAAATCAGGATAAATCCCAATACCAATTATGGGTAGAAGAATAGAGATTGAAA
GAAATAACTCTCGGGGTCCAGAATCAAAAAAAGAAAAGTTTTTGGCATTAATTAACTTGT
ATCCATAGAACATTTGACGTGACATAGATAATAAATATATAGGAGTTAATATCATTCCAA
TTGCCATTACAAAAATAATTAAAATTTTTGAAATTAAGAAATATTTTTGGCTGGTAATT*
**CCAAAAAAAACGATTAATTCTGCAATAAAACCACTCATGCCCGGTAATGCAAGGGAAG
CCATCGATAAGATAGTGAACATTGTAAATATCTTTGGAATGGAGATAGCCATTCCACCCA
TTTCATCAAGATAAACAAGCCGGATTCTATCATAACTAGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTG
CAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTAAGCCCAGGATCCG
TTATAGAACCAATACCTATAATTATAAAACCCATATGAGATACAGAAGAATAGACTATTC
TCTTTTTT*AAATTACGTTGACCGAGAGATGTTAAAGCTGCATAAATTATTTGGATTGTA
CCGACTACCATCAACCAAGGAGAAAACATAGAATGAGCGTGAGGTAATAATTCTATATTG
ATTCGAACCAATCCATATGCTCCCATTTTTAATAAGATTCCAGCGAGAAGCATACAGGTA
CTGTAATGTGCCTCGCCGTGGGTGTCAGGTAACCAAGTATGTAAAGGTATAATCGGTAAT
TTGACG

QA 1 846 1 846
DS 



AS 2 12

CO CL230Contig1 1158 4 43 U
GGAAGATCATACTTTCCCTTTAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTACGAAA
ATTTTAAGATGAAGTCTCTTCAATCACCGATTGTTTGCCCTAGTGTTCGTCCCAGACAAG
TGAGTGTGTCTGCTTCACTCGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCTCAGGAACC
AGTTTTGGGGTCATCAGACCAAAAACGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGATAGTACGGA
GTTGTAAGGGTATACAGTGTCTTTTCAGCTCTCATTCAGATGGTAACGGAAGCACAGCAG
AGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATCTGCTGAGG
TAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACTTCGTTGTG
TTCACAATAATCCTCAGGGTGGGAATCTTCCGAGTTATGCTCCACACTCTGCTATTGTGC
TGAAGATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGATGCCAAGTG
TATTACTGATGGCAGCATTGACTAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTATGAAGTGG
TGATGGAGATGGTAGAAAAAATGGGATACGAGGTTAGGCTTGTTCGAGTTACCACAAGAG
TTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTTCTTTCAAAGGTGGGTGATAAGTCGGACTGTG
TCAGCTTCGATCTTCGTCCTTCTGATGCTATTAATATAGCTGTCAGGTGCAAGGTACCCA
TCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGCGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCTGGAAAGC
TGTCAAAGCAAACACCTGCTTCAGATGGTTTATTACATACTGAACTAGACCGGCCAAATG
GTCAGCCTTGTCTTGATACAAAAGAGTTTGATCTCCTGAACAACATGATGCAAGCCGTTA
ATGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTCAAGCGA
AACGCAAACTAAGGAAATACACATGATCGACAGAGCAGTTCCGAGACAAAATGTATTTAT
AAAAGTAGTAGTATTATTGTAAATAATAAAGAAGCCATTGCTTAGAAGCTGCGATCAAAG
TGATGGACATGGACGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B394TF U 1
AF RR4DD23TF U 233
AF RR4D737TF U 28
AF RR4F995TF U 417
BS 1 122 RR4B394TF
BS 123 123 RR4D737TF
BS 124 139 RR4B394TF
BS 140 140 RR4D737TF
BS 141 147 RR4B394TF
BS 148 148 RR4D737TF
BS 149 201 RR4B394TF
BS 202 202 RR4D737TF
BS 203 241 RR4B394TF
BS 242 243 RR4D737TF
BS 244 251 RR4B394TF
BS 252 252 RR4D737TF
BS 253 382 RR4B394TF
BS 383 383 RR4D737TF
BS 384 409 RR4B394TF
BS 410 410 RR4D737TF
BS 411 439 RR4B394TF
BS 440 440 RR4D737TF
BS 441 616 RR4B394TF
BS 617 617 RR4D737TF
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BS 645 645 RR4D737TF
BS 646 655 RR4B394TF
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BS 657 666 RR4B394TF
BS 667 698 RR4D737TF
BS 699 699 RR4DD23TF
BS 700 766 RR4D737TF
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BS 768 773 RR4D737TF
BS 774 774 RR4F995TF
BS 775 778 RR4D737TF
BS 779 779 RR4F995TF
BS 780 789 RR4D737TF
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BS 791 813 RR4D737TF
BS 814 1158 RR4F995TF

RD RR4B394TF 666 0 0
GGAAGATCATACTTTCCCTTTAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTACGAAA
ATTTTAAGATGAAGTCTCTTCAATCACCGATTGTTTGCCCTAGTGTTCGTCCCAGACAAG
TGGGTGTGTCTGCTTCACTTGTCAACTGCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCTCAGGAACC
AGTTTTGGGGTCATCAGACCAGAAACGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGATAGTACGGA
GGGGTAAGGGTGTACAGTGTCTTTTCAGCTCTCATTCAGATGGTAACGGAAGCACAGCAG
AGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATCTGCTGAGG
TAAGAAGTGGACCAGATGGTTT*GTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAGCTTCGTTGTG
TTCACAATAATCCTCAGGGAGGGAATCTTCCGAGTTATGCTCCACACTCTGCTATTGTGC
TGAAGATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGATGCCAAGTG
TATTACTGATGGCAGCATTGACTAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTATGAAGTGG
TGATGGAGATGGTAGATAAAATGGGTTACGAGGTTCGACTTGTTAGAGTTACCACCAGAG
TTCACG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4DD23TF 536 0 0
G
GTACGGAGTTGTAAGGGTATACAGTGTCTTTTCAGCTCTCATTCAGAAGGTAACGGAAGC
ACAGCAGAGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATCT
GCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACTT
CGTTGTGTTCACAATAATCCTCAGGGTGGGAATCTTCCGAGTTATGCTCCACACTCTGCT
ATTGTACTGAAGATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGATG
CCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACTAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTAT
GAAGTGGTGATGGAGATGGTAGAAAAAATGGGATACGAGGTTAGGCTTGTTCGAGTTACC
ACAAGAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTTCTTTCAAAGGTGGGTGATAAGTCG
GACTGTGTCAGCTTCGATCTTCGTCCTTCTGATGCTATTAATATAGCTGTCAG
GT

QA 2 534 2 534
DS 

RD RR4D737TF 786 0 0
GG
GTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTACGAAAATTTTAAGATGAGGTCTCTTCAATCACCG
ATTGTTTGCCCTAGTGTTCGTCCCAGACAAGTGAGTGTGTCTGCTTCGCTCGTCAACTCC
ACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCTCAGGAACCGGTTTTGGGGTCATCAGACCAAAAACGTC
AAGTCCCAGGTTGCTACAGTGATAGTACGGAGTTGTAAGGGTATACAGTGTCTTTTCAGC
TCTCATTCAGATGGTAACGGAAGCACAGCAGAGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTAT
GTCAAGTCTAGTGTACTTGAATCTGCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTG
AAGATGAGAGACGGTAGGCAACTTCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAGGGTGGGAATCTT
CCGAGTTATGCTCCACACTCTGCTATTGTGCTGAAGATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTT
CTTCCTATTATCGTCTTGGAGATGCCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACTAATGTG
AAAATAGCAAGGCCAACTATGTATGAAGTGGTGATGGAGATGGTAGAAAAAATGGGATAC
GAGGTTAGGCTTGTTCGAGTTACCACAAGAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTT
CTTTCAAAG*TGGGTGATAAGTCGGACTGTGTCAGCTTCGATCTTCGTCCTTCTGATGCT
ATTAATATAGCTGTCAG*TGCAAG*TACC*ATCCAAGTGA*CAAGTTTCTAGCTTATAGC
GATG

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR4F995TF 742 0 0
G
GTGTTCACAATAATCCTCAGGGTGGGAATCTTCCGAGTTATGCTCCACACTCTGCTATTG
TGCTGAAGATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGATGCCAA
GTGTATTACTGATGGCAGCATTGACTAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTATGAAG
TGGTGATGGAGATGGTAGAAAAAATGGGATACGAGGTTAGGCTTGTTCGAGTTACCACAA
GAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTTCTTTCAAAGGTGGGTGATAAGTCGGACT
GTGTCAGCTTCGATCTTCGTCCTTCTGATGCTATTAATATAGCTTTCAGGTGCAAGGTAC
CCATCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGCGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCTGGAA
AGCTGTCAAAGCAAACACCTGCTTCAGATGGTTTATTACATACTGAACTAGACCGGCCAA
ATGGTCAGCCTTGTCTTGATACAAAAGAGTTTGATCTCCTGAACAACATGATGCAAGCCG
TTAATGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTCAAG
CGAAACGCAAACTAAGGAAATACACATGATCGACAGAGCAGTTCCGAGACAAAATGTATT
TATAAAAGTAGTAGTATTATTGTAAATAATAAAGAAGCCATTGCTTAGAAGCTGCGATCA
AAGTGATGGACATGGACGCTT

QA 2 742 2 742
DS 



CO CL230Contig2 808 8 4 U
AATACTTTCCACTATAATTTATTAATCTAATTACGAGAGATGATCAATGTATGATTATGT
ATGTACACATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTT
ATCTTCGAGGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCA
CACGAGATATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATGTCCATCACTTTGATCGC
AGCTTCTAAGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACAT
TTTGTCTCGGAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAA
CTGGCCAAGCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTTG
CATCATGTTGTTCAGGAGATCAAACTCTTTTGTATCAAGACAAGGCTGACCATTTGGCCG
GTCTAGTTCAGTATGTAATAAACCATCTGAAGCAGGTGTTTGCTTTGACAGCTTTCCAGA
CTCGATGACTCTCATTCCATCGCTATAAGCTAGAAACTTGTTCACTTGGATGGGTACCTT
GCACCTGACAGCTATATTAATAGCATCAGAAGGACGAAGATCGAAGCTGACACAGTCCGA
CTTATCACCCACCTTTGAAAGGAATAACTGTGCGTAATAAGCCTCGTGAACTCTGGTGGT
AACTCTAACAAGTCGAACCTCGTAACCCATTTTATCTACCATCTCCATCACCACTTCATA
CATAGTTGGCCTTGCTATTTTCACATTA


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD23JQ U 4
AF RR4CC40TF C 4
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AF RR4GB96JQ U 9
AF RR4D737JQ U 1
AF RR4F995JQ U 48
AF RR4GB96TF C 9
AF RR4B394JQ U 10
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BS 520 520 RR4GB96JQ
BS 521 647 RR4D737JQ
BS 648 808 RR4B394JQ

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G
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ACACATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTTATCT
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AGATATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATGTCCATCACTTTGATCGCAGCT
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TCTCGGAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAACTGG
CCAAGCTTG

QA 2 370 2 370
DS 

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A
CTTTCCACTATAATTTATTAATCTAATTACGAGAGATGATCAATGTATGATTATGTATGT
ACACATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTTATCT
TCGAGGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCACACG
AGATATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCTATTTCCATCACTTTGATCGCAGCT
TCTAAGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACATTT*G
TCTCGGAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAACTGG
CCAAGCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTCGCATC
ATGTTGTTCAAGAGATCAAACTCTTTTGGATCAAGACAAGGCTGACCATTTGGCCGGTCT
AG
C

QA 2 483 2 483
DS 

RD RR4CF25TF 484 0 0
A
CTTTCCACTATAATTTATTAATCTAATTACGAGAGATGATCAATGTATGATTATGTATGT
ACACATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTTATCT
TCGAGGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCACACG
AGATATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCTATTTCCATCACTTTGATCGCAGCT
TCTAAGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACATTT*G
TCTCGGAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAACTGG
CCAAGCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTCGCATC
ATGTTGTTCAAGAGATCAAACTCTTTTGGATCAAGACAAGGCTGACCATTTGGCCGGTCT
AG
C

QA 2 483 2 483
DS 

RD RR4GB96JQ 543 0 0
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GGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCACACGAGAT
ATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATGTCCATCACTTTGATCGCAGCTTCTA
AGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACATTTTGTCTC
GGAACTGCTC*GTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAACTGGCCAA
GCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGT
TGTTCAGGAGATCAAACTCTTTTGTATCAAGACAAGGCTGACCATTTGGCCGGTCTAGTT
CAGTATGTAATAAACCATCTGAAGCAGGTGTTTGCTTTGACAGCTTTCCGGACTCGATGA
CTC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4D737JQ 647 0 0
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ATGTACACATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTT
ATCTTCGAGGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCA
CACGAGATATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATGTCCATCACTTTGATCGC
AGCTTCTAAGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACAT
TTTGTCTCGGAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAA
CTGGCCAAGCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTTG
CATCATGTTGTTCAGGAGATCAAACTCTTTTGTATCAAGACAAGGCTGACCATTTGGCCG
GTCTAGTTCAGTATGTAATAAACCATCTGAAGCAGGTGTCTGCTTTGACAGCTTTCCAGA
CTCGATGACTCTCATTCCATCGCTATAAGCTAGAAACTTGTTCACTTGGATGGGTACCTT
GCACCTGACAGCTATATTAATAGCATCAGAAGGACGAAGATCGAAGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4F995JQ 591 0 0
G
GTATGATTATGTATGTACACATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGAT
TTTATGTCTTTTATCTTCGAGGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAG
TATTCTCCATCACACGAGATATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATGTCCAT
CACTTTGATCGCAGCTTCTAAGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTT
TTATAAATACATTTTGTCTCGGAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCG
TTTCGCTTGAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTC
ATTAACGGCTTGCATCATGTTGTTCAGGAGATCAAACTCTTTTGTATCAAGACAAGGCTG
ACCATTTGGCCGGTCTAGTTCAGTATGTAATAAACCATCTGAAGCAGGTGTTTGCTTTGA
CAGCTTTCCAGACTCGATGACTCTCATTCCATCGCTATAAGCTAGAAACTTGTTCACTTG
GATGGGTACCTTGCACCTGAAAGCTATATTAATAGCATCAGAAGGACGAA

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR4GB96TF 656 0 0
CCACTATAATTTATTAATCTAATTACGAGAGATGATCAATGTATGATTATGTATGTACAC
ATCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTTATCTTCGA
GGAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCACACGAGAT
ATATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATGTCCATCACTTTGATCGCAGCTTCTA
AGCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACATTTTGTCTC
GGAACTGCTC*GTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCTTGAAACTGGCCAA
GCTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGT
TGTTCAGGAGATCAAACTCTTTTGTATCAAGACAAGGCTGACCATTTGGCCGGTCTAGTT
CAGTATGTAATAAACCATCTGAAGCAGGTGTTTGCTTTGACAGCTTTCCGGACTCGATGA
CTCTCATTCCATCGCTATAAGCTAGAAACTTGTTCACTTGGATGGGTACCTTGCACCTGA
CAGCTATATTAATAGCATCAGAAGGACGAAGATCGAAGCTGACACAGTCCGACTT
C

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4B394JQ 799 0 0
CACTATAATTTATTAATCTAATTACGAGAGATGATCAATGTATGATTATGTATGTACACA
TCACTGATTGGTTTCACACGATAACACTACATACAAGATTTTATGTCTTTTATCTTCGAG
GAACTTACTAACAACGTGCACATGTGTATGATAGACGAGTATTCTCCATCACACGAGATA
TATTATTTCTTTTGCAAGGTTGGAAGCGTCCATTTCCATCACTTTGATCGCAGCTTCTAA
GCAATGGCTTCTTTATTATTTACAATAATACTACTACTTTTATAAATACATTT*GTCTCG
GAACTGCTCTGTCGATCATGTGTATTTCCTTAGTTTGCGTTTCGCGTGAAACTGGCCAAG
CTTGTCTCTCCACTCAGCTGCTTCATCATACCGTTCTTCATTAACGGCTCGCATCATGTT
GTTCAAGAGATCAAACTCTTTTGTATCAAGACAAGGATGACCATTTGGCCGGTCTAGTTC
AGTATGTAATAAACCATCAGAAGCAGGTGTTTGCTTTGATAGCTTTCCAGACTCGATGAC
TCTCATTCCATCACTATAAGCTAGAAACTTGTTGACTTGGATGGGCACCTTGCATCTGAC
AGCTATATTAATAGCATCAGAAGGACGAAGATCGAAGCTGACACAGTCCGACTTATCACC
CACCTTTGAAAGGAATAACTGTGCGTAATAAGCCTCGTGAACTCTGGTGGTAACTCTAAC
AAGTCGAACCTCGTAACCCATTTTATCTACCATCTCCATCACCACTTCATACATAGTTGG
CCTTGCTATTTTCACATTA

QA 1 799 1 799
DS 



AS 2 11

CO CL231Contig1 1308 6 19 U
CTCGAATCATAATCTAGTATTATATAAAAAGAAGCTCATTCTTATTCCCAGCTACACCAT
CCACAATATTTATTATTCATTAAGGTTCCTCAAACTAAGGTTAACAACAACACAAAGTCA
ATGTCACACCAGAAAACACGTGAGAGAGAGCTAAGATAACAAAAAGGGTTCAAAAGCCAA
GCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCGTGCATACGATTCTCAGCCTGTGGGAAGACAA
TGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCTTTCTGCAGGCAAAC
AATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGAGCTTCATCCACCTGGAATC
CTTGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCTTTTTGGCCCATACTGGCCCATACGT
CTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATCATGTACGATCTCTATCT
TACTTAATCCAGCTTGTTCTGCCTTTAGAACTCTCTCTTTGTCTGGCTCAAACCCTTTTG
GGCAAGCGCAGACAAAATGAAATGGAATAACTGATGCCAATTCTAACCATGAATGGACCA
TATTGTTCCCATCTCCAACATAGACAACCTTTGTCCCTTCAACTTGACCAATGTGCTCAA
TGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTATGATCTGTCAGACCATTGA
CAACAGGCACACTCGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTCCTGATGAGCAAAGACACGGG
CCATAATGATGTCATTATATCTCGACAGAACACGAGCAACGTCGCGAGTCTCCTCCCTCT
TGCCCATCTGAATGTCATCGGGACCAAGATACAAGGCATGTCCACCGAGCAAAAAGAAGC
CAGTCTCGAAGGAAACACGAGTCCTCATGGAGGGCTTTGCGAAGATCATAGACATGGACT
TGCCTTTGAAAGGCAGATAGTTCCTCTCCCCTGACTTGAGCAGGGCTTTGACCTCTGAGG
CCTTGTCTAGGATCTTTTTGATGGTCTCTGTGTCAAAATCATCTATGGCCAGAAAGTCTT
TCAGGTCACAACTTCCTTTCACATCGGAAGTTGTGGGGGAAGTGACAGAGGAGGCTTGGC
AGGCGACACGAAGGCGGAGGGAGGAGAAGGTCGCCGGAGAAGAGAGTGATACTGCGGAGA
AGCGAGTAAGAGTGGTGGACGATGAAGAGGAGAGGGAAAGAGAAGGTGATCGTGGCGTCG
AGACGTGAGAAGCCATAGCCGCCATTGTCCTAGTTAGGCTGATTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A387JQD U 47
AF RR4A787JQ U 1
AF RR4A787TF C 104
AF RR4A387JQ U 47
AF RR4A387TF C 507
AF RR4A387TFB C 632
BS 1 592 RR4A787JQ
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BS 596 596 RR4A387JQ
BS 597 605 RR4A787JQ
BS 606 606 RR4A387JQ
BS 607 724 RR4A787JQ
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BS 726 727 RR4A787JQ
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BS 729 733 RR4A787JQ
BS 734 734 RR4A387JQ
BS 735 801 RR4A787JQ
BS 802 802 RR4A387JQ
BS 803 806 RR4A787JQ
BS 807 874 RR4A387JQ
BS 875 875 RR4A387TF
BS 876 929 RR4A387JQ
BS 930 1308 RR4A387TF

RD RR4A387JQD 690 0 0
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GGTTCAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCGTGCATACGATTCTCAGC
CTGGGGGAAGACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCT
TTCTGCAGGCAAACAATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGAGCTTC
ATCCACCTGGAATCCTTGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCTTTTTGGCCCAT
ACTGGCCCATACGTCTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATCATG
TACGATCTCTATCTTACTTAATCCAGCTTGTTCTGCCTTTAGAACTCTCTCTTTGTCTGG
CTCAAACCCTTTTGGGCAAGCGCAGACAAAATGAAATGGAATAACTGATGCCAATTCTAA
CCATGAATGGACCATATTGTTCCCATCTCCAACATAGACAACCTTTGTCCCTTCAACTTG
ACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTATGATC
TGTCAGACCATTGACAACAGGCACACTCGA

QA 1 690 1 690
DS 

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CTCGAATCATAATCTAGTATTATATAAAAAGAAGCTCATTCTTATTCCCAGCTACACCAT
CCACAATATTTATTATTCATTAAGGTTCCTCAAACTAAGGTTAACAACAACACAAAGTCA
ATGTCACACCAGAAAACACGTGAGAGAGAGCTAAGATAACAAAAAGGGTTCAAAAGCCAA
GCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCGTGCATACGATTCTCAGCCTGTGGGAAGACAA
TGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCTTTCTGCAGGCAAAC
AATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGAGCTTCATCCACCTGGAATC
CTTGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCTTTTTGGCCCATACTGGCCCATACGT
CTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATCATGTACGATCTCTATCT
TACTTAATCCAGCTTGTTCTGCCTTTAGAACTCTCTCTTTGTCTGGCTCAAACCCTTTTG
GGCAAGCGCAGACAAAATGAAATGGAATAACTGATGCCAATTCTAACCATGAGTGAACCA
TATTGGTCCCATCTCCAACATAGACAACCTTTGTCCCTTCAACTTGACCAATGTGCTCAA
TGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTATGATCTGTCAGACCATTGA
CAACTGGTACACTAGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTCCTGATGAGCAAAGACACGGG
CCATAATGATGTCATTATATCCCGAC

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DS 

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ACAACAACACAAAGTCAATGTCACACCAGAAAACACGTGAGAGAGAGCTAAGATAACAAA
AAGGGTTCAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCGTGCATACGATTCTC
AGCCTGTGGGAAGACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCC
TCTTTCTGCAGGCAAACAATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGAGC
TTCATCCACCTGGAATCCTTGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCTTTTTGGCC
CATACTGGCCCATACGTCTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATC
ATGTACGATCTCTATCTTACTTAATCCAGCTTGTTCTGCCTTTAGAACTCTCTCTTTGTC
TGGCTCAAACCCTTTTGGGCAAGCGCAGACAAAATGAAATGGAATAACTGATGCCAATTC
TAACCATGAGTGAACCATATTGGTCCCATCTCCAACATAGACAACCTTTGTCCCTTCAAC
TTGACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTATG
ATCTGTCAGACCATTGACAACTGGTACACTAGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTCCTG
ATGAGCAAAGACACGGGCCATAATGATGTCATTATATCCCGACAGAACACGAGCAACGTC
GCGAGTCTCCTCCCTCTTGCCCATCTGGATGTCATTGGGACCGAGGTACAATGCATGTCC
ACC
AAGC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4A387JQ 883 0 0
CCCAGCTACACCATCCACAATATTTATTATTCATTAAGGTTCCTCAAACTAAGGTTAACA
ACAACACAAAGTCAATGTCACACCAGAAAACACGTGAGAGAGAGCTAAGATAACAAAAAG
GGTTCAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCGTGCATACGATTCTCAGC
CTGTGGGAAGACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCT
TTCTGCAGGCAAACAATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGAGCTTC
ATCCACCTGGAATCCTTGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCTTTTTGGCCCAT
ACTGGCCCATACGTCTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATCATG
TACGATCTCTATCTTACTTAATCCAGCTTGTTCTGCCTTTAAAACTCTCTCTTTGTCTGG
CTCAAACCCTTTTGGGCAAGCGCAGACAAAATGAAATGGAATAACTGATGCCAATTCTAA
CCATGAATGGACCATATTGTTCCCATCTCCAACATAGACAACCTTTGTCCCTTCAACTTG
ACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTATGATC
TGTCAGACCATTGACAACAGGCACACTCGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTCCTGATG
AGCAAAGACACGGGCCATAATGATGTCATTATATCTCGACAGAACACGAGCAACGTCGCG
AGTCTCCTCCCTCTTGCCCATCTGAATGTCATCGGGACCAAGATACAAAGCATGTCCACC
GAGCAAAAAGAAGCCAGTCTCGAAGGAAACACGAGTCCTCATG

QA 1 883 1 883
DS 

RD RR4A387TF 802 0 0
AGAACTCTCTCTTTGTCTGGCTCAAACCCTTTTGGGCAAGCGCAGACAAAATGAAATGGA
ATAACTGATGCCAATTCTAACCATGAATGGACCATATTGTTCCCATCTCCAACATAGACA
ACCTTTGTCCCTTCAACTTGACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATC
TGACAAGGATGGTTATGATCTGTCAGACCATTGACAACAGGCACACTCGAGTAGTTAGCC
AAATCAAGAATGTCCTGATGAGCAAAGACACGGGCCATAATGATGTCATTATATCTCGAC
AGAACACGAGCAACGTCGCGAGTCTCCTCCCTCTTGCCCATCTGAATGTCATCGGGACCA
AGATACAAGGCATGTCCACCGAGCAAAAAGAAGCCAGTCTCGAAGGAAACACGAGTCCTC
ATGGAGGGCTTTGCGAAGATCATAGACATGGACTTGCCTTTGAAAGGCAGATAGTTCCTC
TCCCCTGACTTGAGCAGGGCTTTGACCTCTGAGGCCTTGTCTAGGATCTTTTTGATGGTC
TCTGTGTCAAAATCATCTATGGCCAGAAAGTCTTTCAGGTCACAACTTCCTTTCACATCG
GAAGTTGTGGGGGAAGTGACAGAGGAGGCTTGGCAGGCGACACGAAGGCGGAGGGAGGAG
AAGGTCGCCGGAGAAGAGAGTGATACTGCGGAGAAGCGAGTAAGAGTGGTGGACGATGAA
GAGGAGAGGGAAAGAGAAGGTGATCGTGGCGTCGAGACGTGAGAAGCCATAGCCGCCATT
GTCCTAGTTAGGCTGATTCTCC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4A387TFB 677 0 0
GTCCCT
TTCAACTTGACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATG
GTTATGATCTGTCAGACCATTGACAACAGGCACACTCGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAAT
GTCCTGATGAGCAAAGACACGGGCCATAATGATGTCATTATATCTCGACAGAACACGAGC
AACGTCGCGAGTCTCCTCCCTCTTGCCCATCTGAATGTCATCGGGACCAAGATACAAGGC
ATGTCCACCGAGCAAAAAGAAGCCAGTCTCGAAGGAAACACGAGTCCTCATGGAGGGCTT
TGCGAAGATCATAGACATGGACTTGCCTTTGAAAGGCAGATAGTTCCTCTCCCCTGACTT
GAGCAGGGCTTTGACCTCTGAGGCCTTGTCTAGGATCTTTTTGATGGTCTCTGTGTCAAA
ATCATCTATGGCCAGAAAGTCTTTCAGGTCACAACTTCCTTTCACATCGGAAGTTGTGGG
GGAAGTGACAGAGGAGGCTTGGCAGGCGACACGAAGGCGGAGGGAGGAGAAGGTCGCCGG
AGAAGAGAGTGATACTGCGGAGAAGCGAGTAAGAGTGGTGGACGATGAAGAGGAGAGGGA
AAGAGAAGGTGATCGTGGCGTCGAGACGTGAGAAGCCATAGCCGCCATTGTCCTAGTTAG
GCTGATTCTCC

QA 7 677 7 677
DS 



CO CL231Contig2 1293 5 14 U
ACCTAACTAGGACAATGGCGGCTATGGCTTCTCACGTCTCGACGCCACGCTCACCTGCTC
TTTCCCTCTCCTCTTCACCGTCCACCACTCTCACTCGCTTCTCCGCCGTATCACTCTCTT
TTCCGGCGACCTTCTCCTCCCTCCGTCTTCGTGTCTCCTGCCAAGCCTCCTCCGTCACTT
CCCCCACAACTTCCGATTTGAAAGGAAGTTGTGACCTGAAAGACTTTCTGGCCATAGATG
ATTTTGACACAGAGACCATCAAAAAGATTCTCGACAAGGCCTCAGAGGTCAAGGCCCTGT
TGAAATCAGGTGAGAGGAACTATCTGCCTTTCAAAGGCAAGTCTATGTCTATGATCTTCG
CAAAGCCCTCCATGAGGACTCGTGTTTCCTTCGAGACTGGCTTCTTCTTGCTCGGTGGAC
ATGCCTTGTATCTTGGTCCCGATGACATCCAGATGGGCAAGAGGGAGGAGACTCGCGACG
TTGCTCGTGTTCTGTCGAGATATAATGACATCATTATGGCCCGTGTCTTTGCTCATCAGG
ACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGTGCCTGTTGTCAATGGTCTGACAGATCATA
ACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCACATTGGTCAAGTCG
AAGGGACAAAGGTTGTTTATGTTGGAGATGGGAACAATATGGTTCACTCATGGTTAGAAT
TGGCATCAGTTATTCCTTTCCACTTCGTCTGCGCTTGCCCAAAAGGGTTTGAGCCAGACA
AAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAAGCTGGTTTAAGTAAGATAGAGATCGTGCATGATG
CTAAAGAAGCTGTGATAGGAGCTGATGTTGTGTACTCAGACGTATGGGCCAGTATGGGCC
AAAAGGATGAAGCTGAATACCGCCGAAAAGCATTCCAAGGATTCCAGGTGGATGAAGCTC
TTATGAAGTTGGCTGGACCAAAAGCCTATTTCATGCATTGTTTGCCTGCAGAAAGAGAAG
TTGAGGTGACCAATGGAGTCGTGGAAGCTCCTTATTCCATTGTCTTCCCACAGGCTGAGA
ATCGTATGCATGCTCAAAATGCTATAATGCTTCATTTGCTTGGCTTTTAAACCCCTTTTT
GTTATCTTAGCTCTCTCTCTCTCTCACGTGTTTACTGGTGTGTCATTGACTTTGTGTTGT
TGTTAACCTTAGTGTGAGGAACCTTGATGAATAATATTGTGGATGGTCTAGCTGGGAATA
AGAATGAGCTTCTTTTTATATAATGCTAGATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AN34TF U 1
AF RR4GA09TF U 511
AF RR4FG78TF U 538
AF RR4FG78JQ C 610
AF RR4EO44JQ C 628
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BS 573 574 RR4AN34TF
BS 575 575 RR4GA09TF
BS 576 662 RR4AN34TF
BS 663 663 RR4GA09TF
BS 664 714 RR4AN34TF
BS 715 715 RR4GA09TF
BS 716 806 RR4AN34TF
BS 807 918 RR4GA09TF
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BS 920 1254 RR4GA09TF
BS 1255 1261 RR4FG78TF
BS 1262 1293 RR4FG78JQ

RD RR4AN34TF 806 0 0
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TTCCGGCGACCTTCTCCTCCCTCCGTCTTCGTGTCTCCTGCCAAGCCTCCTCCGTCACTT
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ATGCCTTGTATCTTGGTCCCGATGACATCCAGATGGGCAAGAGGGAGGAGACTCGCGACG
TTGCTCGTGTTCTGTCGAGATATAATGACATCATTATGGCCCGTGTCTTTGCTCATCAGG
ACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGTACCAGTTGTCAATGGTCTGACAGATCATA
ACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCACATTGGTCAAGTCG
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TGGCATCAGTTATTCCTTTCCACTTCGTCTGCGCTTGCCCAAAAGGGTTTGAGCCAGACA
AAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAA

QA 1 806 1 806
DS 

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G
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GCCTGTTGTCAATGGTCTGACAGATCATAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCT
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CGCTTGCCCAAAAGGGTTTGAGCCAGACAAAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAAGCTGG
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ATTCCAAGGATTCCAGGTGGATGAAGCTCTTATGAAGTTGGCTGGACCAAAAGCCTATTT
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TCATTTGCTTGGCTTTTAAACCCCTTTTTGTTATCTTAGCTCTCTCTCTCTCTCACGTGT
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TAATATTGTGGATGGTCTAGCTG

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR4FG78TF 724 0 0
G
GGACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGTGCCTGTTGTCAATGGTCTGACAGATCA
TAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCACATTGGTCAAGT
CGAAGGGACAAAGGTTGTTTATGTTGGAGATGGGAACAATATGGTTCACTCATGGTTAGA
ATTGGCATCAGTTATTCCTTTCCACTTCGTCTGCGCTTGCCCAAAAGGGTTTGAGCCAGA
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TCTTATGAAGTTGGCTGGACCAAAAGCCTATTTCATGCATTGTTTGCCTGCAGAAAGAGA
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TAA

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR4FG78JQ 684 0 0
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TTATTCCTTTCCACTTCGTCTGCGCTTGCCCAAAAGGGTTTGAGCCAGACAAAGAGAGAG
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CCAATGGAGTCGTGGAAGCTCCTTATTCCATTGTCTTCCCACAGGCTGAGAATCGTATGC
ATGCTCAAAATGCTATAATGCTTCATTTGCTTGGCTTTTAAACCCCTTTTTGTTATCTTA
GCTCTCTCTCTCTCTCACGTGTTTACTGGTGTGTCATTGACTTTGTGTTGTTGTTAACCT
TAGTGTGAGGAACCTTGATGAATAATATTGTGGATGGTCTAGCTGGGAATAAGAATGAGC
TTCTTTTTATATAATGCTAGATTA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EO44JQ 666 0 0
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ATGGGAACAATATGGTTCACTCATGGTTAGAATTGGCATCAGTTATTCCTTTCCACTTCG
TCTGCGCTTGCCCAAAAGGGTTTGAGCCAGACAAAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAAG
CTGGTTTAAGTAAGATAGAGATCGTGCATGATGCTAAAGAAGCTGTGATAGGAGCTGATG
TTGTGTACTCAGACGTATGGGCCAGTATGGGCCAAAAGGATGAAGCTGAATACCGCCGAA
AAGCATTCCAAGGATTCCAGGTGGATGAAGCTCTTATGAAGTTGGCTGGACCAAAAGCCT
ATTTCATGCATTGTTTGCCTGCAGAAAGAGAAGTTGAGGTGACCAATGGAGTCGTGGAAG
CTCCTTATTCCATTGTCTTCCCACAGGCTGAGAATCGTATGCATGCTCAAAATGCTATAA
TGCTTCATTTGCTTGGCTTTTAAACCCCTTTTTGTTATCTTAGCTCTCTCTCTCTCTCAC
GTGTTTACTGGTGTGTCATTGACTTTGTGTTGTTGTTAACCTTAGTGTGAGGAACCTTGA
TGAATAATATTGTGGATGGTCTAGCTGGGAATAAGAATGAGCTTCTTTTTATATAATGCT
AGATTA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 11

CO CL232Contig1 668 6 15 U
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CTCTCTCAGCAAGAGTTGAAACCATATGCATCAAACCTACTTGAACTAAAATATTTTTTA
AAAAAGGTAATTAAACCAAACAAAACAAAACACAACCATTACAGAGTATCCTTCTTCAAA
TCATTCATCTCTTTTTCAAGCTTTCTTTCACTTGGCACTGGCGAGCTGGGAGCGGATGAG
TTTAGCCGCATCAACCATGTTCTTCAGGGCAGGCTTAACCTCTGTGTACTTACGGGTCTT
GAGCCCACAGTCAGGGTTAACCCAAAGGATGTTCTGCTCAAGAACAGCAAGCATCTTGTT
GACTCTGTCTGCGATTTCCTCAGAAGATGGTATTCTTGGAGAGTGGATATCGTAGACACC
TGGACCAATTCCAGCACCGTACTTCACTCCTTCGCGGAACACAGAGAGAAGCTTCTCATC
AGATCGGGAGTTCTCAATGGTGATGACATCAGCATCCATGTCGATGATGGAGTGTATGAT
GTCATTGAAGTGGGAGTAGCACATGTGAGTGTGGATCTGGGTGGTGTCTTGGACGCCACA
GTTGGTGA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 5 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ53JQ U 1
AF RR4FQ53TF C 1
AF RR4DB17JQ U 38
AF RR4CU88TF C 37
AF RR4CU88JQ U 37
AF RR4FB07JQ U 1
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BS 179 179 RR4FQ53JQ
BS 180 215 RR4FB07JQ
BS 216 216 RR4FQ53JQ
BS 217 221 RR4FB07JQ
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BS 223 322 RR4FB07JQ
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RD RR4FQ53JQ 447 0 0
G
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TTAGCCGCATCAAC*ATGTTCTTCAGGGCAGGCTTAACCTCTGTGTACTTACGGGTCTTG
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DS 

RD RR4FQ53TF 450 0 0
G
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AGAAATGAAGGATACAAAACGAGAAACACAAACAGATCCAAAGGATACATATCTCTCATC
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AAAAGGTAATTAAACCAAAAAAAACAAAACACAACCATTACAGAGTATCCTTCTTCAAAT
CATTCATCTCTTTT*CAAGCTTTCTTTCACTTGGCACTGGCGAGCTGGGAGCGGATGAGT
TTAGCCGCATCAAC*ATGTTCTTCAGGGCAGGCTTAACCTCTGTGTACTTACGGGTCTTG
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ACTCTGTCTGCGATTTCCTCAGAAGATG
C

QA 2 449 2 449
DS 

RD RR4DB17JQ 478 0 0
GC
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QA 3 478 3 478
DS 

RD RR4CU88TF 481 0 0
G
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GGAGAGTGGATATCGTAGACACCTGGACCAATTCCAGCACCGTACTTCACTCC
TTCGCGG

QA 2 474 2 474
DS 

RD RR4CU88JQ 528 0 0
G
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TCCAAACGATACATATCTCTCATCTCTCTCAGCAAGAGTTGAAACCATATGCATCAAACC
TACTTGAACTAAAATATTTTT*AAAAAAGGTAATTAAACCAAACAAAACAAAACACAAGC
ATTATAGAGTATCCTTCTTCAAATCATTCATCTCTTTTTCAAGCTTTCTTTCACTTGGCA
CTGGCGAGCTGGGAGCGGATGAGTTTAGCCGCATCAACCATGTTCTTCAGGGCAGGCTTA
ACCTCTGTGTACTTACGGGTCTTGAGCCCACAGTCAGGGTTAACCCAAAGGATGTTCTGC
TCAAGAACAGCAAGCATCTTGTTGACTCTGTCTGCGATTTCCTCAGAAGATGGTATTCTT
GGAGAGTGGATATCGTAGACACCTGGACCAATTCCAGCACCGTACTTCACTCCTTCGCGG
AACACAGAGAGAAGCTTCTCATCAGATCGGGAGTTCTCAATGGTGA
C

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR4FB07JQ 668 0 0
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GAGAAATGAAGGATACAAAACGAGAAACACAAACAGATCCAAACGATACATATCTCTCAT
CTCTCTCAGCAAGAGTTGAAACCATATGCATCAAACCTACTTGAACTAAAATATTTTT*A
AAAAAGGTAATTAAACCAAACAAAACAAAACACAAGCATTATAGAGTATCCTTCTTCAAA
TCATTCATCTCTTTTTCAAGCTTTCTTTCACTTGGCACTGGCGAGCTGGGAGCGGATGAG
TTTAGCCGCATCAACCATGTTCCTCAGGGCAGGCTTAACCTCTGTGTACTTACGGGTCTT
GAGCCCACAGTCAGGGTTAACCCAAAGGATGTTCTGCTCAAGAACAGCAAGCATCTTGTT
GACTCTGTCTGCGATTTCCTCAAAAGATGGTATTCTTGGAGAGTGGATGTCGTAAACACC
TGGACCAATTCCAGCACCGTACTTCACTCCTTCGCGGAACACAGAGAGAAGCTTCTCATC
AGATCGGGAGTTCTCAATGGTGATGACATCAGCATCCATGTCGATGATGGAGTGTATGAT
GTCATTGAAGTGGGAGTAGCACATGTGAGTGTGGATCTGGGTGGTGTCTTGGACGCCACA
GTTGGTGA

QA 1 668 1 668
DS 



CO CL232Contig2 1151 5 38 U
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AGTCGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATTGATGTCCTCGTCCACGGAGAGCCAGAGAG
AAACGACATGGTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACCGCAAACGG
ATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGCTGTGTGAAACCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAG
CCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCC
AATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGA
CCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTTGAGGA
TCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGATGAGGCTGCACTCAGAGAAGGATT
ACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCCTTCAGAAT
CACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCTCACTT
CAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATTGAGAACTC
CCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGTTCCGTGAGGGAGTCAAGTACGGTGCTGGAAT
TGGTCCAGGTGTCTACGACATCCACTCCCCAAGAATACCATCCTCTGAGGAAATCGCAGA
CAGAGTAAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTTAACCCTGACTG
TGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAGCCAGCATTGAAGAACATGGTTGATGC
CGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAAAGCTTGAAATGAGAT
GATGAATTTGATGTGGTCTTGCTATAATGGTTTGTGTTTTTTATTTTGCTTTGATTACTT
TTTCTTATAAAAATATTTAGTCGAAGTTAGTTTTGATGCATATTGTTTATGATATGTCAT
CTTTTGGATTTGCTGTAATGTTTGTCCCTCCTTCGATTTCTCTGAAAGAAAATAAAGATT
GATTTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4FB07TF U 1
AF RR4AK11TF U 170
AF RR4ET66TF U 538
AF RR4AK11JQ C 395
AF RR4ET66JQ C 538
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BS 188 213 RR4FB07TF
BS 214 214 RR4AK11TF
BS 215 246 RR4FB07TF
BS 247 247 RR4AK11TF
BS 248 390 RR4FB07TF
BS 391 391 RR4AK11TF
BS 392 414 RR4FB07TF
BS 415 415 RR4AK11TF
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BS 737 1135 RR4ET66TF
BS 1136 1151 RR4AK11JQ

RD RR4FB07TF 693 0 0
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AGTCGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATTGATGTCCTCGTCCACGGAGAGCCAGAGAG
AAACGACATGGTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACCGCAAACGG
ATGGGTTCAATCTTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAG
CCGTCCTAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCC
AATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGA
CCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATTGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTCGGGGA
TCTTGAGAAAGGTGGAATTAGTGTCATTCAGATTGACGAGGCTGCCCTCAGAGAAGGACT
ACCACTCAGGAAGTCCGAGCACGCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCCTTCAGAAT
CACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCCCACTT
CAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTC
CCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGT
CCGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4AK11TF 567 0 0
ACT
GCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAACCACCAGTTATCTACGGT
GATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGTATGACC
TCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTAACTGGTCCTTCGTC
AGAAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAA
GTTGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGATGAGGCTGCACTCAGA
GAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCC
TTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTAC
TCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATT
GAGAACTCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGTTCCGTGAGGGAGTCAAGTACGGT
GCTGGAATTGGTCC*GGTGTCTAC

QA 4 567 4 567
DS 

RD RR4ET66TF 598 0 0
G
ATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCTCAC
TTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATTGAGAAC
TCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGTTCCGTGAGGGAGTCAAGTACGGTGCTGGA
ATTGGTCCAGGTGTCTACGACATCCACTCCCCAAGAATACCATCCTCTGAGGAAATCGCA
GACAGAGTAAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTTAACCCTGAC
TGTGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAGCCAGCATTGAAGAACATGGTTGAT
GCCGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAAAGCTTGAAATGAG
ATGATGAATTTGATGTGGTCTTGCTATAATGGTTTGTGTTTTTTATTTTGCTTTGATTAC
TTTTTCTTATAAAAATATTTAGTCGAAGTTAGTTTTGATGCATATTGTTTATGATATGTC
ATCTTTTGGATTTGCTGTAATGTTTGTCCCTCCTTCGATTTCTCTGAAAGAAAATAA

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR4AK11JQ 757 0 0
TTGGCCATCAAGGACGAAGTTGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATC
GATGAGGCTGCACTCAGAGAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACTTG
GACTGGGCTGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATC
CACACTCACATGTGCTACTCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGAT
GCTGATGTGATCACCATTGAGAACTCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGTTCCGT
GAGGGAGTCAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCC*GGTGTCTACGACATCCACTCCCCAAGA
ATACTATCCTCTGAGGAAACCGCAGACAGAGTAAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAG
AACATCCTTTGGGTTAACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAG
CCAGCATTGAAGAACATGGTTGATGCCGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCC
AAGTGAAGAAAAGCTTGAAATGAGATGATGAATTTGATGTGGTCTTGCTATAATGGTTTG
TGTTTTTTATTTTGCTTTGATTACTTTTTCTTATAAAAATATTTAGTCGAAGTTAGTTTT
GATGCATATTGTTTATGATATGTCATCTTTTGGATTTGCTGTAACGTTTGTCCCTCCTTC
GATTTCTCTGAAAGAAAATAAAGATTGATTTTTCTTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4ET66JQ 612 0 0
G
ATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCTCAC
TTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATTGAGAAC
TCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGTTCCGTGAGGGAGTCAAGTACGGTGCTGGA
ATTGGTCCAGGTGTTTACGACATCCACTCCCCAAGAATACCATCCTCTGAGGAAATCGCA
GACAGAGTAAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTTAACCCTGAC
TGTGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAGCCAGCATTGAAGAACATGGTTGAT
GCCGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAAAGCTTGAAATGAG
ATGATGAATTTGATGTGGTCTTGCTATAATGGTTTGTGTTTTTTATTTTGCTTTGATTAC
TTTTTCTTATAAAAATATTTAGTCGAAGTTAGTTTTGATGCATATTGTTTATGATATGTC
ATCTTTTGGATTTGCTGTAATGTTTGTCCCTCCTTCGATTTCTCTGAAAGAAAATAAAGA
TTGATTTTTCT

QA 2 612 2 612
DS 



AS 1 12

CO CL233Contig1 870 12 8 U
GGGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGAGCAGAACAGTCTCACGATGGCTACCA
CGTCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGT
TCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATC
TGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTA
GCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTA
ATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTC
CGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGG
AGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCG
GCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTC
TCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTATTGGTGGG*
CTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTT
TCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTT*AATTATCTCAT
ATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATG
TTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAACGATCATGTAATTCA
TAAGACATACATTAATAACTGATATTTGTT


BQ
10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 30 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF50TF U -2
AF RR4ET71TF U 2
AF RR4CO24TF U 1
AF RR4CS89JQ C 46
AF RR4CS89TF U 74
AF RR4AO47TF U 1
AF RR4BV79TF U 46
AF RR4BA31TF U 1
AF RR4AO47JQ C 74
AF RR4CO24JQ C 293
AF RR4ET71JQ C 122
AF RR4EF50JQ C 293
BS 1 96 RR4AO47TF
BS 97 97 RR4CS89TF
BS 98 164 RR4AO47TF
BS 165 165 RR4CS89TF
BS 166 241 RR4AO47TF
BS 242 242 RR4CS89TF
BS 243 840 RR4AO47TF
BS 841 870 RR4EF50JQ

RD RR4EF50TF 508 0 0
GGATC
GATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGAGCAGAACAGTCTCACGATGGCTACCACG
TCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGTTC
TTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATCTG
GCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAGC
CAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTAAGCACAAGATTCTGATTCCTAAT
GCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCCG
TTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGAG
GATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGGC
GTTGAACTCATTAACAGGATCCA

QA 6 508 6 508
DS 

RD RR4ET71TF 516 0 0
GGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGAGCAGAACAGTCTCACGATGGCTACCAC
GTCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGTT
CTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATCT
GGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAG
CCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTAA
TGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCCCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCC
GTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGA
GGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGG
CGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAAGTTGCTGA

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4CO24TF 686 0 0
G
GGATTCTGAAA*TCTTATCCTTCTGCAAACAGAGCAGAACAGTCTCACGATGGCTACCAC
GTCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGTT
CTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATTT
GGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCC***CCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAG
CCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTAA
TGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCC
GTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGA
GGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGG
CGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCT
CCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTATTGGTGGG*C
TGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTT
CCCCTAGGAAA*GAGCTTGGGCGTA

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR4CS89JQ 729 0 0
GG
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ACCACGGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTA
ACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCG
GAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAG
ATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCG
CCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGG
TGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGG
GATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGT
CATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTATCTCT
TCTATTGGTGGG*CTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAA
GACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTT
T*AATTATCTCATATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTC
GTTGGTC

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR4CS89TF 699 0 0
CTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGTTCTTCGGTTTCTC
ACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTT
TCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGA
TAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCT
CTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGA
TGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGG
TGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCAT
TAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAG
TCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTATCTCTTCTATTGGTGGGGCTGAGTATGAACG
ATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAA*
GAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTT**AATTATCTCATATTTGTGACATTT
TTGTATGATAACATATA*TACACGTGATGTATTCGTTGG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4AO47TF 840 0 0
GGGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGAGCAGAACAGTCTCACGATGGCTACCA
CGTCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACCTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGT
TCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGATAACCCGGAACAATC
TGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTA
GGCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTA
ATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTC
CGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGG
AGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCG
GCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTC
TCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTATTGGTGGG*
CTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTT
TCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTT*AATTATCTCAT
ATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATG
TTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAACGATCATGTAATTCA

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4BV79TF 757 0 0
AGGG
GATGGCTACCACGTCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCAC
CACGGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAAC
CCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGA
GGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGAT
TCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCC
TTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTG
GAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGA
TTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCA
TTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTC
TATTGGTGGA*CTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGA
CTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTTT
AATTATCTCATATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGT
TGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGT

QA 5 757 5 757
DS 

RD RR4BA31TF 828 0 0
G
GGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGAGCAGAACAGTCTCACGATGGCTACCAC
GTCATGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGTT
CTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATCT
GGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAG
CCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTAA
TGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCC
GTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGA
GGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGCGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGG
CGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCT
CCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTATTGGTGGG*C
TGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTT
CCCCTAG*AAAAGAGCTTGGGCGTAACATACTTGTTCTTTTTTTTTT*AATTATCTCATA
TTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATGT
TAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGG
GAAACG

QA 2 822 2 822
DS 

RD RR4AO47JQ 773 0 0
CTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACCTCCTCCTTGCACCACGGTTCAGTTCTTCGGTTTCTC
ACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGATAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTT
TCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAGGCAGTTCGGTGA
TAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCT
CTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGA
TGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGG
TGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCAT
TAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAG
TCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTATTGGTGGG*CTGAGTATGAACG
ATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAA
GAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTT*AATTATCTCATATTTGTGACATTT
TTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAG
AAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAACGATCATGTAATTCA
TAAGAC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4CO24JQ 520 0 0
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TCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAG
TATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTT
TGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTTTGGTCATTA
CCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTAT
TGGTGGG*CTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTT
CTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGGGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTTTAAT
TATCTCATATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGG
TCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCAT
G

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4ET71JQ 674 0 0
CTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGGAACAATCT
GGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAG
CCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTTTGATTCCTAA
TGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCCCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTTTCAGGCTCC
GTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGA
GGATGAAGCGGGTGGTTTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGG
CGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTTTGGTCATTACCCTTCTCT
CCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATTTACCTTTTTTATTGGTGGG*C
TGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTT
CCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTT*AATTATTTCATA
TTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATGT
TAAGTTATATAGA
G

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4EF50JQ 578 0 0
GATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTC
TCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAG
TATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTT
TGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTA
CCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCTAT
TGGTGGG*CTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTT
CTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTTTTTAAT
TATCTCATATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGG
TCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAACGATCAT
GTAATTCATAAGACATACATTAATAACTGATATTTGTT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 11

CO CL234Contig1 1265 11 36 U
TTTTTGTTTTTAGGGTTTCTCCTTTTCTCCTCCTAACTCACACAACACTCTCCCGAGGTT
AAAGCGACGGTGCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCTAGGCCCTC
CTCACTTTTTTTTCTTATCTTTTACCATCCCCTCTCAATCAAAATGGCGGTGAAAGCAAC
AAAGGCGGAGAAGAAGATCGTGTACGACTCGAAGCTGTGCCAGCTTCTGAATGAGTACCC
TCAGATCCTCATCGTCGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAA
AGGTCTCCGCGGAGATTCCGTTGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGAGATCTGT
TAAGCTTCATGCTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCA
GGGGAACGTTGGGCTTATCTTTACTAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGC
TAAGTACAAGGTTGGAGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTTGCTCCAATTGATGTGGTTGT
GCAACCAGGCAACACTGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCAAGTGCTCAACAT
TCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCTGTTGAGCTCATCAAGAA
GGGCGACAAGGTCGGTTCATCCGAGGCAGCTCTTCTGGCCAAGCTTGGTATCAGGCCGTT
CTCTTATGGTCTCGTCGTGGAGTCGGTCTACGACAACGGCTCTGTGTTTGACCCTGAGGT
GCTTAACCTCACTGAAGACGACCTTGTTGAAAAGTTTGCAGCTGGTGTCTCGCTGGTGAC
CGCGTTTTCTCTTTCCATCTCTTACCCAACCATAGCAGCTGCGCCTCACATGTTCCTCAA
TGCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGCATTGGCTACTGAGTATTCTTTCCCTCAGGCTGA
GAATGTGAAGGAGTTCCTCAAGGATCCAAGCAAGTTTGCTGTTGCTTCGGCGGCTGCACC
TGTTTCAGGAGAATCTAGTGGAGCTCCTGTTGTGGCAGCTGTGGAGGAAGAAGCTGCGGA
GGAGTCTGATGGAGACATGGGATTCGATCTGTTCGGCTAAAATATGCCCGTCTTAAGCTT
TGCACCTGTTATTTTTATGATTATCAGTTAAAGTTGAACCTTTTATTAATTTTTACTTTT
CAGAATTTCGTTGTTGCAAGTTATGGATATTTTATTTTATCTATCAAAAAGTGTTTTCTG
GTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 45 
5 45 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 

AF RR4DB82TF U 12
AF RR4AC48TF U 12
AF RR4GX54TF U 10
AF RR4FT27TF U 1
AF RR4GU21TF U 1
AF RR4AK96TF U 12
AF RR4AA53TF U 12
AF RR4GX54JQ C 883
AF RR4GU21JQ C 482
AF RR4DB82JQ C 581
AF RR4AK96JQ C 533
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BS 104 132 RR4FT27TF
BS 133 133 RR4GU21TF
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BS 202 202 RR4GU21TF
BS 203 342 RR4FT27TF
BS 343 343 RR4GU21TF
BS 344 369 RR4FT27TF
BS 370 370 RR4GU21TF
BS 371 444 RR4FT27TF
BS 445 445 RR4GU21TF
BS 446 548 RR4FT27TF
BS 549 549 RR4GU21TF
BS 550 662 RR4FT27TF
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GCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCTAGGCCCTCCTCACTTTTTT
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TCGTCGCGGTGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAAAGGTCTCCGCG
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GGCTTATCTTTACTAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGCTAAGTACAAGG
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DS 

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GT
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GCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGCGCTTCGTCTAGGCCCTCCTCACTTTTTT
T*CTTATCTTTTACCATCCCCTCTCAATCAAAATGGCGGTGAAAGCAACAAAGGCGGAGA
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TCGTCGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAAAGGTCTCCGCG
GAGATTCCGTTGTTCTCATGGGGAAGAACACGATGATGAAGAGATCTGTTAAGCTTCACG
CTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCAGGGGAACGTTG
GGCTTATCTTTACCAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGCTAAGTACAAGG
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ACACTGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCAAGTGCTCAACATTCCAACCAAGA
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DS 

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TCAGATCCTCATCGTCGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAA
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TAAGCTTCACGCTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCA
GGGGAACGTTGGGCTTATCTTTACCAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGC
TAAGTACAAGGTTGGAGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTTGCTCCAATTGATGTGGTTGT
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GG*CGACAAGGTCGGTTCGTCCGAG*CAGCTCTTCTG

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DS 

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AAAGCGACGGCGCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCTAGGCCCTC
CTCACTTTTTTTTCTTATCTTTTACCATCCCCTCTCAATCAAAATGGCGGTGAAAGCAAC
AAAGGCGGAGAAGAAGATCGTGTACGACTCGAAGCTGTGCCAGCTTCTGAATGAGTACCC
TCAGATCCTCATCGTCGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAA
AGGTCTCCGCGGAGATTCCGTTGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGAGATCCGT
TAAGCTTCATGCTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCA
GGGGAACGTTGGGCTTATCTTTACTAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGC
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TCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCTGTTGAGCTCATCAAGAA
AG
CGA

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DS 

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GCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGCGCTTCGTCTAGGCCCTCCTCACTTTTTT
T*CTTATCTTTTACCATCCCCTCTCAATCAAAATGGCGGTGAAAGCAACAAAGGCGGAGA
AGAAGATCGTTTACGACTCGAAGCTGTGCCAGCTTCTGAATGAGTACCCTCAGATCCTCA
TCGTCGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAAAGGTCTCCGCG
GAGATTCCGTTGTTCTCATGGGGAAGAACACGATGATGAAGAGATCTGTTAAGCTTCACG
CTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCAGGGGAACGTTG
GGCTTATCTTTACCAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGCTAAGTACAAGG
TTGGAGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTTGCTCCAATTGATGTGGTTGTGCAACCAGGCA
ACACTGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCATGTGCTCAACATTCCAACCAAGA
TCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCTGTTGAGCTCATCAAGAAGGGCGAC

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DS 

RD RR4AA53TF 726 0 0
AGGT
TTTCTCCTTCTCTCCTCCTAACTCACACAACACTTTCCCGAGGTTAAAGCGACGGCGCTA
CTTCGTTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCTAGGCCCTCCTCACTTTTTTTTCT
TATCTTTTACCATCCCCTCTCAATCAAAATGGCGGTGAAAGCAACAAAGGCGGAGAAGAA
GATCGTGTACGACTCGAAGCTGTGCCAGCTTCTAAATGAGTACCCTCAGATCCTCATCGT
CGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTCCAGAACATACGGAAAGGTCTCCGCGGAGA
TTCCGTTGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGAGATCTGTTAAGCTTCATGCTCA
GAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCAGGGGAACGTTGGGCT
TATCTTTACTAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGCTAAGTACAAGGTTGG
AGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTTGCTCCAATTGATGTGGTTGTGCAACCAGGCAACAC
TGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCAAGTGCTCAACATTCCAACCAAGATCAA
CAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCTGTTGAGCTCATCAAGAAAGGCGACAAGGTCGG
TTCATCCGAGGCAGCTCTTCTGGCCAAGCTTGGTATCAG*CCGTTCTCTTATGGTCTCGT
CG

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DS 

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TGCTTCGGCGGCTGCCCCTGTTTCAGGAGAATTTAGTGGAGCTCCTGTTGTGGCATCTGT
GGAGGAAGAAGCTGCGGAGGAGTTTGATGGAGACATGGGATTCGATCTGTTCGGCTAAAA
TATGCCCGTCTTAAGCTTTGCCCCTGTTATTTTTATGATTATCAGTTAAAGTTGACCCTT
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DS 

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GGCGACAAGGTCGGTTCATCCGAGGCAGCTCTTCTGGCCAAGCTTGGCATCAGGCCGTTC
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GCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGCATTGGCTACTGAGTATTCTTTCCCTCAGGCTGAG
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GTTTCAGGAGAATCTAGTGGAGCTCCTGTTGTGGCAGCTGTGGAGGAAGAAGCTGCGGAG
GAGTCTGATGGAGACATGGGATTCGATCTGTTCGGCTAAAATATGCCCGTCTTAAGCTTT
GCACCTGTTATTTTTATGATTATCAGTTTAAGTTGAACTTTTTATTAAAATTTACTTT*C
AGAATTTCGTTGTTGCAAGTTATGGATATTTTATTTTATCTATCAAAATGTGTTTTCTGG
T
TTT

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4DB82JQ 683 0 0
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TCTGTGTTTGACCCTGAGGTGCTTAACCTCACTGAAGACGACCTTGTTGAAAAGTTTGCA
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GCGCCTCACATGTTCCTCAATGCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGCATTGGCTACTGAG
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GTTGCTTCGGCGGCTGCACCTGTTTCAGGAGAATCTAGTGGAGCTCCTGTTGTGGCAGCT
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TTTTATTAATTTTTACTTT*CAGAATTTCGTTGTTGCAAGTTATGGATATTTTATTTTAT
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C

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4AK96JQ 733 0 0
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CTCAACATTCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCTGTTGAGCTC
ATCAAGAAGGGCGACAAGGTCGGTTCGTCCGAGGCAGCTCTTCTGGCCAAGCTTGGTATC
AGGCCGTTCTCTTATGGTCTCGTCGTGGAGTCGGTCTACGACAACGGCTCTGTGTTTGAC
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CTGGTGACCGCGTTTTCTCTTGCCATCTCTTACCCAACCGTTGCAGCTGCGCCTCACATG
TTCCTCAATGCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGCATTGGCTACTGAGTATTCTTTTCCT
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GCTGCGGAGGAGTCTGATGGAGACATGGGATTCGATCTGTTCGGCTAAAATATGCCCGTC
TTAAGCTTTGCACCTGTTATTTTTATGATTATCAGTTAAAGTTGAACCTTTTATTAATTT
TTACTTTTCAGAATTTCGTTGTTGCAAGTTATGGATATTTTATTTTATCTATCAAAAATC
GTTTTCTGGTTTT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 11

CO CL235Contig1 824 11 9 U
GGGAGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTACCAAAGAAAATCAATTATGGCAACAA
TGAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTAATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCC
ATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGA
GACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACC
TTACCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTG
TTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTA
TTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTC
CTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTT
CTCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTC
CAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACC
ACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTG
GCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTTT
CTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAATTTG
ATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATATTTTTTTAAATCACG


BQ
10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 40 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 
65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
30 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 20 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 40 40 40 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H637TF U 2
AF RR4F235TF U 2
AF RR4G475TF U 2
AF RR4F235JQ C 280
AF RR4AR41TF U -3
AF RR4G475JQ C 415
AF RR4E817TF U -3
AF RR4BI85TF U 1
AF RR4BI85JQ C 2
AF RR4AR41JQ C 239
AF RR4E817JQ C 195
BS 1 211 RR4BI85TF
BS 212 212 RR4H637TF
BS 213 214 RR4BI85TF
BS 215 215 RR4F235TF
BS 216 757 RR4BI85TF
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BS 760 798 RR4BI85TF
BS 799 816 RR4BI85JQ
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ACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCT
TACCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGT
TGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGGGTAGTAAAGATATGGGTAT
TGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCC
TCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTC
TCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCC
AACTTTGGCTGACTCGCCGGACATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCA
CCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTC

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DS 

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GAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTAATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCA
TGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGAG
ACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATTTTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCT
TACCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGT
TGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTAT
TGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCC
TCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTC
TCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCC
AACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCA
CCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGG
CTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTG

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DS 

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ACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATTTTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCT
TACCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGT
TGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGTTATGGGTAT
TGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCC
TCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTC
TCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCC
AACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCATTAACCA
CCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGG
CTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTTTC
TTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAG*ACCGATGCTGTT

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DS 

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TTTGCAAGCTCCCCGTTTTTCCTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGGGCATTTA
CTCCTGGTATGTTTTCAGTTTTTCCTTTTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTTTTCAG
CCCAGTCACCCACATTTTTTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTC
CCTCGAGTTTTGGCACCAACCACCTTTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATT
TTTTTTATAACTTACATTTTGGCTTTTTTTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATA
TTTTTTTACTGAATTTTTTTTTTTTTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAG
ACCGATGCTGTTTTT

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DS 

RD RR4AR41TF 779 0 0
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CCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGAC
CATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTA
CCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTG
TACAATATAATCCTGATTGTTTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTG
CAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTC
CCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTC
CTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCCAA
CTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACC
TCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGGCT
TTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTTTCTT
CTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTA

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DS 

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TTT
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TTTCTCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTTTTCAGCCCAGTCACCCACATTTT
CTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCATTA
ACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTTTTCTATAACTTACATT
TTGGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTT
TTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGC

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DS 

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GGAAATC
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AGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTAATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCATG
CCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGAC
CATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTA
CCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTG
TACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTG
CAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTC
CCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGCGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTC
CTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCCAA
CTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACC
TCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGGCT
TTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTT*CTT
CTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAG*ACCGATGCTGT

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DS 

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TGAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTAATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCC
ATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGA
GACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATTTTCGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACC
TTACCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTG
TTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTA
TTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTC
CTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTT
CTCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTC
CAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACC
ACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTG
GCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTTT
CTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAG*ACCGATGCTGTTTTTAATTTG
ATGTTCTTTGTTAATCAA

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DS 

RD RR4BI85JQ 821 0 0
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GAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTAATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCA
TGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGAG
ACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATTTTCGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCT
TACCCCTGGATCAAATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGT
TGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTAT
TGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCC
TCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTC
TCCTTCTGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCC
AACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCA
CCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGG
CTTTTTTTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTTTC
TTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAGGACCGATGCTGTTTTTAATTTGA
TGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATATTTTTTT
TAAATC

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DS 

RD RR4AR41JQ 578 0 0
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TGTTGTACAATATAATCCTGATTGTTTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGG
TATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTTT
TCCTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTTTTCAGT
TTCTCCTTTTGCTGTAACACCTATGACTCCCCCGTTTTCAGCCCAGTCACCCACATTTTT
TCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCCCCTCCCTCGAGTTTTGGCACCAA
CCACCTTTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTTTTCTATAACTTACATTT
TGGCTTTTTTTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTTTACTGAATTTTTT
TTTTTTTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAATT
TGATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATATTTTTTT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4E817JQ 630 0 0
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AATGATACTAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGAAATCCAATCTGTTGTACAATATAAT
CCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTGCAGTGAATAAC
ACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTCCCCATTGTACT
ATACTGGACGCGCCGAGCGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTCCTTCTGCTGTA
ACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATTTTCTCCAACTTTGGCTGAC
TCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACCTCTCAGTTTCA
ACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGGCTTTTTCTAATTA
ATTTCAGCTTTCACGTTTCCATATATTTTTCTACTGAATTTTTTTTCTTCTACTGAATTG
GACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAATTTGATGTTCTTTGTTAA
TCAAATTAATATATATTTTTTTAAATCACG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 11

CO CL236Contig1 1015 11 9 U
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TCAAACATAAAAACTTCCTCATGACACACATATCTCTTTACAAACTCGGACAAGGCGTCT
CCTTAGGGCATCTGCATTAAAGCTTCTTAGATGAAGTTCACACGCAGTCCAAGAAAAATA
AAATATTATAATATACAAATGCAACGGACCGAGTCCGTTCCGCCTCTTCCACATGAACCT
GTATCGCCACGTGGCGGCTGATTACAGGTCTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA
AAGGACAAACGAAAAAATAATAAAAAATAATAAAAAACGTGAGTT*ATGAACCCCAAACA
ATGCAGATGGCCTTAGTCCTTATTTATAGTAATTTCAAAGACAGAACTTAAAGGCAAACA
CACAAATATAATTATGGATATATGGGATTGAGACAAGAGAA*TTCATCCTCTATTCTTCG
GACATGAGATGTGCATCGATCTCTTTGGAGACCTCGACGGCAAACTGGAGGAGAGTCTCA
GGGTGAGCCACCTCCTCACTAATTTTCTCGTACTCAAAGTGCCAA*TGTAAAATACTTCC
AGGTTCACCTTCCTTAGGGGTCACTTGAAAGGTGATCAAGAAACTCTTGTACTCGTTCAT
TAAATCACCCTCTAACACCCTGTACGTGGCCCGATTGTTCTCCGGGTCTATTGACTCGAT
CCTCTCTTTCATTACTCTTGCCTCCCCATCGTGAAAGTAATTCCAGGTTACGATAGCACC
AACTAGGCCAATTTCGCCTTCGTGCAGTTCAAAGCCCTGAACTAAGGATGGAGAAGCAGT
GGGGATACGGTGTTTCCCGACAAACATGTCATGCACCTTCTCTGGTGAAGATTTTACCTC
CACGGTTGTCTCAATGATCCCGACCAAACTTGATGCTTCTTCTGCCATTCTTGATCTCTC
GATAATTTGCAAAAGTGTCTTTAGGGTTTTGTTTTTGTTTTGAGAATGAATATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR4B545JQ U 1
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BS 521 777 RR4B545JQ
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DS 

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TCAAACATAAAAACTTCCTCATGACACACATATCTCTTTACAAACTCGGACAAGGCGTCT
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AAATATTATAATATACAAATGCAACGGACCGAGTCCGTTCCGCCTCTTCCACATGAACCT
GTATCGCCACGTGGCGGCTGATTACAGGTCTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA
AAGGACAAACGAAAAAATAATAAAAAATAATAAAAAACGTGAGTT*ATGAACCCCAAACA
ATGCAGATGGCCTTAGTCCTTATTTATAGTAATTTCAAAGACAGAACTTAAAGGCAAACA
CACAAATATAATTATGGATATATGGGATTGAGACAAGAGAA*TTCATCCTCTATTCTTCG
GACATGAGATGTGCATCGATCTCTTTGGAGACCTCGACGACAAACTGGAGGAGAGTCTCA
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AAGATTTTACCTCCACGGTTGTCTCAATGAT

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AA
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GGGATACGGTGTTTCCCGACAAACATGTCATGCACCTTCTCTGGTGAAGATTTTACCTCC
ACGGTTGTCTCAATGATCCCGACCAAACTTGATGCTTCTTCTGCCATTCTTGATCTCTCG
ATAATTTGCAAAAGTGTCTTTAGGGTTTTGTTTTTGTTTT

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DS 

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ACAAATATAATTATGGATATATGGGATTGAGACAAGAGAA*TTCATCCTCTATTCTTCGG
ACATGAGATGTGCATCGATCTCTTTGGAGACCTCGACGACAAACTGGAGGAGAGTCTCAG
GGTGAGCCACCTCCTCACTAATTTTCTCGTACTCAAAGTGCCAA*TGTAAAATACTTCCA
GGTTCACCTTCCTTAGGGGTCACTTGAAAGGTGATCAAGAAACTCTTGTACTCGTTCATT
AAATCACCCTCTAACACCCTGTACGTGGCCCGATTGTTCTCCGGGTCTATTGACTCGATC
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ACTAGGCCAATTTCGCCTTCGTGCAGTTCAAAGCCCTGAACTAAGGATGGAGAAGCAGTG
GGGATACGGTGTTTCCCGACAAACATGTCATGCACCTTCTCTGGTGAAGATTTTACCTCC
ACGGTTGTCTCAATGATCCCGACCAAACTTGATGCTTCTTCTGCCATTCTTGATCTCTCG
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AGATGGCCTTAGTCCTTATTTATAGTAATTTCAAAGACAGAACTTAAAGGCAAACACACA
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GAGCCACCTCCTCACTAATTTTCTCGTACTCAAAGTGCCAA*TGTAAAATACTTCCAGGT
TCACCTTCCTTAGGGGTCACTTGAAAGGTGATCAAGAAACTCTTGTACTCGTTCATTAAA
TCACCCTCTAACACCCTGTACGTGGCCCGATTGTTCTCCGGGTCTATTGACTCGATCCTC
TCTTTCATTACTCTTGCCTCCCCATCGTGAAAGTAATTCCAGGTTACGATAGCACCAACT
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QA 6 716 6 716
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TTTGTTTTGAGAATGAATATCC

QA 8 629 8 629
DS 

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TCTTGCCTCCCCATCGTGAAAGTAATTCCAGGTTACGATAGCACCAACTAGGCCAATTTC
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TGTCTTTAGGGTTTTGTTTTTGTTTTGAGAATGAATATCC

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TTCAAAGCCCTGAACTAAGGATGGAGAAGCAGTGGGGATACGGTGTTTCCCGACAAACAT
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TTTGTTTTTGTTTTGAGAATGAATATCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4DX51JQ 700 0 0
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GGATATATGGGATTGAGACAAGAGAA*TTCATCCTCTATTCTTCGGACATGAGATGTGCA
TCGATCTCTTTGGAGACCTCGACGGCAAACTGGAGGAGAGTCTCAGGGTGAGCCACCTCC
TCACTAATTTTCTCGTACTCAAAGTGCCAA*TGTAAAATACTTCCAGGTTCACCTTCCTT
AGGGGTCACTTGAAAGGTGATCAAGAAACTCTTGTACTCGTTCATTAAATCACCCTCTAA
CACCCTGTACGTGGCCCGATTGTTCTCCGGGTCTATTGACTCGATCCTCTCTTTCATTAC
TCTTGCCTCCCCATCGTGAAAGTAATTCCAGGTTACGATAGCACCAACTAGGCCAATTTC
GCCTTCGTGCAGTTCAAAGCCCTGAACTAAGGATGGAGAAGCAGTGGGGATACGGTGTTT
CCCGACAAACATGTCATGCACCTTCTCTGGTGAAGATTTTACCTCCACGGTTGTCTCAAT
GATCCCGACCAAACTTGATGCTTCTTCTGCCATTCTTGATCTCTCGATAATTTGCAAAAG
TGTCTTTAGGGTTTTGTTTTTGTTTTGAGAATGAATATCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 12

CO CL237Contig1 1063 12 24 U
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AGCATTTGCGTCAATCTTAAGCGGCCATAAGTCTGTTTAAAAACCCTATCTCTCTCTCTT
TCCCCTAACTCCTTCGCCGTCTCGTTCTCATATATACTCCTCGACTCGCTTCTCTTCTCT
TCTGGATCTCACGCTGCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTC
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GTTCACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACT
GCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCC
GTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGT
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CAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGG**GAGAGAGAGAGAGTTCCG
CACTATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATTTCTTTTTTTTTT**GATGGTGCTACTTT
TATTTGTGTGTTCAAAATATGAATTTTAAAAATCGAGGTTTGCTTTTATCGATGTCACTA
GTATTTTCCCGCTTAAGTCCCACCTTTTAATTCTAGTTATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 50 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 35 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD01TF U 1
AF RR4DF69TF U 125
AF RR4BY79TF U 134
AF RR4D921TF U 183
AF RR4FD01JQ C 537
AF RR4BB72TF U 183
AF RR4BF49TF U 183
AF RR4BF49JQ C 184
AF RR4BB72JQ C 273
AF RR4D921JQ C 290
AF RR4FK35TF U 462
AF RR4BY79JQ C 668
BS 1 183 RR4FD01TF
BS 184 184 RR4BB72TF
BS 185 496 RR4FD01TF
BS 497 497 RR4DF69TF
BS 498 505 RR4FD01TF
BS 506 506 RR4DF69TF
BS 507 730 RR4FD01TF
BS 731 731 RR4DF69TF
BS 732 764 RR4FD01TF
BS 765 771 RR4DF69TF
BS 772 785 RR4BY79TF
BS 786 786 RR4BB72TF
BS 787 844 RR4BY79TF
BS 845 845 RR4BB72TF
BS 846 850 RR4BY79TF
BS 851 851 RR4BB72TF
BS 852 869 RR4BY79TF
BS 870 870 RR4BB72TF
BS 871 881 RR4BY79TF
BS 882 882 RR4BB72TF
BS 883 896 RR4BY79TF
BS 897 987 RR4BB72TF
BS 988 988 RR4BF49TF
BS 989 1063 RR4FK35TF

RD RR4FD01TF 764 0 0
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AGCATTTGCGTCAATCTTAAGCGGCCATAAGTCTGTTTAAAAACCCTATCTCTCTCTCTT
TCCCCTAACTCCTTCGCCGTCTCGTTCTCATATATACTCCTCGACTCGCTTCTCTTCTCT
TCTCGATCTCACGCTGCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTC
GATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTT
GTGAAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAG
GTTCACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACT
GCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCC
GTCATCATGTTTGATGCCACAGCACTTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGT
GATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTG
AAGAACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTAT
TACGAGATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGA
AAACTTGCCG*TGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4DF69TF 647 0 0
GG
AACTCCTTCGCCGTCTCGTTCTCATATATACTCCTCGACTCCCTTCTCTTCTCTTCTCGA
TCTCACGCTGCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTAC
CCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTGAAG
AGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTTCAC
CCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGA
CAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCATC
ATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGATCTT
TGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAAC
AGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTACGAG
ATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTT
GCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCT

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR4BY79TF 763 0 0
GG
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GCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTC
AAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTGAAGAGACATCTC
ACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGAC
TTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAG
TTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGAT
GTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTC
TGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTG
AAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTACGAGATCTCTGCC
AAGAGCAACTACAATTTTGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGAC
C*TAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCACATTGACATG
GCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGC*ACTCC*TGAT
GACGATGATGACAC*TTCGAGTAGG*AGAGAGAGAGAGAGT

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR4D921TF 713 0 0
G
GGATCTCACGCTGCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGAT
TACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTG
AAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTT
CACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCT
GGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTC
ATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGAT
CTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAG
AACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTAC
GAGATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAA
CTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTC
CAGATTGACATGGCTGCTCAGCA*CAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAG
C*ACTCC*TGACGACGATGATGACAC*TTCGAGTAGG**GAGAGAGAG
GAGT

QA 2 709 2 709
DS 

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TGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATTTCCA
GTATTACGAGATTTTTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTTTTGTACCTTGC
TAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCCCC
AGAAGTCCAGATTGACATGGCTGTTCAGCAACAGCATGAGGGGGAGCTTGCAGCGGCAGC
AAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACCCCTTCGAGTAGG**GGGAGAGAGAG
T

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR4BB72TF 805 0 0
G
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TACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTG
AAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTT
CACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCT
GGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTC
ATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGAT
CTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAG
AACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTAC
GAGATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAA
CTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTC
CAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAG
CCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGG**GAGAGAGAGAGAGTTCCGCAC
TATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATTTCTTTTTTTTTT**GATGGTGCTACTTTTAT
TTGTGTGTTCAAAATATGAATTTT

QA 2 805 2 805
DS 

RD RR4BF49TF 806 0 0
G
GGATCTCACGCTGCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGAT
TACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTG
AAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTT
CACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCT
GGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTC
ATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGAT
CTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAG
AACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTAC
GAGATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAA
CTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTC
CAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAG
CCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGG**GAGAGAGAGAGAGTTCCGCAC
TATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATTTCTTTTTTTTTT**GATGGTGCTACTTTTAT
TTGTGTGTTCAAAATATGAATTTTA

QA 2 806 2 806
DS 

RD RR4BF49JQ 824 0 0
GGATCTCACGCTGCTTCAGTTTCTTCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGAT
TACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTG
AAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTT
CACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCT
GGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTC
ATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGAT
CTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAG
AACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTAC
GAGATTTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAA
CTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTC
CAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAG
CCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGG**GAGAGAGAGAGAGTTCCGCAC
TATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATTTCTTTTTTTTTT**GATGGTGCTACTTTTAT
TTGTGTGTTCAAAATATGAATTTTAAAAATCGAGGTTTGCTTTT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4BB72JQ 735 0 0
TGATGGAGGCACAGGGAAAACGACCTTTGTGAAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAA
GAAATACGAACCCACCATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGG
AAAGATCAGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGA
TGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGAC
ATACAAGAATGTCCCTACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGAT
TGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGAC
ATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTATTACGAGATTTCTGCCAAGAGCAACTACAATTT
CGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGT
GGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCA
TGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTT
CGAGTAGG**GAGAGAGAGAGAGTTCCGCACTATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATT
TCTTTTTTTTTT**GATGGTGCTACTTTTATTTGTGTGTTCAAAATATGAATTTTAAAAA
TCGAGGTTTGCTTTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4D921JQ 715 0 0
AAACGACCTTTGTGAAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATACGAACCCACCA
TTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGAAAGATCAGGTTTTACT
GCTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATG
GGCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTCCCTA
CATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACA
AAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCAAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGA
ATCTCCAGTATTACGAGATTTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGT
ACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTG
CTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAG
CGGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGACGACGATGATGACACCTTCGAGTAGGGAGAGAGAG
AGAGAGTTCCGCACTATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATTTCTTTTTTTT****GAT
GGTGCTACTTTTATTTGTGTGTTCAAAATATGAATTTTAAAAATCGAGGTTTGC
G

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FK35TF 602 0 0
G
ATCCATGGGCAGTC*GCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAAT
GTCCCTACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGT
GGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGACAAAGCAGGTGACATTCCGCAGG
AAGAAGAATCTCCAGTATTACGAGATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCA
TTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCT
GCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAG
CTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGGGA
GAGAGAGAGAGAGTTCCGCACTATGTGATTCCGTCACTAGTATTATCATTTCTTTTTTTT
TTT*GATGGTGCTACTTTTATTTGTGTGTTCAAAATATGAATTTTAAAAATCGAGGTTTG
CTTTTATCGATGTCACTAGTATTTTCCCGCTTAAGTCCCACCTTTTAATTCTAGTTATGA
A

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR4BY79JQ 381 0 0
TTTT
TGCCAAGAGCAACTACAATTTTGAGAAGCCATTTTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGG
TGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCACATTGA
CATGGCTGTTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGCCACTCCC
TGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGGGAGAGAGAGAGAGAGTTCCGCACTATGTGAT
TCCGTCACTAGTATTATCATTTTTTTTTTTTTTTTGATGGTGCTACTTTTATTTGTGTGT
TCAAAATATGAATTTTAAAAATCGAGGTTTGCTTTTATCGATGTCACTAGTATTTTCCCG
TTTAAGTCCCCCCTTTT

QA 5 381 5 381
DS 



AS 1 8

CO CL238Contig1 861 8 6 U
GGGGTGTTTGGGTGAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGAAAGAAAGTAGCGGATGT
GGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCTAAGGTCCTTGTCACCGA
CGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCAGCT
CCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTAT
TGGATCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTA
CGTGGATAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAA
AGAAGCAGAACAGAAGTCGCTGAAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGT
CCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCC
TGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATC
ATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCTTGT
ACTGTGATTTTTTTTT*CTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATC
CAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTAC
**********ATTTTCTATTTTTCTTTTACACTGAGTGACACTTTTCACATGTGAGATAT
TTTTTGGTGGAAATCATGCGTGCTTTTACAAATTTGTCTTTGTGGGAAATCAAAAATTGT
GGGTATGGACAACTAATTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV45TF U 140
AF RR4DE03TF U 28
AF RR4F188JQ C 143
AF RR4GI22TF U 1
AF RR4DE03JQ C 418
AF RR4DH26JQ C 29
AF RR4DH26TF U 28
AF RR4GI22JQ C 118
BS 1 249 RR4GI22TF
BS 250 250 RR4CV45TF
BS 251 742 RR4GI22TF
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BS 744 805 RR4GI22TF
BS 806 861 RR4GI22JQ

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ATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGT

QA 1 146 1 146
DS 

RD RR4DE03TF 656 0 0
GGG
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TCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACC
CATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGA
AGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTACGTGGATAATGTTACCCCTGAATACAAGCC
AAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTGAAGGAGTC
TGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGAT
GACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAAT
CCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAA
AGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTTTCTTGAATAAGTAC
ACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAACT

QA 4 656 4 656
DS 

RD RR4F188JQ 628 0 0
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TACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAA
TACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTC
AAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTC
AGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGAT
GACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGG
CCTTGAAAAGAAACTAAACTATCTCTCTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTT*CTTGA
ATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAAC
TGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTACATTAAACGACATTTTCAATTTT
TCTTTTACACTGAGTGACACTTTTCACG

QA 1 628 1 628
DS 

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GGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCTAAGGTCCTTGTCACCGA
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CCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTAT
TGGATCTGGAATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTA
CGTGGATAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAA
AGAAGCAGAACAGAAGTCGCTGAAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGT
CCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCC
TGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATC
ATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCTTGT
ACTGTGATTTTTTTTT*CTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATC
CAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTAC
**********ATTTTCTATTTT*CTTTTACACTGAGTGACACTTTTCACATGTGAGATAT
TTTTTGGTGGAAATCATGCGTGCTT

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DS 

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CCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATG
ATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCT
TGTACTGTGATTTTTTTTT*CTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAG
ATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGAT
TAC**********ATTTTCTATTTTTCTTTTACACTGAGTGACACTTTTCACATGTGAGA
TATTTTTTGGTG

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DS 

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GG
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GGAAGGGATGGCTAAGGTCCTTGTCACCGACGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCG
TCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACC
CATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGA
AGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTACGTGGATAATGTTACCCCTGAATACAAGCC
AAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTGAAGGAGTC
TGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGAT
GACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAAT
CCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAA
AGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTT*CTTGAATAAGTAC
ACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATA
GTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTAC**********ATTTTCTATTTTTCTTTTAC
ACTGAGTGACACTTTTCACATGTGAGATATTTTTTGGTG

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR4DH26TF 762 0 0
GGG
GAGCGGAGCAGGAAAGAAAGTAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTG
GGAAGGGATGGCTAAGGTCCTTGTCACCGACGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCG
TCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACC
CATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGA
AGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTACGTGGATAATGTTACCCCTGAATACAAGCC
AAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTGAAGGAGTC
TGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGAT
GACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAAT
CCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAA
AGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTT*CTTGAATAAGTAC
ACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATA
GTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTAC**********ATTTTCTATTTTTCTTTTAC
ACTGAGTGACACTTTTCACATGTGAGATATTTTTTGGTG

QA 4 762 4 762
DS 

RD RR4GI22JQ 744 0 0
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GCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGG
TATTGGATCTGGAATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAA
GTACGTGGATAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACT
GAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTGAAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGA
TGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCA
CCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATG
ATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACT**CTCTCTTTTTTCT
TGTACTGTGATTTTTTTTT*CTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAG
ATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGAT
TAC**********ATTTTCTATTTTTCTTTTACACTGAGTGACACTTTTCACATGTGAGA
TATTTTTTGGTGGAAATCATGCGTGCTTTTACAAATTTGTCTTTGTGGGAAATCAAAAAT
TGTGGGTATGGACAACTAATTGTG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 3 10

CO CL239Contig1 787 3 10 U
GGACTCAACGCAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCT
CCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTCGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTC
CACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAGACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAAA
GCCTTTCCTTCTGTCCCCACAGCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGACGAGACTCATC
CCTCGCGCAACGATGGAGACGGAAGAAAAACCCGCGTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCA
AGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACTC
GTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGA
AGCCGTAGGTTTGGTTTCGCCACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCCGTCATTGAG
AAGTTGAATGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAACCT
ATAGAATCATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCT
TTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGTTACTAAAGAG
ATGCTTGAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAAAGTTTCGAGAGTG
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GAAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D429TF U 1
AF RR4GL60TF U 42
AF RR4E695TF U 32
BS 1 259 RR4D429TF
BS 260 260 RR4E695TF
BS 261 669 RR4D429TF
BS 670 670 RR4E695TF
BS 671 671 RR4GL60TF
BS 672 707 RR4E695TF
BS 708 708 RR4GL60TF
BS 709 734 RR4E695TF
BS 735 735 RR4GL60TF
BS 736 787 RR4E695TF

RD RR4D429TF 669 0 0
GGACTCAACGCAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCT
CCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTCGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTC
CACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAGACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAAA
GCCTTTCCTTCTGTCCCCACAGCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGACGAGACTCATC
CCTCGCGCAACGATGGAGATGGAAGAAAAACCCGCGTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCA
AGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACTC
GTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGA
AGCCGTAGGTTTGGTTTCGCCACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCCGTCATTGAG
AAGTTGAATGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAACCT
ATAGAATCATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCT
TTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGTTACTAAAGAG
ATGCTTGAG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4GL60TF 709 0 0
GGATTATC
TCCTTCCTTCTCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACAC
TCTTCTCATTCCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTC
TCAAAACCAAAGCCTTTCCTTCTGTCCCCACAGCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGA
TGAGACTCATCCCTCGCGCAACGATGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTAGACCCTAACG
CAGAATCCTCAAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGC
TCACCAAACTCGTCGAAGAACACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGT
ACTCAGGAAGAAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATG
CTGTCATTGAGAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTA
CAGAGAAGCCTATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTG
AAGATTCGGCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCGAAGAGTG
TTACTAAAGAGATGCTTGAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAAAG
TTTCGAGAGTGCCTGGTACTTCCAAATCTACTGGGTTTGGG

QA 9 709 9 709
DS 

RD RR4E695TF 756 0 0
GGTCCCCCATTATCTCCT
TCCTTCCTTCTCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTCGTTTCAATCAAACCCACAC
TCTTCTCATTCCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAGACCAATGCATTCGCTC
TCAAAGCCAAAGCCTTTCCTTCTGTCCCCACAGCCATCTCCCTTCCACGGACCTCCAGGA
CGAGACTCATCCCTCGCGCAACGATGGAGACGGAAGAAAAACCCGCGTTGGACCCTAACG
CAGAATCCTCAAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGC
TCACCAAACTCGTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGT
ACTCAGGAAGAAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCCACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATG
CCGTCATTGAGAAGTTGAATGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTA
CAGAGAAACCTATAGAATCATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTG
AAGATGCAGCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTG
TTACTAAAGAGATGCTTGAGAGTTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAA*G
TTTCGAGAGTGCCTGGTACTTCCAA*TCTACTGGGTTTGGGTTTGTTACGTTTTCTTCTG
ATGAAGATGTCGAAGCTG

QA 19 756 19 756
DS 



CO CL239Contig2 636 3 6 U
GCTTTCATCAACTTTGAATGATTACAAAGACAGTGACACTATGCTCTAAATGTATTGCAT
TACAAACTCCTCAAATACAATACAAAAAAAAAAAA**CGATTCTGCCAAAAGACTCGCCC
TCTCTCTCTCTCCCTCCCATACACAGACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAATCTTCTG
TCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAAAGCCAAAATAGCAGCTTCGACATCTTCATCAGAAGA
AAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAAATTTGGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACCTTAGC
ACTCAAAACTTTCCCTTTCTCAAAAAACAAACTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTT
TGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAAAGCTGCATCTTCAGACTG
AAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATGATTCTATAGGTTTCTCTGTAATATT
AACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCATTCAACTTCTCAATGACGGCATTGGC
ATCTTCAACTGATTTCATTGTGGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTTCCTGAGTACTTATC
ATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D429JQ U 7
AF RR4E695JQ U 1
AF RR4BM18JQ U 7
BS 1 95 RR4E695JQ
BS 96 97 RR4D429JQ
BS 98 203 RR4E695JQ
BS 204 204 RR4D429JQ
BS 205 619 RR4E695JQ
BS 620 636 RR4BM18JQ

RD RR4D429JQ 438 0 0
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TCTCTCCCTCCCATACACAGACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAATCTTCTGTCCTTC
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AACAAACCCAAACCCAGTAAATTTGGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACCTTAGCACTCAA
AACTTGCCCTTTCTCAAAAAACAAACTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTTTGCTAG
ATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAAAGCTGCATCTTCAGACTGAAGCAG
CGACAAATCAGGAGACGA

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR4E695JQ 619 0 0
GCTTTCATCAACTTTGAATGATTACAAAGACAGTGACACTATGCTCTAAATGTATTGCAT
TACAAACTCCTCAAATACAATACAAAAAAAAAAAAAACGATTCTGCCAAAAGACTCGCCC
TCTCTCTCTCTCCCTCCCATACACAGACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAATCTTCTG
TCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCTTCGACATCTTCATCAGAAGA
AAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAAATTTGGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACCTTAGC
ACTCAAAACTTTCCCTTTCTCAAAAAACAAACTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTT
TGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAAAGCTGCATCTTCAGACTG
AAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATGATTCTATAGGTTTCTCTGTAATATT
AACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCATTCAACTTCTCAATGACGGCATTGGC
ATCTTCAACTGATTTCATTGTGGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTTCCTGAGTACTTATC
ATACATCACCTGGACTTGT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BM18JQ 630 0 0
ATCAACTTTGAATGATTACAAAGACAGTGACACTATGCTCTAAATGTATTGCATTACAAA
CTCCTCAAATACAATACAAAAAAAAAAA***CGATTCTGCCAAAAAACTCGCCCTCTCTC
TCTC**CCTCCCATACACAGACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAATCTTCTGTCCTTC
CAGCAAAGAGTTGTTAAAAGCCAAAATAGCAGCTTCGACATCTTCATCAAAAGAAAACGT
AACAAACCCAAACCCAGTAAATTTGGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACCTTAGCACTCAA
AACTTTCCCTTTCTCAAAAAACAAACTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTTTGCTAG
ATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAAAGCTGCATCTTCAGACTGAAGCAG
CGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATGATTCTATAGGTTT*TCTGTAATATTAACCTT
CACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCATTCAACTTCTCAATGACGGCATTGGCATCTTC
AACTGATTTCATTGTGGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTTCCTGAGTACTTATCATACAT
CACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGCTC

QA 1 630 1 630
DS 



CO CL239Contig3 966 4 10 U
CAACTTAGAATGATTACAAAGACAATGATACTATGCTCTAAATGTTTTGCATTACAAACT
CCTCAACACAATACAAAAAAAAACGATCCTGCCAAAAGACTCTCTCACACACACACTAGG
CCTTATTCACCCGAATCTTCTGTCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAG
CATCGACATCTTCATCAGAAGAAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTGGAAGTAC
CAGGCACTCTCGAAACCTTAGCACTCAGAACTTTCCCTTTCTCAGAAAACAAATTCTCAA
GCATCTCTTTAGTAACACTCTTCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCA
CAAAAGCCGAATCTTCAGACTGAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATAATT
CTATAGGCTTCTCTGTAATATTAACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCA
ACTTCTCAATGACAGCATTGGCATCTTCAACTGATTTCATTGTAGCGAAACCAAACCTAC
GGCTTCTTCCTGAGTACTTATCATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGTTCTT
CGACGAGTTTGGTGAGCTGTTCGTTAGTTACGGTTCTTGGTATGTTTCCGATGTAGACGC
GTCTTGAGGATTCTGCGTTAGGGTCCAAAGCGGGTTTTTCTTCCGTCTCCGTCGTTGCGC
GAGGGATGAATCTCGTTCTGGAGGTCCGTGGAAGAGAGATGGGTCTGGGGACAGAAGGAA
AGGGTTGGCTTTGAGAGCGAATGCATTGGTCTGAGATTGCAAAGAGGTGGAGGACTCGGA
GTGGAATGAGAAGAGCGTGGGTTTGATTGAAATAACAGCTGTTAGGAAAGTAGCCATTGT
CGGAGAAGGAAGGAAGGAGATAATGGGTGAAAAGAGAAGAGGGTGTTGTGTTGTGTTGTG
TTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL60JQ U 158
AF RR4EZ53JQ U 1
AF RR4GO05JQ U 18
AF RR4AK33TF C 141
BS 1 23 RR4EZ53JQ
BS 24 24 RR4GO05JQ
BS 25 96 RR4EZ53JQ
BS 97 97 RR4GO05JQ
BS 98 408 RR4EZ53JQ
BS 409 409 RR4GO05JQ
BS 410 590 RR4EZ53JQ
BS 591 591 RR4GO05JQ
BS 592 598 RR4EZ53JQ
BS 599 966 RR4AK33TF

RD RR4GL60JQ 177 0 0
GTTGTTAAGAGCCAAAAGAGCAGCATCGACATCTTCATCAGAAGAAAACGTAACAAACCC
AAACCCAGTAGATTTGGAAGTACCGGGCACTCTCGAAACCTTAGCACTCAGAACTTTCCC
TTTCTCAGAAAACAAATTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTTCGCTAGATTCCC

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR4EZ53JQ 598 0 0
CAACTTAGAATGATTACAAAGACGATGATACTATGCTCTAAATGTTTTGCATTACAAACT
CCTCAACACAATACAAAAAAAAACGATCCTGCCAAAGGACTCTCTCACACACACACTAGG
CCTTATTCACCCGAATCTTCTGTCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAG
CATCGACATCTTCATCAGAAGAAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTGGAAGTAC
CAGGCACTCTCGAAACCTTAGCACTCAGAACTTTCCCTTTCTCAGAAAACAAATTCTCAA
GCATCTCTTTAGTAACACTCTTCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCA
CAAAAGCCGAATCTTCAGACTGAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGGTGATGATAATT
CTATAGGCTTCTCTGTAATATTAACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCA
ACTTCTCAATGACAGCATTGGCATCTTCAACTGATTTCATTGTAGCGAAACCAAACCTAC
GGCTTCTTCCTGAGTACTTATCATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGTCGTGTTC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4GO05JQ 579 0 0
AAAGACAATGATACTATGCTCTAAATGTTTTGCATTACAAACTCCTCAACACAATACAAA
AAAAAACGATCCTGCCAAAAGACTCTCTCACACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAATC
TTCTGTCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCATCGACATCTTCATCA
GAAGAAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTGGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACC
TTAGCACTCAGAACTTTCCCTTTCTCAGAAAACAAATTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACA
CTCTTCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAAAGCCGAATCTTCA
GACTGAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATAATTCTATAGGCTTCTCTGTA
ATATTAACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCAACTTCTCAATGACAGCA
TTGGCATCTTCAACTGATTTCATTGTAGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTTCCTGAGTAC
TTATCATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4AK33TF 826 0 0
CTGT
CTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCATCGACATCT*CATCTGAAGAAA
ACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTGGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACTTTAGCAC
TCAGAACTTTCCCTTTCTCAGAAAACAAATTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTTCG
CTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCGCAAAAGCCGAATCTTCAGACTGAA
GCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATAATTCTATAGGCTTCTCTGTAATATTAA
CCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCAACTCCTCAATGACAGCATTGGCAT
CTTCAACTGATTTCATTGTAGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTTCCTGAGTACTTATCAT
ACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGTTCTTCGACGAGTTTGGTGAGCTGTTCGT
TAGTTACGGTTCTTGGTATGTTTCCGATGTAGACGCGTCTTGAGGATTCTGCGTTAGGGT
CCAAAGCGGGTTTTTCTTCCGTCTCCGTCGTTGCGCGAGGGATGAATCTCGTTCTGGAGG
TCCGTGGAAGAGAGATGGGTCTGGGGACAGAAGGAAAGGGTTGGCTTTGAGAGCGAATGC
ATTGGTCTGAGATTGCAAAGAGGTGGAGGACTCGGAGTGGAATGAGAAGAGCGTGGGTTT
GATTGAAATAACAGCTGTTAGGAAAGTAGCCATTGTCGGAGAAGGAAGGAAGGAGATAAT
GGGTGAAAAGAGAAGAGGGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTCC

QA 5 826 5 826
DS 



AS 1 12

CO CL240Contig1 973 12 14 U
GGATTCTTTCTCTAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTC
ATTCCCAAAGTATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTCTC
TCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAA
TCGTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACT
TTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCC
AAAGAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTG
AAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTC
CGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGG
TATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAG
GAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGAT
GCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATA
TACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCA
GAAGTGAAGGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAG
AGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATG
GCTCAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCA
AACTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTTAC
GGTTTCTTGGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN05TF U 12
AF RR4EZ28TF U 1
AF RR4BQ74TF U 12
AF RR4A150JQ C 381
AF RR4CF07TF U 300
AF RR4A150TFB U 12
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AF RR4CB01TF U 448
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AF RR4BQ74JQ C 325
BS 1 71 RR4EZ28TF
BS 72 72 RR4BQ74TF
BS 73 437 RR4EZ28TF
BS 438 438 RR4BQ74TF
BS 439 696 RR4EZ28TF
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BS 698 709 RR4EZ28TF
BS 710 728 RR4A150TFB
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BS 730 823 RR4A150TFB
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BS 825 864 RR4A150TFB
BS 865 958 RR4CB01TF
BS 959 973 RR4BQ74JQ

RD RR4FN05TF 608 0 0
GG
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TCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAG
ATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTG
AAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTA
CTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGG
AAAATC

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR4EZ28TF 709 0 0
GGATTCTTTCTCTAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTC
ATTCCCAAAGTGTCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTCTC
TCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAA
TCGTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACT
TTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCC
AAAGAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTG
AAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTC
CGGAAGCTCACTAGTAAGGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGG
TATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAG
GAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGAT
GCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATA
TACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACAGTCTCCCAGATC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4BQ74TF 659 0 0
GG
AGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTAT
CATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCG
TCTCTGTCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAG
ATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTG
AAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTA
CTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGG
AAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAA*TACAATGAGGCAATATACAGCAGTG

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR4A150JQ 364 0 0
TGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAAGC
AGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGG
CAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGG
TCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCT
TCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTT
GGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAACAAGAG
AGAA

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR4CF07TF 434 0 0
CAAAGAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCT
GAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGT
CCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATG
GTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAGGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAA
GGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGA
TGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAAT
ATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCC*AGATCCCGGGGGTCC
AGAAGTGAAG
ATAC

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4A150TFB 853 0 0
GG
AGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTAT
CATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCG
TCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACA*
*TGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTG
AAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTA
CTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGG
AAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAA
AACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAAGATA
ACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCA
GTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGTCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATG
CTTATGTATCC

QA 3 853 3 853
DS 

RD RR4A150JQD 822 0 0
TCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACA**T
GCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGGC
ACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACGTT
GTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCT
GATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGT
AAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAA
GAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACT
GGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAA
AATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAA
CGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAAC
AAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGT
CTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGTCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCT
TATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCA
TAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4FN05JQ 776 0 0
GTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTT
CTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAA
AGAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAA
GAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCG
GAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTA
TCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGA
AGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGC
TACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATA
CAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGTAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGA
AGTGAAGGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAG
AGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGC
TCAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAA
CTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4CF07JQ 758 0 0
G
TAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCAC
CTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAA
CTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAAC
TCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGC
TCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTT
CAATTGAAGAAGGCAACAATAGGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGG
CCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTG
TCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCA
GTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGA
AGGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGAC
AGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGT
ACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAG
CCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAAT

QA 2 758 2 758
DS 

RD RR4CB01TF 517 0 0
GG
CGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAA
GGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTT
CATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATT
AGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGC
AATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAACAAGAGAGAATCAAA
TTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGG
TTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAA
GTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCA
AACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTT
ACGGTT

QA 3 511 3 511
DS 

RD RR4EZ28JQ 581 0 0
TCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAA
GGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGA
AGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGG
TGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAA
TCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACG
GTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAACAA
GAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGTCT
TGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTTA
TGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTTTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCATA
ACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTT

QA 1 581 1 581
DS 

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GCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAA
TACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGAT
GCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAAC
AATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCT
GCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCCACTGTCTCGGAAAATCTTCCC
GTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTT
GCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAACAAGAGAGAA
TCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTT
GGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTTATGTATCC
AAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCATAACATTGC
TATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTTACGGTTTCTTGGTAG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 12

CO CL241Contig1 610 12 16 U
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GAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAG
CACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGT
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**GAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGTAGCAGCAGTGACAGCGACAGC
GATTAAGGCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCAT
CTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
AATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATGTAAGGAGTT
TATATTTAGC


BQ
45 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 50 40 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4BS56JQ C 1
AF RR4A438JQ C 1
AF RR4F864TF U 379
AF RR4F647TF U 14
AF RR4GO73TF U 2
AF RR4DZ53JQ C 4
AF RR4DZ53TF U 4
AF RR4E141TF U 1
AF RR4E869TF U 1
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AF RR4F649JQ C 1
AF RR4F649TF U 1
BS 1 1 RR4E141TF
BS 2 13 RR4GO73TF
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BS 303 338 RR4F647TF
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CTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTTCTT**AACTGTCATTTTCACCTCT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR4A438JQ 592 0 0
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GAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAG
GAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAG
CACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGT
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**GAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGTAGCAGCAGTGACAGCGACAGC
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C

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DS 

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GTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCATGTATCG
TAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

QA 1 209 1 209
DS 

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GCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAATAAGGACAAGAAGGAGAAGA
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GAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCTTT
TAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCATG
TATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATG
T

QA 1 578 1 578
DS 

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GAGAAGACCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAA********
*GAAGGAGAAGAAACATCATGACGATGGTCACCACAGTAGCAGCAGTGACAGCGACAGCG
ATTAAGGCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATC
TCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTAT
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ATAAGCCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

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DS 

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GG
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C

QA 3 583 3 583
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RD RR4DZ53TF 584 0 0
GG
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AGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAA*********GAA
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TTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAA
ACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
C

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR4E141TF 584 0 0
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TCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
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DS 

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CTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
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QA 1 588 1 588
DS 

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CTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
AATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATG
C

QA 1 591 1 591
DS 

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GGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAA*******
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CTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
AATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATGTAAGGAGTT
TATATTTAGC

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DS 

RD RR4F649TF 610 0 0
GGATCAAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAAAGAAAGAGATCA
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GGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAA*******
**GAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGTAGCAGCAGTGACAGCGACAGC
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CTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
AATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATGTAAGGAGTT
TATATTTAGC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 2 12

CO CL242Contig1 614 6 4 U
GGGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTTCAAT
GTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAAGCTCGATGCCACTCAAATCACAC
CAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATA
TTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCC
AGATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATA
AGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAA
AAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGA
AGACCATGCCACTTTCCTGATAGTTATGTTAGCTGGAGAGTGGAGATTGAAGTTACTATA
AAAGCATATAATAAACTGATAATAAAGTAGATAAAAGTACTTTACCTATGGTTTTTGAGA
CAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAAAAGTCAATGAATTT
TCATCTAGCCATCC


BQ
15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4H901TF U 1
AF RR4H901JQB C 453
AF RR4F777TF U 1
AF RR4B066JQ C -2
AF RR4F777JQ C 26
AF RR4B066TF U 5
BS 1 440 RR4F777TF
BS 441 441 RR4H901TF
BS 442 609 RR4F777TF
BS 610 614 RR4B066JQ

RD RR4H901TF 577 0 0
GGGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTTCAAT
GTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAAGCTCGATGCCACTCAAATCACAC
CAAAACATGTCGAAACAGCTCAACTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATA
TTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCC
AGATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATA
AGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAA
AAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGA
AGACCATGCCACTTTCCTGATAGTTATGTTAGCTGGAGAGTAGAGATTGAAGTTACTATA
AAAGCATATAATAAACTGATAATAAAGTAGATAAAAGTACTTTACCTATGGTTTTTGAGA
CAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4H901JQB 135 0 0
CTGGAGAGTAGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCATATAATAAACTGATAATAAAGTAGAT
AAAAGTACTTTACTTATGGTTTTTGAGACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAG
AATCGGTCAACAAAA

QA 1 135 1 135
DS 

RD RR4F777TF 609 0 0
GGGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTTCAAT
GTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAAGCTCGATGCCACTCAAATCACAC
CAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATA
TTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCC
AGATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATA
AGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAA
AAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGA
AGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGAGTGGAGATTGAAGTTACTATA
AAAGCATATAATAAACTGATAATAAAGTAGATAAAAGTACTTTACCTATGGTTTTTGAGA
CAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAAAAGTCAATGAATTT
TCATCTAGC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4B066JQ 617 0 0
GGGT
GGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTTCAATG
TTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAAGCTCGATGCCACTCCAATCACACC
AAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATAT
TGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCA
GATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTTTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATAA
GATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAA
AGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAA
GACCATGCCACTTTCCTGATAGTTATGTTAGCTGGAGAGTGGAGATTGAAGTTACTATAA
AAGCATATAATAAACTGATAATAAAGTAGATAAAAGTACTTTACCTATGGTTTTTGAGAC
AAATAAGTTGTCGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAAAAGTCAATGAATTTT
CATCTAGCCATCC

QA 5 617 5 617
DS 

RD RR4F777JQ 584 0 0
TAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTTCAATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAA
CCTACAAGATAAGCTCGATGCCACTCAAATCACACCAAAACATGTCGAAACAGTTCAGCT
TACTAATTTGGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTT
AGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTT
TACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCC
AGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAG
CGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTT
ATGTTAGCTGGAGAGTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCATATAATAAACTGATAATAA
AGTAGATAAAAGTACTTTACCTATGGTTTTTGAGACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATC
AATCAAGAATCGGTCAACAAAAAGTCAATGAATTTTCATCTAGC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4B066TF 610 0 0
GAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTTCAATGTTT
CAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAAGCTCGATGCCACTCCAATCACACCAAA
ACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATATTGG
TTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCAGAT
TCCTTTTCCAAAGGAAGGTTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATAAGAT
TAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAAAGA
TGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAAGAC
CATGCCACTTTCCTGATAGTTATGTTAGCTGGAGAGTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAG
CATATAATAAACTGATAATAAAGTAGATAAAAGTACTTTACCTATGGTTTTTGAGACAAA
TAAGTTGTCGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAAAAGTCAATGAATTTTCAT
CTAGC
CATCC

QA 1 605 1 605
DS 



CO CL242Contig2 625 6 5 U
GGGGGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTACA
ATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAATCTCGATGCCACTCAAATCAC
ACCAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAA
TATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCAT
CCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGA
TAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGG
AAAAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATT
GAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGC
ATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAGACAAATAAG
TTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGG*TCAACAAAGTCAATGAATTTTCATCTTTT
TTTTTTTTGTTACAGAAATTTCATT


BQ
10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C471TF U 36
AF RR4C471JQ C 0
AF RR4FG64JQ C 1
AF RR4FG64TF U 1
AF RR4C585JQ C 36
AF RR4C585TF U 56
BS 1 2 RR4FG64JQ
BS 3 35 RR4FG64TF
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BS 606 625 RR4C585TF

RD RR4C471TF 547 0 0
TATGTATAGGATTCATGTTCGTACAATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAG
ATAATCTCGATGCCACTCAAATCACACCAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATT
TCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTG
CCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTCTACGGTGG
GCATTATTAACGAACACGACAAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTA
CTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAG
AAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGC
TGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTT
CCCTATGTTTTTTGAGACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGG*TCAA
CAAAG
CC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4C471JQ 583 0 0
GGGT
GGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTACAATG
TTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAATCTGGATGCCACTCAAATCACACC
AAAACATGTCGAAACAGTTCAGCTTACTAATTTGGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATAT
TGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCA
GATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTTTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATAA
GATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAA
AGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAA
GACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCATA
TGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAGACAAATAAGTTG
TTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGG*TCAACAAAG
CC

QA 5 581 5 581
DS 

RD RR4FG64JQ 605 0 0
GGGGGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTACA
ATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAATCTCGATGCCACTCAAATCAC
ACCAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAA
TATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCAT
CCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGA
TAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGG
AAAAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATT
GAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGC
ATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAGACAAATAAG
TTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGG*TCAACAAAGTCAATGAATTTTCATCTTTT
TTTTT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4FG64TF 605 0 0
GG
GGGAGAAAATGACAACGCTAACATATAATACTTTATGTATAGGATTCATGTTCGTACAAT
GTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAATCTCGATGCCACTCAAATCACAC
CAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATA
TTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCC
AGATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATA
AGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAA
AAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGA
AGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCAT
ATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAGACAAATAAGTT
GTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGGTCAACAAAGTCAATGAATTTTCATCTTTTTT
TTT

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR4C585JQ 572 0 0
TATGTATAGGATTCATGTTCGTACAATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAG
ATAATCTCGATGCCACTCAAATCACACCAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATT
TCGGAGCTAAACACATTCCAAGTAATATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTG
CCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTTTACGGTGG
GCATTATTAACGAACACGACAAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACCCCAGCGACTA
CTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAGTTTTGACACAGCGAGGGAG
AAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGC
TGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTT
CCCTATGTTTTTTGAGACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGG*TCAA
CAAAGTCAATGAATTTTCATCTTTTTTTTT
TT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4C585TF 570 0 0
GTACAATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCAACCTACAAGATAATCTCGATGCCACTCAA
ATCACACCAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACATTCCA
AGTAATATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCT
ATCATCCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGATTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGAC
AAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACCCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCC
CCTGGAAAAGATGGTGTAGAGTTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGA
GTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTACTATA
AAAGCATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAGACAA
ATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGG*TCAACAAAGTCAATGAATTTTCAT
CTTTTTTTTTTTTGTTACAGAAATTTCATT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 12

CO CL243Contig1 833 12 23 U
GGAACTCCTCACTCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTTAA
GAGAACAAAGGTAAGAGATCCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGG
TTGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAA
TGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAG
CCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCAC
AGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGA
AAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTG
GTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATA
AAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTG
TTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGT
ACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTT*CCTCCAAAAAAA*GAAGA
ATAGAATATTGTGTATTTAGGACACTAAACATATAAAGAACTTT*GAGGCAGTAATCTCA
AAAGTATATTTTTACTTTCTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGAT
ACATAAATAAGTACTACTGATATAGTTAGTGGCTAATCTTTTTTTTCTAAAAA


BQ
35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4C815TF U 1
AF RR4B346JQ C 1
AF RR4B346TF U 1
AF RR4DU87TF U -3
AF RR4B487JQ C 340
AF RR4B487TF U 382
AF RR4DU09TF U -3
AF RR4CA32TF U -4
AF RR4B424JQ C 1
AF RR4B424TF U 1
AF RR4DU09JQ C 85
AF RR4DU87JQ C 315
BS 1 60 RR4C815TF
BS 61 61 RR4B346TF
BS 62 89 RR4C815TF
BS 90 90 RR4B346TF
BS 91 481 RR4C815TF
BS 482 482 RR4B346TF
BS 483 586 RR4C815TF
BS 587 587 RR4B346TF
BS 588 591 RR4C815TF
BS 592 647 RR4B346TF
BS 648 654 RR4B487TF
BS 655 655 RR4DU09TF
BS 656 677 RR4B487TF
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BS 679 704 RR4B487TF
BS 705 705 RR4DU09TF
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BS 775 783 RR4B424TF
BS 784 828 RR4DU09JQ
BS 829 833 RR4DU87JQ

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QA 1 591 1 591
DS 

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TTGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAA
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ACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTT*CCTCC

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DS 

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TTGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAA
TGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAG
CCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCAC
AGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGGCTGCTCAGA
AAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTG
GTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATA
AAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTG
TTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGT
ACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTT*CCTCC

QA 1 647 1 647
DS 

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GCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAG
AAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAA
GGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGT
GAAGCGATGGACACGGTGGCTGAGACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAA
GGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTT
GAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTAC
GTTGGAGATAAAGCAGC

QA 7 623 7 623
DS 

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G
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TTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGA
AAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACAT
GCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATT
T*CCTCCAAAAAAAAGAAGAATAGAATATTGTGTATT*AGGACACTAAACATATAAAGAA
CTTT*GAGGCAGTAATCTCAAAAGTATATTTTTAC

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DS 

RD RR4B487TF 355 0 0
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AAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCAC
AGGCTAAAGAAGCTATATTTTCCTCCAAAAAAAAGAAGAATAGAATATTGTGTATT*AGG
ACACTAAACATATAAAGAACTTTTGAGGCAGTAATCTCAAAAGTATATTTTT
TAC

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DS 

RD RR4DU09TF 787 0 0
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GGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATG
AGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCC
GCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAG
AAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAA
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GAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTAC
GTTGGAGATAAAGCAGCACAG*CTAAAGAAGCTATATTT*CCTCCAAAAAA**GAAGA*T
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*GTATATTTTTACTTTCTGAGA*TATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAA
CTGATAAAT

QA 7 778 7 778
DS 

RD RR4CA32TF 782 0 0
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GGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATG
AGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCC
GCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAG
AAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAA
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GAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAA
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GAAAA*GCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTAC
GTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTT*CCTCCAAAAAA**GAAGAAT
AGAATATTGTGTATTTAGGACACTAAACATATAAAGA*CTTT*GAGGCAGTAATCTCAAA
AGTATATTTTTACTTTCTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGA
TAACTGA

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DS 

RD RR4B424JQ 784 0 0
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TGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAG
CCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATTCCTCAC
AGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGA
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AAAGTATATTTTTACTTTCTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGAT
ACA
C

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4B424TF 784 0 0
GGAACTCCTCACTCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTTAA
GAGAACAAAGGTAAGAGATCCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGG
TTGGCTCTTCGTTATTGATCAATGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAA
TGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAG
CCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATTCCTCAC
AGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGA
AAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTG
GTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATA
AAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTG
TTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGT
ACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTT*CCTCCAAAAAAA*GAAGA
ATAGAATATTGTGTATTTAGGACACTAAACATATAAAGAACTTT*GAGGCAGTAATCTCA
AAAGTATATTTTTACTTTCTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGAT
ACA
C

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4DU09JQ 744 0 0
TGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGGTTGGCTCTTCGTTATTGATCAACG
GAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGA
CCATTACACCACAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGT
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ACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATA
TGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGGCTG
AGACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAA
CTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAG
ATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGG
CTAAAGAAGCTATATTT*CCTCCAAAAAAA*GAAGAATAGAATATTGTGTATTTAGGACA
CTAAACATATAAAGAACTTT*GAGGCAGTAATCTCAAAAGTATATTTTTACTTTCTGAGA
ATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTACTACTGATATA
GTTAGTGGCTAATCTTTTTTTTCT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DU87JQ 519 0 0
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AAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATGGAC
ACGGTGGCTGAGACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACC
AAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGAT
GAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAA
GCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTT*CCTCCAAAAAAA*GAAGAATAGAATATTGTGT
ATTTAGGACACTAAACATATAAAGAACTTT*GAGGCAGTAATCTCAAAAGTATATTTTTA
CTTTCTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTAC
TACTGATATAGTTAGTGGCTAATCTTTTTTTTCTAAAAA

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 11

CO CL244Contig1 971 11 10 U
GGATCTCTCTCTCTATCTTATTCCATATTCGACCTTATCTTCGAAGCTTTTCATCTGTTG
GTGTGCATCCCCCAACATGGCTGTTCCTCTCTCAATCTCAACGAATCCTCTCATCTCCCG
CCAATGTCACAGTCTCTACTTCCCTTCCACTTCATTTAAGGGAAACGTAAGCGTCTTATT
AGGAGCAAACCCACGTCAGATTCTTTCTCTTAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACC
CCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTCGTCGTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCG
TCTGGATAATCTGGGACCACAGCCTGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTAGAGG
TATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGTTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATC
TGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTCCC
CAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGGTATGCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAA
TCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTT
GAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCT
TGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCCCGTGCGTTCTCAACATCAGC
CAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCAGGTTGTACACTCACAGTGCTGCCGGGAAGAAAGAAATG
GGTGAAGCCTTCAGTTGCAAAGAACCTTGCACGTGCCGATGAATACTTTGCTAAGAAGAG
AGCTGACGCAGCAGCAGCTTCTTCAGAACCAGCTACTTCTGCTTAAACATGTTCATTTTC
AAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAACGGTAAAAATTATTATTGAACATTTTGA
TTCTAAATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C054TF U 1
AF RR4EC19TF U 23
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AF RR4DD14TF U 55
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AF RR4G215JQ C 478
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BS 630 712 RR4G215TF
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BS 714 743 RR4G215TF
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BS 841 964 RR4A239JQ
BS 965 971 RR4EC19JQ

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AGGAGCAAACCCACGTCAGATTCTTTCTCTTAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACC
CCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTCGTCGTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCG
TCTGGATAATCTGGGACCACAGCCTGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTAGAGG
TATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGTTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATC
TGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTCCC
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TCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTT
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DS 

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GG
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TTCTCTTAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTC
GTCGTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATCTGGGACCACAGCC
TGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAG
TTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTT
TGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTCCCCAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGG
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GTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGC

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CAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTCGTCGTCTTCTTCTCCAGC
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GAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGTTGTGGTTTCGGGATGAG
AGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGC
TCTTTATCGCCGTCTCCCCAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGGTATGCGTGCAGGATTGCC
CAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGA
AGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGG

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DS 

RD RR4DD14TF 583 0 0
GG
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CCCGCCAATGTCACAGTCTCTACTTCCCTTCCACTTCATTTAAGGGAAACGTAAGCGTCT
TATTAGGAGCAAACCCACGTCAGATTCTTTCTCTTAAACTTCACCACAAGCGTCGAACGG
GACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTCGTCGTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGT
TCCGTCTGGATAATCTGGGACCACAGCCTGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTA
GAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGTTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCGGAAGTCAC
GATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTC
TCCCCAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGGTATGCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAG
TTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGA
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QA 3 583 3 583
DS 

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TCCTCTCTCAATCTCAACGAATCCTCTCATCTCCCGCCAATGTCACAGTCTCTACTTCCC
TTCCACTTCATTTAAGGGAAACGTAAGCGTCTTATTAGGAGCAAACCCACGTCAGATTCT
TTCTCTTAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTC
GTCGTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATCTGGGACCACAGCC
TGGTTCGAGGAAGAGAGCGAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAG
TTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTT
TGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTCCCCAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGG
TATGCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGG
GTT*GAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCC
TTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAA
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TTGTACACTCACAGTGCT

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DS 

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G
ATATTCGACCTTATCTTCGAAGCTTTTCATCTGTTGGTGTGCATCCCCCAACATGGCTGT
TCCTCTCTCAATCTCAACGAATCCTCTCATCTCCCGCCAATGTCACAGTCTCTACTTCCC
TTCCACTTCATTTAAGGGAAACGTAAGCGTCTTATTAGGAGCAAACCCACGTCAGATTCT
TTCTCTTAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTC
GTCGTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATCTGGGGCCACAGCC
TGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAG
TTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGCCCTGGAATCATGAGAGGTTT
TGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTCCCCAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGG
TATGCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGG
GTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCC
TTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAA
GCTCAACTTCAAAGCCCGTGCGTTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTTGAAGCTT

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DS 

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GTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATCTGGGGCCACAGCCTGG
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TGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGCCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGA
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GCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTT
TGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCCTTC
TGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCT
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TGCACGTGCCGATGAATACTTTGCTAAGAAGATAGCTGACGCAGCAGCAGCTTCTTCAGA
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DS 

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GTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGAT
TCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCCCGTGCGTTCTCAACATC
AGCCAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCAGGTTGTACACTCACAGTGCTGCCGGGAAGAAAGAA
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GAGAGCTGACGCAGCAGCAGCTTTTTCAGAACCAGCTACTTCTGCTTAAACATGTTCATT
TTCAAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAACGGTAAAAATTATTATTGAACATTT
TGATTCT

QA 1 487 1 487
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RD RR4GZ45JQ 597 0 0
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AGAGGCATCGCCGGAGGTATGCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAA
GACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTC
AAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACT
GGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCCCGTGCGTTCTCAACATCAGCCAAAGAG
AAGCTTGAAGCTTCAGGTTGTACACTCACAGTGCTGCCGGGAAGAAAGAAATGGGTGAAG
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GCAGCAGCAGCTTCTTCAGAACCAGCTACTTCTGCTTAAACATGTTCATTTTCAAGCTTT
TCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAACGGTAAAAATTATTATTGAACATTTTGATTCT

QA 1 597 1 597
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RD RR4A239JQD 817 0 0
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TCTTAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACCTCGTC
GTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATCTGGGGCCACAGCCTGG
TTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGTTG
TGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGCCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGA
AGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTCCCCAAACTCAGAGGCATCGCCGGAGGTAT
GCGTGCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTT
TGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCCTTC
TGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCT
CAACTTCAAAGCCCGTGCGTTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCAGGTTG
TACACTCACAGTGCTGCCGGGAAGAAAGAAATGGGTGAAGCCTTCAGTTGCAAAGAACCT
TGCACGTGCCGATGAATACTTTGCTAAGAAGATAGCTGACGCAGCAGCAGCTTCTTCAGA
ACCAGCTACTTCTGCTTAAACATGTTCATTTTCAAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTG
TAAAACGGTAAAAATTATTATTGAACATTTTGATTCT

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DS 

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AGTACGTACCAGTTAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAG
TGTCACTTGAGACGTTGAAGCTCAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAAC
TCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCCCGTG
CGTTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCAGGTTGTACACTCACAGTGCTGC
CGGGAAGAAAGAAATGGGTGAAGCCTTCAGTTGCAAAGAACCTTGCACGTGCCGATGAAT
ACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGACGCAGCAGCAGCTTCTTCAGAACCAGCTACTTCTGCTT
AAACATGTTCATTTTCAAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAACGGTAAAAATTA
TTATTGAACATTTTGATTCTAAATTAG

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DS 



AS 1 12

CO CL245Contig1 895 12 16 U
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CCCAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGA
AGATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCT
CACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCAT
CGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTC
CGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTG
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CCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGA
GAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTT
GGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAG
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CGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTG
CCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTA
GAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTTGTTTACTTGATGTCTGAAGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 
25 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 55 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK58JQ U 5
AF RR4FB88JQ U 1
AF RR4GA47JQ U 12
AF RR4FH73JQ U 5
AF RR4CK66JQ U 3
AF RR4BJ58JQ U 43
AF RR4CK66TF C 86
AF RR4BJ58TF C 217
AF RR4FB88TF C 220
AF RR4FH73TF C 219
AF RR4EK58TF C 219
AF RR4GA47TF C 218
BS 1 269 RR4FB88JQ
BS 270 270 RR4CK66JQ
BS 271 271 RR4FB88JQ
BS 272 272 RR4CK66JQ
BS 273 379 RR4FB88JQ
BS 380 380 RR4CK66JQ
BS 381 757 RR4FB88JQ
BS 758 763 RR4CK66JQ
BS 764 764 RR4BJ58JQ
BS 765 809 RR4CK66JQ
BS 810 810 RR4BJ58JQ
BS 811 823 RR4CK66JQ
BS 824 849 RR4CK66TF
BS 850 850 RR4BJ58TF
BS 851 886 RR4CK66TF
BS 887 895 RR4BJ58TF

RD RR4EK58JQ 632 0 0
A
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ACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAGATA
AACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCA
GATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAA
ACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAAC
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AACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCA
CCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGG
TTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATG
AGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAA
GCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGC

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR4FB88JQ 757 0 0
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CCCAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGA
AGATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCT
CACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCAT
CGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCGGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTC
CGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTG
ATCTCAACGCATTGCTGACGCGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAG
CTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAA
CCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGA
GAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTT
GGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAG
TGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGAC
CGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACC

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DS 

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AAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCAGATGCT
GACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCA
GTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCA
CCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCA
TTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTG
AAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTC
ACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTG
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TCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGG
CTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCG
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FH73JQ 725 0 0
G
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ACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAGATA
AACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCA
GATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAA
ACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCGATCGGGGAACGCTTGTGCTCTCCGAAC
ATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTC
AACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCA
CCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGG
TTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATG
AGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAA
GCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCC
ACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCT
TTTT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4CK66JQ 821 0 0
GTA
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ACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATGCAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAGATA
AACTTCAAACACAAGATGACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCA
GATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAA
ACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGATCTCCGAAC
ATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTC
AACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCA
CCGGTGAAGTTAAATCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGG
TTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATG
AGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAA
GCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCC
ACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCT
TTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGG*CCTGGAGCTGGTGCTGCCGGC
TGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGA*GCACCGCGGCGAT

QA 4 821 4 821
DS 

RD RR4BJ58JQ 781 0 0
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ATCACAATTATATTCAGAAGATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACC
CTAGTCCAACTCTCCTCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAG
TGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCGATCG
GGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACA
CCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTG
AGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGC
CGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATT
TGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAG
TTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGG
ATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCA
TGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAG
GGCCTGGAGCTGGTGCTGCAGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGA
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4CK66TF 810 0 0
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AAGTCCAAAACCAA*CCCTAGTCCA*CTCTCCTCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGA
CGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTT
AGGG*CAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGATCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAAC
CATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGT
CTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAATCCGTA
AACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATC
GTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGC
GCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAA
CACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGT
GATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAG
GTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGA
GAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACAGGTGATAGCCATTGC
TAGTTTGTTTACTTGATGTCT
GAAGAGTCC

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DS 

RD RR4BJ58TF 679 0 0
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CGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAA
CATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAAC
CGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGT
CACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGT
AGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGT
TTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGC
CTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAA
GATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGAC
CAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCAGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCG
CGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTTGTTTA
CTTGATGTCTGAAGAGTCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4FB88TF 676 0 0
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ACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACGCGTGTCTCCACGTAACCGG
TTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCAC
GGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGA
ATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTA
GAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTT
CGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGAT
GCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAG
CAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGTCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGTACCGCGG
CGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTTGTTTACTT
GATGTCT
GAAGAGTCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4FH73TF 655 0 0
TTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCG
ATCGGGGAACGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACA
TACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCG
GTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCA
CGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAG
AATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTT
AGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCT
TCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGA
TGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCA
GCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCG
GCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTT
CC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4EK58TF 670 0 0
TTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGG*CAGGAGCG
ATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACA
TACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCG
GTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCA
CGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAG
AATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTT
AGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCT
TCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGA
TGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTTC*GTGAGGTAGATAGGACCA
GCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCG
GCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTTGTTTACT
TGATGTCT
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GA47TF 671 0 0
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GATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAAC
ATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACC
GGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTC
ACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTA
GAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAAATTGTT
TAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCC
TTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAG
ATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACC
AGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGC
GGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTTGTTTAC
TTGATGTCT
CC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 12

CO CL246Contig1 1056 12 16 U
GGGTATCGCAACTATTGCTACCTACCTCCTCCCTCTTCTCTTACATCATTACTAGGCCAT
CAAACATTCAAACCTAACCCCAAACTCAAACCATGTCTTCTTCCCATTGTCCGTCACCGT
TACCCTCCGTCACCAAACTTCAAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCTCAGTCATCTCAC
CGGCTTCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACATACACG
AAAAATTCGTGATCTTCACGGTCATCGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCAC
TTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCC
GTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAA
CGGGACATCAATATTCCGAGAAA*GTTACGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCT
AGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGG
ACCAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTGCTCTCTCTCCTAACGGGTCTCTCA
CGATTGCCTTTTCCAAGGACGATCATATTCCTAAAACCGGAAAAGCCGTGATCGAGAATA
AATTGCTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGG
CTAGGTTGAGTCTTGCCGAGAGATTATCTCAGCTGATGAAGAAGAACAAGGTCGAAGAAG
ATGCAACAAAGACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGG
CCAAAGAGAACTAATCGTGTGGGAGGTTTTTCTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTC
TATTTCTAATCATGTTGTTTATTTCACATCTCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAA
GAATAATTAAATAATCTCATAAAATTGGAACAAATCTACCAAAACTGTATTATCAGTGAT
GTTGATTCTATAAATTATGAACAAAACCGATTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
0 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 20 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX73TF U 1
AF RR4AW21JQ C 408
AF RR4ET18TF U 80
AF RR4BI45TF U 55
AF RR4AW21TF U 62
AF RR4AU13TF U 62
AF RR4ET18JQ C 208
AF RR4AU13JQ C 211
AF RR4GX73JQ C 210
AF RR4D492JQ C 611
AF RR4D492TF U 611
AF RR4BI45JQ C 246
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BS 241 241 RR4BI45TF
BS 242 259 RR4GX73TF
BS 260 260 RR4BI45TF
BS 261 265 RR4GX73TF
BS 266 266 RR4BI45TF
BS 267 368 RR4GX73TF
BS 369 370 RR4BI45TF
BS 371 536 RR4GX73TF
BS 537 765 RR4BI45TF
BS 766 915 RR4AU13TF
BS 916 916 RR4D492TF
BS 917 956 RR4AU13TF
BS 957 988 RR4D492TF
BS 989 1016 RR4GX73JQ
BS 1017 1056 RR4BI45JQ

RD RR4GX73TF 536 0 0
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CAAACATTCAAACCTAACCCCAAACTCAAACCATGTCTTCTTCCCATTGTCCGTCACCGT
TACCCTCCGTCACCAAACTTCAAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCTCAGTCATCTCAC
CGGCTTCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACATACACG
GAAAATTCGTGATCTTCACCGTCATTGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCAC
TTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCC
GTGAAATCACCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAA
CGGGACATCAATATTCCGAGAAA*GTTACGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCT
AGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4AW21JQ 118 0 0
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TTGGAAAATCGCTAGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAAAGCTGTGGAGAGGTTCT

QA 1 118 1 118
DS 

RD RR4ET18TF 533 0 0
GG
AAACTCAAACCATGTCTTCTTCCCATTGTCCGTCCCCGTTACCCTCCGTCACCAAACTTC
AAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCTCAGTCATCTCACCGGCTTCCTCCACTCCCCTCT
TCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACATACACGGAAAATTCGTGATCTTCACCG
TCATTGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCCGTTAAGTGGAAAGGCA
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TTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACGGGACATCAATATTCCGAGA
AA*GTTACGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCTAGGTATCTACACAGACGCTGA
AGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACCAAACGTTCCCTCCTGGTG
CTTCGATCCTCTTTGCTTTCTCCCCTAACGGGTCTCTCACGATTGCCTTTT

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DS 

RD RR4BI45TF 711 0 0
GGCCATCAAAC
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TCCGTCACCAAACTTCAAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCTCAGTCATCTCACCGGCT
TCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACATACACGAAAAA
TTCGTGATCTTCACGGTCATCGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCC
GTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAA
ATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACGGGA
CATCAATATTCCGAGAAA*GTTACGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCTAGGTA
TCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACCAA
ACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTGCTCTCTCTCCTAACGGGTCTCTCACGATT
GCCTTTTCCAAGGACGATCATATTCCTAAAACCGGAAAAGCCGTGATCGAGAATAAATTG
CTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGG
TTGAGTCTTGCCGAGAGATTATCTCAGCTGATGAAGAAGA

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DS 

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TCCGTCACCAAACTTCAAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCTCAGTCATCTCACCGGCT
TCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACATACACGAAAAA
TTCGTGATCTTCACGGTCATCGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCC
GTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAA
ATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACTGGA
CATCAATATTCCGAGAAA*GTTGCGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCTAGGTA
TCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACCAA
ACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTTCTCTCTCTCCTAACGGGTCTCTCACGATT
GCCTTTTCCAAGGACGATCATATTCCTAAAACCGGAAAAGCCGTGATCGAGAATAAATTG
CTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGGTCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGG
TTGAGTCTTGCCGAGAGATTATCTCAGCTGATGAAGAAGAACAAAGTCGAAGAAGATGCA
ACAAAGACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAA
GAGAACTAATCG

QA 5 796 5 796
DS 

RD RR4AU13TF 895 0 0
AGGG
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TCCGTCACCAAACTTCAAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCTCAGTCATCTCACCGGCT
TCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACATACACGAAAAA
TTCGTGATCTTCACGGTCATCGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCC
GTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAA
ATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACTGGA
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TCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACCAA
ACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTTCTCTCTCTCCTAACGGGTCTCTCACGATT
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CTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGGTCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGG
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ACAAAGACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAA
GAGAACTAATCGTGTGGGAGGTTTTTCTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTT
CTAATCATGT*GTTTATTTCACATCTCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTC

QA 5 895 5 895
DS 

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GAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGA
CAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAAA
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AAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAAGAGAACTAATCGTGTGGGAGGT
TTTTCTTGGTTGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTTCTAATCATGTTGTTTATTTCAC
ATCTCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAAGAATAATTAAATAATCTCATAAAATTG
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AU13JQ 781 0 0
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TTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAG
AGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGT
TTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACTGGACATCAATATTCCGAGAAA*GTTGCG
GAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCTAGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*G
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TCTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTTCTAATCATGTTGTTTATTTCACATC
TCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAAGAATAATTAAATAATCTCATAAAATTGG
AAC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4GX73JQ 809 0 0
GTGCGCA
GCGTGCGAGGTT*GGACATACACGGAAAATTCGTGATCTTCACCGTCATTGGAGTTTATC
TAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGT
TAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAAATCGCCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTA
AGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACGGGACATCAATATTCCGAGAAA*GTTACGGAGAAC
TGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCTAGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGG
AGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACCAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTG
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CCGGAAAAGCCGTGATCGAGAATAAATTGCTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAG
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ATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAAGAGAACTAATCGTGTGGGAGGTTTTTCTTGG
TCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTTCTAATCATGTTGTTTATTTCACATCTCACAT
GTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAAGAATAATTAAATAATCTCATAAAATTGGAACAAATC
TACCAAAACTGTATTATCAG
CG

QA 8 807 8 807
DS 

RD RR4D492JQ 378 0 0
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AGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGGTTGAG
TCTTGCCGAGAGATTATTTCAGCTGATGAAGAAGAACAAGGTCGAAGAAGATGCAACAAA
GACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAAGAGAA
CTAATCGTGTGGGAGGTTTTTTTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTTCTAAT
CATGTTGTTTATTTCACATCTCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAAGAATAATTAA
ATAATCTCATAAAATTGG

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4D492TF 378 0 0
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AGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGGTTGAG
TCTTGCCGAGAGATTATCTCAGCTGATGAAGAAGAACAAGGTCGAAGAAGATGCAACAAA
GACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAAGAGAA
CTAATCGTGTGGGAGGTTTTTTTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTTCTAAT
CATGTTGTTTATTTCACATCTCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAAGAATAATTAA
ATAATCTCATAAAATTGG

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4BI45JQ 811 0 0
TTCGTGATCTTCACGGTCATCGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCCGTCACTTTCC
GTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTTCTTCCGTGAA
ATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACTGCCGTTAACGGGA
CATCAATATTCCGAGAAA*GTTACGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAA*TCGCTAGGTA
TCTACACAGACGCTGAAGCTAAA*GCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACCAA
ACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTGCTCTCTCTCCTAACGGGTCTCTCACGATT
GCCTTTTCCAAGGACGATCATATTCCTAAAACCGGAAAAGCCGTGATCGAGAATAAATTG
CTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAGGAAAGAAGGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGG
TTGAGTCTTGCCGAGAGATTATCTCAGCTGATGAAGAAGAACAAGGTCGAAGAAGATGCA
ACAAAGACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAGATAAGTTGGCCAAA
GAGAACTAATCGTGTGGGAGGTTTTTCTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTTTCTATTT
CTAATCATGTTGTTTATTTCACATCTCACATGTGTTTATTTGCTTCTACTCGTAAGAATA
ATTAAATAATCTCATAAAATTGGAACAAATCTACCAAAACTGTATTATCAGTGATGTTGA
TTCTATAAATTATGAACAAAACCGATTATCC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 2 12

CO CL247Contig1 504 10 8 U
GGACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGA
TGAAAAAATCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAG
TGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTA
GATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAG
AGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGC
GCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCA
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T*TTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATAAATGACA
AAATAAGCTGTAAAAGTTAATTAT


BQ
30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 10 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 30 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A480TF U 1
AF RR4AQ46TF U 1
AF RR4A480JQ C 22
AF RR4BW35TF U 1
AF RR4BX14TF U 1
AF RR4GG60TF U 1
AF RR4EW44TF U 12
AF RR4B838TF U 5
AF RR4GG60JQ C 16
AF RR4C530JQ C 5
BS 1 143 RR4A480TF
BS 144 144 RR4AQ46TF
BS 145 219 RR4A480TF
BS 220 220 RR4AQ46TF
BS 221 419 RR4A480TF
BS 420 438 RR4BW35TF
BS 439 465 RR4GG60TF
BS 466 504 RR4C530JQ

RD RR4A480TF 419 0 0
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TGAAAAAATCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAG
TGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGGATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTA
GATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTGGCCAATCTGCGTGCAACAAG
AGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGC
GCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCA
GATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR4AQ46TF 396 0 0
GGACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGA
TGAAAAAATCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAT
TGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTA
GATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAG
AGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGC
GCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAAAATTCA
GATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4A480JQ 398 0 0
GATAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGATGAAAAAATCACTTATATTTT
CATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAG
GGGATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGT
TGTAAGAACAAGGCAGCTGGCCAATTTGCGTGCAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATA
AAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCA
AAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCAGATATATTTATAATAAATTAT
GATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAA

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR4BW35TF 440 0 0
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TGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGTACTAG
TGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTA
GATAACCAACAGTCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAG
AGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCTCGGGAAACAAATGC
GCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCA
GATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAAT
T*TTTATTTTCAAATTAC
AT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR4BX14TF 440 0 0
GGACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAA**CATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGA
TGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGTACTAG
TGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTA
GATAACCAACAGTCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAG
AGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCTCGGGAAACAAATGC
GCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCA
GATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAAT
T*TTTATTTTCAAATTAC
AT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR4GG60TF 469 0 0
GGACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGA
TGAAAAAATCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAG
TGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTA
GATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAG
AGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGC
GCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCA
GATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAAT
T*TTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCAT
ATGT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4EW44TF 418 0 0
AAAATTTTCTGATAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGATGAAAAAATCA
CTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCGGAGCG
ATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTAGATAACCAACA
GCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAGAGGATACAAGG
GTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGCGCCTGCTATAC
CCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACAGAATTCAGATATATTTAT
AATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAATT*TTTATTT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4B838TF 461 0 0
GG
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AATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCG
GAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAAGATATATGTCCCATATATCTAGATAAC
CAACAGTCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAGAGGATA
CAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCTCGGGAAACAAATGCGCCTGC
TATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATATTTAGTTTATTGACAACAGAATTCAGATATA
TTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAAAAATTTA
TTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCAT

QA 3 461 3 461
DS 

RD RR4GG60JQ 454 0 0
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TATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGG
GGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTAGATAACCAACAGCCT
GGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAGAGGATACAAGGGTCA
GGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGCGCCTGCTATACCCCA
TGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCAGATATATTTATAATA
AATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAATT*TTTATTTTCAAAT
TACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCAT
ATGT

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4C530JQ 500 0 0
GG
ACAACAAAATTTTCTGATAAAAA**CATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGATGAAAA
AATCACTTATATTTTCATTCAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCG
GAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAA*GATATATGTCCCATATATCTAGATAAC
CAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAGAGGATA
CAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGATACAAATGCGCCTGC
TATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCAGATATA
TTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAAATT*TTTA
TTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATAAATGACAAAATAA
GCTGTAAAAGTTAATTAT

QA 3 500 3 500
DS 



CO CL247Contig2 468 2 1 U
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AAGGATGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGT
ACTATTGGCCGGAGGGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAAGATATATGTCCCATATA
TCTAGATAACCAACAGTCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAA
CAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCTCGGGAAACAA
ATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATATTTAGTTTATTGACAACAGAA
TTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCA
AATTTTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GP14TF U 1
AF RR4GP14JQ C 46
BS 1 468 RR4GP14TF

RD RR4GP14TF 468 0 0
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AAGGATGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGT
ACTATTGGCCGGAGGGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAAGATATATGTCCCATATA
TCTAGATAACCAACAGTCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAA
CAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCTCGGGAAACAA
ATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATATTTAGTTTATTGACAACAGAA
TTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCA
AATTTTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCAT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4GP14JQ 423 0 0
TTCATTCATATTACCAAGGATGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTAT
CCTCGTCATTCTTGTACTATTGGCCGGAGGGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAAGA
TATATGTCCCATATATCTAGATAACCAACAGTCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTG
CCAATCTGCGTGCAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTG
TGTCTCGGGAAACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATATTTAGT
TTATTGACAACAGAATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAA
TTAAATAAGTTGTCAAATTTTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTG
CAT

QA 1 423 1 423
DS 



AS 2 8

CO CL248Contig1 1233 4 12 U
GGATTCCATACGTTCATTCTCTCTCTCACTCAGGAGTGAAACTTGCTTGCTTGAATCATG
GCTTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGATTGGGAACACCCCTTTGGTTTATCTG
AACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCT
TGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGT
CTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTT*GG
GTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTACTATGCCAGCTTCGAT
GAGTGTAGAGAGGAGGATCATCCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTTGATCTTAACTGACCC
TGCTAAGGGCATGAAAGGAGCTATTGCAAAGGCCGAAGAGATTTTGGCCAAAACACCTAA
CGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGACTAC
TGGACCTGAGATATGGAAAGGCACCGGTGGAAAAATCGATGGATTTGTCTCTGGGATTGG
TACTGGTGGTACCATCACAGGTGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACGTTAA
GCTGTATGGCGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTATCCCGTGGGAAGCCAGGCCCTCA
CAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGTGTGTTGGAGGTTGATCTTATAGA
TGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGTAAGGCTTCTTGCTCTTAA
AGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAGCTTGC
AAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCGGTGTTCCCGAGTTTTGGGGAGAG
GTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCAATGACCTTCGA
GGCTTGAATTTGTCTCCCCTGAAAATTTCATTTTTCTGTTTCTTTTCATTTGAGACGCCA
AAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAATCTCTTCATCTTCAGCTTC
AGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAATCAATCT
AGATTTTCTCTTTTGAAGAACACATTGCTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BK50TF U 86
AF RR4CU49TF U 16
AF RR4CA33TF U 1
AF RR4BK50JQ C 518
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BS 768 799 RR4CA33TF
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CGA

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GGATGTGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAA
GACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGA
GAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTT*GGGTTAGCCTTCACGGC
TGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTACAATGCCAGCTTCGATTAGTGTAGAGAGGAG
GATCATTCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTTGATCTTAACTGACCCTGCTAAGGGCATGAA
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ACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGACTACTGGACCTGAGATATG
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CACAG
T

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DS 

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AACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCT
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CTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTT*GG
GTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTACTATGCCAGCTTCGAT
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TGGACCTGAGATATGGAAAGGCACCGGTGGAAAAATCGATGGATTTGTCTCTGGGATTGG
TACTGGTGGTACCATCACAGGTGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACGTTAA
GCTGTATGGCGTG*AGCCAATTGAAAGTGCTATTCTATCCCGTGGGAAGCCAGGCC*TCA
CAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATAC*AAGTGTGTTGGAG*TTGATCTTATAGA
TGAAGTTGTTCAAGTTTCA
GTGA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4BK50JQ 716 0 0
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GATGGATTTGTCTCTGGGATTGGTACTGGTGGTTCCATCACAGGTGCAGGGAAGTATCTC
AAGGAACAGAACCCTAACGTTAAGCTGTATGGCGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTA
TCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGT
GTGTTGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGAC
ATGGTAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCA
GCAGCCGCAGCAATCAAGCTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCG
GTGTTCCCGAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAA
GAAGCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTTGTCTCCCCTGAAAATTTCATTTTTCT
GTTTCTTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAG
AGAATCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTT
TGTGTGAGAATAAAAATCAATCTAGATTTTCTCTTTTGAAGAACACATTGCTGTCT

QA 1 716 1 716
DS 



CO CL248Contig2 1293 4 15 U
GGACGTTCTCTATTCTCTTCAAACATACGTTATTGACTTTCTCTCTCTATCTCTCTCTCT
CAGAAGGAGCAGTGAAGCTTGAACCATCATGGCCTCTCGTATTGCTAATGATGTGACCGA
ATTGATTGGGAACACTCCGTTGGTGTATCTGAACAGTGTTGCTCAAGGATGTGTTGGTCG
TGTTGCTGCTAAGCTTGAGATGATGGAGCCCTGCTCCAGCGTTAAAGACAGGATTGGTTT
TAGCATGATCTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGTTGAT
TGAGCCAACAAGTGGAAACACTGGAGTTGGGTTAGCGTTCACGGCGGCTGCCAAGGGCTA
CAAGCTTATTATTACCATGCCAGCTTCAATGAGCGTTGAGAGAAGAATCATCCTCTTAGC
TTTTGGTGTTGAGTTGGTTTTAACTGACCCGGCCAAGGGTATGAAAGGCGCTATCGCAAA
GGCTGAAGAGATTTTGGCTAAAACACCCAATGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCC
TGCTAACCCAAAGATCCACTATGAGACAACTGGACCTGAGATTTGGAAAGGCACTGGTGG
AAAAATCGATGGCTTTGTCTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATAACAGGTGCGGGGAA
GTATCTCAAGGAACAGAACCCCAACGTTAAGCTGTATGGAGTGGAGCCAGTTGAAAGCGC
AATTCTATCCGGTGGAAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTAT
ACCAGGTGTATTGGAGGTTAATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATC
CATCGATATGGCAAGGCTTCTTGCTCGTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCAGG
TGCAGCAGCTGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAACGCCGGGAAGCTTTT
TGTGGCGGTGCTCCCAAGTTTCGGAGAGAGGTACCTGTCGACCGTACTATTCGATGCCAC
AAGGAAAGAAGCAAAATCCATGACCTTCGAGGCTTGAATAGCTCTCAGAGCTGCAAGACA
AAAAATCTCCATTTCTTTGATTAGAGACGCCACTAATAAAAAAAAAAGGATGTTACAGTT
TCTTCCTAAAGAGAATTGTTCATCTTCAGTTTCAATGCGTCTTTTGTTTTTATTTATGTA
TCTTCTGTGTGTGTGAGAACAAAACTCAAAACTCTATATTTCTTCTTGTGAACGAACCCA
CTTGCTGTTAATAAGTTTGAATTTTCTGTGTGG


BQ
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GCTG
G

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DS 



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AGCGGACAGGAAACTTTTGGAGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCA


BQ
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TCCAGGGTTTGGTGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTT
AAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGG
TTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTA
GACTGGGTATTCACCCTATCAATATC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AE10TF 664 0 0
AACACTGAATGGACTGTTCTTACTCATCAAACAGGTATCGCCATTGCAAACCGGGTACTC
ATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGTCATCGCAGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCAACATCC
CCAACCAAAGCAGTACTTGCCGTACTGGAAGAGACAACAACAAGTGTTGCTCTCGGGGCA
AGAGTAGTACTTGTCACACTGGGTCGGTGGCTTAATGGGAGATGGTGGTGACGGTCCAGG
GTTTGGTGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATAT
AGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATA
GGACGAAAAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGG
GTATTCACCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATG
GGGTACTTTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAGT
CATGGAGTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGA
CTCCTCTGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGC
CCTC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4FG05TF 693 0 0
G
CTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGCCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACAT
CCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGAT
CATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTA
TCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAAT
AGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGA
CATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAA
ACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGATTCCGGA**TACCATAGCCAT***CCTAAAATTACA
TCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTA
CGAGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCCGAGTA
TAACAGAGAGATTCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCA
AGATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTT
GGAGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCA

QA 2 693 2 693
DS 



CO CL249Contig2 674 9 9 U
GTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACAT
GCATTTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACC
ATATTTTTTCTTAAAAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTT
TTTAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTT
GGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCT
AACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAA
AAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCA
CCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACT
TTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGA
GTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTC
TGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTCGT
GTTTATGATCCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4GU62TF C 75
AF RR4F521JQ U 1
AF RR4F521TF C 1
AF RR4G424JQ U 75
AF RR4GU62JQ U 77
AF RR4G424TF C 75
AF RR4GH84JQ U 75
AF RR4D710JQ U 75
AF RR4D710TF C 75
BS 1 142 RR4F521JQ
BS 143 143 RR4G424JQ
BS 144 148 RR4F521JQ
BS 149 149 RR4G424JQ
BS 150 273 RR4F521JQ
BS 274 274 RR4G424JQ
BS 275 607 RR4F521JQ
BS 608 658 RR4G424JQ
BS 659 674 RR4GH84JQ

RD RR4GU62TF 489 0 0
A
CATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAA
AAAAAA**GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATT
CTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGT
AGGTCTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAA
AAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAG
TTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTC
AAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAAT
GTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGAGTAAGACATCGATTT
ATTAATAA

QA 2 489 2 489
DS 

RD RR4F521JQ 607 0 0
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GCATTTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACC
ATATTTTTTCTTAAAAAAAAAAAGATAAAAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTT
TTTAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTT
GGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAAATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCT
AACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAA
AAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCA
CCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACT
TTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGA
GTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTC
TGAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4F521TF 607 0 0
GTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACAT
GCATTTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACC
ATATTTTTTCTTAAAAAAAAAAAGATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTT
TTTAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTT
GGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCT
AACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAA
AAGATCATTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCA
CCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACT
TTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGA
GTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTC
TGAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4G424JQ 584 0 0
GCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAA
AAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAAT
TCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGAAG
TAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAA
AAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGA
GTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCT
CAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAA
TGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGAGTAAGACATCGATT
TATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGC
GCACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4GU62JQ 582 0 0
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AAAAA**GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATTC
TAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGTA
GGTCTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAA
AATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAGT
TCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTCA
AATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAATG
TCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGAGTAAGACATCGATTTA
TTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCGC
ACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4G424TF 584 0 0
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AAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAAT
TCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGAAG
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AAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGA
GTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCT
CAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAA
TGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAA*GTCATGGAGTAAGACATCGATT
TATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGC
GCACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4GH84JQ 600 0 0
GCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAA
AAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAAT
TCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACG
TAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAA
AAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGA
GTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCT
CAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAA
TGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAA**GTCATGGAGTAAGACATCGATT
TATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGC
GCGCGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTTGTGTTTATGATCCATC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4D710JQ 598 0 0
A
CATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAA
AAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATT
CTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGT
AGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAA
AAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAG
TTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTC
AAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAAT
GTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTT
ATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCG
CACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTTGTGTTTATGATCC
C

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR4D710TF 598 0 0
A
CATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAA
AAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATT
CTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGT
AGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAA
AAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCATTTTTGAG
TTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTC
AAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAAT
GTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTT
ATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCG
CACGTGTAAACGAGGTGCTCTACCTAACTGAGCTATAGCCCTTGTGTTTATGATCC
C

QA 2 597 2 597
DS 



AS 1 11

CO CL250Contig1 1018 11 7 U
GGTAATGAAGCTACAGTGAAAATTGTAGCCAAGTCCTTCACATATTTGTTTATTACATCT
TTCTTTTTTTTTGCTTGTTTATTATTCTCTTGAAGTCGTAGCGTAGAGAATACAGTGTTC
CTCCCGGTTAAACAAACTTGATTGGACATAACCAGATAAACCGATATGTAATTAAAAACA
AAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAATCTACAGATTCTCAACTTCTCCTAATACAA
AACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGAAAAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACAT
CTATATTTAATATTTTCTTAATCGTATATTATATGGTTTATAATACACGATCCGTGATCT
GCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGC
GTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGTAATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATC
ATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCA
CAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAA
TCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTC
CTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAACCGCGTCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGA
GATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACGCCGGTGTGAACGTAGAGAACGGAGAAAGG
TTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCCTCTAGATACTTCTTCAACACATCCAATGA
CAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATGATCCGAAGGATCTTACGTCCTCGTTTGTC
TCTTCCATGGATCTTGAAAATCTCAAGCTTCTCAATCAGCTGCTCCTGTTCGATCTCCGA
TATCTGAGTGGTGCTCATCTCTTCGACGGTGATAATAATCAGTTGAGATATGCGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 25 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 

AF RR4G932JQ U 1
AF RR4F427JQ U 120
AF RR4GT25JQ U 33
AF RR4CM51JQ U 174
AF RR4GT25TF C 289
AF RR4A861JQ U 144
AF RR4A861TF C 197
AF RR4BE31JQ U 151
AF RR4G932TF C 287
AF RR4F427TF C 324
AF RR4BE31TF C 154
BS 1 230 RR4G932JQ
BS 231 231 RR4F427JQ
BS 232 690 RR4G932JQ
BS 691 748 RR4GT25JQ
BS 749 988 RR4A861JQ
BS 989 989 RR4BE31JQ
BS 990 1018 RR4A861JQ

RD RR4G932JQ 690 0 0
GGTAATGAAGCTACAGTGAAAATTGTAGCCAAGTCCTTCACATATTTGTTTATTACATCT
TTCTTTTTTTTTGCTTGTTTATTATTCTCTTGAAGTCGTAGCGTAGAGAATACAGTGTTC
CTCCCGGTTAAACAAACTTGATTGGACATAACCAGATAAACCGATATGTAATTAAAAACA
AAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAATCTACAGATTCTCAACTTCTTCTAATACAA
AACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGAAAAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACAT
CTATATTTAATATTTTCTTAATCGTATATTATATGGTTTATAATACACGATCCGTGATCT
GCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGC
GTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGTAATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATC
ATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCA
CAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAA
TCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTC
CTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4F427JQ 582 0 0
CCTCACGGTTAAACAAACTTGATTGGACATAACCAGATAAACCGATATGTAATTAAAAAC
AAAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAATCTACAGATTCTCAACTTCTCCTAATACA
AAACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGAAAAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACA
TCTATATTTAATATTTTCTTAATCGTATATTATATGATTTATAATACACGATCCGTGATC
TGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGG
CGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGTAATCCATCATCGGACGGTACTCCAGAT
CATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCC
ACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGA
ATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCT
CCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAACCGCGTCGT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4GT25JQ 716 0 0
GTCCTTCACATATTTGTTTATTACATCTTTCTTTTTTTTTGCTTGTTTATTATTCTCTTG
AAGTCGTAGCGTAGAGAATACAGTGTTCCTCCCGGTTAAACAAACTTGATTGGACATAAC
CAGATAAACCGATATGTAATTAAAAACAAAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAATC
TACAGATTCTCAACTTCTTCTAATACAAAACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGAA
AAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACATCTATATTTAATATTTTCTTAATCGTATATTAT
ATGGTTTATAATACACGATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGG
AGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGT
AATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATCATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCT
CTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCT
TCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACT
GCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAA
CCGCGTCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4CM51JQ 730 0 0
AAAAACAAAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAATCTACAGATTCTCAACTTCTCCT
AATACAAAACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGAAAAGCGCTCACTGACTTCGAAA
AGCACATCTATATTTAATATCTTCTTAATCGTATATTATATGGTTTATAATACACGATCC
GTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCAACGGCGG
CTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGAACGTAATCCATCATCGGACGGTACT
CCAGATCATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCTCACGT
GTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCCGGAAA
AAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGT
AAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAACCGCGTCGTAGATCGCCCGTA
GAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACGCCGGTGTGAACGTAGAGAACGG
AGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCCTCTAGATACTTCTTCAACACAT
CCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATGATCCGAAGGATCTTACGTCCTC
GTTTGTCTCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4GT25TF 638 0 0
CGAAAAGCACATCTATATTTA*TATTTTCTTAATCGTATATTATATGGTTTATAATACAC
GATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCAAC
GGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGTAATCCATCATCGGACG
GTACTCCAGATCATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCT
CACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCC
GGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAG
GAAGTAAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAACCGCGTCGTAGATCGC
CCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACGCCGGTGTGAACGTAGAG
AACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCCTCTAGATACTTCTTCAA
CACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATGATCCGAAGGATCTTACG
TCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTGAAAATCTCAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4A861JQ 875 0 0
GGACATAACCAGATAAACCGATATGTAATTAAAAACAAAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAA
AAAAAAATCTACAGATTCTCAACTTCTCCTAATACAAAACGCCAACAGCTGTCTAATCTT
TTCCGTGAAAAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACATCTATATTTAATATTTTCTTAATC
GTATATTATATGGTTTATAATACACGATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGG
AGAAACTGGAGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCCCT
CTTGACCGTAATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATCATCGTCGTGATCGTACACAAACT
CCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGT
ACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGA
GACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTCCCGGAGATTATTGTCTCTTACGT
TAACCGGAACCGCGTCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCC
TCTGTACGCCGGTGTGAACGTAGAGAACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGA
TCTTCTCCTCTAGATACTTCTTCAACACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACT
TGCCGATGATCCGAAGGATCTTACGTCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTGAAAATCT
CAAGCTTCTCAATCAGCTGCTCCTGTTCGATCTCCGATATCTGAGTGGTGCTCATCTCTT
CGACG*TGATAATAATCAGTTGAGATATGCGGCCC

QA 1 875 1 875
DS 

RD RR4A861TF 822 0 0
AGAAGAAAAAAAAATCTACAGATTCTCAACTTCT*CTAATACAAAACGCCAACAGCTGTC
TAATCTTTTCCGTGAAAAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACATCTATATTTAATATTTT
CTTAATCGTATATTATATGGTTTATAATACACGATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACAC
CTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGA
TCGCCCTCTTGACCGTAATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATCATCGTCGTGATCGTAC
ACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTG
CTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCG
AGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTCCCGGAGATTATTGTCT
CTTACGTTAACCGGAACCGCGTCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTC
TCGCTCCTCTGTACGCCGGTGTGAACGTAGAGAACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGA
GGAAAGATCTTCTCCTCTAGATACTTCTTCAACACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGA
AAGAACTTGCCGATGATCCGAAGGATCTTACGTCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTG
AAAATCTCAAGCTTCTCAATCAGCTGCTCCTGTTCGATCTCCGATATCTGAGTGGTGCTC
ATCTCTTCGACGGTGATAATAATCAGTTGAGATATGCGGCCC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4BE31JQ 868 0 0
G
CCAGATAAACCGATATGTAATTAAAAACAAAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAAT
CTACAGATTCTCAACCTCTCCTAATACAAAACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGA
AAAGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACATCTATATTTAATATTTTCTTAATCGTATATTA
TATGGTTTATAATACACGATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTG
GAGACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCG
TAATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATCATCGCCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATC
TCTATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGC
TTCCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGAC
TGCAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGA
ACCGCGTCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACG
CCGGTGTGAACGTAGAGAACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCC
TCTAGATACTTCTTCAACACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATG
ATCCGAAGGATCTTACGTCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTGAAAATCTCAAGCTTC
TCAATCAGCTGCTCCTGTTCGATCTCCGATATCTGAGTGGTGCTCATCTCTTCGACGGTG
ATAATAATCAGTTGAGATATGCGGCCC

QA 2 868 2 868
DS 

RD RR4G932TF 732 0 0
TTCGAAAAGCACATCTATATTTA*TATTTTCTTAATCGTATATTATATGGTTTATAATAC
ACGATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGAGACTGAAGAATCA
ACGGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGTAATCCATCATCGGA
CGGTACTCCAGATCATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATCTCGTTCCTC
CTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCGTACAGCCCG
CCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGGCCTGGGTGG
AGGAAGTAAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAACCGCGTCGTAGATC
GCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACGCCGGTGTGAACGTAG
AGAACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCCTCTAGATACTTCTTC
AACACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATGATCCGAAGGATCTTA
CGTCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTGAAAATCTCAAGCTTCTCAATCAGCTGCTCC
TGTTCGATCTCCGATATCTGAGTGGTGCTCATCTCTTCGACGGTGATAATAATCAGTTGA
GATATGCGGCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4F427TF 694 0 0
TCGTATATATATGA
TTATAATACACGATC*GTGATCTGCGCTAAGAGATACAC*TCATGGAGAAACTGGAGACT
GAAGAATCAACGGCGGCTC*GGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGA*CGTAATCC
ATCATCGGACGGTACTCCAGATCATCGTCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTCTATC
TCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTTCCCG
TACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTGCAGG
CCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAACCGCG
TCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACGCCGGTG
TGAACGTAGAGAACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCCTCTAGA
TACTTCTTCAACACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATGATCCGA
AGGATCTTACGTCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTGAAAATCTCAAGCTTCTCAATC
AGCTGCTCCTGTTCGATCTCCGATATCTGAGTGGTGCTCATCTCTTCGACGGTGATAATA
ATCAGTTGAGATATGCGGCC

QA 15 694 15 694
DS 

RD RR4BE31TF 865 0 0
AGATAAACCGATATGTAATTAAAA*CAAAAGAGAACAGGTTTAAGAAGAAAAAAAAATCT
ACAGATTCTCAACCTCT*CTAATACAAAACGCCAACAGCTGTCTAATCTTTTCCGTGAAA
AGCGCTCACTGACTTCGAAAAGCACATCTATATTTAATATTTTCTTAATCGTATATTATA
TGGTTTATAATACACGATCCGTGATCTGCGCTAAGAGATACACCTCATGGAGAAACTGGA
GACTGAAGAATCAACGGCGGCTCCGGCGTAAACCCTAGCGTGATCGCTCTCTTGACCGTA
ATCCATCATCGGACGGTACTCCAGATCATCGCCGTGATCGTACACAAACTCCGGCATCTC
TATCTCGTTCCTCCTCACGTGTTCCCACAAGTACTCAACTCTGCTTATGTACCTTAGCTT
CCCGTACAGCCCGCCGGAAAAAAGGAATCGTCCGCAAGTGGCGAGAAAGAGACGTGACTG
CAGGCCTGGGTGGAGGAAGTAAACCTCCTGGAGATTATTGTCTCTTACGTTAACCGGAAC
CGCGTCGTAGATCGCCCGTAGAGCTGAGATTCCCGGGAAATTCTCGCTCCTCTGTACGCC
GGTGTGAACGTAGAGAACGGAGAAAGGTTTTCTCCCTAATCGAGGAAAGATCTTCTCCTC
TAGATACTTCTTCAACACATCCAATGACAGAAACCGAGCTGGAAAGAACTTGCCGATGAT
CCGAAGGATCTTACGTCCTCGTTTGTCTCTTCCATGGATCTTGAAAATCTCAAGCTTCTC
AATCAGCTGCTCCTGTTCGATCTCCGATATCTGAGTGGTGCTCATCTCTTCGACGGTGAT
AATAATCAGTTGAGATATGCGGCCC

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 11

CO CL251Contig1 1235 11 11 U
AAAAATAAACATAGTCATACTTTATTAAAATCCACAAATGACAACACAAACATCGCACTC
AAACACAAAAATCACACTCAAACATAAGAAAACGTGAAACATAGTCTTTTTTTTTTTGAG
AAACAACATAAACGTATTATTATTTAAGAAAAACAAACATAAAACGTATTTAGTCCATAC
GGAAATCCACACAAGTATGGCTCTGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAACGGA
CCCAACAACGATTTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAGAATTGAGTTGCG
AGTCAGCGAGGCCATGAAAACCAACGATCTTCTTGTCTTTCACTTCAAGTGAAATATCTG
TACCTTCTTCTCCAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGGTTA
TGAATTTAATTCCCACAATCTTGTTGGATGAATCAGACCAACCCTTCGCAGAAAGTAAAT
ACTCGTTGGGATGACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCAT
GGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCTCAATAC
CTCTACCAACTGCGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCCATT
CATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCACTGT
TTGAGTCATCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGGCATCGATAGCATTAC
TGCTACGTCCATGGAATCCAATAAGCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGAACTCGAATTCGG
TTCCCTTCATCTCACCGAATAAAGGAGAGGTAAATCCTTTAGAGGTTGTGAAGTACAGCG
ATGTGATAAGCATTGTATCATAAGAGTAAATATGCTTGTAGGTTCCACCAACGGCAGTGA
TACTATCTTTCGGATAATCCACTGAAAACTCTTTTAGTTCGCCACGAGCCGCTCCATGCT
CACGGATGTCGACTTTTCCGTTCTTTACGTATTCGATCTTGATATAAGTTATGTTTACAT
CATCGGCTCCCACAGTTATTTTCTTCACACCTTCAAAACCAACATCGTTGAATCCTTGTC
CTTTGTTACCACCAAGCGGTTCCATGGTGGCCGTTCAAATCCGTCAGATATCTCCTGACT
GAAAGATGATGGGGGAGAAGAGTGAATCGCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 30 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F669JQ U 1
AF RR4GQ23JQ U 3
AF RR4GE77JQ U 1
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AF RR4BE28JQ U 7
AF RR4BR06JQ U 118
AF RR4BR06TF C 118
AF RR4F669TF C 434
AF RR4BE28TF C 412
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BS 1 287 RR4F669JQ
BS 288 288 RR4GQ23JQ
BS 289 419 RR4F669JQ
BS 420 420 RR4GQ23JQ
BS 421 660 RR4F669JQ
BS 661 661 RR4GQ23JQ
BS 662 759 RR4F669JQ
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BS 776 785 RR4BE28JQ
BS 786 832 RR4BR06JQ
BS 833 1235 RR4BE28TF

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GGAAATCCACACAAGTATGGCTCTGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAACGGA
CCCAACAACGATTTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAAAATTGAGTTGCG
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TACCTTCTTCTCCAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGGTTG
TGAATTTAATTCCCACAATCTTGTTGGATGAATCAGACCAACCCTTCGCAGAAAGTAAAT
ACTCGTTGGGATGACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCAT
GGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCTCAATAC
CTCTACCAACTGCGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCCATT
AATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCACTGT
TTGAGTCATCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTC

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AAGTATGGCTCTGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAACGGACCCAACAACGAT
TTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAGAATTGAGTTGCGAGTCAGCGAGGC
CATGAAAACCAACGATCTTCTTGTCTTTCACTTCAAGTGAAATATCTGTACCTTCTTCTC
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CCACAATCTTGTTGGATGAATCAGACCAACCCTTCGCAGAAAGTAAATACTCGTTGGGAT
GACTTATCTCAAACGTTCTAACGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCATGGGCGGGTCCTT
CCTTTGTCTGTACATTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCTCAATACCTCTACCAACTG
CGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCCATTCATTGCCTCCGT
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CT
TTGAA

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DS 

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CACACTCAAACATAAGAAAACGTGAAACATAGTCTTTTTTTTTTTGAGAAACAACATAAA
CGTATTATTATTTAAGAAAAACAAACATAAAACGTATTTAGTCCATACGGAAACCCACAC
AAGTATGGCTCCGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAACGGACCCAACAACGAT
TTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAGAATTGAGTTGCGAGTCAGCGAGGC
CATGAAAACCAACGATCTTCTTGTCTTTCACTTCAAGTGAAATATCTGTACCTTCTTCTC
CAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGGTTATGAATTTAATTC
CCACAATCTTGTCGGATGAATCAGACCAACCCTTCGCAGAAAGTAAATACTCGTTGGGAT
GACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCATGGGCGGGTCCTC
CCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCTCAATACCTCTACCAACCG
CGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCAACTCCATCATCCCATTCATTGCCTCCGT
TGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCACTGTTTGAGTCATCAC
CTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGGCATCGATAGC

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DS 

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GG
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CGGAAATCCACACAAGTATGGCTCTGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAACGG
ACCCAACAACGATTTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAAAATTGAGTTGC
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GTACCTTCTTCTCCAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGGTT
ATGAATTTAATTCCCACAATCTTGTTGGATGAATCAAACCAACCCTTCGCAGAAAGTAAA
TACTCGTTGGGATGACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCA
TGGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCTCAATA
CCTCTACCAACTGCGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCCAT
TCATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCACTG
TTTGAGTCATCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGG

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DS 

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AGTCATACTTTATTAAAATCCACAAATGACAACACAAACATCGCACTCAAACACAAAAAT
CACACTCAAACATAAGAAAACGTGAAACATAGTCTTTTTTTTTTTGAGAAACAACATAAA
CGTATTATTATTTAAGAAAAACAAACATAAAACGTATTTAGTCCATACGGAAATCCACAC
AAGTATGGCTCTGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAACGGACCCAACAACGAT
TTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAAAATTGAGTTGCGAGTCAGCGAGGC
CATGAAAACCAACGATCTTCTTGTCTTTCACTTCAAGTGAAATATCTGTACCTTCTTCTC
CAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGGTTATGAATTTAATTC
CCGCAATCTTGTTGGATGAATCAAACCAACCCTTCGCAAAAAGTAAATACTCGTTGGGAT
GACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCATGGGCGGGTCCTT
CCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAAATAATCAAACCTGATTTGCTCAATACCTCTACCAACTG
CGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCCATTCATTGCCTCCGT
TGCCACCTTGAGCGTAAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCACTGTTTGAGTCATCAC
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CTGTACCTTCTTCTCCAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGG
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AATACTCGTTGGGATGACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACAC
CATGGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGGTTTGCTCAA
TACCTCTACCAACTGCGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCC
ATTCATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCAC
TGTTTGAGTCACCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGGCATCGATAGCAT
TACTGCTACGTCCATGGAATCCAATAAGCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGAACTC

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DS 

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TACGGAAATCCACACAAGTATGGCTCTGATGTAACCTTATTCATAGGGAAATCAAGAAAC
GGACCCAACAACGATTTCAGCTGGTGATTGGAGCGAAATAAGCTCCAAGAGAATTGAGTT
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CTGTACCTTCTTCTCCAGGAACTTTTTCAAATCCATAACATTCTGAAGTCTTTGTGTTGG
TTATGAATTTAATTCCCACAATCTTGTTGGATGA*TCAGACCAACCCTTCGCAGAAAGTA
AATACTCGTTGGGATGACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACAC
CATGGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGGTTTGCTCAA
TACCTCTACCAACTGCGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCC
ATTCATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCAC
TGTTTGAGTCACCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGGCATCGATAGCAT
TACTGCTACGTCCATGGAATCCAATAAGCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGAACTC

QA 1 715 1 715
DS 

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CCCACAATCTG
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ACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCACACCATGGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTC
CGTTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCTCAATACCTCTACCAACTGCGATATGTATCT
TTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCATCCCATTAATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAG
CGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTCCACTGTTTGAGTCATCACCTCCGGAGTTAG
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GCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGAACTCGAATTCGGTTCCCTTCATCTCACCGAATAAAG
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AGTAAATATGCTTGTAGGTTCCACCAACGGCAGTGATACTATCTTTCGGATAATCCACTG
AAAACTCTTTTAGTTCGCCACGAGCCGCTCCATGCTCACGGATGTCGACTTTTCCGTTCT
TTACGTATTCGATCTTGATATAAGTTATGTTTACATCATCGGCTCCCACAGTTATTTTCT
TCACACCTTCAAAACCAACATCGTTGAATCCTTGTCCTTTGTTACCACCAAGCGGTTCCA
TGGTGGCCGTTCAAATCCGTCAGATATCTCC

QA 12 762 12 762
DS 

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GTG
TGGTTATGAATTTAATTCCCGCAATCTTGTTGGATGAATCAGACCAACCCTTCGCAGAAA
GTAAATACTCGTTGGGATGACTTATCTCAAACGTTCTAATGGAAGATCTGCCACCCTTCA
CACCATGGGCGGGTCCTTCCTTTGTTTGTCCGTTCTTGAGATAATCAAACCTGATTTGCT
CAATACCTCTACCAACTGCGATATGTATCTTTGTCACACCGTCGTGATCACCTCCATCAT
CCCATTCATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTAAAGTTTTTGAGTACTAGATCCGCTTC
CACTGTTTGAGTCATCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGGCATCGATAG
CATTACTGCTACGTCCATGGAATCCAATAAGCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGAACTCGA
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CAGTGATACTATCTTTCGGATAATCCACTGAAAACTCTTTTAGTTCGCCACGAGCCGCTC
CATGCTCACGGATGTCGACTTTTCCGTTCTTTACGTATTCGATCTTGATATAAGTTATGT
TTACATCATCGGCTCCCACAGTTATTTTCTTCACACCTTCAAAACCAACATCGTTGAATC
CTTGTCCTTTGTTACCACCAAGCGGTTCCATGGTGGCCGTTCAAATCCGTCAGATATCTC
CTGACTGAAAGATGATGGGGGAGAAGAGTGAATCGCAATCC

QA 4 824 4 824
DS 

RD RR4GE77TF 648 0 0
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AACTCGAATTCGGTTCCCTTCATCTCACCGAATAAAGGAGAGGTAAATCCTTTAGAGGTT
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CCAACGGCAGTGATACTATCTTTCGGATAATCCACTGAAAACTCTTTTAGTTCGCCACGA
GCCGCTCCATGCTCACGGATGTCGACTTTTCCGTTCTTTACGTATTCGATCTTGATATAA
GTTATGTTTACATCATCGGCTCCCACAGTTATTTTCTTCACACCTTCAAAACCAACATCG
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ATATCTCCTGACTGAAAGATGATGGGGGAGAAGAGTGGATCGCAATCC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4B686TF 647 0 0
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CATCATCCCATTCATTGCCTCCGTTGCCACCTTGAGCGTCAAGTTTTTGAGTACTAGATC
CGCTTCCACTGTTTGAGTCATCACCTCCGGAGTTAGAGCCGAAATAAGCTCCGATGGCAT
CGATAGCATTACTGCTACGTCCATGGAATCCAATAAGCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGA
ACTCGAATTCGGTTCCCTTCATCTCACCGAATAAAGGAGAGGTAAATCCTTTAGAGGTTG
TGAAGTACAGCGATGTGATAAGCATTGTATCATAAGAGTAAATATGCTTGTAGGTTCCAC
CAACGGCAGTGATACTATCTTTCGGATAATCCACTGAAAACTCTTTTAGTTCGCCACGAG
CCGCTCCATGCTCACGGATGTCGACTTTTCCGTTCTTTACGTATTCGATCTTGATATAAG
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TGAATCCTTGTCCTTTGTTACCACCAAGCGGTTCCATGGTGGCCGTTCAAATCCGTCAGA
TATCTCCTGACTGAAAGATGATGGGGGAGAAGAGTGAATCGCAATCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 3 11

CO CL252Contig1 694 6 2 U
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ATGGCTGGGAGAGCTTCGATCCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCTGAC
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ACTAATTACCTCATCGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAG
GAGTTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATG
ATCAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGATCCTGGAGATCCCTTCC
AAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTC
TCTGCTGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACCATCCTGCAAAGCTTTTGCTGAGC
TTTTTATATCATTTGTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTAT
CTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAACACCGTC
TGGTTCTTTTTGCATTAGATAAAGAGAGTGAGTCTGTTGTGTATAACAAGAGACAAGAGC
AAACTTTAAAGATTTTAAGTGAAGACTTTCAGCT


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B572JQ C 1
AF RR4BH44JQ C 1
AF RR4B572TF U 1
AF RR4BH44TF U 1
AF RR4A244TFB U -6
AF RR4A244TF U 357
BS 1 598 RR4B572TF
BS 599 694 RR4A244TFB

RD RR4B572JQ 598 0 0
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CTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAACACCG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BH44JQ 598 0 0
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ATGGCTGGGAGAGCTTCGATCCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCTGAC
GAGGACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAGGAGGAAG
ACTAATTACCTCATCGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAG
GAGTTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATG
ATCAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGATCCTGGAGATCCCTTCC
AAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTC
TCTGCTGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACCATCCTGCAAAGCTTTTGCTGAGC
TTTTTATATCATTTGTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTAT
CTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAACACCG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4B572TF 598 0 0
GGAAGGAGGAGAAACGAGAAGAAACAGCGAGAAGAGAAAAAGTAGTAGTTTGAATCAAAT
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GAGGACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAGGAGGAAG
ACTAATTACCTCATCGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAG
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ATCAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGATCCTGGAGATCCCTTCC
AAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTC
TCTGCTGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACCATCCTGCAAAGCTTTTGCTGAGC
TTTTTATATCATTTGTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTAT
CTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAACACCG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BH44TF 598 0 0
GGAAGGAGGAGAAACGAGAAGAAACAGCGAGAAGAGAAAAAGTAGTAGTTTGAATCAAAT
ATGGCTGGGAGAGCTTCGATCCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCTGAC
GAGGACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAGGAGGAAG
ACTAATTACCTCATCGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAG
GAGTTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATG
ATCAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGATCCTGGAGATCCCTTCC
AAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTC
TCTGCTGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACCATCCTGCAAAGCTTTTGCTGAGC
TTTTTATATCATTTGTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTAT
CTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAACACCG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4A244TFB 701 0 0
GGAAATCCC
AAGGAGGAGAAACGAGAAGAAACAGCGAGAAGAAAAAAAGTAGT***TTGAATCAAATAT
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GGACACTGTTGTCGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAGGAGGAAGAC
TAATTACCTCATCGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGA
GTTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATGAT
CAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGATCCTGGAGATCCCTTCCAA
GGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTCTC
TGCTGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACCATCCTGCAAAGCTTTTGCTGAGCTT
TTTATATCATTTGTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTATCT
CTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAGCACCATCTG
GTTCTTTTTGCATTAGATAAAGAGAGTGAGTCTGTTGTGTATAACAAGAGACAAGAGCAA
ACTTTAAAGATTTTAAGTGAAGACTTTCAGCT

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DS 

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TTCCAAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCT
CTTCTCTGCTGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACCATCCTGCAAAGCTTTTGCT
GAGCTTTTTATATCATTTGTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAAT
GTATCTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGGAATGATAGCAC
CATCTGGTTCTTTTTGCATTAGATAAAGA*AGTGAGTCTGTTGTGTATAACAAGAGACAA
GAGCAA
CTTT

QA 1 306 1 306
DS 



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CTCACTCTCTTTATTTAATGCAAAAAGAACCAGATGGTGTTTTACCGTTGCTTCTTAATA
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AATACAAGAATGTCAAAAACCAAACAAATGATATAAAAAGCTCAGCAAGCTTTGCAGGAT
GTGTATATGTTTTTAACGCTGTGACACAGATTCCGCAGAGAAGAGGTACTTGACACGGGA
GAGAACAGAGTCATGAGCAGGATCATAAGGATGGTCCTTGGAAGGGATCTCCAGGATCGC
AGGAACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAACCTGATCATATTGGCAACATATTGGCT
GATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTTGA*GAGAATTCCTTGAAAGCATCCTCAATTTG
TCTCACCGTTGTCTTTGAATCCACGATAAGGTAATTAGTCTTCCTCCTTATGTCAACATT
ACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACAACAGTGTCCTCGTCAGCGATCATAGCGATAAG
GGCAGAGTTGCGAGCAGGGATTGAAGCTCTCCCAGCCATATTTGATTCAAACTACTACTA
CTTTTCTCTTCTCTCTGTTTCTTCTCGTTTTGTCCTCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4BM89JQ U 1
AF RR4AU05JQ U 46
AF RR4AU05TF C 46
BS 1 450 RR4BM89JQ
BS 451 451 RR4AU05JQ
BS 452 498 RR4BM89JQ
BS 499 499 RR4AU05JQ
BS 500 503 RR4BM89JQ
BS 504 504 RR4AU05JQ
BS 505 698 RR4BM89JQ
BS 699 702 RR4AU05JQ

RD RR4BM89JQ 702 0 0
GGTCAAAGTCTTCACTTAAAATCTTTATAGTCTGCTCTTGTCTCTTGAATACACAACAGA
CTCACTCTCTTTATTTAATGCAAAAAGAACCAGATGGTGTTTTACCGTTGCTTCTTAATA
ACATAAACATCCATCTTTAAATAAAAATCAAGAGAGAACATTATTGAAATTCGAGACTCA
AATACAAGAATGTCAAAAACCAAACAAATGATATAAAAAGCTCAGCAAGCTTTGCAGGAT
GTGTATATGTTTTTAACGCTGTGACACAGATTCCGCAGAGAAGAGGTACTTGACACGGGA
GAGAACAGAGTCATGAGCAGGATCATAAGGATGGTCCTTGGAAGGGATCTCCAGGATCGC
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GATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTTGATGAGAATTCCTTGAAAGCATCCTCAATTTG
TCTCACCGTTGTCTTTGAGTCCAAGATAAGGTAATTAGTCTTCCTCCTTATGTCAACATT
ACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACAACAGTGTCCTCGTCAGCGATCATAGCGATAAG
GGCAGAGTTGCGAGCAGGGATTGAAGCTCTCCCAGCCATATTTGATTCAAACTACTACTA
CTTTTCTCTTCTCTCTGTTTCTTCTCGTTTTGTCCTCC
TTCC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AU05JQ 657 0 0
C
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GCATCCTCAATTTGTCTCACCGTTGTCTTTGAATCCACGATAAGGTAATTAGTCTTCCTC
CTTATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACAACAGTGTCCTCGTCAGCG
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TCAAACTACTACTACTTTTCTCTTCTCTCTGTTTCTTCTCGTTTTGTCCTCCTTCC

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR4AU05TF 657 0 0
C
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AAATTCGAGACTCAAATACAAGAATGTCAAAAACCAAACAAATGATATAAAAAGCTCAGC
AAGCTTTGCAGGATGTGTATATGTTTTTAACGCTGTGACACAGATTCCGCAGAGAAGAGG
TACTTGACACGGGAGAGAACAGAGTCATGAGCAGGATCATAAGGATGGTCCTTGGAAGGG
ATCTCCAGGATCGCAGGAACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAACCTGATCATATTG
GCAACATATTGGCTGATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTTGA*GAGAATTCCTTGAAA
GCATCCTCAATTTGTCTCACCGTTGTCTTTGAATCCACGATAAGGTAATTAGTCTTCCTC
CTTATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACAACAGTGTCCTCGTCAGCG
ATCATAGCGATAAGGGCAGAGTTGCGAGCAGGGATTGAAGCTCTCCCAGCCATATTTGAT
TCAAACTACTACTACTTTTCTCTTCTCTCTGTTTCTTCTCGTTTTGTCCTCC
TTCC

QA 2 653 2 653
DS 



CO CL252Contig3 799 2 3 U
GTCTCTTGATACACACAGACTCACTCTCTTATTAATGCAAAAAGAACCAGATGGTGTTTA
CCGTTGCTTCTTAATAACATAAACATCCATCTTTAAATAAAATCAAGAGAGAACATTATT
GAAATTCGAGACTCAGATACAAGAATGTCAAAAACCAAACAAATGATATAAAAAGCTCAG
CAAGCTTTGCAGGATGTGTATATGTTTTTAACGCTGTGACACAGATTCCGCAGAGAAGAA
GTACTTGACACGGGAGAGAACAGAGTCATGAGCAGGATCATAAGGATGGTCCTTGGAAGG
GATCTCCAGGATCGCAGGAACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAACCTGATCATATT
GGCAACATACTGGCTGATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTTGATGAAAATTCCTTGAA
AGCATCCTCAATTTGTCTCACCGTTGTCTTTGAATCCACGATAAGGTAATTAGTCTTCCT
CCTTATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACAACAGTGTCCTCGTCAGC
GATCATAGCGATAAGGGCAGAATTGCGAGCAGGGATTGAAGCTCTCCCAGCCATATTTGA
TTCAAACTACTACTACTACACACAGACAGAACAACAACAATAACAACAAAAGAACCCTAA
TCAAATTGGGAAAAAAATCGAAAATTGGGTTAAGAAACCCTAATCAATTCCTGATCTCAG
ATCGTAAAATCAAGCTTCGAAGATGGAGAACAAAGCCTCATTTACCTTTTCTCTTCTCTC
TGTTTCTTCTCGTTTTCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AA
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DS 

RD RR4CA73TF 799 0 0
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CCTTATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACAACAGTGTCCTCGTCAGC
GATCATAGCGATAAGGGCAGAGTTGCGAGCAGGGATTGAAGCTCTCCCAGCCATATTTGA
TTCAAACTACTACTACTACACACAGACAGAACAACAACAATAACAACAAAAGAACCCTAA
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ATCGTAAAATCAAGCTTCGAAGATGGAGAACAAAGCCTCATTTACCTTTTCTCTTCTCTC
TGTTTCTTCTCGTTTTCCT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 11

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GGTTCTTATCGATCATTCATTTATCATCTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAA
GTGATATACAAGACGCAACATGGGATAGTTCTGTAGAATAACTACACTAGACTTAGAAAA
GCAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCC
CAGCTGATGTAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCA
TTTTGGTGGCCTCCTTTCACCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACA
AACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGC
AAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTG
TACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTG
ACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATC
ATAGCTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAA
GCCTTCTCATAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCGACACGGAGCATAACTTGACAA
AGAGGTTCAGGTGTAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTTCA
ATGAAGGCGATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCT
CCCTTGGCTTTTATCAGTTCTACAGTTTTCGCTACGTCGTCGACGGCAATACCAAAGTGA
CCAAAACCTGCCCCAATGTCATACTTGTCAACTCCATAATTATAAGTGAGCTCAATGACG
AAGTGTGAATCTTCAGGACCATAACCAAGGAAAGCATTAGTATACTTCTCTTCCGGTATA
TCACGCTTGCGTAGAAGCTTCATCCCAAGACATTCCGTATAGAATTTAATAGTCCGGTCC
AAATCGCCAACACGGTAAACGACGTGAAGCATTCTTCTGTTATCATTTTTGACCCACTTG
AGAAGATCCTCTTCCGTAACTGCTTGAGCCGCGTTTCCAGATTCAGCTACTCCTAAGCAC
CTTACGCTTCTTCTCAGAGTCAAAGCCTTTGACTGATTAACATGGGAGAAAGAAGAAAGG
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CCCAGGGAAGGTCGGATGGTGGTGGACGCCATTGAAATTATCCTCATCCTCACAG****T
CTCTGTGATTCTGAACCTCCGCCGAGTGAAGCCAACGGTGAAGATAAAGCTCTATCAATC
CCCCTCCCT


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 10 10 10 10 

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BS 88 88 RR4FI89JQ
BS 89 394 RR4EA69JQ
BS 395 395 RR4FI89JQ
BS 396 577 RR4EA69JQ
BS 578 603 RR4FI89JQ
BS 604 604 RR4FK37JQ
BS 605 670 RR4FI89JQ
BS 671 671 RR4C244JQ
BS 672 912 RR4B208JQ
BS 913 1090 RR4B208TF
BS 1091 1091 RR4FK37TF
BS 1092 1311 RR4B208TF
BS 1312 1312 RR4FK37TF
BS 1313 1348 RR4B208TF
BS 1349 1349 RR4FK37TF
BS 1350 1389 RR4B208TF

RD RR4EA69JQ 577 0 0
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GTGATATACAAGACGCAACATGGGATAATTCTGTAGAATAACTACACTAGACTTAGAAAA
GCAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCC
CAGCTGATGTAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCA
TTTTGGTGGCCTCCTTTCACCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACA
AACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGC
AAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAGGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTG
TACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTG
ACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATC
ATAGCTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTG

QA 1 577 1 577
DS 

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GCAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCC
CAGCTGATGTAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCA
TTTTGGTGGCCTCCTTTCACACATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACA
AACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGC
AAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTG
TACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTG
ACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATC
ATAGCTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGC
C

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DS 

RD RR4G928TF 581 0 0
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GTGATATACAAGACGCAACATGGGATAGTTCTGTAGAATAACTACACTAGACTTAGAAAA
GCAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCC
CAGCTGATGTAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCA
TTTTGGTGGCCTCCTTTCACACATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACA
AACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGC
AAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTG
TACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTG
ACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATC
ATAGCTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGC
C

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4FK37JQ 626 0 0
GGTTCTTATCGATCATTCATTTATCATCTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAA
GTGATATACAAGACGCAACATGGGATAGTTCTGTAGAATAACTACACTAGACTTAGAAAA
GCAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCC
CAGCTGATGTAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCA
TTTTGGTGGCCTCCTTTCACCTATCACTCCAGTTATTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACA
AACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGC
AAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTG
TACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTG
ACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATC
ATAGCTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAA
GCCTTCTCATAGAATTTGATGGACTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4FI89JQ 672 0 0
GGTTCTTATCGATCATTCATTTATCATCTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAA
GTGATATACAAGACGCAACATGGGATAGTTCTGTAGAATAACTACACTAGACTTAGAAAA
GCAAATCATTCACTTTGAACAAGCTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCC
CAGCTGATGTAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCA
TTTTGGTGGCCTCCTTTCACCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACA
AACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGC
AAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTG
TACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTG
ACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGAC***AGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATC
ATAGCTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAA
GCCCTCTCATAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCGACACGGAGCATAACTTGACAA
AGAGGTTCAG
GT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4C244JQ 847 0 0
TTTTCT
TCATCTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAAGTGATATACAAGACGAAACATGG
GATAGTTCTGTAGAATAACTACACTAGACTTAGAAAAGCAAATCATTCACTTTGAACAAA
CTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCCCAGCTGATGTAAAACGAAAAACC
CATCCTCACGTTTCCCTCATAGCTATGAAACTAGCCATTTTGGTGGCCTCCTTTCACCTA
TCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACAAGCACCGACTTCCAACCATCGGG
ATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGCAAGGGACCAGGTTACCTCGTGAT
TTTTCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTGTACACATCATCCGTCCCTATTGC
AATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTGACACCATAGTTATATGTCAGCTC
CAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATCATAGCTATTGTGTACTTGTACTC
TGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAAGCCTTCTCATAGAATTTGATGGA
CTTGTCGAGATCACCGACACGGAGCATAACTTGACAAAGAGGTTCAGGTGTAGGACCTCT
CTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTTCAATGAAGGCGATTACAGTTTTGCC
ACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCTCCCTTGGCTTTTATCAGTTCTAC
AGTTTTCGCTACGTCGTCGACGGCAATAC*AAAGTGACCAAAACCTGCCCCAATGTCATA
C

QA 7 847 7 847
DS 

RD RR4B208JQ 903 0 0
CGATCATTCATTTATCATCTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAAGTGATATAC
AAGACGCAACATGGGATAGTTATGTATAATAACTACACTAGACTTAGAAAAGCAAATCAT
TCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGGCAGATATACGAAACCCCAGCTGATG
TAAAACGAAAAACCCATCCTCACGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCATTTTGGTGG
CCTCCTTTCACCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACAAACACCGAC
TTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGCAAGGGACCA
GGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTGTACACGTCA
TCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTGACACCATAG
TTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATCATAGCTATT
GTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAAGCCTTCTCA
TAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCGACACGGAGCATAACTTGACAAAGAGGTTCA
GCTGTAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTTCAATGAAGGCG
ATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCTCCCTTGGCT
TTTATCAGTTCTACAGTTTTCGCTACGTCGTCGACGGCAATACCAAAGTGACCAAAACCT
GCCCCAATGTCATACTTGTCAACTCCATAATTATAAGTGAGCTCAATGACGAAGTGTGAA
TCT

QA 1 903 1 903
DS 

RD RR4FI89TF 715 0 0
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CTTTCACCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACAAACACCGACTTCC
AACCATCGGGATCCAAACACGCCGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGCAAGGGACCAGGTT
CCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTGTACACGTCATCCG
TCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTGACACCATAGTTAT
ATGTCAGCTCCAGGAC***AGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATCATAGCTATTGTGT
ACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAAGCCCTCTCATAGA
ATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCGACACGGAGCATAACTTGACAAAGAGGTTCAGGTG
TAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTTCAATGAAGGCGATTA
CAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCTCCCTTGGCTTTTA
TCAGTTCTACAGTTTTCGCTACGTCGTCGACGGCAACACCAAAGTGACCAAAACCTGCCC
CAATGTCATACTTGTCAACTCCATAATTATAAGTGAGCTCAATGACGAAGTGTG
C

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4EA69TF 766 0 0
TAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCAC*GACACGGAGCATAACT*GACAAAGAGGTTCA
GGTGTAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTTCAATGAAGGCG
ATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCC*TTGTTACTTTCCCTCCCTTGGCT
TTTATCAGTTCTACAGTTTTCGCTACGTCGTCGACGGCAATACCAAAGTGACCAAAACCT
GCCCCAATGTCATACTTGTCAACTCCATAATTATAAGTGAGCTCAATGACGAAGTGTGAA
TCTTCAGGACCATAACCAAGGAAAGCATTAGTATACTTCTCTTCCGGTATATCACGCTTG
CGTAGAAGCTTCATCCCAAGACATTCCGTATAGAATTTAATAGTCCGGTCCAAATCGCCA
ACACGGTAAACGACGTGAAGCATTCTTCTGTTATCATTTTTGACCCACTTGAGAAGATCC
TCTTCCGTAACTGCTTGAGCCGCGTTTCCAGATTCAGCTACTCCTAAGCACCTTACGCTT
CTTCTCAGAGTCAAAGCCTTTGACTGATTAACATGGGAGAAAGAAGAAAGGGTGGGGCGA
GAGGGATTCCTGGAGGAGACGAAGGGGAAGCGAGGAGATGCAGAGAAGCAGCCCAGGGAA
GGTCGGATGGTGGTGGACGCCATTGAAATTAACCTCATCCTCACAGTCTGTCTCTGTGAT
TCTGAACCTCCGTCGAGTGAAGCCAACGGTGAAGATAAAGCTCT
CC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4B208TF 880 0 0
ACTGCAGTTTATC
TCTGGACCATATCCCATCATAGCTAT*GTGTACT*GTACTCTGGGT*GTCTCT*GTGCGC
AGAAGCTCCATTCCAAAAGC*TTCTCATAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCGACA
CGGAGCATAACTTGACAAAGAGGTTCAGCTGTAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTG
TAACCATCAGGATCTTCAATGAAGGCGATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGC
TCCCTTGTTACTTTCCCTCCCTTGGCTTTTATCAGTTCTACAGTTTTCGCTACGTCGTCG
ACGGCAATACCAAAGTGACCAAAACCTGCCCCAATGTCATACTTGTCAACTCCATAATTA
TAAGTGAGCTCAATGACGAAGTGTGAATCTTCAGGACCATAACCAAGGAAAGCATTAGTA
TACTTCTCTTCCGGTATATCACGCTTGCGTAGAAGCTTCATCCCAAGACATTCCGTATAG
AATTTAATAGTCCGGTCCAAATCGCCAACACGGTAAACGACGTGAAGCATTCTTCTGTTA
TCATTTTTGACCCACTTGAGAAGATCCTATTCCGTAACTGCTTGAGCCGCGTTTCCAGAT
TCAGCTACTCCTAAGCACCTTACGCTTCTTCTCAGAGTCAAAGCCTTTGACTGATTAACA
TGGGAGAAAGAAGAAAGGGTGGGGCGAGAGAGATTCCGGGAGGAGACGAAGGGGAAGCGA
GGAGATGCAGAGAAGCAGCCCAGGGAAGGTCGGATGGTGGTGGACGCCATTGAAATTATC
CTCATCCTCGCAG****TCTCTGTGATTCTGAACCTCCGCCGAGTGGAGCCAACGGTGAA
GATAAAGCTCTATCAATCCCCCTCCCT

QA 14 880 14 880
DS 

RD RR4FK37TF 640 0 0
GACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCTCCCTTGGCTTTTATCAGTTCTACAGTTTT
CGCTACGTCGTCGACGGCAATACCAAAGTGACCAAAACCTGCCCCAATGTCATACTTGTC
AACTCCATAATTATAAGTGAGCTCAATGACGAAGTGTGAATCTTCAGGACCATAACCAAG
GAAAGCATTAGTATACTTCTCTTCCGGTATATCACGCTTGCGTAGAAGCTTCATCCCAAG
ACATTCCGTATAGAATTTAATAGTCCGGTCCAAATCGCCAACACGGTAAACGACGTGAAG
CATTCTTCTGTTATCATTTTTGACCCACTTGAGAAGATCCTCTTCCGTAACTGCTTGAGC
CGCGTTTCCAGATTCAGCTACTCCTAAGCACCTTACGCTTCTTCTCAGAGTCAAAGCCTT
TGACTGATTAACATGGGCGAAAGAAGAAAGGGTGGGGCGAGAGAGATTCCGGGAGGAGAC
GAAGGGGAAGCGAGGAGATGCAGAGAAGCAGCCCAGGGAAGGTCGGATGGTGGTGGACGC
CATTGAAATTATCCTCATCCTCACAG****TCTCTGTGATTCTGAACCTCCGCCGAGTGA
AGCCAACGGTGAAGATAAAGCTCTATCAATCCCCCT
TCCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 10

CO CL254Contig1 1326 10 27 U
GGGATATCACCAACCTACAAAGTAACAGAAGTCAAGTAAATATGTCTAGTACTGAAGATA
TGTCAAAAGCTCTCAAAGGCACTACTCCTACTTTTAGCGACATGCCATCTACCATCGTTC
GAGCTACCATCGTCCAGGCCTCCACCGTCTACAACGATACTCCCAAAACTATAGAAAAGG
CAGAGAAGTATATTGCAGAGGCGGCCAGTGATGGAGCGCAGCTGGTGCTGTTCCCCGAGG
GGTATATCGGTGGCTATCCTCGTGGATATAGGTTTGGCATAGCGGTTGGTGTTCATAACG
AAGATGGTGGTGACTCTTTCCGCAAATATCATGCTTCTGCCATCGCGGTTCCCGGCCCTG
AGGTAGACAAGCTGGCGGAGATGGCAAGGAAACACAAAGTGTACCTGGTGATGGGAGCGA
TAGAGAAGGATGGGTATACACTCTACTGCACAGCCCTTTTCTTCAGTTCCGAAGGTCGCT
TCTTGGGCAAGCACCGTAAAGTCATGCCCACATCTCTGGAACGTTGCATATGGGGTTGCG
GGGATGGATCAACCATCCCTGTCTACGACACCCCCCTTGGCAAACTCGGTGCTGCTATCT
GCTGGGAAAATAGGATGCCTCTCTTCAGAACTGCCTTGTACGGGAAAGGAATTGAATTAT
ACTGTGCACCTACTGCTGACGGTACCAAGAATTGGCAATCGTCTATGATGCACATTGCCA
TAGAGGGTGGATGCTTCGTATTGTCGGCTTGCCAGTTCTCTGTGCGTAAAGATTTCCCTG
ACCATGCTGATTACTTGTTCACCGACCCAAGCAGCGGCATGTACGACGGTGAACACCAAG
ACACTATTGTCTCCCAGGGCGGTAGTGTCATTATTTCACCATTGGGAAAGATACTCGCCG
GACCAAACTTTGAATCAGAGGGTCTCATCACTGCTGATCTTGATCTTGGTGATATTGCAC
GTGCCAAGTTATACTTCGATGTGGTCGGACATTACTCAAGGCCAGAGATATTTAACTTGA
CAGTAAATGAGAACCAAAGAAAACCGGTTACATTCGTGTCCAAGTCAGTGAAAGCGGCGG
ATGACTCAGAACCCCAAGACAGCTAATCAAAGATACGAAGGTTGTTAATGTCAGTTCAAA
TAAATCTGCTTGAAAAACTATGTTAAGTTTGTTTATCCTTGTGTTCAATAATTTAAGAGA
CCCAGCTGGATAAGGTTTGATATATGGTCTCTGATAAAACCAATAATAGGGTTCTCTTCT
CTTGTATTTTGGATATTGTGCAATTTATTTTAAGTTGAAATATTGATAACATCTGGAATT
TTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 

AF RR4DT01TF U 4
AF RR4DP96TF U 1
AF RR4H451TF U 46
AF RR4GR45TF U 4
AF RR4EC61TF U 2
AF RR4BT40TF U 547
AF RR4GR45JQ C 583
AF RR4AG85JQ C 699
AF RR4DT01JQ C 628
AF RR4EC61JQ C 746
BS 1 73 RR4DP96TF
BS 74 74 RR4EC61TF
BS 75 109 RR4DP96TF
BS 110 110 RR4EC61TF
BS 111 383 RR4DP96TF
BS 384 384 RR4EC61TF
BS 385 386 RR4DP96TF
BS 387 390 RR4EC61TF
BS 391 539 RR4DP96TF
BS 540 645 RR4EC61TF
BS 646 718 RR4BT40TF
BS 719 719 RR4GR45JQ
BS 720 721 RR4BT40TF
BS 722 722 RR4GR45JQ
BS 723 739 RR4BT40TF
BS 740 740 RR4GR45JQ
BS 741 761 RR4BT40TF
BS 762 762 RR4GR45JQ
BS 763 952 RR4BT40TF
BS 953 953 RR4GR45JQ
BS 954 955 RR4BT40TF
BS 956 956 RR4GR45JQ
BS 957 1028 RR4BT40TF
BS 1029 1269 RR4GR45JQ
BS 1270 1270 RR4DT01JQ
BS 1271 1310 RR4GR45JQ
BS 1311 1326 RR4DT01JQ

RD RR4DT01TF 418 0 0
GG
ATCACCAACCTACAAAGTAACAGAAGTCAAGTAAATATGTCTAGTACTGAAGATATGTCA
AAAGCTCTCAAAGGCACTACTCCTACTTTTAGCGACATGCCATCTACCATCGTTCGAGCT
ACCATCGTCCAGGCCTCCACCGTCTACAACGATACTCCCAAAACTATAGAAAAGGCAGAG
AAGTATATTGCAGAGGCGGCCAGTGATGGAGCGCAGCTGGTGCTGTTCCCCGAGGGGTAT
ATCGGTGGCTATCCTCGTGGATATAGGTTTGGCATAGCGGTTGGTGTTCATAACGAAGAT
GGTGGTGACTCTTTCCGCAAATATCATGCTTCTGCCATCGCGGTTCCCGGCCCTGAGGTA
GACAAGCTGGCGGAGATGGCAAGGAAACACAAAGTGTACCTGGTGATGGGAGCGAT

QA 3 418 3 418
DS 

RD RR4DP96TF 539 0 0
GGGATATCACCAACCTACAAAGTAACAGAAGTCAAGTAAATATGTCTAGTACTGAAGATA
TGTCAAAAGCTCTTAAAGGCACTACTCCTACTTTTAGCGACATGCCATCCACCATCGTTC
GAGCTACCATCGTCCAGGCCTCCACCGTCTACAACGATACTCCCAAAACTATAGAAAAGG
CAGAGAAGTATATTGCAGAGGCGGCCAGTGATGGAGCGCAGCTGGTGCTGTTCCCCGAGG
GGTATATCGGTGGCTATCCTCGTGGATATAGGTTTGGCATAGCGGTTGGTGTTCATAACG
AAGATGGTGGTGACTCTTTCCGCAAATATCATGCTTCTGCCATCGCGGTTCCCGGCCCTG
AGGTAGACAAGCTGGCGGAGATGACA****AACACAAAGTGTACCTGGTGATGGGAGCGA
TAGAGAAGGATGGGTATACACTCTACTGCACAGCCCTTTTCTTCAGTTCCGAAGGTCGCT
TCTTGGGCAAGCACCGTAAAGTCATGCCCACATCTCTGGAACGTTGCATATGGGGTTGC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4H451TF 498 0 0
GG
AGTACTGAAGATATGTCAAAAGCTCTCAAAGGCACTACTCCTACTTTTATCGACATGCCA
TCTACCATCGTTCGAGCTACCATCGTCCAGGCCTCCACCGTCTACAACGATACTCCCAAA
ACTATAGAAAAGGCAGGGGAGTTTATTGCACAGGCGGCCAGTGATGGAGCGCAGCTGGTG
CTGTTCCCCGAGGGGTATATCGGTGGCTATCCTCGTGGATATAGGTTTGGCATAGCGGTT
GGTGTTCACAACGAAGATGGTGGTGACTCTTTCCGCAAATATCATGCTTCTGCCATCGCG
GTTCCCGGCCCTGAGGTAGACAAGCTGGCGGAGATGGCAAGGAAACACAAAGTGTACCTG
GTGATGGGAGCGATAGAGAAGGATGGGTATACACTCTACTGCACAGCCCTTTTCTTCAGT
TCCGAAGGTCGCTTCTTGGGCAAGCACCGTAAAGTCATGCCCACATCTCTGGAACGTTGC
ATATGGGGTTGC
GGGG

QA 3 494 3 494
DS 

RD RR4GR45TF 524 0 0
GG
ATCACCAACCTACAAAGTAACAGAAGTCAAGTAAATATGTCTAGTACTGAAGATATGTCA
AAAGCTCTCAAAGGCACTACTCCTACTTTTAGCGACATGCCATCTACCATCGTTCGAGCT
ACCATCGTCCAGGCCTCCACCGTCTACAACGATACTCCCAAAACTATAGAAAAGGCAGAG
AAGTATATTGCAGAGGCGGCCAGTGATGGAGCGCAGCTTGTGCTGTTCCCCGAGGGGTAT
ATCGGTGGCTATCCTCGTGGATATAGGTTTGGCATAGCGGTTGGTGTTCATAACGAAGAT
GGTGGTGACTCTTTCCGCAAATATCATGCTTCTGCCATCGCGGTTCCCGGCCCTGAGGTA
GACAAGCTGGCGGAGATGGCAAGGAAACACAAAGTGTACCTGGTGATGGGAGCGATAGAG
AAGGATGGGTATACACTCTACTGCACAGCCCTTTTCTTCAGTTCCGAAGGTCGCTTCTTG
GGCAAGCACCGTAAAGTCATGCCCACATCTCTGGAATGTTGC

QA 3 524 3 524
DS 

RD RR4EC61TF 644 0 0
GGAT
ATCACCAACCTACAAAGTAACAGAAGTCAAGTAAATATGTCTAGTACTGAAGATATGTCA
AAAGCTCTCAAAGGCACTACTCCTACTTTTAGCGACATGCCATCTACCATCGTTCGAGCT
ACCATCGTCCAGGCCTCCACCGTCTACAACGATACTCCCAAAACTATAGAAAAGGCAGAG
AAGTATATTGCAGAGGCGGCCAGTGATGGAGCGCAGCTGGTGCTGTTCCCCGAGGGGTAT
ATCGGTGGCTATCCTCGTGGATATAGGTTTGGCATAGCGGTTGGTGTTCATAACGAAGAT
GGTGGTGACTCTTTCCGCAAATACCATGCTTCTGCCATCGCGGTTCCCGGCCCTGAGGTA
GACAAGCTGGCGGAGATGGCAAGGAAACACAAAGTGTACCTGGTGATGGGAGCGATAGAG
AAGGATGGGTATACACTCTACTGCACAGCCCTTTTCTTCAGTTCCGAAGGTCGCTTCTTG
GGCAAGCACCGTAAAGTCATGCCCACATCTCTGGAACGTTGCATATGGGGTTGCGGGGAT
GGATCAACCATCCCTGTCTACGACACCCCCCTTGGCAAACTCGGTGCTGCTATCTGCTGG
GAAAATAGGATGCCTCTCTTCAGAACTGCCTTGTACGGGA

QA 5 644 5 644
DS 

RD RR4BT40TF 482 0 0
GATCAACCATCCCTGTCTACGACACCCCCCTTGGCAAACTCGGTGCTGCTATCTGCTGGG
AAAATAGGATGCCTCTCTTCAGAACTGCCTTGTACGGGAAAGGAATTGAATTATACTGTG
CACCTACTGCTGACGGTACCAAGAATTGGCAATCGTCTATGATGCACATTGCAATTGAGG
GTGGATGCTTCGTGTTGTCGGCTTGCCAGTTCTCTCTGCGTAAAGATTTCCCTGACCATG
CTGATTACTTGTTCACCGACCCAAGCAGCGGCATGTACGACGGTGAACACCAAGACACTA
TTGTCTCCCAGGGCGGTAGTGTCATTATTTCACCATTGGGAAAGATACTCGCCGGACCAA
ACTTTGAATCAGAGGGTCTCATCACTGCTGATCTTGATCTTGGTGACATCGCACGTGCCA
AGTTATACTTCGATGTGGTCGGACATTACTCAAGGCCAGAGATATTTAACTTGACAGTAA
AT

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4GR45JQ 734 0 0
AACTCGGTGCTGCTATCTGCTGGGAAAATAGGATGCCTCTCTTCAGAACTGCCTTGTACG
GGAAAGGAATTGAATTATACTGTGCACCTACTGCTGACGGTACCAAGAATTGGCAATCGT
CCATGATGCACATTGCCATAGAGGGTGGATGCTTCGTATTGTCGGCTTGCCAGTTCTCTG
TGCGTAAAGATTTCCCTGACCATGCTGATTACTTGTTCACCGACCCAAGCAGCGGCATGT
ACGACGGTGAACACCAAGACACTATTGTCTCCCAGGGCGGTAGTGTCATTATTTCACCAT
TGGGAAAGATACTCGCCGGACCAAACTTTGAATCAGAGGGTCTCATCACTGCTGATCTTG
ATCTTGGTGATATTGCACGTGCCAAGTTATACTTCGATGTGGTCGGACATTACTCAAGGC
CAGAGATATTTAACTTGACAGTAAATGAGAACCAAAGAAAACCGGTTACATTCGTGTCCA
AGTCAGTGAAAGCGGCGGATGACTCAGAACCCCAAGACAGCTAATCAAAGATACGAAGGT
TGTTAATGTCAGTTCAAATAAATCTGCTTGAAAAACTATGTTAAGTTTGTTTATCCTTGT
GTTCAATAATTTAAGAGACCCAGCTGGATAAGGTTTGATATATGGTCTCTGATAAAACCA
ATAATAGGGTTCTCTTCTCTTGTATTT*GGATATTGTGCAATTTATTTTAAGTTGAAATA
TTGATAAC
ATCTGG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4AG85JQ 612 0 0
TCGTCTATGATGCACATTGCCATAGAGGGTGGATGCTTCGTATTGTCGGCTTGCCAGTTC
TCTGTGCGTAAAGATTTCCCTGACCATGCTGATTACTTGTTCACCGACCCAAGCAGCGGC
ATGTACGACGGTGAACACCAAGACACTATTGTCTCCCAGGGCGGTAGTGTCATTATTTCA
CCATTGGGAAAGATACTCGCCGGACCAAACTTTGAATCAGAGGGTCTCATCACTGCTGAT
CTTGATCTTGGTGATATTGCACGTGCCAAGTTATACTTCGATGTGGTCGGACATTACTCA
AGGCCAGAGATATTTAACTTGACGGTAAATGAGAACCAAAGAAAACCGGTTACATTCGTG
TCCAAGTCAGTGAAAGCGGCGGATGACTCAGAACCCCAAGACAGCTAATCAAAGATACGA
AGGTTGTTAATGTCAGTTCAAATAAATCTGCTTGAAAAACTATGTTAAGTTTGTTTATCC
CTGTGTTCAATAATTTAAGAGACCCAGCTGGATAAGGTTTGATATATGGTTTCTGATAAA
ACCAATAATAGGGTTCTCTTCTCTTGTATTTTGGATATTGTGCAATTTATTTTAATTTGA
AATATTGATAAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4DT01JQ 699 0 0
GAACTGCCTTGTACGGGAAAGGAATTGAATTATACTGTGCACCTACTGCTGACGGTACCA
AGAATTGGCAATCGTCTATGATGCACATTGCCATAGAGGGTGGATGCTTCGTATTGTCGG
CTTGCCAGTTCTCTGTGCGTAAAGATTTCCCTGACCATGCTGATTACTTGTTCACCGACC
CAAGCAGCGGCATGTACGACGGTGAACACCAAGACACTATTGTCTCCCAGGGCGGTAGTG
TCATTACTTCACCATTGGGAAAGATACTCGCCGGACCAAACTTTGAATCAGAGGGTCTCA
TCACTGCTGATCTTGATCTTGGTGATATTGCACGTGCCAAGTTATACTTCGATGTGGTCG
GACATTACTCAAGGCCAGAGATATTTAACTTGACAGTAAATGAGAACCAAAGAAAACCGG
TTACATTCGTGTCCAAGTCAGTGAAAGCGGCGGATGACTCAGAACCCCAAGACAGCTAAT
CAAAGATACGAAGGTTGTTAATGTCAGTTCAAATAAATCTGCTTGAAAAACTATGTTAAG
TTTGTTTATCCTTGTGTTCAATAATTTAAGAGACCCAGCTGGATAAGGTTTGATATATGG
TCTCTGATAAAACCAATAATAGGGTTCTCTTCTCTTGTATTTTGGATATTGTGCAATTTA
TTTTAAGTTGAAATATTGATAACATCTGGAATTTTGTGT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4EC61JQ 581 0 0
GGCTTGCCAGTTCTCTGTGCGTAAAGATTTCCCTGACCATGCTGATTACTTGTTCACCGA
CCCAAGCAGCGGCATGTACGACGGTGAACACCAAGACACTATTGTCTCCCAGGGCGGTAG
TGTCATTATTTCACCATTGGGAAAGATACTCGCCGGACCAAACTTTGAATCAGAGGGTCT
CATCACTGCTGATCTTGATCTTGGTGATATTGCACGTGCCAAGTTATACTTCGATGTGGT
CGGACATTACTCAAG*CCAGAGATATTTAACTTGACAGTAAATGAGAACCAAAGAAAACC
GGTTACATTCGTGTCCAAGTCAGTGAAGGCGGCGGATGACTCAGAACCCCAAGACAGCTA
ATCAAAGATACGAAGGTTGTTAATGTCAGTTCAAATAAATCTGCTTGAAAAACTATGTTA
AGTTTGTTTATCCTTGTGTTCAATAATTTAAGAGACCCAGCTGGATAAGGTTTGATATAT
GGTCTCTGATAAAACCAATAATAGGGTTCTCTTCTCTTGTATTTTGGATATTGTGCAATT
TATTTTAAGTTGAAATATTGATAACATCTGGAATTTTGTG
C

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 12

CO CL255Contig1 772 12 13 U
GGATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAAAGAAAGATCAGAGATGGCGACGTCAGG
AACATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAA
GAATGAGAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCACCGTCCA
CGATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAA
ACAAGAGGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAA
AGGGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCAT
TCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGA
TGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGA
TCACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTT
ATATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTTTGTGTGCGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAATAAA
TGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCT
TTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATATTTTCAGTCTATCAGT
TGAATATATGTATCCTTGTTAATTAATGCTTTCAAAAGAGTAATTCTTACCC


BQ
35 35 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CA94TF U 1
AF RR4G116TF U 1
AF RR4D920TF U -4
AF RR4E570TF U -4
AF RR4D920JQ C 7
AF RR4EK63TF U 1
AF RR4EZ66JQ C 1
AF RR4EZ66TF U 1
AF RR4EK63JQ C 35
AF RR4AK55TF U 391
AF RR4AK55JQ C 392
AF RR4CA94JQ C 61
BS 1 248 RR4CA94TF
BS 249 249 RR4EK63TF
BS 250 269 RR4CA94TF
BS 270 270 RR4EK63TF
BS 271 290 RR4CA94TF
BS 291 291 RR4EK63TF
BS 292 301 RR4CA94TF
BS 302 595 RR4EK63TF
BS 596 596 RR4G116TF
BS 597 741 RR4EK63TF
BS 742 742 RR4EZ66TF
BS 743 760 RR4EK63TF
BS 761 772 RR4EK63JQ

RD RR4CA94TF 301 0 0
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AACATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAA
GAATGAGAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCACCGTCCA
CGATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAA
ACAAGAGG*ATTCAAGGAGAGGAGAGAGA*TGACGATGCGAATATGGCGG*AACGCTCAA
A

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR4G116TF 610 0 0
GGATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAAAGAAAGATCAGAGATGGCTACGTCAGG
AACATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAA
GAATGAGAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCACCGTCCA
CGATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAA
ACAAGAGGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAA
AGGGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCAT
TCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGA
TGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGA
TCACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTT
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TGGGGCTCTT

QA 1 610 1 610
DS 

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CGAATTC
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ATGAGAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCACCGTCCACG
ATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAGC
AAGAGGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAAAG
GGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCATTC
AAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATG
ACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGATC
ACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTTAT
ATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTTTGTGTGCGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAATAAATG
GGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCTTT
GATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATATTTTCAGTCT

QA 8 719 8 719
DS 

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GGAATTC
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CATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAGA
ATGAGAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCACCGTCCACG
ATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACCACACATGCGATGGGAAAC
AAGAGGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAAAG
GGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCATTC
AAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATG
ACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGATC
ACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTTAT
ATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTTTGTGTGCGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAATAAATG
GGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCTTT
GATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTC

QA 8 696 8 696
DS 

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TGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAGAATGA
GAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCACCGTCCACGATGG
TGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAGCAAGA
GGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAAAGGGCT
CGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCATTCAAAA
GTCGCCTAGTGATATAGTTTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATGACTC
GCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGATCACCA
CGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTTATATAT
GGCTGCCTTTGTGTGTGTTTGTGTGCGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAATAAATGGGGC
TCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCTTTGATG
TTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATATTTTCAGT
TT

QA 1 706 1 706
DS 

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AGGGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCAT
TCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGA
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TCACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTT
ATATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTTTGTGTGCGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAGTAAA
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QA 1 760 1 760
DS 

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ACAAGAGGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAA
AGGGCTCGAAGGTCGCGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCAT
TCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGA
TGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGA
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TGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCT
TTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATATTTTCAGTCTATCAGT
TGAATATATGTATCCTTGTTAATTAATGCTTTC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EZ66TF 755 0 0
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CGATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAA
ACAAGAGGTATTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGCGAATATGGCGGTAACGCTCAA
AGGGCTCGAAGGTCGCGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCAT
TCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGA
TGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGA
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ATATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTTTGTGTGCGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAATAAA
TGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCT
TTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATATTTTCAGTCTATCAGT
TGA*TATATGTATCCTTGTTAATTAATGCTTTCAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4EK63JQ 738 0 0
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GCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAGAATGAGAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGC
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TTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCTTTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAG
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AAAGAGTAATTCTTACCC

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DS 

RD RR4AK55TF 371 0 0
A
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ATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCTTTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTC
GAGGTTTCATATATTTTCAGTCTATCAGTTGAATATATGTATCCTTGTTAATTAATGCTT
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C

QA 2 370 2 370
DS 

RD RR4AK55JQ 370 0 0
GTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAG
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CGCGCGCCTTCGTATTATGTTATAATAAATGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAAT
ATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCTTTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTC
GAGGTTTCATATATTTTCAGTCTATCAGTTGAATATATGTATCCTTGTTAATTAATGCTT
TCAAAAGAG
C

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DS 

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AGGGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCAT
TCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGA
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TCACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTT
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TGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAGTTACAATATATTGCTGTTTGGGTATTTTGATATGCT
TTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATATTTTCAGTCTATCAGT
TGAATATATGTATCCTTGTTAATTAATGCTTTCAAAAGAGTAATTCTTAC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 2 10

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GCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACAGTATCATCATCAATCGC
AGATTAGCAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCAAGTTTAGAGAGTAAAAGAT
GAGATTCAAAGTC**CTC*GAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTGCTACTCTC
ATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTTCTCCCG
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GAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCATGTCTT
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CTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGTGACGCC
AGGAAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTACCGGATCCATAAGGCACATCGTGAGAATG
CAGACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTCCCATAACTTACCTCGAC
GCCTTCTTTACCGGAAGGCGCTGCGGCGGAGGCAGAGGTGTAGCCGGAATCGGGATCAAG
GCCGAGGTAAAGGAAGAGAGCGAGGCAGAAGAATCCCATAGCCATCAGGAAGAGGAGAGC
GATGAACCAGTTCTGCTGATAAAAGGGAAACTCGGGGCTCGCTTTCCTCGCCGAGGGAGT
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AGGCTTCCTTCTTGAGAGACCTTCTTGTTGTTGCCCTGACGTCGACGCCACCGTAAAGGA
TCAGAAATGAGATCTCGCCGGAGACAAATTGAATGTGTTGGGTTCTCTCTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DP41JQ U 1
AF RR4FE51JQ U 37
AF RR4GK21JQ U 68
AF RR4DX05JQ U 39
AF RR4DX02JQ U 1
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AF RR4DX05TF C 412
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BS 691 691 RR4DX05JQ
BS 692 726 RR4DX02JQ
BS 727 727 RR4DX05JQ
BS 728 735 RR4DX02JQ
BS 736 736 RR4DX05JQ
BS 737 780 RR4DX02JQ
BS 781 781 RR4ER77JQ
BS 782 788 RR4DX02JQ
BS 789 821 RR4ER77JQ
BS 822 1133 RR4GK21TF

RD RR4DP41JQ 628 0 0
CCAATCACAAACGCATAATAATTAAACTCTTAAATAAGGAAGAAAAAAAAGAAGATTAAT
GCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGCGACTACAGTATCATCATCAATCGC
AGATTAGCAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCGAGTTTAGAGAGTAAAAGAT
GAGATTCAAAGTCTCCTCAAAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTGCTACTCTC
ATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTTCTCCCG
GATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACCTCTTGTCGTGGCTATG
GAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCATGTCTT
ACCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGAATCATCTCC
AAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGAGGCATGTAGGTGACTGTGGAGCCA
TTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGCACCACCTTG
CTTGGCTGTTGTCCCAGGCACAGGTTTT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4FE51JQ 598 0 0
AAGGAAG
AAAAAAAGAAGATTAATGCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACA
GTATCATCATCAATCGCAGATTAGCAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCAAG
TTTAGAGAGTAAAAGATGAGATTCAAAGTC**CTC*GAGAGAAGTTAACACAACTCTTTA
CCTTACTTGCTACTATCATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTA
TCAGCCCGCTTCTCCCGGATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTAC
TTCTTGTCGTGGCTATGGAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGG
TCTTGTTTCCATGTCTTACCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCG
GAATTTGAATCATCTCCAAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCTGAGATAGGGGATGCATGT
AGGTGACTGTGGAGCCATTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTC
TTGATGGCATCACCTTGCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACA
TCGTGAGAATGC

QA 8 586 8 586
DS 

RD RR4GK21JQ 653 0 0
ACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACAGTATCATCATCAATCGCAGATTAG
CAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCAAGTTTAGAGAGTAAAAGATGAGATTC
AAAGTC**CTC*GAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTGCTACTCTCATTAACG
GGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTTCTCCCGGATTCCA
CAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACTTCTTGTCGTGGCTATGGAGGTAG
TCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCATGTCTTACCACTA
CCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGAATCATCTCCAAAGCAG
CTAACCTCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGATGCGTGTAGGTGACTGTGGAGCCATTTTCTG
GTCTTCATGCGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCACTCTTGATGGCATCACCTTGCTTGGCT
TTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGTGACGCCAGGAAAG
CCAGTAACAGACTGCTGACCACTACCGGATCCATAAGGCACATCGTGAGAATG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4DX05JQ 740 0 0
GGAAG
AAAAAAAGAAGATTAATGCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACA
GTATCATCATCAATCGCAGATTAGCAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCAAG
TTTAGAGAGTAAAAGATGAGATTCAAAGTC**CTC*GAGAGAAGTTAACACAACTCTTTA
CCTTACTTGCTACTCTCATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTA
TCAGCCCGCTTCTCCCGGATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTAC
TTCTTGTCGTGGCTATGGAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGG
TCTTGTTTCCATGTCTTACCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCG
GAATTTGAATCATCTCCAAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAAATAGGGGATGCGTGT
AGGTGACTGTGGAGCCATTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTC
TTGATGGCATCACCTTGCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATACAGTAGCTG
TTGGAATCAGTGACGCCAGGAAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTACCGGATCCATAA
GGCACATCGTGAGAATGCAGACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTC
CCATAACTTACCTCG

QA 6 740 6 740
DS 

RD RR4DX02JQ 788 0 0
CCAATCACAAACGCATAATAATTAAACTCTTAAATAAGGAAGAAAAAAAAGAAGATTAAT
GCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGCGACTACAGTATCATCATCAATCGC
AGATTAGCAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCGAGTTTAGAGAGTAAAAGAT
GAGATTCAAAGTCTCCTCAGAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTGCTACTCTC
ATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTTCTCCCG
GATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACCTCTTGTCGTGGCTATG
GAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCATGTCTT
ACCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGAATCATCTCC
AAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGAGGCATGTAGGTGACTGTGGAGCCA
TTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGCACCACCTTG
CTTGGCTGTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGTGACGCC
AGGGAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTGCCGGATCCATAAGGCACATCGTGAGAATG
CAGACGGAACTTCGTTTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTCCCATAACTTACCTCGAC
ACCTTCTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4ER77JQ 764 0 0
AG
TGCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACAGTATCATCATCAATCG
CAGATTAGCAAAATACATATATTTTCTATTTTCTTGTTTTCAAGTTTAGAGAGTAAAAGA
TGAGATTCAAAGTC**CTC*GAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTGCTACTCT
CATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTTCTCCC
GGATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACTTCTTGTCGTGGCTAT
GGAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCATGTCT
TACCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGAATCATCTC
CAAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGATGCGTGTAGGTGACTGTGGAGCC
ATTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGCATCACCTT
GCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGTGACGC
CAGGAAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTACCGGATCCATAAGGCACATCGTGAGAAT
GCAGACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTCCCATAACTTACCTCGA
CGCCTTCTTTACCGGAAGGCGCTGCGGCGGAGGCAGAGGTGT

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR4GK21TF 775 0 0
TGGAGGTAGTCACTAGTGTCAATGTGT*GAAGACGGACTCTTTGGTCTG**TTCCATGTC
TTACCACTAC*TTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGAATCATCT
CCAAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGATGCGTGTAGGTGACTGTGGAGC
CATTTTCTGGTCTTCATGCGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCACTCTTGATGGCATCACCT
TGCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGTGACG
CCAGGAAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTACCGGATCCATAAGGCACATCGTGAGAA
TGCAGACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCACCAGCTTTATCGCACTCCCATAACTTACCTCG
ACGCCTTCTTTACCGGAAGGCGCTGCGGCGGAGGCAGAGGTGTAGCCGGAATCGGGATCA
AGGCCGAGGTAAAGGAAGAGAGCGAGGCAGAAGAATCCCATAGCCATCAGGAAGAGGAGA
GCGATGAACCAGTTCTGCTGATAAAAGGGAAACTCGGGGCTCGCTTTCCTCGCCGAGGGA
GTTCGTAGTAGAGGCGAATCAGAGGAAGGAGGAGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GGAGGCTTCCTTCTTGAGAGACCTTCTTGTTGTTGCCCTGACGTCGACGCCACCGTAAAG
GATCAGAAATGAGATCTCGCCGGAGACAAATTGAATGTGTTGGGTTCTCTCTCCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4DX05TF 722 0 0
CCATGTCTTACCACTAC*TTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGA
ATCATCTCCAAAGCAGCTAAC*TCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGATGCGTGTAGGTGACT
GTGGAGCCATTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGC
ATCACCTTGCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATACAGTAGCTGTTGGAATC
AGTGACGCCAGGAAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTACCGGATCCATAAGGCACATC
GTGAGAATGCAGACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTCCCATAACT
TACCTCGACGCCTTCTTTACCGGAAGGCGCTGCGGCGGAGGCAGAGGTGTAGCCGGAATC
GGGATCAAGGCCGAGGTAAAGGAAGAGAGCGAGGCAGAAGAATCCCATAGCCATCAGGAA
GAGGAGAGCGATGAACCAGTTCTGCTGATAAAAGGGAAACTCGGGGCTCGCTTTCCTCGC
CGAGGGAGTTCGTAGTAGAGGCGAATCAGAGGAAGGAGGAGATGATGATGATGATGATGA
TGATGATGGAGGCTTCCTTCTTGAGAGACCTTCTTGTTGTTGCCCTGACGTCGACGCCAC
CGTGAAGGATCAGAAATGAGATCTCGCCGGAGACAAATTGAATGTGTTGGGTTCTCTCTC
CC

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL256Contig2 776 2 2 U
GGGAGAGAGAACCCAACACATTCAATTATCTCAGGCGAGATCTCATTTCTGATCCTTCAC
GGTGGCGTCGACGTCCGGGCAACAACAAGAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCATCATC
ATCATCATCATCTCCTCCTCCTTCCTCTGATTCGCCTCTACTACGAACTCCCTCGGCGAG
GAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCCTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCT
GATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCTCTCTTCCTTTACCTCGGCCTTGATCCCGATTC
CGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCGCCTTCTGGTAAAGAAGGTGTCGAGGTAAGTTA
TGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAGAAAACGAAGTTCCGTCTGCATTCTCACGATGT
GCCTTATGGATCCGGCAGTGGTCAGCAGTCTGTTACTGGCTTCCCTGGCGTCACTGATTC
CAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTGCCTGGGACAACAGCCAAGCAAGGTGGTGCCAT
CAAGAATGGAGAAACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCA
CCTACATGCCTCCCCTATCTCTGGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAA
TTCCGATACTGGGGATCACTGGAAGCTTACAATCGAAGTAGTGGTAAGACATGGAAACAG
ACCAAAGAGTCCGTCTTCACACATTGACACTAGTGGCTACCTCCATAGCACGACAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP41TF U 1
AF RR4DX02TF U 1
BS 1 581 RR4DP41TF
BS 582 776 RR4DX02TF

RD RR4DP41TF 581 0 0
GGGAGAGAGAACCCAACACATTCAATTATCTCAGGCGAGATCTCATTTCTGATCCTTCAC
GGTGGCGTCGACGTCCGGGCAACAACAAGAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCATCATC
ATCATCATCATCTCCTCCTCCTTCCTCTGATTCGCCTCTACTACGAACTCCCTCGGCGAG
GAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCCTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCT
GATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCTCTCTTCCTTTACCTCGGCCTTGATCCCGATTC
CGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCGCCTTCTGGTAAAGAAGGTGTCGAGGTAAGTTA
TGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAGAAAACGAAGTTCCGTCTGCATTCTCACGATGT
GCCTTATGGATCCGGCAGTGGTCAGCAGTCTGTTACTGGCTTCCCTGGCGTCACTGATTC
CAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTGCCTGGGACAACAGCCAAGCAAGGTGGTGCCAT
CAAGAATGGAGAAACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4DX02TF 776 0 0
GGGAGAGAGAACCCAACACATTCAATTATCTCAGGCGAGATCTCATTTCTGATCCTTCAC
GGTGGCGTCGACGTCCGGGCAACAACAAGAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCATCATC
ATCATCATCATCTCCTCCTCCTTCCTCTGATTCGCCTCTACTACGAACTCCCTCGGCGAG
GAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCCTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCT
GATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCTCTCTTCCTTTACCTCGGCCTTGATCCCGATTC
CGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCGCCTTCTGGTAAAGAAGGTGTCGAGGTAAGTTA
TGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAGAAAACGAAGTTCCGTCTGCATTCTCACGATGT
GCCTTATGGATCCGGCAGTGGTCAGCAGTCTGTTACTGGCTTCCCTGGCGTCACTGATTC
CAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTGCCTGGGACAACAGCCAAGCAAGGTGGTGCCAT
CAAGAATGGAGAAACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCA
CCTACATGCCTCCCCTATCTCTGGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAA
TTCCGATACTGGGGATCACTGGAAGCTTACAATCGAAGTAGTGGTAAGACATGGAAACAG
ACCAAAGAGTCCGTCTTCACACATTGACACTAGTGGCTACCTCCATAGCACGACAG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 12

CO CL257Contig1 819 12 13 U
GGGACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGG
CTACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCG
CCCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTG
ACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTAT
TCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGG
AGCTGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCA
AGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTA
AGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTG
CGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGG
ATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATC
TATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAG
ACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACG
TCCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTT
CCCAGATCTTAAATTAAGTCCCACAATTCCTCTCTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 40 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 60 60 60 60 60 60 
45 60 45 60 60 60 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4CC51TF U 266
AF RR4FF90TF U 6
AF RR4D771TF U 2
AF RR4BD38TF U 2
AF RR4GY13TF U 10
AF RR4B741TF U 584
AF RR4FF90JQ C 105
AF RR4GE55TF U 1
AF RR4GY13JQ C 52
AF RR4B531TF U 505
AF RR4BK69JQ C 244
AF RR4D771JQ C 182
BS 1 129 RR4GE55TF
BS 130 132 RR4D771TF
BS 133 598 RR4GE55TF
BS 599 599 RR4D771TF
BS 600 713 RR4GE55TF
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BS 715 722 RR4GE55TF
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BS 724 729 RR4GE55TF
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BS 731 781 RR4GE55TF
BS 782 814 RR4B531TF
BS 815 819 RR4GY13JQ

RD RR4CC51TF 366 0 0
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TAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGATTTCGAGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGC
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CATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTTGGATATCTGTTTATCCAT
CCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTATCTATTGTGTCCGGGTGTT
TCGCTT

QA 1 366 1 366
DS 

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GG
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GCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCCACAA
GTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACAT
CAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCAA
CTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCTGGA
GAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTT
CTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCA
GATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTTACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTT
TGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTT
GGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTAT
CTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTGCTTATCAATAACGTGCTCTCTCTAAGACTGAAG
AGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGT

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DS 

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GGACTC
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GCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCCACAA
GTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCGCAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACAT
CAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCAA
CTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCTGGA
GAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTT
CTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCA
GATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTT
TGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTT
GGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTAT
CTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAG
AGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTT

QA 7 725 7 725
DS 

RD RR4BD38TF 774 0 0
GGACTC
ACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGTACAGGCTACGAT
GCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCCACAA
GTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACAT
CAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCAA
CTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCTGGA
GAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTT
CTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCA
GATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTT
TGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCCTT
GGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTAT
CTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAG
AGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTT
GAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTT

QA 7 774 7 774
DS 

RD RR4GY13TF 766 0 0
GG
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TCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCCACAAGTAC
TACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACATCAAG
AGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCAACTAT
GTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCTGGAGAAG
AATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTTCTTG
ATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCAGATG
AAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTTTGTC
AAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTTGGAT
ATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTATCTAT
TGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGAT
CTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTTGA*G
TTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTT

QA 3 766 3 766
DS 

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G
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ATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGA
TGTCTAGCGTGTTACGACCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCG

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DS 

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CCGAAAGTCACTCCTGACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAA
GTTGGAAGTATCCTATTCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAG
AGGATTGAGGCACTGGAGCTGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGAT
CTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGA
CCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTTAC
CCAGAGAATCTACTTGCGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTTT
TTTGAAGTTTAAGAGGATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTAT
TATCTGTCCGTCCATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTGCTTATCAATA
ACGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGA
TGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTTGAAGTTGTGAAGGTTGTAAACCGAATAAGTTGTG

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DS 

RD RR4GE55TF 781 0 0
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CTACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCG
CCCACAAGT***ACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTG
ACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTAT
TCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGG
AGCTGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCA
AGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTA
AGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTG
CGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGG
ATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCACC
TATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAG
ACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGAGTTACG
TCTGTTTGA*GTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTT
C

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DS 

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AAACCCCCGCCCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAG
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GTATCCTATTCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTG
AGGCACTGGAGCTGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGC
AAGAGTTCAAGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAA
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ATCTACTTGCGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAG
TCTAAGAGGATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGT
CCGTCCATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCT
CTCTCTAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAG
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QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4B531TF 312 0 0
G
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CCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTT
TCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGT
TTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGCGTTACGTCCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTA
AACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTTCCCAGATCTTAAATTAAGTCCCACA
ATTCCTCTC
TT

QA 2 310 2 310
DS 

RD RR4BK69JQ 571 0 0
TCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGC
TGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATTTAATGCAAGAGTTCGAGA
GCTTTTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGT
GTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATTTACTTGCGG
CTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTTTTTTGAAGTTTAAGAGGATT
CTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTAT
TTATTTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACT
GAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCC
GTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGCTCTCTTCCC
AGATCTTAAATTAAGTCCCACAATTCCTCTC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4D771JQ 621 0 0
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CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGA
GCTGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
GGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGT
CCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTTC
CCAGATCTTAAATTAAGTCC
T

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 11

CO CL258Contig1 871 11 14 U
GGTCCACATCCTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTAACCTCTCGTAGCAATGGCGATT
GCAACATCGATGAGTTTGAATCTAATCGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCTTCAACC
TCGTCCTTCCTCAGAGGCGATTTGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTTGTGACT
CTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAA
GGAGCTGGGAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATT
TACGGTGACCAAGTCGCTAAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTC
CATGCTGGAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGG
TTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCTAGAGAA
GTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGAGAAGCTTTTAGAGTGCAA
AGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACGCTTCCTACCCCTCAGCTT
GTGCTTGCATCTGCTGCGGTCGATGATGAGGAAACCAATACCGATTGCTGAAATTCATAT
GTGAATCTGTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTG
CTAATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAATGTTCCAAGAGTTGTTGTGTGTGTTCAACTCAA
ACCTCACTTTTGTCAAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTTATCCACCCGAGTCACCACGA
GTGTAATCTAATTGATTATTGTTCATTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 5 20 30 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 45 45 45 60 60 60 60 
60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 50 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 60 60 45 60 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B553TF U 1
AF RR4AP09TF U 5
AF RR4B118TF U 14
AF RR4B816TF U 2
AF RR4B553JQ C 21
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AF RR4B816JQ C 48
AF RR4AL27TF U 60
AF RR4AL27JQ C 183
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AF RR4FJ26JQ C 169
BS 1 20 RR4B553TF
BS 21 21 RR4B816TF
BS 22 55 RR4B553TF
BS 56 56 RR4B816TF
BS 57 331 RR4B553TF
BS 332 332 RR4B816TF
BS 333 468 RR4B553TF
BS 469 469 RR4B816TF
BS 470 776 RR4B553TF
BS 777 780 RR4B816TF
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BS 782 810 RR4B816TF
BS 811 820 RR4AL27TF
BS 821 871 RR4AP09JQ

RD RR4B553TF 776 0 0
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CTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAA
GGAGCTGGGAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATT
TACGGTGACCAAGTCGCTAAGCCCGGCGCCACCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTC
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TTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGCACCCTAGAGAA
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GTGCTTGCATCTGCTGCGGTCGATGATGAGGAAACCAATACCGATTGCTGAAATTCATAT
GTGAATCTGTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTG
CTAATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAATGTTCCAAGAGTTGTTGTGTGTGTTCAAC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4AP09TF 723 0 0
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AAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTT
GGTATTTGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGGTTAGTCAAGTTCGAGAAG
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DS 

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AGGGGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGAT
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TTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAA

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DS 

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GGATCCTCACAAAAAGA
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GATTTGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTTGTGACTCTCCCTTTGGGAAAACTC
CAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCTGGGAGTACTAAG
AACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGCT
AAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTT
GGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGGTTAGTCAAGTTCGAGAAG
TTTGGTCCTGACAAGAAGAAGATTAGTGTGTATCCTAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCCC
AACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGAGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGCC
AGACGCGAGAACTACACTTACACGCTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCG
GTCGATGATGAGGAAACCAATACCGATTGCTGAAATTCATATGTGAATCTGTCTTTGTCC
TCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCT
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TGAGTTCAAGCC

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DS 

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AG
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TAATCGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCTTCAACCTCGTCCTTCCTCAGAGGCGATT
TGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAG
CTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCTGGGAGTACTAAGAACG
GTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAGC
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TTCAAGCCTTCGGATTT

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DS 

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AATCGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCTTCAACCTCGTCCTTCCTCAGAGGCGATTT
GATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGC
TCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCTGGGAGTACTAAGAACGG
TCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAGCC
CGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGAT
TGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGGTTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGG
TCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCTAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCCCAACAG
TTACAGAGCAAGAAAGAGAGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACG
CGAGAACTACACTTACACGCTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGGTCGA
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TTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAG*CTTTGTT
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DS 

RD RR4B816JQ 773 0 0
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CACTGTTGTGACTCTCCCTTTGGGAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATC
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CGGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACG
TGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTC
TTTAATCGATGGGTTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAAGAAGAAGATTAGTGT
GTATCCTAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGAGAAGC
TTTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACGCTTCC
TACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGGTCGATGATGAGGAAACCAATACCGATTG
CTGAAATTCATATGTGAATCTGTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGAT
CATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAATGTTCCGAGAGTTGTTGTGT
GTGTTCAACTCAAACCTCACTTTTGTCAAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATT
CT

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DS 

RD RR4AL27TF 761 0 0
G
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CTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAA
GGAGCTGGGAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATT
TACGGTGACCAAGTCGCTAAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGTACTAAGTTC
CATGCTGGAAAGAACGCTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGG
TTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCTAGAGAA
GTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAGGAGAGAAGCTTTTAGAGTGCAA
AGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACGCTTCCTACCCCTCAGCTT
GTGCTTGCATCTGCTGCGGTCGATGATGAGGAAACCAATACCGATTGCTGAAATTCATAT
GTGAATCTGTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTG
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ACCTCACTTTTGTCAAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTT

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DS 

RD RR4AL27JQ 638 0 0
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CGGTGACCAAGTCGCTAAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGTACTAAGTTCCA
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TGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAGGAGAGAAGCTTTTAGAGTGCAAAG
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GAATCTGTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTGCT
AATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAATGTTCCAAGAGTTGTTGTGTGTGTTCAACTCAAAC
CTCACTTTTGTCAAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTT

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DS 

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AGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTTG
GTATTTGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGGTTAGTCAAGTTCGAGAAGT
TTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCTAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCCCA
ACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGAGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCA
GACGCGAGAACTACACTTACACGCTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGG
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CTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACGAAGAGGCTT
TGTTTCAATGTTCCAAGAGTTGTTGTGTGTGTTCAACTCAAACCTCACTTTTGTCAAATT
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TGTTCATTAGCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4FJ26JQ 696 0 0
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GCGCACAAGAAAGGAGCTGGGAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTC
GGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAGCCCGGCGCCATCATCGTTCGTCAACGT
GGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCT
TTAATCGATGGGTTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTG
TACCCTAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGAGAAGCT
TTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACGCTTCCT
ACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGGTCGATGATGAGGAAACCAATACCGATTGC
TGAAATTCATATGTGAATCTGTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTT*AAGATC
ATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAATGTTCCAAGAGTTGTTGTGTG
TGTTCAACTCAAACCTCACTTTTGTCAAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTTATCCACCC
GAGTCACCACGAGTGTAATCTAATTGATTATTGT
CC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 9

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TGAAGCCATCGCAAAGGAGAAGCTGCCTAAGATGGTATACGACTACTATGCCTCTGGTGC
AGAAGACCAATGGACTCTTAAAGAGAACAGGAATGCTTTCGCAAGGATCCTCTTTCGTCC
TAGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCGTCTCGGGATTCAAGAT
CTCCATGCCAATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAAAAGATGGCTCACCCGGAAGGGGA
ATATGCTACGGCTAGAGCTGCATCTGCTGCTGGAACCATCATGACACTCTCTTCATGGGC
TACTTCCAGCGTTGAAGAAGTTGCTTCCACAGGTCCAGGGATCAGATTCTTCCAGCTCTA
TGTATACAAGAACAGGAAAGTGGTTGAGCAGCTTGTAAGAAGAGCCGAGAAAGCTGGATT
CAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACTCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAA
GAACAGGTTCACTTTGCCTCCGAACTTGACATTGAAGAACTTT*GAAGGTCTTGACCTTG
GAAAGATGGATGAGGCAAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGACC
GTACTTTGAGCTGG*AAGGATGTGCAGCGGCTCCAGACAATCACCAGCATGCCAATTCTT
GTCAAGGGTGTTCTTACAGGAGAGGATGCAAGGATAGCGATTCAAGCTGGTGCAGCAGGG
ATCATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGCCAGCTTGACTATGTCCCAGCCACTATCTCAGCA
CTTGAAGAGGTTGTTAAAGCTACACAAGGAGGAGTTCCTGTCTTCTTAGATGGTGGTGTT
CGACGTGGCACTGACGTCTTCAAGGCACTTGCACTTGGAGCCTCAGGGATATTTATTGGA
AGACCAGTGGTATTCTCACTTGCTGCTGAAGGAGAGGCTGGAGTCAGAAAAGTGCTTCAA
ATGCTACGTGATGAGTTCGAGCTAACCATGGCGTTAAGTGGGTGCAGGTCTCTCAGCGAG
ATCACACGTAACCACATTATCACAGAGTGGGAAACTCCACGCCATTTGCCTAGGTTATAG
AGGCCAAAACAAAGAAACAGAGAAGAGCAACAACACAGAGGTAAACCTAATGAGATTCTG
ATTGGTGGTGACTTGGCATCTACGCTACTATTTATCTCTCAAGGATTTGTTTTTTTTTTT
***GCTGTAATTGAAACACACAAAAACAGTGACCGGAGACTCTATGTAATGCTATTTGGC
TACTTCTATACCCTCAGTCCATTCTTCTTCCTTGTAGCAATGCTACTTGGAGATTCTATC
TAATGCTATTTGAATTTTTAGAACATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS60TF U 1
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GTACTTTGAGCTGGGAAGGATGTGCAGCGGCTCCAGACAATCACCAGCATGCCAATTCTT
GTC

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DS 

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G
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GTTGTTAAAGCTACACAAGGACGAGTTCCTGTCTTCTTAGATGGTGGTGTTCGACGTGGC
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GATGAGTTCGAGCTAACCATGGCGTTAAGTGGGTGCAGGTCTCTCAGCGAGATCACACGT
AACCACATTATCACAGAGTGGGAA*CTCCACGCCATTTGCCTAGGT
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AAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGTACTTTGAGCTGG*A
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ATGGAGCTCGCCAGCTTGACTATGTCCCAGCCACTATCTCAGCACTTGAAGAGGTTGTTA
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ATGCTATTTGAATTTTTAG
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DS 

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QA 1 511 1 511
DS 

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QA 1 297 1 297
DS 



AS 2 11

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TGAAGAGTTATTAAGCAAAACTCCAGATGGTCACATACTAGAGCAATTCAGAAA*CCCTT
CAAACCCACAATCTCATTACGAGGCCACTGGTCCAGAGATATGGAGAGACTCTGCAGAGA
AAGTAGATATATTGGTTGTTGGTGTTGGGACTGGTGGAACGATCTCTGGAGCAGGGAAGT
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ATTTGGATTTCAGCGTTCTTGATGAGCCATCAAGTGACAGTGTGGAAGCTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK74TF U 1
AF RR4DL24TF U 1
AF RR4CM15TF U 66
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QA 1 769 1 769
DS 



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ATCTTTGAAATTCCAAGCTCGAGAGAAGAAAGACTGTCCACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AT67JQ U 23
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C

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C

QA 1 575 1 575
DS 

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QA 1 671 1 671
DS 

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QA 1 665 1 665
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ACTCGGGAAAACCACAACTATGAGCTTATCTGCGTTTTCTGGTCGTTTTGCAACCTTTAT
CGCAGCGGCTGCAGCAGCTCCGGATGATATTCCAACCAGTAATCCTTCTTTCAGGGCAAG
AAGTTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCACACTTGTCACTTGAATGACTTCATCAAGAACGCT
GAAATCCAAATTGTCTGGGATGAGTCCAGCTCCTATACCTTGGATCCCATGTGGACCAGG
TTGCCCTCCACTGAGTACTGCACTCTCTGCAGGTTCCACTCCATAAACCTTAACGTCTTG
ATTCTTATCCTTGAGGAACTTCCCTGCTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCAAC
AACCAATATATCTACTTTCTCTGCAGAGTCTCTCCATATCTCCGGACCAGTGGCCTCGTA
ATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTCTGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTTTT
GCTTAATAACTCTTCAGCTTTGACAATTACTCCCATAACGCC

QA 1 762 1 762
DS 

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GAAAACAATATTACGTCATGTCATTTCAAGTCAAACAACACTTTCAATGTATGTCAAAAC
TCAAAAATGACAAAACCGGTATCTTGGTACTTTATTACATAACCGAACCGAGTTACGTAG
TAGTAGCAGTGGATAAGTCTCTCTCATTCAATTGCCAAATTCTCCGCTTCACTTCTGATC
GAGTCGAACATCGGAGTCGACAAGTACCGTTCCCCGCCACTCGGGAAAACCACAACTATG
AGCTTCCCTGCGTTTTCTGGTCGTTTCGCAACCTTTATCGCAGCGGCTGCAGCAGCTCCG
GATGATATTCCAACCAGTAATCCTTCTTTCAGGGCAAGAAGTTTGGCTGTTTCAATAGCT
TCCACACTTGTCACTTGAATGACTTCATCAAGAACGCTGAAATCCAAATTGTCTGGGATG
AGTCCAGCTCCTATACCTTGGATCCCATGTGGACCAGGTTGCCCTCCACTGAGTACTGCA
CTCTCTGCAGGTTCCACTCCATAAACCTTAACGGCTTGATTCTTCTCCTTGAGGAACTTC
CCTGCTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCAACAACCAATATATCTACTTTCTCT
GCAGAGTCTCTCCATATCTCTGGACCAGTGGCCTCGTAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGG
TTTCTGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTTTTGCTTAATAACTCTTCAGCTTTG
ACAATTACTCCCATAACGCCTTTT

QA 1 744 1 744
DS 

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TCTGCAGG
TCCACTCCATAAACCT*AACGTCTTGATTCTTATCCTTGAGGAACTTCCCTGCTCCAGAG
ATCGTTCCACCAGTCCCAACACCAACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCAGAGTCTCTC
CATATCTCCGGACCAGTGGCCTCGTAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTCTGAATTGC
TCTAGTATGTGACCATCTGGAGTTTTGCTTAATAACTCTTCAGCTTTGACAATTACTCCC
ATAACGCCTTTTTTAGGATCTGTGAGGTGAACCTCTGCACCTAATGCTAGAAGAATGATT
CTTCTCTCAATGCTGACTGATGCAGGCAGTGTAATCACAACTTTGTAACCTCTAGCTGCC
CCAACCATTGCTATACCAATCCCGGTGTTACCAGATGTTGGCTCAATCAATATGCTCTTT
CCGGGAGTAATCAAACCCTTGTCTTCTGCATCTTTAATCATACCATAAGCAATTCTGTCC
TTGACACTAGAGCAAGGCTGCATCATCTCAAGCTTAGCCGCGATACGTGCAACACAACCA
TCTACAATGTTGTTCAGGTACACCATTGGAGTGTTACCTATCAGTTGAGTCACATCATCC
TTGATCGAGTACTCCATGTTACAAGGATCTTTGAAATTCCAAGCTCGAGAGAAGAAAGAC
TGTCCACCC

QA 9 677 9 677
DS 

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GTCTTGATTCTTATCCTTGAGGAACTTCCCTGCTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAAC
ACCAACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCAGAGTCTCTCCATATCTCCGGACCAGTGGC
CTCGTAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTCTGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGG
AGTTTTGCTTAATAACTCTTCAGCTTTGACAATTACTCCCATAACGCCTTTTTTAGGATC
TGTGAGGTGAACCTCTGCACCTAATGCTAGAAGAATGATTCTTCTCTCAATGCTGACTGA
TGCAGGCAGTGTAATCACAACTTTGTAACCTCTAGCTGCCCCAACCATTGCTATACCAAT
CCCGGTGTTACCAGATGTTGGCTCAATCAATATGCTCTTTCCGGGAGTAATCAAACCCTT
GTCTTCTGCATCTTTAATCATACCATAAGCAATTCTGTCCTTGACACTAGAGCAAGGCTG
CATCATCTCAAGCTTAGCCGCGATACGTGCAACACAACCATCTACAATGTTGTTCAGGTA
CACCATTGGAGTGTTACCTATCAGTTGAGTCACATCATCCTTGATCGAGTACTCCATGTT
ACAAGGATCTTTGAAATTCCAAGCTCGAGAGAAGAAAGACTGTCCACCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 3 10

CO CL261Contig1 1178 5 16 U
CATATATGTAGCTAGACCAATTTTTGAACGTTTAGAACAATTTACAAACAGAAACATAAA
CATAAAACGAAAACATTGGTAAAACATAAACATAAACGCAAATGCAAGAATACAACCTCT
CATTGATTTTAATTCAGTCACTCGATAAACTTGGCATTGGTGTAAGAAAAAACAATTACA
CCGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAGAAAACAGAGATTTGATTTGG
ATACATTTGTATATAGAGAAAAGATAACAACTATTTGTAGTTATCATCTTATTATTTCAG
AGTGCGTTTTGGTGGGCAAAAGCGTTTATTAGACGTTTGCAGCACTTCTGAAAGACCCTA
GAGACTTGGAACCTGAAGCTCTCAGAACAAACTGGTGGTAGACTGCAGCAATCGCAGCTC
CAATGAATGGTCCCAGCCAAAAGATCCAGTGATCATCCCATGGCTTGCTCTCGTTGAAGA
TGACGGCTGCTCCGAAACTCCTCGCAGGATTTATTCCAGTTCCGGTGATGGGAATGGTAG
CCAAGTGTACCATGAACACCGCAAATCCAATAGGAAGTGGAGCCAACACTGGAACATGGG
AGTCTCTGGCACTGCGTTTAGGGTCAGTGGCCGAGAAGACTGTGTAGACAAGAACGAAAG
TACCGATGATCTCTGCGGCCAGGCCAGTACCCGTGCTGTATCCATCGGCTAGAGAGTTGG
CTCCACCACCGTAACGGACGTAGTAAGCACTTTGGAAGGCTTTGACGAACCCAACTCCAC
AAATTGCACCCAAACACTGAGCTACCATGTACAATATGGCTCTAACCAAGGATACTTTTC
GGGCCAAGAGTAGCCCAAGCGATACCAAGGATGCCAACTCCACCGCAGTCAACGCCGCCA
GCAGTACTATCTGTCTGAACCTTATAACCGATGACTGTCAAAATGGTGATGTATAGGAAG
AGGAGAGTAGCTACGAACTCGGCGATGACTGCTCGGTAAAAAGACCACTTCGTCAGCTCC
TCCGGATCAAACAGAGGCGCTGGCGGCGGGTCTTGATAGTCTCTTGTCTGAAACCCTTCT
CCGGCAACGGCTTCCACGTCCTTGGCCATTACTTATTTCTTTGCTTTTTTTCCTTTCCAG
CAAATGGTTTTTGTTTTGCTTCTATGTTGTGTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 15 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ20JQ U 316
AF RR4BZ14JQ U 1
AF RR4EL08JQ U 102
AF RR4AV02JQ U 104
AF RR4AZ20TF C 327
BS 1 219 RR4BZ14JQ
BS 220 220 RR4EL08JQ
BS 221 245 RR4BZ14JQ
BS 246 246 RR4EL08JQ
BS 247 299 RR4BZ14JQ
BS 300 300 RR4EL08JQ
BS 301 331 RR4BZ14JQ
BS 332 332 RR4EL08JQ
BS 333 384 RR4BZ14JQ
BS 385 385 RR4EL08JQ
BS 386 478 RR4BZ14JQ
BS 479 479 RR4EL08JQ
BS 480 637 RR4BZ14JQ
BS 638 822 RR4EL08JQ
BS 823 857 RR4AV02JQ
BS 858 1178 RR4AZ20TF

RD RR4AZ20JQ 136 0 0
GCAAAAGCGTTTATTAGACGTTTGCAGCACTTCTGAAAGACCCTAGAGACTTGGGACCTG
AAGCTCTCAGAACAAACTGGTGGTAGACTGCAGCAATCGCAGCTCCAATGAATGGTCCCA
GCCAAAAGAACCAGTG

QA 1 136 1 136
DS 

RD RR4BZ14JQ 637 0 0
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CATAAAACGAAAACATTGGTAAAACATAAACATAAACGCAAATGCAAGAATACAACCTCT
CATTGATTTTAATTCAGTCACTCGATAAACTTGGCATTGGTGTAAGAAAAAACAATTACA
CCGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAAAAAACAGAGATTTGATTTGG
ATACACTTGTATATAGAGAAAAGATAACAACTATTTGTAGTTATCATCTTATTATTTCAA
AGTGCGTTTTGGTGGGCAAAAGCGTTTATTAAACGTTTGCAGCACTTCTGAAAGACCCTA
GAGACTTGGAACCTGAAGCTCTCAAAACAAACTGGTGGTAGACTGCAGCAATCGCAGCTC
CAATGAATGGTCCCAGCCAAAAGATCCAGTGATCATCCCATGGCTTGCTCTCGTTGAAAA
TGACGGCTGCTCCGAAACTCCTCGCAGGATTTATTCCAGTTCCGGTGATGGGAATGGTAG
CCAAGTGTACCATGAACACCGCAAATCCAATAGGAAGTGGAGCCAACACTGGAACATGGG
AGTCTCTGGCACTGCGTTTAGGGTCAGTGGCCGAGAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4EL08JQ 721 0 0
C
TGCAAGAATACAACCTCTCATTGATTTTAATTCAGTCACTCGATAAACTTGGCATTGGTG
TAAGAAAAAACAATTACACCGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAGAA
AACAGAGATTTGATTTGGATACATTTGTATATAGAGAAAAGATAACAACTATTTGTAGTT
ATCATCTTATTATTTCAGAGTGCGTTTTGGTGGGCAAAAGCGTTTATTAGACGTTTGCAG
CACTTCTGAAAGACCCTAGAGACTTGGAACCTGAAGCTCTCAGAACAAACTGGTGGTAGA
CTGCAGCAATCGCAGCTCCAATGAATGGTCCCAGCCAAAAGATCCAGTGATCATCCCATG
GCTTGCTCTCGTTGAAGATGACGGCTGCTCCGAAACTCCTCGCAGGATTTATTCCAGTTC
CGGTGATGGGAATGGTAGCCAAGTGTACCATGAACACCGCAAATCCAATAGGAAGTGGAG
CCAACACTGGAACATGGGAGTATCTGGCACTGCGTTTAGGGTCAGTGGCCGAGAAGACTG
TGTAGACAAGAACGAAAGTACCGATGATCTCTGCGGCCAGGCCAGTACCCGTGCTGTATC
CATCGGCTAGAGAGTTGGCTCCACCACCGTAACGGACGTAGTAAGCACTTTGGAAGGCTT
TGACGAACCCAACTCCACAAATTGCACCCAAACACTGAGCTACCATGTACAATATGGCTC

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR4AV02JQ 754 0 0
GCAAGAATACAACCTCTCATTGATTTTAATTCAGTCACTCGATAAACTTGGCATTGGTGT
AAGAAAAAACAATTACACCGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAGAAA
ACAGAGATTTGATTTGGATACATTTGTATATAGAGAAAAGATAACAACTATTTGTAGTTA
TCATCTTATTATTTCAGAGTGCGTTTTGGTGGGCAAAAGCGTTTATTAGACGTTTGCAGC
ACTTCTGAAAGACCCTAGAGACTTGGAACCTGAAGCTCTCAGAACAAACTGGTGGTAGAC
TGCAGCAATCGCAGCTCCAATGAATGGTCCCAGCCAAAAGATCCAGTGATCATCCCATGG
CTTGCTCTCGTTGAAGATGACGGCTGCTCCGAAACTCCTCGCAGGATTTATTCCAGTTCC
GGTGATGGGAATGGTAGCCAAGTGTACCATGAACACCGCAAATCCAATAGGAAGTGGAGC
CAACACTGGAACATGGGAGTCTCTGGCACTGCGTTTAGGGTCAGTGGCCGAGAAGACTGT
GTAGACAAGAACGAAAGTACCGATGATCTCTGCGGCCAGGCCAGTACCCGTGCTGTATCC
ATCGGCTAGAGAGTTGGCTCCACCACCGTAACGGACGTAGTAAGCACTTTGGAAGGCTTT
GACGAACCCAACTCCACAAATTGCACCCAAACACTGAGCTACCATGTACAATATGGCTCT
AACCAAGGATACTTTTCGGGCCAAGAGTAGCCCA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AZ20TF 852 0 0
TATTAGACGTT*GCAGCACT*CTGAAAGACCCTAGAGACT*GGGACCTGAAGCTCTCAGA
ACAAACTGGTGGTAGACTGCAGCAATCGCAGCTCCAATGAATGGTCCCAGCCAAAAGATC
CAGTGATCATCCCATGGCTTGCTCTCGTTGAAGATGACGGCTGCTCCGAAACTCCTCGCA
GGATTTATTCCAGTTCCGGTGATGGGAATGGTAGCCAAGTGTACCATGAACACCGCAAAT
CCAATAGGAAGTGGAGCCAACACTGGAACATGGGAGTCTCTGGCACTGCGTTTAGGGTCA
GTGGCCGAGAAGACTGTGTAGACAAGAACGAAAGTACCGATGATCTCTGCGGCCAGGCCA
GTGCCCGTGCTGTATCCATCGGCTAGAGAGTTGGCTCCACCACCGTAACGGACGTAGTAA
GCACTTTGGAAGGCTTTGACGAACCCAACTCCACAAATTGCACCCAAACACTGAGCTACC
ATGTACAATATGGCTCTAACCAAGGATACTTTTCGGGCCAAGAGTAGCCCAAGCGATACC
AAGGATGCCAACTCCACCGCAGTCAACGCCGCCAGCAGTACTATCTGTCTGAACCTTATA
ACCGATGACTGTCAAAATGGTGATGTATAGGAAGAGGAGAGTAGCTACGAACTCGGCGAT
GACTGCTCGGTAAAAAGACCACTTCGTCAGCTCCTCCGGATCAAACAGAGGCGCTGGCGG
CGGGTCTTGATAGTCTCTTGTCTGAAACCCTTCTCCGGCAACGGCTTCCACGTCCTTGGC
CATTACTTATTTCTTTGCTTTTTTTCCTTTCCAGCAAATGGTTTTTGTTTTGCTTCTATG
TTGTGTGGTTCC

QA 1 852 1 852
DS 



CO CL261Contig2 873 3 6 U
GGAACCACACAACATAGAAGCAAAACAAAAACCATTTGCTGGAAAGGAAAAAAAGCAAAG
AAATAAGTAATGGCCAAGGACGTGGAAGCCGTTGCCGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGAC
TATCAAGACCCGCCGCCAGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGACGAAGTGGTCTTTT
TACCGAGCAGTCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCCTATACATCACCATTTTG
ACAGTCATCGGTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCGTTGACTGCGGTGGA
GTTGGCATCCTTGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCATTCTCGTCTACTGC
ACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATAAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCC
CGAAAAGTATCCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCAATT
TGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCCGTTACGG*TGGTGG
AGCCAACTCTCTAGCCGATGGATACAGCACGGGTACTGGCCTGGCCGCAGAGATCATCGG
TACTTTCGTTCTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGA
CTCCCATGTTCCAGTGTTGGCTCCACTTCCTATTGGATTTGCGGTGTTCATGGTACACTT
GGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGAATAAATCCTGCGAGGAGTTTCGGAGCAGCCGT
CATCTTCAACGAGAGCAAGCCATGGGATGATCACTGGATCTTTTGGCTGGACCATTCATG
AGCTGCGATTGCTGCAGTCTACCACCAGTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ14TF U 1
AF RR4EL08TF U 9
AF RR4AV02TF U 1
BS 1 533 RR4BZ14TF
BS 534 534 RR4AV02TF
BS 535 619 RR4BZ14TF
BS 620 621 RR4AV02TF
BS 622 684 RR4BZ14TF
BS 685 873 RR4AV02TF

RD RR4BZ14TF 684 0 0
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AAATAAGTAATGGCCAAGGACGTGGAAGCCGTTGCCGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGAC
TATCAAGACCCGCCGCCAGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGACGAAGTGGTCTTTT
TACCGAGCAGTCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCCTATACATCACCATTTTG
ACAGTCATCGGTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCGTTGACTGCGGTGGA
GTTGGCATCCTTGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCATTCTCGTCTACTGC
ACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATAAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCC
CGAAAAGTATCCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCAATT
TGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCCGTTACGGGTGGTGG
AGCCAACTCTCTAGCCGATGGATACAGCACGGGTACTGGCCTGGCCGCAGAGATCATCGG
TACTTTCGTTCTTGTCTACT*AGTCTTCTCGGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGA
CTCCCATGTTCCAGTGTTGGCTCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EL08TF 803 0 0
GG
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CGCCGCCAGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGACGAAGTGGTCTTTTTACCGAGCAG
TCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCCTATACATCACCATTTTGACAGTCATCG
GTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCGTTGACTGCGGTGGAGTTGGCATCC
TTGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCATTCTCGTCTACTGCACCGCCGGTA
TCTCTGGTGGTCACATAAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCCCGAAAAGTAT
CCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCAATTTGTGGAGTTG
GGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCCGTTACGG*TGGTGGAGCCAACTCT
CTAGCCGATGGATACAGCACGGGTACTGGCCTGGCCGCAGAGATCATCGGTACTTTCGTT
CTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGATACTCCCATGTT
CCAGTGTTGGCTCCACTTCCTATTGGATTTGCGGTGTTCATGGTACACTTGGCTACCATT
CCCATCACCGGAACTGGAATAAATCCTGCGAGGAGTT*CGGAGCAGCCGTCATCTTCA*C
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QA 3 803 3 803
DS 

RD RR4AV02TF 873 0 0
GGAACCAC
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AATGGCCAAGGACGTGGAAGCCGTTGCCGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGACTATCAAGA
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AGTCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCCTATACATCACCATTTTGACAGTCAT
CGGTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCGTTGACTGCGGTGGAGTTGGCAT
CCTTGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCATTCTCGTCTACTGCACCGCCGG
TATCTCTGGTGGTCACATAAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCCCGAAAAGT
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TGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCCGTTACGG*TGGTGGAGCCAACT
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TTCTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGACTCCCATG
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TTGCTGCAGTCTACCACCAGTTTGT

QA 9 873 9 873
DS 



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CGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAGAAAACAGAGATTTGATTTGGA
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GCTTCTATGTTGTGTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G560TF C 1
AF RR4G560JQ U 48
BS 1 47 RR4G560TF
BS 48 621 RR4G560JQ

RD RR4G560TF 621 0 0
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ATAAAACGAAAACATTGGTAAAACATAAACATAAACGCAAATGCAAGAATACAACCTCTA
ATTGATTTTAATTCAGTCACTCGATAAACTTGGCATTGGTGTAAGAAAAAACAATTACAC
CGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAGAAAACAGAGATTTGATTTGGA
TACATTTGTATATAGAGAAAAGATAACAACTATTTGTAGTTATCATCTTATTATTTCAGA
GTGCGTTTTGGTGGGCAAAAGCGTTTATTAGACGTTTGCAGCACTTCTGAAAGACCCTAG
AGACTTGGAACCTGAAGCTCTCAGAACAAACTGGTGGTAGACTGCAGCAATCGCAGCTCC
AATGAATGGTCCCAGCCAAAAGATCCAGTGATCATCCCATGGCTTGCTCTCGTTGAAGAT
GACGGTTGCTCCGAAACTCCTCGCAGGATTTATTCCAGTTCCGGTGATGGGAATGGTAGC
CAAGTGTACCATTACTTATTTCTCTGCTTTTTTTCCTTTCCAGCAAATGGTTTTTGTTTT
GCTTCTATGTTGTGTGGTTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4G560JQ 574 0 0
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AATACAACCTCTAATTGATTTTAATTCAGTCACTCGATAAACTTGGCATTGGTGTAAGAA
AAAACAATTACACCGAATGAAATTGCAAAAGCAAGTAGAAGACATAAATAAGAAAACAGA
GATTTGATTTGGATACATTTGTATATAGAGAAAAGATAACAACTATTTGTAGTTATCATC
TTATTATTTCAGAGTGCGTTTTGGTGGGCAAAAGCGTTTATTAGACGTTTGCAGCACTTC
TGAAAGACCCTAGAGACTTGGAACCTGAAGCTCTCAGAACAAACTGGTGGTAGACTGCAG
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TCTCGTTGAAGATGACGGTTGCTCCGAAACTCCTCGCAGGATTTATTCCAGTTCCGGTGA
TGGGAATGGTAGCCAAGTGTACCATTACTTATTTCTCTGCTTTTTTTCCTTTCCAGCAAA
TGGTTTTTGTTTTGCTTCTATGTTGTGTGGTTCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 3 12

CO CL262Contig1 1256 7 22 U
GGGGGAACCGTTACTACTAATCTAACACCTCTCTCGCACTCCACCAACTCAGGAACTCGC
ATCATCTTATCATCTTCCGTAACTAAACCAAAATGTTCCTCTTAAAGACATGGAGATCAA
CCGCTTTCGGGATTTATGGCTATATGAATTTCACCAAGAATGGTTTCCTAGACCATTCAA
AGAAGTTCAAACCTGAAGATATGCAGATACAAATACAAGGAAAGAATTGTGTGGTCACTG
GAGCTAACTCTGGTATTGGTTACGCCGCTGCTGAAGGTCTTGCTTCACGTGGAGCAAATG
TTTACATGGTGTGTCGGAACAAGGAAAGAGGAGAAGAGGCTCTTTCTAAGATTCAAAACT
CTACAGGAAACCAGAATGTCTACCTTGAAGTTTGTGATTTGTCTTCTGTTAATGATATAA
AGTCATTTGCTTCGACTTTTGCTTCCAAGGATGTTCCTGTTCATGTCCTGGTTAATAACG
CCGGTTTGCTCGAGAACAAACGGACTACTACACCCGAAGGATTCGAGCTGAACTTCGCAA
TAAATGTACTTGGGACATACACGATGACAGAGCTGATGCTTCCACTGTTGGAGAAAGCCT
CACCTGACTCCAAAGTCATCACCGTCTCCTCTGGTGGAATGTACACGTCGCCACTTACAA
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GAATCCAGGTGGCTCTGACAGAAAAAT*GGGCTGATAAGTACAAGGACAAAGGCATAGGT
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TTTCAAAGAATCGTTCTCTGGTAAGCTTAGAACAAGCGAAGAAGGAGCAGACACTGTGGT
ATGGCTAGCACTTCAGCCTAAGGAGAAGCTCGTCTCTGGTGCATTCTATTTCGATAGAGC
TGAAGCACCAAAACATCTGACACTTGCAGGTACGAGCAAGTCTCATGACCTTATCGACTC
TGTCATTGATTCAGTGCACTCCATGGCAGCTCTTTGATCCTTAAATCTCTATCTCATCTT
CTCCATTGTGGTTTTCTCTCGAGAATAAAATGTGATCGATCTCAGGTAAATATCACACAA
TTGAATAAAGATTCAAATATTAAACTTTTCTTTCTTTCCGTGGAAGTATTATTGTGCTGG
ATGTTTTATATAATATATTGTACTCAGAACAGAAGAAATACACATGGTTTTTCAAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4BQ44TF U 17
AF RR4BI34TF U 1
AF RR4G111TF U 2
AF RR4AN92TF U 77
AF RR4G111JQ C 648
AF RR4AN92JQ C 407
AF RR4BQ44JQ C 608
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BS 564 741 RR4BI34TF
BS 742 745 RR4G111TF
BS 746 747 RR4AN92TF
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BS 767 818 RR4AN92TF
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BS 885 885 RR4AN92JQ
BS 886 922 RR4AN92TF
BS 923 923 RR4AN92JQ
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BS 928 942 RR4AN92TF
BS 943 1256 RR4AN92JQ

RD RR4BQ44TF 685 0 0
GG
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ATATGCAGATACAAATACAAGGAAAGAATTGTGTGGTCACTGGAGCTAACTCTGGTATTG
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TTGCTTCCAAGGATGTTCCTGTTCATGTCCTGGTTAATAACGCCGGTTTGCTCGAGAACA
AACGGACTACTACACCCGAAGGATTCGAGCTGAACTTCGCAATAAATGTACTTGGGACAT
ACACGATGACAGAGCTGATGCTTCCACTGTTGGAGAAAGCCTCACCTGACTCCAAAGTCA
TCACCGTCTC*TCTGGTGGAATGTACACGTCGCCACTTACA*CAGATCTTCAGTTTAGTG
*TGAAA*GTTCGATGGAGTGT
AC

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CCGCTTTCGGGATTTATGGCTATATGAATTTCACCAAGAATGGTTTCCTAGACCATTCAA
AGAAGTTCAAACCTGAAGATATGCAGATACAAATACAAGGAAAGAATTGTGTGGTCACTG
GAGCTAACTCTGGTATTGGTTACGCCGCTGCTGAAGGTCTTGCTTCACGTGGAGCAAATG
TTTACATGGTGTGTCGGAACAAGGAAAGAGGAGAAGAGGCTCTTTCTAAGATTCAAAACT
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AGTCATTTGCTTCGACTTTTGCTTCCAAGGATGTTCCTGTTCATGTCCTGGTTAATAACG
CCGGTTTGCTCGAGAACAAACGGACTACTACACCCGAAGGATTCGAGTTGAACTTCGCAA
TAAATGTACTTGGGACATACACAATGACAGAGCTGATGCTTCCACTGTTGGAGAAAGCCT
CACCTGACTCCAAAGTCATCACCGTCTCCTCTGGTGGAATGTACACGTCGCCACTTACAA
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TCATCTTATCATCTTCCGTAACTAAACCAAAATGTTCCTCTTAAAGACATGGAGATCAAC
CGCTTTCGGGATTTATGGCTATATGAATTTCACCAAGAATGGTTTCCTAGACCATTCAAA
GAAGTTCAAACCTGAAGATATGCAGATACAAATACAAGGAAAGAATTGTGTGGTCACTGG
AGCTAACTCTGGTATTGGTTACGCCGCTGCTGAAGGTCTTGCTTCACGTGGAGCAAATGT
TTACATGGTGTGTCGGAACAAGGAAAGAGGAGAAGAGGCTCTTTCTAAGATTCAAAACTC
TACAGGAAACCAGAATGTCTACCTTGAAGTTTGTGATTTGTCTTCTGTTAATGATATAAA
GTCATTTGCTTCGACTTTTGCTTCCAAGGATGTTCCTGTTCATGTCCTGGTTAATAACGC
CGTTTTGCTCGAGAACAAACGGACTACTACACCCGAAGGATTCGAGCTGAACTTCGCAAT
AAATGTACTTGGGACATACACGATGACAGAGCTGATGCTTCCACTGTTGGAGAAAGCCTC
ACCTGACTCCAAAGTCATCACCGTCTCCTCTGGTGGAATGTACACGTCGCCACTTACAAC
AGATCTTCAGTTTAGTGGTGAAAAGTTCGATGGAGTGTTACAATACGCACGGAATAAAAG
AATCCAGGTGGCTCTGACAGAAAAT**GGGCTGATAAGTACAAGG

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DS 

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GG
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GCTATATGAATTTCACCAAGAATGGTTTCCTAGACCATTCAAAGAAGTTCAAACCTGAAG
ATATGCAGATACAAATACAAGGAAAGAATTGTGTGGTCACTGGAGCTAACTCTGGTATTG
GTTACGCCGCTGCTGAAGGTCTTGCTTCACGTGGAGCAAATGTTTACATGGTGTGTCGGA
ACAAGGAAAGAGGAGAAGAGGCTCTTTCTAAGATTCAAAACTCTACAGGAAACCAGAATG
TCTACCTTGAAGTTTGTGATTTGTCTTCTGTTAATGATATAAAGTCATTTGCTTCGACTT
TTGCTTCCAAGGATGTTCCTGTTCATGTCCTGGTTAATAACGCCGGTTTGCTCGAGAACA
AACGGACTACTACACCCGAAGGATTCGAGCTGAACTTCGCAATAAATGTACTTGGGACAT
ACACGATGACAGAGCTGATGCTTCCACTGTTGGAGAAAGCCTCACCTGACTCCAAAGTCA
TCACCGTCTCCTCTGGTGGAATGTACACGTCGCCACTTACAACAGATCTTCAGTTTAGTG
GTGAAAAGTTCGATGGAGTGTTACAATACGCACGGAATAAAAGAATCCAGGTGGCTCCGA
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GGCTGGGCTGAGACACCTGGGTGTGGCCAGGAGTTTGCCCAGTTTCAAAGAATCGTTCTC
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TAAG*AGA*GCTCGTCTCTGGTGC

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GGAGTTTGCCCAGTTTCAAAGAATCGTTCTCTGGTAAGCTTAGAACAAGCGAAGAAGGAG
CAGACACTGTGGTATGGCTAGCACTTCAGCCTAAGGAGAAGCTCGTCTCTGGTGCATTCT
ATTTCGATAGAGCTGAAGCACCAAAACATCTGACACTTGCAGGTACGAGCAAGTCTCATG
ACCTTATCGACTCTGTCATTGATTCAGTGCACTCCATGGCAGCTCTTTGATCCTTAAATC
TCTATCTCATCTTCTCCATTGTGGTTTTCTCCCGAGAATAAAATGTGATCGATCTCAGGT
AAAT**CACACAATTGAATAAAGATTCAAATATTAAAC
C

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GTTGGAGAAAGCCTCACCTGACTCCAAAGTCATCACCGTCTCCTCTGGTGGAATGTACAC
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CGCACGGAATAAAAGAATCCAGGTGGCTCCGACAGAAAAAT*GGGCTGATAAGTACAAGG
ACAAAGGCATAGGTTTCTACTCAATGCACCCTGGCTGGGCTGAGACACCTGG*TGTGGCC
AGGAGTTTGCCCAGTTTCAAAGAATCGTTCTCTGGTAAGCTTAGAACAAGCGAAGAAGGA
GCAGACACTGTGGTATGGCTAGCACTTCAGCCTAAGGAGAAGCTCGTCTCTGGTGCATTC
TATTTCGATAGAGCTGAAGCACCAAAACATCTGACACTTGCAGGTACGAGCAAGTCTCAT
GACCTTATCGACTCTGTCATTGATTCAGTGCACTCCATGGCAGCTCTTTGATCCTTAAAT
CTCTATCTCATCTTCTCCATTGTGGTTTTCTCTCGAGAATAAAATGTGATCGATCTCAGG
TAAATATCACACAATTGAATAAAGATTCAAATATTAAACTTTTCTTTCTTTCCGTGGAAG
TATTATTGTGCTGGATGTTTTATATAATATATTGTACTCAGAACAGAAGAAATACACATG
GTTTTTCAAC

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DS 

RD RR4BQ44JQ 647 0 0
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TCAGTTTAGTGGTGAAAAGTTCGATGGAGTGTTACAATACGCACGGAATAAAAGAATCCA
GGTGGCTCTGACAGAAAAAT*GGGCTGATAAGTACAAGGACAAAGGCATAGGTTTCTACT
CAATGCACCCTGGCTGGGCTGAGACACCTGG*TGTGGCCAGGAGTTTGCCCAGTTTCAAA
GAATCGTTCTCTGGTAAGCTTAGAACAAGCGAAGAAGGAGCAGACACTGTGGTATGGCTA
GCACTTCAGCCTAAGGAGAAGCTCGTCTTTGGTGCATTCTATTTCGATAGAGCTGAAGCA
CCAAAACATTTGACACTTGCAGGCACGAGCAAGTCTCATGACCTTATCGACTCTGTCATT
GATTCAGTGCACTCCATGGCAGCTCTTTGATCCTTAAATCTCTATCTCATCTTCTCCATT
GTGGTTTTCTCTCGAGAATAAAATGTGATCGATCTCAGGTAAATATCACACAATTGAATA
AATATTCAAATATTAAACTTTT***TCTTTCCGTGGAAGTATTATTGTGCTGGATGTTTT
ATATAATATATTGTACTCAGAACAGAAGAAATACACATGGTTTTTC
G

QA 1 646 1 646
DS 



CO CL262Contig2 506 3 1 U
GGCTTAAAAAGCACCAGATTTTACCTTTCTACTCATCTCATAAGTAAAAAAAGAATCCAA
TGTTTGGGATCCACAATATTAGCTACTATGCCAATGTTGAAAAACCATGTGTATTTCTTC
TGTTATGAGTACAATAATACTTCCACCGAAAGAAAGAAAAGTTTAATATTTGAATCTCTA
TTCAATTGTGTGATATTTACCTGAGATCGATCACATTTTATTCTCGAGAGAAAACCACAA
TGGAGAAGATAAGATAGAGATTTAAGGATCAAAGAGCTGCCATGGAGTGCACTGAATCAA
TGACAGAGTCGATAAGGTCATGAGACTTGCTTGTACCAGCAAGTGTCAGATGTTTTGGTG
CTTCTGCTCTATCGAAATAGAATGCACCAGAAACGAGCTTCTCCTTAGGCCGAAGTGCTA
GCCATACCACAGTGTCTGCTCCTTCTTCGCTTGTTCTAAGCTTACCAGAAAACGATTCTT
TGAAACTGGGCAAACTCCTGGCCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BI34JQ U 96
AF RR4BJ71JQ U 1
AF RR4BJ71TF C 1
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AATA

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TGAAACTGGGCAAACTCCTGGCCACC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4BJ71TF 506 0 0
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TGTTATGAGTACAATAATACTTCCACCGAAAGAAAGAAAAGTTTAATATTTGAATCTCTA
TTCAATTGTGTGATATTTACCTGAGATCGATCACATTTTATTCTCGAGAGAAAACCACAA
TGGAGAAGATAAGATAGAGATTTAAGGATCAAAGAGCTGCCATGGAGTGCACTGAATCAA
TGACAGAGTCGATAAGGTCATGAGACTTGCTTGTACCAGCAAGTGTCAGATGTTTTGGTG
CTTCTGCTCTATCGAAATAGAATGCACCAGAGACGAGCTTCTCCTTAGGCCGAAGTGCTA
GCCATACCACAGTGTCTGCTCCTTCTTCGCTTGTTCTAAGCTTACCAGAGAACGATTCTT
TGAAACTGGGCAAACTCCTGGCCAC
C

QA 1 505 1 505
DS 



CO CL262Contig3 1224 2 12 U
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TTTCATTCTCTCTGTTTCAAAGTCTTTCTCTGGTTCCAAGATTCCTCGCAACTCTCTTGA
TGGCAGTAGGAATCTTTGGATTGATCCCAAGCTCATCACCAGACGAGCTAAGGAAGATTC
TGCAAACACTTTCAACAAAATGGGGAGACGTAATTGAGGATCTTGAGAGTCTTGAAGTGA
AGCCGATGAAAGGAGCGATGACTAACGAAGTGTTCATGGTGAGTTGGCCTAGAAAAGAAA
CGAATCTTCGATCTAGGAAACTTCTTGTTCGTGTCTATGGTGAAGGCGTTGAGCTTTTCT
TTAACAGAGACGACGAGGTTCGGACTTTCGAGTTCGTGGCCTGACATAGCCACGGTCCAA
GACTGCTTGGCCGTTTCGCCGGCGGCAGAGTCGAGGAGTTTATCCATGCCCGGACCCTAT
CAGCAAGCGATCTTCGGGATCTGAACATATCAGCTTTAGTGGCAACTAAGCTGAGAAAAT
TTCACAGCATAAACATTCCTGGAGATCAAACTGTTCACATCTGGGACAGAATGAGGACTT
GGGTAGGACAAGCCAAGAATCTGTGTTCAGCTGAAGATTCAGAAGAGTTTGGTCTAGACA
ACATTGAAGATGAAATTAACTTGGTAGAACAAGAAGTGAACAATGAGTATCACCAACAAG
AAATAGGGTTTTGTCACAATGATTTGCAGTATGGTAACATCATGATTGACGAAGACACCA
ACGCCATCACTATCATAGATTATGAGTATGCAAGTTACAATCCAGTTGCTTATGACATAG
CAAATCACTTCTGTGAGATGGTAGCAGATTACCATTTTGACACTCCTCATATCTTGGACT
ACACTTTATATCCAGGAGAAGAAGAAAGGAGGAGATTCATCAGCAACTACATCGCCTCTT
CAGATGAAGAACCAAGAGAAGAAGACATAGAAGAGCTTTTGGATGATGTCGAGAAATATA
CACTGGCGAGCCATCTCTTTTGGGGTTTATGGGGGATCATCTCTGGCTATGTGAACAAGA
TTGACTTCAATTATCACGAGTATTCGAAGCAGAGATTCAAACAGTATTGGCTTAGAAAGC
CCCAGCTTTTACCTTTTTACTCATCTCATAAGTAAAAAAAGAATCCAATGTTTGGGATCC
ACAATATAGCTACTATGCCAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC54TF U 1
AF RR4FC54JQ C 585
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BS 719 719 RR4FC54JQ
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BS 813 1224 RR4FC54JQ

RD RR4FC54TF 814 0 0
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TTTCATTCTCTCTGTTTCAAAGTCTTTCTCTGGTTCCAAGATTCCTCGCAACTCTCTTGA
TGGCAGTAGGAATCTTTGGATTGATCCCAAGCTCATCACCAGACGAGCTAAGGAAGATTC
TGCAAACACTTTCAACAAAATGGGGAGACGTAATTGAGGATCTTGAGAGTCTTGAAGTGA
AGCCGATGAAAGGAGCGATGACTAACGAAGTGTTCATGGTGAGTTGGCCTAGAAAAGAAA
CGAATCTTCGATCTAGGAAACTTCTTGTTCGTGTCTATGGTGAAGGCGTTGAGCTTTTCT
TTAACAGAGACGACGAGGTTCGGACTTTCGAGTTCGTGGCCTGACATAGCCACGGTCCAA
GACTGCTTGGCCGTTTCGCCGGCGGCAGAGTCGAGGAGTTTATCCATGCCCGGACCCTAT
CAGCAAGCGATCTTCGGGATCTGAACATATCAGCTTTAGTGGCAACTAAGCTGAGAAAAT
TTCACAGCATAAACATTCCTGGAGATCAAACTGTTCACATCTGGGACAGAATGAGGACTT
GGGTAGGACAAGCCAAGAATCTGTGTTCAGCTGAAGATTCAGAAGAGTTTGGTCTAGACA
ACATTGAAGATGAAATTAACTTGGTAGAACAAGAAGTGAACAATGAGTATCACCAACA*G
AAATAGG*TTTTGTCACA*TGATTTGCAGTATGGTAACATCATGATTGACGAAGACAC*A
ACGC*ATCACTATCATAGATTATGAGTATGCA
GT

QA 1 812 1 812
DS 

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GACAGAATGAGGACTTGGGTAGGACAAGCCAAGAATCTGTGTTCAGCTGAAGATTCAGAA
GAGTTTGGTCTAGACAACATTGAAGATGAAATTAACTTGGTAGAACAAGAAGTGAACAAT
GAGTATCACCAACAAGAAATAGGGTTTTGTCACAATGATTTGCAGTATGGTAACATCATG
ATTGACGAAGACACCAACGCCATCACTATCATAGATTATGAGTATGCAAGTTACAATCCA
GTTGCTTATGACATAGCAAATCACTTCTGTGAGATGGTAGCAGATTACCATTTTGACACT
CCTCATATCTTGGACTACACTTTATATCCAGGAGAAGAAGAAAGGAGGAGATTCATCAGC
AACTACATCGCCTCTTCAGATGAAGAACCAAGAGAAGAAGACATAGAAGAGCTTTTGGAT
GATGTCGAGAAATATACACTGGCGAGCCATCTCTTTTGGGGTTTATGGGGGATCATCTCT
GGCTATGTGAACAAGATTGACTTCAATTATCACGAGTATTCGAAGCAGAGATTCAAACAG
TATTGGCTTAGAAAGCCCCAGCTTTTACCTTTTTACTCATCTCATAAGTAAAAAAAGAAT
CCAATGTTTGGGATCCACAATATAGCTACTATGCCAATGT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 12

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GACTCACCCATCAAGTCCCCAATTCCCAACACTGTCACAAAAGAGTATCT*CGAACGATG
AAACTCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGTCTCAACCACAACATGTTGTCCG
CCTTCAGACCACCGCGCACTCCTAGCTTTCCGAGCAGCACTACACGAGCCATACCTCGGC
ATTTTCAACTCATGGACCGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGAC
TCGCTCACTCACCGAGTCGCCGACATTAACCTCCGCGGCGAGTCAGAAGACCCCATCTTC
GAGCGAGCTCACCGAACCGGCTACATGACGGGACACATCTCTCCGGCAATCTGCGACCTC
ACGCGTCTCTCCGCCATCACAATCGCCGACTGGAAAGGTATCTCCGGCGAGATCCCCACC
TGCATCACACGTCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGC
CCGATACCAAACGACATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGTAGCAGATAAC
CGGATTTCCGGTTCAATTCCAAAATCGTTAACCAGCCTCTCTAGCTTAATGCATTTGGAC
CTACGTAACAACTTGATCTCCGGTTTAATCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTAACGATGCTT
AGCCGGGCGTTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGGTCGAATTCCCGAATCACTAACCAAG
ATTTATCGGTTAGCTGACGTGGATCTCTCAGGTAACCAACTATACGGCCCAATCCCACCG
TCTCTAGGCCGTATGGCGGTTCTCGCGACCCTTAACCTCGACGGAAACAAATTCTCCGGT
GAGATACCTCAAACTCTGATGACGTCATCGGTGATGAACTTGAACTTGAGCAGGAACTTG
TTGCAAGGGAAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTTACTTCACTGTACTTGATTTG
TCTTACAACAACCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATCTCCGGTGCGTCGTTTATTGGT
CATTTGGATCTTAGCCATAACCATCTCTGCGGTAGGATTCCGGTGGGGTCACCGTTCAGT
CACCTTGAAGCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTTGCGGCAAACCTTTGAAGGCT
TGTTTAAAAAACTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAGACCTTACTATATTTTATGAT
TATGTATTGAAAAACATAAATGTGTGGG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET34TF U 3
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AF RR4GF17TF U 245
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AF RR4BZ74JQ C 461
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GGC
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GGCGTTACTAAGCGGTAACCGGATACCCGGTCGAATTCCCGAATCACTA

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TGCATCACACGTCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGC
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AATC

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GG
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CAACTCATGGACCGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTC**T
CACTCACCGAGTCGCCGACATTAACCTCCGCGGCGAGTCAGAAGACCCCATCTTCGAGCG
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G
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TCTCTCCGCCATCACAATCGCCGACTGGAAAGGTATCTCCGGCGAGATCCCCACCTGCAT
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TAACAACTTGATCTCCGGTTTAATCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTAACGATGCTTAGCCG
GGCGTTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGGTCGAATTCCCGAATCACTAACCAAGATTTA
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CTAGGCCGTATGGCGGTTCTCGCGACCCTTAACCTCGACGGAAACAAATTCTCCGGTGAG
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GTAT
GG

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CTAGCTTAATGCATTTGGACCTCCGTAACAACTTAATATCCGGTTTAATCCCTTCAGACT
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TGAACTTGAGCAGGAACTTGTTGCAAGGGAAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTT
ACTTCACTGTACTTGATTTGTCTTACAACAACCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATTT
CCGGTGCGTCGTTTATTGGTCATTTGGATTTTAGCCATAACCATCTTTGCGGTAGGATTC
CGGTGGGGTCACCGTTCAGTCACCTTGAAGCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTT
GCGGCAAACCTTTGAAGGCTTGTTTAAAAAACTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAG
ACCTTACTATATTTTATGATTATGTATTGAAAAACATAAATGTGTGGG

QA 1 768 1 768
DS 



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AAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCCTTCAAAGGTTTGCCGCAAAGAC
AGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTGAACGGTGACCCCACCGGAATCC
TACCGCAGAGATGGTTATGGCTAAGATCCAAATGACCAATAAACGACGCACCGGAGATCG
ATCTCGGTATTGGTCCCTTGAGGTTGTTATAAGACAAATCAAGCACAGTGAAGTAAGACC
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B812TF C 38
AF RR4B901TF C 38
AF RR4GF17JQ U 19
AF RR4GB67TF C 1
AF RR4GB67JQ U 7
AF RR4ET34JQ U 27
BS 1 6 RR4GB67TF
BS 7 733 RR4GB67JQ
BS 734 750 RR4ET34JQ

RD RR4B812TF 190 0 0
G
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TAAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCC
TTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTG
AACGGTGAC

QA 2 190 2 190
DS 

RD RR4B901TF 190 0 0
G
TAATCATAAAGTACCAGAAGACAGACGCAGCACACATTTATGTTTTTCAATACATAATCA
TAAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCC
TTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTG
AACGGTGAC

QA 2 190 2 190
DS 

RD RR4GF17JQ 603 0 0
GATCCGGTAGTGATAATAATTAATCATAAAGTACCAGAAGACAGACGTAGCACACATTTA
TGTTTTTCAATACATAATCATAAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAA
CTCAATTTTTTAAACAAGCCTTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACG
ACGCCGCTTCAAGGTGACTGAACGGTGACCCCACCGGAATCCTACCGCAGAGATGGTTAT
GGCTAAGATCCAAATGACCAATAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATTGGTCCCT
TGAGGTTGTTATAAGACAAATCAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCCTTCCG
GAATCTTCCCTTGCAACAAGTTCCTGCTCAAGTTCAAGTTCATCACCGATGACGTCATCA
GAGTTTGAGGTATCTCACCGGAGAATTTGTTTCCGTCGAGGTTAAGGGTCGCGAGAACCG
CCATACGGCCTAGAGACGGTGGGATTGGGCCGTATAGTTGGTTACCTGAGAGATCCACGT
CAGCTAACCGATAAATCTTGGTTAGTGATTCGGGAATTCGACCGGTTATCCGGTTACCGC
TTA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4GB67TF 734 0 0
TTTTTTAGCTGGTAAGTAGATCCGGTAGTGATAATAATTAATCATAAAGTACCAGAAGAC
AGACGTAGCACACATTTATGTTTTTCAATACATAATCATAAAATATAGTAAGGTCTAATA
AAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCCTTCAAAGGTTTGCCGCAAAGAC
AGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTGAACGGTGACCCCACCGGAATCC
TACCGCAGAGATGGTTATGGCTAAGATCCAAATGACCAATAAACGACGCACCGGAGATCG
ATCTCGGTATTGGTCCCTTGAGGTTGTTATAAGACAAATCAAGCACAGTGAAGTAAGACC
TTGGTCCGAACCCTTCCGGAATCTTCCCTTGCAACAAGTTCCTGCTCAAGTTCAAGTTCA
TCACCGATGACGTCATCAGAGTTTGAGGTATCTCACCGGAGAATTTGTTT**TTCGAGGT
TAAGGGTCGCGAGAACCGCCATACGGCCTAGAGACGGTGGGATTGGGCCGTATAGTTGGT
TACCTGAGAGATCCACGTCAGCTAACCGATAAATCTTGGTTAGTGATTCGGGAATTCGAC
CGGTTATCCGGTTACCGCTTAGTAACGCCCGGCTAAGCATCGTTAACCGGCCGAAGTCTG
AAGGGATTAAACCGGAGATCAAGTTGTTACGTAGGTCCAAATGCATTAAGCTAGAGAGGC
TGGTTAACGATTT
C

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4GB67JQ 728 0 0
AGCTGGTAAGTAGATCCGGTAGTGATAATAATTAATCATAAAGTACCAGAAGACAGACGT
AGCACACATTTATGTTTTTCAATACATAATCATAAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAA
AATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCCTTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGT
TATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTGAACGGTGACCCCACCGGAATCCTACCGC
AGAGATGGTTATGGCTAAGATCCAAATGACCAATAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCG
GTATTGGTCCCTTGAGGTTGTTATAAGACAAATCAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTC
CGAACCCTTCCGGAATCTTCCCTTGCAACAAGTTCCTGCTCAAGTTCAAGTTCATCACCG
ATGACGTCATCAGAGTTTGAGGTATCTCACCGGAGAATTTGTTT**TTCGAGGTTAAGGG
TCGCGAGAACCGCCATACGGCCTAGAGACGGTGGGATTGGGCCGTATAGTTGGTTACCTG
AGAGATCCACGTCAGCTAACCGATAAATCTTGGTTAGTGATTCGGGAATTCGACCGGTTA
TCCGGTTACCGCTTAGTAACGCCCGGCTAAGCATCGTTAACCGGCCGAAGTCTGAAGGGA
TTAAACCGGAGATCAAGTTGTTACGTAGGTCCAAATGCATTAAGCTAGAGAGGCTGGTTA
ACGATTT
C

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4ET34JQ 724 0 0
AGTGATAATAATTAATCATAAAGTACCAGAAGACAGACGTAGCACACATTTATGTTTTTC
AATACATAATCATAAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTT
TTTAAACAAGCCTTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCT
TCAAGGTGACTGAACGGTGACCCCACCGGAATCCTACCGCAAAGATGGTTATGGCTAAAA
TCCAAATGACCAATAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATTGGTCCCTTGAGGTTG
TTATAAGACAAATCAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCCTTCCGGAATCTTC
CCTTGCAACAAGTTCCTGCTCAAGTTCAAGTTCATCACCGATGACGTCATCAGAGTTTGA
GGTATCTCACCGGAAAATTTGTTTCCGTCGAGGTTAAGGGTCGCGAGAACCGCCATACGG
CCTAAAGACGGTGGGATTGGGCCGTATAGTTGGTTACCTGAGAGATCCACGTCAGCTAAC
CGATAAATCTTGGTTAGTGATTCGGGAATTCGACCGGTTATCCGGTTACCGCTTAGTAAC
GCCCGGCTAAGCATCGTTAACCGGCCGAAGTCTGAAGGGATTAAACCGGAGATCAAGTTG
TTACGTAGGTCCAAATGCATTAAGCTAGAGAGGCTGGTTAACGATTTTGGAATTGAACCG
GAAA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 12

CO CL264Contig1 745 2 3 U
CTGGGTGAATGTTCATTCTTTCAACTTGATATAAAAGAAAAACATCATTTCGTTGGAGAC
AAAGTTCATAACATAAAAAGAAAAACATGTGACGTTCAGGATAAGTTTATTATAAAGTGC
ATGCGTTGAATGTAAAAAGCTCATAACATGATAATCCAGAGCTACGAGTAGAATTGTCTT
TAAAAAGGATTGATTCTTGATGTCGTCTCTCAAGCAGCCAAGCTCTTAGAGGCAATCTCA
AATACATTTTCAGACAACCCATTAGCTGACATTATCATCTCCAACTGTGCCTTGGCCAGA
GCTTGTCGGGTTTCATCGTAGCGCTTCCACCTCGAAAAGGCAGACACCATACGAGAAGCA
ACCTGGGGATTGATTTTGTCTAACTGGACAACAATGTCACCCAAGAACTTGTAACCTGAT
CCATCTTTTGCATGGAAATTCACTGGCGAACCGCAGAACCCTCCAATGAGCGAGTAAACC
TTGTTTGGATTGCGCAGATCAAAAGCTGGGTGATCCAAAAGCTTCTTGACATTCTCCACA
TTCCCGGGAATGGATGATGCTTGAAGGAGGAACCATTTATTAACGACCAAGTAATCGCCC
TGCCACTTGTTATAGAAGTCAGCAAGAACCTCGTCACGGGTTTTACCCGGCTTTTGTGCA
AGAGCTGCCAAAGCAGCAATTTGGTCTGTCAAATTGGTGGCCGACTTGTATTCACCCAAT
GCAAGTTCCACGTATGCTGGATCCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD75JQ U 2
AF RR4AT12JQ U 1
BS 1 157 RR4AT12JQ
BS 158 158 RR4DD75JQ
BS 159 745 RR4AT12JQ

RD RR4DD75JQ 369 0 0
CGG
GTGAATGTTCATTCTTTCAACTTGATATAAAAGAAAAACATCATTTCGTTGGAGACAAAG
TTCATAACATAAAAAGAAAAACATGTGACGTTCAGGATAAGTTTATTATAAAGTGCATGC
GTTGAATGTAAAAAGCTCATAACATGATAATCCAGAGCTACGAGTAGAATTGTCTTTAAA
AAGGATTGATTCTTGATGTCGTCTCTCAAGCAGCCAAGCTCTTAGAGGCAATCTCAAATA
CATTTTCAGACAACCCATTAGCTGACATTATCATCTCCAACTGTGCCTTGGCCAGAGCTT
GTCGGGTTTCATCGTAGCGCTTCCACCTCGAAAAGGCAGACACCATACGAGAAGCAACCT
GGGGAT

QA 4 369 4 369
DS 

RD RR4AT12JQ 745 0 0
CTGGGTGAATGTTCATTCTTTCAACTTGATATAAAAGAAAAACATCATTTCGTTGGAGAC
AAAGTTCATAACATAAAAAGAAAAACATGTGACGTTCAGGATAAGTTTATTATAAAGTGC
ATGCGTTGAATGTAAAAAGCTCATAACATGATAATCCGGAGCTACGAGTAGAATTGTCTT
TAAAAAGGATTGATTCTTGATGTCGTCTCTCAAGCAGCCAAGCTCTTAGAGGCAATCTCA
AATACATTTTCAGACAACCCATTAGCTGACATTATCATCTCCAACTGTGCCTTGGCCAGA
GCTTGTCGGGTTTCATCGTAGCGCTTCCACCTCGAAAAGGCAGACACCATACGAGAAGCA
ACCTGGGGATTGATTTTGTCTAACTGGACAACAATGTCACCCAAGAACTTGTAACCTGAT
CCATCTTTTGCATGGAAATTCACTGGCGAACCGCAGAACCCTCCAATGAGCGAGTAAACC
TTGTTTGGATTGCGCAGATCAAAAGCTGGGTGATCCAAAAGCTTCTTGACATTCTCCACA
TTCCCGGGAATGGATGATGCTTGAAGGAGGAACCATTTATTAACGACCAAGTAATCGCCC
TGCCACTTGTTATAGAAGTCAGCAAGAACCTCGTCACGGGTTTTACCCGGCTTTTGTGCA
AGAGCTGCCAAAGCAGCAATTTGGTCTGTCAAATTGGTGGCCGACTTGTATTCACCCAAT
GCAAGTTCCACGTATGCTGGATCCT

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL264Contig2 1244 10 30 U
CTGATATATCAGAAAAACCTGTGCCGTCTCTGTTTAGAGGATTCAGTGCCCCAGTTCGTG
TTGAGACTGACCTCTCTGATGATGATCTGTTCTTCCTCCTAGCCCATGATTCAGATGAAT
TCAATCGGTGGGAGGCAGGTCAAGTTCTGGCAAGGAAGCTCATGCTGAACTTAGTTTCTG
ATTTCCAACAAAACAAACCATTGGTTCTAAACCCAAAATTCATTCAGGGTCTCGGAAGCG
TGCTTTCTGACTCGAGCTTGGACAAGGAATTTATCGCCAAGGCAATAACATTGCCTGGGG
AGGGAGAGATTATGGACATGATGGCCGTGGCGGATCCTGATGCTGTTCATGCTGTTAGAA
AGTTTGTTAGAAAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAAACTGAGCTTCTAAAGATAGTTGATA
ACAATAGGAGCACAGAGGCTTATGTATTTGACCACCCAAACATGGCTAGGCGTGCTTTGA
AGAACACGGCTCTAGCTTATCTTGCATCTCTTGAGGATCCAGCATACGTGGAACTTGCAT
TGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTGCTTTGGCAGCTCTTG
CACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTATAACAAGTGGCAGG
GCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCCTCCGACATTCCCGGCA
ATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCCAAACA
AGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATG
GATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAATCAATCCTCAGG
TTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCCGACAAG
CTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAATGTAT
TTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATCAAGAATCAATTCTACTC
GTTGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCACTTTTATAATAA
ACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGTCTCCAACGAAAT
GATGTTTTTCTTTTATATCAAGTTGAAAGAATGAACATTCACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 
40 40 40 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 20 45 45 45 30 35 35 50 50 50 50 50 50 50 35 10 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN21TF U 1
AF RR4GN79TF U 46
AF RR4DD75TF U 191
AF RR4FY69TF U 226
AF RR4AT12TF U 426
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AF RR4FY69JQ C 466
AF RR4GN79JQ C 399
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BS 400 423 RR4BN21TF
BS 424 492 RR4GN79TF
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BS 494 687 RR4GN79TF
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BS 730 730 RR4DD75TF
BS 731 759 RR4GN79TF
BS 760 775 RR4DD75TF
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BS 925 1092 RR4GA52TF
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BS 1112 1112 RR4GN79JQ
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BS 1120 1120 RR4GN79JQ
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BS 1133 1133 RR4GN79JQ
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BS 1171 1217 RR4GN79JQ
BS 1218 1244 RR4BN21JQ

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TTGAGACTGACCTCTCTGATGATGATCTGTTCTTCCTCCTAGCCCATGATTCAGATGAAT
TCAATCGGTGGGAGGCAGGTCAAGTTCTGGCAAGGAAGCTCATGCTGAACTTAGTTTCTG
ATTTCCAACAAAACAAACCATTGGTTCTAAACCCAAAATTCATTCAGGGTCTCGGAAGCG
TGCTTTCTGACTCGAGCTTGGACAAGGAATTTATCGCCAAGGCAATAACATTGCCTGGGG
AGGGAGAGATTATGGACATGATGGCCGTGGCGGATCCTGATGCTGTTCATGCTGTTAGAA
AGTTTGTTAGAAAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAAACTTAGCTTCTAAAGATAGTTGATA
ACA

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DS 

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ATGATTCAGATGAATTCAATCGGTGGGAGGCAGGTCAAGTTCTGGCAAGGAAGCTCATGC
TGAACTTAGTTTCTGATTTCCAACAAAACAAACCATTGGTTCTAAACCCAAAATTCATTC
AGGGTCTCGGAAGCGTGCTTTCTGACTCGAGCTTGGACAAGGAATTTATCGCCAAGGCAA
TAACATTGCCTGGGGAGGGAGAGATTATGGACATGATGGCCGTGGCGGATCCTGATGCTG
TTCATGCTGTTAGAAAGTTTGTTAGAAAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAAACTGAGCTTC
TAAAGATAGTTGATAACAATAGGAGCACAGAGGCTTATGTATTTGACCACCCAAACATGG
CTAGGCGTGCTTTGAAGAACACGGCTCCAGCTTATCTTGCATCTCTTGAGGATCCAGCAT
ACGTGGAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTG
CTTTGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCT
ATAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGT*CCTCCTTCAAGTATCCT
CCGACATTCCCGC*AATGTGGAGA*TGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTT

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DS 

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G
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ATGGACATGATGTCCGTGGCGGATCCTGATGCTGTTCATGCTGTTAGAAAGTTTGTTAGA
AAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAAACTGAGCTTCTAAAGATAGTTGAGAACAATAGGAGC
ACAGAGGCTTATGTATTTGACCACCCAAACATGGCTAGGCGTGCTTTGAAGAACACGGCT
CTAGCTTATCTTGCATCTGTTGAGGATCCAGCATACGTGGAACTTGCATTGGGTGAATAC
AAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTGCTTTGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCG
GGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTATAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTG
GTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCATCCGACATTCCCGGGAATGTGGAGAAT
GTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCC

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DS 

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G
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AACATTGCCTGGGGAGGGAGAGATTATGGACATGATGGCCGTGGCGGATCCTGATGCTGT
TCATGCTGTTAGAAAGTTTGTTAGAAAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAAACTGAGCTTCT
AAAGATAGTTGATAACAATAGGAGCACAGAGGCTTATGTATTTGACCACCCAAACATGGC
TAGGCGTGCTTTGAAGAACACGGCTCTAGCTTATCTTGCATCTCTTGAGGATCCAGCATA
CGTGGAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTGC
TTTGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTA
TAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCCTC
CGACATTCCCGGCAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCT
GCGCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTT
CCATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAA
AATCAATCCTCAG*TTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGT

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G
GGAGCACAGAGGCTTATGTATTTGACCACCCAAACATGGCTAGGCGTGCTTTGAAGAACA
CGGCTCTAGCTTATCTTGCATCTGTTGAGGATCCAGCATACGTGGAACTTGCATTGGGTG
AATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTGCTTTGGCAGCTCTTGCACAAA
AGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTATAACAAGTGGCAGGGCGATT
ACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCATCC***ATTCCCGGGAATGTGG
AGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCCAAACAAGGTTT
ACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATGGATCAG
GTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAATCAATCCCCAGGTTGCTT

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DS 

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G
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TTTGAAGAACACGGCTCTAGCTTATCTTGCATCTCTTGAGGATCCAGCATACGTGGAACT
TGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTGCTTTGGCAGC
TCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTATAACAAGTG
GCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCCTCCGACATTCC
CGGCAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCC
AAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAA
AGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAATCAATCC
TCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCCG
ACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAA
TGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATCAAGAATCAATTC
TACTCGTTGCTCCGGAT*ATCATGTTATGAGCTTTT*ACATTCA*CGCATGCACTTT*AT
AATAAACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTT

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DS 

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ACGTGGAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTG
CTTTGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCT
ATAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCCT
CCGACATTCCCGGCAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATC
TGCGCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATT
TCCATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACA
AAATCAATCCTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACG
ATGAAACCCGACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGT
TATCTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATCAA
GAATCAATTCTACTCGTTGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCAT
GCACTTTTATAATAAACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTT
TGTCTCCAACGAAA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GN79JQ 821 0 0
TGAGC
TCTAAAGATAGTTGATAACAATAGGAGCACAGAGGCTTATGTATTTGACCACCCAAACAT
GGCTAGGCGTGCTT*GAAGAACACGGCTCCAGCTTATCTTGCATCTCTTGAGGATCCAGC
ATACGTGGAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAATTTGACAGACCAAATTGC
TGCTTTGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTT
CTATAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGTATC
CTCCGACATTCCCGGCAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGA
TCTGCGCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAA
TTTCCATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGA
CAAAATCAATCCTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTA
CGA**AAACCCGACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGG
GTTATCTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATC
AAGAATCAATTCTACTCGTTGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGC
ATGCACTTTTATAATAAACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAAC
TTTGTCTCCAACGAAATGATGTTTTTCTTTTATA
CC

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DS 

RD RR4BN21JQ 536 0 0
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GCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCC
ATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAA
TCAATCCTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATG
AAACCCGACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTAT
CTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATCAAGAA
TCAATTCTACTCGTTGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCA
CTTTTATAATAAACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGT
CTCCAACGAAATGATGTTTTTCTTTTATATCAAGTTGAAAGAATGAACATTCACGC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4E588JQ 268 0 0
GCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAATGTATTTGAG
ATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATCAAGAATCAATTCTACTCGTTGC
TCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCACTTTTATAATAAACTGA
TCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGTCTCCAAGGAAATGATGT
TTTTCTTTTATATCAAGTTGAAAGAATG

QA 1 268 1 268
DS 



AS 1 8

CO CL265Contig1 1644 8 14 U
GGGAGGAAAGATAGTCTTTACTCTTCAGTGGTGGGTAGAGAGCGAAAGTTAGAGAGAGAG
AAAGAGAGCACATGACCTCACTATCATTGGGGCCTCAGCCTCCGGTTACTGCTCCGCCGC
CGCCGCAGCAGCTTCGCGACGGAGATGCTTCTAGACGTCGTCCCGATATGGATACAGACA
AGGATATGTCTGCTGCTGTTATAGAGGGAAATGATGCCGTTACAGGCCACATCATTTCTA
CTACAATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGACCATTAGTTACATGGCAGAACGTG
TTGTTGGACAAGGATCATTCGGAATTGTATTCCAGGCCAAGTGCTTGGAAACTGGGGAAT
CTGTAGCCATTAAGAAGGTTTTGCAAGACCGGCGCTACAAGAATCGTGAGCTGCAACTCA
TGCGATTAATGGACCACCCAAATGTGGTTTCCTTGAAGCATTGTTTCTTCTCTACAACGA
GTAGAGATGAGCTCTTCCTCAATCTCGTAATGGAGTATGTACCCGAGACTTTGTACCAGG
TTTTGAAGCACTATACTAGTTCAAGCCAAAGAATGCCAATTTTCTATGTCAAACTGTACA
CATACCAAATCTTCAGAGGCTTGGCTTATATCCATACTGTTCCTGGTGTCTGTCACAGAG
ATGTGAAACCACAAAATCTTCTGGTTGATCCCCTCACTCATCAGTGTAAGCTGTGTGATT
TTGGAAGTGCAAAAGTATTGGTGAAAGGTGAAGCAAACATATCATACATCTGCTCTCGGT
ATTACCGAGCTCCAGAGCTGATCTTTGGGGCCACAGAGTATACATCCTCTATAGACATAT
GGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAGCTCCTTCTTGGCCAGCCCTTGTTCCCGGGAGAAA
ATTCTGTGGACCAGCTGGTGGAGATCATCAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAAGAAA
TCCGATGCATGAATCCAAACTACACAGACTTCAGATTCCCCCAAATCAAAGCTCACCCGT
GGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGATCTTGCATCTCGGCTTC
TTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTGCGCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTTTTCA
ATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCCAAACGGCAGACCTCTACCACCGTTGTTCA
ACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGGCTCATACCTGAGC
ACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGGTAAC
TGAGATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACGAGGAGAGAGGGTTTTACTTATCTCTGATT
TTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTATGAGTAGAGAGATGATTGGCCAATTAAGC
TTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTGTGTCTAATATACATTCTCTCTCTCT****
CTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGTAGAGAGATACCTTTTCTCGTTGTATTATT
TGTATATGTTTTTGTCAGTAAGACAGCAAACGCGATGATGGAAGAATGGCATGAATGAAT
GAATGATGTTTAAAACTTAAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E316TF U 6
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AF RR4DH50TF U 708
AF RR4BG39JQ C 811
AF RR4E316JQ C 874
AF RR4FH12TF U 1051
AF RR4FL38TF U 1051
AF RR4DH50JQ C 888
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BS 163 309 RR4BG39TF
BS 310 310 RR4E316TF
BS 311 747 RR4BG39TF
BS 748 748 RR4DH50TF
BS 749 866 RR4BG39TF
BS 867 1098 RR4DH50TF
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BS 1100 1108 RR4DH50TF
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BS 1110 1311 RR4DH50TF
BS 1312 1597 RR4FH12TF
BS 1598 1644 RR4DH50JQ

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ATGTCTGCTGCTGTTATAGAGGGAAATGATGCTGTTACAGGCCACATCATTTCTACTACA
ATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGACCATTAGTTACATGGCATAACGTGTTGTT
GGACAAGGATCATTCGGAATTGTATTCCAGGCCAAGTGCTTGGAAACTGGGGAATCTGTA
GCCATTAAGAAGGTTTTGCAAGACCGGCGCTACAAGAATCGTGATCTGCAACTCATGCGA
TTAATGGACCACCCAAATGTGGTTTCCTTGAAGCATTGTTTCTTCTCTACAACGAGTAGA
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AAGCACTATACTAGTTCAAGC

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DS 

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AAAGAGAGCACATGACCTCACTATCATTGGGGCCTCAGCCTCCGGTTACTGCTCCGCCGC
CGCCGCAGCAGCTTCGCGACGGAGATGCTTCTAGACGTCGTTCCGATATGGATACAGACA
AGGATATGTCTGCTGCTGTTATAGAGGGAAATGATGCCGTTACAGGCCACATCATTTCTA
CTACAATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGACCATTAGTTACATGGCAGAACGTG
TTGTTGGACGAGGATCATTCGGAATTGTATTCCAGGCCAAGTGCTTGGAAACTGGGGAAT
CTGTAGCCATTAAGAAGGTTTTGCAAGACCGGCGCTACAAGAATCGTGAGCTGCAACTCA
TGCGATTAATGGACCACCCAAATGTGGTTTCCTTGAAGCATTGTTTCTTCTCTACAACGA
GTAGAGATGAGCTCTTCCTCAATCTCGTAATGGAGTATGTACCCGAGACTTTGTACCAGG
TTTTGAAGCACTATACTAGTTCAAGCCAAAGAATGCCAATTTTCTATGTCAAACTGTACA
CATACCAAATCTTCAGAGGCTTGGCTTATATCCATACTGTTCCTGGTGTCTGTCACAGAG
ATGTGAAACCACAAAATCTTCTGGTTGATCCCCTCACTCATCAGTGTAAGCTGTGTGATT
TTGGAAGTGCAAAAGTATTGGTGAAAG*TGAAGCAAACATATCATACATCTGCTCTCGGT
ATTACCGAGCTCCAGAGCTGATCTTTGGGGCCACAGAGTATACATCCTCTATAGACATAT
GGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAG

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DS 

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G
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TCTGCTCTCGGTATTACCGAGCTCCAGAGCTGATCTTTGGGGCCACAGAGTATACATCCT
CTATAGACATATGGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAGCTCCTTCTTGGCCAGCCCTTGT
TCCCGGGAGAAAATTCTGTGGACCAGCTGGTGGAGATCATCAAGGTTCTTGGTACTCCAA
CTCGAGAAGAAATCCGATGCATGAATCCAAACTACACAGACTTCAGATTCCCCCAAATCA
AAGCTCACCCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGATCTTG
CATCTCGGCTTCTTCAATACTCACCGAGCCCGCGTTACACCGCGCTTGAAGCATGTGCAC
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CACCGTTGTTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGGC
TCATACCTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCATT
AGA

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TTCTTGGCCAGCCCTTGTTCCCGGGAGAAAATTCTGTGGACCAGCTGGTGGAGATCATCA
AGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAAGAAATCCGATGCATGAATCCAAACTACACAGACT
TCAGATTCCCCCAAATCAAAGCTCACCCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTC
CAGAAGCCATTGATCTTGCATCTCGGCTTCTTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTG
CGCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTTTTCAATGAACTCCGCGAGCCGAATGCTCGTCTCC
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CAGAGCTTATAAACAGGCTCATACCTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTC
CAGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGGTAACTGAGATGCTCTTGCAGAGCCTGATGGAAAC
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AGGAGTAGAGAGATGATTGGCCAATTAAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATT
GTGTCTAATATACATTCTCTCTCTCT****CTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTG
TAGAGAGATACCTTTTCTCGTTGTATTATTTGTATATGTTTTTGTCAGTAAGACAGCAAA
CGCGATG

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DS 

RD RR4E316JQ 728 0 0
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GATTCCCCCAAATCAAAGCTCACCCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAG
AAGCCATTGATCTTGCATCTCGGCTTCTTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTGCGC
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ACGGCAGACCTCTACCACCGTTGTTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAG
AGCTTATAAACAGGCTCATACCTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAG
TACAAGCTGGCCATTAGAAAAGGTAACTGAGATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACGAG
GAGAGAGGGTTTTACTTATCTCTGATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTATG
AGTAGAGAGATGATTGGCCAATTAAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTGTG
TCTAATATACATTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGTAG
AGAGATACCTTTTCTCGTTGTATTATTTGTATATGTTTTTGTCAGTAAGACAGCAAACGC
GATG
ATGG

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G
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GCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTTTTCAATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCC
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AGAGCTTATAAACAGGCTCATACCTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCC
AGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGGTAACTGAGATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACG
AGGAGAGAGGGTTTTACTTATCTCTGATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTA
TGAGTAGAGAGATGATTGGCCAATTAAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTG
TGTCTAATATACATTCTCTCTCTCT****CTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGT
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GCGATG

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DS 

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G
AGAAGCCATTGATCTTGCATCTCGGCTTCTTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTGCACTGC
GCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTTTTCAATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCC
AAACGGCAGACCTCTCCCACCGTTGTTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACC
AGAGCTTATAAACAGGCTCATACCTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCC
AGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGGTAACTGAGATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACG
AGGAGAGAGGGTTTTACTTATCTCTGATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTA
TGAGTAGAGAGATGATTGGCCAATTAAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTG
TGTCTAATATACATTCTCTCTCTCT****CTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGT
AGAGAGATACCTTTTCTCGTTGTATTATTTGTATATGTTTTTGTCAGTAAGACAGCAAAC
GCGATG

QA 2 547 2 547
DS 

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AAAGCTCACCCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGATCTT
GCATCTCGGCTTCTTCAATACTCACCGAGCCCGCGTTACACCGCGCTTGAAGCATGTGCA
CATCCTTTTTTCAATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCCAAACGGCAGACCTCTA
CCACCGTTGTTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGG
CTCATACCTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCAT
TAGAAAAGGTAACTGAGATGTTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACGAGGAGAGAGGGTTTTA
CTTATCTCTGATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTATGAGTAGAGAGATGAT
TGGCCAATTAAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTGTGTCTAATATACATTC
TCTCTCTCT****CTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGTAGAGAGATACCTTTTC
TCGTTGTATTATTTGTATATGTTTTTGTCAGTAAGACAGCAAACGCGATGATGGAAGAAT
GGCATGAATGAATGAATGATGTTTAAAACTTAAGCCG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 9

CO CL266Contig1 1163 5 12 U
GGGTGAACTTAATAGTCGATATGTTTAGGGAAAATATATTGGTCTTGACATTATTTTCCA
TTTATTGGCTTTCATCAGCGTCTGGACAAAACAAATCCTTTTCTGCAGTTTTTGCTTTTG
GAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTATTCAAGGGAAATT
ACTGGCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGAA
GAGTTTTCACCGATATGGTTGCTCAAGGGTTGGGGTTGAAAAGAGTTGTACCCGCTTATC
GTAGGATGCGTCGCATCAAGCGCAACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTG
GTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTAGAATACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAG
TAAGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGGGACGAAAAATAAGAAAGAGA
TGAAAAATATAATTTCAAACGCGGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGATATTGCAT
ACTTCGTGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGG
TTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGG
TGATGGGAGCGATTCCGGTAGGATGCTTGCCTTTCCATCGCTTCATATTTGGTGGAGTAT
TTGCATGGTGTAACTTCATGATGAATAAAATTTCGGAAGACTTCAACACAAAATTGCGGA
AAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTCG
ACATGTACGGCTCTATTATGAATCTTATCAACCATCCTAAGGCCTTTGGGTTTACAGAAG
CGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGGTGACATCGATAATACCATGCCGAAACCCGGATGAGT
ACGTATTCTATGACTTTGCTCACCCCACCATGAAAGCCTATGAAGTAATATCTAAACCTC
TTATCTATCAGATGAGGAAAGGCCTTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACCATGATTA
AATTTAATATTCATGTAACAGGCGACACTATCATACATGACGATATATATTCTTAGTGTA
AAGAATGTATGATCCACCAGTTC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F447JQ C 3
AF RR4F447TF U 3
AF RR4BX21TF U 1
AF RR4AB07TF U 1
AF RR4BX21JQ C 562
BS 1 80 RR4AB07TF
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BS 82 312 RR4AB07TF
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BS 314 429 RR4AB07TF
BS 430 430 RR4BX21TF
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BS 691 808 RR4AB07TF
BS 809 1163 RR4BX21JQ

RD RR4F447JQ 462 0 0
GG
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TTGGCTTTCATCAGCGTCTGGACAAAACAAATCCTTTTTTGCAGTTTTTGCTTTTGGAGA
TTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTTTTCTTACTCTATTCAAGGGAAATTACTG
GCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGAAGAGT
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AGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGGGACG

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR4F447TF 462 0 0
GG
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TTGGCTTTCATCAGCGTCTGGACAAAACAAATCCTTTTCTGCAGTTTTTGCTTTTGGAGA
TTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTATTCAAGGGAAATTACTG
GCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGAAGAGT
TTTCACCGATATGGTTGCTCAAGGGTTGGGGTTGAAAAGAGTTGTACCCGCTTATCGTAG
GATGCGTCGCATCAAGCGCAACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTTC
AGGAATCGACGATCTTACATCTAGAATACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTAAG
AGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGGGACG

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR4BX21TF 669 0 0
GGGT
GAACTTAATAGTCAATATGTTTAGGGAAAATATATTGGTCTTGACATTATTTTCCATTTA
TTGGCTTTCATCAGCGGCTGGACAAAACAAATCCTTTTCTGCAGTTTTTGCTTTTGGAGA
TTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTATTCAAGGGAAATTACTG
GCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGAAGAGT
TTTCACCGATATGGTTGCTCAAGGGTTGGGGTTGAAAAGAGTTGTACCCGCTTATCGTAG
GATGCGTCGCATCAAGCGCAACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTTC
AGGAATCGACGATCTTACATCTAGAATACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTAAG
AGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGGGACGAAAAATAAGAAAGAGATGAA
AAATATAATTTCAAACGCGGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGATATTGCATACTT
CGTGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGGTTTT
TTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGGTGAT
GGGAG

QA 5 669 5 669
DS 

RD RR4AB07TF 814 0 0
GGGTGAACTTAATAGTCGATATGTTTAGGGAAAATATATTGGTCTTGACATTATTTTCCA
TTTATTGGCTTTCATCAGCGGCTGGACAAAACAAATCCTTTTCTGCAGTTTTTGCTTTTG
GAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTATTCAAGGGAAATT
ACTGGCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGAA
GAGTTTTCACCGATATGGTTGCTCAAGGGTTGGGGTTGAAAAGAGTTGTACCCGCTTATC
GTAGGATGCGTCACATCAAGCGCAACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTG
GTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTAGAATACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAG
TAAGAGATTCCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGGGACGAAAAATAAGAAAGAGA
TGAAAAATATAATTTCAAACGCGGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGATATTGCAT
ACTTCGTGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGG
TTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGG
CGATGGGAGCGATTCCGGTAGGATGCTTGTCTTTCCATCGCTTCATATTTGGTGGAGTAT
TTGCATGGTGTAACTTCATGATGAATAAAATTTCGGAAGACTTCAACACAAAATTGCGGA
AAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGA
TGTTTT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4BX21JQ 602 0 0
TACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGGTTTTTTGGACAAAAACATTCC
TACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGGTGATGGGAGCGATTCCGGTAG
GATGCTTGCCTTTCCATCGCTTCATATTTGGTGGAGTATTTGCATGGTGTAACTTCATGA
TGAATAAAATTTCGGAAGACTTCAACACAAAATTGCGGAAAGCTCTTATTGGTTACGAAG
TAGAAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTCGACATGTACGGCTCTATTATGA
ATCTTATCAACCATCCTAAGGCCTTTGGGTTTACAGAAGCGAAAAGATCGTGTTGTTGTA
TGGTGACATCGATAATACCATGCCGAAACCCGGATGAGTACGTATTCTATGACTTTGCTC
ACCCCACCATGAAAGCCTATGAAGTAATATCTAAACCTCTTATCTATCAGATGAGGAAAG
GCCTTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACCATGATTAAATTTAATATTCATGTAACAG
GCGACACTATCATACATGACGATATATATTCTTAGTGTAAAGAATGTATGATCCACCAGT
TC

QA 1 602 1 602
DS 



CO CL266Contig2 1120 4 12 U
GGATAGAAACACGCAAAAAAAGAACTTGTGAACTTAATTAATTGTCAATATGTTTAGGGA
AAAAATATTGGTGTTGTCATTATTTTCCATTTATTGCCTTTCATCAGTGGCTGGAAAAAA
CAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTTGGAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAA
TCGTCTTCTTACTCTACTCAAGGCAAATTACTGGCCATATGGATTGAAATATGACTTTAA
GATACCGACCGGAAGATTTACAAGTGGAAGAGTTTTCACCGATGTGGTTGCTGAAGGGTT
GGGGATAAAAAGAATTGTACCAGCTTATCGTAGGATGCGTCGCATCAAGCCTGACGACCT
TAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTGGACT
ACACAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTAAGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACT
AAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAGGAGATGAAAGATATCATTTCAAACGCAGTGTTTCT
TGTTTCTAGAGGAAATAACGATATTGGATACTTCGTGAGTCCCGCTCGTTATATGCGATT
ACAATCCAAAGATAAATACACAAGTAACCTGGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGA
TTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTCGCGGTAATGGGAGTGCTGCCGGCAGGGTGTTT
GCCACTCCATCGATTTCTATTTGGTGAAGGATTCGCATGGTGTAACTTCATAATGAATAG
ACTTTCGGTGAACTTTAACACAAAATTGCAGAAAGCTCTTATTGGTTACGAGTAGAAGAG
TCGTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTTGACATGTACGGCAGTCTTATGGATATTATC
AACCATCCCAAGGCTTACGGGTTTAAAGAAGTGAAACGATCGTGTTGTTGTATGGTGAAT
TCGATAATACCATGCCGAAACCCGGATGAGTATGCATTCTATGACTTCATTCACCCCACC
ACGAAAGCCTATGAAGTTATATCTAAACCTCTTGTCCATCAAATGAGGAAAGGCCTTGCT
TGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACAATCAATCCATATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4HB76JQB C 28
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AF RR4FH85TF U 1
AF RR4FH85JQ C 451
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TATGGATTGAAATATGACTTTAAGATACCGACCGGAAGATTTACAAGTGGAAGAGTTTTC
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DS 

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CTTTCATCAGTGGCTGGAAAAAACAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTTGGAGATTCA
ATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTACTCAAGGCAAATTACTGGCCA
TATGGATTGAAATATGACTTTAAGATACCGACCGGAAGATTTACAAGTGGAAGAGTTTTC
ACCGATGTGGTTGCTGAAGGGTTGGGGATAAAAAGAATTGTACCAGCTTATCGTAGGATG
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CTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAAGAGATGAAAGAT
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AAAAATATTAGTGTTGTCATTATTTTCCATTTATTGCCTTTCGTCAGTGGCTGGAAAAAA
CAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTTGGAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAA
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GATACCGACCGGAAGATTTACAAGTGGAAGAGTTTTCACCGACGTGGTTGCTGAAGGGTT
GGGGATAAAAAGAATTGTACCAGCTTATCGTAGGATGCGTCGCATCAAGCCTGACGACCT
TAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTGGACT
ACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTAAGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACT
AAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAGGAGATGAAAGATATCATTTCAAACGCAGTGTTTCT
TGTTTCTAGAGGAAATAACGATATTGGATACTTCGTGAGTCCCGCTCGTTATATGCGATT
ACAATCCAAAGATAAATACACAAGTAACCTGGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGA
TTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTCGCGGTAATGGGAGTGCTGCCGGCAGGGTGTTT
GCCACTCCATCGATT
CTATTTGG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4FH85JQ 670 0 0
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GAAAGATATCATTTCAAACGCAGTGTTTCTTGTTTCTAGAGGAAATAACGATATTGGATA
CTTCGTGAGTCCCGCTCGTTATATGCGATTACAATCCAAAGATAAATACACAAGTAACCT
GGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTCGC
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ATTCGCATGGTGTAACTTCATAATGAATAGACTTTCGGTGAACTTTAACACAAAATTGCA
GAAAGCTCTTATTGGTTACGAGTAGAAGAGTCGTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTT
GACATGTACGGCAGTCTTATGGATATTATCAACCATCCCAAGGCTTACGGGTTTAAAGAA
GTGAAACGATCGTGTTGTTGTATGGTGAATTCGATAATACCATGCCGAAACCCGGATGAG
TATGCATTCTATGACTTCATTCACCCCACCACGAAAGCCTATGAAGTTATATCTAAACCT
CTTGTCCATCAAATGAGGAAAGGCCTTGCTTGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACAATCAAT
CCATATTATT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 12

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AATCATACTCCAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTAC
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TATCCTCGAACTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCT
TGATCTCTGGATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCAT
CAAAAGTAATAATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAGGATACCTCTGCT
TAGCTCCAATTGTTTTCAGCTCCTCGAGAGTAAAATCAACAGTAAAGAAGCCGGTCATGT
TCATCCCTTGGACTTCATAAGTTCTCTTACGGTCTGCAAACTCCTTGTGGTCCGCAACAT
CGGTTGTATCATCGAGATTCACATCGTGATGGCATATAAGAACACCGTCTTTCGTAGATA
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CTTACCCACCCCTAAGAGTTCCTCAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4AU63JQ U 71
AF RR4H981JQB U 67
AF RR4F495TF C 494
AF RR4B554TF C 496
AF RR4AU63TF C 488
AF RR4CE22TF C 586
AF RR4CF36TF C 642
BS 1 100 RR4B554JQ
BS 101 101 RR4F495JQ
BS 102 673 RR4B554JQ
BS 674 674 RR4F495JQ
BS 675 884 RR4B554JQ
BS 885 888 RR4H981JQB
BS 889 889 RR4F495TF
BS 890 906 RR4H981JQB
BS 907 907 RR4F495TF
BS 908 915 RR4H981JQB
BS 916 916 RR4F495TF
BS 917 922 RR4H981JQB
BS 923 923 RR4F495TF
BS 924 934 RR4H981JQB
BS 935 1017 RR4F495TF
BS 1018 1018 RR4B554TF
BS 1019 1177 RR4F495TF
BS 1178 1256 RR4B554TF
BS 1257 1315 RR4AU63TF
BS 1316 1316 RR4CE22TF
BS 1317 1346 RR4AU63TF

RD RR4F495JQ 690 0 0
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AATAACTATAGAAGATTAACTATAGCTTAAGCAAAAGAAAAACAGAATCCATTGCATAAT
CACAGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAATTGTGAAGACTTCCGGTGAAG
TCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTCCAAATACGCA
TCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTATGGATGCACC
TGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGTGTAGTGAGACGGTTATTG
CTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGGTTTAATGTAA
TCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTCGGTTAAGATA
GTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAATGTGAACTAGC
GAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCTTTAGCCAATCTTGAGACATATAT
GAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAACTTTTTACCA
TCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4CE22JQ 658 0 0
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CACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTCCAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAAT
GCAGAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTATGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTG
CTCTTGCAACCAAATCCGTTGGTGTAGTGAGACGGTTATTGCTAACAGGAACAATAGTGT
CCTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGGTTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGATG
TAATATCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTCGGTTAAGATAGTGACATCATCGATCAAGA
ACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAATGTGAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACT
GGATAAATATTGGCTGCATTAGCCAATCTTGAGACATATATGAGCCTTTGTATCCATATT
TCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAACTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCT
GATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGGATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4B554JQ 884 0 0
AAAATTATCACAGTAACTTAAGACTGAGTTGCTGCCTAGACAAAAATACATTCTCAAGGC
ATTGTGAACAAGATAAAAGGAGCAGTTGCTTCTTTTTATTGAAGAGAGAAGAATGAAAAG
TTTCAAAGGATTCCTACAAAAATAACTATAGAAGATTAACTATAGCTTAAGCAAAAGAAA
AACAGAATCCATTGCATAATCACAGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAAT
TGTGAAGACTTCCGGTGAAGTCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAAT
AATCATACTCCAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTAC
GGTATGTGTATGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATCCGTTG
GTGTAGTGAGACGGTTATTGCTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATCCCAA
CCACATATGGTTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTAT
TAGTGTCTTCGGTTAAGATAGTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCA
TGTTTGAAATGTGAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCTTTA
GCCAATCTTGAGATATATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCT
TATCCTCGAACTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCT
TGATCTCTGGATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCAT
CAAAAGTAATAATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTG

QA 1 884 1 884
DS 

RD RR4H953JQB 796 0 0
GACA
AGATAAAAGGAGCAGTTGCTTCTTTTTATTAAAGAGAGAAGAATGAAAAGTTTCAAAGGA
TTCCTACAAAAATAACTATAGAAGATTAACTATAGCTTAAGCAAAAGAAAAACAGAATCC
ATTGCATAATCACAGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAATTGTGAAGACT
TCCGGTGAAGTCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTC
CAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTA
TGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGTGTAGTGAG
ACGGTTATTGCTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGG
TTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTC
GGTTAAGATAGTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAAT
GTGAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTACTTTAGCCAATCTTG
AGACATATATGAGCCTTTGTATACATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAA
CTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGG
ATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAAAGTAAT
AATTGGGAACTT

QA 5 796 5 796
DS 

RD RR4CF36JQ 808 0 0
G
GATAAAAGGAGCAGTTGCTTCTTTTTATTAAAGAGAGAAGAATGAAAAGTTTCAAAGGAT
TCCTACAAAAATAACTATAGAAGATTAACTATAGCTTAAGCAAAAGAAAAACAGAATCCA
TTGCATAATCACAGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAATTGTGAAGACTT
CCGGTGAAGTCGGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTCC
AAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTAT
GGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGTGTAGTGAGA
CGGTTATTGCTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGGT
TTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATATCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTCG
GTTAAGATAGTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAATG
TGAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCATTAGCCAATCTTGA
GACATATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAAC
TTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGGA
TATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAAAGTAATA
ATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGA

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR4AU63JQ 814 0 0
AGATAAAAGGAGCAGTTGCTTCTTTTTATTAAAGAGAGAAGAATGAAAAGTTTCAAAGGA
TTCCTACAAAAATAACTATAGAAGATTAACTATAGCTTAAGCAAAAGAAAAACAGAATCC
ATTGCATAATCACAGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAATTGTGAAGACT
TCCGGTGAAGTCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTC
CAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTA
TGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATTCGTTGGTGTAGTGAG
ACGGTTATTGCTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGG
TTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTC
GGTTAAGATGGTGACGTCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAAT
GTGAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCTTTAGCCAATCTTG
AGACATATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAA
CTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGG
ATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAAAGTAAT
AATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4H981JQB 876 0 0
GACA
AGATAAAAGGAGCAGTTGCTTCTTTTTATTAAAGAGAGAAGAATGAAAAGTTTCAAAGGA
TTCCTACAAAAATAACTATAGAAGATTAACTATAGCTTAAGCAAAAGAAAAACAGAATCC
ATTGCATAATCACAGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAATTGTGAAGACT
TCCGGTGAAGTCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTC
CAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTA
TGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGTGTAGTGAG
ACGGTTATTGCTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGG
TTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTC
GGTTAAGATAGTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAAT
GTGAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTACTTTAGCCAATCTTG
AGACATATATGAGCCTTTGTATACATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAA
CTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGG
ATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAA*GTAAT
AATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAG*ATACCTCTGCTTAGCTC*AAT
TGTTT*CAGCTC*TCGAGAGTAAA
TCACAGTA

QA 5 868 5 868
DS 

RD RR4F495TF 685 0 0
AATGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTCGGT
TAAGATAGTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAATGTG
AACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCTTTAGCCAATCTTGAGA
CATATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAACTT
TTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGGATA
TATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAAAGTAATAAT
TGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAGGATACCTCTGCTTAGCTCCAATTAT
TTTCAGCTCCTCGAGAGTAAAATCAACAGTAAAGAAGCCGGTCATGTTCATCCCTTGGAC
TTCATAAGTTCTCTTACGGTCTGCAAACTCCTTGTGGTCCGCAAAATCGGTTGTATCATC
GAGATTCACATCGTGATGGCATATAAGAACACCGTCTTTCGTAGATAGAATATCAGATTC
TATGAAATCTGCACCTTCCTCGATGGCCCTCATATATGCAGGAGCAGTTTCTTCAGGGAA
CTCGCCGTTTGCTCCTCTGTGTGC
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4B554TF 761 0 0
TGTAATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCTTATTAGTGTCTTCGGTTA
AGATAGTGACATCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAATGTGAA
CTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCTTTAGCCAATCTTGAGATA
TATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAACTTTT
TACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGGATATA
TCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAAAGTAATAATTG
GGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAGGATACCTCTGCTTAGCTCCAATTGTTT
TCAGCTCCTCGAGGGTAAAATCAACAGTAAAGAAGCCGGTCATGTTCATCCCTTGGACTT
CATAAGTTCTCTTACGGTCTGCAAACTCCTTGTGGTCCGCAACATCGGTTGTATCATCGA
GATTCACATCGTGATGGCATATAAGAACACCGTCTTTCGTAGATAGAATATCAGATTCTA
TGAAATCTGCACCTTCCTCGATGGCCCTCATATATGCAGGAGCAGTTTCTTCAGGGAACT
CGCCGTTTGCTCCTCTGTGTGCAACATTGAACGGACGAGAAGTCTGAAGCGGTTTCTTGG
TTCCAGCTTTTGCTAGACTTGGGAGCGTATACAATGGCCTT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4AU63TF 859 0 0
ATATGTTTATGT
ATCTAAATATGCGTCTGATGTAATCTCAGCGTATGTCT*ATTAGTGTCT*CGGTTAAGAT
GGTGACGTCATCGATCAAGAACACTTTTGGTGAGTCTGTCATGTTTGAAATGTGAACTAG
CGAAGTTGCAGCAAAAGACTGGATAAATATTGGCTGCTTTAGCCAATCTTGAGACATATA
TGAGC*TTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCTCGAACTTTTTACC
ATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGGTTCTTGATCTCTGGATATATCCC
AACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGCTATATACTCATCAAAAGTAATAATTGGGAA
CTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAGGATACCTCTGCTTAGCTCCAATTGTTTTCAG
CTCCTCGAGAGTAAAATCAACAGTAAAGAAGCCGGTCATGTTCATCCCTTGGACTTCATA
AGTTCTCTTACGGTCTGCAAACTCCTTGTGGTCCGCAACATCGGTTGTATCATCGAGATT
CACATCGTGATGGCATATAAGAACACCGTCTTTCGTAGATAGAATATCAGATTCTATGAA
ATCTGCACCTTCCTCGATGGCCCTCATATATGCAGGAGCAGTTTCTTCAGGGAACTCGCC
GTTTGCTCCTCTGTGTGCAACATTGAACGGACGAGAAGTCTGAAGCGGTTTCTTGGTTCC
AGCTTTTGATAGACTTGGGAGCGTATACAATGGCCTTGAGGCACATTCAGCAATCAACAA
TGACAGTAAAAGCAACGGTAGACAATACTTGACACCAATGACTTACCCACCCCTAAGAGT
TCCTCAC

QA 13 859 13 859
DS 

RD RR4CE22TF 746 0 0
TTT
GTGAGTCTGTCATGTT*GAAATGTGAACTAGCGAAGT*GCAGCAAA*GACTGGATAAATA
TTGGCTGCATTAGCCAATCTTGAGACATATATGAGC*TTTGTATCCATATTTCTTCAAAG
TTGCAACAATCTTATCCTCGAACTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGA
AAACAGGGTTCTTGATCTCTGGATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTG
CTATATACTCATCAAAAGTAATAATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAG
GATACCTCTGCTTAGCTCCAATTGTTTTCAGCTCCTCGAGAGTAAAATCAACAGTAAAGA
AGCCGGTCATGTTCATCCCTTGGACTTCATAAGTTCTCTTACGGTCTGCAAACTCCTTGT
GGTCCGCAACATCGGTTGTATCATCGAGATTCACATCGTGATGGCATATAAGAACACCGT
CTTTCGTAGATAGAATATCAGATTCTATGAAATCTGCACCTTCCTCGATGGCCCTCATAT
ATGCAGGAGCAGTTTCTTCAGGGAACTCGCCGTTTGCTCCTCTGTGTGCAACATTGAACG
GACGAGAAGTCTGAAGCGGTTTCTTGGTTCCAGCTTTTGCTAGACTTGGGAGCGTATACA
ATGGCCTTGAGGCACATTCAGCAATCAACAATGACAGTAAAAGCAACGGTAGACAATACT
TGACACCCATGACTTACCCACCC

QA 4 746 4 746
DS 

RD RR4CF36TF 690 0 0
GATAAATA
TGGCTGCATTAGCCAATCT*GAGACATATATGAGC*TTTGTATCCATATTTCTTCAAAGT
TGCAACAATCTTATCCTCGAACTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAA
AACAGGGTTCTTGATCTCTGGATATATCCCAACAACTCTAGGTGCATCCAGTGCTATTGC
TATATACTCATCAAAAGTAATAATTGGGAACTTACCATTGTACTGTTGATCCCTGAAAGG
ATACCTCTGCTTAGCTCCAATTGTTTTCAGCTCCTCGAGAGTAAAATCAACAGTAAAGAA
GCCGGTCATGTTCATCCCTTGGACTTCATAAGTTCTCTTACGGTCTGCAAACTCCTTGTG
GTCCGCAACATCGGTTGTATCATCGAGATTCACATCGTGATGGCATATAAGAACACCGTC
TTTCGTAGATAGAATATCAGATTCTATGAAATCTGCACCTTCCTCGATGGCCCTCATATA
TGCAGGAGCAGTTTCTTCAGGGAACTCGCCGTTTGCTCCTCTGTGTGCAACATTGAACGG
ACGAGAAGTCTGAAGCGGTTTCTTGGTTCCAGCTTTTGCTAGACTTGGGAGCGTATACAA
TGGCCTTGAGGCACATTCAGCAATCAACAATGACAGTAAAAGCAACGGTAGACAATACTT
GACACCCATGACTTACCCACCC

QA 9 690 9 690
DS 



AS 1 11

CO CL268Contig1 1085 11 39 U
GGAGAAAAAAAAACAAATCACCAATTTCTCTCAAAGGGCCAATCAATCTCAGTGATCTAC
TTGCAAAAGTCTCCTCGAGAGGCCCAG****TAGTTAACATGGCTGGCCAAAACGCGCGT
TTGAATGTGGTTCCCACTGTTACTATGCTCGGAGTTATGAAAGCCCGTCTTGTTGGAGCC
ACAAGAGGCCATGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGATGCTTTAACTGTTCAGTTCAGGGCT
CTTCTCAAGAAAATCGTCACGGCCAAGGAATCCATGGGAGACATGATGAAGACATCGTCT
TTTGCTCTTACCGAAGGAAAGTACGTTGCTGGTGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAG
AACGTCAAAGAAGCTACGCTCAAGGTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAG
CTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCT
AGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTC
GTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACT
AACCGCAGGGTCAATGCCCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGT
TACATCAAGGGGGAGCTTGACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATT
CAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAAGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAG
GAGATGGTT***GAAGGGATATCTATGCAGAGAGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAAC
TTGCTCGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTAAAGTTTGAGGCTCTCT
CGCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAA
ATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCC
TCTTGAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGCCTTATGATAATGTAAAACGTTACCTTGC
GGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 55 55 55 20 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG73TF U 1
AF RR4BV49TF U 18
AF RR4FD67TF U 18
AF RR4C369TF U 372
AF RR4C369JQ C 372
AF RR4AT90JQ C 272
AF RR4FD67JQ C 447
AF RR4GD29TF U 373
AF RR4AY17TF U 272
AF RR4AY17JQ C 437
AF RR4AT90TF U 272
BS 1 87 RR4DG73TF
BS 88 91 RR4BV49TF
BS 92 272 RR4DG73TF
BS 273 273 RR4FD67TF
BS 274 316 RR4DG73TF
BS 317 318 RR4AY17TF
BS 319 377 RR4DG73TF
BS 378 378 RR4FD67TF
BS 379 457 RR4DG73TF
BS 458 460 RR4BV49TF
BS 461 604 RR4DG73TF
BS 605 614 RR4BV49TF
BS 615 615 RR4FD67TF
BS 616 617 RR4BV49TF
BS 618 618 RR4FD67TF
BS 619 671 RR4BV49TF
BS 672 672 RR4FD67TF
BS 673 707 RR4BV49TF
BS 708 789 RR4GD29TF
BS 790 792 RR4AY17TF
BS 793 800 RR4GD29TF
BS 801 801 RR4AY17TF
BS 802 845 RR4GD29TF
BS 846 846 RR4AY17TF
BS 847 883 RR4GD29TF
BS 884 884 RR4AY17TF
BS 885 888 RR4GD29TF
BS 889 889 RR4AY17TF
BS 890 901 RR4GD29TF
BS 902 902 RR4AY17TF
BS 903 942 RR4GD29TF
BS 943 943 RR4AY17TF
BS 944 945 RR4GD29TF
BS 946 946 RR4AY17TF
BS 947 1015 RR4GD29TF
BS 1016 1016 RR4AY17TF
BS 1017 1028 RR4GD29TF
BS 1029 1069 RR4AY17TF
BS 1070 1085 RR4AT90TF

RD RR4DG73TF 604 0 0
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TTGCAAAAGTCTCCTCGAGAGGCCCAGGTATTAGTTAACATGGCTGGCCAAAACGCGCGT
TTGAATGTGGTTCCCACTGTTACTATGCTCGGAGTTATGAAAGCCCGTCTTGTTGGAGCC
ACAAGAGGCCATGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGATGCTTTAACTGTTCAGTTCAGGGCT
CTTCTCAAGAAAATCGTCACGGCCAAGGAATCAATGGGAGACATGATGAAGACATCGTCT
TTTGCTCTTACCGAAGTCAAGTACGTTGCTGGTGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAG
AACGTCAAAGAAGCTACTCTCAAGGTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAG
CTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCA***ACGACTTAACCGGTTTAGCT
AGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTC
GTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACT
AACC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4BV49TF 694 0 0
GG
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AGGCCCAG****TAGTTAACATGGCTGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTTCCCACTG
TTACTATGCTCGGAGTTATGAAAGCCCGTCTTGTTGGAGCCACAAGAGGCCATGCTCTCC
TCAAGAAGAAGAGCGATGCTTTAACTGTTCAGTTCAGGGCTCTTCTCAAGAAAATCGTCA
CGGCCAAGGAATCAATGGTAGACATGATGAAGACATCGTCTTTTGCTCTTACCGAAGTCA
AGTACGTTGCTGGTGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCTACTC
TCAAAGTCCGTTCTAGGCAAGAGAACATCGCTGGTGTGAAGCTTCCAAAGTTTGATCACT
TCTCTGAAGGCGAGACCAAGAATGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACAGGTCC
AAGCTTGCCGTGTCGCTTATGTGAAAGCTATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCC
AGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACGAACCGCAGGGTCAACGCTC
TGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGAGAGCTTG
ACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAG
CTTA

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DS 

RD RR4FD67TF 693 0 0
GG
ACCAATTTCTCTCAAAGGGCCAATCAATCTCAGTGATCTACTTGCAAAAGTCTCCTCGAG
AGGCCCAG*******TTAACATGGCTGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTTCCCACTG
TTACTATGCTCGGAGTTATGAAAGCCCGTCTTGTTGGAGCCACAAGAGGCCATGCTCTCC
TCAAGAAGAAGAGCGATGCTTTAACTGTTCAGTTCAGGGCTCTTCTCAAGAAAATCGTCA
CGGCCAAGGAATCCATGGGAGACATGATGAAGACATCGTCTTTTGCTCTTACCGAAGTCA
AGTACGTTGCTGGTGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCTACGC
TCAAGGTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAGCTTCCGAAGTTTGATCACT
TCTCTGAAGGCGAGACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACAGGTCC
AAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCC
AGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAATGCCC
TGGAGAATGTAGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGGGAGCTTG
ACGAGCTTGAGAGGGA*GATTTCTTCAG
CTT

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DS 

RD RR4C369TF 322 0 0
G
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GATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAA
CAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCT
TCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTC
AATGCCCTGGAGAATGT*GTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGG
GAGCTTGAC
AGCTTGAAGGGA

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DS 

RD RR4C369JQ 607 0 0
G
GCTACGCTCAAGGTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAGCTTCCGAAGTTT
GATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAA
CAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCT
TCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTC
AATGCCCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGG
GAGCTTGACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAG
AGGAGGGGAGTCGAGAGACAAGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTTCTT
GAAGGGATATCTATGCAGAGAGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTCGAAGGT
GGGGCAGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTAAAGTGTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCT
TTTGTTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAAATGGATTTGATG
TAGATG

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DS 

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G
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TGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCTACGCTCAAGGTCCGTTC
AAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAGCTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGA
GACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGT
GGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGT*CTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTT
GACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAATGCCCTGGAGAATGTGGT
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GGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACA
AGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTT***GAAGGGATATCTATGCAGAG
AGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTCGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGA
CATTATTTTCTAAAGTTTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTT
CATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCAT
CTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTCTTGAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGC
CTTATGATAATGTAAAA

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR4FD67JQ 595 0 0
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CCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTC
GTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAATGCCCTGGAGAA
TGTAGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGGGAGCTTGACGAGCT
TGAGAGGGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGA
GAGACAAGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTTCTTGAAGGGATATCTAT
GCAGAGAGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTCGAAGGTGGGGCAGAGAAGGA
TGCAGACATTATTTTCTAAAGTGTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCTTTTGTTATTATTAC
TCTCTTCATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTG
TATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTCTTGAGAGATTTGTGATTG
C

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DS 

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GG
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TCACTCCTCTGAAGGCGAGACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACA
GGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCTTC
TCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAA
CGCTCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACCATCAGTTACATCAAGGGAGA
GCTTGACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAG
GAGGGAAGTCGAGAGACAAGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTTCTTGA
AGGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTTGAAGGTGG
GGCAGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTGAAGTGTGAGGCTCTCTCTCTATTTATCTTT
TGTTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTAATGTTTCTACAAATAAAATGGATTTGATGTA
GATGAAATACTGTATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATATTCCTCTTGAGA

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR4AY17TF 798 0 0
G
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TGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCTACGCTCAAGGTCCGTTC
AAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAGCTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGA
GACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGT
GGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGT*CTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTT
GACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAATGCCCTGGAGAATGTGGT
GAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGGGAGCTTGACGAGCTTGAGAG
GGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACA
AGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTT***GAAGGGATATCTATGCAGAG
AGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTCGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGA
CATTATTTTCTAAAGTTTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTT
CATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCAT
CTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTCTTGAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGC
CTTATGATAATGTAAAA

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR4AY17JQ 636 0 0
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TCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGT*CTCGTTGAGCTTGCTTCTC
TCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAATG
CCCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGGGAGC
TTGACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAGGA
GGGAAGTCGAGAGACAAGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTT***GAAG
GGATATCTATGCAGAGAGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTCGAAGGTGGGG
CAGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTAAAGTTTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCTTTTG
TTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGA
TGAAATACTGTATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTCTTGAGAGATTTGTG
ATTGTTACTCTTCTGCCTTATGATAATGTAAAA
CGT

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DS 

RD RR4AT90TF 814 0 0
G
CATGGGAGACATGATGAAGACATCGTCTTTTGCTCTTACCGAAGGAAAGTACGTTGCTGG
TGAGAATGTCAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCTACGCTCAAGGTCCGTTC
AAGGCAAGAGAACATCGCCGGTGTGAAGCTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGA
GACCAAGAACGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGT
GGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGT*CTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTT
GACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACTAACCGCAGGGTCAATGCCCTGGAGAATGTGGT
GAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACATCAAGGGGGAGCTTGACGAGCTTGAGAG
GGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACA
AGCAGCTAATGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTT***GAAGGGATATCTATGCAGAG
AGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTCGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGA
CATTATTTTCTAAAGTTTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTT
CATAAGACTTGATATTTCTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCAT
CTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTCTTGAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGC
CTTATGATAATGTAAAACGTTACCTTGCGGAAA

QA 2 814 2 814
DS 



AS 1 9

CO CL269Contig1 744 9 28 U
TTTTTTTTCCGAAATTGAAATAGTATTTTCTCTAGAGAACCAAAAAGTGTCTACAAAAAC
TGTCAATAAGATCAAGGAAATAAGCAAAGATTTTGCCTCTCCTCATGGTTTCCAAAATAA
AAAATAAAAATACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTT
TGCTTTAGCTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCAT
TCCAATGAAGAAGAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAG
TTGGCTGAATTCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGC
AACGGCTTGATGCAGAAGCAAGAGATAAGCTCCCAGAGAGCTGCCAAAGACGAACAAAAG
TCCACCAATGCCCTTCAAGGCTACAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACCGGTGG
CAATTGCTGGCCGGTATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAA
GGATTTAGCTGCTCGACCCCCATCATCCCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAG
AAGGAATACGGAAACGAACAGAGCTCTACCGACAAAGGAAGCTAACTCCATTGAAGCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTGCTTCTCA
CGAATCCAAGGCAGAGAGAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 40 40 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI92TF C 6
AF RR4FX85TF C 416
AF RR4F080JQ U 9
AF RR4FX85JQ U 6
AF RR4DZ86JQ U 5
AF RR4EZ39TF C 1
AF RR4BS14JQ U 9
AF RR4EZ39JQ U 9
AF RR4BS14TF C 1
BS 1 7 RR4EZ39TF
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BS 96 96 RR4FX85JQ
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AA
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AAGATCAAGGAAATAAGCAAAGATTTTGCCTCTCCTCATGGTTTCCAAAATAAAAAATAA
AAATACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTA
GCTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATG
AAGAAGAGTAGTGCCCC
C

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DS 

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CTTAAGG

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DS 

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CT
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ATCAAGGAAATAAGCAAAGATTTTGTCTCTCCTCATGGTTTCCAAAATAAAAAATAAAAA
TACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTAGCT
TTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATGAAA
AAAAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAGTTGGCTGAAT
TCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGCAACGGCTTGA
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CCCTTCAAGGCTATAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACTGGTGGCAATTGCTGG
CCGGTATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAAGGATTTAGCT
GCTCGACCTCCATCATCTCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAGAAGGAATACG
GAAACGAACAGAGC

QA 3 616 3 616
DS 

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AG
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AAGATCAAGGAAATAAGCAAAGATTTTGCCTCTCCTCATGGTTTCCAAAATAAAAAATAA
AAATACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTA
GCTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACTATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATG
AAGAAGAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAGTTGGCTG
AATTCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACGGAATCGGGGTGGCAACGGCT
TGATGCAGAAGCAAGAGATAAGCTCCGAGAGAGCTGCCAAAGACGAACAAAAGTCCACCA
ATGCCCTTCAAGGCTATAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACTGGTGGCAATTGC
TGGCCGGTATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAAGGATTTA
GCTGCTCGACCTCCATCATCTCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAGAAGGAAT
ACGGAAACGAACAGAGC

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4DZ86JQ 621 0 0
AGA
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AAGATCAAGGAAATAAGCAAAGATTTTGCCTCTCCTCATGGTTTCCAAAATAAAAAATAA
AAATACAGACAAAAGCTTGAACA*CCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTA
GCTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATG
AAGAAGAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAGTTGGCTG
AATTCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGCAACGGCT
TGATGCAGAAGCAAGAGATAAGCTCCCAGAGAGCTGCCAAAGACGAACAAAAGTCCACCA
ATGCCCTTCAAGGCTACAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACCGGTGGCAATTGC
TGGCCGGTATGAGTTGTCACGCGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAAGGATTTA
GCTGCTCGACCCCCATCATCCCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAGAAGGAAT
ACGGAAACGAACAGAGCT

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DS 

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AAAATAAAAATACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTT
TGCTTTAGCTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCAT
TCCAATGAAGAAGAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAG
TTGGCTGAATTCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGC
AACGGCTTGATGCAGAAGCAAGAGATAAGCTCCCAGAGAGCTGCCAAAGACGAACAAAAG
TCCACCAATGCCCTTCAAGGCTACAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACCGGTGG
CAATTGCTGGCCGGTATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAA
GGATTTAGCTGCTCGACCCCCATCATCCCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAG
AAGGAATACGGAAACGAACAGAGCTCTACCGACAAAGGAAGCTAACTCCATTGAAGCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTC

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DS 

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AATACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTAG
CTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATGA
AGAAGAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAGTTGGCTGA
ATTCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGCAACGGCTT
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TGCCCTTCAAGGCTACAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACCGGTGGCAATTGCT
GGCCGGTATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAAGGATTTAG
CTGCTCGACCCCCATCATCCCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAGAAGGAATA
CGGAAACGAACAGAGCTCTACCGACAACGGAAGCTAACTCCATTGAAGCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC

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DS 

RD RR4EZ39JQ 671 0 0
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AGATCAAGGAAATAAGCAAAGATTTTGCCTCTCCTCACGGTTTCCAAAATAAAAAATAAA
AATACAGACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTAG
CTTTTGGAGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATGA
AGAAGAGTAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAGTTGGCTGA
ATTCCTTTTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGCAACGGCTT
GATGCAAAAGCAAGAGATAAGCTCCCAGAGAGCTGCCAAAGACGAACAAAAGTCCACCAA
TGCCCTTCAAGGCTACAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACCGGTGGCAATTGCT
GGCCGGTATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAAGGATTTAG
CTGCTCGACCCCCATCATCCCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAGAAGGAATA
CGGAAACGAACAGAGCTCTACCGACAAAGGAAGCTAACTCCATTGAAGCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTC

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DS 

RD RR4BS14TF 744 0 0
TTTTTTTTTCCGAAA
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GGAAATAAGCAAAGATTTTGCCTCTCCTCATGGTTTCCAAAATAAAAAATAAAAATACAG
ACAAAAGCTTGAACAACCCGATGAAAACATCATTTTTTATCAGTTTGCTTTAGCTTTTGG
AGCCTTCTTCCGGAGTTGCCTACCATGTCTCCTCGAATTCTTCATTCCAATGAAGAAGAG
TAGTGCCCCAAGGAGTGCCAAGCTCTGAGTAAACTTGGAAAACAGTTGGCTGAATTCCTT
TTTGTCAACATCGTAGTTGTAGAAATCATACAGAATCGGGGTGGCAACGGCTTGATGCAG
AAGCAAGAGATAAGCTCCCAGAGAGCTGCCAAAGACGAACAAAAGTCCACCAATGCCCTT
CAAGGCTACAGCAGCAGCAACAAGAATCTTCATATCAACCGGTGGCAATTGCTGGCCGGT
ATGAGTTGTCACGTGGCTAACAAAAGCATTGTACTTTGGTCTTAAGGATTTAGCTGCTCG
ACCCCCATCATCCCCAAACCCATTGAACTCTTGCCATGCGGAGAGAAGGAATACGGAAAC
GAACAGAGCTCTACCGACAACGGAAGCTAACTCCATTGAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTGCTTCTCACGAATCCAAGGCAGA
GAGAGTTCC

QA 16 744 16 744
DS 



AS 1 12

CO CL270Contig1 885 12 13 U
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GACCCTTAAAACCAAAAGCAAAGACCCTTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGATGGT
TTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAG
TATAACTCAGAATGAAGGGAACATCCTAAGACCCTT*CGCAAACACATTCTCTGTGGACG
TGTCAACCTCACGG*AACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGA
ACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCA
CTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAA
AAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAG
GAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTC
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GCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTG
GATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCAC
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TGGCTTATTGTTACCCATGGTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 35 30 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 10 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 20 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BT73TF C 210
AF RR4AO39JQ U 88
AF RR4BK72JQ U 1
AF RR4B540JQ U 26
AF RR4B817JQ U 26
AF RR4BT73JQ U 49
AF RR4B540TF C 98
AF RR4EU44JQ U 68
AF RR4B817TF C 105
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AF RR4EU44TF C 348
AF RR4AO39TF C 137
BS 1 86 RR4BK72JQ
BS 87 87 RR4B540JQ
BS 88 271 RR4BK72JQ
BS 272 272 RR4AO39JQ
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RD RR4BT73TF 339 0 0
AGA
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CGCACCAATACCTTTTATAGCTGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTC
ATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGT
GGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACCCTTCCATATCTTTGAAGAAG
GGCGAAGCCATATCGAAGACCGGAACTCGATAACTA

QA 4 339 4 339
DS 

RD RR4AO39JQ 599 0 0
TTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAAATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTATT
TTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAGTATAACTCAAAATGAAGGGAACATCCA
AAGACCCTT*CCCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGG*AACTTAACAGGG
AAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAAAACAAAATAAGGTGCTCCAAATAAACCG
GGGGTCCCACCAATACCTTTTATAGCCGAATCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTG
TTTTCATCGTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCTCTCGTGCTGGAGCTACCA
CCAGTGATTACGTAGTTCTTGTCAAAACTTGAGGAGGGATCGACC*TTCCATATCTTTGA
AAAAGGGCAAAGCCATATCGAAAACTGGAACTCGATAACCAAATCGGTGTTTGTTGTCAA
TACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGG
AAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4BK72JQ 763 0 0
GCTTAAACTTAACAAGAGTTTGGTTTCTTAAGAAAAAGAAGGATCCTCATAAAGAACAAA
GACCCTTAAAACCAAAAGCAAAGACC*TTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGATGGT
TTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAG
TATAACTCAGAATGAAGGGAACATCCTAAGACCCTT*CGCAAACACATTCTCTGTGGACG
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CTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAA
AAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAG
GAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTC
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ATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAA
GCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTG
GATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4B540JQ 779 0 0
G
CTTAAGAAAAAGAAGGATCCTCATAAAGAACAAAGACCCTTAAAACCAAAAGCAAAGACC
CTTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTAT
TTTACATAATTCAACTTATTAAACAAAATCGAAGTATAACTCAAAATGAAGGGAACATCC
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GAAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACC
GGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGT
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GAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGA
CAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAA
GTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAAC

QA 2 779 2 779
DS 

RD RR4B817JQ 787 0 0
G
CTTAAGAAAAAGAAGGATCCTCATAAAGAACAAAGACCCTTAAAACCAAAAGCAAAGACC
CTTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTAT
TTTACATAATTCAACTTATTAAACAAAATCGAAGTATAACTCAAAATGAAGGGAACATCC
TAAGACCCTT*CGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGG*AACTTAACAGG
GAAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACC
GGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGT
GTTTT**TCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACC
ACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTG
AAGAAGGGCAAAGCC*TATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTTGTTGTCA
ATACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATG
GAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGA
CAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAA
GTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAG
CTGACA

QA 2 787 2 787
DS 

RD RR4BT73JQ 792 0 0
G
TAAAGAACAAAGACCCTTAAAACCAAAAGCAAAGACCCTTAACTTTTTATTACATCAAAC
CAAAAGATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAA
CAACATCGAAGTATAACTCAAAATGAAGGGAACATCCTAAGACCCTT*CGCAAACACATT
CTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGG*AACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATTATTAT
CATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTA
TAGCTGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCT
GAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGT
CAGAACTTGAGGAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCGAAGCCATATCGAA
AACCGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTTGTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAGAT
GGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCT
AATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTACTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCTTGTTT
GAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTG
ACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAGCTGACACGAGAAG*ATCAAAGAG
ATGAATGACAA

QA 2 792 2 792
DS 

RD RR4B540TF 721 0 0
ATTACATCAAACCAAAAGATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATT
CAACTTATTAAACAAAATCGAAGTATAACTCAGAATGAAGGGAACATCCTAAGACCCTT*
CGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGGGAACTTAACAGGGAAAACATTTT
TATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCAC
CAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTT**TCTT
TTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTA
CATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAA
AGCC*TATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTTGTTGTCAATACATCACCA
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TGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGACAAGACCACCT
CCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCA
TTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAGCTGACACGAGA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4EU44JQ 748 0 0
AG
AACCAAAAGCAAAGACCCTTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGATGGTTTAGTGGTA
TTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAGTATAACTCA
GAATGAAGAGAACATCCTAAGACCCTT*CGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCT
CACGG*AACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATAA
GGTGCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAG
TGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCC
CTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCG
ACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAG
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CTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCC
AGCTGATATTGCAACAGCTGACACGA

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR4B817TF 781 0 0
CAAACCAAAAGATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTA
TTAAACAAAATCGAAGTATAACTCAGAATGAAGGGAACATC*TAAGACCCTT*CGCAAAC
ACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGG*AACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATT
ATTATCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACC
TTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTT**TCTTTTCCATA
TTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTT
CTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCC*TA
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AAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAA
TACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCT
TGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGT
CCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAGCTGACACGAGAAGGATCA
AAGAGATGAATGACAATGGCTTATTGTTACCCATGGTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4BK72TF 757 0 0
ATTGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAGTATA*CTC
AGAATGAAGGGAACATC*TAAGACCCTT*CGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACC
TCACGG*AACTTAACAGGGAAAAAATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATA
AGGTGCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCGGAGTCACTCTCGTA
GTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTC
CCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATC
GACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTA
GATCGGTGTTTGTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAG
GAAGGCCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAA
AGTCAGTGCTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGT
ACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTC
CAGCTGATATTGCAACAGCTGACACGAGAAGGATCAAAGAGATGAATGACAATGGCTTAT
TGTTACCCATGGTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTTCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4EU44TF 538 0 0
TATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTT
CTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTT
GTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACC*TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCG
AAGACTGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTTGTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAG
ATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATAC
CTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGTGACAAGACCACCTCCTTTCTTGT
TTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCT
TGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAGCTGACACGAGAAGGATCAAAG
AGATGAATGACAATGGCTTATTGTTACCCATGGTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTTCC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4AO39TF 749 0 0
AACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAGTATAACTCAGAATGAA
GGGAACATCCAAAGACCCTTTCGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGG*A
ACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTC
CGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTA
GCTTGTAAGTGTTTTCATCGTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCTCTCGTGC
TGGAGCTACCACCAGTGATTACGTAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGGATCGACC*TTC
CATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACCAGATCGGTG
TTTGTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCT
GGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTG
CTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTC
TGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGAT
ATTGCAACAGCTGACACGAGAAGGATCAAAGAGATGAATGACAATGGCTTATTGTTACCC
ATGGTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTTCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 12

CO CL271Contig1 935 12 25 U
GATCGCAATCTTGACAGGAGCTGAGTACCAAGCCCTTGACATGGGCCTGCTGGTGGAAAA
CACAACCATAGATCAGTTGGGTATTGCACGTAAAGTGACCATAAGCAAAGACTCGACTAC
GCTGATCGCAGATGCGGCTTCCAAGGACGAGTTGCAAGCTCGTATCTCCCAGCTGAAGAA
GGAACTGTTCGAGACTTACTCTGTGTACGACTCGGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAA
ACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGA
CCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACGCTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGAT
AGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGA
GACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGC
ACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGAT
TATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTT
GGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTC
GGTTGCAGGGATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGC
TGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGGCCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTG
TATCTCTTGTCCCCCATCTATCTATCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGG
AAATGACTCAATGAGTAGCTTTGTTTAAATGAGAAATAATTATCTTTTTTTGAGTAAGGA
TCGTTCTGATTGCATAATAAAAGTTTTGTATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 

AF RR4G915TF U 82
AF RR4FJ94TF U 216
AF RR4EO53TF U 1
AF RR4EA63TF U 92
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AF RR4G915JQ C 241
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AF RR4AK19TF U 260
AF RR4EA63JQ C 385
AF RR4AK19JQ C 332
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RD RR4G915TF 631 0 0
G
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AAGGACGAGTTGCAAGCTCGTATCTCCCAGCTGAAGAAGGAACTGTTCGAGACTGACTCT
GTGTACGACTCGGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTC
ATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGAC
GCGAAGAACGCTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACT
CTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAA
CGTCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCGCAG
AACGCTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTA
GGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCG
GCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTGACC
ACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAA

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR4FJ94TF 533 0 0
G
GAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTAAAGTCGGAGC
AGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACGCTAC
CTTTGCTGCTGTCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTC
CACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGAGCTGA
TATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTGGGATTGA
AGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCAT
GACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAG
ATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGT
TGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGGCCTC

QA 2 533 2 533
DS 

RD RR4EO53TF 834 0 0
GATCGCAATCTTGACAGGAGCTGAGTACCAAGCCCTTGACATGGGCCTGCTGGTGGAAAA
CACAACCATAGATCAGTTGGGTATTGCACGTAAAGTGACCATAAGCAAAGACTCGACTAC
GCTGATCGCAGATGCGGCTTCCAAGGACGAGTTGCAAGCTCGTATCTCCCAGCTGAAGAA
GGAACTGTTCGAGACTTACTCTGTGTACGACTCGGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAA
ACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGA
CCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACGCTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGAT
AGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGA
GACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGC
ACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTTGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGAT
TATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTT
GGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTC
GGT*GCAGGGATGGTGCTGACCACTCAG*CTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAA*GC
TGCTGCTGCTGCTGCAC*TGAGGGC*TCATGGTGTA*TGAG**TGCACATGTCACATGTG
TATCTCT*GTCCC**ATCTATCTATCTGCGATGTTTT
AGTATTTCTCTTTGGGG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4EA63TF 718 0 0
G
AAGTGACCATAAGCAAAGACTCGACTACGCTGATCGCAGATGCGGCTTCCAAGGACGAGT
TGCAAGCTCGTATCTCC*AGCTGAAGAAGGAACTGTTCGAGACTGACTCTGTGTACGACT
CGGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTAAAGTCG
GAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACG
CTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATC
TCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGAG
CTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTGGGA
TTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAACG
CCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTGA
CCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTGACCACTCAGGCTA
TCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAAGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGGCCTCATGG
TGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTGTCTCTTGTCCCC*ATCTATCTATCTGC

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR4BR55JQ 339 0 0
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AGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGG
GATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGC
TGCTGCACCTGAGGGCCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTATCTCTTG
TCCCCCATCTATCTATCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTC
AATGAGTAGCTTTGTTTAAATGAGAAATAATTATCTTTT

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR4BR55TF 347 0 0
TGAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGG
AGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGG
GATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGC
TGCTGCACCTGAGGGCCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTATCTCTTG
TCCCCCATCTATCTATCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTC
AATGAGTAGCTTTGTTTAAATGAGAAATAATTATCTTTTTTTGAGT
C

QA 1 346 1 346
DS 

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CCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACGCTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGAT
AGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGA
GACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGC
ACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGAT
TATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTT
GGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTC
GGTTGCAGGGATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGC
TGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGGCCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTG
TATCTCTTGTCCCCCATCTATCTATCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGG
AAATGACTCAATGAGTAGCTTTGTTTAAATGAGAAATAATTATCTTTTTTTGA
AAAAATAAAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4EO53JQ 742 0 0
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GGTGTTGCCGTCATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTT
CGTATCGAGGACGCGAAGAACGCTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGT
GGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAG
GACGCTGATGAACGTCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCA
CTTATTGCGCAGAACGCTTGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGT
GAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGA
GTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGGG
ATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGCT
GCTGCACCTGAGGGCCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTATCTCTTGT
CCCCCATCTATCTATCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTCA
ATGAGTAGCTTTGTTTAAATGAGAAATAATTATCTTTTTTTGAGTAAGGATCGTTCTGAT
TGCATAATAAAAGTTTTGTAT
T

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4FJ94JQ 717 0 0
G
GAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTAAAGTCGGAGC
AGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACGCTAC
CTTTGCTGCTGTCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTC
CACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGAGCTGA
TATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTGGGATTGA
AGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAACGCCAT
GACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTGACCAG
ATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTGACCACTCAGGCTATCGT
TGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGGCCTCATGGTGTA
ATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTATCTCCTGTCCCCCATCTATCTATCTGCGATGTTT
TTAAGTTATCTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTCAATGAGTAGCTTTGTTTAAATGAGAAA
TAATTATCTTTTTTTGAGTAAGGATCGTTCTGATTGCATAATAAAAGTTTTGTA
CT

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR4AK19TF 676 0 0
GTCATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAG
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ACTCTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGAT
GAACGTCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCG
CAGAACGCTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAG
CTAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGAT
CCGGCTAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCCGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTG
ACCACTCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGCTGCTGCACCT
GAGGGCCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTATCTCTTGTCCCCCATCT
ATCTATCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTCAATGAGTAGC
TTTGTTTAAATGAGAAATAATTATCTTTTTTTGAGTAAGGATCGTTCTGATTGCATAATA
AAAGTTTTGTAT
TATG

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DS 

RD RR4EA63JQ 548 0 0
GGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAACG
TCTTGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAA
CGCTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGG
GTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGC
TAAAGTGACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTGACCAC
TCAGGCTATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGG
CCTCATGGTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTGTCTCTTGTCCCCCATCTATCTA
TCTGCGATGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTCAATGAGTAGCTTTGT
TTAAATGAGAAATAATTATCTTTTTTTGAGTAAGGATCGTTCTGATTGCATAATAAAAGT
TTTGTAT
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4AK19JQ 604 0 0
GCTACCTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCAT
CTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTCTTGGA
GCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCACTTATTGCGCAGAACGCTGGG
ATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGTACAAC
GCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTAAAGTG
ACCAGATGTGCGCTTCAGAACGCCGCTTCGGTTGCAGGGATGGTGCTGACCACTCAGGCT
ATCGTTGTTGATAAGCCTAAACCTAAGGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGGCCTCATG
GTGTAATGAAGTTGCACATGTCACATGTGTATCTCTTGTCCCCCATCTATCTATTTGCGA
TGTTTTTAAGTTATTTTCTTCTCTTGGGGAAATGACTCAATGAGTAGCTTTGTTTAAATG
AGAAATAATTATCTTTTTTTGAGTAAGGATCGTTCTGATTGCATAATAAAAGTTTTGTAT
TATG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 11

CO CL272Contig1 756 11 11 U
GGACATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACA
CCAAGTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTC
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAAC
CTTTTATTGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATATTTCGATAAAC
ATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCT
AATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGT
GGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCT
TGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGAC
CCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAA
CTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAG
AGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTAATAA
ACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGTTT
ATGTATTATCCATAATATAGTTTTTAATCAACAAAA


BQ
25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H480TF U 1
AF RR4CF89TF U 1
AF RR4EC22TF U 1
AF RR4FQ72TF U 1
AF RR4FQ34JQ C 3
AF RR4FQ34TF U 3
AF RR4EC22JQ C 106
AF RR4H360JQ C 106
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AF RR4C778TF U 200
AF RR4H480JQB C 130
BS 1 13 RR4CF89TF
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RD RR4H480TF 622 0 0
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TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAAC
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GGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCT
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AGGGTAATTATCCGTTGTG
TGA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4CF89TF 704 0 0
GGACATCCCTCAAGACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACA
CCAAGTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTC
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAAC
CTTTTATTGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATATTTCGATGAAC
ATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCT
AATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGT
GGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCT
TGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGAC
CCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAA
CTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAG
AGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTAATAA
ACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTT*CTATTTTGTAACAAAAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4EC22TF 683 0 0
GGACATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACA
CCAAGTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTC
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAAC
CTTTTATTGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCGCATATTTCGATAAAC
ATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCT
AATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGT
GGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCT
TGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGAC
CCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAA
CTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAG
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ACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4FQ72TF 750 0 0
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CCAAGTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTC
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAAC
CTTTTATTGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATATTTCGATAAAC
ATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCT
AATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAATCTAGCGGTGGAAAAGGT
GGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCT
TGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGAC
CCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAA
CTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAG
AGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTAATAA
ACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAG*ATCGTTGGATGTTT
ATGTATTATCCATAATATAGTTTT
ATCATT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FQ34JQ 747 0 0
GG
ATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTT*GAGAGAGAGAATACAGACGACACCAA
GTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCA**TTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCT
TCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAACCTTT
TATTGTCTGTTCCACCTCTCTCTCTCT**TTCAAGAAACCACATATTTCGATAAACATGG
CTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATG
CAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAG
CCGTTTTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGA
TTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGAAAACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAG
CGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAACTCT
GATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGAGGG
TAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTAATAAACTA
ATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGTTTATGT
ATTATCCATAATATAGTTTTTAATC

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR4FQ34TF 754 0 0
GG
ATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACACCAA
GTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCA**TTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCT
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GATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGAGGG
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ATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTA*CAAAAAG*ATCGTTGGATGTTTATGT
ATTATCCATAATATAGTTTTTAATCAACAAAA

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DS 

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CATATTTCGATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTC
TCTCAAGAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCT
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TCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTG
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GCGATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAG
GATCGTTGGATGTTTATGTATTATCCATAATATAGTTTTTAATC

QA 1 644 1 644
DS 

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AACAAAAGTTTCAACCTTTTATTGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCA
CATATTTCGATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTC
TCTCAAGAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCT
AGCGGTGGAAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCG
AACCAGAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGT
TCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTG
ATTAATTCAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCT
TAAGATTAGGGGAAGAGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGT
GCGATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAG
GATCGTTGGATGTTTATGTATTATCCATAATATAGTTTTTAATC
AATT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4C778JQ 622 0 0
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TGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCT**TTCAAGAAACCACATATTTCGATAAACATGGCTC
GTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCAA
TCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAGCCG
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GAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGTTTATGTATT
ATCCATAATATAGTTTTTAATC

QA 1 622 1 622
DS 

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A
TCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATATTTCGATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAA
CGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGG
TTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGT
AGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAAC
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TCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTAG
TTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGAGGGTAATTATCCGTTGTGG
TGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCCTTCTT
GGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGTTTATGTATTATCCATAATATAG
TTTTTAATC

QA 2 550 2 550
DS 

RD RR4H480JQB 624 0 0
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TCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATATTTCGATAAACATGGCTCGT
TCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCAATC
TTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAGCCGTT
GTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCA
GACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAG
TTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAATTCAGAAAAACTCTGATTT
ATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGAGGGTAATT
ATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATTTGCTATGTGCGATTCTTTAATAAACTAATAGA
GAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGTTTATGTATTAT
CCATAATATAGTTTTTAATC
AATT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 2 11

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CTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGGTGAGTCTCGTCTTCCGTTCTATGTA
TTTCCGATGATCTTCTCTACCACCAATTATCGATCAGAAATTTATGTTCCTATATTTAAT
TCATGAAATATTGCTTAATTCGAATTCAAATTTACATTTTTGTTTGGAAACCCTAGATGG
GAATCTTCAATTTCGTTAGGAATAGCTAGTTTTTTAGGGTTTCGATTTCCATAAATCAGG
GAAGAACTTGTATTGAACCAGCTTATCTTGTTAGTGTTTGATTTTGTTTTGTTTTAAGAT
TCTTAGTCGTTGCTGGAACTTGATGTTCAGGTATCTGCTTTTGCTATGAGTCTTTTGGAG
TTAAGAGAGAGAGATGAGTTTTGCTTATCATATTCTAGACAGAACATTGAACTGAATCCG
ATTATAATATTATTTTGGCAGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAGGGAGGAAAGAACA
GGAAGAGAGGAAAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCTTATATTCAAGGAAGATG
GACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAGATGTGAATGTATGTGCA
TCGATGGCACTAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCACAAGAAGGTTTGGATTG
CAGCAGGTGACATCATACTTGTTGGTCTGAGAGACTACCAAGATGACAAAGCGGATGTCA
TCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCGTATGGTGAGCTTCCAGAGA
ATACTCGTCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGAAGATGAGGAAAATCTGGCCG
AAGACTATGTTGAGTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGATCTAAAGTGTTGTTTGGCATT
TCTTTACCGTTTCCGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCATGAATTCTGAGTTTAAGAAGA
AACTGGTGGTAAAACATTATATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD88TF U 1
AF RR4AD88JQ C 237
BS 1 726 RR4AD88TF
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BS 728 805 RR4AD88TF
BS 806 806 RR4AD88JQ
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RD RR4AD88TF 851 0 0
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CTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGGTGAGTCTCGTCTTCCGTTCTATGTA
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TCATGAAATATTGCTTAATTCGAATTCAAATTTACATTTTTGTTTGGAAACCCTAGATGG
GAATCTTCAATTTCGTTAGGAATAGCTAGTTTTTTAGGGTTTCGATTTCCATAAATCAGG
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ATACTCGTCT
A

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4AD88JQ 809 0 0
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AGATTCTTAGTCGTTGCTGGAACTTGATGTTCAGGTATCTGCTTTTGCTATGAGTCTTTT
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TCCGATTATAATATTATTTTGGCAGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAGGGAGGAAAG
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GATGGACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAGATGTGAATGTATG
TGCATCGATGGCACTAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCACAAGAAGGTTTGG
ATTGCAGCAGGTGACATCATACTTGTTGGTCTGAGAGACTACCAAGATGACAAAGCGGAT
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GAGAATACTCGTCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGAAGATGAGGAAAATCTG
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AAGAAACTGGTGGTAAAACATTATATGCG

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DS 



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GAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGC
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ACAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGACATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCA
AGATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGG
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AAGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTATGTTGAGTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGA
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CATTATTTTCTTGTCACATTCTGTTGTAGTGATGCTGGTTATAATTGGAAACTGAACAGA
AAAAGATGTAAGACC


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE60TF U 1
AF RR4B485TF U 90
AF RR4EU01TF U 2
AF RR4EK75JQ C 95
AF RR4EK75TF U 2
AF RR4AV19TF U 90
AF RR4GF68JQ C 89
AF RR4GF68TF U 1
AF RR4CE60JQ C 1
BS 1 1 RR4CE60JQ
BS 2 154 RR4CE60TF
BS 155 156 RR4B485TF
BS 157 188 RR4CE60TF
BS 189 189 RR4B485TF
BS 190 324 RR4CE60TF
BS 325 325 RR4B485TF
BS 326 343 RR4CE60TF
BS 344 383 RR4B485TF
BS 384 384 RR4GF68TF
BS 385 464 RR4B485TF
BS 465 523 RR4GF68TF
BS 524 524 RR4EK75TF
BS 525 638 RR4GF68TF
BS 639 639 RR4EK75TF
BS 640 712 RR4GF68TF
BS 713 735 RR4CE60JQ

RD RR4CE60TF 343 0 0
G
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TTATCTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGG
AAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAA**AAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCT
TATATTCGAGGAAGATGGACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAG
ATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACTAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCA
CAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCATGTGACATCATACTT*GTT

QA 2 343 2 343
DS 

RD RR4B485TF 382 0 0
CTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGA
AAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCTTATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATAC
GCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAGATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACT
AAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCACAAGAAGGTTTGGATTTGCAGCAGGTGA
CATCATACTTTGTTGGTCTGAGAGACTACCAAGATGACAAAGCGGATGTCATCCCTCAAG
TACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCGTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGT
CTTAACGAAGGAATT
TGTTGGT

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR4EU01TF 557 0 0
GGCAGCCGCACAGCACGAGAAGAAAACGTTGATCCAATTCCCAACAGGAATTTGCGAAT*
TTATCTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGG
AAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCT
TATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAG
ATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACTAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCA
CAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGACATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCAA
GATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGC
GTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGTCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGA
AGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTATGTTGAGTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGAT
CTAAAGTGTTGTTTGGC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4EK75JQ 558 0 0
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TGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCTTATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATACGCTCA
AGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAGATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACTAAACG
CCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCACAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGACATCA
TACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCAAGATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAGTACAT
GTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCGTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGTCTTAA
CGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGAAGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTATGTTGA
GTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGATCTAAAGTGTTGTTTGGCATTTCTTTACCGTTTC
CGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCATGAATTCTGAGTTTAAGAAGAAACTGGTGGTAAA
ACATTATATGTGTTTTG
C

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4EK75TF 651 0 0
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TTATCTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGG
AAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCT
TATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAG
ATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACTAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCA
CAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGACATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCAA
GATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGC
GTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGTCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGA
AGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTATGTTGAGTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGAT
CTAAAGTGTTGTTTGGCATTTCTTTACCGTTTCCGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCAT
GAATTCTGAGTTTAAGAAGAAACTGGTGGTAAAACATTATATGTGTTTTG
C

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4AV19TF 548 0 0
CTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGA
AAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCTTATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATAC
GCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAGATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACT
AAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCACAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGA
CATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCAAGATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAG
TACATGTCTTATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCGTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGT
CTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGAAGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTAT
GTTGAGTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGATCTAAAGTGTTGTTTGGCATTTCTTTACC
GTTTCCGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCATGAATTCTGAGTTTAAGAAGAAGCTGGTG
GTAAAACA

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4GF68JQ 625 0 0
TCTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGG
AAAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCTTATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATA
CGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAGATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCAC
TAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCACAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTG
ACATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCAAGATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAA
GTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCGTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCG
TCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGAAGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTA
TGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGATCTAAAGTGTTGTTTGGCATTTCTTTAC
CGTTTCCGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCATGAATTCTGAGTTTAAGAAGAAACTGGT
GGTAAAACATCATATGTGTTTTGTTCTTGTTGCATTATTTTCTTGTCACATTCTGTTGTA
GTGATGCTGGTTATAATTGGAAAC
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4GF68TF 713 0 0
G
GGCAGCCGCACAGCACGAGAAGAAAACGTTGATCCAATTCCCAACAGGAATTTGCGAATC
TTATCTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGG
AAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAATGAAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGCT
TATATTCAAGGAAGATGGACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAAG
ATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACTAAACGCCTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGCA
CAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGACATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCAA
GATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGC
GTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGTCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAGA
AGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTATGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGAT
CTAAAGTGTTGTTTGGCATTTCTTTACCGTTTCCGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCAT
GAATTCTGAGTTTAAGAAGAAACTGGTGGTAAAACATCATATGTGTTTTGTTCTTGTTGC
ATTATTTTCTTGTCACATTCTGTTGTAGTGATGCTGGTTATAATTGGAAAC
C

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR4CE60JQ 735 0 0
GGGCAGCCGCACAGCACGAGAAGAAAACGTTGATCCAATTCCCAACAGGAATTTGCGAAT
CTTATCTCAACCAAGCAGTTAATTGATCTCTTCTTAGTGTTACCATGCCGAAGAACAAGG
GAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAA**AAGCGGATGACGAGAAGCGAGAGC
TTATATTCGAGGAAGATGGACAAGAATACGCTCAAGTCCTTCGTATGCTTGGTAATGGAA
GATGTGAATGTATGTGCATCGATGGCACTAAACGCTTCTGCCATATCCGTGGTAAAATGC
ACAAGAAGGTTTGGATT*GCAGCAGGTGACATCATACTT*GTTGGTCTGAGAGACTACCA
AGATGACAAAGCGGATGTCATCC*TCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGG
CGTATGGTGAGCTTCCAGAGAATACTCGTCTTAACGAAGGAATTGTTGGTGATCTTGAAG
AAGATGAGGAAAATCTGGCCGAAGACTATGTTGAGTTTGAGGATGAGGATATCGATAGGA
TCTAAAGTGTTGTTTGGCATTTCTTTACCGTTTCCGTTTGTATTTTCAATTTGACACGCA
TGAATTCTGAGTTTAAGAAGAAACTGGTGGTAAAACATTATATGTGTTTTGTTCTTGTTG
CATTATTTTCTTGTCACATTCTGTTGTAGTGATGCTGGTTATAATTGGAAACTGAACAGA
AAAAGATGTAAGACC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 11

CO CL274Contig1 648 11 4 U
TTTTTTTTGGTAAAGGCTTTTTAATTCATTTGGCAACCATCACAAACTGTTGTTCTTTTA
CCAGACACTGAGAAAACACTAAAGACTGTTCTTGCAATTTCCAACAGATAGATAGATACT
AGAATACAAAA*GGCAAA*TGTCTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAA*GATTA
ATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCATCTTC
TTCTTCCTCTTCTTCATAAACTTCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATC
ATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGC
TTCACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAAT
ACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGG
ACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGA
CTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATAC
GAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 20 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 20 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4HA74TF C 23
AF RR4GZ92TF C 1
AF RR4DJ24JQ U 23
AF RR4GI78JQ U 174
AF RR4B613JQ U 41
AF RR4BT42JQ U 103
AF RR4B613TF C 41
AF RR4GI78TF C 23
AF RR4GZ92JQ U 23
AF RR4HA74JQB U 23
AF RR4DJ24TF C 23
BS 1 22 RR4GZ92TF
BS 23 482 RR4DJ24JQ
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BS 484 648 RR4DJ24JQ

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CTTTTGACAGACACACGGTC

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR4GZ92TF 648 0 0
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AGAATACAAAA*GGCAAA*TGTCTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAA*GATTA
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TTCTTCCTCTTCTTCATAAACTTCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATC
ATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGC
TTCACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAAT
ACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGG
ACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGA
CTTCCTTTTCCCCATTGCCGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATAC
GAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4DJ24JQ 626 0 0
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AGACTGTTCTTGCAATTTCCAACAGATAGATAGATACTAGAATACAAAA*GGCAAA*TGT
CTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAA*GATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTC
CTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCATAAACT
TCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTC
TCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTT
GTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTA
ATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACGACTAAAGACAGTGTCAAGC
TTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTA
ACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATACGAAACCCTAAGATAGTGCGACG
AAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4GI78JQ 442 0 0
AAA
ATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCAT
CTTCTTCTTCCTCTTCTTCATAAACTTCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAA
CATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTA
TAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTG
CAATACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGA
AAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCC
TTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAA
ATACGAAACCCTAAGAT
CC

QA 4 440 4 440
DS 

RD RR4B613JQ 598 0 0
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ACCAGACACTGAGAAAACACTAGAGACTGTTCTTGCAATTTTCTTCAGATAGATAGATAC
TAGAATACAAAA*GGCAAA*TGTCTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTCGATAAAA*GATT
AATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCATCATCTT
CTTCTTCCTCTTCTCCATAAACTTCTTCTTCTTCAGCTTCAGCTTCTTCTTGCTCAACAT
CATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCACACTCGTCAATCCATTCGCTATAGATGTCTATAG
CTTCACTCAAAGCTGTGATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAA
TACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAG
GACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTG
ACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATA
CGAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTT
CC

QA 20 596 20 596
DS 

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TTT*CGATAAAA*GATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTC
ATCTTCCTCATCATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCATAAACTTCTTCTTCTTCAGCTTCAGC
TTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTCAACCCTCTCACACTCGTCAATCCATTC
GCTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTGATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACA
GATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGA
GCCGTGATTGCAGAAAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGT
AGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCT
CGAGGAAGAGCGAAATACGAAACCCT
CC

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DS 

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TTCATTTGGCAACCATCAC
ACCAGACACTGAGAAAACACTAGAGACTGTTCTTGCAATTTTCTTCAGATAGATAGATAC
TAGAATACAAAA*GGCAAA*TGTCTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTCGATAAAA*GATT
AATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCATCATCTT
CTTCTTCCTCTTCTCCATAAACTTCTTCTTCTTCAGCTTCAGCTTCTTCTTGCTCAACAT
CATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCACACTCGTCAATCCATTCGCTATAGATGTCTATAG
CTTCACTCAAAGCTGTGATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAA
TACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAG
GACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTG
ACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATA
CGAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTT
CC

QA 20 596 20 596
DS 

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TCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTC
TCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTT
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CC

QA 1 591 1 591
DS 

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CTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCATAAACT
TCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTC
TCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTT
GTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTA
ATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGC
TTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCCGTA
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CTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCATAAACT
TCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTC
TCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTT
GTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTA
ATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGC
TTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTA
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AAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4DJ24TF 626 0 0
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CTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAA*GATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTC
CTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCATAAACT
TCTTCTTCTTCAGCTT***CCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTC
TCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTT
GTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTA
ATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACGACTAAAGACAGTGTCAAGC
TTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTA
ACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATACGAAACCCTAAGATAGTGCGACG
AAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 2 11

CO CL275Contig1 945 5 14 U
ATATTTATTTTCGTGGCCACAGAAACACAAAACTAATCAGTAGAATCCCCACGACGACGA
CGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTT
CATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGAC
CGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAG
CAAAGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTT
TCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTGGTCCTCGAAGATGTCAG*GCCGTTCCTCATC
TCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTC
CAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGG
GTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAA
GTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATC
AAGAACTACGGAGGAAGTGTAGAAGTTTTATCAGTTGAAGG*GAAGACTGTGTTGTGAAG
TATGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAG
GACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAAAAA**ACACAA
AGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATGTCCACATCACTAGTAGTCTCCTA
GAGCTATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGAGTGAAGGCAAAGAAGCAAGTTGTTCTCCA
AGTCACCAATTTCTTCACCAGAAAATAAAAAGAACACTGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS16TF U 33
AF RR4DY74TF U 12
AF RR4BI64TF U 1
AF RR4FS16JQ C 680
AF RR4BI64JQ C 127
BS 1 346 RR4BI64TF
BS 347 347 RR4DY74TF
BS 348 615 RR4BI64TF
BS 616 616 RR4DY74TF
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BS 641 641 RR4DY74TF
BS 642 720 RR4BI64TF
BS 721 721 RR4BI64JQ
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BS 745 745 RR4BI64JQ
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BS 776 833 RR4BI64TF
BS 834 945 RR4BI64JQ

RD RR4FS16TF 401 0 0
GG
AATCAATAGAATCCCCACGACGACCACGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCCGG
AGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTC
GAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTGGC
GATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAAGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACC
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CGAAGATGTCAG*GCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTTG
AAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTA

QA 3 401 3 401
DS 

RD RR4DY74TF 712 0 0
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TCTCTCGCGACTTCCATTGCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCA
AAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAA
GCTGGGATCTTTCCCCGATTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAAGTCTTCA
CCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACT
CCTCAAAATGTCGACTTGGTCCTCGAAGATGTCAG*GCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGG
GAACGTCGACGTTGTCTCCGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATG
TACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGA
GAAGTTTGGAGATGCGTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATAT
AACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAG**CTACGG
AGGAAGTGTGGAAGTTTTATCAGTTGAAGG*GAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACC
TGAATCAAT*GGAATGGGAATTAAAGCAGCGAT
AAAGAAAGTCAGACATATC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4BI64TF 839 0 0
ATATTTATTTTCGTGGCCACAGAAACACAAAACTAATCAGTAGAATCCCCACGACGACGA
CGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTT
CATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGAC
CGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAG
CAAAGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTT
TCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTGGTCCTCGAAGATGTCAGAGCCGTTCCTCATC
TCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTC
CAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGG
GTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAA
GTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATC
AAGAACTACGGAGGAGGTGTAGAAGTTTTATCAGTTGAAGC*GAAGACTGTGTTGTGAAG
TATGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAG
*ACATATCTAATGTTACCTTTACA*GCTAGAAACTGTATATGTAAAAAAAAA***CACAA
AGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATGTCCACATCACTAGTAG
TCTCCT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4FS16JQ 154 0 0
TTGGAATGGGAATTAAAGCAGGGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATATTTAATGTTACCT
TTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAAAAAAAACACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGC
TTATTTCATTTTGTAAT
GTCCACATCACTAGTAG

QA 1 137 1 137
DS 

RD RR4BI64JQ 819 0 0
CTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCT
CTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAAGT
CTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATT
TGACTCCTCAAAATGTCGACTTGGTCCTCGAAGATGTCAG*GCCGTTCCTCATCTCCGAC
GGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGA
GCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTC
AAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAG
CATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAAC
TACGGAGGAAGTGTAGAAGTTTTATCAGTTGAAGGCGAAGACTGTGTTGTGAAGTATGTT
GGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATA
TCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAAAAA**ACACAAAGTTGC
TCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATGTCCACATCACTAGTAGTCTCCTAGAGCTA
TCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGAGTGAAGGCAAAGAAGCAAGTTGTTCTCCAAGTCAC
CAATTTCTTCACCAGAAAATAAAAAGAACACTGTTTTAC

QA 1 819 1 819
DS 



CO CL275Contig2 843 6 17 U
GGAATCAGTAGAATCCCCACGACGACGACGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCC
GGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAAC
TCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTG
GCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAGGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCA
CCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTGGTC
CTCGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTT
GAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCA
ACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAA
GATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCT
CATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGAGGAAGTGTGGAAGTTTTATCA
GTTGAAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATT
AAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAA
CTGTATATGTAAAAAAACACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATCT
CTTAGAGCTATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAAGTTGTTC
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 

AF RR4GX57TF U 57
AF RR4G037TF U 1
AF RR4H364TF U 57
AF RR4GX57JQ C 305
AF RR4H364JQ C 114
AF RR4DY74JQ C 76
BS 1 142 RR4G037TF
BS 143 143 RR4GX57TF
BS 144 211 RR4G037TF
BS 212 212 RR4GX57TF
BS 213 517 RR4G037TF
BS 518 518 RR4GX57TF
BS 519 581 RR4G037TF
BS 582 582 RR4H364TF
BS 583 719 RR4G037TF
BS 720 720 RR4H364TF
BS 721 736 RR4G037TF
BS 737 737 RR4DY74JQ
BS 738 775 RR4G037TF
BS 776 776 RR4H364TF
BS 777 777 RR4DY74JQ
BS 778 806 RR4H364TF
BS 807 843 RR4DY74JQ

RD RR4GX57TF 613 0 0
G
GCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCA
AACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGA
TTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAGGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCG
TCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTG
GTCCTCGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCC
GTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCT
TCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTG
AAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAAT
GCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGAGG*AGTGTGGAAGTTTTA
TCAGTTGAAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGA
ATTAAAGCAGCG

QA 2 613 2 613
DS 

RD RR4G037TF 775 0 0
GGAATCAGTAGAATCCCCACGACGACGACGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCC
GGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAAC
TCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGTTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTG
GCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAAGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCA
CCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTGGTC
CTCGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTT
GAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCA
ACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAA
GATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATACAACCGTGGAGGCAGTGAATGCT
CATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGAGGTAGTGTGGAAGTTTTATCA
GTTGAAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATT
AAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAA*
CTGTATATGTAAAAAA*CACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4H364TF 750 0 0
G
GCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCA
AACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGA
TTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAGGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCG
TCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTG
GTCCTCGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCC
GTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCT
TCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTG
AAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAAT
GCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGAGGAAGTGTGGAAGTTTTA
TCAGTTGAAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGA
ATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAG
AAACTGTATATGTAAAAAA*CACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTA*
TCTCTTAGAGCTATCTTGCAAAGTTGATC

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR4GX57JQ 539 0 0
AAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTTGAAG
ACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAA
CCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAAGATA
TTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATC
TTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGAGGAAGTGTGGAAGTTTTATCAGTTG
AAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAG
CAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGT
ATATGTAAAAAAACACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATCTCTTA
GAGCTATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAAGTTGTT
CTCC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4H364JQ 730 0 0
TCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCCTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCC
CCGATTGGCGATACATGCTTCGAGCCAAGAGGAAGCAAGGTCTTCACCTTTCGCATCCGT
TGCGTCACCACCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGA
CTTGGTCCTCGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGT
CTCCGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAG
TTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGC
GTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGT
GAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGAGGAAGTGTGGAAGT
TTTATCAGTTGAAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAAT
GGGAATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAG
CTAGAAACTGTATATGTAAAAAAACACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTT
GTAATCTCTTAGAGCTATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAA
GTTGTT
CTCC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4DY74JQ 768 0 0
AAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTC
CTTTTCGCTAGACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATTGGCGATACATGCTTCG
AGCCAAGAGGAAGCAAAGTCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCACCGGGTCTATAC
TCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAATGTCGACTTGGTCCTCGAAGATGTCAGG
CCGTTCCTCATCTCCGACGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCCGTTGAAGACGGCGTCGTT
TCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATG
GGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCGTTGAAAGATATTCGACAAGTT
TTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTG
AGACCAGCGATCAAG**CTACGGAGGAAGTGTGGAAGTTTTATCAGTTGAAGGGGAAGAC
TGTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCAATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAA
GAAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAA
AACACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATCTCTTAGAGCTATCTTG
CAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAAGTTGTTCTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 12

CO CL276Contig1 1012 12 11 U
GGAAAAGGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCT
ATCTTCACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGC
TCCGATCTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACC
CGGTCCGGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATT
TTCATCAACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAG
ACCTCTTTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTC
GCCTTCCTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTC
GTGAACCGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTG
TTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCG
GTCGATTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTG
TTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAAC
AATTTAAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCA
TTGATCGAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTT
ACCGGTTCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAAT
TAGATTAACAGGGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTAAACCGGTTTTCCTTTGGTTTGTT
TCTTTGTCTTGTTTTGATAGCTTCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAA
TGCCCAAGTTGTCGGTTTCCAAATTTCAAAGAATAATACAACATTCTACCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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70 70 70 70 70 70 65 65 65 35 50 50 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4BK61TF U 1
AF RR4EO23TF U 5
AF RR4FY64TF U 7
AF RR4BD84TF U 4
AF RR4A558TF U 3
AF RR4AN66TF U 9
AF RR4BD61TF U 4
AF RR4A558JQ C 192
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AF RR4EO23JQ C 307
AF RR4AN66JQ C 267
AF RR4BK61JQ C 263
BS 1 439 RR4BK61TF
BS 440 440 RR4EO23TF
BS 441 703 RR4BK61TF
BS 704 706 RR4A558TF
BS 707 734 RR4BK61TF
BS 735 735 RR4A558TF
BS 736 748 RR4BK61TF
BS 749 749 RR4A558TF
BS 750 777 RR4BK61TF
BS 778 838 RR4A558TF
BS 839 1012 RR4A558JQ

RD RR4BK61TF 777 0 0
GGAAAAGGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCT
ATCTTCACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGC
TCCGATCTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACC
CGGTCCGGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATT
TTCATCAACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAG
ACCTCTTTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTC
GCCTTCCTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTC
GTGAACCGAACCAGCAACGTTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTG
TTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCG
GTCGATTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTG
TTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAAC
AATTTAAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAG**AACCGAACCGACCA
TTGATCGAGGAGAA*TTCGACCTCTCTA*TGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4EO23TF 766 0 0
GA
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAATGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACCCGGTCC
GGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATC
AACCCAATCGCCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACC*TGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAG**AACCGAACCGACCATTGATC
GAGAGAAA*TTCGACCTCTCTA*TGTGCTGCTCGAGA
GATGTAC

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR4FY64TF 726 0 0
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACCCGGTCC
GGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATC
AACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAG*AACCGA*CCGACCATTGATC
GAGGAG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4BD84TF 723 0 0
GGG
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACCCGGCCC
GGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATC
AACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATC

QA 4 723 4 723
DS 

RD RR4A558TF 842 0 0
GGGA
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACCCGGTCC
GGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATC
AACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATC
GAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGT
TCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGA
TTAGAT

QA 5 836 5 836
DS 

RD RR4AN66TF 786 0 0
GAGAACAAATATGACAATGCAAACACTCTGCGTCACCACTCTCTTCATAGCTATCTTCAC
CCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGATCT
CTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTCTGGTCACGACACCGACGGCACGACCCGGTCCGG
TTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATCAA
CCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTT
CACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCT
CGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACCG
AACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGA
CAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATTC
GGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGA
CTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTAAA
AGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGTATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATCGA
G*AGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGA*GATGTACGCCGGTTTTACCGGGTC
AATGGG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4BD61TF 829 0 0
GGG
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACCGACGGCACGACCCGGCCC
GGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATC
AACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATC
GAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCCGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGT
TCATTGGGCCTTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTT

QA 4 829 4 829
DS 

RD RR4A558JQ 821 0 0
TCTCTCATTGACCAAAGACAAAACTCCTTTCTCTCACGGTCGAGCTATTTTCATCAACCC
AATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTTCAC
TTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGT
CGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACCGAAC
CAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAA
GTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATTCGGT
GAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTT
GAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTAAAAGT
AATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATCGAGGA
GAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAAT
GGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATTAACAG
GGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTAAACCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTGTCTTG
TTTTGATAGCTTCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCAAGTTG
TCGGTTTCCAAATTTCAAAGAATAATACAACATTCTACCAT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4FY64JQ 641 0 0
TCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACCGAA
CCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACA
AGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATTCGG
TGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACT
TGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTAAAAG
TAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATCGAGG
AGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAA
TGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATTAACA
GGGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTAAACCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTGTCTT
GTTTTGATAGCTTCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCAAGTT
GTCGGTTTCCAAATTTCAAAGAATAATACAACATTCTACC
T

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4EO23JQ 671 0 0
TTCACTTTCTCCATCACTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACC*TGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATC
GAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGT
TCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATT
AACAGGGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTAAACCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTG
TCTTGTTTTGATGGCTTCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCA
AGTTGTCGGTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4AN66JQ 714 0 0
TCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTTCACTTTCTCCATCACTCC
TCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAAGTAACCA
ACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGTCATCC
CAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACAT
CAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATTCGGTGAAGTCGGTTAAATC
CGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGG
AGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTAAAAGTAATCTCGGTTACCAT
CGGTCTCGCGTATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATCGAGGAGAAATTCGACCTCTC
TAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAATGGGCCGTGGTGTTGA
GCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATTAACAGGGTTCATTCGATGTG
AGATCGGTTTAAACCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGCTTCTG
TTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATTCCCAAGTTGTCGGTT
TCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BK61JQ 714 0 0
AACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTTCACTTTCTCCATCA
CTCCTCACCAAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAAGTA
ACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGTTC
ATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAAG
ACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATTCGGTGAAGTCGGTTA
AATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGCA
GTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTAAAAGTAATCTCGGTTA
CCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGACCATTGATCGAGGAGAAATTCGACC
TCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAATGGGCCGTGGTG
TTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATTAACAGGGTTCATTCGA
TGTGAGATCGGTTTAAACCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGCT
TCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCAAGTTGTCGGT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 10

CO CL277Contig1 873 2 8 U
GTGAGGAGACGACTGAACCGTCTATATGCTTGAGCACAGAGATGGAGTCAAATGAGTGCT
TAGATAACAATGGCGGTTGTTGGCAAGATAAATCAGCCAACATAACTGCTTGCCAGGATA
CTTTCCGGGGAAGAGTATGTGAGTGTCCTCTAGTTGATGGTGTAGAATTCAAAGGGGATG
GATACAGCCACTGTGAACCAAGCGGGCCAGGAAGATGCACGATCAACAATGGAGGTTGTT
GGCATGAAGAGAGAGATGGACATACCTTCTCTGCTTGTGTGGACAAGGACAGTGTTAAGT
GCGAGTGTCCTCCAGGATTCAAAGGAGACGGTGTTAAGAAGTGTGAAGACATTAATGAGT
GCAAGGAGAAGAAAGCTTGTCAGTGTCCTGAATGTAGCTGCAAGAATACCTGGGGAAGCT
ATGAGTGCTCTTGTAGCGGTGACCTTCTCTACATCAGAGATCATGACACTTGCATCAGCA
AGACTGGTTCACAAGTGAAGTCAGCGTGGACGGCCGTTTGGCTTATAATGTTATCATTGG
GACTTGCAGCTGGTGGGGCGTACCTCGTCTACAAACATAGGTTAAGGCAATACATGGACT
CAGAGATAAGAGCCATAATGGCACAGTACATGCCACTGGAGAGCCAACCCGAGGTCCCAA
ACCACGTGAATGATGAACGCGCCTGAGAGAGTGGAATGCTCCCCATCTATTTATTCCTCG
TTGTGGCCACTTGTTGCCTTTGTATCTTCTCTGTAACTCTACCAAATAGTGTATTTACTG
AAACAGTTTGGAGATTTTCAGTGGTTTTATACTTTTGTACGCATACTCTCGTGTGTACTA
TTTTCACTTGTGTCATGGGACTTGCGTAATAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CCTTCTCTACATCAGAGATCATGACACTTGCATCAGCAAGACTGGTTCACAAGTGAAGTC
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TGCGTAATAGA

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DS 



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AACTAGACAAGTGTATGGGAGACCCTAATGCTGATTCGGACAATCCAGTTCTAAAGGAAG
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AAGGGGATGGATACAGCCACTGTGAACCAAGCGGGCCAGGGAGATGCACGATCAACAATG
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TATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGGGGCGTACCTCGTTTACAAATATAGATTAAGGCAAT
ACATGGACTCGGAGATCAGAGCAATAATGGCACAGTACATGCCATTGGACAGCCAACCCG
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TTCCTCGTTAA*GGGCTCAAGTGACATGGTCTTTTAACCGTTTTGGCCCTTGATGCCTCT
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TCAAATGGCTTATACTTTTTTACTCGTATGTCTTTTACTTATGTCCATGCGACTTATGTA
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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AACTAGATAAGTGTATGGGAGACCCTAATGCTGATTCGGATAATCCAGTTCTGAAGGAAG
AACAAGATGCACAGGTTGGCAAGGGTTCAAGGGGTGATGTTACTATATTACCTACATTGG
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ACGAGTGCTTAGATAACAATGGTGGATGTTGGCAAGATAAATCAGCCAACATAACTGCTT
GCAAGGATACCTTTCGTGGAAGAGTATGCGAGTGTCCTCGAGTTGATGGTGTGCAATTCA
AAGGGGATGGATACAGCCACTGTGAACCAAGCGGGCCAGGGAGATGCACG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4AH25TF 746 0 0
GCTCCTGATCCGGAGCAGGACTTTAGCTCCGGGTACGATGGTAAAGACGTGGTTGTTGAG
AATTTGAGGCAGCTTTGTGTTTTCAAGGTGGCGAATGAGACGGGTAAGCCGTGGGTGTGG
TGGGATTACGTGACTGATTTTCAGATTAGGTGCCCCATGAAGG*GAAGAAGTACAATAAA
GAGTGTGCTGACTCTGTTATCAAATCTCTTGGAATTGATAGTAGGAAACTTGACAAGTGT
ATGGGAGACCCTAATGCTGATTCGGACAATCCAGTTCTAAAGGAAGAACAAGATGCACAG
GTTGGCAAGGGTTCAAGGGGTGATGTTACCATATTGCCTACATTGGTTGTCAACAACAGA
CAGTACCGAGGAAAGTTGGAGAAGGGTGCAGTACTCAAGGCTCTGTGTTCTGGTTTTGAG
GAGACGACCGAACCAGCTATATGCCTTAGCACAGAGATGGAGTCAAACGAGTGCTTAGAC
AACAATGGTGGATGTTGGCAAGATAAATCAGCCAACATTACTGCTTGCAAGGATACCTTC
CGTGGAAGAGTATGTGAGTGTCCTCGAGTTGATGGTGTGCAATTCAAAGGGGATGGATAC
AGCCACTGTGAACCAAGCGGGCCAGGGAGATGCACGATCAACAATGGTGGATGTTGGCAT
GAAGAGAGAGATGGACATGCGTTCTCTGCTTGTGTGGACAAAGACAGTGTTAAGTGCGAG
TGTCCTCCAGGATTCAAAGGAGACGG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4BA93TF 698 0 0
G
GCTATATGCCTTAGCACAGAGATGGAGTCAAACGAGTGCTTAGACAACAACGGTGGATGT
TGGCAAGATAAATCAGCCAACATTACTGCTTGCAAGGATACCTTCCGTGGAAGACTATGT
GAGTGTCCTCGAGTTGATGGTGTGCAATTCAAAGGGGATGGATACAGCCACTGTGAACCA
AGCGGGCCAGGGAGATGCACGATCAACAATGGTGGATGTTGGCATGAAGAGAGAGATGGA
CATGCGTTCTCTGCTTGTGTGGACAAGGACAGTGTTAAGTGCGAGTGTCCTCCAGGATTC
AAAGGAGACGGTTTTAAGAAGTGTGAAGACATCAATGAGTGCAAAGAGAAGAAAGCCTGT
CAGTGCCCGGAATGTAGCTGCAAGAATACTTGGGGAAGCTATGAATGCTCTTGTAGCGGG
GACCTTCTCTACATGAGAGACCATGACACTTGCATCAGCAAGACGGGTTCACAAGTGAGA
TCAGCGTGGGCGGCCGTTTGGCTTATAATGTTATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGGGGCG
TACCTCGTTTACAAATATAGATTAAGGCAATACATGGACTCGGAGATCAGAGCAATAATG
GCACAGTACATGCCATTGGACAGCCAACCCGAGGTTCCAAACCACGTGAATGATGAACGT
GCCTGAGTAAGCGGAATGATCCATCTATTTATTCCTC

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4BG59TF 858 0 0
G
GCTATATGCCTTAGCACAGAGATGGAGTCAAACGAGTGCTTAGACAACAACGGTGGATGT
TGGCAAGATAAATCAGCCAACATTACTGCTTGCAAGGATACCTTCCGTGGAAGACTATGT
GAGTGTCCTCGAGTTGATGGTGTGCAATTCAAAGGGGATGGATACAGCCACTGTGAACCA
AGCGGGCCAGGGAGATGCACGATCAACAATGGTGGATGTTGGCATGAAGAGAGAGATGGA
CATGCGTTCTCTGCTTGTGTGGACAAGGACAGTGTTAAGTGCGAGTGTCCTCCAGGATTC
AAAGGAGACGGTTTTAAGAAGTGTGAAGACATCAATGAGTGCAAAGAGAAGAAAGCCTGT
CAGTGCCCGGAATGTAGCTGCAAGAATACTTGGGGAAGCTATGAATGCTCTTGTAGCGGG
GACCTTCTCTACATGAGAGACCATGACACTTGCATCAGCAAGACGGGTTCACAAGTGAGA
TCAGCGTGGGCGGCCGTTTGGCTTATAATGTTATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGGGGCG
TACCTCGTTTACAAATATAGATTAAGGCAATACATGGACTCGGAGATCAGAGCAATAATG
GCACAGTACATGCCATTGGACAGCCAACCCGAGGTTCCAAACCACGTGAATGATGAACGT
GCCTGAGTAAGCGGAATGATCCATCTATTTATTCCTCGTTAAAGGGCTCAAGTGACATGG
TCTTTTAACCGTTTTGGCCCTTGATGCCTCTGTATCTCTGTAACTCCTTTACCAAATAGT
GTGTTTGCAGAAACTTGACGG*TCTTT*ACTTCAAATGGCTTATACTTTTTTACTCGTAT
GTCTTTTACTTATGTCC

QA 2 858 2 858
DS 

RD RR4AH25JQ 750 0 0
CATTACTGCTTGCAAGGATACCTTCCGTGGAAGAGTATGTGAGTGTCCTCGAGTTGATGG
TGTGCAATTCAAAGGGGATGGATACAGCCACTGTGAACCAAGCGGGCCAGGGAGATGCAC
GATCAACAATGGTGGATGTTGGCATGAAGAGAGAGATGGACATGCGTTCTCTGCTTGTGT
GGACAAGGACAGTGTTAAGTGCGAGTGTCCTCCAGGATTCAAAGGAGACGGTTTTAAGAA
GTGTGAAGACATCAATGAGTGCAAAGAGAAGAAAGCCTGTCAGTGCCCGGAATGTAGCTG
CAAGAATACTTGGGGAAGCTATGAATGCTCTTGTAGCGGGGACCTTCTCTACATGAGAGA
CCATGACACTTGCATCAGCAAGACGGGTTCACAAGTGAGATCAGCGTGGGCGGCCGTTTG
GCTTATAATGTTATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGGGGCGTACCTCGTTTACAAATATAG
ATTAAGGCAATACATGGACTCGGAGATCAGAGCAATAATGGCACAGTACATGCCATTGGA
CAGCCAACCCGAGGTTCCAAACCACGTGAATGATGAACGTGCCTGAGTAAGCGGAATGAT
CCATCTATTTATTCCTCGTTAA*GGGCTCAAGTGACATGGTCTTTTAACCGTTTTGGCCC
TTGATGCCTCTGTATCTCTGTAACTCCTTTACCAAATAGTGTGTTTGCAGAAACTTGACG
GGTCTTTTACTTCAAATGGCTTATACTTT
C

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4BA93JQ 808 0 0
ATGTGAGTGTCCTCGAGTTGATGGTGTGCAATTCAAAGGGGATGGATACAGCCACTGTGA
ACCAAGCGGGCCAGGGAGATGCACGATCAACAATGGTGGATGTTGGCATGAAGAGAGAGA
TGGACATGCGTTCTCTGCTTGTGTGGACAAGGACAGTGTTAAGTGCGAGTGTCCTCCAGG
ATTCAAAGGAGACGGTTTTAAGAAGTGTGAAGACATCAATGAGTGCAAAGAGAAGAAAGC
CTGTCAGTGCCCGGAATGTAGCTGCAAGAATACTTGGGGAAGCTATGAATGCTCTTGTAG
CGGGGACCTTCTCTACATGAGAGACCATGACACTTGCATCAGCAAGACGGGTTCACAAGT
GAGATCAGCGTGGGCGGCCGTTTGGCTTATAATGTTATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGG
GGCGTACCTCGTTTACAAATATAGATTAAGGCAATACATGGACTCGGAGATCAGAGCAAT
AATGGCACAGTACATGCCATTGGACAGCCAACCCGAGGTTCCAAACCACGTGAATGATGA
ACGTGCCTGAGTAAGCGGAATGATCCATCTATTTATTCCTCGTTAA*GGGCTCAAGTGAC
ATGGTCTTTTAACCGTTTTGGCCCTTGATGCCTCTGTATCTCTGTAACTCCTTTACCAAA
TAGTGTGTTTGCAGAAACTTGACGGGTCTTTTACTTCAAATGGCTTATACTTTTTTACTC
GTATGTCTTTTACTTATGTCCATGCGACTTATGTAATAGGGAAACTTGATTTAGCTTTGG
AGAATTAGAAAAGAAAGATGATAGAATC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4BG59JQ 806 0 0
GTGAGTGTCCTCGAGTTGATGGTGTGCAATTCAAAGGGGATGGATACAGCCACTGTGAAC
CAAGCGGGCCAGGGAGATGCACGATCAACAATGGTGGATGTTGGCATGAAGAGAGAGATG
GACATGCGTTCTCTGCTTGTGTGGACAAGGACAGTGTTAAGTGCGAGTGTCCTCCAGGAT
TCAAAGGAGACGGTTTTAAGAAGTGTGAAGACATCAATGAGTGCAAAGAGAAGAAAGCCT
GTCAGTGCCCGGAATGTAGCTGCAAGAATACTTGGGGAAGCTATGAATGCTCTTGTAGCG
GGGACCTTCTCTACATGAGAGACCATGACACTTGCATCAGCAAGACGGGTTCACAAGTGA
GATCAGCGTGGGCGGCCGTTTGGCTTATAATGTTATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGGGG
CGTACCTCGTTTACAAATATAGATTAAGGCAATACATGGACTCGGAGATCAGAGCAATAA
TGGCACAGTACATGCCATTGGACAGCCAACCCGAGGTTCCAAACCACGTGAATGATGAAC
GTGCCTGAGTAAGCGGAATGATCCATCTATTTATTCCTCGTTAA*GGGCTCAAGTGACAT
GGTCTTTTAACCGTTTTGGCCCTTGATGCCTCTGTATCTCTGTAACTCCTTTACCAAATA
GTGTGTTTGCAGAAACTTGACGGGTCTTTTACTTCAAATGGCTTATACTTTTTTACTCGT
ATGTCTTTTACTTATGTCCATGCGACTTATGTAATAGGGAAACTTGATTTAGCTTTGGAG
AATTAGAAAAGAAAGATGATAGAATC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4F283JQ 603 0 0
GTGAAGACATCAATGAGTGCAAAGAGAAGAAAGCCTGTCAGTGCCCGGAATGTAGCTGCA
AGAATACTTGGGGAAGCTATGAATGCTCTTGTAGCGGGGACCTTCTCTACATGAGAGACC
ATGACACTTGCATCAGCAAGACGGGTTCACAAGTGAGATCAGCGTGGGCGGCCGTTTGGC
TTATAATGTTATCTTTGGGACTTGCAGCTGGTGGGGCGTACCTCGTTTACAAATATAGAT
TAAGGCAATACATGGACTCGGAGATCAGAGCAATAATGGCACAGTACATGCCATTGGACA
GCCAACCCGAGGTTCCGAACCACGTGAATGATGAACGTGCCTGAGTAAGCGGAATGATCC
ATCTATTTATTCCTCGTTAA*GGGCTCAAGTGACATGGTCTTTTAACCGTTTTGGCCCTT
GATGCCTCTGTATCTCTGTAACTCCTTTACCAAATAGTGTGTTTGCTGAAACTTGACGGG
TCTTTTACTTCAAATGGCTTATACTTTTTTACTCGTATGTCTTTTACTTATGTCCATGCG
ACTTATGTAATAGGGAAACTTGATTTAGCTTTGGAGAATTAGAAAAGAAAGATGATAGAA
TCT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 2 12

CO CL278Contig1 711 2 7 U
AAAGTGACCAAGCCAACCGACCAACCGTCATCTTAGCTTTTTAACTAACCACCCCCACTT
TTTACTTTGTTAATCCTTTGTGCTCTCTCTCTAGTTCGCTCGTTGCCCAATGGAGTCTTC
TGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTAGGATCCGCCGCCATAAATGTTCACTCGCT
TTCTGGTAATTCTTGTGCGCCACGGTGGAGTTTGTTCAACAGGAACACCAGGCACTCGCT
AGTTGTGTTGCGTGCAGAGTCCTCTAAATCTTCCACAACAACAACCAAAACTGACAATTC
ATCTGATGCTAGTGTTGTGTCAAATGTTCGAAGGACAACTTTCCCCAAGGAAGTGGAGGC
ACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGA
TTTCGAGATGAACTTAAAGCGGAAGATTGGACAGACCGCAACTCCCATTCCTGTGCCTGA
TATTTCTCCATCAATAGCTCCTCCCATTCCTACTGAACCCATGAACAAATCAGTTTCTGC
TGCTGCTGCTACCCCATCCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAA
TGCTGCTTACCGAAAATCATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAACAACTA
TGTTCTAGTCACCTCTCCCTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4BV52TF U 1
AF RR4GX04TF U 37
BS 1 511 RR4BV52TF
BS 512 512 RR4GX04TF
BS 513 615 RR4BV52TF
BS 616 616 RR4GX04TF
BS 617 672 RR4BV52TF
BS 673 673 RR4GX04TF
BS 674 711 RR4BV52TF

RD RR4BV52TF 711 0 0
AAAGTGACCAAGCCAACCGACCAACCGTCATCTTAGCTTTTTAACTAACCACCCCCACTT
TTTACTTTGTTAATCCTTTGTGCTCTCTCTCTAGTTCGCTCGTTGCCCAATGGAGTCTTC
TGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTAGGATCCGCCGCCATAAATGTTCACTCGCT
TTCTGGTAATTCTTGTGCGCCACGGTGGAGTTTGTTCAACAGGAACACCAGGCACTCGCT
AGTTGTGTTGCGTGCAGAGTCCTCTAAATCTTCCACAACAACAACCAAAACTGACAATTC
ATCTGATGCTAGTGTTGTGTCAAATGTTCGAAGGACAACTTTCCCCAAGGAAGTGGAGGC
ACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGA
TTTCGAGATGAACTTAAAGCGGAAGATTGGACAGACCGCAACTCCCATTCCTGTGCCTGA
TATTTCTCCATCAATAGCTCCTCCCATTCCTTCTGAACCCATGAACAAATCAGTTTCTGC
TGCTGCTGCTACCCCATCCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAA
TGCTGCTTACCGAAA*TCATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAACAACTA
TGTTCTAGTCAC*TCTCCCTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4GX04TF 680 0 0
T
TTTTTAACTAACCACCCCCACTTTTTACTTTGTTAATCCTTTGTGCTCTCTCTCTAGTTC
GCTCGTTGCCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTAGGATCC
GCCGCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAATTCTTGTGCGCCACGGTGGAGTTTGTTC
AACAGGAACACCAGGCACTCGCTAGTTGTGTTGCGTGCAGAGTCCTCTAAATCTTCCACA
ACAACAACCAAAACTGACAATTCATCTGATGCTAGTGTTGTGTCAAATGTTCGAAGGACA
ACTTTCCCCAAGGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACTGAGGTTGCT
GTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTAAAGCGGAAGATTGGACAGACC
GCAACTCCCATTCCTGTGCCTGATATTTCTCCATCAATAGCTCCTCCCATTCCTACTGAA
CCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTACCCCATCCAAAGCAAAACCTGCCTCT
GAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCTTACCGAAAATCATCAAAGTTGGCTGCTTTG
GATGCATCTGGATCCAACAACTATGTTCTAGTCACCTCTCCCTCAGTGGGCAAGTTTCAG
AGAAGCAGA
CTGTAAAGGG

QA 2 670 2 670
DS 



CO CL278Contig2 1756 10 7 U
GTCTATGTTATCATCACAGGTGAATACCATAGTAAGTTTTGTAAAATGAACCTGGGACAA
ATGAACGTTTAAAGACCCTTATAAAAAGCTGAGCCCACAACCCATTGCTGCACAGTGGAT
TCAGTGCAGTGTATTTGTACAATAATAATATGTCAAACATGACAAGAGTAGCTACCAAGA
TTCCACATCCTGCTCACAACATTTTTCAGGCATATAAACGTTAGGAAACTCAATGATCTA
CCTAACCAGAAATTAATGTTGAATCACATTAAGGGCCTTCAAAGTATTCTTCAAAGAAAC
TCAATGTACTACCTACGATCAACATATATGTACTGCACGGACAAATTGTGCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATCAATAAGCCTCGTTGATAAAGCCTTTAACA
ACAAAAAGAAAGCAGCGAACAAGTTGCTAATAAAGCATATTCACAGATTCGCCAAAACTT
TTGTGGATCTTCCACTACTTATGGCCAGCTCCTACTCTGCTCAATAGTATTTTTTCAACT
AATCATCATCCTAGATACAAACAAACAAACAACTTAACAAAAGTGTCAAATATGCTCATT
TCAACAATATTTAGTTTTTTTTTCTCTGGTGCAAAAAAATAGATGATCCCATATTAAGAC
GAACCAAAAATCCAAAAGAGTGACCAAAACAATATAGCTGCGTGTCACATGTTCAGGAAT
TAAATCTCCACACAAATCATGTGATCAAAGATGAAGATCAAAATAGATTCTCAAACTCCA
TAAAAGGAAAGATGAAGAAGAGTACAGTCTCCATATGAAGATGCTATTAATTTATTGTGG
AACTGGGCCCTGACATCATCACTGGATGTTGATATCATGGAACGATGGCAAGACCGCAAC
CAGAGGCTCCCCATACCCTATAGAGTCTCCATCATCTGAAAGAAGCTTGAGAACTTCACC
AGCTACATCAGACGTTAGTGGAAGTTCTTTTCCCAGCTGATGCACGTATCCAATCACTTG
CCCTTCCTTTATTGCATCACCCTCTTTGCAGCTAGGACCTTGTTTCTTTCCTTTTACAGT
TCTGCTTCTCTGAAACTTGCCCACTGAGGGAGATGTGACTAGAACATAGTTGTTAGATCC
AGATGCATCCAAAGCAGCCAACTTTGATGATTTTCGGTATGCAGCATTAATAAATGGAGA
CACTTTTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGGGGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGA
TTTGTTCATGGGTTCAGAAGGAATCGGAGGAGCTACTGATGGAGAAATATCAGGCACAGG
AATGGGAGTTTCGGTCTGTCCAATCTTCCGCTTTAAGTTCATCTCGAAATCTCCAACCTT
AAGTTTGAGCACAGCAACCTCAGTCTCATCACACATCTCGTGAACCAGTGCCTCCACTTC
TTTCGGGAACGTTGTGCGTCGAACAGTACCCTTCCCCGTTGAAGCATCACATGATTCGTC
AGTTTTGGTTGTTGTTGTGGAAGATTTAGAGGACTCTGCACGTAACACAAGCGTGTACTT
GGTGTTCCTGTTGCACAAACTCCACCGTGGCGCACAAGAATTGCCAGAGGCAGACCAGTT
ACCAGAAAGCGAGTGAACATTTATGGAGGAACCAAAAGTCTGAGGGAGAGATCCGAGAGC
TGCAGAAGACTCCATTGGAAGAACAAGGCAGCGAGCTAGCTAGAGAAGACTCCACAGAAG
CGGGGGGTGGTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 5 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G489TF U 1
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AF RR4FQ48JQ U 631
AF RR4FX82JQ U 631
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AF RR4DK84TF C 1084
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BS 1431 1756 RR4BS70TF

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TCAGTGCAGTGTATTTGTACAATAATAATATGTCAAACATGACAAGAGTAGCTACCAAGA
TTCCACATCCTGCTCACAACATTTTTCAGGCATATAAACGTTAGGAAACTCAATGATCTA
CCTAACCAGAAATTAATGTTGAATCACATTAAGGGCCTTCAAAGTATTCTTCAAAGAAAC
TCAATGTACTACCTACGATCAACATATATGTACTGCACGGACAAATTGTGCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATCAATAAGCCTCGTTGATAAAGCCTTTAACA
ACAAAAAGAAAGCAGCGAACAAGTTGCTAATAAAGCATATTCACAGATTCGCCAAAACTT
TTGTGGATCTTCCACTACTTATGGCCAGCTCCTACTCTGCTCAATAGTATTTTTTCAACT
AATCATCATCCTAGATACAAACAAACAAACAACTTAACAAAAGTGTCAAATATGCTCATT
TCAACAATATTTAGTTTTTTTTTCTCTGGTGCAGAAAAATAGATGATCCCATATTAAGAC
GAGCCAAAAATCCAAAAGAGTGACCAAAACAATATAGCTGCGTGTCACATGT

QA 1 712 1 712
DS 

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GCAG
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TATGAAGATGCTATTAATTTATTGTGGAACTGGGCCCTGACATCATCACTGGATGTTGAT
ATCATGGAACGATGGCAAGACCGCAACCAGAGGCTCCCCATACCCTATAGAGTCTCCATC
ATCTGAAAGAAGCTTGAGAACTTCACCAGCTACATCAGACGTTAGTGGAAGTTCTTTTCC
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TGTGACTAGAACATAGTTGTTAGATCCAGATGCATCCAAAGCAGCCAACTTTGATGATTT

QA 5 544 5 544
DS 

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AAACTTGCCCACTGAGGGAGAGGTGACTAGAACATAGTTGTTGGATCCAGATGCATCCAA
AGCAGCCAACTTTGATGATTTTCGGTAAGCAGCATTAATAAATGGAGACACTTTTTC

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DS 

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CAA
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AAGATCAAAATAGATTCTCAAACTCCATAAAAGGAAAGATGAAGAAAAGTACAGTCTCCA
TATGAAGATGCTATTAATTTATTGTGGAACTGGGCCCTGACATCATCACTGGATGTTGAT
ATCATGGAACGATGGCAAGACCGCAACCAGAGGCTCCCCATACCCTATAGAGTCTCCATC
ATCTGAAAGAAGCTTGAGAACTTCACCAGCTACATCAAACGTTAGTGGAAGTTCTTTTCC
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AGGACCTTGTTTCTTTCCTTTTACAGTTCTGCTTCTCTGAAACTTGCCCACTGAGGGAGA
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TCAGTATGCAGCATTAATAAATGGAGACACTTTTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGG
GGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGATTTGTTCATGGGTTCAGAAGGAATC

QA 4 655 4 655
DS 

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CAG
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AAGATCAAAATAGATTCTCAAACTCCATAAAAGGAAAGATGAAGAAGAGTACAGTCTCCA
TATGAAGATGCTATTAATTTATTGTGGAACTGGGCCCTGACATCATCACTGGATGTTGAT
ATCATGGAACGATGGCAAGACCGCAACCAGAGGCTCCCCATACCCTATAGAGTCTCCATC
ATCTGAAAGAAGCTTGAGAACTTCACCAGCTACATCAGACGTTAGTGGAAGTTCTTTTCC
CAGCTGATGCACGTATCCAATCACTTGCCCTTCCTTTATTGCATCACCCTCTTTGCAGCT
AGGACCTTGTTTCTTTCCTTTTACAGTTCTGCTTCTCTGAAACTTGCCCACTGAGGGAGA
TGTGACTAGAACATAGTTGTTAGATCCAGATGCATCCAAAGCAGCCAACTTTGATGATTT
TCAGTATGCAGCATTAATAAATGGAGACACTTTTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGG
GGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGATTTGTTCATGGGTTCAGAAGGAA

QA 4 653 4 653
DS 

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GCAG
AAAAAATAGATGATCCCATATTAAGACGAACCAAAAATCCAAAAGAGTGACCAAAACAAT
ATAGCTGCGTGTCACATGTTCAGGAATTAAATCTCCACACAAATCATGTGATCAAAGATG
AAGATCAAAATAGATTCTCAAACTCCATAAAAGGAAAGATGAAGAAGAGTACAGTCTCCA
TATGAAGATGCTATTAATTTATTGTGGAACTGGGCCCTGACATCATCACTGGATGTTGAT
ATCATGGAACGATGGCAAGACCGCAACCAGAGGCTCCCCATACCCTATAGAGTCTCCATC
ATCTGAAAGAAGCTTGAGAACTTCACCAGCTACATCAGACGTTAGTGGAAGTTCTTTTCC
CAGCTGATGCACGTATCCAATCACTTGCCCTTCCTTTATTGCATCACCCTCTTTGCAGCT
AGGACCTTGTTTCTTTCCTTTTACAGTTCTGCTTCTCTGAAACTTGCCCACTGAGGGAGA
TGTGACTAGAACATAGTTGTTAGATCCAGATGCATCCAAAGCAGCCAACTTTGATGATTT
TCGGTATGCAGCATTAATAAATGGAGACACTTTTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGG
GGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGATTTGTTCATGGGTTCAGAAGGAATCGGAGGAGC
TACTGATGGAGAAATATCAGGCACAGGAATGGGAGTTTCGGTCTGTCCAATCTTCCGCTT
TAAGTTCATCTCGAAATCTCCAACCTTAAGTTTGAGCACAGCAACCTCAGTCTCATCACA
CATCTCGTGAACCAGTG

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DS 

RD RR4DK84TF 635 0 0
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TGCATCCAAAGCAGCCAACTTTGATGATTTTCGGTATGCAGCATTAATAAATGGAGACAC
TTTTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGGGGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGATTT
GTTCATGGGTTCAGAAGGAATCGGAGGAGCTACTGATGGAGAAATATCAGGCACAGGAAT
GGGAGTTTCGGGCTGTCCAATCTTCCGCTTTAAGTTCATCTCGAAATCTCCAACCTTAAG
TTTGAGCACAGCAACCTCAGTCTCATCACACATCTCGTGAACCAGTGCCTCCACTTCTTT
CGGGAACGTTGTGCGTCGAACAGTACCCTTCCCCGTTGAAGCATCACATGATTCGTCAGT
TTTGGTTGTTGTTGTGGAAGATTTAGAGGACTCTGCACGTAACACAAGCGTGTACTTGGT
GTTCCTGTTGCACAAACTCCACCGTGGCGCACAAGAATTGCCAGAGGCAGACCAGTTACC
AGAAAGCGAGTGAACATTTATGGAGGAACCAAAAGTCTGAGGGAGAGATCCGAGAGCTGC
AGAAGACTCCATTGGAAGAACAAGGCAGCGAGCT
C

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DS 

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TTTACAG
TCTGCTTCTCTGAAACTTGCCCACTGAGGGAGATGTGACTAGAACATAGTTGTTAGATCC
AGATGCATCCAAAGCAGCCAACTTTGATGATTTTCGGTATGCAGCATTAATAAATGGAGA
CACTTTTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGGGGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGA
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CGGGGGGTGGTTAGTT

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DS 

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AATGGGAGTTTCGGTCTGTCCAATCTTCCGCTTTAAGTTCATCTCGAAATCTCCAACCTT
AAGTTTGAGCACAGCAACCTCAGTATCATCACACATCTCGTGAACCAGTGCCTCCACTTC
TTTCGGGAACGTTGTGCGTCGAACAGTACCCTTCCCCGTTGAAGCATCACATGATTCGTC
AGTTTTGGTTGTTGTTGTGGAAGATTTAGAGGACTCTGCACGTAACACAAGCGTGTACTT
GGTGTTCCTGTTGCACAAACTCCACCGTGGCGCACAAGAATTGCCAGAGGCAGACCAGTT
ACCAGAAAGCGAGTGAACATTTATGGAGGAACCAAAAGTCTGAGGGAGAGATCCGAGAGC
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CGGGGGGTGGTTAGTT

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DS 

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TTCTCTGAAACTTGCCCACTGAGGGAGATGTGACTAGAACATAGTTGTTAGATCCAGATG
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TTTCAGAGGCAGGTTTTGCTTTGGATGGGGTAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTGATTTGT
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GAGTTTCGGTCTGTCCAATCTTCCGCTTTAAGTTCATCTCGAAATCTCCAACCTTAAGTT
TGAGCACAGCAACCTCAGTATCATCACACATCTCGTGAACCAGTGCCTCCACTTCTTTCG
GGAACGTTGTGCGTCGAACAGTACCCTTCCCCGTTGAAGCATCACATGATTCGTCAGTTT
TGGTTGTTGTTGTGGAAGATTTAGAGGACTCTGCACGTAACACAAGCGTGTACTTGGTGT
TCCTGTTGCACAAACTCCACCGTGGCGCACAAGAATTGCCAGAGGCAGACCAGTTACCAG
AAAGCGAGTGAACATTTATGGAGGAACCAAAAGTCTGAGGGAGAGATCCGAGAGCTGCAG
AAGACTCCATTGGAAGAACAAGGCAGCGAGCTAGCTAGAGAAGACTCCACAGAAGCGGGG
GGTGGTTAGTT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 2 11

CO CL279Contig1 1110 5 10 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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G

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C
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BQ
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15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX63JQ U 1
AF RR4AT23JQ U 3
AF RR4AE83JQ U 63
AF RR4AT23TF C 196
AF RR4FX63TF C 530
AF RR4AE83TF C 576
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BS 167 227 RR4FX63JQ
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BS 770 983 RR4AT23TF
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AATCCAATAACAACAAGTAAATCACTTAAAGAACAAACCTTTTAGTGGTTGGGATGTAAA
ATAAGCTAAGTACATGATATTCATAATCACCCCTCGTTATTACTAAATCAATGGAATTAT
ATACTGCGGAATGTAAGTAGCATATGTAAATGTAGTGGCAATTGTAT

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DS 

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G
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AGCTAAGTACATGATATTCATAATCACACCTCGTTATTACTAGATCAATGGAATTATATA
CTGCGGAATGTAAGTAGCATATGTAAATGTAGTGGCAATTGTATACCAGTAATAAGAGAT
CAGTGTTTGCGCTTGGACTTCAAGGAAGTGAGGGAATGAGAGTTATTGTGCCAGTTCCTC
TTGCGTTGATTAATGAACCAGTTGTTGATTTGCTTCAACTGTAATCCTGTCTCCTCCACC
AATTTTGCCTTGTCGTCTTCAGTAGGGTAAGGCCATTTGCAATGTTGTTGCCACCAATTT
TTCAAGACGGTTGTTGTGTCTCCAGGCAATTTCCCAGCCCTTCTTTTCCTCATTATCTCT
TCTCTTACATCTTCAATTCTTGATTTAAAACCCTGTTTGAGTTCGAGTTTCAGCTCTTGT
CTGACTCTTTCCATAAGAGATCTTTC

QA 2 567 2 567
DS 

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AAGCTAAGTACATGATATTCATAATCACACCTCGTTATTACTAGATCAATGGAATTATAT
ACTGCGGAATGTAAGTAGCATATGTAAATGTAGTGGCAATTGTATACCAGTAATAAGAGA
TCAGTGTTTGCGCTTGGACTTCAAGGAAGTGAGGGAATGAGAGTTATTGTGCCAGTTCCT
CTTGCGTTGATTAATGAACCAGTTGTTGATTTGCTTCAACTGTAATCCTGTCTCCTCCAC
CAATTTTGCCTTGTCGTCTTCAGTAGGGTAAGGCCATTTGCAATGTTGTTGCCACCAATT
TTTCAAGACAGTTGTTGTGTCTCCAGGCAATTTCCCAGCCCTTCTTTTCCTCATTATCTC
TTCTCTTACATCTTCAATTCTTGATTTAAAACCCTGTTTGAGTTCGAGTTTCAGCTCTTG
TCTGACTCTTTCCATAAGAGATCTTTCAGATTCAGTCGGAAGCAATGGACCAAATCCCGT
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ATCGTCCTCATCCTCGGACATCGTCGCACCGGACCCTTCTCCTAATGTCGCTCCTGTGAG
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DS 

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TTGGACTTCAAGGAAGTGAGGGAATGAGAGTTATTGTGCCAGTTCCTCTTGCGTTGATTA
ATGAACCAGTTGTTGATTTGCTTCAACTGTAATCCTGTCTCCTCCACCAATTTTGCCTTG
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ATAAGAGATCTTTCAGATTCAGTCGGAAGCAATGGACCAAATCCCGTCATATCTTGTCCC
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CATGCCAC
GTGTGCGGCCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4FX63TF 672 0 0
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CCCGTCATATCTTGTCCCCCGCTAAAATCAATGCCGGAATTATCAGATAAGAAATCCATA
TGAAGATCGTCCTCATCCTCGGACATCGTCGCACCGGACCCTTCTCCTAATGTCGCTCCT
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GGAGTCGCCACTCTCAGACATGCCACGTGTGCGGCCAAAAGCTGCTCGTACATGGGATGT
GTAGCTATTTCACCTTTCATTTGTCTATTCTGCTCCGCCGCCACGGCTGCGTCTCCTTCT
CCTCCTCCGCCTACGATCATACCTAACGCTGCTTCTTGCATATTCTTGATAGAAGACGGA
GAGAGAAACTCGGTTTTGTCCTGAAAACCCTGATTCTTCGACCTGATTTTGGTTGTACGA
TT
CC

QA 9 670 9 670
DS 

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CCCTTCTCCTAATGTCGCTCCTGTGAGAGAGTGGAGGTTGTTCTCAATTTCACGGCAAGC
CATCACAGCTTCGACGGCATGAACCCTCACGTGTTGTTGAAGCTGTTCTTTGAAGCTACA
CAACACCATTACATATTGTGCCAAGAAATTGTCGAGCTCTTGACGATCATGATGCGAGAA
TCCAACGACTGTCGAAGCATAAGATCGGAGAAAATGATGAGAGTGAGAAAGCTGAGCTTC
AATGATCGGAAGCTGGTCGATGGGAGTCGCCACTCTCAGACATGCCACGTGTGCGGCCAA
AAGCTGCTCGTACATGGGATGTGTAGCTATCTCACCTTTCATTTGTCTATTCTGCTCCGC
CGCCACGGCTGCGTCTCCTTCTCCTCCTCCGCCTACGATCATACCTAACGCTGCTTCTTG
CATATTCTTGATAGAAGACGGAGAGCGAAACTCGGTTTTGTCCTGAAAACCCTGATTCTT
CGACCTGATTTTGGTTGTACGATTAGAGAGAACCGAAGAGATCAACGTACGTATATCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 11

CO CL280Contig1 883 2 10 U
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TCTGCGCCTCTTTCCGTCTACAAATCTCTTGCTGGTAACGCTCAACCTTCTTTGGGTAGT
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AAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTCGTACAG
CAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTACTGCGTTAGCCGCGCTTTACCATACTATCAAG
AGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGAAAACAACAACCTCCTCCCAAAGCTCTTTCGTTG
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AAAAGAGAGTAGAAACGTTTTGTCAAACTCTCATCGTCTTTTTGACAAAGCAAGTGTCTA
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TAAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAATGTAATAAAATGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C847TF U 1
AF RR4C847JQ C 220
BS 1 723 RR4C847TF
BS 724 724 RR4C847JQ
BS 725 734 RR4C847TF
BS 735 735 RR4C847JQ
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BS 786 883 RR4C847JQ

RD RR4C847TF 794 0 0
GGATTTCCTTTTGTTCGGACTTGTCTCTCGCTCGCAGGAAGGTTAGTCGAGATACTGCTT
TCGATTCAGACGATGGCTGCCACGGCTCTTCTCCGATCGCTTCGTCGACGCGACGTCGTC
TCTGCGCCTCTTTCCGTCTACAAATCTCTTGCTGGTAACGCTCAACCTTCTTTGGGTAGT
GGTCAAAACTATGCAAGTTTGTGTAGAGCTTTCGGATCGAAATCTGGTTTGAACGACAAT
TTTGGGACTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCCTTCAGAGAGGAGAGAGAGCAC
TCAAGAGCTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGAGCTCTTGGTGTGGGAACACCG
AGACGCGTGTTGTCCACAGTCGCAGAGAGTATAAAGATGACAGAGGAAGATCAGACTTCT
CCAAAACCCCAGAGCTTTCGCCCTCTATCTCCTCACCTCACTGTTTACCTTCTCTACCTG
AAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTCGTACAG
CAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTACTGCGTTAGCCGCGCTTTACCATACTATCAAG
AGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGAAAACAACAACCTCCTCCCAAAGCTCTTTCGTTG
TTTGGTTGAAGCCGCCAAAGTCTCCAGTAAGAGTTTCCTTGAGATGGCACAAGATTTAAT
AAA*GAGAGTAGAA*CGTTT*GTCAAACTCTCATCGTCTTTT*GACAAAGCAAGTGTCTA
GCTTT
GTTTGGGAT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4C847JQ 664 0 0
AAATCTGGTTTGAACGACAATTTTGGGACTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCC
TTCAGAGAGGAGAGAGAGCACTCAAGAGCTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGA
GCTCTTGGTGTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCCACAGTCGCAGAGAGTATAAAGATG
ACAGAGGAAGATCAGACTTCTCCAAAACCCCAGAGCTTTCGCCCTCTATCTCCTCACCTC
ACTGTTTACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCTAC
CAGGTTCATTACCTCGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTACTGCGTTAGCC
GCGCTTTACCATACTATCAAGAGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGAAAACAACAACCT
CCTCCCAAAGCTCTTTCGTTGTTTGGTTGAAGCCGCCAAAGTCTCCAGTAAGAGTTTCCT
TGAGATGGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACGTTTTGTCAAACTCTCATCGTCT
TTTTGACAAAGCAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATTTCAGGCTTTGAAAGCTTTATGT
TTTTTTGCTTTTTTTTTGTTATAAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAATGTAATAAAATGTT
TACC

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL280Contig2 973 9 24 U
GGTCTTAGAACTGGTAAACATTTTATTACATTCCAACCCCTTCAATTAGGTCTTAAAACA
AAGAAAAAGCAAACAAACATAAAGCTTTCAAAGCCTGAAATCCCAAAACAAAAGCTAGAC
ACTTGCTTTGTCAAAAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAA
TCTTGTGCATCTCAAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTGGCGGC*TTTAACCAAACAACGA
AAGAGCTTTTGGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAG
TATGGTAAAGCGCGGCTAACGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAA
GGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAAGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGA
GAAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGG
ATAGCATTGAGTTCTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGC
TTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAG
ACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAGCATTCA
CAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTTAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAA
AACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAACCAGATTTCGATCCGAAAGCTCTACACAAACTTG
AATAGTTTTGACCACTACCCAAAGAAGCTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGACGG
AAAGAGGAGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCCGTGGAAGCCA
TCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTCGACTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGAGAAGTCCGAA
CAAAAGGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E870JQ U 1
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AF RR4EX56JQ U 13
AF RR4GF62JQ U 13
AF RR4AZ28JQ U 5
AF RR4EX56TF C 766
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AF RR4GF62TF C 208
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RD RR4E870JQ 691 0 0
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TCTTGTGCATCTCAAGGAAACTCTTACTGGAGACTCTGGCGGCCTTTAACCAAACAACGA
AAGAGCTTT*GGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAG
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ATAGCATTGAGTTCTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGC
TTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATTTTTATACCCTCTGCGACTGTAG
ACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAGCATTCA
CAGTAGTTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCT

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DS 

RD RR4FS51JQ 678 0 0
C
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AAAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATCTC
AAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTGGCGGC*TTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTTTGGG
AGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAGCGC
GGCTAACGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAACCTG
GTAGAAGCTTGGGTAAGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCCGCC
ATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAGCATTGAGTT
CTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTGG
AGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGCCT
CGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAACATTCACAGTAGCTCTTGA
GTGCTCTCTCTCCTCTC

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR4EX56JQ 679 0 0
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ACAAACATAAAGCTTTCAAAGCCTGAAATCCCAAAACAAAAGCTAGACACTTGCTTTGTC
AAAAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATCT
CAAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTGGCGGC*TTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTTTGG
GAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAGCG
CGGCTAACGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAACCT
GGTAGAAGCTTGGGTAAGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCCGC
CATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAGCATTGAGT
TCTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTG
GAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGTC
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AGTGCTCTCTCTCCTCTCT

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DS 

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GA
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AAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATCTCA
AGGAAACTCTTACTGGAGACTCTGGCGGCCTTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTT*GGGA
GGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAGCGCG
GCTAAAGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAACCTGG
TAGAAGCTTGGGTAAGTGAGGCAGGTCATACCCATCTTCAGGTAGAGAGGGTATCCGCCA
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TTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTGGA
GAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGTCTC
GGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTAGTTCTTGAG
TGCTCTCTCTCCTCTCTGACGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCAGTCCCGAAA
TTGTCGTTCAAACCAGA

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR4AZ28JQ 886 0 0
C
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AAAGCAAACAAACATAAAGCTTTCAAAGCCTGAAATCCCAAAACAAAAGCTAGACACTTG
CTTTGTCAAAAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTG
TGCATCTCAAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTGGCGGC*TTTAACCAAACAACGAAAGAG
CTTTTGGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGG
TAAAGCGCGGCTAACGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAA
TGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAAGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGG
TATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAGC
ATTGAGTTCTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGG
GGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAAC
ACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTA
GCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTTAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCA
GTCCCAAAATTGTCGTTCAAACCAGATTTCGATCCGAAAGCTCTACACAAACTTGAATAG
TTTTGACCACTACCCAAAGAAGCTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGACGGAAAGA
GGAGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCC

QA 2 886 2 886
DS 

RD RR4EX56TF 110 0 0
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GAGATTTGTAGACGGAAAGAGGAGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGC

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DS 

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TAAGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCG
GTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAGCATTGAGTTCTTCTGAGGCTGG
TAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCT
TCCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGCCTCGGTGTTCCCACA
CCAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAACATTCACAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCC
TCTCTTAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAA
CCAGATTTCGATCCGAAAGCTCTACACAAACTTGAATAGTTTTGACCACTACCCAAAGAA
GCTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGACGGAAAGAGGAGCAGAGACGACGTCGCGT
CGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCCGTGGAAGCCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTCG
ACTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGAGAAGTCC
CC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4AZ28TF 863 0 0
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GTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATCTCAAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTG
GCGGC*TTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTTTGGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAG
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ACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAAGTGAGGCAG
ATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATC
CCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAGCATTGAGTTCTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGG
TGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATC
TTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTC
AAATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTTAAGGCA
TTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAACCAGATTTCGAT
CCGAAAGCTCTACACAAACTTGAATAGTTTTGACCACTACCCAAAGAAGCTTGAGCGTTA
CCAGCAAGAGATTTGTAGACGGAAAGAGGAGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGCGAT
CGGAGAAGAGCCGTGGAAGCCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTCGACTAACCTTCCT
GCGAGCGAGAGAGAAGTCCGAAC

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4GF62TF 766 0 0
TGGAGACTCTGGCGGC**TTTACCAAACAACGAAAGAGCTTT*GGGAGGAGGTTGTTTTC
AATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAGCGCGGCTAAAGCAGTAA
CCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGT
AAGTGAGGCAGGTCATACCCATCTTCAGGTAGAGAGGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGG
TCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAGCATTGAGTTCTTCTGAGGCTGGT
AAACAGTGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTT
CCTCTGTCATCTTTATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACAC
CAAGAGCTCTCAAATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTAGTTCTTGAGTGCTCTCTCTCCT
CTCTGACGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCAGTCCCGAAATTGTCGTTCAAAC
CAGATTTCGATCCGAAAACTCTACACAAACTTGCATAGTTTTGACCACTACCCAATGAAG
GTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGACGGAAAGAGGCGCAGAGACGACGTCGCGTC
GGCGAAGAGATCGGAGAAGAGCCGCGGAAGCCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTCGA
CTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGACAAGTCCGAACAAAAGGAAATCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 2 12

CO CL281Contig1 839 4 5 U
GAAACCGATTGAAAGATGTTTTGATACCCTAAGAAATTTTATTAACCGTATCAACTCAAC
TTAAAACTTAAAACTGTTACCGACACATCAAAGCATTCCAAGAAGTAATGTGAACAAACA
CAACGAAAAGAGCTTTTAATTTTGATCGATTCCACTTGGCCATGTCTGATTCTTTACAGG
CTCGAGAATAGCTTCAACCTCAGAGAGAGTTTCTTGATCCATACCCACACCTTCAAGCTC
TCTAACTGCTGCAACATTTTCTTCCACCTGTGAGACAGAGCTCATTCCAACCAACACTGA
TGAAACCTCCTTGTTTCCTAAGCTGTACTGCAGTGCTAACTTTGTGATCTTCTTACCCTT
TGATTTACAATGACCAACAGCAGCTTTGCAAGCAGACTTAAGCTCAGGGGAAGCAGGGTG
CCATTCAGGAGGACCTTGTTCCGTAAGGAGACCCATTGCCAATGGAGAAGCACTTATCAC
GCCCACACCTTTGCTCTTCAAGTAAGGCAACAAATCCAGCAACGTCGAATCGTTTACACC
GTAATGGCAGTACGACAATATCACATCAACACTCCCTGGAGGCACTCTATCAAGAACATA
AGTGAATATACTCAACGGAAGACCAGTGATACCGATAAACCTTGGCTTCCCTTCCCGTTT
CAGTTTCTGCAGCGCAGGGATTGTTTTCACTCACAATCTGGTCAAGAGACCCGAACTCAA
TGTCGTGGCAGTGAAGTATGTCGACGTAATCTAGCTGAAGCCTCTCCAAGCTCTCGTCGA
TGCTCTTTGTGACTCTCTCAGCACTGAAATCGAAACCTTCTTCGTAACGTCCACACTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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DS 



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CTTAGGTAATACCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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BS 480 480 RR4DU32TF
BS 481 485 RR4C187TF
BS 486 486 RR4DU32TF
BS 487 671 RR4C187TF
BS 672 734 RR4AT70TF
BS 735 735 RR4DU32JQ
BS 736 739 RR4AT70TF
BS 740 740 RR4DU32JQ
BS 741 754 RR4AT70TF
BS 755 885 RR4DU32JQ
BS 886 886 RR4C187JQ
BS 887 1094 RR4DU32JQ

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TTTTTATCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGT
CTCAAAGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTC
GCCGAAGTCGATGCCGTCACCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTC
GACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACGCTATCGGAGAAGATGCTTGGTAAGGGACTAAAG
GCACTACAAGTCCCTAGAAATGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAA
GGCTTCGATTTCTGTGCTGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTT
CAGCTAGATTGCGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAG
ATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTT
ATCGGTATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTCACTTATGTTCTTGATAGAGTGCCTCCA
GGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCGACGTTGCTG
GATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGTGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCCATT

QA 1 656 1 656
DS 

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TTTTTATCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGT
CTCAAAGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTC
GCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTC
GACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACGCTATCGGAGAAGATGCTTGGTAAGGGACTAAAG
GCACTACAAGTCCCTAGAAACGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAA
GGTTTCGATTTCAGTGCTGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTT
CAGCTATATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAG
ATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTT*
ATCGGCATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTCACTTATGTTCTTGATCGAGTGCCTCCA
GGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCGACGTTGCTG
GATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGTGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCCATTGGCA
ATGGGTCTCCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4DU32TF 670 0 0
TTTTTATCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGT
CTCAAAGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTC
GCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTC
GACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACGCTATCGGAGAAGATGCTTGGTAAGGGACTAAAG
GCACTACAAGTCCCTAGAAACGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAA
GGTTTCGATTTCAGTGTTGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTT
CAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAG
ATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTT
ATCGGTATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTCACTTATGTTCTTGATCGAGTGCCTCCA
GGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACG*TGTAAACGATTCGACGTTGCTG
GATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAG*TGTGGGCGTGATAAGTGCCTCTCCATTGGCA
ATGGGTCTC
T

QA 1 669 1 669
DS 

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TTTTTATCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGAGAAACACAGGT
CTCAAAGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTC
GCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTC
GACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACGCTATCGGAGAAGATGCTTGGTAAGGGACTAAAG
GCACTACAAGTCCCTAGAAATGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAA
GGTTTCGATTTCAGT*CTGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTT
CAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAG
ATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTT
ATCGGTATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTCACTTATGTTCTTGATAGAGTGCCTCCA
GGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCGACGTTGCTG
GATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGTGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCCATTGGCA
ATGGGTCTCCT

QA 1 671 1 671
DS 

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GCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTCGCCGAAGTCGATGCCGTCACCACCGTA
AGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTCGACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACG
CTATCGGAGAAGATGCTTGGTAAGGGACTAAAGGCACTACAAGTCCCTAGAAATGACTAC
ATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAAGGCTTCGATTTCTGTGCTGAGAGAGTC
ACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCTAGATTGCGTCGACATACTTCAC
TGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTG
CAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTTATCGGTATCACTGGTCTTCCGTTGAGT
ATATTCACTTATGTTCTTGATAGAGTGCCTCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTAC
TGCCATTACGGTGTAAACGATTCGACGTTGCTGGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAA
GGTGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCCATTGGCAATGGGTCTCCTTACG*AACAAG*TCCT
CCTGAATGGCACCCTGCTTCCC
TGA

QA 1 622 1 622
DS 

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ATCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGTCTCAA
AGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTCGCCGA
AGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTCGACAC
TTCCCCGTATTATGGAGGAACGCTATCGGAGAAGATGCTTGGTAAGGGACTAAAGGCACT
ACAAGTCCCTAGAAATGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAAGGTTT
CGATTTCAGTGCTGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCT
AGATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAGATTGT
GAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGGCAAGGTTTATCGG
TATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTGACTTATGTTCTTGATAGAGTGCCTCCAGGGAG
TGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCGACGTTGCTGGATTT
GTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGTGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCCATTGGCAATGGG
TCTCCTTACGGAACAAGGTCCTCCTGAATGGCACCCTGCTTCCCCTGAGCTTAAGTCTGC
TTGCAAAGCTGCTGTTGGTCATTGTAAAT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4DU32JQ 861 0 0
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GAGGCTTCAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCT
TGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGAC
AAGGTTTATCGGTATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTCACTTATGTTCTTGATCGAGT
GCCTCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCGAC
GTTGCTGGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGTGTGGGCGTGATAAGTGCCTCTCC
ATTGGCAATGGGTCTCCTTACGGAACAAGGTCCTCCTGAATGGCACCCTGCTTCCCCTGA
GCTCAAGTCTGCTTGCAAAGCAGCTGCTGGTCACTGTAAATCAAAGGGTAAGAAGATCAC
AAAGTTAGCACTGCAGTACAGCTTAGGAAACAAGGAGGTTTCATCAGTGTTGGTTGGAAT
GAGCTCTGTCTCACAGGTAGAAGAAAATGTTGAAGCAGTTAGAGAGCCTGAAGGTTTGGG
TATGGATCAAGAAACTCTGTCTGAGGTTGAAGCTATTCTCGAGCCTGTAAAGAATCAGAC
ATGGCCAAGCGGAATCGATCAAAAGTAAAAAGCTCTCTTCGTTGTGTTTGTTCACATTAC
TTCTTCTTGGAATGCTTTGATGTGTCGGTAACAGTTTTAAGTTGAGTTGATACGGTTAAT
AAAATTTCTTAGGTAATACCG

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR4C187JQ 740 0 0
GAGGCTTCAGCTATATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCT
TGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGAC
AAGGTT*ATCGGCATCACTGGTCTTCCGTTGAGTATATTCACTTATGTTCTTGATCGAGT
GCCTCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCGAC
GTTGCTGGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGTGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCC
ATTGGCAATGGGTCTCCTTACGGAACAAGGTCCTCCTGAATGGCACCCTGCTTCCCCTGA
GCTTAAGTCTGCTTGCAAAGCAGCTGCTGGTCATTGTAAATCAAAGGGTAGGAAGATCAC
AAAGTTAGCACTGCAGTACAGCTTAGGAAACAAGGAGGTTTCATCAGTGTTGGTTGGAAT
GAGCTCTGTCTCACAGGTGGAAGAAAATGTTGCAGCAGTTAGAGAGCTTGAAAGTTTGGG
TATGGATCAAGAGACTCTGTCTGAGGTTGAAGCTATTCTCGAGCCTGTAAAGAATCAGAC
ATGGCCAAGCGGAATCGATCAAAAGTAAAAAGCTCTCTTCGTTGTGTTTGTTCACATTAC
TTCTTCTTGGAATGCTTTGATGTGTCGGTAACTGTTTTATGTTGAGTTGATACGGTTAAT
AAAATTTCTTAGGTAATACC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 11

CO CL282Contig1 1125 11 31 U
CTCAACAAAAGATTAGTAAAAACTTTATAGTGGAAAGGATAATTTAGAGAGGATTCTACA
GGCAAACACACACAAATAGAGATGTTCATGATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTG
TTATCGAGTTAACTATTTAAGCACACTCAGAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAA
AGAGAGCTACACAGAGACCATATGGACGCATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTT
CAGCATCAGCCTTTAGGGTTCACCCCGCCTGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGA
TGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTG*TAGATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAAC
CAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCTCGGGTTCTCATAGTCTTCCTCGTCGTCAAGCT
CGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTGAGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCT
GGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAG
CCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGAT
CAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCTTCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAG
AGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAA
CAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAACCATGGAGCAGGAAGGT
CCAAGGAACGGAGGCTAAACCCATGATCACCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCG
CCATGAGACCAGCAGGATTGTTCAAAGTGGGAGGATCGACGGGGACGTGACGGTGGAATT
GATCGAGCATCCATATGGAGTAGATGATGATGGAAACACCGAAGAAAGCTTGAACGAAAT
TGAGGATCTTGAGAGTTGAGGCGAACGAAATATGGCAACAATTATGCCTCATTTCTTCTT
TCGATCACGAAAAGATGATTGATTGATGGATGGATGGATGGATAAACCCGGAAGCTTTTT
TTCAAAGGTCGTCTTCTTGGCTGTAAAGGTGTCTGTCTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 0 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D004JQ U 1
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AF RR4BP28JQ U 29
AF RR4A213JQ U 29
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AF RR4A213TF C 288
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AF RR4BP28TF C 387
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GGCAAACACACACAAATAGAGATGTTCATGATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTG
TTATCGAGTTAACTATTTAAGCACACTCAGAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAA
AGAGAGCTACACAGAGACCATATGGACGCATGCAGTTTCAAAATCATGTTTATTTGGCTT
CAGCATCAGCCTTTAGGGTTCACCCCGCCTGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGA
TGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTGCTAGATCCAGCAAAGGCTTGGTTTGCTTGAGAAC
CA

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR4CA55JQ 493 0 0
G
GTGGAAAGGATAATTTAGAGAGGATTCTACAGGCAAACACACACAAATAGAGATGTTCAT
GATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTGTTATCGAGTTAACTATTTAAGCACACTCA
GAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTACACAGAGACCATATGGACGC
ATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCAGCATCAGCCTTTAGGGTTCACCCCGCC
TGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTGCTA
GATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCTC
GGGTTCTCATAGTCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTG
AGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCAT
TTGCATATATCA

QA 2 493 2 493
DS 

RD RR4BP28JQ 736 0 0
G
GTGGAAAGGATAATTTAGAGAGGATTCTACAGGCAAACACACACAAATAGAGATGTTCAT
GATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTGTTATCGAGTTAACTATTTAAGCACACTCA
GAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTACACAGAGACCATATGGACGC
ATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCAGCATCAGCCTTTAGGGTTCACCCCGCC
TGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTGCTA
GATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCATC
GGGTTCTCATAGTCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTG
AGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCAT
TTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGA
TCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCT
TCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATA
GCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATA
AAAGAGTAGATGAAC

QA 2 736 2 736
DS 

RD RR4A213JQ 819 0 0
A
GTGGAAAGGATAATTTAGAGAGGATTCTACAGGCAAACACACACAAATAGAGATGTTCAT
GATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTGTCATCGAGTTAACTATTTAAGCACACTCA
GAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTACACAGAGGCCATATGGACGC
ATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCAGCATCAGCCTTTAGGGTTCACCCCGCC
TGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTG*TA
GATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCTC
GGGTTCTCATAATCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTG
AGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCAT
TTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGA
TCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCT
TCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATA
GCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATA
AAAGAGTAAATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGATCGGAGGCTAAACCCATGATCA
CCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAG

QA 2 819 2 819
DS 

RD RR4A213JQD 820 0 0
A
GTGGAAAGGATAATTTAGAGAGGATTCTACAGGCAAACACACACAAATAGAGATGTTCAT
GATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTGTCATCGAGTTAACTATTTAAGCACACTCA
GAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTACACAGAGGCCATATGGACGC
ATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCAGCATCAGCCTTTAGGGTTCACCCCGCC
TGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTG*TA
GATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCTC
GGGTTCTCATAATCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTG
AGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCAT
TTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGA
TCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCT
TCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATA
GCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATA
AAAGAGTAAATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGATCGGAGGCTAAACCCATGATCA
CCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAGA

QA 2 820 2 820
DS 

RD RR4A213TF 585 0 0
TACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTT*CACTCTG**TAGATCCAGCAGAGGCTTGG
TTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCTCGGGTTCTCATAATCTTCC
TCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTGAGAACCATGGCTAGTAGC
AGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTG
TCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTT
TCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCTTCAAGTAGAATGAGCAGA
GTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAA
CCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAAATGAACCAT
GGAGCAGGAAGGTCCAAGGATCGGAGGCTAAACCCATGATCACCACCACCACTAGACCCT
AGAACGACGCTCGCCATGAGACCAGCAGGATTGTTCAAAGTGGGA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4C903JQ 857 0 0
G
AGAGATGTTCATGATGTTCTAGCGACACACAAAAAGGACACTGTTATCGAGTTAACTATT
TAAGCACACTCAGAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTACACAGAGA
CCATATGGACGCATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCAGCATCAGCCTTTAGG
GTTCACCCCGCCTGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTT
TCACTCTTGCTAGATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAA
GCTCTACTCCTCGGGTTCTCATAGTCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAA
ACCATAGCTCTGAGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCA
GCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGC
TCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCA
ACAAGGGCAGCTTCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAA
CAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACA
CCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGAACGGAGGCTA
AACCCATGATCGCCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAGACCAGCAG*A
TTGTTCAA*GTGGGAGGAT*GACGGG*ACGTGACG*TGGAATTGATCGAGCATCCATATG
GAGTAGATGATGATGG

QA 2 857 2 857
DS 

RD RR4A213TFB 835 0 0
CCG
CTGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAGCTCCAGTTTTCACTCTTG*T
AGATCCAGCAGAGGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCT
CGGGTTCTCATAATCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGGGTCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCT
GAGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCA
TTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGG
ATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGC
TTCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGAT
AGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCAT
AAAAGAGTAAATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGATCGGAGGCTAAACCCATGATC
ACCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAGACCAGCAGGATTGTTCAAAGT
GGGAGGATCGACGGGGACGTGACGGTGGAATTGATCGAGCATCCATATGGAGTAGATGAT
GATGGAAACACCGAAGAAAGCTTGAACGAAATTGAGGATCCTGAGAGTTGAGGCGAACGA
AATATGGCAACAATTATGCCTCATTTCTTCTTTCGATCACGAAAAGATGATTGATTGATG
GATGGATGGATGGATAAACCCGGAAGCTTTTTTTCAAAGGTCGTCTTCTT
CC

QA 4 833 4 833
DS 

RD RR4D004TF 762 0 0
AACCAAGAAGTGGATCCCAAGCTCTACTCCTCGGGTTCTCATAGTCTTCCTCGTCGTCAA
GCTCGG*TCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTGAGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTA
GCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGA
AAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGAC
GATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCTTCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAA
TAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGG
TAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAACCATGGAGCAGGAA
GGTCCAAGGAACGGAGGCTAAACCCATGATCACCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGC
TCGCCATGAGACCAGCAGGATTGTTCAAAGTGGGAG*ATCGACGGGGACGTGACGGTGGA
ATTGATCGAGCATCCATATGGAGTAGATGATGATGGAAACACCGAAGAAAGCTTGAACGA
AATTGAGGATCTTGAGAGTTGAGGCGAACGAAATATGGCAACAATTATGCCTCATTTCTT
CTTTCGATCACGAAAAGATGATTGATTGATGGATGGATGGATGGATAAACCCGGAAGCTT
TTTTTCAAAGGTCGTCTTCTTGGCTGTAAAGGTGTCT
GTCCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4C903TF 753 0 0
CCCAAGCTCTACTCCTCGGGTTCTCATAGTCTTCCTCGTCGTCAAGCTCGG*TCTCTTAG
GTGAAACCATAGCTCTGAGAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTA
CAGCAGCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTAT
TGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGA
ATGCAACAAGGGCAGCTTCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACA
AGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCA
ATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGAACGGA
GGCTAAACCCATGATCGCCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAGACCAG
CAGGATTGTTCAAAGTGGGAGGATTGACGGGGACGTGACGGTGGAATTGATCGAGCATCC
ATATGGAGTAGATGATGATGGAAACACCGAAGAAAGCTTGAACGAAATTGAGGATCTTGA
GAGTTGAGGCGAACGAAATATGGCAACAATTATGCCTCATTTCTTCTTTCGATCACGAAA
AGATGATTGATTGATGGATGGATGGATGGATAAACCCGGAAGCTTTTTTTCAAAGGTCGT
CTTCTTGGCTGTAAAGGTGTCTGTCTTCTTCCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4BP28TF 730 0 0
CATCGGG
TCTCATAGTCT*CCTCGTCGTCAAGCTCGG*TCTCTTAGGTGAAACCATAGCTCTGAGAA
CCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGACGACTACTACAGCAGCCCCGACCCATTTGC
ATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGACTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCAT
ACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCGATGAATGCAACAAGGGCAGCTTCAA
GTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAACACAAGCAACAGGTATTGATAGCTT
CAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAGACCAATACACCAACCGCCATAAAAG
AGTAGATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGAACGGAGGCTAAACCCATGATCACCAC
CACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAGACCAGCAGGATTGTTCAAAGTGGGAG
GATCGACGGGGACGTGACGGTGGAATTGATCGAGCATCCATATGGAGTAGATGATGATGG
AAACACCGAAGAAAGCTTGAACGAAATTGAGGATCTTGAGAGTTGAGGCGAACGAAATAT
GGCAACAATTATGCCTCATTTCTTCTTTCGATCACGAAAAGATGATTGATTGATGGATGG
ATGGATGGATAAACCCGGAAGCTTTTTTTCAAAGATCGTCTTCTTGGCTGTAAAGGTGTC
T
CC

QA 8 728 8 728
DS 



AS 1 12

CO CL283Contig1 843 12 14 U
GGGAATAAAGTTATTTCTGTTTATTATATTTAGAGTTTCACAATCATATAGTTGTTAAAT
GCGTAGGCGAACATTGGTTGTTCATGTCCAAATATAAACGAGTCTATATTGAACATAGAG
CCTTAAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCACATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAG
TGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACT
TGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATAT
TTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGA
AGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTCCTTCTGTACCATC
TTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGA
TACCGAGGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCA
ACGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCT
TTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAAT
CGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAG
GCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGC
TCATCTCTCTCTCT**GTTTCTGTCTTGTGAAGTTTCCTTATCTGTTGAGATTGGTTCTC
CCA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 
55 40 55 40 55 55 55 25 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 
10 

AF RR4EE15JQ U 111
AF RR4GW23JQ U 61
AF RR4D903JQ U 1
AF RR4B912JQ U 7
AF RR4GX84JQ U 106
AF RR4GX84TF C 108
AF RR4GP56JQ U 118
AF RR4GP56TF C 163
AF RR4EE15TF C 132
AF RR4D903TF C 141
AF RR4GW23TF C 61
AF RR4B912TF C 31
BS 1 31 RR4D903JQ
BS 32 32 RR4B912JQ
BS 33 37 RR4D903JQ
BS 38 38 RR4B912JQ
BS 39 179 RR4D903JQ
BS 180 180 RR4B912JQ
BS 181 210 RR4D903JQ
BS 211 211 RR4B912JQ
BS 212 320 RR4D903JQ
BS 321 321 RR4B912JQ
BS 322 812 RR4D903JQ
BS 813 817 RR4B912JQ
BS 818 840 RR4GP56JQ
BS 841 843 RR4B912TF

RD RR4EE15JQ 577 0 0
GAACATAGAGCCTTAAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCACATTGAGTGAGTCCAGA
GTATATACAGTGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCA
AATGGGTACTTGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGA
TACTTCATATTTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGTCCATAACAGT
AGCCCGGGGAAGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTCCTT
CTGTACCATCTTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAA
ACAGATATGATACCGAGGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCA
GTTATAGCCAACGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAG
ATTGTCTTCTTTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGA
AGAAGTGAATCGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4GW23JQ 696 0 0
GCGTAGGCGAACATTGGTTGTTCATGTCCAAATATAAACGAGTCTATATTGAACATAGAG
CCTTAAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCGCATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAG
TGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACT
TGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATAT
TTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGA
AGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTTCTTCTGTACCATC
TTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGA
TACCGATGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCA
ACGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCT
TTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAAT
CGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAG
GCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4D903JQ 812 0 0
GGGAATAAAGTTATTTCTGTTTATTATATTTTGAGTTCCACAATCATATAGTTGTTAAAT
GCGTAGGCGAACATTGGTTGTTCATGTCCAAATATAAACGAGTCTATATTGAACATAGAG
CCTTAAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCACATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAA
TGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTAGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACT
TGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATAT
TTGGATCTCTTGGGAACTTTTTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGA
AGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTCCTTCTGTACCATC
TTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGA
TACCGAGGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCA
ACGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCT
TTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAAT
CGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAG
GCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGC
TCATCTCTCTCTCT**GTTTCTGTCTTGTGAA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4B912JQ 819 0 0
AAAGTTATTTCTGTTTATTATATTTAGAGTTTCACAATCATATAGTTGTTAAATGCGTAG
GCGAACATTGGTTGTTCATGTCCAAATATAAACGAGTCTATATTGAACATAGAGCCTTAA
AAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCACATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAGTGACAA
GATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACTTGAGGT
AACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATATTTGGAT
CTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGAAGAACA
TGAAGACGAACATGAACTATAAATACATCTCGAAGAACTTCCTTCTGTACCATCTTACTC
TCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGATACCGA
GGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCAACGCCG
GATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCTTTGCTC
CAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAATCGGTGT
TAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAGGCCTTG
GAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGCTCATCT
CTCTCTCT**GTTTCTGTCTTGTGAAGTTTC
TTATCTGT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4GX84JQ 686 0 0
AC
ATTGAACATAGAGCCTTAAAGACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCACATTGAGTGAGTCC
AGAGTATATACAGTGACAAGATATGTAGGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTAT
GCAAATGGGTACTTGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAA
GGATACTTCATATTTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAAC
AGTAGCCCGGGGAAGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTC
CTTCTGTACCATCTTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAG
AAAACAGATATGATACCGATGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACT
CCAGTTATAGCCAATGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGGGCTGCA
AAGATTGTCTTCTTTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTT
TGAAGAAGTGAATCGGTGTTAGAGATGAGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCT
TTGACGCTGCGAGGCCTTGGAGAAAGAGGGGACAAAGCATTCGGGACACAGAGACCAAGA
TAGCAGCAACGGCTCATCTCTCTC

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR4GX84TF 684 0 0
ATTGAACATAGAGC*TTAAAGACTGAGTATAAGAAAAGAGC*TGCACATTGAGTGAGTCC
AGAGTATATACAGTGACAAGATATGTAGGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTAT
GCAAATGGGTACTTGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAA
GGATACTTCATATTTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAAC
AGTAGCCCGGGGAAGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTC
CTTCTGTACCATCTTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAG
AAAACAGATATGATACCGATGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACT
CCAGTTATAGCCAATGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGGGCTGCA
AAGATTGTCTTCTTTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTT
TGAAGAAGTGAATCGGTGTTAGAGATGAGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCT
TTGACGCTGCGAGGCCTTGGAGAAAGAGGGGACAAAGCATTCGGGACACAGAGACCAAGA
TAGCAGCAACGGCTCATCTCTCTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4GP56JQ 724 0 0
GG
GCCTTAAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGCGCATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACA
GTGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTAC
TTGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATA
TTTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGG
AAGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTTCTTCTGTACCAT
CTTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATG
ATACCGATGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCC
AACGCCGGATGATCAATCGTGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTC
TTTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAA
TCGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGA
GGCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGG
CTCATCTCTCTCTCTCTGTTTCTGTCTTGTGAAGTTTCCTTATCTGTTGAGATTGGTTCT
C
C

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR4GP56TF 679 0 0
AGTCCAGAGTATATACAGTGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTG
GCTGTGCAAATGGGTACTTGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGT
CCCAAGGATACTTCATATTTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCC
ATAACAGTAGCCCGGGGAAGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGA
ACTTTCTTCTGTACCATCTTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGA
AGTAGAAAACAGATATGATACCGATGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGT
TGACTCCAGTTATAGCCAACGCCGGATGATCAATCGTGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAG
CTGCAAAGATTGTCTTCTTTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAA
CATTTTGAAGAAGTGAATCGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAG
GAGCTTTGACGCTGCGAGGCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCC
CAAGATAGCAGCAACGGCTCATCTCTCTCTCTCTGTTTCTGTCTTGTGAAGTTTCCTTAT
CTGTTGAGATTGGTTCTC
C

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4EE15TF 709 0 0
GAGTATAAGAAAAGAGC*TGCACATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAGTGACAAGATAT
GTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACTTGAGGTAACCG
TTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATATTTGGATCTCTT
GGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGTCCATAACAGTAGCCCGGGGAAGAACATGAAG
ACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTCCTTCTGTACCATCTTACTCTCAGC
CAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGATACCGAGGTCG
AGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCAACGCCGGATGA
TCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCTTTGCTCCAAAG
ATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAATCGGTGTTAGAG
ATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAGGCCTTGGAGAA
AGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGCTCATCTCTCTC
TCT**GTTTCTGTCTTGTGAAGTTTCCTTATCTGTTGAGATTGGTTCTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4D903TF 686 0 0
AAAAGAGC*TGCACATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAATGACAAGATATGTAAGGAAC
TTTTAGTAGTAGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACTTGAGGTAACCGTTCTTGATA
GTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATATTTGGATCTCTTGGGAACTTT
TTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGAAGAACATGAAGACGAACATG
AACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTCCTTCTGTACCATCTTACTCTCAGCCAGTTCATT
ATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGATACCGAGGTCGAGCACCACG
CTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCAACGCCGGATGATCAATCATG
GCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCTTTGCTCCAAAGATATCACCA
GCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAATCGGTGTTAGAGATGGGTTTT
GTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAGGCCTTGGAGAAAGAGGGGTC
AAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGCTCATCTCTCTCTCT**GTTT
CTGTCTTGTGAAGTTTCCTTATCT
CC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4GW23TF 766 0 0
GCGTAGGCGAACATTGGTTGTTCATGTCCAAATATAAACGAGTCTATATTGAACATAGAG
CCT*AAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGC*TGCGCATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAG
TGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCGTAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACT
TGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCTTTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATAT
TTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGAAATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGA
AGAACATGAAGACGAACATGAACTGTAAATACATCTCGAAGAACTTTCTTCTGTACCATC
TTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGCATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGA
TACCGATGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCCTGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCA
ACGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTCCCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCT
TTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTCATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAAT
CGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTAATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAG
GCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGGACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGC
TCATCTCTCTCTCTCTGTTTCTGTCTTGTGAAGTTTCCTTATCT
CC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4B912TF 813 0 0
TA
GAGTTTCACAATCATATAGTTGTTAAATGCGTAGGCGAACATTGGTTGTTCATGTCCAAA
TATAAACGAGTCTATATTGAACATAGAGCCTTAAAAACTGAGTATAAGAAAAGAGCCTGC
ACATTGAGTGAGTCCAGAGTATATACAGTGACAAGATATGTAAGGAACTTTTAGTAGTCG
TAGTCTTCTGGCTGTGCAAATGGGTACTTGAGGTAACCGTTCTTGATAGTGGAAGGGTCT
TTTGGTTTGTCCCAAGGATACTTCATATTTGGATCTCTTGGGAACTTTCTGAAGTTGAGA
AATGGTGCCCATAACAGTAGCCCGGGGAAGAACATGAAGACGAACATGAACTATAAATAC
ATCTCGAAGAACTTCCTTCTGTACCATCTTACTCTCAGCCAGTTCATTATGATTGGTGGC
ATTACTAGGAAGTAGAAAACAGATATGATACCGAGGTCGAGCACCACGCTGCCCAGTTCC
TGCTCGTGGTTGACTCCAGTTATAGCCAACGCCGGATGATCAATCATGGCAAGAACTGTC
CCTAGTTGAGCTGCAAAGATTGTCTTCTTTGCTCCAAAGATATCACCAGCCTTTGCTCTC
ATCTTGGCAACATTTTGAAGAAGTGAATCGGTGTTAGAGATGGGTTTTGTGTGAGATGTA
ATACAGAAAGGAGCTTTGACGCTGCGAGGCCTTGGAGAAAGAGGGGTCAAAGCATTCGGG
ACACAGAGCCCAAGATAGCAGCAACGGCTCATCTCTCTCTCT**GTTTCTGTCTTGTGAA
GTTTC*TTATCTGTTGAGATTGGTTCTCCCA

QA 3 813 3 813
DS 



AS 2 12

CO CL284Contig1 672 3 2 U
GGATCTTTCTCCTTCCATTGATCTGCTTCCCTGTTCACACCATCACACCTCTGTAACTAC
GGCGATGAACCTTTGTTTCACTGTTCATGTGAAAGCTCGCATAGTTCGTGGACAATCATT
GATCTTCAGTCCCTGCGCTCGTGTTCCAAGTGACGTGAACTGATTCAACTTCCAAAGACT
TCACCTTGCTCGTAACCATCATTGTGACCGTTTATGGTTCCTCACTGCACAAGATCCACC
CTCCATACCGAAGATGTTCTGAAACTCGCAAAGGATGGTCTAGAGCGTAGGGGCTACAAG
GAAGTTGGTTTCTTAAACGCTGTGGATGAAGTGGTCAGAACAGGAGTTACGCCGGCGGAG
AATCTCTTGGAAATGTACAATGGGGAATGGGGACAAAGCGTAGATCCTGTGTTCCAGGAA
CTCCTGTACTAAGAGGGATCAACCCAAACCCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGCTATCTGAGG
AACTCAAGTCTCTCATGAATAAGGTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTTGAGAACTGA
TTTTTATTTTCTTTTTTAATTTGAAGCGGTCAAAATAAAAAGTAAACATCTACGCTAAAG
GATTTCGATGTGTGGAAATCGTCTATGAATAAAAATTATTTTCTTCGTGACAAGTTTGTC
AATTTCGAAACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB04JQ C 1
AF RR4DB04TF U 1
AF RR4E470TF U 412
BS 1 651 RR4DB04TF
BS 652 672 RR4E470TF

RD RR4DB04JQ 651 0 0
GGATCTTTCTCCTTCCATTGATCTGCTTCCCTGTTCACACCATCACACCTCTGTAACTAC
GGCGATGAACCTTTGTTTCACTGTTCATGTGAAAGCTCGCATAGTTCGTGGACAATCATT
GATCTTCAGTCCCTGCGCTCGTGTTCCAAGTGACGTGAACTGATTCAACTTCCAAAGACT
TCACCTTGCTCGTAACCATCATTGTGACCGTTTATGGTTCCTCACTGCACAAGATCCACC
CTCCATACCGAAGATGTTCTGAAACTCGCAAAGGATGGTCTAGAGCGTAGGGGCTACAAG
GAAGTTGGTTTCTTAAACGCTGTGGATGAAGTGGTCAGAACAGGAGTTACGCCGGCGGAG
AATCTCTTGGAAATGTACAATGGGGAATGGGGACAAAGCGTAGATCCTGTGTTCCAGGAA
CTCCTGTACTAAGAGGGATCAACCCAAACCCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGCTATCTGAGG
AACTCAAGTCTCTCATGAATAAGGTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTTGAGAACTGA
TTTTTATTTTCTTTTTTAATTTGAAGCGGTCAAAATAAAAAGTAAACATCTACGCTAAAG
GATTTCGATGTGTGGAAATCGTCTATGAATAAAAATTATTTTCTTCGTGAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4DB04TF 651 0 0
GGATCTTTCTCCTTCCATTGATCTGCTTCCCTGTTCACACCATCACACCTCTGTAACTAC
GGCGATGAACCTTTGTTTCACTGTTCATGTGAAAGCTCGCATAGTTCGTGGACAATCATT
GATCTTCAGTCCCTGCGCTCGTGTTCCAAGTGACGTGAACTGATTCAACTTCCAAAGACT
TCACCTTGCTCGTAACCATCATTGTGACCGTTTATGGTTCCTCACTGCACAAGATCCACC
CTCCATACCGAAGATGTTCTGAAACTCGCAAAGGATGGTCTAGAGCGTAGGGGCTACAAG
GAAGTTGGTTTCTTAAACGCTGTGGATGAAGTGGTCAGAACAGGAGTTACGCCGGCGGAG
AATCTCTTGGAAATGTACAATGGGGAATGGGGACAAAGCGTAGATCCTGTGTTCCAGGAA
CTCCTGTACTAAGAGGGATCAACCCAAACCCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGCTATCTGAGG
AACTCAAGTCTCTCATGAATAAGGTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTTGAGAACTGA
TTTTTATTTTCTTTTTTAATTTGAAGCGGTCAAAATAAAAAGTAAACATCTACGCTAAAG
GATTTCGATGTGTGGAAATCGTCTATGAATAAAAATTATTTTCTTCGTGAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4E470TF 261 0 0
TTCCAGGAACTCCTGTACTAAGAGGGATCAACCCAAACCCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGC
TATCTGAGGAACTCAAGTCTCTCATGAATAAGGTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTT
GAGAACTGATTTTTATTTTCTTTTTTAATTTGAAGCGGTCAAAATAAAAAGTAAACATCT
ACGCTAAAGGATTTCGATGTGTGGAAATCGTCTATGAATAAAAATTATTTTCTTCGTGAC
AAGTTTGTCAATTTCGAAACG

QA 1 261 1 261
DS 



CO CL284Contig2 1100 9 32 U
CGTTTCGAAATTGACAAACTTGTCACGAAGAAAATAATTTTTATTCATAGACGATTTCCA
CACATCGAAATCCTTTAGCGTAGATGTTTACTTTTTATTTTGACCGCTTCAAATTAAAAA
AGAAAATAAAAATCAGTTCTCAAATCCGAATTACAACAAATAAGAAAACCTTATTCATGA
GAGACTTGAGTTCCTCAGATAGCACAAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTC
TTAGTACAGGAGTTCCTGGAACACAGGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACAT
TTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCGTAACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAGCGTTTAA
GAAACCAACTTCCTTGTAGCCCCTACGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAGAACATC
TTCAGCTACATGTTTCAACAAACCATCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAAC
TTTGTTCCTTAGCATATCTCTTTCTGCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAGATCCAAGGCAGC
TTGGAGAACGTCCTCATCATATAACAAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACAACCT
CCTCCAGGGACCTCCATCAGCGCCTCTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAACCTCAGG
GAATATTGTTGTCAGATGATTTTCCCAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGGGAGACA
AGGAAGCTTTCCAGCTAAAAATTGCCGAAATGTCATTCCAGTACAGTCCACGTATTTGTT
GTTTCGGTAGGCAAAGTACATAGGAACATCCAGTGCGTAGTCAGCATACTGCTCAAACCC
AAAAGAGTCACCAAAGACAAACGGTAGCATCCCTGTGCGGTCCTTGTCAGTGTCTGTCCA
TATATGGCTTCTCATGCTGAGGAACCCGTTTGGCTTTCCTTCGGTGAAAGGGGAATTTGC
AAATAGAGCAGTTGCTATAGGTTGCAAGGCAAGACCAACACGGAACTTCCTGATCATATC
AGCTTCTGAGCTAAAATCCAGATTAACCTGAACAGTACAAGTCCGAAGCATCATATCAAG
TCCAAGGGAACCAACTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 50 50 50 50 50 50 
35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 15 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E470JQ U 1
AF RR4DM61JQ U 26
AF RR4DN24JQ U 26
AF RR4BK66JQ U 22
AF RR4DN24TF C 174
AF RR4DM61TF C 175
AF RR4CS47JQ U 22
AF RR4FI30JQ U 24
AF RR4FI30TF C 387
BS 1 29 RR4E470JQ
BS 30 30 RR4BK66JQ
BS 31 82 RR4E470JQ
BS 83 83 RR4BK66JQ
BS 84 121 RR4E470JQ
BS 122 122 RR4BK66JQ
BS 123 147 RR4E470JQ
BS 148 148 RR4BK66JQ
BS 149 163 RR4E470JQ
BS 164 164 RR4BK66JQ
BS 165 180 RR4E470JQ
BS 181 181 RR4BK66JQ
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BS 183 183 RR4BK66JQ
BS 184 197 RR4E470JQ
BS 198 198 RR4BK66JQ
BS 199 273 RR4E470JQ
BS 274 274 RR4BK66JQ
BS 275 308 RR4E470JQ
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BS 310 316 RR4E470JQ
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BS 742 750 RR4BK66JQ
BS 751 751 RR4FI30JQ
BS 752 803 RR4BK66JQ
BS 804 804 RR4FI30JQ
BS 805 823 RR4BK66JQ
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BS 825 834 RR4BK66JQ
BS 835 854 RR4FI30JQ
BS 855 1100 RR4FI30TF

RD RR4E470JQ 316 0 0
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AAAAAATAAAAATCAGTTCTCAAATCCAAATTACAACAAATAAAAAAACCTTATTCATGA
AAAACTTGAGTTCCTCAAATAGCACAAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTC
TTAGTACAGGAGTTCCTGGAACACAGGATCTACCCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACAT
TTCCAAGAAATTCTCC

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR4DM61JQ 629 0 0
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GTTTACTTTTTATTTTGACCGCTTCAAATTAAAAAAGAAAATAAAAATCAGTTCTCAAAT
CCGAATTACAACAAATAAGAAAACCTTATTCATGAGAGACTTGAGTTCCTCAGATAGCAC
AAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACACA
GGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACATTTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCGTA
ACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAGCGTTTAAGAAACCAACTTCCTTGTAGCCCCTA
CGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAAAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAACCA
TCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTTCT
GCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAGATCCAAGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCATATAAC
AAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACGACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGCCT
CTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAAC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4DN24JQ 716 0 0
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GTTTACTTTTTATTTTGACCGCTTCAAATTAAAAAAGAAAATAAAAATCAGTTCTCAAAT
CCGAATTACAACAAATAAGAAAACCTTATTCATGAGAGACTTGAGTTCCTCAGATAGCAC
AAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACACA
GGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACATTTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCGTA
ACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAGCGTTTAAGAAACCAACTTCCTTGTAGCCCCTA
CGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAAAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAACCA
TCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTTCT
GCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAAATCCAAGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCATATAAC
AAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACGACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGCCT
CTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAACCTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTTCC
CAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGGGAGACAAGGAAGCTTTCCTGCTAAAAA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4BK66JQ 813 0 0
GC
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ATGTTTACTTTTTATTTTGACCGCTTCAAATTAAAAAAGAAAATAAAAATCAGTTCTCAA
ATCCGAATTACAACAAATAAGAAAACCTTATTCATGAGAGACTTGAGTTCCTCAGATAGC
ACAAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACA
CAGGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACATTTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCG
TAACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAGCGTTTAAGAAACCAACTTCCTTGTAGCCCC
TACGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAGAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAAC
CATCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTT
CTGCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAGATCCAAGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCATATA
ACAAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACAACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGC
CTCTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAACCTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTT
CCCAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGGGAGACAAGGAAGCTTTCCAGCTAAAA*TT
GCCGAAACGTCATTCCAGTACAGTCCACGTATTTGTTGTTTCGGTAGGCAAAGTACATAG
*AACATCCAGTGCGTAGTCA*CATACTGCTC

QA 3 813 3 813
DS 

RD RR4DN24TF 648 0 0
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ATCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACACAGGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCAT
TGTACATTTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCGTAACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAG
CGTTTAAGAAACCAACTTCCTTGTAGCCCCTACGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCA
GAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAACCATCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTA
CTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTTCTGCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAGATCCA
AGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCATATAACAAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCAC
ACGACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGCCTCTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAA
CCTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTTCCCAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCG
GGAGACAAGGAAGCTTTCCTGCTAAAAATTGCCGAAATGTCATTCCAGTACAGTCCACGT
ATTTGTTGTTTCGGTAGGCAAAGTACATAGGAACATCCAGTGCGTAG
C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4DM61TF 647 0 0
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TCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACACAGGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATT
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GTTTAAGAAACCAACTTCCTTGTAGCCCCTACGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAG
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TGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTTCTGCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAGATCCAA
GGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCATATAACAAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACA
CGACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGCCTCTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAAC
CTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTTCCCAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGG
GAGACAAGGAAGCTTTCCTGCTAAAAATTGCCGAAATGTCATTCCAGTACAGTCCACGTA
TTTGTTGTTTCGGTAGGCAAAGTACATAGGAACATCCAGTGCGTAG
C

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4CS47JQ 766 0 0
GC
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ATGTTTACTTTTTATTTTGACCGCTTCAAATTAAAAAAGAAAATAAAAATCAGTTCTCAA
ATCCGAATTACAACAAATAAGAAAACCTTATTCATGAGAGACTTGAGTTCCTCAGATAGC
ACAAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACA
CAGGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACATTTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCG
TAACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAGCGTTTAAGAAACCAACTTCCTTGTAGCCCC
TACGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAGAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAAC
CATCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTT
CTGCTGGAGTCCAGTCAGCTGTCAGATCCAAGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCATATA
ACAAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACAACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGC
CTCTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAACCTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTT
CCCAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGGGAGACAAGGAAGCTTTCCAGCTAAAAATT
GCCGAAACGTCATTCCAGTACAGTCCACGTATTTGTTGTTTCGG

QA 3 766 3 766
DS 

RD RR4FI30JQ 831 0 0
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ATGTTTACTTTTTATTTTGACCGCTTCAAATTAAAAAAGAAAATAAAAATCAGTTCTCAA
ATCCGAATTACAACAAATAAGAAAACCTTATTCATGAGAGACTTGAGTTCCTCAGATAGC
ACAAACTCACACCTAAAAGGGTTTGGGTTGATCCCTCTTAGTACAGGAGTTCCTGGAACA
CAGGATCTACGCTTTGTCCCCATTCCCCATTGTACATTTCCAAGAGATTCTCCGCCGGCG
TAACTCCTGTTCTGACCACTTCATCCACAGCGTTTAAAAAACCAACTTCCTTGTAGCCCC
TACGCTCTAGACCATCCTTTGCGAGTTTCAAAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAAC
CATCTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTT
CTGCTGGAGTCCAGTAAGCTGTCAAATTCAAGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCGTATA
ACAAACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACAACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGC
CTCTCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAACCTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTT
CCCAATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGGGAGACAAGGAAGCTTTCCAGATAAAAATT
GCCGAAATGTCATTCCAGTACAGTCCACGTACTTGTTGTTTCGGTAGGCAAAGTACATAG
GA*CATCCAGTGCGTAGTCAGCATACTGCTCAAACCCAAAAGAGTCACCAA

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4FI30TF 714 0 0
GCTCTAGACCATC*TTTGCGAGTTTCAGAACATCTTCAGCTACATGTTTCAACAAACCAT
CTCTAAATGGTGTCTTTAAACCAGTTACTGGAACTTTGTTCCTTAGCATATCTCTTTCTG
CTGGAGTCCAGTAAGCTGTCAGATTCAAGGCAGCTTGGAGAACGTCCTCATCGTATAACA
AACCCACCCAGAAAGCTGGAAGGGCACACAACCTCCTCCAGGGACCTCCATCAGCGCCTC
TCATCTCCATGTATCTCTTCAACCGAACCTCAGGGAATATTGTTGTCAGATGATTTTCCC
AATCATTATATGTAGGGAGTTCACCCGGGAGACAAGGAAGCTTTCCAGATAAAAATTGCC
GAAATGTCATTCCAGTACAGTCCACGTACTTGTTGTTTCGGTAGGCAAAGTACATAGGAA
CATCCAGTGCGTAGTCAGCATACTGCTCAAACCCAAAAGAGTCACCAAAGACAAACGGTA
GCATCCCTGTGCGGTCCTTGTCAGTGTCTGTCCATATATGGCTTCTCATGCTGAGGAACC
CGTTTGGCTTTCCTTCGGTGAAAGGGGAATTTGCAAATAGAGCAGTTGCTATAGGTTGCA
AGGCAAGACCAACACGGAACTTCCTGATCATATCAGCTTCTGAGCTAAAATCCAGATTAA
CCTGAACAGTACAAGTCCGAAGCATCATATCAAGTCCAAGGGAACCAACTTTCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 12

CO CL285Contig1 1192 12 15 U
GGGGTTTTGTCCCATCTTTCTTTATTATCCTCTCAATGGCGGATAACACGAGAGCTGTCC
AAATCCAAAGGCTTGTGTTCACTGCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCATTCTTTCTTGTTCT
TTTGCTTCGGATTCAAGTAAGATAATATGGTGGTTGCTGCTATAGCCTCTGCTTCTGGTT
CTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACACGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTG
CTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATCTCAACAGAC
TACGGTTATCTGGTTTGAAGACTAAAGCATCAAATGCTACTGCTGTTGAGAATGCAAATG
CGGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACGCTG
ATGCCACCCTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGA
ATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCG
GCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTG
AACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAAT
CAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTG
ATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGTTTACTAT
ACATAGAAACAGCAGATAGGCCTGGACTGTTAGTTGAGCTGGTCAAAATCATTTCAGATA
TCAGCGTCGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGCTGGCTAAGGTAAAGT
TCCACGTAAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATA
GTCTGAGGTATTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGATGTTT
ACCAAAAAAAAAAAAATGAAGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCCTTTTTC
TTTACATTTGACAAAAATAAGCTGTTTTTTTAGTGGCCTTATCTCATACATCTGTGTAGT
AGCAACATTATCTGTTTCAATCATTTATCAAATTTACTTTCATTTACGACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF21TF U 1
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AF RR4DC45TF U 125
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AF RR4D514TF U 59
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AF RR4FF21JQ C 857
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BS 192 712 RR4FF21TF
BS 713 716 RR4D514TF
BS 717 717 RR4DC45TF
BS 718 801 RR4D514TF
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BS 803 827 RR4D514TF
BS 828 828 RR4EF05TF
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BS 867 879 RR4D514TF
BS 880 1153 RR4EF05TF
BS 1154 1182 RR4FZ84TF
BS 1183 1192 RR4FF21JQ

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AAATCCAAAGGCTTGTGTTCACTGCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCATTCTTTCTTGTTCT
TTTGCTTCGGATTCAAGTAAGATAATATGGTGGTTGCTGCTATAGCCTCTGCTTCTGGTT
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CTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATCTCAACAGAC
TACGGTTATCTGGTTTGAAGACTAAAGCATCAAATGCTACTGCTGTTGAGAATGCAAATG
CGGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACGCTG
ATGCCACCCTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGA
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GCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTG
AACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAAT
CAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGA

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DS 

RD RR4C273TF 610 0 0
GGGTCC
AAATCCAAAGGCTTGTGTTCACTGCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCATTCTTTCTTGTTCT
TTTGCTTCGGATTCAAGTAAGATAATATGGTGGTTGCTGCTATAGCCTCTGCTTCTGGTT
CTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACACGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTG
CTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATCCCAACAGAC
TACGGTTATCTGGTTTGAAGACTAAAGCATCAAATGCTACTGCTGTTGAGAATGCAAATG
CGGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACGCTG
ATGCCACCCTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGA
ATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCG
GCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTG
AACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAAT
CAAG

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DS 

RD RR4DC45TF 679 0 0
GGGG
GGATTCAAGTAAGATAATATGGTGGTTGCTGCTATAGCCTCTGCTTCTGGTTCTGCTCCT
TGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACACGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTGCTCCTAGG
ACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATCTCAACAGACTACGGTTA
TCTGGTTTGAAGACTAAAGCATCAAATGCTACTGCTGTTGAGAATGCAAATGCGGCTGAT
TCTGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACGCTGATGCCACC
CTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGAATGCGCTC
AAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCAAGCAC
AACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCTT
GAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCT
CAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGAC
ATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGTTTACTATACATAGAA
ACAGCAGATAG
CCTG

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DS 

RD RR4GW09TF 692 0 0
GG
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CCTCTGCTTCTGGTTCTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACACGATGCTG
GAGCTTTCTGTCTTGCTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTA
CCAATCTCAACAGACTACGGTTATCTGGTTTGAAGACTAAAGCATCAAATGCTACTGCTG
TTGAGAATGCAAATGCGGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACC
AAGATTCTGACGCTGATGCCACCCTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTC
TACTTGACACTATGAATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCT
ACCTAGACTCTTCCGGCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAA
AAGTAGAAGACCCTGAACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTG
AGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCAC
CAACCGAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCG
ACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCAG

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DS 

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GG
AAATCCAAAGGCTTGTGTTCACTGCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCATTCTTTCTTGTTCT
TTTGCTTCGGATTCAAGTAAGATAATATGGTGGTTGCTGCTATAGCCTCTGCTTCTGGTT
CTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACACGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTG
CTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATCTCAACAGAC
TACGGTTATCTGGTTTGAAGACTAAAGCATCAAATGCTACTGCTGTTGAGAATGCAAATG
CGGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACGCTG
ATGCCACCCTCGTTGAAGTTACATTCGGA**CCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGA
ATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCG
GCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTG
AACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAAT
CAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAG*TTG
ATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGTTTACTAT
ACATAGAAACAGCAGATAGGC*TGGACTGTTAGTTGAGCTGGTCAAA*TCATTTCAGATA
TCAGCGTCGCTGTCGAATCTGGAGA*TTTGACACCGAGG
TTGCTGG

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DS 

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ACCCTGAACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATC
CTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTTTTCCACCAACTGAAC
AGGTTGATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGTT
TACTATACATAGAAACAGCAGATAGGCCTGGACTGTTAGTTGAGCTGGTCAAAATCATTT
CAGATATCAGCGTCGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGCTGGCTAAGG
TAAAGTTCCACGTAAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTG
CTAAT

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DS 

RD RR4GW09JQ 656 0 0
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CCTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGAATGCGCT
CAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCAAGCA
CAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCT
TGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTC
TCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACCGAACAGGTTGATGTGGA
CATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGTTTACTATACATAGA
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AAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAG
GTATTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGATGTTTACC

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DS 

RD RR4D514JQ 550 0 0
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TCTTCCGGCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAA
GACCCTGAACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCAT
CCTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAA
CAGGTTGATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGT
TTACTATACATAGAAACAGCAGATAGGCCTGGACTGTTAGTTGAGCTGGTCAAAATCATT
TCAGATATCAGCGTCGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGCTGGCTAAG
GTAAAGTTCCACGTAAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATT
GCTAATAGTCTGAGGTATTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAAT
GATGTTTACC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4EF05TF 699 0 0
G
CTTGGAGCTCTACTTGACACTATGAATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGTCAAG
GCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCTAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGAT
AGTGGAAGAAAAGTA**AGACCCCGAACTGCTTGAGGTCATCCGTCTCACTGTCATCAAC
AACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGT
GTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACATTTCAACACACATAAGCATTAAAGAT
GATGGACCCGACCGCAGTTTACTACACATAGAAACAGCAGATAGGCCTGGACTGTTAGTT
GAGCTGGTCAAAATCATTTCAGATATCAGCGTCGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACC
GAGGGTTTGCTGGCTAAGGTAAAGTTCCACGTAAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAG
CCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAGGTATTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGAC
GAGTCAAGTTTCTGAAATGATGTTTACCAAAAAAAAAAAAATGAAGTCACATTCCATATG
ACTGCTTTTTACCACTTCCTTTTTCTTTACATTTGACAAAAATAAGCTGTTTTTTTAGTG
GCCTTATCTCATACATCTGTGTAGTAGCAACATTATCT

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DS 

RD RR4DC45JQ 577 0 0
TTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTT
CTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGG
ACATTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGACCCGACCGCAGTTTACTATACATAG
AAACAGCAGATAGGCCTGGACTGTTAGTTGAGCTGGTCAAAATCATTTCAGATATCAGCG
TCGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGCTGGCTAAGGTAAAGTTCCACG
TAAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGA
GGTATTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGATGTTTACCAAA
AAAAAAA***TGAAGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCCTTTTTCTTTACA
TTTGACAAAAATAAGCTGTTTTTTTAGTGGCCTTATCTCATACATCTGTGTAGTAGCAAC
ATTATCTGTTTCAATCATTTATCAAATTTACTTTCA
C

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DS 

RD RR4FZ84TF 385 0 0
GCCTGGACTGTTAGTTGAGCTGGTCAAAATCATTTCAGATATCAGCGTCGCTGTCGAATC
TGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGCTGGCTAAGGTAAAGTTCCACGTAAGTTACAGAAA
CAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAGGTATTTCTTGAG
GCGCCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGATGTTTACCAAAAAAAAAA***TGA
AGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCCTTTTTCTTTACATT*GACAAAAATA
AGCTGTTTTTTTAGTGGCCTTATCTCATACATCTGTGTAGTAGCAACATTATCTGTTTCA
ATCATTTATCAAATTTACTTTCA
TT

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DS 

RD RR4FF21JQ 336 0 0
ATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGCTGGTTAAGGTAAAGTTCCACGTAAGTTACAG
AAACAAAGCTTTAATCAAGCCTTTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTTTGAGGTATTTCTT
GAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTTTGAAATGATGTTTACCAAAAAAAAAAAAA
TGAAGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCCTTTTTCTTTACATTTGACAAAA
ATAAGCTGTTTTTTTAGTGGCCTTATTTCATACATCTGTGTAGTAGCAACATTATCTGTT
TCAATCATTTATCAAATTTACTTTCATTTACGACCT

QA 1 336 1 336
DS 



AS 1 12

CO CL286Contig1 794 12 14 U
GGACTCATTCTTACATTCATATCAGCAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTG
ACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCAT
CGGCCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATA
GCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCG
ACATTGGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGA
ACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTT
TGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAG
TAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGC
TTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTACAGACGG
TGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAA
ATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGC
AAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTG
CCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAAACTGTGAGA
ATATTCAGTCAAAC


BQ
10 10 10 10 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 15 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 30 20 60 60 30 60 60 60 
60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX92TF U 2
AF RR4CI96TF U 3
AF RR4EM27TF U 1
AF RR4G616TF U 1
AF RR4G277TF U 5
AF RR4CI96JQ C 43
AF RR4FM20TF U 472
AF RR4FM20JQ C 482
AF RR4EM27JQ C 38
AF RR4DI44TF U 5
AF RR4DI44JQ C 5
AF RR4AB23TF U 577
BS 1 24 RR4EM27TF
BS 25 25 RR4G616TF
BS 26 149 RR4EM27TF
BS 150 150 RR4CI96TF
BS 151 325 RR4EM27TF
BS 326 326 RR4CI96TF
BS 327 572 RR4EM27TF
BS 573 573 RR4CI96TF
BS 574 632 RR4EM27TF
BS 633 633 RR4G616TF
BS 634 711 RR4EM27TF
BS 712 712 RR4FM20TF
BS 713 750 RR4EM27TF
BS 751 794 RR4AB23TF

RD RR4BX92TF 248 0 0
GAC
TCATTCTTACATTCATATCAGCAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTGACTC
TCTCCTCCTCTCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCGTAGCATCGGC
CCCGGCCGAACAACAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACAAGAGATAGCTC
CGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCA*TCTCGGACAA*TCCGGACAGCACATCGACAT
TGGAG

QA 4 248 4 248
DS 

RD RR4CI96TF 603 0 0
GG
TCATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTGACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCATCGGC
CCCGGCCGAACGAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTC
CGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACAT
TGGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGG
CAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAA
TCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAA
GACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGC
CGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTACAGACGGTGAG
TACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAA
T

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR4EM27TF 751 0 0
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ACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCAT
CGGCCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACGCATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATA
GCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCG
ACATTGGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGA
ACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGG*ACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTT
TGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAG
TAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGC
TTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTACAGACGG
TGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACGGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAA
ATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCA*TATATAATGAACGTTCATATATAATGC
AAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGA*TAAAACTG
CCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATC
C

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4G616TF 722 0 0
GGAC
TCATTCTTACATTCATATCAGCAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTGACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCATCGGC
CCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTC
CGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACAT
TGGAGGCCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGG
CAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAA
TCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAA
GACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGC
CGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTACAGACGGTGAG
TACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAA
TGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAA
TTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGA*ATAAACTGCC

QA 5 722 5 722
DS 

RD RR4G277TF 745 0 0
GG
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TCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCATCGGCCC
CGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCG
GCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTG
GAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCA
ATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTAGGCTTTTTGAATC
TGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGA
CGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTACAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCGTATATAATGCAAAATT
GAATAAAATTGTCTTTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGA*T*AAACTGCCTCCT
TGTGAGTGTGGGATGGCATTGAT

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR4CI96JQ 709 0 0
CAACTATGGCTCACACTGACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCG
CCACCGTTGTCTTCGCATCGGCCCCGGCCGAACGAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCA
AAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACA
AATCCGGACAGCACATCGACATTGGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAG
GTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTC
CGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGT
ATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACT
TCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGA
ACAACTGCCTACAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCA
TCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATG
AACGTTCATATATAATGCGAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAAT
GTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATC
C

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4FM20TF 280 0 0
G
GCAATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCT
ACAGACGGTGAGTGCCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAAT
CATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATA
TATAATGCAAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAA
TAAAGCTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATC
T

QA 2 279 2 279
DS 

RD RR4FM20JQ 269 0 0
TGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTACAGACGGT
GAGTGCCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAA
TAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCA
AAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAGCTGC
CTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGAT
T

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR4EM27JQ 714 0 0
TCCAACAACTATGGCTCACACTGACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCT
CATCGCCACCGTTGTCTTCGCATCGGCCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACGCATTTAA
AATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTC
GGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGG
ACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGG*ACAGCGCCGTG
TCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGG
CTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCA
GTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGA
ACGGAACAACTGCCTACAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACGGGAA
GTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCA*TATA
TAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCA
ATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATC
C

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4DI44TF 746 0 0
GG
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TCCTCCTCTCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCGTAGCATCGGCCC
CGGCCGAACAACAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACAAGAGATAGCTCCG
GCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTG
GAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCA
ATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATC
TGAACTCTGACTGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGA
CGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACTGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATT
GAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGA**TAAACTGCCTCCT
TGTGAGTGTGGGATGGCATTGATC

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR4DI44JQ 786 0 0
GG
ATTCTTACATTCATATCAGCAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTGACTCTC
TCCTCCTCTCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCGTAGCATCGGCCC
CGGCCGAACAACAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACAAGAGATAGCTCCG
GCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTG
GAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCA
ATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATC
TGAACTCTGACTGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGA
CGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACTGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATT
GAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCT
TGTGAGTGTGGGATGGCATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAAACTGTGAGAATATTC
AG
CC

QA 3 784 3 784
DS 

RD RR4AB23TF 218 0 0
G
GTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATA
TAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACACGTGATAGCA
ATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATCTAAAAGT
TCCAATCGAATTAAACTGTGAGAATATTCAGTCAAAC

QA 2 218 2 218
DS 



AS 2 12

CO CL287Contig1 458 6 10 U
GGATACTGGAATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTCTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGATAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTGCTCAAAATGTGA
GAGAAAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCGTGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTGTTTATAT
ATCCAGAGTTATATGTATATAGGTGTTGTATATGCAGTCCATGATCTTAAATTTCCATGT
AAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGTCTATAATTTGTTTTATTAGCCAATATACAGTG
TTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D685JQ C 1
AF RR4D685TF U 1
AF RR4BB09JQ C 225
AF RR4BB09TF U 225
AF RR4BD36JQ C 225
AF RR4BD36TF U 225
BS 1 224 RR4D685TF
BS 225 225 RR4BB09TF
BS 226 270 RR4D685TF
BS 271 271 RR4BB09TF
BS 272 322 RR4D685TF
BS 323 323 RR4BB09TF
BS 324 387 RR4D685TF
BS 388 388 RR4BB09TF
BS 389 409 RR4D685TF
BS 410 458 RR4BB09TF

RD RR4D685JQ 409 0 0
GGATACTGGAATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTCTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGATAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTGCTCAAAATGTGA
GAGAAAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTATATCTCCCCTTTGTTGATGTTTGTTTATAT
ATCCAGAGTTATATGTATATAGATGTTGTATATGCAGTCCATGATCTTAAATTTCCATGT
AAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGGCTATAATTTGTTTTATTAGCC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR4D685TF 409 0 0
GGATACTGGAATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTCTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGATAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTGCTCAAAATGTGA
GAGAAAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTATATCTCCCCTTTGTTGATGTTTGTTTATAT
ATCCAGAGTTATATGTATATAGATGTTGTATATGCAGTCCATGATCTTAAATTTCCATGT
AAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGGCTATAATTTGTTTTATTAGCC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR4BB09JQ 192 0 0
GTGGACCGTTTTGTTCCATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGT
TGATGTTTGTTTATATATCCAGAGTTATATGTATATAGGTGTTGTATATGCAGTCCATGA
TCTTAAATTTCCATGTAAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGTCTATAATTTGTTTTAT
TAGCC
TAATATA

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR4BB09TF 234 0 0
GTGGACCGTTTTGTTCCATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGT
TGATGTTTGTTTATATATCCAGAGTTATATGTATATAGGTGTTGTATATGCAGTCCATGA
TCTTAAATTTCCATGTAAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGTCTATAATTTGTTTTAT
TAGCCAATATACAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTT

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR4BD36JQ 211 0 0
GTGGACCGTTTTGTTCCATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGT
TGATGTTTGTTTATATATCCAGAGTTATATGTATATAGGTGTTGTATATGCAGTCCATGA
TCTTAAATTTCCATGTAAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGTCTATAATTTGTTTTAT
TAGCCAATATACAGTGTTTAATTATTATAAT

QA 1 211 1 211
DS 

RD RR4BD36TF 234 0 0
GTGGACCGTTTTGTTCCATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGT
TGATGTTTGTTTATATATCCAGAGTTATATGTATATAGGTGTTGTATATGCAGTCCATGA
TCTTAAATTTCCATGTAAATCTATGAGATAATGTGTTTTGAGGTCTATAATTTGTTTTAT
TAGCCAATATACAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTT

QA 1 234 1 234
DS 



CO CL287Contig2 474 6 7 U
CTCAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTTATTATAATAATTAAACACTGTATATTGACTAATA
AAACAAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATC
ATGGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAA
ACAAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCACCATGGAACAA
AACGGTCCATGAGAAGACAGACAGTGAGCTCAGACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACAT
TTTGAGCAACTCCTCTTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAGAAGATGTAC
TCTTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCT
CTCCAACCCAGAGCTCCATAGCTTTTGCCATTCTTCTTGTTGATTCCAGTATCC


BQ
10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DG01JQ U 1
AF RR4HB77JQB U 1
AF RR4D789JQ U 3
AF RR4HB77TF C 1
AF RR4DG01TF C 1
AF RR4D789TF C 3
BS 1 25 RR4DG01JQ
BS 26 26 RR4HB77JQB
BS 27 243 RR4DG01JQ
BS 244 244 RR4HB77JQB
BS 245 271 RR4DG01JQ
BS 272 272 RR4HB77JQB
BS 273 474 RR4DG01JQ

RD RR4DG01JQ 474 0 0
CTCAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTCATTATAATAATTAAACACTGTATATTGACTAATA
AAACAAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATC
ATGGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAA
ACAAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCACCATGGAACAA
AACAGTCCATGAGAAGACAGACAGTGAGCTCGGACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACAT
TTTGAGCAACTCCTCTTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAGAAGATGTAC
TCTTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCT
CTCCAACCCAGAGCTCCATAGCTTTTGCCATTCTTCTTGTTGATTCCAGTATCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4HB77JQB 429 0 0
G
TCAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTTATTATAATAATTAAACACTGTATATTGACTAATAA
AACAAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATCA
TGGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAAA
CAAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCGCCATGGAACAAA
ACGGTCCATGAAAAGACAGACAGTGAGCTCAAACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACATT
TTGAGCAACTCCTCTTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAAAAAATGTACT
CTTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCTC
TCCAACCC

QA 2 429 2 429
DS 

RD RR4D789JQ 465 0 0
CAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTTATTATAATAATTAAACACTGTATATTGGCTAATAAA
ACGAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATCAT
GGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAAAC
AAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCACCATGGAACAAAA
CGGTCCATGAGAAGACAGACAGTGAGCTCAGACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACATTT
TGAGCAACTCCTCCTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAAAAAATGTACTC
TTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCTCT
CCAACCCAGAGCTCCATAGCTTTTGCCATTCTTCTTGTTGATTCC

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4HB77TF 474 0 0
G
TCAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTTATTATAATAATTAAACACTGTATATTGACTAATAA
AACAAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATCA
TGGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAAA
CAAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCGCCATGGAACAAA
ACGGTCCATGAGAAGACAGACAGTGAGCTCAGACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACATT
TTGAGCAACTCCTCTTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAGAAGATGTACT
CTTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCTC
TCCAACCCAGAGCTCCATAGCTTTTGCCATTCCTCTTGTTGATTCCAGTATCC

QA 2 474 2 474
DS 

RD RR4DG01TF 474 0 0
C
TCAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTCATTATAATAATTAAACACTGTATATTGACTAATAA
AACAAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATCA
TGGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAAA
CAAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCACCATGGAACAAA
ACAGTCCATGAGAAGACAGACAGTGAGCTCGGACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACATT
TTGAGCAACTCCTCTTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAGAAGATGTACT
CTTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCTC
TCCAACCCAGAGCTCCATAGCTTTTGCCATTCTTCTTGTTGATTCCAGTATCC

QA 2 474 2 474
DS 

RD RR4D789TF 472 0 0
CAAAAGAAAGCTGTCATCATTTTTATTATAATAATTAAACACTGTATATTGGCTAATAAA
ACGAATTATAGCCCTCAAAACACATTACCCTCATAGATTTACATGGAAATTTAAGATCAT
GGACTGCATATACAACATCTATATACATATATATATACATATAACTCTGGATATATAAAC
AAACATCAACAAAGGGGAGATCTAAAAAATACTATATTGGAGGATCACCATGGAACAAAA
CGGTCCATGAGAAGACAGACAGTGAGCTCAGACATAGTTGTATCCTTTTCTCTCACATTT
TGAGCAACTCCTCCTTCTTCTTCTCCTTGTTGTTGTTTGGACACAATAGAAGATGTACTC
TTCTTGTTTTGCATCAACGGGTTTCTATGGTTTATCTTCTCACCCATCTTTTTCATCTCT
CCAACCCAGAGCTCCATAGCTTTTGCCATTCTTCTTGTTGATTCCAGTATCC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 11

CO CL288Contig1 843 11 21 U
TTTTTTTTTATTCGAAAAATTCAGACAAAAGCAGAAGAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGT
CTGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGT
TAAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTC
CCACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAG
GAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAAC
ATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCCCATA
TCTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGA
CGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAAC
GTCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATA
CAAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAAATAA
AAATGAGGTTTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGT
GGCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACAT
CTGAAATGTCTCACACCTTGAAATTAACTGTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGA
TTGTATTTGGG*AACATGTTTTTTCTTTTTT*GCAATATATGTTCTTATTCTAGTAAAAG
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 30 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 40 55 55 55 55 50 50 50 35 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
25 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EE17TF U 1
AF RR4AU26JQ C 260
AF RR4A482JQ C 193
AF RR4CY16TF U 2
AF RR4A903TF U 55
AF RR4AU26TF U 9
AF RR4DA83TF U 21
AF RR4A482TF U 36
AF RR4CY16JQ C 62
AF RR4DA83JQ C 193
AF RR4EE17JQ C 265
BS 1 343 RR4EE17TF
BS 344 344 RR4AU26TF
BS 345 412 RR4EE17TF
BS 413 413 RR4AU26TF
BS 414 457 RR4EE17TF
BS 458 458 RR4AU26TF
BS 459 577 RR4EE17TF
BS 578 578 RR4AU26TF
BS 579 587 RR4EE17TF
BS 588 588 RR4AU26TF
BS 589 603 RR4EE17TF
BS 604 696 RR4CY16TF
BS 697 697 RR4AU26TF
BS 698 736 RR4CY16TF
BS 737 791 RR4AU26TF
BS 792 792 RR4DA83TF
BS 793 803 RR4AU26TF
BS 804 811 RR4CY16JQ
BS 812 812 RR4DA83JQ
BS 813 834 RR4CY16JQ
BS 835 843 RR4EE17JQ

RD RR4EE17TF 603 0 0
TTTTTTTTTATTCGAAAAATTCAGACAAAAGCAGAAGAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGT
CTGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGT
TAAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTC
CCACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAG
GAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAAC
ATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATA
TCTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATGA
CGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAAC
GTCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATA
CAAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAA
AAA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4AU26JQ 425 0 0
TGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGGAATCTCC
TCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCCCATATTTACAGCAATGGACATAT
TTGTTTAGATATTTTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGACGGTTAGTTCAGTACGCAT
CAGCATTCTTTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATAATGACCG
ATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTTTCCTAAAGATACAAGATGGTGGTTCCATGA
CGACAAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAAATAAAAATGAGGTTTTATATAAT
TTCCCCAGAGACTGGTAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTGGCCTCAAACCCTTTTTCT
TTCTT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4A482JQ 498 0 0
AGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAGGTA
CGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGG
AATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCCCGTATCTACAGCAATG
GACATATTTGTTTAGATATTTTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGACGGTTAGTTCAG
TATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATA
ATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGTGGT
TCCATGACGACAAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAAATAAAAATGAGGTTTT
ATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTG*GGCCTCAAACCC
TTTTTTTTTCTTTTTATC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4CY16TF 751 0 0
TTTTTTTT
ATTCGAAAAATTCAGACAAAAGCAGAAGAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGTCTGATTCTA
CGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGTTAAGCAAGA
TCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTCCCACTGGGT
TTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAG
GTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACTCCA
TGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATATCTACAGCA
ATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCCGCCATGACGGTTAGTT
CAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTG
ATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGACACAAGATGGT
GGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAAAAATGAGGT
TTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTGGCCTCAAA
CCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTCTGTATGGATGATTATGTAGACATCTGAAATGT
CTCACAC
TTGAATAACTGTTCTT

QA 9 735 9 735
DS 

RD RR4A903TF 702 0 0
GG
GTGTCTGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAG
GCGTTAAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAAT
CCTCCCACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTA
ACAGGAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCT
GAACATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCC
CATATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATGTTCTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCC
ATGACGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAG
CAACGTCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAA
GATACAAGATGGTGGTTCCATGACGACGAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAA
ATAAAAATGAGGTTTTATACAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCC
TTGTGGCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAG
ACATCTGAAATGTCTCACACCTTGAAATTAACTGTTTCTT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR4AU26TF 800 0 0
A
ATTCGAAAAATTCAGACAAAAGCAGAAGAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGTCTGATTCTA
CGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGTTAAGCAAGA
TCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGTTATCAGATTGGCAAGTCAATCCTCCCACTGGGT
TTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAG
TTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCA
TGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCCCATATCTACAGCA
ATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGACGGTTAGTT
CAGTACGCATCAGCATTCTCTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTG
ATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGT
GGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAAATAAAAATGAGGT
TTTATATAATTTCCCCAGAGACTGGTAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTGGCCTCAAA
CCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACATCTGAAATGT
CTCACACCTTGAAATTAACTGTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTGTATTTG
GGGAACATGTTTTT
TTCTT

QA 2 795 2 795
DS 

RD RR4DA83TF 785 0 0
GG
AGACAAAAGCAGAAGAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGTCTGATTCTACGCCTGTCTCCAC
GACCATGACCAGCTCTTTATCTCCTTCACGCAAGGCGTTAAGCAAGATCGCGTGTAATAG
GCTACAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTCCCACTGGGTTTAAGCACAAAGT
TACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAGGTACGCTCTATTC
GAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGGAATCTCCTCA
GGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCCCATATCTACAGCAATGGACATATTTG
TTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGACGGTTAGTTCAGTATGCATCAG
CATTCTCTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATAATGACCGATA
TGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGTGGTTCCATGACGA
CAAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAAATAAAAATGAGGTTTTATATAATTTC
CCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTGGCCTCAAACCCTTTTTCTTTC
TTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACATCTGAA*TGTCTCACACCTTGAA
ATTAACTGTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTGTATTTGGG*AACATGTTTT
T
CT

QA 3 783 3 783
DS 

RD RR4A482TF 775 0 0
G
GAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGTCTGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCT
CTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGTTAAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGT
TATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTCCCACTGC*TTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCC
AAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACA
AGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTC
CACCGGCGCCGCTACATCCCCGTATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGT
ATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGACGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGC
TTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCA
AGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGT
ACTATGACCAATCATCATAAATAAAAATGAGGTTTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATA
GTAACTGATATTGGAATTCCTTG*GGCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTT
TTGTATGGATGATTATGTAGACATCTGAAATGTCTCACACCTTGAAATTAACTGTTTCTT
TCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTGTATTTGGG*AACATGTTTTT
TTCTTTT

QA 2 768 2 768
DS 

RD RR4CY16JQ 775 0 0
TGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGTT
AAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTACAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTCC
CACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGG
AGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACA
TTACTCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATAT
CTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCCGCCATGAC
GGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAACG
TCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGACAC
AAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAAA
AATGAGGTTTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTG
GCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTCTGTATGGATGATTATGTAGACATT
TGAAATGTCTCACACCTTGAA*TTAACTGTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGAT
TGTATTTGGG*AACATGTTTTCTCTTTTTTTGCAATATATGTTCTTATTCTAG
GG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4DA83JQ 644 0 0
AGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAGGTA
CGCTCTATTCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGG
AATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCGCCGCTACATCCCCATATCTACAGCAATG
GACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCTGCCATGACGGTTAGTTCAG
TATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTTTCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATA
ATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGTGGT
TCCATGACGACAAGGCATGATGGTACTATGACCAATCATCATAAATAAAAATGAGGTTTT
ATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTGGCCTCAAACCC
TTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACATCTGAAATGTCTC
ACACCTTGAAATTAACTGTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTGTATTTGGG*
AACATGTTTTTTCTTTTTT*GCAATATATGTCCTTATTCTAG
TA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4EE17JQ 579 0 0
ATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGGAATCTCCTCAGG
TAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATATCTACAGCAATGGACATATTTGTT
TAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATGACGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCA
TTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATAATGACCGATATG
TAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGTGGTTCCATGACGACA
AGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAAAAATGAGGTTTTATATAATTTCCC
CAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGAATTCCTTGTGGCCTCGAACCCTTTTTCTTTCTT
TCTATCTGTTTTCTGTATGGATGATTATGTAGACATTTGAAATGTCTCACACCTTGAA*T
TAACTGTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTGTATTTGGG*AACATGTTTTCT
CTTTTTT*GCAATATATGTTCTTATTCTAGTAAAAGTTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 2 12

CO CL289Contig1 584 6 5 U
GGATCTCGACTCCATCCACTTCTGTTGCATCCTTCAAACGTACTCATAGCAAAAAAGGAA
ATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAA
TCCGGACAGGCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCTTACATGAGAGGACTAAATTCT
TACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCACTCTGCACC
GAACAGTGCTTCGCTAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGTGGA
GCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAAC
GCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTT
GAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTTCTTATATTATTACTATATATTTGT
TATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTT
CTTACTGATCAAACGGTACCTTTTTTTTTGTTTGCATTGCCAAA


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CT94JQ C 33
AF RR4BH66TF U 1
AF RR4BL95JQ C 1
AF RR4BL95TF U 1
AF RR4FZ93TF U 1
AF RR4GM06TF U 1
BS 1 191 RR4BH66TF
BS 192 192 RR4BL95TF
BS 193 550 RR4BH66TF
BS 551 582 RR4FZ93TF
BS 583 584 RR4GM06TF

RD RR4CT94JQ 225 0 0
TTCAAACGTACTCATAGCAAAAAAGGAAATGGCTACAGCAGCGGCCCCGGCGGTGGTTGC
ACGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGGCACAGAGGAAGACGGAGATGAA
AATTTTTTACATGAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGT
TGTCTCCATGGGATTACCACTTTGCACCGAACAGTGCTTCGCTAA

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR4BH66TF 550 0 0
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ATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAA
TCCGGACAGGCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCTTACATGAGAGGACTAAATTCT
TACGGTGGTCTAAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCACTCTGCACC
GAACAGTGCTTCGCTAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGTGGA
GCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAAC
GCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTT
GAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTTCTTATATTATTACTATATATTTGT
TATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTT
CTTACTGATC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4BL95JQ 545 0 0
GGATCTCGACTCCATCCACTTCTGTTGCATCCTTCAAACGTACTCATAGCAAAAAAGGAA
ATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTAGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAA
TCCGGACAGGCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCTTACATGAGAGGACTAAATTCT
TACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCACTCTGCACC
GAACAGTGCTTCGCTAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGTGGA
GCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAAC
GCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTT
GAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTTCTTATATTATTACTATATATTTGT
TATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTT
CTTA
T

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4BL95TF 545 0 0
GGATCTCGACTCCATCCACTTCTGTTGCATCCTTCAAACGTACTCATAGCAAAAAAGGAA
ATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTAGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAA
TCCGGACAGGCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCTTACATGAGAGGACTAAATTCT
TACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCACTCTGCACC
GAACAGTGCTTCGCTAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGTGGA
GCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAAC
GCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTT
GAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTTCTTATATTATTACTATATATTTGT
TATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTT
CTTA
T

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4FZ93TF 582 0 0
GGATCTCGACTCCATCCATTTCTGTTGCATCCTTCAAACGTACTCATAGCAAAAAAGGAA
ATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAA
TCCGGACAGGCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCTTACATGAGAGGACTAAATTCT
TACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCACTCTGCACC
GAACAGTGCTTCGCTAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGTGGA
GCCTTAACCTCAACTTGTAACGCATTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAAC
GCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTT
GAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTTCTTATATTATTACTATATATTTGT
TATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTT
CTTACTGATCAAACGGTACCTTTTTTTTTGTTTGCATTGCCA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4GM06TF 584 0 0
GGATCTCGACTCCATCCATTTCTGTTGCATCCTTCAAACGTACTCATAGCAAAAAAGGAA
ATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAA
TCCGGACAGGCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCTTACATGAGAGGACTAAATTCT
TACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCACTCTGCACC
GAACAGTGCTTCGCTAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGTGGA
GCCTTAACCTCAACTTGTAACGCATTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAAC
GCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTT
GAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTTCTTATATTATTACTATATATTTGT
TATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTT
CTTACTGATCAAACGGTACCTTTTTTTTTGTTTGCATTGCCAAA

QA 1 584 1 584
DS 



CO CL289Contig2 570 6 6 U
GGATCTCGACTCCATCCACTTCTGTTGCATCCTTCAACCTCACTCATAGCAAAAAGGAAA
TGACTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAAT
CCGGACAGTCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTGAGAGGACTAAATTCTT
ACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCG
AACAGTGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAG
CCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACG
CTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTG
AGGAAGCTGAGTAAATAGATCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTG
TTATTGTTGTTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTG
TTCTTACTGATCAAACGGTACCTTTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4F317JQ C 1
AF RR4G258TF U 20
AF RR4GL90TF U 20
AF RR4ES67JQ C 13
AF RR4ES67TF U 13
AF RR4F317TF U 1
BS 1 12 RR4F317TF
BS 13 19 RR4ES67TF
BS 20 163 RR4G258TF
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BS 165 550 RR4G258TF
BS 551 570 RR4F317TF

RD RR4F317JQ 569 0 0
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CCGGACAGTCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTGAGAGGACTAAATTCTT
ACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCG
AACAGTGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAG
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CTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAGGCTTCTGTTG
AGGAGGCTGAGTAAATAGATCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTG
TTATCGTTGTTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTG
TTCTTACTGATCAAACGGTACCTTTTTTT

QA 1 569 1 569
DS 

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GGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTCACAGAGGAA
AACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTTAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCAAGGCACA
GAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTGCCAATGT
CGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAACTTGTAA
CGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTTGTTGGCGT
TGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGTAAATAGA
TCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTTGTCAAGC
TTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTACTGA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4GL90TF 531 0 0
TTCTGTTGCATCCTTCAACCTCACTCATAGCAAAAAGGAAATGACTACAGCAGCGGCACC
GGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTAACAGAGGAA
AACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTTAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCAAGGCACA
GAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTGCCAATGT
CGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAACTTGTAA
CGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTTGTTGGCGT
TGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGTAAATAGA
TCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTTGTCAAGC
TTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTACTGA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4ES67JQ 536 0 0
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CGGCCCCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTCAC
AGAGGAAAACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTGAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCA
AGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTG
CCAATGTCGTGATGTCTCTCAA*GGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAA
CTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTTG
TTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGT
AAATAGATCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTT
GTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTAC
C

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4ES67TF 536 0 0
CATCCACTTCTGTTGCATCCTTCAACCTCACTCATAGCAAAAAGGAAATGACTACAGCAG
CGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTCAC
AGAGGAAAACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTGAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCA
AGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTG
CCAATGTCGTGATGTCTCTCAA*GGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAA
CTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTTG
TTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGT
AAATAGATCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTT
GTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTAC
C

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4F317TF 570 0 0
GGATCTCGACTCCATCCACTTCTGTTGCATCCTTCAACCTCACTCATA**AAAAAGGAAA
TGACTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAAT
CCGGACAGTCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAGTTTCTTACGTGAGAGGACTAAATTCTT
ACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCG
AACAGTGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAG
CCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACG
CTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAGGCTTCTGTTG
AGGAGGCTGAGTAAATAGATCGAACAATCCTTTTCCTTTTCTTATATTAATATATATTTG
TTATCGTTGTTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTATGAAGCTCTTTTG
TTCTTACTGATCAAACGGTACCTTTTTTTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 2 9

CO CL290Contig1 936 2 2 U
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AATGTGTGTTTAACAGGACCAGCGAGATGCTACCGTCAGATCAAGGGCAAACCCTACCCG
AAATCCCGCTACTGCCGTGGTGTCCCCGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATG
AAGAAAAAGGGAGTCGACGAGTTCCCCTTCTGCGTCCACCTCGTCTCCTGGGAGAAGGAG
AACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTCAAA
TCCGCCGGGAAAGACGCCTTCCATCTGAGGATTAGGGTTCATCCTTTCCATGTTTTGCGT
ATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCCGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCG
TTCGGGAAGGCGTTGGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTTGTCTGT
GAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCTCTAGGAGGGCTAAGTTTAAG
CTCCCTGGTCGTCAGAAGATCATTGTTAGCAGGAAGTGGTATGTCTTTATACTCTTTCTT
GTGTTTTGAAGAGATTGCTTACGTGTACATTTGATGTGTTTAGGGGATTCACTAAGTTTA
ACCGTGCTGACTACACGAGGTTGAGACAGTCGAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATG
CCAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCGTTTGGCTAACCGTCAACCTGGAAGCGCCTTCATTT
CAGCCACCAGCGATTAAGGATGGAGATGATTTTTGGTTGTAGAACCTATCATCATCATCT
AGTTTTTGAATATCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCGTTGTAACAAGGATCCTATTATGGT
TTCATTTTGCCATGACAATTGCTTTAATTTCAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS74TF U 1
AF RR4CS74JQ C 224
BS 1 553 RR4CS74TF
BS 554 936 RR4CS74JQ

RD RR4CS74TF 553 0 0
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AATGTGTGTTTAACAGGACCAGCGAGATGCTACCGTCAGATCAAGGGCAAACCCTACCCG
AAATCCCGCTACTGCCGTGGTGTCCCCGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATG
AAGAAAAAGGGAGTCGACGAGTTCCCCTTCTGCGTCCACCTCGTCTCCTGGGAGAAGGAG
AACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTCAAA
TCCGCCGGGAAAGACGCCTTCCATCTGAGGATTAGGGTTCATCCTTTCCATGTTTTGCGT
ATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCCGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCG
TTCGGGAAGGCGTTGGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTTGTCTGT
GAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCTCTAGGAGGGCTAAGTTTAAG
CTCCCTGGTCGTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4CS74JQ 713 0 0
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ACAAGTACATGGTCAAATCCGCCGGGAAAGACGCCTTCCATCTGAGGATTAGGGTTCATC
CTTTCCATGTTTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCCGGAGCTGATAGGCTTCAGA
CTGGTATGAGAGGTGCGTTCGGGAAGGCGTTGGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGC
AGGTGCTTTT*GTTTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCTCTA
GGAGGGCTAAGTTTAAGCTCCCTGGTCGTCAGAAGATCATTGTTAGCAGGAAGTGGTATG
TCTTTATACTCTTTCTTGTGTTTTGAAGAGATTGCTTACGTGTACATTTGATGTGTTTAG
GGGATTCACTAAGTTTAACCGTGCTGACTACACGAGGTTGAGACAGTCGAAGAGGATTGT
TCCTGATGGTGTCAATGCCAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCGTTTGGCTAACCGTCAACC
TGGAAGCGCCTTCATTTCAGCCACCAGCGATTAAGGATGGAGATGATTTTTGGTTGTAGA
ACCTATCATCATCATCTAGTTTTTGAATATCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCGTTGTAAC
AAGGATCCTATTATGGTTTCATTTTGCCATGACAATTGCTTTAATTTCAGTTT

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL290Contig2 871 7 11 U
AATAAACTTGAGTATAAAAAAACATAATCCATAAACTGAACTTAAAGCAATTGTCATAGC
AAAATGAAACCATAATAGGATCCTTGTTACAACGAAAACAAAAAAAAA*CAAAAAGATAT
TCAGAAACTAGATGATGATGATAGGTTCTACAACCAAAAATCATCTCCATCCTTAATCGC
TGGTGGCTGAAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTTAGCCAAACGACCATGGTTCGACA
GAAACTTGGCATTGACACCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTCAACCTCGTGTAGT
CAGCACGGTTGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAG
GGAACTTAAACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTAC
ACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAAAGCCTTCC
CGAACGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGT
TGATACGCAAAACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTCAGATGGAACGCGTCTTTCCCGG
CGGATTTGACCATGTACTTGTTGCAGGCGATACGAGCGGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGA
CGTTCTCCTTCTCCCAGGAGACGAGGTGGACGCAGAAGGGGAACTCGTCGACTCCCTTTT
TCTTCATCCCGACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTCGGGGACTCCGCGGCAGTAGCGGG
ATTTCGGGTAGGGTTTGCCCTTGATCTGACGGTAGCATCTCGCTGGTCTTCGTCCCATCT
TGTTGGTTTGGTTTGGTTTCGGCGGTAGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4A207JQ U 9
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AF RR4FW50TF C 190
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CGG
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TTGACACCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCACGGTTG
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AAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAAAGCCTTCCCGAACGCACCT
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ATGTACTTGTTGCAGGCGATACGAGCGGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCTTC
TCCCAGGAGACGAGGTGGACGC

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DS 

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TCTTCATCCCGACGTCG

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DS 

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AAAATGAAACCATAATAGGATCCTTGTTACAACGAAAACAAAACAAAA*CAAAAAGATAT
TCAGAAACTAGATGATGATGATAGGTTCTACAACCAAAAATCATCTCCATCCTTAATCGC
TGGTGGCTGAAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTTAGCCAAACGACCATGGTTCGACA
GAAACTTGGCATTGACATCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTAAACCTCGTGTAGT
CAGCACGGTTGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAG
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ACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAAAGCCTTCC
CGAACGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGT
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TCTTCATCCCGACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTCGGGGA

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CGG
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ATGATGATGATAGGTTCTACAACCAAAAATCATCTCCATCCTTAATCGCTGGTGGCTGAA
ATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTTAGCCAAACGACCATGGTTCGACAGAAACTTGGCA
TTGACACCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCACGGTTG
AACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAAC
TTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGAC
AAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAAAGCCTTCCCGAACGCACCT
CTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAAA
ACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTCAGATGGAACGCGTCTTTCCCGGCGGATTTGACC
ATGTACTTGTTGCAGGCGATACGAGCGGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCTTC
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ACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTCGGGGACTCCGCGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAG
GGTTTGCCCTTGATCTGACGGTAGCATCTCGCTGGTCTTCGTCCCATCTTGTTGGTT

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TCTACAACCAAAAATCATCTCCATCTTTAATCGCTGGTGGCTGAAATGAAGGCGCTTCCA
GGTTGACGGTTAGCCAAACGACCATGGTTCGACAGAAACTTGGCATTGACACCATCAGGA
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CACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTAAGA
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GCGATACGAGCGGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCTTCTCCCAGGAGACGAGG
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ATCTTCGGGTCGGGGACTCCGCGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAGGGTTTGCCCTTGATC
TGACGGTAGCATCTCGCTGGTCTTCGTCCCATCTTGTTGGTT
CCC

QA 1 762 1 762
DS 

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CTGAAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTTAGCCAAACGACCATGGTTCGACAGAAACT
TGGCATTGACACCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCAC
GGTTGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTCCTGACGACCAGGGAACT
TAAACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGCATGAGCCCCATGGTCATCCTTACACCTCA
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CC

QA 1 740 1 740
DS 

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CATTGACATCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTAAACCTCGTGTAGTCAGCACGGT
TGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAA
ACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAG
ACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAAAGCCTTCCCGAACGCAC
CTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCA
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CCATGTACTTGTTGCAGGCGATACGAGCGGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCT
TCTCCCAGGAGACGAGGTGGACGCAGAAGGGGAACTCGTCGACTCCCTTTTTCTTCATCC
CGACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTCGGGGACTCCGCGGCAGTAGCGGGATTTCGGGT
AGGGTTTGCCCTTGATCTGACGGTAGCATCTCGCTGGTCTTCGTCCCATCTTGTTGGTTT
GGTTTGGTTTCGGCGGTAGTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 10

CO CL291Contig1 1235 10 18 U
GGGAGACATCGAAAAAGACGAAGAAAGTGAACTCTGCGCTATCTCTACTCTCTACCTACT
CCTCCTCCGGTCAGAGAAGCTTCTGATGGCTCCCCTTACACTCTCTGTTGATGTGAAGAA
CTCTACATCCACTGCTCCCGATGTTTCGAGTAGGGTAGTGCAGATTCCACAGATCAAAAA
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ATTTGTGGGAGTTTATGAACCCACAAAGCAGAAACTGCTTAAGACCTTTCCTGATCATTT
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CGCTGTTCGAGTTATTGCATCACAAGAGGGCTTTAGGGGTCTCTATGCAGGATACCGATC
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CTTGGGGTATAAAAAAGCAGCGCGTAGAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCTCATTGG
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TGTAAGAGAGGAAGGAGCTTCTGCTCTCTTAAAGGGTATAGGGCCAAGAGTGTTGTGGAT
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GTGAGTTCTATGTTGATCAGACTGTGAATCATGTTCATTTCAACTTTAATTCCCCAGATA
AAATAAAGTGGCAAAATATCAAATTCGATGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP12TF U 6
AF RR4E148TF U 1
AF RR4AG56TF U 4
AF RR4AA25TF U 85
AF RR4EO09TF U 247
AF RR4EO09JQ C 1076
AF RR4AA25JQ C 372
AF RR4AG56JQ C 415
AF RR4AP12JQ C 507
AF RR4BP46JQ C 492
BS 1 650 RR4E148TF
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BS 652 734 RR4E148TF
BS 735 813 RR4AG56TF
BS 814 814 RR4AA25TF
BS 815 828 RR4AG56TF
BS 829 833 RR4AA25TF
BS 834 838 RR4EO09TF
BS 839 839 RR4AA25JQ
BS 840 966 RR4EO09TF
BS 967 967 RR4AA25JQ
BS 968 976 RR4EO09TF
BS 977 977 RR4AA25JQ
BS 978 1009 RR4EO09TF
BS 1010 1010 RR4AA25JQ
BS 1011 1031 RR4EO09TF
BS 1032 1212 RR4AA25JQ
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GG
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CG*****AGAAGCTTCTGATGGCTCCCCTTACACTCTCTGTTGATGTGAAGAACTCTACA
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GGCTTTGCTTCAGTCAGTACGCAAGACGAAAACCCTTTTGATTTCTTCCGCACTCTCTTT
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CTCTATTCAGGATTAGCTGGAAATATCGCTGGTGTCTTACCGGCTTCGGCTTTATTTGTG
GGAGTTTATGAACCCACAAAGCAGAAACTGCTTAAGACCTTTCCTGATCATTTAAGCGCA
GTTGCTCACTTGACTGCAGGGGCAATCGGTGGACTTGCTGCCTCTCTGATTCGAGTGCCT
ACAGAGGTTGTGAAGCAGAGAATGCAGACTGGACAGTTTGCATCAGCTCCCAACGCTGTT
CGAGTTATTGCATCACAAGAGGGCTTTAGGGGTCTCTAT

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DS 

RD RR4E148TF 734 0 0
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GAGCAAAGGCTTTGCTTCAGTCAGTACGCAAGACGAAAACCCTTTTGATTTCTTCCGCAC
TCTCTTTGAGGGATTTATAGCAGGAGGTACAGCTGGAGTTGTAGTTGAAACAGCTTTATA
CCCTATTGATACTATAAAGACTAGACTTCAGGCAGCTCGTGGAGGTGGGAAGATTGTGTT
GAAGGGTCTCTATTCAGGATTAGCTGGAAATATCGCTGGTGTCTTACCGGCTTCGGCTTT
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CTTGGGGTATAAAA

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DS 

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GGAC
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CGGTCAGAGAAGCTTCTGATGGCTCCCCTTACACTCTCTGTTGATGTGAAGAACTCTACA
TCCACTGCTCCCGATGTTTCGAGTAGGGTAGTGCAGATTCCACAGATCAAAAAGAGCAAA
GGCTTTGCTTCAGTCCGTACGCAAGACGAAAACCCTTTTGATTTCTTCCGCACTCTCTTT
GAGGGATTTATAGCAGGAGGTACAGCTGGAGTTGTAGTTGAAACAGCTTTATACCCTATT
GATACTATAAAGACTAGACTTCAGGCAGCTCGTGGAGGTGGGAAGATTGTGTTGAAGGGT
CTCTATTCAGGATTAGCTGGAAATATCGCTGGTGTCTTACCGGCTTCGGCTTTATTTGTG
GGAGTTTATGAACCCACAAAGCAGAAACTGCTTAAGACCTTTCCTGATCATTTAAGCGCA
GTTGCTCACTTGACTGCAGGGGCAATCGGTGGACTTGCTGCCTCTCTGATTCGAGTGCCT
ACAGAGGTTGTGAAGCAGAGAATGCAGACTGGACAGTTTGCATCAGCTCCCAACGCTGTT
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TATAAAAAAGCAGCGCGTAGAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCTCATTGGTGCATTT
GCTGGTGCTCTGACAGGAGCTGTCAC*ACTCCGCTTGATGT
ATTAGACAGATTAATGGT

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DS 

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TACGCAAGACGAAAACCCTTTTGATTTCTTCCGCACTCTCTTTGAGGGATTTATAGCAGG
AGGTACAGCTGGAGTTGTAGTTGAAACAGCTTTATACCCTATTGATACTATAAAGACTAG
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TGGAAATATCGCTGGTGTCTTACCGGCTTCGGCTTTATTTGTGGGAGTTTATGAACCCAC
AAAGCAGAAACTGCTTAAGACCTTTCCTGATCATTTAAGCGCAGTTGCTCACTTGACTGC
AGGGGCAATCGGTGGACTTGCTGCCTCTCTGATTCGAGTGCCTACAGAGGTTGTGAAGCA
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AGAGGGCTTTAGGGGTCTCTATGCAGGATACCGATCCTTCCTATTGAGAGATTTGCCGTT
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TAGAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCTCATTGGTGCATTTGCTGGTGCTCTGACAGG
AGCTGTCACCACTCCGCTTGGTGTTATTA
G

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DS 

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G
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GATACTATAAAGACTAGACTTCAGGCAGCTCGTGGAGGTGGGAAGATTGTGTTGAAGGGT
CTCTATTCAGGATTAGCTGGAAATATCGCTGGTGTCTTACCGGCTTCGGCTTTATTTGTG
GGAGTTTATGAACCCACAAAGCAGAAACTGCTTAAGACCTTTCCTGATCATTTAAGCGCA
GTTGCTCACTTGACTGCAGGGGCAATCGGTGGACTTGCTGCCTCTCTGATTCGAGTGCCT
ACAGAGGTTGTGAAGCAGAGAATGCAGACTGGACAGTTTGCATCAGCTCCCAACGCTGTT
CGAGTTATTACATCACAAGAGGGCTTTAGGGGTCTCTATGCAGGATACCGATCCTTCCTA
TTGAGAGATTTGCCGTTTGATGCTATTCAGTTCTGCATTTATGAGCAGCTATGCTTGGGG
TATAAAAAAGCAGCGCGTAGAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCTCATTGGTGCATTT
GCTGGTGCTCTGACAGGAGCTGTCACCACTCCGCTTGATGTTATTAAGACA*GATTAATG
GTTCAGGGATCAGCTAAACAATATCAAGGAATAGTTGACTGTGTTCAAACAATTGTAAGA
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GGTGGTTCA*TCTTCTTTGGTGTCCTTGAGAGCACGAAGAGA*CACTTGCAGAGAGACGT
CCCA
GACGGTAAGATCGAAGAGG

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DS 

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TTTATGAACCCACAAAGCAGAAACTGCTTAAGACCTTTCCTGATCATTTAAGCGCAGTTG
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AGGTTGTGAAGCAGAGAATGCAGACTGGACAGTTTGCATCAGCTCCCAACGCTGTTCGAG
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GTGCTCTGACAGGAGCTGTCACCACTCCGCTTGGTGTTATTAAGACAAGATTAATGGTTC
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AAGGAGCTTCTGCTCTCTTAAAGGGTATAGGGCCAAGAGTGTTGTGGATAGGTATTGGTG
GTTCAATCTTCTTTGGTGTCCTTGAGAGCACGAAGAGAACACTTGCAGAGAGACGTCCCA
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AAAATGGTTGAAAGGTGATACTGTTGGACATTCAACCGATCCCCTTTGTGTGAGTTCTAT
GTTGATCAGACTGTGAATCATGTTCATTTCAACTTTAATTCCCCAGATAAAATAAAGTGG
C

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4AG56JQ 821 0 0
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CCGATCCTTCCTATTGAGAGATTTGCCGTTTGATGCTATTCAGTTCTGCATTTATGAGCA
GCTATGCTTGGGGTATAAAAAAGCAGCGCGTAGAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCT
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GTGGATAGGTATTGGTGGTTCAATCTTCTTTGGTGTCCTTGAGAGCACGAAGAGAACACT
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TATTCTTGAGGACTATAAAAATGGTTGAAAGGTGATACTGTTGGACATTCAACCGATCCC
CTTTGTGTGAGTTCTATGTTGATCAGACTGTGAATCATGTTCATTTCAACTTTAATTCCC
CAGATAAAATAAAGTGGCAAAATATCAAATTCGATGTTACT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4AP12JQ 714 0 0
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GAATGCAGACTGGACAGTTTGCATCAGCTCCCAACGCTGTTCGAGTTATTGCATCACAAG
AGGGCTTTAGGGGTCTCTATGCAGGATACCGATCCTTCCTATTGAGAGATTTGCCGTTTG
ATGCTATTCAGTTCTGCATTTATGAGCAGCTATGCTTGGGGTATAAAAAAGCAGCGCGTA
GAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCTCAT*GGTGCATTTGCTGGTGCTCTGACAGGAG
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AATATCAAGGAATAGTTGACTGTGTTCAAACAATTGTAAGAGAGGAAGGAGCTTCTGCTC
TCTCAAAGGGTATAGGGCCAAGAGTGTTGTGGATAGGTATTGGTGGTTCAATCTTCTTTG
GTGTCCTTGAGAGCACGAAGAGAACACTTGCAGAGAGACGTCCCAAGACGGTTAAAGAAT
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TGATACTGTTGGACATTCAACCGATCCCCTTTGTGTGAGTTCTATGTTGATCAGACTGTG
AATCATGTTCATTTCAACTTTAATTCCCCAGATAAAATAAAGTGGCAAAATA
CC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4BP46JQ 721 0 0
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AGGTTGTGAAGCAGAGAATGCAGACTGGACAGTTTGCATCAGCTCCCAACGCTGTTCGAG
TTATTGCATCACAAGAGGGCTTTAGGGGTCTCTATGCAGGATACCGATCCTTCCTATTGA
GAGATTTGCCGTTTGATGCTATTCAGTTCTGCATTTATGAGCAGCTATGCTTGGGGTATA
AAAAAGCAGCGCGTAGAGAGCTTAATGATCCTGAGAACGCTCTCATTGGTGCATTTGCTG
GTGCTCTGACAGGAGCTGTCACCACTCCGCTTGATGTTATTAAGACAAGATTAATGGTTC
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AAGGAGCTTCTGCTCTCTTAAAGGGTATAGGGCCAAGAGTGTTGTGGATAGGTATTGGTG
GTTCAATCTTCTTTGGTGTCCTTGAGAGCACGAAGAGAACACTTGCAGAGAGACGTCCCA
AGACGGTTAAAGAATCGAAAGAGGATTGAGTTTTCTTGCACATTATTCTTGAGGACTATA
AAAATG*TTGAAAGGTGATACTGTTGGACATTCAACCGATCCCCTTTGTATGAGTTCTAT
GTTGATCAGACTGTGAATCATGTTCATTTCAACTTTAATTCCCCAGATAAAATAAAGTGG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 8

CO CL292Contig1 1141 8 7 U
CTAGGTAACACAATGATATAAAGAGATCTACAGTTCTAAAGACATTACAGAGGCAAAGAC
ATTGTCAAAAGGTCAAAGCGCGTTTGAGAAGTGAGGATAAATTAAAAAGATAATTGAGTT
AGTGATGTAAACAGTCGCAAGCCGAACGAGTCTGACACCGTATTCGAGAAGATCAATCTA
TCAATGACAAAAGCAGCAAAAAGAGTCCAAGACATTCAGCCTTTCTTGACCGGCCTCTGA
ACGTATGATTTGTTCGGATCCTCTGTCTTCAATTTCGGAGGACGTGTCGCTCCCTTCTTG
GCCTTCTTTCCTGCTTTCATGAAGTCTCTCCAGCTTGATACCCTGTTTTCTCTCGTTCCT
TCCCACTGTTCTTCATGCCCACGTTTTTTCTTCCGTATCTCCTTTTGTTCTTCTTCATCC
TTCTTCAGTCGTCCCTCTTCTTCTGATATCCTCATGGCCATTTTTCTCCTACGCCACTCT
TGGTCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTCCTTCTGAAACTCTTCAGATTGC
TCATATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACCATGGACTTTATTTTAGAGGCGGTATTT
TTCTTCAACTGTTTCTTTCTCTTCATCTTAAGCTCTTCTTTGGCAGCCTGGACTTGGGTG
AGAATATAATCTCTTTCTTGGTCGTTCAGCAGTAGTTGTTGCGCTTTCGCCAACGCTCCA
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GGGTTCAGCTTGAAGCATGAGAGAATCCTGACGACTTCGTTGTCCCTCTCAACCTCACCG
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GCCAAGGCGACGAACGATTCCCTTTTCTGGGCTGTTTTCTGGATTAACCGTCGGGTACTC
AGGCGGGTCTGGATTTCAGATATATCGACTCGGGTCTCTCGTGCCAAACAGGGAGCTTCC
C


BQ
10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4A183JQ U 175
AF RR4AD55JQ U 4
AF RR4DZ23JQ U 1
AF RR4DZ23TF C 39
AF RR4A183JQD U 4
AF RR4AD55TF C 405
AF RR4A183TF C 473
AF RR4A183TFB C 473
BS 1 7 RR4DZ23JQ
BS 8 8 RR4A183JQD
BS 9 288 RR4DZ23JQ
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BS 290 573 RR4DZ23JQ
BS 574 583 RR4A183JQD
BS 584 1141 RR4AD55TF

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CTCTGAACGTATGATTTGTTCGGATCCTCTGTCTTCAATTTCGGAGGACGTGTCGCTCCC
TTCTTGGCCTTCTTTCCTGCTTTCATGAAGTCTCTCCAGCTTGATACCCTGTTTTCTCTC
GTTCCTTCCCACTGTTCTTCATGCTCACGTTTTTTCTTCCGTATCTCCTTTTGTTCTTCT
TCATCCTTCT

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GTCAAAAGGTCAAAGCGCGTTTGAGAAGTGAAGATAAATTAAAAAGATAATTGAGTTAGT
GATGTAAACAGTCACAAGCAGAACGAGTCTGACACAATATTCGAGAAGATCAATCTATCA
ATGACAAAAGCAGCAAAAAGAGTCCAAGACATTCAGCCTTTCTTGACCGGCCTCTGAACG
TATGATTTGTTCGGATCCTCTGTCTTCAATTTCGGAGGACGTGTCGCTCCCTTCTTGGCC
TTCTTTCCTGCTTTCATGAAGTCTCTCCAGCTTGATACCCTGTTTTCTCTCGTTCCTTCC
CACTGTTCTTCATGCTCACGTTTTTTCTTCCGTATCTCCTTTTGTTCTTCTTCATCCTTC
TTCAGTCGTCCCTCTTCTTCTGATATCCTCATGGCCATTTTTCTCCTACGCCACTCTTGG
TCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTCCTTCTGAAACTCTTCAGATTG

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ATTGTCAAAAGGTCAAAGCGCGTTTGAGAAGTGAGGATAAATTAAAAAGATAATTGAGTT
AGTGATGTAAACAGTCGCAAGCCGAACGAGTCTGACACCGTATTCGAGAAGATCAATCTA
TCAATGACAAAAGCAGCAAAAAGAGTCCAAGACATTCAGCCTTTCTTGACCGGCCTCTGA
ACGTATGATTTGTTCGGATCCTCTGTCTTCAATTTCGGAGGACGTGTCTCTCCCTTCTTG
GCCTTCTTTCCTGCTTTCATGAAGTCTCTCCAGCTTGATACCCTGTTTTCTCTCGTTCCT
TCCCACTGTTCTTCATGCCCACGTTTTTTCTTCCGTATCTCCTTTTGTTCTTCTTCATCC
TTCTTCAGTCGTCCCTCTTCTTCTGATATCCTCATGGCCATTTTTCTCCTACGCCACTCT
TGGTCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTCCTTCTGAAACTCTTCAGATTGC
TCATATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACC

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AAATTAAAAAGATAATTGAGTTAGTGATGTAAACAGTCGCAAGCCGAACGAGTCTGACAC
CGTATTCGAGAAGATCAATCTATCAATGACAAAAGCAGCAAAAAGAGTCCAAGACATTCA
GCCTTTCTTGACCGGCCTCTGAACGTATGATTTGTTCGGATCCTCTGTCTTCAATTTCGG
AGGACGTGTCTCTCCCTTCTTGGCCTTCTTTCCTGCTTTCATGAAGTCTCTCCAGCTTGA
TACCCTGTTTTCTCTCGTTCCTTCCCACTGTTCTTCATGCCCACGTTTTTTCTTCCGTAT
CTCCTTTTGTTCTTCTTCATCCTTCTTCAGTCGTCCCTCTTCTTCTGATATCCTCATGGC
CATTTTTCTCCTACGCCACTCTTGGTCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTC
CTTCTGAAACTCTTCAGATTGCTCATATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACC

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GTCAAAAGGTCAAAGCGCGTTTGAGAAGTGAAGATAAATTAAAAAGATAATTGAGTTAGT
GATGTAAACAGTCACAAGCAGAACGAGTCTGACACAATATTCGAGAAGATCAATCTATCA
ATGACAAAAGCAGCAAAAAGAGTCCAAGACATTCAGCCTTTCTTGACCGGCCTCTGAACG
TATGATTTGTTCGGATCCTCTGTCTTCAATTTCGGAGGACGTGTCGCTCCCTTCTTGGCC
TTCTTTCCTGCTTTCATGAAGTCTCTCCAGCTTGATACCCTGTTTTCTCTCGTTCCTTCC
CACTGTTCTTCATGCTCACGTTTTTTCTTCCGTATCTCCTTTTGTTCTTCTTCATCCTTC
TTCAGTCGTCCCTCTTCTTCTGATATCCTCATGGCCATTTTTCTCCCACGCCACTCTTGG
TCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTCCTTCTGAAACTCTTCAGATTGCTCA
TATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACCATGGACTTTA

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DS 

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TCTCATACGCCACTCTTGGTCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTCCTTCTG
AAACTCTTCAGATTGCTCATATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACCATGGACTTTAT
TTTAGAGGCGGTATTTTTCTTCAACTGTTTCTTTCTCTTCATCTTAAGCTCTTCTTTGGC
AGCCTGGACTTGGGTGAGAATATAATCTCTTTCTTGGTCGTTCAGCAGTAGTTGTTGCGC
TTTCGCCAACGCTCCAAAAGCCTCCTGTGCTTGGGGATGCTTGCATTTGTCAGGGTGAAC
CATCAAAGATATCTTTCTGTACCGCCTTTTAACATCATCCGTGGATGAATCAAAAGATAG
GTTAAGATGCTCAAACGGGTTCAGCTTGAAGCATGAGAGAATCCTGACGACTTCGTTGTC
CCTCTCAACCTCACCGACCTCGGCGAGGAACGATTTTAGAATCGCATCGTCGACATCTCC
CATGACTCCCGCCTTTTTTTTTATGTATGATCCCTTCCCCTTCCCCCTCTCCCCCTTTTC
AAGTACCGACAGAAAAGCCAAGGCGACGAACGATTCCCTTTTCTGGGCTGTTTTCTGGAT
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CAAACAGGGAGCTTCCC

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CAGATTGCTCATATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACCATGGACTTTATTTTAGAGG
CGGTATTTTTCTTCAACTGTTTCTTTCTCTTCATCTTAAGCTCTTCTTTGGCAGCCTGGA
CTTGGGTGAGAATATAATCTCTTTCTTGGTCGTTCAGCAGTAGTTGTTGCGCTTTCGCCA
ACGCTCCAAAAGCCTCCTGTGCTTGGGGATGCTTGCATTTGTCAGGGTGAACCATCAAAG
ATATCTTTCTGTACCGCCTTTTAACATCATCCGTGGATGAATCAAAAGATAGGTTAAGAT
GCTCAAACGGGTTCAGCTTGAAGCATGAGAGAATCCTGACGACTTCGTTGTCCCTCTCAA
CCTCACCGACCTCGGCGAGGAACGATTTTAGAATCGCATCGTCGACATCTCCCATGACTC
CCGCCTTTTTTTTTATGTATGATCCCTTCCCCTTCCCCCTCTCCCCCTTTTCAAGTACCG
ACAGAAAAGCCAAGGCGACGAACGATTCCCTTTTCTGGGCTGTTTTCTGGATTAACCGTC
GGGTACTCAGGCGGGTCTGGATTTCAGATATATCGACTCGGGTCTCTCGTGCCAAACAGG
GAGCTTCCC

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DS 

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GCCACTCTTGGTCTGTTAATATCTCTCGGACCTTTAACTTCAGCTCCTTCTGAAACTCTT
CAGATTGCTCATATATTTGCTCATGCTTTCCCTCATCAACCATGGACTTTATTTTAGAGG
CGGTATTTTTCTTCAACTGTTTCTTTCTCTTCATCTTAAGCTCTTCTTTGGCAGCCTGGA
CTTGGGTGAGAATATAATCTCTTTCTTGGTCGTTCAGCAGTAGTTGTTGCGCTTTCGCCA
ACGCTCCAAAAGCCTCCTGTGCTTGGGGATGCTTGCATTTGTCAGGGTGAACCATCAAAG
ATATCTTTCTGTACCGCCTTTTAACATCATCCGTGGATGAATCAAAAGATAGGTTAAGAT
GCTCAAACGGGTTCAGCTTGAAGCATGAGAGAATCCTGACGACTTCGTTGTCCCTCTCAA
CCTCACCGACCTCGGCGAGGAACGATTTTAGAATCGCATCGTCGACATCTCCCATGACTC
CCGCCTTTTTTTTTATGTATGATCCCTTCCCCTTCCCCCTCTCCCCCTTTTCAAGTACCG
ACAGAAAAGCCAAGGCGACGAACGATTCCCTTTTCTGGGCTGTTTTCTGGATTAACCGTC
GGGTACTCAGGCGGGTCTGGATTTCAGATATATCGACTCGGGTCTCTCGTGCCAAACAGG
GAGCTTCCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 11

CO CL293Contig1 1130 11 10 U
TTTTTTTAAAACAATGGCGACGGTTCAGTTCTTCAACCAATTCCCCTGCAAAACCCGAGT
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GCTCACTCGCCGTCCGTTGTTCTCTCCCGGAGAATTCGCCGTTTCTCGTGCGGACATCAG
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CGAGATCGGAGTTCTAATCACACAGCTCGAGTCCAAGAACCCCACGCCAGCTCCCACCGA
AGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTT
CCCGTTGCTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGTTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCAT
CGATTCAGACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGAC
CTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTT
CGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTACGT
TGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTACA
AGACACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTT
GCCAGGGGACAATGCACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGATATTCGGAT
CTCTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAA
TCCTTGAGTTAATAGCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGT
AGGTTTTTACTTTAATCGTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGAAATAATGTT
GTAACTGCTAAAAAGGTACAAATGTTTAAGAATCTCTTGCTCTATGGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 35 65 65 
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65 65 65 65 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4BU10TF U 1
AF RR4BX10TF U 1
AF RR4BF89TF U 8
AF RR4ER86TF U 178
AF RR4BX10JQ C 365
AF RR4BU10JQ C 378
AF RR4GB36JQ C 591
AF RR4GB36TF U 591
AF RR4ER86JQ C 423
AF RR4C979JQ C 494
AF RR4C979TF U 494
BS 1 512 RR4BU10TF
BS 513 513 RR4BF89TF
BS 514 666 RR4BU10TF
BS 667 709 RR4BF89TF
BS 710 887 RR4ER86TF
BS 888 1040 RR4GB36TF
BS 1041 1041 RR4C979TF
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BS 1083 1127 RR4C979TF
BS 1128 1130 RR4ER86JQ

RD RR4BU10TF 666 0 0
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CCAAAGCTCATCAAACTCAAAAACCATCCCCAAGCCACAAGCCCTGGTGCAGATGAGCAC
GCTCACTCGCCGTCCGTTGTTCTCTCCCGGAGAATTCGCCGTTTCTCGTGCGGACATCAG
AGTCAGAGCCATCGATGCGGACGACGAGAGCGTTCCAGAGACGAGCGAGGGAGGATCTGC
TCTATTGCTGGCGGAAGAAGCAATCGAATCCGTGGAAGAGACGGAGGCTCTCAAGAGATC
GCTGGTGGATTCCTTGTACGGGACAGACCGAGGTTTGAGCGCATCGAGCGAGACTCGAGC
CGAGATCGGAGTTCTAATCACACAGCTCGAGTCCAAGAACCCCACGCCAGCTCCCACCGA
AGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTT
CCCGTTGCTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGCTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCAT
CGATTCAGACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGAC
CTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTT
CGAGGA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4BX10TF 664 0 0
TTTTTTT
AAAACAATGGCGACGGTTCAGTTCTTCAACCAATTCCCCTGCAAAACCCGAGTCCAAAGC
TCATCAAACTCAAAAACCATCCCCAAGCCACAAGCCCTGGTGCAGATGAGCACGCTCACT
CGCCGTCCGTTGTTCTCTCCCGGAGAATTCGCCGTTTCTCGTGCGGACATCAGAGTCAGA
GCCATCGATGCGGACGACGAGAGCGTTCCAGAGACGAGCGAGGGAGGATCTGCTCTATTG
CTGGCGGAAGAAGCAATCGAATCCGTGGAAGAGACGGAGGCTCTCAAGAGATCGCTGGTG
GATTCCTTGTACGGGACAGACCGAGGTTTGAGCGCATCGAGCGAGACTCGAGCCGAGATC
GGAGTTCTAATCACACAGCTCGAGTCCAAGAACCCCACGCCAGCTCCCACCGAAGCTCTC
TTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTTCCCGTTG
CTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGCTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCGATTCA
GACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGACCTCGATC
AGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAG

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DS 

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AAAACAATGGCGACGGTTCAGTTCTTCAACCAATTCCCCTGCAAAACCCGAGTCCAAAGC
TCATCAAACTCAAAAACCATCCCCAAGCCACAAGCCCTGGTGCAGATGAGCACGCTCACT
CGCCGTCCGTTGTTCTCTCCCGGAGAATTCGCCGTTTCTCGTGCGGACATCAGAGTCAGA
GCCATCGATGCGGACGACGAGAGCGTTCCAGAGACGAGCGAGGGAGGATCTGCTCTATTG
CTGGCGGAAGAAGCAATCGAATCCGTGGAAGAGACGGAGGCTCTCAAGAGATCGCTGGTG
GATTCCTTGTACGGGACAGACCGAGGTTTGAGCGCATCGAGCGAGACTCGAGCCGAGATC
GGAGATCTAATCACACAGCTCGAGTCCAAGAACCCCACGCCAGCTCCCACCGAAGCTCTC
TTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTTCCCGTTG
CTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGTTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCGATTCA
GACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGACCTCGATC
AGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAA
GGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATC

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DS 

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G
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GCTCTATTGCTGGCGGAAGAAGCAATCGAATCCGTGGAAGAGACGGAGGCTCTCAAGAGA
TCGCTGGTGGATTCCTTGTACGGGACAGACCGAGGTTTGAGCGCATCGAGCGAGACTCGA
GCCGAGATCGGAGATCTAATCACACAGCTCGAGTCCAAGAACCCCACGCCAGCTCCCACC
GAAGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTG
TTCCCGTTGCTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGTTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACC
ATCGATTCAGACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACG
ACCTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAG
TTCGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTAC
GTTGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTA
CAAGACACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCT
TTGCCAGGGGACAATGCACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACA
GGATA

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DS 

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CTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTTCCCG
TTGCTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGCTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCGAT
TCAGACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGACCTCG
ATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAG
GAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTACGTTGAG
TTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTACAAGAC
ACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTTGCCA
GGGGACAATGCACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGATATTCGGATCTCT
AGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAATCCT
TGAGTTAATAGCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGTAGGT
TTTTACTTTAATCGTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGAAATAATGTTGTAA
CTGCTAAAAAGGTACAAATGTTT

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DS 

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ACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTTCCCGTTGCTCTCACGTG
GGATCGTGCCGTTAGCTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCGATTCAGACTTCTTTA
CGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGACCTCGATCAGCACCAACG
CCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGATCG
GGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTACGTTGAGTTTCTTGGACAGA
AGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTACAAGACACGGCTTCGTCTG
TGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTTGCCAGGGGACAATGCAC
AGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGATATTCGGATCTCTAGAGGAGATGGTG
GAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAATCCTTGAGTTAATAGCT
CGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGTAGGTTTTTACTTTAATC
GTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGAAATAATGTTGTAACTGCTAAAAAGGT
ACAAATGTTT

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DS 

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G
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GGAGTACGTTGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTAC
ATCGGTACAATACACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAA
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TATTCGGATCTCTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCC
TCTCTTGAATCCTTGAGTTAATAGCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAG
TGTTGTCGTAGGTTTTTACTTTAATCGTTCGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGA
AATAATGTTGT

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DS 

RD RR4GB36TF 492 0 0
G
GGCTACGACCTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCA
GATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCC
GGAGTACGTTGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTAC
ATCGGTACAATACACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAA
GTTCGCTTTGCCAGGGGACAATGCACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGA
TATTCGGATCTCTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCC
TCTCTTGAATCCTTGAGTTAATAGCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAG
TGTTGTCGTAGGTTTTTACTTTAATCGTTCGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGA
AATAATGTTGT

QA 2 492 2 492
DS 

RD RR4ER86JQ 708 0 0
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CGTTGCTCTCACGTGGGATCGTGCCGTTAGTTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCG
ATTCAGACTTCTTTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTACGACCT
CGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCG
AGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTACGTTG
AGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTACAAG
ACACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTTGC
CAGGGGACAATGCACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGATATTCGGATCT
CTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAATC
CTTGAGTTAATAGCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGTAG
GTTTTTACTTTAATCGTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGAAATAATGTTGT
AACTGCTAAAAAGGTACAAATGTTTAAGAATCTCTTGCTCTATGGTCG

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DS 

RD RR4C979JQ 636 0 0
G
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ACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGA
TCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTACGTTGAGTTTCTTGGAC
AGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTACAAGACACGGCTTCGT
CTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTC**TTTGCCAGGGGACAATG
CACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGATATTCGGATCTCTAGAGGAGATG
GTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAATCCTTGAGTTAATA
GCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGTAGGTTTTTACTTTA
ATCGTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGAAATAATGTTGTAACTGCTAAAAA
GGTACAAATGTTTAAGAATCTCTTGCTCTATGG
CC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR4C979TF 636 0 0
G
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TTACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGCTGGCTAC*ACCTCGATCAGCACCA
ACGCCAAATTCGAAATCCGGAGCCCCAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGA
TCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCCCGGAGTACGTTGAGTTTCTTGGAC
AGAAGATTGATCTTGCTCCGGTCAGAGGGTTGCTTACATCGGTACAAGACACGGCTTCGT
CTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTC**TTTGCCAGGGGACAATG
CACAGTCGTGGCTGCTCACCACTTATCTGGACAAGGATATTCGGATCTCTAGAGGAGATG
GTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAATCCTTGAGTTAATA
GCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGTAGGTTTTTACTTTA
ATCGTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAATTAAGAAATAATGTTGTAACTGCTAAAAA
GGTACAAATGTTTAAGAATCTCTTGCTCTATGG
CC

QA 2 634 2 634
DS 



AS 1 10

CO CL294Contig1 962 10 10 U
GACATCTGCTTCTTCTCTGAACTACTACTACTAAAGACAAACACACAATCGCCTTCGAAT
CTGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTTGAACATGGCGAATTCGGGAGAAGAGAA
GGAGAAGCTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGC
CCTCTCTCTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACA
ATCCGATCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGA
TGGAGATATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCC
TGAACCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAG
TATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGA
AAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCAC
TGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTA
CTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCAACAGATTCCAGATTAA
CATGGAACCATACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACGAGTCATACAAGGATGTTCCTGCGTT
TCAAAACGCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCATGTGA
ACCAGTAGTAAG****CTACTCCCAGTTCAATAAAACCTCACAGAAACAACAACAACAAT
GATAAAAATACCATGTACTCATCATATATAGGTGTATCATATCAACCAGTTCACTTCTTA
GTCACTCTACTTGTATTATAAAATAAAGATCAGAGACTTTCGAAATCGCAAACATTTCAT
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4EQ49TF U 58
AF RR4GL14TF U 61
AF RR4EQ86TF U 1
AF RR4GM33TF U 55
AF RR4F243TF U 69
AF RR4GL14JQ C 161
AF RR4EQ86JQ C 231
AF RR4GM33JQ C 247
AF RR4EQ49JQ C 793
AF RR4C553JQ C 390
BS 1 706 RR4EQ86TF
BS 707 707 RR4F243TF
BS 708 716 RR4GM33TF
BS 717 717 RR4F243TF
BS 718 810 RR4GM33TF
BS 811 811 RR4GL14JQ
BS 812 826 RR4GM33TF
BS 827 942 RR4GL14JQ
BS 943 958 RR4EQ86JQ
BS 959 962 RR4C553JQ

RD RR4EQ49TF 550 0 0
GGGAATCTGT
GAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTTGAACATGGCGAATTCGGGAGAATAGAAGGAGAAG
CTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCT
CTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGAT
CCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGAT
ATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCCTGAACCA
CCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTC
TTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATC
AATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCTC
GAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCT

QA 11 550 11 550
DS 

RD RR4GL14TF 571 0 0
GGGTGAA
GAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTTGAACATGGCGAATTCGGGAGAAGAGAAGGAGAAG
CTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCT
CTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGAT
CCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGAT
ATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCCTGAACCA
CCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTC*AGGCAGCGAGTATTGTC
TTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATC
AATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCTC
GAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCT
GATCTCTTTCTAGCACCACAGATC

QA 8 571 8 571
DS 

RD RR4EQ86TF 710 0 0
GACATCTGCTTCTTCTCTGAACTACTACTACTAAAGACAAACACACAATCGCCTTCGAAT
CTGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTTGAACATGGCGAATTCGGGAGAAGAGAA
GGAGAAGCTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGC
CCTCTCTCTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACA
ATCCGATCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGA
TGGAGATATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCC
TGAACCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAG
TATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGA
AAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCAC
TGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTA
CTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCAACAGATTCCAGATTAA
CATGGAACCATACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACGAGTCATACAAG
ATGT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4GM33TF 774 0 0
GGGAATCTGTGAA
GAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTTGAACATGGCGAATTCGGGAGAAGAGAAGGAGAAG
CTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCT
CTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGAT
CCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGAT
ATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCCTGAACCA
CCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTC
TTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATC
AATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCTC
GAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCT
GATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCAACAGATTCCAGATTAACATGGAA
CCATACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACGAGTCATACAAG*ATGTTCCTGTGTTTCAAAAC
GCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCATGTGAACCAGTA
GTAAG****CTACTCCCAGTTCA*TAAAACCTCACAGAA
CA

QA 14 772 14 772
DS 

RD RR4F243TF 744 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAACCATTTACTTGAACATGGCGAATTCGGGAGTAGAGAAGGAGAAGCTG
AAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCTCCC
AAAGGGCTTGAGTATGAGTATAT*CCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGATCCA
GAGTTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGATATT
GTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGACAAGTATCCTGAACCACCT
CTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTCTTT
TCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTGGGTGTTATTAGGTTCATCGAGGAAAAGATCAAT
TCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACGGCTCTCGAG
AAACTGTTGGTGAGCTTCTCTGGAAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCTGAT
CTCTTTCTAGCACCACAGATCTATGGAGCTATCAACAGGTTCCAGATTAACATGGAACCG
TACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAGTCATACAAGGATCTTCCTGCGTTTCAAAACGCG
GCACCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCTTGTGAACCGGTAGTA
AGTAAGCGACTCTCAGTTCA
TA

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR4GL14JQ 782 0 0
GCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCTCTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTT
AATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGATCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACT
GTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGATATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATG
TATCTGGATGAGAAGTATCCTGAACCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCT
GTCAATTTC*AGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGT
GTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAAT
GCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACAC
GCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCT
ATCAACAGATTCCAGATTAACATGGAACCATACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACGAGTCA
TACAAGGATGTTCCTGCGTTTCAAAACGCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCT
TCCACCAGCTGATCATGTGAACCAGTAGTAAG****CTACTCCCAGTTCAATAAAACCTC
ACAGAAACAACAACAACAATGATAAAAATACCATGTACTCATCATATATAGGTGTATCAT
ATCAACCAGTTCACTTCTTAGTCACTCTACTTGTATTATAAAATAAAGATCAGAGACTTT
CG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4EQ86JQ 732 0 0
AAGGTGAACAATCCGATCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCC
TTGTTGTTGATGGAGATATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATG
AGAAGTATCCTGAACCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCC
AGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGT
TCATTGAGGAAAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAA
AAGGATTCACTGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTG
ATGAAGTTTACTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCAACAGAT
TCCAGATTAACATGGAACCATACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACGAGTCATACAAGGATG
TTCCTGCGTTTCAAAACGCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCT
GATCATGTGAACCAGTAGTAAG****CTACTCCCAGTTCAATAAAACCTCACAGAAACAA
CAACAACAATGATAAAAATACCATGTACTCATCATATATAGGTGTATCATATCAACCAGT
TCACTTCTTAGTCACTCTACTTGTATTATAAAATAAAGATCAGAGACTTTCGAAATCGCA
AACATTTC
ATCC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4GM33JQ 716 0 0
TCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGA
TATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCCTGAACC
ACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGT
CTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGAT
CAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCT
CGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGC
TGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCAACAGATTCCAGATTAACATGGA
ACCATACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACGAGTCATACAAGGATGTTCCTGTGTTTCAAAA
CGCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCATGTGAACCAGT
AGTAAG****CTACTCCCAGTTCAATAAAACCTCACAGAAACAACAACAACAATGATAAA
AATACCATGTACTCATCATATATAGGTGTATCATATCAACCAGTTCACTTCTTAGTCACT
CTACTTGTATTATAAAATAAAGATCAGAGACTTTCGAAATCGCAAACATTTC
ATCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EQ49JQ 166 0 0
TAAGGTAT
TCCCAGTTCAATAAAACCTCACAGAAACAACAACAACAATGATAAAAATACCATGTACTC
ATCATATATAGGTGTATCATATCAACCAGTTCACTTTTTAGTCACTCTACTTGTATTATA
AAATAAAGATCAGAGACTTTCGAAATCGCAAACATTTC

QA 9 166 9 166
DS 

RD RR4C553JQ 573 0 0
ACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATC
AAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTT
GGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCG
CTGGCAAACACGCAACTGGTGACGAAGTTTACTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGA
TTTACGGAGCTATCAACGGACTCCAGATTAACATGGAACCATACCCGACCCTTGCAAAGT
GTTACGAGTCATACAAGGATGTTCCTGCGTTTCAAAACGCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAG
ATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCATGTGAACCAGTAGTAAG****CTACTCCCAGTTC
AATAAAACCTCACAGAAACAACAACAACAATGATAAAAATACCATGTACTCATCATATAT
AGGTGTATCATATCAACCAGTTCACTTCTTAGTCACTCTACTTGTATTATAAAATAAAGA
TCAGAGACTTTCGAAATCGCAAACATTTCATTC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 2 10

CO CL295Contig1 780 3 2 U
GGGACAAGAGCAGAGAACTGGTGTTGGTTCGGTAGTAGAAGAGGATCCATGGCGACATTA
GTCCAGTGTCTTTCTTCCTGTGCGACACTCAATCCCAAATTCAAATCCCTTTCTCTTAAC
GGAGCTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGTCTGCTCCTCCTCCTCCCTTAGCTTC
TCTCAGAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGTAGAGAAGAAT
AAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACGAAGAAAGCTGATTCAGCT
GCCAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGCGTTTACAACAAGTCTAAAAAGTCCGAA
GCCCGCACACGGATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAAGAAGGCAGAT
GCGGTACCTGACGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTTACTCTGCTATA
GACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCACGTAGGAAGTCTCGG
TTGGCTAGGAGGAAAAAGGCTGTTGAGATCCACCACGGTTGGTATGTCCCTGCCGCAGCA
GCAGAAGCTGTCACCATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATGTTTTCTTTTTTT
TGTAATGTATAATTCAATCGCTTTCAGACTCTCTTCTTGTGTACTGTTGTGTTTAAGCTT
CTTGTCTTCCATCATTGGGCTTGGCCTTGGTCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTTCTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ04TF U 10
AF RR4DB23TF U 1
AF RR4CK62JQ C 7
BS 1 653 RR4DB23TF
BS 654 780 RR4CK62JQ

RD RR4CJ04TF 548 0 0
GG
AGAGAACTGGTGTTGGTTCGGTAGTAGAAGAGGATCCATGGCGACATTAGTCCAGTGTCT
TTCTTCCTGTGCGACACTCAATCCCAAATTCAAATCCCTTTCTCTTAACGGAGCTTCTTC
TTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGTCTGCTCCTCCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGCGT
TTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGTAGAGAAGAATAAGCCAGCGAG
GCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCCAAGAGAGC
TCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGCGTTTACAACAAGTCTAAAAAGTCCGAAGCCCGCACACG
GATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAAGAAGGCAGATGCGGTACCTGA
CGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTTACTCTGCTATAGACAAAGCAGT
CAAGGTTAGAGCGCTGCACAAGAACACTGGTGCACGTAG*AAGTCTCGGTTGGCTAGGAG
GAAAAA

QA 3 548 3 548
DS 

RD RR4DB23TF 653 0 0
GGGACAAGAGCAGAGAACTGGTGTTGGTTCGGTAGTAGAAGAGGATCCATGGCGACATTA
GTCCAGTGTCTTTCTTCCTGTGCGACACTCAATCCCAAATTCAAATCCCTTTCTCTTAAC
GGAGCTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGTCTGCTCCTCCTCCTCCCTTAGCTTC
TCTCAGAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGTAGAGAAGAAT
AAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACGAAGAAAGCTGATTCAGCT
GCCAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGCGTTTACAACAAGTCTAAAAAGTCCGAA
GCCCGCACACGGATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAAGAAGGCAGAT
GCGGTACCTGACGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTTACTCTGCTATA
GACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCACGTAGGAAGTCTCGG
TTGGCTAGGAGGAAAAAGGCTGTTGAGATCCACCACGGTTGGTATGTCCCTGCCGCAGCA
GCAGAAGCTGTCACCATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATGTTTTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4CK62JQ 774 0 0
AGAG
CAGAGAACTGGTGTTGGTTCGGTAGTAGAAGAGGATCCATGGCGACATTAGTCCAGTGTC
TTTCTTCCTGTGCGACACTCAATCCCAAATTCAAATCCCTTTCTCTTAACGGAGCTTCTT
CTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGTCTGCTCCCCCTCCTCCCTTAGCTTCTCTCAGAGCG
TTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGTAGAGAAGAATAAGCCAGCGA
GGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCCAAGAGAG
CTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGCGTTTACAACAAGTTTAAAAAGTCCGAAGCCCGCACAC
GGATGAAGAAGGTTTCGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAAGAAGGCAGATGCGGTACCTG
ACGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTTACTTTGCTATAGACAAAGCAG
TCAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCACGTAGGAAGTCTCGGTTGGCTAGGA
GGAAAAAGGCTGTTGAGATCCACCACGGTTGGTATGTCCCTGCCGCAGCAG*AGAAGCTG
TCACCATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATGTTTTCTTTTTTTTGTAATGTAT
AATTCAATCGCTTTCAGACTCTCTTCTTGTGTACTGTTGTGTTTAAGCTTCTTGTCTTCC
ATCATTGGGCTTGGCCTTGGTCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTTCTTGCCG

QA 5 774 5 774
DS 



CO CL295Contig2 826 7 7 U
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AGAAGAGGATCCATGGCGACATTAGTCCAGTGTCTTTCATCCTGTGCGGCGACACTCAAT
CCCAAATTCAAATCCCTTTCTCTTAACGGAGCTTCTTCGTCCTTATCTCCAACTTCTTCC
TTGTCCACTCGTCGTGGTGTCTGCTCCTCCTCCTCCCTTAGCTTCGCTCAGAGCGTTTCT
CAATGCGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGTACAGAAGAATAAGCCAGCGAGGCAA
TCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACTAAGAAAGCTGATTCAGCTGCCAAGAGAGCTCGT
CAAGCCGTGAAGAGGCGTGTCTACAACAAGTCTAAAAAGTCCGAAGCCCGCACACGGATG
AAAAAAGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAAGAAGGCAGATGCGGTACCTGACGAG
ATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTTACTCTGCTATAGACAAAGCAGTCAAG
GTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCACGTAGGAAGTCTCGGTTGGCTAGGAGGAAA
AAGGCCGTTGAGATCCACCACGGTTGGTATGTCCCTGCCGCAGCAGCAGAAGCTGTCCCC
ATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATGTTTTCTTTTTTTTTTGTAATGTATAAT
TCAATCGCTTTCAGACTCTCTTCTTGTGTACTGTTGTGTCTAAGCTTCTTGTCTTCCATC
ATTGGGCTTGGTCTTGGTCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF31TF U 1
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AF RR4A424TF U 34
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AF RR4A890JQ C 200
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RD RR4DF31TF 708 0 0
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ATGGCTGCGTAA*CAACATGGACAGATATAATGTTTTCTTTTTTTT
GT

QA 1 706 1 706
DS 

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DS 

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**CTTAGCTTCGCTCAGAGCGTTTCTCAATGCGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGG
TACAGAAGAATAAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACTAAGAAAG
CTGATTCAGCTGCCAAGAGAGCTCGTCAAGCCGTGAAGAGGCGTGTCTACAACAAGTCTA
AAAAGTCCGAAGCCCGCACACGGATGAAAAAAGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGA
AGAAGGCAGATGCGGTACCTGACGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTT
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QA 14 759 14 759
DS 

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CCTTAGCTTCGCTCAGAGCGTTTCTCAATGCGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGT
ACAGAAGAATAAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACTAAGAAAGC
TGATTCAGCTGCCAAGAGAGCTCGTCAAGCCGTGAAGAGGCGTGTCTACAACAAGTCTAA
AAAGTCCGAAGCCCGCACACGGATGAAAAAAGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAA
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TGCCGCAGCAGCAGAAGCTGTCCCCATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATGTT
TTCTTTTTTTTTTGTAATGTATAATTCAATCGCTTTCAGACTCTCTTCTTGT

QA 3 714 3 714
DS 

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GTACAGAAGAATAAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACTAAGAAA
GCTGATTCAGCTGCCAAGAGAGCTCGTCAAGCCGTGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCT
AAAAAGTCCGAAGCCCGCACACGGATGAAAAAAGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAG
AAGAAGGCAGATGCGGTACCTGACGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCT
TACTTTGCTATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCACGT
AGGAAGTCTCGGTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGTTGGTATGTC
CCTGCCGCAGCAGCAGAAGCTGTCCCCATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATG
TTTTCTTTTTTTTT*GTAATGTATAATTCAATCGCTTTCAGACTCTCTTCTTGTGTACTG
TTGTGTTTAAGCTTCTTGTCTTCCATC
G

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4A890TF 792 0 0
GG
GAGAACTGGTGTTGGTTCGGTAGTAGAAGAGGATCCATGGCGACATTAGTCCAGTGTCTT
TCATCCTGTGCGGCGACACTCAATCCCAAATTCAAATCCCTTTCTCTTAACGGAGCTTCT
TCGTCCTTATCTCCAACTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGTCTGCTCCTCCTCCTCC
CTTAGCTTCGCTCAGAGCGTTTCTCAATGCGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATATGTGGGTA
CAGAAGAATAAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTGCTCCCACTAAGAAAGCT
GATTCAGCTGCCAAGAGAGCTCGTCAAGCCGTGAAGAGGCGTGTCTACAACAAGTCTAAA
AAGTCCGAAGCCCGCACACGGATGAAAAAAGTTTTGGAAGCACTTGATGGGCTCAAGAAA
AAGGCAGATGCGGTACCTGACGAGATTGTAACCGTGGAGAAACTTATAGGAGAGGCTTAC
TCTGCTATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCACGTGGG
AAGTCTCGGTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGTTGGTATGTCCCT
GCCGCAGCAGCAGAAGCTGTCCCCATGGCTGCGTAAACAACATGGACAGATATAATGTTT
TCTTTTTTTTTTGTAATGTATAATTCAATCGCTTTCAGACTCTCTTCTTGTGTACTGTTG
TGTCTAAGCTTCTTGTCTTCCATCATTGGGCTTGGTCTTGGTCTGGTTTAGTAAGATCTC
AGTTCTTGCC

QA 3 792 3 792
DS 

RD RR4A890JQ 621 0 0
TCTGCTCCTCCTCCTCCCTTAGCTTCGCTCAGAGCGTTTCTCAATGCGTCGCCTTCTCCT
CCGGGAATATGTGGGTACAGAAGAATAAGCCAGCGAGGCAATCGATTGTGTGCGAGGCTG
CTCCCACTAAGAAAGCTGATTCAGCTGCCAAGAGAGCTCGTCAAGCCGTGAAGAGGCGTG
TCTACAACAAGTCTAAAAAGTCCGAAGCCCGCACACGGATGAAAAAAGTTTTGGAAGCAC
TTGATGGGCTCAAGAAAAAGGCAGATGCGGTACCTGACGAGATTGTAACCGTGGAGAAAC
TTATAGGAGAGGCTTACTTTGCTATAGACAAAGCAGTCAAGGTTAGAGCGCTACACAAGA
ACACTGGTGCACGTGGGAAGTCTCGGTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACC
ACGGTTGGTATGTCCCTGCCGCAGCAGCAGAAGCTGTCCCCATGGCTGCGTAAACAACAT
GGACAGATATAATGTTTTCTTTTTTTTTT*TAATGTATAATTCAATCGCTTTCAGACTCT
CTTCTTGTGTACTGTTGTGTATAAGCTTCTTGTCTTCCATCATTGGGCTTGGTCTTGGTC
TGGTTTAGTAAGATCTCAGT
T

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 10

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CTCCTTTCAAAATATTCTTATTCACAGCTCTCCTCGCGGCGGCGTTTTCAGCCTCCACCG
CTGACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAGCA
ACGGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAA
CAGAGTATTTGTTCGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTTGTAACTCAGCAG
GCACAGTCACAACTTTCTATTTGAAATCGGAAGGAACGACATGGGATGAGATTGATTTTG
AGTTCTTGGGAAACATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAG
GTAAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGATCCAACAGCAAATTTCCACA
CTTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATACTAACCGTCGATAACACGCCAATTA
GAGAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAACAAGCCGATGAGGA
TGTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGG
ATTGGTCCAAAGCTCCATTCACAGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGCTC
ATTCAAACGGAAGATCGTCTTGTACCACGACGAAACCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAG
AAATGGATTCAACGAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACA
ATTACTGTACGGATACTAAGAGGTTTCCACAGGGAATCCCTAGGGAATGTGCAACAAGGT
CATAGAGGGATCATATACATTTGATCTATTTATCCTCCTCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTC
TCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTCAATTGTGTTCGATTCTTTCGATT
GTATATCTTTGTCCAATAAAGCAAATTAAAGGTGTGCCTATATATTTATAAATGTTAAGA
TGTCAATGTATTTTTTTGGAAAATATTTTTTATGAAAATGATAGTTATTTATTCGT


BQ
10 20 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4DG11TF U 2
AF RR4AV39TF U 1
AF RR4AG76TF U 9
AF RR4BA10TF U 2
AF RR4AE54TF U 3
AF RR4AE54JQ C 230
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AF RR4BA10JQ C 371
AF RR4AV39JQ C 456
AF RR4CF74TF U 885
BS 1 22 RR4AV39TF
BS 23 23 RR4BA10TF
BS 24 287 RR4AV39TF
BS 288 288 RR4AE54TF
BS 289 316 RR4AV39TF
BS 317 317 RR4BA10TF
BS 318 366 RR4AV39TF
BS 367 367 RR4BA10TF
BS 368 753 RR4AV39TF
BS 754 822 RR4BA10TF
BS 823 825 RR4AE54TF
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BS 863 884 RR4AE54JQ
BS 885 1136 RR4CF74TF

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AGAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAACAAGCCGATTAGGAT
GTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAA*CGGA
TTGGTCCAAAGCTC

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DS 

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CTGACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAGCA
ACGGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAA
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GCACAGTCACAACTTTTTATTTGAAATCGGAAGGAACGACATGGGATGAGATTGATTTTG
AGTTCT*GGGAAACATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAG
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CTTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATACTAACCGTCGATAACACGCCAATTA
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TGTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGG
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ATTCAAACGGAAGATCGTCTTGTACCACGACGA

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AACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAGCAACGGCCAG
CTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACAGAGTAT
TTGTTCGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTTGTAACTCAGCAGGCACAGTC
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AAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAACAAGCCGATGAGGATGTACGCA
AGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGATTGGTCC
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GACTACATG

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TGACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAGCAA
CGGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAAC
AGAGTATTTGTTCGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACTCAGCAGG
CACAGTCACAACTTTCTATTTGAAATCGGAAGGAACGACATGGGATGAGATTGATTTTGA
GTTCTTGGGAAACATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGG
TAAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGATCCAACAGCAAATTTCCACAC
TTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATACTAACCGTCGATAACACGCCAATTAG
AGAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAACAAGCCGATGAGGGT
GTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGA
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TTCAAACGGAAGATCGTCTTGTACCACGACGAAACCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAGA
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TTACTGTACGGATACTA

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DS 

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GAGTATTTGTTCGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTTGTAACTCAGCAGGC
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TTCTTGGGAAACATGAGTGGGGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGGT
AAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGATCCAACAGCAAATTTCCACACT
TACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATACTAACCGTCGATAACACGCCAATTAGA
GAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAACAAGCCGATGAGGATG
TACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGAT
TGGTCCAAAGCTCCATTCACAGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGCTCAT
TCAAACGGAAGATCGTCTTGTACCACGACGAAACCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAGAA
ATGGATTCAACGAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAAT
TACTGTACG*ATACTAAGAG
TTT

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TGCAACAAGGTCATAGAGGGATCATATACATTTGATCTATTTATCCTCCTCCTCCTCCTC
TGCTTTCTTTCTCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTCAATTGTGTTCGA
TTCTTTCGATTGTATATCTTTGTCCAATAAAGCAAATTAAAGGTGTGCCTATATATTTAT
AAATGTTAAGATGTCAATGTATTTTTT*GGAAAATATTTTTTATGAAAATGATAGTTATT
TA
CT

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DS 

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CATACTAACCGTCGATAACACGCCAATTAGAGAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGT
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ATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAATTACTGTACGGATACTAAGAGGTTTCCACA
GGGAATCCCTAGGGAATGTGCAACAAGGTCATAGAGGGATCATATACATTTGATCTATTT
ATCCTCCTCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTCTCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCT
TTTGTCAATTGTGTTCGATTCTTTCGATTGTATATCTTTGTCCAATAAAGCAAATTAAAG
GTGTGCCTATATATTTATAAATGTTAAGATGTCAATGTATTTTTT*GGAAAATATTTTTT
ATGAAAATGATAGTTATTTA
CT

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DS 

RD RR4BA10JQ 764 0 0
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TAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGATCCAACAGCAAATTTCCACACTTACTCAAT
CCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATACTAACCGTCGATAACACGCCAATTAGAGAGTTTAA
GAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAACAAGCCGATGAGGGTGTACGCAAG
TCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGATTGGTCCAA
AGCTCCATTCACAGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGCTCATTCAAACGG
AAGATCGTCTTGTACCACGACGAAACCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAGAAATGGATTC
AACGAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAATTACTGTAC
GGATACTAAGAGGTTTCCACAGGGAATCCCTAGGGAATGTGCAACAAGGTCATAGAGGGA
TCATATACATTTGATCTATTTATCCTCCTCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTCTCTTCTATAT
GTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTCAATTGTGTTCGATTCTTTCGATTGTATATCTTT
GTCCAATAAAGCAAATTAAAGGTGTGCCTATATATTTATAAATGTTAAGATGTCAATGTA
TTTTTTTGGAAAATATTTTTTATGAAAATGATAGTTATTTA
TTC

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DS 

RD RR4AV39JQ 659 0 0
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CCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAGAAATGGATTCAACGAGCCAAGCTAGACTCAGATGG
GTTCAGAAGAACTACATGATCTACAATTACTGTACGGATACTAAGAGGTTTCCACAGGGA
ATCCCTAGGGAATGTGCAACAAGGTCATAGAGGGATCATATACATTTGATCTATTTATCC
TCCTCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTCTCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTG
TCAATTGTGTTCGATTCTTTCGATTGTAT********CCAATAAAGCAAATTAAAGGTGT
GCCTATATATT*ATAAATGTTAAGATGTCAATGTATTTTTTTGGAAAATATTTTTT
TAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CF74TF 252 0 0
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TCCTCTGCTTTCTTTCTCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTCAATTGTG
TTCGATTCTTTCGATTGTATATCTTTGTCCAATAAAGCAAATTAAAGGTGTGCCTATATA
TTTATAAATGTTAAGATGTCAATGTATTTTTTTGGAAAATATTTTTTATGAAAATGATAG
TTATTTATTCGT

QA 1 252 1 252
DS 



AS 1 7

CO CL297Contig1 949 7 10 U
GGGGATACAGAAGAAACAATTTTGTCGGAAAATTCTGTCTTTGTCGGAGGGAAGATCCGT
GCATTCCATATCGGAAAAGTGTGTCGTTATTCTGCTGTTCGGCGTCGGGTTGATCCATTT
GGATACTTGGAAAGATGGATCCTAACCAGCCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGA
CGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTC
TCTTCTTCAACAGCTTTGTCATTATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCGGCACTTGACT
TCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGA
TCAATGACTTGGGTGAAAGTGTGTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTC
GGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGT
GGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCG
GTGTTTGCTTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGAT
GCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCACGGTTCCAATCCACA
GTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAAAAGGACTTAGTGAGAGCAAAAACA
GTGTACAAAAGAAGATTCGCCATAAGCCACACCATGTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTC
AATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTATATTATGTCTTCTTACATGT
ATTTTCATTTTCGACTTGTCCTGTTTAAGATACTTTTTGAGGTTGTAAAACATTTTGAAA
AGATCTCGATGTAGCTTTCACTTTAGCTTGCTAATATGTTTCCAGTGTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 10 10 30 30 45 30 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4BU66TF U 67
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AF RR4GU75TF U 1
AF RR4BU66JQ C 214
AF RR4GU75JQ C 222
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AF RR4FL83TF U 468
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BS 654 654 RR4BU66TF
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BS 731 948 RR4FL83TF
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TTGGAAAGATGGATCCTAACCAGCCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGACGTGTC
TCTTCCACGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCTCTTCT
TCAACAGCTTTGTCATTATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCGGCACTTGACTTCTGGG
TGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATG
ACTTGGGTGAAAGTTTGTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGA
ACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGTGGTTAG
TCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTT
GCTTGTCCCCTCAACGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAG
AAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCACGTTTCCAATCCACAGTACAA
TCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAG**AGAAAAGGACTTAGTGAGAGCAAAAA

QA 1 652 1 652
DS 

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CATTCCATATCGGAAAAGTGTGTCGTTATTCTGCTGTTCGGCGTCGGGTTGATCCATTTG
GATACTTGGAAAGATGGATCCTAACCAGCCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGAC
GTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCT
CTTCTTCAACAGCTTTGTCATTATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCGGCACTTGACTT
CTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGTTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGAT
CAATGACTTGGGTGAAAGTGTGTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCG
GATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGTG
GTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGG
TGTTTGCTTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCACCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGATG
CAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGGCAATCGCATCACGGTTCCAATCCACAG
TACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAA**GAAGAA

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DS 

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GGGGATACAGAAGAAACAATTTTGTCGGAAAATTCTGTCTTTGTCGGAGGGAAGATCCGT
GCATTCCATATCGGAAAAGTGTGTCGTTATTCTGCTGTTCGGCGTCGGGTTGATCCATTT
GGATACTTGGAAAGATGGATCCTAACCAGCCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGA
CGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTC
TCTTCTTCAACAGCTTTGTCATTATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCGGCACTTGACT
TCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGA
TCAATGACTTGGGTGAAAGTGTGTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTC
GGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGT
GGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCG
GTGTTTGCTTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGAT
GCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCACGGTTCCA*TCCACA
GTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAG**AGAAAAG*ACTTAGTGAGAGCAAAAACA
GTGTACAAAA
AA

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DS 

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GCG
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CTGTTCTTCTTGCGGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGG
TTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTTTGTGGAAGTTTGAGT
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CGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTC
AGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCATC
GGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACA
ATCGCATCACGTTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAA
AAGGACTTAGTGAGAGCAAAAACAGTGTACAAAAGAAGATTCGCCATAAGCCACACCATG
TTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTT
ATTATATTATGTCTTCTTACATGTATTTTCATTTTCGACTT*TCCTGTTTAAGATACTTT
TTGAGGTTGTAAAACATTTTGAAAAGATCTCGATGTAGCT

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DS 

RD RR4GU75JQ 711 0 0
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CTTCTTGCGGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGT
CTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTGTGGAAGTTTGAGTTTCTT
GACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTTTGGTGGACGCTT
TCCCTTGCAGCAGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCC
GACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCATCGGCTT
CACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCGC
ATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAAAAGGA
CTTAGTGAGAGCAAAAACAGTGTACAAAAGAAGATTCGCCATAAGCCACACCATGTTTTT
TTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTAT
ATTATGTCTTCTTACATGTATTTTCATTTTCGACTTGTCCTGTTTAAGATACTTTTTGAG
GTTGTAAAACATTTTGAAAAGATCTCGATGTAGCTTTCACTTTAGCTTGCT

QA 1 711 1 711
DS 

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GTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGTTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGAC
TTGGGTGAAAGTGTGTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAAC
AAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGTGGTTAGTC
CTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGC
TTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCACCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAA
ACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGGCAATCGCATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATC
TGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAAAAGGACTTAGTGAGAGCAAAAACAGTGTACAA
AAGAAGATTCGCCATAAGCCACACCATGTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACT
ATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTATATTATGTCTTCTTACATGTATTTTCAT
TTTCGACTTGTCCTGTTTAAGATACTTTTAGAGGTTGTAAAACATTTTGAAAAGATCTCG
ATGTAGCTTTCACTTTAGCTTGCTAATATGTTTCCAGTGTC

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DS 

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CTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCC*TCAACGTGGCTAATATCATCGGCTTTACAAA
GTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCACG
GTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAAAAGGACTTAGT
GAG*GCAAAAACAGTGTACAAAAGAAGATTCGCCATAAGCCACACCATGTTTTTTTGACT
GATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTATATTATG
TCTTCTTACATGTATTTTCATTTTCGACTTGTCCTGTTTAAGATACTTTTTGAGGTTGTA
AAACATTTTGAAAAGATCTCGATGTAGCTTTCACTTTAGCTTGCTAATATGTTTCCAGTG
T
T

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 10

CO CL298Contig1 1037 10 4 U
GAGCCTTGAATCACTTAAAAACTTTTAATCATGAGAGAATCCAATTTTTCACATATACAT
ATCCAACAAGTATTTCCTTTCTCATTACACAAAGTGGTTTGAGTTTTACTTATGTTTTCA
TAAATCCAACGACGCTTTTACTTATTTGCAACACACATCTGTTGCAGCATGCATATACCC
ATCAACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTCATCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTA
AGCTCGACGCCTCAACTGAGACTCCCCAGATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATC
GTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAG
AGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCAC
TGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAA
GATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTC
GACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGAT
GTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGAC
CATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCC
AGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAACATTTCATTAAC
AAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAGTTT
CAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCCTTCTTCTTCTGTTGTTGTGCTTCTCAAACCT
AGCTTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTGATCACTTTAGCGACTTTTTGATCGGAGAGAAGAT
AATTTGACGAAGAAGACGAGAAAAAAGGTGGAAGGGACTCTCGCTTTGTTAGAGCTTCTC
GCTTGTTCCAGATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 35 50 50 50 50 50 50 50 0 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BV47JQ U 1
AF RR4FV73JQ U 30
AF RR4CP89JQ U 12
AF RR4B209JQ U 33
AF RR4AU15JQ U 33
AF RR4AU15TF C 196
AF RR4FV73TF C 410
AF RR4BV47TF C 235
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AF RR4B209TF C 198
BS 1 768 RR4BV47JQ
BS 769 774 RR4CP89JQ
BS 775 869 RR4AU15JQ
BS 870 1037 RR4AU15TF

RD RR4BV47JQ 770 0 0
GAGCCTTGAATCACTTAAAAACTTTTAATCATGAGAGAATCCAATTTTTCACATATACAT
ATCCAACAAGTATTTCCTTTCTCATTACACAAAGTGGTTTGAGTTTTACTTATGTTTTCA
TAAATCCAACGACGCTTTTACTTATTTGCAACACACATCTGTTGCAGCATGCATATACCC
ATCAACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTCATCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTA
AGCTCGACGCCTCAACTGAGACTCCCCAGATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATC
GTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAG
AGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCAC
TGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAA
GATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTC
GACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGAT
GTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGAC
CATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCC
AGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAA
AA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4FV73JQ 724 0 0
CATGAGAGAATCCAATTTTTCACATATACATATCCAACAAGTATTTCCTTTCTCATTACA
CAAAGTGATTTTAGTTTTCCTTATGTTTTCAACAAACCAACGACGCTTTTACTTATTTGC
AACACACATCTGTTGCAGCATGCATATCCCCATCAACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTAT
GTCATCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAAACTCCCCAG
ATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCA
TTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAAAGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTG
CTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAA
CAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTG
CTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGA
ATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAA
AGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTC
CCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGC
CATC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4CP89JQ 763 0 0
CACTTAAAAACTTTTAATCATGAGAGAATCCAATTTTTCACATATACATATCCAACAAGT
ATTTCCTTTCTCATTACACAAAGTGGTTTGAGTTTTACTTATGTTTTCATAAATCCAACG
ACGCTTTTACTTATTTGCAACACACATCTGTTGCAGCATGCATATACCCATCAACCCTCT
TGTATCTTCGGTGTTTATGTCATCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCC
TCAACTGAAACTCCCCAGATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCA
CGTACGCATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAAAGGATCAACAC
GTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCACTGACGATATGA
GATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAAAATCTTGAAAC
TGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAG
ATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAG
GCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGT
TAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGT
AGACTTCAA*CTCAACGCCATCTCGGACA*GAACAAACATTTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4B209JQ 727 0 0
GG
GAGAATCCAATTTTTCACATATACATATCCAACAAGTATTTCCTTTCTCATTACACAAAG
TGGTTTGAGTTTTACTTATGTTTTCATAAATCCAACGACGCTTTTACTTATTTGCAACAC
ACATCTGTTGCAGCATGCATATACCCATCAACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTCAT
CAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGACTCCCCAGATGGC
TGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCA
TCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGT
TGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAAC
GTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTA
TGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATT
GGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTC
TCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTG
GCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCT
CGGAC

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR4AU15JQ 837 0 0
GG
GAGAATCCAATTTTTCACATATACATATCCAACAAGTATTTCCTTTCTCATTACACAAAG
TGGTTTGAGTTTTACTTATGTTTTCATAAATCCAACGACGCTTTTACTTATTTGCAACAC
ACATCTGTTGCAGCATGCATATACCCATCAACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTCAT
CAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGACTCCCCAGATGGC
TGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCA
TCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGT
TGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAAC
GTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTA
TGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATT
GGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTC
TCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTG
GCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCT
CGGACAAGAACAAATATTTCATTAACAAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGA
GGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCC

QA 3 837 3 837
DS 

RD RR4AU15TF 842 0 0
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CTGAGACTCCCCAGATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTA
CGCATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGG
TGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCACTGACGATATGAGATT
CAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTG
TGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATAT
ATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCAT
GTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGA
CAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGAC
TTCAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAATATTTCATTAACAAAGGGAACAGGCAT
CCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCC
GAGTAAAAGGTCCCTTCTTCTTCTGTTGTTGTGCTTCTCAAACCTAGCTTCTTCCCTTGC
TGTGTAACCTGATCACTTTAGCGACTTTTTGATCGGAGAGAAGATAATTTGACGAAGAAG
ACGAGAAAAAAGGTGGAAGGGACTCTCGCTTTGTTAGAGCTTCTCGCTTGTTCCAGATGC
CC

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4FV73TF 628 0 0
TATTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCT
TCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGT
ACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTC
TCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTT
GCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCT
CCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAAC
ATTTCATTAACAAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGCCATG
GCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCCTTCTTCTTCTGTTGTTGTGC
TTCTCAAACCTAGCTTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTGATCACTTTAGCGACTTTTTGATC
GGAGAGAAGATAATTTGACGAAGAAGACGAGAAAAAAGGTGGAAGGGACTCTCGCTTTGT
TAGAGCTTCTCGCTTGTTCCAGATGCCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4BV47TF 803 0 0
AAT
GTAAGCTCGACGC*TCAACTGAGACTCCCCAGATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGG
ATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATT*CATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTG
AAGAGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCT
CACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAA
TAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGG
CTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTG
GATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAA
GACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCC
TCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAAAATTTCATT
AACAAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAG
TTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCCTTCTTCTTCTGTTGTTGTGCTTCTCAAA
CCTAGCTTCTTCCCATGCTGTGTAACCT*******TTAGCGACTTTTTGATCGGAGAGAA
GATAATTTGACGAAGAAGACGAGAAAAAAGGTGGAAGGGACTCTCGCTTTGTTAGAGCTT
CTCGCTTGTTCCAGATGCCC

QA 4 803 4 803
DS 

RD RR4CP89TF 753 0 0
CTGCAGGTATATCTCG
TGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGC
TTGAAGAGGATCAACACGTGGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTG
CCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTT
GAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCAC
AGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGC
GTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAAC
AAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATG
TCCTCCAGGAATCTTGTAGACTTCAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAACATTTC
ATTAACAAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGACATGGCTGC
AAGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCCTTCTTCTTCTGTTGTTGTGCTTCTC
AAACCTAGCTTCTTCCCTTGCTGTGTAACCT*******TTAGCGACTTTTTGATCGGAGA
GAAGATAATTTGACGAAGAAGACGAGAAAAAAGGTGGAAGGGACTCTCGCTTTGTTAGAG
CTTCTCGCTTGTTCC
CC

QA 17 751 17 751
DS 

RD RR4B209TF 840 0 0
TTCGGTGTTTATGTCATCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACT
GAGACTCCCCAGATGGCTGCTGCAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACG
CATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTG
GTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTATTGCCTCACTGACGATATGAGATTCA
AGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAACCCCCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTG
TTGAATACAGTGCTCTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATAT
TGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGT
CAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACA
AGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTT
CAAACTCAACGCCATCTCGGACAAGAACAAATATTTCATTAACAAAGGGAACAGGCATCC
CATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCCGA
GTAAAAGGTCCCTTCTTCTTCTGTTGTTGTGCTTCTCAAACCTAGCTTCTTCCCTTGCTG
TGTAACCTGATCACTTTAGCGACTTTTTGATCGGAGAGAAGATAATTTGACGAAGAAGAC
GAGAAAAAAGGTGGAAGGGACTCTCGCTTTGTTAGAGCTTCTCGCTTGTTCCAGATGCCC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 10

CO CL299Contig1 1093 10 11 U
GGACGACAGAAGTGACTTCCGTCTCTTGGATAATCAATTCGCTGAGAGTATGGCCTCGCG
TTTGTTATCAACCACACTCATCACACCACCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCT
AACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGGAAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTC
TCAAGGAGGAACCGTTTACAAAGGCGTTTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGT
CAAAGAGGTTGTTCTGTACAGATCAGGACTTGTAACTGCTGCTGCTTCCTTTGTTACCGC
TTCGTCTGCCGCCTTTCTACCGGAGAACTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCA
GGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGGTGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATAT
CTATGTAACGGAGATCAAGAGGACTCTTCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTC
CTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAGACCCGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGT
TGGTCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGTTGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGT
TTTCAAAGAAGGGCTGTGTTACGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACC
CTCAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGGCCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCT
AGGAACATGGATGGCACTCTTTGTAGTATTTGCTGGAAGGAAATTCACTCAGCCTATTAA
GGATGATATTGGGGATAAATCTGTTTT*CATGTTCATGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAA
AAGCTGTAGTTGCAAAACTCGAGCAAGATAACTCTGGGTAAGACTCTTAATGCTTAGAAA
ATGTTATCTTCAAGAACAGGTAAATATCATGTACCCGTATGAGGAGAGACGTTACCATAA
ACAGTTTGTACATCTTATGAGCATTGATAGATTTCCTGCTTCACATGGGCTGTTGTAATG
GGCCTGTCCAGCCCAGGTCGGACTCTGACTTGGCCTTTATTTCATTATTAATATTAAGGT
CTTGTTGTCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DF94TF U 28
AF RR4GK13TF U 1
AF RR4G526TF U 28
AF RR4G459TF U 28
AF RR4BG90TF U 28
AF RR4G526JQ C 394
AF RR4G459JQ C 317
AF RR4GK13JQ C 380
AF RR4BM28JQ C 382
AF RR4FY85JQ C 548
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BS 28 29 RR4DF94TF
BS 30 762 RR4GK13TF
BS 763 763 RR4G459JQ
BS 764 775 RR4GK13TF
BS 776 781 RR4BG90TF
BS 782 782 RR4G459JQ
BS 783 799 RR4BG90TF
BS 800 1082 RR4G459JQ
BS 1083 1089 RR4GK13JQ
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ACCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCTAACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGG
AAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTCTCAAGGAGGAACCGTTTACAAAGGCGT
TTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGTCAAAGAGGTTGCTCTGTACAGATCAGG
ACTTGTAACTGCTGCTGCTTCCTTTGTTACCGCTTCGTCTGCCGCCTTTCTACCGGAGAA
CTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCAGGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGG
TGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATATACGTAACGGAGATCAAGAGGACTCT
TCAGGCTTTGTGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAT
ACCAGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTG
AGGATAATGCTCGATGTA

QA 1 515 1 515
DS 

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TTTGTTATCAACCACACTCATCACACCACCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCT
AACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGGAAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTC
TCAAGGAGGAACCGTTTACAAAGGCGTTTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGT
CAAAGAGGTTGTTCTGTACAGATCAGGACTTGTAACTGCTGCTGCTTCCTTTGTTACCGC
TTCGTCTGCCGCCTTTCTACCGGAGAACTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCA
GGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGGTGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATAT
CTATGTAACGGAGATCAAGAGGACTCTTCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTC
CTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAGACCCGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGT
TGGTCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGTTGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGT
TTTCAAAGAAGGGCTGTGTTACGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACC
CTCAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGGCCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCT
AGGAACATGGATGGCACTCTTTGTAGTATTTGCTGGAAGGAA*TTCACTCAGCCT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4G526TF 731 0 0
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ACCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCTAACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGG
AAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTCTCAAGGAGGAACCGTTTACAAAGGCGT
TTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGTCAAAGAGGTTGTTCTGTACAGATCAGG
ACTTGTAACTGCTGCTGCTTCCTTTGTTACCGCTTCGTCTGCCGCCTTTCTACCGGAGAA
CTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCAGGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGG
TGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATCTATGTAACGGAGATCAAGAGGACTCT
TCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAG
ACCCGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGT
TGTTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTGTGTTACGGTAA
GCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGG
CCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGA*CATGGATGGCACTCTTTGTAGT
ATTTGCTGGAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4G459TF 729 0 0
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ACCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCTAACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGG
AAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTCTCAAGGAGGAACCGTTTACAAAGGCGT
TTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGTCAAAGAGGTTGTTCTGTACAGATCAGG
ACTTGTAACTGCTGCTGCTTCCTTTGTTACCGCTTCGTCTGCCGCCTTTCTACCGGAGAA
CTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCAGGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGG
TGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATCTATGTAACGGAGATCAAGAGGACTCT
TCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAG
ACCCGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGT
TGTTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTGTGTTACGGTAA
GCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGG
CCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGAACATGGATGGCACTCTTTGTAGT
ATTTGCTGG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4BG90TF 772 0 0
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GCCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCTAACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGG
AAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTCTCAAGGAGAAACCGCTTACAAAGGCGT
TTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGTCAAAGAGGTTGTTCTGTACAGATCAGG
ACTTGTAACTGCTGCTGCCTCCTTTGTTACCGCTTCTTCTGCCGCCTTTCTACCGGAGAA
CTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCAGGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGG
TGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATCTATGTAACGGAGATCAAGAGGACTCT
TCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCGTTCGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAG
ACCAGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGT
TGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTCTGTTACGGTAA
GCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGG
CCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTACTAG*AACATGGATGGCACTCTTTGTAGT
ATTTGCTGGAAGAAA*TTCACTCAGCCTATTAAG*ATGATATTGGGGATAAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4G526JQ 645 0 0
GGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATCTATGTAACGGAGATCAAGAGGACTCTTCAGGC
TTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAGACCCGC
CAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGTTGTTCC
TCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTGTGTTACGGTAAGCTAGA
AGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGGCCTGAT
GAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGAACATGGATGGCACTCTTTGTAGTATTTGC
TGGAAGGAAATTCACTCAGCCTATTAAGGATGATATTGGGGAAAAATCTGTTTT*CATGT
TCATGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAAAAGCTGTAGTTGCAAAACTCGAGCAAGATAACT
CTGGGTAAGACTCTTAATGCTTAGAAAATGTTATCTTCAAGAACAGGTAAATATCATGTA
CCCGTATGAGGAGAGACGTTACCATAAACAGTTTGTACATCTTATGAGCATTGATAGATT
TCCTGCTTCACATGGGCTGTTGTAATGGGCCTGTCCAGCCCAGGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4G459JQ 766 0 0
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GTTGGTGCTGGTGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATCTATGTAACGGAGATC
AAGAGGACTCTTCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCT
GCCCTTGCTAGACCCGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCT
GTTTGGTTTGTTGTTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTG
TGTTACGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTCTCGGG
CATTTGAGTGGCCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGAACATGGATGGCA
CTCTTTGTAGTATTTGCTGGAAGGAAATTCACTCAGCCTATTAAGGATGATATTGGGGAA
AAATCTGTTTT*CATGTTCATGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAAAAGCTGTAGTTGCAAA
ACTCGAGCAAGATAACTCTGGGTAAGACTCTTAATGCTTAGAAAATGTTATCTTCAAGAA
CAGGTAAATATCATGTACCCGTATGAGGAGAGACGTTACCATAAACAGTTTGTACATCTT
ATGAGCATTGATAGATTTCCTGCTTCACATGGGCTGTTGTAATGGGCCTGTCCAGCCCAG
GTCGGACTCTGACTTGGCCTTTATTTCATTATTAATATTAAGGTCT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4GK13JQ 713 0 0
GGTGCTGGTGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATCTATGTAACGGAGATCAAG
AGGACTCTTCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCC
CTTGCTAGACCCGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCTGTT
TGGTTTGTTGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTGTGT
TACGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTTTCGGGCAT
TTGAGTGGCCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGAACATGGATGGCACTC
TTTGTAGTATTTGCTGGAAGGAAATTCACTCAGCCTATTAAGGATGATATTGGGGATAAA
TCTGTTTT*CATGTTCATGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAAAAGCTGTAGTTGCAAAACT
CGAGCAAGATAACTCTGGGTAAGACTCTTAATGCTTAGAAAATGTTATCTTCAAGAACAG
GTAAATATCATGTACCCGTATGAGGAGAGACGTTACCATAAACAGTTTGTACATCTTATG
AGCATTGATAGATTTCCTGCTTCACATGGGCTGTTGTAATTG*CCTGTCCAGCCCAGGTC
GGACTCTGACTTGGCCTTTATTTCATTATTAATATTAAGGTCTTGTTGTC
CCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4BM28JQ 708 0 0
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GACTCTTCAGGCTTTGTGGGCACTTGGTGTTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCT
TACTATACCAGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGGTCATCCAACTGCTGTTTG
GTTTGTTGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTGTGTTA
CGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTACTTCTCGGGCATTT
GAGTGGCTTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGAACATGGATGGCACTCTT
TGTAGTATTTGCTGGAAGGAAATTCACTCAGCCTATTAAGGATGATATTGGGGATAAATC
TGTTTT*CATGTTCACGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAAAAGCTGTAGTTGCAAAACTCG
AGCAAGATAACTCTGGGTAAGACTCTTAATGCTTAGAAAATGTTATCTTCAAGAACAGGT
AAATATCATGTACCCGTATGAGGAGAGACGTTACCATAAACAGTTTGTACATCTTATGAG
CATTGATAGATTTCCTGCTTCACATGGGCTGTTGTAATGGGCCTGTCCAGCCCAGGTCGG
ACTCTGACTTGGCCTTTATTTCATTATTAATATTAAGGTCT
TGTTGTC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4FY85JQ 546 0 0
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GAAGGGCTGTGTTACGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCTCAGTA
CTTCTCGGGCATTTGAGTGGCCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTGCTAGGAACA
TGGATGGCACTCTTTGTAGTATTTGCTGGAAGGAAATTCACTCAGCCTATTAAGGATGAT
ATTGGGGATAAATCTGTTTTTCATGTTCATGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAAAAGCTGT
AGTTGCAAAACTCGAGCAAGATAACTCTGGGTAAGACTCTTAATGCTTAGAAAATGTTAT
CTTCAAGAACAGGTAAATATCATGTACCCGTATGAGGAGAGACGTTACCATAAACAGTTT
GTACATCTTATGAGCATTGATAGATTTCCTGCTTCACATGGGCTGTTGTAATGGGCCTGT
CCAGCCCAGGTCGGACTCTGACTTGGCCTTTATTTCATTATTAATATTAAGGTCTTGTTG
TCCCTC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 2 9

CO CL300Contig1 758 5 2 U
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TTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGATCCG
GTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGACGTGGGTGGTTCGCCGTCTGCGACGTCGCGAGAAGTC
CACTAAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCT
GCGGAAGGATCATTGTCGTATCCTGGAAACAGAACGACCCGAGAACGTTGAAACATCACT
CTCGGTGGGCTGGGTTCTCTTACCGGAATCCATGCCTTCCGATTCCGTGGTTATGTGTTT
CGTCCCCGGTCAAGGCTGGGTCGTGCACATAGCTTCCGGATATCACCAAACCCCGGCACG
AAAAGTGTCAATGAACATGCAACTAAACAGTCTGCTTTCGCCAACCCGGAAACGGTGTTT
GTTCGGAAACAGTTCTGAAATGTAAAGTCTATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGC
TCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGT
GAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTG
CCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCCCCATCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTC
CCCCGTGCGTTACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AE08JQ C 1
AF RR4AE08TF U 1
AF RR4B757JQ C 510
AF RR4B757TF U 510
AF RR4GV89TF U 131
BS 1 431 RR4AE08TF
BS 432 758 RR4GV89TF

RD RR4AE08JQ 432 0 0
GCATTGCAATTGTTGGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCG
TTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGATCCG
GTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGACGTGGGTGGTTCGCCGTCTGCGACGTCGCGAGAAGTC
CACTAAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCT
GCGGAAGGATCATTGTCGTATCCTGGAAACAGAACGACCCGAGAACGTTGAAACATCACT
CTCGGTGGGCTGGGTTCTCTTACCGGAATCCATGCCTTCCGATTCCGTGGTTATGTGTTT
CGTCCCCGGTCAAGGCTGGGTCGTGCACATAGCTTCCGGATATCACCAAACCCCGGCACG
AAAAGTGTCAA
C

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4AE08TF 432 0 0
GCATTGCAATTGTTGGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCG
TTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGATCCG
GTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGACGTGGGTGGTTCGCCGTCTGCGACGTCGCGAGAAGTC
CACTAAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCT
GCGGAAGGATCATTGTCGTATCCTGGAAACAGAACGACCCGAGAACGTTGAAACATCACT
CTCGGTGGGCTGGGTTCTCTTACCGGAATCCATGCCTTCCGATTCCGTGGTTATGTGTTT
CGTCCCCGGTCAAGGCTGGGTCGTGCACATAGCTTCCGGATATCACCAAACCCCGGCACG
AAAAGTGTCAA
C

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4B757JQ 174 0 0
G
ATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATG
CGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG
CCCTAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTC

QA 2 174 2 174
DS 

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G
ATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATG
CGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG
CCCTAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTC

QA 2 174 2 174
DS 

RD RR4GV89TF 628 0 0
G
GGATCGCGGCGACGTGGGTGGTTCGCCGTCTGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTAAACCTT
ATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATC
ATTGTCGTATCCTGGAAACAGAACGACCCGAGAACGTTGAAACATCACTCTCGGTGGGCT
GGGTTCTCTTACCGGAATCCATGCCTTCCGATTCCGTGGTTATGTGTTTCGTCCCCGGTC
AAGGCTGGGTCGTGCACATAGCTTCCGGAGATCACCAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAA
TGAACATGCAACTAAACAGTCTGCTTTCGCCAACCCGGAAACGGTGTTTGTTCGGAAACA
GTTCTGAAATGTAAAGTCTATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGA
TGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAG
TCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCA
CAAATCGTCGTCCCCCCATCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTCCCCCGTGCGTT
ACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAG

QA 2 628 2 628
DS 



CO CL300Contig2 1280 4 6 U
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CAAAGTTCCTTTGATCAAAATGAATCCGTGGTTATAACATTATGACAAATGAAACATGTA
GTATAGTAATCAATTGTGTGCTACAACACATGGGATTACATTTCACTGCTCTCCTGTATC
ATCATCTTCGCCAGCTTTCTTGTATTCTGGTTTAAGCTCATACGTCCCTTGGTTCGAACC
TCTCTTGTTGTACACGCACAGCTCGTTCAGTATCTCTTTCAAAAACTGAGCTGGTTGATC
CGTCTCCTGTACCAGCTGCTTCAAAGTCCAGTTTGGTTGGCCTTCGAATAGCTTGAACAT
TATAGCCTCGAGCTCCCCACAATCTCTCCTCGTCCTCTTCACCTCTGTTTGCTTGACTGG
TGCAGGTTTCTTCTTCTCCTTTGAATTGGAGGAAACTAAACCAAGCATTCCAGGCATAGG
CCTCATATGTACGCCACGGTCGTTATCAATAACCTGTATCTGTCTACTTTTAACCATGGA
TTTGCTTGTTCTCTCTCGACAAAGCTTTGCGTACTCTTCGATGTCTTCGCCGTGAGGCTT
CATATCAAACTTGTGTTCTACCTTTCCTTCACTTGCGGGATCACCTAGATTGGATTCGGA
GAAGATACCCATGGGAACAAAGTCTTTAAACATGTTCAAAGCGTAGCTCTTTGGCATGTT
CCCATACTCAGCACCAACCATCTCCATGAAAAACTCGGTCTGGGACTGTAGAGGATCAAA
GGATTCAACAACCTTGCCTAAGCTATTGAATCCGGAGGATGAGAACGAAGAGGAAGAAGA
AGGAGCTTGCTTTCCCCAGGCCTTGGCGACAACTACAGGGCTCTTCATCAACCAAACAGG
CCGATCTGATTTTTCCAAATCGAGTTCGTGAATGTTACTTTTATCGTCTTCCATGGTCAA
CTCAAAAAATCGAATCTTTGTTCGTCTTCTTACAGTTTAGTTCTCTTCAGTTCTGATCTA
AACTCTGTTTCGGATCCTTTTTTTTCTTTGTCCTCCGCTTATTGATATGCTTAAACTCAG
CGGGTGATCCCGCCTGACCTGGGGTCGCGTTGAGGACTTTGGGTCATCGAGAGCTTTTGG
ACCGGAACGACCGACGATATGACGAGGAGATTGAATTCACCACCGCATGTCAAGACGCTC
CTGGCATCCTTAGCTCGGATTTTGGCCAACCGCGTGCGGTAACACACGGGAGACCAGCTT
CCGTCCTATATCCTCGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK95JQ U 1
AF RR4AR55JQ U 59
AF RR4AR55TF C 403
AF RR4EP23JQ U 1053
BS 1 380 RR4BK95JQ
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BS 730 813 RR4AR55JQ
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RD RR4BK95JQ 729 0 0
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GTATAGTAATCAATTGTGTGCTACAACACATGGGATTACATTTCACTGCTCTCCTGTATC
ATCATCTTCGCCAGCTTTCTTGTATTCTGGTTTAAGCTCATACGTCCCTTGGTTCGAACC
TCTCTTGTTGTACACGCACAGCTCGTTCAGTATCTCTTTCAAAAACTGAGCTGGTTGATC
CGTCTCCTGTACCAGCTGCTTCAAAGTCCAGTTTGGTTGGCCTTCGAATAGCTTGAACAT
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TGCAGGTTTCTTCTTCTCCTTTGAATTGGAGGAAACTAAACCAAGCATTCCAGGCATAGG
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TTTGCTTGTTCTCTCTCGACAAAGCTTTGCGTACTCTTCGATGTCTTCGCCGTGAGGCTT
CATATCAAACTTGTGTTCTACCTTTCCTTCACTTGCGGGATCACCTAGATTGGATTCGGA
GAAGATACCCATGGGAACAAAGTCTTTAAACATGTTCAAAGCGTAGCTCTTTGGCATGTT
CCCATACTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4AR55JQ 755 0 0
A
CCAAAGTTCCTTTGATCAAAATGAATCCGTGGTTATAACATTATGACAAATGAAACATGT
AGTATAGTAATCAATTGTGTGCTACAACACATGGGATTACATTTCACTGCTCTCCTGTAT
CATCATCTTCGCCAGCTTTCTTGTATTCTGGTTTAAGCTCATACGTCCCTTGGTTCGAAC
CTCTCTTGTTGTACACGCACAGCTCGTTCAGTATCTCTTTCAAAAACTGAGCTGGTTGAT
CCGTCTCCTGTACCAGCTGCTTCAAAGTCCAGTTTGGTTGGCCTTCGAATAGCTTGAACA
TTATAGCCTCGAGCTCCCCACAATCTCTCCTCGTCCTCTTCACCTCTGTTTGCTTGACTG
GTGCAGGTTTCTTCTTCTCCTTTGAATTGGAGGAAACTAAACCAAGCATTCCAGGCATAG
GCCTCATATGTACGCCACGGTCGTTATCAATAACCTGTATCTGTCTACTTTTAACCATGG
ATTTGCTTGTTCTCTCTCGACAAAGCTTTGCGTACTCTTCGATGTCTTCGCCGTGAGGCT
TCATATCAAACTTGTGTTCTACCTTTCCTTCACTTGCGGGATCACCTAGATTGGATTCGG
AGAAGATACCCATGGGAACAAAGTCTTTAAACATGTTCAAAGCGTAGCTCTTTGGCATGT
TCCCATACTCAGCACCAACCATCTCCATGAAAAACTCGGTCTGGGACTGTAGAGGATCAA
AGGATTCAACAACCTTGCCTAAGCTATTGAATCC

QA 2 755 2 755
DS 

RD RR4AR55TF 707 0 0
CTCTGTTTGCTTGACTGGTGCAGGTTTCTTCTTCTCCTTTGAATTGGAGGAAACTAAACC
AAGCATTCCAGGCATAGGCCTCATATGTACGCCACGGTCGTTATCAATAACCTGTATCTG
TCTACTTTTAACCATGGATTTGCTTGTTCTCTCTCGACAAAGCTTTGCGTACTCTTCGAT
GTCTTCGCCGTGAGGCTTCATATCAAACTTGTGTTCTACCTTTCCTTCACTTGCGGGATC
ACCTAGATTGGATTCGGAGAAGATACCCATGGGAACAAAGTCTTTAAACATGTTCAAAGC
GTAGCTCTTTGGCATGTTCCCATACTCAGCACCAACCATCTCCATGAAAAACTCGGTCTG
GGACTGTAGAGGATCAAAGGATTCAACAACCTTGCCTAAGCTATTGAATCCGGAGGATGA
GAACGAAGAGGAAGAAGAAGGAGCTTGCTTTCCCCAGGCCTTGGCGACAACTACAGGGCT
CTTCATCAACCAAACAGGCCGATCTGATTTTTCCAAATCGAGTTCGTGAATGTTACTTTT
ATCGTCTTCCATGGTCAACTCAAAAAATCGAATCTTTGTTCGTCTTCTTACAGTTTAGTT
CTCTTCAGTTCTGATCTAAACTCTGTTTCGGATCCTTTTTTTTCTTTGTCCTCCGCTTAT
TGATATGCTTAAACTCAGCGGGTGATCCCGCCTGACCTGGGGTCGC
C

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EP23JQ 228 0 0
CTCCGCTTATTGATATGCTTAAACTCAGCGGGTGATCCCGCCTGACCTGGGGTCGCGTTG
AGGACTTTGGGTCATCGAGAGCTTTTGGACCGGAACGACCGACGATATGACGAGGAGATT
GAATTCACCACCGCATGTCAAGACGCTCCTGGCATCCTTAGCTCGGATTTTGGCCAACCG
CGTGCGGTAACACACGGGAGACCAGCTTCCGTCCTATATCCTCGAGAC

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 10

CO CL301Contig1 770 10 30 U
GGGGACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCA
CCAAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAGAAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTAGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGT
TTGATCATCA***AGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCT
GTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAAATGT
AAAAACATAAAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAAGTAGCCT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 35 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 35 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE49TF U 1
AF RR4FR19TF U 3
AF RR4B935JQ C 374
AF RR4B935TF U 374
AF RR4FZ19TF U 3
AF RR4B236TF U 70
AF RR4B355JQ C 146
AF RR4B355TF U 70
AF RR4B236JQ C 151
AF RR4FE49JQ C 235
BS 1 60 RR4FE49TF
BS 61 61 RR4FR19TF
BS 62 70 RR4FE49TF
BS 71 73 RR4FR19TF
BS 74 91 RR4FE49TF
BS 92 92 RR4FR19TF
BS 93 105 RR4FE49TF
BS 106 106 RR4FR19TF
BS 107 149 RR4FE49TF
BS 150 150 RR4FR19TF
BS 151 218 RR4FE49TF
BS 219 219 RR4B236TF
BS 220 370 RR4FE49TF
BS 371 373 RR4FR19TF
BS 374 393 RR4FE49TF
BS 394 394 RR4FR19TF
BS 395 460 RR4FE49TF
BS 461 461 RR4FR19TF
BS 462 527 RR4FE49TF
BS 528 528 RR4FR19TF
BS 529 565 RR4FE49TF
BS 566 567 RR4FR19TF
BS 568 688 RR4FE49TF
BS 689 716 RR4FR19TF
BS 717 717 RR4B236TF
BS 718 724 RR4FZ19TF
BS 725 725 RR4B236TF
BS 726 735 RR4FZ19TF
BS 736 757 RR4B236TF
BS 758 770 RR4FE49JQ

RD RR4FE49TF 688 0 0
GGGGACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCA
ACAAGATCTAGT*ATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGCTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCATTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGT
TTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAACGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAATAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGGAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGT*GGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCT
GTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FR19TF 714 0 0
GGACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCACC
AAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAGAAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCT
ACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTC
TCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGC
CAGCACCTGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCT
GATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTT
GATCATCA***AGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTA
GGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGGGCCCTAGGTCGATTGTT
GAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGA
AACATCCACCAGCCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGACAGAGTATGTTGTATCTT
TAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGT
AACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4B935JQ 338 0 0
G
GGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTTTGAGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGT
GAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTGGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAG
TATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAG
CCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTA
CCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTA
TCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATC
CCC

QA 2 335 2 335
DS 

RD RR4B935TF 338 0 0
G
GGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGT
GAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTGGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAG
TATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAG
CCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTA
CCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTA
TCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACC

QA 2 338 2 338
DS 

RD RR4FZ19TF 733 0 0
GGACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCACC
AAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAGAAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCT
ACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTC
TCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGC
CAGCACCTGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCT
GATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTT
GATCATCA***AGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTA
GGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGGGCCCTAGGTCGATTGTT
GAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGA
AACATCCACCAGCCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGACAGAGTATGTTGTATCTT
TAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGT
AACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAA*TGTAA
AA*CATAAAAAAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4B236TF 688 0 0
AAAGATTCAGAGTTATACAAAGAAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACGCTAA
ACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGG
AGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTAGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACC
AGGGGGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTC
TTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATC
A***AGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAGGGAAGA
ATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGG
CCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCC
ACCAGCCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCAC
CTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCT
TTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAAATGTAAAAACATA
AAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4B355JQ 612 0 0
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GACGACCTCCACTAGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGGGCTGATGGTTT
TTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGA
TTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATCA***AGGATACGTTGG
GCAACAAATGTATCAGGCACCTTTTGAGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAG
GAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAA
GCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAG
GAGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATT
TTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATG
TTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAATTGTATAA
TTTGAAGAGTAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4B355TF 688 0 0
AAAGATTCAGAGTTATACAAAGAAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACGCTAA
ACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGG
AGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTAGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACC
AGGGGGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTC
TTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATC
A***AGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAGGGAAGA
ATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGG
CCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCC
ACCAGCCTCGTTGAAGGAGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCAC
CTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCT
TTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAAATGTAAAAACATA
AAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4B236JQ 607 0 0
TTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGA
CCTCCACTAGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGGGCTGATGGTTTTTACG
ACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCG
ATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATCA***AGGATACGTTGGGCAAC
AAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAAT
CGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAG
CCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGGAGGG
TTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAG
TATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAG
TCTCAAA*ACTTGTTATCACCAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAATTGTATAATTTGA
AGAGTAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FE49JQ 536 0 0
GGATCAGCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCG
ATGTAGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAG
CTGAGTTTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAACGTATCAGGCACCTTTTGAGT
TTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAATAGGAGCCCTAGGT
CGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGGAGGTTG
CTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGT*GGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGT
TGTATCTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGA
GAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAGACTTGTTATCAC*AAA
AAATGTAAAAACATAAAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAAGTAGCCT

QA 1 536 1 536
DS 



AS 2 11

CO CL302Contig1 462 3 5 U
AAGCCAAAAAAATTACAATCTCAAAATCAGTAATACAAAAAAAAAATTATCTTGGGACTT
TCACTTATCATCCCAAACATCACATAAAAAAAGAGGAAACATAACCCATTAATTTTCTTC
ACTTTTTTGAAAAAACCGTTGAGGATGATGATTCCGGCTCTTTCCATGCCGCTTGCCATT
GCTTGTCATATAACGTTGTCTCTTCAATCAAACCCTTAATTTTGTCTAAATCTTCTTTCT
TGCGGATGAAAAAAACTCCGGCAACACCCACAAACAAAAGTGTTTTGCAAAAAAAATTTC
CCATTTGATCAACAAGTCCTACTCCTGTAAGGGTATCAACAAAGTAAGCCATGAAAAACC
CTACCATCCCCCCACGACCATTGAGGAGTTCAGCTTCGGGTAAATGGTATCTCTTCATCC
ATGCCCACCATGGAATGATGGAGGTATCGAAAAGGACAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS68JQ U 228
AF RR4B020JQ U 250
AF RR4CQ31JQ U 1
BS 1 266 RR4CQ31JQ
BS 267 267 RR4AS68JQ
BS 268 332 RR4CQ31JQ
BS 333 333 RR4AS68JQ
BS 334 462 RR4CQ31JQ

RD RR4AS68JQ 126 0 0
AAATCTTCTTTCTTGCGGATGAAAAAAACTCCGGCAACCCCCACAAACAAAAGTGTTTTG
CAAAAAAAATTTCCCATTTGATCAACAAGTCCTACTCCTGTAAGGGTATCAACAAAGTAA
GCCATG

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR4B020JQ 104 0 0
AAAAAACC
CCGGCAACACCCCCAAACAAAAGTGTTTTGCAAAAAAAATTTCCCATTTGATCAAAAAGT
CCTACTCCTGTAAGGGTATCAACAAAGTAAGCCATG

QA 9 104 9 104
DS 

RD RR4CQ31JQ 462 0 0
AAGCCAAAAAAATTACAATCTCAAAATCAGTAATACAAAAAAAAAATTATCTTGGGACTT
TCACTTATCATCCCAAACATCACATAAAAAAAGAGGAAACATAACCCATTAATTTTCTTC
ACTTTTTTGAAAAAACCGTTGAGGATGATGATTCCGGCTCTTTCCATGCCGCTTGCCATT
GCTTGTCATATAACGTTGTCTCTTCAATCAAACCCTTAATTTTGTCTAAATCTTCTTTCT
TGCGGATGAAAAAAACTCCGGCAACAGCCACAAACAAAAGTGTTTTGCAAAAAAAATTTC
CCATTTGATCAACAAGTCCTACTCCTGTAAGGCTATCAACAAAGTAAGCCATGAAAAACC
CTACCATCCCCCCACGACCATTGAGGAGTTCAGCTTCGGGTAAATGGTATCTCTTCATCC
ATGCCCACCATGGAATGATGGAGGTATCGAAAAGGACAGGCT

QA 1 462 1 462
DS 



CO CL302Contig2 1028 8 6 U
AGGGGGAACCACACATTCAAAACTAACTCTGAAGAACTGAACAGAGGAGAGACAGAGGAG
GAGTGTGTGTGTGTGTGAGGACTGAGCAAGCAACAAATGTCCATATCCATGGCGTTATTC
TCTCCGCCGATCTCTTCTCCACTTCTAAACCCTAACCCCATCCCCAAGATCTCGCTCTCT
CTCCTCTCCACCAAGCGCCTCTCTCTCGTCTCCCTCACTCGAGCCTCCTCCGACAACGGT
ACGTCAACACCCGCTTCCTCCACAGTCTCTGCAACCACCGTGGAGGCTCCAAAGCCTGTA
GAGGAAGTCTCAGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGGCGAAGAGACTGAC
TTGACGACCACGACGACGACTGAGATCAAGTTCCAAGATGCGAAGTGGGTTAATGGAACG
TGGGATCTGAAACAGTTCGAGAAAGAAGGCAAAACAGATTGGGACTCTGTTATCGTTGCT
GAGGCAAAGAGGAGAAAGTGGCTTGAAGATAACCC*GGAGACAACTACCAACGACGAGCC
*TGTCCTTTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTAC
CC*GAAGCTGAACTCCTCAATGGTCGTGCGGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTT
GTTGATAGCCTTACAGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAATTTCTTCTGCAAAACA
CTCTTGTTTGTGGCTGTTGCCGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGACAAA
CTTAAGGGTCTGATTGAAGAGACAACGTTATATGACAAGCAATGGCAAGCGGCATGGAAA
GAGCCGGAATCATCATCCTCAACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAAGAAAATTAATGGCTTAT
GTTTCCTCTTTTCTTATGTGATGTTTGTGATGATAAGTGAAAGTCCCAAGATAATTTCTT
TTTTGTATTACTGATCTTGAGATTGTAATCTTTCTGGCTTTAGAAATCTCTATGAAGTAG
TCCATCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DI35TF U 1
AF RR4CQ31TF U 54
AF RR4AS68TF U 68
AF RR4B020TF U 4
AF RR4E217JQ C 374
AF RR4E217TF U 374
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CTCCTCTCCACCAAGCGCCTCTCTCTCGTCTCCCTCACTCGAGCCTCCTCCGACAACGGT
ACGTCAACACCCGCTTCCTCCACAGTCTCTGCAACCACCGTGGAGGCTCCAAAGCCTGTA
GAGGAAGTCTCAGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGGCGAAGAGACTGAC
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TGGGATCTGAAACAGTTCGAGAAAGAAGGCAAAACAGATTGGGACTCTGTTATCGTTGCT
GAGGCAAAGAGGAGAAAGTGGCTTGAAGATAACCC*GGAGACAACTACCAACGACGAGCC
*TGTCCTTTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTAC
CC*GAAGCTGAACTCCTCAATGGTCGTGCGGCGATG

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DS 

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G
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TTATTCTCTCCGCCGATCTCTTCTCCACTTCTAAACCCTAACCCCATCCCCAAGATCTCG
CTCTCTCTCCTCTCCACCAAGCGCCTCTCTCTCGTCTCCCTCACTCGAGCCTCCTCCGAC
AACGGTACGTCAACACCCGCTTCCTCCACAGTCTCTGCAACCACCGTGGAGGCTCCAAAG
CCTGTAGAGGAAGTCTCAGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGGCGAAGAG
ACTGACTTGACGACCACGACGACGACTGAGATCAAGTTCCAAGATGCGAAGTGGGTTAAT
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GTTGCTGAGGCAAAGAGGAGAAAGTGGCTTGAAGATAACCC*GGAGACAACTACCAACGA
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ATCTACCC*GAAGCTGAACTCCTCAATGGTCGTGCGGCGATGG

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TCTCAGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGGCGAAGAGACTGACTTGACGA
CCACGACGACGACTGAGATCAAGTTCCAAGATGCGAAGTGGGTTAATGGAACGTGGGATC
TGAAACAGTTCGAGAAAGAAGGCAAAACAGATTGGGACTCTGTTATCGTTGCTGAGGCAA
AGAGGAGAAAGTGGCTTGAAGATAACCCCGGAGACAACTACCAACGACGAGCCCTGTCCT
TTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCCCGAAG
CTGAACTCCTCAATGGTCGTGCGGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATA
GCCTTACAGGAGT

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DS 

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TGTGTGTGTGTGTGAGGACTGAGCAAGCAACAAATGTCCATATCCATGGCGTTATTCTCT
CCGCCGATCTCTTCTCCACTTCTAAACCCTAACCCCATCCCCAAGATCTCGCTCTCTCTC
CTCTCCACCAAGCGCCTCTCTCTCGTCTCCCTCACTCGAGCCTCCTCCGACAACGGTACG
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GAAGTCTCAGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGGCGAAGAGACTGACTTG
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TCCTTTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCC*
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DS 

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G
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AAAGTGGCTTGAAGATAACCC*GGAGACAACTACCAACGACGAGCC*TGTCCTTTTCGAT
ACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCC*GAAGCTGAACT
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TCTTGAGATTGTAATCTTTCTGGC

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G
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AAAGTGGCTTGAAGATAACCC*GGAGACAACTACCAACGACGAGCC*TGTCCTTTTCGAT
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AGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAATTTCTTCTGCAAAACACTCTTGTTTGTGGC
TGTTGCCGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGACAAACTTAAGGGTCTGAT
TGAAGAGATAACGTTATATGACAAGCAATGGCAAGCGGCATGGAAAGAGCCGGAATCATC
ATCCTCAACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAAGAAAATTAATGGCTTATGTTTCCTCTTTTCT
TATGTGATGTTTGTGATGATAAGTGAAAGTCCCAAGATAATTTCTTTTTTGTATTACTGA
TCTTGAGATTGTAATCTTTCTGGC

QA 2 625 2 625
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G
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GTTTTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGCCTTACAGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGG
AAATTTCTTCTGCAAAACACTCTTGTTTGTGGCTGTTGCCGGAGTTCTTTTCATCCGCAA
GAACGAAGATTTAGACAAACTTAAGGGTTTGATTGAAGAGACAACGTTATATGACAAGCA
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AAGAAAATTAATGGCTTATGTTTCCTCTTTTCTTATGTGATGTTCGTGATGATAAGTGAA
AGTCCCAAGATAATTTCTTTTTTGTATTACTGATCTTGAGATTGTAATCTTTCTGGC
TTTAG

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CCTGTAGAGGAAGTCTCAGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGGCGAAGAG
ACTGACTTGACGACCACGACGACGACTGAGATCAAGTTCCAAGATGCGAAGTGGGTTAAT
GGAACGTGGGATCTGAAACAGTTCGAGAAAGAAGGCAAAACAGATTGGGACTCTGTTATC
GTTGCTGAGGCAAAGAGGAGAAAGTGGCTTGAAGATAACCC*GGAGACAACTACCAACGA
CGAGCC*TGTCCTTTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACC
ATCTACCC*GAAGCTGAACTCCTCAATGGTCGTGCGGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCT
TACTTTGTTGATAGCCTTACAGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAATTTCTTCTGC
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GACAAACTTAAGGGTCTGATTGAAGAGACAACGTTATATGACAAGCAATGGCAAGCGGCA
TGGAAAGAGCCGGAATCATCATCCTCAACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAAGAAAATTAATG
GCTTATGTTTCCTCTTTTCTTATGAGATGTTTGTGATGATAAGTGAAAGTCCCAAGATAA
CTTCTTTTTTGTATTACTGATCTTGAGATTGTAATCTTTCTGGCTTTAGAAATCTCTATG
AAGTAGTCCATCCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 2 11

CO CL303Contig1 950 2 4 U
GGGCTTTGATCAGGTTTCTTGTCTGAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACTCCAAGTT
CCATTCAGATTCTTCGTTCCTCTGTTTCTCCTACGTGCTCGAAACCCTTGTTTCGATCAT
CATCTAGCTTATCATCATCCTCCATCGTTTCTGCTCCTTTCGCCAGATTAAAATCCAATT
CCCTAATCTCTAGACCTCGTGTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTGATC
CCGTCACTGAGTACAGAGAAGATATCGGTGAGATACTCGGGGATGTCTCCATTTTTACTG
CATCAGACCAGCCCGTGAAGTTCAGCAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTG
TTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAACTTGCTACTGCATTGAGAG
AGGCGAAACCGCGGTTTGATGCGGCCGGTGTTAAACTGGTGGCTGTTGGTGTTGGAACGC
CTGATAAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTACCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCG
ATCCTGAGCGCAAGGCGTATGATGTTCTTGGTTTATACTACGGTTTAGGCCGTACTTTCT
TCAACCCAGCTAGTAAAAAAATCTTCTCACGATTTGATGAGTTACGAGAAGCTGCAAAGA
ACTACACCATAAAAGCCGCTCCTGAAGACAGAAGCAGCGTGTTGCAACAGGGAGGTACGT
TTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTTGTATGGTCGAAAAGACGAAGGTACTGGTGATCATC
CATCTCTAGGTGATGTTCTCAATGTCTGCTGCACAACCCAAGCCACTGTTGCTTGAACAT
TGGTTTAAAGTCTCTCTGGTCTGGTTTAATGCTTACATCACTGTAATAATTGTAGCTATT
AATACATGTTTTTACGCGTTAATAAATTATAAATAGTATACATTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU30TF U 1
AF RR4EU30JQ C 200
BS 1 620 RR4EU30TF
BS 621 621 RR4EU30JQ
BS 622 706 RR4EU30TF
BS 707 950 RR4EU30JQ

RD RR4EU30TF 706 0 0
GGGCTTTGATCAGGTTTCTTGTCTGAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACTCCAAGTT
CCATTCAGATTCTTCGTTCCTCTGTTTCTCCTACGTGCTCGAAACCCTTGTTTCGATCAT
CATCTAGCTTATCATCATCCTCCATCGTTTCTGCTCCTTTCGCCAGATTAAAATCCAATT
CCCTAATCTCTAGACCTCGTGTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTGATC
CCGTCACTGAGTACAGAGAAGATATCGGTGAGATACTCGGGGATGTCTCCATTTTTACTG
CATCAGACCAGCCCGTGAAGTTCAGCAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTG
TTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAACTTGCTACTGCATTGAGAG
AGGCGAAACCGCGGTTTGATGCGGCCGGTGTTAAACTGGTGGCTGTTGGTGTTGGAACGC
CTGATAAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTACCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCG
ATCCTGAGCGCAAGGCGTATGATGTTCTTGGTTTATACTACGGTTTAGGCCGTACTTTCT
TCAACCCAGCTAGTAAAAAA*TCTTCTCACGATTTGATGAGTTACGAGAAGCTGCAAAGA
ACTACACCATAAAAGCCGCTCCTGAAGACAGAAGCAGCGTGTTGCA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EU30JQ 751 0 0
T
GTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTGATCCCGTCACTGAGTACAGAGAA
GATATCGGTGAGATACTCGGGGATGTCTCCATTTTTACTGCATCAGACCAGCCCGTGAAG
TTCAGCAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTC
GGATGCGTTTGCTGTTGGGAACTTGCTACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCGCGGTTTGAT
GCGGCCGGTGTTAAACTGGTGGCTGTTGGTGTTGGAACGCCTGATAAGGCTCGTATACTT
GCATCTCGGTTACCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCGTAT
GATGTTCTTGGTTTATACTACGGTTTAGGCCGTACTTTCTTCAACCCAGCTAGTAAAAAA
ATCTTCTCACGATTTGATGAGTTACGAGAAGCTGCAAAGAACTACACCATAAAAGCCGCT
CCTGAAGACAGAAGCAGCGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAG
CTCTTGTATGGTCGAAAAGACGAAGGTACTGGTGATCATCCATCTCTAGGTGATGTTCTC
AATGTCTGCTGCACAACCCAAGCCACTGTTGCTTGAACATTGGTTTAAAGTCTCTCTGGT
CTGGTTTAATGCTTACATCACTGTAATAATTGTAGCTATTAATACATGTTTTTACGCGTT
AATAAATTATAAATAGTATACATTTGAACC

QA 2 751 2 751
DS 



CO CL303Contig2 1031 9 16 U
AGGTTCCATCGTCGCCAAACTGCTTTGATCAGGTTTCTTGTCTGAACAATGGCGAGTCTC
TCTGTACGAACGCCAAGTTCCATTCAGATTCTTCGTTCCTCTGTTTCTCCTATGTGCTCG
AAACACTTGTTTCGATCATCATC*AAACTTTTCATCTTCCATCGTTTCTACTCCTTTTGC
CAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATCTCTATACCTCGCGTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTT
CCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACATCGGTGAGATCCTCGGGG
ATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGGCCAGCCCGTGAAGTTCAGCAATCTCTTGGATCAGA
ACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAGC
TTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGGCTGGTGTTAAACTGGTTG
CGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTCCAA
TGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACTACG
GATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCTTCTCAAGATTTGACGAGA
TACGAGAAGCTACGAAGAACTACACCATACAAGCCACTCCTGAAGACAGAAGCAGTGTGT
TGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTTGTATGGTCGAAAAGACG
AAGGTACTGGTGATCACCCATCTCTAGATGATGTTCTCAATGTCCGCTGCACAACACAAG
CCACTGTTGCTTGAACATTGGTTTAAAGTCCCTCTGGTTTGGTTTAATGCTTTCATCACT
GTATAATTGTAGCTATTAATATATGTTTTAAATATGATAATAAATTATAAATAGTATACA
TTTGAACCACACAAGTTTATACTGTAAAGATAAGACAATTGTTTGGTATGTAATTTTGGT
CATTTGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI59TF U 25
AF RR4EX18TF U 1
AF RR4E901TF U 26
AF RR4A492TF U 43
AF RR4AW09TF U 42
AF RR4AZ71TF U 42
AF RR4AZ71JQ C 103
AF RR4AW09JQ C 178
AF RR4EX18JQ C 264
BS 1 210 RR4EX18TF
BS 211 211 RR4AW09TF
BS 212 342 RR4EX18TF
BS 343 345 RR4GI59TF
BS 346 678 RR4EX18TF
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BS 680 703 RR4EX18TF
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BS 705 729 RR4EX18TF
BS 730 730 RR4AW09TF
BS 731 746 RR4EX18TF
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BS 880 966 RR4AZ71JQ
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RD RR4GI59TF 578 0 0
GG
GATCAGGTTTCTTGTCTGAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACGCCAAGTTCCATTCA
GATTCTTCGTTCCTCTGTTTCTCCTATGTGCTCGAAACACTTGCTTCGATCATCATC*AA
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GAGTACAGAGAAGACATCGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGGC
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GCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAG
CGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACTACGGA

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR4EX18TF 746 0 0
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TCTGTACGAACGCCAAGTTCCATTCAGATTCTTCGTTCCTCTGTTTCTCCTATGTGCTCG
AAACACTTGTTTCGATCATCATC*AAACTTTTCATCTTCCATCGTTTCTACTCCTTTTGC
CAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATCTCTAGACCTCGCGTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTT
CCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACATCGGTGAGATCCTCGGGG
ATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGGCCAGCCCGTGAAGTTCA***ATCTCTTGGATCAGA
ACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAGC
TTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGGCTGGTGTTAAACTGGTTG
CGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTCCAA
TGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACTACG
GATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCTTCTCAAGATTTGACGAGA
TACGAGAAGCTACGAAGAGCTACACCATACAAGCCACTCCTGA*GACAGAAGCAGTGTGT
TGCAACAGG*AGGTACGTTTGTTTTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4E901TF 699 0 0
G
GATCAGGTTTCTTGTCTGAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACGCCAAGTTCCATTCA
GATTCTTCGTTCCTCTGTTTCTCCTATGTGCTCGAAACACTTGTTTCTATCATCATC*AA
ACTTTTCATCTTCCATCGTTTCTACTCCTTTTGCCAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATC
TCTAGACCTCGCGTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACT
GAGTACAGAGAAGACATCGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGGC
CAGCCCGTGAAGTTCAGCAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTT
TTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAA
CCACGGTTTGATGCGGCTGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAG
GCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAG
CGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCA
GCTAGCACTAAGGTCTCCTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAACTACACC
ATACAAGCCACTCCTGAAGACAGAAGCAGTGTGTTGCA

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR4A492TF 738 0 0
G
GAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACGCCAAGTTCCATTCAGATTCTTCGTTCCTCTG
TTTCTCCTATGTGCTCGAAACACTTGTTTCGATCATCATC*AAACTTTTCATCTTCCATC
GTTTCTACTCCTTTTGCCAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATCTCTAGACCTCGCGTTGT
TCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACAT
CGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGGCCAGCCCGTGAAGTTCAG
CAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATG
CGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGGC
TGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCATC
TCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATGT
TCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCTT
CTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAACTACACCATACAAGCCACTCCTGA
AGACAGAAGCAGTGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTT
GTATGGTCGAAAAGACG

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4AW09TF 838 0 0
GG
GAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACGCCAAGTTCCATTCAGATTCTTCGTTCCTCTG
TTTCTCCTATGTGCTCGAAACACTTGTTTCGATCATCATC*AAACTTTTCATCTTCCATC
GTTTCTACTCCTTTTGCCAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATCTCTATACCTCGCGTTGT
TCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACAT
CGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGTCCAGCCCGTGAAGTTCAG
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CGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGGC
TGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCATC
TCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATGT
TCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCTT
CTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAACTACACCATACAAGCCACTCCTGA
AGACAGAAGCAGTGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTT
GTATGGTCGAAAAGACGAAAGTACTGGTGATCACCCATCTCTAGATGATGTTCTCAATGT
CCGCTGCACAACACAAGCCACTGTTGCTTGAACATTGGTTTAAAGTCCCTCTGGTT

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DS 

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GG
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TTTCTCCTATGTGCTCGAAACACTTGTTTCGATCATCATC*AAACTTTTCATCTTCCATC
GTTTCTACTCCTTTTGCCAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATCTCTATACCTCGCGTTGT
TCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACAT
CGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGTCCAGCCCGTGAAGTTCAG
CAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATG
CGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGGC
TGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCATC
TCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATGT
TCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCTT
CTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAACTACACCATACAAGCCACTCCTGA
AGACAGAAGCAGTGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTT
GTATGGTCGAAAAGACGAAGGTACTGGTGATCACCCATCTCTAGATGATGTTCTCAATGT
CCGCTGCACAACACAAGCCACTGTTGCTTGAACA

QA 3 816 3 816
DS 

RD RR4AZ71JQ 866 0 0
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CGTTTCTACTCCTTTTGCCAGATCAAAATCCCAATTCCCCGATCTCTATACCTCGCGTTG
TTCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACA
TCGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGTCCAGCCCGTGAAGTTCA
GCAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGAT
GCGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGG
CTGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCAT
CTCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATG
TTCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCT
TCTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAACTACACCATACAAGCCACTCCTG
AAGACAGAAGCAGTGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCT
TGTATGGTCGAAAAGACGAAGGTACTGGTGATCACCCATCTCTAGATGATGTTCTCAATG
TCCGCTGCACAACACAAGCCACTGTTGCTTGAACATTGGTTTAAAGTCCCTCTGGTTTGG
TTTAATGCTTTCATCACTGTATAATTGTAGCTATTAATATATGTTTTAAATATGATAATA
AATTATAAATAGTATACATTTGAA
AC

QA 1 864 1 864
DS 

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TGCCAGATCAAAATCC*AATTCCCCGATCTCTATACCTCGCGTTGTTCTCGCGAGAGCAG
CTTCCACGGGAGTAGCTAATCCCGTCACTGAGTACAGAGAAGACATCGGTGAGATCCTCG
GGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCAGTCCAGCCCGTGAAGTTCAGCAATCTCTTGGATC
AGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGG
AGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCGAAACCACGGTTTGATGCGGCTGGTGTTAAACTGG
TTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGATAAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTC
CAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCTGAGCGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACT
ACGGATTAGGCCGCACTTTCTTCAACCCAGCTAGCACTAAGGTCTTCTCAAGATTTGACG
AGATACGAGAAGCTACGAAGAACTACACCATACAAGCCACTCCTGAAGACAGAAGCAGTG
TGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTTGTATGGTCGAAAAG
ACGAAGGTACTGGTGATCACCCATCTCTAGATGATGTTCTCAATGTCCGCTGCACAACAC
AAGCCACTGTTGCTTGAACATTGGTTTAAAGTCCCTCTGGTTTGGTTTAATGCTTTCATC
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ACATTTGAA
AC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4EX18JQ 768 0 0
ACTGAGTACAGAGAAGACATCGGTGAGATCCTCGGGGATGTCTCCATGTTTACTGCTTCA
GGCCAGCCCGTGAAGTTCA***ATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGTTGTG
CTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGAGGCG
AAACCACGGTTTGATGCGGCTGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCCTGAT
AAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGATCCT
GAGCGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTTTTCAAC
CCAGCTAGCACTAAGGTCTTCTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAGCTAC
ACCATACAAGCCACTCCTGAAGACAGAAGCAGTGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTTTGTT
TTCAGAGGCAAGAAGCTCTTGTATGGTCGAAAAGACGAAGGTACTGGTGATCACCCATCT
CTAGATGATGTTCTCAATGTTTGCTGCACAACACAAGCCACTGTTGCTTGAACATTGGTT
TAAAGTCCCTCTGGTTTGGTTTAATGCTTTCATCACTGTATAATTGTAGCTATTAATATA
TGTTTTAAAGATGATAATAAATTATAAATAGTATACATTTGAACCACACAAGTTTATACT
GTAAAGATAAGACAATTGTTTGGTATGTAATTTTGGTCATTTGTTTCG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 7

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AGAACTTACAATGAGTTTAATAACATAAATTTGAAATTAGAAAAATAAAAACCACTTCAC
AGAGTAT**CATTCAGTACAAATTATTCAGACATTTAAACAAGAAAAAGAACTTTGGTAG
TTGAAAAAAAAA*CAGAGAACCCTTTACTCTTAGCATATTGGAATGGGAGCTCCGTTCCA
CTCATTGAGACACTCCATCAACGGATCAATGATCTTCCCTTCACAAATCGCCGTGAAAAC
CTTGTCGAACTCTTCTCCTGGCGACGTGACTTTCTCTCCGGTCAAAAGCTCTGTTCCAAG
CTCTTCCCTCACGAACCTATACAAAGGATACGACCTACACTCCTTGATCCTGTTCGGGAT
AGCAGATGTTCCGTTCTCGTAAGCCACCC*AAGCTGCCTCCACTTCATTAGGAAGCACCA
CCTTGAGCTCCTCCTCGAAAGCTCCAATCTTATGAAAGATCGAAGTCATAACGTTCTTCT
CACTCTCACCGTTGACCAAAGCATGGTCAACGATAACTTGCCTTAGCTTCTGGATCAACG
GGTACGTAGCGCTGCATGGATCGTCCGCGTACGTGAAGACTTGCTCACGGTCCACGACTT
TGAGTAGATCTTTCTCGCAGAAGCGAGACGGGTGAAGCTCACCGTTGACTCCAGTCGTTA
GAACTTTCTTGGCCACTTGAGAGACAGTGTTCTTCACAGTTTGTTTTAGATTCTCCTCCA
AGTGTCTTAGATCCACAGCTTGGCAGATTCCGACAAGGAACGTTGTCGACATGAGTTTGA
GAATGTCGATAGCTTCTGCCGTCTTGCGAGATGAGATGAGTCCTAGAGAGTTCACGTCTT
GGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4BC42TF C 8
AF RR4B469JQ U 200
AF RR4F728TF C 1
AF RR4EN10JQ U 99
AF RR4F728JQ U 10
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AF RR4AN20TF C 35
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BS 679 846 RR4AN20JQ
BS 847 905 RR4AN20TF

RD RR4BC42TF 176 0 0
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TTCAGTACAAATTATTCAGACATTTAAACAAGAAAAAGAACTTTGGTAGTTG

QA 5 176 5 176
DS 

RD RR4B469JQ 426 0 0
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GGCGACGTGACTTTCTCTCCGGTCAAAAGCTCTGTTCCAAGCTCTTCCCTCACGAACCTA
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TAAGCCACCC*AAGCTGCCTCCACTTCATTAGGAAGCACCACCTTGAGCTCCTCCTCGAA
AGCTCCAATCTTATGAAAGATCGAAGTCATAACGTTCTTCTCACTCTCACCGTTGACCAA
AGCATGGTCAACGATAACTTGCCTTAGCTTCTGGATCAACGGGTACGTAGCGCTGCATGG
ATCGTC

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4F728TF 684 0 0
TTTTTTTTTATCGAAAGGATGTATCATTCCACACTTTGTAACAAGAAAACTGTTCACTTG
AGAACTTACAATGAGTTTAATAACATAAATTTGAAATTAGAAAAATAAAAACCACTTCAC
AGAGTAT**CATTCAGTACAAATTATTCAGACATTTAAACAAGAAAAAGAACTTTGGTAG
TTGAAAAAAAAAACAGAGAACCCTTTACTCTTAGCATATTGGAATGGGAGCTCCGTTCCA
CTCATTGAGACACTCCATCAACGGATCAATAATCTTCCCTTCACAAATCGCCGTGAAAAC
CCTGTCGAACTCTTCTCCTGGCGACGTGACTTTCTCTCCGGTCAAAAGCTCTGTTCCAAG
CTCTTCCCTCACGAACCTATACAAAGGATACGACCTACACTCCTTGATCCTGTTCGGGAT
AGCAGATGTTCCGTTCTCGTAAGCCACCC*AAGCTGCCTCCACTTCATTAGGAAGCACCA
CCTTGAGCTCCTCCTCGAAAGCTCCAATCTTATGAAAGATCGAAGTCATAACGTTCTTCT
CACTCTCACCGTTGACCAAAGCATGGTCAACGATAACTTGCCTTAGCTTCTGGATCAACG
GGTACGTAGCGCTGCATGGATCGTCCGCGTACGTGAAGACTTGCTCACGGTCCACGACTT
TGAGTAGATCTTTCTCGCAGAAGC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EN10JQ 578 0 0
G
GAAAAATAAAAACCACTTCACAGAGTATATCATTCAGTACAAATTATTCAGACATTTAAA
CAAGAAAAAGAACTTTGGTAGTTGAAAAAAAA**CAGAAAACCCTTTACTCTTAGCATAT
TGGAATGGGAGCTCCGCTCCACTCATTGAGACACTCCATCAACGGATCAATGATCTTCCC
TTCACAAGTCGCCGTGAAAACCTTGTCGAACTCTTCTCCCGGCGACGTGACTTTCTCTCC
GGTCAAAAGCTCAGTTCCAAGCTCTTCCCTCACAAACCTATACAAAGGATACGACCTACA
CTCCTTGATCCTGTTCGGGATAGCAGATGTCCCGTTCTCGTAAGCCACCC*AAGCTGCCT
CCACTTCATTAGGAAGCACCACCTTGAGCTCCTCCTCGAAAGCTCCAATCTTATGAAAGA
TCGAAGTCATAACGTTCTTCTCACTCTCGCTGTTGACCAAAGCATGGTCAAC*ATAACTT
GCCTTAACTTCTGGATCAACGGGTACGTAGCGCTGCATGGATCGTCCGCGTACGTGAAGA
CTTGCTCACGGTCCACGACTTTGAGTAGATCTTTCTC

QA 2 578 2 578
DS 

RD RR4F728JQ 669 0 0
AT
CGAAAGGATGTATCATTCCACACTTTGTAACAAGAAAACTGTTCACTTGAGAACTTACAA
TGAGTTTAATAACATAAATTTGAAATTAGAAAAATAAAAACCACTTCACAGAGTAT**CA
TTCAGTACAAATTATTCAGACATTTAAACAAGAAAAAGAACTTTGGTAGTTGAAAAAAAA
AACAGAGAACCCTTTACTCTTAGCATATTGGAATGGGAGCTCCGTTCCACTCATTGAGAC
ACTCCATCAACGGATCAATAATCTTCCCTTCACAAATCGCCGTGAAAACCCTGTCGAACT
CTTCTCCTGGCGACGTGACTTTCTCTCCGGTCAAAAGCTCTGTTCCAAGCTCTTCCCTCA
CGAACCTATACAAAGGATACGACCTACACTCCTTGATCCTGTTCGGGATAGCAGATGTTC
CGTTCTCGTAAGCCACCC*AAGCTGCCTCCACTTCATTAGGAAGCACCACCTTGAGCTCC
TCCTCGAAAGCTCCAATCTTATGAAAGATCGAAGTCATAACGTTCTTCTCACTCTCACCG
TTGACCAAAGCATGGTCAACGATAACTTGCCTTAGCTTCTGGATCAACGGGTACGTAGCG
CTGCATGGATCGTCCGCGTACGTGAAGACTTGCTCACGGTCCACGACTTTGAGTAGATCT
TTCTCGC

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR4AN20JQ 837 0 0
GG
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TGAGTTTAATAACATAAATTTGAAATTAGAAAAATAAAAACCACTTCA*AGAGTAT**CA
TTCAGTACAAATTATTCAGACATTTAAACAAGAAAAAGAACTTTGGTAGTTGAAAAAAAA
A*CAGAGAACCCTTTACTCTTAGCATATTGGAATGGGAGCTCCGTTCCACTCATTGAGAC
ACTCCATCAACGGATCAATGATCTCCCCTTCACAAATCGCCGTGAAAACCTTGTCGAACT
CTTCTCCTGGCGACGTGACTTTCTCTCCGGTCAAAAGCTCTGTTCCAAGCTCTTCCCTCA
CGAACCTATACAAAGGATACGCCCTACACTCCTTGATCCTGTTCGGGATAGCAGATGTTC
CGTTCTCGTAAGCCACCC*AAGCTGCCTCCACTTCATTAGGAAGCACCACCTTGAGCTCC
TCCTCGAAAGCTCCAATCTTATGAAAGATCGAAGTCATAACGTTCTTCTCACTCTCACCG
TTGACCAAAGCATGGTCAACGATAACTTGCCTTAGCTTCTGGATCAACGGGTACGTAGCG
CTGCATGGATCGTCCGCGTACGTGAAGACTTGCTCACGGTCCACGACTTTGAGTAGATCT
TTCTCGCAGAAGCGAGACGGGTGAAGCTCACCGTTGACTCCAGTCGTTAGAACTTTCTTG
GCCACTTGAGAGACAGTGTTCTTCACAGTTTGTTTTAGATTCTCCTCCAAGTGTCTTAGA
TCCACAGCTTGGCAGATTCCGACAAGGAACGTTGTCGACATGAGTTTGAGAATGT

QA 3 837 3 837
DS 

RD RR4AN20TF 871 0 0
TTTGTAACAAGAAAACTGTTCACTTGAGAACTTACAATGAGTTTAATAACATAAATT*GA
AATTAGAAAAATAAAAACCACTTCA*AGAGTAT**CATTCAGTACAAATTATTCAGACAT
TTAAACAAGAAAAAGAACTTTGGTAGTTGAAAAAAAAA*CAGAGAACCCTTTACTCTTAG
CATATTGGAATGGGAGCTCCGTTCCACTCATTGAGACACTCCATCAACGGATCAATGATC
TCCCCTTCACAAATCGCCGTGAAAACCTTGTCGAACTCTTCTCCTGGCGACGTGACTTTC
TCTCCGGTCAAAAGCTCTGTTCCAAGCTCTTCCCTCACGAACCTATACAAAGGATACGCC
CTACACTCCTTGATCCTGTTCGGGATAGCAGATGTTCCGTTCTCGTAAGCCACCCCAAGC
TGCCTCCACTTCATTAGGAAGCACCACCTTGAGCTCCTCCTCGAAAGCTCCAATCTTATG
AAAGATCGAAGTCATAACGTTCTTCTCACTCTCACCGTTGACCAAAGCATGGTCAACGAT
AACTTGCCTTAGCTTCTGGATCAACGGGTACGTAGCGCTGCATGGATCGTCCGCGTACGT
GAAGACTTGCTCACGGTCCACGACTTTGAGTAGATCTTTCTCGCAGAAGCGAGACGGGTG
AAGCTCACCGTTGACTCCAGTCGTTAGAACTTTCTTGGCCACTTGAGAGACAGTGTTCTT
CACAGTTTGTTTTAGATTCTCCTCCAAGTGTCTTAGATCCACAGCTTGGCAGATTCCGAC
AAGGAACGTTGTCGACATGAGTTTGAGAATGTCGATAGCTTCTGCCGTCTTGCGAGATGA
GATGAGTCCTAGAGAGTTCACGTCTTGGTTC

QA 1 871 1 871
DS 



AS 2 11

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GGTATCAAATTTCAAAGGCTTTTGATATTATCTAGAATCTTTAGAGGAAGACTACTTCAG
AAATATAGAAAGAGCCGATTCAGACGAGTGTATCTCACAAAATGTACTTATTATTCCTCG
AAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCG
GTAACTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTT
GAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACT
TCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCTCGTCTCTGTCTCAAGAATCTCGTCATCTTTT
CCCACAA*TTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCTGATGAT
GGTGTATGGAATACCGGAGTCAGCCAA*GTACTGCTCAGCTTTCCT*CTTCCAAA*CCAG
AATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACC
C*GACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGG*CATCTATCTGATTCTTCTG
ACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTC
TCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAA
AGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAATGTCTCCAACGAA
CACTTCCTCCTCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCTCTTTCGTCCTCACCAAACCTCTCGC
CACGAACTGATCCGACCTCTCCTTCAACTTCTTGTACACGATTTGCCCTGTTCTTCCACC
GGCACCGGTGACCAGAACGGTGAGAGGCTTAGTTGCTGAGGCGGCGGAGACAGTTAAGGA
TACTCTTCTGAGATCTCCGGTTAACTTCCTCCGAGCATAAACCGACGTTGAATCCGAGAC
AAGCGAGCGGAATTGGAGAGACGACGAAGAAGACGGAACTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV74JQ U 1
AF RR4EN08JQ U 54
AF RR4CN82TF C 136
AF RR4FX10JQ U 58
AF RR4CN82JQ U 7
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AF RR4AV74TF C 394
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BS 48 549 RR4AV74JQ
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BS 551 654 RR4AV74JQ
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BS 656 739 RR4AV74JQ
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BS 878 1064 RR4AV74TF

RD RR4AV74JQ 739 0 0
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TCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAA
AGCATCAATCCCTTGAACA

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DS 

RD RR4EN08JQ 685 0 0
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ATCTTTTCCCACAA*TTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCC
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AA*CCAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCC
ATCGACCC*GACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGG*CATCTATCTGAT
TCTTCTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAG
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DS 

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AGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGATCAAGT
GCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACTTCTGCAACATCAGCC
CTTGCTATTGTTCTCGTCTCTGTCTCAAGAATCTCGTCATCTTTTCCCACAAATTAGTTC
CCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCTGATGATGGTGTATGGAATACC
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AATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCC*GACCAAAACAATC
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AAAACCAGGTTTCATCTTCGGGACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTCG
AACAG

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DS 

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TCGAAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGA
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TTTGAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAG
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TTTCCCACAA*TTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCTGAT
GATGGTGTATGGAATACCGGAGTCAGCCAA*GTACTGCTCAGCTTTCCT*CTTCCAAA*C
CAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCG
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CTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCT
CTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGAC
CAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCT

QA 1 697 1 697
DS 

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AAAA
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TCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAAAACCGAGCGGTAACTTGAG
CGAAAAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGAT
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CAGCCCTTGCTATTGTTCTCGTCTCTGTCTCAAGAATCTCGTCATCTTTTCCCACAA*TT
AGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAAACCACCCGCCCTGATGATGGTGTATGGA
ATACCGGAGTCAGCCAA*GTACTGCTCAGCTTTCCT*CTTCCAAA*CCAAAATGTTGGCA
TTGCCAATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCC*GACCAAAA
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TCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTA
GGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGGACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATC
CCTCGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAATGTCTCCAACGAACACTTCCTCC
TCTCCACCGATCTTCTC
TTGCTCTCC

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DS 

RD RR4AB77JQ 833 0 0
GAGG
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TCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGC
CTGAACGCAGACTTCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTATTCTCGTCTCTGTCTCAAGAAT
CTCGTCATCTTTTCCCACAA*TTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGGCCAC
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CTTCCAAA*CCAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTT
CCTCCCATCGACCC*GACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGG*CATCTA
TCTGATTCTTCTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGA
ACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGGACAGCGCTCG
TAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAA
TGTCTCCAACGAACACTTCCTCCTCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCTCTTTCGTCCTCA
CCAAACCTCTCGCCACGAACTGATCCGACCTCTCCTTCAACTTCTTGTA

QA 5 833 5 833
DS 

RD RR4AB77TF 430 0 0
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CAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCG
ACCCCGACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGG*CATCTATCTGATTCTT
CTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCT
CTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGGACAGCGCTCGTAAGAATGAC
CAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAATGTCTCCAAC
GAACACTTCCTCCTCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCTCTTTCGTCCTCACCAAACCTCT
CGCCACGAAC

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4H935TF 741 0 0
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GTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGATCAAGTG
CTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACTTCTGCAACATCAGCCC
TTGCTACTGTTCTCGTCTCTGTCTCAAGAATCTCGTCATCTTTTCCCACAA*TTAGTTCC
CGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCTGATGATGGTGTATGGAATACCG
GAGTCAGCCAA*GTACTGCTCAGCTTTCCT*CTTCCAAA*CCAGAATGTTGGCATTGCCA
ATGCTATTCAAGGGG*TTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCC*TACCAAAACAATCT
GCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGG*CATCTATCTGATTCTTCTGACCAATCCAATCAACC
TGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTAGGATCA
AAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTTGA
ACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAATGTCTCCGACGAACACTTCCTCCTCTCCA
CCGATCTTCTCCTTGCTCTCTTTCGTCCTCACCAAACCTCTCGCCACGAACTGATCCGAC
CTCTCCTTCAACTTCTTGTAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4AV74TF 671 0 0
TGT
CTGCAGACCACCCGCCCTGATGATGGTGTATGGAATACCGGAGTCAGCCAA*GTACTGCT
CAGCTTTCCT*CTTCCAAAACCAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGGTTGT
TTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCC*GACCAAA*CAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTA
GCGGACATCTATCTGATTCTTCTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTC
TTCAAAGTAGAACTCAGGTCTCTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGG
TACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTC
AAGGTCTCGAATATCTCCGACGAACACTTCCTCCTCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCTC
TTTCGTCCTCACCAAACCTCTCGCCAAGAACTGATCCGACCTCTCCTTCAACTTCTTGTA
CACGATTTGCCCTGTTCTTCCACCGGCACCGGTGACCAGAACGGTGAGAGGCTTAGTTGC
TGAGGCGGCGGAGACAGTTAAGGATACTCTTCTGAGATCTCCGGTTAACTTCCTCCGAGC
ATAAACCGACGTTGAATCCGAGACAAGCGAGCGGAATTGGAGAGACGACGAAGAAGACGG
AACTGAGC

QA 4 671 4 671
DS 



CO CL305Contig2 751 2 12 U
GGGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCT
TCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAAACAGGAGCTGTGTCCTCTTCGTTAGTCT
CAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGG
TTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGCCG
CCGCAGCAACTAAACCTCTCACCGTTCTCGTCACCGGTGCCGGTGGAAGAACAGGGCAAA
TCGTGTACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCAGTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGA
CGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTCGGAGACATTCGAG
ACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACAAGCG
CTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGACCTGAGTTCTACT
TTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATG
CCGCTAAGGCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTTGGTAGGGTCGATGGGAGGAACAAACA
TAAACAACCCCTTGAATAGCATTGGCATGCCACATTCTGGTTTGGAGAGAAGCTGAGCAG
TACTTGGCTGACTCCGTATCCATACACATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EN08TF U 1
AF RR4FX10TF U 7
BS 1 242 RR4EN08TF
BS 243 243 RR4FX10TF
BS 244 253 RR4EN08TF
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BS 413 413 RR4FX10TF
BS 414 616 RR4EN08TF
BS 617 751 RR4FX10TF

RD RR4EN08TF 616 0 0
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TCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAAACAGGAGCTGTGTCCTCTTCGTTAGTCT
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TTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGCCG
CCTCAGCAACTAAGCCTCTCACCGTTCTGGTCACCGGTGCCGGTGGAAGAACAGGGCAAA
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CGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTCGGAGATATTCGAG
ACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACAAGCG
CTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGACCTGAGTTCTACT
TTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATG
CCGCTAAGGCAGCTGG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4FX10TF 745 0 0
GG
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CTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAAACAGGAGCTGTGTCCTCTTCGTTAGTCTCAGTTCCG
TCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTATGCT
CGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGCCGCCGCAGCA
ACTGAACCTCTCACCGTTCTCGTCACCGGTGCCGGTGGACGAACAGGGCAAATCGTGTAC
AAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCAGTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAAGAG
AGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTCGGAGACATTCGAGACCTTGAA
GCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCG
AAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAAGAA
GGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCTAAG
*CAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTTGGTAGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAACAAC
CCCTTGAATAGCATTGGCATGCCACATTCTGGTTTGGAGAGAAGCTGAGCAGTACTTGGC
TGACTCCGTATCCATACACATCA

QA 3 745 3 745
DS 



AS 2 11

CO CL306Contig1 1126 3 17 U
GGAAACAAACAATGGCGACTCTGAAACTCACTCTGTCTTCACCTTCTCCCTCTTTAATTC
AGTCAAAGTTATCTGCGGCGTCTTTCATCCCAAATGCAGCGCGTGCGTTTAATGCGACAG
CAAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGTAAATGCTTGAGATCAAGCCCGATGACAATAC
ACAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCAGCTGCTACTC
TTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTC
ACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCG
ATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCATATTTTA
ATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAG
CTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAGCTGCTTCC
TCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTTAAGGTTGC
TGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACC
AGAACGAGCAGAGAACATCAAGATATTCGCTGGAGATGTAGTTCCTAAAAAGAAACTTGA
CCCGGCCATCTACAACTTAGCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGT
GGTTGAAGATAGCGCTATTGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGT
AACAAAGAGTGGATACACAGCGGATGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTG
CATTGGAGACCCTCCAGAAGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAA
ACAATTCGTTAGCTAAACTACAAAACTCTCAAACATTCGTTTGTGTGTATAGTGAAAAAA
TACTCATTCACTTCAACCTCGTATTACACATTATATCTCTGACATTTCCATCAGCAGATG
CATTGCTGGATTGAGATTTTCTCATGCAATGTCACAGTTTCAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DD62TF U 1
AF RR4CQ92TF U 73
AF RR4CQ92JQ C 440
BS 1 93 RR4DD62TF
BS 94 94 RR4CQ92TF
BS 95 98 RR4DD62TF
BS 99 99 RR4CQ92TF
BS 100 169 RR4DD62TF
BS 170 170 RR4CQ92TF
BS 171 207 RR4DD62TF
BS 208 208 RR4CQ92TF
BS 209 230 RR4DD62TF
BS 231 231 RR4CQ92TF
BS 232 385 RR4DD62TF
BS 386 386 RR4CQ92TF
BS 387 475 RR4DD62TF
BS 476 595 RR4CQ92TF
BS 596 596 RR4CQ92JQ
BS 597 617 RR4CQ92TF
BS 618 1126 RR4CQ92JQ

RD RR4DD62TF 475 0 0
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AGTCAAAGTTATCTGCGGCGTCTTTCATCCCAAGTGCATCGCGTGCGTTTAATGCGACAG
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ACAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCATTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCATCTGCTACTC
TTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTC
ACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCG
ATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATCGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCATATTTTA
ATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4CQ92TF 550 0 0
CTT
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CGCGGTTCATTGGTAAATGCTTGAGATCAAGCCCGTTGACAATACACAGAGGATCTCGCT
CCGTAGAAATCGCTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCAGCTGCTACTCTTCCCTCAGCTCTTC
TCTTCGATTGCGTTGGCGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCACGGGATCTCCTTCA
ACGACACTTTCAAAGAGAGAGGTTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAAC
TACTGAAAATAGGTGGCGTGAAAGAAAGAATGACAGCATATTTTAATAAGGTGGGTTGGC
CTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGC
AGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGT
TGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTTAAG*TTGCTGTGTGCAGCACTTC
AA
TGAGA

QA 4 545 4 545
DS 

RD RR4CQ92JQ 687 0 0
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GACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGTTGCC
AAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTTAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAAT
GAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCAGAACGAGCAGAGAACATC
AAGATATTCGCTGGAGATGTAGTTCCTAAAAAGAAACTTGACCCGGCCATCTACAACTTA
GCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGCTATT
GGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTAACAAAGAGTGGATACACA
GCGGATGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAA
GAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAACAATTCGTTAGCTAAACT
ACAAAACTCTCAAACATTCGTTTGTGTGTATAGTGAAAAAATACTCATTCACTTCAACCT
CGTATTACACATTATATCTCTGACATTTCCATCAGCAGATGCATTGCTGGATTGAGATTT
TCTCATGCAATGTCACAGTTTCAACTT

QA 1 687 1 687
DS 



CO CL306Contig2 1124 8 7 U
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TCAGTCAAAGTTATCTGCGGCGTCTTTCATCCCCAGTGCATCGCGTGCGTTTAATGCGAC
AGCAAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGTAAATGCTTGAGATCAAGCCCGACGACAAT
ACACAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCTGCTACTCT
TCCCCAGACTGCTCTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATAC
GGAGAAGGACGGCCACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAAAGATTTGGGTGT
TACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGGTGGCGGGAAAGAAAGAAT
GACAGCGTATTTTAATAAAGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAG
GAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGA
GAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGACCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAA
TGGAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTC
ATGCTTGCTTGGACCAGAACGAGCAGAGAATATCAAGATATTCGCTGGAGATGTAGTTCC
TAAAAAGAAACCTGACCCGGCCATTTACAACTTAGCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCC
CTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGCTATTGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGG
TATGACTTGCATAGTTACAAAGAGTGGATACACAGCGGACGAAGATTTTGTGAACGCAGA
CGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAAGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGG
AAGCCTCCTCCAGAAACAGTTCGTTAGCTAAAGTGCTAAAATACAAACTCTCTCAAACAT
TGGTTGTGTATAGTGAAAAAAAATAATTCACTGTAAACTACAAACTCTCTCAAACATTGG
TTGAGATTTTCTCTCAAGCAATGTCACAGTTTCAACTTCTCAGG


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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AF RR4FN15TF U 1
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AF RR4AA56TF U 3
AF RR4EJ69JQ C 358
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QA 1 638 1 638
DS 

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AG
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QA 3 636 3 636
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RD RR4CP02TF 674 0 0
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CCCAGACTGCTCTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGG
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CCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGA
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AAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGA
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GCTTGCTTGGACCA

QA 1 674 1 674
DS 

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CCCAGACTGCTCTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGG
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GAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCAT
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CGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGACCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTGAC
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AGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAAGAGAGATTTGATCTATCATTCTG
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TGGTTGAGATTTTCTCTCAAGCAATGTCACAGTTTCAACTTCTCAGG

QA 1 767 1 767
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RD RR4FN15JQ 302 0 0
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AGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAAGAGAGATT
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AACTCTCTCAAACATTGGTTGAGATTTTCTCTCAAGCAATGTCACAGTTTCAACTTC
TCAGG

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DS 

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ATTTACAACTTAGCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAA
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GACCCTCCAGAAGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTCCTCCAGAAACAGTTC
GTTAACTAAAGTGCTAAAATACAAACTCTCTCAAACATTGGTTGTGTATAGTGAAAAAAA
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GTCACAGTTTCAACTTC
CC

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DS 

RD RR4AA56JQ 719 0 0
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GACCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTTGCTGTGT
GCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCAGAAC
GAGCAGAGAATATCAAGATATTCGCTGGAGATGTAGTTCCTAAAAAGAAACCTGACCCGG
CCATCTACAACTTAGCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTG
AAGATAGCGCTATTGGACTAG*AGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGCATAGTTACAA
AGAGTGGATACACAGCGGACGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTG
GAGACCCTCCAGAAGAGAGATT*GATCTATCATTCTGTGGAAGCCTCCCCCAGAAACAGT
TCGTTAGCTAAAGTGCTAAAATACAAACTCTCTCAAACATTGGTTGTGTATAGTGAAAAA
AAATAATTCACTGTAAACTACAAACTCTCTCAAACATTGGTTGAGATTTTCTCTCAAGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 11

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GACGAATCTCTAAGAACACTGGTATTGGGTCCATCCTCATCGGTCAAGATCCCTACTCCT
TGGGATAATAAGGTCAAGGCAACAGGACGACGGTACTTAGTGTCCGATAATAGCTGTGAC
GGTCTGGTTTGTCTCTACCATCCCTTGGAATCCGGTTACGTTGTCAACCCCGCCACAAGA
TGGTATCGTCCTCTTCCTCTCTCCCGGCTTCAACAACTCATTATCAGCCAAGGACAGAGT
TACGTTAATACTAAGCACGGCCTCTTTAAGCTTGGATTCGGTAAAGACATAATAATAGGT
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TGCGAAGTTTTCGACTTCGTCTCCAATGCTTGGAGGTATGTCACCCCCTCTGCTCCTTAT
CGGGTTGTTGGGGTCGCCGATCCCGTGTTTGTAGATGGTTCGCTTCATTGGCTCACAGAT
TGCGAGGAAACCAAACTTGTATCTTTTGATCTCCACACCGAGGCCTTTCAAGTCATCTCT
TCTAAACCTCCCTTTCCCGCCAATTCACATGATGATAATCCTTACGCGATGGTCTTGTGC
AACCTCGACAACCGTTTGTGCGTGTCGCACATGAAGTCGCCCGACCAAGTGATATGGCCC
TTGAATTCAGGCAACAAGACATGGGAAAAAATTTACTCCATCGATCTGGTTATGACTTCT
ATTTTATATGACTGCCCAACAGTGTGCGCCTTCCGTCCACTACTATTTTTGGATGCAAAG
ACCAAGGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATTGCTCTTTTATGACAGTGTGAAAAGTGGA
TATCTGTTGATACATGACCCCGAAACCCTTCTAGACGATTTTACTTTCAGGGCTGATGTT
TCCATGGGATTTCTTGTTTGTTATTTCCAGACTTTAATCTCTATTTGATTTCTTTCTTTT
TTTTTTATTAATGTAACCGTTTCTTTTCTTCCCTTTTGAATTTGATATCTTGACCAAAAA
TTAACTAACTTTGGGTTTTGTCTCTCCAGGCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C051TF U 233
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AF RR4CF60TF U 233
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TAATAGG*ACTTACAAGCTTGTT
G

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TGGGATAATAAGGTCAAGGCAACAGGACGACGGTACTTAGTGTCCGATAATAGCTGTGAC
GGTCTGGTTTGTCTCTACCATCCCTTGGAATCCGGTTACGTTGTCAACCCCGCCACAAGA
TGGTATCGTCCTCTTCCTCTCTCCCGACTTCAACAACTCATTATCAGCCAAGGACAGAGT
TACGTTAATACTAAGCACGGCCTCTTTAAGCTTGGATTCGGTAAAGACATAATAATAGGT
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CGGGTTGTTGGGGTCACCGATCCCGTGTTTG

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GACAGAGTTACGTTAATACTAAGCACGGCCTCTTTAAGCTTGGATTCGGTAAAGACATAA
TAATAGGTACTTACAAGCTTGTTTGGCTGTACAACTCTTCAGAAATAGACCTTGACAACG
CTACCACATGCGAAGTTTTCGACTTCGTCTCCAATGCTTGGAGGTATGTCACCCCCTCTG
CTCCTTATCGGGTTGTTGGGGTCGCCAATCCCGTGTTTGTAG

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G
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CTTTAAGCTTGGATTCGGTAAAGACATAATAATAGGTACTTACAAGCTTGTTTGGCTGTA
CAACTCTTCAGAAATAGACCTTGACAACGCTACCACATGCGAAGTTTTCGACTTCGTCTC
CAATGCTTGGAGGTATGTCACTCCCTCTGCTCCTTATCGGGTTGTTGGGGTCGCCGATCC
CGTGTTTGTAGATGGTTCGCTTCATTGGCTCACAGATTGCGAGGAAACCAAACTTGTATC
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TTCACATGATGATAATCCTTACGCGATGGTCTTGTGCAACCTCGACAACCGTTTGTGTGT
GTCGCACATGAAGTCGCCCGACCAAGTGATATGGTCCTTGAAT

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CCACAAGATGGTATCGTCCTCTTCCTCTCTCCCGGCTTCAACAACTCATTATCAGCCAAG
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CTACCACATGCGAAGTTTTCGACTTCGTCTCCAATGCTTGGAGGTATGTCACCCCCTCTG
CTCCTTATCGGGTTGTTGGGGTCGCCGATCCCGTGTTTGTAGATGGTTCGCTTCATTGGC
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TCTTGTGCAACCTCGACAACCGTTTGTGCGTGTCGCACATGAAGTCGCCCGACCAAGTGA
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CCACAAGATGGTATCGTCCTCTTCCTCTCTCCCGGCTTCAACAACTCATTATCAGCCAAG
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TAATAGGTACTTACAAGCTTGTTTGGCTGTACAACTCTTCAGAAATAGACCTTGACAACG
CTACCACATGCGAAGTTTTCGACTTCGTCTCCAATGCTTGGAGGTATGTCACCCCCTCTG
CTCCTTATCGGGTTGTTGGGGTCGCCGATCCCGTGTTTGTAGATGGTTCGCTTCATTGGC
TCACAGATTGCGAGGAAACCAAACTTGTATCTTTTGATCTCCACACCGAGGCCTTTCAAG
TCATCTCTTCTAAACCTCCCTTTCCCGCCAATTCACATGATGATAATCCTTACGCGATGG
TCTTGTGCAACCTCGACAACCGTTTGTGCGTGTCGCACATGAAGTCGCCCGACCAAGTGA
TATGGCCCTTGAATTCAGGCAACAAGACATGGGAAAAAATTTACTCCATCGATCTGGTTA
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ATGCAAAGA
C

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CCCGCCAATTCACATGATGATAATCCTTACGCGATGGTCTTGTGCAACCTCGACAACCGT
TTGTGCGTGTCGCACATGAAGTCGCCCGACCAAGTGATATGGTCCTTGAATTCAGGCAAC
AAGACATGGGAAAAAATTTACTCCATCGATCTGGTTATGACTTGTATTTTATATGACTGC
CCAACAGTGTGCGCCTTCCGTCCACTACTATTTTTGGATGCAAAGACCAAGGATAAGAAG
AAGAAGAAGAAGAAATTGCTCTTTTATGACAGTGTGAAAAGTGGATATCTGTTGATACAT
GACCCCGAAACCCTTCTAGACGATTTTACTTTCAGGGCTGATGTTTCCATGGGATTTCTT
GTTTGTTATTTCCAGACTTTAATCTCTATTTGATTTCTTTCTTTTTTTTT*ATTAATGTA
ACCGTTTCTTTT

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CTTTTGAATTTGATATCTTGACCAAAA

QA 1 147 1 147
DS 

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TCGCCGATCCCGTGTTTGTAGATGGTTCGCTTCATTGGCTCACAGATTGCGAGGAAACCA
AACTTGTATCTTTTGATCTCCACACCGAGGCCTTTCAAGTCATTTTTTTTAAACCTCCCT
TTCCCGCCAATTCACATGATGATAATCCTTACGCGATGGTCTTGTGCAACCTCGACAACC
GTTTGTGCGTGTCGCACATGAAGTCGCCCGACCAAGTGATATGGCCCTTGAATTCAGGCA
ACAAGACATGGGAAAAAATTTACTCCATCGATCTGGTTATGACTTCTATTTTATATGACT
GCCCAACAGTGTGCGCCTTCCGTCCACTACTATTTTTGGATGCAAAGACGAAGGATAAGA
AGAAGAAGAAGA***ATTTGCTCTTTTATGACAGTGTGAAAAGTGGATATCTGTTGATAC
ATGACCCCGAAACCCTTTTAGACGATTTTACTTTCAGGGCTGATGTTTCCATGGGATTTC
TTGTTTGTTATTTCCAGACTTTAATCTCTATTTGATTTCTTTCTTTTTTTTTTATTAATG
TAACCGTTTCTTTTCTTCCCTTTTGAATTTGATATCTTGACCAAAAATTAACTAACTTTG
GGTTTTGTCTCTCCAGGCTGAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4C075JQ 186 0 0
TCT
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TTTAATCTCTATTTGATTTCTTTCTTTTTTTTTTATTAATGTAACCGTTTCTTTTCTTCC
CTTTTGAATTTGATATCTTGACCAAAAATTAACTAACTTTGGGTTTTGTCTCTCCAGGCT
GAT

QA 4 186 4 186
DS 

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AGACGATTTTACTTTCAGGGCTGATGTTTCCATGGGATTTCTTGTTTGTTATTTCCAGAC
TTTAATCTCTATTTGATTTCTTTCTTTTTTTTTTATTAATGTAACCGTTTCTTTTCTTCC
CTTTTGAATTTGATATCTTGACCAAAAATTAACTAACTTTGGGTTTTGTCTCTCCAGGCT
GAT

QA 1 183 1 183
DS 



AS 1 11

CO CL308Contig1 903 11 5 U
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CGTTTAAATCCTTGTCTCCGGCCGGCGGGTTGGCTTCTTTTGCCACCGCCGG*TCCGGCC
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ATAATATTTAGAGAGCTTTTCTAGATCTAGAATTTCAGATCTGGTTGATCAGTTGAGGTT
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GGGTTCTGATGGCGGGTCTCTGGAGTTTCAGCTCCTTCCTGCCTGTGGGCCTCGATCTCA
GTTCTGCAGGTGCTTTTCTCAGGTTGTCTCTGGCTTTGATCCCGTTGAGGTTTGGTGGTT
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ATTGTGCCGTGGG*TGGTTGAAGCTTT*ATTGG*TGTGTCTCTTCTCCCCCCC*GGGATA
GATTCTCAGCTGCCTGTCTCATGGCTT*CTGG*TTTGTTTCCGAAGCAATTAGAGTGAGT
TGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTCTCTAATCATTCCTC
CTTCTTCTCCGGTTCATTTGTTAGGATGTTTATGGGTTGATCTTGTCTTGGTTCTCTATC
TTGTTCAAGTTAACTGTGTTATATAATGTTTTTTGGGTTCAGAGGATCGGTTGATTCTGC
TGACTTATGTTTCTTTTTTTTTAACACTGAATATTATTAAGCCATAAGGCAGGGTTCAAA
ATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4A889TF U 1
AF RR4G094TF U 1
AF RR4C829TF U 11
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AF RR4A889JQ C 75
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GTGGCTCGAGTTGGTTTCTCC*GGCTTGATTTCAAGGAAGAGGGGTTTCGACCC*TTATC
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TGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTCTCTAATCATTCCTC
CTTCTTCTCCGGTTCATTTG

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GGGTTCTGATGGCGGGTCTCTGGAGTTTCAGCTCCTTCCTGCCTGTGGGCCTCGATCTCA
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TGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTCTCTAATCATTCCTC
CTTCTTCTCC

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DS 

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GG
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TTCATTTG

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TCCGACGGTGGCTTGGCTGTGTGGCGTGGTTCCTCAGTTCCATCTCTGCTTCAACTTCTA
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GATTCTCAGCTGCCTGTCTCATGGCTT*CTGG*TTTGTTTCCGAAGCAATTAGAGTGAGT
TGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTCTCTAATCATTCCTC
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CCA

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TCTT*GGTAGCGACGGAATAGATTCTTTGGTGATT*GGTTCTTATTGTGGCTCGAGTTGG
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G
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G
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T*ATTGG*TGTGTCTCTTCTCCCCCCC*GGGATAGATTCTCAGCTGCCTGTCTCATGGCT
T*CTGG*TTTGTTTCCGAAGCAATTAGAGTGAGTTGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAA
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QA 2 696 2 696
DS 



AS 1 11

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AAACAATATGTCATCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATTATCTTGGTTGCTTTATTTCC
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BQ
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 

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AF RR4AQ68TF U 3
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AT

QA 4 530 4 530
DS 



AS 2 10

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TATC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

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RD RR4BO05JQ 759 0 0
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TCAAACACAAGATACATAAATAGAAATAAACAACAAATCGGCCTTTCAATACATTTTGGT
ACGTATAGTAAATACGCAAAATGCATTATTAGCCTTTTATTTAACACACGTGCAAGCAAA
CTCCAACAACAAGCTCCACAAAGCATGACAGGAGAGATTATTAATGCTACTTTGTAAAGG
ACACACTATTTTAATGTGTGTTGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTTTGTCAAGGT
ACCACATAGTTTCGACTTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAGGTAAAGCAAGATTGTTGTGCT
TAAAGATATCAGCGATGGAGCGTGCACATTGCTCTGTGTTGTCGTCGCAAACGGCCATAA
GATTGTACAAAGCTGAGTTGATGACCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTT
TAGGAGAGTCGGTAATGTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCG
GGAAGAG***AGCCATGTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAG
GATACTTTCCGTTTGGACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACT
CCTCGTAGAGCGCCGCGCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTG
CATAGATGTTCTCATTCGGAATCCCAACCTTGGAGAGAA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4GR13JQ 710 0 0
CGAAAGAACTTATTATTATTATACCACAGGCTCATAGCCTGTGACTCAAACACAAGATAC
ATAAATAGAAATAAACAACAAATCGGCCTTTCAATACATTTTGGTACGTATAGTAAATAC
GCAAAATGCATTATTAGCCTTTTATTTAACACACGTGCAAGCAAACTCCAACAACAAGCT
CCACAAAGCATGACAGGAGAGATTATTAATGCTACTTTGTAAAGGACACACTATTTTAAT
GTGTGTTGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTTTGTCAAGGTACCACATAGTTTCGA
CTTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAGGTAAAGCAAGATTGTTGTGCTTAAAGATATCAGCGA
TGGAGCGTGCACATTGCTCTGTGTTGTCGTCGCAAACGGCCATAAGATTGTACAAAGCTG
AGTTGATGACCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAGAGCCGGAAA
TGTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGAGAGAAGCCA
TGTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACTTTCCGTTTG
GACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGTAGAGCGCCG
CGCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4C289JQ 716 0 0
GAAAGAACTTATTATTATTATACCACAGGCTCATAGCCTGTGACTCAAACACAAGATACA
TAAATAGAAATAAACAACAAATCGGCCTTTCAATACATTTTGGTACGTATAGTAAATACG
CAAAATGCATTATTAGCCTTTTATTTAACACACGTGCAAGCAAACTCCAACAACAAGCTC
CACAAAGCATGACAGGAGAGATTATTAATGCTACTTTGTAAAGGACACACTATTTTAATG
TGTGTTGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTTTGTCAAGGTACCACATAGTTTCGAC
TTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAGGTAAAGCAAGATTGTTGTGCTTAAAGATATCAGCGAT
GGAGCGTGCACATTGCTCTGTGTTGTCGTCGCAAACGGCCATAAGATTGTACAAAGCTGA
GTTGATGGCCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAGAGTCGGTAAT
GTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGAAAGAAGCCAT
GTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACTTTCCGTTTGG
ACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGTAGAGCGCCGC
GCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAGATGTTCT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4D982JQ 820 0 0
CGAAAGAACTTATTATTATTATACCACAGGCTCATAGCCTGTGACTCAAACACAAGATAC
ATAAATAGAAATAAACAACAAATCGGCCTTTCAATACATTTTGGTACGTATAGTAAATAC
GCAAAATGCATTATTAGCCTTTTATTTAACACACGTGCAAGCAAACTCCAACAACAAGCT
CCACAAAGCATGACAGGAGAGATTATTAATGCTACTTTGTAAAGGACACACTATTTTAAT
GTGTGTTGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTTTGTCAAGGTACCACATAGTTTCGA
CTTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAGGTAAAGCAAGATTGTTGTGCTTAAAGATATCAGCGA
TGGAGCGTGCACATTGCTCTGTGTTGTCGTCGCAAACGGCCATAAGATCGTACAAAGCTG
AGTTGATGACCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAGAGTCGGTAA
TGTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGAGAGAAGCCA
TGTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACTTTCCGTTTG
GACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGTAGAGCGCCG
CGCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAGATGTTCTCAT
TCGGAATCCCAACCTTGGAGAGAAAACCATCCATGGCGAGTTTGTAGTTGCTGTTTGGAT
CTTCATATGCACAAACCCTCTCGTCGACCCAAAAGACGTG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4AR73JQ 859 0 0
AT
TAACAATTTCGAAAGAACTTATTATTATTATACCACAGGCTCATAGCCTGTGACTCAAAC
ACAAGATACATAAACAGAAATAAACAACAAATCGGCCTTTCAATACATTTTGGTACGTAT
AGTAAATACGCAAAATGCATTATTAGCCTTTTATTTAACACACGTGCAAGCAAACTCCAA
CAACAAGCTCCACAAAGCATGACAGGAGAGATTATTAATGCTACTTTGTAAAGGACACAC
TATTTTAATGTGTGTTGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTTTGTCAAGGTACCACA
TAGTTTCGACTTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAGGTAAAGCAAGATTGTTGTGCTTAAAGA
TATCAGCGATGGAGCGTGCACATTGCTCTGTGTTGTAGTCGCAAACGGCCATAAGATTGT
ACAAAGCTGAGTTGATGACCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAG
AGTCGGTAATGTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGA
GAGAAGCCATGTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACT
TTCCGTTTGGACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGT
AGAGCGCCGCGCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAGA
TGTTCTCATTCGGAATCCCAACCTTGGAGAGAAAACCATCCATGGCGAGTTTGTAGTTGC
TGTTTGGATCTTCATATGCACAAACCCTCTCGTCGACCCAAAAGACGTGCCACTTTGACC
ATTCGATTGAATCTATG

QA 3 859 3 859
DS 

RD RR4AR73TF 826 0 0
TAATGTGTGTTGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTTTGTCAAGGTACCACATAGTT
TCGACTTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAGGTAAAGCAAGATTGTTGTGCTTAAAGATATCA
GCGATGGAGCGTGCACATTGCTCTGTGTTGTAGTCGCAAACGGCCATAAGATTGTACAAA
GCTGAGTTGATGACCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAGAGTCG
GTAATGTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGAGAGAA
GCCATGTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACTTTCCG
TTTGGACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGTAGAGC
GCCGCGCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAGATGTTC
TCATTCGGAATCCCAACCTTGGAGAGAAAACCATCCATGGCGAGTTTGTAGTTGCTGTTT
GGATCTTCATATGCACAAACCCTCTCGTCGACCCAAAAGACGTGCCACTTTGACCATTCG
ATTGAATCTATGTAGGGAGGTTCCAACAACTTGCAGAGCCAGTCGATGAGGCCACCGCCG
GAGAGAACAACAGTGAAAATGCCTTTCTCCTTACAGAACTTCTCCGAGAGATGGGCAGTG
TACCTAGCCATTGCTACCGACAATTCATCCTTGGTCTGAAACTTATGCCATTTCCTATGA
ATAACTTCTGTCATCGTTGCCTATAAG
AATTGTGTGTTTGTATATC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4BO05TF 821 0 0
G
TGGCTCTCTAAAGCAATGATGCAGCTGCTT*GTCAAG*TACCACATAGTTTCGACTTGGG
CAGTAAGATGAGCAGCAGT**AAGCAAGATG**TGTGCTTAA*GATATCAGCGATGGAGC
GTGCACATTGCTCTGTGT*GTCGTCGCAAACGGCCATAAGATTGTACAAAGCTGAGTTGA
TGACCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAGAGTCGGTAATGTGAG
TGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGAG***AGCCATGTGGC
CATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACTTTCCGTTTGGACATA
GTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGTAGAGCGCCGCGCAGT
GCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAGATGTTCTCATTCGGAA
TCCCAACCTTGGAGAGAAAACCATCCATGGCGAGTTTGTAGTTGCTGTTTGGATCTTCAT
ATGCACAAACCCTCTCGTCGACCCAAAAGACGTGCCACTTTGACCATTCGATTGAATCTA
TGTAGGGAGGTTCCAACAACTTGCAGAGCCAGTCGATGAGGCCACCGCCGGAGAGAACAA
CAGTGAAAATGCCTTTCTCCTTACAGAACTTCTCCGAGAGACGGGCAGTGTACTTAGCCA
TTGCTACCGACAATTCATCCTTGGTCTGAAACTTATGCCATTTCCTATGCCTAGCTTCTG
TCATCGTTGCCTATAAGTGTGTGTGTGTGTGT
TTGTATCC

QA 2 813 2 813
DS 

RD RR4C289TF 773 0 0
TCGACTTGGGCAGTAAGATGAGCAGCAG*TAAAGCAAGATTGTTGTGCTTAAAGATATCA
GCGATGGAGCGTGCACATTGCTCTGTGT*GTCGTCGCAAACGGCCATAAGATTGTACAAA
GCTGAGTTGATGGCCGGTAAAGTGAATGTGATTCTCCTTGGTGGCAGTTTAGGAGAGTCG
GTAATGTGAGTGACCCATTTGTCCTTGACATTGATCTGAGGATGTCCCGGGAAGAGAGAA
GCCATGTGGCCATCAGGACCCATCCCTAGAAGCTGGAGATCGAACTGAGGATACTTTCCG
TTTGGACATAGTGGGATTATGTCTTGCTTCACCAGGTTCCTCAAGCACTCCTCGTAGAGC
GCCGCGCAGTGCTCCGCGTTACCATCAGCGGCATAGTGTTTGTCGATTGCATAGATGTTC
TCATTCGGAATCCCAACCTTGGAGAGAAAACCATCCATGGCGAGTTTGTAGTTGCTGTTT
GGATCTTCATATGCACAAACCCTCTCGTCGACCCAAAAGACGTGCCACTTTGACCATTCG
ATTGAATCTATGTAGGGAGGTTCCAACAACTTGCAGAGCCAGTCGATGAGGCCACCGCCG
GAGAGAACAACAGTGAAAATGCCTTTCTCCTTACAGAACTTCTCCGAGAGACGGGCAGTG
TACTTAGCCATTGCTACCGACAATTCATCCTTGGTCTGAAACTTATGCCATTTCCTATGC
CTAGCTTCTGTCATCGTTGCCTATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATATC

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL310Contig2 789 2 3 U
GGATATACAAACACACAATTCTTATAGGCAACGATGACAGAAGTTATTCATAGGAAATGG
CATAAGTTTCAGACCAAGGATGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCCCATCTC
TCGGAGAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGTGGCCTC
ATCGACTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTCCCTACATAGATTCAATCGAATGGTCAAAG
TGGCACGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTGCATATGAAGATCCAAACAGCAACTAC
AAACTCGCCATGGATGGTTTTCTCTCCAAGGTTGGGATTCCGAATGAGAACATCTATGCA
ATCGACAAACACTATGCCGCTGATGGTAACGCGGAGCACTGCGCGGCGCTCTACGAGGAG
TGCTTGAGGAACCTGGTGAAGCAAGACATAATCCCACTATGTCCAAACGGAAAGTATCCT
CAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCTTCTCTCTTCCCG
GGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTCACTCACATTACCGACTCTCCTAAA
CTGCCACCAAGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTGTACGATCTTA
TGGCCGTTTGCGACGACACACAGAGCAATGTGCACGCTCATCGCTGATATCTTTAGCACA
CATCTTGCTTTACTGCTGCTCATCTACTGCCCAGTCGAACTATGTGTACTTGACAAGCAG
CTGCATCAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR13TF U 1
AF RR4D982TF U 1
BS 1 16 RR4D982TF
BS 17 17 RR4GR13TF
BS 18 789 RR4D982TF

RD RR4GR13TF 297 0 0
G
GATATACAAACACACAATTCTTATAGGCAACGATGACAGAAGTTATTCATAGGAAATGGC
ATAAGTTTCAGACCAAGGATGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCCCATCTCT
CGGAGAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGTGGCCTCA
TCGACTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTTCCTACATAGATTCAATCGAATGGTCAAAGT
GGCACGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTGCATATGAAGATCCAAACAGCAAC

QA 2 297 2 297
DS 

RD RR4D982TF 789 0 0
GGATATACAAACACACTATTCTTATAGGCAACGATGACAGAAGTTATTCATAGGAAATGG
CATAAGTTTCAGACCAAGGATGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCCCATCTC
TCGGAGAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGTGGCCTC
ATCGACTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTCCCTACATAGATTCAATCGAATGGTCAAAG
TGGCACGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTGCATATGAAGATCCAAACAGCAACTAC
AAACTCGCCATGGATGGTTTTCTCTCCAAGGTTGGGATTCCGAATGAGAACATCTATGCA
ATCGACAAACACTATGCCGCTGATGGTAACGCGGAGCACTGCGCGGCGCTCTACGAGGAG
TGCTTGAGGAACCTGGTGAAGCAAGACATAATCCCACTATGTCCAAACGGAAAGTATCCT
CAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCTTCTCTCTTCCCG
GGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTCACTCACATTACCGACTCTCCTAAA
CTGCCACCAAGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTGTACGATCTTA
TGGCCGTTTGCGACGACACACAGAGCAATGTGCACGCTCATCGCTGATATCTTTAGCACA
CATCTTGCTTTACTGCTGCTCATCTACTGCCCAGTCGAACTATGTGTACTTGACAAGCAG
CTGCATCAT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 11

CO CL311Contig1 887 11 14 U
GGATTCGAAGAATTGGAGTTGTGATTCATCGCGTTTGAGGACTGTGCGATCCTGCCTGGT
TGAATTTACTGCAGCTTTTCGCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACAC
AAGATCTTGGTCTATTTTGTAGACGGAATGGCTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGT
CGGAATGATATTCCCATCTATGAAGCTGAAGTTGGTTCTGCTGCCAAAAGAGAAGATGCT
GCTCAGTTGCACCAGTTTATACTACACGCTGCATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGG
ACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTC
TATGTTACCGCTGGCCATACACGACTCATGCTCCTTCATGATTCACGCAATGAAGACGGC
ATCAAGAGCTTCTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTG
TATCTGCCCGGTTCTCGTATTTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCA
AGAAAGTATCTGTAGAGAAGACCGAGATCCTACTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCG
AAGTTGCTGTCAATTGTTTGTTATTGTGTTTATGTTCAATGGCTAGAGTTTTCTTCTTCA
TAACGTCGACGTCCAAGCAATGTTTTGAGATTTTTAGTAAGAAAAATAATCCATTCAATC
TAAACCCATAGTTTTCATTTTTGGTTGGTTGTTATCAAGTCTCTCTCTCCTCTCGAGGTA
GTGTAACACACGGAAAGAAACAAAGACGTAAATGTCTGTTGTTATCAGATTCTTAAATAA
ACAATTGGAACTTCTAATCTGAGCTAACGTAAAACTTGAATTCCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ50TF U 5
AF RR4D182TF U 1
AF RR4F270TF U 2
AF RR4F351TF U 2
AF RR4DJ50JQ C 6
AF RR4EX43TF U 19
AF RR4EA50TF U 84
AF RR4EX43JQ C 203
AF RR4F270JQ C 192
AF RR4F351JQ C 273
AF RR4D182JQ C 219
BS 1 12 RR4D182TF
BS 13 13 RR4DJ50TF
BS 14 647 RR4D182TF
BS 648 648 RR4F270TF
BS 649 705 RR4D182TF
BS 706 706 RR4EA50TF
BS 707 717 RR4EX43TF
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BS 719 723 RR4EX43TF
BS 724 724 RR4EA50TF
BS 725 769 RR4EX43TF
BS 770 818 RR4EA50TF
BS 819 859 RR4F270JQ
BS 860 887 RR4D182JQ

RD RR4DJ50TF 607 0 0
GG
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TACTGCAGCTTTTCGCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACACAAGATC
TTGGTCTATTTTGTAGACGGAATGGTTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGTCGGAAT
GATATTCCCATCTATGAAGCTGAAGTTGGTTCTGCTGCCAAAAGAGAAGATGCTGCTCAG
TTGCACCAGTTTATACTACACGCTGCATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGGACTACA
AGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTT
ACCGCTGGCCATACACGACTCATGCTCCTTCATGATTCACGCAATGAAGACGGCATCAAG
AGCTTCTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTGTATCTG
CCCGGTTCTCATATTTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCAAGAAAG
TATCTGTAGAGAAGACCGAGATCCTACTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCGAAGTTG
CTGTC

QA 3 607 3 607
DS 

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TGAATTTACTGCAGCTTTTCGCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACAC
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GCTCAGTTGCACCAGTTTATACTACACGCTGCATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGG
ACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTC
TATGTTACCGCTGGCCATACACGACTCATGCTCCTTCATGATTCACGCAATGAAGACGGC
ATCAAGAGCTTCTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTG
TATCTGCCCGGTTCTCGTATTTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCA
AGAAAGTATCTGTAGAGAAGACCGAGATCCTACTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCG
AAGTTGCTGTCAATTGTTTGTTATTGTGTTTATGTTCAATGGCTAGATTTTTCTTCTTCA
TAACGTCGACGTCCAAGCAATGTTTTGAGATTTTTAGTAAGAAAA
TAATCCA

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DS 

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TACTGCAGCTTTTCGCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACACAAGATC
TTGGTCTATTTTGTAGACGGAATGGCTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGTCGGAAT
GATATTCCCATCTATGAAGCTGAAGTTGGTTCTGCTGCCAAAAGAGAAGATGCTGCTCAG
TTGCACCAGTTTATACTACACGCTGCATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGGACTACA
AGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTT
ACCGCTGGCCATACACGACTCATGCTCCTTCATGATTCACGCAATGAAGACGGCATCAAG
AGCTTCTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTGTATCTG
CCCGGTTCTCGTATTTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCAAGAAAG
TATCTGTAGAGAAGACCGAGATCCTACTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCGAAGTTG
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CGACGTCCAAGCAATGTTTTGAGATTTTT

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DS 

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TACTGCAGCTTTTCGCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACACAAGATC
TTGGTCTATTTTGTAGACGGAATGGCTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGTCGGAAT
GATATTCCCATCTATGAAGCTGAAGTTGGTTCTGCTGCCAAAAGAGAAGATGCTGCTCAG
TTGCACCAGTTTATACTACACGCTGCATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGGACTACA
AGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTT
ACCGCTGGCCATACACGACTCATGCTCCTTCATGATTCACGCAATGAAGACGGCATCAAG
AGCTTCTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTGTATCTG
CCCGGTTCTCGTATTTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCAAGAAAG
TATCTGTAGAGAAGACCGAGATCCTACTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCGAAGTTG
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CGACGTCCAAGCAATGTTTTGAGATTTT

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DS 

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G
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TACTGCAGCTTTTCGCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACACAAGATC
TTGGTCTATTTTGTAGACGGAATGGTTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGTCGGAAT
GATATTCCCATCTATGAAGCTGAAGTTGGTTCTGCTGCCAAAAGAGAAGATGCTGCTCAG
TTGCACCAGTTTATACTACACGCTGCATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGGACTACA
AGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTT
ACCGCTGGCCATACACGACTCATGCTCCTTCATGATTCACGCAATGAAGACGGCATCAAG
AGCTTCTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTGTATCTG
CCCGGTTCTCATATTTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCAAGAAAG
TATCTGTAGAGAAGACCGAGATCCTACTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCGAAGTTG
CTGTCAATTGTTTGTTATTGTGTTTATGTTCAATGGCTAGAGTTTTCTTCTTCATAACGT
CGACGTCCAAGCAATGTTTTGAGATTTTTAGTAAGAAAAATAATCCATTCAATCTAAACC
CATAGTTTTCAT
C

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DS 

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GG
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GCACCGCTCACTTGCATTCATTTCTAAACGAGGGAGACACAAGATCTTGGTCTATTTTGT
AGACGGAATGGCTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGTCGGAATGATATTCCCATCTA
TGAAGCTGAAGTTGGTTCTGCTGCCAAAAGAGAAGATGCTGCTCAGTTGCACCAGTTTAT
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GAAGTCAATTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTTACCGCTGGCCATAC
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TTCATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCAAGAAAGTATCTGTAGAGAAG
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TGTTTTGAGATTTTTAGTAAGAAAA*TAATCCATTCA*TCTAA*CCCATAGTTTTCATTT
TTGGTTGGTTGTTATCAAGTCTCTCTCTC
TCTCGAGTAGTG

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DS 

RD RR4EA50TF 735 0 0
G
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GGAATGGCTAACACAGCGTGCTTTATAATAGTGGGTCGGAATGATATTCCCATCTATGAA
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TTGGTTGTTATCAAGTCTCTCTCTCCTCTCGAGGTAGTGTAACACACGGAAAGAAACAAA
GACGTAAATGTCTG

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DS 

RD RR4EX43JQ 615 0 0
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AGTCAATTGACAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTTACCGCTGGCCATACAC
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CATCGTCACATTTTGACACCAAGGTGCGTGCACTTGCAAGAAAGTATCTGTAGAGAAGAC
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GGTTGGTTGTTATCAAGTCTCTCTCTCCTCTCGAGGTAGTGTAACACACGGAAAGAAACA
AAGACGTAAATGTCT

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DS 

RD RR4F270JQ 668 0 0
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CTTCCAGGAGGTTCATGAGCTTTATATTAAGATTCTTCTGAATCCATTGTATCTGCCCGG
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GGAAAGAAACAAAGACGTAAATGTCTGTTGTTATCAGATTCTTAAATAAACAATTGGAAC
TTCTAATC

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DS 

RD RR4F351JQ 587 0 0
ATTGGATGTCGTCCAAGACCTTGCTTGGACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCAGTTGA
CAGGTTTAACGATCTGGTTGTGTCTGTCTATGTTACCGCTGGCCATACACGACTCATGCT
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CTGACTTGCGTTGTTTAGTGGAGGTCCGAAGTTGCTGTCAATTGTTTGTTATTGTGTTTA
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TGTCTGTTGTTATCAGATTCTTAAATAAACAATTGGAACTTCTAATC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4D182JQ 669 0 0
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TAAGATTCTTCTGAATCCATTGTATCTGCCCGGTTCTCGTATTTCATCGTCACATTTTGA
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TTGTTATCAGATTCTTAAATAAACAATTGGAACTTCTAATCTGAGCTAACGTAAAACTTG
AATTCCCTT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 2 9

CO CL312Contig1 574 2 2 U
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AACGCAAATCAACGAAAGACACAAATCTTACAAGAATATCATAAAGATAAAAAGAAAAAA
CCATCAAAGAAACACAGCAAATGTCCCACTCCCACATCATTATTTTTTTTCATATTTTCT
TCTTAATCATCGGACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCGTGA
TAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTCTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGCTCA
GCCGTTTCCTCAGTCACTGGTACCGCAGTCCCCGTGTCGACCACTTGAAAATCCTCTGGT
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GGATGCTCTACCGTTTCCTCCTTCACCGGCAGGGTGGCGATGACTGGAGTATCATCCTCT
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TTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCATCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4AJ88TF C 1
AF RR4AJ88JQ U 1
BS 1 6 RR4AJ88TF
BS 7 574 RR4AJ88JQ

RD RR4AJ88TF 574 0 0
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TCTTAATCATCGGACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCGTGA
TAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTCTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGCTCA
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TTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCATCTTCTTC
C

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4AJ88JQ 574 0 0
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AAGAAACACAGCAAATGTCCCACTCCCACATCATTATTTTTTTTCATATTTTCTTCTTAA
TCATCGGACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCGTGATAACCT
GGAAGCTTCTCTTTGATCTTCTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGCTCAGCCGTT
TCCTCAGTCACTGGTACCGCAGTCCCCGTGTCGACCACTTGAAAATCCTCTGGTTTCTCG
CTGTGACCTGGAAACTTCTCCTTGATCTTCTCCATCAGTCCTTTCTTCTCCTCCGGATGC
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GTTCCGTGTGGAAACTTCTCCCTTATCTGCTCCATTACATCCTTTCTATCTTCCTTTATT
TTCTCATCTTCTTCGGCCATCTTCTTCC

QA 7 574 7 574
DS 



CO CL312Contig2 1095 7 13 U
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AAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATAAGGGAGAAGT
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AAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGGAAGAAA
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TCTTTCGTCGATTTGCATTTGCCCATTTGTATTGTAATTTCATTATCTTTTTTATAAAGT
TTGTATTATGTTTCT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK37JQ C 106
AF RR4E040JQ C 106
AF RR4DK37TF U 106
AF RR4E040TF U 106
AF RR4EI62TF U 1
AF RR4BJ59TF U 3
AF RR4EI62JQ C 380
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QA 1 407 1 407
DS 

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CCACCGAGGAATCATCTGCGACGACGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGT
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CTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGCGAGAAGAGG

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR4DK37TF 407 0 0
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CAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACAGCCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACG
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CTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGCGAGAAGAGG

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR4E040TF 407 0 0
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CAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACAGCCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACG
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AGGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCT
CTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGCGAGAAGAGG

QA 1 407 1 407
DS 

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GTTTATCACATCTCGTTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAGTACA
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AAAAAGAGGAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGACGCTGGAGTCAGATTTCGAGCACA
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AGGAACACAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAAG
AGAACAAACCTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAA
GCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGCGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCG
AAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGA

QA 1 588 1 588
DS 

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TTATCACATCTCGTTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAGTACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAA
AAAGAGGAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGACGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAACAGCCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAG
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GAGGAAGAAGGTGAAGACGGCGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAA
GAAGATGAGAAAATAGAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATAAGGGAGAAGTTT
CCACACGGAACAAAGACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAG
GAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAAGGAGAAGCT
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AGTGACTGAG*AAACGGCTGAGCA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4EI62JQ 716 0 0
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GGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAA*GGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGA
AACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCAGTGACTGAGGAAACGG
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ATCACCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGGAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGA
AGAAAATATGAAAAAAAATAATGATGTGGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGG
TTTTCTCTTTTTATCTTTACGATGTTCTTGTAAGATTTGTGTCTTTCGTCGATTTGCATT
TGCCCATTTGTATTGTAATTTCATTATCTTTTTTATAAAGTTTGTATTATGTTTCT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 10

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CTCGACTTGTTTTCGCAAGAAGAAGATGACTGGAGTTGATGATGGTAAGGAGTTCAAGGA
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AGAAGGTTCCGACGAGGAACCAGAAGTCGATGGAAGTGAAGGTGACGACGATGATGATGA
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CGGCGATGACGACGACGACGATGATGATGACGACGACGACGATGATGACGAGGATGAAGA
CGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGA
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CGAAGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGGTGGTGCTGGAAAATCTGAGGCTCCTCC
CAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGTGATGATGGAGATGA
TGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGTTTTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCAAACAAA
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TGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTATTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTT
TATGCAGATGTTTTCTCTTTTCTAGTGAGTCAATAACCAATGTTTCTTGAACGATTTGCT
GTCTAATGCTTTTTCTTTATTAGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 10 10 40 40 40 40 40 40 0 25 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 50 50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 10 10 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 15 40 15 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FD92TF U 32
AF RR4EQ54TF U 1
AF RR4G912TF U 23
AF RR4BV19TF U 51
AF RR4BV19JQ C 84
AF RR4EQ54JQ C 133
AF RR4ER93TF U 316
AF RR4EX71TF U 347
AF RR4EX71JQ C 316
AF RR4ER93JQ C 324
BS 1 32 RR4EQ54TF
BS 33 33 RR4G912TF
BS 34 208 RR4EQ54TF
BS 209 209 RR4FD92TF
BS 210 673 RR4EQ54TF
BS 674 715 RR4G912TF
BS 716 744 RR4BV19TF
BS 745 745 RR4ER93TF
BS 746 805 RR4BV19TF
BS 806 806 RR4ER93TF
BS 807 822 RR4BV19TF
BS 823 823 RR4ER93TF
BS 824 828 RR4BV19TF
BS 829 831 RR4ER93TF
BS 832 853 RR4BV19TF
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GG
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AGTGGAAGAAGTTAAAGACGGAGGAGAAGAAGGTTCCGACGAGGAACCAGTAGTCGATGG
AAGTGAAGGTGACGACGATGATGATGATGACGATGATGAGGAAGATGACGACGACGAGGT
CCAGGTTCTGCAGTCCTTAGGTGGGCCTCCGGTACAGTCGGCGGAAGACGAAGATGAGGA
AGGAGAGGAAGACGGAAACGGAGACGACGGCGATGACGACGACGACGATGATGATGACGA
CGACGACGATGATGACGAGGATGAAGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATA
CCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGAAGATGAAGAGGACGCGAGTGATTTTGAGCCGGA
AGAGAACGGTGTTGAGGAGGACCTTGACGAAGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGG
TGGTGCTGGAAAATCTGAGGC
CCTCCCA

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR4EQ54TF 673 0 0
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AGAAGGTTCCGACGAGGAACCAGAAGTCTATGGAAGTGAAGGTGACGACGATGATGATGA
TGACGATGATGAGGAAGATGACGACGACGAGGTCCAGGTTCTGCAGTCCTTAGGTGGGCC
TCCGGTACAGTCGGCGGAAGACGAAGATGAGGAAGGAGAGGAAGACGGAAACGGAGACGA
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CGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGA
AGATGAAGAGGACGCGAGTGATTTTGAGCCGGAAGAGAACGGTGTTGAGGAAGACCTTGA
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DS 

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GG
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CGACGAGGTCCAGGTTTTGCAGTCCTTAGGTGGGCCTCCGGTACAGTCGGCTGAAGATGA
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TGATGACGACGACGACGATGATGACGAGGACGAAGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGG
GACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGAAGATGAAGAGGACGCGAGTGATTT
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TGACTCGGGTGGTGCTGGAAAATCTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGA
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TTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCAA

QA 3 693 3 693
DS 

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TGATGA***CGATGACGAGGAAGATGACGACGACGAGGTCCAGGTTCTGCAGTCCTTAGG
TGGGCCTCCGGTACAGTCGGCGGAAGACGAAGATGAGGAAGGAGAGGAAGACGGAAACGG
AGACGACGGCGATGACGACGACGACGATGATGATGACGACGACGACGATGATGACGAGGA
TGAAGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCG
GGCTGAAGATGAAGAGGACGCGAGTGATTTTGAGCCGGAAGAGAACGGTGTTGAGGAAGA
CCTTGACGAAGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGGTGGTGCTGGAAAATCTGAGGC
TCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGTGATGATGG
AGATGATGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGTTTTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCA
AACAAACAGAAAGAGAGCTTTATGGTTTTT*CCTTTTTAAGTTTGGAGTCGTGAGATTTG
AATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTATT*TGGATCAAGAAGTAGG*CTTTTA**TTT
TCATTTTATGCAGATGTTT
CTCTTT

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DS 

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ACGACGAGGTCCAGGTTCTGCAGTCCTTAGGTGGGCCTCCGGTACAGTCGGCGGAAGACG
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ATGACTCGGGTGGTGCTGGAAAATTTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTG
ATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGTGATGATGGAGATGATGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGT
TTTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCAAACAAACAGAAAGAGAGCTTTATGGTTTT
TTCCTTTTTAAGTTTGGAGTCGTGAGATTTGAATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTA
TTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTTTTCTCTTTTCT
AGTGAGTCAATAACCAATGTTTCTTGAACG

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ATGTAAGTTTATTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTT
TTCTCTTTTCTAGTGAGTCAATAACCAATGTTTCTTGAACGATTTGCTGTCT

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DS 

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TAAGTTTATTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTTTTC
TCTTTTCTAGTGAGTCAATAACCAATGTTTCTTGAACGATTTGCTGTCTAATGCTTTTTC
TTTATTAGAGTT

QA 1 612 1 612
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GAGGAAGACCTTGACGAAGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGGTGGTGCTGGAAAA
TCTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGT
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GAGATTTGAATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTATTATGGATCAAGAAGTAGGGCTT
TTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTTTTCTCTTTTCTAGTGAGTCAATAACCAATGTTTC
TTGAACGATTTGCTGTCTAATGCTTTTTCTTTATTAGAGTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4EX71JQ 612 0 0
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CGACGATGATGATGACGACGACGACGATGA***CGAGGATGAAGACGGTGAAGATGAGGA
GGATCTTGGGACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGAAGATGAAGAGGACGC
GAGTGATTTTGAGCCGGAAGAGAACGGTGTTGAGGAAGACCTTGACGAAGGTGAAGACGA
CGAGAATGATGACTCGGGTGGTGCTGGAAAATTTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGG
AGCTGCTGATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGTGATGATGGAGATGATGCAAGACCTCCAAA
GAGGTAGTTTTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCAAACAAACAGAAAGAGAGCTTT
ATGGTTTTTTCCTTTTTAAGTTTGGAGTCGTGAGATTTGAATCATTGGTTGGGGTTCATG
TAAGTTTATTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTTTTT
TTTTTTTTAGTGAGTCAATAACCAATGTTTTTTGAACGATTTGCTGTTTAATGCTTTTTT
TTTATTAGAGTT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4ER93JQ 604 0 0
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ATGATGACGACGACGACGATGA***CGAGGATGAAGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTG
GGACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGAAGATGAAGAGGACGCGAGTGATT
TTGAGCCGGAAGAGAACGGTGTTGAGGAAGACCTTGACGAAGGTGAAGACGACGAGAATG
ATGACTCGGGTGGTGCTGGAAAATTTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTG
ATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGTGATGATGGAGATGATGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGT
TTTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCAAACAAACAGAAAGAGAGCTTTATGGTTTT
TTCCTTTTTAAGTTTGGAGTCGTGAGATTTGAATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTA
TTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTTTTTTTTTTTTT
AGTGAGTCAATAACCAATGTTTTTTGAACGATTTGCTGTTTAATGCTTTTTTTTTATTAG
AGTT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 9

CO CL314Contig1 932 9 28 U
GGACACAAGATTAAAGTCCAAATCACGGAGGAGAAAGGGAGGAGAGAAAAAAATGGAGTA
TCTAGGGATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGGAACGGTGAATTCCCGGAGAA
AGATTGTCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCAT
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TGTTGTGGCATTCGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCA
CAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAAT
CTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAGC
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TACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTCTA
TCACAAGGCTGCTCCAGCAAAGGAGAAGAAAACCAATTGAAAGCTAGAAAGATAATCCTA
AATCAAATACGTTTGTTGTTGGCTCCAAAAACAAAAGAGATTAATCAGTGTTGCAGTTTT
TTTTTTTAATATTCCTTTTCAAGGATGACCAGACTTTGTTCACTGTATGGGTTTCGACTT
GATTCTGATGGTAAAGTAGCTGTTTGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4BH29TF U 1
AF RR4G757TF U 5
AF RR4EI37TF U 1
AF RR4EN60TF U 1
AF RR4F294TF U 57
AF RR4AB25TF U 95
AF RR4G757JQ C 104
AF RR4EI37JQ C 280
AF RR4EN60JQ C 363
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BS 107 108 RR4EI37TF
BS 109 334 RR4BH29TF
BS 335 335 RR4EI37TF
BS 336 389 RR4BH29TF
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BS 391 708 RR4BH29TF
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BS 811 813 RR4G757JQ
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BS 848 879 RR4G757JQ
BS 880 932 RR4EI37JQ

RD RR4BH29TF 708 0 0
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CAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGACTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAAT
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ACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTT
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CGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCT
TACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCA

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DS 

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GG
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GGCATTCGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCACAAAGG
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TGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCT
ATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTTCGACGC
TCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGGCTCCCTCAGATATGGAAGAA
CTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTTCGCTGG
GTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGG
ATTTGCT

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DS 

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GGCATTCGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCACAAAGG
TCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGT
TGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCT
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DS 

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GGACAC
AAGATTAAAGTCCAAATCACGGAGGAGAAAGGGAGGAGAGAAAAAAATGGAGTATCTAGG
GATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGGAACGGTGAATTCCCGGAGAAAGATTG
TCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCATCACCGT
CAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTACGAGGCCTTAGTGTTGT
GGCATTCGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCACAAAGG
TCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGT
TGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCT
ATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTTCGACGC
TCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGGCTCCCTCAGATATGGAAGAA
CTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTTCGCTGG
GTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGG
ATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTCTATCACAA
G*CTGCTCCAGCAA

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DS 

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TTAGTGTTGTCGCATTCGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCC
TTCACAAAGGCCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTCCCTTTTGATTCAAGCTT
TAATCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCA
GAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATCAATCCAACTC
TTTTCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGACTCCCTCAGA
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ACTTTGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCA
TTCTTACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCC
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C

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DS 

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CTT
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TACATCCTTGTCGCTGCTTCCATCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCAC
CATAAAAGCGTACGAGGCCTTAGTGTTGTCGCATTCGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACA
ATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCACAAAGGCCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCT
TTTCTTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTC
CCTATGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACTAACTGTGCTTGCT
GGGCAGATCAATCCAACTCTTTTCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTG
TTTGCAAGACTCCCTCAGATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGT
TTCTTAACTTTCTTCATGAACTTTGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAG
GAAAATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGTATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACC
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ATTGTTTTT

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CTTGTCGCTGCTTCCATCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAA
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CTTGCCTATTGCCTTCACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAGATGGCTTTTCTT
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ACTTTCTTCATGAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAAT
GCCCCAGTTAGCATTCTTACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTG
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CTAGAAAGATAATCCTAAATCAAATACGTTTGTTGTTGGCTCCAAAAACAAAAGAGATTA
ATCAGTGTTGCAGTTTTTTTTT**AATATTCCTTTTCAAGGATGACCAGACTTTGT
AC

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DS 

RD RR4EI37JQ 653 0 0
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TCTTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCC
TATGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGG
GCAGATTAATCCAACGCTTTTCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTT
TGCAAGGCTCCCTCAGATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTT
CTTAACTTTCTTCATGAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGA
AAATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCAT
CCTGAGTCAGATTCTCCTCTATCACAAGGCTGCTCCAGCAAAGGAGAAGAAAACCAATTG
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TCACTGTATGGGTTTCGACTTGATTCTGATGGTAAAGTAGCTGTTTGAAGTCC

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DS 

RD RR4EN60JQ 570 0 0
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TCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTTCG
ACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGGCTCCCTCAGATATGGA
AGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTTCG
CTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCTTA
CGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTTTCCTCTATC
ACAAGGCTGCTCCAGCAAAGGAGAAGAAAACCAATTGAAAGCTAGAAAGATAATCCTAAA
TCAAATACGTTTGTTGTTGGCTCCAAAAACAAAAGAGATTAATCAGTGTTGCAGTTTTTT
TTTTTAATATTCCTTTTCAAGGATGACCAGACTTTGTTCACTGTATGGGTTTCGACTTGA
TTCTGATGGTAAAGTAGCTGTTTGA
AGTCC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 10

CO CL315Contig1 790 10 23 U
GGAACCTTCACCCACCACACAAACACAATCGCCTCTTGTAGAATTCTCCTCCCCAGATAA
AAAAAAA**ATCAAT*CCCTCAAATTGTCATCGATCAGTCAATGGAAGAAGCTAAAGTGG
AAGCAAAAGACGGAACCATCTCCGTTGCTACTGCATTCGCCGGTCACCAGCAAGCTGTGC
AAGACAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACT
GTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCT
GCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTC
GAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCT
GTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTAT
ATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTC
TGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAACG
GAGCTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAACACTAAGGAGAAGTTCCGTTTATACTGAG
AGACTTCTTCTCCTCCTTCATATCACATCCTTCTTCTTCTCCTTATTCATTCATGATGGC
CAATCAGAAGAAGAAGAAATGCACTTTTGCTTTTAACCAAATAAATCTCTGTTTTCGAAT
TGTTAATTTC


BQ
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 5 5 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E537TF U 1
AF RR4BQ12TF U 1
AF RR4DE84TF U 1
AF RR4DH43TF U 1
AF RR4CD78JQ C 317
AF RR4E234TF U 1
AF RR4CD78TF U 1
AF RR4E234JQ C 150
AF RR4DH43JQ C 156
AF RR4DE84JQ C 175
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BS 605 630 RR4DE84TF
BS 631 635 RR4DH43TF
BS 636 637 RR4E234TF
BS 638 638 RR4CD78TF
BS 639 681 RR4E234TF
BS 682 682 RR4CD78TF
BS 683 728 RR4E234TF
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BS 736 753 RR4E234TF
BS 754 754 RR4CD78TF
BS 755 755 RR4E234TF
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BS 776 790 RR4E234JQ

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AAGACAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACT
GTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGT

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DS 

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AAAAAAA***TCAAT*CCCTCAAATTGTCATCGATCAGTCAATGGAAGAAGCTAAAGTGG
AAGCAAAAGACGGAACCATCTCCGTTGCTACTGCATTCGCCGGTCACCAGCAAGCTGTGC
AAGACAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACT
GTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCT
GCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTC
GAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCT
GTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTAT
ATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTC
TGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAA

QA 1 566 1 566
DS 

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AAAAAAA**ATCAAAGCCCTCAAATTGTCATCGATCAGTCAATGGAAGAAGCTAAAGTGG
AAGCAAAAGACGGAACCATCTCCGTTGCTACTGCATTCGCCGGTCACCAGCAAGCTGTGC
AAGACAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACT
GTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCT
GCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTC
GAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCT
GTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTAT
ATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTC
TGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAACG
GAGTTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGA
CACT

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DS 

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AAAAAAAAAATCAAAGCCCTCAAATTGTCATCGATCAGTCAATGGAAGAAGCTAAAGTGG
AAGCAAAAGACGGAACCATCTCCGTTGCTACTGCATTCGCCGGTCACCAGCAAGCTGTGC
AAGACAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACT
GTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCATAATAACCAGGTCGTCGCTAGCT
GCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCACATGCCGAAGTCACTGCCATTC
GAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCT
GTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTAT
ATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTC
TGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAATG
GAGCTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAACACT

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DS 

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ACTTAACAAAATCGAGCTTTCAGAATGGGAGATTTACGCATCCTGTGAGCCGTGTCCCAT
GTGCTTTGGAGCCATCCATTTTTCCAGACTCAAGAGATTGGTATATGGAGGGAAAGCTGC
AGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGTTTTGAGAGGAACCGGTGT
TTACCAGAAATTTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAACGGAGCTGTGATTGCTGA
ACAAGTGTTCCAGAACACTGAGGAGAAGTTCCGTTTATACTGAGAGACTTTTTTTCCTCC
TTCATATCACATCCTT
TTTTT

QA 1 376 1 376
DS 

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AAAAAAA***TCAAT*CCCTCAAATTGTCATCGATCAGTCAATGGAAGAAGCTAAAGTGG
AAGCAAAAGACGGAACCATCTCCGTTGCTAATGCATTCGCCGGTCACCAGCAAGCTGTGC
AAGACAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACT
GTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCT
GCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTC
GAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCT
GTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTAT
ATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTC
TGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAACG
GAGCTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAACACTAAAGAGAAGTTCCGTTTATACTGAG
AGACTTCTTCTCCTCCTTCATGTCACATCCTTCTTCTTCTCCTTATTCATTCATGATGGC
CAATCAGA*GAAGA*GAAATGCACTTTTGCTTTAACC**AATAAATCTCTGTTTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4CD78TF 760 0 0
GGAG
CCTTCACCCACCACACAAACACAATCGCCTCTTGTAGAATTCTCCTCCCCAGATAAAAAA
AAAAAATCAAT*CCCTCAAATTGTCATCGATCAGTCAATGGAAGAAGCTAAAGTGGAAGC
AAAAGACGGAACCATCTCCGTTGCTACTGCATTCGCCGGTCACCAGCAAGCTGTGCAAGA
CAGTGACCACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACTGTGG
TGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTTTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCTGCCA
CAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTCGAGA
GGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCTGTGA
GCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTATATGG
AGCGAAAGCTGCAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTCTGAG
AGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAACGGAGC
TGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAACACTGAGGAGAAGTTCCGTTTATACTGAGAGAC
TTCTTCTCCTCCTTCATATCACATCCTTCTTCTTCTCCTTATTCATTCATGATGGCCAAT
CAGA*GA*GA*GAA*TGCACTTTTGCTTTTACC**A

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DS 

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AA
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TGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACTGTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTAT
TGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCTGCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCC
TACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTCGAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGA
GCTCTCAGAATGCGAGATTTACGCATCCTGTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCAT
CCATCTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTATATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAAT
CGGGTTTGATGACTTCATAGCTGATGCTCTGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAA
CCTGGTGATCAAGAAAGCCGACGGGAACGGAGCTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAA
CACTAAGGAGAAGTTCCGTTTATACTGAGAGACTTCTTCTCCTCCTTCATGTCACATCCT
TCTTCTTCTCCTTATTCATTCATGATGGCCAATCAGAAGAAGAAGAAATGCACTTTTGCT
TTTAACCAAATAAATCTCTGTTTTCGAATTGTTAATTTC

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DS 

RD RR4DH43JQ 635 0 0
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GAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACTGTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTC
CATAATAACCAGGTCGTCGCTAGCTGCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACT
GCACATGCCGAAGTCACTGCCATTCGAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTC
TCAGAATGCGAGATTTACGCATCCTGTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCAT
CTCTCCAGACTCAAGAGATTGGTATATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGG
TTTGATGACTTCATAGCTGATGCTCTGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTG
GTGATCAAGAAAGCCGACGGGAATGGAGCTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAACACT
AAGGAGAAGTTCCGTTTATACTGAGAGACTTTTTCTCCTCCTTCATATCACATCCTTTTT
TTTCTCCTTATTCATTCATGATGGCCAATCAGAAGAAGAAGAAATGCACTTTTGCTTTTA
ACCAAATAAATCTCTGTTTTCGAATTGTTAATTTC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4DE84JQ 616 0 0
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TTGACTGTGGTGATGGTGGCCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCG
CTAGCTGCCACAACATGGTTCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTG
CCATTCGAGAGGCATGCAAGAAACTTAACAAAATCGAGCTCTCAGAATGCGAGATTTACG
CATCCTGTGAGCCGTGTCCCATGTGCTTCGGAGCCATCCATCTCTCCAGACTCAAGAGAT
TGGTATATGGAGCGAAAGCTGAAGCAGCCATAGCAATCGGGTTTGATGACTTCATAGCTG
ATGCTCTGAGAGGAACCGGTGTTTACCAGAAATCTAACCTGGTGATCAAGAAAGCCGACG
GGAACGGAGTTGTGATTGCTGAACAAGTGTTCCAGAACACTAAGGAGAAGTTCCGTTTAT
ACTGAGAGACTTTTTCTCCTCCTTCATATCACATCCTTCTTCTTCTCCTTATTCATTCAT
GATGGCCAATCAGAAGAAGAAGAAATGCACTTTTGCTTTTAACCAAATAAATCTCTGTTT
TCGAATTGTTAATTTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 2 11

CO CL316Contig1 866 9 16 U
GGAGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTC
GACTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCT
CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGT
GGACAGGTCACTGATATTTTTATCCACGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTT
GGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGAAATATAAAGGCCGTCGTAT
TACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCA
ACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTT
TATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGG
TGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCG
TTATTCTGCCAAGATGTTCTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTA
TCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAACAAC
GTTTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTGGTTTTTCTTGTTAGTAAAACATTTCTG
AAGCATTTTTCTGAATATTGTAGAAT


BQ
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 0 50 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU89TF U 1
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AF RR4DO30TF U 1
AF RR4DI30TF U 1
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AF RR4EU89JQ C 88
AF RR4DO30JQ C 123
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BS 405 405 RR4DO30TF
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BS 409 565 RR4DI30TF
BS 566 566 RR4DO30TF
BS 567 664 RR4DI30TF
BS 665 665 RR4ER16TF
BS 666 683 RR4DI30TF
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BS 685 756 RR4DI30TF
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BS 813 813 RR4EU89JQ
BS 814 866 RR4ER16TF

RD RR4EU89TF 513 0 0
GGAGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTC
GACTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCT
CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGCTGAAAAAACTCTTGTCATCATGC
GGACAGCTCACTGATATTTTTATCCACGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAACGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTT
GGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTTCCGGAATCTACAGGCCGTCGTAT
TACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCA
ACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR4EZ12TF 639 0 0
GGAGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTC
GACTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCT
CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTTGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGT
GGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCAAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTT
GGAGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGAAATATGAAGGCCGTCGTAT
TACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCA
ACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTT
TATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGG
TGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4DO30TF 715 0 0
GGAGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTC
GACTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCT
CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGT
GGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTT
GGAGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGAAATATGAAGGCCGTCGTAT
TACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCA
ACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTT
TATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGG
TGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCG
TTAT*CTGCCAAGATGTTCTAAG*TGCA*TGGAGGAGC*TTTCTATCTTAT
ACTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DI30TF 771 0 0
GGAGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTC
GACTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCT
CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGT
GGACAGGTCACTGATATTTTTATCCACGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTT
GGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGGAATCTACAGGCCGTCGTAT
TACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCA
ACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTT
TATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAAACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGG
TGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCG
TTAT*CTGCCAAGATGTTCTAAG*TGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTA
TCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTA
TATATCTTTCTATGG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4DI30JQ 817 0 0
AGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTCGA
CTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCTCG
TACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTATGA
CACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGTGG
ACAGGTCACTGATATTTTTATCCACGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATTGT
TTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTTGG
AGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGGAATCTACAGGCCGTCGTATTA
CCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAAC
ATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTTTA
TTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAAACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGTG
GACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGTT
ATTCTGCCAAGATGTTTTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTATC
TGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAACAACGT
TTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTTGTTTT
T

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4EU89JQ 753 0 0
ATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCTCGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACC
CGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTATGACACCAGTCTTCCACATGATGATGTC
GAAGGAGCGCTGAAAAAACTCTTGTCATCATGCGGACAGCTCACTGATATTTTTATCCAC
GAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATTGTTTATATCTTGGGAGAACGTGCAGCA
GACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTTGGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCT
TATCGTTTT*CCGGAATCTACAGGCCGTCGTATTACCGTTAATGTTACTGGATATGACAA
CTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAG
TAACTTCGAATTTTTTTCGGGTTCAGTTTATTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGA
CAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGTGGACGCACATTACATGTTATGGTTGT
TTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGTTATTTTGCCAAGATGTTTTAAGGTGC
AATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTATCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTT
GGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAACAACGTTTTTTCATTAGAGAAAGTCGAAACA
TGTTTGTTTTT*CTTGTTAGTAAAACATTT
TTG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4DO30JQ 724 0 0
TACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTATGA
CACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGTGG
ACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATTGT
TTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTTGG
AGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGAAATATGAAGGCCGTCGTATTA
CCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAAC
ATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTTTA
TTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGTG
GACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGTT
ATTCTGCCAAGATGTTTTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTATC
TGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAACAACGT
TTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTGGTTTT*CTTGTTAGTAAAACATTT
CTGAAGCAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4EZ12JQ 722 0 0
TACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTATGA
CACCAGTCTTCCACATGATGATGTTGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGTGG
ACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCAAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATTGT
TTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTTGG
AGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTT*CCGAAATATGAAGGCCGTCGTATTA
CCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAAC
ATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTTTA
TTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGTG
GACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGTT
ATTCTGCCAAGATGTTCTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTATC
TGGATATGTTGTAGCGTGACTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTACGGGAACAACGT
TTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTGGTTTTTCTTGTTAGTAAAACATTT
CTGAAGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4ER16TF 407 0 0
GATTGAGAGTGCAATGCGTCAACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATT
TTTCTCGGGTTCAGTTTATTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGA
TCTTGATGGAAGTGAAATGGGTGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAAT
AACCACTGTTCACACCAAGCGTTATTCTGCCAAGATGTTCTAAGGTGCAATGGAGGAGCC
TTTCTATCTTATTACTTTCTATCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATA
ATATCTTTCTATGGGAACAACGTTTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTTGTTTTT
CTTGTTAGTAAAACATTTCTGAAGCATTTTTCTGAATATTGTAGAAT

QA 1 407 1 407
DS 



CO CL316Contig2 870 2 2 U
GGATAGAACTGATAAAAAATGTCGCCGCTTAAGGATATCCTAGCAAGGGAAGCCAAGAGG
GAAGCCAAGAGGGAAGCTAAGAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAGGCCGAGAGG
GAAGCCGAGAGGGAAGGATCGCCTCCGGCGGACAGTTCCAAGAGGATGAGAATCATTGGA
CTGGCATTGGACGACCCTCGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGG
GTTTTCGTTGCGGGGTATGACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAA
AAACTCTTGTCATCATGTGGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGA
CTCGCAAGGCGTGCTATTGTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTA
CTTAGTGGAATTGACGTTGGAGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGAAA
TATGAAGGCCGTCGTATTACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATT
GAGAGTGCAATGCGTCAACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTC
TCGGGTTCAGTTTATTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTT
GATGGAAGTGAAATGGGTGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACC
ACTGTTCACACCAAGCGTTATTCTGCCAAGATGTTCTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTC
TATCTTATTACTTTCTATCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATAT
CTTTCTATGGGAACAACGTTTTTTCATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV03TF U 1
AF RR4FV03JQ C 4
BS 1 684 RR4FV03TF
BS 685 870 RR4FV03JQ

RD RR4FV03TF 684 0 0
GGATAGAACTGATAAAAAATGTCGCCGCTTAAGGATATCCTAGCAAGGGAAGCCAAGAGG
GAAGCCAAGAGGGAAGCTAAGAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAGGCCGAGAGG
GAAGCCGAGAGGGAAGGATCGCCTCCGGCGGACAGTTCCAAGAGGATGAGAATCATTGGA
CTGGCATTGGACGACCCTCGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGG
GTTTTCGTTGCGGGGTATGACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAA
AAACTCTTGTCATCATGTGGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGA
CTCGCAAGGCGTGCTATTGTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTA
CTTAGTGGAATTGACGTTGGAGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGAAA
TATGAAGGCCGTCGTATTACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATT
GAGAGTGCAATGCGTCAACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTC
TCGGGTTCAGTTTATTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTT
GATGGAAGTGAAATGGGTGGACAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4FV03JQ 867 0 0
GATAGACTGAT
AAAAATGTCGCCGCTTA*GGATATC*TAGCAAGGGA*GCCA*GAGGGAAGCCA*GAGGGA
AGCTA*GAGGGA*GCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAGGCCGAGAGGGAAGCCGAGAGGGA
AGGATCGCCTCCGGCGGACAGTTCCAAGAGGATGAGAATCATTGGACTGGCATTGGACGA
CCCTCGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGG
GTATGACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATC
ATGTGGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGC
TATTGTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGA
CGTTGGAGGATGGAATGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGAAATATGAAGGCCGTCG
TATTACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCG
TCAACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTA
TTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAAT
GGGTGGACACACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAA
GCGTTATTCTGCCAAGATGTTCTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTT
CTATCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAAC
AACGTTTTTTCATTAG

QA 12 867 12 867
DS 



AS 1 10

CO CL317Contig1 947 10 19 U
GGGAATCGAAGTGCTCAAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCC
ACTGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTC
GAGAACACCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGG
GAAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGA
AGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTA
TCCTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAA
CCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTA
TAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGC
CACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAG
TACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGT
GAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGG
GACAGATGAAGAAACCGAAGGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAG*TCCAAGGCTGAACGAT
TGATACATGACTGGCTGATTCCTAATGTCTCAACCGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTC
ACTGGATAGGACGAGGTTGTCCACTCACTACTTTGTGCACATTTTTCTTCTTAGTTCGTT
TCCTGAATACTTGTACACCTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATATA
ACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTTAC


BQ
10 25 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 35 35 50 50 0 50 50 50 50 25 50 50 50 50 25 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 35 50 50 50 50 30 45 10 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 

AF RR4DP32TF U 6
AF RR4G310TF U -5
AF RR4E437TF U 1
AF RR4F215TF U 2
AF RR4FF75TF U 2
AF RR4GZ46TF U 1
AF RR4FF75JQ C 259
AF RR4GZ46JQ C 367
AF RR4DP32JQ C 299
AF RR4F215JQ C 389
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BS 558 558 RR4F215TF
BS 559 597 RR4E437TF
BS 598 598 RR4F215TF
BS 599 679 RR4E437TF
BS 680 680 RR4FF75JQ
BS 681 710 RR4E437TF
BS 711 711 RR4FF75JQ
BS 712 715 RR4E437TF
BS 716 716 RR4FF75TF
BS 717 730 RR4E437TF
BS 731 731 RR4F215TF
BS 732 741 RR4E437TF
BS 742 742 RR4FF75JQ
BS 743 752 RR4E437TF
BS 753 753 RR4FF75JQ
BS 754 763 RR4E437TF
BS 764 768 RR4GZ46TF
BS 769 947 RR4FF75JQ

RD RR4DP32TF 661 0 0
GG
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AACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCGAGAACA
CCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAA
GGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGAC
GGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCTCTC
AGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTG
GGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTATAGAGAT
GAGAAGGAGATACAAAAGACAACAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAG
TTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGTACCTCA
GATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTGAAAGAC
TTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGA

QA 3 661 3 661
DS 

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GGGTTGGT
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TGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCGA
GAACACCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGA
AGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTGCTCCTCCCCCCATGCCTAAGATTGAAG
ACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATC
CTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACC
TCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTACTGTTATTTATA
GAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCTTGTCTTGCGGACTGCCA
CTGAGTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGTA
CCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTGA
AAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGA
CAGATGAAGAAACCGAAAGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAG*T
AAGTATACATTAT

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DS 

RD RR4E437TF 763 0 0
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GAGAACACCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGG
GAAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGA
AGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTA
TCCTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAA
CCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTA
TAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGC
CACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAG
TACCTCAGATGTCATCGGGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAACGT
GAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGG
GACAGATGAAGAAACCGAAAGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAG*TCCAAG*CTGA*CGAT
TGATACATGATTGGCTGATTC*TAATGTCTCA*CCGTCTTGAT

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DS 

RD RR4F215TF 752 0 0
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CTGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCG
AGGACACCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGG
AAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAA
GACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTAT
CCTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAAC
CTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTAT
AGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCC
ACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGT
ACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTG
AAAGACTTTTTTGGGGATGCAAA*GAGTCCTTCGGAA*GATATCATCACTGAATCCTGGG
ACAGATGA*GAAACCGAA*GAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAG*TC**AG*CTGA*CGAT*
GATACATGACTGGCTGAT
CTATGTCTCACGTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FF75TF 746 0 0
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CTGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCG
AGGACACCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGG
AAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAA
GACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTAT
CCTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAAC
CTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTAT
AGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCC
ACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGT
ACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTG
AAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGG
ACAGATGAAGAAACCGAAAGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAG*TCCAAG*CTGAACGAT*
GATACATGACTGGGTGATTC
TATGTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4GZ46TF 781 0 0
G
GGAATCGAAGTGCTCAAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCA
CTGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCTAGACACTCTCTGTTCACCTCG
AGAACACCATGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAAGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGG
AAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAA
GACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTAT
CCTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAAC
CTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTAT
AGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCC
ACTGAGTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGT
ACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTG
AAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGG
ACAGATGAAGAAACCGAA*GAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAG*TCCAAG*CTGAACGATT
GATACATGATTGGCTGATCC*TA*TGTCTCA*CCGTCTTGATATGGA
TGCAGAGTCACTG

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DS 

RD RR4FF75JQ 689 0 0
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TGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATAT
TTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTATAGAGATGAGAAGGAGAT
ACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGG
CTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGA
GCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGA
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AGGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCTGAACGATTGATACATGACTGGCTGA
TTCCTAATGTCTCAACCGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGATAGGACGAGGTT
GTCCACTCACTACTTTGTGCACATTTTTCTTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAC
CTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATATAACTTATTGTGTCTGTAGA
TTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTTAC

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DS 

RD RR4GZ46JQ 581 0 0
GGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTATAGAGA
TGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGA
GTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGTACCTC
AGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTGAAAGA
CTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGA
TGAAGAAACCGAAGGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCTGAACGATTGATAC
ATGATTGGCTGATTCCTAATGTCTCAACCGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGA
TAGGACGAGGTTGTCCACTCACTACTTTGTGCACATTTTTCTTCTTAGTTCGTTTCCTGA
ATACTTGTACACCTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATATAACTTAT
TGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTT
GC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4DP32JQ 649 0 0
TATCCTCTCAGTATAATAGCTGGTGGTACAACTGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGAC
AACCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATT
TATAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAACAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACT
GCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTT
AGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAA
GTGAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCT
GGGACAGATGAAGGAACCGAAGGAAGTCCTGATGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCTGAACG
ATTGATACATGATTGGCTGATTCCTAATGTCTCAACCGTCTTGATATGCAATGCAGAAGT
TCACTGGATAGGACGAGGTTGTCCACTCACTACTTTGTGCACATTTTTCTTCTTAGTTCG
TTTCCTAAATACTTGTACACCTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATA
TAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTTAC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4F215JQ 559 0 0
ACCATTGCAAGAAATATTGCTGCTGTTATTTATAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACA
GCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTT
GTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACC
CAGGACCAGCTTAAAACAGTATTCGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAG
TCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAAGAAACCGAAGGAAGTCCT
GATGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCTGAACGATTGATACATGACTGGCTGATTCCTAATGT
TTCAACCGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGATAGGACGAGGTTGTCCACTCAC
TACTTTGTGCACATTTTTCTTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACACCTCTGAGAGA
AACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATATAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAA
GAAAGAGCTGTTTGGTTAC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 2 10

CO CL318Contig1 799 3 20 U
CTGTAGAATAGCTGCTACGTTTTCTTAATCAGTAGATTATGAATGTACATGTGATAATCA
TCCCCCCTCATTGCTTAAAATTTAATTTGGCTTCTCAAATCTTCACATTACACAACACAC
TTTTAACAATATATAGAAA*TACCGTTTAATAAACATTACATGAAAGTAGATTAGTAACC
AAGAGAAAGGTCTTTTCGCTGAAGATGGG*TTGATCCAAACACTCCAAATCATGATGGTT
GAGAAGGACGAGGTAGCCTCTTTCCAATTTCCTCAAACAGTTCATTTATGTTATCTGCCG
TCTTAGCTGACGTTTCAATAAAGAACATGCCGTTCTTCTCTGCAAGCTCCATACCATCCT
CGGAGAGTACTTCTCTTTTTTCATGTAGATCAGCTTTGTTACCAACCAAAGCCATAACAA
TGTCTGGGCTTCCATGCTTCTGCAGTTCCTTAACCCAATACTGAGCTTTCTTGAACGACT
CAGGGCTTGTAATATCATACACAATAACAGCAACTCCAGCTCCACGGTAGTATAGTGGAG
CAAGCGCAGAATACCTCTCTTGCCCTGCTGTATCCCATATTTCAAACTTCACTGTGGTAG
AGTCTTGCAAGGTTATTGTCTGGGACAAGAATGAAGCTCCAACAGTTACCTTAGATGTTG
CGTCAAATTGACCACGGACAAACTGGAGGACAATACAGCTTTTACCCACACCAGAATCTC
CTAACAGAACTAACTTCACGCGTAGATTCTTAGCATCTGCTGGAGCTGCATTCTCTGAGC
TAGTAAGACCGTTTAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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QA 1 778 1 778
DS 

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AA
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A*TACCGTTTAATAAACATTACATGAAAGTAGATTAGTAACCAAGAGAAAGGTCTTTTCG
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TAAAGAACGTGCCGTTCTTCTCTGCAAGCTCCATCCCATCCTCGGAGAGTACTTCTCTTT
TTTCATGCAGATCAGCTTT**TACCAACCAAAGCCATAACAATGTCTGGGCTTCCATGCT
TCTGCAGTTCCTTAACCCAATACTGAGCTTTCTTGAAAGACTCAGGGCTTGTAATATCAT
ACACAATAACAGCAACTCCAGCTCCACGGTAGTATAGCGGAGCAAA*GCAGAATACCTCT
CTCGCCCTGCTGTATCCCATATTTCAAACTTCACTGTGGTAGAGTCTTGCAAGGTTATTG
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CGCGTAGATTCTTAGCATCTGCTGGAGCTGCATTCTCTGAGCTAGTAAGACCGTTTAAAG
C

QA 3 723 3 723
DS 



CO CL318Contig2 908 7 33 U
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ATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTACTGGGTCAAGGAACTGCAGAAGCAT
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GACAGACCTTTCTCTTGGTTACTAATCTCTTGCATACTTTCATGTAATGTTTATTAAACG
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AATTAAGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

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G

QA 1 632 1 632
DS 

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GGAAGGAC
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GCTCTATCATCTCATCAATTCT*CTATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCT
TCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTTAAACGGTCTTACTAGCTCAGAGAATGCAGCTCCAGC
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CTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAATTTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGG
AGCTTCGTTCTTGTCCCAGACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAAT
ATGGGATACAGCAGGGCGAGAGAGGTATTCTGCT*TTGCTCCGCTATACTACCGTGGAGC
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**AAGCTGATCTGCATGAAAAAAGAGAAGTACTCTCCGAGGATGGGATGGAGCTTGCAGA
GAAGAACGGCACGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAATGAACT
G

QA 9 669 9 669
DS 

RD RR4D373TF 737 0 0
GG
GATCCTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCTCCAAAACTTGGATACGATCTCTCA
GCTCTATCATCTCATCAATTCT*CTATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCT
TCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTTAAACGGTCTTACTAGCTCAGAGAATGCAGCTCCAGC
AGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTCTATTAGGAGATTCTGGTGTGGGTAAAAG
CTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAATTTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGG
AGCTTCGTTCTTGTCCCAGACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAAT
ATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCTCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGC
TGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCTTTCAAGAAAGCTCAGTA
TTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTTATGGCTTTGGTTGGTAA
CAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTACTCTCCGAGGATGGGATGGAGCTTGCAGA
GAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAATGAACT
GTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGCTACCTCGTCCTTCTCAACCATCATGATTTGGAGTGTT
TGGATCAACCCATCT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR4D007TF 799 0 0
TTT
TTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCCCCAAAA*TTGGATACGATCTCTCAGCTCTATAAAC
TCATCAATTCTACTATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCTTCCAGATAGGA
ACTCTGGAGCTTTAAACGGTCTTACCAGCTCGGAGAATGCAGCTCCAGCAGATGCTAGGA
ATCTACGCGTAAAGTTAGTTCTATTAGGAGATTCTGGTGTGGGTAAAAGTTGTATTGTCC
TCCAATTTGTCCGTGGTCAGTTTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGGAGCTTCATTCT
TGTCCCAAACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAATCTGGGATACAG
CAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCGCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTG
TTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTACTGGGTCAAGG
AACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTTATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATC
TACATGAAAAAAGAGAAGTACTCTCCGAGGATGGTATTGAGCTTGCAGATAAGAACGGCA
TGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAATGAACTGTTTGAGGAAA
TTGGAAAGAGGCTACCTCGTCCTTCTCA*CCACCATGATTTGGAGTGTTTGGATCAACCC
ATCTTCAGCGAAA*GACAGACCTTTCTCTTGGT*ACTAATCTCT*GCATACTTTCATGTA
TGTTATAAACGTATTC

QA 4 783 4 783
DS 

RD RR4D007JQ 443 0 0
GAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTC
AGTACTGGGTCAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTTATGGCTTTGGTTG
GTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTACTTTCCGAGGATGGTATTGAGCTTG
CAGATAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGTTAAGACGGCAGATAACATAAATG
AACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGCTACCTCGTCCTTTTCAACCACCATGATTTGGAG
TGTTTGGATCAACCCATTTTCAGCGAAAAGACAGACCTTTCTCTTGGTTACTAATTTCTT
GCATACTTTCATGTAATGTTTATTAAACGGTATTTCTATATATTGTTAAAAGTGTGTTGT
GTAATGTGAAGATTTGAGAAGCC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR4CO71JQ 607 0 0
GTCAGTTTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGGAGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAA
CCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAATCTGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGT
ATTCTGCGCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATA
TTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTACTGGGTCAAGGAACTGCAGAAGCATG
GAAGCCCAGACATTGTTATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAG
AAGTACTCTCCGAGGATGGTATTGAGCTTGCAGATAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAA
CGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAATGAACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGCTAC
CTCGTCCTTCTCAACCATCATGATTTGGAGTGTTTGGATCAACCCATCTTCAGCGAAAAG
ACAGACCTTTCTCTTGGTTACTAATCTCTTGCATACTTTCATGTAATGTTTATTAAACGG
TATTTCTATATATTGTTAAAAGTGTGTTGTGTAATGTGAAGATTTGAGAAGCCAAATCAA
ATTAAGC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 11

CO CL319Contig1 749 11 13 U
GGGAACCACAATCGCTTATTACATTCACGTCCACGTCATCATGATCCTCATTCATCTCCT
CAATACTAAAATCTAATCTCTTCCTTCTTCAGTCACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAG
CCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGC
TAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGA
TCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCA
TGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTA
GCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGA
GATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAGTTCGGAAGCTGCA
AGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTCA
TCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATG
TTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTATATAAACCCA
CCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCATGTCCCATTTGAATCTA
TCAAAGTTATCCTCTCATTAGGGATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 50 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F831TF U 1
AF RR4CP61JQ C 92
AF RR4FT04TF U 570
AF RR4CP61TF U 92
AF RR4F831JQ C 366
AF RR4FX81JQ C 111
AF RR4FW57JQ C 115
AF RR4FW57TF U 115
AF RR4GO17JQ C 111
AF RR4GO17TF U 111
AF RR4FX81TF U 111
BS 1 376 RR4F831TF
BS 377 377 RR4CP61TF
BS 378 439 RR4F831TF
BS 440 440 RR4CP61TF
BS 441 466 RR4F831TF
BS 467 467 RR4CP61TF
BS 468 495 RR4F831TF
BS 496 496 RR4CP61TF
BS 497 609 RR4F831TF
BS 610 610 RR4FT04TF
BS 611 720 RR4F831TF
BS 721 734 RR4FW57TF
BS 735 749 RR4FX81TF

RD RR4F831TF 722 0 0
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CAATACTAAAATCTAATCTCTTCCTTCTTCAGTCACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAG
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TAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGA
TCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCA
TGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTA
GCGTCTTCGATGAATACCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGA
GATTGGCAACAAGTGGAGCCAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCA
AGTTCCCTGAGAATTCCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTCA
TCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATG
TTTTCTGGAGATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTATATAAACCCA
CCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCATGTCCCATTTGAATCTA
CC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4CP61JQ 628 0 0
GGAC
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CAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGAT
GGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCT
G***TGTCTGCTTCTACTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCC
AACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCA
TTCACTGTCCAGTTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTC
GCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTCATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAA
GACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTT
TGTTATTCATTCTTATATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAA
AATTTTCATGTCCCATTTGAATCT

QA 5 628 5 628
DS 

RD RR4FT04TF 149 0 0
GGCAAAGACAAGTACAAGCGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTT
GTTGTTTGTTATTCATTCTTATATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATC
CATCAAAATTTTCATGTCCCATTTGAATC

QA 1 149 1 149
DS 

RD RR4CP61TF 628 0 0
GGAC
CCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCA
ATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGT
CAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGAT
GGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCT
G***TGTCTGCTTCTACTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCC
AACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCA
TTCACTGTCCAGTTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTC
GCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTCATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAA
GACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTT
TGTTATTCATTCTTATATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAA
AATTTTCATGTCCCATTTGAATCT

QA 5 628 5 628
DS 

RD RR4F831JQ 357 0 0
TTCGATGAATACCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTG
GCAACAAGTGGAGCCAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTC
CCTGAGAATTCCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTCATCTCT
GAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTC
TGGAGATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTATATAAACCCACCCCC
AACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCATGTCCCATTTGAATCTA
CC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR4FX81JQ 639 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTC*AGTTC
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GTCCCATTCATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTA
TATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCATGTCCCA
TTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCTCATTAGGGATTATG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4FW57JQ 622 0 0
G
GGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGT
AGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACGTTTCC
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AGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAA
TGCTAGCGGCTTCGATGAATACCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAACGATAA
GAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCCAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTCGGAAG
CTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCC
ATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGTGGTTC
CAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTATATAA
ACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATTAAAATTTTCATGTCCCATTTGA
ATCTATCAAAGTTATCCTC
AT

QA 2 620 2 620
DS 

RD RR4FW57TF 622 0 0
G
GGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGT
AGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACGTTTCC
TGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGGTGGGTCTAATGGAAGAAGATC
AGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAA
TGCTAGCGGCTTCGATGAATACCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAACGATAA
GAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCCAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTCGGAAG
CTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCC
ATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGTGGTTC
CAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTATATAA
ACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATTAAAATTTTCATGTCCCATTTGA
ATCTATCAAAGTTATCCTC
AT

QA 2 620 2 620
DS 

RD RR4GO17JQ 623 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAGTTC
GGAAGCTGCAAGTTACCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTCATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTA
TATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCGTGTCCCA
TTTGAATCTATCAAAGTTATCC
C

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4GO17TF 623 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAGTTC
GGAAGCTGCAAGTTACCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTCATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTA
TATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCGTGTCCCA
TTTGAATCTATCAAAGTTATCC
C

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4FX81TF 639 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTC*AGTTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTCATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATTCATTCTTA
TATAAACCCACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATCCATCAAAATTTTCATGTCCCA
TTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCTCATTAGGGATTATG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 8

CO CL320Contig1 1122 8 22 U
GGATCCAGAAAGGTATTGACAGCGAAAGCAATAGCCCGAGAAGATGATGACGACGAGCTT
CTCTTCTCCTCCTCCTCTTCATCTTCCTCCTCCTCCATCAACGTACAGATCCCTACTCCT
ATTCCCTTCATCTCATCTAAAATCCACCCCTCGTCTACTCTTACATGGTCGCTCTACTCT
CTCCTGTTCAGCCGCCAGCAACAACGGACCTCCTCCCGCCGGCGACTCTGTTCCAAATAA
CTTCTGTATAATCGAGGGATCAGAGACGGTTCAAGACTTTGTGCAGATGCAGCTTCAGGA
GATTCAAGACAACATAAGGAGCAGACGCAACAAGATCTTTCTCCTCATGGAGGAAGTCAG
GAGGTTACGCGTTCAGCAGCGTATCAAGAGTGTTAAATCCATCAGCGTGGAGGAGACTCT
GCTCGAGGCAACCGAGATGCCTGAGATCCCTTCTTCCATTCCTTTTCTCCCCAACGTGAC
ACCAAAGACTCTGAAACAACTCTACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTT
CTTTGGTGGTCTCATTGCACCTAAGCTGGAGCTGAAGGTAGGATTAGGAGGGACCTCGTA
CGAGGATTTCATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTTGCAATTAAGCCAAGTAGATCCCATTGT
GGCATCATTTTCTGGGGGAGCCGTTGGTGTCATTTCGACATTGATGTTAATTGAAGTGAA
CAATGTTAAACAACAAGAGAAGAAGAGGTGCAAGTACTGCCTTGGGACTGGATACTTGCC
ATGCGCTAAATGTTCTGCAAGTGGTGTGTGCTTAAGCGTTGATCCAATAAAACGAACAAG
AGCTTCAAGCAGGCTTCTGCAAGCTCCGACAACAGAAAGGTGTCTAAATTGTTCCGGCGC
AGGAAAGGTGATGTGTCCGACTTGTCTATGTACTGGGATGGTCACAGCTAGTGAGCACGA
CCCACGATTTGACCCTTTCGACTAGAAAAGCGATGGCATTTAGCCTTTCAAATTAA*GGG
TTTTTGTATGTACATTTGTTCTTCAAAACCCTAAGCCAAGAGACTCTGTACTGAGGAAAG
CCATATAAATGTTTACATAATCAAGAAAAGTAGATTTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 50 10 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4GW12TF U 79
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AF RR4A654TF U 101
AF RR4AC10TF U 262
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BS 790 837 RR4A654TF
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BS 894 901 RR4AC10TF
BS 902 902 RR4GW12JQ
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BS 1018 1087 RR4AC10TF
BS 1088 1122 RR4GW12JQ

RD RR4GW12TF 522 0 0
GG
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AATCCACCCCTCGTCTACTCTTACATGGTCGCTCTACTCTCTCCTGTTCAGCCGCCAGCA
ACAACGGACCTCCTCCCGCCGGCGACTCTGTTCCAAATAACTTCTGTATAATCGAGGGAT
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GTATCAAGAGTGTTAAATCCATCAGCGTGGAGGAGACTCTGCTCGAGGCAACCGAGATGC
CTGAGATCCCTTCTTCCATTCCTTTTCTCCCCAACGTGACACCAAAGACTCTGAAACAAC
TCTACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTTCTTTGGTGGTCTCATTGCAC
CTAAGCTGGAGCTGAAGGTAGGATTAGGAGGGACCTCGTA

QA 3 522 3 522
DS 

RD RR4H566TF 797 0 0
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CTCTTCTCCTCCTCCTCTTCATCTTCCTCCTCCTCCATCAACGTACAGATCCCTACTCCT
ATTCCCTTCATCTCATCTAAAATCCACCTCTCGTCTACTCTTACATGGTCGCTCTACTCT
CTCCTGTTCAGCCGCCAGCAACAACGGACCTCCTCCCGCCGGCGACTCTGTTCCAAATAA
CTTCTGTATAATCGAGGGATCAGAGACGGTTCAAGACTTTGTGCAGATGCAGCTTCAGGA
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GAGGTTACGCGTTCAGCAGCGTATCAAGAGTGTTAAATCCATCAGCGTGGAGGAGACTCT
GCTCGAGGCAACCGAGATGCCTGAGATCCCTTCTTCCATTCCTTTTCTCCCCAACGTGAC
ACCAAAGACTCTGAAACAATTCTACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTT
CTTTGGTGGTCTCATTGCACCTAAGCTGGAGCTGAAGGTAGGATTAGGAGGGACCTCGTA
CGAGGATTTCATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTTGCAATTAAGCCAAGTAGATCCCATTGT
GGCATCATTTTCTGGGGGAGCCGTTGGTGTCATTTCGACATTGATGTTAATTGAAGTGAA
CAATGTTAAACA*CAAGAGAAGA*GAG*TGCAAGTACTGCCTTGGGACTGGATACTTGCC
ATGCGCTAA
TGTTCTGC

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DS 

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GCATCTAGATCCAC
ACTCCTATTCCCTTCATCTCATCTAAAATCCACCCCTCGTCTACTCTTACATGGTCGCTC
TACTCTCTCATGTTCAGCCGCCAGCAACAACGGACCTCCTCCCGCCGGCGACTCTGTTCC
AAATAACTTCTGTATCATCGAGGGATCAGAGACGGTTCAAGACTTTGTGCAGATGCAGCT
TCAGGAGATTCAAGACAACATAAGGAGCAGACGCAACAAGATCTTTCTCCTCATGGAGGA
AGTCAGGAGGTTACGCGTTCAGCAGCGTATCAAGAGTGTTAAATCCATCAGCGTGGAGGA
GACTCTGCTCGAGGCAACCGAGATGCCTGAGATCCCTTCTTCCATTCCTTTCCTCCCCAA
CGTGACACCAAAGACTCTGAAACAACTCTACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCTCTGGTAT
CATCTTCTTTGGTGGTCTCATTGCACCTAAGCTGGAGCTGAAGGTAGGATTAGGAGGGAC
CTCGTACGAGGATTTCATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTTGCAATTAAGCCAAGTAGATCC
CATTGTGGCATCATTTTCTGGGGGAGCCGTTGGTGTCATTTCGACATTGATGTTAATTGA
AGTGAACAATGTTAAACAACAAGAGAAGAAGAGGTGCAAGTACTGCCTTGGGACTGGATA
CTTGCCATGCGCTAAATGTTCTGCAAGTGGTGTGTGCTTAAGCGTTGATCCAATAAAACG
AACTAGAGCTTCAAGCAGGCTTCTCCAAGCTCCGACAACAGAAAGGTGTCTAAATTGTT

QA 15 793 15 793
DS 

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G
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AGACGCAACAAGATCTTTCTCCTCATGGAGGAAGTCAGGAGGTTACGCGTTCAGCAGCGT
ATCAAGAGTGTTAAATCCGTCAGCGTGGAGGAGACTCTGCTCGAGGCAACAGAGATGCCT
GAGATCCCTTCTTCTATTCCTTTTCTCCCCAACGTGACACCAAAGACTTTGAAACAACTC
TACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTTCTTTGGTGGTCTCATTGCACCT
AAGCTGGAACTCAAGGTAGGATTAGGAGGAACCTCGTACGAGGATTTTATAAGGAGCTTG
CATCTCCCCTTGCAATTAAGCCAAGTAGATCCCATTGTGGCATCATTTTCTGGGGGAGCC
GTTGGTGTCATTTCGACATTGATGTTAATTGAAGTTAACAATGTTAAACAACAAGAGAAG
AAGAGGTGCAAGTACTGCCCTGGGACTGGATACTTGCCATGCGCTAAATGTTCTGCAAGT
GGTGTGTGCTTAAGCGTTGATCCAATAAAACGGACAAGAGCTTCAAGCAGGCTTCTGCAA
GCTCCGACAACAGAAAGGTGTCTAAATTGTTCCGGCGCACGAAAGGTGATGTGTCCGACT
TGTCTATGTACTGGGATGGTCACAGCTAGTGAGCACGACCCACGATTTGACCCTTTCGAC
TAGAAAAGCGATGGCATTTAGCCTTTCAAATTAAAGGGTTTTTGTATGTACATTTGTTCT
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DS 

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TGGAGGAGACTCTGCTCGAGGCAACCGAGATGCCTGAGATCCCTTCTTCCATTCCTTTTC
TCCCCAACGTGACACCAAAGACTCTGAAACAACTCTACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCT
CTGGAATCATTTTCTTTGGTGGTCTCATTGCACCTAAGCTGGAGCTGAAGGTAGGATTAG
GAGGGACCTCGTACGAGGATTTCATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTTGCAATTAAGCCAAG
TAGATCCCATTGTGGCATCATTTTCTGGGGGAGCCGTTGGTGTCATTTCGACATTGATGT
TAATTGAAGTGAACAATGTTAAACAACAAGAGAAGAAGAGGTGCAAGTACTGCCTTGGGA
CTGGATACTTGCCATGCGTTAAATGTTCTGCAAGTGGTGTGTGCTTAAGCGTTGATCCAA
TAAAACGAACCAGAGCTTCAAGCAGGCTTCTGCAAGCTCCGACAACAGAAAGGTGTCTAA
ATTGTTCCGGCGCAGGAAAGGTGATGTGTCCGACTTGTCTATGTACTGGGATGGTCACAG
CTAGTGAGCACGACCCACGATTTGACCCTTTCGACTAGAAAAGCGATGGCATTTAGCCTT
TCAAATTAA*GGGTTTTTGTATGTACATTTGTTCTTCAAAACCCTAAGCCAAGAGACTCT
GTACTGAGGAAAGCCATATAAATGTTTACATAATCAAGAAAAGTAGATTTATACC

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DS 

RD RR4H566JQB 643 0 0
CCATTCCTTTTCTCCCCAACGTGACACCAAAGACTCTGAAACAATTCTACTTGACCAGCG
TTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTTCTTTGGTGGTCTCATTGCACCTAAGCTGGAGCTGA
AGGTAGGATTAGGAGGGACCTCGTACGAGGATTTCATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTTGC
AATTAAGCCAAGTAGATCCCATTGTGGCATCATTTTTTGGGGGAGCCGTTGGTGTCATTT
CGACATTGATGTTAATTGAAGTGAACAATGTTAAACAACAAGAGAAGAAGAGGTGCAAGT
ACTGCCTTGGGACTGGATACTTGCCATGCGCTAAATGTTTTGCAAGTGGTGTGTGCTTAA
GCGTTGATCCAATAAAACGAACTAGAGCTTCAAGCAGGCTTTTGCAAGCTCCGACAACAG
AAAGGTGTTTAAATTGTTCCGGCGCAGGAAAGGTGATGTGTCCGACTTGTTTATGTACTG
GGATGGTCACAGCTAGTGAGCACGACCCACGATTTGACCCTTTCGACTAGAAAAGCGATG
GCATTTAGCCTTTCAAATTAA*GGGTTTTTGTATGTACATTTGTTTTTCAAAACCCTAAG
CCAAGAGACTCTGTACTGAGGAAAGCCATATAAATGTTTACAT

QA 1 643 1 643
DS 

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GCGTTCAGCAGCGTATCAAGAGTGTTAAATCCATCAGCGTGGAGGAGACTCTGCTCGAGG
CAACAGAGATGCCTGAGATCCCTTCTTCTATCCCTTTTCTCCCCAACGTGACACCAAAGA
CTTTGAAACAACTCTACTTGACCAGCGTTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTTCTTTGGTG
GTCTCATTGCACCTAAGCTGGAACTCAAGGTAGGATTAGGAGGAACCTCGTACGAGGATT
TTATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTTGCAATTAAGCCAAGTAGGTCCCATTGTGGCATCAT
TTTCTGGGGGAGCCGTTGGTGTCATTTCGACATTGATGTTAATTGAAGTTAACAATGTTA
AACAACAAGAGAAGAAGAGGTGCAAGTACTGCCTTGGGACTGGATACTTGCCATGCGCTA
AATGTTCTGCAAGTGGTGTGTGCTTAAGCGTTGATCCAATAAAACGGACAAGAGCTTCAA
GCAGGCTTCTGCAAGCTCCGACAACAGAAAGGTGTCTAAATTGTTCCGGCGCAGGAAAGG
TGATGTGTCCGACTTGTCTATGTACTGGGATGGTCACAGCTAGTGAGCACGACCCACGAT
TTGACCCTTTCGACTAGAAAAGCGATGGCATTTAGCCTTTCAAATTAA*GGGTTTTTGTA
TGTACATTTGTTCTTCAAAACCCTAAGCCAAGAGACTCTGTACTGAGGAAAGCCATATAA
ATGTTTACATAATCAAGAAAAGTAGATTT

QA 1 749 1 749
DS 

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TTCTATTCCTTTTCTCCCCAACGTGACACCAAAGACTTTGAAACAACTCTACTTGACCAG
CGTTGCTTTGATCTCTGGAATCATTTTCTTTGGTGGTCTCATTGCACCTAAGCTGGAACT
CAAGGTAGGATTAGGAGGAACCTCGTACGAGGATTTTATAAGGAGCTTGCATCTCCCCTT
GCAATTAAGCCAAGTAGATCCCATTGTGGCATCATTTTCTGGGGGAGCCGTTGGTGTCAT
TTCGACATTGATGTTAATTGAAGTTAACAATGTTAAACAACAAGAGAAGAAGAGGTGCAA
GTACTGCCCTGGGACTGGATACTTGCCATGCGCTAAATGTTTTGCAAGTGGTGTGTGCTT
AAGCGTTGATCCAATAAAACGGACAAGAGCTTCAAGCAGGCTTTTGCAAGCTCCGACAAC
AGAAAGGTGTTTAAATTGTTCCGGCGCAGGAAAGGTGATGTGTCCGACTTGTCTATGTAC
TGGGATGGTCACAGCTAGTGAGCACGACCCACGATTTGACCCTTTCGACTAGAAAAGCGA
TGGCATTTAGCCTTTCAAATTAA*GGGTTTTTGTATGTACATTTGTTCTTCAAAACCCTA
AGCCAAGAGACTCTGTACTGAGGAAAGCCATATAAATGTTTACATAATC
G

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 11

CO CL321Contig1 1032 11 13 U
GGATTGCTCTCTTTATTATCTCTATTTCTTCTAATCAACCACACTGTCTCTCTATTTTCT
TTAGACGGGAAAAAAATGGTTGAGCAGAAAAAGTTCGCACTGTTTCTAGCCACTCCTGAT
TCAGAGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGT
GACGAAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAA
GATCTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAAT
GATCCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAA
ATTCTTGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGA
AGAGCAAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATT
AAACCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACAT
CAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTAC
GAGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTAT
AACAGAGAGATTCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAA
GATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTG
GAGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTC
CCAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTATATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGT
ATTCGTATTCAATATATAACCTATTATTCTCATCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATAT
TTATCTCAAGGTCATATTTATGTGTTGTACTCATAAGTAAAATAATTCAATAAAAAATAT
AGTTTGCATATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4F136TF U 2
AF RR4CZ72TF U 4
AF RR4AO29TF U 31
AF RR4AY71TF U 1
AF RR4AO29JQ C 120
AF RR4AP15TF U 447
AF RR4AQ52TF U 447
AF RR4CZ72JQ C 333
AF RR4AY71JQ C 147
AF RR4AP38TF U 447
AF RR4AQ16TF U 447
BS 1 87 RR4AY71TF
BS 88 88 RR4F136TF
BS 89 153 RR4AY71TF
BS 154 154 RR4F136TF
BS 155 372 RR4AY71TF
BS 373 373 RR4F136TF
BS 374 458 RR4AY71TF
BS 459 459 RR4F136TF
BS 460 783 RR4AY71TF
BS 784 784 RR4AP15TF
BS 785 794 RR4AY71TF
BS 795 1011 RR4AP15TF
BS 1012 1032 RR4AP38TF

RD RR4F136TF 657 0 0
GATT
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CGGGAAAAAAATGGTTGAGCAGAAAAAGTTCGCACTGTTTCTAGCCACTCCTGATTCAGA
GTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCGCGTTCGGTGACGA
AGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGATCT
TGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGATCC
TTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATTCT
TGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGAGC
AAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACGGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATTAAACC
GGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGA
CGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAGGT
GGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGT

QA 5 657 5 657
DS 

RD RR4CZ72TF 697 0 0
GG
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CGGGAAAAAAATGGTTGAGCAGAAAAAGTTCGCACTGTTTCTAGCCACTCCTGATTCAGA
GTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGTGACGA
AGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGATCT
TGAAAAGTACGGCGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGATCC
TTGGATCCTTAAGCTACGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATTCT
TGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGAGC
AAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATTAAACC
GGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACTATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGA
CGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAGGT
GGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTATAACAG
AGAGATTCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTG

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DS 

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GG
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GTTCGCACTGTTTCTAGCCACTCCTGATTCAGAGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATA
CCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGTGACGAAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGT
CGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGATCTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAG
TGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGATCCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGT
CAAGAAACTTGATGAGACGAAGAAGAAAATTCTTGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAAT
AGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGAGCAAGGAAGGGACCAGAATTTAAGCTTAC
AGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATTAAACCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCC
GGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGC
TAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTT
ATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTATAACAGAGAGATTCTCCACGAGGTCGTTGATCG
TGTTCTCGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATTTTGCGGATGCGGC

QA 3 707 3 707
DS 

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TTAGACGGGAAAAAAATGGTTGAGCAGGAAAAGTTCGCACTGTTTCTAGCCACTCCTGAT
TCAGAGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACTACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGT
GACGAAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAA
GATCTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAAT
GATCCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAA
ATTCTTGGCATCCGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGA
AGAGCAAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATCACCCTCGTGAAGGATGCAATT
AAACCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACAT
CAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTAC
GAGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTAT
AACAGAGAGATTCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAA
GATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTG
GAGCCGATTTGCAA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4AO29JQ 812 0 0
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TGACGAAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAA
AGATCTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAA
TGATCCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGACGAAGAAGAA
AATTCTTGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGG
AAGAGCAAGGAAGGGACCAGAATTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAAT
TAAACCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACA
TCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTA
CGAGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTA
TAACAGAGAGATTCTCCACGAGGTCGTTGATCGTGTTCTCGGTCTTGGCTTCATCAAGCA
AGATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTT
GGAGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACT
CCCAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTATATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTG
TATTCGTATTCAATATATAACCTATTATTC
CC

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DS 

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DS 

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TGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTC
GATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGAGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAA
AGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCCAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTA
TATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTATTCGTATTCAATATATAACCTATTA
TTCTCATCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTATCTCAAGGTCATATTTATGTGTT
GTACTCATAAGTAAAATAATTCAAT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4CZ72JQ 662 0 0
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AGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATTAAACCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCC
GGATACTATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGC
TAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTT
ATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTATAACAGAGAGATTCTCCACGAGATCGTTGATCG
TGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATTTTGCTGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGA
GAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGAGACGATTTGCAAGATTTTCCTCAAAGGCAG
AGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCCAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTATATTGG
AGCACTTATGGATTTATTACCTTGTGGTATTCGTATTCAATATATAACCTATTATTTTCT
TCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTATCTCAAGGTCATATTTATGTGTTGTACTC
A
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4AY71JQ 886 0 0
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TAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGATCTTGAAAAGTACGACGGTTTCGT
TATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGATCCTTGGATCCTTAAGCTATGTGA
GATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATTCTTGGCATCCGCTTTGGCCACCA
GATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGAGCAAGGAAGGGACCAGAACTTAA
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GATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGA
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TGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTC
GATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGAGCCGATTTGCAAGAATTTCCTCAA
AGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCCAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTA
TATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTATTCGTATTCAATATATAACCTATTA
TTCTCTTCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTATCTCAAGGTCATATTTATGTGTT
GTACTCATAAGTAAAATAATTCAATAAAAAATATAGTTTGCATA
CC

QA 1 884 1 884
DS 

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GATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGA
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TTCTCATCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTATCTCAAGGTCATATTTATGTGTT
GTACTCATAAGTAAAATAATTCAATAAAAAATATAGTTTGCATATC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4AQ16TF 586 0 0
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GATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGA
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TCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCTGAGTATAACAGAGAGATTCTCCACGAGATCGT
TGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTC
GATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGAGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAA
AGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCCAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTA
TATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTATTCGTATTCAATATATAACCTATTA
TTCTCATCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTATCTCAAGGTCATATTTATGTGTT
GTACTCATAAGTAAAATAATTCAATAAAAAATATAGTTTGCATA
TC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 11

CO CL322Contig1 636 11 18 U
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACTACAAAAACTATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAAGCAGACCCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAACTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCAGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC


BQ
10 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 

AF RR4C465JQ C 1
AF RR4C465TF U 115
AF RR4FL56JQ C 343
AF RR4C411JQ C 2
AF RR4C411TF U 2
AF RR4FL56TF U 2
AF RR4CO11JQ C 1
AF RR4CV07TF U 49
AF RR4H077JQ C 2
AF RR4H077TF U 2
AF RR4CO11TF U 1
BS 1 1 RR4C465JQ
BS 2 3 RR4H077TF
BS 4 33 RR4C411TF
BS 34 38 RR4FL56TF
BS 39 63 RR4C411TF
BS 64 65 RR4FL56TF
BS 66 114 RR4C411TF
BS 115 216 RR4C465TF
BS 217 217 RR4C411TF
BS 218 310 RR4C465TF
BS 311 311 RR4C411TF
BS 312 520 RR4C465TF
BS 521 564 RR4C411TF
BS 565 565 RR4CV07TF
BS 566 576 RR4C411TF
BS 577 633 RR4CV07TF
BS 634 635 RR4H077TF
BS 636 636 RR4CO11JQ

RD RR4C465JQ 521 0 0
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TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTG
C

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4C465TF 407 0 0
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GCAGTTGCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTC
ACCGTTTGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTG
C

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR4FL56JQ 219 0 0
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AAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTTAATT

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DS 

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GG
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TTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTG
CTACTACATGATTTAATTAATCGGCTTTGGTTG
GC

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DS 

RD RR4C411TF 577 0 0
GG
ATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAA*****ATAATTTTTTACACTCCACAGCCTA
**CCCAACCCTAAACTACAAAAACTATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCC
AAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAGTA
GCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAAGCAGACCCAGACGGAGACCACTGAA
ACAACTCCTGAGGAAACTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCTCCT
ACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTTGCA
GCAGCAACTGAGAAAGTTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGACAGTTGCG
GTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGA
TTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTG
CTACTACATGATTTAATTAATCGGCTTTGGTTG
GC

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR4FL56TF 560 0 0
GG
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AACCCAACCCTAAACTACAAAAACTATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCC
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GCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAAGCAGACCCAGACGGAGACCACCGAA
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ACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTTGCA
GCAGCAACTGAGAAAGTTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCAGTTGCG
GTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTCGTCACCGTTTGA
TTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTG
CTACTACATGATTTAATT

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DS 

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G
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CTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTTG
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CGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTT
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TGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCTT
CTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR4CV07TF 585 0 0
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TCTGAAGACGTAGTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAAGCAGACCCAG
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AAGGAAACAGCTCCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCT
GCTGGTGAGGTTGCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGGGAACGTCGTGACTGCAACAGAAAAC
GTTGAGGCAGTTGCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTT
GTTGTCACCGTTTGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCA
CCTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGT
CATAATGATTCTTCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGC

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DS 

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CTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATTTTCTGCTGGTGAGGTTG
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TGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCTT
CTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4H077TF 634 0 0
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TAAACCCAACCCTAAACTACAAAAACTATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGAC
CCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAG
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AAACAACTCCTGAGGAAACTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCTC
CTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTTG
CAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGAACGTCGTGGTTGCAACAGAAAACGTTGAGGCAGTTG
CGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGA*GGAAGAGAAAGAAGTTGTAGTCACCGTTT
GATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATT
TGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCTT
CTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4CO11TF 636 0 0
G
GAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTTACACTCCACAGCC
TAAACCCAACCCTAAACTACAAAAACTATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGAC
CCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAG
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AAACAACTCCTGAGGAAACTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCTC
CTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTTG
CAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCAGTTG
CGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTT
GATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATT
TGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCTT
CTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTT
C

QA 2 635 2 635
DS 



AS 2 11

CO CL323Contig1 601 9 7 U
GGATCGTAGAGTGAAACAAGCTGCATCCTCCATTTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTCTT
CGCATTTCCGGAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCCAGC
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CATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAAC
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GCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAATATGTTGC
TGTGATGTTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTTATGTTT
CTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCTATGCTTTATTT
TAGTTTTAATCAATCTCAGGCTGCTTCACTTTTGTCTGGTTTCTTGTTCATTGTATTGCA
TGTTGGTTTTGTCATGCGATTGAATAAATAGCCATTGATAAAAGTGAAAAGAAGTTTATT
T


BQ
45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4GR68TF U -1
AF RR4F504JQ C 1
AF RR4F504TF U 1
AF RR4B019TF U 1
AF RR4FE93JQ C 1
AF RR4FE93TF U 1
AF RR4GR68JQ C 317
AF RR4EK39TF U 1
AF RR4A871TF U 1
BS 1 58 RR4A871TF
BS 59 59 RR4F504TF
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BS 411 601 RR4A871TF

RD RR4GR68TF 131 0 0
GGGC
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AGCTGGA

QA 5 131 5 131
DS 

RD RR4F504JQ 437 0 0
GGATCGTAGAGTGAAACAAGCTGCATCCTCCATTTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTCTT
CGCATTTCCGGAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCCAGC
TGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCCTACTCTTTCTT
CATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAAC
AGTTGTAGTATGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTACCAGCCCACCGGTGGTAAAGCAAG
GCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAAAATGTTGC
TGTGATGTTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTTATGTTT
CTTATGAAAAGATTT
CG

QA 1 435 1 435
DS 

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CTTATGAAAAGATTT
CG

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CTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCT

QA 1 469 1 469
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TT
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TTTTTTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTTTTATGTTTTTTATGAAAAGATTTTGA
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QA 3 171 3 171
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TAGTTTT
AAT

QA 1 487 1 487
DS 

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CATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAAC
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TGTGATGTTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTCTCTTATGTTT
CTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCTATGCTTTATTT
TAGTTTTAATCAATCTCAGGCTGCTTCACTTTTGTCTGGTTTCTTGTTCATTGTATTGCA
TGTTGGTTTTGTCATGCGATTGAATAAATAGCCATTGATAAAAGTGAAAAGAAGTTTATT
T

QA 1 601 1 601
DS 



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ATGATTAAATAAACCAAGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAAAGCGAA
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TTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTT
CTTTACGGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTG
CATTTTTATCCGATCTGGGAAGCTGCATCCTCCATTTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTC
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TTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAA
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GCTGTGATGTTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTTATGT
TTCTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTGATCCTTTGCTTTAGTTT
AAATCAATCTCAGGCTGCTTCACTTGTCTGGTTTCTTGTTCGTTGTATTATTGCATGTTG
GTTTTGTCATACGATTGAATAAATAGCCATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF33TF U 1
AF RR4EF33JQ C 297
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BS 657 934 RR4EF33JQ

RD RR4EF33TF 656 0 0
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QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4EF33JQ 638 0 0
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TTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTC
TCAAACAGTTGTAGTATGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAA
AGCAAGGCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAAAA
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ATGTTTCTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTGATCCTTTGCTTTA
GTTTAAATCAATCTCAGGCTGCTTCACTTGTCTGGTTTCTTGTTCGTTGTATTATTGCAT
GTTGGTTTTGTCATACGATTGAATAAATAGCCATTGAT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 8

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TCTTCTCCATCGAAGCTTTTTGGCTTTGAATTGGATTTGGGGTTTCAAAGCCACCTCCTT
TTTCTTCTTATCATCATCCCTGTGGAGAAATCAAGAGAGATATGCAGGACCAGCTAGTGT
GTCATGGCTGTAGAAATACATTGATGTATCCTAGAGGAGCTACGAACGTCCGTTGTGCGT
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CTAGTGTAAGATGCTCTTGCTGTCAGACTGTCAACCTTGTCCCAGGACCCCCACCGTCTA
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CATCATCTGTTAAATGCGCTATTTGCCAGTTTGTTACTAACGTTAACATGAGCAATGGAA
GGGTGCCATTAGCAAGCAACCGGCCAAATGGAACAGCCTCTCCCGGGACTATGCCTTCTA
CATCCACTCAGTCAACACCACCGTCTCAGACACAAACTGTTGTAGTAGAGAACCCAATGT
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AAAGTTGATGAACACAAAAGGTTTTTGGTTCAGTAATCTGGCATTCCTGTTTGTAAACTC
CATTGACCATTTTGTGGCATTGTTAAATGTATGTATTAATATAAATCTGATACACCAATG
AAACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B410TF U 1
AF RR4A313TFB U 24
AF RR4A313TF U 82
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BS 578 660 RR4B410TF
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BS 720 779 RR4A313TF
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TTTCTTCTTATCATCATCCCTGTGGAGAAATCAAGAGAGATATGCAGGACCAGCTAGTGT
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CATCCACTCAGTCAACACCACCGTCTCAGACACAAACTGTTGTAGTAGAGAACCCAATGT
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G
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GTGGTTGTCGAGCAATGCTCATGTATACCCGTGGGGCTACTAGTGTAAGATGCTCTTGCT
GTCAGACTGTCAACCTTGTCCCAGGACCCCCACCGTCTAATCAGGTTGCTCATATCAACT
GTGGGAACTGTCGGACGACACTCATGTACCCTTACGGTGCATCATCTGTTAAATGCGCTA
TTTGCCAGTTTGTTACTAACGTTAACATGAGCAATGGAAGGGTGCCATTAGCAAGCAACC
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CGTC

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TCATGGCTGTAGAAATACATTGATGTATCCTAGAGGAGCTACGAACGTCCGTTGTGCGTT
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CGTTAATGAAAGTGGAAAGTTGGTGAGCAACGTTGTGGTTGGAGTGACAACAGGCCAAAA
ATAACTTTTTAAGAATGATTGATCTAAAAGATCAATTCCGATTTCGTCTATATCCCTGCG
TCTGGTTTGTGCATATTTTACATACTGTTAATGAACAATTTTTTTTTTTGTTAAAAGAAA
AAGTTGATGAACACAAAAGGTTTTTGGTTCAGTAATCTGGCATTCCTGTTTGTAAACTCC
ATTGACCATTTTGTGGCATTGTTAAATGTATGTATTAATATAAATCTGATACACCAATGA
AACATT

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CTAGAGGAGCTACGAACGTCCGTTGTGCGTTATGTCACATTGTCAACATGGTTCCTCTTC
ATCCTCCTCCTCCTCATCACCATGGGATGGACATGGCTCACATTGTGTGTGGTGGTTGTC
GAGCAATGCTCATGTATACCCGTGGGGCTACTAGTGTAAGATGCTCTTGCTGTCAGACTG
TCAACCTTGTCCCAGGACCCCCACCGTCTAATCAGGTTGCTCATATCAACTGTGGGAACT
GTCGGACGACACTCATGTACCCTTACGGTGCATCATTTGTTAAATGCGCTATTTGCCAGT
TTGTTACTAACGTTAACATGAGCAATGGAAGGGTGCCATTAGCAAGCAACCGGCCAAATG
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ACGTTGTGGTTGGAGTGACAACAGGCCAAAAATAACTTTTTAAGAATGATTGATTTAAAA
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AATGAACAATTTTTTTTTTTGTTAAAAGAAAAAGTTGATGAACACAAAAGGTTTTTGGTT
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ATGTATTAATATAAATTTGATACACCAATGAAACATT

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DS 



CO CL324Contig2 970 3 2 U
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AAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGATTCTGAAAAGCCTTTTTTTCTTGGGGGTTAAAAAAA
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CGTTAGTAACGAACTGGCAAACAGCACATCTAACAGATGGTGCACCGTAAGGATACATGA
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ACATAAGCATTGTACGACAACCACCACATACAATGTGAGCCATGTCCATCCCTAAATGAG
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AGGCACAGCGAACGTTGGTAGCTCCTCTAGGATAAACCAATGTATTTCTACAGCCATGAC
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CAAAAAATCCAATTCAAAGCCCAAAGCTTCGATTGGAGATGGAAGAGGGATCTCGATTGC
AAAACCCCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F009JQ U 1
AF RR4EE16JQ U 1
AF RR4F009TF C 292
BS 1 732 RR4EE16JQ
BS 733 970 RR4F009TF

RD RR4F009JQ 353 0 0
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QA 1 353 1 353
DS 

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AAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGATTCTGAAAAGCCTTTTTTTCTTGGGGGTTAAAAAAA
AAGGAGTCAAGGATATAACATAAAACAGTCACTTTTCCGCGTATGTAATATGCACAAACC
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CATGATGATGAG
AGGAGG

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DS 

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CTACGACGACGGTTTGGGTCTGAGACGGTGGTGTTGACTGAGTGGATGTAGAGGGCATTG
AACCAGGAGAGGCTGCTGTTCCATTTGGCAGGTTAGTTGGGAAAGGCACCCTTCCATTGC
CCATATTAACGTTAGTAACGAACTGGCAAACAGCACATCTAACAGATGGTGCACCGTAAG
GATACATGAGGGTTGTTCGACAGTTCCCACAGCTGATATGCGCAGGCTGATTGGCGGGTG
TGGTTGTTGCTGGGACAAGGTTCGCAGTCTGACAGCAAGAGCATCTTACACTATTGGCCC
CACGAGTATACATAAGCATTGTACGACAACCACCACATACAATGTGAGCCATGTCCATCC
CTAAATGAGCATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAGGATGAAGAGGGACCATGTTGATAG
TGTTACATAAGGCACAGCGAACGTTGGTAGCTCCTCTAGGATAAACCAATGTATTTCTAC
AGCCATGACATACCAGCTGGTCCTGCATCTCTGATTTTTCACAAAGGAGCTGGATTTGAA
ACCGAAACCCAAAAAATCCAATTCAAAGCCCAAAGCTTCGATTGGAGATGGAAGAGGGAT
CTCGATTGCAAAACCCCCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 7

CO CL325Contig1 848 7 12 U
TTGGAAACAAAATTATGTGTACTGCTAACTACACAGTATACAATCAAACCATCTTTGCCA
AGTGATAAACATTCCCCC*AAGTATACATTTCAACTACAACTCTCATTGTTTCCAAACTC
TAGAAACTTGTCC*AAATATCTTATCTTTAGTTTTCATTGAAGTGAATGCCACCAAGTTT
CCAGACAACATAAGTGGTAGCAAACATCACAGTGCTTATGAACACAAACGAAAAAGCAAT
CACAAGTATATCTGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAGCCCTTTCTTCGGCATACCTCT
CTTGCTATCATCGAGCATGTTGGTCGGTGCTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGATTT
CTTGTCACTCTCCTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCCCATTTTGGGTTTCGACGGTTT
CGGCGTCGCTTCCGTGTATCGGCTGAGCACACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCTGT
CAACGGCGCTCTTTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTTGGTTCAACGGGTTTGCT
TGAAGAATCCGAAGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGTTGTTGCGATGGAATCTTCGTT
TGACTTCAGACAAGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGAAAGTAACGGACTTGGAGATGT
GTGGAGCGTTAAAGGTGAAGGCTTTAACGTTGTGAATTGAGTTGAGAATCTTACAACGGG
GTGGGATCTGTTATGAAGCGGAGAAGTGAAACCAGCGTTGACAGCGACGGCCATTTTGAA
TAGGGATGAACGTATCTATTAAGAGCGATGCATATGGAAGAAGACGAAGAGGGAAACCGC
TTTGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 

AF RR4DN84JQ U 17
AF RR4DN84TF C 1
AF RR4G632JQ U 40
AF RR4G581TF C 73
AF RR4A165JQ U 57
AF RR4A165TFB C 57
AF RR4A165JQD U 57
BS 1 16 RR4DN84TF
BS 17 307 RR4DN84JQ
BS 308 308 RR4G632JQ
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BS 363 494 RR4DN84JQ
BS 495 724 RR4G632JQ
BS 725 725 RR4A165JQ
BS 726 821 RR4G632JQ
BS 822 848 RR4A165JQ

RD RR4DN84JQ 478 0 0
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ATGTTGGTCGGTACTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGATTTCCTGTCACTCTCCTTG
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TATCGGCTGAGCACACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCTGTCAACGGCGCTCTTT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4DN84TF 696 0 0
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TAGAAACTTGTCC*AAATATCTTATCTTTAGTTTTCATTGAAGTGAATGCCACCAAGTTT
CCAGACAACATAAGTGGTAGCAAACATCACAGTGCTTATGAACACAAACGAAAAAGCAAT
CACAAGTATATCTGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAGCCCTTTCTTCGGCATACCTCT
CTTGCTAACATCGAGCATGTTGGTCGGTACTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGATTT
CCTGTCACTCTCCTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCCCATTTTGGGTTTCGACGGTTT
CGGCGTCGCTTCCGTGTATCGGCTGAGCACACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCTGT
CAACGGCGCTCTTTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTG***CTTGGTTCAACGGGTTTGCT
TGAAGAATCCGAAGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGTTGTTGCGATGGAATCTTCGTT
TGACTTCAGACAAGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGAAAGTAACGGACTTGGAGATGT
GTGGAGCGTTAAAGGTGAAGGCTTTAACGTTGTGA
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4G632JQ 782 0 0
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GAACACAAACGAAAAAGCAATCACAAGTATATCTGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAG
CCCTTTCTTCGGCATACCTCTCTTGCTATCATCGAGCATGTTGGTCGGTGCTTCGGGTAG
ACCCGGTTTCCTATTCGATTTCTTGTCACTCTCCTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCC
CATTTTGGGTTTCGACGGTTTCGGCGTCGCTTCCGTGTATCGGCTGAGCACACGAGCTGC
TCTTAGCCTCTCTCTTGCTGTCAACAGCGCTCTTTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTGTT
GCTTGGTTCAACGGGTTTGCTTGAAGAATCCGAAGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGT
TGTTGCGATGGAATCTTCGTTTGACTTCAGACAAGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGA
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AGTTGAGAATCTTACAACGGGGTGG*ATCTGTTATGAAGCGGAGAAGTGAAACCAGCGTT
GACAGCGACGGCCATTTTGAATAGGGATGAACGTATCTATTAAGAGCGATGCATATGGAA
GA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4G581TF 723 0 0
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C*AAATATCTTATCTTTAGTTTTCATTGAAGTGAATGCCACCAAGTTTCCAGACAACATA
AGTGGTAGCAAACATCACAGTGCTTATGAACACAAACGAAAAAGCAATCACAAGTATATC
TGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAGCCCTTTCTTCGGCATACCTCTCTTGCTATCATC
GAGCATGTTGGTCGGTGCTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGATTTCTTGTCACTCTC
CTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCCCATTTTGGGTTTCGACGGTTTCGGCGTCGCTTC
CGTGTATCGGCTGAGCA*ACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCTGTCAACGGCGCTCT
TTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTTGGTTCAACGGGTTTGCTTGAAGAATCCGA
AGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGTTGTTGCGATGGAATCTTCGTTTGACTTCAGACA
AGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGAAAGTAACGGACTTGGAGATGTGTGGAGCGTTAA
AGGTGAAGGCTTTAACGTTGTGAATTGAGTTGAGAATCTTACAACGGGGTGGGATCTGTT
ATGAAGCGGAGAAGTGAAACCAGCGTTGACAGCGACGGCCATTTTGAATAGGGATGAACG
T
CC

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4A165JQ 792 0 0
AT
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TCTAGAAACTTGTCC*AAATATCTTATCTTTAGTTTTCATTGAAGTGAATGCCACCAAGT
TTCCAGACAACATAAGTGGTAGCAAACATCACAGTGCTTATGAACACAAACGAAAAAGCA
ATCACAAGTATATCTGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAGCCCTTTCTTCGGCATACCT
CTCTTGCTATCATCGAGCATGTTGGTCGGTGCTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGAT
TTCTTGTCACTCTCCTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCCCATTTTGGGTTTCGACGGT
TTCGGCGTCGCTTCCGTGTATCGGCTGAGCACACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCT
GTCAACGGCGCTCTTTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTTGGTTCAACGGGTTTG
CTTGAAGAATCCGAAGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGTTGTTGCGATGGAATCTTCG
TTTGACTTCAGACAAGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGAAAGTAACGGACTTGGAGAT
GTGTGGAGCGTTAAAGGTGAAGGCTTTAACGTTGTGAATTGAGTTGAGAATCTTACAACG
GGGTGGGATCTGTTATGAAGCGGAGAAGTGAAACCAGCGTTGACAGCGACGGCCATTTTG
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GCTTTGTGTC

QA 3 792 3 792
DS 

RD RR4A165TFB 792 0 0
AT
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TCTAGAAACTTGTCCCAAATATCTTATCTTTAGTTTTCATTGAAGTGAATGCCACCAAGT
TTCCAGACAACATAAGTGGTAGCAAACATCACAGTGCTTATGAACACAAACGAAAAAGCA
ATCACAAGTATATCTGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAGCCCTTTCTTCGGCATACCT
CTCTTGCTATCATCGAGCATGTTGGTCGGTGCTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGAT
TTCTTGTCACTCTCCTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCCCATTTTGGGTTTCGACGGT
TTCGGCGTCGCTTCCGTGTATCGGCTGAGCACACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCT
GTCAACGGCGCTCTTTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTTGGTTCAACGGGTTTG
CTTGAAGAATCCGAAGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGTTGTTGCGATGGAATCTTCG
TTTGACTTCAGACAAGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGAAAGTAACGGACTTGGAGAT
GTGTGGAGCGTTAAAGGTGAAGGCTTTAACGTTGTGAATTGAGTTGAGAATCTTACAACG
GGGTGGGATCTGTTATGAAGCGGAGAAGTGAAACCAGCGTTGACAGCGACGGCCATTTTG
AATAGGGATGAACGTATCTATTAAGAGCGATGCATATGGAAGAAGACGAAGAGGGAAACC
GCTTTGTGT
C

QA 3 791 3 791
DS 

RD RR4A165JQD 792 0 0
AT
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TCTAGAAACTTGTCC*AAATATCTTATCTTTAGTTTTCATTGAAGTGAATGCCACCAAGT
TTCCAGACAACATAAGTGGTAGCAAACATCACAGTGCTTATGAACACAAACGAAAAAGCA
ATCACAAGTATATCTGCGCTTCCCGGTAGATCAAAGGTAAGCCCTTTCTTCGGCATACCT
CTCTTGCTATCATCGAGCATGTTGGTCGGTGCTTCGGGTAGACCCGGTTTCCTATTCGAT
TTCTTGTCACTCTCCTTGAGCACCTCCAGGATCTGGCTCCCCATTTTGGGTTTCGACGGT
TTCGGCGTCGCTTCCGTGTATCGGCTGAGCACACGAGCTGCTCTTAGCCTCTCTCTTGCT
GTCAACGGCGCTCTTTTCGCGGAACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTTGGTTCAACGGGTTTG
CTTGAAGAATCCGAAGAGGGAGGAGGGTCGTTGACCGATGTTGTTGCGATGGAATCTTCG
TTTGACTTCAGACAAGATGAAACCAATCTACTTTTGCTTGAAAGTAACGGACTTGGAGAT
GTGTGGAGCGTTAAAGGTGAAGGCTTTAACGTTGTGAATTGAGTTGAGAATCTTACAACG
GGGTGGGATCTGTTATGAAGCGGAGAAGTGAAACCAGCGTTGACAGCGACGGCCATTTTG
AATAGGGATGAACGTATCTATTAAGAGCGATGCATATGGAAGAAGACGAAGAGGGAAACC
GCTTTGTGT
C

QA 3 791 3 791
DS 



AS 2 9

CO CL326Contig1 823 7 7 U
GCAAGAACTTATGATTTATTGAAGGAAAGTACTAATTGTTGAAGAACAACATACAGAAGA
AGAATGTATGAAATAATAAAAACTCGGTTTCGTTTTGTAGAGCTAGAGAAACAGACCCCT
CAACAGTGGTGTATAAAACAAAACAAGCAAAAATGAGTCCTGCTACCGGCTTTCTACGCC
TTGTTTGCAATGTTGTTGGAGAGCCAGTCAAGTCCCTCGTAGAGTCCTTCTCCAGAGGTG
GCACATGTGCTCTGAATGTACCAGTGTCGCTGACGGAGAGAGTGAAGGCCAAGCTTGTCA
GTGATCTCAGCAGCGTTCATTGCGTTGGGAAGATCTTGCTTGTTAGCAAAAACAAGCAGA
ACTGCATCCCTCAATTCATCCTCGTTGAGCATCCTGTGAAGCTCGTCCCTGGCTTCAACA
ACACGGTCACGATCGTTGCTGTCAACAACAAAGATAAGTCCCTGCGTGTTCTGGAAGTAG
TGCCTCCACAATGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACGGTGAAGCTAATG
TTCTTGTATTCCACAGTCTCAACATTGAAACCAATGGTAGGAATGGTAGTGACGATCTCA
CCAAGTTTGAGCTTGTAGAGGATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCGAGACCAACCATGAGA
ATACGCATCTCCTTCTTGGCAAAAAGCCTGCTGAACAGCTTCCCGAATGATACCCCCATC
CTTTCTTTTTTTTTTT*AATCACAAACCGAAAAGCCAACGCCGCGCGAGATCTAAGCTCT
CTCTGTCTCTCTGATGCCAATGGCCTGCGAACGCTCTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4B414TF C 137
AF RR4B414JQ U 182
AF RR4DB32JQ U 21
AF RR4BD96JQ U 1
AF RR4CE61JQ U 82
AF RR4DB32TF C 164
AF RR4CE61TF C 184
BS 1 634 RR4BD96JQ
BS 635 635 RR4CE61JQ
BS 636 736 RR4BD96JQ
BS 737 737 RR4CE61JQ
BS 738 806 RR4BD96JQ
BS 807 819 RR4DB32TF
BS 820 823 RR4CE61TF

RD RR4B414TF 110 0 0
ACAAAACA
AAGCAAAAATGAGTCCTGCTACCGGCTTTCTACGCCTTGTTTGCAATGTTGTTGGAGAGC
CAGTCAAGTCCCTCGTAGAGTCCTTCTCCAGAGGTGGCACAT

QA 9 110 9 110
DS 

RD RR4B414JQ 388 0 0
TGTTTGCAATGTTGTTGGAGAGCCAGTCAAGTCCCTCGTAGAGTCCTTCTCCAGAGGTGG
CACATGTGCTCTGAATGTACCAGTGTCGCTGACGGAGAGAGTGAAGGCCAAGCTTGTCAG
TGATCTCAGCAGCGTTCATTGCGTTGGGAAGATCTTGCTTGTTAGCAAAAACAAGCAGAA
CTGCATCCCTCAATTCATCCTCGTTGAGCATCCTGTGAAGCTCGTCCCTGGCTTCAACAA
CACGGTCACGATCGTTGCTGTCAACAACAAAGATAAGTCCCTGCGTGTTCTGGAAGTAGT
GCCTCCACAATGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACGGTGAAGCTAATGT
TCTTGTATTCCACAGTCTCAACATTGAA

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4DB32JQ 728 0 0
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AACTCGGTTTCGTTTTGTAGAGCTAGAGAAACAGACCCCTCAACAGTGGTGTATAAAACA
AAACAAGCAAAGATGAGTCCTGCTACCGGCTTTCTACGCCTTGTTTGCAATGTTGTTGGA
GAGCCAGTCAAGTCCCTCGTAGAGTCCTTCTCCAGAGGTGGCACATGTGCTCTGAATGTA
CCAGTGTCGCTGACGGAGAGAGTGAAGGCCAAGCTTGTCAGTGATCTCAGCAGCGTTCAT
TGCGTTGGGAAGATCTTGCTTGTTAGCAAAAACAAGCAGAACTGCATCCCTCAATTCATC
CTCGTTGAGCATCCTGTGAAGCTCGTCCCTGGCTTCAACAACACGGTCACGATCGTTGCT
GTCAACAACAAAGATAAGTCCCTGCGTGTTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAATGGACGGAT
CTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACGGTGAAGCTAATGTTCTTGTATTCCACAGTCTC
AACATTGAAACCAATGGTAGGAATGGTAGTGACGATCTCACCAAGTTTGAGCTTGTAGAG
GATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCGAGACCAACCATGAGAATACGCATCTCCTTCTTGGC
AAAAAGCCTGCTGAACAGCTTCCCGAATGATACCCCCATCCTTTCTTTTTTTTTTT*AAT
CACAAACC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4BD96JQ 806 0 0
GCAAGAACTTATGATTTATTGAAGGAAAGTACTAATTGTTGAAGAACAACATACAGAAGA
AGAATGTATGAAATAATAAAAACTCGGTTTCGTTTTGTAGAGCTAGAGAAACAGACCCCT
CAACAGTGGTGTATAAAACAAAACAAGCAAAAATGAGTCCTGCTACCGGCTTTCTACGCC
TTGTTTGCAATGTTGTTGGAGAGCCAGTCAAGTCCCTCGTAGAGTCCTTCTCCAGAGGTG
GCACATGTGCTCTGAATGTACCAGTGTCGCTGACGGAGAGAGTGAAGGCCAAGCTTGTCA
GTGATCTCAGCAGCGTTCATTGCGTTGGGAAGATCTTGCTTGTTAGCAAAAACAAGCAGA
ACTGCATCCCTCAATTCATCCTCGTTGAGCATCCTGTGAAGCTCGTCCCTGGCTTCAACA
ACACGGTCACGATCGTTGCTGTCAACAACAAAGATAAGTCCCTGCGTGTTCTGGAAGTAG
TGCCTCCACAATGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACGGTGAAGCTAATG
TTCTTGTATTCCACAGTCTCAACATTGAAACCAATGGTAGGAATGGTAGTGACGATCTCA
CCAAGTTTGAGCTTGTAGAGGATGGTGGTCTTACAAGCAGCATCGAGACCAACCATGAGA
ATACGCATCTCCTTCTTGGCAAAAAGCCTGCTGAACAGCTTCCCGAATGATACCCCCATC
CTTTCTTTTTTTTTTTTAATCACAAACCGAAAAGCCAACGCCGCGCGAGATCTAAGCTCT
CTCTGTCTCTCTGATGCCAATGGCCT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4CE61JQ 714 0 0
ACTCGGTTTCGTTTTGTAGAGCTAGAGAAACAGACCCCTCAACAGTGGTGTATAAAACAA
AACAAGCAAAGATGAGTCCTGCTACCGGCTTTCTACGCCTTGTTTGCAATGTTGTTGGAG
AGCCAGTCAAGTCCCTCGTAGAGTCCTTCTCCAGAGGTGGCACATGTGCTCTGAATGTAC
CAGTGTCGCTGACGGAGAGAGTGAAGGCCAAGCTTGTCAGTGATCTCAGCAGCGTTCATT
GCGTTGGGAAGATCTTGCTTGTTAGCAAAAACAAGCAGAACTGCATCCCTCAATTCATCC
TCGTTGAGCATCCTGTGAAGCTCGTCCCTGGCTTCAACAACACGGTCACGATCGTTGCTG
TCAACAACAAAGATAAGTCCCTGCGTGTTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAATGGACGGATC
TTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACGGTGAAGCTAATGTTCTTGTATTCCACAGTCTCA
ACATTGAAACCAATGGTAGGAATGGTAGTGACGATCTCACCAAGTTTT*GCTTGTAGAGG
ATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCGAGACCAACCATGAGAATACGCATCTCCTTCTTGGCA
AAAAGCCTGCTGAACAGCTTCCCGAATGATACCCCCATCCTTTCTTTTTTTTTT**AATC
ACAAACCGAAAAGCCAACGCCGCGCGAGATCTAAGCTCTCTCTGTCTCTCTGAT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DB32TF 658 0 0
TACCGGCTTTCTACGC*TTGTTTGCAATGTTGTTGGAGAGCCAGTCAAGTCCCTCGTAGA
GTC*TTCTCCAGAGGTGGCACATGTGCTCTGAATGTACCAGTGTCGCTGACGGAGAGAGT
GAAGGCCAAGCTTGTCAGTGATCTCAGCAGCGTTCATTGCGTTGGGAAGATCTTGCTTGT
TAGCAAAAACAAGCAGAACTGCATCCCTCAATTCATCCTCGTTGAGCATCCTGTGAAGCT
CGTCCCTGGCTTCAACAACACGGTCACGATCGTTGCTGTCAACAACAAAGATAAGTCCCT
GCGTGTTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAATGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCC
AGACGGTGAAGCTAATGTTCTTGTATTCCACAGTCTCAACATTGAAACCAATGGTAGGAA
TGGTAGTGACGATCTCACCAAGTTTGAGCTTGTAGAGGATGGTGGTCTTACCAGCAGCAT
CGAGACCAACCATGAGAATACGCATCTCCTTCTTGGCAAAAAGCCTGCTGAACAGCTTCC
CGAATGATACCCCCATCCTTTCTTTTTTTTTTT*AATCACAAACCGAAAAGCCAACGCCG
CGCGAGATCTAAGCTCTCTCTGTCTCTCTGATGCCAATGGCCTGCGAACGCTCTTC
CC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CE61TF 640 0 0
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CATGTGCTCTGAATGTACCAGTGTCGCTGACGGAGAGAGTGAAGGCCAAGCTTGTCAGTG
ATCTCAGCAGCGTTCATTGCGTTGGGAAGATCTTGCTTGTTAGCAAAAACAAGCAGAACT
GCATCCCTCAATTCATCCTCGTTGAGCATCCTGTGAAGCTCGTCCCTGGCTTCAACAACA
CGGTCACGATCGTTGCTGTCAACAACAAAGATAAGTCCCTGCGTGTTCTGGAAGTAGTGC
CTCCACAATGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACGGTGAAGCTAATGTTC
TTGTATTCCACAGTCTCAACATTGAAACCAATGGTAGGAATGGTAGTGACGATCTCACCA
AGTTTT*GCTTGTAGAGGATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCGAGACCAACCATGAGAATA
CGCATCTCCTTCTTGGCAAAAAGCCTGCTGAACAGCTTCCCGAATGATACCCCCATCCTT
TCTTTTTTTTTTT*AATCACAAACCGAAAAGCCAACGCCGCGCGAGATCTAAGCTCTCTC
TGTCTCTCTGATGCCAATGGCCTGCGAACGCTCTTCACCC

QA 1 640 1 640
DS 



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AATGTTGAGACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAG
GACAAGATCCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACGCAGGGACTTATCTTTGTT
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AACGCAATGAACGCTGCTGAGATCACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGTCAGCGA
CACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTCTACGAGGGACTTGAC
TGGCTCTCCAACAACATTGCAAACAAGGCGTAGAAAGCCGGTAGCAGGACTCATCTTTGC
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CGAGTTTTTATTATTTCATACATTCTTCTTCTGTATGTTGTTCTTCAACAATTAGTACTT
TCCTTCAATAAATCATAAGTTCTTTCTTTTGCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ35TF U 1
AF RR4GJ35JQ C 1
BS 1 474 RR4GJ35TF
BS 475 754 RR4GJ35JQ

RD RR4GJ35TF 474 0 0
GGGCAGGCCATTGGCATCAGAGAGACAGAGAGAGCTTGGATCTCGCGCGGCGTTGGCTTT
TCGGTTTGTGATTAAAAAAAAAAAGAAAGGATGGGGGTATCATTCGGGAAGCTGTTCAGC
AGGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGCGTATTCTCGTCACTACCATTCCTACCATTGGTTTC
AATGTTGAGACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAG
GACAAGATCCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACGCAGGGACTTATCTTTGTT
GTTGACAGCAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCCAGGGACGAGCTTCACAGGATGCTC
AACGAGGATGAATTGAGGGATGCAGTTCTGCTTGTTTTTGCTAACAAGCAAGATCTTCCC
AACGCAATGAACGCTGCTGAGATCACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4GJ35JQ 754 0 0
GGGCAGGCCATTGGCATCAGAGAGACAGAGAGAGCTTGGATCTCGCGCGGCGTTGGCTTT
TCGGTTTGTGATTAAAAAAAAAAAGAAAGGATGGGGGTATCATTCGGGAAGCTGTTCAGC
AGGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGCGTATTCTCGTCACTACCATTCCTACCATTGGTTTC
AATGTTGAGACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAG
GACAAGATCCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACGCAGGGACTTATCTTTGTT
GTTGACAGCAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCCAGGGACGAGCTTCACAGGATGCTC
AACGAGGATGAATTGAGGGATGCAGTTCTGCTTGTTTTTGCTAACAAGCAAGATCTTCCC
AACGCAATGAACGCTGCTGAGATCACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGTCAGCGA
CACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTCTACGAGGGACTTGAC
TGGCTCTCCAACAACATTGCAAACAAGGCGTAGAAAGCCGGTAGCAGGACTCATCTTTGC
TTGTTTTGTTTTATACACCACTGTTGAGGGGTCTGTTTCTCTAGCTCTACAAAACGAAAC
CGAGTTTTTATTATTTCATACATTCTTCTTCTGTATGTTGTTCTTCAACAATTAGTACTT
TCCTTCAATAAATCATAAGTTCTTTCTTTTGCTC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 11

CO CL327Contig1 717 11 3 U
ACAACTAACAAAGCCATGTCATATTGAATAGAAAAGCTAAATTCATGTGGTAGTAGCGAC
ACAGATCACGTTTATATATTCGTCATCAAAGACCAATCAAATCAATCTCAACGTACCAAC
AAAAGTTTTCTCATAGTCAACATCCAATGATCTTAACTTCCAGAAGAAGAAAAGTAAAAT
GACATACGGTCTAATTAAATGCTCCGAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGG
TTTGCGTTAAACCGGGGG*AGTTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCA
AATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGT
TAAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAG
CAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTA
CAATGTCACTCACTTTCTGCACTGTCTCTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAA
GGCTCTTTGAAGACTGGAAACGACCAAATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCA
ACACCTGGGAGATTCTGGTCGATTGTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTG
ACAAAGAAGCCATTGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 

AF RR4FC51JQ U 74
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AF RR4FC51TF C 74
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AF RR4DI21TF C 1
AF RR4CG76JQ U 45
AF RR4CG76TF C 209
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TCTGGTCGATTGTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTT

QA 1 574 1 574
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QA 1 626 1 626
DS 

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CTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCAC
TTTCTGCACTGTCTCTGATTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAGGCTCTTTGAAGA
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TGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA

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GGGGG*AGTTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTC
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CTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCAC
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TGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA

QA 1 644 1 644
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GGGGG*AGTTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTC
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CTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCAC
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TCTGGTCGATTGTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGACAAAGAAGCCAT
TGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA

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DS 

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AAAATGACGTACGGTCTAATTAAATGCTCCGAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAA
GCCGGTTTGCGTTAAACCGGGGG*AGTTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTC
AATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCATAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACT
TATGTTAAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCC
AAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTC
CTTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACTGTCTCTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAG
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CCTCAACACCTGGGAGATTCTGGTCGATTGTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGT
TGCTGACAAAGAAGCCATTGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAG

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GACATACGGTCTAATTAAATGCTCCGAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGG
TTTGCGTTAAACCGGGGG*AGTTTAGGCCGCAGGCTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCA
AATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGT
TAAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAG
CAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTA
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CGGCGCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCA
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QA 5 673 5 673
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DS 



AS 1 10

CO CL328Contig1 781 10 7 U
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CCATCAAGATCGGCTTCTCGCACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCC
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ATTATATACAAGAAATCATCAAAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTC
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AGTTTCTCCTTCGTGATGAACCCATCGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAA
AACTCTTGGATCTGCTCATCGGTGAAAGCATCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAG
TCAAACCTTTTCTTGATGATTTATCTTTTCTCTTGGTTTGGTTTGTGAAGGAAGATGATC
C


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 30 
10 

AF RR4AG44JQ U 24
AF RR4AG44TF C 24
AF RR4A335JQ U 137
AF RR4BE67TF C 326
AF RR4DY76JQ U 1
AF RR4B475JQ U 2
AF RR4DY76TF C 19
AF RR4BE67JQ U 141
AF RR4A335TFB C 137
AF RR4A335JQD U 137
BS 1 760 RR4DY76JQ
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TTTAAGTTTAACATATGGAAAAGTAGTTGATACGTGCTTAAACAAACCCACTTTTTTATC
ATTTGAAGCTTTATTAGAAATTGCAAACCCAGAAAACAGAGCATCATCCAAACAAACCCC
CTTATATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAATGCTAATAAGAGGCAGCGATCAT
CATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTTCTCGCAC
CATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTTCTCCCAA
CTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTCCTATCAA
CTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCA
C

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DS 

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GGGACCGACACTTTTATTATATCACATGGAAAATACTGTGACATACGATTCGATGTGTGT
TTTAAGTTTAACATATGGAAAAGTAGTTGATACGTGCTTAAACAAACCCACTTTTTTATC
ATTTGAAGCTTTATTAGAAATTGCAAACCCAGAAAACAGAGCATCATCCAAACAAACCCC
CTTATATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAATGCTAATAAGAGGCAGCGATCAT
CATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTTCTCGCAC
CATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTTCTCCCAA
CTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTCCTATCAA
CTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCA
C

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR4A335JQ 569 0 0
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AAACCCCCTTATATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAATGCTAATAAGAGGCAG
CGATCATCATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTT
CTCGCACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTT
CTCCCAACTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTT
CTATCAACTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCATTATATACAAGAAAT
CATCAAAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTCATCATCTCTTGAAGTT
GTTCCTCGTTTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAGTTTCTCCTTCGTGA
TGAACCCATCGGAGTCTTTGTCGATGAAACAGAAGGCTTCGTAAAACTCTTGGATCTGCT
CATCGGTGAAAGCATCCGCCATCTTCGTC

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DS 

RD RR4BE67TF 369 0 0
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CAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTTCTATCAACT
CATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCATTATATACAAGAAATCATCAAAGG
TGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTCATCATCTCTTGAAGTTGTTCCTCGT
TTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAGTTTCTCCTTCGTGATGAACCCAT
CGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAAAACTCTTGGATCTGCTCATCGGTGA
AAGCATCCG

QA 1 369 1 369
DS 

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GTGACATACGATTCGATGTGTGTTTTAAGTTTAACATATGGAAAAGTAGTTGATACGTGC
TTAAACAAACCCACTTTTTTATCATTTGAAGCTTTATTAGAAATTGCAAACCCAGAAAAC
AGAGCATCATCCAAACAAACCCCCTTATATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAA
TGCTAATAAGAGGCAGCGATCATCATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCG
CCATCAAGATCGGCTTCTCGCACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCC
ATGTCTTTCATTCCTTCTCCCAACTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCG
AACACTCTAAACACTTCTATCAACTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCC
ATTATATACAAGAAATCATCAAAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTC
ATCATCTCTTGAAGTTGTTCCTCGTTTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTT
AGTTTCTCCTTCGTGATGAACCCATCGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAA
AACTCTTGGATCTGCTCATCGGTGAAAGCATCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAG
TCAAACCTTTTCTTGATGATTTATCTTTTCTCTTGGTTTGTTTTGTGAAGGA
GA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4B475JQ 779 0 0
G
CTCAAAATAATTTATTGATATGGGACCGACACTTTTATTATATCACATGGAAAATACTGT
GACATACGATTCGATGTGTGTTTTAAGTTTAACATATGGAAAAGTAGTTGATACGTGCTT
AAACAAACCCACTTTTTTATCATTTGAAGCTTTATTAGAAATTGCAAACCCAGAAAACAG
AGCATCATCCAAACAAACCCCCTTATATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAATG
CTAATAAGAGGCAGCGATCATCATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGTC
ATCAAGATCGGCTTCTCGCACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCAT
GTCTTTCATTCCTTCTCCCAACTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAA
CACTCTAAACACTTCTATCAACTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCAT
TATATACAAGAAATCATCAAAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCCCAT
CATCTCTTGAAGTTGTTCCTCGTTTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAG
TTTCTCCTTCGTGATGAACCCATCGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAAAA
CTCTTGGATCTGCTCATCGGTGAAAGCGTCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAGTC
AAACCTTTTCTTGATGATTTATCTTTTCTCTTGGTTTGGTTTGTGAAGGAAGAAGATC

QA 2 779 2 779
DS 

RD RR4DY76TF 763 0 0
ATGATATGGA
CGACACTTTTATTATATCACATGGAAA*TACTGTGACATACGATTCGATGTGTGTTT*AA
GTTTAACATATGGAAAAGTAGTTGATACGTGCTTAAACAAACCCACTTTTTTATCATTTG
AAGCTTTATTAGAAATTGCAAACCCAGAAAACAGAGCATCATCCAAACAAACCCCCTTAT
ATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAATGCTAATAAGAGGCAGCGATCATCATTT
TGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTTCTCGCACCATAT
GCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTTCTCCCAACTCAA
GTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTTCTATCAACTCAT
CCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCATTATATACAAGAAATCATCAAAGGTGA
TGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTCATCATCTCTTGAAGTTGTTCCTCGTTTG
GATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAGTTTCTCCTTCGTGATGAACCCATCGG
AGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAAAACTCTTGGATCTGCTCATCGGTGAAAG
CATCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAGTCAAACCTTTTCTTGATGATTTATCTTT
TCTCTTGGTTTGTTTTGTGAAGGAAGATGATC
C

QA 11 762 11 762
DS 

RD RR4BE67JQ 645 0 0
G
TCATTTGAAGCTTTATTAGAAATTGCAAACCCAGAAAACAGAGCATCATCCAAACAAACC
CCCTTATATCATAGCATTTACTTTATAGGGATATATAAATGCTAATAAGAGGCAGCGATC
ATCATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTTCTCGC
ACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTTCTCCC
AACTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTTCTATC
AACTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCATTATATACAAGAAATCATCA
AAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTCATCATCTCTTGAAGTTGTTCC
TCGTTTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAGTTTCTCCTTCGTGATGAAC
CCATCGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAAAACTCTTGGATCTGCTCATCG
GTGAAAGCATCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAGTCAAACCTTTTCTTGATGATT
TATCTTTTCTCTTGGTTTGGTTTGTGAAGGAAGATGAT
GGGGCC

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DS 

RD RR4A335TFB 645 0 0
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CGATCATCATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTT
CTCGCACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTT
CTCCCAACTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTT
CTATCAACTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCATTATATACAAGAAAT
CATCAAAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTCATCATCTCTTGAAGTT
GTTCCTCGTTTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAGTTTCTCCTTCGTGA
TGAACCCATCGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAAAACTCTTGGATCTGCT
CATCGGTGAAAGCATCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAGTCAAACCTTTTCTTGA
TGATTTATCTTTTCTCTTGGTTTGGTTTGTGAAGGAAGATGATC
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4A335JQD 645 0 0
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CGATCATCATTTTGGAGAACTCGTGGAAAGAGAGAACACCATCGCCATCAAGATCGGCTT
CTCGCACCATATGCTCCGCCTCTTCCGCCGTTATCTTCATCCCCATGTCTTTCATTCCTT
CTCCCAACTCAAGTGCAGATATGACACCGTCTCCGTCTCTGTCGAACACTCTAAACACTT
CTATCAACTCATCCGATCCCGCTTCCTGAGAGGTGTTTTGAGCCATTATATACAAGAAAT
CATCAAAGGTGATGCCTCCGTTGCCAAAGATATCGACATGGCTCATCATCTCTTGAAGTT
GTTCCTCGTTTGGATTCTTCCCCATCGACTTCATCACCTTCGTTAGTTTCTCCTTCGTGA
TGAACCCATCGGAGTCTTTGTCGATGAGACAGAAGGCTTCGTAAAACTCTTGGATCTGCT
CATCGGTGAAAGCATCCGCCATCTTCGTCGATCACAAAGAAAAGTCAAACCTTTTCTTGA
TGATTTATCTTTTCTCTTGGTTTGGTTTGTGAAGGAAGATGATCC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 2 11

CO CL329Contig1 1062 7 5 U
GGGTCCGTAACACTTCATCGTCCCTTTAATCAAATCTTGCAGAAACATTATAAACACGAC
ATACAAGACTTGTTAAATCACATGATAATTTTTTGCTCCAAATTAAACCTAAAAATCTAC
TCATAACTTTTGTTTTCCGGCTCTGCATTTGTTTTGATCTTCAGCAGTCTCAATACTAAC
TGAAACCCATCTATTTGTATGTACAGAGACCCACTAGTCCAAAAACTCCCATCACAATCA
GCAGTCATCAGCACATTGTTTCAATAGAGATAGAAAGAGTCTTCTCTTCCTTTGGTTGAA
TCATTGGTGACGAGAGTCTCGCAACCAAAACATCTAATGCTTCTTTCATCCACCAATCTC
TACAGGCTTCTCTGGCGTCAACTACGTTCATCCAGATTCTTTGCCTAGCATGTTGCTCAG
GCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGGGAACATCAGTCCTTCATAGTATGTTC
CTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAACTGATGCTCTACGTTGCCAAGAACTC
CAGCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGATGCAGCTTCTTCTACAGATTCATCAAGCTCCCAAC
CACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTTTGAGAAGAGATAACAAGAACTTCTACCT
CGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATAACTTGAATCTGTACGGAATACATCCGACGACTT
GGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAAACTGACGACCAGTGCGAGAAACCAAACACACCA
TTTTTTCAACACCCATTTTTAGCTTAAAAGTTTCACAGATGAAGAAGTAGGAGTCTGATA
TTATATAAAAACAAAGGTTTCACCGTGTCGTTTGAAACAACTATAACGGATTAGAATCTG
TCGAAATAAAGAAGAGCCCAAGAATCTATTGTCAGTTAATAGATCAGGAAGTTTTAGTTA
TACTTTGAAGTGCTTATGATTCGATTTAGTTATGCCTGAAAAGATTTGAGGGAGAGAGAG
AGAGAGA**TAGGAGGAGAAGGTGAAGGAGATGAGACAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4EL69JQ U 3
AF RR4CE66JQ U 39
AF RR4AJ53JQ U 1
AF RR4GW96JQ U 95
AF RR4AJ53TF C 231
AF RR4EL69TF C 346
AF RR4CE66TF C 370
BS 1 804 RR4AJ53JQ
BS 805 1027 RR4AJ53TF
BS 1028 1029 RR4EL69TF
BS 1030 1057 RR4AJ53TF
BS 1058 1062 RR4CE66TF

RD RR4EL69JQ 679 0 0
GTCCGTAACACTTCATCGTCCCTTTAATCAAATCTTGCAGAAACATTATAAACACGACAT
ACAAGACTTGTTAAATCACATGATAATTTTTTGCTCCAAATTAAACCTAAAAATCTACTC
ATAACTTTTGTTTTCCGGCTCTGCATTTGTTTTGATCTTCAGCAGTCTCAATACTAACTG
AAACCCATCTATTTGTATGTACAGAGACCCACTAGTCCAAAAACTCCCATCACAATCAGC
AGTCATCAGCACATTGTTTCAATAGAGATGGAAAGAGTCTTCTCTTCCTTTGGTTGAATC
ATTGGTGACGAGAGTCTCGCAACCAAAACATCTAATGCTTCTTTCATCCACCAATCTCTA
CAGGCTTCTCTGGCGTCAACTACGTTCATCCAGATTCTTTGCCTAGCATGTTGCTCAGGC
CAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGGAAACATCAGTCCTTCATAGTATGTTCCT
CTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAACTGATGCTCTACGTTGCCAAGAACTCCA
GCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGATGCAGCTTCTTCTACAGATTCATCAAGCTCCCAACCA
CCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTT*GAGAAGAGATAACAAGAACTTCTACCTCG
TCACTAATTTTACCATCGC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4CE66JQ 741 0 0
GCAGAAACATTATAAACACGACATACAAGACTTGTTAAATCACATGATAATTTTTTGCTC
CAAATTAAACCTAAAAATCTACTCATAACTTTTGTTTTCCGGCTCTGCATTTGTTTTGAT
CTTCAGCAGTCTCAATACTAACTGAAACCCATCTATTTGTATGTACAGAGACCCACTAGT
CCAAAAAATCCCATCACAATCAGCAGTCATCAGCACATTGTTTCAATAGAGATGGAAAGA
GTCTTCTCTTCCTTTGGTTGAATCATTGGTGACGAGAGTCTCGCAACCAAAACATCTAAT
GCTTCTTTCATCCACCAATCTCTACAGGCTTCTCTGGCGTAAACTACGTTCATCCAGATT
CTTTGCCTAGCATGTTGCTCAGGCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGGGAAC
ATCAGTCCTTCATAGTATGTTCCTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAACTGA
TGCTCTACGTTGCCAAGAACTCCAGCTTCTTCAAGAAACTCTCTTGATGCAGCTTCTTCT
ACAGATTCATCAAGCTCCCAACCACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTTTGAGAA
GAGATAACAAGAACTTCTACCTCGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATAACTTGAATCTG
TACGGAATACATCCGACGACTTGGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAAACTGACGACCA
GTGCGAGAAACCAAACACACC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4AJ53JQ 804 0 0
GGGTCCGTAACACTTCATCGTCCCTTTAATCAAATCTTGCAGAAACATTATAAACACGAC
ATACAAGACTTGTTAAATCACATGATAATTTTTTGCTCCAAATTAAACCTAAAAATCTAC
TCATAACTTTTGTTTTCCGGCTCTGCATTTGTTTTGATCTTCAGCAGTCTCAATACTAAC
TGAAACCCATCTATTTGTATGTACAGAGACCCACTAGTCCAAAAACTCCCATCACAATCA
GCAGTCATCAGCACATTGTTTCAATAGAGATAGAAAGAGTCTTCTCTTCCTTTGGTTGAA
TCATTGGTGACGAGAGTCTCGCAACCAAAACATCTAATGCTTCTTTCATCCACCAATCTC
TACAGGCTTCTCTGGCGTCAACTACGTTCATCCAGATTCTTTGCCTAGCATGTTGCTCAG
GCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGGGAACATCAGTCCTTCATAGTATGTTC
CTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAACTGATGCTCTACGTTGCCAAGAACTC
CAGCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGATGCAGCTTCTTCTACAGATTCATCAAGCTCCCAAC
CACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTTTGAGAAGAGATAACAAGAACTTCTACCT
CGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATAACTTGAATCTGTACGGAATACATCCGACGACTT
GGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAAACTGACGACCAGTGCGAGAAACCAAACACACCA
TTTTTTCAACACCCATTTTTAGCT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4GW96JQ 700 0 0
GCTCCAAATTAAACCTAAAAATCTACTCATAACTTTTGTTTTCCGGCTCCGCATTTGTTT
TGATCTTCAGCAGTCTCAATACTAACTGAAACCCATCTATTTGTATGTACAGAGACCCAC
TAGTCCAAAAACTCCCATCACAATCAGAAGTCATCAGCACATTGTTTCAATAGAGATGGA
AAGAGTCTTCTCTTCCTTTGGTTGAATCATTGGTGACGAGAGTCTCGCAACCAAAACATC
TAATGATTCTTTCATCCACCAATCTCTACAGGCTTCTCTGGCGTCAACTACGTTCATCCA
GATTCTTTGCCTAGCATGTTGCTCAGGCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGG
GAACATCAGTCCTTCATAGTATGTTCCTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAA
CTGATGCTCTACGTTGCCAAGAACTCCAGCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGAGGCAGCTTC
TTCTACAGATTCATCAAGCTCCCAATCACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTTTG
AGAAGAGATAACAAGAACTTCTACCTCGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATAACTTGAA
TCTGTACGGAATACATCCGACGACTTGGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAAACTGACG
ACCAGTGCGAGAAACCAAACACACCATTTTTTCAACACCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4AJ53TF 827 0 0
TCAC
CAATCAGCAGTCATCAGCACATTGTTTCAATAGAGATAGAAAGAGTCTTCTCTTCCTTTG
GTTGAATCATTGGTGACGAGAGTCTCGCAACCAAAACATCTAATGCTTCTTTCATCCACC
AATCTCTACAGGCTTCTCTGGCGTCAACTACGTTCATCCAGATTCTTTGCATAGCATGTT
GCTCAGGCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGGGAACATCAGTCCTTCATAGT
ATGTTCCTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAACTGATGCTCTACGTTGCCAA
GAACTCCAGCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGATGCAGCTTCTTCTACAGATTCATCAAGCT
CCCAACCACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTTTGAGAAGAGATAACAAGAACTT
CTACCTCGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATAACTTGAATCTGTACGGAATACATCCGA
CGACTTGGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAAACTGACGACCAGTGCGAGAAACCAAAC
ACACCATTTTTTCAACACCCATTTTTAGCTTAAAAGTTTCACAGATGAAGAAGTAGGAGT
CTGATATTATATAAAAACAAAGGTTTCACCGTGTCGTTTGAAACAACTATAACGGATTAG
AATCTGTCGAAATAAAGAAGAGCCCAAGAATCTATTGTCAGTTAATAGATCAGGAAGTTT
TAGTTATACTTTGAAGTGCTTATGATTCGATTTAGTTATGCCTGAAAAGATTTGAGGGAG
AGAGAGAGAGAGAGATAGGAGGAGAAGGTGAAGGAGATGAGAC

QA 5 827 5 827
DS 

RD RR4EL69TF 717 0 0
TCATCCACCA*TCTCTACAGGCT*CTCTG*CGTCAACTACGTTCATCCAGATTCTTG**C
TAGCATGTTGCTCAGGCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAAGCAAAGGAAACATCAGTC
CTTCATAGTATGTTCCTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATTTTCCTAACTGATGCTCTA
CGTTGCCAAGAACTCCAGCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGATGCAGCTTCTTCTACAGATT
CATCAAGCTCCCAACCACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGACCTTTT*GAGAAGAGATAA
CAAGAACTTCTACCTCGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATAACTTGAATCTGTACGGAA
TACATCCGACGACTTGGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAAACTGACGACCAGTGCGAG
AAACCAAACACACCATTTTTTCAACACCCATTTTTAGCTTAAAAGTTTCACAGATGAAGA
AGTAGGAGTCTGATATTATATAAAAACAAAGGTTTCACCGTGTCGTTTGAAACAACTATA
ACGGATTAGAATCTGTCGAAATAAAGAAGAGCACAAGAATCTATTGTCAGTTAATAGATC
AGGAAGTTTTAGTTATACTTTGAAGTGCTTATGATTCGATTTAGTTATGCCTGAAAAGAT
TTGAGGGAGAGAGAGAGAGAGA**TAGGAGGAGAAGGTGAAGGAGATGAGAC
AAAAA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4CE66TF 693 0 0
CTCTCTGCGTAAACTACG
TCATCCAGATTCTTTG*CTAGCATGTTGCTCAGGCCAAAGCTCAAGTTGTTCTGTTACAA
GCAAAGGGAACATCAGTCCTTCATAGTATGTTCCTCTGCTTTTGCTCAAAAAGTCCCATT
TTCCTAACTGATGCTCTACGTTGCCAAGAACTCCAGCTTCTTCAAGAGACTCTCTTGATG
CAGCTTCTTCTACAGATTCATCAAGCTCCCAACCACCCTTAGGAAACATCATGGCGTGAC
CTTTTTGAGAAGAGATAACAAGAACTTCTACCTCGTCACTAATTTTACCATCGCTTGATA
ACTTGAATCTGTACGGAATACATCCGACGACTTGGCGACGACCTTTGTTGTATCTCTGAA
ACTGACGACCAGTGCGAGAAACCAAACACACCATTTTTTCAACACCCATTTTTAGCTTAA
AAGTTTCACAGATGAAGAAGTAGGAGTCTGATATTATATAAAAACAAAGGTTTCACCGTG
TCGTTTGAAACAACTATAACGGATTAGAATCTGTCGAAATAAAGAAGAGCCCAAGAATCT
ATTGTCAGTTAATAGATCAGGAAGTTTTAGTTATACTTTGAAGTGCTTATGATTCGATTT
AGTTATGCCTGAAAAGATTTGAGGGAGAGAGAGAGAGAGA**TAGGAGGAGAAGGTGAAG
GAGATGAGACAAAAA

QA 19 693 19 693
DS 



CO CL329Contig2 1120 4 5 U
GGACAACGTTCTTGTCATCTCCTTCATATTCTCCTTCTTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CAAATCTTTTTCAGGCGCAACCTAATAGAAACATAAACATTTAAGAGCATAAACCAACCA
TAGATTCTTGGGACACTTCTTAGTTTCGACCGATTCTGATCCGTTATAGTTGTTTCAAAC
GACACGGTGAAACGTTTGTTCTTATTTAAAATATCATACTCCTCTTTTCTTTCTCCTCCT
TCTCTATCTTGGAAACTAGGGTTCTTCAAGATCCTTTGTGAGCTAAATGGGTGTTGAGAA
AATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAATAAAGGTCGTCG
TCAAGTCGTCGGATGTATACCGTACAGATTCAAGCTATCAAGTGATGGGAAAATTAGCGA
TGAATTAGAAATTCTTGTTATCTCTTCTCAAAAAGGTCATGCCATGATGTTCCCAAAGGG
TGGCTGGGAGCTTGATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCTGCAAGAGAATCTCTCGAAGAAGC
TGGAGTTCTTGGCAATATTGGGCATCAACTAGGAAAATGGGATTTTTTGAGCAAAAGCAG
GGGAACATATTATGAAGGACTAATGTTCCCTATGCTTGTTACAGAACAACTTGAGCTTTG
GCCTGAACAACATGCTAGGCAAAGAATCTGGATGAATCTAGTTGACGCTAGAGAAGCTTG
TAGAGATTGGTGGATGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTCGAGAGACTCTCATCACCAAT
GAATCAACCAAAGGAAGAGAAGAATATTTCAATATCTATCGAAACAATGTGCTGATGATT
TGCTACAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATGGGAGTTTTATGGACTAATGGATCTCTGTA
GATAGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAATTGAGAGAGTGATTTGAAGAGCAGGTGCAG
AACAGGAACA**********GTAGATCTTTTAGGTTTAATTTGGAGCAATGAAAAAACAT
CATGTGATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTTATAACGTTTCTGCATGATTTACTTAAG
GGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BA25TF U 1
AF RR4BA25JQ C 314
AF RR4AO51JQ C 532
AF RR4AO51TF U 532
BS 1 339 RR4BA25TF
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RD RR4BA25TF 367 0 0
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CAAATCTTTTTCAGGCGCAACCTAATAGAAACATAAACATTTAAGAGCATAAACCAACCA
TAGATTCTTGGGACACTTCTTAGTTTCGACCGATTCTGATCCGTTATAGTTGTTTCAAAC
GACACGGTGAAACGTTTGTTCTTATTTAAAATATCATACTCCTCTTTTCTTTCTCCTCCT
TCTCTATCTTGGAAACTAGGGTTCTTCAAGATCCTTTGTGAGCTAAATGGGTGTTGAGAA
AATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGTCGTCAGTTTCATAGATACAATAAAGGTCGTCG
TCAAGTC

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4BA25JQ 720 0 0
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TGTATACCGTACAGATTCAAGCTATCAAGTGATGGGAAAATTAGCGATGAATTAGAAATT
CTTGTTATCTCTTCTCAAAAAGGTCATGCCATGATGTTCCCAAAGGGTGGCTGGGAGCTT
GATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCTGCAAGAGAATCTCTCGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGC
AATATTGGGCATCAACTAGGAAAATGGGATTTTTTGAGCAAAAGCAGGGGAACATATTAT
GAAGGACTAATGTTCCCTATGCTTGTTACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAACAACAT
TCTAGGCAAAGAATCTGGATGAATCTAGTTGACGCTAGAGAAGCTTGTAGAGATTGGTGG
ATGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTCGAGAGACTCTCATCACCAATGAATCAACCAAAG
GAAGAGAAGAATATTTCAATATCTATCGAAACAATGTGCTGATGATTTGCTACAAAAAAA
TTGCGGCTGATTGTGATGGGAGTTTTATGGACTAATGGATCTCTGTAGATAGAAATAGAT
GTGGTCTCCAATTAGAATTGAGAGAGTGATTTGAAGAGCAGGTGCAGAACAGGAACAAAA
AAGATGGGTAGATCTTTTAGGTTTAATTTGGAGCAATGAAAAAACATCATGTGATTTAAG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AO51JQ 589 0 0
G
GAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAATATTGGGCATCAACTAGGAAAATGGGATTTTTTGAGC
AAAAGCAGGGGAACATATTATGAAGGACTAATGTTCCCTATGCTTGTTACAGAACAACTT
GAGCTTTGGCCTGAACAACATGCTAGGCAAAGAATCTGGATGAATCTAGTTGACGCTAGA
GAAGCTTGTAGAGATTGGTGGATGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTCGAGAGACTCTCA
TCACCAATGAATCAACCAAAGGAAGAGAAGAATATTTCAATATCTATCGAAACAATGTGC
TGATGATTTGCTACAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATGGGAGTTTTATGGACTAATGGA
TCTCTGTAGATAGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAATTGAGAGAGTGATTTGAAGAGC
AGGTGCAGAACAGGAACA**********GTAGATCTTTTAGGTTTAATTTGGAGCAATGA
AAAAACATCATGTGATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTTATAACGTTTCTGCATGATT
TACTTAAGGGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCAAGC

QA 2 589 2 589
DS 

RD RR4AO51TF 589 0 0
G
GAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAATATTGGGCATCAACTAGGAAAATGGGATTTTTTGAGC
AAAAGCAGGGGAACATATTATGAAGGACTAATGTTCCCTATGCTTGTTACAGAACAACTT
GAGCTTTGGCCTGAACAACATGCTAGGCAAAGAATCTGGATGAATCTAGTTGACGCTAGA
GAAGCTTGTAGAGATTGGTGGATGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTCGAGAGACTCTCA
TCACCAATGAATCAACCAAAGGAAGAGAAGAATATTTCAATATCTATCGAAACAATGTGC
TGATGATTTGCTACAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATGGGAGTTTTATGGACTAATGGA
TCTCTGTAGATAGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAATTGAGAGAGTGATTTGAAGAGC
AGGTGCAGAACAGGAACA**********GTAGATCTTTTAGGTTTAATTTGGAGCAATGA
AAAAACATCATGTGATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTTATAACGTTTCTGCATGATT
TACTTAAGGGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCAAGC

QA 2 589 2 589
DS 



AS 2 10

CO CL330Contig1 765 5 13 U
GGGCGAAGAAGAATATGGCGACAGAGGATATGAACGAAGCCCTTGCGGCGGCGGAGGTAA
CGGCGATTGAATCGACGGAGAAGCCTCACAAGCTAGAAAGAAAGTGGAGTTTCTGGTTCG
ATAACCAATCCAAACCAAAGCAAGGCGACGCGTGGGGAGCTTCCCTCCGTAAAGCATGTA
CTTTCGATACCGTCGAAGATTTCTGGGG*TTTGCACGAGACTATATTCGTTCCCAGCAGA
TTGACACCCAA*TGCTGACATTCACATGTTCAAA*GCTGGTGTTGAGCCAAA*GTGGGAA
GATCCTGAGTGTGCTAACGGCGGCAAGTGGACTTATGTTGTTACCAACAACAGGAAGCAA
GCTTTAGACAAGGCTTGGCTTGAAACTTTGATGGCTTTAGTTGGAGAGCAGTTTGATGAG
TCAGATGAGATTTGTGGTGTGGTTGCTAGTGTCCGCCAAAAGCAAGACAAGCTCTCCTTG
TGGACTAGGACTAAATCTAATGAAGCTGTTCTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGGAG
ATACTTGATGTCACCGACAAGATATCTTTCACTAACCATAATGATTCAAGAAGAAGTCGA
TTTAGTGTCTGAAGAGAAGACGCAAGTGTGTTAAGACTGATGAAGATGCAATATGGCTAT
TTTCTTGCATTGTTTGAGCCGTTTTTCCTTGCAACTCTACAAAGTTCTGTGTTTTACTAA
AAGATATTTTTTCTTAATATTAAGTTCAGTCATATAAAATTAAAA


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4B921JQ C 147
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AF RR4BA28TF U 19
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G
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TTAAGTTCAGTCATATAAAATTAAAA

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DS 



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ACAAAGTTCTATTTTCACTGGAAAGAGTTTCTTAATATTAAGTTCAGTTATTTCTTTTTG
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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AF RR4EL37JQ C 173
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GG
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TGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATGAGGCAGATGAGATTTGTGGTGTGGTTGCTAGTG
TGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGACAAGGACCAAATCTAATGAAGCTGTTC
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CTAACCATGATGATTCTAGAAGAACACGGTTCACTGTCTGAAGAGAAATGACGCAAGGGT
GGTGAGACCTGAG*GA
GATG

QA 3 678 3 678
DS 

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TGGCGACAGAGGATGTGAACGAAGCCCTTACGGCGGCGGAAGTACCGGCAATAGAGACGA
CGGAGAAGCAGCCCCCTCACAAGCTCGAAAGAAAGTGGAGTTTCTGGTTCGATAACCAAT
CCAAACCTAAGCAAGGCGCCCCCTGGGGAGCCTCTCTTCGCAAAGCCTATACCTTCGACA
CCGTCGAAGATTTCTGGGGTTTGCACGAGACTATATTCATCCCTAGCAAATTGACGGCGA
ATGCAGAAATTCACATGTTCAAAGCTGGTGTTGAGCCCAAGTGGGAAGATCCTGAGTGTG
CTAATGGCGGAAAGTGGACTTTTGTTGTTACCTCCAACAGGAAGCCTGCTTTAGACAAGG
CTTGGCTTAAAACTTTGATGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATGAGGCTGATGAGATTT
GTGGTGTGGTTGCTAGTGTGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGACAAGGACCA
AATCTAATGAAGCTGTTCTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGGATATACTTGATGTCG
CTGACAAGATAACTTTCACTAACCATGATGATTCTAGAAGAACTCGGTTCACTGTCTGAA
GAGAAATGACGCAAGGGTGGTGAGACCTGAG*AAGATGCAATATCGCTTTGTCTTGCATT
ATTCTGTCGGTTTACTCATAGCTGAGACCTTTAGGGAAACTCACTTTGAGGTGTA
C

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4BJ64TF 725 0 0
GG
GACCCGATCGAGAGAATCGAATCCAAAGTGCGATGGCGACAGAGGATGTGAACGAAGCCC
TTACGGCGGCGGAAGTACCGGCAATAGAGACGACGGAGAAGCAGCCCCCTCACAAGCTCG
AAAGAAAGTGGAGTTTCTGGTTCGATAACCAATCCAAACCTAAGCAAGGCGCCGCCTGGG
GAGCCTCTCTTCGCAAAGCCTATACCTTCGACACCGTCGAGGATTTCTGGGGTTTGCACG
AGACTATATTCATCCCTAGCAAATTGACGT*GAATGCAGAAATTCACATGTTCAAAGCTG
GTGTTGAGCCCAAGTGGGAAGATCCTGAGTGTGCTAACGGCGGAAAGTGGACTTATGTTG
TTACCTCCAACAGGAAGCCTGCTTTAGACAAGGCTTGGCTTGAAACTTTGATGGCTCTTG
TCGGAGAGCAATTTGATGAGGCAGATGAGATTTGTGGTGTGGTTGCTAGTGTGCGCCCAA
AGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGACAAGGACCAAATCTAATGAATCTGTTCTGATGGGTA
TTGGGAAGAAGTGGAAGGATATACTTGATGTCGCTGACAAGATAACTTTCACTAACCATG
ATGATTCTAGAAGAGCACGGTTCACTGTCTGAAGAGAAATGACGCAAGGGTGGTGAGACC
TGAG*AAGATGCGATATCGCTTTGTCTTGCATTATTCTGTCGGTTTACTCATAGCTGAGA
CCT

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR4EL37JQ 722 0 0
TAACCAATCCAAACCTAAGCAAGGCGCCCCCTGGGGAGCCTCTCTTCGCAAAGCCTATAC
CTTCGACACCGTCGAAGATTTCTGGGGTTTGCACGAGACTATATTCATCCCTAGCAAATT
GACGGCGAATGCAGAAATTCACATGTTCAAAGCTGGTGTTGAGCCCAAGTGGGAAGATCC
TGAGTGTGCTAATGGCGGAAAGTGGACTTTTGTTGTTACCTCCAACAGGAAGCCTGCTTT
AGACAAGGCTTGGCTTAAAACTTTGATGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATGAGGCTGA
TGAGATTTGTGGTGTGGTTGCTAGTGTGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGAC
AAGGACCAAATCTAATGAAGCTGTTCTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGGATATACT
TGATGTCGCTGACAAGATAACTTTCACTAACCATGATGATTCTAGAAGAACTCGGTTCAC
TGTCTGAAGAGAAATGACGCAAGGGTGGTGAGACCTGAGGAAGATGCAATATCGCTTTGT
CTTGCATTATTCTGTCGGTTTACTCATAGCTGAGACCTTTAGGGAAACTCACTTTGAGGT
GTAACTCTACAAAGTTTTATTTTCACTGGAAAGAGTTTCTTAATATTAAGTTCAGTTATT
TCTTTTTGGAAGCATCAAATTTTGGAGACACACATTAAATTTGAATGTTTGATTTTTATG
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4ED52JQ 586 0 0
AATTCACATGTTCAAAGCTGGTGTTGAGCCCAAGTGGGAAGATCCTGAGTGTGCTAACGG
CGGAAAGTGGACTTATGTTGTTACCTCCAACAGGAAGCCTGCTTTAGACAAGGCTTGGCT
TGAAACTTTGATGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATGAGGCAGATGAGATTTGTGGTGT
GGTTGCTAGTGTGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGACAAGGACCAAATTTAA
TGAAGCTGTTTTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGGATATACTTGATGTCGCTGACAA
GATAACTTTCACTAACCATGATGATTCTAGAAGAACACGGTTCACTGTCTGAAGAGAAAT
GACGCAAGGGTGGTGAGACCTGAGGAAGATGCAATATCGCTTTGTCTTGCATTATTCTGT
CGGTTTACTCATAGCTGAGACCTTTAGGGAAACTCACTTTGAGGTGTAACTCTACAAAGT
TCTATTTTCACTGGAAAGAGTTTCTTAATATTAAGTTCAGTTATTTCTTTTTGGAAGCAT
CAAATTTTGGAGACACACATTAAATTTGAATGTTTGATTTTTATGC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 11

CO CL331Contig1 628 11 10 U
GGGATATCAAACAACAAAAAAAAAGTAGAGACAAATATTCATATTTTATCACAAAAGCAA
AGAAAGAAAAGCAAACACACAAATGGCTTTGGCTCCGAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCT
GACAGTGTGCATTGTTGCGTCAGTAGATGCAGAAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAG
CTTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAACGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGC
TGGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAA
ATGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCT
TCCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACA
CCGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCA
TAAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTT
TTCCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATC
TAATATATATTAGCATAACTTATATCCA


BQ
10 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 0 60 0 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 0 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4FF85TF U 1
AF RR4D614JQ C 2
AF RR4D614TF U 2
AF RR4CM59JQ C 2
AF RR4CM59TF U 2
AF RR4CV22JQ C 2
AF RR4CV22TF U 121
AF RR4B218JQ C 3
AF RR4B218TF U 3
AF RR4DT55JQ C 2
AF RR4DT55TF U 2
BS 1 13 RR4FF85TF
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BS 15 56 RR4FF85TF
BS 57 58 RR4B218TF
BS 59 138 RR4FF85TF
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RD RR4FF85TF 627 0 0
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TCCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACA
CCGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCA
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DS 

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AAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGCCCTATGGTTT
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AATATATATTAGCA
C

QA 1 614 1 614
DS 

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CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACAC
CGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCAT
AAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGCCCTATGGTTT
TCCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCT
AATATATATTAGCA
C

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4CM59JQ 610 0 0
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AAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTT
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AATATATATT

QA 1 610 1 610
DS 

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AATATATATT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4CV22JQ 626 0 0
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GGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAA
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CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACAC
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AAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTT
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AATATATATTAGCATAACTTATATCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4CV22TF 507 0 0
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CTTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAACGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGC
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TCCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATTTCCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACA
CCGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCA
TAAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTT
TTCCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATC
TAATATATATTAGCATAACTTATATCC

QA 1 507 1 507
DS 

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CAGTGTGCATTGTTTCGTCAGTAGATGCAGAAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGCT
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GAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAAT
GCCTACAGTCCGCTGCAAAGCGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTTC
CTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACC
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AATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTTTCCTATGGTTTT
CCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCTA
ATATATATTAGCATAACTT
G

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4B218TF 620 0 0
GATATCAAACAACAAAACATAAGTAGAGACAAATATTCATATTTTATCACAAAAGCAAAG
AAAGAAAAGCAAACACACAAATGGCTTTGGCTCTGAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCTGA
CAGTGTGCATTGTTTCGTCAGTAGATGCAGAAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGCT
TGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAACGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGCTA
GAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAAT
GCCTACAGTCCGCTGCAAAGCGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTTC
CTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACC
GTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCATA
AATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTTTCCTATGGTTTT
CCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCTA
ATATATATTAGCATAACTT
G

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4DT55JQ 626 0 0
GGATATCAAACAACAAAACATAAGTAGAGACAAATATTCATATTTTATCACAAAAGCAAA
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ACAGTGTGCATTGTTGCGTCAGTAGATGCAGAAATTTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGC
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GGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAA
TGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTT
CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACAC
CGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCAT
AAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTT
TCCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCT
AATATATATTAGCATAACTTATATCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4DT55TF 627 0 0
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GAAAGAAAAGCAAACACACAAATGGCTTTGGCTCTGAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCTG
ACAGTGTGCATTGTTGCGTCAGTAGATGCAGAAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGC
TTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAACGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGCT
GGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAA
TGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTT
CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATT*CCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACAC
CGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCAT
AAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTT
TCCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCT
AATATATATTAGCATAACTTATATCCA

QA 1 627 1 627
DS 



AS 2 11

CO CL332Contig1 1305 5 7 U
GGAGAGAATTCTCATTCATTACCAAAAGAAATGGGTGATGACAAGGATTCGGACAGTAGT
ATCATCAAGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTG
AACGATCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCA
CTCGGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAA
GTGTTACAAGACAAGAGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCAT
CCTAACGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTAT
CTCAACCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACC
AAGATGAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGC
GCTGTGAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAAC
CTATTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATG
CTGTGATGTGTTCTTGGTTTCAGATTCCTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCAA
GGTATTACAGAGCTCCAGAACTCATCTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATA
TGTGGTCTGTAGGTTGTGTAATGGCTGAGCTTTTTCTTGGACATCCTTTGTTCCCTGGAG
AGACTAGTGTTGATCAATTGGTGGATATCATTAAGGTTTTGGGAACACCAGCAAGAGAAG
AGATAAAGAACATGAACCCTAGTTACAATGATTTCAAGTTCCCACAGATAAAACCTCAGC
CATGGCACAAGATTTTTAGTAGACAGGTACCTCCTGAAGCATTGGATCTTGGCTCTAGAC
TCCTCCAGTATTCACCAAACCTGAGATGCTCAGCGCTTGAAGCCTGTGCGCACCCGTTCT
TTGATGCTCTGAGAGACCCCAACGCATCCTTGCCTAATGGAAGAGCACTTCCTCCATTGT
TTGATTTCACAGCTCAAGAATTGGCTGGTGCATCTGTTGAACTGCGTCATCGCTTAATCC
CTGAGCATGCATGAAATGACCTCTTCTTTTCTCTCTACACATGTCCTTGTTCACTGACCT
CTGCAACCACTCGGACTAGTAGTTAAAAAAGTGTAATAATTTTTATAAGTTTGCAACTTT
GTAGCTTCCATTGTTGTATACAGAAATGCAGAATTTTCCAACTTT


BQ
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G
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******************ATTCCTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCT

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TCT

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GTTTGCAACTTTGTAGCTTCCATTGTTGTATACAGAAATGCAGAATTTTCCAACTTT

QA 1 777 1 777
DS 



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TAAAAATTATTACACTTTTTTAACTACTAGTCCGAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAG
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C082JQ U 4
AF RR4EI55JQ U 1
AF RR4AE69JQ U 4
AF RR4C569JQ U 7
AF RR4EI55TF C 428
AF RR4AE69TF C 496
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T
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AATTATTACACTTTTTTAACTACTAGTCCGAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACA
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GTTC

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DS 

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TAAAAATTATTACACTTTTTTAACTACTAGTCCGAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAG
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**GGCTTCAAGCGCTGAGCATCTCAGGTTTGGTGAATACTGGAGGAGTCTAGAGCCAAGA
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TGTGGGAACTTGAAATCATTGTAACTAGGGTTCATGTTCTTTATCTCTTCTCTTGCTGGT
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DS 

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G
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AATTATTACACTTTTTTAACTACTAGTCCGAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACA
TGTGTAGAGAGAAAAGAAGAGGTCATTTCCTTGCATGCTCAGGGATTAAGCGATGACGCA
GTTCAACAGATGCACCAGCCAATTCTTGAGCTGTGAAATCAAACAATGGAGGAAGTGCTC
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DS 

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TTATTACACTTTTTTAACTACTAGTCCGAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACATG
TGTAGAGAGAAAAGAAGAGGTCATTTCCTTGCATGCTCAGGGATTAAGCGATGACGCAGT
TCAACAGATGCACCAGCCAATTCTTGAGCTGTGAAATCAAACAATGGAGGAAGTGCTCTT
CCATTAGGCAAGGATGCGTTGGGGTCTCTCAGAACATCAAAGAACGGGTGCGCACAGGCT
TCAAGCGCTGAACATCTCAGGTTTGGTGAATACTGGAGGAGTCTAGAGCCAAGATCCAAT
GCTTCAGGAGGTACCTGTCTACTAAAAATCTTGTGCCATGGCTGAAGTTTTATCTGTGGG
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AAAACCTTAATGATCTCCACCAATTGATCAACACTAGTCTCTCCAGGGAACAAAGGATGT
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TCAGTTGCTCCAAAGATGAGTTCTGGAGCTCTGTAATACCTTGAGCATATGTAAGATATA
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CGATGTAGA

QA 1 789 1 789
DS 

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CAAGAAAAAGCTCAGCCATTACACAACCTACGGACCACATATCGATGGCGGTTGTGTACT
CAGTTGCTCCAAAGATGAGTTCTGGAGCTCTGTAATACCTTGAGCATATGTAAGATATAT
TGGGTTCTCCAGGAATCAGCATTTTCGCGCTTCCAAAGTCACATATCTTCACCTCATGTG
TAACATTATTCACCAATAGGTTTTGTGGTTTAATGTCACGGTGGCACACTCCAACAGCTC
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GCATCTGATGATTCATCTTGGTGTAAGATCTTGATGCACGGTATATAGTCTCAGGTACAT
ACTCGAGAACAAGGTTGAGATAAAGCTCGTCTTTCTCAGTGGTGGAGAAGAAAGAGTGCT
TGAGCTCAACGACGTTAGGATGGTCGAGCATTCGCATGATCTGAAGCTCTCTGTTC
C

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DS 

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CCAAAGATGAGTTCTGGAGCTCTGTAATACCTTGAGCATATGTAAGATATATTGGGTTCT
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TAAATTCAGCATCATTAAT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 10

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CTCTTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGT
GAAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGACCGATCAA
GACTGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCC
ACTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTT
TTCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAA
CGCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTC
ATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTT
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ATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTT
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BQ
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60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 

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RD RR4EQ10TF 708 0 0
GGCACTCAAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGAT
CTCTTTTCTCATCACTCTTCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGT
GAAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAA
GACTGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCC
ACTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTT
TTCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTA*GACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAA
CGCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTC
ATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTT
TAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGA
CGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATG
ATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTT
CTCGTGTTGAGAACTCAG*TCTAAG*ATGTTCCCATTCTA
TAGTCAGA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4EW40TF 674 0 0
GG
AAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATCTCTTTT
CTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAAAGAC
ACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGACTGAA
AGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGC
ATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGAC
TCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGC
AAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCT
TCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATA
GAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACC
GTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGC
TAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGT
TGAGAACTCAG
T

QA 3 673 3 673
DS 

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AACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTG
ATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTA
TATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGG
GGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTT
ATAAGCTGAC*AGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCA
AAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATACAAT
GAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAAC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4E860TF 679 0 0
GG
ACTCAAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATCTC
TTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAA
AGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCATCAATACTTCATCCGACCGATCAAGAC
TGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACT
TGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTC
TGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGC
TAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATC
GGCTTCCGATCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAA
GATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGG
GACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATG
ACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTC
GTGTTGAGAACTC
GGTC

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DS 

RD RR4BJ31TF 677 0 0
GG
AAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATCTCTTTT
CTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAAAGAC
ACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGACTGAA
AGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGC
ATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGAC
TCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGC
AAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCT
TCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTATGATA
GAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACC
GTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGC
TAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGT
TGAGAACTCACGTCT

QA 3 677 3 677
DS 

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GG
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TTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAA
AGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCATCAATACTTCATCCGACCGATCAAGAC
TGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACT
TGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTC
TGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGC
TAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATC
GGCTTCCGATCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAA
GATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGG
GACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATG
ACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTC
GTGTTGAGAACTCAG*TCTAAG*ATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTTA
AGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGG*TTGAGATA*TACCCGCATGCATGTTT
CTTTACTTTCCTCATGAATATAT

QA 3 805 3 805
DS 

RD RR4E080JQ 824 0 0
G
ACTCAAACACCCCAAACACCAA*CCTAAAA*CACAAGAACATCATCACAATGAAGATCTC
TTT*CTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAA
AGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCATCAATACTTCATCCGACCGATCAAGAC
TGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACT
TGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTC
TGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGC
TAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATC
GGCTTCCGATCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAA
GATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGG
GACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATG
ACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTC
GTGTTGAGAACTCAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTTA
AGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCATGCATGTTT
CTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGAAATTATGTTTTAT

QA 2 824 2 824
DS 

RD RR4EW40JQ 649 0 0
ATCAAGACTGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCT
TGCCCACTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTC
CAGTTTTCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAG
TTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTTTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAG
TCCTCATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTTTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGC
CGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGC
TTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTTTCAC
CAATGATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATT
TGCTTTTCGTGTTGAGAACTCAGGTTTAAGGATGTTCCCATTTTAATAGTCAAGATAATG
TAACGTTAAGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCAT
GCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGAAATTATGTTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4E860JQ 684 0 0
CTTGAGATAGGTCATCAATACTTCATCCGACCGATCAAGACTGAAAGCCTCAATGGTGGT
GGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAACCAAGCACTC
TTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACAGAATCC
ATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTC
TGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCTTCCGATCCAGCAATT
CTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAA
GGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCC
GGTTTTTTT*GGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATATTCGT
CAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAACTCAGGTCT
AAGGATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGACTCGTCCATG
GCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGAAT
ATATAAAATGAAATTATGTTTT
AT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4BJ31JQ 805 0 0
ACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATCTCTTTTCTCATCACTCT
CCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAAAGACACTGCCGGGAA
TTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGACTGAAAGCCTCAATGG
TGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAACCAAGC
ACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACAGA
ATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACC
ACTTTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCTTCCGAGCCAGC
AATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTATGATAGAGAAAGCCGG
AGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGT
CCCCGGTTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATAT
TCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAACTCAG
GTCTAAGGATGTTCCCATTCTAATAGTCGAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGACTCGTC
CATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCCTCAT
GAATATATAAAATGAAATTATGT
CC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 2 11

CO CL334Contig1 773 9 16 U
GGGTTCTTCAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGT
GTGAAGACAACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGG
TTCCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAACCCATGTCA
CAAATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCT
AACCGGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCA
CAACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGC
TGTTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAA
GCGCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGT
GAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATC
TCCGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGA
TGTTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGC
ATTTTATCTTAGTATTGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATTGA
TCTGCTGCTCTGTTCTGGAAATTTCTTGTTTTAATAATAACTTGGTGAAGTAG


BQ
25 25 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DM22TF U 1
AF RR4GJ66TF U -4
AF RR4DM22JQ C 1
AF RR4EX25TF U 1
AF RR4G330TF U -4
AF RR4GJ66JQ C -2
AF RR4AF14JQ C 8
AF RR4AF14TF U 8
AF RR4G330JQ C 137
BS 1 68 RR4DM22TF
BS 69 69 RR4EX25TF
BS 70 259 RR4DM22TF
BS 260 260 RR4EX25TF
BS 261 365 RR4DM22TF
BS 366 367 RR4EX25TF
BS 368 449 RR4DM22TF
BS 450 450 RR4EX25TF
BS 451 632 RR4DM22TF
BS 633 633 RR4EX25TF
BS 634 655 RR4DM22TF
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BS 707 718 RR4EX25TF
BS 719 739 RR4G330TF
BS 740 773 RR4GJ66JQ

RD RR4DM22TF 655 0 0
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AACCGGGTTGAACCATGTCCGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCA
CAACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGC
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GCGCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTTTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGT
GAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATC
TCCGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGA
TGTTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAG*TGTATCTCCCTCCTTGTCTGAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4GJ66TF 633 0 0
GGACTCT
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CCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCTCGATGGACCCAACCCATGTCACA
AATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAA
CCGGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACA
ACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTG
TTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAGGC
GCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGA
GCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATCTC
CGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATG
TTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGA

QA 8 633 8 633
DS 

RD RR4DM22JQ 680 0 0
GGGTTCTTCAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGT
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TTCCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAACCCATGTCA
CAAATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCT
AACCGGGTTGAACCATGTCCGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCA
CAACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGC
TGTTA**GGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAA
GCGCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTTTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGT
GAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATC
TCCGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGA
TGTTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGC
ATTTTATCTTAGTATTGTTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4EX25TF 718 0 0
GGGTTCTTCAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGT
GTGAAGACAACGTACGAGAAAACAAACAACGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGG
TTCCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAACCCATGTCA
CAAATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCT
AACCGGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCA
CAACTCTTTGTGCCGAGCT*GTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGC
TGTTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAA
GCGCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGT
GAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATC
TCCGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGA
TGTTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGC
ATTTTATCTTAGTATTGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAG*AGAGACTTCATT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4G330TF 746 0 0
GGACTCT
GTTCTTCAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGTGT
GAAGACAACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTT
CCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCTCGATGGACCCAACCCATGTCACA
AATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAA
CCGGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACA
ACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTG
TTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAGGC
GCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGA
GCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATCTC
CGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATG
TTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGCAT
TTTATCTTAGTATTGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAG*AGAGACTTCATTGATC
TGCTGCTCTGTTCTGGA
AA

QA 8 744 8 744
DS 

RD RR4GJ66JQ 776 0 0
ACTCT
GTTCTTCAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGTGT
GAAGACAACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTT
CCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCTCGATGGACCCAACCCATGTCACA
AATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAA
CCGGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACA
ACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTG
TTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAGGC
GCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGA
GCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATCTC
CGAGGGAATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATG
TTTATTCATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGCAT
TTTATCTTAGTATTGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATTGATC
TGCTGCTCTGTTCTGGAAATTTCTTGTTTTAATAATAACTTGGTGAAGTAG

QA 6 776 6 776
DS 

RD RR4AF14JQ 731 0 0
GG
AGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGTGTGAAGACA
ACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTTCCGCCAA
TGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAACCCATGTCACAAATGTGA
CTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAACCGGGTT
GAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACAACTCTTT
GTGCCGAGCCAGTGGCCGAATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTGTTAGAGG
AGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCT**GAAAGCTGCGTCAAGCGCCGCCG
ACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGAGCCCAAT
TTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATCTCCGAGGGA
ATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATGTTTATTC
ATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGCATTTTATCT
TAGTATTGTTGAACTCTTATGTATTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATTAATCTGCTGCT
CTGTTCTGG

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR4AF14TF 731 0 0
GG
AGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGTGTGAAGACA
ACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTTCCGCCAA
TGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAACCCATGTCACAAATGTGA
CTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAACCGGGTT
GAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACAACTCTTT
GTGCCGAGCCAGTGGCCGAATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTGTTAGAGG
AGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCT**GAAAGCTGCGTCAAGCGCCGCCG
ACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGAGCCCAAT
TTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATCTCCGAGGGA
ATAATAACTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATGTTTATTC
ATGTGCTCTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGCATTTTATCT
TAGTATTGTTGAACTCTTATGTATTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATTAATCTGCTGCT
CTGTTCTGG

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR4G330JQ 637 0 0
TACTTGTCTGCGTTACTTGGTCTCGATGGACCCAACCCATGTCACAAATGTGACTGGAAA
TGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAACCGGGTTGAACCAT
GTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACAACTCTTTGTGCCGA
GCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTGTTAGAGGAGTCCGG
AGGAAGCTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAGGCGCCGCCGACGTGAC
GCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGAGCCCAATTTGCAGC
CAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTTCTATCTCCGAGGGAATAATAA
CTTACCTTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATGTTTATTCATGTGCT
CTTCCAGGGAGATTAGGTGTATCTCCCTCCTTGTCTGAAGAAGCATTTTATCTTAGTATT
GTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATTGATCTGCTGCTCTGTTCT
GGAAATTTCTTGTTTTAATAATAACTTGGTGAAGTAG

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL334Contig2 766 2 3 U
GGGTTCTTCAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGT
GTGAAGACAACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGG
TTCCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGAGATGGACCCAACCCATGTCA
CAAATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCGAGCT
AACCAGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCA
CAACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGC
TGTTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAATCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAA
GCGCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGT
GAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTCTATCT
CCGATGGAATAATAACTTACCTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATA
ATTATTCATGTTCTCTTCCAGGGAGACTAGGTGTAGCTCCCGGTATGAAGCAGCATTTTA
TCTTAGTACCGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATGATTCTGCT
GCTCTGTTGTGGACGTTTCTTGTTTTAATATAACTTGTTGAAGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FA69TF U 1
AF RR4FA69JQ C 68
BS 1 699 RR4FA69TF
BS 700 700 RR4FA69JQ
BS 701 766 RR4FA69TF

RD RR4FA69TF 766 0 0
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GTGAAGACAACGTACGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGG
TTCCGCCAATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGAGATGGACCCAACCCATGTCA
CAAATGTGACTGGAAATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCGAGCT
AACCAGGTTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCA
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GCGCCGCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGT
GAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTCTATCT
CCGATGGAATAATAACTTACCTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATA
ATTATTCATGTTCTCTTCCAGGGAGACTAGGTGTAGCTCCCGGTATGAAGCAGCATTTTA
TCTTAGTACCGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAG*AGAGACTTCATGATTCTGCT
GCTCTGTTGTGGACGTTTCTTGTTTTAATATAACTTGTTGAAGTAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4FA69JQ 699 0 0
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AATGTTATCTACTTGTCTGCGTTACTTGGTCGAGATGGACCCAACCCATGTCACAAATGT
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TTGAACCATGTCTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACAACTCT
TTGTGCCGAGCCAGTGGCCGGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCTGTTAGA
GGAGTCCGGAGGAAGCTTGATGATGAGAATCAAACCTTTGAAAGCTGCGTCAAGCGCCGC
CGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTGCTGCCGTGAGCCCA
ATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTCTATCTCCGATGG
AATAATAACTTACCTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATAATTATTC
ATGTTCTCTTCCAGGGAGACTAGGTGTAGCTCCCGGTATGAAGCAGCATTTTATCTTAGT
ACCGTTGAACTCTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATGATTCTGCTGCTCTGT
TGTGGACGTTTCTTGTTTTAATATAACTTGTTGAAGTAG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 11

CO CL335Contig1 1063 7 5 U
TAAGACAATAACCCACCATGGATTTTCATAAAATTAAGAAACGAAACACACAACAATTTA
TCAATATGGGAAAATTACTCAAGAATTAAAGTGAAACACAAACAAAATGGGTACAATACC
AATTTCTTAGTTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACA
TACACAAATACATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTAT
GCACTTCACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGC
TTGGATGGTGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGA
TCCATGGAATGCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCT
ACTTCCTTGTTATCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGA
TGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACA
GCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCGATCATTGGCATAAGACCAATAGCCTTG
GCCCGAAGAAAGCATCCTGGAATCACCGGTTCCTGCATAATGACGAGAACATCAATAGGG
TCATTGTCCTCACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGAT
GAGTAAAGAATACGGTCCACCTTGATGAGACCCGTAGTTTTGTCGAGTTCATACTTCACT
TTGCTCCCCTTTCCTATCTCAACCACACAGTTGAAGATTACTGGAGCTTCAGGTCCTATC
TCAAGATCATGCCATGGGTGTGCAGCAACTGATCTATGGGTCAAGGACGAAAGTATCCTC
TCATTAAGAGGAGGCACTGAAGACTGTTTCTCCGCATAGTTCTTGGTAGCAGCAATCTCA
ATCGGTGGCGCCATATCTGAGCAAAAGGTGACGAACGAAGAAGAGAACACAGGCACAGAT
CTCGAGAAGAAGGAACTCAAGAAGCACTGATGCAGAGAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM80JQ U 1
AF RR4CM92TF C 5
AF RR4BZ04JQ U 2
AF RR4CM92JQ U 2
AF RR4BZ04TF C 88
AF RR4BZ79JQ U 68
AF RR4BZ79TF C 342
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BS 802 802 RR4BZ79TF
BS 803 828 RR4BZ79JQ
BS 829 1063 RR4BZ79TF

RD RR4CM80JQ 740 0 0
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TCAATATGGGAAAATTACTCAAGAATTAAAGTGAAACACAAACAAAATGGGTACAATACC
AATTTCTTAGTTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACA
TACACAAATACATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTAT
GCACTTCACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGC
TTGGATGGTGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGA
TCCATGGAATGCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCT
ACTTCCTTGTTATCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGA
TGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACA
GCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCGATCATTGGCATAAGACCAATAGCCTTG
GCCCGAAGAAAGCATCCTGGAATCACCGGTTCCTGCATAATGACGAGAACATCAATAGGG
TCATTGTCCTCACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGAT
GAGTAAAGAATACGGTCCAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4CM92TF 736 0 0
AGACAT
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AAAATTACTCAAGAATTAAAGTGAAACACAAACAAAATGGGTACAATACCAATTTCTTAG
TTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATACACAAATA
CATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTATGCACTTCACA
TCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGCTTGGATGGTG
GTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGATCCATGGAAT
GCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCTACTTCCTTGT
TATCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTGGAA
GCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACAGCAATGATCT
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CACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGATGAGTAAAGAA
TACGGTCCAC

QA 7 736 7 736
DS 

RD RR4BZ04JQ 730 0 0
AAGACAATA
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AAAATTACTCAAGAATTAAAGTGAAACACAAACAAAATGGGTACAATACCAATTTCTTAG
TTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATACACAAATA
CATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTATGCACTTCACA
TCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGCTTGGATGGTG
GTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGATCCATGGAAT
GCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCTACTTCCTTGT
TATCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTGGAA
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AGCATCCTGGAATCACCGGTTCCTGCATAATGACGAGAACATCAATAGGGTCATTGTCCT
CACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGATGAGTAAAGAA
T

QA 10 730 10 730
DS 

RD RR4CM92JQ 739 0 0
AAGACAATA
ACCCACCATGGATTTTCATAAAATTAAGAAACGAAACACACAACAATTTATCAATATGGG
AAAATTACTCAAGAATTAAAGTGAAACACAAACAAAATGGGTACAATACCAATTTCTTAG
TTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATACACAAATA
CATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTATGCACTTCACA
TCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGCTTGGATGGTG
GTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGATCCATGGAAT
GCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCTACTTCCTTGT
TATCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTGGAA
GCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACAGCAATGATCT
TGTCGTCTTTCTCACCCTGATCGATCATTGGCATAAGACCAATAGCCTTGGCCCGAAGAA
AGCATCCTGGAATCACCGGTTCCTGCATAATGACGAGAACATCAATAGGGTCATTGTCCT
CACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGATGAGTAAAGAA
TACGGTCCAC

QA 10 739 10 739
DS 

RD RR4BZ04TF 653 0 0
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*CGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATACACAAATACATTCTTTTGAGAACCC
TAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTATGCACTTCACATCTGTCAAGAAAACAAA
TGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGCTTGGATGGTGGTGAAAGAGATCACCGT
CTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGATCCATGGAATGCTGAACTGCTTCATAG
GCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCTACTTCCTTGTTATCATTTTTCCTATAG
TCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTG
TAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACAGCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCC
TGATCGATCATTGGCATAAGACCAATAGCCTTGGCCCGAAGAAAGCATCCTGGAATCACC
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ATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGATGAGTAAAGAATACGGTCCAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4BZ79JQ 761 0 0
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ATACATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGTAAGTATTTATACTTTGTATGCACTTC
ACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGCTTGGATG
GTGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACATAATCCGCATACAGATCCATGG
AATGCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCTACTTCCT
TGTTCTCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTG
GAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACAGCAATGA
GCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCGATCATTGGCATAAGACCAATAGCCTTGGTCCGAA
GAAAGCATCCTGGAATCACCGGTTCCTGCATAATGACGAGAAAATCAATAGGGTCATTGT
CCTCACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTTGTGTGGGTACACAACAGATGAGTAAA
GAATACGGTCCACCTTGATGAGACCCGTAGTTTTGTCGAGTTCATACTTCACTTTGCTCC
CCTTTCCTATCTCA*CCACACAGTTGAAGATTACTGGAGCT

QA 1 761 1 761
DS 

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AAGGAAGTCGTTAACGGCTACTTCCTTGTTCTCATTTTTCCTATAGTCTTCAAAGAAACG
ACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTC
TGGATCGTCGGCGCAGACAGCAATGAGCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCGATCATTGG
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GACGAGAAAATCAATAGGGTCATTGTCCTCACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCATAGTT
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GTCGAGTTCATACTTCACTTTGCTCCCCTTTCCTATCTCAACCACACAGTTGAAGATTAC
TGGAGCTTCAGGTCCTATCTCAAGATCATGCCATGGGTGTGCAGCAACTGATCTATGGGT
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CTTGGTAGCAGCAATCTCAATCGGTGGCGCCATATCTGAGCAAAAGGTGACGAACGAAGA
AGAGAACACAGGCACAGATCTCGAGAAGAAGGAACTCAAGAAGCACTGATGCAGAGAGAA
CC

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL335Contig2 979 4 4 U
GTCGAGATCTGTGCCTGTGTTTTCTTCTTTGCTCGGGAGATTCGTTACTACGCTCAGATA
TGGCGCCACCGATTGAGATTGCTGCTACCAAGAACTATGCGGAGAAACAGGCTTCAGTTC
CTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCCTTGACCCATAGATCAGTTGCTGCACACCCAT
GGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCGGTAATCTTCAACTGTGTGGTTGAGATAG
GAAAAGGGAGCAAGGTGAAGTATGAACTTGACAAAACTACTGGGCTCATCAAGGTCGATC
GTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCGCGTACACTTT
GTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGGT
GCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATTGATCAGGGTGAGAAAGACG
ACAAGATCATTGCTGTCTGCGCCGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGG
AGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATG
AGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACTACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTC
AGCATTCCATGGATCTGTATGCGGATTACGTCATGGAGACCTTGAGACGGTGATCTCTTT
CACCACCATCCAAGCAATAAAGAAAGTTTCCAACTGCATTTTCGCATTTGTTTTCTTGAC
AGATGTGAAGTGTATACAAAAGTATAAATACTTAACATATATATGTTAGGGTTCTCAAAA
GAATGTATTTGTGTATGTCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATGATGATGCCGAAAAAATTGT
CAAAGAAACTAAGAACGTTGGTATTGTACCCATTTTGTTTGTTCTTCACTTTTATTCTTG
AGTAATTTTCCCATATTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GF95TF U 1
AF RR4GC91TF U 1
AF RR4GC91JQ C 318
AF RR4GF95JQ C 505
BS 1 709 RR4GC91TF
BS 710 710 RR4GC91JQ
BS 711 721 RR4GC91TF
BS 722 979 RR4GC91JQ

RD RR4GF95TF 685 0 0
GTCGAGATCTGTGCCTGTGTTTTCTTCTTTGCTCGGGAGATTCGTTACTACGCTCAGATA
TGGCGCCACCGATTGAGATTGCTGCTACCAAGAACTATGCGGAGAAACAGGCTTCAGTTC
CTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCCTTGACCCATAGATCAGTTGCTGCACACCCAT
GGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCGGTAATCTTCAACTGTGTGGTTGAGATAG
GAAAAGGGAGCAAGGTGAAGTATGAACTTGACAAAACTACTGGGCTCATCAAGGTCGATC
GTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCGCGTACACTTT
GTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGGT
GCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATTGATCAGGGTGAGAAAGACG
ACAAGATCATTGCTGTCTGCGCCGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGG
AGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATG
AGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACTACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTC
AGCATTCCATGGATCTGTATGCGGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GC91TF 721 0 0
GTCGAGATCTGTGCCTGTGTTTTCTTCTTTGCTCGGGAGATTCGTTACTACGCTCAGATA
TGGCGCCACCGATTGAGATTGCTGCTACCAAGAACTATGCGGAGAAACAGGCTTCAGTTC
CTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCCTTGACCCATAGATCAGTTGCTGCACACCCAT
GGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCGGTAATCTTCAACTGTGTGGTTGAGATAG
GAAAAGGGAGCAAGGTGAAGTATGAACTTGACAAAACTACTGGGCTCATCAAGGTCGATC
GTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCGCGTACACTTT
GTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGGT
GCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATTGATCAGGGTGAGAAAGACG
ACAAGATCATTGCTGTCTGCGCCGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGG
AGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATG
AGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACTACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTC
AGCATTCCATGGATCTGTATGCGGATTACGTCATGGAGACCTTGAGACG*TGATCTCTTT
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4GC91JQ 662 0 0
GTTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCGCGTACACTTTGTGAGGACAATGACCCT
ATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGGTGCTTTCTTCGGGCCAAA
GCTATTGGTCTTATGCCAATGATTGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCTGTC
TGCGCCGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGT
CTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCC
GTTAACTACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTG
TATGCGGATTACGTCATGGAGACCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCACCATCCAAGCAA
TAAAGAAAGTTTCCAACTGCATTTTCGCATTTGTTTTCTTGACAGATGTGAAGTGTATAC
AAAAGTATAAATACTTAACATATATATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTATTTGTGTATG
TCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATGATGATGCCGAAAAAATTGTCAAAGAAACTAAGAACG
TTGGTATTGTACCCATTTTGTTTGTTCTTCACTTTTATTCTTGAGTAATTTTCCCATATT
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4GF95JQ 475 0 0
ACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTG
AGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACT
ACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTGTATGCGG
ATTACGTCATGGAGACCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCCCCATCCAAGCAATAAAGAA
AGTTTCCAACTGCATTTTCGCATTTGTTTTCTTGACAGATGTGAAGTGTATACAAAAGTA
TAAATACTTAACATATATATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTATTTGTGTATGTCCTTTT
GCTGAATCCGGTAGATGATGATGCCGAAAAAATTGTCAAAGAAACTAAGAACGTTGGTAT
TGTACCCATTTTGTTTGTTCTTCACTTTTATTCTTGAGTAATTTTCCCATATT
CC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 10

CO CL336Contig1 900 10 12 U
AACATGCATAGCTTTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGATACTGTCCAA
CAAACACCAGAAACTAAATTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGA
TGGAGCTGATCTAAAACATAATAGCAGTGTGACCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATA
TATGACCAGACTAAATAAATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTG
AGCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTC
CACGAAATAACAAGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTC
AATCACCATAGTCCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGCATGTACAGTCAAGATTGAAGA
ATAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATGCCGAGGATGCGTTCATCATC
ATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAGTAGTTGCAGGAAGACCAGATTTGACGTTGAC
TTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGATGGCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTT
GTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTT
AATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGACGATGATGCAA
CCGTGCATACTGCGCCGTGACAAGAGCACCGTACATCTCTGAATCCTCTACGATCATCTC
CTCCATCTCTTATCTTCCTTGTGATTTTAAGGAAAGCTGGTTTGGTCTCAATGAGAAGTG
GATAAGATAGAGAGGAAAGGCAGGCGACTAAAGAAAGAAGAATAAATTTAGCTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 30 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 5 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 0 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C035JQ U 32
AF RR4GQ67JQ U -4
AF RR4EA87JQ U -6
AF RR4H353JQ U 1
AF RR4H353TF C -3
AF RR4BZ78JQ U 18
AF RR4BZ78TF C 83
AF RR4B381JQ U 11
AF RR4EA87TF C 241
AF RR4B381TF C 242
BS 1 633 RR4H353JQ
BS 634 634 RR4EA87JQ
BS 635 653 RR4H353JQ
BS 654 654 RR4EA87JQ
BS 655 696 RR4H353JQ
BS 697 697 RR4B381JQ
BS 698 772 RR4H353JQ
BS 773 773 RR4B381JQ
BS 774 775 RR4H353JQ
BS 776 807 RR4B381JQ
BS 808 865 RR4EA87TF
BS 866 900 RR4B381TF

RD RR4C035JQ 175 0 0
GGGTGCATAAATGCAAAGATACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAATTACATCAAAACT
TTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACATAATAGCAGTGTG
ACCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATAAATAGCTTC

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR4GQ67JQ 599 0 0
ACAACAACATGCACAGCT
TTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGATAATGTCCAACAAACACCAGAAA
CTAAATTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTA
AAACATAATAGCAGTGTGACCACTCATGCTGCCTCTCTATACATATATATGACCAGACTA
AATAAATAGCTTCAGAAGGGGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTT
TCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACGAAATAACAA
GTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCAATCACCATAGTC
CCTGCTCTCCCATCGATCGTCTCCGCATGTACAGTCAAGATCGAAGAATAGTTCTTAAGT
CTATGATCACCACCAATGATGTTGATGCCGAGGATGCGTTCATCATTATCAAGCTGTTCC
AATCTCTCGGTACTAGTAGTTGCAGGAAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTA
CCGATCTCAG*ATGGCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAA

QA 19 599 19 599
DS 

RD RR4EA87JQ 685 0 0
CAACAACACGCTAAGT
AGCTTTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATACAAAGACACTGTCCAACAAACACCA
GAAACTAAATTACATCAAAACTTTTACCACATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGA
TCTAAAACATAATAGCAGTGTG*CCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATATATGACCAG
ACTAAATGAATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAA
TCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGACTTCAAGTTACACTTGATGAGTGATTCCACGAAATA
ACAAGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCAATCACCAT
AGTTCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTT
AAGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTG
TTCAAGTCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGAAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAG
ACTACCGATCTCAGGATGTCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTG
CGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTT
GACGAGAAC

QA 17 685 17 685
DS 

RD RR4H353JQ 776 0 0
AACATGCATAGCTTTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGATACTGTCCAA
CAAACACCAGAAACTAAATTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGA
TGGAGCTGATCTAAAACATAATAGCAGTGTGACCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATA
TATGACCAGACTAAATAAATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTG
AGCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTC
CACGAAATAACAAGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTC
AATCACCATAGTCCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGCATGTACAGTCAAGATTGAAGA
ATAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATGCCGAGGATGCGTTCATCATC
ATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAGTAGTTGCAGGAAGACCAGATTTGACGTTGAC
TTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGATGGCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTT
GTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGTGACCAAACGAGATGAACAGAGGCTTT
AATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACACTGATTCTCGCTGCAGTGGTGACGATGATGCAA
CCGTGCATACTGCGCCGTGACAAGAGCACCGTACATCTCTGAATCCTCTACGGTC
C

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4H353TF 780 0 0
TTTTTAACATGCATAGC
TTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGATACTGTCCAACAAACACCAGAAA
CTAAATTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTA
AAACATAATAGCAGTGTGACCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTA
AATAAATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTT
TCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACGAAATAACAA
GTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCAATCACCATAGTC
CCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGCATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGT
CTATGATCACCACCAATGATGTTGATGCCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCC
AATCTCTCGGTACTAGTAGTTGCAGGAAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTA
CCGATCTCAGGATGGCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGC
TGATCAAATCTTCGGACAAGTGACCAAACGAGATGAACAGAGGCTTTAATGTATTTGACG
AGAACAGAGGTACACTGATTCTCGCTGCAGTGGTGACGATGATGCAACCGTGCATACTGC
GCCGTGACAAGAGCACCGTACATCTCTGAATCCTCTACGGTC
C

QA 18 779 18 779
DS 

RD RR4BZ78JQ 742 0 0
C
CTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGATACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAA
TTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACA
TAATAGCAGTGTGACCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATAA
ATAGCTTCAAAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAAA
GACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACGAAATAACAAGTCTC
ATATTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCAATCACCATAGTCCCTGC
TCTCCCATCGATCATCTCCGCATGTACAGTCAAGATTGAAAAATAGTTCTTAAGTCTATG
ATCACCACCAATGATGTTGATGCCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCT
CTCGGTACTAGTAGTTGCAGGAAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGAT
CTCAGGATGGCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTGTTTCTGCGGCTGATC
AAATCTTCGGACAAGTGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAAC
AGAGGTACACTGATTCTCACTGCAGTGGTGACGATGATGCAACCGTGCATACTGCGCCGT
GACAAGAGCACCGTACAT
ATC

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR4BZ78TF 694 0 0
ATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACATAAT
AGCAGTGTGACCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATAAATAG
CTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGAGACA
CAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACGAAATAACAAGTCTCATAT
TTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCAATCACCATAGTCCCTGCTCTC
CCATCGATCATCTCCGCATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATGATCA
CCACCAATGATGTTGATGCCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCTCTCG
GTACTAGTAGTTGCAGGAAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGATCTCA
GGATGGCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTGTTTCTGCGGCTGATCAAAT
CTTCGGACAAGTGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAACAGAG
GTACACTGATTCTCACTGCAGTGGTGACGATGATGCAACCGTGCATACTGCGCCGTGACA
AGAGCACCGTACATATCTGAATCCTCTACGGTC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4B381JQ 797 0 0
GCTTTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATACAAAGACACTGTCCAACAAACACCAG
AAACTAAATTACATCAAAACTTTTACCACATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGAT
CTAAAACATAATAGCAGTGTG*CCACTCATGCTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGA
CTAAATGAATAGCTTCAGA*GGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAAT
CTTTCAGAGACACAAGCCAAGGACTTCAAGTTACACTTGATGAGTGATTCCACGAAATAA
CAAGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCAATCACCATA
GTTCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTA
AGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGT
TCAAGTCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGAAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGA
CTACCGATCTCAGGATGTCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGC
GGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTG
ACGAGAACAGAGGTACACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAACCGTGCGTAC
TGCGCCGTGACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATCCTCTACGATGATCTCCTCCATCTCT
TATCTTCCTTGTGATTT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4EA87TF 627 0 0
AGCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGACTTCAAGTTACACTTGATGAGTGATTC
CACGAAATAACAAGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTC
AATCACCATAGTTCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGA
ATAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATC
ATCAAGCTGTTCAAGTCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGAAGACCAGATTTGACGTTGAC
TTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGATGTCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTT
GTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTT
AATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAA
CCGTGCGTACTGCGCCGTGACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATCCTCTACGATGATTTC
CTCCATCTCTTATCTTCCTTGTGATTTTAAGGAAAGCTGGTTTGGTCTCAATGAGAAGTG
GATAAGATAGAGAGGAAAGGCAGGC
CC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4B381TF 659 0 0
GCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGACTTCAAGTTACACTTGATGAGTGATTCC
ACGAAATAACAAGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCCACAACAAAAGATTCA
ATCACCATAGTTCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAA
TAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCA
TCAAGCTGTTCAAGTCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGAAGACCAGATTTGACGTTGACT
TCTCTGAGACTACCGATCTCAGGATGTCCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTG
TATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTA
ATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAAC
CGTGCGTACTGCGCCGTGACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATCCTCTACGATGATCTCC
TCCATCTCTTATCTTCCTTGTGATTTTAAGGAAAGCTGGTTTGGTCTCAATGAGAAGTGG
ATAAGATAGAGAGGAAAGGCAGGCGACTAAAGAAAGAAGAATAAATTTAGCTTTTATCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 3 11

CO CL337Contig1 705 2 2 U
GGTTCTTGAATCTGCTGGGGAAGGTGGAAAGGCTCGGCTTTATCAGGTTCTGGAGTCTAG
TGTTACTACCGCCTCTGGAGAAGATAACAAGAGCACCAATGGAACTGTTGTTTGGCTTCA
TCTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGAACGAAGC
TCATTTCCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATATTTTTTGA
AGATGGAAGCATTTTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATATTCAATAT
ACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGTACGGTTTGTGTGCAA
CTACCTCTACTATCACTCCCTCAGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCTTCCT
CCACGTTCCTTTGTTCTCCAAAATCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTGGTCTCTCT
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GCTTGTGATAAAAAAAAAAGACTTATTTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTA
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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AK78JQ C 1
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DS 

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G
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CTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGAACGAAGCT
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GATGGAAGCATTTTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATATTCAATATA
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CTTGTGATAAAAAAAAAAGACTTATTTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTAA
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QA 2 705 2 705
DS 



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GGCTTCAAGAGGTTCCTTGGTGTTTCCGAAAACCCTACTGAGAAAATCGCTACTAATCTG
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ACTACCGCCTCTGGAGAAGATAACAAGAGCACCAATGGAACTGTTGTTTGGCTTCATCTT
GGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGAACGAAGCTCAT
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ATATAAAAAAAAAGACTTATTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTAAAGCACA
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TTGAAAAATGTCAAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DG93TF U 1
AF RR4HB79TF U 88
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AF RR4C507TF U 607
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GGAGTGAGTAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGAACGAAGCTCAT
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G
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QA 2 753 2 753
DS 

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GG
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CTCAAAAAACTCGATCTAGAACTGGTTTGGAGAAGATGGGCTCTGAAGGACCAAAAGCAA
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GG
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TTGTTTGGCTTCACCTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAG
CAGTGAACGAAGCTCATTTCCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTC
CTATAGTTTTTGAAGGTGGAAGCATTTTAAAGGCAAAATAGACTACATGTCCAACAGAGT
CGATATTCAATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGAC
GGTTTGTGTGCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCAGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACA
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TCGTCGTCTCCCTCTTGGAGGCAATTGCAGCTACTTGCTAGTGTACTATTGCCAATGTGT
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QA 3 863 3 863
DS 

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GAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGAACGAAGCTCATTTCCGTTGTCCTGATCAA
TTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAGTTTTTGAAGATGGAAGCATTTTAAAGGCA
AAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATATTCAATATACTAAAGAACAAAGGCTACGAC
GTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTGTGCGCAACTACCTCTACTATCACTCCCTC
AGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCTTCCTCCACGTTCCTTTGTTCTCCAAA
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TGCTAGTGTACTATTGCCAATGTGTGTAAGTATAATGTATATCATCCTTCTACGAAGCAT
TGTGTTCTTTTGTTGGGGAGTGTGGTTGTATTGTAGCTTGTGATATAAAAAAAAAGACTT
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QA 1 780 1 780
DS 

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QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4C507TF 492 0 0
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TATCACTCCCTCAGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCTTCCTCCACGTTCCT
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AAAAAAAGACTTATTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTAAAGCACACGATTA
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AATGTCAAAGTT

QA 1 492 1 492
DS 



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TTTTATGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET74JQ C 1
AF RR4ET74TF U 1
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TTTTATGAT

QA 1 729 1 729
DS 

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ACATGTCCAACAGAGTCGATATTCAATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAA
TCAGACGACGCTGGACGGTTTGTGTGCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCAGGTTCGCT
GAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCTTCCTCCACGTTCCTTTGTTCTCCAAAATCGATGAA
GATACTCAGATGCAGTTCGTGGTCTCTCTCTTGGAGGCAATTGCAGCTACTTGCTAGTGT
ACTATTGCCAATGTGTGTAAGTATAAATGTATATCCTTCTACGAAGCATTGTGTTCTTTT
GTTGGGGAGTGTGGTTGGTTGTATTGTAGCTTGTGATAAAAAAAAAGACTTATTTGCTTT
TGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTAAAGCACACGATTAGGAAAGAAAGAGCCTTTTGT
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TTT
ATGAT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 11

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TTCTCCATTATCTTTTCTAATCTCTTCCCGTTCGTCAGATACAGATAACCAATCAGTGTC
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BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET52JQ U 2
AF RR4C760JQ U 2
AF RR4AX03JQ U 1
AF RR4C982JQ U 2
AF RR4EG78JQ U 2
AF RR4AX03TF C 182
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BS 168 761 RR4AX03JQ
BS 762 890 RR4AX03TF

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DS 

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CATAAATGGAATCACCTA

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DS 

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TCATCAACAAGTTTCTTCAGCAAAGCATACTGAGCTTCACAGCGCACCACAGCTCTAACA
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TCATAAATGGAATCACCTATAAAAGCTAAAGAAGCAGCATTGAAAACTGATCTCGGCTTC
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DS 

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GTTTTGGCTTGGCCATTTCAATCATGATCTGAGTCGAAAAGTCGCTTGAGAATCCTAGCT
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CCAATGATGATGCTTTGTTATAAACTGCAACACCTGCACGCCTTCTTGTACGTGTTCTAG
CAAAGCCTAAATTCTTTCCCCACCTCAGTACATCTCTCTCTTCCTTTGTTAAGAAATCAT
CATCAACAAGTTTCTTCAGCAAAGCATACTGAGCTTCACAGCGCACCACAGCTCTAACAC
GATCGTTATAATCTTCAATACTAAGTGGAGGGAAAAGGAAATGCCTACGAGCATATAGCT
CATAAATGGAATCACCTATAAAAGCTAAAGAAGCAGCATTGAAAACTGGTCTCGGCTTCT
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CACTCAACTCTTTACTTGC

QA 1 739 1 739
DS 

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TCACGATGTGTACGGCACAATACACATACTCTCCGGTTAAGTGAACAATGAAATGCTAAA
CCGGCCTAACCCTGATGATCCTTCAGCTTTTGCATGATCTGAGAGAGTAAACCACCTTTT
TACTATACTACTGTGACACTTGCTCATTGAGTATAAAGGAAGGCAGGTTTGATTCTGATG
GCTTTGGCTTGGCCATTTCAATCATGATCTCAGTCGAAGAGTCGCTTGAGAATCCTAGCT
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CCAAAGATGATGCTTTGTTATAAACTGCAACACCTGCACGCCTTCTTGAACGTGTTCTAG
CCGAGCCTAGATTCTTTCCCCACCTGAGTACATCCCTCTCTTCCTTTGTTAGAAAATCAT
CATCAACAAGTTTCTTCAGCAAAGCGTACTGAGCTTCACAGCGCACCACAGCTCTAACAC
GATCGTTATAATCTTCAATACTAAGTGGAGGGAAAAGGAAATGCCTACGAGCATATAGCT
CATAAATGGAATCACCTATAAAAGCTAAAGAAGCAGCATTGAAAACTGATCTCGGCTTCT
CAAGCTTTGGTGGACTTGGAGACCACGTTTCATATCCCATATAACTATCATCAACTTCTT
CACTCAACTCTTTACTTGCGGGTCGCTTGA

QA 1 750 1 750
DS 

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TACTATACTACTGTGACACTTGCTCATTGAGTATAAAGGCAGGCAGGTTTGATTCTGATG
GCTTTGGCTTGGCCATTTCAATCATGATCTCAGTCGAAGAGTCGCTTGAGAATCCTAGCT
TCTCCATTATCTTTTCTAATCTCTTCCCGTTCGTCAGATACAGATAACCAATCAGTGTCT
CCAAAGATGATGCTTTGTTATAAACTGCAACACCTGCACGCCTTCTTGAACGTGTTCTAG
CCGAGCCTAGATTCTTTCCCCACCTGAGTACATCCCTCTCTTCCTTTGTTAGAAAATCAT
CATCAACAAGTTTCTTCAGCAAAGCATACTGAGCTTCACAGCGCACCACAGCTCTAACAC
GATCGTTATAATCTTCAATACTAAGTGGAGGGAAAAGGAAATGCCTACGAGCATATAGCT
CATAAATGGAATCACCTATAAAAGCTAAAGAAGCAGCATTGAAAACTGATCTCGGCTTCT
CAAGCTTTGGTGGACTTGGAGACCACGTCTCATATCCCATATAACTATCATCAACTTCTT
CACTCAACTCTTTACTTGCGGGTCGCTTGAGCAAATCGTCGACGGAGATGCTAATTCGAG
GAGACGGTGGAGGAGGAGGTAAAGGCGGCGGCAAGAAAGAGTTGCTGTTTGGGGCTTTCT
TCGCTTTACGAGGCGCGTTAGGGTTGTACGGAAGTCTAGGCTGTGTATC

QA 1 709 1 709
DS 



CO CL338Contig2 769 5 37 U
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GATACACAACCTAGACTTCCGTACAACCCTAACGCGCCTCGTAAAGCGAAGAAAACCCCA
AACAGCAACTCTTTCTTGCCGCCGCCTTTACCTCCTCCACCACCGTCTCCGCGACTCAGC
ATCTCCGTCGACGATTTGCTCAAGCGACCCGCAAGTAAAGAGTTGAGTGAAGAAGTTGAT
GATAGTTATATGGGATATGAAACGTGGTCTCCAAGTCCACCAAAGCTTGAGAAGCCGAGA
TCAGTTTTCAATGCTGCTTCTTTAGCTTTTATAGGTGATTCCATTTATGAGCTATATGCT
CGTAGGCATTTCCTTTTCCCTCCACTTAGTATTGAAGATTATAACGATCGTGTTAGAGCT
GTGGTGCGCTGTGAAGCTCAGTATGCTTTGCTGAAGAAACTTGTTGATGATGATTTTCTA
ACAAAGGAAGAGAGGGATGTACTCAGGTGGGGAAAGAATCTAGGCTCGGCTAGAACACGT
TCAAGAAGGCGTGCAGGTGTTGCAGTTTATAACAAAGCATCATCATTGGAGACACTGATT
GGTTATCTGTATCTGACGAACGGGAAGAGATTAGAAAAGATAATGGAGAAGCTAGGATTC
TCAAGCGACTCTTCGACTGAGATCATGATTGAAATGGCCAAGCCAAAGCCATCAGAATCA
AACCTGCCTTCCTTTATACTCAATGAGCAAGTGTCACAGTAGTATAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 

AF RR4C982TF U 1
AF RR4ET52TF U 30
AF RR4C760TF U 8
AF RR4DE94TF U 8
AF RR4EG78TF U 30
BS 1 68 RR4C982TF
BS 69 69 RR4C760TF
BS 70 105 RR4C982TF
BS 106 106 RR4C760TF
BS 107 115 RR4C982TF
BS 116 116 RR4C760TF
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BS 139 158 RR4C982TF
BS 159 159 RR4C760TF
BS 160 170 RR4C982TF
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BS 172 174 RR4C982TF
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BS 176 260 RR4C982TF
BS 261 261 RR4C760TF
BS 262 300 RR4C982TF
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BS 302 476 RR4C982TF
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BS 652 766 RR4C760TF
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RD RR4C982TF 651 0 0
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AACAGCAACTCTTTCTTACCGCCGCCTTTACCTCCTCCTCCACCGTCTCCTCGAATCAGC
ATCTCCGTCGACGATTTGCTCAAGCGACCCGCAAGTAAAGAGTTGAGTGAAGAAGTTGAT
GATAGTTATATGGGATATGAGACGTGGTCTCCAAGTCCACCAAAGCTTGAGAAGCCGAGA
CCAGTTTTCAATGCTGCTTCTTTAGCTTTTATAGGTGATTCCATTTATGAGCTATATGCT
CGTAGGCATTTCCTTTTCCCTCCACTTAGTATTGAAGATTATAACGATCGTGTTAGAGCT
GTGGTGCGCTGTGAAGCTCAGTATGCTTTGCTGAAGAAACTTGTTGATGATGATTTCTTA
ACAAAGGAAGAGAGAGATGTACTGAGGTGGGGAAAGAATCTAGGCTCTGCTAGAACACGT
ACAAGAAGGCGTGCAGGTGTTGCAGTTTATAACAAAGCATCATCATTGGAGACACTGATT
GGTTATCTGTATCTGACGAACGGGAAGAGATTAGAGAA*ATAATGGAGAAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4ET52TF 589 0 0
G
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AACGCGCCTCGTAAAGCGAAGAAAACCCCAAACAGCAACTCTTTCTTGCCGCCGCCTTTA
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CCAAGTCCACCAAAGCTTGAGAAGCCGAGATCAGTTTTCAATGCTGCTTCTTTAGCTTTT
ATAGGTGATTCCATTTATGAGCTATATGCTCGTAGGCATTTCCTTTTCCCTCCACTTAGT
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CTGAAGAAACTTGTTGATGATGATTTTCTAACAAAGGAAGAGAGGGATGTACTCAGGTGG
GGAAAGAATCTAGGCTCGGCTAGAACACGTTCAAGAAGGCGTGCAGGTGTTGCAGTTTAT
AACAAAGCATCATCTTTGGAGACACTGATTGGTTATCTGTATCTGACG

QA 2 589 2 589
DS 

RD RR4C760TF 759 0 0
GGG
AAGCTTCAATGGTGATTATATCGGGGAGCTTCTCCGTGAGAGCTGCCTTGGATACACAAC
CTAGACTTCCGTACAACCCTAACGCGCCTCGTAAAGCGAAGAAAACCCCAAACAGCAACT
CTTTCTTGCCGCCGCCTTTACCTCCTCCACCACCGTCTCCGCGACTCAGCATCTCCGTCG
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TGGGATATGAAACGTGGTCTCCAAGTCCACCAAAGCTTGAGAAGCCGAGATCAGTTTTCA
ATGCTGCTTCTTTAGCTTTTATAGGTGATTCCATTTATGAGCTATATGCTCGTAGGCATT
TCCTTTTCCCTCCACTTAGTATTGAAGATTATAACGATCGTGTTAGAGCTGTGGTGCGCC
GTGAAGCTCAGTATGCTTTGCTGAAGAAACTTGTTGATGATGATTTTCTAACAAAGGAAG
AGAGGGATGTACTCAGGTGGGGAAAGAATCTAGGCTCGGCTAGAACACGTTCAAGAAGGC
GTGCAGGTGTTGCAGTTTATAACAAAGCATCATCATTGGAGACACTGATTGGTTATCTGT
ATCTGACGAACGGGAAGAGATTAGAAAAGATAATGGAGAAGCTAGGATTCTCAAGCGACT
CTTCGACTGAGATCATGATTGAAATGGCCAAGCCAAAGCCATCAGAATCAAACCTGCCTT
CCTTTATACTCAATGAGCAAGTGTCACAGTAGTATA

QA 4 759 4 759
DS 

RD RR4DE94TF 762 0 0
GGG
AAGCTTCAATGGTGATTATATCGGGGAGCTTCTCCGTGAGAGCTGCCTTGGATACACAAC
CTAGACTTCCGTACAACCCTAACGCGCCTCGTAAAGCGAAGAAAACCCCAAACAGCAACT
CTTTCTTGCCGCCGCCT**ACCTCCTCCACCACCGTCTCCGCTACTCAGCATCTCCGTCG
ACGATTTGCTCGAGCGACCCGCAAGTAAAGAGTTGAGTGAAGAAGTTGATGATAGTTATA
TGGGATATGAAACGTGGTCTCCAAGTCCACCAAAGCTTGAGAAGCCGAGATCAGTTTTCA
ATGCTGCTTCTTTAGCTTTTATAGGTGATTCCATTTATGAGCTATATGCTCGTAGGCATT
TCCTTTTCCCTCCACTTAGTATTGAAGATTATAACGATCGTGTTAGAGCTGTGGTGCGCT
GTGAAGCTCAGTATGCTTTGCTGAAGAAACTTGTTGATGATGATTTTCTAACAAAGGAAG
AGAGGGATGTACTCAGGTGGGGAAAGAATCTAGGCTCGGCTAGAACACGTTCAAGAAGGC
GTGCAGGTGTTGCAGTTTATAACAAAGCATCATCATTGGAGACACTGATTGGTTATCTGT
ATCTGACGAACGGGAAGAGATTAGAAAAGATAATGGAGAAGCTAGGATTCTCAAGCGACT
CTTCGACTGAGATCATGATTGAAATGGCCAAGCCAAAGCCATCAGA*TCAAACCTGCCTT
CCTTTATACTCAATGAGCAAGTATCACAGTAGTATAGTA

QA 4 762 4 762
DS 

RD RR4EG78TF 738 0 0
G
TCGGGGAGCTTCTCCGTGAGAGCTGCCTTGGATACACAACCTAGACTTCCGTACAACCCT
AACGCGCCTCGTAAAGCGAAGAAAACCCCAAACAGCAACTCTTTCTTGCCGCCGCCTTTA
CCTCCTCCACCACCGTCTCCGCGACTCAGCATCTCCGTCGACGATTTGCTCAAGCGACCC
GCAAGTAAAGAGTTGAGTGAAGAAGTTGATGATAGTTATATGGGATATGAAACGTGGTCT
CCAAGTCCACCAAAGCTTGAGAAGCCGAGATCAGTTTTCAATGCTGCTTCTTTAGCTTTT
ATAGGTGATTCCATTTATGAGCTATATGCTCGTAGGCATTTCCTTTTCCCTCCACTTAGT
ATTGAAGATTATAACGATCGTGTTAGAGCTGTGGTGCGCTGTGAAGCTCAGTACGCTTTG
CTGAAGAAACTTGTTGATGATGATTTTCTAACAAAGGAAGAGAGGGATGTACTCAGGTGG
GGAAAGAATCTAGGCTCGGCTAGAACACGTTCAAGAAGGCGTGCAGGTGTTGCAGTTTAT
AACAAAGCATCATCTTTGGAGACACTGATTGGTTATCTGTATCTGACGAACGGGAAGAGA
TTAGAAAAGATAATGGAGAAGCTAGGATTCTCAAGCGACTCTTCGACTGAGATCATGATT
GAAATGGCCAAGCCAAAGCCATCAGAATCAAACCTGCCTTCCTTTATACTCAATGAGCAA
GTGTCACAGTAGTATAG

QA 2 738 2 738
DS 



AS 2 10

CO CL339Contig1 955 2 2 U
GCAAAAGGCGTACGTTTTATATTATAAAATGAGACCATAGTCGAGACACCACACGAACAC
AAACCACTTTGGTCACAGAATCTTTAGGAAAACTAGAACCCTACGAAACCTAAAACTTGG
AACTCATTTTTAGACCAACGAAATGCTGCTCTCACCACCCGGAGGCCTCCTGGCGCCACC
ATAGTAATCCCTATACTCAGACTTGCCGTCTGCAAATATATTGTTCCCCCTCATCTCCCG
CGATTTAGCTGAGCTGTGCATCTTCTCCGAATAGCCAGGAGGGACCTTATCGGATTTGAA
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GGCGGTGGAGTGATGGGGATCGCTTGATCGCTCCATTACCTCTCTTTTAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E303JQ U 1
AF RR4E041TF C 272
BS 1 814 RR4E303JQ
BS 815 955 RR4E041TF

RD RR4E303JQ 814 0 0
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TAG
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ATTACCTCTCTTTTAATTTCC

QA 4 684 4 684
DS 



CO CL339Contig2 954 8 17 U
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GATGACTTCACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTAACATTGGAGGCTTTA
ACAGATTCCTCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTGTTGGAGGAGGAGATGCA
AAGATGGTTGCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCCTGTGTTTGTACAGAC
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TTCTGGTTGGAGGGATTAGCGGAGGAGGAGTGGTGGATCTGGGACCAAGAGAGAAGATCG
GCGGTGGAGTGATGGGGATCGCTTGATCGCTCCATTACCTCTCTTTTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RR4A837JQ U 52
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ACCTTATCGGATTTGAAGATACCGTTGCTCGTGAGTTGATGAAACTTGGGGTTGTTGTGT
CCGTTCCTTGATGACTTCACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTAACATTG
GAGGCTTTAACAGATTCCTCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTGTTGGAGGA
GGAGATGCAAAGATGGTTGCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCCTGTGTT
TGTACAGACCTTCCCAACTCCT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4AH85JQ 762 0 0
GCACTA
CAAAAGGCGTACGTTTTATATTATAAAATGAGACCATAGTCGAGACACCACACGAACACA
AACCACTTTGGTCACAGCATCTTTAGGAAAACTAGAACCCTACGAAACCTAAAACTTGGA
ACTCATTTTTAGATCAACGAAATGCTGCTCTCACCACCCGGAGGCCTCCTGGCGCCACCA
TAGTAATCCCTATACTCAGACTTGCCGTCTGCAAATATATTGTTTCCCCTCATTTCCCGC
GATTTAGCCGAGCTATGCATCTTCTCCGAATAACCAGGAGGGACCTTATCGGATTTGAAG
ATACCGTTGCTCGTGAGTTGCTGAAACTTGGGGTTGTTGTGTCCGTTCCTTGATGACTTC
ACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTAACATTGGAGGCTTTAACAGATTCC
TCCATGTTGTTGTTTTCTTTAACTTGTTGTTTTGTTGGAGGAGGAGATGCAAAGATGGTT
GCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCCTGTGTTTGTACAGACCTTCCCAAC
TCCTTAAGCTTAGCAGAAGAGGTTGGTTTCTTAGGAGTCACAGCAGCGTTGTCTTCGCCG
CTGAAAGAGATCTGACTATCCTGA*CATGATGGTAATGGATTCTTGAAGTGTGGTTTGGA
TAAGCGTTGTTAGTAACGTTACCATTATCAGAGAAGATATCACTACCAGTCATTTCTTTT
AGCTTGTGACCAGAACAGTTCTTCCTGTATGATACA

QA 7 762 7 762
DS 

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TTTA
CAAAAGGCGTACGTTTTATATTATAAAATGAGACCATAGTCGAGACACCACACGAACACA
AACCACTTTGGTCACAGCATCTTTAGGAAAACTAGAACCCTACGAAACCTAAAAATTGGA
ACTCATTTTTAGATCAACGAAATGCTGCTCTCACCACCCGGAGGCCTCCTGGCGCCACCA
TAGTAATCCCTATACTCAGACTTGCCGTCTGCAAATATATTGTTTCCCCTCATTTCCCGC
GATTTAGCTGAGCTATGCATCTTCTCCGAATAACCAGGAGGGACCTTATCGGATTTGAAG
ATACCGTTGCTCGTGAGTTGCTGAAACTTGGGGTTGTTGTGTCCGTTCCTTGATGACTTC
ACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTAACATTGGAGGCTTTAACAGATTCC
TCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTGTTGGAGGAGGAGATGCAAAGATGGTT
GCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCCTGTGTTTGTACAGACCTTCCCAAC
TCCTTAAGCTTAGCAGAAGAGGTTGGTTTCTCAGGAGTCACAGCAGCGTTGTCTTCGCCG
CTGAAAGAGATCTGACTATCCTGATCATGATGGTAATGGATTCTTGAAGTGTGGTTTGGA
TAAGCGTTGTTAGTAACGTTACCATTATCAGAGAAGATATCACTACCAGTCATTTCTTTT
AGCTTGTGACCAGAACAGTTCTTCCTGTATGATACATTC
C

QA 5 763 5 763
DS 

RD RR4A910JQ 722 0 0
GTCGAGACACCACACGAACACAAACCACTTTGGTCACAGCATCTTTAGGAAAACTAGAAC
CCTACGAAACCTAAAAATTGGAACTCATTTTTAGATCAACGAAATGCTGCTCTCACCACC
CGGAGGCCTCCTGGCGCCACCATAGTAATCCCTATACTCAGACTTGCCGTCTGCAAATAT
ATTGTTTCCCCTCATTTCCCGCGATTTAGCTGAGCTATGCATCTTCTCCGAATAACCAGG
AGGGACCTTATCGGATTTGAAGATACCGTTGCTCGTGAGTTGCTGAAACTTGGGGTTGTT
GTGTCCGTTCCTTGATGACTTCACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTAAC
ATTGGAGGCTTTAACAGATTCCTCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTGTTGG
AGGAGGAGATGCAAAGATGGTTGCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCCTG
TGTTTGTACAGACCTTCCCAACTCCTTAAGCTTAGCAGAAGAGGTTGGTTTCTCAGGAGT
CACAGCAGCGTTGTCTTCGCCGCTGAAAGAGATCTGACTATCCTGATCATGATGGTAATG
GATTCTTGAAGTGTGGTTTGGATAAGCGTTGTTAGTAACGTTACCATTATCAGAGAAGAT
ATCACTACCAGTCATTTCTTTTAGCTTGTGACCAGAACAGTTCTTCCTGTATGATACATT
C
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4GX03TF 711 0 0
CTAG
ACCCTACGAAAC*TAAAACTTGGA*CTCATTTT*AGATCAACGAAATGCTGCTCTCACCA
CCCGGAGGCCTCCTGGCGCCACCATAGTAATCCCTATACTCAGACTTGCCGTCTGCAAAT
ATATTGTTTCCCCTCATTTCCCGCGATTTAGCTGAGCTATGCATCTTCTCCGAATAACCA
GGAGGGACCTTATCGGATTTGAAGATACCGTTGCTCGTGAGTTGCTGAAACTTGGGGTTG
TTGTGTCCGTTCCTTGATGACTTCACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTA
ACATTGGAGGCTTTAACAGATTCCTCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTGTT
GGAGGAGGAGATGCAAAGATGGTTGCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCC
TGTGTTTGTACAGACCTTCCCAACTCCTTAAGCTTAGCAGAAGAGGTTGGTTTCTTAGGA
GTCACAGCAGCGTTGTCTTCGCCGCTGAAAGAGATCTGACTATCCTGATCATGATGGTAA
TGGATTCTTGAAGTGTGGTTTGGATAAGCGTTGTTAGTGACGTTACCATTATCAGAGAAG
ATATCACTACCAGTCATTTCTTTTAGCTTGTGACCAGAACAGTTCTTCCTGTATGATACA
TTCTTGTTAAGCGATTCGGCTTCCTTGTTGGTGGTTCTACCACCACC

QA 5 711 5 711
DS 

RD RR4A837TF 736 0 0
TGCAAATATATTGTTTCCCCTCATTTCCCGCGATTTAGCTGAGCTATGCATCTTCTCCGA
ATAACCAGGAGGGACCTTATCGGATTTGAAGATACCGTTGCTCGTGAGTTGATGAAACTT
GGGGTTGTTGTGTCCGTTCCTTGATGACTTCACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTG
CCCTTTAACATTGGAGGCTTTAACAGATTCCTCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTG
TTTTGTTGGAGGAGGAGATGCAAAGATGGTTGCTTTGCTCTGCTTCTTTTTGCTCTTGGA
GTCAGCCTGTGTTTGTACAGACCTTCCCAACTCCTTAAGCTTAGCAGAAGAGGTTGGTTT
CTTAGGAGTCACAGCAGCGTTGTCTTCGCCGCTGAAAGAGATCTGACTATCCTGATCATG
ATGGTAATGGATTCTTGAAGTGTGGTTTGGATAAGCGTTGTTAGTAACGTTACCATTATC
AGAGAAGATATCACTACCAGTCATTTCTTTTAGCTTGTGACCAGAACAGTTCTTCCTGTA
TGATACATTCTTGTTAAGTGATTCGGCTTCCTTGTTGGTGGTTCTACCACCACCGCCAAG
GACGTCGCCGATGTCACCAGAATTCTGGTTGGAGGGATTAGCGGAGGAGGAGTGGTGGAT
CTGGGACCAAGAGGGAAGATCGGCGGTGGAGTGATGGGGATCGCTTGATCGCTCCATTAC
CTCTCTTTTGATTTCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4AP28TF 695 0 0
AGCTATGCATCTTCTCCGAATAACCAGGAGGGACCTTATCGGATTTGAAGATACCGTTGC
TCGTGAGTTGCTGAAACTTGGGGTTGTTGTGTCCGTTCCTTGATGACTTCACAACATGTT
CTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTTTAACATTGGAGGCTTTAACAGATTCCTCCATGTTGT
TGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTGTTGGAGGAGGAGATGCAAAGATGGTTGCTTTGCTCT
GCTTCTTTTTGCTCTTGGAGTCAGCCTGTGTTTGTACAGACCTTCCCAACTCCTTAAGCT
TAGCAGAAGAGGTTGGTTTCTTAGGAGTCACAGCAGCGTTGTCTTCGCCGCTGAAAGAGA
TCTGACTATCCTGATCATGATGGTAATGGATTCTTGAAGTGTGGTTTGGATAAGCGTTGT
TAGTAACGTTACCATTATCAGAGAAGATATCACTACCAGTCATTTCTTTTAGCTTGTGAC
CAGAACAGTTCTTCCTGTATGATACATTCTTGTTAAGCGATTCGGCTTCCTTGTTGGTGG
TTCTACCACCACCGCCAAGGACGTCGCCGATGTCATCAGAATTCTGGTTGGAGGGATTAG
CGGAGGAGGAGTGGTGGATCTGGGACCAAGAGAGAAGATCGGCGGTGGAGTGATGGGGAT
CGCTTGATCGCTCCATTACCTCTCTTTTGATTTCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 11

CO CL340Contig1 759 11 14 U
TTTTTCATAAAATCATCTTACTGAAAATTGAAATGGAAGTTTCCAGATTATCTGACGATG
GCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTATCGCGGCGACACTACGA
CGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGAGGATTACAAGCGTGGG
GAGATCGGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATAT
TCACCAGCTAGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAAC
TTCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCT
TATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTT
GCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCT
AAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCACAGAACTGATCTTCT
TCCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATG
GTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTT
GG*ATTTTTTTTTT*GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGG*TAATGA
TAAACACTCTTTATGAGGTTTCGTCAAAGCTTTCTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CP90TF U 51
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AF RR4FP33TF U 35
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AF RR4CP90JQ C 45
AF RR4AV06JQ C 48
AF RR4AV06TF U 78
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BS 35 35 RR4FP33TF
BS 36 239 RR4FU03TF
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BS 561 670 RR4FU03TF
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GACATTACGACGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGAGGATTA
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GAAGATTAAC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR4FU03TF 670 0 0
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GCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTATCGCGGCGACACTACGA
CGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGAGGATTACAAGCGTGGG
GAGATCGGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATAC
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TTCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCT
TATACCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTT
GCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCT
AAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCACAGAACTGATCTTCT
TCCATTTCTCGAGAAAAAA*GGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATG
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GG*ATTTTTT

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DS 

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QA 1 679 1 679
DS 

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CTAGCCGTATCGCGGCGACACTACGACGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGG
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TGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTT
CTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGG*ATTTTTTTTT**GTCTGTTTCCTTATTTTAA
CAATAATATGATATGATGG
A

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4GD28TF 679 0 0
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GCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGA
TGGGGTGGACTTCTACGGGTGACCCTTATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTG
ATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGA
ATCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCA
AACCTCAACCACAGAACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATC
TGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTT
CTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGG*ATTTTTTTTTT*GTCTGTTTCCTTATTTTAA
CAATAATATGATATGATGG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4FU03JQ 733 0 0
ATAAAATCATCTTACTGAAAATTGAAATTGAAGTTTCCAGATTATCTGACGATGGCGCTT
CGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTATCGCGGCGACACTACGACGCGTC
GCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGAGGATTACAAGCGTGGGGAGATC
GGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATACTCACCA
GCTAGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTC
TCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCTTATACC
AATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAG
CGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCTAAGTCT
TACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCACAGAACTGATCTTCTTCCATT
TCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCT
TTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGG*ATT
TTTTTTT**GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGG*TAATGATAAACA
CTCTTTATGAGG
C

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4CN07JQ 708 0 0
G
GGAAGTTTCCAGATTATCTGACGATGGCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGA
CTAGCCGTATCGCGGCGACACTACGACGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGG
TAGAGTCAGAGGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGT
ATCTTTCTCGCAGGGTGATAATATATTCACCAGCTAGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTG
GCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCCCCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGA
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ATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGA
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AACCTCAACCACAGAACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATT
TGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTT
CTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGG*ATTTTTTTTTTTGTCTGTTTCCTTATTTTAA
CGATAATATGATATGATGG*TAATGATAAACACTCTTTATGAGGTTT

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR4CN07TF 712 0 0
G
GGAAGTTTCCAGATTATCTGACGATGGCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGA
CTAGCCGTATCGCGGCGACACTACGACGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGG
TAGAGTCAGAGGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGT
ATCTTTCTCGCAGGGTGATAATATATTCACCAGCTAGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTG
GCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGA
TGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCTTATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTG
ATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGA
AGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCA
AACCTCAACCACAGAACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATC
TGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTT
CTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGG*ATTTTTTTTTTTGTCTGTTTCCTTATTTTAA
CGATAATATGATATGATGG*TAATGATAAACACTCTTTATGAGGTTTCG
TC

QA 2 710 2 710
DS 

RD RR4CP90JQ 701 0 0
AGATTATCTGACGATGGCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTAT
CGCGGCGACATTACGACGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGA
GGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGGTTTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCG
CAAGGTGATAATATATTCACCAGCTAGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGG
CAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGAC
TTCTACGGGTGACCCTTATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCT
TGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAAC
GCCCTTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACC
ACAGAACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAA
AAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTA
TGTATTATACATGTTTGG*ATTTTTTTTTT*GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATG
ATATGATGG*TAATGATAAACACTCTTTATGAGGTTTCG
CC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4AV06JQ 712 0 0
GG
ATCTGACGATGGCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTATCGCGG
CTACACTACGACGCGTCGCTCGGCCATTATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGAGGATT
ACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGG
TGATAATATATTCACCAGCTAGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAAT
GGAAGATTAACTTCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTA
CGGGTGACCCTTATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCTTGCTG
CCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCC
TATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCACAGA
ACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAACAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGA
AACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTAT
TATACATGTTTGG*ATTTTTTTTTT*GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATG
ATGG*TAATGATAAACACTCTTTATGAGGTTTCGTCAAAGCTTTCTGACC

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR4AV06TF 682 0 0
TACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTATCGCGGCTACACTACGACGCGTCGCTCGGC*ATT
ATCAACAGACGCGGTGGTAGAGTCAGAGGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGGTCTC
CGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATATTCACCAGCTAGAAGTGC
TACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCTTAAA
GTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCTTATGCCAATGTTGGCGA
CTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACGGCTG
GGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCCTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGGACAA
CTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCACAGAACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAACA
AAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTA
GCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGGGATTTTTTTTTTTGT
CTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGGGTAATGATAAACACTCTTTATGAG
GTTTCGTCAAAGCTTTCTGACC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 11

CO CL341Contig1 877 11 9 U
TTTTTCTTCCTGTCTCTCTCCTCTGTTTGTATCCATGGATAAGATTAATCTTGTGAAGAA
TGGTGTTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGT
TCAGTATCTCAAGAGAAAAGTTTTTTCTTCCCCATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATGT
CGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTCGAAAAGGAGAGGTACTT
CTTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTC
CGGTTATTGGAAAGCTACTGGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAAT
CGTTGGTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAAC
CGATTGGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCAC
TCAGAATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGA
CGAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAA
CCAAACCGAGGATAAAACCGAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTAC
GGATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGAC
GGAGATCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTA
ATTAAATTTTAATGTTGACTGTCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCC
TTTTTCCCATGTTACTTGAAAACGAATCTGTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 40 25 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 35 65 65 65 65 65 65 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG93TF U 1
AF RR4GI02TF U 1
AF RR4AE56TF U 6
AF RR4BH14TF U 6
AF RR4A407JQ C 6
AF RR4G290JQ C 509
AF RR4G290TF U 509
AF RR4BH14JQ C 202
AF RR4AE56JQ C 62
AF RR4A407TF U 6
AF RR4FG93JQ C 209
BS 1 126 RR4FG93TF
BS 127 127 RR4GI02TF
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RD RR4FG93TF 658 0 0
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TGGTGTTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGT
TCAGTACCTCAAGAGAAAAGTTTTTTCTTCCCCATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATGT
CGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTCGAAAAGGAGAGGTACTT
CTTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTC
CGGTTATTGGAAAGCTACTGGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAAT
CGTTGGTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAAC
CGATTGGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCAC
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CGAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAA
CCAAACCGAGGATAAAACCGAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GI02TF 658 0 0
TTTTT
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GTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATT
GGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACTCAGA
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GAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAA
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TGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTT

QA 1 687 1 687
DS 

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GAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAA
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TGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGCCACGCTTCAAGTGGAGTCACGACGGAGA
TCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGA*GAAATCCTTA

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DS 

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ATCTCAAGAGAAAAGTTTTTTCTTCCCCATTATCAGCTTCCATCATTCCTGATGTCGATG
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GCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTCCGGTT
ATTGGAAAGCTACTGGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATCGTTG
GTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATT
GGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACTCAGA
ATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGACGAGG
GAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAA
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TGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGACGGAGA
TCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAATTAA
ATTTTAATGTTGACTGTCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCC
T

QA 1 835 1 835
DS 

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G
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TCTTCGACTTCATGAGAAAA***AGGACTACGGATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTT
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AGTAATTTTAT

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DS 

RD RR4G290TF 312 0 0
G
TTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGACGAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTA
ATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAACCGAGGATAAAACCAAACCAATCT
TCTTCGACTTCATGAGAAAA***AGGACTACGGATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTT
CTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGACGGAGATCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCA
GTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAATTAAATTTTAATGTTGACTGTCTTATAT
AGTAATTTTAT

QA 2 312 2 312
DS 

RD RR4BH14JQ 639 0 0
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GTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTCCGGTTATTGGAAAGCTACTGG
TATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATCGTTGGTTTAAAGAAAACTCT
CGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATTGGATCATGCACGAATA
TCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACTCAGAATTGGGTTCTTTGTCG
CATCCTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGACGAGGGAGATAACCGGAATCT
TAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAACCGAGGATAAAACCGA
ACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACGGATTTGAACCTTTTGCCGAG
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TCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AE56JQ 780 0 0
GGTGTTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGTT
CAGTATCTCAAGAGAAAAGTTTTTTCTTCCCCATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATGTC
GATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTG*CAACTTCGAAAAGGAGAGGTACTTC
TTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTCC
GGTTATTGGAAAGCTACTGGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATC
GTTGGTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACC
GATTGGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACT
CAGAATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGAC
GAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAAC
CAAACCGAGGATAAAACCGAACCAATCTTTTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACG
GATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGACG
GAGATCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAA
TTAAATTTTAATGTTGACTGTCTTATATGGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCC
G

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4A407TF 835 0 0
CTTCCTGTCTCTCTCCTCTGTTTGTATCCATGGATAAGATTAATCTTGTGAAGAATGGTG
TTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGTTCAGT
ATCTCAAGAGAAAAGTTTTTTCTTCCCCATTATCAGCTTCCATCATTCCTGATGTCGATG
TTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTCGAAAAGGAGAGGTACTTCTTCA
GCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTCCGGTT
ATTGGAAAGCTACTGGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATCGTTG
GTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATT
GGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACTCAGA
ATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGACGAGG
GAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAA
CCGAAGATAAAACCGAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACGGATT
TGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGACGGAGA
TCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAATTAA
ATTTTAATGTTGACTGTCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTC
TTCCT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4FG93JQ 669 0 0
TTACCTGGCAACTTCGAAAAGGAGAGGTACTTCTTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCA
AATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTCCGGTTATTGGAAAGCTACTGGTATTGAT
AAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATCGTTGGTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTT
TACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATTGGATCATGCACGAATATCGGCTC
TCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACTCAGAATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTC
CTTAAGAAGAGAGCCGGTGACGAGAACGAAGACGAGGGAGATAACCGGAATTTTAGATGT
AATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAACCGAGGATAAAACCGAACCAATT
TTTTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACGGATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCT
TCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGACGGAGATCTTCTCTTTTGATGAAGAGACC
AGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAATTAAATTTTAATGTTGACTGTCTTATA
TAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCCTTTTTCCCATGTTACTTGAAAACGAATC
TGTTTCTTG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 11

CO CL342Contig1 777 11 22 U
GGCCCCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTTTTCCCCCATCG
ATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCA
CCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCT
GGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACC
CCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTG
ACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCG
CCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAG
AGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCC
AGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGG
AGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCT
AAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTGACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCT
TATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCT
CATCTCTGTTGCAAGATCCTTAAGTTATTAATCGGAAAACAATGGTTTTTTAGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 15 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 30 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 25 65 
65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 35 30 45 0 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ62TF U 57
AF RR4CO94TF U 117
AF RR4BT23TF U 1
AF RR4FW65TF U 1
AF RR4AN44JQ C 17
AF RR4AN44TF U 17
AF RR4AQ79JQ C 55
AF RR4AQ79TF U 2
AF RR4BT23JQ C 49
AF RR4FW65JQ C 87
AF RR4CO94JQ C 44
BS 1 187 RR4BT23TF
BS 188 188 RR4FW65TF
BS 189 207 RR4BT23TF
BS 208 208 RR4FW65TF
BS 209 289 RR4BT23TF
BS 290 290 RR4FW65TF
BS 291 331 RR4BT23TF
BS 332 332 RR4FW65TF
BS 333 334 RR4BT23TF
BS 335 335 RR4FW65TF
BS 336 460 RR4BT23TF
BS 461 461 RR4FW65TF
BS 462 626 RR4BT23TF
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BS 628 713 RR4BT23TF
BS 714 714 RR4FW65TF
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BS 740 766 RR4FW65TF
BS 767 777 RR4BT23JQ

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CTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATT
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AACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTT
GTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGGGTTC
ATCGCCTACATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAA
GCTGAGTTC

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4CO94TF 573 0 0
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CTCTGGGAAGTCGAAGGAAAATGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCC
AACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTT
GTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGGGTTC
ATCGCCTACATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAA
GCTGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAAGGAC
TTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTAC
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TGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGT*ACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAA
GCCTTATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTT
C

QA 1 572 1 572
DS 

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ATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCA
CCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCT
GGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACAACCCGGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACC
CCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAAAAGGTTGTTG
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CCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAG
AGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCC
AGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGG
AGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCT
AAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTG*CTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCT
TATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCGACTTCT
CATCTCTGTTGCAAG

QA 1 735 1 735
DS 

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AGGGG
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AGAGAGAGA**ATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGT
GATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAA
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GCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTG
AGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGT
TTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTT*CGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCTCATCT
CTGTTGCAGATTC*TTAAGTTATTAATCGGAAAACAATGGT

QA 6 766 6 766
DS 

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GTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTTGAAGGAAA
GTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGG
TGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAAAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTT
CAGGCTCCAGGAGCAGCCAACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTA
CATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTAT
TGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGA
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TACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCT
CGTTGGGGTG*CTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCGTTATATT
GTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCGACTTCTCATCTCTGTTGCAAGA
TCCTTAAGTTATTAATC
CGAGAACA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AN44TF 745 0 0
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ATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACGCTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCT
GTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTTGAAGGAAA
GTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGG
TGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAAAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTT
CAGGCTCCAGGAGCAGCCAACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTA
CATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTAT
TGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGA
GAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCC
TACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCT
CGTTGGGGTG*CTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCGTTATATT
GTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCGACTTCTCATCTCTGTTGCAAGA
TCCTTAAGTTATTAATC
CGAGAACA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AQ79JQ 707 0 0
CCCCATCGATCG
GAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTG
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TCGAAGGAAAGTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTG
CCGAAGGAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTCGTTGACATTG
TCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATA
TCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAATCAGAGTTCA
AGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCT
TTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTG
CTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGA
GACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTT
TCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCTCATCTC
TGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCGGAAAACA

QA 13 707 13 707
DS 

RD RR4AQ79TF 729 0 0
GGCC
CTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTGCAGATTCGTTTTTTTTCCCCATCGATCGG
AGAGAGAGA**ATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGT
GATGAGCTTCTGCCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAA
GTCGAAGGAAAGTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCT
GCCGAAGGAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTCGTTGACATT
GTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTAT
ATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAATCAGAGTTC
AAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTC
TTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGT
GCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTG
AGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGT
TTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCTCATCT
CTGTT

QA 5 729 5 729
DS 

RD RR4BT23JQ 729 0 0
TTTCCCCCATCGATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACA
CTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGA
ATGGTATTCTCTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACAACCCGGGGATCTGTAGAGGTTAACA
TTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTC
AAAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCAACCTACGACAAGA
AGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGG
AACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTCCCCAAGC
TCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTG
CTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGG
AGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTG*CTGTGGTCGGTCGCAGCGACT
CTATTTAAGTCTTATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTT
CTTTCGACTTCTCATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAGAACAATGGTTT
TTTAGTTGT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4FW65JQ 691 0 0
AAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCT
TTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACAACC
CAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTG*TGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGAC
GAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTCGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAG
GAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCGTCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTT
TTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTACTGAGGGAGCT
ACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCAC
GATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTG
TACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTT
ACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTT
TTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCTCATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTT
ATTAATCGGAAAACAATGGTTTTT
TAGTTAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4CO94JQ 732 0 0
TTTTTTGTT
CCCCATCGATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGA
TCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGG
TATTCTCTGGGAAGTCGAAGGAAAATGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGG
TGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAA
GGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAACCTACCTACGACAAGAAGGG
GTTCATCGCCTACATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACA
GCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAA
GGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTA
CTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGT
CAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGT*ACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTAT
TTAAGCCTTATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTT*CGTTACCTGATTACTTTTCTTT
CTATTTCTCATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCGGAAAACAATGGTTTTT
AGTGG

QA 10 727 10 727
DS 



AS 3 11

CO CL343Contig1 815 2 5 U
GGGCAGTGAAACGAAGACTTTCGAAGCAACACAGAAGCGAAACCATGGCGGATTTGGAAG
AAGTTCAAACTGTGGATCTCATGTCCGAGCTCCTCCGCCGCCTCAAATGTGCACAAAAGC
CTGACAAACGCCTCATCTTCATCGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAA
TAGTGAAGGATGAGTATTGCTTGTGTCATTTATCCACTGGCGACATGTTAAGAGCTGCTG
TTGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACAAGGGAGCGCTTG
TCACTGATGAGTTGGTTGTTGGTATAATTGATGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGCCAGA
AAGGTTTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCAGGCAGAGAAGCTAGACGAGA
TGCTTAAGAAGCGAGGGACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTGCTATTGATGACTCAG
TCCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGCAGGAGTTACCACA
CCAAGTTCGCCCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATCACCGGAGAGCCTCTGATCC
AACGCAAAGATGATAATGCTGAGGTTCTAAGGTCGAGGCTCGCTGCGTTCCACAGTCAAA
CTGAACCGGTGATCGACTACTACGGAAAGAAGTCTGTTCTTACAAACATCCACGCCGAGA
AGCCTCCCAAAGAAGTGACATCAGAGTTCAAAAAGCATTGTCCTGATGATGAAGCTCAAG
CAGTCATCTCCTCTGGTTAGAAATCCATTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E446TF U 5
AF RR4BE71TF U 1
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CT

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CAGTCATCTCCTCTGGTTAGAAATCCATTCTTTTT

QA 1 815 1 815
DS 



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AACCTCTGATGTCACTTCTTTGGGAGGCTTCTCGGCGTGGATGTTTGTAAGAACAGACTT
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**CAATTATACCAACAACCAACTCATCAGTGACAAGCGCTCCCTTGTCCATAGCTTCTTT
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TAAGTGACACAAGAAATACTCATCCTTCACTATGGGAGATTGTGTACCTTTCCCTGACCC
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GAGCTCGGACATGAGATCCACAGTTTGAACATCTTCCAAATCCGCCATGGTTTCGCTTCT
GTGTTGCTTCGAAAGTCTTCGTTTCACTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 0 30 15 30 30 
15 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 15 30 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E446JQ U 88
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AF RR4FH74JQ U 52
AF RR4FL27JQ U 1
AF RR4DG71JQ U 61
AF RR4FH74TF C 298
AF RR4DG71TF C 282
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QA 1 562 1 562
DS 

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TTTTGAACCTCTGATGTCACTTCTTTGGGAGGCTTCTCGGCGTGGATGTTTGTAAAAACA
GACTTCTTCCCGTAATAGTCAATCACCGGTTCAGTTTGACTGTGGAAAGCAACAAGCCTC
GACCTTAAAACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTGGATCAAAGGCTCTCCGGTGATATCA
TCAACTCCAGGGGTCTTGGGAGGGGCAAACTTGGTGTGGTAACTCCTGCCACTCGATGGG
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ACTTTGTCGATTC

QA 5 557 5 557
DS 

RD RR4FL27JQ 740 0 0
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AAGAACTCCTGCGTTAGACAGGAGACAAAAGAGAGTATTCAAGATCGTTTCGATCCAAAG
TATCAATTATTTTTGCCATGTTTTAAAAAACAAAGTCGAACAAAAGACTAAAAGAACTGT
CATTCCGCAGATGAGTAGATATATAGATGTGTTCGTCTCTCTCGTAGGAAGGAAAAAGAA
TGGATTTCTAACCAGAGGAGATGACTGCTTGAGCCTTCATCATCAGGACAATGCTTTTTG
AACCTCTGATGTCACTTCTTTGGGAGGCTTCTCGGCGTGGATGTTTGTAAGAACAGACTT
CTTCCCGTAATAGTCAATCACCGGTTCGGTTTGACTGTGGAAAGCAGCAAGCCTCGACCT
TAGAACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTGGACCAGAGGCTCTCCGGTGATATCATCAAC
TCCAGGGGTCTTGGGAGGGGCAAACTTGGTGTGGTAACTCCTGCCACTCGATGGGTGGAT
CCATCTCCCGGTTATTCTTTCCTCCAGAACTGAGTCATCGATGGCAAAGTTGAGAACTTT
GTCGATTCCAGTTCCACGCTTCTTAAGCATCTCATCTAGCTTCTCTGCCTGAGCAACCGT
CCTGGGAAACCCATCAAGGATGAAACCTTTCTGGCATTTTGGCTTGTCCATAGCTTCTTT
GGCCTTGAGACCAAGAGGG
T

QA 1 739 1 739
DS 

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GAG
AACTCCTGCGTTAGACAGGAGACAAAAGAGAGTATTCAAGATCGTTTCGATCCAAAGTAT
CAATTATTTTTGCCATGTTTTAAAAAACAAAGTCGAACAAAAGACTAAAAGAACTGTCAT
TCCGCAGATGAGTAGATATATAGATGTGTTCGTCTCTCTCGTAGGAAGGAAAAAGAATGG
ATTTCTAACCAGAGGAGATGACTGCTTGAGCCTTCATCATCAGGACAATGCTTTTTGAAC
CTCTGATGTCACTTCTTTGGGAGGCTTCTCGGCGTGGATGTTTGTAAGAACAGACTTCTT
CCCGTAATAGTCAATCACCGGTTCAGTTTGACTGTGGAAAGCAGCAAGCCTCGACCTTAG
AACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTGGATCAGAGGCTCTCCGGTGATATCATCAACTCC
AGGGGTCTTGGGAGGGGCAAACTTGGTGTGGTAACTACTGCCACTCGATGGGTGGATCCA
TCTCCCGGTTATTCTTTCCTCCAGAACTGAGTCATCGATGGCAAAGTTGAGAACTTTGTC
GATTCCAGTTCCACGCTTCTTAAGCATCTCATCTAGCTTCTCTGCCTGAGCAACAGTCCT
GGGAAACCCATCAAGGATGAAACCTTTCTGGCATTTTGGCTTGTTCATGGCTCCAT***C
AATTATACCAACAACCAACTCATCAGTGACAAGCGCTCCCTTGTCCATAGCTTCTTTGGC
CTTGAGACCAAGAGGGGTCTTAGAAGCAACAGCAGCTCTTAACATGTCACCAGTGGATAA
GTGACACAAGAAATACTCATCCTTCACTATGGGAGATTGTGT

QA 4 825 4 825
DS 

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CTTCTTCCCGTAATAGTCAATCACCGGTTCAGTTTGACTGTGGAAAGCAACAAGCCTCGA
CCTTAGAACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTGGATCAGAGGCTCTCCGGTGATATCATC
AACTCCAGGGGTCTTGGGAGGGGCAAACTTGGTGTGGTAACTCCTGCCACTCGATGGGTG
GATCCATCTCCCGGTTATTCTTTCCTCCAGAACTGAGTCATCGATGGCAAAGTTGAGAAC
TTTGTCGATTCCAGTTCCACGCTTCTTAAGCATCTCATCTAGCTTCTCTGCCTGAGCAAC
AGTCCTGGGAAACCCATCAAGGATGAAACCTTTCTGGCATTTTGGCTTGTTCATGGCTTC
AT***CAATTATACCAACAACCAACTCATCAGTGACAAGCGCTCCCTTGTCCATAGCTTC
TTTGGCCTTGAGACCAAGAGGGGTCTTAGAAGCAACAGCAGCTCTTAACATGTCACCAGT
GGATAAGTGACACAAGCAATACTCATCCTTCACTATGGGAGATTGTGTACCTTTCCCTGA
CCCTGGAGGTCCAATGAAGATGAGGCGTTTGTCAGGCTTTTGTGCACATTTGAGGCGGCG
GAGGAGCTCGGACATGAGATCCACAGTTTGAACATCTTCCAAATCCGCCAT
CC

QA 1 711 1 711
DS 

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ATCAGGACAATGCTTTT*GAAC*TCTGATGTCACTTCTTTGGGAGGCTTCTCGGCGTGGA
TGTTTGTAAGAACAGACTTCTTCCCGTAATAGTCAATCACCGGTTCAGTTTGACTGTGGA
AAGCAGCAAGCCTCGACCTTAGAACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTGGATCAGAGGCT
CTCCGGTGATATCATCAACTCCAGGGGTCTTGGGAGGGGCAAACTTGGTGTGGTAACTAC
TGCCACTCGATGGGTGGATCCATCTCCCGGTTATTCTTTCCTCCAGAACTGAGTCATCGA
TGGCAAAGTTGAGAACTTTGTCGATTCCAGTTCCACGCTTCTTAAGCATCTCATCTAGCT
TCTCTGCCTGAGCAACAGTCCTGGGAAACCCATCAAGGATGAAACCTTTCTGGCATTTTG
GCTTGTTCATGGCTCCAT***CAATTATACCAACAACCAACTCATCAGTGACAAGCGCTC
CCTTGTCCATAGCTTCTTTGGCCTTGAGACCAAGAGGGGTCTTAGAAGCAACAGCAGCTC
TTAACATGTCACCAGTGGATAAGTGACACAAGAAATACTCATCCTTCACTATGGGAGATT
GTGTACCTTTCCCTGACCCTGGAGGTCCAATGAAGATGAGGCGTTTGTCAGGCTTTTGTG
CACATTTGAGGCGGCGGAGGAGCTCGGACATGAGATCCACAGTTTGAACATCTTCCAAAT
CCGCCATGGTTTCGCTTCTGTGTTGCTTCGAAAGTCTTCGTTTCACTCC

QA 1 769 1 769
DS 



CO CL343Contig3 815 2 2 U
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GATTTGGAAGATGTTCAAACTGTGGATCTCATGTCCGAGCTCCTCCGCCGCCTCAAATGT
GCACAAAAGCCTGACAAACGCCTCATCTTCATTGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACA
CAATCTCCCATAGTGAAGGATGAGTATTGCTTGTGTCACTTATCCACTGGTGACATGTTA
AGAGCTGCTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACAAG
CCAAAATGCCAGAAAGGTTTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACGGTTGCTCAGGCAGAG
AAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTGCC
ATCGATGACTCAGTTCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGC
AGGAGTTACCACACCAAGTTTGCCCCTCCCAAGACCCCTGGAGTTGATGATATCACCGGA
GAGCCTCTGGTCCAACGCAAAGATGATAATGCTGAGGTTCTAAGGTCGAGGCTTGCTGCT
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ATCCACGCCGAGAAGCCTCCCAAAGAAGTGACATCAGAGTTCAAAAAGCATTGTCCTGAT
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ACACATCTATATATCTACTCATCTGCGGATGACAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER61TF U 1
AF RR4FL27TF U 1
BS 1 683 RR4ER61TF
BS 684 815 RR4FL27TF

RD RR4ER61TF 683 0 0
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QA 1 683 1 683
DS 

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GCACAAAAGCCTGACAAACGCCTCATCTTCATTGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACA
CAATCTCCCATAGTGAAGGATGAGTATTGCTTGTGTCACTTATCCACTGGTGACATGTTA
AGAGCTGCTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACAAG
CCAAAATGCCAGAAAGGTTTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACGGTTGCTCAGGCAGAG
AAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTGCC
ATCGATGACTCAGTTCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGC
AGGAGTTACCACACCAAGTTTGCCCCTCCCAAGACCCCTGGAGTTGATGATATCACCGGA
GAGCCTCTGGTCCAACGCAAAGATGATAATGCTGAGGTTCTAAGGTCGAGGCTTGCTGCT
TTCCACAGTCAAACCGAACCGGTGATTGACTATTACGGGAAGAAGTCTGTTCTTACAAAC
ATCCACGCCGAGAAGCCTCCCAAAGAAGTGACATCAGAGTTCAAAAAGCATTGTCCTGAT
GATGAAGCTCAAGCAGTCATCTCTCTGGTAGAATCATTCTTTTCTTCTACGAGAGAGACG
ACACATCTATATATCTACTCATCTGCGGATGACAG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 11

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TTAGGGTTGAAAACTCACACCCAAATCGTCAAGAGAGAGAAAAATGGAAGGATGGGATCC
GAGCACGAAGTCGACGCTAACGCGGATCCCTCTTCTGACAACAAAAGCGGGACCAAGAGA
CGGCGATGCATGGAAACAGAGGCTTAAAGAGGAGTACAAGTCACTGATCGCGTATACACA
GATGAACAAGTCCAACGACAATGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCTAACCCCGAAGGTAC
GCGTTGGACTGGCAAGTGTTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAATACGAGTTCGATCTCCA
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ACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAATCTTGAAAAACTTGTACAA
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TTTTTTTTTTGGTAAATCGAACACTAAAATTGAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EI70TF U 181
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GATGAACAAGTCCAACGACAATGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCTAACCCCGAAGGTAC
GCGTTGGACTGGCAAGTGTTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAATACGAGTTCGATCTCCA
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ATACGAGTTCGATCTCCAATTCGATATCCCCGTCACCTACCCTGCAACTGCTCCCTAGCT
TGAGTTGCCTCAGATTGACGGCAAAACCCAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCCT
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TAACCCCGAAGGTACGCGTTGGACTGGCAAGTGTTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAATA
CGAGTTCGATCTCCAATTCGATATCCCCGTCACCTACCCTGCAACTGCTCCCGAGCTTGA
GTTGCCTCAGATTGACGGCAAAACCCAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCCTGAC
TGTTCATTTCAAGCCACTCTGGGCTAAAAACTATCCTAGGTTTGGTATAGCACATGCACT
TTGTTTGGGGCTTGCTCCATGGCTTGCTGCAGAGATTCCAATCCTTGTGGACTCTGGCAT
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CTCTATAAAAA

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DS 

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AAAAAAAAAAAAACACATTTAGGGTTGAAAACTCACACCCAAATCGTCAAGAGAGAGAAA
AATGGAAGGATGGGATCCGAGCACGAAGTCGACGCTAACGCGGATCCCTCTTCTGACAAC
AAAAGCGGGACCAAGAGACGGCGATGCATGAAAACAGAGGCTTAAAGAGGAGTACAAGTC
ACTGATCGCGTATACACAGATGAACAAGTCCAACGACAATGACTGGTTCCGCATCTCCGC
CTCTAACCCCGAAGGTACGCGTTGGACTGGCAAGTGTTGGTACGTTCACAACCTCCTCAA
ATACGAGTTCGATCTCCAATTCGATATCCCCGTCACCTACCCTGCAACTGCTCCCGAGCT
TGGGTTGCCTCAGATTGACGGCAAAACCCAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCCT
GACTGTTCATTTCAAGCCACTCTGGGCTAAAAACTGTCCTAGGTTTGGTATAGCACATGC
ACTTTGTTTGGGGCTTGCTCCATGGCTTGCTGCAGAGATTCCAATCCTTGTGGACTCTGG
CATGATTAAGCACAAAGATGACGCAGCCTCCTCTACTGAATCTTAAGTCTATCTATCTCA
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CTTCTCTATAAAAAGCTTACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAAT
CTTG

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DS 

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ACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAATCTTGAAAAA

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DS 

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GCGTTGGACTGGCAAGTGTTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAATACGAGTTCGATCTCCA
ATTCGATATCCCCGTCACCTACCCTGCAACTGCTCCCGAGCTTGAGTTGCCTCAGATTGA
CGGCAAAACCCAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCCTGACTGTTCATTTCAAGCC
ACTTTGGGCTAAAAACTGTCCTAGGTTTGGTATAGCACATGCACTTTGTTTGGGGCTTGC
TCCATGGCTTGCTGCAGAGATTCCAATCCTTGTGGACTCTGGCATGATTAAGCACAAAGA
TGACGCAGCCTCCTCTACTGAATCTTAAGTCTATCTATTTCAGAGTTGAGAGGTTATGTT
AGTCAGTTATAGCTGAACTCATAAATTTCTGAAGCGGATGGTCTTCTCTATAAAAAGCTT
ACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAATCTTGAAAAACTTGTACAA
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DS 

RD RR4F549JQ 641 0 0
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GCGTTGGACTGGCAAGTGTTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAATACGAGTTCGATCTCCA
ATTCGATATCCCCGTCACCTACCCTGCAACTGCTCCCGAGCTTGAGTTGCCTCAGATTGA
CGGCAAAACCCAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCCTGACTGTTCATTTCAAGCC
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ACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAATCTTGAAAAACTTGTACAA
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DS 

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GATCCCTCTTCTGACAACAAAAGCGGGACCAAGAGACGGCGATGCATGAAAACAGAGGCT
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AGGTGGGAAGATTTGCCTGACTGTTCATTTCAAGCCACTCTGGGCTAAAAACTGTCCTAG
GTTTGGTATAGCACATGCACTTTGTTTGGGGCTTGCTCCATGGCTTGCTGCAGAGATTCC
AATCCTTGTGGACTCTGGCATGATTAAGCACAAAGATGACGCAGCCTCCTCTACTGAATC
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ATTTCTGAAGCGGATGGTCTTCTCTATAAAAAGCTTACATGAAACCCAATAAAGAATTAA
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GTGTGGATATTGTTATTACGAACCTTTTTATTGCTGTTTTTTTT
GGC

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DS 

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TCCAATTCGATATCCCCGTCACCTACCCTGCAACTGCTCCCGAGCTTGAGTTGCCTCAGA
TTGACGGCAAAACCCAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCCTGACTGTTCATTTCA
AGCCACTTTGGGCTAAAAACTATCCTAGGTTTGGTATAGCACATGCACTTTGTTTGGGGC
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AAGATGACGCAGCCTCCTTTACTGAATCTTAAGTCTATCTATTTCAGAGTTGAGAGGTTA
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GCTTACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAATCTTGAAAAACTTGT
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GCTGTTTTTTTT**GGTAAATCGAACACTAAAATTGAGGTC

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DS 

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TTGGGGCTTGCTCCATGGCTTGCTGCAGAGATTCCAATCCTTGTGGATTCTGGCATGATT
AAGCACAAAGATGACGCAGCCTCCTTTACTGAATCTTAAGTCTATCTATTTCAGAGTTGA
GAGGTTATGTTAGTCAGTTATAGCTGAACTCATAAATTTTTGAAGCGGATGGTTTTCTCT
ATAAAAAGCTTACATGAAACCCAATAAAGAATTAAGCTATTGCAGTGTTTAATCTTGAAA
A*CTTGTACAATTCGAGAACACTGGTTCGTGCAAGGTGTGGATATTGTTATTACGAACCT
TTTTATTGCTGTTTTTTTTTTGGTAAATCTAACACTAAAATTGAGGTC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 10

CO CL345Contig1 1581 10 22 U
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TACTACTGACTTTTGGACATCCCATGAGTGCTTGCTACTGCCTTACGAGCAAGCACTCAC
GAGAGAA*GACTCAACGTCTGGACTTTACTATGACTGCTCTGCGCACATGG*TTTGGGTT
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GGAGGGTCACGCACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTACCATACACACTGTGAC
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AAGAGAAGGCTCGGTTCC*GGGAACCTTCTGTCTTCTATTGGATTCTAGACGACACAAAG
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GTGTCCTAGTAAAGTAAACACTTTGGTTGTGTTTGGTTATGCTTTAGGGGTGTTATTTGG
TTATGTATTTTAATGGATTTGAAAATCTAAACCAAATTGAGTGTTTTTGTTTCTATAATT
TCGAAATCCATATTAAAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 20 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 30 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B761TF U 89
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AF RR4CJ77TF U 557
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AF RR4B774JQ C 890
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GTTCGGTGGTCAGATGCCCGTTATAAAGGTGGGGAGAATGGCGGGTCAGTTTGCGAAGCC
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CATAAACGGTGATGCTTTTGATGAGAAGTCTAGGATACCTGACCCGCACAGGATGGAAAG
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TGCGGCAATGCAGAGAGTTAGCCAGTGGAATCTCGATTTCAGCCAACATAGTGAACAGGG
*CGACAGGTACCGTGAATTGGCTAATAGAGTTGATGAGGCTTTAGGATTCATGGGGTGCA
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GGATACCTGATCCGCACAGGATGGAAAGAGCGTATACACAATCTGTAGCTACGTTGAATC
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TCGATTTCAGCCAACATAGTGAACAGGGGCGACAGGTACCGTGAATTGGCTAATAGAGTT
GATGAGGCTTTAGGATTCATGGG*TGCAGCTGGGCTTACGAACGCACACCCGATCATGAC
TACTACTGACTTTTGGACATCCCATGAGTGCTTGCTACTGCCTTACGAGCAAGCACTCAC
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GGGGAACGGACTCGCCAACTCGATGGTGCTCATGTTGAGTTCTTGAGGG
ATTCGCTAACCC

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CAATGCACGGGAACACCATCATGGCTCCAAGTGGGCTTAAAACTCGATCTTTCGATGCAA
TCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATGATCAAGAAG
TAG

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GACTCAACGTCTGGACTTTACTATGACTGCTCTGCGCACATGG*TTTGGGTTGGGGAACG
GACTCGCCAACTCGATGGTGCTCATGTTGAGTTCTTGAGGGGAATCGCTAACCCCCTTGG
AATCAAGGTGAGTGATAAGATGGTTCCAAGTGAACTGGTGAAGCTGATAGAGATACTAAA
CCCACAGAACAAGCCTGGAAGGATAACGGTTATAGTGAGAATGGGAGCTGAGAATATGAG
GGTGAAGCTTTCTCATTTGATCAGGTCAGTACGTGGAGCTGGTCAGATTGTGACTTGGGT
TAGTGATCCAATGCACGGGAACACCATCATGGCTCCAAGTGGGCTTAAAACTCGATCTTT
CGATGCAATCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATGATCAAGAAGGTAGCTT
CCCTGGTGGGGTTCATCTAGAGATGACGGGTCAAAACGTGACGGAATGCGTTGGAGGGTC
ACGCACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTAC*ATACACACTGTGACCCGAGGCT
CA
CG

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CGGAATGCGTTGGAGGGTCACGCACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTACCATA
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DS 

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GGGCTGAGAATATGAGGGTGAAGCTTCCTCATTTGATCAGAGCAGTACGTGGAGCTGGTC
AGATTGTGACTTGGGTTAGTGATCCAATGCACGGGAACACCATCATGGCTCCAAGTGGGC
TAAAAACTCGATCTTTCGACGCAATCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATG
ATCAAGAAGGAAGCTTCCCTGGTGGGGTTCATCTAGAGATGACGGGTCAAAACGTGACAG
AATGTGTTGGAGGGTCACGCACCATCACTTACAACGATCTAAGCTCACGTTACCATACCC
ACTGTGACCCGAGACTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGAGCTTGCCTTCATCATCGCAGAGC
GTCTGCGTAAGAGAAGGCTCGGTTCCCGGGAACCTTCTGTCCTCTATTGGATTCTAGACG
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TTTGGTTGGTGTCCTAGTAAA

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CGCTAACCCCCTTGGAATCAAGGTGAGTGATAAGATGGTTCCAAGTGAACTGGTGAAGCT
GATAGAGATACTAAACCCACAGAACAAGCCTGGAAGGATAACGGTTATAGTGAGAATGGG
AGCTGAGAATATGAGGGTGAAGCTTCCTCATTTGATCAGGTCAGTACGTGGAGCTGGTCA
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TAAAACTCGATCTTTCGATGCAATCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATGA
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ATGCGTTGGAGGGTCACGCACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTACCATACACA
CTGTGACCCGAGGCTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGAGCTTGCCTTCATCATCGCAGAGCG
TCTGCGTAAGAGGAGGCTCGGTTCC*GGGAACCTTCTGTCTTCTATTGGATTCTAGACGA
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TATTTGGTTATGTATTTTAATGGATTTGAAAATCT

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TGAAGCTTCCTCATTTGATCAGGTCAGTACGTGGAGCTGGTCAGATTGTGACTTGGGTTA
GTGATCCAATGCACGGGAACACCATCATGGCTCCAAGTGGGCTTAAAACTCGATCTTTCG
ATGCAATCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATGATCAAGAAGGTAGCTTCC
CTGGTGGGGTTCATCTAGAGATGACGGGTCAAAACGTGACGGAATGCGTTGGAGGGTCAC
GCACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTACCATACACACTGTGACCCGAGGCTCA
ACGCTTCTCAGTCTCTGGAGCTTGCCTTCATCATCGCAGAGCGTCTGCGTAAGAGGAGGC
TCGGTTCC*GGGAACCTTCTGTCTTCTATTGGATTCTAGACGACACAAAGACAATGCCTT
CATCCCAATTCTGATATGATGATGTGTATAGAGACTCTTAAGTTTGGTTGGTGTCCTAGT
AAAGTAAACACTTTGGTTGTGTTTGGTTATGCTTTAGGGGTGTTATTTGGTTATGTATTT
TAATGGATTTGAAAATCT

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DS 

RD RR4BA68JQ 837 0 0
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ACAGAACAAGCCTGGAAGGATAACGGTTATAGTGAGAATGGGAGCTGAGAATATGAGGGT
GAAGCTTCCTCATTTGATCAGGTCAGTACGTGGAGCTGGTCAGATTGTGACTTGGGTTAG
TGATCCAATGCACGGGAACACCATCATGGCTCCAAGTGGGCTTAAAACTCGATCTTTCGA
TGCAATCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATGATCAAGAAGGTAGCTTCCC
TGGTGGGGTTCATCTAGAGATGACGGGTCAAAACGTGACGGAATGCGTTGGAGGGTCACG
CACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTACCATACACACTGTGACCCGAGGCTCAA
CGCTTCTCAGTCTCTGGAGCTTGCCTTCATCATCGCAGAGCGTCTGCGTAAGAGAAGGCT
CGGTTCC*GGGAACCTTCTGTCTTCTATTGGATTCTAGACGACACAAAGACAATGCCTTC
ATCCCAATTCTGATATGATGATGTGTATAGAGACTCTTAAGTTTGGTTGGTGTCCTAGTA
AAGTAAACACTTTGGTTGTGTTTGGTTATGCTTTAGGGGTGTTATTTGGTTATGTATTTT
AATGGATTTGAAAATCTAAACCAAATTGAGTGTTTTTGTTTCTATAATTTCGAAATC

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DS 

RD RR4B761JQ 805 0 0
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TAACCCCCTTGGAATCAAGGTGAGTGATAAGATGGTTCCAAGTGAACTGGTGAAGCTGAT
AGAGATACTAAACCCACAGAACAAGCCTGGAAGGATAACGGTTATAGTGAGAATGGGAGC
TGAGAATATGAGGGTGAAGCTTCCTCATTTGATCAGGTCAGTACGTGGAGCTGGTCAGAT
TGTGACTTGGGTTAGTGATCCAATGCACGGGAACACCATCATGGCTCCAAGTGGGCTTAA
AACTCGATCTTTCGATGCAATCAGGGCGGAGTTGAGAGCGTTCTTCGACGTGCATGATCA
AGAAGGTAGCTTCCCTGGTGGGGTTCATCTAGAGATGACGGGTCAAAACGTGACGGAATG
CGTTGGAGGGTCACGCACCATCACTTACAACGATCTGAGCTCACGTTACCATACACACTG
TGACCCGAGGCTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGAGCTTGCCTTCATCATCGCAGAGCGTCT
GCGTAAGAGAAGGCTCGGTTCC*GGGAACCTTCTGTCTTCTATTGGATTCTAGACGACAC
AAAGACAATGCCTTCATCCCAATTCTGATATGATGATGTGTATAGAGACTCTTAAGTTTG
GTTGGTGTCCTAGTAAAGTAAACACTTTGGTTGTGTTTGGTTATGCTTTAGGGGTGTTAT
TTGGTTATGTATTTTAATGGATTTGAAAATCTAAACCAAATTGAGTGTTTTTGTTTCTAT
AATTTCGAAATCCATATTAAAATCT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 11

CO CL346Contig1 886 11 7 U
GGATCACACACATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCTT
TTCACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAG
AATATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTG
GGTAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTT
CAACCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAA
CCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAA
CCAGCAAATCACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGAC
AGTGTTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTC
GCTCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGC
GTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCAT
ACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAG
TACACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCT
CTGACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTT*CTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCT
TCTGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACTCATGCCA
TTACAGTGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACAATAACTTACATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4A369TF U 264
AF RR4CJ56TF U 2
AF RR4D715TF U 8
AF RR4F807TF U 4
AF RR4CB56TF U 10
AF RR4CJ56JQ C 114
AF RR4CB56JQ C 126
AF RR4A369TFB U 1
AF RR4A369JQD C 114
AF RR4F807JQ C 124
AF RR4A369JQ C 323
BS 1 746 RR4A369TFB
BS 747 747 RR4CB56TF
BS 748 822 RR4A369TFB
BS 823 823 RR4A369JQD
BS 824 875 RR4A369TFB
BS 876 884 RR4A369JQD
BS 885 886 RR4A369JQ

RD RR4A369TF 153 0 0
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ACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCAGCAAATCACTTTTCCCTACG
GCCATTTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGA

QA 1 153 1 153
DS 

RD RR4CJ56TF 541 0 0
GGGATCAC
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GTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGG
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CCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCAC
GCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTC
CAGGATCGGAATCTACTACGACCATCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCAGCAAAT
CACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGG
TCTCCTATTATCTACGGGAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGA
GACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGT

QA 9 541 9 541
DS 

RD RR4D715TF 687 0 0
GG
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GTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGG
AGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCT
CCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCAC
GCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTC
CAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCAGCAAAT
CACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGG
TCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGA
GACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAGGTGG
AAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATC
AATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTACACTGTG
GACTACCAATGCAGTGTCGACGTTT

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR4F807TF 703 0 0
GGACAC
ACATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCTTTTCACCAAT
GTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGG
AGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCT
CCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCAC
GCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTC
CAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCAGCAAAT
CACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGG
TCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGA
GACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGTGCGTGAGGTGG
AAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATC
AATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTACACTGTG
GACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACG
TGAA

QA 7 699 7 699
DS 

RD RR4CB56TF 795 0 0
GG
ATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCTTTTCACCAATGT
CCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGGAG
TGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCTCC
AGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCACGC
AACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTTCA
GGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCAGCAAATCT
CTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTC
TCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGAGA
CGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAG*TGGAA
GGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAA
TCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGGA
CTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACG*TGAAATGGGATACAGCTCTGACGCCGTT
AAGTTTGCTTTTTT**CTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTATCGTT
TAATTTGTCTACT

QA 3 795 3 795
DS 

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TCGTCTGGGTAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCT
TCGCCTTCAACCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTA
TACGAAACCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCATCTTCACGTCTACGCCACTT
ACAGGAACCAGCAAATCACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAA
AGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTATCTACGGGAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAA
CGCCGTCGCTCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGA
CGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCG
TTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATAT
CGTTAAGTACACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGA
TACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTT*CTTTATTCACTCGTTTTTCCGCTACT
CTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACT
C

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DS 

RD RR4CB56JQ 714 0 0
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TCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACC
TCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAA
ACTTCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCAGC
AAATCTCTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGT
TTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCT
CGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAG
*TGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTT
TATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTACAC
TGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGAC
GCCGTTAAGTTTGCTTTTTTT*CTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGT
ATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACTCATGCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4A369TFB 875 0 0
GGATCACACACATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCTT
TTCACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAG
AATATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTG
GGTAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTT
CAACCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAA
CCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAA
CCAGCAAATCACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGAC
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GCTCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGC
GTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCAT
ACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAG
TACACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCT
CTGACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCT
TCTGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCATTATCTCGTAA*CTATACCACTCATGCCA
TTACAGTGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACAATA

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DS 

RD RR4A369JQD 773 0 0
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TCGTCTGGGTAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCT
TCGCCTTCAACCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTA
TACGAAACCGAAACTCCAGGATCGGAATTTACTACGACCGTCTTCACGTTTACGCCACTT
ACAGGAACCAGCAAATCACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAA
AGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTATTTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAA
CGCCGTCGCTCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGA
CGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCG
TTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATAT
CGTTAAGTACACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGA
TACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACT
CTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACT
CATGCCATTACAGTGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACAATAACTTACATG
CC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4F807JQ 763 0 0
ATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGT
AATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAA
CCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCG
AAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACAGGAACCA
GCAAATCACTTT*CCCTACGGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGT
GTTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCT
CTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGTGCGTG
AGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACT
TTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTAC
ACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTG
ACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTT*CTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCT
GTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACTCATGCCATTA
CAGTGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACAATAACTTACATG
TC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4A369JQ 564 0 0
TACTACGACCGTCTTCACGTTTACGCCACTTACAGGAACCAGCAAATCACTTT*CCCTAC
GGCCATT*CCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTATCT
ACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGAGACGAGCAGAGTC
GTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGACTC
TTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGGATA
AATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGGACTACCAATGCA
GTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGCTTT
TTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTTGTCTA
CTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACTCATGCCATTACAGTGTCGCTAAATTATTT
TAAATGAACAATAACTTACATGCC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 8

CO CL347Contig1 1077 8 12 U
ACGATAAATAAACCCATTTTTATACCATATACATTCGATATACAACGTATTACAAAAAAT
GGTAGAATTTGGATATCTAGTGCATAGACGCAACAGACAAACATGTTATACATTTGTAAA
CACCATACACATGGCTGAAAACAAATTGAGACTATGTGGAAGAAAGCTGTGCCAGCCATG
GAAGGAGACGCTCATGGACAAGATCCGGACGATCATCTTGTGGGCAATGTCCAACACCTT
CTAGAACATAGAGGTTGAAGTTAGGTAACTGATCCGGAAGGGACGTGAAGTACTTACCTA
CAGGACCGTCAAGTGGAGTTAATCCATCCTGGTCTCCCCATAAGACAAGAACCGGTTTTG
TTATTCCAGGAATCAGCGTAATCGGGTTTGGTCCAGGTGGACCCGTTAATATCGAAACAA
ATGCATCTAGCGCACCTTCGCTGTTTGCTGGTCCAGCGATAATCTCTACAAGGGTATCAT
CTACATTGTCTTTGTTGCTATATACATTTGTCAAGATGTTCTTGAGATTCTCCCTGTCTT
TAACACGGTTAAAGAGTGCAGAAGCAATTCCTCTTTGCTTGAGTAAGAAGTCGATAAGCA
AGAGCAATGGCATCAGCAGCTTGATTCTCCAGTCGTCAAACACAGCTTTGTTGTTCATAC
CACCAGCACAATTCAACAGAACAAGACCTTTAACCAGATCTCTCTGCGATTCTTCTGAAG
CAGCTATAACGCAAGCAAGGCTTCCAACAGAGTTTCCAATCAAAACTGTCGGTTTCTGAA
CCACATCCTCCAAGAAGTTTAGTATCAACTCAGCCCATGACTCCATAGTGTAGCTAAAAC
CAGGCGGCTTCTCGGAAGCACCAAACCCAAGAAGATCAATGGCATACACTGTATGGTGTT
TGGACAGAGCATTTATATTCCTTCGCCAGTGAGGAATAGAGGCGCCAAAGCCGTGAACTA
AGAGAACAGTCTGACTCGCCGGAGTTACTTCCTCCGGCGAACTCTTGAGAAAGTAATTGA
TCGAGTACTCTCCCTTCCACTTCCATTGCTTACTCTTCTCTCCTATCTCAGCCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E060JQ U 17
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AF RR4BF69JQ U 6
AF RR4AD17JQ U 4
AF RR4AH66JQ U 6
AF RR4E060TF C 337
AF RR4AX43TF C 279
AF RR4BF69TF C 311
BS 1 264 RR4AX43JQ
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BS 266 745 RR4AX43JQ
BS 746 746 RR4AD17JQ
BS 747 760 RR4AX43JQ
BS 761 784 RR4AD17JQ
BS 785 785 RR4AH66JQ
BS 786 826 RR4AD17JQ
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BS 828 891 RR4AD17JQ
BS 892 1052 RR4AX43TF
BS 1053 1077 RR4BF69TF

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GAAGTTAGGTAACTGATCCGGAAGGGACGTGAAGTACTTACCTACAGGACCGTCAAGTGG
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TTCCCTGTTTGCTGGTCCAGCGATAATCTCTACAAGGGTATCATCTACATTGTCTTTGTT
GCCATATACATTTGTCAAGATGTTCTTG

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GAAGGAGACGCTCATGGACAAGATCCGGACGATCATCTTGTGGGCAATGTCCAACACCTT
CTAGAACATAGAGGTTGAAGTTAGATAACTGATCCGGAAGGGACGTGAAGTACTTACCTA
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TTATTCCAGGAATCAGCGTAATCGGGTTTGGTCCAGGTGGACCCGTTAATATCGAAACAA
ATGCATCTAGCGCACCTTCGCTGTTTGCTGGTCCAGCGATAATCTCTACAAGGGTATCAT
CTACATTGTCTTTGTTGCTATATACATTTGTCAAGATGTTCTTGAGATTCTCCCTGTCTT
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AGAGCAATGGCATCAGCAGCTTGATTCTCCAGTCGTCAAACACAGCTTTGTTGTTCATAC
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DS 

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CT
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AATTTGGATATCTAGTGCATAGACGCAACAGACAAACATGTTATACATTTGTAAACACCA
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CCGTCAAGTGGAGTTAATCCATCCTGGTCTCCCCATAAGACAAGAACCGGTTTTGTTATT
CCAGGAATCAGCGTAATCGGGTTTGGTCCAGGTGGACCCGTTAATATCGAAACAAATGCA
TCTAGCGCACCTTCGCTGTTTGCTGGTCCAGCGATAATCTCTACAAGGGTATCATCTACA
TTGTCTTTGTTGCCATATACATTTGTCAAGATGTTCTTGAGATTCTCCCTGTCTTTAACA
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TCCTCCAAGAAGTTTAGTATCAACTCAGCCCATGACTCCATGGTGTAGCTAAAACCAGGC
GGCTTCTCGGAAGCACCAAACCCAAGAAGATCAATGGCATACACTG

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DS 

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AATTTGGATATCTAGTGCATAGACGCAACAGACAAACATGTTATACATTTGTAAACACCA
TACACATGGCTGAAAACAAATTGAGACTATGTGGAAGAAAGCTGTGCCAGCCATGGAAGG
AGACGCTCATGGACAAGATCCGGACGATCATCTTGTGGGCAATGTCCAACACCTTCTAGA
ACATAGAGGTTGAAGTTAGGTAACTGATCCGGAAGGGACGTGAAGTACTTACCTACAGGA
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CCAGGAATCAGCGTAATCGGGTTTGGTCCAGGTGGACCCGTTAATATCGAAACAAATGCA
TCTAGCGCACCTTCGCTGTTTGCTGGTCCAGCGATAATCTCTACAAGGGTATCATCTACA
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AATGGCATCAGCAGCTTGATTCTCCAGTCATCAAACACAGCTTTGTTGTTCATACCACCA
GCACAATTCAACAGAACAAGACCTTTAACCAGATCTCTCTGCGATTCTTCTGAAGCAGCT
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TCCTCCAAGAAGTTTAGTATCAACTCAGCCCATGACTCCATAGTGTAGCTAAAACCAGG
TGGC

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ATGACTCCATGGTGTAGCTAAAACCAGGCGGCTTCTCGGAAGCACCAAACCCAAGAAGAT
CAATGGCGTACACTGTATGGTGTTTGGACAGAGCATTTATATTCCTTCGCCAGTGAGGAA
TA
CC

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DS 

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ATAATCTCTACAAGGGTATCATCTACATTGTCTTTGTTGCTATATACATTTGTCAAGATG
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ATCAAAACTGTCGGTTTCTGAACCACATCCTCCAAGAAGTTTAGTATCAACTCAGCCCAT
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CTCC

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AAGTGGAGTTAATCCATCCTGGTCTCCCCATAAGACAAGAACCGGTTTTGTTATTCCAGG
AATCAGCGTAATCGGGTTTGGTCCAGGTGGACCCGTTAATATCGAAACAAATGCATCTAG
CGCACCTTCGCTGTTTGCTGGTCCAGCGATAATCTCTACAAGGGTATCATCTACATTGTC
TTTGTTGCTATATACATTTGTCAAGATGTTCTTGAGATTCTCCCTGTCTTTAACACGGTT
AAAGAGTGCAGAAGCAATTCCTCTTTGCTTGAAGA*GAAGTCGATAAGCAAGAGCAATGG
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CTCGGAAGCACCAAACCCAAGAAGATCAATGGCATAAACTGTATGGTGTTTGGACAGAGC
ATTTATATTCCTTCGCCAGTGAGGAATAGAGGCGCCAAAGCCGTGAACTAAGAGAACAGT
CTGACTCGCCGGAGTTACTTCCTCCGGCGAACTCTTGAGAAAGTAATTGATCGAGTACTC
TCCCTTCCACTTCCATTGCTTACTCTTCTCTCCTATCTCAGCCAGTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 2 11

CO CL348Contig1 1144 9 11 U
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CAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGA
ATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGC
ACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGGAAGCT
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CCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTAATACACAAAAGAAAGGTGACTATGGCCAA
GGCTCAGGGAAAACCATCCTTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCAT
GGCTGATCATGATGCCTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAA
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CTTAGCATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGACATGAAAACCTCATTGCAGCAAG
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ATTATGCTTGTGTGGATCAGCAATAGCACAGCTCTCAAAAGGCAGGAACAAGGAGGACAA
GGACATGGCCGCACCAGAGCTTCAGTCTCTAGCTGCAACTGCTCTGGAGAAAGAGTACAA
GCAAAAAGCTCCTGCCAAACTCAACCTACTCTCTTCTGCATTAAGAAGCTTGAAGCTCTA
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TTTTTTTTGTTTTCAGAATTTGATCTCGTTGTTTTCGCTTATTCTATTTCACTCTTGATT
TATTATACACTGACTCTTATATACACTGTTTACTAGAGGTGTTTAATCAAGTTAATTAAA
TTTT


BQ
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4CP07JQ C 1
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AF RR4CP07TF U 1
AF RR4CX67TF U 1
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AF RR4FR47TF U 1
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AF RR4FR47JQ C 504
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CAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGA
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GAAGACGGAGGAGACGGAGCTAAACCAACTGGAGAATCAAGTTGAGAACGGAGGAGGAGG
TGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTCGCCGATCAGAGCTTGTGCT
CAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGA
ATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGC
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CCTTTTGGAGGATAATCCACTC

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DS 

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TGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTCGCCGATCAGAGCTTGTGCT
CAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGA
ATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGC
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CCTTTTGGAGGATAATCCACTC

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DS 

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CAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGA
ATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGC
ACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGGAAGCT
GGAAGCGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGGATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTATTCGAT
CCTTTTGGAGGATAATCCACTC

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DS 

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TGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTCGCCGATCAGAGCTTGTGCT
CAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGCCCTGATGA
ATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGC
ACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGGAAGCT
GGAAGCGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGGATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTATTCGAT
CCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTAATACACAAAAGAAAGGTGACTATGGCCAA
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CTTAGCATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGACATGAAAACCTCATTGCAGCAAG
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DS 

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GGA
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ACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGAATGGA
CGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGA
ATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGGAAGCTGGAAG
CGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGGATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTATTCGATCCTTT
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AGGGAAAACCATCCTTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCTG
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CAGCTTTCTGCTACGAGGAGCTCATATTATCTCAGCCTACTCTTCCACTGTACCACTTAG
CATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGACATGAAAACCTCATTGCAGCAAGAAAGT
ACTATGCATCAACCATAGACCTTACAG*TGGTAAA*GCACGAGAGCCCTGTTTG

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DS 

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ATACGATTGGTGGACATGAAAACCTCATTGCAGCAAGAAAGTACTATGCATCAACCATAG
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ACCTACTCTCTTCTGCATTAAGAAGCTTGAAGCTCTAGTAATTTCATCAGAGGCCACCAG
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TCTCGTTGTTTTCGCTTATTTTATTTCACTCTTGATTTATTATACACTGACTCTTATATA
CACTGTTTACTAGAGGTGTTTAA
CT

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AAACTCAACCTACTCTCTTCTGCATTAAGAAGCTTGAAGCTCTAGTAATCTCATCAGAGG
CCACCAGAGAAAAAACGCTGGCTCGTATTTTTCTTGGTTAAAGCTTTTTTTTGTTTTCAG
AATTTGATCTCGTTGTTTTCGCTTATTCTATTTCACTCTTGATTTATTATACACTGACTC
TTATATACACTGTTTACTAGAGGTGTTTAATCAAGTTAATTAAATTTT

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DS 



CO CL348Contig2 827 2 8 U
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GCTGTTTCACAGAATTGCATCAAGGTTCTCCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTG
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TACTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCT
ATGGCCAAGGCACAGGGAAAACCTTCCCTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAA
GTATTCATGGCTGATCATGATGCGTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAA
ATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTACGAGGAGCTCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCA
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CTCCTCGGAATATGCTTGTGTGGATCAGCAATCGCACAGCTCTCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX52TF U 1
AF RR4F865TF U 94
BS 1 176 RR4DX52TF
BS 177 177 RR4F865TF
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RD RR4DX52TF 750 0 0
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ATGGTGACGAAGACGGAGGAGAGAGAGCTAAACGAACTCGAGAACCAAGTGGAGAACGGA
GGCGGAGGCGTTTGGGAGTATCTCTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTCGCCGATCGGAG
ATGGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCCTGAACGATCCGGGGAAGCGATCCGCTCTTGGT
CCAGATGAATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGATTGTCAATCTCTT
GCTGTTTCACAGAATTGCATCAAGGTTCTCCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTG
GGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTATAGAAGCGAAGGGAATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCC
TACTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCT
ATGGCCAAGGCACAGGGAAAACCTTCCCTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAA
GTATTCATGGCTGATCATGATGCGTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAA
ATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTACGAGGAGCTCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCA
TTGTACCACTTAGCATACGCTGATAT*CTCTATACGATTGGTGGACTTGAAA*TCTCATC
GCAGCAAGAAAGTACTATGCAGCAAC
ATAG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4F865TF 734 0 0
G
AACTCGAGAACCAAGTGGAGAACGGAGGCGGAGGCGTTTGGGAGTATCTCTGCCTCGTTC
GTAAGCTCAAGGTTCGCCGATCAGAGATGGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCCTGAACG
ATCCGGGGAAGCGATCCGCTCTTGGTCCAGATGAATTGACGCTATATGAGCAGGTAGCAA
TTGCAGCTATGGATTGTCAATCTCTTGCTGTTTCACAGAATTGCATCAAGGTTCTCCAGA
AGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTATAGTAGCGAAGG
GAATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTACTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATC
AAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACAGGGAAAACCTTCCCTAGCCA
TTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCGTGGAGAGAAC
TTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTACGAGGAGC
TCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATACGCTGATATTCTCTATA
CGATTGGTGGACTTGAAAATCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCAGCAACCATAGACT
TAACAGGTGGTAAAAGCACAAGAGCCCTCCTCGGAATATGCTTGTGTGGATCAGCAATCG
CACAGCTCTCAGA

QA 2 734 2 734
DS 



AS 1 11

CO CL349Contig1 684 11 4 U
GGGGATTCAAAAGGCAAAGAAATCAAAGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTA
GAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCT
AGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCATTCTCAAGCCC
ACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGA
GTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCC
GCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGAT
GACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGT
TGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCT
CTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTA**TGTCTC
TTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCA
ACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGTTTTTAAATGAACACAAAAAAA*TCATGTGTATATC
TTATTTAAATGTTTCATGTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 40 40 40 40 40 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CN50JQ C 35
AF RR4CN50TF U 45
AF RR4G271JQ C 184
AF RR4FC80JQ C 45
AF RR4FC80TF U 45
AF RR4GJ37TF U 385
AF RR4G271TF U 1
AF RR4FN88JQ C 35
AF RR4FN88TF U 35
AF RR4G949JQ C 38
AF RR4G949TF U 38
BS 1 617 RR4G271TF
BS 618 618 RR4FC80TF
BS 619 677 RR4G271TF
BS 678 684 RR4G949JQ

RD RR4CN50JQ 548 0 0
GG
GTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATTTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTT
GTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTTTGCTTCCACCGTTTCTGTCGCT
CGTCCTGCTCTCATTTTCAAGCCCACCGTCTCCCTTTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCT
CCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTT
TCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGC
AACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTT
GGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACT
TTTTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGA
ATATGTACTACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTC
ATTCTC

QA 3 548 3 548
DS 

RD RR4CN50TF 538 0 0
AGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTTGTGTTGGA
GCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCTCGTCCTGC
TCTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAG
TAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAGCCGT
TGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGC
CATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAG
CAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTT
TACCTACACTTCATCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTAC
TACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4G271JQ 436 0 0
GTCTCCCTTTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTG
AAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTTTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCT
GCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGAC
AGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGG
ATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATTTGGACTTTTTACTTTACCTACACTTCATCTCTC
GATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTA**TGTCTCTTT
TAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACA
ATATGATTTT
TTGGCT

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4FC80JQ 616 0 0
G
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CAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCTCGTCCTGCT
CTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGT
GAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAGCCGTT
GGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGCC
ATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAGC
AACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTT
ACCTACACTTCACCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTACT
ACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTCATG
TCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGTTTTTAAATGAACACAAAAAA
A*TCATGTGTATATC

QA 2 616 2 616
DS 

RD RR4FC80TF 594 0 0
G
GAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTTGTGTTGGAG
CAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCTCGTCCTGCT
CTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGT
GAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAGCCGTT
GGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGCC
ATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAGC
AACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTT
ACCTACACTTCACCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTACT
ACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTCATG
TCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGTTTTTAAATGAACA

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR4GJ37TF 250 0 0
GGATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGT
TTGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGT
CTTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATC
TCTCTCATTTTCATCCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATCTTCTGGTTTCTTG
TTTTTAAATG

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR4G271TF 682 0 0
GGGGATTCAAAAGGCAAAGAAATCAAAGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTA
GAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCT
AGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCATTCTCAAGCCC
ACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGA
GTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCC
GCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGAT
GACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGT
TGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCT
CTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTA**TGTCTC
TTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCA
ACAATATGATTTTCTGGCTTCTTGTTTTTAAATGAACACAAAAAAA*TCATGTGTATATC
TTATTTAAATGTTTCAT
GTTAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4FN88JQ 647 0 0
GG
GTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAG*GTTTGTACTT
GTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCT
CGTCCTGCTCTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCT
CCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTT
TCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTTCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGC
GACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTT
GGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACT
TTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGA
ATATGTACTACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTC
ATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGTTTTTAAATGAA
CACAAAAAAAATCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCAT
ATTG

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4FN88TF 647 0 0
GG
GTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAG*GTTTGTACTT
GTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCT
CGTCCTGCTCTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCT
CCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTC
TCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTTCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGC
GACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTT
GGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACT
TTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGA
ATATGTACTACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTC
ATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGTTTTTAAATGAA
CACAAAAAAAATCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCAT
ATTG

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4G949JQ 647 0 0
GG
GCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTTGTG
TTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTTTCTGTCGCTCGT
CCTGCTCTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCA
ATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGCCTCA
GCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAAC
CCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGG
CTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTC
TACTTTACCTACACTTCATCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATA
TGTACTACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATT
CTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTATGGTTTCTTGTTTTTAAATGAACAC
AAAAAAA*TCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCATGTTAATC

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR4G949TF 647 0 0
GG
GCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTACTTGTG
TTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTCTCTGTCGCTCGT
CCTGCTCTCATTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCCGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCA
ATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGCCTCA
GCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAAC
CCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCATTTGGG
CTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTC
TACTTTACCTACACTTCATCTCTCGATGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATA
TGTACTACTACTA**TGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTTTTCATT
CTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTATGGTTTCTTGTTTTTAAATGAACAC
AAAAAAA*TCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCAT
GTTAATC

QA 3 640 3 640
DS 



AS 1 11

CO CL350Contig1 735 11 10 U
GGAGCTTAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGACGAACGAAGATCAAATC*AAGA
GGGTTGGATGGATCGTGACAGTAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTA
CAAAGAAATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTCGACGTCCTCC
CCTTTTGTTCGGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTC
CTGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGT
TCTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCA
TGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTT
GGTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTT
TGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGG
ATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTT
CTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTT
CTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATT
ATGATCTTTTGGTGC


BQ
10 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 5 5 5 55 55 55 25 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 35 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 40 40 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4BG47TF U 2
AF RR4D115TF U 9
AF RR4F291TF U 1
AF RR4A663JQ C 1
AF RR4A663TF U 1
AF RR4FH26TF U 2
AF RR4AS47JQ C 10
AF RR4AS47TF U 2
AF RR4FH26JQ C 31
AF RR4F291JQ C 275
AF RR4D115JQ C 369
BS 1 1 RR4A663JQ
BS 2 444 RR4BG47TF
BS 445 445 RR4D115TF
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BS 640 679 RR4BG47TF
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BS 689 726 RR4A663TF
BS 727 733 RR4FH26TF
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RD RR4BG47TF 682 0 0
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CTTTTGTTCGGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCC
TGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTT
CTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCAT
GCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTG
GTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCCCTAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTT
GACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGA
TCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTC
TTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGGGTTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTC
TTTTAACTTATGGTTGTA
TGAT

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DS 

RD RR4D115TF 680 0 0
GGGC
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TATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTCGACGTCCTCCCCTTTTGTTCGG
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CGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTTCTTCCTAGGTG
CTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTA
TAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAGGGGACA
GCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGGTTA
CTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACAT*AAGGATCGCAAACAAT
AAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCGTATT
TTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTCTTTTAACTTAT
GGTTGTAAGATAAAAA

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DS 

RD RR4F291TF 688 0 0
G
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GGTTGGATGGATCGTGACAGTAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTAC
AAAGAAATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTCGACGTCCTCCC
CTTTTGTTCGGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCC
TGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTT
CTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCAT
GCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTG
GTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTT
GACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGA
TCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTC
TTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAA*CATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTC
TTT*AACTTATGGTTGTAAGATAAAAA

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DS 

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GGGTTGGATGGATCGTGACAGTAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTA
CAAAGAAATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTCGACGTCCTCC
CCTTTTGTTCGGAGACTTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACCGATTCAGTTGTCTC
CTGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGGGTTCCTCGGAGATGT
TCTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCA
TGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTT
GGTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTT
TGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGG
ATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTT
CTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTT
CTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATT
ATGATC

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DS 

RD RR4A663TF 726 0 0
G
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GGTTGGATGGATCGTGACAGTAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTAC
AAAGAAATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTCGACGTCCTCCC
CTTTTGTTCGGAGACTTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACCGATTCAGTTGTCTCC
TGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGGGTTCCTCGGAGATGTT
CTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCAT
GCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTG
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TCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTC
TTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTC
TTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTA
TGATC

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DS 

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AAAGAAATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTCGACGTCCTCCC
CTTTTGTTCGGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCC
TGGGGTGATAGCAGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTT
CTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCAT
GCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTG
GTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTT
GACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGA
TCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTC
TTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTC
TTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTA
TGATCTTTTGGT

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DS 

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GGATCGTGACAGCAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTACAAAGAAAT
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GTGCTTATCCTATGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGG
CTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTGAGAGG
ACAGCCTCCCTCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGG
TTACTCCAGAATATGCCAAAATCTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGATCGCAAAC
AATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCAATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCGT
ATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCT*CTCCTTTTCTTTTAACT
TATGGTTGTAAGATAAAA*GATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGA
CC

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DS 

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GGGCC
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GTTCAGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGG
TGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAAGGAATCTGAATTCCTCGGAGATGTTCTTCC
TAGGTGCTTATCCTATGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCT
CGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTGAG
AGGACAGCCTCCCTCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGA
TGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATCTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGATCGCA
AACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCAATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAAT
CGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCT*CTCCTTTTCTTTTA
ACTTATGGTTGTAAGATAAAA*GATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGA
CC

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DS 

RD RR4FH26JQ 705 0 0
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GAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGGTGATAGCAGCAAGAGCTTCATCGT
CTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTTCTTCCTAGGTGCTTATCCTACGATTACAA
AGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATC
TGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGG
ATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAA
TGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGT
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ACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTCTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAAGA
TGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGATCTTTTGGT
TC

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DS 

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ATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTG
CATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCC
ATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTA
CGAGTGGTCCTTTGCTTACATTAAGGATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGA
TGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACAT
TGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTCTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAAGATGTT
TGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGATCTTTTGGT
CC

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DS 

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GCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAGGG
GACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATG
GTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTTGCTTACAT*AAGGATCGCAAA
CAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCG
TATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGG*TTTGGTCTCTCTTCTCCTTTTCTTTTAAC
TTATGGTTGTAAGATAAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGATCTT
TTGGTGC

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DS 



AS 1 11

CO CL351Contig1 1188 11 24 U
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CGGAATCGATGTGTTTGATCCTAAGTTCAACATTGTCTCTCCTGGTGCTGATATGACCAT
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GCCCATCCTCTTCACCATGGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACCTGTCAGGACTCGTCGA
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CAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGAGAAGGCCGAGATGAAGAGAATGTATGACCT
CATCGATGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGT
TAGGAACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGC
GTTGTATGAAGCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTT
CGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATAT
TGACCCTTACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAA
GGAAGATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAA
ATACACGTGGCAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTG
GAAGCATGTATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGC
ATTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATG
CGGAACCATTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAA
AAAAA*TCTCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGT
TATTTCAATCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTGATCATTTGCCTCTCAGGCAAGGCTAATG
CGTTGTATTCTGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTTTCTATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 10 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT58TF U 1
AF RR4F795TF U 136
AF RR4FE37TF U 256
AF RR4FG28TF U 256
AF RR4EL91TF U 371
AF RR4DT58JQ C 361
AF RR4FE37JQ C 509
AF RR4F795JQ C 489
AF RR4FG28JQ C 431
AF RR4EL91JQ C 401
AF RR4BQ91TF U 880
BS 1 164 RR4DT58TF
BS 165 165 RR4F795TF
BS 166 348 RR4DT58TF
BS 349 349 RR4F795TF
BS 350 675 RR4DT58TF
BS 676 676 RR4F795TF
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BS 683 683 RR4F795TF
BS 684 721 RR4DT58TF
BS 722 722 RR4F795TF
BS 723 755 RR4DT58TF
BS 756 803 RR4F795TF
BS 804 925 RR4FE37TF
BS 926 983 RR4FG28TF
BS 984 984 RR4EL91TF
BS 985 991 RR4FG28TF
BS 992 992 RR4EL91TF
BS 993 1009 RR4FG28TF
BS 1010 1060 RR4EL91TF
BS 1061 1061 RR4BQ91TF
BS 1062 1097 RR4EL91TF
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BS 1171 1188 RR4BQ91TF

RD RR4DT58TF 762 0 0
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CTACTTCCCTTACACAGAGGAGAAGCGTAGATTGACTAAGTTCCGCCCTGAGATCGAGGA
GCTACTCTACAGCGATGTTGAAAACCAAGAGCACTTATGTGTGCTCAAGGACAAGAAGAA
GCCCATCCTCTTCACCATGGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACCTGTCAGGACTCGTCGA
GTGGTACGGGAAGAACAAACGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTCGTTGGAGGAGA
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CATCGATGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGT
TAGGAACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGC
GTTGTATGAAGCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTT
CGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATAT
TGACCCTTACCATGGCGATCAG*CTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAA
G*AAGATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGG
AGGGCTT

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DS 

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GGT
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TGAAAACCAAGGGCACTTATGTGTGCTCAAGGACAAGAAGAAGCCCATCCTCTTCACCAT
GGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACCTGTCAGGACTCGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAA
ACGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTTGGAGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAA
GGACAACGAAGAGAAGGCCGAGATGAAGAGAATGTATGACCTCATCGATGGGTCCAAGCT
GAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTCTA
CCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTTGG
TCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGG
TCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTACCATGGTGA
TCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCATTG
GGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACGTGGCAGATATA
CTCAC

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DS 

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G
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AAACGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTTGGAGGAGACAGG**GAAAGAGTCG
AAGGACAACGAAGAGAAGGCCGAGATGAAGAGAATGTATGACCTCATCGATGAGTACAAG
CTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTC
TACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTT
GGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGT
GGTCCGGCTGGGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTACCATGGT
GATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCAT
TGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGATAAATACACGTGGCAGATA
TACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTATCGAAC
CTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTATCGCCCA
CTGGCTAAG
CTG

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DS 

RD RR4FG28TF 767 0 0
G
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AAACGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTTGGAGGAGACAGG**GAAAGAGTCG
AAGGACAACGAAGAGAAGGCCGAGATGAAGAGAATGTATGACCTCATCGATGAGTACAAG
CTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTC
TACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTT
GGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGT
GGTCCGGCTGGGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTACCATGGT
GATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCAT
TGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGATAAATACACGTGGCAGATA
TACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTATCGAAC
CTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTATCGCCCA
CTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATTATAAAG
AGCTTGA*GAGAGAA*GAGCTTGCAGTGTGTGA
GAAGATAAAAAAA

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DS 

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TACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGGACAGGGTTAGGAACGGT
GAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAA
GCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGC
AAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTAC
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TCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACGTGG
CAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTA
TCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTAT
CGCCCACTGGCTAAGGCTATTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATT
ATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAA*TCTC
TTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAG*AGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAATC
CATTCGT

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DS 

RD RR4DT58JQ 828 0 0
CAGGA
GGAAAGAGTCGAAGGACA*CGAAGAGAAGGCCGAGATGAAGAGAATGTATGACCTCATCG
ATGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGTTAGGA
ACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGT
ATGAAGCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCA
CTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACC
CTTACCATGGCGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAG
ATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACA
CGTGGCAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGC
ATGTATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGA
AGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAA
CCATTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAA
ATCTCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTT
CAATCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTGATCATTTGCCTCTCAGGCAAGGCTAATGCGTTG
TATTCTGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTTTC
TATCTG

QA 6 822 6 822
DS 

RD RR4FE37JQ 674 0 0
TGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTTGGTCTTACTGTT
GTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGGG
ATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTACCATGGTGATCAGGCTGCT
GATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCATTGGGATGAGATC
TCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGATAAATACACGTGGCAGATATACTCACAGAGG
CTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTATCGAACCTTGACCGTCTT
GAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCT
GTTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATTATAAAGAGCTTGAAGAGA
GAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAA*TCTCTTTTGATTCTTACTGTCA
TTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAATCCATTCGTCTTTGTTTTTA
TTTGATCATTTGCCTCTCAGGCAAGGCTAATGCGTTGTATTCTGATTGTTGAGAGAATGA
AATTTCTATTTTTC

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DS 

RD RR4F795JQ 695 0 0
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AAGCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTT
GCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTT
ACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATC
CATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACGT
GGCAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATG
TATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGT
ATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCA
TTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAAATC
TCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAA
TCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTGATCATTTGCCTCTCAGGCAAGGCTAATGCGTTGTAT
TCTGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTTTC
G

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4FG28JQ 752 0 0
TACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCACAGATGAACAGGGTTAGGAACGGT
GAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAGGGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAA
GCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGC
AAAGGTGGTCCGGCTGGGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTAC
CATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCA
TCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGATAAATACACGTGG
CAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTA
TCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTAT
CGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATT
ATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAA*TCTC
TTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAATC
CATTCGTCTTTGTTTTTATTTGATCATTTGCCTCTCAGGCAAGGCTAATGCGTTGTATTC
TGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTTTC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4EL91JQ 788 0 0
ATGAAGAGAATGTATGAC*TCATCGATGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATC
TCTTCACAGATGGACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAG
GGCGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTTGGTCTTACTGTTGTGGAGGCCATG
ACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCAC
GGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCT
GACTTCCTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGG
CTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACGTGGCAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTG
ACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGT
TACCTTGAGATGTTTTATGCATTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTATTCCTCTTGCC
GAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGC
AGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAAATCTCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAG
GAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAATCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTGATCATTTG
CCTCTCAGGCAAGGCTAATGCGTTGTATTCTGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTT
TC
TATCTT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4BQ91TF 309 0 0
G
TACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCC
GAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGC
AGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAA**TCTCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAG
GAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAATCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTGATCATTTG
CCTCTCAGGCAAGGCTAATGCGTTGTATTCTGATTGTTGAGAGAATGAAGTTTCTATTTT
TCTATCTT

QA 2 309 2 309
DS 



AS 2 10

CO CL352Contig1 588 2 2 U
GATCCCTTCACCGCTGGAGTTTACGTCGCCCTTATGATGGCTCAGATCGAGATCTTGAGG
AAGAAGGGTCACTCGTACTCGGAGATCATCAACGAGAGTGTGATTGAATCTGTTGATTCT
CTCAACCCTTTTATGCACGCTAGGGGAGTGTCTTTCATGGTGGACAACTGCTCGACCACA
GCAAGATTGGGATCGAGGAAATGGGCACCAAGGTTCGACTACAACCTGACCCAACAAGCT
CTGGTAGCTGTGGACAATGGTGCACCAATCAACAAAGACTTGATCAGCAACTTCTTTGCT
GATCCAGTCCATGGTGCTATCGAGGTCTGTGCACAGCTCAGGCCTACCGTTGATATCTCT
GTGCCTGAAGATGCAGATTTTGTTCGACCTGAGCTGCGTCAGTCTAACTGAGTGAAGGGT
TGAATGATGATCAGTTTCTTTTGATGTAACGGTTTTTGAAAAAAAAAGAAATAGACAAAT
GGGTTTTGGAAGGTTTAGGCGTGAGTGTTTCGTTTTGGACGGTTTGAATAATGATGTCTC
TTTGTCTCTTTGGACTTTCCATTAATAGAATGTTCTCTTATATTCTCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EF64JQ C 1
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G
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DS 



CO CL352Contig2 1387 8 17 U
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TCTTTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 20 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 15 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 

AF RR4GW59TF U 1
AF RR4H948TF U 1
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DS 

RD RR4H948TF 689 0 0
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CGGTTTGTCACACGGGTTTCTACTGGGGCATTTGCAGTCCATGGGACTTGATTTCCCAAA
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TTTGCTTGGCGCTGTCCACGGAATCGTGGAGTCTCTGTTCAGAAGGTACACCGAAAATGG
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TTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAA

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DS 

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GGCA
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ACCCTTGTATGGAGATCCTCTACGAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCA
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TGGGAAAGATTGATCAGACA*GAATGTGGAAG
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DS 

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G
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CCTTTTACTTTTGCTACTACTCTTGAGCAAGAGTACAAGAGTGACATCTTTGGAGAAAGA
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GAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTCTTAGCCGGTCGT
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ATGTGGAAGGTCGGTGAACGCGTCAGGAAGTCCAGACCAGCTGGTGACTTGGGTCCCTTG
TATCCCTTCACCGCTGGAGTTTACGTTGCTCTTATGATGGCTCAGATTGAGATCTTGAGG
A

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR4FC31TF 728 0 0
G
ATCACAGGAAATATCTCGAGAACTATCTCTACCCAGGGAATGTTGGCTGTCTACAACTCC
TTGTCTGAAGAAGGCAAAAAGGATTTCGAGACTGCGTACAGTGCATCCTTCTACCCTTGT
ATGGAGATCCTCTACGAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTT
GTCTTAGCCGGTCGTCGCTTCTACGATAAGGAGGGCTTACCTGCATTCCCAATGGGAAAG
ATTGATCAGACAAGAATGTGGAAGGTCGGTGAACGCGTCAGGAAGTCCAGACCAGCTGGT
GACTTGGGTCCCTTGTATCCCTTCACCGCTGGAGTTTACGTTGCTCTTATGATGGCTCAG
ATTGAGATCTTGAGGAAGAAGGGTCACTCCTACTCGGAGATCATCAACGAGAGTGTGATT
GAGTCAGTTGATTCTCTGAACCCGTTTATGCACGCTAGAGGAGTGTCCTTCATGGTGGAC
AACTGCTCGACCACAGCAAGATTGGGATCAAGGAAATGGGCACCACGGTTTGACTACAAC
CTGACACAACAAGCTTTGGTGGCTGTGGACAATGGTGCACCAATCAACAAAGACTTGATC
AGCAACTTCTTCGCTGATCCAGTCCATGGTGCTATCCAGGTCTGTGCGGAGCTCAG*CCC
ACCGTTGATATCTCAGTGCCTCA*GATGCAGATTTTGTTCGACCAGAGCTCCGTCAGTCC
AACTGAG

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR4GW59JQ 860 0 0
ACAGGAAATATCTCGAGA*CTATCTCTACCCAGGGAATGTTGGCTGTCTACAACTCCTTG
TCTGAAGAAGGCAAAA*GGATTTCGAGACTGCGTACAGTGCATCCTTCTACCCTTGTATG
GAGATCCTCTACGAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTC
TTAGCCGGTCGTCGCTTCTACGATAAGGAGGGCTTACCTGCATTCCCAATGGGAAAGATT
GATCAGACAAGAATGTGGAAGGTCGGTGAACGCGTCAGGAAGTCCAGACCAGCTGGTGAC
TTGGGTCCCTTGTATCCCTTCACCGCTGGAGTTTACGTTGCTCTTATGATGGCTCAGATT
GAGATCTTGAGGAAGAAGGGTCACTCCTACTCGGAGATCATCAACGAGAGTGTGATTGAG
TCAGTTGATTCTCTGAACCCGTTTATGCACGCTAGAGGAGTGTCCTTCATGGTGGACAAC
TGCTCGACCACA*CAAGATTGGGATCAAGGAAATGGGCACCACGGTTTGACTACAACCTG
ACACAACAAGCTTTGGTGGCTGTGGACAATGGTGCACCAATCAACAAAGACTTGATCAGC
AACTTTTTCGCTGATCCAGTCCATGGTGCTATCCAGGTCTGTGCGGAGCTCAGGCCCACC
GTTGATATCTCAGTGCCTCAAGATGCAGATTTTGTTCGACCAGAGCTCCGTCAGTCCAAC
TGAGTGAAGGGTTTGAAATGTTATCAGTCTCTTTCAATGTAATCGTGTTTTGAAGAAAGA
CAATGGTCTTTGGAAGTTGTAGGCGTGAATGAATGTTTT*GTTTGGACTACTTCAGTAAT
AATGATGTTTCGTTGTCTCT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4H948JQB 725 0 0
TGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTCTTAGCCGGTCGTCGC
TTCTACGATAAGGAGGGCTTACCTGCATTCCCAATGGGAAAGATTGATCAGACAAGAATG
TGGAAGGTCGGTGAACGCGTCAGGAAGTCCAGACCAGCTGGTGACTTGGGTCCCTTGTAT
CCCTTCACCGCTGGAGTTTACGTTGCTCTTATGATGGCTCAGATTGAGATCTTGAGGAAG
AAGGGTCACTCCTACTCGGAGATCATCAACGAGAGTGTGATTGAGTCAGTTGATTCTCTG
AACCCGTTTATGCACGCTAGAGGAGTGTCCTTCATGGTGGACAACTGCTCGACCACA*CA
AGATTGGGATCAAGGAAATGGGCACCACGGTTTGACTACAACCTGACACAACAAGCTTTG
GTGGCTGTGGACAATGGTGCACCAATCAACAAAGACTTGATCAGCAACTTCTTCGCTGAT
CCAGTCCATGGTGCTATCCAGGTCTGTGCGGAGCTCAGGCCCACCGTTGATATCTCAGTG
CCTCAAGATGCAGATTTTGTTCGACCAGAGCTCCGTCAGTCCAACTGAGTGAAGGGTTTG
AAATGTTATCAGTCTCTTTCAATGTAATCGTGTTTTGAAGAAAGACAATGGTCTTTGGAA
GTTGTAGGCGTGAATGAATGTTTT*GTTTGGACTACTTCAGTAATAATGATGTTTCGTTG
TCTCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4EY93JQ 731 0 0
AATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTCTTAGCCGGTCGTC
GCTTCTACGATAAGGAGGGCTTGCCTGCATTCCCAATGGGAAAGATTGATCAGACAAGAA
TGTGGAAGGTCGGTGAACGCGTCAGGAAGTCCAGACCAGCTGGTGACTTGGGTCCCTTGT
ATCCCTTCACCGCTGGAGTTTACGTTGCCCTTATGATGGCTCAGATTGAGATCTTGAGGA
AGAAGGGTCACTCCTACTCGGAGATCATCAACGAGAGTGTGATTGAGTCTGTTGATTCTC
TGAACCCGTTTATGCACGCTAGAGGAGTGTCCTTCATGGTGGACAACTGCTCGACCACAG
CAAGATTGGGATCGAGGAAATGGGCACCACGGTTTGACTACAACCTGACACAACAAGCTT
TGGTGGCTGTGGACAATGGTGCACCAATCAACAAAGACTTGATCAGCAACTTTTTCGCTG
ATCCAGTCCATGGTGCTATCCAGGTCTGTGCGGAGCTGAGGCCCACCGTGGATATCTCAG
TGCCTCAAGATGCAGATTTTGTTCGACCAGAGCTCCGTCAGTCCAACTGAGTGAAGGGTT
TGAAATGTTATCAGTCTCTTTCAATGTAATCGTGTTTTGAAGAAAGACAATGGTCTTTG*
******TAGGCGTGAATGAATGTTTTTGTTTGGACTACTTGAATAATAATGATGTTTCTT
TGTCTCTTTTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 11

CO CL353Contig1 599 11 10 U
GGAGAGGCATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAG
ATGGTGATAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGAT
AAAGCCAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGAC
ATGATAGAAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAG
ATTGAGCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCT
TTTGTTGAAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATG
TGGGTTCCTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCT
AATAACACCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATAT
AAATCAGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTA
AAATGTTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATCGTAAAGAGAATCCTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 35 35 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 45 45 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CO64TF U 83
AF RR4BI23TF U 1
AF RR4EY83JQ C 3
AF RR4EY83TF U 3
AF RR4CJ73JQ C 5
AF RR4CO64JQ C 7
AF RR4CJ73TF U 5
AF RR4GE68JQ C 8
AF RR4GE68TF U 8
AF RR4GZ68TF U 8
AF RR4GZ68JQ C 140
BS 1 199 RR4BI23TF
BS 200 200 RR4EY83TF
BS 201 248 RR4BI23TF
BS 249 249 RR4EY83TF
BS 250 392 RR4BI23TF
BS 393 393 RR4EY83TF
BS 394 573 RR4BI23TF
BS 574 575 RR4EY83TF
BS 576 580 RR4CJ73TF
BS 581 599 RR4GZ68TF

RD RR4CO64TF 225 0 0
ATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCAAGGAGCTTCTTGCAC
TCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAGAAGTTGGATACAACA
AAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGCATACATTCGCTGCTA
TAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTT
TGTT

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR4BI23TF 573 0 0
GGAGAGGCATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAG
ATGGTGATAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGAT
AAAGCCAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGAC
ATGATAGAAGTTGGACACATCAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAG
ATTGAGCACACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCT
TTTGTTGAAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATG
TGGGTTCCTGTGCATGATATCTTCATCAAAGATAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCT
AATAACACCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATAT
AAATCAGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTA
AAATGTTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4EY83JQ 571 0 0
GGA
GGCATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGT
GATAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGC
CAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGAT
AGAAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGA
GCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGT
TGAAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGT
TCCTGTGCATGATATCTTCATCAAGGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAA
CACCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATC
AGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATG
TTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATT

QA 4 571 4 571
DS 

RD RR4EY83TF 576 0 0
GGA
GGCATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGT
GATAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGC
CAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGAT
AGAAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGA
GCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGT
TGAAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGT
TCCTGTGCATGATATCTTCATCAAGGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAA
CACCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATC
AGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATG
TTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAA
AAA

QA 4 573 4 573
DS 

RD RR4CJ73JQ 576 0 0
G
GGCATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGT
GATAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGC
CAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGAT
AGAAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGA
GCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAATTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGT
TGAAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGT
TCCTGTGCATGATATTTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAA
CACCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATC
AGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATG
TTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATCG

QA 2 576 2 576
DS 

RD RR4CO64JQ 568 0 0
G
GATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGA
TAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCA
AGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAG
AAGTTGGATACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGC
ATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGTTG
AAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGTTC
CTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAACA
CCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATCAG
AAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATGTT
CCATATCAATAGAACACAGTTTCA
CCG

QA 2 565 2 565
DS 

RD RR4CJ73TF 576 0 0
G
GGCATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGT
GATAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGC
CAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGAT
AGAAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGA
GCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAATTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGT
TGAAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGT
TCCTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAA
CACCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATC
AGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATG
TTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATCG

QA 2 576 2 576
DS 

RD RR4GE68JQ 574 0 0
GATACGTACGACCATCAAAAAGCAAAGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGA
TAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCA
AGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAG
AAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGC
ATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGTTG
AAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGTTC
CTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAACA
CCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATCAG
AAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATGTT
CCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATCG
C

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4GE68TF 574 0 0
GATACGTACGACCATCAAAAAGCAAAGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGA
TAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCA
AGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAG
AAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGC
ATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGTTG
AAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGTTC
CTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAACA
CCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATCAG
AAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATGTT
CCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATCG
C

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4GZ68TF 592 0 0
GATACGTACGACCATCAAAAAGAAAGGATCTACCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGA
TAGGTGATTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCATTGTCTGGATAAAGCCA
AGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAG
AAGTTGGACACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGC
ATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGTTG
AAGACCGTAAGTTGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGTTC
CTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAACA
CCGGCCTGTCACGAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATCAG
AAAAAGAGGAGTAACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATGTT
CCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATCGTAAAGAGAATCCTTTCTCC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4GZ68JQ 460 0 0
CACTTTTCAATTTACCTACAGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAGAAGTTGGACACA
ACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGCATACATTCGCTG
CTATAGGTCGTAAAGTGATATATGACACGGAGATAACTGCTTTTGTTGAAGACCGTAAGT
TGAAGAGGCTCACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATGTGGGTTCCTGTGCATGATA
TCTTCATCAAAGAGAAAGATCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAACACCGGCCTGTCAC
GAACATTTAAAGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAATCAGAAAAAGAGGAGT
AACTAAAGTTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAGAACATTAAAATGTTCCATATCAATAG
AACACAGTTTCATTAATATCGTAAAGAGAATCCTTTCTCC

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 11

CO CL354Contig1 545 11 10 U
GGATCTGGGAAGCAAAAAGGCGATAATGGCGGATCAACAAGGAGGAACAGTTTTAGGAGG
AGTTCGCGATGTCGATCCAAATGCAAACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGC
TGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGAGCCTGGAGTACAGGAGGCTCATCGGTGC
GAAAACGCAGGTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGA
GAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTT
GGAGGCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATACCTCAGCTTTGAACACATCAC
GTGATAATTAAGAGTCCCGGTTTAACCAATGGGTTAACTCCTTAAAATAAGTGAATGTGA
ACTCTGTCTTTGATTTGATGGGTGTGTGTAATGGAACTCGTGTTATTATTATCTATGACT
TTCGTTTGTGTATTATTGCAAGTTTGCAAACTTTCACTTTATATCTTATCTTGTCATGAT
TCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4GW57TF U 7
AF RR4H719TF U 7
AF RR4G046TF U 1
AF RR4GT76JQ C 4
AF RR4GT76TF U 4
AF RR4G046JQ C 25
AF RR4H006JQ C 7
AF RR4H006TF U 7
AF RR4G791JQ C 7
AF RR4G791TF U 7
AF RR4GX91TF U 4
BS 1 6 RR4G046TF
BS 7 8 RR4GW57TF
BS 9 234 RR4G046TF
BS 235 235 RR4GT76TF
BS 236 393 RR4G046TF
BS 394 394 RR4GT76TF
BS 395 505 RR4G046TF
BS 506 506 RR4GT76TF
BS 507 520 RR4G046TF
BS 521 545 RR4GX91TF

RD RR4GW57TF 468 0 0
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TCTTTGATTTGATGGGTGTGTGTAATGGAACTCGTGTTATTATTATC
C

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DS 

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CGATGTCGATCCAAATGCAAACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGA
TGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGAGCCTGGAGTACAGGAGGCTCATCGGTGCGAAAAC
GCAGGTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAA
GAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGGC
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TCTTTGATTTGATGGGTGTGTGTAATGGAACTCGTGTTATTATTAT

QA 1 466 1 466
DS 

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TGTGTATTATTGCAAGTTTGCAAACTTTC

QA 4 512 4 512
DS 

RD RR4GT76TF 512 0 0
GGA
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TCTTTGATTTGATGGGTGTGTGTAATGGAACTCGTGTTATTATTATCTATGACTTTCGTT
TGTGTATTATTGCAAGTTTGCAAACTTTC

QA 4 512 4 512
DS 

RD RR4G046JQ 496 0 0
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GATGCCCCATTTGACTGTGGAGGTGGCTGACGGTGAGAAGAAGAAGGTTTACGAGGCCAA
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ACCAATGGGCTAACTCCTTAAAATAAGTGAATGTGAACTCTGTCTTTGATTTGATGGGTG
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TACAAACTTTCACTTT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4H006JQ 492 0 0
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TGTGTATTA
AGG

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DS 

RD RR4H006TF 492 0 0
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GCAGGTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAA
GAAGGTCTACGGGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGGC
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TGTGTATTA
AGG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4G791JQ 520 0 0
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ATATCT

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DS 

RD RR4G791TF 520 0 0
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GCAGGTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAA
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ATATCT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4GX91TF 542 0 0
GGA
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CGATGTCGATCCAAATGCAAACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGA
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GCAGGTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAA
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TCTTTGATTTGATGGGTGTGTGTAATGGAACTCGTGTTATTATTATCTATGACTTTCGTT
TGTGTATTATTGCAAGTTTGCAAACTTTCACTTTATATCTTATCTTGTCATGATTCTAC

QA 4 542 4 542
DS 



AS 1 10

CO CL355Contig1 765 10 15 U
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TTAGAGAGAGAGCCAACCAACCACAGAAGAAACCAAACAAACAAACAACAATGTCTTCTT
CTCCTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCGAAGAAATCGATCCCAAAAACG
TATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCTCGACGATT
TCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGAGCTCTCTCCGTCT
CACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACCAATTACTTTAATG
GGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATGGCTTGCGCGAGAA
CCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTCTCTG
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TGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTCACTTACCTATCTC
GTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCTGAACTTTTGTTGA
TTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATTAGTATATG
GACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 

AF RR4GL70TF U 1
AF RR4F212TF U 43
AF RR4F269TF U 43
AF RR4B573JQ C 46
AF RR4F269JQ C 328
AF RR4F212JQ C 64
AF RR4B573TF U 46
AF RR4GY47TF U 46
AF RR4H558TF U 52
AF RR4H558JQB C 127
BS 1 158 RR4GL70TF
BS 159 159 RR4F212TF
BS 160 325 RR4GL70TF
BS 326 326 RR4F212TF
BS 327 343 RR4GL70TF
BS 344 344 RR4F212TF
BS 345 403 RR4GL70TF
BS 404 404 RR4F212TF
BS 405 579 RR4GL70TF
BS 580 580 RR4F212TF
BS 581 595 RR4GL70TF
BS 596 597 RR4F212TF
BS 598 640 RR4GL70TF
BS 641 717 RR4F212TF
BS 718 765 RR4F269TF

RD RR4GL70TF 655 0 0
GGAATTCGAAATAAAACTAGGTTAAAATCGAATTGGGGGAAAAATCCATGAAACTTGGAG
TTAGAGAGAGAGCCAACCAACCACAGAAGAAACCAAACAAACAAACAACAATGTCTTCTT
CTCCTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCAAAGAAATCGATCCCAAAAACG
TATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCTCGACGATT
TCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGAGCTCTCTCCGTCT
CACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTTGTCGTCACGCCTGCCCTTACCAATTACTTTAATG
GGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCAATGGCTTGCGCGAGAA
CCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTCTCTG
CTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGGGAGGAACC
TGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCACGAAAGTCACTTACCTTGCTC
GTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGC
TTTTCTGATACTTGA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4F212TF 675 0 0
GGGGC
ATGAAACTTGGAGTTAGAGAGAGAGCCAACCAACCACAGAAGAAACCAAACAAACAAACA
ACAATGTCTTCTTCTCCTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCGAAGAAATC
GATCCCAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCC
TCCCTCGACGATTTCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGA
GCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACC
AATTACTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATG
GCTTGCGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATG
TCTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGG
AGTGGGAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTC
ACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCT
GAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATAC
AGATTAGTAT

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GGGGC
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TCCCTCGACGATTTCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGA
GCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACC
AATTACTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATG
GCTTGCGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATG
TCTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGG
AGTGGGAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTC
ACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCT
GAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATAC
AGATTAGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTTCC

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GG
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ACAATGTCTTCTTCTCCTTCTCCGATTTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCGAAGAAATC
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TCCCTCGACGATTTCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGA
GCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACC
AATTACTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATG
GCTTGCGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATG
TCTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGG
AGTGGGAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTC
ACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCT
GAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATAC
AGATTAGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTTCC

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DS 

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TTGCAGAGAGATTATCGATGGCTTGCGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGT
TCCTCGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTTTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGG
TGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGGGAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGA
TGAAGGATACCATGAAAGTCACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCT
CCAAGCTTTAAGCGAGATCTGAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGAC
AAGAGTCTGTTTATGTATACAGATTAGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTA
CTACTTTTCTCTGTTTCC

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DS 

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CTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCGAAGAAATCGATCCCAAAAACGTAT
CCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCTCGACGATTTCG
CCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGAGCTCTCTCCGTCTCAC
GTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACCAATTACTTTAATGGGT
TACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATGGCTTGCGCGAGAACCA
TCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTCTCTGCTG
CTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGGGAGGAACCTGA
CGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTCACTTACCTATCTCGTG
CTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCTGAACTTTTGTTGATTC
TTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATTAGTATATGGAC
CTACGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTTCC

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DS 

RD RR4B573TF 720 0 0
GG
ATGAAACTTGGAGTTAGAGAGAGAGCCAACCAACCACAGAAGAAACCAAACAAACAAACA
ACAATGTCTTCTTCTCCTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCGAAGAAATC
GATCCCAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCC
TCCCTCGACGATTTCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGA
GCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACC
AATTACTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATG
GCTTGCGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATG
TCTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGG
AGTGGGAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTC
ACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCT
GAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATAC
AGATTAGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTTCC

QA 3 720 3 720
DS 

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GG
ATGAAACTTGGAGTTAGAGAGAGAGCCAACCAACCACAGAAGAAACCAAACAAACAAACA
ACAATGTCTTCTTCTCCTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATCCGAAGAAATC
GATCCCAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCC
TCCCTCGACGATTTCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGA
GCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACC
AATTACTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATG
GCTTGCGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTTT*
*CTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGG
AGTGGGAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTC
ACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCT
GAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATAC
AGATTAGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACT

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DS 

RD RR4H558TF 717 0 0
G
ACTTGGAGTTAGAGAGAGAGCCAACCAACCACAGAAGAAACCAAACAAACAAACAACAAT
GTCTTCTTCTCCTTCTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATC*GAAGAAATCGATCC
CAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCT
CGACGATTTCGCCTCTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGAGCTCT
CTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACCAATTA
CTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATGGCTTG
CGCGAGAACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATGTCTTA
TCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGG
GAGGAACCTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATTCCATGAAAGTCACTTA
CCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCTGAACT
TTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATT
AGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTT
TCAAA

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DS 

RD RR4H558JQB 639 0 0
CTCCGATCTCGTCCGAGACGACGAAGATATC*GAAGAAATCGATCCCAAAAACGTATCCC
TATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCTCGACGATTTCGCCT
CTTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTTCAGAACAACATCAGAGCTCTCTCCGTCTCACGTG
GCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTCACCAATTACTTTAATGGGTTAC
ACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCGATGGCTTGCGCGAGAACCATCG
TGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTCGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTTTCTGCTGCTC
CAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGGGAGGAACCTGACGG
TGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATTCCATGAAAGTCACTTACCTATCTCGTGCTA
CTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCGAGATCTGAACTTTTGTTGATTCTTT
ATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATTAGTATATGGACCTA
CGAGATATATAATGAGCGTTACTACTTTTCTCTGTTT
TC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 3 10

CO CL356Contig1 1340 4 12 U
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GGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCCACAAAGCTGCTTGTGAACAACA
CCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCTAACAAAGTGTTGAACTC
GGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATACTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAGCTCTA
CAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGAAGGCGA
CGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTAGAGGCCTATTTTGAGGATACCATCAA
GACCTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGACGACCT
TTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGGAATAC
TAAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAACACGA
TTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGAGTCGGTCAAAAAGGAGCAGGAAAACCT
TCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGCGGCATATGCGGCGGCACAAGC
ACATAGCAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGG
GGTGGCTACATTTGCATTCGGGGGCGAAGCTCTGGTGGCAGGTGCAGTAGCTGCGGGTTT
AGCGTTACCAGTCGTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCGAGGTTGCAATGCAGAAACTGGA
GGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGATTGGGAAAGGTTTGGAAGTCAA
CAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAAGAAACTTTTAGATAAGATAGAGTC
GATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGAAAAATGAACT
GAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGCGGTTGACGAAAC
TGTGGCTAAGCTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATCCA
AGATTAGTGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCAAGACAC
CCACGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCATTG
TACTTTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCTAT
CCCCTATTCGTGAAATAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AN89TF U 1
AF RR4DJ05TF U 1
AF RR4DJ05JQ C 603
AF RR4AN89JQ C 607
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RD RR4AN89TF 580 0 0
AGGATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCAAAATTCCAATCCAAGTTCAGTAATGTCAAT
GGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCTACAAAGCTGCTTGTGAACAACA
CCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCTAACAAAGTGTTGAACTC
GGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATACTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAGCTCTA
CAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGAAGGCGA
CGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTAGAGGCCTATTTTGAGGATACCATCAA
GACCTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGACGACCT
TTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGGAATAC
TAAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAACACGA
TTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTT
TGAGTCGGTC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4DJ05TF 736 0 0
G
GGATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCAAAATTCCAATCCAAGTTCAGTAATGTCAATG
GCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCCACAAAGCTGCTTGTGAACAACAC
CCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCTAACAAAGTGTTGAACTCG
GTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAGCTCTAC
AAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGAAGGCGAC
GTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTAGAGGCCTATTTTGAGGATACCATCAAG
ACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGGCGACCTT
TACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTTACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGGAATACT
AAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAACACGAT
TTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGAGTCGGTCAAAAAGGAGCAGGAAAACCTT
CTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGCGGCATATGCGGCGGCACAAGCA
CATAGCAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGGG
*TGGCTACATTTGCA

QA 2 736 2 736
DS 

RD RR4DJ05JQ 738 0 0
TGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGCGGCATATGCGGCGGCACAAGCAC
ATAGCAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGGGG
TGGCTACATTTGCATTCGGGG*CGAAGCTCTGGTGGCAGGTGCAGTAGCTGCGGGTTTAG
CGTTACCAGTCGTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCGAGGTTGCAATGCAGAAACTGGAGG
ACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGATTGGGAAAGGTTTGGAAGTCAACA
AAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAAGAAACTTTTAGATAAGATAGAGTCGA
TGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGGGGCTAGCGAGAGAGACACGAAAAATGAACTGA
AACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGCGGTTGACGAAACTG
TGGCTAAGCTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATCCAAG
ATTAGTGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCAAGACACCC
ACGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCATTGTA
CTTTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCTATCC
CCTATTCGTGAAATAAA
A

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AN89JQ 734 0 0
GCAAGTGGGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGCGGCATAT*CGGCGGCACAAGCACATAG
CAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGGGGTGGC
TACATTTGCATTCGGGGGCGAAGCTCTGGTGGCAGGTGCAGTAGCTGCGGGTTTAGCGTT
ACCAGTCGTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCGAGGTTGCAATGCAGAAACTGGAGGACAC
TGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGATTGGGAAAGGTTTGGAAGTCAACAAAGA
TGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAAGAAACTTTTAGATAAGATAGAGTCGATGTT
GGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGAAAAATGAACTGAAACT
AATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGCGGTTGACGAAACTGTGGC
TAAGCTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATCCAAGATTA
GTGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCAAGACACCCACGC
TATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCATTGTACTTT
TTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCTATCCCCTA
TTCGTGAAATAAAA

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL356Contig2 1044 4 2 U
GGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAGCTCTACAAGTATCTGCT
TGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTTCTATCGAAGGCGACGTGTGGGACAA
CGAAGATCTAAAGAAGATAGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACCATCAAGACTTTACAGTT
TTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAAAGCATCAATTGGCGACCTTTACCTTCAACG
CGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGGAATACTATGAACAAGTA
TGAGAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAACACGATTTTGATGGCGA
CAAGTTAATAGCTCAGTTCGACTTGGTCAAAAAGGAGCAGGAAAACCTTCTGGAGCAAGT
GAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCACAAGCACATAGCAAACT
TACGTATATAATTTTCGGCACGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGGGATGCAGAAACT
GGAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACACGTTGGGAAAGGTTTGGAAGT
CAACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAGGAAACTTTTAAATAAGATAAA
GTCGATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGAAAAATGA
ACTGAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGACGA
AACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGAT
CCAAGATTAATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCAAGA
CACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCA
TTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTC
TATCCCCTATTCGTGAAATAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DX29TF U 1
AF RR4DX29JQ C 238
AF RR4AS73TF U 608
AF RR4AV57TF U 608
BS 1 638 RR4DX29TF
BS 639 1044 RR4AS73TF

RD RR4DX29TF 643 0 0
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GAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCACAAGCACATAGCAAACT
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GGAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACACGTTGGGAAAGGTTTGGAAGT
CAACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCA
GGAAC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4DX29JQ 807 0 0
ACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGGAATACTATGAACAA
GTATGAGAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAACACGATTTTGATGG
CGACAAGTTAATAGCTCAGTTCGACTTGGTCAAAAAGGAGCAGGAAAACCTTCTGGAGCA
AGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCACAAGCACATAGCAA
ACTTACGTATATAATTTTCGGCACGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGGGATGCAGAA
ACTGGAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAAAGGTTTGGA
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AAAGTCGATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGAAAAA
TGAACTGAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGA
CGAAACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAA
GATCCAAGATTAATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCA
AGACACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGC
CCATTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTAC
CTCTATCCCCTATTCGTGAAATAAAGT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4AS73TF 437 0 0
GATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAGGAAACTTTTAAATAAGATAAAGTCGATG
TTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGAAAAATGAACTGAAA
CTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGACGAAACCGTG
GCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATCCAAGAT
TAATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCAAGACACCCTC
GCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCATTGTACT
TTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCTATCCCC
TATTCGTGAAATAAAGT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4AV57TF 437 0 0
GATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAGGAAACTTTTAAATAAGATAAAGTCGATG
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CTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGACGAAACCGTG
GCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATCCAAGAT
TAATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGAATCAAGACACCCTC
GCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCATTGTACT
TTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCTATCCCC
TATTCGTGAAATAAAGT

QA 1 437 1 437
DS 



CO CL356Contig3 751 2 9 U
AGGAAAACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGA
CGTCACAAGCACATAGCAAACTTACGAATATAATTTTCGGCACGTTGTTTGGTGTTGTTG
CTCTCATAGGGGTGGCTACATTTGCATTCGGGGGCGAATTTCTGGTGGAAGGTGCAATAG
CTGCGGGTTTTGCGTTACCAGTCCTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCAAGATTGCAATGC
AGAAACTGGAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAAAGGTT
TGGAAGTCAACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAGGAAACTTTTAAATA
AGATAAAGTCGATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGA
AAAATGAACTGAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGG
TTGACGAAACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGG
AAAAGATCCAAGATTAATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGA
ATCAAGACACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTA
TAGCCCATTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGAT
GTACCTCTATCCCCTATTCGTGAAATAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H330JQ C 1
AF RR4AD90TF U 121
BS 1 120 RR4H330JQ
BS 121 262 RR4AD90TF
BS 263 264 RR4H330JQ
BS 265 555 RR4AD90TF
BS 556 556 RR4H330JQ
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BS 693 744 RR4AD90TF
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RD RR4H330JQ 751 0 0
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AGATAAAGTCGATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGA
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TTGACGAAACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGG
AAAAGATCCAAGATTAATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGA
ATCAAGACACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTA
TAGCCCATTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAACGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGAT
GTACCTCTATCCCCTATTCGTGAAATAAAGT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4AD90TF 635 0 0
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CTGCGGGTTTTGCGTTACCAGTCCTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCAAGATTGCAATGC
AGAAACTGGAGGACACTGTGAA**AACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAAAGGTT
TGGAAGTCAACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAGGAAACTTTTAAATA
AGATAAAGTCGATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGAGACACGA
AAAATGAACTGAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGG
TTGACGAAACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGG
AAAAGATCCAAGATTGATGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTATTGTTCAAGA
ATCAAGACACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTA
TAGCCCATTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAGCGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGAT
GTACCTCTATCCCCTATTCGTGAA
TAAGTTGTTGT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 7

CO CL357Contig1 844 7 16 U
GGGATAAAAGATTATCAACAGCAATATGGTGAAACTTATTCTAGGAGAGAATTACATTAG
CAGCCCCCTGTTCAGGTTTTACTATAAGCAATGTTATACTTCAATACAGGTTAACAATAT
AGGATGATACAGGGAGTCAGAACTGTGTCTGGCTAATAAAAGTCCGTTTACAGTATTGAC
TGGAGCTGCTGTATCTCAGCGGAGTCTGATGAAACATTGTCTTCATCGAATGGTGATCTG
TACACTTCAACCATAGCTTTCCCTTTATCAAGAACTTCAGAAGGAACTGTTTGTAAAAGG
CTGTCTAGTGCTGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAACAGTTGCGTTT
GGGTCCTTCCTCGACGCACGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAG
CGATCAACATCACTAGACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACG
GCTCGAATGTTTACACGCAAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCC
TCGAATTCAGGCTTCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCTGAGCT
AGAATGACTGGTGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTGACGTACTTA
TCAATCAAGCTACTGGCCATGGCATCGTTAGGGAGGAGAAGGAGGCGGGAGAGGAGGAAG
GAGACAGAGATCACTCTTCGGCTCTGTTTCTTCCATACCAGAAATGACGAAGATGCGCAC
GTCAGCCTTTCGCGGTGCTTCGAAAGTGGGAGGAGGCTCGCAGTAGCGTTAAGTGAAGCC
ATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4H802JQB U 1
AF RR4A939JQ U 54
AF RR4AQ87JQ U 218
AF RR4DI02JQ U 74
AF RR4GG68TF C 457
AF RR4H802TF C 83
AF RR4A939TF C 57
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BS 239 275 RR4H802JQB
BS 276 277 RR4A939JQ
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BS 298 298 RR4A939JQ
BS 299 597 RR4H802JQB
BS 598 598 RR4A939JQ
BS 599 674 RR4H802JQB
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BS 822 822 RR4GG68TF
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RD RR4H802JQB 715 0 0
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TGGAGCTGCTGTATCTCAGCGGAGTCTGATGAAACATTGTCTTCATCGAATGGTGATATG
TACACTTCAACCATAGCTTTCCCTTTATCAAGAACA*CAGAAGGAACTGTTTGTAAAGGG
CTGTCTAGTGCTGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAACAGTTGCGTTT
GGGTCCTTCCTCGACGCACGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAG
CGATCAACATCACTAGACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACG
GCTCGAATGTTTACACGCAAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCC
TCGAATTCAGGCTTCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCTGAACT
AGAATGACTGGTGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTGACGTACTTA
TCAATCAAGCTACTAGCCATGGCATCGTTAGGGAGGAGAAGGAGGCGGGAGAGGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4A939JQ 693 0 0
CC
ATTAGCAGCCCCCTGTTCAGGTTTTACTATAAGCAATGTTATACTTCAATACAGGTTAAC
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TTGACTGGAACTGCTGTATCTCAGCGGAGTCTGATGAAACATTGTCTTCATTGAATGGTG
ATCTGTACACTTCAACCATAGCTTTCCCTTTATCAAGAACTTCAAAAGGAACTGTTTGTA
AAAGGCTGTCTAGTGCTGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAGCAGTTG
CGTTTGGGTCCTTCCTCGACGCACGTAAAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGA
GACAGCGATCAACATCACTAAACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAG
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ATGCCTCGAATTCAGGCTTCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCT
GAGCTAGAATGACTGGTGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTGACGT
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GGAAGGAGACAGAGATCACTCTTCGGCTCTG

QA 3 693 3 693
DS 

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CAAAAGGAACTGTTTGTAAAAGGCTGTCTAGTGCTGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACT
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TTTCTTCCAGTGCTCTGAAACAGCGATCAACATCACTAGACGCGGTTTGGGAATAACCAG
CATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTTTACACCCAAGGAACTAGCAGGTCCAG
ACCTGAGTACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCTTGTCCACGCTCAAAATTTTTTCAA
GATCTTGAAATTGAAGCTGAGCTAGAATGACTGGCGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAA
GTCTTTTCCTCTTCACGTACTTATCAATCAAGCTACTCGCCATGGCATCGTTAGGGAGGA
GAAGGAGGCGGGAGAGGAGGAAGGAGAC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4DI02JQ 679 0 0
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GAGTCAGAACTGTGTCTGGCTAATAAAAGTCCGTTTACAGTATTGACTGGAGCTGCTGTA
TCTCAGCGGAGTCTGATGAAACATTGTCTTCATCGAATGGTGATCTGTACACTTCAACCA
TAGCTTTCCCTTTATCAAGAACTTCAGAAGGAACTGTTTGTAAAAGGCTGTCTAGTGCTG
TTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAACAGTTGCGTTTGGGTCCTTCCTCG
ACGCACGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAGCGATCAACATCAC
TAGACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTTTA
CACGCAAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCT
TCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCTGAGCTAGAATGACTGGTG
GTACATATGCTT*AAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTGACGTACTTATCAATCGAGCTAC
TGGCCATGGCATCGTTAGGGAGGAGAAGGAGGCGGGAGAGGAGGAAGGAGACAGAGATCA
CTCTTCGGCTCTGTTTCTT

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DS 

RD RR4GG68TF 388 0 0
AGCAT
TGAAGCGTA*TGAGCAACGGCTCGAATGTTTACACGCAAGGAA*TAGCAGGTCCAGACCT
GAGTACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCTTCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATC
TTGAAATTGAAGCTGAGCTAGAATGACTGGTGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAAGTCT
TTTCCTCTTGACGTACTTATCAATCAAGCTACTGGCCATGGCATCGTTAGGGAGGAGAAG
GAGGCGGGAGAGGAGGAAGGAGACAGAGATCACTCTTCGGCTCTGTTTCTTCCATACCAG
AAATGACGAAGATGCGCACGTCAGCCTTTCGCGGTGCTTCGAAAGTGGGAGGAGGCTCGC
AGTAGCGTTAAGTGA
AGCCATCC

QA 6 380 6 380
DS 

RD RR4H802TF 738 0 0
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CTGTGTCTGGCTAATAAAAGTCCGTTTACAGTATTGACTGGAGCTGCTGTATCTCAGCGG
AGTCTGATGAAACATTGTCTTCATCGAATGGTGATATGTACACTTCAACCATAGCTTTCC
CTTTATCAAGAACA*CAGAAGGAACTGTTTGTAAAGGGCTGTCTAGTGCTGTTAACGCCG
TACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAACAGTTGCGTTTGGGTCCTTCCTCGACGCACGTA
GAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAGCGATCAACATCACTAGACGCGG
TTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTTTACACGCAAGG
AACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCTTCTCCACGC
TCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCTGAGCTAGAATGACTGGTGGTACATATG
CTTCAAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTGACGTACTTATCAATCAAGCTACTAGCCATGG
CATCGTTAGGGAGGAGAAGGAGGCGGGAGAGGAGGAAGGAGACAGAGATCACTCTTCGGC
TCTGTTTCTTCCATACCAGAAATGACGAAGATGCGCACGTCAGCCTTTCGCGGTGCTTCG
AAAGTGGGAGGAGGCTCG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4A939TF 788 0 0
ATTAGCAG
CCCCTGTTCAGGTTTTACTATAAGCAATGTTATACTTCAATACAGGTTAACAATATAGGA
TGATACAGGGAGTCAGAACTGTGTCTGGCTAATAAAAGTCCGTTTACAGTATTGACTGGA
ACTGCTGTATCTCAGCGGAGTCTGATGAAACATTGTCTTCATTGAATGGTGATCTGTACA
CTTCAACCATAGCTTTCCCTTTATCAAGAACTTCAGAAGGAACTGTTTGTAAAAGGCTGT
CTAGTGCTGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAGCAGTTGCGTTTGGGT
CCTTCCTCGACGCACGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAGCGAT
CAACATCACTAGACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTC
GAATGTTTACACGCAAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCCTCGA
ATTCAGGCTTCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCTGAGCTAGAA
TGACTGGTGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTGACGTACTTATCAA
TCAAGCTACTGGCCATGGCATCGTTAGGGAGGAGAAGGAGGCGGGAGAGGAGGAAGGAGA
CAGAGATCACTCTTCGGCTCTGTTTCTTCCATACCAGAAATGACGAAGATGCGCACGTCA
GCCTTTCGCGGTGCTTCGAAAGTGGGAGGAGGCTCGCGGTAGCGTTAAGTGAAGCCATCC

QA 9 788 9 788
DS 



AS 1 11

CO CL358Contig1 843 11 23 U
ATGAAACAGTAAAATTGTTTTTATTCCAGATACGATGATGATGATGATCGACGAACAAAG
AAAACAGCATAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAA*GTTATAACTCTTATCCTCT
TCATTAAGTGGTCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATC
TCACTAGCTTTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTAT
AACCAAACCCC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGT
CCCTACAATATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGA
AACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACG
ATCTCCAGGGACTGGGGGCTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAG
GTTCGACATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACC
TCCAGTTTGAAAATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGATAA
AGAGGGGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCCCC
TGATGACGGAGATAGCGTAGTAACTGCCGCCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAA
CTGGTCCGGCGTTTGCGGTGGCAGCCAAAACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAAACA
TAGGATTCATCTTTTTTTTTTTGAGTTTATTTAGTTGATGAGATTTGAATGTTACCTGGA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 0 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BU90TF C 4
AF RR4GG73JQ U 1
AF RR4AJ54TF C 12
AF RR4B874JQ U 2
AF RR4E268JQ U 10
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AF RR4AJ54JQ U 10
AF RR4FP88JQ U 72
AF RR4B874TF C 86
AF RR4E268TF C 223
AF RR4GG73TF C 119
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BS 119 146 RR4GG73JQ
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BS 148 153 RR4GG73JQ
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RD RR4BU90TF 248 0 0
AA
ACAGTAAAATTGTTTTTATTCCAGATACGATGATGATGATGATCGACGAACAAAGAAAAC
AGCATAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAA*GTTATAACTCTTATCCTCTTCATT
AAGTGGTCTTTATTTCTCTCAGATA*TAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATCTCACT
AGCTTTCACGAACATAACCTCGAATGGGCCAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCA
AACCCC

QA 3 248 3 248
DS 

RD RR4GG73JQ 464 0 0
ATGAAACAGTAAAATTGTTTTTATTCCAAATACGATGATGATGATGATCGACGAACAAAG
AAAACAGCATAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAAACGTAA*GTTATAACTCTTATCCCCT
TCATTAAGTGGTCTTTATTTCTCTCAAATAATAAACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATC
TCACTAGCTTTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAAAGCCTAT
AACCAAACCCC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGT
CCCTACAATATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAAA
AACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACG
ATCTCCAGGGACTGGGGGTTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGAC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4AJ54TF 565 0 0
TAAAATG
TTTTATCCCAGATACGATGATGATGATGATCGACGAACAAAGAAAACAGCATAAAGGGAA
AGAGTTTTATTATTAGACGTAAAGTTATAACTCTTATCCTCTTCATTAAGTGGTCTTTAT
TTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGCCTCTATCTCACTAGCTTTCACGAAC
ATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGGGTAGAGCCTATAACCAAACCCC*GAACGC
CACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAATATGCAAACT
TGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAACTCCTCGACGAATCTT
CTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTCCAGGGACTGGGGG
CTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCGACATCCATCTCGA
TGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAGTTTGAAAATTTCA
CGGGAATGCCCCTCCTGA

QA 8 565 8 565
DS 

RD RR4B874JQ 624 0 0
ATAA
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AGCATAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAA*GTTATAACTCTTATCCTCTTCATT
AAGTGGTCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATCTCACT
AGCTTTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCA
AACCCC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTA
CAATATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAGACTC
CTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTC
CAGGGACTGGGGGCTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCG
ACATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAG
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GGACACTGGTTGCCATTACG

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DS 

RD RR4E268JQ 654 0 0
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TAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAA*GTTATAACTCTTATCCTCTTCATTAAGT
GGTCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATCTCACTAGCT
TTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCAAACC
CC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAAT
ATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAGACTCCTCG
ACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTCCAGG
GACTGGGGGGTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCGACAT
CCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAGTTTG
AAAATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGATAAAGAGGGGAC
ACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCCCCTGA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4FQ10JQ 719 0 0
ACAGTAAAATTGTTTTTATTCCAGATACGATGATGATGATGATCGACGAACAAAGAAAAC
AGCATAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAAAGTTATAACTCTTATCCTCTTCATT
AAGTGGTCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATCTCACT
AGCTTTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCA
AACCCC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTA
CAATATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAACTC
CTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTC
CAGGGACTGGGGGCTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCG
ACATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAG
TTTGAAAATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGATAAAGAGG
GGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCCCCTGATG
ACGGAGATAGCGTAGTAACAGCCGCCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGG

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DS 

RD RR4AJ54JQ 734 0 0
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TAAAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAAAGTTATAACTCTTATCCTCTTCATTAAGT
GGTCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGCCTCTATCTCACTAGCT
TTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCAAACC
CC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAAT
ATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAACTCCTCG
ACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTCCAGG
GACTGGGGGCTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCGACAT
CCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAGTTTG
AAAATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGATAAAGAGGGGAC
ACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCCCCTGATGACGG
AGATAGCGTAGTAACTGCCGCCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGGTCCGG
CGTTTGCGGTGGCA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4FP88JQ 672 0 0
AAGGGAAAGAGTTTTATTATTAGACGTAA*GTTATAACTCTTATCCTCTTCATTAAGTGG
TCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATCTCACTAGCTTT
CACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCAAACCCC
*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAATAT
GCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTTTTGATCTGGAAGAAACTCCTCGAC
GAATCTTCTACTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTCCAGGGA
CTGGGGGCTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCGACATCC
ATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAGTTTGAA
AATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGATAAAGAGGGGACAC
TGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCCCCTGATGACGGAG
ATAGCGTAGTAACTGCCGCCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGGTCTGGCG
TTTGCGGTGGCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4B874TF 758 0 0
TATTATTAGACGTAA*GTTATAACTCTTATCCTCTTCATTAAGTGGTCTTTATTTCTCTC
AGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTATCTCACTAGCTTTCACGAACATAACCT
CGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCTATAACCAAACCCC*GAACGCCACCTTC
CTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAATATGCAAACTTGTAAGC
GTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAGACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCC
AGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAACGATCTCCAGGGACTGGGGGCTGGAGT
GACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCGACATCCATCTCGATGTTGAG
GTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACCTCCAGTTTGAAAATTTCACGGGAAT
GCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGATAAAGAGGGGACACTGGTTGCCATTACG
GGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCCCCTGATGACGGAGATAGCGTAGTAACT
GCCGCCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGGTCCGGCGTTTGCGGTGGCAGC
CAAAACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAAACATAGGATTCATCTTTTTTTTTTTGAG
TTTATTTAGTTGATGAGATTTGAATGTTACCTGGATCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4E268TF 621 0 0
GGTGGGG*TAGAGCCTATAACCAAACCCC*GAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACAT
CGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAATATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAG
TTTTCTTGATCTGGAAGAGACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGAC
CAACCGCTATGAACAACGATCTCCAGGGACTGGGGGGTGGAGTGACCCACCAATAAGTTG
ACTCAGCGCAGAACGTAGGTTCGACATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGA
CGAACCCAACTCTAGACCTCCAGTTTGAAAATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTG
AACGCTCCTGTCCGATAAAGAGGGGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGC
CGCCACCTCCAGCGCCCCTGATGACGGAGATAGCGTAGTAACTGCCGCCGAATATGATAT
CACCATTCACGTCGAGAACTGGTCCGGCGTTTGCGGTGGCAGCCAAAACAGCTGTTAGGG
CAAGAAGGAAGTAAAACATAGGATTCATCTTTTTTTTTT*GAGTTTATTTAGTTGATGAG
ATTTGAATGTTACCTGGATCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4GG73TF 725 0 0
CTTCATTAAGTG*TCTTTATTTCTCTCAGATAATAGACATAATCTTGGATGAAGTCTCTA
TCTCACTAGCTTTCACGAACATAACCTCGAATGGGCTAGCGAATGGTGGGG*TAGAGCCT
ATAACCAAACCCCCGAACGCCACCTTCCTCGTTTCTACCGACATCGGTGCAATCGTTACC
GTCCCTACAATATGCAAACTTGTAAGCGTTAGGGTTTTCACTAGTTTTCTTGATCTGGAA
GAGACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACAA
CGATCTCCAGGGACTGGGGGTTGGAGTGACCCACCAATAAGTTGACTCAGCGCAGAACGT
AGGTTCGACATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGA
CCTCCAGTTTGAAAATTTCACGGGAATGCCCCTCCTGAGATCTGAACGCTCCTGTCCGAT
AAAGAGGGGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTCCAGCGCC
CCTGATGACGGAGATAGCGTAGTAACTGCCGCCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAG
AACTGGTCCGGCGTTTGCGGTGGCAGCCAAAACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAAA
CATAGGATTCATCTTTTTTTTTTTGAGTTTATTTAGTTGATGAGATTTGAATGTTACCTG
GATCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 11

CO CL359Contig1 972 11 6 U
AGGAAACAAAGCACAAAGACCTGTTTAAAAATTGTCGGAGCTGTGAATTTATTTTTCAAT
TGGTGCTGTTGTTAAGCTCTAACTTTCAAAAGCTTTGTTTTGGAGGAAACAACAAACTCA
CCTTAAATAGGTCTTTGGTCAGTTATTGACCTTTATTGTCTCAAGGACACAATAACGCAA
ATAAAAACATATAAAATTTGTTTTATGCCCTTTGCTCCACGTAAGACCCCGAGAGTCCTG
AGGTTCCAAGAACGGTAACCTTTCCCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCA
AGTGGATCATCTTTGTTCCCAACTCCATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAG
GTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTA
TATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTCTCCCCACTCATTCCAATGCTATCATCGATCTCCA
TCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACAT
TCATCAAGGCCTCTTGCCCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGT
CTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCGCTGCCCAATCTGCCGCCATCAAATCTCTGAAAGATT
TCAGAACATCACTGTCTTTGATTTCAGGCATGTGAGACACATCTTCGCTAAAGCTGCGCA
CTTGTCCAATATCCATTGCTCGAGGATACCGAGAATCGTAAGGAGTTCGATTAGAAGGAA
ATGAAGAAACAGCGAAGAATCCTCGCGTTGAGAGGAAACGATGGCGCAATAGCTGACTGG
GAGCGGCTGATCTGGATGATCGGAGCGTAGCGACGGAGGCCGCCGCAGCGGTACGGCAGA
GGGATCTCAGAAATGCCATCTTAGATTTTTTCGCTCTTCTCAAATCTGCTGTAATGCGAA
AGCTCTCTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D757JQ U 1
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AF RR4DC11JQ U 57
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BS 1 189 RR4D757JQ
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BS 867 957 RR4DC11TF
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ATAAAAACACATAAAATTTGTTTTATGCCCTTTGCTCCACGTAA

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DS 

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GCCCTTTGCTCCACGTAAGACCCCGAGAGTCCTGAGGTTCCAAGAACGGTAACCTTTCCC
CATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATCATCTTTGTTCCCAACTCC
ATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCCAAAGCATCTAGG

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DS 

RD RR4DC11JQ 387 0 0
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CTCACCTTAAATAGGTCTTTGGTCAGTTATTGACCTTTATTGTCTCAAGGACACAATAAC
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CCTGAGGTTCCAAGAACGGTAACCTTTCCCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATC
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TCAGGTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTG
GTTATATCTTCTGGTAGGGTCTTCACA

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4GC82JQ 681 0 0
GCTT
AAAAATTGTCGGAGCTGTGAATTTATTTTTCAATTGGTGCTGTTGTTAAGCTCTAACTTT
CAAAAGCTTTGTTTTGGAGGAAACAACAAACTTACCTTAGATAGGTCTTTGGTCAGTTAT
TGACCTTTATTGTCTCAAGGACACAATAACGCAGATAAAAACATATAAAATTTGTTTTAT
GCCCTTTGCTCCACGTAAGACCCCGAGAGTCCTGAGGTTCCAAGAACGGTAACCTTCCCC
CATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATAATCTTTGTTCCCAACTCC
ATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTG
TACCTTTGATAAGCAAGACGCAGTGCTTTGGTTATATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTC
TCCCCACTCATTCCAAT*CTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCA
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TCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCGCT
GCCCAATCTGCCGCCATCAAATCTCTGAAAGATTTCAGAACATCACTGTCTTTGATTTCA
GGCACGTGAGACACATC

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DS 

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CTCACCTTAGATAGGTCTTTGGTCAGTTATTGACCTTTATTGTCTCAAGGACACAATAAC
GCAGATAAAAACATATAAAATTTGTTTTATGCCCTTTGCTCCACGTAAGACCCCGAGAGT
CCTGAGGTTCCAAGAACGGTAACCTTTCCCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATC
TTCAAGTGGATCATCTTTGTTCCCAACTCCATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCT
TCAGGTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTG
GTTATATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTCTCCCCACTCATTCCAATGCTATCATCGATC
TCCATCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAAC
ACATTCACCAAGGCCTCTTGCCCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTG
GCGTCTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCGCTGCCCAATCTGCCGCCATCAA*TCTCTGAAA
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CGCACTTGTCCAATATCCATTGCTCGAGGATACCGAGAATCGTAAGGAGTTC

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DS 

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ATTGACCTTTATTGTCTCAAGGACACAATAACGCAGATAAAAACATATAAAATTTGTTTT
ATGCCCTTTGCTCCACGTAAGACCCCGAGAGTCCTGAGGTTCCAAGAACGGTAACCTTTC
CCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATCATCTTTGTTCCCAACT
CCATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAG
TGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCTGGTAGGGTCTTCACAT
TCTCCCCACTCATTCCAATGCTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCAC
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TGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCG
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GATACCGAGAATCGTAAGGAGTTCGATTAGAAGGAAATGAAGAAACAGCGAAGAATCCTC
GCGTTGAGAGGAAACGATGGCGCAATAGCTGACTGGGAGCGGCTGATCTGGATGATCGGA
GC

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AGTGGATCATCTTTGTTCCCAACTCCATCTCAAC*TTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAG
GTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTA
TATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTCTCCCCACTCATTCCAATGCTATCATCGATCTCCA
TCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACAT
TCATCAAGGCCTCTTGCCCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTAGCGT
CTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCGCTGCCCAATCTGCCGCCATCAAATCTCTGAAAGATT
TCAGAACATCACTGTCTTTGATTTCAGGCATGTGAGACACATCTTCGCTAAAGCTGCGCA
CTTGTCCAATATCCATTGCTCGAGGATACCGAGAATCGTAAGGAGTTCGATTAGAAGGAA
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GAGCGGCTGATCTGGATGATCGGAGCGTAGCGACGGAGGCCGCCGCAGCGGTACGGCAGA
GGGATCTCAGAAATGCCATCTTAGATTTTTTCGCTCTTCTCAAATCTGCTGTAATGC
C

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DS 

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GTGGATAATCTTTGTTCCCAACTCCATCTCAACTTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGG
TCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGTGCTTTGGTTAT
ATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTCTCCCCACTCATTCCAAT*CTATCATCGATCTCCAT
CTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACATT
CATCAAGGCCTCTTGCCCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTC
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GGATCTCAGAAATGCCATCTTAGATTTTTTCGCTCTTCTCAAATCTGCTGTAATGCGAAA
GCTCTCTCCGC

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DS 

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TCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCGAAAGCATCTAGGTAGGTAGTGTACCTTTGAT
AAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTCTCCCCACTCA
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CAGCCTCAGCTGCTCTGAACACATTCATCAAGGCCTCTTGCCCTTCCTTGTCATCTGTGT
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TTCTCAAATCTGCTGTAATGCGAAAGCTC
TCTCCC

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AGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCTGGTAGGGTCTTCACATTCTCCCCACTCAT
TCCAATGCTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCAAATTCCTCAAC
AGCCTCAGCTGCTCTGAACACATTCATCAAGGCCTCTTGCCCTTCCTTGTCATCTGTGTT
TTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCGCTGCCCAATCTGC
CGCCATCAAATCTCTGAAAGATTTCAGAACATCACTGTCTTTGATTTCAGGCATGTGAGA
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GGCCGCCGCAGCGGTACGGCAGAGGGATCTCAGAAATGCCATCTTAGATTTTTTCGCTCT
TCTCAAATCTGCTGTAATGCGAAAGCTC
TCTCCC

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DS 

RD RR4G413TF 711 0 0
T
ACCTTTCCCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATCATCTTTGTT
CCCAACTCCATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCGAAAGCATCTAGG
TAGGTAGTGTACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCTGGTAGGGTC
TTCACATTCTCCCCACTCATTCCAATGCTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGAGA
ATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACATTCACCAAGGCCTCTTGC
CCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAGAA
GGTAGCGCTGCCCAATCTGCCGCCATCAA*TCTCTGAAAGATTTCAGAACATCACTGTCT
TTGATTTCAGGCATGTGAGACACATCTTCGCTAAAGCTGCGCACTTGTCCAATATCCATT
GCTCGAGGATACCGAGAATCGTAAGGAGTTCGATTAGAAGGAAATGAAGAAACAGCGAAG
AATCCTCGCGTTGAGAGGAAACGATGGCGCAATAGCTGACTGGGAGCGGCTGATCTGGAT
GATCGGAGCGTAGCGACGGAGGCCGCCGCAGCGGTACGGCAGAGGGATCTCAGAAATGCC
ATCTTAGATTTTTTCGCTCTTCTCAAATCTGCTGTAATGCGAAAGCTC
CC

QA 2 709 2 709
DS 



AS 1 10

CO CL360Contig1 949 10 27 U
GGGAGAGTTGGGGAGTTCTCGTTGACCTTATCATCCTGATCGTTGGAAGATAAGATAACA
ATGGCTGGAGAGTCTGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGG
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CAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAA
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GGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATG
TGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATG
AAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAAT
GGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*GA
ATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCACTCTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATC
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TT**GTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTGGGCTTACATAGACAATGCTGC
TTCTAAACCTCTCTAAGATTGTTTGGAGCTTTCAGGTTTCTGAGTTGTTTGTTTACTTAC
TACTAAAACCACATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTCTCTTTGAGTGTGGTG*TTATT
ATGTAAACTATATATGTATCCTTTGTTGTCATATCAGACCACAACAGTAGCTGAAACAAT
CTCAAGCTACAAAATTTATTTTATGCAAAATCAGATTGTTTTCTAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 15 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 20 20 20 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ53TF U 1
AF RR4CB72TF U 8
AF RR4BX86TF U 7
AF RR4AD94TF U 31
AF RR4BD92TF U 31
AF RR4A137JQ C 40
AF RR4A137JQD C 119
AF RR4A137TFB U 489
AF RR4AD94JQ C 142
AF RR4CJ53JQ C 293
BS 1 282 RR4CJ53TF
BS 283 283 RR4BX86TF
BS 284 285 RR4CJ53TF
BS 286 286 RR4BX86TF
BS 287 541 RR4CJ53TF
BS 542 563 RR4BX86TF
BS 564 564 RR4AD94TF
BS 565 573 RR4BX86TF
BS 574 574 RR4AD94TF
BS 575 671 RR4BX86TF
BS 672 672 RR4AD94TF
BS 673 713 RR4BX86TF
BS 714 714 RR4AD94TF
BS 715 728 RR4BX86TF
BS 729 751 RR4AD94TF
BS 752 752 RR4BD92TF
BS 753 755 RR4A137TFB
BS 756 756 RR4A137JQ
BS 757 832 RR4A137TFB
BS 833 833 RR4A137JQ
BS 834 834 RR4A137TFB
BS 835 835 RR4A137JQ
BS 836 859 RR4A137TFB
BS 860 868 RR4A137JQ
BS 869 910 RR4AD94JQ
BS 911 911 RR4CJ53JQ
BS 912 949 RR4AD94JQ

RD RR4CJ53TF 541 0 0
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TATGCATCTTTCGGATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGA
CAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAA
ACAACGTGGAGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTTAACCCACAGTTACTTGG
GGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATG
TGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATG
AAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAAT
GGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*GA
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4CB72TF 545 0 0
GG
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GAGTCTGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGGTATGCATCT
TTCGGATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGCG
GGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGG
AGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGA
GGATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTAC
AGGATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGAT
TCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATC
CCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGCGGGAAAA*GAATCAGGCGT
ACC

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DS 

RD RR4BX86TF 725 0 0
GGG
GGGGAGTTCTCGTTGACCTTATCATCCTGATCGTTGGAAGATAAGATAACAATGGCTGGA
GAGTCTGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGGTATGCATCT
TTCGGATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGCG
GGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGG
AGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGA
GGATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTAC
AGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGAT
TCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATC
CCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*GAATCAGGCAT
ACCTATACTTACAACGACATGCACACTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGT
GCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGG*ACTT**GTTGA
AG*AGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTGGGCTTACATAGACA*TGCTGCTTCTAAAC
TCT

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DS 

RD RR4AD94TF 721 0 0
GG
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AAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGGTATGCATCTTTCGGATCCAACATGTGGAAACC
GAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGG
TGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGGAGCACGTTTCCAAACAGGTTGTT
CTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTCAACCCTCT
TACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAA
CGATGTTCTGTTTCGGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTCTGATCT
ATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTA
TGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*GAATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCA
CTCTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAG
CCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGG*ACTT**GTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAG
AAGCTTGGGCTTACATAGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTGTTTGGAGCTT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR4BD92TF 722 0 0
GG
ATCCTGATCGTTGGAAGATAAGATAACAATGGCTGGAGAGTCTGAAACTGCATCTTGGAG
AAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGGTATGCATCTTTCGGATCCAACATGTGGAAACC
GAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGG
TGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGGAGAACGTTTCCAAACAGGTTGTT
CTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTAAACCCTCT
TACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAA
CGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCT
ATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTA
TGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*GAATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCA
CACTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAG
CCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGG*ACTT**GTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAG
AAGCTTGG*CTTACATAGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTGTTTGGAGCTTT

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4A137JQ 830 0 0
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CTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATG
GATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGGAGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGC
CGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAGT
CCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTT
CTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCT
CTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAAC
GTTGTCTGCGTGGGAAAA*GAATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCACTCTTTC
TGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGC
CAACAGTTTGGTAATGGG*ACTT**GTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTG
GGCTTACATAGATAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTGCTTGGAGCTTTCAGGTTT
TTGAGTTGTTTGTTTACTTACTACTAAAACCACATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTC
TCTTTGAGTGTGGTG*TTATTATGTAAACTATATATGTATCCTTTGTTG
C

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DS 

RD RR4A137JQD 751 0 0
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GACAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGG
AAACAACGTGGAGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTT
GGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACA
TGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCA
TGAAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACA
ATGGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*
GAATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCACTCTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATA
TCAGGTGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGG*
ACTT**GTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTGGGCTTACATAGATAATGCT
GCTTCTAAACCTCTCTAAGATTGCTTGGAGCTTTCAGGTTTCTGAGTTGTTTGTTTACTT
ACTACTAAAACCACATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTCTCTTTGAGTGTGGTG*TTA
TTATGTAAACTATATATGTATCCTTTGTTG
C

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4A137TFB 371 0 0
CCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAAAGAATCAGGCA
TACCTATACTTACAATGACATGCACTCTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGG
TGCCATTAAGATCTCCTGCAAAAGTCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGGGACTTTGTTTG
AAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTGGGCTTACATAGATAATGCTGCTTCTAAAC
CTCTCTAAGATTGCTTGGAGCTTTCAG*TTTCTGAGTTGTTTGTTTACTTACTACTAAAA
CCACATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTCTCTTTGAGTGTGGGGGTTATTATGTAAAC
TATATATGTAT

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR4AD94JQ 808 0 0
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GCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGGAGCACGTTTCCA
AACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTC
CTCAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTT
GAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCGGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGAGACTCCC
CTCTCTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATCCCACTTGCTAAA
TCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAA*GAATCAGGCATACCTATACTTAC
AATGACATGCACTCTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGTGCCATTAAGACC
TCCTGCAAAAGCCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGG*ACTT**GTTGAAGGAGGAAGACT
CTCTGAAGAAGAAGCTTGGGCTTACATAGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTG
TTTGGAGCTTTCAGGTTTCTGAGTTGTTTGTTTACTTACTACTAAAACCACATGGTTTAA
TAAAAGATTGTGTCTTTCTCTTTGAGTGTGGTG*TTATTATGTAAACTATATATGTATCC
TTTGTTGTCATATCAGACCACAACAGTAGCTGAAACAATCTCAAGCTACTAAATTTATTT
TATGCAAAATCAGATTGTTTTCTAGAAC

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DS 

RD RR4CJ53JQ 639 0 0
TTACTTGGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAAT
CTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAA
ACGGCATGAAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTAC
AGAACAATGGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGG
GAAAA*GAATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCACACTTTCTGTTCTTGAGAAG
TTTATATCAGGTGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAACAGTTTGGTA
ATGGG*ACTT**GTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTGGGCTTACATAGAC
AATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTGTTTGGAGCTTTCAGGTTTTTGAGTTGTTTGT
TTACTTACTACTAAAACCACATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTCTCTTTGAGTGTGG
TG****TTATGCAAACTATGTATGTATC*TTTGTTGTCATATCAGACCACAACAGTAGCT
GAAACAATCTCAAGCTACAAAATTTATTTTATGCAAAA
A

QA 1 638 1 638
DS 



AS 3 11

CO CL361Contig1 673 2 1 U
AAATAAAACTCAACTTGTTTCATTACATTCCATGTTTCTCTCAATAAAAGGCTTGCTTTA
AATTACACTTATTATTATTTTTCTCCTCAAAGAGTGAGTATAGTGATGATAAAAAATGTG
TTACTATCAGCAGCTGAAATGAAATGTTTTTGTTTAAGCTATGGTTTCAATGGCAACCTT
CTGCCTGGCTCTAATCTCCTCGGCTTTGTCGTCAACAGCATCCCATAGTTCAGGAAAAGC
TTCACGTATGTTGTGAATATGCTCCAGTGCAATATCTACCCCTTCCGCTTTGTGTGAGGT
CCCAACCCATACAGTGTGGAAACCCACACGTTTCCCGGTTTGAATGTTACGGATGCTGTC
ATCAAAAAACAATGTCTTGTGAGGATTGATGTTGGTCATCTTGAAAACCTGTTCGAATGC
TCCTTCAAATGGTTTGCATACAACCGGAGTCTTTGGGAGCTCAACGCTTGGGTCAGGATT
TGCAATGTAACTGCTTATGTCGAAAATCTCTCTGGCTTCAGTAGCAGCAACAGGAGATTC
GGTTTTGGTGATGGGGTTGAGAGTCTCGAAAGATATGATTCTTTCAAAGCAGTCCTCTAG
GCCTAGCCTAGCAATGATCTTGGCTGCATGAGCCTTGTCTGCATTGGTGAATACCACTTT
GCGAATAGGCAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CO81JQ U 1
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CTGCCTGGCTCTAATCTCCTCGGCTTTGTCGTCAACAGCATCCCATAGTTCAGGAAAAGC
TTCACGTATGTTGTGAATATGCTCCAGTGCAATATCTACCCCTTCCGCTTTGTGTGAGGT
CCCAACCCATACAGTGTGGAAACCCACACGTTTCCCGGTTTGAATGTTACGGATGCTGTC
ATCAAAAAACAATGTCTTGTGAGGATTGATGTTGGTCATCTTGAAAACCTGTTCGAATGC
TCCTTCAAATGGTTTGCATACAACCGGAGTCTTTGGGAGCTCAACGCTTGGGTCAGGATT
TGCAATGTAACTGCTTATGTCGAAAATCTCTCTGGCTTCAGTAGCAGCAACAGGAGATTC
GGTTTTGGTGATGGGGTTGAGAGTCTCGAAAGATATGATTCTTTCAAAGCAGTCCTCTAG
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GCGAATAGGCAAG

QA 1 673 1 673
DS 



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AAAACATTTCGACTTCTATTTATTATTTAAAGATATTTCTTCCCTTCATTGCTTCTCCAT
CTTTCTCTTTTTCTTTCTTCTCTCTCGAAGTTTCATTGGATCAGAAAAAAGAAAGGTGTC
TATCAACTTGGTAATTAAAAATGGCGTACGAGGAGAACTTTCAGAAAACTTCCGGACCCA
AGTATGATTGTCTTTTGTTTGATATAGATGATACTCTTTACCCTTTCAGTTCTGGTCTCG
CTACGCTTGTTAAAAACAACATTCAAGAGTATATGACCCAGAAACTTGGTATTGAAGAAG
ATAAAGTCCAAGAACTTTGTCTTTCGCTTTACAAAATCTATGGAACTACTATGGCTGGTC
TCAAGGCTGTTGGTTATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGAT
TGCCATACGCAACACTCAAGCCTGACCCTGTTCTGAGGAACATTATTCTCAGCTTGCCTA
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TAGGCCTAGAGGACTGCTTTGAAAGAATCATATCTTTCGAGACTCTCAACCCCATCACCA
AAACCGAATCTCCTGTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGATCTTCGACATAAGCAGTTACA
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TTGGGACCTCACACAAAGCTGAAGGAGTGGATATTGCGTTGGAGCATATTCACAACATAC
GTGAAGCTTTTCCTGAACTGTGGG*ATGCTGTTGACGACAAAGCCGAGGAGATTAGAGCC
AGGCAGAAGGTTGCCATTGAAACCATAGCTTAAAACAAACATTTCATTTCAGCTGCTGAT
AGTTACACATTTCTTATCATCACTATACTCACTCTTTGAGGAGAAAAAAAATAATAAGTG
TAATCTAAAGCAAGCCTTTTATTGAGAGAAACATGGAATGTAATGAAACAAGTTGAGTTT
TATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4DA85TF U 1
AF RR4FZ40TF U 128
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AF RR4DA85JQ C 520
AF RR4FZ40JQ C 946
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BS 867 1205 RR4G559JQ

RD RR4DA85TF 776 0 0
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AAAACATTTCGACTTCTATTTATTATTTAAAGATATTTCTTCCCTTCATTGCTTCTCCAT
CTTTCTCTTTTTCTTTCTTCTCTCTCGAAGTTTCATTGGATCAGAAAAAAGAAAGGTGTC
TATCAACTTGGTAATTAAAAATGGCGTACGAGGAGAACTTTCAGAAAACTTCCGGACCCA
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CTACGCTTGTTAAAAACAACATTCAAGAGTATATGACCCAGAAACTTGGTATTGAAGAAG
ATAAAGTCCAAGAACTTTGTCTTTCGCTTTACAAAATCTATGGAACTACTATGGCTGGTC
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TAGGCCTAGAGGACTGCTTTGAAAGAATCATATCTTTCGAGACTCTCAACCCCATCACCA
AAACCGAATCTCCTGTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGATCTTCGACATAAGCAGTTACA
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GTTTGTAACCATC

QA 1 763 1 763
DS 

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TGTTGGTTATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGATTGCCATA
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AGTTGTTTTCACTAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAAGATCATTGGCAGGCTAGGCCT
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CAGCATCCGT

QA 1 730 1 730
DS 

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TTGTCTTTTGTTTGATATAGATGATACTCTTTACCCTTTCAGTTCTGGCCTCGCTACGCT
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CCAAGAACTTTGTCTTTCGCTTTACAAAATCTATGGAACTACTATGGCTGGTCTCAAGGC
TGTTGGTTATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGATTGCCATA
CGCAACACTCAAGCCTGACCCTGTTCTGAGGAACATTATTCTCAGCTTGCCTATTCGCAA
AGTTGTTTTCACTAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAAGATCATTGGCAGGCTAGGCCT
AGAGGACTGCTTTGAAAGAATCATATCTTTCGAGACTCTCAACCCCATCACCAAAACCGA
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CAGCATCCGTAACATTCAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4G559JQ 739 0 0
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TCTCAGCTTGCCTATTCGCAAAGTTGTTTTCACTAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAA
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CAACCCCATCACCAAAACCGAATCTCCTGTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGGTCTTCGA
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CAAGACATTGTTCTTTGATGACAGCATCCGTAACATTCAAACCGGGAAACGTGTGGGTCT
CCACACTGTATGGGTTGGGACCTCACACAAAGCTGAAGGAGTGGATATTGCGTTGGAGCA
TATTCACAACATACGTGAAGCTTTTCCTGAACTGTGGG*ATGCTGTTGACGACAAAGCCG
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AAAAATAATAAGTGTAATCTAAAGCAAGCCTTTTATTGAGAGAAACATGGAATGTAATGA
AACAAGTTGAGTTTTATTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4DA85JQ 686 0 0
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AGACTCTCAACCCCATCACCAAAACCGAATCTCCTGTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGA
TCTTCGACATAAGCAGTTACATGGCAAATCCTGACCCAAGCGTTGAACTCCCTAAGACTC
CGGTTGTTTGTAAACCATCTGAAGGAGCATTCGAACAGGTTTTCGAGATGACCAACATCA
ATCCTCACAAGACATTGTTCTTTGATGACAGCATCCGTAACATTCAAACCGGGAAACGTG
TGGGTCTCCACACTGTATGGGTTGGGACCTCACACAAAGCTGAAGGAGTGGATATTGCGT
TGGAGCATATTCACAACATACGTGAAGCTTTTCCTGAACTGTGGG*ATGCTGTTGACGAC
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CATTTCATCTCAGCTGCTGATAGTTACACATTTCTTATCATCACTATACTCACTCTTTGA
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GTAATGAAACAAGTTGAGTTTTATTT

QA 1 686 1 686
DS 

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ATTTCAGCTGCTGATAGTTACACATTTCTTATCATCACTATACTCACTCTTTGAGGAGAA
AAAAA*TAATAAGTGTAATCTAAAGCAAGCCTTTTATTGAGAGAAACATGGAATGTAATG
AAACAAGTTGAGTTTTATTT

QA 1 260 1 260
DS 



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GGGACTTCTATTTATTTATTTAAAGATATTTCTTCCCTTCATTGCTTCTCCATCTTTTTT
CTTTCTTCTCTCTCGAAGTTTCATTGGATCAGAAAAAAGAAAGGTGTCTATCAACTTGTT
AATTAAAAATGGCGTACGAGGAGAACTTTCAGAAAACTTCCGGACCCAAGTATGATTGTC
TTTTGTTTGACATAGATGATACTCTTTACCCTTTCAGTTCTGGTCTCGCTACGCTTGTTA
AAAACAACATTCAAGAGTATATGACCCAGAAACTTGGTATTGAAGAAGATAAAGTCCAAG
AACTTTGCCTTTCGCTTTACAAAATCTACGGAACAACTATGGCTGGTCTCAAGGCTGTTG
GTTATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGATTGCCATACGCAA
CACTCAAGCCTGACCCTGTTCTGAGGAACATTATTCTCAGCTT*GCCTATTCGCAAAGTG
GTATTCACCAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAAGATCATTGCTAGGCTAGGCCTAGAG
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CCTGTTGCTGCTACTGAAGCCAGAGAGATCTTCGACATAAGCAGTTACATTGCAAATCCT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 11

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AATGCATTTGAC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4DC91TF U 45
AF RR4FC44TF U 30
AF RR4GN68TF U 1
AF RR4DA45TF U 45
AF RR4AW18TF U 38
AF RR4AW18JQ C 782
AF RR4FU58TF U 793
AF RR4GN68JQ C 680
AF RR4DA45JQ C 625
AF RR4DC91JQ C 788
AF RR4FC44JQ C 757
BS 1 254 RR4GN68TF
BS 255 255 RR4FC44TF
BS 256 526 RR4GN68TF
BS 527 527 RR4FC44TF
BS 528 615 RR4GN68TF
BS 616 616 RR4FC44TF
BS 617 666 RR4GN68TF
BS 667 667 RR4FC44TF
BS 668 683 RR4GN68TF
BS 684 684 RR4FC44TF
BS 685 762 RR4GN68TF
BS 763 763 RR4AW18TF
BS 764 774 RR4GN68TF
BS 775 775 RR4AW18TF
BS 776 785 RR4GN68TF
BS 786 786 RR4AW18TF
BS 787 801 RR4GN68TF
BS 802 855 RR4AW18TF
BS 856 856 RR4FU58TF
BS 857 869 RR4AW18TF
BS 870 1228 RR4FU58TF
BS 1229 1229 RR4DA45JQ
BS 1230 1316 RR4FU58TF
BS 1317 1317 RR4DA45JQ
BS 1318 1361 RR4FU58TF
BS 1362 1452 RR4DA45JQ

RD RR4DC91TF 486 0 0
CGAACTGTCTCGACATCATGGACCGATTTAACTCGTGACTCAGCTGTTTACTTGCTCTTC
ACGTTTTCCGCCATCAAAGTCTCCCAATTCATCTACCGTTGCTTTCAATCATCCGAAATG
TCATCGTTTTCGATGGAGACTCACCCTGAAGCTCTCCGGCGAGAACGAATCCTCTCCAGC
AAACTCTACTTCAACGTCCCTGAATCAAAGGTTTCGATCATCTATTCATCAGCATACGAC
ATCTCGTTCATGTGGATTGAGAAGTTGCATCCGTTTGATTCAACCAAGTGGCGTAGAGTT
TGCAAGTTCCTCGTTTCTGATGGGTTCTTGGAGGAGAAATCAATCGTTGAGCCTCTAGAA
GCTTCCAACAGTGATCTCTTAGTGGTGCACTCGTTGAACTACTTGAACAGTTTGAAAAGC
AGTGCAACCGTCGCTAGGATAACCGAGGTTCCACCAGTTGCTTTGTTCCCAAACTTTCTT
GTGCAG

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4FC44TF 741 0 0
AG
CATGTAAGATATCCGAACTGTCTCGACATCATGGACCGATTTAACTCGTGACTCAGCTGT
TTACTTGCTCTTCACGTTTTCCGCCATCAAAGTCTCCCAATTCATCTACCGTTGCTTTCA
ATCATCCGAAATGTCATCGTTTTCGATGGAGACTCACCCTGAAGCTCTCCGGCGAGAACG
AATCCTCTCCAGCAAACTCTACTTCAACGTCCCTGAATCAAAGGTTTCGATCATCTATTC
ATCAGCATACGACATCTCGTTCATGTGGATTGAGAAGTTGCATCCGTTTGATTCAACCAA
GTGGCGTAGAGTTTGCAAGTTCCTCGTTTCTGATGGGTTCTTGGAGGAGAAATCAATCGT
TGAGCCTCTAGAAGCTTCCAACAGTGATCTCTTAGTGGTGCACTCGTTGAACTACTTGAA
CAGTTTGAAAAGCAGTGCAACCGTCGCTAGGATAACCGAGGTTCCACCAGTCGCTTTGTT
CCCAAACTTTCTTGTGCAGCAGAAGGTTCTAAGACCGTTCCGAAAGCAGGTTGGTGGGAC
GATTCTGGCAGCGAAGCTAGCAGTGGAACGTGGATGGGCGATAAATGTAGGAGGAGGTTT
TCATCATTGTACTGCTGACAGAGGAGGCGGGTTCTGTGCTTTCGCTGATATTTCTCTTTG
TATTCATTTTGCATTTCTTCGTCTAAGCATATCCAGGGTTATGATCATAGATCTTGATGC
TCATCAAGGG**A
TGGCCA

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR4GN68TF 805 0 0
GGAAACATAAACTCGCCGCTTCATCATCAGTCATGAAAGATATCCGAACTGTCTCGACAT
CATGGACCGATTTAACTCGTGACTCAGCTGTTTACTTGCTCTTCACGTTTTCCGCCATCA
AAGTCTCCCAATTCATCTACCGTTGCTTTCAATCATCCGAAATGTCATCGTTTTCGATGG
AGACTCACCCTGAAGCTCTCCGGCGAGAACGAATCCTCTCCAGCAAACTCTACTTCAACG
TCCCTGAATCAAAGTTTTCGATCATCTATTCATCAGCATACGACATCTCGTTCATGTGGA
TTGAGAAGTTGCATCCGTTTGATTCAACCAAGTGGCGTAGAGTTTGCAAGTTCCTCGTTT
CTGATGGGTTCTTGGAGGAGAAATCAATCGTTGAGCCTCTAGAAGCTTCCAACAGTGATC
TCTTAGTGGTGCACTCGTTGAACTACTTGAACAGTTTGAAAAGCAGTGCAACCGTCGCTA
GGATAACCGAGGTTCCACCAGTTGCTTTGTTCCCAAACTTTCTTGTTCAGCAGAAGGTTC
TAAGACCGTTCCGAAAGCAGGTTGGTGGGACGATTCTGGCAGCGAAGCTAGCAGTGGAAC
GTGGATGGGCGATAAGTGTAGGAGGAGGTTTTCATCATTGTACTGCTGAAAGAGGAGGCG
GGTTCTATGCTTTCGCTGATATT*CTCTTTGTATTCATTTTGCATTTCTTCGTCTAAGCA
TATCCAGGGTTATGATCATAGATCTTGATGCTCATCAAGGG**ATGGCCATGAA*CAGAT
CTCGGGGATGATAGTCGTGTT
ACAT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4DA45TF 786 0 0
CGAACTGTCTCGACATCATGGACCGATTTAACTCGTGACTCAGCTGTTTACTTGCTCTTC
ACGTTTTCCGCCATCAAAGTCTCCCAATTCATCTACCGTTGCTTTCAATCATCCGAAATG
TCATCGTTTTCGATGGAGACTCACCCTGAAGCTCTCCGGCGAGAACGAATCCTCTCCAGC
AAACTCTACTTCAACGTCCCTGAATCAAAGGTTTCGATCATCTATTCATCAGCATACGAC
ATCTCGTTCATGTGGATTGAGAAGTTGCATCCGTTTGATTCAACCAAGTGGCGTAGAGTT
TGCAAGTTCCTCGTTTCTGATGGGTTCTTGGAGGAGAAATCAATCGTTGAGCCTCTAGAA
GCTTCCAACAGTGATCTCTTAGTGGTGCACTCGTTGAACTACTTGAACAGTTTGAAAAGC
AGTGCAACCGTCGCTAGGATAACCGAGGTTCCACCAGTTGCTTTGTTCCCAAACTTTCTT
GTGCAGCAGAAGGTTCTAAGACCGTTCCGAAAGCAGGTTGGTGGGACGATTCTGGCAGCG
AAGCTAGCAGTGGAACGTGGATGGGCGATAAATGTAGGAGGAGGTTTTCATCATTGTACT
GCTGAAAGAGGAGGCGGGTTCTGTGCTTTCGCTGATATTTCTCTTTGTATTCATTTTGCA
TTTCTTCGTCTAAGCATATCCAGGGTTATGATCATAGATCTTGATGCTCATCAAGGG**A
TGGCCATGAA*CAGATCTCG*CGATGATAGTCGTGTTTACATTCTGGATATGTACAATC
TGAGATA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4AW18TF 832 0 0
GGATATC
CGAACTGTCTCGACATCATGGACCGATTTAACTCGTGACTCAGCTGTTTACTTGCTCTTC
ACGTTTTCCGCCATCAAAGTCTCCCAATTCATCTACCGTTGCTTTCAATCATCCGAAATG
TCATCGTTTTCGATGGAGACTCACCCTGAAGCTCTCCGGCGAGAACGAATCCTCTCCAGC
AAACTCTACTTCAACGTCCCTGAATCAAAGGTTTCGATCATCTATTCATCAGCATACGAC
ATCTCGTTCATGTGGATTGAGAAGTTGCATCCGTTTGATCCAACCAAGTGGCGTAGAGTT
TGCAAGTTCCTCGTTTCTGATGGGTTCTTGGAGGAGAAATCAATCGTTGAGCCTCTAGAA
GCTTCCAACAGTGATCTCTTAGTGGTGCACTCGTTGAACTACTTGAACAGTTTGAAAAGC
AGTGCAACCGTCGCTAGGATAACCGAGGTTCCACCAGTTGCTTTGTTCCCAAACTTTCTT
GTGCAGCAGAAGGTTCTAAGACCGTTCCGAAAGCAGGTTGGTGGGACGATTCTGGCAGCG
AAGCTAGCAGTGGAACGTGGATGGGCGATAAATGTAGGAGGAGGTTTTCATCATTGTACT
GCTGAAAGAGGAGGCGGGTTCTGTGCTTTCGCTGATATTTCTCTTTGTATTCATTTTGCA
TTTCTTCGTCTAAGCATATCCAGGGTTATGATCATAGATCTTGATGCTCATCAAAGGGAA
TGGCCATGAAACAGATCTCGGCGATGATAGTCGTGTTTACATTCTGGATATGTACAATCC
TGAGATATATCCTTATGATTATAGTGCTAGA*GATTTATCGATCA

QA 8 832 8 832
DS 

RD RR4AW18JQ 536 0 0
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ATTATAGTGCTAGAAGATTTATCGATCAGAAGGTTGAGGTGATGAGCGGGACCAGCACTG
ATGAGTATTTGAGGAAACTAGATAAAGCGCTTGAGGTTGCTTTCCGGAACTTCCAACCAG
AGTTGGTAGTTTACAATGCTGGGACTGATATTTTAGACGGTGACCCTCTGGGGCTTCTAA
AGATAAGCCCTGATGGCATAACCAGTAGAGACGAGAAAGTCTTCAGATGTGCAAGGGAGA
GAGAGATTCCTGTTGTGATGCTGACTTCAGGCGGGTACATGAAGTCCAACGCCAGAGTTA
TTGCGGATTCCATAGAAAATCTCTCACGTCAAGGGTTAATCAATACACAACTGGACTCAA
CTTCCACGTGAAACTGTTGTCAAGAGCCAAAGCAGTTATGCTAGAAGCTTCTATGCGCTG
CGTACATGTGAATATATAACCGTCTTGTCTTGTGTGTGTAACATGATGTTCTTTTT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4FU58TF 569 0 0
G
GTCGTGTTTACATTCTGGATATGTACAATCCTGAGATATATCCTTATGATTATAGTGCTA
GAAGATTTATCGATCAGAAGGTTGAGGTGATGAGCGGGACCAGCACTGATGAGTATTTGA
GGAAACTAGATAAAGCGCTTGAGGTTGCTTTCCGGAACTTCCAACCAGAGTTGGTAGTTT
ACAATGCTGGGACTGATATCTTAGACGGTGACCCTCTGGGGCTTCTAAAGATAAGCCCTG
ATGGCATAACCAGTAGAGACGAGAAAGTCTTCAGATGTGCAAGGGAGAGAGAGATTCCTG
TTGTGATGCTGACTTCAGGCGGGTACATGAAGTCCAACGCCAGAGTTATTGCGGATTCCA
TAGAAAATCTCTCACGTCAAGGGTTAATCAATACACAACTGGACTCAACTTCCACGTGAA
ACTGTTGTCAAGAGCTAAAGCAGTTATGCTAGAAGCTTCTATGCGCTGCGTACATGTGAA
TATATAACCGTCTTGTCTTGTGTGTGTAACATGATGTTCTTTTCCATCCCAAACACAACC
TTTAGTGGGATGGTCTTTCCTGCTTTCT

QA 2 569 2 569
DS 

RD RR4GN68JQ 703 0 0
TATTTCTCTTTGTATTCATTTTGCATTTCTTCGTCTAAGCATATCCAGGGTTATGATCAT
AGATCTTGATGCTCATCAAGGG*AATGGCCATGAAACAGATCTCGGCGATGATAGTCGTG
TTTACATTCTGGATATGTACAATCCTGAGATATATCCTTATGATTATAGTGCTAGAAGAT
TTATCGATCAGAAGGTTGAGGTGATGAGCGGGACCAGCACTGATGAGTATTTGAGGAAAC
TAGATAAAGCGCTTGAGGTTGCTTTCCGGAACTTCCAACCAGAGTTGGTAGTTTACAATG
CTAGGACTGATATCTTAGACGGTGACCCTCTGGGGCTTCTAAAGATAAGCCCTGATGGCA
TAACCAGTAGAGACGAGAAAGTCTTCAGATGTGCAAGGGAGAGAGAGATTCCTGTTGTGA
TGCTGACTTCAGGCGGGTACATGAAGTCCAACGCCAGAGTTATTGCGGATTCCATAGAAA
ATCTCTCACGTCAAGGGTTAATCAATACACAACTGGACTCAACTTTCACGTGAAACTGTT
GTCAAGAGCCAAAGCAGTTATGCTAGAAGCTTCTATGCGCTGCGTACATGTGAATATATA
ACCGTCTTGTCTTGTGTGTGTAACATGATGTTCTTTTTCATCCCAAACACAACCTTTAGT
GGGATGGTCTTTCCTGCTTTCTTAAGGTGAAGAAAATTACAC
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4DA45JQ 828 0 0
GAGGTTTTCATCATTGTACTGCTGAAAGAGGAGGCGGGTTCTGTGCTTTCGCTGATATTT
CTCTTTGTATTCATTTTGCATTTCTTCGTCTAAGCATATCCAGGGTTATGATCATAGATC
TTGATGCTCATCAAGGG*AATGGCCATGAAACAGATCTCGGCGATGATAGTCGTGTTTAC
ATTCTGGATATGTACAATCCTGAGATATATCCTTATGATTATAGTGCTAGAAGATTTATC
GATCAGAAGGTTGAGGTGATGAGCGGGACCAGCACTGATGAGTATTTGAGGAAACTAGAT
AAAGCGCTTGAGGTTGCTTTCCGGAACTTCCAACCAGAGTTGGTAGTTTACAATGCTGGG
ACTGATATTTTAGACGGTGACCCTCTGGGGCTTCTAAAGATAAGCCCTGATGGCATAACC
AGTAGAGACGAGAAAGTCTTCAGATGTGCAAGGGAGAGAGAGATTCCTGTTGTGATGCTG
ACTTCAGGCGGGTACATGAAGTCCAACGCCAGAGTTATTGCGGATTCCATAGAAAATCTC
TCACGTCAAGGGTTAATCAATACACAACTGGACTCAACTTCCACGTGAAACTGTTGTCAA
GAGCCAAAGCAGTTATGCTAGAAGCTTCTATGCGCTGCGTACATGTGAATATATAACCGT
CTTGTCTTGTGTGTGTAACATGATGTTCTTTTTCATCCCAAACACAACCTTTAGTGGGAT
GGTCTTTCCTGCTTTCTTAAGGTGAAGAAAATTACACTAATGATCGTGTTGAAAGATGAT
GACTTTTTTAACTTCTGATTAATAAACAAAAGAAAGAATGCATTTGAC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4DC91JQ 665 0 0
ATGATAGTCGTGTTTACATTCTGGATATGTACAATCCTGAGATATATCCTTATGATTATA
GTGCTAGAAGATTTATCGATCAGAAGGTTGAGGTGATGAGCGGGACCAGCACTGATGAGT
ATTTGAGGAAACTAGATAAAGCGCTTGAGGTTGCTTTCCGGAACTTCCAACCAGAGTTGG
TAGTTTACAATGCTGGGACTGATATCTTAGACGGTGACCCTCTGGGGCTTCTAAAGATAA
GCCCTGATGGCATAACCAGTAGAGACGAGAAAGTCTTCAGATGTGCAAGGGAGAGAGAGA
TTCCTGTTGTGATGCTGACTTCAGGCGGGTACATGAAGTCCAACGCCAGAGTTATTGCGG
ATTCCATAGAAAATCTCTCACGTCAAGGGTTAATCAATACACAACTGGACTCAACTTCCA
CGTGAAACTGTTGTCAAGAGCCAAAGCAGTTATGCTAGAAGCTTCTATGCGCTGCGTACA
TGTGAATATATAACCGTCTTGTCTTGTGTGTGTAACATGATGTTCTTTTTCATCCCAAAC
ACAACCTTTAGTGGGATGGTCTTTCCTGCTTTCTTAAGGTGAAGAAAATTACACTAATGA
TCGTGTTGAAAGATGATGACTTTTTTAACTTCTGATTAATAAACAAAAGAAAGAATGCAT
TTG
AC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FC44JQ 696 0 0
AAGGG*AATGGCCATGAAACAGATCTCGGCGATGATAGTCGTGTTTACATTCTGGATATG
TACAATCCTGAGATATATCCTTATGATTATAGTGCTAGAAGATTTATCGATCAGAAGGTT
GAGGTGATGAGCGGGACCAGCACTGATGAGTATTTGAGGAAACTAGATAAAGCGCTTGAG
GTTGCTTTCCGGAACTTCCAACCAGAGTTGGTAGTTTACAATGCTGGGACTGATATCTTA
GACGGTGACCCTCTGGGGCTTCTAAAGATAAGCCCTGATGGCATAACCAGTAGAGACGAG
AAAGTCTTCAGATGTGCAAGGGAGAGAGAGATTCCTGTTGTGATGCTGACTTCAGGCGGG
TACATGAAGTCCAACGCCAGAGTTATTGCGGATTCCATAGAAAATCTCTCACGTCAAGGG
TTAATCAATACACGACTGGACTCAACTTCCACGTGAAACTGTTGTCAAGAGCCAAAGCAG
TTATGCTAGAAGCTTCTATGCGCTGCGTACATGTGAATATATAACCGTCTTGTCTTGTGT
GTGTAACATGATGTTCTTTTTCATCCCTAACACAACCTTTAGTGGGATGGTCTTTCCTGC
TTTCTTAAGGTGAAGAAAATTACACTAATGATCGTGTTGAAAGATGATGACTTTTTTAAC
TTCTGATTAATAAACAAAAGAAAGAATGCATTTG
TC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 2 10

CO CL363Contig1 1474 5 23 U
ATTTGCTTTTACCCTATGTGAACAAAGTGAGAGAGTTGGATGATAGCAACTTGTATGCTT
CTCGAGCTATTCTTCCTCAGTGATAATAGCACACTGAGACCTGTTGCGATTGAGTTGACT
CGTCCCCAAGATGTAAACGGGCCCCAGAGGAGGCAAGTATTCACGCCAGGATATGATGCT
ACCTCCTGCTGGCTATGGAGTCTTGCTAAGACCCACGCTATTTCTCATGACGCTGGTTAT
CACCAGCTTATTTCCCACTGGCTGAGGACTCACTGCTGTATGGAGCCATACATTATAGCG
GCAAACAGACAACTAAGTGCGATGCATCCTATCTATAGGCTTTTGCATCCCCACTTCCGC
TACACCATGGAGATCAATGCTCGTGCACGCCAAAGTCTCATCAACGCAGGTGGAATCATT
GAGTCTTGTTTCTGGCCCGGAAAGTATTCACTAGAGCTAAGTTCAGATGTCTATGACAAA
CTATGGAGGTTCGACACGGAAGGCTTACCTGCAGACCTCATCAGCAGGGGTATAGCTGTG
GAAGATGAGACGGCGGAACATGGGGTACGCCTGACGATACCAGATTACCCATTTGCGAAT
GACGGTTTAATGCTGTGGGATGCACTAAAGGAATGGATCACAGACTATGTGAAGCACTAT
TATCCAGATGCGGAACATGTCATGTTGGATGAGGAACTCCAAGGATGGTGG*AGTGAAGT
GAGGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAAATGAACCATGGTGGCCTGATCTCAAAACTCA
AGATGACTTGATTGAAGTGGTGACCACGATT*GCATGGGTGGCTCCAGGTCACCATGCAG
CTGTGAACTTTGGACAATACGGGTATGGGGGATACTTTCCCAACCGACCAACCACAACAA
GGATAAAAATGCCAGTGGAAGAACCGACAGAGGAAGAGCTCAGAGAGTTCTATGAGGAGC
CAGAGAAGACTATGCTTAAGACATTCCCTTCGAAGAAGCAGGCGACCAAAGTGATGGTGG
CTTTGGATCTTCTATCATCACATTCACCAGATGAAGAGTACCTAGGAGAAAACCCAGAAG
CATCTTGGGCCCACGAACCTGTCATCTATGCTGCATATGAACGTTTCAAAGGCAAGCTCC
AATACCTAGAAGGAGTGATAGATGAGAGGAACGTGAATGTTTCTCTAAAGAATCGAGCTG
GAGCAGGTGTTGTTAAGTACGAGCTTTTGAAGCCTATCTCTGAACCAGGCGTTACCGGGA
TGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATTTGATCTCTAATGCATTGGAAGTTATCATTTACGT
TTCTCCCAAGCTATAATCTATGTTTCTTTCTTTCGTAATAAATAATGAATCTCACCCTGC
TCAAGGGTACCTTGTTTGTGCTGGGAAGCTCTGAAGGATCTTGATGTTGTTATTTATTTT
GGGAATAAGACAATGTGTGGTCGTTTTTATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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GACGGTTTAATGCTGTGGGATGCACTAAAGGAATGGATCACAGACTATGTGAAGCACTAT
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GAGGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAAATGAACCATGGTGGCCTGATCTCAAAACTCA
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G
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G
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G
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GCTCCAATACCTAGAAGGAGTGATAGATGAGAGGAACGTGAATGTTTCTCTAAAGAATCG
AGCTGGAGCAGGTGTTGTTAAGTACGAGCTTTTGAAGCCTATCTCTGAACCAGGCGTTAC
CGGGATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATTTGATCTCTAATGCATTGGAAGTTATCATC
TACGTTTCTCCCAAGCTATAATCTATGTTTCTTTCTTTCGTAATAAATAATGAATCTCAC
CCTGCTCAAGGGTACCTTGTTTGTGCTGGGAAGCTCTGAAGGATCTTGATGTTGTTATTT
ATTTTGGGAATAAGACAATGTGTGGTCGTTTTTATGTTT

QA 2 520 2 520
DS 



CO CL363Contig2 760 5 11 U
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AAACGTAGATGAAACGTAGATGATAACTTCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTG
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CCTTCTAGGTATTGGAGCTTGCCTTTGAAACGTTCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCG
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ATAGTCTTCTCTGGCTCCTCATAGAACTCTCTGAGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACT
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CCTATGTTCCTCACTTCACTCCACCATCCTTGGAGTTCCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4EQ92JQ U 3
AF RR4BU23JQ U 3
AF RR4F717TF C 76
AF RR4EQ92TF C 84
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CCTTCTAGGTATTGGAGCTTGCCTTTGAAACGTTCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCG
TGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTTTTCTCCTAGGTACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGAT
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GGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTCGGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGT
CCAAAGTTCACAGCTGCATGGTGACCTGAAGCCACCCATGCAATCGTGGTCACCACTTCA
ATCAAGTCATCTTGTGT

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DS 

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AGATGATAACTTCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCC
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TCGATTCTTTAGAGAAACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAG
CTTGCCTTTGAAACGTTCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTC
TGGGTTTTCTCCTAGGTACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCAC
CATCACTTTGGTCGCCTGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCTC
CTCATAGAACTCTCTGAGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGT
TGTGGTTGGTCGGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGTCCAAAGTTCACAGCTGC
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DS 

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TATTTATTACGAAAGAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAAATGAAACGTA
AATGATAACTTCCAATGCATTAAAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCG
GTAACACCGGGTTCAGAGATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCT
CGATTCTTTAAAGAAACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGC
TTGCCTTTGAAACGTTCATATGCAGCATAAATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCT
GGGTTTTCTCCTAGGTACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACC
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T
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TAGATGATAACTTCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCC
CGGTAACGCCGGGTTCAGAGATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAG
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CCATCACTTTGGTCGCCTGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCT
CCTCATAGAACTCTCTGAGCTCTTCCTCTGT****TCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTG
TTGTGGTTGGTCGGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGTCCAAAGTTCACAGCTG
CATGGTGACCTGAAGCCACCCATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGTG
TTTTGAGATCAGGCCACCATGGTTCATTTTTCTTGTCTCCATGCCCTATGTTCCTCACTT
CACTCCACCATCCTTGGAGTTCCC

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TAACTTCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAAC
GCCGGGTTCAGAGATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGATT
CTTTAGAGAAACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTGCC
TTTGAAACGTTCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTT
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TTTGGTCGCCTGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCTCCTCATA
GAACTCTCTGAGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGT
TGGTCGGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGTCCAAAGTTCACAGCTGCATGGTG
ACCTGAAGCCACCCATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGTGTTTTGAG
ATCAGGCCACCATGGTTCATTTTTCTCGTCTCCATGCCCTATGTTCCTCACTTCACTCCA
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 8

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TTCTAGCAGACCGATCTCTTGTCTCTCTGTCTTTGTCGGAAACTTTTTGAGTTTTCTAAA
TCATAAACTATGGGTTTGTGGGATGCTTTTCTCAATTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAG
CAAGAAATGGAGCTTTCCTTGATCGGACTTCAAAATGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAAC
GTCGTTGCTACCGGTGGATACAGTGAAGATATGATTCCTACGGTAGGGTTCAACATGAGG
AAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTC
CGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGTTCTGTTTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCT
GCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACC
TCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTCCTCGGTAACAAAATCGACAAGCCTGGTGCTCTA
TCCAAAGATGACTTAACCGAGGAAATGGGGCTCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGT
TGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGACCAAGTGGTTGATTGGCTTGTA
AAGCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAAACAAGAACCCCCTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCT
CAGTCTTCCTGTGTGTTGCAACTCCTTTGATGGTGGAAGAATGACAATTTTTTTTTTTTC
TTTGTTTTAAATCCTGTGAGAAACAAGATTTGTCTTTGTTTTTTATCCTCTTTCTTCTTC
TTCTGTATATTAGTTTTGATTTATTTTCTTAATTCACCTTCCTTCAGGGTCGGATTTGAA
AGAATTAAAACGTACTGGGTTAATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 45 25 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GX10TF U 31
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AF RR4CT59TF U 1
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AF RR4EL62TF U 31
AF RR4GX10JQ C 311
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AF RR4EL62JQ C 347
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AGGGG
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GTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACAT
TGACCAAGTGGTTGATTGGCTTGTAA*GCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAA*CAAGAACCC
C*TCTGCATTTTCTTCATCTTT
CTCA

QA 6 747 6 747
DS 

RD RR4CT59JQ 223 0 0
TTTTT
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AAATGGGGCTCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTTTGTTGTTTCATGATATCTTGCAAGA
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AAAACAAGAACCCCCTCTGCATTTTTTTCATTTTTT
TT

QA 6 221 6 221
DS 

RD RR4CT59TF 782 0 0
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TCATAAACTATGGGTTTGTGGGATGCTTTTCTCAATTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAG
CAAGAAATGGAGCTTTCCTTGATAGGACTTCAAAATGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAAC
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AAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTC
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GCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACC
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TGTTTCATGATATCTTGCAAGA*CTCTACCAACATTGACCAAGTGATTGATTGGCTTGTA
AAGCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAA*CAA*AACCCCCTCTGCATTT*CTTCATCTTTTCT
CA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4B001TF 796 0 0
GGAGCAGC
AGCCCAAGAAGGCCTAGAAAAGGAAAGAGAGAGGGAGAGAAGCTTCCATTTGAACCCATA
GAGATCCCGTCCCGTGGAGGAGAATTTCTAGCAGACCGATCTCTTGTCTCTCTGTCTTTG
TCGGAAACTTTTTGAGTTTTCTAAATCATAAACTATGGGTTTGTGGGATGCTTTTCTCAA
TTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGTAGCTTTCCTTGATCGGACTTCAAAA
TGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAACGTCGTTGCTACCGGTGGATACAGTGAAGATATGAT
TCCTACGGTAGGGTTCAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTG
GGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGTTCTGTTTC
CGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGA
ACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACCTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTCCTCGGTAA
CAAAATCGACAAGCCTGGTGCTCTATCCAAAGATTACTTAACCGGGGAAATGGGGCTCAA
GTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACAT
TGACCAAGTGGTTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAAACAAGAACCC
CCTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCA*CTCCTTTGATGGTG
GA
GAATGA

QA 9 790 9 790
DS 

RD RR4EL62TF 781 0 0
GGAGC
AGCCCAAGAAGGCCTAGAAAAGGAAAGAGAGAGGGAGAGAAGCTTCCATTTGAACCCATA
GAGATCCCGTCCCGTGGAGGAGAATTTCTAGCAGACCGATCTCTTGTCTCTCTGTCTTTG
TCGGAAACTTTTTGAGTTTTCTAAATCATAAACTATGGGTTTGTGGGATTCTTTTCTCAA
TTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAGCTTTCCTTGATCGGACTTCAAAA
TGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAACGTCGTTGCTACCGGTGGATACAGTGAAGATATGAT
TCCTACGGTAGGGTTCAACATGAGTAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTG
GGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGTTCTGTTTC
CGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGA
ACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACCTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTCCTCGGTAA
CAAAATCGACAAGCCTGGCGCTCTATCCAAAGATGACTTAACCGAGGAAATGGGGCTCAA
GTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACAT
TGACCAAGTGGTTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAA*CAAGAACCC
CCTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCA*CTCCTTTGAT

QA 6 781 6 781
DS 

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AAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGT
GGGAACGCTACTGCCGTTCTGTTTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTG
ACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACCTCGCTTAGTG
GTATCCCTCTTCTAGTCCTCGGTAACAAAATCGACAAGCCTGGTGCTCTATCCAAAGATG
ACTTAACCGAGGAAATGGGGCTCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGA
TATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGACCAAGTGGTTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCA
AGTCAGCAAGCTAAAACAAGAACCCCCTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCT
GTGTGTTGCAACTCCTTTGATGGTGGAAGAATGACAATTTTTTTTTT**CTTTGTTTTAA
ATCCTGTGAGAAACAAGATTTGTCTTTGTTTTTTATCCTCTTTCTTCTTCTTCTGTATAT
TAGTTTTGATTTATTTTCTTAATTCACCTTCCTTCAGGGTCGGATTTG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4B001JQ 777 0 0
TCAATTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGTAGCTTTCCTTGATCGGACTTC
AAAATGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAACGTCGTTGCTACCGGTGGATACAGTGAAGATA
TGATTCCTACGGTAGGGTTCAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAAC
TCTGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGTTCTG
TTTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAA
GCGAACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACCTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTCCTCG
GTAACAAAATCGACAAGCCTGGTGCTCTATCCAAAGATTACTTAACCGGGGAAATGGGGC
TCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCA
ACATTGACCAAGTGGTTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAAACAAGA
ACCCCCTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCAACTCCTTTGAT
GGTGGAAGAATGACAATTTTTTTTTTTTCTTTGTTTTAAATCCTGTGAGAAACAAGATTT
GTCATTGTTTTTTATCCTCTTTCTTCTTCTTCTGTATATTAGTTTTGATTTATTTTCTTA
ATTCACCTTCCTTCAGGGTCGGATTTGAAAGAATTAAAACGTACTGGGTTAATTCAT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4EL62JQ 642 0 0
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GTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGTTCTGTTTCCGCCATTGTGT
ATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGAACTCCATGATT
TGTTGAGCAAGACCTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTCCTCGGTAACAAAATCGACA
AGCCTGGCGCTCTATCCAAAGATGACTTAACCGAGGAAATGGGGCTCAAGTCGCTCACAG
ATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGACCAAGTGG
TTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAGTCAGCAAGCTAAAACAAGAACCCCCTCTGCATTT
TCTTCATCTTTTTTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCAACTCCTTTGATGGTGGAAGAATGACA
ATTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTAAATCCTGTGAGAAACAAGATTTGTCTTTGTTTTTTAT
CCTCTTTCTTCTTCTTCTGTATATTAGTTTTGATTTATTTTCTTAATTCCCCTTCCTTCA
GGGTCGGATTTGAAAGAATTAAAACGTACTGGGTTAATTCAT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 3 11

CO CL365Contig1 727 6 10 U
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CACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTCAGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGC
TCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCC
ACCGTCTCTAACAACTCTAAGACCTAAGAGCCTCCTCCCAATCACCATGATGGTCAAACC
GGCGCTCCAGTTCATCCAAGGGACAGACGAGCTGACGATTCCTGACGTCAAGCTGACTAG
GTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTTCTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGA
CTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTTGTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGAT
TCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTTAACGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAA
GCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTC
TGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCA
AAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAGGCTATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTT
TTGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FE45TF U 1
AF RR4DH87JQ C 32
AF RR4FE45JQ C 361
AF RR4DH87TF U 32
AF RR4AS04JQ C 34
AF RR4AS04TF U 34
BS 1 178 RR4FE45TF
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BS 180 573 RR4FE45TF
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BS 664 688 RR4FE45TF
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RD RR4FE45TF 688 0 0
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CTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTTGTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGAT
TCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTTAACGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAA
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AA*TGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAA

QA 1 688 1 688
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GG
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QA 3 659 3 659
DS 

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GCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTC
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GGCTATTGGTCC

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR4DH87TF 657 0 0
GG
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CTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTT
GTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTCAA
CGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAG
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ATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR4AS04JQ 694 0 0
GGACTCTTCTGTCTCTAGTTTCCTCGCGCACACCGATAAGCACGAAACAATGGCTTGTGT
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AGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTTCTCCTTCACTGGCTC
TCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCGTCTCTAACAACTCTAAGACCTAAGAGCCT
CCTCCCAATCACCATGATGGTCAAACCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGGACAGACGAGCT
GACGATTCCTGACGTCAAGCTGACTAGGTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTT
CTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCTGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTT
GTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTTAA
CGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAG
GTCCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCA
ATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAGGC
TATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTTTTGATCG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4AS04TF 694 0 0
GGACTCTTCTGTCTCTAGTTTCCTCGCGCACACCGATAAGCACGAAACAATGGCTTGTGT
TCGTTCGTTAGGGTCTTTAACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTC
AGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTTCTCCTTCACTGGCTC
TCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCGTCTCTAACAACTCTAAGACCTAAGAGCCT
CCTCCCAATCACCATGATGGTCAAACCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGGACAGACGAGCT
GACGATTCCTGACGTCAAGCTGACTAGGTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTT
CTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCTGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTT
GTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTTAA
CGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAG
GTCCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCA
ATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAGGC
TATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTTTTGATCG

QA 1 694 1 694
DS 



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CCTCTACTCTTCTGTCTCTAGTTTCCTCGCGCACACCGATAAGCGCGAAACAATGGCTTG
TGTTCGTTCGTTAGGGTCTTTAACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCAC
CTCAGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGG
CTCTCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAAC
TCTCGTCCCAATCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGA
GCTGACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGGGACGGATCTAACGGAATGGCGCT
CTTCTCTTTCGACCAACCATCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGGGAGATAACGGG
TTTGTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGT
GAACGGGAAGCCAGAAGGGATAGTGGCGAAGCACGTGATGCGGACGCCGAAGGAATGGGA
CAGGTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAA
GCAATGAGGTTGGAGACTTTTGTATGAGAGCATAATGTGAATGTTACATTTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4FR59TF U 1
AF RR4FR59JQ C 72
AF RR4F733TF U 87
BS 1 556 RR4FR59TF
BS 557 557 RR4F733TF
BS 558 603 RR4FR59TF
BS 604 668 RR4F733TF
BS 669 669 RR4FR59JQ
BS 670 700 RR4F733TF
BS 701 701 RR4FR59JQ
BS 702 717 RR4F733TF

RD RR4FR59TF 607 0 0
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CCTCTACTCTTCTGTCTCTAGTTTCCTCGCGCACACCGATAAGCGCGAAACAATGGCTTG
TGTTCGTTCGTTAGGGTCTTTAACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCAC
CTCAGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGG
CTCTCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAAC
TCTCGTCCCAATCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGA
GCTGACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGGGACGGATCTAACGGAATGGCGCT
CTTCTCTTTCGACCAACCATCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGGGAGATAACGGG
TTTGTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGT
GAACGGGAAGCCAGAAAGGATAGTGGCGAAGCACGTGATGCGGACGCCGAAGGAATGGGA
CAG
TTCA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4FR59JQ 641 0 0
CTGTCTCTAGTTTCCTCGCGCACACCGATAAGCGCGAAACAATGGCTTGTGTTCGTTCGT
TAGGGTCTTTAACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTCAGGCATTG
TCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGGCTCTCCCATTT
CCCTCTCTCGACTCCATCCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAACTCTCGTCCCAA
TCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGAGCTGACGATTC
CTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGGGACGGATCTAACGGAATGGCGCTCTTCTCTTTCG
ACCAACCATCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGGGAGATAACGGGTTTGTACATGA
TTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTGAACGGGAAGC
CAGAAGGGATAGTGGCGAAGCACGTGATGCGGACGCCGAAGGAATGGGACAGGTTCATGA
GGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTT
GGAGACTTTTGTATGAGAGCATAATGTGAATGTTACATTTC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4F733TF 631 0 0
GG
GCGCACACCGATAAGCACGAAACAATGGCTTGTGTTCGTTCGTTAGGGTCTTTAACTTCT
GTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTCAGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCT
GCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCAT
CCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAACTCTCGTCCCAATCACGATGATGGTCAAG
CCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGAGCTGACGATTCCTGACGTTAAGCTGACT
CGGTCAAGGGACGGATCTAACGGAATGGCGCTCTTCTCTTTCGACCAACCATCCGTTTTC
GACTCGAGCGGTGAGGTCGGGGAGATAACGGGTTTGTACATGATTGACGAGGAAGGTGTG
ATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGGGATAGTGGCG
AAGCACGTGATGCGGACGCCGAAGGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTAC
TCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAG*TTGGAGACTTTTGTATGAG
AGCATAATGTGA*TGTTACATTTCAAAAA

QA 3 631 3 631
DS 



CO CL365Contig3 670 2 2 U
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AGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGGCTC
TCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAACTCT
CGTCCCAATCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGAGCT
GACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGAGACGGATCTAACGGAATGGCACTCTT
CTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTT
GTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTGAA
CGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAG
GTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCA
ATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAAGG
CTATTGGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL32TF U 1
AF RR4GL32JQ C 1
BS 1 652 RR4GL32TF
BS 653 670 RR4GL32JQ

RD RR4GL32TF 652 0 0
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AGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGGCTC
TCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAACTCT
CGTCCCAATCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGAGCT
GACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGAGACGGATCTAACGGAATGGCACTCTT
CTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTT
GTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTGAA
CGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAG
GTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCA
ATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4GL32JQ 670 0 0
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TCGTTCGATAGGGTCTTTAACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGACATGTTTCACGCACCTC
AGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTCACTGGCTC
TCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCATATCCAACAACTCTGAGACCAAGAACTCT
CGTCCCAATCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCATCCAAGGTACCGATGAGCT
GACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGAGACGGATCTAACGGAATGGCACTCTT
CTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGTTT
GTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCTAGATTCGTGAA
CGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAG
GTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCA
ATGAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAAGG
CTATTGGTTT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 10

CO CL366Contig1 716 10 6 U
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GGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCC
AAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGAT
TTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCT
CCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGG
GGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCT
TCCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGT
CCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTC
CCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCA
AGCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTACAAAACAAT
GGTGTCTTTTTTCTTTTTCATTTGAATCATGGAAAAATCAATTGCATTTAAAACCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E110TF U -1
AF RR4EZ29JQ C 1
AF RR4EZ29TF U 1
AF RR4BA50JQ C 2
AF RR4BA50TF U 2
AF RR4EP58JQ C 24
AF RR4EP58TF U 24
AF RR4D138TF U 518
AF RR4HB96TF U 204
AF RR4E110JQ C 142
BS 1 1 RR4EZ29JQ
BS 2 631 RR4EZ29TF
BS 632 632 RR4EP58TF
BS 633 650 RR4EZ29TF
BS 651 652 RR4EP58TF
BS 653 716 RR4E110JQ

RD RR4E110TF 510 0 0
GGACTTACTTTGGCAA
CAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACATGGCATCGTTTGC
AACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCAGAGGAAGCTCTCTCAC
CGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCACCAAAGCTTCAAGCCCAAATCCACAAGAGC
TGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACT
TCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGGTTTGCTTCTCAA
GTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGCGA
TGTTCTTCCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTCCACGTGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTC

QA 17 510 17 510
DS 

RD RR4EZ29JQ 650 0 0
GGGACTTACTTTGGCAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAAC
ATGGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGA
GGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCC
AAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGAT
TTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCT
CCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGG
GGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCT
TCCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGT
CCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTC
CCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCA
AGCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAATTGCATTTCAAGTCTGCT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4EZ29TF 650 0 0
G
GGACTTACTTTGGCAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACA
TGGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAG
GAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCA
AATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATT
TAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTC
CTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGG
GTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTT
CCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTC
CACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCC
CAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAA
GCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAA*TTGCATTTCAAGTCTGCT

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4BA50JQ 643 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACA
TGGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAG
GAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCA
AATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATT
TAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTC
CTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGG
GTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTT
CCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTC
CACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCC
CAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAA
GCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAATTGCATTTCAAG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BA50TF 643 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACA
TGGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAG
GAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCA
AATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATT
TAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTC
CTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGG
GTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTT
CCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTC
CACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCC
CAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAA
GCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAATTGCATTTCAAG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4EP58JQ 629 0 0
GGAGAGAGA
TCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACATGGCATCTTTTGCAACCATGGCTGCCGTTCA
ACCATCCTCCGCCGTGAAAGGGCTCGGAGGAAGCTCTCTCACCGGAGTTAAGCTCTTCAT
CAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAA
GTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGGCAATG
GGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGA
GACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGG
AGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCG
AGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAA
TCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATG
TATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAT
TTGCATTTCAAGTCTGCTAC

QA 10 629 10 629
DS 

RD RR4EP58TF 634 0 0
GGAGAGAGA
TCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACATGGCATCTTTTGCAACCATGGCTGCCGTTCA
ACCATCCTCCGCCGTGAAAGGGCTCGGAGGAAGCTCTCTCACCGGAGTTAAGCTCTTCAT
CAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAA
GTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGGCAATG
GGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGA
GACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGG
AGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGCG
AGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAA
TCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATG
TATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAT
TTGCATTTCAAGTCTGCTAC
AAAAA

QA 10 629 10 629
DS 

RD RR4D138TF 135 0 0
G
GAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATT
GTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTAATCAATCAATGAAAAATTTGCAT
TTCAAGTCTGCTAC

QA 2 135 2 135
DS 

RD RR4HB96TF 438 0 0
GGTT
GCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTTTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGA
CAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTT
TTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTT
GGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGCGATGTTCT**CTATC
AAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTT
CTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGAT
CTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTAATCAATCAATGA
AAAATTTGCATTTC

QA 5 438 5 438
DS 

RD RR4E110JQ 575 0 0
AAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCACCAAAGCTTCAAGCCCAAATCCACAAGAGCTGGTGCC
GTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACA
ACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGC
AAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTG
ATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGCGATGTTCTT
CCTATCAAGCGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTGGTCCACGTGGCAAGCTTTAAATT
AGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTT
ACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTAATCAAT
CAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTACAAAACAATGGTGTCTTTTTTCTTTTTCAT
TTGAATCATGGAAAAATCAATTGCATTTAAAACCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 11

CO CL367Contig1 873 11 37 U
GGGGATACAGAGAGAGAGAGAGGAGATCCAGGAGAGAAACAAACCCTTTGCTGAACAGTG
CGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGAACCCTAAG
CGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAGGTTTTTTT
CGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGAAAAGAC
AGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTTCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGTAA
GAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTTCATAGGGTCATACCAAGCTTTAT
GCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGG*AGAGTCTATCTATGGTG
AGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCTATGG
CAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAACAAGCT
GGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGG*ACGTGGTGTAC
AAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGAC
AGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATCAGCCAT
TGATGTGAGCTAAATCTAGTGCGTGAAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTAGCCACT
TGATAAAAGATACTACCATTCTGCTTTTATTTCAGTTGTCTGCTGCTTATAACTCAAA*T
CTGAATTAAAAATTAGAGATTTATTTCGAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 40 40 50 50 50 50 50 50 50 55 55 0 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 5 65 65 65 0 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT53TF U 315
AF RR4GW89TF U 39
AF RR4F239TF U 1
AF RR4GT53JQ C 43
AF RR4GW89JQ C 55
AF RR4E523TF U 48
AF RR4B238TF U 22
AF RR4B238JQ C 22
AF RR4D048JQ C 220
AF RR4D048TF U 23
AF RR4E523JQ C 48
BS 1 44 RR4F239TF
BS 45 45 RR4D048TF
BS 46 56 RR4F239TF
BS 57 57 RR4D048TF
BS 58 176 RR4F239TF
BS 177 177 RR4D048TF
BS 178 233 RR4F239TF
BS 234 234 RR4D048TF
BS 235 253 RR4F239TF
BS 254 254 RR4D048TF
BS 255 265 RR4F239TF
BS 266 266 RR4D048TF
BS 267 270 RR4F239TF
BS 271 271 RR4D048TF
BS 272 327 RR4F239TF
BS 328 328 RR4D048TF
BS 329 336 RR4F239TF
BS 337 337 RR4D048TF
BS 338 413 RR4F239TF
BS 414 414 RR4GT53TF
BS 415 713 RR4F239TF
BS 714 714 RR4D048TF
BS 715 725 RR4F239TF
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BS 730 730 RR4D048TF
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BS 740 740 RR4D048TF
BS 741 753 RR4F239TF
BS 754 754 RR4D048TF
BS 755 784 RR4F239TF
BS 785 785 RR4B238TF
BS 786 794 RR4F239TF
BS 795 851 RR4D048TF
BS 852 852 RR4B238JQ
BS 853 867 RR4D048TF
BS 868 873 RR4B238JQ

RD RR4GT53TF 429 0 0
TACATTACAAGGGTAGCTCGTTCCATAGGGTCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCG
ATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGGGAGAGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGAT
GAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAA
GACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGA
CACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGGGATGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGA
GGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCC
TCTGTA*CTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATTAGCCATTGATGCGAG*TAAA
TCTAGCGCG

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR4GW89TF 705 0 0
GG
AAACCCTTTGCTGAACAGTGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTT
CTTCTTCTCGGAACCCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAAGGAGAACTTAAAGGAG
ATCACACACAAGGTTTTTTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTC
ATGGGTCTATATGAAAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTTCGAGCTTTGTGCATA
GGGGAAAAGGGAATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTTCAT
AGGGTCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGCAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGA
GG*AGAGTCTATCTATGGTGAGACGCTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGG
TCCAGGGCTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCAT
CACAACAGTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAAGTCGTGTC
GGGAATGG*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGA
GTAAAGTTGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTT
TTCTCCATCTCATCAGCCATTGATGTGAGCTAAATCTAGTGCG

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR4F239TF 794 0 0
GGGGATACAGAGAGAGAGAGAGGAGATCCAGGAGAGAAACAAACACTTTGCTGAACGGTG
CGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGAACCCTAAG
CGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAGGTTTATTT
CGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGGAAAGAC
AGTCCCTAAAACTACAGAGAATTTTAGAGCCTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGTAA
GAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGTAGCTCGTTCCATAGGGTCATACCAAGCTTTAT
GCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGG*AGAGTCTATCCATGGTG
AGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCTATGG
CAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAACAAGCT
GGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGG*ACGTGGTGTAC
AAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGAC
AGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATTAGCCAT
TGATGCGAGTTAAATCTAGCGCGTGAAGACTTT*GTGTTTAAACGACTATCTTAGCCACT
TGATTAAAGATACT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4GT53JQ 753 0 0
ACA
CTTTGCTGAAC*GTGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCT
TCTCGGAACCCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAAGGAGAACTTAAAGGAGATCAC
ACACAAGGTTTATTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGG
TCTATATGGAAAGACAGTCCCTAAAACTACAGAGAATTTTAGAGCCTTGTGCACAGGGGA
AAAGGGAATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGTAGCTCGTTCCATAGGGT
CATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGG*AG
AGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAG
GGCTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAA
CAGTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAA
TGG*ATGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAA
GTTGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTC
CATCTCATTAGCCATTGATGCGAGTTAAATCTAGCGCGTGAAGACTTTT*TGTTTAAACG
ACTATCTTAGCCACTTGATTAAAGATACTA

QA 4 753 4 753
DS 

RD RR4GW89JQ 754 0 0
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CCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAGGT
TTTTTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGA
AAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTTCGAGCTTTGTGCATAGGGGAAAAGGGAAT
AGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTTCATAGGGTCATACCAAG
CTTTATGCTCCAGGCAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGG*AGAGTCTATCT
ATGGTGAGACGCTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTAT
TTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAA
CAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGG*ACGTG
GTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATT
GTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATC
AGCCATTGATGTGAGCTAAATCTAGTGCGTGAAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTA
GCCACTTGATAAAAGATACTACCATTCTGCTTTT

QA 1 754 1 754
DS 

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TCGGAACCCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACAC
ACAAGGTTTATTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTC
TATATGGAAAGACAGTCCCTAAAACTACAGAGAATTTTAGAGCCTTGTGCACAGGGGAAA
AGGGAATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGTAGCTCGTTCCATAGGGTCA
TACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGG*AGAG
TCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGG
CTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAACA
GTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATG
G*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGT
TGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCA
TCTCATTAGCCATTGATGCGAGTTAAATCTAGCGCGTGAAGACTTTTGTGTTTAAACGAC
TATCTTAGCCACTTGATTAAAGATACTACCATTCTGCTTTTATTTCAGTTGTCTGCTGCT
TATA
CTCAATCTGAA

QA 1 784 1 784
DS 

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GGA
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GCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGAACCCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAA
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AGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGAAAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTT
TCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGTAA**AAGGGAAGGCTCTACATTACAA
GGGGAGCTCGTTTCATAGGGTCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCA
TGGCAATGGTATGGGAGG*AGAGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCA
AACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACG
GATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGT
TCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGG*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAACTGAGGGTAATCAG
AGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTC
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GAAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTAGCCACTTGATAAAAGATACTACCATTCTGC
TTTTATTTCAGTTGTCTGCTGCTTATA*CTCAA
ATCTGAAT

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DS 

RD RR4B238JQ 852 0 0
GGA
GATCCAGGAGAGAAACAAACCCTTTGCTGAACAGTGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCT
GCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGAACCCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAA
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AGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGAAAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTT
TCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGTAA**AAGGGAAGGCTCTACATTACAA
GGGGAGCTCGTTTCATAGGGTCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCA
TGGCAATGGTATGGGAGG*AGAGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCA
AACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACG
GATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGT
TCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGG*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAACTGAGGGTAATCAG
AGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTC
AACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATCAGCCATTGATGTGAGCTAAATCTAGTGCGT
GAAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTAGCCACTTGATAAAAGATACTACCATTCTGC
TTTTATTTCAGTTGTCTGCTGCTTATAACTCAAAATCTGAATTAAAAATTAGAGATTTAT
TTCGAAAAG

QA 4 852 4 852
DS 

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AGGGGAAAAGGGAATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTTCA
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AGG*AGAGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTG
GTCCAGGGCTTCTATTTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATTTCAGTTTTTCA
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CGGGAATGG*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAG
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TTTCTCCATCTCATCAGCCATTGATGTGAGCTAAATCTAGTGCGTGAAGACTTTTGTGTT
TAAACGACTATCTTAGCCACTTGATAAAAGATACTACCATTCTGCTTTTATTTCAGTTGT
CTGCTGCTTATAACTCAAAATCTGAATTAAAAATTAGAGATTTATTTC
C

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4D048TF 846 0 0
GG
GATCCAGGAGAGAAACAAACCCTTTGCTGAACAGTGCGAGAGGGCGAGCTCAGTGACGCT
GCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTAGGAACCCTAAGCGCGATTCAGGCCAAGAAGTCAAA
GGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAGGTTTTTTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGA
AGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGAAAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTT
TCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAA
GGGGAGCTCGTTTCATAGGGTCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGCAGGCGATTTCACCCA
TGGCAATGGTATGGGAGG*AGAGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCA
AACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACG
GATCTCAGTTTTTCATCACAACAGTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGT
TCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATGG*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAG
AGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTC
AACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATCAGCCATTGATGTGAGCTAAATCTAGTGCGT
GAAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTAGCCACTTGAT*AAAGATACTACCATTCTGC
TTTTATTTCAGTTGTCTGCTGCTTATAACTCAAA*TCTGAATTAAAA*TTAGAGATTTAT
TTC
C

QA 3 845 3 845
DS 

RD RR4E523JQ 812 0 0
TTGCTGAACGGTGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTC
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ACAAGGTTTATTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTC
TATATGGAAAGACAGTCCCTAAAACTACAGAGAATTTTAGAGCCTTGTGCACAGGGGAAA
AGGGAATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGTAGCTCGTTCCATAGGGTCA
TACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCATGGCAATGGTATGGGAGG*AGAG
TCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGG
CTTCTATCTATGGCAAACGCTGGCCAAGACACCAACGGATCTCAGTTTTTCATCACAACA
GTAACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGACACGTAGTGTTCGGGAAGGTCGTGTCGGGAATG
G*ACGTGGTGTACAAAGTCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGT
TGTGATTGTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCA
TCTCATTAGCCATTGATGCGAGTTAAATCTAGCGCGTGAAGACTTTTGTGTTTAAACGAC
TATCTTAGCCACTTGATTAAAGATACTACCATTCTGCTTTTATTTCAGTTGTCTGCTGCT
TATAACTCAAA*TCTGAATTAAAA
TATTAGAG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 8

CO CL368Contig1 1503 8 20 U
GGAAATATTTTCTCTACTCTCCCAAAGAAAACTCTGCAACAACGACAAGAAAAATGTGGC
CACTCTCCTCCATATCAGTTGTCTTCCTCCCATGCTTGGCCGCTTTTCTACTCATCACGG
CTCTTTCTTCGGCGTATGGCTACGGCGACTCGGAGGCGACATGTTCAGGAATAGTTCCCT
TAAGGTACCGGAACGATAAGATCTCTATAACGGACTTTGGCGGCGTCGGGGACGGGAGGA
CGGTGAACACTAAGGCGTTTAGGGCGGCGATATATAGGATTCAGCATCTGAGGAGGAGAG
GAGGCACGGTTCTGTACATACCACCGGGAGTGTTTCTCACGGAGAGCTTCAGTCTCACCA
GCCATATGACTCTCTTCTTGGCCAGAGGCGCTGTTATCAAAGCCGTTCAGGATACATCAA
ATTGGCCATTGATTGATCCTTTGCCATCTTATGGAAGAGGGAGGGAGTTACCAGGGGCAC
GGTATATGAGCTTCATTCATGGTGATGGCCTTCGTGATGTAGTCATCACTGGACAAAACG
GGACAATAGACGGTCAAGGAGAAGTGTGGTGGAACATGTGGCGCAGCAGAACACTAAAGT
TCACTAGACCAAATCTAATCGAATTCAAGAACTCTAAGGAGATCATAATCTCCAATGTTA
TTTTCCAGAACTCACCCTTCTGGAACATTCACCCTGTCTATTGCAGTGATGTCGTCATCC
ATCACGTTACCATCTTAGCTCCACAAGATTCCCCCAACACCGATGGAATCGATCCAGATT
CCAGCAACAACGTCTGCATAGAAGACTCCTACATCTCAACAGGGGACGACCTAGTTGCCA
TCAAAAGCGGTTGGGACGATTACGGAATCGCTTTCGGCCGTCCAAGCTCAAACATAACGA
TCCGCCGCATCACAGGATCTTCTCCGTACGCAGGTATCGCAATAGGAAGCGAAACATCAG
GAGGAATCAAGAACATCGTAGCAGAACATATCAGTCTCTCCAATATGGGCATTGGAGTCA
ACATCAAGACAAACATTGGTCGTGGAGGATACATCAAAAACATCAAAATCTCTAACGTCT
ATGTTGAAAACGCAAAGTACGGGATCAAGATCGCTGGCGACACGGGAGATCACCCTGACG
CGTATTATAACCCGAACGCTCTTCCAGTCGTTAAAGGAATACATATTAATAACGTTTGGG
GGGTTAACGTTCAAAACGCCGGTTCCATTCAAGGCCTTAAGGGTTCACCTTTTACAGCGA
TATGTCTGAGTGAGATTAATCTACATGGAAGCTTTAACTCGTATCGCACGTGGAAGTGTT
CCGATGTTATTGGAACTTCGCTCAAAGTCAGCCCTTGGCCTTGTTCAGAGCTGAGAACTA
CCGGCGGATCATATTCGTGTTCTTCCACCTTCTGATGTTTT*CTATATAGTTTACCAAAA
AAAAATGTTTTT*CTATATATAAGTTT*GTATTTTCTAAATTTAAACTCATGAAATTAAT
TTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4DM32TF U 1
AF RR4G796TF U 321
AF RR4DE87TF U 866
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AF RR4A003TF U 1377
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TAAGGTACCGGAACGATAAGATCTCTATAACGGACTTTGGCGGCGTCGGGGACGGGAGGA
CGGTGAACACTAAGGCGTTTAGGGCGGCGATATATAGGATTCAGCATCTGAGGAGGAGAG
GAGGCACGGTTCTGTACATACCACCGGGAGTGTTTCTCACGGAGAGCTTCAGTCTCACCA
GCCATATGACTCTCTTCTTGGCCAGAGGCGCTGTTATCAAAGCCGTTCAGGATACATCAA
ATTGGCCATTGATTGATCCTTTGCCATCTTATGGAAGAGGGAGGGAGTTACCAGGGGCAC
GGTATATGAGCTTCATTCATGGTGATGGCCTTCGTGATGTAGTCATCACTGGACAAAACG
GGACAATAGACGGTCAAGGAGAAGTGTGGTGGAACATGTGGCGCAGCAGAACACTAAAGT
TCACTAGACCAAATCTAATCGAATTCAAGAACTCTAAGGAGATCATAATCTCCAATGTTA
TTTTCCAGAACTCACCCTTCTGGAACATTCACCCTGTCTATTGCAGTGATGTCGTCATCC
ATCACGTTACCATCTTAGC

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GCA
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CCATCTTATGGAAGAGGGAGGGAGTTACCAGGGGCACGGTATATGAGCTTCATTCATGGT
GATGGCCTTCGTGATGTAGTCATCACTGGACAAAACGGGACAATAGACGGTCAAGGAGAA
GTGTGGTGGAACATGTGGCGCAGCAGAACACTAAAGTTCACTAGACCAAATCTAATCGAA
TTCAAGAACTCTAAGGAGATCATAATCTCCAATGTTATTTTCCAGAACTCACCCTTCTGG
AACATTCACCCTGTCTATTGCAGTGATGTCGTCATCCATCACGTTACCATCTTAGCTCCA
CAAGATTCCCCCAACACCGATGGAATCGATCCAGATTCCAGCAACAACGTCTGCATAGAA
GACTCCTACATCTCAACAGGGGACGACCTAGTTGCCATCAAAAGCGGTTGGGACGAGTAC
GGAATCGCTTTCGGCCGTCCAAGCTCAAACATAACGATCCGCCGCATCACAGGATCTTCT
CCGTACGCAGGTATCGCAATAGGAAGCGAAACATCAGGAGGAATCAAGAACATCGTAGCA
GAACA

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DS 

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G
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TACGCAGGTATCGCAATAGGAAGCGAAACATCAGGAGGAATCAAGAACATCGTAGCAGAA
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GGATACATCAAAAACATCAAAATCTCTAACGTCTATGTTGAAAACGCAAAGTACGGGATC
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GTCGTTAAAGGAATACATATTAATAACGTTTGGGGGGTTAACGTTCAAAATGCCGGTTCC
ATTCAAGGCCTTAAGGGTTCACCTTTTACAGCGATATGTCCGAGTGAGATTAATCTACAT
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DS 

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G
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ACACGGGAGATCACCCTGACGCGTATTATAACCCGAACGCTCTTCCAGTCGTTAAAGGAA
TACATATTAATAACGTTTGGGGGGTTAACGTTCAAAACGCCGGTTCCATTCAAGGCCTTA
AGGGTTCACCTTTTACAGCGATATGTCTGAGTGAGATTAATCTACATGGAAGCTTTAACT
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DS 

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G
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CCAATATGGGCATTGGAGTCAACATCAAGACAAACATTGGTCGTGGAGGATACATCAAAA
ACATCAAAATCTCTAACGTCTATGTTGAAAACGCAAAGTACGGGATCAAGATCGCTGGCG
ACACGGGAGATCACCCTGACGCGTATTATAACCCGAACGCTCTTCCAGTCGTTAAAGGAA
TACATATTAATAACGTTTGGGGGGTTAACGTTCAAAACGCCGGTTCCATTCAAGGCCTTA
AGGGTTCACCTTTTACAGCGATATGTCTGAGTGAGATTAATCTACATGGAAGCTTTAACT
CGTATCGCACGTGGAAGTGTTCCGATGTTATTGGAACTTCGCTCAAAGTCAGCCCTTGGC
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QA 2 685 2 685
DS 

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CAAGACAAACATTGGTCGTGGAGGATACATCAAAAACATCAAAATCTCTAACGTCTATGT
TGAAAACGCAAAGTACGGTATCAAGATCGCTGGCGACACGGGAGATCACCCTGACGCGTA
TTATAACCCGAACGCTCTTCCAGTCGTTGAAGGAATACATATTAATAACGTTTGGGGGGT
TAACGTTCAAAACGCCGGTTCCATTCAAGGCCTTAAGGGTTCACCTTTTACAGCGATATG
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TGTTATTGGAACTTCGTTCAAAGTCAGCCCTTGGCCTTGTTCAGAGCTGAGAACTACCGG
CGGATCATATTCGTGTTCTTCCACCTTCTGATGTTTT*CTATATAGTTTACCAAAAAAA*
*TGTTTTT*CTATATATAAGTTT*GTATTTTCTAAATTTAAACTCATGAAATTAATTTA

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DS 

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G
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GTCCAAGCTCAAACATAACGATCCGCCGCATCACAGGATCTTCTCCGTACGCAGGTATCG
CAATAGGAAGCGAAACATCAGGAGGAATCAAGAACATCGTAGCAGAACATATCAGTCTCT
CCAATATGGGCATTGGAGTCAACATCAAGACAAACATTGGTCGTGGAGGATACATCAAAA
ACATCAAAATCTCTAACGTCTATGTTGAAAACGCAAAGTACGGGATCAAGATCGCTGGCG
ACACGGGAGATCACCCTGACGCGTATTATAACCCGAACGCTCTTCCAGTCGTTAAAGGAA
TACATATTAATAACGTTTGGGGGGTTAACGTTCAAAACGCCGGTTCCATTCAAGGCCTTA
AGGGTTCACCTTTTACAGCGATATGTCTGAGTGAGATTAATCTACATGGAAGCTTTAACT
CGTATCGCACGTGGAAGTGTTCCGATGTTATTGGAACTTCGCTCAAAGTCAGCCCTTGGC
CTTGTTCAGAGCTGAGAACTACCGGCGGATCATATTCGTGTTCTTCCACCTTCTGATGTT
TT*CTATATAGTTTACCAAAAAAAAATGTTTTT*CTATATATAAGTTT*GTATTTTCTAA
ATTTAAACTCATGAAATTAATTTA

QA 2 685 2 685
DS 



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GCTAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAA
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TCTGCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCT
CGTCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTC
AAAGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTTGGTGGATACAACTGGACG
TTACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTAC
GTTAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTATGCAGAGATCACA
TTCCTTACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAG
CGGTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTAC
AGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTGTTTGGTGTTGACATC
CTCGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAAACATTCGTGAC
CCTCTTTTCAACTGGAAGCTCATTAAATTCTCTACACGTAATCTTGACTCTTACACTTCT
GATTCGTTTTCTTCTGGAGGAAGAGACTGGGTGTTGAAAGTGTATCCCAACGGAGTTGGG
CATGCAACGGGCAATTCGCTGTCACTCTTTTTGTTAAGTGCGTCAAATGAAAAGGGTTAC
GTGAAAGCCAAGTTACGAGTTATTGACCAGATCCGGTCCAACCATTTGGAGAAACAAGTG
GAGGGATGGCCTAACGCAACGGAAAATGGATGGGGGTTTGAGAAGTTTATTTCTTTCGCA
GATCTCAAGGACTCAACCAAAGGTTTCATTGCTGATGATGCCATCAAGTTTGAAGTCGAG
ATCTTGTCCTTCTCTAAGACCGATACTCTCTAAAATGGTCACACGATCATTCTTATGTTG
TTGTTTTCCCCTGTTTTAACCGGAGATAGTGCGTTCGTAGAAACCAACACACTAATCTCT
GCCGCTATGTAATTCCACGGTGGCCTAGTGAATTAACGTCACTTTGGTTTACTGTTTGTC
TAATAATAACTTGTTGGAGCTTTCCTGTGCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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GCTAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAA
GAAGGATTCGTGGACGTCCTGAACTCAGGGAAACTTCCACGTCCCTTCAAAACATCTAGC
TCTGCTTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCT
CGTCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTC
AAAGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTTGGTGGATACAACTGGACG
TTACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTAC
GTTAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCTACCCACACGATGTGTATGCAGAGATCACA
TTCCTTACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4GI66TF 689 0 0
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GGCACGATCTTTGTTTACTTCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTC
GCTAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAA
GAAGGATTCGTGGACGTCCTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCTTCAAAACATCTAGC
TCTGCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCT
CGTCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTC
AAAGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTTGGTGGATACAACTGGACG
TTACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTAC
GTTAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTATGCAGAGATCACA
TTCCTTACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAG
CGGTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGT*ACTAC
AGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGA

QA 1 689 1 689
DS 

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GGCACGATCTTTGTTTACTTCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTC
GCTAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAA
GAAGGATTCGTGGACGTCCTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCTTCAAAACATCTAGC
TCTGCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCT
CGTCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTC
AAAGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTTGGTGGATACAACTGGACG
TTACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTAC
GTTAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTATGCAGAGATCACA
TTCCTTACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAG
CGGTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTAC
AGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACG*TGGACAAAGTGTGTTTGGTGTTGACATC
CTCGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4E423TF 737 0 0
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GGCACGATCTTTGTTTACTTCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTC
GCTAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAA
GAAGGATTCGTGGACGTCCTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCTTCAAAACATCTAGC
TCTGCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCT
CGTCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTC
AAAGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTTGGTGGATACAACTGGACG
TTACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTAC
GTTAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTATGCAGAGATCACA
TTCCTTACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAG
CGGTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTAC
AGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACG*TGGACAAAGTGTGTTTGGTGTTGACATC
CTCGTTGCTAACCCCTT

QA 1 737 1 737
DS 

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GGCTCGATCTTTGTCTACTGCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTC
GCTAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAA
GAAGGATTCGTGGACGTCCTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCTTCAAAACATCTAGC
TCTGCTTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCT
CGTCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTC
AAAGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTTGGTGGATACAACTGGACG
TTACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTAC
GTCAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTATGCAGAGATCACA
TTCCTTACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAG
CGGTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTAC
AGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTGTTTGGTGTTGACATC
CTCGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAAACATTCGTGAC
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4GI66JQ 710 0 0
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TGGTTACTACAGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTGTTTGG
TGTTGACATCCTCGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAAA
CATTCGTGACCCTCTTTTCAACTGGAAGCTCATTAAATTCTCTACACGTAATCTTGACTC
TTACACTTCTGATTCGTTTTCTTCTGGAGGAAGAGACTGGGTGTTGAAAGTGTATCCCAA
CGGAGTTGGGCATGCAACGGGCAATTCGCTGTCACTCTTTTTGTTAAGTGCGTCAAATGA
AAAGGGTTACGTGAAAGCCAAGTTACGAGTTATTGACCAGATCCGGTCCAACCATTTGGA
GAAACAAGTGGAGGGATGGCCTAACGCAACGGAAAATGGATGGGGGTTTGAGAAGTTTAT
TTCTTTCGCAGATCTCAAGGACTCAACCAAAGGTTTCATTGCTGATGATGCCATCAAGTT
TGAAGTCGAGATCTTGTCCTTTTCTAAGACCGATACTCTCTAAAATGGTCACACGATCAT
TCTTATGTTGTTGTTTTCCCCTGTTTTAACCGGAGATAGTGCGTTCGTAGAAACCAACAC
ACTAATCTCTGCCGCTATGTAATTCCACGGTGGCCTAGTGAATTAACGTC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4E423JQ 722 0 0
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GATTGGTTACTACAGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTGTT
TGGTGTTGACATCCTCGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGA
AAACATTCGTGACCCTCTTTTCAACTGGAAGCTCATTAAATTCTCTACACGTAATCTTGA
CTCTTACACTTCTGATTCGTTTTCTTCTGGAGGAAGAGACTGGGTGTTGAAAGTGTATCC
CAACGGAGTTGGGCATGCAACGGACAATTCGCTGTCACTCTTTTTGTTAAGTGCGTCAAA
TGAAAAGGGTTACGTGAAAGCCAAGTTACGAGTTATTGACCAGATCCGGTCCAACCATTT
GGAGAAACAAGTGGAGGGATGGCCTAACGCAACGGAAAATGGATGGGGGTTTGAGAAGTT
TATTTCTTTCGCAGATCTCAAGGACTCAACCAAAGGTTTCATTGCTGATGATGCCATCAA
GTTTGAAGTCGAGATCTTGTCCTTCTCTAAGACCGATACTCTCTAAAATGGTCACACGAT
CATTCTTATGTTGTTGTTTTCCCCTGTTTTAACCGGAGATAGTGCGTTCGTAGAAACCAG
CACACTAATCTCTGCCGCTATGTAATTCCACGGTGGCCTAGTGAATTAACGTCACTTTGG
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4GE25JQ 785 0 0
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AAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTACAGAGATCCAGGACAT
GGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTGTTTGGTGTTGACATCCTCGTTGCTAACCCC
TTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAAACATTCGTGACCCTCTTTTCAACTGG
AAGCTCATTAAATTCTCTACACGTAATCTTGACTCTTACACTTCTGATTCGTTTTCTTCT
GGAGGAAGAGACTGGGTGTTGAAAGTGTATCCCAACGGAGTTGGGCATGCAACGGGCAAT
TCGCTGTCACTCTTTTTGTTAAGTGCGTCAAATGAAAAGGGTTACGTGAAAGCCAAGTTA
CGAGTTATTGACCAGATCCGGTCCAACCATTTGGAGAAACAAGTGGAGGGATGGCCTAAC
GCAACGGAAAATGGATGGGGGTTTGAGAAGTTTATTTCTTTCGCAGATCTCAAGGACTCA
ACCAAAGGTTTCATTGCTGATGATGCCATCAAGTTTGAAGTCGAGATCTTGTCCTTTTCT
AAGACCGATACTCTCTAAAATGGTCACACGATCATTCTTATGTTGTTGTTTTCCCCTGTT
TTAACCGGAGATAGTGCGTTCGTAGAAACCAACACACTAATCTCTGCCGCTATGTAATTC
CACGGTGGCCTAGTGAATTAACGTCACTTTGGTTTACTGTTTGTCTAATAATAACTTGTT
GGAG
G

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4B022JQ 768 0 0
AGGAGACCGATGCGCAGCGGTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTC
TTGAGATTGGTTACTACAGAGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTG
TGTTTGGTGTTGACATCCTCGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACG
AAGAAAACATTCGTGACCCTCTTTTCAACTGGAAGCTCATTAAATTCTCTACACGTAATC
TTGACTCTTACACTTCTGATTCGTTTTCTTCTGGAGGAAGAGACTGGGTGTTGAAAGTGT
ATCCCAACGGAGTTGGGCATGCAACGGGCAATTCGCTGTCACTCTTTTTGTTAAGTGCGT
CAAATGAAAAGGGTTACGTGAAAGCCAAGTTACGAGTTATTGACCAGATCCGGTCCAACC
ATTTGGAGAAACAAGTGGAGGGATGGCCTAACGCAACGGAAAATGGATGGGGGTTTGAGA
AGTTTATTTCTTTCGCAGATCTCAAGGACTCAACCAAAGGTTTCATTGCTGATGATGCCA
TCAAGTTTGAAGTCGAGATCTTGTCCTTCTCTAAGACCGATACTCTCTAAAATGGTCACA
CGATCATTCTTATGTTGTTGTTTTCCCCTGTTTTAACCGGAGATAGTGCGTTCGTAGAAA
CCAACACACTAATCTCTGCCGCTATGTAATTCCACGGTGGCCTAGTGAATTAACGTCACT
TTGGTTTACTGTTTGTCTAATAATAACTTGTTGGAGCTTTCCTGTGCC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4EO28JQ 681 0 0
GACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTGTTTGGTGTTGACATCCTCGTTGCTA
ACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAAACATTCGTGACCCTCTTTTCA
ACTGGAAGCTCATTAAATTCTCTACACGTAATCTTGACTCTTACACTTCTGATTCGTTTT
CTTCTGGAGGAAGAGACTGGGTGTTGAAAGTGTATCCCAACGGAGTTGGGCATGCAACGG
GCAATTCGCTGTCACTCTTTTTGTTAAGTGCGTCAAATGAAAAGGGTTACGTGAAAGCCA
AGTTACGAGTTATTGACCAGATCCGGTCCAACCATTTGGAGAAACAAGTGGAGGGATGGC
CTAACGCAACGGAAAATGGATGGGGGTTTGAGAAGTTTATTTCTTTCGCAGATCTCAAGG
ACTCAACCAAAGGTTTCATTGCTGATGATGCCATCAAGTTTGAAGTCGAGATCTTGTCCT
TCTTTAAGACCGATACTCTCTAAAATGGTCACACGATCATTCTTATGTTGTTGTTTTCCC
CTGTTTTAACCGGAGATAGTGCGTTCGTAGAAACCAACACACTAATTTCTGCCGCTATGT
AATTCCACGGTGGCCTAGTGAATTAACGTCACTTTGGTTTACTGTTTGTCTAATAATAAC
TTGTTGGAGCTTTCCTGTGCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 2 11

CO CL370Contig1 859 7 28 U
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCAAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGAAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACATTCGACAAG
AACGGAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCAGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGACGAGTTCGAGTCGCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGAAACAGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACGTTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTTAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAGAGGTGATGGTTTTAGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTAGAGTTTAATATAAGAGTGTGTGTGTTTATTTGTGCTTGTGTTTCTTT
TTATGTGTAAATAATTTTTTTGATGATGCATCAAGTGTGTAATTTTTTTTCCTTTTTAGG
ATTTCTCTTAAGGTTATGT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 
45 45 45 45 30 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 20 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 5 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 15 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE21TF U 1
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AF RR4CX40TF U 1
AF RR4G704TF U 1
AF RR4CL67TF U 1
AF RR4CL67JQ C 118
BS 1 308 RR4CL67TF
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BS 801 819 RR4CL67TF
BS 820 859 RR4CL67JQ

RD RR4GE21TF 597 0 0
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCAAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTCTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
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GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAAC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4CR33TF 769 0 0
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCAAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTCTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCT*AGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
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TACATACCGGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
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GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTCA*TTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAG*TGATGGTTTTAGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTAGAGTTTAACATAAGAGTGTGTGTGTTTATTTGTGTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4CY68TF 785 0 0
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCAAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCCTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
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AACGGAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
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GATGGTGAAACAGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTCAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAAGTGATGGTTTTAGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTAGAGTTTA*CATA*GAGTGTGTGTGTT*ATTTGTG
TTCTTTTATGTGTAAAAA

QA 1 767 1 767
DS 

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AATCTCTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCT*AGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGCAAAACGGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACTTTCGACAAG
AACGTAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCGGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGAGGAGTTCGAGTCGCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGAAACAGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTCA*TTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAG*TGATGGTTT*AGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTAGAGTTTA

QA 1 740 1 740
DS 

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CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGAAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACATTCGACAAG
AACGGAGATGGTCGGATCACCAAGGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCAGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGACGAGTTCGAGTCTCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGAAACGGAGGAAGGGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACGTTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTTA*TTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAGAGGTGATGGTTTTAGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4CL67TF 819 0 0
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCAAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGAAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACATTCGACAAG
AACGGAGATGGTCGGATCACCAAGGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCAGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGACGAGTTCGAGTCTCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGAAACGGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGATGAGTTGAAGTTTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
G*TAAGACGTTAGAAAGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTTAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAGAGGTGATGGTTTTAGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTAGAGTT*AATATAAGAGTGTGTGTGTT*ATTTGTGCTTGTGTTTCTTT
T*ATGTGTAA*TAATTTT**TGATGATGCATCAAGTGTG

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4CL67JQ 742 0 0
TACAATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTC
TCTCTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCC
CCTGCTCCAACGAGAAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACATTCGAC
AAGAACGGAGATGGTCGGATCACCAAGGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGA
ATCTACATACCAGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGAT
GGATGCGTGGACATAGACGAGTTCGAGTCTCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCAC
AAGGATGGTGAAACGGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGAC
GGTGATGGGTTTATCACTGTGGATGAGTTGAAGTTTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAAC
CAAGGTAAGACGTTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGAT
GGTAGAGTTAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAGAGGTGATGGTTTTAGCTGCAGT
AACTGATCTTTATTTAGAGTTTAATATAAGAGTGTGTGTGTTTATTTGTGCTTGTGTTTC
TTTTTATGTGTAAATAATTTTTTTGATGATGCATCAAGTGTGTAATTTTTTTTCCTTTTT
AGGATTTCTCTTAAGGTTATGT

QA 1 742 1 742
DS 



CO CL370Contig2 802 4 11 U
AAGTTAGACTAATTACTAGTGACTGTATTGATAGGAAATGCTAAACAATCTACTAAAGAA
CACCAAACCAAATGTAATGAGAAAGAGAATCTTACATAACCTTAAGAGAAATCCTATAAA
GGAAAAAAAAATTACACACTTGATGCATCATCAAAAAAATTATTTACACATAAAAAGAAA
CACAAATAAACACACACACTCTTATGTTAAAACTCTAAATAAAGATCAGTTACTGCAGCT
AAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTGACTCTACCATCACCATC
AGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCC
CAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTC
AAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCCTCTGTTTCACCATCCTTGTGGTGCTC
ATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCCTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTT
GGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCCGGTATGTAGATTCCAAGATT
CTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTACGTTCTTGTCGAAAGT
CTGGAAAACACGTTTTAGCTCGGAAGGATCTGTTTTGCTCGTTGGAGCAGGGGACGATGA
TGGTGGAGGTGGAGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAGGAGAGAGAGAATAGACT
TCGCAGCTTCTTTGGTACTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY68JQ U 1
AF RR4CX40JQ U 55
AF RR4GE21JQ U 30
AF RR4CR33JQ U 55
BS 1 116 RR4CY68JQ
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BS 530 643 RR4CY68JQ
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BS 645 706 RR4CY68JQ
BS 707 723 RR4GE21JQ
BS 724 802 RR4CR33JQ

RD RR4CY68JQ 706 0 0
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QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4CX40JQ 628 0 0
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QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4GE21JQ 694 0 0
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ACTCTTTGTAATTGACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGC
AACCTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCT
CCACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCT
CTTCCTCTGTTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGA
ACTCCTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGA
GGTCTTTGTCCGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGG
TGATCCGACCGTCTCCGTTCTTGTCGAAAGTCTGGAAAACACGTTTTAGCTCGGAAGGAT
CTGTTTTGCTCGTTGGAGCAGGGGACGATGATGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4CR33JQ 748 0 0
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TATAAAGGAAAAAAAA*TTACACACTTGATGCATCATCAAAAAAATTATTTACACATAAA
AAGAAACACAAATAAACACACACACTCTTATGTTAAAACTCTAAATAAAGATCAGTTACT
GCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTGACTCTACCATC
ACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTACCTTGGTT
GAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCATCACCGTC
CTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCCTCTGTTTCACCATCCTTGTG
GTGCTCATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCCTCTATGTCCACGCATCCATC
ACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCCGGTATGTAGATTCC
AAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTACGTTCTTGTC
GAAAGTCTGGAAAACACGTTTTAGCTCGGAAGGATCCGTTTTGCTCGTTGGAGCAGGGGA
CGATGATGGTGGAGGTGGAGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAGGAGAGAGAGAA
TAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTACTAGG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 10

CO CL371Contig1 577 10 1 U
CTGGGGTGTAATACCACCCC**AAATTATTATATATAGATCTCATATCTTATGATCATGA
AACCTTTCAAAAATATATTTATTACAAACATAATTTAGAGAAATAAAAAATTGCTAGAAA
CCAGAAATAGCCATGAATATATAAATAGTTATTTGAGAAGTACGAATACTCATCTCCTCA
TTTCTTCTCGTTCATGCCAAGGCTGTTTTTAACACCATCGAAAGCACCCTGAGCCATGTT
CTTCACAGATTCACCGGTCTGACCGAGAAAACCAGTGGTTTGTTCCTGGCCATGTTGAGC
AGATGCGTGGGTGGAATGAGATGCATCTGCAGACTTGCTATGTGTTGATTGTGTCAAATT
GGCAGTCTTGTCACGTGCTGATAGTGCTGCATCTGCAGTCTTGTCACATGCTGATTGTGC
GGTCTGCTTGGCAGACTCAGTCCACTGCTCAGCCTTCTCTTGAGCATGGCCTCTGGTTTG
TCCAGCATTGAATGATTGTTGAGACATAATTGATGATTCAAAGAAGAGAAAAGGATACAA
AATATATTAGAGAGTAAGTTCTATCAGTTTTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 

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AF RR4BV73TF C 6
AF RR4A253JQ U 6
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G
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CC

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GCTGCATCTGCAGTCTTGTCACATGCTGATTGTGCGGTCTGCTTGGCAGACTCAGTCCAC
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AGTTTTGATTCC

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TCTCGTTCATGCCAAGGCTGTCTTTAACACCATCGAAAGCACCCTGAGCCATGTTCTTCA
CAGATTCACCGGTCTGACCGAGAAAACCAGTGGTTTGTTCCTGGCCATGTTGAACAGATG
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TCTCGTTCATGCCAAGGCTGTTTTTAACACCATCGAAAGCACCCTGAGCCATGTTCTTCA
CAGATTCACCGGTCTGACCGAGAAAACCAGTGGTTTGTTCCTGGCCATGTTGAACAGATG
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ATTAGAGAGTAAGTTCTATCAGTTTTGATTCC

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GG
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TCGTTCATGCCAAGGCTGTCTTTAACACCATCGAAAGCACCCTGAGCCATGTTCTTCACA
GATTCACCGGTCTGACCGAGAAAACCAGTGGTTTGTTCCTGGCCATGTTGAACAGATGCG
TGGGTGGAATGAGATGCATCTGCAGACTTGCTATGTGTTGATTGTGTCAAATTGGCAGTC
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TTGAATGATTGTTGAGACATAATTGATGATTCAAAGAAGAGAAAAGGATACAAAATATAT
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QA 3 572 3 572
DS 



AS 2 11

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H894TF U 81
AF RR4DJ67JQ C 1
AF RR4H894JQB C 5
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TGGTTATGA
CG

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DS 

RD RR4DJ67TF 637 0 0
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GATATTTGGTTATG

QA 1 614 1 614
DS 



CO CL372Contig2 631 4 2 U
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CGGAAGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGCAGATA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTG
AGGAGGAGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTGTTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGATGAAGAAACAATATGTGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAAA
AGATTACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGATATTT
GGTTATGATGAAATGATATATTTGGGAGTTC


BQ
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C

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C006TF U 1
AF RR4D787TF U 1
AF RR4DL20TF U 203
AF RR4FC57TF U 450
AF RR4CE92TF U 634
AF RR4FC57JQ C 887
AF RR4EI65JQ C 597
AF RR4DL20JQ C 641
BS 1 48 RR4C006TF
BS 49 52 RR4D787TF
BS 53 506 RR4C006TF
BS 507 507 RR4D787TF
BS 508 643 RR4C006TF
BS 644 644 RR4D787TF
BS 645 674 RR4C006TF
BS 675 675 RR4DL20TF
BS 676 684 RR4C006TF
BS 685 685 RR4DL20TF
BS 686 718 RR4C006TF
BS 719 888 RR4DL20TF
BS 889 889 RR4FC57TF
BS 890 933 RR4DL20TF
BS 934 1014 RR4FC57TF
BS 1015 1015 RR4CE92TF
BS 1016 1096 RR4FC57TF
BS 1097 1280 RR4CE92TF
BS 1281 1281 RR4EI65JQ
BS 1282 1293 RR4CE92TF
BS 1294 1318 RR4EI65JQ
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BS 1320 1342 RR4EI65JQ
BS 1343 1430 RR4DL20JQ

RD RR4C006TF 718 0 0
GGGTGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTCTCTCTCTCTCTCT****ACAGCTCC
TTGATTATTCTCCCTCTCTGGTAATATCTGAATCTAATCGATCTTCTTCGCGAGCTCCAT
TTTCAACCAGCGATTCGTTTTCTCTCTGAGTTGAAGAAACAACCATAAGTTTTCAAAATG
TCACCGGAAGAGAAGCTACAGAGCAATGTCTCTGATGGAGGACTGAAGGAGCATAACTAC
TTGGGTCTCTCTGACTGTTCCTCTGTTGGAAGCTCAAATCTCTCCGGCCTTGCAGATGAT
GACAAAGCCACTATCAGCCTCAAGGCCACTGAGCTCACACTTGGCCTTCCTGGATCACAG
TCTCCTCCTCGAGACAACACCGAGCTCAACTTACTTGGCCCGGCTAAGCTCGATGAGAAG
CCTTTCTTTCCTTTGCTTCCTTCCAAGGATGAGATAAGCTGCTCCTCTTCTCAGAAGAAC
ATTGCCTCGGGGAACAAAAGAGGCTT*TCTGACACTATGGATAAGTTCTCTGAAGCTAAA
GTCTCTGTTTATTCTGAGAAAAACTGGATGTTTCCTGAAGCGGTGGTAGCCAACCAATCT
GTTGTGAAGAAGGAAGTGCCACAGAACATTCCTAAAGGAAAGCGGAGCACTACAAACAAT
AGCTCTAGCCCACCCGCGGCCAAG*CACAGATTGTTGGTTGGCCTCCAGTGAGATCCT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4D787TF 674 0 0
GGGTGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGCTCC
TTGATTATTCTCCCTCTCTGGTAATATCTGAATCTAATCGATCTTCTTCGCGAGCTCCAT
TTTCAACCAGCGATTCGTTTTCTCTCTGAGTTGAAGAAACAACCATAAGTTTTCAAAATG
TCACCGGAAGAGAAGCTACAGAGCAATGTCTCTGATGGAGGACTGAAGGAGCATAACTAC
TTGGGTCTCTCTGACTGTTCCTCTGTTGGAAGCTCAAATCTCTCCGGCCTTGCAGATGAT
GACAAAGCCACTATCAGCCTCAAGGCCACTGAGCTCACACTTGGCCTTCCTGGATCACAG
TCTCCTCCTCGAGACAACACCGAGCTCAACTTACTTGGCCCGGCTAAGCTCGATGAGAAG
CCTTTCTTTCCTTTGCTTCCTTCCAAGGATGAGATAAGCTGCTCCTCTTCTCAGAAGAAC
ATTGCCTCGGGGAACAAAAGAGGCTTCTCTGACACTATGGATAAGTTCTCTGAAGCTAAA
GTCTCTGTTTATTCTGAGAAAAACTGGATGTTTCCTGAAGCGGTGGTAGCCAACCAATCT
GTTGTGAAGAAGGAAGTGCCACAGAACATTCCTAAAGGAAAGCAGAGCACTACAAACAAT
AGCTCTAGCCCACC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4DL20TF 731 0 0
GCAATGTCTCTGATGGAGGACTGAAGGAGCATAACTACTTGGGTCTCTCTGACTGTTCCT
CTGTTGGAAGCTCAAATCTCTCCGGCCTTGCAGATGATGACAAAGCCACTATCAGCCTCA
AGGCCACTGAGCTCACACTTGGCCTTCCTGGATCACAGTCTCCTCCTCGAGACAACACCG
AGCTCAACTTACTTGGCCCGGCTAAGCTCGATGAGAAGCCTTTCTTTCCTTTGCTTCCTT
CCAAGGATGAGATAAGCTGCTCCTCTTCTCAGAAGAACATTACCTCGGGGAACAAAAGAG
GCTTCTCTGACACTATGGATAAGTTCTCTGAAGCTAAAGTCTCTGTTTATTCTGAGAAAA
ACTGGATGTTTCCTGAAGCGGTGGTAGCCAACCAATCTGTTGTGAAGAAGGAAGTGCCAC
AGAACATTCCTAAAGGAAAGCAGAGCACTACAAACAATAGCTCTAGCCCGCCTGCGGCCA
AGGCACAGATTGTTGGTTGGCCTCCAGTGATATCCTACAGGAAGAACACATTGGCCACCA
CTTGTAAGAACAGTGATGAAGTTGATGGGAAGCCAGGTTCTGGGCCCCTCTTTGTGAAGG
TCAGTATGGATGGTGCTCCATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTATG
GAGAGCTTTCTGCAGCCTTGGAGAAA*TGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGAT
CTAGCGGAGCT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4FC57TF 647 0 0
G
GAGATAAGCTGCTCCTCTTCTCAGAAGAACATTGCCTCGGGGAACAAAAGAGGCTTCTCT
GACACTATGGATAAGTTCTCTGAAGCTAAAGTCTCTGTTTATTCTGAGAAAAACTGGATG
TTTCCTGAAGCGGTGGTAGCCAACCAATCTGTTGTGAAGAAGGAAGTGCCACAGAACATT
CCTAAAGGAAAGCAGAGCACTACAAACAATAGCTCTAGCCCACCTGCGGCCAAGGCACAG
ATTGTTGGTTGGCCTCCAGTGAGATCCTACAGGAAGAACACATTGGCCACCACTTGTAAG
AACAGTGATGAAGTTGATGGGAAGCCAGGTTCTGGGCCCCTCTTTGTGAAGGTCAGTATG
GATGGTGCTCCATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTATGGAGAGCTT
TCTGCAGCCTTGGAGAAAATGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGATCTAGCGGA
GCTACAGGGAAAGATGTGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATCTTCTGAATGGAAAGGAC
TATGTGCTCACCTATGAGGACAAG*ATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGATTTCTCATGG
GAGATATTTATTGGTGTCTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAAAGGCT

QA 2 647 2 647
DS 

RD RR4CE92TF 664 0 0
GG
AGGAAGGCAGAGCACTACAAACAATAGCTCTAGCCCACCTGCGGCCAAGGCACAGATTGT
TGGTTGGCCTCCAGTGAGATCCTACAGGAAGAACACATTGGCCACCACTTGTAAGAACAG
TGATGAAGTTGATGGGAAGCCAGGTTCTGGGCCCCTCTTTGTGAAGGTCAGTATGGATGG
TGCTCCATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTATGGAGAGCTTTCTGC
AGCCTTGGAGAAAATGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGATCTAGCGGAGCTAC
AGGGAAAGATGTGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATCTTCTGAATGGAAAGGACTATGT
GCTCACCTATGAGGACAAGGATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGATTTCTCATGGGAGAT
ATTTATTGGTGTCTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAA*GGCTCTGATGCCATTGGGTTAGC
TGCAGCTCCAGCACCAAGAACTATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCTTAAAAGACTTTGTT
GGAAAATGGATGATTCAGAAGCTTTCTAATTATTACTAAATATGTGCAATTCCCTTTTGG
TGGTGTTTTAAATCAAAGCATTCTACATCTTTAGCTTCTGAGATA*TTATTATTAAGA
GAAA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4FC57JQ 415 0 0
AAATGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGATCTAGCGGAGCTACAGGGAAAGATG
TGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATCTTCTGAATGGAAAGGACTATGTGCTCACCTATG
AGGACAAGGATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGATTTTTCATGGGAGATATTTATTGGTG
TTTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAAAGGCTCTGATGCCATTGGGTTAGCTGCAGCTCCAG
CACCAAGAACTATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCTTAAAAGACTTTGTTGGAAAATGGAT
GATTCAGAAGCTTTCTAATTATTACTAAATATGTGCAATTCCCTTTTGGTGGTGTTTTAA
ATCAAAGCATTTTACATCTTTAGCTTTTGAGATAATTATTATTAAGAAAAAAAAA

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4EI65JQ 746 0 0
ATCTGTTGTGAAGAAGGAAGTGCCACAGAACATTCCTAAAGGAAAGCAGAGCACTACAAA
CAATAGCTCTAGCCCACCTGCGGCCAAGGCACAGATTGTTGGTTGGCCTCCATTGAGATC
CTACAGGAAGAACACATTGGCCACCACTTGTAAGAACAGTGATGAAGTTGATGGGAAGCC
AGGTTCTGGGCCCCTCTTTGTGAAGGTCAGTATGGATGGTGCTCCATATCTGAGGAAAGT
TGACCTGAGGAGCTACAACAACTATGGAGAGCTTTCTGCAGCCTTGGAGAAAATGTTCAG
CACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGATCTAGCGGAGCTACAGGGAAAGATGTGCGTAATGA
GACCAGACTCAAGGATCTTCTGAATGGAAAGGACTATGTGCTCACCTATGAGGACAAGGA
TGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGATTTCTCATGGGAGATATTTATTGGTGTCTGCAAGAA
GCTCAAGATAATGAAAGGCTCTGATGCCATTGGGTTAGCTGCAGCTCCAGCACCAAGAAC
TATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCTTAAAAGACTTTGTTGGAAAATGGATGATTCAGAAG
CTTTCTAATTATTACTAAATATGTGCAATTCCCTTTTGGTGGTGTTTTAAATCAAAGCAT
TCTACATCTTTAGCTTCTGAGATAATTATTATTAAGAAGAAAAAAAAAAGACTTCGTTTG
TAGGGAAATGAAGAAGAATTTAAATT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4DL20JQ 790 0 0
AGCAGAGCACTACAAACAATAGCTCTAGCCCGCCTGCGGCCAAGGCACAGATTGTTGGTT
GGCCTCCAGTGATATCCTACAGGAAGAACACATTGGCCACCACTTGTAAGAACAGTGATG
AAGTTGATGGGAAGCCAGGTTCTGGGCCCCTCTTTGTGAAGGTCAGTATGGATGGTGCTC
CATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTATGGAGAGCTTTCTGCAGCCT
TGGAGAAAATGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGATCTAGCGGAGCTACAGGGA
AAGATGTGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATCTTCTGAATGGAAAGGACTATGTGCTCA
CCTATGAGGACAAGGATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGATTTCTCATGGGAGATATTTA
TTGGTGTCTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAAAGGCTCTGATGCCATTGGGTTAGCTGCAG
CTCCAGCACCAAGAACTATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCTTAAAAGACTTTGTTGGAAA
ATGGATGATTCAGAAGCTTTCTAATTATTACTAAATATGTGCAATTCCCTTTTGGTGGTG
TTTTAAATCAAAGCATTCTACATCTTTAGCTTCTGAGATAATTATTATTAAGAAGAAAAA
AAAA*GACTTCGTTTGTAAGGAAATGAAGAAGAATTTAAATTATCTGTTTTCTTTTTTTG
TTTTTGTTGCTTCTTGCTTTAGTCGAACCAAGTAACTCTGGAGTCTGGTCTATGTTTGGT
TTTTGATTTC

QA 1 790 1 790
DS 



CO CL373Contig2 600 2 1 U
GGGATGATAATAAAGCTTTTGCGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTTTGTGAAG
GTCAGTATGGATGGTGCTCCATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTAT
GGAGAGCTTTCTGTAGCCTTGGAGAAAATGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGA
TCTAGCGGAGCTACAGGGAAAGATGTGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATCTTCTGAAT
GGAAAGGACTATGTGCTCACCTATGAGGACAAGGATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGAT
TTCTCATGGGAGATATTTATTGGTGTCTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAAAGGCTCTGAT
GCCATTGGGTTAGCTGCAGCTCCAGCACCAAGAACTATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCT
TAAAAGACTTTGTTGGAAAATGGATGATTCAGAAGCTTTCTAATTATTACTAAATATGTG
CAATTCCCTTTTGGTGGTGTTTTAAATCAAAGCATTCTACATCTTTAGCTTCTGAGATAA
TTATTATTAAGAAGAAAAAAAAAGACTTCGTTTGTAAGGAAATGAAGAAGAATTTAAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FA15JQ C 1
AF RR4FA15TF U 1
BS 1 600 RR4FA15TF

RD RR4FA15JQ 600 0 0
GGGATGATAATAAAGCTTTTGCGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTTTGTGAAG
GTCAGTATGGATGGTGCTCCATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTAT
GGAGAGCTTTCTGTAGCCTTGGAGAAAATGTTCAGCACTTTCACTTTCGGTCAACCTGGA
TCTAGCGGAGCTACAGGGAAAGATGTGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATTTTTTGAAT
GGAAAGGACTATGTGCTCACCTATGAGGACAAGGATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGAT
TTTTCATGGGAGATATTTATTGGTGTCTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAAAGGCTCTGAT
GCCATTGGGTTAGCTGCAGCTCCAGCACCAAGAACTATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCT
TAAAAGACTTTGTTGGAAAATGGATGATTCAGAAGCTTTCTAATTATTACTAAATATGTG
CAATTCCCTTTTGGTGGTGTTTTAAATCAAAGCATTCTACATCTTTAGCTTTTGAGATAA
TTATTATTAAGAAGAAAAAAAAAGACTTCGTTTGTAAGGAAATGAAGAAGAATTTAAATT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4FA15TF 600 0 0
GGGATGATAATAAAGCTTTTGCGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTTTGTGAAG
GTCAGTATGGATGGTGCTCCATATCTGAGGAAAGTTGACCTGAGGAGCTACAACAACTAT
GGAGAGCTTTCTGTAGCCTTGGAGAAAATGTTCAGCACTTTCACTCTCGGTCAACCTGGA
TCTAGCGGAGCTACAGGGAAAGATGTGCGTAATGAGACCAGACTCAAGGATCTTCTGAAT
GGAAAGGACTATGTGCTCACCTATGAGGACAAGGATGGGGACTGGATGCTTGTTGGCGAT
TTCTCATGGGAGATATTTATTGGTGTCTGCAAGAAGCTCAAGATAATGAAAGGCTCTGAT
GCCATTGGGTTAGCTGCAGCTCCAGCACCAAGAACTATGGAGAAATCGAAGATGAGAGCT
TAAAAGACTTTGTTGGAAAATGGATGATTCAGAAGCTTTCTAATTATTACTAAATATGTG
CAATTCCCTTTTGGTGGTGTTTTAAATCAAAGCATTCTACATCTTTAGCTTCTGAGATAA
TTATTATTAAGAAGAAAAAAAAAGACTTCGTTTGTAAGGAAATGAAGAAGAATTTAAATT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 10

CO CL374Contig1 1259 10 23 U
GGATTTGAAAGTATCTGAGAATCAATTAAAAGAAGTTTTTTCATACTTTCTTATTTATTC
AAACAAGGAGAAGAAAGCACCATAGTCCATAAAGACCAACAGAAAATAAATAAAACACAC
TTGCTTAAAACCACCAAATCTTAGTTCATAATCTAGTTGGGAGGAGGGAAGAAAATGGCA
TCAGAAGTCCTCTTAGATCGGAAAGCCTTCTCCACCTCCGGAGCAACCTTAAACGCCGCC
TGCAGAACCTCCGGCGACAATGCCTTCCAAACAGATGTCTTGCCCGCCAAGTGAGTGAAA
ATGGGATCAGGAGTGGTCACAATGGAGAACCAAGACAAGCCATCAGAATCAGCAATTTTG
GAGACAACAAAGAACCTAGGAACAATGAATAAAGCACCAGCTTTCACATGAGTCTCAAGA
ACTCTCTTCCCATCAGCTCCAACCACCTGAACACGACCGCTACCACCAACAATGTAAGTA
ACTTGAAGAGCAGAGTCACAAGAGAATCCAGGAGAACACATGGAATGTCCATCGATCCTC
ACAAGATCAGCACCAAATCCAACTTCACCAACCAATGGAAGATTCTTTGTGTTCAACACA
ACAACTCTTCCCCCATCCTTGATATCAACATCAAGAGGAGCCTCCAAGCAGTTCAGCACA
AACCCTT*CCCTGTCACCTTTCCTAGGCGAAGGCATTTTCAAACTCCCATCAACTTTGAC
GATCCCGTTCCCTGTCTGAGATCCGACAAGCTTCTTCACTGTTGTCTCATCGAGATCCCA
TGCTCTGCCTACAAACTCGGATGAGAAACCGATGAAGATTCCATTGGAACCGGTTAAGTA
AAACTCGGTGAACTGTCCTGCTTTGTGACCCTTGTGAGTCTCACCAAGGAAGAGGATGAC
CAGCTCAGTGTCTTCGTTGTTGAACCACCATGTCACTACACCGAAAGGTATAGCTATGGA
ATCTCCTTTCTTGATTTCAATCACTTTCTCTTCTTTCTCAGGGAGAACAATTCCAGCTGT
TCCAGATCCTTGAAGAACGTAGGCGACCTTGGAGGAATCAGAGTAGCGAGGAAGAGCTAA
GCCATACTTCTCGAGAGCGAGCTTCGCGGCTCCAATGTTGCCATCACGTAGCATGGGTAA
CTCTTCAGGGCACCATGCAAAGTATGAACCTCCGTCTCCTCCGTACACTTTCTTCGGTAG
TCTAGGTGAAAGATCCAACTCCATCGTTAAACGCTAAATGAAAACGGTGAAAGAATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 25 40 20 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BS67JQ U 42
AF RR4BS67TF C 42
AF RR4CK65JQ U 23
AF RR4DN83JQ U 42
AF RR4BV91JQ U 1
AF RR4H171JQ U 7
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AF RR4CK65TF C 491
AF RR4H171TF C 621
AF RR4BV91TF C 614
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BS 821 833 RR4BR90JQ
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C

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DS 

RD RR4BS67TF 323 0 0
CG
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AAATAAATAAAACACACTTGCTTAAAACCACCAAATCTTAGTTCATAATCTAGTTGGAAG
GAGGGAAGAAAATGGCATCAGAAGTCCTCTTAGATCGGAAAGCCTTCTCCACCTCCGGAG
CAACCTTAAACGCCGCCTGCAGAACCTCCGGCGACAATGCCTTCCAAACAGATGTCTTGC
CCGCCAAGTGAGTGAAAATGGGATCAGGAGTGGTCACAATGGAGAACCAAGACAAGCCAT
CAGAATCAGCAATTTTGGAG
C

QA 3 322 3 322
DS 

RD RR4CK65JQ 658 0 0
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TATCAACATCAAGAGGAGCCTCCAAGCAGTTCAGCACAAACCCAT*CCCTGTCACCTT

QA 1 658 1 658
DS 

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AGCAACCTTAAACGCCGCCTGCAGAACCTCCGGCGACAATGCCTTCCAAACAGATGTCTT
GCCCGCCAAGTGAGTGAAAATGGGATCAGGAGTGGTCACAATGGAGAACCAAGACAAGCC
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TGCAGAACCTCCGGCGACAATGCCTTCCAAACGGATGTCTTGCCCGCCAAGTGAGTGAAA
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ACAACTCTTCCTCCATCCTTGATATCAACATCAAGAGGAACCTCCAAGCAGTTCAGCACA
AACCCTT*CCCTGTCACCTTTCCTAGGCGAAGGCATTTTCAAACTCCCATCAATTTTGAC
GATCCCGTTCCCTGTCTGAGATCCGACAAGCTTCTTCACTGTTGTCTCATCGAGATCCCA
TGCTCT

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GG
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AACCACCAAATCTTAGTTCATAATCTAGTTGGGAGGAGGGAAGAAAATGGCATCAGAAGT
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CTCCGGCGACAATGCCTTCCAAACAGATGTCTTGCCCGCCAAGTGAGTGAAAATGGGATC
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CCCTGTCACCTTTCCTAGGCGAAGGCATTTTCAAACTCCCATCAACTTTGACGATCCCGT
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CTACAAACTCGGATGAGAA

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DS 

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AAGCCTTCTCCACCTCCGGAGCAACCTTAAACGCCGCCTGCAGAACC**CGGCGACAATG
CCTTCCAAACAGATGTCTTGCCCGCCAAGTGAGTGAAAATGGGATCAGGAGTGGTCACAA
TGGAGAACCAAGACAAGCCATCAAAATCAGCAATTTTGGAGACAACAAAGAACCTAGGAA
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CCACCTGAACACGACCGCTACCACCAACAATGTAAGTAACTTGAAGAGCAAAGTCACAAG
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CTTCACCAACCAATGGAAGATTCTTTGTGTTCAACACAACAACTCTTCCCCCATCCTTGA
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CCGACAAGCTTCTTCACTGTTGTCTCATCGAGATCCCATGCTCTGCCTACAAACTCGGAT
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DS 

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TGAACCACCATGTCACTACACCGAAAGGTATAGCTATGGAATCTCCTTTCTTGATTTCAA
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AGTATGAACCTCCGTCTCCTCCGTACACTTTCTTCGGTAGTCTAGGTGAAAGATCCAACT
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QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4BV91TF 646 0 0
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AGAGCGAGCTTCGCGGCTCCAATGTTGCCATCACGTAGCATGGGTAACTCTTCAGGGCAC
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TCCAACTCCATCGTTAAACGCTAAATGAAAACGGTGAAAGAATGAT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 3 9

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GAGGAACTATCTCTGCCAAAGCGCGATAGATGCAGCTGAACAAGGGGACTTCTCAGAGGT
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TGCTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGACCAGGCGTCTGCATGCTCTCTTGCTCCTC
CTAGTTCTTCTCCTTTCCTACTTTTGTTTTTTCCCTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACTAA
AAACACTCTTTATATGTGTGTGGTTTTGTAATGCATTACATTTGACAAGAAAAGTTATAT
GTTTTCAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4AQ38JQ C 1
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BS 703 729 RR4AQ38JQ

RD RR4AQ38TF 702 0 0
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CTAGTTCTTCTCCTTTCCTACTTTTGTTTTTTCCCTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACTAA
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DS 

RD RR4AQ38JQ 729 0 0
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GAGGAACTATTTCTGCCAAAGCGCGATAGATGCAGCTGAACAAGGGGACTTCTCAGAGGT
CAACAACTTGATCCGTCTCATGAAAAATCCTTACGAGGAACAGCCAGGGATGGAGAAATA
TGCTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGACCAGGCGTCTGCATGCTCTCTTGCTCCTC
CTAGTTCTTCTCCTTTCCTACTTTTGTTTTTTCCCTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACTAA
AAACACTCTTTATATGTGTGTGGTTTTGTAATGCATTACATTTGACAAGAAAAGTTATAT
GTTTTCAGG

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL375Contig2 1047 4 14 U
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CGACCCGTGTCCAGATCACAATCGGCAACTGCTAGACCCGTCGTCGCGATGAGCACCACC
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ATTAGCTGCAAGTCTCTCAATGAAGTTGACACTTCTAAAATCTTGTCTAAGATTTTACAA
CAATCTGATTCAGATACAATGGCACGGAAAAAGCTATATGTCCCATGGGTAGAGGATAAG
AACAGTAACATGCGTATGCTTCACATATCTCATATGGATGATCTTATTGCAAACTCTATT
AACATTTTGGAACCAGCTCCAGTTGGTGCTCAAGGGAATGAGCGTGAAGATGTGTTGCAA
GCAGATGAACCAATCGATCTATTCATCTTGCCAGGGCTTGCGTTTGACAGATGTGGGCGA
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TCTGGAGATGAAGCTCAGATCACTCTGTTTGTTGGCGCTTGAAGGTTGCATTTTGGATTT
TACCAATTCAGCATCTGCATCTGACGTCGCCAGTTAATGTTTTTACTAAACTCGAGTCGA
ATGTTCTTGAGTGATGAGATATGAAAGACGTTGAAAACAAAGATTGTTTAGTGTCACCCG
TTCATTTAATATACAATAAGCTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP57TF U 1
AF RR4F363TF U 10
AF RR4CT36JQ C 278
AF RR4BP57JQ C 348
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RD RR4BP57TF 639 0 0
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CGTTTAG*CCGTGGGGGTGGCTACTACGACACTTTCTTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4F363TF 767 0 0
GTCTTTTC
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CGAAGCTCCTTGGTTCAAATCAAGCCAGGGACTGTGTGCTTACATTAGCTGCAAGTCTCT
CAATGAAGTTGACACTTCTAAAATCTTGTCTAAGATTTTACAACAATCTGATTCAGATAC
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TGTA*CACCAAATGATGTTCTGATCGATGCCCTTGTGAC

QA 9 767 9 767
DS 

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CTTGAAGGTTGCATTTTGGATTTTACCAATTCAGCATCTGCATCTGACGTCGCCAGTTAA
TGTTTTTACTAAACTCGAGTCGAATGTTCTTGAGTGATGAGATATGAAAGACGTTGAAAA
CAAAGATTGTTTAGTGTCACCCGTTCATTTAATATA
CAATAAGCTTTTAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4BP57JQ 700 0 0
TAAGATTTTACAACAATCTGATTCAGATACAATGGCACGGAAAAAGCTATATGTCCCATG
GGTAGAGGATAAGAACAGTAACATGCGTATGCTTCACATATCTCATATGGATGATCTTAT
TGCAAACTCTATTAACATTTTGGAACCAGCTCCAGTTGGTGCTCAAGGGAATGAGCGTGA
AGATGTGTTGCAAGCAGATGAACCAATCGATCTATTCATCTTGCCAGGGCTTGCGTTTGA
CAGATGTGGGCGACGTTTAGGCCGTGGGGGTGGCTATTACGACACTTTCTTGAAGAGGTA
CCAGGACCGTGCAAAGGAGATGGGCTGGAACTATCCACTTAAGGTTGCATTGTCATATTC
ACCTCAGATTCTTGAGGACGGAAGTATTCCTGTAACACCAAATGATGTTCTGATCGATGC
CCTTGTGACACCTTCTGGTGTGGTTCCCATTAGTCCTCGTGCTATCGAGAGAATGTGAGC
TCAGGAGCTTGTGTCTGGAGATGAAGCTCAGATCACTCTGTTTGTTGGCGCTTGAAGGTT
GCATTTTGGATTTTACCAATTCAGCATCTGCATCTGACGTCGCCAGTTAATGTTTTTACT
AAACTCGAGTCGAATGTTCTTGAGTGATGAGATATGAAAGACGTTGAAAACAAAGATTGT
TTAGTGTCACCCGTTCATTTAATATACAATAAGCTTTTAC

QA 1 700 1 700
DS 



CO CL375Contig3 1004 3 2 U
ATTCTTATATGAAACGAACGGGTGACATTAAACAAACTTGTTTTTCAACGTCTTTCATAT
CTCATCATTCAAGAACATTCCACTCGAGTTTAGTAAAATCATTAACTGGCGACGTCAGAT
GCTGGATTGGCAAAATCCAAGCGCCAGTAAACAGAGTGATCTGAGCCTCATCTCCAAACA
CAAGCTCCTGAGCTCACATTCTCTCGATAGCACGAGGACTAATGGGAACCACACCAGAAG
GTGTCACAAGGGCATCGATCAGGACATCATTTGCTGTTACAGGAATACTTCCGTCCTCAA
GAATCTGAGGTGAATATGGCAATGCAACCTTAAGTGGATTACTCCAGCCCTTCTCCTTTG
CACGGTCCTGGTACCTCTTCAAGAAAGTGTCGTAATAGCCACCTCCACGGCCTAAACGTC
GCCCACATCTGTCAAACGCAAGCCCTGGCAAGATGAATAGATCGATTGGTTCATCTGCTT
GTAACACATCTTCACGCTCAATCCCTTGAGCATCAACTGGAGCTGGTTCCAAAATGTTCA
TAGAGTTTGCAATAAGATCATCCATATGAGATATGTGAAGCATACGCATGTTACTGTTCT
TATCCTCTACCCAGGGAACATATAGCTTTTTCTGTGCCATTGTATCTGGATCAGGTTGTT
GTAAAATCTTAGACAAGATTTTAGAAGTGTCAACTTCATTGAGAGACTTGCAGCTAATGT
AAGCACACAGTCTCTGGCTTGATTTGAACCAAGGAGCTTCGAGAACAGTGCTTTGAATGG
CATCATCTTGTTGGATTCGGAGGGAAGGGTCCAAGGCTTTAAGAGATTTGCGGACGGTGG
AACGCACAATCTTTTTCTGCTTGAAAATGGAATCGAGCTCCTCTTGACTTTTGCTGGTGG
TGGTGCTCATGGTGACGACGGATCTAGCAGTTGCCGATTGTAATCTGGACACGGGTCGGG
TCAAGATCCTGGGGAAGAGGAAGATTGATGTCCTAGTGATACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH13JQ U 1
AF RR4CT05JQ U 1
AF RR4CH13TF C 296
BS 1 747 RR4CH13JQ
BS 748 1004 RR4CH13TF

RD RR4CH13JQ 747 0 0
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GCTGGATTGGCAAAATCCAAGCGCCAGTAAACAGAGTGATCTGAGCCTCATCTCCAAACA
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GCCCACATCTGTCAAACGCAAGCCCTGGCAAGATGAATAGATCGATTGGTTCATCTGCTT
GTAACACATCTTCACGCTCAATCCCTTGAGCATCAACTGGAGCTGGTTCCAAAATGTTCA
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AAGCACACAGTCTCTGGCTTGATTTGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4CT05JQ 745 0 0
ATTCTTATATGAAACGAACGGGTGACATTAAACAAACTTGTTTTTCAACGTCTTTCATAT
CTCATCATTCAAGAACATTCCACTCGAGTTTAGTAAAATCATTAACTGGCGACGTCAGAT
GCTGGATTGGCAAAATCCAAGCGCCAGTAAACAGAGTGATCTGAGCCTCATCTCCAAACA
CAAGCTCCTGAGCTCACATTCTCTCGATAGCACGAGGACTAATGGGAACCACACCAGAAG
GTGTCACAAGGGCATCGATCAGGACATCATTTGCTGTTACAGGAATACTTCCGTCCTCAA
GAATCTGAGGTGAATATGGCAATGCAACCTTAAGTGGATTACTCCAGCCCTTCTCCTTTG
CACGGTCCTGGTACCTCTTCAAGAAAGTGTCGTAATAGCCACCTCCACGGCCTAAACGTC
GCCCACATCTGTCAAACGCAAGCCCTGGCAAGATGAATAGATCGATTGGTTCATCTGCTT
GTAACACATCTTCACGCTCAATCCCTTGAGCATCAACTGGAGCTGGTTCCAAAATGTTCA
TAGAGTTTGCAATAAGATCATCCATATGAGATATGTGAAGCATACGCATGTTACTGTTCT
TATCCTCTACCCAGGGAACATATAGCTTTTTCTGTGCCATTGTATCTGGATCAGGTTGTT
GTAAAATCTTAGACAAGATTTTAGAAGTGTCAACTTCATTGAGAGACTTGCAGCTAATGT
AAGCACACAGTCTCTGGCTTGATTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4CH13TF 709 0 0
CCTC
AGAATCTGAGGTGAATATGGCAATGCAAC*TTAAGTGGATTACTCCAGCCCTTCTCCTTT
GCACGGTCCTGGTACCTCTTCAAGAAAGTGTCGTAGTAGCCACCTCCACGGCCTAAACGT
CGCCCACATCTGTCAAACGCAAGCCCTGGCAAGATGAATAGATCGATTGGTTCATCTGCT
TGTAACACATCTTCACGCTCAATCCCTTGAGCATCAACTGGAGCTGGTTCCAAAATGTTC
ATAGAGTTTGCAATAAGATCATCCATATGAGATATGTGAAGCATACGCATGTTACTGTTC
TTATCCTCTACCCAGGGAACATATAGCTTTTTCTGTGCCATTGTATCTGGATCAGGTTGT
TGTAAAATCTTAGACAAGATTTTAGAAGTGTCAACTTCATTGAGAGACTTGCAGCTAATG
TAAGCACACAGTCTCTGGCTTGATTTGAACCAAGGAGCTTCGAGAACAGTGCTTTGAATG
GCATCATCTTGTTGGATTCGGAGGGAAGGGTCCAAGGCTTTAAGAGATTTGCGGACGGTG
GAACGCACAATCTTTTTCTGCTTGAAAATGGAATCGAGCTCCTCTTGACTTTTGCTGGTG
GTGGTGCTCATGGTGACGACGGATCTAGCAGTTGCCGATTGTAATCTGGACACGGGTCGG
GTCAAGATCCTGGGGAAGAGGAAGATTGATGTCCTAGTGATACCC

QA 5 709 5 709
DS 



AS 1 11

CO CL376Contig1 707 11 7 U
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTA
CAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCTCATATTATTTGTGGCTTTCTGGGGTAAACGTCTAATGCCAAAAC
ACTCCAAAGGATCAATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTACAACTTCTTCTAGGTGAAT
TTTAAAGTTGGACCTTATGTAATTAATGTTATATTAATCTATTTATTATTAGACATGTCT
TTTTATAAATAATTAATATCAACCATTACCATAGTTTTTTACTTTTG


BQ
40 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 35 35 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 5 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 60 40 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D894JQ C 1
AF RR4D894TF U 1
AF RR4G662JQ C 1
AF RR4GZ95JQ C 1
AF RR4GZ95TF U 1
AF RR4E366JQ C 40
AF RR4E366TF U 40
AF RR4ET89TF U 2
AF RR4G662TF U 1
AF RR4EP65JQ C -1
AF RR4EP65TF U -1
BS 1 495 RR4D894TF
BS 496 496 RR4GZ95TF
BS 497 497 RR4D894TF
BS 498 498 RR4GZ95TF
BS 499 502 RR4G662TF
BS 503 694 RR4EP65TF
BS 695 707 RR4EP65JQ

RD RR4D894JQ 497 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTA
CAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCCC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4D894TF 497 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTA
CAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCCC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4G662JQ 502 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
GCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGAGCT*CAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTCTTACAAAAAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATAAAGCTGTTTTTATGAAATAAA*TAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCTCATATT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4GZ95JQ 499 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTA
CAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCTCA
G

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4GZ95TF 499 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTA
CAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCTCA
G

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4E366JQ 458 0 0
GG
AACATATACAAATAATTTAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGT
CATACTTCTGACATCGTTTGCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGC
ATGTGATCCAAAGCAGCTTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTC
GGGTGACTGTTGTGCAAAGCTGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAA
CCCTGCTTTTGCTCAGTACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGG
CATTCCTTACCCAAGTTGTTAAAACTCTTAAGAGTTCTTACAAAAAAATAAATTACGAGT
AAGGAAGATGAATAACATTATATAAAGCTGTTTTTATGAAATAAA*TAACCGTTAGTATG
TAATGGTTTATATGGTTAAATAAAGTTTACTTTCCC

QA 3 458 3 458
DS 

RD RR4E366TF 458 0 0
GG
AACATATACAAATAATTTAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGT
CATACTTCTGACATCGTTTGCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGC
ATGTGATCCAAAGCAGCTTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTC
GGGTGACTGTTGTGCAAAGCTGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAA
CCCTGCTTTTGCTCAGTACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGG
CATTCCTTACCCAAGTTGTTAAAACTCTTAAGAGTTCTTACAAAAAAATAAATTACGAGT
AAGGAAGATGAATAACATTATATAAAGCTGTTTTTATGAAATAAA*TAACCGTTAGTATG
TAATGGTTTATATGGTTAAATAAAGTTTACTTTCCC

QA 3 458 3 458
DS 

RD RR4ET89TF 495 0 0
GGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAG
TAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTG
CCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTTC
AGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGC
TGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGTACA
TTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGTT
AAAACTCTTAAGAGTTCTTACAAAAAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATTA
TATAAAGCTGTTTTTATGAAATAAA*TAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAA
TAAAGTTTACTTTCT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4G662TF 502 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
GCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGAGCT*CAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTCTTACAAAAAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATAAAGCTGTTTTTATGAAATAAA*TAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAA
ATAAAGTTTACTTTCTCATATT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4EP65JQ 709 0 0
GGCT
GAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAGT
AGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTCC
CGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTACA
GCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGCT
GAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTACAT
TAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGTTA
AAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATTAT
ATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAAT
AAAGTTTACTTTCTCATATTATTTGTGGCTTTCTGGGGTAAACGTCTAATGCCAAAACAC
TCCAAAGGATCAATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTACAACTTCTTCTAGGTGAATTT
TAAAGTTGGACCTTATGTAATTAATGTTATATTAATCTATTTATTATTAGACATGTCTTT
TTATAAATAATTAATATCAACCATTACCATAGTTTTTTACTTTTG

QA 5 709 5 709
DS 

RD RR4EP65TF 696 0 0
GGCT
GAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAGT
AGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTCC
CGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTACA
GCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGCT
GAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTACAT
TAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGTTA
AAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATTAT
ATCAAGCTGTCTT*ATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAAT
AAAGTTTACTTTCTCATATTATTTGTGGCTTTCTGGGGTAAACGTCTAATGCCAAAACAC
TCCAAAGGATCAATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTACAACTTCTTCTAGGTGAATTT
TAAAGTTGGACCTTATGTAATTAATGTTATATTAATCTATTTATTATTAGACATGTCTTT
TTATAAATAATTAATATCAACCATTACCATAG

QA 5 696 5 696
DS 



AS 2 10

CO CL377Contig1 823 3 8 U
AGGACACCACAAAGTCATTTAAGCTTTTAAATACAAACAAAATCCCCAACAGAAAAAGAG
CAGAAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTA
ACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGA
TCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCG
ACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAG
AAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTT
AAGGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATCCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACTGCCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCA
GCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTTCTGCACCGGGAGGAACGTCT
CCGGCAACTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCTTCATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGG
GATGGGTTTGGCCTAGACGGTAGGCACGTGATATTAGGGGATGTAATCTTTCTTTCTTTA
TTGTGTGAAGCTTTTGTCTCAAATTTTAAGACTTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTC
GGACCATTTGTTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTTATCTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU36TF U 1
AF RR4E078JQ C 411
AF RR4E078TF U 55
BS 1 104 RR4DU36TF
BS 105 105 RR4E078TF
BS 106 440 RR4DU36TF
BS 441 441 RR4E078TF
BS 442 625 RR4DU36TF
BS 626 626 RR4E078TF
BS 627 636 RR4DU36TF
BS 637 823 RR4E078TF

RD RR4DU36TF 636 0 0
AGGACACCACAAAGTCATTTAAGCTTTTAAATACAAACAAAATCCCCAACAGAAAAAGAG
CAGAAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTT*CACCTCTTCCTAGTA
ACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGA
TCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCG
ACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAG
AAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTT
AAGGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATCCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCA
GCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTTCTGCACCGGGAGGAACGTCT
CCGGCAACTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCTTCATGGCTCTAGCCGTCGCTTTGATGACCGTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4E078JQ 214 0 0
TCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGCCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTC
ACCAGAGGCAGCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACCCCTTTTGCACCGGG
AGGAACGTTTCCGGCAACTCCAGGGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAA
AGATGGTCACCCCTTCATGGCTTTAGCCGTCGCT

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR4E078TF 769 0 0
GG
AGAGCAGAAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCT
AGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGG
AGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTT
CGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAGGGAATAAA
AGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGC
TTTTAAGGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCT
CCACAACGCTAGCATCTCCAACTGCCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGA
GGCAGCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTTCTGCACCGGGAGGAAC
GTCTCCGGCAACTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGG
TCACGCCTTCATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCC
TTGGGATGGGTTTGGCCTAGACGGTAGGCACGTGATATTAGGGGATGTAATCTTTCTTTC
TTTATTGTGTGAAGCTTTTGTCTCAAATTTTAAGACTTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTG
CTTCGGACCATTTGTTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTTATCTTCAT

QA 3 769 3 769
DS 



CO CL377Contig2 799 7 10 U
GGAGAGCAGAAAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTC
CTAGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGA
GGAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGAT
TTCGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATA
AAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAA
GCTTTTAAGGATCTTGGCATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAG
CTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCA
GAAGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGA
AAGTCTCCGGCAGCTCCATCGACGACTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGAT
GGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTT
CCTTGG*ATGGGTTTGGCCTAGTCTGTAGGCACGTGACATTAGGGGGGTGTAATCTTTTC
TTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTCTTTGTCGTGTGTGTTTCTTGG
TTCAGACCATTTTGCTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTTAATCTTTATCTCTTTCCACAA
TAACTAAAGTTTATATTAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CO95TF U 23
AF RR4BI77TF U 5
AF RR4BV16TF U 48
AF RR4E156TF U 1
AF RR4E156JQ C 1
AF RR4BV16JQ C 47
AF RR4BO87JQ C 62
BS 1 629 RR4E156TF
BS 630 630 RR4E156JQ
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BS 688 688 RR4E156JQ
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BS 692 693 RR4E156JQ
BS 694 760 RR4E156TF
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CCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGATCTTTGTTAGACGAAT
GTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGACAGGGAAGGCACCAA
ATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGATCCAAAGTGTT
TGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAGGATCTTGGCATTC
AAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCA
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ATGCTACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCTCCGGCAGCTCCATCGA
CGACTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCACGCCATAATGGCTCTAG
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TCTGTAG*CACGTGACA

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DS 

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AAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAACCA
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TGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGACAG
GGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAG
ATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAGG
ATCTTGGCATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTCCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAGCG
CTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAAGCAGCCG
TATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCTCCGG
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GGTTTGGCCTAGTCT

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DS 

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GGCTCCGGCGGGAGGAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGAC
TTTGTGTTTGGATTTCGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGC
TATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAA
GTCAGGAGGACAAGCTTTTAAGGATCTTGGCATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCC
AACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTT
GCCAAGCTCACCAGAAGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGAT
GGCACCGGTAGGAAAGTCTCCGGCAGCTCCATCGACGACTAGCGAGAAAGTAGGATCAGC
TTCCATAAAAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTT
CCTCTCGACCTTTCCTTGGGATGGGTTTGGCCTAGTCTGTAG*CACGTGACA

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DS 

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CTAGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGA
GGAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGAT
TTCGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATA
AAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAA
GCTTTTAAGGATCTTGGCATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAG
CTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCA
GAAGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGA
AAGTCTCCGGCAGCTCCATCGACGACTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGAT
GGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTT
CCTTGG*ATGGGTTTGGCCTAGTCTGTAG*CACGTGACATTAGGGGG*TGTAATCTTTTC
TTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAATTTT**AGACTCTTTGTCGTGTGTGTTTCTTGG
TTCAGACCATTTTGCTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTTA
AAAAAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4E156JQ 759 0 0
GGAGA
GCAGAAAAAAA*GTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGT
AACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGG
ATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGC
GACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGA
GAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTT
TAAGGATCTTGGCATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCA
CAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAAGC
AGCCGTATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTC
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CGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTTCCTTG
G*ATGGGTTTGGCCTAGTCTGTAGGCACGTGACATTAGGGGGGTGTAATCTTTTCTTTAT
TGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTCTTTGTCGTGTGTGTTTCTTGGTTCAG
ACCATTTTGCTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTT

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DS 

RD RR4BV16JQ 753 0 0
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CAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTT
TGCCAAGCTCACCAGAAGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGA
TGGCACCGGTAGGAAAGTCTCCGGCAGCTCCATCGACGACTAGCGAGAAAGTAGGATCAG
CTTCCATAAAAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCT
TCCTCTCGACCTTTCCTTGG*ATGGGTTTGGCCTAGTCTGTAGGCACGTGACATTAGGGG
GGTGTAATCTTTTCTTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTCTTTGTCG
TGTGTGTTTCTTGGTTCAGACCATTTTGCTGTAATGAATGAACTTTCTCGCTTAATCTTT
ATCTCTTTCCACAATAACTAAAGTTTATATTAC

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DS 

RD RR4BO87JQ 738 0 0
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GAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATT
TCGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCCAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAA
AAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAG
CTTTTAAGGATCTTGGCATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGC
TCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAG
AAGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCTACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAA
AGTCTCCGGCAGCTCCATCGACGACTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATG
GTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTTC
CTTGG*ATGGGTTTGGCCTAGTCTGTAGGCACGTGACATTAGGGGGGTGTAATCTTTTCT
TTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTCTTTGTCGTGCGTGTTTCTTGGT
TCAGACCATTTTGCTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTTAATCTTTATCTCTTTCCACAAT
AACTAAAGTTTATATTAC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 11

CO CL378Contig1 872 11 16 U
TCTTCCATAAAATTGAGTCCACTGGGCCCTAGTGCCTGGCCGAATAGTAATCCATTAAAG
ACAACTAAAAATATTAGCTAATGTAATGTCAGTAGTAATTTGTGTCACTGATGAAAGAAC
AAAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAAAAATACTTAGCAGAACTCTTGC
AAAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGATCTTTGTGTGACTCTT
ACTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACGGAAGTCACTTACCATA
CGAGGCAGACCATCACGCAGAGAGATCTTTGGTTCCCAGTTCAGAAGTTCCTTTGCTTTG
CTTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGTGTTCGGTCTGAACTCTATAGTT
GCGCTCGAGTCAATCACCTCCTTAACCACCTCTGCAAGCTCAAGCATTGTGAA*TTCCCC
TGGGTTACCAAGATTGAAA*GGTCCTACGTGATCGTTTTCCATTAACGCTACAA*GTCCA
TCCACCAAGTCGGAAACATACTGAAAGCTTCGAGTTTGTTTTCCATCACCATAAACAGTC
ATCGGGTGTTTGCGTATGGTCTGCGCAACAAAGTTACTAACAACACGCCCATCATCGAGG
CACATTCGGGGACCATAGGTGTTGAAAATACGAGCAATTCTAACCTCCACACCGGCACCT
CGGTGATAATCCATGGCTAGAGTTTCAGCTGTACGCTTTCCTTCATCATAGCAACTCCTC
TCACCAATTGGATTCACATTTCCCAATACGTCTCCTTCTGTGGATGCTCAAGAGGATCCC
ATAGACTTCACTTGTGCTGTGAGCAGAACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 
65 65 65 65 65 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G596JQ U 39
AF RR4GQ09JQ U 39
AF RR4G596TF C 39
AF RR4GQ09TF C 39
AF RR4EB28JQ U 105
AF RR4E216JQ U 60
AF RR4E216TF C 60
AF RR4EB28TF C 60
AF RR4CK21JQ U 1
AF RR4CK21TF C 394
AF RR4CN20JQ U 10
BS 1 192 RR4CK21JQ
BS 193 193 RR4G596JQ
BS 194 319 RR4CK21JQ
BS 320 320 RR4CN20JQ
BS 321 343 RR4CK21JQ
BS 344 344 RR4G596JQ
BS 345 358 RR4CK21JQ
BS 359 359 RR4G596JQ
BS 360 390 RR4CK21JQ
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BS 392 420 RR4CK21JQ
BS 421 421 RR4G596JQ
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BS 453 671 RR4CK21JQ
BS 672 872 RR4CN20JQ

RD RR4G596JQ 389 0 0
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TTTGTGTCACTGATGAAAGAACAAAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAA
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GTTCGGTCTGAACTCTATAGTTGCGCTCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4GQ09JQ 389 0 0
GCCGAATAGTAATCCATTAAAGACAACTAAAAATATTAGCTAATGTAAAGTCAGTAGTAA
TTTGTGTCACTGATGAAAGAACAAAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAA
AAATACTTAGCAGAACTCTTGCAAAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAA
GGAAGATCTTTGTGTGACTCTTACTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCG
GTTACGGAAGTCACTTACCATACGAGGCAGACCATCACGCAGAGGGATCTTTGGTTCCCA
GTTCAGAAGTTCCTTTGCTTTGCTTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGT
GTTCGGTCTGAACTCTATAGTTGCGCTCC

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DS 

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AAATACTTAGCAGAACTCTTGCAAAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAA
GGAAGATCTTTGTGTGACTCTTACTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCG
GTTACGGAAGTCACTTACCATACGAGGCAGACCATCACGCAGAGGGATCTTTGGTTCCCA
GTTCAGAAGTTCCTTTGCTTTGCTTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGT
GTTCGGTCTGAACTCTATAGTTGCGCTCC

QA 1 389 1 389
DS 

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TTTGTGTCACTGATGAAAGAACAAAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAA
AAATACTTAGCAGAACTCTTGCAAAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAA
GGAAGATCTTTGTGTGACTCTTACTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCG
GTTACGGAAGTCACTTACCATACGAGGCAGACCATCACGCAGAGGGATCTTTGGTTCCCA
GTTCAGAAGTTCCTTTGCTTTGCTTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGT
GTTCGGTCTGAACTCTATAGTTGCGCTCC

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TTAGCAGAACTCTTGCAAAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGA
TCTTTGTGTGACTCTTACTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACG
GAAGTCACTTACCATACGAGGCAGACCATCACGCAGAGAGATCTTTGGTTCCCAGCTCAG
AAGTTCCTTTGCTTTGCTTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGTGTTCGG
TCTGAACTCTATAGTTGCGCTCGAGTCAATCACCTCCTTAACCACCTCTGCAAGCTCAAG
CATTGTGA

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AAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAAAAATACTTAGCAGAACTCTTGCA
AAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGATCTTTGTGTGACTCTTA
CTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACGGAAGTCACTTACCATAC
GAGGCAGACCATCACGCAGAGAGATCTTTGGTTCCCAGCTCAGAAGTTCCTTTGCTTTGC
TTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGTGTTCGGTCTGAACTCTATAGTTG
CGCTCGAGTCAATCACCTCCTTAACCACCTCTGCAAGCTCAAGCATTGTGAA*TTCGCCT
GGGTTACCAAGATTGAAA*GGTCCTACGTGATCGTTTTCCATTAACGCTACAA*GTCCAT
CCACCAAGTCGGAAACATACTGAAAGC

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GG
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AAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAAAAATACTTAGCAGAACTCTTGCA
AAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGATCTTTGTGTGACTCTTA
CTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACGGAAGTCACTTACCATAC
GAGGCAGACCATCACGCAGAGAGATCTTTGGTTCCCAGCTCAGAAGTTCCTTTGCTTTGC
TTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGTGTTCGGTCTGAACTCTATAGTTG
CGCTCGAGTCAATCACCTCCTTAACCACCTCTGCAAGCTCAAGCATTGTGAA*TTCGCCT
GGGTTACCAAGATTGAAA*GGTCCTACGTGATCGTTTTCCATTAACGCTACAA*GTCCAT
CCACCAAGTCGGAAACATACTGAAAGCTTCGAGTTTGTTTTCCATCACCATAAACAGTCA
TCGGGTGTTTGCGTATGGTCTGCGCAACAAA
C

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DS 

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GG
CAACTAAAAATATTAGCTAATGTAATGTCAGTAGTAATTTGTGTCACTGATGAAAGAACA
AAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAAAAATACTTAGCAGAACTCTTGCA
AAAGAGACTAT*ACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGATCTTTGTGTGACTCTTA
CTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACGGAAGTCACTTACCATAC
GAGGCAGACCATCACGCAGAGAGATCTTTGGTTCCCAGCTCAGAAGTTCCTTTGCTTTGC
TTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCACCCGCTGTGTTCGGTCTGAACTCTATAGTTG
CGCTCGAGTCAATCACCTCCTTAACCACCTCTGCAAGCTCAAGCATTGTGAA*TTCGCCT
GGGTTACCAAGATTGAAA*GGTCCTACGTGATCGTTTTCCATTAACGCTACAA*GTCCAT
CCACCAAGTCGGAAACATACTGAAAGCTTCGAGTTTGTTTTCCATCACCATAAACAGTCA
TCGGGTGTTTGCGTATGGTCTGCGCAACAAA
C

QA 3 573 3 573
DS 

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TCTTCCATAAAATTGAGTCCACTGGGCCCTAGTGCCTGGCCGAATAGTAATCCATTAAAG
ACAACTAAAAATATTAGCTAATGTAATGTCAGTAGTAATTTGTGTCACTGATGAAAGAAC
AAAAAAAGAAAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAAAAATACTTAGCAGAACTCTTGC
AAAAGAGACTATTACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGATCTTTGTGTGACTCTT
ACTTAGAGACCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACGGAAGTCACTTACCATA
CGAGGCAGACCATCACGCAAAGAGATCTTTGGTTCCCAGTTCAAAAGTTCCTTTGCTTCG
CTTATGTCTGGTTTTCTCTTGTGAGGATCATCCGCTGTGTTCGGTCTGAACTCTATAGTT
ACGCTCGAGTCAATCACCTCCTTAACCACCTATGCAAGCTCAAGCATTGTGAA*TTCCCC
TGGGTTACCAAGATTGAAA*GGTCCTACGTGATCGTTTTCCATTAACGCTACAA*GTCCA
TCCACCAAGTCGGAAACATACTGAAAGCTTCGAGTTTGTTTTCCATCACCATAAACAGTC
ATCGGGTGTTTGCGTATGGTCTGCGCAACAAAGTTACTAACAACACGCCCATCATCGAGG
CACATTCGGGG

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DS 

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GCAAGCTCAAGCATTGTGAAATTCCCCTGGGTTACCAAGATTGAAAAGGTCCTACGTGAT
CGTTTTCCATTAACGCTACAAAGTCCATCCACCAAGTCGGAAACATACTGAAAGCTTCGA
GTTTGTTTTCCATCACCATAAACAGTCATCGGGTGTTTGCGTATGGTCTGCGCAACAAAG
TTACTAACAACACGCCCATCATCGAGGCACATTCGGGGACCATAGGTGTTGAAAATACGA
GCAATTCTAACCTCCACACCGGCACCTCGGTGATAATCCATGGCTAGAGTTTCAGCTGTA
CGCTTTCCTTCATCATAGCAACTCCTCTCACCAATTGGAT

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DS 

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AATATTAGCTAATGTAATGTCAGTAGTAATTTGTGTCACTGATGAAAGAACAAAAAAAGA
AAAAGAAATAAGAAAAGAACAGAAGAAAAAAATACTTAGCAGAACTCTTGCAAAAGAGAC
TATTACATATATGAATCTTAAACCAAGAAGGAAGATCTTTGTGTGACTCTTACTTAGAGA
CCTTTGCCTTCGTCTTCGTTCAAGATTCGGTTACGGAAGTCACTTACCATACGAGGCAGA
CCATCACGCAGAGAGATCTTTGGTTCCCAGTTCAAAAGTTCCTTTGCTTCGCTTATGTCT
GGTTTTCTCTTGTGAGGATCATCCGCTGTGTTCGGTCTGAACTCTATAGTTACGCTCGAG
TCAATCACCTCCTTAACCACCTATGCAAGCTCAAGCATTGTGAA*TTCCCCTGGGTTACC
AAGATTGAAA*GGTCCTACGTGATCGTTTTCCATTAACGCTACAA*GTCCATCCACCAAG
TCGGAAACATACTGAAAGCTTCGAGTTTGTTTTCCATCACCATAAACAGTCATCGGGTGT
TTGCGTATGGTCTGCGCAACAAAGTTACTAACAACACGCCCATCATCGAGGCACATTCGG
GGACCATAGGTGTTGAAAATACGAGCAATTCTAACCTCCACACCGGCACCTCGGTGATAA
TCCATGGCTAGAGTTTCAGCTGTACGCTTTCCTTCATCATAGCAACTCCTCTCACCAATT
GGATTCACATTTCCCAATACGTCTCCTTCTGTGGATGCTCAAGAGGATCCCATAGACTTC
ACTTGTGCTGTGAGCAGAACTTG

QA 1 863 1 863
DS 



AS 2 10

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CAAGAAAAAGACGCATTGATAACGTAGTTTCTTTTATTCGTTGAGACAGGCAACATCTTT
ATTTGTATTCAAGATCAGGGGGAAGGAACACAAGAAGAAGACAAACAGCACACAATCTGT
ACTTCTTCCTCAGGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGATCTC
GATCCAGTAGCCATCTGGATCCTTTATGAAGGCTAAGTTCTTCATCTTTCCATCGTTAGG
TTTCTTGACAAACTCCACTCCGAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATCATC
AACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACCTTT
AAACTCGGGATCACTCTCTGTGCCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCGACC
AAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTATCCTCGTAGCC
CACGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTAGCCTCTTCAGCAACGACATTCC
CAGGACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCTTTAGGGTCCTTCACTCGAAACATAGTCTG
CTGCATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACCGTTGACAAGCCAGGATTGTTTGC
TGGTGATTCCTTCGCTTCCAACGCCATTGAGAACACACGAAGCTGATCAGATCTCTTTGG
CCTCAGGGCTCTGTTGCAAGGGCAATTGATGTAAGAAAAAGGTTTAACGAAGCGGGTTAG
AGGCGCAAATCGAGATATAGCACTGGCTATTGAGTACGAACCCATTTACGTTTTCCTTTG
CTTTTTCAATTCGTGCCACAGAAATTATTAGAGGAAAACAAATATGAAAAAGGAGAGATT
TTTTTATTACCGATGTACGATGAACCGACCGAGAGCTGTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B131JQ U 1
AF RR4AW28JQ U 5
AF RR4AW28TF C 92
AF RR4B131TF C 290
BS 1 816 RR4B131JQ
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RD RR4B131JQ 816 0 0
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ATTTGTATTCAAGATCAGGGGGAAGGAACACAAGAAGAAGACAAACAGCACACAATCTGT
ACTTCTTCCTCAGGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGATCTC
GATCCAGTAGCCATCTGGATCCTTTATGAAGGCTAAGTTCTTCATCTTTCCATCGTTAGG
TTTCTTGACAAACTCCACTCCGAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATCATC
AACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACCTTT
AAACTCGGGATCACTCTCTGTGCCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCGACC
AAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTATCCTCGTAGCC
CACGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTAGCCTCTTCAGCAACGACATTCC
CAGGACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCTTTAGGGTCCTTCACTCGAAACATAGTCTG
CTGCATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACCGTTGACAAGCCAGGATTGTTTGC
TGGTGATTCCTTCGCTTCCAACGCCATTGAGAACACACGAAGCTGATCAGATCTCTTTGG
CCTCAGGGCTCTGTTGCAAGGGCAATTGATGTAAGAAAAAGGTTTAACGAAGCGGGTTAG
AGGCGCAAATCGAGATATAGCACTGGCTATTGAGTA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AW28JQ 884 0 0
AAAAAGACGCATTGATAACGTAGTTTCTTTTATTCGTTGAGACAGGCAACATCTTTATTT
GTATTCAAGATCAGGGGGAAGGAACACAAGAAGAAGACAAACAGCACACAATCTGTACTT
CTTCCTCAGGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGATCTCGATC
CAGTAGCCATCTGGATCCTTTATGAAGGCTAAGTTCTTCATCTTTCCATCGTTAGGTTTC
TTGACAAACTCCACTCCGAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATCATCAACT
GTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACCTTTAAAC
TCGGGATCACTCTCTGTGCCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCGACCAAAG
GTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTATCCTCGTAGCCCACG
AAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAAAGAAATCTAGCCTCTTCAGCAACGACATTCCCAGG
ACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCTTTAGGGTCCTTCACTCGAAACATAGTCTGCTGC
ATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACCGTTGACAAGCCAGGATTGTTTGCTGGT
GATTCCTTCGCTTCCAACGCCATTGAGAACACACGAAGCTGATCAGATCTCTTTGGCCTC
AGGGCTCTGTTGCAAGGGCAATTGATGTAAGAAAAAGGTTTAACGAAGCGGGTTAGAGGC
GCAAATCGAGATATAGCACTGGCTATTGAGTACGA*CCCATTTACGTTTTCCTTTGCTTT
TTCAATTCGTGCCACAGAAATTATTAGAGGAAAACAAATATGAA

QA 1 884 1 884
DS 

RD RR4AW28TF 855 0 0
AAGAAGAAGACAAACAGCACACAATCTGTACTTCT**CTCAGGCTGCGTT*CCGGCTGTT
GTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGATCTCGATCCAGTAGCCATCTGGATCCTTTATGAAG
GCTAAGTTCTTCATCTTTCCATCGTTAGGTTTCTTGACAAACTCCACTCCGAGTTGTTCA
AATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATCATCAACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTA
GGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACCTTTAAACTCGGGATCACTCTCTGTGCCCCAGTTG
TGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCGACCAAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCC
GTTGGAGCTGTTGAAGTATCCTCGTAGCCCACGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAG
AAATCTAGCCTCTTCAGCAACGACATTCCCAGGACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCT
TTAGGGTCCTTCACTCGAAACATAGTCTGCTGCATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCA
CGAACCGTTGACAAGCCAGGATTGTTTGCTGGTGATTCCTTCGCTTCCAACGCCATTGAG
AACACACGAAGCTGATCAGATCTCTTTGGCCTCAGGGCTCTGTTGCAAGGGCAATTGATG
TAAGAAAAAGGTTTAACGAAGCGGGTTAGAGGCGCAAATCGAGATATAGCACTGGCTATT
GAGTACGAACCCATTTACGTTTTCCTTTGCTTTTTCAATTCGTGCCACAGAAATTATTAG
AGGAAAACAAATATGAAAAAGGAGAGATTTTTTTATTACCGATGTACGATGAACCGACCG
AGAGCTGTGTTTTCC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4B131TF 657 0 0
TGCACATCATCAACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTA
TGATAACCTTTAAACTCGGGATCACTCTCTGTGCCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTT
GCTGGTCGACCAAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTA
TCCTCGTAGCCCACGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTAGCCTCTTCAGC
AACGACATTCCCAGGACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCTTTAGGGTCCTTCACTCGA
AACATAGTCTGCTGCATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACCGTTGACAAGCCA
GGATTGTTTGCTGGTGATTCCTTCGCTTCCAACGCCATTGAGAACACACGAAGCTGATCA
GATCTCTTTGGCCTCAGGGCTCTGTTGCAAGGGCAATTGATGTAAGAAAAAGGTTTAACG
AAGCGGGTTAGAGGCGCAAATCGAGATATAGCACTGGCTATTGAGTACGAACCCATTTAC
GTTTTCCTTTGCTTTTTCAATTCGTGCCACAGAAATTATTAGAGGAAAACAAATATGAAA
AAGGAGAGATTTTTTTATTACCGATGTACGATGAACCGACCGAGAGCTGTGTTTTCC

QA 1 657 1 657
DS 



CO CL379Contig2 938 6 23 U
GGGCCTCTAATAATTTCTGTGGCACGAATTGAAAAAGCAAAGGAAAACGTAAATGGGTTC
GTACTCAATAGCCAGTGCTATATCTCGATTTGCGCCTCTAACCCGCTTCGTTAAACCTTT
TTCTTACATCAATTGCCCTTGCAACAGAGCCCTGAGGCCAAAGAGATCTGATCAGCTTCG
TGTGTTCTCAATGGCGTTGGAAGCGAAGGAATCACCAGCAAACAATCCTGGCTTGTCAAC
GGTTCGTGATGAAGCTACCAAAGGGTATATCATGCAGCAGACTATGTTTCGAGTGAAGGA
CCCTAAAGCTAGTCTTGACTTTTACTCACGTGTCCTGGGAATGTCATTGCTGAAGAGGCT
AGATTTCTCTGAGATGAAATTCAGCTTGTACTTCGTGGGCTACGAGGATACTTCAACAGC
TCCAACGGATCCAACTGAGAGAACTGTTTGGACCTTTGGTCGACCAGCAACAATTGAGCT
GACTCACAACTGGGGCACAGAGAGTGATCCCGAGTTTAAAGGTTATCATAATGGGAACTC
CGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAGTTGATGATGTGCACAAGGCATGCGA
GAGATTCGAACAACTGGGGGTGG*AGTTTGTCAAGAAACCTAACGATGGAAAGATGAAGA
ACATAGCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGGATCGAGATCTTTGATCTCAAGACTA
TCGGGACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAAGAAGTACCGATTGTGTGCTGTTTGTCTTCT
TCTTGTGTTCCTTCCAGCTGAGCTTTGAATACAAATAAAGATGTTGCCTGTCTCAACGAA
TAAAAGAAACTACATTATCAATGTGTCTTTTTCTTGATATTAACAATGAGTTGAGTTAAA
TAAGTTGTTATCAATGAGAATCAGTTTGGTTCGATGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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TCTTGTGT
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GG
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TGTGTGCTGTTTGTCTTCTTCTTGTGTTCCTTCCAGCTGAGCTTTGAATACAAATAAAGA
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AACAATGAGTTGAGTT

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GACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAAGAAGTACCGATTGTGTGCTGTTTGTCTTCTTCTT
GTGTTCCTTCCAGCTGAGCTTTGAATACAAATAAAGATGTTGCCTGTCTCAACGAATAAA
AGAAACTACATTA

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TTAAAGGTTATCATAATGGGAACTCCGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAG
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AAACCTAACGATGGAAAGATGAAGAACATAGCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGG
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TAAAGATGTTGCCTGTCTCAACGAATAAAAGAAACTACATTATCAATGTGTCTTTTTCTT
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GCC

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TCTCTGAGATGAAATTCAGCTTGTACTTCGTGGGCTACGAGGATACTTCAACAGCTCCAA
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CTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAGTTGATGATGTGCACAAGGCATGCGAGAGAT
TCGAACAACTGGGGGTGG*AGTTTGTCAAGAAACCTAACGATGGAAATATGAAGAACATA
GCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGGATCGAGATCTTTGATCTCAAGACTATCGGG
ACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAAGAAGTACCGATTGTGTGCTGTTTGTCTTCTTCTTG
TGTTCCTTCCACCTGAGCTT*GAATACAAATAAAGATGTTGCCTGTCTCAAAGAATAAAA
GAAACTACATTATCAATGTGTCTTTTTCTTGATACTAACAATGAGTTGAGTTAAATAAGT
TGTTATCAATGAG

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DS 



AS 1 8

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TCTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATA
CAAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTT
AGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAA
CCCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCA
TCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGT
TAACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGAC
ATACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTT
GTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAA
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TAATTGAAGTAGCTCTCACTTTCTTCTTTTGTAAACAGTGTCC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ72JQ U 1
AF RR4CB39JQ U 5
AF RR4GJ72TF C 1
AF RR4EQ19JQ U 2
AF RR4G465JQ U 1
AF RR4AD05JQ U 2
AF RR4AD05TF C 37
AF RR4G465TF C 176
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BS 265 265 RR4GJ72JQ
BS 266 312 RR4G465JQ
BS 313 313 RR4GJ72JQ
BS 314 702 RR4G465JQ
BS 703 703 RR4AD05JQ
BS 704 738 RR4G465JQ
BS 739 739 RR4AD05JQ
BS 740 811 RR4G465JQ
BS 812 833 RR4AD05JQ
BS 834 860 RR4AD05TF
BS 861 861 RR4G465TF
BS 862 871 RR4AD05TF
BS 872 943 RR4G465TF

RD RR4GJ72JQ 563 0 0
C
GATGAAAATCTCATTTTATTTGTTCAACCGATTTTACAAAACAACATACACAAACGGTTT
CTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATAC
AAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTA
GCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGGCACGAAC
CCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCAT
CCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCCTTGAATGTT
AACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGACA
TACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTG
TCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAAC
GCTAAGTTTATGATTAAGCTCC

QA 2 563 2 563
DS 

RD RR4CB39JQ 569 0 0
GAAAGTCTCATTTTATTTGTTCAACCGATTTTACACAACAACATACACAAACGGTTTCTT
CAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATACAAA
AGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTAGCA
CAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAACCCT
TCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCATCCA
AAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAGGTTCCACATCTCTTTGAATGTTAAC
TTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGACATAC
CTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTGTCG
ATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAACGCT
AAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4GJ72TF 651 0 0
C
GATGAAAATCTCATTTTATTTGTTCAACCGATTTTACAAAACAACATACACAAACGGTTT
CTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATAC
AAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTA
GCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGGCACGAAC
CCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCAT
CCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCCTTGAATGTT
AACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGACA
TACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTG
TCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAAC
GCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTGAAACCGAGGTCACGG
AATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTC

QA 2 651 2 651
DS 

RD RR4EQ19JQ 626 0 0
GATGAAAATCTCATTTTATTTGTTCAACCGATTTTACACAACAACATACACAAACGGTTT
CTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATAC
AAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTA
GCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAAC
CCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCAT
CCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGTT
AACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGACA
TACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTG
TCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAAC
GCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTGAAACCGAGGTCACGG
AATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4G465JQ 811 0 0
CGATGAAAATCTCATTTTATTTGTTCAACCGATTTTACACAACAACATACACAAACGGTT
TCTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATA
CAAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTT
AGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAA
CCCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATGTAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCA
TCCAAAAGGATCAATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGT
TAACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGAC
ATACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTT
GTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAA
CGCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTGAAACCGAGGTCACG
GAATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAGAAAGC
AACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCGTGGCCTTCTGTTCCATTCGGATG
CTCTGTATCTGGAGCTACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCCTCCAA
GTCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTCACC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4AD05JQ 832 0 0
GATGAAAATCTCATTTTATTTGTTCAACCCATTTTACACAACAACATACACAAACGGTTT
CTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACATACTTATTCATAC
AAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTA
GCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAAC
CCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCAT
CCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGTT
AACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGGGACA
TACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTG
TCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAAC
GCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTGAAACCGAGGTCACGG
AATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAGAAAGCA
ACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCGTGGCCATCTGTTCCATTCGGATGC
TCTGTATCTGGAGCTACCAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCCTCCAAG
TCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTCACCGGAGCTAACGGCGCTGTCGTGG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4AD05TF 837 0 0
ACACAACAACATACACAAACGGTTTCTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAA
TACAGTAATACATACTTATTCATACAAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGA
ATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTAGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACC
TCTCACAGCTTCTTTGGACACGAACCCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTAT
CCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGT
TAAGTTCCACATCTCTTTGAATGTTAACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAA
TATATTCTCCAGATTAAATGGGACATACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACT
CCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTGTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCA
ACTCGGAAGTGTAACATAGCTAAACGCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGA
GACTGGGTTGAAACCGAGGTCACGGAATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACC
GTCGCCGTTCTGGTCGAAGAAAGCAACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTC
GTGGCCATCTGTTCCATTCGGATGCTCTGTATCTGGAGCTACCAGTGCTCTTGCCAAATA
TGGCTTTGGTAGTTTTTCCTCCAAGTCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTCACCGGAGC
TAACGGCGCTGTCGTGGCAAAAGCTTCTGACGCATCTCCCATTTTGCTCTTAGAT
CC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4G465TF 768 0 0
TTTTTAGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAAC*TCTCACAGCTTCTTTGGAC
ACGAACCTT**CTCATCTTT*GCAAGGATGTAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAA
AGCCATCCAAAAGGATCAATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTG
AATGTTAACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAAT
GGGACATACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGT
ATGTTGTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAG
CTAAACGCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTGAAACCGAGG
TCACGGAATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAG
AAAGCAACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCGTGGCCTTCTGTTCCATTC
GGATGCTCTGTATCTGGAGCTACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCC
TCCAAGTCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTCACCGGAGCTAACGGCGCTGTCGTGGCA
AAAGCTTCTGACGCATCTCCCATTTCGCTCTTAGATTCTTTCTCTCTCTCTTCGGTAAGT
GTTAATAATTGAAGTAGCTCTCACTTTCTTCTTTTGTAAACAGTGTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 10

CO CL381Contig1 638 10 11 U
GGAACCACGGAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTT
TCTACTACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTC
AAATCCTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACA
AGTCCATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTTTGTGTCTATCA
ATATCCAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGC
TCAACGTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAACCACTGTTC
CAGCCTTTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAGTTGTCGGAG
TTGTCTTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCA
AACTTTACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGT
GTCTGTTTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGCTTTTTTTTTTTTAAT
GTAACCTGGTCTTTATGTATGTAGTTTGTATTTTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 5 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 5 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 35 35 50 50 50 45 45 35 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CJ88JQ C 226
AF RR4EW79JQ C 67
AF RR4AW52JQ C 9
AF RR4AW52TF U 9
AF RR4DI51TF U 5
AF RR4EW79TF U 5
AF RR4CJ88TF U 1
AF RR4AA36JQ C 9
AF RR4AA36TF U 9
AF RR4DD12TF U 4
BS 1 8 RR4CJ88TF
BS 9 10 RR4AW52TF
BS 11 162 RR4CJ88TF
BS 163 163 RR4AW52TF
BS 164 182 RR4CJ88TF
BS 183 183 RR4AW52TF
BS 184 584 RR4CJ88TF
BS 585 585 RR4AW52TF
BS 586 598 RR4CJ88TF
BS 599 599 RR4AA36TF
BS 600 638 RR4CJ88TF

RD RR4CJ88JQ 185 0 0
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AACTATAGAGTCAGCTCAACGTTTCCGTTGCTAGTTTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAA
ATAAAACCACTGTTCCACCCTTTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGG
GAAAA

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR4EW79JQ 394 0 0
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TAACCTCTTTTTTGCCAGTACCCATAATAGTTCATATGTTTACCACGGTCCACAAGTCCA
TACCGTTAGAGAGTCCATAACATTTTTTACAAACGCAACTTTTTGTGTCTATCAATATCC
AAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACG
TTTCCGTTGCTAGTTTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAACCACTGTTCCAGCCT
TTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATAGGAAAAGTTGTCGGAGTTGTCT
TGCAATTTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTG

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4AW52JQ 589 0 0
GGAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACTAC
GCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATCCTA
ATCTCTCTTCTGTCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCATA
CCATTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACATTTTGTGTCTATCAATATCCAA
ATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACGTT
TCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAATCACTGTTCCAGCCTTT
CAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAATTGTCGGAGTTGTCTTG
CAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGCGAGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTTTAC
TCTCTTAAGAGTTATGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGTTT
GTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGCTTTTTTT
AAAAG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4AW52TF 589 0 0
GGAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACTAC
GCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATCCTA
ATCTCTCTTCTGTCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCATA
CCATTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACATTTTGTGTCTATCAATATCCAA
ATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACGTT
TCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAATCACTGTTCCAGCCTTT
CAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAATTGTCGGAGTTGTCTTG
CAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGCGAGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTTTAC
TCTCTTAAGAGTTATGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGTTT
GTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGCTTTTTTT
AAAAG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4DI51TF 607 0 0
GG
ACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACT
ACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATCC
TAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATATGTCTACCACGGTCCACAAGTCCA
TACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTTTGTGTCTATCAATATCC
AAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACG
TTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAACCACTGTTCCAGCCT
TTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAGTTGTCGGAGTTGTCT
TGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTTT
ACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGT
TTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGTTTTTTTTT
AGTGTAACCTGGTCTTTA

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR4EW79TF 586 0 0
GG
ACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACT
ACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATCC
TAACCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATATGTCTACCACGGTCCACAAGTCCA
TACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTCTGTGTCTATCAATATCC
AAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACG
TTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAACCACTGTTCCAGCCT
TTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATAGGAAAAGTTGTCGGAGTTGTCT
TGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGACCGTCTCAAACTTT
ACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGT
TTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGTTTTTT

QA 3 586 3 586
DS 

RD RR4CJ88TF 638 0 0
GGAACCACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTT
TCTACTACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTC
AAATCCTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATATGTCTACCACGGTCCACA
AGCCCATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTTTGTGTCTATCA
ATATCCAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGC
TCAACGTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAACCACTGTTC
CAGCCTTTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAGTTGTCGGAG
TTGTCTTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCA
AACTTTACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGT
GTCTGTTTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGTTTTTTTTTTTTTAGT
GTAACCTGGTCTTTATGTATGTAGTTTGTATTTTCTGT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4AA36JQ 606 0 0
GGAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACTAC
GCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCA*TTCAAATCCTA
ATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCATA
CCATTAGAGAGTCCATAACATTTTCTACAAACGCAACATTTTGTGTCTATCAATATCCAA
ATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACGTT
TCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAATCACTGTTCCAGCCTTT
CAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAATTGTCGGAGTTGTCTTG
CAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGCGAGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTTTAC
TCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGTTT
GTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGCTTTTTTTTTTTTAATGTAACCTG
GTCTTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4AA36TF 606 0 0
GGAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACTAC
GCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCA*TTCAAATCCTA
ATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCATA
CCATTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACATTTTGTGTCTATCAATATCCAA
ATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACGTT
TCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAATCACTGTTCCAGCCTTT
CAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAATTGTCGGAGTTGTCTTG
CAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGCGAGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTTTAC
TCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGTTT
GTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGCTTTTTTTTTTTTAATGTAACCTG
GTCTTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4DD12TF 635 0 0
GGG
ACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTACT
ACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATCC
TAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCA
TACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTTTGTGTCTATCAATATCC
AAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACG
TTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAACCACTGTTCCAGCCT
TTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAGTTGTCGGAGTTGTCT
TGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTGAGTGAGTGCGTACCGGCTCAAACTTT
ACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGT
TTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCG***TTTTTTTTTTAGTGTAACC
TGGTCTTTATGTATGTAGTTTGTATTTTCTGT

QA 4 635 4 635
DS 



AS 1 9

CO CL382Contig1 865 9 38 U
CTTGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCTAGGGTTCT
TCGTCGTTGTTAACTGAATCTACGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGAT
AAGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGATTTGGAG
AACACAAATCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAG
ATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAA
GCTTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAA
GAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTA
CAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACCTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCT
TACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATG
AAGGTGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTC
GGTGTCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCT
TGAAGAAATGAATGTTTGATTCTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATACTGTTTTC
TGAGTAAAAACTCTTTGCAAAAGATTT*CTTGTTTAAGTTGTTGCATCTCAGTCTTTCTC
AAAACTTGTGTTTAAACAAGATCCATCTTTTGTTCTTTGAGCATTCACCATTTCAAGAAA
CTTTTATCACGAGAACTTTCACATC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 40 40 40 40 5 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 10 10 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 
55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 20 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 25 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GF74TF U 8
AF RR4GV46TF U 1
AF RR4D650TF U 8
AF RR4DZ57TF U 2
AF RR4GV46JQ C 52
AF RR4E376TF U 2
AF RR4D650JQ C 60
AF RR4DZ57JQ C 83
AF RR4E376JQ C 211
BS 1 51 RR4GV46TF
BS 52 52 RR4DZ57TF
BS 53 81 RR4GV46TF
BS 82 82 RR4DZ57TF
BS 83 173 RR4GV46TF
BS 174 175 RR4DZ57TF
BS 176 188 RR4GV46TF
BS 189 189 RR4DZ57TF
BS 190 266 RR4GV46TF
BS 267 267 RR4DZ57TF
BS 268 299 RR4GV46TF
BS 300 300 RR4DZ57TF
BS 301 302 RR4GV46TF
BS 303 303 RR4DZ57TF
BS 304 310 RR4GV46TF
BS 311 311 RR4GF74TF
BS 312 419 RR4GV46TF
BS 420 420 RR4DZ57TF
BS 421 446 RR4GV46TF
BS 447 447 RR4DZ57TF
BS 448 500 RR4GV46TF
BS 501 501 RR4DZ57TF
BS 502 654 RR4GV46TF
BS 655 655 RR4DZ57TF
BS 656 666 RR4GV46TF
BS 667 667 RR4DZ57TF
BS 668 694 RR4GV46TF
BS 695 695 RR4GV46JQ
BS 696 711 RR4GV46TF
BS 712 712 RR4DZ57TF
BS 713 715 RR4GV46TF
BS 716 729 RR4DZ57TF
BS 730 730 RR4GV46JQ
BS 731 741 RR4E376TF
BS 742 742 RR4GV46JQ
BS 743 783 RR4E376TF
BS 784 784 RR4D650JQ
BS 785 865 RR4DZ57JQ

RD RR4GF74TF 462 0 0
GG
GAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCCAGGGTTCTTCGTCGTTG
TTAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGGGTGTG
GCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGAACACAAAC
CAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTT
TCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGGCCTTCCGC
AAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATC
TTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTCCAGAGACCA
CGCAACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTG

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR4GV46TF 724 0 0
CTTGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCCAGGGTTCT
TCGTCGTTGTTAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGAT
AAGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAG
AACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAG
ATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAG
GCCTTCCGCATGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAA
GAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTC
CAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCT
TACCCTGCTGAGATTGTTGGCAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATG
AAGGTGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTC
GGTGTCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAAAAGCT
TGAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTGTCAG*ATAGAGAGCTTTTGATTCTG
CTTTTTGAG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4D650TF 678 0 0
GG
GAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCATTTCACCACCTTCTAGGGCTCTTCGTCGTTG
TTAACTGAATCTACGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGGGTGTG
GCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCCTTCTTTGATTTGGAGAACACAAAT
CAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTT
TCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCTTTCCGC
AAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATC
TTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTACAGAGACCA
CGCAACAGAACTCTCACCTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCT
GAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTAT
TTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTAC
AGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGAAGAAAT
GAATGTTTGATTCTTT

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR4DZ57TF 734 0 0
GGG
AACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCTAGGGCTCTTCGT
CGTTGTTAACTGAATCTACGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGG
GTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGATTTGGAGAACA
CAAATCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGG
ATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCTT
TCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAG
TTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTACAGA
GACCACGCAACAGAACTCTCACCTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACC
CTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGG
TGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTG
TCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGAA
GAAATGAATGTTTGATTCTTTTTT*GTCAG*ATAGAGAGCTTTTGATACTGTTTTCTGAG
TAAAA
CTCTTT

QA 4 728 4 728
DS 

RD RR4GV46JQ 718 0 0
C
AGGGTTCTTCGTCGTTGTTAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCC
ATAAGGATAAGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTG
ACCTGGAGAACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAG
CTGTTCAGATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGAC
TGAGGAAGGCCTTCCGCATGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCA
GTGGCAAAGAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCT
CTGCTGTCCAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGG
ATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGCAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCA
AGATCATGAAGGTGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGA
CAATGGTCGGTGTCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCG
TAAAAGCTTGAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATT
CTGCTTTTTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAAGATTTTCTTGTTTAAGTTGTTGCATCT

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR4E376TF 793 0 0
GGG
AACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCTAGGGCTCTTCGT
CGTTGTTAACTGAATCTACGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGG
GTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGATTTGGAGAACA
CAAATCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGG
ATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCTT
TCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAG
TTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTACAGA
GACCACGCAACAGAACTCTCACCTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACC
CTGCTGAGATTGTTGG*AAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGG
TGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTG
TCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGAA
GAAATGAATGTTTGATTCTTTTTT*GTCAG*ATAGAGAGCTTTTGATACTGTTTTCTGAG
TAAAA*CTCTTTGCAAA*GATTT*CTTGTTTAAGTTGTTGCATCTCAGTCTTTCTCAAA
CTTGTGTTTAA

QA 4 782 4 782
DS 

RD RR4D650JQ 725 0 0
TTCGTCGTTGTTAACTGAATCTACGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGA
TAAGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGC*TTCTTTGATTTGGA
GAACACAAATCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCA
GATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAA
AGCTTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAA
AGAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGT
ACAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACCTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGC
TTACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCAT
GAAGGTGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGT
CGGTGTCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGC
TTGAAGAAATGAATGTTTGATTCTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTT
CTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAAGATTT*CTTGTTTAAGTTGTTGCATCTCAGCCTTTCT
CAAAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4DZ57JQ 783 0 0
CGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGGGTGTGGCTCCAACAGACT
TCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGATTTGGAGAACACAAATCAGGAGTTGAAAA
GTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTTTCTGGCAACCGCA
AGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATTCATCCTC
GTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATCTTTGTTGCCACCA
GAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTACAGAGACCACGCAACAGAACTC
TCACCTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGAA
AGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATTTGGAGCCTAAGG
AGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTACAGGAAGCTTACAG
GGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGAAGAAATGAATGTTTGATTC
TTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATACTGTTTTCTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAA
GATTT*CTTGTTTAAGTTGTTGCATCTCAGTCTTTCTCAAAACTTGTGTTTAAACAAGAT
CCATCTTTTGTTCTTTGAGCATTCACCATTTCAAGAAACTTTTATCACGAGAACTTTCAC
ATC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4E376JQ 655 0 0
AAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATT
GTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTC
AGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATC
ATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTACAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACCTCC
GTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACC
AGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAAT
AACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGAT
GTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGAAGAAATGAATGTTTGATTCTTTTTTTG
TCAGGATAGAGAGCTTTTGATACTGTTTTCTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAAGATTT*CT
TGTTTAAGTTGTTGCATCTCAGTCTTTCTCAAAACTTGTGTTTAAACAAGATCCATCTTT
TGTTCTTTGAGCATTCACCATTTCAAGAAACTTTTATCACGAGAACTTTCACAT
C

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 11

CO CL383Contig1 698 11 9 U
GGAATTCACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGC
TACTAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAA
ACCTCGCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTT
CAACAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTC
AGACCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTC
GACTCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGAT
CATCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTA
CATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTC
TTGTGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCC
AGTTTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGT
AGTTAGCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTC
AACTTATGTAACTAATATCGTTGTATCTAAATTAATTT


BQ
10 10 10 30 30 5 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BM47TF U 6
AF RR4D016JQ C 469
AF RR4DE05TF U 6
AF RR4EM41TF U 6
AF RR4BF03JQ C 1
AF RR4BM47JQ C 107
AF RR4DE05JQ C 32
AF RR4D016TF U 6
AF RR4AZ56TF U 2
AF RR4AZ56JQ C 3
AF RR4BF03TF U 1
BS 1 3 RR4BF03JQ
BS 4 7 RR4AZ56TF
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BS 141 141 RR4DE05TF
BS 142 456 RR4BM47TF
BS 457 654 RR4DE05TF
BS 655 672 RR4D016TF
BS 673 675 RR4AZ56TF
BS 676 698 RR4BF03TF

RD RR4BM47TF 451 0 0
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AATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAGCAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGACTC
AACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCATCG
CAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGA
AATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4D016JQ 186 0 0
CAATGAGTTTTCTTGTGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATA
TTTTTCTGTTCCAGTTTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTG
ATTAAAAGTTGTAGTTAGCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGT
AAAAAA

QA 1 186 1 186
DS 

RD RR4DE05TF 649 0 0
GGACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTA
AATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGACTC
AACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCATCG
CAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGA
AATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTG
ATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTT
TACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTA
GCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4EM41TF 649 0 0
GGACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTA
AATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGAC*ATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGACTC
AACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCATCG
CAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGA
AATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTG
ATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTT
TACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTA
GCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4BF03JQ 698 0 0
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TACTAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAA
ACCTCGCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTT
CAACAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTC
AGACCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTC
GACTCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGAT
CATCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTA
CATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTC
TTGTGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCC
AGTTTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGT
AGTTAGCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTC
AACTTATGTAACTAATATCGTTGTATCTAAATTAATTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4BM47JQ 560 0 0
ATCTCAACCAGAAAACCTCGCAGATGCAACCAAAGCAAGCCCCGACCATCCAAATCCATA
AGCGAAAACATGTTCAACAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAAT
GACCTAAACAATTCAGACCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTT
AAAGAAGAGGAGTCGACTCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGAC
GACGGTAAGTCGATCATCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTA
AGCTTGTTGTGGTACATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTT
TACAATGAGTTTTCTTGTGATACTTTTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCA
TATTTTTCTGTTCCAGTTTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTTTACG
TGATTAAAAGTTGTAGTTAGCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATAT
GTAAAAAATACGTCAACTT
G

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4DE05JQ 642 0 0
ATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCAC
CGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTCGCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGA
CCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACG
GAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATG
GAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGACTCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATA
TGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCATCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGT
GAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGG
AAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATG
GTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAAT
ATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTAGCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTG
AAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAACTTATGTAAC
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4D016TF 668 0 0
GGACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTA
AATTTATTACCCGTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGGAGAGGAGTCGACTC
AACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCATCG
CAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGA
AATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTG
ATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTT
TACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTA
GCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAACTT
ATGTAAC
C

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4AZ56TF 677 0 0
GG
ATTCACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTAC
TAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACC
TCGCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAA
CAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGA
CCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGAC
TCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCAT
CGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACAT
GAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTG
TGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCTATATTTTTCTGTTCCAGT
TTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGT
TAGCATTTCGCTGTGTTGTAACGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAAC
TTATGTAACTAA
AAG

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR4AZ56JQ 676 0 0
G
ATTCACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTAC
TAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACC
TCGCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAA
CAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGA
CCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGAC
TCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCAT
CGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACAT
GAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTG
TGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCTATATTTTTCTGTTCCAGT
TTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGT
TAGCATTTCGCTGTGTTGTAACGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAAC
TTATGTAACTAA
AAG

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR4BF03TF 698 0 0
GGA
ATTCACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTAC
TAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAGATCTCGATCTCAACCAGAAAACC
TCGCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAA
CAATGTTCTCCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGA
CCCCCTTACTAATTCACTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGAGGAGTCGAC
TCAACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGATCAT
CGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACAT
GAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTG
TGATACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGT
TTTACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGT
TAGCATTTCGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAAC
TTATGTAACTAATATCGTTGTATCTAAATTAATTT

QA 4 698 4 698
DS 



AS 2 11

CO CL384Contig1 1281 7 14 U
TTTTTAACGATAATACATCTTTTTTTTTGTAAAAGGGCATAATACATCATATTTTTGCTT
TTATTATATATTTCTTGCAATCATTTTACAAATTGGTGATATTCTATTTGCAATGTTATC
AATGAAACTTTGTTTTCCCACATTATCAACTTTGGTTTAATCAATGGAGTAGAAAAATTG
CTTCTAATTAGCTTCTATTGATAGAAAAATTGAAAGATTACATTGCAATTTTATTATTGT
GAATGAACTTGCATGAAACAGAAGGGATTATATGAGTTATTGTTATTGAAGTTGCATGAA
TATTTTAAGATCCCCAACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGACACCGAGGG
TGAAAGCTCCCATACGGAGATCACAAGAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAAGTCTTTGA
AGCCTCGAGTCATATAATTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTTTTCCTCATCCCACATGAATC
CTTGTATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTCCAGAGTTTGCGTATA
TGTCTGGGAGGATCACAACACCTTTCTTCCTCAATATCTCGTCAGCCTCAGGATCAGTTG
GATGATTAGCACCTTCAATTATAAACTTTGCTTTAATCTCATTTGCATTTCCCCTGTTGA
TGACACCTCCTAGAGCTGCAGGAATCAGGACATCACAATCTTCAACAAGAATCGAATCAG
GATCGATAGAATCAGCACCATCAAACCCTTTGATTCCTCTGTTTTCTTCAGAATGCTCGA
GCAGACCAGAGATATCGATACCGTTCTTGTTCTTGATAGCTCCTGTGACATCGCTCACTG
CCACTATCTTCCCACCTTTTTCATTTATTAACTTTGCCGCCCAAGAACCCACATTTCCAA
AACCCTGGATGACGAATCTCTGTCCAGATATGCTCTTTCCATGTTCATTGAGTAAAGCTT
CTGTTGCAAACAGCACTCCTCTTCCGGTAGCAGCATCTCTCCCCAGAGATCCACCAAGAT
CAATGGGTTTTCCTGTCACAACAGCAGGAGAGTGTCCATGGAACTTGGAGTATTCATCAA
GCATCCACGCCATTGTCTGAGGACCGGTTCCCATATCAGGAGCTGGAACATCGGTATGAA
TCCCAATTAGATCATGGATCTTCTGTGTGAAAACTCGAGTCAAACGTTCAAGCTCTGAGA
TGCTTAACTCGCTCGGGTCACAACCAATACCTCCTTTGGCTCCACCATAAGGTATCTTAG
CCACTGCGGTTTTCCATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 5 20 20 20 20 20 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C044JQ U 1
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AAAA

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CTTTTCCTCATCCCACATGAATCCTTGTATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGT
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CTCGTCAGCCTCAGGATCA

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TATTTTAAGATCCCCAACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGACACCGAGGG
TGAAAGCTCCCATACGGAGATCACAAGAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAAGTCTTTGA
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CTTGTATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTCCAGAGTTTGCGTATA
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CC

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AACTTTGTTTTCCCACATTATCAACTTTGGTTTAATCAATGGAGTAAAAAAATTGCTTCT
AATTAGCTTCTATTGATAGAAAAATTGAAAGATTACATTGCAATTTTATTATTGTGAATG
AACTTGCATGAAACAGAAGGGATTATATGAGTTATTGTTATTGAAGTTGCATGAATATTT
TAAGATCCCCAACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGACACCGAGGGTGAAA
GCTCCCATATGGAGATCACATGAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAAGTCTTTGAAGCCT
CGAATCATATAATTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTTTTCCTCATCCCACATGAATCCTTGT
ATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTCCAGAGTTTGCGTATATGTCT
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CCTTGTATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTCCAGAGTTTGCGTAT
ATGTCTGGGAGGATCACAACACCTTTCTTCCTCAATATCTCGTCAGCCTCAGGATCAGTT
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GCCACTATCTTCCCACCTTTTTCATTTATTAACTTTGCCGCCCAAGAACCCACATTTCCA
AA
CCCTGGA

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GGTTGACACCGAGGGTGAAAGCTCCCATACGGAGATCACAAGAGTGTGTCTTGCACATCT
CTTTCAAGTCTTTGAAGCCTCGAGTCATATAATTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTTTTCCT
CATCCCACATGAATCCTTGTATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTC
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CCTCAGGATCAGTTGGATGATTAGCACCTTCAATTATAAACTTTGCTTTAATCTCATTTG
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CAAGAATCGAATCAGGATCGATAGAATCAGCACCATCAAACCCTTTGATTCCT**GTTTT
CTTCAGAATGCTCGAGCAGACCAGAGATATCGATACCGTTCTTGTTCTTGATAGCTCCTG
TGACATCGCTCACTGCCACTATCTTCCCACCTTTTTCATTTATTAACTTTGCCGCCCAAG
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CATTGAGTAAAGCTTCTGTTGCAA

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ATCGCTCACTGCCACTATCTTCCCACCTTTTTCATTTATTAACTTTGCCGCCCAAGAACC
CACATTTCCAAAACCCTGGATGACGAATCTCTGTCCAGATATGCTCTTTCCATGTTCATT
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AAGCTCTGAGATGCTTAACTCGCTCGGGTCACAACCAATACCTCCTTTGGCTCCACCATA
AGGTATCTTAGCCACTGCGGTTTTCCATGTCC

QA 1 632 1 632
DS 



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ACACCATGAATGCTTTGGCAGCAACCAACAGAAACTTCAAGCTAGCTTCTAGGCTGCTTG
GTTTGGACTCAAAGCTTGAGAAAAGTCTTCTCATTCCCTTCAGAGAAATCAAGGTGGAAT
GTACCATACCGAAAGATGATGGAACTCTAGCATCATTCATTGGATTCAGAGTCCAACATG
ATAACGCAAGAGGTCCCATGAAAGGTGGCATCAGATATCATCCAGAGGTAGAACCGGATG
AAGTAAACGCTTTGGCTCAACTCATGACATGGAAAACCGCAGTGGCTAAGATACCTTATG
GTGGAGCCAAAGGAGGTATTGG**TTGTGACCCGAGCGAGTTAAGCATCTCAGAGCTTGA
ACGTTTGACTCGAGTTTTCACACAGAAGATCCATGATCTAATTGGGATTCATACCGATGT
TCCAGCTCCTGATATGGGAACCGGTCCTCAGACAATGGCGTGGATGCTTGATGAATACTC
CAAGTTCCATGGACACTCTCCTGCTGTTGTGACAGGAAAACC*ATTGATCTTGGTGGATC
TCTGGGG*AGAGATGCTGCTACCGGAAGAGGAGTGCTGTTTGCAACAGAAGCTTTACTCA
ATGAACATGGAAAGAGCATATCTGGACAGAGATTCGTCATCCAGGGTTTTGGAAATGTGG
GTTCTTGGGCGGCAAGTTATAAATGAAAAGTGGGAGATAGTGGCAGTGAGCGATGTCACA
GAGCTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CL52TF U 1
AF RR4C044TF U 1
AF RR4AA49TF U 10
AF RR4E052TF U 9
BS 1 46 RR4C044TF
BS 47 47 RR4E052TF
BS 48 340 RR4C044TF
BS 341 341 RR4E052TF
BS 342 441 RR4C044TF
BS 442 442 RR4E052TF
BS 443 523 RR4C044TF
BS 524 524 RR4E052TF
BS 525 575 RR4C044TF
BS 576 576 RR4E052TF
BS 577 579 RR4C044TF
BS 580 580 RR4E052TF
BS 581 630 RR4C044TF
BS 631 631 RR4E052TF
BS 632 644 RR4C044TF
BS 645 693 RR4E052TF
BS 694 694 RR4AA49TF
BS 695 702 RR4E052TF
BS 703 703 RR4AA49TF
BS 704 709 RR4E052TF
BS 710 710 RR4AA49TF
BS 711 787 RR4E052TF

RD RR4CL52TF 410 0 0
GGACATTTTCCAATAGCTTTCTTATCGAAGTCTCTCACAGAATAAATCCAAAAATTAAGA
ACACCATGAATGCTTTGGCAGCAACCAACAGAAACTTCAAGCTAGCTTCTAGGCTGCTTG
GTTTGGACTCAAAGCTTGAGAAAAGTCTTCTCATTCCCTTCAGAGAAATCAAGGTGGAAT
GTACCATACCGAAAGATGATGGAACTCTAGCATCATTCATTGGATTCAGAGTCCAACATG
ATAACGCAAGAGGTCCCATGAAAGGTGGCATCAGATATCATCCAGAGGTAGAACCGGATG
AAGTAAACGCTTTGGCTCAACTCATGACATGGAAAACCGCGGTGGCTAAGATACCTTATG
GTGGAGCCAAAGGAGGTATTTGGTTTGTGACCCGAGCGAGTTAAGCATCT

QA 1 410 1 410
DS 

RD RR4C044TF 644 0 0
GGACATTTTCCAATAGCTTTCTTATCGAAGTCTCTCACAGAATAAATCCAAAAATTAAGA
ACACCATGAATGCTTTGGCAGCAACCAACAGAAACTTCAAGCTAGCTTCTAGGCTGCTTG
GTTTGGACTCAAAGCTTGAGAAAAGTCTTCTCATTCCCTTCAGAGAAATCAAGGTGGAAT
GTACCATACCGAAAGATGATGGAACTCTAGCATCATTCATTGGATTCAGAGTCCAACATG
ATAACGCAAGAGGTCCCATGAAAGGTGGCATCAGATATCATCCAGAGGTAGAACCGGATG
AAGTAAACGCTTTGGCTCAACTCATGACATGGAAAACCGCGGTGGCTAAGATACCTTATG
GTGGAGCCAAAGGAGGTATTGG**TTGTGACCCGAGCGAGTTAAGCATCTCAGAGCTTGA
ACGTTTGACTCGAGTTTTCACGCAGAAGATCCATGATCTAATTGGGATTCATACCGATGT
TCCAGCTCCTGATATGGGAACCGGTCCTCAGACAATGGCGTGGGTGCTTGATGAATACTC
CAAGTTCCATGGACACTCTCCTGCTGTTGTGACAG*AAACCC*ATTGATCTTGGTGGATC
TCTGGGG*AGAGATGCTGCTACCGGAAGAG*AGTGCTGTTTGCA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4AA49TF 740 0 0
GG
AATAGCTTTCTTATCGAAGTCTCTCACAGAATAAACCCAAAAATTAAGAACACCATGAAT
GCTTTGGCAGCAACCAACAGAAACTTCAAGCTAGCTTCTAGGCTGCTTGGTTTGGACTCA
AAGCTTGAGAAAAGTCTTCTCATTCCCTTCAGAGAAATCAAGGTGGAATGTACCATACCG
AAAGATGATGGAACTCTAGCATCATTCATTGGATTCAGAGTCCAACATGATAACGCAAGA
GGTCCCATGAAAGGTGGCATCAGATATCATCCAGAGGTAGAACCGGATGAAGTAAACGCT
TTGGCTCAACTCATGACATGGAAAACCGCAGTGGCTAAGATACCTTATGGTGGAGCCAAA
GGAGGTATTGG**TTGTGACCCGAGCGAGTTAAGCATCTCAGAGCTTGAACGTTTGACTC
GAGTTTTCACACAGAAGATCCATGATCTAATTGGGATTCATACCGATGTTCCAGCTCCTG
ATATGGGAACCGGTCCTCAGACAATGGCGTGGATGCTTGATGAATACTCCAAGTTCCATG
GACACTCTCCTGCTGTTGTGACAGGAAAACCCATTGATCTTGGTGGATCTCTGGGG*AGA
GATGCTGCTACCGGAAGAGGAGTGCTGTTTGCAACAGAAGCTTTACTCAATGAACATGGA
AAGAGCATATCTGGACAGAGATTCGTCATCCAGGGTTTTGGAAATGTGGGTTCTTGGGCG
GCAA
AGTTAATAAATGAA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4E052TF 779 0 0
GGG
AATAGCTTTCTTATCGAAGTCTCTCACAGAATAAACCCAAAAATTAAGAACACCATGAAT
GCTTTGGCAGCAACCAACAGAAACTTCAAGCTAGCTTCTAGGCTGCTTGGTTTGGACTCA
AAGCTTGAGAAAAGTCTTCTCATTCCCTTCAGAGAAATCAAGGTGGAATGTACCATACCG
AAAGATGATGGAACTCTAGCATCATTCATTGGATTCAGAGTCCAACATGATAACGCAAGA
GGTCCCATGAAAGGTGGCATCAGATATCATCCAGAGGTAGAACCGGATGAAGTAAACGCT
TTGGCTCAACTCATGACATGGAAAACCGCAGTGGCTAAGATACCTTATGGTGGAGCCAAA
GGAGGTATTGG**TTGTGACCCGAGCGAGTTAAGCATCTCAGAGCTTGAACGTTTGACTC
GAGTTTTCACACAGAAGATCCATGATCTAATTGGGATTCATACCGATGTTCCAGCTCCTG
ATATGGGAACCGGTCCTCAGACAATGGCGTGGATGCTTGATGAATACTCCAAGTTCCATG
GACACTCTCCTGCTGTTGTGACAGGAAAACC*ATTGATCTTGGTGGATCTCTGGGGGAGA
GATGCTGCTACCGGAAGAGGAGTGCTGTTTGCAACAGAAGCTTTACTCAATGAACATGGA
AAGAGCATATCTGGACAGAGAT*CGTCATCCTGGGTTT*GGAAATGTGGGTTCTTGGGCG
GCAAGTTATAAATGAAAAGTGGGAGATAGTGGCAGTGAGCGATGTCACAGAGCTAT

QA 4 779 4 779
DS 



AS 2 9

CO CL385Contig1 523 3 5 U
GGATCAATCGATCAATCAAAGCTCATTAATCATCCAGAAAAAAAA*GAACCTCACTTCTT
ATAATAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAG
CTAAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCG
ACAAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAG
CCTCTGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTG
ATGGTGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTC
TCATGTTATATTTTTCAATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTT
TCTAATTAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTTTTT*CCAAAGATCTTGTAATAAGAC
ATGCATAAGTAATAAAATGGTGCGAGTTACCCATACTATATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C609JQ C 1
AF RR4H741TF U 8
AF RR4DZ88TF U 15
BS 1 14 RR4C609JQ
BS 15 458 RR4H741TF
BS 459 459 RR4DZ88TF
BS 460 512 RR4H741TF
BS 513 523 RR4DZ88TF

RD RR4C609JQ 500 0 0
GGATCAATCGATCAATCAAAGCTCATTAATCATCCAGAAAAAAAAAGAACCTCACTTCTT
ATAATAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAG
CTAAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCG
ACAAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAG
CCTCTGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTG
ATGGTGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTC
TCATGTTATATTTTTCAATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTT
TCTAATTAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTTTTT*CCAAAGATCTTGTAATAAGAC
ATGCATAAGTAATAAAATGG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4H741TF 508 0 0
GGAATCA
ATCAAAGCTCATTAATCATCCAGAAAAAAAA*GAACCTCACTTCTTATAATAAAATCATG
TCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCC
GAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAAC
GCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATC
CAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAAC
ACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATGTTATATTTT
TCAATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTG
TAATAAAATTTTGAATTTTTTTTTTCCAAAGATCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATA
AAATGGTGCGAGTTACCC
ATA

QA 8 505 8 505
DS 

RD RR4DZ88TF 509 0 0
ATCAAAGCTCATTAATCATCCAGAAAAAAAA*GAACCTCACTTCTTATAATAAAATCATG
TCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCC
GAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAAC
GCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATC
CAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAAC
ACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATGTTATATTTT
TCAATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTG
TAATAAAATTTTGAATTTTTTTTT*CCAAAGATCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATA
AAATGGTGCGAGTTACCCATACTATATGT

QA 1 509 1 509
DS 



CO CL385Contig2 500 6 4 U
ATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATCAAAAAAAAAA*GAACTACACTTCTTATAATAA
AATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGA
GAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGAC
TGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGG
TTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGT
CAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAACACACTTCTCATGTC
ATGTTTTTCAATTTATTTGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAAT
TTTGTAATAAAATTTTGATTTTTTTCTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACGAATAAGTAA
TAAAATGGTGCGAGTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4FD62TF U 1
AF RR4DE85JQ C 9
AF RR4FD62JQ C 9
AF RR4H120JQ C 9
AF RR4H120TF U 9
AF RR4DE85TF U 9
BS 1 120 RR4FD62TF
BS 121 121 RR4H120TF
BS 122 266 RR4FD62TF
BS 267 500 RR4H120TF

RD RR4FD62TF 266 0 0
ATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATCAAAAAAAAAA*GAACTACACTTCTTATAATAA
AATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGA
TAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGAC
TGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGG
TTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAG

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR4DE85JQ 492 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATCAAAAAAAAAAAGAACTACACTTCTTATAATAAAATCATGT
CGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAGAAGAA***ATGAGAAATCAACACACTTCTCATGTCATGTTTTT
CAATTTATTTGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTAAT
AAAATTTTGATTTTTTTCTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACGAATAAGTAATAAAATGG
TGCGAGTTACCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4FD62JQ 492 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATCAAAAAAAAAA*GAACTACACTTCTTATAATAAAATCATGT
CGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGATAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAACACACTTCTCATGTCATGTTTTT
CAATTTATTTGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTAAT
AAAATTTTGATTTTTTTCTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACGAATAAGTAATAAAATGG
TGCGAGTTACCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4H120JQ 492 0 0
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CGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACATGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAACACACTTCTCATGTCATGTTTTT
CAATTTATTTGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTAAT
AAAATTTTGATTTTTTTCTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACGAATAAGTAATAAAATGG
TGCGAGTTACCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4H120TF 492 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATCAAAAAAA****GAACTACACTTCTTATAATAAAATCATGT
CGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACATGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAACACACTTCTCATGTCATGTTTTT
CAATTTATTTGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTAAT
AAAATTTTGATTTTTTTCTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACGAATAAGTAATAAAATGG
TGCGAGTTACCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4DE85TF 492 0 0
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CGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAGAAGAA***ATGAGAAATCAACACACTTCTCATGTCATGTTTTT
CAATTTATTTGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTAAT
AAAATTTTGATTTTTTTCTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACGAATAAGTAATAAAATGG
TGCGAGTTACCC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 11

CO CL386Contig1 697 11 16 U
GGAATCTTCTTCTGGATCCAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACAACTAGCAAGAGGG
AAGCCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTCCGATTACGAACGACCT
CATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTG
GCTTAAGAATCTCGCATGCTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCCCATCTCCCTTCCTTCCT
TTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAG
CAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCA
ACTTACAGTACAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTAT
CAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTG
GCATAGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAA
TTTCTTTT*CTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTC
TTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAAAAAAGAAAATATTACATTTCATGT
TTACGGCTCTTTTATATTAATATATCGTTTATCAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 50 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX52JQ C 14
AF RR4EX52TF U 14
AF RR4BU89JQ C 1
AF RR4F845JQ C 14
AF RR4F845TF U 14
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AF RR4AW91TF U 14
AF RR4DD07JQ C 14
AF RR4DD07TF U 14
AF RR4BU89TF U 1
AF RR4B121TF U 42
BS 1 13 RR4BU89TF
BS 14 310 RR4EX52TF
BS 311 311 RR4F845TF
BS 312 319 RR4EX52TF
BS 320 320 RR4F845TF
BS 321 376 RR4EX52TF
BS 377 377 RR4F845TF
BS 378 433 RR4EX52TF
BS 434 434 RR4F845TF
BS 435 543 RR4EX52TF
BS 544 544 RR4F845TF
BS 545 595 RR4EX52TF
BS 596 606 RR4F845TF
BS 607 632 RR4AB37TF
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BS 640 697 RR4B121TF

RD RR4EX52JQ 598 0 0
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QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4EX52TF 598 0 0
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AAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTTCG
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AACTGTTTAATGTTTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4BU89JQ 643 0 0
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TTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGTAAGAAAG
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CAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTG
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TTTTTTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTC
TTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAAAAA
AGAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4F845JQ 595 0 0
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GCATGCTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCCCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTTT
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G

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4F845TF 593 0 0
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GCATGCTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCCCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCT
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GAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTTCG
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DS 

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DS 

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GAATTAGACAAAACTCGTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4DD07JQ 594 0 0
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QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4DD07TF 592 0 0
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GCATGCTCCCTCCATTGACGTCATCAACCCCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCT
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GAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTT
GAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTTCG
CAAGAAGTAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTT*CTTA
ATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4BU89TF 642 0 0
GGAATCTTCTTCTTTATCCAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACAACTAGCAAGAGGG
AAGCCAAAAATATGA*GACAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTCCGATTACGAACGACCT
CATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTG
GCTTAAGAATCTCGCATGCTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCCCATCTCCCTTCCTTCCT
TTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGTAAGAAAG
CAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCA
ACTTACAGTACAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTAT
CAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTG
GCATAGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAA
TTTTTTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTC
TTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAAAAA
GAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4B121TF 656 0 0
GG
AACAACTAGCAAGAGGGAAGCCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCT
CCGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCT
CAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATGCTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCC
CATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCC
TTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAA
GAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTT
CGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGC
TGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGC
ATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTT*CTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAG
TTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAAAAAAGAA
AATATTACATTTCATGTTTACGGCTCTTTTATATTAATATATCGTTTATCAACT

QA 3 656 3 656
DS 



AS 2 10

CO CL387Contig1 1084 6 20 U
GGGCACATTCTCTGTCTCACTAAATATTTCTTCTTTCTTCTGAAACTTCTGTGCGGTAAA
GAAAGAATAACTTTTTAAATTTTGATATAAAGAAGAAAAGAAAAAAGATTTACTTGGTGT
CTTTTAATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAGG
TAACCTAGAAGACGGAGAGTGGGTTAACGAAAGCTCATAGTAGTAATCCTTTCTCATCAA
GAAAACCAAAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTT
GCTTTACCTTCTGATCGTTTTCTACTGGGTTTAAAATCAAGAAACCATGACCACAAGTCT
ACTAAGTGATCCAACGATGATGATTTCAACAACAGAGGTCATGATCTCCTCTCAACGGCC
GTCTCCATCGCCTACAACACAAATTTCGGGCGACGAGCCTGAGCCCGTGACGTGCGACTG
CTGCGGATTAACCGAGGAGTGTACACAATCGTACATAGAGATGATCAGAGAGCGTTACAT
GGGTAAATGGATCTGTGGTCTTTGTTCTGAAGCTGTTAAGTACGAGGTTATAAGAACTAA
ACGATTGCTAACTCCAGAGGAAGCTATGGCAAGACACATGAACACGTGTTACAAGTTCAA
ATGCTCAAGCCCACCTCCTAATCCGACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTT
GAGAAGAAGCTTGGATTCTCCAAGAGTGCTTAGATCAATGCCTAGTAGTCCTTCTAAAGA
TGAAGATGATTGTGTTCCAAATGTTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGAC
CTAAAAAA**GCTCATAATTGGAAAAATAAGTGTTTAAACCGGGTGATAACCGCGGTTTA
AGGACCACCACCTGGTAAGGATCCGGTTTTCAGATTGCAAGTTTTCGTCATTAACCAAAA
CTGGTCTCTTGTATGTGTTTTTTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAA
*GCTTAAAATGTACAAGTCTTGCGTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTAATAACTTTT
GTCA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4CW09TF U 1
AF RR4F533TF U 1
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AF RR4CW09JQ C 313
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AF RR4BC79TF U 362
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GAAAACCAAAAAAAAAA*GTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTT
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GAGA*GA*GCTTG*ATTCTCCA*GAGTGCTTAGATCA*TGCCTAGTAGTCCT
CTAA

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TAATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAGGTAAC
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ACCAAAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTTGCTT
TACCTTCTGATCGTTTTCTACTGGGTTTAAAATCAAGAAACCATGACCACAAGTCTACTA
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GGATTAACCGAGGAGTGTACACAATCGTACATAGAGATGATCAGAGAGCGTTACATGGGT
AAATGGATCTGTGGTCTTTGTTCTGAAGCTGTTAAGTACGAGGTTATAAGAACTAAACGA
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TCAAGCCCACCTCCTAATCCGACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTTGAGA
AGA
GCTTG

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ATTGCAAGTTTTCGTCATTAACCAAAACTGG

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DS 

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AACGATGATGATTTCAACAACAGAGGTCATGATCTCCTCTCAACGGCCGTCTCCATCGCC
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ATGTGTTTTTTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAATGCTTAAAATGT
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TT
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TTTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAA*GCTTAAAATGTACAAGTCT
TGCGTTGTTT

QA 3 492 3 492
DS 

RD RR4BC79TF 723 0 0
G
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CTCCATCGCCCACAACACAAATCTCGGGCGACTAGCCTGAGCCCGTGACGTGTGACTGCT
GCGGATTAACCGAGGAGTGTACACAATCGTACATAGAGATGATCAGAGAGCGTTACATGG
GTAAATGGATCTGTGGTCTTTGTTCTGAAGCTGTTAAGTACGAGGTTATAAGAACTAAAC
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GCTCAAGCCCACCTCCTAATCCGACTGGACATTTGATATCTGCGATGAGACAGATCTTGA
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AAGATGATTGTGTTCCAAATGTTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGACCT
AAAAAA**GCTCATAATTGGAAAAATAAGTGTTTAAACCGGGTGATAACCGCGGTTTAAG
GACCACCACCTGGTAAGGATCCGGTTTTCAGATTGCAAGTTTTCGTCATTAACCAAAACT
GGTCTCTTGTATGTGTTTTTTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAA*G
CTTAAAATGTACAAGTCTTGCGTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTAATAACTTTTGT
CA

QA 2 723 2 723
DS 



CO CL387Contig2 906 4 4 U
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AAGAATAACTTTTAAATTTTGATATAAAGAAGAAAAGAAAAAAGATTTACTTGGTGTCTT
TTAATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAGGTAA
CCTAGAAGACGGAGAGTGGGTTAACGAAAGCTCATAGTAGTAATCCTTTCTCATCAAGAA
AACCGAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTTGCTT
TACCTTCTGATCGTTTTCTGCATGGGTTATAAGAACTAAACGATTGCTAACTCCAGAGGA
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GCGTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTAATAACTTTTTTCATTGTGTGCTTAGTAGTT
AAACAAGAACAAAATAATGTAGATACTATTCGATTAAAGTTTGATGATAGAAAAGGATAT
TCTTAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4GF70TF U 1
AF RR4GL77TF U 1
AF RR4GL77JQ C 107
AF RR4GF70JQ C 183
BS 1 588 RR4GF70TF
BS 589 589 RR4GL77JQ
BS 590 641 RR4GF70TF
BS 642 906 RR4GL77JQ

RD RR4GF70TF 641 0 0
GGACATTCTCTGTCTCACTAAATATTTCTTCTTTCTTCTGAAACTTCTGTGCGGTAAAGA
AAGAATAACTTTTAAATTTTGATATAAAGAAGAAAAGAAAAAAGATTTACTTGGTGTCTT
TTAATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAGGTAA
CCTAGAAGACGGAGAGTGGGTTAACGAAAGCTCATAGTAGTAATCCTTTCTCATCAAGAA
AACCGAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTTGCTT
TACCTTCTGATCGTTTTCTGCATGGGTTATAAGAACTAAACGATTGCTAACTCCAGAGGA
AGCTATGGCAAGACACATGAACACGTGTTACAAGTTCAAATGCTCAAGCCCACCTCCTAA
TCCGACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTTGAGAAGAATCTTGGATTCTCC
AAGAGTGCTTAGATCAATGCCTAGTAGTCCTTCTAAAGATGAAGATGATTGTGTTCCAAA
TGTTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGACCTAAAAAAA*GCTCATAGTTG
GGAAAATAAGTGTTTAAACCGGGTGATAACCGCGGTTTAAG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GL77TF 642 0 0
GG
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GAATAACTTTTAAATTTTGATATAAAGAAGAAAAGAAAAAAGATTTACTTGGTGTCTTTT
AATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAGGTAACC
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CCGAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTTGCTTTA
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CTATGGCAAGACACATGAACACGTGTTACAAGTTCAAATGCTCAAGCCCACCTCCTAATC
CGACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTTGAGAAGAATCTTGGATTCTCCAA
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TTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGACCTAAAAAAA*GCTCATAGTTGGG
AAAATAAGTGTTTAAACCGGGTGATAACCGCGGTTTA
GGA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4GL77JQ 800 0 0
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GGTGAAGAAGGTAACCTAGAAGACGGAGAGTGGGTTAACGAAAGCTCATAGTAGTAATCC
TTTCTCATCAAGAAAACCGAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCAT
AAGAGAGTTTGCTTTACCTTCTGATCGTTTTCTGCATGGGTTATAAGAACTAAACGATTG
CTAACTCCAGAGGAAGCTATGGCAAGACACATGAACACGTGTTACAAGTTCAAATGCTCA
AGCCCACCTCCTAATCCGACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTTGAGAAGA
ATCTTGGATTCTCCAAGAGTGCTTAGATCAATGCCTAGTAGTCCTTCTAAAGATGAAGAT
GATTGTGTTCCAAATGTTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGACCTAAAAA
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CCACCTGGTAAGGATCCGGTTTTCAGATTGCAAGTTTTCGTCATTAACCAAAACTGGTCT
CTTGTATGTGTTTTTTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAATGCTTAA
AATGTACAAGTCTTGCGTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTAATAACTTTTTTCATTG
TGTGCTTAGTAGTTAAACAAGAACAAAATAATGTAGATACTATTCGATTAAAGTTTGATG
ATAGAAAAGGATATTCTTAC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4GF70JQ 724 0 0
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CCGAAAAAAAAAGTTTTCCTTTTCAAGTCTTTCATCTGTTTCATAAGAGAGTTTGCTTTA
CCTTCTGATCGTTTTCTGCATGGGTTATAAGAACTAAACGATTGCTAACTCCAGAGGAAG
CTATGGCAAGACACATGAACACGTGTTACAAGTTCAAATGCTCAAGCCCACCTCCTAATC
CGACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTTGAGAAGAATCTTGGATTCTCCAA
GAGTGCTTAGATCAATGCCTAGTAGTCCTTCTAAAGATGAAGATGATTGTGTTCCAAATG
TTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGACCTAAAAAAAAGCTCATAGTTGGG
AAAATAAGTGTTTAAACCGGGTGATAACCGCGGTTTAAGGACCACCACCTGGTAAGGATC
CGGTTTTCAGATTGCAAGTTTTCGTCATTAACCAAAACTGGTCTCTTGTATGTGTTTTTT
GCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAATGCTTAAAATGTACAAGTCTTGC
GTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTAATAACTTTTTTCATTGTGTGCTTAGTAGTTAA
ACAAGAACAAAATAATGTAGATACTATTCGATTAAAGTTTGATGATAGAAAAGGATATTC
TTAC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 11

CO CL388Contig1 470 11 12 U
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CTTTTTTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCC
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CTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTACAC


BQ
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 45 45 30 10 

AF RR4B533JQ C 1
AF RR4B533TF U 1
AF RR4D116TF U 1
AF RR4DM59JQ C 151
AF RR4BB03JQ C 17
AF RR4D116JQ C 289
AF RR4BB03TF U 17
AF RR4F756TF U 1
AF RR4EK04TF U 1
AF RR4DK44TF U 1
AF RR4DM59TF U 1
BS 1 132 RR4B533TF
BS 133 133 RR4D116TF
BS 134 257 RR4B533TF
BS 258 258 RR4D116TF
BS 259 272 RR4B533TF
BS 273 273 RR4D116TF
BS 274 317 RR4B533TF
BS 318 318 RR4D116TF
BS 319 332 RR4B533TF
BS 333 333 RR4D116TF
BS 334 468 RR4B533TF
BS 469 470 RR4D116TF

RD RR4B533JQ 468 0 0
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CTAGCTGCAGCTGCGTCGACTGCACTTGCTGCTCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAAGGGACCATGTCTCTTTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTAC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4B533TF 468 0 0
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CTTTTTTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCC
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AGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCT
CTAGCTGCAGCTGCGTCGACTGCACTTGCTGCTCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAAGGGACCATGTCTCTTTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTAC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4D116TF 470 0 0
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CTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTACAC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4DM59JQ 320 0 0
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GCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCTAAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCT
CTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATAT
CTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGATGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTA
ATACATCATGTTATCTACA
T

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4BB03JQ 452 0 0
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CAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCTAAAATACACATTCAAA
AGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAAAAGTTG
ATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGATGTAATAGTTCTATGT
CCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCT
GC

QA 1 450 1 450
DS 

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AACTAAAATGTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTG
GCTGGTGTGTGATGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTA

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR4BB03TF 452 0 0
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AATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAAGAAGGG
AACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGGTCAT
GGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGCTGCAGCTGCGT
CAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCTAAAATACACATTCAAA
AGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAAAAGTTG
ATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGATGTAATAGTTCTATGT
CCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCT
GC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4F756TF 468 0 0
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AGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGTT
CTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTAC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4EK04TF 466 0 0
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CTTTTTTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCC
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AGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCT
CTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4DK44TF 470 0 0
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CTTTTTTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCC
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CTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTACA
T

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DS 

RD RR4DM59TF 470 0 0
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CTTTTTTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCC
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AGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCT
CTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAATTAAAATAAAAAATAAAGCTCCT
AAAATACACATTCAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTA
ATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTCTCTGGCTGGTGTGTGA
TGTAATAGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTACA
T

QA 1 469 1 469
DS 



AS 2 10

CO CL389Contig1 955 6 13 U
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AGCTTCTTCACTTACATAATGGAATCACAGAAACTTGGTAAAAATATGGAAACAGAGGAG
GCTGAAATTTGATGATTTTGTCTCACTTGCCAAGTCCAAGTTCTTTCTCTACCTCTCTGG
TTAGGCTGAACTGTAAAGTGTTCTGCCATGGGAACAGAGTTCTTGTCACTGGAAGTTTCC
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GGTACTCCGTCTCATGGTGTCGGATGATATTGGCTATAGCTATCGCGCAGTCATCGGGAG
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CGAAATAATGGGCTCCTACCTGCAATTTCCCTTTTATGTCAAGCACCTGAGATTCATCCT
GGAAATAAATGTTCCATACAGATCTCCAACTTCCATTACAGAAGTTTTGGGGACTGAGCT
TCATGGCAGTAATTATAACGACGAACTCAAAGTTCGACCCTGGACCATCAGCATCTTTGC
CTTTCACACAGTTAACTGCGGACACACCTTTCGGGTAAGATTCACTAACGTATCTCTGGA
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CAGCAGGTCTTACATTTGTACAAATCTGTTTGACGTGATCAACAATGGCAACCTGGGCAG
TTCTTGGATCAAGGTACTCATTCTCTGTAATTTCACTGTAAGATGAAAAATCACCTGAGC
ACAACAAATGGTTATGCAAAACATTTTCATAAAACACGAAAAGAACACACATGGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C706JQ U 1
AF RR4EZ59JQ U 1
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AF RR4H766JQB U 1
AF RR4A103JQD U 22
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BS 79 79 RR4EZ59JQ
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BS 123 123 RR4EZ59JQ
BS 124 208 RR4C706JQ
BS 209 209 RR4EZ59JQ
BS 210 530 RR4C706JQ
BS 531 531 RR4EZ59JQ
BS 532 717 RR4C706JQ
BS 718 728 RR4ER38JQ
BS 729 887 RR4A103JQ
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BS 889 955 RR4A103JQ

RD RR4C706JQ 717 0 0
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QA 1 717 1 717
DS 

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TTAGGCTGAACTGTAAAGTGTTCTGCCATGGGAACAGAGTTCTTGTCACTGGAAGTTTCC
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GGTACTCCGTCTCATGGTGTCGGATGATATTGGCTATAGCTATCGCGCAGTCATCGGGAG
ACTGAAATATTGTCGAATCTTGGAACTCTTTTTTTGCATCTAACTCCACATTCCCCTCTT
CGAAATAATGGGCTCCTACCTGCAATTTCCCTTTTATGTCAAGCACCTGAGATTCATCCT
GGAAATAAATGTTCCATACAGATCTCCAACTTCCATTACAGAAGTTTTGGGGACTGAGCT
TCATGGCAGTAATTATAACGACGAACTCAAAGTTCGACCCTGGACCATCAGCATCTTTGC
CTTTCACACAGTTAACTGCGGACACACCTTTCGGG

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CGAAATAATGGGCTCCTACCTGCAATTTCCCTTTTATGTCAAGCACCTGAGATTCATCCT
GGAAATAAATGTTCCATACAGATCTCCAACTTCCATTACAGAAGTTTTGGGGACTGAGCT
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GCTGAAATTTGATGATTTTGTCTCACTAGCCAAGTCCAAGTTCTTTCTCTACCTCTCTGG
TTAGGCTGAACTGTAAAGTGTTCTGCCATGGGAACAGAGTTCTTGTCACTGGAAGTTTCC
TCCTCAGATCCTTGAAAGTGTTATCCGGTAATTTGGAATACGCCACCTCTAGAGCTGCAA
GGTACTCCGTCTCATGGTGTCGGATGATATTGGCTATAGCTATCGCGCAGTCATCGGGAG
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CGAAATAATGGGCTCCTACCTGCAATTTCCCTTTTATGTCAAGCACCTGAGATTCATCCT
GGAAATAAATGTTCCATACAGATCTCCAACTTCCATTACAGAAGTTTTGGGGACTGAGCT
TCATGGCAGTAATTATAACGACGAACTCAAAGTTCGACCCTGGACCATCAGCATCTTA*C
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TTTCAGCA

QA 1 728 1 728
DS 

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AAATCTGTTTGACGTGATCAACAATGGCAACCTGGGCAGTTCTTGGATCAAGGTACTCAT
TCTCTGTAATTTCACTGTAAGATGAAA

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DS 

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TATCCGGTAATTTGGAATACGCCACCTCTAGAGCTGCAAGGTACTCCGTCTCATGGTGTC
GGATGATATTGGCTATAGCTATCGCGCAGTCATCGGGAGACTGAAATATTGTCGAATCTT
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GCAATTTCCCTTTTATGTCAAGCACCTGAGATTCATCCTGGAAATAAATGTTCCATACAG
ATCTCCAACTTCCATTACAGAAGTTTTGGGGACTGAGCTTCATGGCAGTAATTATAACGA
CGAACTCAAAGTTCGACCCTGGACCATCAGCATCTTTGCCTTTCACACAGTTAACTGCGG
ACACACCTTTCGGGTAAGATTCACTAACGTATCTCTGGATTTCAGCATCAAGGGCACATC
TGAATTCCTCAATATACGAAGATGGAAGTTCTTCATCGTCAGCAGGTCTTACATTTGTAC
AAATCTGTTTGACGTGATCAACAATGGCAACCTGGGCAGTTCTTGGATCAAGGTACTCAT
TCTCTGTAATTTCACTGTAAGATGAACAATCACCTGAGCACAACAAATGGTTATGCAAAA
CATTTTCATAAAACACGAAAAGAACACACATGGC

QA 1 934 1 934
DS 



CO CL389Contig2 835 4 16 U
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ATTACTGCCATGAAGCTCAGTCCCCAAAACTTCTGTAATGGAAGTTGGAGATCTGTATGG
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CGGAGTACTTGCAGCTCTAGAGTGGCGTATTCCAAATACCGGATACACTTCAAGA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER38TF U 1
AF RR4EZ59TF U 1
AF RR4H766TF U 1
AF RR4CK04TF U 3
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BS 263 650 RR4ER38TF
BS 651 654 RR4EZ59TF
BS 655 655 RR4CK04TF
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BS 660 680 RR4H766TF
BS 681 681 RR4CK04TF
BS 682 715 RR4H766TF
BS 716 716 RR4CK04TF
BS 717 735 RR4H766TF
BS 736 736 RR4CK04TF
BS 737 782 RR4H766TF
BS 783 783 RR4CK04TF
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RD RR4ER38TF 650 0 0
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CTTGATGCTGAAATCCAGAGATACGTTAGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTGTCCGCAGTT
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AACATTTATTTCCAGGATGAATCTCA*GTGCTTGACATAAAAGGGAAATT

QA 1 650 1 650
DS 

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GGGA
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GGGG
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GACCTGCTGACGATGAAGAACTTCCATCTTCGTATATTGAGGAATTCAGATGTGCCCTTG
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DS 

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GG
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TCAATTACGTCGCCAAAGATTTAAAGGCTGTTTTGAGCGATGAGGAAGTGTACAACGAGG
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GACCTGCTGACGATGAAGAACTTCCATCTTCGTATATTGAGGAATTCAGATGTGCCCTTG
ATGCTGAAATCCAGAGATACGTTAGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTGTCCGCAGTTAACT
GTGTGAAAGGCAAAGATGCTGATGTTCCAGGGTCGAACTTTGAGTTCGTCGTTATAATTA
CTGCCATGAAGCTCAGTCCCCAAAACTTCTGTAATGGAAGTTGGAGATCTGTATGGAACA
TTTATTTCCAGGATGAATCTCAGGTGCTTGACATAAAAGGGAAATTGCAGGTAGGAGCCC
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TTTCAGTCTCCCGATGACTGCGCGATAGCTATAGCCATATCATCCGACACATGAGACGGA
GTAC
TTGCAGCT

QA 3 786 3 786
DS 



AS 1 11

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A**AACGCAACACGGAATGAACAAGAACTTGATTAAAGAGACAAGAGAGCATTTAAAATA
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TATTATTCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGG
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CTTGATGAACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATATCTATTGCAGTAATACG
GCCATCTTCAGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACGCCGAG
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CTTGAGCTCTTCATGCTCTCTTGGATATGCCGTTGTTTCAAGGATGTACTTTTTGAGTTC
CTCGTTCTTGAGAATTCCTTTGGACGGAATCAAATTCTCCATATCTGGTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 20 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 40 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 35 35 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 35 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4H657JQB U 1
AF RR4DN62JQ U 10
AF RR4DN62TF C 10
AF RR4F873JQ U 7
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AF RR4D536TF C 79
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RD RR4H657JQB 677 0 0
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TATTATTCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGG
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GTTCTTGGCG
AC

QA 1 670 1 670
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AGTCTCCTCTTCCTCGGCCACGAACCCAAACCACAATGTGTTATCAAAAGCTATTATTCC
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CTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACCAGCATTCTTGATGAA
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GTTCTTGGCG
AC

QA 1 670 1 670
DS 

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QA 1 724 1 724
DS 

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G
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AGAAGCGAGCTGCTTGTTCAACTCCATGAGGGCTTTTCTGTTGACCCTCATGTACACTGG
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TCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGGTTTATC
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GGCCTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACCAGCATTCTTGAT
GAACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATATCTATTACAGTAATACGGCCATC
TTCAGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACGCCGAGTTCTAG
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TACCTCCATCTCGCTTAAATTGCCATACTTTTGGACC

QA 2 758 2 758
DS 

RD RR4CZ15JQ 804 0 0
G
AAAAAAGGGAACAAATCTTTATTCTTTAGAATAATCCAACACACACACACACACA**AAC
GCAACACGGAATGAACAAGAACTTGATTAAAGAGACAAGAGAGCATTTAAAATATTCTTA
AAAACTTGATTTTAAGTAAAAAACCAAGAACATTGGATGAGTCTCTTTTGTTCACACGAG
GCGTCTGCAGAGAGTGACACCATCACCAATGGATACTTGAGAGACCTCGATGCGAGGATC
AGAAGCGAGCTGCTTGTTCAACTCCATGAGGGCTTTTCTGTTGACCCTCATGTGCACTGG
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TCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGGTTTATC
AGCGTCCACAAATGCGAAATCAAACTCCGGTTTTGGATTCTCGGTCAGCAACTTGTCTAA
GGCCTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACCAGCATTCTTGAT
GAACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATAT**ATTGCAGTAATACGGCCATC
TTCAGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACGCCGAGTTCTAG
CGTGTTCTTGGCGTTCATCATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAGTGTCCCTCATCAACCGG
TACCTCCATCTCGCTTAAATTGCCATACTTTTGGACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCTTGAG
CTCTTCATGCTCTCTTGGATATG

QA 2 804 2 804
DS 

RD RR4CU35JQ 821 0 0
GG
AAAAAGGGAACAAATCTTTATTCTTTAGAATAATCCAACACACACACACACACA**AACG
CAACACGGAATGAACAAGAACTTGATTAAAGAGACAAGAGAGCATTTAAAATATTCTTAA
AAACTTGATTTTAAGTAAAAAACCAAGAACATTGGATGAGTCTCTTTTGTTCACACGAGG
CGTCTGCAGAGAGTGACACCATCACCAATGGATACTTGAGAGACCTCGATGCGAGGATCA
GAAGCGAGCTGCTTGTTCAACTCCATGAGGGCTTTTCTGTTGACCCTCATGTGCACTGGC
ACAGTCTCCTCTTCCTCGGCCACGAACCCAAACCACAATGTGTTATCAAAAGCTATTATT
CCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGGTTTATCA
GCGTCCACAAATGCGAAATCAAACTCCGGTTTTGGATTCTCGGTAAGCAACTTGTCTAAG
GCCTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACCAGCATTCTTGATG
AACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATATCTATTGCAGTAATACGGCCATCT
TCAGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACGCCGAGTTCTAGC
GTGTTCTTGGCGTTCATCATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAGTGTCCCTCATCAACCGGT
ACCTCCATCTCGCTTAA*TTGCCATACTTTTGGACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCTTGAGC
TCTTCATGCTCTCTTGGATATGCCGTT
TTTCAGGATGTA

QA 3 809 3 809
DS 

RD RR4A703TF 840 0 0
ACACACA**AACGCAACACGGAATGAACAAGAACTTGATTAAAGAGACAAGAGAGCATTT
AAAATATTCTTAAAAACTTGATTTTAAGTAAAAAACCAAGAACATTGGATGAGTCTCTTT
TGTTCACACGAGGCGTCTGCAGAGAGTGACACCATCACCAATGGATACTTGAGAGACCTC
GATGCGAGGATCAGAAGCGAGCTGCTTGTTCAACTCCATGAGGGCTTTTCTGTTGACCCT
CATGTGCACTGGCACAGTCTCCTCTTCCTCGGCCACGAACCCAAACCACAATGTGTTATC
AAAAGCTATTATTCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTA
GTTTGGTTTATCAGCGTCCACAAATGCGAAATCAAACTCCGGTTTTGGATTCTCGGTCAG
CAACTTGTCTAAGGCCTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACC
AGCATTCTTGATGAACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATATCTATTGCAGT
AATACGGCCATCTTCAGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAAC
GCCGAGTTCTAGCGTGTTCTTGGCGTTCATCATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAGTGTCC
CTCATCAACCGGTACCTCCATCTCGCTTAAATTGCCATACTTTTGGACCGTAGCTTCTCG
TAGTTTCTTGAGCTCTTCATGCTCTCTTGGATATGCCGTTGTTTCAAGGATGTACTTTTT
GAGTTCCTCGTTCTTGAGAATTCCTTTGGACGGAATCAAATTCTCCATATCTGGTTCCCC

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4H657TF 674 0 0
TACTTGAGAGACCTCGATGCGAGGATCAGAAGCGAGCTGCTTGCTCAGCTCCATGAGGGC
TTTTCTGTTGACCCTCATGTGCACTGGCACAGTCTC*TCTTC*TCGGCCACGAACCCAAA
CCACAATGTGTTATCAAAAGCTATTATTCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTC
GAGGGCGTTAGCGTAGTTTGGTTTATCAGCGTCCACAAATGCGAAATCAAACTCCGGTTT
TGGATTCTCGGTCAGCAACTTGTCTAAGGCCTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGAT
TTTATGATCAACACCAGCATTCTTGATGAACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATC
AATATCTATTGCAGTAATACGGCCATCTTCGGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGA
GTAGCCCGTGAAAACGCCGAGTTCTAGCGTGTTCTTGGCGTTCATCATTTTTAAAAGCAT
CGATAGAAAGTGTCCCTCATCAACCGGTACCTCCATCTCGCTTAAATTGCCATACTTTTG
GACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCTTGAGCTCTTCATGCTCTCTTGGATATGCCGTTGTTTC
AAGGATGTACTTTTTGAGTTCCTCGTTCTTGAGAATTCCTTTGGACGGAATCAAATTCTC
CATATCTGGTTCCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4CZ15TF 755 0 0
CT
AAAACTTGATTTTAAGTAAAAA*CCAAGAACATTGGATGAGTCTCTTTG**TCACACGAG
GCGTCTGCAGAGAGTGACACCATCACCAATGGATACTTGAGAGACCTCGATGCGAGGATC
AGAAGCGAGCTGCTTGTTCAACTCCATGAGGGCTTTTCTGTTGACCCTCATGTGCACTGG
CACAGTCTCCTCTTCCTCGGCCACGAACCCAAACCACAATGTGTTATCAAAAGCTATTAT
TCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGGTTTATC
AGCGTCCACAAATGCGAAATCAAACTCCGGTTTTGGATTCTCGGTCAGCAACTTGTCTAA
GGCCTGAAGACCATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACCAGCATTCTTGAT
GAACTCTAAACCCATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATAT**ATTGCAGTAATACGGCCATC
TTCAGGCAATGCAAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACGCCGAGTTCTAG
CGTGTTCTTGGCGTTCATCATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAGTGTCCCTCATCAACCGG
TACCTCCATCTCGCTTAAATTGCCATACTTTTGGACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCTTGAG
CTCTTCATGCTCTCTTGGATATGCCGTTGTTTCAAGGATGTACTTTTTGAGTTCCTCGTT
CTTGAGAATTCCTTTGGACGGAATCAAATTC
CC

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR4D536TF 806 0 0
GAACAAGAACTTGATTAAAGAGACAAGAGAGCATTTAAAATAT*CT**AAAACTTGATTT
TAAGTAAAAA*CCAAGAACATTGGATGAGTCTCTTTTGTTCACACGAGGCGTCTGCAGAG
AGTGACACCATCACCAATGGATACTTGAGAGACCTCGATGCGAGGATCAGAAGCGAGCTG
CTTGTTCAACTCCATGAGGGCTTTTCTGTTGACCCTCATGTACACTGGCACAGTCTCCTC
TTCCTCGGCCACGAACCCAAACCACAATGTGTCATCAAAAGCTATTATTCCCCCTACCTT
CACCAGCTTCATTAGTCTCTCGAGGGCGTTAGCGTAGTTTGGTTTATCAGCGTCCACAAA
TGCGAAATCAAACTCCGGTTTTGGATTCTCGGTCAGCAACTTGTCTAAGGCCTGAAGACC
ATCGGATTGGATGAAGTTGATTTTATGATCAACACCAGCATTCTTGATGAACTCTAAACC
CATCTCGTAAGCTTCTTTATCAATATCTATTACAGTAATACGGCCATCTTCAGGCAATGC
AAGGGCCGTCGCGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACGCCGAGTTCTAGCGTGTTCTTGGC
GTTCATCATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAGTGTCCCTCATCGACCGGTACCTCCATCTC
GCTTAAATTGCCATACTTTTGGACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCTTGAGCTCTTCATGCTC
TCTTGGATATGCCGTTGTTTCAAGGATGTACTTTTTGAGTTCCTCGTTCTTGAGAATTCC
TTTGGACGGAATCAGATTC
TCCATCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 2 11

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CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACG
TGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGATTATCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACT
AAATAGGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGTC
ATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACTATTGCACTGCATCACATGAATACTGACTCTT
TTGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4AP84TF U 1
AF RR4EF31JQ C 1
AF RR4EF31TF U 1
AF RR4D439TF U 1
BS 1 12 RR4AP84TF
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RD RR4AP84TF 334 0 0
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CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACG
TGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGATTATCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACT
AAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTT

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4EF31JQ 389 0 0
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TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATTTATGCTATATACG
TGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGATTATCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACT
AAATAGGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGTC
ATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4EF31TF 389 0 0
GGGTCCACCTTT*AGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACG
TGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
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AAATAGGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGTC
ATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4D439TF 424 0 0
GGGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACG
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CTTGAGATTATCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACT
AAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGTC
ATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACTATTGCACTGCATCACATGAATACTGACTCTT
TTGT

QA 1 424 1 424
DS 



CO CL391Contig2 394 7 10 U
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CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACG
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CTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTATGTAATGTAA
CCATTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCGGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTC
AAGTCATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACT


BQ
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4C352TF U 1
AF RR4D578TF U 5
AF RR4C352JQ C 1
AF RR4D046JQ C 1
AF RR4D046TF U 1
AF RR4G693TF U 1
AF RR4ED87TF U 24
BS 1 141 RR4C352TF
BS 142 142 RR4D578TF
BS 143 170 RR4C352TF
BS 171 171 RR4D578TF
BS 172 281 RR4C352TF
BS 282 290 RR4D578TF
BS 291 291 RR4D046TF
BS 292 339 RR4D578TF
BS 340 382 RR4D046TF
BS 383 394 RR4G693TF

RD RR4C352TF 281 0 0
GGGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTACCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATACTATTTACG
TGATCGTGTTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTG

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4D578TF 335 0 0
CCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGT
CCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGAT
ATGCTTGGTGTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACGTGAT
CGTGTTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTG
AGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTAGGTAATGTAACCAT
TAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCGGTTTCCTT

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR4C352JQ 380 0 0
GGGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTACCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATACTATTTACG
TGATCGTGTTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTATGTAATGTAA
CCATTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCGGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTC
AAGTCATGCCAATTTCATA
C

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR4D046JQ 389 0 0
GGGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACG
TGATCGTGTTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTATGTAATGTAA
CCATTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCGGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTC
AAGTCATGCCAATTTCATAGAA
AAAAAAA

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4D046TF 389 0 0
GGGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACG
TGATCGTGTTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTATGTAATGTAA
CCATTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCGGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTC
AAGTCATGCCAATTTCATAGAA
AAAAAAA

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4G693TF 394 0 0
GGGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCG
CAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCT
TGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACG
TGATCGTGTTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAG
CTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTCAATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTATGTAATGTAA
CCATTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCGGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTC
AAGTCATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4ED87TF 371 0 0
GG
AAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGT
CTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGTGTTGACTATCTT
AGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACGTGATCGTGTTTCAGAACCGTGAAGG
GGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCTGCTGGTCCATTC
AATGTCTTTGAAACTGTTTTACTTATGTAATGTAACCATTAAATAAGTTGCTATGCAATC
TCATCGGCTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGTCATGCCAATTTCATAGAATGA
CTTTTGAC
C

QA 3 370 3 370
DS 



AS 1 11

CO CL392Contig1 1202 11 11 U
GGGGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCTTCACTAACAACTTCTT
CTGCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCCTCTACCT
CTCATTCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCTTCTGCCTCCA
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GAGTTCTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTATTCTCAAGAAAATTTGCAAAGTCTG
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ACTTCATCAAGAAGGACGCAACTTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTGTGAGAGCAG
ATGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCAGGTTCTGTTGATGCAGTTCATGCTGGTGCAGCAT
TACACTGTTGGCCTTCTCCTACAAATGCTATTGCTGAGGTATGTCGTGTTCTGAGAAGTG
GAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGATACAGTCCTTCCACTCCATGGATGATCA
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CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 25 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 20 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 45 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

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RD RR4CC38TF 722 0 0
GG
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GG
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GGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACCGTCACTGCT
GGTT**GATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTA
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CGC

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GG
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CTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCTACCTCTCATTCT
CGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCTTCTGCCTCCATACGCGCC
GTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAATTCCGACAAGAAAGACACTGAAACT
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ATGAGGAAAGGACCTTCAGGTATTAACCTACAAGCAATCTACAGGTCTGGTTTCAGGTGT
GGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACCGTCACTGCT
GGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTA
GTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGT
CCAGATGAAGAGTTTAGGATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTTCTC
GTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTATTCTCAAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAATAC
TCTGGCGTCATTGCTCTTGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTCATC
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CGCCTCCCTTTCCCT

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DS 

RD RR4E793TF 782 0 0
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AACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCCCCCACCTCTCATTCTCGT
CTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGCTTCCCTTCTGCCTCCATACGCGCCGTT
GCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAATTCCGACAAGAAAGACACTGAAACTCAA
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AGGAAAGGACCTTCAGGTATTAACCTACAAGCAATCTACAGGTCTGGTTTCAAGTGTGGA
CAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACCGTCACTGCTGGT
TTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTAGTA
TCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGTCCA
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GGCGTCATTGCTCTTGACTACTCTGAAA*CATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAG
AACGACGCAACTTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTGTGAGAGCAGATGTCTCTCGC
CT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AQ65TF 684 0 0
G
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AAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACCGTCACCGCTGGTTTTGATTCT
TTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTAGTATCATTCTTG
TATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGATGAAGAG
TTTAGGATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGACGTTAGC
TGTGGAAGCGGTTTATTCTCAAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAATACTCTGGCGTCATT
GCTCTTGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACGCA
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CCTTCAGGTTCTGTTGATGCAGTTCATGCTGGTGCAGCATTACACTGTTGGCCTTCTCCT
ACAAATGCTATTGCTGAGGTATGTCGTGTTCTGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACA
ACGTTTCTAAGATACAGTCCTTCCACTCCATGGATGATCAGACCTTTTCAATCGAGGATT
CTGCAGAACTACAATTACTTGAT

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DS 

RD RR4AG21JQ 783 0 0
ATCTAACCGTCACTGCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAAC
TCTTTCGGAGTCCATTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTC
GAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGATGAAGAGTTTAGGATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAG
CAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTATTCTCAAGAAAATTTG
CAAAGTCTGGCAAATACTCTGGCGTCATTGCTCTTGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTC
AGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACGCAACTTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTG
TGAGAGCAGATGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCAGGTTCTGTTGATGCAGTTCATGCTG
GTGCAGCATTACACTGTTGGCCTTTTCCTACAAATGCTATTGCTGAGGTATGTCGTGTTC
TGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGATACAGTCCTTCCACTCCAT
GGATGATCAGACCTTTTCAATCGAGGATTCTGCAGAACTACAATTACTTGATGCAGGATG
AGATCAAGGATGTGTGTACAACATGTGGTCTCACAGATTATGAAGATATTGTTCAGGATT
CTTTTATAATGTTTACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCTCTTTGCTACCTATTCAT
GTAACTTGTTGTATAGACACAGAAACAAAAGTTGTTATAGTAATAAAGAGGAAGATGATA
TA
C

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4E793JQ 728 0 0
TGAACTCTTTCGGAGTCCATTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTT
TGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGATGAAGAGTTTAGGATGGCTGAGGAGTACTTCAA
AGAAGCAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTATTCTCAAGAAA
ATTTGCAAAGTCTGGCAAATACTCTGGCGTCATTGCTCTTGACTACTCTGAAAACATGCT
TCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACGCAACTTTCGATAGCTCGACTAACATAGC
TGTTGTGAGAGCAGATGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCAGGTTCTGTTGATGCAGTTCA
TGCTGGTGCAGCATTACACTGTTGGCCTTCTCCTACAAATGCTATTGCTGAGGTATGTCG
TGTTCTGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGATACAGTCCTTCCAC
TCCATGGATGATCAGACCTTTTCAATCGAGGATTCTGCAGAACTACAATTACTTGATGCA
GGATGAGATCAAGGATGTGTGTACAACATGTGGTCTCACAGATTATGAAGATATTGTTCA
GGATTCTTTTATAATGTTTACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCTCTTTGCTACCTA
TTCATGTAACTTGTTGTATAGACACAGAAACAAAAGTTGTTATTGTAATAAAGAGGAAGA
TGATATA
C

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4AQ65JQ 791 0 0
ATCTAACCGTCACCGCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAAC
TCTTTCGGAGTCCATTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTC
GAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGATGAAGAGTTTAGGATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAG
CAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTATTCTCAAGAAAATTTG
CAAAGTTTGGCAAATACTCTGGCGTCATTGCTCTTGACTACTTTGAAAACATGCTTCGTC
AGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACGCAACTTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTG
TGAGAGCAGATGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCAGGTTCTGTTGATGCAGTTCATGCTG
GTGCAGCATTACACTGTTGGCCTTTTCCTACAAATGCTATTGCTGAGGTATGTCGTGTTT
TGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGATACAGTCCTTCCACTCCAT
GGATGATCAGACCTTTTCAATCGAGGATTTTGCAGAACTACAATTACTTGATGCAGGATG
AGATCAAGGATGTGTGTACAACATGTGGTCTCACAGATTATGAAGATATTGTTCAGGATT
CTTTTATAATGTTTACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCTCTTTGCTACCTATTCAT
GTAACTTGTTGTATAGACACAGAAACAAAAGTTGTTATAGTAATAAAGAGGAAGATGATA
TATAAAACTCG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 11

CO CL393Contig1 980 11 13 U
GACTAACTCGCAAATTTCCGGCATAACGTCAACAAACAGCAAACTATTCCACATGAACAT
CCATCAATGCACTAACGTAACTCTTACAGATGTTCATATTGAGGCACCACCTGAGAGTCT
CAACACCGATGGTATCCACGTCGGAAAGTCCGTAGGCGTCACCATAAGAGGGTCAAAGAT
TAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAATTTACTTGTCGAGGG
CGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGTAAGTCTTGGAAAGCACCCTAATGA
GCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATTAAGCATACCGATAATGGTGT
TCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGAAGA
TATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCATGG
CAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAACATTCA
TGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCA
AAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGTCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTC
GGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGA
AGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTGGT*
*GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAATAA
ATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTGAAGAGTGACTAATGACTGAGT
AGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAAATTTTTATTTAATAAAGAAG
GACATCATTGAATGTTTTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4AS44TF U 1
AF RR4EH48TF U 176
AF RR4AX39TF U 1
AF RR4BI86TF U 259
AF RR4AX39JQ C 169
AF RR4EH48JQ C 333
AF RR4DA63TF U 755
AF RR4D122JQ C 460
AF RR4D122TF U 460
AF RR4AS44JQ C 416
AF RR4H461TF U 379
BS 1 629 RR4AS44TF
BS 630 630 RR4EH48TF
BS 631 741 RR4AS44TF
BS 742 742 RR4AX39TF
BS 743 778 RR4AS44TF
BS 779 781 RR4AX39TF
BS 782 810 RR4AS44TF
BS 811 811 RR4AX39TF
BS 812 831 RR4AS44TF
BS 832 857 RR4AX39TF
BS 858 956 RR4BI86TF
BS 957 976 RR4DA63TF
BS 977 980 RR4EH48JQ

RD RR4AS44TF 840 0 0
GACTAACTCGCAAATTTCCGGCATAACGTCAACAAACAGCAAACTATTCCACATGAACAT
CCATCAATGCACTAACGTAACTCTTACAGATGTTCATATTGAGGCACCACCTGAGAGTCT
CAACACCGATGGTATCCACGTCGGAAAGTCCGTAGGCGTCACCATAAGAGGGTCAAAGAT
TAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAATTTACTTGTCGAGGG
CGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGTAAGTCTTGGAAAGCACCCTAATGA
GCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATTAAGCATACCGATAATGGTGT
TCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGAAGA
TATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCATGG
CAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAACATTCA
TGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCA
AAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGCCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTC
GGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGA
AGAATGTAAACCGGATAAAAA*TAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTGGGT
GGGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAA*TTATGTTTTAAGTTTTTTTT
TGTCGATAA

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4EH48TF 660 0 0
GG
GATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAATTTACTTGTCGA
GGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGAAGTCTTGGAAAGCACCCTAA
TGAGCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATTAAGCATACCGATAATGG
TGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGA
AGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCA
TGGCAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAACAT
TCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTG
CCAAAAAGTTACTTTGTCTTACATAAACTTGGTCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGT
CTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCAC
CGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTG
AT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCG

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4AX39TF 857 0 0
GACTAACTCGCAAATTTCCGGCATAACGTCAACAAACAGCAAACTATTCCACATGAACAT
CCATCAATGCACTAACGTAACTCTTACAGATGTTCATATTGAGGCACCACCTGAGAGTCT
CAACACCGATGGTATCCACGTCGGAAAGTCCGTAGGCGTCACCATAAGAGGGTCAAAGAT
TAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAATTTACTTGTCGAGGG
CGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGTAAGTCTTGGAAAGCACCCTAATGA
GCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATTAAGCATACCGATAATGGTGT
TCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGAAGA
TATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCATGG
CAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAACATTCA
TGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCA
AAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGCCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTC
GGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGA
AGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTGGT*
*GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAATAA
ATAGGCAGTAGTCCCTT

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR4BI86TF 698 0 0
G
CACGGTCTTTCCATCGGAAGTCTTGGAAAGCACCCTAATGAGCAACCAGTGAAAGGAATC
ACCATTCGTAAATGCATCATTAAGCATACCGATAATGGTGTTCGTATCAAAACATGGCCT
GGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGAAGATATCACCATGGACAATGTT
AGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAAAG*****CA
TCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAATAACATTCATGGCACATCATCAACAAAG
ATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGAC
ATAAACTTGGTCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAG
CCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAA
AAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTGGT**GGAGATGATTCCATTAGA
TGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTA
CGCTTGGAGTTTACCAGCTGAAGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTC
GAATCATGCGAGAATGTTTAAATTTTTATTTAATAAA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4AX39JQ 796 0 0
AGGGTCAAA
GATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAATTTACTTGTCGA
GGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGTAAGTCTTGGAAAGCACCCTAA
TGAGCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATTAAGCATACCGATAATGG
TGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGA
AGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTTTCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCA
TGGCAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAACAT
TCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTG
CCAAAAAGTTACTTTGTTTGACATAAACTTGGCCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGT
CTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCAC
CGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTG
GT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAA
TAAATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTGAAGAGTGACTAATGACTG
AGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAAATTTTTATTTAATAAAG
AAGGACA

QA 10 796 10 796
DS 

RD RR4EH48JQ 648 0 0
GCATCATTAAGCATACCGATAATGGTGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTG
GTCTCGTCTCCAACGTTATTTTTGAAGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTC
TCATCGACCAAGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGT
TGGAGAACCTGAACTTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAAC
TAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTTACATAAACTTGGTCA
GCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCG
GGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTT
GCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTGAT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAAT
TATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTA
CCAGCTGAAGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGA
ATGTTTAAATTTTTATTTAATAAAGAAGGACATCATTGAATGTTTTAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4DA63TF 224 0 0
G
CACCAAGCTTTCATCCGATCTGGT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTAT
GTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCA
GCTGAAGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATATACGATTCGAATCATGCGAGAATG
TTTAAATTTTTATTTAATAAAGAAGGACATCATTGAATGTT
TT

QA 2 222 2 222
DS 

RD RR4D122JQ 511 0 0
G
CAAGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAAC
CTGAACTTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGC
AGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTTTGACATAAACTTGGTCAGCAGCGGT
AAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATG
ATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCA
AGCTTTCATCCGATCTGGT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTT
AAGTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTGA
AGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAA
ATTTTTATTTAATAAAGAAGGACATCATTG

QA 2 511 2 511
DS 

RD RR4D122TF 511 0 0
G
CAAGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAAC
CTGAACTTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGC
AGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGTCAGCAGCGGT
AAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATG
ATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCA
AGCTTTCATCCGATCTGGT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTT
AAGTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTGA
AGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAA
ATTTTTATTTAATAAAGAAGGACATCATTG

QA 2 511 2 511
DS 

RD RR4AS44JQ 549 0 0
GAAGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCT
CATGGCAAATGCAAAAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAAC
ATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCT
TGCCAAAAAGTTACTTTGTTTGACATAAACTTGGCCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCT
GTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGC
ACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATC
TGGT**GGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCG
AATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTGAAGAGTGACTAATGAC
TGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAAATTTTTATTTAATAA
AGAAGGACA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4H461TF 598 0 0
G
GGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACTTTATTTTTGAAGATATCACCATGGACAATGTT
ATCTTGCCCGTTCTCATCGACCAGGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAAAGTGGGGCA
TCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAG
ATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGAC
ATAAACTTGGTCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAG
CCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAA
AAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCATCCGATCTGGT**GGAGATGATTCCATTAGA
TGGAGTATTAAATTATGTTTTAAGTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAGTAGTCCCTTTA
CGCTTGGAGTTTACCAGCTGAAGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTC
GAATCATGCGAGAATGTTTAAATTTTTATTTAATAAAGAAGGACATCATTG
AATGTT

QA 2 592 2 592
DS 



AS 2 8

CO CL394Contig1 1272 5 4 U
TTTTTGGTATCTTCAAAAGTTAAAGAAAAACCTGTTGTAACTTGTATAACTTTCATAAGT
CTTTGCAAGATGTTTGAAAATCTAAAAAGAACAAAAAGGGCTGAAAACTATTTTGAAGGG
ACTGATAATCACTGGAAACAAAAAAAA*TGTTTTCCTTTCTCTATTTTTTCCATACATAT
AAAACACACATTTTTATGTGTATATAAATGTTACTCCTCTTCCCTTCTTTCTCCATTGTC
TTCATTCTTCATGAGCTTTATTAACCTCCCCCTCTGTACTCTTCGATTCATCAAACGCCA
TCAACGGTTTGATGTCACCATTCCAAATGCAATGAGAAGCCAAAAAACCAATGACGGCTG
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GGACAACTCCAGCAACGTATCCCACAAATGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTC
TTGACACGTCAAATCTTAAAGCCAGTGCAACAAAAATACCCGGGATGACAATATCACCAG
GCCCAAGCATAGAGTAGGGTCTTAGAGCATCGCCCGTAGGGAACAAAAGCTTGATCGGAG
CATCAAATGATTTGACAACACTAACCATAACCGGAGTAAAGAAGACCCAGAAAATATCAT
AGAAAAACAGTCCAACCAAAAGGATGCCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCT
CAATTCCCTGAACGCAGAAGGAAAGGCCAAGGATATTGTTAGCGAGCCAATGTTTCTTCC
AGGCATACCAGGCGCAGAAGAAGAATCCAGGGATTCCCGCAACAACTTGGGACTTTGTGA
ACTCTACCTCCAAAGATTTGAAATAAGGAAAAGTCCAGACGGTAACAACGTCATTCCAAA
GGTTGGGAAGAAATCTGCTGATGGCAGGTAACAGTGTCGCTGAAAGGGCGACGGTGCCAA
GAACAAAGAAGTAAGCAGTGAGGACAGCATTGACCAAGTCCTTGGAGAGAAACTTGAACA
ATAAGAAAAGAGAGAGAAGCATAGCACTCCCAACCAATGGGAAACGCATGGCATGCTCTT
TCGACATCGTCTCAGTTGGAGGAGAATCCTTGACGGAACGAAAGCAACCGACAAAAACAG
TGAGGCATGCCGTAAGGACAACATTCAAGTTTGGGTTCACCCTCACAACAAGTGGTGCCA
ATGTCAATCCTGCGAGAGCGAGATTAGCGATGCGCTCACAGTTCTTCATGACTGAGATCC
CTCCGTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR09JQ U 6
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CTTTGCAAGATGTTTGAAAATCTAAAAAGAACAAAAAGGGCTGAAAACTATTTTGAAGGG
ACTGATAATCACTGGAAACAAAAAAAA*TGTTTTCCTTTCTCTATTTTTTCCATACATAT
AAAACACACATTTTTATGTGTATATAAATGTTACTCCTCTTCCCTTCTTTCTCCATTGTC
TTCATTCTTCATGAGCTTTATTAACCTCCCCCTCTGTACTCTTCGATTCATCAAACGCCA
TCAACGGTTTGATGTCACCATTCCAAATGCAATGAGAAGCCAAAAAACCAATGACGGCTG
GGACAATGTACAACAAAGCAGGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACGATAGTGA
GGACAACTCCAGCAACGTATCCCACAAATGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTC
TTGACACGTCAAATCTTAAAGCCAGTGCAACAAAAATACCCGGGATGACAATATCACCAG
GCCCAAGCATAGAGTAGGGTCTTAGAGCATCGCCCGTAGGGAACAAAAGCTTGATCGGAG
CATCAAATGATTTGACAACACTAACCATAACCGGAGTAAAGAAGACCCAGAAAATATCAT
AGAAAAACAGTCCAACCAAAAGGATGCCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCT
CA

QA 1 722 1 722
DS 

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GG
AGGGACTGATAATCACTGGAAACAAAAAAAAATGTTTTCCTTTCTCTATTTTTTCCATAC
ATATAAAACACACATTTTTATGTGTATATAAATGTTACTCCTCTTCCCTTCTTTCTCCAT
TGTCTTCATTCTTCATGAGCTTTATTAACCTCCCCCTCTGTACTCTTCGATTCATCAAAC
GCCATCAACGGTTTGATGTCACCATTCCAAATGCAATGAGAAGCCAAAAAACCAATGACG
GCTGGGACAATGTACAACAAAGCAGGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACGATA
GTGAGGACAACTCCAGCAACGTATCCCACAAATGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTG
CGTCTTGACACGTCAAATCTTAAAGCCAGTGCAACAAAAATACCCGGGATGACAATATCA
CCAAGCCCAAGCATAGAGTAGGGTCTTAAAGCATCGCCCGTAGGGAACAAAAGCTTGATC
GGAGCATCAAATGATTTGGCAACACTAACCATAACCGGAGTAAAGAAGACCCAGAAAATA
TCATAAAAAAACAGTCCAACCAAAAGGATGCCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGC
ATCTCAATTCCCTGAA
CGC

QA 3 618 3 618
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GCCAGTGCAC
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CCCGTAGGGAACAAAAGCTTGATCGGAGCATCAAATGATTTGACAACACTAACCATAACC
GGAGTAAAGAAGACCCAGAAAATATCATAGAAAAACAGTCCAACCAAAAGGATGCCACCA
GTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCTCAATTCCCTGAACGCAGAAGGAAAGGCCAAGG
ATATTGTTAGCGAGCCAATGTTTCTTCCAGGCATACCAGGCGCAGAAGAAGAATCCAGGG
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GTCCAGACGGTAACAACGTCATTCCAAAGGTTGGGAAGAAATCTGCTGATGGCAGGTAAC
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ACCAAGTCCTTGGAGAGAAACTTGAACAATAAGAAAAGAGAGAGAAGCATAGCACTCCCA
ACCAATGGGAAACGCATGGCATGCTCTTTCGACATCGTCTCAGTTGGAGGAGAATCCTTG
ACGGAACGAAAGCAACCGACAAAAACAGTGAGGCATGCCGTAAGGACAACATTCAAGTTT
GGGTTCACCCTCACAACAAGTGGTGCCAATGTCAATCCTGCGAGAGCGAGATTAGCGATG
CGCTCACAGTTCTTCATGACTGAGATCCCTCCGT
TTCCC

QA 11 764 11 764
DS 

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CATCTCAATTCCCTGAACGCAGAAGGAAAGGCCAAGGATATTGTTAGCGAGCCAATGTTT
CTTCCAGGCATACCAGGCGCAGAAGAAGAATCCAGGGATTCCCGCAACAACTTGGGACTT
TGTGAACTCTACCTCCAAAGATTTGAAATAAGGAAAAGTCCAGACGGTAACAACGTCATT
CCAAAGGTTGGGAAGAAATCTGCTGATGGCAGGTAACAGTGTCGCTGAAAGGGCGACGGT
GCCAAGAACAAAGAAGTAAGCAGTGAGGACAGCATTGACCAAGTCCTTGGAGAGAAACTT
GAACAATAAGAAAAGAGAGAGAAGCATAGCACTCCCAACCAATGGGAAACGCATGGCATG
CTCTTTCGACATCGTCTCAGTTGGAGGAGAATCCTTGACGGAACGAAAGCAACCGACAAA
AACAGTGAGGCATGCCGTAAGGACAACATTCAAGTTTGGGTTCACCCTCACAACAAGTGG
TGCCAATGTCAATCCTGCGAGAGCGAGATTAGCGATGCGCTCACAGTTCTTCATGACTGA
GATCCCTCCGTGTTCCC

QA 1 557 1 557
DS 



CO CL394Contig2 770 3 2 U
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GAAAATCTAAAAAGAGCAAAAAAAGGTGAAGGGAATGATGATCGTTGGAAACAAAAATTG
TTTTCCTTCTCTTTGTTTCCATACATATAAAACACACACACATTCATGTGTATACATATT
TCTCCTCTCGCACTTCTTTCTCCACATTTGCTTCATTCTGCATGGCTTTTGTTAACATCT
CCCTCACTACTCTTTGATTCCTCCTCAGCACTCTTCGCTGATTCATCAAACGCCATCAAC
GGTTTGATGTCACCGTTCCAAATGCAGTGAGAAGCCAGGAACCCGATGACGGCTGGGACA
ATGTACAACAAAGCAGGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGGACA
ACGCCAGCAACGTATCCCACAAACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGAC
ACATCGAATCTTAGAGCCAACGCAACAAAAATACCCGGAATGACAATATCACCAAGCCCT
AGCATAGAGTATGGCCTTAGAGCATCCCCCGTAGGGAACAAAAGCTTTATCGGAGCATCA
AAGGATTTGGCAACACTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAAAATATCATAGAAA
AACAGTCCTACCAAAAGGATGGCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCTCAATT
CCCTGAATGCAGAAGGAGAGGCCAAGGATATTGTTAGCCAGCCAATGTTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D117JQ U 1
AF RR4D117TF C 1
AF RR4GT52JQ U 196
BS 1 511 RR4D117JQ
BS 512 770 RR4GT52JQ

RD RR4D117JQ 511 0 0
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TTTTCCTTCTCTTTGTTTCCATACATATAAAACACACACACATTCATGTGTATACATATT
TCTCCTCTCGCACTTCTTTCTCCACATTTGCTTCATTCTGCATGGCTTTTGTTAACATCT
CCCTCACTACTCTTTGATTCCTCCTCAGCACTCTTCGCTGATTCATCAAACGCCATCAAC
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ACGCCAGCAACGTATCCCACAAACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGAC
ACATCGAATCTTAGAGCCAACGCAACAAAAA

QA 1 511 1 511
DS 

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GAAAATCTAAAAAGAGCAAAAAAAGGTGAAGGGAATGATGATCGTTGGAAACAAGAATTG
TTTTCCTTCTCTTTGTTTCCATACATATAAAACACACACACATTCATGTGTATACATATT
TCTCCTCTCGCACTTCTTTCTCCACATTTGCTTCATTCTGCATGGCTTTTGTTAACATCT
CCCTCACTACTCTTTGATTCCTCCTCAGCACTCTTCGCTGATTCATCAAACGCCATCAAC
GGTTTGATGTCACCGTTCCAAATGCAGTGAGAAGCCAGGAACCCGATGACGGCTGGGACA
ATGTACAACAAAGCAGGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGGACA
ACGCCAGCAACGTATCCCACAAACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGAC
ACATCGAATCTTAGAGCCAACGCAACAAAAATACCCGGAATGACAATATCACCAAGCCCT
AGCATAGAGTATGGCCTTAGAGCATCCCCCGTAGGGAACAAAAGCTTTATCGGAGCATCA
AAGGATTTGGCAACACTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAAAATATCATAGAAA
AACAGTCCTACCAAAAGGATGGCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCTCAATT
CCCTGAATGCAGAAGGAGAGGCCAAGGAT
C

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GT52JQ 575 0 0
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GATTCCTCCTCAGCACTCTTCGCTGATTCATCAAACGCCATCAACGGTTTGATGTCACCG
TTCCAAATGCAGTGAGAAGCCAGGAACCCGATGACGGCTGGGACAATGTACAACAAAGCA
GGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGGACAACGCCAGCAACGTAT
CCCACAAACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGACACATCGAATCTTAGA
GCCAACGCAACAAAAATACCCGGAATGACAATATCACCAAGCCCTAGCATAGAGTATGGC
CTTAGAGCATCCCCCGTAGGGAACAAAAGCTTTATCGGAGCATCAAAGGATTTGGCAACA
CTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAAAATATCATAGAAAAACAGTCCTACCAAA
AGGATGGCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCTCAATTCCCTGAATGCAGAAG
GAGAGGCCAAGGATATTGTTAGCCAGCCAATGTTT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 2 10

CO CL395Contig1 969 8 7 U
GTTTGACAGATAGTGAGAGAGAGAAGTCTCGATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCT
CATCTCCTCCTCCACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTCCATCTCCCTCCATCTC
TTTCCTTCCAACCCTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGGTTTTCTCAACGCTCTTCCCTCAC
CTCAATCCGCTCCACTTCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCC
ATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCAT
CAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTT
GGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATT
TGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGC
GTGGGTTCAAACAGACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATC
AGATGTCACTAAATCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGC
GTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAA
TCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAGGCACTACAGTACAT
CCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAA
GCCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAGTATTTCTCAGCTATTTAGAAATATCTACGAAACCT
TTGTTATATGTGAGCTGAGTTTTTTT**CTTTTAAGCGCCGAACAATCCGTTGTTTGGAT
CTCCACTTTGTCCCCCACCCCAGAATCCTTAAAACTTACATTTTCCATTAATAAAAGTTT
ATCTCCAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
20 35 20 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 30 30 30 30 30 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H015TF U 28
AF RR4DM09TF U 1
AF RR4BI93TF U 1
AF RR4B725TF U 1
AF RR4GV55TF U 15
AF RR4DM09JQ C 129
AF RR4B725JQ C 265
AF RR4BI93JQ C 137
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BS 405 752 RR4B725TF
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BS 754 830 RR4B725TF
BS 831 958 RR4DM09JQ
BS 959 969 RR4BI93JQ

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CTCA
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GCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAG
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TCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACAGACAGAAAATCTGGAGGA
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GGAGTGATCCAACATTCAACCATCAGCAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACA
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TGC

QA 5 719 5 719
DS 

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TTTCCTTCCAACCCTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGGTTTTCTCAACGCTCTTCCCTCAC
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ATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCAT
CAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTT
GGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATT
TGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGC
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GTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGACGAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAA
TCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAAGCCTTCAGGCACTACAGTACAT
CCAGGAGAACCCTGA

QA 1 735 1 735
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CATCTCCTCCTCCACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTCCATCTCCCTCCATCTC
TTTCCTTCCAACCCTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGGTTTTCTCAACGCTCTTCCCTCAC
CTCAATCCGCTCCACTTCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCC
ATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCAT
CAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTT
GGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATT
TGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTTAGGTGTCTTTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGC
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TCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAGGCACTACAGTACAT
CCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCTGCAGGATGGAAAC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4B725TF 830 0 0
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CATCTCCTCCTCCACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTCCATCTCCCTCCATCTC
TTTCCTTCCAACCCTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGGTTTTCTCAACGCTCTTCCCTCAC
CTCAATCCGCTCCACTTCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCC
ATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCAT
CAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTT
GGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTCACCGGTATGCAGAATT
TGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGC
GTGGGTTCAAACAGACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATC
AGATGTCACTAAATCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGC
GTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAA
TCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAGGCACTACAGTACAT
CCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCTGCAG*ATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAA
GCCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAGTATTTCTCAGCTATTTAGAAATATC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4GV55TF 818 0 0
GAC
AGAGATAAGTCTCAATGGCGTCTGTAGCTTCTTCATCCACTCTCATCTCCTCCTCCACCA
GAGCTCTCCC**CCAAGTCTCCGCTTCCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACCCTCT
CTTCTCCCCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACCTCAATCCGCTCCACTT
CTCGCCCGAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCATTGGTTGGAAACAAGG
CGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTG
AGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCT
GCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACAG
AGGTGTTAGGTATCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACTGACA
GAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTATCCCCTTATATCAGATGTCACTAAATCAA
TCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCA
TAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAA
GTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAG*CACTACAGTACATCCAGGAGA*CCCTGATG
AAGTCTGCCCTGCAG*ATGGAAGCCAGTG*AGAAGTCA*TGAAAC*TGACCC**AGCTCA
GCAA*GAGTATT*CTCAGCTATTAGTA
TATCTACG

QA 4 810 4 810
DS 

RD RR4DM09JQ 838 0 0
CAACCCTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGGTTT*CTCAACGCTCTTCCCTCACCTCAATCC
GCTCCACTTCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCATTGGTTG
GAAACAAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTA
AGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCA
CTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGT
TGAACACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTTC
AAACAGACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCA
CTAAATCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGCGTTGAGAG
GGCTTTTCATAATAGACGAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTA
TTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAAGCCTTCAGGCACTACAGTACATCCAGGAGA
ACCCTGATGAAGTCTGCCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAAGCCTGACC
CCAAGCTCAGCAAAGAGTATTTCTCAGCTATTTAGAAATATCTACGAAACCTTTGTTATA
TGTGAGCTGAGTTTTTTT**CTTTTAAGCGCCGAACAATCCGTTGTTTGGATCTCCACTT
TGTCCCCCACCCCAGAATCCTTAAAACTTACATTTTCCATTAATAAAAGT
TTATCTCC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4B725JQ 702 0 0
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TGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAAC
AGAGATTACTGCCTTCAGTCACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTT
AGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTTCAAACAGACAGAAAATC
TGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCAATCTCAAA
ATCTTTTGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGA
CAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGA
TGAGACAATGAGAACCCTTCAGGCACTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTG
CCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAAGCCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGA
GTATTTCTCAGCTATTTAGAAATATTTACGAAACCTTTGTTATATGTGAGCTGAGTTTTT
TT**CTTTTAAGCGCCGAACAATCCGTTGTTTGGATCTCCACTTTGTCCCCCACCCCAGA
ATCCTTAAAACTTACATTTTCCATTAATAAAAGT
TTATCTCC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BI93JQ 833 0 0
TCTTCTCCTCTCCGCTCTGGGTTTTCTCAACGCTCTTCCCTCACCTCAATCCGCTCCACT
TCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCATTGGTTGGAAACAAG
GCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCT
GAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTC
TGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACA
GAGGTGTTAGGTGTCTTTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTTCAAACAGAC
AGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCA
ATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCATGACCAGG*AACAGCGTTGAGAGGGCTTTTC
ATAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGA
AGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAGGCACTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGAT
GAAGTCTGCCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAAGCCTGACCCCAAGCTC
AGCAAAGAGTATTCCTCAGCTATTTAGAAATATCTACGAAACCTTTGTTATATGTGAGCT
GAGTTTTTTTTTCTTTTAAGCGCCGAACAATCCGTTGTTTGGATCTCCACTTTGTCCCCC
ACCCCAGAATCCTTAAAACTTACATTTTCCATTAATAAAAGTTTATCTCCAAG

QA 1 833 1 833
DS 



CO CL395Contig2 702 2 3 U
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GTGGAGATCCAAACAACGGATTGTTCGGCGCTTAAAAGAAAAAAAAACTCAGCTCACATA
TAACAAAGGTTTCGTAAATATTACTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGG
TCAGGTTTCATTAACTTCTCACCTGGCTTCCATCCTGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTC
TCCTGGATGTACTGTAGTGCCTGAAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACACTTCGGCCAATA
CCAAGATTGTTGATGGTTGAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCTATTATGAAAAGCCCT
CTCAACGCTATTCCCTGGTCATGGATGAGCACTCCAAAAGATTTTGAGATTGATTTAGTG
ACATCTGATATAAGGGGATAGTTGAGATCACCAAGTCCTCCAGATTTTCTGTCAGTTTGA
ACCCAAGCAAGGGGGGAGAACACACTATCAACAGAGATACCTAACACCTCTGTGTTCAAC
TTCTCAAATTCTGCATACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTG
AAGTCCAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAGAGCTTA
ACCTTGATGAACTCCTGATCGAACACAGCCTCAGCCTCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV55JQ U 33
AF RR4FA26JQ U 1
BS 1 492 RR4FA26JQ
BS 493 493 RR4GV55JQ
BS 494 702 RR4FA26JQ

RD RR4GV55JQ 587 0 0
TAAGTTTTAAGGATTCTG
GGGGGACAAAGTGGAGATCCAAACAACGGATTGTTCGGCGCTTAAAAGAAAAAAAAACTC
AGCTCACATATAACAAAGGTTTCGTAGATATTACTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCT
GAGCTTGGGGTCAGGTTTCATTGACTTCTCACCTGGCTTCCATCCTGCAGGGCAGACTTC
ATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAGTGCCTGAAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACACT
TCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTTGAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCTATTAT
GAAAAGCCCTCTCAACGCTATTCCCTGGTCATGGATGAGCACTCCAAAAGATTTTGAGAT
TGATTTAGTGACATCTGATATAAGGGGATAGTTGAGATCACCAAGTCCTCCAGATTTTCT
GTCAGTTTGAACCCAAGCAAGGGGGGAGAACACACTATCAACAGAGATACCTAACACCTC
TGTGTTCAACTTCTCAAATTCTGCATACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGCA
GACGAAAGTGAAGTCCAAAGGGTAGAAAA

QA 19 587 19 587
DS 

RD RR4FA26JQ 702 0 0
GGAGATAACAAGACTTTTATTAATGGAAAATGTAAGTTTTAAGGATTCTGGGGGGACAAA
GTGGAGATCCAAACAACGGATTGTTCGGCGCTTAAAAGAAAAAAAAACTCAGCTCACATA
TAACAAAGGTTTCGTAAATATTACTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGG
TCAGGTTTCATTAACTTCTCACCTGGCTTCCATCCTGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTC
TCCTGGATGTACTGTAGTGCCTGAAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACACTTCGGCCAATA
CCAAGATTGTTGATGGTTGAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCTATTATGAAAAGCCCT
CTCAACGCTATTCCCTGGTCATGGATGAGCACTCCAAAAGATTTTGAGATTGATTTAGTG
ACATCTGATATAAGGGGATAGTTGAGATCACCAAGTCCTCCAGATTTTCTGTCAGTTTGA
ACCCAAGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGATACCTAACACCTCTGTGTTCAAC
TTCTCAAATTCTGCATACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTG
AAGTCCAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAGAGCTTA
ACCTTGATGAACTCCTGATCGAACACAGCCTCAGCCTCAAAA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 10

CO CL396Contig1 1371 8 18 U
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CGACTCAAGGTCAGGTTATCACTTGCAAAGCTGCGGTGGCTTACGAGCCGAACAAACCTC
TGGTCATCGAAGATGTCCAAGTCGCTCCTCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGCATCAAGATCC
TCTTCACCGCTCTCTGTCACACCGACGCCTACACCTGGAGCGGCAAGGATCCCGAAGGTC
TCTTCCCCTGTATCCTCGGTCATGAAGCTGCTGGGGTTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTG
TGACTGAAGTTCAACCAGGAGACCATGTTATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGTGAAT
GCAAGTTCTGCAAATCTGGCAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTTCGTTCCGCTACTGGTG
TTGGGGTCATGATGAACGACCGTAAGAGCCGGTTCTCGGTTGATGGGAAACCCATTTATC
ACTTCATGGGCACCTCCACCTTTAGCCAGTACACTGTTGTTCATGATGTCAGTGTTGCCA
AGATCGACCCTCAGGCTCCTTTGGAGAAAGTCTGCCTTCTTGGATGTGGTGTTCCCACTG
GCCTTGGAGCTGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAACCAGGGTCAAATGTTGCCATCTTTG
GTCTTGGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGA
TCATTGGCATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTAAATG
AGTTTGTGAACCCAAAGGACCACCAAAAGCCAATTCAGGAAGTGATTGTCGATCTCACTG
ATGGAGGTGTTGACTACAGCTTTGAGTGCATCGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCAT
TGGAGTGCTGTCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTGGGTGTTGCAGCATCAGGAC
AAGAGATATCCACACGACCGTTCCAACTTGTGACTGGTCGTGTGTGGAAAGGAACAGCCT
TTGGTGGTTTCAAGAGTCGAACCCAAGTGCCTTGGCTCGTAGAGAAGTATATGAACAAGG
AGATCAAAGTGGATGAGTACATAACTCACAACATGACATTGGGAGAGATCAACAAGGCTT
TTGATCTTCTGCATGAAGGCACTTGTCTTCGTTGTGTCCTTAGTACCAGCGATTAAAAAA
AACAATGGGTTTATGTCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGCTTCATCATGTGTCTTGTGA
CTTGTCAATTTCCTGAGCAACAGACTCGAATCGTGTGTGCGCTTTAATAACTTTTGATTA
AAAGACCGAAAAGCTCATTAATAATAAGCAACCATGTTTGTGGAGGGATTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4CJ69TF U 419
AF RR4FA56TF U 1
AF RR4DV79TF U 1
AF RR4EV10TF U 3
AF RR4EV10JQ C 607
AF RR4DV79JQ C 611
AF RR4G817JQ C 665
AF RR4G817TF U 665
BS 1 188 RR4DV79TF
BS 189 189 RR4FA56TF
BS 190 418 RR4DV79TF
BS 419 419 RR4FA56TF
BS 420 469 RR4DV79TF
BS 470 470 RR4CJ69TF
BS 471 490 RR4DV79TF
BS 491 491 RR4CJ69TF
BS 492 574 RR4DV79TF
BS 575 575 RR4CJ69TF
BS 576 693 RR4DV79TF
BS 694 694 RR4CJ69TF
BS 695 718 RR4DV79TF
BS 719 719 RR4G817TF
BS 720 744 RR4DV79TF
BS 745 786 RR4EV10TF
BS 787 1367 RR4G817TF
BS 1368 1371 RR4G817JQ

RD RR4CJ69TF 282 0 0
G
GTTGGGGTTATGATGAACGACCGTAAGAGCCGGTTCTCGGTTGATGGGAAACCCATTTAT
CACTTCATGGGCACCTCCACCTTTAGTCAGTACACTGTTGTTCATGATGTCAGTGTTGCC
AAGATCGACCCTCAGGCCCCTTTGGAGAAAGTCTGCCTTCTTGGATGTGGTGTTCCCACT
GGCCTTGGAGCTGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAACCTGGGTCAAATGTTGCCATCTTT
GGTCTTGGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGGGTGC
AAA

QA 2 279 2 279
DS 

RD RR4FA56TF 695 0 0
GGAC
ACACCACACCACCAGAAAGTGCCTCCCTCTTTCTCTCTAA*TCTATCTATCAATGGCGAC
TCAAGGTCGGGTTATCACTTGCAAAGCTGCGGTGGCTTACGAGCCGAACAAACCTCTGGT
GATCGAAGATGTCCAAGTCGCTCCTCCTCAGGCCCGTGAGGTTCGCATCAAGATCCTCTT
CACCGCTCTCTGTCACACCGACGCCTACACCTGGAGCGGCAAGGATCCCGAAGGTCTCTT
CCCCTGTATCCTCGGTCATGAAGCTGCTGGGGTTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTGCGAC
TGAAGTTCAACCAGGAGACCATGTTATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGTGAATGCAA
GTTCTGCAAATCGGGCAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTTCGGTCCGCTACTGGTGTTGG
GGTTATGATGAACGACCGTAAGAGCCGGTTCTCGGTTGATGGGAAACCCATTTATCACTT
CATGGGCACCTCCACCTTTAGTCAGTACACTGTTGTTCATGATGTCAGTGTTGCCAAGAT
CGACCCTCAGGCTCCTTTGGAGAAAGTCTGCCTTCTTGGATGTGGTGTTCCCACTGGCCT
TGGAGCTGTTTGGAGCACTGCAAAAGTAGAACCTGGGTCAAATGTTGCCATCTTTGGTCT
TGGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGG
TG

QA 5 693 5 693
DS 

RD RR4DV79TF 750 0 0
GGACACACCACACCACCACAAAGTGCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATCAATGG
CGACTCAAGGTCAGGTTATCACTTGCAAAGCTGCGGTGGCTTACGAGCCGAACAAACCTC
TGGTCATCGAAGATGTCCAAGTCGCTCCTCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGCATCAAGATCC
TCTTCACCACTCTCTGTCACACCGACGCCTACACCTGGAGCGGCAAGGATCCCGAAGGTC
TCTTCCCCTGTATCCTCGGTCATGAAGCTGCTGGGGTTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTG
TGACTGAAGTTCAACCAGGAGACCATGTTATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGTGAAT
GCAAGTTCTGCAAATCTGGCAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTTCGTTCCGCTACTGG*G
TTGGGGTCATGATGAACGACCGTAAGAGCCGGTTCTCGGTTGATGGGAAGCCCATTTATC
ACTTCATGGGTACCTCCACCTTTAGCCAGTACACTGTTGTTCATGATGTCAGTGTTGCCA
AGATCGACCCTCAGGCTCCTTTGGAGAAAGTCTGTCTTCTTGGATGTGGTGTTCCCACTG
GCCTTGGAGCTGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAACCAGGGTCAAATGTTGCCATCTTTG
GTCTTGGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGG*TGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAG*A
TCATTGGCATTGATATCGACAGCA
GAAGTA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4EV10TF 784 0 0
GG
ACACCACACCACCACAAAGTGCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATCAATGGCGAC
TCAAGGTCAGGTTATCACTTGCAAAGCTGCGGTGGCTTACGAGCCGAACAAACCTCTGGT
CATCGAAGATGTCCAAGTCGCTCCTCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGCATCAAGATCCTCTT
CACCGCTCTCTGTCACACCGACGCCTACACCTGGAGCGGCAAGGATCCCGAAGGTCTCTT
CCCCTGTATCCTCGGTCATGAAGCTGCTGGGGTTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTGTGAC
TGAAGTTCAACCAGGAGACCATGTTATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGTGAATGCAA
GTTCTGCAA*TCTGGCAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTTCGTTCCGCTACTGGTGTTGG
GGTCATGATGAACGACCGTAAGAGCCGGTTCTCGGTTGATGGGAAGCCCATTTATCACTT
CATGGGTACCTCCACCTTTAGCCAGTACACTGTTGTTCATGATGTCAGTGTTGCCAAGAT
CGACCCTCAGGCTCCTTTGGAGAAAGTCTGTCTTCTTGGATGTGGTGTTCCCACTGGCCT
TGGAGCTGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAACCAGGGTCAAATGTTGCCATCTTTGGTCT
TGGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGG*TGCGAAA*CAGCTGGTGCTACAAG*ATCAT
TGGCATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTAAATGAGTT
TG

QA 3 784 3 784
DS 

RD RR4EV10JQ 713 0 0
GAGCTGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAACCAGGGTCAAATGTTGCCATCTTTGGTCTTG
GCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATTG
GCATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTAAATGAGTTTG
TGAACCCAAAGGACCACCAAAAGCCAATTCAGGAAGTGATTGTCGATCTCACTGACGGAG
GTGTTGACTACAGCTTTGAGTGCATCGGGAATTTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAGT
GCTGTCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTGGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAGA
TATCCACACGACCGTTCCAACTTGTGACTGGTCGTGTGTGGAAAGGAACAGCCTTTGGTG
GTTTCAAGAGTCGAACCCAAGTGCCTTGGCTCGTGGAGAAGTATATGAACAAGGAGATCA
AAGTGGATGAGTACATAACTCACAGCATGACATTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGATC
TTCTGCATGAAGGCACTTGTCTTCGTTGTGTCCTTAGTACCAGCGATTAAAAAAAACAAT
GGGTTTATGTCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGCTTCATCATGTGTCTTGTGACTTGTC
AATTTCCTGAGCAACAGACTCGAATCGTGTGTGCGCTTTAATAACTTTTGATT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4DV79JQ 757 0 0
TGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAACCAGGGTCAAATGTTGCCATCTTTGGTCTTGGCAC
TGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATTGGCAT
TGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTAAATGAGTTTGTGAA
CCCAAAGGACCACCAAAAGCCAATTCAGGAAGTGATTGTCGATCTCACTGATGGAGGTGT
TGACTACAGCTTTGAGTGCATCGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAGTGCTG
TCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTGGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAGATATC
CACACGACCGTTCCAACTTGTGACTGGTCGTGTGTGGAAAGGAACAGCCTTTGGTGGTTT
CAAGAGTCGAACCCAAGTGCCTTGGCTCGTAGAGAAGTATATGAACAAGGAGATCAAAGT
GGATGAGTACATAACTCACAACATGACATTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGATCTTTT
GCATGAAGGCACTTGTCTTCGTTGTGTCCTTAGTACCAGCGATTAAAAAAAACAATGGGT
TTATGTCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGCTTCATCATGTGTCTTGTGACTTGTCAATT
TCCTGAGCAACAGACTCGAATCGTGTGTGCGCTTTAATAACTTTTGATTAAAAGACCGAA
AAGCTCATTAATAATAAGCAACCGTGTTTGTGGAGGG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4G817JQ 707 0 0
G
GGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATT
GGCATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTAAATGAGTTT
GTGAACCCAAAGGACCACCAAAAGCCAATTCAGGAAGTGATTGTCGATCTCACTGATGGA
GGTGTTGACTACAGCTTTGAGTGCATCGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAG
TGCTGTCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTGGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAG
ATATCCACACGACCGTTCCAACTTGTGACTGGTCGTGTGTGGAAAGGAACAGCCTTTGGT
GGTTTCAAGAGTCGAACCCAAGTGCCTTGGCTCGTAGAGAAGTATATGAACAAGGAGATC
AAAGTGGATGAGTACATAACTCACAACATGACATTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGAT
CTTCTGCATGAAGGCACTTGTTTTCGTTGTGTCCTTAGTACCAGCGATTAAAAAAAACAA
TGGGTTTATGTCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGCTTCATCATGTGTCTTGTGACTTGT
CAATTTCCTGAGCAACAGACTCGAATCGTGTGTGCGCTTTAATAACTTTTGATTAAAAGA
CCGAAAAGCTCATTAATAATAAGCAACCATGTTTGTGGAGGGATTT

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR4G817TF 707 0 0
G
GGCACTGTGGGACTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATT
GGCATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTAAATGAGTTT
GTGAACCCAAAGGACCACCAAAAGCCAATTCAGGAAGTGATTGTCGATCTCACTGATGGA
GGTGTTGACTACAGCTTTGAGTGCATCGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAG
TGCTGTCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTGGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAG
ATATCCACACGACCGTTCCAACTTGTGACTGGTCGTGTGTGGAAAGGAACAGCCTTTGGT
GGTTTCAAGAGTCGAACCCAAGTGCCTTGGCTCGTAGAGAAGTATATGAACAAGGAGATC
AAAGTGGATGAGTACATAACTCACAACATGACATTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGAT
CTTCTGCATGAAGGCACTTGTCTTCGTTGTGTCCTTAGTACCAGCGATTAAAAAAAACAA
TGGGTTTATGTCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTGCTTCATCATGTGTCTTGTGACTTGT
CAATTTCCTGAGCAACAGACTCGAATCGTGTGTGCGCTTTAATAACTTTTGATTAAAAGA
CCGAAAAGCTCATTAATAATAAGCAACCATGTTTGTGGAGGG
ATTT

QA 2 703 2 703
DS 



CO CL396Contig2 752 2 3 U
CCCTCCACAAACATGGTTGCTTATTATTAATGATGCTTTTCGGTCTTTAATGAAAATTTA
TAAAAGCGCACACACGATTCGAGTCTGTTGCTCAGGAAATTGACAAAGTCACAAGACACA
TAATGAAGCAAAGAGAGAGACGACATAAACCCATTGTTTTTTTTTAATCGCTGGTACTAA
GGACACAACGAAAACAAATGCCTTCATGCAGCAAATCAAAAGCCTTGTTGATCTCTCCCA
ATGTCATGTTGTGCGTTATGTATTCATCCACTTTGATCTCCTTGTTCATATACTTCTCTA
CGAGCCAAGGCACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAGCTGTTCCTTTCCACACAC
GACCAGTCACAAGTTGGAACGGTCGTGTGGATATCTCTTGTCCTGATACTGCAACACCCA
CTATAACCGAAGTTCCCCATCCCTTGTGACAGCACTCCAATGCGGCTCTCATCACGGAAA
CATTCCCGATGCACTCAAAGCTGTAGTCAACACCTCCATCAGTGAGATCGACAATCACTT
CCTGAATGGGCTTTTGGTGATCCTTTGGGTTCACAAACTCATTAACACCAAACTTCTTTG
CAGTTTCATACTTCTTGCTGTCGATATCAATGCCAATGATCCTAGTAGCACCAGCTGTTT
TTGCACCCTCAGCAACAGCAAGTCCCACAGTGCCAAGACCAAAGATGGCAACATTTGACC
CAGGTTCTACTTTTGCAGTGCTCCAAACAGCT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ69JQ U 1
AF RR4FA56JQ U 1
BS 1 405 RR4FA56JQ
BS 406 406 RR4CJ69JQ
BS 407 752 RR4FA56JQ

RD RR4CJ69JQ 719 0 0
CG
CTCCACAAACATGGTTGCTTATTATTAATGATGCTTTTCGGTCTTTAATGAAAATTTATA
AAAGCGCACACACGATTCGAGTCTGTTGCTCAGGAAATTGACAAAGTCACAAGACACATA
ATGAAGCAAAGAGAGAGACGACATAAACCCATTGTTTTTTTTTAATCGCTGGTACTAAGG
ACACAACGAAAACAAGTGCCTTCATGCAGCAAATCAAAAGCCTTGTTGATCTCTCCCAAT
GTCATGTTGTGCGTTATGTATTCATCCACTTTGATCTCCTTGTTCATATACTTCTCTACG
AGCCAAGGCACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAGCTGTTCCTTTCCACACACGA
CCAGTCACAAGTTGGAACGGTCGTGTGGATATCTCTTGTCCTGATGCTGCAACACCCACT
ATAACCGAAGTTCCCCATCCCTTGTGACAGCGCTCCAATGCGGCTCTCATCACGGAAACA
TTCCCGATGCACTCAAAGCTGTAGTCAACACCTCCATCAGTGAGATCGACAATCACTTCC
TGAATGGGCTTTTGGTGATCCTTTGGGTTCACAAACTCATTAACACCAAACTTCTTTGCA
GTTTCATACTTCTTGCTGTCGATATCAATGCCAATGATCCTAGTAGCACCAGCTGTTTTT
GCACCCTCAGCAACAGCAAGTCCCACAGTGCCAAGACCAAAGATGGCAACATTTGAC

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR4FA56JQ 752 0 0
CCCTCCACAAACATGGTTGCTTATTATTAATGATGCTTTTCGGTCTTTAATGAAAATTTA
TAAAAGCGCACACACGATTCGAGTCTGTTGCTCAGGAAATTGACAAAGTCACAAGACACA
TAATGAAGCAAAGAGAGAGACGACATAAACCCATTGTTTTTTTTTAATCGCTGGTACTAA
GGACACAACGAAAACAAATGCCTTCATGCAGCAAATCAAAAGCCTTGTTGATCTCTCCCA
ATGTCATGTTGTGCGTTATGTATTCATCCACTTTGATCTCCTTGTTCATATACTTCTCTA
CGAGCCAAGGCACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAGCTGTTCCTTTCCACACAC
GACCAGTCACAAGTTGGAACGGTCGTGTGGATATCTCTTGTCCTGGTACTGCAACACCCA
CTATAACCGAAGTTCCCCATCCCTTGTGACAGCACTCCAATGCGGCTCTCATCACGGAAA
CATTCCCGATGCACTCAAAGCTGTAGTCAACACCTCCATCAGTGAGATCGACAATCACTT
CCTGAATGGGCTTTTGGTGATCCTTTGGGTTCACAAACTCATTAACACCAAACTTCTTTG
CAGTTTCATACTTCTTGCTGTCGATATCAATGCCAATGATCCTAGTAGCACCAGCTGTTT
TTGCACCCTCAGCAACAGCAAGTCCCACAGTGCCAAGACCAAAGATGGCAACATTTGACC
CAGGTTCTACTTTTGCAGTGCTCCAAACAGCT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 11

CO CL397Contig1 647 11 6 U
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATATTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
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GAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTAAAATATTTTTGTGTTAC


BQ
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AA57JQ C 1
AF RR4AA57TF U 1
AF RR4G185TF U 1
AF RR4B437JQ C 1
AF RR4BE56JQ C 1
AF RR4B437TF U 1
AF RR4BE56TF U 1
AF RR4GV79TF U 1
AF RR4GV79JQ C 135
AF RR4G185JQ C 57
AF RR4GM64TF U 2
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BS 498 548 RR4G185TF
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BS 592 634 RR4B437TF
BS 635 647 RR4GV79TF

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DS 

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GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
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ATGATAGTTTTATTCAC

QA 1 497 1 497
DS 

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QA 1 634 1 634
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AATGAGATATTTTCTAAAATATTTTTGTGTT

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ATTCCTAATGTTTTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAAAAAAGA
AACGGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCT

QA 1 573 1 573
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GAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCCT
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ACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAAGAGGGTGGACCAAAATGCC
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TGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTACCTTATTTTATTCC
TAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAAAAAAAAAACGG
AGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCT
TA

QA 1 628 1 628
DS 



AS 3 10

CO CL398Contig1 618 3 5 U
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AAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAAC
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AGATCGGACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCA
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TTGAAGTCTGTTGAGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A071JQD C 16
AF RR4A071TFB U 16
AF RR4E242TF U 1
BS 1 151 RR4E242TF
BS 152 152 RR4A071TFB
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RD RR4A071JQD 564 0 0
GGAAGAGGA
AGCAGAGCGAAAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGT
GGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGA
TCTCACC*ACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGG
ACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGACATGGACAGGCAA
ATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGGACCAATTCCTTCGTCAATGCTTGGTTTAGAA
GTCTACACAGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGAC
TCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCA
AAGGGGCCGGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTCGGTTTTTATTGC
ATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTTTATAAAAAATTT
TCTACTTGTACTCTC

QA 10 564 10 564
DS 

RD RR4A071TFB 564 0 0
GGAAGAGGA
AGCAGAGCGAAAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGT
GGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGA
TCTCACC*ACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGG
ACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGACATGGACAGGCAA
ATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGGACCAATTCCTTCGTCAATGCTTGGTTTAGAA
GTCTACACAGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGAC
TCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCA
AAGGGGCCGGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTCGGTTTTTATTGC
ATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTTTATAAAAAATTT
TCTACTTGTACTCTC

QA 10 564 10 564
DS 

RD RR4E242TF 618 0 0
GGACTAAACTAAAGAGGAAGAGGAAGCAGAGCGAAAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCG
AAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAAC
GGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAG
AGATCGGACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCA
CTGAAGATGGACATGGACAGGCAATTTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGGACCAATT
CCTTCGTCAATGCTTGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAG
GATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGG
ATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGGCCGGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCC
CCATCATGGGTCGGTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAA
GTGAGATCATTTTATAAAAAATTTTCTACTTGTACTCTCTCTTGAGTCCTTGACCCAAGT
TTGAAGTCTGTTGAGACA

QA 1 618 1 618
DS 



CO CL398Contig2 664 5 17 U
CGAGGAAGAGATAGCAGAGCGAGAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCT
CATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGC
GACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACGAG
GCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGAC
ATGGACAGGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCAATTCCTTCGTCAATG
CTCGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAAT
GACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGT
CTTGGCATGTCAAAGGGGCCGGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTC
GGTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTT
TATAAACTTCTTTCTACTTGTACTCTCTCTTGAGTCCTTGACCCAAGTTTGAAGTCTGTT
GAGACAACTACTGAATATGGTCAATCAATTCTCGTATGTTAGGTTTTACGAAACTAAAGT
TTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4ET56TF U 1
AF RR4G180JQ C 19
AF RR4G180TF U 19
AF RR4DC35TF U 20
AF RR4DC35JQ C 97
BS 1 149 RR4ET56TF
BS 150 150 RR4G180TF
BS 151 171 RR4ET56TF
BS 172 172 RR4G180TF
BS 173 182 RR4ET56TF
BS 183 183 RR4G180TF
BS 184 227 RR4ET56TF
BS 228 229 RR4G180TF
BS 230 239 RR4ET56TF
BS 240 240 RR4G180TF
BS 241 254 RR4ET56TF
BS 255 255 RR4G180TF
BS 256 570 RR4ET56TF
BS 571 571 RR4G180TF
BS 572 614 RR4ET56TF
BS 615 650 RR4G180TF
BS 651 664 RR4DC35TF

RD RR4ET56TF 620 0 0
CGAGGAAGAGATAGCAGAGCGAGAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCT
CATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGC
GACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATCTGGAAAGAGAACGCACGAG
GCCATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCTTTGAAGATGGAT
ATGGACAGGCAAATCCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCAATTCCTTCGTCAATG
CTCGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAAT
GACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGT
CTTGGCATGTCAAAGGGGCCGGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTC
GGTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTT
TATAAACTTCTTTCTACTTGTACTCTCTCTCGAGTCCTTGACCCAAGTTTGAAGTCTGTT
GAGACAACTACTGA
TATGGT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4G180JQ 635 0 0
GG
GAGAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAA
GAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCC
ACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACGAGGCGATGAAGAGGACGATCAT
TGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGACATGGACAGGCAAATTCTCTC
TAGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACAC
AGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTCGAATGACCCTCGTGACTCGGAGAC
ATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGGCC
GGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTCGGTTTTTATTGCATGTTATG
TCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTTTATAAACTTCTTTCT*CTTG
TACTCTCTCTTGAGTCCTTGACCCAAGTTTGAAGTCTGTTGAGACAACTACTGAATATGG
TCAATCAATTCTCGTATGTTAGGTTTTACG
GAG

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR4G180TF 635 0 0
GG
GAGAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAA
GAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCC
ACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACGAGGCGATGAAGAGGACGATCAT
TGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGACATGGACAGGCAAATTCTCTC
TAGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACAC
AGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTCGAATGACCCTCGTGACTCGGAGAC
ATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGGCC
GGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTCGGTTTTTATTGCATGTTATG
TCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTTTATAAACTTCTTTCT*CTTG
TACTCTCTCTTGAGTCCTTGACCCAAGTTTGAAGTCTGTTGAGACAACTACTGAATATGG
TCAATCAATTCTCGTATGTTAGGTTTTACG
GAG

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR4DC35TF 645 0 0
G
GAGAGGAAGAGAAACAATGGAGTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAA
AAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCC
ACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACGAGGCGATGAAGAGGACGATCAT
TGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGACATGGACAGGCAAATTCTCTC
TAGGTTTCAGAGACCTTCTGGTCCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACAC
AGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGTC
ATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGGCC
GGTTGCTCCAAGTTTCATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTCGGTTTTTATTGCATGTTATG
TCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTGAGATCATTTTATAAACTTCTTTCTACTTG
TACTCTCTCTTGAGTCCTTGACCCAAGTTTGAAGTCTGTTGAGACAACTACTTAATATGG
TCAATCAATTCTCGTATGTTAGGTTTTACGAAACTAAAGTTTGC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR4DC35JQ 568 0 0
TTTGGTCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTAC
GAATCTGGAAAGAGATCGCACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGG
ACTGCACTTCCACTGAAGATGGACATGGACAGGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCT
TCTGGTCCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATGAC
TTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGTCATTCAAGCCGGTAGAC
TTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGGCCGGTTGCTCCAAGTTTC
ATGTAAGGCCCCCCATCATGGGTCGGTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGA
ATGATGAATCAAGTGAGATCATTTTATAAACTTCTTTCTACTTGTACTCTCTCTTGAGTC
CTTGACCCAAGTTTGAAGTCTGTTGAGACAACTACTTAATATGGTCAATCAATTCTCGTA
TGTTAGGTTTTACGAAACTAAAGTTTGC

QA 1 568 1 568
DS 



CO CL398Contig3 498 2 2 U
GCAAGTAGAAAGAAGTTATAAAACGATCCCACTTGATTCATCATTCAAAATCTAAAAAGA
CATAACATGCAATAAAACCCCACCCATGATAGGGGGGCCTTACATGAAACTTGGGGCAAC
AGGGCCCTTTGACATGCCAAGACGAACTTCCATCCCGTGGTGGAAATCTACGGGCTTGAA
TGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTCAAGTAATCCTCAAAACCAAAGTCATCAATGGCTCC
TGTGTAGACTTCTAAACCAAGCATTGACGAAGGAATTGGTCCAGGAGGTCTCTGAAACCT
AGAGAGAATTTGCCTGTCCATGTCCATCTTCAGTGGAAGTGCAGTCCCGTAGGTATGCCC
AATGATCGTCCTCTTCATCGCCTCGTGCGATCTCTTTCCAGATTCGTAAGAGGATTCGAG
TGGGTGAGATCCGACGATGTCGCTCTTAACACCGTTGAGACCAAATCGAAAGCCTCAAAA
CAGTGTCTGCGCAAACCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FZ10TF C 1
AF RR4FZ10JQ U 2
BS 1 1 RR4FZ10TF
BS 2 498 RR4FZ10JQ

RD RR4FZ10TF 498 0 0
GCAAGTAGAAAGAAGTTATAAAACGATCCCACTTGATTCATCATTCAAAATCTAAAAAGA
CATAACATGCAATAAAACCCCACCCATGATAGGGGGGCCTTACATGAAACTTGGGGCAAC
AGGGCCCTTTGACATGCCAAGACGAACTTCCATCCCGTGGTGGAAATCTACGGGCTTGAA
TGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTCAAGTAATCCTCAAAACCAAAGTCATCAATGGCTCC
TGTGTAGACTTCTAAACCAAGCATTGACGAAGGAATTGGTCCAGGAGGTCTCTGAAACCT
AGAGAGAATTTGCCTGTCCATGTCCATCTTCAGTGGAAGTGCAGTCCCGTAGGTATGCCC
AATGATCGTCCTCTTCATCGCCTCGTGCGATCTCTTTCCAGATTCGTAAGAGGATTCGAG
TGGGTGAGATCCGACGATGTCGCTCTTAACACCGTTGAGACCAAATCGAAAGCCTCAAAA
CAGTGTCTGCGCAAACCC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4FZ10JQ 497 0 0
CAAGTAGAAAGAAGTTATAAAACGATCCCACTTGATTCATCATTCAAAATCTAAAAAGAC
ATAACATGCAATAAAACCCCACCCATGATAGGGGGGCCTTACATGAAACTTGGGGCAACA
GGGCCCTTTGACATGCCAAGACGAACTTCCATCCCGTGGTGGAAATCTACGGGCTTGAAT
GTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTCAAGTAATCCTCAAAACCAAAGTCATCAATGGCTCCT
GTGTAGACTTCTAAACCAAGCATTGACGAAGGAATTGGTCCAGGAGGTCTCTGAAACCTA
GAGAGAATTTGCCTGTCCATGTCCATCTTCAGTGGAAGTGCAGTCCCGTAGGTATGCCCA
ATGATCGTCCTCTTCATCGCCTCGTGCGATCTCTTTCCAGATTCGTAAGAGGATTCGAGT
GGGTGAGATCCGACGATGTCGCTCTTAACACCGTTGAGACCAAATCGAAAGCCTCAAAAC
AGTGTCTGCGCAAACCC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 10

CO CL399Contig1 2249 10 24 U
GGAACTCTACCGTGCGTATCTATCTCGTGCCTCTTCTGGTGATTTGGATAATACAGCAAT
CATTGACCAAATCTTGAAGCTTCGATTGGAAAAGGCTAAGCTTCTTGGCTACAACAATTA
CGCTGAGGTAAGCATGACTATGAAAATGGCCACTGTTGAGAAAGCAGCAGAGCTTTTAGA
GAAGCTTCGTAGTGCTTCCTGGGGTCCAGCTGTTCAAGACATGGAAGACCTCAAGAGTTT
CGCAAAAAACCAAGGTGCTGAAGAAGCTGGCAGCTTGACTCACTGGGACACCACTTTCTG
GAGTGAGAGGCTTCGTGAATCCAAATATGATATTAATGAGGAAGAACTCCGTCCATACTT
CTCCCTGCCAAAGGTTATGGATGGACTTTTCAGTCTAGCTAAGACATTATTTGGTGTCGA
TATAGAACCAGCAGATGGTGTAGCTCCGGTCTGGAACAGCGATGTTCGGTTCTATTGTGT
CAAAGATTCTTCTGGCCCAATCGCTTACTTTTACTTTGATCCATACTCTCGCCCTTCAGA
GAAAAGAGGTGGTGCCTGGATGGGTGAGGTTTTTCCCCGTAGCCAAGTCATGGCTCAGAA
AAGTACTTCTGTTAGGCTGCCTGTTGCGCACATGGTATGCAACCAAACTCCTCCAGTAGG
TGACAAGCCAAGCCTTATGACATTCCGTGAGGTAGAGACTGTGTTTCATGAATTTGGACA
TGCACTTCAGCATATGCTTACCAAGCAGGATGAGGGGCTTGTGGCTGGTATTCGGAATGT
AGAGTGGGACGCGGTTGAATTACCATCACAGTTTATGGAGAATTGGTGTTACCACAGGGA
CACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAAACAGGAGTAACACTCCCAGAGGAAGTATA
CAAGAAACTCTTAGCTGCAAGAACATTCCGAGCAGGGTCCTTCAGTCTTCGTCAGCTGAA
ATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAATTACATACCAGGTGGACCAGAATCCAT
CTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACCCAAGTTATCCCTCCACTTCCTGAGGA
TAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCAGGAGGATATGCAGCCGGCTACTACAG
TTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCATTTTCAGCGTTTGAAGACGCTGGACT
GGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAGAGATTCAGAAACACAGTACTTGCACT
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BQ
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TATAGAACCAGCAGATGGTGTAGCTCCGGTCTGGAACAGCGATGTTCGGTTCTATTGTGT
CAAAGATTCTTCTGGCCCAATCGCTTACTTTTACTTTGATCCATACTCTCGCCCTTCAGA
GAAAAGAGGTGGTGCCTGGATGGGTGAGGTTTTTCCCCGTAGCCAAGTCATGGCTCAGAA
AAGTACTTCTGTTAGGCTGCCTGTTGCGCACATGGTATGCAACCAAACTCCTCCAGTATG
TGACAAGCCAAGCCTTATGACATTCCGTGAGGTAGAGACTGTGTTTCATGAATTTGGAC

QA 1 719 1 719
DS 

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G
AGAGTTTCGCAAAAAACCAAGGTGCTGAAGAAGCTGGCAGCTTGACTCACTGGGACACCA
CTTTCTGGAGTGAGAGGCTTCGTGAATCCAAATATGATATTAATGAGGAAGAACTCCGTC
CATACTTCTCCCTGCCAAAGGTTATGGATGGACTTTTCAGTCTAGCTAAGACATTATTTG
GTGTCGATATAGAACCAGCAGATGGTGTAGCTCCGGTCTGGAACAGCGATGTTCGGTTCT
ATTGTGTCAAAGATTCTTCTGGCCCAATCGCTTACTTTTACTTTGATCCATACTCTCGCC
CTTCAGAGAAAAGAGGTGGTGCCTGGATGGGTGAGGTTTTTTCCCGTAGCCAAGTCATGG
CTCAGAAAAGTACTTCTGTTAGGCTGCCTGTTGCGCACATGGTATGCAACCAAACTCCTC
CAGTAGGTGACAAGCCAAGCCTTATGACATTCCGTGAGGTAGAGACTGTGTTTCATGAAT
TTGGACATGCACTTCAGCATATGCTTACCAAGCAGGATGAGGGGCTTGTGGCTGGTATTC
GGAATGTAGAGTGGGACGCGGTTGAATTACCATCACAGTTTATGGAGAATTGGTGTTACC
ACAGG*ACACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAA

QA 2 639 2 639
DS 

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G
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ATGCAACCAAACTCCTCCAGTAGGTGACAAGCCAAGCCTTATGACATTCCGTGAGGTAGA
GACTGTGTTTCATGAATTTGGACATGCACTTCAGCATATGCTTACCAAGCAGGATGAGGG
GCTTGTGGCTGGTATTCGGAATGTAGAGTGGGACGCGGTTGAATTACCATCACAGTTTAT
GGAGAATTGGTGTTACCACAGGGACACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAAACAGT
AGTAACACTCCCAGAGGAAGTATACAAGAAACTCTTAGCTGCAAGAACATTCCGAGCAGG
GTCCTTCAGTCTTCGTCAGCTGAAATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAATTA
CATACCAGGTGGACCAGAATCCATCTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACCCA
AGTTATCCCTCCACTTCCTGAGGATAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCAGG
AGGATATGCAGCCGGCTACTACAGTTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCATT
TTCAGCGTTTGAAGACGCTGGACTGGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAGAG
ATTCAGAAACACAGTACTTGCACTTGGAGGAGGAAAAGCGCCTCTCAAGGTGTTTGTTGA
GTTCAGAGGACGTGAACCTTCACCAGAGCCTCTTCTCAGACACAATGGACTCTTGACTGC
CTCTGCTTCCG

QA 2 792 2 792
DS 

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G
ATGCACTTCAGCATATGCTTACCAAGCAGGATGAGGGGCTTGTGGCTGGTATTCGGAATG
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ACACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAAACAGGAGTAACACTCCCAGAGGAAGTAT
ACAAGAAACTCTTAGCTGCAAGAACATTCCGAGCAGGGTCCTTCAGTCTTCGTCAGCTGA
AATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAATTACATACCAGGTGGACCAGAATCCA
TTTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACCCAAGTTATCCCTCCACTTCCTGAGG
ATAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCAGGAGGATATGCAGCCGGCTACTACA
GTTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCATTTTCAGCGTTTGAAGACGCTGGAC
TGGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAGAGATTCAGAAACACAGTACTTGCAC
TTGGAGGAGGAAAAGCGCCTCTCAAGGTGTTTGTTGAGTTCAGAGGACGTGAACCTTCAC
CAGAGCCTCTTTTCAGACACAATGGACTCTTGACTGCCTCTGCTTCCGCTTGAGACTTAT
TATTTTTATAACATTTGGTATTACTGTAGTCTTCGAACTTAAGATTTGATTAATACAAGA
TG

QA 2 723 2 723
DS 

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G
ATGCACTTCAGCATATGCTTACCAAGCAGGATGAGGGGCTTGTGGCTGGTATTCGGAATG
TAGAGTGGGACGCGGTTGAATTACCATCACAGTTTATGGAGAATTGGTGTTACCACAGGG
ACACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAAACAGGAGTAACACTCCCAGAGGAAGTAT
ACAAGAAACTCTTAGCTGCAAGAACATTCCGAGCAGGGTCCTTCAGTCTTCGTCAGCTGA
AATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAATTACATACCAGGTGGACCAGAATCCA
TCTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACCCAAGTTATCCCTCCACTTCCTGAGG
ATAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCAGGAGGATATGCAGCCGGCTACTACA
GTTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCATTTTCAGCGTTTGAAGACGCTGGAC
TGGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAGAGATTCAGAAACACAGTACTTGCAC
TTGGAGGAGGAAAAGCGCCTCTCAAGGTGTTTGTTGAGTTCAGAGGACGTGAACCTTCAC
CAGAGCCTCTTCTCAGACACAATGGACTCTTGACTGCCTCTGCTTCCGCTTGAGACTTAT
TATTTTTATAACATTTGGTATTACTGTAGTCTTCGAACTTAAGATTTGATTAATACAAGA
TGAAAA
CCAGAAAAAAA

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR4AS01JQ 702 0 0
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AATTGGTGTTACCACAGGGACACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAAACAGTAGTA
ACACTCCCAGAGGAAGTATACAAGAAACTCTTAGCTGCAAGAACATTCCGAGCAGGGTCC
TTCAGTCTTCGTCAGCTGAAATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAATTACATA
CCAGGTGGACCAGAATCCATCTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACCCAAGTT
ATCCCTCCACTTCCTGAGGATAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCAGGAGGA
TATGCAGCCGGTTACTACAGTTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCATTTTCA
GCGTTTGAAGACGCTGGACTGGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAGAGATTC
AGAAACACAGTACTTGCACTTGGAGGAGGAAAAGCGCCTCTCAAGGTGTTTGTTGAGTTC
AGAGGACGTGAACCTTCACCAGAGCCTCTTTTCAGACACAATGGACTCTTGACTGCCTCT
GCTTCCGCTTGAGACTTATTATTTTTATAACATTTGGTATTACTGTAGTCTTCGAACTTA
AGATTTGATTAATACAAGATGAAAAACCCGAACTTTTTCAAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BA95JQ 716 0 0
ATTCGGAATGTAGAGTGGGACGCGGTTGAATTACCATCACAGTTTATGGAGAATTGGTGT
TACCACAGGGACACTTTAATGAGCATTGCGAAGCATTATGAAACAGGAGTAACACTCCCA
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CGTCAGCTGAAATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAATTACATACCAGGTGGA
CCAGAATCCATTTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACCCAAGTTATCCCTCCA
CTTCCTGAGGATAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCAGGAGGATATGCAGCC
GGCTACTACAGTTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCATTTTCAGCGTTTGAA
GACGCTGGACTGGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAGAGATTCAGAAACACA
GTACTTGCACTTGGAGGAAGAAAAGCGCCTCTCAAGGTGTTTGTTGAGTTCAGAGGACGT
GAACCTTCACCAGAGCCTCTTCTCAGACACAATGGACTCTTGACTGCCTCTGCTTCCGCT
TGAGACTTATTATTTTTATAACATTTGGTATTACTGTAGTTTTCGAACTTAAGATTTGAT
TAATACAAGATGAAAAACCCGAACTTCTTCAACAAATAAGATATCTTTTTCTTC
CG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GN18TF 611 0 0
G
GGAGTAACACTCCCAGAGGAAGTATACAAGAAACTCTTAGCTGCAAGAACATTCCGAGCA
GGGTCCTTCAGTCTTCGTCAGCTGAAATTTGCGAGTCTTGATTTGGAGCTTCACACAAAT
TACATACCAGGTGGACCAGAATCCATCTACGATGTTGACCAAAGGGTATCAGTAAAAACC
CAAGTTATCCCTCCACTTCCTGAGGATAGATTCCTCTGTGGCTTCAGTCACATATTTGCA
GGAGGATATGCAGCCGGCTACTACAGTTACAAGTGGGCAGAGGTTTTGTCTGCAGATGCA
TTTTCAGCGTTTGAAGACGCTGGACTGGACGACATCAAGGCTGTTAAAGAAACAGGACAG
AGATTCAGAAACACAGTACTTGCACTTGGAGGAGGAAAAGCGCCTCTCAAGGTGGTTGTT
GAGTTCAGAGGACGTGAACCTTCACCAGAGCCTCTTCTCAGACACAATGGACTCTTGACT
GCCTCTGCTTCCGCTTGAGACTTATTATTTTTATAACATTTGGTATTACTGTAGTCTTCG
AACTTAAGATTTGATTAATACAAGATGAAAAACCCGAACTTCTTCAACAAATAAGATATC
TTTTTCTTC
T

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR4EN35JQ 743 0 0
CAACAAATAAGATATCTTTTTCTTCTGGATTTTGCAAACCATTTACATCATCACTCCGGT
TACTACATTGCATTGATTCTTTATCCTAAACTCAACCTTCCCTGTTCATCATCTCACAAA
TACAATTAAACAACTTTCTACATCTAAAAGGTAAATTAAATAACGAACTCCTCTCCCTCA
AACTATCACTTCTCTCTAGCTAACCATACCATCTTCTTCTCTAACTACTACTGCTTCCTA
AGGTTTCCTCCCTTTACACCCACGCTTCCACCTCTCCTAGCACTTGAAGAAAGAACAATA
GACTTAATCCTCCACAGATTCTATCATAGAGCTTCTTTAGCTTCCACAAATGGCGACTGA
ACACTATCTGCATCAAAATCACTACCTGATGAACTTCCACCTGACCCTGAATCACTAGAG
GAGGAACCACTACTAGAACTAGAGCTGCCTGAAGAGCTAGATCCGCTACTAGCAGCAGCA
GCTGCTACTGCAGTACCATCTCTTTCGATCTCCACAGATGGGTAATCTTCAATTGGTATG
TCTTCTCCAATGTCTACATCCTCTTCCCCTGCATCCCCTTTCCTTGTTCTCTTCTCCGCA
CTACCCATTTCTGCCTCCAAAAGCATATTTCTAGCAGGTGGAGGAGTTGACACGTTATGG
ATAAACCCTTGGCGTTTGATTTTGCTAGCCATCTTCTTGTAATTAGTCACGAAACGATCA
AGCTCCCACAGAGTCTCATTGTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4H462JQB 842 0 0
GCC
TTCGAACTTAAGATTTGATTAATACAAGATGAAAAACCCGAACTTCTTCAACAAATAAGA
TATCTTTTTCTTCTGGATTTTGCAAACCATTTACATCATCACTCCGGTTACTACATTGCA
TTGATTCTTTATCCTAGACTCAACCTTCCCTGTTCATCATCTCACAAATACAATTAAACA
ACTTTCTACATCTAAAAGGTAAATTAAATAACGAACTCCTCTCCCTCAAACTATCACTTC
TCTCTAGCTAACCATACCATCTTCTTCTCTAACTACTACTGCTTCCTAAGGTTTCCTCCC
TTTACACCCACGCTTCCACCTCTCCTAGCACTTGAAGAAAGAACAATAGACTTAATCCTC
CACAGATTCTATCATAGAGCTTCTTTAGCTTCCACAAATGGCGACTGAACACTATCTGCA
TCAGAATCACTACCTGATGAACTTCCACCTGACCCTGAATCACTAGAGGAGGAACCACTA
CTAGAACTAGAGCTGCCTGAAGAGCTAGATCCGCTACTAGCAGCAGCAGCTGCTACTGCA
GTACCATCTCTTTCGATCTCCACAGATGGGTAATCTTCAATTGGTATGTCTTCTTCA*TG
TCTACATACTCTTCCCCTGCATCCCCTTTCCTTGTTCTCTTCTCCGCACTACCCATTTCT
GCCTCCAAAAGCATGTTTCTAGCAGGTGGAGGAGTTGACACGTTATGGATAAACCCTTGG
CGTTTGATTTTGCTAGCCATCTTCTTGTAATTAGTCACGAAACGATCAAGCTCCCACAGA
GTCTCATTGTCTACGGCTTCAATATCTAGCTCAATCTCATCTCCATCTTGAGCTAATGA

QA 4 842 4 842
DS 



AS 1 10

CO CL400Contig1 1335 10 11 U
CAGGAAGAGTAAAATTACTCAATAACACTTAAAAAGAGTTATTTATGATCCAACATGGTT
GTTTTGCAATACATTACAACTTGAGACCATCAGATATTTTTACTAAAATGATTCTTCCAT
ATCTCCTCTTCTTCATAATACTCTTTAACTCACAGCTTCGACACAGGCAATCCCAAGGCT
TTTGAGTTGACAATGCTTGGGCTGGCATTAGGCGGTGAAGCATTTTCGTTCAAGAACGGG
TCGACCCGGTTCGGGTCACTCCAAATAGGATATCCTTTGATCCTTCCGACGACGTTGAGA
GCTGCAAGCGTAGCCATTCCTTCACGAGTCCACTTGGAAGCAGAAGCAATGTGAGGAACA
ACAATAGCATTCTTCATATCAGCAAGGCCTGGCTTCATGAATGGCTCTTCCTCAAACACA
TCCAGGCCAACTCGGAACATTGGGTTCTCTCTTAGATGATCGACAAGTGCTACCTCATCG
ATCACTGGACCTCTACTACAGTTCACAAGAATTGCTTCCTTTTTCATCATGGCAAGCCTC
TCCTTATTGACAAGATGGTAAGTGGTTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCA
GCCTCACGCAGAACCTCCTCC*ATGGAAGAAGCTCGTTTCCATGTCACAGGTTGTTCCCC
ATTTGCTTTCAAGAATTGTCCATAAGCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTA
AAGATCAAAGTAGATCAAATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGA
CCCAATACGCCCAGCTCCAATAACTCCCACGGTCTGTCCTTTAAGTAAGTTCCCCACAAA
CAGATGAGGAAGCCAACCCTCGTACAAGCCACCTCTCATGAAACCATCAGCTTCAACGAT
CCTTCTTGCAGCAGCAAGGGAAAGAGAAGCAGCTAGTTCAGCGGTTGTCTCGGTCAACAC
TCCAGGAGTGTTACCAACGGCGATACCATACTTATTGGCGGCTTCAACATCGACGTTGTT
GTAACCTACGGCCATGTTGCTGAAAGCTTTTCCTCCAGCTTTGCTCAGAGCTGAAAACAG
TGTCTCTCCCCAATCTTCCGTCAACTGACCGATGACTCCATCACACCTGTTTCCAATCAG
ATCAATGATGTCTTCCACAGACAAGATTGTCTTCTTTAAATGGCATATCTCGAGGCGACA
ACCTTGGTCGATCAAGAGGTTGATCCAGCGAGTACCAGGCATAGGTTTCGTGCTGACGAC
TCTGTACTTCCCATTGGGATTATACACTTCAATAGACACCGGTTTGGCCATGGCAGAGAA
CAAGTGTTTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4CY27JQ U 1
AF RR4FN25JQ U 17
AF RR4B848JQ U 17
AF RR4CY27TF C 594
AF RR4AU57JQ U 25
AF RR4AW61JQ U 25
AF RR4AU57TF C 550
AF RR4FN25TF C 656
AF RR4B848TF C 550
AF RR4AW61TF C 550
BS 1 454 RR4CY27JQ
BS 455 455 RR4B848JQ
BS 456 508 RR4CY27JQ
BS 509 509 RR4B848JQ
BS 510 693 RR4CY27JQ
BS 694 789 RR4B848JQ
BS 790 790 RR4AU57JQ
BS 791 822 RR4B848JQ
BS 823 843 RR4AU57JQ
BS 844 848 RR4AW61JQ
BS 849 1335 RR4AU57TF

RD RR4CY27JQ 693 0 0
CAGGAAGAGTAAAATTACTCAATAACACTTAAAAAGAGTTATTTATGATCCAACATGGTT
GTTTTGCAATACATTACAACTTGAGACCATCAGATATTTTTACTAAAATGATTCTTCCAT
ATCTCCTCTTCTTCATAATACTCTTTAACTCACAGCTTCGACACAGGCAATCCCAAGGCT
TTTGAGTTGACAATGCTTGGGCTGGCATTAGGCGGTGAAGCATTTTCGTTCAAGAACGGG
TCGACCCGGTTCGGGTCACTCCAAATAGGATATCCTTTGATCCTTCCGACGACGTTGAGA
GCTGCAAGCGTAGCCATTCCTTCACGAGTCCACTTGGAAGCAGAAGCAATGTGAGGAACA
ACAATAGCATTCTTCATATCAGCAAGGCCTGGCTTCATGAATGGCTCTTCCTCAAACACA
TCCAGGCCAACTCGGAACATTGGGTTCTCTCTTAAATGATCGACAAGTGCTACCTCATCG
ATCACTGGACCTCTACTACAGTTCACAAAAATTGCTTCCTTTTTCATCATGGCAAGCCTC
TCCTTATTGACAAGATGGTAAGTGGTTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCA
GCCTCACGCAGAACCTCCTCC*ATGGAAGAAGCTCGTTTCCATGTCACAGGTTGTTCCCC
ATTTGCTTTCAAGAATTGTCCATAAGCTGTCAC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4FN25JQ 657 0 0
G
CTCAATAACACTTAAAAAGAGTTATTTATGATCCAACATGGTTGTTTTGCAATACATTAC
AACTTGAGACCATCAGATATTT**ACTAAAATGATTCTTCCATATCTCCTCTTCTTCATA
ATACTCTTTAACTCACAGCTTCGACACAGGCAATCCCAAGGCTTTTGAGTTGACAATGCT
TGGGCTGGCATTAGGCGGTGAAGCATTTTCGTTCAAGAACGGGTCGACCCGGTTCGGGTC
ACTCCAAATAGGATATCCTTTGATCCTTCAGACGACGTTGAGAGCTGCAAGCGTAGCCAT
TCCTTCACGAGTCCACTTGGAAGCAGAAGCAATGTGAGGAACAACAATAGCATTCTTCAT
ATCAGCAAGGCCTGGCTTCATGAATGGCTCTTCCTCAAACACATCCAGGCCAACTCGGAA
CATTGGGTTCTCTCTTAGATGATCGACAAGTGCTACCTCATCGATCACTGGACCTCTACT
ACAGTTCACAAGAATTGCTTCCTTTTTCATCATGGCAAGCCTCTCCTTATTGACAAGATG
GTAAGTGGTTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCAGCCTCACGCAGAACCTC
CTCC*ATGGAAGAAGCTCGTTTCCATGTCACAGGTTGTTCCCCATTTGCTTTCAAG

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR4B848JQ 806 0 0
G
CTCAATAACACTTAAAAAGAGTTATTTATGATCCAACATGGTTGTTTTGCAATACATTAC
AACTTGAGACCATCAGATATTTTTACTAAAATGATTCTTCCATATCTCCTCTTCTTCATA
ATACTCTTTAACTCACAGCTTCGACACAGGCAATCCCAAGGCTTTTGAGTTGACAATGCT
TGGGCTGGCATTAGGCGGTGAAGCATTTTCGTTCAAGAACGGGTCGACCCGGTTCGGGTC
ACTCCAAATAGGATATCCTTTGATCCTTCCGACGACGTTGAGAGCTGCAAGCGTAGCCAT
TCCTTCACGAGTCCACTTGGAAGCAGAAGCAATGTGAGGAACAACAATAGCATTCTTCAT
ATCAGCAAGGCCTGGCTTCATGAATGGCTCTTCCTCAAACACATCCAGGCCAACTCGGAA
CATTGGGTTCTCTCTTAGATGATCGACAAGTGCTACCTCATCGATCACTGGACCTCTACT
ACAGTTCACAAGAATTGCTTCCTTTTTCATCATGGCAAGCCTCTCCTTATTGACAAGATG
GTAAGTGGTTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCAGCCTCACGCAGAACCCC
CTCC*ATGGAAGAAGCTCGTTTCCATGTCACAGGTTGTTCCCCATTTGCTTTCAAGAATT
GTCCATAAGCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTAAAGATCAAAGTAGATCA
AATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGACCCAATACGTCCAGCTC
CAATAACTCCCACGGTCTGTCCTTT

QA 2 806 2 806
DS 

RD RR4CY27TF 227 0 0
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GTTCCCCATTTGCTTTCAAGAATTGTCCATAAGCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGG
ATTGGTAA*GATCAAAGTAGATCAAATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCAT
AAGCAGACCCAATACGTCCAGCTCCAATAACTCCCACGGTCTGTCC
C

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DS 

RD RR4AU57JQ 819 0 0
G
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ACCATCAGATATTTTTACTAAAATGATTCTTCCATATCTCCTCTTCTTCATAATACTCTT
TAACTCACAGCTTCGACACAGGCAATCCCAAGGCTTTTGAGTTGACAATGCTTGGGCTGG
CATTAGGCGGTGAAGCATTTTCGTTCAAGAACGGGTCGACCCGGTTCGGGTCACTCCAAA
TAGGATATCCTTTGATCCTTCCGACGACGTTGAGAGCTGCAAGCGTAGCCATTCCTTCAC
GAGTCCACTTGGAAGCAGAAGCAATGTGAGGAACAACAATAGCATTCTTCATATCAGCAA
GGCCTGGCTTCATGAATGGCTCTTCCTCAAACACATCCAGGCCAACTCGGAACATTGGGT
TCTCTCTTAGATGATCGACAAGTGCTACCTCATCGATCACTGGACCTCTACTACAGTTCA
CAAGAATTGCTTCCTTTTTCATCATGGCAAGCCTCTCCTTATTGACAAGATGGTAAGTGG
TTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCAGCCTCACGCAGAACCTCCTCC*ATG
AAAGAAGCTCGTTTTCATGTCACAGGTTGTTCCCCATTTGCTTTCAAGAATTGTCCATAA
GCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTAAAGATCAAAGTAGATCAAATTCATC
TTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGACCCAATACGCCCAGCTCCAATAACT
CCCACGGTCTGTCCTTTAAGTAAGTTCCCCACAAACAG

QA 2 819 2 819
DS 

RD RR4AW61JQ 828 0 0
G
CACTTAAAAAGAGTTATTTATGATCCAACATGGTTGTTTTGCAATACATTACAAATTGAG
ACCATCAGATATTTTTACTAAAATGATTCTTCCATATCTCCTCTTCTTCATAATACTCTT
TAACTCACAGCTTCGACACAGGCAATCCCAAGGGTTTTGAGTTGACAATGCTTGGGCTGG
CATTAGGCGGTGAAGCATTTTCGTTCAAGAACGGGTCGACCCGGTTCGGGTCACTCCAAA
TAGGATATCCTTTGATCCTTCCGACGACGTTGAGAGCTGCAAGCGTAGCCATTCCTTCAC
GAGTCCACTTGGAAGCAGAAGCAATGTGAGGAACAACAATAGCATTCTTCATATCAGCAA
GGCCTGGCTTCATGAATGGCTCTTCCTCAAACACATCCAGGCCAACTCGGAACATTGGGT
TCTCTCTTAGATGATCGACAAGTGCTACCTCATCGATCACTGGACCTCTACTACAGTTCA
CAAGAATTGCTTCCTTTTTCATCATGGCAAGCCTCTCCTTATTGACAAGATGGTAAGTGG
TTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCAGCCTCACGCAGAACCTCCTCC*ATG
AAAGAAGCTCGTTTTCATGTCACAGGTTGTTCCCCATTTGCTTTCAAGAATTGTCCATAA
GCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTAAAGATCAAAGTAGATCAAATTCATC
TTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGACCCAATACGCCCAGCTCCAA*AACT
CCCACGGTCTGTCCTTTAAGTAAGTTCCCCACAAACAGATGAG
AAGC

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DS 

RD RR4AU57TF 786 0 0
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AGAACCTCCTCCCATGAAAGAAGCTCGTTTTCATGTCACAGGTTGTTCCCCATTTGCTTT
CAAGAATTGTCCATAAGCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTAAAGATCAAA
GTAGATCAAATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGACCCAATACG
CCCAGCTCCAATAACTCCCACGGTCTGTCCTTTAAGTAAGTTCCCCACAAACAGATGAGG
AAGCCAACCCTCGTACAAGCCACCTCTCATGAAACCATCAGCTTCAACGATCCTTCTTGC
AGCAGCAAGGGAAAGAGAAGCAGCTAGTTCAGCGGTTGTCTCGGTCAACACTCCAGGAGT
GTTACCAACGGCGATACCATACTTATTGGCGGCTTCAACATCGACGTTGTTGTAACCTAC
GGCCATGTTGCTGAAAGCTTTTCCTCCAGCTTTGCTCAGAGCTGAAAACAGTGTCTCTCC
CCAATCTTCCGTCAACTGACCGATGACTCCATCACACCTGTTTCCAATCAGATCAATGAT
GTCTTCCACAGACAAGATTGTCTTCTTTAAATGGCATATCTCGAGGCGACAACCTTGGTC
GATCAAGAGGTTGATCCAGCGAGTACCAGGCATAGGTTTCGTGCTGACGACTCTGTACTT
CCCATTGGGATTATACACTTCAATAGACACCGGTTTGGCCATGGCAGAGAACAAGTGTTT
CTGTCC

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DS 

RD RR4FN25TF 680 0 0
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TGGTAAAGATCAAAGTAGATCAAATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAA
GCAGACCCAATACGTCCAGCTCCAATAACTCCCACGGTCTGTCATTTAAGTAAGTTCCCC
ACAAACAGATGAGGAAGCCAACCCTCGTACAAGCCACCTCTCATGAAACCATCAGCTTCA
ACGATCCTTCTTGCAGCAGCAAGGGAAAGAGAAGCAGCTAGTTCAGCGGTTGTCTCGGTC
AACACTCCAGGAGTGTTACCAACGGCGATACCATACTTATTGGCGGCTTCAACATCGACG
TTGTTGTAACCTACGGCCATGTTGCTGAAAGCTTTTCCTCCAGCTTTGCTCAGAGCTGAA
AACAGTGTCTCTCCCCAATCTTCCGTCAACTGACCGATGACTCCATCACACCTGTTTCCA
ATCAGATCAATGATGTCTTCCGCAGACAAGATTGTCTTCTTTAAATGGCATATCTCGAGG
CGACAACCTTGGTCGATCAAGAGGTTGATCCAGCGAGTACCAGGCATAGGTTTCGTGCTG
ACGACTCTGTACTTCCCATTGGGATTATACACTTCAATAGACACCGGTTTGGCCATGGCA
GAGAACAAGTGTTTCT
GTCC

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DS 

RD RR4B848TF 784 0 0
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CAAGAATTGTCCATAAGCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTAAAGATCAAA
GTAGATCAAATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGACCCAATACG
TCCAGCTCCAATAACTCCCACGGTCTGTCCTTTAAGTAAGTTCCCCACAAACAGATGAGG
AAGCCAACCCTCGTACAAGCCACCTCTCATGAAACCATCAGCTTCAACGATCCTTCTTGC
AGCAGCAAGGGAAAGAGAAGCAGCTAGTTCAGCGGTTGTCTCGGTCAACACTCCAGGAGT
GTTACCAACGGCGATACCATACTTATTGGCGGCTTCAACATCGACGTTGTTGTAACCTAC
GGCCATGTTGCTGAAAGCTTTTCCTCCAGCTTTGCTCAGAGCTGAAAACAGTGTCTCTCC
CCAATCTTCCGTCAACTGACCGATGACTCCATCACACCTGTTTCCAATCAGATCAATGAT
GTCTTCCACAGACAAGATTGTCTTCTTTAAATGGCATATCTCGAGGCGACAACCTTGGTC
GATCAAGAGGTTGATCCAGCGAGTACCAGGCATAGGTTTCGTGCTGACGACTCTGTACTT
CCCATTGGGATTATACACTTCAATAGACACCGGTTTGGCCATGGCAGAGAACAAGTGTTT
CT
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AW61TF 786 0 0
ACAAGATGGTAAGTGGTTTTGTCCAATACAGGGTGAAGACTTATCAGATCAGCCTCACGC
AGAACCTCCTCC*ATGAAAGAAGCTCGTTTTCATGTCACAGGTTGTTCCCCATTTGCTTT
CAAGAATTGTCCATAAGCTGTCACGAATTTCTCAAGACGAGTGGATTGGTAAAGATCAAA
GTAGATCAAATTCATCTTGAACCCTTCAACCATCATTCTAGCATAAGCAGACCCAATACG
CCCAGCTCCAATAACTCCCACGGTCTGTCCTTTAAGTAAGTTCCCCACAAACAGATGAGG
AAGCCAACCCTCGTACAAGCCACCTCTCATGAAACCATCAGCTTCAACGATCCTTCTTGC
AGCAGCAAGGGAAAGAGAAGCAGCTAGTTCAGCGGTTGTCTCGGTCAACACTCCAGGAGT
GTTACCAACGGCGATACCATACTTATTGGCGGCTTCAACATCGACGTTGTTGTAACCTAC
GGCCATGTTGCTGAAAGCTTTTCCTCCAGCTTTGCTCAGAGCTGAAAACAGTGTCTCTCC
CCAATCTTCCGTCAACTGACCGATGACTCCATCACACCTGTTTCCAATCAGATCAATGAT
GTCTTCCACAGACAAGATTGTCTTCTTTAAATGGCATATCTCGAGGCGACAACCTTGGTC
GATCAAGAGGTTGATCCAGCGAGTACCAGGCATAGGTTTCGTGCTGACGACTCTGTACTT
CCCATTGGGATTATACACTTCAATAGACACCGGTTTGGCCATGGCAGAGAACAAGTGTTT
CT
GTCC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 9

CO CL401Contig1 1408 9 28 U
GACACACATATATATATATATATTGATACTATATATGTATATGTTGTAGGGTTTAACTCT
CTCCTTCTCCTTCTCGGCGACAACAATGGCGTCTCTTCTGACCTCTCCCTTAACAAAGCC
CAAACCTTTCTTCCTCTCCTCGCCTCCACGACCTCTAACCTCACCGCCCTCGTTGAATCT
CTCCGGAATCTCACTCACCCACAACCAAAAGCTCGCTCCTTTCACCCTCCCGAGCCTCCT
CGTCTCCTCCGCATTCAAGGGTCCTAAGAGAGATGTCGCCGCCGCAGCAGCTTCAGATTA
CACAAGGATAATGCTTTCGGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGACAAAGCGGTTTGGTG
GGAGAGAGAGTGGACTTCGATGGATTTCGGCGCTGTTGCTGTTGTTGTCTCCATGCATTT
GCTTAGCTTGTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCTGTCTCGGTTGCTTTTGCGCT
TTATATTGTGACGGGTCTTCTGGGGATCACTCTGTCTTTTCATAGGAATCTTACTCATAG
AAGCTTCAAGCTTCCTAAGTGGCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAGCTCAGGCTCT
TCAGGGGCACCCTATTGATTGGGTGAGTACGCATAGGTACCATCATCAGTTTTGTGATTC
AGACAAGGATCCTCATAGCCCGCTTGAAGGGTTTTGGTTTAGTCACATGAATTGGATGTT
TGATACCAATACTATCACGCAAAGGGTTGGAGAGCCTAATAATGTTGGGGACTTGGAGAA
GCAGCCCTTCTATCAGTTCCTTAAAAACACCTACATTTGGCATCCGGTAGCTCTGGCGGT
GGCTCTTTACGCAATGGGTGGCTTCCCCTTCATCGTTTGGGGAATGGGTGTAAGAATAGT
ATGGGTATATCACATAACGTGGCTTGTAAACTCAGCTTGTCACGTTTGGGGAAACCAAGC
ATGGAACACTGGAGATTTGTCTAAGAACAACTGGTGGGTAGCAGCTCTAGCATTTGGAGA
AGGATGGCACAACAATCACCATGCTTTCGAGTTCTCTGCTAGACATGGACTTGAATGGTG
GCAATTTGATATGACTTGGTACGTCGTTAGATTCCTCCAAGCCATTGGCTTAGCAACCGA
TGTTAAGCTGCCATCAGAAGCTCAGAAAGAAAGAATGGCACTTACCACCAGTGATTGATG
ATAGTACGTAGTAACTATGTGCTCACCACCGGAATCAAAACTGTTGTACGTTTCGAGCTA
TGAAAAATTAAAAGAGTTTTTGTTTTTTTGGGTGCCTTTACATATAAACGTATATATGTT
CTATGCAAGAGAGTGTATGTGAACAAAACTGATTATGAATTTTAAGTTTTATCTTCTTAT
TACATTCAATACACAAGAAACTGATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C211TF U 41
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AF RR4G169TF U 45
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AF RR4DF03TF U 441
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AF RR4BP31JQ C 676
AF RR4DF03JQ C 846
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GGGTT
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CCTCCCGAGCCTCCTCGTCTCCTCCGCATTCAAGGGTCCTAAGAGAGATGTCGCCGCCGC
AGCAGCTTCAGATTACACAAGGATAATGCTTTCGGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGA
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CGTCTCCATGCATTTGCTTAGCTTGTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCTGTCTC
GGTTGCTTTTGCGCTTTATATTGTGACGGGTCTTCTGGGGATCACTCTGTCTTTTCATAC
GAATCTTA

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DS 

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CTCCTTCTCCTTCTCGGCGACAACAATGGCGTCTCTTCTGACCTCTCCCTTAACAAAGCC
CAAACCTTTCTTCCTCTCCTCGCCTCCACGACCTCTAACCTCACCGCCCTCGTTGAATCT
CTCCGGAATCTCACTCACCCACAACCAAAAGCTCGCTCCTTTCACCCTCCCGAGCCTCCT
CGTCTCCTCCGCATTCAAGGGTCCTAAGAGAGATGTCGCCGCCGCAGCAGCTTCAGATTA
CACAAGGATAATGCTTTCGGATGTGATGGTGAGGAAGAAGAAGGACAAAGCGGTTTGGTG
GGAGAGAGAGTGGACTTCTATGGATTTCGGCGCTGTTGCTGTTGTTGTCTCCATGCATTT
GCTTAGCTTGTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCTGTCTCGGTTGCTT**GCGCT
TTATATTGTGACGGGTCTTCTGGGGATCACTCTGTCTTTTCATAGGAATCTTACTCATAG
AAGCTTCAAGCTTCCTAAGTGGCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAGCTCAGGCTCT
TCAGGGGCACCCTATTTATTGGGTGAGTACGCATAGGTACCATCATCAGTTTTGTGATTC
AGACAAG*ATCCTCATAGCCCGCTTGAAGGGTTT*GGTTTAGTCACATGAATTGGATGTT
TGATAC*AATACTATCACGCAA
G

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DS 

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G
GTAGGGTTTAACTCTCTCCTTCTCCTTCTCGGCGACAACAATGGCGTCTCTTCTGACCTC
TCCCTTAACAAAGCCCAAACCTTTCTTCCTCTCCTCGCCTCCACGACCTCTAACCTCACC
GCCCTCGTTGAATCTCTCCGGAATCTCACTCACCCACAACCAAAAGCTCGCTCCTTTCAC
CCTCCCGAGCCTCCTCGTCTCCTCCGCATTCAAGGGTCCTAAGAGAGATGTCGCCGCCGC
AGCAGCTTCAGATTACACAAGGATAATGCTTTCGGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGA
CAAAGCGGTTTGGTGGGAGAGAGAGTGGACTTCGATGGATTTCGGCGCTGTTGCTGTTGT
TGTCTCCATGCATTTGCTTAGCTTGTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCTGTCTC
GGTTGCTTTTGCGCTTTATATTGTGACGGGTCTTCTGGGGATCACTCTGTCTTTTCATAG
GAATCTTACTCATAGAAGCTTCAAGCTTCCTAAGTGGCTTGAGTACTTGTTTGTTTATTG
TGGAGCTCAGGCTCTTCAGGGGCACCCTATTGATTGGGTGAGTACGCATAGGTACCATCA
TCAGTTTTGTGATTCAGACAAGGATCCTCATAGCCCGCTTGAAGGGTTTTGGTTTAGTCA
CATGAATTGGATGTTTGATACCAATACTATCACGCAAAGGGCTGGAGAGCCTAATAGTGT
TGGGGACT

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G
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TCACCCTCCCGAGCCTCCTCGTCTCCTCCACATTCAAGGGTCCTAAGAGAGATGTCGCCG
CCGCAGCAGCTTCAGATTACACAAGGATAATGCTTTCGGATGTGATGGTTAAGAAGAAGA
AGGACAAAGCGGTTTGGTGGGAGAGAGAGTGGACTTCGATGGATTTCGGCGCTGTTGCTG
TTGTTGTCTCCATGCATTTGCTTAGCTTGTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCTG
TCTCGGTTGCTTTTGCGCTTTATATTGCGACGGGTCTTCTGGGGATCACTCTGTCTTTTC
ATAGGAATCTTACTCATAGAAGCTTCAAGCTTCCTAAGTGGCTTGAGTACTTGTTTGCTT
ATTGTGGAGCTCAGGCTCTTCAGGGGCACCCTATTGATTGGGTGAGTACGCATAGGTACC
ATCATCAGTTTTGTGATTCAGACAAGGATCCTCATAGCCCGCTTGAAGGGTTTTGGTTTA
GTCACATGAATTGGATGTTTGATACCAATACTATCACGCAAAGGGTTGGAGAGCCTAATA
ATGTTGGGGACTTGGGGAAGCAGCCCTTCTATCAGTTCCTTAAAAACACCTACATTTGGC
ATCCGGTAGCTCTGGCGGTGGCTCTTTACGCAATGGGTGGCTTCCCCTTCATCGTTGGGG
GAATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTATATCACATAACGTGGCTTGTAAACTCAGCTTGTC
ACGTTTGGGGAAACCAAGCATGGAACACTGGAGATTTGTCTAAGAACAACTGGTGGGTAG
CAGCTCTAGC

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G
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GGGGATCACTCTGTCTTTTCATAGGAATCTTACTCATAGAAGCTTCAAGCTTCCCT**TG
GCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAGCTCAGGCTCTTCAGGGGCACCCTATTGATTG
GGTGAGTACGCATAGGTACCATCATCAGTTTTGTGATTCAGACAAGGATCTTCATAGCCC
GCTTGAAGGGTTTTGGTTTAGTCACATGAATTGGATGTTTGATACCAATACTATCACGCA
AAGGGTTGGAGAGCCTAATAATGTTGGGGACTTGGAGAAGCAGCCCTTCTATCAGTTCCT
TAAAAACACCTACATTTGGCATCCGGTAGCTCTGGCGGTGGCTCTTTACGCAATGGGTGG
CTTCCCCTTCATCGTTTGGGGAATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTATATCACATAACGTG
GCTTGTAAACTCAGCTTGTCACGTTTGGGGAAACCAAGCATGGAACACTGGAGATTTGTC
TAAGAACAACTGGTGGGTAGC

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DS 

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TTGGGTGAGTACGCATAGGTACCATCATCAGTTTTGTGATTCAGACAAGGATCCTCATAG
CCCGCTTGAAGGGTTTTGGTTTAGTCACATGAATTGGATGTTTGATACCAATACTATCAC
GCAAAGGGCTGGAGAGCCTAATAGTGTTGGGGACTTGGAGAAGCAGCCCTTCTATCAGTT
CCTTAAAAACACCTACATTTGGCATCCGGTAGCTCTGGCGGTGGCTCTTTACGCAATGGG
TGGCTTCCCCTTCATCGTTTGGGGAATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTATATCACATAAC
GTGGCTTGTAAACTCAGCTTGTCACGTTTGGGGAAACCAAGCATGGAACACTGGAGATTT
GTCTAAGAACAACTGGTGGGTAGCAGCTCTAGCATTTGGAGAAGGATGGCACAACAATCA
CCATGCTTTCGAGTTCTCTGCTAGACATGGACTTGAATGGTGGCAATTTGATATGACTTG
GTACGTCGTTAGATTCCTCCAAGCCATTGGCTTAGCAACCGATGTTAAGCTGCCATCAGA
AGCTCAGAAAGAAAGAATGGCACTTACCACCAGTGATTGATGATAGTACGTAGTAACTAT
GTGCTCACCACCGGAATCAAAACTGTTGTACGTTTCGAGCTATGAAAAATTAAAAGAGTT
TTTGTT
G

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GTTCCTTAAAAACACCTACATTTGGCATCCGGTAGCTCTGGCGGTGGCTCTTTACGCAAT
GGGTGGCTTCCCCTTCATCGTTTGGGGAATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTATATCACAT
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TCACCATGCTTTCGAGTTCTCTGCTAGACATGGACTTGAATGGTGGCAATTTGATATGAC
TTGGTACGTCGTTAGATTCCTCCAAGCCATTGGCTTGGCAACCGATGTTAAGCTGCCATC
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TATGTGCTCACCACCGGAATCAAAACTGTTGTACGTTTCGAGCTATGAAAAATTAAAAGA
GTTTTTGTTTTTTTGGGTGCCTTTAC

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DS 

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GTTCCTTAAAAACACCTACATTTGGCATCCGGTAGCTCTGGCGGTGGCTCTTTACGCAAT
GGGTGGCTTCCCCTTCATCGTTTGGGGAATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTATATCACAT
AACGTGGCTTGTAAACTCAGCTTGTCACGTTTGGGGAAACCAAGCATGGAACACTGGAGA
TTTGTCTAAGAACAACTGGTGGGTAGCAGCTCTAGCATTTGGAGAAGGATGGCACAACAA
TCACCATGCTTTCGAGTTCTCTTCTAGACATGGACTTAAATGGTGGCAATTTGATATGAC
TTGGTACGTCGTTAGATTCCTCCAAGCCATTGGCTTAGCAACCGATGTTAAGCTGCCATC
AGAAGCTCAGAAAGAAAGAATGGCACTTACCACCAGTGATTGATGATAGTACGTAGTAAC
TATGTGCTCACCACCGGAATCAAAACTGTTGTACGTTTCGAGCTATGAAAAATTAAAAGA
GTTTTTGTTTTTTTGGGTGCCTTTACATATAAACGTATATATGTTCTATGCAAGAGAGTG
TATGTGAACAAAACTGATTATGAA

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DS 

RD RR4DF03JQ 563 0 0
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TATATCACATAACGTGGCTTGTAAACTCAGCTTGTCACGTTTGGGGAAACCAAGCATGGA
ACACTGGAGATTTGTCTAAGAACAACTGGTGGGTAGCAGCTCTAGCATTTGGAGAAGGAT
GGCACAACAATCACCATGCTTTCGAGTTTTCTGCTAGACATGGACTTGAATGGTGGCAAT
TTGATATGACTTGGTACGTCGTTAGATTCCTCCAAGCCATTGGCTTAGCAACCGATGTTA
AGCTGCCATCAGAAGCTCAGAAAGAAAGAATGGCACTTACCACCAGTGATTGATGATAGT
ACGTAGTAACTATGTGCTCACCACCGGAATCAAAACTGTTGTACGTTTCGAGCTATGAAA
AATTAAAAGAGTTTTTGTTTTTTTGGGTGCCTTTACATATAAACGTATATATGTTCTATG
CAAGAGAGTGTATGTGAACAAAACTGATTATGAATTTTAAGTTTTATCTTCTTATTACAT
TCAATACACAAGAAACTGATTAT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 9

CO CL402Contig1 918 9 26 U
TTTTTCCGATAAATAGCTTTTGATTCAACAAAAATCTCTCAAGAACACAAACACATACAT
ATAAAAGGGAGAATAAAAACAGAGGACACAACAGAAAGACGAAACAGAGCACTGAGAAAT
TGGGCAATGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATTATTATTACGGTGACTGAAGCAGA
ATCATTTTCTTTTCCCTTCTTCAGAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCC
TGTTGGTGATCTCTTCCACCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAGAGCTTTTTGG
TGGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAG
TTTCACCAGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGG
CTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCT
TGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTT
CCATTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGT
TGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGA
GCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTGCGGG*AGAGGAAG
GGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGGTTT
TTCTCGTGGAGGGTGAGGAGGACTCTCCTGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCCGAAAACT
TTGATACCTGCCATTGAATTGATCACAAAGAAAGTCTTTGAAATGTGATTCGTTTGCTGT
TGAATGTGAAGGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4F867JQ U 1
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AF RR4GD56JQ U 7
AF RR4GG19JQ U 7
AF RR4CT26JQ U 26
AF RR4GD56TF C 199
AF RR4GG19TF C 215
AF RR4FC33TF C 244
AF RR4F867TF C 294
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BS 180 203 RR4F867JQ
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ATAAAAGGGAGAATAAAAACAGAGGACACAACAGAAAGACAAAACAGAGCACTGAGAAAT
TGGGCAATGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATTATTATTACGGTGACTGAAGCAAA
ATCATTTTCTTTTCCCTTCTTCAAAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCC
TGTTGGTGATCTCTTCCACCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAAAGCTTTTTGG
TGGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAATAACGAGAATGTGGTGAAAATCGGTCAAAGTAAAAG
TTTCACCAGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGG
CTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAAAAAAGCT
TGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTT
CCATTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGT
TGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGA

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DS 

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A
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GGAGAATAAAAACAGAGGACACAACAGAAAGACGAAACAGAGCACTGAGAAATTGGGCAA
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TCTTTTCCCTTCTTCAGAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTTGGT
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TCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTCACC
AGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTT
AGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCTTGAACAC
TTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCC
AATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGTTCC
TTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAG
GTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCA

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR4GD56JQ 766 0 0
A
GATAAATAGCTTTTGATTCAACAAAAATCTCTCAAGAACACAAACACATACATATAAAAG
GGAGAATAAAAACAGAGGACACAACAGAAAGACAAAACAGAGCACTGAGAAATTGGGCAA
TGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATTATTATTACGGTGACTGAAGCAAAATCATTT
TCTTTTCCCTTCTTCAGAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTTGGT
GATCTCTTCCACCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAAAGCTTTTTGGTGGGAGT
TCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTCACC
AGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTT
AGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAAAAGAGCTTGAACAC
TTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCC
AATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGG*GAAGGTTGGTTCC
TTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAG
GTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTGCGGGGAGAGGAAGGGCTCTT
TCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCA
GAGT

QA 2 762 2 762
DS 

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A
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GGAGAATAAAAACAGAGGACACAACAGAAAGACGAAACAGAGCACTGAGAAATTGGGCAA
TGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATTATTATTACGGTGACTGAAGCAGAATCATTT
TCTTTTCCCTTCTTCAGAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTTGGT
GATCTCTTCCACCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAAAGCTTTTTGGTGGGAGT
TCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTCACC
AGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTT
AGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCTTGAACAC
TTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCC
AATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGTTCC
TTCCTCTTCATATCGGTGAGCTA****CTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAG
GTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTGCGGGGAGAGGAAGGGCTCTT
TCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGGTTTTTCTCG

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4CT26JQ 768 0 0
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ACACAACAGAAAGACGAAACAGAGCACTGAGAAATTGGGCAATGAGGCAGCCACTTATTT
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AATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTTGGTGATCTCTTCCACCCACTC
GTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAGAGCTTTTTGGTGGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAAT
AACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTCACCAGCCAAATACTTGAACTC
CTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAAC
AACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTT
TGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCCAATAGCCATGATTGCGTA
GTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTG
AGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGGC
GGGAACTTTACCAAAAGGGTTGCGGG*AGAGGAAGGGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTT
TGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGGTTTT*CTCGTGGAGGG

QA 1 768 1 768
DS 

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TTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGC*TGTTGGTGATCTCTTCCACCCACTCGTT
GACATGTGGACGCTCGGCGAAGAGCTTTTTGGTGGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAATAAC
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GAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAAC
GGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGA
AGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTG
GGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGG*GAAGGTTGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGC
TATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGG
AACTTTACCAAAAGGGTTGCGGG*AGAGGAAGGGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGA
GCTCGACATGAACGAGCTCAGAGTCGAGGTTTTTCTCGTGGAGGGTGAGGAGGACTCTCC
TGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCCGAAAACTTTGATACCTGCCATTGAATTGATCACAA
AGAAAGTCTTTGAAATGTGATTCGTTTGCTGTTGAATGT
C

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DS 

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AGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTG
GTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCAC
TGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATAT
GTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTA****
CTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTT
ACCAAAAGGGTTGCGGG*AGAGGAAGGGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGA
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TCTTTGAAATGTGATTCGTTTGCTGTTGAATGTGAAGGT
GATCC

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DS 

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CACCAGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTA
ACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGAGCTTGA
ACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCA
TTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGG
TTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCT
TGAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTGCGGG*AGAGGAAGGGC
TCTTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGGTTTTTC
TCGTGGAGGGTGAGGAGGACTCTCCTGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCCGAAAACTTTG
ATACCTGCCATTGAATTGATCACAAAGAAAGTCTTTGAAATGTGATTCGTTTGCTGTTGA
ATGTGAAGGT
C

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DS 

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ACCGCGGCTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAG
AAGAGCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCT
TCTACTTCCATTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGG
AGAAGGTTGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGAT
TCGAAGAGCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTGCGGG*A
GAGGAAGGGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTC
GAGGTTTTTCTCGTGGAGGGTGAGGAGGACTCTCCTGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCC
GAAAACTTTGATACCTGCCATTGAATTGATCACAAAGAAAGTCTTTGAAATGTGATTCGT
TTGCTGTTGAATGTGAAGGTGATCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 10

CO CL403Contig1 874 10 28 U
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TTCTTCTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACGTTAGATGGACAAAGGCAAAGCAGTG
ATGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCC
CGCGACATCCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCA
ACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTA
GCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAAC
ACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCC
CTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATG
CCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTC
AATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCT
CAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACTACAAAGAT
GCTCGAGTGATTTGTTCAATCCTCCTGACATGAGGGG*AGGGAAGATTCATGTGGAACTT
GTCATATTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTTTTTTCACTTTCTAGTATGAT
GGTCATTGCTTATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGAGCTACCTGCTTCCCA
GCTTCTTTAGACACGAATAGATAAAGTTCCAGAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ55TF U 53
AF RR4G890TF U 1
AF RR4F069TF U 4
AF RR4BN85TF U 78
AF RR4FQ55JQ C 226
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AF RR4BN85JQ C 270
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BS 656 656 RR4BN85TF
BS 657 678 RR4G890TF
BS 679 679 RR4F069TF
BS 680 701 RR4G890TF
BS 702 703 RR4BN85TF
BS 704 716 RR4G890TF
BS 717 718 RR4BN85TF
BS 719 758 RR4DA75TF
BS 759 759 RR4G890JQ
BS 760 856 RR4DA75TF
BS 857 874 RR4BN85JQ

RD RR4FQ55TF 547 0 0
CGGATCTAGCTC
TCTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACGTTAGATGGACAAAGGCAAAGCAGTGATGG
GTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCCCGCG
ACATTCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCCTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAACGA
GCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGC
AATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAACACTG
TTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCC
AGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATGCCGA
AACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATA
CTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCC

QA 13 547 13 547
DS 

RD RR4G890TF 717 0 0
GGATTAGAAGGAAACATCTGATCGGATCTAGCTCTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCTTCTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACGT*AGATGGACAAAGGCAAATCCGTG
ATGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCC
CGCGACATCCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCA
ACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTA
GCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGAAAC
ACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCC
CTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATG
CCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTC
AATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCT
CAGGAAGTTTAACACTCTGGCGGAGGATCTGCTTTCCACTGATGAGATAACTACAGAGAT
GCTCGAGTGATTTGTTCA*TCCTCCTGACATGAGGGG*AGG**AGATTCATGTGGA
C

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4F069TF 687 0 0
GG
AGAAGGAAACATCTGATCGGATCTAGCTCTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACGT*AGATGGACAAAGGCAAATCCGTGATGGG
TGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCTCGCGA
CATCCTCGATCCCCTTGGCTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAACGAG
CCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCA
ATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGAAACACTGT
TCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCCA
GAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATGCCGAA
ACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATAC
TTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCTCAG*A
AGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTC*ACTGATGAGATAACTACAGAGATGCTCG
AGTGATTTGTTCAATCCTCCTGACA

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR4BN85TF 641 0 0
CAGATCGAAGAAGTAACGTTAGATGGACAAAGGCAAAGCAGTGATGGGTGCTGGTCGGAG
ATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCCCGCGACATTCTCGATCC
CCCTGGCTTCTCTCGTGCCTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAA
AGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCAATCACCATTTAA
GAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAG
CATTGGCATTACTTTCTCTGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAA
GATTCTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATGCCGAAACTAGTGTTTCT
TGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCT
TCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTC
TGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACTACAAAGATGCTCGAGTGATTTGTTC
AATCCTCCTGACATGAGGGGGAGGGAAGATTCATGTGGAAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4FQ55JQ 602 0 0
CAGGATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAG
AAAGCATGGGAGGTAGCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATG
TGGATGGCTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTTTGG
CAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAG
GTGGAACTACTTATGCCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTG
GGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCT
TCTCTACCCCCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGA
GATAACTACAAAGATGCTCGAGTGATTTGTTCAATCCTCCTGACATGAGGGG*AGGGAAG
ATTCATGTGGAACTTGTCATATTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTTTTTTC
ACTTTCTAGTATGATGGTCATTGCTTATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGA
GC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4F069JQ 605 0 0
CGAACAGGATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACT
TCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCAT
GATGTGGATGGCTGGAAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCT
TTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAA
TAAGGTGGAACTACTTATGCCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTACCCTTGGAGGCTTAGC
TTTGGGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGT
TTCTTCTCTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTG
ATGAGATAACTACAGAGATGCTCGAGTGATTTGTTCAATCCTCCTGACATGAGGGGAAGG
*AAGATTCATGTGGAACTTGTCATATTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTTT
TTTCACTTTCTAGTATGATGGTCATTGCTTATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCAC
TTGAG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4G890JQ 713 0 0
TGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCCCGCGACAT
CCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAACGAGCCG
CCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCAATC
ACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGAAACACTGTTCA
TCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCTTTGGCAGCCTTTCAGCGCCCTCCAGAG
CGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATGCCGAAACT
AGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATACTTT
GGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCTCAGGAAGT
TTAACACTCTGGCGGAGGATCTGCTTTCCACTGATGAGATAACTACAGAGATGCTCGAGT
GATTTGTTCAATCCTCCTGACATGAGGGGAAGG*AAGATTCATGTGGAACTTGTCATATT
GTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTTTTTTCACTTTCTAGTATGATGGTCATTG
CTTATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGAGCTACCTGCTTCCCAG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4DA75JQ 626 0 0
ACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAGAAAGCAT
GGGAGGTAGCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGG
CTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTTTGGCAGCCTC
TCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAAC
TACTTATGCCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCT
GGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTAC
CACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACT
ACAAAGATGCTCGAGTGATTTGTTCAATCCTCCTGACATGAGGGG*AGGGAAGATTCATG
TGGAACTTGTCATATTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCCTTTTTCACTTTCT
AGTATGATGGTCATTGCTTATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGAGCTACCT
GCTTCCCAGCTTCTTTAGACACGA
GT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4DA75TF 626 0 0
ACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAGAAAGCAT
GGGAGGTAGCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGG
CTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTTTGGCAGCCTC
TCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAAC
TACTTATGCCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCT
GGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCGGATTGGGTTTCTTCTCTAC
CACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACT
ACAAAGATGCTCGAGTGATTTGTTCAATCCTCCTGACATGAGGGG*AGGGAAGATTCATG
TGGAACTTGTCATATTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCCTTTTTCACTTTCT
AGTATGATGGTCATTGCTTATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGAGCTACCT
GCTTCCCAGCTTCTTTAGACACGA
GT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4BN85JQ 605 0 0
TAACTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGAT
GATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGCATTAC
TTTCTCTGTTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTCTTGAGCC
ATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATGCCGAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCT
TGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGC
ATCGGATTGGGTTTTTTCTCTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATT
TGCTTTCCACTGATGAGATAACTACAAAGATGCTCGAGTGATTTGTTCAATCCTCCTGAC
ATGAGGGG*AGGGAAGATTCATGTGGAACTTGTCATATTGTAGCATTTTCAAAACTCAGA
AACCATAGCTTTTTTCACTTTCTAGTATGATGGTCATTGCTTATCATAAGTATGGATTGT
ATTATTTGGCACTTGAGTTACCTGCTTCCCAGCTTTTTTAGACACGAATAGATAAAGTTC
CAGAC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 10

CO CL404Contig1 833 10 14 U
ACGGATAAGATTGTGTGAGCCATTGATTAATAGTCATCACAGGTGTCACATTTAGCGTAA
GGAATCTGAAATGATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATG*AAAAAAAAAACAGAC
AGGACAATGGTAGTGGTTGTGAAGATGG*AGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAA
CAGCAAACAACAAGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATG
AGAGATTATTTCAGGCTGTAGCCTCGACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGG
TGTCTTCTGATTTTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCT
TGTCAGCCAATACCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAG
GCAATTTCCTCATGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTG
CATACACACATCCAAGAGCACCGACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATA
GGCCAGTGCTTCCTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTT
TGTTTCTGGGAGCAGAAAACTGGAGCTTTTTAGAAGGATTCAGACCGAAAGAAACGTTGA
CACGACGAGCAACTGGCTTCAGAGAAAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGAGTATTCC
TGGGAAGAGAGAGAGA**TGTTGAAAGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAAC
TTGGATCCTCTCGGAGCTGTTTGTGAGCTTGGAGGACCTTCGATGATATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL76JQ U 61
AF RR4GC92JQ U 73
AF RR4GC92TF C 73
AF RR4HA91JQB U 1
AF RR4FL76TF C 63
AF RR4CC50JQ U 266
AF RR4GR08JQ U 145
AF RR4GR08TF C 145
AF RR4CC50TF C 67
AF RR4HA91TF C 69
BS 1 145 RR4HA91JQB
BS 146 146 RR4FL76JQ
BS 147 224 RR4HA91JQB
BS 225 225 RR4FL76JQ
BS 226 274 RR4HA91JQB
BS 275 275 RR4FL76JQ
BS 276 282 RR4HA91JQB
BS 283 283 RR4FL76JQ
BS 284 320 RR4HA91JQB
BS 321 321 RR4FL76JQ
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BS 739 802 RR4HA91JQB
BS 803 833 RR4FL76TF

RD RR4FL76JQ 480 0 0
GGAATCTGG
AATGATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATGGAAAGAAAAAACAGATAGGACAATG
GTAGTGGTTTTGAAGATGGGAGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACA
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TTCAGGCTGTAGCCTCGACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTG
ATTTTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCA
ATACCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCC
TCATGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACAC
ATCCAAGAGCACCGACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATA

QA 10 480 10 480
DS 

RD RR4GC92JQ 532 0 0
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GTGGTTTTGAAGATGG*AGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACAACA
AGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATGCGAGATTATTTC
AGGCTGTAGCCTCGACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTGATT
TTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCAATA
CCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTGGGCAATTTCCTCA
TGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGCGCATACACACATC
CAAGAGCGCCCACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGCTTC
CTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTG
CC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4GC92TF 532 0 0
GATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATGAAAAAAAAAAACAGACAGGACAATGGTA
GTGGTTTTGAAGATGG*AGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACAACA
AGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATGCGAGATTATTTC
AGGCTGTAGCCTCGACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTGATT
TTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCAATA
CCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTGGGCAATTTCCTCA
TGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGCGCATACACACATC
CAAGAGCGCCCACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGCTTC
CTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTG
CC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4HA91JQB 803 0 0
ACGGATAAGATTGTGTGAGCCATTGATTAATAGTCATCACAGGTGTCACATTTAGCGTAA
GGAATCTGAAATGATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATG*AAAAAAAAAACAGAC
AGGACAATGGTAGTGGTTGTGAAGACGG*AGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAA
CAGCAAACAACAAGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCGTCCTAAAAACAGATG
AGAGATTATTTCAGGCTGTAGCCTCGACTTCATCAGTGCTTAAAGCTGCACCATTAGGGG
TGTCTTCTGATTTTAGCTGAAAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCT
TGTCAGCCAATACCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAG
GCAATTTCCTCATGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTG
CATACACACATCCAAGAGCACCGACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATA
GGCCAGTGCTTCCTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTT
TGTTTCTGGGAGCAGAAAACTGGAGCTTTTTAGAAGGATTCAGACCGAAAGAAACGTTGA
CACGACGAGCAACTGGCTTCAGAGAAAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGAGTATTCC
TGGGAAGAGAGAGAGAGATGTTGAAAGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAAC
TTGGATCCTCTCGGAGCTGTTT
C

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4FL76TF 771 0 0
GGATCTG
AATGATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATG**AAAGAAAAACAGATAGGACAATG
GTAGTGGTT*TGAAGATGGGAGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACA
ACAAGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATGAGAGATTAT
TTCAGGCTGTAGCCTCGACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTG
ATTTTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCA
ATACCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCC
TCATGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACAC
ATCCAAGAGCACCGACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGC
TTCCTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTGTTTCTGG
GAGCAGAAAACTGGAGCTTTTTAGAAGGATTCAGCCCGAAAGAAACGTTGACACGACGAG
CAACTGGCTTCAGAGAAAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGAGTATTCCTGGGAAGAG
AGAGAGA**TGTTGAAAGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAACTTGGATCCT
CTCGGAGCTGTTTGTGAGCTTGGAGGACCTTCGATGATATCTCC

QA 8 771 8 771
DS 

RD RR4CC50JQ 541 0 0
GACTTCATCAGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGGGTCTTCTGATTTTAGCTGAGAGGA
CACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCAATACCTTGCGAGTTTT
CTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCCTCATGAGATCCTTTCG
GTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACACATCCAAGAGCACCGAC
TATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGCTTCCTGAACTGTCATC
ATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTGTTTCTGGGAGCAAAAAACTGGAG
CTTTTTAAAAGGATTCAAACCGAAAGAAGCGTTGACACGACGAGCAACTGGCTTCAGAGA
AAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGAGTATTCCTGGGAAGAGAGAGAGA**TGTTGAA
AGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAACTTGGATCCTCTCGGAGCTGTTT
GTCC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4GR08JQ 655 0 0
C
TGGGAGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACAACAAGAAGTAACAATG
ACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATGAGAGATTATTTCAGGCTGTAGCCTC
GACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTGATTTTAGCTGAGAGGA
CACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCAATACCTTGCGAGTTTT
CTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCCTCATGAGATCCTTTCG
GTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACACATCCAAGAGCACCGAC
TATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGCTTCCTGAACTGTCATC
ATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTGTTTCTGGGAGCAGAAAACTGGAG
CTTTTTAGAAGGATTCAGCCCGAAAGAAACGTTGACACGACGAGCAACTGGCTTCAGAGA
AAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGA**ATTCCTGGGAAGAGAGAGAGA**TGTTGAA
AGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAACTTGGATCCTCTCGGAGCT
C

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR4GR08TF 655 0 0
C
TGGGAGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACAACAAGAAGTAACAATG
ACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATGAGAGATTATTTCAGGCTGTAGCCTC
GACTTCATCGGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTGATTTTAGCTGAGAGGA
CACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCAATACCTTGCGAGTTTT
CTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCCTCATGAGATCCTTTCG
GTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACACATCCAAGAGCACCGAC
TATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGCTTCCTGAACTGTCATC
ATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTGTTTCTGGGAGCAGAAAACTGGAG
CTTTTTAGAAGGATTCAGCCCGAAAGAAACGTTGACACGACGAGCAACTGGCTTCAGAGA
AAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGA**ATTCCTGGGAAGAGAGAGAGA**TGTTGAA
AGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAACTTGGATCCTCTCGGAGCT
C

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR4CC50TF 740 0 0
TGA
AATGATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATG**AAAAAAAAACAGACAGGACAATG
GTAGTGGTTGTGAAGACGG*AGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACA
ACAAGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCATCCTAAAAACAGATGAGAGATTAT
TTCAGGCTGTAGCCTCGACTTCATCAGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTG
ATTTTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCA
ATACCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCC
TCATGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACAC
ATCCAAGAGCACCGACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGC
TTCCTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTGTTTCTGG
GAGCAGAAAACTGGAGCTTTTTAGAAGGATTCAGACCGAAAGAAGCGTTGACACGACGAG
CAACTGGCTTCAGAGAAAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGAGTATTCCTGGGAAGAG
AGAGAGA**TGTTGAAAGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAACTTGGATCCT
CTCGGAGCTGTTT
GTCC

QA 4 736 4 736
DS 

RD RR4HA91TF 736 0 0
A
AATGATGATGATAAATCGTTCAACATAGTCTAATG**AAAAAAAAACAGACAGGACAATG
GTAGTGGTTGTGAAGACGG*AGGAAAAGTTTTAGACAAAATTACACAGAAACAGCAAACA
ACAAGAAGTAACAATGACCCACAATTTGTTTCAGCGTCCTAAAAACAGATGAGAGATTAT
TTCAGGCTGTAGCCTCGACTTCATCAGTGCTTAGAGCTGCACCATTAGGGGTGTCTTCTG
ATTTTAGCTGAGAGGACACATCGTCGATAGCAGAGTTGAGCTGAGCAATCTTGTCAGCCA
ATACCTTGCGAGTTTTCTCCAAAGCTTTTTCCTCATCATAAATGAACTTAGGCAATTTCC
TCATGAGATCCTTTCGGTCTGCTCCAGCTATAGCCTTGCTGATCTGTGGTGCATACACAC
ATCCAAGAGCACCGACTATGAGCCCGCCCAAAATGAACCCTCCCACAAATAGGCCAGTGC
TTCCTGAACTGTCATCATCTCTGTATGCTGATTGGATGGTTAGGATCCTTTTGTTTCTGG
GAGCAGAAAACTGGAGCTTTTTAGAAGGATTCAGACCGAAAGAAACGTTGACACGACGAG
CAACTGGCTTCAGAGAAAAGCCAGATGAAGGGTGGAGTTGTTGAGTATTCCTGGGAAGAG
AGAGAGAGATGTTGAAAGAGTCGCCATCGATGGAACGAATGAGAAAGAAACTTGGATCCT
CTCGGAGCTGTTT
CC

QA 2 734 2 734
DS 



AS 1 10

CO CL405Contig1 998 10 15 U
ATAAAATGTGAAGAAATATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGTC
AAATTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAAC
AATCTTCGTTTCTGTTTTTTTTT*TAAAATAATGCACACTCAAACCCC*ATCTTCCAACA
CCAACTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGTTGGTTGTGTGTTTATAGTGCCATCTCAG
CCTGAAGTGCAGCGAGTTCATCTTCTTCATCAGCAGTCTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGAC
GAGAAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCT
CCAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAAATCAGCGGCGG
AGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGA
TCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAG
CAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACA
TAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGT
ATAACCTCTTCCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATT
CTTTGGCTCTCTCAACCTCTCCAGCAGCTTTCTTGAGAAGAACAGATTCCTTCTTCTCCA
GCATCTCAAGTGTCTCATTAAGCTTGCCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGG
GTTTCCCGAATAGCCGTGTAAACATTCTTCTTGATTAAACACCTGGGAGAGATTTGATGC
CCGAAGGTTGCTTGATTGCTTGCGATGATGATGAAGAGACGGAGGAGAAGGAGAAACGGC
GTTGAAGTGCTTATCAATACTTTTTTTTTATAATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 
35 50 0 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 
50 50 50 50 55 55 55 55 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 10 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 30 30 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA65JQ U 225
AF RR4DT49JQ U 21
AF RR4EB26JQ U 1
AF RR4AD68JQ U 8
AF RR4E912JQ U 147
AF RR4EB26TF C 367
AF RR4E912TF C 212
AF RR4BA65TF C 147
AF RR4AD68TF C 147
AF RR4DT49TF C 371
BS 1 142 RR4EB26JQ
BS 143 143 RR4DT49JQ
BS 144 234 RR4EB26JQ
BS 235 235 RR4DT49JQ
BS 236 244 RR4EB26JQ
BS 245 245 RR4BA65JQ
BS 246 396 RR4EB26JQ
BS 397 397 RR4DT49JQ
BS 398 761 RR4EB26JQ
BS 762 762 RR4AD68JQ
BS 763 823 RR4E912JQ
BS 824 896 RR4AD68TF
BS 897 897 RR4EB26TF
BS 898 985 RR4AD68TF
BS 986 998 RR4DT49TF

RD RR4BA65JQ 396 0 0
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TTCTGAGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGA
AGTTGGTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCG
CCGAAATCAGCAGCAGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTA
TCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTC
TGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCT
TTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATA

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4DT49JQ 681 0 0
CAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGTCAAATTGTATATAAAATAATG
TATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAACAATCTTCGTTTCTGTTTTTT
TTTTTAAAATAATGCACACTCAAACCCC*ATCTTCCAACACCAGCTTCCGCTGCAGTAAA
AATAAAACCCGTTGGTTGTGTGTTTATAGTGCCATCTCAGCCCGTAGTGCAGCGAGTTCA
TCTTCTTCATCAGCAGTCTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGAAGGTAGCTTTCCTTCA
GGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCCAAGCCTTCAAGTTCGTCA
AGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAAATCAGCGGCGGAGCCAAATGGAGCGGACAAT
GCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCA
ACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAA
GCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATA
CGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCTCTTCCTTTTCAAA
CATTGTATAGCCGCGCGTTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4EB26JQ 761 0 0
ATAAAATGTGAAGAAATATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGTC
AAATTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAAC
AATCTTCGTTTCTGTTTTTTTT**TAAAATAATGCACACTCAAACCCC*ATCTTCCAACA
CCAACTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGTTGGTTGTGTGTTTATAGTGCCACCTCAG
CCTGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCTTCATCAGCAGTCTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGAC
GAGAAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCT
CCAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTAATCCTCATCGAAATCAGCGGCGG
AGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGA
TCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAG
CAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACA
TAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGT
ATAACCTCTTCCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATT
CTTTGGCTCTCTCAACCTCTCCAGCAGCTTTCTTGAGAAGA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4AD68JQ 755 0 0
CTC
AAGAAATATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGTCAAATTGTATA
TAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAACAATCTTCGTT
TCTGTTTTTTTTT*TAAAATAATGCACACTCAAACCCC*ATCTTCCAACACCAACTTCCG
CTGCAGTAAAAATAGAACCCGTTGGTTGTGTGTTTATAGTGCCATCTCAGCCTGTAGTG*
AGCGAGTTCATCTTCTTCATCAGCAGTCTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGAAGGTAG
CTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCCAAGCCTTC
AAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAAATCAGCGGCGGAGCCAAATGG
AGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCAT
GGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACC
AGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTG
ATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTACTCGTATAACCTCTT
CCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCT
CTCAACCTCTCCAGCAGCTTTCTTGAGAAGAA

QA 4 755 4 755
DS 

RD RR4E912JQ 677 0 0
AAATAATGCACACTCAAACCCC*ATCTTCCAACACCAACTTCCGCTGCAGTAAAAATAGA
ACCCGTTGTTTGTGTGTTTATAGTGCCATCTCAGCCTGAAGTGCAGCGAGTTCATCTTCT
TCATCAGCAGTCTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTACTTCAGGAAGT
GGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAGGTTCGTCAAGTTCT
GCTTCCAATTCATCCTCGTCGAAATCAGCAGCAGAACCAAATGGAGCGGACAATGCGTCC
TGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCG
TCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCT
ACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGC
TGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCTCTTCCTTTTCAAACATTGT
ATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCTCTCAACCTCTCCAGCA
GCTTTCTTGAGAAGAACAGATTCCTTCTTCTCCAGCATCTCAAGTGTCTCATTAAGCTTG
CCTAATGTGTGGAGAGT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4EB26TF 596 0 0
CTTCAAGTTCGTCAAGT*CTGCTTCCAATTAATC*TCATCGAAATCAGCGGCGGAGCCAA
ATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCAT
CCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAG
CACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCA
TTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACC
TCTTCCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGG
CTCTCTCAACCTCTCCAGCAGCTTTCTTGAGAAGAACAGATTCCTTCTTCTCCAGCATCT
CAAGTGTCTCATTAAGCTTGCCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCC
CGAATAGCCGTGTAAACATTCTTCTTGATTAAACACCTGGGAGAGATTTGATGCCCGAAG
GTTGCTTGATTGCTTGCGATGATGATGAAGAGACGGAGGAGAAGGAGAAAC
GGCCC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4E912TF 748 0 0
TTGT
TTGTGTGTTTATAGTGCCATCTCAGCCTGAAGTGCAGCGAGTTCATCTTCTTCATCAGCA
GTCTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTACTTCAGGAAGTGGTCTTGCT
GGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAGGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAAT
TCATCCTCGTCGAAATCAGCAGCAGAACCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGT
TTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTT
GTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCT
GTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTG
CCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCTCTTCCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCG
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TGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGCTTCCCGAATAGCCGTGTAAACATTCTTCTTGAT
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CC

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GGTGAT
CC

QA 1 786 1 786
DS 

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GGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCCAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCT
GCTTCCAATTCATCCTCATCGAAATCAGCGGCGGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCC
TGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCG
TCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCT
ACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGC
TGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTACTCGTATAACCTCTTCCTTTTCAAACATTGT
ATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCTCTCAACCTCTCCAGCA
GCTTTCTTGAGAAGAACAGATTCCTTCTTCTCCAGCATCTCAAGTGTCTCATTAAGCTTG
CCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCCCGAATAGCCGTGTAAACATT
CTTCTTGATTAAACACCTGGGAGAGATTTGGTGCCCGAAGGTTGCTTGATTGCTTGCGAT
GATGATGAAGAGACGGAGGAGAAGGAGAAACGGCGTTGAAGTGCTTATCAATACTTTTT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4DT49TF 628 0 0
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AGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTTTGCTCATTGATCTCATCCAT
GGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACC
AGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTG
ATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCTCTT
CCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCT
CTCAACCTCTCCAGCAGCTTTCTTGAGAAGAACAGATTCCTTCTTCTCCAGCATCTCAAG
TGTCTCATTAAGCTTGCCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCCCGAA
TAGCCGTGTAAACATTCTTCTTGATTAAACACCTGGGAGAGATTTGATGCCCGAAGGTTG
CTTGATTGCTTGCGATG***ATGAAGAGACGGAGGAGAAGGAGAAACGGCGTTGAAGTGC
TTATCAATACTTTTTTTTTATAATATCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 2 10

CO CL406Contig1 806 4 12 U
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TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGTCGTAT
TGACCTTCCTCGCTTCCAGCCAAGTCACAGAAGGGTCACGTATGATGAACCTCTGCTCTC
ACACTGCATATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTACCACGAATCCAAGACGCG
CCACGCACCGAACTATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTTGCTGAAGCAG
CTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGCGACATGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGATTATAAGGAAACGTGATGTGATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGA
ACCAGGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCT
TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAAATTACCATTTTTTTATTTTTTCT
CAAAACAAACACAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAAATCTT
GAATAATTAAAAAATGTTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATGTTTG
CTGGATCATCATTTGTCATGTAAAACGCCACTGGGTGTTATTAATTATACTTGGTTTCTT
GTAAATTTATTGCTGTTAGAATTCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4AY36TF U 65
AF RR4BB02TF U 1
AF RR4BD14TF U 1
AF RR4AY36JQ C 27
BS 1 114 RR4BB02TF
BS 115 115 RR4AY36TF
BS 116 222 RR4BB02TF
BS 223 223 RR4AY36TF
BS 224 289 RR4BB02TF
BS 290 290 RR4AY36TF
BS 291 311 RR4BB02TF
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BS 313 387 RR4BB02TF
BS 388 388 RR4AY36TF
BS 389 804 RR4BB02TF
BS 805 806 RR4AY36JQ

RD RR4AY36TF 643 0 0
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GTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAAATTACCATTTTTTTATTTTTTCTCAAA
ACAA*CACAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAAATCTTGAAT
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QA 1 643 1 643
DS 

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DS 

RD RR4BD14TF 804 0 0
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TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
TGACCTTCCTCGCTTCCAGCCAAGTCACAGAAGGGTCACGTATGATGAACCTCTGCTCTC
ACACTGCATATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAATCCAAGACGCG
CCACGCACCGAACTATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCAG
CTAGGTACAAATACGGTAACCAAGCGATCGCGACATGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGATGTGATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGA
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TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAAATTACCATTTTTTTATTTTTTCT
CAAAACAAACACAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAAATCTT
GAATAATTAAAAAATGTTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATGTTTG
CTGGATCATCATTTGTCATGTAAAACGCCACTGGGTGTTATTAATTATACTTGGTTTCTT
GTAAATTTATTGCTGTTAGAATTC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AY36JQ 780 0 0
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CGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGTCGTATTGACCTTCCTCGCTTCCAGCCAAGTC
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ATCGCGACATGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGGTTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAG
ATTATAAGGAAACGTGATGTGATGGGGATGAACACGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGAT
TACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGAACCAGGTTAATACGGTTCAGAATGTA
GCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCTTGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATG
ATTGATTACAAATTACCATTTTTTTATTTTTTCTCAAAACAAACACAAAACTAATTAATT
TCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAAATCTTGAATAATTAAAAAATGTTTTTTCTTA
TGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATGTTTGCTGGATCATCATTTGTCATGTAAAAC
GCCACTGGGTGTTATTAATTATACTTGGTTTCTTGTAAATTTATTGCTGTTAGAATTCCT

QA 1 780 1 780
DS 



CO CL406Contig2 787 6 2 U
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AATTATTCAAGATTTTTTTTCCTTCTTATTCATTTAGACGAAATTAATTAGTTTTGTGTT
TGTTTTGAGAAAAAATAAAAAAATGGTAATTTGTAATCAATCATCTAAACCAATGTAGAC
AACGACAAGCAGTTGCTGCTAATTTTTCTCAGGTCAACCGCTACATTCTGAACCGTATTA
ACCTGGTTCGCGTCAATAAACCCTTCAACACATACACCGTAATCAGACACAGCCGCGGTC
AAAAACGTGTTCATCCCCATCACGTCACGTTTCCTTATACTCTTCCTCGCGTTCGCAAGA
TTATAAACTGCATCGCTAAACGTCGCGTAACACGTCGCGATTGCTTGGTTACCGTCTTTG
TACCTAGCCGCTTCAGCTAAAGCCACTTTTGTCTTAGCTTCCAAAGCCTGAATGGTTCGG
TGCGTGGCACGTCTTGGGTTCGTGATACGTTTAATCAAAGGTTGGCATAGGGGTGGATAC
GCGGTGTGTGAGCAGAGGTTCATCACACGTGACGCTTCTGTGACTTGAGTGGAGAAGAGG
AAGGTCAATACGGCGACGGATACCGCGACAGCCGCAAAACGCAGCTGGAAGATGTCACGG
CCCGCCATTTTTATTTTTGTGTTTAAATCTGTTTTAGTTTAACTGAGAATAAATTAGATT
GGTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4GM74JQ U 1
AF RR4GH71JQ U 1
AF RR4FB55JQ U 156
AF RR4GH71TF C 156
AF RR4GM74TF C 221
AF RR4FB55TF C 156
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BS 764 787 RR4FB55JQ

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TGTTTTGAGAAAAAATAAAAAAATGGTAATTTGTAATCAATCATCTAAACCAATGTAGAC
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AAAAACGTGTTCATCCCCATCACGTCACGTTTCCTTATACTCTTCCTCGCGTTCGCAAGA
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TATACTCTTCCTCGCGTTCGCAAGATTATAAACTGCATCGCTAAACGTCGCGTAACACGT
CGCGATTGCTTGGTTACCGTCTTTGTACCTAGCCGCTTCAGCTAAAGCCACTTTTGTCTT
AGCTTCCAAAGCCTGAATGGTTCGGTGCGTGGCACGTCTTGGGTTCGTGATACGTTTAAT
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AGTTTAACTGAGAATAAATTAGCTTGGTGTCC

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DS 

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AACTGAGAATAAATTAGCTTGGTGTCC

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DS 

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AACCGCTACATTCTGAACCGTATTAACCTGGTTCGCGTCAATAAACCCTTCAACACATAC
ACCGTAATCAGACACAGCCGCGGTCAAAAACGTGTTCATCCCCATCACGTCACGTTTCCT
TATACTCTTCCTCGCG****CAAGATTATAAACTGCATCGCTAAACGTCGCGTAACACGT
CGCGATTGCTTGGTTACCGTCTTTGTACCTAGCCGCTTCAGCTAAAGCCACTTTTGTCTT
AGCTTCCAAAGCCTGAATGGTTCGGTGCGTGGCACGTCTTGGGTTCGTGAAACGTTTAAT
CAAAGGTTGGCATAGGGATGGATACGCGGTGTGTGAGCAGAGGTTCATCACACGTGACGC
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AGTTTAACTGAGAATAAATTAGATTGGTGTCC

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DS 



AS 2 10

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CTTTTGTGGGGTCTTAGTGAAACCTGTTGTGTGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4E443JQ U 15
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AF RR4E443TF C 1
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G
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GACTCCAGTGAGCTTCTTGATCCTGCCGGTCTCAACCACGGCAGTGATCTCGGTTCCATA
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TT
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TATAGATCTCATTGACTGTGATCCATATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGCT
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CGATCTCTTCGAACTTGTGGATGATGCTCTCTTTCTGCTTCAGCCACACAACTCCTGACT
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TAGTGAAACCTGTTGTGTGTTGTCC

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DS 

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TTTTATTAGGCCTCCTTAACTGCAACAGCCTCCTTGATAGCAACAGCCTCCTTGACCTCG
GTGGCTTCACTGCCCTTTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCTTCTGGGACTGTAAAAGCTGAG
ACAGGGAAAGTCCTGGACAGAGTGGTTGGTGTCTTGAATGTGATCTTCCCTCCGTCCTGT
GTATAGATCTCATTGACTGTGATCCATATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGC
TTCTTGATCCTGCCGGTCTCAACCACGGCAGTGATCTCGGTTCCATAAGAGACGAGCTTA
TCGATCTCTTCGAACTTGTGGATGATGCTCTCTTTCTGCTTCAGCCACACAACTCCTGAC
TCTCTGTCATATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAACGGTAGTAAGCCACTGGGCATAGGT
ATTTCCTTGTAGAAAACCTTGGCCTTCTCTTGGCATATTTCTCCTGTGTACTTCTCTGCC
TTGGCTCTGATCTCCTCTGTAACCAAACCCATCTCTATTTCTTTGTTCTTTTGTGGGGTC
TTAGTGAAACCTGTTGTGTGTTGTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DM42TF 730 0 0
G
CCAACTTTAATTTAGAT*ACAGATATAGTACGGTAATATTTGTAGATGAGGATGATGTTG
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CTTGGCCTTCTCTTGGCATATTTCTCCTGTGTACTTCTCTGCCTTAGCTCTGATCTCCTC
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GTGTTGTCC

QA 2 730 2 730
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TG
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AACTGCAACAGCCTCCTTGATAGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGTGGCTTCACTGCCCTT
TTCCTTGGCAGGTTCCACTTCTTCTGGGACTGTAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGA
CAGAGTGGTTGGTGTCTTGAATGTGATCTTCCCTCCGTCCTGTGTATAGATCTCATTGAC
TGTGATCCATATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCCTGCCGGT
CTCAACCACGGCAGTGATCTCGGTTCCATAAGAGACGAGCTTATCGATCTCTTCGAACTT
GTGGATGATGCTCTCTTTCTGCTTCAGCAACACAACTCCTGACTCTCTGTCATATCCAAC
CTCTTCTATGTCCTTCAACGGTAGTAAGCCACTGGGCATAGATATTTCCTTGTAGAAAAC
CTTGGCCTTCTCTTGGCATATTTCTCCTGTGTACTTCTCTGCCTTAGCTCTGATCTCCTC
TGTAACCAAACCCATCTCTATTTCTTTGTTCTTTTGTGGGGTCTTAGTGAAACCTGTTGT
GTGTTGTCC

QA 3 731 3 731
DS 



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CTTTTGTGGGGTCTTAGTGAAACCTGTTGTGTGTTGTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FY35TF C 1
AF RR4FY35JQ U 8
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BS 8 699 RR4FY35JQ

RD RR4FY35TF 699 0 0
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QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4FY35JQ 692 0 0
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GGGGTCTTAGTGAAACCTGTTGTGTGTTGTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 10

CO CL408Contig1 734 10 16 U
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TTTCTGTTCTCATC


BQ
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55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ04TF U -2
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AF RR4FT79JQ C 1
AF RR4FT58TF U 1
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AF RR4FT79TF U 1
AF RR4D503JQ C 89
AF RR4EQ04JQ C 24
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GGGCC
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TATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCC
TCGCGGCTCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAGAG
CGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTTTT
TGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAATCG
ATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTGTT
TACCTCACGGAGATTTGAAAAAAAA*GACGAGAGGATATGGAGGATTTGAAGCTCTCAAG
ATGAAAAA

QA 6 553 6 553
DS 

RD RR4EE95TF 627 0 0
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TAAAAATAAACTGAAGCAAAAAAAT*TCTCTCTCTATCTGTGTTAGTCAAAAGCTATGGA
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ATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCCT
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ACCTCACGGAGATTTGAAAAAAAA*GACGAGAGGATATGGAGGATTTGAAGCTCTCAAGA
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CACTGATCAGAAAAA

QA 13 627 13 627
DS 

RD RR4FT58JQ 716 0 0
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CGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTG
TTTACCTCACGGAGATTTGAAAAAAAA*GACGAGAGTATATGGAGGATTTGAAGCTCTCA
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QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4FT79JQ 716 0 0
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CGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTG
TTTACCTCACGGAGATTTGAAAAAAAA*GACGAGAGTATATGGAGGATTTGAAGCTCTCA
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ATGCACTGATTAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAAG
AGTTCTTGTAAAGAAA*GATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTT*GTTCCTAGTTTA
AAAAAAAA

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TAAAAATAAACTGAAGCAAAAAAAT*TCTCTCTCTATCTGTGTTAGTCAAAAGCTATGGA
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CTCACCGTCTTCTCCAACGATCCACGACGTTCTTCGGTCAAAAGGTCTCCCCGCGGGACT
ATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCCT
CGCGGCCCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAGAGC
GAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTTTTT
GTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAATCGA
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ACCTCACGGAGATTTAAAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGACTTGAAGCTCTCAAGA
TGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTATG
CACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAG*TTTTTGTTTAAGAGT
TCTTGTAA

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TACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCCTCG
CGGCTCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACCCTGTAGTGAGAGCGA
ATCTGAGCTGCGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTTTTTGT
GGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAATCGATA
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CTCACGGAGATTTGAAAAAAAA*GACGAGAGGATATGGAGGATTTGAAGCTCTCAAGATG
AAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTATGCA
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DS 

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GGAGAAACTCATCTACCAAATAACCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCACATTCTCTCT
CTCCTCACCGTCTTCTCCAACGATCCACGACGTTCTTCGGTCAAAAGGTCTCCCCGCGGG
ACTATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTT
CCTCGCGGCTCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGGG
AGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTT
TTTGTGGCTGTCGGTGAAAGACATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAAT
CGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTG
TTTACCTCACGGAGATTTGAAAAAAAA*GACGAGAGTATATGGAGGATTTGAAGCTCTCA
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ATGCACTGATTAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAAG
AGTTCTTGTAAAGAAA*GATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTT*GTTCCTAGTT

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DS 

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ACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCCTCGCGGCCCCGTGTCTCGCCAAGTCC
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TCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTGTTTACCTCACGGAGATTTAAAAAAAAAA
GACGAGAGGATATGGAGGACTTGAAGCTCTCAAGATGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGAT
ATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCT
AATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAAGAGTTCTTGTAAAGAAAAGATTCTCAATG
TCCTATCCTATGTTTTTGTTCCTAGTTT
AT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4EQ04JQ 711 0 0
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CCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCACATTCTCTCTCTCCTCACCGTCTTCTCCAACGA
TCCACGACGTTCTTCGGTCAAAAGGTCTCCCCGCGGGACTATTACCCCAAGAGGTTGACT
CTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCCTCGCGGCTCCGTGTCTCGCCA
AGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAGAGCGAATCTGAGCTACGGGAGCC
TTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTTTTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATA
TTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAATCGATATCGGCGTTGCTTATAAAC
AACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTGTTTACCTCACGGAGATTTGAAAA
AAAA*GACGAGAGGATATGGAGGATTTGAAGCTCTCAAGATGAAAAATTTAAAAGAAGGG
TGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTATGCACTGATTAGAAAAACCAAT
ATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAAGAGTTCTTGTAAAGAAAAGATTCT
CAATGTTCTATCCTATGTTTTTGTTCCTAGTTTATATTTTCTGTTCTCATC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 2 10

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TCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAAAGTTATTTGAAGACTTGCTTTG
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

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C

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DS 

RD RR4DX90TF 696 0 0
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TACTGAACTTCAAGAGAATCTTTTTTGTCCAGGGTTTATACTTTGCTTCTCCTTTTGGTG
AGATGAGGATTTCGATTGAGCTCAATGTTAAGAGACTAGTAGACGTTTCTCTGTTTGCTT
TCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAAAGTTATTTGAAGACTTGCTTTG
TAGACAGTAATTTTCAATGAAAAAA*ACTTGCGTT
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4AL22TF 679 0 0
GGGTAGTAAGCTCAACTTTGTTTCTTCGTCTTTAGCAGAGGAGAGTTTTGTGCGGCTGCC
ACTTCAATCTCCGAGTGTTTGAGCTTTTGAAAGATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAACGAT
GGTCTGAAGAGTATGTACAATGCTGAGAAAAGAGGCAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCT
TCTTCTAAGGTCATCAT***GTTCCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGAG
TTTGAGTACGTTGATGATCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTCAATGGAAGACTT
AACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTCGATGTCGGAGTTAAAGAGATTGAAAGCTGG
ACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTTCTAACAACCTCAGCCGGT
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TACTGAACTTCAAGAGAATCTTTTTTGTCCAGGGTTTATACTTTGCTTCTCCTTTTGGTG
AGATGAGGATTTCGATTGAGCTCAATGTTAAGAGACTAGTAGACGTTTCTCTGTTTGCTT
TCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAAAGTTATTTGAAGACTTGCTTTG
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QA 1 679 1 679
DS 



CO CL409Contig2 706 6 7 U
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CACTTCAATCTCCAAGTGTTTTGAGCTTTTGAAAGATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAACG
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GGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTTCTAACAACCTCAGCCG
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TGTAGACAGTAATTTTCAATGAACAAAAACTTGCGTTTCTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E650JQ C 1
AF RR4FA93JQ C 268
AF RR4FA93TF U 268
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AF RR4D067TF U 10
AF RR4D067JQ C 393
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G
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G

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G
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ACTTGCGTTTC
G

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ATTCTTTTACTGAACTTCAAGAGAATCTTCTTTGTCCAGGGTTTATACTTTGCTTCTCCT
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TGCTATGTAGACAGTAATTTTCAATGAACAAAAACTTGCGTTTC
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GG
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CTTCTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTTCTAACAACCTCAGCCGGTATCATGGAC
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ATTTTCAATGAACAAAAACTTGCGT
CCAAAAAA

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DS 

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GGT
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GTTTATACTTTGCTTCTCCTTTTGGTGAGACGAGGATTTCGATTTAGCTCAATGTTAAGA
GAGTAGTAGACGTTTCTCTGTTTGCTTTCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCT
TCAAAAGTTAATTGAAGACTTGCTATGTAGACAGTAATTTTCAATGAACAAAAACTTGCG
T
CC

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DS 



AS 1 8

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AAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGGAATCGTAATTACGTTTTTTGGTATAA
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AAAAAAAAAAAA***TCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGG
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ATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGGAATCGTAATTACGTTTTTTGGTATAA
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AATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTTTAATA
AAAAAAAAAAAA***TCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGG
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ATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTT

QA 1 508 1 508
DS 

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TTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTTTAATAAAAAAAAAAA*****TCACTTAAACGC
AATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAA
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TATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATT
GATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATTATTAGTCTCGGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4F377TF 665 0 0
TTTTTT
GATTCATCAGATAAAGGAATCGTAATTACGTTTTTTGGTATAACAGGATTATTATTCACG
CGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAATCAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTT
TCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAATC
ACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGGCC
TTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAA
TGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGATCATTATTAT
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TCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAG*AGCTGTATGGGCTAATGAAACGTGGGGTTCA

QA 7 665 7 665
DS 

RD RR4AR58TF 749 0 0
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CGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAAGCAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTT
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TGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGATCATTATTAT
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ATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4A816JQ 849 0 0
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AATTTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCC
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GCGTCAATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAA
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QA 1 849 1 849
DS 

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TTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGT
ACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTT
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GACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTC
TGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCT
TTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4AR58JQ 846 0 0
GGTATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAAGCAAT
TTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTAT
TTTAATAAAAAAAAAAAAA***TCACTTAAACGCGATAACTGTGCCAAGTGCTATTTTTA
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CAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCG
CTCTGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCG
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GGGCTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTA
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TCAATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAAC
ATTAAC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4BR86JQ 732 0 0
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TATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACTTTTTGGAAAA
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GATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGCTAATGAAACGTGGG
GTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTACTTGGACCATCTTCG
CAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTCTGCAATTGTGG
CTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTTTTAGGAATAG
GTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATTAACAAAAAGAGAAAA
GAATCCAAATAAAAAAAATAGAATCTATATATAACTTCATATAAGTTAAGAAATCAAATT
TAGTTTTAGTAGTAAATCATCAAGAACCTTTTGAATCAAGTAGTACAATGATTCAAAAGG
TTCTCACAATAC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 9

CO CL411Contig1 825 9 12 U
GGGTGTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTAATCTCTCTTCTTC***********
*CTCTTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGA
CGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTG
CATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGC
AGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACTATTGATTTCCC
CGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAA
GGAGGCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTTCG
CCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAA
GGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGAT
GGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTTCCAAACCTGGTTTGCTGCT
GCCTCTATTCTTATATTGCTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGG*ACTCATGTCTG
CTTCTTTGTATGCTCTACATTTGAAGTCTGAACATTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTTTTTT
TTCATTTATCTTTTGTCAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGACGGTC
TCTAGTAAAAGCATTGTATCATGGTTTTGTTAAATGCAGTTCTCT


BQ
10 10 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ34TF U 1
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AF RR4G832TF U 60
AF RR4DG78TF U 4
AF RR4AO64TF U 3
AF RR4AK58TF U 1
AF RR4AK58JQ C 220
AF RR4AO64JQ C 3
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RD RR4BJ34TF 757 0 0
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QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4AV63TF 757 0 0
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DS 

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GGGGT
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TTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGACGAT
CAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATT
ACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAG
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GTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAA
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QA 6 770 6 770
DS 

RD RR4G832TF 699 0 0
GG
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GAGTCCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAG
GAGGCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTTCGC
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*CATTTATCTTTTGTCAGTTGTAACGTGGTCTAGTTT

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR4DG78TF 732 0 0
G
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TTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGACGAT
CAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATT
ACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAG
CTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACTATTGATTTCCCCGAG
TTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAG
GCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTTCGCCAT
GTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAA
GCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCT
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CTATTCTTATATTGCTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGG*ACTCATGTCTGCTTC
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TTTATCTTTTG

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DS 

RD RR4AO64TF 765 0 0
GG
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TTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGACGAT
CAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATT
ACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAG
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TTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAG
GCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTTCGCCAT
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AAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTTCCAAACCTGGTTTGCTGCTGCCT
CTATTCTTATATTGCTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGG*ACTCATGTCTGCTTC
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QA 3 765 3 765
DS 

RD RR4AK58TF 794 0 0
GGGT
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TTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGACTAT
CAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATT
ACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAG
CTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACTATTGATTTCCCCGAG
TTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGTAG
GCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTTCGCCAT
GTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAA
GCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCT
AAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTTCCAAACCTGGTTTGCTGCTGCCT
CTATTCTTATATTGCTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGG*ACTCATGTCTGCTTC
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TTTATCTTTTGTCAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGACGGTCTCTA
GTAAAAGC
AA

QA 5 792 5 792
DS 

RD RR4AK58JQ 573 0 0
AGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGG
TAACGGCACTATTGATTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACAC
CGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGTAGGCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTT
CATCTCAGCTGCTGAGCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGA
AGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTATGA
GGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAG
TTCCAAACCTGGTTTGCTGCTGCCTCTATTCTTATATTGCTGTTATGTTTTAAAATTCTT
ATTCATGGG*ACTCATGTCTGCTTCTTTGTATGCTCTACATTTGAAGTCTGAACATTTCA
TGTCTTTGCTTTGTTTTTTTTTTCATTTATCTTTTGTCAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTC
GGTGGTTTCTTATTGACGGTCTCTAGTAAAAGC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4AO64JQ 823 0 0
GG
GTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTAATCTCTCTTCTTC************CTC
TTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGACGAT
CAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATT
ACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAG
CTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGGCGCTGATGGTAACGGCACTATTGATTTCCCCGAG
TTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAG
GCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTTCGCCAT
GTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAA
GCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGACT
AAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTTCCAAACCTGGTTTGCTGCTGCCT
CTATTCTTATATTGCTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGG*ACTCATGTCTGCTTC
TTTGTATGCTCTACATTTGAAGTCTGAACATTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTTTTTTTTCA
TTTATCTTTTGTCAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGATGGTCTCTA
GTAAAAGCATTGTATCATGGTTTTGTTAAATGCAGTTCTCT

QA 3 823 3 823
DS 



AS 1 9

CO CL412Contig1 640 9 7 U
CGCGTTCTCGTCTTCTCCGGGACACATTGATTTTGTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTC
ATCATCATGGGCTTAAAGGAGGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACC
ACGAAACCATCTGACGCTGACTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTC
GGGCCAGTGGACACCAGCCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGAT
GCTTGGAAGGCCGTTGAAGCAAAATCGACGGATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAG
GCGAAGCAACTTCTGGAAGCTGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGAT
TCACCAAAAGCTCCACTGCAATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTT
GTTCTTGTTGCTTCTTGTGTTTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACTTTCG
TCTTGATTTTAAAAAAAAAAAATCCTATGTTTTTTTTTTCTTTTTTGACAAAGAAAATTC
TATGGTTTCTGAAGATTCCTGATGCATAATTAAAACCATTATCTGTGTGTGATAATATCT
TGTTGATTTGAAGATGAAGCTTATATGTTTAAGACTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 25 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C837TF U 20
AF RR4GJ79TF U 1
AF RR4BN88TF U 20
AF RR4C837JQ C 20
AF RR4ED96JQ C 20
AF RR4ED96TF U 90
AF RR4A523JQ C 18
AF RR4A523TF U 18
AF RR4H183TF U 111
BS 1 19 RR4GJ79TF
BS 20 21 RR4BN88TF
BS 22 488 RR4GJ79TF
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BS 490 490 RR4ED96TF
BS 491 498 RR4BN88TF
BS 499 640 RR4H183TF

RD RR4C837TF 316 0 0
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CAAAATCGACGGATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAG
CTGAGGCTTCTGCTGC

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR4GJ79TF 488 0 0
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ACGAAACCATCTGACGCTGACTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTC
GGGCCAGTGGACACCAGCCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGAT
GCTTGGAAGGCCGTTGAAGCAAAATCGACGGATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAG
GCGAAGCAACTTCTGGAAGCTGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGAT
TCACCAAAAGCTCCACTGCAATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTT
GTTCTTGTTGCTTCTTGTGTTTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACTTTCG
TCTTGATT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4BN88TF 497 0 0
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AGGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTG
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GTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAG
CAAAATCGACGGATGATGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGGAAG
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TCCTATGGTTTTTTTTCT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4C837JQ 471 0 0
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GTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAG
CAAAATCGACGGATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAG
CTGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGC
AATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTG
TTTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACTTTCGTCTTGATTT
C

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4ED96JQ 471 0 0
GGACACATTGATTTTGTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGG
AGGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTG
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GTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAG
CAAAATCGACGGATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAG
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AATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTG
TTTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGCGACTTTCGTCTTGATTTT

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4ED96TF 401 0 0
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CCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCGTCCTGGAAT
GTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGCAAAATCGAC
GGATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAGCTGAGGCTTC
TGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCAATAATTCCA
TCTAAGTTTCAATAACTTATCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGTTTCTCTCGT
TATGAATCTATTATGTACTTTGCGACTTTCGTCTTGATTTT

QA 1 401 1 401
DS 

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GACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGAC
TTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCGT
CCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGCA
AAATCGACGTATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAGCT
GAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCAA
TAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGTT
TCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACTTTCGTCTTGATTTTAAAAAAAA
GTCCTATGTTTTTTTTTCC

QA 5 481 5 481
DS 

RD RR4A523TF 500 0 0
GGTC
ACACATTGATTTTGTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGGAG
GACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGAC
TTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCGT
CCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGCA
AAATCGACGTATGAGGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAGCT
GAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCAA
TAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGTT
TCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACTTTCGTCTTGATTTTAAAAAAAA
GTCCTATGTTTTTTTTTCC

QA 5 481 5 481
DS 

RD RR4H183TF 530 0 0
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AGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGC
CAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGCAAAATCGACGGATGAGGCTATGAGTGACTA
CATCACCAAGGCGAAGCAACTTCTGGAAGCTGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAAT
ATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCAATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGC
ATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGTTTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTT
GTGACTTTCGTCTTGATTTTAAAAAAAAAAAATCCTATGTTTTTTTTTTCTTTTTTGACA
AAGAAAATTCTATGGTTTCTGAAGATTCCTGATGCATAATTAAAACCATTATCTGTGTGT
GATAATATCTTGTTGATTTGAAGATGAAGCTTATATGTTTAAGACTTGTT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 10

CO CL413Contig1 1015 10 19 U
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AGATGGAGCCTTCAAGTCAAGACTGCACTTGTAACCGGTGGAACCAAAGGCATTGGACAT
GCTGTGGTAGAGGAACTTGCAGGATTTGGAGCCATAATACATACTTGCGCCAGAGACGAA
TCTCAGCTTAACGAGTGTATAAGCCAATGGCAAAAGAAAGGGTTTCAAGTCACAGGTTCA
GTCTGTGACGTCACTTCTAGAACAGACAGAGAGAAGCTTATGGAGACGGTTTCATCGATG
TTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGGTCAAAGCCAACA
GTGGATCATACAGCAGAAGACTTTT*CATTT*CATATCTCGACCAACTTAGAATCTGCTT
T*CCATCTAAGCCAGCTTT*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCG
TGTTCATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAA
CAAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCA
TTAGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATG
ATGAAGAGTTTAAGAAGGCTGTGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCTG
AAGAGGTTGCCTCACTTGTGGCTTTTCTATGTATGCCTGCAGCTTCTTACATAACTGGTC
AGACCATTTGTGTCGATGGAGGTCTCTCTGTCAATGGCTTCTCATATCAGCCACATGGTT
AAAATCCAATGCTCCAAATAAATTAAAAACTTCAAATTTTTACAAATAAGTTTCAGTGTC
TAGAAACAGAATTTGTATGTTCACTATGTTTCTCGTTATCATATTGGGCTAATTCACCAA
TATATAAGAGACTTCATAAACTTCCAGAACGAATCTCTCCTCTGATCAGTACATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 40 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX19TF U 1
AF RR4GE78TF U 20
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AF RR4AM01TF U 20
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AF RR4GE78JQ C 534
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BS 728 764 RR4E134TF
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GTCTGTGACGTCACTTCTAGAACAGACAGAGAGAAGCTTATGGAGACGGTTTCATCGATG
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GTGGATCATACAGCAGAAGACTTTT*CATTT*CATATCTCGACCAACTAAGAATCTGCTT
T*CCATCTAAGCCAGCTTT*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCG
TGTTCATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAA
CAAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCA
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ATGAAGAGTTTA

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*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCGTCGTGTTCATGTCCTCTGTTGC
TGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACAAAAGGGGCTATGAATCA
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CATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACAAA
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DS 

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GCTGTGGTAGAGGAACTTGCAGGATTTGGAGCCATAATACATACTTGCGCCAGAGACGAA
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TTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGATCAAAGCCAACA
GTGGATCATACAGCAGAAGACTTTT*CATTT*CACATCTCGACCAACTTAGAATCTGCTT
T*CCATCTAAGCCAGCTTT*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCG
TGTTCATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGGTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAA
CAAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCA
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ATGTAGAGTTTAAGAAG*CTGTGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCTG
AAGAG**TGCCTCACTTGTGGCTTTTCTATGTATGCCTGCAGCT

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DS 

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TAAGCCAATGGCAAAAGAAAGGGTTTCAAGTCACAGGTTCAGTCTGTGACGTCACTTCTA
GAACAGACAGAGAGAAGCTTATGGAGACGGTTTCATCGATGTTTGGCGGGAAGCTAGATA
TCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGGTCAAAGCCAACAGTGGATCATACAGCAGAAG
ACTTTT*CATTT*CATATCTCGACCAACTTAGAATCTGCTTT*CCATCTAAGCCAGCTTT
*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCGTGTTCATGTCCTCTGTTGC
TGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACAAAAGGGGCTATTAATCA
GCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCATTAGGGCTAATGCTGTGGC
TCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATGATGAAGAGTTTAAGAAGGC
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AG*TCTCTCTGTCAATGGCTTCTCATATCAGCCACA

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DS 

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GTCACAGGTTCAGTCTGTGACGTCACTTCTAGAACAGACAGAGAGAAGCTTATAGAGACG
GTTTCATCGATGTTTGGCGGGAAGCTAGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGG
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TCTACTCTGCAACAAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGG
CTAGTGATGGCATTAGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTA
AAGCTGTGTATGATGAAGAGTTTAAGAAGGCTGTGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTT
TTGGGGAGCCTGAAGAGGTTGCCTCACTTGTGGCTTTTCTATGTATGCCTGCAGCTTCTT
ACATAACTGGTCAGACCATTTGTGTCGATGGAGGTCTCTCTGTCAATGGCTTCTCATATC
AGCCACATGGTTAAA*TCCAATGCTTCAAATAAATT

QA 1 816 1 816
DS 

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CGTCACTTCTAGAACAGACAGAGAGAAGCTTATGGAGACGGTTTCATCGATGTTTGGCGG
GAAGCTAGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGGTCAAAGCCAACAGTGGATCA
TACAGCAGAAGACTTTT*CATTT*CATATCTCGACCAACTTAGAATTTGCTTT*CCATTT
AAGCCAGCTTT*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCGTGTTCATG
TCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACAAAAGGG
GCTATTAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCATTAGGGCT
AATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATGATGAAGAG
TTTAAGAAGGCTGTGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCTGAAGAGGTT
GCCTCACTTTTGGCTTTTTTATGTATGCCTGCAGCTTCTTACATAACTGGTCAGACCATT
TGTGTCGATGGAGGTCTCTCTGTCAATGGCTTCTCATATCAGCCACATGGTTAAAATCCA
ATGCTCCAAATAAATTAAAAACTTCAAATTTTTACAAAT

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DS 

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ATCATACAGCAGAAGACTTTT*CATTT*CATATCTCGACCAACTAAGAATCTGCTTT*CC
ATCTAAGCCAGCTTT*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCGTGTT
CATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACAAA
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DS 

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CATCGATGTTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGATCAA
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ATCTGCTTT*CCATCTAAGCCAGCTTT*CACACCCCTT*GCTTAAGGCTTCAGGATACGG
TAGCATCGTGTTCATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGGTTAGCGTCGGTTCCATCTA
CTTTGCAACAAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAG
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AACTGGTCAGACCATTTGTGTCGATGGAGGTCTCTCTGTCAATGGCTTCTCGTATCAGCC
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TTCACCAATATATAAGAGACTTCATAAACTTCC
G

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DS 

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GATGGCATTAGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCT
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GAGCCTGAAGAGGTTGCCTCACTTGTGGCTTTTCTATGTATGCCTGCAGCTTCTTACATA
ACTGGTCAGACCATTTGTGTCGATGGAGGTCTCTCTGTCAATGGCTTCTCATATCAGCCA
CATGGTTAAAATCCAATGCTCCAAATAAATTAAAAACTTCAAATTTTTACAAATAAGTTT
CAGTGTCTAGAAACAGAATTTGTATGTTCACTATGTTTCTCGTTATCATATTGGGCTAAT
TCACCAATATATAAGAGACTTCATAAACTTCCAGAACGAATCTCTCCTCTGATCAGTACA
TA

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 10

CO CL414Contig1 755 10 7 U
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TGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTT
TCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACA
TTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTA
CTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTG
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GCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGA
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CCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTA
TGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACT
GAATAGAAACCTACGTACTTCTTTCGTCATCTAAAAATTACTACATTCGACTGTGTGTCT
GTGTCTAATCCTTGATTGATACTAGAGCGTAAAGG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 35 35 35 35 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CI01TF U 40
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AF RR4C882JQ C 1
AF RR4C882TF U 1
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GG
GGAGAGCAGCAGGAGCAGGAGGAGCAACTAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCA
TTTCTAAAGCAGCCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCT
GGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGA***TTGGTTTGGTTTTCAAGACTCCCCGCGAT
GCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGA
GGGCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGC
AGAAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATC
CCTGCGCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAA
TGCAGGCCGTCGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCA
TCTGCCTTTGCAAAGAAGGCCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAG
TTTCTTTGT

QA 3 551 3 551
DS 

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TCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGA
TCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGA
AGTCATGGAGAGAGTTTTTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTCGTTGATC
CCTCTTGTGTGAGACTTGG

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4C882JQ 688 0 0
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AGGAGCAACTAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGG
TGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTT
TCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACA
TTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTA
CTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTG
TCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCGCATGTCTCACCCT
GCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGA
CCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGG
CCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTA
TGTTTCAGAATGTTTTGTTCGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACT
GAATAGAAACCTACGTACTTCTTTCG
CC

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DS 

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AGGAGCAACTAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGG
TGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTT
TCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACA
TTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTA
CTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTG
TCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCGCATGTCTCACCCT
GCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGA
CCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAG*
CCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTA
TGTTTCAGAATGTTTTGTTCGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACT
GAATAGAAACCTACGTACTTC

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DS 

RD RR4CW40TF 688 0 0
GGGCATCTCTTTTACATCTCATTTTGCCTCAATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGGAGCAGG
AGGAGCAACTAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGG
TGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTT
TCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACA
TTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTA
CTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTG
TCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCGCATGTCTCACCCT
GCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGA
CCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGG
CCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTA
TGTTTCAGAATGTTTTGTTCGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACT
GAATAGAAACCTACGTACTTCTTTCG
CC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4CI01JQ 606 0 0
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GGTGGAAACCGTTTCTGGAAGA***TTGGTTTGGTTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATT
GAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTTTGTGAGAGGGCGT
ATTTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAAC
TATTTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGGG
CATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGG
CCGTCGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATTTGCC
TTTGCAAAGAAGGCCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAGTTTTTT
TGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGT
TTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTTCTTTCGTCATTTAAAAATTACTACATT
CGAC
CG

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DS 

RD RR4D168JQ 565 0 0
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GAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAA
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CAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATTTCCACTTTGTCAAGAA
GTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCGCATGTCTCACCCTGCTTCCG
TGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAG
GTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCCTTCAC
TGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCA
GAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACTGAATAGA
AACCTACGTACTTCTTTCGTCATC
C

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4D168TF 655 0 0
GG
GTGGAGAGCAGCAGGAGCAGGAGGAGTAACTAGTATCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGG
CATTTCTAAAGCAGCCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGC
CTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCG
ATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAGATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGG
GAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTC
GCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACA
TCCCTGCGCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCC
AATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCG
CATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTCATGGAGAG
AGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGTGTGA
GACTTGGTTTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTTCTTTCGTCATC
C

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR4C804JQ 732 0 0
GG
GCCTCAATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGGAGCAGGAGGAGCAACTAGTAGCCATGGCGGA
ACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGG
GAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTT
CAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGG
AACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATTTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAG
GACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAA
GAGACATTCCAACATCCCTGCGCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCA
TGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGT
GATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTT
GAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGA
TCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTTCTTTC
GTCATCTAAAAATTACTACATTCGACTGTGTGTCTGTGTCTAATCCTTGATTGATACTAG
AGCGTAAAGG

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DS 

RD RR4C804TF 732 0 0
GG
GCCTCAATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGGAGCAGGAGGAGCAACTAGTAGCCATGGCGGA
ACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGG
GAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTT
CAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGG
AACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAG
GACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAA
GAGACATTCCAACATCCCTGCGCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCA
TGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGT
GATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCCTTCACTGGAATGTAATAGTTTTT
GAAGTCATGGAGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGA
TCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTTCTTTC
GTCATCTAAAAATTACTACATTCGACTGTGTGTCTGTGTCTAATCCTTGATTGATACTAG
AGCGTAAAGG

QA 3 732 3 732
DS 



AS 3 9

CO CL415Contig1 653 3 9 U
GGAATTTTCTTCTTATCGATCGTCTGTTGGACTTTTGTTAGGGTTTTCGTGTTTTTCTCA
GAGATCAAAAATCGATGGCTTCCCTAGATTCCGACGTAAACATGATCCCTGCAGGTGAAT
CCTCCAACCCCGTCGTCCCTTCTTCTTCGTCGAGCAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTTA
AGAAGTGGAGCGCGGTTGCTCTCTGGGCTTGGGATATAGTTGTTGACAATTGCGCTATCT
GCAGAAACCACATTATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCAAGCGCTACGA
GTGAGGAATGCACCGTTGCTTGGGGGGTTTGCAATCACGCCTTCCACTTCCACTGCGTCA
GCAGATGGTTAAAGACTCGTCAAGTTTGCCCTTTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGA
AATATGGTCACTAATCCTCCCATCTAATATATATAAGATATCATCATGTTCACTTCGCTG
CTGCGGCTTATGAGATACTCAAACTTCTTGTTTTCCTTTTCTGTTTTTTTCCCCTTGCTG
TGTGTGATTTACTTTCACTGAATCTATTATTCTTTTTTACTTCGGTAATATCTTT*****
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4BI60TF U 1
AF RR4D586JQ C 143
AF RR4D586TF U 1
BS 1 133 RR4BI60TF
BS 134 134 RR4D586TF
BS 135 253 RR4BI60TF
BS 254 254 RR4D586TF
BS 255 356 RR4BI60TF
BS 357 357 RR4D586TF
BS 358 595 RR4BI60TF
BS 596 600 RR4D586TF
BS 601 653 RR4BI60TF

RD RR4BI60TF 653 0 0
GGAATTTTCTTCTTATCGATCGTCTGTTGGACTTTTGTTAGGGTTTTCGTGTTTTTCTCA
GAGATCAAAAATCGATGGCTTCCCTAGATTCCGACGTAAACATGATCCCTGCAGGTGAAT
CCTCCAACCCCGTTGTCCCTTCTTCTTCGTCGAGCAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTTA
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GCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCAAGCGCTACGA
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TTTTAAAATTATGTAGTTCCAACTTCCATTAAGTATTGCTTAAGACTTTCATC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4D586JQ 508 0 0
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CTGGGCTTGGGATATAGTTGTTGACAATTGCGCTATCTGCAGAAACCACATTATGGATCT
CTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCAAGCGCTACGAGTGAGGAATGCACCGTTGCTTG
GGGGGTTTGCAATCACGCCTTCCACTTCCACTGCGTCAGCAGATGGTTAAAGACTCGTCA
AGTTTGCCCTTTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAATCCTCCCA
TCTAATATATATAAGATATCATCATGTTCACTTCGCTGCTGCGGCTTATGAGATACTCAA
ACTTCTTGTTTTCCTTTTCTGTTTTTTTCCCCTTGCTGTGTGTGATTTACTTTCACTGAA
TCTATTATTCTTTTTTACTTCGGTAATATCTTT*****TTTTAAAATTATGTAGTTCCAA
CTTCCATTAAGTATTGCTTAAGACTTTC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4D586TF 650 0 0
GGAATTTTCTTCTTATCGATCGTCTGTTGGACTTTTGTTAGGGTTTTCGTGTTTTTCTCA
GAGATCAAAAATCGATGGCTTCCCTAGATTCCGACGTAAACATGATCCCTGCAGGTGAAT
CCTCCAACCCCGTCGTCCCTTCTTCTTCGTCGAGCAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTTA
AGAAGTGGAGCGCGGTTGCTCTCTGGGCTTGGGATATAGTTGTTGACAATTGCGCTATCT
GCAGAAACCACATTATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCAAGCGCTACGA
GTGAGGAATGCACCGTTGCTTGGGGGGTTTGCAATCACGCCTTCCACTTCCACTGCGTCA
GCAGATGGTTAAAGACTCGTCAAGTTTGCCCTTTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGA
AATATGGTCACTAATCCTCCCATCTAATATATATAAGATATCATCATGTTCACTTCGCTG
CTGCGGCTTATGAGATACTCAAACTTCTTGTTTTCCTTTTCTGTTTTTTTCCCCTTGCTG
TGTGTGATTTACTTTCACTGAATCTATTATTCTTTTTTACTTCGGTAATATCTTT*****
TTTTAAAATTATGTAGTTCCAACTTCCATTAAGTATTGCTTAAGACTTTC

QA 1 650 1 650
DS 



CO CL415Contig2 582 2 1 U
GGATCTTCTCGCTTCGACTTTTCTTAGGGCTTTCCCGTGTTCCAATCCGATGGCTACACT
CGATTCCGACGTGAACATGATCCCTGCGGGGGAACCCTCGAGCAACGCCGTGGCTTCTTC
GTCGAGCAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGCGCCGTCGCTCTTTGGGC
TTGGGATATCGTCGTGGACAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCAT
TGAATGTCAGGCTAATCAGGCCAGCGCCACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGT
TTGCAATCACGCTTTTCACTTTCACTGCATCAGCAGATGGTTGAAGACTCGTCAAGTTTG
TCCATTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAAATCAACCAACCGCA
CCAGCAGATTTGTGTATCACGTTCATTTCGCCGCTGCTTATGGGATACTAAGATTGCTCT
TTTTTCGCCAGTTGTTAAAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGAT
GTCTTCAGTTTTCAGAAAATCTATATACATGCATGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EV18TF U 1
AF RR4EV18JQ C 192
BS 1 582 RR4EV18TF

RD RR4EV18TF 582 0 0
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CGATTCCGACGTGAACATGATCCCTGCGGGGGAACCCTCGAGCAACGCCGTGGCTTCTTC
GTCGAGCAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGCGCCGTCGCTCTTTGGGC
TTGGGATATCGTCGTGGACAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCAT
TGAATGTCAGGCTAATCAGGCCAGCGCCACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGT
TTGCAATCACGCTTTTCACTTTCACTGCATCAGCAGATGGTTGAAGACTCGTCAAGTTTG
TCCATTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAAATCAACCAACCGCA
CCAGCAGATTTGTGTATCACGTTCATTTCGCCGCTGCTTATGGGATACTAAGATTGCTCT
TTTTTCGCCAGTTGTTAAAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGAT
GTCTTCAGTTTTCAGAAAATCTATATACATGCATGTTTTTTT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4EV18JQ 391 0 0
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CTAATCAGGCCAGCGCCACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAATCACG
CTTTTCACTTTCACTGCATCAGCAGATGGTTGAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTGGATA
ACAGTGAGTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAAATCAACCAACCGCCCCAGCAGATTT
GTGTATCACGTTCATTTCGCCGCTGCTTATGGGATACTAAGATTGCTCTTTTTTCGCCAG
TTGTTAAAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGATGTTTTCAGTTT
TCAGAAAATTTATATACATGCATGTTTTTTT

QA 1 391 1 391
DS 



CO CL415Contig3 641 4 1 U
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TTTTCTTAGGGCTTTCCCGTGTTCCAATCCGATGGCTACACTCGATAGCGACGTAAACAT
GATACCTGCGGGAGAACCCTCGAGCAACGCCGTGGCTTCTTCGTCGAGCAAGAAGGCGAA
GAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGCGCCGTCGCTCTTTGGGCTTGGGATATCGTCGTGGA
CAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCA
GGCCAGCGCTACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAATCACGCTTTCCA
CTTTCACTGCATCAGCAGATGGTTAAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTGGATAACAGTGA
GTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAAATCAGCCAACCGCACCAGCAGATTTGTGTATC
ATGTTCATTTCGCCGCTGCTTATGAGATACTAAGATTGCTCAGACTTCTTTTTTTCCTTT
TTTCGCCAGTTGTGAAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGATGTC
TTCAGTTTTCAGAAAATCTATATACATGCATGTTTTTTTCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4H642JQB C 1
AF RR4H642TF U 1
AF RR4C806JQ C 13
AF RR4C806TF U 13
BS 1 641 RR4H642TF

RD RR4H642JQB 641 0 0
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TTTTCTTAGGGCTTTCCCGTGTTCCAATCCGATGGCTACACTCGATAGCGACGTAAACAT
GATACCTGCGGGAGAACCCTCGAGCAACGCCGTGGCTTTTTCGTCGAGCAAGAAGGCGAA
GAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGCGCCGTCGCTCTTTGGGCTTGGGATATCGTCGTGGA
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GTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAAATCAGCCAACCGCACCAGCAGATTTGTGTATC
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TTTCGCCAGTTGTGAAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGATGTC
TTCAGTTTTCAGAAAATCTATATACATGCATGTTTTTTTCG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4H642TF 641 0 0
GGGATTTTCATTATATTCATCAGAAGACTCTTCTTCTTCCTCCGATCTTCTCGCTTCGAC
TTTTCTTAGGGCTTTCCCGTGTTCCAATCCGATGGCTACACTCGATAGCGACGTAAACAT
GATACCTGCGGGAGAACCCTCGAGCAACGCCGTGGCTTCTTCGTCGAGCAAGAAGGCGAA
GAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGCGCCGTCGCTCTTTGGGCTTGGGATATCGTCGTGGA
CAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCA
GGCCAGCGCTACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAATCACGCTTTCCA
CTTTCACTGCATCAGCAGATGGTTAAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTGGATAACAGTGA
GTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAAATCAGCCAACCGCACCAGCAGATTTGTGTATC
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TTTCGCCAGTTGTGAAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGATGTC
TTCAGTTTTCAGAAAATCTATATACATGCATGTTTTTTTCG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4C806JQ 629 0 0
GG
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TCCCGTGTTCCAATCCGATGGCTACACTCGATAGCGACGTAAACATGATACCTGCGGGAG
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AAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGATGTCTTCAGTTTTCAGAA
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QA 3 629 3 629
DS 

RD RR4C806TF 629 0 0
GG
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TCCCGTGTTCCAATCCGATGGCTACACTCGATAGCGACGTAAACATGATACCTGCGGGAG
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AGAAGTGGAGCGCCGTCGCTCTTTGGGCTTGGGATATCGTCGTGGACAATTGCGCCATCT
GCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATTGAGTGTCAGGCTAATCAGGCCAGCGCTACGA
GTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAATCACGCTTTCCACTTTCACTGCATCA
GCAGATGGTTAAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGA
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GCTGCTTATGAGATACTAAGATTGCTCAGACTTCTTTTTTTCCTTTTTTCGCCAGTTGTG
AAAACAGTTTTCATTGAACCCTTGTCGTTTTGCTTTGGATGATGTCTTCAGTTTTCAGAA
AATCTATATACATGCATGTTTTTTTCG

QA 3 629 3 629
DS 



AS 3 8

CO CL416Contig1 1268 2 4 U
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TGTCGTAATCTCGATTTCGTGACGAAGGTTGATCGCATTTGAGTCTTGAAGACCTGAAAA
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AAGATAGATTGGAATCCTAGTCTTGGATTAAGACATGTCCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTA
CTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCATTAAACGAACAGGCTGGGAAGATGCTACTTGAG
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GCAATACCCTCCTCAGTGGCAGACATCAACAGAGTAACAACAATAACGAGTGGCCAAGAC
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AGAAAGAAGAGCTTGAGGAGACTGTGATGATGTTACTTTTCAAGAGCCATTGGAGGCTTT
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ATCGGTTTACAGTAACCAAACCAGGCTTGAGATATTCCTTATAATTTAGTGCGACCAATA
AACTGGTTTAAAACTTTTAAATTGTACGAAATCCATGGGTTAACTTTCAAGATTTTGGTC
AAAGTATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB14TF U 1
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GGTCAAAGTATA

QA 1 852 1 852
DS 



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GGTTATGTTGATTTGTTGGACTATATAATCACTCTTTTGTAATCGGTTTACAGTAACCAA
ACCAGGCTTGAGATATTCCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF88TF U 1
AF RR4A955TF U 40
AF RR4A955JQ C 329
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CATGCT

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GG
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GCTTCTAATGGAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGA
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TTAAACGAACAGGCTGGGAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGCT
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GCAATACCCTCCTCAGTGGCAGACATCAACA
GAG

QA 3 813 3 813
DS 

RD RR4A955JQ 835 0 0
CGAGTCTCCTCCAGAAGGCATCAAGGTTGTTGTCAATGACGAGGATTTCTCCCAGATATG
TGCTGACATTGAAGGACCAGTTGGGACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTT
AGCACTGTCGCATGATTTCCCACATTCCCCACCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATT
CCATCCCAATATTGCTTCTAATGGAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAA
TCCTAGTCTTGGATTAAGACATGTCCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTT
TCCAGAATCTGCATTAAACGAACAGGCTGGGAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTA
TGCTAGGCATGCTCGGCTTTACACGGGTATCCATGCTAAACCAAAACCTAAGTTCAAGAC
GGGAGCTATCTCAGAGTCTACGACGGCTCTAAACGTTGGCCAGACTAACAACGAGACGCC
TGGTGCTGCTTCTGCAATACCCTCCTCAGTGGCAGACATCAACAGAGTAACAACAATAAC
GAGTGGCCAAGACCAACAAGAGGTGGCTAACAATTCTGTAGCAGCAGCAGGTTCTGCGAG
TGTGGTCACTACGACGCAGAAAAGGGAAGCCGGTTTGGCCAAGGTTCAGGCAGACAAGAA
GAAGGTAGACGCCAGAAAGAAGAGCTTGAGGAGACTGTGATGATGTTACTTTTCAAGAGC
CATTGGAGGCTTTCATGTAATCAGGCATGTCTGGTTATGTTGATTTGTTGGACTATATAA
TCACTCTTTTGTAATCGGTTTACAGTAACCAAACCAGGCTTGAGATATTCCTTAT

QA 1 835 1 835
DS 



CO CL416Contig3 913 3 5 U
GGGATTTCAACTTTGAGATTACTCCGTAGAGAGAAAGGGATCGCCTTTTCTCACTCTGCA
TAGAGTTTGATTGCGTTTGAGTCTTGAAGACCTCATCACATTGGGGAGTGTTTGTCTGCC
TGTTTGAGGAGAAAGGGTCCTTTTGCACTATTATTATTCTCCATGGCTAGTAATGAGAAT
CTACCTCCCAATGTTATCAAGCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCT
CCTGATGGCATCAAGGTCCTCGTCAATGACGAGGACTTCTCACAAATATCTGCTGATATT
GAAGGACCAGTTGGAACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTGGCATTGTCT
CATGATTTTCCACATTCTCCTCCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAAT
GTTGCTTCTAATGGAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAAAAAGATTGGAACCCTAGTCTT
GGCTTAAGACATGTTCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTAATCGAGCCATTTCCAGAATCT
GCATTAAACGAACAGGCTGGAAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCAT
GCTCGGCTTTACACGGGTATCCATGGTAAACCAAAACCCAAGTTCAAGACAGGAGCTATC
TCAGAGTCAACAACGGCTCTAAATGTTGGCGGCCAGACCACCAACAACGAGACGCCTGGT
GCACTACCACCCTCTTCAGTGGCGGACATCAATAGAGTAACAACAGCGACTGCCAAAGAC
CAACAACAACAAGTGGCTAACAACGTTCCTGTTGCGGCAGCAGGATCTGCAAATGTGGCG
TCCACTACGACGACACAGAAAAGAGAAGCCGGTTTGGCCAGGTTCAAGCAGACAAGAAGA
AGGTAGATGCCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI73TF U 1
AF RR4GP58TF U 1
AF RR4F090TF U 201
BS 1 652 RR4GI73TF
BS 653 653 RR4GP58TF
BS 654 665 RR4GI73TF
BS 666 669 RR4GP58TF
BS 670 913 RR4F090TF

RD RR4GI73TF 665 0 0
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TAGAGTTTGATTGCGTTTGAGTCTTGAAGACCTCATCACATTGGGGAGTGTTTGTCTGCC
TGTTTGAGGAGAAAGGGTCCTTTTGCACTATTATTATTCTCCATGGCTAGTAATGAGAAT
CTACCTCCCAATGTTATCAAGCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCT
CCTGATGGCATCAAGGTCCTCGTCAATGACGAGGACTTCTCACAAATATCTGCTGATATT
GAAGGACCAGTTGGAACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTGGCATTGTCT
CATGATTTTCCACATTCTCCTCCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAAT
GTTGCTTCTAATGGAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAAAAAGATTGGAACCCTAGTCTT
GGCTTAAGACATGTTCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTAATCGAGCCATTTCCAGAATCT
GCATTAAACGAACAGGCTGGAAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCAT
GCTCGGCTTTACACGGGTATCCATGGTAAACCAAAACCCAAGTTCAAGACAG*AGCTATC
TCAGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4GP58TF 676 0 0
GGGATTTCAACTTTGAGATTACTCCGTAGAGAGAAAGGGATCGCCTTTTCTCACTCTGCA
TAGAGTTTGATTGCGTTTGAGTCTTGAAGACCTCATCACATTGGGGAGTGTTTGTCTGCC
TGTTTGAGGAGAAAGGGTCCTTTTGCACTATTATTATTCTCCATGGCTAGTAATGAGAAT
CTACCTCCCAATGTTATCAAGCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCT
CCTGATGGCATCAAGGTCCTCGTCAATGACGAGGACTTCTCACAAATATCTGCTGATATT
GAAGGACCAGTTGGAACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTGGCATTGTCT
CATGGTTTTCCACATTCTCCTCCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAAT
GTTGCTTCTAATGGAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAAAAAGATTGGAACCCTAGTCTT
GGCTTAAGACATGTTCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTAATCGAGCCATTTCCAGAATCT
GCATTAAACGAACAGGCTGGAAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCCAGGCAT
GCTCGGCTTTACACGGGTATCCATGGTAAACCAAAACCCAAGTTCAAGACAGGAGCTATC
TCAGAGTCA
CACGGCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4F090TF 713 0 0
GCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCTCCTGATGGCATCAAGGTCCT
CGTCAATGACGAGGACTTCTCACAAATATCTGCTGATATTGAAGGACCAGTTGGAACTCC
TTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTGGCATTGTCTCATGATTTTCCACATTCTCC
GCCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAATGTCGCTTCTAATGGAGAGAT
CTGCGTTAACACCCTTAAAAAAGATTGGAACCCTAGTCTTGGATTAAGACATGTTCTCTC
TGTTGTGAGGTGCTTACTAATCGAGCCATTTCCAGAATCTGCATTAAACGAACAGGCTGG
AAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGCTCGGCTTTACACGGGTAT
CCATGCTAAACCAAAACCTAAGTTCAAGACAGGAGCTATCTCAGAGTCAACAACGGCTCT
AAATGTTGGCGGCCAGACCACCAACAACGAGACGCCTGGTGCACTACCACCCTCTTCAGT
GGCGGACATCAATAGAGTAACAACAGCGACTGCCAAAGACCAACAACAACAAGTGGCTAA
CAACGTTCCTGTTGCGGCAGCAGGATCTGCAAATGTGGCGTCCACTACGACGACACAGAA
AAGAGAAGCCGGTTTGGCCAGGTTCAAGCAGACAAGAAGAAGGTAGATGCCAG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 9

CO CL417Contig1 1088 9 6 U
TCATTTTGAATATAACATACAGATGTCATTATGCATGATTTTATTCTGATGGTAAGTTTA
AATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCAACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGC
ACTTGTTGTGTAAATATGCATAAGCATCAAACCTCTGAAGGTCCCCTCCCTGGGGGATGC
GTCCACAAAGTCTGTTATAGCTAACATTGAAAGACTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAA
CCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAAGTCTAAGTTATTAACTGTCGTAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAGAGAGAGAGAAC
CGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCT
GACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCACAGAAAACGAA
GATACTTGAGCTTGGCGATGGTAGGTTGGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAGTTTGCGGA
ATATAAGGGTTTGTAGATACGATAAGTCACCTACTTCAGGAGGGATCTGAGCGGAGACAT
CGTCGTCTGATATATATAGGGAGATGACACGGTGGTTAACAGTAGAGTCACCGCACTCAA
CGGAGACCCAGGTACAGCAGTCGTCTTTGGGATCCCAGGAGATGATGGTGTAAGGGTTGT
TAAGGGATTTCTTGATCTTGAGGAGGGTGTTTTCGTCATCTTTGTGACAGAGATCTTTAG
ACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAAGAGCAATGTCGTTATCTTATCCA
TGGTGTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4GM27JQ U 1
AF RR4FO42JQ U 1
AF RR4GC63JQ U 1
AF RR4AC30JQ U 1
AF RR4GL30JQ U 1
AF RR4AC30TF C 268
AF RR4GM27TF C 335
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AF RR4GL30TF C 353
BS 1 708 RR4AC30JQ
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BS 710 710 RR4GM27TF
BS 711 903 RR4AC30TF
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GTCCACAAAGTCTGTTATAGCTAACATTGAAAGACTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAA
CCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAAGTCTAAGTTATTAACTGTCGTAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAGAAAAA

QA 1 489 1 489
DS 

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AATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCAACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGC
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GTCCACAAAGTCTGTTATAGCTAACATTGAAAGACTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAA
CCGGGATACTCCCTGTGATCCTGTTGTGATTCAAGTCTAAGTTATTAACTGCCGTAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4GC63JQ 587 0 0
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AATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCAACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGT
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GTCCACAAAGTCTGTTATAGCTAACATTGAAAGACTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAA
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CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAAAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAAC

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DS 

RD RR4AC30JQ 708 0 0
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CCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAAGTCTAAGTTATTAACTGTCGTAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAGAGAGAGAGAAC
CGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCT
GACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4GL30JQ 670 0 0
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AATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCAACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGT
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GTCCACAAAGTCTGTTATAGCTAACATTGAAAGACTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAA
CCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAAGTCTAAGTTATTAACTGTCGTAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAAAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAGAGAGAGAGAAC
CGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCT
GACTCAAAAA

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DS 

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ACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACGTCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAG
CATCACTTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAATCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTG
ATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCGATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTC
CTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAACCTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAA
GAATCCTGAGTTTAGGTAACAGAGAGAGAGAACCGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGA
AGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCTGACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGG
TCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCAGAGAAAACGAAGATACTTGAGCTTGGCGATGGTAGGTT
GGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAGTTTGCGGAATATAAGGGTTTGTAGATACGATAAGT
CACCTACTTCAGGAGGGATCTGAGCGGAGACATCGTCGTCTGATATATATAGGGAGATGA
CACGGTGGTTAACAGTAGAGTCACCGCACTCAACGGGGACCCAGGTACAGCAGTCGTCTT
TGGGATCCCAGGAGATGATGGTGTAAGGGTTGTTAAGGGATTTCTTGATCTTGAGGAGGG
TGTTTTCGTCATCTTTGTGACAGAGATCTTTAGACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGA
ACAAGGGAAAGAGCAATGTCGTTATCTTATCCATGGTGTCC

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DS 

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TTCTCGAT
AATCAATGGACCATGACGTCTTTT*GTCTCCAAACATCATTGAAGCATCAC*TTCTAGCT
TGT*ACGGGAGAAATCAATCCGGTAAAA*TCCAGGTTGC*TAGTGATTTTGGTATCGAAC
GTGATAGCTTGTTGTGCGATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGAACCAA
ATGACTCTGGTATTGAACCTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAG
GTAACAGAGAGAGAGAACCGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAACGAAAGGTTAATGC
ACTCTAGATCCTTGAGCTGACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGC
TGAGCCACAGAAAACGAAGATACTTGAGCTTGGCGATGGTAGGTTGGATTTCACCGGTGA
GGTTAGGGAGTTTGCGGAATATAAGGGTTTGTAGATACGATAAGTCACCTACTTCAGGAG
GGATCTGAGCGGAGACATCGTCGTCTGATATATATAGGGAGATGACACGGTGGTTAACAG
TAGAGTCACCGCACTCAACGGAGACCCAGGTACAGCAGTCGTCTTTGGGATCCCAGGAGA
TGATGGTGTAAGGGTTGTTAAGGGATTTCTTGATCTTGAGGAGGGTGTTTTCGTCATCTT
TGTGACAGAGATCTTTAGACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAAGAGCA
ATGTCGTTATCTTATCCATGGT
GTCC

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DS 

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TGACGTCTTTT*GTCTCCAAACATCATTGAAGCATCAC*TTCTAGCTTGT*ACGGGAGAA
ATCAATCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTT
GTGCGATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTAT
TGAACCTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAGAGAGAG
AGAACCGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTT
GAGCTGACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCACAGAAA
ACGAAGATACTTGAGCTTGGCGATGGTAGGTTGGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAGTTT
GCGGAATATAAGGGTTTGTAGATACGATAAGTCACCTACTTCAGGAGGGATCTGAGCGGA
GACATCGTCGTCTGATATATATAGGGAGATGACCCGGTGGTTAACAGTAGAGTCACCGCA
CTCAACGGAGACCCAGGTACAGCAGTCGTCTTTGGGATCCCAGGAGATGATGGTGTAAGG
GTTGTTAAGGGATTTCTTGATCTTGAGGAGGGTGTTTTCGTCATCTTTGTGACAGAGATC
TTTAGACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAAGAGCAATGTCGTTATCTT
ATCCATGGT
CC

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DS 

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GAAATCAATCCGGTAAAAATCCAGGTTGC*TAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTT
GTTGTGCGATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGG
TATTGAACCTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAGAGA
GAGAGAACCGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATC
CTTGAGCTGACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCACAG
AAAACGAAGATACTTGAGCTTGGCGATGGTAGGTTGGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAG
TTTGCGGAATATAAGGGTTTGTAGATACGATAAGTCACCTACTTCAGGAGGGATCTGAGC
GGAGACATCGTCGTCTGATATATATAGGGAGATGACCCGGTGGTTAACAGTAGAGTCACC
GCACTCAACGGAGACCCAGGTACAGCAGTCGTCTTTGGGATCCCAGGAGATGATGGTGTA
AGGGTTGTTAAGGGATTTCTTGATCTTGAGGAGGGTGTTTTCGTCATCTTTGTGACAGAG
ATCTTTAGACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAAGAGCAATGTCGTTAT
CTTATCCATGGT
CC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 9

CO CL418Contig1 1111 9 10 U
GGGGAAAAGATGATTTTAAAAAAGCAAAATCCATGTCAAAGATGTTCTTAGTCTAATAAG
ATCCCAGCAAGTCTACAGACATCAACTAAAGAAATATATATAGAGAGATGAGTCAAACGA
GTAGAAATCTAGAAATCTCCCCTTCACGTGATACACCAACGGCGAGATATCTGACTAATC
CAGGAATGAGATGATTGGAAAATTAGGACCCCGAGCCGGTTCTAATGGAAAAAGATTGGG
GCGATAGTGAAAGACGCAGTGTGTTGGGTAGAAGGGTGGAAAAAGTTGGTAGCGTCTCCT
TACGATGTAGGGGAGCAAATCGTCATCATCGGGATTCTCGGTACAATCAAACTTCGATTG
AAAAGCTCCAGGTTTCGAATGGGTTTTGGAATTGAACCATGTGTGACCGTCTCTCGGGTA
TAAGAAAGCATCAGCAGTGTATTTGAATAACCCGGTAACTGGTCCTGGTCCTCCTCTCTG
TAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGCACCATGGAATCGGTGAG
CCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATATATTCAGTGGCCTCATCCACCGAACAATAGTG
AGGCGGAACACCCTCGTCCATCCGTATGGTAACATTTTGGTGAGGAGCTTGTGGATATGG
TAATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGATGGACAGCAGGTGGATATAAATC
GCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGCTGGACAGCAGGTGGATTTTGCAGATTAACGTT
TTCAAAATAATCTGCCATGTGAGCGTCTACATCTGCCTCGGCGTTTTGATTTCCCTGGTT
GTGAATCTCAACTCCATTGGTGAAACGTATGTTGATACCAAGACCTTCGATTCTAGGTTG
TCCCCCTGGTGGAGACTGGATAAACTGAACCGGCTCCTTCACAGTTAAGGTGTTGTTGAC
ACCACCTACATTGAAATTAATCAGCAGAGCTTGGGTTTGGACTCGAGCAATAACACCAGG
AGGTTCAACCGCAATCGCCGTAATCTGGTCAGACAAATCCAAGATGTTGCGTTGTGCCTC
TTGCATTTTTTTTTTCTTTAGTGGTTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI75JQ U 31
AF RR4F666JQ U 18
AF RR4G044JQ U 1
AF RR4E784JQ U 18
AF RR4FD49JQ U 32
AF RR4E784TF C 284
AF RR4FD49TF C 352
AF RR4G044TF C 390
AF RR4F666TF C 469
BS 1 152 RR4G044JQ
BS 153 153 RR4E784JQ
BS 154 464 RR4G044JQ
BS 465 465 RR4E784JQ
BS 466 603 RR4G044JQ
BS 604 700 RR4E784JQ
BS 701 717 RR4FD49JQ
BS 718 1094 RR4E784TF
BS 1095 1095 RR4FD49TF
BS 1096 1111 RR4G044TF

RD RR4CI75JQ 424 0 0
CT
ATGTCAAAGATGTTCTTAGTCTAATAAGATCCCAGCAAGTCTACAGACATCAACTAAAGA
AATATATATAGAGAGATGAGTCAAACGAGTA***ATCTAGAAATCTCCCCTTCACGTGAT
ACACCAACGGCGAGATATCTGACTAATCCA***ATGAGATGATTGGAAAATTAGGACCCC
GAGCCGGTTCTAATGGAAAAAGATTGGGGCGATAGTGAAAGACGCAGTGTGTTGGGTAGA
GGGGTGGAAAAAGTTGGTAGCGTCTCCTTACGATGTAGGGGAGCAAATCGTCATCATCGG
GATTCTCGGTACAATCAAACTTCGATTGAAAAGCTCCAGGTTTCGAATGGGTTTTGGAAT
TGAACCATGTGTGACCGTCTCTCGGGTATAAGAAAGCATCA*CA*TGTATTTGAATAACC
CG

QA 3 424 3 424
DS 

RD RR4F666JQ 558 0 0
AAAAAAGCAAAATCCATGTCAAAGATGTTCTTAGTCTAATAAGATCCCAGCAAGTCTACA
GACATCAACTAAAGAAATATATATAGAGAGATGAGTCAAACGAGTAGAAATCTAGAAATC
TCCCCTTCACGTGATACACCAACGGCGAGATATCTGACTAATCCAGGAATGAGATGATTG
GAAAATTAGGACCCCGAGCCGGTTCTAATGGAAAAAGATTGGGGCGATAGTGAAAGACGC
AGTGTGTTGGGTAGAAGGGTGGAAAAAGTTGGTAGCGTCTCCCTACGATGTAGGGGAGCA
AATCGTCATCATCGGGATTCTCGGTACAATCAAACTTCGATTGAAAAGCTCCAGGTTTCG
AATGGGTTTTGGAATTGAACCATGTGTGACCGTCTCTCGGGTATAAGAAAGCATCAGCGG
TGTATTTGAATAACCCGGTAACTGGTCCTGATCCTCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCAC
CGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGCACCATGGAATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAAT
GGTGCACGATATATTCAG

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4G044JQ 603 0 0
GGGGAAAAGATGATTTTAAAAAAGCAAAATCCATGTCAAAGATGTTCTTAGTCTAATAAG
ATCCCAGCAAGTCTACAGACATCAACTAAAGAAATATATATAGAGAGATGAGTCAAACGA
GTAGAAATCTAGAAATCTCCCCTTCACGTGATGCACCAACGGCGAGATATCTGACTAATC
CAGGAATGAGATGATTGGAAAATTAGGACCCCGAGCCGGTTCTAATGGAAAAAGATTGGG
GCGATAGTGAAAGACGCAGTGTGTTGGGTAGAAGGGTGGAAAAAGTTGGTAGCGTCTCCT
TACGATGTAGGGGAGCAAATCGTCATCATCGGGATTCTCGGTACAATCAAACTTCGATTG
AAAAGCTCCAGGTTTCGAATGGGTTTTGGAATTGAACCATGTGTGACCGTCTCTCGGGTA
TAAGAAAGCATCAGCAGTGTATTTGAATAACCCGGTAACTGGTCATGGTCCTCCTCTCTG
TAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGCACCATGGAATCGGTGAG
CCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATATATTCAGTGGCCTCATCCACCGAACAATAGTG
AGG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4E784JQ 683 0 0
AAAAAAGCAAAATCCATGTCAAAGATGTTCTTAGTCTAATAAGATCCCAGCAAGTCTACA
GACATCAACTAAAGAAATATATATAGAGAGATGAGTCAAACGAGTAGAAATCTAGAAATC
TCCCCTTCACGTGATACACCAACGGCGAGATATCTGACTAATCCAGGAATGAGATGATTG
GAAAATTAGGACCCCGAGCCGGTTCTAATGGAAAAAGATTGGGGCGATAGTGAAAGACGC
AGTGTGTTGGGTAGAAGGGTGGAAAAAGTTGGTAGCGTCTCCTTACGATGTAGGGGAGCA
AATCGTCATCATCGGGATTCTCGGTACAATCAAACTTCGATTGAAAAGCTCCAGGTTTCG
AATGGGTTTTGGAATTGAACCATGTGTGACCGTCTCTCGGGTATAAGAAAGCATCAGCAG
TGTATTTGAATAACCCGGTAACTGGTCCTGGTCCTCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCAC
CGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGCACCATGGAATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAAT
GGTGCACGATATATTCAGTGGCCCCATCCACCGAACAATAGTGAGGCGGAACACCCTCGT
CCATCCGTATGGTAACATTTTGGTGAGGAGCTTGTGGATATGGTAATAAATCGCCAATGC
CAGGATGAAAGAGACCTTGATGG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4FD49JQ 686 0 0
CATGTCAAAGATGTTCTTAGTCTAATAAGATCCCAGCAAGTCTACAGACATCAACTAAAG
AAATATATATAGAGAGATGAGTCAAACGAGTAGAAATCTAGAAATCTCCCCTTCACGTGA
TACACCAACGGCGAGATATCTGACTAATCCAGGAATGAGATGATTGGAAAATTAGGACCC
CGAGCCGGTTCTAATGGAAAAAGATTGGGGCGATAGTGAAAGACGCAGTGTGTTGGGTAG
AAGGGTGGAAAAAGTTGGTAGCGTCTCCTTACGATGTAGGGGAGCAAATCGTCATCATCG
GGATTCTCGGTACAATCAAACTTCGATTGAAAAGCTCCAGGTTTCGAATGGGTTTTGGAA
TTGAACCATGTGTGACCGTCTCTCGGGTATAAGAAAGCATCAGCAGTGTATTTGAATAAC
CCGGTAACTGGTCCTGGTCCTCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTTGC
AGCATAAAGAGCACCATGGAATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATATAT
TCAGTGGCCTCATCCACCGAACAATAGTGAGGCGGAACACCCTCGTCCATCCGTATGGTA
ACATTTTGGTGAGGAGCTTGTGGATATGGTAATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGA
CCTTGATGGACAGCAGGTGGATATAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4E784TF 820 0 0
AGTTGGTAGCGTCTCCTTACGATGTAGGGGAGCAAATCGTCATCATCGGGATTCTCGGTA
CAATCAAACTTCGATTGAAAAGCTCCAGGTTTCGAATGGGTTT*GGAATTGAACCATGTG
TGAC*GTCTCTCGGGTATAAGAAAGCATCAGCAGTGTATTTGAATAACCCGGTAACTGGT
CCTGGTCCTCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGC
ACCATGGAATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATATATTCAGTGGCCCCA
TCCACCGAACAATAGTGAGGCGGAACACCCTCGTCCATCCGTATGGTAACATTTTGGTGA
GGAGCTTGTGGATATGGTAATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGATGGACA
GCAGGTGGATATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGCTGGACAGCAGGTGGA
TTTTGCAGATTAACGTTTTCAAAATAATCTGCCATGTGAGCGTCTACATCTGCCTCGGCG
TTTTGATTTCCCTGGTTGTGAATCTCAACTCCATTGGTGAAACGTATGTTGATACCAAGA
CCTTCGATTCTAGGTTGTCCCCCTGGTGGAGACTGGATAAACTGAACCGGCTCCTTCACA
GTTAAGGTGTTGTTGACACCACCTACATTGAAATTAATCAGCAGAGCTTGGGTTTGGACT
CGAGCAATAACACCAGGAGGTTCAACCGCAATCGCCGTAATCTGGTCAGACAAATCCAAG
ATGTTGCGTTGTGCCTCTTGCATTTTTTTTT
CTTTAGTCC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4FD49TF 757 0 0
CTTCGATTGAAAAGCTCCAGGTTTCGAATGGGTTTTGGAATTGAACCATGTGTGACCGTC
TCTCGGGTATAAGAAAGCATCAGCAGTGTATTTGAATAACCCGGTAACTGGTCCTGGTCC
TCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGCACCATGGA
ATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATATATTCAGTGGCCTCATCCACCGA
ACAATAGTGAGGCGGAACACCCTCGTCCATCCGTATGGTAACATTTTGGTGAGGAGCTTG
TGGATATGGTAATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGATGGACAGCAGGTGG
ATATAAATCGCCAATGCCAGGGTGAAAGAGACCTTGCTGGACAGCAGGTGGATTTTGCAG
ATTAACGTTTTCAAAATAATCTGCCATGTGAGCGTCTACATCTGCCTCGGCGTTTTGATT
TCCCTGGTTGTGAATCTCAACTCCATCGGTGAAACGTATGTTGATACCAAGACCTCCGAT
TCTAGGTTGTCCCCCTGGTGGAGACTGGATAAACTGAACCGGCTCCTTCACAGTTAAGGT
GTTGTTGACACCACCTACATTGAAATTAATCAGCAGAGCTTGGGTTTGGACTC*AGCAAT
AACACCAGGAGGTTCAACCGCAATCGCCGTAATCTGGTCAGACAAATCCAAGATGTTGCG
TTGTGCCTCTTGCATTTTTTTTTT
CTTTAGTGGTTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4G044TF 722 0 0
AATTGAACCATGTGTGAC*GTCTCTCGGGTATAAGAAAGCATCAGCAGTGTATTTGAATA
ACCCGGTAACTGGTCATGGTCCTCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTT
GCAGCATAAAGAGCACCATGGAATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATAT
ATTCAGTGGCCTCATCCACCGAACAATAGTGAGGCGGAACACCCTCGTCCATCCGTATGG
TAACATTTTGGTGAGGAGCTTGTGGATATGGTAATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGA
GACCTTGATGGACAGCAGGTGGATATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGCT
GGACAGCAGGTGGATTTTGCAGATTAACGTTTTCAAAATAATCTGCCATGTGAGCGTCTA
CATCTGCCTCGGCGTTTTGATTTCCCTGGTTGTGAATCTCAACTCCATTGGTGAAACGTA
TGTTGATACCAAGACCTTCGATTCTAGGTTGTCCCCCTGGTGGAGACTGGATAAACTGAA
CCGGCTCCTTCACAGTTAAGGTGTTGTTGACACCACCTACATTGAAATTAATCAGCAGAG
CTTGGGTTTGGACTCGAGCAATAACACCAGGAGGTTCAACCGCAATCGCCGTAATCTGGT
CAGACAAATCCAAGATGTTGCGTTGTGCCTCTTGCATTTTTTTTTTCTTTAGTGGTTGGT
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4F666TF 637 0 0
TCCTCCTCTCTGTAATTGTACAGCGTCACCGTTACTGTGTTGCAGCATAAAGAGCACCAT
GGAATCGGTGAGCCTACTGGTCTGGGAATGGTGCACGATATATTCAGTGGCCTCATCCAC
CGAACAATAGTGAGGCGGAACACCCTCGTCCATCCGTATGGTAACATTTTGGTGAGGAGC
TTGTGGATATGGTAATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGATGGACAGCAGG
TGGATATAAATCGCCAATGCCAGGATGAAAGAGACCTTGCTGGACAGCAGGTGGATTTTG
CAGATTAACGTTTTCAAAATAATCTGCCATGTGAGCGTCTACATCTGCCTCGGCGTTTTG
ATTTCCCTGGTTGTGAATCTCAACTCCATTGGTGAAACGTATGTTGATACCAAGACCTTC
GATTCTAGGTTGTCCCCCTGGTGGAGACTGGATAAACTGAACCGGCTCCTTCACAGTTAA
GGTGTTGTTGACACCACCTACATTGAAATTAATCAGCAGAGCTTGGGTTTGGACTCGAGC
AATAACACCAGGAGGTTCAACCGCAATCGCCGTAATCTGGTCAGACAAATCCAAGATGTT
GCGTTGTGCCTCTTGCATTTTTTTTTT
TCTTTAGTCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 10

CO CL419Contig1 1232 10 10 U
AGGGAGAGCAATTTTATAACCTTTCAACGGGAAAATAAGGTGATATTCATATCCAACAGA
TAATTTAGTTACACTAGTAATTAAAAGAAGAAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAAA
TCCCGAGATAATTAATCCTCGACTTGGCACACGTAGACGATGATATTAAGATAGAGTACA
AATTCAACAATGCAAAAGATAGGCAAACAGTTTATTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAG
TGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTCCATTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCATTACATATA
CACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTGTGATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTCCCT
AGCTTCAGCATATCAATACTCACCTCCGGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACC
AAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCG
AGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGTAGATATCCCTAAGAGCAAGACCATAA
AGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCC
ACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTGATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACA
GAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAAT
TGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAATCCTCCAAA*GTTCATTAGCAAC**AAGAGCTTC
ACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGTGGCGAAGGCAA*CGAATATGGCGATGTATATGGT
TTCTATGAAGCAACC**AAAGGAGTTGATTGTGACGAGAAGGAAGACATCTTTCTTCTGA
GTAGCGTAGTAGAGCCAAAGCATCGCGCTGAAGAGCGCCACCACATAGGGAAGAGATTGA
AAATCTTCTGTGGTTTTTTT*CTTCCAAATCCTATAGAACGTTGGCACGGGGGAGAGGAA
AACAGCAAAGGAAATGATGTTTCCGAGCAAGCCGAAGGCGAAGGCCCATGTGTTTTGAGT
GTTGAAGATAGCCATGGTTTTAGAGTATTTTTAGGTAGGAAGAATAATTTAGGTTTTTAT
TTGTATAGGAGGGAGAAGATGAACTCTTCGAGGTAAGAGAGATATAAGCTTTGTAAGTGT
TTCTCTTTAATTAAAAGCTTATGGCACCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 15 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4A619JQ U 25
AF RR4AT51JQ U 26
AF RR4AF76JQ U 1
AF RR4ET70JQ U 53
AF RR4B349JQ U 26
AF RR4AF76TF C 344
AF RR4A619TF C 395
AF RR4ET70TF C 433
AF RR4B349TF C 447
AF RR4AT51TF C 739
BS 1 678 RR4AF76JQ
BS 679 679 RR4A619JQ
BS 680 715 RR4AF76JQ
BS 716 716 RR4AT51JQ
BS 717 809 RR4AF76JQ
BS 810 877 RR4B349JQ
BS 878 980 RR4AF76TF
BS 981 981 RR4A619TF
BS 982 1229 RR4AF76TF
BS 1230 1232 RR4A619TF

RD RR4A619JQ 658 0 0
C
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AGAAGAAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAAATCCCGAGATAATTAATCCTCGACTT
GGCACACGTAGACGATGACATTAAGATAGAGTACAAATTCAACAATGCAAAAGATAGGCA
AACAGTTTATTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAGTGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTC
CATTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCATTACATATACGCTTGTTCGCAGTTGGTACCACTG
TGATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTCCCTAGCTTCAGCATATCAATACTCACCT
CCGGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATT
TGAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGA
AAGCAACGTAGATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTG
TAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTC
TGATAATGCTAAGCGGCGAAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTC

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR4AT51JQ 699 0 0
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AGAAGAAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAAATCCCGAGATAATTAATCCTCGACTT
GGCACACGTAGACGATGATATTAAGATAGAGTACAAATTCAACAATGCAAAAGATAGGCA
AACAGTTTATTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAGTGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTC
CATTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCATTACATATACACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTG
TGATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTCCCTAGCTTCAGCATATCAATACTCACCT
CCGGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATT
TGAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGA
AAGCAACGTAAATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTG
TAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTC
CGATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCATCCGA
TAATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGC

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DS 

RD RR4AF76JQ 809 0 0
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TAATTTAGTTACACTAGTAATTAAAAGAAGAAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAAA
TCCCGAGATAATTAATCCTCGACTTGGCACACGTAGACGATGATATTAAGATAGAGTACA
AATTCAACAATGCAAAAGATAGGCAAACAGTTTATTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAG
TGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTCCATTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCATTACATATA
CACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTGTGATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTCCCT
AGCTTCAGCATATCAATACTCACCTCCGGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACC
AAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCG
AGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGTAGATATCCCTAAGAGCAAGACCATAA
AGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCC
ACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTGATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACA
GAGAATCCGACACAGATTTCTCCGATAATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTACGAAT
TGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAATCCTCCAAA*GTTCATTAGCAAC**AAGAGCTTC
ACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGTGGC

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DS 

RD RR4ET70JQ 754 0 0
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AATGTAAATCCCGAGATAATTAATCCTCGACTTGGCACACGTAGACGATGATATTAAGAT
AGAGTACAAATTCAACAATGCAAAAGATAGGCAAACAGTTTATTGTTTTTTAACAAGCTG
CAGTGGAGTGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTCCATTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCAT
TACATATACACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTGTGATCTCTGCTGCTTCAG*AGATGCCA
ATGTCCCTAGCTTCAGCATATCAATACTCACCACCGGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTT
TCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAA
GTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGTAGATATCCCTAAGAGCAA
GACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCA
TGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTGATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAA
CGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTG
CTAAGAATTGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAATCCTCCAAA*GTTCATTAGCAAC**A
AGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4B349JQ 852 0 0
AACGGGAAAATAAGGTGATATTCATATCCAACAGATAATTTAGTTACACTAGTAATTAAA
AGAAGAAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAAATCCCGAGATAATTAATCCTCGACTT
GGCACACGTAGACGATGATATTAAGATAGAGTACAAATTCAACAATGCAAAAGATAGGCA
AACAGTTTATTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAGTGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTC
CATTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCATTACATATACACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTG
TGATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTCCCTAGCTTCAGCATATCAATACTCACCT
CCGGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATT
TGAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGA
AAGCAACGTAAATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTG
TAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTC
CGATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCATCCGA
TAATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGA
ATCCTCCAAA*GTTCATTAGCAAC**AAGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGG
TGGCGAAGGCAA*CGAATATGGCGATGTATATGGTTTCTATGAAGCAACC**AAAGGAGT
TGATTGTGACGA

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4AF76TF 886 0 0
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CGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAAAACCACGTAAAGTA
TCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGTAGATATCCC
TAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTAAGTGTCAAGGATAAGC
TAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTGATAATGCTAAGCGGCG
CAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTTCTCCGATAATCTTCGCACGTGTGG
AACCTTTTGCTACGAATTGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAATCCTCCAAA*GTTCATT
AGCAAC**AAGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGTGGCGAAGGCAA*CGAAT
ATGGCGATGTATATGGTTTCTATGAAGCAACC**ACAGGAGTTGATTGTGACGAGAAGGA
AGACATCTTTCTTCTGAGTAGCGTAGTAGAGCCAAAGCATCGCGCTGAAGAGCGCCACCA
CATAGGGAAGAGATTGAAAATCTTCTGTGGTTTTTTTTCTTCCAAATCCTATAGAACGTT
GGCACGGGGGAGAGGAAAACAGCAAAGGAAATGATGTTTCCGAGCAAGCCGAAGGCGAAG
GCCCATGTGTTTTGAGTGTTGAAGATAGCCATGGTTTTAGAGTATTTTTAGGTAGGAAGA
ATAATTTAGGTTTTTATTTGTATAGGAGGGAGAAGATGAACTCTTCGAGGTAAGAGAGAT
ATAAGCTTTGTAAGTGTTTCTCTTTAATTAAAAGCTTATGGCACCC

QA 1 886 1 886
DS 

RD RR4A619TF 838 0 0
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CGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGT
AGATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTAAGTGTCA
AGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTGATAATGC
TAAGCGGCGAAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAATCTTCG
CACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAATCCTCCAA
A*GTTCATTAGCAAC**AAGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGTGGCGAAGG
CAA*CGAATATGGCGATGTATATGGTTTCTATGAAGCAACC**AAAGGAGTTGATTGTGA
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GCGCCACCACATAGGGAAGAGATTGAAAATCTTCTGTGGTTTTTTT*CTTCCAAATCCTA
TAGAACGTTGGCACGGGGGAGAGGAAAACAGCAAAGGAAATAATGTTTCCGAGCAAGCCG
AAGGCGAAGGCCCATGTGTTTTGAGTGTTGAAGATAGCCATGGTTTTAGAGTATTTTTAG
GTAGGAAGAATAATTTAGGTTTTTATTTGTATAGGAGGGAGAAGATGAACTCTTCGAGGT
AAGAGAGATATAAGCTTTGTAAGTGTTTCTCTTTAATTAAAAGCTTATGGCACCCCCT

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4ET70TF 797 0 0
GGCGTTTGCAGTATTG
AAACCACGTAAAGTATCATT*GAAGTGCAC*GAGAACAAACCCAATCACGT*CGGGAAAG
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TAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAA
TCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAATC
CTCCAAA*GTTCATTAGCAAC**AAGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGTGG
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CGAAGAGCGCCACCACATAGGGAAGAGATTGAAAACCTTCTGTGGTTTTTTT*CTTCCAA
ATCCTATAGAACGTTGGCACGGGGGAGAGGAAAACAGCAAAGGAAATGATGTTTCCGAGC
AAGCCGAAGGCGAAGGCCCATGTGTTTTGAGTGTTGAAGATAGCCATGGTTTTAGAGTAT
TTTTAGGTAGGAAGAATAATTTAGGTTTTTATTTGTATAGGAGGGAGAAGATGAACTCTT
CGAGGTAAGAGAGATATAAGCTTTGTAAGTGTTTCTCTTTAATTAAAAGCTTATGGCACC
C

QA 17 797 17 797
DS 

RD RR4B349TF 783 0 0
GAAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAA
AGCAACGTAGATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGT
AAGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCC
GATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCATCCGAT
AATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGCAGAGGAGGAGAATCAGACAGAA
TCCTCCAAA*GTTCATTAGCAAC**AAGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCTTTCTTGGT
GGCGAAGGCAA*CGAATATGGCGATGTATATGGTTTCTATGAAGCAACC**AAAGGAGTT
GATTGTGACGAGAAGGAAGACATCTTTCTTCTGAGTAGCGTAGTAGAGCCAAAGCATCGC
GCTGAAGAGCGCCACCACATAGGGAAGAGATTGAAAATCTTCTGTGGTTTTTTT*CTTCC
AAATCCTATAGAACGTTGGCACGGGGGAGAGGAAAACAGCAAAGGAAATGATGTTTCCGA
GCAAGCCGAAGGCGAAGGCCCATGTGTTTTGAGTGTTGAAGATAGCCATGGTTTTAGAGT
ATTTTTAGGTAGGAAGAATAATTTAGGTTTTTATTTGTATAGGAGGGAGAAGATGAACTC
TTCGAGGTAAGAGAGATATAAGCTTTGTAAGTGTTTCTCTTTAATTAAAAGCTTATGGCA
CCC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4AT51TF 486 0 0
AGACAGAATCCTCCAAAAGTTCATTAGCAAACAAAGAGCTTCACCGTTAACATTCGTGCT
TTCTTGGTGGCGAAGGCAAACGAATATGGCGATGTATATGGTTTCTATGAAGCAAACCAA
AAGGAGTTGATTGTGACGAGAAGGAAGACATCTTTCTTCTGAGTAGCGTAGTAGAGCCAA
AGCATCGCGCTGAAGAGCGCCACCACATAGGGAAGAGATTGAAAATCTTCTGTGGTTTTT
TT*CTTCCAAATCCTATAGAACGTTGGCACGGGGGAGAGGAAAACAGCAAAGGAAATGAT
GTTTCCGAGCAAGCCGAAGGCGAAGGCCCATGTGTTTTGAGTGTTGAAGATAGCCATGGT
TTTAGAGTATTTTTAGGTAGGAAGAATAATTTAGGTTTTTATTTGTATAGGAGGGAGAAG
ATGAACTCTTCGAGGTAAGAGAGATATAAGCTTTGTAAGTGTTTCTCTTTAATTAAAAGC
TTATGG

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 10

CO CL420Contig1 771 10 20 U
TTTTTAGGTCTTCCAGTGTAAAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAG
ACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATC
AGATCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAAT
AAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGAC
GCTGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCA
ATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGT
GATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGAC
GAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATC
CCCAAGGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGA
ATAGATTATAGCCCCCTCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTT
TGAAGTTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGGATTATGAA
TTTTATTTATGTTTGCTTATCTCATTTTGTATTTTAATTTCAACCATCTATGAAATTGCC
TGATCAGTTCATGGCGTGTACATGACTTTAATTTTCTTCAATAGCAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF53TF U 1
AF RR4AS38JQ C 6
AF RR4AS38TF U 6
AF RR4CD02TF U 1
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AF RR4FV86TF U 1
AF RR4CB62TF U 17
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TTTTT
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GCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGATC
TAACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTT
GAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGC
TCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGT
TGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGC
AGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAA
GAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTTCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAA
GGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGA
TTATAGCCCCCTCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAG
TTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAA*GAGATTTTTATGG

QA 6 652 6 652
DS 

RD RR4AS38JQ 647 0 0
AGGTCTTCCAGTGTAAAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAGACTGA
GCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGATC
TGACTCTCAGGTGTTTTTGTCCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTT
GAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGC
TCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGT
TGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGC
AGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAA
GAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAA
GGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGA
TTATAGCCCCCTCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAG
TTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGG

QA 1 647 1 647
DS 

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GCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGATC
TGACTCTCAGGTGTTTTTGTCCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTT
GAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGC
TCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGT
TGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGC
AGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAA
GAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAA
GGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGA
TTATAGCCCCCTCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAG
TTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGG

QA 1 647 1 647
DS 

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ACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATC
AGATCTAACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAAT
AAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGAC
GCTGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCA
ATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGT
GATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGAC
GAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTTCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATC
CCCAAGGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGA
ATAGATTATAGCCCCCTCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTT
TGAAGTTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAA*GAGATTTTTATGGATTATGA*
TTTTATTTATGTTTGC

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DS 

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AAAGACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGC
AATATCCCCAAGGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGCGGCAGA
CGTTGAATAGATTATAGCCCCCTCTTATCATCTTTCTGCACTTATCTTTTTAGTTGTTTC
AATTTTTGAAGTTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGGAT
TATGAATTTTATTTATGTTTGCTTATC
CC

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4ED16TF 667 0 0
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TGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTTGAAGCCTTCCA
AGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGCTCAAGAGGCTG
TGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGTTGGAGCTACTT
TGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAG
CTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAAGAAGGCAAAGA
AGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAAGGCTTCAGCCG
CACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGCGGCAGACGTTGAATAGATTATAGCCCCC
TCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTAGTTGTTTCAATTTTTGAAGTTTTTCACCTT
ATTGGTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGGATTATGAATTTTATTTATGTTTGC
TTATC
CC

QA 1 665 1 665
DS 

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TTTTT
AGGTCTTCCAGTGTAAAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAGACTGA
GCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGATC
TGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTT
GAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGC
TCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGT
TGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGC
AGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAA
GAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAA
GGCTTCAGCCGCACCAAAGGCTGCCGAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGA
TTATAGCCCCCTCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAG
TTTTTCACCTTATTGGTATTTGTGTACTCAAAA*GAGATTTTTATGGATTATGAATTTTA
TTTATGTTTGCTTATCTCATTT*GTATTTTA*TTTCA*CCATCTATGAAATTGCCTGATC
AGT
CAGAAAAAAAA

QA 6 728 6 728
DS 

RD RR4CB62TF 753 0 0
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TCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGATCTGACTCTCAGG
TGTTTTTGTTCATTAACTCATAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTTGAAGCCTTCCA
AGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGCTCAAGAGGCTG
TGAAGAAGAGGAAACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGTTGGAGCTACTT
TGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAG
CTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAAGAAGGCAAAGA
AGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAAGGCTTCAGCCG
CACCAAAGGCTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGATTATAGCCCCC
TCTTATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAGTTTTTCACCTT
ATTGGTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGGATTATGAATTTTATTTATGTTTGC
TTATCTCATTTTGTATTTTAATTTCAACCATCTATGAAATTGCCTGATCAGTTCATGGCG
TGTACATGACTTTA*TTTTCTTCA
TAGCATTTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FV86JQ 712 0 0
AAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAGACTGAGCTTTGCCGATTCAG
TGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGATCTGACTCTCAGGTGTT
TTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTTGAAGCCTTCCAAGCT
TGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGCTCAAGAGGCTGTGAA
GAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCAATCGTTGGAGCTACTTTGGA
GGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGC
TTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGC
CGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAAGGCTTCAGCCGCACC
AAAGGCTGCCGAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGATTATAGCCCCCTCTT
ATCATCTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAGTTTTTCACCTTATTG
GTATTTGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGGATTATGAATTTTATTTATGTTTGCTTAT
CTCATTTTGTATTTTAATTTCAACCATCTATGAAATTGCCTGATCAGT
CCAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4CB62JQ 746 0 0
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TCATTAACTCATAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCAT
GGACCACCATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGACGCTGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGA
GGAAACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTTTAGGTCAATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCA
TTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTAC
GTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGT
TTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAGGGCAATATCCCCAAGGCTTCAGCCGCACCAAAGG
CTGCCAAGTTGGGTGGTGGCGGTGGCAGACGTTGAATAGATTATAGCCCCCTCTTATCAT
CTCTCTGCACTTATCTTTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAGTTTTTCACCTTATTGGTATT
TGTGTACTCAAAAAGAGATTTTTATGGATTATGAATTTTATTTATGTTTGCTTATCTCAT
TTTGTATTTTAATTTCAACCATCTATGAAATTGCCTGATCAGTTCATGGCGTGTACATGA
CTTTAATTTTCTTCAATAGCAATTTT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 2 10

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TTCTTCTTGGCTGCTTCTGTCCCTCTCTTGGGTTCTTCTTCTTCTGCCATGGCCACCTTG
GCTAAGGAGCACGCAGCCGTAGCTGCAGCCGTGAACATTAGATCCCTCCTCATCTTCATG
CTCTGTTCTTGCTTGGTTGTTGTGTTATCGCTCGTGGAGGAGGCTTTGACCACAGTGAGG
CTTCGTATGTTGTTGCAAGAAATGGTTGCTGGTAGCTTTGAGTGGGCCGGGAGAAATGAA
GATGTCATGGTCATCAAAGCCATCATAGCAAATTGTGATGTTGATCTGCACGTGTGATCT
CTTAAACTCTCTATGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4G742JQ U 1
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AF RR4A937JQ U 52
AF RR4A937TF C 52
AF RR4F366TF C 64
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BS 1 203 RR4G742JQ
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CC

QA 1 527 1 527
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TAGTGAATTTAGTTACGGCAAATCTTGGCGGTAGGCATTGTGACACAGACAGGAGCATAC
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GCTAAGGAGCACGCAGCCGTAGCTGCAGCCGTGAACATTAGATCCCTCCTCATCTTCATG
CTCTGTTCTTGCTTGGTTGTTGTGTTGTCGCTCGTGGAGAAGGCTTTGACCACAGTGAGG
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CC

QA 1 527 1 527
DS 

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DS 

RD RR4A937TF 508 0 0
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GCCACCTTGGCTAAGGAGCACGCAGCCGTAGCTGCAGCCGTGAACATTAGATCCCTCCTC
ATCTTCATGCTCTGTTCTTGCTTGGTTGTTGTGTTATCGCTCGTGGAGGAGGCTTTGACC
ACAGTGAGGCTTCGTATGTTGTTGCAAGAGATGGTTGCTGGTAGCTTTGAGTGGGCCGGG
AGAAATGAAGATGTCATGGTCATCAAAGCCATCATAGCAAATTGTGATGTTGATCTGCAC
GTGTGATCTCTTAGACTCTCTATGTTCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4F366TF 496 0 0
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TTCTTGGCTGCTTCTGTCCCTCTCTTGGGTTCTTCTTCTTCTGCCATGGCCACCTTGGCT
AAGGAGCACGCAGCCGTAGCTGCAGCCGTGAACATTAGATCCCTCCTCATCTTCATGCTC
TGTTCTTGCTTGGTTGTTGTGTTATCGCTCGTGGAGGAGGCCTTGACCACAGTGAGGCTT
CGTATGTTGTTGCAAGAGATGGTTGCTGGTAGCTTTGAGTGGGCCGGGAGAAATGAAGAT
GTCATGGTCATCGAAGCCATCATAGCAAATTGTGATGTTGATCTGCACGTGTGATCTCTT
AGACTCTCTATGTTCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4AI38JQ 508 0 0
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AATATTTGATAGACACAAAACAGACACATGGAGTTGATATATATATTTGTATATATAAGT
TGGTGAAAATAGTGAATTTAGTTACGGCAAATATTGGCGGTAGGCATTGTGACACAGACA
GGAGCATACTTCTTCTTGGCTGCTTCTGTCCCTCTCTTGGGTTCTTCTTCTTCTGCCATG
GCCACCTTGGCTAAGGAGCACGCAGCCGTAGCTGCAGCCGTGAACATTAAATCCCTCCTC
ATCTTCATGCTCTGTTCTTGCTTGGTTGTTGTGTTATCGCTCGTGGAGGAGGCTTTGACC
ACAGTGAGGCTTCGTATGTTGTTGCAAGAAATGGTTGCTGGTAGCTTTGAGTGGGCCGGG
AGAAATGAAAATGTCATGGTCATCAAAGCCATCATAGCAAATTGTGATGTTGATCTGCAC
GTGTGATCTCTTAAACTCTCTATGTTCC

QA 1 508 1 508
DS 



CO CL421Contig2 1540 4 3 U
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CTTCGATGACCATGACATCTTCATTTCTCCCGGCCCACTCAAAGCTACCAGCAACCATCT
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ATATATCAACTCCATGTGTCTGTTTTGTGTCTATCAAATATTCTCAGTCAGTATGTAATG
ATCATAGTTGATCAAATCTATTAAAAAAACCTCTGTTAA*TGTACTTTTATCGTCCACTG
TTGTCAGCAAATACTTCTACTCAACCTTTGGCTACAAATCTTTACACTCTCAATAAGAGC
CATATGATCCAATAATAATGCAATATTTGGGATTAAATCATGAGGTTTGAATAAGAATAA
ACAGCATAAGGAAGGCTGACAAGTTCATGAGAAGACAAAGGTAATGCGCCTCTGGTTTTA
TTCTTCTGGTGTATACTGAAGAGTTGCTTCTGTTACTCTACTCCAGTGGCCCAGACGAAG
TTCCCTCCTCTTCACCATCAAACTCTTGCTCAACACCTTTGACCTCGGATATATAATGCA
TCAGCATATTCTCAATCCCTGATTTCAAAGTAACAGATGAACTTGGACAACCGCTACAAG
CTCCTTGCATTCTAAGCTTAACTATCCCAGTTTCCGTATCAAACCCACAATACTCAATGT
CTCCTCCATCATCTTGGACTGATGGTCGGATGCGAGTCTCCAAGAGTTCCTTGATCATTG
CTACAGTTTCAGAGTCATCCTCGTTAACGGCAGTATCCTTGGCAGCTGCAACTTGTGAGT
CCAGAAACAAAGGCTGGCCAGAAGAGTAGAAGTCCATTACCACTGCAAACACTTCAGGCT
TGAGGAAGTCCCATGTCACGTCATCTGACTTTGTCACAGTGACAAAATCCGATCCGAAGA
AAACTCTAACAACACCATCAATGGAGAAGATGGCTTTGGCCAAAGGTGAACTCATAGCTG
AACGAGAATTAGGGAAGTCTGCGCTTCCCACTTCCATGACTGGTTTACCAGGACTAAACA
TCAGAGAAGAAGGGTTTGGTGTTGACTGTGTTTGTATAAACATCGTCCTCCTTTGCACTC
CCAGTGAGATCGATTTGAGAGGAAAGGAAGAAACTTTCGGAGAGTTACGAGAAGCGTAAG
TCTTCCCGTGACTCGTAGCGAATTGGGTTGTCGCCGAGATGAACAGAGGGCGACGTGATA
TCAGAAGAGGACGACAAGGCGAAGAAGAGACCTCGCGAGCTCTATGTCTCCAAATAGAAT
TTAGAAGCCTCGTTATCCCTCTCATCGTTGCCTACGTTTTCCAGATTCTAAAGATTTAAT
CTTTCGTCGGAGAATCGAAAATCGTGGGAATGGTGATCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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CTTGCAACAACATACGGCTGCGTGCTCCTTAGCCAAGGTGGCCATGGCAGAAGAAGAATA
ACCCAAGAGAGGGACAGAAGCAGCCAAGAAGAAGTATGCTCCTGTCTGTGTCACAATGCC
TACCGCCAAGATTTGCCGTAACTAAATTCACTATTTTCACCAACTTATATATACAAATAT
ATATATCAACTCCATGTGTCTGTTTTGTGTCTATCAAATATTCTCAGTCAGTATGTAATG
ATCATAGTTGATCAAATCTATTAAAAAAACCTCTGTTAA*TGTACTTTTATCGTCCACTG
TTGTCAGCAAATACTTCTACTCAACCTTTGGCTACAAATCTTTACA
GTCCC

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CGAAGAAAACTCTAACAACACCATCAATGGAGAAGATGGCTT

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TCCCGTGACTCGTAGCGAATTGGGTTGTCGCCGAGATGAACAGAGGGCGACGTGATATCA
GAAGAGGACGACAAGGCGAAGAAGAGACCTCGCGAGCTCTATGTCTCCAAATAGAATTTA
GAAGCCTCGTTATCCCTCTCATCGTTGCCTACGTTTTCCAGATTCTAAAGATTTAATCTT
TCGTCGGAGAATCGAAAATCGTGGGAATGGTGATCCC

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DS 



AS 2 10

CO CL422Contig1 789 2 3 U
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AAACTGAAAGATCTGGGGCGACATCATTTCAATTTGATCATCTATTTGCGAAATTCCCCA
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TACGAGTTCTACGGAGAAGTATTCGCCTATAGAATGGACAAGCTACTTTGACAAAGAAGA
CGATGTATCAATCCCTGGATCCAACGATGTATTTCACGTGTACATGGCAGGAACAGAAGG
ACCTGTTGTCTTTTGTCTCCATGGAGGTGGCTTCTCTGGGCTCTCGTTTTCTATAGTGGC
AAGTAAGATCAAGGAGAAAGCACGTGTGGTTGCTATGGACTTGAGAGGACACGGTAAATC
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GATTAAGGAATTGTATGGAGATTCTCCTCCTGCTATTGTGCTAGTTGGTCACAGCATGGG
AGGTTCGGTCGCTGTGCAAGTTGCTGCAAACAAAACATTGCCTAGCTTGGCTGGGCTTGT
CGTTGTGGATGTTGTTGAGGGTACTGCTGTTGCCTCTTTGATTCACATGCAGAAAATTCT
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AGGGTCATT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AE51TF U 1
AF RR4B508TF U 1
BS 1 193 RR4AE51TF
BS 194 194 RR4B508TF
BS 195 789 RR4AE51TF

RD RR4AE51TF 789 0 0
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AAACTGAAAGATCTGGGGCGACATCATTTCAATTTGATCATCTATTTGCGAAATTCCCCA
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CCCCGACGGAGAATCAGCTCCGGCGTCCGTCTTCGCCACTCGTCCTCTTCGTCCTCCTTC
TACGAGTTCTACGGAGAAGTATTCGCCTATAGAATGGACAAGCTACTTTGACAAAGAAGA
CGATGTATCAATCCCTGGATCCAACGATGTATTTCACGTGTACATGGCAGGAACAGAAGG
ACCTGTTGTCTTTTGTCTCCATGGAGGTGGCTTCTCTGGGCTCTCGTTTTCTATAGTGGC
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GATTAAGGAATTGTATGGAGATTCTCCTCCTGCTATTGTGCTAGTTGGTCACAGCATGGG
AGGTTCGGTCGCTGTGCAAGTTGCTGCAAACAAAACATTGCCTAGCTTGGCTGGGCTTGT
CGTTGTGGATGTTGTTGAGGGTACTGCTGTTGCCTCTTTGATTCACATGCAGAAAATTCT
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AGGGTCATT

QA 1 789 1 789
DS 

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AAAAAAAAAAGCTGGAGAAAAGCGAATTGTAGAGTGGGAACGGAAACTGAAAGATCTGGG
GCGACATCATTTCAATTTGATCATCTATTTGCGAAATTCCCCAGAGCTGAAGCCTTGCAG
CGATGGATTCCTCTTCAAATTTGAATCCCCTTCCCGAGGATATCCCCGACGGAGAACCAG
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AGTATTCGCCTGTAGAATGGACAATCTACTTTGACAAAGAAGACGATGTATCAATCCCTG
GATCCAACGATGTATTTCACGTGTACATGGCAGGAACAGAAGGACCTGTTGTCTTTTGTC
TCCATGGAGGTGGCTTCTCTGGGCTCTCGTTTTCTATAGTGGCAAGTAAGATCAAGGAGA
AAGCACGTGTGGTTGCTATGGACTTGAGAGGACACGGTAAATCTGTTTCTGAGAATGAAC
TGGACTTATCGCTTGAGACAATGAGCAGTGATGTTGTTGCTGTGATTAAGGAATTGTATG
GAGATTCTCCTCCTGCTATTGTGCTAGTTGGTCACAGCATGGGAGGTTCGGTCGCTGTGC
AAGTTGCTGCAAACAAAACATTGCCTAGCTTGGCTGGGCTTGTCGTTGTGGATGTTGTTG
AGGGTACTGCTGTTGCCTCTTTGATTCACATGCAGAAAATTCTTTCGAACAGAATGCAAC
ACTTTCCCAGCATCCAAAAAGCAATTGAGTACAGCGTTAGAGGAGGGTCAT

QA 18 788 18 788
DS 



CO CL422Contig2 1273 8 20 U
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AAACCATACAATGTCCTGATTCAAGTCTTGGGCTGTGAAGGCTTCCACGTTCCTGGTATC
TCAACACCATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGAAATTCACAACTAGATTCGCAAAC
TCCTCTGGTACATCTTCCTGTATAGCATGTCCAGTGTGTTTGACCACAATCATTTGAAAC
TTTCCTTGCATTTGACCAATTGTGAGGGTCCGGTCCAATCTGTCGGTTCCAGCTAATAGC
AAGAGTTTTGGAACAGGAGATGACAAGAACTTCTCTGAGAGACCTTCGTACCAGCCTTTC
CAATATTGCTCTGTTTGCTCTAGACGTGTCCGGTAAGTGTAGCAGTGTTTTGAATCATCG
TATATGAGAGTTGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACTCGATGTTCCTT*AATGACCCTCC
TCTAACGCTGTACTCAATTGCTTTTTGGATGCTGGGAAAGTGTTGCATTCTGTTTGAAAG
AATTTTCTGCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGTACCCTCAACAACATCCACTACGAC
AAGCCCAGCCAAGCTAGGCAATGTTTTGTTTGCAGCAACTTGCACAGCGACGGAACCTCC
CATGCTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATCTCCATACAATTCCTTAACCAC
AGCAACAACATCACTGCTCATTGTCTCAAGCGATAAGTCCAGTTCGTTCTCAGAAACCGA
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CACTATTGAAAACGAGAGCCCAGAGAAGCCACCTCCATGGAGACAAAAGACAACAGGTCC
TTCAGTTCCTGCCATATATACGTGAAATACATCGTTGGATCCAGGGATTGATACATCGTC
TTCTTTGTCAAAGTAGCTTGTCCATTCTACAGACGAATACTTCTCCGAAGAACTCGTAGA
AGGAGGACGAAGAGGACGAGTGGCGAAGACGGACGCCGGAGCTGGTTCTCCGTCAGAGAT
ATCCTCGGGAAGGGGATTCAAATTTGAAGAAGAATCCATCGTTGCAAGTCTTCTTCAGCT
CTGGGGAATTTCGTAATAGATCAAATTGAAATGATCTGCCCCAGATCTTTCAGTTTCCGT
TCCCACTCTACCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 
45 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN60JQ U 1
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AF RR4D980JQ U 1
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QA 5 397 5 397
DS 

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QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4B508JQ 809 0 0
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GAGCTATAGAGTTGTTAATTGTTTTATTCATAAAAGCCGACAAGCAAAACAAGTGAAAAC
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CACCATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGAAATTCACAACTAGATTCGCAAACTCCT
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CTTGCATTTGACCAATTGTGAGGGTCCGGTCCAATCTGTCGGTTCCAGCTAATAGCAAGA
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TGAGAGTTGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACTCGATGTTCCTT*AATGACCCTCCTCTA
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CTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATCTCCATACAATTCCTTAATCACAGCA
ACAACATCACTGCTCATTGTCTCAAGCGA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4D980JQ 849 0 0
AAGT
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CTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATCTCCATACAATTCCTTAATCACAGCA
ACAACATCACTGCTCATTGTCTCAAGCGATAAGTCCAGTTCAT*CTCAGAAACAGATTTA
CCGTG

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AAACCATACAATGTCCTGATTCAAGTCTTGGGCTGTGAAGGCTTCCACGTTCCTGGTATC
TCAACACCATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGAAATTCACAACTAGATTCACAAAC
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AATTTTCTGCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGTACCCTCAACAACATCCACTACGAC
AAGCCCAGCCAAGCTAGGCAATGTTTTGTTTGCAGCAACTTGCACAGCGACGGAACCTCC
CATGCTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATCTCCATACAATTCCTTAACCAC
AGCCACAACATCACTGCTCATTGTCTCGAGGGATAAGTCCAGTTCGTTCTCAGAAACCGA
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CACTAT

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GCA
TTGACCAATTGTGAGGGTCCGGTCCAATCTGTCGGTTCCGGCTAATAGCAAGAGTTTTGG
AACAGGAGATGACAAGAACTTCTCTGAGAGACCTTCGTACCAGCCTTTCCAATATTGCTC
TGTTTGCTCTAGACGTGTCCGGTAAGTGTAGCAGTGTTTTGAATCATCGTATATGAGAGT
TGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACTCGATGTTCCTT*AATGACCCTCCTCTAACGCTGT
ACTCAATTGCTTTTTGGATGCTGGGAAAGTGTTGCATTCTGTTCGAAAGAATTTTCTGCA
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CAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATCTCCATACAATTCCTTAATCACAGCAACAACAT
CACTGCTCATTGTCTCAAGCGATAAGTCCAGTTCATTCTCAGAAACAGATTTACCGTGTC
CTCTCAAGTCCATAGCAACCACACGTGCTTTCTCCTTGATCTTACTTGCCACTATAGAAA
ACGAGAGCCCAGAGAAGCCACCTCCATGGAG
C

QA 4 634 4 634
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TAATCC

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DS 

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GTGTTGCATTCTGTTTGAAAGAATTTTCTGCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGTACC
CTCAACAACATCCACTACGACAAGCCCAGCCAAGCTAGGCAATGTTTTGTTTGCAGCAAC
TTGCACAGCGACGGAACCTCCCATGCTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATC
TCCATACAATTCCTTAACCACAGCCACAACATCACTGCTCATTGTCTCGAGGGATAAGTC
CAGTTCGTTCTCAGAAACCGATTTACCGTGTCCTCTCAAGTCCATAGCAACCACACGTGC
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TCCAGGGATTGATACATCGTCTTCTTTGTCAAAGTAGCTTGTCCATTCTACAGACGAATA
CTTCTCCGAAGAACTCGTAGAAGGAGGACGAAGAGGACGAGTGGCGAAGACGGACGCCGG
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CCCAGATCTTTCAGTTTCCGTTCCCACTCTACCC

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DS 



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AAGATTTTCTTGCTCTTTCCGACATTTTCGTCTACTCCACTAAGCGTGTCGCCAGTGCGA
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TCAATCATCATTCTTCGACTGTCCTTGATTCTATCAGTGGTACGACCCAATCGATCAGTG
GACATCATCAATCTCGCTCTTTGATCAGCTGAAGCCGTCTTAGTGTCAGCAAGGCCAGCT
TCGAGCAAGTCGTCACGAGCAGCAGCGTTCAAGTTAGCAGAGGAGGTGATAGTCTTGAGT
TCGGTTTTGAAGTTGTTGAGATCAGACTTGAACTCTCTTAATTTGACAAGGAGGGTGGTC
TTAACGCTCGGTGGGAGGCTCCTCGCCTCAACATCCATTTTCCTAATCAAAGCTTCAGCA
TTATCGAGGCCAGACCTTATTTCAGAGAGCTTCTGCTTCTTTTGCTCTCCGTGGAGGGAA
ATAGCAGAGGAGCATTTCTTGGAAAGATGGGCGGAGAGGTCGCAGTATTGGCGCTCGTAT
CCGTTAAACACCTCACTCATTCTGATTGATTGATTGATACTCTCTCTCTCTCTCTTCTGA
TAACACGAAGCACCCTCGGAATCGGAAGATAGAGAGATCCAAAGGTAAAGAAAGGTAAGG
AAAGACGACGGCGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP19JQ U 1
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C

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GATAATACAAAAGGTAGCAAAGACATATAACTTTTATCACACAGAAAGCCAGAAACGGAT
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TACAGAGAGGATTATTTGGTGAGTTTGAAGTACAAGATGAGGAAAATAGCGGCGACCAAA
GCGGTGATAATGGCTCCAATGGTCCATTTGTTCCTGTTCATCCTCCTCGTCATGCCCGTC
AAGATTTTCTTGCTCTTTCCGACATTTTCGTCTACTCCACTAAGCGTGTCGCCAGTGCGA
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TCGAGCAAGTCGTCACGAGCAGCAGCGTTCAAGTTAGCAGAGGAGGTGATAGTCTTGAGT
TCGGTTTTGAAGTTGTTGAGATCAGACTTGAACTCTCTTAATTTGACAAGGAGGGTG
C

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GACCAAAGCGGTGATAATGGCTCCAATGGTCCATTTGTTCCTGTTCATCCTCCTCGTCAT
GCCCGTCAAGATTTTCTTGCTCTTTCCGACATTTTCGTCTACTCCACTAAGCGTGTCGCC
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TTCAGTCTCAATCATCATTCTTCGACTGTCCTTGATTCTATCAGTGGTACGACCCAATCG
ATCAGTGGACATCATCAATCTCGCTCTTTGATCAGCTGAAGCCGTCTTAGTGTCAGCAAG
GCCAGCTTCGAGCAAGTCGTCACGAGCAGCAGCGTTCAAGTTAGCAGAGGAGGTGATAGT
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TTTT
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CTCGCCTCAACATCCATTTTCCTAATCAAAGCTTCAGCATTATCGAGGCCAGACCTTATT
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GAAAGATGGGCGGAGAGGTCGCAGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATT
CTGATTGATTGATTGATACTCTCTCTCTCTCTCTTCTGATAACACGAAGCACCCTCGGAA
TCGGAAGATAGAGAGATCCAA
AAGTCC

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DS 

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G
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AAGATTTGGTCGTGTTTTAATAGATACAGAGAGGGTTATTTGGTGAGTTTGAAGTACAAG
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TTCATCCTCCTCGTCATGCCCGTCAAGATTTTCTTGCTCTTTCCGACATTTTCGTCTACT
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AGGTCGCAGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATTCTGATTGATTGATTG
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A

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TGATCAGCTGAAGCCGTCTTAGTGTCAGCAAGGCCAGCTTCGAGCAAGTCGTCACGAGCA
GCAGCGTTCAAGTTAGCAGAGGAGGTGATAGTCTTGAGTTCGGTTTTGAAGTTGTTGAGA
TCAGACTTGAACTCTCTTAATTTGACAAGGAGGGTGGTCTTAACGCTCGGTGGGAGGCTC
CTCGCCTCAACATCCATTTTCCTAATCAAAGCTTCAGCATTATCGAGGCCAGACCTTATT
TCAGAGAGCTTCTGCTTCTTTTGCTCTCCGTGGAGGGAAATAGCAGAGGAGCATTTCTTG
GAAAGATGGGCGGAGAGGTCGCAGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATT
CTGATTGATTGATTGATACTCTCTCTCTCTCTCTTCTGATAACACGAA

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4BC86TF 830 0 0
ATAAATAAAACATTCACACCATTCGTTCATCAGGGACAAAGATTTGGTCGTGTTTTAATA
GATACAGAGAGGATTATTTGGTGAGTTTGAAGTACAAGATGAGGAAAATAGCGGCGACCA
AAGCGGTGATAATGGCTCCAATGGTCCATTTGTTCCTGTTCATCCTCCTCGTCATGCCCG
TCAAGATTTTCTTGCTCTTTCCGACATTTTCGTCTACTCCACTAAGCGTGTCGCCAGTGC
GAAGGAGAGACTGTCTCTGACTGTGCAAGTCTTGGAGGACAGAGACGCCAAGCTCTTCAG
TCTCAATCATCATTCTTCGACTGTCCTTGATTCTATCAGTGGTACGACCCAATCGATCAG
TGGACATCATCAATCTCGCTCTTTGATCAGCTGAAGCCGTCTTAGTGTCAGCAAGGCCAG
CTTCGAGCAAGTCGTCACGAGCAGCAGCGTTCAAGTTAGCAGAGGAGGTGATAGTCTTGA
GTTCGGTTTTGAAGTTGTTGAGATCAGACTTGAACTCTCTTAATTTGACAAGGAGGGTGG
TCTTAACGCTCGGTGGGAGGCTCCTCGCCTCAACATCCATTTTCCTAATCAAAGCTTCAG
CATTATCGAGGCCAGACCTTATTTCAGAGAGCTTCTGCTTCTTTTGCTCTCCGTGGAGGG
AAATAGCAGAGGAGCATTTCTTGGAAAGATGGGCGGAGAGGTCGCAGTATTGGCGCTCGT
ATCCGTTAAACACCTCACTCATTCTGATTGATTGATTGATACTCTCTCTCTCTCTCTTCT
GATAACACGAAGCACCCTCGGAATCGGAAGATAGAGAGATCCAA
AAGTCC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4GE56TF 665 0 0
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CACTAAGCGTGTCGCCAGTGCGAAGGAGAGACTGTCTCTGACTGTGCAAGTCTTGGAGGA
CAGAGACGCCAAGCTCTTCAGTCTCAATCATCATTCTTCGACTGTCCTTGATTCTATCAG
TGGTACGACCCAATCGATCAGTGGACATCATCAATCTCGCTCTTTGATCAGCTGAAGCCG
TCTTAGTGTCAGCAAGGCCAGCTTCGAGCAAGTCGTCACGAGCAGCAGCGTTCAAGTTAG
CAGAGGAGGTGATAGTCTTGAGTTCGGTTTTGAAGTTGTTGAGATCAGACTTGAACTCTC
TTAATTTGACAAGGAGGGTGGTCTTAACGCTCGGTGGGAGGCTCCTCGCCTCAACATCCA
TTTTCCTAATCAAAGCTTCAGCATTATCGAGGCCAGACCTTATTTCAGAGAGCTTCTGCT
TCTTTTGCTCTCCGTGGAGGGAAATAGCAGAGGAGCATTTCTTGGAAAGATGGGCGGAGA
GGTCGCAGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATTCTGATTGATTGATTGA
TACTCTCTCTCTCTCTCTTCTGATAACACGAAGCACCCTCGGAATCGGAAGATAGAGAGA
TCCAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4B687TF 836 0 0
CGTTCATCAGGGACAAAGATTTGGTCGTGTTTTAATAGATACAGAGAGGATTATTTGGTG
AGTTTGAAGTACAAGATGAGGAAAATAGCGGCGACCAAAGCGGTGATAATGGCTCCAATG
GTCCATTTGTTCCTGTTCATCCTCCTCGTCATGCCCGTCAAGATTTTCTTGCTCTTTCCG
ACATTTTCGTCTACTCCACTAAGCGTGTCGCCAGTGCGAAGGAGAGACTGTCTCTGACTG
TGCAAGTCTTGGAGGACAGAGAAGCCAAGCTCTTCAGTCTCAATCATCATTCTTCGACTG
TCCTTGATTCTATCAGTGGTTCGACCCAATCGATCAGTGGACATCATCAATCTCGCTCTT
TGATCAGCTGAAGCCGTCTTAGTGTCAGCAAGGCCAGCTTCGAGCAAGTCGTCACGAGCA
GCAGCGTTCAAGTTAGCAGAGGAGGTGATAGTCTTGAGTTCGGTTTTGAAGTTGTTGAGG
TCAGACTTGAACTCTCTTAATTTGACAAGGAGGGTGGTCTTAACGCTCGGTGGGAGGCTC
CTCGCCTCAACATCCATTTTCCTAATCAAAGCTTCAGCATTATCGAGGCCAGACCTTATT
TCAGAGAGCTTCTGCTTCTTTTGTTCTCCGTGGAGGGAAATAGCAGAGGAGCATTTCTTG
GAAAGATGGGCGGAGAGGTCGCAGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATT
CTGATTGATTGATTGATACTATCTCTCTCTCTCTTCTGATAACACGAAGAACCGTCGGAA
TCGGAAGATAGAGAGATCCAAAGGTAAAGAAAGGTAAGGAAAGACGACGGCGATCC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 10

CO CL424Contig1 1106 10 13 U
GTCCTGTTAAATAGTGGCCTTATTTGTTTTCTCATTGGTCTCAGGTTTGTCCCCAAAATA
AAATAGTGGAAATATGACAAGCAGCACAAAATAAACATACAAAACAACAAATGAATACAG
AAACAAAATAGAATTACAACGTATCCTTACAGAAAGAACCTCATAAATTATACTTATTTT
CATTTTTACCCCATTAATATTTTTTGGTTCATGGCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTA
GTGATTAATATGGTTTAGCATGGTTTTCCGACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTG
GTAAGCTTTGAAACGGCCGAACCGTGTTTGGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAA
CTCATGAACCTTGGATTTCCAGATTGTCTGAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTG
TCGGATCTCCAATTCCAATTTTTCCACTCCGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACC
TCTCTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTA
GGACTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACA
TGGACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTG
AAAGCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTTGTCATTTTGTGCACCAAGCAAC
ATCACATCGTTGTGGCGGGTGAAATGAGAGTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATT
ATAGCGTCGATGAGACCATCTTGGCATTTAGACATAGAAATGTGGTCTAGCCAAATGTTT
GTTGCTCCAAAGATAGAGATACCATCTCCATCGGCCTGTCCTCTAAACCCAAAGTGGTCA
TTAGAGTTTCTTATCATGCCACCACTGCCGGGGACGATGTGATGCACGTGAAGCCCATGG
ATGATGATATTTTGCACGTACTGCATCGTGATCCCAGCACCATATGCGATGTGCACGTTA
GTGCCACGAGCATCAATCGTCTTGTGACTATTAATCATTAGCTCTTGGCTCAACCTAATG
CTCATATCGTGCTTGAAAATGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 25 25 25 25 25 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK33JQ U 1
AF RR4H682JQB U 94
AF RR4B222JQ U 131
AF RR4GK33TF C 774
AF RR4AW07JQ U 131
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AF RR4H682TF C 295
AF RR4FG38JQ U 149
AF RR4FG38TF C 424
BS 1 111 RR4GK33JQ
BS 112 114 RR4H682JQB
BS 115 433 RR4GK33JQ
BS 434 434 RR4H682JQB
BS 435 465 RR4GK33JQ
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BS 467 700 RR4GK33JQ
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BS 736 736 RR4AW07JQ
BS 737 809 RR4H682JQB
BS 810 910 RR4AW07JQ
BS 911 1045 RR4FG38JQ
BS 1046 1106 RR4FG38TF

RD RR4GK33JQ 700 0 0
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AAATAGTGGAAATATGACAAGCAGCACAAAATAAACATACAAAACAACAAA***ATACAG
AAACAAAATAGAATTACAACGTATCCTTACAGAAAGAACCTCATAAATTATACTTATTTT
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GTGATTAATATGGTTTAGCATGGTTTTCCGACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTG
GTAAGCTTTGAAACGGCCGAACCGTGTTTGGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAA
CTCATGAACCTTGGATTTCCAGATTGTCTGAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTG
TCGGATCTCCAATCCCAATTTTTCCACTCCGATTCTGGAGCATAACCCCTCTTTGTCACC
TCTCTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTA
GGACTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACA
TGGACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTG
AAAGCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTTGT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4H682JQB 716 0 0
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AAGAACCTCATAAATTATACTTATTTTCATTTTTACCCCATTAATATTTTTTGGTTCATG
GCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTAGTGATTAATATGGTTTAGCATGGTTTTCCGACC
CGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTGGTAAGCTTTGAAACGGCCGAACCGTGTTTGGGC
TTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAACTCATGAACCTTGGATTTCCAGATTGTCTGAAA
TATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTGTCGGATCTCCAATTCCAATTTTTCCACTCCGAT
TCTGGATC******CCTCTCTGTCACCTCTCTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGCGATG
AAACGGTTTCCGTGGCTGAAAATGGTAGGACTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAGCTCC
CAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGGACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCATCCTC
TGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAAGCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTCCGCT
TGGTTGTCATTTTGTGCACCAAGCAACATCACATCGTTGTGGTGGGTGAAATGAGAGTTA
GAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATAGCGTCGATGAGACCATCTTGGCATTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4B222JQ 705 0 0
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CCATTAATATTTTTTGGTTCATGGCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTAGTGATTAATA
TGGTTTAGCATGGTTTTCCGACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTGGTAAGCTTTG
AAACGGCCGAACCGTGTTTGGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAACTCATGAACC
TTGGATTTCCAGATTGTCTGAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTGTCGGATCTCC
AATTCCAATTTTTCCACTCCGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACCTCTCTGTAAT
GTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTAGGACTTTGGC
TACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGGACGAAAC
CCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAAGCCACAG
TGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTTGTCATTTTGTGCACCAAGCAACATCACATCGT
TGTGGCGGGTGAAATGAGAGTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATAGCGTCGA
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QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GK33TF 104 0 0
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AATGTTTGTTGCTCCAAAGATAGAGATACCAT*TCCATCGGCC
C

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR4AW07JQ 781 0 0
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CCATTAATATTTTTTGGTTCATGGCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTAGTGATTAATA
TGGTTTAGCATGGTTTTCCGACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTGGTAAGCTTTG
AAACGGCCGAACCGTGTTTGGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAACTCATGAACC
TTGGATTTCCAGATTGTCTGAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTGTCGGATCTCC
AATTCCAATTTTTCCACTCCGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACCTCTCTGTAAT
GTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTAGGACTTTGGC
TACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGGACGAAAC
CCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAAGCCACAG
TGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTTGTCATTTTGTGCACCAAGCAACATCACATCGT
TGTGGCGGGTGAAATGAGAGTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATAGCGTCGA
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C

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AW07TF 762 0 0
CAGAAAGAACCTCATAAATTATACTTATTTTCATTTTTACCCCATTAATATTTTTTGGTT
CATGGCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTAGTGATTAATATGGTTTAGCATGGTTTTCC
GACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTGGTAAGCTTTGAAACGGCCGAACCGTGTTT
GGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAACTCATGAACCTTGGATTTCCAGATTGTCT
GAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTGTCGGATCTCCAATTCCAATTTTTCCACTC
CGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACCTCTCTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGC
GATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTAGGACTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAG
CTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGGACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCAT
CCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAAGCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTC
CGCTTGGTTGTCATTTTGTGCACCAAGCAACATCACATCGTTGTGGCGGGTGAAATGAGA
GTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATAGCGTCGATGAGACCATCTTGGCATTT
AGACATAGAAATGTGGTCTAGCCAAATGTTTGTTGCTCCAAAGATAGAGATACCATCTCC
ATCGGCCTGTCCTCTAAACCCAAAGTGGTCATTAGAGTTTC
C

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4B222TF 781 0 0
GAATTACAACGTATCCT*ACAGAAAGAAC*TCATAAATTATACTTATTTTCATTTTTACC
CCATTAATATTTTTTGGTTCATGGCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTAGTGATTAATA
TGGTTTAGCATGGTTTTCCGACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTGGTAAGCTTTG
AAACGGCCGAACCGTGTTTGGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAACTCATGAACC
TTGGATTTCCAGATTGTCTGAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTGTCGGATCTCC
AATTCCAATTTTTCCACTCCGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACCTCTCTGTAAT
GTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTAGGACTTTGGC
TACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGGACGAAAC
CCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAAGCCACAG
TGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTTGTCATTTTGTGCACCAAGCAACATCACATCGT
TGTGGCGGGTGAAATGAGAGTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATAGCGTCGA
TGAGACCATCTTGGCATTTAGACATAGAAATGTGGTCTAGCCAAATGTTTGTTGCTCCAA
AGATAGAGATACCATCTCCATCGGCCTGTCCTCTAAACCCAAAGTGGTCATTAGAGTTTC
C

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4H682TF 662 0 0
TATTTGGTAAGCTTTGAAACGGCCGAACCGTGTTTGGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAG
TGTGAACTCATGAACCTTGGATTTCCAGATTGTCTGAAATATGCATTGTTCATGAAAATG
TCTTTGTCGGATCTCCAATTCCAATTTTTCCACTCCGATTCTGGA******TCCCTCTCT
GTCACCTCTCTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGA
ATGGTAGGACTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTG
ACAACATGGACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAG
TGGTTGAAAGCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTTGTCATTTTGTGCACCA
AGCAACATCACATCGTTGTGGTGGGTGAAATGAGAGTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAG
CCCATTATAGCGTCGATGAGACCATCTTGGCATTTAGACATAGAAATGTGGTCTAGCCAA
ATGTTTGTTGCTCCAAAGATAGAGATACCATCTCCATCGGCCTGTCCTCTAAACCCAAAG
TGGTCATTAGAGTTTCTTATCATGCCACCACTGCCGGGGACGATGTGATGCACGTGAAGC
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4FG38JQ 897 0 0
G
CAGAAAGAACCTCATAAATTATACTTATTTTCATTTTTACCCCATTAATATTTTTTGGTT
CATGGCCTAGATACAAGAGAGAAAAGTAGTAGTGATTAATATGGTTTAGCATGGTTTTCC
GACCCGGCAATCCAATGCTCCGGCGTATTTGGTAAGCTTTGAAACGGCCGAACCGTGTTT
GGGCTTTATCATCTGTTGTCTAGAGTGTGAACTCATGAACCTTGGATTTCCAGATTGTCT
GAAATATGCATTGTTCATGAAAATGTCTTTGTCGGATCTCCAATTCCAATTTTTCCACTC
CGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACCTCTCTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGC
GATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAAAATGGTAGGACTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAG
CTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGGACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCAT
CCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAAGCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTC
CGCTTGGTCGTCATTTTGTACACCAAGCAACATCACATCGTTGTGGTGGGTGAAATGAGA
GTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATAGCGTCGATGAGACCATCTTGGCATTT
AGACATAGAAATGTGGTCTAGCCAAATGTTTGTTGCTCCAAAGATAGAGATACCATCTCC
ATCGGCCTGTCCTCTAAACCCAAAGTGGTCATTAGGGTTTCTTATCATGCCACCACTGCC
GGGGACGATGTGATGCACGTGAAGCCCATGGATGATGATATTTTGCACGTACTGCATCGT
GATCCCAGCACCATATGCGATGTGCACGTTAGTGCCACGAGCATCAATCGTCTTGT

QA 2 897 2 897
DS 

RD RR4FG38TF 683 0 0
GATCTCCAATTCCAATTTT*CCACTCCGATTCTGGAGCATAATCCCTCTTTGTCACCTCT
CTGTAATGTTGTATGTGAGGAGGAGCGATGAAACGGTTTCCGTGGCTGAGAATGGTAGGA
CTTTGGCTACCGCCGATAGCGTAAAGCTCCCAGTGAGTGTAGTCATTGTTGACAACATGG
ACGAAACCCCACCGAATCCTCGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCAAAGTGGTTGAAA
GCCACAGTGACTTGCATCTTCTTGTCCGCTTGGTCGTCATTTTGTACACCAAGCAACATC
ACATCGTTGTGGTGGGTGAAATGAGAGTTAGAGATAGTGATCCCGGTGGAGCCCATTATA
GCGTCGATGAGACCATCTTGGCATTTAGACATAGAAATGTGGTCTAGCCAAATGTTTGTT
GCTCCAAAGATAGAGATACCATCTCCATCGGCCTGTCCTCTAAACCCAAAGTGGTCATTA
GGGTTTCTTATCATGCCACCACTGCCGGGGACGATGTGATGCACGTGAAGCCCATGGATG
ATGATATTTTGCACGTACTGCATCGTGATCCCAGCACCATATGCGATGTGCACGTTAGTG
CCACGAGCATCAATCGTCTTGTGACTATTAATCATTAGCTCTTGGCTCAACCTAATGCTC
ATATCGTGCTTGAAAATGATCCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 9

CO CL425Contig1 853 9 40 U
GGGACTGGGGAGAGAGAGATCAGAAAA*GTGATGTCTATGGCTACTTCCACTCACCTATC
TTCTTCTGCCTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGC
GGCTGCGACGATCAGCGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTATC
CCAACGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCCGTTGACATCAATGAACCGGT
GAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTT
AGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGA
AGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTT
AGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGC
ATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGG
AAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTAT
CCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCCAA
AACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTAT
TCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATTTAATCATATTCCTTGATGTATCAATCTCGTTAA
AAAAAATACTTAATATGTAAATTTAAACTCGGTGTAATCACCCCTTTTGACTTTAGATAA
ACCATCCATTATC


BQ
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 
25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF60TF U 4
AF RR4DS02TF U 32
AF RR4B328JQ C 1
AF RR4G345JQ C 148
AF RR4BZ32TF U 1
AF RR4B328TF U 1
AF RR4G345TF U 1
AF RR4BZ32JQ C 116
AF RR4DF60JQ C 219
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BS 49 49 RR4BZ32TF
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RD RR4DF60TF 653 0 0
GGG
GGGGAGAGAGAGATCAGAAAA*GTGATGTCTATGGCTACTTCCACTCACCTATCTTCTTC
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ATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTTAGAGCC
AGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCA
CTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAGGGCT
TCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCATCCTC
TGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCT
AGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATC
CAATCTGCCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAG

QA 4 653 4 653
DS 

RD RR4DS02TF 715 0 0
GG
GTCTATGGCTACTTCGACTCACCTATCTTCTTCTGCCTCTTTGTTTCACTCTCAAATTAC
CAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGCGGCTGCGACGATCAGCGTTCATGGTTTCTCGCC
ACGTAGGCTAAAGTCTCTCTCTTTATCCCAACGTTCTTCCATCTCGGCTTTGTCTGCTTC
CTCCGCCGTTGACCTCAATGAACCGGTGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTCCGAGT
AGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGAT
TGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTG
TGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGA
TTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACT
TATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAGCCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACC
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CCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCCAAAACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAA*
CAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGAT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR4B328JQ 834 0 0
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AGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGA
AGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTT
AGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGC
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AAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTAT
CCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCCAA
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TCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATTTAATCATATTCCTTGATGTATCAATCTCGTTAA
AAAAAATACTTAATGTGTAAATTTAAACTCGGTGTAATCCCCCCTTTTGACTTT

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DS 

RD RR4G345JQ 682 0 0
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TGCTTCCTCCGCCGTTGACATCAATGAACCGGTGAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTT
TCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGG
AGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCT
CCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTT
CCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGT
GAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACA
GAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGG
TGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCCAAAACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGG
AGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATT
TAATCATATTCCTTGATGTATCAATCTCGTTAAAAAAAATACTTAATATGTAAATTTAAA
CTCGGTGTAATCACCCCTTT
CG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4BZ32TF 785 0 0
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TTCTTCTGCCTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGC
GGCTGCGACGATCAGCGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTATC
CCAACGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCCGTTGTCATCAATGAACCGGT
GAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTT
AGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGAT*TCCCTCACGATAGAGGCTGCGA
AGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTT
AGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGC
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AAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTAT
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A*CACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAA*CAGAAGCATTGCAGCTCACGCTGTTAT
*CTCCTCATGAA*AAGTGAGTCAGATTTAATCATATTCCTTGATGTATCA*TCTCGTTAA
AAAAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4B328TF 834 0 0
GGGACTGGGGAGAGAGAGATCAGAAAA*GTGATGTCTATGGCTACTTCCACTCACCTATC
TTCTTCTGCCTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGC
GGCTGCGACGATCAGCGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTATC
CCAACGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCCGTTGACATCAATGAACCGGT
GAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTT
AGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGA
AGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTT
AGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGC
ATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGG
AAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTAT
CCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCCAA
AACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTAT
TCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATTTAATCATATTCCTTGATGTATCAATCTCGTTAA
AAAAA*TACTTAATGTGTAAATTTAAACTCGGTGTAATCACCCCTTTTGACTTT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4G345TF 785 0 0
GGGACTGGGGAGAGAGAGATCAGAAAA*GTGATGTCTATGGCTACTTCCACTCACCTATC
TTCTTCTGCCTCTTTGTTTT*CTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGC
GGCTGCGACGATCAGCGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTATC
CCAACGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCCGTTGACATCAATGAACCGGT
GAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCATAGGTT
AGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGA
AGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTT
AGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGC
ATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGG
AAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTAT
CCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCCAA
A*CACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAA*CAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTAT
TCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATTTAATCATATTCCTTGATGTATCAATCTCGTTAA
AAAAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4BZ32JQ 724 0 0
GCCGCGGCTGCGACGATCAGCGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCGAAAGTCTCTCTCT
TTATCCCAACGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCCGTTGTCATCAATGAA
CCGGTGAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCAT
AGGTTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGAT*TCCCTCACGATAGAGGC
TGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGA
GCGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGA
GCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAG
ATAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAG
ACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAA
GCCAAAACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCACGCT
GTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATTTAATCATATTCCTTGATGTATCAATCTC
GTTAAAAAAAATACTTAATATGTAAATTTAAACTCGGTGTAATCACCCCTTTTGACTTT
AGACG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4DF60JQ 635 0 0
CCGTTGACATCAATGAACCGGTGAAGAAATCAACCAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTC
ACGGGTTCGATCTGCATAGGTTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATCATCGGAGGGATTGATA
TCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTCCATTGTGTGG
TGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTG
ATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAGACTTATGG
ACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGA
TAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGCCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTT
CTGTTGTGAACTTGAAAGCCAAAACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAA
GCATTGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCAGATTTAATCATATTC
CTTGATGTATCAATCTCGTTAAAAAAAATACTTAATATGTAAATTTAA*CTCGGTGTAAT
CATCCCTTTTGACTTTAGATAAACCATCCATTATC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 8

CO CL426Contig1 1463 8 13 U
GTACAAACAAAGCTTGTAATCGCGGTACAATGCAAACTGTGATGCAACAAGATGATTGTT
GTTACTAGAATAATAAAAGTGGTAGTGATTATTTTAGACAAATCCGTGGTTTCAATATTT
TCTATAACTAACACACTCAAGTTTATCTGCTCTCGCATTACATTGAGATATCTGATATTG
CAGGCCTAGTGAAATATGGTGGGCTTTGCTTTGAAAAACTTTCTTGAAGTGTCCTCAAAC
AGCTTGGACAAGCTCAAACTCATTACCATCTGGGAGCTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAA
TATAATTTCTCAGAGAAGGAGACTGAGTAAGACCATCCGGTGCAACAGTGGTGTTCTGAG
TTCCATTCTTCTGCTTCATCCTTCTCCGTGCTATGTAGCCTCTGACCCAAGGAGTTACAT
CCTCGTTGGTCTTGATCATGATGAAGAAGATGATTCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAA
TCACAGTGAGGTTAATCCATTTTGATCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTCTCAAGAA
CGTATTCACCTGGAATCTTGAAAGCACTTCCCTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGAT
CATTCTGGTATTGACCTTGTAGCGCCCAGAAGTGGAAGCTAATGTATGACATAGGGTAAC
GCCAGAAAGGTTTAGGGATGTCATTTGGAAGCCTGAAGAATCCAGAAACCAGCATGAAGA
TCCCCTGAATCCCAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATGCTAGCTA
TCGCCATCATCAAGCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAGCAAAGAAGA
GATAGTGAGTGAATCCTGGATGCAACCCCACCATGAAGTAACAAATCGTCCCGGAGATGA
AAGTTATGATGATCAAGAACGGTGTTGCAGCTAGTGTGTTGGCTATCACAAACGCAGCTA
CTCCGTAGTGACCGTTCAGTCTCTCTCTTTGGAAGACCTTCATGTCTCCAACAAACGAAG
GAAACCCTCCGATTGACATGAATGTTACAAAGCCAAAGACGAAAGACGCACATGAACCTC
GTGCCAGAATGGCGCTGTAGCTAGTGCCAACGTTCCAATAGATGGTTCCAATGCAGAATG
TGACCAAGATGTAAATAAGGAGTCTGAGCCAGTAATATCCAAAGTCCCTTGACATGTTGA
TGAAGGACCGCTTTGTTAGAGTGTAGGTCTGGAGAAGGAAACTAGCCTGGCTGCCTCCAG
AGTCAAGAATAGTCCCTTTATATTGTGATATCTCCTCAACCTTGGCTTTTGCATTGTAAT
AGTAGTCAGAAGTGTGGTAGTAGTCCACCAAGAGTCTAATAGCTTCGGTTGTGGTAATCT
TCTCCAGAGGATCATCGCTTGCTTCAAACCTTAGCTTCATAGAGCCTTTCAGAGTGGCTC
TAACTTTGTCAAAATCTGAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F035JQ U 1
AF RR4FZ59JQ U 96
AF RR4FZ59TF C 96
AF RR4CZ12JQ U 96
AF RR4GX27JQ U 72
AF RR4F035TF C 330
AF RR4GX27TF C 594
AF RR4ES09TF C 669
BS 1 297 RR4F035JQ
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BS 299 312 RR4F035JQ
BS 313 313 RR4GX27JQ
BS 314 314 RR4F035JQ
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BS 316 516 RR4F035JQ
BS 517 881 RR4GX27JQ
BS 882 928 RR4F035TF
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BS 1325 1463 RR4ES09TF

RD RR4F035JQ 516 0 0
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GTTACTAGAATAATAAAAGTGGTAGTGATTATTTTAGACAAATCCGTGGTTTCAATATTT
TCTATAACTAACACACTCAAGTTTATCTGCTCTCGCATTACATTGAGATATCTGATATTG
CAGGCCTAGTGAAATATGGTGGGCTTTGCTTTGAAAAACTTTCTTGAAGTGTCCTCAAAC
AGCTTGGACAAGCTCAAACTCATTACCATCTGGGAGCTCCTCCATTGGTTCGTGTAGTAA
TATAATTTCTCAAAAAAGGAGACTGAGTAAGACCATCCGGTGCAACAGTGGTGTTCTGAG
TTCCATTCTTCTGCTTCATCCTTCTCCGTGCTATGTAGCCTCTGACCCAAGGAGTTACAT
CCTCGTTGGTCTTGATCATGATGAAGAAGATGATTCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAA
TCACAGTGAGGTTAATCCATTTTGATCGGTGCAAGT

QA 1 516 1 516
DS 

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G
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GGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGGTTAATCCATTTTGATCGGTGCAAGT
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C

QA 2 479 2 479
DS 

RD RR4FZ59TF 480 0 0
G
GACAAATCCGTGGTTTCAATATTTTCTATAACTAACACACTCAAGTTTATCTGCTCTCGC
ATTACATTGAGATATCTGATATTGCAGGCCTAGTGAAATATGGTGGGCTTTGCTTTGAAA
AACTTT**TGAAGTGTCCTCAAACAGCTTGGACAAGCTCAAACTCATTACCATCTGGGAG
CTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAATATAATTTCTCAGAGAAGGAGACTGAGTAAGACCAT
CCGGTGCAACAGTGGTGTTCTGAGTTCCATTCTTCTGCTTCATCCTTCTCCGTGCTATGT
AGCCTCTGACCCAAGGG***ACATCCTCGTTGGTCTTGATCATGATGAAGAAGATGATTC
GGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGGTTAATCCATTTTGATCGGTGCAAGT
TGATCTGGAAGACGTTCTCAAGAACGTATTCACCTGGAATCTTGAAAGCACTTCCCTG
C

QA 2 479 2 479
DS 

RD RR4CZ12JQ 658 0 0
A
GACAAATCCGTGGTTTCAATATTTTCTATAACTAACACACTCAAGTTTATCTGCTCTCGC
ATTACATTGAGATATCTGATATTGCAGGCCTAGTGAAATATGGGGGGCTTTGCTTTGAAA
AACTTTCTTGAAGTGTCCTCAAACAGCTTGGACAAGCTCAAACTCATTACCATCTGGGAG
CTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAATATAATTTCTCAGAGAAGGAGACTGAGTAAGACCAT
CCGGTGCAACAGTGGTGTTCTGAGTTCCATTCTTCTGCTTCATCCTTCTCCGTGCTATGT
AGCCTCTGACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTCTTGATCATGATGAAGAAGATGATTC
GGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGGTTAATCCATTTTGATCGGTGCAAGT
TGATCTGGAAGACGTTCTCAAGAACGTATTCACCTGGAATCTTGAAAGCACTTCCCTGGC
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AGCTAATGTATGACATAGGGTAACGCCAGAAAGGTTTAGGGATGTCATTTGGAAGCCTGA
AGAATCCAGAAACCAGCATGAAGATCCCCTGAATCCCAGCTCCAATGATGATACCCA

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR4GX27JQ 813 0 0
AG
TAAAAGTGGTAGTGATTATTTTAGACAAATCCGTGGTTTCAATATTTTCTATAACTAACA
CACTCAAGTTTATCTGCTCTCGCATTACATTGAGATATCTGATATTGCAGGCCTAGTGAA
ATATGGTGGGCTTTGCTTTGAAAAACTTTCTTGAAGTGTCCTCAAACAGCTTGGACAAGC
TCAAACTCATTACCATCTGGGAGCTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAATATAATTTCTCAG
AGAAGGAGACTGAGTAAGACCATCCGGTGCAACAGTGGTGTTCTGAGTTCCATTCTTCTG
CTTCATCCTTCTCCGTGCTATGTAGCCTCTGACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTCTT
GATCATGATGAAGAAGATGATGCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGGTT
AATCCATTTTGATCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTCTCAAGAACGTATTCACCTGG
AATCTTGAAAGCACTTCCCTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTATTG
ACCTTGTAGCGCCCAGAAGTGGAAGCTAATGTATGACATAGGGTAACGCCAGAAAGGTTT
AGGGATGTCATTTGGAAGCCTGAAGAATCCAGAAACCAGCATGAAGATCCCCTGAATCCC
AGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATGCTAGCTATCGCCATCATCAA
GCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAGCAAAGAAGAGATAGTGAGTGAA
TCCTGGATGCAACCCCACCATGAAGTAA
AAA

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR4F035TF 657 0 0
AGACCATCCGGTGCAACAGTGGTGTTCTGAGTTCCATTCTTCTGCTTCATCCTTCTCCGT
GCTATGTAGCCTCTGACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTCTTGATCATGATGAAGAAG
ATGATTCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGGTTAATCCATTTTGATCGG
TGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTCTCAAGAACGTATTCACCTGGAATCTTGAAAGCACTT
CCCTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTATTGACCTTGTAGCGCCCAG
AAGTGGAAGCTAATGTATGACATAGGGTAACGCCAGAAAGGTTTAGGGATGTCATTTGGA
AGCCTGAAGAATCCAGAAACCAGCATGAAGATCCCCTGAATCCCAGCTCCAATGATGATA
CCCATGAGGAAGTTTGGAACAATGCTAGCTATCGCCATCATCAAGCTCTCCACAACGGTG
ACACTTGCATAGAGGCAGAGAACAAAGAAGAGATAGTGAGTGAATCCTGGATGCAACCCC
ACCATGAAGTAACAAATCGTCCCGGAGATGAAAGTTATGATGATCAAGAACGGTGTTGCG
GCTAGTGTGTTGGCTATCACAAACGCAGCTACTCCGTAGTGACCGTTCAGTCTCTC
C

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4GX27TF 733 0 0
CTCAGATCATTCTGGTAT*GAC*TTGTAGCGCCCAGAAGTGGAAGCTAATGTATGACATA
GGGTAACGCCAGAAAGGTTTAGGGATGTCATTTGGAAGC*TGAAGAATCCAGAAACCAGC
ATGAAGATCCCCTGAATCCCAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATG
CTAGCTATCGCCATCATCAAGCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAGCA
AAGAAGAGATAGTGAGTGAATCCTGGATGCAACCCCACCATGAAGTAACAAATCGTCCCG
GAGATGAAAGTTATGATGATCAAGAACGGTGTTGCAGCTAGTGTGTTGGCTATCACAAAC
GCAGCTACTCCGTAGTGACCGTTCAGTCTCTCTCTTTGGAAGACCTTCATGTCTCCAACA
AACGAAGGAAACCCTCCGATTGACATGAATGTTACAAAGCCAAAGACGAAAGACGCACAT
GAACCTCGTGCCAGAATGGCGCTGTAGCTAGTGCCAACGTTCCAATAGATGGTTCCAATG
CAGAATGTGACCAAGATGTAAATAAGGAGTCTGAGCCAGTAATATCCAAAGTCCCTTGAC
ATGTTGATGAAGGACCGCTTTGTTAGAGTGTAGGTCTGGAGAAGGAAACTAGCCTGGCTG
CCTCCAGAGTCAAGAATAGTCCCTTTATATTGTGATATCTCCTCAACCTTGGCTTTTGCA
TTGTAATAGTA
CC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4ES09TF 795 0 0
AGG
TTAGGGATGTCATTTGGAAGC*TGAAGAATCCAGAAACCAGCATGAAGATCCC*TGAATC
CCAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATGCTAGCTATCGCCATCATC
AAGCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAACAAAGAAGAGATAGTGAGTG
AATCCTGGATGCAACCCCACCATGAAGTAACAAATCGTCCCGGAGATGAAAGTTATGATG
ATCAAGAACGGTGTTGCAGCTAGTGTGTTGGCTATCACAAACGCAGCTACTCCGTAGTGA
CCGTTCAGTCTCTCTCTTTGGAAGACCTTCATGTCTTCAACAAACGAAGGAAACCCTCCG
ATTGACATGAATGTTACAAAGCCAAAGACGAAAGACGCACATGAACCTCGTGCCAGAATG
GCGCTGTAGCTAGTGCCAACGTTCCAATAGATGGTTCCAATGCAGAATGTGACCAAGATG
TAAATAAGGAGTCTGAGCCAGTAATATCCAAAGTCCCTTGACATGTTGATGAAGGACCGC
TTTGTTAGAGTGTAGGTCTGGAGAAGGAAACTAGCCTGGCTGCCTCCAGAGTCAAGAATG
GTCCCTTTATATTGTGATATCTCCTCAACCTTGGCTTTTGCATTGTAATAGTAGTCAGAA
GTGTGGTAGTAGTCCACCAAGAGTCTAATAGCTTCGGTTGTGGTAATCTTCTCCAGAGGA
TCATCGCTTGCTTCAAACCTTAGCTTCATAGAGCCTTTCAGAGTGGCTCTAACTTTGTCA
AAATCTGAGTTC

QA 4 795 4 795
DS 



AS 1 10

CO CL427Contig1 806 10 10 U
ATCACGCAAACCAAAATAACTCTTTAAATAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATATT
CTCTAATTCGTACAAGTTCGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACAACAACGAACAATG
CAGATCTTTCTCATTATCGTCTCACTACTTTTAGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGC
TGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCAC
TGAAACAAGTGATCCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGG
AGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGC
TGCCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAAC
CTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGA
TCTTGATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAG
AGTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACG
CTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCAT
TTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAG
CTTAGCTAAGGGGATCGCCATGGTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAG
ATCTGTGATTGATTGATTTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 30 60 60 60 60 35 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 55 45 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 25 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4C324JQ U 4
AF RR4BZ11JQ U 4
AF RR4BO92JQ U 36
AF RR4CB93JQ U 41
AF RR4DS59JQ U 1
AF RR4BO92TF C 12
AF RR4C324TF C 83
AF RR4BZ11TF C 121
AF RR4CB93TF C 14
AF RR4DS59TF C 78
BS 1 117 RR4DS59JQ
BS 118 118 RR4C324JQ
BS 119 144 RR4DS59JQ
BS 145 147 RR4C324JQ
BS 148 300 RR4DS59JQ
BS 301 301 RR4C324JQ
BS 302 732 RR4DS59JQ
BS 733 733 RR4BO92TF
BS 734 798 RR4DS59JQ
BS 799 806 RR4BO92TF

RD RR4C324JQ 724 0 0
G
CGCAAACCAAAATAACTCTTTAAATAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATATTCTCT
AATTCGTACAAGTTCGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACAACAACGAACAATGCAGA
TCTTTCTCATTATCGTCTCACTACTTTTAGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCA
TTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAA
ACAAGTGATC*AT*TTTTGCAAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGA
ATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCC
TTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTA
GCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTT
GATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGGGTC
ACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCG
GCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCC
GAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTA
GCT

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR4BZ11JQ 723 0 0
G
CGCAAACCAAAATAACTCTTTAAATAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATATTCTCT
AATTCGTACAAGTTCGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACAACAACGAACAATGCAGA
TCTTTCTCATTATCGTCTCACTACTTTTAGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCA
TTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAA
ACAAGTGATC*AT*TTTTGCAAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGA
ATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCC
TTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTA
GCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTT
GATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGGGTC
ACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCG
GCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCC
GAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTA
GC

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR4BO92JQ 691 0 0
CTGCAACACCAAAATCAAGTATATTCTCTAATTCGTACAAGTTCGGAAACTGTGCTTTAA
CTGCTAAACACAACAACGAACAATGCAAATCTTTCTCATTATCGTCTCACTACTTTTAGC
GTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATA
CGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATCCATATTTTGCCAGCACCCTCT
TTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTG
GAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAG
AAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATAC
CTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTT
TCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGT
AGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTT
TCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGA
GAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4CB93JQ 685 0 0
ACACCAAAATCAAGTATATTCTCTAATTCGTACAAGTTCGGAAACTGTGCTTTAACTGCT
AAACACAACAACGAACAATGCAGATCTTTCTCATTATCGTCTCACTACTTTTAGTGTTTC
TTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAAC
AAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATCCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCC
AGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTT
GAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCA
CCATAGAAGAGTCCTTTAGCCTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCT
GCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTA
TCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATG
TCGAAAGAAACGAGGACACGCTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTG
TGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACC
GCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4DS59JQ 805 0 0
ATCACGCAAACCAAAATAACTCTTTAAATAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATATT
CTCTAATTCGTACAAGTTCGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACAACAACGAACAGTG
CAGATCTTTCTCATTATCGTCTCA***CTTTTAGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGC
TGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCAC
TGAAACAAGTGATCCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGG
GGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGC
TGCCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAAC
CTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGA
TCTTGATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAG
AGTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACG
CTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCAT
TTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAG
CTTAGCTAAGGG*ATCGCCATGGTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAG
ATCTGTGATTGATTGATT
CTCTCCC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4BO92TF 795 0 0
CC
AAATAACTCTT*AAATAGTC*TCTGCAACACCAAA*TCAAGTATAT*CTCTAAT*CGTAC
AAGT*CGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACA*CAACGAACAATGCAGATCTTTCTCA
TTATCGTCTCACTACTTTTAGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTT
GAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGAT
CCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCG
AGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCCTTTGTGGGG
ATGCGGAAAGTAACCACAGCAGAAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTAGCCTCTAAT
TCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGATGTGTTT
CCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATAC
GCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCGGCGCCGGAT
TTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCG
AACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGCTAAGGGG
ATCGCAACGGTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAGATCTGTGATTGAT
TGATTTCTCTCCC

QA 3 795 3 795
DS 

RD RR4C324TF 722 0 0
AACTGTGCTTTA*CTGCTAAACACA*CAACGAACAATGCAGATCTTTCTCAT*ATCGTCT
CACTACTTT*AGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAGGTGTT
GCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATC*AT*TTTT
GCAAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGG*TCTGTTGGAGGAATGTCCGCGAGGATGTCT
AGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCCTTTGTGGGGATGCGGAAA
GTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTAGCCTCTAATTCGAAAGAA
TGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGATGTGTTTCCATTAACA
ACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGGGTCACATCATACGCCGTCGCA
GATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCGGCGCCGGATTTGAGCCTG
TTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCG
GAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGCTAAGGGGATCGCCATG
GTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAGATCTGTGATTGATTGATTTCTC
CC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4BZ11TF 684 0 0
CAGATCTTTCTCATTATCGTCTCACTACTTT*AGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGC
TGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCAC
TGAAACAAGTGATC*AT*TTTTGCAAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGG
AGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGC
TGCCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAAC
CTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGA
TCTTGATGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAG
GGTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACG
CTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCAT
TTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAG
CTTAGCTAAGGGGATCGCCATGGTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAG
ATCTGTGATTGATTGATTTCTC
CC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4CB93TF 791 0 0
AAATAACTCTTTAAATAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATAT*CTCTAATTCGTAC
AAGTTCGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACAACAACGAACAATGCAGATCTTTCTCA
TTATCGTCTCACTACTTTTAGTGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTT
GAAGGTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGAT
CCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCG
AGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCCTTTGTGGGG
ATGCGGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAGCCTTAGCCTCTAAT
TCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGATGTGTTT
CCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATAC
GCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCGGCGCCGGAT
TTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCG
AACGAAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGCTAAGGGG
ATCGCC**GGTGTTTGATCTTTCGAAGA*GATGAAGATGCGAAACAGATCTGTGATTGAT
TGATTTCTC
CC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4DS59TF 729 0 0
TCGGAAACTGTGCTTTAACTGCTAAACACAACAACGAACAGTGCAGATCTTTCTCATTAT
CGTCTCA***CTTTTAGCGTTTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAG
GTGTTGCTACCAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATCCAT
ATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGGGGAATGTCCGCGAGGA
TGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCTGCCTTTGTGGGGATGC
GGAAAGTAACCACAGCAGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTAGCCTCTAATTCGA
AAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGATGTGTTTCCAT
TAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATACGCCG
TCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAAGAAACGAGGACACGCTCGGCGCCGGATTTGA
GCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCGAACG
AAGCGGAGACGAGCATGAGAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGCTAAGGGGATCG
CCATGGTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAGATCTGTGATTGATTGAT
TTCTC
TCCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 8

CO CL428Contig1 762 8 15 U
GGGGGTCGGTAGCGTACGGACAGGGATATTTATATATCGTCGGCAGCAAAAGTATATAAA
AAGGGGACAAAGAAATCGATGAATCTTTTTTTTTCTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGG
GTTCGTTATCAGCAATGATTCCAGCGAAGAGTTCCGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATT
TGTCAGAGGATCTTCGAATGTATAATGAAGAGTGGGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCG
ACTTCTCGAAACTCCGTCACAAATTCGACACAGGAGCTGTGGATCTCAACGACGATAACC
TGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTA
TCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCTTGAGTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAA
ACTACCACCCATCCGCTGGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGATACTG
CAGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAGGCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGGATACTC
AAGTT*ATCTCTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTA
TGAATGGGAAGAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTC
AGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAAGTGTTGTTGCTACAAAAGCCACTACT
ATTTACATCAGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 

AF RR4CM35TF U 287
AF RR4AJ55JQ C 1
AF RR4BL19TF U 513
AF RR4BL19JQ C 95
AF RR4C657JQ C 95
AF RR4C657TF U 191
AF RR4CM35JQ C 96
AF RR4AJ55TF U 1
BS 1 190 RR4AJ55TF
BS 191 283 RR4C657TF
BS 284 284 RR4AJ55TF
BS 285 286 RR4C657TF
BS 287 395 RR4CM35TF
BS 396 524 RR4C657TF
BS 525 545 RR4BL19TF
BS 546 546 RR4C657TF
BS 547 553 RR4BL19TF
BS 554 554 RR4C657TF
BS 555 619 RR4BL19TF
BS 620 620 RR4C657TF
BS 621 741 RR4BL19TF
BS 742 761 RR4C657TF
BS 762 762 RR4AJ55TF

RD RR4CM35TF 113 0 0
CAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTT
GACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCTT
TGAG

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR4AJ55JQ 762 0 0
GGGGGTCGGTAGCGTACGGACAGGGATATTTATATATCGTCGGCAGCAAAAGTATATAAA
AAGGGGACAAAGAAATCGATGAATCTTTTTTTTTCTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGG
GTTCGTTATCAGCAATGATTCCAGCGAAGAGTTCCGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATT
TGTCAGAGGATCTTCGAATGTATAATGAAGAGTGGGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCG
ACTTCTCGAAACTCCGTCACAAATTCGACACAGGAGCTGTGGATCTCAACGACGATAACC
TGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTA
TCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCTTGAGTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAA
ACTACCACCCATCCGCTGGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGATACTG
CAGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAGGCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGGATACTC
AAGTT*ATCTCTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTA
TGAATGGGAAGAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTC
AGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAAGTGTTGTTGCTACAAAAGCCACTACT
ATTTACATCAGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGTGTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BL19TF 229 0 0
GGTTCCGCTACT
TTGCCTATGGATACTCAAGTTTATCTCTTTGCTGCCCTAAACCCTCTTGAATGTTTTCCA
CCACTGCCGCTCTCTATGAATGGGAAGAATAAAAAAGTCGGTTACTGTTATCTTGTTCCT
TTAACTTCTATATGTCAGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAAGTGTTGTTGC
TACAAAAGCCACTACTATTTACATCAGCTACTTATGG

QA 13 229 13 229
DS 

RD RR4BL19JQ 647 0 0
CTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGGGTTCGTTATCAGCAATGATTCCAGCGAAGAGTTC
CGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATTTGTCAGAGGATCTTCGAATGTATAATGAAGAGTG
GGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCGACTTCTCGAAACTCCGTCACAAATTCGACACAGG
AGCTGTGGATCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCT
GCCCACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCT
TGAGTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCCATCCGCTGGAGTCACCTACTACAT
CACATTCGAAGCCAATGATGATACTGCAGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAGGCAGT
GGTTCGCTACTTGCCTATGGATACTCAAGTT*ATCTCTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGA
ATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTATGAATGGGAAGAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTA
TCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAA
GTGTTGTTGCTACAAAAGCCACTACTATTTACATCAGCTACTTATGG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4C657JQ 667 0 0
CTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGGGTTCGTTATCAGCAATGATTCCAGCGAAGAGTTC
CGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATTTGTCAGAGGATCTTCGAATGTATAATGAAGAGTG
GGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCGACTTCTCGAAACTCCGTCACAAATTCGACACAGG
AGCTGTGGATCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCT
GCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCT
TGAGTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCCATCCGCTGGAGTCACCTACTACAT
CACATTCGAAGCCAATGATGATACTGCAGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAGGCAGT
GGTTCGCTACTTGCCTATGGATACTCAAGTT*ATCTCTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGA
ATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTA**AATGGGAAGAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTA
TCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAA
GTGTTGTTGCTACAAAAGCCACTACTATTTACATCAGCTACTTATGGAATATGTTGTTGT
TTCGTGT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4C657TF 571 0 0
TCTTCGAATGTATAATGAAGAGTGGGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCGACTTCTCGAA
ACTCCGTCACAAATTCGACACAGGAGCTGTGGACCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGA
CCCTGATGATACCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCA
CAAATACGAGACGGGTATAAGCCTTGAGTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCC
ATCCGCTGGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGATACTGCAGATGGTAA
TCAGACTAAACAGTATCAGGCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGGATACTCAAGTT*ATCT
CTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTA**AATGGGAA
GAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTTAG
TTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAAGTGTTGTTGCTACAAAAGCCACTACTATTTACATCA
GCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGTGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4CM35JQ 665 0 0
GG
AATCAATCGAGAAGAGAGTTAGGGTTCGTTATCAGCAATGATTCCAGCGAAGAGTTCCGA
TGATTTCAGTTGGGAGAAAGATTTGTCAGAGGATCTTCGAATGTATAATGAAGAGTGGGA
TAAGAGCGGGGGTTTCGATATCGACTTCTCGAAACTCCGTCACAAATTCGACACAGGAGC
TGTGGATCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCTGCT
CACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCTTGA
GTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCCATCCGCTGGAGTCACCTACTACATCAC
ATTCGAAGCCAATGGTGATACTGCAGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAGGCAGTGGT
TCGCTACTTGCCTATGGATACTCAAGTT*ATCTCTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGAATG
TTTTCCACCACTGCCGCTCTCTATGAATGGGAAGAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTATCT
TGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAAGTG
TTGTTGCTACAAAAGCCACTACTATTTACATCAGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTC
GTG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR4AJ55TF 762 0 0
GGGGGTCGGTAGCGTACGGACAGGGATATTTATATATCGTCGGCAGCAAAAGTATATAAA
AAGGGGACAAAGAAATCGATGAATCTTTTTTTTTCTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGG
GTTCGTTATCAGCAATGATTCCAGCGAAGAGTTCCGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATT
TGTCAGAGGATCTTCGAATGTATAATGAAGAGTGGGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCG
ACTTCTCGAAACTCCGTCACAAATTCGACACAGGAGCTGTGGATCTCAACGACGATAACC
TGGTTCTTGACCCTGATGATACCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTA
TCACGCACCACAAATACGAGACGGGTATAAGCCTTGAGTTTGTCAAGGTCTTGAAAGCAA
ACTACCACCCATCCGCTGGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGATACTG
CAGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAGGCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGGATACTC
AAGTT*ATCTCTT*GCTGCCCTAAACCCTCTTGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTA
TGAATGGGAAGAATAAAAA*GTCGGTTACTGTTATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTC
AGACTTTTAGTTGTTTCACTATGGCTTTTGCCAAGTGTTGTTGCTACAAAAGCCACTACT
ATTTACATCAGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGTGTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 2 8

CO CL429Contig1 1197 2 2 U
GTAGACTAATTAACTTTCGAATAGAGATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTGGCTGGATCA
ATCAGAATACTCAACAGCCCCTTAAGACGTCCAAGAGATCTAAGAATTGTAAATCTAGTT
CAGTTTCAGAAGAAGATAGGTATATTCAGGGACCATGGTATTGGGATCTTGATTTAAGCC
CTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAGATCTATGCCGCTGCTTACTA
CCGATCCTAGGTACTATGACATGGATGAACTGGTGAGGCAAGACAGTCTTTGGAATTCTG
AATATAAAAAACATCCATGGAACGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAAAAAGG
GTCTTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGTCTTCGAGA
TGTTCACTAATCCTAGAAATCTGGGAGTCTTCCATTCAATGGGGAAGTACAAGAACCATT
GGCGCACACGTTTGGACACAATAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGA
TCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTCAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATCCCAA
TACATTTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTATCGCAACATATAAGAAAGTGAAAG
TGAAGCACATGAATGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATGGATCCACTGTACGTAGATCAGA
AACGTTTGTGCAAGTCTAGGTCGAGGATTAGTGAAGAAGAGTACAAAAAATGTAGCGGCG
GTAAAGGAAGGATTGGCTCAAAGGTGACAATGGAGCATGTATTTGAGCCATCTTCTCTTC
TTAATGTGCCACCGGTTTCTTGGTTTATCCATGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAGACTT
TGATCCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCATGATGAACAAAATGGAGGTCTTGAACCCAG
CTGGCGGTAAATAAACAAAAAGAATCAAGTATTAAATGTTTGGATTATATTGAGTGAGGA
TCAATATCTAGCTATCCACGTCACTAAAACAATCACCAAATCAGTACACAATTTATGTAA
ATGCCATCTGGATTATATTGAGTGAGGATCAATATCTAACAATCCATGATCGACCAATCA
GAATACAGTTTATGTAAATGCAATTTTCTAATTAAATAATAAATTATTTATTAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD50TF U 1
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CTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAGATCTATGCCGCTGCTTACTA
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AATATAAAAAACATCCATGGAACGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAAAAAGG
GTCTTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGTCTTCGAGA
TGTTCACTAATCCTAGAAATCTGGGAGTCTTCCATTCAATGGGGAAGTACAAGAACCATT
GGCGCACACGTTTGGACACAATAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGA
TCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTCAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATCCCAA
TACATTTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTATCGCAACATATAAGAAAGTGAAAG
TGAAGCACATGAATGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATGGATCCACTGTACGTAGATCAGA
AACGTTTGTGCAAGTCTAGGTCGAGGATTAGTGAAGAAGAGTAC

QA 1 764 1 764
DS 

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CAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTCA
GATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATCCCAATACATTTAATCATCGATGAAAACC
ATCAAAAAGTTATCGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCACATGAATGTGTTTGAGG
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GGATTAGTGAAGAAGAGTACAAAAAATGTAGCGGCGGTAAAGGAAGGATTGGCTCAAAGG
TGACAATGGAGCATGTATTTGAGCCATCTTCTCTTCTTAATGTGCCACCGGTTTCTTGGT
TTATCCATGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAGACTTTGATCCAAGATCTTAGAGAACATG
TAATCATGATGAACAAAATGGAGGTCTTGAACCCAGCTGGCGGTAAATAAACAAAAAGAA
TCAAGTATTAAATGTTTGGATTATATTGAGTGAGGATCAATATCTAGCTATCCACGTCAC
TAAAACAATCACCAAATCAGTACACAATTTATGTAAATGCCATCTGGATTATATTGAGTG
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TTTCTAATTAAATAATAAATTATTTATTAGTTT

QA 1 813 1 813
DS 



CO CL429Contig2 773 6 8 U
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ATCGATGATTAGATGTATTGGGATAATCCCATTATACCCAAGTATCTTCCATCTCAAAAC
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BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU13JQ U 9
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QA 1 643 1 643
DS 

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CTTGGAGCAAAGCCTTGGTGACTTTGACGGCGATACCACGGATGAACCAAGAAACCGGTG
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TGTGCATCACTTTCACTTTCTTATATGTTGCTGTAACTTTTTGATGGTTTTCATCGATGA
T*AGATGTATTGGGATAATCCCATTATACCCAAGTATCTTCCATCTCAAAACCTTTTCCA
CTTCCGTGATCTGCCTTGGTCCATCCTTCTTTAAAATCTTTGTTGCTAATGTGTCCAAAC
GTGTGCGCCAATTGTTCTTGTACTTGCCCATTGAATGGAAAAA

QA 1 643 1 643
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QA 1 165 1 165
DS 

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TCATGTGCATCACTTTCACTTTCTTATATGTTGCTGTAACTTTTTGATGGTTTTCATCGA
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GATC
TCTTGGACGTCGTCTGA

QA 6 669 6 669
DS 

RD RR4C442JQ 739 0 0
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TCCGATTCTTTTAGTTCAGATTCTTTTTCGGCTTCTATTTTTTTTT**GACTTCTTCTAC
TACTTTAGCATACACCAGCGGGTCTACCGTCTTCATTTTGTTCATGGTGATTACATGTTC
TCTAAGATCTTGGAGCAAAGCCTTGGTGACTTTGACGGCGATACCACGGATGAACCAAGA
AACCGGTGGCACATTAAGAAGCGAAGATGGCTGAAATATATGCTCCATTGTCACCTTTGA
CCCAATCCTTCCCTTACTGCCGCTACATTTTTTGTACTCTTCTTCACTAATCGGCGACCT
AGATTTGCACAACCGTTTCTGATCCACGTACAGTGGCTCTATTTTCCAGCTACCCTCAAA
CACTTTCATGTGCATCACTTTCACTTTCTTATATGTTGCTGTAACTTTTTGATGGTTTTC
ATCGATGATTAGATGTATTGGGATAATCCCATTATACCCAAGTATCTTCCATCTCAAAAC
CTTTTCCACTTCCGTGATCTGCCTTGGTCCATCCTTCTTTAAAATCTTTGTTGCTAATGT
GTCCAAACGTGTGCGCCAATTGTTCTTGTACTTGCCCATTGAATGGAAAAATCCCATATT
TCTTGGATCAGTGAACAACTCGAAGACAGCTTGAGGAGGAGATCCCAATGTGAAATCTAT
GTTTAAATGGCAAA
TGCCG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4FK25TF 674 0 0
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GATACCACGGATGAACCAAGAAACCGGTGGCACATTAAGAAGCGAAGATGGCTGAAATAT
ATGCTCCATTGTCACCTTTGACCCAATCCTTCCCTTACTGCCGCTACATTTTTTGTACTC
TTCTTCACTAATCGGCGACCTAGATTTGCACAACCGTTTCTGATCTACGTACAGTGGCTC
TATTTTCCAGCTACCCTCAAACACTTTCATGTGCATCGCTTTCACTTTCTTATATGTTGC
TGTAACGTTTTTATGGTTTTCATCGATGATTAGATGTATTGGGATAGTCCCATTATACCC
AAGTATCTTCCATCTCAAAACCTTTTCCACTTCCGTTATCTGCCTTGGTCCATCCTTGTT
TAAAACCTTTGTTGCTAATGTGTCCAAACGTGTGCGCCAATTGTTCTTGTACTTGCCCAT
TGAATGGAAAGATCCCATATTTCTTGGATCAGTGAACAACTCGAAGACGGCTTGAGGAGG
AGATCCCAATGTGAAATCTATGCTTAAATGGCAAGTGCCGTTTTTTGTTTTCACCTTCAC
CTTAGCAGGTGCAC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 2 10

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ACAATAATATCTCTCTAAACAGGTTTTCGATAAATTAACAAGGGCGGCCGTGAGTATTGG
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CTGAAACCGATCATCTAG**CGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGG
TTTCTCCGGAGCTGTTTTCGGCACAGGCTGGTGGTTTTGGGTGGACGCCGTTGTGTGCAG
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GATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATG
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CTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAACTTACGAATGCC
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU14TF U 1
AF RR4D837TF U 121
AF RR4BW85JQ C 175
AF RR4BW85TF U 175
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BS 178 198 RR4EU14TF
BS 199 200 RR4D837TF
BS 201 255 RR4EU14TF
BS 256 256 RR4D837TF
BS 257 327 RR4EU14TF
BS 328 328 RR4D837TF
BS 329 330 RR4EU14TF
BS 331 331 RR4D837TF
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BS 334 334 RR4D837TF
BS 335 618 RR4EU14TF
BS 619 705 RR4D837TF
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BS 816 837 RR4D837TF
BS 838 900 RR4D837JQ

RD RR4EU14TF 618 0 0
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CTGAAACCGATCATCTAGAGCGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGG
TTTCTCCGGAGCTGTATTCGGCACAGGCTGGTGGTTTTGGGTGGACGCCGTTGTGTGCAG
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GATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATG
GAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTC
TGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGT
CGCCGGTGTCTTTCAATGTGTTTTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACA
CTCGGAGTAAGTAGACTT

QA 1 618 1 618
DS 

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GG
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GAAACCGATCATCTAG**CGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTT
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CCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTTCCCGGCATATTCGCATCTCTGGGAGCTTTGA
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GGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTG
TTGGTCTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTCG
CCGGTGTCTTTCAATGTGTTTTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACT
CGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAACTTACGAATGCCTC
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TTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGAAA*TAATCTTGAACTTTGTGTGAAT

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DS 

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G
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CCGGGTTTCTCCGGAGCTGTTTTCGGCACAGGCTGGTGGTTTTGGGTGGACGCCGTTGTG
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TGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTG
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CG

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DS 

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G
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CCGGGTTTCTCCGGAGCTGTTTTCGGCACAGGCTGGTGGTTTTGGGTGGACGCCGTTGTG
TGCAGCTCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTTCCCGGCATATTCGCATCTCTGGGA
GCTTTGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGC
GAATGGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCT
GCTTCTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACT
GGTGTCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTTTTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACA
TCACACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAACTTACGA
ATGCCTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGCTTGGTGTTG
TGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTG
GGTTAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGAAAATAATCTTGAACTTTGTG
CG

QA 2 658 2 658
DS 

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T
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GACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTTCCCGGCATATTC
GCATCTCTGGGAGCTTTGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCT
TACGACGAAGGCGAATGGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTT
GTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCT
TCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTTTTCGTATTGATAAGTGGGCTA
ATGTATTGGACATCACACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGT
GACAACTTACGAATGCCTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCC
AGTTTGGTGTTGTGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTC
GTTCTATGCTTGGGTTAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGAAAATAATCTTG
AACTTTGTGTGAATGTTATGGAACGCCTTGTCGAGGTCTCTGCTCCGTCTCTTAATTGCA
TTGGCGTGAAAGATTGG

QA 2 738 2 738
DS 



CO CL430Contig2 816 5 8 U
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GGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCAC
TACCTCCCCGGCATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAA
GATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATGGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATA
GCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCT
GTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTATTC
GTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCA
CATACAGATACATGTGGTGACAACTTACGAATGCCTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCT
TGTGTCTTTGTCTGGTCCAGTTTGGTGTTGTGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTG
TTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTTAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGAT
GGATAGAAAATAATCTTGAACTTTGTGTGAATGTTATGGAACGCCTTGTCGAGGTCTCTG
CTCCGTCTCTTAATTGCATTGGCGTGAAAGATTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW37TF U 1
AF RR4CI77TF U 23
AF RR4EI23TF U 24
AF RR4CI77JQ C 35
AF RR4EI23JQ C 97
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BS 226 226 RR4CI77TF
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RD RR4FW37TF 695 0 0
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GACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTTTCTCCGGAGCTGTATTCGGCACC
GGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATCCAATTTCCCTTCCTCCAC
TACCTCCCCGGCATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAA
GATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATGGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATA
GCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCT
GTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTATTC
GTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCA
CAT**AGATACATGTGGTGACAACTTACGAATGCCTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCT
TGTGTCTTTGTCTGGTCCAGTTTGGTGTTGTGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTG
TTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTTA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4CI77TF 641 0 0
G
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AGATCCGATCCGATCTGAAACCGATCATCTGGAGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGAT
TTTCGGGCCGGGTTTCTCCGGAGCTGTATTCGGCACCGGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGC
CGTTGTGTGCAGCTCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTCCCCGGCATATTCGCATC
TCTCGGAGCTTTGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGA
CGAAGGCGAATGGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTC
CCTAGCTGCTTCTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCTGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCAC
CTGGACTGGTGTCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTA
TTGGACATCACACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAA
CTTACGAATGCCTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGTTT
GGTGTTGTGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTT

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR4EI23TF 737 0 0
GGGCGGCCGTGAGTATTGCTTGTCACAAAGATTGTCAAAATTTTCACTGCCACGGGCGTT
AGATCCGATCCGATCTGAAACCGATCATCTGGAGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGAT
TTTCGGGCCGGGTTTCTCCGGATCTGTATTCGGCACCGGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGC
CGTTGTGTGCAGCTCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTCCCCGGCATATTCGC*TC
TCTCG*AGCTTTGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGA
CGAAGGCGAATGGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTC
CCTAGCTGCTTCTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCTGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCAC
CTGGACTGGTGTCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTA
TTGGACATCACACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAA
CTTACGAATGCCTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCCTTGTCTGGTCCAGTTT
GGTGTTGTGTGCTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCT
ATGCTTGGGTTAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGAAAATAATCTTGAACTT
TGTGTGAATGTTATGGA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4CI77JQ 742 0 0
AGTATTGCTTGTCACAAAGATTGTCAAAATTTTCACTGCCACGGGCGTTAGATCCGATCC
GATCTGAAACCGATCATCTGGAGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGG
GTTTCTCCGGAGCTGTATTCGGCACCGGCTGGTGGTTTTGGTTCGACGCCGTTGTGTGCA
GCTCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTCCCCGGCATATTCGCATCTCTCGGAGCTT
TGATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAAT
GGAGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTT
CTGTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCTGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTG
TCGCCGGTGTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCAC
ACTCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAACTTACGAATGC
CTCGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGTTTGGTGTTGTGTG
CTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTT
AAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGAAAATAATCTTGAACTTTGTGTGAATGT
TATGGAACGCCTTGTCGAGG
AC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4EI23JQ 720 0 0
TCTGAAACCGATCATCTGGAGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGT
TTCTCCGGATCTGTATTCGGCACCGGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGCCGTTGTGTGCAGC
TCCATCCAAGTTCCCTTCCTCCACTACCTCCCCGGCATATTCGC*TCTCTCG*AGCTTTG
ATGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATGG
AGGTTGAAGCTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCT
GTTGGTCTGCTGATTCAAGATTCTGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTC
GCCGGTGTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACAC
TCGGAGTAAGTAGACTTGGAGGCACATACAGATACATGTGGTGACAACTTACGAATGCCT
CGTTGCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCCTTGTCTGGTCCAGTTTGGTGTTGTGTGCT
AGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTTAA
GTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGAAAATAATCTTGAACTTTGTGTGAATGTTA
TGGAACGCCTTGTCGAGGTCTCTGCTCCGTCTCTTAATTGCATTGGCGTGAAAGATTGGT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 10

CO CL431Contig1 738 10 5 U
GGTAGAACTACCACAATTCGTACAGGTAATATATAGTGAAGTGAACTGTGAACAGAAGCA
AGCTCCTAAAAATGCAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAA
CAACAATCACTGTAAAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGT
TCTGCAGCTTCCTTATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGG
ATTCCAGTGAAAGCAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAAC
ACCCCGAACACTGGATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCA
GTGATTGCAGAGGCTAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTA
GAAGAACGACCTTCCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCAC
GACGGTTGACTCTCTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTC
CTCACTCTAGTACCCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGG
GCATGGCCTTGGTTGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTG
GTCGGAAGAGACGCGGCCATCCTATTTACAGTTACCCAGAAGACCAAAGCACTAGACTTT
TGGTCTAAAACAGATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE32JQ U 1
AF RR4DE32TF C 1
AF RR4GR94JQ U 81
AF RR4FE09JQ U 74
AF RR4FE09TF C 74
AF RR4AE33TF C 11
AF RR4B151JQ U 73
AF RR4BU61JQ U 74
AF RR4B151TF C 73
AF RR4BU61TF C 74
BS 1 383 RR4DE32JQ
BS 384 384 RR4GR94JQ
BS 385 649 RR4DE32JQ
BS 650 697 RR4GR94JQ
BS 698 738 RR4BU61TF

RD RR4DE32JQ 649 0 0
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CAACAATCACTGTAAAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGT
TCTGCAGCTTCCTTATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGG
ATTCCAGTGAAAGCAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAAC
ACCCCGAACACTGGATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCA
GTGATTGCAGAGGCTAGCAGATAGACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTA
GAAGAACGACCTTCCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCAC
GACGGTTGACTCTCTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTC
CTCACTCTAGTACCCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGG
GCATGGCCTTGGTTGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4DE32TF 697 0 0
GGTAGAACTACCACAATTCGTACAGGTAATATATAGTGAAGTGAACTGTGAACAGAAGCA
AGCTCCTAAAAATGCAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAA
CAACAATCACTGTAAAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGT
TCTGCAGCTTCCTTATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGG
ATTCCAGTGAAAGCAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAAC
ACCCCGAACACTGGATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCA
GTGATTGCAGAGGCTAGCAGATAGACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTA
GAAGAACGACCTTCCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCAC
GACGGTTGACTCTCTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTC
CTCACTCTAGTACCCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGG
GCATGGCCTTGGTTGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTG
GTCGGAAGAGACGCGGCCATCCTATTTACAGTTACCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4GR94JQ 617 0 0
TATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAACAACAATCACTGTAAAAGTT
GCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGCAGCTTCCTTATTAGC
AGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACGGAAGTGGGGATTCCAGTGAAAGCAAAGAA
TCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTGGATTCTT
ACTCGAGTATTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGGCTAGCAG
ATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTAGAAGAACGACCTTCCTCTCT
GGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCCCCCACGACGGTTGACTCTCTTTAGA
TTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTACCCACGCA
GCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGTTGGGTGA
ACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAGACGCGGCCAT
CCTATTTACAGTTACCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4FE09JQ 624 0 0
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AAAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGCAGCATCCT
TATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAATGAAAG
CAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTG
GATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGG
CTAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTAGAAGAACGACCTT
CCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGACTCT
CTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTAC
CCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGT
TGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAGACG
CGGCCATCCTATTTACAGTTACCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4FE09TF 624 0 0
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AAAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGCAGCATCCT
TATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAATGAAAG
CAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTG
GATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGG
CTAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTAGAAGAACGACCTT
CCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGACTCT
CTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTAC
CCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGT
TGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAGACG
CGGCCATCCTATTTACAGTTACCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4AE33TF 673 0 0
CCACAATTCGTACAGGTAATATATAGTGAAGTGAACTGTGAACAGAAGCAAGCTCCTAAA
AATGCAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAACAACAATCAC
TGTAAAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGCAGCTT
CCTTATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAGTGA
AAGCAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACA
CTGGATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAG
AGGCTAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTAGAAGAACGAC
CTTCCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGAC
TCTCTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAG
TACCCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTT
GGTTGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAG
ACGCGGCCATCC
C

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4B151JQ 625 0 0
A
GCAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAACAACAATCACTGT
AAAAGTTGCGAAGACAGTTATAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGCAGCTTCCT
TATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAGTGAAAG
CAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTG
GATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGG
CTAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTATTGGGACGTAGAAGAACGACCTT
CCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGACTCT
CTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTAC
CCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGT
TGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAGACG
CGGCCATCCTATTTACAGTTACCC

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR4BU61JQ 594 0 0
A
CAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAACAACAATCACTGTA
AAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGTAGCTTCCTT
ATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAGTGAAAGC
AAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTGG
ATTCTTACTCGAGTGCTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGGC
TAGCAAATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTAAAAAAACGACCTTC
CTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGACTCTC
TTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTACC
CACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGTT
GGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAAACATAAAGTGGTCGGAA

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR4B151TF 625 0 0
A
GCAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAACAACAATCACTGT
AAAAGTTGCGAAGACAGTTATAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGCAGCTTCCT
TATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAGTGAAAG
CAAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTG
GATTCTTACTCGAGTACTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGG
CTAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTATTGGGACGTAGAAGAACGACCTT
CCTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGACTCT
CTTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTAC
CCACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGT
TGGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAGACG
CGGCCATCCTATTTACAGTTACCC

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR4BU61TF 665 0 0
A
CAGAAGTATCTTCATATTATCATAAATGTATGTATGTGGAGGACAACAACAATCACTGTA
AAAGTTGCGAAGACAGTTTTAACGATATCCATCTCTCTTATCTTGTTCTGTAGCTTCCTT
ATTAGCAGCTTCAACGGATTTGAACCATAGGAATACAGAAGTGGGGATTCCAGTGAAAGC
AAAGAATCCAAGCACGGGAGTATAAAAGATACTGTCAGAGTCCAACACCCCGAACACTGG
ATTCTTACTCGAGTGCTCAAAAACAGAACCGATAGCAGCAATGGCAGTGATTGCAGAGGC
TAGCAGATAAACATAGAAGGGAACCTCAATGCCCTCTTGGGACGTAGAAGAACGACCTTC
CTCTCTGGCCCAAGGAGGTGGCTCATCCGAGTCAGGATTCGCCCACGACGGTTGACTCTC
TTTAGATTTTCTAGATCCTTCAGTCGCAGCCGTCACGACCAATCTCCTCACTCTAGTACC
CACGCAGCGCCCCGAGTAACCCATTAGGTTCCTCTTCACAGCAAGGGCATGGCCTTGGTT
GGGTGAACGTTTGCAACACTCGTCGCCATGGCTAAGACATAAAGTGGTCGGAAGAGACGC
GGCCATCCTATTTACAGTTACAAAGAAGACCAAAGCACTAGACTTTTGGTCTAAAACAGA
TTCC

QA 2 665 2 665
DS 



AS 2 9

CO CL432Contig1 622 2 3 U
GCATTGCTGCTCACTCAGAGAAAACCTAATCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCATTTTCT
CTTATTCGAGATAGAAGAACCCCTAGCATGGGTCTTATGGTGAAAGCTAATGGTAAAAGT
TCTGAAACATCTACTGATCTTGATGTCATTGGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCT
GAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCA
CTTAACATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTT
GGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGGGAG
GAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGACGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTT
TCTCAAAAGGAAAAAAAAATATACTTGGCCAGTAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTG
AGATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTTCTG
AACCTGTAAATACTGTATTTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTT
CATATAAAGAATTAAGACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AE79JQ C 1
AF RR4AE79TF U 11
BS 1 10 RR4AE79JQ
BS 11 620 RR4AE79TF
BS 621 622 RR4AE79JQ

RD RR4AE79JQ 622 0 0
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CTTATTCGAGATAGAAGAACCCCTAGCATGGGTCTTATGGTGAAAGCTAATGGTAAAAGT
TTTGAAACATCTACTGATCTTGATGTCATTGGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCT
GAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCA
CTTAACATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTT
GGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGGGAG
GAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGACGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTT
TCTCAAAAGGAAAAAAAAATATACTTGGCCAGTAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTG
AGATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTTCTG
AACCTGTAAATACTGTATTTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTT
CATATAAAGAATTAAGACATCG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4AE79TF 612 0 0
TCACTCAGAGAAAACCTAATCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCATTTTCTCTTATTCGAG
ATAGAAGAACCCCTAGCATGGGTCTTATGGTGAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGAAACAT
CTACTGATCTTGATGTCATTGGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGATCGTT
TAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAACATAA
TCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGT
TCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGGGAGGAGCTATCCC
AAATTGTCAAGAAATCAGTGACGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCAAAAGG
AAAAAAAAATATACTTGGCCAGTAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTG
TGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTTCTGAACCTGTAAA
TACTGTATTTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATATAAAGA
ATTAAGACAT
CG

QA 1 610 1 610
DS 



CO CL432Contig2 725 7 9 U
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CAAATACAGTATTTACAGGTTCAGAACATGAACATGAACCAGAGATAACAACATCTATCA
TGTCACAAACACAAATCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTGCCTTACTGGCCAAGTA
TATTTTTTTTTCCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAAGTATATTCGTCACTGATTT
CTTGACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAGATATCGATATGTAAA
CCACGTGGAGAACAAGATACCAACTAGTTCAAACCCAGAGGAGATAACAGGCAAATTGTC
GATTGCCGTGATTATGTTAAGTGACGCCCAAAGAGCTACAATAGCAGCAAAACTCAAACC
AATAAGACCTAAACGATCTTCAGACTTATCCCAAACATTCTGAATTGAACTAATGACGTC
AAGATCAGTCGATGATTCAGAACTTTTACCATTAGCTTTCACCATAACACCCATGCTAGG
GCTTCTTCTATCTCGAATAAGAGAAAATGGGATTTTCTGAACTGATGTGAGATTAGGTTT
TCTCTGAGTGAGCAGCAATGGTGGAGGCAAACTTGCAGAAACTGACGCCATTTAGAGATT
TTTTTCTCGTTTATCTGAGGAAGAAGAGACCGTCCAAGTAATTGTTATTGGATAGCAAGA
AACCC


BQ
10 10 20 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 5 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR4EB27JQ U 45
AF RR4A576JQ U 107
AF RR4E633JQ U 4
AF RR4EB27TF C 4
AF RR4A576TF C 2
AF RR4GN27JQ U 1
AF RR4GN27TF C 2
BS 1 43 RR4GN27JQ
BS 44 44 RR4E633JQ
BS 45 134 RR4GN27JQ
BS 135 135 RR4E633JQ
BS 136 190 RR4GN27JQ
BS 191 191 RR4E633JQ
BS 192 220 RR4GN27JQ
BS 221 221 RR4E633JQ
BS 222 725 RR4GN27JQ

RD RR4EB27JQ 240 0 0
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ATAACAACATCTATCATGTCACAAAAACAAATCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTG
CCTTACTGGCCAAGTATATTTTTTTTTCCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAAGTA
TATTCGTCACTGATTTCTTGACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGA

QA 1 240 1 240
DS 

RD RR4A576JQ 230 0 0
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TTACTGGCCAAGTATATTTTTTTTTCCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAAGTATA
TTCGTCACTGATTTCTTGACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAAA
TATCGATATGTAAACCACGTGGAGAACAAGATACCAACTAGTTCAAACCC

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR4E633JQ 708 0 0
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CACAAAAACAAATCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTGCCTTACTGGCCAAGTATAT
TTTTTTTTCCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAAGTATATTCGTCACTGATTTCTT
GACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAGATATCGATATGTAAACCA
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AAGACCTAAACGATCTTCAGACTTATCCCAAACATTCTGAATTGAACTAATGACGTCAAG
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TCTTCTATCTCGAATAAGAGAAAATGGGAGTTTCTGAACTGATGTGAGGTTAGGTTTTCT
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CC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EB27TF 708 0 0
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CACAAAAACAAATCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTGCCTTACTGGCCAAGTATAT
TTTTTTTTCCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAAGTATATTCGTCACTGATTTCTT
GACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAGATATCGATATGTAAACCA
CGTGGAGAACAAGATACCAACTAGTTCAAACCCAGAGGAGATAACAGGCAATTTGTCGAT
TGCCGTGATTATGTTAAGTGACGCCCAAAGAGCTACAATAGCAGCAAAACTCAAACCAAT
AAGACCTAAACGATCTTCAGACTTATCCCAAACATTCTGAATTGAACTAATGACGTCAAG
ATCAGTCGATGATTCAGAACTTTTACCATTAGCTTTCACCATAACACCCATGCTAGGGCT
TCTTCTATCTCGAATAAGAGAAAATGGGAGTTTCTGAACTGATGTGAGGTTAGGTTTTCT
CTGAGTGAGCAGCAATGGTGGAGGCAAACTTGCAGAAACTGACGCCATTTT*AGAGATTT
TTCTCGTTTATCTGAGGAAGAAGAGACCGTCCAAGTAATTGTTATT
CC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4A576TF 700 0 0
G
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TCACAAACACAAATCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTGCCTTACTGGCCAAGTATA
TTTTTTTTTCCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAAGTATATTCGTCACTGATTTCT
TGACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAGATATCGATATGTAAACC
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TTGCCGTGATTATGTTAAGTGACGCCCAAAGAGCTACAATAGCAGCAAAACTCGAACCAA
TAAGACCTAAACGATCTTCAGACTTATCCCAAACATTCTGAATTGAACTAATGACGTCAA
GATCAGTCGATGATTCAGAACTTTTACCATTAGCTTTCACCATAACACCCATGCTAGGGC
TTCTTCTATCTCGAATAAGAGAAAATGGGATTTTCTGAACTGATGTGAGATTAGGTTTTC
TCTGAGTGAGCAGCAATGGTGGAGGCAAACTTGCAGAAACTGACGCCATTTAGAGATTTT
TTTCTCGTTTATCTGAGGAAGAAGAGACCGTCCAAGT
CC

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4GN27JQ 725 0 0
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TGTCACAAACACAAGTCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTGCCTTACTGGCCAAGTA
TATTTTTTTT*CCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAGGTATATTCGTCACTGATTT
CTTGACAATTTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAGATATCGATATGTAAA
CCACGTGGAGAACAAGATACCAACTAGTTCAAACCCAGAGGAGATAACAGGCAAATTGTC
GATTGCCGTGATTATGTTAAGTGACGCCCAAAGAGCTACAATAGCAGCAAAACTCAAACC
AATAAGACCTAAACGATCTTCAGACTTATCCCAAACATTCTGAATTGAACTAATGACGTC
AAGATCAGTCGATGATTCAGAACTTTTACCATTAGCTTTCACCATAACACCCATGCTAGG
GCTTCTTCTATCTCGAATAAGAGAAAATGGGATTTTCTGAACTGATGTGAGATTAGGTTT
TCTCTGAGTGAGCAGCAATGGTGGAGGCAAACTTGCAGAAACTGACGCCATTTAGAGATT
TTTTTCTCGTTTATCTGAGGAAGAAGAGACCGTCCAAGTAATTGTTATTGGATAGCAAGA
AACCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4GN27TF 724 0 0
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ATTCTTTATATGAAATGATTGATTTGT*CACAAGGAACAGCAACCAAAACCCAAATACAG
TATT*ACAGGT*CAGAACATGAACATGAACCAGAGATAACAACATCTATCATGTCACAAA
CACAAGTCATCTCAGGATACCACATGCATTTACTGCCTTACTGGCCAAGTATATTTTTTT
T*CCTTTTGAGAAAGGGTTTTCTACTGGCCAGGTATATTCGTCACTGATTTCTTGACAAT
TTGGGATAGCTCCTCTCTGTCGGGTTTGAACAAGAGATATCGATATGTAAACCACGTGGA
GAACAAGATACCAACTAGTTCAAACCCAGAGGAGATAACAGGCAAATTGTCGATTGCCGT
GATTATGTTAAGTGACGCCCAAAGAGCTACAATAGCAGCAAAACTCAAACCAATAAGACC
TAAACGATCTTCAGACTTATCCCAAACATTCTGAATTGAACTAATGACGTCAAGATCAGT
CGATGATTCAGAACTTTTACCATTAGCTTTCACCATAACACCCATGCTAGGGCTTCTTCT
ATCTCGAATAAGAGAAAATGGGATTTTCTGAACTGATGTGAGATTAGGTTTTCTCTGAGT
GAGCAGCAATGGTGGAGGCAAACTTGCAGAAACTGACGCCATTTAGAGATTTTTTTCTCG
TTTATCTGAGGAAGAAGAGACCGTCCAAGTAATTGTTATTGGATAGCAAGAAACCC

QA 9 724 9 724
DS 



AS 2 10

CO CL433Contig1 758 4 2 U
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GCTTTTCAAGAGAAACAACGGTACCAATTTATCTCCATCACAATATCTCAAAATTCTTAT
TTAAAGACAATGAACTGTAGGAAGTCAAAGCATGTAGTATTGGTGCACACATACACAAAT
ATGTATGAGCATATACTCCAGTGATATTTAGGGTTTCTGTGAGTCTTCTTGTTTCATCTC
GGCTTTAATAGCTAAAGCCAAGTGATCATAAGCTTGAGACCAAGCTCCTTCAACTTCTTC
ATTGTATTTCTCTCCCAGCCCTTCTTTCAGTGTCCTCACCAAAGCCTCTTTCACCACCTC
AAAGTGAGGATCAAGAACACCGCTCTTGAGATGAACAGAGCCCAAGTATTGGAGGGTTGT
GTCAGCCACCACTACCTTCCCTTTCTCCCTCAGCTGTATTGCCGTTTCACATATCATCTT
GAAGACTTTAACAGCATGAGCTTTGAGTTTAGGATTGTTATGAGGGACTTCATCTGTGTC
TCTTAGGAAAGAGAACATGTCCTTTGCTGCTGGTGCAATCTCCAGTATCTGTGAGAAGAA
GTGAAGACTGTATTTGGGGATGTCTTGCTTGAGTATCTCCCAAGACTCCTTCACCAAAGC
TTCTTGCTTCTCCGTAAACACAATCTCCCCCATCTCTCTCTCTTCTGAGCTCTCCAACTA
CTTGTTCAACTTAACAACAAGAGGTTTTGGGAACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C335JQ U 1
AF RR4C335TF C 45
AF RR4A565JQ U 22
AF RR4A565TF C 22
BS 1 712 RR4C335JQ
BS 713 758 RR4A565JQ

RD RR4C335JQ 713 0 0
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GCTTTTCAAGAGAAACAACGGTACCAATTTATCTCCATCACAATATCTCAAAATTCTTAT
TTAAAGACAATGAACTGTAGGAAGTCAAAGCATGTAGTATTGGTGCACACATACACAAAT
ATGTATGAGCATATACTCCAGTGATATTTAGGGTTTCTGTGAGTCTTCTTGTTTCATCTC
GGCTTTAATAGCTAAAGCCAAGTGATCATAAGCTTGAGACCAAGCTCCTTCAACTTCTTC
ATTGTATTTCTCTCCCAGCCCTTCTTTCAGTGTCCTCACCAAAGCCTCTTTCACCACCTC
AAAGTGAGGATCAAGAACACCGCTCTTGAGATGAACAGAGCCCAAGTATTGGAGGGTTGT
GTCAGCCACCACTACCTTCCCTTTCTCCCTCAGCTGTATTGCCGTTTCACATATCATCTT
GAAGACTTTAACAGCATGAGCTTTGAGTTTAGGATTGTTATGAGGGACTTCATCTGTGTC
TCTTAGGAAAGAGAACATGTCCTTTGCTGCTGGTGCAATCTCCAGTATCTGTGAGAAGAA
GTGAAGACTGTATTTGGGGATGTCTTGCTTGAGTATCTCCCAAGACTCCTTCACCAAAGC
TTCTTGCTTCTCCGTAAACACAATCTCCCCCATCTCTCTCTCTTCTGAGCTC
C

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4C335TF 669 0 0
TCTTG
TTCTCATGAAAGCTTTTCAAGAGAAACAACGGTACCAATTTATCTCCATCACAATATCTC
AAAATTCTTATTTAAAGACAATGAACTGTAGGAAGTCAAAGCATGTAGTATTGGTGCACA
CATACACAAATATGTATGAGCATATACTCCAGTGATATTTAGGGTTTCTGTGAGTCTTCT
TGTTTCATCTCGGCTTTAATAGCTAAAGCCAAGTGATCATAAGCTTGAGACCAAGCTCCT
TCAACTTCTTCATTGTATTTCTCTCCCAGCCCTTCTTTCAGTGTCCTCACCAAAGCCTCT
TTCACCACCTCAAAGTGAGGATCAAGAACACCGCTCTTGAGATGAACAGAGCCCAAGTAT
TGGAGGGTTGTGTCAGCCACCACTACCTTCCCTTTCTCCCTCAGCTGTATTGCCGTTTCA
CATATCATCTTGAAGACTTTAACAGCATGAGCTTTGAGTTTAGGATTGTTATGAGGGACT
TCATCTGTGTCTCTTAGGAAAGAGAACATGTCCTTTGCTGCTGGTGCAATCTCCAGTATC
TGTGAGAAGAAGTGAAGACTGTATTTGGGGATGTCTTGCTTGAGTATCTCCCAAGACTCC
TTCACCAAAGCTTCTTGCTTCTCCGTAAACACAATCTCCCCCATCTCTCTCTCTTCTGAG
CTC
C

QA 6 668 6 668
DS 

RD RR4A565JQ 737 0 0
GC
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ATATTTAGGGTTTCTGTGAGTCTTCTTGTTTCATCTCGGCTTTAATAGCTAAAGCCAAGT
GATCATAAGCTTGAGACCAAGCTCCTTCAACTTCTTCATTGTATTTCTCTCCCAGCCCTT
CTTTCAGTGTCCTCACCAAAGCCTCTTTCACCACCTCAAAGTGAGGATCAAGAACACCGC
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TCTCCCTCAGCTGTATTGCCGTTTCACATGTCATCTTGAAGACTTTAACAGCATGAGCTT
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TTGCTGCTGGTGCAATCTCCAGTATCTGTGAGAAGAAGTGAAGACTGTATTTGGGGATGT
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TCTCTCCCATCTCTCTCTCTTCTGAGCTCTCCAACTACTTGTTCAACTTAACAACAAGAG
GTTTTGGGAACCCCC

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR4A565TF 737 0 0
GC
CGGTTTAATTTCAAACCGTATCTTGTTTCTCATGAAAGCTTTTCAAGAGAAACAACGGTA
CCAATTTATCTCCATCACAATATCTCAAAATTCTTATTTAAAGACAATGAACTGTAGGAA
GTCAAAGCATGTAGTATTGGTGCACACATACACAAATATGTATGAGCATATACTCCAGTG
ATATTTAGGGTTTCTGTGAGTCTTCTTGTTTCATCTCGGCTTTAATAGCTAAAGCCAAGT
GATCATAAGCTTGAGACCAAGCTCCTTCAACTTCTTCATTGTATTTCTCTCCCAGCCCTT
CTTTCAGTGTCCTCACCAAAGCCTCTTTCACCACCTCAAAGTGAGGATCAAGAACACCGC
TCTTGAGATGAACAGAGCCCAAGTATTGGAGGGTTGTGTCAGCCACCACTACCTTCCCTT
TCTCCCTCAGCTGTATTGCCGTTTCACATGTCATCTTGAAGACTTTAACAGCATGAGCTT
TGAGTTTAGGATTGTTATGAGGGACTTCATCTGTGTCTCTTAGGAAAGAGAACATGTCCT
TTGCTGCTGGTGCAATCTCCAGTATCTGTGAGAAGAAGTGAAGACTGTATTTGGGGATGT
CTTGCTTGAGTATCTCCCAAGACTCCTTCACCAAAGCTTCTTGCTTCTCCGTAAACACAA
TCTCTCCCATCTCTCTCTCTTCTGAGCTCTCCAACTACTTGTTCAACTTAACAACAAGAG
GTTTTGGGAACCCCC

QA 3 737 3 737
DS 



CO CL433Contig2 655 6 16 U
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GGGAGATACTGAAGAATGACATCCCCAAATACAGCCTTCACTTCTTCTCACAGATACTGG
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CAATACAGCTGAGGGAGAAAGGAAAAGCGGCTGTGCCTGACACAACCCTCCAGTACTTGG
GATCTGTTCATCTCAAAAGCGGTGTTCTTGATCCTCACTTTGAGGTGGTGAAAGAGG*CT
TTGGTGAGGACACTGAAATAAGGGTTGGGG**GAGAAGTACAATGAAGAAGTGGAAGG*A
GCTTGGTCTCAAGCTTATGATCACTTGGCTCTAGCCATTAAG*GCCGAGATGAAACAGGA
AGACGCATAATTAGTTTTTATGGTGAATCTGTATGCAAAAAGTATGCAAAATTTCATCCC
ATTATCTTTGTGAAATTTCTCTCAACTACTTTT*GTTCTTTCTTTAAATACAGAGCTACA
TGACAATCAATCAATGAAATAAATAAATAAAAATAAATAAACCTACTGTTAACAG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DO96TF U 1
AF RR4E054JQ C 1
AF RR4E640TF U 306
AF RR4E054TF U 1
AF RR4B084TF U 500
AF RR4B273TF U 500
BS 1 262 RR4DO96TF
BS 263 305 RR4E054TF
BS 306 357 RR4E640TF
BS 358 358 RR4E054TF
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BS 380 390 RR4E640TF
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GGGAGATACTGAAGAATGACATCCCCAAATACAGCCTTCACTTCTTCTCACAGATACTGG
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DS 

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GGG
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DS 

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CTTTGTGAAATTTCTCTCAACTACTTTTTGTTCTTTCTTTAAATACAGAGCTACATGACA
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QA 1 323 1 323
DS 

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GGG
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ATCTTTGTGAAATTTCTCTCAACTACTTTT*GTTCTTTCTTTAAATACAGAGCTACATGA
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QA 4 655 4 655
DS 

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DS 

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TAAATAAATAAAAATAAATAAACCTACTGTTAACAG

QA 1 156 1 156
DS 



AS 2 10

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AGAACATGTAAAGT*ACAAAAATCTCAAATAGTTTAAAAGAAAAAGTT*AAATATCGCTC
ATGATAAAACACAGCCTAAAGATCACTTCTCACTTGAAAAGGGAAATACAACAATACATC
TGTTTGTAACTGTATGTATCCACACAAACTTTTGCTGTCGTGTAAACCTCCTCTTATCTT
AGTTTTCTTAAACCTTGAACTCATGGACGTGGAACCATTTCGTGGATGACCATTTGTTTC
CTTTTACCACTGGGCATCCACCGTGCAAACTGGAAGGGTCTAGAGAGGCATCAGGTCTCA
TGTTCCAGAAAAGTAAAGCATCTCTCTTCTTTGGTAGAACAGAGAGTCCTTCTTTGCCAC
ATTTCGAGAGCTGGTCCCACCATGGGACTGCACTAATGTTTCCTTTTGCTGCTGGGAACA
CGGTCTCGCCACCATCATCAACATCCGAGAGGTACATAAGAACAGTGGCTATTCGTTGTC
CTCCGTTCTTGGTGTTGAACTCATCTAAGAAATAATCATAGTGAGGCTCATACTTCTACC
CAACTTGGTAGTGAAGAACCTGAAGGCCTTCTCCATTTTCAACAGGAATGAAGGTGAAAT
CAGAAATCCTTTGCTCAATCCTCTCGACAACTTGGTCATGTCCTCTTTTAAGAAAAGTCC
CAGAGCTAGTCCTTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGTTTTCTCATCGACCACAGTTG
ATTTAACCATGTTGGGTTTAGCGAGGCTGATGAGGTGCTCACATTCTTCATTGGTCAAGA
AATTGTGGTAAACAACAGCTCTAGGCTCCCACGATATCACTTCAACCCAACGCTCTCCGT
TCCCTTCCTCCTCCTCTCCTCCATAACTCTCATCCTGGCTCTTCCGCACAATGTTGGTCA
AATCGTTGGGCTTGGAAGAGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATCTAAATGATTAAC
ATTGAAGAAGATGAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EC74JQ U 16
AF RR4AO48JQ U 34
AF RR4A242JQD U 1
AF RR4A242JQ U 26
AF RR4AM13JQ U 33
AF RR4AM13TF C 306
AF RR4AO48TF C 613
BS 1 128 RR4A242JQD
BS 129 129 RR4EC74JQ
BS 130 384 RR4A242JQD
BS 385 385 RR4AM13JQ
BS 386 460 RR4A242JQD
BS 461 461 RR4AM13JQ
BS 462 526 RR4A242JQD
BS 527 527 RR4AM13JQ
BS 528 597 RR4A242JQD
BS 598 598 RR4AM13JQ
BS 599 625 RR4A242JQD
BS 626 626 RR4AM13JQ
BS 627 691 RR4A242JQD
BS 692 692 RR4AM13JQ
BS 693 861 RR4A242JQD
BS 862 864 RR4A242JQ
BS 865 865 RR4AM13JQ
BS 866 943 RR4A242JQ
BS 944 944 RR4AM13JQ
BS 945 945 RR4AM13TF
BS 946 957 RR4AM13JQ
BS 958 1039 RR4AM13TF

RD RR4EC74JQ 603 0 0
GTG
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AAAATCTCAAATAGTTTAAAAGAAAAAGTT*AAATATCGCTCATGATAAAACACAGCCTA
AAGATCACTTCTCACTTGAAAAGGGAAATACAACAATACATCTGTTTGTAACTGTATGTA
TCCACACAAACTTTTGCTGTCGTGTAAACCTCCTCTTATCTTAGTTTTCTTAAACCTTGA
ACTCATGGACGTGGAACCATTTCGTGGATGACCATTTGTTTCCTTTTACCACTGGGCATC
CACCGTGCAAACTGGAAGGGTCTAGAGAGGCATCAGGTCTCATGTTCCAGAAAAGTAAAG
CATCTCGCTTCTTTGGTAGAACAGAAAGTCCTTCTTTGCCACATTTCGAGAGCTGGTCCC
ACCATGGGACTGCACTAATGTTCCCTTTTGCTGCTGGGAACACGGTCTCGCCACCATCAT
CAACATCCGAGAGGTACATAAGAACAGTTGCTATTCGTTGTCCTCCGTTCTTGGTGTTGA
ACTCATCTAAGAAATAATCATAGTGAGGCTCATACTTCTGCCCAACTTGGTAGTGAAGAA

QA 4 603 4 603
DS 

RD RR4AO48JQ 758 0 0
GTATTAA
ATTATTGATGTTATAAAAACAGAACATGTAAAGTTACAAAAATCTCAAATAGTTTAAAAG
AAAAAGTTCAAATATCGCTCATGATAAAACACAGCCTAAAGATCATTTCTCACTTGAAAA
GAGAAATACAACAATACATCTGTTTGTAACTGTATGTATCCACACAAACTTTTGCTGTCG
TGTAAACCTCCTCTTATCTTAGTTTTCTTAAACCTTGAACTCATGGACGTGGAACCATTT
CGTGGATGACCATTTGTTTCCTTTCACCACTGGGCATCCACCGTGCAAACTGGAAGGGTC
TAGAGAGGCATCAGGTCTCATGTTCCAAAAAAGTAAAGCATCTCTCTTCTTTGGTAGAAC
AGAGAGTCCTTCTTTGCCACATTTCGAGAGCTGGTCCCACCATGGGACTGCACTAATGTT
TCCTTTTGCTGCTGGGAACACGGTCTCGCCACCATCATCAACATCCGAGAGGTACATAAA
AACAGTGGCTATTCGTTGTCCTCCGTTCTTGGTGTTGAACTCATCTAAGAAATAATCATA
GTGAGGCTCATACTTCTACCCAACTTGGTAGTGAAGAACCTGAAGGCCTTCTCCATTTTC
AACAGGAATGAAGGTGAAATCAGAAATCCTTTGCTCAATCCTCTCGACAACTTGGTCATG
TCCTCTTTTAAGAAAAGTCCCAGAGCTAGTCCTTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGT
TTTCTCATCGACCACAGTTGATTTAACCATG

QA 8 758 8 758
DS 

RD RR4A242JQD 861 0 0
GGCGCATCAGGAATGATACAAGTGCCTCATTATATTATAGATTATTGAAGTTATAAAAAC
AGAACATGTAAAGT*ACAAAAATCTCAAATAGTTTAAAAGAAAAAGTT*AAATATCGCTC
ATGATAAA*CACAGCCTAAAGATCACTTCTCACTTGAAAAGGGAAATACAACAATACATC
TGTTTGTAACTGTATGTATCCACACAAACTTTTGCTGTCGTGTAAACCTCCTCTTATCTT
AGTTTTCTTAAACCTTGAACTCATGGACGTGGAACCATTTCGTGGATGACCATTTGTTTC
CTTTTACCACTGGGCATCCACCGTGCAAACTGGAAGGGTCTAGAGAGGCATCAGGTCTCA
TGTTCCAGAAAAGTAAAGCATCTCGCTTCTTTGGTAGAACAGAGAGTCCTTCTTTGCCAC
ATTTCGAGAGCTGGTCCCACCATGGGACTGCACTAATGTTCCCTTTTGCTGCTGGGAACA
CGGTCTCGCCACCATCATCAACATCCGAGAGGTACATAAGAACAGTTGCTATTCGTTGTC
CTCCGTTCTTGGTGTTGAACTCATCTAAGAAATAATCATAGTGAGGCTCATACTTCTGCC
CAACTTGGTAGTGAAGAACCTGAAGACCTTCTCCATTTTCAACAGGAATGAAGGTGAAAT
CAGAAATCCTTTGCTCAATCCTCTCGACAACATGGTCATGTCCTCTTTTAAGAAAAGTCC
CAGAGCTAGTCCTTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGTTTTCTCATCGACCACAGTTG
ATTTAACCATGTTGGGTTTAGCGAGGCTGATGAGGTGCTCACATTCTTCATTGGTCAAGA
AATTGTGGTAAACAACAGCTC

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR4A242JQ 918 0 0
CTCATTATATTATAG
ATTATTGAAGTTATAAAAACAGAACATGTAAAGT*ACAAAAATCTCAAATAGTTTAAAAG
AAAAAGTT*AAATATCGCTCATGATAAA*CACAGCCTAAAGAACACTTCTCACTTGAAAA
GGGAAATACAACAATACATCTGTTTGTAACTGTATGTATCCACACAAACTTTTGCTGTCG
TGTAAACCTCCTCTTATCTTAGTTTTCTTAAACCTTGAACTCATGGACGTGGAACCATTT
CGTGGATGACCATTTGTTTCCTTTTACCACTGGGCATCCACCGTGCAAACTGGAAGGGTC
TAGAGAGGCATCAGGTCTCATGTTCCAGAAAAGTAAAGCATCTCGCTTCTTTGGTAGAAC
AGAGAGTCCTTCTTTGCCACATTTCGAGAGCTGGTCCCACCATGGGACTGCACTAATGTT
CCCTTTTGCTGCTGGGAACACGGTCTCGCCACCATCATCAACATCCGAGAGGTACATAAG
AACAGTTGCTATTCGTTGTCCTCCGTTCTTGGTGTTGAACTCATCTAAGAAATAATCATA
GTGAGGCTCATACTTCTGCCCAACTTGGTAGTGAAGAACCTGAAGACCTTCTCCATTTTC
AACAGGAATGAAGGTGAAATCAGAAATCCTTTGCTCAATCCTCTCGACAACATGGTCATG
TCCTCTTTTAAGAAAAGTCCCAGAGCTAGTCCTTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGT
TTTCTCATCGACCACAGTTGATTTAACCATGTTGGGTTTAGCGAGGCTGATGAGGTGCTC
ACATTCTTCATTGGTCAAGAAATTGTGGTAAACAACAGCTCTAG*CTCCCACGATATCAC
TTCAACCCAACGCTCTCCGTTCCCTTCCTCCTCCTCTCCTCCATAACTCTCATCCTGGCT
CTT

QA 16 918 16 918
DS 

RD RR4AM13JQ 925 0 0
CGTATTAA
ATTATTGATGTTATAAAAACAGAACATGTAAAGTTACAAAAATCTCAAATAGTTTAAAAG
AAAAAGTTCAAATATCGCTCATGATAAAACACAGCCTAAAGATCATTTCTCACTTGAAAA
GAGAAATACAACAATACATCTGTTTGTAACTGTATGTATCCACACAAACTTTTGCTGTCG
TGTAAACCTCCTCTTATCTTAGTTTTCTTAAACCTTGAACTCATGGACGTGGAACCATTT
CGTGGATGACCATTTGTTTCCTTTCACCACTGGGCATCCACCGTGCAAACTGGAAGGGTC
TAGAGAGGCATCAGGTCTCATGTTCCAGAAAAGTAAAGCATCTCTCTTCTTTGGTAGAAC
AGAGAGTCCTTCTTTGCCACATTTCGAGAGCTGGTCCCACCATGGGACTGCACTAATGTT
TCCTTTTGCTGCTGGGAACACGGTCTCGCCACCATCATCAACATCCGAGAGGTACATAAG
AACAGTGGCTATTCGTTGTCCTCCGTTCTTGGTGTTGAACTCATCTAAGAAATAATCATA
GTGAGGCTCATACTTCTACCCAACTTGGTAGTGAAGAACCTGAAGGCCTTCTCCATTTTC
AACAGGAATGAAGGTGAAATCAGAAATCCTTTGCTCAATCCTCTCGACAACTTGGTCATG
TCCTCTTTTAAGAAAAGTCCCAGAGCTAGTCCTTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGT
TTTCTCATCGACCACAGTTGATTTAACCATGTTGGGTTTAGCGAGGCTGATGAGGTGCTC
ACATTCTTCATTGGTCAAGAAATTGTGGTAAACAACAGCTCTAGGCTCCCACGATATCAC
TTCAACCCAACGCTCTCCGTTCCCTTCCTCCTCCTCTCCTCCATAACTCTCATCCTGGCT
CTCC*GCACAATGTTGG

QA 9 925 9 925
DS 

RD RR4AM13TF 734 0 0
ACCACTGGGCATCCAC*GTGCAAACTGGAAGGGTCTAGAGAGGCATCAGGTCTCATGTTC
CAGAAAAGTAAAGCATCTCTCTTCTTTGGTAGAACAGAGAGTCCTTCTTTGCCACATTTC
GAGAGCTGGTCCCACCATGGGACTGCACTAATGTTTCCTTTTGCTGCTGGGAACACGGTC
TCGCCACCATCATCAACATCCGAGAGGTACATAAGAACAGTGGCTATTCGTTGTCCTCCG
TTCTTGGTGTTGAACTCATCTAAGAAATAATCATAGTGAGGCTCATACTTCTACCCAACT
TGGTAGTGAAGAACCTGAAGGCCTTCTCCATTTTCAACAGGAATGAAGGTGAAATCAGAA
ATCCTTTGCTCAATCCTCTCGACAACTTGGTCATGTCCTCTTTTAAGAAAAGTCCCAGAG
CTAGTCCTTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGTTTTCTCATCGACCACAGTTGATTTA
ACCATGTTGGGTTTAGCGAGGCTGATGAGGTGCTCACATTCTTCATTGGTCAAGAAATTG
TGGTAAACAACAGCTCTAGGCTCCCACGATATCACTTCAACCCAACGCTCTCCGTTCCCT
TCCTCCTCCTCTCCTCCATAACTCTCATCCTGGCTCTTCCGCACAATGTTGGTCAAATCG
TTGGGCTTGGAAGAGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATCTAAATGATTAACATTGA
AGAAGATGAGTCCC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4AO48TF 427 0 0
GAAGAACCTGAAGGCCTTCTCCATTTTCAACAGGAATGAAGGTGAAATCAGAAATCCTTT
GCTCAATCCTCTCGACAACTTGGTCATGTCCTCTTTTAAGAAAAGTCCCAGAGCTAGTCC
TTACTCTGCTATCTTTGCTGCCACCGGTTTTCTCATCGACCACAGTTGATTTAACCATGT
TGGGTTTAGCGAGGTTGATGAGGTGCTCACATTCTTCATTGGTCAAGAAATTGTGGTAAA
CAACAGCTCTAGGCTCCCACGATATCACTTCAACCCAACGCTCTCCGTTCCCTTCCTCCT
CCTCTCCTCCATAACTCTCATCCTGGCTCTTCCGCACAATGTTGGTCAAATCGTTGGGCT
TGGAAGAGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATCTAAATGATTAACATTGAAGAAGAT
GAGTCCC

QA 1 427 1 427
DS 



CO CL434Contig2 878 3 3 U
GGATCTTCTTCAATGTTAATCATTTAGATCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAAAAATC
AAATAACATGGCGGCGAAATCGAAGAACAACCTTCGTTACCAACCGCGAAAATCAGCATC
GCGATCGACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCGGTCTGCTGGTGGTGCTTATGATACTTCT
GGGTCTGGGGATCTTGTCACTCCCCAATGCCAACAGAAACTCTTCCAAGCCCAACGATTT
GACCAACATTGTGCGGAAGAGCCAGGATGAGAGTTATGGAGGAGAGGAGGAGGAAGGGAA
CGGAGAGCGTTGGGTTGAAGTGATATCGTGGGAGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATTT
CTTGACCAATGAAGAATGTGAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAATC
AACTGTGGTCGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTGG
GACTTTTCTTAAAAGAGGACATGACCATGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTGA
TTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTT*CAGGTTCTTCACTACCAAGTTG
GG*CAGAAGTATGAGCCTCACTATGATTATTTC**TTAGATGAGTTCAACACCAAGAACG
GAGGACAACGAATAGCAACTGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTGGATGATGGTGGCGAG
ACCGTGTTCCCAGCAGCAAAAGGGAACATTAGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCG
AAATGTGGCAAAGAATGACTCTCTGTTCTACCAAAGAAGCGAGATGCTTTACTTTTCTGG
AACATGAGACCTGATGCCTCTCTAGACCCTTCCAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EC74TF U 31
AF RR4A242TF U 300
AF RR4A242TFB U 1
BS 1 705 RR4A242TFB
BS 706 706 RR4A242TF
BS 707 878 RR4A242TFB

RD RR4EC74TF 620 0 0
GG
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TTCGTTACCAACCGCGAAAATCAGCATCGCGATCGACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCG
GTCTGCTGGTGGTGCTTATGATACTTCTGGGTCTGGGGATCTTGTCACTCCCCAATGCCA
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GTTATGGAGGAGAGGAGGAGGAAGGGAACGGAGAGCGTTGGGTTGAAGTGATATCGTGGG
AGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATTTCTTGACCAATGAAGAATGTGAGCACCTCATCA
GCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAATCAACTGTGGTCGATGAGAAAACCGGTGGCAGCA
AAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTGGGACTTTTCTTAAAAGAGGACATGACCATGTTG
TCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTGATTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAG
GTCTT*CAGGTTCTTCACTACCAAGTTGGG*CAGAAGTATGAGCCTCACTATGATTATTT
C**TTAGATGAGTTCAAC

QA 3 620 3 620
DS 

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TCTTGACCAATGAAGAATGTGAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAAT
CAACTGTGGTCGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTG
GGACTTTTCTTAAAAGAGGACATGACCATGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTG
ATTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTTTCAGGTTCTTCACTACCAAGTT
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GGAGGACAACGAATAGCAACTGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTGGATGATGGTGGCGA
GACCGTGTTCCCAGCAGCAA

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4A242TFB 878 0 0
GGATCTTCTTCAATGTTAATCATTTAGATCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAAAAATC
AAATAACATGGCGGCGAAATCGAAGAACAACCTTCGTTACCAACCGCGAAAATCAGCATC
GCGATCGACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCGGTCTGCTGGTGGTGCTTATGATACTTCT
GGGTCTGGGGATCTTGTCACTCCCCAATGCCAACAGAAACTCTTCCAAGCCCAACGATTT
GACCAACATTGTGCGGAAGAGCCAGGATGAGAGTTATGGAGGAGAGGAGGAGGAAGGGAA
CGGAGAGCGTTGGGTTGAAGTGATATCGTGGGAGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATTT
CTTGACCAATGAAGAATGTGAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAATC
AACTGTGGTCGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTGG
GACTTTTCTTAAAAGAGGACATGACCATGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTGA
TTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTT*CAGGTTCTTCACTACCAAGTTG
GG*CAGAAGTATGAGCCTCACTATGATTATTTC**TTAGATGAGTTCAACACCAAGAACG
GAGGACAACGAATAGCAACTGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTG*ATGATGGTGGCGAG
ACCGTGTTCCCAGCAGCAAAAGGGAACATTAGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCG
AAATGTGGCAAAGAATGACTCTCTGTTCTACCAAAGAAGCGAGATGCTTTACTTTTCTGG
AACATGAGACCTGATGCCTCTCTAGACCCTTCCAGTTT

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 2

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TAAAACATCCATTGTTGAAAAAACGACTGTGTGGAGCCACTGCAAAAGATTTATAGCAAG
TGCTTCTTTAGTTCACCACGTCCAGAACCAGCTTCCGGGACTTGAGAACCGACCATTTCA
GTCGCCTGTAGTACGCAGCTTGTAGCAAAGCCAGAGATAGTAGGAATATCCATTTGAAAC
CCATCAACTTCCTATCTTCCATTTCTGGTTCAGCTGCCCAAGACAAGAATGACACAACGT
CTTTACCCATCTGTGCCTCTGTGGCGGGGACACCATCTTCATACTCAACAGCTTCATCAT
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CTCTTATCGAAATGCCAGCAGGAGGATCACGGCAACCCGTCAGAAGAGCAAAGACGTAGT
TCTGACCGTTGTGACGTGCCTTAGTGATAAGA


BQ
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AF RR4H641JQB U 1
AF RR4H863JQB U 1
BS 1 327 RR4H641JQB
BS 328 328 RR4H863JQB
BS 329 582 RR4H641JQB
BS 583 632 RR4H863JQB

RD RR4H641JQB 582 0 0
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TAAAACATCCATTGTTGAAAAAACGACTGTGTGGAGCCACTGCAAAAGATTTATAGCAAG
TGCTTCTTTAGTTCACCACGTCCAGAACCAGCTTCCGGGACTTGAGAACCGACCATTTCA
GTCGCCTGTAGTACGCAGCTTGTAGCAGAGCCAGAGATAGTAGGAATATCCATTTGAAAC
CCATCAACTTCCTATCTTCCATTTCTGGTTCAGCTGCCCAAGACAAGAATGACACAACGT
CTTTACCCATCTGTGCCTCTGTGGCGGGGACACCATCTTCATACTCAACAGCTTCATCAT
TAAGCATTTTCGGCATAGCAATTGCTCCCCCAGGGAAATAAGGATTGTAGTGTAACCCTT
CTCTTATCGAAATGCCAGCAGGAGGATCACGGCAACCCGTCA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4H863JQB 632 0 0
AATCTTAAAATCATGTTTGATTACGAGGATCAAACTTTTTTCGTTATTATCCTCATAAAA
CTCCTAAAGAGTTAAAAAAGAAAAACAAGAAAGATAGGTCTTTCCACCTTCAGAGATTTT
TATGACACAGAAAAATGGAGATACGTTATTACCCTCAGAGAAAAGGCTCTACTCCTTTTT
TAAAACATCCATTGTTGAAAAAACGACTGTGTGGAGCCACTGCAAAAGATTTATAGCAAG
TGCTTCTTTAGTTCACCACGTCCAGAACCAGCTTCCGGGACTTGAGAACCGACCATTTCA
GTCGCCTGTAGTACGCAGCTTGTAGCAAAGCCAGAGATAGTAGGAATATCCATTTGAAAC
CCATCAACTTCCTATCTTCCATTTCTGGTTCAGCTGCCCAAGACAAGAATGACACAACGT
CTTTACCCATCTGTGCCTCTGTGGCGGGGACACCATCTTCATACTCAACAGCTTCATCAT
TAAGCATTTTCGGCATAGCAATTGCTCCCCCAGGGAAATAAGGATTGTAGTGTAACCCTT
CTCTTATCGAAATGCCAGCAGGAGGATCACGGCAACCCGTCAGAAGAGCAAAGACGTAGT
TCTGACCGTTGTGACGTGCCTTAGTGATAAGA

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 10

CO CL436Contig1 760 10 12 U
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ACAAGAAGAACAATAGAGAACAATAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGGTGATTT
GTTTCTTAAGATCATTTTCAAGAGTATAATTTAGGTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAA
ATCAAATCATAATACACGGCAGAAGAGTGTTT*ATGTAGTAAA*GAACAACCTTAA*GTT
GAAATTTTGGTTTGAAGCACT*TTTTGAAAGTGTGTAAACTTAGAGATCAGACTCGATAA
GGTAATCGCCGAGCCTCTCCACCACCAAGTTGCACTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGT
AGATGCCAAAGACAAAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCACCAGGTCCCTTTT
TGCCTCTGATGACAGCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTTTCGCCGCCAAGGA
AGAGCCCGGTTGGGGCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCT
CAGTAGTCTTCAACTGAGGGAAGTTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGA
GGATGGCGGCGGATGTGAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGT
ATGATTGCCACGACATCTTCTCTTTTCGTCTTCTCCGGCTGGATTGTTTCTTCTCTCTCT
CTCTTTGTGTTTTCTCTTCTTTGTGAGCTTTTGTTCGTCC


BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 
35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 

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CAAAAACACAAAGGGTGATTTGTTTCTTAAGATCATTTTCAAGAGTATAATTTAGGTTTT
TGTTTTGATGCACGACCACAAATCAAATCATAATACACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAG
TAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGAAACACT
CTTTTTGAAAAGTGTAAAC

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DS 

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ACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGAAGCACTCTTTTTGAAAAGTGTAAACTTAGAGATC
AGACTCGATAAGGTAATCGCCGAGCCTCTCCACCACCAAGTTGCACTGACCTCCAGTCAT
TGGTTCAT

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DS 

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AATAGAGAACAATAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGGTGATTTGTT**TTAAGA
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DS 

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G
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ACAGCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTTTCGCCGCCAAGGAAAAGCCCGGTT
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GATGTGAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGCCAC
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CC

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DS 

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G
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AATAGAGAACAATAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGGTGATTTGTTTCTTAAGA
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GACATCTTCTCTTTTCGTCTTCTCCGGCTGGATTGTTTCTTC
CC

QA 2 703 2 703
DS 

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CTCTTTGTGTTTTCTCTTCTTTGTGAGCTTTTGTTCGTCC

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TCCGGCTGGATTGTTTCTTCTCTCTCTCT**TTGTGTTTTCTCTTCTTTGTGAGCTTTTG
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GACATCTTCTCTTTTCGTCTTCTCCGGCTGGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTCTTTGTGTT
TTCTCTTCTTTGTGAGCTTTTGTTCGTCC

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TTGTTCGTCC

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DS 

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GTCTTCTCCGGCTGGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTCTTTGTGTTTTCTCTTCTTTGTGAG
CTTTTGTTCGTCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 10

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB37TF U 4
AF RR4F017TF U 1
AF RR4D601TF U 1
AF RR4DJ21TF U 1
AF RR4AU03TF U 1
AF RR4DJ21JQ C 455
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AF RR4F017JQ C 979
AF RR4GB37JQ C 522
AF RR4AU03JQ C 522
BS 1 442 RR4AU03TF
BS 443 443 RR4GB37TF
BS 444 476 RR4AU03TF
BS 477 477 RR4GB37TF
BS 478 826 RR4AU03TF
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BS 849 849 RR4DJ21JQ
BS 850 861 RR4AU03TF
BS 862 864 RR4DJ21JQ
BS 865 883 RR4AU03TF
BS 884 1189 RR4DJ21JQ
BS 1190 1302 RR4AU03JQ

RD RR4GB37TF 488 0 0
GG
GAGGCCTGAAAATGCTGATGACGGATGTCTCCAGTCGGCTTTCACCGGCGATCCTCCCAA
ACAGTTTATCAGTTTCGCGGTTGGTTTCAGTCAAGTACGCCCCACAGAGACTCCCTGTTT
CCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATCTTATGACTCCGTTGAGACGAATCCTAGTGTGGATT
CTGTGATCGAGAAAGAGGAGAAGAACATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTCCTTAA
AATCATTGATTAGTCATCCCCATGGATCAGTAGGATCTCCTGCCTCTGGTAGTACTCAAC
TACAATGCAGTACCTGTAAAAAGATTTTCTCAGCTAATGAGACACATCTTGATTTGGCTG
TGGCTAGTGGAACCAAGCATTACACTGAACCCCTGCCTCTTTCAATCGAGTTATTCAGGA
ATCCATTAGTCTCTTTCCTTTACGAGAGAGGTTGGCGTCAAAATTTCATATGGGGTGGTT
TTCCAG

QA 3 488 3 488
DS 

RD RR4F017TF 654 0 0
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CCCAAACAGTTTATCAGTTTCGCGGTTGGTTTCAGTCAAGTACGCCCCTCAGAGACTCCC
TGTTTCCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATCTTATGACTCCGTTGAGACGAATCCTAGTGT
GGATTCTGTGATCGAGAAAGAGGAGAAGAACATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTC
CTTAAAATCATTGATTAGTCATCCCCATGGATCAGTAGGATCTCCTGCCTCTGGTAGTAC
TCAACTACAATGCAGTACCTGTAAAAAGATTTTCTCAGCTAATGAGACACATCTTGATTT
GGCTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTACACTGAACCCCTGCCTCTTTCAATCGAGTTATT
CAGGAATCCATTAGTCTCTTTCCTTTACGAGAGAGGTTGGCGTCAAAATTTCATATGGAG
TGGTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTTTGAAATGGCTAAGGAATACTCGAAGCATGTTTT
GGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGGAAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAA
GAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGA*TATGCTGCG

QA 1 654 1 654
DS 

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CCCAAACAGTTTATCAGTTTCGCGGTTGGTTTCAGTCAAGTACGCCCCACAGAGACTCCC
TGTTTCCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATCTTATGACTCCGTTGAGACGAATCCTAGTGT
GGATTCTGTGATCGAGAAAGAGGAGAAGAACATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTC
CTTAAAATCATTGATTAGTCATCCCCATGGATCAGTAGGATCTCCTGCCTCTGGTAGTAC
TCAACTACAATGCAGTACCTGTAAAAAGATTTTCTCAGCTAATGCGACACATCTTGATTT
GGCTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTACACTGAACCCCTGCCTCTTTCAATCGAGTTATT
CAGGAATCCATTAGTCTCTTTCCTTTACGAGAGTGGTTGGCGTCAAAATTTCATATGGGG
TGGTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTTTGAAATGGCTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTT
GGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGGAAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAA
GAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTG
TTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATTGACAAAA*GATCGTTGTGCTGGCTCG
AGCAGACGTAGCTAGA

QA 1 736 1 736
DS 

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CCCAAACAGTTTATCAGTTTCGCGGTTGGTTTCAGTCAAGTACGCCCCACAGAGACTCCC
TGTTTCCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATCTTATGACTCCGTTGAGACGAATCCTAGTGT
GGATTCTGTGATCGAGAAAGAGGAGAAGAACATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTC
CTTAAAATCATTGATTAGTCATCCCCATGGATCAGTAGGATCTCCTGCCTCTGGTAGTAC
TCAACTACAATGCAGTACCTGTAAAAAGATTTTCTCAGCTAATGCGACACATCTTGATTT
GGCTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTACACTGAACCCCTGCCTCTTTCAATCGAGTTATT
CAGGAATCCATTAGTCTCTTTCCTTTACGAGAGTGGTTGGCGTCAAAATTTCATATGGGG
TGGTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTTTGAAATGGCTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTT
GGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGGAAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAA
GAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTG
TTACGAGTTCTTGAAACAG*AAGCTAACCTAATTGACAAAAAGATCGTTGTGCTGGCTCG
AGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCT

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DS 

RD RR4AU03TF 883 0 0
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CCCAAACAGTTTATCAGTTTCGCGGTTGGTTTCAGTCAAGTACGCCCCACAGAGACTCCC
TGTTTCCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATCTTATGACTCCGTTGAGACGAATCCTAGTGT
GGATTCTGTGATCGAGAAAGAGGAGAAGAACATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTC
CTTAAAATCATTGATTAGTCATCCCCATGGATCAGTAGGATCTCCTGCCTCTGGTAGTAC
TCAACTACAATGCAGTACCTGTAAAAAGATTTTCTCAGCTAATGAGACACATCTTGATTT
GGCTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTACACTGAACCCCTGCCTCTTTCAATCGAGTTATT
CAGGAATCCATTAGTCTCTTTCTTTTACGAGAGAGGTTGGCGTCAAAATTTCATATTGGG
TGGTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTTTGAAATGGCTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTT
GGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGGAAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAA
GAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTG
TTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATTGACAAAAAGATCGTTGTGCTGGCTCG
AGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCTCAGTTGATGCTGTCCATGCTGGTGC
TGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTGTTGCTGAGATA*GCCGTGTTCTTAG
ACCTGGAG*AGTATTTGTTGCA**CACGTTCATCTATGATGGC

QA 1 883 1 883
DS 

RD RR4DJ21JQ 735 0 0
T
GTTGGCGTCAAAATTTCATATGGGGTGGTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTTTGAAATGG
CTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTTGGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGGAAGCG
GCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACT
ACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATTG
ACAAAAAGATCGTTGTGCTGGCTCGAGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCT
CAGTTGATGCTGTCCATGCTGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTG
TTGCTGAGATAAGCCGTGTTCTTAGACCTGGAGGAGTATTTGTTGCCACCACGTTCATCT
ATGATGGCCTTTTCCGTTTTATACCGTTCTTGGAGGATCTTCGCCAGGAAGTAATGAGAT
ATTCTGGTTCTCACATGTTTCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATCATGTG
GACTCGTTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAAC
CCAGCCAGATAAGCTCAGCTTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAAGTATATATACACA
ATCTTTCCGTTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGAGTTATAACAATGTAATAACATGCATT
TTAAATTTAAAACC

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DS 

RD RR4D601JQ 595 0 0
TGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGAATATGCTGCG
ACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATTGACAAAAAGATCGTTGTGCT
GGCTCGAGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCTCAGTTGATGCTGTCCATGC
TGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTGTTGCTGAGATAAGCCGTGT
TCTTAGACCTGGAGGAGTATTTGTTGCCACCACGTTCATCTATGATGGCCTTTTCCGTTT
TATACCGTTCTTGGAGGATCTTCGCCAGGAAGTAATGAGATATTCTGGTTCTCACATGTT
TCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATCATGTGGACTCGTTGGTTTCACTTG
TGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAACCCAGCCAGATAAGCTCAGC
TTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAAGTATATATACACAATCTTTCCGTTGTTGAAAA
TTTGGTTTAATTAGAGTTATAACAATGTAATAACATGCATTTTAAATTTAAAACC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4F017JQ 262 0 0
TTTT
TGCAAATCATGTGGACTCGTTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTT
TCGGCCACAAAACCCAGCCAGATAAGTTCAGCTTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAA
GTATATATACACAATCTTTCCGTTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGAGTTATAACAATGT
AATAACATGCATTTTAAATTTAAAACCTATATTGTAAAGTATTTTGCAAATGTTATTTTA
TTTACTACTGGCTTGTAT

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DS 

RD RR4GB37JQ 693 0 0
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TCTCGAGATTATTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGG
AGAATATGCTGCGACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATTGACAAAA
AGATCGTTGTGCTGGCTCGAGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCTCAGTTG
ATGCTGTCCATGCTGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTGTTGCTG
AGATAAGCCGTGTTCTTAGACCTGGAGGAGTATTTGTTGCCACCACGTTCATCTATGATG
GCCTTTTCCGTTTTATACCGTTCTTGGAGGATCTTCGCCAGGAAGTAATGAGATATTCTG
GTTCGCACATGTTTCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATCATGTGGACTCG
TTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAACCCAGCC
AGATAAGCTCAGCTTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAAGTATATATACACAATCTTT
CCGTTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGAGTTATAACAATGTAATAACATGCATTTTAAAT
TTAAAACCTATATTGTAAAGTATTTTGCAAATG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4AU03JQ 781 0 0
AATACTTGAAGCATGTTTTGGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGGAAGCGGCATGT
TCTCGAGATTATTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGG
AGAATATGCTGCGACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATTGACAAAA
AGATCGTTGTGCTGGCTCGAGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCTCAGTTG
ATGCTGTCCATGCTGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTGTTGCTG
AGATAAGCCGTGTTCTTAGACCTGGAGGAGTATTTGTTGCCACCACGTTCATCTATGATG
GCCTTTTCCGTTTTATACCGTTCTTGGAGGATCTTCGCCAGGAAGTAATGAGATATTCTG
GTTCTTACATGTTTCTGAGCGAACGTGAGCAGGAAGATCTCTGCAAATCATGTGGACTCG
TTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAACCCAGCC
AGATAAGCTCAGCTTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAAGTATATATACACAATCTTT
CCGTTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGAGTTATAACAATGTAATAACATGCATTTTAAAT
TTAAAACCTATATTGTAAAGTATTTTGCAAATGTTATTTTATCTACTACTGGCTTGTATA
ATTGATTTTTTTTCTCAAGACCAAACATGGGCCTAATCTACCATTTGCTGGTGTTTGAGA
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 10

CO CL438Contig1 745 10 13 U
CGTTCAAACTGTAAAGTTTTTTTTATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAACACATACA
GAAACCAAATAAAAATCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAA
ACATCCAACGATCGATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTTAGAGTTA
AAGATGTCGGCAAAGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATG
TCACCAACAACAGGAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCAATGTCCCAG
TCCAAAAACATGTCCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACG
TCCAGAACCGTCGACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCT
ATCATCCTTGTGTCACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGG
TAAGGATTCTTGACGGAGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACG
AAGTCTACGTCGTCCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAG
AAACCTTTGGCTTTGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTT
TGCTCCGATGATGACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTC
GAAATGATCAGATCTATATCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 

AF RR4EG69JQ U 6
AF RR4GN32JQ U 11
AF RR4AX20TF C 1
AF RR4EG69TF C 219
AF RR4FK36JQ U 65
AF RR4FK36TF C 65
AF RR4G846JQ U 11
AF RR4GN32TF C 53
AF RR4G846TF C 17
AF RR4AX20JQ U 25
BS 1 13 RR4AX20TF
BS 14 74 RR4EG69JQ
BS 75 75 RR4FK36JQ
BS 76 166 RR4EG69JQ
BS 167 167 RR4FK36JQ
BS 168 290 RR4EG69JQ
BS 291 291 RR4FK36JQ
BS 292 329 RR4EG69JQ
BS 330 330 RR4FK36JQ
BS 331 513 RR4EG69JQ
BS 514 514 RR4FK36JQ
BS 515 599 RR4EG69JQ
BS 600 745 RR4FK36JQ

RD RR4EG69JQ 594 0 0
AAACTGTA
AAGTTTTTTTTATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAACACATACAGAAACCAAATAAA
AGTCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACATCCAACGATC
GATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGAGGGTTTAGAGTTAAAGATGTCGGCAA
AGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCACCAACAACAG
GAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCGATGTCCCAGTCCAAAAACATGT
CCTTCATCAAACTTATAGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCAGAACCGTCG
ACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCATCCTTGTGT
CACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAGGATTCTTGA
CGGAGACCTTGGCGTGATAAGCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGTCTACGTCGT
CCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAA

QA 9 594 9 594
DS 

RD RR4GN32JQ 694 0 0
GTG
AAGTTTTTTTTATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAA*ACATACAGAAACCAAATAAA
AATCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACATCCAACGATC
GATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTTAGAGTTAAAGATGTCGGCAA
AGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCACCAACAACAG
GAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCAATGTCCCAGTCCAAAAACATGT
CCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCAGAACCGTCG
ACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCATCCTTGTGT
CACTCTTGAGGAGGTAAGAAATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAGGATTCTTGA
CGGAGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGTCTACGTCGT
CCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAGAAACCTTTGGCTT
TGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCTCCGATGATG
ACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTT

QA 4 694 4 694
DS 

RD RR4AX20TF 745 0 0
CGTTCAAACTGTAAAGTTTTTTTTATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAACACATACA
GAAACCAAATAAAAGTCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAA
ACATCCAACGATCGATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGAGGGTTTAGAGTTA
AAGATGTCGGCAAAGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATG
TCACCAACAACAGGAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCGATGCCCCAG
TCCAAAAACATGTCCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACG
TCCAGAACCGTCGACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCT
ATCATCCTTGTGTCACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGG
TAAGGATTCTTGACGGAGACCTTGGCGTGATAAGCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACG
AAGTCTACGTCGTCCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAG
AAACCTTTGGCTTTGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTT
TGCTCCGATGATGACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTC
GAAATGATCAGATCTATATCTCTCC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EG69TF 531 0 0
AGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCACCAACAACAGGAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTC
TAGTTGATAGTCGATGTCCCAGTCCAAAAACATGTCCTTCATCAAACTTATAGCTATGCT
GTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCAGAACCGTCGACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGG
ATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCATCCTTGTGTCACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTG
GCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAGGATTCTTGACGGAGACCTTGGCGTGATAAGCAGC
TCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGTCTACGTCGTCCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAAT
ATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAGAAACCTTTGGCTTTGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGA
TCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCTCCGATGATGACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAG
ACCTTTCAACTAGTTTTACTTCGAAATGATCAGATCTATATCTCT
ATCTCC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4FK36JQ 681 0 0
CCAAATAAAAATCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACAT
CCAACGATCGATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTTAGAGTTAAAGA
TGTCGGCAAAGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCAC
CAACAACAGGAAGGTCGATGGTTAGTACGATGTCTAGTTGATAGTCAATGTCCCAGTCCA
AAAACATGTCCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCA
GAACCGTCGACCCGTTCGCAACCAACGAACCGGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCA
TCCTTGTGTCACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAG
GATTCTTGACGGAGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGT
CTACGTCGTCCACGGTGGCTTCCGGAGTCGAAATATTGGCAGGCTTCTCTGCGAAGAAAC
CTTTGGCTTTGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCT
CCGATGATGACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTCGAAA
TGATCAGATCTATATCTCTCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4FK36TF 681 0 0
CCAAATAAAAATCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACAT
CCAACGATCGATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTTAGAGTTAAAGA
TGTCGGCAAAGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCAC
CAACAACAGGAAGGTCGATGGTTAGTACGATGTCTAGTTGATAGTCAATGTCCCAGTCCA
AAAACATGTCCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCA
GAACCGTCGACCCGTTCGCAACCAACGAACCGGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCA
TCCTTGTGTCACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAG
GATTCTTGACGGAGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGT
CTACGTCGTCCACGGTGGCTTCCGGAGTCGAAATATTGGCAGGCTTCTCTGCGAAGAAAC
CTTTGGCTTTGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCT
CCGATGATGACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTCGAAA
TGATCAGATCTATATCTCTCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4G846JQ 735 0 0
GCG
AAGTTTTTTTTATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAACACATACAGAAACCAAATAAA
AATCCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACATCCAACGATC
GATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTTAGAGTTAAAGATGTCGGCAA
AGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCACCAACAACAG
GAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCAATGTCCCAGTCCAAAAACATGT
CCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCAGAACCGTCG
ACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCATCCTTGTGT
CACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAGGATTCTTGA
CGGAGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGTCTACGTCGT
CCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAGAAACCTTTGGCTT
TGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCTCCGATGATG
ACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTCGAAATGATCAGAT
CTATATCTCTCC

QA 4 735 4 735
DS 

RD RR4GN32TF 697 0 0
A
ACATACAGAAACCAAATAAAAATC*TTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCAC
AACTGAAACATCCAACGATCGATTACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTT
AGAGTTAAAGATGTCGGCAAAGGAAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGAT
GGTAATGTCACCAACAACAGGAAGGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCAAT
GTCCCAGTCCAAAAACATGTCCTTCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAAC
CGGTACGTCCAGAACCGTCGACCCGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCC
AGACGCTATCATCCTTGTGTCACTCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGC
TTGAGGGTAAGGATTCTTGACGGAGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCAC
ACGTACGAAGTCTACGTCGTCCACGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTC
TGCGAAGAAACCTTTGGCTTTGTCCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTAC
ATCCTTTTGCTCCGATGATGACATTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTT
TTACTTCGAAATGATCAGATCTATATCTCT
ATCTCC

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4G846TF 729 0 0
TTTTTTTTATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAACACATACAGAAACCAAATAAAAAT
CCTTTATTAATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACATCCAACGATCGAT
TACGGATCGTACTTATTGAAAATCACTCAGCGGGTTTAGAGTTAAAGATGTCGGCAAAGG
AAGGGAGCTTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCACCAACAACAGGAA
GGTCGATGGTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCAATGTCCCAGTCCAAAAACATGTCCT
TCATCAAACTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCAGAACCGTCGACC
CGTTCGCAACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAGACGCTATCATCCTTGTGTCAC
TCTTGAGGAGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAGGATTCTTGACGG
AGACCTTGGCGTGATAATCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGTCTACGTCGTCCA
CGGTGGCTTCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAGAAACCTTTGGCTTTGT
CCAGCAAGCCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCTCCGATGATGACA
TTCTTTCTCTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTCGAAATGATCAGATCTA
TATCTCTCC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4AX20JQ 721 0 0
ATTCTTACCAACAACATGTTCAAAGGAACACATACAGAAACCAAATAAAAGTCCTTTATT
AATCCAACAACAAAACAAGAGTACTCCACAACTGAAACATCCAACGATCGATTACGGATC
GTACTTATTGAAAATCACTCAGAGGGTTTAGAGTTAAAGATGTCGGCAAAGGAAGGGAGC
TTGATCTCACCCTGAGTAGAGACAGGGATGGTAATGTCACCAACAACAGGAAGGTCGATG
GTTAGTCCGATGTCTAGTTGATAGTCGATGCCCCAGTCCAAAAACATGTCCTTCATCAAA
CTTATCGCTATGCTGTAAGGCACTTTAACCGGTACGTCCAGAACCGTCGACCCGTTCGCA
ACCAACGAACCCGGATCCGGTATCGTGCCAAACGCTATCATCCTTGTGTCACTCTTGAGG
AGGTAAGAGATCTGGCAAATAGGGATTGCTTGAGGGTAAGGATTCTTGACGGAGACCTTG
GCGTGATAAGCAGCTCCTTGAGCAGTCACACGTACGAAGTCTACGTCGTCCACGGTGGCT
TCCGGAGTCGGAATATTGGCAAGCTTCTCTGCGAAGAAACCTTTGGCTTTGTCCAGCAAG
CCTGAGATCAACGATCCCTTCTCTTCTACATCCTTTTGCTCCGATGATGACATTCTTTCT
CTGTTTTGTTTTAGACCTTTCAACTAGTTTTACTTCGAAATGATCAGATCTATATCTCTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 10

CO CL439Contig1 842 8 24 U
GGACGAGATACTTTTCGCAGAAACCTAGAGATCTTTTCGCAGAAACCTAGAGATTATTGG
TGTATTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGTAGAATCGACGAACAA
GAACGTTAAGAAGGCAAATCTTCTGGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTC
CGTCGCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGTCTGAGCAATCTCAA
GCTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTGGCTCTCGTTGCACAGTTCTACAACAAGAA
GTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGG
GGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCC
TGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTGA
TGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGT
CCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTT
GTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCAAAAGAAGA***ACCAAAGAA
GAAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAAATTATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCG
TTTTAGATAATTAAAAATCAATGGCGACATTTGGTCGAGATGACATTAATATTCCCTATA
AGAACATTCCAGTTTTTTTTTGTCATAACAAAACGAATCGAATTTTATCTGAGATTGTGG
AC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 15 50 25 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GE15TF U 39
AF RR4GE15JQ C 39
AF RR4EO25TF U 3
AF RR4FK83TF U 17
AF RR4GZ39TF U 1
AF RR4EO25JQ C 386
AF RR4BM06JQ C 251
AF RR4GZ39JQ C 422
BS 1 124 RR4GZ39TF
BS 125 125 RR4GE15TF
BS 126 584 RR4GZ39TF
BS 585 585 RR4GE15TF
BS 586 630 RR4GZ39TF
BS 631 631 RR4GE15TF
BS 632 689 RR4GZ39TF
BS 690 690 RR4GE15TF
BS 691 704 RR4GZ39TF
BS 705 705 RR4GE15TF
BS 706 731 RR4GZ39TF
BS 732 733 RR4GE15JQ
BS 734 751 RR4GZ39TF
BS 752 752 RR4GE15JQ
BS 753 768 RR4GZ39TF
BS 769 769 RR4GE15JQ
BS 770 780 RR4GZ39TF
BS 781 781 RR4BM06JQ
BS 782 787 RR4GZ39TF
BS 788 788 RR4BM06JQ
BS 789 800 RR4GZ39TF
BS 801 828 RR4BM06JQ
BS 829 829 RR4GZ39JQ
BS 830 842 RR4BM06JQ

RD RR4GE15TF 682 0 0
GG
AGAAACCTAGAGATTATTGGTGTATTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAG
AAGGTAGAATCGACGAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCTTCTGGAGCACAACTCGATC
AAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCGCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGAT
GTGAGTCTGAGCAATCTCAAGCTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTGGCTCTCGTT
GCACAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCA
TCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCC
ATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTTCA
AAGCTGCCGAGGTTCTCTGATGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCG
ATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGAT
GGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCA
AAAGAAGA***ACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAAATTATGTTCTT
TAAAACTCCTAAATGTTTCG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4GE15JQ 739 0 0
GG
AGAAACCTAGAGATTATTGGTGTATTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAG
AAGGTAGAATCGACGAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCTTCTGGAGCACAACTCGATC
AAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCGCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGAT
GTGAGTCTGAGCAATCTCAAGCTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTGGCTCTCGTT
GCACAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCA
TCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCC
ATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTTCA
AAGCTGCCGAGGTTCTCTGATGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCG
ATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGAT
GGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCA
AAAGAAGA***ACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAAATTATGTTCTT
TAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATAATTAAAAATCAATGGCGACATTTGGTCGAGA
TGACATTAATATTCCC
C

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR4EO25TF 728 0 0
GG
GAGATACTTTTCGCAGAAACCTAGAGATCTTTTCGCAGAAACCTAGAGATTATTGGTGTA
TTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAAC
ATTAAGAAGGCAAATCTTCTGGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTC
GCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGTCTGAGCAATCTCAAGCTG
ATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTGGCTCTCGTTGCACAGTTCTACAACAAGAAGTTT
CCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTG
TTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCGTTTTGTTCACCTATCCTCCTGAG
GGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTGATGAG
TACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAA
CTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTT
TGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCAAAAGAAGA***ACCAAAGAAGAAG
AAATGATGATTATATTATGGAGAAAATTATGTTCTTTAAA*CTCCTAAATGTTTCGTTTT
AGATAA

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR4FK83TF 711 0 0
GGCTTCCTCTTCGATACA
TTTCGCAGAAACCTAGAGATTATTGGTGTATTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAA
GATAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCTTCTGGAGCACAAC
TCGATCAAGCACATCCTTGACGAGTCCGTCGCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAG
GAGGATGTGAGTCTGAGCAATCTCAAGCTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGTTGGCT
CTCGTTGCACAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTCGATCGGATGC
ATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAG
AATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTG
TCTTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGATGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCA
AAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACG
AAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGAC
TATTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATGTTATGGAGAAAATAAT
GTTCTTTAAA*CTCCTAAATGTTTCGTTT
AGAT

QA 19 707 19 707
DS 

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TGTATTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGTAGAATCGACGAACAA
GAACTTTAAGAAGGCAAATCTTCTGGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTC
CGTCGCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGTCTGAGCAATCTCAA
GCTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTGGCTCTCGTTGCACAGTTCTACAACAAGAA
GTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGG
GGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCC
TGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTGA
TGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGT
CCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGCTCTTGTTGAGGGTTT
GTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAAGACTATGCAAAAGAAGA***ACCAAAGAA
GAAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAA*TTATGTTCTTTAAA*CTCCTAAATGTTTCG
TTTTAGATAAT**AAAATCAATGGCGACATT*GGTCGAGATGACATTA*TATTCCCTATA
*GAACAT*CCAGTTTTTTTT
GTCATACAAACGATCGA

QA 1 800 1 800
DS 

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AAGGAGAAGAATGCCGTTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGA
TTGGTTGTGTTTTCAAAGCTGCCGAGGTTTTTTGATGAGTACACTTTCACCATTGACAGT
GGTGATCCAAAATCGATTTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAA
TGGTTCACGAAAGATGGAGTTTTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTG
ATCAAGGACTATGCAAAAGAAGA***ACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTTTTTTATGGG
GAAAATTATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTTGTTTTAGATAATTAAAAATCAATGGG
GACATTTGGTCGAGATGACATTAATATTCCCTATAAGAACATTCCAGTTTTTTTTTGTCA
TAACAAAAAGAATTGAATTTT
TTTTG

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4BM06JQ 592 0 0
GGGACGATTATCATCGTGGTGGCTCTCGTTGCACAGTTTTACAACAAGAAGTTTCCGGAG
AACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAG
CTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCA
TTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTTTTCAAAGCTGCCGAGGTTTTTTGATGAGTACACT
CTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATTTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACC
AAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAA
GACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCAAAAGAAGA***ACCAAAGAAGAAGAAATGA
TGATTATATTATGGAGAAAATTATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATAA
TTAAAAATCAATGGCGACATTTGGTCGAGATGACATTAATATTCCCTATAAGAACATTCC
AGTTTTCTTTTGTCATAACAAAACGAATCGAATTTTATTTGAGATTGTGGAC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4GZ39JQ 421 0 0
GAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGGTTTTCTGAT
GAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATTTCAGCTGGGAAGTCAGTC
CAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGCTCTTGTTGAGGGTTTG
TTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCAAAAGAAGA***ACCAAAGAAG
AAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAAATTATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGT
TTTAGATAATTAAAAATCAATGGCGACATTTGGTCGAGATGACATTAATATTCCCTATAA
GAACATTCCAGTTTTCTTTTGTCATAACAAAACGAATCGAATTTTATCTGAGATTGTGGA
C

QA 1 421 1 421
DS 



CO CL439Contig2 727 2 7 U
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TAAGAAGGCAGAATCGACGAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCTGTTGGAGCACAACTC
GATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCTCTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGA
GGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTTGCTCT
CGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCAT
CGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGTTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAA
TGCCATATTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTC
TTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGATGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAA
ATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAA
AGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTA
TTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATGTTATGGAGAAAATAATGT
TCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATTATTAAAAATCAACGGCGACATTTGGTT
AGAGACG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H628TF U 1
AF RR4H628JQB C 1
BS 1 2 RR4H628JQB
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BS 654 654 RR4H628JQB
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BS 670 700 RR4H628TF
BS 701 727 RR4H628JQB

RD RR4H628TF 704 0 0
GG
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AGAAGGCAGAATCGACGAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCTGTTGGAGCACAACTCGA
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ATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTTGCTCTCG
TTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCG
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CCATATTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTCTT
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CGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAG
ATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATT
CAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATGTTATGGAGAAA*TAATGTTC
TTTAAA*CTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATTATTAAAA
TCAA

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR4H628JQB 727 0 0
GGGCAGAAACCTAGAGATTATTGGTGTATTCTCTGGATCCGATCTGTTCGCCATGGAAGA
TAAGAAGGCAGAATCGACGAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCTGTTGGAGCACAACTC
GATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTTTTTGACATCGTCAAGAGCCGTGGATACAAGGA
GGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGACGATTATCATCGTGGTTGCTCT
CGTTGCGCAGTTTTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCAT
CGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGTTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAA
TGCCATATTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTGGTTGTGTC
TTCAAAGCTGCCGAGATTTTTTGATGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAA
ATCGATTTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAA
AGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTA
TTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATGTTATGGAGAAAATAATGT
TCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATTATTAAAAATCAACGGCGACATTTGGTT
AGAGACG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 9

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AGACACAGCTTATAATGTTTCCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAAC
TGAATTCCAAGTGTGTACCCAATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAACTGAACAAT
GACGAGTAGGCTCTCATGGGGAAATCAAAGTCTTCTTCCTCTACGTCCACCCTTTCTACG
TGTACTGTCGGTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACG
AGCAAGGGCTCTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCC
AGTGGCACGGAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGAC
ATCTTGAGCAGCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAGCCTTGACCTT
CATCCCACCTGTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAA
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GTTGGACGATGGATGAAGAGAGACGAAATGCTAGGGGGTTTTGGAATTTTGGGATGCTGC
TCTTTCTCTGGGTGGGAGCTGTGGCAGTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ49JQ U 1
AF RR4GN04JQ U 291
AF RR4FF26JQ U 69
AF RR4DP57JQ U 70
AF RR4FF26TF C 69
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AF RR4G639JQ U 70
BS 1 278 RR4FZ49JQ
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RD RR4FZ49JQ 675 0 0
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ACGTGATATAGTCACTGTTACTCTTCTCATTCTCAAAACTCCAAATGCAACATTGAAGAA
AGACACAGCTTATAATGTTTCCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAAC
TGAATTCCAAGTGTGTACCCAATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAACTGAACAAT
GACGAGTAGGCTCTCATGGGGAAATCAAAGTCTTCTTCATCTACGTCCACCCTTTCTACG
TGTACTGTCGGTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACG
AGCAAGGGCTCTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCC
AGTGGCACGGAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGAC
ATCTTGAGCAGCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTAGTCACGGTCAGCCTTGACCTT
CATCCCACCTGTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAA
AGTGTCATTGAAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAAC
GGCGGGTCCGAGAGT

QA 1 675 1 675
DS 

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TGCCAAAACGAGCAAGGGCTCTAAAAGCAAACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCT
TGTTTCCTCCAGTGGCACGGAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATC
CTTGAGCGACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCAGCGTAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAG
CCTTGACCTTCATCCCACCTGTGATACAAACGAAAGTTTCTCTTCCAAAAAGATCAGTCA
CATGAATGAAAGTGTCATTGAAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTC
CGTCACGAACGGCGGG

QA 1 376 1 376
DS 

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T
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TTATAATGTTTCCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAACTGAATTCCA
AGTGTGTACCCAATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAACTGAACAATGACGAGTAG
GCTCTCATGGGGAAATCAAAGTCTTCTTCCTCTACGTCCACCCTTTCTACGTGTACTGTC
GGTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACGAGCAAGGGC
TCTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCCAGTGGCACG
GAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGACATCTTGAGC
AGCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAGCCTTGACCTTCATCCCACC
TGTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAAAGTGTCATT
GAAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAACGGCGGGTCC
GAGAGTGACGGTTTCCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCTCGACATGATGTTGGACGA
TGGATGAAGAGAGACGAAATG

QA 2 682 2 682
DS 

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G
GTCACTGTTACTCTTCTCATTCTCAAAACTCCAAATGCAACATTGAAGAAAGACACAGCT
TATAATGTTTCCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAACTGAATTCCAA
GTGTGTACCCAATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAAATGAACAATGACGAGTAGG
CTCTCATGGGGAAATCAAAGTCTTCTTCCTCTACGTCCACCCTTTCTACGTGTACTGTCG
GTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACGAGCAAGGGCT
CTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCCAGTGGCACGG
AGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGACATCTTGAGCA
GCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTCGTCACAGTCAGCCTTGACCTTCATCCCACCT
GTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAAAGTGTCATTG
AAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAACGGCGGGTCCG
AGAGTGACGGTTTCCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCTCGACATGATGTTGGACGAT
GGATGAAGAGAGACGAAATG

QA 2 681 2 681
DS 

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T
AGTCACTGTTACTCTTCTCATTCTCAAAACTCCAAATGCAACATTGAAGAAAGACACAGC
TTATAATGTTTCCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAACTGAATTCCA
AGTGTGTACCCAATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAACTGAACAATGACGAGTAG
GCTCTCATGGGGAAATCAAAGTCTTCTTCCTCTACGTCCACCCTTTCTACGTGTACTGTC
GGTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACGAGCAAGGGC
TCTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCCAGTGGCACG
GAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGACATCTTGAGC
AGCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAGCCTTGACCTTCATCCCACC
TGTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAAAGTGTCATT
GAAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAACGGCGGGTCC
GAGAGTGACGGTTTCCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCTCGACATGATGTTGGACGA
TGGATGAAGAGAGACGAAATGCTAGGGGGTTTTGGGATTTTGGGATGCTGCTCTTTCTCT
GGGTGGGAGCTGTGGCAGTGACCC

QA 2 745 2 745
DS 

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ATCAAAGTCTTCTTCATCTACGTCCACCCTTTCTACGTGTACTGTCGGTGGGAATCGGAG
TCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACGAGCAAGGGCTCTAAGAGCAGACT
GAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCCAGTGGCACGGAGCTTCACGTGCA
TGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCAG
CATAAGGAGAGGATTAGTCACGGTCAGCCTTGACCTTCATCCCACCTGTGATACGAACGA
GAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAAAGTGTCATTGAAAGATGCAAAGA
TGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAACGGCGGGTCCGAGAGTGACGGTTT
CCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCTCGACATGATGTTGGACGATGGATGAAGAGAGA
CGAAATGCTAGGGGGTTTTGGGATTTTGGGATGCTGCTCTTTCTCTGGGTGGGAGCT
CC

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DS 

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CTTTCTACGTGTACTGTCGGTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCAT
GCCAGAACGAGCAAGGGCTCTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTT
GTTTCCTCCAGTGGCACGGAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCT
TTGAGCGACATCTTGAGCAGCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAGC
CTTGACCTTCATCCCACCTGTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCAC
ATGAATGAAAGTGTCATTGAAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCC
GTCACGAACGGCGGGTCCGAGAGTGACGGTTTCCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCT
CGACATGATGTTGGACGATGGATGAAGAGAGACGAAATGCTAGGGGGTTTTGGAATTTTG
GGATGCTGCTCTTTCTCTGGGTGGGAGCTGTGGCAGT
CC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4GN04TF 670 0 0
CCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAACTGAAATCCAAGTGTGTACCC
AATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAACTGAACAATGACGAGTAGGCTCTCATGGG
GAAATCAAAGTCTTCTTCCTCTACGTCCACCCTTTCTACGTGTACTGTCGGTGGGAATCG
GAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACGAGCAAGGGCTCTAAGAGCAG
ACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCCAGTGGCACGGAGCTTCACGT
GCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCCTTGAGCGACATCTTGAGCAGCAAGCATAG
CAGCGTAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAGCCTTGACCTTCATCCCACCTGTGATACGAA
CGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAAAGTGTCATTGAAAGATGCAA
AGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAACGGCGGGTCCGAGAGTGACGG
TTTCCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCTCGACATGATGTTGGACGATGGATGAAGAG
AGACGAAATGCTAGGGGGTTTTGGGATTTTGGGATGCTGCTCTTTCTCTGGGTGGGAGCT
GTGGCAGT
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4G639JQ 725 0 0
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TTATAATGTTTCCGAAGTAACATGAAAAGATAAATTGTAACGAGACAGAACTGAATTCCA
AGTGTGTACCCAATAAACAACCAGAGTCAAAAGGGACAACAACTGAACAATGACGAGTAG
GCTCTCATGGGGAAATCAAAGTCTTCTTCCTCTACGTCCACCCTTTCTACGTGTACTGTC
GGTGGGAATCGGAGTCACATCCTCTATACGACCAATCTTCATGCCAGAACGAGCAAGGGC
TCTAAGAGCAGACTGAGCACCAGGACCTGGAGTCTTGGTCTTGTTTCCTCCAGTGGCACG
GAGCTTCACGTGCATGGCTGTGATGCCGAGCTCCTTGCATCTTTGAGCGACATCTTGAGC
AGCAAGCATAGCAGCATAAGGAGAGGATTCGTCACGGTCAGCCTTGACCTTCATCCCACC
TGTGATACGAACGAGAGTTTCTCTTCCAGAAAGATCAGTCACATGAATGAAAGTGTCATT
GAAAGATGCAAAGATGTGAACAACACCGAAAACTTGCTCTCCGTCACGAACGGCGGGTCC
GAGAGTGACGGTTTCCTCCTTGGGCTCTCTGGTCTTTCTCCTCGACATGATGTTGGACGA
TGGATGAAGAGAGACGAAATGCTAGGGGGTTTTGGAATTTTGGGATGCTGCTCTTTCTCT
GGGTG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 2 8

CO CL441Contig1 693 6 3 U
GGAATGGCGTTCTCAACGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCTCTTTCGAGGATCTCCTCTTCA
CTGCCACTTTCTTCTAGAAGATTCTCTCTTCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCA
GAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCATACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCA
GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
CAAATCGTTCGTGTAGACAAGGATAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGT
CATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTTCTGGAC
ATTCGCGTCTTT*GAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACCGC
ACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACT
ATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGA
TAACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAGAGTTTTACAATGTATCAAATGAGTTACC
GCAGTCAAAAAAACTGTTGTGGAATGTAAAAAAAATGTGATGAGACTGAATCTTACAAAA
AGAATGCAGCTTCCATAGTTGCATACCTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 

AF RR4A344TFB U 1
AF RR4GV65TF U 75
AF RR4GV65JQ C 88
AF RR4A344JQ C 89
AF RR4A344TF U 408
AF RR4A344JQD C 90
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BS 397 407 RR4GV65JQ
BS 408 693 RR4A344TF

RD RR4A344TFB 400 0 0
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GAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCATACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCA
GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
CAAATCGTTCGTGTAGACAAGGATAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGT
CATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTTCTGGAC
ATTCGCGTCTTT*GAGACAGGAGAGTATGCCCTTGT
GGGA

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4GV65TF 315 0 0
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GAAACAGAGCACACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCAGCTTCAACCAAAAC
CCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAAATCGTTCGTGT
AGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTA
CAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTTCTGGACATTCGCGTCTTTTG
AGACAGGAGAGTATG

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR4GV65JQ 601 0 0
C
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AGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCAGCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTC
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ACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATT
ACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTTCTGGACATTCGCGTCTTT*GAGACAGGAGAGTAT
GCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACCGCACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTC
ATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAAT
GCAACTGATACGATG**TTGTGAGATGAATGATAACGCAATGGAACCACCATGATCATGT
CAAGAGTTTTACAATGTATCAAATGAGTTACCGCAGTCAAAAAAACTGTTGTGGAATGTA
AAAAAAATGTGATTAGACTGAATCTTACAAAAAGAATGCAGCTTCCATAGTTGCATACCT

QA 2 601 2 601
DS 

RD RR4A344JQ 605 0 0
TTCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCAGAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCATAC
AGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCAGCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTC
CCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAAATCGTTCGTGTAGACAAGGATAAGT
ACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATT
ACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTTCTGGACATTCGCGTCTTT*GAGACAGGAGAGTAT
GCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACCGCACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTC
ATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAAT
GCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGATAACACAATGGAACCACCATGATCATGT
CAAGAGTTTTACAATGTATCAAATGAGTTACCGCAGTCAAAAAAACTGTTGTGGAATGTA
AAAAAAATGTGATGAGACTGAATCTTACAAAAAGAATGCAGCTTCCATAGTTGCATACCT
AAACC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4A344TF 286 0 0
GTATCCCAACCGCACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTG
TTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATGCAACTGATACGATGGGTT
GTGAGATGAATGATAACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAGAGTTTTACAATGTAT
CAAATGAGTTACCGCAGTCAAAAAAACTGTTGTGGAATGTAAAAAAAATGTGATGAGACT
GAATCTTACAAAAAGAATGCAGCTTCCATAGTTGCATACCTAAACC

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR4A344JQD 604 0 0
TCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCAGAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCATACA
GACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCAGCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCC
CAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAAATCGTTCGTGTAGACAAGGATAAGTA
CCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTA
CATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTTCTGGACATTCGCGTCTTT*GAGACAGGAGAGTATG
CCCTTGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACCGCACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCA
TCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATG
CAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGATAACACAATGGAACCACCATGATCATGTC
AAGAGTTTTACAATGTATCAAATGAGTTACCGCAGTCAAAAAAACTGTTGTGGAATGTAA
AAAAAATGTGATGAGACTGAATCTTACAAAAAGAATGCAGCTTCCATAGTTGCATACCTA
AACC

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL441Contig2 540 2 9 U
TTCTCTTTCGACAATCTCCTCTTCACCAGCTCCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAA
GAAACCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACCT
CAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACAT
CTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGACATTCGCGTCTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCT
TGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACCGCACCGGCGTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAA
GTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCTACAAGAAGAATGCAAC
TGATGGGTTCTGAGATGAATGATAACAATGTAACCACCATGATCATCATGTCAAGAGTTT
TACAATGTATCAAATGAGTTACCGTAGTAAAAAAAAACTGTTGTGGTATGTAAAAAAAAA
TGTGATGAGACCGAATCTTACAAAAAGAATGCAGCTTTCCATAGTTGCATACCTAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES47JQ C 1
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QA 1 478 1 478
DS 



AS 3 9

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GAATCCAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP56JQ U 1
AF RR4GT47JQ U 1
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QA 1 635 1 635
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TACACCACCGTTCTCACTTCCCTCATGTAGAACCGGAAATGTGGGTTCAAATAACGGTCG
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QA 1 731 1 731
DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F932TF U 9
AF RR4FU65TF U 1
AF RR4GT47TF U 1
AF RR4FP56TF U 1
BS 1 220 RR4FP56TF
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BS 225 790 RR4FP56TF

RD RR4F932TF 273 0 0
GG
ATTTTCGTTTGATTAAAGTGTGTAGCAATTAGCCATGGACGGTGGAGCGGAAGGATCTCA
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DS 

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CCTTTTTCTACATGGATTTCGACCTTGTGTCCAAAAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGT
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GCATGTCCACCAGAAATTTTAACAAGGCTGCCAGCTTATTTTTGGATTCTATCTCAACCT
TCACGACTTATGAGATTTTTCCTTACGAGACCTTCATTTTCTACACCGTCCAGACAGCAT
CATAACTCTCGACAGAGTTTCGCTTAAGCAGAGTTGTTGACGCCCCTGAGATCTTAACCG
TGCTGGGAAG

QA 1 790 1 790
DS 



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ACATCGTTTCTCACACCTTAAGATTCTACCCATTTGAGTTTTGCAAGTCGTTGCAGTTTT
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CTTCTGGATCCGGTTAAGTAAGAAGTCCCCTTGCTTGATTGTTGCCTGGTAAAGTGCATT
CTTTGCATCTGGACGGTTAGTCTCCAAAACACCTGCAACCTTGTCTATCTTGCAGTGAAG
CTTCCCAGCTGCAATGAAGCGTGACAGCTCCTGATCGATGAAATCCACGGAAACACCAAA
GGCATTTGCCATCGCATCCACCGTTACGCTCTTGTAAGACTCCAAAAACTGAGAGTACAC
CACCGTTCTCACTTCCCTCATATAGAACCGGAAATGTGGGTTCAAATAGCGGTCGAACTT
TATCTGCTCCGCCATTCCAGCGAATGCTGAGAAAAACGCCTTGTACTGGCACTCGTACAA
GGAGTTCAGGAACTCAGAAAGGAATGGTATCTTCCCAAGCACGGTTAAGATCTCAGGTGC
GTCAACAACCTTCTGCTTAAGCGAAACTCTGTCGAGAGTTATGATGCTCGTCAGGACGGT
GTAGAAAATGAAGGTCTCGTAGGGAAAGATCTCATAAGTCGTGAAGGTTGAGATAGAATC
CAAAAATAAGCTGGCAGCCTTCTTAAATTTCTGGTGGACATGCAATACAAGCCTTCATAG
ACCTTTAGCCTGTTCTTCCTCTCCAGTCACCCCCTCTTCAACACTTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU65JQ U 1
AF RR4GV57JQ U 24
AF RR4F932JQ U 41
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RD RR4FU65JQ 729 0 0
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GTAGAAAAT

QA 1 729 1 729
DS 

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TTC
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ATTTCTGGTGGACATGTAATACAAGCCT

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DS 

RD RR4F932JQ 850 0 0
CG
CCACTGAAACCAATCAACTAGATTCAAAAGAGATAAGAACTAGAGTCATAAGAAAGAACA
GGCGGGTGTTGATCTCAAACATCGTTTCTCACACCTTAAGATTCTACCCATTTGAGTTTT
GCAAGTCGTTGCAGTTTTGAAGAAAAGTGCTAAACAGAAACATGTGAGACACGCTCACAG
ATCGATGACTCGTGACAGCTTCTGGATCCGGTTAAGTAAGAAGTCCCCTTGCTTGATTGT
TGCCTGGTAAAGTGCATTCTTTGCATCTGGACGGTTAGTCTCCAAAACACCTGCAACCTT
GTCTATCTTGCAGTGAAGCTTCCCAGCTGCAATGAAGCGTGACAGCTCCTGATCGATGAA
ATCCACGGAAACACCAAAGGCATTTGCCATCGCATCCACCGTTACGCTCTTGTAAGACTC
CAAAAACTGAGAGTACACCACCGTTCTCACTTCCCTCATATAGAACCGGAAATGTGGGTT
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GTACTGGCACTCGTACAAGGAGTTCAGGAACTCAGAAAGGAATGGTATCTTCCCAAGCAC
GGTTAAGATCTCAGGTGCGTCAACAACCTTCTGCTTAAGCGAAACTCTGTCGAGAGTTAT
GATGCTCGTCAGGACGGTGTAGAAAATGAAGGTCTCGTAGGGAAAGATCTCATAAGTCGT
GAAGGTTGAGATAGAATCCAAAAATAAGCT***AGCCTTCTTAAATTTCTGGTGGACATG
CAATACAAGCCTTCATAGACCTTTAGCCTGTTCTTCCTCTCCAGTCACCCCCTCTTCAAC
ACTTTTAG

QA 3 850 3 850
DS 



AS 2 9

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TATTACTATTTGTTATATACACAAACTGACAAAAGCAACAGAAATTTTCGATAAAAATAA
ACTAAAAAA*TATATTAGCCTCTCTAGCCATGAATATAAGCAAA*GTGATTAATCAAAGC
TAAAGCATTACTCGTTAGATGAGCAATAACCAAAATCCTCCC*TCTAACCAAATCCTTGA
CTTTCCCATTCATGTCAGCTCCTCCAAAACCATCCGAGCACGTGTTCTCATCGGTCAGAG
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TTGCTGATGTGGCTTTAACCGAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATGAGTT
TGTGGCTGGTTTGGATGAGACTGGATTGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTTTTTGAT
ATGTTGTGAATTTGCATGATGATTTTACGAACTCCGTGTTTGTTGTTGTTGCTGTATGGA
CCGACTTGAGCGTGGTTATCGTAATGGTAATGAGAAGAGATGTGAGGAAGTGATGATTAA
ATCTAAGAGATCCAGCCATTCTTATATAGTATGAGTTATATGAGATTGTGAATGTGATGA
TGTTGCTGTCC


BQ
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO69JQ U 24
AF RR4E936JQ U 4
AF RR4AZ16JQ U 1
AF RR4B243TF C 1
AF RR4AZ16TF C 1
AF RR4B243JQ U 1
AF RR4E936TF C 39
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BS 559 559 RR4E936JQ
BS 560 774 RR4AZ16JQ
BS 775 791 RR4E936TF

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AACTGACAAAAGCAACAGAAATTTTCGATAAAAATAAACTAAAAAA

QA 1 106 1 106
DS 

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TACTATTTGTTATATACACAAACTGACAAAAGCAACAGAAATTTTCGATAAAAAGAAACT
AAAAAA*TATATTAGTCTCTCTAGCCATGAATATAAGCAAA*GTGACTAATCAAAGCTAA
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TCCCATTCATGTCAGCTCCTCCAAAACCATCCGAGCACGTGTTCTCATCGGTCAGAGCCG
CGCTAACCCAAGTCTGAATATCACTCATGTAGATTTCGTAGTTCGAGCCACTTAACAGAC
CCATCTCACCTATCGATTTCCTAAGC**CGCCAACGTGTCACCTAGCTCCTCAACGCAGT
CTCTCATGGCCGAGACTTCTCTGGGCTTGAGCTGACTACTCGAGAGACGCACCATCATTG
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GGCTGGTTTGGATGAGACTGGATTGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTTTTTGATATG
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QA 1 688 1 688
DS 

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QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4B243TF 774 0 0
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TATTACTATTTGTTATATACACAAACTGACAAAAGCAACAGAAATTTTCGATAAAAATAA
ACTAAAAAA*TATATTAGCCTCTCTAGCCATGAATATAAGCAAAAGTGATTAATCAAAGC
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CTTTCCCATTCATGTCAGCTCCTCCAAAACCATCCGAGCACGTGTTCTCATCGGTCAGAG
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TGTGGCTGGTTTGGATGAGACTGGATTGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTTTTTGAT
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QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AZ16TF 774 0 0
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ATCTAAGAGATCCAGCCATTCTTATATAGTATGAGTTATATGAGATTGTGAATG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4B243JQ 774 0 0
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TATTACTATTTGTTATATACACAAACTGACAAAAGCAACAGAAATTTTCGATAAAAATAA
ACTAAAAAA*TATATTAGCCTCTCTAGCCATGAATATAAGCAAA*GTGATTAATCAAAGC
TAAAGCATTACTCGTTAGATGAGCAATAACCAAAATCCTCCC*TCTAACCAAATCCTTGA
CTTTCCCATTCATGTCAGCTCCTCCAAAACCATCCGAGCACGTGTTCTCATCGGTCAGAG
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TTGCTGATGTGGCTTTAACCGAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGAGCCATGAGTT
TGTGGCTGGTTTGGATGAAACTGGATTGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAGAGTTTTTGAT
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ATCTAAGAGATCCAGCCATTCTTATATAGTATGAGTTATATGAGATTGTGAATG

QA 1 774 1 774
DS 

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TCAC*TCTAACCAAATCCTTGACTTTCCCATTCATGTCAGCTCCTCCAAAACCATCCGAG
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TATGAGATTGTGAATGTGATGATGTTGCTGTCC

QA 1 753 1 753
DS 



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CCCTCTAACCAAATCCTTGACTTTCCCATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BL56JQ U 1
AF RR4CS40JQ U 67
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CAAAAATTTTTCAAAAAAAAAAAACTAAAAAATATATTATTCTCTCTAGCCATGAATATA
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CCCTCTAACCAAATCCTTGACTTTCCCATT

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DS 

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T
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ACCAAATCCTTGACTTTCCCATT

QA 2 144 2 144
DS 



AS 2 7

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AGTCGTTCCCACGGTCAATTCTATGTTCATATGGTAAAGACCCTTCTTATTTGTCATCTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CH57JQ U 337
AF RR4EV38JQ U 1
AF RR4CZ74TF C 405
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T
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TGGAA

QA 2 126 2 126
DS 

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TCTATATTTTCTAAAAATTATGTATTCAACAACATAGTTCTCTCTCGCTTTGATGGCTTA
TTCTGAGGGAGGCCCTGCCTGTCGTAAAGAAAAAGCCATGTCCTGAAGCAAGTTGAGCAT
TTTTTTGGAGGTTTTGATGGTGAACCCACGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTAAA
TGGAGGATATGGCTGGAAGTATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCC
ACCGCTACATTTTTTGTATTCTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAACCGTTC
TTGATCTACATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTAC
TTTCTCTTTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTAT
CGGGATAGATATAGTCGTCAGCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAGCTTTCTCTACCATGAC
GACCCGCTTCGGACCATTCTCCTTCAGAACCTTTCTTGATGTGTTTTTC
TTGATAACAAACAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4CZ74TF 665 0 0
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CTTTCATCAATATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTT
CCATAGTTAGATGTATCGGGATAGATATAGTCGTCAGCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAG
CTTTCTCTACCATGACGACCCGCTTCGGACCATTCTCCTTCAGAACCTTTCTTGATGTGT
TTTTCATTAGGAAACGCCACTTCTCCCTATCGAAAAACGGATCGCTTTCAGTCATCACGT
AGTAGACAATATTAGGAGTCGTTCCCACGGTCAATTCTATGTTCATATGGTAAAGACCCT
TCTTATTTGTCATCTTGATCTTGGGAGGTGTATTATGCCATGGATGCTTCTTCTCTGCTT
CATGCCAAAGTCCCTCTTGTCTCGTGTCCTCCTTTTCATCATAATACACCACCTCCTCCT
CCTCCTTCTTCTTAGTAGTGTCTTTCTCTGACTCCGACTTAGATTCGCCATTTTCAGATC
TCTGGGACTCGGCCTTAAGAGGCTGTTGACTGTTCAAATTGATCCAGCTACCAAATCCAG
TGAACACACCCATTTAATATTCGAAAGTTTAGCCTACTAAAACTGATTAGAGCAAAAGTA
AATCC

QA 1 665 1 665
DS 



CO CL444Contig2 1335 4 6 U
GGATAATATATATCCACAAGCTTTAATTTAGATCCTTCATTTGCTCCTGCTCTCATCAGT
TTTGGTAGGCTAAACTTTCCAATAGAAATGGGTGTATTCCCTGGATTTGGTGCCTGGATC
AATCAGAACAATCAAGAGTCTCCTAATGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGTCGAGTCC
AAGTCGGCGTCAGAGAAAGACACTAATAATGCTCATTTTAAGAAGAAGAAGAAGGATGTG
ATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACAAGGGCTTTGGTATGAAGCAGAGAAG
AAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAAGGTGACAAATAAAAAGGGTCTTTAC
CATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACAGCTCCTGATACACTCTATGGATTGATGATT
GAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAAGTGGCGCGACCTAATGAAAAACACA
TCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGGAGAAAGCTGTA
GCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAACTATGGTAGAA
AACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGATGAAAGAGTTC
CACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGCAAAAAGAAG
TCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAATGTAGTGGTGGCCGAGGAAGGGTTGCGTCA
AAGCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAATATACCGCCGCTTTCT
TGGTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAAGCTGCTCAGCGCGCTTCAGGAG
ATGGCTTCGATTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGAAGAAATCATCAAAGCGAGTGAG
AAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAGATTGTCGTCA
AACATACAAAAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATCTTGGTATCGACTACGTACCGCA
GCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGTGATTTAACATATCAC
AAGATGAAGGGCTACATGATACACCTAAGTGAAGACACGAAGAAATAAACATGGAAAGCA
CTTACTTCGTTCAATGAACATACGCAATTTCATGTTTGTAAAAAAAAGAGTCTTATACAA
ATATAAGAACACAAACATATGTAGTGCTAGATTGATTAGTTACTAATGGGCTTTAGAAAA
GTGTCTGGTCCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F002TF U 1
AF RR4G714TF U 50
AF RR4G714JQ C 399
AF RR4FB28TF U 782
BS 1 712 RR4F002TF
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RD RR4F002TF 712 0 0
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TTTGGTAGGCTAAACTTTCCAATAGAAATGGGTGTATTCCCTGGATTTGGTGCCTGGATC
AATCAGAACAATCAAGAGTCTCCTAATGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGTCGAGTCC
AAGTCGGCGTCAGAGAAAGACACTAATAATGCTCATTTTAAGAAGAAGAAGAAGGATGTG
ATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACAAGGGCTTTGGTATGAAGCAGAGAAG
AAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAAGGTGACAAATAAAAAGGGTCTTTAC
CATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACAGCTCCTGATACACTCTATGGATTGATGATT
GAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAAGTGGCGCGACCTAATGAAAAACACA
TCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGGAGAAAGCTGTA
GCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAACTATGGTAGAA
AACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGATGAAAGAGTTC
CACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4G714TF 667 0 0
CTCTCATCAGTTTTGGTAGGCTAAACTTTCCAATAGAAATGGGTGTATTCCCTGGATTTG
GTGCCTGGATCAATCAGAACAATCAAGAGTCTCCTAATGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAA
ATGTCGAGTCCAAGTCGGCGTCAGAGAAAGACACTAATAATGCTCATTTTAAGAAGAAGA
AGAAGGATGTGATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACAAGGGCTTTGGTATG
AAGCAGAGAAGAAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAAGGTGACAAATAAAA
AGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACAGCTCCTGATACACTCTATG
GATTGATGATTGAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAAGTGGCGCGACCTAA
TGAAAAACACATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGG
AGAAAGCTGTAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAA
CTATGGTAGAAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGA
TGAAAGAGTTCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGT
GCAAAA
G

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4G714JQ 747 0 0
TACACTCTATGGATTGATGATTGAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAAGTG
GCGCGACCTAATGAAAAACACATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGA
CATCATGGTGGAGAAAGCTGTAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCC
GATACATCTAACTATGGTAGAAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAA
AGTAATGTTGATGAAAGAGTTCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCA
AGAACGGCTGTGCAAAAAGAAGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAATGTAGTGG
TGGCCGAGGAAGGGTTGCGTCAAAGCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCC
ATTTAATATACCGCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAA
GCTGCTCAGCGCGCTTCAGGAGATGGCTTCGATTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGA
AGAAATCATCAAAGCGAGTGAGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATA
GAACTATAGAAGATTGTCGTCAAACATACAAAAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATC
TTGGTGTCGACTACGTACCGCAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAAT
TATTTGTGATTTAACATATCACAAGA
C

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4FB28TF 554 0 0
G
GCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAATATACCGCCGCTTTCTTG
GTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAAGCTGCTCAGCGCGCTTCAGGAGAT
GGCTTCGATTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGAAGAAATCATCAAAGCGAGTGAGAA
AGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAGATTGTCGTCAAA
CATACAAAAGCCGTTTACCGCTTATTAGCGATTATCTTGGTATCGACTACGTACCGCAGC
TAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGTGATTTAACATATCACAA
GATGAAGGGCTACATGATACACCTAAGTGAAGACACGAAGAAATAAACATGGAAAGCACT
TACTTCGTTCAATGAACATACGCAATTTCATGTTTGTAAAAAAAAGAGTCTTATACAAAT
ATAAGAACACAAACATATGTAGTGCTAGATTGATTAGTTACTAATGGGCTTTAGAAAAGT
GTCTGGTCCATTT

QA 2 554 2 554
DS 



AS 2 10

CO CL445Contig1 701 4 3 U
TATAAACACCAAAACGTTTAGCATAATCACAACAAATATATAGGTAGATTAAGGACATAA
CAATGACAAGGAAATATTACATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTA
GTACGCACTTATTTAAATTTATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCA
TGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCT
TCTTAGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAG
GAGTACCGGCGGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCT
TCTCCAGGTACTGACCAGTGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCAT
CTAAGATATCAGCGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTAC
GAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATG
AAGCTGGTCTGTTGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTG
GTTTGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGGTCGGAGAGGAAGTTCATCTTTCGTTTTTTTT
**TCTTTGTTTGCTGACTTTGATTTCTTGTGGTGGATGTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4C710TF C 234
AF RR4DR21TF C 1
AF RR4DR21JQ U 2
AF RR4C710JQ U 20
BS 1 1 RR4DR21TF
BS 2 697 RR4DR21JQ
BS 698 701 RR4C710JQ

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GGGGGAGGAGTACCGGCGGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTC
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GAGG

QA 1 304 1 304
DS 

RD RR4DR21TF 699 0 0
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TCTTAGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAG
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GTTTGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGGTCGGAGAGGAAGTTCATCTTTCGTTTTTTTT
**TCTTTGTTTGCTGACTTTGATTTCTTGTGGTGGAT
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DR21JQ 698 0 0
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AATGACAAGGAAATATTACATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAG
TACGCACTTATTTAAATTTATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCAT
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CTTAGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAGG
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*TCTTTGTTTGCTGACTTTGATTTCTTGTGGTGGAT
CC

QA 1 696 1 696
DS 

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C
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ATTAATACA**GTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTA
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QA 2 682 2 682
DS 



CO CL445Contig2 701 6 8 U
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CTTTGTTTGCTGACTTTGATTTCTTGTGGTGGATGTAAGCC


BQ
10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 

AF RR4HA54TF C 1
AF RR4HA54JQB U 1
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AF RR4B603TF C 4
AF RR4BA06TF C 4
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QA 4 536 4 536
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CC

QA 1 696 1 696
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QA 1 698 1 698
DS 

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QA 1 698 1 698
DS 

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TGTTTGCTGACTTTGATTTCTTGTGGTGGATGTAAGCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 10

CO CL446Contig1 1372 10 19 U
AGGGAAACCATCTCTCTTTCCTCACCCTTTTGGTAGTTTTGTTCTTAGAGAGAGATGGCG
AGAATGTGTTTTATGATGATGATTATGGTTGCTGTGGCCATTAACATGGTTGCTAGTGAT
CCAATTGCACCGTGTTACTTTATATTTGGTGACTCTTTGGTTGATAATGGCAATAATAAT
CAGCTTAATTCACTAGCTAGAGCCAATTACTTTCCTTATGGTATTGATTTCTCTTTCGGT
CCAACCGGTCGGTTTAGCAACGGCAAAACTACTGTCGATGTTATCACTGAGCTTTTGGGT
TTCGACGACTACATTACACCATATGCAGCGGCGAGAGGAGAAGACATCCTCCGTGGAGTC
AACTATGCTTCTGCTGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACAGGCAGACAATTGGGAGGTAGA
ATAGCGTTTGCAGGTCAAGTAGCAAATCACGTGAACACAGTGTCACAAGTAGTGAACATA
CTCGGCGATGAGAACCAAGCCTCCAGTTACCTCAGCAAATGCATTTACTCTATCGGCTTA
GGCAGTAACGATTACCTCAACAACTACTTCATGCCCACTTTCTACTCTACCGGTAACCAG
TTCTCTCCTGAATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATA
TTGTATAACAATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGC
CCGAACGAGCTAGCTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCT
GCGAACAGAATTTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACT
CCTGATGCTAAGTTCACTT*ACATAAACGCATACGGCATCTT*CCAAGACATCGTTACAA
ACCC*TGCTCGCTACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTT*GTGGAGTT*GGGAGGA
ATAATGGACAGATAACTT*GTCTTCCTGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTAT
GTGTTTTGGGATGCGTTTCATCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGGAACAAGATCG
TTTAAGCGAGAAGCTGCTTCTGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCAACTCTC
TAAGTTGAGAGTGACAAGAAAGATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGA
TAATGGTAACTGAGTTTGGACTCATGAAGAGAAAGTGATGTGTGTGATGTGATAAGTGTT
TATGTAAGGATTTTGAGCTACAGTTTTATCTTTTATATTTTTCTTTCTATTATAAATTTG
ATTATTTCATTTTCTAATTTAGTTACATTATTTCTAATGAATCTACAATTGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 20 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F131TF U 3
AF RR4DB67TF U 1
AF RR4BC25TF U 2
AF RR4CM09TF U 551
AF RR4DB67JQ C 704
AF RR4F482TF U 540
AF RR4F482JQ C 612
AF RR4BC25JQ C 428
AF RR4CM09JQ C 514
AF RR4F131JQ C 621
BS 1 149 RR4DB67TF
BS 150 150 RR4BC25TF
BS 151 457 RR4DB67TF
BS 458 458 RR4BC25TF
BS 459 537 RR4DB67TF
BS 538 791 RR4BC25TF
BS 792 792 RR4F482TF
BS 793 856 RR4BC25TF
BS 857 955 RR4F482TF
BS 956 956 RR4CM09TF
BS 957 1069 RR4F482TF
BS 1070 1070 RR4BC25JQ
BS 1071 1092 RR4F482TF
BS 1093 1093 RR4BC25JQ
BS 1094 1133 RR4F482TF
BS 1134 1134 RR4BC25JQ
BS 1135 1281 RR4F482TF
BS 1282 1328 RR4BC25JQ
BS 1329 1372 RR4CM09JQ

RD RR4F131TF 298 0 0
GG
AAACCATCTCTCTTTCCTCACCCTTTTGGTAGTTTTGTTCTTAGAGAGAGATGGCGAGAA
TGTGTTTTATGATGATGATTATGGTTGCTGTGGCCATTAACATGGTTGCTAGTGATCCAA
TTGCACCGTGTTACTTTATATTTGGTGACTCTTTGGTTGATAATGGCAACAATAATCAGC
TTAATTCACTAGCTAGAGCCAATTACTTTCCTTATGGTATTGATTTCTCTTTCCGTCCAA
CCGGTCGGTTTAGCAACGGCAAAACTACTGTCGATGTTATCACTGAGCTTTTGGGT

QA 3 298 3 298
DS 

RD RR4DB67TF 537 0 0
AGGGAAACCATCTCTCTTTCCTCACCCTTTTGGTAGTTTTGTTCTTAGAGAGAGATGGCG
AGAATGTGTTTTATGATGATGATTATGGTTGCTGTGGCCATTAACATGGTTGCTAGTGAT
CCAATTGCACCGTGTTACTTTATATTTGGAGACTCTTTGGTTGATAATGGCAATAATAAT
CAGCTTAATTCACTAGCTAGAGCCAATTACTTTCCTTATGGTATTGATTTCTCTTTCGGT
CCAACCGGTCGGTTTAGCAACGGCAAAACTACTGTCGATGTTATCACTGAGCTTTTGGGT
TTCGACGACTACATTACACCATATGCAGCGGCGAGAGGAGAAGACATCCTCCGTGGAGTC
AACTATGCTTCTGCTGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACAGGCAGACAATTGGGAGGTAGA
ATAGCGTTTGCAGGTCAAGTAGCAAATCACGTGAACATAGTGTCACAAGTAGTGAACATA
CTCGGCGATGAGAACCAAGCCTCCAGTTACCTCAGCAAATGCATTTACTCTATCGGC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4BC25TF 855 0 0
GGA
AAACCATCTCTCTTTCCTCACCCTTTTGGTAGTTTTGTTCTTAGAGAGAGATGGCGAGAA
TGTGTTTTATGATGATGATTATGGTTGCTGTGGCCATTAACATGGTTGCTAGTGATCCAA
TTGCACCGTGTTACTTTATATTTGGTGACTCTTTGGTTGATAATGGCAATAATAATCAGC
TTAATTCACTAGCTAGAGCCAATTACTTTCCTTATGGTATTGATTTCTCTTTCGGTCCAA
CCGGTCGGTTTAGCAACGGCAAAACTACTGTCGATGTTATCACTGAGCCTTTGGGTTTCG
ACGACTACATTACACCATATGCAGCGGCGAGAGGAGAAGACATCCTCCGTGGAGTCAACT
ATGCTTCTGCTGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACAGGCAGACAATTGGGAGGTAGAATAG
CGTTTGCAGGTCAAGTAGCAAATCACGTGAACACAGTGTCACAAGTAGTGAACATACTCG
GCGATGAGAACCAAGCCTCCAGTTACCTCAGCAAATGCATTTACTCTATCGGCTTAGGCA
GTAACGATTACCTCAACAACTACTTCATGCCCACTTTCTACTCTACCGGTAACCAGTTCT
CTCCTGAATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGT
ATAACAATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGA
ACGAGCTAGCTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGA
ACAGAATCTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTG
ATGCTAAGTTCA

QA 4 855 4 855
DS 

RD RR4CM09TF 458 0 0
ATTACCTCAACAACTACTTCATGCCCATTTTCTACTCTACCGGTAACCAGTTCTCTCCTG
AATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATAACA
ATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGC
TAGCTCAGAACAGTAGAGGTGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAA
TTTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTA
AGTTCACTTTACATAAACGCATACGGCATCTTTCCAAGACATCGTTACAAACCCCTGCTC
GCTACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTTTGTGGAGTTTGGGAGGAATAATGGACA
GATAACTTTGTCTTCCTGGTCAAGCTCC
CATGTTTTGA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4DB67JQ 576 0 0
GAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGCTAGGTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTG
ACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAATCTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACA
ACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTAAGTTCACTT*ACATCAACGCATACGGCATTTT*
CCAAGACATCGTTACAAACCC*TGCTCGCTACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTT
*GTGGAGTT*GGGAGGAACAATGGACAGATAACTT*GTCTTCCGGGTCAAGCTCCATGTT
TGAATAGGAATGAGTATGTGTTTTGGGATGCGTTTCATCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTA
TCATCGGAACAAGATCGTTTAAACGAGAAGCTGCTTTTGATGCTCATCCTTGTGATATTC
AGCAGCTAGCAACTCTTTAAGTTGAGAGTGACAAGAAAGATAAGAAACTTGTTGTTTTGC
TTGTATAAGTGTTTTGATAATGGTAACTGAGTTTGGACTCATGAAGAGAAAGTGATGTGT
GTGATGTGATAAGTGTTTATGTAAGGATTTTGAGCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4F482TF 742 0 0
GGGCAGTAACGAT
TACCTCAACAACTACTTCATGCCCACTTTCTATTCTACCGGTAACCAGTTCTCTCCTGAA
TCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATAACAAT
GGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGCTA
GCTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAATT
TTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTAAG
TTCACTT*ACATAAACGCATACGGCATCTT*CCAAGACATCGTTACAAACCC*TGCTCGC
TACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTT*GTGGAGTT*GG*AGGAATAATGGACAGA
TAACTT*GTCTTCCTGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTTGGGAT
GCGTTTCATCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGAAACAAGATCGTTTAAGCGAGAA
ACTGCTTCTGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCGACTCTCTAAGTTGAGAGT
GACAAGAAAGATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGTAACTG
AGTTTGGACTCATGAAGAGAAAGTGATGTGTGTGATGTGATAAGTGTTTATGTAAGGATT
TTGAGCTAC

QA 14 742 14 742
DS 

RD RR4F482JQ 702 0 0
ATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATAACAA
TGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGCT
AGCTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAAT
TTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTAA
GTTCACTT*ACATAAACGCATACGGCATCTT*CCAAGACATCGTTACAAACCC*TGCTCG
CTACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTT*GTGGAGTT**GGAGGAATAATGGACAG
ATAACTT*GTCTTCCTGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTTGGGA
TGCGTTTCATCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGAAACAAGATCGTTTAAGCGAGA
AACTGCTTCTGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCGACTCTCTAAGTTGAGAG
TGACAAGAAAGATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGTAACT
GAGTTTGGACTCATGAAGAGAAAGTGATGTGTGTGATGTGATAAGTGTTTATGTAAGGAT
TTTGAGCTACAGTTTTATCTTTTATATTTTTCTTTCTATTAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BC25JQ 901 0 0
TTGCAGGTCAAGTAGCAAATCACGTGAACACAGTGTCACAAGTAGTGAACATACTCGGCG
ATGAGAACCAAGCCTCCAGTTACCTCAGCAAATGCATTTACTCTATCGGCTTAGGCAGTA
ACGATTACCTCAACAACTACTTCATGCCCACTTTCTACTCTACCGGTAACCAGTTCTCTC
CTGAATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATA
ACAATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACG
AGCTAGCTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACA
GAATCTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATG
CTAAGTTCACTT*ACATCAACGCATACGGCATCTT*CCAAGACATCGTTACAAACCC*TG
CTCGCTACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTT*GTGGAGTT*GGGAGGAACAATGG
ACAGATAACTT*GTCTTCCGGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTT
GGGATGCGTTTCATCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGGAACAAGATCGTTTAAAC
GAGAAGCTGCTTCTGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCAATTCTCTAAGTTG
AGAGTGACAAGAAAGATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGT
AACTGAGTTTGGACTCATGAAGAGAAAGTGATGTGTGTGATGTGATAAGTGTTTATGTAA
GGATTTTGAGCTACAGTTTTATCTTTTATATTTTTCTTTCTATTATAAATTTGATTATTT
C

QA 1 901 1 901
DS 

RD RR4CM09JQ 859 0 0
AGCAAATGCATTTACTCTATCGGCTTAGGCATTAACGAT*ACCTCAACAACTACTTCATG
CCCATTTTCTACTCTACCGGTAACCAGTTCTCTC*TGAATCCTTTAGCGACGATCTCATC
GCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATAACAATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTA
ATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGCTAGCTCAGAACAGTAGAGGTGGG
AGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAATTTTCAACAGCAAGCTCATATCA
ATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTAAGTTCACTT*ACATAAACGCATA
CGGCATCTT*CCAAGACATCGTTACAAACCC*TGCTCGCTACGGGTTTACAGTGACAAAT
GCAGGGTGTT*GTGGAGTT*GGGAGGAATAATGGACAGATAACTT*GTCTTCCTGGTCAA
GCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTTGGGATGCGTTTCATCCTGGTGAAGCT
GCTAATGTTATCATCGGAACAAGATCGTTTAAGCGAGAAGCTGCTTCTGATGCTCATCCT
TATGATATTCAGCAGCTAGCAACTCTTTAAGCTGAGAGTGACAAGAAAGATAAGAAACTT
GTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGTAACTGAGTTTGGACTCATGAAGAGAA
AGTGATGTGTGTGATGTGATAAGTGTTTATGTAAGGATTTTGAGCTACAGTTTTATCTTT
TATATTTTTCTTTCTATTATAAATTTGATTATTTCATTTTCTAATTTAGTTACATTATTT
CTAATGAATCTACAATTGC

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR4F131JQ 729 0 0
CGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATAACAATGGAGCAAG
GAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGCTAGCTCAGAA
CAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAATTTTCAACAG
CAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTAAGTTCACTT*
ACATAAACGCATACGGCATCTT*CCAAGACATCGTTACAAACCC*TGCTCGCTACGGGTT
TACAGTGACAAATGCAGGGTGTT*GTGGAGTT*GGGAGGAATACTGGACAGATAACTT*G
TCTTCCTGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTTGGGATGCGTTTCA
TCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGGAACAAGATCGTTTAAGCGAGAAGCTGCTCC
TGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCAACTCTCTAAGTTGAGAGTGACAAGAA
AGATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGTAACTGAGTTTGGA
CTCATGAAGAGAAAGTGATGTGTGTGATGTGATAAGTGTTTATGTAAGGATTTTGAGCTA
CAGTTTTATCTTTTATATTTTTCTTTCTATTATAAATTTGATTATTTCATTTTCTAATTT
AGTTACATT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 2 10

CO CL447Contig1 836 4 5 U
AGACGAGCTGTAGCTTCTGGTTCTTGAACAATAAAGTGACAAACATTCTCCGGAAAATAA
CAACAGCATTCAACAAGATCATAACTTAAATATGTTTTAAGCAAACAGAACTTAACATTA
AAAGCTCCAAAATTTCGACAAAGCAACAAAAGGGTCAATTCATCTTCTGAATCTCCCACC
TCTGCCACCACCGCGGCCACCTCTTCTACCACCACCACCACCACCATGTCCACTACCGTT
AGACCCAGGAGTCTTCATGTTTTCAGGCAAAGGTAGGATGTGATCAACGCACTTCCTGTA
GCTGAAATCGTCAGCAGTGTCGTCTTCCCTAACCAGAAAAAAACACCTGCTTTTCCACAT
CGGGTGGGTTCTCACTTGGAAGGCTTTGATCCCTCCTCCAATCTTATTGTCAGGCTCAGT
ATGGCCCTTCTTGATCAAATCTAGCAGCACCATGTGCTCATACTTGTTGACATCGAGATC
AGTGGGCCAGAAATGCATAAACTTGGTGAAGTAATCAAACATCGCCACAGAGGTGACGAA
CTCCTTGGGACCCAGCTTGACCGAATCCGACCCGTTGGGTTTCTCTTCCTCTCCCACTTT
CTGCTTCTTGGATTCGCCTCCTCCATCCTCTGTTTCCTCCGTCGTCTCCTCTCTCCCGCG
TTTCTCTGCAGCTTCTTCGACTTCAGTGTCCGTTATTGGATCTGGTTTCACTTCGGCTGC
CGACACTGAATCGAGGATCTCTTGTTGCTCAGCCATTGTTATTAACCTTGTGAGAAGCTT
TCGCCTTTTCTCTTATTTCTACGCGGTTGCTAGGGTTTAAGCTTTAGGTAGAGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX16JQ U 1
AF RR4CX16TF C 1
AF RR4AY91JQ U 19
AF RR4AY91TF C 42
BS 1 232 RR4CX16JQ
BS 233 233 RR4AY91JQ
BS 234 589 RR4CX16JQ
BS 590 815 RR4AY91JQ
BS 816 836 RR4AY91TF

RD RR4CX16JQ 590 0 0
AGACGAGCTGTAGCTTCTGGTTCTTGAACAATAAAGTGACAAACATTCTCCGGAAAATAA
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TCTGCCACCACCGCGGCCACCTCTTCTACCACCACCACCACCACCATGTCCATTACCGTT
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GCTGAAATCGTCAGCAGTGTCGTCTTCCCTAACCAGAAAAAAACACCTGCTTTTCCACAT
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CTCCTTGGGACCCAGCTTGACCGAATCCGACCCGTTGGGTTTCTCTTCC
C

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4CX16TF 590 0 0
AGACGAGCTGTAGCTTCTGGTTCTTGAACAATAAAGTGACAAACATTCTCCGGAAAATAA
CAACAGCATTCAACAAGATCATAACTTAAATATGTTTTAAGCAAACAGAACTTAACATTA
AAAGCTCCAAAATTTCGACAAAGCAACAAAAGGGTCAATTCATCTTCTGAATCTCCCACC
TCTGCCACCACCGCGGCCACCTCTTCTACCACCACCACCACCACCATGTCCATTACCGTT
AGACCCAGGAGTCTTCATGTTTTCAGGCAAAGGTAGGATGTGATCAACGCACTTCCTGTA
GCTGAAATCGTCAGCAGTGTCGTCTTCCCTAACCAGAAAAAAACACCTGCTTTTCCACAT
CGGGTGGGTTCTCACTTGGAAGGCTTTGATCCCTCCTCCAATCTTATTGTCAGGCTCAGT
ATGGCCCTTCTTGATCAAATCTAGCAGCACCATGTGCTCATACTTGTTGACATCGAGATC
AGTGGGCCAGAAATGCATAAACTTGGTGAAGTAATCAAACATCGCCACAGAGGTGACGAA
CTCCTTGGGACCCAGCTTGACCGAATCCGACCCGTTGGGTTTCTCTTCC
C

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4AY91JQ 797 0 0
GGTTCTTGAACAATAAAGTGACAAACATTCTCCGGAAAATAACAACAGCATTCAACAAGA
TCATAACTTAAATATGTTTTAAGCAAACAGAACTTAACATTAAAAGCTCCAAAATTTCGA
CAAAGCAACAAAAGGGTCAATTCATCTTCTGAATCTCCCACCTCTGCCACCACCGCGGCC
ACCTCTTCTACCACCACCACCACCACCATGTCCACTACCGTTAGACCCAGGAGTCTTCAT
GTTTTCAGGCAAAGGTAGGATGTGATCAACGCACTTCCTGTAGCTGAAATCGTCAGCAGT
GTCGTCTTCCCTAACCAGAAAAAAACACCTGCTTTTCCACATCGGGTGGGTTCTCACTTG
GAAGGCTTTGATCCCTCCTCCAATCTTATTGTCAGGCTCAGTATGGCCCTTCTTGATCAA
ATCTAGCAGCACCATGTGCTCATACTTGTTGACATCGAGATCAGTGGGCCAGAAATGCAT
AAACTTGGTGAAGTAATCAAACATCGCCACAGAGGTGACGAACTCCTTGGGACCCAGCTT
GACCGAATCCGACCCGTTGGGTTTCTCTTCCTCTCCCACTTTCTGCTTCTTGGATTCGCC
TCCTCCATCCTCTGTTTCCTCCGTCGTCTCCTCTCTCCCGCGTTTCTCTGCAGCTTCTTC
GACTTCAGTGTCCGTTATTGGATCTGGTTTCACTTCGGCTGCCGACACTGAATCGAGGAT
CTCTTGTTGCTCAGCCATTGTTATTAACCTTGTGAGAAGCTTTCGCCTTTTCTCTTATTT
CTACGCGGTTGCTAGGG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4AY91TF 795 0 0
AACATTCTCCGGAAAATAACAACAGCATTCAACAAGATCATAACTTAAATATGTTTTAAG
CAAACAGAACTTAACATTAAAAGCTCCAAAATTTCGACAAAGCAACAAAAGGGTCAATTC
ATCTTCTGAATCTCCCACCTCTGCCACCACCGCGGCCACCTCTTCTACCACCACCACCAC
CACCATGTCCACTACCGTTAGACCCAGGAGTCTTCATGTTTTCAGGCAAAGGTAGGATGT
GATCAACGCACTTCCTGTAGCTGAAATCGTCAGCAGTGTCGTCTTCCCTAACCAGAAAAA
AACACCTGCTTTTCCACATCGGGTGGGTTCTCACTTGGAAGGCTTTGATCCCTCCTCCAA
TCTTATTGTCAGGCTCAGTATGGCCCTTCTTGATCAAATCTAGCAGCACCATGTGCTCAT
ACTTGTTGACATCGAGATCAGTGGGCCAGAAATGCATAAACTTGGTGAAGTAATCAAACA
TCGCCACAGAGGTGACGAACTCCTTGGGACCCAGCTTGACCGAATCCGACCCGTTGGGTT
TCTCTTCCTCTCCCACTTTCTGCTTCTTGGATTCGCCTCCTCCATCCTCTGTTTCCTCCG
TCGTCTCCTCTCTCCCGCGTTTCTCTGCAGCTTCTTCGACTTCAGTGTCCGTTATTGGAT
CTGGTTTCACTTCGGCTGCCGACACTGAATCGAGGATCTCTTGTTGCTCAGCCATTGTTA
TTAACCTTGTGAGAAGCTTTCGCCTTTTCTCTTATTTCTACGCGGTTGCTAGGGTTTAAG
CTTTAGGTAGAGTCC

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL447Contig2 868 6 14 U
AGGGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAGAAAAGGCGAAAGCT
TCTCACAAGGTTAGTAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAGC
CGAAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGG
GAGAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGG
AGAGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCAC
CTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGA
TGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCC
TGACAATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAA
AAGCAGGTGTTTTTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAA
GTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAA
TGGACATGGTGGTGGTAGAAGAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAG
ATGAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAAGTTCTGTT
TGCTTAAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCGGAGAATG
TTTGTCACTTTATTGTTCAAGAACCGGAAGCTACAGCTCGTCTCTATGTTCACAACTTGA
GAGTATACTTGAATTTGGGCCTTTTGCT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H564TF U 1
AF RR4AS56TF U 3
AF RR4AW44TF U 3
AF RR4FB93TF U 3
AF RR4FB93JQ C 30
AF RR4H564JQB C 125
BS 1 106 RR4H564TF
BS 107 107 RR4AS56TF
BS 108 249 RR4H564TF
BS 250 250 RR4AS56TF
BS 251 506 RR4H564TF
BS 507 507 RR4AS56TF
BS 508 623 RR4H564TF
BS 624 728 RR4AS56TF
BS 729 729 RR4AW44TF
BS 730 761 RR4AS56TF
BS 762 762 RR4AW44TF
BS 763 773 RR4AS56TF
BS 774 782 RR4FB93TF
BS 783 868 RR4H564JQB

RD RR4H564TF 623 0 0
AGGGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAGAAAAGGCGAAAGCT
TCTCACAAGGTTAGTAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATCCAGTGTCGGCAGC
CGAAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGG
GAGAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGG
AGAGGAAGA*AAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCAC
CTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGA
TGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCC
TGACAATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAA
AAGCAGGTGTTTTTTTCTGGTTAGGGGAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAA
GTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAA
TGGACATGGTGGTGGTAGAAGAG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4AS56TF 778 0 0
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAGAAAAGGCGAAAGCTTC
TCACAAGGTTAGTAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAGCCG
AAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGGGA
GAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGGAG
AGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCACCT
CTGTGGCGATGTTTGGTTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGATG
TCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCCTG
ACAATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAA
GCAGGTGTTTTTTTCTGGTTGGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGT
GCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATG
GACATGGTGGTGGTAGAAGAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGAT
GAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAAGTTCTGTTTG
CTTAAA*CTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGT*GTTATTTTCCG
AGATGTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AW44TF 765 0 0
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAGAAAAGGCGAAAGCTTC
TCACAAGGTTAGTAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAGCCG
AAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGGGA
GAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGGAG
AGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCACCT
CTGTGGCGATGTTTGGTTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGATG
TCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCCTG
ACAATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAA
GCAGGTGTTTTTTTCTGGTTGGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGT
GCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATG
GACATGGTGGTGGTAGAAGAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGAT
GAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAAGTTCTGTTTG
CTTAAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTAT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4FB93TF 780 0 0
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAGAAAAGGCGAAAGCTTC
TCACAAGGTTAGTAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAGCCG
AAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGGGA
GAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGGAG
AGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCACCT
CTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGATG
TCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAGGGGCCATACTGAGCCTG
ACAATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAA
GCAGGTGTTTTTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGT
GCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATG
GACATGGTGGTGGTAGAAGAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGAT
GAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAAGTTCTGTTTG
CTTAAA*CTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCGGAGAATGTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4FB93JQ 753 0 0
CAACCGCGTAGAAAGAGAAAAGGCGAAAGCTTCTCACAAGGTTAGTAACAATGGCTGAGC
AACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAGCCGAAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACA
CTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGGGAGAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGG
ATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGGAGAGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATC
CGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCACCTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCA
AGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGATGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGT
TAGATCTGATCAAGAGGGGCCATACTGAGCCTGACAATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAG
CCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAAGCAGGTGTTTTTTTCTGGTTAGGGAAG
ACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTG
AAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATGGACATGGTGGTGGTAGAAGAGGTGGCC
GCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGATGAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGA
AATTTTGGAGCTTTTAATGTTAAGTTCTGTTTGCTTAAAACTTATTTAAGTTATGATCTT
GTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCGGAGAATGTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4H564JQB 744 0 0
GTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGGGAGA
GAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGGAGAG
GAAGA*AAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCACCTCT
GTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGATGTC
AACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCCTGAC
AATAAGATTGGAGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAAGC
AGGTGTTTTTTTCTGGTTAGGGGAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGTGC
GTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATGGA
CATGGTGGTGGTAGAAGAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGATGA
ATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAAGTTCTGTTTGCT
TAAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCGGAGAATGTTTG
TCACTTTATTGTTCAAGAACCGGAAGCTACAGCTCGTCTCTATGTTCACAACTTGAGAGT
ATACTTGAATTTGGGCCTTTTGCT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 10

CO CL448Contig1 941 10 15 U
AAATGATAAAACTAAAATAAAATAGTTCACGTAAAAATAAAAGTTCCAAAATAATAAATT
TTAAACATAATAAATTTTAAACATATAATCCGCGGAAAAAGGATCTAGTCTTATTAAAAG
CACAAATTAAACTTATAGTAACACCAAAGAAAAAGTCATTATTGGAGGATCTAACAGTTT
TATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATTTGTTGATCATACAAGGCGTCTACAG
AGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAGAGACCTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGT
TTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTATATTCCCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCT
TCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTTGTCGAACGCAATGATTCCTCCAACC
TTAACCAATTTCAGAAGCCTCTCATGGAAGTTGACGTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCA
AATGCGAAATCAAACTCCTTTTTGTCTTTCACCAATTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCG
GAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCCTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACT
TCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGT
GCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAACACCGAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTG
GCGATCTTTAAAAGCATCGATAGAAGAAGGCCCTCATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTT
AAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTACGGAGTTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTT
GGATATGCTGACGTTTCCAAGATGTAATGTTTCAGAGCTTCGGTCTTGAGGATCCCTTTG
GTAGGTATTTCATTCGCCATCTCTCAGTCTCGTTATTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 35 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR4DP45JQ U 90
AF RR4DA94JQ U 1
AF RR4G708JQ U 90
AF RR4BF86JQ U 93
AF RR4BF62JQ U 93
AF RR4DA94TF C 261
AF RR4BF62TF C 93
AF RR4DP45TF C 259
AF RR4G708TF C 170
AF RR4BF86TF C 152
BS 1 270 RR4DA94JQ
BS 271 271 RR4G708JQ
BS 272 319 RR4DA94JQ
BS 320 320 RR4G708JQ
BS 321 433 RR4DA94JQ
BS 434 434 RR4G708JQ
BS 435 458 RR4DA94JQ
BS 459 459 RR4G708JQ
BS 460 686 RR4DA94JQ
BS 687 736 RR4G708JQ
BS 737 737 RR4BF62JQ
BS 738 757 RR4G708JQ
BS 758 758 RR4BF62JQ
BS 759 841 RR4G708JQ
BS 842 941 RR4BF62JQ

RD RR4DP45JQ 283 0 0
CCGCGG
AAAAAGGATCTAGTCTTATTAAAAGCACAAATTAAACTTATAGTAACCCCAAAAAAAAAG
TCATTATTGGAGGATCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATT
TGTTGATCATACAAGGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAAAAAC
CTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAAAGCCTTTCTATATTC
CCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCC

QA 7 283 7 283
DS 

RD RR4DA94JQ 686 0 0
AAATGATAAAACTAAAATAAAATAGTTCACGTAAAAATAAAAGTTCCAAAATAATAAATT
TTAAACATAATAAATTTTAAACATATAATCCGCGGAAAAAGGATCTAGTCTTATTAAAAG
CACAAATTAAACTTATAGTAACACCAAAGAAAAAGTCATTATTGGAGGATCTAACAGTTT
TATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATTTGTTGATCATACAAGGCGTCTACAG
AGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAAAGACCTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGT
TTCTTATTGAACTCTATAAAAGCCTTTCTATATTCCCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCT
TCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTTGTCGAACGCAATGATTCCTCCAACC
TTAACCAATTTCAAAAGCCTCTCATGGAAGTTGACGTAATTCGACTTGTCAGCATCCGCA
AATGCGAAATCAAACTCCTTTTTGTCTTTCACCAATTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCG
GAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCCTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACT
TCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGT
GCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4G708JQ 752 0 0
CCGCGG
AAAAAGGATCTAGTCTTATTAAAAGCACAAATTAAACTTATAGTAACACCAAAGAAAAAG
TCATTATTGGAGGATCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATT
TGTTGATCATACAAGGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAGAGAC
CTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTATATTC
CCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTT
GTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGCCTCTCATGGAAGTTGAC
GTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTCCTTTTTGTCTTTCACCAA
TTGGTCTAAGGCCTTAATACCGTCGGAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGC
CTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTACAGTAAT
GCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAACACC
GAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCACCGATAGAAGAAGGCCCTC
ATAAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTACGGAG
TTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTG

QA 7 752 7 752
DS 

RD RR4BF86JQ 781 0 0
CGA
AAAAAGGATCTAGTCTTATTAAAAGCACAAATTAAACTTATAGTAACACCAAAGAAAAAG
TCATTATTGGAGGATCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATT
TGTTGATCATACAAGGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAGAGAC
CTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTATATTC
CCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTT
GTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGCCTCTCATGGAAGTTGAC
GTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTACTTTTTGTCTTTCACCAA
TTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCGGAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGC
CTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTGCAGTGAT
GCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAACACC
GAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCATCGATAGAAGAAGGCCCTC
ATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTACGGAG
TTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCCAAGATGTAATGTTTC

QA 4 781 4 781
DS 

RD RR4BF62JQ 849 0 0
CGA
AAAAAGGATCTAGTCTTATTAAAAGCACAAATTAAACTTATAGTAACACCAAAGAAAAAG
TCATTATTGGAGGATCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATT
TGTTGATCATACAAGGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAGAGAC
CTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTATATTC
CCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTT
GTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAAAAGCCTCTCATGGAAGTTGAC
GTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTACTTTTTGTCTTTCACCAA
TTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCGGAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGC
CTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTGCAGTGAT
GCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAACACC
GAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCATCGATAGAAGAAGGCCCTC
ATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTACGGAG
TTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCCAAGATGTAATGTTTCAG
AGCTTCGGTCTTGAGGATCCCTTTGGTAGGTATTTCATTCGCCATCTCTCAGTCTCGTTA
TTATCC

QA 4 849 4 849
DS 

RD RR4DA94TF 681 0 0
GGAAATCTGAGAGAC*TCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGA*CTCTATAAG
AGCCTTTCTATATTCCCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTC*TCAGCCACGAAACC
AAACCACAAGGTGTTGTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGCCT
CTCATGGAAGTTGACGTAATTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTCCTT
TTTGTCTTTCACCAATTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCGGAGTGAATGAAATTGATCTT
GTGATCAACACCTGCCTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAAT
ATCTATTGCAGTAATGCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTA
ACCGGTGAAAACACCGAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCATCGA
TAGAAGAAGGCCCTCATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGAC
TGTGGCTTTACGGAGTTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCCAA
GATGTAATGTTTCAGAGCTTCGGTCTTGAGGATCCCTTTGGTAGGTATTTCATTCGCCAT
CTCTCAGTCTCGTTATTATCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BF62TF 849 0 0
CGA
AAAAAGGATCTAGTCTTAT*AAAAGCACAAATTAAACTTATAGTAACACCAAAGAAAAAG
TCATTATTGGAGGATCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATT
TGTTGATCATACAAGGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAGAGAC
CTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTATATTC
CCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTT
GTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGCCTCTCATGGAAGTTGAC
GTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTACTTTTTGTCTTTCACCAA
TTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCGGAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGC
CTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTGCAGTGAT
GCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAACACC
GAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCATCGATAGAAGAAGGCCCTC
ATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTACGGAG
TTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCCAAGATGTAATGTTTCAG
AGCTTCGGTCTTGAGGATCCCTTTGGTAGGTATTTCATTCGCCATCTCTCAGTCTCGTTA
TTATCC

QA 4 849 4 849
DS 

RD RR4DP45TF 683 0 0
ATGGAAATCTGAGAGACCTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATA
AGAGCCTTTCTATATTCCCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAA
CCAAACCACAAGGTGTTGTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGC
CTCTCATGGAAGTTGACGTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTCC
TCTTTGTCTTTCACCAATTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCGGAGTGAATGAAATTGATC
TTGTGATCAACACCTGCCTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCA
ATATCTATTGCAGTAATGCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAG
TAACCGGTGAAAACACCGAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCATC
GATAGAAGAAGGCCCTCATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGG
ACTGTGGCTTTACGGAGTTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCC
AAGATGTAATGTTTCAGAGCTTCGGTCTTGAGGATCCCTTTGGTAGGTATTTCATTCGCC
ATCTCTCAGTCTCGTTATTATCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4G708TF 772 0 0
TCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTGAATTTGTTGATCATACAA
GGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAA*TCTGAGAGACCTCAACTCGTGTAT
CCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTATATTCCCTCATATGTTCAG
GAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGGTGTTGTCGAACGCAATGA
TTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGCCTCTCATGGAAGTTGACGTAGTTCGACTTGT
CAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTCCTTTTTGTCTTTCACCAATTGGTCTAAGGCCT
TAATACCGTCGGAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCCTTCTTGATAAACT
CTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTACAGTAATGCGGCCATCTTCAG
GCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAACACCGAGCTCGAGTGTGT
TCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCACCGATAGAAGAAGGCCCTCATAAACCGGAACTT
CCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTACGGAGTTCCTTAAGCAGCC
CATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCCAAGATGTAATGTTTCAGAGCTTCGGTCTTGA
GGATCCCTTTGGTAGGTATTTCATTCGCCATCTCTCAGTCTCGTTATTATCC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4BF86TF 790 0 0
AAAGTCATTATTGGAGGATCTAACAGTTTTATTCTAAACTCCCAATTGCTCTTGGTCTTG
AATTTGTTGATCATACAAGGCGTCTACAGAGCGTGAAACCATCTCCAATGGAAATCTGAG
AGACCTCAACTCGTGTATCCAAAGCCAGTTTCTTATTGAACTCTATAAGAGCCTTTCTAT
ATTCCCTCATATGTTCAGGAACTCCCTCTTCGTCCTCAGCCACGAAACCAAACCACAAGG
TGTTGTCGAACGCAATGATTCCTCCAACCTTAACCAATTTCAGAAGCCTCTCATGGAAGT
TGACGTAGTTCGACTTGTCAGCATCCGCAAATGCGAAATCAAACTACTTTTTGTCTTTCA
CCAATTGGTCTAAGGCCTTAATACCATCGGAGTGAATGAAATTGATCTTGTGATCAACAC
CTGCCTTCTTGATAAACTCTAGTCCCACTTCGTAGGCTTCTTTGTCAATATCTATTGCAG
TGATGCGGCCATCTTCAGGCAAAGCAAGTGCCGTGGAGAGAAGAGAGTAACCGGTGAAAA
CACCGAGCTCGAGTGTGTTCTTAGCGTTGGCGATCTTTAAAAGCATCGATAGAAGAAGGC
CCTCATCAACCGGAACTTCCATCTCGCTTAAATTGCCATATTTCTGGACTGTGGCTTTAC
GGAGTTCCTTAAGCAGCCCATGCTCTCTTGGATATGCTGACGTTTCCAAGATGTAATGTT
TCAGAGCTTCGGTCTTGAGGATCCCTTTGGTAGGTATTTCATTCGCCATCTCTCAGTCTC
GTTATTATCC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 10

CO CL449Contig1 894 10 18 U
ATGAAAAGACATGGAACCATAAAATTAAAAGGGGAAGAGTAAATATAATATGCAAAAGGC
AAGAATGATTCTGATTCAAGAATCCTTACAAAAGTAAAACAACGGTCGTGAGAGTTTTGG
CATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCAC
CAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTCAAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAG
CCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCA
GGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACCGGGCATTCA
AAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCA
CCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTA
GTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCT
TGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTC
CCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGA
TTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAA
GCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGGCGATTCTTCTCCACATG
ATTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAGGTCACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGC
GAATCTCGAATCTCTTCTCACCGATGCTCTTTTTCTCAGTTGACCTCTGGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 10 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F633JQ U 50
AF RR4BP19JQ U 1
AF RR4B255JQ U 27
AF RR4AR57TF C 93
AF RR4AR57JQ U 43
AF RR4FM14JQ U 47
AF RR4B255TF C 89
AF RR4F633TF C 122
AF RR4BP19TF C 276
AF RR4FM14TF C 91
BS 1 32 RR4BP19JQ
BS 33 33 RR4B255JQ
BS 34 66 RR4BP19JQ
BS 67 67 RR4AR57JQ
BS 68 207 RR4BP19JQ
BS 208 208 RR4AR57JQ
BS 209 347 RR4BP19JQ
BS 348 348 RR4AR57JQ
BS 349 376 RR4BP19JQ
BS 377 377 RR4B255JQ
BS 378 723 RR4BP19JQ
BS 724 791 RR4B255JQ
BS 792 792 RR4AR57JQ
BS 793 835 RR4B255JQ
BS 836 849 RR4FM14JQ
BS 850 877 RR4B255TF
BS 878 878 RR4F633TF
BS 879 894 RR4B255TF

RD RR4F633JQ 663 0 0
G
TGCAAAAGGCAAGAATGATTCTGATTCAAGAATCCTTACAAAAGTAAAACAACGGTCGTG
AGAGTTTTGGCATTTCCGATAAAGAAGTGCTGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAAC
TGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTCAAAAAATACTAAAAA**AAAAG
CAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACC
GTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGAC
CGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTC
GCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGG
AGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTC
AAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCAC
CTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGA
AGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCG
GC

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4BP19JQ 723 0 0
ATGAAAAGACATGGAACCATAAAATTAAAAGGTGAAGAGTAAATATAATATGCAAAAGGC
AAGAATAATTCTGATTCAAGAATCCTTACAAAAGTAAAACAACGGTCGTGAGAGTTTTGG
CATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCAC
CAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTAAAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAG
CCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCA
GGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAAACCGGGCATTCA
AAAGACTTTCCTTTCTACAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCA
CCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTA
GTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCT
TGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTC
CCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGA
TTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAA
GCG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4B255JQ 809 0 0
AG
AAGGGGAAGAGTAAATATAATATGCAAAAGGCAAGAATAATTCTGATTCAAGAATCCTTA
CAAAAGTAAAACAACGGTCGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCA
AGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTA
AAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGT
GGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCA
GCTCAAAGTACTGAGTGCAAACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACC
ACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCAT
AGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAA
TGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTG
CGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGA
AATGGCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTC
TCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTT
TGAGACCAGAGGAGGCGATTCTTCTCCACATGATTATGATTGT*TGTTTGTGTCGTGAAT
CTCAGGTCACCCCTCCAACTCCAAGGA

QA 3 809 3 809
DS 

RD RR4AR57TF 733 0 0
AGTAAAACAACGGTCGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCAAGGG
ATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTCAAAA
AATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTG
CTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTC
AAAGTACTGAGTGCGG*CCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACAC
AACGTCGTGCTCATCCCCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTA
AGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTC
GAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGAT
GGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATG
GCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCAC
GGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAG
ACCAGAGGAGGCGATTCTTCTCCACATGATTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCA
GGTCACCCCTCC
C

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4AR57JQ 782 0 0
CTTT
AATATGCAAAAGGCAAGAATGATTCTGATTCAAGAATCCTTACAAAAGTAAAACAACGGT
CGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTT
CAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTCAAAAAATACTAAAAACAA
AAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCAT
CACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGC
GG*CCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTCAT
CCCCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAG
CAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCC
CCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCT
CCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGAGGGATAAGGG
AAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAG
ATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGGCGA
TTCTTCTCCACATGATTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAGGTCACCCCTCC

QA 5 782 5 782
DS 

RD RR4FM14JQ 810 0 0
AATATGCAAAAGGCAAGAATGATTCTGATTCAAGAATCCTTACAAAAGTAAAACAACGGT
CGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTT
CAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTCAAAAAATACTAAAAACAA
AAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCAT
CACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGC
AGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTCAT
CCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAG
CAGGAGATTCCTTAGCTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCC
CCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCT
CCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGAGGGATAAGGG
AAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAG
ATCGGCGAGGAGAGGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGGCGA
TTCTTCTCCACATGATTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAGGTCACCCCTCCAA
CTCCA*GGATTAGCGAATCTCGA
TCTCTTC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4B255TF 806 0 0
CAAAAGTAAAACAACGGTCGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGCTGTTCCCA
AGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTCCAGTA
AAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGT
GGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCA
GCTCAAAGTACTGAGTGCAAACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACC
ACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCAT
AGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAA
TGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTG
CGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGA
AATGGCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTC
TCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTT
TGAGACCAGAGGAGGCGATTCTTCTCCACATGATTATGATTGT*TGTTTGTGTCGTGAAT
CTCAGGTCACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGCGAATCTCGAATCTCTTCTCACCGATGCT
CTTTTTCTCTGTTGACCTCTGGGACC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4F633TF 767 0 0
ATTTCCGATAAAGAAGTGCTGT*CCCAAGGGATCAAAA*CAATT*CAACTGTGTT*CACC
AGCAGCAATATGTTTTT*ATTCCAGTCAAAAAATACTAAAAA***AAAGCAAAACTCAGC
CGCAAGGGAGAAGCGGGAATCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAG
GAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACCGGGCATTCAA
AAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCAC
CAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAG
TTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTT
GAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCC
CAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGAT
TGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAG
CGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGGCGATTCTTCTCCACATGA
TTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAGGTCACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGCG
AATCTCGAATCTCTTCTCACCGATGCTCTTTTTCTCAGTTGACCTC
C

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BP19TF 597 0 0
ATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAA
GTACTGAGTGCAAACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTACAGCCAGAACCACACAAC
GTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGA
CTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAG
CAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGG
CATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCG
AGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGT
GGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACC
AGAGGAGGCGATTCTTCTCCACATAATTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAAGT
CACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGCGAATCTCGAATCTCTTCTCACCGATGCTC
TCC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4FM14TF 781 0 0
CAAAGT
AAACAACGGTCGTGAGAGTTT*GGCATTTCCGATAACGAAGTGCTGT*CCCAAGGGATCA
AAA*CAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTT*ATTCCAGTCAAAAAATA
CTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCAGTGGTGGTGCTCA
TCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAG
TACTGAGTGCAGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACG
TCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGAC
TTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGCTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGC
AGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGC
ATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCCCAACGGTCTCAACTGATTCGGAACTGAAATGGCGA
GGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTG
GTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAGGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACCA
GAGGAGGCGATTCTTCTCCACATGATTATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAGGTC
ACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGCGAATCTCGAATCTCTTCTCACCGATGCTC
CC

QA 7 779 7 779
DS 



AS 1 9

CO CL450Contig1 775 9 3 U
GGAGCGAGAAAGATCTCTGCCGCATTAATCATGGCTTCTCTTAATCTCTGGAGGAGAGTT
GCTGCTCCGATGGCTTCGAATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCG
CCGTTTTCATCTGGTGTGGAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCT
CCTAGCAAGGCAGAGAAGGGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCA
CTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTC
ACTCAAACGGATCTTGTCAGTTGGGCCAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAA
AACGCACTAGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAA
CTCGCCGTGTATGTTGATCTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTAC
TTTCGCAAAGTGGATCCAACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCC
CACATGAAGCTCGTGGAAAGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTA
GTTTTTATCTATCCCAGCCTAGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAA
TGAATAAAAGCATATCTGTTTTGCTTTGAAAGAACGAACCCTAAGCATCTCCTTCTTGTT
ATTATATAATTTTGTTTTGCCCAAAAAAAGAATTTCTATTGTCATGTTTTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H645TF U 29
AF RR4D993TF U 17
AF RR4CD88TF U 1
AF RR4GD88TF U 4
AF RR4GB58JQ C 15
AF RR4GB58TF U 15
AF RR4GD88JQ C 48
AF RR4D993JQ C 81
AF RR4H645JQB C 151
BS 1 675 RR4CD88TF
BS 676 748 RR4GD88TF
BS 749 775 RR4GD88JQ

RD RR4H645TF 566 0 0
GG
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TGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCGCCGTTTTCATCTGGTGTGGAGAGGTCAGCT
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AAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCTTA
AGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTGTCAGTTGGGCCAAA
CGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGCACTCGAGATCTTTAGGTGGATGGAT
AAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTGATCTCATAGCCGAG
GTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATCCAACATTCAAAGAG
TGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGGAAAGGCTCATTGAT
ATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAG

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR4D993TF 617 0 0
GG
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AATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCGCCGTTTTCATCTGGTGTG
GAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCTCCTAGCAAGGCAGAGAAG
GGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAATA
GATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTGTC
AGTTGGGCCAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGCACTAGAGATCTTT
AGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTGAT
CTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATCCA
ACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGGAA
AGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTAGTTTTTATCTATCCCAGC
CTAGATCTTGCTAAC

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR4CD88TF 675 0 0
GGAGCGAGAAAGATCTCTGCCGCATTAATCATGGCTTCTCTTAATCTCTGGAGGAGAGTT
GCTGCTCCGATGGCTTCGAATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCG
CCGTTTTCATCTGGTGTGGAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCT
CCTAGCAAGGCAGAGAAGGGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCA
CTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTC
ACTCAAACGGATCTTGTCAGTTGGGCCAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAA
AACGCACTAGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAA
CTCGCCGTGTATGTTGATCTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTAC
TTTCGCAAAGTGGATCCAACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCC
CACATGAAGCTCGTGGAAAGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTA
GTTTTTATCTATCCCAGCCTAGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAA
TGAATAAAAGCATAT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4GD88TF 745 0 0
GG
GAGAAAGATCTCTGCCGCATTAATCATGGCTTCTCTTAATCTCTGGAGGAGAGTTGCTGC
TCCGATGGCTTCGAATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCGCCGTT
TTCATCTGGTGTGGAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCTCCTAG
CAAGGCAGAGAAGGGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTAC
GGTTGAGACAATAGATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCA
AACGGATCTTGTCAGTTGGGCCAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGC
ACTAGAGGTCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAACTCGC
CGTGTATGTTGATCTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCG
CAAAGTGGATCCAACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACAT
GAAGCTCGTGGAAAGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTAGTTTT
TATCTATCCCAGCCTAGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAATGAAT
AAAAGCATATCTGTTTTGCTTTGAAAGAACGAACCCTAAGCATCTCCTTCTTGTTATTAT
ATAATTTTGTTTTGCCCAAAAAA

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR4GB58JQ 749 0 0
GG
CTGCCGCATTAATCATGGCTTCTCTTAATCTCTGGAGGAGAGTTGCTGCTCCGATGGCTT
CGAATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCGCCGTTTTCATCTGGTG
TGGAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCTCCTAGCAAGGCAGAGA
AGGGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAA
TAGATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTG
TCAGTTGGGCTAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGCACTAGGGATCT
TTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATCTTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTG
ATCTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATC
CAACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGG
AAAGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTAGTTTTTATCTATCCCA
GCCTAGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAATGAATAAAAGCATATC
TGTTTTGCTTTGAAAGAACGAACCCTAAGCATCTCCTTCTTGTTATTATATAATTTTGTT
TTGCCCAAAAAA
AGAATTTCTATTGTC

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR4GB58TF 721 0 0
GG
CTGCCGCATTAATCATGGCTTCTCTTAATCTCTGGAGGAGAGTTGCTGCTCCGATGGCTT
CGAATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCGCCGTTTTCATCTGGTG
TGGAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCTCCTAGCAAGGCAGAGA
AGGGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAA
TAGATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTG
TCAGTTGGGCTAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGCACTAGGGATCT
TTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATCTTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTG
ATCTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATC
CAACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGG
AAAGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTAGTTTTTATCTATCCCA
GCCTAGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAATGAATAAAAGCATATC
TGTTTTGCTTTGAAAGAACGAACCCTAAGCATCTCCTTCTTGTTATTATATAATTTTGT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR4GD88JQ 728 0 0
CTGGAGGAGAGTTGCTGCTCCGATGGCTTCGAATGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAG
GACGTTGACTGCGCCGTTTTCATCTGGTGTGGAGAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAA
GGAGAGCTCAGCTCCTAGCAAGGCAGAGAAGGGGAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCA
GAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAA
GGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTGTCAGTTGGGCCAAACGTCTTGCAAAGAACAA
AAACAAATCTGAAAACGCACTAGAGGTCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATT
TTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTGATCTCATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGC
TGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATCCAACATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAA
GAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGGAAAGGCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTC
TCTGAAGAATTTAGTTTTTATCTATCCCAGCCTAGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTG
CGTCTGTCTTTAATGAATAAAAGCATATCTGTTTTGCTTTGAAAGAACGAACCCTAAGCA
TCTCCTTCTTGTTATTATATAATTTTGTTTTGCCCAAAAAAAGAATTTCTATTGTCATGT
TTTTTCCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4D993JQ 683 0 0
TGGTCGTATGTGGAAGATGGATTGTAGGACGTTGACTGCGCCGTTTTCATCTGGTGTGGA
GAGGTCAGCTCCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCTCCTAGCAAGGCAGAGAAGGG
GAAGGTGGAGAAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAATAGA
TCTCATCTTAAGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTGTCAG
TTGGGCCAAACGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGCACTAGAGATCTTTAG
GTGGATGGATAAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTGATCT
CATAGCCGAGGTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATCCAAC
ATTCAAAGAGTGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGGAAAG
GCTCATTGATATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTAGTTTTTATCTATCCCAGCCT
AGATCTTGCTAACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAATGAATAAAAGCATATCTGTT
TTGCTTTGAAAGAACGAACCCTAAGCATCTCCTTCTTGTTATTATATAATTTTGTTTTGC
CCAAAAAA
AGAATTTCTATTGCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4H645JQB 613 0 0
CCGATCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCAGCTCCTAGCAAGGCAGAGAAGGGGAAGGTGGAG
AAGAGGAAAGTATTTCAGAAGCTGAAGTCACTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCTTA
AGGGAAGAAGAGAAGAAGGGCGTTTACGTCACTCAAACGGATCTTGTCAGTTGGGCCAAA
CGTCTTGCAAAGAACAAAAACAAATCTGAAAACGCACTCGAGATCTTTAGGTGGATGGAT
AAAAAGAAGATGGAATTTTCTCCCTCGGAACTCGCCGTGTATGTTGATCTCATAGCCGAG
GTTAAAGGATATCCAGCTGCTCATGCCTACTTTCGCAAAGTGGATCCAACATTCAAAGAG
TGGGAACCTAATCCCAAGAATTGGCCTGCCCACATGAAGCTCGTGGAAAGGCTCATTGAT
ATTGAAGATAAATCCTCTCTGAAGAATTTAGTTCTTATCTATCCCAGCCTAGATCTTGCT
AACAAGGGGAATTAGTGCGTCTGTCTTTAATGAATAAAAGCATATCTGTTTTGCTTTGAA
AGAACGAACCCTAAGCATCTCCTTCTTGTTATTATATAATTTTGTTTTGCCCAAAAAA
GATATTTATATTGCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 9

CO CL451Contig1 1056 9 17 U
GGCCCACACCTTCTCTCTCTTAAGTCTTAACATACTCTGCTCTTTCTCTCTCTACATCCG
CCAGCTTCTGTTCTAAGCTTAAGAGAATGGAGTTCCAAAACCGGTACGGACTTACAACGA
CGCAGAAGTACGACTGTCTCTTATTCGATTTGGACGATACTCTTTATCCTCTTAGCACCG
GAATCGCAAGAGAGTGTGGGCAGAACATCAAAGATTATATGGTCGAGGAACTCGGTATTC
CGAAGGACAAAATCGTTGAATTGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGG
CCGGTCTTAGAGCGATCGGATATGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACG
GTCGTTTACCGTACGACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTCTTGCTTAGCC
TTCCTCTCCGCAAAGTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGA
AGAGGCTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGA
CGCACACAAACGCAGTGTCTGGAAATACAGATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACC
GGTCTGAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCG
CTATTGAGAAAGCTCTCGAAATCGCCAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGG
ACAGTGTCCGAAATGTACAAGCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTG
CATCAAACAAAGTCAAAGGAGCAGATTACGCCTTCGAAAACATTCACAACATGAAGGAGG
CGTTACCAGAGTTATGGAAATCGGACAGAAAATCAGCTGATGTTGGATATTCAGGCAAGG
TCGCCGTTGAGACACCTGTCACAGCGTAGGACTGTTTCACCGTTGTACCTAATTTTCATC
CACTGTCATTTTCAATCTTTTTTTCAAATGACGTTATGTCATTTTTGTTTTTCGAGTCGT
GTTTATAAATTTAAATAAAAGCAGGAAATAATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 0 40 40 40 40 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4ER89TF U 1
AF RR4GN86TF U 64
AF RR4GV72TF U 3
AF RR4CJ03TF U 64
AF RR4A238TFB U 91
AF RR4A238JQ C 517
AF RR4ER89JQ C 255
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BS 1 208 RR4ER89TF
BS 209 209 RR4GV72TF
BS 210 322 RR4ER89TF
BS 323 323 RR4GV72TF
BS 324 646 RR4ER89TF
BS 647 647 RR4GV72TF
BS 648 685 RR4ER89TF
BS 686 686 RR4GV72TF
BS 687 715 RR4ER89TF
BS 716 786 RR4GV72TF
BS 787 787 RR4ER89JQ
BS 788 819 RR4A238TFB
BS 820 820 RR4ER89JQ
BS 821 835 RR4A238TFB
BS 836 892 RR4ER89JQ
BS 893 893 RR4GN86JQ
BS 894 1056 RR4ER89JQ

RD RR4ER89TF 715 0 0
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CGAAGGACAAAATCGTTGAATTGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGG
CCGGTCTTAGAGCGATCGGATACGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACG
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TTCCTCTCCGCAAAGTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGA
AGAGGCTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGA
CGCACACAAACGCAGTGTCTGGAAATACAGATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACC
GGTCTGAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATCGTGTGTAA*CCGTCAGAAGCCG
CTATTGAGAAAGCTCTCGAAATCGCTAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTT

QA 1 715 1 715
DS 

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TGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGGCCGGTCTTAGAGCGATCGGAT
ATGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACGGTCGTTTACCGTACGACAACA
TAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCATCTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAAGTCATAT
TCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTAGAGGATT
GTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCACACAAACGCAGTGTCTG
GAAATACATATATTTTTGATATCGTTGGACATTTCGACCGGTCTGAACCGGTTAGTTTGC
TTCCGAAAACGCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCTCTCGAAA
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DS 

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GGG
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TTCTGTTCTAAGCTTAAGAGAATGGAGTTCCAAAACCGGTACGGACTTACAACGACGCAG
AAGTACGACTGTCTCTTATTCGATTTGGACAATACTCTTTATCCTCTTAGCACCGGAATC
GCAAGAGAGTGTGGGCAGAACATCAAAGATTATATGGTCGAGGAACTCGGTATTCCGAAG
GACAAAATCGTTGAATTGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGGCCGGT
CTTAGAGCGATCGGATATGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACGGTCGT
TTACCGTACGACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTCTTGCTTAGCCTTCCT
CTCCGCAAAGTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGG
CTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCAC
ACAAACGCAGTGTCTGGAAATACAGATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACCGGTCT
GAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAA*CGCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATT
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GTCCGAAATGTACAAGCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCATCA
A
CAAA

QA 4 784 4 784
DS 

RD RR4CJ03TF 718 0 0
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AGAGAATGGAGTTCCAAAACCGGTACGGACTTACAACGACGCAGAAGTACGACTGTCTCT
TATTCGATTTGGACGATACTCTTTATCCTCTTAGCACCGGAATCGCAAGAGAGTGTGGGC
AGAACATCAAAGATTATATGGTCGAGGAACTCGGTATTCCGAAGGACAAAATCGTTGAAT
TGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGGCCGGTCTTAGAGCGATCGGAT
ATGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACGGTCGTTTACCGTACGACAACA
TAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTCTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAGGTCATAT
TCACGAACGCGGATAGAGTCCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTAGAGGATT
GTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCACACAAACGCAGTGTCTG
GAAATACAGATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACCGGTCTGAACCGGTTAGTTTGC
TTCCGAAAACGCCTATCGTGTATAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCTCTCGAAA
TCGCCAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAATGTACAAG
CTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGC

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RD RR4A238TFB 745 0 0
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TGGACGATACTCTTTATCCTCTTAGCACCGGAATCGCAAGAGAGTGTGGGCAGAACATCA
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TTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGGCCGGTCTTAGAGCGATCGGATATGGCTTTG
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ACCCTGTTCTTCGAAGCCTCTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAAGTCATATTCACGAACG
CGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAG
GGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCACACAAACGCAGTGTCTGGAAATACAG
ATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACCGGTCTGAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAAC
GCCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCTCTCGAAATCGCCAATA
TTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAATGTACAAGCTGGAAAAC
GCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCGTCAA*CAAAGTCAAAGGAGCAGATTACG
CCTTCGAAA*CATTCACAACATGAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4A238JQ 311 0 0
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TTGATATCGTTAGACATTTCGACCGGTCTGAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAA*CGCCTA
TCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCTCTCGAAATCGCCAATATTGACC
CTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAATGTACAAGCTGGAAAACGCGTTG
GTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCGTCAAACAAAGTCAAAGGAGCAGATTACCCCTTCG
AAAACATTCAC

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR4ER89JQ 802 0 0
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ATCGGATACGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACGGTCGTTTACCGTAC
GACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTCTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAA
GTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTA
GAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCACACAAACGCA
GTGTCTGGAAATACAGATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACCGGTCTGAACCGGTT
AGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCT
CTCGAAATCGCTAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAAT
GTACAAGCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCATCAAACAAAGTC
AAAGGAGCAGATTACGCCTTCGAAAACATTCACAACATGAAGGAGGCGTTACCAGAGTTA
TGGAAATCGGACAGAAAATCAGCTGATGTTGGATATTCTGGCAAGGTCGCCGTTGAGACA
CCTGTCACAGCGTAGGACTGTTTCACCGTTGTACCTAATTTTCATCCACTGTCATTTTCA
ATCTTTTTTTCAAATGACGTTATGTCATTTTTGTTTTTCGAGTCGTGTTTATAAATTTAA
ATAAAAGCAGGAAATAATCTTC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4GN86JQ 631 0 0
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CTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCAC
ACAAACGCAGTGTCTGGAAATACATATATTTTTGATATCGTTGGACATTTCGACCGGTCT
GAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATT
GAGAAAGCTCTCGAAATCGCCAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGT
GTCCGAAATGTACAAGCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCATCA
AACAAAGTCAAAGGAGCAGATTACGCCTTCGAAAACATTCACAACATGAAGGAGGCGTTA
CCAGAGTTATGGAAATCGGACAGAAAATCAGCTGATGTTGGATATTCAGGCAAGGTCGCC
GTTGAGACACCTGTCACCGCGTAGGACTGTTTCACCGTTGTACCTAATTTTCATCCACTG
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DS 

RD RR4A238JQD 661 0 0
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TTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTAGAGGAT
TGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCCGACGCACACAAACGCAGTGTCT
GGAAATACAGATATTTTTGATATCGTTAGACATTTCGACCGGTCTGAACCGGTTAGTTTG
CTTCCGAAA*CGCCTATCGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCTCTCGAA
ATCGCCAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAATGTACAA
GCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCGTCAAACAAAGTCAAAGGA
GCAGATTACGCCTTCGAAAACATTCACAACATGAAGGAGGCGTTACCAGAGTTATGGAAA
TCGGACAGAAAATCAGCTGATGTTGGATATTCAGGCAAGGTCGCCGTTGAGACCCCTGTC
ACAGCGTAGGACTGTTTCACCGTTGTACCTAATTTTCATCCACTGTCATTTTCAATCTTT
TTTTCAAATGACGTTATGTCATTTTTGTTTTTCGAGTCGTGTTTATAAATTTAAATAAAA
G

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 9

CO CL452Contig1 1335 9 13 U
GGACAAAAGCTAAATGGTATTAATTGTAGTTAATATACTTTTGTTTGGGTTTATTAGAAT
CTTTTT*GATTCTTTTCACTGGAAACAAGAAGCAAATTACATTATATTACAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGTCGAGACACGTCTTTTGTTTTCTCATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAAC
TAGAACATCATCGGAAGTATTTACACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGC
TACAACACCGTGTTCGATTCCACATTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATC
ATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGATTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGA
AGTTCCCCAGCCAATAAGCTTGACAGCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTT
GTACACTCCAGATTTGTAATGCGCAAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGG
TCCGTTTGTGTAAACTTCAGCCATAATGTCTTGAGGGTCATGCCTGACTTTGTAGGCGCT
AACACCATAGTGTTTTGATTCACGCCAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACA
TTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCGCATCCCGGGTGTGAGCATCCAGTATTGTCAAAGTA
TGGATCACACTCTTCGGTGACTACACCGTGGTGCTTAAAGTATCGCCAGGCGGAAATAGG
GTAGCCACCATTACAGCCTTGACCGCAAAGGAATCCACAACATGCTAAGAGATCATTGAC
TGATAAAGAAATATTCATGTTATATTTGATGCAGAACCTGTCAGACAATGATTCTACAGC
CCCAAATGCCCAGCAAGAACCACAGTGACCCTGATCTAGGATCCTTCCAATACTGGAGCA
CTGAGACCAAGCGGTTCTAGCGTCAAATTGTTTAGGAAGCTTGAGAGAGATGGAGATGTG
ATGGCTTACAACAGGTACACCTAAGAATGCGTTCTTAGGTGATGGTTTAACACCGAGGAG
GCGCTTAAACTCTGCAACGGTGGAGTTAGCAAAGCGATCATTAAAAGCAGCTTTCCATCC
AGCCTTTGGATTCTCATTGACTTGCTTCACAATCTCATCCTGGAGAATTGGTGAGGTCAG
CTTCTGATTAGAAAGATTGTCTGCTGCAAATGCATTTCCCTCCCCAAAGTAAAAGTAAGA
TAGCAAAGGCTAAGTAGTAGACTCTGATGATGCGATGATGATGATGATGATCACCCATTA
ATCTCCCCTCCTCTGCTCAATCAGTTCCCAGAGAATCAATCAAACAAAACAATGATTTGC
CGACTTTTTGGATCC


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 20 20 10 10 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4EA67TF C 16
AF RR4E287TF C 1
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AF RR4HA24JQB U -1
AF RR4DU34TF C 210
AF RR4EJ11TF C 560
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BS 124 127 RR4E287JQ
BS 128 441 RR4DU34JQ
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BS 443 522 RR4DU34JQ
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GTACACTCCAGATTTGTAATGCGCAAAGTCCTCGTAAA

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AGA****GAGTCGAGACACGTCTTTTGTTTTCTCATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAAC
TAGAACATCATCGGAAGTATTTACACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGC
TACAACACCGTGTTCGATTCCACATTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATC
ATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGATTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGA
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GTACACTCCAGATTTGTAATGTGCAAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGG
TCCGTTTGTGTAAACTTCAGCCATAATGTCTTGAGGGTCATGTCTGACTTTGTAGGCGCT
AACACCATAGTGTTTTGATTCACGCCAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACA
TTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCGCATCCCGGGTGTGAGCATC

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DS 

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CTTTTT*GATTCTTTTCACTGGAAACAAGAAGCAAATTACATTATATTACAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGTCGAGACACGTCTTTTGTTTTCTCATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAAC
TAGAACATCATCGGAAGTATTTACACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGC
TACAACACCGTGTTCGATTCCACATTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATC
ATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGATTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGA
AGTTCCCCAGCCAATAAGCTTGACAGCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTT
GTACACTCCAGATTTGTAATGCGCAAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGG
TCCGTTTGTGTAAACTTCAGCCATAATGTCTTGAGGGTCATGCCTGACTTTGTAGGCGCT
AACACCATAGTGTTTTGATTCACGCCAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACA
TTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCGCATCCCGGGTGTGAGCATCCAGTATTGTCAAAGTA
TGGATCACACTCTTCG
CC

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DS 

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ACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGCTACAACACCGTGTTCGATTCCACA
TTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATCATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTG
ATTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGAAGTTCCCCAGCCAATAAGCTTGAC
AGCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTTGTAATGCGC
AAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGGTCCGTTTGTGTAAACTTCAGCCAT
AATGTCTTGAGGGTCATGCCTGACTTTGTAGGCGCTAACACCATAGTGTTTTGATTCACG
CCAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACATTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTC
GCATCCCGGGTGTGAGCATCCAGTATTGTCAAAGTATGGATCACACTCTTCG
CC

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AGAGAGAGAGTCGAGACACGTCTTTTGTTTTCTCATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAAC
TAGAACATCATCGGAAGTATTTACACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGC
TACAACACCGTGTTCGATTCCACATTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATC
ATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGATTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGA
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GTACACTCCAGATTTGTAATGCGCAAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGG
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AACACCATAGTGTTTTGATTCACGCCAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACA
TTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCGCATCCCGGGTGTGAGCATCCAGTATTGTCAAAGTA
TGGATCACACTCTTCG
CC

QA 1 676 1 676
DS 

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AAACAAGAAGCAAATTACATTATATTACAGAGAGAGAGAGA******GTCGAGACACGTC
TTTTGTTTTCTCATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAACTAGAACATCATCGGAAGTATTT
ACACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGCTACAACACCGTGTTCGATTCCA
CATTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATCATCACCCCAGCTTCGGTTCCAT
TGATTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAAAAGTTCCCCAGCCAATAAGCTTG
ACAGCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAAATTTGTAATGC
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TCGCATCCCGGGTGTGAGCATCCAGTATTGTCAAAGTATGGATCACACTCTTCGGTGACT
ACACCGTGGTGCTTAAAGTATCGCCAGGCGGAAATAGGGTA

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DS 

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CTGA
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TTTTTGATTCTTTTCACTGGAAACAAGAAGCAAATTACATTATATTACAGAGAGAGAGAG
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GAACATCATCGGAAGTATTTACACCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAAACCGGCTA
CAACACCGTGTTCGATTCCACATTCGTTCGTTCCTCTCTTGATCTTGAAGTAACCATCAT
CACCCCAGCTTCGGTTCCATTGATTTGTAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGAAG
TTCCCCAGCCAATAAGCTTGACAGCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTTGT
ACACTCCAGATTTGTAATGCGCAAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGGTC
CGTTTTTGTAAACTTCTGCCATAATGTCTTGAGGGTCATGCCTGACTTTGTAGGCGCTAA
CACCATAGTGTTTTGATTCACGCCAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACATT
TTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCGCATCCCGGGTGTGAGCATCCAGTATTGTCAAAGTATG
GATCACACTCTTCGGTGACTACGCCGTGGTGCTTAAAGTATCGCCAGGCGGAAATAGGGT
AGCCACCATTACAGCCTTGACCGCAAAGGAATCCACAACATGCTAAGAGATCATTGACTG
ATAAAGAAATATTCATGTTATATTTGATGCA

QA 5 815 5 815
DS 

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GACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTTGTAATGTGCAAAGT
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CCTGATCTAGGATCCTTCC
C

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DS 

RD RR4EJ11TF 776 0 0
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ACTACACCGTGGTGCTTAAAGTATCGCCAGGCGGAAATAGGGTAGCCACCATTACAGCCT
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TTATATTTGATGCAGAACCTGTCAGACAATGATTCTACAGCCCCAAATGCCCAGCAAGAA
CCACAGTGACCCTGATCTAGGATCCTTCCAATACTGGAGCACTGAGACCAAGCGGTTCTA
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CCTAAGAATGCGTTCTTAGGTGATGGTTTAACACCGAGGAGGCGCTTAAACTCTGCAACG
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TCTGCTGCAAATGCATTTCCCTCCCCAAAGTAAAAGTAAGATAGCAAAGGCTAAGTAGTA
GACTCTGATGATGCGATGATGATGATGATGATCACCCATTAATCTCCCCTCCTCTGCTCA
ATCAGTTCCCAGAGAATCAATCAAACAAAACAATGATTTGCCGACTTTTTGGATCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 9

CO CL453Contig1 1637 9 19 U
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CTTTCATTTAGGGTTTTCATTTCTTTTGGTGGAAGGAAACAATGTTGCAAAGATTGGTCT
CCCTTCTCATTGTTCTCCTGATTCAGTCTTCTTTCGTTTTTGAGATTTCCTCTGCTCTCC
AGGAAGGTAAAACATGTATACGAAACGACAACTGTGACGCTGGATTACACTGTGAAACAT
GTCTAGCCAACAATAATTTGAGACCCAGATGCTCTCGGACCCAACCCATCAACCCCATCT
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CTTCGAAAACGATATCTGGCTTTGTCACTC*TTTCGATGGAACGTGTTTTAATTTCACCC
GCTTTCCAACC*AGCGGTTAACGTTCTAAGGGAGATACAAGTGTTTCTAGAGAATAACAA
GGATGAAGTTGTAACGATTATTATAGAAGACTATGTGAAATCTCCCAAGGGCCTCACGAA
AGTGTTTAATGCGGCAGGGCTACAAAAGTTCATGTTTCCAGTTACTAGAATGCCCAAAAA
TGGAGGGGACTGGCCAACGCTTGACGACATGATAAAACAAAACCAAAGGTTGCTAGTTTT
CACATCCGACAGAAGTAAAGAAGCAACCGAAGGAATCGCATATCAGTGGAAGTACATGGT
CGAGAACCAATATGGAAATGGAGGGTTGAAGGAAGGAGCGTGTCCTAACAGAGCTCAATC
AGCACCAATGAGCGATAAATCGAAATCTCTTGTACTTGTTAACCATTTTCCAGATGCTCC
GGATTTGGTAGTAGCATGTAGACAAAACTCTGCTCCACTTCTTGAATCCATCAA*GGCAT
GTTACCAAGCCGCAGGACAAAGATGGCCTAACTTCATAGCAGTCGATTTCTACAAGAGAA
GTGATGGTGGAGGAGCCCCGCAAGCTGTTGATGTTTCAAATGGCAATTTGATATGCGGTT
GCGATAATTTTGCAGCTTGCAAGGCCAATGGAGAGTGTGGATAGTTAGCAAGACTGAGCC
ATCGGAGGCAACTTCCATGAACAAAAGCTATGGCTGTTTACAAAAAATGTAACGTGTGTG
CCCTTTATTTTATAACAACACATGGTTCAACTTGTTTCCTTTTACACTAGTTGCCAAATA
TTAGTGAAAGTATCATTCATCTCAAACTCATTTTCACACAAAAAGGAACCACACAGCTTG
AGTAAATCCATTTACGCAGCCCCAAAACATAATATAAACACATAGATACATGTTAGCTGT
TGAGAGGATTTGCGAAAATTGATATATCATGTTTGTCTTTTCTTTTCTCCAATTACATAT
TGAGAATGTTGGGACCAACTTGTCACAATGCGTTGCTACTTCTTTATTCAAAAAGTGATA
GAAAATTAGAATTTTGTCTTGATTCTACATGTTGGATTACTACAAACAAAACTATAATAA
TGGACCTCGATTCTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A264TF U 181
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CAAAGGTAAAGGGATTGCCTTTCAACAAGTACGCATGGTTAACAACACACAACTCGTTTG
CA

QA 1 182 1 182
DS 

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AGCCAACAATAATTTGAGACCCAGATGCTCTCGGACCCAACCCATCAACCCCATCTCAAA
GGTAAAGGGATTGCCTTTCAACAAGTACGCATGGTTAACAACACACAACTCGTTTGCAAG
ATTGGGGCAAGTATCAAAAACCGGTTCTGTAATTTTGGCTCCCTACTAATCAACAAGATT
CGGTCACAACCCCAACTCACGAACGGTGTAAGGGGGTTTATGCTCGACATGTACGACTTC
GAAAACGATATCTGGCTTTGTCACTCCTTTCGATGGAACGTGTTTTAATTTCACCCGCTT
TCCAACCCAGCGGTTAACGTTCTAAGGGAGATACAAGTGTTTCTAGAGAATAACAAGGAT
GAAGTTGTAACGATTATTATAGAAGACTATGTGAAATCTCCCAA

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DS 

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CCCTTCTCATTGTTCTCCTGATTCAGTCTTCTTTCGTTTTTGAGATTTCCTCTGCTCTCC
AGGAAGGTAAAACATGTATACGAAACGACAACTGTGACGCTGGATTACACTGTGAAACAT
GTCTAGCCAACAATAATTTGAGACCCAGATGCTCTCGGACCCTACCCATCAACCCCATCT
CAAAGGTAAAGGGATTGCCTTTCAACAAGTACGCATGGTTAACAACACACAACTCGTTTG
CAAGATTGGGGCAAGTATCAAAAACCGGTTCTGTAATTTTGGCTCC*TACTAATCAACAA
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GCTTTCCAACC*AGCGGTTAACGTTCTAAGGGAGATACAAGTGTTTCTAGAGAATAACAA
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AGTGTTTAATGCGGCAGG*CTACAAAAGTTCATGTTTCCAGTTACTAGAATGCC**AAAA
TGGAGGG*ACTGGCCA*CGCTTGACGACATGATAA

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CCGGATTTGGTAGTAGCATGTAGACAAA

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DS 

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G
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GGTTAACAACACACAACTCGTTTGCAAGATTGGGGCAAGTATCAAAAACCGGTTCTGTAA
TTTTGGCTCC*TACTAATCAACAAGATTCGGTCACAACCC*AACTCACGAACGGTGTAAG
GGGGTTTATGCTCGACATGTACGACTTCGAAAACGATATCTGGCTTTGTCACTC*TTTCG
ATGGAACGTGTTTTAATTTCACC*GCTTTCCAACC*AGCGGTTAACGTTCTAAGGGAGAT
ACAAGTGTTTCTAGAGAATAACAAGGATGAAGTTGTAACGATTATTATAGAAGACTATGT
GAAATCTCCCAAGGGCCTCACGAAAGTGTTTAATGCGGCAGGGCTACAAAAGTTCATGTT
TCCAGTTACTAGAATGCCCAAAAATGGAGGGGACTGGCCAACGCTTGACGACATGATAAA
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CGCATATCAGTGGAAGTACATGGTCGAGAACCAATATGGAAATGGAGGGTTGAAGGAAGG
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DS 

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TTTCA
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AAGGATGAAGTTGTAACGATTATTATAGAAGACTATGTGAAATCTCCCAAGGGCCTCACG
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AATGGAGGGGACTGGCCAACGCTTGACGACATGATAAAACAAAACCAAAGGTTGCTAGTT
TTCACATCCGACAGAAGTAAAGAAGCAACCGAAGGAATCGCATATCAGTGGAAGTACATG
GTCGAGAACCAATATGGAAATGGAGGGTTGAAGGAAGGAGCGTGTCCTAACAGAGCTCAA
TCAGCACCAATGAGCGATAAATCGAAATCTCTTGTACTTGTTAACCATTTTCCAGATGCT
CCGGATTTGGTAGTAGCATGTAGACAAAACTCTGCTCCACTTCTTGAATCCATCAA*GGC
ATGTTACCAAGCCGCAGGACAAAGATGGCCTAACTTCATAGCAGTCGATTTCTACAAGAG
AAGTGATGGTGGAGGAGCCCCGCAAGCTGTTGATGTTTCAAATGGCAATTTGATATGCGG
TTGCGATAATTTTGCAGCTTGCAAGGCCAATGGAGAGTGTGGATAGTTAGCAAGACTGAG
CCATCGGAGGCAACTTCCATGAACAAAAGCTATGGCTGTTTACAAAAAATGTAACGTGTG
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TATTAGTGAAAGTATCATTCATCTCAAACTCATTTTCACAC

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DS 

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G
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CAAAGATGGCCTAACTTCATAGCAGTCGATTTCTACAAGAGAAGTGATGGTGGAGGAGCC
CCGCAAGCTGTTGATGTTTCAAATGGCAATTTGATATGCGGTTGCGATAATTTTGCAGCT
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TGAACAAAAGCTATGGCTGTTTACAAAAAATGTAACGTGTGTGCCCTTTATTTTATAACA
ACACATGGTTCAACTTGTTTCCTTTTACACTAGTTGCCAAATATTAGTGAAAGTATCATT
CATCT

QA 2 366 2 366
DS 

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G
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ACAGAGCTCAATCAGCACCAATGAGCGATAAATCGAAATCTCTTGTACTTGTTAACCATT
TTCCAGATGCTCCGGATTTGGTAGTAGCATGTAGACAAAACTCTGCTCCACTTCTTGAAT
CCATCAA*GGCATGTTACCAAGCCGCAGGACAAAGATGGCCTAACTTCATAGCAGTCGAT
TTCTACAAGAGAAGTGATGGTGGAGTAGCCCCGCAAGCTGTTGATGTTTCAAATGGCAAT
TTGATATGCGGTTGCGATAATTTTGCAGCTTGCAAGGCCAATGGAGAGTGTGGATAGTTA
GCAAGACTGAGCCATCGGAGGCAACTTCCATGAACAAAAGCTATGGCTGTTTACAAAAAA
TGTAACGTGTGTGCCCTTTATTTTATAACAACACATGGTTCAACTTGTTTCCTTTTACAC
TAGTTGCCAAATATTAGTGAAAGTATCATTCATCT
C

QA 2 516 2 516
DS 

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TGTACTTGTTAACCATTTTCCAGATGCTCCGGATTTGGTAGTAGCATGTAGACAAAACTC
TGCTCCACTTCTTGAATCCATCAA*GGCATGTTACCAAGCCGCAGGACAAAGATGGCCTA
ACTTCATAGCAGTCGATTTCTACAAGAGAAGTGATGGTGGAGGAGCCCCGCAAGCTGTTG
ATGTTTCAAATGGCAATTTGATATGCGGTTGCGATAATTTTGCAGCTTGCAAGGCCAATG
GAGAGTGTGGATAGTTAGCAAGACTGAGCCATCGGAGGCAACTTCCATGAACAAAAGCTA
TGGCTGTTTACAAAAAATGTAACGTGTGTGCCCTTTATTTTATAACAACACATGGTTCAA
CTTGTTTCCTTTTACACTAGTTGCCAAATATTAGTGAAAGTATCATTCATCTCAAACTCA
TTTTCACACAAAAAGGAACCACACAGCTTGAGTAAATCCATTTACGCAGCCCCAAAACAT
AATATAAACACATAGATACATGTTAGCTGTTGAGAGGATTTGCGAAAATTGATATATCAT
GTTTGTCTTTTCTTTTCTCCAATTACATATTGAGAATGTTGGGACCAACTTGTCACAATG
CGTTGCTACTTCTTTATTCAAAAAGTGATAGAAAATTAGAATTTTGTCTTGATTCTACAT
GTTGGATTACTACAAACAAAACTATAATAATGGACCTCGATTCTTAG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 2 7

CO CL454Contig1 748 3 5 U
GGACGCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCTGAAACTAA
TTTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAA
GCTCAAGTTTCTGGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGA
GGAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGA
CTTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGT
CACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGC
AAGGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGA
TGGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAA
AAGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGACAATATATTTGGTTGAATCCA
ACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAACC
AAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTTTG
GTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTTAAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTACCATTGT
GTAAGAAACCCCCCCAAACCCTTTACCG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH50TF U 3
AF RR4FI86TF U 3
AF RR4BI67TF U 1
BS 1 294 RR4BI67TF
BS 295 295 RR4BH50TF
BS 296 675 RR4BI67TF
BS 676 676 RR4FI86TF
BS 677 748 RR4BI67TF

RD RR4BH50TF 678 0 0
GG
GCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCTGAAACTAATTTT
GATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTC
AAGTTTCTGGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCTAGGAG
CAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTT
GCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTCACT
GCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGG
GTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGATGGA
ATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGC
CGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGACAATATATTTGGTTGAATCCAACTA
CTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAACCAAAA
CAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGCCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTT*GGTCC
TTGCAGTGTTT
GCTTA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4FI86TF 710 0 0
GG
GCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCTGAAACTAATTTT
GATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTC
AAGTTTCTGGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAG
CGGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGTTCAATCCCACGACGACTTT
GCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTCACT
GCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGG
GTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGATGGA
ATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGC
CGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGACAATATATTTGGTTGAATCCAACTA
CTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAACCAAAA
CAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTTTGGTCC
TTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTTAAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTT

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR4BI67TF 748 0 0
GGACGCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCTGAAACTAA
TTTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAA
GCTCAAGTTTCTGGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGA
GGAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGA
CTTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGACTTCGT
CACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGC
AAGGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGA
TGGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAA
AAGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGACAATATATTTGGTTGAATCCA
ACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAACC
AAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTTTG
GTCCTTGCAGTGTTT*GCTTAAAACTTTAAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTACCATTGT
GTAAGAAACCCCCCCAAACCCTTTACCG

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL454Contig2 788 4 12 U
GGAAAGGAAGAGAAAAGACGCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTT
CGTCTCCGAAACTAAAAATTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCA
GTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTC
ATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCT
GGTCAATCCCACGACGACTTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTT
TTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCA
TGGTCTCCAGACACGGCGAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGG
TTTAAACGTGAGCTTGATAGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATG
GATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGGAAAA
AAAATATATTTGGTTGAATCCAACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTT
GCTGTGAAGGCAACCACCAACCAAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCT
ATTGTCCTTTATATTTTTTT***GTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTAAGAGATTTG
GCTTATGCTCTTTTACCATTGTGTAAGAAACCCCCCAACCCCTTTACCAAAAGATGAATC
TTGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4GA94TF U 1
AF RR4FR81TF U 20
AF RR4CG11TF U 35
AF RR4GA94JQ C 86
BS 1 591 RR4GA94TF
BS 592 606 RR4FR81TF
BS 607 607 RR4CG11TF
BS 608 683 RR4FR81TF
BS 684 706 RR4CG11TF
BS 707 707 RR4GA94JQ
BS 708 724 RR4CG11TF
BS 725 725 RR4GA94JQ
BS 726 736 RR4CG11TF
BS 737 737 RR4GA94JQ
BS 738 752 RR4CG11TF
BS 753 788 RR4GA94JQ

RD RR4GA94TF 591 0 0
GGAAAGGAAGAGAAAAGACGCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTT
CGTCTCCGAAACTAAAAATTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCA
GTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTC
ATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCT
GGTCAATCCCACGACGACTTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTT
TTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCA
TGGTCTCCAGACACGGCGAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGG
TTTAAACGTGAGCTTGATAGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATG
GATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGGAAAA
AAAATATATTTGGTTGAATCCAACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4FR81TF 666 0 0
GG
ACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCCGAAACTAAAAATTT
GATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTC
AAGTTTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAG
CAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACTACTTT
GCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTTGATTTCGTCACT
GCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCATGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACGGCGAGA
GTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAACGTGAGCTTGATGGA
ATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGC
CGAGCCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGGAAAAAAAATATATTTGGTTGAATCC
AACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGGAGGCAACCACCAAC
CAAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCCTTTATATTTTTTT*
**TG

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4CG11TF 718 0 0
GACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCCGAAACTAAAAATTTGATTCAGCAGCCA
TGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAGC
TCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGTAGCAGTAACAAG
TGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTTGCTGCTAGTCTCC
CTGC*GATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAGCTGCC
AGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACGGCGAGAGTGAGAAGCAAGA
TGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAACGTGAGCTTGATGGAATTCAAGTTGAGC
TTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAGCCAACTGAG
GAGGAGTTACCATCCCTCCAGGAAAAAAAATATATTTGGTTGAATCCAACTACTATTACT
GAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAACCAAAACAACTTCA
TTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCCTTTATATTTTTTG***GTCCTTGCAGT
GTTTTGCTTAAA*CTTAAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTAC*ATTGTGTAAGAAACC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4GA94JQ 703 0 0
CAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGT
TTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGC
AGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTTGCTG
CTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTG
AGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCGTCGCATGGTCTCCAGACACGGCGAGAGTGA
GAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAACGTGAGCTTGATAGAATTC
AAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAG
CCAACTGAGGAGGAGTTACCATCCCTCCAGGAAAAAAAATATATTTGGTTGAATCCAACT
ACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAACCAAA
ACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCCTTTATATTTTTTTTTGGT
CCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTAAGAGATTTGGCTTATGCTCTTTTACCATTGTGTA
AGAACCCCCCCAACCCCTTTACCAAAAGATGAATCTTGTTGGC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 9

CO CL455Contig1 1373 9 21 U
GGGCCTTACGAACCATTCACAGGCACTCACATAAGACCTTCTCTTCAGTTTGCTCAGAGA
GTGAACCAACAAGCATGGCGAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTC
TCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACA
AGAGGAAAGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAGA
TTCTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTATCCAGGCTCCTTGTTAAAG
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GCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTTTTCACTTGAAAGGAGACA
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CTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCT
TGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGA
CAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCT
ACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTC
GACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAGGACT
TGGCAACAGCCTTTCTCGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCAAGCAGAGAGATATTCAACA
TCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAGGCTGGTG
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AGGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCT
TGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCGTACAACCTCGACT
TCGGTCGTGGCACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTCTAAGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW67TF U 58
AF RR4BH49TF U 1
AF RR4AG91TF U 222
AF RR4GV16TF U 525
AF RR4FG48TF U 400
AF RR4AG91JQ C 486
AF RR4FG48JQ C 669
AF RR4BH49JQ C 566
AF RR4FW67JQ C 549
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BS 371 639 RR4BH49TF
BS 640 640 RR4FW67TF
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BS 686 723 RR4BH49TF
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BS 725 820 RR4BH49TF
BS 821 821 RR4AG91TF
BS 822 836 RR4BH49TF
BS 837 837 RR4AG91TF
BS 838 850 RR4BH49TF
BS 851 851 RR4AG91TF
BS 852 865 RR4BH49TF
BS 866 903 RR4AG91TF
BS 904 1022 RR4FG48TF
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BS 1120 1305 RR4AG91JQ
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RD RR4FW67TF 738 0 0
G
GAGTGAACCAATAAGCATGGCGAAGATGATGATGT***AACAGAGCCAGCCTTCTTTATC
TCTCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTA
CAAGAGGAAGGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAA
GATTCTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAA
AGAGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCC
TGGCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCAAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGA
CAGAAAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTC*********AGCTGAAGGCTTCGA
TGTTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCTATAATAGAGGCACT
TCCTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATAT
CTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGA
GACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACAT
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TCGACCTATCCCAGTTC

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4BH49TF 877 0 0
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TCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACA
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TTCTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTATCCAGGCTCCTTGTTAAAG
AGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTG
GCGAATCTGGCCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTTTTCACTTGAAAGGAGACA
GAAAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCTAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATG
TTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGATGCACTTC
CTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCT
TGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCACGCACAAGGGGAAGCTGGAGA
CAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAG*TGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCT
ACG*TCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTC
GACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACA*CTCGGTCACGTTAAG*ACT
TGGCAACAGC*TTTCTCGCCGTGCT
GGTACGAGAAGC

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4AG91TF 682 0 0
GCATCGAGCGAGAAGAAGATTCTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTA
TCCAGGCTCCTTGTTAAAGAGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCT
ATTGCCAAACAATTGCCTGGCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATCTTTCTTCCAAGATT
TTTCACTTGAAAGGAGACAGAAAGGACTACGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCTAGTCTT
TCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAG
CCCATATTAGATGCACTTCCTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTT
TACCTGAAATCTGATATCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGG
CACAAGGGGAAGTTGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCT
ATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTC
CACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAA
CTCGGTCACGTTAAGGACTTGGCAACAGCCTTTCTCGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCA
AGCAGAGAGATATTCAACATCT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4GV16TF 493 0 0
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CTGAAATCTGATATCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCAC
AAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATA
CGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCAC
CGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTC
GGTCACGTTAAGGACTTGGCAACAGCCTTTCTCGCCGTGCTTGGCAACGAGAAAGCAAGC
*GAGAGATATTCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCT
TGCGCAAAGGCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTC
GACTTTGGGAAGA

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4FG48TF 720 0 0
TTT
TTCACTTGAAAGGAGACAGAAAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCTAGTCTTT
CAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGC
CCATATTAGATGCACTTCCTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTT
ACCTAAAATCTGATATCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGC
ACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTA
TACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCC
ACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAAC
TCGGTCACGTTAAGGACTTGGCAACAGCCTTTCTCGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCAA
GCAGAGAGATATTCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAG
CTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGT
TCGACTTTGGGAAGAAGAAG*CCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGG
AGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCA

QA 4 720 4 720
DS 

RD RR4AG91JQ 821 0 0
TATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGATGCACTTCCTAAA
CTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCTTGCCA
CACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGTTGGAGACAGAG
AGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGT
CCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCT
ATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAGGACTTGGCA
ACAGCCTTTCTCGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCAAGCAGAGAGATATTCAACATCTCA
GGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTTT
CCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAGAAGGCC
TTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGA
TGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCGTACAACCTCGACTTCGGT
CGTGGCACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTCTAAGCAAGAAA
CTTGTTCTTCAATAGAAAACATTATTGGCTTTTATATGGTTGTGTGATCTCAAACTGAAC
AAGATTCTCAAGTTTATCATCGTCTCAAATGTACTTTCTG
T

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4FG48JQ 637 0 0
TTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCA
TTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATC
CCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAGGACTTGGCAACA
GCCTTTCTCGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCAAGCAGAGAGATATTCAACATCTCAGGA
GAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTTTCCA
GAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAGAAGGCCTTC
CCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGATGG
AAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCGTACAACCTCGACTTCGGTCGT
GGCACTTTCAGAGAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTTTAAGCAAGAAACTT
GTTCTTCAATAGAAAACATTATTGGCTTTTATATGGTTGTGTGATCTCAAACTGAACAAG
ATTCTCAAGTTTATCATCGTCTCAAATGTACTTTCTG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4BH49JQ 721 0 0
TTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGT
TGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGG
TGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGT
AGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGG
GATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAGGACTTGGCAACAGCCTTTCTCGCCGTGCT
TGGTAACGAGAAAGCAAGCAGAGAGATATTCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTT
TGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCA
CTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAGAAGGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCA
TTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTT
GGTGGATGGTCTCACTGACTCGTACAACCTCGACTTCGGTCGTGGCACTTTCAGAAAAGA
GGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTTTAAGCAAGAAACTTGTTCTTCAATGGAAAAC
ATTATTGGCTTTTATATGGTTGTGTGATCTCAAACTGAACAAGATTCTCAAGTTTATCA
CC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FW67JQ 825 0 0
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CCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAGGACTTGGCAACA
GCCTTTCTCGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCAAGCAGAGAGATACTCAACATCTCAGGA
GAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAGAGGCTGGTGGGTTTCCA
GAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAGAAGGCCTTC
CCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGATGG
ACACCGGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAACCTCGACTTCGGTCGT
GGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTCTAAGCAAGAAACTT
GTTCTTCAATAGAAA*CATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGATCTCAAACTGAAGAAG
ATTCTCAAGTTTAACGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGGATTGTGTTCGAGTTTTTT
CTATAAAAAAAAAGCGGCGCGCGGTCTGGCTCTTGAAATTTTACT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 10

CO CL456Contig1 693 10 2 U
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TTTGAATTCAACAATTAACTGCAACACGAATGTATTGTAAAACAAAGTTTTGACGACTAG
AGACAAAACCACAAGTCCTTTTTATAATAGGAGAGGTAGACGAACTTAGATGATGCCAAT
CTTGTTAGCAACATCTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGT
TCCATCAGGCCTGATGAGAGTGTTGACCTTCTTGGTCTGAATGTCATACATCTTTTTAAC
AGCATCCTTAATCTTCTTCTTGTCGGCACGAATGTCAACGATGAAGACAAGAGTGTTGTT
GTCTTCAATCTTCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCATAGTG
ATCCAACTTGTTCCTTGGAGTAGCGCTGATTCTTGGGTACTTGGGATCTCTAGCCTTGGT
CAAAGTCTTTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAA
GGCTTGGCCAGACTTAACTGCTTTCGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCCTTAGGATCAGCCTT
CTTCGTGGTATCAACTTTAGCTGGAGACATAGCTCTAGATGATTCTTCCCACTCGAAATC
TGGAGAGGTGTTAAAAGAAGCTGAATACCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 

AF RR4E350TF C 1
AF RR4DZ67TF C 3
AF RR4F744JQ U 9
AF RR4F744TF C 9
AF RR4DZ67JQ U 9
AF RR4E350JQ U 9
AF RR4BJ88JQ U 39
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AF RR4BJ88TF C 39
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BS 9 693 RR4F744JQ

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CTTGTTAGCAACATCTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGT
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QA 1 693 1 693
DS 

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TTTTTT
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QA 7 691 7 691
DS 

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DS 

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TCTTCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCATAGTGATCCAACT
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DS 

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TAATCTTCTTCTTGTCGGCACGA*TGTCAACGATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAA
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TTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTAGTCCAGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGC
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DS 

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TAATCTTCTTCTTGTCGGCACGA*TGTCAACGATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAA
TCTTCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCATAGTGACCCAACT
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TTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTAGTCCAGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGC
CAGACTTAACTGCTTTCGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCCTTAGGATCAGCCTTCTTCGTGG
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GCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGATGAGGGTGTTGACCTTCTTGGTCT
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G
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AACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGATGAGGGTGTTGACCTTCTTGGTCTGAAT
GTCATACATCTTTTTAACAGCATCCTTAATCTTCTTCTTGTCAGCACGAATGTCAACAAT
GAAGACAAGGGTGTTGTTGTCTTCAATCTTCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTA
CTTGAGGATACCATAGTGATCCAACTTGTTCCTTGGAGTAGCACTGATTCTTGGGTACTT
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CTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGCCAGACTTAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGGCCTT
GGCCTTGGGGTCAGCCTTCTTCGTGGTATCAACTTTAGCTGGAGACATAGCTCAAGATGA
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DS 

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CTTGTCAGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGGGTGTTGTTGTCTTCAATCTTCTTCAT
TGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCATAGTGATCCAACTTGTTCCTTGG
AGTAGCACTGATTCTTGGGTACTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGTCTTTGGCCTGTG
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TGCCTTCGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCCTTGGGGTCAGCCTTCTTCGTGGTATCAACTTT
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DS 

RD RR4BJ88TF 655 0 0
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GCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGATGAGGGTGTTGACCTTCTTGGTCT
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CAATGAAGACAAGGGTGTTGTTGTCTTCAATCTTCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTG
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ACTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGTCTTTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTGGTCCTGA
TCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGCCAGACTTAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGG
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QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 10

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GCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTG
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TTTTTTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTATGTACTTTGGGTT
TGCCACTTCCTTAATATGAAAATTTTAAAAATCTCCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B329TF U 1
AF RR4F201TF U 7
AF RR4AU46TF U 185
AF RR4F201JQ C 165
AF RR4H319TF U 8
AF RR4H319JQ C 96
AF RR4AA29JQ C 46
AF RR4GH64JQ C 52
AF RR4GH64TF U 52
AF RR4AA29TF U 46
BS 1 188 RR4B329TF
BS 189 189 RR4F201TF
BS 190 346 RR4B329TF
BS 347 347 RR4F201TF
BS 348 684 RR4B329TF
BS 685 686 RR4F201TF
BS 687 705 RR4H319TF

RD RR4B329TF 684 0 0
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GATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGACCCGTTT
GCTGATGTTGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATACGTGTC
CAGCAGCGGAATGGTAGAAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTATAGT
TACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGAAACTGTGGTTCAA
GACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACG
TTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCT
GCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTG
TTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCACTTGTTACTGTTT
TTTTTTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTATGTACTTTGGGTT
TGCCACTTCCTTAATATGAAAATT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4F201TF 680 0 0
GGG
GCATACTTTTATCCGAATCTAGGGTTTCATTCTTCTCTTCTCCCGAAAAATCAGATCCTC
GAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTCTCAGTTTCTCTGTCGTTTGCCCATCAGATCAACAA
AGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTGATGTG
GATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATACGTGTCCAGCAGCGG
AATGGTAGAAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTATAGTTACAGCAAG
ATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTGGTTCAAGACTCTGAA
CTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGCTCCTAGTC
CAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCTGCTTGTGTT
ACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTGTTATCCTCC
CTGTTCCAAAACATTTCTTCAACCTTCATCTTTGATCACTTGTTACTGTTTTTTTTTA*A
TATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTATGTACTTTGGGTTTGCCACTTC
CTTAATATGAAAATTTT

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DS 

RD RR4AU46TF 500 0 0
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AGCGGAATGGTAGAAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTATAGTTACA
GCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGAAACTGTGGTTCAAGACT
CTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCC
TAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCTGCTT
GTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTGTTAT
CCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCACTTGTTACTGTTTTTTT
TTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTATGTACTTTGGGTTTGCC
ACTTCCTTAATATGAAAATT

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DS 

RD RR4F201JQ 511 0 0
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CGTCCACATACGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGAAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCT
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CGGAACTGTGGTTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAG
GAAGAACGTCTCCACGCTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGAT
CCATGGTTTTTGAGCTGCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTC
TAGTGGATCATCACTGTTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACCTTCATCTTTGA
TCACTTGTTACTGTTTTTTTTTA*ATATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATC
TTATGTACTTTGGGTTTGCCACTTCCTTAAT

QA 1 511 1 511
DS 

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GG
GCATACTTTTATCCGAATCTAGGGTTTCATTCTTCTCTTCTCCCGATAAATCAGATCCTC
GAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTCTCAGTTTCTCTGTCGTTTGCCCATCAGATCAACAA
AGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTGATGTT
GATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATACGTGTCCAGCAGCGG
AATGGTAGAAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTATAGTTACAGCAAG
ATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTGGTTCAAGACTCTGAA
CTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCCTAGTC
CAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCTGCTTGTGTT
ACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGGTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTGTTATCCTCC
CTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCACTTGTTACTGTTTTTTTTTTTC
TATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTATGTACTTTGGGTTTGCCACTTC
CTTAATATGAAAATTTTAAAAATCTCCAAAAAAAAA

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DS 

RD RR4H319JQ 602 0 0
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GGTCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTGATGTTGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAAC
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CCAGGGGCTGAAGAAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTT
TTGTTGCAACGGAACTGTGGTTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGG
CGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAA
CATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCTGCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTAC
ATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTGTTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTT
CATCTTTGATCACTTGTTACTGTTTTTTTTTTTCTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAG
ACTACCATCTTATGTACTTTGGGTTTGCCACTTCCTTAATATGAAAATTTTAAAAA
ATCTCC

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DS 

RD RR4AA29JQ 653 0 0
GGG
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GTTTGCCCATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCC
TTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTC
CACATCCGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACGACGGTTCAGGGGCTGAAG
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GGTTTTTGAGCTGCTTATGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGT
GGATCATCACTGTTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCAC
TTGTTACTGTTTTTTTTTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTAT
GTACTTTGG*TTTGCCACTTCCTTAATATGAAAATTTTAAAAA
ATCTCCG

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DS 

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GG
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CCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACAT
CCGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACGACGGTTCAGGGGCTGAAGAAAGA
GTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGT
GGTTCAAGACTCTGAACTCGTACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACAT
CTCCACGTTCCTAGTTCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTT
CTGAGCTGCTTATGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATC
ATCACTGTTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCACTTGTT
ACTGTTTTTTTTTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGGCTACCATCTTATGTACT
TTGG*TTTGCCACTTCCTTAATATGAAAATTTT

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DS 

RD RR4GH64TF 635 0 0
GG
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CCCATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGA
CCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACAT
CCGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACGACGGTTCAGGGGCTGAAGAAAGA
GTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGT
GGTTCAAGACTCTGAACTCGTACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACAT
CTCCACGTTCCTAGTTCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTT
CTGAGCTGCTTATGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATC
ATCACTGTTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCACTTGTT
ACTGTTTTTTTTTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGGCTACCATCTTATGTACT
TTGG*TTTGCCACTTCCTTAATATGAAAATTTT

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR4AA29TF 653 0 0
GGG
CTCCCGATAAATCAGATCCTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTCTCAGTTTCTCTGTC
GTTTGCCCATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCC
TTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTC
CACATCCGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACGACGGTTCAGGGGCTGAAG
AAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGA
ACTGTGGTTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAG
AACGTCTCCACGTTCCTAGTTCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCAT
GGTTTCTGAGCTGCTTATGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGT
GGATCATCACTGTTATCCTCCCTGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTGATCAC
TTGTTACTGTTTTTTTTTA*CTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACCATCTTAT
GTACTTTGG*TTTGCCACTTCCTTAATATGAAAATTTTAAAAA
ATCTCCG

QA 4 646 4 646
DS 



AS 1 10

CO CL458Contig1 823 10 8 U
GGAATAGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTT
TACGAGTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAG
CTGCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACG
ACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTT
TGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAG
ATTGTGCTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCT
GGGGATACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGA
GGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACAC
AGCTCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTG
GGATCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATT
GATCGATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGG
ATGTATTTTGTATTTTACTAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGT
TTGTATCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAGGTTGTAATTTTATTTCGGTTGTTTAT
ATCTTTATATATAGCCGTTAGAATGACCAATATATGTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 45 40 40 40 40 25 40 40 5 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H788TF U 2
AF RR4HA94TF U 1
AF RR4EM50TF U 5
AF RR4DV75TF U 4
AF RR4HA94JQB C 1
AF RR4DV75JQ C 146
AF RR4H788JQB C 157
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AF RR4AN35TF U 4
AF RR4EM50JQ C 116
BS 1 5 RR4HA94JQB
BS 6 369 RR4HA94TF
BS 370 370 RR4H788TF
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BS 807 823 RR4EM50JQ

RD RR4H788TF 640 0 0
GGAT
AGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGA
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TTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAGGATTCGAACCT**TTTGATA
TGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGT
GCTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGA
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TATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTC
GTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATC
TTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCGGAAACCCTATTGATCG
ATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTT

QA 5 640 5 640
DS 

RD RR4HA94TF 755 0 0
GGAAT
AGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGA
GTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCA
ACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCG
TTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATA
TGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGT
GCTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGA
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TATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTC
GTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATC
TTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGATCG
ATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGGATGTA
TTTTGTATTTTACTAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTA
TCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAGG

QA 6 755 6 755
DS 

RD RR4EM50TF 761 0 0
GG
GCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGAG
TAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCAA
CACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGACTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCGT
TACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATAT
GGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGTG
CTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGATTATTTTCTGGGGAT
ACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGTGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTTTT
ATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTCG
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TTTGTATTTTAC*AGAAATAGAAGTTTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTAT
CGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAG
TTGTATTTTAT

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR4DV75TF 747 0 0
GG
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GTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCA
ACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCG
TTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATA
TGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGT
GCTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGA
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TATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTC
GTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATC
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ATCATTCATCTTATCTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGGATGTA
TTTTGTATTTTACTAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTA
TCGCTATACATGATTTTGTTCACGT

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR4HA94JQB 809 0 0
GGAATAGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAA*GGATGAGTTCATCATCCTTTT
TACGAGTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAG
CTGCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACG
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TGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAG
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GGGGATACGTAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGA
GGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACAC
AGCTCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTG
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TTGTATCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAGGTTGTAATTTTATTTCGGTTGTTTAT
ATCTTTATATATAGCCGTTAGAATGA
CCG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4DV75JQ 638 0 0
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GGCAGACGCTGTGGTCGCGGGGGCCAGCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAACTC
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AGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCTATACATGATTTTGTT
CACGTCAAGGTTGTTATTGCATTTCGGTTGTTTATA
CC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4H788JQB 652 0 0
GTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCC
GTGCCGCAGGATTCGAACCT**TTTGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAA
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TTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGATACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTG
TGGTCGCGTGGACCAGCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTG
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ACTACATCGGCCGGAAACCCTATTGATCGATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTAT
GACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGGATGTATTTTGTATTTTACTAGAGATAGAAGTGTTTG
TGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAGGT
TGTAATTTTATTTCGGTTGTTTATATCTTTATATATAGCCGTTAGAATGA
CC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4AN35JQ 631 0 0
ACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTC
CTTTGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGT
CAGATTGTGGTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTT
TCTGGGGATACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGA
AGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACA
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GTGGGATCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCT
ATTGATCGATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGA
TGGATGTATTTTGTATTTTACTAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATA
CGTTTGTATCGCTTTACATGATTTTGTTCACGTCAAGGTTGTAATATTATTTCGGTTGTT
TATATCTTTATATATAGCCGTTAGAATGA
TC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4AN35TF 803 0 0
GG
AGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGA
GTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCA
ACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGACTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCG
TTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATA
TGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGT
GGTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGA
TACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTTT
TATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTC
GTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGTGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATC
TTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGATCG
ATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGGATGTA
TTTTGTATTTTACTAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTA
TCGCTTTACATGATTTTGTTCACGTCAAGGTTGTAATATTATTTCGGTTGTTTATATCTT
TATATATAGCCGTTAGAATGA

QA 3 803 3 803
DS 

RD RR4EM50JQ 708 0 0
CAAAGCTGCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGACTTTATGCCCGGGATGTGA
CTACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACC
TCCTTTGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAA
GTCAGATTGTGCTTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTTTCGGCGAGATTAT
TTTCTGGGGATACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGTGTGGGCCAGCGA
GAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTA
CACACAGCTCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATTGGATGCGCACGTGTAGTGTGCGACAA
CGGTGGGACCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACC
CTATTGATCGATCATTCATCTTATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTA
GATGGATGTATTTTGTATTTTACCAGAAATAGAAGTTTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAA
TACGTTTGTATCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAGGTTGTAATTTTATTTCGGTTG
TTTATATCTTTATATATAGCCGTTAGAATGACCAATATATGTTTCATC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 9

CO CL459Contig1 911 9 19 U
GGAAGAACTCTGAGACACACACAGCAAAGAGAAACCGAGTGAAGAAGATAAAGCAAAAAA
ACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCAAAGATC
ATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCAACGTT
GTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTCTCTGCG
GCTGGACTGTCGCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTCGAGCTT
AACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACTTATTAC
GAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTTCTGCTGTG
GATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCT
GGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGCGCGGGTTTGTTTACCATA
GTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCTCAGATT
TACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTATAACACTATGAGCATT
TGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAATGATATC
GCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAAAAA*TGATGATGGTATTTGATGAAAA
CTGTTTATAAATGATGAATGAAACGTCTTACCATGTGTATAATGTATTCTTCATGTGCTT
CATTAGTCTCTTCAAACCTTCCTAGAATGTTATAGGATTCTGTTTCTTTGTTCAAAAAGT
TCACTACAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI95TF U 55
AF RR4DY65TF U 1
AF RR4F094TF U 55
AF RR4D675TF U 10
AF RR4AD13TF U 71
AF RR4DY65JQ C 278
AF RR4CI95JQ C 166
AF RR4D675JQ C 596
AF RR4F094JQ C 279
BS 1 89 RR4DY65TF
BS 90 90 RR4D675TF
BS 91 668 RR4DY65TF
BS 669 709 RR4D675TF
BS 710 710 RR4AD13TF
BS 711 713 RR4D675TF
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BS 715 731 RR4D675TF
BS 732 753 RR4AD13TF
BS 754 755 RR4CI95JQ
BS 756 756 RR4AD13TF
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BS 758 766 RR4AD13TF
BS 767 767 RR4CI95JQ
BS 768 806 RR4AD13TF
BS 807 807 RR4CI95JQ
BS 808 816 RR4AD13TF
BS 817 874 RR4CI95JQ
BS 875 911 RR4F094JQ

RD RR4CI95TF 546 0 0
AAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCA
AAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCC
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GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGCGCGGGTTTGTTT
ACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCT
CAGATT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4DY65TF 668 0 0
GGAAGAACTCTGAGACACACACAGCAAAGAGAAACCGAGTGAAGAAGATAAAGCAAAAAA
ACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACTATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCAAAGATC
ATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCAACGTT
GTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTCTCTGCG
GCTGGACTGTCGCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTCGAGCTT
AACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACTTATTAC
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GATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCT
GGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGCGCGGGTTTGTTTACCATA
GTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCTCAGATT
TACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTATAACACTATGAGCATT
TGGGACTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4F094TF 651 0 0
AAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCA
AAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCC
AACGTTGTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTC
TCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCACTGGTCAGTTC
GAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACT
TATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTTCT
GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCTGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGCGCGGGTTTGTTT
ACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCT
CAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTATAACACTATG
AGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4D675TF 728 0 0
GGGAGAC
ACACACAGCAAAGAGAAACCGAGTGAAGAAGATAAAGCAAAAAAACAATGGCAACCATTA
ATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCAAAGATCATCAACTCGAAACTCG
GAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCAACGTTGTGAAATGTGTGAGTT
CCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGATCTCTGCGGCTGGACTGTCGCAGA
TCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGG
AGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAA
AGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTTCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGT
TTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTTTGATG
CTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGCGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAG
AGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAG
GAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTATAACACTATGAGCATTTGGGACTTTAATGACA
AGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGA*GAACGATATCGCCACAAGATA
GATGTT

QA 8 722 8 722
DS 

RD RR4AD13TF 746 0 0
G
CATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCAAAGATCATCAACTCGAA
ACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCAACGTTGTGAAATGTGT
GAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTCTCTGCGGCTGGACTGTC
GCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGA
AATGGAGGATTTCAAGTATGGTTATTACGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGT
TGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTGCTGCTGTGGATCCTCCATC
TGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGCTGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTT
TGATGCTCCGGGTGAGTACATGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTAT
AATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGA
GAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATGAGCATTTGGGACTTTAA
TGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAATGATATCGCCACAAGATA
AGATGTTGATTCTTACAAAAAA**A**TGATGATGATATTTGATGAAAACTGTTTATAAA
TGATGAATGAAACGTGTTACCATGT

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR4DY65JQ 548 0 0
ATCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATT
ACGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAA
TTGCAGATGATATTTCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATTTCTTGGT
TGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCA
TAGGCGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGC
CCCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTA
ATGACTATAACACTATGAGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATT
TCACCGTCGAGAAGAATGATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAAAAA
*TGATGATGGTATTTGATGAAAACTGTTTATAAATGATGAATGAAACGTCTTACCATGTG
TATAATG
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4CI95JQ 709 0 0
TTCTCTCCCAACGTTGTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCG
AAGCTGGTCTCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATT
GGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGA
GCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGAT
GATATTTCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTT
CCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGCGCG
GGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAAC
TTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTAT
AACACTATGAGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTC
GAGAAGAATGATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAAAA**TGATGAT
GGTATTTGATGAAAACTGTTTATAAATGATGAATGAAACGTCTTACCATGTGTATAATGT
ATTCTTCATGTGCTTCATTAGTCTCTTCAAACCTTCCTAGAATGTTATA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4D675JQ 246 0 0
AGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTATAACACTATGA
GCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAACG
ATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAAAAAATGATGATGGTATTTGAT
GAAAACTGTTTATAAATGATGAATGAAACGTCTTACCATGTGTATAATGTATTCTTCATG
TGCTTC

QA 1 246 1 246
DS 

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TCCCACTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTA
CGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAAT
TGCAGATGATATTTCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTT
GTTTCTTCCTGCTATTGCTGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCAT
AGGCGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCC
CCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAA
TGACTATAACACTATGAGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTT
CACCGTCGAGAAGAATGATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAAAAAA
TGATGATGGTATTTGATGAAAACTGTTTATAAATGATGAATGAAACGTCTTACCATGTGT
ATAATGTATTCTTCATGTGCTTCATTAGTCTCTTCAAACCTTCCTAGAATGTTATAGGAT
TCTGTTTCTTTGTTCAAAAAGTTCACTACAGTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 9

CO CL460Contig1 1077 9 18 U
ACACACTACAACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTTGACCAA
CATTGTCTTCCATATCAGGAA*GATCAATTGTACTCAGAATCACAAAGATAACAAATTAG
ACAAGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGAGATATCCTACTCGTCCTATGTTACACA
AAACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGTAACATCAGATGGCTAGAGACT
TAAAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAG
CAAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTG
ATGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCG
ATAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTG
ATTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCA
TCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCT
ATGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACA
AGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGA
CCAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATC
TTGAAGTCAATTCCAATGGTAGTAATGAAACTTGTAGTGAAAGTATCATCTGAGAAACGC
AGCAACAAGCAACTCTTCCCCACACCGCTGTCTCCGATGAGAAGGAGCTTGATGAGGTAA
TCATAGTCAGAACGAGCTCTCGCCGGAGCAACCGCCATCTCTAAAGA*TCAGATAAAAAG
CTCAGAGATTTATCACTTTTGCTTCTCTCTTACAAAAGCTAGCTCCTGCTTCTTCTTCTT
TT**TTCCAGAAGAGATTGAAATGGTATAATGGAAAACAGCAGAAGAAGTTGATTCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 30 30 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H427JQB U 1
AF RR4H037JQ U 2
AF RR4D446JQ U 1
AF RR4DI25JQ U 1
AF RR4FN57JQ U 55
AF RR4DI25TF C 256
AF RR4FN57TF C 190
AF RR4D446TF C 382
AF RR4H037TF C 455
BS 1 545 RR4D446JQ
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BS 768 782 RR4FN57JQ
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BS 949 988 RR4FN57TF
BS 989 990 RR4DI25TF
BS 991 1005 RR4FN57TF
BS 1006 1006 RR4DI25TF
BS 1007 1010 RR4FN57TF
BS 1011 1011 RR4DI25TF
BS 1012 1038 RR4FN57TF
BS 1039 1077 RR4D446TF

RD RR4H427JQB 652 0 0
A
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ATTGTCTTCCATATCAGGAA*GATCAATTGTACTCAGAATCACAAAGATAACAAATTAAA
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AAAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAAAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGC
AAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAAAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGACCTTGA
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CCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTA
TGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTACGT

QA 2 652 2 652
DS 

RD RR4H037JQ 648 0 0
CACACTACAACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATCGTTTTTGACCAAC
ATTGTCTTCCATATCAGGAA*GATCAATTGTACTCAGAATCACAAAGATAACAAATTAGA
CAAGACATACAAGATCGCAACCATCAATGAGAGATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAA
AACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGTAACATCAGATGGCTAGAGACTT
AAAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGC
AAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAAAAAACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGA
TGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCATTTGCGA
TAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGA
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CCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTA
TGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4D446JQ 767 0 0
ACACACTACAACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTTGACCAA
CATTGTCTTCCATATCAGGAA*GATCAATTGTACTCAGAATCACAAAGATAACAAATTAG
ACAAGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGAGATATCCTACTCGTCCTATGTTACACA
AAACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGTAACATCAGATGGCTAGAGACT
TAAAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAG
CAAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTG
ATGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCG
ATAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTG
ATTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCA
TCCATATCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCT
ATGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACA
AGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGA
CCAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4DI25JQ 766 0 0
A
CACACTACAACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTTGACCAAC
ATTGTCTTCCATATCAGGAA*GATCAATTGTACTCAGAATCACAAAGATAACAAATTAGA
CAAGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGAGATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAA
AACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGTAACATCAGATGGCTAGAGACTT
AAAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGC
AAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGA
TGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCGA
TAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGA
TTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCAT
CCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTA
TGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAA
GCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGAC
CAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCT

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR4FN57JQ 728 0 0
GACCAACATTGTCTTCCATATCAGGAAAGATCAATTGTAC**AAAATCACAAAGATAACA
AATTAGACAAGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGT
TACACAAAACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACGGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTG
GAGACTTAAAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAA
CTACAGCAAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTG
ATCTTGATGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCT
TTTGCGATAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAG
AATCTGATTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTG
CTTTCATCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGC
TGCTCTATGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCATCGGTTACGTCG
TAGACAAGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGT
TCTTGACCAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTT
CTTATCTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4DI25TF 767 0 0
CAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCAAGCTGATTTCTCA
GCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGATGC*TTGAGGCTCT
GCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCGATAGAGAGGAAAACC
GACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGATTCCATATTCATCA
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ATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATCTTGAAGTCAATTCCA
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CTTTTGCTTCTCTCTTACAAAAGCTAGCTCCTGCTTCTTCTTCTT
CC

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T*CTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGATGCCTTGA
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AAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATCTGATTCCATAT
TCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCATCCATGTCA
GCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTATGTTCTTC
ATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAAGCAGTATA
CCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGACCAGCAGTG
TCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATCTTGAAGTCA
ATTCCAATGGTGGTAATGAAACTTGTAGTGAAAGTATCATCTGAGAAACGCAGTAACAAG
CAACTCTTCCCCACACCGCTGTCTCCGATGAGAAGGAGCTTGATGAGGTAATCATAGTCA
GAACGAGCTCTCGCCGGAGCAACCGCCATCTCTAAAGAATCAGATAAAAAGCTCAGAGAT
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GAAGAGATT
CC

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DS 

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ACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGATTCCATATTCATCAGCTAAA
GCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCATCCATATCAGCTTTGTTACCG
ACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTATGTTCTTCATCCAGTTCCTA
ATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAAGCAGTATACCCATCGCTCCT
CTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCATATCTGC
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GCCGGAGCAACCGCCATCTCTAAAGA*TCAGATAAAAAGCTCAGAGATTTATCACTTTTG
CTTCTCTCTTACAAAAGCTAGCTCCTGCTTCTTCTTCTTTTGATTCCAGAAGAGATTGAA
ATGGTATAATGGAAAACAGCAGAAGAAGTTGATTCC

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CTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCATCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGT
TGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTATGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGG
ATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAAGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTG
TGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCT
TCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATCTTGAAGTCAATTCCAATGGTAGTAATGAAACTTA
TAGTGAAAGTATCATCTGAGAAACGCAGCAACAAGCAACTCTTCCCCACACCGCTGTCTC
CGATGAGAAGGAGCTTGATGAGGTAATCATAGTCAGAACGAGCTCTCGCCGGAGCAACCG
CCATCTCTAAAGA*TCAGATAAAAAGCTCAGAGATTTATCACTTTTGCTTCTCTCTTACC
AAAGCTAGCTC*TGTTTCTTCTTCTTTT**TTCCAGAAGAGATTGAAATGGTATAATGGA
AAAC
CC

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DS 



AS 2 10

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GTCATTCTGAAAAAATATATCAATGGTAACCGCTTTATAGGTTTAGTGAATTATCGTGAT
GTAGTCCTCTACGGTGATATTGATGTGGGTGATCACCTCAGAGATTCAGAGTTGTTTTTG
ATACGGGAAGTGCCGATCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGTCCATCCGC
ATCAAAAGTTCAATCCCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGGAGTTTTGG
ATCTTAAATATGAAAAGGGGGAGCTAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGTAATGGTGG
GTGGAGTTTTACTCGATAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAATAGTGTTTGGTGGATTC
GACCCAAACCACTTTAAAGGGGAACATACGTATGTTCCCGTCTATGGGAGAATAAGAAAT
TTCTGGAGAATTAAAATGACAACTATTCACATTGGTGAAACACCAACTCGACATTGTGCA
GCACAATGCGTAGCAATTGTTGATTCTGGGATAACTGACATTCTGGGTCCAAAGAAACCT
ATCAGCGACATAAATAAAGCACTTGGAAAGGTGAGTTGCTCTACCATGCGTACGATGCCC
ACTATCTTCTTCACGATCGGGGGAAAGCTTTTTCCCCTCACGCCAGATGATTACATAGCC
AAGGATGGTGGAAAGTGCTTCAGTCGTTTTGTTGAGTCACATCGCTGGTTTTTAGGCCTC
GCTTTTATGCGAGCCTATCACACAATTTTCGACCTCCAAGACCAGAAGAAACCCAGAGTT
GGGTTTGCCATAGCAACATAAGCACAACAACAACAACAAAACTTAACTTGTTGTTTCTAA
TAATAGTGGTGCTGCAGATGATGATCAAGTTAAATAAAGTCTTTTGCGAAAAACTTTACC
CATATGGTAGCAATAATGCTATCTAAACACGTATTTTAGTCTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B403TF U 1
AF RR4B403JQ C 224
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BS 725 769 RR4B403TF
BS 770 1005 RR4B403JQ

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GTAGTCCTCTACGGTGATATTGATGTGGGTGATCACCTCAGAGATTCAGAGTTGTTTTTG
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ATCAAAAGTTCAATCCCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGGAGTTTTGG
ATCTTAAATATGAAAAGGGGGAGCTAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGTAATGGTGG
GTGGAGTTTTACTCGATAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAATAGTGTTTGGTGGATTC
GACCCAAACCACTTTAAAGGGGAACATACGTATGTTCCCGTCTATGGGAGAATAAGAAAT
TTCTGGAGAATTAAAATGACAACTATTCACATTGGTGAAACACCAACTCGACATTGTGCA
GCACAATGCGTAGCAATTGTTGATTCTGGGATAACTGACATTCTGGGTCCAAAGAAACCT
ATCAGCGACATAAATAAAGCACTTGGAAAGGTGAGTTGCTCTACCATGCGTACGATGCCC
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AAG*ATGGTGGAAAGTGCTTCAGTCGTTTTGTTGAGTCACATCGCTGGT

QA 1 769 1 769
DS 

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CGGAGGAGGAGTTTTGGATCTTAAATATGAAAAGGGGGAGCTAACAGGTTTCCTAGGTCG
AGATAAAGTAATGGTGGGTGGAGTTTTACTCGATAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAA
TAGTGTTTGGTGGATTCGACCCAAACCACTTTAAAGGGGAACATACGTATGTTCCCGTCT
ATGGGAGAATAAGAAATTTCTGGAGAATTAAAATGACAACTATTCACATTGGTGAAACAC
CAACTCGACATTGTGCAGCACAATGCGTAGCAATTGTTGATTTTGGGATAACTGACATTC
TGGGTCCAAAGAAACCTATCAGCGACATAAATAAAGCACTTGGAAAGGTGAGTTGCTCTA
CCATGCGTACGATGCCCACTATTTTCTTCACGATCGGGGGAAAGCTTTTTCCCCTCACGC
CAGATGATTACATAGCCAAGGATGGTGGAAAGTGCTTCAGTCGTTTTGTTGAGTCACATC
GCTGGTTTTTAGGCCTCGCTTTTATGCGAGCCTATCACACAATTTTCGACCTCCAAGACC
AGAAGAAACCCAGAGTTGGGTTTGCCATAGCAACATAAGCACAACAACAACAACAAAACT
TAACTTGTTGTTTCTAATAATAGTGGTGCTGCAGATGATGATCAAGTTAAATAAAGTCTT
TTGCGAAAAACTTTACCCATATGGTAGCAATAATGCTATCTAAACACGTATTTTAGTCTA
TT

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL461Contig2 1373 8 23 U
GCTAATATATGTTTTAGTTTAATTAAAAACAGAAACATCTTTCTTTTCTTGGGGGGCCGA
CACTCCTTGCTAACAGATTGATTGGACAACGAATAAAAATTAGCGTAGTTATTATTTTTG
TTAAAATATAATAGACTAAAATACGTGTTTAGATAGCATTATTGCTACCATATGGGTAAA
GTTTTTCGCAAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCATCTGCAGCACCACTATTATTAGAA
ACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTATGTTGCTATGGCAAACCCAACTCT
GGGTTTCTTCTGGTCTTGGAGGTCGAAAATTGTGTGATAGGCTCGCATAAAAGCGAGGCC
TAAAAACCAGCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAAGCACTTTCCACCATCCTTGGCTAT
GTAATCATCTGGCGTGAGGGGAAAAAGCTTTCCCCCGATCGTGAAGAAGATAGTGGGCAT
CGTACGCATGGTAGAGCAACTCACCTTTCCAAGTGCTTTATTTATGTCGCTGATAGGTTT
CTTTGGACCCAGAATGTCAGTTATCCCAGAATCAACAATTGCTACGCATTGTGCTGCACA
ATGTCGAGTTGGTGTTTCACCAATGTGAATAGTTGTCATTTTAATTCTCCAGAAATTTCT
TATTCTCCCATAGACGGGAACATACGTATGTTCCCCTTTAAAGTGGTTTGGGTCGAATCC
ACCAAACACTATTTGTCCACCATTTGGATCTTCATGTCTTCCGTCACCGTGGTAACTTCT
AATCCAAAA*GAAAATATGTTTTTATTAATCAGTCTTTTGTTCATCATATTTTCCAAGAC
CGTAGTTGTTCCTTTCACCGCAAGGCTTGGAAATCCCAATCCTAGGATGCCATCATATAC
CACGTCTTCTATATGAGGACCAGGTTTTGTTGCCTGTATAAACTCTTGTCTATCGAGTAA
AACTCCACCCACCATTACTTTATCTCGACCTAGGAAACCTGTTAGCTCCCCCTTTTCATA
TTTAAGATCCAAAACTCCTCCTCCGCTCTGTATATAGGTTCTTGATGCTTTGGGATTGAA
CTTTTGATGCGGATGGACCGTTTTAGGATATGTACTAGAAGGTATCCAAAGATCGGCACA
TCCCGTATCAAAAACAACTCTGAATCTCTGAGGTGGATCACCCACATCAATATCACCGTA
GAGGACTACATCACGATAATTCACTAAACCTATAAAGCGGTTACCATTGATATATTTTTT
CAAGAATGACTTTGACAGTTCCATTCGATAATCCGTGACAGGATCCAGATAGTAGCACAG
CTGATATGACAAAAAACCATATACTTTCCATTTTCTGAAGGTTAAAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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CTTTGGACCCAGAATGTCAGTTATCCCAGAATCAACAATTGCTACGCATTGTGCTGCACA
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C

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GCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAAGCACTTTCCACCATCCTTGGCTATGTAATCATC
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C

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A

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C

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CCAGATAGTAGCACAGCTGATATGAC
AAAAAA

QA 1 566 1 566
DS 



AS 2 8

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB81TF U 1
AF RR4GG57JQ C 228
AF RR4EB81JQ C 309
AF RR4CW34TF U 614
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TTATGAGCCATACACTTTCTATGGTGGAAGATTTGATA*TAGTAATACT

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AAGGTGTTCCTATAAGAGTGCCTTTGATGAAACTATTCAATTCCGTTGATAAATTCTCAG
ATCATTTGTGGAAAAATGCTCAAGAACGGAGCGGGTTGATCAATGGTGTGAGCTCAGCGG
ATAGTAAGATGATGCAGAAGATAAAGTTCATATGCAAAAAATCTGTTGAACAAGCCAAAC
ACCTTGCCACTATTTATGAGCCATACACTTTTTATGGTGGAAGATTTGATAATAGTAATA
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GAAACATTAACTGGAAGGATTACATTACAAATGTTCACATTCCCGGTTTAAGAAAACATG
TCTTGAAGGGAAGAGCTTAAGTTCAATCTCGTTAAACAAGACCAAAACTAATCATACCTT
TTCTTTAATCGTTTTTTTTTT*CATCTCATGTGTACTCGTGTTGTGTTGTCTAGTATATC
ATTTTGATTT
AT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4EB81JQ 672 0 0
CATTAGCTGCTATTGCAAAGCATGGAGTGGCGAGTACAGATCAAGAACCTGATATAAACG
TGTATCAGATCGCTTCTTCTGCAATAAATCCACTTGTTTTCGAGGACTTAGCAGAGCTTC
TTTATAACCACTACAAATCTACCCCATGCATGGACTCAAAAGGTGTTCCTATAAGAGTGC
CTTTGATGAAACTATTCAATTCCGTTGATAAATTCTCAGATCATTTGCGGAAAGATGCTC
AAGAACGGAGCGGGTTGATCAATGGTGTGAGCTCAGCGGATAGTAAGATGATGCAGAAGA
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CATACACTTTCTATGGTGGAAGATTTGATAATAGTAATACTCAAAGGTTAATGGAGTATA
TGTCTGAAGCAGAGAAGGATGAGTTTGGGTTTGATGTTGGAAACATTAACTGGAAGGATT
ACATTACAAATGTTCACATTCCCGGTTTAAGAAAACATGTCTTGAAGGGAAGAGCTTAAG
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*CATCTCATGTGTACTCGTGTTGTGTTGTCTAGTATATCATTTTGATTTGTAATAATTTG
AATTTAGTAGT
T

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CW34TF 374 0 0
G
TCATATGCAAAAAATCTGTTGAACAAGCCAAACACCTTGCCACTATTTATGAGCCATACA
CTTTCTATGGTGGAAGATTTGATAATAGTAATACTCAAAGGTTAATGGAGTATATGTCTG
AAGCAGAGAAGGATGAGTTTGGGTTTGATGTTGGAAACATTAACTGGAAGGATTACATTA
CAAATGTTCACATTCCCGGTTTAAGAAAACATGTCTTGAAGGGAAGAGCTTAAGTTCAAT
CTCGTTAAACAAGACCAAAACTAATCATACCTTTTCTTTAATCGTTTTTTTTTTTCATCT
CATGTGTACTCGTGTTGTGTTGTCTAGTATATCATTTTGATTTGTAATAATTTGAATTTA
GTAGTATTGTGTC

QA 2 374 2 374
DS 



CO CL462Contig2 963 4 3 U
AGACTTGAGATAAAGCTATTATTACTTTCAAATTATAACAAGTTAAAATCATATATTATA
TAACAATAACACGATTATAGTCATTACTCATTAGACATAGAAAAACGACCAAAGAAAAGG
TTTGATTCTGGTTTAGCGAGATTTGACCTAAGCCCTTCCTTTCAAAACATGTCTTCTTAA
ACCTGGAATGTGAACATTTATAATGTAGTCATTCCAGTTAATGCTTCCAACGTCAAACCC
AAACCCACTCTTCTCTTCTTCGGACATATTCTCCATTAATCTATGTGTATTGCTGTTATC
AAATCTTCCTCCATAGAAAGTGTATGGCTCATAAATAGTGGCAAGGTGTTTGGCTTGCTC
AACAGATTTCTTGCACATGAATTTAAGCTTTTGTAGTATCTTACTATCTGATGAGTTCAT
ACCCTTCATTAAGCCACTCCGTTCTTGAGCATCTCTCCACAAATGATCCGAGAAATCATC
AACTGAGTCGAAAAGCTTCATCAAAGGCACCCTAATAGGAACACCTTTCGAGTCCATGCA
CGGGGTGGATTTGTAATGGTTATAAAGAAGCTCAGCTAAGTCCTTGAAAACAAGAGGATT
TATCGCTGAAGAAGCGATCTGATACACGTTTATCTCAGGTTCTGGATCTGCCTTAGCCAT
TCCATGCTTTGCTATAGCAGCTAATGTCGCATTAACGACCATATCAGCAGGAACCACATC
AAGAACTCCTTTTGGATCCACCAAGAACCCCGTGAGCTGTCCCTTTCCATAACACAGCAC
TATAGGATCCATCATCCTGTTTCCTTCCATCCATCCAGGGAAAGGATCTTTGTAGGTGCT
TTCAATGACGCTAGGCCTTATAATAACCACAGGTACGTCCCCTCTAGTGCTATTGATCAT
CATCTCTCCCATTGCTTTGGTGAAAACATACGTGTCTTGCCATCCATATGATCTTGCCCT
ACC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CP03JQ U 62
AF RR4GY59JQ U 1
AF RR4H414JQB U 1
AF RR4GY59TF C 310
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BS 761 781 RR4H414JQB
BS 782 963 RR4GY59TF

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CCATGCTTTG

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ACCTGGAATGTGAACATTTATAATGTAGTCATTCCAGTTAATGCTTCCAACGTCAAACCC
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CGGGGTGGATTTGTAATGGTTATAAAGAAGCTCAGCTAAGTCCTTGAAAACAAGAGGATT
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QA 1 760 1 760
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AG
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TGATTCTGGTTTAGCGAGATTTGACCTAAGCCCTTCCTTTCAAAACATGTCTTCTTAAAC
CTGGAATGTGAACATTTATAATGTAGTCATTCCAGTTAATGCTTCCAACGTCAAACCCAA
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ATCTTCCTCCATAGAAAGTGTATGGCTCATAAATAGTGGCAAGGTGTTTGGCTTGCTCAA
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CTGAGTCGAAAAGCTTCATCAAAGGCACCCTAATAGGAACACCTTTCGAGTCCATGCACG
GGGTGGATTTGTAATGGTTATAAAGAAGCTCAGCTAAGTCCTTGAAAACAAGAGGATTTA
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CATGCTTTGCTATAGCAGCTAATGTCGCATTAACGACCATATCAGCAGGAACCACATCAA
GAACTCCTTTTGGATCCACCAAGAACCCCGTGAGCTGTCCCTTTCCATAACACAGCACT

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR4GY59TF 654 0 0
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CTTGCACATGAATTTAAGCTTTTGTAGTATCTTACTATCTGATGAGTTCATACCCTTCAT
TAAGCCACTCCGTTCTTGAGCATCTCTCCACAAATGATCCGAGAAATCATCAACTGAGTC
GAAAAGCTTCATCAAAGGCACCCTAATAGGAACACCTTTCGAGTCCATGCACGGGGTGGA
TTTGTAATGGTTATAAAGAAGCTCAGCTAAGTCCTTGAAAACAAGAGGATTTATCGCTGA
AGAAGCGATCTGATACACGTTTATCTCAGGTTCTGGATCTGCCTTAGCCATTCCATGCTT
TGCTATAGCAGCTAATGTCGCATTAACGACCATATCAGCAGGAACCACATCAAGAACTCC
TTTTGGATCCACCAAGAACCCCGTGAGCTGTCCCTTTCCATAACACAGCACTATAGGATC
CATCATCCTGTTTCCTTCCATCCATCCAGGGAAAGGATCTTTGTAGGTGCTTTCAATGAC
GCTAGGCCTTATAATAACCACAGGTACGTCCCCTCTAGTGCTATTGATCATCATCTCTCC
CATTGCTTTGGTGAAAACATACGTGTCTTGCCATCCATATGATCTTGCCCTACC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 8

CO CL463Contig1 1199 8 41 U
GGGAGATAACATAGAGAGTGAGTGAGTGTCAGAGAGAGAGAAAAACAGAGATGGATCACG
AAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGATCACGAGATTCGTGCTGAATGAGCAAT
CAAAGTACCCAGAGTCTCGCGGGGATTTCACGATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGTT
GCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTGCCG
GGGAGACAAATATTCAGGGCGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCTCTCTAACGATGTTT
TTATCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGTAGAACTTCTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATGAGG
AAGCTACGTTTGTGGAATCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTG
ATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATCTACACGA
TGAACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTG
CAGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTG
TCCACGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTA
AGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATG
GTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGATGGTTCTCCAGCAAAAT
CTCTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGGAA
TCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCCTGTATGAAG
TCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAA
GGGCACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCGATATTTCTTGGGAGCT
ACGATGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTACGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCC
ATTGTAATATCGTATTTCTACATCTTCTTCTGTTGAGACGAACCATTTGACTCGACTCAT
GTATGCCAAGGAGACTGGTTTAAAAAAAAAGATAATAATAATATATAACTTTTTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 20 45 45 15 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 
25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4CG55TF U 1
AF RR4CA48TF U 28
AF RR4A131TFB U 59
AF RR4CB32TF U 298
AF RR4A271TFB U 416
AF RR4A131JQD C 318
AF RR4CA48JQ C 425
AF RR4A131JQ C 366
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BS 42 42 RR4CA48TF
BS 43 131 RR4CG55TF
BS 132 132 RR4CA48TF
BS 133 139 RR4CG55TF
BS 140 140 RR4CA48TF
BS 141 238 RR4CG55TF
BS 239 239 RR4CA48TF
BS 240 241 RR4CG55TF
BS 242 242 RR4CA48TF
BS 243 253 RR4CG55TF
BS 254 254 RR4CA48TF
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BS 260 260 RR4CA48TF
BS 261 325 RR4CG55TF
BS 326 326 RR4CA48TF
BS 327 337 RR4CG55TF
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BS 339 373 RR4CG55TF
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BS 696 778 RR4A131TFB
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BS 780 846 RR4A131TFB
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BS 848 861 RR4A131TFB
BS 862 877 RR4CB32TF
BS 878 878 RR4A131JQD
BS 879 938 RR4CB32TF
BS 939 939 RR4A271TFB
BS 940 1198 RR4A131JQD
BS 1199 1199 RR4A131JQ

RD RR4CG55TF 516 0 0
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AAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGATCACGAGATTCGTGCTGAATGAGCAAT
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GCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTGCTG
GAGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCTCTCTAACGATGTTT
TTATCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTTCTGTCCTTGTCTCGGAAGAAGATGAGG
AAGCTACGTTTGTCGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTG
ATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATTTACACAA
TGAACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGT
CT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4CA48TF 668 0 0
GGG
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CGATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGG
CTGGTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTGCCGGGGAGACAAATATTCAGGGCGAAGAGCAAA
AGAAACTGGATGTGCTCTCTAACGATGTTTTTATCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGTAGAA
CTTCTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATGAGGAAGCTACGTTTGTGGAATCATCCAAGCGTG
GAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCT
CCATTGGAACAATCTTTGGAATCTACACGATGAACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGG
ATGTTCTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCAGCGGG****TGTATGTACGGAAGCTCCT
GCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCACGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAG
GAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAG
TGAAT

QA 4 668 4 668
DS 

RD RR4A131TFB 814 0 0
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ATCAAAGTACCCAGAGTCTCGCGGGGATTTCACGATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGG
TTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTGC
CGGGGAGACAAATATTCAGGGCGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCTCTCTAACGATGT
TTTTATCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGTAGAACTTCTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATGA
GGAAGCTACGTTTGTGGAATCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACT
TGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATCTACAC
GATGAACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAAGCTGGGAATGAAATGGT
TGCAGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGG
TGTCCACGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACAT
TAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGA
TGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGATGGTTCTCCAGCAAA
*TCTCTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGG
AATCTTCT*GTACCCGGCTGACA
GAAAGCCCCAA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4CB32TF 641 0 0
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AGGAAGCTACGTTTGTCGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCAC
TTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATTTACA
CAATGAACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAACGAAATGG
TTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAG
GTGTCCACGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACA
TTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGG
ATGGTCCAACCACAAAGTACGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGACGGTTCTCCTGCAA
AATCTCTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAG
GAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGAAAATTGCGTGTCCTGTATG
AAGTCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4A271TFB 524 0 0
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CACAATGAACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAACGAAAT
GGTTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAAC
AGGTGTCCACGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGA
CATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTG
GGATGGTCCAACCACAAAGTACGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGACGGTTCTCCTGC
AAAATCTCTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGG
AGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGAAAATTGCGTGTCCTGTA
TGAAGTCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4A131JQD 882 0 0
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TCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATT
GACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATCTACACGATGAACCACAGTGATGAG
CCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAAGCTGGGAATGAAATGGTTGCAGCGGGTTACTGTATG
TACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCACGGATTTACCCTG
GACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGATTCCAAATAAGGGA
AACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTAT
GTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGATGGTTCTCCAGCAAAATCTCTTAGATATGTCGGA
AGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCT
GACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCCTGTATGAAGTCTTCCCAATGGCGTTC
TTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCACTGGACCTTGTC
CCGGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCGATATTTCTTGGGAGCTACGATGATGTAGAGGAG
ATTAAGGCTCTGTATGCTACGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCCATTGTAATATCGTATTT
CTACATCTTCTTCTGTTGAGACGAACCATTTGACTCGACTCATGTATGCCAAGGAGACTG
GTTTAAAAAAAAAGATAATAATAATATATAACTTTTTTCAG
T

QA 1 881 1 881
DS 

RD RR4CA48JQ 775 0 0
ATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATCTACACGATGAA
CCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCAGC
GGG****TGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCA
CGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGAT
TCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCC
AACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGATGGTTCTCCAGCAAAATTTTT
TAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGGAATCTT
CTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCCTGTATGAAGTCTT
CCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGC
ACTGGACCTTGTCCCGAAGAAGATCCATGAGCGTTTTCCGATATTTCTTGGGAGCTACGA
TGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTACGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCCATTG
TAATATCGTATTTCTACATCTTCTTCTGTTGAGACGAACCATTTGACTCGACTCATGTAT
GCCAAGGAGACTGGTTTAAAAAAAAAGATAATAATAATATATAACTTTTTTCAG
G

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4A131JQ 834 0 0
ACGTTTGTGGAATCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGA
TCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATCTACACGATGAAC
CACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAAGCTGGGAATGAAATGGTTGCAGCG
GGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCAC
GGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGATT
CCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCA
ACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGATGGTTCTCCAGCAAAATCTCTT
AGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGGAATCTTC
TTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCCTGTATGAAGTCTTC
CCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCA
CTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCGATATTTCTTGGGAGCTACGAT
GATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTACGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCCATTGT
AATATCGTATTTCTACATCTTCTTCTGTTGAGACGAACCATTTGACTCGACTCATGTATG
CCAAGGAGACTGGTTTAAAAAAAAAGATAATAATAATATATA*CTTTTTTCAGT

QA 1 834 1 834
DS 



AS 2 10

CO CL464Contig1 678 8 8 U
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ATCGACGTCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTTTGACGAAGAAAGATGGCGA
TGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCAAGTCGTATT
GTCCGTACTGTGTGATAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAATTCGTTGCCG
TTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAGAATGGACTG
GGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCTGCGACAATG
TGACCAAACTGCACAAAGACGGGAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTGGAGCTATCG
CTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTGATGGGCACAATCAATTTGTGATTTGCTTCTAT
CAGGAATAAACAAGTTTGAGCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTTTTAAACTTGTG
GTTATGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTATACATTTATGTTATGATTATCAGCATTTGCT
AGTAATTTCATCTCTCTTAATATTTCGATGTGAAGAGAAATCGAACTTTAGTTTTGAAAG
ATTTAATAAACTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE96TF U 1
AF RR4B766JQ C 52
AF RR4B766TF U 52
AF RR4B977JQ C 52
AF RR4B977TF U 52
AF RR4E568JQ C 28
AF RR4E568TF U 52
AF RR4H170TF U 202
BS 1 76 RR4GE96TF
BS 77 77 RR4B766TF
BS 78 195 RR4GE96TF
BS 196 196 RR4B766TF
BS 197 225 RR4GE96TF
BS 226 226 RR4B766TF
BS 227 638 RR4GE96TF
BS 639 678 RR4H170TF

RD RR4GE96TF 638 0 0
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GTTATGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTATACATTTATGTTATGATTATCAGCATTTGCT
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GCATTTGCTAGTAATTTCATCTCTCTT

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GCATTTGCTAGTAATTTCATCTCTCTT

QA 1 567 1 567
DS 

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QA 1 567 1 567
DS 

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QA 1 567 1 567
DS 

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GA
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GGTGAAAAACACATCGGTGGCTGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGGAAGTTG
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TGAACTTTGTTTGAAATGTTTTAAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTA
TACATTTATGTTATGATTATCAGCATTTGCTATTAATTTTATCTCTCTT

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GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTGATGGGCACAATCAATTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTTGAGCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTTTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTATACATTTATGTTATGATTATCA
GCATTTGCTATTAATTTTATCTCTCTT

QA 1 567 1 567
DS 

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G
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QA 2 477 2 477
DS 



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CAGCATTTGCTAGTAATTCCATTTCTCTTAATATTTCGACGTGAAGAGAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4GY58JQ C 1
AF RR4GY58TF U 1
BS 1 589 RR4GY58TF
BS 590 591 RR4GY58JQ

RD RR4GY58JQ 591 0 0
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TGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGGAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCT
GGAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAAGGCACAATCAGTTTGTGAT
TCGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTTGAGCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTTT
TAAACTCGTGGTTATGTTGAAGTCGGTATTGAACTTCTGATACAATTATGTTATAATTAT
CAGCATTTGCTAGTAATTCCATTTCTCTTAATATTTCGACGTGAAGAGAAA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4GY58TF 591 0 0
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GAATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATTGGTGAAAAACACATCGGTGGC
TGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGGAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCT
GGAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAAGGCACAATCAGTTTGTGAT
TCGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTTGAGCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTTT
TAAACTCGTGGTTATGTTGAAGTCGGTATTGAACTTCTGATACAATTATGTTATAATTAT
CAGCATTTGCTAGTAATTCCATTTCTCTTAATATTTCGACGTGAAGAGA
AA

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 9

CO CL465Contig1 1026 9 7 U
AAATCAAATTGTTATAAATTGAATCTAAATTTACTATTGCAATTATAAATATTCAAGTTA
AAAATGATTACAAACTTTAGGACAAAGCAAAAATCACTTAAAATAAGTCAGACGATAAAC
TTAAGTTTAAGTTTCTTACAAATATTTGACAAAATTTGACTATAGCCTAAGTTCGAGATC
TTTCGAACACTGGCCTTCTTCCTTAACTTCCATCAACATATCTTTATCACATTCTGGTGT
GAGTTGGGAAGCGGTTTGAGCCGGTCGTTGTGACGACTGTCCCTGCTCTAGCTGTTGTTG
ACCAGGCACAGTCTCTGACTTCGGAGGATAGTGATGACCACCACCATTTTGGTTAACTTG
GTATGGAGCTCTAGCCACAGCTCTGTCTTTACGTTTAGCAAAGAATCGATGAAGGGAAGC
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 5 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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CT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 15 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4C403TF U 16
AF RR4EK59TF U 15
AF RR4AL20JQ C 1
AF RR4C403JQ C 16
AF RR4AL20TF U 1
AF RR4DT70TF U 15
AF RR4AY19TF U 216
AF RR4B344JQ C 216
AF RR4B344TF U 216
AF RR4AY19JQ C 317
BS 1 20 RR4AL20TF
BS 21 35 RR4C403TF
BS 36 36 RR4AL20TF
BS 37 72 RR4C403TF
BS 73 74 RR4AL20TF
BS 75 86 RR4C403TF
BS 87 87 RR4AL20TF
BS 88 312 RR4C403TF
BS 313 313 RR4AL20TF
BS 314 314 RR4C403TF
BS 315 315 RR4AL20TF
BS 316 361 RR4C403TF
BS 362 615 RR4AL20TF
BS 616 616 RR4EK59TF
BS 617 739 RR4AL20TF
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DS 

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GG
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ACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCG*TGCGAAGCCATGTGCATTGACGGAA
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DS 

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CCTGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAAT
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ATAATTTACAGCATGTTCTTT

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DS 

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GAGAG
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AGAAAAATTGATTCACTTCGACGATCGTCGTGATTAGCTTAAAATTTGGTCCATCCATCC
GTAGTTCGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAA
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TCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCATGTGCATTGACTGCACCAA
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TGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGACGACAAAGCTGACGTCATCCTTAAGTACAT
GTTTGATGAAGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAATACCCGTCTTAA
TGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGATGATAATAATGTTGATGATTACGTTGA
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TGTGTT**GTATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCCCAAATAATTTACAGCATGTTCTT
G

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AAAATTTGGTCCATCCATCCGTAGTTCGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGA
AAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAA
GAAGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCC
ATGTGCATTGACGGAACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTC
TGGATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCT
GACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTT
CCTGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAAT
AATGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTGGCCTT
GTAATATCGAAGTTGAATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGT
TAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTTCGTATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCCCAA
ATAATTTACAGCATGTTCT

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DS 

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GGT
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AAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAGAAGATGGCCAAGAGTA
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TGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTG
TTATGTGTTTCGTATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCC*AAATAATTTACAGCATGTT
C

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QA 4 567 4 567
DS 

RD RR4B344TF 567 0 0
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GGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCCAGGCT
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TGATAGGATCTAAGTTGGCCTTGTAATATCGAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAA
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TACTGTCATTTGATTCCCCCAAATAATTTACAGCATGTTCTTTATTTCCCGTTTTGCAGC
TCGTTAGTGCGGTTTTGGCTTTCT

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DS 

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ACATGTCTGATGAAGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAATACCCGTC
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TTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTGGCCTTGTAATATCGAAGTTGG
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QA 1 466 1 466
DS 



AS 2 9

CO CL467Contig1 672 6 11 U
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CAAATTTAAACCAAATAAAAAAAATCAAAACAAACAAAAAGTAAACCTAGATCTATGGAT
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BQ
10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
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DS 

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A
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A*AAAAGAAGAGATGAGATTTTAAGAGAGAGAGAGAGGATATGAGAGTGTCGGAAAGAA

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4F175TF U 1
AF RR4C470JQ C 42
AF RR4E555TF U 161
BS 1 87 RR4F175TF
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DS 

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TATGAAAACCTGTTTAGGAAGATCCATAGATCTAGGTTTACTTTT*GTTTGTTTTGATTT
TTTTTATTTGGTTTAAATTTGTAAACGTATTGTAACTGTAATAGACCAATTTTGATTTAT
AAATAAAATTCAATTTGG
T

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 5

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GGCTTCAACAACTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 
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AF RR4FQ76JQ U 39
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AF RR4AL86JQ U 1
AF RR4B332TF C 297
AF RR4FQ76TF C 489
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C
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TCCTAACAAAACCTCTATAACAATGGCGACAAACATTAAATTTTAAAAAAA*TGAAAAGG
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TTCAGCTC

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CTCAAGGTGTAACTGTCAGTAGTCTTCACATCGACATGGGATTCAATCAATGTCTGCCAC
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CTG
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CCTCAAGGTGTAACTGTCAGTAGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAATGTCTGCCA
CTTTTTCACCAATGACCTCAGCTTATCGGTGGTGAAGTCCATACCCCAGAATTGGGTTAA
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ATCATTTTGGAGATCGGCAAGAGATACCTCAAAAACCCTGTGTTTCAATCCCTCAGAAGC
AATCTTGGTACCCTGAGTCCTTGAAACAAGAGTCTTGCCAACATTCCTGATTTTGAAGTT
AGAGGGGGCCTTGATATCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAGGATCAACAATCTTCTTCTT
GCCTCCTTTACGACCCTTGGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGACAGCCATGGTTAGGGATCT
TCAGAAGGTGCCGACGACCACCGAGCTAGCAAGA***AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
CGGCTTCAACAACTGAGATCC

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DS 

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AGTACGCTTGACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACAACCTCAAGGT
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GCCTTGGACATCTTCAGCTCTAAGACGGATCTTCCTGTAAGAGTGGTCCTCATCATTTTG
GAGATCGGCAAGAGATACCTCAAAAACCCTGTGTTTCAATCCCTCAGAAG**ATCTTGGT
ACCCTGAGTCCTTGAAACAAGAGCCTTGCCAACATTTCTGATTTTGAAGTTAGAGGGGGC
CTTGATATCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAGGATCAACAATCTTCTTCTTGCCTCCTTT
**GACCCTTGGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGACAGCCATGGTTAGGGATCTTCAGAAGGT
GCCGACGACCACCGAGCTAGCAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGGCTTCAA
CAACTGAGATCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 6

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TCTCTCCTCCGCCAAGCCTAAGCTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGCAGTAGCTACCC
TGTGGTGAAAGCCCTATCTAACCAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAATGCTTCAGCTCC
TGCAGGACCCTCAGCTGAAGGAAAGGATACAAACTCATCAAAAGACTCTTCTTCACCTGA
TTTAGCTACAGAGGAGTCTATCTCTGAGTTCCTGACCCAAGTCACAACTCTTGTCAAGCT
TGTGGATTCTAGAGACATTGTCGAGTTGCAGTTGAAACAGCTCGACTGTGAGCTTGTCAT
CCGGAAAAAGGAAGCCTTACCTCAACCACAAGCCCCTGCGCCTTATGTTATGATGCAGCA
ACCAAACCAACCATCCTATGTGCAAGC*GTGGCTCCTCCTCCTTCTGCACCTGCTGCCTC
ACCTCCACCTTCTTCTACTCCGGCCTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTAGTCCAGCGAA
ATCATCGCTTCCAACTGTTAAAAGTCCCATGGCAGGCACATTCTACCGCAGTCCAGGACC
TGGTGAACCACCTTTTATCAAGGTTGGAGACAAAGTGCAGAAGGGGCAAGTTCTATGCAT
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TATCGTTGCAGAAGACGGCAAGCCTGTTAGCCTCGACACTCCTCTGTTTGTGGTTCAACC
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TGGTAATACTGTTTTCTTGAGTTTTACGAATGTCTTCTTCATTGTTACTGTCAAACTCTC
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AAGAAAAAGAAAAAAAGATGAGACCTCTGTTTTATTTCTTTCTTATACACACGCACATTC
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BQ
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20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI08TF U 1
AF RR4AX59TF U 4
AF RR4EV29TF U 324
AF RR4G605JQ C 673
AF RR4GI08JQ C 673
AF RR4EV29JQ C 427
BS 1 550 RR4GI08TF
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BS 552 627 RR4GI08TF
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BS 629 629 RR4GI08TF
BS 630 630 RR4EV29TF
BS 631 679 RR4GI08TF
BS 680 751 RR4AX59TF
BS 752 820 RR4EV29TF
BS 821 1008 RR4EV29JQ
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BS 1010 1231 RR4EV29JQ

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TTGAGCCCTTTGGTTTCATCGAGAGACCCCTAAAACCCGATCTAGGTGAAGAATGGCGTC
TTCTTCTTCCTTCTCCCTCACCTCTCCGGCTGCTTCCGTCTATGGAGGAGCCACTCAAAC
CTCGTCGCAGTTACCTCTCCCAACCACTCGCTCTCGTCTCCCTCGCAGAGTTTCGTTCCG
TCTCTCCTCCGCCAAGCCTAAGCTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGCAGTAGCTACCC
TGTGGTGAAAGCCCTATCTAACCAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAATGCTTCAGCTCC
TGCAGGACCCTCAGCTGAAGGAAAGGATACAAACTCATCAAAAGACTCTTCTTCACCTGA
TTTAGCTACAGAGGAGTCTATCTCTGAGTTCCTGACCCAAGTCACAACTCTTGTCAAGCT
TGTGGATTCTAGAGACATTGTCGAGTTGCAGTTGAAACAGCTCGACTGTGAGCTTGTCAT
CCGGAAAAAGTAAGCCTTACCTCAACCACAAGCCCCTGCGCCTTATGTTATGATGCAGCA
ACCAAACCAACCATCCTATGTGCAAGCAGCGGCTCCTCCTCCTTCTGCACCTGCTGCCTC
ACCTCCACCTTCTTCTACT

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DS 

RD RR4AX59TF 748 0 0
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TCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTAAAGCTGGAGTGAACTGTTGAGCCCTTTGGTTTCATCGA
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TCTCCGGCTGCTTCCGTCTATGGAGGAGCCACTCAAACCTCGTCGCAGTTACCTCTCCCA
ACCACTCGCTCTCGTCTCCCTCGCAGAGTTTCGTTCCGTCTCTCCTCCGCCAAGCCTAAG
CTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGCAGTAGCTACCCTGTGGTGAAAGCCCTATCTAAC
CAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAATGCTTCAGCTCCTGCAGGACCCTCAGCTGAAGGA
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TCTGAGTTCCTGACCCAAGTCACAACTCTTGTCAAGCTTGTGGATTCTAGAGACATTGTC
GAGTTGCAGTTGAAACAGCTCGACTGTGAGCTTGTCATCCGGAAAAAGGAAGCCTTACCT
CAACCACAAGCCCCTGCGCCTTATGTTATGATGCAGCAACCAAACCAACCATCCTATGTG
CAAGCAGCGGCTCCTCCTCCTTCTGCACCTGCTGCCTCACCTCCACCTTCTTCTACTCCG
GCCTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTAGTCCAGCGAAATCATCGCTTCCAACTGTTAAA
AGTCCCATG

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DS 

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G
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GGATACAAACTCATCAAAAGACTCTTCTTCACCTGATTTAGCTACAGAGGAGTCTATCTC
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ACCACAAGCCCCTGCGCCTTATGTTATGATGCAGCAACCAAACCAACCATCCTATGTGCA
AGC*GTGGCTCCTCCTCCTTCTGCACCTGCTGCCTCACCTCCACCTTCTTCTACTCCGGC
CTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTAGTCCAGCGAAATCATCGCTTCCAACTGTTAAAAG
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TGGAGACAAAGTGCAG

QA 2 497 2 497
DS 

RD RR4G605JQ 453 0 0
TTT
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TATCAAGGTTGGAGACAAAGTGCAGAAGGGGCAAGTTCTATGCATCGTGGAAGCCATGAA
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CTTGAGTTTTACGAATGTCTTCTTCATTGTTACTGTCAAACTCTCTAGTTTTTTTTTTTG
GTGAGGAGGAAGAAAGAGTTTTT
AGTTTCC

QA 4 446 4 446
DS 

RD RR4GI08JQ 446 0 0
TTT
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TATCAAGGTTGGAGACAAAGTGCAGAAGGGGCAAGTTCTATGCATCGTCGAAGCCATGAA
GTTAATGAATGAAATAGAGTCTGATCAAACCGGAACCGTAGTGGATATCGTTGCAGAAGA
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TGAGAAACGGAGAAACGTCGCTACTTTAATTCAATCTTTCTGCTTTGGTAATACTGTTTT
CTTGAGTTTTACGAATGTCTTCTTCATTGTTACTGTCAAACTCTCTAGTTTTTTTTT***
GTGAGGAGGAAGAAAGAGTTTTT

QA 4 446 4 446
DS 

RD RR4EV29JQ 805 0 0
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ACCTTCTTCTACTCCGGCCTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTAGTCCAGCGAAATCATC
GCTTCCAACTGTTAAAAGTCCCATGGCAGGCACATTCTACCGCAGTCCAGGACCTGGTGA
ACCACCTTTTATCAAGGTTGGAGACAAAGTGCAGAAGGGGCAAGTTCTATGCATCGTCGA
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TACTGTTTTCTTGAGTTTTACGAATGTCTTCTTCATTGTTACTGTCAAACTCTCTAGTTT
TTTTTT***GTGAGGAGGAAGAAAGAGTTTTTAGTTTCTATTGGTTAAACAAAAAAGAAA
AAGAAAAAAAGATGAGACCTCTGTTTTATTTCTTTCTTATACACACGCACATTCTTGGTT
CTGTTTTATTGCAATTTTCCTGTTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 8

CO CL470Contig1 1189 8 16 U
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ATAAAATAGTTTTCACAAGTTCATTGGCCTTTGATAAGACTAAGATTGTTCAGAAGTTTA
AGAGAAACGTCCGTGAATCAGAGTAACAAACCACTGATCATCACCAAAATCTTCATCCTC
ATCTTTGATCTTAACGTCAGCGTCTTCTCCAAACTGGATGCAGACATCAATCTGAGACAG
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TTCTCCCACCATCTCAATCAGGGCTTTGTTCAATTTCGCGTATCGTGGACCCATCTTTTC
GTTTAACTCTGCCAACAATGTGCGAGGCTCCGGATCCAAGTAGTTATCAATGTTGCTTTT
ATCCTGCAAGAGATCCATCTTTGAGAGGATGTTGATGTGTGGTAATTCAAGCTGGATCAT
TGCAGAGAGAGACGACATGCAACCGCTGATAAACTTGGTGACATCTGTTATGAACTGTGA
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CTTGAGCACAGGAACATGTGTAAACAGTTCTATCTGGCCTGGACAATCAAATATAAGGTA
ATCATCGTCCCTGTAGTTCTCCAATTCTTCATCCACCCAATCATGTAAGCTATCCTCAAG
GTATTCCATGCAGTACATGAGGGCACCATTAGGACCAAGCCCAAGCTCCTCCATTACATC
TTCCAAAGAAACAAGCTCTCTGATATCCATAGCCACAGGATAGTTAAAGATTTCAGCAGC
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TGCTGGACCGATAACGAGCTGAGCATAACCCATTGTAACAAAGCAAAAATCTTCCAGAAA
GAAAAAAAGTCAAAGGGAGAAAACAGAGTGAAGGATTCTAAAAGATGCGAAAACGGCGAC
TGATATATAAGCAATGCACCAAACACCTAAACCGAACAACACACTCAGAATGTCGCAGGA
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CTTCCTTTTTTTTTCCTTTGGGGCTGGATACGAAGAAGAGAGCGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER71JQ U 1
AF RR4BP72JQ U 19
AF RR4AU14JQ U 37
AF RR4AU14TF C 37
AF RR4AU91JQ U 37
AF RR4H439JQB U 19
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AF RR4BP72TF C 428
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RD RR4ER71JQ 681 0 0
GCGTGGAGAATTCCGAATAGTTGTAAATATCTCACTAGTTAAGGTTTTGGTATTCAGCAA
ATAAAATAGTTTTCACAAGTTCATTGGCCTTTGATAAGACTAAGATTGTTCAGAAGTTTA
AGAAAAACGTCCGTGAATCAGAGTAACAAATCACTGATCATCACCAAAATCTTCATCCTC
ATCTTTGATCTTAACGTCAGCGTCTTCTCCAAACTGGATGCAGACATCAATCTGAGACAG
AACATACTGAATACTTCGTTCTTTCCTTATGTCAAGCGGAATGAAATTCACCATCCCATA
TTCTCCCACCATCTCAATCAGGGCTTTGTTCAATTTCGCGTATCGTGGACCCATCTTTTC
GTTTGACTCTGCCAACAATGTGCGAGGCTCCGGATCCAAGTAGTTATCAATGTTGCTTTT
ATCCTGCAAGAGATCCATCTTTGAGAGGATGTTGATGTGTGGTAATTCAAGCTGGATCAT
TGCAGAAAGAGACGACATGCAACCGCTGATAAACTTGGTGACATCTGTTATGAACTGTGA
ATCAAGCAGATAAACAACACAGACGTTAAAGTTCTTCTGTTGCAAATGCGCCACAAAGTT
CTTGAGCACAGGAACATGTGTAAACAGTTCTATCTGGCCTGGACAATCAAATATAAGGTA
ATCATCGTCCCTGTAGTTCTC

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DS 

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AGCGTCTTCTCCAAACTGGATGCAGACATCAATCTGAGACAGAACATACTGAATAATTCG
TTCTTTCCTTATGTCAAGCGGAATGAAATTCACCATCCCATATTCTCCCACCATCTCAAT
TAGGGCTTTGTTCAATTTCGCGTATCGTGGACCCATCTTTTCGTTTAACTCTGCCAACAA
TGTGCGAGGCTCCGGATCCAAGTAGTTATCAATGTTGCTTTTATCCTGCAAGAGATCCAT
CTTTGAGAGGATGTTGATGTGTGGTAATTCAAGCTGGATCATTGCAGAGAGAGACGACAT
GCAACCGCTGATAAACTTGGTGACATCTGTTATGAACTGTGAATCAAGCAGGTAAACAAC
ACAGACGTTGAAGTTCTTCTGTTGCAAATGCGCCACAAAGTTCTTGAGCACAGGAACATG
TGTAAACAGTTCTATCTGGCCTGGAAAATCAAATATAAGGTAATCATCATCCCTGTAGTT
CTCCAACTCTTCATCCACCCAATCATGTAAGCTATCCT

QA 1 698 1 698
DS 

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G
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ATGCAGACATCAATCTGAGACAGAACATACTGAATACTTCGTTCTTTCCTTATGTCAAGC
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GCGTATCGTGGACCCATCTTTTCGTTTAACTCTGCCAACAATGTGCGAGGCTCCGGATCC
AAGTAGTTATCAATGTTGCTTTTATCCTGCAAGAGATCCATCTTTGAGAGGATGTTGATG
TGTGGTAATTCAAGCTGGATCATTGCAGAGAGAGACGACATGCAACCGCTGATAAACTTG
GTGACATCTGTTATGAACTGTGAATCAAGCAGTTAAACAACACAGACGTTAAAGTTCTTC
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CCTGGACAATCAAATATAAGGTAATCATCGTCCCTGTAGTTCTCCAATTCTTCATCCACC
C
C

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR4AU14TF 663 0 0
G
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GACTAAGATTGTTCAGAAGTTTAAGAGAAACGTCCGTGAATCAGAGTAACAAACCACTGA
TCATCACCAAAATCTTCATCCTCATCTTTGATCTTAACGTCAGCGTCTTCTCCAAACTGG
ATGCAGACATCAATCTGAGACAGAACATACTGAATACTTCGTTCTTTCCTTATGTCAAGC
GGAATGAAATTCACCATCCCATATTCTCCCACCATCTCAATCAGGGCTTTGTTCAATTTC
GCGTATCGTGGACCCATCTTTTCGTTTAACTCTGCCAACAATGTGCGAGGCTCCGGATCC
AAGTAGTTATCAATGTTGCTTTTATCCTGCAAGAGATCCATCTTTGAGAGGATGTTGATG
TGTGGTAATTCAAGCTGGATCATTGCAGAGAGAGACGACATGCAACCGCTGATAAACTTG
GTGACATCTGTTATGAACTGTGAATCAAGCAGTTAAACAACACAGACGTTAAAGTTCTTC
TGTTGCAAATGCGCCACAAAGTTCTTGAGCACAGGAACATGTGTAAACAGTTCTATCTGG
CCTGGACAATCAAATATAAGGTAATCATCGTCCCTGTAGTTCTCCAATTCTTCATCCACC
C
C

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR4AU91JQ 663 0 0
G
GTTAAGGTTTTGGTATTCAGCAAATAAAATAGTTTTCACAAGTTCATTGGCCTTTGATAA
GACTAAGATTGTTCAGAAGTTTAAGAGAAACGTCCGTGAATCAGAGTAACAAACCACTGA
TCATCACCAAAATCTTCATCCTCATCTTTGATCTTAACGTCAGCGTCTTCTCCAAACTGG
ATGCAGACATCAATCTGAGACAGAACATACTGAATACTTCGTTCTTTCCTTATGTCAAGC
GGAATGAAATTCACCATCCCATATTCTCCCACCATCTCAATCAGGGCTTTGTTCAATTTC
GCGTATCGTGGACCCATCTTTTCGTTTAACTCTGCCAACAATGTGCGAGGCTCCGGATCC
AAGTAGTTATCAATGTTGCTTTTATCCTGCAAGAGATCCATCTTTGAGAGGATGTTGATG
TGTGGTAATTCAAGCTGGATCATTGCAGAGAGAGACGACATGCAACCGCTGATAAACTTG
GTGACATCTGTTATGAACTGTGAATCAAGCAGTTAAACAACACAGACGTTAAAGTTCTTC
TGTTGCAAATGCGCCACAAAGTTCTTGAGCACAGGAACATGTGTAAACAGTTCTATCTGG
CCTGGACAATCAAATATAAGGTAATCATCGTCCCTGTAGTTCTCCAATTCTTCATCCACC
C
C

QA 2 662 2 662
DS 

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AGCGTCTTCTCCAAACTGGATGCAGACATCAATCTGAGACAGAACATACTGAATACTTCG
TTCTTTCCTTATGTCAAGCGGAATGAAATTCACCATCCCATATTCTCCCACCATCTCAAT
CAGGGCTTTGTTCAATTTCGCGTATCGTGGACCCATCTTTTCGTTTAACTCTGCCAACAA
TGTGCGAGGCTCCGGATCCAAGTAGTTATCAATGTTGCTTTTATCCTGCAAGAAATCCAT
CTTTGAGAGGATGTTGATGTGTGGTAATTCAAGCTGGATCATTGCAGAAAGAGACGACAT
GCAACCGCTGATAAACTTGGTGACATCTGTTATGAACTGTGAATCAAGCAGATAAACAAC
ACAGACGTTAAAGTTCTTCTGTTGCAAATGCGCCACAAAGTTCTTGCGCACAGGAACATG
TGTAAACAGTTCTATCTGGCCTGGACAATCAAATATAAGGTAATCATCGTCCCTGTAGTT
CTCCAATTCTTCATCCACCCAATCATGTAAGCTATCCTCAAGGTATTCCATGCAGTACAT
GAGGG

QA 1 725 1 725
DS 

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CAGAGTAACAAATCACTGATCATCACCAAAATCTTCATCCTCATCTTTGATCTTAACGTC
AGCGTCTTCTCCAAACTGGATGCAGACATCAATCTGAGACAGAACATACTGAATAATTCG
TTCTTTCCTTATGTCAAGCGGAATGAAATTCACCATCCCATATTCTCCCACCATCTCAAT
TAGGGCTTTGTTCAATTTCGCGTATCGTGGACCCATCTTTTCGTTTAACTCTGCCAACAA
TGTGCGAGGCTCCGGATCCAAGTAGTTATCAATGTTGCTTTTATCCTGCAAGAAATCCAT
CTTTGAGAGGATGTTGATGTGTGGTAATTCAAGCTGGATCATTGCAGAAAGAGACGACAT
GCAACCGCTGATAAACTTGGTGACATCTGTTATGAACTGTGAATCAAGCAGGTAAACAAC
ACAGACGTTGAAGTTCTTCTGTTGCAAATGCGCCACAAAGTTCTTGAGCACAGGAACATG
TGTAAACAGTTCTATCTGGCCTGGAAAATCAAATATAAGGTAATCATCATCCCTGTAGTT
CTCCAACTCTTCATCCACCCAATCATGTAAGCTATCCTCAAGGTATTCCATGCAGTACAT
GAGGGCACCATTAGGACCAAGCCCAAGCTCCTCCATTACATCTTCCAAA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BP72TF 762 0 0
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AGGTAAACAACACAGACGTTGAAGTTCTTCTGTTGCAAATGCGCCACAAAGTTCTTGAGC
ACAGGAACATGTGTAAACAGTTCTATCTGGCCTGGAAAATCAAATATAAGGTAATCATCA
TCCCTGTAGTTCTCCAACTCTTCATCCACCCAATCATGTAAGCTATCCTCAAGGTATTCC
ATGCAGTACATGAGGGCACCATTAGGACCAAGCCCAAGCTCCTCCATTACATCTTCCAAA
GAAACAAGCTCTCTGATATCCATAGCCACAGGATAGTTAAAGATTTCAGCAGCAGGATCC
AAGTTAACAACATTCATTGTTCAAAATTGACAAGAGAAGACCTTTCCGCTGCCTGCTGGA
CCGATAACGAGCTGAGCATAACCCATTGTAACAAAGCAAAAATCTTCCAGAAAGAAAAAA
AGTCAAAGGGAGAAAACAGAGTGAAGGATTCTAAAAGATGCGAAAACGGCGACTGATATA
TAAGCAATGCACCAAACACCTAAACCGAACAACACACTCAGAATGTCGCAGGAACCCATA
GAGCAGAAGCAATCAACAGACACATCTCAGCACCTTTGAGTATTTGGTTGCGTCTTCCTT
TTTTTTTCCTTTGGGGCTGGATACGAAGAAGAGAGCGATTCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 10

CO CL471Contig1 1564 10 43 U
GGACCTACTCCTCGCACTCACCAAACCAGCCTTGCACGATCCGATCCGCATATCTCACCC
GAAAACCTTGTCTCGTTTTGTAGATCGCCGACGAGGTTGACATACCTTTCTGATCTACTG
AATCAGTCTTTCTAACGCAAAAAAAAAACAATGGCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCAAAT
CCCATCGTTGAGATGGATGGTGATGAAATGACCCGAGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGAC
AAGCTTATCACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATCAAGTACTTCGACCTTGGTCTTCCTCAC
CGTGATGCTACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAAT
GTGGCGATCAAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTTACGGAATTTGGCTTG
AAGCAGATGTGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTGTTT
AGAGAACCAATTCTCTGCAAAAATGTTCCCAAGCTTGTCCCAGGCTGGACAAAACCCATC
TGTATCGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGA
CCTGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGG*AAAACTGAAACTGAAGTGTT
CACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCG
TGCTTTTGCGGACGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAAGTGGCCACTTTATCTTAG
CACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGT
GTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAGGCTGCTGGAATATGGTACGAGCACCGTCT
CATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAA
AAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTTGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATT
GATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGTAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGG
TACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCAT
AGCCTCCATCTTTGCCTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTC
AAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGG
AAAAATGACCAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTA
CCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGC
TTAAGAAAACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTG
AAGGAATAAAAGAGAGAACGTTTGCGTTTTGAGAACAATTTGTTTCATCTGCTATAATAT
TTTCAAACATTGTCACATGTTTCCCTTTTTCATGCAGATTTCAAATAAATTTTCATTGAT
TATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4EK68TF U 1
AF RR4BE50TF U 1
AF RR4BZ02JQ C 948
AF RR4EG47TF U 540
AF RR4BZ02TF U 984
AF RR4D590TF U 598
AF RR4EK68JQ C 683
AF RR4BE50JQ C 698
AF RR4F123TF U 981
AF RR4F123JQ C 981
BS 1 56 RR4BE50TF
BS 57 57 RR4EK68TF
BS 58 545 RR4BE50TF
BS 546 546 RR4EK68TF
BS 547 639 RR4BE50TF
BS 640 640 RR4EK68TF
BS 641 751 RR4BE50TF
BS 752 752 RR4EG47TF
BS 753 837 RR4BE50TF
BS 838 838 RR4EG47TF
BS 839 846 RR4BE50TF
BS 847 847 RR4EG47TF
BS 848 851 RR4BE50TF
BS 852 852 RR4EG47TF
BS 853 863 RR4BE50TF
BS 864 888 RR4EG47TF
BS 889 889 RR4EK68JQ
BS 890 993 RR4EG47TF
BS 994 994 RR4BZ02TF
BS 995 1050 RR4EG47TF
BS 1051 1051 RR4BZ02TF
BS 1052 1074 RR4EG47TF
BS 1075 1075 RR4BZ02TF
BS 1076 1119 RR4EG47TF
BS 1120 1120 RR4BZ02TF
BS 1121 1140 RR4EG47TF
BS 1141 1141 RR4BZ02TF
BS 1142 1155 RR4EG47TF
BS 1156 1156 RR4BZ02TF
BS 1157 1238 RR4EG47TF
BS 1239 1239 RR4D590TF
BS 1240 1262 RR4EG47TF
BS 1263 1264 RR4D590TF
BS 1265 1265 RR4BZ02TF
BS 1266 1321 RR4D590TF
BS 1322 1322 RR4F123TF
BS 1323 1337 RR4D590TF
BS 1338 1338 RR4F123TF
BS 1339 1356 RR4D590TF
BS 1357 1357 RR4F123TF
BS 1358 1366 RR4D590TF
BS 1367 1558 RR4F123TF
BS 1559 1564 RR4F123JQ

RD RR4EK68TF 749 0 0
GGACCTACTCCTCGCACTCACCAAACCAGCCTTGCACGATCCGATCCGCATCTCTCACCC
GAAAACCTTGTCTCGTTTTGTAGATCGCCGACGAGGTTGACATACCTTTCTGATCTACTG
AATCAGTCTTTCTAACGCAAAAAAAA**CAATGGCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCAAAT
CCCATCGTTGAGATGGATGGTGATGAAATGACCCGAGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGAC
AAGCTTATCACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATCAAGTACTTCGACCTTGGTCTTCCTCAC
CGTGATGCTACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAAT
GTGGCGATCAAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTTACGGAATTTGGCTTG
AAGCAGATGTGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTGTTT
AGAGAACCAATTCTCTGCAAAAATGTTCCCAAGCTTGTCCCAGGCTGGACAAAACCCATC
TGTATCGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGA
CCTGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGG*AAAACTGAAACTGAAGTGTT
CACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCG
TGCTTTTGCGGACGCATCGATGAACACTG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4BE50TF 863 0 0
GGACCTACTCCTCGCACTCACCAAACCAGCCTTGCACGATCCGATCCGCATATCTCGCCC
GAAAACCTTGTCTCGTTTTGTAGATCGCCGACGAGGTTGACATACCTTTCTGATCTACTG
AATCAGTCTTTCTAACGCAAAAAAAAAACAATGGCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCAAAT
CCCATCGTTGAGATGGATGGTGATGAAATGACCCGAGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGAC
AAGCTTATCACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATCAAGTACTTCGACCTTGGTCTTCCTCAC
CGTGATGCTACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAAT
GTGGCGATCAAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTTACGGAATTTGGCTTG
AAGCAGATGTGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTGTTT
AGAGAACCAATTCTCTGCAAAAATGTTCCCAAGCTTGTCCCAGGCTGGACAAAACCCATC
TGTATTGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGA
CCTGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGGGAAAACTGAAACTGAAGTGTT
CACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCG
TGCTTTTGCGGACGCATCGATGAACACTGCTCATGAGAAAAAGTGGCCACTTTATCTTAG
CACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGA*GT
GTATGA*GCCATCTGGAAGTCAA

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4BZ02JQ 233 0 0
TGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTTGCACAAGGATTCG
GGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGTAAGACAATTGAAGCTG
AAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGCGAGACCA
GCACAAACAGCATAGCCTCCATTTTTGCCTGGACTCGTGGACTTGCACACAGA

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR4EG47TF 723 0 0
GTGCATT
GGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCTGGA
AGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGG*AAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATT
TACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCGTGCTTT
TGCGGACGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAAGTGGCCTCTTTATCTTAGCACAAA
GAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGA
AGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAGGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGA
TGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTA
TGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGAC
ATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCTCATGGTACCGT
TACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGAGAGACCAGCACAAACAGCATTGCCTC
CATCTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACT
CTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTATGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAA

QA 8 723 8 723
DS 

RD RR4BZ02TF 313 0 0
GCGATTTCCTTGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCC
CGGATGGTAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGG
TTCACCATAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCCTGGACTC
GTGGACTTGCACACAGAGCTCAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGA
AGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGC
TCATCATTCACGG

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR4D590TF 788 0 0
GGC
CCTGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGG*AAAACTGAAACTGAAGTGTT
CACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCG
TGCTTTTGCGGACGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAATTGGCCTCTTTATCTTAG
CACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGT
GTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAGGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCT
CATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAA
AAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATT
GATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCTCATGG
TACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGAGAGACCAGCACAAACAGCAT
TGCCTCCATCTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTC
AAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGG
AAAA*TGACCAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTA
C*TCAACACGGAGGAGT*CATCGATGCAGTTGCGGATGAGCTCAAA
CAGCTCGGCGCTTAAAAAA

QA 4 769 4 769
DS 

RD RR4EK68JQ 849 0 0
TG
TGCTATGGCCATGTACA*CACTGATGAGTCCATCCGTGCTTT*GCGGACGCATCGATGAA
CACTGCTTATGAGAAAAAGTGGCCACTTTATCTTAGCACAAAGAACACCATTCTTAAGAA
ATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAA
GTATGAGGCTGCTGGAATATGGTACGAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTACGC
TCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGCGATGTCCAGAG
CGATTTCCTTGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCC
GGATGGTAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGGT
TCACCAGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCCTGGACTCG
TGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAA
GCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCT
CATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGA
TGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAACATTCGACGACTTAG
TCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGTTTG
CGTTTTGAGAACGATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAACATTGTCACATGTTTCC
CTTTTTC

QA 3 849 3 849
DS 

RD RR4BE50JQ 861 0 0
TACAACACTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCGGACGCATCGATGAACACTGCTCATGAG
AAAAAGTGGCCACTTTATCTTAGCACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGA
TTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCATCTGGAAGTCAAAGTATGAGGCTGCT
GGAATATGGTACGAGCACCGTCTCATTGAT**TATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAG
GGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTTGCA
CAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGTAAGACA
ATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGT
GGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCCTGGACTCGTGGACTTGCACAC
AGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCCGCT
TGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGC
TCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGAA
GAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTA
ATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGTTTGCGTTTTGAGAACG
ATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAACATTGTCACATGTTTCCCTTTTTCATGCAG
ATTTCAAATAAATCTTCATTG

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR4F123TF 584 0 0
G
GAGCGATTTCCTTGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTG
CCCGGATGGTAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAG
GGTTCACCAGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCCTGGAC
TCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGA
GAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGC
GCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCAT
CGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAACATTCGACGACT
TAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGT
TTGCGTTTTGAGAACAATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAACATTGTCACATGTT
TCCCTTTTTCATGCAGATTTCAAATAAATTTTCATTG
ATTATC

QA 2 578 2 578
DS 

RD RR4F123JQ 584 0 0
G
GAGCGATTTCCTTGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTG
CCCGGATGGTAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAG
GGTTCACCAGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCCTGGAC
TCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGA
GAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGC
GCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCAT
CGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAACATTCGACGACT
TAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGT
TTGCGTTTTGAGAACAATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAACATTGTCACATGTT
TCCCTTTTTCATGCAGATTTCAAATAAATTTTCATTGATTATC

QA 2 584 2 584
DS 



AS 1 10

CO CL472Contig1 1164 10 16 U
GGGAAACCCCTTTCCCTAAAACCCTAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCG
TAGCCTCTCTCTCCCTCTCGACGAATCAAAGATGTTGCGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAA
GGAGTATCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCG
CAAGATAAGAGAAGCCCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGA
GGCCAAGCTTCGTCAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGAACACTGCCGTACCGAGGAGTCA
TATTGATGATGAATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTC
TAGGGATCCAAGTGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAA
CGCCAGTAGACTAAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACGGCGCGTTC
TCATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGACGGTCTTAT
TATCTCGCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACGAG
ACATGAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCAT
TTTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTT
CCCAGTTCCAAAACTTGATGCAAAGCGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGATTACAT
TTCATTCAGGAATCATGTGTATGATAAAGGAGAAGGAGGCCCGAAATCGATTGAGCTAAA
AGAAATTGGTCCTCGGTTTGAGTTGCGGCTCTACCAGGTGAAATTAGGAACATTGGAACA
AGATGAAGCAGAGGTCGAATGGGTTCTGAGACCTTACATGAACACTGCTAAAAAACGCCA
GTTTCTCGGTGAATGAAGATAATATTGCTAAAAGGCACCAACCGTTACTTTCAAATTCTG
TTTTACCTTTT*GATTTTGTTGTAGGAGCTGTTTA*CCTTTTATGTGACAGAGAATATTT
GCGAAAAACTTATATGAGCTAAAATTAGCATTATCAGTGGAAAACGTTTCGCTACTAAAA
AAAGAAAACATGCTCTTAAACTGG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 30 45 
10 60 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX53TF U 29
AF RR4E804TF U 1
AF RR4EM88TF U 2
AF RR4GV06TF U 13
AF RR4BG52TF U 1
AF RR4B535TF U 19
AF RR4BG52JQ C 234
AF RR4B535JQ C 253
AF RR4EM88JQ C 355
AF RR4EX53JQ C 389
BS 1 198 RR4BG52TF
BS 199 199 RR4E804TF
BS 200 789 RR4BG52TF
BS 790 790 RR4BG52JQ
BS 791 805 RR4BG52TF
BS 806 1067 RR4BG52JQ
BS 1068 1068 RR4EM88JQ
BS 1069 1080 RR4BG52JQ
BS 1081 1083 RR4EM88JQ
BS 1084 1084 RR4EX53JQ
BS 1085 1096 RR4EM88JQ
BS 1097 1097 RR4EX53JQ
BS 1098 1106 RR4EM88JQ
BS 1107 1107 RR4EX53JQ
BS 1108 1112 RR4EM88JQ
BS 1113 1164 RR4EX53JQ

RD RR4EX53TF 659 0 0
GG
GCCACACCACAAACGAAATGAGTTCCTTCGTAGCCTCTCTCTCCCTCTCGACGAATCAAA
GATGTTGCGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAAGGAGTATCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGG
TGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAGATAAGAGAAGCCCTTCAAGAAGGGAA
GCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGGCCAAGCTTCGTCAGGAGATTGATCTCGA
AGATCAGAACACTGCCGTACCGAGGAGTCATATTGATGATGAATACGCAAATGCAACTGA
GAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTCTAGGGATCCAAGTGCTCCTCTTACCCGATT
CGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCCAGTAGACTAAATCGTGGTAGTCAGGT
CATTTCCGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCTCATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTC
TGAGAACCGTGGTAAGCCTGACGGTCTTTTTATCTCGCATCTCCCGTTCGGACCTACTGC
CTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACGAGACATGAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGG
AAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATTTTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGG

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR4E804TF 776 0 0
GGGT
AACCCCTTTCCCTAAAACCCTAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCGTAGC
CTCTC*CTCCCTCTCGACGAATCAAAGATGTTGCGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAAGGAG
TATCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAG
ATAAGAGAAGCTCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGGCC
AAGCTTCGACAGGAGATTGATCTCGAAGATCAAAACACTGCCGTACCGCGGAGTCATATT
GATGATGAATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTCTAGG
GATCCAAGTGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCC
AGTAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACTGCGCGTTCTCAT
GATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGATGGTCTTATCATT
TCTCATCTCCCGTTCGGACCAACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGACAT
GAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGTAAAATGTCTGAGCAGTATCCTCATCTCATTTTT
GAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTTCCCA
GTTCCTAAACTTGATGCAAAACGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGATT

QA 5 776 5 776
DS 

RD RR4EM88TF 768 0 0
GGT
AACCCCTTTCCCTAAAACCCTAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCGTAGC
CTCTC*CTCCCTCTCGACGAATCAAAGATGTTGCGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAAGGAG
TATCTCTACAGGAAGAACTT**AAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAG
ATAAGAGAAGCTCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGGCC
AAGCTTCGACAGGAGATTGATCTCGAAGATCAAAACACTGCCGTACCGCGGAGTCATATT
GATGATGAATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTCTAGG
GATCCAAGTGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCC
AGTAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACTGCGCGTTCTCAT
GATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGATGGTCTTATCATT
TCTCATCTCCCGTTCGGACCAACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGACAT
GAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGTAAAATGTCTGAGCAGTATCCTCATCTCATTTTT
GAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAA*CACATCTTCCCA
GTTCCTAAACTTGATGCAAA*CGCATAGTTACTTTTTCTAATGAA

QA 4 768 4 768
DS 

RD RR4GV06TF 760 0 0
TCCCTAAAACCCTAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCGTAGCCTCTC*CT
CCCTCTCGACGAATCAAAGATGTTGTGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAAGGAGTATCTCTA
CAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAGATAAGAGA
AGCTCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGGCCAAGCTTCG
ACAGGAGATTGATCTCGAAGATCAAAACACTGCCGTACCGCGGAGTCATATTGATGATGA
ATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTCTAGGGATCCAAG
TGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCCAGTAGACT
GAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACTGCGCGTTCTCATGATTTTAC
TGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGATGGTCTTACCATTTCTCATCT
CCCGTTCGGACCAAC**CCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGACATGAGATTCA
AACCAAGAAAGAAATGGGTAAAATGTCTGAGCAGTATCCTCATCTCATTTTTGAACGCTT
TACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAA*CACATCTTCCCAGTTCCTAA
ACTTGATGCAAA*CGCATAGTTACTTTT
CTATGATCTGAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4BG52TF 805 0 0
GGGAAACCCCTTTCCCTAAAACCCTAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCG
TAGCCTCTCTCTCCCTCTCGACGAATCAAAGATGTTGCGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAA
GGAGTATCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCG
CAAGATAAGAGAAGCCCTTCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGA
GGCCAAGCTTCGTCAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGAACACTGCCGTACCGAGGAGTCA
TATTGATGATGAATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTC
TAGGGATCCAAGTGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAA
CGCCAGTAGACTAAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACGGCGCGTTC
TCATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGACGGTCTTAT
TATCTCGCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACGAG
ACATGAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCAT
TTTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTT
CCCAGTTCCAAAACTTGATGCAAAGCGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGATTACAT
TTCATTCAG*AATCATGTGTATGAT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4B535TF 769 0 0
AAACCCTAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCGTAGCCTCTCTCTCCCTCT
CGACGAATCAAAGATGTTGCGCAGGAACGTTAGGTTGAGAAAGGAGTATCTCTACAGGAA
GAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAGATAAGAGAAGCCCT
TCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGGCCAAGCTTCGTCAGGA
GATTGATCTCGAAGATCAGAACACTGCCGTACCGAGGAGTCATATTGATGATGAATACGC
AAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTCTAGGGATCCAAGTGCTCC
TCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCCAGTAGACTAAATCG
TGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCTCATGATTTTACTGATGT
GATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGACGGTCTTATTATCTCGCATCTCCCGTT
CGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACGAGACATGAGATTCAAACCAA
GAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATTTTTGAACGCTTTACAAC
CCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTTCCCAGTTCCAAAACTTGA
TGCAAAGCGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGATTACATTTCATTC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BG52JQ 865 0 0
ACGAGGAGGCCAAGCTTCGTCAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGAACACTGCCGTACCGA
GGAGTCATATTGATGATGAATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGA
CTACGTCTAGGGATCCAAGTGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTAT
TTCCTAACGCCAGTAGACTAAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACGG
CGCGTTCTCATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGACG
GTCTTATTATCTCGCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGG
TAACGAGACATGAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTC
ATCTCATTTTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAAC
ACATCTTCCCAGTTCCAAAACTTGATGCAAAGCGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTG
ATTACATTTCATTCAGGAATCATGTGTATGATAAAGGAGAAGGAGGCCCGAAATCGATTG
AGCTAAAAGAAATTGGTCCTCGGTTTGAGTTGCGGCTCTACCAGGTGAAATTAGGAACAT
TGGAACAAGATGAAGCAGAGGTCGAATGGGTTCTGAGACCTTACATGAACACTGCTAAAA
AACGCCAGTTTCTCGGTGAATGAAGATAATATTGCTAAAAGGCACCAACCGTTACTTTCA
AATTCTGTTTTACCTTTT*GATTTTGTTGTAGGAGCTGTTTA*CCTTTTATGTGGCAGAG
AATATTT
CGAAAAACTTTTATGAGC

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR4B535JQ 846 0 0
TCAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGAACACTGCCGTACCGAGGAGTCATATTGATGATGA
ATACGCAAATGCAACTGAGAAAGAACCCAAGATTTTGTTGACTACGTCTAGGGATCCAAG
TGCTCCTCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCCAGTAGACT
AAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCTCATGATTTTAC
TGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGACGGTCTTATTATCTCGCATCT
CCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACGAGACATGAGATTCA
AACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATTTTTGAACGCTT
TACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTTCCCAGTTCCAAA
ACTTGATGCAAAGCGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGATTACATTTCATTCAGGAA
TCATGTGTATGATAAAGGAGAAGGAGGCCCGAAATCGATTGAGCTAAAAGAAATTGGTCC
TCGGTTTGAGTTGCGGCTCTACCAGGTGAAATTAGGAACATTGGAACAAGATGAAGCAGA
GGTCGAATGGGTTCTGAGACCTTACATGAACACTGCTAAAAAACGCCAGTTTCTCGGTGA
ATGAAGATAATATTGCTAAAAGGCACCAACCGTTACTTTCAAATTCTGTTTTACCTTTT*
GATTTTGTTGTAGGAGCTGTTTA*CCTTTTATGTGGCAGAGAATATTT
CGAAAAACTTTTATGAGC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4EM88JQ 758 0 0
TACGTCTAGAGATCCAAGTGCTC*TCTTACCCGATTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATT
TCCTAACGCCAGTAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTCATTTCCGAGATTATTGAAACTGC
GCGTTCTCATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGATGG
TCTTATCATTTCTCATCTCCCGTTCGGACCAACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGT
AACAAGACATGAGATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGTAAAATGTCTGAGCAGTATCCTCA
TCTCATTTTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACA
CATCTTCCCAGTTCCTAAACTTGATGCAAAACGCATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGA
TTACATTTCATTCAGGAATCATGTGTATGATAAAGGAGAAGGAGGTCCGAAATCGATTGA
GCTAAAAGAAATTGGTCCTCGGTTTGAGTTGCGGCTCTACCAGGTGAAACTAGGAACATT
GGAACAAGATGAAGCAGTGGTCGAATGGGTTTTGAGACCTTACATGAACACTGCTAAAAA
ACGCCAGTTTCTCGGTGAATGAAGATAATATTGCTAAAACGCACCAACCGTTACTTTCAA
ATTCTGTTTTACCTTTTTGATTTTGTTTAAGGAGCTGTTCAACCTTTTATGTGATAGAGA
ATATTTGCGGAAAACTTATATGTGCTAAAATTGGCATT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4EX53JQ 776 0 0
TTCGTCAAGGAATTGAACAATGTATTTCCTAACGCCAGTAGACTAAATCGTGGTAGTCAG
GTCATTTCCGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCTCATGATTTTACTGATGTGATATTTGTT
TCTGAGAACCGTGGTAAGCCTGACGGTCTTTTTATCTCGCATCTCCCGTTCGGACCTACT
GCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACGAGACATGAGATTCAAACCAAGAAAGAAATG
GGAAAAATGTTTGAGCAATATCCTCATTTCATTTTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGGT
AAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTTCCCAGTTCCAAAACTTGATGCAAAGCGC
ATAGTTACTTTTTCTAATGAATCTGATTACATTTCATTCAGGAATCATGTGTATGATAAA
GGAGAAGGAGGCCCGAAATCGATTGAGCTAAAAGAAATTGGTCCTCGGTTTGAGTTGCGG
CTCTACCAGGTGAAATTAGGAACATTGGAACAAGATGAAGCAGAGGTCGAATGGGTTTTG
AGACCTTACATGAACACTGCTAAAAAACGCCAGTTTCTCGGTGAATGAAGATAATATTGC
TAAAAGGCACCAACCGTTACTTTCAAATTCTGTTTTACCTTTT*GATTTTGTTGTAGGAG
CTGTTTA*CCTTTTATGTGACAGAGAATATTT*CGAAAAACTTTTATGAGCTAAAATTAG
CATTATCAGTGGAAAACGTTTCGCTACTAAAAAAAGAAAACATGCTCTTAAACTGG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 8

CO CL473Contig1 1237 8 24 U
GGAGATGCTATTCGGGAGAGACGATCATCAGATCAGATTATTCCCCACTCTCTTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTC**CGACAGCCCCCCTTCGTGTCTACCTGTTGACAAGAATGGCGGA
CAAACCAAGCAGAGCACTTGTATTATACGGAGACGGCTTGGCTAGATCCGTCGACCCGTC
GAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGGCTTCTTGAGCCTTCCTCA
TGCGCCTCCAGCAGAAACAGAGAACGAAAGAATAGTTCGAGAATTTTCCCATTTGCTTGA
TGCATCAGAAGCTTATACTATAGCTAGTGGATTAAAAATTAAGGGAAGTGAAAATGAAAT
CTCAACTTTGTCCGAAAGGTTTATGGGACTGAAAGCTGCTTTAGTAACGGACAGTTCTTC
CCTGACTTCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGACGTACTACAACTCAGTGAAATATCCCA
AAAGAGTGATGATGATTCCTTTCCTTCTGATGCCACAGCAACTGAGTTACTGAGGCTGCT
TGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGACTCCGTTTTTGTGCATAT
AGGTGGTGGTGGTGATAACGTGGGAAGGATCAACTCTTTGATTGGTAGTGTTATGAGAAT
GGCTCAGCCTGGTTCGGAGATTGTACCTCGCTTGCATCTCTCGCTTGTTCTCAGCTACGG
TTCTGTCACAGACCAGGATGTTTCAATTTTTCCTGTCGAGGCTCCACAAGAAGGTGTTAA
CCCCGCGTTTCAAGGACTAGTCCCGCGTCAGAGCTACACCATGCGAGGTGAAAAGACACG
AGATGATGTTCGGGACTACTGCCCTATGTTGGTAGCTCAGTGGCAGGATGCAGTGACACG
GAAAGACTTGGTTGATACATTATCTTTCGAAGCTCTAAAAAAGCTCTCTGGAAACCTTGT
TATACCGGCTGATCGGTTCATCCATGAAGTTGCTTTCAAACTTTGGAAGGCCCCAAAATA
CGGAGCTTGAGAAAATAAAACGGTATTTT*ATTGTAATCATCTAAGTCATGATGAATAAC
AAGCTCTTTCCACTGTTGAAGTTGAGTGTGGATTGATCCCCTTGGCAAAGACACTTTGAC
TCTTTTATATCCAACTCAGAGCTAGTACTTTTAAATCAAAATTATCCAAGGTGTACACAC
AATAATAATATTCAAATTTTTTTGATGTCATTTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE93TF U 1
AF RR4DJ39TF U 20
AF RR4GB20TF U 22
AF RR4C088TF U 33
AF RR4F356TF U 104
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AF RR4GB20JQ C 435
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BS 359 600 RR4DE93TF
BS 601 718 RR4DJ39TF
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BS 774 774 RR4GB20JQ
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BS 835 849 RR4F356TF
BS 850 859 RR4GB20JQ
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BS 861 1214 RR4GB20JQ
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BS 1216 1221 RR4GB20JQ
BS 1222 1237 RR4DJ39JQ

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CTCTCTCTCTCTC****CGACAGCCCCCCTTCGTGTCTACCTGTTGACAAGAATGGCGGA
CAAACCAAGCAGAGCACTTGTATCATACGGAGACGGCTTGGCTAGATCCGTCGACCCGTC
GAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGGCTTCTTGAGCCTTCCTCA
TGCGCCTCCAGCAGAAACAGAGAACGAAAGAATAGTTCGAGAATTTTCCCATTTGCTTGA
TGCATCAGAAGCTTATACTACAGCTAGTGGATTAAAAATTAAGGGAAGTGAAAATGAGAT
CTCAACTTTGTCCGAAAGGTTTATGGGACTGAAAGCTGCTTTAGTAACGGACAGTTCTTC
CCTGACTTCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGACGTACTACAACTCAGTGAAATATCCCA
AAAGAGTGATGATGATTCCTTTCCTTCTGATGCCACAGCAACTGAGTTACTGAGGCTGCT
TGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGACTCCGTTTTTGTGCATAT

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DS 

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GGG
GATCATCAGATCAGATTATTCCCCACTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTC******CGACA
GCCCCCCTTCGTGTCTACCTGTTGACAAGAATGGCGGACAAACCAAGCAGAGCACTTGTA
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GCTTCCTTCGGTACCTGCGGCTTCTTGAGCCTTCCTCATGCGCCTCCAGCAGAAACAGAG
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GCTAGTGGATTAAAAATTAAGGGAAGTGAAAATGAAATCTCAACTTTGTCCGAAAGGTTT
ATGGGACTGAAAGCTGCTTTAGTAACGGACAGTTCTTCCCTGACTTCTTTCGGAAAACTG
ATTGGCTTAGACGTACTACAACTCAGTGAAATATCCCAAAAGAGTGATGATGATTCCTTT
CCTTCTGATGCCACAGCAACTGAGTTACTGAGGCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGC
TTGGATGTGAGCCTATACGACTCCGTTTTTGTGCATATAGGTGGTGGTGGTGATAACGTG
GGAAGGATCAACTCTTTGATTGGTAGTGTTATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCGGAGATT
GTACCTCGCTTGCATCTCTCGCTTGTTCTCAGCTAC*GTTCTGTCACAGACCAGGATGTT
TCAATTTTTCCTGTCGAG*CTCCACAAGAAG
TGTT

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G
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GCCCCCCTTCGTGTCTACCTGTTGACAAGAATGGCGGACAAACCAAGCAGAGCACTTGTA
TTATACGGAGACGGCTTGGCTAGATCCGTCGACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTC
GCTTCCGTCGGTACCTGCGGCTTCTTGAGCCTTCCTCATGCGCCTCCAGCAGAAACAGAG
AACGAAAGAATAGTTCGAGAATTTTCCCATTTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATACTATA
GCTAGTGGATTAAAAATTAAGGGAAGTGAAAATGAAATCTCAACTTTGTCCGAAAAGTTT
ATGGGACTGAAAGCTGCTTTAGTAACGGACAGTTCTTCCCTGACTTCTTTCGGAAAACTG
ATTGGCTTAGACGTACTACAACTCAGTGAAATATCCCAAAAGAGTGATGATGATTCCTTT
CCTTCTGATGCCACAGCAACTGAGTTACTGAGGCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGC
TTGGATGTGAGCCTATACGACTCCGTTTTTGTGCATATAGGTGGTGGTGGTGATAACGTG
GGAAGGATCAACTCTTCGATTGGTAGTGTTATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCGGAGATT
G*ACCTCGCTTGCATCTCTCGCTTGTTCTCAGCTACAGTTCTGTCACAGACCAGGATGCT
TCAATTTTTCCTGTCGAG

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DS 

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GG
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GTCTACCTGTTGACAAGAATGGCGGACAAACCAAGCAGAGCACTTGTATTATACGGAGAC
GGCTTGGCTAGATCCGTCGACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGT
ACCTGCGGCTTCTTGAGCCTTCCTCATGCGCCTCCAGCAGAAACAGAGAACGAAAGAATA
GTTCGAGAATTTTCCCATTTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATACTATAGCTAGTGGATTA
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GCTGCTTTAGTAACGGACAGTTCTTCCCTGACTTCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGAC
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CTATACGACTCCGTTTTTGTGCATATAGGTGGTGGTGGTGATAACGTGGGAAGGATCAAC
TCTTTGATTGGTAGTGTTATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCGGAGATTGTACCTCGCTTG
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GG
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ATCCGTCGACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGGCTT
CTTGAGCCTTCCTCATGCGCCTCCAGCAGAAACAGAGAACGAAAGAATAGTTCGAGAATT
TTCCCATTTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATACTATAGCTAGTGGATTAAAAATTAAGGG
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AACGGACAGTTCTTCCCTGACTTCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGACGTACTACAACT
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GTTACTGAGGCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGACTC
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AGGTGAAA*GACACGAGATGATGT

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DS 

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ATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCGGAGATTGTACCTCGCTTGCATCTCTCGCTTGTTCTC
AGCTACGGTTCTGTCACAGACCAGGATGTTTCAATTTTTCCTGTCGAGGCTCCACAAGAA
GGTGTTAACCCCGCGTTTCAAGGACTAGTCCCGCGTCAGAGCTACACCATGCGAGGTGAA
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ACTTTGACTCTTTTATATCCAACTCAGAGCTAGTACTTTTAAATC

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DS 

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GACTAGTCCCGCGTCAGAGCTACACCATGCGAGGTGAAAAGACACGAGATGATGTTCGGG
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ATACATTATCTTTCGAAGCTCTAAAAAAGCTCTCTGGAAACCTTGTTATACCGGCTGATC
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GTTGAAGTTGAGTGTGGATTGATCCCCTTGGCAAAGACACTTTGACTCTTTTATATCCAA
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GATTTTT
GATGTCG

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DS 

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GATCAACTCTTTGATTGGTAGTGTTATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCGGAGATTGTACC
TCGCTTGCATCTCTCGCTTGTTCTCAGCTACGGTTCTGTCACAGACCAGGATGTTTCAAT
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GTTGGTAGCTCAGTGGCAGGATGCAGTGACACGGAAAGACTTGGTTGATACATTATCTTT
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TTTATTGTAATCATCTAAGTCATGATGAATAACAAGCTCTTTCCACTGTTGAAGTTGAGT
GTGGATTGACCCCCTTGGCAAAGACACTTTGACTCTTTTATATCCAACTCAGAGCTAGTA
CTTTTAAATCAAAATTATCCAATGTGTACACACAATAATAATATTCAAATTTTTTTGATG
TCATTTAGAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 2 10

CO CL474Contig1 979 8 10 U
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GATAGAAGCAAGTAATAGAAACAAGAATCTGCAAAGTCTCCTCTGATTTTGAGATGTGAA
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TAGAGATATTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGTAG
ATCAAGCGGCTTCTGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAAGTGATT
GAACAGCGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCGATGAT
TCTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCG
TCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTC
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CTTCCCACGGATGTGATTAGCAATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCGGTTGC
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TGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGATTCGC
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CTGTCTTTTGATTTCTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 5 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B760JQ U 189
AF RR4D576JQ U 1
AF RR4DW38JQ U 1
AF RR4BA72JQ U 202
AF RR4B251TF C 231
AF RR4BA72TF C 282
AF RR4C218TF C 256
AF RR4B760TF C 325
BS 1 515 RR4D576JQ
BS 516 516 RR4DW38JQ
BS 517 673 RR4D576JQ
BS 674 721 RR4BA72JQ
BS 722 810 RR4B251TF
BS 811 811 RR4BA72TF
BS 812 963 RR4B251TF
BS 964 964 RR4BA72TF
BS 965 972 RR4B251TF
BS 973 979 RR4B760TF

RD RR4B760JQ 368 0 0
TTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGTAGATCAAGCG
GCTTCTGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACGCCTTCAAGTGATTGAACAGCG
CTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCGATGATTCTTTCAG
GGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAAT
GCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCA
CCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCAC
GGATGTGA

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4D576JQ 673 0 0
AGCAGCAAAAATCTGAATAGAAGATTATTTCACATTACAAAGGTTTTAAAGCATAGAGTT
GATAGAAGCAAGTAATAGAAACAAGAATCTGCAAAGTCTCCTCTGATTTTGAGATGTGAA
ACTAGAGAAACCGGAGAAGAAGAAAAAACTCTTATGAGCTTGGCGATAATGGTAGCTTAG
TAGAGATATTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGTAG
ATCAAGCGGCTTCTGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAAGTGATT
GAACAGCGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCGATGAT
TCTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCG
TCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTC
AGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGAAACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTT
CTTCCCACGGATGTGATTAGCAATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCGGTTGC
ATCGACAACATACCAAGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACCACGT
TGTGTTCCAAATG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4DW38JQ 673 0 0
G
GCAGCAAAAATCTGAATAGAAGATTATTTCACATTACAAAGGTTTTAAAGCATAGAGTTG
ATAGAAGCAAGTAATAGAAACAAGAATCTGCAAAGTCTCCTCTGATTTTGAGATGTGAAA
CTAGAGAAACCGGAGAAGAAGAAAAAACTCTTATGAGCTTGGCGATAATGGTAGCTTAGT
AGAGATATTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGTAGA
TCAAGCGGCTTCTGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAAGTGATTG
AACAGCGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCGATGATT
CTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGT
CCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCA
GCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTC
TTCCCACGGATGTGATTAGCAATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCGGTTGCA
TCGACAACATACCAAGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGACACCACGTT
GTGTTCCAAATG

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR4BA72JQ 520 0 0
CTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGTAGAACAAGCGGCTTCTGCGCCTC
GTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAAGTGATTGAACAGCGCTCTCCCAAGCCG
TCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCGATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTG
CAACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAG
CTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAA
GGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGC
AATGGTGG**GCCAATCTACCGAGAATCTTGTCGGTTGCATCGACAACATACCAAGGCTT
GTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACCACGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCC
ATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGATTCGCC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4B251TF 744 0 0
TGATGGGTAGATCAAGCGGCTTCTGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACTT
TCAAGTGATTGAACAGCGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCAT
GCTCGATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATAC
CACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAG
CAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGG
AGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCAATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCT
TGTCGGTTGCATCGACAACATACCAAGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTG
GATACCACGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACC
GTTGATTCGCCGGAACAAGGGAAGTAGTAGTAGCAGTAGTCCCCTGCTCCTCCGCTTCGC
ACTTCACCTGCAATCCCCTCTTCGTGTTCGCGTAAATGCCAACTCGCACCGACGGTTTCG
AGATAGCAGCTAGAGAGAAGCCTAGAAACGGAGACCTTCTGTTACCACCAGAGGTTTTCA
CCGAAGGGAGTATAACTGTTGAAGACGAACAGAGAACCGCCATGTTTGTTTGTGTTTCTC
TCCTCTGCTGCTGGCTTTTGAT
CC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4BA72TF 693 0 0
TGTACACTTTCAAGTGATTGAACAGCGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCAC
GAACAGCATGCTCGATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAAAGTTTCCA
CTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTC
CAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGG
GAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCAATGGTGG**GCCAATCTAC
CGAGAATCTTGTCGGTTGCATCGACAACATACCAAGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCG
AAGCCTTTGGATACCACGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGA
ACATCCACCGTTGATTCGCCGGAACAAGGGAAGTAGTAGTAGCAGTAGTCCCCTGCTCCT
CCGCTTCGCACTTCACCTGCAATCCCCTCTTCGTGTTCGCGTAAATGCCGACTCGCACCG
ACGGTTTCGAGATAGCAGCTAGAGAGAAGCCTAGAAACGGAGACCTTCTGTTACCACCAG
AGGTTTTCACCGAAGGGAGTATAACTGTTGAAGACGAACAGAGAACCGCCATGTTTGTTT
GTGTTTCTCTCCTCTGCTGCTGTCTTTTGAT
CC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4C218TF 721 0 0
GCGCTCA
TGAGGATGCTCTGG*CCTTTGTACACTTTCAGGTGAT*GAACAGCGCTCTCCCAAGCCGT
CCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCGTGCTCAATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGC
AACTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTAAAGC
TTCTGGTTCCT**TCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAG
GCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCA
ATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCAGTTGCATCGACAACATACCAAGGCTTG
TCCGTGTTCACATGGTCTGAAGCCTTTGGATACCATGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCA
TTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGATTCGCCGGAACAAGGGAGGAAGTAGTA
GCAGTAGTACCCTGCTCCTCCGCTTCGCACTTCACCTGCAATCCCCTCTTCGTGTTCGCG
TAAATGCCGACTCGCACCGACGGTTTCGAGATAGCAGCTAGAGAGAAGCCTAGAAACGGA
GACCTTCTGTTACCACCAGAGGTTTTCACCGAAGGGAGTATAACTGTTGAAGACGAACAG
AGAACCGCCATGTTTGTTTGTGTTTCTCTCCTCTGCTGCTGTCTTTTGAT
TTCC

QA 8 717 8 717
DS 

RD RR4B760TF 655 0 0
CTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCGATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAA
CTGATCAAAAGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTT
CTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGC
TCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCAAT
GGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCGGTTGCATCGACAACATACCAAGGCTTGTC
CGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACCACGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATT
AGCTTCTTCTTCG***AACATCCACCGTTGATTCGCCGGAACAAGGGAAGTAGTAGTAGC
AGTAGTCCCCTGCTCCTCCGCTTCGCACTTCACCTGCAATCCCCTCTTCGTGTTCGCGTA
AATGCCGACTCGCACCGACGGTTTCGAGATAGCAGCTAGAGAGAAGCCTAGAAACGGAGA
CCTTCTGTTACCACCAGAGGTTTTCACCGAAGGGAGTATAACTGTTGAAGACGAACAGAG
AACCGCCATGTTTGTTTGTGTTTCTCTCCTCTGCTGCTGTCTTTTGATTTCTCCC

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL474Contig2 690 2 3 U
GGGTTATTATTAACTGAAGAACCCAATCTTATCCGAGAAATCAAAAGAGAGAGAGAGAGA
GCAGAGGAGAGAAAACACAAACATGGCGGTTCTCTGTTCGTCTTCAACAGTTATACTCCC
TTCGGTGAAACCTTCTGGAAGTAACAGAAGGTCTCCGTTTCTAGGCTTCTTCTCTCTAAC
TGCTATCTCGAAGCCGTCGGTGCGAGTCGGCATTTACGCGAACACGAAGAGGGGATTGCA
GGTGAAGTGCGAAGCGGAGGAGCAGGGGACTACTGCTACTACTACTTCCCCTGTTCCGGC
GAATCAACGGTGGATGTTCGACGAAGAAGAAGCTAATGGCCCTGACATTTGGAACACAAC
GTGGTATCCAAAGGCTTCGGACCATGTGAACACGGACAAGCCTTGGTATGTTGTCGATGC
AACCGACAAGATTCTCGGTAGATTGGCATCCACCATTGCTAATCACATCCGTGGGAAGAA
CCTTGCCTCCTACACTCCCAGTGTCGACATGGGAGCCTTTGTGATTGTGGTGAATGCTGA
GAAAGTTGCTGTGTCTGGAAAGAAGAGGAACCAGAAGCTGTACAGGAGGCATTCGGGACG
ACCTGGTGGTATGACAGTGGAAACTTTTGATCAGTTGCAGCAGAGGATCCCTGAAAGAAT
CATCGAGCATGCTGTTCGTGGAATGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D576TF U 45
AF RR4DW38TF U 1
BS 1 365 RR4DW38TF
BS 366 366 RR4D576TF
BS 367 690 RR4DW38TF

RD RR4D576TF 602 0 0
GGGG
GAGAGAGAGAGAGCAGAGGAGAGAAAACACAAACATGGCGGTTCTCTGTTCGTCTTCAAC
AGTTATACTCCCTTCGGTGAAACCTTCTGGAAGTAACAGAAGGTCTCCGTTTCTAGGCTT
CTTCTCTCTAACTGCTATCTCGAAGCCGTCGGTGCGAGTCGGCATTTACGCGAACACGAA
GAGGGGATTGTAGGTGAAGTGCGAAGCGGAGGAGCAGGG*ACTACTGCTACTACTACTTC
CCTTGTTCCGGCGAATCAACGGTGGATGTTCGACGAAGAAGAAGCTAATGGCCCTGACAT
TTGGAACACAACGTGGTATCCAAAGGCTTCGGACCATGTGAACACGGACAAGCCTTGGTA
TGTTGTCGATGCAACCGACAAGATTCTCGGTAGATTGGCATCCACCATTGCTAATCACAT
CCGTGGGAAGAACCTTGCCTCCTACACTCCCAGTTTCGACATGGGAGCCTTTGTGATTGT
GGTGAATGCTGAGAAAGTTGCTGTGTCTGGAAAGAAGAGGAACCAGAAGCTGTACAGGAG
GCATTCGGGACGACCTGGTGGTATGACAGTGGAAACTTTTGATCAGTTGCAGCAGAGG

QA 5 602 5 602
DS 

RD RR4DW38TF 690 0 0
GGGTTATTATTAACTGAAGAACCCAATCTTATCCGAGAAATCAAAAGAGAGAGAGAGAGA
GCAGAGGAGAGAAAACACAAACATGGCGGTTCTCTGTTCGTCTTCAACAGTTATACTCCC
TTCGGTGAAACCTTCTGGAAGTAACAGAAGGTCTCCGTTTCTAGGCTTCTTCTCTCTAAC
TGCTATCTCGAAGCCGTCGGTGCGAGTCGGCATTTACGCGAACACGAAGAGGGGATTGCA
GGTGAAGTGCGAAGCGGAGGAGCAGGGGACTACTGCTACTACTACTTCCCCTGTTCCGGC
GAATCAACGGTGGATGTTCGACGAAGAAGAAGCTAATGGCCCTGACATTTGGAACACAAC
GTGGTGTCCAAAGGCTTCGGACCATGTGAACACGGACAAGCCTTGGTATGTTGTCGATGC
AACCGACAAGATTCTCGGTAGATTGGCATCCACCATTGCTAATCACATCCGTGGGAAGAA
CCTTGCCTCCTACACTCCCAGTGTCGACATGGGAGCCTTTGTGATTGTGGTGAATGCTGA
GAAAGTTGCTGTGTCTGGAAAGAAGAGGAACCAGAAGCTGTACAGGAGGCATTCGGGACG
ACCTGGTGGTATGACAGTGGAAACTTTTGATCAGTTGCAGCAGAGGATCCCTGAAAGAAT
CATCGAGCATGCTGTTCGTGGAATGCTTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 2 10

CO CL475Contig1 815 2 1 U
AGCTTGAAAAAAATTAACTGTAAATACTGGAATCATTTCGAGTGTTTTATTCCTTTTAGT
ATGGAACTATAGCTTGTGGAGGATGAGATGAGCACCATACTCTGGGTGAAGGGTGAAGAC
TGTGTAAGGAGCATGGACATAAGAAGGAGAAAGCTCAAAGGAGAATCTCTGTAGAATCAA
TGCCATTGCCATCTTTGCCTCTAATAAGGCAAAATTTTGGCCAATGCAGATCCTTGGTCC
CCAAGCAAAGGGAAAGAAGGAGACTTGGCTCTTTGTTGCCTTTGAGACACCATCTTCGAA
TCTCTCCGGCTTGAACTCTGCTGCATCGTTACCCCATAGCTGGGTATCGTGTTGGACTAG
CATAATAGGCAGACTGATGTGAACGCCACCTGGTAGCGTCAGGTCGCCTAGCTTCATCTC
TTTGTGAATGGTTCGACTCAGCTGAGTTACTGGAGGATATAGCCTAAGAACCTCATTAAA
TATCATTGTCATAGTTTTGAGATGGTTAAGCCCTTCTGTATCAGGTTCTTTATCACCAAA
TACTTGCTTAACTTCTTCTCGTGCACGAGCCTGCCAATCTTGGTGTTGGCTTAGCAGAAT
CATTGTCCAGACTAGAAGTACTGAAGTTGTCTCTTGCCCAGCAAAGTAGAACAGCTTGCA
CTCCTATATCACATCGTCAACGCTCATTCCATTTCCTTTAGCTTGCCCTAAATTCGATTC
AAGAAGTATACCTAACAAATCTTCATTTGGTGCTTCCCCAGCCTCTCTTGCCCGTAACCT
TTTGTTAACGAGCCCTTTCAGTATATCATGCGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A325JQ U 1
AF RR4A325JQD U 1
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QA 1 792 1 792
DS 



CO CL475Contig2 923 8 13 U
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BQ
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40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 25 5 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 25 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4EB33JQ U 1
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AAA

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QA 1 720 1 720
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AG
TGTAGAAACTGTACTCATATAGATATTTATGTAGAAACTTTGAATGCATGAAACGGTTGA
TATTATCATAAAGTTATAATGGAATTGAACATTATTTAATAGCCAGGAAAGATCTGGTGA
GCAGAGCCTTTGAGTTTGAGTTCTACTTTTACTGCTCTGGTATGGAACTATAGCTTGTGG
AGGATGAGATGAGCACCATACTCTGGATGAAGGGTGAAGACTGTGTAAGGAGCATGGACA
TAGGAAGGAGAAAGCTCAAAGGAGAATCTCTGTAAAATCAATGCCATTGCCATCTTTGCC
TCTAATAAGGCAAAATTTTGGCCAATGCAGATCCTTGGTCCCCAAGCAAAGGGAAAGAAG
GAGACTTGGCTCTTTGTTGCCTTTGAGACACCATCTTTGAATCTCTCAGGATTGAACTCT
GCTGCATTGTTACCCCATAGCTGGGTATCGCGTTGGACTAGAATAATAGGCAGACTGATG
TGAACGCCACCTGGTAGCGTCAGGTCGCCTAGCTTCATCTCTTTGTGAATGGTTCGACTC
AGCTGAGTTACTGGAGGATATAACCTAAGGACTTCATTAATTATCATTGTCATAGTTTTG
AGATGGTTAAGCCCTTCTGTATCAGGTTCTTTATCACCAAATACTTGCTTAACTTCTTCT
CGTGCACGAGCATGCCAATCTTGGTGTTGGCTTAGCAGAATCATTGTCCAAACTAGAAGT
ACTGAAGTTGTCTCTTGCCCCGCAAAGTAGAACAGCTTGCACTCCTCTATCACAT

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR4GM14TF 762 0 0
ATAGCCAGGAAAGATCTGGTGAGCAGAGC*TTTGAGTT*GAGTTCTACTTTTACTGCTCT
GGTATGGAACTATAGCTTGTGGAGGATGAGATGAGCACCATACTCTGGATGAAGGGTGAA
GACTGTGTAAGGAGCATGGACATAGGAAGGAGAAAGCTCAAAGGAGAATCTCTGTAAAAT
CAATGCCATTGCCATCTTTGCCTCTAATAAGGCAAAATTTTGGCCAATGCAGATCCTTGG
TCCCCAAGCAAAGGGAAAGAAGGAGACTTGGCTCTTTGTTGCCTTTGAGACACCATCTTT
GAATCTCTCAGGATTGAACTCTGCTGCATTGTTACCCCATAGCTGGGTATCGCGTTGGAC
TAGAATAATAGGCAGACTGATGTGAACGCCACCTGGTAGCGTCAGGTCGCCTAGCTTCAT
CTCTTTGTGAATGGTTCGACTCAGCTGAGTTACTGGAGGATATAACCTAAGGACTTCATT
AATTATCATTGTCATAGTTTTGAGATGGTTAAGCCCTTCTGTATCAGGTTCTTTATCACC
AAATACTTGCTTAACTTCTTCTCGTGCACGAGCATGCCAATCTTGGTGTTGGCTTAGCAG
AATCATTGTCCAAACTAGAAGTACTGAAGTTGTCTCTTGCCCCGCAAAGTAGAACAGCTT
GCACTCCTCTATCACATCGTCAACGCTCATTCCATTTCCTTTAGCTTGCCCTAAATTCGA
TTCAAGAAGTATACCTAACAAATCTTCATTTGATGCTTCCCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4EB33TF 742 0 0
GCTCT
GTATGGAACTATAGCTTGTGGAGGATGAGATGAGCACCATACTCTGGGTGAAGGGTGAAG
ACTGTGTAAGGAGCATGGACATAGGAAGGAGAAAGCTCAAAGGAGAATCTCTGTAAAATC
AATGCCATTGCCATCTTTGCCTCTAATAAGGCAAAATTTTGGCCAATGCAGATCCTTGGT
CCCCAAGCAAAGGGAAAGAAGGAGACTTGGCTCTTTGTTGCCTTTGAGACACCATCTTTG
AATCTCTCAGGATTGAACTCTGCTGCATTGTTACCCCATAGCTGGGTATCGCGTTGGACT
AGCATAATAGGCAGACTGATGTGAACGCCACCTGGTAGCGTCAGGTCGCCTAGCTTCATC
TCTTTGTGAATGGTTCGACTCAGCTGAGTTACTGGAGGATATAACCTAAGGACTTCATTA
ATTATCATTGTCATAGTTTTGAGATGGTTAAGCCCTTCTGTATCAGGTTCTTTATCACCA
AATACTTGCTTAACTTCTTCTCGTGCACGAGCCTGCCAATCTTGGTGTTGGCTTAGCAGA
ATCATTGTCCAAACTAGAAGTACTGAAGTTGTCTCTTGCCCCGCAAAGTAGAACGGCTTG
CACTCCTCTATCACATCGTCAACGCTCATTCCATTTCCTTTAGCTTGCCCTAAATTCGAT
TCAAGAAGTATACCTAACAAATCTTCATTTGATGCTTCCCCAGCCTCTCTTGCCCGTAAC
CTTTTGTTAACGAG
CCC

QA 6 739 6 739
DS 

RD RR4DY73TF 687 0 0
AAGGGTGAAGACTGTGTAAGGAGCATGGACATAGGAAGGAGAAAGCTCAAAGGAGAATCT
CTGTAAAATCAATGCCATTGCCATCTTTGCCTCTAATAAGGCAAAATTTTGGCCAATGCA
GATCCTTGGTCCCCAAGCAAAGGGAAAGAAGGAGACTTGGCTCTTTGTTGCCTTTGAGAC
ACCATCTTTGAATCTCTCAGGATTGAACTCTGCTGCATTGTTACCCCATAGCTGGGTATC
GCGTTGGACTAGCATAATAGGCAGACTGATGTGAACGCCACCTGGTAGCGTCAGGTCGCC
TAGCTTCATCTCTTTGTGAATGGTTCGACTCAGCTGAGTTACTGGAGGATATAACCTAAG
GACTTCATTAATTATCATTGTCATAGTTTTGAGATGGTTAAGCCCTTCTGTATCAGGTTC
TTTATCACCAAATACTTGCTTAACTTCTTCTCGTGCACGAGCCTGCCAATCTTGGTGTTG
GCTTAGCAGAATCATTGTCCAAACTAGAAGTACTGAAGTTGTCTCTTGCCCCGCAAAGTA
GAACGGCTTGCACTCCTCTATCACATCGTCAACGCTCATTCCATTTCCTTTAGCTTGCCC
TAAATTCGATTCAAGAAGTATACCTAACAAATCTTCATTTGATGCTTCCCCAGCCTCTCT
TGCCCGTAACCTTTTGTTAACGAGCCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 3 10

CO CL476Contig1 586 2 1 U
TTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCCTCTCTCGCTCTCTCCACCTTCAACCCTAAATCCCT
TCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCCCTCCTTCCCTCTCCTTCAA
ACTCAACTCCCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGTCTCGCTTCGTCCGCAACGT
CGCCGTCACAGATGACTTCAACGTAGAAGAAGAAGACGGAGTTTTCTCCGATGACGCTCC
TCCGCAGCAGGAGCAATCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTCCCCTT
CGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGGGCGCCGGAAATGTCGAGATGGT
TGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGAAGAAGCAGAGGTTTTGGGTTCGTGACTATGTC
TTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATGGCTATGAGTTAGATGGTAG
AGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGG
ACCCAGAAGCAGCTTTGGAGGCTCTGGTTCTGGATATGGTGGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT19TF U 1
AF RR4CS75TF U 15
BS 1 586 RR4CT19TF

RD RR4CT19TF 586 0 0
TTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCCTCTCTCGCTCTCTCCACCTTCAACCCTAAATCCCT
TCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCCCTCCTTCCCTCTCCTTCAA
ACTCAACTCCCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGTCTCGCTTCGTCCGCAACGT
CGCCGTCACAGATGACTTCAACGTAGAAGAAGAAGACGGAGTTTTCTCCGATGACGCTCC
TCCGCAGCAGGAGCAATCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTCCCCTT
CGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGGGCGCCGGAAATGTCGAGATGGT
TGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGAAGAAGCAGAGGTTTTGGGTTCGTGACTATGTC
TTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATGGCTATGAGTTAGATGGTAG
AGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGG
ACCCAGAAGCAGCTTTGGAGGCTCTGGTTCTGGATATGGTGGTGTG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4CS75TF 563 0 0
CTTCAGCTTCCTCTCTCGCTCTCTCCACCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCT
CCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCCCTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACTCCCAAT
CCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGTCTCGCTTCGTCCGCAACGTCGCCGTCACAGATG
ACTTCAACGTAGAAGAAGAAGACGGAGTTTTCTCCGATGACGCTCCTCCGCAGCAGGAGC
AATCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTCCCCTTCGACGTCGACAGTG
CTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGGGCGCCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATG
ACAAAGTGACAGGAAGAAGCAGAGGTTTTGGGTTCGTGACTATGTCTTCAGTGTCTGAAG
TTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATGGCTATGAGTTAGATGGTAGAGCCTTGAGAGTTA
ATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCT
TTGGAGGCTCTGGTTCTGGATAT

QA 1 563 1 563
DS 



CO CL476Contig2 715 6 5 U
GGTGAAAAAGACTTAAATTAGACTGTTAAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACA
AAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAAAGCTAAGTAGTCAATGGCAGAACACAGACAGT
CGAGAACATGTTCTTCACTCATAACCTTTACTTAATACGTTTCTAATAAAAAGACCACTC
GTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAA*CAGCCATC
CTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAGTGCGTTTAATGAGAATAG
GAAGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCAGAGACTCTTAT
TTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGC
AGAGTTGTAGGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAGATGAC
TCTAGCCTCAGCTACTTTTCCTTGCTCCCCGAACAAACTCTCGAGAGCCATGTCGTCGAC
TCCCCAAGATAGGTTGCCGACATAAACACGGTTTCCTGAACCAGCACCACCACCACCACC
ACCATATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTC
CCTCTTCGGTGGAGGAGGACCAGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCTAACTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT19JQ U 56
AF RR4D028JQ U 1
AF RR4D028TF C 1
AF RR4CS75JQ U 272
AF RR4DY55JQ U 1
AF RR4DY55TF C 79
BS 1 128 RR4D028JQ
BS 129 129 RR4CT19JQ
BS 130 492 RR4D028JQ
BS 493 681 RR4DY55JQ
BS 682 715 RR4DY55TF

RD RR4CT19JQ 226 0 0
CCACAAAATAAAGAGAAACCCGAATCAAACCAAAGCTAAGTAGTCAATGGCAGAACACAG
ACAGTCGAAAACATGTTCTTCACTCATAACCTTTACTTAATACGTTTCTAATAAAAAGAC
CACTCGTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGTTTAGTACGGTCCAAAA*CAG
CCATCCTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCA
AAAA

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4D028JQ 492 0 0
GGTGAAAAAGACTTAAATTAGACTGTTAAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACA
AAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAAAGCTAAGTAGTCAATGGCAGAACACAGACAGT
CGAGAACACGTTCTTCACTCATAACCTTTACTTAATACGTTTCTAATAAAAAGACCACTC
GTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAA*CAGCCATC
CTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAGTGCGTTTAATGAGAATAG
GAAGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCAGAGACTCTTAT
TTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGC
AGAGTTGTAGGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAGATGAC
TCTAGCCTCAGC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4D028TF 492 0 0
GGTGAAAAAGACTTAAATTAGACTGTTAAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACA
AAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAAAGCTAAGTAGTCAATGGCAGAACACAGACAGT
CGAGAACACGTTCTTCACTCATAACCTTTACTTAATACGTTTCTAATAAAAAGACCACTC
GTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAA*CAGCCATC
CTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAGTGCGTTTAATGAGAATAG
GAAGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCAGAGACTCTTAT
TTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGC
AGAGTTGTAGGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAGATGAC
TCTAGCCTCAGC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4CS75JQ 274 0 0
CCTCCAAAAAGTGCGTTTAATGAGAATAGGAAGGGTGGGGATCAAAACTGGCGCCTTGGA
GGCCTAGCCTCAGCTTCAGAAACTCTTATTTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAG
TTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGCAAAATTGTAGGTCACAAACCCAAAACCCTTA
AATCGACCACTGTCCCTGTCGTAAATGACTCTAGCCTCAGCTACTTTTCCCTGCTCCCCG
AACAAACTCTCGAGAGCCATGTCAT
CGACTCCCC

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR4DY55JQ 682 0 0
GGTGAAAAAGACTTAAATTAGACTGTTAAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACA
AAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAAAGCTAAGTAGTCAATGGCAGAACACAGACAGT
CGAGAACATGTTCTTCACTCATAACCTTTACTTAATACGTTTCTAATAAAAAGACCACTC
GTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAAACAGCCATC
CTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAGTGCGTTTAATGAGAATAG
GAAGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCGGAGACTCTGAT
TTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGC
AGAGTTGTACGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAAATGAC
TCTAGCCTCAGCTACTTTTCCTTGCTCCCCGAACAAACTCTCGAGAGCCATGTCGTCGAC
TCCCCAAGATAGGTTGCCGACATAAACACGGTTTCCTGAACCAGCACCACCACCACCACC
ACCATATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTC
CCTCTTCGGTGGAGGAGGACC
A

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4DY55TF 637 0 0
ATCAAACCAAAGCTAAGTAGTCAATGGCAGAACACAGACAGTCGAGAACATGTTCTTCAC
TCATAAC*TTTACTTAATACGTTTCTAATAAAAAGACCACTCGTGCATCCATTGCATAAC
AAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAAACAGCCATCCTCTCACATAACTCTATA
TTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAGTGCGTTTAATGAGAATAGGAAGGGTGGTGATCAAAA
CTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCGGAGACTCTGATTTGTCTACCGTCCAAATC
GGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGCAGAGTTGTACGTCACAAA
CCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAGATGACTCTAGCCTCAGCTACTTT
TCCTTGCTCCCCGAACAAACTCTCGAGAGCCATGTCGTCGACTCCCCAAGATAGGTTGCC
GACATAAACACGGTTTCCTGAACCAGCACCACCACCACCACCACCATATCCAGAACCGGA
GCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTCCCTCTTCGGTGGAGGAGG
ACCAGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCTAACTCC

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL476Contig3 584 2 2 U
GTGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCAAGAGGACCTAGAAGCAGCT
TTGGAAGTGGAGGTGGAGGTTCTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTGTTTATGTGGGTAATC
TCTCGTGGGGTGTATATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGGAGCAAGGGAAGGTTG
TTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGGGGTTTGGGTTTGTGA
CGTACAACTCTGCTCAAGAGGTTCAGAATGCTATCAGAACCTTGGATGGTGCTGATTTGG
ATGGGAGACAGATTAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAGGGCGCCAGTTTTGAG
CACCTCTTCGTTATTCTCAAAAACGCATGTTGTGGTGGAGGGCGCTTTGTGCAGTTTTGT
GTGAGAGGATGGTGGCAGTTTCGGACCTTACTTATGTGTTGTTGTGCCTTGGATGCACGG
ATGGTCTTATGTTTGAGAAATCTTATATATTAAAATAGTAATCATGATTTATTTCATGTG
TTGACATTTTATTTTGGATCATCTATTAAAAAATCTATCACTTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DC39JQ C 1
AF RR4DC39TF U 1
BS 1 1 RR4DC39JQ
BS 2 584 RR4DC39TF

RD RR4DC39JQ 584 0 0
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TTGAGGCTAGAGTCATTTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGGGGTTTGGGTTTGTGA
CGTACAACTCTGCTCAAGAGGTTCAGAATGCTATCAGAACCTTGGATGGTGCTGATTTGG
ATGGGAGACAGATTAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAGGGCGCCAGTTTTGAG
CACCTTTTCGTTATTCTCAAAAACGCATGTTGTGGTGGAGGGCGCTTTGTGCAGTTTTGT
GTGAGAGGATGGTGGCAGTTTCGGACCTTACTTATGTGTTGTTGTGCCTTGGATGCACGG
ATGGTCTTATGTTTGAGAAATCTTATATATTAAAATAGTAATCATGATTTATTTCATGTG
TTGACATTTTATTTTGGATCATCTATTAAAAAATCTATCACTTC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4DC39TF 584 0 0
G
TGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCAAGAGGACCTAGAAGCAGCTT
TGGAAGTGGAGGTGGAGGTTCTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTGTTTATGTGGGTAATCT
CTCGTGGGGTGTATATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGGAGCAAGGGAAGGTTGT
TGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGGGGTTTGGGTTTGTGAC
GTACAACTCTGCTCAAGAGGTTCAGAATGCTATCAGAACCTTGGATGGTGCTGATTTGGA
TGGGAGACAGATTAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAGGGCGCCAGTTTTGAGC
ACCTCTTCGTTATTCTCAAAAACGCATGTTGTGGTGGAGGGCGCTTTGTGCAGTTTTGTG
TGAGAGGATGGTGGCAGTTTCGGACCTTACTTATGTGTTGTTGTGCCTTGGATGCACGGA
TGGTCTTATGTTTGAGAAATCTTATATATTAAAATAGTAATCATGATTTATTTCATGTGT
TGACATTTTATTTTGGATCATCTATTAAAAAATCTATCACTTC

QA 2 584 2 584
DS 



AS 1 8

CO CL477Contig1 1194 8 12 U
GGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCAGTTGGGGTTGGGTTCTCGTATACCAATAA
CTCAATGGATCTTCATAAGCTCGGAGATCAAGTTACTGCAGATGACTCTCTTGCTTTCTT
GATCAACTGGTTCATGAAATTTCCTGAGTTTCGATCCAACGAGTTTTATATCGCCGGAGA
GAGTTATGCCGGAACAAGAAGGTTACAAGAGACTTGCAGATCAATCTCAAGGGTTTCATG
ATTGGTAACGCGGTGATCAATGAAGAAACAGACATGGCAGGGCTAGTGGACTACGCATGG
AGCCACGCTATAGTGTCCGACGAGATCCACAGCAACATCCATGGCATGTGCCGTTTTGAG
GAAGAGCAAAAGAGCAACCAGACCGTAGAATGTAACGACAATTTCAAAGCTTTCATGGAA
GGTTACAACGATATCGATATATACAGCATCTATACACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCG
TCGTCTTCTTCTCCAAGAAAACCTAAACTCATCGTGTCTCCTCGTCTACTAACTTCACAC
GACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCCATGCACTGAAGGTTATGCTGAAAAA
TATTTTAACCGGAAAGATGTGCAGGTTGCACTTCATGCAAACGTTACAAACCTTCCTTAT
CCGTATACCCCTTGCAGCGAAGTAATAAAGAGATGGAATGATGCTCCTTCCACCGTGATT
CCCATCATCCAGAAGCTATTGGCAGGCGGCCTCCGCATCTGGATCTATAGTGGAGATACG
GATGGGAGAGTTCCAGTAACGTCTACACGTTATAGCATAAAGAAGATGGGACCTAAGGTG
GAGTCACCGTGGAGGTCATGGTTTCACAT*AGTCAAGTGGCTGGATGGGTTGAAACTTAC
GCTGGAGGATTAACTTTTGCCACCGTGAGAGGAGCCGGTCATCAGGTTCCGGTCTTTGCT
CCAGCCCAATCTCTTTCCTTATTCTCTCACTTCCTTTCTTCCACCCCATTGCCTTCAAAA
CGTTCCTGATCATTACGCCACCAAGTCATGGCAAGTTGTTGTTATGTTTTAGTATCCGTC
GTTTGGTACTTAATTAGCACCCAATTAAGGTTTTGAAACTTTTGGTACTTAATTAGTACC
CAATTAAGGTAGTGAGTTTCAAAAGATCAATAAAAAAACATTGCGTTTTGTTGG


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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AF RR4C134TF U 1
AF RR4C261TF U 1
AF RR4C135TF U 1
AF RR4H690TF U 689
AF RR4C135JQ C 389
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AF RR4C261JQ C 534
AF RR4C134JQ C 429
BS 1 600 RR4C134TF
BS 601 689 RR4C135JQ
BS 690 737 RR4H690TF
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BS 739 800 RR4H690TF
BS 801 801 RR4C135JQ
BS 802 868 RR4H690TF
BS 869 870 RR4C135JQ
BS 871 926 RR4H690TF
BS 927 927 RR4C135JQ
BS 928 959 RR4H690TF
BS 960 1194 RR4C135JQ

RD RR4C134TF 600 0 0
GGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCAGTTGGGGTTGGGTTCTCGTATACCAATAA
CTCAATGGATCTTCATAAGCTCGGAGATCAAGTTACTGCAGATGACTCTCTTGCTTTCTT
GATCAACTGGTTCATGAAATTTCCTGAGTTTCGATCCAACGAGTTTTATATCGCCGGAGA
GAGTTATGCCGGAACAAGAAGGTTACAAGAGACTTGCAGATCAATCTCAAGGGTTTCATG
ATTGGTAACGCGGTGATCAATGAAGAAACAGACATGGCAGGGCTAGTGGACTACGCATGG
AGCCACGCTATAGTGTCCGACGAGATCCACAGCAACATCCATGGCATGTGCCGTTTTGAG
GAAGAGCAAAAGAGCAACCAGACCGTAGAATGTAACGACAATTTCAAAGCTTTCATGGAA
GGTTACAACGATATCGATATATACAGCATCTATACACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCG
TCGTCTTCTTCTCCAAGAAAACCTAAACTCATCGTGTCTCCTCGTCTACTAACTTCACAC
GACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCCATGCACTGAAGGTTATGCTGAAAAA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4C261TF 581 0 0
GGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCAGTTGGGGTTGGGTTCTCGTATACCAATAA
CTCAATGGATCTTCATAAGCTCGGAGATCAAGTTACTGCAGATGACTCTCTTGCTTTCTT
GATCAACTGGTTCATGAAATTTCCTGAGTTTCGATCCAACGAGTTTTATATCGCCGGAGA
GAGTTATGCCGGAACAAGAAGGTTACAAGAGACTTGCAGATCAATCTCAAGGGTTTCATG
ATTGGTAACGCGGTGATCAATGAAGAAACAGACATGGCAGGGCTAGTGGACTACGCATGG
AGCCACGCTATAGTGTCCGACGAGATCCACAGCAACATCCATGGCATGTGCCGTTTTGAG
GAAGAGCAAAAGAGCAACCAGACCGTAGAATGTAACGACAATTTCAAAGCTTTCATGGAA
GGTTACAACGATATCGATATATACAGCATCTATACACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCG
TCGTCTTCTTCTCCAAGAAAACCTAGACTCATCGTGTCTCCTCGTCTACTAACTTCACAC
GACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCCATGCAC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4C135TF 600 0 0
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CTCAATGGATCTTCATAAGCTCGGAGATCAAGTTACTGCAGATGACTCTCTTGCTTTCTT
GATCAACTGGTTCATGAAATTTCCTGAGTTTCGATCCAACGAGTTTTATATCGCCGGAGA
GAGTTATGCCGGAACAAGAAGGTTACAAGAGACTTGCAGATCAATCTCAAGGGTTTCATG
ATTGGTAACGCGGTGATCAATGAAGAAACAGACATGGCAGGGCTAGTGGACTACGCATGG
AGCCACGCTATAGTGTCCGACGAGATCCACAGCAACATCCATGGCATGTGCCGTTTTGAG
GAAGAGCAAAAGAGCAACCAGACCGTAGAATGTAACGACAATTTCAAAGCTTTCATGGAA
GGTTACAACGATATCGATATATACAGCATCTATACACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCG
TCGTCTTCTTCTCCAAGAAAACCTAAACTCATCGTGTCTCCTCGTCTACTAACTTCACAC
GACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCCATGCACTGAAAGTTATGCTGAAAAA

QA 1 600 1 600
DS 

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G
GAGATGGAATGATGCTCCTTCCACCGTGATTCCCATCATCCAGAAGCTTTTGGCAGGCGG
CCTCCGCATCTGGATCTATAGTGGAGATACGGATGGGAGAGTTCCAGTAACATCTACACG
TTATAGCATAAAGAAGATGGGACCTAAGGTGGAGTCACCGTGGAGGTCATGGTTTCACAA
GAGTCAAGTGGCTGGATGGGTTGAAACTTACGCTGGAGGATTAACTTTTGCCACCGTAAG
AGGAGCCGGTCATCAGGTTCCGGTCTTTGC

QA 2 271 2 271
DS 

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TCTATACACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCGTCGTCTTCTTCTCCAAGAAAACCTAAAC
TCATCGTGTCTCCTCGTCTACTAACTTCACACGACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGT
ACGATCCATGCACTGAAGGTTATGCTGAAAAATATTTTAACCGGAAAGATGTGCAGGTTG
CACTTCATGCAAACGTTACAAACCTTCCTTATCCGTATACCCCTTGCAGCGAAGTAATAA
AGAGATGGAATGATGCTCCTTCCACCGTGATTCCCATCATCCAGAAGCTATTGGCAGGCG
GCCTCCGCATCTGGATCTATAGTGGAGATACGGATGGGAGAGTTCCAGTAACGTCTACAC
GTTATAGCATAAAGAAGATGGGACCTAAGGTGGAGTCACCGTGGAGGTCATGGTTTCACA
T*AGTCAAGTGGCTGGATGGGTTGAAACTTACGCTGGAGGATTAACTTTTGCCACCGTGA
GAGGAGCCGGTCATCAGGTTCCGGTCTTTGCTCCAGCCCAATCTCTTTCCTTATTCTCTC
ACTTCCTTTCTTCCACCCCATTGCCTTCAAAACGTTCCTGATCATTACGCCACCAAGTCA
TGGCAAGTTGTTGTTATGTTTTAGTATCCGTCGTTTGGTACTTAATTAGCACCCAATTAA
GGTTTTGAAACTTTTGGTACTTAATTAGTACCCAATTAAGGTAGTGAGTTTCAAAAGATC
AATAAAAAAACATTGCGTTTTGTTGG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4C110JQ 799 0 0
CGACAATTTCAAAGCTTTCATGGAAGGTTACAACGATATCGATATATACAGCATCTATAC
ACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCGTCGTCTTCTTCTCCAAGAAAACCTAAACTCATCGT
GTCTCCTCGTCTACTAACTTCACACGACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCC
ATGCACTGAAGGTTATGCTGAAAAATATTTTAACCGGAAAGATGTGCAGGTTGCACTTCA
TGCAAACGTTACAAACCTTCCTTATCCGTATACCCCTTGCAGCGAAGTAATAAAGAGATG
GAATGATGCTCCTTCCACCGTGATTCCCATCATCCAGAAGCTATTGGCAGGCGGCCTCCG
CATCTGGATCTATAGTGGAGATACGGATGGGAGAGTTCCAGTAACGTCTACACGTTATAG
CATAAAGAAGATGGGACCTAAGGTGGAGTCACCGTGGAGGTCATGGTTTCACAT*AGTCA
AGTGGCTGGATGGGTTGAAACTTACGCTGGAGGATTAACTTTTGCCACCGTGAGAGGAGC
CGGTCATCAGGTTCCGGTCTTTGCTCCAGCCCAATCTCTTTCCTTATTCTCTCACTTCCT
TTCTTCCACCCCATTGCCTTCAAAACGTTCCTGATCATTACGCCACCAAGTCATGGCAAG
TTGTTGTTATGTTTTAGTATCCGTCGTTTGGTACTTAATTAGCACCCAATTAAGGTTTTG
AAACTTTTGGTACTTAATTAGTACCCAATTAAGGTAGTGAGTTTCAAAAGATCAATAAAA
AAACATTGCGTTTTGTTGG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4C261JQ 661 0 0
TTCACACGACTTGTGGGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCCATGCACTGAAGGTTATGC
TGAAAAATATTTTAACCGGAAAGATGTGCAGGTTGCACTTCATGCAAACGTTACAAACCT
TCCTTATCCGTATACCCCTTGCAGCGAAGTAATAAAGAGATGGAATGATGCTCCTTCCAC
CGTGATTCCCATCATCCAGAAGCTATTGGCAGGCGGCCTCCGCATCTGGATCTATAGTGG
AGATACGGATGGGAGAGTTCCAGTAACGTTTACACGTTATAGCATAAAGAAGATGGGACC
TAAGGTGGAGTCACCGTGGAGGTCATGGTTTCACAT*AGTCAAGTGGCTGGATGGGTTGA
AACTTACGCTGGAGGATTAACTTTTGCCACCGTGAGAGGAGCCGGTCATCAGGTTCCGGT
CTTTGCTCCAGCCCAATCTCTTTCCTTATTCTCTCACTTCCTTTCTTCCACCCCATTGCC
TTCAAAACGTTCCTGATCATTACGCCACCAAGTCATGGCAAGTTGTTGTTATGTTTTAGT
ATCCGTCGTTTGGTACTTAATTAGCACCCAATTAAGGTTTTGAAACTTTTGGTACTTAAT
TAGTACCCAATTAAGGTAGTGAGTTTCAAAAGATCAATAAAAAAACATTGCGTTTTGTTG
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4C134JQ 766 0 0
CGATATCGATATATACAGCATCTATACACCCGTTTGTCTCTCCTCTTACTCGTCGTCTTC
TTCTCCAAGAAAACCTAAACTCATCGTGTCTCCTCGTCTACTAACTTCACACGACTTGTG
GGATAGCTTGCCGGCCGGGTACGATCCATGCACTGAAGGTTATGCTGAAAAATATTTTAA
CCGGAAAGATGTGCAGGTTGCACTTCATGCAAACGTTACAAACCTTCCTTATCCGTATAC
CCCTTGCAGCGAAGTAATAAAGAGATGGAATGATGCTCCTTCCACCGTGATTCCCATCAT
CCAGAAGCTATTGGCAGGCGGCCTCCGCATCTGGATCTATAGTGGAGATACGGATGGGAG
AGTTCCAGTAACGTCTACACGTTATAGCATAAAGAAGATGGGACCTAAGGTGGAGTCACC
GTGGAGGTCATGGTTTCACAT*AGTCAAGTGGCTGGATGGGTTGAAACTTACGCTGGAGG
ATTAACTTTTGCCACCGTGAGAGGAGCCGGTCATCAGGTTCCGGTCTTTGCTCCAGCCCA
ATCTCTTTCCTTATTCTCTCACTTCCTTTCTTCCACCCCATTGCCTTCAAAACGTTCCTG
ATCATTACGCCACCAAGTCATGGCAAGTTGTTGTTATGTTTTAGTATCCGTCGTTTGGTA
CTTAATTAGCACCCAATTAAGGTTTTGAAACTTTTGGTACTTAATTAGTACCCAATTAAG
GTAGTGAGTTTCAAAAGATCAATAAAAAAACATTGCGTTTTGTTGG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 2 8

CO CL478Contig1 827 3 2 U
GTCCAGAAAATAAGATTTTTAACCAAAACCAAAAAAAACAGATTCAACAAATGTCATGTT
CGGTTTGGTTTAATGTCTGTTTAATTATAGAGGAAGAAGCTGATGAAGCTTTCTTCAACA
CTCTCAACAAGTATGAAAGCTTAAAACCAATGGCCAAACAATCTGCCCACAAACATCTCT
GACACTCCAATGGAATCTAGATTTGGAGTTTCGAACCAACGGAAACAAAGGGGATACAAA
GGTTTCATTGTTATTACTAAGCCTTGTGGTCTTTAGCCATTTCATCCACGTCAAGTTCTA
CCGCCAAGAGTGGAGAATCCTCTTCCATTGCGAATTCACTGTTACTAACTGGACCATGAT
CAACGGCTGTCCTCAGACAATATATAGCTCTTCCTACAATGTCCGCCATCGAGACCGGAC
CAAATGTTCGGC*ATCGTATGCTTCCTTAGATTTCATCTCTTTGTTTTCAGCAACGACCC
AGCACTGATCCTTTTCGAGAACAAAAGGCTCCTCCTTCTCATCACTTGATACCATTTCGG
ATCCTTCTAAAGCTGCCAATCTTCTCACTAGATACTTGTTTGTTTCATTTGGGTCCTTCA
ACACAACAGCATCTCCAACAAAAACATACCTTGTATCAACAACAGGTAGCTTACGGACAA
GCAGCGTGTTGTCATGTGCTCCCATGGTTGGGGACATCTCTTGCCCTTTACCAGAGTGTA
AGTAGGTTAGCCTTCCATAGAGTAGATTCTTCAGGACTACACCAGCTAGTTCCCGGTCAT
TTATCCCTTTAGTATGATTCTTGAGGCTGAGAGTGAGGGAGTACTCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA95JQ U 1
AF RR4AL14JQ U 1
AF RR4AL14TF C 1
BS 1 751 RR4AL14JQ
BS 752 827 RR4AL14TF

RD RR4DA95JQ 588 0 0
GG
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GTTTGGTTTAATGTCTGTTTAATTATAGAGGAAGAAGCTGATGAAGCTTTCTTCAACACT
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CACTCCAATGGAATCTAGATTTGGAGTTTCGAACCAACGGAAACAAAGGGGATACAAAGG
TTTCATTGTTATTACTAAGCCTTGTGGTCTTTAGCCATTTCATCCACGTCAAGTTCTACC
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CACTGATCCTTTTCGAGAACAAAAGGCTCCTCCTTCTCATCACTTGATACCATTTCGGAT
CCTTCTAAAGCTGCCAATCTTCTCACTAGATACTTGTTTGTTTCAT

QA 3 588 3 588
DS 

RD RR4AL14JQ 751 0 0
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CTCTCAACAAGTATGAAAGCTTAAAACCAATGGCCAAACAATCTGCCCACAAACATCTCT
GACACTCCAATGGAATCTAGATTTGGAGTTTCGAACCAACGGAAACAAAGGGGATACAAA
GGTTTCATTGTTATTACTAAGCCTTGTGGTCTTTAGCCATTTCATCCACGTCAAGTTCTA
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CAACGGCTGTCCTCAGACAATATATAGCTCTTCCTACAATGTCCGCCATCGAGACCGGAC
CAAATGTTCGGC*ATCGTATGCTTCCTTAGATTTCATCTCTTTGTTTTCAGCAACGACCC
AGCACTGATCCTTTTCGAGAACAAAAGGCTCCTCCTTCTCATCACTTGATACCATTTCGG
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ACACAACAGCATCTCCAACAAAAACATACCTTGTATCAACAACAGGTAGCTTACGGACAA
GCAGCGTGTTGTCATGTGCTCCCATGGTTGGGGACATCTCTTGCCCTTTACCAGAGTGTA
AGTAGGTTAGCCTTCCATAGAGTAGATTCTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4AL14TF 827 0 0
GT
CCAGAAAATAAGATTTTTAACCAAAACCAAAAAAAACAGATTCAACAAATGTCATGTTCG
GTTTGGTTTAATGTCTGTTTAATTATAGAGGAAGAAGCTGATGAAGCTTTCTTCAACACT
CTCAACAAGTATGAAAGCTTAGAACCAATGGCCAAACAATCTGCCCACAAACATCTCTGA
CACTCCAATGGAATCTAGATTTGGAGTTTCGAACCAACGGAAACAAAGGGGATACAAAGG
TTTCATTGTTATTACTAAGCCTTGTGGTCTTTAGCCATTTCATCCACGTCAAGTTCTACC
GCCAAGAGTGGAGAATCCTCTTCCATTGCGAATTCACTGTTACTAACTGGACCATGATCA
ACGGCTGTCCTCAGACAATATATAGCTCTTCCTACAATGTCCGCCATCGAGACCGGACCA
AATGTTCGGC*ATCGTATGCTTCCTTAGATTTCATCTCTTTGTTTTCAGCAACGACCCAG
CACTGATCCTTTTCGAGAACAAAAGGCTCCTCCTTCTCATCACTTGATACCATTTCGGAT
CCTTCTAAAGCTGCCAATCTTCTCACTAGATACTTGTTTGTTTCATTTGGGTCCTTCAAC
ACAACAGCATCTCCAACAAAAACATACCTTGTATCAACAACAGGTAGCTTACGGACAAGC
AGCGTGTTGTCATGTGCTCCCATGGTTGGGGACATCTCTTGCCCTTTACCAGAGTGTAAG
TAGGTTAGCCTTCCATAGAGTAGATTCTTCAGGACTACACCAGCTAGTTCCCGGTCATTT
ATCCCTTTAGTATGATTCTTGAGGCTGAGAGTGAGGGAGTACTCC

QA 3 827 3 827
DS 



CO CL478Contig2 941 5 7 U
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CGACGAGGCAAAAGGTCGTGTCCGATAACAAGTAGCTAACTTTTCGAGATCAAACCTCTG
CGGAAGATGGCATACATATCGAATTGGGTCAGATACATGGCTCACAAGCTGGAGTACTCC
CTCACTCTCAGCCTCAAGAATCATACTAAAGAGAAGCTAAATGACCGGGAACTAGTTGGT
GTAGTCGTGAAGAATTTACTCTATGGAAGGATAACCTACTTACACTCTGGTAAAGGTCAA
GAGATGTCACCAACCATGGGAGCACATGACAACACACTGCTTGTCCGTAAGCTACCTGTT
GTTGATACAAGGTATGTTTTTGTTGGAGATGCTGTTGTGTTGAAGGACCCGAATGAAACA
AACAAGTATCTAGTGAGAAGACTAGCAGCTTTAGAAGGATCAGAAATGGTATCAACTGAT
GAGAAGGAGGAGCCTTTTGTTCTCGAAAAGGATCAGTGCTGGGTCGTAGCTGAAAACCAA
GAGATGAAATCTAAGGAAGCATACGATAGCCGAACATTTGGTCCGGTCTCAATGGCGGAC
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AGTGAATTCGCAATGGAAGAGGATTCTCCACTCTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAA
ATGGCTAAAGACCACAAGGCTTAGTAATAACAAGGAAACCTTTGTATCCCCTTTGTTTCC
GTTGGTTCGAAACTCCAATCTAGATTCCATTGGAGTGTCAGAGATGTTTGTGGCGAATGT
TTGGCCGTTGGTTTTTAAGCTTTCATATACAGTTCCTTGTTGAGAGTGCTGAAGAAAGCT
TCATCAGCTTCTTCCTCTATAATTAAACACACATTAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE40TF U 22
AF RR4EU36TF U 1
AF RR4GQ34TF U 23
AF RR4EU36JQ C 289
AF RR4EE40JQ C 434
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RD RR4EE40TF 646 0 0
GGAC
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GGA
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CTAAAGAGAAGCTAAATGACCGGGAACTAGTTGGTGTAGTCGTGAAGAATTTACTCTATG
GAAGGATAACCTACTTACACTCTGGTAAAGGTCAAGAGATGTCACCAACCATGGGAGCAC
ATGACAACACACTGCTTGTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGATACAAGGTATGTTTTTGTTG
GAGATGCTGTTGTGTTGAAGGACCCGAATGAAACAAACAAGTATCTAGTGAGAAGACTAG
CAGCTTTAGAAGGATCAGAAATGGTATCAACTGATGAGAAGGAGGAGCCTTTTGTTCTCG
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ATAGCCGAACATTTGGTCCGGTCTCAATGGCGGACATAGTAGGAAGAGCTATATATTGTC
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CTCCACTCTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGCTAAAGAC
A

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CCAGTTAGTAACAGTGAATTCGCAATGGAAGAGGATTCTCCACTCTTGGCGGTAGAACTT
GACGTGGATGAAATGGCTAAAGACCACAAGGCTTAGTAATAACAAGGAAACCTTTGTATC
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TGTGGCGAATGTTTGGCCGTTGGTTTTTAAGCTTTCATATACAGTTCCTTGTTGAGAGTG
CTGA

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CTATATATTGTCTGAGGACAGCCGTTGATCATGGTCCAGTTAGTAACAGTGAATTCGCAA
TGGAAGAGGATTCTCCACTCTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGCTAAAGACC
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TCCAATCTAGATTCCATTGGAGTGTCAGAGATGTTTGTGGCGAATGTTTGGCCGTTGGTT
TTTAAGCTTTCATATACAGTTCCTTGTTGAGAGTGCTGAAGAAAGCTTCATCAGCTTCTT
CCTCTATAATTAAACACACATTAAACCC

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DS 



AS 1 9

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AATAAAAACATTCAAGAAAAAATTACTCAAGAAAACCCTTTTTGTTTTTACTGTTTGTTT
CTTTATCTCTTCGCCTTGTGAATTCCAATCAGGCGGCC*TACAAAAGCATATTATATAGA
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TCAGACATGAGAAATCCAGGCATCTCATAGGAGGCAGCGAACTTCTCAACATCAGCCTTG
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GCCTGCTTCAATGCAACAGCTAGAGCACCAATCTGGTGGTTGTGAGGACCACCTTGAAGC
GCAGGGAACACAGCAAAGTTGATTTTGTCCTCAAAGTCATAGACTGCACCCTCGGCTTGC
CCCTTCTTTGGTGGTTTTGGGCCCTTCCTGTAGAAGATCATACCAGCCCTTGGACCCTCA
AACTCTTGTGGGTTGTGGTTGTCACAACGTCACAGTACTCAAAGGGGTTTGCAGCTTCCT
GAGCAGCAACGAGACCACTGC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BI18JQ U 1
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AF RR4G644JQ U 2
AF RR4E785JQ U 1
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QA 1 296 1 296
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GCTCCTTCTGGATGTTCAATGTCAGCGTCACTGATCGGCTCAAGAACTCTCCTATCATCT
CAAAGTCCTTCTCCACCAATCCCCTTGATGT

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DS 

RD RR4E785JQ 562 0 0
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TCAAAGTCCTTCTCCACCAATCCCCTTGATGTCATCGCAGGAGTACCGATTCTTACACCT
CCAGGAGCAAGAGCACTGCTGTCTCCAAAGACAGCATTCTTGTTTAAAGTAATGTCGCAT
AGATCGCACAGCTTCTCAACC
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4E785TF 562 0 0
AAAAACTCGCTTGATATTATTATTAAAAGCCAACAAAATACAACAATTTCAATAAGAGAG
AATAAAAACATTCAAGAAAAAATTACTCAAGAAAACCCTTTTTGTTTTTACTGTTTGTTT
CTTTATCTCTTCGCCTTGTGAATTCCAATCAGGCGGCC*TACAAAAGCATATTATATAGA
GAGATAACAGAAGATTACTCTTTGATAGAGAGAGGAAATCTCTAGTTATGGTACTTCATC
TCAGACATGAGAAATCCAGGCATCTCATAGGAGGCAGCGAACTTCTCAACATCAGCCTTG
AGCTCCTCGATCTCTTTGTTGTTCACCAAACCCTTGTTGAAGTCCTTCAACAGCTTACCA
TGCTCCTTCTGGATGTTCAATGTCAGCGTCACTGATCGGCTCAAGAACTCTCCTATCATC
TCAAAGTCCTTCTCCACCAATCCCCTTGATGTCATCGCAGGAGTACCGATTCTTACACCT
CCAGGAGCAAGAGCACTGCTGTCTCCAAAGACAGCATTCTTGTTTAAAGTAATGTCGCAT
AGATCGCACAGCTTCTCAACC
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4FM77JQ 649 0 0
AAAAACTCGCTTGATATTATTATTAAAAGCCAACAAAATACAACAATTTCAATAAGAGAG
AATAAAAACATTCAAGAAAAAATTACTCAAGAAAACCCTTTTTGTTTTTACTGTTTGTTT
CTTTATCTCTTCGCCTTGTGAATTCCAATCAGGCGGCC*TACAAAAGCATATTATATAGA
GAGATAACAGAAGATTACTCTTTGATAGAGAGAGGAAATCTCTAGTTCTGGTACTTCATC
TCAGACATGAGAAATCCAGGCATCTCATAGGAGGCAGCGAACTTCTCAACATCAGCCTTG
AGCTCCTCGATCTCTTTGTTGTTCACCAAACCCTTGTTAAAGTCCTTCAACAGCTTACCA
TGCTCCTTCTGGATGTTCAATGTCAGCGTCACTGATCGGCTCAAGAACTCTCCTATCATC
TCAAAGTCCTTCTCCACCAATCCCCTTGATGTCATCGCAGGAGTACCGATTCTTACACCT
CCAGGAGCAAGAGCACTGCTGTCTCCAAAGACAGCATTCTTGTTCAAAGTAATGTCGCAT
AGATCGCACAGCTTCTCAACCTTGTTACCGGTCAATCCAAGAGGGCGAAGATCCCAAAGA
ACAAGATGGTTCTCAGTTCCACCGGTTACAATACTGTATCCCTTGCCCA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4B962JQ 814 0 0
G
AAAACTCGCTTGATATTATTATTAAAAGCCAACAAGATACAACAATTTCAATGAGAGAAA
ATAAAAACACTCAAGAAAAAATTACTCAAGAAAACCCTTTTTGTCTTTACTGTTTGTTTC
TTTATCTCTTCGCCTTGTGAATTCCAATCAGGCGGCCCTACAAAAGCATATTATATAGAG
AGATAACAGAAGATTACTCTTCGATAGAGAGAGGAAATCTCTAGTGCTGGTACTTCATCT
CAGACATGAGAAATCCAGGCATCTCATAGGAGGCAGCGAACTTCTCAACATCAGCCTTGA
GCTCCTCGATCTCTTTGTTGTTCACCAAACCCTTGTTGAAGTCCTTCAACAGCTTACCAT
GCTCCTTCTGGATGTTCAATGTCAGCGTCACTGATCGGCTCAAGAACTCTCCTATCATCT
CAAAGTCCTTCTCCACCAATCCCCTTGATGTCATCGCAGGAGTACCGATTCTTACACCTC
CAGGAGCAAGAGCACTGCTGTCTCCAAAGACAGCATTCTTGTTCAAAGTAATGTCGCATA
GATCGCACAGCTTCTCAACCTTGTTACCGGTCAATCCAAGAGGGCGAAGATCCCAAAGAA
CAAGATGGTTCTCAGTTCCACCGGTTACAATACTGTATCCCTTGCCCATCAGGTAGTTTG
CAAGGGCAACAGCATTAGCTTTCACCTGCTTCGCATAGACCTTGAAACCAGGAGTATTAG
CCTGCTTCAATGCAACAGCTAGAGCACCAATCTGGTGGTTGTGAGGACCACCTTGAAGCG
CAGGGAACACAGCAAAGTTGATTTTGTCCTCA
C

QA 2 813 2 813
DS 

RD RR4B962TF 676 0 0
TGAATTCCAATCAGGCGGCCCTACAAAAGCATATTATATAGAGAGATAACAGAAGATTAC
TCTTCGATAGAGAGAGGAAATCTCTAGTGCTGGTACTTCATCTCAGACATGAGAAATCCA
GGCATCTCATAGGAGGCAGCGAACTTCTCAACATCAGCCTTGAGCTCCTCGATCTCTTTG
TTGTTCACCAAACCCTTGTTGAAGTCCTTCAACAGCTTACCATGCTCCTTCTGGATGTTC
AATGTCAGCGTCACTGATCGGCTCAAGAACTCTCCTATCATCTCAAAGTCCTTCTCCACC
AATCCCCTTGATGTCATCGCAGGAGTACCGATTCTTACACCTCCAGGAGCAAGAGCACTG
CTGTCTCCAAAGACAGCATTCTTGTTCAAAGTAATGTCGCATAGATCGCACAGCTTCTCA
ACCTTGTTACCGGTCAATCCAAGAGGGCGAAGATCCCAAAGAACAAGATGGTTCTCAGTT
CCACCGGTTACAATACTGTATCCCTTGCCCATCAGGTAGTTTGCAAGGGCAACAGCATTA
GCTTTCACCTGCTTCGCATAGACCTTGAAACCAGGAGTATTAGCCTGCTTCAATGCAACA
GCTAGAGCACCAATCTGGTGGTTGTGAGGACCACCTTGAAGCGCAGGGAACACAGCAAAG
TTGATTTTGTCCTCA
C

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4FM77TF 645 0 0
TTA
AAGTCTTTCAACAGCTTACCATGCTCTTTCTGGATGTTCAATGTCAGCGTCACTGATCGG
CTCAAGAACTCTCCTATCATCTCAAAGTCCTTCTCCACCAATCCCCTTGATGTCATCGCA
GGAGTACCGATTCTTACACCTCCAGGAGCAAGAGCACTGCTGTCTCCAAAGACAGCATTC
TTGTTCAAAGTAATGTCGCATAGATCGCACAGCTTCTCAACCTTGTTACCGGTCAATCCA
AGAGGGCGAAGATCCCAAAGAACAAGATGGTTCTCAGTTCCACCGGTTACAATACTGTAT
CCCTTGCCCATCAGGTAGTTTGCAAGGGCAACAGCATTAGCTTTCACCTGCTTCGCATAG
ACCTTGAAACCAGGAGTATTAGCCTGCTTCAACGCAACAGCTAGAGCACCAATCTGGTGG
TTGTGAGGACCACCTTGAAGCGCAGGGAACACGGCAAGGTTGATTTTGTCCTCAAAGTCA
TAGACTGCACCCTCGGCTTGCCCCTTCTTTGGTGGTTTTGGGCCCTTCCTGTAGAAGATC
ATACCAGCCCTTGGACCCTCAAACTCTTGTGGGTTGTGGTTGTCACAACGTCACAGTACT
CAAAGGGGTTTGCAGCTTCCTGAGCAGCAACGAGACCACTGC

QA 4 645 4 645
DS 



AS 2 10

CO CL480Contig1 801 4 6 U
CATAGCGAATACATATGTTGAATATCTTCTTAAGATCGTTGGTAATTTCTCAAGTATTAA
GTATATATACATAAGCATATCAAGAAGCTTTATTTTCTCGTCTGTAAGAACATAAGACAG
AGAGACTTCCCGTATTTTGTTTTACTCAGTTTCTGTGTTTTTGCTCATAGGAATAAACCC
ATAAACAACAAACAGCTACTACAAACAGTGAAAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGACCA
AAGTCGTGGATAATGATGATACTTTGGATTCTTTAACCGGTACTCAGGGATATATATAAT
CATTGTGGTGAGGCTTCAGGCTGGTGTTGTGGATTCGGTATCAGCTCGGGTGCTACAGCG
AAATGCAATCCTCCTCTGCGCTGTCCTCCACCGCCAGCCCCGTTGTGTAGCATAAACGCA
ACTTCTGCAGCAGCTAGAGCGGCTGCTTCCTGTCTTTGTCTTCGGCGTTGTAAGATACTG
ATGGCCCAAGCCATTATGTAACAAGGGAGGAGAAAAGCGGCAGCACGGAGCATGAAAAGA
AAGAAGAAAGCTGATGGATCATCTTCTTCGTCGTCTGAGTTGTTGTTGTTGTTTGAAAGG
TTCATGGCGTGTCGCAGCAATAAAAGCGCCATTAAGATAAGAGCAGCGGAACGAAGGAAA
GCAGCACCGCTAGAGTTAGAATCAGCATACTCGTCGTAGTCCGGATCGAAGAAACGGCGT
TCTGCAGCCGCCATTGCAAAATGCGCGGGTCGTTGAAGTCTAAGGAACACCACCATTGGC
CCAATCTTCACCGATATCGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB52JQ U 1
AF RR4DZ60JQ U 1
AF RR4G150JQ U 59
AF RR4FF42JQ U 11
BS 1 474 RR4DZ60JQ
BS 475 475 RR4G150JQ
BS 476 548 RR4DZ60JQ
BS 549 549 RR4G150JQ
BS 550 590 RR4DZ60JQ
BS 591 801 RR4FF42JQ

RD RR4EB52JQ 495 0 0
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AGAGACTTCCCGTATTTTGTTTTACTCAGTTTCTGTGTTTTTGCTCATAGGAATAAACCC
ATAAACAACAAACAGCTACTACAAACAGTGAAAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGACCA
AAGTCGTGGATAATGATGATACTTTGGATTCTTTAACCGGTACTCAGGGATATATATAAT
CATTGTGGTGAGGCTTCAGGCTGGTGTTGTGGATTCGGTATCAGCTCGGGTGCTACAGCG
AAATGCAATCCTCCTCTGCGCTGTCCTCCACCGCCAGCCCCGTTGTGTAGCATAAACGCA
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ATGGCCCAAGCCATT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4DZ60JQ 605 0 0
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GTATATATACATAAGCATATCAAGAAGCTTTATTTTCTCGTCTGTAAGAACATAAGACAG
AGAGACTTCCCGTATTTTGTTTTACTCAGTTTCTGTGTTTTTGCTCATAGGAATAAACCC
ATAAACAACAAACAGCTACTACAAACAGTGAAAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGACCA
AAGTCGTGGATAATGATGATACTTTGGATTCTTTAACCGGTACTCAGGGATATATATAAT
CATTGTGGTGAGGCTTCAGGCTGGTGTTGTGGATTCGGTATCAGCTCGGGTGCTACAGCG
AAATGCAATCCTCCTCTGCGCTGTCCTCCACCGCCAGCCCCGTTGTGTAGCATAAACGCA
ACTTCTGCAGCAGCTAGAGCGGCTGCTTCCTGTCTTTGTCTTCGGCGTTGTAAGGTACTG
ATGGCCCAAGCCATTATGTAACAAGGGAGGAGAAAAGCGGCAGCACGGAGCATGAAAAGA
AAGAAGAACGCTGATGGATCATCTTCTTCGTCGTCTGAGTTGTTGTTGTT
TGAAAGGTTCATGGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4G150JQ 545 0 0
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AGAGAGACTTCCCGTATTTTGTTTTACTCAGTTTCTGTGTTTTTGCTCATAGGAATAAAC
CCATAAACAACAAACAGCTACTACAAACAGTGAAAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGAC
CAAAGTCGTGGATAATGATGATACTTTGGATTCTTTAACCGGTACTCAGGGATATATATA
ATCATTGTGGTGAGGCTTCAGGCTGGTGCTGTGGATTCGGTATCAGCTCGGGTGCTACAG
CGAAATGCAATCCTCCTCTGCGCTGTCCTCCACCGCCAGCCCCGTTGTGTAGCATAAACG
CAACTTCTGCAGCAGCTAGAGCGGCTGCTTCCTGTCTTTGTCTTCGGCGTTGTAAGATAC
TGATGGCCCAAGCCATTATGTAACAAGGGAGGAGAAAAGCGGCAGCACGGAGCATGAAAA
GAAAGAAGAAAGCTGATGGATCATCTTCTTCGTCGTCTGAGTTGTTGTTGTT
TGAAAGGTTCATG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4FF42JQ 791 0 0
ACATATGTTGAATACCTTCTTAAGATCGTTGGTAATTTCTCAAGTATTAAGTATATATAC
ATAAGCATATCAAGAAGCTTTATTTTCTCGTCTGTAAGAACATAAGACAGAGAGACTTCC
CGCATTTTGTTTTACTCAGTTTCTGTGTTTTTGCTCATAGGAATAAACCCATAAACAACA
AACAGCTACTACAAACAGTGAAAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGACCAAAGTCGTGGA
TAATGATGATACTTCGGATTCTTTAACCGGTACTCAGGGATATATATAATCATTGTGGTG
AGGCTTCAGGCTGGTGTTGTGGATTCGGTATCAGCTCGGGTGCTACAGCGAAATGCAATC
CTCCTCTGCGCTGTCCTCCACCGCCAGCCACGTTGTGTAGCATAAACGCAACTTCTGCAG
CAGCTAGAGCGGCTGCTTCCTGTCTTTGTCTTCGGCGTTGTAAGATACTGATGGCCCAAG
CCATTATGTAACAAGGGAGGAGAAAAGCGGCAGCACGGAGCATGAAAAGAAAGAAGAAAG
CTGATGGATCATCTTCTTCGTCGTCTGAGTTGTTGTTGTTGTTTGAAAGGTTCATGGCGT
GTCGCAGCAATAAAAGCGCCATTAAGATAAGAGCAGCGGAACGAAGGAAAGCAGCACCGC
TAGAGTTAGAATCAGCATACTCGTCGTAGTCCGGATCGAAGAAACGGCGTTCTGCAGCCG
CCATTGCAAAATGCGCGGGTCGTTGAAGTCTAAGGAACACCACCATTGGCCCAATCTTCA
CCGATATCGAT

QA 1 791 1 791
DS 



CO CL480Contig2 945 6 10 U
GGGATCAAACAAAGAAAACACATTTGTCCGAGTTTCGTTCGAGAGCTGCGCCTTCAAGAA
ATCGCAAGAGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAGTATCT
CTATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGTAGAGGGAGAGATGTCTGATCAT
CTGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACCTGAATTCAGACAGAGGAGGA
TCCATTGAATCTTCTGGAGAAAGTTCAAGAACTCAAGGCACCACAATCATTTCTTCTACG
ACTACTACTTTTACTAAATCTAAGGATGATAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTC
GAAGACGAAGAGGAACCGCTTATCCAATCAGCTGAATGCCGTATATGCCAAGATGAGGAT
TCTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGG
AAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAG
TCTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCGAT
ATCGGTGAAGATTGGGCCAATGGTGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCGCGCATTTTT
*GCAATGGCGGCTGCAGAACGCCGTTTTTTCGATCCGGACTACGAC*ACAACGGGG***C
TGGCGGTGGAGGA*CAGCGCAGAGGAGGATTGCATTTCGCTGTAGCACCCGAGCTGTTTG
TTGTTTATGGGTTTATTCCTATGAGCAAAAACACAGAAACTGAGTAAAACAAAATACGGG
AAGTCTCTCTGTCTTATGTTCTTACAGACGAGAAAATAAAGCTTCTTGATATGCTTATGT
ATATATACTTAATACTTGAGAAATTACCAACGATCTTAAGAAGAT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 5 30 5 5 30 30 30 5 5 30 5 
5 30 5 30 5 30 30 5 30 5 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ60TF U 1
AF RR4EB52TF U 1
AF RR4G150TF U 2
AF RR4FF42TF U 2
AF RR4AE66TF U 2
AF RR4AE66JQ C 299
BS 1 219 RR4DZ60TF
BS 220 220 RR4AE66TF
BS 221 602 RR4DZ60TF
BS 603 615 RR4EB52TF
BS 616 660 RR4AE66TF
BS 661 661 RR4G150TF
BS 662 810 RR4AE66TF
BS 811 811 RR4AE66JQ
BS 812 823 RR4AE66TF
BS 824 945 RR4AE66JQ

RD RR4DZ60TF 602 0 0
GGGATCAAACAAAGAAAACACATTTGTCCGAGTTTCGTTCGAGAGCTGCGCCTTCAAGAA
ATCGCAAGAGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAGTATCT
CTATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGTAGAGGGAGAGATGTCTGATCAT
CTGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACTTGAATTCAGACAGAGGAGGA
TCCATTGAATCTTCTGGAGAAAGTTCAAGAACTCAAGGCACCACAATCATTTCTTCTACG
ACTACTACTTTTACTAAATCTAAGGATGATAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTC
GAAGACGAAGAGGAACCGCTTATCCAATCAGCTGAATGCCGTATATGCCAAGATGAGGAT
TCTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGG
AAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAG
TCTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCGAT
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4EB52TF 615 0 0
G
GGATCAAACAAAGAAAACACATTTGTCCGAGTTTCGTTCGAGAGCTGCGCCTTCAAGAAA
TCGCAAGAGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAGTATCTC
TATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGTAGAGGGAGAGATGTCTGATCATC
TGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACTTGAATTCAGACAGAGGAGGAT
CCATTGAATCTTCTGGAGAAAGTTCAAGAACTCAAGGCACCACAATCATTTCTTCTACGA
CTACTACTTTTACTAAATCTAAGGATGATAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTCG
AAGACGAAGAGGAACCGCTTATCCAATCAGCTGAATGCCGTATATGCCAAGATGAGGATT
CTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGGA
AGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAGT
CTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCGATA
TCGGTGAAGATTGG

QA 2 615 2 615
DS 

RD RR4G150TF 743 0 0
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TCGCAAGGGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAGTATCTC
TATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGTAGAGGGAGAGATGTCTGATCATC
TGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACCTGAATTCAGACAGAGGAGGAT
CCATTGAATCTTCTGGAGAAAGTTCAAGAACTCAAGGCACCACAATCATTTCTTCTACGA
CTACTACTTTTACTAAATCTAAGGATGATAAAACTGTGCAGGTAGAAGAACTTGATGTCG
AAGACGAAGAGGAACCGCTTATCCAATCAGCTGAATGCCGTATATGCCAAGATGAGGATT
CTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGGA
AGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAGT
CTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCGATA
TCGGTGAAGATTGGGCCAATGGTGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCGCGCATTTTT*
GCAATGGCGGCTGCAGAACGCCGTTTCTTCGATCCGGACTACGACGAGTATGCTGATTCT
AACTCTAGCGGTGCTGC
TTTCCT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FF42TF 737 0 0
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TATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGTAGAGGGAGAGATGTCTGATCATC
TGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACCTGAATTCAGACAGAGGAGGAT
CCATTTAATCTTCTGGAGAAAGTTCAAGAACTCAAGGCACCACAATCATTTCTTCTACGA
CTACTACTTTTACTAAATCTAAGGATGATAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTCG
AAGACGAAGAGGAACCGCTTATCCAATCAGCTGAATGCCGTATATGCCAAGATGAGGATT
CTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGGA
AGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAGT
CTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTTCCGCTGATGAAACTGTTATCGATA
TCGGTGAAGATTGGGCCAATGGTGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCGCGCATTTTT*
GCAATGGCGGCTGCAGAACGCCGTTTCTTCGATCCGGACTACGACGAGTATGCTGATTCT
AACTCTAGCGGTGCTGC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AE66TF 822 0 0
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TCGCAAGAGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAGTATCTC
TATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGTAGAGGGAGAGATGTCTGATCATC
CGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACCTGAATTCAGACAGAGGAGGAT
CCATTGAATCTTCTGGAGAAAGTTCAAGAACTCAAGGCACCACAATCATTTCTTCTACGA
CTACTACTTTTACTAAATC*AAGGATGATAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTCG
AAGACGAAGAGGAACCGCTTATCCAATCAGCTGAATGCCGTATATGCCAAGATGAGGATT
CTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGGA
AGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAGT
CTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCGATA
TCGGTGAAGATTGGGCCAATGGTGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCGCGCATTTTTT
GCAATGGCGGCTGCAGAACGCCGTTTTTTCGATCCGGACTACGAC*ACAACGGGG***CT
GGCGGTGGAGGA*CAGCGCAGAGGAGGATTGCATTTCGCTGTAGCACCCGAGCTGTTTGT
TGTTTATGGGTTTATTCCTATGAGCAAAA*CACAGAAACTGA

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AE66JQ 647 0 0
CGACTACTACTTTTACTAAATC*AAGGATGATAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATG
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ATTCTGTTAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATC
GGAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACA
AGTCTTATCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCG
ATATCGGTGAAGATTGGGCCAATGGTGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCGCGCATTT
TT*GCAATGGCGGCTGCAGAACGCCGTTTTTTCGATCCGGACTACGAC*ACAACGGGG**
*CTGGCGGTGGAGGA*CAGCGCAGAGGAGGATTGCATTTCGCTGTAGCACCCGAGCTGTT
TGTTGTTTATGGGTTTATTCCTATGAGCAAAAACACAGAAACTGAGTAAAACAAAATACG
GGAAGTCTCTCTGTCTTATGTTCTTACAGACGAGAAAATAAAGCTTCTTGATATGCTTAT
GTATATATACTTAATACTTGAGAAATTACCAACGATCTTAAGAAGAT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 2 10

CO CL481Contig1 1253 8 12 U
AAATTCGACTTGATAGAGGTTTTAAACCCAATATAGTTCTACAAGTTTGAAAATACATGG
AAGCAGTCTCGAGAATATCTGATAAACTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAA
AGAAAACAATAACCATAAAACATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTG
AGTTCTCGTTCTGCTGCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGC
TTCTTTTGCAGTTAACCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAAT
CGCCTCAGGTGAGACCAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCT
GCTATGTCTCCCAACAAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAG
ATATGCATTCAGTTCATCGGTTCCAAGGACCTTTGCAATTTTGACGAGCTGATCTTGGTT
ATCATGGCCATAAAAGAAAGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAG
GCTCCACATGTCCAAGGAATAGTCATAGTCCTGTAAATCCACTAGAAGTTCCGGTCCCTT
GAAGTACCTTGAGGCCACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAG
ACCCCAATCAATTAAGCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTT
GACATCTCTGTGCATTATACCTTGCGAGTGGCAGTAGTCCAACGCCTTCAAGAGCTCATA
GATGTAGTAACGGATGTCATAATCAGTCAATGTTGGATACAGAACCTTGAAGTCAGTGCT
GTTAACATACTCAAATATCAAGCTTGGTGTTTTTGAGTGTTGGTCTCTCACAACATCAAA
CAGCTTGACAATATTTGGCCCTCCACACAGATTCTGAAGAATTTTTATCTCTCTTCTTAT
CTTCTTCTTCTTGACAGGCTTGAGAATCTTGATAACGCACTTCTCGTTGTTGTTCACGTT
AATCCCCTCAAACACCTCACTGTATTTGCCTCTCCCCACCTTCATGACAACCTCGTAATC
ATCTTGCTCCCCCCACTGAACGTTGAGAGACTCGTAATCCCAATACTCCTTGGGTCGGAT
CACGTTGACGTCGGTGTAAACAAGAGCTTTCGACATCCCTCTCCGCACGGTGGTGGAAGG
TGGAGAGAGAGAGAGAGAGATCTCGTCGAGAAAATTAAGAACCGTTCGAAGCC


BQ
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GS07JQ U 1
AF RR4ET86JQ U 1
AF RR4AC17TF C 2
AF RR4B685JQ U 15
AF RR4BN45JQ U 1
AF RR4C741JQ U 1
AF RR4B685TF C 511
AF RR4GS07TF C 613
BS 1 529 RR4BN45JQ
BS 530 530 RR4ET86JQ
BS 531 735 RR4BN45JQ
BS 736 736 RR4ET86JQ
BS 737 770 RR4BN45JQ
BS 771 771 RR4B685TF
BS 772 810 RR4BN45JQ
BS 811 1063 RR4B685TF
BS 1064 1064 RR4GS07TF
BS 1065 1106 RR4B685TF
BS 1107 1110 RR4GS07TF
BS 1111 1253 RR4B685TF

RD RR4GS07JQ 544 0 0
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AAGCAGTCTCGAGAATATCTGATAAACTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAA
AGAAAACAATAACCATAA**CATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTG
AGTTCTCGTTCTGCTGCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGC
TTCTTTTGCAGTTAACCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAAT
CGCCTCAGGTGAGACCAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCT
GCTATGTCTCCCAACAAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAG
ATATGCATTCAGTTCATCGGTTCCAAGGACCTTTGCAATTTTGACGAGCTGATCTTGGTT
GTCATGGCCATAAAAGAAAGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAG
GCTC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4ET86JQ 761 0 0
AAATTCGACTTGATAGAGGTTTTAAACCCAATATAGTTCTACAAGTTTGAAAATACATGG
AAGCAGTCTCGAGAATATCTGATAAACTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAA
AGAAAACAATAACCATAAAACATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTG
AGTTCTCGTTCTGCTGCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGC
TTCTTTTGCAGTTAACCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAAT
CGCCTCAGGTGAGACCAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCT
GCTATGTCTCCCAACAAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAG
ATATGCATTCAGTTCATCGGTTCCAAGGACCTTTGCAATTTTGACGAGCTGATCTTGGTT
ATCATGGCCATAAAAGAAAGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAG
GCTCCACATGTCCAAGGAATAGTCATAGTCCTGTAAATCCACTAGAAGTTCCGGTCCCTT
GAAGTACCTTGAGGCCACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAG
ACCCCAATCAATTAAGCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCACGACATTGTGTGGCTT
GACATCTCTGTGCATTATACCTTGCGAGTGGCAGTAGTCCA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4AC17TF 746 0 0
AATTCGACTTGATAGAGGTTTTAAACCCAATATAGTTCTACAAGTTTGAAAATACATGGA
AGCAGTCTCGAGAATATCTGATAA*CTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAAA
GAAAACAATAACCATAAAACATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTGA
GTTCTCGTTCTGCTGCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGCT
TCTTTTGCAGTTAACCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAATC
GCCTCAGGTGAGACCAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCTG
CTATGTCTCCCAACAAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAGA
TATGCATTCAGTTCATCGGTTCCAAGGACCTTTGCAATTTTGACGAGCTGATCTTGGTTA
TCATGGCCATAAAAGAAAGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAGG
CTCCACATGTCCAAGGAATAGTCATAGTCCTGTAAATCCACTAGAAGTTCCGGTCCCTTG
AAGTACCTTGAGGCCACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAGA
CCCCAATCAATTAAGCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTTG
ACATCTCTGTGCATTATACCTTGCG
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4B685JQ 754 0 0
G
GAGGTTTTAAACCCAATATAGTTCTACAAGTTTGAAAATACATGAAAGTAGTCTCGAGAA
TATCTGATAAACTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAAAGAAAACAATAACCA
TAA**CATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTGAGTTCTCGTTCTGCT
GCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGCTTCTTTTGCAGTTAA
CCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAATCGCCTCAGGTGAGAC
CAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCTGCTATGTCTCCCAAC
AAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAGATATGCATTCAGTTC
ATCGGTTCCAAGGACCTTTGCGATTTTGACGAGCTGATCTTGGTTGTCATGGCCATAAAA
GAAAGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAGGCTCCACATGTCCAA
GGAATAGTCATAGTCCTGTAAATCCACTAGAAGTTCCGGTCCCTTGAAGTACCTTGAGGC
CACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAGACCCCAATCAATTAA
GCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTTGACATCTCTGTGCAT
TATACCTTGCGAGTGGCAGTAGTCCAACGCCTT

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR4BN45JQ 811 0 0
AAATTCGACTTGATAGAGGTTTTAAACCCAATATAGTTCTACAAGTTTGAAAATACATGG
AAGCAGTCTCGAGAATATCTGATAAACTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAA
AGAAAACAATAACCATAAAACATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTG
AGTTCTCGTTCTGCTGCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGC
TTCTTTTGCAGTTAACCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAAT
CGCCTCAGGTGAGACCAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCT
GCTATGTCTCCCAACAAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAG
ATATGCATTCAGTTCATCGGTTCCAAGGACCTTTGCAATTTTGACGAGCTGATCTTGGTT
ATCATGGCCATAAAAGAAAGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACGTGCAACCGAG
GCTCCACATGTCCAAGGAATAGTCATAGTCCTGTAAATCCACTAGAAGTTCCGGTCCCTT
GAAGTACCTTGAGGCCACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAG
ACCCCAATCAATTAAGCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTT
GACATCTCTGTGCAT*ATACCTTGCGAGTGGCAGTAGTCCAACGCCTTCA*GAGCTCATA
GATGTAGTAACGGATGTCATAATCAGTCAA
A

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4C741JQ 808 0 0
AAATTCGACTTGATAGAGGTTTTAAACCCAATATAGTTCTACAAGTTTGAAAATACATGA
AAGCAGTCTCGAGAATATCTGATAAACTTTTAGGATTAGGCAGTGACATCACTTCTTTAA
AGAAAACAATAACCATAA**CATCACGTCACTTTGACATACTCAGAGAACATCTCTACTG
AGTTCTCGTTCTGCTGCTTTCTGCTGCCCTGACTTGCGCGAAATAAGGGTGAGCCATTGC
TTCTTTTGCAGTTAACCTGTCTTGATGATCATACCGCAGTAGCTTGTCGAGGTAATCAAT
CGCCTCAGGTGAGACCAAATGGCGATTGTCAGCATTGATGAACTTGGACCAAGGCTTCCT
GCTATGTCTCCCAACAAGTGCCTCTAGTTGGGCATCAAGTTCTAACTGATACTTATTCAG
ATATGCATTCAGTTCATCGGTTCCAAGGACCTTTGCAATTTTGACGAGCTGATCTTGGTT
GTCATGGCCATAAAAGAAGGGTTCCTTGCGGAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAG
GCTCCACATGTCCAAGGAATAGTCATAGTCCTGTAAATCCACTAAAAGTTCCGGTCCCTT
GAAGTACCTTGAGGCCACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAG
ACCCCAATCAATTAAGCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTT
GACATCTCTGTGCAT*ATACCTTGCGAGTGGCAGTAGTCCAACGCCTTCA*GAGCTCATA
GATGTAGTAACGGATGTCATAATCAGTC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4B685TF 743 0 0
GAATATCATCCCAGCAAACATGCAACCGAGGCTCCACATGTCCAAGGAATAGTCATAGTC
CTGTAAATCCACTAGAAGTTCCGGTCCCTTGAAGTACCTTGAGGCCACACGGACGTTATA
CTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAGACCCCAATCAATTAAGCGAAGTTTGCGGAG
CTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTTGACATCTCTGTGCATTATACCTTGCGAGTG
GCAGTAGTCCAACGCCTTCAAGAGCTCATAGATGTAGTAACGGATGTCATAATCAGTCAA
TGTTGGATACAGAACCTTGAAGTCAGTGCTGTTAACATACTCAAATATCAAGCTTGGTGT
TTTTGAGTGTTGGTCTCTCACAACATCAAACAGCTTGACAATATTTGGCCCTCCACACAG
ATTCTGAAGAATTTTTATCTCTCTTCTTATCTTCTTCTTCTTGACAGGCTTGAGAATCTT
GATAACGCACTTCTCGTTGTTGTTCACGTTAATCCCCTCAAACACCTCACTGTATTTGCC
TCTCCCCACCTTCCTGACAACCTCGTAATCATCTTGCTCCCCCCACTGAACGTTGA****
CTCGTAATCCCAATACTCCTTGGGTCGGATCACGTTGACGTCGGTGTAAACAAGAGCTTT
CGACATCCCTCTCCGCACGGTGGTGGAAGGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGATCTCGTCGAG
AAAATTAAGAACCGTTCGAAGCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4GS07TF 641 0 0
GGCCACACGGACGTTATACTCTTTTCCAGGATGATAAAACTCAGCGAGACCCCAATCAAT
TAAGCGAAGTTTGCGGAGCTCATGGTCAATCATGACATTGTGTGGCTTGACATCTCTGTG
CATTATACCTTGCGAGTGGCAGTAGTCCAACGCCTTCAAGAGCTCATAGATGTAGTAACG
GATGTCATAATCAGTCAATGTTGGATACAGAACCTTGAAGTCAGTGCTGTTAACATACTC
AAATATCAAGCTTGGTGTTTTTGAGTGTTGGTCTCTCACAACATCAAACAGCTTGACAAT
ATTTGGCCCTCCACACAGATTCTGAAGAATTTTTATCTCTCTTCTTATCTTCTTCTTCTT
GACAGGCTTGAGAATCTTGATAACGCACTTCTCGTTGTTGTTCACGTTAATCCCCTCAAA
CACCTCACTGTATTTGCCTCTCCCCACCTTCATGACAACCTCGTAATCATCTTGCTCCCC
CCACTGAACGTTGAGAGACTCGTAATCCCAATACTCCTTGGGTCGGATCACGTTGACGTC
GGTGTAAACACGAGCTTTCGACATCCCTCTCCGCACGGTGGTGGAAGGTGGAGAGAGAGA
GAGAGAGATCTCGTCGAGAAAATTAAGAACCGTTCGAAGCC

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL481Contig2 619 2 13 U
GGGACGAGATCTCTCTCTCTCTCTCCACCTTCCACCACCGTGCGGAGAGGGATGTCGAAA
GCTTGTGTTTACACCGACGTCAACGTGATCCGACCCAAGGAGTATTGGGATTACGAATCT
CTCAACGTTCAGTGGGGGGAGCAAGATGATTACGAGGTTGTCAGGAAGGTGGGGAGAGGC
AAATACAGTGAGGTGTTTGAGGGGATTAACGTTAACAACAACGAGAAGTGCGTTATCAAG
ATTCTCAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAGATTAAGATACTTCAGAATCTG
TGTGGAGGGCCAAATATTGTCAAGCTGTTTGATGTTGTGAGAGACCAACACTCAAAAACC
CCAAGCTTTGATATTTGAGTATGTTTAACAGCACTGACTTCAAGGTTCTGTATCCGACTT
TTGACTGATTATGACATCCCGTTACTACATCTATGAGCTCTTGAAGGCGTTGGACTACTG
CCACTCGCAAGGTATAATGCACAGAGATGTCAAGCCACACAATGTCATGATTGACCATGA
GCTCCGCAAACTTCGCTTAATTGATTGGGGTCTCGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGA
GTATAACGTCCGTGTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN45TF U 314
AF RR4ET86TF U 1
BS 1 368 RR4ET86TF
BS 369 369 RR4BN45TF
BS 370 385 RR4ET86TF
BS 386 386 RR4BN45TF
BS 387 421 RR4ET86TF
BS 422 422 RR4BN45TF
BS 423 439 RR4ET86TF
BS 440 440 RR4BN45TF
BS 441 448 RR4ET86TF
BS 449 449 RR4BN45TF
BS 450 526 RR4ET86TF
BS 527 527 RR4BN45TF
BS 528 619 RR4ET86TF

RD RR4BN45TF 251 0 0
ATATTGTCAAGCTGTTTGATGTTGTGAGAGACCAACACTCAAAAACCCCAAGCTTTGATA
TTTGAGTATGTTTAACAGCACTGACTTCAAGGTTCTGTATCCGACTTTTGACTGATTATG
ACATCCCGTTACTACATCTATGAGCTCTTGAAGGCGTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGT
ATAATGCACAGAGATGTCAAGCCACACAATGTCATGATTGACCATGAGCTCCGCAAACTT
CGCTTAATTGA

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR4ET86TF 619 0 0
GGGACGAGATCTCTCTCTCTCTCTCCACCTTCCACCACCGTGCGGAGAGGGATGTCGAAA
GCTTGTGTTTACACCGACGTCAACGTGATCCGACCCAAGGAGTATTGGGATTACGAATCT
CTCAACGTTCAGTGGGGGGAGCAAGATGATTACGAGGTTGTCAGGAAGGTGGGGAGAGGC
AAATACAGTGAGGTGTTTGAGGGGATTAACGTTAACAACAACGAGAAGTGCGTTATCAAG
ATTCTCAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAGATTAAGATACTTCAGAATCTG
TGTGGAGGGCCAAATATTGTCAAGCTGTTTGATGTTGTGAGAGACCAACACTCAAAAACC
CCAAGCTT*GATATTTGAGTATGTT*AACAGCACTGACTTCAAGGTTCTGTATCCGACTT
T*GACTGATTATGACATCC*GTTACTACGTCTATGAGCTCTTGAAGGCGTTGGACTACTG
CCACTCGCAAGGTATAATGCACAGAGATGTCAAGCCACACAATGTCGTGATTGACCATGA
GCTCCGCAAACTTCGCTTAATTGATTGGGGTCTCGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGA
GTATAACGTCCGTGTGGCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 2 9

CO CL482Contig1 895 3 23 U
GGCACAGAGGAGGAAGATATTTCTAGGAACGTAGAAAATAAATGTGTTACGGCAGAAGCA
GGAAACAAAGTTAACAAGAGTTTGCTGTACAAAGAGGGAACACTTGAAGAAGTGAAAACA
GACTTAAACAAAGTTACTCTCGATTCCCAAAGGCATTCTTGTACCCCAAGAAACACAACA
TATTTTTTTTCCGATGAAAGATGAAGTAGTAAAAGCGGCAAAAGGAGATGGGAAATATGG
GGATTTTACCAGATCGTCGCCTAACACCCATGCCAGTTACACCTTCAACAATTCCTTCTC
TTTCTGTTTGCAGAGCTCCTCTACCTTCTTCATGTATGTGTCAATTAGTTTCTGCAAATC
GCTTGACAAATCCTTCACGTTGTCTTCTGACAGCTTCTTCTCCTTCTCGAGTTTATCATA
AGATTTCAAGGCATCCCTCCTTATGTTTCTCAGTGCAACCTTCCCTTCTTCAGTCTGTTT
GGCTACAACCTTTGTTAGTTCCTTTCTTCGCTCAGAAGTGAGGGGAGGCAAGGACAAGCG
AATGACATCACCATCGTTATTAGGAGTGACACCAAGATCAGAACTGACAATGGCCTTTTC
TATAGCCTTCAAGCTAGATTTGTCATAAGGCTGGAGCAAAAGAGAAGTGCCATCGGGGGT
ACTGATTTGGGCAATGCTTTTCAGACTTACAGGACTTCCATAGTATTCAACCTCAATCTT
GTCAAGCATAGCAACATTGGCTCTCCCGGTCCTTATGGAGTTGAAACTAGTCCTAAGCGT
TTCAATCGTACTCTCCATTTTTGATTTAACGTCTTTCTCAATAGCAGATTTCTCGGCTTC
AATCTCTTCAATAGTTGCAGATCTTATCACCACTCTCTTCTGTAGTGACCGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 0 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF55JQ U 25
AF RR4BM38JQ U 1
AF RR4AS74JQ U 23
BS 1 191 RR4BM38JQ
BS 192 192 RR4AS74JQ
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BS 218 218 RR4AS74JQ
BS 219 241 RR4BM38JQ
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BS 453 784 RR4BM38JQ
BS 785 785 RR4AS74JQ
BS 786 789 RR4BM38JQ
BS 790 790 RR4AS74JQ
BS 791 801 RR4BM38JQ
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BS 803 820 RR4BM38JQ
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BS 842 842 RR4AS74JQ
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BS 872 872 RR4AS74JQ
BS 873 895 RR4BM38JQ

RD RR4DF55JQ 600 0 0
G
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GTAGTAAAAGCGGCAAAAGGAGATGGGAAATATGGGGATTTTACCAGATCGTCGCCTAAC
ACCCATGCCAGTTACACCTTCAACAATTCCTTCTCTTTCTGTTTGCAGAGCTCCTCTACC
TTCTTCATGTATGTGTCAATTAGTTTCTGCAAATCGCTTGACAAATCCTTCACGTTGTCT
TCTGACAGCTTCTTCTCCTTCTCGAGTTTATCATAAGATTTCAAGGCATCCCTCCTTATG
TTTCTCAGTGCAACCTTCCCTTCTTCAGTCTGTTTGGCTACAACCTTTGTTAGTTCCTTT
CTTCGCTCAGAAGTGAGGGGAGGCAAGGACAAGCGAATGACATCACTATAGTTATTAGGA
GTGACACCAAGATCAGAACTGACAATGGCCTTTTCTATAGCCTTCAAGCTAGATTTGTC

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR4BM38JQ 895 0 0
GGCACAGAGGAGGAAGATATTTCTAGGAACGTAGAAAATAAATGTGTTACGGCAGAAGCA
GGAAACAAAGTTAACAAGAGTTTGCTGTACAAAGAGGGAACACTTGAAGAAGTGAAAACA
GACTTAAACAAAGTTACTCTCGATTCCCAAAGGCATTCTTGTACCCCAAGAAACACAACA
TATTTTTTTTC*GATGAAAGATGAAGTAGTAAAAGCGACAAAAGGAGATGGGAAATATGG
GAATTTTACCAGATCGTCGCCTAACACCCATGCCAGTTACACCTTCAACAATTCCTTCTC
TTTCTGTTTGCAGAGCTCCTCTACCTTCTTCATGTATGTGTCAATTAGTTTCTGCAAATC
GCTTGACAAATCCTTCACGTTGTCTTCTGACAGCTTCTTCTCCTTCTCGAGTTTATCATA
AGATTTCAAGGCATCCCTCCTTATGTTTCTCGGTGCAACCTTCCCTTCTTCAGTCTGTTT
GGCTACAACCTTTGTTAGTTCCTTTCTTCGCTCAGAAGTGAGGGGAGGCAAGGACAAGCG
AATGACATCACCATCGTTATTAGGAGTGACACCAAGATCAGAACTGACAATGGCCTTTTC
TATAGCCTTCAAGCTAGATTTGTCATAAGGCTGGAGCAAAAGAGAAGTGCCATCGGGGGT
ACTGATTTGGGCAATGCTTTTCAGACTTACAGGACTTCCATAGTATTCAACCTCAATCTT
GTCAAGCATAGCAACATTGGCTCTCCCGGTCCTTATGGAGTTGAAACTAGTCCTAAGCGT
TTCA*TCGTCCTCTCCATTTT*GATTTAACGTCTTTCTCA*TAGCAGATTTCTCGGCTTC
ATTCTC****ATAGTTGCAGATCTTATCACC*CTCTCTTCTGTAGTGACCGCTTG

QA 1 895 1 895
DS 

RD RR4AS74JQ 860 0 0
CTA
GGAACGTAGAAAATAAATGTGTTACGGCAGAAGCAGGAAACAAAGTTAACAAGAGTTTGC
TGTACAAAGAGGGAACACTTGAAGAAGTGAAAACAGACTTAAACAAAGTTACTCTCGATT
CCCAAAGGCATTCTTGTACCCCAAGAAACACAACATATTTTTTTTCCGATGAAAGATGAA
GTAGTAAAAGCGGCAAAAGGAGATGGGAAATATGGGGATTTTACCAGATCGTCGCCTAAC
ACCCATGCCAGTTACACCTTCAACAATTCCTTCTCTTTCTGTTTGCAGAGCTCCTCTACC
TTCTTCATGTATGTGTCAATTAGTTTCTGCAAATCGCTTGACAAATCCTTCACGTTGTCT
TCTGACAGCTTCTTCTCCTTATCGAGTTTATCATAAGATTTCAAGGCATCCCTCCTTATG
TTTCTCAGTGCAACCTTCCCTTCTTCAGTCTGTTTGGCTACAACCTTTGTTAGTTCCTTT
CTTCGCTCAGAAGTGAGGGGAGGCAAGGACAAGCGAATGACATCACCATCGTTATTAGGA
GTGACACCAAGATCAGAACTGACAATGGCCTTTTCTATAGCCTTCAAGCTAGATTTGTCA
TAAGGCTGGAGCAAAAGAGAAGTGCCATCGGGGGTACTGATTTGGGCAATGCTTTTCAGA
CTTACAGGACTTCCATAGTATTCAACCTCAATCTTGTCAAGCATAGCAACATTGGCTCTC
CCGGTCCTTATGGAGTTGAAACTAGTCCTAAGCGTTTCAATCGTACTCTCCATTTTTGAT
TTAACGTCTTTCTCAATAGCAGATTTCTCGGCTTCAATTTCTTCAATAGTTGCAGATCTT
ATCACCACTCTCTTCTG

QA 4 860 4 860
DS 



CO CL482Contig2 768 6 16 U
GGATGTGCTCATCAAGGAGCCGAAGCGCTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTTTC
GAAGTCGAGTCTCTCACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCAATGCTCAGACCAC
ACCGATTCTTCGATTCAGAGCCAGTGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTG
TTTGAGGGTCATGGCTTCGAACAATGCTTCATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAG
GAGCGACAATCCTTGGCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAA
GCGGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGA
GAAATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAGGACGATTGAAACGCTTAG
GACTAGTTTCAACTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGA
GGTTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGA
TGGCACTTCTCTTTTGCTCCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAAAAGGC
CATTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGATGGTGATGTCATTCGCTTGTC
CTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAGGTTGTAGCCAAACAGAC
TGAAGAAGGGAAGTTGCACTGAGAAACATAAGGAGGGATGTCTTGAAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF55TF U 1
AF RR4BM38TF U 44
AF RR4AS74TF U 3
AF RR4F814TF U 20
AF RR4D206TF U 1
AF RR4BK08TF U 93
BS 1 63 RR4D206TF
BS 64 64 RR4DF55TF
BS 65 81 RR4D206TF
BS 82 82 RR4DF55TF
BS 83 139 RR4D206TF
BS 140 140 RR4DF55TF
BS 141 409 RR4D206TF
BS 410 410 RR4DF55TF
BS 411 431 RR4D206TF
BS 432 432 RR4DF55TF
BS 433 703 RR4D206TF
BS 704 704 RR4AS74TF
BS 705 714 RR4D206TF
BS 715 715 RR4BK08TF
BS 716 729 RR4D206TF
BS 730 768 RR4BK08TF

RD RR4DF55TF 582 0 0
GG
ATGTGCTCATCAAGGAGCCGAAGCGCTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTTTCGA
AGTCGAGTCTCTCACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCAATGCTCAGACCACAC
CGAT*CTTCGATTCAGAGCCAGTGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTT
TGAGGGTCATGGCTTCGAACAATGCTTCATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGA
GCGACAATCCTTGGCTGGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAAGC
GGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGA
AATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAGGACGATTGAAACGCTTAGGA
CTAGTTTCAACTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGG
TTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATG
GCACTTCTCTTTTGCTCCAGCCTTATGACAAATCTAGCTT

QA 3 582 3 582
DS 

RD RR4BM38TF 660 0 0
GG
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TCCCCCAGATTCGTGTTTGAGGGTCATGGCTTCGAACAATGCTTCATCTGCACGCGCAAT
TGCGTGTTCTTTAAGGAGCGACAATCCTTGGCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGG
TGGCCCCGTTGTCAAGCGGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGA
AGAAATTGAAGCCGAGAAATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAGGAC
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GCTTGACAAGATTGAGGTTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCA
AATCAGTACCCCCGATGGCACTTCTCTTTTGCTCCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAA
GGCTATAGAAAAGGCCATTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGATGGTGA
TGTCATTCGCTTGTCCTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAG

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4AS74TF 707 0 0
ATGTGCTCATCAAGGAGCCGAAGCGCTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTTTCGA
AGTCGAGTCTCTCACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCAATGCTCAGACCACAC
CGATTCTTCGATTCAGAGCCAGTGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTT
TGAGGGTCATGGCTTCGAACAATGCTTCATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGA
GCGACAATCCTTGGCTGGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAAGC
GGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGA
AATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAGTACGATTGAAACGCTTAGGA
CTAGTTTCAACTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGG
TTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATG
GCACTTCTCTTTTGCTCCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAAAAGGCCA
TTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGATGGTGATGTCATTCGCTTGTCCT
TGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAGGTTGTA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4F814TF 679 0 0
GG
GAAGCGCTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTTTCGAAGTCGAGTCTCTCACAGAC
AGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCAATGCTCAGACCACACCGATTCTTCGATTCAGAGC
CAGTGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTTTGAGGGTCATGGCTTCGAA
CAATGCTTCATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGAGCGACAATCCTTGGCTCGG
TGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAAGCGGTCACTACAGAAGAGAGT
GGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGAAATCTGCTATTGAGAAAGA
CGTTAAATCAAAAATGGAGAGGACGATTGAAACGCTTAGGACTAGTTTCAACTCCATAAG
GACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGGTTGAATACTATGGAAGTCC
TGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATGGCACTTCTCTTTTGCTCCA
GCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAAAAGGCCATTGTCAGTTCTGATCTTGG
TGTCACTCCTAATAACGATGGTGATGTCATTCGCTTGTCCTTGCCTCCCCTCACTTCTGA
GCGAAGAAAGGA
CTAAC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR4D206TF 734 0 0
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GAACTCGAGTCTCTCACAGACTGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCAATGCTCAGACCAC
ACCGATTCTTCGATTCAGAACCAGTGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTG
TTTGAGGGTCATGGCTTCGAACAATGCTTCATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAG
GAGCGACAATCCTTGGCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAA
GCGGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGA
GAAATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAGGACGATTAAAACGCTTAG
GACTAGTTTCAGCTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGA
GGTTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGA
TGGCACTTCTCTTTTGCTCCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAAAAGGC
CATTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGATGGTGATGTCATTCGCTTGTC
CTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAG*TTGTAGCCAA*CAGAC
TGAAGAAGG
AAGTT

QA 1 729 1 729
DS 

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CTTCACTCTCTTCCAATGCTCAGACCACACCGATTCTTCGATTCAGAGCCAGTGATTCCA
AGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTTTGAGGGTCATGGCTTCGAACAATGCTTCAT
CTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGAGCGACAATCCTTGGCTGGGTGCGGGAGTTA
AGCTCTCTGGTGGTGTCCCCGTTGTCAAGCGGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGAT
CTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGAAATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAA
AAATGGAGAGGACGATTGAAACGCTTAGGACTAGTTTCAACTCCATAAGGACCGGGAGAG
TCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGGTTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGA
TAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATGGCACTTCTCTTTTGCTCCAGCCTTATGACA
AATCTAGCTTGAAGGCTATAGAAAAGGCCATTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTA
ATAACGATGGTGATGTCATTCGCTTGTCCTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGG
AACTAACAAAGGTTGTAGCCAAACAGACTGAAGAAGGGAAGTTGCACTGAGAAACATAAG
GAGGGATGTCTTGAAA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 10

CO CL483Contig1 1351 10 44 U
GGGGGGACCACCCTCTAAGCCTAAGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTG
AGGGAAAGGTGAAAAGCACCCTATGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCG
AACAATCAGTCGAAGGAGTAGTCAAGCGCACTCACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATGAT
GGGCCAGCGAGGAAATGGGAAGAGCGGCTTAAGCCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGG
TGGAATCTTCTAGTTCTTCCTATTTGACCCGAAACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTT
GAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGAACCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGAT
GACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACCAAGATCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAAT
CTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCCGAGGTAGAGCACTCAATGGGCTAGGGT
GGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAGGGAAACTCCGAATACAGGCCGTTCTCGTTTGTA
CAGACAGACTTTTGGGGTGCTAAGATCCAAAGTCGAGAGGGAAACAGCCCAGATCGTACG
CTAAGGTCCCTAAGCAATCACTTAGTGGAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGA
GGTGGGCTTGGAAGCAGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAGCTCACTGGTCTAGCTCCA
TGGCACCGAAAATGTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGCGACGAGACCTTGCAAAGC
TGCTTTTCAAGTGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAGGTTTTTGGTGACAAG
ACCTGGAGATATCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACGAAAAATCCTGTGAAAAACA
AGATCGCCTGCCAGTGGAAGGCTTTCTGCGTTCAGTCAATCTACGCAGAGTGAATCGGTC
CCTAAGGAAACCCCGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGTACACGAAAGTGACGAAGTTGCTT
TGACTACAAAACCATCCCTCTCTCTTGGAGCGAATTGGATGATCGGGACGACTCTCCTTT
TAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTAATATGAACCTTGAGTCATCAAAG
CCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTACTGGCGCTTCAAAAGGCCAAAGT
CTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTTTAGTCTTTTGATTAGAGTAGGGGTC
GCGAGAGAGCAGAGCGTACCGACCTGCCATAGTCACGAGTCTGTTTATAGTCGCGACTCT
TGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAACTTCCAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 10 40 10 10 10 40 40 10 10 10 10 40 40 40 
10 10 40 40 10 10 40 10 10 10 40 10 40 10 40 10 40 10 40 10 40 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4C175TF U 1
AF RR4C176TF U 1
AF RR4F429TF U 254
AF RR4F429JQ C 268
AF RR4B640JQ C 642
AF RR4B640TF U 642
AF RR4C176JQ C 614
AF RR4C175JQ C 766
AF RR4ER30JQ C 937
AF RR4ER30TF U 937
BS 1 339 RR4C175TF
BS 340 340 RR4F429TF
BS 341 551 RR4C175TF
BS 552 552 RR4F429TF
BS 553 605 RR4C175TF
BS 606 606 RR4F429TF
BS 607 625 RR4C175TF
BS 626 703 RR4F429TF
BS 704 704 RR4B640TF
BS 705 757 RR4F429TF
BS 758 758 RR4B640TF
BS 759 824 RR4F429TF
BS 825 825 RR4B640TF
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BS 1196 1196 RR4ER30TF
BS 1197 1243 RR4B640TF
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BS 1282 1351 RR4ER30TF

RD RR4C175TF 625 0 0
GGGGGGACCACCCTCTAAGCCTAAGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTG
AGGGAAAGGTGAAAAGCACCCTATGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCG
AACAATCAGTCGAAGGAGTAGTCAAGCGCACTCACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATGAT
GGGCCAGCGAGGAAATGGGAAGAGCGGCTTAAGCCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGG
TGGAATCTTCTAGTTCTTCCTATTTGACCCGAAACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTT
GAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGAACCCACGCATGTGGCAAAATACGGGGAT
GACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACCAAGATCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAAT
CTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCCGAGGTAGAGCACTCAATGGGCTAGGGT
GGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAGGGAAACTCCGAATACAGGCCGTTCTCGTTTGTA
CAGACAGACTTCTGGGGTGCTAAGATCCAAAGTCGAGAGGGAAACAGCCCAGATCGTACG
CTAAG*TCCCTAAGCAATCACTTAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4C176TF 629 0 0
GGGGGGACCACCCTCTAAGCCTAAGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTG
AGGGAAAGGTGAAAAGCACCCTATGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCG
AACAATCAGTCGAAGGAGTAGTCAAGCGCACTCACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATGAT
GGGCCAGCGAGGAAATGGGAAGAGCGGCTTAAGCCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGG
TGGAATCTTCTAGTTCTTCCTATTTGACCCGAAACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTT
GAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGAACCCACGCATGTGGCAAAATACGGGGAT
GACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACCAAGATCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAAT
CTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCCGAGGTAGAGCACTCAATGGGCTAGGGT
GGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAGGGAAACTCCGAATACAGGCCGTTCTCGTTTGTA
CAGACAGACTTCTGGGGTGCTAAGATCCAAAGTCGAGAGGGAAACAGCCCAGATCGTACG
CTAAG*TCCCTAAGCAATCACTTAG
TGGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4F429TF 637 0 0
GG
CTTCCTATTTGACCCGAAACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAAC
AGGCCTTGGAGGACCGAACCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGG
GTGAAAGGCCAACCAAGATCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGC
GTATGATGTCGATGGCCCGAGGTAGAGCACTCAATGGGCTAGGGTGGCCCCATTTCGCCT
TACCAACCCCAGGGAAACTCCGAATACAGGCCGTTCTCGTTTGTACAGACAGACTTTTGG
GGTGCTAAGATCCAAAGTCGAGAGGGAAACAGCCCAGATCGTACGCTAAGGTCCCTAAGC
AATCACTTAGTGGAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGAGGTGGGCTTGGAAGC
AGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAGC*CACTGGTCTAGCTCCATGGCACCGAAAATGT
ATCAGGGCTCAAGTGATTCACCTAAGCGACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAGTGTC
AGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAAGTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATATCAG
AAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACGGAAAA
AAAA

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR4F429JQ 615 0 0
CCCGAAACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGG
ACCGAACCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAA
CCAAGATCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGA
TGGCCCGAGGTAGAGCACTCAATGGGCTAGGGTGGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAG
GGAAACTCCGAATACAGGCCGTTCTCGTTTGTACAGACAGACTTTTGGGGTGCTAAGATC
CAAAGTCGAGAGGGAAACAGCCCAGATCGTACGCTAAGGTCCCTAAGCAATCACTTAGTG
GAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGAGGTGGGCTTGGAAGCAGCCATCCTTTG
AAGAAAGCGTAATAGC*CACTGGTCTAGCTCCATGGCACCGAAAATGTATCAGGGCTCAA
GTGATTCACCTAAGCGACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAGTGTCAGTAGCGGAACG
TTCTGTCAATCGGAGAAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATATCAGAAGTGAGAATGC
TGACATGAGTAACG
G

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4B640JQ 641 0 0
G
GAGCGATGACAACCAGGAGGTGGGCTTGGAAGCAGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAG
CTCACTGGTCTAGCTCCATGGCACCGAAAATGTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGC
GACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAGTGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAG
AAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATATCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACGA
AAAATCCTGTGAAAAACAAGATCGCCTGCCAGTGGAAGGCTTTCTGCGTTCAGTCAATCT
ACGCAGAGTGAATCGGTCCCTAAGGAAACCCCGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGTACACG
AAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCTCTCTCTTGGAGCGAATTGGATGA
TCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTAATATG
AACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTACTGGC
GCTTCAAAAGGCCGAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTTTAGTCTT
TAGTCTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAA*CTTCCAGG

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR4B640TF 641 0 0
G
GAGCGATGACAACCAGGAGGTGGGCTTGGAAGCAGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAG
CTCACTGGTCTAGCTCCATGGCACCGAAAATGTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGC
GACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAGTGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAG
AAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATATCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACGA
AAAATCCTGTGAAAAACAAGATCGCCTGCCAGTGGAAGGCTTTCTGCGTTCAGTCAATCT
ACGCAGAGTGAATCGGTCCCTAAGGAAACCCCGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGTACACG
AAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCTCTCTCTTGGAGCGAATTGGATGA
TCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTAATATG
AACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTACTGGC
GCTTCAAAAGGCCGAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTTTAGTCTT
TAGTCTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAA*CTTCCAGG

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR4C176JQ 738 0 0
GCAATCACTTAGTGGAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGAGGTGGGCTTGGAA
GCAGTCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAGCTCACTGGTCTAGCTCCATGGCACCGAAAAT
GTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGCGACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAGTG
TCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATATC
AGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACGAAAAATCCTGTGAAAAACAAGATCGCCTGCCA
GTGGAAGGCTTTTTGCGTTCAGTCAATCTACGCAGAGTGAATCGGTCCCTAAGGAAACCC
CGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGTACACGAAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACC
ATCCCTCTCTCTTGGAGCGAATTGGATGATCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAG
GAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTAATATGAACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCG
GCCTGGCATGGTCGACCTACGCTACTGGCGCTTCAAAAGGCCAAAGTCTCGTCGTAGTTT
GGCGAACTTCAGTAGAGGCCTTTAGTCTTTTGATTAGAGTAGGGGTCGCGAGAGAGCAGA
GCGTACCGACCTGCCATAGTCACGAGTCTGTTTATAGTCGCGACTCTTGTCATAGTCAAG
AAGGTTGAAACTTCCAGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4C175JQ 586 0 0
GAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAGTGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAG
GTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATATCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACGAAAA
ATCCTGTGAAAAACAAGATCGCCTGCCAGTGGAAGGCTTTTTGCGTTCAGTCAATCTACG
CAGAGTGAATCGGTCCCTAAGGAAACCCCGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGTACACGAAA
GTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCTCTCTCTTGGAGCGAATTGGATGATCG
GGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTAATATGAAC
CTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCATGGTCGACCTACGCTACTGGCGCT
TCAAAAGGCCAAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGAGGCCTTTAGTCTTTTG
ATTAGAGTAGGGGTCGCGAGAGAGCAGAGCGTACCGACCTGCCATAGTCACGAGTCTGTT
TATAGTCGCGACTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAACTTCCAGG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4ER30JQ 415 0 0
G
AATCTACGCAGAGTGAATCGGTCCCTAAGGAAACCCCGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGT
ACACGAAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCCCTCTCTTGGAGCGAATTG
GATGATCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTA
ATATGAACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTA
CTGGCGCTTCAAAAGGCCAAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTCTA
GTCTTTTGATTAGAGTAGGGGTCGCGAGAGAGCAGAGCGTACCGACCTGCCATAGTCACG
AGTCTGTTTATAGTCGCGACTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAACTTCCAGG

QA 2 415 2 415
DS 

RD RR4ER30TF 415 0 0
G
AATCTACGCAGAGTGAATCGGTCCCTAAGGAAACCCCGAAAGGGCTGCCGTCCGATGGGT
ACACGAAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCCCTCTCTTGGAGCGAATTG
GATGATCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTA
ATATGAACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTA
CTGGCGCTTCAAAAGGCCAAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTCTA
GTCTTTTGATTAGAGTAGGGGTCGCGAGAGAGCAGAGCGTACCGACCTGCCATAGTCACG
AGTCTGTTTATAGTCGCGACTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAACTTCCAGG

QA 2 415 2 415
DS 



AS 2 10

CO CL484Contig1 822 4 6 U
GGGTTCTGAACATTGAAGATATCGATCGAATAGTATTCAGAGACACAACAACAGCTTTTG
TCTTTGCATCTATGGCGTCGATGCCGACGATCAAACTTGTTCTCCTAGTCTGCTACGTTT
ATCTTCTCTGTTTTGTATCATCATCGTCATCTGATCTTTCTGGAATATCTAAACCATCTT
CTTCGCAGAAAGTCTCGCTGGGACTGTACTACGAGTCTCTATGTCCATACTGTTCTTCCT
TCATAGTAAACCACCTCACGAAGCTCTTCGAAGACGATCTCATATCAATCGTGGACCTCC
ATCTGTCTCCCTGGGGCAACACCAAGCTCCGCTCCGATAATGCCACCGTCGTTTGCCAGC
ACGGTGCATATGAATGCTTCTTGGACACGGTAGAAGCTTGTGCGATTGATGTTTGGCCTG
AATTGAGCGATCATTTCCCGTTCATTTACTGTGTTGAGAGCTTGGTGATTGAACACAAGT
ACAAAAAGTGGGAGACTTGTTATGAGAAGCTCGATCTGAACTCAAAACATGTATCGGATT
GCCTCAGCAGTGGACATGGGAAAGAGCTTCAGTTGCAGTATGCTGCAGAAACTAGTGCAC
TTGAGCCGCCTCATAAATACGTTCCCTGGGTTGTCGTGGATGGTCAGCCACTTTATGAGG
ATTATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAA*GCTTACAAAGGTAACAAACTGCCTGGAG
CGTGTGCCAAATATTCTTCCATCCGTAGTGTCAAAGTGAATCGCTTCCCTCTGGTTTGCC
GGATGGAGTCTATACGATGTGGGATTTTTGGACGTATCAAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA76TF U 11
AF RR4EA01TF U 1
AF RR4AJ39TF U 1
AF RR4H666TF U 13
BS 1 38 RR4AJ39TF
BS 39 39 RR4GA76TF
BS 40 691 RR4AJ39TF
BS 692 692 RR4GA76TF
BS 693 783 RR4AJ39TF
BS 784 822 RR4H666TF

RD RR4GA76TF 688 0 0
GATT
GAAGATATCGATCGAATAGTATTCAGAGACACAACAACAGCTTTTGTCTTTGCATCTATG
GCGTCGATGCCGACGATCAAACTTGTTCTCCTAGTCTGCTACGTTTATCTTCTCTGTTTT
GTATCATCATCGTCATCTGATCTTTCTGGAATATCTAAACCATCTTCTTCGCAGAAAGTC
TCGCTGGGACTGTACTACGAGTCTCTATGTCCATACTGTTCTTCCTTCATAGTAAACCAC
CTCACGAAGCTCTTCGAAGACGATCTCATATCAATCGTGGACCTCCATCTGTCTCCCTGG
GGCAACACCAAGCTCCGCTCCGATAATGCCACCGTCGTTTGCCAGCACGGTGCATATGAA
TGCTTCTTGGACACGGTAGAAGCTTGTGCGATTGATGTTTGGCCTGAATTGAGCGATCAT
TTCCCGTTCATTTACTGTGTTGAGAGCTTGGTGATTGAACACAAGTACAAAAAGTGGGAG
ACTTGTTATGAGAAGCTCGATCTGAACTCAAAACATGTATCGGATTGCCTCAGCAGTGGA
CATGGGAAAGAGCTTCAGTTGCAGTATGCTGCAGAA*CTAGTGCACTTGAGCCGCCTCAT
AAATACGTTCCCTGGGTTGTCGTGGATGGTCAGCCACTTTATGAGGATTATGAAAACTTC
ATAAGCTACATCTGCAA*GCTTA
C

QA 5 687 5 687
DS 

RD RR4EA01TF 697 0 0
GGGTTCTGAACATTGAAGATATCGATCGAATAGTATTCAGAGACACAACAACAGCTTTTG
TCTTTGCATCTATGGCGTCGATGCCGACGATCAAACTTGTTCTCCTAGTCTGCTACGTTT
ATCTTCTCTGTTTTGTATCATCATCGTCATCTGATCTTTCTGGAATATCTAAACCATCTT
CTTCGCAGAAAGTCTCGCTGGGACTGTACTACGAGTCTCTATGTCCATACTGTTCTTCCT
TCATAGTAAACCACCTCACGAAGCTCTTCGAAGACGATCTCATATCAATCGTGGACCTCC
AT**GTCTCCCTGGGGCAACACCAAGCTCCGCTCCGATAATGCCACCGTCGTTTGCCAGC
ACGGTGCATATGAATGCTTCTTGGACACGGTAGAAGCTTGTGCGATTGATGTTTGGCCTG
AATTGAGCGATCATTTCCCGTTCATTTACTGTGTTGAGAGCTTGGTGATTGAACACAAGT
ACAAAAAGTGGGAGACTTGTTATGAGAAGCTCGATCTGAACTCAAAACATGTATCGGATT
GCCTCAGCAGTGGACATGGGAAAGAGCTTCAGTTGCAGTATGCTGCAGAAACTAGTGCAC
TTGAGCCGCCTCATAAATACGTTCCCTGGGTTGTCGTGGATGGTCAGCCACTTTATGAGG
ATTATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAA*GCTTA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4AJ39TF 783 0 0
GGGTTCTGAACATTGAAGATATCGATCGAATAGTATTCCGAGACACAACAACAGCTTTTG
TCTTTGCATCTATGGCGTCGATGCCGACGATCAAACTTGTTCTCCTAGTCTGCTACGTTT
ATCTTCTCTGTTTTGTATCATCATCGTCATCTGATCTTTCTGGAATATCTAAACCATCTT
CTTCGCAGAAAGTCTCGCTGGGACTGTACTACGAGTCTCTATGTCCATACTGTTCTTCCT
TCATAGTAAACCACCTCACGAAGCTCTTCGAAGACGATCTCATATCAATCGTGGACCTCC
ATCTGTCTCCCTGGGGCAACACCAAGCTCCGCTCCGATAATGCCACCGTCGTTTGCCAGC
ACGGTGCATATGAATGCTTCTTGGACACGGTAGAAGCTTGTGCGATTGATGTTTGGCCTG
AATTGAGCGATCATTTCCCGTTCATTTACTGTGTTGAGAGCTTGGTGATTGAACACAAGT
ACAAAAAGTGGGAGACTTGTTATGAGAAGCTCGATCTGAACTCAAAACATGTATCGGATT
GCCTCAGCAGTGGACATGGGAAAGAGCTTCAGTTGCAGTATGCTGCAGAAACTAGTGCAC
TTGAGCCGCCTCATAAATACGTTCCCTGGGTTGTCGTGGATGGTCAGCCACTTTATGAGG
ATTATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAAAGCTTACAAAGGTAACAAACTGCCTGGAG
CGTGTGCCAAATATTCTTCCATCCGTAGTGTCAAAGTGAATCGCTTCCCTCTGGTTTGCC
GGA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4H666TF 810 0 0
GG
GAAGATATCGATCGAATAGTATTCAGAGACTCAACAACAGCTTTTGTCTTTGCATCTATG
GCGTCGATGCCGACGATCAAACTTGTTCTCCTAGTCTGCTACGTTTATCTTCTCTGTTTT
GTATCATCATCGTCATCTGATCTTTCTGGAATATCTAAACCATCTTCTTCGCAGAAAGTC
TCGCTGGGACTGTACTACGAGTCTCTATGTCCATACTGTTCTTCCTTCATAGTAAACCAC
CTCACGAAGCTCTTCGAGGACGATCTCATATCAATCGTGGACCTCCATCTGTCTCCCTGG
GTCAACACCAAGCTCCGCTCCGATAATGCCACCGTCGTTTGCCAGCACGGTGCATATGAA
TGCTTCTTGGACACGGTAGAAGCTTGTGCGATTGATGTTTGGCCTGAATTGAGCGATCAT
TTCCCGTTCATTTACTGTGTTGAGAGCTTGGTGATTGAACACAAGTACAAAAAGTGGGAG
ACTTGTTATGAGAAGCTCGATCTGAACTCAAAACATGTATCGGATTGCCTCAGCAGTGGA
CATGGGAAAGAGCTTCAGTTGCAGTATGCTGCA*AAACTAGTGCACTTGAGCCGCCTCAT
AAATACGTTCCCTGGGTTGTCGTGGATGGTCAGCCACTTTATGAGGATTATGAAAACTTC
ATAAGCTACATCTGCAG*GCTTACAAAG*TAACAA*CTGCCTGGAGCGTGTGC*AAATAT
TCTTCCATCCGTAGTGTCAA*GTGA*TCGCTTCCCTCTGGTT*GCCGGATGGAGTCTATA
CGATGTGGGATTTTTGGACGTATCAAAC

QA 3 810 3 810
DS 



CO CL484Contig2 1154 6 11 U
CGTACAAAATTATAAATTATTATTGCATATGGTCAACGTCGAAATGAGTAGTGGGTCACG
GTCCTCACTTTACTATTCTATCTTAAATTCTAATAGTCTCCTCTCCTACTGATGTTATCC
GGTGCATGACCAGTTTGGACCGAATCAGAAGGTCACCAGAGGAAAACAAACTGTTCCATT
TATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAAACATGGATTCTGATATGTAA
ACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCTTTTCAGGGTATCATGCTACA
CAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTGACGAATGACGACAAAGAGGT
TTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCATTCCGGCAAACCAGAGGGAA
GCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTCCAGGCAGTTTATT
ACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGGCTG
ACCATCCACGACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGTTTAAGTGCACTCGTTTCTGC
AGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCGATACATGTTT
TGAGTTCAGATTGAGCTTCTCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACTTGTGTTCAATCAC
CAAACTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCAATTCAGGCCAAACATCAAT
CGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCACCGTGCTGGCAAACGACGGT
GACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACAGATGGAGATCCACGATTGA
TATGAGATCGTCTTCGAAGAGCTTCGTGAGGTGGTTTACTATGAAGGAAGAACAGTATGG
ACATAGAGACTCGTAGTACAGTCCCAGAGAGACTTTCGGAGAAGAAGATGGTTTAGATAT
TCCAGAAAGATCAGATGACGATGATGATGATATAAAACAGAGAAGAGAAACGTAGCAGAC
TAGGAGAACAAGTTTGATCGTCGGCATCGACGCCATAGATGCAAAGACAAAGCTGTTGTT
GTGTCTCTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 
25 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA01JQ U 418
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AF RR4H666JQB U 160
AF RR4GA76JQ U 162
AF RR4DU82TF C 231
AF RR4EZ31TF C 424
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BS 725 836 RR4H666JQB
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BS 923 985 RR4DU82TF
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GTTACCTTTGTAAGCCTTGCATATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGG
CTGACCATCCACGACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCTCAAGTGCACTAG

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DS 

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GTCCTCACTTTACTATTCTATCTTAAATTCTAATAGTCTCCTCTCCTACTGATGTTATCC
GGTGCATGACCAGTTTGGACCGAATCAGAAGGTCACCAGAGGAAAACAAACTGTTCCATT
TATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAAACATGGATTCTGATATGTAA
ACCATACATCTTCATCATAACTAAAAAATCTATATAAGCTTTTCAGGGTATCATGCTACA
CAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTGACGAATGACGACAAAGAGGT
TTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCATTCCGGCAAACCAGAGGGAA
GCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTCCAGGCAGTTTATT
ACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGGCTG
ACCATCCACGACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGTTTAAGTGCACTCGTTTCTGC
AGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCGATACATGTTT
TGAGTTCAGATTGAGCTTCTCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACTTGTGTT

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DS 

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GGGGAAAA
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AAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTC
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CACTAGTTT*TGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAAT
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TGTGTTCAATCACCAAGCTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCAATTCAG
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GGCAAACGA

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DS 

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GGAAAA
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TTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCTTTTCAGG
GTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTGACGAATG
ACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCATTCCGGC
AAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTC
CAGGCAGTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCT
CATAAAGTGGCTGACCATCCACGACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCTCAAGTG
CACTAGTTTCTGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAAT
CCGATACATGTTTTGAGTTCAGATCGAGCTTCTCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACT
TGTGTTCAATCACCAAGCTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCAATTCAG
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GGCAAACGACGGTGG

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DS 

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TCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCGTGTGACGAATGACG
ACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCATTCCGGCAAA
CCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTCCAG
GCAGTTTATTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCAT
AAAGTGGCTGACCATCCACGACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGTTTAAGTGCAC
TCGTTTCTGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCG
ATACATGTTTTGAGTTCAGATTGAGCTTCTCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACTTGT
GTTCAATCACCAAACTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCAATTCAGGCC
AAACATCAATCGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCACCGTGCTGGC
AAACGACGGCGACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACAGATGGAGAT
CCACGATTGATATGAGATCGTCTTCGAAGAGTTTCGTGAGGTGGTTTACTATGAAGGAAG
AACAGTATGGACATAGAGACTCGTAGTACAGTCCC

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DS 

RD RR4EZ31TF 731 0 0
CGATCAC
TTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTCCAGGCAGTTTATTACCTTTGTAA
GCCT*GCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGGCTGACCATCCACG
ACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGTTTAAGTGCACTCGTTTCTGCAGCATACTGC
AACTGAAGCCCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCGATACATGTTTTGAGTTCAGA
TTGAGCTTCTCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACTTGTGTTCAATCACCAAACTCTCA
ACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCAATTCAGGCCAAACATCAATCGCACAAGCT
TCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCACCGTGCTGGCAAACGACGGTGACATTATCG
GAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACAGATGGAGATCCACGATTGATATGAGATCG
TCTTCGAAGAGCTTCGTGAGGTGGTTTACTATGAAGGAAGAACAGTATGGACATGGAGAC
TCGTAGTACAGTCCCAGAGAGACTTTCGGAGAAGAAGATGGTTTAGATATTCCAGAAAGA
TCAGATGACGATGATGATGATATAAAACAGAGAAGAGAAACGTAGCAGACTAGGAGAACA
AGTTTGATCGTCGGCATCGACGCCATAGATGCAAAGACAAAGCTGTTGTTGTGTCTCTGA
ATCC

QA 8 731 8 731
DS 



AS 1 7

CO CL485Contig1 975 7 4 U
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AGCCAGCAAAGATGCAGCTGATAGGATGAAAGAATTCTTCTTGGGATGGTTCATGGAGCC
GCTAACAAAGGGTAGATACCCAGACATCATGAGACAAATTGTGGGTAGTCGGCTTCCCAA
TTTCACGGAAGCAGAAGCGGAACTCGTTGCGGGTTCATATGATTTTCTTGGTCTCAATTA
CTACACCACTCAGTACGCCCAGCAAAAACCTAACCCAGTTACATGGGCAAATCACACTGC
CATGATGGACCCAGGCGTAAAGCTCACATATGACAATTCACGTGGTGAAAATCTTGGTCC
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CGTTATGGACTACTTCAAAACCAAATACAATAACCCTTTGATCTATATCACTGAGAACGG
ATTCAGTACTCCCGGTGATGAAACCCGTGAGGAAGCTATTGCCGATTCCAAGCGGATCGA
TTATCTCTGCAGTCATCTATGTTTTCTCCGTAAGGTCATCAGGGAGAAGGGTGTCAACAT
AAAAGGATACTTTGCATGGGCCCTTGGAGACAATTATGAATTCTGCAAAGGTTTTACCGT
TAGATTCGGACTTAGTTACGTTAACTGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATC
TGGCAAATGGTACCAAAGCTTTATTAACGGTACTACAAAGAACCCTGCCAAACAAGATTT
CCGCCGCCCAAACCTCTCATTCCAGAACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACAC
TTTTTCCCACCATCATGATCATCTTCATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCT
TGTTCTATCTATATTGTACTAAATAAGTATTCCAATAAAAGATGATCATTTACTAATGAA
TAGTTTCGTTTGAGT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU64TF U 1
AF RR4AU64JQ C 126
AF RR4DT54JQ C 625
AF RR4DT54TF U 625
AF RR4FA39JQ C 421
AF RR4FA39TF U 421
AF RR4AV82TF U 193
BS 1 500 RR4AU64TF
BS 501 501 RR4AV82TF
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BS 579 975 RR4AV82TF

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GCTAACAAAGGGTAGATACCCAGACATCATGAGACAAATTGTGGGTAGTCGGCTTCCCAA
TTTCACGGAAGCAGAAGCGGAACTCGTTGCGGGTTCATATGATTTTCTTGGTCTCAATTA
CTACACCACTCAGTACGCCCAGCAAAAACCTAACCCAGTTACATGGGCAAATCACACTGC
CATGATGGACCCAGGCGTAAAGCTCACATATGACAATTCACGTGGTGAAAATCTTGGTCC
ACTGTTCGTAAAAGACGCAAAAAACGGCATTGCCTATTACTACCCAAAAGGCATTTATTA
CGTTATGGACTACTTCAAAACCAAATACAATAACCCTTTGATCTATATCACTGAGAACGG
ATTCAGTACTCCCGGTGATGGAACCCGTGAGGAAGCTATTGCCGATTCCAAGCGGATCGA
TTATCTCTGCAGTCATCTATGTTTTCTCCGTAAGGTCA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4AU64JQ 831 0 0
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CGGAAGCAGAAGCGGAACTCGTTGCGGGTTCATATGATTTTCTTGGTCTCAATTACTACA
CCACTCAGTACGCCCAGCAAAAACCTAACCCAGTTACATGGGCAAATCACACTGCCATGA
TGGACCCAGGCGTAAAGCTCACATATGACAATTCACGTGGTGAAAATCTTGGTCCACTGT
TCGTAAAAGACGCAAAAAACGGCATTGCCTATTACTACCCAAAAGGCATTTATTACGTTA
TGGACTACTTCAAAACCAAATACAATAACCCTTTGATCTATATCACTGAGAACGGATTCA
GTACTCCCGGTGATGGAACCCGTGAGGAAGCTATTGCCGATTCCAAGCGGATCGATTATC
TCTGCAGTCATCTATGTTTTCTCCGTAAGGTCATCAGGGAGAAGGGTGTCAACATAAAAG
GATACTTTGCATGGGCCCTTGGAGACAATTATGAATTCTGCAAAGGTTTTACCGTTAGAT
TCGGACTTAGTTACGTTAACTGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATCTGGCA
AATGGTACCAAAGCTTTATTAACGGTACTACAAAGAACCCTGCCAAACAAGATTTCCGCC
GCCCAAACCTCTCATTCCAGAACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACACTTTTT
CCCACCATCATGATCATCTTCATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCTTGTTC
TATCTATATTGTACTAAATAAGTATTCCAATAAAAGATGATCATTTACTA
T

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DS 

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G
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TGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATCTGGCAAATGGTACCAAAGCTTTATT
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AACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACACTTTTTCCCACCATCATGATCATCTT
CATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCTTGTTCTATCTATATTGTACTAAATA
AGTATTCCAATAAAAGATGATCATTTACTAATG

QA 2 334 2 334
DS 

RD RR4DT54TF 334 0 0
G
GGAGACAATTATGAATTCTGCAAAGGTTTTACCGTTAGATTCGGACTTAGTTACGTTAAC
TGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATCTGGCAAATGGTACCAAAGCTTTATT
AACGGTACTACAAAGAACCCTGCCAAACAAGATTTCCGCCGCCCAAACCTCTCATTCCAG
AACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACACTTTTTCCCACCATCATGATCATCTT
CATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCTTGTTCTATCTATATTGTACTAAATA
AGTATTCCAATAAAAGATGATCATTTACTAATG

QA 2 334 2 334
DS 

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G
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AGATTCGGACTTAGTTACGTTAACTGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATCT
GGCAAATGGTACCAAAGCTTTATTAACGGTACTACAAAGAACCCTGCCAAACAAGATTTC
CGCCGCCCAAACCTCTCATTCCAGAACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACACT
TTTTCCCACCATCATGATCATCTTCATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCTT
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GT

QA 2 534 2 534
DS 

RD RR4FA39TF 536 0 0
G
GTTATGGACTACTTCAAAACCAAATACAATAACCCTTTGATCTATATCACTGAGAACGGA
TTCAGTACTCCCGGTGATGAAACCCGTGAGGAAGCTATTGCCGATTCCAAGCGGATCGAT
TATCTCTGCAGTCATCTATGTTTTCTCCGTAAGGTCATCAGGGAGAAGGGTGTCAACATA
GAAGGATACTTTGCATGGGCCCTTGGAGACAATTATGAATTCTGCAAAGGTTTTACCGTT
AGATTCGGACTTAGTTACGTTAACTGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATCT
GGCAAATGGTACCAAAGCTTTATTAACGGTACTACAAAGAACCCTGCCAAACAAGATTTC
CGCCGCCCAAACCTCTCATTCCAGAACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACACT
TTTTCCCACCATCATGATCATCTTCATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCTT
GTTCTATCTATATTGTACTAAATAAGTATTCCAATAAAAGATGATCATTTACT
GT

QA 2 534 2 534
DS 

RD RR4AV82TF 783 0 0
G
GAAGCGGAACTCGTTGCGGGTTCATATGATTTTCTTGGTCTCAATTACTACACCACTCAG
TACGCCCAGCAAAAACCTAACCCAGTTACATGAGCAAATCACACTGCCATGATGGACCCA
GGCGTAAAGCTCACATATGACAATTCACGTGGTGAAAATCTTGGTCCACTGTTCGTAAAA
GACGCAAAAAACGGCAATGCCTATTACTACCCAAAAGGCATTTATTACGTTATGGACTAC
TTCAAAACCAAATACAATAACCCTTTGATCTATATCACTGAGAACGGATTCAGTACTCCC
GGTGATGAAACCCGTGAGGAAGCTATTGCCGATTCCAAGCGGATCGATTATCTCTGCAGT
CATCTATGTTTTCTCCGTAAGGTCATCAGGGAGAAGGGTGTCAACATAAAAGGATACTTT
GCATGGGCCCTTGGAGACAATTATGAATTCTGCAAAGGTTTTACCGTTAGATTCGGACTT
AGTTACGTTAACTGGACAAACCTCGATGATAGAAATCTCAAAGAATCTGGCAAATGGTAC
CAAAGCTTTATTAACGGTACTACAAAGAACCCTGCCAAACAAGATTTCCGCCGCCCAAAC
CTCTCATTCCAGAACCAGAAGAAGAAGCTCGCAGATGCATGAAACACTTTTTCCCACCAT
CATGATCATCTTCATATCTCTACTACTTGCGTCATAGATAAGGAGCTTGTTCTATCTATA
TTGTACTAAATAAGTATTCCAATAAAAGATGATCATTTACTAATGAATAGTTTCGTTTGA
GT

QA 2 783 2 783
DS 



AS 1 10

CO CL486Contig1 953 10 8 U
TTTTCGGTTTAAGATAGAAGATTGCAAAATACCGTATATGGCTTACAAAACTATATTATA
TCAAAATCAACAGCTTCAGACTATATAGACCGTAGATGATATAACAAGATGGAAAGAGAA
ACTGGTATGACTCTGAATCAAACAAAAACACATTTCTTGAAAACACAATACAAACCAAAT
CCAAAAGTATAAAAAGAAACTCATGAAGTCCTCGAGACCAAACTTATGCAAACATTTTTC
AATGCTTGGAAGCATAGACATTGATCAAAGCCAAGGAATTGCTGGTATCTTGCGCCACAC
GCACAATGTGTGCTCTGACCAAGCTTTTCAGCTCCCCATCCATGCCTTTCCCTCCAAACC
CATCAAGACAAGTGGTCTCATCTGTAAGCGCCGCGCTTGTCCATGTCCTGACATTGCTCA
AACAGAACCAGAAGTCTTCTTTGCTCTCTCCTTCCTCCAGATTCTTCAGTTCCTTCAGCG
ACTTGCTCAACCTGTCAACAGTATCTCCCATCTCTTCAACACAGTCCAACACAGCCTCGT
GCTGCCTCTTTGTGATTCCTTTGTAGTCAGTCATGTCCGAGATATAGGTTTTGGCTGACT
TTGCTCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCTCCGCGAGCTGTAGTGGCCGCTTCTTGA
TCTGGCTTGCGTAAGAAGACAGAGATTGAAAGCACAGTTTCGGGTACGTTGCTGTCTCAC
AAGAGGCTTTAATGAACTCTGTATCTTCACTAGATTCCTCTCCAAGGTTTCTGGCCATGG
CTATTGCTGCAGTGGACACATACAGAACAAAGAGAATCAGAGATAGATCTAAACATTTCG
CCATTTTGGGTTCCAAACACAAATGTGAGTAGCAGCAAAAGGGTTCAGGGATTTATAGAG
AGAGAGGCTTAAAGAATGTTCCAGATACAAATAATAGAATCTAGAGCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 
50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 10 60 30 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B460JQ U 105
AF RR4FM76JQ U 39
AF RR4GV15JQ U 40
AF RR4FY57JQ U 5
AF RR4G858JQ U 1
AF RR4GV15TF C 183
AF RR4G858TF C 198
AF RR4FY57TF C 209
AF RR4B460TF C 411
AF RR4FM76TF C 243
BS 1 530 RR4G858JQ
BS 531 531 RR4GV15JQ
BS 532 655 RR4G858JQ
BS 656 656 RR4GV15JQ
BS 657 829 RR4G858JQ
BS 830 932 RR4GV15TF
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BS 948 953 RR4FM76TF

RD RR4B460JQ 576 0 0
CG
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ATCTTGCGCCACACGCACAATGTGTGCCCTGACCAAGCTTTTCAGCTCCCCATCCATGCC
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CCTGACATTGCTCAAACAGAACCAAAAGTCTTCTTTGCTCTCTCCTTCCTCCAAATTCTT
CAGTTCCTTCAGCGACTTGCTCAACCTGTCAACAGTATCTCCCATCTCTTCAACACAGTC
CAACACGGCCTCGTGCTGCCTCTTTGTGATTCCTTTGTAGTCAGTCATGTCCGAAATATA
GGTTTTGGCTGACTTTGCTCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCCCCGCGAGCTGTAG
TGGCCGCTTCTTGATCTGGCTTGCGTAAGAAGAC

QA 3 576 3 576
DS 

RD RR4FM76JQ 642 0 0
C
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TATAACAAGATGGAAAGAGAAACTGGTATGACTCTGAATCAAACAAAAACACATTTCTTG
AAAACGCAATACAAACCAAATCCAAAAGTATAAAAAGAAACTCATGAAGTCCTCGAGACC
AAACTTATGCAAACATTTTTCAATGCTTGGAAGCATAGACATTGATCAAAGCCAAGGAAT
TGCTGGTATCTTGCGCCACACGCACAATGTGTGCTCTGACCAAGCTTTTCAGCTCCCCAT
CCATGCCTTTCCCTCCAAACCCATCAAGACAAGTGGTCTCATCTGTAAGCGCCGCGCTTG
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CA**GTCCAACACAGCCTCGTGCTGCCTCTTTGTGATTCCTTTGTAGTCAGTCATGTCCG
AGATATAGGTTTTGGCTGACTTTGCTCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCTCCGCGA
GCTGTAGTGGCCGCTTCTTGATCTGGCTTGCGTAAGAAGAC

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR4GV15JQ 719 0 0
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TATAACAAGATGGAAAGAGAAACTGGTATGACTCTGAATCAAACAAAAACACATTTCTTG
AAAACACAATACAAACCAAATCCAAAAGTATAAAAAGAAACTCATGAAGTCCTCGAGACC
AAACTTA****AACATTTTTCAATGCTTGGAAGCATAGACATTGATCAAAGCCAAGGCAT
TGCTGGTATCTTGCGCCACACGCACAATGTGTGCTCTGACTAAGCTTTTCAGCTCCCCAT
CCATGCCTTTCCCTCCAAACCCATCAAGACAAGTGGTCTCATCTGTAAGCGCCGCGCTTG
TCCATGTCCTGACATTGCTCAAACAGAACCAGAAGTCTTCTTTGCTCTCTCCTTCCTCCA
GATTCTTCAATTCCTTCAGCGACTTGCTCAACCTGTCAACAGTATCTCCCATCTCTTCAA
CACAGTCCAACACAGCCTCGTGCTGCCTCTTTGTGATTCCTTTGTAGTCAGTCATGTCCG
AAATATAGGTTTTGGCTGACTTTGCTCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCTCCGCGA
ACTGTAGTGGCCGCTTCTTGATCTGGCTTGCGTAAGAAGACAGAGATTGAAAGCACAGTT
TCGGGTACGTTGCTGTCTCACAAGAGGCTTTAATGAACTCTGTATCTTCACTAGATTCC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FY57JQ 753 0 0
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AATCAACAGCTTCAGACTATATAGACCGTAGATGATATAACAAGATGGAAAGAGAAACTG
GTATGACTCTGAATCAAACAAAAACACATTTCTTGAAAACACAATACAAACCAAATCCAA
AAGTATAAAAAGAAACTCATGAAGTCCTCGAGACCAAACTTATGCAAACATTTTTCAATG
CTTGGAAGCATAGACATTGATCAAAGCCAAGGAATTGCTGGTATCTTGCGCCACACGCAC
AATGTGTGCTCTGACCAAGCTTTTCAGCTCCCCATCCATGCCTTTCCCTCCAAACCCATC
AAGACAAGTGGTCTCATCTGTAAGCGCCGCGCTTGTCCATGTCCTGACATTGCTCAAACA
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GCTCAACCTGTCAACAGTATCTCCCATCTCTTCAACACAGTCCAACGCAGCCTCGTGCTG
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TCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCTCCGCGAGCTGTAGTGGCCGCTTATTGATCTG
GCTTGCGTAAGAAGACAGAGATTGAAAGCACAGTTTCGGGTACGTTGCTGTCTCACAAGA
GGCTTTAATGAACTCTGTATCTTCACTAGATTC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4G858JQ 829 0 0
TTTTCGGTTTAAGATAGAAGATTGCAAAATACCGTATATGGCTTACAAAACTATATTATA
TCAAAATCAACAGCTTCAGACTATATAGACCGTAGATGATATAACAAGATGGAAAGAGAA
ACTGGTATGACTCTGAATCAAACAAAAACACATTTCTTGAAAACACAATACAAACCAAAT
CCAAAAGTATAAAAAGAAACTCATGAAGTCCTCGAGACCAAACTTATGCAAACATTTTTC
AATGCTTGGAAGCATAGACATTGATCAAAGCCAAGGAATTGCTGGTATCTTGCGCCACAC
GCACAATGTGTGCTCTGACCAAGCTTTTCAGCTCCCCATCCATGCCTTTCCCTCCAAACC
CATCAAGACAAGTGGTCTCATCTGTAAGCGCCGCGCTTGTCCATGTCCTGACATTGCTCA
AACAGAACCAGAAGTCTTCTTTGCTCTCTCCTTCCTCCAGATTCTTCAGTTCCTTCAGCG
ACTTGCTCAACCTGTCAACAGTATCTCCCATCTCTTCAACACAGTCCAACGCAGCCTCGT
GCTGCCTCTTTGTGATTCCTTTGTAGTCAGTCATGTCCGAGATATAGGTTTTGGCTGACT
TTGCTCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCTCCGCGAGCTGTAGTGGCCGCTTATTGA
TCTGGCTTGCGTAAGAAGACAGAGATTGAAAGCACAGTTTCGGGTACGTTGCTGTCTCAC
AAGAGGCTTTAATGAACTCTGTATCTTCACTAGATTCCTCTCCAAGGTTTCTGGCCATGG
CTATTGCTGCAGTGGACACATACAGAACAAAGAGAATCAGAGATAGATC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4GV15TF 752 0 0
AAAAGTATAAAAAGAAACTCATGAAGTCCTCGAGACCAAACTTA****AACATTTT*CAA
TGCTTGGAAGCATAGACATTGATCAAAGCCAAGGCATTGCTGGTATCTTGCGCCACACGC
ACAATGTGTGCTCTGACTAAGCTTTTCAGCTCCCCATCCATGCCTTTCCCTCCAAACCCA
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CAGAACCAGAAGTCTTCTTTGCTCTCTCCTTCCTCCAGATTCTTCAATTCCTTCAGCGAC
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ATTTTGGGTTCCAAACACAAATGTGAGTAGCAGCAAAAGGGTTCAGGGATTTATAGAGAG
AGAGGCTTAAAGAATGTTCCAGATACAAAT
CC

QA 1 750 1 750
DS 

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TCTTTGCTCTCTCCTTCCTCCAGATTCTTCAGTTCCTTCAGCGACTTGCTCAACCTGTCA
ACAGTATCTCCCATCTCTTCAACACAGTCCAACGCAGCCTCGTGCTGCCTCTTTGTGATT
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GTTCCAGATACAAATAATAGAATCTAGAGC
AAAAAA

QA 1 750 1 750
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CAGCTCCCCATCCATGCCTTTCCCTCCAAACCCATCAAGACAAGTGGTCTCATCTGTAAG
CGCCGCGCTTGTCCATGTCCTGACATTGCTCAAACAGAACCAGAAGTCTTCTTTGCTCTC
TCCTTCCTCCAGATTCTTCAGTTCCTTCAGCGACTTGCTCAACCTGTCAACAGTATCTCC
CATCTCTTCAACACAGTCCAACGCAGCCTCGTGCTGCCTCTTTGTGATTCCTTTGTAGTC
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TGTCTCCGCGAGCTGTAGTGGCCGCTTATTGATCTGGCTTGCGTAAGAAGACAGAGATTG
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AAATAATAGAATCTAGAGC
AAAAAA

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DS 

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TTGGCTGACTTTGCTCGGGCAATGCTAACGGCAAGCGCTGTCCCCGCGAGCTGTAGTGGC
CGCTTCTTGATCTGGCTTGCGTAAGAAGACAGAGATTGAAAGCACAGTTTCGGGTACGTT
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CTGGCCATGGCTATTGCTGCAGTGGACACATACAGAACAAAGAGAATCAGAGATAGATCT
AAACATTTCGCCATTTTGGGTTCCAAACACAAATGTGAGTAGCAGCAAAAGGGTTCAGGG
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AG**GCTTAAAGAATGTTCCAGATACAAATAATAGAATCTAGAGCAAAAAA

QA 1 711 1 711
DS 



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TCTTTTGCAGGAGAAAATGATGTTGAGCACTTTGCAATTCAATGTCTCGTTGCCTACACA
ATACCCTTTCTTGAGAAGATTCCTCAAGGCAGCTCAAGCAGACAAGAAGTGTGAGGTTTT
GGCGTCCTTCTTGATCGAGCTTGCCCTTGTGGAGTACGAGATGCTTCGGTTTCCACCTTC
ATTACTAGCTGCCACAGCGGTGTACACTGCTCAGTGTACACTTGATGGATTCAGGAAATG
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AAGATGGTGAGTCTTCATCAGAGGGCGGCCACTGGGAAATTGACAGGAGTATATAGGAAG
TACAGCACATTCAAGTTTGGGTACATAGCCAAGTGTGAAGCTGCACACTTTATTGTTTCT
TAGTCTCATCATCCTTAAAGGCTGCAAAAGACAGTTATATTTTTTGTACAGTTCTCTTGG
C


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 

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TCTTTTGCAGGAGAAAATGATGTTGAGCACTTTGCAATTCAATGTCTCGTTGCCTACACA
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GGCGTCCTTCTTGATCGAGCTTGCCCTTGTGGAGTACGAGATGCTTCGGTTTCCACCTTC
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RD RR4AQ83JQ 716 0 0
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TTCAGTCTTGTCTCATTTAATAATTTTAAGATATTTCTCTGATTAAATAAATGGTTCTTT
TGCAGGAGAAAATGATGTTGAGCACTTTGCAATTCAATGTCTCGTTGCCTACACAATACC
CTTTCTTGAGAAGATTCCTCAAGGCAGCTCAAGCAGACAAGAAGTGTGAGGTTTTGGCGT
CCTTCTTGATCGAGCTTGCCCTTGTGGAGTACGAGATGCTTCGGTTTCCACCTTCATTAC
TAGCTGCCACAGCGGTGTACACTGCTCAGTGTACACTTGATGGATTCAGGAAATGGAACC
GTACATGTGAATTCCACTGTCACTACTCTGAAGATCAGCTCATAGAATGTTGAGGAAGAT
GGTGAGTCTTCATCAGAGGGCGGCCACTGGGAAATTGACAGGAGTATATAGGAAGTACAG
CACATTCAAGTTTGGGTACATAGCCAAGTGTGAAGCTGCACACTTTATTGTTTCTTAGTC
TCATCATCCTTAAAGGCTGCAAAAGACAGTTATATTTTTTGTACAGTTCTCTTGGC

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DS 

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ACGCTATCCTTGTTGAAGATTTAGTGCTCATTTCAGACAGAGCTTATACCAGGACTGATG
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TTCTCTGATTAAATAAATGGTTCTTTTGCAGGAGAAAATGATGTTGAGCACTTTGCAATT
CAATGTCTCGTTGCCTACACAATACCCTTTCTTGAGAAGATTCCTCAAGGCAGCTCAAGC
AGACAAGAAGTGTGAGGTTTTGGCGTCCTTCTTGATCGAGCTTGCCCTTGTGGAGTACGA
GATGCTTCGGTTTCCACCTTCATTACTAGCTGCCACAGCGGTGTACACTGCTCAGTGTAC
ACTTGATGGATTCAGGAAATGGAACCGTACATGTGAATTCCACTGTCACTACTCTGAAGA
TCAGCTCATAGAATGTTGAGGAAGATGGTGAGTCTTCATCAGAGGGCGGCCACTGGGAAA
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TTTTTTGTACAGTTCTCTTGGC

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DS 

RD RR4AQ48JQ 755 0 0
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GTAGAAAGTTGGGACAAGAGACGAAGAGAAGAGTGTTGGGTGTGATTAATCAGAATCTGG
TTGGTGGTGGAAGACGCTATCCTTGTTGAAGATTTAGTGCTCATTTCAGACAGAGCTTAT
ACCAGGACTGATGTTCTACACATGGTAAAAGTGCTGTTCTTCAGTCTTGTCTCATTTAAT
AATTTTAAGATATTTCTCTGATTAAATAAATGGTTCTTTTGCAGGAGAAAATGATGTTGA
GCACTTTGCAATTCAATGTCTCGTTGCCTACACAATACCCTTTCTTGAGAAGATTCCTCA
AGGCAGCTCAAGCAGACAAGAAGTGTGAGGTTTTGGCGTCCTTCTTGATCGAGCTTGCCC
TTGTGGAGTACGAGATGCTTCGGTTTCCACCTTCATTACTAGCTGCCACAGCGGTGTACA
CTGCTCAGTGTACACTTGATGGATTCAGGAAATGGAACCGTACATGTGAATTCCACTGTC
ACTACTCTGAAGATCAGCTCATAGAATGTTGAGGAAGATGGTGAGTCTTCATCAGAGGGC
GGCCACTGGGAAATTGACAGGAGTATATAGGAAGTACAGCACATTCAAGTTTGGGTACAT
AGCCAAGTGTGAAGCTGCACACTTTATTGTTTCTTAGTCTCATCATCCTTAAAGGCTGCA
AAAGACAGTTATATTTTTTGTACAGTTCTCTTGGC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 8

CO CL488Contig1 1085 8 12 U
CAAGAAGAATGGTTCTAATACTTCATTATTACCCTGCTAATCCTCGTCTTCAAGTGATTT
AAACAGTAGAAGAAAAATCATGAACATTACGAAAGTGAACGAGAGAGTAAGGATAAAAGC
GAAAACTAGTTGATCCATTTACAATCTTGTGCAATAAGAGGAATACGCAAACCAAAGTAC
GTCCTAATCATAAAAACACCAAATCATAAAAACACCAAAACACCCCCAACACTCTTATTA
GACTTCCTTGTCACTTTTTAAGTCTCTCAGTTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTTA
TCTGCCGAGTTCTTCAGCATTATGATGAGAATACGGACAAACACAGCAACAAAATCGGTG
AAAAGGGTCAACGCATGTTTCACATAGTCCATGTCCCCTAGATGTGCCTTCTCTATAATC
TCTTGGGTATCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGCCCAAAGTAGAGCTCGAAC
TTAAAGATAGAGGCAGAGCCACCAAAGATGGAAGAGGCAAACTGAAGCCACATCAGCATA
GACAAGCCAGATGAGAGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGCCTTGCCAGCATC
GCTGCTCCTGAGAAACAGACAAACGCTATCGCAGTTCCGACGAACGCAGTGATAAGGATG
CTTGGATCAAAATCAACAGCCACTTTGATCAAGGGGCCAACAGAAGCACCTTCAAGAACG
GCAGACAGGAACAGAAGCGAGAGCCTCTTTTGTTGTTCATGAGGAGGGCAGGAGAGGAGC
CAGATCATGCTTCCACAGCATGCAATGGTTGTGAGAAGACCACCGATGTTCCAGAGCACG
TGGAGGTAAGCTCCAAAGGCAGAGGCAACTAGGGCACAGCACAAAGTGAGATAAACCCGC
TTGAGGTGATTCTGGACGGAGGGAGAGATCTGATGGAGGTTCTTGAGAGAATCATAGCTC
CAGCTTCTGCTACCTGGTTGTGAATCGAAGAAGGACGAGAACGAATCCATATGGCCTTTT
TTGTTTTCTTTTGCTTCGTGAGAGAGAGAATCAATTATAAGCGTCGATATCGTTAACGAA
AATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 

AF RR4FV43JQ U 115
AF RR4D278JQ U 61
AF RR4BU01JQ U 68
AF RR4GV33JQ U 1
AF RR4AL50JQ U 61
AF RR4GV33TF C 308
AF RR4D278TF C 316
AF RR4FV43TF C 519
BS 1 386 RR4GV33JQ
BS 387 387 RR4D278JQ
BS 388 788 RR4GV33JQ
BS 789 811 RR4GV33TF
BS 812 812 RR4D278TF
BS 813 817 RR4GV33TF
BS 818 818 RR4D278TF
BS 819 869 RR4GV33TF
BS 870 870 RR4D278TF
BS 871 1010 RR4GV33TF
BS 1011 1080 RR4D278TF
BS 1081 1085 RR4FV43TF

RD RR4FV43JQ 198 0 0
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AAGTACGTCCTAATCATAAAAACACCAAATCATAAAAACACCAAAACACCCCCAACACTC
TTATTAAACTTCCTTGTCACTTTTTAAGTCTCTCAATTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCTCC
TCTTTATCTGCCGAGTTC

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR4D278JQ 394 0 0
AAACAGTA
GAAGAAAAATCATGAACATTACGAAAGTGAACGAGAG**TAAGGATAAAAGCGAAAACTA
GTTGATCCATTTACAATCTTGTGCAATAAGAAGAATACGCAAACCAAAGTACGTCCTAAT
CATAAAAACACCAAATCATAAAAACACCAAAACACCACCAACACTCTTATTAGACTTCCT
TGTCACCTTTTAAGTCTCTCAGTTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTTATCTGCCGA
GTTCTTCAGCATTATGATGAGAATACGGACAAACACAGCAACAAAAACGGTGAAAAGGGT
CAACGCATGTTTCACATAGTCCATGTCCCCTAGATGTGCCTTCTCTATAATCTCTTGGGT
ATCCACCACCATGTATCCCACAAAGA

QA 9 394 9 394
DS 

RD RR4BU01JQ 689 0 0
G
GAAGAAAAATCATGAACATTACGAAAGTGAACGAGAG**TAAGGATAAAAGCGAAAACTA
GTTGATCCATTTACAATCTTGTGCAATAAGAGGAATACGCAAACCAAAGTACGTCCTAAT
CATAAAAACACCAAATCATAAAAACACCAAAACACCCCCAACACTCTTATTAGACTTCCT
TGTCACTTTTTAAGTCTCTCAGTTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTTATCTGCCGA
GTTCTTCAGCATTATGATGAGAACACGGACAAACACAGCAACAAAATCGGTGAAAAGGGT
CAACGCATGTTTCACATAGTCCATGTCCCCTAGATGTGCCTTCTCTATAATCTCTTGGGT
ATCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGCCCAAAGTAGAGCTCGAACTTAAAGAT
AGAGGCAGAGCCACCAAAGATGGAAGAGGCAAACTGAAGCCACATCAGCATAGACAAGCC
AGATGAGAGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGCCTTGCCAGCATCGCTGCTCC
TGAGAAACAGACAAACGCTATCGCAGTTCCGACGAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGATC
AAAATCAACAGCCACTTTGATCAAGGGGCCAACAGAAGCACCTTCAAGAACGGCAGACAG
GAACAGAAGCGAGAGCCTCTTTTGTTGT

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR4GV33JQ 788 0 0
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AAACAGTAGAAGAAAAATCATGAACATTACGAAAGTGAACGAGAGAGTAAGGATAAAAGC
GAAAACTAGTTGATCCATTTACAATCTTGTGCAATAAGAGGAATACGCAAACCAAAGTAC
GTCCTAATCATAAAAACACCAAATCATAAAAACACCAAAACACCCCCAACACTCTTATTA
GACTTCCTTGTCACTTTTTAAGTCTCTCAGTTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTTA
TCTGCCGAGTTCTTCAGCATTATGATGAGAATACGGACAAACACAGCAACAAAATCGGTG
AAAAGGGTCAACGCATGTTTCACATAATCCATGTCCCCTAGATGTGCCTTCTCTATAATC
TCTTGGGTATCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGCCCAAAGTAGAGCTCGAAC
TTAAAGATAGAGGCAGAGCCACCAAAGATGGAAGAGGCAAACTGAAGCCACATCAGCATA
GACAAGCCAGATGAGAGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGCCTTGCCAGCATC
GCTGCTCCTGAGAAACAGACAAACGCTATCGCAGTTCCGACGAACGCAGTGATAAGGATG
CTTGGATCAAAATCAACAGCCACTTTGATCAAGGGGCCAACAGAAGCACCTTCAAGAACG
GCAGACAGGAACAGAAGCGAGAGCCTCTTTTGTTGTTCATGAGGAGGGCAGGAGAGGAGC
CAGATCAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AL50JQ 723 0 0
AAACAGTA
GAAGAAAAACCATGAACATTACGAAAGTGAACGAGAGAGTAAGGATAAAAGCGAAAACTA
GTTGATCCATTTACAATCTTGTGCAATAAGAGGAATACGCAAACCAAAGTACGTCCTAAT
CATAAAAACACCAAATCATAAAAACACCAAAACACCCCCAACACTCTTATTAGACTTCCT
TGTCACTTTTTAAGTCTCTCAGTTTCTCCTCTTCTTCTTCT***CCTCTTTATCTGCCGA
GTTCTTCAGCATTATGATGAGAATACGGACAAACACAGCAACAAAATCGGTGAAAAGGGT
CAACGCATGTTTCACATAGTCCATGTCCCCTAGATGTGCCTTCTCTATAATCTCTTGGGT
ATCCATCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGCCCAAAGTAGAGCTCGAACTTAAAGAT
AGAGGCAGAGCCACCAAAGATGGAAGAGGCAAACTGAAGCCACATCAGCATAGACAAGCC
AGATGAGAGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGCCTTGCCAGCATCGCTGCTCC
TGAGAAACAGACAAACGCTATCGCAGTTCCGACGAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGATC
AAAATCAACAGCCACTTTGATCAAGGGGCCAACAGAAGCACCTTCAAGAACGGCAGACAG
GAACAGAAGCGAGAGCCTCTTTTGTTGTTCATGAGGAGGGCAGGAGAGGAGCCAG

QA 9 723 9 723
DS 

RD RR4GV33TF 703 0 0
AGTTCTTCAGCATTATGATGAGAATACGGACAAACACAGCAACAAAATCGGTGAAAAGGG
TCAACGCATGTTTCACATAATCCATGTCCCCTAGATGTGCCTTCTCTATAATCTCTTGGG
TATCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGCCCAAAGTAGAGCTCGAACTTAAAGA
TAGAGGCAGAGCCACCAAAGATGGAAGAGGCAAACTGAAGCCACATCAGCATAGACAAGC
CAGATGAGAGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGCCTTGCCAGCATCGCTGCTC
CTGAGAAACAGACAAACGCTATCGCAGTTCCGACGAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGAT
CAAAATCAACAGCCACTTTGATCAAGGGGCCAACAGAAGCACCTTCAAGAACGGCAGACA
GGAACAGAAGCGAGAGCCTCTTTTGTTGTTCATGAGGAGGGCAGGAGAGGAGCCAGATCA
TGCTTCCACAGCATGCAATGGTTGAGAGAATACCACCGATGTTCCAGAGCACGTGGAGGT
AAGCTCCAAAGGCAGAGGCAACAAGGGCACAGCACAAAGTGAGATAAACCCGCTTGAGGT
GATTCTGGACGGAGGGAGAGATCTGATGGAGGTTCTTGAGAGAATCATAGCTCCAGCTTC
TGCTACCTGGTTGTGAATCGAAGAAGGACGAGAACGAATCCAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4D278TF 770 0 0
AGCATTATGATGAGAATACGGACAAACACAGCAACAAAA*CGGTGAAAAGGGTCAACGCA
TGTTTCACATAGTCCATGTCCCCTAGATGTGC*TTCTCTATAATCTCTTGGGTATCCACC
ACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGCCCAAAGTAGAGCTCGAACTTAAAGATAGAGGCA
GAGCCACCAAAGATGGAAGAGGCAAACTGAAGCCACATCAGCATAGACAAGCCAGATGAG
AGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGCCTTGCCAGCATCGCTGCTCCTGAGAAA
CAGACAAACGCTATCGCAGTTCCGACGAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGATCAAAATCA
ACAGCCACTTTGATCAAGGGGCCAACAGAAGCACCTTCAAGAACGGCAGACAGGAACAGA
AGCGAGAGCCTCTTTTGTTGTTCATGAGGAGGGCACGAAAGGAGCCAGATCATGCTTCCA
CAGCATGCAATGGTTGTGAGAAGACCACCGATGTTCCAGAGCACGTGGAGGTAAGCTCCA
AAGGCAGAGGCAACTAGGGCACAGCACAAAGTGAGATAAACCCGCTTGAGGTGATTCTGG
ACGGAGGGAGAGATCTGATGGAGGTTCTTGAGAGAATCATAGCTCCAGCTTCTGCTACCT
GGTTGTGAATCGAAGAAGGACGAGAACGAATCCATATGGCCTTTTTTGTTTTCTTTTGCT
TCGTGAGAGAGAGAATCAATTATAAGCGTCGATATCGTTAACGAA
GATCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4FV43TF 567 0 0
AAACTGAAGCCACATCAGCATAGACAAGCCAGATGAGAGAAGGCCTCCGAGGTAGAGATA
CTCTCTGCGCCTTGCCAGCATCGCTGCTCCTGAGAAACAGACAAACGCTATCGCAGTTCC
GACGAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGATCAAAATCAACAGCCACTTTGATCAAGGGGCC
AACAGAAGCACCTTCAAGAACGGCAGACAGGAACAGAAGCGAGAGCCTCTTTTGTTGTTC
ATGAGGAGGGCACGAAAGGAGCCAGATCATGCTTCCACAGCATGCAATGGTTGTGAGAAG
ACCACCGATGTTCCAGAGCACGTGGAGGTAAGCTCCGGAGGCAGAGGCAACTAGGGCACA
GCACAAAGTGAGATAAACCCGCTTGAGGTGATTCTGGACGGAGGGAGAGATCTGATGGAG
GTTCTTGAGAGAATCATAGCTCCAGCTTCTGCTACCTGGTTGTGAATCGAAGAAGGACGA
GAACGAATCCATATGGCCTTTTTTGTTTTCTTTTGCTTCGTGAGAGAGAGAATCAATTAT
AAGCGTCGATATCGTTAACGAAAATCC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 10

CO CL489Contig1 1825 10 30 U
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AATATTACTCTCGCCAGACTTAAAAAACCTAAGTGAAGTAAAAAAAAATCACTAAAAACA
AGAGTTCGGACAACTCCCCTTTGCCCGCTTTTTTGATTAAAACTAAAAAGGCACAAGGGA
AGGGATTTTGTCGGGGAATCTTTTTCCTATTCATGTATCATAGATTGGTAGGGAGGTTTG
GATCCCTTGTTTGCTCTTCCCAGCATTTTCCATAGCAAAGAAATGTAGATTTTATATCGA
TTTTTTTTATTTGATTTGATACGTTGCGGTCAATCACGTAAGATTGGTTATTTAGTTGAA
AGTACGGAAAGAGAGGGATTCGAACCCTCGGTAAACAAAAGCCTACATAACAGTTCCAAT
GTTACGCCTTCAACCACTCGGCCATCTCTCCGACATCAGGATTATGACTGAGTACCTGGG
TGAATAGCGAGTTATTCATCGTTTTTTAGATTATGGTTAATAGATACCTTTTTTGATCGG
AAAAATTGGAAGTAGATAGAATATTTTTTTATAAAAAACGAGTCCGCTTTTATGTTAGTT
CGTACTATAAAATTCCTTTGTTTGTGAGAAAATTTTCTCACAAAAGAAAAGTTAAAGGAA
ATAAAAAGAGTTATAGAATGGATTACTACCTATGCCAAGATCGCGTATAAATGGAAATTT
TATTGATAAAACCTTTACAATTGTAGCCGATATCTTATTACGAGTCATTCCGACAACTTC
CGGAGAAAAAGAGGCATTTACTTATTACAGAGATGGTGCGATTTGATTATCATTATCATT
TTTTTTTATTTCTCACCGATTTGGAATAAAAAAAACGAGTATTGAAAAAAATCTACGCTT
TTGAAGGTGAAGTTTATAATATAAAAAGCAATCCCTTCTGTCATGTATCCACGATTAGTG
CAGCCTTAGATGCTTCAATTATGAATTCGAGTATTGAGCAAAAGGTTTTTACCTACGGTT
CCCGTATTACAGATCAATCCTACTAGACTAATACAATATACGAATAGGAGGCACAGGGGA
AGAAGCACTACGCCGAGAAGTCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATTCCTTTTCT
TTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCATCTCGT
CCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAAT
TTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATG
AATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAA
AAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATT
ATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTG
AAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGA
AATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTAT
GATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACC
AAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTT*ACCACAAGCTTT
TAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAAC
GAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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*ATTGATAAA
C

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G
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TTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCATCTCGT
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AAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGA
AATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTAT
GATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACC
AAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTT*ACCACAAGCTTT
TAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAAC
GAACAGCTAGTCAATGAAATAC
C

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4FL85TF 721 0 0
G
AACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATTCCTTTTCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTA
ATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCATCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACC
ATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAAT
TTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCACTTG*TAGTAAGAAAAGAT
CTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATA
ATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGG
AGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCCGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAAT
GACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATT
ATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATA
TAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGG
CATTAGAACGAAACCCCTTTTT*ACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCAT
TACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAA*GAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACT
AG

QA 2 719 2 719
DS 

RD RR4GQ69JQ 598 0 0
ATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAAT
TTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCCAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGAT
TTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACACTAGCCCCGCTTAGTTCATA
ATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGG
AGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAAT
GACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATT
ATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATA
TAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGG
CATTAGAACGAAACCCCTTTTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCAT
TACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4AG10JQ 677 0 0
TTCTTTGGGATTGAGACTAATTAAAATGGTTGGAACTATAAACATCCATCTCGTCCGTAC
TTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGG
GCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCCTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCA
CTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACAT
TAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTC
ATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTGAAACGG
AGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTAT
GCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGA
AGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCT
TTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTT*ACCACAAGCTTTTAATAA
TATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAG
CTAGTCAATGAAATACT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4FL85JQ 600 0 0
ATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAAT
TTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCACTTG*TAGTAAGAAAAGAT
CTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATA
ATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGG
AGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCCGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAAT
GACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATT
ATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATA
TAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGG
CATTAGAACGAAACCCCTTTTT*ACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCAT
TACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 10

CO CL490Contig1 737 10 16 U
TTTTTTTATTAGTGAAATGAAGTTGATAAGCACCAAAATTCTCAAGTCTGAGATTACGAG
TTGCAAAAGGAAAAAGACAAACGGCAACAACAAAAGGTTTACGTTCGGCAGAATATTCCG
AGTTCAACATATAACTAACAAAAGAGTAAAGATAAAATGGGTTTGGGCTCTTCAGCGTTT
GCCACCACCACCTCCCAACTTAGGACCTCCCTTTGCAGCAGCCTTTGGGACCTTAGCCTG
AATCTTCTGTTGCTTTGAGGCAAATTCAGCTTTCTTTGCCTTCTTCTCATCCTTGGTCTT
CTTGATTCTCTCCTTGATATCACGGAGAGCAGCTTCTCTTGCGGCATCACGAACTTCAGG
CTTCTCAGCTCTCTTCTTCTGGATCACTTCCAAGGTAGCACCAACAATCGACCTTGAGTA
AGGCTTCTTGGTAGCACGTCTCCTCTTCTTGACAGCTTCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTG
CTGCTTTCTGTACATGGTAGTCCAACAAAGCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTGTGAAAGTA
ATGCTTACACTTTGAGTTGATGAACAAGAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGAT
TCCCCTTCCTGGGTAAATCTTGTGGCCACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCAT
GGTGGCGTGTTTCTGCTGCTGCTCCTCTTCTTCCTCCTTTTCTCAAGCTGCTGCCGAAAC
CCTAGTTCAATCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H402JQB U 11
AF RR4F468JQ U 29
AF RR4D212JQ U 12
AF RR4H402TF C 1
AF RR4CG15JQ U 11
AF RR4CG15TF C 434
AF RR4F468TF C 29
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AF RR4D212TF C 12
BS 1 11 RR4H402TF
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BS 226 306 RR4H402JQB
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BS 328 422 RR4H402JQB
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A
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QA 2 572 2 572
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RD RR4F468JQ 552 0 0
C
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QA 2 552 2 552
DS 

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QA 1 622 1 622
DS 

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CTTCTCAGCTCTCTTCTTCTGGATCACTTCCAAGGTAGCACCAACAATCGACCTTGAGTA
AGACTTCTTGGTAGCACGTCTCCTCTTCTTGACAGCTTCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTG
CTGCTTTCTGTACATGGTAGTCCAACAAAGCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTGTGAAAGTA
ATGCTTACACTTTGAGTTGATGAACAAGAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGAT
TCCCCTTCCTGGGTAAATCTTGTGGCCACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCAT
GGTGGCGTGTTTCTGCTGCTGCTCCTCTTCTTCCTCCTTTTCTCAAGCTGCT
CC

QA 1 712 1 712
DS 

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A
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AAAAGACAAACGGCAACAACAAAAGGTTTACGTTCGGCAGAATATTCCGAGTTCAACATA
TAACTAACAAAAGAGTAAAGATAAAATGGGTTTGGGCTCTTCAGCGCTTGCCACCACCAC
CTCCCAACTTAGGACCTCCCTTTGCAGCAGCCTTTGGGACCTTAGCCTGAATCTTCTGTT
GCTTTGAGGCAAATTCAGCTCTCTTTGCCTTCTTCTCATCCTTGGTCTTCTTGATTCTCT
CCTTGATATCACGGAGAGCAGCTTCTCTTGCGGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCAGCTC
TCTTCTTCTGGATCACTTCCAAGGTAGCACCAACAATCGACCTTGAGTAAGGCTTCTTGG
TAGCACGTCTCCTCTTCTTGACAGCTCCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTGCTGCTTTCTGT
ACATGGTAGTCCAACAAAGCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTGTGAAAGTAATGCTTACACT
TTGAGTTGATGAACAAGAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGATTCCCCTTCCTG
GGTAAATCTTGTGGACACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCATGGTGGCGTGTT
TCTGCTGCTGCTCCTCTTCTTCCTCCTTTTCTCAAGCTGCTGCC
C

QA 2 705 2 705
DS 

RD RR4CG15TF 283 0 0
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GAGTTGATGAACAAGAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGATTCCCCTTCCTGGG
TAAATCTTGTGGACACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCATGGTGGCGTGTTTC
TGCTGCTGCTCCTCTTCTTCCTCCTTTTCTCAAGCTGCTGCC
C

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DS 

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C
GCACCAAAATTCTCAAGTCTGAGATTACGAGTTGCAAAAGGAAAAAGACAAACGGCAACA
ACAAAAGGTTTACGTTCGGCAGAATATTCCGAGTTCAACATATAACTAACAAAAGAGTAA
AGATAAAATGGGTTTGGGCTCTTCAGCGTTTGCCACCACCACCTCCCAACTTAGGACCTC
CCTTTGCAGCAGCCTTTGGGACCTTAGCCTGAATCTTCTGTTGCTTTGAGGCAAATTCAG
CTTTCTTTGCCTTCTTCTCATCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTGATATCACGGAGAG
CAGCTTCTCTTGCGGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCAGCTCTCTTCTTCTGGATCACTT
CCAAGGTAGCACCAACAATCGACCTTGAGTAAGGCTT**TGGTAGCACGTCTCCTCTTCT
TGACAGCTTCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTGCTGCTTTCTGTACATGGTAGTCCAACAAA
GCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTGTGAAAGTAATGCTTACACTTTGAGTTGATGAACAAGA
ACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGATTCCCCTTCCTGGGTAAATCTTGTGGCCAC
TGAAACGACAAAGCTCCGTATTGAGAACCATGGTGGCGTGTTTCTGCTGCTGCTCCTCTT
CTTCCTCCTTTTCTCAAGCTGCTGCC
C

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR4CY90JQ 640 0 0
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GGCTTTCTTTGCCTTCTTCTCATCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTGATATCACGGAG
AGCAGCTTCTCTTGCGGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCAGCTCTCTTCTTCTGGATCAC
TTCCAAGGTAGCACCAACAATAGACCTTGAGTAAGGCTTCTTGGTAGCACGTCTCCTCTT
CTTGACAGCTTCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTGCTGCTTTCTGTACATGGTAGTCCAACA
AAGCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTATGAAAGTAATGCTTACACTTTGAGTTGATGAACAA
GAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGATTCCCCTTCCTGGGTAAATCTTGTGGCC
ACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCATGGTGGC
C

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DS 

RD RR4CY90TF 640 0 0
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AAAGATAAAATGGGTTTGGGCTCTTCAGCGTTTGCCACCACCACCTCCCAACTTAGGACC
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GGCTTTCTTTGCCTTCTTCTCATCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTGATATCACGGAG
AGCAGCTTCTCTTGCGGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCAGCTCTCTTCTTCTGGATCAC
TTCCAAGGTAGCACCAACAATAGACCTTGAGTAAGGCTTCTTGGTAGCACGTCTCCTCTT
CTTGACAGCTTCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTGCTGCTTTCTGTACATGGTAGTCCAACA
AAGCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTATGAAAGTAATGCTTACACTTTGAGTTGATGAACAA
GAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGATTCCCCTTCCTGGGTAAATCTTGTGGCC
ACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCATGGTGGC
C

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4D212TF 726 0 0
GTGAAATGAAGTTGATAAGCACCAAAATTCTCAAGTCTGAGATTACGAGTTGCAAAAGGA
AAAAGACAAACGGCAACAACAAAAGGTTTACGTTCGGCAGAATATTCCGAGTTCAACATA
TAACTAACAAAAGAGTAAAGATAAAATGGGTTTGGGCTCTTCAGCGTTTGCCACCACCAC
CTCCCAACTTAGGACCTCCCTTTGCAGCAGCCTTGGGGACCTTAGCCTGAATCTTCTGTT
GCTTTGAGGCAAATTCGGCTTTCTTTGCCTTCTTCTCATCCTTGGTCTTCTTGATTCTCT
CCTTGATATCACGGAGAGCAGCTTCTCTTGCGGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCAGCCC
TCTTCTTCTGGATCACTTCCAAGGTAGCACCAACAATAGACCTTGAGTAAGGCTTCTTGG
TAGCACGTCTCCTCTTCTTGACAGCTTCTTGAGCTGCATCCTTCTTGTGCTGCTTTCTGT
ACATGGTAGTCCAACAAAGCTTGGAAGGCTTCAGTTTGTTATGAAAGTAATGCTTACACT
TTGAGTTGATGAACAAGAACACCTGAGAGTCAGATCGGATGAATCTGATTCCCCTTCCTG
GGTAAATCTTGTGGCCACTGAAACGACAAAGCTCCGTCTTGAGAACCATGGTGGCGTGTT
TCTGCTGCT***CCTATTCTTCCTCCTTTTCTCAAGCTGCTGCCGAAACCCTAGTTCAAT
CGATCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 10

CO CL491Contig1 688 10 10 U
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TTTCACCTTCACAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTC
AGGGCCAAATCATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAA
TCTGATGAGAGGAAGCTTGGGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGC
TGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTATGGCA
TCTAAGTGATAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGG
ATGTCTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGA
TGGAGGTGATGGAACTGGATATTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGC
AAGAGCAGAGCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTT
AAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTGAATCATACAGAAATT
ATACATATGTAAAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATTTATATAAT
ACTATATGTTATCTGTTTTGTGTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 35 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH01JQ C 49
AF RR4FE02JQ C 19
AF RR4FE02TF U 19
AF RR4G513TF U 11
AF RR4G513JQ C 11
AF RR4BW40TF U 1
AF RR4GW55TF U 10
AF RR4GW64JQ C 10
AF RR4BH01TF U 13
AF RR4GW64TF U 10
BS 1 10 RR4BW40TF
BS 11 11 RR4GW55TF
BS 12 105 RR4BW40TF
BS 106 106 RR4FE02TF
BS 107 209 RR4BW40TF
BS 210 210 RR4GW55TF
BS 211 294 RR4BW40TF
BS 295 295 RR4GW55TF
BS 296 675 RR4BW40TF
BS 676 688 RR4GW64JQ

RD RR4BH01JQ 252 0 0
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TAAGCAGATTTCAGGGCCAAATCATGGATTGTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAG
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GCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAA
ACACGTATGGCA

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DS 

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GG
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CAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGAT
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C

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DS 

RD RR4FE02TF 639 0 0
GG
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GGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAGAGGAAGCTTGG
GTGTGAGAAGGGCTCTGCCACATGATATACCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAG
AGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCACCTAAGTGATAAAGCCATCA
AGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCG
CAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGAT
ATTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATATAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGCTATGGCGTG
AAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTG
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C

QA 3 638 3 638
DS 

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CAAAAAAAAA

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DS 

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DS 

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TGGAGGTGATGGAACTGGATATTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGC
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AAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTGAATCATACAGAAATT
ATACATATGTAAAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATTTATATAAT
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DS 

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G
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GGAGGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCC*CTAATGGCTGTGGTGGTT
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ATCTG
AAAAAAAA

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G
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ATCTGTTTTGTGTTCTGC

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GG
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G
TTTTA

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G
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ACAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAAT
CATGGATTCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAGA
GGAAGCTTGGGTGTGAGAAGGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTT
CAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGAT
AAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTAC
TTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATCCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGAT
GGAACTGGATATTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAG
CTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAGATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTC
GAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTGAATCATACAGAAATTATACATATGT
AAAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATTTATATAATACTATATGTT
ATCTG
TTTTGTGTTCTG

QA 2 666 2 666
DS 



AS 1 8

CO CL492Contig1 875 8 6 U
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ATGGCTTCTTCTTCTT***GTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCAC
TCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCA
TCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCGCCCCCCTCTAC
TCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCTTTGCTAAGGTAAACAAGGGGCAGAGTGCACCA
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CCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGT
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CAAAATATAAGAGTTTAATTTCACAAAAATTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH66TF U 1
AF RR4GE23TF U 27
AF RR4AH02TF U 26
AF RR4AQ01TF U 26
AF RR4AH02JQ C 52
AF RR4AQ01JQ C 275
AF RR4EH66JQ C 205
AF RR4GE23JQ C 253
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BS 816 860 RR4AH02JQ
BS 861 875 RR4EH66JQ

RD RR4EH66TF 555 0 0
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ATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCAC
TCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCA
TCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCGCCCCCCTCTAC
TCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCTTTGCTAAGGTAAACAAGGGGCAGAGTGCACCA
GACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAG
CCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGT
GCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGT
GGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTG
TTGAGTGACGAAGGG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4GE23TF 653 0 0
GG
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TTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCT*TTCCTCAGAGAAACACCATTCTCA
CCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTCTCTCGCCCCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCT
TTGCTAAGGTAAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAA
AGCCGGTGAGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAG
ATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCA
AGAAGGCCGGCGCATAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTT
TTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGA
AAGACTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTC
TTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTG

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DS 

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TTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCA
CCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTCTCTCGCCCCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCT
TTGCTAAGGTAAACAAGTG*CAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAA
AGCCGGTGAGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAG
ATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCA
AGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTT
TTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGA
AAGACTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTC
TTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACA
TTGATGAGACCTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATCTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCATC
TTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTTCCCAATGAC
TCCAATT

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DS 

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GGA
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CCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTCTCTCGCCCCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCT
TTGCTAAGGTAAACAAGTG*CAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAA
AGCCGGTGAGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAG
ATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCA
AGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTT
TTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGA
AAGACTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTC
TTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACA
TTGATGAGACCTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATCTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCATC
TTTACAAA*CAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTT

QA 4 774 4 774
DS 

RD RR4AH02JQ 813 0 0
AAAAAAAATATGGCTTCTTCTTCTT***GTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACC
ACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAACCCAATTTCCAGCTCCC
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CCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCTTTGCTAAGGTAAACAAGTG*CAG
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AAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAG
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GGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCA
TACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGACTGGGGAGTGCCTGGAGAT
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AAAGCTGCTTGATCTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCATCTTTACAAAACAACAATTCATGAC
CTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTTCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTG
ATAATAAAACAAAATATAAGAGTTTAATT
AAAG

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DS 

RD RR4AQ01JQ 590 0 0
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GGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACA
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AGACCTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATCTTTTTTTCTTCCTTTTCTGCATCTTTACA
AAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTTCCCAATGACTCCAAT
TCAAAACACCAAACTTGATAATAAAACAAAATATAAGAGTTTAATT
AAAG

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DS 

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CATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTTCCCAA
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AAAAATTTTTG

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DS 

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TCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCATAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCT
GCTTCCCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAA
GGGAATAAGGTGAGGAAAGACTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGG
AGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTC
CAGCCTGAGAAACACATTGATGAGACCTTAAAGTTCCTCAAATCTGCTTGATCTTCTCTT
CTTCCTCTTCTGCATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTG
CTGTTTTCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTGATAATAAAACAAAATATAAGA
GTTTAATT
TCAC

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DS 



AS 1 10

CO CL493Contig1 1456 10 5 U
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AAAGTATATATATATAGAAAGATTTGAGATTATCCTATTCGGCTTAGTTTTCATTCATTG
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CTGTACTTTCTTTTTTTTGGGGGGGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTA
AGTGCGACTAGCATCTTTTACACATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGT
AGAGTTTGTAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTA
TCAAGGGAGAATTCAGATACCATTTTTTTTTT*GCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG
AAAAAAAAAAAAGAAGAATTCCAATTTGGGTCGAGTGAATAAATATAAATGGATGGATAA
AAAACCAGTTTTCCTTATTCTAAGAAAAAAAAGAAACGAGCTTCCATTCGTAATTTGAAA
AATTACCCGATCTAATTAAATGTTAAAAATAGATTAGTACCTAATACGGGTATAGGAAGG
AATTTTTTTCTTGCGTGTTATTATCAATTTTTTCGTGAGTCCTAATTATTTTTTCCCTAG
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TCATCTTGTTTTGTTATTCTATAATATAACGAACAGAAACCTATTAAAGATAGAGAATCC
GGTTAGCAGTCTACCTGTTTATGAGGTATTTATTGCTTTCGTAATCTAATACCTTATTTT
GACTGTATCGCACTATGTGTCATTTCAGGACTCAAGAAAATAAAGACTTTACTTTTAGTT
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GGCAACAGAGTTTTCTATATCCACTTTTTTTTCGGGAGTATATTTATGTATTTGCTTATG
ATCACGGTTTAAATAGATTAAATAGAAATCGCCTTATTTTCTTGGAAAATGCGGATTATG
ACAAAAAATATAGTTCACTAATTGTGAAACGCTTAATTTTACGAATGTACGAACAGAATC
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ATCAAATGATATCTGTTTTATTTGCAGTGATTGTAGAAATTCCATTTTCCCTAAGGTTGG
GATCCTCTATCGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4H012TF U 1
AF RR4EF86JQ C 268
AF RR4EF86TF U 268
AF RR4BR89JQ C 324
AF RR4H012JQ C 330
AF RR4BR89TF U 324
AF RR4GP21TF U 332
AF RR4GP21JQ C 739
AF RR4F951JQ C 1014
AF RR4F951TF U 1014
BS 1 540 RR4H012TF
BS 541 1009 RR4GP21TF
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BS 1015 1451 RR4F951TF
BS 1452 1456 RR4GP21JQ

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AAAGTATATATATATAGAAAGATTTGAGATTATCCTATTCGGCTTAGTTTTCATTCATTG
TATGAACTAACAAACCACGGGGTTAAACTTTTTTATTTTTTCTATTCTTTTAAAAATTTA
CAATCATATTGACAACAGTGTATGGACCAAATATAATTCTCTCATAGAGAAATAGATCTA
TTTATCCCTGACGCACACATGACTGGATTTTTCTTTATTCTGGTTGTATCTACATATTTG
CTGTACTTTCTTTTTTTTGGGGGGGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTA
AGTGCGACTAGCATCTTTTACACATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGT
AGAGTTTGTAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTA
TCAAGGGAGAATTCAGATACCATTTTTTTTTT*GCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4EF86JQ 273 0 0
TTTTTCTTTATTCTGGTTGTATCTACATATTTGCTGTACTTTCTTTTTTTTGGGGGGGGG
TTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTCTTACACATTT
GTATGAGGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTGATCCT
GAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCATTTTT
TTTTT*GCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR4EF86TF 273 0 0
TTTTTCTTTATTCTGGTTGTATCTACATATTTGCTGTACTTTCTTTTTTTTGGGGGGGGG
TTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTCTTACACATTT
GTATGAGGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTGATCCT
GAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCATTTTT
TTTTT*GCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR4BR89JQ 217 0 0
GGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTTTTACAC
ATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATTTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTGA
TCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCAT
TTTTTTTTT*GCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR4H012JQ 193 0 0
GCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATTTTTTACACATTTGT
ATGAAGAAAAGGATTTGTCCAGATTTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTGATCCTGA
AAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCATTTTTTT
TTT*GCTTTT
TTG

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4BR89TF 217 0 0
GGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTTTTACAC
ATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTGA
TCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCAT
TTTTTTTTT*GCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR4GP21TF 678 0 0
G
AACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTTTTACACATTTGTATG
AAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTGATCCTGAAAG
GAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCATTTTTTTTTT
TGCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCGAAAAAAAAAAAAGAAGAATTCCAATTTGGGTC
GAGTGAATAAATATAAATGGATGGATAAAAAACCAGTTTTCCTTATTCTAAGAAAAAAAA
GAAACGAGCTTCCATTCGTAATTTGAAAAATTACCCGATCTAATTAAATGTTAAAAATAG
ATTAGTACCTAATACGGGTATAGGAAGGAATTTTTTTCTTGCGTGTTATTATCAATTTTT
TCGTGAGTCCTAATTATTTTTTCCCTAGTTCGTTTGGGTTAGGTTGGAGATGGATGTGTA
AAAGAAGCAGTATATTGATAAAAAAAATATATATATATATTTCCAAAATCAAAAGAGCGA
TTAGGTTCAAAAAATAAAGGATTTCTAATCATCTTGTTTTGTTATTCTATAATATAACGA
ACAGAAACCTATTAAAGATAGAGAATCCGGTTAGCAGTCTACCTGTTTATGAGGTATTTA
TTGCTTTCGTAATCTAA

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR4GP21JQ 718 0 0
TATTATCAATTTTTTCGTGAGTCCTAATTATTTTTTCCCTAGTTCGTTTGGGTTAGGTTG
GAGATGGATGTGTAAAAGAAGCAGTATATTGATAAAAAAAATATATATATATATTTCCAA
AATCAAAAGAGCGATTAGGTTCAAAAAATAAAGGATTTCTAATCATCTTGTTTTGTTATT
CTATAATATAACGAACAGAAACCTATTAAAGATAGAGAATCCGGTTAGCAGTCTACCTGT
TTATGAGGTATTTATTGCTTTCGTAATCTAATACCTTATTTTGACTGTATCGCACTATGT
GTCATTTCAGAACTCAAGAAAATAAAGACTTTACTTTTAGTTCAAATCGAATTTCAATCC
AAATGGAGAAATTTCAAGGATATTCAGAGTTCGATGGGGCTCGGCAACAGAGTTTTCTAT
ATCCACTTTTTTTTCGGGAGTATATTTATGTATTTGCTTATGATCACGGTTTAAATAGAT
TAAATAGAAATCGCCTTATTTTCTTGGAAAATGCGGATTATGACAAAAAATATAGTTCAC
TAATTGTGAAACGCTTAATTTTACGAATGTACGAACAGAATCGTTTGATTATTCCCACTA
AGGATTTGAACAAAAATCTGGGGCATACCAATAATTTCTATTATCAAATGATATCTGTTT
TATTTGCAGTGATTGTAGAAATTCCATTTTCCCTAAGGTTGGGATCCTCTATCGAAGG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4F951JQ 438 0 0
G
TATTTTGACTGTATCGCACTATGTGTCATTTCAGGACTCAAGAAAATAAAGACTTTACTT
TTAGTTCAAATCGAATTTCAATCCAAATGGAGAAATTTCAAGGATATTTAGAGTTCGATG
GGGCTCGGCAACAGAGTTTTCTATATCCACTTTTTTTTCGGGAGTATATTTATGTATTTG
CTTATGATCACGGTTTAAATAGATTAAATAGAAATCGCCTTATTTTCTTGGAAAATGCGG
ATTATGACAAAAAATATAGTTCACTAATTGTGAAACGCTTAATTTTACGAATGTACGAAC
AGAATCGTTTGATTATTCCCACTAAGGATTTGAACAAAAATCTGGGGCATACCAATAATT
TCTATTATCAAATGATATCTGTTTTATTTGCAGTGATTGTAGAAATTCCATTTTCCCTAA
GGTTGGGATCCTCTATC

QA 2 438 2 438
DS 

RD RR4F951TF 438 0 0
G
TATTTTGACTGTATCGCACTATGTGTCATTTCAGGACTCAAGAAAATAAAGACTTTACTT
TTAGTTCAAATCGAATTTCAATCCAAATGGAGAAATTTCAAGGATATTTAGAGTTCGATG
GGGCTCGGCAACAGAGTTTTCTATATCCACTTTTTTTTCGGGAGTATATTTATGTATTTG
CTTATGATCACGGTTTAAATAGATTAAATAGAAATCGCCTTATTTTCTTGGAAAATGCGG
ATTATGACAAAAAATATAGTTCACTAATTGTGAAACGCTTAATTTTACGAATGTACGAAC
AGAATCGTTTGATTATTCCCACTAAGGATTTGAACAAAAATCTGGGGCATACCAATAATT
TCTATTATCAAATGATATCTGTTTTATTTGCAGTGATTGTAGAAATTCCATTTTCCCTAA
GGTTGGGATCCTCTATC

QA 2 438 2 438
DS 



AS 1 10

CO CL494Contig1 951 10 17 U
GGATCTCTGTTCCCATCCCCCAGATTTTGCTCTTGTTCGCATCATCGACAGTCGAAACCA
CCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTTAAGCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGG
GGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATTCTCTGATGATTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCA
CTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCC
AAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCG
GCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGA
AGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTG
GAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTG
CCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAAC
AGGCTTTCATGGCGATGTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGA
ACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTTGTCCAAAAGAATGGCT
GTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGAGTTCAAAATCGTTTTCTCTT
CAGTTCACTTGTACTTTGTATGTAATATCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGG
TGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTCGTACCAACACATTTCTGTGGCTGCCTT
CAGTGTATTTATATCGATACTGTCGTTTTGCGTAACAATGTTTATTAGAAGACCCACTGA
TTTATTACAAAATATCAAATGTAATAATTAAGGTAAGTTTTTATCGCGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 20 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR30TF U 113
AF RR4GV44JQ C 100
AF RR4GV44TF U 125
AF RR4H384TF U 27
AF RR4AH35TF U 1
AF RR4BZ61TF U 1
AF RR4AK41TF U 1
AF RR4BZ61JQ C 214
AF RR4H384JQ C 420
AF RR4CR30JQ C 437
BS 1 140 RR4AH35TF
BS 141 141 RR4GV44TF
BS 142 211 RR4AH35TF
BS 212 212 RR4GV44TF
BS 213 649 RR4AH35TF
BS 650 650 RR4BZ61TF
BS 651 651 RR4AH35TF
BS 652 652 RR4BZ61TF
BS 653 806 RR4AH35TF
BS 807 819 RR4AK41TF
BS 820 820 RR4BZ61JQ
BS 821 823 RR4AK41TF
BS 824 824 RR4BZ61JQ
BS 825 840 RR4AK41TF
BS 841 841 RR4H384JQ
BS 842 873 RR4BZ61JQ
BS 874 951 RR4CR30JQ

RD RR4CR30TF 267 0 0
TGGCGTGGGGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATTCT**GATTATTCGTATGTAGAAAGTTA
CATAAGCACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAACAAGACGGGAAGACGAT
TAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGCAGTTA
TTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAA
CAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAAT

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR4GV44JQ 319 0 0
TCATCGGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATTCTCTGATGATTCGT
ATGTAGAAAGTTACATAAGCACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAACAAG
ACGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAA
TTACTAGCAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTTTACGACGTAACAGATC
AAGAAAGCTTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCTAGTGACA
ATGTGAACAAACTCCTGGT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4GV44TF 522 0 0
GTCTTGTCTACTGTTGAGATTCTCTGATGATTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCACTAT
TGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCCAAAT
TTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCGGCGC
ACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGAAGCA
ATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAA
CAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGA
TGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGC
TTTCATGGCGATGTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAA
TGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAG*ACAGCCTGTTGT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4H384TF 661 0 0
GG
GCTCTTGTTCGCATCATCGACAGTCGAAACCACCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTT
TAAGCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATTCTC
TGATGATTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGAC
TGTGGAACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCG
GTTCAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCTCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGA
CGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTA
TGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAG
AGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGA
GACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATAGCGATGTCCACATCGAT
CAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGAT
CAGAGGACAGCCTGTTGTCCAAAAGAATGGCTGTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATA

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR4AH35TF 806 0 0
GGATCTCTGTTCCCATCCCCCAGATTTTGCTCTTGTTCGCATCATCGACAGTCGAAACCA
CCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTTAAGCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGG
GGAAGTCTTGTCTACTGTTGGGATTCTCTGATGATTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCA
CTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTTGAACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCC
AAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCG
GCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGA
AGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTG
GAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTG
CCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAAC
AGGCTTTCATGGCGATGTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGA
ACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTTGTCCATA*GAATGGCT
GTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGAGTTCAAAATCGTTTTCTCTT
CAGTTCACTTGTACTTTGTATGTAATATCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGG
TGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4BZ61TF 790 0 0
GGATCTCTGTTCCCATCCCCCAGATTTTGCTCTTGTTCGCATCATCGACAGTCGAAACCA
CCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTTAAGCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGG
GGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATTCTCTGATGATTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCA
CTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCC
AAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCG
GCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGA
AGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTACGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTG
TAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTG
CCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAAC
AGGCTTTCATGGCGATGTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGA
ACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTTGTCCAAAAGAATGGCT
GTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGAGTTCAAA*TCGTTTTCTCTT
CAGTTCACTTGTACTTTGTATGTA*TATCTGGTCTGTA*TTAAGCTCA*GTGTCCTTTGG
TGGTTGTTTT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4AK41TF 840 0 0
GGATCTCTGTTCCCATCCCCCAGATTTTGCTCTTGTTCGCATCATCGACAGTCGAAACCA
CCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTTAAGCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGG
GGAAGTCTTGTCTACTGTTGGGATTCTCTGATGATTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCA
CTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTTGAACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCC
AAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCG
GCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAACAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGA
AGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTG
GAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTG
CCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAAC
AGGCTTTCATGGCGATGTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGA
ACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTTGTCCATA*GAATGGCT
GTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGAGTTCAAAATCGTTTTCTCTT
CAGTTCACTTGTACTTTGTATGTAATATCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGG
TGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTCGTACCA*CACGTTTCTGTGGCTGCCTT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4BZ61JQ 660 0 0
AACAAGACGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCA
GGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTAA
CAGATCAAGAAAGCTTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTACGCTA
GTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTGTAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCG
TTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTA
GTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCCACATCGATCAAAC
AGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAG
GACAGCCTGTTGTCCAAAAGAATGGCTGTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATATCCTTT
TCTTCGAGTTCAAAATCGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTTTGTATGTAATATCTGGT
CTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGGTGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTC
GTACCAACACATTTCTGTGGCTGCCTTTAGTGTATTTATATCGATACTGTCGTTTTGCGT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4H384JQ 454 0 0
GGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTT
GCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAA
CAGGCTTTCATAGCGATGTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGG
AACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTTGTCCAAAAGAATGGC
TGTTGCTCAACTTGATTCCCTAGCAATATCCTTTTTTTCGAGTTCAAAATCGTTTTCTCT
TCAGTTCACTTGTACTTTGTATGTAATATCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCTTTTG
GTGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTCGTACCAACACATTTCTGTGGCTGCCT
TCAGTGTATTTATATCGATACTGTCGTTTTGCGT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4CR30JQ 515 0 0
TACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAAT
TCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGAT
GTCCACATCGATCAAACAGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAATGCCAGACCGCC
GACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTTGTCCAAAAGAATGGCTGTTGCTCAACTTGATT
CCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGAGTTCAAAATCGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTT
TGTATGTAATATCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGGTGGTTGTTTTTCTCTT
TGCGTATCAACATTTTCGTACCAACACATTTCTGTGGCTGCCTTCAGTGTATTTATATCG
ATACTGTCGTTTTGCGTAACAATGTTTATTAGAAGACCCACTGATTTATTACAAAATATC
AAATGTAATAATTAAGGTAAGTTTTTATCGCGTCC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 2 10

CO CL495Contig1 914 6 9 U
GGATAACAAAAACCATTCAGAAAGGAACAGAGAACAAAATGTCTCGAAAAAGAAAGTAAA
CTGAAAAGCTAAAAAAATCCTTAAAAGCATAACAATTGTGTTTTTCTGCGCCAAGAAAGT
ATTTCAACAAAAGCAACTTCATAAAACATTCAAAAAACTTCTTCCAAGTCAAGGAAATGA
ACTGAGGCTTGATGACTATCCTCTTCACTTTTTAGACTTCTTCTTCGGTACCTCTGCGGT
TTGAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGCAGTCGCAGGCTCGACATCTCCACC
*AGGACCCTTAGCAAGACGCTCTTCTCTCCTAGCATGTTTCCTTTCTCGGCTAGCCTTGT
TCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTTCTCTCTGGCTTTCTCGGCCT
TGGACTTGTGGATGCTCTCCATCAAAACACGCTTGTTCTTGAACACGTTACCCTTAACAC
GCATGTACATGTCGTGGTACATGTGCTTGTCAATCTTCTTCGACTCTCTGTACTTCTTCA
GGAGACGCCTTAGCACACGCATCCTGCGCATCCACAGTACCTTTGTTGGCAACCTAGCTT
CACGCGTACCCTTCCTCTTACCATATCCAGAGTGACGACCCTTCATCTTGGCAATCTTCA
TGCGGCGGGCCCGGGAGCGAGAGTGGATCTTGGTTGGCTTCTTGATAATGAAACCATCAT
TCACCAACTTCCTGATGTTTTGGCGGGAGTTGGCCATGGAGATATCGGCGGTTTCATTTG
GATCGAGCCAAACTTTGCCCTTCCCGCACTTCATCACCGATGCGGCGAGCCGATTCTGTT
GCTTCAGCGCTACCATTTCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTGCTCGCTCCTCTTCCTG
GGAGATTAGTGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX76JQ U 1
AF RR4BX76TF C 1
AF RR4GT80JQ U 58
AF RR4GQ63JQ U 66
AF RR4HB56JQB U 41
AF RR4GQ63TF C 228
BS 1 326 RR4BX76JQ
BS 327 327 RR4HB56JQB
BS 328 351 RR4BX76JQ
BS 352 552 RR4HB56JQB
BS 553 553 RR4GQ63JQ
BS 554 778 RR4HB56JQB
BS 779 779 RR4GQ63JQ
BS 780 852 RR4HB56JQB
BS 853 914 RR4GQ63TF

RD RR4BX76JQ 368 0 0
GGATAACAAAAACCATTCAGAAAGGAACAGAGAACAAAATGTCTCGAAAAAGAAAGTAAA
CTGAAAAGCTAAAAAAATCCTTAAAAGCATAACAATTGTGTTTTTCTGCGCCAAGAAAGT
ATTTCAACAAAAGCAACTTCATAAAACATTCAAAAAACTTCTTCCAAGTCAAGGAAATGA
ACTGAGGCTTGATGACTATCCTCTTCACTTTTTAGACTTCTTCTTCGGTACCTCTGCGGT
TTGAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGCAGTCGCAGGCTCGACATCTCCACC
*AGGACCCTTAGCAAGACGCTCTTCTATCCTAGCATGTTTCCTTTCTCGGC
CTTGGACTTGTGGATGC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4BX76TF 368 0 0
GG
ATAACAAAAACCATTCAGAAAGGAACAGAGAACAAAATGTCTCGAAAAAGAAAGTAAACT
GAAAAGCTAAAAAAATCCTTAAAAGCATAACAATTGTGTTTTTCTGCGCCAAGAAAGTAT
TTCAACAAAAGCAACTTCATAAAACATTCAAAAAACTTCTTCCAAGTCAAGGAAATGAAC
TGAGGCTTGATGACTATCCTCTTCACTTTTTAGACTTCTTCTTCGGTACCTCTGCGGTTT
GAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGCAGTCGCAGGCTCGACATCTCCACC*A
GGACCCTTAGCAAGACGCTCTTCTATCCTAGCATGTTTCCTTTCTCGGC
CTTGGACTTGTGGATGC

QA 3 351 3 351
DS 

RD RR4GT80JQ 494 0 0
AAACTGAAAAGCTAAAAAAATCCTTAAAAGCATAACAATTGTGTTTTTCTGCGCCAAGAA
AGTATTTCAACAAAAGCAACTTCATAAAACATTCAAAAAACTTCTTCCAAGTCAAGGAAA
TGAACTGAGGCTTGATGACTATCCTCTTCACTTTTTAGACTTCTTCTTCGGTACCTCTGC
GGTTTGAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGGGGTGCAGTCGCAGGCTCGACATCTCC
ACC*AGGACCCTTAGCAAGACGCTCTTCTCTCCTAGCATGTTTCCTTTCTCGGCTAGCCT
TGTTCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTTCTCTCTGGCTTTCTCGG
CCTTGGACTTGTGGATGCTCTCCATCAAAACACGCTTGTTCTTGAACACGTTACCCTTAA
CACGCGTGTACATGTCGTGGTACATGTGCTTGTCAATCTTCTTCGACTCTCTGTACTTCT
TCAGGAGACGCCTT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4GQ63JQ 762 0 0
G
AGCTAAAAAAATCCTTAAAAGCATAACAATTGTGTTTTTCTGCGCCAAGAAAGTATTTCA
ACAAAAGCAACTTCATAAAACATTCAAAAAACTTCTTCCAAGTCAAGGAAATGAACTGAG
GCTTGATGACTATCCTCTTCACTTTTTAGACTTCTTCTTCGGTACCTCTGCGGTTTGAGC
AGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGCAGTCGCAGGCTCGACATCTCCACC*AGGAC
CCTTAGCAAGACGCTCTTCTCTCCTAGCATGTTTCCTTTCTCGGCTAGCCTTGTTCTTAG
CCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTTCTCTCTGGCTTTCTCGGCCTTGGACT
TGTGGATGCTCTCCATCAAAACACGCTTGTTCTTGAACACGTTACCCTTAACACGCATGT
ACATGTCGTGGTACATGTGCTTGTCAATCTTCTTCGACTCTCTGTACTTCTTCAGGAGAC
GCCTTAGCACACGCATCCTGCGCATCCACAGTACCTTTGTTGGCAACCTAGCTTCACGCG
TACCCTTCCTCTTACCATATCCAGAGTGACGACCCTTCATCTTGGCAATCTTCATGCGGC
GGGCCCGGGAGCGAGAGTGGATCTTGGTTGGCTTCTTGATAATGAAACCATCATTCACCA
ACTTCCTGATGTTTTGGCGGGAGTTGGCCATGGAGATATCGGCGGTTTCATTTGGATCGA
GCCAAACTTTGCCCTTCCCGCACTTCATCACCGATGCGGCG

QA 2 762 2 762
DS 

RD RR4HB56JQB 812 0 0
GCCTCGA
AAAAGAAAGTAAACTGAAAAGCTAAAAAAATCCTTAAAAGCATAACAATTGTGTTTTTCT
GCGCCAAGAAAGTATTTCAACAAAAGCAACTTCATAAAACATCCAAAAAACTTCTTCCAA
GTCAAGGAAATGAACTGAGGCTTGATGACTATCCTCTTCACTTTTTAGACTTCTTCTTCG
GTACCTCTGCGGTTTGAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGCAGTCGCAGGCT
CGACATCTCCACC*AGGACCCTTAGCAAGACGCTCTTCTCTCCTAGCATGTTTCCTTTCT
CGGCTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTTCTCTCTG
GCTTTCTCGGCCTTGGACTTGTGGATGCTCTCCATCAAAACACGCTTGTTCTTGAACACG
TTACCCTTAACACGCATGTACATGTCGTGGTACATGTGCTTGTCAATCTTCTTCGACTCT
CTGTACTTCTTCAGGAGACGCCTTAACACACGCATCCTGCGCATCCACAGTACCTTTGTT
GGCAACCTAGCTTCACGCGTACCCTTCCTCTTACCATATCCAGAGTGACGACCCTTCATC
TTGGCAATCTTCATGCGGCGGGCCCGGGAGCGAGAGTGGATCTTGGTTGGCTTCTTGATA
ATGAAACCATCATTCACCAACTTCCTGATGTTTTGGCGGGAGTTGGCCATGGAGATATCG
GCGGTTTCATTCGGATCGAGCCAAACTTTGCCCTTCCCGCACTTCATCACCGATGCGGCG
AGCCGATTCTGTTGCTTCAGCGCTA

QA 8 812 8 812
DS 

RD RR4GQ63TF 687 0 0
GTACCTCTGCGGTT*GAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTGGTGGTGCAGTCGCAGGCT
CGACATCTCCACCCAGGACCCTTAGCAAGACGCTCTTCTCTCCTAGCATGTTTCCTTTCT
CGGCTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTTCTCTCTG
GCTTTCTCGGCCTTGGACTTGTGGATGCTCTCCATCAAAACACGCTTGTTCTTGAACACG
TTACCCTTAACACGCATGTACATGTCGTGGTACATGTGCTTGTCAATCTTCTTCGACTCT
CTGTACTTCTTCAGGAGACGCCTTAGCACACGCATCCTGCGCATCCACAGTACCTTTGTT
GGCAACCTAGCTTCACGCGTACCCTTCCTCTTACCATATCCAGAGTGACGACCCTTCATC
TTGGCAATCTTCATGCGGCGGGCCCGGGAGCGAGAGTGGATCTTGGTTGGCTTCTTGATA
ATGAAACCATCATTCACCAACTTCCTGATGTTTTGGCGGGAGTTGGCCATGGAGATATCG
GCGGTTTCATTTGGATCGAGCCAAACTTTGCCCTTCCCGCACTTCATCACCGATGCGGCG
AGCCGCTTCTGTTGCTTCAGCGCTACCATTTCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTGCTC
GCTCCTCTTCCTGGGAGATTAGTGTCC

QA 1 687 1 687
DS 



CO CL495Contig2 417 4 7 U
GAACAAGGCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTAGGAGAGAAGAGCGTCTTGCTAAGGGTCC
TGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTCA
AACCGCAGAGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGATAGTCATCAAGCCCCTC
AGTTCATTTCCTTGACTTGGAAGAAGTTTTTTGAATGTTTTATGAAGTTGCTTTTGTTGA
AATACTTTCTTGACGCAGAAAAACATAATTGTTATGCTTTTAAGGATTTTTTTAGCTTTT
CAGTTGACTTTCTTTTCGAGACATTTTGTTCTCTGTTCTTTTCTGAATGCTTTTCGTTAT
TCACCTAATCTAATTCACCCACACATGAATTTGATTATCCGATATGTTGAACGTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GA55TF U 1
AF RR4F594JQ C 16
AF RR4F594TF U 16
AF RR4GA55JQ C 46
BS 1 252 RR4GA55TF
BS 253 253 RR4F594TF
BS 254 262 RR4GA55TF
BS 263 263 RR4F594TF
BS 264 272 RR4GA55TF
BS 273 273 RR4F594TF
BS 274 417 RR4GA55TF

RD RR4GA55TF 417 0 0
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TGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTCA
AACCGCAGAGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGATAGTCATCAAGCCCCTC
AGTTCATTTCCTTGACTTGGAAGAAGTTTTTTGAATGTTTTATGAAGTTGCTTTTGTTGA
AATACTTTCTTGGCGCAGAAAAGCATAATTGT*ATGCTTTTAAGGATTTTTTTAGCTTTT
CAGTTGACTTTCTTTTCGAGACATTTTGTTCTCTGTTCTTTTCTGAATGCTTTTCGTTAT
TCACCTAATCTAATTCACCCACACATGAATTTGATTATCCGATATGTTGAACGTCCG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4F594JQ 388 0 0
G
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CCTGCGACTGCACCACCAGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCG
AAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGATAGTCATCAAGCCCCTCAGTTCATTTCCTTGAC
TTGGAATAAGTTTTTTGAATGTTTTATGAAGTTGCTTTTGTTGAAATACTTTCTTGACGC
AGAAAAACATAATTGTTATGCTTTTAAGGATTTTTTTAGCTTTTCAGTTGACTTTCTTTT
CGAGACATTTTGTTCTCTGTTCTTTTCTGAATGCTTTTCGTTATTCACCTAATCTAATTC
ACCCACACATGAATTTGATTATCCGA
C

QA 2 387 2 387
DS 

RD RR4F594TF 388 0 0
G
GAAAGGAAACATGCTAGGAGAGAAGAGCGTCTTGCTAAGGGTCCTGGTGGAGATGTCGAG
CCTGCGACTGCACCACCAGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCG
AAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGATAGTCATCAAGCCCCTCAGTTCATTTCCTTGAC
TTGGAATAAGTTTTTTGAATGTTTTATGAAGTTGCTTTTGTTGAAATACTTTCTTGACGC
AGAAAAACATAATTGTTATGCTTTTAAGGATTTTTTTAGCTTTTCAGTTGACTTTCTTTT
CGAGACATTTTGTTCTCTGTTCTTTTCTGAATGCTTTTCGTTATTCACCTAATCTAATTC
ACCCACACATGAATTTGATTATCCGA
C

QA 2 387 2 387
DS 

RD RR4GA55JQ 372 0 0
TCTTGCTAAGGGTCCTGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGCTGCTGCTGC
TGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGATA
GTCATCAAGCCCCTCAGTTCATTTCCTTGACTTGGAAGAAGTTTTTTGAATGTTTTATGA
AGTTGCTTTTGTTGAAATACTTTCTTGGCGCAGAAAAGCATAATTGT*ATGCTTTTAAGG
ATTTTTTTAGCTTTTCAGTTGACTTTCTTTTCGAGACATTTTGTTCTCTGTTCTTTTCTG
AATGCTTTTCGTTATTCACCTAATCTAATTCACCCACACATGAATTTGATTATCCGATAT
GTTGAACGTCCG

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 10

CO CL496Contig1 1263 10 14 U
GGACTCTCAATCAAAACAATCAAACAACACACAGAGCTAGCTACTTCAACCAAATACTTT
CAAAGAAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAAGAACATTAAGTTTCCAGTTGTAGACTTGTCCA
AGCTCATTGGTGAAGAGAGAGACCAAACCATGGCTTTAATCAACAATGCTTGTGAGAATT
GGGGCTTCTTTGAGATAGTGAACCATGGTTTACCACATGATTTGATGGACAACGTCGAGA
AGATGACAAAGGAACATTACAAGAAATCAATGGAACAAAAGTTCAACGACATGCTCAAGT
CCAAAGGTCTGGAAAATCTTGAGAGAGAAGTTGAGGATGTCGATTGGGAAAGCACTTTCT
ACCTTCGTCATCTCCCTCAGTCCAATCTCTACGACATTCCTGATATGTCTGATGAATACC
GGACGG*CTATGAAAGATTTCGGG*AAGATATTGGAGAATCTTGCTGAGGATTTGTTGGA
TCTATTGTGTGAAAATCTAGGGTTAGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAAC
AAAAGGTCCAACCTTTGGGACTAAGGTGAGCAATTATCCAGCTTGTCCTAAGCCAGAGAT
GATCAAAGGTCTAAGGGCCCACACTGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGA
CAAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTGG*ATTGATGTTCCTCCACTCA
ACCACTCTATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTTATAACCAACGGCAGGTACA
AGAGTGTGATGCACCGTGTGGTGACTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTT
TCTACAACCCGGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTCTGCAAAGAAA
CCGAGTACCCGAGTTTTGTTTTTGATGACTACATGAAGCTCTATGCTGGGGTCAAGTTTC
AGCCTAAGGAGCCACGGTTCGAGGCAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACAGAATTGAACC
CAACAGCAGCCGTAGAGACTTTCTAAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAAGCAAAGAAAC
AAAAACGTGTGTTGTGGTGTGTGTGTGTATACGTCAATAAGTTACAAGACTGATATTATT
GTTGATATAATTAAGATGTCTGGTGGTTAATTGTTGGTCAATGGTGTTTTAAAGTGTGGT
GTGTTTATTTATGTTTATTGAAGATGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTCTAA
GAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4E842TF U 1
AF RR4GV64TF U 189
AF RR4AN94TF U 1
AF RR4AM09TF U 325
AF RR4GV64JQ C 520
AF RR4AM09JQ C 591
AF RR4EZ93TF U 504
AF RR4E842JQ C 1060
AF RR4CN56JQ C 725
AF RR4AN94JQ C 556
BS 1 308 RR4AN94TF
BS 309 309 RR4GV64TF
BS 310 632 RR4AN94TF
BS 633 633 RR4AM09TF
BS 634 700 RR4AN94TF
BS 701 701 RR4AM09TF
BS 702 756 RR4AN94TF
BS 757 996 RR4AM09TF
BS 997 1037 RR4EZ93TF
BS 1038 1039 RR4GV64JQ
BS 1040 1075 RR4EZ93TF
BS 1076 1076 RR4AN94JQ
BS 1077 1258 RR4EZ93TF
BS 1259 1263 RR4AN94JQ

RD RR4E842TF 240 0 0
GACTCTCAC
ATCAAAACAATCAAACAACACACAGAGCTAGCTACTTCAACCAAATACTTTCAAAGAAGA
GAGAGAGAGA**TGGAGAAGAACATTAAGTTTCCAGTTGTAGACTTGTCCAAGCTCATTG
GTGAAGAGAGAGACCAAACCATGGCTTTAATCAACAATGCTTGTGAGAATTGGGGCTTCT
TTTAGATAGTGAACCATGGTTTACCACATGATTTGATGGACAACGTC
TAGA

QA 10 236 10 236
DS 

RD RR4GV64TF 355 0 0
TTTGAGATAGTGAACCATGGTTTACCACATGATTTGATGGACAACGTCGAGAAGATGACA
AAGGAACATTACAAGAAATCAATGGAACAAAAGTTCAACGACATGCTCAAGTCCAAAGGT
CTGGAAAATCTTGAGAGAGAAGTTGAGGATGTCGATTGGGAAAGCACTTTCTACCTTCGT
CATCTCCCTCAGTCCAATCTCTACGACACTCCTGATATGTCTGATGAATACCGGACGGGC
TATGAAAGATTTCGGGGAAGATATTGGAGAATCTTGCTGAGGATTTGTTGGATCTATTGT
GTGAAAATCTAGGGTTAGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAACAAA

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR4AN94TF 756 0 0
GGACTCTCAATCAAAACAATCAAACAACACACAGAGCTAGCTACTTCAACCAAATACTTT
CAAAGAAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAAGAACATTAAGTTTCCAGTTGTAGACTTGTCCA
AGCTCATTGGTGAAGAGAGAGACCAAACCATGGCTTTAATCAACAATGCTTGTGAGAATT
GGGGCTTCTTTGAGATAGTGAACCATGGTTTACCACATGATTTGATGGACAACGTCGAGA
AGATGACAAAGGAACATTACAAGAAATCAATGGAACAAAAGTTCAACGACATGCTCAAGT
CCAAAGGTTTGGAAAATCTTGAGAGAGAAGTTGAGGATGTCGATTGGGAAAGCACTTTCT
ACCTTCGTCATCTCCCTCAGTCCAATCTCTACGACATTCCTGATATGTCTGATGAATACC
GGACGG*CTATGAAAGATTTCGGG*AAGATATTGGAGAATCTTGCTGAGGATTTGTTGGA
TCTATTGTGTGAAAATCTAGGGTTAGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAAC
AAAAGGTCCAACCTTTGGGACTAAGGTGAGCAATTATCCAGCTTGTCCTAAGCCAGAGAT
GATCAAAGGTCTAAGGGCCCACACTGATGCAG*AGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGA
CAAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTGGGATTGATGTTCCTCCACTCA
ACCACTCTATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4AM09TF 672 0 0
GAGAAGTTGAGGATGTCGATTGGGAAAGCACTTTCTACCTTCGTCATCTCCCTCAGTCCA
ATCTCTACGACATTCCTGATATGTCTGATGAATACCGGACGG*CTATGAAAGATTTCGGG
*AAGATATTGGAGAATCTTGCTGAGGATTTGTTGGATCTATTGTGTGAAAATCTAGGGTT
AGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAACAAAAGGTCCAACCTTTGGGACTAA
GGTGAGCAATTATCCAGCTTATCCTAAGCCAGAGATGATCAAAGGTCTAAGGGCCCACAC
TGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGACAAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCT
TAAAGATGGTGACTGG*ATTGATGTTCCTCCACTCAACCACTCTATTGTCATCAATCTTG
GTGACCAACTTGAGGTTATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGTGATGCACCGTGTGGTGA
CTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTTTCTACAACCCGGGAAGCGATGCTG
AGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTCTGCAAAGAAACCGAGTACCCGAGTTTTGTTTTTG
ATGACTACATGAAGCTCTATGCTGGGGTCAAGTTTCAGCCTAAGGAGCCACGGTTCGAGG
CAATGAAGAATG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4GV64JQ 556 0 0
GAAGAAAGTGTTTCATGGAACAAAAGGTCCAAC**TTGGGACTAAGGTGAGCAATTATCC
AGCTTGTCCTAAGCCAGAGATGATCAAAGGTCTAAGGGCCCACACTGATGCAGGAGGCAT
CATCTTGTTGTTTCAAGATGACAAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTG
G*ATTGATGTTCCTCCACTCAACCACTCTATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGG
TTATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGTGATGCACCGTGTGGTGACTCAGCAAGAAGGAA
ACAGAATGTCCATTGCATCTTTCTACAACCCGGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCAGCTT
CATCGCTTGTCTGCAAAGAGACCGAGTACCCGAGTTTTGTTTTTGATGACTACATGAAGC
TCTATGCTGGGGTCAAGTTTCAGCCTAAGGAGCCACGGTTCGAGGCAATGAAGAATGCAA
ATGCAGTTACAGAATTGAACCCAACAGCAGCCGTAGAGACTTTCTAAAAACAAAGTTGAG
TTTGAGCGAAA
AAAAA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4AM09JQ 589 0 0
AGCCAGAGATGATCAAAGGTCTAAGGGCCCACACTGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGT
TTCAAGATGACAAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTGG*ATTGATGTT
CCTCCACTCAACCACTCTATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTTATAACCAAC
GGCAGGTACAAGAGTGTGATGCACCGTGTGGTGACTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCC
ATTGCATCTTTCTACAACCCGGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTC
TGCAAAGAAACCGAGTACCCGAGTTTTGTTTTTGATGACTACATGAAGCTTTATGCTGGG
GTCAAGTTTCAGCCTAAGGAGCCACGGTTCGAGGCAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACA
GAATTGAACCCAACAGCAGCCGTAGAGACTTTCTAAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAA
GCAAAGAAACAAAAACGTGTGTTGTGGTGTGTGTGTGTATACGTCAATAAGTTACAAGAC
TGATATTATTGTTGATATAATTAAGATGTCTGGTGGTTAATTGTTGG
CC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EZ93TF 757 0 0
G
AGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAACAAAAGGTCCAACCTTTGGGACTAA
GGTGAGCAATTATCCAGCTTGTCCTAAGCCAGAGATGATCAAAGGTCTAAGGGCCCACAC
TGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGACAAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCT
TAAAGATGGTGACTGG*ATTGATGTTCCTCCACTCAACCACTCTATTGTCATCAATCTTG
GTGACCAACTTGAGGTTATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGTGATGCACCGTGTGGTGA
CTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTTTCTACAACCCGGGAAGCGATGCTG
AGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTCTGCAAAGAAACCGAGTACCCGAGTTTTGTTTTTG
ATGACTACATGAAGCTCTATGCTGGGGTCAAGTTTCAGCCTAAGGAGCCACGGTTCGAGG
CAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACAGAATTGAACCCAACAGCAGCCGTAGAGT*TTTCT
AAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAAGCAAATAAACAAAAACGTGTGTTGTGGTGTGTGT
GTGTATACGTCAATAAGTTACAAGACTGATATTATTGTTGATATAATTAAGATGTCTGGT
GGTTAATTGTTGGTCAATGGTGTTTTAAAGTGTGGTGTGTTTATTTATGTTTATTGAAGA
TGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTCT
AG

QA 2 755 2 755
DS 

RD RR4E842JQ 199 0 0
TTTGAGCGAAAGCAAAGAAACAAAAACGTGTGTTGTGGTGTGTGTGTGTATACGTCAATA
AGTTACAAGACTGATATTATTGTTGATATAATTAAGATGTCTGGTGGTTAATTGTTGGTC
AATGGTGTTTTAAAGTGTGGTGTGTTTATTTATGTTTATTGAAGATGATAATAATAATGA
ATAATATGATAACTGTTCT

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR4CN56JQ 537 0 0
CTT
TATTGTCATCAATTTTGGTGACCAACTTGAGGTTATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGT
GATGCCCCGTGTGGTGACTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTTTTTACAA
CCCGGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTTTGCAAAGAAACCGAGTA
CCCGAGTTTTGTTTTTGATGACTACATGAAGCTTTATGCTGGGGTCAAGTTTCAGCCTAA
GGAGCCACGGTTCGAGGCAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACAGAATTGAACCCAACAGC
AGCCGTAGAGACTTTTTAAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAAGCAAAGAAACAAAAACG
TGTGTTGTGGTGTGTGTGTGTATACGTCAATAAGTTACAAGACTGATATTATTGTTGATA
TAATTAAGATGTTTGGTGGTTAATTGTTGGTCAATGGTGTTTTAAAGTGTGGTGTGTTTA
TTTATGTTTATTGAAGATGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTCT
AGG

QA 4 534 4 534
DS 

RD RR4AN94JQ 708 0 0
TGGGACTAAGGTGAGCAATTATCCAGCTTGTCCTAAGCCAGAGATGATCAAAGGTCTAAG
GGCCCACACTGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGACAAGGTTAGTGGTCT
CCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTGG*ATTGATGTTCCTCCACTCAACCACTCTATTGTCA
TCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTTATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGTGATGCACC
GTGTGGTGACTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTTTCTACAACCCGGGAA
GCGATGCTGAGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTCTGCGAAGAAACCGAGTACCCGAGTT
TTGTTTTTGATGACTACATGAAGCTCTATGCTGGGGTCAAGTTTCAGCCTAAGGAGCCAC
GGTTCGAGGCAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACAGAATTGA*CCCAACAGCAGCCGTAG
AGACTTTCTAAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAAGCAAAGAAACAAAAACGTGTGTTGT
GGTGTGTGTGTGTATACGTCAATAAGTTACAAGACTGATATTATTGTTGATATAATTAAG
ATGTCTGGTGGTTAATTGTTGGTCAATGGTGTTTTAAAGTGTGGTGTGTTTATTTATGTT
TATTGAAGATGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTCTAAGAC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 10

CO CL497Contig1 735 10 31 U
GGATATTAACTAAAATCTCAGAAGAATCAGGGAGGCAGCCATGGCTGCCATTTCATCATG
CAGAGCTCCTTCTACGAGCTTCTTCTTCTCTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCC
TTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTCTTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTAGTAT
CCGACTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAGCCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGG
CGTAGATGCTGAGAATGCTGGAATCTATGGCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGA
CGATGTCGAGCAGTATTTCAACTATATGGGGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTACGATAA
GATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTCATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGC
ATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGGAGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGT
CAAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTGACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTT
GATCCTTGGATCCATCACTCAAAAGGCTTGACAAAATCTTCACAACAAGCTTCTTATTAC
AGAGAAGGTGATAATCTGCTTTTGGTACCTGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGT
TGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCCTAACTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGCATAG
ACTGATTCTATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 0 0 60 
60 0 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
0 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 0 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4BQ58TF U 1
AF RR4BF50JQ C 3
AF RR4G148TF U 30
AF RR4BF50TF U 3
AF RR4AM57TF U 30
AF RR4AM57JQ C 30
AF RR4AL59JQ C 6
AF RR4AJ64JQ C 30
AF RR4AJ64TF U 30
AF RR4AL59TF U 6
BS 1 29 RR4BQ58TF
BS 30 31 RR4G148TF
BS 32 46 RR4BQ58TF
BS 47 47 RR4G148TF
BS 48 71 RR4BQ58TF
BS 72 72 RR4G148TF
BS 73 181 RR4BQ58TF
BS 182 182 RR4G148TF
BS 183 183 RR4BQ58TF
BS 184 184 RR4G148TF
BS 185 240 RR4BQ58TF
BS 241 241 RR4G148TF
BS 242 243 RR4BQ58TF
BS 244 244 RR4G148TF
BS 245 279 RR4BQ58TF
BS 280 280 RR4G148TF
BS 281 354 RR4BQ58TF
BS 355 355 RR4G148TF
BS 356 546 RR4BQ58TF
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BS 548 586 RR4BQ58TF
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BS 602 602 RR4G148TF
BS 603 606 RR4BQ58TF
BS 607 607 RR4G148TF
BS 608 686 RR4BQ58TF
BS 687 713 RR4G148TF
BS 714 716 RR4BF50TF
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BS 732 735 RR4AL59JQ

RD RR4BQ58TF 686 0 0
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CAGAGCTCCTTGTACGAGCTTCTTCTTCTCTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCC
TTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTCTTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTAGTAT
CGGGCTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAGCCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGG
TGTCGATGCTGAGAATGCTGGAATCTATGGCAGCCAGTCGCGGGATGATTTCGACAGAGA
CGATGTCGAGCAGTATTTCAACTATATGGGGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTATGATAA
GATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTCATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGC
ATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGGAGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGT
CAAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTGACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTT
GATCCT*GGATCCATCACTCAAAAGGCTTGACAAAATCTTCACAACTAGCTTCTTATTAC
ATAGAAAGTGATAATCTGCTTTTGGTACCTGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGT
TGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4BF50JQ 714 0 0
GGATT
AACTAAAATCTCAGAAGAATCATTGAGGCAGCCATGGCTGCCATTTCATCATGCAGAGCT
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GCTGAGAATGCTGGCATCTATGGCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTC
GAGCAGTATTTCAACTATATGGGGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTACGATAAGATGGAG
GCTCTTCTCAACCAAAACATTCATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAA
GGAGACAAGCCTAAGATCGAGGAGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGAC
GCTGATGGAAGAACTGCTCTTGACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTT
GGATCCATCACTCAAAAGGCTTGACAAAATCTTCACTACAAGCTTCTTATTACAGAGAAG
GTGATA*TCTG*TTTTGGTACCTGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAAC
TTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCCTAACTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGC

QA 6 714 6 714
DS 

RD RR4G148TF 684 0 0
GGGAGGCAGCCATGGCTGCCATTTCATCATGCAGAGCTCCTTCTACGAGCTTCTTCTTCT
CTACAACCAAAACTACCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTC
TTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTA***TCCGACTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAG
CCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGCGTAGATGCTGAGAATGCTGGCATCTATG
GCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTCGAGCAGTATTTCAACTATATGG
GGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTACGATAAGATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTC
ATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGG
AGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTG
ACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTTGGATCCATCACTCAAAAGGCTT
GACAAAATCTTCACTACAAGCTTCTTATTACAGAGAAGGTGATA*TCTG*TTTTGGTACC
TGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCC
TAACTGAGTGAGCTGCAACTTTAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BF50TF 714 0 0
GGATT
AACTAAAATCTCAGAAGAATCATTGAGGCAGCCATGGCTGCCATTTCATCATGCAGAGCT
CCTTCTACGAGCTTCTTCTTCTCTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCA
GTAAGACTCTCCTCTCGGTTTCTTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTA***TCCGACTC
GGACCCTCCAATGGGTCTAGAGCCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGCGTAGAT
GCTGAGAATGCTGGCATCTATGGCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTC
GAGCAGTATTTCAACTATATGGGGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTACGATAAGATGGAG
GCTCTTCTCAACCAAAACATTCATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAA
GGAGACAAGCCTAAGATCGAGGAGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGAC
GCTGATGGAAGAACTGCTCTTGACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTT
GGATCCATCACTCAAAAGGCTTGACAAAATCTTCACTACAAGCTTCTTATTACAGAGAAG
GTGATA*TCTG*TTTTGGTACCTGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAAC
TTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCCTAACTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGC

QA 6 714 6 714
DS 

RD RR4AM57TF 690 0 0
GGGAGGCAGCCATGGCTTCCATTTCATCATGCAGAGCTCCTTGTACGAGCTTCTTCTTCT
CTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTC
TTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTAGTATCGGACTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAG
CCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGTGTCGATGCTGAGAATGCTGGAATCTATG
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GGATGCTTGCGGTGGAAGGATCCTATGATAAGATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTC
ATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGG
AGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTG
ACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTTGGATCCATCACTCAAAAGGCTT
GACAAAATCTTCACAACTAGCTTCTTATTACATAGAAGGTGATAATCTGCTTTTGGTACC
TGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCACAATGTGTTGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCC
TAAGTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGC
AAA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4AM57JQ 687 0 0
GGGAGGCAGCCATGGCTTCCATTTCATCATGCAGAGCTCCTTGTACGAGCTTCTTCTTCT
CTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTC
TTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTAGTATCGGACTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAG
CCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGTGTCGATGCTGAGAATGCTGGAATCTATG
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GGATGCTTGCGGTGGAAGGATCCTATGATAAGATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTC
ATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGG
AGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTG
ACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTTGGATCCATCACTCAAAAGGCTT
GACAAAATCTTCACAACTAGCTTCTTATTACATAGAAGGTGATAATCTGCTTTTGGTACC
TGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCACAATGTGTTGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCC
TAAGTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4AL59JQ 730 0 0
GG
AACTAAAATCTCAGAAGAATCATTGAGGCAGCCATGGCTGCCATTTCATCATGCAGAGCT
CCTTCTACGAGCTTCTTCTTCTCTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCA
GTAAGACTCTCCTCTCGGTTTCTTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTA***TCCGACTC
GGACCCTCCAATGGGTCTAGAGCCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGCGTAGAT
GCTGAGAATTCTGGCATCTATGGCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTC
GAGCAGTATTTCAACTATATGGGGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTACGATAAGATGGAG
GCTCTTCTCAACCAAAACATTCATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAA
GGAGACAAGCCTAAGATCGAGGAGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGAC
GCTGATGGAAGAACTGCTCTTGACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTT
GGATCCATCACTCAAAAGGCTTGACAAAATCTTCACTACAAGCTTCTTATTACAGAGAAG
GTGATA*TCTG*TTTTGGTACCTGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAAC
TTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCCTAACTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGTATAGACTGATT
CTATTACC

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR4AJ64JQ 705 0 0
GGGAGGCAGCCATGGCTTCCATTTCATCATGCAGAGCTCCTTGTACGAGCTTCTTCTTCT
CTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTC
TTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTAGTATCGGACTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAG
CCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGTGTCGATGCTGAGAATGCTGGAATCTATG
GCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTCGAGCAGTATTTCAACTATATGG
GGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTATGATAAGATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTC
ATCCTGTAGATATCCTCTTGATGTTAGCAGCATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGG
AACTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCGAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTG
ACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTTGGATCCATCACTCAAAAGGCTT
GACAAAATCTTCACAACTAGCTTCTTATTACATAGAAGGTGATAATCTGCTTTTGGTACC
TGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCC
TAAGTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGTATAGACTGATTCTAT
TAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AJ64TF 703 0 0
GGGAGGCAGCCATGGCTTCCATTTCATCATGCAGAGCTCCTTGTACGAGCTTCTTCTTCT
CTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCAGTAAGACTCTCCTCTCGGTTTC
TTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTAGTATCGGACTCGGACCCTCCAATGGGTCTAGAG
CCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGTGTCGATGCTGAGAATGCTGGAATCTATG
GCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTCGAGCAGTATTTCAACTATATGG
GGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTATGATAAGATGGAGGCTCTTCTCAACCAAAACATTC
ATCCTGTAGATATCCTCTTGATGTTAGCAGCATCAGAAGGAGACAAGCCTAAGATCGAGG
AACTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCGAGGACGCTGATGGAAGAACTGCTCTTG
ACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTTGGATCCATCACTCAAAAGGCTT
GACAAAATCTTCACAACTAGCTTCTTATTACATAGAAAGTGATAATCTGCTTTTGGTACC
TGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAACTTTTAAAGTTTGGTCCAA*GCC
TAAGTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGTATAGACTGATTCTAT
A

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AL59TF 730 0 0
GG
AACTAAAATCTCAGAAGAATCATTGAGGCAGCCATGGCTGCCATTTCATCATGCAGAGCT
CCTTCTACGAGCTTCTTCTTCTCTACAACCAAAACTATCAACAGTTCTTCTCCTTCCTCA
GTAAGACTCTCCTCTCGGTTTCTTGGAACTCGGGTTGTGAAGCTCAGTA***TCCGACTC
GGACCCTCCAATGGGTCTAGAGCCACTTGCTGGTTCAAGTTCGGAAAGAACGGCGTAGAT
GCTGAGAATTCTGGCATCTATGGCAGCCAGTCACGGGATGATTTCGACAGAGACGATGTC
GAGCAGTATTTCAACTATATGGGGATGCTTGCGGTGGAAGGAACCTACGATAAGATGGAG
GCTCTTCTCAACCAAAACATTCATCCTGTAGATATCCTTTTGATGTTAGCAGCATCAGAA
GGAGACAAGCCTAAGATCGAGGAGCTCCTCAGAGCCGGTGCTAACTACACTGTCAAGGAC
GCTGATGGAAGAACTGCTCTTGACAGAGCCAACAGCGAGGAGATCCGTGATTTGATCCTT
GGATCCATCACTCAAAAGGCTTGACAAAATCTTCACTACAAGCTTCTTATTACAGAGAAG
GTGATA*TCTG*TTTTGGTACCTGTAGTTGAAATCTCAGTCGTCTCAATGTGTTGTTAAC
TTTTAAAGTTTGGTCCAAAGCCTAACTGAGTGAGCTGCAACTTTAAAGTATAGACTGATT
CTAT
TACC

QA 3 726 3 726
DS 



AS 2 10

CO CL498Contig1 786 2 2 U
GTGTTCAAGTGTGAACCTACAGGAGAGCTTAGTTTCCAACTAATGTCTTCTAAATCTAAA
ACCTTATTAGGTTCTGCTTCTTTGTCGCTTTCTGAGTTTCTGTGTCCAGTTACTAGACTC
TCTGTTGAGAAGTGGCTGGAGTTAACAACACCAGTTCAAAGGGGAAAGGCCATCTCTCTA
CGAGTTGCTGTCTCCTTCACTCCACCAACTCGTAGCCCCACAGTTCTACATTTGGTTCAA
GCAAGACCATCAGTGAAAGACTCTTGTTTCTTTCCTATGCTTGGAAACGTTTCTAAGAGT
TTTACACGAGTTGTTGATGAGACAGAAACAGAGTTGATCAGTCTCCATATGAGGAACCAC
AACAACGCAAGACAAGTGATTGGTGTGAAGGAGAGTGGTGAAACTCTTGTTCTAGCAACT
CATGATGGGTGTGTCTGGTCTTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGCAAACAAGCAGT
CTTGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTTATTATGGAAGG
AAGCTGGAGTATGATACAAAACGTTGCGCGAAGCTAAGAAGTGAGCAAGATTTCATGACA
GCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCCGTGGGGTTGCTAGACTTGAAG
TTTGGTTCTTTTGAGCTAATGAGAGATGGTTGGTTTTACCTGGATAGTATCTGCTTTCAT
ACTCATGATCTCTTAAGATGAAGTTTTGTGGAGCTGCAAAGACATAGTCAAAGTATGGGA
TACTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ49TF U 1
AF RR4E218TF U 1
BS 1 699 RR4DZ49TF
BS 700 786 RR4E218TF

RD RR4DZ49TF 699 0 0
GTGTTCAAGTGTGAACCTACAGGAGAGCTTAGTTTCCAACTAATGTCTTCTAAATCTAAA
ACCTTATTAGGTTCTGCTTCTTTGTCGCTTTCTGAGTTTCTGTGTCCAGTTACTAGACTC
TCTGTTGAGAAGTGGCTGGAGTTAACAACACCAGTTCAAAGGGGAAAGGCCATCTCTCTA
CGAGTTGCTGTCTCCTTCACTCCACCAACTCGTAGCCCCACAGTTCTACATTTGGTTCAA
GCAAGACCATCAGTGAAAGACTCTTGTTTCTTTCCTATGCTTGGAAACGTTTCTAAGAGT
TTTACACGAGTTGTTGATGAGACAGAAACAGAGTTGATCAGTCTCCATATGAGGAACCAC
AACAACGCAAGACAAGTGATTGGTGTGAAGGAGAGTGGTGAAACTCTTGTTCTAGCAACT
CATGATGGGTGTGTCTGGTCTTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGCAAACAAGCAGT
CTTGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTTATTATGGAAGG
AAGCTGGAGTATGATACAAAACGTTGCGCGAAGCTAAGAAGTGAGCAAGATTTCATGACA
GCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCCGTGGGGTTGCTAGACTTGAAG
TTTGGTTCTTTTGAGCTAATGAGAGATGGTTGGTTTTAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4E218TF 786 0 0
GTGTTCAAGTGTGAACCTACAGGAGAGCTTAGTTTCCAACTAATGTCTTCTAAATCTAAA
ACCTTATTAGGTTCTGCTTCTTTGTCGCTTTCTGAGTTTCTGTGTCCAGTTACTAGACTC
TCTGTTGAGAAGTGGCTGGAGTTAACAACACCAGTTCAAAGGGGAAAGGCCATCTCTCTA
CGAGTTGCTGTCTCCTTCACTCCACCAACTCGTAGCCCCACAGTTCTACATTTGGTTCAA
GCAAGACCATCAGTGAAAGACTCTTGTTTCTTTCCTATGCTTGGAAACGTTTCTAAGAGT
TTTACACGAGTTGTTGATGAGACAGAAACAGAGTTGATCAGTCTCCATATGAGGAACCAC
AACAACGCAAGACAAGTGATTGGTGTGAAGGAGAGTGGTGAAACTCTTGTTCTAGCAACT
CATGATGGGTGTGTCTGGTCTTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGCAAACAAGCAGT
CTTGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTTATTATGGAAGG
AAGCTGGAGTATGATACAAAACGTTGCGCGAAGCTAAGAAGTGAGCAAGATTTCATGACA
GCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCCGTGGGGTTGCTAGACTTGAAG
TTTGGTTCTTTTGAGCTAATGAGAGATGGTTGGTTTTACCTGGATAGTATCTGCTTTCAT
ACTCATGATCTCTTAAGATGAAGTTTTGTGGAGCTGCAAAGACATAGTCAAAGTATGGGA
TACTGT

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL498Contig2 866 8 6 U
GCATTGTTAGAAAACGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTACAAATGTTTAAAAGAAA
AGAAAACACATAACAACACATCTCATTAGTTTTATTATACTGTTAGTCCATTTGTTAACA
TCACATAGATAAAACTTAATATCGTTTTTCTTTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTG
CGTCGATGGGAGCTTCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATAT
TACCACATCCTCCACCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGG
AGCCGCCACCTGTGGTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTC
CTCCGCACCCACTGCCACCGCCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCAC
CTTCTTCTTCCACCATGTTCCCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCAT
TGATGTTCACATGCATCATTGTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTCA
CTATGTCTTTTGCAGCTCCACAAAAACCTTCCTTCTTAAGAAGATCATTGAGTATGAAAG
CAGATACTAATCCAGGTAAAACCAACCATCTCTCATTAGCCTCAAA**AACCAAACTTCA
GGTCTAGCAACCCCACAGCTTTACCATAAGGATACTGCTTTGAGAATTCGACAGCTGTCA
TGAAATCTTGCTCACTTCTTAGCTTCGCGCAACGTTTTGTCTCATACTCCAGCTTCCTTC
CATAATAAACTTTCACCATTCTCACACCAAAAATCTCAAAGACAGGACCATCAAGACTGC
TTGTTTGCTTAAGTGACCATTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A601JQ U 189
AF RR4A601TF C 6
AF RR4FC74JQ U 1
AF RR4FC74TF C 1
AF RR4E218JQ U 15
AF RR4DZ49JQ U 15
AF RR4EP91JQ U 1
AF RR4EP91TF C 261
BS 1 43 RR4EP91JQ
BS 44 44 RR4FC74JQ
BS 45 151 RR4EP91JQ
BS 152 152 RR4FC74JQ
BS 153 812 RR4EP91JQ
BS 813 866 RR4EP91TF

RD RR4A601JQ 183 0 0
GGAGCTTCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACAT
CCTCCACCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCGCCA
CCTGTGGTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCCGCAC
CC
C

QA 1 182 1 182
DS 

RD RR4A601TF 366 0 0
GTTAGAAAACGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTACAAATGTTTAAAAGAAAAGAAA
ACACATAACAACACATCTCAATAGTTTCATTATGCTGTTAGTCCATTTGTTAACATCACA
TAGATAAAACTTAATATCGTTTTTCTTTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTGCGTCG
ATGGGAGCTTCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCA
CATCCTCCACCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCG
CCACCTGTGGTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCCG
CACCC
C

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4FC74JQ 566 0 0
GCATT
GTTAGAAAACGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTACAAATGTTTAAAAGAAAAGAAA
ACACATAACAACACATCTCATTAGTTTTATTATACTGTTAGTCCATTTGTTAACATCACA
TAGATAAAACTTAATATCGTTTTTCTTTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTGCGTCG
ATGGGAGCTTCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCA
CATCCTCCACCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCG
CCACCTGTGGTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCAG
CACCCACTGCCACCGCCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCACCTTCT
TCTTCCACCATGTTCCCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCATTGATG
TTCACATGCATCATTGTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTCACTATG
TCTTTTGCAGCTCCACAAAAA

QA 6 566 6 566
DS 

RD RR4FC74TF 566 0 0
GCATT
GTTAGAAAACGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTACAAATGTTTAAAAGAAAAGAAA
ACACATAACAACACATCTCATTAGTTTTATTATACTGTTAGTCCATTTGTTAACATCACA
TAGATAAAACTTAATATCGTTTTTCTTTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTGCGTCG
ATGGGAGCTTCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCA
CATCCTCCACCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCG
CCACCTGTGGTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCAG
CACCCACTGCCACCGCCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCACCTTCT
TCTTCCACCATGTTCCCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCATTGATG
TTCACATGCATCATTGTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTCACTATG
TCTTTTGCAGCTCCACAAAAA

QA 6 566 6 566
DS 

RD RR4E218JQ 552 0 0
CGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTACAAATGTTTAAAAGAAAAGAAAACACATAAC
AACACATCTCATTAGTTTTATTATACTGTTAGTCCATTTGTTAACATCACATAGATAAAA
CTTAATATCGTTTTTCTTTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTGCGTCGATGGGAGCT
TCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCCTCCA
CCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCGCCACATGTG
GTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCCGCACCCACTG
CCACCGCCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCACCTTCTTCTTCCACC
ATGTTCCCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCATTGATGGTCACATGC
ATCATTGTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTGACTATGTCTTTTGCA
GCTCCACAAAAA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4DZ49JQ 753 0 0
CGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTACAAATGTTTAAAAGAAAAGAAAACACATAAC
AACACATCTCATTAGTTTTATTATACTGTTAGTCCATTTGTTAACATCACATAGATAAAA
CTTAATATCGTTTTTCTTTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTGCGTCGATGGGAGCT
TCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCCTCCA
CCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCGCCACATGTG
GTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCCGCACCCACTG
CCACCGCCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCACCTTCTTCTTCCACC
ATGTTCCCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCATTGATGGTCACATGC
ATCATTGTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTGACTATGTCTTTTGCA
GCTCCACAAAAACCTTCATTCTTAAGAAGATCATTGAGTATGAAAGCAGATACTAATCCA
GGTAAAACCAACCATCTCTCATTAGCCTCAAAAGAACCAAACTTCAAGTCTAGCAACCCC
ACGGCTTTACCATAAGGATACTGCTTTGAGAATTCGACAGCTGTCATGAAATCTTGCTCA
CTTCTTAGCTTCGCGCAACGTTTTGTATCATAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EP91JQ 816 0 0
GCATTGTTAGAAAACGTTTAACTATATATTTTATTACAGCTTAAAAATGTTTAAAAGAAA
AGAAAACACATAACAACACATCTCATTAGTTTTATTATACTGTTAGTCCATTTGTTAACA
TCACATAGATAAAACTTAATATCGTTTTTCTGTCTTTAAATAATAATCAAGCTGCAACTG
CGTCGATGGGAGCTTCCGCTGCTGCTACTAATGATGGAACATTTTCATTGGTCATCATAT
TACCACATCCTCCACCGGCTCCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGG
AGCCGCCACCTGTGGTAACATTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTC
CTCCGCACCCACTGCCACCGCCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCAC
CTTCTTCTTCCACCATGTTCCCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCAT
TGATGTTCACATGCATCATTGTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTCA
CTATGTCTTTTGCAGCTCCACAAAAACCTTCCTTCTTAAGAAGATCATTGAGTATGAAAG
CAGATACTAATCCAGGTAAAACCAACCATCTCTCATTAGCCTCAAA**AACCAAACTTCA
GGTCTAGCAACCCCACAGCTTTACCATAAGGATACTGCTTTGAGAATTCGACAGCTGTCA
TGAAATCTTGCTCACTTCTTAGCTTCGCGCAACGTTTTGTCTCATACTCCAGCTTCCTTC
CATAATAAACTTTCACCATTCTCACACCAAAA
TCTC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4EP91TF 606 0 0
CCACCGCACCCACCGCATCCAGTGGAACCGCCAGTGCAGGAGCCGCCACCTGTGGTAACA
TTTTCATTGGTCATCATATTACCACATCTTCCACCACCTCCTCCGCACCCACTGCCACCG
CCACATCCTCCACATCCACCACAACCACCACAATGACCACCTTCTTCTTCCACCATGTTC
CCACTGTTAAGCTCCTTGGACAAGCACCTAGCACCCCCATTGATGTTCACATGCATCATT
GTTTCTTCTTCTAGCTTCACAGTTATCCCATTACCTTTCACTATGTCTTTTGCAGCTCCA
CAAAAACCTTCCTTCTTAAGAAGATCATTGAGTATGAAAGCAGATACTAATCCAGGTAAA
ACCAACCATCTCTCATTAGCCTCAAA**AACCAAACTTCAGGTCTAGCAACCCCACAGCT
TTACCATAAGGATACTGCTTTGAGAATTCGACAGCTGTCATGAAATCTTGCTCACTTCTT
AGCTTCGCGCAACGTTTTGTCTCATACTCCAGCTTCCTTCCATAATAAACTTTCACCATT
CTCACACCAAAAATCTCAAAGACAGGACCATCAAGACTGCTTGTTTGCTTAAGTGACCAT
TTTGCT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 10

CO CL499Contig1 746 8 6 U
GGACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCC
TCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATATCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGG
AGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGAT
TGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTT
AGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCC
CATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGG
TCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGT
GTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAG
AGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGC
CAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTACTTCTTCGGGATG
AGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCT
GTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCTTTTGTATGTGTAAATGTTTTCAAGCAATATGATG
ATCAAATATAATTTCATTTGCTGTGC


BQ
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4C201TF U 1
AF RR4HB57TF U -1
AF RR4GD24TF U -2
AF RR4GD24JQ C 185
AF RR4BC95TF U 1
AF RR4HB57JQB C 145
AF RR4EK21TF U 1
AF RR4EK21JQ C 76
BS 1 224 RR4BC95TF
BS 225 225 RR4C201TF
BS 226 576 RR4BC95TF
BS 577 577 RR4GD24TF
BS 578 744 RR4BC95TF
BS 745 746 RR4EK21JQ

RD RR4C201TF 252 0 0
GGACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCC
TCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATATCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGG
AGCTGCGAAAAAGCA*TGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGATGAT
TGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTA
CTTAAGACTGTGAATG

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR4HB57TF 556 0 0
GGAC
ACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCCTC
TGTCTCTCCGTCTAGCTCCATATCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGGAG
CTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGATTG
GGTTCTTCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAG
AGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCA
TCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTC
CATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGT
TTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAG
TGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCA
AATATGATGATC

QA 5 556 5 556
DS 

RD RR4GD24TF 679 0 0
GGGAC
ACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCCTC
TGTCTCTCCGTCTAGCTCCATATCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGGAG
CTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGATTG
GGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAG
AGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCA
TCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTC
CATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGT
TTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAG
TGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCA
AATATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTACTTCTTCGGGATGAG
CCAATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGT
TGGTGCTCTTATTG

QA 6 679 6 679
DS 

RD RR4GD24JQ 507 0 0
TTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAG
ACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCATC
GTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCA
TGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTT
CTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTG
GTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAA
TATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTACTTCTTCGGGATGAGCC
AATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTG
GTGCTCTTATTGTGACTCTGCTTTTGT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4BC95TF 744 0 0
GGACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCC
TCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATATCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGG
AGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGAT
TGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGCGGTGAGGTGTAGCTT
AGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCC
CATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGG
TCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGT
GTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAG
AGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGC
CAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCGAGGTCTGCTACTTCTTCGGGATG
AGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCT
GTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCTTTTGTATGTGTAAATGTTTTCAAGCAATATGATG
ATCAAATATAATTTCATTTGCTGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4HB57JQB 578 0 0
CCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGATTGGGTTCTTCTCACTGGATTCTGT
GAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGG
TCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAA
GATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAA
GTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCC
TGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATT
GAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGC
CATTGAAACAGCAAGGTCTGCTACTTTTTCGGGATGAGCCAATCAACCTCCATGTCTTTA
CTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTG
CTTTTGTATGTGTAAATGTTTTCAAGCAATATGATGAT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4EK21TF 735 0 0
GGACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCC
TCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGG
AGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGAT
TGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTT
AGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCC
CATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGG
TCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGT
GTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAG
AGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGC
CAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTACTTCTTCGGGACG
AGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCT
GTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCTTTTGTATGTGTAA*TGTTTTCAAGCAATATGATG
ATCAAATATAATTTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4EK21JQ 671 0 0
TAGCTCCATCT
CTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGGAGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCC
CTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGACGAGGATTGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGA
GAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTC
AAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGA
TTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGT
ACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTG
AAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGA
AGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCA
TTGAAACAGCAAGGTCTGCTACTTCTTCGGGACGAGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACT
TGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCT
TTTGTATGTGTAA*TGTTTTCAAGCAATATGATGATCAAATATAATTTCATTTGCTGTGC

QA 12 671 12 671
DS 



CO CL499Contig2 985 2 2 U
GGACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAATGCC
TCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATATCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGG
AGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCTACGACGACGACGAGGAT
TGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTT
AGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCC
CATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTATGT
TAAATTACCGCTTTTCTGCTTCTTCTATATGGTTCTTGAAGTAGCCTAGAGCTCAGTTGA
TTGTTGAGTCCATCTATGAATGCTTTAGTTCTGATGTTCTCAATCTTCTAAGAGAATTCA
AAAGTTGCTGTTGGTTCAACTAAAGAGATGTATGTTAAATGCAGGTGTGGTCCATGTAAA
GTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTTAAG
CTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGGTTTGTCTTCTGCCTTCTTTAAGATCTCATTTCTCC
ACATCAGTGTCTTGCTGTTGTTGCTGCTTAGCTATAATAACTTTGGTTTGGTGCAGCCAT
TAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAG
TGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCAA
GGTCTGCTACTTCTTCGGGATGAGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCT
GTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCCTTTGTATGTGTA
AATGTTTTCAAGCAATATGATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 716 985 RR4FV85JQ

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TGGGTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTT
AGAGACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCC
CATCGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTATGT
TAAATTACCGCTTTTCTGCTTCTTCTATATGGTTCTTGAAGTAGCCTAGAGCTCAGTTGA
TTGTTGAGTCCATCTATGAATGCTTTAGTTCTGATGTTCTCAATCTTCTAAGAGAATTCA
AAAGTTGCTGTTGGTTCAACTAAAGAGATGTATGTTAAATGCAGGTGTGGTCCATGTAAA
GTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTTAAG
CTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGGTTTGTCTTCTGCCTTCTTTAAGATCTCATTTCTCC
ACATCAGTGTCTTGCTGTTGTTGCTGCTTAGCTATAATAACTTTGGTTTGGTGCA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4FV85JQ 687 0 0
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GTTAAATTACCGCTTTTCTGCTTCTTCTATATGGTTCTTGAAGTAGCCTAGAGCTCAGTT
GATTGTTGAGTCCATCTATGAATGCTTTAGTTCTGATGTTCTCAATCTTCTAAGAGAATT
CAAAAGTTGCTGTTGGTTCAACTAAAGAGATGTATGTTAAATGCAGGTGTGGTCCATGTA
AAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTTA
AGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGGTTTGTCTTCTGCCTTCTTTAAGATCTCATTTCT
CCACATCAGTGTCTTGCTGTTGTTGCTGCTTAGCTATAATAACTTTGGTTTGGTGCAGCC
ATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCA
AGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGC
AAGGTCTGCTACTTCTTCGGGATGAGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGG
CTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCCTTTGTATGTG
TAAATGTTTTCAAGCAATATGATGATC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 10

CO CL500Contig1 1185 4 9 U
GGGACTTTAAACTCCGATGATCTTCTGAGCCTTTCCCTCTGTTTCGATTCCCTTACTGTT
TCAGAGACAAAGATCTCTCTGACCAGACATTTACGATCCTGGTAGGGAATAAAGAAGTAA
ATAACAGAAATTATGAACCCTAATCAAGTCCCTAATGGGTTTGTGAAACCTGTTCCTACT
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AGTTGTGTGGACAAACACGGACGACCTGTTCTTATCATGAGACCTAGTGTTGAGAATTCA
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GGTGGAAACGATGACTCGGGTTTCAACATAGACAAGCACTCAGAGAGGATGAAAGAAGAC
GACAAGAAAAGGTTGGCTGCCTTGAAGGACATTGCTCCCCCTTCCCTAGACTCACTCAGC
TTCTTATCTGTCTCTGATGGTGCCACCTCTGACAGTGCTCATCTCGGCTCTGAAGATGTG
TCTGAGGACGAGCAACAGCCCCATGGTATGAATGAGAAGAAGGAATCTATCCCATGATGA
GTAGTATCCAATGATTGTAACGTCACATGAATTTATCTATTGAGACTTTCTTCTGAGACA
TTCTATGTTTTCTCATCATTTATATATTTTTAATATTTCAGAAGC


BQ
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AF RR4DK41TF U 1
AF RR4DN46TF U 1
AF RR4DN46JQ C 415
AF RR4DK41JQ C 377
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RD RR4DK41TF 745 0 0
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GAAGAAATCTGTTGGGAGGAGATAGCTGATGAAGCAGAGACAGGGAAGATTTATAGATCT
AGTTGTGTGGACAAACACGGACGACCTGTTCTTATCATGAGACCTAGTGTTGAGAATTCA
AAGTCGATGAAAGGACAGATTAGATACCTTGTGTACTGTATGGAGAACGCAATCCAGAAT
TTGCCAACAGGGGAGGAACAAATGGTGTGGATGATAGATTTCAATGGCTATAGCTTGGCG
AATGTATCGTTAAGAACTACTAGAGAGACTGCTCATGTATTACAAGAACACTACCCTGAG
AGATTATCTTTGGCCATTCTTTATAATCCTCCCAAGTTCTTTGA*CCCTTCTGGAAG*TG
GCGAGACCTTTCTTAGAGCCGAAGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4DN46TF 784 0 0
GGGACTTTAAACTCCGATGATCTTCTGAGCCTTTCCCTCTGTTTCGATTCCCTTACTGTT
TCAGAGACAAAGATCTCTCTGACCAGACATTTACGATCCTGGTAGGGAATAAAGAAGTAA
ATAACAGAAATTATGAACCCTAATCAAGTCCCTAATGGGTTTGTGAAACCTGTTCCTACT
GAAGAAGAGAAGGGAAAGATTGAGGAACTGAGAAAGCTGTTAGGGCCATTGCCGGAGAAA
CTCTCGAGTTTTTGTTCGGATGACGCAGTTTTGAGGTATTTAAGAGCTCGCAATTGGCAT
GTCAAGAAAGCTGCCAAGATGCTTAAAGAAACCTTGAAATGGAGAGTTCAATACAAACCT
GAAGAAATCTGTTGGGAGGAGATAGCTGATGAAGCAGAGACAGGGAAGATTTATAGATCT
AGTTGTGTGGACAAACACGGACGACCTGTTCTTATCATGAGACCTAGTGTTGAGAATTCA
AAGTCGATGAAAGGACAGATTAGATACCTTGTGTACTGTATGGAGAACGCAATCCAGAAT
TTGCCAACAGGGGAGGAACAAATGGTGTGGATGATAGATTTCAATGGCTATAGCTTGGCG
AATGTATCGTTAAGAACTACTAGAGAGACTGCTCATGTATTACAAGAACACTACCCTGAG
AGATTATCTTTGGCCATTCTTTATAATCCTCCCAAGTTCTTTGAACCCTTCTGGAAG*TG
GCGAGACCTTTCTTAGAGCCGAAGACGCGGAACAAAGTCA*CTTTGTTTACTCGGATGAC
C
AAA

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4DN46JQ 519 0 0
AGATCTAGTTGTGTGGACAAACACGGACGACCTGTTCTTATCATGAGACCTAGTGTTGAG
AATTCAAAGTCGATGAAAGGACAGATTAGATACCTTGTGTACTGTATGGAGAACGCAATC
CAGAATTTGCCAACAGGGGAGGAACAAATGGTGTGGATGATAGATTTCAATGGCTATAGC
TTGGCGAATGTATCGTTAAGAACTACTAGAGAGACTGCTCATGTATTACAAGAACACTAC
CCTGAGAGATTATCTTTGGCCATTCTTTATAATCCTCCCAAGTTCTTTGAACCCTTCTGG
AAGGTGGCGAGACCTTTCTTAGAGCCGAAGACGCGGAACAAAGTCAACTTTGTTTACTCG
GATGACCCAAACACCAAGCAGATCATGGAGGAGAACTTCGACATGGGCAAAATGGAGTCA
GCGTTTGGTGGAAACGATGACTCGGGTTTCAACATAGACAAGCACTCAGAGAGGATGAAA
GAAGACGACAAGAAAAGGTTGGCTGCCTTGAAGGACATT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4DK41JQ 809 0 0
AGGAGATAGCTGATGAAGCAGAGACAGG*AAGATTTATAGATCTAGTTGTGTGGACAAAC
ACGGACGACCTGTTCTTATCATGAGACCTAGTGTTGAGAATTCAAAGTCGATGAAAGGAC
AGATTAGATACCTTGTGTACTGTATGGAGAACGCAATCCAGAATTTGCCAACAGGGGAGG
AACAAATGGTGTGGATGATAGATTTCAATGGCTATAGCTTGGCGAATGTATCGTTAAGAA
CTACTAGAGAGACTGCTCATGTATTACAAGAACACTACCCTGAGAGATTATCTTTGGCCA
TTCTTTATAATCCTCCCAAGTTCTTTGAACCCTTCTGGAAGGTGGCGAGACCTTTCTTAG
AGCCGAAGACGCGGAACAAAGTCAACTTTGTTTACTCGGATGACCCAAACACCAAGCAGA
TCATGGAGGAGAACTTCGACATGGGCAAAATGGAGTCAGCGTTTGGTGGAAACGATGACT
CGGGTTTCAACATAGACAAGCACTCAGAGAGGATGAAAGAAGACGACAAGAAAAGGTTGG
CTGCCTTGAAGGACATTGCTCCCCCTTCCCTAGACTCACTCAGCTTCTTATCTGTCTCTG
ATGGTGCCACCTCTGACAGTGCTCATCTCGGCTCTGAAGATGTGTCTGAGGACGAGCAAC
AGCCCCATGGTATGAATGAGAAGAAGGAATCTATCCCATGATGAGTAGTATCCAATGATT
GTAACGTCACATGAATTTATCTATTGAGACTTTCTTCTGAGACATTCTATGTTTTCTCAT
CATTTATATATTTTTAATATTTCAGAAGC

QA 1 809 1 809
DS 



CO CL500Contig2 717 6 14 U
GGATTACTCTCTTGCTTTCTCTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAACAAAAAAAGTTCA
TCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTG
CTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGG
ACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCC
TGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCA
CGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGA
TCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACC
TGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACG
TTTCGCTAACAACTTGGGGTTTCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCAT
GAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTC
CTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTT
GTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTCTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G236TF U 1
AF RR4DP80TF U 4
AF RR4DP80JQ C 69
AF RR4G236JQ C 196
AF RR4DW63JQ C 7
AF RR4DW63TF U 4
BS 1 54 RR4G236TF
BS 55 55 RR4DP80TF
BS 56 153 RR4G236TF
BS 154 154 RR4DP80TF
BS 155 333 RR4G236TF
BS 334 334 RR4DP80TF
BS 335 398 RR4G236TF
BS 399 399 RR4DP80TF
BS 400 435 RR4G236TF
BS 436 436 RR4DP80TF
BS 437 501 RR4G236TF
BS 502 502 RR4DP80TF
BS 503 617 RR4G236TF
BS 618 717 RR4DP80TF

RD RR4G236TF 617 0 0
GGATTACTCTCTTGCTTTCTCTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAACAAAAAA*GTTCA
TCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTG
CTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGG
ACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCC
TGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCA
CGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAATATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGA
TCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTCACGCTGCTCCAATGTCTCACC
TGGTCATGACCGTGCTCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACG
TTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCAT
GAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTC
CTGCGACATGTGGGATT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4DP80TF 714 0 0
GGA
CTCTCTTGCTTTCTCTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAACAAAAAAAGTTCATCCTTG
TAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTT
ACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGT
CTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGC
GGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGC
GAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTT
CTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCA
TGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGC
TAACAACTTGGGGTTTCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGCA
ATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGA
CATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTAC
TTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTCTCAA

QA 4 714 4 714
DS 

RD RR4DP80JQ 647 0 0
AAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTTAC
CGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGTCT
ATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGCGG
TGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGCGA
GAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTTCT
GTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCATG
ACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGCTA
ACAACTTGGGGTTTCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGCAAT
ATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGACA
TGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTACTT
CTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAA
ACATAGAATGTCTC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4G236JQ 482 0 0
TACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGCGGTGGTTAG
ATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGA
CTCAACAGGATCATACAATATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTTCTGTGATAC
CATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTCACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGC
TCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTT
GGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGCAATATCAAGA
AACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGA
TTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTACTTCTGAAAT
AT

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4DW63JQ 709 0 0
CTCTCTTGCTTTCTCTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAACAAAAAAAGTTCATCCTTG
TAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTT
ACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGT
CTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGC
GGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGC
GAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTT
CTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCA
TGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGC
TAACAACTTGGGGTTTCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGCA
ATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGA
CATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTAC
TTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAA
ACATAGAATGTCTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4DW63TF 710 0 0
GGA
CTCTCTTGCTTTCTCTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAACAAAAAAAGTTCATCCTTG
TAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTT
ACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGT
CTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGC
GGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGC
GAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTT
CTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCA
TGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGC
TAACAACTTGGGGTTTCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGCA
ATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGA
CATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTAC
TTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAA
CATAGATGTCTC

QA 4 698 4 698
DS 



AS 2 10

CO CL501Contig1 743 8 10 U
GGGTGTTGCACAGATTCTTCCCCGGAAAAATAAAATTCAGAGCTCGGAGCTTCCAGGAAG
TAATATCAATGGGTGGCGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCTGCTGCTCGTAAAGAGG
CGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAACAAAGAAGAGGGAGAAGGTG
ATGCTGCTGCTGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTC
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAG
ATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTG
CTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCGCGATGATACGACTTGAAA
AGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAG
CTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTG
AACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATCGATTC
ACTTTAGTCAAGTTCTGGTTTTG


BQ
30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL02TF U 27
AF RR4A260JQ C 1
AF RR4BJ29JQ C 3
AF RR4BJ29TF U 3
AF RR4A260JQD C 1
AF RR4A260TF U 1
AF RR4A260TFB U 1
AF RR4CZ66TF U 3
BS 1 4 RR4A260TF
BS 5 28 RR4BJ29TF
BS 29 159 RR4GL02TF
BS 160 160 RR4A260TF
BS 161 520 RR4GL02TF
BS 521 521 RR4BJ29TF
BS 522 522 RR4A260TF
BS 523 686 RR4BJ29TF
BS 687 716 RR4A260TF
BS 717 743 RR4CZ66TF

RD RR4GL02TF 494 0 0
GG
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GATAGAGCAGAAGTCTGCTGCTCGTAAAGAGGCGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGA
ACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGCTGCTGCTGCTTCTGTTGAAGAAGA
TGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAA
AGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAGATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGT
GGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCG
AAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAA
ACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGA
AAGTTAAAAGAC

QA 3 494 3 494
DS 

RD RR4A260JQ 716 0 0
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TAATATCAATGGGTGGCGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCTGCTGCTCGTAAAGAGG
CGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAACAAAGAAGAGGGAGAAGGTG
ATGCTGCTG***CTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTC
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAG
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CTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCGCGATGATACGACTTGAAA
AGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAG
CTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTTTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTG
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QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4BJ29JQ 685 0 0
GG
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ATCAATGGGTGGCGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCTGCTGCTCGTAAAGAGGCGCT
TAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGC
TGCTGCTGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCA
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AATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCC
AAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAG
GCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGC
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GCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAGCTCT
TAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTGAACT
TCAGTTTATAACCGGTTTGATC
C

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR4BJ29TF 685 0 0
GG
GTTGCACAGATTCTTCCCCGGAAAAATAAAATTCAGAGCTCGGAGCTTCCAGGAAGTAAT
ATCAATGGGTGGCGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCTGCTGCTCGTAAAGAGGCGCT
TAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGC
TGCTGCTGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCA
AGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAGATCC
AATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCC
AAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAG
GCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGC
CGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCACGATGATACGACTTGAAAAGAA
GCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAGCTCT
TAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTGAACT
TCAGTTTATAACCGGTTTGATC
C

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR4A260JQD 716 0 0
GGGTGTTGCACAGATTCTTCCCCGGAAAAATAAAATTCAGAGCTCGGAGCTTCCAGGAAG
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CGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAACAAAGAAGAGGGAGAAGGTG
ATGCTGCTG***CTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTC
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAG
ATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTG
CTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCGCGATGATACGACTTGAAA
AGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAG
CTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTG
AACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATCG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4A260TF 716 0 0
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CGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAACAAAGAAGAGGGAGAAGGTG
ATGCTGCTG***CTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTC
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAG
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CTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCGCGATGATACGACTTGAAA
AGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAG
CTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTG
AACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATCG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4A260TFB 716 0 0
GGGTGTTGCACAGATTCTTCCCCGGAAAAATAAAATTCAGAGCTCGGAGCTTCCAGGAAG
TAATATCAATGGGTGGCGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCTGCTGCTCGTAAAGAGG
CGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAACAAAGAAGAGGGAGAAGGTG
ATGCTGCTG***CTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTC
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAG
ATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTG
CTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCGCGATGATACGACTTGAAA
AGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAG
CTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTG
AACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATCG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4CZ66TF 741 0 0
GG
GTTGCACAGATTCTTCCCCGGAAAAATAAAATTCAGAGCTCGGAGCTTCCAGGAAGTAAT
ATCAATGGGTGGCGAAGATGAATCGATAGAGCAGAATTCTGCTGCTCGTAAAGAGGCGCT
TAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGC
TGCTGCTGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCA
AGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAGATCC
AATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCC
AAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAG
GCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGC
CGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCACGATGATACGACTTGAAAAGAA
GCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAGCTCT
TAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTGAACT
TCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAA*TGCA*TGCATTTTCAGT*CAGATCAATTCACTT
TAGTCAAGTTCTGGTTTTG

QA 3 741 3 741
DS 



CO CL501Contig2 718 2 5 U
GGGTGTGTTGCACAGATTATTTCCCCGGAAAAAGAAATTTTACAGCTCGGAGCTTCCAGG
AAGTAATATCAATGGGTGGTGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCAGCTGCTCGCAAAG
AGGCGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAAAGCAAAGAAGAGGGAGAAG
GTGATGCTGCTGCTGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATG
TTCCCCAAGCTGAGGAGCTTCAGGGCAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCG
AAGATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACA
TTGCTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGC
TCGAAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTG
AGACGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCACGATGATACGACTTG
AAAAGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAG
TAGCTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGA
TTGAACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FZ73TF U 1
AF RR4FZ73JQ C 75
BS 1 677 RR4FZ73TF
BS 678 678 RR4FZ73JQ
BS 679 684 RR4FZ73TF
BS 685 685 RR4FZ73JQ
BS 686 718 RR4FZ73TF

RD RR4FZ73TF 718 0 0
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AAGATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACA
TTGCTCCAAAGAAACCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGC
TCGAAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTG
AGACGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCACGATGATACGACTTG
AAAAGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAG
TAGCTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGA
TTGAACTTCAGTTTATACCCGGTT*GATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4FZ73JQ 644 0 0
GGTGGTGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCAGCTGCTCGCAAAGAGGCGCTTAGAGCT
TTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAAAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGCTGCTGCT
GCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCAAGCTGAG
GAGCTTCAGGGCAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAGATCCAATCGCT
GCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCCAAAGAAA
CCCAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTGCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAGGCGGACC
CAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGCCGAAGCT
GATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAAGACCACGATGATACGACTTGAAAAGAAGCCACAG
AACACTCTACTCAGTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTAGCTCTTAGTGCC
TTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTGAACTTCAGTTT
ATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGATC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 2 10

CO CL502Contig1 666 5 7 U
GGCCCAGCCAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTTATCCAAAAAATGTTTTTT
CAGATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGT
ATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTC
AGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCC
ACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTATTAAG
GCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCCAGCG
TCTGGGGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTAAAT
GAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTCTCTTTAATATAATAC
TAATTACACGCGGATGAACCAAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTA
CGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACAAATCTGCCACTGATCATGAGATG
CTCTAAATTTTGATATTATTTTATTTGGTTTGAAAATTAATTTTTGGCATGTGTTTTGCC
TCTTGC


BQ
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4ED60TF U 1
AF RR4DU12JQ C 4
AF RR4DU12TF U 4
AF RR4B176JQ C 1
AF RR4B176TF U 1
BS 1 169 RR4ED60TF
BS 170 171 RR4DU12TF
BS 172 328 RR4ED60TF
BS 329 329 RR4DU12TF
BS 330 559 RR4ED60TF
BS 560 573 RR4DU12TF
BS 574 666 RR4B176TF

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QA 3 570 3 570
DS 

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GG
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TATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGTATAAC
CCTTGGTAACTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGTCC
GATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACCGG
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GGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTAAATGAGAA
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TTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGT

QA 3 570 3 570
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TCTGGGGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTAAAT
GAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTCTCTTTAATATAATAC
TAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTA
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TCTTGC

QA 1 666 1 666
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TCTGGGGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTAAAT
GAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTCTCTTTAATATAATAC
TAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTA
CGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACAAATCTGCCACTGATCATGAGATG
CTCTAAATTTTGATATTATTTTATTTGGTTTGAAAATTAATTTTTGGCATGTGTTTTGCC
TCTTGC

QA 1 666 1 666
DS 



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ATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTC
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ACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAG
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ATTATTGGGATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATAATAAT
TACGCGCGGATGAAACCAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACGAA
ATTATAATAAACGTACTCGATTGTGTTGTATTTTTTAACGAATTAAGTGATATCAGTCAC
TATCAGTGAGATTACCATAGATGATTATAGTCAAGTTACATTATTGATTCACTGAATCAT
TCGACTTTGAAACTAGTGTTGTTTCTACCATTATGTTTTAAAAGATAAACCTCAAAGTTC
TTAATTTGCAACT


BQ
20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G746JQ C 1
AF RR4G746TF U 1
AF RR4GA93TF U 1
AF RR4F601TF U 2
AF RR4F601JQ C 18
BS 1 569 RR4G746TF
BS 570 608 RR4F601TF
BS 609 733 RR4F601JQ

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TACGCGCGGATGAAACCAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACGAA
ATTATAATAAACGTACTCGATTGTGTTGT

QA 1 569 1 569
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CAGATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGT
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AGTTCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCC
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GCGAAGGGAGGGTCAAAAATATTCCGGGATTGGCCCCGTCCAGAGTCTAAACCAGCGTCT
GGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGA
ATTATTGGGATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATAATAAT
TACGCGCGGATGAAACCAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACGAA
ATTATAATAAACGTACTCGATTGTGTTGT

QA 1 569 1 569
DS 

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AACCCCAG
CAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAAATGTTTTTTCAGATTAT
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TCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACCGGCGG
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GATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATAATAATTACGCGCG
GATGAAACCAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACGAAATTATAAT
AAACGTACTCGATTGTGTTG

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DS 

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GG
CCAGCCAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAAATGTTTTTTCAG
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ACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGT
TCGATTCTCGTGCCAGTAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACC
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AAGGGAGGGTCAAAAATATTCCGGGATTGGCCCCGTCCAGAGTCTAAACCAGCGTCTGGG
GGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGAATT
ATTGGGATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATAATAATTAC
GCGCGGATGAAACCAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACGAAATT
ATAATAAACGTACTCGATTGTGTTGTATTTTTTAACGAATTAAGTGATATCAGTCACTAT
CAGTG

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR4F601JQ 716 0 0
TCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAAATGTTTTTTCAGATTATTCAGGGGGT
TTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGTATAACCCTTGGTAGCTC
AGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGTTCGATTCTCGTGCC
AGTAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACCGGCGGCCTCGGTTT
AACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAGGCGAAGGGAGGGTCAAA
AATATTCCGGGATTGGCCCCGTCCAGAGTCTAAACCAGCGTCTGGGGGTAAACGGAGTAG
GCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGAATTATTGGGATTCCTTA
AATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATAATAATTACGCGCGGATGAAACC
AATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACGAAATTATAATAAACGTACT
CGATTGTGTTGTATTTTTTAACGAATTAAGTGATATCAGTCACTATCAGTGAGATTACCA
TAGATGATTATAGTCAAGTTACATTATTGATTCACTGAATCATTCGACTTTGAAACTAGT
GTTGTTTCTACCATTATGTTTTAAAAGATAAACCTCAAAGTTCTTAATTTGCAACT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 10

CO CL503Contig1 815 10 25 U
TTTTTTCTCATTTAAACTAAAAAGGTCTAAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACA
TTTTCCAGCTGCGTTTCGCGGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTAT
CCAGCCAAGTCGCGGAGGCATCGCGTATGATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCAT
CTCTGTGCCAGCCTTTGGTGAAGCGTGAAACGAACCCAAGAAGAGCCACACACAAAACCA
TACAGGCTTTGGAGGCTAAGACAAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCG
GTAACCAAGAGATCACGACATGTTATGAAACGCTTACCGATGCGCTTTATAATTTGGCAA
GCGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGG
CTGTGTCTGATTACGGTGTATGCGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGG
TTCAAAATTCAGCGGTTGATTTGAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTGTCTACAT
TGATTAGATGATAAACTAACAAACATTTGTTACTTTCTCCAAAAAATACTAATTAATTTC
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TGTTTTTATTTCGGGGAGCTGTTTGTTGATCATCATTCGTCGTGTAAACGCCACTGGGTA
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BQ
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55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 
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AF RR4FA31TF U 1
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GTAACCAAGAGATCACGACATGTTATGAAACGCTTACCGATGCGCTTTATAATTTGGCAA
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CAAAAAA

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CTTTGGAGGCTAAGA*AAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCGGTAACC
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TGATATGAT

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G
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AATTTCAATGATATGATAACTTTTCGAAATTTCATTA

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DS 



AS 2 9

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP62TF U 1
AF RR4AP62JQ C 145
AF RR4EZ67TF U 305
BS 1 669 RR4AP62TF
BS 670 925 RR4EZ67TF

RD RR4AP62TF 669 0 0
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TAGCATCTTCGTTTGTATCTTGTTACGACCCAAGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTTGCCG
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TCGGAAGCCAAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTT
TGATAATGC

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DS 

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CGGGGGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGTCCTTGTTG
AAGGAACGCTTTTAGTTGGGTTTGTAACATCAAACCAAGACAACAACAGATTGTTCTCGA
AGGTTCTTTATCCTGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTTCCAAGTGA
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AAGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAAGCAAGGTTTTCTTCTAAGT
ACGATCATCATTATTAATAAGATTAAAGGAGTGAATTAACAAAAGAAAGATAAAAGGAAC
GACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGACGTGGTATGTAATATAGTGTGTGAAA
ATTGAAATAAAACAATTAAGGCGG
C

QA 1 744 1 744
DS 

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G
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GTTCGTATTGACTTTGCCCCGGGGGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGTCACG
GAGATCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTTTTAGTAGGGTTTGTAACATCAAACCAAGAC
AACAACAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCTGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGG
ATGATCCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGAACGAATGCGGTTGCGT**GCTGGTCTCGGA
AGCCAAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATA
ATGCCGGAGATTCTGGCTAAAGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAA
GCAAGGTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAATAAGATTAAAGGAGTGAATTAACA
AAAGAAAGATAAAAGGAACGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGACGTGGTA
TGTAATATAGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAGGCGGTAAACACGAGTTATTAA
TTACAGCTTGATAATAAAAA

QA 2 621 2 621
DS 



CO CL504Contig2 905 6 23 U
GGGCAATATCTCAAAACCTACCACAAAGCTAGAGACAAAAAGAAATACATCGGAAATACA
AAATATAAAAATGGATGGGCTTCTTCGCTTCCTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTGGCTCT
AGCATCTTCATTTGTATCTTGTTACGACCCAAGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGT
CGATGACGTTAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAA
GGCCGAGGATTTCTTTACTTCCGGACTAAACATTGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGG
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TCTTGTTCGTATTGACTTTGCTCCGGGGGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGC
CACGGAGATCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTTTTAGTAGGGTTTGTAACATCGAACCA
AGACAACAACAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCAT
CGGGATGATCCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCT
CGGAAGCCAAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTT
GATAATGCCGGAGATTTTGGCTAAAGCGCTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTGAGGTTTCT
CGAAGCAAGGTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAATAAATATTAAAAGAGTGAAT
TAACAAAATAAAGATAAAAGGAATGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATG
TGGTATGTAATATTGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAGGCGGTAAACACGAGTT
ATTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 15 15 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4CY60TF U 1
AF RR4C089TF U 3
AF RR4AU78JQ C 129
AF RR4C066JQ C 701
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AF RR4AU78TF U 129
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RD RR4CY60TF 457 0 0
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AAATATAAAAATGGATGGGCTTCTTCGCTTCCTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTGGCTCT
AGCATCTTCATTTGTATCTTGTTACGACCCAAGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGT
CGATGACGTTAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAA
GGCCGAGGATTTCTTTACTTCCGGACTAAACATTGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGG
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TCTTGTTCGTATTGACTCTGCTCCGGGGGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGC
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QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4C089TF 758 0 0
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TACTTCCGGACTAAACATTGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGTTCCAACGTTACCAA
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CCTTGTTGAAGGAACGCTTTTAGTAGGGTTTGTAACATCGAACCAA**CAACAACGGATT
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CGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCA*CGCCTTTGATAATGCCGGAGAT
TTTGGCTAAAGCG*TTCAGCTGGATGTGAACGTGGTGAGGTT*CTCGAAGCAAGGTTTTC
TTCTA*GTACGATCATCAT
ATAATA

QA 14 752 14 752
DS 

RD RR4AU78JQ 765 0 0
G
ATTTGTATCTTGTTACGACCCAAGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACGT
TAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGA
TTTCTTTACTTCCGGACTAAACATTGCCGGAAACGCCATGAACCGCGTCGGTTCCAACGT
TACCAACGTTAACGTTGACAAGATCCCCGGACTCAACACCCTTGGAGTCTCTCTTGTTCG
TATTGACTTTGCTCCGGGGGGTCAAAACTCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGAT
CCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTTTTAGTAGGGTTTGTAACATCGAACCAAGACAACAA
CAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGAT
CCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCA
AAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATAATGCC
GGAGATTTTGGCTAAAGCGCTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTGAGGTTTCTCGAAGCAAG
GTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAATAAATATTAAAAGAGTGAATTAACAAAAT
AAAGATAAAAGGAATGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTA
ATATTGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAGGCGGTAAAC

QA 2 765 2 765
DS 

RD RR4C066JQ 189 0 0
GTGAACGTGGTGAGGTTTCTCGAAGCAAGGTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAA
TAAATATTAAAAGAGTGAATTAACAAAATAAAGATAAAAGGAATGACGTGAAATGTAAAA
TACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTAATATTGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAAT
TAAGGCGGT

QA 1 189 1 189
DS 

RD RR4CY60JQ 715 0 0
GATGACGTTAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAG
GCCGAGGATTTCTTTACTTCCGGACTAAACATTGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGT
TCCAACGTTACCAACGTTAACGTTGACAAGATCCCCGGACTCAACACCCTTGGAGTCTCT
CTTGTTCGTATTGACTCTGCTCCGGGGGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCC
ACGGAGATCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTTTTAGTAGGGTTTGTAACATCGAACCAA
GACAACA*CAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATC
GGGATGATCCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTC
GGAAGCCAAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTG
GTAATGCCGGAGATTTTGGCTAAAGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTGAGGTTTCTC
GAAGCAAGGTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAATAAATATTAAAAGAGTGAATT
AACAAAATAAAGATAAAAGGAATGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATGT
GGTATGTAATATTGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAGGCGGTAAAC
ACG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4AU78TF 777 0 0
G
ATTTGTATCTTGTTACGACCCAAGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACGT
TAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGA
TTTCTTTACTTCCGGACTAAACATTGCCGGAAACGCCATGAACCGCGTCGGTTCCAACGT
TACCAACGTTAACGTTGACAAGATCCCCGGACTCAACACCCTTGGAGTCTCTCTTGTTCG
TATTGACTTTGCTCCGGGGGGTCAAAACTCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGAT
CCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTTTTAGTAGGGTTTGTAACATCGAACCAAGACAACAA
CAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGAT
CCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCA
AAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATAATGCC
GGAGATTTTGGCTAAAGCGCTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTGAGGTTTCTCGAAGCAAG
GTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAATAAATATTAAAAGAGTGAATTAACAAAAT
AAAGATAAAAGGAATGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTA
ATATTGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAAGCGGTAAACACGAGTTATTAA

QA 2 777 2 777
DS 



AS 1 10

CO CL505Contig1 1132 10 5 U
CTTTATGACAAAACTTGCGAGATAAATATAGTTGAAATTCCATTCAAAACAAAAGGTGCA
AAGCAGAATACCCTCCTAAAGATTGAAAGAGACAGACAGTTGTGGTTCGATAACACTTTC
AATTCCAACAGCAACCAAAAAAAACATTGTCTATGACCATCGCCATCAACTTTACTCCCA
ACCAGCAGCTGCAGTTGTGGGTGGCACAGCCGCGTCCCATCCACCTTCTGCTGCTGGAGC
AACGCTGGAATCGTTCCAAGAAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAGATTGGCGCCTGGGCTTC
TCCTGGCCATGCAGCATCAGGGATGGCAGCAGTGGTCCATTGCTCACCACCATACTCAGG
AGCAGGTAGTCCAAACTCTGCCTGAGGGGCAACTTCATCCTCGTCCTCTGGCTTAGCCTC
CTCTGGCTCCCTGTAGAAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGAAT
GGTACCACGCATCTGAAGGACCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTGTG
CTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGG*ATACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGT
CACAGAAAGCAATGATTGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGG
TACGAGGATCTGTAAGAATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAG
TGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACT
TCAAGACAGCTCTCTGACCATAGGGCCTAGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTTCT
CAATAGCAACGATAACTCGTGCAGCCATCATCAGCTTATCCCATGTCTTGCCAAGGTTAA
AGATGTAGATACCGTCGTTACGTCTCTTGAAGACGTAACGCTCCATTTGGTAATTGCAGT
TCTTGGTTCCGAGGTGAACCTCAGCAGCGCACATCATCTTGATGTCAGCCTCCTTCTGGG
ATAGCTGTGCGGATCCTTGAGTCGCCATTCTGTTTTTCTCTTCTTCTTC***TTTGCCGG
GACCTAATCGCCTAGGTACGCGTTTGCAGTGTAAATCACACGAGAGAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 20 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4A074JQ U 16
AF RR4BT43JQ U 12
AF RR4A074JQD U 16
AF RR4B903JQ U 1
AF RR4AX09JQ U 21
AF RR4BT43TF C 178
AF RR4B903TF C 386
AF RR4A074TF C 285
AF RR4AX09TF C 389
AF RR4A074TFB C 402
BS 1 518 RR4B903JQ
BS 519 519 RR4BT43JQ
BS 520 890 RR4B903JQ
BS 891 937 RR4BT43TF
BS 938 1132 RR4A074TF

RD RR4A074JQ 246 0 0
G
GCGAGATAAATATAGTTGAAATTCCATTCAAAACAAAAGGTGCAAAGCAGAATACCCTCC
TAAAGATTGAAAGAAACAGACAGTTGTGGTTCGATAACACTTTCAATTCCAACAGCAACC
AAAAAAAACATTGTCTATGACCATCGCCATCAACTTTACTCCCAACCAGCAGCTGCAGTT
GTGGGTGGCACAGCCGCGTCCCATCCACCTTCTGCTGCTGGAGCAACGCTGGAATCGTTC
CAAGA

QA 2 246 2 246
DS 

RD RR4BT43JQ 709 0 0
AACTT
GCGAGATAAATATAGTTGAAATTCCATTCAAAACAAAAGGTGCAAAGCAGAATACCCTCC
TAAAGATTGAAAGAGACAGACAGTTGTGGTTCGATAACACTTTCAATTCCAACAGCAACC
AAAAAAAACATTGTCTATGACCATCGCCATCAACTTTACTCCCAACCAGCAGCTGCAGTT
GTGGGTGGCACAGCCGCGTCCCATCCACCTTCTGCTGCTGGAGCAACGCTGGAATCGTTC
CAAGAAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAGATTGGCGCCTGGGCTTCTCCTGGCCATGCAGCA
TCAGGGATGGCAGCAGTGGTCCATTGCTCACCACCATACTCAGGAGCAGGTAGTCCAAAC
TCTGCCTGAGGGGCAACTTCATCCTCGTCCTCTGGCTTAGCCTCCTCTGGCTCCCTGTAG
AAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGAATGGTACCACGCATCTGA
AGGACCATGAGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTG
GCGGGG*ATACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGAT
TGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGGTACGAGGATCTGTAAG
AATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAG

QA 6 709 6 709
DS 

RD RR4A074JQD 780 0 0
G
GCGAGATAAATATAGTTGAAATTCCATTCAAAACAAAAGGTGCAAAGCAGAATACCCTCC
TAAAGATTGAAAGAGACAGACAGTTGTGGTTCGATAACACTTTCAATTCCAACAGCAACC
AAAAAAAACATTGTCTATGACCATCGCCATCAACTTTACTCCCAACCAGCAGCTGCAGTT
GTGGGTGGCACAGCCGCGTCCCATCCACCTTCTGCTGCTGGAGCAACGCTGGAATCGTTC
CAAGAAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAAATTGGCGCCTGGGCTTCTCCTGGCCATGCAGCA
TCAGGGATGGCAGCAGTGGTCCATTGCTCACCACCATACTCAGGAGCAGGTAGTCCAAAC
TCTGCCTGAGGGGCAACTTCATCCTCGTCCTCTGGCTTAGCCTCCTCTGGCTCCCTGTAG
AAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGAATGGCACCACGCATCTGA
AGGACCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTG
GCGGGG*ATACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGAT
TGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGACGGGCTGGTGGTCGGTACGAGGATCTGTAAG
AATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAGTGAAGGTACCAGGAGT
GTGCCTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACTTCAAGACAGCTCTCT

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4B903JQ 890 0 0
CTTTATGACAAAACTTGCGAGATAAATATAGTTGAAATTCCATTCAAAACAAAAGGTGCA
AAGCAGAATACCCTCCTAAAGATTGAAAGAGACAGACAGTTGTGGTTCGATAACACTTTC
AATTCCAACAGCAACCAAAAAAAACATTGTCTATGACCATCGCCATCAACTTTACTCCCA
ACCAGCAGCTGCAGTTGTGGGTGGCACAGCCGCGTCCCATCCACCTTCTGCTGCTGGAGC
AACGCTGGAATCGTTCCAAGAAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAGATTGGCGCCTGGGCTTC
TCCTGGCCATGCAGCATCAGGGATGGCAGCAGTGGTCCATTGCTCACCACCATACTCAGG
AGCAGGTAGTCCAAACTCTGCCTGAGGGGCAACTTCATCCTCGTCCTCTGGCTTAGCCTC
CTCTGGCTCCCTGTAGAAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGAAT
GGTACCACGCATCTGAAGGACCATGCGAGCAAGAAGCCGGAAAAGACACCCAATGCTGTG
CTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGG*ATACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGT
CACAGAAAGCAATGATTGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGG
TACGAGGATCTGTAAGAATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAG
TGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACT
TCAAGACAGCTCTCTGACCATAGGGCCTAGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTTCT
CAATAGCAACGATAACTCGTGCAGCCATCATCAGCTTATCCCATGTCTTG

QA 1 890 1 890
DS 

RD RR4AX09JQ 824 0 0
GATAAATATAGTTGAAATTCCATTCAAAACAAAAGGTGCAAAACAGAGTACCCTCCTAAA
GATTGAAAGAGACAGACAGTTGTGGTTCGATAACACTTTCAATTCCAACAGCAACCAAAA
AAAACATTGTCTATGACCATGGTCATCAACTTTACTCCCAACCAGCAGCTGCAGTCGTGG
GTGGCACAGCCGCGTCCCATCCACCTTCTGCTGCTGGAGCAACGCTGGAATCGTTCCAAG
AAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAAATTGGCGCCTGGGCTTCTCCTGGCCATGCAGCATCAG
GGATGGCAGCAGTGGTCCACTGTTCACCACCATACTCAGGAGCAGGTAGTCCAAACTCTG
CCTGAGGGGCAACTTCATCCTCATCCTCTGGCTTAGCCTCTTCGGGCTCCCTGTAGAAGA
ACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGCGCAGGGCGAATGGTACCACGCATCTGAAGGA
CCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTGGCGG
GG*ATACCGATGCCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGA
ATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGGTACGAGGATCAGTAAGAATC
AACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAGTGAAGGTACCAGGAGTGTGC
CTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACTTCAAGACAGCTCTCTGACCA
TATGGCCTAGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTTCTCAAT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4BT43TF 762 0 0
CCC
ACCAGCAGCTGCAGT*GTGG*TGGCACAGCCGCGTCCCATCCAC*TTCTGCTGCTG*AGC
AACGCTGGAATCGT*CCAAGAAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAGATTGGCGCCTGGGCTTC
TCCTGGCCATGCAGCATCAGGGATGGCAGCAGTGGTCCATTGCTCACCACCATACTCAGG
AGCAGGTAGTCCAAACTCTGCCTGAGGGGCAACTTCATCCTCGTCCTCTGGCTTAGCCTC
CTCTGGCTCCCTGTAGAAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGAAT
GGTACCACGCATCTGAAGGACCATGAGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTGTG
CTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGGGATACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGT
CACAGAAAGCAATGATTGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGG
TACGAGGATCTGTAAGAATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAG
TGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACT
TCAAGACAGCTCTCTGACCATAGGGCCTAGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTTCT
CAATAGCAACGATAACTCGTGCAGCCATCATCAGCTTATCCCATGTCTTGCCAAGGTTAA
AGATGTAGATACCGTCGTTACGTCTCTTGAAGACGTA
CG

QA 4 760 4 760
DS 

RD RR4B903TF 674 0 0
GGGGCAACTTCATCCTCGTCCTCTGGCTTAGCCTCCTCTGGCTCCCTGTAGAAGAACAGG
TCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGAATGGTACCACGCATCTGAAGGACCATG
CGAGCAAGAAGCCGGAAAAGACACCCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGG*AT
ACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGAATGTT
TCCCAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGGTACGAGGATCTGTAAGAATCAACAA
CCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAGTGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCC
AGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACTTCAAGACAGCTCTCTGACCATAGGG
CCTAGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTTCTCAATAGCAACGATAACTCGTGCAGC
CATCATCAGCTTATCCCATGTCTTGCCAAGGTTAAAGATGTAGATACCGTCGTTACGTCT
CTTGAAGACGTAACGCTCCATTTGGTAATTGCAGTTCTTGGTTCCGAGGTGAACCTCAGC
AGCGCACATCATCTTGATGTCAGCCTCCTTCTGGGATAGCTGTGCGGATCCTTGAGTCGC
CATTCTGTTT
TTCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4A074TF 848 0 0
AGATGGCGCTGGGC
TCTCCTGGCCATGCAGCATCAGG*ATGGCAGCAGTGGTCCATTGCTCACCACCATACTCA
GGAGCAGGTAGTCCAAACTCTGC*TGAGGGGCAACTTCATCCTCGTC*TCTGGCTTAGCC
TCCTCTGGCTCCCTGTAGAAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTTCTGAGCAGGGCGA
ATGGCACCACGCATCTGAAGGACCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTG
TGCTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGG*ATACCGATGTCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGT
GTCACAGAAAGCAATGATTGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGACGGGCTGGTGGTC
GGTACGAGGATCTGTAAGAATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATT
AGTGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAA
CTTCAAGACAGCTCTCTGACCATAGGGCCTAGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTT
CTCAGTAGCAACGATAACTCGTGCAGCCATCATCAGCTTATCCCATGTCTTGCCAAGGTT
AAAGATGTAGATACCGTCGTTACGTCTCTTGAAGACGTAACGCTCCATTTGGTAATTGCA
GTTCTTGGTTCCGAGGTGAACCTCAGCAGCGCACATCATCTTGATGTCAGCCTCCTTCTG
GGATAGCTGTGCGGATCCTTGAGTCGCCATTCTGTTTTTCTCTTCTTCTTC***TTTGCC
GGGACCTAATCGCCTAGGTACGCGTTTGCAGTGTAAATCACACGAGAGAGGCCC

QA 15 848 15 848
DS 

RD RR4AX09TF 742 0 0
GCAACTTCATCCTCATCCTCTGGCTTAGCCTCTTCGGGCTCCCTGTAGAAGAACAGGTCA
ACCATGACATCCCACTTCTGCGCAGGGCGAATGGTACCACGCATCTGAAGGACCATGCGA
GCAAGAAGCCAGAAAAGACACCCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGG*ATACC
GATGCCAACAAACCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGAATGTTTCC
CAAAGCACCTTCCTTGATGGGCTGGTGGTCGGTACGAGGATCAGTAAGAATCAACAACCT
TGGCTCACTGAATGAGGTTTGCATCTGATTAGTGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCCAGC
AATGGCATTGGCCCCAGTGTACTGAGCAAACTTCAAGACAGCTCTCTGACCATATGGCCT
AGCTGACTGCACAATGATGTCTTGTGGGTTCTCAATAGCAACGATAACTCGTGCAGCCAT
CATCAGCTTATCCCATGTCTTGCCAAGGTTAAAGATGTAGATACCGTCGTTGCGTCTCTT
GAAGACGTAACGCTCCATTTGGTAATTGCAGTTCTTGGTTCCGAGGTGAACCTCAGCAGC
ACACATCATCTTGATGTCAGCCTCCTTCTGGGAAAGCTGTGCGGATCCTTGAGTCGCCAT
TTTGTTTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTTGCCGGGACCTAATCGCCGAGGTACGCGTTTGCA
GTGTAAATCACACGAGAGAG
CC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4A074TFB 731 0 0
TCGT
CTCTGGCTTAGCCTCCTCTGGCTCCCTGTAGAAGAACAGGTCAACCATGACATCCCACTT
CTGAGCAGGGCGAATGGCACCACGCATCTGAAGGACCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAG
ACACCCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTGGCGGGG*ATACCGATGTCAACAAACCTCA
TGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGAATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGA
CGGGCTGGTGGTCGGTACGAGGATCTGTAAGAATCAACAACCTTGGCTCACTGAATGAGG
TTTGCATCTGATTAGTGAAGGTACCAGGAGTGTGCCTTCCAGCAATGGCATTGGCCCCAG
TGTACTGAGCAAACTTCAAGACAGCTCTCTGACCATAGGGCCTAGCTGACTGCACAATGA
TGTCTTGTGGGTTCTCAGTAGCAACGATAACTCGTGCAGCCATCATCAGCTTATCCCATG
TCTTGCCAAGGTTAAAGATGTAGATACCGTCGTTACGTCTCTTGAAGACGTAACGCTCCA
TTTGGTAATTGCAGTTCTTGGTTCCGAGGTGAACCTCAGCAGCGCACATCATCTTGATGT
CAGCCTCCTTCTGGGATAGCTGTGCGGATCCTTGAGTCGCCATTCTGTTTTTCTCTTCTT
CTTC***TTTGCCGGGACCTAATCGCCTAGGTACGCGTTTGCAGTGTAAATCACACGAGA
GAG
GCCC

QA 5 727 5 727
DS 



AS 1 8

CO CL506Contig1 1161 8 12 U
ATCATCAATACTATTATCCTTTTCCTCGTTACAGCACTGTTATGTAAATATCTCGGCTTT
GTTACTGTGACATATGTAAATATTATTCGGCTTTGAAATAGACCAGAGCTCTTGAACATC
TTTTTTGGTAATGCAAAGGCTTTGATAAAAAGAAAACGGGTTTAGTTTACTCGGTAATGT
GACAGAAACACAAGTATCACAGAACTAAACCAAGATTCACTTGCTCAAAGGGCAAGAATG
AGAGGAAAAGACAATATCATCCATTAAAACTCTCAAAAGTATTCATGAGAAAAATCTGCA
GTCTGGCAAATGATCCACGCTTTAGCTTTGAGATGGAAAGATATTTAGGGAGCGAGCCTT
AAAGGGTCACGAGGGAAGAGCGATGTTTTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCATT
ACCACTCGCTCCAGACCCACTCCGAATCCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGAA
TCAATGTATGTTTTTATTGTCTCGACGTCAATGCCAACTCGTGTTGCCTGTTCCTTCAAA
AGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGCTCCTGATATGATCTCCTCACCTCTTATAAAGACA
TCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATCGTCCGCACAAGGCATAGTGTAAAATGGCCTAATC
GCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTAGAACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGAACGAGCTGG
CCAAGCTTTCTCTCAACTTCTGTATTTAGATCTCCAAGAGGATCAGCCTCGACACCAGCT
TCCTTCAGCATTTGAATCCCTTCTGCAAAGGGTATAATCAATGTTTTTGGAAGGAACTTC
AACGGCTCAAATGGGTATTGCTTTCTAATAGCTTCAAGTTCCTTCGAGCACCTCTCTTCT
AATTTAGTGAATATGAACGGAAACAACTCGCCCACAATATCCATTACCTCAGAATAGTGC
TTGTGAATCGCCATCTCCACATCAAGACCAATAAACTCACACAGATGTCTATGAGTGAAC
GAGTCTTCTGCTCTGTAAACAGCACCAACCTCAAAGACGCGTTCCAAGTCACCACATATT
GCCATCTGCTTATGAAGCTGAGGAGACTGAGCTAGACAAGCAGGCTGCCCTTTGTACTCC
AACCTAAACACAGCAGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E818TF C 127
AF RR4F028TF C 1
AF RR4DE55JQ U 160
AF RR4BX05JQ U 148
AF RR4DJ88JQ U 147
AF RR4CS85JQ U 127
AF RR4DJ88TF C 357
AF RR4BX05TF C 470
BS 1 126 RR4F028TF
BS 127 288 RR4CS85JQ
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BS 954 954 RR4DJ88TF
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BS 978 1062 RR4DJ88TF
BS 1063 1161 RR4BX05TF

RD RR4E818TF 369 0 0
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AACACAAGTATCACAGAACTAAACCAAGATTCACTTGCTCAAAGGGCAAGAATGAGAGGA
AAAGACAATATCATCCATTAAAACTCTCAAAAGTATTCATGAGAAAAATCTGCAGTCTGG
CAAATGATCCACACTTTAGCTTTGAGATGGAAAGATATTTAGGGAGCGAGCCTTAGAGGG
TCACGAGGGAAGAGCGATGTTTTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCATTACCACT
CGCTCCAGACCCACTCCGAATCCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGAATCAATG
TATGTTTT
C

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4F028TF 741 0 0
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GTTACTGTGACATATGTAAATATTATTCGGCTTTGAAATAGACCAGAGCTCTTGAACATC
TTTTTTGGTAATGCAAAGGCTTTGATAAAAAGAAAGCGGGTTTAGTTTACTCGGTAATGT
GACAGAAACACAAGTATCACAGAACTAAACCAAGATTCACTTGCTCAAAGGGCAAGAATG
AGAGGAAAAGACAATATCATCCATTAAAACTCTCAAAAGTATTCATGAGAAAAATCTGCA
GTCTGGCAAATGATCCACGCTTTAGCTTTGAGATGGAAAGATATTTAGGGAGCGAGCCTT
AAAGGGTCACGAGGGAAGAGCGATGTTTTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCATT
ACCACTCGCTCCAGACCCACTCCGAATCCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGAA
TCAATGTATGTTTTTATTGTCTCGACGTCAATGCCAACTCGTGTTGCCTGTTCCTTCAAA
AGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGCTCCTGATATGATCTCCTCACCTCTTATAAAGACA
TCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATCGTCCGCACAAGGCATAGTGTAAAATGGCCTAATC
GCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTAGAACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGAACGAGCTGG
CCAAGCTTTCTCTCAACTTC
C

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4DE55JQ 603 0 0
GTTTAGTTTACTCGGTAATGTGACAGAAAAACAAGTATCACAGAACTAAACCAAGATTCA
CTTGCTCAAAGGGCAAGAATGAGAGGAAAAGACAATATCATCCATTAAAACTCTCAAAAG
TATTCATGAAAAAAATCTGCAGTCTGGCAAATGATCCACGCTTTAGCTTTGAGATGGAAA
GATATTTAGGGAGCGAGCCTTAAAGGGTCACGAGGGAAGAGCGATGCTTTGCGGATGTTG
TTGAGGCCACAAAAGAGCATTACCACTCGCTCCAGACCCACTCCGAATCCACCGTGAGGT
GGTGCACCGTACCTGAATGAATCAATGTATGTTTGT**TGTCTCGACGTCAATGCCAACT
CGTGTTGCCTGTTCCTTCAAAAGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGCTCCTGATATGATC
TCCTCACCTCTTATAAAGACATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATCGTCCGCACAAGGC
ATAGTGTAAAATGGCCTAATCGCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTAGAACTCTGTGTTG
TACTTCTCCAGAACGAGCTGGCCAAGCTTTCTCTCAACTTCTGTATTTAGATCTCCAAGA
GGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4BX05JQ 699 0 0
AAAAGAAAACGGGTTTAGTTTACTCGGTAATGTGACAGAAACACAAGTATCACAGAACTA
AACCAAGATTCACTTGCTCAAAGGGCAAGAATGAGAGGAAAAGACAATATCATCCATTAA
AACTCTCAAAAGTATTCATGAGAAAAATCTGCAGTCTGGCAAATGATCCACACTTTAGCT
TTGAGATGGAAAGATATTTAGGGAGCGAGCCTTAAAGGGTCACGAGGGAAGAGCGATGTT
TTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCATTACCACTCGCTCCAGACCCACTCCGAAT
CCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGAATCAATGTATGTTTTTATTGTCTCGACG
TCAATGCCAACTCGTGTTGCCC**TCCTTCAAAAGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGCT
CCTGATATGATCTCCTCACCTCTTATAAAGACATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATCG
TCCGCACAAGGCATAGTGTAAAATGGCCTAATCGCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTAG
AACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGAACGAGCTGGCCAAGCTTTCTATCAACTTCTGTATTT
AGATCTCCAAGAGGATCAGCCTCGACACCAGCTTCCTTCAGCATTTGAATCCCTTCTGCA
AAGGGTATAATCAATGTTTTTGGAAGGAACTTCAACGGC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4DJ88JQ 795 0 0
AAAAAGAAAACGGGTTTAGTTTACCCGGTAATGTGACAGAAACACAAGTATCACAGAACT
AAACCAAGATTCACTTGCTCAAAGGGCAAGAATGAGAGGAAAAGACAATATCATCCATTA
AAACTCTCAAAAGTATTCATGAGAAAAATCTGCAGTCTGGCAAATGATCCACGCTTTAGC
TTTGAGATGGAAAGATATTTAGGGAGCGAGCCTTAAAGGGTCACGAGGGAAGAGCGATGT
TTTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCATTACCACTCGCTCCAGACCCACTCCGAA
TCCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGAATCAATGTATGTTTTTATTGTCTCGAC
GTCAATGCCAACTCGTGTTGCCTGTTCCTTCAAAAGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGC
TCCTGATATGATCTCCTCACCTCTTATAAAGACATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATC
GTCCGCACAAGGCATAGTGTAAAATGGCCTAATCGCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTA
GAACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGAACGAGCTGGCCAAGCTTTCTCTCAACTTCTGTATT
TAGATCTCCAAGAGGATCAGCCTCGACACCAGCTTCCTTCAGCATTTGAATCCCTTCTGC
AAAGGGTATAATCAATGTTTTTGGAAGGAACTTCAACGGCTCAAATGGGTATTGCTTTCT
AATAGCTTCAAGTTCCTTCGAGCACCTCTCTTCTAATTTAGTGAATATGAACGGAAACAA
CTCGCCCACAATATC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4CS85JQ 856 0 0
GGTAATGCAAAGGCTTTGATAAAAAGAAAACGGGTTTAGTTTACTCGGTAATGTGACAGA
AACACAAGTATCACAGAACTAAACCAAGATTCACTTGCTCAAAGGGCAAGAATGAGAGGA
AAAGACAATATCATCCATTAAAACTCTCAAAAGTATTCATGAAAAAAATCTGCAGTCTGG
CAAATGATCCACGCTTTAGCTTTGAGATGGAAAGATATTTAGGGAGCGAGCCTTAAAGGG
TCACGAGGGAAGAGCGATGTTTTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCATTACCACT
CGCTCCAGACCCACTCCGAATCCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGAATCAATG
TATGTTTTTATTGTCTCGACGTCAATGCCAACTCGTGTTGCCTGTTCCTTCAAAAGTTCC
GGGTCATGGACACGTTGAGCTCCTGATATGATCTCCTCACCTCTTATAAAGACATCGAAT
GAGTTGCTGTAGTTAGGATCGTCCGCACGAGGCATAGTGTAAAATGGCCTAATCGCCGAA
GGATAGCGATGCAGGATGTAGAACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGAACGAGCTGGCCAAGC
TTTCTCTCAACTTCTGTATTTAGATCTCCAAGAGGATCAGCCTCGACACCAGCTTCCTTC
AGCATTTGAATCCCTTCTGCAAAGGGTATAATCAATGTTTTTGGAAGGAACTTCAACGGC
TCAAATGGGTATTGCTTTCTAATAGCTTCAAGTTCCTTCGAGCACCTCTCTTCTAATTTA
GTGAATATGAACGGAAACAACTCGCCCACAATATCCATTACCTCAGA*TAGTGCTTGTGA
*TCGCCATCTC
ACATC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4DJ88TF 707 0 0
GCC
TAAAGGGTCACGAGG*AAGAGCGATGTTTTGCGGATGTTGTTGAGGCCACAAAAGAGCAT
TACCACTCGCTCCAGACCCACTCCGAATCCACCGTGAGGTGGTGCACCGTACCTGAATGA
ATCAATGTATGTTTTTATTGTCTCGACGTCAATGCCAACTCGTGTTGCCTGTTCCTTCAA
AAGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGCTCCTGATATGATCTCCTCACCTCTTATAAAGAC
ATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATCGTCCGCACAAGGCATAGTGTAAAATGGCCTAAT
CGCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTAGAACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGAACGAGCTG
GCCAAGCTTTCTCTCAACTTCTGTATTTAGATCTCCAAGAGGATCAGCCTCGACACCAGC
TTCCTTCAGCATTTGAATCCCTTCTGCAAAGGGTATAATCAATGTTTTTGGAAGGAACTT
CAACGGCTCAAATGGGTATTGCTTTCTAATAGCTTCAAGTTCCTTCGAGCACCTCTCTTC
TAATTTAGTGAATATGAACGGAAACAACTCGCCCACAATATCCATTACCTCAGAATAGTG
CTTGTGAATCGCCATCTCCACATCAAGACCAATAAACTCACACAGATGTCTATGAGTGAA
CGAGTCTTCTGCTCTGTAAACAGCACCAACCTCAAAGACGCGT
C

QA 4 706 4 706
DS 

RD RR4BX05TF 692 0 0
TA
CTGAATGAATCAATGTATGTTT*TATTGTCTCGACGTCAATGCCCACTCGTGTTGCCC**
TCCTTCAAAAGTTCCGGGTCATGGACACGTTGAGCTCCTGATATGATCTCCTCACCTCTT
ATAAAGACATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGGATCGTCCGCACAAGGCATAGTGTAAAAT
GGCCTAATCGCCGAAGGATAGCGATGCAGGATGTAGAACTCTGTGTTGTACTTCTCCAGA
ACGAGCTGGCCAAGCTTTCTATCAACTTCTGTATTTAGATCTCCAAGAGGATCAGCCTCG
ACACCAGCTTCCTTCAGCATTTGAATCCCTTCTGCAAAGGGTATAATCAATGTTTTTGGA
AGGAACTTCAACGGCTCAAATGGGTATTGCTTTCTAATAGCTTCAAGTTCCTTCGAGCAC
CTCTCTTCTAATTTAGTGAATATGAACGGAAACAACTCGCCCACAATATCCATTACCTCA
GAATAGTGCTTGTGAATCGCCATCTCCACATCAAGACCAATAAACTCACACAGATGTCTA
TGAGTGAACGAGTCTTCTGCTCTGTAAACAGCACCAACCTCAAAGACGCGTTCCAAGTCA
CCACATATTGCCATCTGCTTATGAAGCTGAGGAGACTGAGCTAGACAAGCAGGCTGCCCT
TTGTACTCCAACCTAAACACAGCAGCACCC

QA 3 692 3 692
DS 



AS 3 8

CO CL507Contig1 844 2 3 U
GATGATGACGATGATCCGGCTCTTTCCAAGCCGCTTGCCACTGCTTGTCATACAACGTCG
TCTCTTCAAATAGACCCTTGAGCTTATCTAAATCTTCGTTCTTGCGAATGAAAAGAACTC
CAGCTACAGCCACAAACAAGAGCGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATTTGATCAACAAGTC
CTACTCCGGTAAGGCTGTCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTATCATCGCAGCATGAC
CATTGAGGAGTTCAGCTTCTGGTAGATGGTATCGCTTCATCCATGCCCACCATGGAATGA
TGGAGGTATCGAAGAGAACAGGCTCGGCGTTAGTAGTTGTTTCTGGGTTATCTTCAAGCC
ACTTCCTCCTCTTTGCCTCAGCGACGATAACAGAATCCCAATCTGTTTTCCCGTCTTTCT
CGAACTGTTTCAGATCCCAAGTCCCATTAACCCACTTCGCATCCTGAAACTTGATCTCCG
TCGTGGTTGTGGTTGGCAGATCAGTCTCTTCTCCTCCGTTTTCAGACGCGGAGGAGCTTT
CCCGCCGCCGGAGATTTGACCGGTGCTTCCTCTACAGGCTTCGGAATCTCGACTGTTGTC
GAAGAGACTGCAGCGGAATCGGGCGTTGACGCACCGTTATCGGAGGAGGAAGCTCGGGTG
ACGGAGAGGAGGGAGAAGCGCTTTGTGGAGAGGAGAGAGGGTGAGAGTGAGATCTTGGGG
GTGAGATTAGGGTTCTGAGGTGAAGAAGAAGAGATCGGAGGAGAGAAGAGCGCCATGGAT
ATGGACATTTTGTTGCTCTCTCTCGTCTGCTCTCAGTTTTTGGGAGTTGGTTTTGAATGT
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4BA66JQ U 489
AF RR4BA66TF C 1
BS 1 491 RR4BA66TF
BS 492 641 RR4BA66JQ
BS 642 844 RR4BA66TF

RD RR4BA66JQ 153 0 0
GTG
GTTGGCAGATCAGTCTCTTCTCCTCCGTTTTCAGACGCGGAGGAGCTTTCCCGCCGCCGG
AGATTTGACCGGTGCTTCCTCTACAGGCTTCGGAATCTCGACTGTTGTCGAAGAGACTGC
AGCGGAATCGGGCGTTGACGCACCGTTATC

QA 4 153 4 153
DS 

RD RR4BA66TF 844 0 0
GATGATGACGATGATCCGGCTCTTTCCAAGCCGCTTGCCACTGCTTGTCATACAACGTCG
TCTCTTCAAATAGACCCTTGAGCTTATCTAAATCTTCGTTCTTGCGAATGAAAAGAACTC
CAGCTACAGCCACAAACAAGAGCGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATTTGATCAACAAGTC
CTACTCCGGTAAGGCTGTCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTATCATCGCAGCATGAC
CATTGAGGAGTTCAGCTTCTGGTAGATGGTATCGCTTCATCCATGCCCACCATGGAATGA
TGGAGGTATCGAAGAGAACAGGCTCGGCGTTAGTAGTTGTTTCTGGGTTATCTTCAAGCC
ACTTCCTCCTCTTTGCCTCAGCGACGATAACAGAATCCCAATCTGTTTTCCCGTCTTTCT
CGAACTGTTTCAGATCCCAAGTCCCATTAACCCACTTCGCATCCTGAAACTTGATCTCCG
TCGTGGTTGTGGTTGGCAGATCAGTCTCTTCTCCTCCGTTTTCAGACGCGGAGGAGCTTT
CC*GCCGCCGGAGATTTGACCGGTGCTTCCTCTACAGGCTTCGGAATCTCGACTGTTGTC
GAAGAGACTGCAGCGGAATCGGGCGTTGACGCACCGTTATCGGAGGAGGAAGCTCGGGTG
ACGGAGAGGAGGGAGAAGCGCTTTGTGGAGAGGAGAGAGGGTGAGAGTGAGATCTTGGGG
GTGAGATTAGGGTTCTGAGGTGAAGAAGAAGAGATCGGAGGAGAGAAGAGCGCCATGGAT
ATGGACATTTTGTTGCTCTCTCTCGTCTGCTCTCAGTTTTTGGGAGTTGGTTTTGAATGT
GTCC

QA 1 844 1 844
DS 



CO CL507Contig2 627 3 21 U
CAAAGCCAAATAGATGTCACTATCTCAAGATCAGTAATACAATAAAGAAATTATCACTGA
TCACAAACATCACATAACAAAGAGGAAACAAAAAGCGAGAAAGTTTCTGTTCACTTCTTC
GAAGAAACCGTCGATGATGATGACGATTCCGGTTCTTTCCAAGCCGCTTGCCACTGCTTG
TCATACAACGTCGTCTCTTCGAACAGACCCTTGAGCTTATCAAAATCTTCGTTCTTGCGA
ATGAAAAGAACTCCAGCTACAGCCACAAACAAGAGCGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATT
TGATCAACAAGTCCTACTCCGGTAAGGCTGTCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTATC
ATCGCAGCACGGCCATTGAGGAGTTCAGCTTCTGGTAGATGGTATCGCTTCATCCATGCC
CACCATGGAATGATGGATGTATCGAAGAGAACAGGCTCGGCGTTAGTAGTTGTTTCTGGG
TTATCTTCAAGCCACTTCCTCCTCTTTGCCTCAGCGACGATAACAGAATCCCAATCTGTT
TTCCCGTCTTTCTCGAACTGTTTCAGAGACTGCAGCGGAATCGGGCGTTGACGCACCGTT
GTCGGAGGCGGAAGCTCGAGTGACGGA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G383JQ U 1
AF RR4G383TF C 1
AF RR4DD60JQ U 1
BS 1 109 RR4DD60JQ
BS 110 110 RR4G383JQ
BS 111 143 RR4DD60JQ
BS 144 144 RR4G383JQ
BS 145 152 RR4DD60JQ
BS 153 153 RR4G383JQ
BS 154 200 RR4DD60JQ
BS 201 201 RR4G383JQ
BS 202 203 RR4DD60JQ
BS 204 204 RR4G383JQ
BS 205 221 RR4DD60JQ
BS 222 222 RR4G383JQ
BS 223 239 RR4DD60JQ
BS 240 240 RR4G383JQ
BS 241 371 RR4DD60JQ
BS 372 372 RR4G383JQ
BS 373 405 RR4DD60JQ
BS 406 406 RR4G383JQ
BS 407 437 RR4DD60JQ
BS 438 438 RR4G383JQ
BS 439 627 RR4DD60JQ

RD RR4G383JQ 549 0 0
CAAAGCCAAATAGATGTCACTATCTCAAGATCAGTAATACAATAAAGAAATTATCACTGA
TCACAAACATCACATAACAAAGAGGAAACAAAAAGCGAGAAAGTTTCTGTTCACTTCTTC
GAAGAAACCGTCGATGATGATGACGATTCCGGTTCTTTCCAAGCCGCTTGCCACTGCTTG
TCATACAACGTCGTCTCTTCGAACAGACCCTTGAGCTTATCAAAATCTTCGTTCTTGCGA
ATGAAAAGAACTCCAGCTACAGCCACAAACAAGAGCGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATT
TGATCAACAAGTCCTACTCCGGTAAGGCTGTCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTATC
ATCGCAGCACGGCCATTGAGGAGTTCAGCTTCTGGTAGATGGTATCGCTTCATCCATGCC
CACCATGGAATGATGGATGTATCGAAGAGAACAGGCTCGGCGTTAGTAGTTGTTTCTGGG
TTATCTTCAAGCCACTTCCTCCTCTTTGCCTCAGCGACGATAACAGAATCCCAATCTGTT
TTCCCGTC
C

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4G383TF 549 0 0
CAAAGCCAAATAGATGTCACTATCTCAAGATCAGTAATACAATAAAGAAATTATCACTGA
TCACAAACATCACATAACAAAGAGGAAACAAAAAGCGAGAAAGTTTCTGTTCACTTCTTC
GAAGAAACCGTCGATGATGATGACGATTCCGGTTCTTTCCAAGCCGCTTGCCACTGCTTG
TCATACAACGTCGTCTCTTCGAACAGACCCTTGAGCTTATCAAAATCTTCGTTCTTGCGA
ATGAAAAGAACTCCAGCTACAGCCACAAACAAGAGCGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATT
TGATCAACAAGTCCTACTCCGGTAAGGCTGTCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTATC
ATCGCAGCACGGCCATTGAGGAGTTCAGCTTCTGGTAGATGGTATCGCTTCATCCATGCC
CACCATGGAATGATGGATGTATCGAAGAGAACAGGCTCGGCGTTAGTAGTTGTTTCTGGG
TTATCTTCAAGCCACTTCCTCCTCTTTGCCTCAGCGACGATAACAGAATCCCAATCTGTT
TTCCCGTC
C

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4DD60JQ 627 0 0
CAAAGCCAAATAGATGTCACTATCTCAAGATCAGTAATACAATAAAGAAATTATCACTGA
TCACAAACATCACATAACAAAGAGGAAACAAAAAGCGAGAAAGTTTCTGCTCACTTCTTC
GAAGAAACCGTCGATGATGATGATGATTCCGGCTCTTTCCAAGCCGCTTGCCACTGCTTG
TCATACAACGTCGTCTCTTCAAATAGACCCTTGAGCTTATCTAAATCTTCGTTCTTGCGG
ATGAAAAGAACTCCAGCTACAGCCACAAACAAGAGCGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATT
TGATCAACAAGTCCTACTCCGGTAAGGCTGTCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTATC
ATCGCAGCACGACCATTGAGGAGTTCAGCTTCTGGTAGATGGTATAGCTTCATCCATGCC
CACCATGGAATGATGGAGGTATCGAAGAGAACAGGCTCGGCGTTAGTAGTTGTTTCTGGG
TTATCTTCAAGCCACTTCCTCCTCTTTGCCTCAGCGACGATAACAGAATCCCAATCTGTT
TTCCCGTCTTTCTCGAACTGTTTCAGAGACTGCAGCGGAATCGGGCGTTGACGCACCGTT
GTCGGAGGCGGAAGCTCGAGTGACGGA

QA 1 627 1 627
DS 



CO CL507Contig3 752 3 26 U
GGACACATTCAAAACCAACTCCCAAAAACTGAGATCAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGT
CCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCTCTTCTTCATCATTTCAAAACCCTAATC
TCACCCCCAAGATCTCACTCTCACTTTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCT
CCGTCACCCGAGCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCGACGCCCGATTCCGCTGCAGTCT
CTGCGACAACAGTCGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGG
CAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTC
TCTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAG
CTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGACA
GCCTTACCGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGCTCTTGT
TTGTGGCTGTAGCTGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTTGATAAGCTCAAGG
GTCTGTTCGAAGAGACGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGCTTGGAAAGAACCGG
AATCGTCATCATCATCAACGGTTCTTCAAAGAAGTGAACAGAAACTTTCTTGCTTTTGTT
CCTCTTTGTTATGTGATGTTTGTGATCAGTGA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E164TF U 2
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QA 1 751 1 751
DS 



AS 3 9

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI54JQ U 1
AF RR4F611JQ U 89
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DS 

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TTGTGCTTATGCATACATCCATTCCTCTTGCTTTCCCTATCGCATCAAACCTGATTTCAG
GGAAAACGCTTTGGTCTTTGACACCAATGCTGTAGTTTCCGTTGCCATCAAAGCTACTGG
GACTCACACCTTGGAAATCTCTTGTTCTTGGAAGTGCTAAATTGATCAGACGGTCCAGGA
ACGAGTACATCACGTCTCCTCTGAGAGTGACAGCGATCCCAAGAGGTTGATCTTCCCTAA
TCTTGAAAGTAGCAATGGAAGCTCTAGCTCTTGTCTTGACAGGCTTCTGCCCTGTTATCA
GCGCTATGTCTTTCATTGCTGCCTCCAATCCTTTGTCGTTCTGCGCTGCATCTCCTATTC
CACAATTCACCACAATCTTCTGAACCTTTGGAACCTGGTGAACGTTGATGTATTTGAACT
CATCTTTGAGGGCGGGGATGATTCTCTCGAGGTAAGCGGTTTTGAGGCGCTGCACTTTCT
CCGCCTCTGATTTCTCCACCAGCACTGTTCCCGACG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4F611TF 739 0 0
CCTGAAAGGCATTCCCATCAGAGCCAGCAGTCTCTGTC*TTCGTCATCTGTTTTAGCCGT
TGTGCTTATGCATACATCCATTCCTCTTGCTTTCCCTATCGCATCAAACCTGATTTCAGG
GAAAACGCTTTGGTCTTTGACACCAATGCTGTAGTTTCCGTTGCCATCAAAGCTACTGGG
ACTCACACCTTGGAAATCTCTTGTTCTTGGAAGTGCTAAATTGATCAGACGGTCCAGGAA
CGAGTACATCACGTCTCCTCTGAGAGTGACAGCGATCCCAAGAGGTTGATCTTCCCTAAT
CTTGAAAGTAGCAATGGAAGCTCTAGCTCTTGTCTTGACAGGCTTCTGCCCTGTTATCAG
CGCTATGTCTTTCATTGCTGCCTCCAATCCTTTGTCGTTCTGCGCTGCATCTCCTATTCC
ACAATTCACCACAATCTTCTGAACCTTTGGAACCTGGTGAACGTTGATGTATTTGAACTC
ATCTTTGAGGGCGGGGATGATTCTCTCGAGGTAAGCGGTTTTGAGGCGCTGCACTTTCTC
CGCCTCTGATTTCTCCACCAGCACTGTTCCCGACGCCGAGACTTTCAACAAGTTCCTCTG
AGGCGCAGGTGCGGAGGTGCGAATTGCTAGCGATGGGAAACGGCAGTGAAACGACGAAGC
TGAGGAGTGCAGAAGTGAAGGAGATGCCATGGTCGAGGCTCGGCTCCAAGTGGATAAAAT
TGCGCACAAGTGAGAATCC

QA 1 739 1 739
DS 



CO CL508Contig2 944 4 13 U
GGAGCCGAGCCTCGACCATGGCAAGTCCTTCACTTCTGCACTCTTCAGCTTCGTCGTTTC
ACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTGGCACCTCCGCACCTCCGCCGCTGAGGAACGTGG
TGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAAAAATCTGAGGCGGAGAAAGTGCAAC
GCCTCAAAACCGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTCAAAGATGAGTTCAAATACA
TCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGAATTGTGAAATAGGAGATG
CAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCGCTTATAACAGGGC
AGAAGCCTGTCAAGACAAGAGCCAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATTAGGGAAGATC
AACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTC
TGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTG
ATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGT
TTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAG
ATGACGAAGGACAGAGACTGCTGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCG
TCAACACAGGAGGGGCGATAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTCGATGCTA
AAAGCAAAGGAAAGGGAAAGAGATGATGAACGAAAGAAAATTTTCATTTGTGTTGTTGTA
TTATTGTCTTCATGGATTATCTAATGATTTTGTTTTAAAGCCGTGTTATGTTACTCCTCC
CTTGTGATAGTGTTTTGTTAATCCTCCCTGATAAAACAAATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DM58TF U 1
AF RR4EF02TF U 190
AF RR4FN89JQ C 446
AF RR4FN89TF U 446
BS 1 288 RR4DM58TF
BS 289 289 RR4EF02TF
BS 290 573 RR4DM58TF
BS 574 684 RR4EF02TF
BS 685 685 RR4FN89TF
BS 686 693 RR4EF02TF
BS 694 694 RR4FN89TF
BS 695 720 RR4EF02TF
BS 721 721 RR4FN89TF
BS 722 926 RR4EF02TF
BS 927 927 RR4FN89TF
BS 928 932 RR4EF02TF
BS 933 944 RR4FN89TF

RD RR4DM58TF 573 0 0
GGAGCCGAGCCTCGACCATGGCAAGTCCTTCACTTCTGCACTCTTCAGCTTCGTCGTTTC
ACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTGGCACCTCCGCACCTCCGCCGCTGAGGAACGTGG
TGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAAAAATCTGAGGCGGAGAAAGTGCAAC
GCCTCAAAACCGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTCAAAGATGAGTTCAAATACA
TCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGAATTGTGGAATAGGAGATG
CAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCGCTTATAACAGGGC
AGAAGCCTGTCAAGACAAGAGCCAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATTAGGGAAGATC
AACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTC
TGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTG
ATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4EF02TF 743 0 0
G
CGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCA
CCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGAATTGTGAAATAGGAGATGCAGCGCAGAA
CGACAAAGTATTGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCGCTTATAACAGGGCAGAAGCCTGT
CAAGACAAGAGCCAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGG
GATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGAT**ACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTT
AGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGG
AAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGAT
AGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGG
ACAGAGACTGCTGGTTCTGATGGAAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGG
AGGGGCGATAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTCGATGCTAAAAGCAAAGG
AAAGGGAAAGAGATGATGAACGAAAGAAAATTTTCATTTGTGTTGTTGTATTATTGTCTT
CATGGATTATCTAATGATTTTGTTTTAAAGCCGTGTTATGTTACTCCTCCCTTGTGATAG
TGTTTTGTTAATCCTCTCTGAT

QA 2 743 2 743
DS 

RD RR4FN89JQ 499 0 0
G
AGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACA
AGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGT
GTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGA
ATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGCTGGCT
CTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGTCAACACAGGAGGGGCGATAGTGAGG
AAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTCGATGCTAAAAGCAAAGGAAAGGGAAAGAGATGA
TGAACGAAAGAAAATTTTCATTTGTGTTGTTGTATTATTGTCTTCATGGATTATCTAATG
ATTTTGTTTTAAAGCCGTGTTATGTTACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTTGTTAATCCTC
CCTGATAAAACAAATCCG

QA 2 499 2 499
DS 

RD RR4FN89TF 499 0 0
G
AGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACA
AGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGT
GTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGA
ATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGCTGGCT
CTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGTCAACACAGGAGGGGCGATAGTGAGG
AAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTCGATGCTAAAAGCAAAGGAAAGGGAAAGAGATGA
TGAACGAAAGAAAATTTTCATTTGTGTTGTTGTATTATTGTCTTCATGGATTATCTAATG
ATTTTGTTTTAAAGCCGTGTTATGTTACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTTGTTAATCCTC
CCTGATAAAACAAATCCG

QA 2 499 2 499
DS 



CO CL508Contig3 382 2 2 U
GCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACATCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTT
CCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCAC
AACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGCTGACTCTGATGGGAATGCCTTTCAG
GGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAGTGATGAAGAAGAAACTTAAGTCTCA
TCATTTCGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAAGAAATAAGATTTTCATTTG
TATTTGTCTTCATGTATGTTGATGGATTAATCTAATGATTTTGTTTCTCTGCCATGTTAT
ATTATTACTCCTCCCTTGTGAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GD05JQ C 1
AF RR4GD05TF U 1
BS 1 1 RR4GD05JQ
BS 2 382 RR4GD05TF

RD RR4GD05JQ 382 0 0
GCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACATCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTT
CCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCAC
AACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGCTGACTCTGATGGGAATGCCTTTCAG
GGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAGTGATGAAGAAGAAACTTAAGTCTCA
TCATTTCGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAAGAAATAAGATTTTCATTTG
TATTTGTCTTCATGTATGTTGATGGATTAATCTAATGATTTTGTTTCTCTGCCATGTTAT
ATTATTACTCCTCCCTTGTGAT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4GD05TF 382 0 0
G
CCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACATCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTC
CCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACA
ACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGCTGACTCTGATGGGAATGCCTTTCAGG
GAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAGTGATGAAGAAGAAACTTAAGTCTCAT
CATTTCGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAAGAAATAAGATTTTCATTTGT
ATTTGTCTTCATGTATGTTGATGGATTAATCTAATGATTTTGTTTCTCTGCCATGTTATA
TTATTACTCCTCCCTTGTGAT

QA 2 382 2 382
DS 



AS 1 10

CO CL509Contig1 876 10 8 U
GGCTTGATAAAAGGAAAGTAATAGCAAAAGCAAAACAATGATCTAAAACGATCGAATGCA
GATTTAAACCAAAAGTAACAAACATGTTCACAAAGGCACAACTCCAGCAAGAGAAACATC
AAAAGATTATTCTCAGCCAACATTATTTGACATCTGATTCAACAGACAAGAACAACACAG
TAGACACCAAAGTACGTTACTTAGCCCCATACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACC*
GCATGCCAATCTCCCGCCTGCATTTCCAGTGGTCAGGCTAAGCTCATGCCCGCCCTTTCC
GAGGTCATCCTTAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTCCCAACAACAGAATTAGGACCAGT
CAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCTGCCACGCCATCGGCGTTGGCAATAAT
GTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTT
AGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGATGCATCCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAG
GTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCGGTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACC
TGAGTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAACTCCTTCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGC
AACAGCTTTCTTCGCGGCGGAGACGACAGTCAGCGATTTCTTCTTCGTAGCGGAGAAGGA
AACAGATTGGGGACGGCGGGGGTTGATGAGAGAGACGCCGCCGAAAGAGGAGCGGAGAGT
GGATGAAGGAGAGACGAGGAGGAGGCGCGGAGGGGATGAGAAGGAGAGGAAGGTGTGAGG
AGCAGCCATGGGATGTCGTTTGGAAGAAGTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C670JQ U 43
AF RR4D057JQ U 29
AF RR4FP58JQ U 1
AF RR4AF71TF C 32
AF RR4H684JQB U 40
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AF RR4GG75TF C 162
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AF RR4H684TF C 304
BS 1 448 RR4FP58JQ
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BS 450 493 RR4FP58JQ
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BS 495 631 RR4FP58JQ
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BS 633 718 RR4FP58JQ
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RD RR4C670JQ 533 0 0
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TCCAGCAAGAGAAACATCAAAAGATTATTCTCAGCCAACATTATTTGACATCTGATTCAA
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GTCAAACCAACCACACC*GCATGCCAATCTCCCGCCTGCATTTCCAGTGGTCAGGCTAAG
CTCATGCCCGCCCTTTCCGAGGTCATCCTTAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTCCCAAC
AACAGAATTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCTGCCACGCC
ATCGGCGTTGGCAATAATGTTTACCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCGTCTTGAGGAGC
TCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAAATGCATCCGTTTGTTGT
ATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCGGTGA

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DS 

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CTC
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AAAGGCACAACTCCAGCAAGAGAAACATCAAAAGATTATTCTCAGCCAACATTATTTGAC
ATCTGATTCAACAGACAAGAACAACACAGTAGACACCAAAGTACGTTACTTAGCCCCATA
CTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACC*G*ATGCCAATCTCCCGCCTGCATTTCCAGTG
GTCAGGCTAAGCTCATGCCCGCCCTTTCCGAGGTCATCCTTAAGATCGTGAACCACAAAG
GCTCTCCCAACAACAGAATTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTT
TCTGCCACGCCATCGGCGTTGGCAATAATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCG
TCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGATGCAT
CCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCG
GTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCTTG

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DS 

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GGCTTGATAAAAGGAAAGTAATAGCAAAAGCAAAACAATGATCTAAAACGATCGAATGCA
GATTTAAACCAAAAGTAACAAACATGTTCACAAAGGCACAACTCCAGCAAGAGAAACATC
AAAAGATTATTCTCAGCCAACATTATTTGACATCTGATTCAACAGACAAGAACAACACAG
TAGACACCAAAGTACGTTACTTAGCCCCATACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACC*
GCATGCCAATCTCCCGCCTGCATTTCCAGTGGTCAGGCTAAGCTCATGCCCGCCCTTTCC
GAGGTCATCCTTAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTCCCAACAACAGAATTAGGACCAGT
CAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCTGCCACGCCATCGGCGTTGGCAATAAT
GTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATC*CGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTT
AGGGTTGAAATGTAGCCCTGTTGAGATGCATCCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAG
GTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCGGTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACC
TGAGTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAACTCCTCCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGC
AACAGCTTTCTTCGCGGCGGAGACGACAGTCAGCGATTTCTTCTTCGTAGCGGAGAAG
AAACAGAT

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DS 

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AAAGGCACAACTCCAGCAAGAGAAACATCAAAAGATTATTCTCAGCCAACATTATTTGAC
ATCTGATTCAACAGACAAGAACAACACAGTAGACACCAAAGTACGTTACTTAGCCCCATA
CTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACC*GCATGCCAATCTCCCGCCTGCATTTCCAGTG
GTCAGGCTAAGCTCATGCCCGCCCTTTCCGAGGTCATCCTTAAGCTCGTGAACCACAAAG
GCTCTCCCAACAACAGAATTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTT
TCTGCCACGCCATCGGCGTTGGCAATAATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCG
TCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCGTGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGATGCAT
CCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCG
GTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAACTTCT
TCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGCAACAGCTTTCTTCGCGGCGGAGACGACA
C

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DS 

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GG
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GCTCATGCCCGCCCTTTCCGAGGTCATCCTTAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTCCCAA
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CATCGGCGTTGGCAATAATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCGTCTTGAGGAG
CTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGATGCATCCGTTTGTTG
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CATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAACTCCTTCGACATCGG
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DS 

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AAACATGTTCACAAAGGCACAACTCCAGCAAGAGAAACATCAAAAGATTATTCTCAGCCA
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CTTAGCCCCATACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACC*G*ATGCCAATCTCCCGCCT
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TGACGGATCTCGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCT
GTTGAGATGCATCCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCT
G*AGTGAGACCGGTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCTTGAGTCAAA
GTAACAACTCCTTCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGCAACAGCTTTCTTCGCGGCG
GAGACGACAGTCAGCGAT

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DS 

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GCTCATGCCCGCCCTTTCCGAGGTCATCCTTAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTCCCAA
CAACAGAATTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCTGCCACGC
CATCGGCGTTGGCAATAATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCGTCTTGAGGAG
CTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGATGCATCCGTTTGTTG
TATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTG*AGTGAGACCGGTGATACGAA
CATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAACTCCTTCGACATCGG
AGTTACCCTTGAGCACAGCAACAGCTTTCTTCGCGGCGGAGACGACAGTCAGCGATTTCT
TCTTCGTAGCGGAGAAGGAAACAGATTGGGGACGGCGGGGGTTGATGAGAGAGACGC

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AGTACGT*ACTTAGCCCCATACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACCCGCATGCCAAT
CTCCCGCCTGCATTTCCAGTGGTCAGGCTAAGCTCATGCCCGCCCTTTCCGAGGTCATCC
TTAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTCCCAACAACAGAATTAGGACCAGTCAGAGGAATC
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TCACCCGCATGACGGATCTCGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAA
TGTGGCCCTGTTGAGATGCATCCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCA
TGAGGCCCTGGAGTGAGACCGGTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCT
TGAGTCAAAGTAACAACTCCTTCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGCAACAGCTTTC
TTCGCGGCGGAGACGACAGTCAGCGATTTCTTCTTCGTAGCGGAGAAGGAAACAGATTGG
GGACGGCGGGGGTTGATGAGAGAGACGCCGCCGAAAGAGGAGCGGAGAGTGGATGAAGGA
GAGACGAGGAGGAGGCGCGGAGGGGATGAGAAGGAGAGGAAGGTGTGAGG

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DS 

RD RR4D057TF 800 0 0
GTAACAACATG
TCACAAAGGCACAACTCCAGCAAGAGAAACATCAAAAGATA**TCTCAGCCAACATTATT
*GACATCTGATTCAACAGACAAGAACAACACAGTAGACACCAAAGTACGTTACTTAGCCC
CATACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACC*G*ATGCCAATCTCCCGCCTGCATTTCC
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AAAGGCTCTCCCAACAACAGAATTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGT
TGTTTCTGCCACGCCATCGGCGTTGGCAATAATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGAT
CTCGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGAT
GCATCCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAG
ACCGGTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACCTGAGTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAAC
TCCTTCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGCAACAGCTTTCTTCGCGGCGGAGACGAC
AGTCAGCGATTTCTTCTTCGTAGCGGAGAAGGAAACAGATTGGGGACGGCGGGGGTTGAT
GAGAGAGACGCCGCCGAAAGAGGAGCGGAGAGTGGATGAAGGAGAGACGAGGAGGAGGCG
CGGAGGGGATGAGAAGGAGAGGAAGGTGTGAGGAGCAGCCATGGGATGTCGTTTGGAAGA
AGTGATTCC

QA 12 800 12 800
DS 

RD RR4H684TF 560 0 0
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AGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCTGCCACGCCATCGGCGTTGGCAATAATGTT
TCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCTCGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGG
GTTGAAATGTGGCCCTGTTGAGATGCATCCGTTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTG
AAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCGGTGATACGAACATTCACTTTTGTCGGACCTGA
GTCGTCTTGAGTCAAAGTAACAACTCCTTCGACATCGGAGTTACCCTTGAGCACAGCAAC
AGCTTTCTTCGCGGCGGAGACGACAGTCAGCGATTTCTTCTTCGTAGCGGAGAAGGAAAC
AGATTGGGGACGGCGGGGGTTGATGAGAGAGACGCCGCCGAAAGAGGAGCGGAGAGTGGA
TGAAGGAGAGACGAGGAGGAGGCGCGGAGGGGATGAGAAGGAGAGGAAGGTGTGAGGAGC
AGCCATGGGATGTCGTTT
CC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 2 9

CO CL510Contig1 1017 7 9 U
CTTATATAATAGCTCAATGTTATATAATTCAATTTTGGCGACACACAAAATCACAGTATT
TAAAACTCCAAAGACGAAAACAGTTAAGAGTTAGGGGCAAACCATAAACTTTGCAAGTAG
ACTCTTTTTTAAAAACAATCTGATGAAGGAGAGAGGCAAAAATTTTACACATAAGAAGAT
AATAGCGGATCAGATGATGCGAGGGCTGCTTTTTCTCTGAGTATGTTCTTTTGTTCTCTA
TAATGTTTTGTTACCAAATTTTGGTTTTAACAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGAGCC
GAAGATGCATTGGCGTTGGACGACTTGAGATTAACATCAACCATGTCCTCTTGCTTTGTT
GAAGACAGTGTTTCCATCCCGGGCAAAGCTGCTGCTATCTTGCGGAAAAGAGCCTTTATG
TTGAAGCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCT
TCTGCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTTTTATTCCCCACGAGC
ACAACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCAGTGTTT
AGAAACGATTGCCTGCTTGCAACATCATACACGATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATA
TAGCTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCTTGCCCAGCGGTATCCCATAACTGCAGTCTG
ACAGTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAATACCAATTGTGGCCTGG
TAAGTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACTCGTCTTCCCCACGGAT
TGATCTCCCAGAAACACCAGCTTATACTTTGCGAGTGCCGATACCGGAGCCATTGATTCC
TCCA*GATCTATCAAACTACACTTGACGGATCTGAGAATACGTCCAAGCAGTTTCCCAAT
ATAAAGCCGGAGAGAGAGAGAAAGAGAGATCTCGTCGCTGAAATGTTGTTTATTCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ31JQ U 89
AF RR4DX04JQ U 4
AF RR4BI51JQ U 1
AF RR4B590JQ U 1
AF RR4BI51TF C 165
AF RR4AQ31TF C 288
AF RR4CR29TF C 304
BS 1 412 RR4B590JQ
BS 413 413 RR4AQ31JQ
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BS 932 977 RR4BI51TF
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RD RR4AQ31JQ 810 0 0
CT
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GAGAGGCAAAAATTTTACACATAAGAGGATAATAGCGGATCAGATGATGCGAGGGCTGCT
TTTTCTCTGAGTATGTTCTTTTGTTCTCTATAATGTTTTGTTACCAAATTTTGGTTTTAA
CAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGAGCCGAAGATGCATTGGCGTTGGACGACTTGAGA
TTAACATCAACCATGTCCTCTTGCTTTGTTGAAGACAGTGTTTCCATCCCGGGCAAAGCT
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AACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCTTCTGCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTG
TCTACAAGGTCGGTTTTATTCCCCACGAGCACAACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTC
CTAACCTCATAGATCTACTTAGCAGTGTTTAGAAACGATTGCCTGCTTGCAACATCATAC
ACGATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATATAGCTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCT
TGCCCGGCGGTATCTCATAACTGCAGTCTGACAGTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTG
GATAGAAAATCAATACCAATTGTGGCCTGGTAAGTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAAT
CGAGTGATGATACTCGTCTTCCCCACGGATTGATCTCCCAGAAACACCAGCTTATACTTT
GCGAGTGCCGATACCGGAGCCATTGATT

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DS 

RD RR4DX04JQ 875 0 0
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CTTTTTTAAAAACAATCTGATGAAGGAGAGAGGCAAAAATTTTACACATAAGAAGATAAT
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TGTTTTGTTACCAAATTTTGGTTTTAACAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGAGCCGAA
GATGCATTGGCGTTGAACGACTTGAGATTAACATCAACCATGTCCTCTTGCTTTGTTGAA
GACAGTGTTTCCATCCCGGGCAAAGCTGCTGCTATCTTGCGGAAAAGAGCCTTTATGCTG
AAGCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCTTCT
GCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTTTTATTCCACACGAGCACA
ACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGATCTACTTAGCAGTGTTTAGA
AAAGATTGCCTGCTTGCAACATCATACACGATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATATAG
CTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCTTGCCCAGCGGTATCCCATAACTGCAGTCTGACA
GTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAATACCAATTGTGGCCTG*TAA
GTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACTCGTCTTCCCCACGGAT*GA
TCTCCCAGAAACACCAGCTTATACTTTGCGAGTGC

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DS 

RD RR4BI51JQ 845 0 0
CTT
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AACTCCAAAGACGAAAACAGTTAAGAGTTAGGGGCAAACCATAAACTTTGCAAGTAGACT
CTTTTTTAAAAACAATCTGATGAAGGAGAGAGGCAAAAATTTTACACATAAGAAGATAAT
AGCGGATCAGATGATGCGAGGGCTGCTTTTTCTCTGAGTATGTTCTTTTGTTCTCTATAA
TGTTTTGTTACCAAATTTTGGTTTTAACAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGAGCCGAA
GATGCATTGGCGTTGGACGACTTGAGATTAACATCAACCATGTCCTCTTGCTTTGTTGAA
GACAGTGTTTCCATCCCGGGCAAAGCTGCTGCTATCTTGCGGAAAAGAGACTTTATGTTG
AAGCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCTTCT
GCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTTTTATTCCCCACGAGCACA
ACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCAGTGTTTAGA
AACGATTGCCTGCTTGCAACATCATACACGATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATATAG
CTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCTTGCCCAGCGGTATCCCATAACTGCAGTCTGACA
GTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAATACCAATTGTGGCCTGGTAA
GTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACTCGTCTTCCCCACGGATTGA
TC

QA 4 845 4 845
DS 

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TAAAACTCCAAAGACGAAAACAGTTAAGAGTTAGGGGCAAACCATAAACTTTGCAAGTAG
ACTCTTTTTTAAAAACAATCTGATGAAGGAGAGAGGCAAAAATTTTACACATAAGAAGAT
AATAGCGGATCAGATGATGCGAGGGCTGCTTTTTCTCTGAGTATGTTCTTTTGTTCTCTA
TAATGTTTTGTTACCAAATTTTGGTTTTAACAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGAGCC
GAAGATGCATTGGCGTTGGACGACTTGAGATTAACATCAACCATGTCCTCTTGCTTTGTT
GAAGACAGTGTTTCCATCCCGGGCAAAGCTGCTGCTATCTTGCGGAAAAGAGACTTTATG
TTGAAGCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCT
TCTGCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTTTTATTCCCCACGAGC
ACAACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCAGTGTTT
AGAAACGATTGCCTGCTTGCAACATCATACACGATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATA
TAGCTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCTTGCCCAGCGGTATCCCATAACTGCAGTCTG
ACAGTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAATACCAATTGTGGCCTGG
TAAGTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACTCGTCTTCCCCACGGAT
TGATCTCCCAGAA*CACCAGCTTATACTTTGCGAGTGCCGATACCGGAGCCATTGATTCC
TCCA*GATCTATCAA*CTACACTTGACGGAT

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DS 

RD RR4BI51TF 816 0 0
TTACACATAAGAAGATA*TAGCGGATCAGATGATGCGAGGGCTGCTTTT*CTCTGAGTAT
GTTCTTTTGTTCTCTATAATGTTTTGTTACCAAATTTTGGTTTTAACAAGAGCATCCTCG
TGATTGCTGCTGAGC*GAAGATGCATTGGCGTTGGACGACTTGAGATTAACATCAACCAT
GTCCTCTTGCTTTGTTGAAGACAGTGTTTCCATCCCGGGCAAAGCTGCTGCTATCTTGCG
GAAAAGAGACTTTATGTTGAAGCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAG
CTCACGAGCCTTGGCTTCTGCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGT
TTTATTCCCCACGAGCACAACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGAT
CCACTTAGCAGTGTTTAGAAACGATTGCCTGCTTGCAACATCATACACGATAACAGCAAC
AGAAGAGTCCCTGATATAGCTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCTTGCCCAGCGGTATC
CCATAACTGCAGTCTGACAGTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAAT
ACCAATTGTGGCCTGGTAAGTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACT
CGTCTTCCCCACGGATTGATCTCCCAGAAACACCAGCTTATACTTTGCGAGTGCCGATAC
CGGAGCCATTGATTCCTCCAAGATCTATCAAACTACACTTGACGGATCTGAGAATACGTC
CAAGCAGTTTCCCAATATAAAGCCGGAGAGAGA
GCC

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DS 

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AAGAGCCTTTATGTTGAAGCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAGCTC
ACGAGCCTTGGCTTCTGCTTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTTTT
ATTCCCCACGAGCACAACTATGACATCGCTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATAGATCTA
CTTAGCAGTGTTTAGAAACGATTGCCTGCTTGCAACATCATACACGATAACAGCAACAGA
AGAGTCCCTGATATAGCTCGGAATAAGACTCCTAAACCTCTCTTGCCCGGCGGTATCTCA
TAACTGCAGTCTGACAGTTCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAATACC
AATTGTGGCCTGGTAAGTGTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACTCGT
CTTCCCCACGGATTGATCTCCCAGAAACACCAGCTTATACTTTGCGAGTGCCGATACCGG
AGCCATTGATTCCTCCAAGATCTATCAAACTACACTTGACGGATCTGAGAATACGTCCAA
GCAGTTTCCCAATATAAAGCCGGAGAGAGAGAGAAAGAGAGATCTCGTCGCTGAAATGTT
GTTTATTCCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4CR29TF 678 0 0
GG
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CAGTGTTTCCATTCCGGGCAAAGCTGCTGCTATCTTGCGGAAAAGAGCCTTTATGTTGAA
GCCCGCTTTGGCACTGGTTTCGATGAACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCTTCTGC
TTCCTCTATTGACACTTGCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTCTTATTCCCCACGAGCACAAC
TATGACATCACTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCGGTGTTTAGAAA
CGATTGCCTGCTTGAAACATCATAGACAATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATATAGCT
AGGAATAAGACTCCTGAATCTCTCTTGCCCAGCTGTATCCCACAACTGAAGTCTGACAGT
TCGATCTTCAAGGTACATAGTCTTGGATAGAAAATCAATACCAATTGTGGCCTGGTAAGT
GTTGTCGAATTTGTCGTACATGAATCGAGTGATGATACTCGTCTTCCCCACCGATTGATC
TCCCAGAAACACCAGCTTATACTTTGCGAGTGCCGATACTGGAGCCATTGATTCCTCGA*
GATCGATCAAACTACACTTGACGGATCTGAGAATACGTCCAAGCAGTTTCCCAATATAAA
GCCGGAGAGAGA
AAGA

QA 3 674 3 674
DS 



CO CL510Contig2 771 2 10 U
GGAGAACAAGAAGAGTATCCGTCTACTCTTTACTTTATATAATAGCTCAATGTTATATAA
TTCAATTTTGGCGACACACAAAATCACAGTATTTAAAACTCCAAAAGACGAAAACAGTTT
TAAGAGCTAGGGACAAACCATAAACTTTGCAAGTAGACTCTCTTTTTTAAAAAAACAATC
TGATGAAGGAGAAGGCAAAAATTTTACACACAGAAGAAGATAATAGCGGATCAGATGATG
CGAGGGCGGCTTTTTCTGAGTATGTTCTTTTGTTCTCTATAACGTTTTGTTGCCTATTTT
GTTTTTAACAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGACCCGAAGATGCATTGGCGTTGGACG
ACTTGAGATTAACATCAACCATATCCTCTTGCTTTGTTGAAGACAGTGTTTCCATTCCGG
GCAAAGCTGCTGCTATCTTGCGGAAAAGAGCCTTTATGTTGAAGCCCGCTTTGGCACTGG
TTTCGATGAACATTACATTAAGCTCACGAGCCTTGGCTTCTGCTTCCTCTATTGACACTT
GCCTTTTGTCTACAAGGTCGGTCTTATTCCCCACGAGCACAACGATGACATCACTACCAC
GCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCAGTGTTTAGAAACGATTGCCTGCTTGAAA
CATCATAGACAATAACAGCAACAGAAGAGTCCCTGATATAGCTAGGAATAAGACTCCTGA
ATCTCTCTTGCCCAGCTGTATCCCACAACTGAAGTCTGACAGTTCGATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR29JQ U 1
AF RR4BL76JQ U 44
BS 1 126 RR4CR29JQ
BS 127 127 RR4BL76JQ
BS 128 342 RR4CR29JQ
BS 343 343 RR4BL76JQ
BS 344 583 RR4CR29JQ
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BS 632 632 RR4BL76JQ
BS 633 718 RR4CR29JQ
BS 719 771 RR4BL76JQ

RD RR4CR29JQ 718 0 0
GGAGAACAAGAAGAGTATCCGTCTACTCTTTACTTTATATAATAGCTCAATGTTATATAA
TTCAATTTTGGCGACACACAAAATCACAGTATTTAAAACTCCAAAAGACGAAAACAGTTT
TAAGAGTTAGGGACAAACCATAAACTTTGCAAGTAGACTCTCTTTTTTAAAAAAACAATC
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CGAGGGCGGCTTTTTCTGAGTATGTTCTTTTGTTCTCTATAACGTTTTGTTGCCTATTTT
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ACTTGAGATTAACATCAACCATATCCTCTTGCTTTGTTGAAGACAGTGTTTCCATTCCGG
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GCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCGGTGTTTAGAAACGATTGCCTGCTTGAAA
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DS 

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GTTTTGTTGCCTATTTTGTTTTTAACAAGAGCATCCTCCTGATTGCTGCTGACCCGAAGA
TGCATTGGCGTTGGACGACTTGAGATTAACATCAACCATATCCTCTTGCTTTGTTGAAGA
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GATGACATCACTACCACGCTCTGTCCTAACCTCATCGATCCACTTAGCAGTGTTTAGAAA
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AGGAATAAGACTCCTGAATCTCTCTTGCCCAGCTGTATCCCACAACTGAAGTCTGACAGT
TCGATCTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 10

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ATATTACAAGCTAGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAAC
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TGTCCGAAGACGTATGAGTATTATCCCACCTAATAAAATGCATACATGTCTATGCTAATT
TATGATCC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 30 30 10 

AF RR4E228JQ C 6
AF RR4G274JQ C 1
AF RR4G274TF U 1
AF RR4E228TF U 6
AF RR4AP60JQ C 1
AF RR4H163JQ C 1
AF RR4H163TF U 1
AF RR4AP60TF U 1
AF RR4AO79JQ C 12
AF RR4AO79TF U 12
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BS 546 547 RR4AP60TF
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GG
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DS 

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G

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DS 

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CCACGTTGTGTCGTCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTGA
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G

QA 1 535 1 535
DS 

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GG
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CCTCGCCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGACAGGAGCCGACGAGAAGTTCAAATGCCT
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GTGTCGTCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTGAAGAAACA
CAAAAGCAAACCTATCAAATGTTTCTGCGACTACTGCAAAGACGATTAGATATATATTAC
AAGCTAGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAACCGCTCAA
TCCACTATTGCAAACAAAAAAAAA*CCTTTTCCCTATAGCGTTTTATACTTTGATATAAG
TTTATGGTTGTATGTGATTCATGTAATAATGTCGTATGTGATTCATGTAATAATGTCCGA
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AC

QA 3 528 3 528
DS 

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DS 

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DS 

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TATGA
ACG

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4AP60TF 547 0 0
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CGCTCAATCCACTATTGCAAACAAAAAAAAA*CCTTTTCCCTATAGCGTTTTATACTTTG
ATATAAGTTTATGGTTGTATGTGATTCATGTAATAATGTCGTATGTGATTCATGTAATAA
TGTCCGAAGACGTATGAGTATTATCCCACCTAATAAAATGCATACATGTCTATGCTAATT
TATGATC

QA 1 547 1 547
DS 

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G
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DS 

RD RR4AO79TF 537 0 0
G
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CCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGACAGGAGCCGACGAGAAGTTCAAATGCCTGGAGG
AGTACGGGGGAGACGTGGGTCCCACGTTCTGTAACCCTAAGTTCTTCCCCACGTTGTGTC
GTCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTGAAGAAACACAAAA
GCAAACCTATCAAATGTTTCTGCGACTACTGCAAAGACGATTAGATATATATTACAAGCT
AGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAACCGCTCAATCCAC
TATTGCAAACAAAAAAAAAACCTTTTCCCTATAGCGTTTTATACTTTGATATAAGTTTAT
GGTTGTATGTGATTCATGTAATAATGTCGTATGTGATTCATGTAATAATGTCCGAAGACG
TATGAGTATTATCCCACCTAATAAAATGCATACATGTCTATGCTAATTTATGATC
C

QA 2 536 2 536
DS 



AS 2 8

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TCTT**CATTAACATTTCAACTTATCAGACTCCAAAAGCTGTTGAACAGCAACTAAATCA
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CCAATATGCAGAACCTCTCCAGGCGCAATGTTGTTCCCCGCTCTCTCTAACGCCAGCTTG
TATATCCTCGGATCTGGCTTCTCTACCCCTTCCATACCAGAGAACACACCAAAGTCCCAC
TCTCCCTTGTTCAAACCTAAGGCAGGTAAAATAACTTCTTGATAACGATACTCGGCGTTG
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TGAAAGACAGAGTAAGGTGCAGCAGAACCAAACGTTGAGTAGATTCTTCTAAACACTTTC
TCAAACGTTGCCTCATCATAGTCATACCCTGCCTTGACAAATGAATCTCTCACGCAGGTT
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TCTGTATAAGCAATTTTGAAACCTTCGTGAACTCGTGTGTAATCAGGACAAGGCAAGCCA
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TTCCTTTTTTTTCAACACAAAGAAAGAAGCCAGAAGATGAGAATCGAGAAGAAGGATATC
ACATGGAAGACGTTGGTTATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 0 0 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 5 15 15 15 15 15 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 5 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 5 40 40 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD31JQ U 38
AF RR4CT17JQ U 1
AF RR4BT63JQ U 82
AF RR4AD62JQ U 36
AF RR4B256JQ U 36
AF RR4AD62TF C 108
BS 1 61 RR4CT17JQ
BS 62 62 RR4B256JQ
BS 63 72 RR4CT17JQ
BS 73 73 RR4B256JQ
BS 74 75 RR4CT17JQ
BS 76 78 RR4B256JQ
BS 79 98 RR4CT17JQ
BS 99 106 RR4AD62JQ
BS 107 143 RR4CT17JQ
BS 144 144 RR4AD62JQ
BS 145 227 RR4CT17JQ
BS 228 228 RR4AD62JQ
BS 229 251 RR4CT17JQ
BS 252 252 RR4AD62JQ
BS 253 293 RR4CT17JQ
BS 294 294 RR4AD62JQ
BS 295 358 RR4CT17JQ
BS 359 359 RR4AD62JQ
BS 360 410 RR4CT17JQ
BS 411 411 RR4AD62JQ
BS 412 458 RR4CT17JQ
BS 459 459 RR4AD62JQ
BS 460 625 RR4CT17JQ
BS 626 626 RR4AD62JQ
BS 627 725 RR4CT17JQ
BS 726 726 RR4AD62JQ
BS 727 749 RR4CT17JQ
BS 750 750 RR4AD62JQ
BS 751 772 RR4CT17JQ
BS 773 910 RR4AD62JQ
BS 911 984 RR4AD62TF

RD RR4FD31JQ 680 0 0
G
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TA*AATACATTAGAGAGAGGTCTCTTCCCATTAACATTTCAACTTATCAGACTCCAAAAG
CTGTTGAACAGCAACTAAATCAGGAAGCACAACAGCTCCAGCTTCTCTCCAGTCTTTAGC
AGCTTCTGTATTAAACCTATCAAGCAACAAAGCATGCATCCCAATACTCTTTGCCGGGAC
ATAATCTTTACGCATACTGTCTCCAATGTGCAGAACCTCTCCAGGCGCAATGTTGTTACC
CGCTCTCTCTAAAGCCAGCTTGTATATCCTTGGATCTGGCTTCTCTACCCCTTCCATACC
AGAGAACACACCAAAGTCCCACTCTCCCTTGTTCAAACCTAAGGCAGGTAAAATAACTTC
TTGATAACGATACTCGGCGTTGCTAACGAGTCCAACGATAAGCCCTTTCTCGCGTGCCCA
TCTCAAGAAAGGTCGAGAGTCTTGAAACACAGAGTAAGGTGCAGCAGAACCAAACGTTGA
GTAGATTCTTCTAAACACTTTTTCAAAAGTTGCCTCATCATAGTCATACCCTGCCTTGAC
AAATGAATCTCTCACGCAGGTTTTCCACCAAACAATGTTTGACATTTTGGAGAAACCGAA
ACAAGGATACTTCTGAGCC

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR4CT17JQ 775 0 0
ATAAACTCCACCTTGTTGGACTTAGATTAAATCATAGGCCTTTGAAACTCTTTTTACTCA
TGAGAAGAAGAATAA***AGAGCCAAAATGTGCAATAC********ATTAGAGAGAGGTC
TCTT**CATTAACATTTCAACTTGTCAGACTCCAAAAGCTGTTGAACAGCAACTAAATCA
GGAAGCACAACAGCTCCAGCTTCTCTCCAGTCTTTAGCAGCTTCTGTGTTAAACCTATCA
AGCAACAAAGCGTGCATCCCAATACTCTTTGCCGGAACATAATCTTTACGCATGCTATCT
CCAATATGCAGAACCTCTCCAGGCGCAATGTTGTTCCCCGCTCTCTCTAACGCCAGCTAG
TATATCCTCGGATCTGGCTTCTCTACCCCTTCCATACCAGAGAACACACCGAAGTCCCAC
TCTCCCTTGTTCAAACCTAAGGCAGGTAAAATAACTTCCTGATAACGATACTCGGCGTTG
CTAACAAGTCCAACGATAAGCCCTTTCTCGCGTGCCCATCTCAAGAAAGGTCGAGAGTCT
TGAAAGACAGAGTAAGGTGCAGCAGAACCAAACGTTGAGTAGATTCTTCTAAACACTTTC
TCAAACGTTGCCTCATCATAGTCATGCCCTGCCTTGACAAATGAATCTCTCACGCAGGTT
TTCCACCAGACAATGTTTGACATTTTGGAGAAACCGAAACAAGGATACTTCTGAGCCATG
TCTGTGTAAGCAATTTTGAAACCTTCGTGGACTCGTGTGTAATCAGGACAAG
CAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4BT63JQ 678 0 0
GCCAAAATGTGCAATACTACAATACATTAGAGAGAGGTCTCTTTCCATTAACATTTCAAC
TTATCAGACTCCAAAAGCTGTTGAACAGCAACTAAATCAGGAAGCACAACAGCTCCAGCT
TCTCTCCAGTCTTTAGCAGCTTCTGTATTAAACCTATCAAGCAACAAAGCATGCATCCCA
ATACTCTTTGCCGGGACATAATCTTTACGCATACTGTCTCCAATGTGCAGAACCTCTCCA
GGCGCAATGTTGTTCCCCGCTCTCTCTAAAGCCAGCTTGTATATCCTTGGATCTGGCTTC
TCTACCCCTTCCATACCAGAGAACACACCAAAGTCCCACTCTCCCTTGTTCAAACCTAAG
GCAGGTAAAATAACTTCTTGATAACGATACTCGGCGTTGCTAACGAGTCCAACGATAAGC
CCTTTCTCGCGTGCCCATCTCAAGAAAGGTCGAGAGTCTTGAAACACAGAGTAAGGTGCA
GCAGAACCAAACGTTGAGTAGATTCTTCTAAACACTTTCTCAAAAGTTGCCTCATCATAG
TCATACCCTGCCTTGACAAATGAATCTCTCACGCAGGTTTTCCACCAAACAATGTTTGAC
ATTTTGGAGAAACCGAAACAAGGATACTTCTGAGCCATGTCTGTGTAAGCAATTTTGAAA
CCTTCGTGGACTCGTGTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4AD62JQ 881 0 0
AGG
CCTTTGAAACTCTTTTTACTCATGGGAAGAAGAATAA***AGAGCCAAAATGTGCAATAC
TACAATACATTAGAGAGAGGTCTCTT**CATTAACATTTCAACTTATCAGACTCCAAAAG
CTGTTGAACAGCAACTAAATCAGGAAGCACAACAGCTCCAGCTTCTCTCCAGTCTTTAGC
AGCTTCTGTATTAAACCTATCAAGCAACAAAGCATGCATCCCAATACTCTTTGCCGGAAC
ATAATCTTTACGCATACTATCTCCAATATGCAGAACCTCTCCAGGCGCAATGTTGTTCCC
CGCTCTCTCTAACGCCAGCTTGTATATCCTCGGATCTGGCTTCTCTACCCCTTCCATACC
AGAGAACACACCAAAGTCCCACTCTCCCTTGTTCAAACCTAAGGCAGGTAAAATAACTTC
TTGATAACGATACTCCGCGTTGCTAACAAGACCAACGATAAGCCCTTTCTCGCGTGCCCA
TCTCAAGAAAGGTCGAGAGTCTTGAAAGACAGAGTAAGGTGCAGCAGAACCAAACGTTGA
GTAGATTCTTCTAAACACTTTCTCAAACGTCTCCTCATCATAGTCATACCCTGCCCTGAC
AAATGAATCTCTCACGCAGGTTTTCCACCAGACAATGTTTGACATTTTGGAGAAACCGAA
ACAAGGATACTTCTGAGCCATGTCTGTATAAGCAATTTTGAAGCCTTCGTGAACTCGTGT
GTAATCAGGACAAGGCAAGCCAACGGCTTTAGCAGCCATACAGTAGTAATCACCAAGCTC
CCCTTTGTATGCAATGAGCGTGCCAGTTACATCTACTGTGATACACCGTAGCTTCGACAA
AAGCGACATCGTTTTTGGAAGATTCCTTTTTT
TTCACA

QA 4 875 4 875
DS 

RD RR4B256JQ 874 0 0
AGA
CCTTTGAAACTCTTTTTACTCATAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAGCCAAAATGTGTAATAC
TACAATACATTAGAGAGAGGTCTCTTTCCATTAACATTTCAACTTATCAGACTCCAAAAG
CTGTTGAACAGCAACTAAATCAGGAAGCACAACAGCTCCAGCTTCTCTCCAGTCTTTAGC
AGCTTCTGTATTAAACCTATCAAGCATCAAAGCATGCATCCCAATACCCTTTGCCGGGAC
ATAATCTTTACGCATACTGTCTCCAATGTGCAGAACCTCTCCAGGCGCAATGTTGTTCCC
CGCTCTCTCTAAAGCCAGCTTGTATATCCTTGGATCTGGCTTCTCTACCCCTTCCATACC
AGAGAACACACCAAAGTCCCACTCTCCCTTGTTCAAACCTAAGGCAGGTAAAATAACTTC
TTGATAACGATACTCGGCGTTGCTAACGAGTCCAACGATAAGCCCTTTCTCGCGTGCCCA
TCTCAAGAAAGGTCGAGAGTCTTGAAACACAGAGTAAGGTGCAGCAGAACCAAACGTTGA
GTAGATTCTTCTAAACACTTTCTCAAAAGTTGCCTCATCATAGTCATACCCTGCCTTGAC
AAATGAATCTCTCACGCAGGTTTTCCACCAAACAATGTTTGACATTTTGGAGAAACCGAA
ACAAGGATACTTCTGAGCCATGTCTGTGTAAGCAATTTTGAAACCTTCGTGGACTCGTGT
GTAATCAGGACAAGGCAAGCCAACGGCTTTAGCAGCCATACAGTAGTAATCACCAAGCTC
CCCTTTGTAAGCTATGAGCGTACCAGTTACATCTACTGTTATACACCGTAGCTTCGACAA
AAGCGACATCGTTTTTGGAAGATTCCTTTTT

QA 4 874 4 874
DS 

RD RR4AD62TF 877 0 0
TTAGAGAGAGGTCTCTT**CATTAACATTTCAACTTATCAGACTCCAAAAGCTGTTGAAC
AGCAACTAAATCAGGAAGCACAACAGCTCCAGCT*CTCTCCAGTCTTTAGCAGCTTCTGT
ATTAAACCTATCAAGCAACAAAGCATGCATCCCAATACTCTTTGCCGGAACATAATCTTT
ACGCATACTATCTCCAATATGCAGAACCTCTCCAGGCGCAATGTTGTTCCCCGCTCTCTC
TAACGCCAGCTTGTATATCCTCGGATCTGGCTTCTCTACCCCTTCCATACCAGAGAACAC
ACCAAAGTCCCACTCTCCCTTGTTCAAACCTAAGGCAGGTAAAATAACTTCTTGATAACG
ATACTCCGCGTTGCTAACAAGACCAACGATAAGCCCTTTCTCGCGTGCCCATCTCAAGAA
AGGTCGAGAGTCTTGAAAGACAGAGTAAGGTGCAGCAGAACCAAACGTTGAGTAGATTCT
TCTAAACACTTTCTCAAACGTCTCCTCATCATAGTCATACCCTGCCCTGACAAATGAATC
TCTCACGCAGGTTTTCCACCAGACAATGTTTGACATTTTGGAGAAACCGAAACAAGGATA
CTTCTGAGCCATGTCTGTATAAGCAATTTTGAAGCCTTCGTGAACTCGTGTGTAATCAGG
ACAAGGCAAGCCAACGGCTTTAGCAGCCATACAGTAGTAATCACCAAGCTCCCCTTTGTA
TGCAATGAGCGTGCCAGTTACATCTACTGTGATACACCGTAGCTTCGACAAAAGCGACAT
CGTTTTTGGAAGATTCCTTTTTTTTCAACACAAAGAAAGAAGCCAGAAGATGAGAATCGA
GAAGAAGGATATCACATGGAAGACGTTGGTTATCTTC

QA 1 877 1 877
DS 



CO CL512Contig2 726 2 6 U
GGGTAGCTTACCCAAATACAAGAAGATAACCAATGGCTTCCATGTGAATCTTCCTTCCTC
GATTCTCAGCTTCTGGCTTCTTTCTTTGTGTTGTAAAAAAGGAATCTTCCAAAAACGATG
TCGCTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATAACAGTAGATGTAACTGGTACGCTCATAGCTTAC
AAAGGGGAGCTTGGTGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCT
GATTACACACGAGTCCACGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTAT
CCTTGTTTCGGTTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGA
TTCATTTGTCAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGCAACTTTTGAAAAAGTGTTTAGAAG
AATCTACTCAACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAAGACTCTCGACCTTT
CTTGAGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCG
TTATCAAGAAGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGT
GTTCTCGGGTATGGAAGGGGTAGAGAAGCCAGATCCAAGATATACAAGCTGGCTTTAGAG
AGAGCGGGGAACAACATGCGCCTGGAGAGGTCTGCACATTGGAGACAGTATGCGTAAAGA
TATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD31TF U 1
AF RR4BT63TF U 75
BS 1 314 RR4FD31TF
BS 315 315 RR4BT63TF
BS 316 501 RR4FD31TF
BS 502 502 RR4BT63TF
BS 503 565 RR4FD31TF
BS 566 726 RR4BT63TF

RD RR4FD31TF 565 0 0
GGGTAGCTTACCCAAATACAAGAAGATAACCAATGGCTTCCATGTGAATCTTCCTTCCTC
GATTCTCAGCTTCTGGCTTCTTTCTTTGTGTTGTAAAAAAGGAATCTTCCAAAAACGATG
TCGCTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATAACAGTAGATGTAACTGGTACGCTCATAGCTTAC
AAAGGGGAGCTTGGTGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCT
GATTACACACGAGTCCACGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTAT
CCTTGTTTCGGTTT*CTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGA
TTCATTTGTCAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGCAACTTTTGAAAAAGTGTTTAGAAG
AATCTACTCAACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAAGACTCTCGACCTTT
CTTGAGATGGGCACGCGAGAA*GGGCTTATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCG
TTATCAAGAAGTTATTTTACCTGCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4BT63TF 652 0 0
GGCTTCTTTCTTTGTGTTGTAAAAAAGGAATCTTCCAAAAACGATGTCGCTTTTGTCGAA
GCTACGGTGTATAACAGTAGATGTAACTGGTACGCTCATAGCTTACAAAGGGGAGCTTGG
TGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACACACGAGT
CCACGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTATCCTTGTTTCGGTTT
TCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATTTGTCAAGG
CAGGGTATGACTATGATGAGGCAACTTTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAATCTACTCAACGT
TTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAAGACTCTCGACCTTTCTTGAGATGGGCAC
GCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCGTTATCAAGAAGTTA
TTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTCTCGGGTATGG
AAGGGGTAGAGAAGCCAGATCCAAGATATACAAGCTGGCTTTAGAGAGAGCGGGGAACAA
CATGCGCCTGGAGAGGTCTGCACATTGGAGACAGTATGCGTAAAGATATGTC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 2 10

CO CL513Contig1 842 5 6 U
AAGAAATCATCAATTCGTTTATAGTAAATAGTGGTAGTTTTTGATACATAAATTCAAAAG
GGAAAGAACAGTGTAAGACTCTCAAGGTTTGACAGCGATTACAGAAGAGAATTTAATAAG
ACTTGGAGATCAACCGATGAGAGTGAAGCCCTGTCCAATCAAAGAAGTGGCGAGAATCTC
ATTGGCAGCTTCGGAGGGATGAACACTGTCCCAGAACACATACTGAGTAGCATTGGAGCA
TGTCCCGTACGATTTCGGATTGCACAAGAGCGAAGTTGTCTCGACCGTTCCTGTTCCACA
ACATCCTTTTGTTGCTTCCGTGAATCCAGATTTAGCAGGGGACTGAACAAGATCATAGAG
TGGGGTGAAGATGTCAAAGACAACAATCTTTAGACCAGAGTATTGCTTCTGAAGCTTTGA
AGCAGCTGCGTTAAGCTTCTTGTTGAATTGCTGAGCATCTGTATTGAGTCTTGAAACACA
ACCTTTTTCATGGAATCCGAATAGGGTTCTTGCAGCTGGAAGACATCCCGTTGGAGGCAG
AAAAGTCACACCGATCTTCCTTGCCCCAACCGCATATACTTGCTTGATAAATGTAGAGAA
GCTATCAAGAAGCATAGATCCGTACTGATCAGGAGTGTAGACTTTGTTAAGAAGAGGATT
CACATAATAATTTTGAACAAAGTCACTGCTTCCTGCACTTAAGAGATAGAGTGCTCCCTT
AATGATCGTATCAGATTGTTTGCTTCCTGCAACTTTTATGAGCTTGCTCTTGTACTCCTT
GAAGTACTCAACTTGCTGATACAATGGAATCGCATGATTGAGAAGAGCGGCTTTGTCATC
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BE48JQ U 2
AF RR4AM95JQ U 8
AF RR4EJ40JQ U 49
AF RR4BK51JQ U 1
AF RR4GU66JQ U 368
BS 1 227 RR4BK51JQ
BS 228 228 RR4BE48JQ
BS 229 541 RR4BK51JQ
BS 542 542 RR4EJ40JQ
BS 543 732 RR4BK51JQ
BS 733 842 RR4GU66JQ

RD RR4BE48JQ 301 0 0
AGAAAT
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ACAGTGTAAGACTCTCAAGGTTTGACAGCGATTACAGAAGAGAATTTAATAAGACTTGGA
GATCAACCGATGAGAGTGAAGCCCTGTCCAATCAAAGAAGTGGCGAGAATCACATTGGCG
GCTTCGGAGGGATGAACACTGGCCCAAAACACATACTGAGTAGCATTGGAGCATGTCCCG
TACGATTTCGGATTGCACAA*AGCGAAGTTGTCTCGACCGTTCCTGTTCCACAAC

QA 7 301 7 301
DS 

RD RR4AM95JQ 585 0 0
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ACAGTGTAAGACTCTCAAGGTTTGACAGCGATTACAGAAGAGAATTTAATAAGACTTGGA
GATCAACCGATGAGAGTGAAGCCCTGTCCAATCAAAGAAGTGGCGAGAATCTCATTGGCA
GCTTCGGAGGGATGAACACTGTCCCAGAACACATACTGAGTAGCATTGGAGCATGTCCCG
TACGATTTCGGATTGCACAAGAGCGAAGTTGTCTCGACCGTTCCTGTTCCACAACATCCT
TTTGTTGCTTCCGTGAATCCAGATTTAGCAGGGGACTGAACAAGATCATAGAGTGGGGTG
AAGATGTCAAAGATAACAATCTTTAGACCAGAGTACTGCTTCTGAAGCTTTGAAGCAGCT
GCGTTAAGCTTCTTGTTGAATTGCTGAGCATCTGTATTGAGTCTTGAAACACAACCTT**
*CATGGAATCCGAATAGGGTTCTTGCAGCTGGAAGACATCACGTTGGAGGCAGAGAAGTC
ACACCGATCTTCCTTGCCCCAACCGCATATACTTGCTTGATAAAT

QA 1 585 1 585
DS 

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GAATTTAATAAGACTTGGAGATCAACCGATGAGAGTGAAGCCCTGTCCAATCAAAGAAGT
GGCGAGAATCTCATTGGCAGCTTCGGAGGGATGAACACTGTCCCAGAACACATACTGAGT
AGCATTGGAGCATGTCCCGTACGATTTCGGATTGCACAAGAGCGAAGTTGTCTCGACCGT
TCCTGTTCCACAACATCCTTTTGTTGCTTCCGTGAATCCAGATTTAGCAGGGGACTGAAC
AAGATCATAGAGTGGGGTGAAGATGTCAAAGACAACAATCTTTAGACCAGAGTATTGCTT
CTGAAGCTTTGAAGCAGCTGCGTTAAGCTTCTTGTTGAATTGCTGAGCATCTGTATTGAG
TCTTGAAACACAACCTTTTTCATGGAATCCGAATAGGGTTCTTGCAGCTGGAAGACATCC
CGTTGGAGGCAGAAAAGTCACACCGATCTTCCTTGCCCCAACCGCATATACTTGCTTGAT
AAATGTAGAGAAGCTATCAAGAAG

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DS 

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GGAAAGAACAGTGTAAGACTCTCAAGGTTTGACAGCGATTACAGAAGAGAATTTAATAAG
ACTTGGAGATCAACCGATGAGAGTGAAGCCCTGTCCAATCAAAGAAGTGGCGAGAATCTC
ATTGGCAGCTTCGGAGGGATGAACACTGTCCCAGAACACATACTGAGCAGCATTGGAGCA
TGTCCCGTACGATTTCGGATTGCACAAGAGCGAAGTTGTCTCGACCGTTCCTGTTCCACA
ACATCCTTTTGTTGCTTCCGTGAATCCAGATTTAGCAGGGGACTGAACAAGATCATAGAG
TGGGGTGAAGATGTCAAAGACAACAATCTTTAGACCAGAGTATTGCTTCTGAAGCTTTGA
AGCAGCTGCGTTAAGCTTCTTGTTGAATTGCTGAGCATCTGTATTGAGTCTTGAAACACA
ACCTTTTTCATGGAATCCGAATAGGGTTCTTGCAGCTGGAAGACATCCCGTTGGAGGCAG
AGAAGTCACACCGATCTTCCTTGCCCCAACCGCATATACTTGCTTGATAAATGTAGAGAA
GCTATCAAGAAGCATAGATCCGTACTGATCAGGAGTGTAGACTTTGTTAAGAAGAGGATT
CACATAATAATTTTGAACAAAGTCACTGCTTCCTGCACTTAAGAGATAGAGTGCTCCCTT
AATGATCGTATC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4GU66JQ 475 0 0
AAGATGTCAAAGACAACAATCTTTAGACCAGAGTATTGCTTCTGAAGCTTTGAAGCAGCT
GCAT*AAGCTTCTTGTTGAATTGCTGAGCATCTGTATTGAGTCTTGAAACACAACCTTTT
TCATGGAATCCGAATAGGGTTCTTGCAGCTGGAAGACATCCCGTTGGAGGCAGAAAAGTC
ACACCGATCTTCCTTGCCCCAACCGCATATACTTGCTTGATAAATGTAGAGAAGCTATCA
AGAAGCATAGATCCGTACTGATCAGGAGTGTAGACTTTGTTAAGAAGAGGATTCACATAA
TAATTTTGAACAAAGTCACTGCTTCCTGCACTTAAGAGATAGAGTGCTCCCTTAATGATC
GTATCAGATTGTTTGCTTCCTGCAACTTTTATGAGCTTGCTCTTGTACTCCTTGAAGTAC
TCAACTTGCTGATACAATGGAATCGCATGATTGAGAAGAGCGGCTTTGTCATCGT

QA 1 475 1 475
DS 



CO CL513Contig2 826 5 11 U
GGATACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCATGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTCTTG
GTCTCTTTTCAGATTTCATTTGCTCAGGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATG
ACATTTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGA
GCCGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACCGGCCGTTTCTGC
AACGGCAAACTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCA
GCTTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCT
GCAGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAG
CAAGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAA
TCTGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTT
CAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCT
ATGCTTCTTGATAGCTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTATATGCGGTTGGGG*CAAGGAA
GATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGG
ATTCCATGAAAAAGTTGTGTTTCAGACTCATACAGATGCTCAGCATTCAACAGAGCTAAC
GCAGCTGCTTCAAGCTCAGAAGCATACTCTGGTCTAAAGATTGTTG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
5 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ40TF U 3
AF RR4GU66TF U 5
AF RR4BE48TF U 3
AF RR4AM95TF U 3
AF RR4BK51TF U 1
BS 1 63 RR4BK51TF
BS 64 64 RR4BE48TF
BS 65 237 RR4BK51TF
BS 238 238 RR4BE48TF
BS 239 260 RR4BK51TF
BS 261 261 RR4BE48TF
BS 262 706 RR4BK51TF
BS 707 707 RR4BE48TF
BS 708 719 RR4BK51TF
BS 720 722 RR4BE48TF
BS 723 826 RR4BK51TF

RD RR4EJ40TF 639 0 0
GG
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CTTTTCAGATTTCATTTGCTCAGGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGACAT
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ATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGCAG
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ATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTATGC
TTCTTGATAGCTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTATA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4GU66TF 710 0 0
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CTTTTCAGATTTCATTTGCTCAGGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGGCAT
TTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGAGCCG
ACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCTCAAACCCACCGGCCGTTTCTGCAACG
GCAAACTATCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCAGCTT
ATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGCAG
CTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAGCAAG
TTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTG
ATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCAAA
ATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTATGC
TTCTTGATAGCTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTATATGCGGTTGGGG*CAAGGAAGATC
GGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCA
GAACCCTA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BE48TF 728 0 0
GG
ACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCATGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTCTTGGTCT
CTTTTCAGATTTCATTTGCTCAGGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGACAT
TTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGAGCCG
ACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACCGGCCGTTTCTGCAACG
GCAAACTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCAGCTT
ATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGCAG
CTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAGCAAG
TTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTG
ATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCAAA
ATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTATGC
TTCTTGATAGCTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTATATGCGGTTGGGG*CAAGGAAGATC
GGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGGATTC
CATGAA

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR4AM95TF 723 0 0
GG
ACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCATGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTCTTGGTCT
CTTTTCAGATTTCATTTGCTCAGGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGACAT
TTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGAGCCG
ACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACCGGCCGTTTCTGCAACG
GCAAACTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCAGCTT
ATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGCAG
CTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAGCAAG
TTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTG
ATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCAAA
ATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTATGC
TTCTTGATATCTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTATATGCGGTTGGGGGCAAGGAAGATC
GGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGTGATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGGATTC
C

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR4BK51TF 826 0 0
GGATACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCATGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTCTTG
GTCCCTTTTCAGATTTCATTTGCTCAGGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATG
ACATTTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGA
GCCGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACCGGCCGTTTCAGC
AACGGCAAACTAGCCACTGACATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCA
GCTTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCT
GCAGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAG
CAAGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAA
TCTGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTT
CAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCT
ATGCTTCTTGATAGCTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTATATGCGGTTGGGG*CAAGGAA
GATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCA*GAACCCTATTCG*
*ATCCATGAAAAAGTTGTGTTTCAGACTCATACAGATGCTCAGCATTCAACAGAGCTAAC
GCAGCTGCTTCAAGCTCAGAAGCATACTCTGGTCTAAAGATTGTTG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 10

CO CL514Contig1 907 10 22 U
GGGATCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTGTTGGTCGTTG
CTTTACTCATCGGAACAAGCGTACATGCGCAGCAAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGT
TCGTGTATCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTG
ACCCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACT
ACGGATCTCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGT
TTGTAGTGTCTCGGGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTT
TGCTGGAAGGGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGC
CAAGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCAT
TTCACTATCCCCTGAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTT
CCTTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGT
TCGAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATC
CTCTGGTTAACCCACGAGAAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAAC
CATCTTATTAGTCTTGCTTTTTATGCTGCCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATT
TAGTTCTCCAAAATCTCTGTAGAGAACTAATCATCATTAATAACCCAGAAGCATAAAAAC
ATGCATGCTCATAATTTTCAGATACATGCTTAATTTTCTAGCATTTTAACATTTGATCAA
AACTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF37TF U 98
AF RR4ES72TF U 1
AF RR4EL94TF U 2
AF RR4DI75TF U 2
AF RR4ES72JQ C 4
AF RR4CN75JQ C 88
AF RR4AT07TF U 13
AF RR4CN75TF U 88
AF RR4DI75JQ C 135
AF RR4AT07JQ C 61
BS 1 171 RR4ES72TF
BS 172 172 RR4DI75TF
BS 173 321 RR4ES72TF
BS 322 324 RR4DI75TF
BS 325 381 RR4ES72TF
BS 382 384 RR4DI75TF
BS 385 646 RR4ES72TF
BS 647 648 RR4DI75TF
BS 649 649 RR4AT07TF
BS 650 679 RR4DI75TF
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BS 681 692 RR4DI75TF
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BS 788 838 RR4AT07TF
BS 839 839 RR4AT07JQ
BS 840 873 RR4AT07TF
BS 874 907 RR4AT07JQ

RD RR4CF37TF 223 0 0
GCCCCCGCCGAGACGCGATGGGTTCGTGTATCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAAC
GATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACC
GCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATCTCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCC
TTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTGTCTCGGGCCTTG

QA 1 223 1 223
DS 

RD RR4ES72TF 646 0 0
GGGATCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTGTTGGTCGTTG
CTTTACTCATCGGAACAAGCGTACATGCGCAGCAAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGT
TCGTGTATCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGTGTATTTTG
ACCCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACT
ACGGATCTCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGT
TTGTAGTGTCTCGGGCCTTGCT**TTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTT
TGCTGGAAGGGATCTTCAAGC***AGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGC
CAAGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCAT
TTCACTATCCCCTGAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTT
CCTTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGT
TCGAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4EL94TF 689 0 0
GGATCC
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTGTTGGTCGTTGCTTTACT
CATCGGAACAAGCGTACATGCGCAGCAAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGTTCGTGTA
TCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGT
TTGCCCCTATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATC
TCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGT
GTCTCGGGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGA
AGGGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACC
TGCAGTTGTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCATTTCACTA
TCCCCTGAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAA
GTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCT
GCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAA*CACCATTGATCCTCTGGT
TAACCCACGAGAAGCAAAGATAA

QA 7 689 7 689
DS 

RD RR4DI75TF 786 0 0
GGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTGTTGGTCGTTGCTTTACT
CATCGGAACAAGCGTACATGCGCAGCGAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGTTCGTGTA
TCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGT
TTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATC
TCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGT
GTCTCGGGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGA
AGGGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACC
TGCAGTTGTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCATTTCACTA
TCCCCTGAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAA
GTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCT
GCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAA*CACCATTGATCCTCTGGT
TAACCCACGAGA*GCAAAGATAAAG*ACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCTTA
TTAGTCTTGCTTTT*ATGCTGCCTCAA*CTCACACTAATGTACTAGACAAATTTAGTTCT

QA 7 786 7 786
DS 

RD RR4ES72JQ 825 0 0
ATCC
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTGTTGGTCGTTGCTTTACT
CATCGGAACAAGCGTACATGCGCAGCAAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGTTCGTGTA
TCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGTGTATTTTGACCCGGT
TTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATC
TCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGT
GTCTCGGGCCTTGCT**TTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGA
AGGGATCTTCAAGC***AGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACC
TGCAGTTGTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCATTTCACTA
TCCCCTGAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAA
GTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCT
GCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTGGT
TAACCCACGAGAAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTC***CCTCACCCAACCATCTTA
TTAGTCTTGCTTTTTATGCTGCCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATTTAGTTCT
CCAAAATCTCTGTAGAGAACTAATCATCATTAATAACCCAG

QA 5 825 5 825
DS 

RD RR4CN75JQ 741 0 0
G
GCAGCAAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGTTCGTGTATCCACCGGGTAGGAAAATCGA
ACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGC
TTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATCTCGCGTCGCTCTTGTTCTTCA
CCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTGTCTCGGGCCTTGCACATTGT
GAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGAAGGGATCTTCAAGCACCAGGC
ATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGT
TAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCCCATTTCACTATCCCCTGAAATCTGGCTTCCG
CAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGT
TTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCAT
TGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTGGTTAACCCACGAGAAGCAAAGAT
AAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCTTATTAGTCTTGCTTTTTATGCTG
CCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATTTAGTTCTCCAAAATCTCTGTAGAGAACT
AATCATCATTAATAACCCAG

QA 2 741 2 741
DS 

RD RR4AT07TF 861 0 0
GG
GAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTGTTGGTCGTTGCTTTACTCATCGGA
ACAAGCGTACATGCGCAGCAAGTGCCCCC*CCGAGACGCGATGGGTTCGTGTATCCACCG
GGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCC
GATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATCTCGCGTC
GCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTGTCTCGG
GCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGAAGTGATC
TTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACCTGCAGTT
GTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCATTTCACTATCCCCTG
AAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGAGTTTCCTTCAAGTATAGC
GTTCCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCACCCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCTGCCCGAT
GCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTGGTTAACCCA
CGAGGAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCTTATTAGTCT
TGCTTTTTATGCTGCCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATTTAGTTCTCCAAAAT
CTCTGTAGAGAACTAATCATCATTAATAACCCAGAAGCATAAAA*CATGCATGCTCATAA
TTTTCAGATACATGCTTAA

QA 3 861 3 861
DS 

RD RR4CN75TF 769 0 0
G
GCAGCAAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGGTTCGTGTATCCACCGGGTAGGAAAATCGA
ACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGC
TTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATCTCGCGTCGCTCTTGTTCTTCA
CCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTGTCTCGGGCCTTGCACATTGT
GAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGAAGGGATCTTCAAGCACCAGGC
ATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGT
TAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCCCATTTCACTATCCCCTGAAATCTGGCTTCCG
CAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGT
TTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCAT
TGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTGGTTAACCCACGAGAAGCAAAGAT
AAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCTTATTAGTCTTGCTTTTTATGCTG
CCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATTTAGTTCTCCAAAATCTCTGTAGAGAACT
AATCATCATTAATAACCCAGA*GCATAAAA*CATGCATGCT
CAAAAAA

QA 2 762 2 762
DS 

RD RR4DI75JQ 729 0 0
GGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCC
GATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATCTCGCGTC
GCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTGTCTCGG
GCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTTTGCTGGAAGGGATC
TTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACCTGCAGTT
GTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCATTTCACTATCCCCTG
AAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAAGTATAGC
GTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCTGCCCGAT
GCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTGGTTAACCCA
CGAGGAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCTTATTAGTCT
TGCTTTTTATGCTGCCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATTTAGTTCTCCAAAAT
CTCTGTAGAGAACTAATCATCATTAATAACCCAGAAGCATAAAAACATGCATGCT
TATAATTTTCAGAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4AT07JQ 847 0 0
CTTTACTCATCGGAACAAGCGTACATGCGCAGCAAGTGCCCCC*CCGAGACGCGATGGGT
TCGTGTATCCACCGGGTAGGAAAATCGAACCGGAAACGATACTTATCGAAGCGTATTTTG
ACCCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACT
ACGGATCTCGCGTCGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGT
TTGTAGTGTCTCGGGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGATTCCAATGCCACGTTCAGTT
TGCTGGAAGTGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGC
CAAGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCAT
TTCACTATCCCCTGAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGAGTTT
CCTTCAAGTATAGCGTTCCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCACCCTTCTATGTGAATGGGT
TCGAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATC
CTCTGGTTAACCCACGAGGAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAAC
CATCTTATTAGTCTTGCTTTTTATGCTGCCTCAAACTCACACTAATGTACTAGACAAATT
TAGTTCTCCAAAATCTCTGTAGAGAACTAATCATCATTAATAACCCAGAAGCATAAAAAC
ATGCATGCTCATAATTTTCAGATACATGCTTAATTTTCTAGCATTTTAACATTTGATCAA
AACTTGC

QA 1 847 1 847
DS 



AS 2 10

CO CL515Contig1 876 8 9 U
GAGGTCTGAGGCATTGAGAGAGAAAGATGGAATCCCTGATCTGCGGAGAGGAGCTCGTTT
CCGATATTCTAGTGTGACACTTCCTGAGGTTGACGGTGATGTTAAACGGCTACTGAGAGG
TGGAAGAGAAGTTGAAGATGCCTTGACGGCAGTTATCATCAAGAATTTGAAAGCAGTTCA
GGACAGGTCAAAGGTCATTGTTATGGATGCTGATGGAACTCGCTCTAAGGGCATTGCAAG
AGCCTTGAGAAAACTTGGGATTAAGAGGCCATACTTGGTGCAAGGTGGGTTTAGATCATG
GGTTAAAGAAGGTCTTCGTGTGAAAGAACCAAAACCTGAGACCACACTTTCCATCCTCAA
CGAGGAAGCTGAGGCGATCCTTGAGGAAATAAACCCTTCTCCATTGCAAGTAGCTGGAGT
TGGTGTGGGGGTTTTGGCAGGATCATACGCTTTGTTTGAGTGGGAGAAAACACTGCAACT
CATAGCTGTCATTGGCCTTGGTTTGACTATATACCAACGTCTTGCTTCCTATGATGACTC
GGAAGACTTCAAGCAAGACGTCAGGCAATTGTTTGCACCAGTGAAACTTGGAGCTCAGGC
TTTCTCATGGGCTGCAGGAAAGCTTGAGACAAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTC
TTCCTCAGATGTCCGAAGCC*GGGTTTTGCAGGCTGCTGCTAAGCATGAATCTCAGCCGT
CTGATGATACTTCTGAAGGTCTCCAAGATGCATTATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAG
CTTTAAACAACGTTGATGTCTCAGAAGCCTAAAGGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCAT
TTGTAACTGCCAATAAATACTTTGTTGGTCTCTTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI44TF U 1
AF RR4BH52JQ C 371
AF RR4BH52TF U 1
AF RR4F980TF U 36
AF RR4EQ79JQ C 541
AF RR4BI44JQ C 94
AF RR4EQ79TF U 541
AF RR4FE29TF U 150
BS 1 680 RR4BH52TF
BS 681 681 RR4F980TF
BS 682 691 RR4BH52TF
BS 692 692 RR4EQ79TF
BS 693 729 RR4BH52TF
BS 730 730 RR4F980TF
BS 731 734 RR4BH52TF
BS 735 870 RR4EQ79TF
BS 871 876 RR4BI44JQ

RD RR4BI44TF 678 0 0
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GGTTAAAGAAGGTCTTCGTGTGAAAGAACCAAAACCTGAGACCACACTTTCCATCCTCAA
CGAGGAAGCTGAGGCGATCCTTGAGGAAATAAACCCTTCTCCATTGCAAGTAGCTGGAGT
TGGTGTGGGGGTTTTGGCAGGATCATACGCTTTGTTTGAGTGGGAGAAAACACTGCAACT
CATAGCTGTCATTGGCCTTGGTTTGACTATATACCAACGTCTTGCTTCCTATGATGACTC
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TTTCTCATGGGCTGCAGGAAAGCTTGAGACAAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTC
TTCCTCAGATGTCCGAAG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4BH52JQ 332 0 0
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GTTTTGGCAGGATCATACGCTTTGTTTGAGTGGGAGAAAACACTGCAACTCATAGCTGTC
ATTGGCCTTGGTTTGACTATATACCAACGTCTTGCTTCCTATGATGACTCGGAAGACTTC
AAGCAAGACGTCAGGCAATTGTTTGCACCAGTGAAACTTGGAGCTCAGGCTTTCTCATGG
GCTGCAGGAAAGCTTGAGACAAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCCCCTTCTTCCTCAGAT
GTCCGAAGCC*GGGTTTTGCAGGCTGCTGCTA

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR4BH52TF 734 0 0
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TGGAAGAGAAGTTGAAGATGCCTTGACGGCAGTTATCATCAAGAATTTGAAAGCAGTTCA
GGACAGGTCAAAGGTCATTGTTATGGATGCTGATGGAACTCGCTCTAAGGGCATTGCAAG
AGCCTTGAGAAAACTTGGGATTAAGAGGCCATACTTGGTGCAAGGTGGGTTTAGATCATG
GGTTAAAGAAGGTCTTCGTGTGAAAGAACCAAAACCTGAGACCACACTTTCCATCCTCAA
CGAGGAAGCTGAGGCGATCCTTGAGGAAATAAACCCTTCTCCATTGCAAGTAGCTGGAGT
TGGTGTGGGGGTTTTGGCAGGATCATACGCTTTGTTTGAGTGGGAGAAAACACTGCAACT
CATAGCTGTCATTGGCCTTGGTTTGACTATATACCAACGTCTTGCTTCCTATGATGACTC
GGAAGACTTCAAGCAAGACGTCAGGCAATTGTTTGCACCAGTGAAACTTGGAGCTCAGGC
TTTCTCATGGGCTGCAGGAAAGCTTGAGACAAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTC
TTCCTCAGATGTCCGAAGCCCGGGTTTTGCACGCTGCTGCTAAGCATGAATCTCAGCCGT
CTGATGATATTTCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4F980TF 699 0 0
G
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TGATGTTAAACGGCTACTGAGAGGTGGAAGAGAAGTTGAAGATGCCTTGACGGCAGTTAT
CATCAAGAATTTGAAAGCAGTTCAGGACAGGTCAAAGGTCATTGTTATGGATGCTGATGG
AACTCGCTCTAAGGGCATTGCAAGAGCCTTGAGAAAACTTGGGATTAAGAGGCCATACTT
GGTGCAAGGTGGGTTTAGATCATGGGTTAAAGAAGGTCTTCGTGTGAAAGAACCAAAACC
TGAGACCACACTTTCCATCCTCAACGAGGAAGCTGAGGCGATCCTTGAGGAAATAAACCC
TTCTCCATTGCAAGTAGCTGGAGTTGGTGTGGGGGTTTTGGCAGGATCATACGCTTTGTT
TGAGTGGGAGAAAACACTGCAACTCATAGCTGTCATTGGCCTTGGTTTGACTATATACCA
ACGTCTTGCTTCCTATGATGACTCGGAAGACTTCAAGCAAGACGTCAGGCAATTGTTTGC
ACCATTGAAACTTGGAGCTCAGGCTTTCTCATGGGCTGCAGGAAAGCTTGAGACAAATGG
TGTTGGCCTCC*AACTTCACCTTCTTCCTCAGATGTCCGAAGCC*GGGTTTTGCA*GCTG
CTGCTAAGCATGAATCTCAGCCGTCTGATGATACTTCT

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR4EQ79JQ 197 0 0
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TTTCTCATGGGCTGCAGGAAGGCTTGAGACAAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTC
TTCCTCAGATGTCCGAAGCC*GGGTTTTGCAGGCTGCTGCTAAGCATGAATTTCAGCCGT
CTGATGATACTT
TTGAA

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR4BI44JQ 783 0 0
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TATCATCAAGAATTTGAAAGCAGTTCAGGACAGGTCAAAGGTCATTGTTATGGATGCTGA
TGGAACTCGCTCTAAGGGCATTGCAAGAGCCTTGAGAAAACTTGGGATTAAGAGGCCATA
CTTGGTGCAAGGTGGGTTTAGATCATGGGTTAAAGAAGGTCTTCGTGTGAAAGAACCAAA
ACCTGAGACCACACTTTCCATCCTCAACGAGGAAGCTGAGGCGATCCTTGAGGAAATAAA
CCCTTCTCCATTGCAAGTAGCTGGAGTTGGTGTGGGGGTTTTGGCAGGATCATACGCTTT
GTTTGAGTGGGAGAAAACACTGCAACTCATAGCTGTCATTGGCCTTGGTTTGACTATATA
CCAACGTCTTGCTTCCTATGATGACTCGGAAGACTTCAAGCAAGACGTCAGGCAATTGTT
TGCACCAGTGAAACTTGGAGCTCAGGCTTTCTCATGGGCTGCAGGAAAGCTTGAGACAAA
TGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTCTTCCTCAGATGTCCGAAGCC*GGGTTTTGCAGG
CTGCTGCTAAGCATGAATTTCAGCCGTCTGATGATATTTCTGAAGGTCTCCAAGATGCAT
TATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAGCTTTAAACAACGTTGGTGTCTCAGAAGCCTAAA
GGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCATTTGTAACTGCCAATAAATACTTTGTTGGTCTCT
TGC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4EQ79TF 332 0 0
GGAAGACTTCAAGCAAGACGTCAGGCAATTGTTTGCACCAGTGAAACTTGGAGCTCAGGC
TTTCTCATGGGCTGCAGGAAGGCTTGAGACAAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTC
TTCCTCAGATGTCCGAAGCC*GGGTTTTGCAGGCTGCTGCTAAGCATGAATCTCAGCCGT
CTGATGATACTTCTGAAGGTCTCCAAGATGCATTATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAG
CTTTAAACAACGTTGATGTCTCAGAAGCCTAAAGGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCAT
TTGTAACTGCCAATAAATACTTTGTTGGTC
CC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4FE29TF 721 0 0
G
AGTTATCATCAAGAATTTGAAAGCAGTTCAGGACAGGTCAAAGGTCATTGTTATGGATGC
TGATGGAACTCGCTCTAAGGGCATTGCAAGAGCCTTGAGAAAACTTGGGATTAAGAGGCC
ATACTTGGTGCAAGGTGGGTTTAGATCATGGGTTAAAGAAGGTCTTCGTGTGAAAGAACC
AAAACCTGAGACCACACTTTCCATCCTCAACGAGGAAGCTGAGGCGATCCTTGAGGAAAT
AAACCCTTCTCCATTGCAAGTAGCTGGAGTTGGTGTGGGGGTTTTGGCAGGATCATACGC
TTTGTTTGAGTGGGAGAAAACACTGCAACTCATAGCTGTCATTGGCCTTGGTTTGACTAT
ATACCAACGTCTTGCTTCCTATGATGACTCGGAAGACTTCAAGCAAGACGTCAGGCAATT
GTTTGCACCAGTGAAACTTGGAGCTCAGGCTTTCTCATGGGCTGCAGGAAAGCTTGAGAC
AAATGGTGTTGGCCTCCCAACTTCACCTTCTTCCTCAGATGTCCGAAGCC*GGGTTTTGC
AGGCTGCTGCTAAGCATGAATCTCAGCCGTCTGATGATACTTCTGAAGGTCTCCAAGATG
CATTATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAGCTTTAAACAACGTTGATGTCTCAGAAGCCT
AAAGGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCATTTGTAACTGCCAATAAATACTTTGTTGGTC

QA 2 721 2 721
DS 



CO CL515Contig2 221 2 1 U
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AAGATGCATTATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAGCTTTAAACAACGTTGATGTCCCAG
AAGCCTAAAGGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCATTTGTAACTGCCAATAAATACTTTG
TTGGTCTCTTGGAACCGTTAATGTTCATAATCGTTACGCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GR26TF U 1
AF RR4GR88TF U 1
BS 1 221 RR4GR26TF

RD RR4GR26TF 221 0 0
TTTTGCAGGCTGCTGCTGGGCATGAATCTCAGCCGTCTGGTGATACTTCTGAAGGTCTCC
AAGATGCATTATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAGCTTTAAACAACGTTGATGTCCCAG
AAGCCTAAAGGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCATTTGTAACTGCCAATAAATACTTTG
TTGGTCTCTTGGAACCGTTAATGTTCATAATCGTTACGCAG

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR4GR88TF 221 0 0
TTTTGCAGGCTGCTGCTGGGCATGAATCTCAGCCGTCTGGTGATACTTCTGAAGGTCTCC
AAGATGCATTATCATCATCATCTTCCTCAGAAGAAGCTTTAAACAACGTTGATGTCCCAG
AAGCCTAAAGGCTCCAACTTTTAATTTATTGTTCATTTGTAACTGCCAATAAATACTTTG
TTGGTCTCTTGGAACCGTTAATGTTCATAATCGTTACGCAG

QA 1 221 1 221
DS 



AS 1 9

CO CL516Contig1 1286 9 20 U
CTGGAGTTAATGTGCACATTTTATTCAAAATACAACCCAAGACAAAGAAAGAGTAAAGCG
TTTACACTTGCCAAACTGAAGAATCCTAAAACCAAGTGGATTAGATATCTCTCTAAATTC
TCTAGTACCAAACAGAATATGTAGGTAATGGAGAGTTTAAGCAGCAGGAGGCCTGAGTTC
TTGATCACGAGATGTATCACGAACAGATTGAGGCAAGTAATGCCACATTGGCATGTAACC
GTAGCTCGGATAAACTGCCATCTTGTTCTGATTAAATGGAGTTGGAATCTGAGGCATGAA
CCCTGTAGATGAAACCATCATAGACTTCAACTGCTGTTCCGTCTTCTCCTTCTCCGCTTT
CAAAGCTTGCTTCTCCTCCC*TCAGCTCATTCTTCTCAGCCTTGAGACTCTTGATCTCCT
CTAAAAGCTTCTGATTAGTTTCTTCAAGCTCATGAGCTTCATCTCTGAGTTGATTCAAGA
CACGG*ATTGCATCATCGAGAATAGCCGGTTTATCGGTCTTTGGAGTCCTCCCAGGCTCT
AAAACCGAGCTCAAATCCATGAACTTCTCATTTAGCTTTTCTCTCCTCAA*TCTCTCACG
ACAAGCTTTGGTTCCTCCTGGTCTAACACAAGATCCAGTCCTTCCCCGCTTTCTGGAGCA
TTCCTCATCAACATGTTCTTGTTCTTGCTTAACAGGACCACCAGATGAGCCAGAGTTAAC
AACTACTACATCTTCCCGCACAGTTCCACAATCATTTGGTCCACCAAAGTTACGAAACTG
CCCTGGCTCTTGCGCTAAAACTCCATT*GTACGATGTTAAATCTCCAATGCTGAAAACTT
GTTCTGGGTCGTTCTGTAGATTGACACCGTATGACCCGAAATCTGGGAAGGTATCTGCTT
GATCAGGCTGCAAATCTACACCAAACTGTGTGTAGTCATCGAGTTCTGCTCCATTGCTTT
GATCGAAGCAAAAGAAATCAGAGACGAAATCATCATCGTCAAGAGAAGGATACATCTGAA
TCTCAAGAACACAGATTTGATTTTGGGAATGCTTCAAGAGAGAGAGAGAGACGCCAATGT
CGGAAGAAAATTATATTATTACAGGATTTAAAAAAAAAAAATCGAATGACGCCAAGGAGA
TGATGATAAGAATGGTGGGAACAATATTCTACGATTTGATATTAGTGGAAAATTAAAAGA
AGGATTATTTATTAATTTCTAACTTCAAAATTCTTATTCGGGAAAAGACAAATCGCGTCC
AGAAAGTATTGAATCGGAATCAAAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 20 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AG

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GG
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AA*TCTCTCACGACAAGCTTTGGTTCCTCCTGGTCTGACACAAGATCCAGTCCTTCCCCG
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CCCTGGCTCTTGCGCTAAA*CTCCATT*GTACGATGTTAAATCTCCAATGCTGAAA
CTT

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TACTACATCTTCCCGCACAGTTCCACAATCATTTGGTCCACCAAAGTTACGAAACTGCCC
TGGCTCTTGCGCTAAAACTCCATT*GTACGATGTTAAATCTCCAATGCTGAAAACTTGTT
C

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AAATCTGGGA

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C*GTAGCTCGGATAAACTGCCATCTTGTTCTGATTAAATGGAGTTGGAATCTGAGGCATG
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CTCTAAAAGCTTCTGATTAGTTTCTTCAAGCTCATGAGCTTCATCTCTGAGTTGATTCAA
GACACGG*ATTGCATCATCGAGAATAGCCGGTTTATCGGTCTTTGGAGTCCTCCCAGGCT
CTAAAACCGAGCTCAAATCCATGAACTTCTCATTTAGCTTTTCTCTCCTCAA*TCTCTCA
CGACAAGCTTTGGTTCCTCCTGGTCTAACACAAGATCCAGTCCTTCCCCGCTTTCTGGAG
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AATCTCAAGAACACAGATTTG
ATTTGGGAATGCTTCCC

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CC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4GF05TF 789 0 0
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TCTAACTTCAAAATTCTTATTCGGGAAAAGACAAATCGCGTCCAGAAAGTATTGAATCGG
AATCAAAAA

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 9

CO CL517Contig1 875 9 16 U
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GTCCAAACAAACAAAAGAGCTTGACCTTTTTGTTCATCTCCAAACCATTTCAACTCAAAG
TAAAGGTTGATTACAAAAAAATGCTCCGACTAGCGATTTCTTTGTTCCTCTTTGCATTGT
TCTCTCTCACATCTGCAAGATCTTTCGTCACCACAAGACCTGGACCGATTGATTCATTTC
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GCAACGAGGTATACGTGAAGAGACTAGACAATCCAAAGGCGAGGGCATTTGAAAAGTGTT
CCTCAGACACATACAAGATAACGGGACCGTGTATGCGTGACGTATGTTATCTCCACCTAC
TCAGGCAAGGATCCGACGGCTGGAAACCAGAGAACGTCAAGGTATACGGCTCATCCATCA
GATCAGTCACTTTCTACTATAACCTCTTCTTGCCAAACGGAGTTTGGTACGGCTTTAACG
TCTGCAACGGCATTGCCGATGCCAATGACAAGTCTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTG
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TATATGAAATAAATAAAAATAGCATGCATTGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 
55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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AF RR4GG44TF U 115
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BS 873 875 RR4BG22JQ

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AAGATAACGGGACCGTGTATGCGTGACGTATGTTATCTCCACCTACTCAGGCAAGGATCC
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TACTATAACCTCTTCTTGCCAAACGGAGTTTGGTACGGCTTTAACGTCTGCAACGGCATT
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GG
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TTTGTGGCGGAAACTGAAGAGAAGCAAACTTGTGTTTTGAGTGTATTTGTGAAAAAA

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A
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ACTATAACCTCTTCTTGCCAAACGGAGCTTGGTACGGCTTTAACGTTTGCAACGGCATTG
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AAAATAGCAT
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G
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GCATTGG

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GATGCCAATGACAAGTTTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTGCTGCTATGTAAGATCAA
TAAAAACAAAAAAGGTTGATTATCTTGTGGATTTGCTATTTTGTGGCGGAAACTGAAGAG
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C

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DS 



AS 1 7

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BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB86JQ U 47
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AF RR4E026TF C 4
AF RR4EB86TF C 4
AF RR4CP45JQ U 1
AF RR4H243JQ U 4
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ACTTCAAAACTATTGAGAGTTTGATTCTTATGGACTTTTTTATGTCGAATGCAATCTGGT
GAATGACAACAACAACAACATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGATCTTTTTAGCTTG
TTGCTTCACATTACACAGCCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAG
CTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAATACAGCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAG
CCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGT
TTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGA
TAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCT
C

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DS 

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G
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AATCTACAAGACAATGATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGA
GTTTGATTCTTATGGACTTTTTTATGTCGAATGCAATCTGGTGAATGACAACAACAACAA
CATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGATCTTTTTAGCTTGTTGCTTCACATTACACAG
CCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAG
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CATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACAC
ACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAA
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CACTCAATGGGGTTC

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DS 

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G
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GTTTGATTCTTATGGACTTTTTTATGTCGAATGCAATCTGGTGAATGACAACAACAACAA
CATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGATCTTTTTAGCTTGTTGCTTCACATTACACAG
CCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAG
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CATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACAC
ACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAA
ACCCGGGGTTGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAG
CACTCAATGGGGTTC

QA 2 556 2 556
DS 

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G
CATATGTAACACAGCTTATTTCTTATTAATTGCATAATGTATTGAATCTGCATATCCCCA
AATCTACAAGACAATGATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGA
GTTTGATTCTTATGGACTTTTTTATGTCGAATGCAATCTGGTGAATGACAACAACAACAA
CATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGATCTTTTTAGCTTGTTGCTTCACATTACACAG
CCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAG
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CATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACAC
ACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAA
ACCCGGGGTTGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAG
CACTCAATGGGGTTC

QA 2 556 2 556
DS 

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CCCAAATCTACAAGACAATGATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATT
GAGAGTTTGATTCTTATGGA*TTTTTTATGTCGAATGCAATCTGGTGAATGACAACAACA
ACAACATAAACATCTCGGTGGTCTGCCTTATGATCTTTTTAGCTTGTTGCTTCACATTAC
ACAACCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCT
TTAGCTCCAAATACAGCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTG
TATGCATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTCCG
ACACACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCA
CCAAACCCAGGGTTGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCT
ATAGCACTCAATGGGGTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTA
ATTTGATTGGCAGTGCGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACG
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TGAACATCCAAAGGAAGATCAGTA

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DS 

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A
CATATGTAACACAGCTTATTTCTTATTAATTGCATAATGTATTGAATCTGCATATCCCCA
AATCTACAAGACAATGATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGA
GTTTGATTCTTATGGA*TTTTTTATGTCGAATGCAATCTGGTGAATGACAACAACAACAA
CATAAACATCTCGGTGATCTGCCTTATGATCTTTTTAGCTTGTTGCTTCACATTACACAG
CCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAG
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CATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACAC
ACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAA
ACCCAGGGTTGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAG
CACTCAATGGGGTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTAATTT
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CTGCACCTGCTTTGATGAAATCTGGTACCCTCAAATCCGGTTCCACTATCATGAGATGAA
CATCCAAAGGAAGATCAGTAACAGGACGCAAAGCATCAACCACAAG

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DS 

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CA
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ACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGTTTGATTCTTATGGACTTTTTT
ATGTCGAATGCAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACATAAACATCTCGGTGATCTGTC
TTATGATCTTTTTAGCTTGTTGCTTCACATTACACAGACACAGCTTCTGGCTTCTTGCTG
GTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAATACAGCTGATCCAGCT
ACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGAGTGACACCACCA
TCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTCAAATCCGAGATT
TTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTGGCCGA*ATTATC
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AGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAGTGCGGTGCAAATGG
ATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTGCTTTGATGAAATCT
GGTACCCTCAGATCTGGTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAGAGGAAGATCAGTAACA
GGACGCAAAGCATCAACCACAAGAGGTCCAATAGTGATGTTGGGAACAAAACGACCATCC
ATCACATCAACATGGATCCAATCACAACCTGCACACTCTACTGCTTTTACCTGCTCGCCT
AGTTTGG

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DS 



AS 1 10

CO CL519Contig1 1783 10 21 U
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ATTATCACGATCCTTTTCAACTTCCTCTCCCTTTCTCTCTCGTTCTCTAGGGAGAAATTT
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AAGCCCATCGGTTCAAGTTTCTTACACAAAGCTCCTCATCGATGGGAACTTCGTTGACGC
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GACTTATGAACAAGCAATAACAGCAGAGATTCCAATGCTTGCCAGATTGTTCCGCTACTA
CGCTGGGTGGGCGGACAAGATTCATGGGCTTACAGTTCCAGCTGATGGAAACTATCATGT
TCAGACACTGCATGAACCCATAGGAGTTGCTGGACAAATCATTCCCTGGAACTTTCCGCT
TTTGATGTTTGCTTGGAAAGTTGGTCCTGCTCTTGCTTGTGGCAACACCATTGTCCTCAA
AACCGCTGAACAAACTCCTCTCACTGCTTTCTACGTTGGCAAACTTTTCCTTGAAGCTGG
TCTTCCTCCAGGTGTTCTGAATATAGTTTCTGGATTCGGCGCAACCGCTGGTACTTCTCT
CGCAAGTCACATGGATGTAGACAAGCTTGCTTTCACAGGATCGACTGATACGGGCAAAGT
TATACTTGGACTGGCTGCTAACAGCAATCTAAAGCCGGTGACTCTTGAACTTGGAGGGAA
ACCACCCTTCATTGTATTCGAAGATGCTGATATCGATAAAGCTGTGGAGCTTGCTCACTT
TGCTCTCTTCTTTAATCAGGGGCAATGTTGCTGTGCGGGGTCTCGGACATATGTTCATGA
GAAAGTGTATGATGAGTTCGTTGAGAAAGCAAAGGCACGCGCACTAAAACGTGTCGTTGG
TGATCCTTTCAAGAAAGGCATTGAACAGGGTCCTCAGATCGATTCAAAGCAATTTGAGAA
AGTTATGAAGTACATAAGGTCAGGAGTGGAAAGCAATGCTACTCTTGAATGTGGTGGTGG
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CAACGGAAGAGAGAAAGGTATTTACAGTCTCAACAACTACTTGCAGGTCAAGGCAGTCGT
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CAAAAGAACTCTTAAAAGTTAAAACAATAAAAAACGCCAAGGTTTGTTTACTTACTGGAT
TGTGGACACTTTTAATAAATGTGTAAGCAAGTTCTAGCTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 40 55 5 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 

AF RR4EG01TF U 1
AF RR4E321TF U 518
AF RR4EV61TF U 1117
AF RR4DQ59TF U 913
AF RR4DV73TF U 913
AF RR4DV73JQ C 974
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AF RR4DQ59JQ C 1043
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BS 760 961 RR4E321TF
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BS 963 1053 RR4E321TF
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BS 1055 1120 RR4E321TF
BS 1121 1121 RR4DQ59TF
BS 1122 1155 RR4E321TF
BS 1156 1156 RR4EV61TF
BS 1157 1157 RR4DQ59TF
BS 1158 1213 RR4E321TF
BS 1214 1561 RR4DQ59TF
BS 1562 1606 RR4DV73TF
BS 1607 1607 RR4DV73JQ
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BS 1782 1783 RR4E321JQ

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ATTATCACGATCCTTTTCAACTTCCTCTCCCTTTCTCTCTCGTTCTCTAGGGAGAAATTT
GAATAATGGAAGTAGGATCGTACGGAGATTTGGAACATCATCTGCAGCTGAAGAAGTCAT
AAGCCCATCGGTTCAAGTTTCTTACACAAAGCTCCTCATCGATGGGAACTTCGTTGACGC
TGCTTCTGGTAAGACGTTCCCGACTCTTGATCCACGCACAGGGGAAGTCATTGCGCACGT
ATCTGAAGGGGATGCTGAAGATATCAACCGGGCTGTGAAAGCTGCAAGGAAGGCCTTTGA
TGAAGGACCTTGGCCTAAGATGACTGCTTATGAAAGGTCGATGATAATGTTGAGATTCGC
TGATTTGGTTGAGAAACACAGCGAAGAGCTCGCAGCTCTAGAGTCATGGGACAATGGGAA
GACTTATGAACAAGCAATAACAGCAGAGATTCCAATGCTTGCCAGATTGTTCCGCTACTA
CGCTGGGTGGGCGGACAAGATTCATGGGCTTACAGTTCCAGCTGATGGAAACTATCATGT
TCAGACACTGCATGAACCCATAGGAGTTGCTGGACAAATCATTCCCTGGAACTTTCCGCT
TTTGATGTTTGCTTGGAAAGTTGGTCCTGCTCTTGCTTGTGGCAACACCATTGTCCTCAA
A*CCGCTGAACAAACTCCTCTCACTGCTTTCTACGTTGG

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DS 

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G
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CAGCTGATGGAAACTATCATGTTCAGACACTGCATGAACCCATAGGAGTTGCTGGACAAA
TCATTCCCTGGAACTTTCCGCTTTTGATGTTTGCTTGGAAAGTTGGTCCTGCTCTTGCTT
GTGGCAACACCATTGTCCTCAAAACCGCTGAACAAACTCCTCTCACTGCTTTCTACGTTG
GCAAACTTTTCCTTGAAGCTGGTCTTCCTCCAGGTGTTCTGAATATAGTTTCTGGATTCG
GCGCAACCGCTGGTACTTCTCTCGCAAGTCACATGGATGTAGACAAGCTTGCTTTCACAG
GATCGACTGATACGGGCAAAGTTATACTTGGACTGGCTGCTAACAGCAATCTAAAGCCGG
TGACTCTTGAACTTGGAGGGAAATCACCCTTCATTGTATTCGAAGATGCTGATATCGATA
AAGCTGTGGAGCTTGCTCACTTTGCTCTCTTCTTTAATCAGGGGCAATGTTGCTGCGCGG
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GCTCACTAAAACGTGTCGTTGGTGATCCTTTCAAGAA*AGCATTGAACAGGGTCCTCAGA
TCGATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTAC

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GGGT
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TTTTCTAATGTTAAGGATGACATGCTTATTGCTCAAGACGAGATTTTCGGTCCAGTCCAA
TCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGCGATAAGGAGGGCTAACAACACTAGATAC
GGGCTAGCCGCAGGGGTTTTCACAAAGAGCCTGGACACTGCAAACAGGGTCTCGAGGGCT
TTGAAAGCTGGCACCGTTTGGGTCAACTGTTTCGATGTCTTTGACGCAGCCATCCCCTTT
GGTGGTTA

QA 5 432 5 432
DS 

RD RR4DQ59TF 649 0 0
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TGTATTCGAAGATGCTGATATCGATAAAGCTGTGGAGCTTGCTCACTTTGCTCTCTTCTT
TAATCAGGGGCAATGTTGCTGTGCGGGGTCTCGGACATATGTTCATGAGAAAGTGTATGA
TGAGTTCGTTGAGAAAGCAAAGGCACGCGCACTAAAACGTGTCGTTGGTGATCCTTTCAA
*AA*GGCATTGAACAGGGTCCTCAGATCGATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTA
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TCAAGACGAGATTTTCGGTCCAGTCCAATCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGT
GATAAGGAGGGCTAACAACACTAGATACGGGCTAGCCGCAGGGGTTTTCACAAAGAGCCT
GGACACTGCAAACAGGGTCTCGAGGGCTTTGAAAGCTGGCACCGTTTGGGTCAACTGTTT
CGATGTCTTTGACGCAGCCATCCCCTTTGGTGGTTACAAGATGAGCGGC

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DS 

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TGTATTCGAAGATGCTGATATCGATAAAGCTGTGGAGCTTGCTCACTTTGCTCTCTTCTT
TAATCAGGGGCAATGTTGCTGTGCGGGGTCTCGGACATATGTTCATGAGAAAGTGTATGA
TGAGTTCGTTGAGAAAGCAAAGGCACGCGCACTAAAACGTGTCGTTGGTGATCCTTTCAA
*AA*GGCATTGAACAGGGTCCTCAGATCGATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTA
CATAAGGTCAGGAGTGGAAAGCAATGCTACTCTTGAATGTGGTGGTGGGCAGTTTGGCGA
CAAAGGTTACTTCATCCAACCTACAGTCTTTTCTAATGTTAAGGATGACATGCTTATTGC
TCAAGACGAGATTTTCGGTCCAGTCCAATCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGT
GATAAGGAGGGCTAACAACACTAGATACGGGCTAGCCGCAGGGGTTTTCACAAAGAGCCT
GGACACTGCAAACAGGGTCTCGAGGGCTTTGAAAGCTGGCACCGTTTGGGTCAACTGTTT
CGATGTCTTTGACGCAGCCATCCCCTTTGGTGGTTACAAGATGAGCGGCAACGGAAGAGA
GAAAGGTATTTACAGTCTCAACAACTACTTGCAG*TCAAGGCAGTCGTCACTCCACTTAA
TAACCCTGCATGGATCTGATCTTTGTACTTTGTTTCGTCCTAAATGCTCAAA**GACTCT
TAAAAGTTAAA
CA

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DS 

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AATCAGGGGCAATGTTGCTGTGCGGGGTCTCGGACATATGTTCATGAGAAAGTGTATGAT
GAGTTCGTTGAGAAAGCAAAGGCACGCGCACTAAAACGTGTCGTTGGTGATCCTTTCAA*
AA*GGCATTGAACAGGGTCCTCAGATCGATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTAC
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AAAGGTTACTTCATCCAACCTACAGTCTTTTCTAATGTTAAGGATGACATGCTTATTGCT
CAAGACGAGATTTTCGGTCCAGTCCAATCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGTG
ATAAGGAGGGCTAACAACACTAGATACGGGCTAGCCGCAGGGGTTTTCACAAAGAGCCTG
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GATGTCTTTGACGCAGCCATCCCCTTTGGTGGTTACAAGATGAGCGGCAACGGAAGAGAG
AAAGGTATTTACAGTCTCAACAACTACTTGCAGGTCAAGGCAGTCGTCACTCCACTTAAT
AACCCTGCATGGATCTGATCTTTGTACTTTGTTTCGTCCTAAATGCTCAAAAGAACTCTT
AAAAGTTAAAACAATAAAAAACGCCAAGGTTTGTTTACTTACTGGATTGTGGACACTTTT
AATAAATGTGTAAGCAAGTTCTAGCTGT
T

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DS 

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GAACAGGGTCCTCAGATCGATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTACATAAGGTCA
GGAGTGGAAAGCAATGCTACTCTTGAATGTGGTGGTGGGCAGTTTGGCGACAAAGGTTAC
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ATTTTCGGTCCAGTCCAATCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGTGATAAGGAGG
GCTAACAACACTAGATACGGGCTAGCCGCAGGGGTTTTCACAAAGAGCCTGGACACTGCA
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TACAGTCTCAACAACTACTTGCAGGTCAAGGCAGTCGTCACTCCACTTAATAACCCTGCA
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GTAAGCAAGTTCTAGCTGTTT

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DS 

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ATGCTACTCTTGAATGTGGTGGTGGGCAGTTTGGCGACAAAGGTTACTTCATCCAACCTA
CAGTCTTTTCTAATGTTAAGGATGACATGCTTATTGCTCAAGACGAGATTTTCGGTCCAG
TCCAATCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGTGATAAGGAGGGCTAACAACACTA
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GGGCTTTGAAAGCTGGCACCGTTTGGGTCAACTGTTTCGATGTCTTTGACGCAGCCATCC
CCTTTGGTGGTTACAAGATGAGCGGCAACGGAAGAGAGAAAGGTATTTACAGTCTCAACA
ACTACTTGCAGGTCAAGGCAGTCGTCACTCCACTTAATAACCCTGCATGGATCTGATCTT
TGTACTTTGTTTCGTCCTAAATGCTCAAAAGAACTCTTAAAAGTTAAAACAATAAAAAAC
GCCAAGGTTTGTTTACTTACTGGATTGTGGACACTTTTAATAAATGTGTAAGCAAGTTCT
AGCTGT
C

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4EV61JQ 664 0 0
GGGT
GCACTAAAACGTGTCGTTGGTGATCCTTTCAAGAAAGGCATTGAACAGGGTCCTCAGATC
GATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTACATAAGGTCAGGAGTGGAAAGCAATGCT
ACTCTTGAATGTGGTGGTGGGCAGTTTGGCGACAAAGGTTACTTCATCCAACCTACAGTC
TTTTCTAATGTTAAGGATGACATGCTTATTGCTCAAGACGAGATTTTCGGTCCAGTCCAA
TCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGCGATAAGGAGGGCTAACAACACTAGATAC
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TTGAAAGCTGGCACCGTTTGGGTCAACTGTTTCGATGTCTTTGACGCAGCCATCCCCTTT
GGTGGTTACAAGATGAGCGGCAACGGAAGAGAGAAAGGTATTTACAGTTTCAACAACTAC
TTGCAGGTCAAGGCAGTCGTCACTCCACTTAATAACCCTGCATGGATCTGATCTTTGTAC
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GGTTTGTTTACTTACTGGATTGTGGACACTTTTAATAAATGTGTAAGCAAGTTCTAGCTG

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DS 

RD RR4DQ59JQ 740 0 0
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GAGAAAGCAAAGGCACGCGCACTAAAACGTGTCGTTGGTGATCCTTTCAA**AAGGCATT
GAACAGGGTCCTCAGATCGATTCAAAGCAATTTGAGAAAGTTATGAAGTACATAAGGTCA
GGAGTGGAAAGCAATGCTACTCTTGAATGTGGTGGTGGGCAGTTTGGCGACAAAGGTTAC
TTCATCCAACCTACAGTCTTTTCTAATGTTAAGGATGACATGCTTATTGCTCAAGACGAG
ATTTTCGGTCCAGTCCAATCCATCTTGAAGTTCAGTGATGTTGATGAGGTGATAAGGAGG
GCTAACAACACTAGATACGGGCTAGCCGCAGGGGTTTTCACAAAGAGCCTGGACACTGCA
AACAGGGTCTCGAGGGCTTTGAAAGCTGGCACCGTTTGGGTCAACTGTTTCGATGTCTTT
GACGCAGCCATCCCCTTTGGTGGTTACAAGATGAGCGGCAACGGAAGAGAGAAAGGTATT
TACAGTCTCAACAACTACTTGCAGGTCAAGGCAGTCGTCACTCCACTTAATAACCCTGCA
TGGATCTGATCTTTGTACTTTGTTTCGTCCTAAATGCTCAAAAGAACTCTTAAAAGTTAA
AACAATAAAAAACGCCAAGGTTTGTTTACTTACTGGATTGTGGACACTTTTAATAAATGT
GTAAGCAAGTTCTAGCTGT
T

QA 1 739 1 739
DS 



AS 2 10

CO CL520Contig1 1274 6 6 U
TTTTTTTTTAAAAGAAAAAGATGAGCACTTCCATAAAGATACTTAAGCAAACGTTCAGCA
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TGCTCTTCGGCATCATCAAACGTAATCAGGTCCACAAGATCATCAGAGGGCTTCAGAGAA
AGCTGCGGCTGTGATTGACTCGTGGTTACGGGATCAGGCGAAGAGACCGTCTTGTCTAAA
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CTACTTATTGCGGAATACATGAGGGAAAGGTGAGAAACGATCATCATAACTAGTCTGCTT
AGTAGAGAAGAAAGTGTTGATCCAGCAACTAGGCTTCTAGTGTAGGAGAAGAAGGTCCGA
ACTTGTTCCCCCAATTTGATTAGGAGAAGCTTCCATGTCGCGATGAACGAGTGGTGGCTC
ACTTCTTCCTGTATGACGAATGATGTAAGGGCGAGAAGCGAATCCAATGGCTACACCGAG
AAAGCATGAAAGGGCAATTCCTATTGACCAAAGAGAGTATGTCCCCAAATTAGAATGAGA
GCTTTGGAGGCAATCCTCCTCTTTTAGATTAATCTGGCGGATCATTTCGTTTCCATGATC
AGAAACAAGCAAACAACATCTTTGAGGAACAAAAGATATATCGAAATCACTAGAGAAAGT
TGCGTTCTGTGCTGGTCCGTCTCTATGTCCAAACTCATTTGAGATTCCACCAGCAATGGT
GGTTACATAACCTGAAGAGCTGATCTTGCGTATAACTTTATTGTTCTTATCAGCAACATA
GACATTCCCTTTAGTATCCACAGAGAAACCACGCGGCTTGCTGAACCGGCTATTACCAGC
TTTACCATCTAAATAACCGATACTACCATCCCCAGCAAACCGGTTTATCACACTATCAAC
GGACATAGGAAAAGAAGTAGTGTAGAACGTGCTTCCAGACGAATCAAGGACGATCATATT
AGAAGATCCCGGTAGAGCATGAACCGTGTGTGGATTAAGACCAGATTTGTGACCGTCGAC
CACTGTAGTAACCTCGTACCCGTCTTCCAAAACATGCTTACCCTCGACTAAACTGAAAAC
AAAGAACGAGAAGAGGAACAGGGAGGAAAACGACCAAGCCATGTCGGAATCGATGAGGGG
TTTGAGAAAGCGACTGTGTGTGTCTCTCTTACTTAATGTTGCTGCTTAGCATCTTTAAAG
TTCATTCCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4B729JQ U 10
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C

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TTTTAGATTAATCTGGCGG
C

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A
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AG

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CTCTTACTTAATGTTGCTGCTTAGCATCTTTAAAGTTCATTCCTTTTCC

QA 1 709 1 709
DS 



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GCGAGAAGCGAATCCAATGGCTACACCGAGAAAGCATGAAAGAGCAATCCCTATTGACCA
AAGAGAGTATGTCCCCAAATTAGAATGAGAGCTTTGGAGGCAATCCTCCTCCTTTAGATT
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TATAACTTTATTGTTCTTATCAGCAACATAGACATTCCCTTTAGCATCCACAGCAAAACC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX64JQ U 197
AF RR4GX64TF C 1
AF RR4FY75JQ U 21
AF RR4FY75TF C 525
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TTAGT

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DS 

RD RR4GX64TF 459 0 0
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C

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CG
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GAGCATGAACCGTGTGTGGATTTAGACCAGACTTGTGACCATCGACCACTGTAGTAACCT
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CTGTGTGTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 10

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CGGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATG
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ATAATAACTTCTGCAAAGTTGAAACATTTACTCTTAAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
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25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 30 55 55 30 50 50 45 15 45 45 45 45 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCTCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCC
GGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGT
GGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGT
AAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTT
GCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTGAAGTTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTT
GATCTTATGTCTGATGGTTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAA
GAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTTAATATACAGAGTGAT
GGTGATGGCGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGAT
GGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BG48TF 772 0 0
GGGTTCACCTCTTCCATTCTTCTTCTTTTGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCCT
GAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACACGGTATGGTTAGAACTTACAGGACCCTGCCTCCG
TCTCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCC
GGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGT
GGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGT
AAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTT
GCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTT
GATCTTATGTCTGATGATTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAA
GAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGAT
GGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGAT
GGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATTT
GATGAAAGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCC
CCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4BJ50TF 770 0 0
GGGTTCACCTCTTCCATTCTTCTTCTTTTGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCCT
GAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACACGGTATGGTTAGAACTTACAGGACCCTGCCTCCG
TCTCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCC
GGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGT
GGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGT
AAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTT
GCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTT
GATCTTATGTCTGATGATTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAA
GAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGAT
GGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGAT
GGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATTT
GATGAAAGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCC
CCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4GM19TF 803 0 0
GGGGTTCACCTCTTCCATTCTTCTTCTTTTGTGTAGCAAAAGGTCTCATCAATAACCTCC
TGAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACACGGTATGGTTAGAACTTACAGGATCCTGCCTCC
GTCTCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGC
CGGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATG
TGGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAG
TAAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGT
TGCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGTTTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCC
TGATCTTATGTCTGATGATTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACA
AGAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGA
TGGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGAT**
*GGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATT
TGATGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATT*ATTC
CCC*AAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTA*TAATTTGGGG*ATGA*
TGATTAT*ATCTATGTAAATGTG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4CM75TF 810 0 0
GGGTTCACCTCTTCCATTCTTCTTCTTTTGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCCT
GAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACACGGTATGGTTAGAACTTACAGGATCCTGCCTCCG
TCTCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCC
GGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGT
GGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGT
AAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGTCAGGTT
GCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTT
GATCTTATGTCTGATGATTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAA
GAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGAT
GGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGAT
GGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAGGTATTT
GATGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCC
CC*AAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTT*GTAAAT*GTTTTATAAATTTGGGG*ATGA*T
GATTAT*ATCTATGTAA*TGTGATTTATTA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4CM75JQ 815 0 0
TC
TTTGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCTTGAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACA
CGGTATGGTTAGAACTTACAGGATCCTGCCTCCGTCTCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAA
GTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCGGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAA
GCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGTGGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCA
TATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAAAGGCTCTTTTAAGGTGAGATCAAA
TGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGTCAGGTTGCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTT
GAAGCTTTCCGGGTTTTCGGCTACTGGACTTCTTGATCTTATGTCTGATGATTATGGTTA
TGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAAGAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATG
TGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGATGGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGG
GTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGG
GGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAGGTATTTGATGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAGA
AATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGCT
TTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAATGATTATTATCTATGTAAATGTGATTT
ATTATTTAAAATCAAAAACTATGATTTGTAATT

QA 3 815 3 815
DS 

RD RR4BG48JQ 122 0 0
TGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTT
TGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAATGATTATTATCTATGTAAATGTGATTTAT
TA

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR4GM19JQ 642 0 0
CCAACCGCCGGGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACC
GGGAAATGTGGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAA
GTCAAAAGTAAAGGCTCTTTTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACT
TGGCAGGTTGCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGTTTTGAAGCTTTCCGGGTTTTCGGCTACT
GGACTTCCTGATCTTATGTCTGATGATTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAA
GAAGAACAAGAAGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATA
CAGAGTGATGGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGAT
GATGAT***GGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTG
GAAGTATTTGATGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTG
ATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTG
GGGATGAATGATTATTATCTATGTAAATGTGATTTATTATTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4FR04JQ 718 0 0
TCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCGG
GCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGTGG
CCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAA
AGGCTCTTTTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTTGC
TTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTGAAGTTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTTGA
TCTTATGTCTGATGGTTATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAAGA
AGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTTAATATACAGAGTGATGG
TGATGGCGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGG
AAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATTTGA
TGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCC
CAAATCATTGTATT*CCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAATGA
TTATTATCTATGTAAATGTGATTTATTATTTAAAATCAAAAACTATGATTTGTAATT
G

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4BJ50JQ 799 0 0
AAGCAACACGGTATGGTTAGAACTTACAGGACCCTGCCTCCGTCTCTGAATCCAAGACCG
CAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCGGGCTATTCACCAAAGTG
TCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGGAAATGTGGCCAGGCAAGGTGCCTT
GAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAAAGGCTCTTCTAAGGTG
AGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTTGCTTCTGGTGGGTCAAGA
CCCGGTTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTTGATCTTATGTCTGATGAT
TATGGTTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAACAAGAAGAGGAAGAAGAATAC
ACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGATGGTGATGGTGAAAAGGAA
GAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGGAAGGATGAGTTTTTGT
GATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATTTGATGAAGGATGGTGTTTG
GTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTC
CTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAATGATTATTATCTATGTAAA
TGTGATTTATTATTTAAAATCAAAAACTATGATTTGTAATTATAATAACTTCTGCAAAGT
TGAAACATTTACTCTTAAC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 2 9

CO CL522Contig1 763 5 30 U
GGGAGAGTATTTTGTCACACAGAAAAAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAA
GCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGAAAATACTC
CCGTTCTCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGT
TTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTT
TTATCCCGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAA
GCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGG
AAAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGGCCATT
CAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCAC
CAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGT
TGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAA
GAAAGAGATC**CCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATC
AAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCT
CAAGGATGAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 5 15 15 30 30 30 30 10 25 10 25 25 
25 25 10 5 5 20 5 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 5 5 20 5 5 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF77TF U 7
AF RR4D569TF U 1
AF RR4EC75TF U 1
AF RR4AR19TF U 2
AF RR4FE77TF U 11
BS 1 390 RR4D569TF
BS 391 391 RR4EC75TF
BS 392 585 RR4D569TF
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BS 596 596 RR4EC75TF
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BS 609 610 RR4D569TF
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RD RR4DF77TF 594 0 0
GG
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CAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAG
TTGTGTTTCTCAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCA
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AGAAGACTAAGAAAGGAGAAAGAGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAG
TGAAG

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR4D569TF 631 0 0
GGGAGAGTATTTTGTCACACAGAAAAAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAA
GCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGAAAATACTC
CCGTTCTCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGT
TTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTT
TTATCCCGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAA
GCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGG
AAAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTTGCCTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGGCCATT
CAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCAC
CAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGT
TGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAA
GACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4EC75TF 603 0 0
GGGAGAGT
ATTTTGTCACAGAGAGGAAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGA
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GTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCGG
CGTAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGGCGCAAACCTAAGCCTACCAAGCTCAAAG
CAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAG
TTGTGTTTCTCAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCA
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AGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAA

QA 9 603 9 603
DS 

RD RR4AR19TF 720 0 0
GGAGAGT
ATTTTGTCACACAGAAAAAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGA
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CGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAG
CAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAG
TTGTGTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGGCCATTCAAGATCA
ATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTG
ACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGA
AGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGA
TC**CCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCC*T
TGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTC

QA 8 720 8 720
DS 

RD RR4FE77TF 753 0 0
GGGTCACACAGAAAA
AAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGA
AACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGAAAATACTCCCGTTCTCAAATGTACCACAAGAGA
GGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCC
AAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCCGCGGAAGACGTTAAGAAG
CCGCTCGCCAACAGACGCAGACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGA
ACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAA
CTTGCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGGCCATTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGA
CGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGC
ATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGA
GAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATC**CCACAGGAGAAGA
AAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCGGCTTTGATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGC
TCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGATGAACCCCATGAGCTTGTT
TTCTAGATTTCATCTTAT

QA 16 753 16 753
DS 



CO CL522Contig2 625 4 14 U
CATAGAAAATAGTCTTTTTTAAATTTTTAAAAAGGGCAAAATCTCAGGGGAAAACAAATG
TTGTTGAACAGTGAGGATGGGATACAAAAAGATAAGATGAAATCTAGAAAACAAGCTCAT
GGGGTTTCATTCCTTGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCA
CTGCTTCAATGGCTTTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCT
GTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTCTCAGCTTCAAAGAACTCTCCTTCTCCTTTCTTAG
TCTTCTTCTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTTGTCATCAAACTTCTCGATGCTGACTCCAG
AAATGTCAACCTTGGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAA
CACCATTGATCTTGAATGGCCCTGTAACCAAAAGCAAACCAGAAGAAAGTTGCTTAAGAA
ACACAACTCTCTTTCCCTTGAATCGACCAGCAAGGATGATCAACACAGTTCCTGGAGTAA
TGCTTGCTTTGAGCTTGGTAGGCTTAAGTTTGCGCCTGTTAGCGAGCGGCTTCTTAACGT
CTTACGCCGGATAAAACTTAACCGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF77JQ U 4
AF RR4DQ53JQ U 29
AF RR4FE77JQ U 1
AF RR4EC75JQ U 47
BS 1 20 RR4FE77JQ
BS 21 21 RR4DF77JQ
BS 22 74 RR4FE77JQ
BS 75 75 RR4DF77JQ
BS 76 106 RR4FE77JQ
BS 107 107 RR4DF77JQ
BS 108 205 RR4FE77JQ
BS 206 206 RR4DF77JQ
BS 207 337 RR4FE77JQ
BS 338 338 RR4DF77JQ
BS 339 465 RR4FE77JQ
BS 466 466 RR4EC75JQ
BS 467 510 RR4FE77JQ
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RD RR4DF77JQ 456 0 0
AA
AAAATAGTCTTTTTTAA**TTTTAAAAAGGACAAAATCTCAGGGGAAAACAAATGTTGTT
GAACAGTGAGGATGGGATACAAAAAGATAAGATGAAATCTAGAAAACAAGCTCATGGGGT
TTCATTCCTTGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCCGGCACTGCT
TCAATGGCTTTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCTGTGGG
ATCTCTTTCTTCACCTCTTTGTCAGCTTCAAAGAACTCTCCTTCTCCTTTCTTAGTCTTC
TTCTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTTGTCATCAAACTTCTCGATGCTGACTCCAGAAATG
TCAACCTTGGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCA
TTGATCTTGAATGGTCCTGTAACCAAAAGCAAAC

QA 3 456 3 456
DS 

RD RR4DQ53JQ 432 0 0
AAAAAGGGCAAAATCTCAGGGGAAAACAAATGTTGTTGAACAGTGATGATGGGATACAAA
AAGATAAGATGAAATCTAGAAAACAAGCTCATGGGGTTTCATTCCTTGAGACAATGAGAA
CCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCTTTGATCAAAGCTGC
GTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTCTC
AGCTTCAAAGAACTCTCCTTCTCCTTTCTTAATCTTCTTCTCAGCAACCTTTCCGAAATA
CTTGTCATCGAACTTCTCGATGCTGACTCCAGAAATGTCAACCTTGGTGGAGGTTCCAAT
CACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGAATGGCCCTGTAAC
CAAAAGCCAACC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4FE77JQ 510 0 0
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TTGTTGAACAGTGATGATGGGATACAAAAAGATAAGATGAAATCTAAAAAACAAGCTCAT
GGGGTTTCATTCCTTGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCA
CTGCTTCAATGGCTTTGATCAAAGCCGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCT
GTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTCTCAGCTTCAAAGAACTCTCCTTCTCCTTTCTTAG
TCTTCTTCTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCGATGCTGACTCCAG
AAATGTCAACCTTGGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAA
CACCATTGATCTTGAATGGCCCTGTAACCAAAAGCAAACCAGAAGCAAGTTGCTTAAGAA
ACACAACTCTCTTTCCCTTGAATCGACCAG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4EC75JQ 579 0 0
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GAAAACAAGCTCATGGGGTTT**TTCCTTGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGT
CTTGAGCTCTGGCGCTGCTTCAATGGCTTTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTC
TTCTTTCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTGTCAGCTTCAAAGAACTCTCC
TTCTCCTTTCTTAGTCTTCTTCTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTTGTCATCAAACTTCTC
GATGCTGACTCCAGAAATGTCAACCTTGGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAAC
ACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGAATGGTCCTGTAACCAAAAGCAAACCAGAAGA
AAGTTGCTTGAGAAACACAACTCTCTTTCCCTTGAATCGACCAGCAAGGATGATCAACAC
AGTTCCTGGAGTAATGCTTGCTTTGAGCTTGGTAGGCTTAAGTTTGCGCCTGTTAGCGAG
CGGCTTCTTAACGTCTTACGCCGGATAAAACTTAACCGG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 2 10

CO CL523Contig1 791 2 8 U
GGACTCTTTAACACTTCCCTGCAGACCATTACTCAATAATCATCGTCTCTTGGTGACAGA
AGAGAAAAAGTTTAAGCAAAAAAAATGGCAGCACAAGCGCTTGTGTCTTCTTCACTTACC
TCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCACAG
AGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAA
TTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTT
GGATTTGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACTGGAGGGTTCATAGAGCCGAGA
TGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGGTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCT
ATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGG
TTCCAGACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACA
CTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTGG
TACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGT
TCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCACCCTCTAGGGTTTGGAAAGACGA
GAAGTCGATGAAGAGTTGAAACTCAAGAGTCAAGAACGGTAGACTGGCATGCTCGCATCC
TTGGCTATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV71TF U 1
AF RR4CA54TF U 72
BS 1 350 RR4BV71TF
BS 351 351 RR4CA54TF
BS 352 389 RR4BV71TF
BS 390 390 RR4CA54TF
BS 391 395 RR4BV71TF
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BS 397 649 RR4BV71TF
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RD RR4BV71TF 651 0 0
GGACTCTTTAACACTTCCCTGCAGACCATTACTCAATAATCATCGTCTCTTGGTGACAGA
AGAGAAAAAGTTTAAGCAAAAAAAATGGCAGCACAAGCGCTTGTGTCTTCTTCACTTACC
TCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCACAG
AGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAA
TTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTT
GGATTTGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACTGGAGGGTTCATCGAGCCGAGA
TGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGGCGGTTTGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCT
ATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGG
TTCCAGACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACA
CTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTGG
TACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAG
TT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4CA54TF 720 0 0
GG
AAGCAAAAAAAATGGCAGCACAAGCGCTTGT*TCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGA
CAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGGAAGTTGGTTG
TTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCAT
CATCACAGAGTCTTTCTTACTTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTTGACCCGC
TTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACTGGAGGGTTCATAGAGCCGAGATGGCTAGCCTACG
GAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGA
TTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAGACCGGTG
TGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCG
AGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGAT
CTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAGGTAACCCGG
CTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCACCCTCTAGGGTTTGGAAAGACGAGAAGTCGATGAAG
AGTTGAAACTCAAGAGTCAAGAACGGTAGACTGGCATGCTCGCATCCTTGGCTATTTA

QA 3 720 3 720
DS 



CO CL523Contig2 781 8 13 U
GACTTTGGATTTGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACTGGAGGGTTCATAGAG
CCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCT
GGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTT
CCCTGGTTCCAGACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCT
TACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAG
GACTGGTACAACCC*AGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTT
CGCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTCTAGGGTTTGG
AAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGC
AATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCA
GAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTT
CCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATT
CTCTTGTATCCCTACAATCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCACCAGCTTCTTTGTGTTGT
AACACCAAGTGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGGCTAAAAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS89TF U 36
AF RR4BB47JQ C 188
AF RR4DZ45TF U 538
AF RR4FH54JQ C 255
AF RR4CA54JQ C 55
AF RR4FH54TF U 255
AF RR4BB47TF U 89
AF RR4GS89JQ C 1
BS 1 35 RR4GS89JQ
BS 36 191 RR4GS89TF
BS 192 192 RR4BB47TF
BS 193 288 RR4GS89TF
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BS 290 314 RR4GS89TF
BS 315 315 RR4FH54TF
BS 316 371 RR4GS89TF
BS 372 372 RR4FH54TF
BS 373 395 RR4GS89TF
BS 396 538 RR4FH54TF
BS 539 772 RR4DZ45TF
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CCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGG
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GACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGG
TTTTGCTGAGCACAGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCCAGGATCTATGGGTAAACAAT
ACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAG*TAACCCGGCTTACCCCGGTGGAC
TTTCTTCACCCTCTTGG

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR4BB47JQ 436 0 0
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TCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTGGT
ACAACCC*AGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGT
TCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTCTAGGGTTTGGAAAAGAC
GAGAAGTCGATG**GGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTC
GCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTT
CTTGATCATTTGGCGGTTCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGA
GGTGTTCATATCATAT

QA 1 436 1 436
DS 

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G
CAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTCAAG
TTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCA
TTCTCTTGTATCCCTACAATCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCACCAGCTTCTTTGTGTT
GTAACACCAAGTGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGG
CCAT

QA 2 235 2 235
DS 

RD RR4FH54JQ 520 0 0
G
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AGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAGGTAA
CCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTTTAGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTC
GATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCT
TGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCA
TTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCA
TATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCCCTAC
AATCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCACCAGCTTCTTTGTGTTGTAACACCAAGTGTAAA
CATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGG
AC

QA 2 518 2 518
DS 

RD RR4CA54JQ 726 0 0
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GCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACT
GCTCTTCCCTGGTTCCAGACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCA
GACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGG
TTGCAGGACTGGTACAACCC*AGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAA
AGGTTTCGCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTCTAGG
GTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAG
ACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACC
TTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCT
CAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCT
CCCATTCTCTTGTATCCCTACAATCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCACCAGCTTCTTTG
TGTTGTAACACCAAGTGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGG
CCATAATG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4FH54TF 520 0 0
G
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AGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAGGTAA
CCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTCTAGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTC
GATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCT
TGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCA
TTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCA
TATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCCCTAC
AATCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCACCAGCTTCTTTGTGTTGTAACACCAAGTGTAAA
CATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGG
AC

QA 2 518 2 518
DS 

RD RR4BB47TF 671 0 0
G
CAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAA
GGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAGACCGGTGTGATTCCACC
TGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTT
GATGGGTTTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCC*AGGATCTATGGGTA
AACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCG
GTGGACCTTTCTTCAACCCTCTAGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATG**GGAGTTGA
AACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCC
AGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCG
TCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATC
ATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCCCTACAATCTTGCTTCTTT
CTCTTTGGTACCACCAGCTTCTTTGTGTTGTAACACCAAGTGTAAACATATTCGTCTTTT
GTAAGAA
GTG

QA 2 668 2 668
DS 

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CCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCT
GGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTT
CCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCT
TACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACAGGAGGTTGCAG
GACTGGTACAACCC*AGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTT
CGCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTCTTGGGTTTGG
AAAAGACGAGAAGCCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGC
AATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCA
GAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCACAAGTT
CCACTGAGGTGATCATATCATATCATACCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATT
CTCTTGTATCC*TACAGTCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCATCAGTTTCTTTGTGTTGT
AACACCATGTGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGGCTAAAAAA
A

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 10

CO CL524Contig1 721 10 7 U
GGAAAGATAGAAAGCACAAAAGCCATTAAGAGCTCTCTTTCTTTACCGTTTTCTCACATT
ACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAACGC
TCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATCTCCAG
ATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACA
CGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGT
TGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGC
AGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGA
GGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGG
TTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAA
GGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACA
CAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTA
TCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTTATTTTCGGTCA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 

AF RR4EJ90TF U 54
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AF RR4E545TF U 52
AF RR4EJ90JQ C 54
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AF RR4FZ88TF U 457
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AF RR4GE65JQ C 57
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BS 673 675 RR4E545TF
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RD RR4EJ90TF 530 0 0
GG
ACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCA
AACGCTCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATC
TCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAGCTCACATGAGTGGGTC
AAACACGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGA
GAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTT
GGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTC
ATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAA
GAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGT
CCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAG

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR4F068TF 672 0 0
GGAAAGATAGAAAGCACAAAAGCCATTAAGAGCTCTCTTTCTTTACCGTTTTCTCACATT
ACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAACGC
TCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATCTCCAG
ATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACA
CGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGT
TGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGC
AGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGA
GGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGG
TTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAA
GGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACA
CAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTA
TCTCAGCTTGTA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4E545TF 656 0 0
TCTC
ACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCA
AACGCTCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATC
TCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTCGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTC
AAACACGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGA
GAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAA*CTTT
GGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTC
ATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAA
GAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTCGATGGGT
CCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAG
CAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTAC
ATCTATCTCAGCTTGTATCACGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGAT

QA 5 656 5 656
DS 

RD RR4EJ90JQ 666 0 0
GG
ACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCA
AACGCTCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATC
TCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAGCTCACATGAGTGGGTC
AAACACGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGA
GAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTT
GGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTC
ATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAA
GAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGT
CCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAG
CAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTAC
ATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTTATTTTC
GGTC

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4AG75TF 190 0 0
GGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCA
CTAGAGGAATTCAGAGCAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTT
GTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGA
AATTTGATTT

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4FZ88JQ 253 0 0
G
AACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAG
TTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTTTGGGAAGATGAAGACGCTGCT
CACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCAC
TTGTCAATGTTTCTTTACATCTATTTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGA
GAAATTTGATTT

QA 2 253 2 253
DS 

RD RR4FZ88TF 253 0 0
G
AACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAG
TTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCT
CACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCAC
TTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGA
GAAATTTGATTT

QA 2 253 2 253
DS 

RD RR4F068JQ 575 0 0
TCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCA
GTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACACGAAGGCTCAGTG
GCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAG
CTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTA
AAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAG
CTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAG
GTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAG
TTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAAGAAAGATCAT
GCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTAT
CAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGA
GC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4GE65TF 616 0 0
G
ATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAA
CGCTCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATCTC
CAGATGCTCCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAA
ACACGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGA
AGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGG
AGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCAT
TGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGA
AGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCC
AAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCA
ACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACAT
CTATCTCAGCTTGTA

QA 2 616 2 616
DS 

RD RR4GE65JQ 665 0 0
G
ATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAA
CGCTCTCAAGCTCTCATCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCTGCTTTCTCCATCTC
CAGATGCTCCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAA
ACACGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGA
AGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGG
AGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCAT
TGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGA
AGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCC
AAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCA
ACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGTCTGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACAT
CTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTTATTTTCGG
TCAT

QA 2 665 2 665
DS 



AS 1 9

CO CL525Contig1 816 9 4 U
GAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCCTGCTCCTAACTTCATATTTT
TCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGAT
CCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAG
AAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAA
CAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCT
TTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGC
GACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTT*CTCCATCTACGAG
GAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTT*GAAAATCTTTTATAATAG
AGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAA
GACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCG
GAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAAC
TATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTT
GTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGACAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTA
TACTAGTGTTTGCTTATCTCAAGGATTGCGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G795TF U 1
AF RR4ES89TF U 57
AF RR4G147TF U 57
AF RR4AU51JQ C 59
AF RR4AU51TF U 59
AF RR4G795JQ C 93
AF RR4GM59TF U 57
AF RR4ES89JQ C 95
AF RR4GM59JQ C 96
BS 1 669 RR4G795TF
BS 670 715 RR4ES89TF
BS 716 795 RR4GM59TF
BS 796 816 RR4GM59JQ

RD RR4G795TF 669 0 0
GAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCCTGCTCCTAACTTCATATTTT
TCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGAT
CCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAG
AAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAA
CAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCT
TTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGC
GACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTT*CTCCATCTACGAG
GAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTT*GAAAATCTTTTATAATAG
AGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAA
GACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCG
GAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAAC
TATGTTTTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4ES89TF 659 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGTAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTT*CTCCATCTA
CGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCA*CTGCTGCGTTAAAGCTT*GAAAAT*TTTTATA
ATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAA
TGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTC
TGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTC
TAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4G147TF 641 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATGTGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTT*CTCCATCTA
CGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTT*GAAAATCTTTTATA
ATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAA
TGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTC
TGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTC
TAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4AU51JQ 646 0 0
CAAGAAAACAAGATACA
ACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATCCAGAGGAGAACAAG
AACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATT
CCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGAT
CCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCT
ACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCACAGCGACAACAACAGAACC
AACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTT*CTCCATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAG
CTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTT*GAATATCTTTTATAATAGAGACGATGAGGAATC
TCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACAGAAATGAAATG
AGAAATGG*TAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCCGCGGAAGCAGTAAAGTTT
TAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTTTTGGTATT
AGTTTGAAGTGTAGTTTTAA
GTCTCGCAT

QA 18 637 18 637
DS 

RD RR4AU51TF 646 0 0
CAAGAAAACAAGATACA
ACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATCCAGAGGAGAACAAG
AACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATT
CCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGAT
CCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCT
ACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCACAGCGACAACAACAGAACC
AACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTTCTCCATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAG
CTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTTGAATATCTTTTATAATAGAGACGATGAGGAATC
TCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACAGAAATGAAATG
AGAAATGGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCCGCGGAAGCAGTAAAGTTT
TAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTTTTGGTATT
AGTTTGAAGTGTAGTTTTAA
GTCTCGCAT

QA 18 637 18 637
DS 

RD RR4G795JQ 671 0 0
TCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATC
AGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGA
TTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCT
TGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATAC
TAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCA
CCACCAGCCACTTT*CTCCATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCG
TTAAAGCTT*GAAAATCTTTTATAATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTC
AGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGT
GACACCATTACACTTATATTTTTTTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGC
TGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTT
TAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATA
AGTTTTCAGT
G

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4GM59TF 743 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCA*CCACTTT*CTCCATCTA
CGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTT*GAAAATCTTTTATA
ATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAA
TGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTC
TGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTC
TAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTA
TTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGACAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAG
AGTATACTAGTGTTTGCTT
ATCT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4ES89JQ 701 0 0
ACTACAGCTTTGATCATATGGATGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAG
TACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGTAACCATTCCTGACTACTCAATGGATT
TCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTG
GCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTA
AGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACC
ACCAGCCACTTT*CTCCATTTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCA*CTGCTGCGTT
AAAGCTT*GAAAAT*TTTTATAATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAG
ATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGA
CACCATTACACTTATATTTTTTTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTG
TTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTA
ACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAG
TTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTATACTAGTGTTTGCTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4GM59JQ 721 0 0
CTACAGCTTTGATCATATGGATGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGT
ACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTT
CACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGG
CAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAA
GCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCA
CCA*CCACTTT*CTCCATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTA
AAGCTT*GAAAATCTTTTATAATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAAATGTTCTTCAGA
TGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGG*TAGAGTGTGAC
ACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGT
TTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAA
CTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGACAAGT
TTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTATACTAGTGTTTGCTTATCTCAAGGATTGCGTTTGC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 9

CO CL526Contig1 661 9 19 U
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGACGTAAGCAATCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGACTTTTG
TATCTGTTTTTGATAGTTTTAATGTTTACTGAAAACTAGTCAAAACTCTTCTTTATGTGC
C


BQ
35 35 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 40 10 10 10 10 40 10 10 40 40 10 10 30 0 0 30 0 0 0 0 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4C429JQ C 1
AF RR4DK66TF U 1
AF RR4C429TF U 1
AF RR4FU31JQ C 119
AF RR4F857JQ C -6
AF RR4FU31TF U -6
AF RR4F857TF U -6
AF RR4EC36JQ C 1
AF RR4EC36TF U 1
BS 1 49 RR4DK66TF
BS 50 50 RR4C429TF
BS 51 54 RR4DK66TF
BS 55 55 RR4C429TF
BS 56 423 RR4DK66TF
BS 424 424 RR4C429TF
BS 425 445 RR4DK66TF
BS 446 446 RR4C429TF
BS 447 452 RR4DK66TF
BS 453 453 RR4C429TF
BS 454 610 RR4DK66TF
BS 611 624 RR4C429TF
BS 625 636 RR4FU31TF
BS 637 637 RR4F857TF
BS 638 639 RR4EC36TF
BS 640 641 RR4F857TF
BS 642 644 RR4EC36TF
BS 645 645 RR4F857TF
BS 646 661 RR4EC36TF

RD RR4C429JQ 625 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGA*GTAAGCAATCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATTTCAGCATTTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTTTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCTTGGCTTAAGGAAATCA
TAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCATGTTCTATAACAATGGACTTTTG
TATCTGTTTTTGATAGTTTTAATG
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4DK66TF 610 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGACGTCAGCATTCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATCCTTGTTGAGAGCAGAATCCACTGCCTTGTTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGACTTTTG
TATCTGTTTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4C429TF 625 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGA*GTAAGCAATCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTTCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCTTGGCTTAAGGAAATCA
TAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCATGTTCTATAACAATGGACTTTTG
TATCTGTTTTTGATAGTTTTAATG
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4FU31JQ 520 0 0
GCTTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGAT
GAGTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTT
CGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATC
TTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAA
GCAGTAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGA
TTGATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAG
CTCCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAAT
CATAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGACTTT
TGTATCTGTTTTTGATAGTTTTAGTGTTTACTGAAAAC
CC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4F857JQ 653 0 0
GGACTCTTT
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TCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGCTT
TGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGAGT
CCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTG
ACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGA
AAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGCAG
TAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATTGA
TTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCTCC
CTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCGCCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCATA
ATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGACTTTTGTA
TCTGTTTTTGATAGTTTTAGTGTTTACTGAAAACTCTTCTTTA
G

QA 10 652 10 652
DS 

RD RR4FU31TF 645 0 0
GGACTCTTTAGCC
CAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGACGTCAGCATTCTCCGTTCAC
AGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCC
ATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGAGTCCAT
CTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTC
TCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGAAAGC
TCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGCAGTAGC
TATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATTGATTCT
TGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCTCCCTCC
TGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCATAATGC
TGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGACTTTTGTATCTG
TTTTTGATAGTTTTAGTGTTTACTGAAAAC
CC

QA 14 643 14 643
DS 

RD RR4F857TF 653 0 0
GGACTCTTT
AGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGACGTCAGCATTCTCCGT
TCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGCTT
TGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGAGT
CCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTG
ACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGA
AAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGCAG
TAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATTGA
TTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCTCC
CTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCGCCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCATA
ATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGACTTTTGTA
TCTGTTTTTGATAGTTTTAGTGTTTACTGAAAACTCTTCTTTA
G

QA 10 652 10 652
DS 

RD RR4EC36JQ 661 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGA*GTAAGCAATCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCATGTTCTATAACAATGGACTTTTG
TATCTGTTTTTGATAGTTTTAATGTGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTCTTTATGTGC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4EC36TF 661 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCACAGA*GTAAGCAATCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAATGCTGGTCAAGCATTTCATTTGCATTGCAACTCATGTTCTATAACAATGGACTTTTG
TATCTGTTTTTGATAGTTTTAATGTGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTCTTTATGTGC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 8

CO CL527Contig1 887 8 13 U
GCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCATTCTCTATTCGTTTCTCCTTGGAGGATCAGA
TCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGGAGAGAGAGAG
AGAGACTTTGAATTGAAGGATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTTG
CGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTC
TTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGA
AGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCAC
CAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAG
AACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAG
TAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTG
CTTCAAGTGCTCACATGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGG
GATTCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGTTACAACCA
CTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCTGGTACACC
TGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAAAACTCAAATAATCCTCTCTCTATTCTCTAGT
CTAAATTGAAAACTCGATGCCAAACTGATTCAGTTTGTTTTCTCATTTTGTGTCTTTGTG
TATGAGTGTGTAATACTGTAATCTATCCTTTGATGTTCTTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 15 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 0 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4FU87TF U 1
AF RR4C460JQ C 410
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AF RR4BT56JQ C 183
AF RR4C460TF U 18
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AF RR4BT56TF U 219
AF RR4BT74TF U 167
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BS 861 885 RR4BT56TF
BS 886 887 RR4CX27JQ

RD RR4FU87TF 637 0 0
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TCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGGAGAGAGAGAG
AGAGACTTTGAATTGAAGGATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTTG
CGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTC
TTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGA
AGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCAC
CAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAG
AACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAG
TAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTG
CTTCAAGTGCTCACATGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACACAGCTCTTGA*GG
GATTCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTC

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DS 

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GCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATAT
CACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACATGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAATTACGCA
GTTCTTGAAGGGATTTTTTACTGCAAGCACCATTTCGTTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGA
AGTTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAAC

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DS 

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AGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAGGCCTCATTAT
GAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCG
GCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGAACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTT
TCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTA
ACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACATGGAGGCTGCCCT
ATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATTTTTTACTGCAAGCACCATTTCGTT
CAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGTTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGT
TTTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAA
AAA
A

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DS 

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G
GAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTG
CTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGAAGG
TGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGTAGTTTGGTAGCTTCACCAA
GAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGAAC
CCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTTTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAA
AACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTT
CAAGTGCTCACATGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGAT
TTTTTACTGCAAGCACCATTTCGTTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGTTACAACCACTT
GATCAAATTTGCTTCCATCAAACGCTTTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCTGGTACACCTGC
AGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAAAA

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DS 

RD RR4C460TF 765 0 0
GG
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CAAGGAGAGGAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGGATAGAGAGAGAGAGACTTTGAATTGAAGG
ATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACTGTGTACCCT
GTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCAC
TGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAGG
CCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCT
GTTAAACCGGCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGAACCCCTAGCCGAGTTGCT
GGTATGTTCTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATC
GAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACATGGA
GGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATTCTCTACTGCAAGCAC
CATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGTTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCC
ATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAA
TCTTAAAAAAAACTCAAATAATCCTCTCTCTATTCTCTAGTCT

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DS 

RD RR4CX27JQ 795 0 0
GAGAGAGAGAA
GGTGAGGAGAG*GAGAGAGAGACTTTGAATTGAAGGATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAG
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GTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGT
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GAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCGGCTGAGAAATCA
AGTCCTGAGCTGACAAGAACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAG
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GTCGCTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAAA*CTCAAATAATCC
TCTCTCC**TCCCTAGTCTAAATTGAAAACTCAATGCCAAACTGATTCAGTTTGTTTTCT
C*TTTTATGCCTTTGTGTATGAGTGTGTAATACTGTAATCTATCCTTTGATGTTCTTTGC
TTCC

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DS 

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TGAGTAGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCT
TCAAGTAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCGGCTGAGA
AATCAAGTCCTGAGCTGACAAGAACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACAC
AAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGA
GCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACATGGAGGCTGCCCTATCTCACCAT
CAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATTCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCA
AGGAAAAGGGAAGTTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAG
CCGCAGTCGCTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAAAACTCAAAT
AATCCTCTCTCTATTCTCTAGTCTAAATTGAAAACTCGATGCCAAACTGATTCAGTTTGT
TTTCTCATTTTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTGTAT**CT***ATCTATCCTTTGATGTTC
TTTGCTT

QA 1 667 1 667
DS 

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G
AATGCAAGGCTTGCGAGAAGACGGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTA
GCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGAT
ATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGT
CTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCGGCTGAGAAATCAAGTC
CTGAGCTGACAAGAACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAAT
GCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACAT
ATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACG
CAGCTCTTGAAGGGATTCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGG
GAAGCTACAACCACTTAATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCTGCCGCAGTCG
CTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAAAACTCAAATAATCCTCTC
TCTATTCTCTAGTCTAAATTGAAAACTCGATGCCAAACTGATTCAGTTTGTTTTCTCATT
TTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTGTAAT
CTATCTATCCTTTG

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DS 



AS 1 10

CO CL528Contig1 919 10 17 U
GGAAAAACAAATCTCTTCTAACAATTATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAA
GCAGTGACTTCGATGGCTGGTTTACGTGGTGCATCTCAGGCTGTTCTTGAAGGAAGTTTC
CAGAACAATGGCTCAAACCGTTTGAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACC
GGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTACCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTG
ATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCGTTCGCCACC
GAAGCTCTTGCTATCAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACA
GATAACTCAGACCAGGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGATTTTACTTACAG
CCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCCGCTAAAGAGATCATTAAC
GTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAGAACGATCTCCGTTTAAGA
GCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAA
CAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCG
GCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTG
AACAATGTTCTTGCCAAGATTGGTTAAGGAAGAAAGATCTGCTCTTTAATGTATTGTTGT
TGGTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTTCTGTCTGATCAAATCGGT
TATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTCGCCAAGTAAAAATAGTCATAGAATCACTTCTGG
TCTGTTTTGCTTTACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EE87TF U 7
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BS 805 842 RR4B837TF
BS 843 919 RR4A709JQ

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GG
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AAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTA

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CAGAACAATGGCTCAAACCGTTTGAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACC
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GCGAGGTCAAAGAACAGCCCGGATGCTGAGAAGTAT*ACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTG
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GG
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CCTCCTCTT

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GG
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TATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTT
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GTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATTGGTTAAGGAAG
AAAGATCTGCTCTTTAATGTATTGTTGTTGGTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCT
CCTCCTCTTTCT

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AGTACCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTCGCGACTGGTTTAGTCGGGGG
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AAAGATCTGCTCTTTAATGTATTGTTGTTGGTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCT
CCTCCTCTTTCTGTCTGATCAAATCGGTTA

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AGTTTCAAGTTTTCGCC

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DS 

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CGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTACCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGT
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DS 

RD RR4A709JQ 889 0 0
GG
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AGTACCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAGTCGGTGG
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ACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAGGCAAGAGACTTTTCACT
GAAACTGAAAGACAGATTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGC
CAAAGAATCCGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCC
TTACGTCCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGT
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CCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAA
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AAAGATCTGCTCTTTAATGTATTGTTGTTGGTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCT
CCTCCTCTTTCTGTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTCGCCAA
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DS 

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TCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCA
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AGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTC
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ATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTTCTGTCTGATCAAATCGGTTATATTTAAT
TTCAGTTTCAAGTTTTCGCCAAGTAAAAATAGTCATAGAATCACTTCTGGTCTGTTTTGC
TTTACAACT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 10

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TACTCAGTACCCGAACCATTGAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTTTCAAGTGTTTTATCAC
AATGGATTTTTGAGATAACCCTCTCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTC
TTAGTATCGCCTCCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAG
GTGGACCCTTTGCCCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGA
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AGCCACGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGAT
AGAGATACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTG
GCCTGTATGTCCAGAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTT
CATAAGATATGCCGCAGTAGCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCAT
CTAGAGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCA
CAACATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAAT
CGTGAATGACTTTTGTGATGTAGGTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCA
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CATCGTAGCGACTCACTCACCTGTCTTTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4BH51JQ U 1
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AF RR4C402JQ U 14
AF RR4BI30JQ U 1
AF RR4BI30TF C 379
AF RR4B872TF C 386
AF RR4C402TF C 411
AF RR4BH51TF C 413
AF RR4FD84TF C 484
BS 1 264 RR4BH51JQ
BS 265 265 RR4BI30JQ
BS 266 457 RR4BH51JQ
BS 458 467 RR4BI30JQ
BS 468 468 RR4BI30TF
BS 469 582 RR4BI30JQ
BS 583 583 RR4B872JQ
BS 584 878 RR4BI30JQ
BS 879 879 RR4BI30TF
BS 880 940 RR4BI30JQ
BS 941 981 RR4BI30TF
BS 982 982 RR4B872TF
BS 983 1102 RR4BI30TF
BS 1103 1103 RR4B872TF
BS 1104 1206 RR4BI30TF
BS 1207 1231 RR4B872TF

RD RR4BH51JQ 457 0 0
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TACTCAGTACCCGAACCATTGAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTTTCAAGTGTTTTATCAC
AATGGATTTTTGAGATAACCCTCTCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTC
TTAGTATCGCCTCCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAG
GTGGACCCTTTGCCCCTCCAATTAAAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGA
TTGATGCTCCTTTCCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTG
ACAAGATTTCTTCTTCGGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGA
CAGTTGGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCATGCA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4GB42JQ 319 0 0
ATCCCCCC
CCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCCCTTAGTATCCCCCCCCCCTTACCCCCCTCCTTCA
CGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAGGGGGACCCTTTGCCCCTCCAATTAAAATTTCAG
CATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGATTGATGCTCCTTTCCTTCCAATCACACGTCCCA
TCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTGACAATATTTCTTCTTCAGGACATTGATCTCCGA
TCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGACAGTTGGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCA
TGCAGCA
AAAA

QA 9 315 9 315
DS 

RD RR4B872JQ 577 0 0
TTATCACAATGGATTTT*GAGAAGACCCTCTCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATC
CTTCCTCTTAGTATCGCCCCCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATC
TTGTCAGGTGGACCCTTTGCCCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATG
GCAAGGATTGATGCTCCTTTCCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCA
AGCACTGACAATATTTCTTCTTCAGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGC
GGCGGGACAGTTGGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAGAAACACCTACAG
TACAAAGAGCCACGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATT
TTGTGATAGAGATACGGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCA
GTCATTGGCCTGTATGTCCAGAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCT
TTCTCTTCATAAGATATGCCGCAGTAGCGTGGATCAG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4C402JQ 818 0 0
CCAGTAATAGATGTAACTTTTATTGGAGAAGGGATTCTCTCAGGTCGTACTCAGTACCCG
AACCATTGAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTATCAAGTGTTTTATCACAATGGATTTTTGA
GATAACCCTCTCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTCTTAGTATCGCCTC
CGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAGGTGGACCCTTTGC
CCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGATTGATGCTCCTTT
CCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTGACAAGATTTCTTC
TTCGGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGACAGTTGGCCAATT
AGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAAAGACACCTACAGTACAAAGAGCCACGAACTGC
CAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGAGATACAGAAG
GAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTGGCCTGTATGTCCA
GAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCATAAGATATGCC
GCAGTAGCATGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTAGAGGTCTCCT
CCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAACATTGTGCAA
CCTTATCC*AAACTGAAAGTACA*GGCCTCACTGTCAC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4BI30JQ 940 0 0
GTAAGGATAGTTTCCAGTAATAGATGTAACTTTTATTGGAGAAGGGATTCTCTCAGGTCG
TACTCAGTACCCGAACCATTGAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTTTCAAGTGTTTTATCAC
AATGGATTTTTGAGATAACCCTCTCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTC
TTAGTATCGCCTCCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAG
GTGGACCCTTTGCCCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGA
TTGATGCTCCTTTCCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTG
ACAAGATTTCTTCTTCGGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGA
CAGTTGGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAGAGACACCTACAGTACAAAG
AGCCACGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGAT
AGAGATACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGACCATGAGCTCAGTCATTG
GCCTGTATGTCCAGAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTT
CATAAGATATGCCGCAGTAGCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCAT
CTAGAGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCA
CAACATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAAT
CGTGAATGACTTTTGTGATGTAGGTAGACTCGAGTGCACGCTTACATGCTCTCATAAGCA
CCTCTCCACCTTGGATGACATCAACCAGGTATATTGCATT

QA 1 940 1 940
DS 

RD RR4BI30TF 830 0 0
GGACA
TGATCTCCGATCTTCAAGT*ATCTGGAAGCGGCGGGACAGTTGGCCAATTAGCAAAATCA
GTATCATTCATGCAGCAGAGACAC*TACAGTACAAAGAGCCACGAACTGCCAGGTGCCAT
AATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGAGATACAGAAGGAAGCGGACA
TCATCTGCGGCTGCACGGACCATGAGCTCAGTCATTGGCCTGTATGTCCAGAACTTTGGG
TCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCATAAGATATGCCGCAGTAGCGT
GGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTAGAGGTCTCCTCCTGCCTTCT
TGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAACATTGTGCAACCTTATCCCA
AACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAATCGTGAATGACTTTTGTGATGTAG
GTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCACCTCTCCACCTTGGATGACATCA
ACCAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAATCTGCATGATACAAAGCTTGCCATGTCGGCGG
AGGTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAACGACCAGCTTGTTTTCAGGAGAAGGGTTTAAG
AAATCAGCGGGAAGCTGCAATGGCTCTGTCACTATGTGAATAGGAACAGGTGGCTCATTG
GCATCTTGCGTCAGTGACCTTCCTCCTGGCTCAGGAGGGATCGGGACGTGAGTACGCTGA
GTTGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCACAGCAGCAGCATCGT
CC

QA 6 828 6 828
DS 

RD RR4B872TF 846 0 0
ATCTCCGATCTTCAAGT*ATCTGGAAGCGGCGGGACAGTTGGCCAATTAGCAAAATCAGT
ATCATTCATGCAGCAGAGACAC*TACAGTACAAAGAGCCACGAACTGCCAGGTGCCATAA
TGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGAGATACGGAAGGAAGCGGACATC
ATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTGGCCTGTATGTCCAGAACTTTGGGTC
CTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCATAAGATATGCCGCAGTAGCGTGG
ATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTAGAGGTCTCCTCCTGCCTTCTTG
TTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAACATTGTGCAACCTTATCCCAAA
CTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAATCGTGAATGACTTTGGTGATGTAAGT
AGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCACATCTCCACCTTGGATGACATCAAC
CAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAATCTGCATGATACAAAGCTTGCCATGTCGGCAGAG
GTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAACGACCAGCTTGTTTTCAGGAGAAGGGTTTAAGAA
ATCAGCGGGAAGCTGCAAAGGCTCTGTCACTATGTGAATAGGAACAGGTGGCTCATTAGC
ATCTTGCGTCAATGACCTTCCTCCTGGCTCAGGAGGGATCGGGACGTGAGTACGCTGAGT
TGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCACAGCAGCAGCATCGTAGCGACTCACTCACCTGTC
TTTTCC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4C402TF 801 0 0
GAAGCGGCGGACAG
TGGCCAATTAGCAAA*TCAGTATCATTCATGCAGCAGAGACAC*TACAGTACAAAGAGCC
ACGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGAG
ATACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTGGC*T
GTATGTCCAGAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCATA
AGATATGCCGCAGTAGCATGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTAG
AGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAAC
ATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAATCGTG
AATGACTTTTGTGATGTAGGTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCACCTC
TCCACCTTGGATGACATCAACCAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAATCTGCATGATACA
AAGCTTGCCATGTCGGCAGAGGTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAACGACCAGCTTGTT
TTCAGGAGAAGGGTTTAAGAAATCAGCGGGAAGCTGCAATGGCTCTGTCACTATGTGAAT
AGGAGCAGGTGGCTCATTAGCATCTTGCGTCAGTGACCTTCCTCCTGGCTCAGGAGGGAT
CGGGACGTGAGTACGCTGAGGTGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCACAGCAGCAGCATC
GT
AGCCC

QA 15 796 15 796
DS 

RD RR4BH51TF 796 0 0
CGGCGGGACAGTTGGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAGAGACAC*TACA
GTACAAAGAGCCACGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCAT
TTTGTGATAGAGATACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGACCATGAGCTC
AGTCATTGGCCTGTATGTCCAGAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTC
TTTCTCTTCATAAGATATGCCGCAGTAGCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATAT
GTAGTCATCTAGAGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTG
AGTGTCCACAACATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACG
TTTGCAATCGTGAATGACTTTTGTGATGTAGGTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCT
CATAAGCACCTCTCCACCTTGGATGACATCAACCAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAAT
CTGCATGATACAAAGCTTGCCATGTCGGCGGAGGTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAAC
GACCAGCTTGTTTTCAGGAGAAGGGTTTAAGAAATCAGCGGGAAGCTGCAATGGCTCTGT
CACTATGTGAATAGGAACAGGTGGCTCATTGGCATCTTGCGTCAGTGACCTTCCTCCTGG
CTCAGGAGGGATCGGGACGTGAGTACGCTGAGTTGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCAC
AGCAGCAGCATCGT
CC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4FD84TF 725 0 0
CACGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGA
GATACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCAAGGATCATGAGCTCAGTCATTGGCC
TGTATGTCCAGAACTTTGGGTCCTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCAT
AAGATATGCCGCAGTAGCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTA
GAGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAA
CATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAATCGT
GAATGACTTTTGTGATGTAGGTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCACCT
CTCCACCTTGGATGACATCAACCAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAATCTGCATGATAC
AAAGCTTGCCATGTCGGCAGAGGTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAACGACCAGCTTGT
TTTCAGGAGAAGGGTTTAAGAAATCAGCGGGAAGCTGCAATGGCTCTGTCACTATGTGAA
TAGGAACAGGTGGCTCATTAGCATCTTGCGTCAGTGACCTTCCTCCTGGCTCAGGAGGGA
TCGGGACGTGAGTACGCTGAGTTGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCACAGCAGCAGCAT
CGT
CC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 7

CO CL530Contig1 1472 3 5 U
GCTGTTCTCACTTTTCTTGCTACGGAACGCTGTTCTTTTTTCCCATCCTTCTGATGAAAT
ACTTTTCTGGCCATGTAGGTTATGAGTAGAATCAGAACGCTTGTGACTAAAACCGAAACT
CTAAGAACCGGAGTCACTGCTAGTGATGCAGCTTTGACATTGAAAATCGCTCCAGCAATG
GCCAATGAACATCTACTATCTGCAGAGACCAAAGGTAATCAGAACCCCAGCTCGTAGAAA
CCGGATACCATAAGAGCTATGTGATTCTCACGCTGCCATTTGTTTTGTTTTGATCAGGTC
TGCTGTGTAGAGACATGAGCCCAGACGGGCTTCGATTTTATTTCAACCTGTTTCACGAGT
TCGATTTGACCAATCTCCATTTGTAAGTCAAATAGCACACCATAGATGTTTTTCCCGTTG
TGTTGCTCAGTGAGAAACTAATAAACCTTTGGGCTTGGCAGCGTGAAGGACTTTGGGACA
TACGGTGAATGGGTCAAAGCGACTACTTTGTTGTCCGTATGACAGTATTTGATGTGTACA
CATGCAAACAAAAGGATCAAAACATTGTTTCACTTCAAAATAGTGTGCTTTTTTTGTAAG
TTTTGAATTTGCTATTCTGTATTTATATCCGCCAGACAGAGCTTCAAGCCTGACAATCTA
AAAGATAACTTTGAGAATAACAAATCCCATTTGCACATCCTTCTAAAAACATCAAGTTGA
CTGTCGAATGGTAAATAAGTGAAGAGATTGGGACACAGTTAATCGGCTTCAAGGGCTGCA
ATCTCGTACCTAATGTCTTCCAAATACTCATTGATGCAAGTCACAGCGTCTTGCACTCCT
CTAATAGCTTCCTTTAAAGCGTTGTCGAACTCTGCATCCGCTTCTGCTTCCTCCGTTCCT
GCAGCTTCAGTAATCTCATGAAGATGAACACACTCGTGCTGCATCGGTTTCTTGAACTTG
CAGTTCTCATGTGTGAGCATCCGTTCTGACGGCCTCCCTGCCTTCTTCAGTACCTGTATT
ATGACCGTCAGATGCAGTTTCTGCTTCTCCTGAGTTTGAATGTCGCTGAGCAGTTGAGCA
AGATCCGATCTTCCAACTTCTGGATTCAGAAACAGAGTTTCCATTTCGCGCACTTGTTTG
GAGCATTCGTTGAACTCAGCAGTAATCTCACTGCACAGCTTCTGAAAAAGTGCTTCACCA
CTAGTCTCCACATACTCTGAGAATCCTCTTTTGAGTTTGGCGTAGGCCTGGACTCGACGC
TCCTGAATCTCAAGCAATCTCCGAAGCAAAGCCAGGGTTCGAGAGGCTACCCCCGTGGAG
CTACTAGACCCAACACATTCGATTTCCATTTTCGCGTCGATGGGATCACTGATTGAAACC
TTCTTCTGAAAATCTTCGGCACTCATCTCTCCTAGACTCTCTTTCAACTTCTCAAACACG
ACAGAGAGAAAAGAGAAACCAATCTCAGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F996TF U 1
AF RR4GL38JQ U 555
AF RR4GL38TF C 793
BS 1 708 RR4F996TF
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BS 724 1326 RR4GL38JQ
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RD RR4F996TF 723 0 0
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ACTTTTCTGGCCATGTAGGTTATGAGTAGAATCAGAACGCTTGTGACTAAAACCGAAACT
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GCCAATGAACATCTACTATCTGCAGAGACCAAAGGTAATCAGAACCCCAGCTCGTAGAAA
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TGTTGCTCAGTGAGAAACTAATAAACCTTTGGGCTTGGCAGCGTGAAGGACTTTGGGACA
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AAAGATAACTTTGAGAATAACAAATCCCATTTGCACATCCTTCTAAAA*CATCAAGTTGA
CTG

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DS 

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TTCTGTATTTATATCCGCCAGACAGAGCTTCAAGCCTGACAATCTAAAAGATAACTTTGA
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ATAAGTGAAGAGATTGGGACACAGTTAATCGGCTTCAAGGGCTGCAATCTCGTACCTAAT
GTCTTCCAAATACTCATTGATGCAAGTCACAGCGTCTTGCACTCCTCTAATAGCTTCCTT
TAAAGCGTTGTCGAACTCTGCATCCGCTTCTGCTTCCTCCGTTCCTGCAGCTTCAGTAAT
CTCATGAAGATGAACACACTCGTGCTGCATCGGTTTCTTGAACTTGCAGTTCTCATGTGT
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CAGTTTCTGCTTCTCCTGAGTTTGAATGTCGCTGAGCAGTTGAGCAAGATCCGATCTTCC
AACTTCTGGATTCAGAAACAGAGTTTCCATTTCGCGCACTTGTTTGGAGCATTCGTTGAA
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CTCTGAGAATCCTCTTTTGAGTTTGGCGTAGGCCTGGACTCGACGCTCCTGAATCTCAAG
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GACCCAACACATTCGATT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4GL38TF 680 0 0
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CCAACTTCTGGATTCAGAAACAGAGTTTCCATTTCGCGCACTTGTTTGGAGCATTCGTTG
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TACTCTGAGAATCCTCTTTTGAGTTTGGCGTAGGCCTGGACTCGACGCTCCTGAATCTCA
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ACACATTCGATTTCCATTTTCGCGTCGATGGGATCACTGATTGAAACCTTCTTCTGAAAA
TCTTCGGCACTCATCTCTCCTAGACTCTCTTTCAACTTCTCAAACACGACAGAGAGAAAA
GAGAAACCAATCTCAGTCCT

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL530Contig2 887 4 5 U
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TTGTGTATTTATATCCACCAGACAGAGCTTCATGCCTGACAATCTAAAAGATAACTTTGA
GAATAACAAATCCCATTTGCACATATCCTTGTAAAACATCAAGTTGACTGTCGAATGGTA
AAGAAGCCATGAGATTGAGACACAATTAATCAGCTTCAAGGGCTGCAATCTCGTACCTAA
TGTCTTCCAAATACTCATTGATGCAAGTCACAGCGTCTTGCACTCCTCTAATAGCTTCCT
TTAAAGCGTTGTCAAACTCTGCATCCGCTTCTGCTTCCTCTGTTCCTGCAGCTTCAGTAA
TCTCATGAAGATGCACACAATCGTGCTGCATCGGTTTCTTGAACTTGCAGTTCTCATGTG
TGAGCATCCGTTCTGACGGCCTCCCTGCCTTCTTCAGTACCTGTATTGTGACCGTCAGAT
GCAGTTTCTGCTTCTCTTGAGTTTGAATGTCGCTGAGCAGTTGAGCAAGATCCGATCTTC
CAACTTCTGGATTCAGAAACAGAGTTTCCATTTCGCGCACTTGTTTGGAACATTCGTTGA
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CGCCGCGTTCGATTTCGATTTCGCCCTCACTGATGGAAACCTTCTTCTGAAAATCTTCAG
CACTCATCCTCCTCTCCGATCTTTCAACTTCTCAGACACGACAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS42JQ U 1
AF RR4FS42TF C 100
AF RR4A425JQ U 18
AF RR4A425TF C 225
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RD RR4FS42JQ 688 0 0
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TTAAAGCGTTGTCAAACTCTGCATCCGCTTCTGCTTCCTCTGTTCCTGCAGCTTCAGTAA
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GCAGTTTCTGCTTCTCTTGAGTTTGAATGTCGCTGAGCAGTTGAGCAAGATCCGATCTTC
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ACTCCGAGAATCCTCTTTTGAGTTTGGC

QA 1 688 1 688
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RD RR4FS42TF 713 0 0
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TGAACTTGCAGTTCTCATGTGTGAGCATCCGTTCTGACGGCCTCCCTGCCTTCTTCAGTA
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C

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DS 

RD RR4A425JQ 839 0 0
CTCTTC
AAATAGTGGGCTTTTTTTGTAAGTTTTGAATTTGCTATTGTGTATTTATATCCACCAGAC
AGAGCTTCATGCCTGACAATCTAAAAGATAACTTTGAGAATAACAAATCCCATTTGCACA
TATCCTTGTAAAACATCAAGTTGACTGTCGAATGGTAAAGAAGCCATGAGATTGAGACAC
AATTAATCAGCTTCAAGGCCTGCAATCTCGTACCTAATGTCTTCCAAATACTCATTGATG
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TCCGCTTCTGCTTCCTCTGTTCCTGCAGCTTCAGTAATCTCATGAAGATGCACACACTCG
TGCTGCATCGGTTTCTTGAACTTGCAGTTCTCATGTGTGAGCATCCGTTCTGACGGCCTC
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TGAATGTCGCTGAGCAGTTGAGCAAGATCCGATCTTCCAACTTCTGGATTCAGAAACAGA
GTTTCCATTTCGCGCACTTGTTTGGAACATTCGTTGAACTCAGCAGTAATCTCGCTGCAC
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GCTCGAGAGGCTACCCCCGTGGAGCTACTACTAGACCCGCCGCGTTCGATTTCGATTTCG
CCCTCACTGATGGAAACCTTCTTCTGAAAATCTTCAGCACTCATCCTCCTCTC

QA 7 839 7 839
DS 

RD RR4A425TF 663 0 0
GCAATCTCGTACCTAATGTCTTCCAAATACTCATTGATGCAAGTCACAGCGTCTTGCACT
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CCTGCAGCTTCAGTAATCTCATGAAGATGCACACACTCGTGCTGCATCGGTTTCTTGAAC
TTGCAGTTCTCATGTGTGAGCATCCGTTCTGACGGCCTCCCTGCCTTCTTCAGTACCTGT
ATTGTGACCGTCAGATGCAGTTTCTGCTTCTCTTGAGTTTGAATGTCGCTGAGCAGTTGA
GCAAGATCCGATCTTCCAACTTCTGGATTCAGAAACAGAGTTTCCATTTCGCGCACTTGT
TTGGAACATTCGTTGAACTCAGCAGTAATCTCGCTGCACAGCTTCTGATAAAGTGCTTCA
CCACTAGTCTCCACATACTCCGAGAATCCTCTTTTGAGTTTGGCGTAGGCCTGGGCTCGA
CGCTCCTGAATCTCAAGCAATCTCCGAAGCAAAACCAGGGCTCGAGAGGCTACCCCCGTG
GAGCTACTACTAGACCCGCCGCGTTCGATTTCGATTTCGCCCTCACTGATGGAAACCTTC
TTCTGAAAATCTTCAGCACTCATCCTCCTCTCCGATCTTTCAACTTCTCAGACACGACAG
AGA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 10

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AAAAATGGCGACCCTTAAGGTTCCATCTCATGTTCCTTCCCCATCCGAAGATGCTGAGCA
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CTGGACCCTTGAACCTGGTGAGCGCGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATG
GACTTCAAGCAACCAAGTGCTCATGGAAGTAGCCTGCACGAGGACCTCAACGCAGCTGCT
TCACGCTAGGCAAGCTTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCA
CCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGA
AGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGCGAAGCAAGAAGCAAAGCTGATCCATGAGAAAAT
CAAGGACAAGCACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCCACAAGGAGCAGAGC
TCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAG
TCTTGAGGAAGGAGATGAGGACGACAAGTTCCTCGGACTGTTGAGGTCAACCATTCAATG
CTTGACAAGACCAGAGCTCTACTTTGTGGATGTTCTTCGTTCTGCTATCAACAAAACCGG
AACAGACGAAGGAGCTCTCACTAGAATTGTGACTACAAGAGCTGAGATTGACTTGAAGGT
GATCGGAGAAGAGTATCAGAGGAGGAACAGCATTCCACTGGAGAAGGCCATTACCAAAGA
CACTCGCGGAGATTACGAGAAGATGCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAAT
CCTCCAGAGAGAAACAAAAGCTTCTCTGGCTTCTGTTTTCTCTCATCTCCCTCTCTCTCT
TTCTTGTCTTGAAATCGTTTGATTCTGTTCTTTGAAAACTTGTCTGTTGTTTCTGTTGTG
TGTTTTGAGTTTCCAAATAATGCGCGAGAGAGAAAGAGAGTCTGTCTCTTAAGTTATATA
AACTAATAAAAATAATGCTTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 10 10 10 

AF RR4CG24TF U 2
AF RR4GM53TF U 2
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AF RR4GM53JQ C 398
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BS 789 830 RR4BI84TF
BS 831 967 RR4A528TF
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CTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATGGGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGCT
CACAGAAGCGCTGAACAGAGGAAGCTGATCAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGAA
GACCTTCTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACCAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCTC
TGGACCCTTGAACCTGGTGAGCGCGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATGG
ACTTCAAGCAACCAAGTGCTCATG*AGGTAGCCTGCACGAGGACCTCAACGCAGCTGCTT
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GACTTCAAGCAACCAAGTGCTCATGGAAGTAGCCTGCACGAGGACCTCAACGCAGCTGCT
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CCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGA
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G
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CCTCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCGTTTGATTCTGTTCTTTGAAAACTTGTCTGTTG
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T

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TTCTCTCATCTCCCTCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCGTTTGATTCTGTTCTTTGAAA
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TCTTCCG

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G
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TCTGTTTTCTCTCATCTCCCTCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCGTTTGATTCTGTTCT
TTGAAAACTTGTCTGTTGTTTCTGTTGTGTGTTTTGAGTTTCCAAATAATGCGCGAGAGA
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TTC

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G
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AACCATTCAATGCTTGACAAGACCAGAGCTCTACTTTGTGGATGTTCTTCGTTCTGCTAT
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CCCTCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCGTTTGATT**GTTCTTTGAAAACTTGTCTGTT
GTTTCTGTTGTGTGTTTTGAGTTTCCAAATAATGCGCGAGAGAGAAAGAGAGTCTGTCTC
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TTC

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DS 

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CT
G

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DS 

RD RR4BV88TF 603 0 0
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TCAATCGCTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATG
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TCTACTTTGTGGATGTTCTTCGTTCTGCTATCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTC
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AAGCTTCTCTGGCTTCTGTTTTCTCTCATCTCCCTCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCG
TTTGATTCTGTTCTTTGAAAACTTGTCAGTTGTTTCTGTTGTGTGTTTTGAGTTTCCAAA
TAATGCGCGAGAGAGAAAGAGAGTCTGTCTCTTAAGTTATATAAACTAATAAAAATAATG
CT
G

QA 1 602 1 602
DS 



AS 2 9

CO CL532Contig1 638 7 8 U
GGGAGCAACCGCTAAAACCACTACCTCTACTCTTCCGCCATTTTTCACTCAGCTGCTTGT
TAGCTAAAAACATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATTCAAAAGGAGAAGAAGA
AGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGGAAAAAGCTCCAGAAGAGGA
CATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAGAGGCGTTAAAGAAG
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CCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTATTCCTTACGTCT
ACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCCCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTTGTTGTG
TCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGA
AGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATCTGTAATCTGAA
TCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCGTCTTATTTGGTTTGTTGCTTAATGAATATGATG
AGATTTTAAAGCCTTGGGAAATGCTTATTCTATTTGCC


BQ
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BZ96JQ C 224
AF RR4BZ96TF U 1
AF RR4F075JQ C 1
AF RR4F075TF U 1
AF RR4GH74TF U 1
AF RR4GD38JQ C 3
AF RR4GD38TF U 3
BS 1 90 RR4BZ96TF
BS 91 91 RR4F075TF
BS 92 309 RR4BZ96TF
BS 310 310 RR4F075TF
BS 311 609 RR4BZ96TF
BS 610 613 RR4F075TF
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RD RR4BZ96JQ 302 0 0
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ACGACCAACTTGTTGTGTTTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
AT

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DS 

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ACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCCCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTTGTTGTG
TCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGA
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AGATTTTAA
GCCTTGAG

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DS 

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AGATTTTAAAGCC

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DS 

RD RR4F075TF 613 0 0
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TCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGA
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TCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCGTCTTATTTGGTTTGTTGCTTAATGAATATGATG
AGATTTTAAAGCC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4GH74TF 617 0 0
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CCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTATTCCTTACGTCT
ACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCCCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTTGTTGTG
TCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGA
AGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATCTGTAATCTGAA
TCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCGTCTTATTTGGTTTGTTGCTTAATGAATATGATG
AGATTTTAAAGCCT
TGG

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DS 

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GG
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TAAAAACATGGGAAGCGATACCGAAGCAGAGAAGTCGATTCAAAAGGAGAAGAAGAAGGT
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TAAGAGCATAAGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCTGGAAACATATCTCCCAT
CGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTATTCCTTACGTCTACGT
TCCATCAAAAGAGGATCTTGCCCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTTGTTGTGTCTT
GGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGAAGTC
AGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATCTGTAATCTGAATCAG
AAAACACACGAACATGTGTTTCGTCTTATTTGGTTTGTTGCTTAATGAATATGATGAGAT
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DS 

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GG
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TAAAAACATGGGAAGCGATACCGAAGCAGAGAAGTCGATTCAAAAGGAGAAGAAGAAGGT
CATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGGAAAAAGCTCCAGAAGAGGACATT
CAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAGAGGCGTTAAAGAAGTGGT
TAAGAGCATAAGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCTGGAAACATATCTCCCAT
CGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTATTCCTTACGTCTACGT
TCCATCAAAAGAGGATCTTGCCCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTTGTTGTGTCTT
GGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGAAGTC
AGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATCTGTAATCTGAATCAG
AAAACACACGAACATGTGTTTCGTCTTATTTGGTTTGTTGCTTAATGAATATGATGAGAT
TTTAAAGCCTTGGGAAATGCTTATTCTATTTGCC

QA 3 636 3 636
DS 



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TTGCTCGTAGTCTGACTTCAACTTTTCGAGATCCTCTGCACCTAGCTCTCCTTTTGCAGG
TTTAAGCATGACCAAAACACAGCAAGTTGGTCGTTTTGTAGCACCGGCTTGCGCAAGATC
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GGTAATCACATCGATGGGAGATATGTTTCCAGCTATAACACATATTCCTTACTGACCACG
TCGAATGCTCTTAACCACTTCTTTAACGCCCCTCTTCAGACACTTCTTTCCAGCAGCTTT
TTGAATGAGCTTGAATGTCCTCTTCTGGAGCTTTTTCCCGGCGAGAGGTTTAGCGATAGG
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TAACAAAGCAGCTGAGTGAAAATGGCGGAAGAGTAGCGGAAACAAGTAGAGGTAGTGGTT
TAAGCGGTTGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO10JQ U 1
AF RR4CN92TF C 13
BS 1 222 RR4FO10JQ
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RD RR4FO10JQ 364 0 0
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GTTCGTGTGTTTTCTGATTCAAATTACAGATGATGAAAGCTCTTTAACATCATCAGCGAC
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TTTAAGCATGACCAAAACACAGCAAGTTGGTCGTTTTGTAGCGC*GGCTTGCGCAAGATC
CTCTTTTGATGGAACGTAGACGTAAGGAATACCAGCTTCCTCACACAAGATTGGAACATG
GGTAATCACATCGATGGGAGATATGTTTCCAGCTATAACACATATTCCTTACTGACCACG
TC
GA

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR4CN92TF 603 0 0
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TCTGATTCAGATTACAGATGATGAAAGCTCTTTAACATCATCAGCGACTTGCTCGTAGTC
TGACTTCAACTTTTCGAGATCCTCTGCACTTAGCTCTCCTTTTGCAGGTTTAAGCATGAC
CAAGACACAGCAAGTTGGTCGTTTTGTAGCACCGGCTTGCGCAAGATCCTCTTTTGATGG
AACGTAGACGTAAGGAATACCAGCTTCCTCACACAAGATTGGAACATGGGTAATCACATC
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AACCACTTCTTTAACGCCCCTCTTCAGACACTTCTTTCCAGCAGCTTTTTGAATGAGCTT
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CCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 7

CO CL533Contig1 949 7 28 U
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ATTTCATGAAATAACAACAGCTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGTACAAAGTAATTTAAC
ATCACACGAAATAACATAAAAAGAAAGCCTTCTTGAAAGATCTCCAGGCAGCATGTGGTC
GATTAGGCTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTTGAACGCCTTGAA
TTCCCAGAATGTCTTCAATGAGTATGGCTGAAAAACCGTCACGCCTTCTTCTGTGATCTT
CGCTATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCACACGCATACATTT
CTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAAT
TGGCCTAGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCTCGAAACTAACACC
AATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTCTTGACACCTCCAAGGACGAGAGT
GTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGGTCAGATAGTTGTG
CACCTCTTTTGGTCCCAAAGAGTTACCATCGTCCCACATGCTATCATTCAACACGAGCTC
ATCAAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATTTCTCCACTGGCACCGAGAAGAGA
ATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTATACCTTAAGGTGGATCCATATGA
ACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAAAACCCCATCTTTGTACTTGATTGCGACGATCGAAGT
CCCAGTAACATATGGGTACAGTGTTCTTTGTGAATCAGCTTCTGCGTTCTTCACGGAATC
TCCGTTCTCGATCGGAATGGTAAAAGTCATCTTTTTTCTTCTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO54JQ U 30
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G
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C

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GTCACGGTAGAGAAGCACACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCT
TAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAATTGGCCTAGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGT
GGCAACATGATTGTCCTCGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTC
GCCATTCTTGACACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACG
GTTGTACATCACTCGGGTCAGATAGTTGTGC
C

QA 2 572 2 572
DS 

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CG
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DS 

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CAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCACACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTT
CAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAATTGGCCTAGCGAGATGGTTTCCAA
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AAGTTTCGCCATTCTTGACACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGT
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TACCATCATCCCACATGCTATCATTCAACACGAGCTCATCAAGATA

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ATCGAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATTTCTCCACTGGCACCGAGAAGAGA
ATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTATACCT

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G
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CTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTTGAACGCCTTGAATTCCCAG
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AGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAATTGGACTA
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GACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTCTTGACACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAG
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QA 2 755 2 755
DS 

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CTTCGCTATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCACACGCATACA
TTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAG
AATAGGCCTAGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCTCGAAACTAAC
ACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCGTTCTTTACACCTCCAAGGACGAG
AGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGGTCAGATAGTT
GTGCACCTCTTTTGGTCCCAAAGAGTTACCATCGTCCCACATGCTATCATTCAACACGAG
CTCATCGAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATTTCTCCACTGGCACCGAGAAG
AGAATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTATACCTTAAGGTGGATCCATA
TGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAAAACCCCATCTTTGTACTTGATTGCGACGATCGA
AGTCCCAGTAACATATGGGTACAGTGTTCTTTGTGAATCAGCTTCTGCGTTCTTCACGGA
ATCTCCGTTCTCGATCGGAATGGTAAAAGTCATCTTTTTTCTTCTTCTTCCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 2 8

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TTCACACTTCTCTTCTTCATAATAACCACGTCGCTAGCAGTAACGTTTGCCGGTAAAATA
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CCACTGTGGAAACAACTTGAATACTACAAAGAATACCAAACAAAACTAGAAGCATACCAA
GGAAAAGACCAAGCCACAGAAACGATAACCAACTCTCTGTACCTCATAAGCGTAGGGACC
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CTTTACCAAGATTTTCTAGCTGGAATCGCCAAAGACTTTGTGAAGAAGCTGCACGGACTT
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CTTGTTTTTTCAAATCCCTATGAACCATTTATGCGAATCATCAAGAACCCTTCCTCTTTT
GGGTTCGAGGTGGCCGCAGCTGCTTGCTGTGCGACGGGGATGTTCGAGATGGGATATAGT
TGCCAAAGGAATAACCCATTCACATGTTCAAACGCAGACAAGTATGTGTTTTGGGACTCA
TTTCATCCAACACAGAAGACTCATCGCATCATTGCCAATTTTCTCATGAACGACATATTC
TCTGACTTCCTGTAATGATTTATATGTGTGTGTGTCTGGAGAACGGAGGATGGAGAGGAG
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AATTATGCACTTTGTATGTATTAAATTAGACTTTGCTTTTGTGTTAAAATGTCAAAGTAG
CGTAACCTATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G017TF U 7
AF RR4G233TF U 10
AF RR4EA08TF U 1
AF RR4B165TF U 4
AF RR4G233JQ C 548
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AAACAACTTGAATACTACAAAGAATACCAAACAAAACTAGAAGCATACCAAGG

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G
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TCGTGTTTGGCGACTCAACCGTTGATGCGGGTAACAACAACTACATCCCAACAGTGGCAA
GAAGCAACTTTGAGCCATACGGACGGGACTTTGTTGGTGGGAAACCGACTGGGAGGTTTT
GTAACGGAAAGATTGCGACGGACTTTATGTCGGAAGCCATAGGGCTCAAACCAATAATTC
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AAGCCACAGAAACGATAACCAACTCTCTGTACCTCATAAGCGTAGGGACCAACGACTTCC
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TGT

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GGAAAAGACCAAGCCACAGAAACGATAACCAACTCTCTGTACCTCATAAGCGTAGGGACC
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A

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DS 

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AGAAGCAACTTTGAGCCATACGGACGGGACTTTGTTGGTGGGAAACCGACTGGGAGGTTT
TGTAACGGAAAGATTGCGACGTACTTTATGTCGGAAGCCATAGGGCTCAAACCAATAATT
CCGGCATACTTGGATCCTTCTTACAACATTTCAGATTTTGCAACAGGTGTTACTTTTGCT
TCTGCTGCCACCGGCTATGACAACGCCACTTCCGATGTGCTGTCGGTTCTACCACTGTGG
AAACAACTTGAATACTACAAAGAATACCAAACAAAACTAGAAGCATACCAAGGAAAAGAC
CAAGCCACAGAAACGATAACCAACTCTCTGTACCTCATAAGCGTAGGGACCAACGACTTC
CTGGAGAACTACTTTGCCTTTCCTGGACGTTCTTCTCAATACTCGGTCGATCTTTACCAA
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DS 

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AAGATTTTCTAGCTGGAATCGCCAAAGACTTTGTGAAGAAGCTGCACGGACTTGGAGCTA
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TCCTGTAATGATTTATATGTGTGTGTGTCTGGAGAACGGAGGATGGAGAGGAGAGTAATA
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CACTTTGTATGTATTAAATTAGACTTTGCTTTTGTGTTAAAATGTCAAAGTAGCGTAACC
TATGTTT

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL534Contig2 777 3 9 U
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GCGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGA
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TGGTTCATAGGGATTTGAAAAAACGAGGACGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTC
AACAAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCAAACGCA
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TCCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G017JQ U 1
AF RR4E127JQ U 75
AF RR4EA08JQ U 75
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DS 

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AATAATAATATAACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAATCATT
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GTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAATGGGT
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CAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAGTGAAA
TCTTCCTAGCT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4EA08JQ 703 0 0
CACAAAAGCAAAGTCTAATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTATATTTTTTCAAAAAA
AAAA*GTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCTGTAGACAAGCCCT
AATAATAATATAACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAATCATT
ACAGGAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCACGATGCGATGAGTCTTCT
GTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAATGGGT
TATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCCGCTGCGG
CCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAGGGAT
TTGAAAAAACGAGGACGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTCTCAA
GCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCAAACGCACTCACCTCCCGTGC
CAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAGTGAAA
TCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAA
AATCTTGGTAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCAGG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 2 8

CO CL535Contig1 728 2 7 U
GAGAACCTGATTATCTGTAAGACATGGGACAACACATAAGTTCCATTGTTACAAGAACTC
TTATAGCGCATATTTTGCAACACTTATTCACTACACTAATGTCTAATCTAATATTTTCTT
GGCTCTATACATGATGCTTCACATACCTAGATATTTATCTACATTAGTCAAACTTAAGCA
TATGACTAATCCCATCAGTGTGATGAAGATGATGAATTACTCGTAGTTGTTCCTTGAGGC
TCCGTTACATCGTTTCTTCTCCTCTTCCGGCAAGAATTGATCGGAGCATCATACTTACCT
GCATCCAAAAGGGAAGTTGAGCACAGCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTGCGTAGTC
ATAAGCTCTTGCAGCATCAATATCACTCTCAAATGTCCCTAGCCAAAGCCTAAATCCTTT
CTTGGCAGGATCTCGAATCTCTGCTGCAAATTTTCCCCATGGCCTCCTTCTCACGCCTCG
GTAGTGTCTAGTCTCTTCGACCCTCTTTGGTCTTTTCCGGTTTGAGACAGTCTCAACCTC
AGGTGATGTTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGATGATGAAGATGATGCTTGCATTTGAAGAAA
CTCTCGGACATAGGAATCTGGATCAAGAACCGGTGAACTAGGCTCTAGTTTAGGAACTGG
GTTAAAGGGTTCTAGAGACAAGAGTCCTGACACAAAAGCGGAATCATCAAAGAGAAAATC
TTCCATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF18JQ U 26
AF RR4BS31JQ U 1
BS 1 90 RR4BS31JQ
BS 91 91 RR4DF18JQ
BS 92 195 RR4BS31JQ
BS 196 196 RR4DF18JQ
BS 197 309 RR4BS31JQ
BS 310 310 RR4DF18JQ
BS 311 728 RR4BS31JQ

RD RR4DF18JQ 551 0 0
GGGACAACACATAAGTTCCATTGTTACAAGAACTCTTATAGCGCATATTTTGCAACACTT
ATTCACTACACTAATGTCTAATCTAATATTTTCTTGGCTCTATACATGATGCTTCACATA
CCTAGATATTTATCTACATTAGTCAAACTTAAGCATATGACTAATCCCATCAGTGTGATG
AAGATGATGAATTACTCGTAGTTGTTCCTTGAGGCTCCGTTACATCGTTTCTTCTCCTCT
TCCGGCAAGAATTGATCGGAGCATCATACTTACCTGCATCCAAAAGGGAAGTTGAGCACA
GCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTGCGTAGTCATAAGCTCTTGCAGCATCAATATCA
CTCTCAAATGTCCCTAGCCGAAGCCTAGATCCTTTCTTGGCAGGATCTCGAATCTCTGCT
GCAAATTTTCCCCATGGCCTCCTTCTCACGCCTCGGTAGTGTCTAGTCTCTTCGACCCTC
TTTGGTCTTTTCCGGTTTGAGACAGTCTCAACCTCAGGTGATGTTGTTGTAGTTGTTGTT
GTTGATGATGA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4BS31JQ 728 0 0
GAGAACCTGATTATCTGTAAGACATGGGACAACACATAAGTTCCATTGTTACAAGAACTC
TTATAGCGCATATTTTGCAACACTTATTCATTACACTAATGTCTAATCTAATATTTTCTT
GGCTCTATACATGATGCTTCACATACCTAGATATTTATCTACATTAGTCAAACTTAAGCA
TATGACTAATCCCATTAGTGTGATGAAGATGATGAATTACTCGTAGTTGTTCCTTGAGGC
TCCGTTACATCGTTTCTTCTCCTCTTCCGGCAAGAATTGATCGGAGCATCATACTTACCT
GCATCCAAA*GGGAAGTTGAGCACAGCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTGCGTAGTC
ATAAGCTCTTGCAGCATCAATATCACTCTCAAATGTCCCTAGCCAAAGCCTAAATCCTTT
CTTGGCAGGATCTCGAATCTCTGCTGCAAATTTTCCCCATGGCCTCCTTCTCACGCCTCG
GTAGTGTCTAGTCTCTTCGACCCTCTTTGGTCTTTTCCGGTTTGAGACAGTCTCAACCTC
AGGTGATGTTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGATGATGAAGATGATGCTTGCATTTGAAGAAA
CTCTCGGACATAGGAATCTGGATCAAGAACCGGTGAACTAGGCTCTAGTTTAGGAACTGG
GTTAAAGGGTTCTAGAGACAAGAGTCCTGACACAAAAGCGGAATCATCAAAGAGAAAATC
TTCCATGA

QA 1 728 1 728
DS 



CO CL535Contig2 870 6 8 U
GGATCACTTGCAGAGTTTTCTTTAAAAAAAA*CAAAAACAAAAACAAAAACATGACAACT
TTTGAGGAAAGCTCTGATTTGGAGGTTATACACAAGCACCTCTTTGAGGGCTTGATGATC
CCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTG
TCTCTAGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCA
GATTCCTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACA
ACTACAACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTC
GAAGAGAGTAGACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAG
ATTCGAGATCCGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATT
GATGCTGCAAGAGCTTATGACTACGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTC
AACTTCCCTTTGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGA
AGAAACGATGTAACGGAGCCTCAAGGAACAACTACGAGTACTAATTCATTATCTTCATCA
AACTAATGGGACTAGTCATGCTTAACTTTGACTAATGTAGATAAATATCTTAAGTATGTG
AGGCATCATGTATAGAGCCAAGAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAA
TATGTACTAAAGAGTTCCTGTAACAATGGAACTTATGTGTTGTCCCATGTCTTACAGATA
ATCACAGTGGCGGATCTAGAAAATATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF18TF U 1
AF RR4D892TF U 4
AF RR4EL92TF U 4
AF RR4CU25TF U 1
AF RR4CU25JQ C 126
AF RR4EL92JQ C 131
BS 1 60 RR4CU25TF
BS 61 62 RR4DF18TF
BS 63 765 RR4CU25TF
BS 766 768 RR4CU25JQ
BS 769 773 RR4CU25TF
BS 774 774 RR4CU25JQ
BS 775 795 RR4CU25TF
BS 796 870 RR4CU25JQ

RD RR4DF18TF 518 0 0
GGATC
ACTTGCAGAGTTTTCTTTAAAAAAAA*CAAAAACAAAAACAAAAACATGACAACTTTTGA
GGAAAGCTCTGATTTGGAGGTTATACACAAGCACCTCTTTGAGGGCTTGATGATCCCTGA
TGGTTTCATGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCT
AGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTC
CTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACTAC
AACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGA
GACTAGACACTACCGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATTCG
AGATCCTGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTCGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGC
TGCAAGAGCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCT

QA 6 518 6 518
DS 

RD RR4D892TF 638 0 0
GG
ACTTGCAGAGTTTTCTTTAAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACATGACAACTTTTGA
GGAAAGCTCTGATTTGGAGGTTATACACAAGCACCTCTTTGAGGGCTTGATGATCCCTGA
TGGTTTCATGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCT
AGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTC
CTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACTAC
AACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGA
GACTAGACACTACCGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATTCG
AGATCCTGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGGGAGTGATATTGATGC
TGCAAGAGCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTT
CCCTTTGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAA
CGATGTAACGGAGCCTCAAG*AACAACTACGA
ATAA

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR4EL92TF 618 0 0
GG
ACTTGCAGAGTTTTCTTTAAAAAAAA*CAAAAACAAAAACAAAAACATGACAACTTTTGA
GGAAAGCTCTGATTTGGAGGTTATACACAAGCACCTCTTTGAGGGCTTGATGATCCCTGA
TGGTTTCACGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCT
AGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTC
CTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACTAC
AACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGA
GAGTAGACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATTCG
AGATCCGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGC
TGCAAGAGCTTATGACTACGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTT
CCCTTTGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAA
CGATGTAACGGAGCCT

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR4CU25TF 802 0 0
GGATCACTTGCAGAGTTTTCTTTAAAAAAAA*CAAAAACAAAAACAAAAACATGACAACT
**TGAGGAAAGCTCTGATTTGGAGGTTATACACAAGCACCTCTTTGAGGGCTTGATGATC
CCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTG
TCTCTAGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCA
GATTCCTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACA
ACTACAACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTC
GAAGAGAGTAGACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAG
ATTCGAGATCCGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATT
GATGCTGCAAGAGCTTATGACTACGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTC
AACTTCCCTTTGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGA
AGAAACGATGTAACGGAGCCTCAAGGAACAACTACGAGTACTAATTCATTATCTTCATCA
AACTAATGGGACTAGTCATGCTTAACTTTGACTAATGTAGATAAATATCTTAAGTATGTG
AGGCATCATGTATAGAGCCAAGAAAATATTAGATTAGTGTAGTGA**TAGTGT*GCAAAA
TATGTACTAAAGAGT
CCTGTAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4CU25JQ 745 0 0
TGGTTTCATGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCT
AGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTC
CTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACTAC
AACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGA
GAGTAGACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATTCG
AGATCCGGCCAAGAAAGGATTTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGC
TGCAAGAGCTTATGACTACGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTT
CCCTTTGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAA
CGATGTAACGGAGCCTCAAGGAACAACTACGAGTACTAATTCATTATCTTCATCAAACTA
ATGGGACTAGTCATGCTTAACTTTGACTAATGTAGATAAATATCTTAAGTATGTGAGGCA
TCATGTATAGAGCCAAGAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGT
ACTAAAGAGTTCCTGTAACAATGGAACTTATGTGTTGTCCCATGTCTTACAGATAATCAC
AGTGGCGGATCTAGAAAATATTTCG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EL92JQ 729 0 0
TCAC
GGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCTAGAACCCTT
TAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTCCTATGTCCG
AGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACTACAACAACATC
ACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGAGAGTAGACA
CTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATTCGAGATCCGGC
CAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTGCAAGAGC
TTATGACTACGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTCCCTTTGGA
TGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAACGATGTAAC
GGAGCCTCAAGGAACAACTACGAGTACTAATTCATTATCTTCATCAAACTAATGGGACTA
GTCATGCTTAACTTTGACTAATGTAGATAAATATCTTAAGTATGTGAGGCATCATGTATA
GAGCCAAGAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGTACTAAAGAG
TTCCTGTAACAATGGAACTTATGTGTTGTCCCATGTCTTACAGATAATCACAGTGGCGGA
TCTAG

QA 5 729 5 729
DS 



AS 2 10

CO CL536Contig1 624 4 8 U
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AATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTC
GGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCTT
CTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAA
GGCTGTGAGCGGCTTATCCGGTGCAGCTCTCACTGTTTCCATGGTGCTCCCTGAGGTGGC
CGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCCAGAACTTCTTGCTTAGCATTGCTGC
AGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATAGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCC
TGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTGTTAC
TCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAAATCATGTAATGAACTTTTGGCGGTCTTCTTCA
ATCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAAGATT
CATCTTTGATGTCGAGATTTATTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GJ06JQ C 328
AF RR4GJ06TF U 26
AF RR4C314JQ C 1
AF RR4C314TF U 1
BS 1 1 RR4C314JQ
BS 2 27 RR4C314TF
BS 28 47 RR4GJ06TF
BS 48 48 RR4C314TF
BS 49 174 RR4GJ06TF
BS 175 175 RR4C314TF
BS 176 569 RR4GJ06TF
BS 570 624 RR4C314TF

RD RR4GJ06JQ 197 0 0
TTTTT
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TTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAAAGAGAAATGATTTCTGTTGTTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAAATCA
TGTAATGAACTT

QA 6 197 6 197
DS 

RD RR4GJ06TF 544 0 0
GG
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GGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCC
ACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCTTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTT
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TCTCACTGTTTCCATGGTGCTCCCTGAGGTGGCCGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCC
TTCTCTCCAGAACTTCTTGCTTAGCATTGCTGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCAT
AGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTGTTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGA
AATCATGTAATGAACTTTTGGCGGTCTTCTTCAATCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTA
TC

QA 3 544 3 544
DS 

RD RR4C314JQ 624 0 0
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AATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTC
GGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCTT
CTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAA
GGCTGTGAGCGGCTTATCCGGTGCAGCTCTCACTGTTTCCATGGTGCTCCCTGAGGTGGC
CGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCCAGAACTTCTTGCTTAGCATTGCTGC
AGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATAGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCC
TGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAGAAATGATCTCTGTTGTTAC
TCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAAATCATGTAATGAACTTTTGGCGGTCTTCTTCA
ATCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAGGATT
CATCTTTGATGTCGAGATTTATTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4C314TF 624 0 0
G
AAAGCACAAACTCACATTCCCAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAGAA
ATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTCG
GCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCTTC
TCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAG
GCTGTGAGCGGCTTATCCGGTGCAGCTCTCACTGTTTCCATGGTGCTCCCTGAGGTGGCC
GAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCCAGAACTTCTTGCTTAGCATTGCTGCA
GGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATAGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCT
GTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAGAAATGATCTCTGTTGTTACT
CTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAAATCATGTAATGAACTTTTGGCGGTCTTCTTCAA
TCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAAGATTC
ATCTTTGATGTCGAGATTTATTT

QA 2 624 2 624
DS 



CO CL536Contig2 574 6 9 U
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AGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAAC
CGATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAG
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AAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATC
CCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTT
AGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCC
AACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAGAAATGA
TCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTG
GCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTTCTTATATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 10 

AF RR4EK26JQ C 1
AF RR4EK26TF U 1
AF RR4GE13JQ C 42
AF RR4GE13TF U 42
AF RR4E230JQ C 53
AF RR4E230TF U 53
BS 1 325 RR4EK26TF
BS 326 326 RR4GE13TF
BS 327 454 RR4EK26TF
BS 455 455 RR4GE13TF
BS 456 552 RR4EK26TF
BS 553 553 RR4E230TF
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BS 570 573 RR4E230TF
BS 574 574 RR4E230JQ

RD RR4EK26JQ 552 0 0
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AGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAAC
CGATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATTTAAG
GCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTG
AAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATC
CCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTTAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTT
AGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCC
AACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGA**AAGAGAAATGA
TCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTG
GCATTCTTCTTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4EK26TF 552 0 0
GGCTTTCTTTTCAAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAG
AGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAAC
CGATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAG
GCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTG
AAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATC
CCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTTAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTT
AGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCC
AACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGA**AAGAGAAATGA
TCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTG
GCATTCTTCTTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4GE13JQ 529 0 0
GG
GAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCA
TGCCACTCACCGAAAACCGATCATCTTCGGCGAAAACCGTTGCCTTCCTCAAGCCACTGC
CTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAT
TGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCA
CCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCCCTCCTTCTC
TCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTG
TTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGA**AATAGAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATT
CATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCGATCTTATATGCTTCTT
C

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR4GE13TF 529 0 0
GG
GAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCA
TGCCACTCACCGAAAACCGATCATCTTCGGCGAAAACCGTTGCCTTCCTCAAGCCACTGC
CTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAT
TGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCA
CCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCCCTCCTTCTC
TCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTG
TTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGA**AATAGAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATT
CATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCGATCTTATATGCTTCTT
C

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR4E230JQ 522 0 0
G
GAAGAAGAGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCAC
CGAAAACCGATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACC
ATCTAAGGCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTC
TAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCAT
GGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTT
TTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGG
TGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA
GAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGA
ACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTTCTTATATC

QA 2 522 2 522
DS 

RD RR4E230TF 522 0 0
G
GAAGAAGAGAGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCAC
CGAAAACCGATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACC
ATCTAAGGCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTC
TAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCAT
GGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTT
TTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGG
TGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA
GAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGA
ACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTTCTTATAT
C

QA 2 521 2 521
DS 



AS 2 9

CO CL537Contig1 751 4 14 U
GTCAGTAAGTTTGCAACCATTGAATCATGGAGAAAAGTTTCACACTTTTTTCATAAAAAA
AGATTTGCGCAAATACACATTTAACATAGAAAGGGTAAAATACACAACAACAAGGAACAA
AAGATGATCACTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAAT
ACTTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGAGGCCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAA
ACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGATCCTCGTGTTCTCTTCCACTT
TCACTTTCAAACTATCCGGTATCCGCATCTTCACCGGGTGAGAAAACCCCAAATTCAAAA
CCAGCTCTTTCCCTTCCACCGGCGCACGGTAACCAACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCT
CAAAGCCCTTTGACACTCCCACCACCATGTTGTCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCA
TTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAAGAGACCAGCATCTTCTT
TGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTTAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTT
TCAAGTCTTGACCTTCCAATGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATGGGTTGCTTCC
CTATCCTTGATTCCTTGCACTCTATGGTCTTGCTGGAGAAACCCACTCGAGCAAGAGGCT
TGGTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO49JQ U 67
AF RR4E761JQ U 67
AF RR4CP29JQ U 1
AF RR4CA34JQ U 3
BS 1 108 RR4CP29JQ
BS 109 111 RR4DO49JQ
BS 112 211 RR4CP29JQ
BS 212 212 RR4DO49JQ
BS 213 323 RR4CP29JQ
BS 324 324 RR4DO49JQ
BS 325 351 RR4CP29JQ
BS 352 352 RR4DO49JQ
BS 353 357 RR4CP29JQ
BS 358 358 RR4DO49JQ
BS 359 381 RR4CP29JQ
BS 382 382 RR4DO49JQ
BS 383 713 RR4CP29JQ
BS 714 751 RR4CA34JQ

RD RR4DO49JQ 461 0 0
GCGCAAATACACATTTAACATAGAAAGGGTAAAATACACAACAACAAGGAACAAAAGATG
ATCACTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAATACTTAA
CTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGAGGCCTCCACTTCCTCACCGTTGCAGCGAACTGCC
CTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGATCCTCGTGTTCTCTTCCACTTTCACTT
TCAAACTATCCGGTATCCGCATCTTCACCGGGTGAGAAAACCCGAAATTCAAAACCAGCT
CTTTCCCTTCCACGGGGGCACGGTAACCAACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAAGC
CCTTTGACACTCCCACCACCATGTTGTCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGT
TAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGATCCTCAAGA
AA

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR4E761JQ 454 0 0
GCGCAAATACACATTTAACATAGAAAGGGTAAAATACACAACAACAAGGAACAAAAGATG
ATCACTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAATACTTAA
CTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGAGGCCTCCACTTCCTCACCGTTGCAGCGAACTGCC
CTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGATCCTCGTGTTCTCTTCCACTTTCACTT
TCAAACTATCCGGTATCCGCATCTTCACCGGGGGAGAAAACCCGAAATTCAAAACCAGCT
CTTTCCCTTCCACGGGGGCACGGTAACCAACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAAGC
CCTTTGACACTCCCACCACCATGTTGTCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGT
TAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGA
TCCT

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4CP29JQ 713 0 0
GTCAGTAAGTTTGCAACCATTGAATCATGGAGAAAAGTTTCACACTTTTTTCATAAAAAA
AGATTTGCGCAAATACACATTTAACATAGAAAGGGTAAAATACACAAC***AAGGAACAA
AAGATGATCACTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAAT
ACTTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGCGGCCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAA
ACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGATCCTCGTGTTCTCTTCCACTT
TCACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTCACCGGGTGAGAAAACCCCAGATTCAGAA
CCAGCTCTTTCCCTTCCACCGTCGCACGGTAACCAACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCT
CAAAGCCCTTTGACACTCCCACCACCATGTTGTCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCA
TTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAAGAGACCAGCATCTTCTT
TGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTTAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTT
TCAAGTCTTGACCTTCCAATGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATGGGTTGCTTCC
CTATCCTTGATTCCTTGCACTCTATGGTCTTGCTGGAGAAACCCACTCGAGCA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4CA34JQ 749 0 0
CAGTAAGTTTGCAACCATTGAATCATGGAGAAAAGTTTCACACTTTTTTCATAAAAAAAG
ATTTGCGCAAATACACATTTAACATAGAAAGGGTAAAATACACAAC***AAGGAACAAAA
GATGATCACTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAATAC
TTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGCGGCCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAAAC
TGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGATCCTCGTGTTCTCTTCCACTTTC
ACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTCACCGGGTGAGAAAACCCCAGATTCAGAACC
AGCTCTTTCCCTTCCACCGTCGCACGGTAACCAACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCA
AAGCCCTTTGACACTCCCACCACCATGTTGTCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATT
TGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAAGAGACCAGCATCTTCTTTG
ATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTTAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTC
AAGTCTTGACCTTCCAATGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATGGGTTGCTTCCCT
ATCCTTGATTCCTTGCACTCTATGGTCTTGCTGGAGAAACCCACTCGAGCAAGAGGCTTG
GTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGCC

QA 1 749 1 749
DS 



CO CL537Contig2 772 5 27 U
GGAAGTCGTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCTTGGAGCAGAGCTCCG
TCGTCAATCCTAGCAAGCAATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATC
ATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTCTTGCTCGAGTGGGTTT
CTCCAGCAAGACCATA***GAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCTGT
ACCATCCAATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGG
AGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTCTCTT
GAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGAC
GCTTACGGACAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGCTTTGAGAAGAAGCTGATACTAGT
GGGTGTTGGTTACCGTGCGACGGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTTTC
TCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAG
GATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGG*TGAGGA
AGTGGAGGC*GCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGAGTAAGTATCAGATGAGATTGTGAGGA
GGAAAGAGCAAGCTGGAAAGAAGAGTGATCATCTTTGTCCTTGTTGTTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO49TF U 150
AF RR4CP29TF U 8
AF RR4HA45TF U 8
AF RR4CA34TF U 2
AF RR4CX46TF U 1
BS 1 11 RR4CX46TF
BS 12 12 RR4HA45TF
BS 13 44 RR4CX46TF
BS 45 45 RR4HA45TF
BS 46 162 RR4CX46TF
BS 163 164 RR4HA45TF
BS 165 196 RR4CX46TF
BS 197 199 RR4HA45TF
BS 200 210 RR4CX46TF
BS 211 211 RR4HA45TF
BS 212 228 RR4CX46TF
BS 229 229 RR4HA45TF
BS 230 431 RR4CX46TF
BS 432 432 RR4HA45TF
BS 433 498 RR4CX46TF
BS 499 499 RR4HA45TF
BS 500 501 RR4CX46TF
BS 502 502 RR4HA45TF
BS 503 531 RR4CX46TF
BS 532 532 RR4HA45TF
BS 533 642 RR4CX46TF
BS 643 643 RR4HA45TF
BS 644 648 RR4CX46TF
BS 649 649 RR4HA45TF
BS 650 670 RR4CX46TF
BS 671 671 RR4HA45TF
BS 672 772 RR4CX46TF

RD RR4DO49TF 225 0 0
TCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGCAAGACCATAATAGAGTGCAAGG
AGTCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGTACCATCCAATGTAACCATCGCATTGAAAG
GTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAG
TTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTCTCTTGAGGATCAAAAAAA

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR4CP29TF 367 0 0
GTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCTTGGAGCAGAGCTCCGTCGTCAA
TCCTAGCAAGCAATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTTTTG
GGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTCTTGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGC
AAGACCATA***GAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCTGTACCATCC
AATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTC
GCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTCTCTTGAGGGTC
AAAAAAA

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4HA45TF 677 0 0
GTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCTTGGAGCAGAGCTCCGTCGTCAA
TCCTAGCAAGCAATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTTTTG
GGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTCTTGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGC
AAGACCATA***GAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCTGTACCATCC
AATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTC
GCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTCTCTTGAGGGTC
AAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTTACG
GACAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGCTTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTT
GGTTACCGTGCGACGGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTTTCTCACCCG
GTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGGACACGAGGATCACG
GTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGGTGAGGAAGTGGAG
CC*GCCGGAGCCGTACA

QA 1 677 1 677
DS 

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GAAGTC
GTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCTTGGAGCAGAGCTCCGTCGTCAA
TCCTAGCAAGCAATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTTTTG
GGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTCTTGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGC
AAGACCATA***GAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCTGTACCATCC
AATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTC
GCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTCTCTTGAGGGTC
AAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTTACG
GACAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGCTTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTT
GGTTACCGTGCGACGGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTTTCTCACCCG
GTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAGGATCACG
GTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGG*TGAGGAAGTGGAG
GCCGCCGGAGCCGTAC

QA 7 682 7 682
DS 

RD RR4CX46TF 772 0 0
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTCCG
TCGTCAATCCTAGCAAGCAATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATC
ATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTGGGTTT
CTCCAGCAAGACCATAATAGAGTGCAAGGAGTCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGT
ACCATCCAATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGG
AGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTCTCTT
GAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGAC
GCTTACGGACAGCATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGCTTTGAGAAGAAGCTGATACTAGT
GGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTTTC
TCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAG
GATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTCGCTGCAACGG*TGAGGA
AGTGGAGGC*TCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGAGTAAGTATCAGATGAGATTGTGAGGA
GGAAAGAGCAAGCTGGAAAGAAGAGTGATCATCTTTGTCCTTGTTGTTGTGT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 3 9

CO CL538Contig1 837 5 11 U
GAATATAATTTAAAAGTATTTAAACCAATAACAATGGATTTTGATAAGATTTTAACAATA
TATAAAACAATAACAATAGATTTTCAAAATTTCATAATTCCATTAGAATTCTTAAACCAA
TAATCCCCAAAACATCTTTCGGGAAGGGGGAGAGGTTTAAATCTTGTTGAAGGCGACAAT
GTCAACACTCTGG*ATGTACTCGTTGTTAGGTTCAGAGGTGAGATAGTCCTCAATGAGGT
TGTCTGGGGAGACGAGGTCATCAACAATTGTGAGCATGATCGTGAGCTTCTTGATACCGT
ATCCAACTGGTACCAGTTTTGAAGCTCCCCATAAGAGACCAGGCATCTCAACACTGCGAA
CAGCTGCTTCCAGTTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTTACTTCCATGAGCA
CAGATGACTTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTTTCCTTCTTGGCAGTCTCGTCACCAA
ACAGATCCATGTCATCATCGTCATCAGCTGCAGGTGCCTCAGCTTGAGCAGCAGAGCCAC
CGATCGACACTCCGACGGCTTTTCCCGGGAAACTTTTAGCGAGGTGGGAAGCGACGCAAT
CGTACCACTTGCTAGCATTGGGGAAAGCATCGCTTGGTTTCTTCGAAACGGCAGCGTACA
CCTTCACATCATCCACAGACAATTGATCTCCGGAGATGTAGGTTTTTCCGGCGAGGTGCT
CCTCCACGGATTTGACACCCTGCTCTGTGTGTAGATCTGAGAAGGTAACGGCCATTGTTG
CTGACTGCTGCTTTAGAATGTTGAGAGGGAGGGGAGGGACTGAACGAGCAGCTATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC54JQ U 4
AF RR4D559JQ U 1
AF RR4D325JQ U 1
AF RR4AY04JQ U 36
AF RR4AY04TF C 45
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BS 107 419 RR4D325JQ
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A
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QA 2 139 2 139
DS 

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GAAT
ATAATTTAAAAGTATTTAAACCAATAACAATGGATTTTGATAAGATTTTAACAATATATA
AAACAATAACAATAGATTTTCAAAATTTCATAATTCCATTAGAATTCTTAAACCAATAAT
CCCCAAAACATCTTTCGGGAAGGGGGAGAGGTTTAAATCTTGTTGAAGGCGACAATGTCA
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QA 5 333 5 333
DS 

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TATAAAACAATAACAATAGATTTTCAAAATTTCATAATTCCATTAAAATTCTTAAACCAA
TAATCCCCAAAACATCTTTCGGGAAGGGGGAGAGGTTTAAATCTTGTTGAAGGCGACAAT
GTCAACACTCTGG*ATGTACTCGTTGTTAGGTTCAGAGGTGAGATAGTCCTCAATGAGGT
TGTCTGGGGAGACGAGGTCATCAACAATTGTGAGCATGATCGTGAGCTTCTTGATACCGT
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CAGATGACTTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTTTCCTTCTTGG

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DS 

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GGGACTGAACGA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4AY04TF 793 0 0
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CTTAAACCAATAATCCCCAAAACATCTTTCGGGAAGGGGGAGAGGTTTAAATCTTGTTGA
AGGCGACAATGTCAACACTCTGGGATGTACTCGTTGTTAGGTTCAGAGGTGAGATAGTCC
TCAATGAGGTTGTCTGGGGAGACGAGGTCATCAACAATTGTGAGCATGATCGTGAGCTTC
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ACACTGCGAACAGCTGCTTCCAGTTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTTACT
TCCATGAGCACAGATGACTTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTTTCCTTCTTGGCAGTC
TCGTCACCAAACAGATCCATGTCATCATCGTCATCAGCTGCAGGTGCCTCAGCTTGAGCA
GCAGAGCCACCGATCGACACTCCGACGGCTTTTCCCGGGAAACTTTTAGCGAGGTGGGAA
GCGACGCAATCGTACCACTTGCTAGCATTGGGGAAAGCATCGCTTGGTTTCTTCGAAACG
GCAGCGTACACCTTCACATCATCCACAGACAATTGATCTCCGGAGATGTAGGTTTTTCCG
GCGAGGTGCTCCTCCACGGATTTGACACCCTGCTCTGTGTGTAGATCTGAGAAGGTAACG
GCCATTGTTGCTGACTGCTGCTTTAGAATGTTGAGAGGGAGGG*AGGGACTGAACGAGCA
GCTATCC

QA 7 793 7 793
DS 



CO CL538Contig2 767 2 2 U
GGATAGCTGCTCGTTCAGTCCCTCCCTCCCTCTCAACATTCTAAAGCAGCAGTCAGCAAC
AATGGCCGTTACCTTCTCAGATCTACACACAGAGCAGGGTGTCAAATCCGTGGAGGAGCA
CCTCGCCGGAAAAACCTGCATCTCCGGAGATCAATTGTCTGTGGATGATGTGAAGGTGTA
CGCTGCCGTTTCGAAGAAACCAAGCGATGCTTTCCCCAATGCTAGCAAGTGGTACGATTG
CGTCGCTTCCCACCTCGCTAAAAGTTTCCCGGGAAAAGCCGTTGGAGTGTCGATCGGTGG
CTCTGCTGCTCAAGCTGAGGCACCTGCAGCTGATGACGATGATGACAAGCCAAGAAGGAA
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GATGAGACTGACATGAAGAAACTGGAAGCAGCTGTTCGCAGTGTTGAGATGCCTGGTCTC
TTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTACCAGTTGGATACGGTATCAAGAAGCTCACGATCATG
CTCACAATTGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCT
GAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATTGTCGCCTTCAACAAGATTTAAACC
TCTCCCCCTTCCCGAAAGATGTTTTGGGGATTATTGGTTTAAGAATTCTAATGGAATTAT
GAAATTTTGAAATCTATTGTTATGTTTTATATATTGTTAAATCTATC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D325TF U 1
AF RR4D559TF U 1
BS 1 579 RR4D325TF
BS 580 767 RR4D559TF

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CGTCGCTTCCCACCTCGCTAAAAGTTTCCCGGGAAAAGCCGTTGGAGTGTCGATCGGTGG
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CTCACAATTGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTC

QA 1 579 1 579
DS 

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GG
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TCGCTTCCCACCTCGCTAAAAGTTTCCCGGGAAAAGCCGTTGGAGTGTCGATCGGTGGCT
CTGCTGCTCAAGCTGAGGCACCTGCAGCTGATGACGATGATGACAAGCCAAGAAGGAAAC
CAAGAAGCCTAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTAAAGCCATGGGATGA
TGAGACTGACATGAAGAAACTGGAAGCAGCTGTTCGCAGTGTTGAGATGCCTGGTCTCTT
ATGGGGAGCTTCAAAACTGGTACCAGTTGGATACGGTATCAAGAAGCTCACGATCATGCT
CACAATTGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCTGA
ACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATTGTCGCCTTCAACAAGATTTAAACCTC
TCCCCCTTCCCGAAAGATGTTTTGGGGATTATTGGTTTAAGAATTCTAATGGAATTATGA
AATTTTGAAATCTATTGTTATGTTTTATATATTGTTAAATCTATC

QA 3 767 3 767
DS 



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ACGATTGCGTCGCTTCCCACCTCGCTAAAAGTTTCCCGGGAAAAGCCGTTGGAGTGTCGA
TCGGTGGCTCTGCTGCTCAAGCTGAGGCTCCTGCAGCTGATGACGATGATGACATGGATC
TGTTTGGTGACGAGACTGAGGAGGAGAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCCAAGA
AGGAAACCAAGAAGCCTAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTAAAGCCAT
GGGATGATGAGACTGACATGAAGAAACTGGAAGCAGCTGTTCGCAGTGTTGAGATGCCTG
GTCTCTTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTACCAGTTGGGTACGGTATCAAGAAGCTCACGA
TCATGCTCACAATTGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCA
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AAACCTCTCCCCCTTCCCGAAAGATGTTTTGGGGATTATTGGTTTAAGAATTCTAATGGA
ATTATGAAATTTTGAAAATCTATTGTTATTGTTTTATATATTGTTAAAATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC64TF U 1
AF RR4EC64JQ C 335
BS 1 732 RR4EC64TF
BS 733 733 RR4EC64JQ
BS 734 749 RR4EC64TF
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AAACCTCTCCCC*TTCCCGAAAGATGTTT
GGGGATATG

QA 1 749 1 749
DS 

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AGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGT
TGACATTGTCGCCTTCAACAAGATTTAAACCTCTCCCCCTTCCCGAAAGATGTTTTGGGG
ATTATTGGTTTAAGAATTCTAATGGAATTATGAAATTTTGAAAATCTATTGTTATTGTTT
TATATATTGTTAAAATCGC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 2 8

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AGGAATATGCCTTTGTTTTGCTGACTTTTATGTTTGATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H547JQB U 66
AF RR4BF42JQ U 8
AF RR4B825JQ U 1
AF RR4H547TF C 214
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BS 138 138 RR4BF42JQ
BS 139 266 RR4B825JQ
BS 267 267 RR4H547JQB
BS 268 395 RR4B825JQ
BS 396 396 RR4BF42JQ
BS 397 420 RR4B825JQ
BS 421 421 RR4H547JQB
BS 422 491 RR4B825JQ
BS 492 492 RR4H547JQB
BS 493 795 RR4B825JQ
BS 796 942 RR4H547TF

RD RR4H547JQB 540 0 0
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TATCTTGGCTTTCCTCTTCTCGTTGACAAAAAAAACAAAAAAAGCCAGGACGGAAAACAC
GCTGAAGCAAACGGAGGCAATATCCAAGGACTTGTGGCGACCACTGATAGCCTGAACACT
GAAAAGCTTGGTTGACTTTGCCTCGTCCGTGCTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGGCCTTT
GGCATCAACTGCGTAGGCGCGAACGAAGTAGGTCCCCGTTGGGATGTCGCGTTCTAGGGT
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DS 

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AACGCGGTTTTGCTCAACTTCCCAATTACGCAAAGTAAACAACTCATTTGCTCTGCTCTA
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TGAAGCAGACGGAGGCAATATCCAAGGACTTGTGGCGACCACTGATAGCCTGAACACTGA
AGAGCTTGGTTGACTTTGCCTCGTCCGTGCTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGGTCTTTGG
CATCAACTGCGTAGGCGCGAACGAAGTAGGTCCCCGTTGGGATGTCGCGTTCTAGGGTAT
ATTCGAATGATTGAGGGGATTTATCATAGGGCCTGGCAATGATCTTGTGTGGGCAGCTTT
TATCCTTGAAGAGCTCATTTTCTGTCTTGCGCCATGGTCGGTCAACTTGACTTACCGGAG
CGTAGCGTAGCTTTACTTTGATGGTCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTGGAGCTTA
GCTTCCATGTAATGCTCAACTTGTCAATTCCGGCATCCAAAACGCCTTCTCGGCTGGGTG
TAGCGGTGACCTCAAGTGCACCTTTCTCCAGGTCAGAGAAGAGCCT

QA 1 766 1 766
DS 

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CAAAGTCAACGCGGTTTTGCTCAACTTCCCAATTACGCAAAGTAAACAACTCATTTGCTC
TGCTCTATCTTGGCTTTCCTCTTCTCATTGACAAAGAAGACAAGAAGAGCCAGGACGGAG
AACACGCTGAAGCAGACGGAGGCAATATCCAAGGACTTGTGGCGACCACTGATAGCCTGA
ACACTGAAGAGCTTGGTTGACTTTGCCTCGTCCGTACTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGG
TCTTTGGCATCAACTGCGTAGGCGCGAACGAAGTAGGTCCCCGTTGGGATGTCGCGTTCT
AGGGTATATTCGAATGATTGAGGGGATTTATCATAGGGCCTGGCAATGATCTTGTGTGGG
CAGCTTTTATCCTTGAAGAGCTCATTTTCTGTCTTGCGCCATGGTCGGTCAACTTGACTT
ACCGGAGCGTAGCATAGCTTTACTTTGATGGTCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTG
GAGCTTAGCTTCCATGTAATGCTCAACTTGTCAATTCCGGCATCCAAAACGCCTTCTCGG
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GTAGCACCATGACTA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4H547TF 729 0 0
TACGCAAAGTAAACAACTCATTTGCTCTGCTCTATCTTGGCTTTCCTCTTCTCGTTGACA
AAGAAGACAAGAAGAGCCAGGACGGAGAACACGCTGAAGCAGACGGAGGCAATATCCAAG
GACTTGTGGCGACCACTGATAGCCTGAACACTGAAGAGCTTGGTTGACTTTGCCTCGTCC
GTGCTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGGCCTTTGGCATCAACTGCGTAGGCGCGAACGAAG
TAGGTCCCCGTTGGGATGTCGCGTTCTAGGGTATATTCAAATGATTGAGGGGATTTATCA
TAGGGCCTGGCAATGATCTTGTGTGGGCAGCTTTTATCCTTGAAGAGCTCATTTTCTGTC
TTGCGCCATGGTCGGTCAACTTGACTTACCGGAGCGTAGCATAGCTTTACTTTGATGGTC
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ATTCCGGCATCCAAAACGCCTTCTCGGCTGGGTGTAGCAGTGACCTCAAGTGCACCTTTC
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ATTAGAAGTGAAGCGAAGAAGATCTTGTGGATAGCCATGGAGATCTTTGAATCTGAATAT
TTAGAAATTAAGGCTTATGAAGAGAAGAGGAATATGCCTTTGTTTTGCTGACTTTTATGT
TTGATATCC

QA 1 729 1 729
DS 



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GATAGTAAAAAAGTTATATCTTTTATTTTAAACAATTATTTGTGCTTATTTTTTTTATCC
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AACCAAAATTTGAACACCTAAATAAATGTGTTTC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BI72TF U 1
AF RR4BG49JQ C 1
AF RR4BG49TF U 1
AF RR4BI72JQ C 1
BS 1 651 RR4BI72TF
BS 652 694 RR4BG49TF

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GTAGCATAGCTTTACTTTGATGGTCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTGGAGCTTAG
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GTATTGATCAGGATTCAGGCTTGACGTTAGTAATTTGCTCGGCTCTTCTAACGATATTTT
GATAGTAAAAAAGTTATATCTTTTATTTTAAACAATTATTTGTGCTTATTTTTTTTATCC
GGTTAGGCCGAAATCTAAATTTTTCTACCCTCTAGATCTGCGGATAGTCTCTAACGTAAG
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QA 1 651 1 651
DS 

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CTTCCATGTAATGCTCAACTTGTCAATTCCGGCATCCAAAACTGAAAACCCATAAATAAA
GTATTGATCAGGATTCAGGCTTGACGTTAGTAATTTGCTCGGCTCTTCTAACGATATTTT
GATAGTAAAAAAGTTATATCTTTTATTTTAAACAATTATTTGTGCTTATTTTTTTTATCC
GGTTAGGCCGAAATCTAAATTTTTCTACCCTCTAGATCTGCGGATAGTCTCTAACGTAAG
TGGGATTCCGAACCCTGATCGCCCAACATTTCAGAAAAGAACATTGAAATCAAAAACCTA
AACCAAAATTTGAACACCTAAATAAATGTGTTTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BG49TF 694 0 0
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GAGCTTGGTTGACTTTGCCTCGTCCGTGCTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGGTCTTTGGC
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GTAGCATAGCTTTACTTTGATGGTCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTGGAGCTTAG
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GATAGTAAAAAAGTTATATCTTTTATTTTAAACAATTATTTGTGCTTATTTTTTTTATCC
GGTTAGGCCGAAATCTAAATTTTTCTACCCTCTAGATCTGCGGATAGTCTCTAACGTAAG
TGGGATTCCGAACCCTGATCGCCCAACATTTCAGAAAAGAACATTGAAATCAAAAACCTA
AACCAAAATTTGAACACCTAAATAAATGTGTTTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BI72JQ 694 0 0
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ATCCTTGAAGAGCTCATTTTCTGTCTTGCGCCATGGTCGGTCAACTTGACTTACCGGAGC
GTAGCATAGCTTTACTTTGATGGTCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTGGAGCTTAG
CTTCCATGTAATGCTCAACTTGTCAATTCCGGCATCCAAAACTGAAAACCCATAAATAAA
GTATTGATCAGGATTCAGGCTTGACGTTAGTAATTTGCTCGGCTCTTCTAACGATATTTT
GATAGTAAAAAAGTTATATCTTTTATTTTAAACAATTATTTGTGCTTATTTTTTTTATCC
GGTTAGGCCGAAATCTAAATTTTTCTACCCTCTAGATCTGCGGATAGTCTCTAACGTAAG
TGGGATTCCGAACCCTGATCGCCCAACATTTCAGAAAAGAACATTGAAATCAAAAACCTA
AACCAAAATTTGAACACCTAAATAAATGTGTTTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 9

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AACTCTCGAGAGTTTTGAATTACTAACCGAACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAAT
AAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAACTCCTTTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATT
TTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGTAACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTA
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GTTTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGATCCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCTT
CACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATCCCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAAT
AGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGTGCCAACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTT
TAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGATAAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGT
GCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTGATCTTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATA
AGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATCCTCGAGACCTTTGGCGCTGACAAGAACAAC
TTCAAGCGTTCCATGCGGCATTTT*CTTCTCCTTCTTCTCTTCTGATCTTTTTCTTCAAA
AGAATCTCAGAGAAAGTGAAAGATTCAGATCCCCCAAAAGAGAGGTGTGAGAGGCTTTTG
TCTGATTGGTTGGTTTTGTAATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 50 50 35 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 5 5 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4GP29JQ U 1
AF RR4DP20JQ U 1
AF RR4GW60JQ U 1
AF RR4F813TF C 15
AF RR4DO81JQ U 30
AF RR4FN82TF C 52
AF RR4DV15JQ U 30
AF RR4DO81TF C 33
AF RR4DV15TF C 154
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BS 54 54 RR4GP29JQ
BS 55 282 RR4DP20JQ
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BS 649 730 RR4DO81JQ
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GG
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CTCTCGAGAGTTTTGAATTACTAACCGAACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAATAA
GAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAACTCCTTTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATTTT
ATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGTAACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAGT
AAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCCATAAGACTCTTCCTCAAAACCCCTGCTTCGGT
TTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGATCCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTAATCCTTCA
CCACATTGTATGCAGCTGGGGGGATATCTCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAATAG
TTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTATGCCAACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTTTA
ACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGA
C

QA 3 512 3 512
DS 

RD RR4DP20JQ 630 0 0
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AACTCTCGAGAGTTTTGAATTACTAACCGAACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAAT
AAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAACTCCTTTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATT
TTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGTAACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTA
GTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCCATAAGACTCTTCCTCAAAACCCCTGCTTCG
GTTTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGATCCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCTT
CACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATCTCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAAT
AGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGTGCCAACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTT
TAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGATAAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGT
GCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTGGTCTTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATA
AGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATC

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DS 

RD RR4GW60JQ 648 0 0
GA
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CTCTCGAGAGTTTTGAATTACTAACCGAACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAATAA
GAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAACTCTTTTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATTTT
ATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGTAACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAGT
AAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCCATAAGACTCTTCTTCGAAACCCCTGCTTCGGT
TTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGATCCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCTTCA
CCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATCCCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAATAG
TTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGTGCCAACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTTTA
ACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGATAAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGTGC
CTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTGATCTTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATAAG
GATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATCCTCGAGACCTTTGGCGCT

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR4F813TF 754 0 0
TCTAAATACCAAG
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CGAACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAATAAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAG
AACTCCTCTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATTTTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAG
AGTAACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCC
TCCATAAGACTCTTCCTCAAAACCCCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCC
GATCCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCTTCACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGAT
ATCTCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAATAGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTC
TGTGCCAACATCTGCGTCAAAGAGTTTGGCTTTTAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATT
GAAGATAAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGTGCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTT
CTGGTCTTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATAAGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGA
ATCCTCGAGACCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGCGTTCCATGCGTCATTTTTCT
TCTCCTTCTTCTCTTCTGATATTTTTCTTCAAAAGAATCTCAGAGAAAGTGAAAGATTCA
GATCCCCCAATAGAGAGGT
CC

QA 14 752 14 752
DS 

RD RR4DO81JQ 701 0 0
G
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ACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAATAAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAAC
TCTTTTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATTTTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGT
AACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCC
ATAAGACTCTTCTTCGAAACCCCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGGTTGAAGGATAGTCCGAT
CCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCACCACCACATTGTATGCAGCTGGGGGGATATC
CCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAATAGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGT
GCCAACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTTTAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAA
GATAAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGTGCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTG
ATCTTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATAAGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATC
CTCGAGACCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGCGTTCCATGCGGCATTTT*CTTCT
CCTTCTTCTCTTCTGATCTTTTTCTTCAAAAGAATCTCAG

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DS 

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AATAAAAATAAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAACTCCTCTTTCAAGAGGGAAGCC
CTCAACATTTTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGTAACACACATTTGGTGTTTTTG
ATCTCTTTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCCATAAGACTCTTCCTCAAAACC
CCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGATCCAGATCTCGCCTTTGAACTC
TTCATCCTTCACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATCTCCTTCCAGGAAAACCGCCTC
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TTTGGCTTTTAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGATAAATGTCTCATTCCATTC
CGGAGTTGTGCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTGGTCTTGAGTCCGGCAAGTGAG
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AAGAACAACTTCAAGCGTTCCATGCGTCATTTTTCTTCTCCTTCTTCTCTTCTGATATTT
TTCTTCAAAAGAATCTCAGAGAAAGTGAAAGATTCAGATCCCCCAATAGAGAGGT
CC

QA 1 715 1 715
DS 

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G
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ACAGAACAGAACAATAACAATAATAAAAATAAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAAC
TCTTTTTTCAAGAGGGAAGCCCTCAACATTTTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGT
AACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCC
ATAAGACTCTTCTTCGAAACCCCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGAT
CCAGATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCACCACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATC
CCCTTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAATAGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGT
GCCAACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTTTAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAA
GATAAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGTGCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTG
ATCTTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATAAGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATC
CTCGAGACCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGCGTTCCATGCGGCATTTT*CTTCT
CCTTCTTCTCTTCTGATCTTTTTCTTCAAAAGAATCTCAGAGAAAGTGAAAGATTCAGAT
CCCCCAAAAGAGAGGTGTGAGAGGCTTTTGTCTGATTGGTTGGTTTTGTAATCC

QA 2 775 2 775
DS 

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ACAATAATAAAA*TAAGAATAAGAAGAAACTCTCTTAACAGAACTC*TTTTTCAAGAGGG
AAGCCCTCAACATTTTATTACCAAGACTCAACAAATTAAAGAGTAACACACATTTGGTGT
TTTTGATCTCTTTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCCATAAGACTCTTCTTCG
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AACTCTTCATCCACCACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATCCCCTTCCAGGAAAACC
GCCTCCAATGGAATAGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGTGCCAACATCTGTGTCA
AAGAGTTTGGCTTTTAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGATAAATGTCTCATTC
CATTCCGGAGTTGTGCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTGATCTTGAGTCCGGCAA
GTGAGGAGCACATAAGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATCCTCGAGACCTTTGGCG
CTGACAAGAACAACTTCAAGCGTTCCATGCGGCATTTT*CTTCTCCTTCTTCTCTTCTGA
TCTTTTTCTTCAAAAGAATCTCAGAGAAAGTGAAAGATTCAGATCCCCCAAAAGAGAGGT
GTGAGAGGCTTTTGTCTGATTGGTTGGTTTTGTAATCC

QA 15 772 15 772
DS 

RD RR4DV15TF 651 0 0
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ACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTTTTCCAGCCTCCATA
AGACTCTTCTTCGAAACCCCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGTTTGAAGGATAGTCCGATCCA
GATCTCGCCTTTGAACTCTTCATCCACCACCACATTGTATGCAGCTGGTGGGATATCCCC
TTCCAGGAAAACCGCCTCCAATGGAATAGTTGCTTCACCAAGGGGATCATCCTCTGTGCC
AACATCTGTGTCAAAGAGTTTGGCTTTTAACTCTGTAGTTCCTTCAGAGACATTGAAGAT
AAATGTCTCATTCCATTCCGGAGTTGTGCCTTGTCCTGATGCAACATTGCTCTTCTGATC
TTGAGTCCGGCAAGTGAGGAGCACATAAGGATCCATGCTATTCAGAAAATCAGAATCCTC
GAGACCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGCGTTCCATGCGGCATTTT*CTTCTCCT
TCTTCTCTTCTGATCTTTTTCTTCAAAAGAATCTCAGAGAAAGTGAAAGATTCAGATCCC
CCAAAAGAGAGGTGTGAGAGGCTTTTGTCTGATTGGTTGGTTTTGTAATCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 8

CO CL541Contig1 1717 8 6 U
GGGGGAATGCATCTGTGGTTATATGCTGTATAGGTGCTAGTGAGAAAGAAGTATCAGATA
TCACCGGTCCTTACAGGATTGATTACTTAGCTACTAAAAACCTTGTTGATGCTGCAACAT
CTGCAAAGGTTAATAACTTCATCTTGGTGACATCCTTGGGGACAAATAAATTTGGATTTC
CCGCTGCTATTCTCAACCTATTCTGGGGAGTTCTTTGCTGGAAGAGAAAAGCTGAAGAAA
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CTGATACATACGAGGAAACTCATAATCTCACTCTTGCTCTAGATGATACTTTGTTTGGTG
GTCAGGTCTCAAATCTCCAGGTTGCAGAATTGCTAGCTTGTATGGCTAAGAACCCTCAAC
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AAAAACTTCTTGAAAAGATTCCTTCAAAACGTCTTTATGTGCCTCCTCCACCAAAGGAAT
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CAGCCAAAGAGGTAACACCAGTTCCTACTGAGCCTGTCACGCAAGAACCAACACCTCCCA
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ATGAAGACTTGAAACCTCCAACATCTCCTATTCCGGCCACAGCACTTGGTGCCACCAAAG
CTAAGGAGGTGGATGCAACTCCGGTTCCAGAGGTGGAAGCAACTCAGGCTCCTGTTGAGG
CCAATGTAGCTCCACCACCGGAAAATCCTGTTGAGGTCAATGTCCCAGAAGCAGTAGAAG
TGAAACAAGTTGAGGAAAAGAAAGAGAGGCCTCTTTCTCCTTATGCTAGCTATGACAATC
TAAAACCCCCTTCATCACCCACTCCTAAAGCTTCGGGTATCCGCAAGAGCGACTCTGTGG
CGGCGCCTGTTCCAACCGATTCTGGTACTGTTGAAAGCTCAACAGTTGCAATAAGTGTCA
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ACGCAGACCTGAAACCACCAACCTCACCAACTCCTGCATCAACCGGTCCCAAGAAAACAG
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GTAGTGTAAAAACGACTGAATCTGCTTCCGTGCCAGAAGCAGAAACTGTTAACCATGTGA
CAGACACTTCCCTTACACCAGAAGAAAGTGCAGCTAATCCGCCAAAGCCAAGACCATTGT
CACCTTACACAATGTATGAGGACATGAAGCCTCCAACATCACCTCTTCCATCCCCGGTCA
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TCTTTGCTTCAGATTTTAAGAAAAAATGAGAGAGGTGTGGGGCAAATCAGTTTTGCAGGT
ATGAATCATTGAGCTTATATATGTAAAAGTAATACAAGATTCATCTTTTGCTTTCTTGAG
TTCTGTTCAAATACTCATCCATTTCTTATAACCCATTTGTTTCCTTCTCACATTTTTTTT
TTTGCACACATATATATAACCAAAAAGTTTGTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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GTGCCACCAAAGCTAAGGAGGTGGATGCAACTCCGGTTCCAGAGGTGGAAGCAACTCAGG
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AAGCAGTAGAAGTGAAACAAGTTGAGGAAAAGAAAGAGAGGCCTCTTTCTCCTTATGCTA
GCTATGACAATCTAAAACCCCCTTCATCACCCACTCCTAAAGCTTCGGGTATCCGCAAGA
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TATTTGTGAA
TGATT

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AATGAGAGAGTTGTGGGGCAAATCAGTTTTGCAG

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G
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DS 



AS 2 8

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GTTAGTCATCGATTTGGTGATGGTCGCCATCTTGGCCTGAGTGTCTAAGCGGATCGCGTT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA37TF U 1
AF RR4GA37JQ C 13
AF RR4DO51JQ U 725
AF RR4DO51TF C 725
AF RR4EK90JQ U 725
AF RR4EK90TF C 969
BS 1 639 RR4GA37TF
BS 640 724 RR4GA37JQ
BS 725 970 RR4DO51JQ
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RD RR4GA37TF 639 0 0
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CTTGGGATGACGGGATCTATCATGGTGTCCATGAGATCAAACTTGTTTACGATCACTGCA
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GAGGTCAGGGAGGCGACAAAACAACAGAGATAAAGCTGCAATACCCAGAAGAGTATCTGA
TTGGCGTGAGTGGTTACTACAGTCCAGTAATACACAGTGGCACTCCTGTGATCAGATCAA
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TCACTTTCTCAGTTAACGGAGGACGCATTGTTGGCATGAACGGTAGAAGCGGCTGGTACC
TTGACTCCATCGGCTTCCATCTCTCGCGCCCTAAATCAACCAAGATGATCAACGAGCTTC
GAAAGAAGATTCACTGGTTCACAAGAATGGTTGCATGAC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4GA37JQ 784 0 0
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AGTTTGGTTCTTCTTCATAGATGCAGGACGGACACATGGATCAACAACAACAGGGTGATA
AGAATCTGACTGTGTTCGTAGGACCCTGGGGAGGAAATGGTGGAACGGCTTGGGATGACG
GGATCTATCATGGTGTCCATGAGATCAAACTTGTTTACGATCACTGCATTGACTCCATCT
CTTTGGTCTACGATAAGAATGGTAAAGCTGTCAGATCAGAGAAGCATGGAGGTCAGGGAG
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GTTACTACAGTCCAGTAATACACAGTGGCACTCCTGTGATCAGATCAATGACCTTCAAGA
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GCTTCCATCTCTCGCGCCCTAAATCAACCAAGATGATCAACGAGCTTCGAAAGAAGATTC
ACTGGTTCACAAGAATGGTTGCATGACAAGGCCCTTCTGCATAGAAAACAATAATTTCTG
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CATAAATTTTGTGTTACGAAAACTCACACGAAAGCATATAACAATAATTGAAATTGTGCA
AAC
C

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DS 

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C

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DS 

RD RR4DO51TF 570 0 0
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AGCCTCTTGGACAAATCATCCTCATCAACTTTCTCCTCTGTCGCAGTAGGGATCGAATGA
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ATCAGGTTGTTGACGTCGCCTTCTGGAGTGGACAACGATGTCGAACCAGCCATTGCGTTC
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TCTGACATCTTCTGTAGGTTGCCTGTGGCAAGGGAAGACTCAAGGGACTTGACGATGTTA
GTCATCGATTTGGTGATGGTCGCCATCTT
C

QA 1 569 1 569
DS 

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TTTCGATAAGGATCTTGTCCTAAGTGGTAGATTGTTCATCCTCTGGCCTTGAGCACTGCA
AGCCTCCTGGACAAATCATCCTCATCAACTTTCTCCTCTGTCGCAGTAGGGATCGAATGA
CCAGCAGCCTGAGGTAGTCCAACAGAGACTTCAAGACCGTAATCATCTGCCACCTGCTGC
ATCAGGTTGTTGACGTCGCCTTCTGGAGTGGACAATGATGTCGAACCAGCCATTGCGTTC
TCCATGAACTCAGCTTGCACCTCCATGTTCACAAACTGCTTCTCAAATGAATCCATCGTC
TCTGACATCTTCTGTAGGTTGCCTGTGGCAAGGGAAGACTCAAGGGACTTGACGATGTTA
GTCATCGATTTGGTGATGGTCGCCATCTTGGCCTGAGTGTCTAAGCGGATCGCGTTCTCG
GCGTAGATCCGAGCTCCGTCCATGGTCCCCTTCTCGATCGCCTTCTTAACCTTGAGCTTC
TCTGCCTTCTGGAGAGACTTGGACGTGAATTTCAGGTCGAATATCTGGTTAATTAGCTTG
TCTGTGTTACCCATGTTGAAAATCGATTCAGATTTGATCG*TGGAGATTCCAATTAGAGA
TAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4EK90TF 589 0 0
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CAGCCTGAGGTAGTCCAACAGAGACTTCAAGACCGTAATCATCTGCCACCTGCTGCATCA
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TGAACTCAGCTTGCACCTCCATGTTCACAAACTGCTTCTCAAATGAATCCATCGTCTCTG
ACATCTTCTGTAGGTTGCCTGTGGCAAGGGAAGACTCAAGGGACTTGACGATGTTAGTCA
TCGATTTGGTGATGGTCGCCATCTTGGCCTGAGTGTCTAAGCGGATCGCGTTCTCGGCGT
AGATCCGAGCTCCGTCCATGTTCCCCTTCTCGATCGCCTTCTTAACCTTGAGCTTCTCTG
CCTTCTGGAGAGACTTGGACGTGAATTTCAGGTCGAATATCTGGTTAATTAGCTTGTCTG
TGTTACCCATGTTGAAAATCGATTCAGATTTGATCGGTGGAGATTCCAATTAGAGATAAT
TAGGGTTTTTATTTGAATTTGGGGGGAAGGTCTCGACGCGTTTGTTTTA

QA 1 589 1 589
DS 



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GCACCTCCATGTTCACAAACTGCTTCTCAAATGAATCCATCGTCTCTGACATCTTCTGTA
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TGGTCGCCATCTTGAGCTTCTCTGCCTTCTCCTCCTTCTCGCACTTCCTCGACTGCCTCT
GGAGAGACTTGGACGTGAATTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO23TF C 1
AF RR4C784JQ U 1
BS 1 2 RR4GO23TF
BS 3 562 RR4C784JQ

RD RR4GO23TF 233 0 0
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CATCCTCATCAACTTTCTCCTCTGTCGCAGTAGGGATCGAATGACCAGCAGCC

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR4C784JQ 562 0 0
AG
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TATACACAAATGCGTCAGTGTTCGCAGATAGTAGTAGCAACATTTCGATAAGGATCTTGT
CCTAAGTGGTAGATTGTTCATCCTCTGGCCTTGAGCTCTGCAAGCCTCCTGGACAAATCA
TCCTCATCAACTTTCTCCTCTGTCGCAGTAGGGATCGAATGACCAGCAGCCTGAGGTAGT
CCAACAGAGACTTCAAGACCGTAATCATCTGCCACCCGCTGCATCAGGTTGTTGACGTCG
CCTTCTGGAGTGGACAACGATGTCGAACCAGCCATTGCGTTCTCCATGGACTCAGCTTGC
ACCTCCATGTTCACAAACTGCTTCTCAAATGAATCCATCGTCTCTGACATCTTCTGTAGG
TTGCCTGTGGCAAGGGAAGACTCAAGGGACTTGACGATGTTAGTCATCGATTTGGTGATG
GTCGCCATCTTGAGCTTCTCTGCCTTCTCCTCCTTCTCGCACTTCCTCGACTGCCTCTGG
AGAGACTTGGACGTGAATTT

QA 3 562 3 562
DS 



AS 1 9

CO CL543Contig1 774 9 15 U
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GGAACTTCTCTACGGTGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCT
CTACCGGAGAATTGATTAGGGCTCTTCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTCTA
CTCGTGCCGCACACAATGAAGAGGCCGCCGCGAAATCTGCTTCTGACACCGGAGCCCCGA
CCATATTTGACAAGATCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGA
GTGTTTTGGCATTCAGAGACATAAACCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTA
AGTTGAGAGATGGCTTGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTG
GTCAACTTCTGCACGCATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCC
GTGTGGTTATAAACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTTACCATCTTCATCTCCACG
TACTTGGGGGCCGACAGATGAAGTGGCCACCCGGTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACC
AAATCATGCACAATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGCTGTTCAAATTCTGTTAAT
TGTAATCCTTTTCGCTTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAAATAAAA
CCATCCGTTCCTAAAAGTTAAATTTATAACTAGAAAAGTTATTTTGTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 40 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 40 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ17TF U 1
AF RR4AM33JQ C 14
AF RR4AM33TF U 14
AF RR4CZ17JQ C 2
AF RR4BN41TF U 37
AF RR4D654TF U 5
AF RR4D654JQ C 73
AF RR4CO59TF U 343
AF RR4BN41JQ C 144
BS 1 586 RR4CZ17TF
BS 587 587 RR4AM33TF
BS 588 643 RR4CZ17TF
BS 644 644 RR4BN41TF
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BS 646 646 RR4CZ17TF
BS 647 648 RR4AM33TF
BS 649 714 RR4CZ17TF
BS 715 715 RR4AM33TF
BS 716 735 RR4CZ17TF
BS 736 736 RR4CO59TF
BS 737 756 RR4D654TF
BS 757 757 RR4D654JQ
BS 758 769 RR4D654TF
BS 770 774 RR4D654JQ

RD RR4CZ17TF 752 0 0
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GGAACTTCTCTACGGTGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCT
CTACCGGAGAATTGATTAGGGCTCTTCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTCTA
CTCGTGCCGCACACAATGAAGAGGCCGCCGCGAAATCTGCTTCTGACACCGGAGCCCCGA
CCATATTTGACAAGATCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGA
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AGTTGAGAGATGGCTTGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTG
GTCAACTTCTGCACGCATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCC
GTGTGGTTATAAACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTTACCATCTTCATCTCCACG
TACTTGGGGGCCGACAGATGAAGTGGCCACCCGGTTAGGAAGAAGG*TTCATGCCAAACC
AAATCATGCACAATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGCT*GTTCAATTCTGTTAAT
TGTAATCCTTTTCGCTTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAA*TAAAA
CCATCCGTTCCTAAA
GTTAATCTAAAAAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4AM33JQ 719 0 0
GG
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TGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCTCTACCGGAGAATTGA
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ATGAAGAGGCCGCCGCGAAATCTGCTTCTGACACCGGAGCCCCGACCATATTTGACAAGA
TCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGAGTGTTTTGGCATTCA
GAGACATAAACCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGAGAGATGGCT
TGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAACTTCTGCACG
CATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGGTTATAAACA
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AGATGAAGTGGCCACCCGTTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCATGCACAATC
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TTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAAATAAAACCATCCGTTCC
G

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4AM33TF 719 0 0
GG
GAGCTTCTTCGATGGCTGCCACTTCCTCCTCTGTGATGCTGCTCCGGAACTTCTCTACGG
TGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCTCTACCGGAGAATTGA
TTAGGGCTCTTCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTCTACTCGTGCCGCACACA
ATGAAGAGGCCGCCGCGAAATCTGCTTCTGACACCGGAGCCCCGACCATATTTGACAAGA
TCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGAGTGTTTTGGCATTCA
GAGACATAAACCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGAGAGATGGCT
TGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAACTTCTGCACG
CATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGGTTATAAACA
ACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTTACCATCTTCATCTCCACGTACTTGGGGGCCGAC
AGATGAAGTGGCCACCCGTTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCATGCACAATC
AGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGCT*TTCAAATTCTGTTAATTGTAATCCTTTTCGC
TTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAAATAAAACCATCCGTTCC
G

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4CZ17JQ 731 0 0
GGGTT
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TCTCTACGGTGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCTCTACCG
GAGAATTGATTAGGGCTCTTCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTCTACTCGTG
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TGGCATTCAGAGACATAAACCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGA
GAGATGGCTTGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAAC
TTCTGCACGCATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGG
TTATAAACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTTACCATCTTCATCTCCACGTACTTG
GGGGCCGACAGATGAAGTGGCCACCCGGTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCA
TGCACAATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGCTGTTCAAATTCTGTTAATTGTAAT
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GTTCCT

QA 6 731 6 731
DS 

RD RR4BN41TF 700 0 0
CTTT
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ATCGAATTCGAGAATCTTCTCTACCGGAGAATTGATTAGGGCTCCTCCTCGTATTGCTTC
TCAAAGAACCATCTCTTCTACTCGTGCCGCACACAATGAAGAGGCCGCCGCGAAATCTGC
TTCTGACACCGGAGCCCCGACCATATTTGACAAGATCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGA
CATTGTCTATGAAGATGAGAGTGTTTTGGCATTCAGAGACATAAACCCACAGGCTCCTGT
TCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGAGAGATGGCTTGACCACGCTTGGTAAGGCTGAACC
AAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAACTTCTGCACGCATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGA
AGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGTTTATAAACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGT
TTACCATCTACATCTCCACGTACTTGGGGGCCGACAGATGAAGTGGTCGCCCGGTTAGGA
AGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCATGCACAATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTA
GCTGTTCAAATTCTGTTAATTGTAATCCTTTTCGCTTAATATGGTTTACTAGTTGTTACC
TGTGATATGGTAAA*TAAAACCATCCGTTC
TAAAAG

QA 5 694 5 694
DS 

RD RR4D654TF 769 0 0
GG
GTCGAAGCAGAGCTTCTTCGATGGCTGCCACTTCCTCCTCTGTGATGCTGCTCCGGAACT
TCTCTACGGTGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCTCTACCG
GAGAATTGATTAGGGCTCTTCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTCTACTCGTG
CCCCACACAATGAAGAGGCCGCCGCGAAATCTGCTTCTGACACCGGAGCCCCGACCATAT
TTGACAAGATCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGAGTGTTT
TGGCATTCAGAGACATAAACCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGA
GAGATGGCTTGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAAC
TTCTGCACGCATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGG
TTATAAACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTTACCATCTTCATCTCCACGTACTTG
GGGGCCGACAGATGAAGTGGCCACCCGGTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCA
TGCACAATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGCTGTTC*AATTCTGTTAATTGTAAT
CCTTTTCGCTTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAA*TAAAACCATCC
GTTCCTAAA*GTTAAATTTATAACTAGAAA*GTTATTTTGTTT
GGTT

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR4D654JQ 702 0 0
CGGTGGGGAGGATTGCTCAATCTGTTCGATCGAATTCGAGAATCTTCTCTACCGGAGAAT
TGATTAGGGCTCTTCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTCTACTCGTGCCCCAC
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AGATCATAGCGAAAGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGAGTGTTTTGGCAT
TCAGAGACATAAACCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGAGAGATG
GCTTGACCACGCTTGGCAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAACTTCTGC
ACGCATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGGTTATAA
ACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTTACCATCTTCATCTCCACGTACTTGGGGGCC
GACAGATGAAGTGGCCACCCGGTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCATGCACA
ATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGCTGTTCAAATTCTGTTAATTGTAATCCTTTT
CGCTTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAAATAAAACCATCCGTTCCT
AAAAGTTAAATTTATAACTAGAAAAGTTATTTTGTTTTGGTT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4CO59TF 418 0 0
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GACACGTAGAAGTTCTTGGTCAACTTCTGCACGCATCAAATATTGTTGCTGAGAAAGAAG
GCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGGTTATAAACAACGGTGCTGAAGGATGCCAATCCGTTT
ACCATCTTCATCTCCACGTACTTGGGGGCCGACAGATGAAGTGGCCACCCGGTTAGGAAG
AAGGGTTCATGCCAAACCAAATCATGCACAATCAGCGAGCTCATCAATGACTGTTTTAGC
TGTTCAAATTCTGTTAATTGTAATCCTTTTCCCTTAATATGGTTTACTAGTTGTTACCTG
TGATATGGTAAAATAAAACCATCCGTTCCTAAAAGTTAAATTTATAACTAGAAA
AGTT

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4BN41JQ 608 0 0
CC
TCCTCGTATTGCTTCTCAAAGAACCATCTCTTTTACTCGTGCCGCACACAATGAAGAGGC
CGCCGCGAAATCTGCTTCTGACACCGGAGCCCCGACCATATTTGACAAGATCATAGCGAA
AGAGATTCCATCAGACATTGTCTATGAAGATGAGAGTGTTTTGGCATTCAGAGACATAAA
CCCACAGGCTCCTGTTCATGTTTTGGTCATCCCTAAGTTGAGAGATGGCTTGACCACGCT
TGGTAAGGCTGAACCAAGACACGTAGAAGTTCTTGGTCAACTTCTGCACGCATCAAAGAT
TGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGGATGGGTTCCGTGTGTTTATAAACAACGGTGCTGA
AGGATGCCAATCCGTTTACCATCTACATCTCCACGTACTTGGGGGCCGACAGATGAAGTG
GTCGCCCGGTTAGGAAGAAGGGTTCATGCCAAACCAAATCATGCACAATCAGCGAGCTCA
TCAATGACTGTTTTAGCTGTTCAAATTCTGTTAATTGTAATCCTTTTCGCTTAATATGGT
TTACTAGTTGTTACCTGTGATATGGTAAAATAAAACCATCCGTTCCTAAAAGTTAAATTT
ATAAC
C

QA 3 607 3 607
DS 



AS 2 9

CO CL544Contig1 704 5 5 U
GGATAACTCAAAATATCTACAACACAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTACCGC
ACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAA
GTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTC
AAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTGGCGGCGGAAGCATCTAG
AGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTTGCTCAAGCAGGATACAAATA
TCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAACGT
GCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCAGGT
CTCGTCTCATTTCAGAAAACACGATGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATC
TCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGG
AGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAATAAAAAACATG
AACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTTG
TGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4DV50TF U 1
AF RR4E841TF U 1
AF RR4DV50JQ C 156
AF RR4E844TF U 3
AF RR4E844JQ C 153
BS 1 422 RR4DV50TF
BS 423 423 RR4E841TF
BS 424 672 RR4DV50TF
BS 673 702 RR4E841TF
BS 703 704 RR4E844TF

RD RR4DV50TF 672 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACAACACAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTACCGC
ACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAA
GTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTC
AAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTGGCGGCGGAAGCATCTAG
AGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTTGCTCAAGCAGGATACAAATA
TCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAACGT
GCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCAGGT
CTTGTCTCATTTCAGAAAACACGATGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATC
TCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGG
AGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAATAAAAAACATG
AACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTTG
TGTATGTCAATG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4E841TF 703 0 0
GGAT
AACTCAAAATATCTACAACACAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTACCGCACGA
ATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAAGTGG
AAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAAC
TTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAACAAATGTGGCGGCGGAAGCATCTAGAGTT
CCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTTGCTCAAGCAGGATACAAATATCTC
GACGCGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAACGTGCCT
TACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCAGGTCTCG
TCTCATTTCAGAAAACACGATGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATCTCTC
ATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGG
TACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAATAAAAAACATGAACC
TATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTTGTGTA
TGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGG
A

QA 5 702 5 702
DS 

RD RR4DV50JQ 547 0 0
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CAAATGTGGCGGCGGAAGCATTTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGGGCGTG
AGCTTGCTCAAGCAGGATACAAATATCTTGACGTGAGGACCCCGGACGAGTTCAGCATCG
GACATCCGTGTAGTGCTATTAACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTA
AGAACCCGAGTTTTTTAAGGCAGGTCTTGTTTCATTTCAGAAAACACGATGAGATCATCA
TCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATTTTTCATGGCTTCCACTGAACTTTTCACTGCTGGCT
TCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAG
TAGAAGAGTGAAAATAAAAAACATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATT
GTATATGTTTCAACACAAGTGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTT
CATTTGG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4E844TF 702 0 0
GG
AACTCAAAATATCTACAACACAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTACCGCACGA
ATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAAGTGG
AAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAAC
TTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTGGCGGCGGAAGCATCTAGAGTT
CCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTTGCTCAAGCAGGATACAAATATCTC
GACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAACGTGCCT
TACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCAGGTCTCG
TCTCATTTCAGAAATCACGATGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAATATCTCTC
ATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGG
TACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAATAAAAGACATGAACC
TATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTTGTGTA
TGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGAC

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR4E844JQ 550 0 0
TCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCA
GAGCAAATGTGGCGGCGGAAGCATCTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGC
GTGAGCTTGCTCAAGCAGGATACAAATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCA
TCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGG
TTAAGAACCCGAGTTTTTTAAGGCAGGTCTCGTCTCATTTCAGAAATCACGATGAGATCA
TCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAATATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTG
GCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTAC
CAGTAGAAGAGTGAAAATAAAAGACATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATA
ATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAG
TTTCATTTGG

QA 1 550 1 550
DS 



CO CL544Contig2 713 4 11 U
GGAACTCAAAGTATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACAAC
CGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGTTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTT
CAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTC
AAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAACAGCAGC
TAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAA
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CGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGGTCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCA
GGTATCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAG
ATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGC
TGGAGGATACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAAA
AAAACATGGACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACA
AGTGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4E360TF U 1
AF RR4DE50TF U 7
AF RR4DE50JQ C 7
AF RR4E360JQ C 26
BS 1 26 RR4E360TF
BS 27 27 RR4DE50TF
BS 28 29 RR4E360TF
BS 30 31 RR4DE50TF
BS 32 137 RR4E360TF
BS 138 138 RR4DE50TF
BS 139 453 RR4E360TF
BS 454 588 RR4DE50TF
BS 589 699 RR4DE50JQ
BS 700 700 RR4E360JQ
BS 701 713 RR4DE50JQ

RD RR4E360TF 453 0 0
GGAACTCAAAGTATCTACGAACACAAAAA**AAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACAAC
CGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGTTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTT
CAAGTGGAAGCTACCAAGGGCAACAAGAAGAGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTC
AAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAACAGCAGC
TAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAA
ACATCTTGACGTCAGGACACCGGACGAGTTCAGTATCGGACATCCGTCTAGAGCTATTAA
CGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGGTCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCA
GGTATCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGAT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4DE50TF 582 0 0
G
AAAGTATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACAACCGCACGA
ATCGGGAGCTGGTCATCGTTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAAGTGG
AAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAACTTC
CGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAGCAGCTAGAGTT
CCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAAACATCTT
GACGTCAGGACACCGGACGAGTTCAGTATCGGACATCCGTCTAGAGCTATTAACGTGCCT
TACATGTACAGAGTCGGGTCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCAGGTATCG
TCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATCTCTC
ATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGA
TACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTG

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR4DE50JQ 707 0 0
G
AAAGTATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACAACCGCACGA
ATCGGGAGCTGGTCATCGTTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAAGTGG
AAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAACTTC
CGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAGCAGCTAGAGTT
CCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAAACATCTT
GACGTCAGGACACCGGACGAGTTCAGTATCGGACATCCGTCTAGAGCTATTAACGTGCCT
TACATGTACAGAGTCGGGTCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTTTAAGGCAGGTATCG
TCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATCTCTC
ATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGA
TACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAAAAAAACAT
GGACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTT
GTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAATTTTCATTTGGAGC

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR4E360JQ 685 0 0
AAAAA
AAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACAACCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGTTTAT
ATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAAGTGGAAGCTACCAAGGGCAACAAGAAG
AGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGG
CAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAACAGCAGCTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGT
TGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAAACATCTTGACGTCAGGACACCGGACGAGTT
CAGTATCGGACATCCGTCTAGAGCTATTAACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGGTCAGG
AATGGTTAAGAACCCGAGTTTTTTAAGGCAGGTATCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGA
GATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGAGAAAGATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCAC
TGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGATACGTTGCCTGGACAGAGAATGA
ACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAAAAA**CATGGACCTATCCGTTTGTAAATTTG
CAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAA
ATGATATAAGTTTCATTTGG

QA 6 685 6 685
DS 



AS 1 8

CO CL545Contig1 971 8 17 U
CATGTTTCTATTCATACTTGTATTTAAATAAGGATTCCACTAAAGTACAAAAGAAAAAAT
ACATTGAACTTATTTGTAACAGTTGACAGCAAAACAATTAGTAAACACACAATACAAAAA
AAAAAGATCCTTTTAAACTTGCTTACTTGCTGATTTGTTCATCAATTAACAACAAGGACC
AGATAATATTCATTACATAGGCTCTCAAAAGGATGATACATGGCTTACAAGTTCTAAGCA
GTGTAGTTGATCTGAAACAGTCTGTTCATGAAATGCAAGCGCCCATCACCCATTGTTTGC
ATTCAGAGCTTGACCTCCACATCAACACCAGCAGGGAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCG
ATGGTCTGAGCAGTAGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCGGATCTCAAAG
TGGAACCTTGCATCCTTGTGAACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAGATACGCTTCTTG
GTTGGCAATGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTAGTATTCCTCGCAGCGTCAAGTATC
TGCTTACATGAGTCCTCAATAAGAGGCACCCAATATGATCTAAGCTTGATCCTAATCTTC
TGCTTTGGCGCCATCTTATCTGCGTCTACACTTATGGAGGAAGAGCTCGGAACCTCGGAG
AATTCCTCAGAGGATGGTTGATCGAGAGTTAGGGTTTCGGGAGCAGCGAAGATCTTATTC
GTGAACAAGGAGGAAGGTGTGTTAAGGACGGAGGAGCCGGAGCCAATGCTGCTGCTGACA
TGAGTAGAAGAAGATGGAAGTAGTGAAAGCAGAGAGACTTTCTGTCTGGTGGGAGAAGAC
GAAGAGGTGGGATTGGCGAGAGAGGGCAATGTGAACCAAGTTACAGAAGAAACCGCCATT
GAAATTATCAAACCAAGAACCGATCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTGCAGCT
TCGCTTCAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E736JQ U 26
AF RR4E736TF C 26
AF RR4F058JQ U 1
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C

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CTTGCTGATTTGTTCATCAATTAACAACAAGGACCAGATAATATTCATTACATAGGCTCT
CAAAAGGATGATACATGGCTTACAAGTTCTAAGCAGTGTAGTTGATCTGAAACAGTCTGT
TCATGAAATGCAAGCGCCCATCACCCACTGTTTGCATTCAGAGCTTGACCTCCACATCAA
CACCAGCAGGGAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGAT
C

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DS 

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ATTCAAAGCTTGACCTCCACATCAACACCAGCAGGGAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCG
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C

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ACATTGAACTTATTTGTAACAGTTGACAGCAAAACAATTAGTAAACACACAATACAAAAA
AAAAAGATCCTTTTAAACTTGCTTACTTGCTGATTTGTTCATCAATTAACAACAAGGACC
AGATAATATTCATTACATAGGCTCTCAAAAGGATGATACATGGCTTACAAGTTCTAAGCA
GTGTAGTTGATCTGAAACAGTCTGTTCATGAAATGCAAGCGCCCATCACCCATTGTTTGC
ATTCAGAGCTTGACCTCCACATCAACACCAGCAGGGAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCG
ATGGTCTGAGCAGTAGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCGGATCTCAAAG
TGGAACCTTGCATCCTTGTGAACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAGATACGCTTCTTG
GTTGGCAATGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTAGTATTCCTCGCAGCGTCAAGTATC
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TGCTTTGGC
C

QA 1 609 1 609
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CTTGCTGATTTGTTCATCAATTAACAACAAGGACCAGATAATATTCATTACATAGGCTCT
CAAAAGGATGATACATGGCTTACAAGTTCTAAGCAGTGTAGTTGATCTGAAACAGTCTGT
TCATGAAATGCAAGCGCCCATCACCCATTGTTTG*ATTCAGAGCTTGACCTCCACATCAA
CACCAGCAGGGAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATGGTCTGAGCAGTAGGGTAGAGAA
TATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCGGATCTCAAAGTGGAACCTTGCATCCTTGTGAACGT
GGGGAGACTTGAGAACACAGTAGATACGCTTCTTGGTTGGCAAT**AACAGGACCCATCG
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GGACGGAGGAGCC

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AT
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ACAATACAAAAAAAAAAGATCCTTTTAAACTTGCTTACTTGCTGATTTGTTCATCAATTA
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AAGTTCTAAGCAGTGTAGTTGATCTGAAACAGTCTGTTCATGAAATGCAAGCGCCCATCA
CCCATTGTTTGCATTCAGAGCTTGACCTCCACATCAACACCAGCAGGGAGATCCAGCTGC
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CGGATCTCAAAGTGGAACCTTGCATCCTTGTGAACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAG
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GGAACCTCGGAGAATTCCTCAGAGGATGGTTGATCGAGAGTTAGGGTTTCGGGAGCAGCG
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CTGCTGCTGACA

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GCATCAAGGAGTCGATGGTCTGAGCAGTAGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAG
TCCGGATCTCAAAGTGGAACCTTGCATCCTTGTGAACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGT
AGATACGCTTCTTGGTTGGCAAT**AACAGGACCCATCGTCTTGGCATTAGTATTCCTCG
CAGCGTCAAGTATCTGCTTACATGAGTCCTCAATAAGAGGCACCCAATATGATCTAAGCT
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TCGGAACCTCGGAGAATTCCTCAGAGGATGGTTGATCGAGAGTTAGGGTTTCGGGAGCAG
CGAAGATCTTATTCGTGAACAAGGAGGAAGGTGTGTTAAGGACGGAGGAGCCGGAGCCAA
TGCTGCTGCTGACATGAGTAGAAGAAGATGGAAGTAGTGAAAGCAGAGAGACTTTCTGTC
TGGTGGGAGAAGACGAAGAGGTGGGATTGGCGAGAGAGGGCAATGTGAACCAAGTTACAG
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CCTCTTC
T

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CCCATCGTCTTGGCATTAGTATTCCTCGCAGCGTCAAGTATCTGCTTACATGAGTCCTCA
ATAAGAGGCACCCAATATGATCTAAGCTTGATCCTAATCTTCTGCTTTGGCGCCATCTTA
TCTGCGTCTACACTTATGGAGGAAGAGCTCGGAACCTCGGAGAATTCCTCAGAGGATGGT
TGATCGAGAGTTAGGGTTTCGGGAGCAGCGAAGATCTTATTCGTGAACAAGGAGGAAGGT
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AGAGAGGGCAATGTGAACCAAGTTACAGAAGAAACCGCCATTGAAATTATCAAACCAAGA
ACCGATCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTGCAGCTTCGCTTCAAGC

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DS 



AS 1 8

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GCACCGGAGACGCGGCGGTTGTGGATCCAGTTGAACCGGAGAAGGTGATTCAGTCGGCTG
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ATAAGGTCAAGGGATGCACTGATGCGGTCGATAATGGTGACACTTCGTCTTTGGGTCATG
ATCTCAACATCTTAGCTCTTCACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATG
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GCTGTGGGAAGTTTTTCGAAGGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTC
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TGGAGTTTGCTTTGACTGTGGAACCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGG
CCCGTCAACAGCGCCAAGCAAATCTTCCCACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAAGAACTCG
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CACCGATCGATACTTTCAGAGAAATCAGGAACAAGAAGGATCAGTGGAGGGGCTAAGAAT
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TCTCTGTTTCTAGTTTCCTGTGGATAACAATAAATGAGTACCGTCTTTGTTGTGTTTGAT
CCAAAAAAATAAAACCTTTGGATGAAAAATAATTGTCCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH68TF U 1
AF RR4AP83TF U 13
AF RR4DP77TF U 73
AF RR4FB06JQ C 234
AF RR4EH68JQ C 322
AF RR4D474JQ C 554
AF RR4DP77JQ C 384
AF RR4D474TF U 450
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BS 527 625 RR4AP83TF
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BS 719 734 RR4DP77TF
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BS 750 758 RR4DP77TF
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BS 760 771 RR4DP77TF
BS 772 772 RR4D474TF
BS 773 798 RR4DP77TF
BS 799 962 RR4D474TF
BS 963 963 RR4FB06JQ
BS 964 1001 RR4D474TF

RD RR4EH68TF 526 0 0
TGAAGATCTTCCACGTTCCTTGTTTAGAAGACAACTACTCCTATCTGGTAATCGATGAGA
GCACCGGAGACGCGGCGGTTGTGGATCCAGTTGAACCGGAGAAGGTGATTCAGTCGGCTG
AGAAGCACAGTGCAAAGATCAAGTTCGTTCTCACCACACATCATCACTGGGATCATGCTG
GTGGAAACGAGAAGATGAAGCAGTTGGTGCCTGGAATCAAAGTCTATGGAGGTTCTCTTG
ATAAGGTCAAGGGATGCACTGATGCGGTCGATAATGGTGACACTTCGTCTTTGGGTCATG
ATCTCAACATCTTAGCTCTTCACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATG
TCACTGGCAAAGATGGAGAATCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTG
GCTGTGGGAAGTTTTTCGAAGGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTC
TGGCTTCACTACCTAAACCCACCCTGGTTTACTGCGGCCACGAGTA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4AP83TF 613 0 0
ACGTTCCTTGTTTAGAAGACAACTACTCCTATCTGGTAATCGATGAGAGCACCGGAGACG
CGGCGGTTGTGGATCCAGTTGAACCGGAGAAGGTGATTCAGTCGGCTGAGAAGCACAGTG
CAAAGATCAAGTTCGTTCTCACCACACATCATCACTGGGATCATGCTGGTGGAAACGAGA
AGATGAAGCAGTTGGTGCCTGGAATCAAAGTCTATGGAGGTTCTCTTGATAAGGTCAAGG
GATGCACTGATGCGGTCGATAATGGTGACACTTCGTCTTTGGGTCATGATCTCAACATCT
TAGCTCTTCACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATGTCACTGGCAAAG
ATGGAGAATCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGT
TTTTCGAAGGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTCTGGCTTCACTAC
CTAAACCCACCCTGGTTTACTGCGGCCACGAGTACACGGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTT
TGACTGTGGAACCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGC
GCCAAGCAAATCT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4DP77TF 726 0 0
G
GGCGGTTGTGGATCCAGTTGAACCGGAGAAGGTGATTCAGTCGGCTGAGAAGCACAGTGC
AAAGATCAAGTTCGTTCTCACCACACATCATCACTGGGATCATGCTGGTGGAAACGAGAA
GATGAAGCAGTTGGTGCCTGGAATCAAAGTCTATGGAGGTTCTCTTGATAAGGTCAAGGG
ATGCACTGATGCGGTCGATAATGGTGACACTTTGTCTTTGGGTCATGATCTCAACATCTT
AGCTCTTCACACCCCTTGTCACACCAAGGGCCACATTAGTTACTATGTCACTGGCAAAGA
TGGAGAATCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGTT
TTTCGAAGGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTCTGGCTTCACTACC
TAAACCCACCCTGGTTTACTGCGGCCACGAGTACACGGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTTT
GACTGTGGAACCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCG
CCAAGCAAATCTTCCCACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAAGAACTCGAAACCAACCCGTT
TATGCGTGTTAATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAGATCACCGATCGATAC
TCTCAGAGAAATCAG*AACAAGAAG*ATCAGTGGAGGG*CTAAGAATCACCGTAGAGCTA
CTTGC

QA 2 726 2 726
DS 

RD RR4FB06JQ 751 0 0
TCTCTTGATAAGGTCAAGGGATGCACTGATGCGGTCGATAATGGTGACACTTCGTCTTTG
GGTCATGATCTCAACATCTTAGCTCTTCACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGT
TACTATGTCACTGGCAAAGATGGAGAATCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTC
GTTGCTGGCTGTGGGAAGTTTTTCGAAGGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGT
GTGACTCTGGCTTCACTACCTAAACCCACCCTGGTTTACTGCGGCCACGAGTACACGGTG
AAGAACTTGGAGTTTGCTTTGACTGTGGAACCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTA
TCATGGGCCCGTCAACAGCGCCAAGCAAATCTTCCCACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAA
GAACTCGAAACCAACCCGTTTATGCGTGTTAATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGT
TGCAAATCACCGATCGATACTTTCAGAGAAATCAGGAACAAGAAGGATCAGTGGAGGGGC
TAAGAATCACCGTAGAGCTACTTGCATAAATGCCTTTTCGTGTGCTGTGGTGAGCCTTTG
AATGTGTGAAACTGTTAAACCGGTTTGTAACCAAAACCGGACCGACATGTATGCCGTCGT
GTACCCTTCTCTGTTTCTAGTTTCCTGTGGATAACAATAAATGAGTACCGTCTTTGTTGT
GTTTGATCCAAAAAAATAAAACCTTTGGATG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4EH68JQ 663 0 0
ACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATGTCACTGGCAAAGATGGAGAAT
CTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGTTTTTCGAAG
GGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTCTGGCTTCACTACCTAAACCCA
CCCTGGTTTACTGCGGCCACGAGTACACGGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTTTGACTGTGG
AACCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCGCCAAGCAA
ATCTTCCCACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAAGAACTCGAAACCAACCCGTTTATGCGTG
TTAATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAAATCACCGATCGATACTTTCAGAG
AAATCAGGAACAAGAAGGATCAGTGGAGGGGCTAAGAATCACCGTAGAGCTACTTGCATA
AATGCCTTTTCGTGTGCTGTGGTGAGCCTTTGAATGTGTGAAACTGTTAAACCGGTTTGT
AACCAAAACCGGACCGACATGTATGCCGTCGTGTACCCTTCTCTGTTTCTAGTTTCCTGT
GGATAACAATAAATGAGTACCGTCTTTGTTGTGTTTGATCCAAAAAAATAAAACCTTTGG
ATG

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DS 

RD RR4D474JQ 408 0 0
GACTGTGGAACCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCG
CCAAGCAAATCTTCCCACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAAGAACTCGAAACCAACCCGTT
TATGCGTGTTAATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAAATCACCGATCGATAC
TTTCAGAGAAATCAGGAACAAGAAGGATCAGTGGAGGGGTTAAGAATCACCGTAGAGCTA
CTTGCATAAATGCCTTTTCGTGTGCTGTGGTGAGCCTTTGAATGTGTGAAACTGTTAAAC
CGGTTTGTAACCAAAACCGGACCGACATGTATGCCGTCGTGTACCCTTTTCTGTTTCTAG
TTTCCTGTGGATAACAATAAATGAGTACCGTCTTTGTTGTGTTTGATC

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR4DP77JQ 579 0 0
CCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGTTTTT*GAAGGG
ACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTCTGGCTTCACTACCTAAACCCACC
CTGGTTTACTGCGGCCACGAGTACACGGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTTTGACTGTGGAA
CCAAACAACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCGCCAAGCAAAT
TTTCCCACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAAGAACTCGAAACCAACCCGTTTATGCGTGTT
AATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAGATCACCGATCGATACTTTCAGAGAA
ATCAGGAACAAGAAGGATCAGTGGAGGGGTTAAGAATCACCGTAGAGCTACTTGCATAAA
TGCCTTTTCGTGTGCTGTGGTGAGCCTTTGAATGTGTGAAACTGTTAAACCGGTTTGTAA
CCAAAACCGGACCGACATGTATGCCGTCGTGTACCCTTCTCTGTTTCTAGTTTCCTGTGG
ATAACAATAAATGAGTACCGTCTTTGTTGTGTTTGATCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4D474TF 552 0 0
GAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTCTGGCTTCACTACCTAAACCCACCCTGGTT
TACTGCGGCCACGAGTACACGGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTCTGACTGTGGAACCAAAC
AACGAGAAGATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCGCCAAGCAAATCTTCCC
ACAATCCCTTCAACGCTAGAGGAAGAACTCGAAACCAACCCGTTTATGCGTGTTAATAAC
CCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAAATCACCGATCGATACTCTCAGAGAAATCAGG
AACAAGAAGGATCAGTGGAGGGGCTAAGAATCACCGTAGAGCTACTTGCATAAATGCCTT
TTCGTGTGCTGTGGTGAGCCTTTGAATGTGTGAAACTGTTAAACCGGTTTGTAACCAAAA
CCGGACCGACATGTATGCCGTCGTGTACCCTTCTCTGTTTCTAGTTTCCTGTGGATAACA
ATAAATGAGTACCGTCTTTGTTGTGTTTGATCCTAAAAAATAAAACCTTTGGATGAAAAA
TAATTGTCCCGT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 8

CO CL547Contig1 1420 8 17 U
GGGCCACCGCGAGATCGGTAAGAAGCTGCAGTTTCTGTGAATCGAAGAAACGGAAAATGG
GACTGTTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAGAAAGAGAAGGAGATGCGTATTCTTATGG
TTGGACTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAA
GCGTCATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAAAACCATTATTTACCAAAAGTATACGT
TGAATATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTG
AGCAGACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAGCTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATT
GCAAGATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGA
TACTGGCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGC
TAAACTTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGGAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACA
CAGGTGAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGATTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTT
ACATGCTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATTGCGCAATGGAATGTTATGCTCGAGCATT
TGCAGCCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAACACATTGTGCATATCAAACCTGCTCTTTT
GTTACCATTATCTTTGTTCGGCTCAAGTGACTTCATATCTGCACTTTGGCCTTTCTTTTA
TTGTAACAAAATGATTCAACAAACATTATATCCGTGTCTGAAGACAACATCTTCTACTCT
TGTCTTGTTTGATTGAAAATTGACACAAACCACAAAATAATGTAATCATACATCCAAGTC
GAACTTATTGAGAAGCATATCCCAAATCTACCACCAAACAATCAAGGTTCTCCACAGAGT
AAACAAAGAAAAGAAAAGATCATTTCGACTTCTTCCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGT
CAATGTACATTATGCCTTTGCCCTTATAAACCTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACAGTGG
CAGCAAACTGATGCACCCTATCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCACATTGTTCTTGA
AAAGAAGACCCTGACCGCGGGAGGAACTGCCAGCTCGACCTCATGACTGTAACCTAACTT
GAGGTATAAGAAACGCCCTGCTTCCTCGGCTCTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATTTT
CAAGAACCGAAAGAATTTGGCTTCCATCTTCCCTTCTTGCCACACAGAATGTTCACCTGT
CTTTATTGCTTTCCGGCGAAAAGAAAAGAGGACTAATGTGTCAGTACTGCTACTTCTTCG
CCGGCGGATCCAGATCGCTCCCCAACTCCTCCGGCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 5 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP32TF U 1
AF RR4E215TF U 3
AF RR4DE79TF U 4
AF RR4FN69TF U 4
AF RR4BP32JQ C 27
AF RR4FN69JQ C 95
AF RR4E215JQ C 37
AF RR4B975TF C 753
BS 1 303 RR4BP32TF
BS 304 304 RR4E215TF
BS 305 596 RR4BP32TF
BS 597 661 RR4E215TF
BS 662 662 RR4DE79TF
BS 663 718 RR4E215TF
BS 719 719 RR4DE79TF
BS 720 720 RR4BP32JQ
BS 721 736 RR4DE79TF
BS 737 745 RR4FN69TF
BS 746 746 RR4BP32JQ
BS 747 778 RR4FN69TF
BS 779 791 RR4BP32JQ
BS 792 792 RR4E215JQ
BS 793 802 RR4BP32JQ
BS 803 853 RR4E215JQ
BS 854 1420 RR4B975TF

RD RR4BP32TF 596 0 0
GGGCCACCGCGAGATCGGTAAGAAGCTGCAGTTTCTGTGAATCGAAGAAACGGAAAATGG
GACTGTTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAGAAAGAGAAGGAGATGCGTATTCTTATGG
TTGGACTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAA
GCGTCATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAAAACCATTATTTACCAAAAGTATACGT
TGAATATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTG
AGCGGACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAGCTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATT
GCAAGATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGA
TACTGGCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGC
TAAACTTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGGAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACA
CAGGTGAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGATTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4E215TF 716 0 0
GCC
ACCGCGAGATCGGTAAGAAGCTGCAGTTTCTGTGAATCGAAGAAACGGAAAATGGGACTG
TTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAGAAAGAGAAGGAGATGCGTATTCTTATGGTTGGA
CTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAAGCGTC
ATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAAAACCATTATTTACCAAAAGTATACGTTGAAT
ATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCAG
ACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAGCTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATTGCAAG
ATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGATACTG
GCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAAC
TTAGAGTCCATGGATAAAAGCAG*CACTGGAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGT
GAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGATTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATG
CTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATTGCGCAATGGAATGTTATGCTCGAGCATTTACAG
CCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAACACATTGTGCATATCAAACCTGCTCTT

QA 4 716 4 716
DS 

RD RR4DE79TF 733 0 0
GG
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TTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAGAAAGAGAAGGAGATGCGTATTCTTATGGTTGGA
CTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAAGCGTC
ATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAAAACCATTATTTACCAAAAGTATACGTTGAAT
ATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCAG
ACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAGCTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATTGCAAG
ATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGATACTG
GCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAAC
TTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGGAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGT
GAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGATTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATG
CTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATTGCGCAATGGAATGTTATGCTCGAGCATTTGCAG
CCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAACACATTGTGCATATCAA*CCTGCTCTTT*GTTAC
CATTATCTTTG

QA 3 733 3 733
DS 

RD RR4FN69TF 792 0 0
GG
ACCGCGAGATCGGTAAGAAGCTGCAGTTTCTGTGAATCGAAGAAACGGAAAATGGGACTG
TTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAGAAAGAGAAGGAGATGTGTATTCTTATGGTTGGA
CTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAAGCGTC
ATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAAAACCATTATTTACCAAAAGTATACGTTGAAT
ATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCAG
ACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAGCTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATTGCAAG
ATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGATACTG
GCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAAC
TTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGGAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGT
GAAGGTTTGTTGGAAGTATTCGATTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATG
CTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATTGCGCAATGGAATGTTATGCTCGAGCATTTGCAG
CCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAACACATTGTGCATATCAAACCTGCTCTTT*GTTAC
*ATTATCTTTGTTCGGCTCA*GTGACTTCATATCTGCACTTTGGCCTTTCTTT
ATGTAACAAATGATTCA

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4BP32JQ 778 0 0
CTGCAG
TTCTGTGAATCGAAGAAACGGAAAATGGGACTGTTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAG
AAAGAGAAGGAGATGCGTATTCTTATGGTTGGACTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATT
GTTCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAAGCGTCATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATC
AAAACCATTATTTACCAAAAGTATACGTTGAATATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACA
ATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCGGACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGAT
AGCTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATTGCAAGATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAA
GAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGATACTGGCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCT
CTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAACTTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCAC
TGGAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGTGAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGATTGG
TTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATGCTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATT
GCGCAATGGAATGTTATGCTCGAGCATTTGCAGCCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAAC
ACATTGTGCATATCAAACCTGCTCTTTTGTTACCATTATCTTTGTTCGGCTCAAGTGACT
TCATATCTGCACTTTGGCCTTTCTTTTATTGTAACAAAACGATTCAACAA
GC

QA 7 776 7 776
DS 

RD RR4FN69JQ 744 0 0
AGAGAAGGAGATGTGTATTCTTATGGTTGGACTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGT
TCTGAAGATGAACGGTGAAGACACAAGCGTCATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAA
AACCATTATTTACCAAAAGTATACGTTGAATATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAAT
AAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCAGACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAG
CTCTGATCTCAGGAGGCTTGATGATTGCAAGATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGA
GAGGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGATACTGGCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCT
TACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAACTTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTG
GAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGTGAAGGTTTGTTGGAAGTATTCGATTGGTT
GGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATGCTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATTGC
GCAATGGAATGTTATGCTCGAGCATTTGCAGCCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAACAC
ATTGTGCATATCAAACCTGCTCTTTTGTTACCATTATCTTTGTTCGGCTCAAGTGACTTC
ATATCTGCACTTTGGCCTTTCTTTTATTGTAACAAAATGATTCAACAAACATTATATCCG
TGTCTGAGGACAACATCTTCTACT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4E215JQ 819 0 0
GTGAATCGAAGAAACGGAAAATGGGACTGTTAAGCATCATCCGGAAGATCAAGAAGAAAG
AGAAGGAGATGCGTATTCTTATGGTTGGACTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTC
TGAAGATGAACGGTGAAGACACAAGCGTCATCAGTCCAACTCTTGGGTTCAACATCAAAA
CCATTATTTACCAAAAGTATACGTTGAATATATGGGATGTGGGTGGGCAGAAGACAATAA
GATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCAGACTGATGGGTTGGTTTGGGTTGTTGATAGCT
CTGATCTCAGGAGGCTTGATGATTGCAAGATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGA
GGCTTGCTGGGTCATCTTTGCTGATACTGGCGAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTA
CACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAACTTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGGA
AGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGTGAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGATTGGTTGG
TTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATGCTTGACTAATCTCTCAACTACTGCATTGCGC
AATGGAATGTTATGCTCGAGCATTTACAGCCGAAGATTCAGTTTCACTGACGTAACACAT
TGTGCATATCAAACCTGCTCTTTTGTTACCATTATCTTTGTTCGGCTCAAGTGACTTCAT
ATCTGCACTTTGGCCTTTCTTTTATTGTAACAAAATGATTCAACAAACATTATATCCGTG
TCTGAAGACAACATCTTCTACTCTTGTCTTGTTTGAT
CG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4B975TF 668 0 0
TCATATCTGCACTTTGGCCTTTCTTTTATTGTAACAAAATGATTCAACAAACATTATATC
CGTGTCTGAAGACAACATCTTCTACTCTTGTCTTGTTTGATTGAAAATTGACACAAACCA
CAAAATAATGTAATCATACATCCAAGTCGAACTTATTGAGAAGCATATCCCAAATCTACC
ACCAAACAATCAAGGTTCTCCACAGAGTAAACAAAGAAAAGAAAAGATCATTTCGACTTC
TTCCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTCAATGTACATTATGCCTTTGCCCTTATAAACC
TCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACAGTGGCAGCAAACTGATGCACCCTATCCTTGTCGATC
CCGGTGCAGCAAACCACATTGTTCTTGAAAAGAAGACCCTGACCGCGGGAGGAACTGCCA
GCTCGACCTCATGACTGTAACCTAACTTGAGGTATAAGAAACGCCCTGCTTCCTCGGCTC
TGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATTTTCAAGAACCGAAAGAATTTGGCTTCCATCTTCC
CTTCTTGCCACACAGAATGTTCACCTGTCTTTATTGCTTTCCGGCGAAAAGAAAAGAGGA
CTAATGTGTCAGTACTGCTACTTCTTCGCCGGCGGATCCAGATCGCTCCCCAACTCCTCC
GGCCTTCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 2 8

CO CL548Contig1 865 4 8 U
GGTTGATAAAACCTTTTTCTTATACAAATAGTGCTTGATTACGTCTCTTACAAACGACCA
CAATATAACAAGCACCTAATAATAATAATACATTGACGACCAAGATGGAACACTTACAAT
ACCATCTATTCACACAGTACCACTTTATCAGAATCCTCTCTGCTTTTTTCCAGCAGCCTT
TTTTGGTGATGTTGCCTGCAGTACCGTTGATGCGCCCATCGACCTGAGGTTCTCCAGCAA
AGTGTCTCTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCCACCTCCTTGGAAACAAGGTC
TATCCCACTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGCTGCAGCACGATGGGATCTAT
TGACCCTTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGAATCAACAGCCTCGAGCTC
TTTCATAACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTGATCTCTGCGTTCATCGTGTT
CTGCATTTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTTGAGACCGTAACGTACAACAG
GTTCTGCGATGAACCTGAGAAGGCAGCAGCGAAAACACCAGAAATGTACAAAGTCTTGAC
CTTGACACCGTAAAGAGCACGCATCAGGACTTTTCCTTTGGCAGAGTCTTTCACCTTGGG
GAGATTCAAGGTCTGAACAAGGCTGGTCAGGATTGAATGACAGCTTTCCAACCTCGGGTT
CTTGGAAACGATGTGTCGCTTCCAGGAGTCGAGGGACGATTGAGCTTTGGAAAGATTCTG
AGGAGCGTTCGTGTCCAAGTTATGCAAAGCAAACTGGAGAAAGAGATGGCCTTGGTTGAG
GCGGCTAAGCTCAGAGCTAAAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4GM01JQ U 5
AF RR4C441JQ U 1
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BS 757 757 RR4DD52TF
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GG
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AACAAGCACCTAATAATAATAATACATTGACGACCAAGATGGAACACTTACAATACCATC
TATTCACACAGTACCACTTTATCAGAATCCTCTCTGCTTTTTTCCAGCAGCCTTTTTTGG
TGATGTTGCCTGCAGTACCGTTGATGCGCCCATCGACCTGAGGTTCTCCAGCAAAGTGTC
TCTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCCACCTCCTTGGAAACAAGGTCTATCCC
ACTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGATGCAGCACGATGGGATCTATTGACCC
TTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGAATCAACAGCCTCGAGCTCTTTCAT
AACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCCCTTGATCTCTGCGTTCATCGTGTTCTGCAT
TTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTTGAGACCGTAACGTACAACAGGTTCTG
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ACCGTAAAGAGCACG

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DS 

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CAATATAACAAGCACCTAATAATAATAATACATTGACGACCAAGATGGAACACTTACAAT
ACCATCTATTCACACAGTACCACTTTATCAGAATCCTCTCTGCTTTTTTCCAGCAGCCTT
TTTTGGTGATGTTGCCTGCAGTACCGTTGATGCGCCCATCGACCTGAGGTTCTCCAGCAA
AGTGTCTCTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCCACCTCCTTGGAAACAAGGTC
TATCCCACTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGCTGCAGCACGATGGGATCTAT
TGACCCTTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGAATCAACAGCCTCGAGCTC
TTTCATAACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTGATCTCTGCGTTCATCGTGTT
CTGCATTTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTTGAGACCGTAACGTACAACAG
GTTCTGCGATGAACCTGAGAAGGCAGCAGCGAAAACACCAGAAATGTACAAAGTCTTGAC
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GAGATTCAAGGTCTGAACAAGGGTGGTCAGGATTGAATGACAGCTTTCCAACCTCGGGTT
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GCTTTGGAA

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TG
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TGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGAATCAACAGCCTCGAGCTCTTTCATAACG
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GAACCTGAGAAGGCAGCAGCGAAAACACCAGAAATGTACAAAGTCTTGACCTTGACACCG
TAAAGAGCACGCATCAGGACTTTTCCTTTGGCAGAGTTTTTCACCTTGGGGAGATTCAAG
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ATGTGTCGCTTCCAGGAGTCGAGGGACGATTGAGCTTTGGAAAGATTCTGAGGAGCGTTC
GTGTCCAAGTTATGCAAAGCAAACTGGAGAAAGAGATGGCCTTGGTTGAGGCGGCTAAGC
TCAGAGCTAAAGGCC

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DS 



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ATCCCAGTTTCGTTCTTCTTCACTTTAGTTGAAACTTTATAAGATGGCACGTCCACAAGA
CCCTCCACGCGGTTTCTTCCCTTTTGGAAACCCTTTCAAGAACCTCTCTTCCAAGAACCC
TGTACTATCCTCTAAGCTTCTCTCCCTCTTGAACACTTTCGAGACCAACTTAGCTTCTTC
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AGCTATGGTATCTCTTTGCCAGACCCACGATGCTATCAAGACTCTTATAACCGCTCTTGA
GCTTCCTGTCTCTGATTGGGAGGACAAGTGGGTCGATGTCTACCTAGACATCAGCGTCAA
GCTCCTCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATCT
CTTTCTCCAGTATGCTTTGCATAACTTGGACACGAACGCTCCTCAGAATCTTTCCAAAGC
TCAATCCTCCCTCGACTCCTGGAAGCAACACATCGTTTCCAAGAACCCGAGGTTGGAAAG
CTGTCATTCAATCCTGACCACCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAAAACTC
TGCCAAAGGAAAAGTCCTGATGCGTGCTCTTTACGGTGTCAAGGTCAAGACTTTGTACAT
TTCTGGTGTTTTCGCTGCTGGAAAAAAGCAGAGAGGATTCTGATAAAGTGGTACTGTGTG
AATAGATGGTATTGTAAGTGTTCCATCTTGGTCGTCAATGTATTATTATTATTAGGTGCT
TGTTATATTGCGGTCGTTTGTAAGAGACGTAATCAAGCACTATTTGTATAAGAAAAAGGT
TTTATCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM01TF U 6
AF RR4DB93TF U 1
AF RR4FS36TF U 6
AF RR4HA52JQB C 176
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TG

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GCTCCTCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATCT
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CTGTCATTCAATCCTGACCACCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAG*TGAAAA*CTC
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TGCCA

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TATCCTCTAAGCTTCTCTCCCTCTTGAACACTTTCGAGAGCAACTTAGCTTCTTCCATTA
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TGGTATCTCTTTGCCAGACCCACGATGCTATCAAGACTCTTATAACCGCTCTTGAGCTTC
CTGTCTCTGATTGGGAGGACAAGTGGGTCGATGTCTACCTAGACATCAGCGTCAAGCTCC
TCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATCTCTTTC
TCCAGTATGCTTTGCATAACTTGGACACGAACGCTCCTCAGAATCTTTCCAAAGCTCAAT
CCTCCCTCGACTCCTGGAAGCAACACATCGTTTCCAAGAACCCGAGGTTGGAAAGCTGTC
ATTCAATCCTGACCACCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAAAACTCTGCCA
AAGGAAAAGTCCTGATGCGTGCTCTTTACG
TGTC

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DS 

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CTTGAGCTTCCTGTCTCTGATTGGGAGGACAAGTGGGTCGATGTCTACCTAGACATCAGC
GTCAAGCTCCTCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTTTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGC
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AAAGCTCAATCCTCCCTCGACTCCTGGAAGCAACACATCGTTTCCAAGAACCCGAGGTTG
GAAAGCTGTCATTCAATCCTGACCACCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAA
AACTCTGCCAAAGGAAAAGTCCTGATGCTTGCTCTTTACGGTGTCAAGGTCAAGACTTTG
TACATTTCTGGTGTTTTCGCTGCTGGAAAAAAGCAGAGAGGATTCTGATAAAGTGGTACT
GTGTGAATAGATGGTATTGTAAGTGTTCCATCTTGGTCGTCAATGTATTATTATTATTAG
GTGCTTGTTATATTGCGGTCGTTTGTAAGAGACGTAATCAAGCACTATTTGTATAAGAAA
AAGGTTTTATCT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 8

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TCTATCATCAATCAATCTCCGATCAAATGGCAATGGCTGTTTTCCGTCGCGAAGGGAGGC
GTCTCCTCCCTTCAATCGCCGCTCGCCCAATCGCTGCCACCACCCCGTCTCCTCTCTCTT
CTGACCGGGAGGAGGGACCTTTTGGAGTTCGATCTATCTCTACTCAAGTGGTGCGTAACC
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CTGCTCTTCTTGGAGATAATCCCAGCATTGACGTGAAGAAGAGTGTGGTGGTCACTCTCT
CTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTCAGCAGTGCTC
TCTACAAATTGAACGCTGGTCCTGAAAAGGACGTGAAGTTTGTTATCGTGGGAGAGAAAG
CGAAAGCTATAATGTTTCGTGACTCAAAGAACGACATCTCCCTTACTGTCACAGAGCTGA
ACAAGAATCCGCTCAATTATGCTCAGGTCTCAGTTCTTGCTGATGACATCCTGAAAAACG
TTGAATTTGATGCTTTGCGCATTGTCTACAACAAGTTCCATTCCGTTGTCGCATTTCTAC
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AACTCGGTGAGCTTGACTCATACGAGATCGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATTCTGC
AGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTGTGTGATGTTCAACGCGGTGCTGGAGAATGCGT
GTAGTGAGATGGGAGCAAGGATGTCAGCAATGGACAGCTCAAGCAGTAACGCAGGAGAGA
TGCTTGACCGTCTCACCCTCACTTACAACAGGACTCGCCAAGCTTCTATCACAACAGAGC
CTATCGAGATTATCTCTGGAGCTTCTGCACTTGAAGCTGCTAAATAAGCAAAGCACATCA
TCCTTGTTTTGCGTTAAACTTGGCTTTTGATATATCTATATCTACCATAAAGGAGAAGAG
TGTGTTTTGAACTCTTCAGGGCTACCGAAATCATTTTCTTTTACTGGCTTCTTGTTTTGG
CCAACCTGACTTGACTAAGATTTTTCTTACAATAAATTTCCCTGTAATTTCCAGCAAGTT
TTGCAAACAAGAATGAAGAAACAGAGGAGGAAAAAGCATAAGTAAGAAGCTGCTATGTTT
TTATTTTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTAAGCTTAGAGCTGTTCAAGGACGAGCTGAGAACTCCCGTGGTCTTTGGCAGCCATTTA
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CTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTCAGCAGTGCTC
TCTACAAATTGAACGCTGGTCCTGAAAAGGACGTGAAGTTTGTTATCGTGGGAGAGAAAG
CGAAAGCTATAATGTTTCGTGACTCAAAGAACGACATCTCCCTTACTGTCACAGAGCCGA
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TTGAATTTGATGCTTTGCGCATTGTCTACAACAAGTTCCATTCCGTTGTCGCATTTCTAC
*AACTGTGGCCACTGTGTTGTCCC*TGAGATCATTGAAA
GGATCTGAAGT

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G
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TTTCCCTG

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G
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TACCAACTGTGGCCACTGTGTTGTCCCCTGAGATCATTGAAAAGGAATCTGAAGTTGGAG
GAAAACTCGGTGAGCTTGACTCATACGAGATCGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATTC
TGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTGTGTGATGTTCAACGCGGTGCTGGAGAATG
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TGGCCAACCTGACTTGACTAAGATTTTTCTTA

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DS 

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GGCTTCTTGTTTTGGCCAACCTGACTTGACTAAGATTTTTCTTACAATAAATTTCCCTGT
AATTTCC

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ATGCGTGTAGTGAGATGGGAGCAAGGATGTCAGCAATGGACAGCTCAAGCAGTAACGCAG
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TTTTGGCCAACCTGACTTGACTAAGATTTTTCTTACAATAAATTTCCCTGTAATTTCC

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CATTTTCTTTTACTGGCTTCTTGTTTTGGCCAACCTGACTTGACTAAGATTTTTCTTACA
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AAAAGCATAAGT

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DS 

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TGAACAAGAATCCGCTCAATTATGCTCAGGTCTCAGTTCTTGCTGATGACATCCTGAAAA
ACGTTGAATTTGATGCTTTGCGCATTGTCTACAACAAGTTCCATTCCGTTGTCGCATTTC
TACCAACTGTGGCCACTGTGTTGTCCCCTGAGATCATTGAAAAGGAATCTGAAGTTGGAG
GAAAACTCGGTGAGCTTGACTCATACGAGATCGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATTC
TGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTGTGTGATGTTCAACGCGGTGCTGGAGAATG
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TGGCCAACCTGACTTGACTAAGATTTTTCTTACAATAAATTTCCCTGTAATTTCCAGCAA
GTTTTGCAA
CAAGATGAGAAAC

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DS 

RD RR4DM66JQ 785 0 0
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GATGCTTTGCGCATTGTCTACAACAAGTTCCATTCCGTTGTCGCATTTCTACCAACTGTG
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GTTCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 7

CO CL550Contig1 918 7 17 U
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GAGCCGCATATGAGCAAGCAAACTCTAGAGTTTCACTGGGGAAAACACCACAGGGCTTAC
GTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCAT
ATCATCCAAAACACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCTTTCAACAACGCTGCTCAG
GCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGTGGTGGAGGAAAGCCATCA
GGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTATGAGAAGTTTTATGATGAG
TTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGCTTACGCAGAT
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CCATTGCTTACCATTGATGTCTGGGAGCATGCATACTATCTCGACTTCCAGAACCGGAGA
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GGTTATAAGGACACTGCTCTCTTGTTGTAAGGTCTCATCGAGTCTTTCATCTTATTTCTT
GTTTACTGAGATTTGAATCATCGTGTAATAATGAACTACCATGTTTTCTTCTTTGTGTGA
TTTGTTTTTTTATCTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU38TF U 1
AF RR4EU11TF U 102
AF RR4FZ54TF U 1
AF RR4AN40TF U 1
AF RR4BF81JQ C 105
AF RR4FZ54JQ C 194
AF RR4AN40JQ C 235
BS 1 57 RR4AN40TF
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BS 59 356 RR4AN40TF
BS 357 357 RR4FU38TF
BS 358 390 RR4AN40TF
BS 391 391 RR4FU38TF
BS 392 566 RR4AN40TF
BS 567 567 RR4FZ54TF
BS 568 673 RR4AN40TF
BS 674 674 RR4FZ54TF
BS 675 789 RR4AN40TF
BS 790 790 RR4BF81JQ
BS 791 811 RR4AN40TF
BS 812 812 RR4BF81JQ
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BS 836 897 RR4BF81JQ
BS 898 918 RR4AN40JQ

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GAGCCGCATATGAGCAAGCAAACTCTAGAGTTTCACTGGGGAAAACACCACAGGGCTTAC
GTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCAT
ATCATCCAAACCACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCCTTCAACAACGCTGCTCAG
GCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGTGGTGGAGGAAAGCCATCA
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DS 

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G
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AGACACCACAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAA
GGCAAGCCCTTAGAGCATATCATCCAAAACACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCT
TTCAACAACGCTGCTCAGGCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGT
GGTGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTTTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTAT
GAGAAGTTTTATGATGAGTTCAATGCTGCTGC***CACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCC
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GAGGCTGTTAGTTCCAGACTTGAGGCT

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DS 

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GAGCCGCATATGAGCAAGCAAACTCTAGAGTTTCACTGGGGAAAACACCACAGGGCTTAC
GTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCAT
ATCATCCAAACCACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCCTTCAACAACGCTGCTCAG
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GGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTATGAGAAGTTTTATGATGAG
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CTCTGACTTCAGTTATGTGTGTTATGCATTACTGAA

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DS 

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GAGCCGCATATGAGCAAGCAAACTCTAGAGTTTCACTGGGGAAAACACCACAGGGCTTAC
GTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCAT
ATCATCCAAAACACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCTTTCAACAACGCTGCTCAG
GCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGTGGTGGAGGAAAGCCGTCA
GGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATCTCACTTCTTATGAGAAGTTTTATGATGAG
TTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGCTTACGCAGAT
AACAAACTCAAAGTTGTGAAAACTCCAAATGCTGTAAACCCCCTTGTGCTCGGCTCTTTC
CCATTGCTTACCATTGATGTCTGGGAACATGCATACTATCTCGACTTCCAGAACCGGAGA
CCCGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGTCTTGGGAGGCTGTTAGTTCCAGA
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CAACAACGCTGCTCAGGCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGTGG
TGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTATGA
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ATAAAATATTGGTCGTGGTTATAAGGACACTGCTCTCTTGTTGTAAGGTCTCATCGAGTC
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TTTCTTCTTTGTG
ATTTGTTTTTTTATCT

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DS 

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CTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCCTTCAACAACGCTGCTCAGGCGTGGAACCACG
AGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGTGGTGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTG
CTCTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTATGAGAAGTTTTATGATGAGTTCAATGCTGCTG
CTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGCTTACGCAGATAACAAACTCAAAG
TTGTGAAAACTCCAAATGCTGTAAACCCCCTTGTGCTCGGCTCTTTCCCATTGCTTACCA
TTGATGTCTGGGAGCATGCATACTATCTCGACTTCCAGAACCGGAGACCCGATTACATAA
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TATGTGTGTTATGCATTACTGAAGTTTCTTAATAAAATATTGGTCGTGGTTATAAGGACA
CTGCTCTCTTGTTGTAAGGTCTCATCGAGTCTTTCATCTTATTTCTTGTTTACTGAGATT
TGAATCATCGTGTAATAATGAACTACCATGTTTTCTTCTTTGTG
TGATTTGTTTTTTT

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DS 

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CCGTCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATCTCACTTCTTATGAGAAGTTTTAT
GATGAGTTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGCTTAC
GCAGATAACAAACTCAAAGTTGTGAAAACTCCAAATGCTGTAAACCCCCTTGTGCTCGGC
TCTTTCCCATTGCTTACCATTGATGTCTGGGAACATGCATACTATCTCGACTTCCAGAAC
CGGAGACCCGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGTCTTGGGAGGCTGTTAGT
TCCAGACTTGAGGCTGCCAGGGCTGCTTCTGCTTAAGCAGAGTCATCAGACACACTCGGA
CCAAAACTCTGACTTCAGTTATGTGTGTTATGCATTACTGAAGTTTCTTAATAAAATATT
GGTCGTGGTTATAAGGACACTGCTCTCTTGTTGTAAGGTCTCATCGAGTCTTTCATCTTA
TTTCTTGTTTACTGAGATTTGAATCATCGTGTAATAATGAACTACCATGTTTTCTTCTTT
GTGTGATTTGTTTTTTTATCTACT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 3 6

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AGCCAAATCCTCCCCTCCCCCCACGTCCTTTCTCTCTACGGGTTACTTTACTTACTGCTG
GGCACATTGCACCCTCTGCGCACCTCCAGGATGGTCATCATCGCCTTCGTCATCATCATA
AGCCTCTCTCTGAGCTTGTGCTTTCCTTCTCATCTCATCCTCAATGTCGACATCGTGCAG
CGTTGTCTCCTCGCACTCATCAATCTCCATGTCGCTCAGCTGAGTAGTAAAAGGCTTGGG
CAGAATAACTTCAAACGCTTTGGTCTGGTCAGGGGTTAGCGAGTCCGGGAAATCCACTGT
GAAGTGGATGTAGAGCTTACCCTTCATGAATGGCCTCTGGTATATCGGCATCCCTTCATC
GCTTATCGCCTTGTATGAATCAGGTTTAACGACGTCCCCGGGATGAGATTTGATGAGAAG
ATTCCTGCCATCCAAGTGGGTAAGGACGAAGGAGAAGCCACAAAGAGCTTCGGTGAGAGA
GAGTGTGTGTTCTACAAAAAGGTCTTCTCCTTTTCTCTTGAACTTTGGGTGTTCTTTCTG
CTGAATTACAAACACTATATCTCCAGTGACTGTGTCAGGCGCTTCATCTGCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP39JQ U 1
AF RR4ET62JQ U 1
BS 1 349 RR4DP39JQ
BS 350 350 RR4ET62JQ
BS 351 367 RR4DP39JQ
BS 368 368 RR4ET62JQ
BS 369 656 RR4DP39JQ
BS 657 713 RR4ET62JQ

RD RR4DP39JQ 656 0 0
TCATTAATTTAAGAGTGAGAGAACGAAACAAGTTGGTTTTCCAAGTCTTAAACCATAGCA
AACTCCATAAGACTTCCAAATACACTGAAAATAAAGAAAAGGAAGAGGCAAATGTTTTGG
AGCCAAATCCTCCCCTCCCCCCACGTCCTTTCTCTCTACGGGTTACTTTACTTACTGCTG
GGCACATTGCACCCTCTGCGCACCTCCAGGATGGTCATCATCGCCTTCGTCATCATCATA
AGCCTCTCTCTGAGCTTGTGCTTTCCTTCTCATCTCATCCTCAATGTCGACATCGTGCAG
CGTTGTCTCCTCGCACTCATCAATCTCCATGTCGCTCAGCTGAGTAGTAGAAGGCTTGGG
CAGAATAGCTTCAAACGCTTTGGTCTGGTCAGGGGTTAGCGAGTCCGGGAAATCCACTGT
GAAGTGGATGTAGAGCTTACCCTTCATGAATGGCCTCTGGTATATCGGCATCCCTTCATC
GCTTATCGCCTTGTATGAATCAGGTTTAACGACGTCCCCGGGATGAGATTTGATGAGAAG
ATTCCTGCCATCCAAGTGGGTAAGGACGAAGGAGAAGCCACAAAGAGCTTCGGTGAGAGA
GAGTGTGTGTTCTACAAAAAGGTCTTCTCCTTTTCTCTTGAACTTTGGGTGTTCTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4ET62JQ 713 0 0
TCATTAATTTAAGAGTGAGAGAACGAAACAAGTTGGTTTTCCAAGTCTTAAACCATAGCA
AACTCCATAAGACTTCCAAATACACTGAAAATAAAGAAAAGGAAGAGGCAA*TGTTTTGG
AGCCAAATCCTCCCCTCCCCCCACGTCCTTTCTCTCTACGGGTTACTTTACTTACTGCTG
GGCACATTGCACCCTCTGCGCACCTCCAGGATGGTCATCATCGCCTTCGTCATCATCATA
AGCCTCTCTCTGAGCTTGTGCTTTCCTTCTCATCTCATCCTCAATGTCGACATCGTGCAG
CGTTGTCTCCTCGCACTCATCAATCTCCATGTCGCTCAGCTGAGTAGTAAAAGGCTTGGG
CAGAATAACTTCAAATGCTTTGGTCTGGTCAGGGGTTAGCGAGTCCGGGAAATCCACTGT
GAAGTGGATGTAGAGCTTACCCTTCATGAATGGCCTCTGGTATATCGGCATCCCTTCATC
GCTTATCGCCTTGTATGAATCAGGTTTAACGACGTCCCCGGGATGAGATTTGATGAGAAG
ATTCCTGCCATCCAAGTGGGTAAGGACGAAGGAGAAGCCACAAAGAGCTTCGGTGAGAGA
GAGTGTGTGTTCTACAAAAAGGTCTTCTCCTTTTCTCTTGAACTTTGGGTGTTCTTTCTG
CTGAATTACAAACACTATATCTCCAGTGACTGTGTCAGGCGCTTCATCTGCTT

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL551Contig2 710 2 1 U
GGGAGTCATTCCTCCCAGAAGCCACAAGAAGGAAGAAAATCAAACTTGGTCTCCGTGAGA
AAAGATGTTCGGGCGAGGAGCGACGAAGAAGAGCGACAACACAAAGTTCTACGAGATCTT
AGGCGTACCCAAAACCGCATCTCCCGAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCCGCAAT
CAAGAACCATCCCGACAAGGGTGGAGATCCTGAGAAGTTCAAAGAGCTAGCACAGGCGTA
TGAAGTTCTGAGCGACCCAGAGAAGAGAGAGATATACGATGAGTACGGAGAGGATGCACT
CAAGGAAGGAATGGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGGCATGACCCTTTTGATATCTTCTCATC
CTTCTTTGGAGGTGGCAGCCCCTTTGGAGGTGGTGGTAGCAGCAGAGGGAGGAGGCAGAG
ACGTGGTGAAGATGTTGTTCATCCTTTGAAAGTTTCCCTTGAGGATCTTTACCTTGGTAC
TACCAAGAAGCTCTCTCTTTCTAGAAACGCTCTCTGCTCTAAGTGCAACGGAAAGGGTTC
GAAGTCTGGAGCCTCGATGAAATGCGGTGGGTGTCAGGGCACAGGTATGAAGGTGACAAT
CAGGCAGCTTGGACCTGGGATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGACTGCAAAGG
CACGGGCGAGACCATCAACGATCGTGACAGTGTCCTCAATGCAAAGGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP39TF U 19
AF RR4ET62TF U 1
BS 1 710 RR4ET62TF

RD RR4DP39TF 482 0 0
GGGCCAC
AAGAAGGAAGAAAATCAAACTTGGTCTCCGTGAGAAAAGATGTTCGGGCGAGGAGCGACG
AAGAAGAGCGACAACACAAAGTTCTACGAGATCTTAGGCGTACCCAAAACCGCATCTCCC
GAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCCGCAATCAAGAACCATCCCGACAAGGGTGGA
GATCCTGAGAAGTTCAAAGAGCTAGCACAGGCGTATGAAGTTCTGAGCGACCCAGGGAAG
AGAGAGATATACGATGAGTACGGAGAGGATGCACTCAAGGAAGGAATGGGTGGTGGAGGA
GGAGGTGGGCATGACCCTTTTGATATCTTCTCATCCTTCTTTGGAGGTGGCAGCCCCTTT
GGAGGTGGTGGTAGCAGCAGAGGGAGGAGGCAGAGACGTGGTGAAGATGTTGTTCATCCT
TTGAAAGTTTCCCTTGAGGATCTTTACCTTGGTACTACCAAGAAGCTCTCTCTTT

QA 8 482 8 482
DS 

RD RR4ET62TF 710 0 0
GGGAGTCATTCCTCCCAGAAGCCACAAGAAGGAAGAAAATCAAACTTGGTCTCCGTGAGA
AAAGATGTTCGGGCGAGGAGCGACGAAGAAGAGCGACAACACAAAGTTCTACGAGATCTT
AGGCGTACCCAAAACCGCATCTCCCGAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCCGCAAT
CAAGAACCATCCCGACAAGGGTGGAGATCCTGAGAAGTTCAAAGAGCTAGCACAGGCGTA
TGAAGTTCTGAGCGACCCAGAGAAGAGAGAGATATACGATGAGTACGGAGAGGATGCACT
CAAGGAAGGAATGGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGGCATGACCCTTTTGATATCTTCTCATC
CTTCTTTGGAGGTGGCAGCCCCTTTGGAGGTGGTGGTAGCAGCAGAGGGAGGAGGCAGAG
ACGTGGTGAAGATGTTGTTCATCCTTTGAAAGTTTCCCTTGAGGATCTTTACCTTGGTAC
TACCAAGAAGCTCTCTCTTTCTAGAAACGCTCTCTGCTCTAAGTGCAACGGAAAGGGTTC
GAAGTCTGGAGCCTCGATGAAATGCGGTGGGTGTCAGGGCACAGGTATGAAGGTGACAAT
CAGGCAGCTTGGACCTGGGATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGACTGCAAAGG
CACGGGCGAGACCATCAACGATCGTGACAGTGTCCTCAATGCAAAGGAGA

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL551Contig3 1377 2 4 U
GGAAGAAGGAAGAAAAACAAACTTGGTCTCCGTGAGAAAAGATGTTCGGGCGAGGAGCGA
CGAAGAAGAGCGACAACACAAAGTTCTACGAGATCTTAGGCGTACCCAAGACCGCATCTC
CCGAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCCGCAATCAAGAACCATCCCGACAAGGGTG
GAGATCCTGAGAAGTTCAAAGAGCTAGCACAGGCGTATGAAGTTCTGAGCGACCCAGAGA
AGAGAGAGATATACGATGAGTACGGAGAGGATGCACTCAAGGAAGGAATGGGTGGTGGAG
GAGGAGGTGGTGGTAGCAGCAGAGGGAGGAGGCAGAGACGTGGTGAAGATGTTGTTCATC
CTTTGAAAGTTTCCCTTGAGGATCTCTACCTTGGTACTACCAAGAAGCTCTCTCTTTCTA
GAAACGCTCTCTGCTCTAAGTGCAACGGAAAGGGTTCGAAATCCGGAGCCTCGATGAAGT
GTGGTGGGTGTCAGGGGACGGGTATGAAGGTGACAATCAGGCAGCTTGGACCTGGAATGA
TCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGAGTGCAAAGGCACGGGGGGGACCATCAACGATC
GTGACAGGTGTCCGCAGTGCAAAGGAGACAAAGTCGTCCCTGAGAAGAAAGTTCTTGAAG
TGAATGTTGAGAAAGGGATGCAGCACAGTCAGAAGATCACTTTCGAAGGACAAGCAGATG
AAGCGCCTGACACCGTTACTGGAGATATAGTGTTTGTAATTCAGCAGAAAGAACACCCAA
AGTTCAAGAGAAAAGGAGAAGACCTCTTTGTAGAACACACACTCTCTCTCACCGAAGCTC
TTTGTGGCTTCTCCTTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGGAATCTTTTCATCAAATCTC
ATCCCGGGGACGTCGTTAAACCTGATTCATACAAGGCAATAAGCGATGAAGGGATGCCGA
TATACCAGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACGGTGGATTTCCCGG
ACTCGCTAACCCCTGACCAGACCAAAGTATTTGAAGCTATTTTGCCCAAACCTTCGACTA
CTCAGCTGACCGACATGGAGATAGATGAGAAGGAAAGCACAAGCTCAGAGAGAGGCTTAT
GATGATGACGAAGGCGATGATGACCATCCTGGAGGTGCGCAGAGGGTGCAATGTGCCCAG
TAGTAAGTAAGTAACCCTTAGAGAAAGGACGTGATGAGGGGGATTTGGCTCCAACATTTG
CCTCTTCCTTTTCTTTATTTTCAGTGTATTTGGAAGTCTTATGGAGTTTGCTATGGTTTA
TGGACTTGGAAAACCAACTTGTTTCGTTCTCTCACTCTTAAATTAATGACAGTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI61TF U 1
AF RR4FI61JQ C 667
BS 1 708 RR4FI61TF
BS 709 709 RR4FI61JQ
BS 710 746 RR4FI61TF
BS 747 1377 RR4FI61JQ

RD RR4FI61TF 746 0 0
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CGAAGAAGAGCGACAACACAAAGTTCTACGAGATCTTAGGCGTACCCAAGACCGCATCTC
CCGAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCCGCAATCAAGAACCATCCCGACAAGGGTG
GAGATCCTGAGAAGTTCAAAGAGCTAGCACAGGCGTATGAAGTTCTGAGCGACCCAGAGA
AGAGAGAGATATACGATGAGTACGGAGAGGATGCACTCAAGGAAGGAATGGGTGGTGGAG
GAGGAGGTGGTGGTAGCAGCAGAGGGAGGAGGCAGAGACGTGGTGAAGATGTTGTTCATC
CTTTGAAAGTTTCCCTTGAGGATCTCTACCTTGGTACTACCAAGAAGCTCTCTCTTTCTA
GAAACGCTCTCTGCTCTAAGTGCAACGGAAAGGGTTCGAAATCCGGAGCCTCGATGAAGT
GTGGTGGGTGTCAGGGGACGGGTATGAAGGTGACAATCAGGCAGCTTGGACCTGGAATGA
TCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGAGTGCAAAGGCACGGGGGGGACCATCAACGATC
GTGACAGGTGTCCGCAGTGCAAAGGAGACAAAGTCGTCCCTGAGAAGAAAGTTCTTGAAG
TGAATGTTGAGAAAGGGATGCAGCACAGTCAGAAGATCACTTTCGAAG*ACAAGCAGATG
AAGCGCCTGACACCGTTACTGGAGAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4FI61JQ 711 0 0
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CTGACACCGTTACTGGAGATATAGTGTTTGTAATTCAGCAGAAAGAACACCCAAAGTTCA
AGAGAAAAGGAGAAGACCTCTTTGTAGAACACACACTCTCTCTCACCGAAGCTCTTTGTG
GCTTCTCCTTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGGAATCTTTTCATCAAATCTCATCCCG
GGGACGTCGTTAAACCTGATTCATACAAGGCAATAAGCGATGAAGGGATGCCGATATACC
AGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACGGTGGATTTCCCGGACTCGC
TAACCCCTGACCAGACCAAAGTATTTGAAGCTATTTTGCCCAAACCTTCGACTACTCAGC
TGACCGACATGGAGATAGATGAGAAGGAAAGCACAAGCTCAGAGAGAGGCTTATGATGAT
GACGAAGGCGATGATGACCATCCTGGAGGTGCGCAGAGGGTGCAATGTGCCCAGTAGTAA
GTAAGTAACCCTTAGAGAAAGGACGTGATGAGGGGGATTTGGCTCCAACATTTGCCTCTT
CCTTTTCTTTATTTTCAGTGTATTTGGAAGTCTTATGGAGTTTGCTATGGTTTATGGACT
TGGAAAACCAACTTGTTTCGTTCTCTCACTCTTAAATTAATGACAGTATTG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 2 9

CO CL552Contig1 866 6 3 U
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GTTGCATCAGAAGTTAAAATATCTTACAAAGCAAGCAAACAGTCAAAATATTACATAAGC
AGAGGAGAGGAGAAGAGAACTAGTCATGGTGTTGCTCCATGTGGTTGAGATGAAGAACAC
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CTTGAGAAGCATGTTGTACTTTGCAGCCTCCCC*AGTGACCTCAGCGTTAGCGTGAACAA
CCTCCTGGAGTTCATAAGGGAACAAGGAGTTAGACCTCTGCTGGATGGTCTTGACAGCGT
GATCAGCAACGTGCTGCACTTCAGGATCATCTCCTGGAACTTCCCTCCATCCAGATTCAA
GCTCACCTTTCTTGCAGCCAAGATCGGAGGG*AGTGATGGTATTGGTAGTAGAGGCACCA
CCATCATCACTAGTAGCAGGCTTGAACTCCTGTAACTCCTTGAAGTTCAACCAAGGCTTC
ACCCACACTTTGGCTTCGTAAAGCTTCTTCTTCCCAGCCTCTATGATCTCCAGAGTCAGG
TGGTGCAGCGTTCCCGCCACAACTTGCTCTTTCGCCTTCACCACTCTCCCAAACTCTAGA
AGCGCATTCTCTTTCTTGTTATGCTCATCGACAGCGAAGCGAGCGAGGCTCTCGACCTCG
CCACTGTTCTGGTTAGAAGGTACATCGCGAACGGCTCCGGGCATGTCCATGTTGTCGTCG
TTGCAGAAAGTAGCGATCAGAGAGGGAATGAAGATTGAGGAGAGAGAGAGAACAACGATG
AAGAGGAAACGTCTTTTCATCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 25 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG58JQ U 146
AF RR4CX47JQ U 11
AF RR4B651JQ U 1
AF RR4C726JQ U 49
AF RR4B651TF C 38
AF RR4BG58TF C 183
BS 1 816 RR4B651JQ
BS 817 833 RR4B651TF
BS 834 866 RR4BG58TF

RD RR4BG58JQ 288 0 0
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C*TTGAACTTCTCTTCCTTCTCTCC*TCTCA**AGCTTGAAAAGCATGTTGTACTTTGCA
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GGAGTTAGACCTCTGCTGGATGGTCTTGACAGCGTGATCAGCAACGTGCTGCACTTCAGG
ATCATCTCCTGGAACTTCCCTCCATCCAGATTCAAGCTCACCTTTCTT

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR4CX47JQ 723 0 0
GAC
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AGAGAACTAGTCATGGTGTTGCTCCATGTGGTTGAGATGAAGAACACCTTCATGGTTCTT
GTGAACCTCCACC*TTGAACTTCTCCTCCTTCTCTCC*TCTCTTCAACTTGAGAAGCATG
TTGTACTTTGCAGCCTCCCC*GGTGACCTCAGCGTTAGCATGAACAACCTCCTGAAGCTC
ATAAGGGAACAAAGAGTTAGACCTCTGCTGTATGGTCTTGACAGCATGATCAGCAACATG
CTGCACTTCAGGATCATCTCCAGGAACTTCTCTCCATCCAGACTCAAGCTCACCTTTCTT
GCAGCCAAGATCGGAGGG*AGTGATGGTATTGGTAGTAGAGGCACCACCATCACCACTAC
TAGCAGGCTTGAACTCCTGTAACTCCTTGAAGTTCAACCAAGGCTTCACCCACACTTTAG
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CCGCCACAACTTGCTCTTTCGCCTTCACCACTCTCCCAAACTCTAGCAGTGCATTCTCTT
TCTTGTTATGCTCATCGACAGCGAAGCGAGCGAGGCTCTCGACCTCGCCACTGTTCTGGT

QA 4 723 4 723
DS 

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GTTGCATCAGAAGTTAAAATATCTTACAAAGCAAGCAAACAGTCAAAATATTACATAAGC
AGAGGAGAGGAGAAGAGAACTAGTCATGGTGTTGCTCCATGTGGTTGAGATGAAGAACAC
CTTCATGGTTCTTGTGAACCTCCACC*TTGAACTTCTCTTCCTTCTCTCC*TCTCA**AG
CTTGAGAAGCATGTTGTACTTTGCAGCCTCCCC*AGTGACCTCAGCGTTAGCGTGAACAA
CCTCCTGGAGTTCATAAGGGAACAAGGAGTTAGACCTCTGCTGGATGGTCTTGACAGCGT
GATCAGCAACGTGCTGCACTTCAGGATCATCTCCTGGAACTTCCCTCCATCCAGATTCAA
GCTCACCTTTCTTGCAGCCAAGATCGGAGGG*AGTGATGGTATTGGTAGTAGAGGCACCA
CCATCATCACTAGTAGCAGGCTTGAACTCCTGTAACTCCTTGAAGTTCAACCAAGGCTTC
ACCCACACTTTGGCTTCGTAAAGCTTCTTCTTCCCAGCCTCTATGATCTCCAGAGTCAGG
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CCACTGTTCTGGTTAGAAGGTACATCGCGAACGGCTCCGGGCATGTCCATGTTGTCGTCG
TTGCAGAAAGTAGCGATCAGAGAGGGAATGAAGATT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4C726JQ 758 0 0
AAGGGT
TTAGTAGTTGCATCAGAAGTTAAAATATCTTACAAAGCAAGCAAACAGTCAAAATATTAC
ATAAGCAGAGGAGAGGAGAAGAGAACTAGTCATGGTGTTGCTCCATGTGGTTGAGATGAA
GAACACCTTCATGGTTCTTGTGAACCTCCACC*TTGAACTTCTCTTCCTTCTCTCC*TCT
CTTCAACTTGAGAAGCATGTTGTACTTTGCAGCCTCCCC*GGTGACCTCAGCGTTAGCGT
GAACAACCTCCTGGAGTTCA*AGGGGAACAAGGAGTTAGACCTCTGCTGGATGGTCTTGA
CAGCGTGATCAGCAACGTGCTGCACTTCAGGATCATCTCCTGGAACTTCCCTCCATCCAG
ATTCAAGCTCACCTTTCTTGCAGCCAAGATCGGAGGG*AGTGATGGTATTGGTAGTAGAG
GCACCACCATCATCACTAGTAGCAGGCTTGAACTCCTGTAACTCCTTGAAGTTCAACCAA
GGCTTCACCCACACTTTGGCTTCGTAAAGCTTCTTCTTCCCAGCCTCGATGATCTCCAGA
GTCAGGTGGTACAGCGTTCCCGCTACAACTTGCTCTTTCGCCTTCACCACTCTCCCAAAC
TCTAGCAGTGCATTCTCTTTCTTGTTATGCTCATCGACAGCGAAGCGAGCGAGGCTCTCG
ACCTCGCCACTGTTCTGGTTAGAAGGTACATCGCGAACGGCTCCGGGCATGTCCATGTTG
TCGTCGTTGCAGAAAGTAGCGATCAGAGAG
CC

QA 7 756 7 756
DS 

RD RR4B651TF 805 0 0
GGTATGTA
TTTAAGGGTT*AGTAGT*GCATCAGAAGTTAAAATATCTTACAAAGCAAGCAAACAGTCA
AAATATTACATAAGCAGAGGAGAGGAGAAGAGAACTAGTCATGGTGTTGCTCCATGTGGT
TGAGATGAAGAACACTTTCATGGTTCTTGTGAAC*TCCACC*TTGAACTTCTCTTCTTTC
TCTCC*TCTCA**AGCTTGAGAAGCATGTTGTACTTTGCAGCCTCCCCCAGTGACCTCAG
CGTTAGCGTGAACAACCTCCTGGAGTTCATAAGGGAACAAGGAGTTAGACCTCTGCTGGA
TGGTCTTGACAGCGTGATCAGCAACGTGCTGCACTTCAGGATCATCTCCTGGAACTTCCC
TCCATCCAGATTCAAGCTCACCTTTCTTGCAGCCAAGATCGGAGGGGAGTGATGGTATTG
GTAGTAGAGGCACCACCATCATCACTAGTAGCAGGCTTGAACTCCTGTAACTCCTTGAAG
TTCAACCAAGGCTTCACCCACACTTTGGCTTCGTAAAGCTTCTTCTTCCCAGCCTCTATG
ATCTCCAGAGTCAGGTGGTGCAGCGTTCCCGCCACAACTTGCTCTTTCGCCTTCACCACT
CTCCCAAACTCTAGAAGCGCATTCTCTTTCTTGTTATGCTCATCGACAGCGAAGCGAGCG
AGGCTCTCGACCTCGCCACTGTTCTGGTTAGAAGGTACATCGCGAACGGCTCCGGGCATG
TCCATGTTGTCGTCGTTGCAGAAAGTAGCGATCAGAGAGGGAATGAAGATTGAGGAGAGA
GAGAGAAC
AACGATGAA

QA 9 796 9 796
DS 

RD RR4BG58TF 684 0 0
TCATGGTTCTTGTGAACCTCCACCCTTGAACTTCTCTTCCTTCTCTCCCTCTCA**AGCT
TGAGAAGCATGTTGTACTTTGCAGCCTCCCCCAGTGACCTCAGCGTTAGCGTGAACAACC
TCCTGGAGTTCATAAGGGAACAAGGAGTTAGACCTCTGCTGGATGGTCTTGACAGCGTGA
TCAGCAACGTGCTGCACTTCAGGATCATCTCCTGGAACTTCCCTCCATCCAGATTCAAGC
TCACCTTTCTTGCAGCCAAGATCGGAGGG*AGTGATGGTATTGGTAGTAGAGGCACCACC
ATCATCACTAGTAGCAGGCTTGAACTCCTGTAACTCCTTGAAGTTCAACCAAGGCTTCAC
CCACACTTTGGCTTCGTAAAGCTTCTTCTTCCCAGCCTCTATGATCTCCAGAGTCAGGTG
GTGCAGCGTTCCCGCCACAACTTGCTCTTTCGCCTTCACCACTCTCCCAAACTCTAGAAG
CGCATTCTCTTTCTTGTTATGCTCATCGACAGCGAAGCGAGCGAGGCTCTCGACCTCGCC
ACTGTTCTGGTTAGAAGGTACATCGCGAACGGCTCCGGGCATGTCCATGTTGTCGTCGTT
GCAGAAAGTAGCGATCAGAGAGGGAATGAAGATTGAGGAGAGAGAGAGAACAACGATGAA
GAGGAAACGTCTTTTCATCTTTCC

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL552Contig2 869 3 11 U
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ACGACGACGACATGGCCATGCCCGGAGCCGTTCGCGATGTACCTTCTAACCAGAACAGTG
GCGAGGTCGAGAGCCTCGCTCGCTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCAC
TGCTAGAGTTTGGGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTTGTGGCGGGAACGCTGCACC
ACCTGACTCTGGAGATCATAGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCTAAAGTGTGGG
TGAAGCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTACAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTAGTGGTGATG
GTGGTGCCTCTACTACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGC
TTGAGTCTGGATGGAGAGAAGTTCCTGGAGATGATCCTGAAGTGCAGCATGTTGCTGATC
ATGCTGTCAAGACCATACAGCAGAGGTCTAACTCTTTGTTCCCTTATGAGCTTCAGGAGG
TTGTTCATGCTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGT
TGAAGAGAGGAGAGAAGGAGGAGAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTG
TTCTTCATCTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTTCTCTTCTCCTCTCCTCTGCT
TATGTAATATTTTGACTGTTTGCTTGCTTTGTAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTAC
TAAACCCTTAAAATAACATACCAGAAGGAATAAATTAAAAGTTAGTCTTTGATTCGTACA
ATAAACGGAAATAGGAAGAAGACTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT52TF U 1
AF RR4CX47TF U 4
AF RR4H175TF U 570
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TGAAGAGAGGAGAGAAG*AGGAGAAGTT

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GG
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GACGACATGGCCATGCCCGGAGCCGTTCGCGATGTACCTTCTAACCAGAACAGTGGCGAG
GTCGAGAGCCTCGCTCGCTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTA
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DS 



AS 1 6

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TTCGTTCCTTGGAAAGAGTATTTGGAAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW39JQ U 1
AF RR4GG47JQ U 4
AF RR4A172JQD U 30
AF RR4A172JQ U 30
AF RR4AH71TF C 120
AF RR4A172TF C 432
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TCTGGCTCTT

QA 1 730 1 730
DS 

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GT
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GGTCGTCGAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGA
TCTGGATCCAGTCTTCAATGAATTCACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCA
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AGGACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAA
GGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATGAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAG
ATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGG
CTCTTGGCAAGT

QA 3 734 3 734
DS 

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ATAGAGAGAAAACATGAGTAGAACTCTTTTATGACAAGGCAAAAGCTGGGGTGGTCTTGA
AGTCAAGTTCCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCACAAAATCATAGTGAGCGCCTCTTATGG
CGAGCTTGTTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGAACGGGTACGATAACAGGTTCCCCAGCG
ACACGTCCACAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGCACTGGTCGTCGAAGCTCAGGTCTTTAC
AATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATT
CACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAAC
AGCT*GTGACCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACTGTGATTGGATATTCAAGG
GCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTT
CTAACGATAAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAA
TCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAA

QA 1 719 1 719
DS 

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AAACTGAAGATAAAGAAAGATGCTTATTGATGAGAAATTGAGAACACACTTAGAAGCAAC
ATAGAGAGAAAACATGAGTAGAACTCTTTTATGACAAGGCAAAAGCTGGGGTGGTCTTGA
AGTCAAGTTCCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCACAAAATCATAGTGAGCGCCTCTTATGG
CGAGCTTGTTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGAACGGGTACGATAACAGGTTCCCCAGCG
ACACGTCCACAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGCACTGGTCGTCGAAGCTCAGGTCTTTAC
AATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATT
CACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAAC
AGCT*GTGACCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACTGTGATTGGATATTCAAGG
GCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTT
CTAACGATAAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAA
TCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAAC
GAAGGATTCTTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAATCCAGACTTGATCCTTTCT
ACAGAATCTATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTAGCTCACTAGTTAACTGCTTGATCTTT
GCGGCTGCGACGTT

QA 1 854 1 854
DS 

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ATGAAATA
TGAGAACACACTTAGAAGCAGCATAGAGAGAAAACATGAGTAGAACTCTTTTATGACAAG
GCAAAAGCTGGGGTGGTCTTGAAGTCAAGTTCCCAGAGATCAAACGTCC*TTTCACAAAA
TCATAGTGAGCGCCTCTTATGGCAAGCTTGTTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGAACGGG
TACGATAACAGGTTCCCCAGCGACACGTTCACAGCTTC*TTCTCACAGTTGGTGCACTGG
TCGTCGAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATC
TGGATCCAGTCTTCTATGAATTCACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATG
AGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCT*GTGACCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAG
GACTGTGACTGGATATTCAAGGGCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGG
TGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATAAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGAT
GTGAGGCGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCT
CTTGGCAAGTGCACTGTACAACGAAGGATTCTTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTT
GAATCCAGACTTGATCCTTTCTACAGAATCTATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTAGCTC
ACTAGTTAACTGCTTGATCTTTGCGGCTGCGACGTTACCTAGATCCGATTTCTTGGTGAG
AAGCTCTCCAAGTTTTTTAAGGGCATCTTCGTACGAGTCCGTCGACATATCTTTTCGTTC
CT
GAAAATTGATACCC

QA 9 850 9 850
DS 

RD RR4A172TF 557 0 0
TCCAGTCTTCTATGAATTCACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTC
CTTTTATTCCACCACAACAGCT*GTGACCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACT
GTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGC
ACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATAAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGA
GACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTG
GCAAGTGCACTGTACAACGAAGGATTCTTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAAT
CCAGACTTGATCCTTTCTACAGAATCTATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTAGCTCACTA
GTTAACTGCTTGATCTTTGCGGCTGCGACGTTACCTAGATCCGATTTCTTGGTGAGAAGC
TCTCCAAGTTTTTTAAGGGCATCTTCGTACGAGTCCGTCGACATATCTTTTCGTTCCTTG
GAAAGAGTATTTGGAAA

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 8

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GGGGATAGACCAAGGAAGAACCGATCCCAATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAA
ACACAAGACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTT
CTTCGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTC
TTGTCCGAGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGA
GACGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTC
CATCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATG
CATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGG
TATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCA
AACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAG
TTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATG
GGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTT
TGGGCGTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGA
GGAGGTGGGACAAGATGAAAGATAGGCTTCTTACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTG
TTTGAAAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTA
TTTTTTGTTCATTCTTCCTCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTCTTCTCCATTAAGAGAG
ATTCAATACTCTGACTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 5 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F738TF U 5
AF RR4EF29TF U 5
AF RR4GS69JQ C 213
AF RR4GS69TF U 123
AF RR4H025TF U 1
AF RR4CA68JQ C 123
AF RR4F738JQ C 294
AF RR4EF29JQ C 546
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BS 30 229 RR4H025TF
BS 230 230 RR4EF29TF
BS 231 656 RR4H025TF
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CCTTTG*ATATCCCTTTG

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GG
AGACCAAGGAAGAACCGATCCCAATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAAACACAA
GACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGC
CAATCTCTATCCCTAAGAGCTGTGGATATGTTGGTAGGATAGGAGTTTCATTTCTTGTCC
GAGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTG
TGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCATCAT
CATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATG
CCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACA
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CTTATTATCAGTTTGAGTTCA

QA 3 623 3 623
DS 

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CCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGA
TTCATGAGTGTTTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAG
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CAGGCTAGG
GAC

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CGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCA
TCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCA
TATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTA
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GGCGTAAT

QA 1 548 1 548
DS 

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GGGGATAGACCAAGGAAGAACCGATCCCCATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAA
ACACAAGACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTT
CTTCGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTC
TTGTCCGAGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAGTGTCAGAGGA
GACGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTC
CATCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATG
CATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGG
TATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCA
AACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAG
TTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATG
GGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATACTT
TGGGCGTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGA
GG*GGTGGGACAAGATGAAAGATAG*CTTCTTACTGTGATAGAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4CA68JQ 782 0 0
TCGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTT
GTCCGAGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGA
CGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCA
TCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCA
TATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTA
TACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAA
CAGACTATCAAAGATTTCGGCTCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTT
TTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGG
AAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTG
GGCGTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGG
AGGTGGGACAAGATGAAAGATAGGCTTCTTACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTT
TGAAAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATT
TTTTGTTCATTCTTCCTCTCTCTCTTTCCCTCAACATTATTCTTCTCCATTAAGAGAGAT
TC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4F738JQ 628 0 0
AAAGCTCCATCATCACTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAAT
AAGGATGCATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAA
GACAAAGTATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTTAATTTGATCCCT
ACTAGCAAACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTA
AAGAAAGTTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAA
GTTGATGGGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGC
CATGCTTTGGGCGTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCT
AATGAGAGGAGGTGGGACAAGATGAAAGATAGGCTTCACACCGTGATAGATTCTTTCAAG
ATCACTGTTTGAAAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTG
AGTTGTATTTTTTGTTCATTCTTCCTCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTCTTCTCCATT
AAGAGAGATTCAATACTCTGACTTCTTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4EF29JQ 371 0 0
GCACCACCAAATCAGAAGACAACTTTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAG
ACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGTTAGGAACTACCCCCGCCATGCTTTGGGG
GTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTTTACACATTGACAACTGGGGTTAATGAGAGGAGG
TGGGACAAGATGAGAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGA
AAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGCATTTTT
TGTTCATTTTTCCTCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTTTTTTCCATTAAGAGAGATTCA
ATA
TTTTGATT

QA 1 363 1 363
DS 



AS 1 8

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AACATCCCTAGATCTCTCACCGACTCATCTCTCTCTATATTTCTTCTAACCATATCTTCT
GCAGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCACCGTCTTTTAACACGAGCTGCTCTTCTCCGTC
GACGTTAATCGTTTTTCAATCAATCTTCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGA
TTCGATCTTTTTGATGGGTTTTGAAGAACACGTACATAGACAGATGGTGTTCAAGTTTCA
CTTTCCTCATCTCCACATACTCCATCATAACCATCATCATGTTCCGAAAGGCTGTGTTGC
GATCATGGTTGGTCACGAGGGAGATGAAGAAGGTCTACACAGATTCGTTGTTCCCTTGAT
GTTCTTGAGCCATCCTCTGTTCTTGAGGCTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGTTT
CAAACACGCTGGTCCGATCACGATTCCTTGCCGTGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGA
GATTATCGACGAGGAGACACATCGCCGTCATAGTCACGGTAACGGACACAACAACCACAA
CCACCACCACAACAACAACCATTTGCGATGTTTCTGAAGATCTGTGTTTGGTTTTGTTTG
GTTTGACAT*GTAATTGATATTGGTTTGGTTTGGTTTGACTTTTCGTTTGAGATTGGTTT
AGTTTGCTTAGTGATGATGATGATGA***AAAATACAGAGTGCAATTGAATGTTAATGCT
TCTCTCATCTTTTACCAATGTAATCGTGGGGAAAAAGGAATTTCAATGTGTGATTGCCTG
ATTGAAATAAGTATTATTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL34TF U 1
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AF RR4E208TF U 1
AF RR4C182JQ C 122
AF RR4GW62TF U 22
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AF RR4DL34JQ C 72
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GG
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AT*GTAATTGATATTGGTTTGGTTTGGTTTGAC

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GCAGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCACCGTCTTTTAACACGAGCTGCTCTTCTCCGTC
GACGTTAATCGTTTTTCAATCAATCTTCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGA
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GATCATGGTTGGTCACGAGGGAGATGAAGAAGGTCTACACAGATTCGTTGTTCCCTTGAT
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CAAACACGCTGGTCCGATCACGATTCCTTGCCGTGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGA
GATTATCGACGAGGAGACTCATCGACGTCATAGTCACGGTAACGGACACAACAACCACAA
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TGAAAAA

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TTTGACAT*GTAATTGATATTGGTTTGGTTTGGTTTGACTTTTCGTTTGAGATTGGTTTA
GTTTG

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GG
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TATCACCGTCTTTTAACACGAGCTGCTCTTCTCCGTCGGCGTTAATCGTTTTTCAATCAA
TCTTCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGATTCGATCTTTTTGATGGGTTTTG
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GTTTGGTTTGGTTTGACTTTTCGTTTGAGATTGGTTTAGTTTGCTTAGTGATGATGATGA
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TTTTTCAATCAATCTTCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGATTCGATCTTTT
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TGATGATGATGATGA***AAAATACAGAGTGCAATTGAATGTTAATGCTTCTCTCATCTT
TTACCAATGTAATCGTGGGGAAAAAGGAATTTCAATGTGTGATTGCCTGATTGAAATAAG
TATTATTCG

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DS 

RD RR4GW62JQ 656 0 0
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GGTTTTGAAGAACACGTACATAGACAGATGGTGTTCAAGTTTCACTTTCCTCATCTCCAC
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ATGATGATGA***AAAATACAGAGTGCAATTGAATGTTAATGCTTCTCTCATCTTTTACC
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QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 7

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TGAAAGATAAAAACGAAAAAGCCTTTGCCATTTGGCTGTGAATGAAGAAGTTGGGAACTT
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TCTCCTCTCCGCTTTTCTCTGCTCAATAGCTTCTTTCTGTCTCCTGACTAAATCTGTGTG
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GTAGCCTCCTGGAGTTGAGTAACCTTCAACGCATGGCTCAGGATGCAGCGTCTTCAGATC
AATTCCCATCACACTCATGATTGTATTAATGGCTGCGATCCCTTCACATCCTGATTTTAG
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AACAGTAGCTTTAGCATTAATCCATCCGCAAATCTCCTCAAGAAGCGCACAGTCTTGTCC
AACAGCTGCACCCATTCTACGCTCTGGCATACCATGAGGACACGAGAAGTTGATCTCTAA
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TTCCTCCATGATGGAAGCGATGAGGATCCGGTCAGGGTACTCTTGTTTCAGCTGCTTGAA
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GGGTGATAAGGTGGTTTTAGAAGAGAGTCCAGAGAAGCTAGTTAAGGCGAAGCTCATGGA
TGCCATTTGATCAGGTGATTAGCAGAAACTTTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED30JQ U 1
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TATTTATTTAAGTATCTTGGGTCCATCACTTGATCAAGGCTACTGAAGTTAGTTAGAAAC
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TCTCCTCTCCGCTTTTCTATGCTCAATAGCTTCTTTCTGTCTCCTGACTAAATCTGTGCG
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TTTCATAAAATC

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AACGAAAAAGCCTTTGCCATTTGGCTGTGAATGAAGAAGTTGGGAACTTTATTTATTTAA
GTATCTTGGGTCCATCACTTGATCAAGGCTACTGAAGTTAGTTAGAAACCATACTCTCAG
TCTCCTTCACGAACCCATCTCCGGTCCAATCTTTATCAAATTTCAAGCCTCTCCTCTCCG
CTTTTCTCTGCTCAATAGCTTCTTTCTGTCTCCTGACTAAATCTGTGTGTGTTGTAAAGT
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AACTTTAGTTTTCTTTTCTTTTCAAATGAGAGAGGTAAAGAGGTCGACGTGAAAGATAAA
**CGAAAAAGCCTTTGCCATTTGGCTGTGAATGAAGAAGTTGGGAACTTTATTTATTTAA
GTATCTTGGGTCCATCACTTGATCAAGGCTACTGAAGTTAGTTAGAAACCATACTCTCAG
TCTCCTTCACGAACCCATCTCCGGTCCAATCTTTATCAAATTTCAAGCCTCTCCTCTCGG
CTTTTCTCTGCTCAATAGCTTCTTTCCGTCTCCTGACTAAATCTGTGTGTGTTGTAAAGT
ACTGAAGCGAATGTCCTCTAAACTCTTCTATTGTTGAGAAGTTATGTTGTTTCATAAAAT
CTTGAAGCTCGGCGCATAGAGTTTTCACATGACCATAGCCATGCACCATCACACCAGTGC
ATACCTGGACAGTGTTTGATCCGAGGAGAATGAACTCAGCTGCATCATAGCCAGTTTCAA
CACCTCCAATACCCGAAAGCGAGCAATCTTTCTCACTGAACTCATCTCTCATCATCTTAG
CAATGTTCATAACTTTCGCAAGCGCAATGGGGCGAACAGCTTTATAAGAGTAGCCTCCTG
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TTTAAGTATCTTGGGTCCATCACTTGATCAAGGCTACTGAAGTTAGTTAGAAACCATACT
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CTCCGCTTTTCTCTGCTCAATAGCTTCTTTCTGTCTCCTGACTAAATCTGTGTGTGTTGT
AAAGTACTGAAGCGAATGTCCTCTAAACTCTTCTATTGTTGAGAAGTTATGTTGTTTCAT
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TTCAACACCTCCAATACCAGAAAGCGAGCAATCTTTCTCACTGAACTCATCTCTCATCAT
CTTAGCAATGTTCATAACTTTCGCAAGCGCAATGGGGCGAACAGCCTTATAAGAGTAGCC
TCCTGGAGTTGAGTAACCTTCAACGCATGGCTCAGGATGCAGCGTCTTCAGATCGATTCC
CATCACACTCATGATTGTGTTAATGGCTGCGATCCCTTCACATCCTGATTTTAGAGATAC
CCTCGCCGGCTCTGTAATGTCAGTAAT

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DS 

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CTGTCT
CTGACTAAATCTGTGTGTGT*GTAAAGTACTGAAGCGAATGTCCTCTAAACTCTTCTATT
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CCATAGCCATGCACCATCACACCAGTGCATACCTGGACAGTGTTTGATCCGAGGAGAATG
AATTCAGCAGCATCATAGCCAGTTTCAACACCTCCAATACCAGAAAGCGAGCAATCTTTC
TCACTGAACTCATCTCTCATCATCTTAGCAATGTTCATAACTTTCGCAAGCGCAATGGGG
CGAACAGCCTTATAAGAGTAGCCTCCTGGAGTTGAGTAACCTTCAACGCATGGCTCAGGA
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TCACATCCTGATTTTAGAGATACCCTCGCCGGCTCTGTAATGTCAGTAATATTAGGAGTC
ATCTTGGCCCAAACAGGAACAGTAGCTTTAGCATTAATCCATCCGCAAATCTCCTCAAGA
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GAGAAGTTGATCTCTAAAGCATCAACACCGGTTTGCTCAACGCGGTCAATGAGCTCTTCC
CATCCGGTTTTGGTGTATTCCTCCATGATGGAAGCGATGAGGATCCGGTCAGGGTACTCT
TGTTTCAACTGCTTGAACTCTTTGAGCATGGTTTCTAGAGGACGGTCGCTGATGAGTTCT
ATGTTCTGCCACCCGATCACATCTGTTTTGGCTGAGCCGGTTC
TC

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DS 

RD RR4AU70TF 831 0 0
A
TCAGCAGCATCATAGCCAGTTTCAACACCTCCAATACCAGAAAGCGAGCAATCTTTCTCA
CTGAACTCATCTCTCATCATCTTAGCAATGTTCATAACTT*CGCAAGCGCAATGGGGCGA
ACAGCTTTATAAGAGTAGCCTCCTGGAGTTGAGTAACCTTCAACACATGGCTCAGGATGC
AGTGTCTTCAGATCAATTCCCATCACACTCATGATTGTATTGATGGCTGCGATCCCTTCA
CATCCTGATTTTAGAGATACCCTCGCCGGCTCAGTAATGTCAGTAATATTAGGAGTCATC
TTGGCCCAGACAGGAACAGTAGCTTTAGCATTAATCCATCCGCAAACCTCCTCAAGAAGC
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ACGAAAGGATTCGGCATTTTCAGACCGTTTACTGTGACACTGAGATCAG
C

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CTCTGGCATACCATGAGGACACGAGAAGTTGATCTCTAAAGCATCAACACCGGTTTGCTC
AACGCGGTCAATGAGCTCTTCCCAACCGGTTTTGGTGTATTCCTCCATGATGGAAGCGAT
GAGGATCCGGTCAGGGTACTCTTGTTTCAGCTGCTTGAACTCTTTGAGCATGGTTTCGAG
AGGTCGGTCACTTATAAGTTCTATGTTCTGCCACCCGATTACATCTGTTTTGGCTGATCC
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AGAGAGTCCAGAGAAGCTAGTTAAGGCGAAGCTCATGGATGCCATTTGATCAGGTGATTA
GCAGAAACTTTACTTCC

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DS 



AS 1 9

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AGCAAAAAGCTAAAGAACATCCGCAAGCATCAATGGCGATATCCAAGCTCCACCTCCTCT
TTCTTCTCTTACTTGTCAGCCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAACGATGAGG
AAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACACTCA
CACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAAC
CATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACT
ACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCA
TGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCAC
GGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATA
ATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCCGGCTACTA
AGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATTTGGAGTTAACGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGT
TGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGTT
GTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGGGTGAAAAT
CTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATCGTTTTGTTTTGATGGAATATATATTGTAGTAC
TGATCAGCTTATTTGCATTGCGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 5 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL91TF U 1
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AF RR4F934TF U 33
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BS 217 259 RR4GL91TF
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BS 415 759 RR4GL91TF
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AAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAGCATCTCTAAACCTAACAACACTCA
CACATAACAACAACGCAGAGTGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAAC
CATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACT
ACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGT*AGATCA
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ATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCCGGCTACTA
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TGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGTT
GTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTT

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DS 

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GG
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CTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACACTCACACATAACAAC
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ATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTC
CTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCTAGCTTGT
GTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAG
AAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTTCTTCTGATGATAATTGGATTGTG
GTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCCGGCTACTAAGGACAGTAAC
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TTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGTTGTTCTTTCTTC
ATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGGGTGA

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DS 

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CCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCG
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TTCTTGAATAATGATCTCGTTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTT
TCATTGTCTATGGGTGAAA*TCTCATTGCATT

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DS 

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TTCTTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACAT
CTCTAAACCTAACAACACTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCG
CAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGAT
CCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAGTGTCACCTCGACACAACCG
CAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCT
TGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCA
TTGGCATTGCCTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGG
GTGGCTATACTCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATTTGGAGTTAACG
GTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTT
TTCTTGAATAATGATCTCGTTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTT
TCATTGTCTATGGGTGAAA*TCTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATCGT

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DS 

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GGGCAAT
AAACAAAAACAAAAAAAAATCAGCAAAAAGCTAAAGAACATCCGCAAGCATCAATGGCGA
TATCCAAGCTCCACCTCCTCTTTCTTCTCTTACTTGTCAGCCTCTCCCTTCATCGTCCTG
TTCTTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACAT
CTCTAAACCTAACAACACTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCG
CAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGAT
CCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCG
CAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCT
TGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCA
TTGGGATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGG
GTGGCTATACTCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATTTGGAGTTAACG
GTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTT
TTCTTGAATAATGATCTCGTTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTT
TCATTGTCTATGGGTGAAA*TCTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATCGTTTTGTTT*G
ATGGAATATATATTGTAGTACTGATC

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DS 

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CCTCCTCTTTCTTCTCTTACTTGTCAGCCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAA
CGATGAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAAC
AACACTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAA
GAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTT
CCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGG
TGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCAC
AAAGTCACGGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGGATTGCTTC
TGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC
GGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATTTGGAGTTAACGGTGTCGTTTCTTC
GTGTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATG
ATCTCGTTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGG
GTGAAAATCTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATCGTTTTGTTTTGATGGAATATATAT
TGTAGTACTGATC
T

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4G554JQ 678 0 0
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CTAACAACACTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAG
TTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCT
GGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAGTGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGA
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TTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATT
GCCTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTAT
ACTCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATTTGGAGTTAACGGTGTCGTT
TCTTCGTGTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTTTTCTTGAA
TAATGATCTCGTTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTC
TATGGGTGAAAATCTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATCGTTTTGTTTTGATGGAATA
TATATTGTAGTACTGATC

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DS 

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AAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAGCATCTCTAAACCTAACAACACTCA
CACATAACAACAACGCAGAGTGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAAC
CATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACT
ACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGT*AGATCA
TGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCAC
GGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATA
ATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCCGGCTACTA
AGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATTTGGAGTTAACGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGT
TGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGTT
GTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGGGTGAAAAT
CTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATCGTTTTGTTTTGATGGAATATATATTGTAGTAC
TGATCAGCTTATTTGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4GI49JQ 660 0 0
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TGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTC
TGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCT
CGACACAACCGCAACCATAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTGTTTTCCTAACCTTGATGC
CACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAAGCTGAATGATTCTAA
GTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAA
CACAACTGAGGGTGGCTATACTCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTCTCGCATT
TGGAGTTAACGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTGTTCATGCT
TTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGTTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATT
ATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGGGTGAAAATCTCATTGCATTTGTATGTTATCTCTATC
GTTTTGTTTTGATGGAATATATATTGTAGTACTGATCAGCTTATTTGCATTGCGTTTGTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 8

CO CL558Contig1 1689 8 29 U
GGAAAGCACCTCCGCACAGACAGAAAAAAAAACACTTGAGATCCGCCGAGAAGAAGAAGA
AGATGACGACGACTCAAGACGTGGAGATGAAAGACAACCAAACCCCAGCTCAATCCCTCG
TCTCCCCCACCACCTCAACACTTCATCATCTGAAAGAGATTACAGCTCTGATCGATACCG
GCTCATACACCAAAGAAGTCCGCCGCGTCGCTCGCGCCGTGCGTCTCACCGTCGGGCTGA
GACAGAAGCTGACGCCTTCCGTCGTCTCTTCGTTCCTTGACTTCGCTTTGGTTCCCGGAT
CTGAGGCTCACGCTCGTCTCTCTTCCTTCGTTCCCAAGAGTGATGAACATGAGATGGAGG
TTGATACTGCTTCGTCCACTCCTCCCTTGGCTTCCTCCAAGCACGTGCCTGTAGAGCTTG
AGATTTACTGCTACTTCATTGTCCTTCTTTTTCTGATTGACCAGAAGAAGTACAACGAGG
CGAAAGCTTGCTCTTCAGCTAGCATTGCTCGTCTCAAGAGCTTGAACAAGAGAACCATTG
ATGTGATAGCTTCGAGGTTGTATTTTTACTACTCTTTGAGTTATGAGATGACTGGTGATC
TTGCTGAGATTCGTGGTACTCTTTTGTCTTTGCACCATTCTGCAACTCTGCGCCATGATG
AGTTGGGTCACGAAACACTTCTGAATCTGTTGCTTCGCAACTACCTGCACTACAACCTTT
ATGACCAAGCTGAGAAGTTGAGATCAAAAGCACCAAGATTTGAGGCTCATTCTAACCAGC
AGTTCTGTAGGTACTTGTTTTACCTCGGTAAAATCCGGACCATCCAACTCGAGTACACTG
ATGCAAAAGAGAGCCTCCTCCAGGCGGCTAGGAAAGCACCTGTTGCTGCTCTAGGCTTCC
GAGTCCAATGCAACAAGTGGGCTATTCTAGTTCGACTCCTACTGGGTGAGATTCCAGAGC
GATCCATCTTCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTTGAACTTACCA
ATGCTGTGAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGCAAAGA
CATTCTCTGAGGACAGGACTCACAACCTCATTGTCAGGCTCCGACACAACGTGATCAGAA
CAGGACTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTCGCCCAGA
AGCTAAGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCA
TAAGAGACGGAGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTCAAAGG
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TCTGTTTGAACATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACA
GGGAGAAAGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTA
AATACATGGCTGAAGAAGATGACGACGATTTCTAAGATTTTAATGCAATGCCTAGCGTTT
CTCTGTCTCTTTTGTTATTTCGAAATTTTCTGACATTTTTCTTCTTGTTATGGCACTTCA
GTTCTTGTACTTTATGAGAAACAGAACTCAATGTTTTTACTTGGTTTCATTTTAAGAGCT
CGTTCACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4FK86TF U 1
AF RR4EW25TF U 11
AF RR4G758TF U 606
AF RR4EW25JQ C 1040
AF RR4G758JQ C 956
AF RR4AM22TF U 910
AF RR4DO54JQ C 956
AF RR4FK86JQ C 956
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BS 163 667 RR4FK86TF
BS 668 676 RR4EW25TF
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BS 678 725 RR4EW25TF
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BS 727 749 RR4EW25TF
BS 750 940 RR4G758TF
BS 941 942 RR4AM22TF
BS 943 1096 RR4G758TF
BS 1097 1097 RR4AM22TF
BS 1098 1192 RR4G758TF
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BS 1194 1291 RR4G758TF
BS 1292 1292 RR4AM22TF
BS 1293 1297 RR4G758TF
BS 1298 1342 RR4AM22TF
BS 1343 1343 RR4DO54JQ
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BS 1446 1446 RR4DO54JQ
BS 1447 1642 RR4AM22TF
BS 1643 1643 RR4DO54JQ
BS 1644 1674 RR4AM22TF
BS 1675 1675 RR4DO54JQ
BS 1676 1688 RR4AM22TF
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RD RR4FK86TF 667 0 0
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TCTCCTCCACCACCTCAACACTTCATCATCTGAAAGAGATTGCAGCTCTGATCGATACCG
GCTCATACACCAAAGAAGTCCGCCGCGTCGCTCGCGCCGTGCGTCTCACCGTCGGGCTGA
GACAGAAGCTGACGCCTTCCGTCGTCTCTTCGTTCCTTGACTTCGCTTTGGTTCCCGGAT
CTGAGGCTCACGCTCGTCTCTCTTCCTTCGTTCCCAAGAGTGATGAACATGAGATGGAGG
TTGATACTGCTTCGTCCACTCCTCCCTTGGCTTCCTCCAAGCACGTGCCTGTAGAGCTTG
AGATTTACTGCTACTTCATTGTCCTTCTTTTTCTGATTGACCAGAAGAAGTACAACGAGG
CGAAAGCTTGCTCTTCAGCTAGCATTGCTCGTCTCAAGAGCTTGAACAAGAGAACCATTG
ATGTGATAGCTTCGAGGTTGTATTTTTACTACTCTTTGAGTTATGAGATGACTGGTGATC
TTGCTGAGATTCGTGGTACTCTTTTGTCTTTGCACCATTCTGCAACTCTGCGCCATGATG
AGTTGGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EW25TF 739 0 0
GGG
GCACAGACAGAAAAAAAAACACTTGAGATCCGCCGAGAAGAAGAAGA***TGGCGACGAC
TCAAGACGTGGAGATGAAAGACAACCAAACCCCAGCTCAATCCCTCGTCTCCCCCACCAC
CTCAACACTTCATCATCTGAAAGAGATTACAGCTCTGATCGATACCGGCTCATACACCAA
AGAAGTCCGCCGCGTCGCTCGCGCCGTGCGTCTCACCGTCGGGCTGAGACAGAAGCTGAC
GCCTTCCGTCGTCTCTTCGTTCCTTGACTTCGCTTTGGTTCCCGGATCTGAGGCTCACGC
TCGTCTCTCTTCCTTCGTTCCCAAGAGTGATGAACATGAGATGGAGGTTGATACTGCTTC
GTCCACTCCTCCCTTGGCTTCCTCCAAGCACGTGCCTGTAGAGCTTGAGATTTACTGCTA
CTTCATTGTCCTTCTTTTTCTGATTGACCAGAAGAAGTACAACGAGGCGAAAGCTTGCTC
TTCAGCTAGCATTGCTCGTCTCAAGAGCTTGAACAAGAGAACCATTGATGTGATAGCTTC
GAGGTTGTATTTTTACTACTCTTTGAGTTATGAGATGACTGGTGATCTTGCTGAGATTCG
TGGTACTCTTTTGTCTTTGCACCATTCTGCAACTCTGCGCCATGATGAGTTGGGTCACGA
AACGCTTCTGAATCTGTTGCTTCGCAACTACCTGCACTACAACCTTTATGAC*AAGCTGA
GAAGTTGAGATCAAAA

QA 4 739 4 739
DS 

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GGTCAGGAAACACTTCTGAATCTGTTGCTTCGCAACTACCTGCACTACAACCTTTATGAC
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TGTAGGTACTTGTTTTACCTCGGTAAAATCCGGACCATCCAACTCGAGTACACTGATGCA
AAAGAGAGCCTCCTCCAGGCGGCTAGGAAAGCACCTGTTGCTGCTCTAGGCTTCCGAGTC
CAATGCAACAAGTGGGCTATTCTAGTTCGACTCCTCTTGGGTGAGATTCCAGAGCGATCC
ATCTTCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTTGAACTTACCAATGCT
GTGAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGCAAAGACATTC
TCTGAGGACAGTACTCACAACCTCATTGTCAGGCTCCGACACAACGTGATCAGAACAGGA
CTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTGGCCCAGAAGCTA
AGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGA
GACGGAGCAATCGACGCGACCATCGATCACAA

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DS 

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TCACAACCTCATTGTCAGGCTCCGACACAACGTGATCAGAACAGGACTGCGCAACATCAG
CATCTCCTACTCGAGAATCTTTCTTACAGACGTCGCCCAGAAGCTAAGGCTGAACTCTGC
AAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGAGACGGAGCGATCGA
CGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTCAAAGGAAACGGGAGACATCTACTC
CACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGATTGCCTTCTGTTTGAACATGCACAA
CGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACAGGGAGAAAGAGAGCGAGGA
GAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTAAATACATGGTTGAAGAAGA
TGACAACGATTTTTAAGATTTTAATGCAATGCCTAGCGTTTTTCTG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4G758JQ 703 0 0
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TACCAATGCTGTGAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGC
AAAGACATTCTCTGAGGACAGTACTCACAACCTCATTGTCAGGCTCCGACACAACGTGAT
CAGAACAGGACTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTGGC
CCAGAAGCTAAGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAA
AGCCATAAGAGACGGAGCAATCGACGCGACCATCGATCACAACAAGGGTTATATGGTGTC
AAAGGAAACAGGAGACATCTACTCCACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGAT
TGCCTTCTGTTTGAACATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACAC
GCACAGGGAGAAAGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCT
TGCTAAATACATGGCTGAAGAAGATGACGACGATTTCTAAGATTTTAATGCAATGCCTAG
CGTTTCTCTGTCTCTTTTGTTATTTCGAAATTTTCTGACATTTTTCTTCTTGTTATGGCA
CTTCAGTTCTTGTACCTTATGAGAAACAGAACTCAATGTTT
CT

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DS 

RD RR4AM22TF 779 0 0
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TCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTTGAACTTACCAATGCTGTGA
GGATTGGTGACTTGGAGCTTTTCAGGAACGTTCAAGAGAAGTTTGCAAAGACATTCTCTG
AGGACAGGACTCACAACCTCATTGTCAGACTCCGACACAACGTGATCAGAACCGGACTGC
GCAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTCGCCCAGAAGCTAAGGC
TGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGAGACG
GAGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTCAAAGGAAACAGGAG
ACATCTACTCCACCAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGATTGCCTTCTGTTTGA
ACATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACAGGGAGTAAG
AGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTAAATACATGG
CTGAAGAAGATGACGACGATTTCTAAGATTTTAATGCAATGCCTAGCGTTTCTCTGTCTC
TTTTGTTATTTCGAAATTTTCTGACATTTTTCTTCTTGTTATGGCACTTCAGTTCTTGTA
CTTTATGAGAAACGGAACTCAATGTTTTTACTTGGTTTCATTTTA*GAGCTCGTTCACC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4DO54JQ 734 0 0
AGAGCGATCCATCTTCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTTGAACT
TACCAATGCTGTGAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGC
AAAGACATTCTCTGAGGACAGGACTCACAACCTCATTGTCAGGCTCCGACACAACGTGAT
CAGAACAGGACTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTGGC
CCAGAAGCTAAGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAA
AGCCATAAGAGACGGAGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTC
AAAGGAAACAGGAGACATCTACTCCACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGAT
TGCCTTCTGTTTGAACATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACAC
GCACAGGGAGAAAGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCT
TGCTAAATACATGGCTGAAGAAGATGACGACGATTTTTAAGATTTTAATGCAATGCCTAG
CGTTTCTCTGTCTCTTTTGTTATTTCGAAATTTTCTGACATTTTTCTTCTTGTTATGGCA
CTTCAGTTCTTGTACTTTATGAGAAACAGAACTCAATGTTTTTACTTGGTTTCATTTTAA
GAGCTCGTTCACCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4FK86JQ 734 0 0
AGAGCGATCCATCTTCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTTGAACT
TACCAATGCTGTGAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGC
AAAGACATTCTCTGAGGACAGGACTCACAACCTCATTGTCAGGCTCCGACACAACGTGAT
CAGAACAGGACTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTCGC
CCAGAAGCTAAGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAA
AGCCATAAGAGACGGAGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTC
AAAGGAAACGGGAGACATCTACTCCACGAATGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGAT
TGCCTTCTGTTTGAACATGGACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACAC
GCACAGGGAGAAAGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCT
TGCTAAATACATGGCTGAAGAAGATGACGACGATTTCTAAGATTTTAATGCAATGCCTAG
CGTTTCTCTGTCTCTTTTGTTATTTCGAAATTTTCTGACATTTTTCTTCTTGTTATGGCA
CTTCAGTTCTTGTACTTTATGAGAAACAGAACTCAATGTTTTTACTTGGTTTCATTTTAA
GAGCTCGTTCACC
T

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 9

CO CL559Contig1 575 9 12 U
GGACCCAAGTTTCTGAAAAAAGAAAGAAGCAATAAACTAAGTGCAAAAAGAAGAAGCAAA
AGCTACAAAATGGCAAAAACCCTCAGTTCCATCTGCTTCACCACTCTCCTGCTCGTTGTC
TTGTTGATTTCAGCTGGTATCCCGAAGAGCGAGGCGACGTGTACCAAGTACTTAGGCGAA
GCCATATTGCCGTACCCATGCAGGGAAAGCTACTGTGAAGCCAAATGCGCTGAGATTTAC
CACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGTGAGGATCATGATCATCACCACGGAGTGCATTTAACA
AATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTAC
TCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATT
TAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTT*ATAATTAAATAAAATAGTACGTA
AGACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATAAGATCATGTTGTATGTTATTTCG
ATTTGATAATAATAAAGTTGTTCTGTATTTTGGCG


BQ
35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4DQ46JQ C 98
AF RR4CX96TF U 1
AF RR4DQ61JQ C 1
AF RR4CA08JQ C 1
AF RR4E522JQ C 98
AF RR4DQ61TF U 1
AF RR4DQ46TF U 2
AF RR4E522TF U 2
AF RR4CA08TF U 1
BS 1 250 RR4CX96TF
BS 251 251 RR4DQ61TF
BS 252 253 RR4CX96TF
BS 254 254 RR4DQ61TF
BS 255 301 RR4CX96TF
BS 302 302 RR4DQ61TF
BS 303 319 RR4CX96TF
BS 320 320 RR4DQ61TF
BS 321 521 RR4CX96TF
BS 522 564 RR4DQ61TF
BS 565 574 RR4DQ46TF
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AAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATTTAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTTT
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QA 1 400 1 400
DS 

RD RR4CX96TF 521 0 0
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CACGAGTCATTCATAGGAGAGTGTGAGGATCATGATCATCACCACGGAGTGCATTTAACA
AGTGACCATGACGACCATTTCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTAC
TCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATT
TAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTT*ATAATTAAATAAAATAGTACGTA
AGACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATAAGAT

QA 1 521 1 521
DS 

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GCCATATTGCCGTACCCATGCAGGGAAAGCTACTGTGAAGCCAAATGCGCTGAGATTTAC
CACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGAGAGGATCATGATCATCACCACGGAGTGCATTTAACA
AATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTAC
TCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATT
TAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTT*ATAATTAAATAAAATAGTACGTA
AGACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATAAGATCAT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4CA08JQ 575 0 0
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GCCATATTGCCGTACCCATGCAGGGAAAGCTACTGTGAAGCCAAATGCGCTGAGATTTAC
CACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGTGAGGATCATGATCATCACCACGGAGTGCATTTAACA
AATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTAC
TCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATT
TAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTT*ATAATTAAATAAAATAGTACGTA
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DS 

RD RR4E522JQ 478 0 0
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CGTGTACCAAGTACTTAGGGGAAGCCATATTGCCGTACCCATGCAGGGAAAGTTACTGTG
AAGCCAAATGCGCTGAGATTTACCACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGTGAGGATCATGATC
ATCACCACGGAGTGCATTTAACAAATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTT
ATTAAGCTGCTGATGAAGTTTACTCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGT
AAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATTTAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTTT
ATAATTAAATAAAATAGTACGTAAGACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATA
AGATCATGTTGTATGTTATTTCGATTTGATAATAATAAAGTTGTTCTGTATTTTGGC
C

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DS 

RD RR4DQ61TF 564 0 0
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TCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATT
TAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTT*ATAATTAAATAAAATAGTACGTA
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ATTTGATAATAATAAAGTTGTTCT

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DS 

RD RR4DQ46TF 574 0 0
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CCATATTGCCGTACCCATGCAGGGAAAGCTACTGTGAAGCCAAATGCGCTGAGATTTACC
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ATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTACT
CATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATTT
AAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTTTATAATTAAATAAAATAGTACGTAA
GACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATAAGATCATGTTGTATGTTATTTCGA
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C

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DS 

RD RR4E522TF 574 0 0
GACCCAAGTTTCTGAAAAAAGAAAGAAGCAATAAACTAAGTGCAAAAAGAAGAAGCAAAA
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TGTTGATTTCAGCTGGTATCCCGAAGAGCGAGGCGACGTGTACCAAGTACTTAGGCGAAG
CCATATTGCCGTACCCATGCAGGGAAAGCTACTGTGAAGCCAAATGCGCTGAGATTTACC
ACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGTGAGGATCATGATCATCACCACGGAGTGCATTTAACAA
ATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTACT
CATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATTT
AAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTTTATAATTAAATAAAATAGTACGTAA
GACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATAAGATCATGTTGTATGTTATTTCGA
TTTGATAATAATAAAGTTGTTCTGTATTTTGGC
C

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4CA08TF 575 0 0
GGACCCAAGTTTCTGAAAAAAGAAAGAAGCAATAAACTAAGTGCAAAAAGAAGAAGCAAA
AGCTACAAAATGGCAAAAACCCTCAGTTCCATCTGCTTCACCACTCTCCTGCTCGTTGTC
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AATGACCATGACGACCATTGCTACTGCTACAGTCGTTATTAAGCTGCTGATGAAGTTTAC
TCATAAACTCGTACCGTATTAAATAAAATAAAAATGTAAGCGTGGTGGTTTCCTTCGATT
TAAGTGTCATGTGTGAGTGTTGTTTGCTTTTTTTTT*ATAATTAAATAAAATAGTACGTA
AGACGAAGCTAATGACTTCTCTCCTGCGTCTATTATAAGATCATGTTGTATGTTATTTCG
ATTTGATAATAATAAAGTTGTTCTGTATTTTGGC
G

QA 1 574 1 574
DS 



AS 2 9

CO CL560Contig1 519 7 13 U
GGGTTCTTTACACACAACAAATTTTCTTGTAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATATTA
CTAAAGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCT
TGTACTAGTGGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCAT
ATATTTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATG
CAAGACGAAGACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAA
CAAATGCGCATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACC
AAATTCATATATACTTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTG
TGAAATTATGTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGGAGATGTAAT
AAATGACAAAATAAGTTGGAAAAGTTAATTAGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ36TF U 1
AF RR4CZ36JQ C 22
AF RR4C561JQ C 211
AF RR4A947TF U 8
AF RR4C160TF U 8
AF RR4AB62TF U 8
AF RR4ED82TF U 11
BS 1 57 RR4CZ36TF
BS 58 58 RR4A947TF
BS 59 163 RR4CZ36TF
BS 164 164 RR4A947TF
BS 165 191 RR4CZ36TF
BS 192 192 RR4A947TF
BS 193 306 RR4CZ36TF
BS 307 307 RR4A947TF
BS 308 373 RR4CZ36TF
BS 374 374 RR4A947TF
BS 375 403 RR4CZ36TF
BS 404 471 RR4A947TF
BS 472 519 RR4ED82TF

RD RR4CZ36TF 403 0 0
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CTAAAGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCT
TGTACTAGTGGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAACAGGAGACATGTCCCAT
ATATTTAGATAGCCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATG
CAAGACGAAGACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAA
CAAATGTGCATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACC
AAATTCATATATAATTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4CZ36JQ 382 0 0
TTTTTTTGTAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATAATACTAAAGATGAAAAAA*TCACT
TATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAGTGGCTGGAACGAT
GGGGCAAGGAAATAAAAATAAACAGGAGACATGTCCCATATATTTAGATAGCCAACAGCC
TGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATGCAAGACGAAGACAAAAGGGTT
AGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGTGCATGCTATGTCCC
ATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACCAAATTCATATATAATTATAAT
AAATTATGATGTGATTCATAGT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4C561JQ 194 0 0
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ACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGCGCATGCTATGTCCCATGTCCAAA
ATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACCAAATTCATATATACTTATAATAAATTATGA
TGTGATTCATAGT
G

QA 1 193 1 193
DS 

RD RR4A947TF 470 0 0
GG
ACACACAACAAATTTTCTTGTAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATG
AAAAAA*TCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAGT
GGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGA
TAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAACTGCATGCAAGACGAA
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ATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACCAAATTCATA
TATCCCTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTGTGAAATTAT
GTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGG
AGATGT

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR4C160TF 468 0 0
GG
ACACACAACAAATTTTCTTGTAAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATG
AAAAAA*TCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAGT
GGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGA
TAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATGCAAGACGAA
GACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGCGC
ATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGGCAACCAAATTCATA
TATACTTATAATAAATTATGATGTGATTCATAATAATAATTAAATAATTTGTGAAATTAT
GTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGG
AGAA

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR4AB62TF 464 0 0
GG
ACACACAACAAATTTTCTTGTAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATA
AAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAGT
GGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGA
TAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATGCAAGACGAA
GACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGCGC
ATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACCAAATTCATA
TATACTTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTGTGAAATTAT
GTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGG

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR4ED82TF 509 0 0
GGG
ACAACAAATTTTCTTGTAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATGAAAA
AA*TCACTTATATTTTCATTTAATATTTTAACTCTCCTCATCATTCTCGTACTAGTGGCT
GGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGATAAC
CAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGAATGCAAGACGAAGACA
AAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGTGCATGC
TATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACCAAATTCATATATA
CTTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTGTGAAATTATGTTA
TTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGGAGATGTAATAAATGACAAAATA
AGTTGGAAAAGTTAATTAGAAAAAAA

QA 4 509 4 509
DS 



CO CL560Contig2 816 2 2 U
GGGAGACAAGTGAGCTTCAGCTACTACTACTTATTGCTTATTAATTCCTAAAAAGCTTTA
AAATGGCTGCAAATTACAACGAGAAGCTTCTTCTCAACTATGTTCCCGTATACGTTATGC
TTCCTTTGGGAGTGGTGAATGTGGAAAACGTATTCGTGGACCCTGAAACGCTTGAAACGC
AGCTCAGGCGTCTCAAAGAAGAAGCTGGAATCGATGGCGTTATGGTCGACGTTTGGTGGG
GAATCATTGAATCCAAAGGCCCTAAACAATATGACTGGACCGCTTACAAAACGCTTTTCC
AGCTAATCGCACGTTTAGGACTCAAAATCCAAGCAATCATGTCATTTCACCAATGCGGTG
GAAACGTTGGCGACGTCGTCACTATCCCAATCCCGAAATGGGTTCGAGAGGTTGGTGAGA
GCGATCCAGATATCTACTACACTAACCGTAGAGGAACAAGAGATATTGAGTATCTCTCAC
TCGGTGTCGACAATCTTCCTCTCTTTGCTGGAAGAACTCCTCATCATTCTTGTACTAGTG
GCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGAT
AACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATGCAAGACGAAG
ACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGCGCA
TGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACCAAATTCATAT
ATACTTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ35TF U 1
AF RR4DZ35JQ C 111
BS 1 664 RR4DZ35TF
BS 665 816 RR4DZ35JQ

RD RR4DZ35TF 664 0 0
GGGAGACAAGTGAGCTTCAGCTACTACTACTTATTGCTTATTAATTCCTAAAAAGCTTTA
AAATGGCTGCAAATTACAACGAGAAGCTTCTTCTCAACTATGTTCCCGTATACGTTATGC
TTCCTTTGGGAGTGGTGAATGTGGAAAACGTATTCGTGGACCCTGAAACGCTTGAAACGC
AGCTCAGGCGTCTCAAAGAAGAAGCTGGAATCGATGGCGTTATGGTCGACGTTTGGTGGG
GAATCATTGAATCCAAAGGCCCTAAACAATATGACTGGACCGCTTACAAAACGCTTTTCC
AGCTAATCGCACGTTTAGGACTCAAAATCCAAGCAATCATGTCATTTCACCAATGCGGTG
GAAACGTTGGCGACGTCGTCACTATCCCAATCCCGAAATGGGTTCGAGAGGTTGGTGAGA
GCGATCCAGATATCTACTACACTAACCGTAGAGGAACAAGAGATATTGAGTATCTCTCAC
TCGGTGTCGACAATCTTCCTCTCTTTGCTGGAAGAACTCCTCATCATTCTTGTACTAGTG
GCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGAT
AACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATGCAAGACGAAG
ACAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4DZ35JQ 706 0 0
TACGTTATGCTTCCTTTGGGAGTGGTGAATGTGGAAAACGTATTCGTGGACCCTGAAACG
CTTGAAACGCAGCTCAGGCGTCTCAAAGAAGAAGCTGGAATCGATGGCGTTATGGTCGAC
GTTTGGTGGGGAATCATTGAATCCAAAGGCCCTAAACAATATGACTGGACCGCTTACAAA
ACGCTTTTCCAGCTAATCGCACGTTTAGGACTCAAAATCCAAGCAATCATGTCATTTCAC
CAATGCGGTGGAAACGTTGGCGACGTCGTCACTATCCCAATCCCGAAATGGGTTCGAGAG
GTTGGTGAGAGCGATCCAGATATCTACTACACTAACCGTAGAGGAACAAGAGATATTGAG
TATCTCTCACTCGGTGTCGACAATCTTCCTCTCTTTGCTGGAAGAACTCCTCATCATTCT
TGTACTAGTGGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCAT
ATATTTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGCCAGCTTGCCTAGCTGCATG
CAAGACGAAGACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAA
CAAATGCGCATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAACC
AAATTCATATATACTTATAATAAATTATGATGTGATTCATAGTAAT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 9

CO CL561Contig1 574 9 15 U
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAA
CAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCT
CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAG
CATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTG
ATTAGGATCGGTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTTCTT
GGAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTATTTACATTTTCGTCTCTATTGA
TGGATCCCAATTGCATGAAATGAAACTTTAGGTT


BQ
40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD74JQ C 1
AF RR4CD74TF U 1
AF RR4H124JQ C 53
AF RR4H124TF U 1
AF RR4CG20TF U 1
AF RR4EP79JQ C 1
AF RR4EP79TF U 1
AF RR4EI01JQ C 2
AF RR4EI01TF U 2
BS 1 255 RR4CD74TF
BS 256 256 RR4H124TF
BS 257 267 RR4CD74TF
BS 268 268 RR4H124TF
BS 269 381 RR4CD74TF
BS 382 382 RR4H124TF
BS 383 432 RR4CD74TF
BS 433 433 RR4CG20TF
BS 434 441 RR4CD74TF
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BS 443 534 RR4CD74TF
BS 535 546 RR4CG20TF
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BS 548 564 RR4CG20TF
BS 565 574 RR4EI01JQ

RD RR4CD74JQ 535 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAA
CAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCT
CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATTGAGTACTACGCCATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAG
CATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTG
ATTAGGATCGGTCGTTTATGGTTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTTCTT
GGAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTATTTACATTTTCGTCTC
C

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4CD74TF 535 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAA
CAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCT
CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATTGAGTACTACGCCATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAG
CATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTG
ATTAGGATCGGTCGTTTATGGTTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTTCTT
GGAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTATTTACATTTTCGTCTC
C

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4H124JQ 483 0 0
AACTCTTCCCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAG
GGAATCAACAGCAGATTGGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAA
TCTGTTCTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGC
CCTCCGTTGAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCAT
CATTACAATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCT
TGCCTCAGCATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAG
TGATTTTGATTAGGATCGGTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATG
TGTTTCTTGGAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTATTTACATTTTCGTC
TCT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4H124TF 535 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCATCCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATCAA
CAGCAGATTGGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCT
CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCAG
CATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTG
ATTAGGATCGGTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTTCTT
GGAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTATTTACATTTTCGTCTCT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4CG20TF 567 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAA
CAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCT
CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATTGAGTACTACGCCATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAG
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ATTAGGATCGGTTGTTTATGGTTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTTCTT
GGAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTATTTACATTTTCGTCTCTATTGA
TGGATCTCAATTGCATGAAATGAA
GCT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4EP79JQ 557 0 0
GGGCGTTCACCCCAAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCCGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAA
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CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAG
CATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTG
ATTAGGATCGTTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAACGTGTTTCTT
GGAAAGACGGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTGTTTACATTTTCGTCTCTATTGA
TGGATCCCAATTGCATG

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4EP79TF 557 0 0
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CCGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAA
CAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCT
CAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTT
GAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAA
TGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAG
CATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTG
ATTAGGATCGTTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAACGTGTTTCTT
GGAAAGACGGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTGTTTACATTTTCGTCTCTATTGA
TGGATCCCAATTGCATG

QA 1 557 1 557
DS 

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AAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTG
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GGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAGC
ATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTGA
TTAGGATCGGTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCA*TGTGTTTCTTG
GAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTGTTTACATTTTCGTCTCTATTGAT
GGATCCCAATTGCATGAAATGAAACTTTAGGTT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4EI01TF 573 0 0
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CGGCGTGGAGAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAAC
AGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCTC
AAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTG
AGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATTCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAAT
GGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCCTGCCTCAGC
ATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTGA
TTAGGATCGGTTGTTTATGGATTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCA*TGTGTTTCTTG
GAAAGACAGAATGTGTTATGGTTTCTTAAACTCTTTGTTTACATTTTCGTCTCTATTGAT
GGATCCCAATTGCATGAAATGAA
ACTTTAGGTT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 8

CO CL562Contig1 1044 8 20 U
GTGGGAGATGAGATAGCATTCCAGAGGATTAACTATTAGATGAATGCACGATAAAACCCT
TATTCGTCTCTCTACACTCCAGCGAA******GGTAGTTTAGGTTGGTAATGATGATAAG
TGGATGCAGCACGGTGACTTCACATGCTCTAACAAGCTCTTGGGGGTTCAAGCCATCTTC
ATACAGAGCTACAACAACATCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTTCAAGTTCATTGTC
TGTCATAAAGAACTCTTTACCATTTAATGGGCTTCAAGCTAGTGTACAAAGAGGTGTGCC
TTTGTCATATCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTGAGTGGGGAACAAGGTAGTCTGTT
TGGTGCGTTACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAA
AGATGTACCTTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAG
AACTTTAGCATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCACGAAACCTGGATGTACGCAGAAAC
CGCTTACCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAG
CGCCTTAGGGAAGTTACCGGGCTGGTTCCTCATGGCTTACTTCTTTGTAGCATACCTTGG
GGTAGTGAGAAGAAAAGAATGGCCTCACTTCTTCAGGTTCCATGTGGTGATGGGTATGCT
GCTTGAAATCGCTCTTCAGGTGGTAGGAACTGTTAGCAAGTGGATGCCTCTTGGACTCTA
CTGGGGTAAGTTTGGGATGCATTTCTGGACTGCTGTTGCGTTTGCATATCTGTTTACCGT
TCTTGAGAGCATAAGGTGTGCACTTGCGGGTATGTACGCGGACATCCCATTTGTCTGTGA
TGCTGCGTATATCCAGATCCCGTACGACTAATAAGAAGATATTGTTGCATTTTAGATCGT
TGTCGCTCTTCGTTTTAATAATCTGTTTGTTAGACCTTTGTATCTGCAACAACTATGTGT
CTTGTTAAATGGCAGTTATTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CP27TF U 1
AF RR4BW96TF U 4
AF RR4CI65TF U 8
AF RR4AU68TF U 8
AF RR4AX85TF U 8
AF RR4CP27JQ C 316
AF RR4CI65JQ C 338
AF RR4HB12JQB C 338
BS 1 29 RR4CP27TF
BS 30 30 RR4BW96TF
BS 31 32 RR4CP27TF
BS 33 33 RR4BW96TF
BS 34 36 RR4CP27TF
BS 37 37 RR4BW96TF
BS 38 86 RR4CP27TF
BS 87 92 RR4BW96TF
BS 93 604 RR4CP27TF
BS 605 651 RR4BW96TF
BS 652 652 RR4CI65TF
BS 653 696 RR4BW96TF
BS 697 777 RR4CP27JQ
BS 778 778 RR4CI65JQ
BS 779 804 RR4CP27JQ
BS 805 805 RR4CI65JQ
BS 806 841 RR4CP27JQ
BS 842 842 RR4CI65JQ
BS 843 961 RR4CP27JQ
BS 962 1044 RR4CI65JQ

RD RR4CP27TF 604 0 0
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ATACAGAGCTACAACAACATCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTTCAAGTTCATTGTC
TGTCATAAAGAACTCTTTACCATTTAATGGGCTTCAAGCTAGTGTACAAAGAGGTGTGCC
TTTGTCATATCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTGAGTGGGGAACAAGGTAGTCTGTT
TGGTGCGTTACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAA
AGATGTACCTTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAG
AACTTTAGCATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCACGAAACCTGGATGTACGCAGAAAC
CGCTTACCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAG
CGCC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4BW96TF 701 0 0
GGAGAT
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TCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTAGG
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AAGAAAAGAATGGCCTCACTTCTTCAG
TTCCATGT

QA 7 693 7 693
DS 

RD RR4CI65TF 660 0 0
GG
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TACAACAACATCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTTCAAGTTCATTGTCTGTCATAAA
GAACTCTTTACCATTTAATGGGCTTCAAGCTAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTCATA
TCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTGAGTGGGGAACAAGGTAGTCTGTTTGGTGCGTT
ACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACC
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TCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTAGG
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QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4AU68TF 685 0 0
GG
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CTCTACACTCCAGCGAA******GGTAGTTTAGGTTGGTAATGATGATAAGTGGATGCAG
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TACAACAACATCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTTCAAGTTCATTGTCTGTCATAAA
GAACTCTTTACCATTTAATGGGCTTCAAGCTAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTCATA
TCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTGAGTGGGGAACAAGGTAGTCTGTTTGGTGCGTT
ACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACC
TTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGC
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TCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTAGG
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AAGAAAAGAATGGCCTCACTTCT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR4AX85TF 685 0 0
GG
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CTCTACACTCCAGCGAA******GGTAGTTTAGGTTGGTAATGATGATAAGTGGATGCAG
CACGGGGACTTCACATGCTCTAACAAGCTCTTGGGGGTTCAAGCCATCTTCATACAGAGC
TACAACAACATCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTTCAAGTTCATTGTCTGTCATAAA
GAACTCTTTACCATTTAATGGGCTTCAAGCTAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTCATA
TCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTGAGTGGGGAACAAGGTAGTCTGTTTGGTGCGTT
ACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACC
TTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGC
ATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCACGAAACCTGGATGTACGCAGAAACCGCTTACCA
TCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTAGG
GAAGTTACCAGGCTGGTTCCTCATGGCTTACTTCTTTGTAGCTTACCTTGGGGTAGTGAG
AAGAAAAGAATGGCCTCACTTCT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR4CP27JQ 663 0 0
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GTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACCTTCCAG
CTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGCATGCCT
ACCTTACCTGATGCCGCTGCACGAAACCTGGATGTACGCAGAAACCGCTTACCATTTCCA
CCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTTTAAGCGCCTTAGGGAAGTT
ACCGGGCTGGTTCCTCATGGCTTACTTCTTTGTAGCATACCTTGGGGTAGTGAGAAGAAA
AGA*TGGCCTCACTTTTTCAGGTTCCATGTGGTGATGGGTATGCTGCTTGAAATCGCTCT
TCAGGTGGTAGGAACTGTTAGCAAGTGGATGCCTCTTGGACTTTACTGGGGTAAGTTTGG
GATGCATTTTTGGACTGCTGTTGCGTTTGCATATCTGTTTACCGTTTTTGAGAGCATAAG
GTGTGCACTTGCGGGTATGTACGCGGACATCCCATTTGTCTGTGATGCTGCGTATATCCA
GATCCCGTACGACTAATAAGAAGATATTGTTGCATTTTAGATCGTT
GTCGCTCTTCGTTTTAG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4CI65JQ 707 0 0
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CTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACCTTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACC
AAAAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGCATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCAC
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TTCTTGACCTACCCGTTTTTAAGCGCCTTAGGGAAGTTACCGGGCTGGTTCCTCATGGCT
TACTTCTTTGTAGCATACCTTGGGGTAGTGAGAAGAAAAGAATGGCCTCACTTCTTCAGG
TTCCATGTGGTGATGGGTATGCTGCTTGAAATCGCTCTTCAGGTGGTAGGAACTGTTAGC
AAGTGGATGCCTCTTGGACTCTACTGGGGTAAGTTTGGGATGCATTTCTGGACTGCTGTT
GCGTTTGCATATCTGTTTACCGTTCTTGAGAGCATAAGGTGCGCACTTGCGGGTATGTAC
GCGGACATCCCATTTGTCTGTGATGCTGCGTATATCCAGATCCCGTACGACTAATAAGAA
GATATTGTTGCATTTTAGATCGTTGTCGCTCTTCGTTTTAATAATCTGTTTGTTAGACCT
TTGTATCTGCAACAACTATGTGTCTTGTTAAATGGCAGTTATTTTTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4HB12JQB 707 0 0
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AAAAAGCCACAGTGGTGGTGGAGAACTTTAGCATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCAC
GAAACCTGGATGTACGCAGAAACCGCTTACCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAG
TTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTAGGGAAGTTACCGGGCTGGTTCCTCATGGCT
TACTTCTTTGTAGCATACCTTGGGGTAGTGAGAAGAAAAGAATGGCCTCACTTCTTCAGG
TTCCATGTGGTGATGGGTATGCTGCTTGAAATCGCTCTTCAGGTGGTAGGAACTGTTAGC
AAGTGGATGCCTCTTGGACTCTACTGGGGTAAGTTTGGGATGCATTTCTGGACTGCTGTT
GCGTTTGCATATCTGTTTACCGTTCTTGAGAGCATAAAGTGTGCACTTGCGGGTATGTAC
GCGGACATCCCATTTGTCTGTGATGCTACGTATATCCAGATCCCGTACGACTAATAAGAA
GATATTGTTGCATTTTAGATCGTTGTCGCTCTTCGTTTTAATAATCTGTTTGTTAGACCT
TTGTATCTGCAACAACTATGTGTCTTGTTAAATGGCAGTTATTTTTC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 8

CO CL563Contig1 878 8 8 U
GGATAGCTCTCAACTCAATCAAACAAACAATCACAATCATGTCATCATTCCCATTGGTCT
CTTTTCTCGTCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGA
CAGACACCAACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATA
CCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTG
GCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGA
CGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGT
TCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGG
TTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTA
AGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATG
GAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATG
TGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTT
CTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGAC
TCCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATTAATACCCGCACGTACGCATACACGTAA
ACTTTTTTTCTACTGTCAGGATAAGTAAAATATAAGCTATGTTTTGAAACATGAAATTCT
ATTTTCAGTATCCTAATAAATATTATTTGTTTTCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4EI81TF U 3
AF RR4B287TF U 1
AF RR4DD02TF U 13
AF RR4GP39TF U 23
AF RR4GP39JQ C 23
AF RR4G723JQ C 581
AF RR4DD02JQ C 259
AF RR4G723TF U 481
BS 1 242 RR4B287TF
BS 243 243 RR4EI81TF
BS 244 431 RR4B287TF
BS 432 432 RR4EI81TF
BS 433 634 RR4B287TF
BS 635 679 RR4GP39TF
BS 680 874 RR4G723TF
BS 875 878 RR4DD02JQ

RD RR4EI81TF 537 0 0
GGATAG
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GTCACTCTCCTGTTGGCCGCAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGACAGACACC
AACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATACCGGGAAT
AACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTGGCATCACC
CAAACACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATC
CCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCC
AACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAA
GAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTAAGATAGAG
AAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGAT

QA 7 537 7 537
DS 

RD RR4B287TF 634 0 0
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CTTTTCTCGTCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGA
CAGACACCAACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATA
CCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTG
GCGTCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGA
CGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGT
TCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGG
TTTCCGAAGAGTCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTA
AGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATG
GAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATG
TGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATT

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DS 

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CTCTCCTGTTGGCTGCAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGACAGACACCAACG
GAAGCATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATACCGGGAATAACG
GAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTGGCATCACCCAAG
CACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATCCCTC
CCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCCAACA
TATGCAAGGAGTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAAGAGC
CTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAG
TGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATGGAACCGTGGGAG
CTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATGTGGCTAAGACCA
TATTTGTCAAATTCATCAAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4GP39TF 657 0 0
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TCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATACCGGGAATAACGGAGGTGGTAT
TGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTGGCATCACCCAAGCACTTCCGGA
CGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATCCCTCCCATACCATT
CACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCCAACATATGCAAGGA
GTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAAGAGCCTGCAATTCA
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GGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATGTGGCTAATACCATATTCGTCAA
ATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTTCTACTTCTCGTGTTGAGAA

QA 1 657 1 657
DS 

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GGCTGCAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGACAGACACCAACGGAAACATAGT
TCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATACCGGGAATAACGGAGGTGGTAT
TGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTGGCATCACCCAAGCACTTCCGGA
CGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATCCCTCCCATACCATT
CACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCCAACATATGCAAGGA
GTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAAGAGCCTGCAATTCA
AATCAATGGTAATCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGTGGGAAAAGA
AGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACCTCTGATGGAACCGTGGGAGCTGTCCCAGG
GGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATGTGGCTAATACCATATTCGTCAA
ATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTTCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTT
AGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGACTCCGTCCATGGCCAAAAATAAG
GGGTTGAGATT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4G723JQ 255 0 0
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TGTTACTACCGATGTTGCTTCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGATTTT
GTAATGTAAAAGCCAAAGACTCCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATTAATACCC
GCACGTACGCATACACGTAAACTTTTTTTCTACTGTCAGGATAAGTAAAATATAAGCTAT
GTTTTGAAACATGAA

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4DD02JQ 620 0 0
CGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATCCCTCCCATAC
CATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCCAACATATGCA
AGGAGTTCTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAAGAGCCTGCAA
TTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGTGGGAA
AAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTTTGATGGAACCGTGGGAGCTGTCC
CAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATGTGGCTAAGACCATATTTG
TCAAATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTTCTACTTCTCGTGTTGAGA
AGTTAGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGACTCCGTCCATGGCCAAAAA
TAAGGGGTTGAGATTAATACCCGCACGTACGCATGCACGTAAACTTTTTTTCTACTGTCA
GGATAAGTAAAATATAAGCTATGTTTTGAAACGTGAAATTCTATTTTCAGTATCCTAATA
AATATTATTTGTTTTCGATC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4G723TF 395 0 0
G
GATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATGG
AACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATGT
GGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTTC
TACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGACT
CCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATTAATACCCGCACGTACGCATACACGTAAA
CTTTTTTTCTACTGTCAGGATAAGTAAAATATAAGCTATGTTTTGAAACATGAAATTCTA
TTTTCAGTATCCTAATAAATATTATTTGTTTTC
C

QA 2 394 2 394
DS 



AS 2 9

CO CL564Contig1 795 4 2 U
GGACACACTCTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCAT
TCTCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATCC
GAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCG
AGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCT
TTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAA
GTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGG
TATGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCA
TACCGGACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTT
TTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGT
GGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCC
TAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTC
TTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAAT
GCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTTTTAATAAATCATTTTCT
AAATAGATTTTGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC56TF U 1
AF RR4BD31TF U 1
AF RR4AK12TF U 27
AF RR4BD31JQ C 85
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BS 784 795 RR4AK12TF

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CCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGA
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TATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCAC
TGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCA
TAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGG
TGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGG
ACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCAT
CACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACA
AGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAG
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ATGAAGAGGATTGTGGGGTTT

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TCTCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATCC
GAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCG
AGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCT
TTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAA
GTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGG
TATGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCA
TACCGGACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTT
TTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGT
GGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCC
TAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTC
TTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAAT
GCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTTTTAATAAATCATTTTCT
AAA
C

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DS 

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GGGCG
ATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCATTCTCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCT
CTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGAT
GTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTT
CCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGC
GGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATC
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TTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAAC
TCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTA
GATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATT
GAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGA
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GTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTT
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DS 

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CTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAA
GACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGG
GAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATAGAATCATTCCTAGTTT
TATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTGGAGAATCCATCTATGG
TCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTGCTTTCGAT
GGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAG
CTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAGGAATGGATGTTGTCTA
CAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGA
CAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTTTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGG
TTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCAACCGAACAAAAGCACT
TCAGTTTCAGAGCTTTTTTTTAATAAATCATTTTCTAAA
C

QA 1 699 1 699
DS 



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GGTAACAGTAAGTATATAACTTAAAAACCTACTTCTCTTCATGAAGAAGAAAAACAAATC
TCACAGAAAAAACATACGCAAAAGTCACAAAATCTATTTAGAAAATGATTTATTAAAAAA
A*GGCTCTGAAACTGAAGTGCTTTTGTTCGGATGTATAGCATTCGAGAGTGTTTAACATA
CAGAACAACTTAAAAACCCCACAATCCTCTTCATGAAGAAGAAGTGCTTAGGGTTTTAGA
GAGGAA*GCTCTCC*ACTGTCAGCAATAACAACTTTGCTCTTAGGAGTTCCACTTTGCTT
CCCC*TCAGCTTCAATCTTGTAGACAACATCCATTCCTTGAACCACTTTCCCAAACACCA
CATGCCTTCCATCTAACCAGCTTGTTGTCACCGTCGTGATGAAAAACTGCGAACCGTTTG
TGTCCTCTCCAGAGTTTGCCATCGAAAGCAAACCTGGTCCGGTATGCTTGAGCTTGAAGT
TCTCATCAGCAAACTTCTGACCATAGATGGATTCTCCACCCATACCGTTTCCGTGGGTGA
AGTCACCTCCCTGGATCATAAAACTAGGAATGATTCTATGGAACTTGCTCCCCTTGTAGT
GTAGAGGCTTCCCGCTCTTCCCAACACCTTTCTCCCCAGTGCAAAGAGCTCTGAAGTTTT
CTGCAGTTTTGGGAACTGTCTTGCCGAATAGGCCAATAACAACTCGACCAGCTTCTTTGC
CGTCAATCTCAACATCGAAGTAAACTTTGTGAGTGATCTCCTTCGGATCTTCCTTTGCCT
GGATCAAAGCCAGAGCAGCGAAAAGGAGTAGCGTGAGGAAGATAATGGAGGTAGATCTCA
CCATCTTCGTGATTCGCTTCTTCTCAATCGAAACAGGGTGTGTGAGCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC56JQ U 1
AF RR4B649JQ U 4
AF RR4B649TF C 51
AF RR4DN77JQ U 83
AF RR4DN77TF C 144
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BS 877 888 RR4DN77TF

RD RR4EC56JQ 641 0 0
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TCACAGAAAAAACATACGCAAAAGTCACAAAATCTATTTAGAAAATGATTTATTAAAAAA
A*G*CTCTGAAACTGAAGTGCTTTTGTTCGGTTGGATAGCATTCGAGTGTGTTTAAAATA
CAAAACAACTTAAAAACCCCACAATCCTCTTCATGAAGAAGAAGTGCTTAGGATTT*AGA
GAGGAA*GCTCTCC*ACTGTCAGCAATAACAACTTTGCTCTTAGGAGTTCCACTTTGCTT
CCCC*TCAGCTTCAATCTTGTAGACAACATCCATTCCTTGTACCACTTTCCCAAACACCA
CATGCCTTCCATCTAACCAGCTTGTTGTCACCGTCGTGATGAAAAACTGCGAACCGTTTG
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TCTCATCAGCAAACTTCTGACCATAGATGGATTCTCCACCCATACCGTTTCCGTGGGTGA
AGTCACCTCCCTGGATCATAAAACTAGGAATGATTCTATGGAACTTGCTCCCCTTGTAGT
GTAGAGGCTTCCCGCTCTTCCCAACACCTTTCTCCCCAGTG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4B649JQ 798 0 0
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GCTCTGAAACTGAAGTGCTTTTGTTCGGATGTATAGCATTCGAGAGTGTTTAACATACAG
AACAACTTAAAAACCCCACAATCCTCTTCATGAAGAAGAAGTGCTTAGGGTTTTAGAGAG
GAA*GCTCTCC*ACTGTCAGCAATAACAACTTTGCTCTTAGGAGTTCCACTTTGCTTCCC
C*TCAGCTTCAATCTTGTAGACAACATCCATTCCTTGAACCACTTTCCCAAACACCACAT
GCCTTCCATCTAACCAGCTTGTTGTCACCGTCGTGATGAAAAACTGCGAACCGTTTGTGT
CCTCTCCAGAGTTTGCCATCGAAAGCAAACCTGGTCAGGTATGCTTGAGCTTGAAGTTCT
CATCAGCAAACTTCTGACCATAGATGGATTCTCCACCAATACCGTTTCCGTGGGTGAAGT
CACCTCCCTGGATCATAAAACTAGGAATGATTCTATGGAACTTGCTCCCCTTGTAGTGTA
GAGGCTTCCCGCTCTTCCCAACACCTTTCTCCCCAGTGCAAAGAGCTCTGAAGTTTTCTG
CAGTTTTGGGAACTGTCTTGCCGAATAGGCCAATAACAACTCGACCAGCTTCTTTGCCGT
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TCAAAGCCAGAGCAGCGA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4B649TF 831 0 0
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TATTAAAAAAA*GGCTCTGAAACTGAAGTGCTTTTGTTCGGATGTATAGCATTCGAGAGT
GTTTAACATACAGAACAACTTAAAAACCCCACAATCCTCTTCATGAAGAAGAAGTGCTTA
GGGTTTTAGAGAGGAAAGCTCTCCCACTGTCAGCAATAACAACTTTGCTCTTAGGAGTTC
CACTTTGCTTCCCCCTCAGCTTCAATCTTGTAGACAACATCCATTCCTTGAACCACTTTC
CCAAACACCACATGCCTTCCATCTAACCAGCTTGTTGTCACCGTCGTGATGAAAAACTGC
GAACCGTTTGTGTCCTCTCCAGAGTTTGCCATCGAAAGCAAACCTGGTCAGGTATGCTTG
AGCTTGAAGTTCTCATCAGCAAACTTCTGACCATAGATGGATTCTCCACCAATACCGTTT
CCGTGGGTGAAGTCACCTCCCTGGATCATAAAACTAGGAATGATTCTATGGAACTTGCTC
CCCTTGTAGTGTAGAGGCTTCCCGCTCTTCCCAACACCTTTCTCCCCAGTGCAAAGAGCT
CTGAAGTTTTCTGCAGTTTTGGGAACTGTCTTGCCGAATAGGCCAATAACAACTCGACCA
GCTTCTTTGCCGTCAATCTCAACATCGAAGTAAACTTTGTGAGTGATCTCCTTCGGATCT
TCCTTTGCCTGGATCAAAGCCAGAGCAGCGAAAAGGAGTAGCGTGAGGAAGATAATGGAG
GTAGATCTCACCATCTTCGTGATTCGCTTCTTCTCAATCGAAACAG
AGTCC

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DS 

RD RR4DN77JQ 759 0 0
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TTTGTTCGGATGTATAGCATTCGAGAGTGTTTAACATACAGAACAACTTAAAAACCCCAC
AATCCTCTTCATGAAGAAGAAGTGCTTAGGGTTTTAGAGAGGAA*GCTCTCC*ACTGTCA
GCAATAACAACTTTGCTCTTAGGAGTTCCACTTTGCTTCCCC*TCAGCTTCAATCTTGTA
GACAACATCCATTCCTTGAACCACTTTCCCAAACACCACATGCCTTCCATCTAAACAGCT
TGTTGTCACCGTCGTGATGAAAAACTGCGAACCGTTTGTGTCCTCTCCAGAGTTTGCCAT
CGAAAGCAAACCTGGTCCGGTATGCTTGAGCTTGAAGTTCTCATCAGCAAACTTCTGACC
ATAGATGGATTCTCCACCCATACCGTTTCCGTGGGTGAAGTCACCTCCCTGGATCATAAA
ACTAGGAATGATTCTATGGAACTTGCTCCCCTTGTAGTGTAGAGGCTTCCCGCTCTTCCC
AACACCTTTCTCCCCAGTGCAAAGAGCTCTGAAGTTTTCTGCAGTTTTGGGAACTGTCTT
GCCGAATAGGCCAATAACAACTCGACCAGCTTCTTTGCCGTCAATCTCAACATCGAAGTA
AACTTTGTGAGTGATCTCCTTCGGATCTTCCTTTGCCTGGATCAAAGCCAGAGCAGCGAA
A*GGAGTAGCGTGAGGA*GATATGGGAGGTAGATCTCAC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4DN77TF 745 0 0
TTGTTCGGATGTATAGCATTCGAGAGTGTTTAACATACAGAACAACTTAAAAACCCCACA
ATCCTCTTCATGAAGAAGAAGTGCTTAGGGTTTTAGAGAGGAA*GCTCTCC*ACTGTCAG
CAATAACAACTTTGCTCTTAGGAGTTCCACTTTGCTTCCCC*TCAGCTTCAATCTTGTAG
ACAACATCCATTCCTTGAACCACTTTCCCAAACACCACATGCCTTCCATCTAAACAGCTT
GTTGTCACCGTCGTGATGAAAAACTGCGAACCGTTTGTGTCCTCTCCAGAGTTTGCCATC
GAAAGCAAACCTGGTCCGGTATGCTTGAGCTTGAAGTTCTCATCAGCAAACTTCTGACCA
TAGATGGATTCTCCACCCATACCGTTTCCGTGGGTGAAGTCACCTCCCTGGATCATAAAA
CTAGGAATGATTCTATGGAACTTGCTCCCCTTGTAGTGTAGAGGCTTCCCGCTCTTCCCA
ACACCTTTCTCCCCAGTGCAAAGAGCTCTGAAGTTTTCTGCAGTTTTGGGAACTGTCTTG
CCGAATAGGCCAATAACAACTCGACCAGCTTCTTTGCCGTCAATCTCAACATCGAAGTAA
ACTTTGTGAGTGATCTCCTTCGGATCTTCCTTTGCCTGGATCAAAGCCAGAGCAGCGAAA
AGGAGTAGCGTGAGGAAGATAATGGAGGTAGATCTCACCATCTTCGTGATTCGCTTCTTC
TCAATCGAAACAGGGTGTGTGAGCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 9

CO CL565Contig1 816 9 6 U
GGCTTGTAAGAAGAAGCCGCAAAACCTCTTAAGACAGACTCTTCTTCATCCTTGCAGATT
TCGTTAACCGATTCAGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAAT
GCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACC
AACCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGAC
ATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTC
CGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTT
ATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGG
CCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCT
GCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTG
TATTTGGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTG
TACCGCAAACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGG
ATGATGCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATA
TGTTGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTC
AATTTTGAAACCTATTTTATAGTTCGAGTTTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 50 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 20 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM65TF U 2
AF RR4E426TF U 123
AF RR4B823JQ C 45
AF RR4G961TF U 4
AF RR4G882TF U 4
AF RR4B823TF U 1
AF RR4G961JQ C 304
AF RR4BM65JQ C 10
AF RR4G882JQ C 303
BS 1 28 RR4B823TF
BS 29 29 RR4BM65TF
BS 30 607 RR4B823TF
BS 608 608 RR4E426TF
BS 609 804 RR4B823TF
BS 805 816 RR4G882JQ

RD RR4BM65TF 304 0 0
TCTT
GTAAGAAGAAGCCGCAAAACCTCTTAAGACAGACTCTTCTTCATCCTTGCAGATTTCGTT
AACCGATTCAGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCCGA
GCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAACCA
GGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTC
TGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGCAA

QA 5 304 5 304
DS 

RD RR4E426TF 581 0 0
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CCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACAT
CTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCG
CAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTTAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTAT
CTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCC
ACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCTGC
TGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTA
TTTGGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTGTA
CCGCAAACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGGAT
GATGCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4B823JQ 680 0 0
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CAAGAAGGACAAGAATGCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTT
TGATTTAGAAAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCA
AGCTGTTAACATGGACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAG
ATTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTT
CAGTGGAAAGGATGTTATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAAGGG
TGCTGCTGTTCAGAGGCCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGA
GGACGTCGCTTACCCTGCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATC
CAAAGTCATGAAGGTGTATTTGGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGA
GACTATGGTGGGAGTGTACCGCAGACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGT
GGAAGCTTGATGATGGATGATGCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAG
AGGTTTTGAATTTATATGTT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4G961TF 736 0 0
GG
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AACCGATTCAGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCCGA
GCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGTTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAACCA
GGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTC
TGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGCAA
GATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATCTT
TGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAGGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCACG
CAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCTGCTGA
GATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTATTT
GGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTGTACCG
CAAACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAATCTTGATGATGGATGAT
GCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGTTG
TCGTAT
CACAATCT

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR4G882TF 721 0 0
GG
GTAAGAAGAAGCCGCAAAACCTCTTAAGACAGACTCTTCTTCATCCTTGCAGATTTCGTT
AACCGATTCAGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCCGA
GCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGTTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAACCA
GGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTC
TGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGCAA
GATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATCTT
TGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAGGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCACG
CAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCTGCTGA
GATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTATTT
GGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTGTACCG
CAAACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAATCTTGATGATGGATGAT
GCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGTT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR4B823TF 804 0 0
GGCTTGTAAGAAGAAGCCGCAAAACCTCCTAAGACAGACTCTTCTTCATCCTTGCAGATT
TCGTTAACCGATTCAGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAAT
GCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACC
AACCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGAC
ATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTC
CGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTT
ATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGG
CCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCT
GCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTG
TATTTGGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTG
TACCGCAGACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGG
ATGATGCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATA
TGTTGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTC
AATTTTGAAACCTATTTTATAGTT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4G961JQ 493 0 0
AAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATC
TTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAGGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCA
CGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCTGCT
GAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTCCCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTAT
TTGGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTGTAC
CGCAAACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAATCTTGATGATGGATG
ATGCTCTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGT
TTTGGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTCAAT
TTTGAAACCTATT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4BM65JQ 802 0 0
AAGAG
AGCCGCAAAAC*TCTTAAGACAGACTCTTCTTCATCCTTGCAGATTTCGTTAACCGATTC
AGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCCGAGCCGACAGA
ATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAACCAGGAGTTGAA
AAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTCTGGAAACCG
CAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATCCACCC
CCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATCTTTGTTGCCAC
AAGAAGGATCATGTGTCCACCCAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCACGCAACAGGAC
TCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCTGCTGAGATCGTTGG
AAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTATTTGGAGGCCAA
AGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTGTACCGCAAACTTAC
AGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGGATGATGCTCTGAAG
AATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGTTGTCGTATTCA
CAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTATGTCTGTACTTTTCAATTTTGAAACCTA
TTTTATAGTT
CGAGTCT

QA 6 795 6 795
DS 

RD RR4G882JQ 514 0 0
CAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTAT
TTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCCAAGAGGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCC
ACGCAACAGGACTTTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGACGTCGCTTACCCTGC
TGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTA
TTTGGAGGCCAAAGAAAGAAACAACACCGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTGTA
CCGCAAACTTACAGGAAAGGATGTCACGTTTGAGTACCCGGTGGAATCTTGATGATGGAT
GATGCTTTGAAGAATCAACGTCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATG
TTGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTCAA
TTTTGAAACCTATTTTATAGTTCGAGTTTCTTGC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 2 8

CO CL566Contig1 672 6 6 U
TTTTTTTGTATTAATTTAATTTTATTTCTTTGCTATTATTAACTTCTCTACTTTAGAGAA
TTTTCTGTTACCATCTCCACATAAATTACAAACCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCAT
GAAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGAAGAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATA
GACGGGTTCTATTTTGCCTTGTGTTTTAGGCTTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTT
TGTTGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCTGATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAA
GACCTGTTCCATTGTTGCTACCAGGGAAATCAGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTT
CACCGTAGAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAGATGACTCTCCACGTAAATCAGCTCATCCA
GTCTATCGAATTGCCCGTCCATCTCCACAACCGAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAG
GTGCATAGTCGAACTTGATGCCAGGGTAGGAGCAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCC
ACGAGATGGTTGAACCTTCATCGAACAGGTAAACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCT
TCATTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCCTTCATTGTCATCTGGAATCAGCTGTGTTG
GAAGCACTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AE28JQ U 21
AF RR4AE28TF C 21
AF RR4BX34JQ U 32
AF RR4BX34TF C 33
AF RR4BQ75TF C 1
AF RR4BQ75JQ U 32
BS 1 20 RR4BQ75TF
BS 21 415 RR4AE28JQ
BS 416 434 RR4BX34JQ
BS 435 435 RR4BQ75JQ
BS 436 650 RR4BX34JQ
BS 651 672 RR4BQ75JQ

RD RR4AE28JQ 395 0 0
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ATAAATTACAAACCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCATGAAAAATCCATAAAAAGAAA
GAGAGAGAAGAAGAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATAGACGGGTTCTATTTTGCCTT
GTGTTTTAGGCTTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTTTGTTGGCAATGAGCTGCTCA
TAGAGATCTCTGATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAAGACCTGTTCCATTGTTGCTA
CCAGGGAAATCAGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCACCGTAGAATTTGGTCGAT
AGGTTGCTCAGATGACTCTCCACGTAAATCAGCTC

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4AE28TF 395 0 0
TTTATTTCTTTGCTATTATTAACTTCTCTACTTTAGAGAATTTTCTGTTACCATCTCCAC
ATAAATTACAAACCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCATGAAAAATCCATAAAAAGAAA
GAGAGAGAAGAAGAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATAGACGGGTTCTATTTTGCCTT
GTGTTTTAGGCTTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTTTGTTGGCAATGAGCTGCTCA
TAGAGATCTCTGATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAAGACCTGTTCCATTGTTGCTA
CCAGGGAAATCAGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCACCGTAGAATTTGGTCGAT
AGGTTGCTCAGATGACTCTCCACGTAAATCAGCTC

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4BX34JQ 620 0 0
GCTATTATTAACTTCTCTACTTTAGAGAATTTTCTGTTACCATCTCCACATAAATTACAA
ACCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCATGAAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGA
AGAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATAGACGGGTTCTATTTTGCCTTGTGTTTTAGGC
TTTAGCAGCTTCTGCAGGAGTAGTGGCTTTGTTGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCT
GATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAAGACCAGTTCCATTGTTGCTACCAGGGAAATC
AGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCACCGTAAAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAG
ATGGCTCTCCACGTAAATCAGCTCATCCAGTCTATCGAATTGCTCGTCCATCTCCACAAC
CGAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAGGTGCATAGTCGAACTTGATGCCAGGGTAGGA
GCAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCCACGAGATGGTTGAACCTTCATCGAACAGGTA
AACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCTTCATTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCC
TTCATTGTCATCTGGAATC
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BX34TF 619 0 0
CTATTATTAACTTCTCTACTTTAGAGAATTTTCTGTTACCATCTCCACATAAATTACAAA
CCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCATGAAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGAA
GAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATAGACGGGTTCTATTTTGCCTTGTGTTTTAGGCT
TTAGCAGCTTCTGCAGGAGTAGTGGCTTTGTTGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCTG
ATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAAGACCAGTTCCATTGTTGCTACCAGGGAAATCA
GCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCACCGTAGAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAGA
TGGCTCTCCACGTAAATCAGCTCATCCAGTCTATCGAATTGCTCGTCCATCTCCACAACC
GAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAGGTGCATAGTCGAACTTGATGCCAGGGTAGGAG
CAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCCACGAGATGGTTGAACCTTCATCGAACAGGTAA
ACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCTTCATTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCCT
TCATTGTCATCTGGAATC
C

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4BQ75TF 672 0 0
TTTTTTTGTATTAATTTAATTTTATTTCTTTGCTATTATTAACTTCTCTACTTTAGAGAA
TTTTCTGTTACCATCTCCACATAAATTACAAACCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCAT
GAAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGAAGAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATA
GACGGGTTCTATTTTGCCTTGTGTTTTAGGCTTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTT
TGTTGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCTGATCTTCAATCCAACAATGATCTGGAAAA
GACCTGTTCCATTGTTGCTACCAGGGAAATCAGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTT
CACCGTAGAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAGATGACTCTCCACGTAAATCAGCTCGTCCA
GTCTATCGAATTGCCCGTCCATCTCCACAACCGAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAG
GTGCATAGTCGAACTTGATGCCAGGGTAGGAGCAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCC
ACGAGATGGTTGAACCTTCATCGAATAGGTAAACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCT
TCATTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCCTTCATTGTCATCTGGAATCAGCTGTGTTG
GAAGCACTTCTC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BQ75JQ 641 0 0
GCTATTATTAACTTCTCTACTTTAGAGAATTTTCTGTTACCATCTCCACATAAATTACAA
ACCAAAGCAAAAATAGTCCTTTTCGCCATGAAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGA
AGAAACTGCAAAGGGGTTTATACTTTATAGACGGGTTCTATTTTGCCTTGTGTTTTAGGC
TTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTTTGTTGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCT
GATCTTCAATCCAACAATGATCTGGAAAAGACCTGTTCCATTGTTGCTACCAGGGAAATC
AGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCACCGTAAAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAA
ATGACTCTCCACGTAAATCAGCTCGTCCAGTCTATCGAATTGCCCGTCCATCTCCACAAC
CGAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAGGTGCATAGTCGAACTTGATGCCAGGGTAGGA
GCAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCCACGAGATGGTTGAACCTTCATCGAATAGGTA
AACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCTTCATTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCC
TTCATTGTCATCTGGAATCAGCTGTGTTGGAAGCACTTCTC

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL566Contig2 460 2 2 U
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GTAGCCTGCGAAAAGCTTCGGGGAGTCGGCAAACAGACTTTGATCCGGAGATGTCTGAAT
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AACCAGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCTGAGGAAAAGAAATCAACCGAGATTCCCTT
AGTAGTGGCGAGCGAACGGGGACTAGCCCTTAAGTGGCTTTGAGATTAGCGGAACGCTCT
GGAAAGTGCGGCCATAGTGGGTGATAGCCCTGTACGCGAAAATCTCTTAGTCATGAAATC
GAGTAGGACGGAGCACGAGAAACTTTGTCTGAATATGGGGGGACCATCCTCCAAGGCTAA
ATACTACTGACTGACCGATAGTGAACTAGTACCGTGAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO46JQ C 1
AF RR4EO46TF U 1
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BS 448 460 RR4EO46JQ

RD RR4EO46JQ 460 0 0
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GTAGCCTGCGAAAAGCTTCGGGGAGTCGGCAAACAGACTTTGATCCGGAGATGTCTGAAT
GGGGGAACCCAGCCATCATAAGATGGTTATCTTGTACTGAATACATAGGTGCAAGAGGCG
AACCAGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCTGAGGAAAAGAAATCAACCGAGATTCCCTT
AGTAGTGGCGAGCGAACGGGGACTAGCCCTTAAGTGGCTTTGAGATTAGCGGAACGCTCT
GGAAAGTGCGGCCATAGTGGGTGATAGCCCTGTACGCGAAAATCTTTTAGTCATGAAATC
GAGTAGGACGGAGCACGAGAAACTTTGTCTGAATATGGGGGGACCATCCTCCAAGGCTAA
ATACTACTGACTGACCGATAGTGAACTAGTACCGTGAGGG

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4EO46TF 460 0 0
GGTCAAGTGAAGAAGCGCATACGGTGGATGCCTTGGCAGTCAGAGGCGATGAAAGACGTG
GTAGCCTGCGAAAAGCTTCGGGGAGTCGGCAAACAGACTTTGATCCGGAGATGTCTGAAT
GGGGGAACCCAGCCATCATAAGATGGTTATCTTGTACTGAATACATAGGTGCAAGAGGCG
AACCAGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCTGAGGAAAAGAAATCAACCGAGATTCCCTT
AGTAGTGGCGAGCGAACGGGGACTAGCCCTTAAGTGGCTTTGAGATTAGCGGAACGCTCT
GGAAAGTGCGGCCATAGTGGGTGATAGCCCTGTACGCGAAAATCTCTTAGTCATGAAATC
GAGTAGGACGGAGCACGAGAAACTTTGTCTGAATATGGGGGGACCATCCTCCAAGGCTAA
ATACTACTGACTGACCGATAGTGAACT
AGTACCGTGAGGG

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 9

CO CL567Contig1 658 9 4 U
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ATCTGCTACTTCTATATATTTTTTTTTAACAAAGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTT
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TTGCCGTTGTTGTGATTATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGT
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ATTGGATCTTTATTTTGGAACATCTACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCA
TTTATTTTCATATTAATATTACATTAGATTTAATCCGCATTTTAAAAACGCGGAAGTGAT
TTCATTTTAATATTCCACTAATATTTTTTTATTAATTATAAGATTATGTGTTTTAATTTC
TGATAACCTAATATAAGATTTGGAAATAATATCTGTATTCGAAAAACTGATCCATAACTT
ATCTGAAAATTAGGGTATCAAATAAGATTCAATCTGGCCTATATATCCGAACGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CL92TF U 200
AF RR4EZ16JQ C 16
AF RR4EZ16TF U 16
AF RR4H379TF U 1
AF RR4A743TF U 10
AF RR4CL92JQ C 11
AF RR4FI45TF U 20
AF RR4CW77JQ C 13
AF RR4CW77TF U 13
BS 1 332 RR4H379TF
BS 333 333 RR4A743TF
BS 334 463 RR4H379TF
BS 464 658 RR4CW77TF

RD RR4CL92TF 169 0 0
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AGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGATCAAC
GAAATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATC

QA 1 169 1 169
DS 

RD RR4EZ16JQ 391 0 0
GG
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ATTTTTTTT*AACAAGGATACATTACTTGTGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATGTTC
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TAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTGATT
ATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGATCA
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GAACATTTACCAGAAAATCATTATATTAT

QA 3 391 3 391
DS 

RD RR4EZ16TF 391 0 0
GG
ATTCTATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAGATCTGCTACTTCTATAT
ATTTTTTTT*AACAAGGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATGTTC
AAGCACTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCACCATATCGAATCCTATCT
TAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTGATT
ATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGATCA
ACGAAATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATCTTTATTTTG
GAACATCTACCAGAAAATCATTATATTAT

QA 3 391 3 391
DS 

RD RR4H379TF 463 0 0
GGAGAGTAAACAATAGCATTCTATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAG
ATCTGCTACTTCTATATATTTTTTTTTAACAAAGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTT
GATTTTGACATATGTTCAAGCACTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCAC
CATATCGAATCCTATCTTAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAA
TTGCCGTTGTTGTGATTATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGT
TAAATTATAATTGATCAACGAAATATCCAGAT*CGGTTACTCTATGTAATATACGACGGC
ATTGGATCTTTATTTTGGAACATCTACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCA
TTTATTTTCATATTAATATTACATTAGATTTAATCCGCATTTT

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4A743TF 449 0 0
GGAAT
AGCATTCTATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAGATCTGCTACTTCTA
TATATTTTTTTTTAACAAAGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATG
TTCAAGCACTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCACCATATCGAATCCTA
TCTTAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTG
ATTATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGA
TCAACGAAATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATCTTTATT
T*GGAACAT*TACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCATTTATTTTCATATT
AATATTACATTAGATTTAATCCGC

QA 6 449 6 449
DS 

RD RR4CL92JQ 447 0 0
GGAT
AGCATTCTATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAGATTTGCTACTTCTA
TATATTTTTTTTTAACAAAGATACACTACTTGCGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATG
TTCAAGCACTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCACCATATCGAATCCTA
TCTTAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTG
ATTATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGA
TCAACGAAATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATCTTTATT
TTGGAACATCTACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCATTTATTTTCATATT
AATATTACATTAGATTTAATCCG

QA 5 447 5 447
DS 

RD RR4FI45TF 449 0 0
GGG
ATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAGATCTGCTACTTCTATATATTTT
TTTTTAACAAAGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATGTTCAAGCA
CTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCACCATATCGAATCCTATCTTAGGA
AGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTGATTATAGC
AAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGATCAACGAA
ATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATCTTTATTTTGGAACA
TCTACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCATTTATTTTCATATTAATA***C
ATTAGATTTAATCCGCATTTT
AAAAA

QA 4 444 4 444
DS 

RD RR4CW77JQ 646 0 0
GG
AGCATTCTATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAGATCTGCTACTTCTA
TATATTTTTTTTTAACAAAGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATG
TTCAAGCACTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCACCATATCGAATCCTA
TCTTAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTG
ATTATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGA
TCAACGAAATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATCTTTATT
TTGGAACATCTACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCATTTATTTTCATATT
AATATTACATTAGATTTAATCCGCATTTTAAAAACGCGGAAGTGATTTCATTTTAATATT
CCACTAATATTTTTTTATTAATTATAAGATTATGTGTTTTAATTTCTGATAACCTAATAT
AAGATTTGGAAATAATATCTGTATTCGAAAAACTGATCCATAACTTATCTGAAAATTAGG
GTATCAAATAAGATTCAATCTGGCCTATATATCCGAACGGGTCC

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR4CW77TF 646 0 0
GG
AGCATTCTATAAAAAGAGACTATCTTATATATTCATAAGTCATGAGATCTGCTACTTCTA
TATATTTTTTTTTAACAAAGATACACTACTTGTGTTTCATATTTTTGATTTTGACATATG
TTCAAGCACTAGATGTGGGAGCTTGGAACTGCCCTGAAGGCGTCACCATATCGAATCCTA
TCTTAGGAAGATGCTTTAATTCCAGGAGCAGACAGTGTGGTGAAAATTGCCGTTGTTGTG
ATTATAGCAAGCATAATCGCAGGATTACTTGCTACTGTTGCAAAGTTAAATTATAATTGA
TCAACGAAATATCCAGATACGGTTACTCTATGTAATATACGACGGCATTGGATCTTTATT
TTGGAACATCTACCAGAAAATCATTATATTATAAGTTGTCCTCCCATTTATTTTCATATT
AATATTACATTAGATTTAATCCGCATTTTAAAAACGCGGAAGTGATTTCATTTTAATATT
CCACTAATATTTTTTTATTAATTATAAGATTATGTGTTTTAATTTCTGATAACCTAATAT
AAGATTTGGAAATAATATCTGTATTCGAAAAACTGATCCATAACTTATCTGAAAATTAGG
GTATCAAATAAGATTCAATCTGGCCTATATATCCGAACGGGTCC

QA 3 646 3 646
DS 



AS 3 9

CO CL568Contig1 544 2 3 U
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TGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTTCC
GGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTCTTCAGGAA
CAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATGAA
GGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGGAAGGGTCG
TGGGCTTGTCATTGCTCCTAAAGATTACTCCAAATACCGCTACTAACCAACCGGGTCTTG
CCAGGACATTGGATCGAAACTCCTTATGTCATGAGTGCTTCTGATCATTTGAAATATATC
CTATGAACTTGTTGCTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCTGCTGT
TTGCCATTTATGTGTGTGTGTAAGTGCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATTACTTAGA
AGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 

AF RR4AQ66JQ C 1
AF RR4AQ66TF U 1
BS 1 1 RR4AQ66JQ
BS 2 541 RR4AQ66TF
BS 542 544 RR4AQ66JQ

RD RR4AQ66JQ 544 0 0
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TGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTTCC
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GGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGGAAGGGTCG
TGGGCTTGTCATTGCTCCTAAAGATTACTCCAAATACCGCTACTAACCAACCGGGTCTTG
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CTATGAACTTGTTGCTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCTGCTGT
TTGCCATTTATGTGTGTGTGTAAGTGCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATTACTTAGA
AGCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4AQ66TF 544 0 0
G
ATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCATCT
GTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTTCCG
GACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTCTTCAGGAAC
AAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATGAAG
GACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGGAAGGGTCGT
GGGCTTGTCATTGCTCCTAAAGATTACTCCAAATACCGCTACTAACCAACCGGGTCTTGC
CAGGACATTGGATCGAAACTCCTTATGTCATGAGTGCTTCTGATCATTTGAAATATATCC
TATGAACTTGTTGCTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCTGCTGTT
TGCCATTTATGTGTGTGTGTAAGTGCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATTACTTAGAA
GCC

QA 2 541 2 541
DS 



CO CL568Contig2 692 3 7 U
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CATCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAGAGCGTCTCGTC
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CCGGACTTCAACACCATGTACTAGCTCTACGATCCTTCGACTGTCATGTTCTTCTTTAGG
AACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATG
AAGGACAAGCAGGAGTTCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGTGGTGCAAGGAAAGGT
CGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTAACCAACCGGG
TCTTGCCACAACATTTGATGGAAACTCTTTATGTCATAAGTGATTCTGATCATTTGAAAT
ATATCCTATGAACTTGTTGCTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCT
ACTGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGTAAGTGCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATTAC
TTAGAAGCCAAATATTATGTTTATTTAGTATG


BQ
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH51TF U 1
AF RR4CH51JQ C 1
AF RR4GX80TF U -3
BS 1 275 RR4CH51TF
BS 276 339 RR4GX80TF
BS 340 340 RR4CH51JQ
BS 341 517 RR4GX80TF
BS 518 518 RR4CH51JQ
BS 519 666 RR4GX80TF
BS 667 692 RR4CH51JQ

RD RR4CH51TF 283 0 0
GGAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGGAGGGAGACGATGTCGTATCTTCTACCG
CATCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAGAGCGTCTCGTC
GTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCA
TCAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTT
CCGGACTTCAACACCATGTACTAGCTCTACGATCC
TTCGACTG

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR4CH51JQ 692 0 0
GGAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGGAGGGAGACGATGTCGTATCTTCTACCG
CATCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAGAGCGTCTCGTC
GTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCA
TCAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTT
CCGGACTTCAACACCATGTACTAGCTTTACGATCCTTCGACTGTCATGTTCTTCTTTAGG
AACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATG
AAGGACAAGCAGGAGTTCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGTGGTGCAAGGAAAGGT
CGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTAACCAACCGGG
TCTTGCCACAACATTTGATGGAAACTCTTTATGTCATAAGTGATTCTGATCATTTGAAAT
ATATCCTATGAACTTGTTGCTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCT
GCTGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGTAAGTGCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATTAC
TTAGAAGCCAAATATTATGTTTATTTAGTATG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GX80TF 670 0 0
GGAAAC
AGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGGAGGGAGACGATGTCGTATCTTCTACCGCA
TCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAGAGCGTCTCGTCGT
CATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCATC
AGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTTCC
GGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCTTCGACTGTCATGTTCTTCTTTAGGAA
CAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACGACAAGATCAACTGGGCTATGAA
GGACAAGCAGGAGTTCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGTGGTGCAAGGAAAGGTCG
TGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTAACCAACCGGGTC
TTGCCACAACATTTGATGGAAACTCTTTATGTCATGAGTGATTCTGATCATTTGAAATAT
ATCCTATGAACTTGTTGCTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCTAC
TGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGTAAGTGCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATTACTT
AGAA

QA 7 670 7 670
DS 



CO CL568Contig3 690 4 6 U
TTTTTTTTTAGACACAATATTTGGCTTCTAAGTAATCATCATTTCACTGAAGTAAGTTTG
AAGCACTTACACACACACATAAATGGCAAACAGTCGATAGAGAGAGCAAGCAAAATCCGG
AATAACAAATAACAAGTTCATAGGATATATATTTCAAATGATCAGAATCACTCATGACAT
AAAGAGTTTCGATCAAATGTTGTGGCAAGACCCGGTTGGTTAGTAGCGGTATTTGGTGGA
GTAATCTTTAGGAGCAATCACCAAACCACGACCTTTCCTTGCACCGAGGAAGACGGTTTC
AATGATATCGATGAACTCCTGCTTGTCCTTCATAGCCCAGTTGATCTTGTTGTTGTTACC
AGTCCCAAGATCGATCATAATGTGCTTGTTCCTAAAGAAGAACATGACCGTGGATGGATC
GTAGAGCTCGTACATGGTGTTGAAGTCCGGAAACTCAGTGATGTCCACCAGGTATATCAC
CGCAAAGTTCTTTATCGTCTCTGCAACAGATGCCAGCACCTCATCCATCTGCATACAAGT
CTCATCCCAATCATGGCCGAAACGTATGACGACGAGACGCTCTTCCTCCGCCAGAATCGC
CTGATCTACAGCCCAACCGGAGTGCAGATGCGGTAGAAGATACGACATCGTCTCCCTCCC
TCTCGCGCTTTCTCGAAAACTCTGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4G439JQ U 23
AF RR4DA42TF C 1
AF RR4DA42JQ U 10
AF RR4G439TF C 23
BS 1 15 RR4DA42TF
BS 16 286 RR4DA42JQ
BS 287 287 RR4G439JQ
BS 288 452 RR4DA42JQ
BS 453 453 RR4G439JQ
BS 454 690 RR4DA42JQ

RD RR4G439JQ 550 0 0
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ATGGCAAACAGTCGATAGAGAGAGCAAGCAAAATCCGGAATAACAAATAACAAGTTCATA
GGATATATATTTCAAATGATCAGAATCACTCATGACATAAAGAGTTTCGATCAAATGTTG
TGGCAAGACCCGGTTGGTTAGTAGCGGTATTTGGTGGAGTAATCTTTAGGAGCAATCACC
AGACCACGACCTTTCCTTGCATCGAGGAAGACGGTTTCAATGATATCGATGAACTCCTGC
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TGCTTGTTCCTAAAGAAGAACGTGACCGTGGATGGATCGTAGAGCTCGTACATGGTGTTG
AAGTCCGGAAACTCAGTGATGTCCACCAGGTATATCACCGCAAAGTTCTTTATCGTCTCT
GCAACAGATGCCAGCACCTCATCCATCTGCATACAAGTCTCATCCCAATCATGGCCGAAA
CGTATGACGA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4DA42TF 690 0 0
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AAGCACTTACACACACACATAAATGGCAAACAGTCGATAGAGAGAGCAAGCAAAATCCGG
AATAACAAATAACAAGTTCATAGGATATATATTTCAAATGATCAGAATCACTCATGACAT
AAAGAGTTTCGATCAAATGTTGTGGCAAGACCCGGTTGGTTAGTAGCGGTATTTGGTGGA
GTAATCTTTAGGAGCAATCACCAAACCACGACCTTTCCTTGCACCGCGGAAGACGGTTTC
AATGATATCGATGAACTCCTGCTTGTCCTTCATAGCCCAGTTGATCTTGTTGTTGTTACC
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GTAGAGCTCGTACATGGTGTTGAAGTCCGGAACCTCAGTGATGTCCACCAGGTATATCAC
CGCAAAGTTCTTTATCGTCTCTGCAACAGATGCCAGCACCTCATCCATCTGCATACAAGT
CTCATCCCAATCATGGCCGAAACGTATGACGACGAGACGCTCTTCCTCCGCCAGAATCGC
CTGATCTACAGCCCAACCGGAGTGCAGATGCGGTAGAAGATACGACATCGTCTCCCTCCC
TCTCGCGCTTTCTCGAAAACTCTGATCTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4DA42JQ 681 0 0
AGACAC
AATATTTGGCTTCTAAGTAATCATCATTTCACTGAAGTAAGTTTGAAGCACTTACACACA
CACATAAATGGCAAACAGTCGATAGAGAGAGCAAGCAAAATCCGGAATAACAAATAACAA
GTTCATAGGATATATATTTCAAATGATCAGAATCACTCATGACATAAAGAGTTTCGATCA
AATGTTGTGGCAAGACCCGGTTGGTTAGTAGCGGTATTTGGTGGAGTAATCTTTAGGAGC
AATCACCAAACCACGACCTTTCCTTGCACCGCGGAAGACGGTTTCAATGATATCGATGAA
CTCCTGCTTGTCCTTCATAGCCCAGTTGATCTTGTTGTTGTTACCAGTCCCAAGATCGAT
CATAATGTGCTTGTTCCTAAAGAAGAACATGACCGTGGATGGATCGTAGAGCTCGTACAT
GGTGTTGAAGTCCGGAACCTCAGTGATGTCCACCAGGTATATCACCGCAAAGTTCTTTAT
CGTCTCTGCAACAGATGCCAGCACCTCATCCATCTGCATACAAGTCTCATCCCAATCATG
GCCGAAACGTATGACGACGAGACGCTCTTCCTCCGCCAGAATCGCCTGATCTACAGCCCA
ACCGGAGTGCAGATGCGGTAGAAGATACGACATCGTCTCCCTCCCTCTCGCGCTTTCTCG
AAAACTCTGATCTCC

QA 7 681 7 681
DS 

RD RR4G439TF 668 0 0
GGCTTCTAAGTAATCATCATTTCACTGAAGTAAGTTTGAAGCACTTACACACACACATAA
ATGGCAAACAGTCGATAGAGAGAGCAAGCAAAATCCGGAATAACAAATAACAAGTTCATA
GGATATATATTTCAAATGATCAGAATCACTCATGACATAAAGAGTTTCGATCAAATGTTG
TGGCAAGACCCGGTTGGTTAGTAGCGGTATTTGGTGGAGTAATCTTTAGGAGCAATCACC
AGACCACGACCTTTCCTTGCATCGAGGAAGACGGTTTCAATGATATCGATGAACTCCTGC
TTGTCCTTCATAGCCCAGTTGATCTTGTTGTTGTTACCAGTCCCAAGATCGATCATAATG
TGCTTGTTCCTAAAGAAGAACGTGACCGTGGATGGATCGTAGAGCTCGTACATGGTGTTG
AAGTCCGGAAACTCAGTGATGTCCACCAGGTATATCACCGCAAAGTTCTTTATCGTCTCT
GCAACAGATGCCAGCACCTCATCCATCTGCATACAAGTCTCATCCCAATCATGGCCGAAA
CGTATGACGACGAGACGCTCTTCCTCCGCCAGAATCGCCTGATCTACAGCCCAACCGGAG
TGCAGATGCGGTAGAAGATACGACATCGTCTCCCTCCCTCTCGCGCTTTCTCGAAAACTC
TGATCTCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 2 8

CO CL569Contig1 908 4 2 U
GGTGATCTCGGTTTCTCTCAATTTCCCAAAGACCTCAAAGCTTTCATCTTCCGAGATTGT
CTCTCCGCTTTTCGTCTTCTTCCCCACATGAACACATCAGCTGCGGTTTCAGCCGCCAAC
CTTCTCGTTAAGAGCGTGGAATCAGCATTTCCAAAACAGAAGAAGAACTTAGCCGTTGTA
GAATTTAAGCAGGCAAAAGTAGCACTTAAGAGACGCAATATGCCTTCACTTCCACAAGAT
ATCCTTGTTCACATCTTCAGTTTCCTTGATGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTC
TCTCGCTCATGGAACCAAGCAACGTGCGAAGGCCCTCTGTGGCGTTCACTATTTGATCTT
CACTTTAGTCACAAACTCTT*GATTCATATCCATCCCGGTATTGACTGGAGAGAAGCCTT
TAAGAACGAATATATCTTGTCAAATTCATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTG
CAATCACTGCGACTCCATT*GTTTGGCACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAGTGTC
GGTTGAAATCAGGCAAGAAGCCACTCGACCTCATGTTAACTCACCAGGTTGTTAATTATT
TACTAGGAACAACGAGTTCGTCTGATGAAAGTGATTCGGAGGATGAGGCGGCTGTTCGTG
GACTATGGGCTTATCCTACGCTTCAGTAGTTTCGTAGCTTTGCCAGATTATCATGTCTCT
GTGTAAACTTTTTTTACTCATTCGTATTCTGAGTTAGTATTCCAGTAAGAGGCAGAACAG
CAAACACCTCTTGCTTGCCTGCTTGTTGGGCTTGTAGGCTCATTAGAGTCTTGGGCCGAA
TCTGTTAATTTGAATATTTTAATGGGTAAACAACAGTACCTATACTATCGAAACACGAAT
TGAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4AG13TF U 1
AF RR4A887TF U 265
AF RR4A887JQ C 86
AF RR4AG13JQ C 87
BS 1 767 RR4AG13TF
BS 768 908 RR4A887JQ

RD RR4AG13TF 767 0 0
GGTGATCTCGGTTTCTCTCAATTTCCCAAAGACCTCAAAGCTTTCATCTTCCGAGATTGT
CTCTCCGCTTTTCGTCTTCTTCCCCACATGAACACATCAGCTGCGGTTTCAGCCGCCAAC
CTTCTCGTTAAGAGCGTGGAATCAGCATTTCCAAAACAGAAGAAGAACTTAGCCGTTGTA
GAATTTAAGCAGGCAAAAGTAGCACTTAAGAGACGCAATATGCCTTCACTTCCACAAGAT
ATCCTTGTTCACATCTTCAGTTTCCTTGATGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTC
TCTCGCTCATGGAACCAAGCAACGTGCGAAGGCCCTCTGTGGCGTTCACTATTTGATCTT
CACTTTAGTCACAAACTCTT*GATTCATATCCATCCCGGTATTGACTGGAGAGAAGCCTT
TAAGAACGAATATATCTTGTCAAATTCATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTG
CAATCACTGCGACTCCATT*GTTTGGCACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAGTGTC
GGTTGAAATCAGGCAAGAAGCCACTCGACCTCATGTTAACTCACCAGGTTGTTAATTATT
TACTAGGAACAACGAGTTCGTCTGATGAAAGTGATTCGGAGGATGAGGCGGCTGTTCGTG
GACTATGGGCTTATCCTACGCTTCAGTAGTTTCGTAGCTTTGCCAGATTATCATGTCTCT
GTGTAAACTTTTTTTACTCATTCGTATTCTGAGTTAGTATTCCAGTA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4A887TF 496 0 0
CTTGATGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTCTCTCGCTCATGGAACCAAGCAACG
TGCGAAGGCCCTCTGTGGCGTTCACTATTTGATCTTCACTTTAGTCACAAACTCTTTGAT
TCATATCCATCCCGGTATTGACTGGAGAGAAGCCTTTAAGAACGAATATATCTTGTCAAA
TTCATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTGCAATCACTGCGACTCCATTTGTTT
GGCACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAGTGTCGGTTGAAATCAGGCAAGAAGCCAC
TCGACCTCATGTTAACTCACCAGGTTGTTAATTATTTACTAGGAACAACGAGTTCGTCTG
ATGAAAGTGATTCGGAGGATGAGGCGGCTGTTCGTGGACTATGGGCTTATCCTACGCTTC
AGTAGTTTCGTAGCTTTGCCAGATTATCATGTCTCTGTGTAAACTTTTTTTACTCATTCG
TATTCTGAGTTAGTAT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4A887JQ 823 0 0
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CATTTCCAAAACAGAAGAAGAACTTAGCCGTTGTAGAATTTAAGCAGGCAAAAGTAGCAC
TTAAGAGACGCAATATGCCTTCACTTCCACAAGATATCCTTGTTCACATCTTCAGTTTCC
TTGATGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTCTCTCGCTCATGGAACCAAGCAACGT
GCGAAGGCCCTCTGTGGCGTTCACTATTTGATCTTCACTTTAGTCACAAACTCTT*GATT
CATATCCATCCCGGTATTGACTGGAGAGAAGCCTTTAAGAACGAATATATCTTGTCAAAT
TCATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTGCAATCACTGCGACTCCATT*GTTTG
GCACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAGTGTCGGTTGAAATCAGGCAAGAAGCCACT
CGACCTCATGTTAACTCACCAGGTTGTTAATTATTTACTAGGAACAACGAGTTCGTCTGA
TGAAAGTGATTCGGAGGATGAGGCGGCTGTTCGTGGACTATGGGCTTATCCTACGCTTCA
GTAGTTTCGTAGCTTTGCCAGATTATCATGTCTCTGTGTAAACTTTTTTTACTCATTCGT
ATTCTGAGTTAGTATTCCAGTAAGAGGCAGAACAGCAAACACCTCTTGCTTGCCTGCTTG
TTGGGCTTGTAGGCTCATTAGAGTCTTGGGCCGAATCTGTTAATTTGAATATTTTAATGG
GTAAACAACAGTACCTATACTATCGAAACACGAATTGAAACCG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4AG13JQ 822 0 0
CATGAACACATCAGCTGCGGTTTCAGCCGCCAACCTTCTCGTTAAGAGCGTGGAATCAGC
ATTTCCAAAACAGAAGAAGAACTTAGCCGTTGTAGAATTTAAGCAGGCAAAAGTAGCACT
TAAGAGACGCAATATGCCTTCACTTCCACAAGATATCCTTGTTCACATCTTCAGTTTCCT
TGATGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTCTCTCGCTCATGGAACCAAGCAACGTG
CGAAGGCCCTCTGTGGCGTTCACTATTTGATCTTCACTTTAGTCACAAACTCTT*GATTC
ATATCCATCCCGGTATTGACTGGAGAGAAGCCTTTAAGAACGAATATATCTTGTCAAATT
CATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTGCAATCACTGCGACTCCATT*GTTTGG
CACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAGTGTCGGTTGAAATCAGGCAAGAAGCCACTC
GACCTCATGTTAACTCACCAGGTTGTTAATTATTTACTAGGAACAACGAGTTCGTCTGAT
GAAAGTGATTCGGAGGATGAGGCGGCTGTTCGTGGACTATGGGCTTATCCTACGCTTCAG
TAGTTTCGTAGCTTTGCCAGATTATCATGTCTCTGTGTAAACTTTTTTTACTCATTCGTA
TTCTGAGTTAGTATTCCAGTAAGAGGCAGAACAGCAAACACCTCTTGCTTGCCTGCTTGT
TGGGCTTGTAGGCTCATTAGAGTCTTGGGCCGAATCTGTTAATTTGAATATTTTAATGGG
TAAACAACAGTACCTATACTATCGAAACACGAATTGAAACCG

QA 1 822 1 822
DS 



CO CL569Contig2 1130 4 7 U
GGAAACCAAATTGTGAGAAAAGAGGGAAAGAGAGAAGATAAATGCGGAAACAGAAACTCT
GCTCAGATAGATGATCAAACCAAACCCCCAGACGATGATTCAAGAAAAATATACGGGGAG
ATACCAAAATCTAAAGGTAGCAGAAGCCCTATCGAGTAATCATCTCTACCCATTTGCTTG
CAATGAACTGAGCTCCATTATAGATCTGGGTTTCTCTCAATTTCCCAAAGACCTCAAAGC
TTTCATCTTTCGAGATTGTCTCTCCGCTTTTCGTCTTCTTCCCCACATGAACACATCAGC
TGCGGTTTCAGCCGCCAACCTTCTCGTTAAGAGCGTGGAATCAGCATTTCCAAAACAGAA
GAAGAACTTAGCCGTTGTAGAATTTAAGCAGGCAAAAGTAGCACTTAAGAGACGCAGTAA
GAGCCATGAGGAACATATAGATATGCCTTCACTTCCGCAAGATATCCTTGTTTACATCTT
CAGTTTCCTCGATGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTCTCTCGCTCATGGAACCA
AGCAACGTGTGAAGGCTCTATGTGGCGATCACTTTTTGATCTCCACTTCAATCATAGAGT
ATTGATTCATATTCATTCCGGTATTGACTGGAGAGAAGCCTTTAAGAACGAATATATCTT
GTCAAATTCATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTGCAGTTACTGTGACTCCAT
TGTTTGGCACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAATGTCGCTTGAAATCAGGCAAGAA
GCCACTCGACCTCATGTTAACTCACCAGGTTGTTGATTATTTACTGGGGACAACGAGTTC
GTCTGATGAAAGTGATTCGGAGGATGAGGCGGCTGTTCGTGGACTATGGGCTTATCCTAC
GCTACAGTAATTTCGTAGCTTTGCCAAATTATCATGTCTGTGTGTAAACTCTTTTTACTC
ATTCGTATTCTGAATTGGTATTCCAGTAAGAGGCAGAACAAGCAAACACATCTTGCTTGC
CTGCTTGTTGGGCTTGTAGGCTCATTAGAGTCTTGGGCCGAATCTGTTAATATGAATATT
TTAATGGGTAAACTACAGTACCTATACTATCGAAACACGAATTGAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AT

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AGATTGTCTCTCCGCTTTTCGTCTTCTTCCCCACATGAACACATCAGCTGCGGTTTCAGC
CGCCAACCTTCTCGTTAAGAGCGTGGAATCAGCATTTCCAAAACAGAAGAAGAACTTAGC
CGTTGTAGAATTTAAGCAGGCAAAAGTAGCACTTAAGAGACGCAGTAAGAGCCATGAGGA
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TGTATCTTCCTTACTCTCCTCATCTCAAGTCTCTCGCTCATGGAACCAAGCAACGTGTGA
AGGCTCTATGTGGCGATCACTTTTTGATCTTCACTTCAATCATAGAGTATTGATTCATAT
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AAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTGCAGTTACTGTGACTCCATTGTTTGGCACGA
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GAGTAATCATCTCTACCCATTTGCTTGCAATGAACTGAGCTCCATTATAGATCTGGGTTT
CTCTCAATTTCCCAAAGACCTCAAAGCTTTCATCTTTCGAGATTGTCTCTCCGCTTTTCG
TCTTCTTCCCCACATGAACACATCAGCTGCGGTTTCAGCCGCCAACCTTCTCGTTAAGAG
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AAAAGT*GCACTTAAGAGACGCAGTAAGAGCCATGAGGAACATATAGATATGCCTTCACT
TCCGCAAGATATCCTTGTTTACATCTTCAGTTTCCTCGATGTATCTTCCTTACTCTCCTC
ATCTCAAGTCTCTCGCTCATGGAACCAAGCAACGTGTGAAGGCTCTATGTGGCGATCACT
TTTTGATCTTCACTTCAATCATAGAGTATTGATTCATATTCATTCCGGTATTGACTGGAG
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AAATTCATCAAAGATGTTAAGATCTGGTCGGGGATACTGCAGTTACTGTGACTCCATTGT
TTGGCACGACAACTTGAGATGTCCGAAGAAACAATGTCGCTTTAAATCAGGCAAGAAGCC
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ACAGTAATTTCGTAGCTTTGCCAAATTATCATGTCTGTGTGTAAACTCTTTTTACTCATT
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CTTGTTGGGCTTGTAGGCTCATTAGAGTCTTGGGCCGAATCTGTTAATATGAATATTTTA
ATGGGTAAACTACAGTACCTATACTATCGAAACACGAATTGAAACCG

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DS 



AS 1 8

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GCTCATATCCATCGCTTGCGTTATCCTCGAGGGATGTTTCTCTCCCTTCCTCATCTCTCT
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AATATTATCATTTATATTGTATCCGGAAAAAGAATGTAAAAGCATCTACATTGACACAGG
CAACAACTGTTTTTCATAATCTCAACTGCTTGCTTACTCC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 20 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4D636TF U 1
AF RR4E067TF U 3
AF RR4CO23TF U 7
AF RR4C816TF U 289
AF RR4C825JQ C 316
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AF RR4E067JQ C 582
AF RR4D636JQ C 356
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BS 131 211 RR4D636TF
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BS 213 256 RR4D636TF
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BS 553 581 RR4D636TF
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BS 771 982 RR4C816TF
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GCTCATATCCATCGCTTGCGTTATCCTCGAGGGATGTTTCTCTCCCTTCCTCATCTCTCT
ACTTTGGTCAGAAAATTCACCGATCAAGCTTCGATACTGACCTGAAGCTACGTTGTAAAT
CAAACGGAACACGCAGAACCAAGCCAGTGTCGGCTGTTATAAAGTCAAGTCGTGTTCCGG
AGATTGATTCCTCTTCGGAACCAATTCAAGTGTTCGATGGCTCCACAAGGTTGTACATAT
CTTACTCTTGCCCATTTGCGCAACGTGCGTGGATTGCTCGGAACTACAAGGGTTTGCAAG
ACAAGATAGAACTTGTACCAATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAAG
TGTACCCGGCTAACAAGGTGCCTGCATTAGAGCACAATAACCGAGTGATAGGAGAGATCC
TTGACCTGATTAAGTACATCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTGCACCCACTGGTG
TAGAGAAGGAAGCATTCGCTGATGAGTTAATCTCTTACACCAACTCCTTCTCCAAG*CCG
TACGATCCACATTA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4E067TF 782 0 0
GGGAGAAAACGAACGG
AAAAACGATCGAGTATGAGTTTAGGAGTGAGAGTTAGCGTGTGCTCATATCCATCGCTTG
CGTTATCCTCGAGGGATGTTTCTCTCCCTTCCTCATCTCTCTACTTTGGTCGGAAAATTC
ACCGATCAAGCTTCGATACTGACCTGAAGCTACGTTGTAAATCAAACGGAACACGCAGAA
CCAAGCCAGTGTCAGCTGTTATAAAGTCAAGTCGTGTTCCGGAGATTGATTCCTCTTCTG
AACCAATTCAAGTGTTCGATGGCTCGACAAGGTTGTACATATCCTACTCTTGCCCATTTG
CGCAACGTGCGTGGATTGCTCGGAACTACAAGGGTCTGCAAGACAAGATGGAACTTGTAC
CGATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAAGTGTACCCGGCTAACAAGG
TGCCTGCACTAGAGCACAATAACCGAGTGATGGGGGAGAGCCTTGACCTGATTAAGTACA
TCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTGCACCCACTAGTGTAGAGAAGGAAACATTCG
CTGATGAGTTAATCTCTTACACCGACTCCTTCTCCAAGGCCGTACGATCCACATTATCAG
GTGCCGCCGACAGTGATGCAGCAGATGCTGCATTTGATTACATTGAGCAGTCTCTTTCCA
AATTCAAACAAGGGCCTTTCTTC*TTGGCCTATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATATTC
CATTCATAGAGAGAT*CCATCTTATCTTTAAG
ATGTATGAATGTGG

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DS 

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GGAAACGAACGG
AAAAACGATCGAGTATGAGTTTAGGAGTGAGAGTTAGCGTGTGCTCATATCCATCGCTTG
CGTTATCCTCGAGGGATGTTTCTCTCCCTTCCTCATCTCTCTACTTTGGTCGGAAAATTC
ACCGATCAAGCTTCGATACTGACCTGAAGCTACGTTGTAAATCAAACGGAACACGCAGAA
CCAAGCCAGTGTCAGCTGTTATAAAGTCAAGTCGTGTTCCGGAGATTGATTCCTCTTCTG
AACCAATTCAAGTGTTCGATGGCTCGACAAGGTTGTACATATCCTACTCTTGCCCATTTG
CGCAACGTGCGTGGATTGCTCGGAACTACAAGGGTCTGCAAGACAAGATGGAACTTGTAC
CGATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAAGTGTACCCGGCTAACAAGG
TGCCTGCACTAGAGCACAATAACCGAGTGATGGGAGAGAGCCTTGACCTGATTAAGTACA
TCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTGCACCCACTAGTGTAGAGAAGGAAACATTCG
CTGATGAGTTAATCTCTTACACCGACTCCTTCTCCAAGGCCGTACGATCCACATTATCAG
GTGCCGCCGACAGTGATGCAGCAGATGCTGCATTTGATTACATTGAGCAGTCTCTTTCCA
AATTCAAACAAGGGCCTTTCTTCCTTGGCCTATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATATTC
CATTCATAGAGAGAT*CCATCTTATCTTTA

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DS 

RD RR4C816TF 694 0 0
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AGGGTCTGCAAGACAAGATGGAACTTGTACCGATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGT
ACAAGGAGAAAGTGTACCCGGCTAACAAGGTGCCTGCACTAGAGCACAATAACCGAGTGA
TGGGAGAGAGCCTTGACCTGATTAAGTACATCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTG
CACCCACTAGTGTAGAGAAGGAAACATTCGCTGATGAGTTAATCTCTTACACCGACTCCT
TCTCCAAGGCCGTACGATCCACATTATCAGGTGCCGCCGACAGTGATGCAGCAGATGCTG
CATTTGATTACATTGAGCAGTCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCCTTTCTTCCTTGGCC
TATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATATTCCATTCATAGAGAGATTCCATCTTATCTTTA
AGGATGTAATGAATGTGGACATCACATCTGGTCGGCCAAACCTCGCCCTTTGGATTGAGG
AGATGAACACTATTGAAGCTTACACAGAAACCCGTCAAGATCCACAAGAGATAGTTGAGA
GACACAAAAAACGAGCCCAAGCAGAAGCACGTCCCTAAGCATATGAGAGTTTGAGTCATC
AAAGATTTGTTTAATATTATCATTTATATTGTAT

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DS 

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TACCAATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAAGTGTACCCGGCTAACA
AGGTGCCTGCATTAGAGCACAATAACCGAGTGATAGGTGAGAGCCT*GACCTGATTAAGT
ACATTGACACCAATTTCGAAGGGCCATCACTTGCACCCACTAGTGTAGAGAAGGAAGCAT
TCGCTGATGAGTTAATCTCTTACACCGACTCCTTCTCCAAGGCCGTACGATCCACATTAT
CAGGTGCCGCCGACAGTGATGCAGCAGATGCTGCATTTGATTGCATTGAGCAGGCTCTTT
CCAAATTCAAACAAGGGCCTTTCTTCCTTGAGCTATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATA
TTCCGTTCATAGAGAGATTCCATCTTATCTTTAAGGATGTAATGAATGTGGACATCACAT
CTGGTCGGCCAAACCTCGCCCTTTGGATTGAGGAGATGCACACTATTGAAGCTTACACAG
AAACCCGTCAAGATCCACAAGAGATAGTTGAGAGACACAAAAAACGAGCCCAAGCAGAAG
CACGTCCCTAAGCACATGAGAGTTTGAGTCATCAAAGATTTGTTTAATATTATCATTTAT
ATTGTATCCGGAAAAAGAATGTAAAAGCATCTACATTGACACAGGCAAC

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DS 

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CGGA
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CAATAACCGAGTGATGGGAGAGAGCCTTGACCTGATTAAGTACATCGACACCAATTTCGA
AGGGCCTTCACTTGCACCCACTAGTGTAGAGAAGGAAACATTCGCTGATGAGTTAATCTC
TTACACCGACTCCTTCTCCAAGGCCGTACGATCCACATTATCAGGTGCCGCCGACAGTGA
TGCAGCAGATGCTGCATTTGATTACATTGAGCAGTCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCC
TTTCTTCCTTGGCCTATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATATTCCATTCATAGAGAGATT
CCATCTTATCTTTAAGGATGTAATGAATGTGGACATCACATCTGGTCGGCCAAACCTCGC
CCTTTGGATTGAGGAGATGAACACTATTGAAGCTTACACAGAAACCCGTCAAGATCCACA
AGAGATAGTTGAGAGACACAAAAAACGAGCCCAAGCAGAAGCACGTCCCTAAGCATATGA
GAGTTTGAGTCATCAAAGATTTGTTTAATATTATCATTTATATTGTATCCGGAAAAAGAA
TGTAAAAGCATCTACATTGACACAGGCAACAACTGTTTTTCATAATCTCAACTGCTTGCT
TACTCC

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DS 

RD RR4E067JQ 478 0 0
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GATGCTGCATTTGATTACATTGAGCAGTCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCCTTTCTTC
CTTGGCCTATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATATTCCATTCATAGAGAGATTCCATCTT
ATCTTTAAGGATGTAATGAATGTGGACATCACATCTGGTCGGCCAAACCTCGCCCTTTGG
ATTGAGGAGATGAACACTATTGAAGCTTACACAGAAACCCGTCAAGATCCACAAGAGATA
GTTGAGAGACACAAAAAACGAGCCCAAGCAGAAGCACGTCCCTAAGCATATGAGAGTTTG
AGTCATCAAAGATTTGTTTAATATTATCATTTATATTGTATCCGGAAAAAGAATGTAAAA
GCATCTACATTGACACAGGCAACAACTGTTTTTCATAATCTCAACTGCTTGCTTAC
CC

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DS 

RD RR4D636JQ 680 0 0
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GAAAGTGTACCCGGCTAACAAGGTGCCTGCATTAGAGCACAATAACCGAGTGATAGGAGA
GATCCTTGACCTGATTAAGTACATCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTGCACCCAC
TGGTGTAGAGAAGGAAGCATTCGCTGATGAGTTAATCTCTTACACCAACTCCTTCTCCAA
GGCCGTACGATCCACATTATCAGGTGCCG***ACAGTGATGCAGCAGGTGCTGCATTTGA
TTACATTGAGCAGGCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCCTTTCTTCCTTGACCTGTTTAG
TTTGGTCGATATTGCATATATTCCGTTCATAGAGAGATTCCATCTTATCTTTAAGGATGT
AATGAATGTGGACATCACATCTGGTCGGCCAAACCTCGCCTATTGGATTGAGGAGATGAA
CACTATTGAAGCTTACACAGAAACCCGTCAAGATCCACAAGAGATAGTTGAGAGACACAA
GAAACGAGCCCAAGCAGAAGCACGTCCCTAAGCATATGAGAGTTTGAGTCATCAAAGATT
TGTTTAATATTATCATTTATATTGTATCCGGAAAAAGAATGTAAAAGCATCTACATTGAC
ACAGGCAACAACTGTTTTTC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 9

CO CL571Contig1 984 9 8 U
GGATCATCACAACAACAACAAACCAAACAACAAAAGATTCGAACTTTGATCAAACAAAGA
AGAAACAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAAC
AGCCCGGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGATACTCTCTCCGAC
TTCCTCTCCCTCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTA
GCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTC
TACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTC
ACGGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGAT
CGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT*GT
CGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGA
GTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTA
TAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTG
AGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTG
ACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATACTTGTAGTAAGGTCAATG
CCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTC
TTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTTAC
CTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTT
TATATTGCAAATAAAACAGTACAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF11TF U 5
AF RR4BY05TF U 1
AF RR4C568TF U 442
AF RR4CL72TF U 40
AF RR4BA37TF U 4
AF RR4CL72JQ C 191
AF RR4BY05JQ C 218
AF RR4BA37JQ C 518
AF RR4EF11JQ C 279
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BS 383 694 RR4BY05TF
BS 695 833 RR4BA37TF
BS 834 892 RR4CL72JQ
BS 893 893 RR4BY05JQ
BS 894 967 RR4CL72JQ
BS 968 984 RR4BY05JQ

RD RR4EF11TF 547 0 0
G
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CAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAACAGCCC
GGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGATACTCTCTCCGACTTCCT
CTCCCTCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTAGCTTA
CTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTG
TATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGG
GAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGG
TCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT*GTCGTCT
ACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTT
TACTGG

QA 2 547 2 547
DS 

RD RR4BY05TF 699 0 0
GGATCATCACAACAACAACAAACCAAACAACAAAAGATTCGAACTTTGATCAAACAAAGA
AGAAACAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAAC
AGCCCGGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGATACTCTCTCCGAC
TTCCTCTCCCTCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTA
GCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTC
TACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTC
ACGGGGAAGAACACGAACGAGTCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGAT
CGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT*GT
CGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGA
GTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTA
TAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTG
AGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAA
AAGAT

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DS 

RD RR4C568TF 250 0 0
CAAGTCCTCA*AGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTTTGTCGTCTACGATACTCAAACCTC
CTCTGTTTTTCTCAGCTCTGAGCCCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATCTCCG
CTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGT
CATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTG
AGCATCCGAA

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DS 

RD RR4CL72TF 660 0 0
G
GAACTTTGATCAAACAAAGAAGAAACAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTC
ACCCACCGGAGGAGCTCAACAGCCCGGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTC
CCGGAGATACTCTCTCCGACTTCCTCTCCCTCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACT
TTGGAGACTCTGCCGTCTTAGCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGT
TCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGT
TGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAG
CTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAG
AAGGAAGCTACGCCTTT*GTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCTCT
GAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGAT
GTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTAC
TGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGA

QA 2 660 2 660
DS 

RD RR4BA37TF 830 0 0
GG
ATCACAACAACAACAAACCAAACAACAAAAGATTCGAACTTTGATCAAACAAAGAAGAAA
CAGAATGTCGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAACAGCCC
GGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGATACTCTCTCCGACTTCCT
CTCCCTCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTAGCTTA
CTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTG
TATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGG
GAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGG
TCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT*GTCGTCT
ACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTT
TACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAG
CAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACG
GGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGT
GAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATACTTGTAGTAAGGTCAATGCCATT
CCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAA

QA 3 830 3 830
DS 

RD RR4CL72JQ 777 0 0
TCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTAGCTTACTCCC
GCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTGTATGT
TTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAAGA
ACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCCTT
ACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT*GTCGTCTACGAT
ACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTG
GGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGG
ATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCT
TAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGG
TGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAG
GAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTG
ATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTA*TTTTTACCTACTTCCTC
TGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTG

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DS 

RD RR4BY05JQ 767 0 0
ACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTAGCTTACTCCCCCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGT
TGTTCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCA
CGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAAGAACACGAACGAGTCCATGTTTGTGATCG
AAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTT
TAGAAGGAAGCTACGCCTTT*GTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGC
TCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGT
GATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCC
TACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAA
GATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGT
GGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCT
CGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGT
CTTTGTTGCATTTTACTTTTTACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACA
TCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGCAAATAAAACAGTACAC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BA37JQ 451 0 0
TT
TGAGCTTTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATTTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGA
TGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTA
CTGGGTGTATGTTTCCCAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGA
TGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGG
ATACTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCG
CTAATTCACGTTAATTTTTTTTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTTTTTTGTTT
TTGTTGCATTTTACTTTTTACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATC
AATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTG
C

QA 3 450 3 450
DS 

RD RR4EF11JQ 690 0 0
GTTCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCAC
GTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGA
AGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTT
AGAAGGAAGCTACGCCTTT*GTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTT*CTCAGCT
CTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTG
ATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCT
ACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAG
ATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTG
GATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTC
GCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTC
TTTGTTGCATTTTACTTTTTACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACAT
CAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTG
C

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 9

CO CL572Contig1 720 9 7 U
TTTTTGCTTTTTATTTGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTT
CTCTATCTCCAACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
TTGTAAATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACTAAAAA
GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATTAGTCCC


BQ
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 10 

AF RR4D637TF U 1
AF RR4DO04TF U 1
AF RR4EA76TF U 1
AF RR4FS46TF U 1
AF RR4FS46JQ C 1
AF RR4FY30JQ C 1
AF RR4FY30TF U 1
AF RR4DO04JQ C 235
AF RR4EA76JQ C 236
BS 1 684 RR4D637TF
BS 685 685 RR4DO04TF
BS 686 697 RR4D637TF
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BS 712 719 RR4EA76TF
BS 720 720 RR4DO04JQ

RD RR4D637TF 698 0 0
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CTCTATCTCCAACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
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CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
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ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
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GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGCTTTGTTTGTTTT
A

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DO04TF 718 0 0
TTTTTGCTTTTTATTCGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTT
CTCTATCTCCAACTCGTATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAGTGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
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GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTT*ATATATGTCGATA
TTAGTCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4EA76TF 720 0 0
TTTTTGCTTTTTATTCGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTT
CTCTATCTCCAACTCGTATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAGTGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
TTGTAGATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACTAAAAA
GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATTAGTCC
C

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FS46TF 689 0 0
TTTTTGCTTTTTATTTGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTT
CTCTATCTCCAACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
TTGTAAATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACTAAAAA
GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4FS46JQ 720 0 0
TTTTTGCTTTTTATTTGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTT
CTCTATCTCCAACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTTTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
TTGTAAATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACTAAAAA
GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTTTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATTAGTCC
T

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FY30JQ 720 0 0
TTTTTGCTTTTTATTTGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTT
CTCTATCTCCAACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
TTGTAAATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACTAAAAA
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GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATTAGTCC
T

QA 1 719 1 719
DS 

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CTCTATCTCCAACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTTCT
TCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACCGCAC
CAGCGAGCCAGCCTCCAGCCGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTG
CGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGT
GCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTT
ACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGA
TTGTAAATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACTAAAAA
GGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTG
GATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGA
ATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAT
ACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATTAGTCC
T

QA 1 719 1 719
DS 

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ATTTTGCGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAA
GAGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAGTGTTGGATTCTAACATCGAACTTTATG
GTCCTTACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGG
TCGAGATTGTAGATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAAC
TAAAAAGGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATT
CAACTGGATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCC
CTAGGAATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTTTACGTGAAATGATTAATTTGTATTAT
TGTTATACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATT
AGTCCC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4EA76JQ 485 0 0
TTTTGCGTTCGTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAG
AGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAGTGTTGGATTCTAACATCGAACTTTATGG
TCCTTACAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGT
CGAGATTGTAGATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGAACTGACATCGAGAAGGAGAAACT
AAAAAGGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTC
AACTGGATTGGTCGTCATACAACAACTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCC
TAGGAATCTACCTATTGATGATCCCGAAACTTTTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATT
GTTATACTGTATATCATGAAAATGTAACGTTTTGTTTGTTTTTATATATGTCGATAATTA
GTCC
C

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 9

CO CL573Contig1 936 9 12 U
GGAACAAAACATCAAAAACTAAATAGAGAGAAGAAAAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGAT
CAAGAGGATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCAAAGAGAAGAAATGGGTT
GTTCAAGAAAGCCCACGAGCTCACGGTTCTGTGTGACGCTAGGGTTTCGATTATCATGTT
CTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTCATCAGCCCTAACACCACAACGAAGGAGATCAT
AGATCTGTACCAAACAGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCA
AGAAAACAAGAGGAAACTGTTAGAGACAAATAGAAATCTCCGGACTCAGATTAAACAGAG
GCTAGGTGAGTGTTTGGACGAGCTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAAT
GGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTAAATCACTTGGGAATCAAATCGA
GACCACCAAGAAAAAGAACAAGAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCT
GGAACTAAGAGCAGAAGATCCTCATTATGGACTAGTAGACAATGGAGGAGACTACGATTC
GGTCCTTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGC
CCTTCATTCAGCATCTGCCTCTGATATCATTACCTTCCACCTTCTTGAGTAATTACGGGT
TTGAAGGTTGCTGGTGATGTCATTATCTATCTATTTAATAAAATAAATACTTAAAA*GCG
TAAGGCTGGTTCTACTGAAACCTTAAACTGTCATGTTCCTTAATTATGTATTTTCTTAAT
TAAACCTTAAGAACTATGGGTTGTGTGATCAGTAGCTTGCTGCTTTAACTTCTTGTGGAT
TGAATGTTTTCAAGACTATGTATGATATTAGGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 
15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F020TF U 4
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AF RR4DY84TF U 1
AF RR4AC12TF U 98
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BS 778 801 RR4AC12TF
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BS 803 839 RR4AC12TF
BS 840 843 RR4DY84JQ
BS 844 866 RR4AC12TF
BS 867 936 RR4FH22JQ

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GG
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GGATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCAAAGAGAAGAAATGGGTTGTTCA
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QA 3 336 3 336
DS 

RD RR4DP69TF 713 0 0
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GTTCAAGAAAGCCCACGAGCTCACGGTTCTGTGTGACGCTAGGGTTTCGATTATCATGTT
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AGATCTGTACCAAACAGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCA
AGAAAACAAGAGGAAACTGTTAGAGACAAATAGAAATCTCCGGACTCAGATTAAACAGAG
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GGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTAAATCACTTGGGAATCAAATCGA
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GGTCCTTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGC
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QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4FH22TF 706 0 0
GG
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GGATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCAAAGAGAAGAAATGGGTTGTTCA
AGAAAGCCCACGAGCTCACGGTTCTATGTGACGCTAGGGTTCCGATTATCATGTTCTCTA
GCTCCAACAAGCTTCATGAGTTCATCAGCCCTAACACCACAACGAAGGAGATCATAGATC
TGTACCAAACAGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAA
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TTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGCCCTTC
ATTCAGCATCTGCCTCTGATATCATTACCTTCCACCTTCTTGAG

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR4DY84TF 720 0 0
GGAAC
AAAACATCAAAAACTAAATAGAGAGAAGAAAAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGATCAAGA
GGATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCAAAGAGAAGAAATGGGTTGTTCA
AGAAAGCCCACGAGCTCACGGTTCTGTGTGACGCTAGGGTTTCGATTATCATGTTCTCTA
GCTCCAACAAGCTTCATGAGTTCATCAGCCCTAACACCACAACGAAGGAGATCATAGATC
TGTACCAAACAGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAA
ACAAGAGGAAACTGTTAGAGACAAATAGAAATCTCCGGACTCAGATTAAACAGAGGCTAG
GTGAGTGTTTGGACGAGCTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAA
ACACTTTCAAACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTAAATCACTTGGGAATCAAATCGAGACCA
CCAAGAAAAAGAACAAGAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAAC
TAAGAGCAGAAGATCCTCATTATGGACTAGTAGACAATGGAGGAGACTACGATTCGGTCC
TTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGCCCTTC
ATTCAGCATCTGCCTCTGATATCATTACCTTCCACCTTCTTGAGTAATTACGGGT

QA 6 720 6 720
DS 

RD RR4AC12TF 769 0 0
G
ATTCAAAGAGAAGAAATGGGTTGTTCAAGAAAGCCCACGAGCTCACGGTTCTATGTGACG
CTAGGGTTTCGATTATCATGTTCTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTCATCAGCCCTA
ACACCTCAACGAAGGAGATCATAGATCTGTACCAAACAGTTTCTGATGTTGATGTTTGGA
TCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAACCAAGAGGAAACTGTTGGAGACAAACAGAAATC
TTCGGACTCAGATTAAACAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGACGAGCTTGATATTCAGGAGC
TGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTA
AATCACTTGGGAATCAAATCGAGACCACCAAGAAAAAGAACAAGAGTCAACAAGACATAC
AAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAACTAAGAGCAGAAGATCCTCATTATGGACTAGTAG
ACAATGGAGGAGACTACGATTCGGTCCTTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATC
ACCACAATTACCCCAACCATGCCCTTCATTCAGCATCTGCCTCTGATATCATTACCTTCC
ACCTTCTTGAGTAATTACGGGTTTGAAGGTTGCTGATGATGTCATTATCTATCTATTTAA
TAAAATAAATACTTAAAAAGCGTAAGGCTGGTTCTACTGAAACATTAAACTGTCATGTTC
CTTAATTATGTATTTTCTTAA****ACCTTAAGAACTATGGGTTGTGT

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR4DY84JQ 716 0 0
CTCACGGTTCTGTGTGACGCTAGGGTTTCGATTATCATGTTCTCTAGCTCCAACAAGCTT
CATGAGTTCATCAGCCCTAACACCACAACGAAGGAGATCATAGATCTGTACCAAACAGTT
TCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAAACAAGAGGAAACTG
TTAGAGACAAATAGAAATCTCCGGACTCAGATTAAACAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGAC
GAGCTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACACTTTCAAACTC
GTTCGCGAGCGCAAGTTTAAATCACTTGGGAATCAAATCGAGACCACCAAGAAAAAGAAC
AAGAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAACTAAGAGCAGAAGAT
CCTCATTATGGACTAGTAGACAATGGAGGAGACTACGATTCGGTCCTTGGATATCAACTT
CGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGCCCTTCATTCAGCATCTGCC
TCTGATATCATTACCTTCCACCTTCTTGAGTAATTACGGGTTTGAAGGTTGCTGGTGATG
TCATTATCTATCTATTTAATAAAATAAATACTTAAAA*GCGTAAGGCTGGTTCTACTGAA
ACCTTAAACTGTCATGTTCCTTAATTATGTATTTTCTTAATTAAACCTTAAGAACT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DP69JQ 660 0 0
GCTTCATGAGTTCATCAGCCCTAACACCACAACGAAGGAGATCATAGATCTGTACCAAAC
AGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAAACAAGAGGAA
ACTGTTAGAGACAAATAGAAATCTCCGGACTCAGATTAAACAGAGGCTAGGTGAGTGTTT
GGACGAGCTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACACTTTCAA
ACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTAAATCACTTGGGAATCAAATCGAGACCACCAAGAAAAA
GAACAAGAGTCAACAAGACATACAAAAGAATTTCATACATGAGCTGGAACTAAGAGCAGA
AGATCCTCATTATGGACTAGTAGACAATGGAGGAGACTACGATTCGGTCCTTGGATATCA
ACTTCGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGCCCTTCATTCAGCATC
TGCCTCTGATATCATTACCTTCCACCTTCTTGAGTAATTACGGGTTTGAAGGTTGCTGGT
GATGTCATTATCTATCTATTTAATAAAATAAATACTTAAAA*GCGTAAGGCTGGTTTTAC
TGAACCCTTAAACTGTCATGTTCCTTAATTATGTATTTTCTTAATTAAACCTTAAGAACT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4FH22JQ 632 0 0
AACAAGAGGAAACTGTTAGAGACAAATAGAAATCTCCGGACTCAGATTAAACAGAGGCTA
GGTGAGTGTTTGGACGAGCTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGAAA
AACACTTTCAAACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTAAATCACTTGGGAATCAAATCGAGACC
ACCAAGAAAAAGAACAAGAGTCAACAAGACATACAGAAGAATCTCATACATGAGCTGGAA
CTAAGAGCAGAAGATCCTCATTATGGACTAGTAGACGATGGAGGAGACTACGATTCGGTC
CTTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATCACCACAATTACCCCAACCATGCCCTT
CATTCAGCATCTGCCTCTGATATCATTACCTTCCACCTTCTTGAGTAATTACGGGTTTGA
AGGTTGCTGGTGATGTCATTATCTATCTATTTAATAAAATAAATACTTAAAA*GCGTAAG
GCTGGTTCTACTGAAACCTTAAACTGTCATGTTCCTTAATTATGTATTTTCTTAATTAAA
CCTTAAGAACTATGGGTTGTGTGATCAGTAGCTTGCTGCTTTAACTTCTTGTGGATTGAA
TGTTTTCAAGACTATGTATGATATTAGGTGAC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4F020JQ 596 0 0
CGGACTCAGATTAAACAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGACGAGCTTGATATTCAGGAGCTG
CGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGCGAGCGCAAGTTTAAA
TCACTTGGGAATCAAATCGAGACCACCAAGAAAAAGAACAAGAGTCAACAAGACATACAG
AAGAATCTCATACATGAGCTGGAACTAAGAGCAGAAGATCCTCATTATGGACTAGTAGAC
GATGGAGGAGACTACGATTCGGTCCTTGGATATCAACTTCGTTTCCATCAGAACCATCAC
CACAATTACCCCAACCATGCCCTTCATTCAGCATCTGCCTCTGATATCATTACCTTCCAC
CTTCTTGAGTAATTACGGGTTTGAAGGTTGCTGGTGATGTCATTATCTATCTATTTAATA
AAATAAATACTTAAAA*GCGTAAGGCTGGTTCTACTGAACCCTTAAACTGTCATGTTCCT
TAATTATGTATTTTCTTAATTAAACCTTAAGAACTATGGGTTGTGTGATCAGTAGCTTGC
TGCTTTAACTTCTTGTGGATTGAATGTTTTCAAGACTATGTATGATATTAGGTGAC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 9

CO CL574Contig1 1170 9 18 U
GTCAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTAACATACAAGAAACATAGCTCTCTT
TTTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATTCAGGTCCAAA
CAAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGA
TGCATGATATCCGGTCCATTGAAAGTTCGAAACCCTTAGTAGTACTCACAAGTCTCTGTC
CCTTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGAT
GGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAA
TTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCAAAGTACTTGGCCTCCACGGAAGC
TTGGCAGCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATT
GGTTTTCTCTAGACCTCCTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAG
CTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACAC
GGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAG
TATGATAAGCCTTTGAAGGGTCGAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTTC
CTCCTGTAAACACATTCGTCTGCAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTGCCGAGAAACT
CGAAGTCTATCTCGTAATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAAAGGCAGTGACGACCC
CAGCGGTATCACCAGCTGGCAGCTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACC
CTTTGGATTGAAACCCTGTCCCAGTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCAC
CATTGAGTTGCTTCTGGTGGTCAAAAGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCA
CATCAATGGCCTTCCGTGGAGGAATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAG
CTATGAGAGCCCATGGAGTTGAAGAAACAGCCATTTCTGGTTTGAAGAGAGAGAGAGAGA
GAGATGTGATGATGGTGAATGATGTGGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DE75JQ U 11
AF RR4E940JQ U 1
AF RR4FW16JQ U 1
AF RR4E276JQ U 3
AF RR4EE62JQ U 16
AF RR4FW16TF C 373
AF RR4EE62TF C 433
AF RR4E940TF C 448
AF RR4E276TF C 501
BS 1 397 RR4E940JQ
BS 398 398 RR4FW16JQ
BS 399 644 RR4E940JQ
BS 645 646 RR4FW16JQ
BS 647 647 RR4EE62JQ
BS 648 691 RR4FW16TF
BS 692 692 RR4EE62TF
BS 693 702 RR4FW16TF
BS 703 703 RR4EE62TF
BS 704 759 RR4FW16TF
BS 760 760 RR4EE62TF
BS 761 795 RR4FW16TF
BS 796 796 RR4E940TF
BS 797 826 RR4FW16TF
BS 827 827 RR4E940TF
BS 828 1048 RR4FW16TF
BS 1049 1084 RR4EE62TF
BS 1085 1170 RR4E940TF

RD RR4DE75JQ 365 0 0
GACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTAACATACAAGAAACATAGCTCTCTTTTTGGAACTA
ATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATTCAGGTCCAAACAAAGCATAA
ACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGATGCATGATAT
CCGGTCCATTGAAAGTTCGAAACCCTTAGTAGTACTCACAAGTCTCTGTCCCTTTTACAT
TCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTC
ATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAATTCATTCTGG
TCCCA

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4E940JQ 644 0 0
GTCAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTAACATACAAGAAACATAGCTCTCTT
TTTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATTCAGGTCCAAA
CAAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGA
TGCATGATATCCGGTCCATTGAAAGTTCGAAACCCTTAGTAGTACTCACAAGTCTCTGTC
CCTTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGAT
GGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAA
TTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGCCTCCACGGAAGC
TTGGCAGCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATT
GGTTTTCTCTAGACCTCCTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAG
CTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACAC
GGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4FW16JQ 646 0 0
GC
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TGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATTCAGGTCCAAACA
AAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGATG
CATGATATCCGGTCCATTGAAAGTTCGAAACCCTTAGTAGTACTCACAAGTCTCTGTCCC
TTTTACATTCGGCTGGCATGACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGATGG
TCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAATT
CATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCAAAGTACTTGGCCTCCACGGAAGCTT
GGCAGCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAACTGG
TTTTCTCTAGACCTCCTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCT
TCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGG
ATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCA

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR4E276JQ 643 0 0
CAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTAACATACAAGAAACATAGCTCTCTTTT
TGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATTCAGGTCCAAACA
AAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGATG
CATGATATCCGGTCCATTGAAAGTTCGAAACCCTTAGTAGTACTCACAAGTCTCTGTCCC
TTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGATGG
TCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAATT
CATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGCCTCCACGGAAGCTT
GGCAGCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGG
TTTTCTCTAGACCTCCTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCT
TCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGG
ATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4EE62JQ 632 0 0
GC
AAGTTTTATAAATCACGTAACATACAAGAAACATAGCTCTCTTTTTGGAACTAATAAGAA
ACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATTCAGGTCCAAACAAAGCATAAACATAAC
GTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGATGCATGATATCCGGTCC
ATTGAAAGTTCGAAACCCTTAGTAGTACTCACACGTCTCTGTCCCTTTTACATTCGGCTG
GCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAA
CCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAATTCATTCTGGTCCCACC
ACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGCCTCCACGGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGT
GGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTC
CTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGA
ATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCA
ACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAG

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR4FW16TF 676 0 0
CCACCACATGCGGCCTTGG*TAGCAAAGTACTTGGCCTCCACGGAAGCTTGGCAGCCGTC
GATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAACTGGTTTTCTCTAG
ACCTCCTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTG
GTTGAATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGT
TGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCT
TTGAAGGGTCGAACCAGAGGTAAATGCGTTACTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTAAACA
CATTCGTCTGCAATATTGCTGGCTGGCATGTCCTGTTGCCGAGAAACTCGAAGTCTATCT
CGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCAC
CAGCTGGCAGCTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAA
ACCCTGTCCCAGTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTGCT
TCTGGTGGTCAAAAGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCT
TCCGTGGAGGAATTGC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4EE62TF 653 0 0
GATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAG
ACCTCCTCTTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTG
GTTGAATGGGAAACGTACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGT
TGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCT
TTGAAGGGTCGAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTAAACA
CATTCGTCTGCAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTGCCGAGAAACTCGAAGTCTATCT
CGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCAC
CAGCTGGCAGCTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAA
ACCCTGTCCCAGTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTGCT
TCTGGTGGTCAAAAGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCT
TCCGTGGAGGAATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTAT
C

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4E940TF 723 0 0
GTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTTGTGGC
CCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACG
TACTCC*TAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATA
CAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTCGAACC
AGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTAAACACATTCGTCTGCAATA
TTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTGCCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTAATGCTCGTTGT
TAGTCGACGACAGATAAAAGGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGCAGCTTTA
TGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCTGTCCCAGTGT
ATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTGCTTCTGGTGGTCAAAAG
CCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCTTCCGTGGAGGAATTG
CCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGAGTTGAAGAAA
CAGCCATTTCTGGTTTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGATGATGGTGAATGATGTGG
TCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4E276TF 670 0 0
TTGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATG
GGAAACGTACTCCCTAGATCCTTAGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACA
AAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGG
TCGAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTAAACACATTCGTC
TGCAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTGCCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTAATGC
TCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAAAGGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGC
AGCTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCTGTC
CCAGTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTGCTTCTGGTGG
TCAAAAGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCTTCCGTGGA
GGAATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGAGTT
GAAGAAACAGCCATTTCTGGTTTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGATGATGGTGAAT
GATGTGGTCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 9

CO CL575Contig1 719 9 1 U
AACCTAAGAAAGTAGTAGATCCTACATAACAGCAAAACTTGTTTATATTCCAAACAAATC
TGGAGAGGTGTCTGCTAACATAGTAAATATCAAAACCAGTAGAAAAAAGCATTGAGAGAA
TTTGAGAACGGAAACATTTGTAAATCGAGATTTCAAATCCTTCTTAAAACTTAGTTAGAT
TCAATGTGCTTCTTGACGATGTTGAGAGCAGTCGTGTCCTCGCCGTAGTCCTTGACCACA
AGACAGGAGCATCCAACAACCTTCCTAGCATTACCCTCAGAGTCAATCTTACAGAGACCA
GCCCATTCGCCGAGGGTCTTGGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGTTGTGATCAGCG
CAGAGAGCCTTCACAAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAATACGCAG
AGCTGAGCCACACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCGTGGAGACCACGAACAACACCA
CCATGTGCACGTGATTTCCTGAGAGTCAACTCCAATGCGGTCAACAAATCCATATCCTCC
GGGATCGCCGCTGGCTCAGCAACGGGAGGAACAACAACTGGAGCAGCAGCCTCTTCACCA
GACATGTTTTGTCTCTTTCAAATGCCTTTTAAAAAAAATCCCTTGTTATCTCAAAGACGA
AGACGGCTGCACGGAAAGTGTTGAGGAGAGAGAGAGACTTTTTAACTAATCAGTGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
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55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CE44JQ U 234
AF RR4FD32JQ U 19
AF RR4DM29JQ U 1
AF RR4DM54TF C 100
AF RR4DM29TF C 170
BS 1 817 RR4DM29JQ
BS 818 912 RR4DM54TF

RD RR4CE44JQ 392 0 0
AACGACATGCATTGTTCCGCTATTTGGCGGAAGCTGCAAACGAAAAGGAAACAGCTTGCC
GTTTAAAGGATTGCGGGTACACACGACAA*CATCATCCATGCTAGTCTCTTCCTTCAGCG
CCTGGGTCAACTGCTCCACGCTGTTTCCTTTGAAAGTTAAAGCGTATCCAACGGCCGACT
CATCCTCCACGTGACCCTCTTCGTCTGCGATGTGGTAATATATGATCCTTCCTTCAAATT
TCGGCGGCGACTCAGTCAAATTTTCCTCGGATGTTTCTGAAAAACTCCTAAACACCGGAG
GTTTTGACGGGATCCTATGTGGCGGAGGACTCGATGGCCTCCTATGTGGTGGGGGGCTCG
ACGGCCTCCTATGTAGCGGAGGAGTTGTA
CCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4FD32JQ 698 0 0
CACATATAAAATGGCTAAACTTAAGTGATTCGTTTACAAAATAACAAAAAAAATGAAAGA
TTAGCACCCACAGTAATGACCTATCTGCATACTCGTATCTAATGGAACGGGGGACCAAAC
GTTTACATTTTGGTCAACACCATATTTCTCAACACTTCGACCAATATTGCAAAACACACA
TAGCACGCCATTTAAAAAGTATTTGAGGGTACGAGAACGACATGCATTGTTCCGCTATTT
GGCGGAAGCTGCAAACGAAGAGGAAACAGCTTGCCGTTTAAAGGATTGCGTGTACACACG
ACAA*CATCATCCATGCTAATCTCTTCCTTCAGCGCCTGCGTCAACTGCTCCACGCTGTT
TCCTTTGAAAGTTAAAGCGTATCCAACGGCTGAGTCATCCTCCACGTGACCCTCTTCGTC
TGCGATGTGGTAATATATGATCCTTCCTTCAGATTTCGGCGGCGACTCAGTCAAATTTTC
CTCGGATGTTTCCGAAGAACTCCTAGACACCGGAGGTTTTGACGGGATCCTATGTGGCGG
AGGACTCGATGGCCTCCTATGTGGTGGGGGGCTCGACGGCCTCCTATGTAGCGGAGGAGT
TGTAGCCACTGCTGGAGCTGAAGTAACCGTTTCAACCAAGATCTCAACGATATCAACATC
CCACAAGAACGAGTCCGAACTATGAGGAGAGTCATGAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4DM29JQ 817 0 0
TTTATTATCGCGGATGTTCACATATAAAATGGCTAAACTTAAGTGATTCGTTTACAAAAT
AACAAAAAAAATGAAAGATTAGCACCCACAGTAATGACCTATCTGCATACTCGTATCTAA
TGGAACGGGGGACCAAACGTTTACATTTTGGTCAACACCATATTTCTCAACACTTCGACC
AATATTGCAGAACACACATAGCACGCCATTTAAAAAGTATTTGAGGGTACGAGAACGACA
TGCATTGTTCCGCTATTTGGCGGAAGCTGCAAACGAAGAGGAAACAGCTTGCCGTTTAAA
GGATTGCGTGTACACACGACAA*CATCATCCATGCTAGTCTCTTCCTTCAGCGCCTGCGT
CAACTGCTCCACGCTGTTTCCTTTGAAAGTTAAAGCGTATCCAACGGCTGAGTCATCCTC
CACGTGACCCTCTTCGTCTGCGATGTGGTAATATATGATCCTTCCTTCAGATTTCGGCGG
CGACTCAGTCAAATTTTCCTCGGATGTTTCTGAAGAACTCCTAGACACCGGAGGTTTTGC
CGGGATCCTATGTGGCGGAGGACTCGACGGCCTCCTATGTGGTGGGGGGCTCGACGGCCT
CCTATGTAGCGGAGGAGTTGTAGCCACTGCTGGAGCTGAAGTAACCGTTTCAACCAAGAT
CTCAACGATATCAACATCCCACAAGAACGAGTCCGAACTATGAGGAGAGTCATGAGTGAC
TGAGTTACGCCACGGAGGAAGTCCACCATTGGCTCGTAGAAAGTTACCGTCTCTTCGTCC
TCGTCCGCCGTTAGATACTTCTCATGGACGTTACGCA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4DM54TF 813 0 0
TATCTGCATACTCGTATCTAATG*AACGGGG*ACCAA*CGTTTACATTT**GTCAACACC
ATATTTCTCA*CACT*CGACCAATAT*GCAGA*CACACATAGCACGCCATT*AAAAAGTA
TTTGAGG*TACGAGAACGACATGCATTGT*CCGCTATTTGGCGGAAGCTGCAAACGAAGA
GGAAACAGCTTGCCGTTTAAAGGATTGCGTGTACACACGACAA*CATCATCCATGCTAGT
CTCTTCCTTCAGCGCCTGCGTCAACTGCTCCACGCTGTTTCCTTTGAAAGTTAAAGCGTA
TCCAACGGCTGAGTCATCCTCCACGTGACCCTCTTCGTCTGCGATGTGGTAATATATGAT
CCTTCCTTCAGATTTCGGCGGCGACTCAGTCAAATTTTCCTCGGATGTTTCTGAAGAACT
CCTAGACACCGGAGGTTTTGCCGGGATCCTATGTGGCGGAGGACTCGACGGCCTCCTATG
TGGTGGGGGGCTCGACGGCCTCCTATGTAGCGGAGGAGTTGTAGCCACTGCTGGAGCTGA
AGTAACCGTTTCAACCAAGATCTCAACGATATCAACATCCCACAAGAACGAGTCCGAACT
ATGAGGAGAGTCATGAGTGACTGAGTTACGCCACGGAGGAAGTCCACCATTGGCTCGTAG
AAAGTTACCGTCTCTTCGTCCTCGTCCGCCGTTAGATACTTCTCATGGACGTTACGCATC
CTAACGGATTTAGCTTTGTGGAAAAAATCCATTTTCTTGATACTAGCTAGCTATGTTATT
ACTAAGATTTGATTCACAAGCGAATTGTGATCC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4DM29TF 743 0 0
ACACT
TCGACCAATAT*GCAGAACACACATAGCACGCCATT*AAAAAGTATTTGAGGGTACGAGA
ACGACATGCATTGTTCCGCTATTTGGCGGAAGCTGCAAACGAAGAGGAAACAGCTTGCCG
TTTAAAGGATTGCGTGTACACACGACAAACATCATCCATGCTAGTCTCTTCCTTCAGCGC
CTGCGTCAACTGCTCCACGCTGTTTCCTTTGAAAGTTAAAGCGTATCCAACGGCTGAGTC
ATCCTCCACGTGACCCTCTTCGTCTGCGATGTGGTAATATATGATCCTTCCTTCAGATTT
CGGCGGCGACTCAGTCAAATTTTCCTCGGATGTTTCTGAAGAACTCCTAGACACCGGAGG
TTTTGCCGGGATCCTATGTGGCGGAGGACTCGACGGCCTCCTATGTGGTGGGGGGCTCGA
CGGCCTCCTATGTAGCGGAGGAGTTGTAGCCACTGCTGGAGCTGAAGTAACCGTTTCAAC
CAAGATCTCAACGATATCAACATCCCACAAGAACGAGTCCGAACTATGAGGAGAGTCATG
AGTGACTGAGTTACGCCACGGAGGAAGTCCACCATTGGCTCGTAGAAAGTTACCGTCTCT
TCGTCCTCGTCCGCCGTTAGATACTTCTCATGGACGTTACGCATCCTAACGGATTTAGCT
TTGTGGAAAAAATCCATTTTCTTGATACTAGCTAGCTATGTTATTACTAAGATTTGATTC
ACAAGCGAATTGTGATCC

QA 6 743 6 743
DS 



CO CL576Contig2 697 2 5 U
GGACATCACAATTCGCTTGTGAATCAAATCTTAGTAATAACATAGCTAGCTAGTATCAAG
AAAATGGATTTTTTCCACAAAGCTAAATCCGTTAGGATGCGTAACGTCCATGAGAAGTAT
CTAACGGCGGACGAGGACGAAGAGACGGTGACTCAAGACAGGAATGGTTCCGACAAGAGA
GCTCGATGGACCGTCGAACCAGTTCGCGGTTCCTTTGAAGTGATCCGTTTAAGGAGTTGC
TACGGTAACTACCTCACCGCTTCGAACGAGCGGTTCTTGCTCGGTGCCACGGGACTTAAA
GTGGTCCTGTCGAAACCTAGTCGGCTTAACGCGTCCGTCGAGTGGGAGCCGGTGAGAGAA
GGATCCAAAATGAAGCTGAAGACTAGGCATGGTAACTTTCTACGAGCCAATGGTGGACTT
CCTCCGTGGCGTAACTCAGTCACTCATGACTCTCCTCATAGTTCGGACTCGTTCTTGTGG
GATGTTGATATCGTTGAGATCTTGGTTGAAACGGTTACTCCAGCTCCAGCAGTGGCTACA
ACTCCTCCGCTACATAGGAGGCCGTCGAGCCCCCCACCACATAGGAGGCCATCGAGTCCT
CCGCCACATAGGATCCCGTCAAAACCTCCGGTGTCTAGGAGTTCTTCAGAAACATCCGAG
GAAAATTTGACTGAGTCGCCGCCGAATCTGAAGAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FD32TF U 89
AF RR4ET93TF U 1
BS 1 321 RR4ET93TF
BS 322 322 RR4FD32TF
BS 323 569 RR4ET93TF
BS 570 570 RR4FD32TF
BS 571 697 RR4ET93TF

RD RR4FD32TF 492 0 0
G
CGTTAGGATGCGTAACGTCCATGAGAAGTATCTAACGGCGGACGAGGACGAAGAGACGGT
GACTCAAGACAGGAATGGTTCCGACAAGAGAGCTCGATGGACCGTCTAACCAGTTCGCGG
TTCCTTTGAAGTGATCCGTTTAAGGAGTTGCTACGGTAACTACCTCACCGCTTCGAACGA
GCGGTTCTTGCTCGGTGCCACGGGACTTAAAGTGGTCCTGTCGAAACCTAGTCGGCTTAA
CGCGTCCGTCGAGTGGGAGCCGGTGAGAGAAGGATCCAAAATGAAGCTGAAGACTAGGCA
TGGTAACTT*CTACGAGCCAATGGTGGACTTCCTCCGTGGCGTAACTCAGTCACTCATGA
CTCTCCTCATAGTTCGGACTCGTTCTTGTGGGATGTTGATATCGTTGAGATCTTGGTTGA
AACGGTTACTTCAGCTCCAGCAGTGGCTACAACTCCTCCGCTACATAGGAGGCCGTCGAG
CCCCCCACCAC

QA 2 492 2 492
DS 

RD RR4ET93TF 697 0 0
GGACATCACAATTCGCTTGTGAATCAAATCTTAGTAATAACATAGCTAGCTAGTATCAAG
AAAATGGATTTTTTCCACAAAGCTAAATCCGTTAGGATGCGTAACGTCCATGAGAAGTAT
CTAACGGCGGACGAGGACGAAGAGACGGTGACTCAAGACAGGAATGGTTCCGACAAGAGA
GCTCGATGGACCGTCGAACCAGTTCGCGGTTCCTTTGAAGTGATCCGTTTAAGGAGTTGC
TACGGTAACTACCTCACCGCTTCGAACGAGCGGTTCTTGCTCGGTGCCACGGGACTTAAA
GTGGTCCTGTCGAAACCTAGTTGGCTTAACGCGTCCGTCGAGTGGGAGCCGGTGAGAGAA
GGATCCAAAATGAAGCTGAAGACTAGGCATGGTAACTTTCTACGAGCCAATGGTGGACTT
CCTCCGTGGCGTAACTCAGTCACTCATGACTCTCCTCATAGTTCGGACTCGTTCTTGTGG
GATGTTGATATCGTTGAGATCTTGGTTGAAACGGTTACTCCAGCTCCAGCAGTGGCTACA
ACTCCTCCGCTACATAGGAGGCCGTCGAGTCCCCCACCACATAGGAGGCCATCGAGTCCT
CCGCCACATAGGATCCCGTCAAAACCTCCGGTGTCTAGGAGTTCTTCAGAAACATCCGAG
GAAAATTTGACTGAGTCGCCGCCGAATCTGAAGAGGT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 2 8

CO CL577Contig1 1000 5 6 U
AAAGCCATCCATCCCAGTTTCTTCCAATTCGCCGATCAATCAACTGACATTTAAGGGGTT
TATCAGATCGAAGTCGCGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTTCTCACTAGGACCGAGTA
TGACAGAGGAGTCAACACTTTCTCTCCTGAAGGCAGGTTGTTCCAAGTCGAGTATGCCAT
TGAAGCTATCAAGCTTGGTTCCACTGCAATTGGAGTGAAGACAAAGGAAGGAGTTGTGCT
TGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCTCCTTTGCTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTAT
GGAGATTGATGACCATATTGGTTGTGCCATGAGCGGTTTAATTGCTGATGCACGTACACT
TGTTGAGCATGCAAGAGTTGAAACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGTGAGCCAATGAC
TGTAGAGTCCACAACGCAAGCGCTGTGTGATCTGGCTTTACGGTTTGGTGA*GGAGATGA
AGAATCAATGTCTCGCCCATTTGGAGTATCTCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGG
ACCAAGCTTGTACTACACGGACCCATCAGGAACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCCAT
TGGCTCAGGCTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTC
ACTCAGTGAAGCTGAGACGATCGCGGTGTCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGT
GACTCCGAATAATGTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCTTACCATCTCTACACTCCAGA
AGAAGTTGAAACAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGATGATCATACTCTCAATACGAGTGATG
TGTTTATCCCCCTTGTTTTAGTTCGGATTTTGAAACAAAGACTTTTTTTCACTTTTGTCC
GTTAGATTGGATGTTTTATGTGACATTTAAAGTTTTGTTTACGTAACAGAACCTTTTATT
TCCCATTTTCATTCAATAATCGTCTCGGATTGGTTGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GG
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BY41JQ U 38
AF RR4BY62JQ U 38
AF RR4C163JQ U 1
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DS 

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QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 9

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BQ
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN54JQ U 34
AF RR4FS05JQ U 1
AF RR4F452JQ U 2
AF RR4F485TF C 120
AF RR4AN54TF C 389
AF RR4F452TF C 420
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AGATCAAATACTAAGTCTTCCCTCTACTTGATAAGATCACATATTTTATTATTATGGTTA
CGTTTTAGCCGTGATCTATTCGTGACCATAATCATCCCTCTCTC**CTCATTCCAGTTCC
TTCAGAAAATCTTCGTTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAG
ACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGC
TCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCG
ATCTGTACATATGCATTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAATTATAGGTCAGCTCC
AAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCA
GGTCTCTCAATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTGATGGC
GCG

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DS 

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CGACACACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAGATCAAATACTAAGTCTTCCCTCTAC
TTGATAAGATCACATATTTTATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTATTCGTGACC
ATCATCATCCCTCTCTC**CTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCGTTGTCTACCAGA
ACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGA
GGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCA
CCGCTTTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATTGCCCTTTGTG
TACTCAGTCACACCGTAGTTATAGGTCAGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCA
TATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCAAGAGTCTC
ATCCCTAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAACACGAAGCATG
ACTTGGCAGAGTGGT

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DS 

RD RR4F452JQ 693 0 0
AAACACCAAAACC
ATGGCTGATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAAAGTTTTAGCAAACGAAACACAAACTG
AACAAACATCTTATTTAGTAAATCAAATACTAAGTCTTCCCTCTACTTGATAAGATCACA
TATTTTATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTATTCGTGACCATCATCATCCCTCT
CTC**CTCATTCCAGTTCCTTCAAAAAATCTTCGTTGTCTACCAAAACTGTTTTCCAGCC
ATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAAAGGTCCGGCTTCTCT
AGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACAC
ATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACACC
GTAGTTATAGGTCAGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCC
TATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAAGGCCTT
CTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAACACGAAGCATGACTTGGCAGAGTGG
TTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAA
GGCAATGACACTGTTTCCAC

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DS 

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CTTCAA
AAGATCACATATTTTATTATTATGGTAAAGTTTTAGCTGTGATCTATTCTTGACCATCAT
CATCCCTCTCTCTCCTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCGTTGTCTACCAGAACTGT
TTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCC
GGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCAC***TTCACCGCT
TTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATTGCCCTTTGTGTACTC
AGTCACACCGTAGTTATAGGTCAGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCC
CATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCC
TAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAACACGAAGCATGACTTG
GCAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTC
CTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTTGACAGGACCAGGCTCTCTGGTGACATT
TCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTTGGCAACATCTTGAGTGGAAATGGCGAA
ATGCCCAAATCCAGTCCCAATGTCATAGGAGC

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DS 

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TTGCGATCTGTACATATGCATTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCA
GCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGT
ATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTGA
TGGCGCGGTCAAGATCGCCAACACGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTAGGAC
CTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGT
TTCCACCTTTGACCGGACCAGGCTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCT
CAACCATCTTGGCAACATCTTGAGTGGAAATAGCGAAATGCCCAAATCCAGTCCCAATGT
CATAGGAGCTAACACCATAATTGTATGTGAGCTCGACGACAAAGTTGGATGTCTCAGGAC
CAAAACCAAGGAAAGCATTAGAATACTTCTCGTCAGGGACATCTCTTTTCCTCAACACCT
TCATCCCAAAGCACTCAGTGTAAAACTGGATAGTGCGATCAAGATCACCAACGCGGTAGA
CAACATGGAGAAAACGACGCTTATCCTTCTTTGGCCACTCCAACAACTCTGCCTTCTCTG
CCATTTTTTTCTGATCCAAGATGAAGCAGACACACAGACACC
ACTGGACACGGATCC

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DS 

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ATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCAAGAGTCT
CATCCCTAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAACACGAAGCAT
GACTTGGCAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATC
AGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTTGACAGGACCAGGCTCTCTGGT
GACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTTGGCAACATCTTGAGTGGAAAT
GGCGAAATGCCCAAATCCAGTCCCAATGTCATAGGAGCTAACACCATAATTGTATGTGAG
CTCGACGACGAAGTTGGAGGTCTCAGGACCAAAACCAAGAAAAGCATTAGAATACTTCTC
CTCAGGGACATCTCTTTTCCTCAACACCTTCATCCCAAAGCACTCAGTGTAAAACTGGAT
AGTGCGATCAAGATCACCAACGCGGTAAACAACATGGAGAAAACGACGCTTATCCTTCTT
TGGCCACTCCAACAACTCAGCATTTGATGCCATTTTTT*CTGATCGAAGATGAAGCAGAC
ACACAGGCACCTAGGACAGACACCACTGGACACGGATCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 8

CO CL580Contig1 1038 8 5 U
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TAGCGAACAAGGCATAAATTAAACTAAACAGACAGCTACAATACTTAGCATAACTAAGTG
AAACTACATAAACACACAAATTCAAACTGCAGAAGAACCGAAACAACATAAAACACATTC
AAATAATACTAAAAGCGATTTAGTTGACCTAAAAGAAGAACACACACAGCC*AAATGACC
TCAGATTGCATTGGTGCATTCGGGACAAGACGAAGATGTCCGAAAGTGGTTCTGCCTCTC
AATCCAGAGCCACGGAAGAATACACCTTCTATGGTAGATCGTTGTGCAGCAAAAGAATCT
GAGGTAATCTTCATATGCACGATTCTGATGAGCAGGCGCATAGTCCAACAAGTAGTTTTT
GTGACATAATGGACAAGGATCGTCC*ACCTCTATCTCCTCAAACGGGGGTATTTCTTGGC
CCGACCTATTCGTTTCTTCATCCACGATGAAGAGATCGCCCAAAGCTTCATCACAATAAC
AAGCGAAATAGTCCCCCCGTCTTAAAGTACTAAAGTCAATACTATCGCTGACATGTCTAA
CGATATTGTTAGTCACGGTAGACCAGCTCCATTCGTTAACCAAACTATTGTGTACCCATC
TTAGCGGAGTCACCCTATCCAACTCTTGCTGCGCCGTCGGGTTAGTTGAAATGTACTCAC
GAAACGTCCTTCTGGACCGTATAGCCGGAAGACGAAGGTTATAATAAAATGTTCCCTCAC
TCTGAACAACTTGATCAACCAGAATGTCTGGTCCATCGTCGTTGGTACGGAAAATCGTTC
TGCTGAATTTTTTACCTTCAACTCCAACTGCGGAGTACTCTTGCCTACGTACTCTCATCT
CGTTAGCATTATAAACATGACGTGTATAGAGTTCCACAATTTTGTGCGACCCAGACATTT
TAATCTCGACTAAATGATGATCTTTTTTTGGTCACTGAGACAGCTACTTGAAAATCACTC
ACAAGACTTGTGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BR50JQ U 46
AF RR4C466JQ U 46
AF RR4BR50TF C 46
AF RR4BI90JQ U 46
AF RR4EO32JQ U 1
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AF RR4BG74TF C 184
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C
C

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ACAGCC*AAATGACCTCAGATTGCATTGGTGCATTAGGGACAAGACGAAGATGTCCGAAA
GTGGTTCTGCCTCTCAATCCAGAGCCACGGAAGAATACACCTTCTATGGTAGATCGTTGT
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GGGGTATTTCTTGGCCCGACCTATTTGTTTCTTCATCCACGATGAAAAGATCGCCCAAAG
C
C

QA 1 481 1 481
DS 

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ACAGCC*AAATGACCTCAGATTGCATTGGTGCATTAGGGACAAGACGAAGATGTCCGAAA
GTGGTTCTGCCTCTCAATCCAGAGCCACGGAAGAATACACCTTCTATGGTAGATCGTTGT
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C
C

QA 1 481 1 481
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ACATAAAACACATTCAAATAATACTAAAAGCGATTTAGTTGACCTAAAAGAAGAACACAC
ACAGCC*AAATGACCTCAGATTGCATTGGTGCATTCGGGACAGGACGAAGATGTCCGAAA
GTGGTTCTGCCTCTCAATCCAGAGCCACGGAAGAATACACCTTCTATGGTAGATCGTTGT
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GGGGTATTTCTTGGCCCGACCTATTCGTTTCTTCATCCACGATGAAGAGATCGCCCAAAG
CTTCATCACAATAACAAGCGAAATAGTCCCCCCGTCTTAAAGTACTAAAGTCAATACTAT
CGCTGACATGTCTAACGATATTGTTAGTCACGGTAGACCA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4EO32JQ 743 0 0
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AAACTACATAAACACACAAATTCAAACTGCAGAAGAACCGAAACAACATAAAACACATTC
AAATAATACTAAAAGCGATTTAGTTGACCTAAAAGAAGAACACACACAGCC*AAATGACC
TCAGATTGCATTGGTGCATTCGGGACAAGACGAAGATGTCCGAAAGTGGTTCTGCCTCTC
AATCCAGAGCCACGGAAGAATACACCTTCTATGGTAGATCGTTGTGCAGCAAAAGAATCT
GAGGTAATCTTCATATGCACGATTCTGATGAGCAGGCGCATAGTCCAACAAGTAGTTTTT
GTGACATAATGGACAAGGATCGTCC*ACCTCTATCTCCTCAAACGGGGGTATTTCTTGGC
CCGACCTATTCGTTTCTTCATCCACGATGAAGAGATCGCCCAAAGCTTCATCACAATAAC
AAGCGAAATAGTCCCCCCGTCTTAAAGTACTAAAGTCAATACTATCGCTGACATGTCTAA
CGATATTGTTAGTCACGGTAGACCAGCTCCATTCGTTAACCAAACTATTGTGTACCCATC
TTAGCGGAGTCACCCTATCCAACTCTTGCTGCGCCGTCGGGTTAGTTGAAATGTACTCAC
GAAACGTCCTTCTGGACCGTATA

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DS 

RD RR4BG74JQ 659 0 0
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CACGGAAGAATACACCTTCTATGGTAGATCGTTGTGCAGCAAAAGAATCTGAGGTAATCT
TCATATGCACGATTCTGATGAGCAGGCGCATAGTCCAACAAGTAGTTTTTGTGACATAAT
GGACAAGGATCGTCC*ACCTCTATCTCCTCAAACGGGGGTATTTCTTGGCCCGACCTATT
CGTTTCTTCATCCACGATGAAGAGATCGCCCAAAGCTTCATCACAATAACAAGCGAAATA
GTCCCCCCGTCTTAAAGTACTAAAGTCAATACTATCGCTGACATGTCTAACGATATTGTT
AGTCACGGTAGACCAGCTCCATTCGTTAACCAAACTATTGTGTACCCATCTTAGCGGAGT
CACCCTATCCAACTCTTGCTGCGCCGTCGGGTTAGTTGAAATGTACTCACGAAACGTCCT
TCTGGACCGTATAGCCGGAAGACGAAGGTTATAATAAAATGTTCCCTCACTCTGAACAAC
TTGATCAACCAGAATGTCTGGTCCATCGTCGTTGGTACGGAAAATCGTTCTGCTGAATTT
TT*ACCTTCAACTCCAACTGCGGAGTACTCTTGCCTACGTACTCTCATCTCGTTAGCAT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4BG74TF 855 0 0
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CCAGAGCCACGGAAGAATACACTTTCTATGGTAGATCGTTGTGCAGCAAAAGAATCTGAG
GTAATCTTCATATGCACGATTCTGATGAGCAGGCGCATAGTCCAACAAGTAGTTTTTGTG
ACATAATGGACAAGGATCGTCC*ACCTCTATCTCCTCAAACGGGGGTATTTCTTGGCCCG
ACCTATTCGTTTCTTCATCCACGATGAAGAGATCGCCCAAAGCTTCATCACAATAACAAG
CGAAATAGTCCCCCCGTCTTAAAGTACTAAAGTCAATACTATCGCTGACATGTCTAACGA
TATTGTTAGTCACGGTAGACCAGCTCCATTCGTTAACCAAACTATTGTGTACCCATCTTA
GCGGAGTCACCCTATCCAACTCTTGCTGCGCCGTCGGGTTAGTTGAAATGTACTCACGAA
ACGTCCTTCTGGACCGTATAGCCGGAAGACGAAGGTTATAATAAAATGTTCCCTCACTCT
GAACAACTTGATCAACCAGAATGTCTGGTCCATCGTCGTTGGTACGGAAAATCGTTCTGC
TGAATTTTTTACCTTCAACTCCAACTGCGGAGTACTCTTGCCTACGTACTCTCATCTCGT
TAGCATTATAAACATGACGTGTATAGAGTTCCACAATTTTGTGCGACCCAGACATTTTAA
TCTCGACTAAATGATGATCTTTTTTTGGTCACTGAGACAGCTACTTGAAAATCACTCACA
AGACTTGTGTGATCC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4BI90TF 722 0 0
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GCACGATTCTGATGAGCAGGCGCATAGTCCAACAAGTAGTTTTTGTGACATAATGGACAA
GGATCGTCCCACCTCTATCTCCTCAAACGGGGGTATTTCTTGGCCCGACCTATTCGTTTC
TTCATCCACGATGAAGAGATCGCCCAAAGCTTCATCACAATAACAAGCGAAATAGTCCCC
CCGTCTTAAAGTACTAAAGTCAATACTATCGCTGACATGTCTAACGATATTGTTAGTCAC
GGTAGACCAGCTCCATTCGTTAACCAAACTATTGTGTACCCATCTTAGCGGAGTCACCCT
ATCCAACTCTTGCTGCGCCGTCGGGTTAGTTGAAATGTACTCACGAAACGTCCTTCTGGA
CCGTATAGCCGGAAGACGAAGGTTATAATAAAATGTTCCCTCACTCTGAACAACTTGATC
AACCAGAATGTCTGGTCCATCGTCGTTGGTACGGAAAATCGTTCTGCTGAATTTTTTACC
TTCAACTCCAACTGCGGAGTACTCTTGCCTACGTACTCTCATCTCGTTAGCATTATAAAC
ATGACGTGTATAGAGTTCCACAATTTTGTGCGACCCAGACATTTTAATCTCGACTAAATG
ATGATCTTTTTTTGGTCACTGAGACAGCTACTTGAAAATCACTCACAAGACTTGTGTGAT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 8

CO CL581Contig1 803 8 8 U
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GACCACTTGCTTATACCTCCATAAACACCGGATAAAGCTTCCCTTTGATGGTCGTCGTCT
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AAGAGAGATGATTCTCAGGAGCAGTGAACTAGCAATGATCGGAGCCATTTTCCAGCTCAG
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TACAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTCCACTATGCTCCACC
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GTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGG
GAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCATTGCGACAGGAGCTGGAGAA
AAAGGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCAATTAA
GATTTTTCAAGACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTTCTGTCATAAATAAG
AGAGGTTAACACAAGGAACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4DJ81JQ C 3
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AF RR4AA24TF U 106
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TCGTATAACCGCTTCGATACCAGACTCTTCAGATGAAAAACATCCCAAGTTAATTGCTCG
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GATTTT*CAAGACTCGAATGTTATTAAAA
CTCTTCA

QA 1 749 1 749
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RD RR4CM83TF 754 0 0
GGATTTT
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GTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGGGAACTT
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*CA*GACTCGAATGTTATTAAAA
CTCT

QA 8 750 8 750
DS 

RD RR4B004TF 782 0 0
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AACCGCTTCGATACCAGACTCCTCAGATGAAAAACATCCCAAGTTAATTGCTCGAAGAGA
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GAAACCAGATTATATTGGAGTACAGAAGAACGAGAGATTGGCTCTATGTCCTGCTACAAA
CAACTGTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTCCACTATGCTCCACCATGGAA
CTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTTGCAATGAAGGAGCTTGTCAA
TGTGATTAAGTCGA*GAAGCCTGACAAGTTTACTCCTCGGATTGTGGAGAAGAAGGATGA
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GTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGGGAACTT
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ATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCAATTAAGATTTT
TCAAGACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTTCTGTCATAA
TAAGAGAGTTACA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4DJ81JQ 796 0 0
TTTTTCAAA
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TATACCTCCATAAACACCGGATAAAGCTTCCCTTTGATGGTCGTCGTCTTCGTATAACCG
CTTCGATACCAGACTCTTCAGATGAAAAACATCCCAAGTTAATTGCTCGAAGAGAGATGA
TTCTCAGGAGCAGTGAACTAGCAATGATCGGAGCCATTTTCCAGCTCAGTGGGAAGAAAC
CAGATTATATTGGAGTACAGAAGAACGAGAGATTGGCTCTATGTCCTGCTACAAACAACT
GTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTCCACTATGCTCCACCATGGAACTATA
ATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTTGCAATGAAGGAGCTTGTCAGTGTGA
TTAAGTCGACGAAGCCTGACAAGTTTACTCCTCGGATTGTGGAGAAGAAGGATGACTATG
TTCATGTCGAGTATGAAAGTCCAATCTTAGGTTTGGTAGATGATGTTGAGTTCTTGTTCT
CTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGGGAACTTCGACT
TTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCATTGCGACAGGAGCTGGAGAAAAAGGGATGGG
AATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCAATTAAGATTTTTCAAG
ACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTTCTGTCATAAATAAGAGAGGTTAACA
CAAGG
AA

QA 10 794 10 794
DS 

RD RR4CM83JQ 750 0 0
TCCATGGTGTCACCGACCACTTGCTTATACCTCCATAAACACCGGATAAAGCTTCCCTTT
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AAGTTAATTGCTCGAAGAGAGATGATTCTCAGGAGCAGTGAACTAGCAATGATCGGAGCC
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GTAGATGATGTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCT
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GTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGT
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GAGAAAAAGGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCA
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ATAAGAGAGGTTAACAC
GCAAAAAAA

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DS 

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G
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ATTTTCCAGCTCAGTGGGAAGAAACCAGATTATATTGGAGTACAGAAGAACGAGAGATTG
GCTCTATGTCCTGCTACAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTC
CACTATGCTCCACCATGGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTT
GCAATGAAGGAGCTTGTCAATGTGATTAAGTCGATGAAGCCTGACAAGTTTACTCCTCGG
ATTGTGGAGAAGAAGGATGACTATGTTCATGTCGAGTATGAAAGTCCAATCTTAGGTTTG
GTAGATGATGTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAGGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCT
GCATCACGTAAAGGGAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCATTGCGA
CAGGAGCTGGAGAAAAAGGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCT
TGTTATTCAATTAAGATTTTTCAAGACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTT
CTGTCATAAATAAGAGAGGTTAACACAAGGAACCTCC

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4AA24TF 698 0 0
G
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GCTCTATGTCCTGCTACAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTC
CACTATGCTCCACCATGGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTT
GCAATGAAGGAGCTTGTCAATGTGATTAAGTCGATGAAGCCTGACAAGTTTACTCCTCGG
ATTGTGGAGAAGAAGGATGACTATGTTCATGTCGAGTATGAAAGTCCAATCTTAGGTTTG
GTAGATGATGTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAGGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCT
GCATCACGTAAAGGGAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCATTGCGA
CAGGAGCTGGAGAAAAAGGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCT
TGTTATTCAATTAAGATTTTTCAAGACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTT
CTGTCATAAATAAGAGAGGTTAACACAAGG
AACCTCC

QA 2 691 2 691
DS 



AS 1 8

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AATAAAACAATAAGCATAATAATATAACTAGTAAATATCATTTAACTAGACGATCCAAAC
AAAAAAATAACACACAAACAAAATTATTAACGAGAACTAACTATATTTTTCATAACTGTT
GCTCAGTAGAACTCACGTAGCACCCTTTTATTTAACTGGACGCTAGTCTGGCTAAGCATC
TTCACAAACCTAATTTATTTCTAACGAGATACTCCACTAGTTTGTTTCTTCCTTTTTGTT
TTTATTATTTCTTTGTTCGTACGAGACGTCCCGAGCAAACGTCTTAGGAATTTGGAACAT
TGTTATGAGAAAAATATTCTCTTCTTTTACAGGAGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAA
TTTCAATCCGCAAAATGCTGGCCCATCCTCTGCATTCATAAAATCATCTGCAGCCTTATC
AAAATTCCGCATTTTGACGTAATTCAAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATTGGAGTA
AAGCTTAAGGCATTCTTCCAACAACTTTTTAGTAAGACTATTTTTATATTTTTTCTCTTT
TATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTTCGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCTCC
TACCATAGTCAAATCACCGAGATTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGAGA
TGCAATGCAAACTTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGAGACTTTGAAGCGTT
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AAAAGCAAACACAATGATGTATATCATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGTGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 35 0 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED61JQ U 21
AF RR4A447JQ U 244
AF RR4HA78JQB U 1
AF RR4GP48JQ U 22
AF RR4A447TF C 26
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AF RR4GF15TF C 193
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BS 430 430 RR4ED61JQ
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BS 835 840 RR4GF15TF

RD RR4ED61JQ 477 0 0
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AAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATTGGAGTAAAGCTTAAGGCATTCTT

QA 6 477 6 477
DS 

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TATGAAAAAAATATTCTCTTCTTTTACAGGAAATATTTGTTGATTGTCCCCGTTAAATTT
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ATTCCGCATTTTGACGTAATTCAAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATCGGAGTAAAG
CTTAAGGCATTCTTCCAACAACTTCTTAGTA

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR4HA78JQB 727 0 0
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CAAAAAATAACACACAAACAAAATTATTAACGAGAACTAAATATATTTTTCATAATTGTT
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AAGCTTAAGGCATTCTTCCAACAACTTTTTAGTAAGACTATTTTTATATTTTTTCTCTTT
TATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTTCGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCTCC
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TTTGCAA

QA 1 727 1 727
DS 

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ATAT
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ATTAACGAGAACTAACTATATTTTTCATAATTGTTGCTCAGTAGAACTCACGTAGCACCC
TTTTATTTAACTGGACGCTAGTCTGGCTAAGCATCTTCACAAACCTAATTTATTTCTAAC
GAGATACTCCACTAGTTTGTTTCTTCCTTTTTGTTTTTATTATTTCTTTGGTCGTACGAG
ACGTCCCGAGCAAACGTCTTAGGAATTTGGAACATTGTTATGAGAAAAATATTCTCTTCT
TTCACAGGAGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCAAAATGCTGGCCCA
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AAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATTGGAGTAAAGCTTAAGGCATTCTTCCAACAAC
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QA 5 715 5 715
DS 

RD RR4A447TF 814 0 0
AACTAGTAAATATCATTTAACTAGACGATCCAAACAAAAAAATAACACACAAACAAAATT
ATTAACGAGAACTAACTATATTTTTCATAACTGTTGCTCAGTAGAACTCACGTAGCACCC
TTTTATTTAACTGGACGCTAGTCTGGCTAAGCATCTTCACAAACCTAATTTATTTCTAAC
GAGATACTCCACTAGTTTGTTTCTTCCTTTTTGTTTTTATTATTTCTTTGTTCGTACGAG
ACGTCCCGAGCAAACGTCTTAGGAATTTGGAACATTGTTATGAGAAAAATATTCTCTTCT
TTTACAGGAGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCAAAATGCTGGCCCA
TCCTCTGCATTCATAAAATCACCTGCAGCCTTATCAAAATTCCGCATTTTGACGTAATTC
AAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATCGGAGTAAAGCTTAAGGCATTCTTCCAACAAC
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ACGTTTGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCTCCTACCATAGTCAAATCACCGAGATTT
CTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGAGATGCAATGCAAACTTCTTCGAAATGT
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ATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGT
GGTCC

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DS 

RD RR4ED61TF 598 0 0
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TCAAAATTCCGCATTTTGACGTAATTCAAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATTGGAG
TAAAGCTTAAGGCATTCTTCCAACAACTTTTTAGTAAGACTATTTTTATATTTTTTCTCT
TTTATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTTTGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCT
CCTACCATAGTCAAATCACCGAGATTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGA
GATGCAATGCAAACTTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGAGACTTTGAAGCG
TTTTTGCAAGATTCTTGAACCAAAGAATCTGCCACTTTGTTGGCTGTGCAACCATTGAAA
AGAAAAGCAAACACAATGATGTATATCATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGT
CC

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DS 

RD RR4GP48TF 550 0 0
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TTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCAAAATGCTGGCCCATCCTCTGCATTCATAAAATCA
TCTGCAGCCTTATCAAAATTCCGTATTTTGACGTAATTCAAACCTGAAGTTAGCGATTTA
AAGCTATTGGAGTAAAGCTTAAGGCATTCTTCCAACAACTTTTTAGTAAGACTATTTTTA
TATTTTTTCTCTTTTATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTTCGTTAAGTTTGATATG
GCGTTATTTGCTCCTACCATAGTCAAATCACCGAGATTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGA
TTCTCTTTGAGAGATGCAATGCAAACTTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGA
GACTTTGAAGCGTTTTTGCAAGATTCTTGAATCAAAGAATCTGCCACTTTGTTGGCTGTG
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TTCATTGT
CC

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DS 

RD RR4GF15TF 648 0 0
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AATATTCTCTTCAT**ACAGGAGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCA
AAATGCTGGCCCATCCTCTGCATTCATAAAATCATCTGCAGCCTTATCAAAATTCCGCAT
TTTGACGTAATTCAAACCTGAAGTTAGCGATTTAAAGCTATTGGAGTAAAGCTTAAGGCA
TTCTTCCAACAACTTTTTAGTAAGACTATTTTTATATTTTTTCTCTTTTATAATCTTCTC
CACCATTCTTTTCACGTTTGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCTCCTACCATAGTCAA
ATCACCGAGATTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGAGATGCAATGCAAAC
TTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGAGACTTTGAAGCGTTTTTGCAAGATTC
TTGAATCAAAGAATCTGCCACTTTGTTGGCTGTGCAACCATTGAAAAGAAAAGCAAACAC
AATGATGTATATCATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGTGGTCCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 2 9

CO CL583Contig1 916 2 2 U
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CTGATATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAGTTCAATATGGGA
AGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCAGCGAGTCTGATCAATTCT
GATCTGAATGAGTTTGTTGACGCCGCAAAGAAGCTCATGAAAGATGCAACGATGCTAGGC
GGTTTAAGCTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCATCTATCTG
TTGATATTGGATCGGACCAACTGGAGAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGGTGCCATAC
ATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGAGGAGATTTTGGGAAATGG
ATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGGTTG
GAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTTGTTGCACCTAGTCTCATAGCTGGGACA
GTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTCCAT
GAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAGCATGGACTCTCC
AATACTATTGGGATCGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGGTTTGGACCATCTTTTTTAACATC
TTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAACATTCTGTGTCTTGCT
TTCATTTGATAAAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTTGTGTTTGGGAAAATC
TTCATTGAACAAAAGAAGATTCACTTGTGATGTGTAAGATATATGGGTTTGTGTTGTATA
TCGCTTGGTGTGTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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DS 

RD RR4AU79TF 871 0 0
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ATATGGGAAGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGGAGAGGAAACCGCGGCTAACCTGA
TCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTAAAAGATGCAACGA
TGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCA
TCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCTTTTTGG
TGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTTG
GGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAG
ATTGGTTGGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATAG
CTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACC
TTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACATG
GACTCTCCAATACTATTGGGATCGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGGTTTGGACCATCTTTT
TTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAAC
ATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATATAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTT
GTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAG**AGATTCACTTGTGATGTGTA*GATATATG
GGTTTGTGCTGTATATCGCTTG
TGTGTTAAA

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4GI44JQ 751 0 0
TCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTAAAAGATGCAACGA
TGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCA
TCCATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGG
TGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTTG
GGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAG
ATTGGTTGGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATAG
CTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACC
TTTTCCATGAACATATCAAAGCTTTTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACATG
GACTCTCCAATACTATTGGGATCGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGGTTTGGACCATCTTTT
TTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAAC
ATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATATAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTT
GTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATTCACTTGTGATGTGTAAGATATATG
GGTTTGTGTTGTATATCGCTTGGTGTGTTAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4AU79JQ 741 0 0
TCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTAAAAGATGCAACGATGCTAGGCGG
TTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCATCTATCTGTT
GATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCTTTTTGGTGCCATACAT
CTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTTGGGAAATGGAT
TGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGGTTGGA
GATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATAGCTGGGACAGT
AAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTCCATGA
ACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACATGGACTCTCCAA
TACTATTGGGATCGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGGTTTGGACCATCTTTTTTAACATCTT
CTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAACATTCTGTGTC
TTGCTTTCATTTGATATAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTTGTGTTTGGGA
AAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATTCACTTGTGATGTGTAAGATATATGGGTTTGTGCT
GTATATCGCTTGGTGTGTTAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4EX72JQ 706 0 0
TAAAAGATGCAACGATGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCG
CCTCAATCTCAGCCATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGT
TGACTACCCTTTTGGTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCT
TCAGGGGAGATTTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCC
CTAAACACTTTCCAGATTGGTTGGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTG
CACCTAGTCTCATAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTA
TCATAGCATGTTACCTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTT
TAACTCAGAAACATGGACTCTCCAATACTATTGGGATCGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGG
TTTGGACCATCTTTTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCT
GGAAACACCTTCAACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATATAGTGCGAATTGTTTATGT
GTTTTAGCAGCATTTGTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATTCACTTGTGA
TGTGTAAGATATATGGGTTTGTGTTGTATATCGCTTGGTGTGTTAA

QA 1 706 1 706
DS 



AS 2 8

CO CL584Contig1 818 2 2 U
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GTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCT
TGCCTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGA
GGAGATATGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAG
GAAACGCATGAACACTAAGCCGTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGTTCCCTCTAAGAT
CTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCT
TGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGT
TATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGTTTGTTGGG
CCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAA
AAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGAC
TAAGGCTGAAAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCCAT
TAAGTACTGAGAATTTGCATCTTTTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCGA
TTCTACCTTTTGAATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAATATTGGAATG
AGACATTTTGGTTTTTTAATGAACAATCTGTTATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B660TF U 1
AF RR4B660JQ C 4
BS 1 715 RR4B660TF
BS 716 818 RR4B660JQ

RD RR4B660TF 715 0 0
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GTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCT
TGCCTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGA
GGAGATATGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAG
GAAACGCATGAACACTAAGCCGTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGTTCCCTCTAAGAT
CTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCT
TGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGT
TATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGTTTGTTGGG
CCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAA
AAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGAC
TAAGGCTGAAAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCCAT
TAAGTACTGAGAATTTGCATCTTTTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTCGT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4B660JQ 815 0 0
CA
GCAGTGAGAGAGAGAACCAGTCGAATCGAGAGGAAGAGAGAAAGATGGTGTCCGGGTCAG
GGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCCT
CGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGA
TATGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAAC
GCATGAACACTAAGCCGTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGTTCCCTCTAAGATCTTCT
GGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCAC
GCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTC
CTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGTTTGTTGGGCCGTC
TTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAA
AGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGG
CTGAAAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCCATTAAGT
ACTGAGAATTTGCATCTTTTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCGATTCTA
CCTTTTGAATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAATATTGGAATGAGACA
TTTTGGTTTTTTAATGAACAATCTGTTATGGTC

QA 3 815 3 815
DS 



CO CL584Contig2 820 6 19 U
GGGCAGTGAGAGAGAGAACCAATCGAATCGAGAGGAAGAAAAAATGGTGTCCGGGTCAGG
GATATGCGCGAAGCGTGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCTTC
GATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGAT
TTGTCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACG
CATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTG
GCGTACCGTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACG
CTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCC
TGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCT
GTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAA
GGAGAGGTCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGGC
TGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCCATCAAGTA
CTGAGAATTGGCATCTATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCGATTCTAC
CTTTTGAATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAATATTGGAATGAGACAT
TTTGGTTTTTTGAATGAACAATCTGCTATGGTTCTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO11TF U 1
AF RR4DV84TF U -9
AF RR4CT51TF U -9
AF RR4CT51JQ C -8
AF RR4DV84JQ C 87
AF RR4BO11JQ C 167
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BS 589 626 RR4CT51TF
BS 627 627 RR4CT51JQ
BS 628 666 RR4CT51TF
BS 667 667 RR4CT51JQ
BS 668 687 RR4CT51TF
BS 688 688 RR4CT51JQ
BS 689 715 RR4CT51TF
BS 716 716 RR4CT51JQ
BS 717 731 RR4CT51TF
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BS 735 751 RR4CT51TF
BS 752 779 RR4CT51JQ
BS 780 791 RR4DV84JQ
BS 792 820 RR4BO11JQ

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GATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCTTC
GATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGAT
TTGTCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACG
CATGAACGCTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTG
GCGTACCGTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACG
CTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCC
TGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCT
GTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAA
GGAGAGGTCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCT

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DS 

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GCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCTTCGATCATC
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TCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCGTGAAC
ACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACC
GTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAG
GTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCT
CTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCT
GAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGG
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DS 

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GCGAAGCGTGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCTTCGATCATC
GCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGATTTGTCTG
TCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTCCTCAGGAAACGCATGAAC
ACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACC
GTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAG
GTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCT
CTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCT
GAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGG
TCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAG
GTTGCAGAGGAGAAGCTTG*ATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGA*
TTGGCATCTATTATTTGGTT*AATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCGAT*CTACCTTTTGA
ATTT**GTTGTGCTTTTGGTAGCT
GTAACTAAAATA

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DS 

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GCGAAGCGTGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCTTCGATCATC
GCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGATTTGTCTG
TCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTCCTCAGGAAACGCATGAAC
ACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACC
GTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAG
GTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCT
CTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTTT
GAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGG
TCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAG
GTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAA
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ATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAATATTGGAATGAGACA

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DS 

RD RR4DV84JQ 710 0 0
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GACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGATTTGTCTGTCAGGTGGATTGGTTCGAC
AGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCGTGAACACTAAGCCTTCTCACGGTC
CCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGTATGATTCCAC
ACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCAC
CACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCC
AGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATT
ACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTATGTATGAGC
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TTAATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCGATTCTACCTTTTGAATTTTGTTTGTGCTTTTGG
TAGCTTGTAAACTTAAAATATTGGAATGAGACATTTTGGTTTTTT
GGACG

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DS 

RD RR4BO11JQ 654 0 0
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TCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCT
GCTGTTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCCCCTTACGACAAGGTCAAG
AGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGC
TTGTTGGGCCGTCTGTTTTTTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTT
GAGGTCAAAAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAG
CTCAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTT
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CGTCTCGATTCTACCTTTTGAATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAATA
TTGGAATGAGACATTTTGGTTTTTTGAATGAACAATCTGCTATGGTTCTTACTC

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DS 



AS 1 6

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GTACCATCGGAGTTGATCCGAAGTCAGAATCAAAGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGT
GAGAGCGGAGGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGG
ATCTAAGCACGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGC
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GGACAGCAAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGT
TGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGG
AAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCA
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AGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGA
GCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATAA
CTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAA
AGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTT
TACAGGAACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATCGATGAAGAAGA
CATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATG
GAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGAAGAGGA
TGACCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTATTTGCT
GGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTCTTCATGTTCGACCCTTCATTGTGTCT
GGTTTATGAGATTTAAGGTTTCTTAAGAGGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCA
CGACTATGTTTGTTACGTCTCTCATTACTTCATCTATGTGAACTTCTCAACTATTTGGAG
ATTTGATTTGTGTACATCTAATAAAAGATTGTTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4GM60TF U 1
AF RR4BX25TF U 6
AF RR4FE54JQ C 524
AF RR4BX25JQ C 350
AF RR4CZ38TF U 487
AF RR4GM60JQ C 667
BS 1 43 RR4GM60TF
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BS 1110 1181 RR4CZ38TF
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BS 1237 1238 RR4GM60JQ

RD RR4GM60TF 712 0 0
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GTACCATCGGAGTTGATCCGAAGTCAGAATCAAAGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGT
GAGAGCGGAGGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGG
ATCTAAGCACGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGC
CAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTC
GGACAGCAAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGT
TGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGG
AAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCA
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AGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGA
GCAATATGAGAAAGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATAA
CTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCAC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4BX25TF 753 0 0
GG
AACGAAGCAAACCCTCTGCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCAT
CGGAGTTGATCCGAAGTCAGAATCAAAGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCG
GAGGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAG
CACGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATACGCTCGCCAAATCA
TGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGC
AAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACT
AATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTC
AACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTA
GAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTTACC
ACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATAT
GAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATGACTTGCTT
AAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCACC*TTTGCAAAGCTGAT
GTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGA
GTA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR4FE54JQ 554 0 0
TTTTTCCAAAATGAAGAAGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAGGGTGGCACAG
TATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGC
CATTCACTCGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGC
TTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAG
GATCTGGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCT
GTTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAATGAATTTGATAGCATG
GCTCCTCTGGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCA
AAGGAGCTTGAAGAGGATGACCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTC
TTTATTTGTTATTTGCTGGTGTGTAGTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTCTTCATGTTC
GACCCTTCATTGTG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4BX25JQ 849 0 0
TACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCT*GTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTC
TGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTAT
GAAGCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTC
CAAAATGAAGAAGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCT
TCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCA
CTCGGAAATGACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGC
CACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTG
GATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATC
GATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCT
CTGGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAG
CTTGAAGAGGATGACCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATT
TGTTATTTGCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTCTTCATGTTCGACCCT
TCATTGTGTCTGGTTTATGAGATTTAAGGTTTCTTAAGAGGTTTGGTCAAAACTATGTTT
GTTTGATATCACGACTATGTTTGTTACGTCTCTCATTACTTCATCTATGTGA
ACTTCTCAACTATTTGG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4CZ38TF 750 0 0
G
GAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTTACC
ACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATAT
GAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATAACTTGCTT
AAGTATGGAGTCAAGGGCCATCCTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGAT
GTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTTTACAGGA
ACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCA
AAATTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATGGAAGACA
ACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGAAGAGGATGACCTC
ACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTATTTGCTGGTGTGT
ACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTCTTCATGTTCGACCCTTCATTGTGTCTGGTTTAT
GAGATTTAAAGTTTCTTAAGATGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCACGACTAT
GTTTGTTACGTCTCTCATTACTTCATCTATGTGA*CTTCTCA*CTATTTGGAGATTTGAT
TTGTGTACATCTAATAAA*GATTGTTTAC

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR4GM60JQ 572 0 0
TAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGA
TGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTTTACAGG
AACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATCGATGAAGAAGACATCGC
AAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATGGAAGAC
AACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGAAGAGGATGACCT
CACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTATTTGCTGGTGTG
TACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTCTTCATGTTCGACCCTTCATTGTGTCTGGTTTA
TGAGATTTAAGGTTTCTTAAGAGGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCACGACTA
TGTTTGTTACGTCTCTCATTACTTCATCTATGTGAACTTCTCAACTATTTGGAGATTTGA
TTTGTGTACATCTAATAAAAGATTGTTTACAT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 8

CO CL586Contig1 867 8 22 U
CAATACCATATGTTTTTGTAACTACTTCAAAAATTCAAATAATTTAAAGATTTTTTTGTG
TTCTTTTAAGCATCTACATACAAACAGGTTGAAACTCTGAAAACTTCTCTGAATCAATCA
TAATTGTTCTCTTGTCTTTAGTTTGAAGGAAACAGCTTCTCTGCTTGGTCTGGGAAGAAC
GTTATGAACAACAAAGCACAGACGAGCACTGTTCCTAAGACAGCTGAGATCTTGCCTTGA
ATTGTGATAAGCCCTGCCTTGCCTGCATTCTGCAACTCCGTTGAACCAACCGACTCAAAT
GTCCCTGGTTTAACAGACTGTAACCCTGATGTTACACAAGCAATGTTATCGTAACCTGCT
TCCTCCAATCTACTAGCAGCAGCTGCAGATCTGAGACCTTCTTGGCAAACCAGTAACAGT
TTGCTGTCCTGTGAAAACTCGTTTCTAACGGATTTAACGAACTCCGGATTCAGTTTCGTG
AAGGGCAGACCAAAGAAGAGCCCTGAGAAGTTGTTGTGCACTGTCCTCTTCACTATCGTA
CCAAGATCGTTGTCTTCGTTGAAAATGAAGAGAGGGATGTGGTGGCAAGACTTTATATGA
GCCCTCTCGAACTGAGTCTTGTCTCTCACATCCACAACCTTGTAACCTTCCGCTGATATC
AACTTCTTTGCTTCCTCTGCGTTCACGAACTTCACCTCAGCCGCAACTCTCAGACTTCTC
CGGCGGATATTATTGTTACCAGAGCCGCTCTTTCCGGACCAGCTCGACGCTTTCAACCGC
CTTGTCCCGAGATCACTGGTGAAACAAAGAGCCGTAGGGCTAGGGCTTGCGATCCCCGCC
ATTATTGCAGAAGTCAAGTCTCACGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 

AF RR4EP25JQ U 13
AF RR4DL58TF C 1
AF RR4FT51JQ U 1
AF RR4BY67JQ U 18
AF RR4C608JQ U 18
AF RR4C608TF C 392
AF RR4BY67TF C 157
AF RR4EP25TF C 262
BS 1 17 RR4FT51JQ
BS 18 39 RR4EP25JQ
BS 40 40 RR4FT51JQ
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BS 178 200 RR4FT51JQ
BS 201 201 RR4BY67JQ
BS 202 205 RR4FT51JQ
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BS 207 218 RR4FT51JQ
BS 219 219 RR4BY67JQ
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RD RR4EP25JQ 167 0 0
TTTTT
GTAACTACTTCAAAAATTCAAAAAATTTAAAGATTTTTTTGTGTTCTTTTAAGCATCTAC
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TTAGTTTGAAGGAAACAGCTTCTCTGCTTGGTCTGGGAA
AAA

QA 6 164 6 164
DS 

RD RR4DL58TF 359 0 0
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TTCTTTTAAGCATCTACATACAAACAGGTTGAAACTCTGAAAACTTCTCTGAATCAATCA
TAATTGTTCTCTTGTCTTTAGTTTGAAGGAAACAGCTTCTCTGCTTGGTCTGGGAAGAAC
GTTATGAACAACAAAGCACAGACGAGCACCGTTCCTAAGACAGCTGAGATCTTGCCTTGA
ATTGTGATAAGCCCTGCCTTGCCTGCATTCTGCAACTCCGTTGAACCAACCGACTCAAAT
GTCCCTGGTTTAACAGACTGTAACCCCGATGTTACACAAGCAATGTTATCGTAACCTGC

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4FT51JQ 385 0 0
CAATACCATATGTTTTTGTAACTACTTCAAAAATTCAAATAATTTAAAGATTTTTTTGTG
TTCTTTTAAGCATCTACATACAAACAGGTTGAAACTCTGAAAACTTCTCTGAATCAATCA
TAATTGTTCTCTTGTCTTTAGTTTGAAGGAAACAGCTTCTCTGCTTGGTCTGGGAAAAAC
GTTATGAACAACAAAGCACAAACGAACACTGTTCCTAAAACAGCTGAAATCTTGCCTTGA
ATTGTGATAAGCCCTGCCTTGCCTGCATTCTGCAACTCCGTTGAACCAACCGACTCAAAT
GTCCCTGGTTTAACAAACTGTAACCCCGATGTTACACAAGCAATGTTATCGTAACCTGCT
TCCTCCAATCTACTAGCAGCAGCTG

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR4BY67JQ 734 0 0
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ATACAAACAGGTTGAAACTCTGAAAACTTCTCTGAATCAATCATAATTGTTCTCTTGTCT
TTAGTTTGAAGGAAACAACTTCTCTGCTTGGTCTGGGAAGAACGTTATGAACAACAAAGC
ACAGACGAGCACTGTTCCTAAGACAGCTGAAATCTTGCCTTGAATTGTGATAAGCCCTGC
CTTGCCTGCATTCTGCAACTCCGTTGAACCAACCGACTCAAATGTCCCTGGTTTAACAGA
CTGTAACCCTGATGTTACACAAGCAATGTTATCGTAACCTGCTTCCTCCAATCTACTAGC
AGCAGCTGCAGATCTGAGACCTTCTTGGCAAACCAGTAACAGTTTGCTGTCCTGTGAAAA
CTCGTTTCTAACGGATTTAACGAACTCCGGATTCAGTTTCGTGAAGGGCAGACCAAAGAA
GAGCCCTGAGAAGTTGTTGTGCACTGTCCTCTTCACTATCGTACCAAGATCGTTGTCTTC
GTTGAAAATGAAGAGAGGGATGTGGTGGCAAGACTTTATATGAGCCCTCTCGAACTGAGT
CTTGTCTCTCACATCCACAACCTTGTAACCTTCCGCTGATATCAACTTCTTTGCTTCCTC
TGCGTTCACGAACTTCACCTCAGCCGCAACTCTCAGACTTCTCCGGCGGATATTATTGTT
ACCAGAGCCGCTCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4C608JQ 733 0 0
GTAACTACTTCAAAAATTCAAATAATTTAAAGATTTTTTTGTGTTCTTTTAAGCATCTAC
ATACAAACAGGTTGAAACTCTGAAAACTTCTCTGAATCAATCATAATTGTTCTCTTGTCT
TTAGTTTGAAGGAAACAACTTCTCTGCTTGGTCTGGGAAGAACGTTATGAACAACAAAGC
ACAGACGAGCACTGTTCCTAAGACAGCTGAGATCTTGCCTTGAATTGTGATAAGCCCTGC
CTTGCCTGCATTCTGCAACTCCGTTGAACCAACCGACTCAAATGTCCCTGGTTTAACAGA
CTGTAACCCTGATGTTACACAAGCAATGTTATCGTAACCTGCTTCCTCCAATCTACTAGC
AGCAGCTGCAGATCTGAGACCTTCTTGGCAAACCAGTAACAGTTTGCTGTCCTGTGAAAA
CTCGTTTCTAACGGATTTAACGAACTCCGGATTCAGTTTCGTGAAGGGCAGACCAAAGAA
GAGCCCTGAGAAGTTGTTGTGCACTGTCCTCTTCACTATCGTACCAAGATCGTTGTCTTC
GTTGAAAATGAAGAGAGGGATGTGGTGGCAAGACTTTATATGAGCCCTCTCGAACTGAGT
CTTGTCTCTCACATCCACAACCTTGTAACCTTCCGCTGATATCAACTTCTTTGCTTCCTC
TGCGTTCACGAACTTCACCTCAGCCGCAACTCTCAGACTTCTCCGGCGGATATTATTGTT
ACCAGAGCCGCTC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4C608TF 382 0 0
TGAGACCTTCTTGGCAAACCAGTAACAGTTTGCTGTCCTGTGAAAACTCGTTTCTAACGG
ATTTAACGAACTCCGGATTCAGTTTCGTGAAGGGCAGACCAAAGAAGAGCCCTGAGAAGT
TGTTGTGCACTGTCCTCTTCACTATCGTACCAAGATCGTTGTCTTCGTTGAAAATGAAGA
GAGGGATGTGGTGGCAAGACTTTATATGAGCCCTCTCGAACTGAGTCTTGTCTCTCACAT
CCACAACCTTGTAACCTTCCGCTGATATCAACTTCTTTGCTTCCTCTGCGTTCACGAACT
TCACCTCAGCCGCAACTCTCAGACTTCTCCGGCGGATATTATTGTTACCA*AGCCGCTCT
TTCCGGACCAGCTCGACGCTTT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4BY67TF 711 0 0
TTCTCTGCTTG*TCTGAGAAGAACGTTATGAACAACAAAGCACAGACGAGCACTGTTC*T
AAGACAGCTGAGATCTTGCCTTGAATTGTGATAAGCCCTGCCTTGCCTGCATTCTGCAAC
TCCGTTGAACCAACCGACTCAAATGTCCCTGGTTTAACAGACTGTAACCCTGATGTTACA
CAAGCAATGTTATCGTAACCTGCTTCCTCCAATCTACTAGCAGCAGCTGCAGATCTGAGA
CCTTCTTGGCAAACCAGTAACAGTTTGCTGTCCTGTGAAAACTCGTTTCTAACGGATTTA
ACGAACTCCGGATTCAGTTTCGTGAAGGGCAGACCAAAGAAGAGCCCTGAGAAGTTGTTG
TGCACTGTCCTCTTCACTATCGTACCAAGATCGTTGTCTTCGTTGAAAATGAAGAGAGGG
ATGTGGTGGCAAGACTTTATATGAGCCCTCTCGAACTGAGTCTTGTCTCTCACATCCACA
ACCTTGTAACCTTCCGCTGATATCAACTTCTTTGCTTCCTCTGCGTTCACGAACTTCACC
TCAGCCGCAACTCTCAGACTTCTCCGGCGGATATTATTGTTACCAGAGCCGCTCTTTCCG
GACCAGCTCGACGCTTTCAACCGCCTTGTCCCGAGATCACTGGTGAAACAAAGAGCCGTA
GGGCTAGGGCTTGCGATCCCCGCCATTATTGCAGAAGTCAAGTCTCTCGAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4EP25TF 606 0 0
G
CTGCATTCTGCAACTCCGTTGAACCAACCGACTCAAATGTCCCTGGTTTAACAGACTGTA
ACCCTGATGTTACACAAGCAATGTTATCGTAACCTGCTTCCTCCAATCTACTAGCAGCAG
CTGCAGATCTGAGACCTTCTTGGCAAACCAGTAACAGTTTGCTGTCCTGTGAAAACTCGT
TTCTAACGGATTTAACGAACTCCGGATTCAGTTTCGTGAAGGGCAGACCAAAGAAGAGCC
CTGAGAAGTTGTTGTGCACTGTCCTCTTCACTATCGTACCAAGATCGTTGTCTTCGTTGA
AAATGAAGAGAGGGATGTGGTGGCAAGACTTTATATGAGCCCTCTCGAACTGAGTCTTGT
CTCTCACATCCACAACCTTGTAACCTTCCGCTGATATCAACTTCTTTGCTTCCTCTGCGT
TCACGAACTTCACCTCAGCCGCAACTCTCAGACTTCTCCGGCGGATATTATTGTTACCAG
AGCCGCTCTTTCCGGACCAGCTCGACGCTTTCAACCGCCTTGTCCCGAGATCACTGGTGA
AACAAAGAGCCGTAGGGCTAGGGCTTGCGATCCCCGCCATTATTGCAGAAGTCAAGTCTC
ACGAT

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 6

CO CL587Contig1 1169 6 6 U
GAAGAACTTCAGATTTTCTAACGGATGGGACAATAACCAGATGTTTGATCGTTGAATACA
CAGACTTTTTCACAAATAAAAGTCTGGACAACTTTTACAAAATCAAACGTTTTACTTGGC
TTCTCATACACGTGTACAAAGCTCAAACTAGTTTCAGATCAATGATCTGCGACTATCTAC
TAAAGTGTCACGTACCGTCAAGGCTCTATATCACTTTTAGCTCTCTCAGCCATTGGGTGT
GGAGTGGACAAGGATCAGGTTTCCCTTCTGCAATCGCCTTCTGTGAGAGCGAATAAAACC
AACCATTCCTCCATTTAAATTCTTTAACAGCGGTTGGGAAATGAGCAACAGCGCGGGAAT
AAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTGTCTTCAAAGGTTAGTCCTTTTTCTGCAGCAGCAG
CAGCTGCTGCGAGTTCTTGGATGAGTCTCGCCACTTCGTCTCTGTATTCTTTCTCCACCA
TGCCAACACTAGCACCCGGATGACGAGCTCCAACAAGCATAAACGCACAAATCCATATGA
GTTTCTCCAGCATTTGCTTCTGAAAAGCTTCTTTGTCAAGTACCTTGCAAGAGAGGCCAC
CAGATTGCAGTCTTGCAGCTACATCCGAAGCCCATTTGCCATAAGCAGCGGTTAGACCTT
CAGGGTTAGTGTCGGTTATCCCATCCACAGGAGGCTCACCGAGCTTTGACACAGCGAAAT
AGGCCAACACTTGGTCTGCATCACCCAAACCTTTGCTCTCGAACCACGGCTCCATCATTC
CATTTTGGAAAAACACCAAATCTTTCCATCTAGACTGAGGAGTAGCTTCAAGAACAGCAT
CGAGATCATCATTTCTAGTACAAACCAATATAGGTCCTTCGAAATCAACCGGGACTGGTT
CTCCTCTCTTCACCAATACATCATCGCCACTACCCATTTCCTGCAACGCCCTTCCGACTC
TTCCCCCACCCACGATCACAGCAGGAGCCACCTTTTTAGCAGTGGTGGCCATAGCAGCCA
TTGGTACGGCGAGTCTCGCGCTTGGAGCTGAGAGTTTAAGAGATTTAGAAGGAGGGAGAA
GAGAGAAACGAGTCGAAGAAACAGAGGAGGTGAGAGCAAACAGAGTAGTGCTGGCTTTAG
CCATTGACGATGATAATGGGCTTCGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ25JQ U 27
AF RR4FD50JQ U 1
AF RR4GG72JQ U 27
AF RR4GG72TF C 152
AF RR4FQ25TF C 282
AF RR4CV57TF C 461
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BS 720 904 RR4GG72TF
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GCTTCTTTGTCAAGTACCTTGCAAGAGAGGCCA

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TTCTCATACACGTGTACAAAGCTCAAACTAGTTTCAGATCAATGATCTGCGACTATCTAC
TAAAGTGTCACGTACCGTCAAGGCTCTATATCACTTTTAGCTCTCTCAGCCATTGGGTGT
GGAGTGGACAAGGATCAGGTTTCCCTTCTGCAATCGCCTTCTGTGAGAGCGAATAAAACC
AACCATTCCTCCATTTAAATTCTTTAACAGCGGTTGGGAAATGAGCAACAGCGCGGGAAT
AAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTGTCTTCAAAGGTTAGTCCTTTTTCTGCAGCAGCAG
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ACTAGTTTCAGATCAATGATCTGCGACTATCTACTAAAGTGTCACGTACCGTCAAGGCTC
TATATCACTTTTAGCTCTCTCAGCCATTGGGTGTGGAGTGGACAAGGATCAGGTTTCCCT
TCTGCAATCGCCTTCTGTGAGAGCGAATAAAACCAACCATTCCTCCATTTAAATTCTTTA
ACAGCGGTTGGGAAATGAGCAACAGCGCGGGAATAAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTG
TCTTCAAAGGTTAGTCCTTTTTCTGCAGCAGCAGCAGCTGCTGCGAGTTCTTGGATGAGT
CTCGCCACTTCGTCTCTGTATTCTTTCTCCACCATGCCAACACTAGCACCCGGATGACGA
GCTCCAACAAGCATAAACGCACAAATCCATATGAGTTTCTCCAGCATTTGCTTCTGAAAA
GCTTCTTTGTCAAGTACCTTGCAAGAGAGGCCACCAGATTGCAGTCTTGCAGCTACATCC
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ACAGGAGGCTCACCGAGCTTTGACACAGCGAAA

QA 1 693 1 693
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CACTTCGTCTCTGTATTCTTTCTCCACCATGCCAACACTAGCACCCGGATGACGAGCTCC
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CCATTTGCCATAAGCAGCGGTTAGACCTTCAGGGTTAGTGTCGGTTATCCCATCCACAGG
AGGCTCACCGAGCTTTGACACAGCGAAATAGGCCAACACTTGGTCTGCATCACCCAAACC
TTTGCTCTCGAACCACGGCTCCATCATTCCATTTTGGAAAAACACCAAATCTTTCCATCT
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AGGTCCTTCGAAATCAACCGGGACTGGTTCTCC
C

QA 1 753 1 753
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TGAGCAACAGCGCGGGAATAAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTGTCTTCAAAGGTTAGT
CCTTTTTCTGCAGCAGCAGCAGCTGCTGCGAGTTCTTGGATGAGTCTCGCCACTTCGTCT
CTGTATTCTTTCTCCACCATGCCAACACTAGCACCCGGATGACGAGCTCCAACAAGCATA
AACGCACAAATCCATATGAGTTTCTCCAGCATTTGCTTCTGAAAAGCTTCTTTGTCAAGT
ACCTTGCAAGAGAGGCCACCAGATTGCAGTCTTGCAGCTACATCCGAAGCCCATTTGCCA
TAAGCAGCGGTTAGACCTTCAGGGTTAGTGTCGGTTATCCCATCCACAGGAGGCTCACCG
AGCTTTGACACAGCGAAATAGGCCAACACTTGGTCTGCATCACCCAAACCTTTGCTCTCG
AACCACGGCTCCATCATTCCATTTTGGAAAAACACCAAATCTTTCCATCTAGACTGAGGA
GTAGCTTCAAGAACAGCATCGAGATCATCATTTCTAGTACAAACCAATATAGGTCCTTCG
AAATCAACCGGGACTGGTTCTCC
C

QA 1 623 1 623
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CTCTGTA
TCTTTCTCCACCATGCCCACACTAGCACCTGGATGACGAGCTCCAACAAGCATAAAGGCA
CAGATCCAAATGAGTTTCTCCAGCATTTGCTTCTGAAAAGCTTCTTTGTCAAGCACCTTG
CAAGAGAGGCCACCAGATTGCAGTCTTGCAGCTACATCCGAAGCCCATTTGCCATAAGCA
GCAGTTAAACCTTCTGGGTTAGTGTCAGTTATCCCATCCACAGGAGGCTCACCGAGCTTT
GACACAGCAAAATAAGCCAACACTTGGTCTGCATCACCCAAACCTTTGTTCTCGAACCAC
GGCTCCATCATTCCATTTTGGAAAAACACCAAATCTTTCCATCTAGACTGAGGAGTAGCT
TCAAGAACAGCATCAAGATCATCATTTCTAGTACAAACCAATATAGGTCCTTCGAAATCA
ACCGGGACTGGTTCTCCTCTCTTCACCAATACATCATCGCCACTACCCATTTCCTGCAAC
GCCCTTCCGACTCTTCCCCCACCCACGATCACAGCAGGAGCCACCTTTTTAGCAGTGGTG
GCCATAGCAGCCATTGGTACGGCGAGTCTCGCGCTTGGAGCTGAGAGTTTAAGAGATTTA
GAAGGAGGGAGAAGAGAGAAACGAGTCGAAGAAACAGAGGAGGTGAGAGCAAACAGAGTA
GTGCTGGCTTTAGCCATTGACGATGATAATGGGCTTCGACCC

QA 8 709 8 709
DS 



AS 1 9

CO CL588Contig1 512 9 6 U
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CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
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TTTTTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
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TAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGTAT
ACAAACCGTACGATAATGGATTTTACTGGATT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4F084JQ C 105
AF RR4G874TF U 35
AF RR4F084TF U 105
AF RR4G629TF U 1
AF RR4G874JQ C 1
AF RR4D493JQ C 1
AF RR4H357JQ C 1
AF RR4H357TF U 1
AF RR4D493TF U 1
BS 1 34 RR4G629TF
BS 35 104 RR4G874TF
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BS 305 456 RR4F084TF
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RD RR4F084JQ 315 0 0
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CAGCACGATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACAT
AGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAAT
ACCATTTCTTTCTTTATTTCTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTC
TTGTTGAATAAATATGTTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAA
TTGCCGAAGGGCAAT

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR4G874TF 364 0 0
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AGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAGGATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAG
AGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTC
AACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACC
ACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTATTTTTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTC
CTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATGTTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTC
CAGA

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR4F084TF 352 0 0
GACCGGTCTATGGAAGGATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGAT
CAGCACGATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACAT
AGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAAT
ACCATTTCTTTCTTTATTTCTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTC
TTGTTGAATAAATATGTTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAA
TTGCCGAAGGGCAATTTAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCT

QA 1 352 1 352
DS 

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GGGCTCTAGAACATTTGGTGGAGGAAGAAGGCGAAGATGGGAAAGCAGCCGGTGAAATTG
AAGGCGGTAGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCTGTCTGTGGAAG
GATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTC
CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
GAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGGATACCATTTCTTTCTTTA
TTTTTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
TTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGGGCAATT
TAGTTTGATGAATAAAGTTTCTG

QA 1 443 1 443
DS 

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GGGCTCTAGAACATTTGGTGGAGGAAGAAGGCGAAGATGGGAAAGCAGCCGGTGAAATTG
AAGGCGGTAGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAG
GATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTC
CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
GAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTA
TTTTTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
TTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGGGCAATT
TAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTT

QA 1 468 1 468
DS 

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GGGCTCTAGAACATTTGGTGGAGGAAGAAGGCGAAGATGGGAAAGCAGCCGGTGAAATTG
AAGGCGGTAGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAG
GATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTC
CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
GAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTA
TTTTTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
TTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGGGCAATT
TAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGTAT
ACAAACCGTACGATAATGGATTTTACTGGATT

QA 1 512 1 512
DS 

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GGGCTCTAGAACATTTGGTGGAGGAAGAAGGCGAAGATGGGAAAGCAGCCGGTGAAATTG
AAGGCGGTAGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAG
GATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTC
CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
GAGCACAGGCTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTA
TTTTTCAGTTCCCAAAA*CACTTTTGAATGTTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
TTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGGGCAATT
TAGTTTGATGAATAAAGTTTTTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGTAT
ACAAACCGTACGATAATGGATTTTACTGGATT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4H357TF 512 0 0
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AAGGCGGTAGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAG
GATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTC
CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
GAGCACAGGCTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTA
TTTTTCAGTTCCCAAAA*CACTTTTGAATGTTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
TTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGGGCAATT
TAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGTAT
ACAAACCGTACGATAATGGATTTTACTGGATT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4D493TF 512 0 0
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AAGGCGGTAGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAG
GATCTACCTGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTC
CTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTG
GAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTA
TTTTTCAGTTTCCAAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATG
TTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGGGCAATT
TAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGTAT
ACAAACCGTACGATAATGGATTTTACTGGATT

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 9

CO CL589Contig1 1343 9 18 U
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CGTTTGATGAGTTGATGCTGATGAAGAGAGGAGGACAAGTCATCTACGCAGGTCCTTTGG
GTAGAAACTCTCACAAGGTGGTTGAGTACT*CGAAGCCTTTCCCGGAGTGCCCAAGATTC
CTGACAAGTATAATCCAGCCACGTGGATGCTTGAAGCCAGCTCACTTGCTGCTGAGTTAA
AGCTTGGAGTTGACTTTGCTGAGTTGTACAAGAATTCCGCCTTACACCAGAGAAACAAAG
CATTGGTGAAAGAATTGAGCGTACCACCAGAAGGGGCCTCTGATCTCTACTTTGCTACAC
AATTCTCGCAGAACACATGGGGACAGTTCAAATCATGTCTATGGAAGCAGTGGTGGACTT
ACTGGAGATCCCCTGACTACAACCTTGTCCGCTTCATCTTCACATTGGCAACGTCACTCC
TCATTGGTACCATCTTCTGGCAAATCGGAGGTAACCGGTCCAACGCAGCGGACCTGACGA
TGGTGATAGGAGCTTTGTATGCTGCGGTTATCTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGG
TACAGCCGATGGTGGCAGTGGAGAGGACTGTGTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGT
ACTCAGCTATGCCATACGCCATCTCCCAAGTCACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTC
AGACCACTTACTACTCTCTGATCGTCTATGCCATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCC
AAGTTCTTCTGGTTCCTTTTCGTAAGCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTACGGT
ATGATGACTGTTTCCCTCACGCCGAACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCCTTT
TACGGCATTTTCAACCTCTTCTCGGGCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAGTGG
TGGATATGGTACTACTGGATCTGCCCTGTCGCATGGACCGTCTATGGATTGATTGTCTCG
CAGTATGGTGACGTGGAGACACCTATCACTGTCCTCGGAGGACCTGAGGGACTCACCGTT
AAGCAATACATTAAGGACAATTACGGGTTCGAGTCTGACTTTATGGGACCAGTAGCTGCC
GTTTTAGTTGCATTCACCGTCTTTTTT*GCCTTCATCTTTGCCTTCTGCATAAGAACTCT
CAACTTCCAGACCAGATAAAACCCTTTCAAAATCTCGTTCCTTCTTTCTTTCATTTTCTC
TGTATCCTTGTGATTGATATATGCATTTGCTCTCTTTTCTTACTATGTATTCTAGAGTCA
TAAGGATTTGTTTTTCGTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU61TF U 1
AF RR4B942TF U 31
AF RR4BH19TF U 31
AF RR4F186TF U 266
AF RR4CF26TF U 439
AF RR4AD21TF U 439
AF RR4AD21JQ C 538
AF RR4F186JQ C 491
AF RR4DU61JQ C 738
BS 1 150 RR4DU61TF
BS 151 151 RR4B942TF
BS 152 319 RR4DU61TF
BS 320 320 RR4B942TF
BS 321 469 RR4DU61TF
BS 470 761 RR4B942TF
BS 762 762 RR4BH19TF
BS 763 817 RR4B942TF
BS 818 818 RR4F186TF
BS 819 834 RR4B942TF
BS 835 896 RR4BH19TF
BS 897 898 RR4F186TF
BS 899 910 RR4BH19TF
BS 911 911 RR4F186TF
BS 912 938 RR4BH19TF
BS 939 996 RR4F186TF
BS 997 1251 RR4AD21TF
BS 1252 1343 RR4F186JQ

RD RR4DU61TF 472 0 0
TGGACACAGGAAGAACCGTGGTCTGCACCATCCACCAGCCGAGCATTGACATCTTTGAAG
CGTTTGATGAGTTGATGCTGATGAAGAGAGGAGGACAAGTCATCTACGCAGGTCCTTTGG
GTAGAAACTCTCACAAGGTGGTTGAGTACTTCGAAGCCTTTCCCGGAGTGCCCAAGATTC
CTGACAAGTATAATCCAGCCACGTGGATGCTTGAAGCCAGCTCACTTGCTGCTGAGTTAA
AGCTTGGAGTTGACTTTGCTGAGTTGTACAAGAATTCCGCCTTACACCAGAGAAACAAAG
CATTGGTGAAAGAATTGAGTGTACCACCAGAAGGGGCCTCTGATCTCTACTTTGCTACAC
AATTCTCGCAGAACACATGGGGACAGTTCAAATCATGTCTATGGAAGCAGTGGTGGACTT
ACTGGAGATCCCCTGACTACAACCTTGTCCGCTTCATCTTCACATTGGC
GTT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR4B942TF 804 0 0
G
CCACCAGCCGAGCATTGACATCTTTGAAGCGTTTGATGAGTTGATGCTGATGAAGAGAGG
AGGACAAGTCATCTACGCAGGTCCTTTGGGTAGAAACTCTCACAAGGTGGTTGAGTACT*
CGAAGCCTTTCCCGGAGTGCCCAAGATTCCTGACAAGTATAATCCAGCCACGTGGATGCT
TGAAGCCAGCTCACTTGCTGCTGAGTTAAAGCTTGGAGTTGACTTTGCTGAGTTGTACAA
GAATTTCGCCTTACACCAGAGAAACAAAGCATTGGTGAAAGAATTGAGCGTACCACCAGA
AGGGGCCTCTGATCTCTACTTTGCTACACAATTCTCGCAGAACACATGGGGACAGTTCAA
ATCATGTCTATGGAATCAGTGGTGGACTTACTGGAGATCCCCTGACTACAACCTTGTCCG
CTTCATCTTCACATTGGCAACGTCACTCCTCATTGGTACCATCTTCTGGCAAATCGGAGG
TAACCGGTCCAACGCAGCGGACCTGACGATGGTGATAGGAGCTTTGTATGCTGCGGTTAT
CTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGGTACAGCCGATGGTGGCAGTGGAGAGGACTGT
GTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGTACTCAGCTATGCCATACGCCATCTCCCAAGT
CACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTCAGACCACTTACTACTCTCTGATCGTCTATGC
CATGGTTGGGGTTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCTGGTTCCTTTTCGTAAGCTACT
TCTCTTCCCTTTATTGGACCTAT

QA 2 804 2 804
DS 

RD RR4BH19TF 908 0 0
G
CCACCAGCCGAGCATTGACATCTTTGAAGCGTTTGATGAGTTGATGCTGATGAAGAGAGG
AGGACAAGTCATCTACGCAGGTCCTTTGGGTAGAAACTCTCACAAGGTGGTTGAGTACT*
CGAAGCCTTTCCCGGAGTGCCCAAGATTCCTGACAAGTATAATCCAGCCACGTGGATGCT
TGAAGCCAGCTCACTTGCTGCTGAGTTAAAGCTTGGAGTTGACTTTGCTGAGTTGTACAA
GAATTTCGCCTTACACCAGAGAAACAAAGCATTGGTGAAAGAATTGAGCGTACCACCAGA
AGGGGCCTCTGATCTCTACTTTGCTACACAATTCTCGCAGAACACATGGGGACAGTTCAA
ATCATGTCTATGGAATCAGTGGTGGACTTACTGGAGATCCCCTGACTACAACCTTGTCCG
CTTCATCTTCACATTGGCAACGTCACTCCTCATTGGTACCATCTTCTGGCAAATCGGAGG
TAACCGGTCCAACGCAGCGGACCTGACGATGGTGATAGGAGCTTTGTATGCTGCGGTTAT
CTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGGTACAGCCGATGGTGGCAGTGGAGAGGACTGT
GTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGTACTCAGCTATGCCATACGCCATCTCCCAAGT
CACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTCAGACCACTTACTACTCTCTGATCGTCTATGC
CATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCTGGTTCCTTTTCGTAAGCTACT
TCTCTTCCCTTTATTGGACCTATTACGGTATGATGACTGTTTCCCTCACGCCGAACCAGC
AAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGC**TTTACGGCATTT*CAACCTCTTCTCGGGCTTCT
TTATCCC

QA 2 908 2 908
DS 

RD RR4F186TF 731 0 0
GTACAAGAATTCCGCCTTACACCAGAGAAACAAAGCATTGGTGAAAGAATTGAGTGTACC
ACCAGAAGGGGCCTCTGATCTCTACTTTGCTACACAATTCTCGCAGAACACATGGGGACA
GTTCAAATCATGTCTATGGAAGCAGTGGTGGACTTACTGGAGATCCCCTGACTACAACCT
TGTCCGCTTCATCTTCACATTGGCAACGTCACTCCTCATTGGTACCATCTTCTGGCAAAT
CGGAGGTAACCGGTCCAACGCAGCGGACCTGACGATGGTGATAGGAGCTTTGTATGCTGC
GGTTATCTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGGTACAGCCGATGGTGGCAGTGGAGAG
GACTGTGTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGTACTCAGCTATGCCATACGCCATCTC
CCAAGTCACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTCAGACCACTTACTACTCTCTGATCGT
CTATGCCATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCTGGTTCCTTTTCGTAA
GCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTACGGTATGATGACTGTTTCCCTCACGCCGA
ACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCCTTTTACGGCATTTTCAACCTCTTCTCGG
GCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAGTGGTGGATATGGTACTACTGGATCTGCC
CTGTCGCATGG

QA 1 731 1 731
DS 

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G
CAACCTTGTCCGCTTCATCTTCACATTGGCAACGTCACTCCTCATTGGTACCATCTTCTG
GTAAATCGGAGGTAACCGGTCCAACGCAGCGGACCTGACGATGGTGATAGGAGCTTTGTA
TGCTGCGGTTATCTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGTTACAGCCGATGGTGGCAGT
GGAGAGGACTGTGTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGTACTCAGCTATGCCATACGC
CATCTCCCAAGTCACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTCAGACCACTTACTACTCTCT
GATCGTCTATGCCATGGTCGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCTGGTTCCTTT
TCGTAAGCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTACGGTATGATGACTGTTTCCCTCA
CGCCGAACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCCTTTTACGGCATTTTCAACCTCT
TCTCGGGCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAGTGGTGGATATGGTACTACTGGA
T*TGCCCTGTCGCATGGACCGTCTATGGATTGATTGTCTCGCAGTATGGTGACGTGGAGA
CACCTATCACTGTCCTCGGAGGACCTGAGGGACTCACCGTTAAGCAATACATTAAG
ACAAT

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR4AD21TF 813 0 0
G
CAACCTTGTCCGCTTCATCTTCACATTGGCAACGTCACTCCTCATTGGTACCATCTTCCG
GCAAATCGGAGGTAACCGGTCCAACGCAGCGGACCTGACGATGGTGATAGGAGCTTTGTA
TGCTGCGGTTATCTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGTTACAGCCGATGGTGGCAGT
GGAGAGGACTGTGTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGTACTCAGCTATGCCATACGC
CATCTCCCAAGTCACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTCAGACCACTTACTACTCTCT
GATCGTCTATGCCATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCTGGTTCCTTT
TCGTAAGCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTACGGTATGATGACTGTTTCCCTCA
CGCCGAACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCCTTTTACGGCATTTTCAACCTCT
TCTCGGGCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAGTGGTGGATATGGTACTACTGAA
TCTGCCCTGTCGCATGGACCGTCTATGGATTGATTGTCTCGCAGTATGGTGACGTGGAGA
CACCTATCACTGTCCTCGGAGGACCTGAGGGACTCACCGTTAAGCAATACATTAAGGACA
ATTACGGGTTCGAGTCTGACTTTATGGGACCAGTAGCTGCCGTTTTAGTTGCATTCACCG
TCTTTTTT*GCCTTCATCTTTGCCTTCTGCATAAGAACTCTCAACTTCCAGACCAGATAA
AACCCTTTCAAAATCTCGTTCCTTCTTTCTTT

QA 2 813 2 813
DS 

RD RR4AD21JQ 750 0 0
CGATGGTGATAGGAGCTTTGTATGCTGCGGTTATCTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCA
CGTTACAGCCGATGGTGGCAGTGGAGAGGACTGTGTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAA
TGTACTCAGCTATGCCATACGCCATCTCCCAAGTCACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGA
TTCAGACCACTTACTACTCTCTGATCGTCTATGCCATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCT
GCCAAGTTCTTCTGGTTCCTTTTCGTAAGCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTAC
GGTATGATGACTGTTTCCCTCACGCCGAACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCC
TTTTACGGCATTTTCAACCTCTTCTCGGGCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAG
TGGTGGATATGGTACTACTGAATCTGCCCTGTCGCATGGACCGTCTATGGATTGATTGTC
TCGCAGTATGGTGACGTGGAGACACCTATCACTGTCCTCGGAGGACCTGAGGGACTCACC
GTTAAGCAATACATTAAGGACAATTACGGGTTCGAGTCTGACTTTATGGGACCAGTAGCT
GCCGTTTTAGTTGCATTCACCGTCTTTTTT*GCCTTCATCTTTGCCTTCTGCATAAGAAC
TCTCAACTTCCAGACCAGATAAAACCCTTTCAAAATCTCGTTCCTTCTTTCTTTCATTTT
CTCTGTATCCTTGTGATTGATATATGCATT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4F186JQ 853 0 0
CATCTTCTGGCAAATCGGAGGTAACCGGTCCAACGCAGCGGAC*TGACGATGGTGATAGG
AGCTTTGTATGCTGCGGTTATCTTTGTGGGAATCAACAATTGTTCCACGGTACAGCCGAT
GGTGGCAGTGGAGAGGACTGTGTTCTACAGGGAAAGAGCAGCAGGAATGTACTCAGCTAT
GCCATACGCCATCTCCCAAGTCACCTGTGAGCTTCCGTATGTGCTGATTCAGACCACTTA
CTACTCTCTGATCGTCTATGCCATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCT
GGTTCCTTTTCGTAAGCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTACGGTATGATGACTG
TTTCCCTCACGCCGAACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCCTTTTACGGCATTT
TCAACCTCTTCTCGGGCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAGTGGTGGATATGGT
ACTACTGGATCTGCCCTGTCGCATGGACCGTCTATGGATTGATTGTCTCGCAGTATGGTG
ACGTGGAGACACCTATCACTGTCCTCGGAGGACCTGAGGGACTCACCGTTAAGCAATACA
TTAAGGACAATTACGGGTTCGAGTCTGACTTTATGGGACCAGTAGCTGCCGTTTTAGTTG
CATTCACCGTCTTTTTT*GCCTTCATCTTTGCCTTCTGCATAAGAACTCTCAACTTCCAG
ACCAGATAAAACCCTTTCAAAATCTCGTTCCTTCTTTCTTTCATTTTCTCTGTATCCTTG
TGATTGATATATGCATTTGCTCTCTTTTCTTACTATGTATTCTAGAGTCATAAGGATTTG
TTTTTCGTTGACG

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR4DU61JQ 599 0 0
CTGATCGTCTATGCCATGGTTGGG*TTCGAGTGGACAGCTGCCAAGTTCTTCTGGTTCCT
TTTCGTAAGCTACTTCTCTTTCCTTTATTGGACCTATTACGGTATGATGACTGTTTCCCT
CACGCCGAACCAGCAAGTCGCTTCCATCTTCGCTTCGGCCTTTTACGGCATTTTCAACCT
CTTCTCGGGCTTCTTTATCCCACGACCAAAGATCCCCAAGTGGTGGATATGGTACTACTG
GGTCTGCCCTGTCGCATGGACCGTCTATGGATTGATTGTCTCGCAGTATGGTGACGTGGA
GACACCTATCACTGTCCTCGGAGGACCTGAGGGACTCACCGTTAAGCAATACATTAAGGA
CAATTACGGGTTCGAGTCTGACTTTATGGGACCAGTAGCTGCCGTTTTAGTTGCATTCAC
CGTCTTTTTTTGCCTTCATCTTTGCCTTCTGCATAAGAACTCTCAACTTCCAGACCAGAT
AAAACCCTTTCAAAATCTCGTTCCTTCTTTCTTTCATTTTCTCTGTATCCTTGTGATTGA
TATATGCATTTGCTCTCTTTTCTTACTATGTATTCTAGAGTCGTAAGGATTTGTTTTTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 9

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GGGACCAAACAGAAAGAAAAAAAAAACATGGCAACTCAAGCGTCCGGACTCTTTAGCTCC
GCCATAACAACCACAGCAACCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACATCCGCC
CGTCCAAGATCCCTCTCCCTCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGATTCCGCC
GCCGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTA
GACCCAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGAAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCC
CAGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATG
CCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAA
GAACAGTGCTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTT
TACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCG
GAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAAT
GTCAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTG*AA
AACTTAAAATGTGAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGTTTTAA
TTTTTAATGGGGTTCATCTGC


BQ
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 15 15 20 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ83TF U 1
AF RR4EG11TF U -6
AF RR4DU24TF U 1
AF RR4EA77TF U 1
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AF RR4BJ83JQ C 1
AF RR4EG11JQ C 116
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TACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCG
GAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4EG11TF 665 0 0
GGGGAAAAC
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CATAACAACCACAGCAACCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACATCCGCCCG
TCCAAGATCCCTCTCC*TCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGATTCCGCCGC
CGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCT*CTAGA
CCCAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGAAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCCCA
GGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATGCC
GACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAAGA
ACAGTGCTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTTTA
CAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCGGA
GAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATGT
CAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGA

QA 10 665 10 665
DS 

RD RR4DU24TF 691 0 0
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GCCGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTA
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CCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAA
GAACAGTGCTTGGCGTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTT
TACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCG
GAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAAT
GTTAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGGAA
AATTTAAAATGTGA
TAAAAACAAAACAAAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4EA77TF 676 0 0
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GCCATAACAACCACAGCAACCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAAC***CGCC
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GCCGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTA
GACCCAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGAAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCC
CAGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATG
CCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAA
GAACAGTGCTTGGCGTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTT
TACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCG
GAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAAT
GTTAGTCTCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGGAA
AATTTAAAATGTGATA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4G922JQ 698 0 0
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GCCATAACAACCACAGCAACCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACATCCGCC
CGTCCAAGATCCCTCTCCCTCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGATTCCGCC
GCCGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTA
GACCCAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGAAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCC
CAGGTGGAAGAGTTTTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATG
CCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAA
GAACAGTGCTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTT
TACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCG
GAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAAT
GTCAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTG*AA
AACTTAAAATGTGAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4BJ83JQ 739 0 0
GGGACCAAACAGAAAGAAAAAAAAAACATGGCAACTCAAGCGTCCGGACTCTTTAGCTCC
GCCATAACAACCACAGCAACCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTCCACAACATCCGCC
CGTCCAAGATCCCTCTCCCTCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGATTCCGCC
GCCGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTA
GACCCAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGAAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCC
CAGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATG
CCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAGGCTGGCGAGGAAA
GAACAGTGCTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACGAGATTAACTACCAGTTT
TACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCG
GAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAAT
GTCAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTG*AA
AACTTAAAATGTGAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGATTATGTTTGGTTTTAA
TTTTTAATGGGGTTC
ATCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4EG11JQ 626 0 0
CCGCCCGTCCAAGATCCCTCTCC*TCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGATT
CCGCCGCCGCCGCCCCAGCCCCCGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTC
T*CTAGACCCAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGAAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCA
AAGCCCAGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTG
AGATGCCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGA
GGAAAGAACAGTGCTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACC
AGTTTTACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTT
ACCCGGAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGA
AAAATGTCAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTG
TG*AAAACTTAAAATGTGAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGT
TTTAATTTTTAATGGGGTTCATCTGC

QA 1 626 1 626
DS 



CO CL590Contig2 709 2 3 U
AATACGAGAATAATTATTCAAATGGAACCCCATTAAAAATTAACATCAAACATAGTCATC
TCCACATGATTTTTGTTTTGTTTTTATCACATTTTAAATTTTCCACAACTTACAAATCAT
AACTTTGTTTCCCAGTAAACTTAACTTCAATGGGACTAACATTTTTCCCAATAAATCTCA
TATTCTGACCAACACCTTCTCTTCCCGGATTCGCCTTCTCCGGGTAAACTCCATCTTTAG
GATGAAGATACTGAACCTCACCATTAGGGAACACCCTGTAAAACTGGTAGTTAATCTTGT
ACTTGGACCTAAGCCTTGTCCCCAACGCCAAGCACTGTTCTTTCCTCGCCAGCTTCAGCA
AGTTCGGACCTTCCCTCATGATCGCCGCACCTCCCGTCGGCATCTCAAAGATCTGCTCTT
TCGGCGAGTTCCATGTAATAACGTAAAACTCTTCCACCTGGGCTTTGCGGAGAAGCCCAC
CGGTGCTTCCCGCGAAGATCGGTGACGGTGTGTTTGGGTCTAGCTGAGGCGGCGTGAATC
CCACCGGAGCTTCTTTCACGGCGGGGGCTGGGGCGGCGGCGGCGGAATATGTTTTCTCGG
CGCGGATTGCGGTTTTGGTGAGGGAGAGGGATCTTGGACGGGCGGTTGTGAAAAAGTGGA
GTTTTTTCACACCGGAGGTTGCTGTGGTTGTTATGGCGGAGCTAAAGAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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ATCATTCCTTTTTGGAAAGGGTAATATACATGACATTGATAGTTTATACGTCCTCTGGCC
ACCTCCTTCTTCATCATCTCCCGGCTCTTCATCGAGTACTTCAACTTCTTTTGTTTCTCT
ATCGAAGTGAATCACTTTCACCACAAACCATTCATCCTTCTCGGCATCATCAGCTGTGAC
TCTCGCAGCAACCTGTTCACCCCTTAGACTGGCATAAGCCTCGATTTGGTTTCTCACG

QA 1 778 1 778
DS 

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AAACGTAAATTCCACAAGAACAAAAGCGGGAGTTTCTTTTGTGTTCAACATTGTGTCTCG
ACATGGTATAAATACCCCCCCACACACATATATATACATTACCACTCATCTATTACATTA
AACTAGAGTATCTTTTCCAC*GAACTGAATAGAAAAAAAA*CAACAACTTACCTTTTTAT
TCTTCCAAGAGATATCCTTTCAACAACACACACCCAAGGCAACAAACCCTTTAACACTTG
CTTTGGCCTC*AAGTAAACAAACATGAAGAGTCTCTCATTTCAGTGTGTACCCATCTGAA
A**TCACTGGCGATGGCCTTCTGGTAAAGCTACCACTTTGTGGAAAGGCACTGTTCTTTG
TGGCAATGCTCCGTCTTCTTCATCGTCATCGAATTCAAGTAAATACTCGTCAGACTTCCA
CTTTCGTGGGGTACTTATTACAGTCGCCTTGTAAAGTGCCGTGGTTCCTGGATATA**GC
TAAGACATGTTTCCCTGGTTGAAACTCTTGTGTGGTTGAAGGATCATTCCTTTTTGGAAA
GGGTAATATACATGACATTGATAGTTTATACGTCCTCTGGCCACCTCCTTCTTCATAATC
TCCTGGCTCTTCATCGAGTACTTCAACTTCTTTTGTTTCTCTATCGAAGTGAATCACTTT
CACCACAAACCATTCATCCTTCTCGGCATCATCAGCTGTGACTCTCGCAGCAACCTGTTC
ACCCCTTAGACTGGCATAAGCCTCGATTTGGTTTCTCACGGAAG*AGAGACTCTTTGTA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4BJ28JQ 817 0 0
CTTCACACGAACAAAAAC
GGAGTTTCTTTTGTGTTCAACATTGTGTCTCGACATGATATAAATACCCCACC*CACACA
TATATATACATTACCACTCATCTATTACATTAAACTAGAGTATCTTTCCCACCGAACTGA
ATAGAAAAAAA**CAACAACTTACCTTTTTATTCTTCCAAGAGATATCCTTTCAACAACA
CACACC*AAGGCAACAAACC*TTTAACACTTGCTTTGGCCTCCAAGTAATCAAACATGAA
GAGTTTCTCATTTCAGTGTGTACCCATCTGAAAAATCACTGGCGATGGCCTTCTGGTAAA
GCTACCACTTTGTGGAAAGGCACTGTTCTTTGTGGCAATGCTCCGTCTTCTTCGTCGTCG
TCGAATTCCAGTAAATACTCGTCAGACTTCCTCTTTCGTGGGGTACTTATTACAGTCGCC
TTGTAAAGCGCCGTGGTTCCTGGATACACAGCTAAAACGTGTTTCCCTGGTTGAAACTCT
TGTGTGGTTGAAGGATCATTCCTTTTGGGAAAGGGTAATATACATGACATTGATAGTTTA
TACGTCCTCTGGCCACCTCCTTCTTCATCATCTCCTGGCTCTTCATCGAGTACTTCAACT
TCTTTTGTATCTCTATCGAAGTGAATCACTTTCACCACAAACCATTCATCCTTCTCGGCG
TCATCAGCTGTGACTCTCGCAGCAACCTGTTCACCCCTTAGACTGGCATAAGCCTCGATT
TGGTTTCTCACGGAAGGAGAAACTCTTTGTACATCTGACTCTACTTTCATTCTCTTCCTC
TTCTGATCGTTGCCCTCTA

QA 19 817 19 817
DS 

RD RR4BJ28TF 686 0 0
TAAAGCGCCGTGGTTCCTGGATACACAGCTAAAACGTGTTTCCCTGGTTGAAACTCTTGT
GTGGTTGAAGGATCATTCCTTTTGGGAAAGGGTAATATACATGACATTGATAGTTTATAC
GTCCTCTGGCCACCTCCTTCTTCATCATCTCCTGGCTCTTCATCGAGTACTTCAACTTCT
TTTGTATCTCTATCGAAGTGAATCACTTTCACCACAAACCATTCATCCTTCTCGGCGTCA
TCAGCTGTGACTCTCGCAGCAACCTGTTCACCCCTTAGACTGGCATAAGCCTCGATTTGG
TTTCTCACGGAAGGAGAAACTCTTTGTACATCTGACTCTACTTTCATTCTCTTCCTCTTC
TGATCGTTGCCCTCTAGTTTTCTGCGTTGTTGCCCCGTTGGTCCAGATGGAAGCAGAGAA
TCCAACTGGGTGAGCAGAATGGTTGAAACAGTTACTTCACTTTCAGAAAGCTCTTTTGCT
TGAATGTACAAATTTTTAAGCTTTGACAATGAAGTATCACCAGGCTTCTCAACTACCTCA
GGCGTAGCTTGAAGCTTCTTATGCATCTTATTGATCTCGACGAGGACTTCCTCTTGTTCC
TTCCTTAACCGATCAAGCTCCTTCGTGTTCTCCAGAATTCCGGCAATGTCCGGCGATGAC
GACATCGTTATCTCAGGATGCTGC
CC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4CQ02TF 690 0 0
GGTCCTGGATAT
AGCTAAGACATGTTTCCCTGGTTGAAACTCTTGTGTGGTTGAAGGATCATTCCTTTTTGG
AAAGGGTAATATACATGACATTGATAGTTTATACGTCCTCTGGCCACCTCCTTCTTCATA
ATCTCCTGGCTCTTCATCGAGTACTTCAACTTCTTTTGTTTCTCTATCGAAGTGAATCAC
TTTCACCACAAACCATTCATCCTTCTCGGCATCATCAGCTGTGACTCTCGCAGCAACCTG
TTCACCCCTTAGACTGGCATAAGCCTCGATTTGGTTTCTCACGGAAGGAGAGACTCTTTG
TACATCTGACTCTACTTTCATTCCCTTCCTCTTCTGATCGTTGCCTTCTAGTTTTCTGCG
TTGTCGCCCCGTTGGTCCAGATGGAAGCAGAGAATCCAACTGGGTGAGCAGAATGGTTGA
AACAGTTACTTCACTTTCAGAAAGCTCTTTTGCTTGAATGTACAAATTTTTAAGCTTTGA
CAATGAAGTATCACCAGGCTTCTCAACTACCTCAGGCGTAGCTTGAAGCTTCTTATGCAT
CTTATTGATCTCGACGAGGACTTCCTCTTGTTCCTTCCTTAACCGATCAAGCTCCTTCGT
GTTCTCCAGAATTCCGGCAATGTCCGGCGATGACGACATCGTTCTATCAGGCTGCTGCTG
CAGAGAATCAGGCAAAAA

QA 13 690 13 690
DS 

RD RR4D101TF 672 0 0
AAAGGGTAATATACATGACATTGATAGTTTATACGTCCTCTGGCCACCTCCTTC***ATC
ATCTCCTGGCTCCTCATCGAGTACTTCAACTTCTTTTGTGTCTCTATCGAAGTGAATCAC
TTTCACCACAAACCATTCATCCTTCTCGGCATCATCAGCTGTGACTCTCGCAGCAACCTG
TTCACCCCTTAGACTGGCATAAGCCTCGATTTGGTTTCTCACGGAAGGAGAAACTCTTTG
TACATCTGACTCTACTTTCATTCTCTTCATCTTCTGATCGTTGCC***TAGTTTTCTGCG
TTGTTGCCCCGTTGGTCCAGATGGAAGCAGAGAATCCAACTGGGTGAGCAGAATGGTTGA
AACAGTTACTTCACTTTCAGAAAGCTCTTTTGCTTGAATGTACAAATTTTTAAGCTTTGA
CAATGAAGTATCACCAGGCTTCTCAACTACCTCAGGCGTAGCTTGAAGCTTCTTATGCAT
CTTATTGATCTCGACGAGGACTTCCTCTTGTTCCTTCCTTAACCGATCAAGCTCCTTCGT
GTTCTCCAGAATTCCGGCAATGTCCGGCGATGACGACATCGTTCTCTCAGG***CTGCTG
CAGAGAATCAGGCAAAAATTAATTAATTAAAGGATTTATGTTTCGATGTTGAAAACTCTC
TCACGAACTCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 2 7

CO CL592Contig1 927 3 8 U
CGAGAAAGGTCGCAAATAACATTATAGCAAATCTTAAAATATCAAAACAAGGTCTCAGCA
AAAACCCAAAAACAAAAGTGAACAGATTCATCATCTTCAATCCTCTTCTCCTTATTCTTA
CTTGGAAGCAAGAGCAGCAGCTTGACCTCTGAGACGACCAGTTCCCCTTGCAGCAATAAG
ACCAACCTTTTGCCCAGGGGGGGCATCACGACAAACGGTACTGGCGTGACCGATATGCTG
ATGGTTACCTCCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGGTTCATAGCCACACCACGAACCTTAGG
CCAGCAGTTCCTCTTCACACGGTACTTGTGGTACGCGTTACCCGCCTTGAGCATTGGCTT
CTCTGTCCTTCCTCCTCCAGCAACTTGACCAATCATAGCCCTGCATCCACTTGGGACAAT
CTTCTTCGATCCAGATGGCAACTTAACCCTGGTCGTGTCGTTGTCAGGGTGGTGTGAAAT
CACGATAGCGTAATCCCCAGAAGCTCTAGCGAGCACACCACGATCACCGACATGGTGCTC
GACGTTGCAGACAACAGCTCCCTCAGGGATAGATCTGAGAGGAAGAACATTTCCGACAAC
GAGAGTGGCCTTCTTACCGCAGTACAGAAACTGTCCGGTGTACATACCCTCGGCGGCGAC
GAAGAGCTCCTTCTGCTTCTTGTAACGGAAAGGATGACGGAAGGCGACGCGGGCTAACGG
AGCACCACGTCCTGGATCGTGGATGATCTCCGTGACGACACCCTTGAGGTAACCGTTCCT
CTCGCCGAAGTCGAGGCTCCTGAACTTGGCGGGGCCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTT
GAAGACGGAACCAGCTCCCTTACGTTGAGCTCTGATGACACGTCCCATGGTGGATTGTGA
TGTTCTTTCGTCTTCTGAAGTTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO41JQ U 25
AF RR4AJ66JQ U 1
AF RR4DO41TF C 437
BS 1 212 RR4AJ66JQ
BS 213 213 RR4DO41JQ
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BS 283 283 RR4DO41JQ
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BS 472 880 RR4AJ66JQ
BS 881 927 RR4DO41TF

RD RR4DO41JQ 334 0 0
TAGCAAATCTTAAAATA
TCAAAACAAGGTCTCAGCAAAAACCCAAAAACAAAAGTGAACAGATTCATCATCTTCAAT
CCTCTTCTCCTTATTCTTGCTTGGAAGCAAGAGCAGCAGCTTGACCTCTGAGACGACCAG
TTCTCCTTGCAGCAATAAGACCAACCTTTTGCCCAGGGGGTGCATCACGACAAACGGTAC
TGGCGTGACCGATATGCTGATGGTTACCTCCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGGTTCATAG
CCACACCACGAACCTTAGGCCAGCAGTTCCTCTTCCCACGGTACTTGTGGTACGCGTTAC
CCGCCTTGAGCATTGGC

QA 18 334 18 334
DS 

RD RR4AJ66JQ 880 0 0
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AAAACCCAAAAACAAAAGTGAACAGATTCATCATCTTCAATCCTCTTCTCCTTATTCTTA
CTTGGAAGCAAGAGCAGCAGCTTGACCTCTGAGACGACCAGTTCCCCTTGCAGCAATAAG
ACCAACCTTTTGCCCAGGGGGGGCATCACGACGAACGGTACTGGCGTGACCGATATGCTG
ATGGTTACCTCCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGGTTCATAGCTACACCACGAACCTTAGG
CCAGCAGTTCCTCTTCACACGGTACTTGTGGTACGCGTTACCCGCCTTGAGCATTGGCTT
CTCTGTCCTTCCTCCTCCAGCAACTTGACCAATCATAGCCCTGCATCCACTTGGGACAAT
CTTCTTCGATCCAGATGGCAACTTAACCCTGGTCGTGTCGTTGTCAGGGTTGTGTGAAAT
CACGATAGCGTAATCCCCAGAAGCTCTAGCGAGCACACCACGATCACCGACATGGTGCTC
GACGTTGCAGACAACAGCTCCCTCAGGGATAGATCTGAGAGGAAGAACATTTCCGACAAC
GAGAGTGGCCTTCTTACCGCAGTACAGAAACTGTCCGGTGTACATACCCTCGGCGGCGAC
GAAGAGCTCCTTCTGCTTCTTGTAACGGAAAGGATGACGGAAGGCGACGCGGGCTAACGG
AGCACCACGTCCTGGATCGTGGATGATCTCCGTGACGACACCCTTGAGGTAACCGTTCCT
CTCGCCGAAGTCGAGGCTCCTGAACTTGGCGGGGCCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTT
GAAGACGGAACCAGCTCCCTTACGTTGAGCTCTGATGACA

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR4DO41TF 491 0 0
AGAAAACCAAACCTG
GTCGTGTCGTTGTCAGGGTGGTGTGAAATCACGATAGCGTAATCCCCAGAAGCTCTAGCG
AGCACACCACGATCACCGACATGGTGCTCGACGTTGCAGACAACAGCTCCCTCAGGGATA
GATCTGAGAGGAAGAACATTTCCGACAACGAGAGTGGCCTTCTTACCGCAGTACAGAAAC
TGTCCGGTGTACATACCCTCGGCGGCGACGAAGAGCTCCTTCTGCTTCTTGTAACGGAAA
GGATGACGGAAGGCGACGCGGGCTAACGGAGCACCACGTCCTGGATCGTGGATGATCTCC
GTGACGACACCCTTGAGGTAACCGTTCCTCTCGCCGAAGTCGAGGCTCCTGAACTTGGCG
GGGCCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTTGAAGACGGAACCAGCTCCCTTACGTTGAGCT
CTGATGACACGTCCCATGGTGGATTGTGATGTTCTTTCGTCTTCTGAAGTTTACCC

QA 16 491 16 491
DS 



CO CL592Contig2 980 4 3 U
CGAAATCAAAACTGAATCCTGAAATTTAAAATGATAAGGTGGAGGTTTGTCCCTGAAGAC
AAAGGTTTCAAAGAAGATTAAAGAAAATCTAAAGGATTCAAAACAAGGTCTCAGCAAAAA
TCCAACAAAAGTAAACAATTTCATCATCTTGAAACTCTCTCTCTTTATTCTTGCTTGGAG
GCAAGAGCAGCAGCTTGACCTCTGAGACGACCAGTCCTCCTTGCAGCAATAAGACCAACC
TTTTGCCCAGGTGGTGCATCACGACGAACAGTACTGGCGTGACCGATATGTTGATGGTTA
CCTCCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGGTTCATAGCCACACCACGAACCTTAGGCCAGCAG
TTCCTCTTCACACGGTACTTGTGGTAAGCGTTACCTGCCTTCAGCATTGGCTTCTCAGTT
CTTCCACCACCAGCAACTTGACCAATCATGGCCCTGCATCCACTTGGGACAATCTTCTTC
GATCCAGATGGCAACTTAACCCTTGTCGTGTCGTTGTCAGGGTTATGTGAAATAACGATA
GCGTAATCTCCAGAAGCTCTAGCGAGCACACCACGGTCACCGACATGGTGCTCGACGTTG
CAGACAACAGCTCCCTCGGGGATAGATCTGAGAGGCAGAACATTTCCGACGACGAGAGTG
GCCTTCTTACCGCAGTAGAGGAACTGTCCGGTGTACATACCTTCGGCGGCGACGAAGAGC
TCCTTCTGCTTCTTGTAACGGAAAGGATGACGGAAGGCGACGCGGGCTAACGGAGCACCG
CGACCCGGATCGTGGATTATCTCCGTGACGACACCCTTGAGGTAACCATTTCTCTCGCCG
AAATCGAGGCTCCTGAACTTGGCGGGGCCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTTGAAGACG
GAGCCTGCTCCCTTACGTTGAGCTCTGATGACACGACCCATGGATTCGTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTGAGTTTACGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY58JQ U 1
AF RR4AJ29JQ U 28
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AF RR4FY58TF C 258
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BS 897 980 RR4AJ29TF

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TCCAACAAAAGTAAACAATTTCATCATCTTGAAACTCTCTCTCTTTATTCTTGCTTGGAG
GCAAGAGCAGCAGCTTGACCTCTGAGACGACCAGTCCTCCTTGCAGCAATAAGACCAACC
TTTTGCCCAGGTGGTGCATCACGACGAACAGTACTGGCGTGACCGATATGTTGATGGTTA
CCTCCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGGTTCATAGCCACACCACGAACCTTAGGCCAGCAG
TTCCTCTTCACACGGTACTTGTGGTAAGCGTTACCTGCCTTCAGCATTGGCTTCTCAGTT
CTTCCACCACCAGCAACTTGACCAATCATGGCCCTGCATCCACTTGGGACAATCTTCTTC
GATCCAGATGGCAACTTAACCCTTGTCGTGTCGTTGTCAGGGTTATGTGAAATAACGATA
GCGTAATCTCCAGAAGCTCTAGCGAGCACACCACGGTCACCGACATGGTGCTCGACGTTG
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QA 1 649 1 649
DS 

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TCTAAAGGATTCAAAACAAGGTCTCAGCAAAAATCCAACAAAAGTAAACAATTTCATCAT
CTTGAAACTCTCTCTCTTTATTCTTGCTTGGAGGCAAGAGCAGCAGCTTGACCTCTGAGA
CGACCAGTCCTCCTTGCAGCAATAAGACCAACCTTTTGCCCAGGTGGTGCATCACGACGA
ACAGTACTGGCGTGACCGATATGTTGATGGTTACCTCCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGG
TTCATAGCCACACCACGAACCTTAGGCCAGCAGTTCCTCTTCACACGGTACTTGTGGTAA
GCGTTACCTGCCTTCAGCATTGGCTTCTCAGTTCTTCCACCACCAGCAACTTGACCAATC
ATGGCCCTGCATCCACTTGGGACAATCTTCTTCGATCCAGATGGCAACTTAACCCTTGTC
GTGTCGTTGTCAGGGTTATGTGAAATAACGATAGCGTAATCTCCAGAAGCTCTAGCGAGC
ACACCACGGTCACCGACATGGTGCTCGACGTTGCAGACAACAGCTCCCTCGGGGATAGAT
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ACGACACCCTTGAGGTAACCATTTCTCTCGCCGAAATCGAGGCTCCTGAACTTGGCGGGG
CCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTTGAA

QA 1 869 1 869
DS 

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CCTCCGTGAGGATGCTCAACAGGGTTCATAGCCACACCACGAACCTTAGGCCAGCAGTTC
CTCTTCACACGGTACTTGTGGTAAGCGTTACCTGCCTTCAGCATTGGCTTCTCAGTTCTT
CCACCACCAGCAACTTGACCAATCATGGCCCTGCATCCACTTGGGACAATCTTCTTCGAT
CCAGATGGCAACTTAACCCTTGTCGTGTCGTTGTCAGGGTTATGTGAAATAACGATAGCG
TAATCTCCAGAAGCTCTAGCGAGCACACCACGGTCACCGACATGGTGCTCGACGTTGCAG
ACAACAGCTCCCTCGGGGATAGATCTGAGAGGCAGAACATTTCCGACGACGAGAGTGGCC
TTCTTACCGCAGTAGAGGAACTGTCCGGTGTACATACCTTCGGCGGCGACGAAGAGCTCC
TTCTGCTTCTTGTAACGGAAAGGATGACGGAAGGCGACGCGGGCTAACGGAGCACCGCGA
CCCGGATCGTGGATTATCTCCGTGACGACACCCTTGAGGTAACCATTTCTCTCGCCGAAA
TCGAGGCTCCTGAACTTGGCGGGGCCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTTGAAGACGGAG
CCTGCTCCCTTACGTTGAGCTCTGATGACACGACCCATGGATTCGTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTGAGTTTACGGCCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FY58TF 719 0 0
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CTCAACAGGGTTCATAGCCACACCACGAACCTTAGGCCAGCAGTTCCTCTTCACACGGTA
CTTGTGGTAAGCGTTACCTGCCTTCAGCATTGGCTTCTCAGTTCTTCCACCACCAGCAAC
TTGACCAATCATGGCCCTGCATCCACTTGGGACAATCTTCTTCGATCCAGATGGCAACTT
AACCCTTGTCGTGTCGTTGTCAGGGTTATGTGAAATAACGATAGCGTAATCTCCAGAAGC
TCTAGCGAGCACACCACGGTCACCGACATGGTGCTCGACGTTGCAGACAACAGCTCCCTC
GGGGATAGATCTGAGAGGCAGAACATTTCCGACGACGAGAGTGGCCTTCTTACCGCAGTA
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ACGGAAAGGATGACGGAAGGCGACGCGGGCTAACGGAGCACCGCGACCCGGATCGTGGAT
TATCTCCGTGACGACACCCTTGAGGTAACCATTTCTCTCGCCGAAATCGAGGCTCCTGAA
CTTGGCGGGGCCCTTGCGGTGGTGAGTGTGGGACTTGAAGACGGAGCCTGCTCCCTTACG
TTGAGCTCTGATGACACGACCCATGGATTCGTCTTCTTCTTCTTCTT
GAGTTTACGGCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 7

CO CL593Contig1 1308 5 3 U
GTGGGCAGGAAGGGTGTGGTGGCACTTGAGGAGGGTAGAAGTGCCGAGAACGCACTCTAC
GTTGTGGAAGGAATGCAATTTGACCGTGGTTACATATCCCCTTACTTTGTGACAGACAGT
GAGAAAATGTCAGTTGAGTTCGACAATTGCAAGTTGCTTCTCGTTGACAAGAAAATTACC
AATGCAAGGGATCTTGTTGGTGTTCTGGAGGATGCGATTAGAGGAGGATACCCAATTCTA
ATTATCGCAGAAGACATTGAGCAGGAGGCTTTGGCGACCCTTGTTGTTAACAAGCTTAGA
GGCACACTGAAGATTGCAGCTCTCAAAGCTCCAGGTTTTGGAGAGCGCAAGAGCCAGTAC
CTTGATGATATTGCCATTCTCACTGGAGCAACTGTGATCCGTGAGGAAGTTGGTCTTTCA
CTTGACAAAGCTGGAAAAGAGGTTCTTGGTAATGCCGCAAAGGTCGTCCTCACGAAGGAG
ACTTCGACCATTGTAGGTGATGGGACAACACAAGACGCAGTGCAAAAGCGTGTTACACAG
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ATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGCGAAAAGAGCA
CTGAGTTACCCTCTGAAACTGATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGTAGTTAGC
GAGAAGGTGCTTTCTAACGATAACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGGCAAGTAC
GAGGATTTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTGCTTGGAA
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GAACCTGAGCCAGTTCCTGTAGGCAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATACTGAGGA
GAGAGGGGAACAATGTAGCTCTACCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGATGAGAACT
AAGTGTAATGACTTTGAACAAGAGAATGTGA*GTGTGTACTGAAATTTT*GAATCAATCT
TATGAATAAAATCTTGATTCC*TTGATGTTTGGAAATAGTTTATCCCT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4AI03TF U 1
AF RR4AI03JQ C 496
AF RR4B630JQ C 654
AF RR4BH39TF U 654
AF RR4B630TF U 654
BS 1 780 RR4AI03TF
BS 781 1306 RR4BH39TF
BS 1307 1308 RR4B630TF

RD RR4AI03TF 780 0 0
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GTTGTGGAAGGAATGCAATTTGACCGTGGTTACATATCCCCTTACTTTGTGACAGACAGT
GAGAAAATGTCAGTTGAGTTCGACAATTGCAAGTTGCTTCTCGTTGACAAGAAAATTACC
AATGCAAGGGATCTTGTTGGTGTTCTGGAGGATGCGATTAGAGGAGGATACCCAATTCTA
ATTATCGCAGAAGACATTGAGCAGGAGGCTTTGGCGACCCTTGTTGTTAACAAGCTTAGA
GGCACACTGAAGATTGCAGCTCTCAAAGCTCCAGGTTTTGGAGAGCGCAAGAGCCAGTAC
CTTGATGATATTGCCATTCTCACTGGAGCAACTGTGATCCGTGAGGAAGTTGGTCTTTCA
CTTGACAAAGCTGGAAAAGAGGTTCTTGGTAATGCCGCAAAGGTCGTCCTCACGAAGGAG
ACTTCGACCATTGTAGGTGATGGGACAACACAAGACGCAGTGCAAAAGCGTGTTACACAG
ATTAAGAATCTTATTGAGCAAGCCGAGCAAGATTATGAGAAGGAAAAATTGAACGAGAGA
ATAGCAAAGCTCTCCGGTGGAGTTGCTGTTATTCAGGTGGGAGCACAAACGGAGACAGAA
CTCAAAGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGATGCTCTTAATGCTACAAAGGCTGCTGTTGAG
GAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGTTGATGCG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AI03JQ 785 0 0
GGTGAT
GGGACAACACAAGACGCAGTGCAAAAGCGTGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCAA
GCCGAGCAAGATTATGAGAAGGAAAAATTGAACGAGAGAATAGCAAAGCTCTCCGGTGGA
GTTGCTGTTATTCAGGTGGGAGCACAAACGGAGACAGAACTCAAAGAGAAGAAACTGAGA
GTTGAAGATGCTCTTAATGCTACAAAGGCTGCTGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGT
GGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGTTGATGCGATTAAAGCCGCCCTTGAAAAT
GATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGTGAAAAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACTG
ATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGTAGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGAT
AACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGGCAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGA
ATCATTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTGCTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAAG
ACATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGAGATCAAGGAACCTGAGCCAGTTCCTGTA
GGCAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATACTGAGGAGAGAGGGGAACAATGTAGCTC
TACCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGATGAGAACTAAGTGTAATGACTTTGAACAA
GAGAATGTGATGTGTGTACTGAAATTTT*GAATCAATCTTATGAATAAAATCTTGAT
CC

QA 7 783 7 783
DS 

RD RR4B630JQ 654 0 0
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TGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGT
TGATGCGATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGCGAA
AAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACTGATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGT
AGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGATAACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGG
CAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTG
CTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAAGACATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGA
GATCAAGGAACCTGAGCCAGTTCCTGTAGGCAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATA
CTGAGGAGAGAGGGGAACAATGTAGCTCTACCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGAT
GAGAACTAAGTGTAATGACTTTGAACAAGAGAATGTGA*GTGTGTACTGAAATTTT*GAA
TCAATCTTATGAATAAAATCTTGATTCC*TTGATGTTTGGAAATAGTTTATCC
T

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4BH39TF 654 0 0
GACAGAACTCAAAGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGATGCTCTTAATGCTACAAAGGCTGC
TGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGT
TGATGCGATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGCGAA
AAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACTGATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGT
AGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGATAACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGG
CAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTG
CTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAAGACATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGA
GATCAAGGAACCTGAGCCAGTTCCTGTAGGCAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATA
CTGAGGAGAGAGGGGAACAATGTAGCTCTACCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGAT
GAGAACTAAGTGTAATGACTTTGAACAAGAGAATGTGA*GTGTGTACTGAAATTTT*GAA
TCAATCTTATGAATAAAATCTTGATTCC*TTGATGTTTGGAAATAGTTTATCC
T

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4B630TF 655 0 0
GACAGAACTCAAAGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGATGCTCTTAATGCTACAAAGGCTGC
TGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGT
TGATGCGATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGCGAA
AAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACTGATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGT
AGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGATAACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGG
CAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTG
CTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAAGACATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGA
GATCAAGGAACCTGAGCCAGTTCCTGTAGGCAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATA
CTGAGGAGAGAGGGGAACAATGTAGCTCTACCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGAT
GAGAACTAAGTGTAATGACTTTGAACAAGAGAATGTGA*GTGTGTACTGAAATTTTTGAA
TCAATCTTATGAATAAAATCTTGATTCCCTTGATGTTTGGAAATAGTTTATCCCT

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL593Contig2 763 2 2 U
GGGGACAACACAAGACGCAGTGCAAAAGCGTGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCA
AGCAGAGCAAGATTATGAGAAGGAAAAATTGAATGAGAGAATTGCAAAGCTCTCTGGTGG
AGTTGCTGTGATTCAGGTGGGAGCACAAACAGAAACAGAACTCAAAGAGCAGAAACTGAG
AGTTGAAGATGCTTTTAATGCTACAAAGGCTGCTGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGG
TGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGTTGATGTCATTAAAGCCGCCCTTGAAAA
TGATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGTGAAAAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACT
TATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGTAGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGA
TAACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGGCAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGG
AATCACTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTGCTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAA
GACATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGAGATCAAGGAGCCTGAGCCAGTTCCCGT
AGGCAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATACTGAGGAGAGAGGGGAACAGTGTAGCT
CTACCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGATGAGAACTAAGTGTAATGACTTTGAACA
AGAGAATGTGATGTGTGTACTGAAATTTTGAATCAATCTTATG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL31TF U 1
AF RR4FL31JQ C 4
BS 1 597 RR4FL31TF
BS 598 763 RR4FL31JQ

RD RR4FL31TF 603 0 0
GGGGACAACACAAGACGCAGTGCAAAAGCGTGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCA
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AGTTGCTGTGATTCAGGTGGGAGCACAAACAGAAACAGAACTCAAAGAGCAGAAACTGAG
AGTTGAAGATGCTTTTAATGCTACAAAGGCTGCTGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGG
TGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGTTGATGTCATTAAAGCCGCCCTTGAAAA
TGATGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGTGAAAAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACT
TATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGTAGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGA
TAACGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGGCAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGG
AATCACTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTGCTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAA
GACATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGAGATCAAGGAGCCTGAGCCAGTTCC
CGTATG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4FL31JQ 760 0 0
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AGAGCAAGATTATGAGAAGGAAAAATTGAATGAGAGAATTGCAAAGCTCTCTGGTGGAGT
TGCTGTGATTCAGGTGGGAGCACAAACAGAAACAGAACTCAAAGAGCAGAAACTGAGAGT
TGAAGATGCTTTTAATGCTACAAAGGCTGCTGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGG
TTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGTTGATGTCATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGA
TGAAGAAAAGGTAGGAGCGGATATCGTGAAAAGAGCACTGAGTTACCCTCTGAAACTTAT
TGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAGCGTAGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGATAA
CGTGAAATACGGCTACAATGCTGCAACCGGCAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGAAT
CACTGATCCAACAAAGGTTGTGAGATGTTGCTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCAAAGAC
ATTCTTGATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGAGATCAAGGAGCCTGAGCCAGTTCCCGTAGG
CAACCCAATGGACAACTCAGGATACGGATACTGAGGAGAGAGGGGAACAGTGTAGCTCTA
CCGGAAACAGATTCCTTTTGAGCAATAGATGAGAACTAAGTGTAATGACTTTGAACAAGA
GAATGTGATGTGTGTACTGAAATTTTGAATCAATCTTATG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 8

CO CL594Contig1 928 8 14 U
CGTAAAGAAATAAAATAGTATTGATAGTTTATGTTTCTAGTAACATGAAAGAGCCCTTGC
AACCAGAAAACAAGCAAACAGCAGAAAAATAAAAAAAACTTGGAAAGAAATCAAATGTAT
TGTTTGTGGGGGTAGGGAGAGGTTTTAAAGTCTCTTAGATCTTGTTGAATGCAACGATGT
CAACACTCTGGATGTACTCGTTGTTAGGTTCACTGGTGAGATAGTCTTCAATGAGGTTGT
CAGGGGAGACGAGGTCATCAACAATTGTGAGCATGATCGTGAGCTTCTTGATACCGTAAC
CAACTGGAACCAATTTTGAAGCTCCCCATAGAAGACCAGGCATCTCAACAGCACGAACGC
ACTCCTCAAGTTTCTTCATATCTGTCTCGTCATCCCATGGCTTCACTTCCATGAGCACAG
AGGACTTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTGTCCTTCTTAGTAGCCTCCCTCTCCTCTG
CAGCTTTCTTTTCCTCCTCGGTCTCATCACCGAACAGATCCATGTCATCATCATCATCCT
CAGCTACAGCTGATGCAGGTGCCTCAGCTTGAGCAGGAGGAGCAGCAGCAGAGCCACCGA
TACTCACTCCAACGGCTTTTCCAGGGAAGCTTTTAGCAAGGTGGGAAGCGACGCAATCGT
ACCACCTGCCAGCATTGGGGAAAGCATCGCTGGGTTTCTCCGAAACGGCAGCGTATACCT
TCACATCATCCACAGACAACTGATCTCCGGAAATGTAGGTTTTTCCGGCGAGGTGCTCCT
CCACGGATTTGACACCCTGCTCTGTGTGTAGATCTGAGAAGGTAAGCGCCATTTGATGCT
CTGGTTTAGGAGGAGGGAGTGGAAGAGATTAGGAGGAGGGAGGAGGAGATTGACGGAGCT
GAGCTGCTTTAAAACCTATAGACTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB51JQ U 1
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AF RR4AS19JQ U 4
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AF RR4CZ75TF C 160
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BS 64 64 RR4AS19JQ
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BS 159 330 RR4FB51JQ
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BS 332 333 RR4FB51JQ
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BS 335 654 RR4FB51JQ
BS 655 817 RR4AS19JQ
BS 818 882 RR4AS19TF
BS 883 928 RR4CZ75TF

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CAACACTCTGGATGTACTCGTTGTTAGGTTCACTGGTGAGATAGTCTTCAATGAGGTTGT
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CAACTGGAACCAATTTTGAAGCTCCCCATAAAAAACCAGGCATCTCAACAGCACGAACGC
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DS 

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GC
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GAAAACAAGCAAACAGCAGAAAAATAAAAAAAACTTGGAAAGAAATCAAATGTATTGTTT
GTGGGGGTAGGGAGAGGTTTTAAAGTCTCTTAAATCTTGTTGAATGCAACGATGTCAACA
CTCTGGATGTACTCGTTGTTAGGTTCACTGGTGAGATAGTCTTCAATGAGGTTGTCAGGG
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GGAACCAATTTTGAAGCTCCCCATAGAAGACCAGGCATCTCAACAGCACGAACGCACTCC
TCAAGTTTCTTCATATCTGTCTCGTCATCCCATGGCTTCACTTCCATGAGCACAGAGGAC
TTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTGTCCTTCTTAGTAGCCTCCCTCTCCTCTGCAGCT
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DS 

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AA
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GTGGGGGTAGGGAGAGGTTTTAAAGTCTCTTAGATCTTGTTGAATGCAACGATGTCAACA
CTCTGGATGTACTCGTTGTTAGGTTCACTGGTGAGATAGTCTTCAATGAGGTTGTCAGGG
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GGAACCAATTTTGAAGCTCCCCATAGAAGACCAGGCATCTCAACAGCACGAACGCACTCC
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TTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTGTCCTTCTTAGTAGCCTCCCTCTCCTCTGCAGCT
TTCTTTTCCTCCTCGGTCTCATCACCGAACAGATCCATGTCATCATCATCATCCTCAGTT
ACAGCTGATGCAGGTGCCTCAGCTTGAGCAGGAGGAGCAGCAGCAGAGCCACCGATACTC
ACTCCAACGGCTTTTCCAGGGAAGCTTTTAGCAAGGTGGGAAGCGACGCAATCGTACCAC
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TCATCCACAGACAACTGATCTCCG

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DS 

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AA
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GAAAACAAGCAAACAGCAGAAAAATAAAAAAAACTTGGAAAGAAATCAAATGTATTGTTT
GTGGGGGTAGGGAGAGGTTTTAAAGTCTCTTAGATCTTGTTGAATGCAACGATGTCAACA
CTCTGGATGTACTCGTTGTTAGGTTCACTGGTGAGATAGTCTTCAATGAGGTTGTCAGGG
GAGACGAGGTCATCAACAATTGTGAGCATGATCGTGAGCTTCTTGATACCGTAACCAACT
GGAACCAATTTTGAAGCTCCCCATAGAAGACCAGGCATCTCAACAGCACGAACGCACTCC
TCAAGTTTCTTCATATCTGTCTCGTCATCCCATGGCTTCACTTCCATGAGCACAGAGGAC
TTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTGTCCTTCTTAGTAGCCTCCCTCTCCTCTGCAGCT
TTCTTTTCCTCCTCGGTCTCATCACCGAACAGATCCATGTCATCATCATCATCCTCAGTT
ACAGCTGATGCAGGTGCCTCAGCTTGAGCAGGAGGAGCAGCAGCAGAGCCACCGATACTC
ACTCCAACGGCTTTTCCAGGGAAGCTTTTAGCAAGGTGGGAAGCGACGCAATCGTACCAC
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DS 

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CTGGAACCAATTTTGAAGCTCCCCATAGAAGACCAGGCATCTCAACAGCACGAACGCACT
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CTACAGCTGATGCAGGTGCCTCAGCTTGAGCAGGAGGAGCAGCAGCAGAGCCACCGATAC
TCACTCCAACGGCTTTTCCAGGGAAGCTTTTAGCAAGGTGGGAAGCGACGCAATAGTACC
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CC

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DS 

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CGTACCACCTGCCAGCATTGGGGAAAGCATCGCTGGGTTTCTCCGAAACGGCAGCGTATA
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CCTCCACGGATTTGACACCCTGCTCTGTGTGTAGATCTGAGAAGGTAAGCGCCATTTGAT
GCTCTGGTTTAGGAGGAGGGAGTGGAAGAGATTAGGAGGAGGGAG
CC

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DS 

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GTTTCTTCATATCTGTCTCGTCATCCCATGGCTTCACTTCCATGAGCACAGAGGACTTTC
CACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTGTCCTTCTTAGTAGCCTCCCTCTCCTCTGCAGCTTTCT
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CAGCATTGGGGAAAGCATCGCTGGGTTTCTCCGAAACGGCAGCGTATACCTTCACATCAT
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TGACACCCTGCTCTGTGTGTAGATCTGAGAAGGTAAGCGCCATTTGATGCTCTGGTTTAG
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CC

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DS 

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CAACAGCACGAACGCACTCCTCAAGTTTCTTCATATCTGTCTCGTCATCCCATGGCTTCA
CTTCCATGAGCACAGAGGACTTTCCACTCTCTTTAGGCTTCTTGGTGTCCTTCTTAGTAG
CCTCCCTCTCCTCTGCAGCTTTCTTTTCCTCCTCGGTCTCATCACCGAACAGATCCATGT
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CAGCAGAGCCACCGATACTCACTCCAACGGCTTTTCCAGGGAAGCTTTTAGCAAGGTGGG
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DS 



AS 1 6

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GGCGACGATGCTGAGGAAGGAGAGATCGGAGACGGAGACGAATCGAGCAAATCCGCCGTT
CCTCAGTCGCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTTCGATAACCCTTCTGTTAAA
TTAAAGCAGACGACTTGGGGAAGCTCTCTGCGATCCGTCTTCACTTTCTCCACCGTCGAG
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TCTTCATAAAATTTACCTTCCATAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW75TF U 1
AF RR4AD33TF U 6
AF RR4DJ45TF U 1
AF RR4A894TF U 1
AF RR4AD33JQ C 162
AF RR4AY79TF U 62
BS 1 46 RR4A894TF
BS 47 47 RR4GW75TF
BS 48 48 RR4A894TF
BS 49 49 RR4GW75TF
BS 50 67 RR4A894TF
BS 68 69 RR4GW75TF
BS 70 119 RR4A894TF
BS 120 120 RR4GW75TF
BS 121 178 RR4A894TF
BS 179 179 RR4GW75TF
BS 180 185 RR4A894TF
BS 186 186 RR4GW75TF
BS 187 224 RR4A894TF
BS 225 225 RR4GW75TF
BS 226 248 RR4A894TF
BS 249 249 RR4GW75TF
BS 250 560 RR4A894TF
BS 561 561 RR4GW75TF
BS 562 606 RR4A894TF
BS 607 607 RR4GW75TF
BS 608 735 RR4A894TF
BS 736 736 RR4AD33TF
BS 737 760 RR4A894TF
BS 761 761 RR4AD33TF
BS 762 773 RR4A894TF
BS 774 774 RR4AD33TF
BS 775 784 RR4A894TF
BS 785 785 RR4AD33TF
BS 786 804 RR4A894TF
BS 805 805 RR4AY79TF
BS 806 848 RR4A894TF
BS 849 849 RR4AY79TF
BS 850 855 RR4A894TF
BS 856 928 RR4AY79TF

RD RR4GW75TF 730 0 0
GGATCTC
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AGGCAAAAGTTTTAACAATGGCGGTAGAAGACACATCCAAGCCACTTGTTGTCGTTGCGG
AAGAAGCGAACCCTAACCCTACAGACCAACCGATCGATCGATACCATGAACAAGGCGACG
ATGCTGAGGAAGGAGAGATCGGAGACGGAGACGAATCGAGCAAATCCGCCGTTCCTCAGT
CGCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTTCGATAACCCTTCTGTTAAATTAAAGC
AGACGACTTGGGGAAGCTCTCTGCGATCCGTCTTCACTTTCTCCACCGTCGAGGAGTTCT
GGGGTCTGTACAATAACATGCGGGTTCCGAGCAAGTTAGTTACCGGAGCTGACTTCTACT
GTTTCAAACACAATATCGAACCTAAGTGGGAGGATCCTATTTGTGCTAATGGTGGCAAAT
GGACTATGAACTTCTCCAAGGAGAAGTCTGATAAGCCCTGGCTTTACACTTTGCTTGCGT
TGATTGGAGAACAGTTTGACCATGGAGATGAGATATGCGGAGTTGTTGTCAACGTTAGAA
TAAAGCAAGAGAGGATATCCATTTGGACCAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCAG*TGA
GCATTGGGAGACAATGGAAG*AGAT*ATTGATCACA*CAACAGCATGGGTT*CATCATCC
ATG

QA 8 730 8 730
DS 

RD RR4AD33TF 791 0 0
GG
AATTAACCCTACACCAGAAGAAGAAGAAGTACATCCATCATCTGGAGAGAAAAGAGAAAG
AGGCAAAAGTTTTAACAATGGCGGTAGAAGACACATCCAAGCCACTTGTTGTCGTTGCGG
AAGAAGCGAACCCTAACCCTACAGACCAACCGATCGATCGATACCATGAACAAGGCGACG
ATGCTGAGGAAGGAGAGATCGGAGACGGAGACGAATCGAGCAAATCCGCCTTTCCTCAGT
CGCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTTCGATAACCCTTCTGTTAAATTAAAGC
AGACGACTTGGGGAATCTCTCTGCGATCCGTCTTCACTTTCTCCACCGTCGAGGTGTTCT
GGGGTCTGTACAATAACATGCGGGTTCCGAGCAAGTTAGTTACCGGAGCTGACTTCTACT
GTTTCAAACACAATATCGAACCTAAGTGGGAGGATCCTATTTGTGCTAATGGTGGCAAAT
GGACTATGAACTTCTCCAAGGAGAAGTCTGATAAGCCCTGGCTTTACACTTTGCTTGCGT
TGATTGGAGAACAGTTTGACCATGGAGATGAGATATGCGGAGTTGTTGTCAACGTTAGAA
TAAAGCAAGAGAGGATATCCATTTGGACCAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCACGTGA
GCATTGGGAGACAATGGAAGGAGATTATTGATCACAACAACAGCATTGGTTTCATCATCC
ATGAGGATGCCAAGAAGCTGGACAGAGGCGCGAGGAGCGCTTACACCGCTTGAAACCTCA
ACAACTCTC

QA 3 791 3 791
DS 

RD RR4DJ45TF 817 0 0
GGATCTC
AATTAACCCTACACCAGAAGAAGAAGAAGTACATCCATCGTTAGGAGAGAAAAGAGAAAG
**GCAAAAGTTTTAACAATGGCGGTAGAAGACACATCCAAGCCACTTGTTGTTGTTGCGG
AAGAAGCGAACCCTAACCCTACAGACCAACCGATCGATCGATACCATGAACAAGGCGATG
ATGCTGAGGAAGGAGAGATCGGAGACGGAGACGAATCGAGCAAATCCGCCGTTCCTCAGT
CTCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTTCGATAACCCTTCTGTTAAATTAAAGC
AGACGACTTGGGGAAGCTCTCTGCGATCCGTCTTCACTTTCTCCACCGTCGAGGAGTTCT
GGGGCCTGTACAATAACATGCGGGTTCCGAGCAAGTTAGTTACCGGAGCTGACTTCTACT
GTTTCAAACACAATATCGAACCTAAGTGGGAGGATCCTATTTGCGCTAATGGTGGCAAAT
GGACTATGAACTTCTCCAAGGAGAAGTCTGATAAGCCCTGGCTTTACACTTTGCTTGCGT
TGATTGGAGAACAGTTTGACCATGGAGATGAGATATGCGGAGTTGTTGTCAACGTTAGAG
TAAAGCAAGAGAGGATATCCATTTGGACCAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCAG*TGA
GCATTGGGAGACAATGGAAG*AGATTATTGATCACAACAACAGCATTGGTTTCATCATCC
ATGAG*ATGCCAAGAAGCTGGACAGAG*CGCGAAGAGCGCTTACACTGCTTGAAACC*CA
ACA*CTCTCTCAA*TCTTTACACCGTTTCA

QA 8 817 8 817
DS 

RD RR4A894TF 858 0 0
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GAGAAAG**GCAAAAGTTTTAACAATGGCGGTAGAAGACACATCCAAGCCACTTGTTGTT
GTTGCGGAAGAAGCGAACCCTAACCCTACAGACCAACCGATCGATCGATACCATGAACGA
GGCGATGATGCTGAGGAAGGAGAGATCGGAGACGGAGACGAATCAAGCAAATCCGCCGTT
CCTCAGTCTCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTTCGATAACCCTTCTGTTAAA
TTAAAGCAGACGACTTGGGGAAGCTCTCTGCGATCCGTCTTCACTTTCTCCACCGTCGAG
GAGTTCTGGGGTCTGTACAATAACATGCGGGTTCCGAGCAAGTTAGTTACCGGAGCTGAC
TTCTACTGTTTCAAACACAATATCGAACCTAAGTGGGAGGATCCTATTTGTGCTAATGGT
GGCAAATGGACTATGAACTTCTCCAAGGAGAAGTCTGATAAGCCCTGGCTTTACACTTTG
CTTGCGTTGATTGGAGAACAATTTGACCATGGAGATGAGATATGCGGAGTTGTTGTCAAC
GTTAGAGTAAAGCAAGAGAGGATATCCATTTGGACCAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCT
CAGGTGAGCATTGGGAGACAATGGAAGGAGATTATTGATCACAACAACAGCATTGGTTTC
ATCATCCATGAGGATACCAAGAAGCTGGACAGAGGCGCGAAGAGCGCTTACACTGCTTGA
AACCCCAACAACTCTCTCAAATCTTTACACCGTTTCAAATTCAGTTTTGTATGTGAGAGA
TCTCTATTCATATTA
TCA

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4AD33JQ 744 0 0
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ATCGAGCAAATCCGCCTTTCCTCAGTCGCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTT
CGATAACCCTTCTGTTAAATTAAAGCAGACGACTTGGGGAATCTCTCTGCGATCCGTCTT
CACTTTCTCCACCGTCGAGGTGTTCTGGGGTCTGTACAATAACATGCGGGTTCCGAGCAA
GTTAGTTACCGGAGCTGACTTCTACTGTTTCAAACACAATATCGAACCTAAGTGGGAGGA
TCCTATTTGTGCTAATGGTGGCAAATGGACTATGAACTTCTCCAAGGAGAAGTCTGATAA
GCCCTGGCTTTACACTTTGCTTGCGTTGATTGGAGAACAGTTTGACCATGGAGATGAGAT
ATGCGGAGTTGTTGTCAACGTTAGAATAAAGCAAGAGAGGATATCCATTTGGACCAAAAA
CGCTTCCAACGAAGCTGCTCAGGTGAGCATTGGGAGACAATGGAAGGAGATTATTGATCA
CAACAACAGCATTGGTTTCATCATCCATGAGGATGCCAAGAAGCTGGACAGAGGCGCGAG
GAGCGCTTACACCGCTTGAAACCTCAACAACTCTCTCAAATCTCTACACCGTTTCAAATT
CAGTTTTGTATGTGAGAGATCTCTATTTATATTACCAAAACATGACTTGATCACCAGTAT
TTTTAATATTTTAGTATG
CTCTCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4AY79TF 867 0 0
GGAAAG
AGGCAAAAGTTTTAACAATGGCGGTAGAAGACACATCCAAGCCACTTGTTGTCGTTGCGG
AAGAAGCGAACCCTAACCCTACAGACCAACCGATCGATCGATACCATGAACAAGGCGACG
ATGCTGAGGAAGGAGAGATCGGAGACGGAGACGAATCGAGCAAATCCGCCGTTCCTCAGT
CGCATCCGTTGGAGCATTCGTGGACTTTCTGGTTCGATAACCCTTCTGTTAAATTAAAGC
AGACGACTTGGGGAAGCTCTCTGCGATCCGTCTTCACTTTCTCCACCGTCGAGGAGTTCT
GGGGTCTGTACAATAACATGCGGGTTCCGAGCAAGTTAGTTACCGGAGCTGACTTCTACT
GTTTCAAACACAATATCGAACCTAAGTGGGAGGATCCTATTTGTGCTAATGGTGGCAAAT
GGACTATGAACTTCTCCAAGGAGAAGTCTGATAAGCCCTGGCTTTACACTTTGCTTGCGT
TGATTGGAGAACAGTTTGACCATGGAGATGAGATATGCGGAGTTGTTGTCAACGTTAGAA
TAAAGCAAGAGAGGATATCCATTTGGACCAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCAGGTGA
GCATTGGGAGACAATGGAAGGAGATTATTGATCACAACAACAGCATTGGTTTCATCATCC
ATGAG*ATGCCAAGAAGCTGGACAGAGGCGCGAGGAGCGCTTACACCGCTTGAAACCTCA
ACAACTCTCTCAAATCTCTACACCGTTTCAAATTCAGTTTTGTATGTGAGAGATCTCTAT
TTATATTACCAAAACATGACTTGATCACCAGTATTTTTAATATTTTAGTATGTTCTTCAT
AAAATTTACCTTCCATAAAAT

QA 7 867 7 867
DS 



AS 1 9

CO CL596Contig1 935 9 15 U
GGTATACTTTTTTCTCATAAATAATTTTGGGACGGCACTGCTCATCATAGCTAGTACACG
TCGCTTCTCACAGTTACAACTCACAACGTAAAACGATCTTACCATACACACACATAATCA
TGGCACACTCATAATTTATCTCTCACAAACTCGGACAGGGCTCCATAGTCCTTTATTTTG
TCTTAGTAAAAGTACGTAACTTAAGGCACAACACATATTCCTTTGATTTATTCATCGGCC
AAGAGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTCGACACAGAACTGGAGGAGAGTCTCGGGA
TGAGCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGTACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCC
CCACCGTGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTGAGCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGA
TCACCTTCAATAACCCTGAACGTGATCAAGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTC
TCCTTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCATGAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAGCCAGGT
TTGCCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCACAGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAA
ACATGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGTGATGGAACTGCTCAGCAGAAGCTTTGATCTCC
ACGTCTGTCTCAAGCTTCCCCACCAAGCTAGACGTCTCTGTTGGCTTCACCTCCTGTTCC
GCCGGTTTGTTTGTAGCCTCGACCGTTTTAGGAGGTATCACCGTCACCTTGGTCTCAGCT
TCTTCCGCCCTTGCAGCCTCCACCGCTTTAGTTGGTGGCACAGTCACTGGCGTCTCCGCG
TTTTCCTCCATCTTCTTTGCAATTTCGGTAGCAACCTCCGCCATTCTAGGAAATTATGGT
TGTAAAGAGTGATATTCTGTTTATGAGTGAGTTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 20 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL29JQ U 1
AF RR4FK80JQ U 29
AF RR4F395JQ U 29
AF RR4GW37JQ U 2
AF RR4B484JQ U 29
AF RR4BO10TF C 179
AF RR4FL29TF C 235
AF RR4F395TF C 244
AF RR4FK80TF C 256
BS 1 120 RR4FL29JQ
BS 121 121 RR4GW37JQ
BS 122 340 RR4FL29JQ
BS 341 341 RR4GW37JQ
BS 342 343 RR4FL29JQ
BS 344 344 RR4GW37JQ
BS 345 501 RR4FL29JQ
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BS 503 518 RR4FL29JQ
BS 519 519 RR4GW37JQ
BS 520 644 RR4FL29JQ
BS 645 743 RR4GW37JQ
BS 744 840 RR4B484JQ
BS 841 922 RR4BO10TF
BS 923 935 RR4FK80TF

RD RR4FL29JQ 644 0 0
GGTATACTTTTTTCTCATAAATAATTTTGGGACGGCACTGCTCATCATAGCTAGTACACG
TCGCTTCTCACAGTTACAACTCACAACGTAAAACGATCTTACCATACACACACATAATCA
GGGCACACTCATAATTTATCTCTCACAAACTCGGACAGGGCTCCATAGTCCTTTATTTTG
TCTTAGTAAAAGTACGTAACTTAAGGCACAACACATATTCCTTTGATTTATTCATCGGCC
AAGAGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTCGACACAGAACTGGAGGAGAGTCTCGGGA
TGAGCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGTACTCAAGGTGCCGGTACACAATACTTCCTGCC
CCACCGTGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTGAGCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGA
TCACCTTCAATAACCCTGAACGTGATCAAGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTC
TCCTTTGCCACCTTTGCCTCTACATCATGAACGTAGTTTCAGAAAATGATAGAGCCAGGT
TTGCCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCACAGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAA
ACATGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGTGATGGAACTGCTCAGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4FK80JQ 602 0 0
GGGACGGCACTGCTCATCATAGCTAGTACACGTCGCTTCTCACAGTTACAACTCACAACG
TAAAACGATCTTACCATACACACACATAATCATGGCACACTCATAATTTATCTCTCACAA
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CTTCGACACAGAACTGGAGGAGAGTCTCGGGATGAGCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGT
ACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCCCCACCGTGCTTAGGGGTCACCTGGATTG
TGAGCAAGAAACTTTTGTACTCTTTCATCAGATCACCTTCAATAACCCTGAACGTGATCA
AGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCCTTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCAT
GAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAACCAGGTTTGCCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCAC
AGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAAACATGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGT
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4F395JQ 611 0 0
GGGACGGCACTGCTCATCATAGCTAGTACACGTCGCTTCTCACAGTTACAACTCACAACG
TAAAACGATCTTACCATACACACACATAATCATGGCACACTCATAATTTATCTCTCACAA
ACTCGGACAGGGCTCCATAGTCCTTTATTTTGTCTTAGTAAAAGTACGTAACTTAAGGCA
CAACACATATTCCTTTGATTTATTCATCGGCCAAGAGATGTTCGTAGATCTCTTTGGAGA
CTTCGACACAGAACTGGAGGAGAGTCTCGGGATGAGCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGT
ACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCCCCACCGTGCTTAGGGGTCACCTGGATTG
TGAGCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGATCACCTTCAATAACCCTGAACGTGATCA
AGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCCTTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCAT
GAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAGCCAGGTTTGCCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCAC
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GATGGAACTGC

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GC
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CTTCTCACAGTTACAACTCACAACGTAAAACGATCTTACCATACACACACATAATCATGG
CACACTCATAATTTATCTCTCACAAACTCGGACAGGGCTCCATAGTCCTTTATTTTGTCT
TAGTAAAAGTACGTAACTTAAGGCACAACACATATTCCTTTGATTTATTCATCGGCAAAG
AGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTCGACACAGAACTGGAGGAGAGTCTCGGGATGA
GCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGTACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCCCCA
CCGTGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTGAGCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGATCA
CCTTCAATAACCCTGAACGTGATCAAGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCC
TTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCATGAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAGCCAGGTTTG
CCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCACGGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAAACA
TGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGTGATGGAACTGCTCAGCAGAAGCTTTGATCTCCACG
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GGTTTGTTTGTAGCCTCGAC

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ACTCGGACAGGGCTCCATAGTCCTTTATTTTGTCTTAGTAAAAGTACGTAACTTAAGGCA
CAACACATATTCCTTTGATTTATTCATCGGCCAAGAGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGA
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AGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCCTTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCAT
GAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAGCCAGGTTTGCCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCAC
AGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAAACATGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGT
GATGGAACTGCTCAGCAGAAGCTTTGATCTCCACGTCTGTCTCAAGCTTCCCCACCAAGC
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TAGGAGGTATCACCGTCACCTTGGTCTCAGCTTCTTCCGCCCTTGCAGCCTCCACCGCTT
TAGTTGGTGGCACAGTCACTGGCGTCTCCGCG

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TTGTC
TAGTAAAGGTACGTAACTTAAGGCACAACACATATTCCTTTGATTTATTCATCGGCCAAG
AGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTCGACACAGAACTGGAGGAGAGTCTCGGGATGA
GCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGTACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCCCCA
CCGTGCTTAGGGGTAACCTGGATTGTGAGCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGATCA
CCTTCAATAACCCTGAACGTGATCAAGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCC
TTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCATGAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAGCCAGGTTTG
CCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCACAGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAAACA
TGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGTGATGGAACTGCTCAGCAGAAGCTTTGATCTCCACG
TCTGTCTCAAGCTTCCCCACCAAGCTAGACGTCT**GTTGGCTTCACCTCCTGTTCCGCC
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ATGAGTCC

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TGTTCCGCCGGTTTGTTTGTAGCCTCGACCGTTTTAGGAGGTATT*CTGTTTCCTTGGTC
TCAGCTTCTTCCGCCCTTGCAGCCTCCACCGCTTTAGTTGGTGGCACAGTCACTGGCGTC
TCCGCGTTTTCCTCCATCTTCTTTGCAATTTCGGTAGCAACCTCCGCCATTCTAGGAAAT
TATGGTTGTAAAGAGTGAT
ATTCTGTTTCC

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GCAACCTCTTCGCTAATCTTCTCGTACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCCCCA
CCGTGCTTAGGGGTCACCTGGATTGTGAGCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGATCA
CCTTCAATAACCCTGAACGTGATCAAGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCC
TTTGCCACCTTTGCCTCTCCATCATGAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAGCCAGGTTTG
CCCCAATCGCCTTCGTGCAGATCACAGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAAACA
TGGTGTGGTTTGCCGGTGAACATGTGATGGAACTGCTCAGCAGAAGCTTTGATCTCCACG
TCTGTCTCAAGCTTCCCCACCAAGCTAGACGTCTCTGTTGGCTTCACCTCCTGTTCCGCC
GGTTTGTTTGTAGCCTCGACCGTTTTAGGAGGTATCACCGTCACCTTGGTCTCAGCTTCT
TCCGCCCTTGCAGCCTCCACCGCTTTAGTTGGTGGCACAGTCACTGGCGTCTCCGCGTTT
TCCTCCATCTTCTTTGCAATTTCGGTAGCAACCTCCGCCATTCTAGGAAATTATGGTTGT
AAAGAGTGAT
TCTGTTTATGAGTCC

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CTAATCTTCTCGTACTCAAGGTGCCAGTGCACAATACTTCCTGCCCCACCGTGCTTAGGG
GTCACCTGGATTGTGAGCAAGAAACTTTTGTACTCTTTCATCAGATCACCTTCAATAACC
CTGAACGTGATCAAGTTCTTCTCCGGCTCTACCGCCTCGATCCTCTCCTTTGCCACCTTT
GCCTCTCCATCATGAACGTAGTTCCAGAAAATGATAGAACCAGGTTTGCCCCAATCGCCT
TCGTGCAGATCACAGCCCTGAATGTTGCCTGGAGATGCTTTGGAAACATGGTGTGGTTTG
CCGGTGAACATGTGATGGAACTGCTCAGCAGAAGCTTTGATCTCCACGTCTGTCTCAAGC
TTCCCCACCAAGCTAGACGTCTCTGTTGGCTTCACCTCCTGTTCCGCCGGTTTGTTTGTA
GCCTCGACCGTTTTAGGAGGTATCACCGTCACCTTGGTCTCAGCTTCTTCCGCCCTTGCA
GCCTCCACCGCTTTAGTTGGTGGCACAGTCACTGGCGTCTCCGCGTTTTCCTCCATCTTC
TTTGCAATTTCGGTAGCAACCTCCGCCATTCTAGGAAATTATGGTTGTAAAGAGTGATAT
TCTGTTTATGAGTGAGTTCC

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DS 



AS 2 7

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GTCGCTATGGACCAGCGTAGCAATGTGAACGGACATTCCAGTGAAGAAAGGTTTGATCCG
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CTGGCCGTCGCCGCCGTGTATTTTGATAGCTGGTTCTTCTGGCCTCTTTATTGGGCCGCC
CAAGGAACCCTTTTCTGGGCTATCTTCGTACTCGGCCACGACTGTGGACATGGAAGCTTC
TCAGACATTCCTCTTCTGAATACTGCGGTTGGTCATATTCTCCATTCCTTCATCCTCGTT
CCATACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAA
AACGACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAATTGTCCCACAGTACA
CGGATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGGTAC
AGAAGTCCTGGTAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTTTGTTTGCTCCAAGC
GAGAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTTCTT
TATCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATC
ATCTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACGTACTTGCATCATCATGGCCACGATGATAAG
TCGCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATTTACGTGGAGGATTAACAACTGTTGAT
AGAGATTACGGAATCTTCAACAACATTCATCACGATATTGGAACTCACGTGATCCATCAT
CTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGAAGCCACGAAAGCAGCTAAACATGTG
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TCGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

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QA 1 640 1 640
DS 

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G
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AAAGGTTTGATCCGAGCGCACAACCACCGTTTAAGATCGGAGATATAAGGGCGGCCATTC
CTAAGCATTGTTGGGTAAAGAGTCCTTTGAGATCCATGAGCTACGTCGCCAGAGACATTT
TCGCCGTCGTGGCTCTGGCCGTCGCCGCCGTGTATTTTGATAGCTGGTTCTTCTGGCCTC
TTTATTGGGCCGCCCAAGGAACCCTTTTCTGGGCTATCTTCGTACTCGGCCACGACTGTG
GACATGGAAGCTTCTCAGACATTCCTCTTCTGAATACTGCGGTTGGTCATATTCTCCATT
CCTTCATCCTCGTTCCATACCATGGTTGGAGAATAAGTCATCGGACACACCACCAGAACC
ATGGCCATGTTGAAAACGACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAAT
TGTCCCACAGTACACGGATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTC
TCTATCTGTGGTACAGAAGTCCTGGTAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTT
TGTTTGCTCCAAGCGAGAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCGATCATGT
TGGCCACTCTTCTTTATCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAA*GTCTATG
GTGTTCCTTACATCATCTTTGTGATGTGGT*GGACGCTGTCACGTACTTGCATCAT

QA 2 777 2 777
DS 

RD RR4FJ46JQ 750 0 0
CCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGGTACAGAAGTCCTGGTAAAGAAGGGTCACAT
TATAACCCATACAGTAGTTTGTTTGCTCCAAGCGAGAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACT
ACTTGCTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTTCTTTATCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTC
ACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATCATCTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTC
ACGTACTTGCATCATCATGGCCACGATGATAAGTTGCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGG
AGTTATTTACGTGGAGGATTAACGACTGTTGATAGAGATTACGGGATCTTCAACAACATT
CATCACGATATTGGAACTCACGTGATCCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCAC
TTGGTCGAAGCCACGAAAGCAGCTAAACATGTGTTGGGTAGATACTACAGAGAACCAAAG
ACGTCAGGAGCAATACCGATCCACTTGGTGGAAAGTTTGGTGGCAAGTATTAAGAGAGAT
CATTATGTCAGTGACACTGGTGATATTGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTT
TATGCTTCTGACAAATCCAAAATCAATTAACCTTTCTTCCTAGCTCTATTTAGGAATAAA
ACAGTACTTTGTTCTCTACTTATTTCTTGTTGTTTTTAAGTTATAAATGTACTCATGAAA
CTTTTTTTTAATTAAATGTATTTACATTTC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4DQ47JQ 693 0 0
ACCCATACAGTAGTTTGTTTACTCCAAGCGAGAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTT
GTTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTTCTTTATCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAG
TTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATCATCTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACGT
ACTTGCATCATCATGGCCACGATGATAAGTCGCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTT
ATTTACGTGGAGGATTAACAACTGTTGATAGAGATTACGGAATCTTCAACAACATTCATC
ACGATATTGGAACTCACGTGATCCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGG
TCGAGGCCACGAAAGCAGCTAAACATGTGTTGGGTAGATACTACAGAGAACCAAAGACGT
CAGGAGCAATACCGATCCACTTGGTGGAAAGTTTGGTGGCAAGTATTAAGAAAGATCATT
ATGTCAGTGACACTGGTGATATTGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATG
CTTCTGACAAATCCAAAATCAATTAACCTTTCTTCCTAGCTCTATTTAGGAATAAAACAG
TACTTTGTTCTCTACTTATTTCTTGTTGTTTTTAAGTTATAAATGTACTCATGAAACTTT
TTTTTAATTAAATGTATTTACATTTCAAATCGT

QA 1 693 1 693
DS 



CO CL597Contig2 862 3 2 U
TGATTGCAACTAAAGGAAAAGATACCAAAACTTCCACTTTTTGTAATGTAAATACATTAA
TAAAAAGAAAGGTTCCACGAGTACATTTTAAACTTAAAACAGCAACAAATAAGCAAAAGA
AAAGGAGTGCTTATTCCTAATAGAGCCAGGGAGAAGGGTTAATTGATTTTAGATTTGTCA
GAAGCATAAACGTAGAGATCTGGATCTGTCTCGTAGAAGACAATATCACCAGTGTCACTG
ACGTAGTGATCTTTTTTAATACTTGCGACCAAACTCTCCACCAAGTGAATCGGTATTGCT
CCTGACGTCTTCGGCTCTCTGTAGTATCTTCCCAGCACATGTTTAGCTGCTTTCGTGGCG
TCGACCAAGTGATAGTGAGGGATTTGTGGGAAAAGATGATGGATCACGTGAGTTCCAATG
TCGTGATGGATGTTGTTGAAGATTCCATAATCTCTATCAATAGTTGTTAATCCTCCACGT
AAATAACTCCATTCCTTGCCTCTGTACCACGGCAACTTCTCATCATGACCATGATGATGC
AAGTACGTGACAGCGTCCAACCACATCACAAAGATAATGTAAGGAACACCATAGACTTTG
AGAACTGTGACTGGACCAAGGAGGAACGATAGATAAACAAGAGTGGCCAGCATTATGGAC
CAGCAAGTAGTTGAAGTTGCAATAAGCTTCCTCTCGCTTGGAGCAAATAAACTACTGTAT
GGGTTATAATGTGACCCTTCTTTTCCAGGACTTCTGTACCACAGATAGATCGGGTAAGCG
AGCATGGGCAGAGGGACAGTGTATCTGAGCATCCGAGTACTATGGGGCAAGCTCTTGTAC
AACTTTTCTGGCAGCGGACCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK01JQ U 43
AF RR4GA68TF C 1
AF RR4CK56JQ U 42
BS 1 42 RR4GA68TF
BS 43 862 RR4CK56JQ

RD RR4GK01JQ 531 0 0
GTAATGTAAATACATTAATAAAAAGAAAGGTTCCACGAGTACATTTTAAACTTAAAACAG
CAACAAATAAGCAAAAGAAAAGGAGTGCTTATTCCTAATAGAGCCAGGGAGAAGGGTTAA
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AAGTGAATCGGTATTGCTCCTGACGTCTTCGGCTCTCTGTAGTATCTTCCCAGCACATGT
TTAGCTGCTTTCGTGGCGTCGACCAAGTGATAGTGAGGGATTTGTGGGAAAAGATGATGG
ATCACGTGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGAAAATTCCATAATCTCTATCAATA
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TCATGACCATGATGATGCAAGTACGTGACAGCGTCCAACCACATCACAAAG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4GA68TF 689 0 0
TGATTGCAACTAAAGGAAAAGATACCAAAACTTCCACTTTTTGTAATGTAAATACATTAA
TAAAAAGAAAGGTTCCACGAGTACATTTTAAACTTAAAACAGCAACAAATAAGCAAAAGA
AAAGGAGTGCTTATTCCTAATAGAGCCAGGGAGAAGGGTTAATTGATTTTAGATTTGTCA
GAAGCATAAACGTAGAGATCTGGATCTGTCTCGTAGAAGACAATATCACCAGTGTCACTG
ACGTAGTGATCTTTTTTAATACTTGCGACCAAACTCTCCACCAAGTGAATCGGTATTGCT
CCTGACGTCTTCGGCTCTCTGTAGTATCTTCCCAGCACATGTTTAGCTGCTTTCGTGGCG
TCGACCAAGTGATAGTGAGGGATTTGTGGGAAAAGATGATGGATCACGTGAGTTCCAATG
TCGTGATGGATGTTGTTGAAGATTCCATAATCTCTATCAATAGTTGTTAATCCTCCACGT
AAATAACTCCATTCCTTGCCTCTGTACCACGGCAACTTCTCATCATGACCATGATGATGC
AAGTACGTGACAGCGTCCAACCACATCACAAAGATAATGTAAGGAACACCATAGACTTTG
AGAACTGTGACTGGACCAAGGAGGAACGATAGATAAACAAGAGTGGCCAGCATTATGGAC
CAGCAAGTAGTTGAAGTTGCAATAAGCT
C

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4CK56JQ 821 0 0
G
GTAATGTAAATACATTAATAAAAAGAAAGGTTCCACGAGTACATTTTAAACTTAAAACAG
CAACAAATAAGCAAAAGAAAAGGAGTGCTTATTCCTAATAGAGCCAGGGAGAAGGGTTAA
TTGATTTTAGATTTGTCAGAAGCATAAACGTAGAGATCTGGATCTGTCTCGTAGAAGACA
ATATCACCAGTGTCACTGACGTAGTGATCTTTTTTAATACTTGCGACCAAACTCTCCACC
AAGTGAATCGGTATTGCTCCTGACGTCTTCGGCTCTCTGTAGTATCTTCCCAGCACATGT
TTAGCTGCTTTCGTGGCGTCGACCAAGTGATAGTGAGGGATTTGTGGGAAAAGATGATGG
ATCACGTGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGAAGATTCCATAATCTCTATCAATA
GTTGTTAATCCTCCACGTAAATAACTCCATTCCTTGCCTCTGTACCACGGCAACTTCTCA
TCATGACCATGATGATGCAAGTACGTGACAGCGTCCAACCACATCACAAAGATAATGTAA
GGAACACCATAGACTTTGAGAACTGTGACTGGACCAAGGAGGAACGATAGATAAACAAGA
GTGGCCAGCATTATGGACCAGCAAGTAGTTGAAGTTGCAATAAGCTTCCTCTCGCTTGGA
GCAAATAAACTACTGTATGGGTTATAATGTGACCCTTCTTTTCCAGGACTTCTGTACCAC
AGATAGATCGGGTAAGCGAGCATGGGCAGAGGGACAGTGTATCTGAGCATCCGAGTACTA
TGGGGCAAGCTCTTGTACAACTTTTCTGGCAGCGGACCCA

QA 2 821 2 821
DS 



AS 1 7

CO CL598Contig1 1272 7 7 U
AATGAGAAGTTTACTAAATTTGAGAAATAAAGAAAACACTGTATTGCATAAGCATCAAAA
TTATTCAGATATCAGAATCAAAACAACAGTAGAAAACACAGGAAACTTCAAAAATCAAAA
CACACAAAGGCCATCCATCCTTGGAACTCTTTTATCCATCCTCAGATTTTGTTAAAAGCA
ACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATC
ATGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATA
CCGTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAATCCTTCCATCTGGACGGAT
CTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATC
AAAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTC
TCTTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCA
TCTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTCT
GAGACGGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGATC
CTCAAGAGGGCATCGATGTGGCTGTACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTGAAGTTGGG
GGCTTTGCAAGAGCTGTAAAGACAGTGATGTCATCCTTTGAAGCCTGGTACCCAGTGATG
TAACTGCGAGTGAGGAGATGCTCATCGAGCTTCTTCAATCCAGAATCAGAGTTAAGGTTG
GGGAAAGAAGCAGCCATTGTCTTCTAAAGCTCGAGCCTTTATCACTGAGTTGCAACGGCG
GACTCGAAGAGGAAGAAGAGGAGTTAGTGATGCGGACGAGGAACGCTGGAATGTATATAA
CATAACGCCTCTAGGTTTACTTGTAATGGGCTTATTATTGGGCCCATTTAATACCTCTCA
GTGAGGCCTTTCAAGACTCAAATCAAATGTATTTTTTTCAGTGTTTTCATGTCCACAGTT
TTGGTCACGGTAGTATTTTTGTCGCTTATGGAGGAGCAGATAAATCAGCTTTCAGAGAGT
GTTTTTCTCTAACATGGAAGAACCCTTATGTTCTTCGTCTTGCTTTCTCCGCTGGAATCG
GTGGTCTTCTCTTTGGCTACGATACCGGCAAGTTTCTTAATCTGTTATTTGTATATTCAC
TCATCTATGTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK38JQ U 22
AF RR4E341JQ U 1
AF RR4C964JQ U 2
AF RR4CR91JQ U 2
AF RR4CR91TF C 145
AF RR4EK38TF C 167
AF RR4FI22TF C 543
BS 1 335 RR4E341JQ
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BS 337 684 RR4E341JQ
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BS 686 765 RR4CR91JQ
BS 766 905 RR4CR91TF
BS 906 1272 RR4FI22TF

RD RR4EK38JQ 611 0 0
GT
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GAACTCTTTTATCCATCCTCAGATTTTGTTAAAAGCAACAATGTCACAGCTCTGGACAAA
CTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAGACGAGGTC
GTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGCTT
TGACGCTCCCCAGAATAATCCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTT
CATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAAAACTGATGACTTTCCAGATTC
CTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTTCTCCTC
TTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCTTCCTCATCAGCCGCATCCTT
AGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTCTGAGACGGGGGCTGATCCCTCAAC
AATGACACC

QA 3 611 3 611
DS 

RD RR4E341JQ 684 0 0
AATGAGAAGTTTACTAAATTTGAGAAATAAAGAAAACACTGTATTGCATAAGCATCAAAA
TTATTCAGATATCAGAATCAAAACAACAGTAGAAAACACAGGAAACTTCAAAAATCAAAA
CACACAAAGGCCATCCATCCTTGGAACTCTTTTATCCATCCTCAGATTTTGTTAAAAGCA
ACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATC
ATGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATA
CCGTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAAAATAATCCTTCCATCTGGACGGAT
CTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATC
AAAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTC
TCTTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCA
TCTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTCT
GAGACGGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGATC
CTCAAGAGGGCATCGATGTGGCTG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4C964JQ 684 0 0
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ACACAAAGGCCATCCATCCTTGGAACTCTTTTATCCATCCTCAGATTTTGTTAAAAGCAA
CAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCA
TGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATAC
CGTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAATCCTTCCATCTGGACGGATC
TCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCA
AAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTCT
CTTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCAT
CTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTCTG
AGACGGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGATCC
TCAAGAGGGCATCGATGTGGCTGT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4CR91JQ 764 0 0
ATGAGAAGTTTACTAAATTTGAGAAATAAAGAAAACACTGTATTGCATAAGCATCAAAAT
TATTCAGATATCAGAATCAAAACAACAGTAGAAAACACAGGAAACTTCAAAAATCAAAAC
ACACAAAGGCCATCCATCCTTGGAACTCTTTTATCCATCCTCAGATTTTGTTAAAAGCAA
CAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCA
TGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATAC
CGTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAATCCTTCCATCTGGACGGATC
TCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCA
AAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTCT
CTTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCAT
CTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTCTG
AGACGGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGATCC
TCAAGAGGGCATCGATGTGGCTGTACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTGAAGTTGGGG
GCTTTGCAAGAGCTGTAAAGACAGTGATGTCATCCTTTGAAGCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4CR91TF 765 0 0
GACTCTTT*ATCCATC*TCAGATTTG**TAAAAGCAC**ATGTCACAGCTCTG*ACAAAC
TCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAGACGAGGTCG
TCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGCTTT
GACGCTCCCCAGAATAATCCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTC
ATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAAAACTGATGACTTTCCAGATTCC
TTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCT
TCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCTTCCTCATCAGCCGCATCCTTA
GAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTCTGAGACGGGGGCTGATCCCTCAACA
ATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGATCCTCAAGAGGGCATCGATGTGGCTG
TACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTGAAGTTGGGGGCTTTGCAAGAGCTGTAAAGACA
GTGATGTCATCCTTTGAAGCCTGGTACCCAGTGATGTAACTGCGAGTGAGGAGATGCTCA
TCGAGCTTCTTCAATCCAGAATCAGAGTTAAGGTTGGGGAAAGAAGCAGCCATTGTCTTC
TAAAGCTCGAGCCTTTATCACTGAGTTGCAACGGCGGACTC
GAAG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EK38TF 740 0 0
ATTTTG
TAAAAGCAACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCT
CTTCAATCATGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACT
TCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAATCCTTCCATCT
GGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGA
TATCAATCAAAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAG
CAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACAT
CATCATCATCTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAG
CCTCCTCTGAGACGGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACAC
CAGAGATCCTCAAGAGGGCATCGATGTGGCTGTACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTG
AAGTTGGGGGCTTTGCAAGAGCTGTAAAGACAGTGATGTCATCCTTTGAAGCCTGGTACC
CAGTGATGTAACTGCGAGTGAGGAGATGCTCATCGAGCTTCTTCAATCCAGAATCAGAGT
TAAGGTTGGGGAAAGAAGCAGCCATTGTCTTCTAAAGCTCGAGCCTTTATCACTGAGTTG
CAACGGCGGACTC
C

QA 7 739 7 739
DS 

RD RR4FI22TF 730 0 0
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GACGGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCTTTCAGCAGAGACACCAGAGATCCT
CAAGAGGGCATCGATGTGGCTGTACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTGAAGTTGGGGG
CTTTGCAGGAGCTGTAAAGACAGTGATGTCATCCTTTGAAGCCTGGTACCCAGTGATGTA
ACTGCGAGTGAGGAGATGCTCATCGAGCTTCTTCAATCCAGAATCAGAGTTAAGGTTGGG
GAAAGAAGCAGCCATTGTCTTCTAAAGCTCGAACCTTTATCACTGAGTTGCAACGGCGGA
CTCGAAGAGGAAGAAGAGGAGTTAGTGATGCGGACGAGGAACGCTGGAATGTATATAACA
TAACGCCTCTAGGTTTACTTGTAATGGGCTTATTATTGGGCCCATTTAATACCTCTCAGT
GAGGCCTTTCAAGACTCAAATCAAATGTATTTTTTTCAGTGTTTTCATGTCCACAGTTTT
GGTCACGGTAGTATTTTTGTCGCTTATGGAGGAGCAGATAAATCAGCTTTCAGAGAGTGT
TTTTCTCTAACATGGAAGAACCCTTATGTTCTTCGTCTTGCTTTCTCCGCTGGAATCGGT
GGTCTTCTCTTTGGCTACGATACCGGCAAGTTTCTTAATCTGTTATTTGTATATTCACTC
ATCTATGTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 8

CO CL599Contig1 575 8 3 U
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CTCAAATCCTTTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACC
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CCGCTGGTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTC
CAAGCAACTAACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACT
ACTTGTAACCTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCA
GCAACGGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAAT
AAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTT
GGGTTTAATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATT
TTTAAATAATTGCATCTTTATAGACTTGCTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4CH04JQ C 11
AF RR4CC32TF U 11
AF RR4D409TF U 11
AF RR4DH08TF U 1
AF RR4CH04TF U 11
AF RR4D108JQ C 9
AF RR4D108TF U 9
AF RR4DQ34TF U 54
BS 1 10 RR4DH08TF
BS 11 12 RR4CC32TF
BS 13 575 RR4DH08TF

RD RR4CH04JQ 265 0 0
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ACAAAGATTGTATATGTAACGCTCT

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RD RR4CC32TF 497 0 0
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CTTATGTCACATCTATT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4D409TF 514 0 0
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TTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTC
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ACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACC
TCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCGTATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCA
GTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTT
TAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATA
CTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4DH08TF 575 0 0
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GGACCTATGGTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCG
CCGCTGGTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTC
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AAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTT
GGGTTTAATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATT
TTTAAATAATTGCATCTTTATAGACTTGCTTTTAT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4CH04TF 533 0 0
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TTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTC
TGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTA
ACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACC
TCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCA
GTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTT
TAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATA
CTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4D108JQ 567 0 0
GGAT
GTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTT
GCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTT
CGTGCTCAACAATGCCTAGACAATTTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTTTG
CCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAAC
AAAGATTGTATATGTAACGCTTTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTC
CCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGT
TCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTTTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTA
AATAATGAGAAAGTGTTTTTTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATACT
TATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAATTG
CATCTTTATAGACTTGCTTTTAT

QA 5 567 5 567
DS 

RD RR4D108TF 567 0 0
GGAT
GTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTT
GCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTT
CGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTG
CCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAAC
AAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTC
CCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGT
TCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTA
AATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATACT
TATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAATTG
CATCTTTATAGACTTGCTTTTAT

QA 5 567 5 567
DS 

RD RR4DQ34TF 522 0 0
GGAACTTCTCAAATCCTTTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCT
AGAGACCGGACCTATGGTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGT
GTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCAT
CGCTCTCCAAGCAACTAACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTT
TACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCT
AGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGA
ATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTG
TTTGGTTGGGTTTAATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGG
GAATATTTTTAAATAATTGCATCTTTATAGACTTGCTTTTAT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 8

CO CL600Contig1 952 8 7 U
GGTACTACCAAAGTGGTAGTTTTAAAATTCTCCCATTTATTGAATCCAATGTTTGTCATT
CAATATATAAGGGATAGTATTATTTAAGAACCTCGAAGAAACCCGGAAGAAACGAATAGT
CATTTTTCTTTTCTAATCAAACAAGCAAAAGAATAGTGTAAAAAACCATTTATTAATACC
CAATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCATCAATCTTGAGACTAACATCCC
TAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCAGTTTCATCAAAATGGTCTTCACGTG
CGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACGAGTCTAATGACACAAAGG
CACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGGTCTCTAAGTTCCGATGAA
CATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTTGGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAA
GTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGA
CGGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGG
TGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAACAGTTGGATCAGATGGAT
ACTTGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCT
CAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAAACAAAGAGACGATCAACGACATAT
GCTTCATTGTAACCGCCATCTTTTCTCCCCTTCTCTGTATATACCGGCGACGATGAATCT
GGAGACCGGAGGAGGTGGTTACGGGTTGGTTTGATTTGATGATAAAACTTTATCAAGTTG
CACTGATATTTCGGATTCGGATAAGCCCTAAGAAAAGTCTACGAGTGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G794JQ U 39
AF RR4GE83JQ U 1
AF RR4BD60JQ U 100
AF RR4BD60TF C 100
AF RR4G794TF C 108
AF RR4AU40JQ U 155
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AF RR4AU40TF C 155
BS 1 108 RR4GE83JQ
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BS 757 952 RR4AU40JQ

RD RR4G794JQ 515 0 0
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TAAAAAACCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCA
TCAATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCAGTT
TCATCAAAATGGTCTTCACGTGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGG
CACGAGTCTAATGACACAAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGGCAA
GCGGTCTCTAAGTTCCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTTGGC
CATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAG
AAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACGGAGTTGGGAAC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4GE83JQ 732 0 0
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CAATATATAAGGGATAGTATTATTTAAGAACCTCGAAGAAACCCGGAAAAAACGAATAGT
CATTTTTCTTTTCTAATCAAACAAGCAAAAGAATAGTGTAAAAAACCATTTATTAATACC
CAATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCATCAATCTTGAGACTAACATCCC
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CGGAGTTGGGAGCAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGG
TGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAACAGTTGGATCAGATGGAT
ACTTGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCT
CAGCGATGACAC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4BD60JQ 657 0 0
AAA
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TCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCAGTTTCAT
CAAAATGGTCTTCACGTGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACG
AGTCTAATGACACAAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGG
TCTCTAAGTTCCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTTGGCCATA
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TGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCCTGTAAGACATGAAGAGGG
ATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAA
CAGTTGGATCAGA*GGATATTTGCAGATAACCACACCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAG
ACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAA

QA 4 657 4 657
DS 

RD RR4BD60TF 657 0 0
AAA
CCGGAAGAAACGAATAGTCATTTTTCTTTTCTAATCAAACAAGCAAAAGAATAGTGTAAA
AAACCATTTATTAATACCCGATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCATCAA
TCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCAGTTTCAT
CAAAATGGTCTTCACGTGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACG
AGTCTAATGACACAAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGG
TCTCTAAGTTCCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTTGGCCATA
GCAACAG*GACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACAGAGAAGC
TGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCCTGTAAGACATGAAGAGGG
ATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAA
CAGTTGGATCAGA*GGATATTTGCAGATAACCACACCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAG
ACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAA

QA 4 657 4 657
DS 

RD RR4G794TF 755 0 0
AA
AAACGAATAGTCATTTTC**TTTCTAATCAAACAAGCAAAAGAATAGTGTAAAAAACCAT
TTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCATCAATCTTGAG
ACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCAGTTTCATCAAAATG
GTCTTCACGTGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACGAGTCTAA
TGACACAAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGGTCTCTAA
GTTCCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTTGGCCATAGCAACAG
AGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAGAAGCTGGTGCT
TTTGAACAAGACGGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAGGGGTTTGTA
TCCAGTTACGGTGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAACAGTTGG
ATCAGATGGATACTTGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAGACGCAGG
CTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAAACAAAGAGACGAT
CAACGACATATGCTTCATTGTAACCGCCATCTTTTCTCCCCTTCTCTGTATATACCGGCG
ACGATGAATCTGGAGACCGGAGGAGGTGGTT
CC

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR4AU40JQ 798 0 0
G
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GCATCAATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCA
GTTTCATCAAAATGGTCTTCACGTGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAA
AGGCACGAGTCTAATGACACAAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGG
CAAGCGGTCTCTAAGTTCCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTT
GGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACG
GAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACGGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATG
AAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCC
CAGGCAACAGTTGGATCAGATGGATACTTGCAGATA*CCACTCCCTTTCCGTTAATTGGA
GTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCA
AACAAAGAGACGATCAACGACATATGCTTCATTGTAACCGCCATCTTTTCTCCCCTTCTC
TGTATATACCGGCGACGATGAATCTGGAGACCGGAGGAGGTGGTTACGGGTTGGTTTGAT
TTGATGATAAAACTTTATCAAGTTGCACTGATATTTCGGATTCGGATAAGCCCTAAGAAA
AGTCTACGAGTGTCCCC

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR4GE83TF 703 0 0
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TCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACGAGTCTAATGACACAAAGGCACCT
CCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGGTCTCTAAGTTCCGATGAACATTA
CGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTTGGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCA
GATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACGGAG
TTGGGAGCAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAG
GCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAACAGTTGGATCAGATGGATACTTG
CAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCG
ATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAAACAAAGAGACGATCAACGACATATGCTTC
ATTGTAACCGCCATCTTTTCTCCCCTTCTCTGTATATACCGGCGACGATGAATCTGGAGA
CCGGAGGAGGTGGTTACGGGTTGGTTTGATTTGATGATAAAACTTTATCAAGTTGCACTG
ATATTTCGGATTCGGATAAGCCCTAAGAAAAGTCTACGAGT
CC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4AU40TF 798 0 0
G
GTGTAAAAAACCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATTAT*CTCTCAA
GCATCAATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTATTCTCA
GTTTCATCAAAATGGTCTTCACGTGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAA
AGGCACGAGTCTAATGACACAAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCAGTCTTAGCCGTGGGG
CAAGCGGTCTCTAAGTTCCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGCTGCTCTGTAATGGTT
GGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACG
GAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACGGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATG
AAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAAGGCAGCAGAAAGGTAACCC
CAGGCAACAGTTGGATCAGATGGATACTTGCAGATA*CCACTCCCTTTCCGTTAATTGGA
GTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCA
AACAAAGAGACGATCAACGACATATGCTTCATTGTAACCGCCATCTTTTCTCCCCTTCTC
TGTATATACCGGCGACGATGAATCTGGAGACCGGAGGAGGTGGTTACGGGTTGGTTTGAT
TTGATGATAAAACTTTATCAAGTTGCACTGATATTTCGGATTCGGATAAGCCCTAAGAAA
AGTCTACGAGT
GTCCCC

QA 2 792 2 792
DS 



AS 2 5

CO CL601Contig1 819 2 6 U
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CTTCTGGAAAAGGGAGACTAATCAGAAAGCAAAGATTCTCAGGAAAGTGGATTATCCGCT
GGAGTTGGATATTTTTGACCTTTGTTCTGAGGATCTCCGAAAGAAACTGGAAGCTCCTCG
CCAGAAACTAAGAGATGAGGAAGGTAAAAAGCTTGGTCTGCAACCAAAGAGTAGCTCAAA
GGACAGCGATGTGAAAATGACTGATGCAGAGGCGTCTTCAAATGAAAGTGGAGAATCATC
AACTGTTACCCAACAGGAAGGTGCTTCATCTGAGAAGGGAACTCTTCACATGACCGGAAT
CTATGACCTGGTCTCTGTGCTAACCCACAAGGGTAGGAGTGCGGACTCTGGACATTATGT
TGCATGGGTCAAGCAAGAGAGTGGCAAATGGATTCAATATGACGATAGCCACCCAAGCCT
GCAACGGGAGGAAGACATCACAAAGCTCTCTGGAGGAGGGGATTTGGCATATGGCGTACA
TCATTATGTACAAAGCCCGCTTCGTCTCGATGTGAACTCTCTTTTAGTTTTGGTTGTTTT
TTTGGTTCTTGAAACGTTCAGGATCGTCAAGAGCTTTAAATAGACCACCTCAGAAGTTTC
GATGTGATATCTCTTTTACTTTTGGTTCTTGAAACGTTCAGGATCGTCAAGAGCTTTAAA
TAGACCACCTCAGAAGTTTCTGTGTCTTGCAATGTTTTAGACTGTATTTTGTCACAGTAT
ACTATCAAGACCATCAATTGTTTCTTTCGTTTGACACCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AJ80JQ C 1
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BS 1 419 RR4AJ80JQ
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BS 700 700 RR4AJ80JQ
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BS 810 819 RR4A852TF

RD RR4AJ80JQ 818 0 0
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ACTATCAAGACCATCAATTGTTTCTTTCGTTTGACACC

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DS 

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TGT
TTGCATGGGTCAAGCAAGAGAGTGGCAAATGGATTCAATATGACGATAGCCACCCAAGCC
TGCAACGGGAGGAAGACATCACAAAGCTCTCTGGAGGAGGGGATTTGGCATATGGCGTAC
ATCATTATGTACAAAGCCCGCTTCGTCTCGATGTGAACTCTCTTTTAGTTTTGGTTGTTT
TTTTGGTTCTTGAAACGTTCAGGATCGTCAAGAGCTTTAAATAGACCACCTCAGAAGTTT
CGATGTGATATCTCTTTTACTTTTGGTTCTTGAAACGTTCGGGATCGTCAAGAGCTTTAA
ATAGACCACCTCAGAAGTTTCTGTGTCTTGCAATGTTTTAGACTGTATTTTGTCACAGTA
TACTATCAAGACCATCAATTGTTTCTTTCTTTTGACACCA

QA 4 403 4 403
DS 



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TGCTGTTTCCCCTACGCAGTTCTGGATGACATTACGAAAAAAGTTCCCTCAGTTTAGTCA
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CACTCCTTCACAGTCCCTAAAAGCACCAACTTCCAGCGAAGATTCTGATGCAGTGAAAGC
TCTCTTTGGTGTCAATCTTCGGAGCAGGGTGCATTGTCAAGAAAGTGGCGAAGAAAGCTC
AGAGACGGAATCTGTATATTCGCTAAAATGTCATATATCACACGAGGTGAACCACTTGCA
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TACTGCGCTTTACCTCAAGGAGTCCCTTATAGATTCCTTGCCAAGGTACTTGACCGTTCA
GTTTGTGCGGTTCTTCTGGAAAAGGGAGACTAATCAGAAAGCAAAGATTCTCAGGAAAGT
GGATTATCCGCTGGAGTTGGATATCTTTGACCTTTGTTCTGAGGATCTCCGAAAGAAACT
GGAAGCTCCTCGCCAGAAACTAAGAGATGAGGAAGGTAAAAAGCTTGGTCTGCAACCAAA
GAGTACCACCGATGTGAAAATGACTGATGCAGAGGCGCCATCAAATGAAGGTGGAGAATC
ATCCACCACCGCTGTCCAACAGGAAGGTGCATCTTCTTCTTTTGAGAAGGGAACTCACAT
GACTGGAATCTATGACCTGGTCACTGTGTTGACCCACAAGGGAAGGAGTGCGGACTCCGG
TCATTACGTTGCATGGGTTAAGCAAGAGAGTGGCAAATGGATTCAGTATGATGATAGCCA
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TTTTTACAATGTTCGGACTTTATGTACTTGTTCCTGTAGCAATGAGACATGTTTCATCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E206TF U 1
AF RR4AJ80TF U 392
AF RR4CH41JQ C 779
BS 1 432 RR4E206TF
BS 433 433 RR4AJ80TF
BS 434 601 RR4E206TF
BS 602 602 RR4AJ80TF
BS 603 628 RR4E206TF
BS 629 629 RR4AJ80TF
BS 630 665 RR4E206TF
BS 666 666 RR4AJ80TF
BS 667 707 RR4E206TF
BS 708 879 RR4AJ80TF
BS 880 880 RR4CH41JQ
BS 881 894 RR4AJ80TF
BS 895 895 RR4CH41JQ
BS 896 942 RR4AJ80TF
BS 943 943 RR4CH41JQ
BS 944 945 RR4AJ80TF
BS 946 946 RR4CH41JQ
BS 947 1044 RR4AJ80TF
BS 1045 1045 RR4CH41JQ
BS 1046 1111 RR4AJ80TF
BS 1112 1620 RR4CH41JQ

RD RR4E206TF 707 0 0
GAAGACAAAATCTCGTTACCGTCTCTCCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGAAACCTCTC
AGTTCTCACAGAAAACAAAGATGCTCACAGTAAGCGTGAAGTGGCAGAAGAAGGTGTTTG
AAGGGATCGAGATTGATCCCACTCTGCCTCCCTATGTGTTCAAGGCTCAGCTGTATGATT
TGACTGGAGTTCCTCCAGAGAGGCAAAAGATCATGGTCAAAGGTGGCCTCTTGAAGGATG
AAGGATGATGATGGGAACTGCAGATGAGATTGTGAAAGCTCCTGAAAAGGCTATTTTTTT
TGCTGAGGATCTACCTGAAGAAGAGCAAGCCACTCATTTGGGTTACAGTGCAGGCCTTGT
CAACCTTGGCAACACATGTTACATGAACTCCACGGTGCAGTGCTTAAAATCAGTCCCAGA
GTTGAAATCTGCGTTATCCAACTACGCACTTACTGGACGAAGCAATGATGTCGACCAGAC
TTCTCACATGCTCACAGTTGCCACACGCGAGCTATTTGGTGATCTTGACAGAAGTGTCAA
TGCTGTTTCCCCTACGCAGTTCTGGATGACATTACGAAAAAAGTTCCCTCAGTTTAGTCA
GTTGCAGAATGGAATGCACATGCAGCAG*ATGCCGAAGAATGTTGGACACAACTGTTGTA
CACTCTTTCACAGTCCCTAAAAGCACCAACTTCCAGCGAAGATTCTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4AJ80TF 720 0 0
GGGGTT
CAGTGCTTAAAATCAGTCCCAGAGTTGAAATCTGCATTATCCAACTACGCACTTACTGGA
CGAAGTAATGATGTCGACCAGACTTCTCACATGCTCACAGTTGCCACACGCGAGCTATTT
GGTGATCTTGACAGAAGTGTCAATGCTGTTTCCCCTACGCAGTTCTGGATGACATTACGA
AAAAAGTTCCCTCAGTTTAGTCAGCTGCAGAATGGAATGCACATGCAGCAGGATGCTGAA
GAATGTTGGACACAACTGTTGTACACTCCTTCACAGTCCCTAAAAGCACCAACTTCCAGC
GAAGATTCTGATGCAGTGAAAGCTCTCTTTGGTGTCAATCTTCGGAGCAGGGTGCATTGT
CAAGAAAGTGGCGAAGAAAGCTCAGAGACGGAATCTGTATATTCGCTAAAATGTCATATA
TCACACGAGGTGAACCACTTGCATGAAGGATTAAAACATGGTCTGAAAGGAGAACTTGAA
AAGACATCTCCTGCTCTTGGCCGTACTGCGCTTTACCTCAAGGAGTCCCTTATAGATTCC
TTGCCCAGTTACTTGACCGTTCAGTTTGTGCGGTTCTTCTGGAAAAGGGAGACTAATCAG
AAAGCAAAGATTCTCAGGAAAGTGGATTATCCGCTGGAGTTGGATATTTTTGACCTTTGT
TCTGAGGATCTCCGAAAGAAACTGGAAGCTCCTCGCCAGAAACTAAGAGATGAG

QA 7 720 7 720
DS 

RD RR4CH41JQ 842 0 0
TCAGAGACTGAATCTGTATAT*CTCTAAAATGTCATATATCACACGAGGTGAACCACTTG
CATGAAGGATTAAAACATGGTCTGAAAGGAGAACTTGAAAAAACATCTCCTGCTCTGGGC
CGTACTGCTGTTTACCTCAAGGAGTCCCTTATAGATTCCTTGCCAAGGTACTTGACCGTT
CAGTTTGTGCGGTTCTTCTGGAAAAGGGAGACTAATCAGAAAGCAAAGATTCTCAGGAAA
GTGGATTATCCGCTGGAGTTGGATATCTTTGACCTTTGTTCTGAGGATTTCCGAAAGAAA
CTGGAAGCTCCTCGCCAGAAACTTAGAGATGAGGAAGGTAAAAAGCTTGGTCTGCAACCA
AAGAGTACCACCGATGTGAAAATGACTGATGCAGAGGCGCCATCAAATGAAGGTGGAGAA
TCATCCACCACCGCTGTCCAACAGGAAGGTGCATCTTCTTCTTTTGAGAAGGGAACTCAC
ATGACTGGAATCTATGACCTGGTCACTGTGTTGACCCACAAGGGAAGGAGTGCGGACTCC
GGTCATTACGTTGCATGGGTTAAGCAAGAGAGTGGCAAATGGATTCAGTATGATGATAGC
CACCCGAGTATACAACTGGAGGAAGACATCACAAAGCTCTCTGGTGGAGGTGATTGGCAT
ATGGCTTACATCATTATGTACAAAGCCCGCTTCGTCTCCATGTAATCTCCTTCTCTTATG
TTGATTTTTTAAGTTCTTGAAACATTCAAAGTGGTTCAAACCTCAGGGATTTCATGTTTT
TTTTTTTACAATGTTCGGACTTTATGTACTTGTTCCTGTAGCAATGAGACATGTTTCATC
TT

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 7

CO CL602Contig1 854 7 16 U
GGGAAGGTTTCCGCATAGTTCACACACACTCTCGACTTCAACCGACGCACATATCATCAT
CAATTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAG
ATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAC
GATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGC
AGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTCAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGT
GTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGAT
GTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGAC
TTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGC
ATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAG
GTTGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTG
CCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATC
ATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCA
GAGATTGTCAAAAAGGATTCGGAATTTTTTTTG*GACTTTCATGCTTTCTTTTAAGTATT
TTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAAATTATTGAATTTAAGAGTTTGCAATTACTGAT
TTGAGTTTCATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 0 35 35 
35 35 0 0 0 0 0 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 5 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 5 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D721TF U 9
AF RR4FI33TF U 1
AF RR4D820TF U 2
AF RR4GL20JQ C 98
AF RR4AJ90JQ C 32
AF RR4D820JQ C 114
AF RR4AJ90TF U 32
BS 1 52 RR4FI33TF
BS 53 53 RR4AJ90TF
BS 54 218 RR4FI33TF
BS 219 219 RR4D721TF
BS 220 272 RR4FI33TF
BS 273 273 RR4AJ90TF
BS 274 386 RR4FI33TF
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BS 388 684 RR4FI33TF
BS 685 685 RR4D721TF
BS 686 687 RR4FI33TF
BS 688 688 RR4D721TF
BS 689 728 RR4FI33TF
BS 729 730 RR4D820TF
BS 731 847 RR4AJ90TF
BS 848 854 RR4AJ90JQ

RD RR4D721TF 703 0 0
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CATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCT
TGATAAGCCTGAAGTTGAAGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGA
TGATGACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGA
GAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTAAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCG
TGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGGTGTGTTCAA
GAGTCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGACTTGAGCTC
TCAGATCCAGTCACAAGCGGCGGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTC
AAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGA
GGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCC
AAGAGCGGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGTAGCT
TACCACCTAAACAAACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FI33TF 728 0 0
GGGAAGGTTTCCGCATAGTTCACACACACTCTCGACTTCAACCGACGCACATCTCATCAT
CAATTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAG
ATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAC
GATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATGGAGAAGCCGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGC
AGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGT
GTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGAT
GTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACATACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGAC
TTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGC
ATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAG
GTTGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTG
CCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATC
ATGGAGCTTACCACCTAAACAAACATCCTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCA
GAGATTGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4D820TF 729 0 0
GGAAGGT
TTCCGCATAGTTCACACACACTCTCGACTTCAACCGACGCACATCTCATCATCAATTCAT
CATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCT
TGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGA
TGATGACGCAGAGGGACAAGATGGAGAAGCCGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGA
GAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCG
TGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAA
GAGCCCTGCATCAGACACATACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGACTTGAGCTC
TCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTC
AAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGA
GGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTGGGCC
AAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCT
TACCACCTAA*CAAACATCTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGT
CA

QA 8 729 8 729
DS 

RD RR4GL20JQ 726 0 0
CCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCCGATG
ACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATGGATAAG
CAGCAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTCAAGC
TTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCA
TGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACGTGATCT
TCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTGAACTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAGCAGT
TCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCTGC**
TGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATTGAGT
TGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTG
ATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGTGTGG
TTTAACTTGAGTTATATGTCCCATAGATTGTCAAAAAGGATTCGGAATTTCTTTTG*GAC
TTTCATGCTTTCTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAAATTATTGAA
TTTAAG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4AJ90JQ 823 0 0
GG
GACTTCAACCGACGCACATATCATTATCA********TGACTACCGAAGAGAAAGAGATC
CTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCC
GATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATGGA
GAAGCAGCAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTC
AAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAAT
ATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACGTG
ATCTTCGGAGAGGCCAAGATCTAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAG
CAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCT
GCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATT
GAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCT
GCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGT
GTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTCGGAATTTTTTTTG
*GACTTTCATGCTTTCTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAAATTAT
TGAATTTAAGAGTTTGCAATTACTGATTTGAGTTTCATGCG

QA 3 823 3 823
DS 

RD RR4D820JQ 736 0 0
GCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGA
CTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATGGAGAAGCCGGAGGCAAGTCAAA
GCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGTTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCAT
CACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAA
ACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACATACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGAT
AGAGGACTTGAGCTTTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATTT
CAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGA
TGAGGAGGTTGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGC
AGGAGTGCCTGGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTTTC
TGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACATCTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATA
TGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTCGGAATTTTTTTTTTGACTTTCATGCTTTCTTTT
AAGTGTTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAAATTATTGAATTTAAGTTTTTGCAAT
TACTGATTTTAGTT
CC

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DS 

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GG
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GATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATGGA
GAAGCAGCAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTC
AAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAAT
ATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACGTG
ATCTTCGGAGAGGCCAAGATCTAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCGAG
CAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCGCT
GCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAAGACATT
GAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCT
GCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGT
GTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTCGGAATTTTTTTTG
*GACTTTCATGCTTTCTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAAATTAT
TGAATTTAAGAGTTTGCAATTACTGATTTGAGTT
TCATG

QA 3 816 3 816
DS 



AS 1 9

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GTTAGCAAGGTTCAACAGTAGAGCGTTAAAACATTATATAGCTATAGATTTACAGCTAAT
AACATAAATATGATCATCCCAAGTCTTGGGTATAGAAGAACACACCATTACTCCATTCAT
CGTCTTCTTCCACACATTCTCAACATCAATCACCACAGTAGAGCAATCCTTACCAATCAC
AAAGATATTACTCCCAACAGAAACAAGCCGACATTGCTGCGTCATCACCAACTGAGATAG
CTTCCCTATACGGATCCACATCCTCGGCTCCTTGCACCACATTGTAAGCGTAGCTCCAAA
ACTCTGATCCAAAACATAGAGAACATCTCCTACAACAACTGCTGGACCTAGCCATCCTGA
TGCCATGTCATCATCCACTCGTTCCCAAACATTGGTAGACCCATCATAGACTGCAGCTGA
AGATCCAGCAGCACCACGAACATAAACCTTCCCATCCATTACAAATGAATCCTCGATTTC
AGGGACAATATTCGCGTCTGAACACGATACACATGCTCTCGTTATAGGATCATAGATGTC
CCAAGTCTGTGAAGCTCTTGAGTTCACTCCTAACCC*ACCAATGGCCATAACTTTCCCAT
CTAGGGTCTCACAAGCAAA*GAAGCATCTTTTAGTTGAAAGAGGAGGGAGTAAGTGAAGC
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ACACCCACCCAACACAAACAGTCTCTTACCCAACACTGCAAAACCCATACCGTCTCTAAA
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GTGCAAGTAGACACGGCCAGATGTGTGGCGGCACAAGGCGTAGATCCAAGACTCGGTCAA
GTTAGACTTGTTGCGATAATCACAGAAGCCATCACTGCAGATGGAATCTCTCCATCTCCT
GGAAACGCATTTCATGGCCATGTGGTGTTCTCTTGGAACTCTGGCTAAGCAGAGATTCAA
GATATCGTCAGGGACTCCGCTTATAAGCGACGTTTGTGTCTCTTTCGAAGATTCCTTCTC
ATGTACTACTATACGGTCCATTGTGTGAGTGAGTCAATCAGCAAAGGATAGATAGATCCG
AATTTTCGGAGCTTGGCGAGTAGTCTTCTTATAGATCTCAGATCGTGACAAAGGTAAAGC
GTGATTAAGGAATCACCAGAAGTTTGATGAGAAGTTTCCAGCCTCTTTGATTGAGAGAGA
TGATCGATTCTTCTTTTTTTATTTTCGGTCAATGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A162JQ U 46
AF RR4A162TF C 573
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AF RR4AQ29JQ U 1
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BS 1 823 RR4A015JQD
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AGATTTACAGCTAATAACATAAATATGAACATCCCAAGTCTCGGGTATAGAAGAACACAC
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ATCCTTACCAATCACAAAGATATTACTCCCAACAGAAACAAGCCGACATTGCTGCGTCAT
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ACCTAGCCATCCTGATGCCATGTCATCATCCACTCGTTCCCAAACATTGGTAGACCCATC
ATAGACTGCAGCTGAA

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DS 

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QA 1 131 1 131
DS 

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AACATAAATATGATCATCCCAAGTCTTGGGTATAGAAGAACACACCATTACTCCATTCAT
CGTCTTCTTCCACACATTCTCAACATCAATCACCACAGTAGAGCAATCCTTACCAATCAC
AAAGATATTACTCCCAACAGAAACAAGCCGACATTGCTGCGTCATCACCAACTGAGATAG
CTTCCCTATACGGATCCACATCCTCGGCTCCTTGCACCACATTGTAAGCGTAGCTCCAAA
ACTCTGATCCAAAACATAGAGAACATCTCCTACAACAACTGCTGGACCTAGCCATCCTGA
TGCCATGTCATCATCCACTCGTTCCCAAACATTGGTAGACCCATCATAGACTGCAGCTGA
AGATCCAGCAGCACCACGAACATAAACCTTCCCATCCATTACAAATGAATCCTCGATTTC
AGGGACAATATTCGCGTCTGAACACGATACACATGCTCTCGTTATAGGATCATAGATGTC
CCAAGTCTGTGAAGCTCTTGAGTTCACTCCTAACCC*ACCAATGGCCATAACTTTCCCAT
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QA 1 823 1 823
DS 

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AACATAAATATGATCATCCCAAGTCTTGGGTATAGAAGAGCACACCATTACTCCATTCAT
CGTCTTCTTCCACACATTCTCAACATCAATCACCACAGTAGAGCAATCCTTACCAATCAC
AAAGATATTACTCCCAACAGAAACAAGCCGACATTGCTGCGTCATCACCAACTGAGACAG
CTTCCCTATACGGATCCACATCCTCGGCTCCTTGCACCACATTGTAAGCGTAGCTCCAAA
ACTCTGATCCAAAACATAGAGAACATCTCCTACAACAACTGCTGGACCTAGCCATCCTGA
TGCCATGTCATCATCCACTCGTTCCCAAACATTGGTAGACCCATCATAGACTGCAGCTGA
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CCAAGTCTGTGAAGCTCTTGAGTTCACTCCTAACCC*ACCAATGGCCATAACTTTCCCAT
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TGCGTCATCACCAACTGAGATAGCTTCCCTATACGGATCCACATCCTCGGCTCCTTGCAC
CACATTGTAAGCGTAGCTCCAAAACTCTGATCCAAAACATAGAGAACATCTCCTACAACA
ACTGCTGGACCTAGCCATCCTGATGCCATGTCATCATCCACTCGTTCCCAAACATTGGTA
GACCCATCATAGACTGCAGCTGAAGATCCAGCAGCACCACGAACATAAACCTTCCCATCC
ATTACAAATGAATCCTCGATTTCAGGGACAATATTCGCGTCTGAACACGATACACATGCT
CTCGTTATAGGATCATAGATGTCCCAAGTCTGTGAAGCTCTTGAGTTCACTCCTAACCC*
ACCAATGGCCATAACTTTCCCATCTAGGGTCTCACAAGCAAA*GAAGCATCTTTTAGTTG
AAAGAGGAGGGAGTAAGTGAAGCCAAGTGTCCATAGCAGCATCATAGCAATAAACATCAT
CACAAGCATCTTCCACCC*AACCACACCCACCCAACACAAACAGTCTCTTACCCAACACT
GCAAAACCCATACCGTCTCTAAAAGTAATATGCCGAGGAATCTGATTGACTCTTCTCCAT
GACCTTCTCGAAG*AATCAGCACGTGCAAGTAGA

QA 1 874 1 874
DS 

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AAAGTAATATGCCGAGGAATCTGATTGACTCTTCTCCATGACCTTCTCGAAGGAATCAGC
ACGTGCAAGTAGACACGGCCAGATGTGTGGCGGCACAAGGCGTAGATCCAAGACTCGGTC
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AAGATATCGTCAGGGACTCCGCTTATAAGCGACGTTTGTGTCTCTTTCGAAGATTCCTTC
TCATGTACTACTATACGGTCCATTGTGTGAGTGAGTCAATCAGCA

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CTAGGGTCTCACAAGCAAA*GAAGCATCTTTTAGTTGAAAGAGGAGGGAGTAAGTGAAGC
CAAGTGTCCATAGCAGCATCATAGCAATAAACATCATCACAAGCATCTTCCACCCCAACC
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AGTAATATGCCGAGGAATCTGATTGACTCTTCTCCATGACCTTCTCGAAGGAATCAGCAC
GTGCAAGTAGACACGGCCAGATGTGTGGCGGCACAAGGCGTAGATCCAAGACTCGGTCAA
GTTAGACTTGTTGCGATAATCACAGAAGCCATCACTGCAGATGGAATCTCTCCATCTCCT
GGAAACGCATTTCATGGCCATGTGGTGTTCTCTTGGAACTCTGGCTAAGCAGAGATTCAA
GATATCGTCAGGGACTCCGCTTATAAGCGACGTTTGTGTCTCTTTCGAAGATTCCTTCTC
ATGTACTACTATACGGTCCATTGTGTGAGTGAGTCAATCAGCAAAGGATAGATAGATCCG
AATTTTCGGAGCTTGGCGAGTAGTCTTCTTATAGATCTCAGATCGTGACAAAGGTAAAGC
GTGATTAAGGAATCACCAGAAGTTTGATGAGAAGTTTCCAGCCTCTTTGATTGAGAGAGA
TGATCGATTCTTCTTTTTTTATTTTCGGTCAATGATCC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AQ29TF 713 0 0
CCATAACTTTCCCATCTAGGGTCTCACAAGCAAA*GAAGCATCTTTTAGTTGAAAGAGGA
GGGAGTAAGTGAAGCCAAGTGTTCATAGCAGCATCATAGCAATAAACATCATCACAAGCA
TCTTCCACCC*AACCACACCCACCCAACACAAACAGTCTCTTACCCAACACTGCAAAACC
CATACCGTCTCTAAAAGTAATATGCCGAGGAATCTGATTGACTCTTCTCCATGACCTTCT
CGAAGGAATCAGCACGTGCAAGTAGACACGGCCAGATGTGTGGCGGCACAAGGCGTAGAT
CCAAGACTCGGCCAAGTTAGACTTGTTGCGATAATCACAGAAGCCATCACTGCAGATGGA
ATCTCTCCATCTCCTGGAAACGCATTTCATGGCCATGTGGTGTTCTCTTGGAACTCTGGC
TAAGCAGAGATTCAAGATATCGTCAGGGACTCCGCTTATAAGCGACGTTTGTGTCTCTTT
CGAAGATTCCTTCTCATGTACTACTATACGGTCCATTGTGTGAGTGAGTCAATCAGCAAA
GGATAGATAGATCCGAATTTTCGGAGCTTGGCGAGTAGTCTTCTTATAGATCTCAGATCG
TGACAAAGGTAAAGCGTGATTAAGGAATCACCAGAAGTTTGATGAGAAGTTTCCAGCCTC
TTTGATTGAGAGAGATGATCGATTCTTCTTTTTTTATTTTCGGTCAATGATCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 8

CO CL604Contig1 736 8 6 U
GAAACCAGGAAGAAGAAGTAATATAGAAATTACATGTTTCATAAATCAGACATTTTACAA
TCCGATATATAAAGTCTCATAAACAGAAATCCAAAGAGAAAAAAAGCAACAGACTTATTG
AAAATGAAATGAGAAGATATTATTAT*ATGGACGTGACTTAAGCATCAGTGAAGCTTGGT
GGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGCACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATT
CTGATAAAGGCATTGGGGTACTCCTTTTTGCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCA
GAGTCAGTGCAACCGAACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAGTAT
CCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTACACAAATCCGTGCTCCAACTCGAATTCAACACAA
GGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCGACTTCCTTAGCCAACTCAACATCGGAAAGG
TCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCTCAAACTTCTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATG
CAGCTAACTCTTCCTCCGTTGCTAGCGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTG
ACTGGGAATGCAGCGGAAGACTTCAACCCGGTGAATGGAGCGACCATGGTGGTTTGAGCC
GGTGAGGTAACAACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGTAAGCCATGACTAATTCTTCTTCG
TTCTCTTAACTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 

AF RR4ES62JQ U 20
AF RR4GA17JQ U 1
AF RR4GA17TF C 15
AF RR4B007JQ U 23
AF RR4ES62TF C 210
AF RR4CY66JQ U 23
AF RR4CY66TF C 24
AF RR4B007TF C 23
BS 1 656 RR4GA17JQ
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BS 658 684 RR4GA17JQ
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BS 736 736 RR4B007JQ

RD RR4ES62JQ 429 0 0
AATATAA
AAATTACATGTTTCATAAATCAAACATTTTACAATCCGATATATAAAGTCTCATAAACAG
AAATCCAAAAAAAAAAAAAGCAACAAACTTATTGAAAATGAAATGAAAAAATATTATTAT
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CTGCACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATTCTGATAAAGGCATTGGGGTACTCCTT
TTTGCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCAAAGTCAGTGCAACCGAACAAGGGAAG
CTTCCACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAATATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTA
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GT

QA 8 429 8 429
DS 

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CTGATAAAGGCATTGGGGTACTCCTTTTTGCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCA
GAGTCAGTGCAACCGAACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAGTAT
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TCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCTCAAACTTCTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATG
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GGTGAGGTAACAACAGCGGCGGAG*AGAGCATAGAGTAAGCCATGACTAATTCTTCTTCG
TTCTCTTAACTCTTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GA17TF 721 0 0
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AATATAGAAATTACATGTTTCATAAATCAGACATTTTACAATCCGATATATAAAGTCTCA
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TGATGCACTGCACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATTCTGATAAAGGCATTGGGGT
ACTCCTTTTTGCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCAGAGTCAGTGCAACCGAACA
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TCTCAAACTTCTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGT
TGCTAGCGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAAG
ACTTCAACCCGGTGAATGGAGCGACCATGGTGGTTTGGGCCGGTGAGGTAACAACAGCGG
CGGAGGAGAGCATAGAGTAAGCCATGACTAATTCTTCTTCGTTCTCTTAACTCTTC

QA 6 721 6 721
DS 

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TGCACTGCACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATTCTGATAAAGGCATTGGGGTACT
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GGTAGTCGACTTCCTTAGCCAACTCAACATCGGAAAGGTCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCT
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TAGCGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAAGACT
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QA 1 714 1 714
DS 

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GCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCAGAGTCAGTGCAACCGAACAAGGGAAGCTT
CCACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTACAC
AAATCCATACTCCAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTC
GACTTCCTTAGCCAACTCAACATCGGAAAGGTCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCTCAAACTT
CTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGCTAGCGAT
GGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAAGACTTCAACCC
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CATAGAGTGAGCCATGACTAATTCTTCTTCGTTCTCTTAACTCTTCC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4CY66JQ 714 0 0
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TGCACTGCACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATTCTGATAAAGGCATTGGGGTACT
CCTTTTTGCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCAGAGTCAGTGCAACCGAACAAGG
GAAGCTTCCACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCAC
GGTACACAAATCCGTGCTCCAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAAAA
GGTAGTCGACTTCCTTAGCCAACTCAACATCGGAAAGGTCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCT
CAAACTTCTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGC
TAGCGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAAGACT
TCAACCCGGTGAATGGAGCGGCCATGGTGGTTTGAGCCGGTGAGGTAACAACAGCGGCGG
AGGAGAGCATAGAGTAAGCCATGACTAATTCTTCTTCGTTCTCTTAACTCTTCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4CY66TF 713 0 0
ATAGAAA
TACATGTTTCATAA*TCAGACATTT*ACAATCCGATATATAAAGTCTCATAAACAGAAAT
CCAAAGAGAAAAAA*GCAACAGACTTATTGAAAATGAAATGAGAAGATATTATTAT*ATG
GACGTGACTTAAGCATCAGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGC
ACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATTCTGATAAAGGCATTGGGGTACTCCTTTTTG
CACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCAGAGTCAGTGCAACCGAACAAGGGAAGCTTC
CACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTACACA
AATCCGTGCTCCAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCG
ACTTCCTTAGCCAACTCAACATCGGAAAGGTCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCTCAAACTTC
TTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGCTAGCGATG
GAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAAGACTTCAACCCG
GTGAATGGAGCGGCCATGGTGGTTTGAGCCGGTGAGGTAACAACAGCGGCGGAGGAGAGC
ATAGAGTAAGCCATGACTAATTCTTCTTCGTTCTCTTAACTCTTCC

QA 8 713 8 713
DS 

RD RR4B007TF 714 0 0
ATAGAAATTACATGTTTCATAAATCAGACATTTTACAATCCGATATATAAAGTCTCATAA
ACAGAAATCCAAAGAGAAAAAAAGCAACAGACTTATTGAAAATGAAATGAGAAGATATTA
TTAT*ATGGACGTGACTTAAGCATCAGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAGACTGA
TGCACTGCACTTGACGGTTGTTGTCGAATCCGATGATTCTGATAAAGGCATTGGGGTACT
CCTTTTTGCACTCTTGGACTTCCTTCAACACTTGAGCAGAGTCAGTGCAACCGAACAAGG
GAAGCTTCCACATTGTCCAGTAACGGCCATCGTAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCAC
GGTACACAAATCCGTGCTCCAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAA
GGTAGTCGACTTCCTTAGCCAACTCAACATCGGAAAGGTCAGGAAGGTAAGAAAGGGTCT
CAAACTTCTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGC
TAGCGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTTTGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAAGACT
TCAACCCGGTGAATGGAGCGACCATGGTGGTTTGAGCCGGTGAGGTAACAACAGCGGCGG
AGGAGAGCATAGAGTAAGTCATGACTAATTCTTCTTCGTTCTCTTAACTCTTCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 9

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AGACAAAAAACTGAAATCTGAAGTAAACACAATAACCTCAAGAGTTAATAACATGAAAAT
TTAGCATAGCTGCATCCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACACACCCAAGGCAT
GTAGAGGCACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGTGAAAGTGACA
ATAACGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAACACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTAT
GAAGAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCT
ACGATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCACCCTTCATGTAG
ACAAAGGTCGGCATGGCCTCAACCTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACA
TCGACCTTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCA
ATGAAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGCTTGTTGGAT
TCTTTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCT
CCTGCTGGGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTCTCTCTCT**GTTTGATTTT
GGATTTGTTTTTGATGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 

AF RR4A912JQ U 1
AF RR4C480JQ U 50
AF RR4FP64JQ U 50
AF RR4FP64TF C 50
AF RR4A912TF C 1
BS 1 133 RR4A912JQ
BS 134 134 RR4C480JQ
BS 135 616 RR4A912JQ
BS 617 617 RR4C480JQ
BS 618 681 RR4A912JQ

RD RR4A912JQ 681 0 0
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TTAGCATAGCTGCATCCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACACACCCAAGGCAT
GTAGAGGCACCACGCCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGTGAAAGTGACA
ATAACGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAACACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTAT
GAAGAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCT
ACGATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCACCCTTCATGTAG
ACAAAGGTCGGCATGGCCTCAACCTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACA
TCGACCTTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCA
ATGAAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGCTTGTTGGAT
TCTTTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCT
CCTGCTGGGATCAATTATGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTCTCTCTCT**GTTTGATTTT
GGATTTGTTTTTGATGAATCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4C480JQ 628 0 0
AACATGAAAATTTAGCATAGCTGCATCCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACAC
ACCCAAGGCATGTAGAGGCACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAG
TGAAAGTGACAATAACGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAACACCAAACATACTACTAGG
CAAATAGTTATGAAGAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCT
CAAGCTTGGCTACGATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCAC
CCTTCATGTAAACAAAGGTCGGCATGGCCTCAACCTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCA
ATTCATCGACATCGACCTTGAAGAAAACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGA
AAATGGGTGCAATGAAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGCGAAGTCTATCACAATCA
GCTTGTTGGATTCTTTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAG
CGATCACTTCTCCTGCTGGGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTCTCTCTCT*
*GTTTGATTTTGGATTTGTTTTTGAT
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4FP64JQ 631 0 0
AACATGAAAATTTAGCATAGCTGCATCCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACAC
ACCCAAGGCATGTAGAGGCACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAG
TGAAAGTGACAATAACGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAACACCAAACATACTACTAGG
CAAATAGTTATGAAGAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCT
CAAGCTTGGCTACGATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCAC
CCTTCATGTAGACAAAGGTCGGCATGGCCTCAACCTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCA
ATTCATCGACATCGACCTTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGA
AGATGGGTGCAATGAAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCA
GCTTGTTGGATTCTTTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAG
CGATCACTTCTCCTGCTGGGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTCTCTCTCTC
TGTTTGATTTTGGATTTGTTTTTGATGAATC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4FP64TF 631 0 0
AACATGAAAATTTAGCATAGCTGCATCCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACAC
ACCCAAGGCATGTAGAGGCACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAG
TGAAAGTGACAATAACGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAACACCAAACATACTACTAGG
CAAATAGTTATGAAGAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCT
CAAGCTTGGCTACGATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCAC
CCTTCATGTAGACAAAGGTCGGCATGGCCTCAACCTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCA
ATTCATCGACATCGACCTTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGA
AGATGGGTGCAATGAAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCA
GCTTGTTGGATTCTTTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAG
CGATCACTTCTCCTGCTGGGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTCTCTCTCTC
TGTTTGATTTTGGATTTGTTTTTGATGAATC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4A912TF 681 0 0
AGACAG
AAAACTGAAATCTGAAGTAAACACAATAACCTCAAGAGTTAATAACATGAAAATTTAGCA
TAGCTGCATCCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACACACCCAAGGCATGTAGAG
GCACCACGCCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGTGAAAGTGACAATAACG
CAACAAAGGATTTTTATTAAAAAACACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTATGAAGAG
AACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCTACGATT
TCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCACCCTTCATGTAGACAAAG
GTCGGCATGGCCTCAACCTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACATCGACC
TTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCAATGAAA
CGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGCTTGTTGGATTCTTTG
GCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCTCCTGCT
GGGATCAATTATGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTCTCTCTCT**GTTTGATTTTGGATTT
GTTTTTGATGAATC
C

QA 7 680 7 680
DS 



CO CL605Contig2 689 4 10 U
TGTACGTAAAACTGAAATCTGACGTAACACAATAACCTCAAGAGTTAATAACATGAAAAT
TTAGCATAGCTGCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACATACCCAAGGCATGTAG
AGGCACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGCGAAAGTGACAATAA
CGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAA*CACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTATGAA
GAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCTACG
ATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCCTCTCTTCACCCTTCATGTAGACA
AAGGTCGGCATGGCCTCAACTTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACATCG
ACCTTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCAATG
AAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGTTTGTTGGAGTCT
TTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCTCCT
GCTGGGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTGTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCT
CTGTTTGATTTTGGATTTGTTTTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4C644JQ U 21
AF RR4F037TF C 1
AF RR4F037JQ U 2
AF RR4FQ07TF C 65
BS 1 7 RR4F037TF
BS 8 25 RR4F037JQ
BS 26 161 RR4C644JQ
BS 162 162 RR4F037JQ
BS 163 165 RR4C644JQ
BS 166 166 RR4F037JQ
BS 167 336 RR4C644JQ
BS 337 337 RR4F037JQ
BS 338 436 RR4C644JQ
BS 437 689 RR4F037JQ

RD RR4C644JQ 416 0 0
GGCGT
AACACAATAACCTCAAGAGTTAATAACATGAAAATTTAGCATAGCTGCGAGTTATAAAGT
CTGCAAACATTTATTCACATACCCAAGGCATGTAGAGGCACCACACCAAACCAACACAAA
GGGAAAGATGATGACTTAAGTGAAAGTGACAATAACGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAA
A*CACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTATGAAGAGAACGATAAACCAAATCAAGCCG
AAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCTACGATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCA
CCTTGTCGACCTTCTCTTCACCCTTCATGTAGACAAAGGTCGGCATGGCCTCAACTTCGA
AATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACATCGACCTTGAAGAAGACGA

QA 6 416 6 416
DS 

RD RR4F037TF 689 0 0
TGTACGTAAAACTGAAATCTGACGTAACACAATAACCTCAAGAGTTAATAACATGAAAAT
TTAGCATAGCTGCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACATACCCAAGGCATGTAG
AGGCACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGCGAAAGTGACAATAA
CGCAACAAAGGATTTTTATTAAAAAA*CACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTATGAA
GAGAACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCTACG
ATTTCATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCCTCTCTTCACCCTTCATGTAGACA
AAGGTCGGCATGGCCTCAACTTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACATCG
ACCTTGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCAATG
AAACGGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGTTTGTTGGAGTCT
TTGGCGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCTCCT
GCTGGGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTGTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCT
CTGTTTGATTTTGGATTTGTTTTTGATCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4F037JQ 688 0 0
GTACGT
AAAACTGAAATCTGACGTAACACAATAACCTCAAGAGTTAATAACATGAAAATTTAGCAT
AGCTGCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACATACCCAAGGCATGTAGAGGCACC
ACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGCGAAAGTGACAATAACGCAACA
AAGGATTTTTATTAAAAAA*CACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTATGAAGAGAACG
ATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCTACGATTTCAT
CTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCCTCTCTTCACCCTTCATGTAGACAAAGGTCG
GCATGGCCTCAACTTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACATCGACCTTGA
AGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCAATGAAACGGC
AAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGTTTGTTGGAGTCTTTGGCGG
CCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCTCCTGCTGGGA
TCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTGTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTTTG
ATTTTGGATTTGTTTTTGATCC

QA 7 688 7 688
DS 

RD RR4FQ07TF 625 0 0
CATAGCTGCGAGTTATAAAGTCTGCAAACATTTATTCACATACCCAAGGCATGTAGAGGC
ACCACACCAAACCAACACAAAGGGAAAGATGATGACTCAAGTGAAAGTGACAATAACGCA
ACAAAGGATTTTTATTAAAAAAACACCAAACATACTACTAGGCAAATAGTTATGAAGAGA
ACGATAAACCAAATCAAGCCGAAGCAACTTGAGAGTGCTTCTCAAGCTTGGCTACGATTT
CATCTTTCGCAGCACCGACCACCTTGTCGACCTTCTCTTCACCCTTCATGTAGACAAAGG
TCGACATGGCCTCAACTTCGAAATCCTTAGCAACAGAATTCAATTCATCGACATCGACCT
TGAAGAAGACGACATCAAGGTGCTTCTTAGCCAACTCGACGAAGATGGGTGCAATGAAAC
GGCAAGGTGGGCACCATGTTGCTGTGAAGTCTATCACAATCAGTTTGTTGGAGTCTTTGG
CGGCCTTGAACTTGTTGTTCCAGTCATCGACGGTGTGGCAAGCGATCACTTCTCCTGCTG
GGATCAATTCTGCTGGTGCGGCCATTTTTCTCTGTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGT
TTGATTTTGGATTTGTTTTTGATCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 9

CO CL606Contig1 617 9 9 U
GGAGCCAAATTAATACCCTAGCTTACTCCGTATCTTCTCTTCAGAACTCCGAGGCAGAGA
TGACGGTGGAAGCTGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAA
CAATCCTCGATCTTGTTCAGCAAGCCACGAATTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACG
AAGCTACCAAGACACTGAACCGTGGGATCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGATGCTG
AGCCTCTCGAGATTCTTCTTCATCTCCCTCTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATG
TGTTTGTGCCATCCAAACAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTGATTG
CTTGTTCCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGG
ATGCCATTGAGAAGCTCCTCATCTAAAGATTTATGGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTAT
TGGGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATT
TTGGTCTTTTCTTGAAACTTAATGTTGATGTAAGAAGTCAAATGAAGCATCAATAAACAC
AAATATTTCCTCCTCAG


BQ
30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 30 10 10 10 

AF RR4BX19JQ C 1
AF RR4BX19TF U 1
AF RR4CP05JQ C 1
AF RR4CP05TF U 1
AF RR4AX35JQ C 5
AF RR4ED66JQ C 39
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AF RR4ED66TF U 5
AF RR4AX35TF U 5
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AC

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TGGGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATT
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AC

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TGGGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATT
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T

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TGGGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATT
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T

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CC

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G
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TAAACACAAATATTTCCTC

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DS 

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CC

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TGCCATCCAAACAAGCCCGTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGTT
CCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGATGCCA
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TTCCTCCT
CAG

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DS 



AS 1 7

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TTGATGAAGAAGAAAAGGGTTTGCCTTTTTAACACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AE26JQ U 1
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AF RR4A008JQD U 5
AF RR4B629JQ U 29
AF RR4A008JQ U 31
AF RR4B629TF C 137
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BS 912 965 RR4B629TF
BS 966 1058 RR4A008TFB

RD RR4AE26JQ 774 0 0
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CAATAAAACACACAATTCTTGAAACAGTAAAGGAAATATTCCGAGCCTACAAAAACCATA
AAAGATCTGAAACTTTTAAGACATTTGACACTTGGAAATGTTGTTGTTGTGTCATCAAAA
CAAAGCAAAACTTAAACATAGGTATCGATCAAAGACTTCCTCATCTCGTCGACAATAGAG
CTAGGTTGGGCTTCCCTTAGCTTGAAGATGCTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTT
GTGTCTGAACCGCAAAAAGAAGTCCAATCATTGACGGTCATTCCCGCACCTATAACTTCA
CTACCACGGTTCACGGTTCCGGCAACGAGCGGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCC
AAGTCTTCCACAGAAGTGTGAGGATGAACAATGCCACCTCTGTTGGACAAGGCACAGTAG
CTGCCCACAAGAATGTTGCCTGCAATTGTCTGACGGAAAACTTCAACACCAAGAACATCA
GCTATTATCTCCTCAGTTTCCTTGTCGAGATCGGTGTGAGCAAGAGCAACATGGTCATTG
CAGGCAATGCAATTTCCAAGAGCAGAGAGACGCTCCTCGATTCGCTGGACCACAACTTGA
TCAGGTAGACTGTTCCTCAAGTGTTGAAGCTCTTG*TCAGTAGTTGTGTGAGGCACAAGA
AGCCCATTCTTGTTTCCAGCGCATAGACGGCCAATGATTCGTGTTCCTCCAAT
C

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DS 

RD RR4AE26TF 774 0 0
CGAGACCA
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GAAACTTTTAAGACATTTGACACTTGGAAATGTTGTTGTTGTGTCATCAAAACAAAGCAA
AACTTAAACATAGGTATCGATCAAAGACTTCCTCATCTCGTCGACAATAGAGCTAGGTTG
GGCTTCCCTTAGCTTGAAGATGCTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGA
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GTTCACGGTTCCGGCAACGAGCGGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCCAAGTCTTC
CACAGAAGTGTGAGGATGAACAATGCCACCTCTGTTGGACAAGGCACAGTAGCTGCCCAC
AAGAATGTTGCCTGCAATTGTCTGACGGAAAACTTCAACACCAAGAACATCAGCTATTAT
CTCCTCAGTTTCCTTGTCGAGATCGGTGTGAGCAAGAGCAACATGGTCATTGCAGGCAAT
GCAATTTCCAAGAGCAGAGAGACGCTCCTCGATTCGCTGGACCACAACTTGATCAGGTAG
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CTTGTTTCCAGCGCATAGACGGCCAATGATTCGTGTTCCTCCAAT
C

QA 9 773 9 773
DS 

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GTTT
TAAAAACTAAGAGATTCATGAGACCATAAAAAACTCATAACTTTTGATATGACAATAAAA
CACACAATTCTTGAAACAGTAAAGGAAATATTCCGAGCCTACAAAAACCATAAAAGATCT
GAAACTTTTAAGACATTTGACACTTGGAAATGTTGTTGTTGTGTCATCAAAACAAAGCAA
AACTTAAACATAGGTATCGATCAAAGACTTCCTCATCTCGTCGACAATAGAGCTAGGTTG
GGCTTCCCTTAGCTTGAAGATGCTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGA
ACCGCAGAAAGAAGTCCAATCATTGACGGTCATTCCCGCACCTATAACTTCACTACCACG
GTTCACGGTTCCGGCAACGAGCGGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCCAAGTCTTC
CACAGAAGTGTGAGGATGAACAATGCCACCTCTGTTGGACAAGGCACAGTAGCTGCCCAC
AAGAATGTTGCCTGCAATTGTCTGACGGAAAACTTCAACACCAAGAACATCAGCTATTAT
CTCCTCAGTTTCCTTGTCGAGATCGGTGTGAGCAAGAGCAACATGGTCATTGCAGGCAAT
GCAATTTCCAAGAGCAGAGAGACGCTCCTCGATTCGCTGGACCACAACTTGATCAGGTAG
ACTGTTCCTCAAGTGTTGAAGCTCTTGGTCAGTAGTTGTGTGAGGCACAAGAAGCCCATT
CTTGTTTCCAGCGCATAGACGGCCAATGATTCGTGTTCCTCCAATAGAGGTCTTAACAAT
AGGGATAACATCAGCTAACTCCGACTCAAATGCACTGTAAAAGTTCTCAGAGCCTCCAAT
AGCAACTAAG

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DS 

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CACTTGGAAATGTTGTTGTTGTGTCATCAAAACAAAGCAAAACTTAAACATAGGTATCGA
TCAAAGACTTCCTCATCTCGTCGACAATAGAGCTAGGTTGGGCTTCCCTTAGCTTGAAGA
TGCTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTCGTGTCTGAACCGCAGAAAGAAGTCCAAT
CATTGACGGTCATTCCCGCACCTATAACTTCACTACCACGGTTCACGGTTCCGGCAACGA
GCGGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCCAAGTCTTCCACAGAAGTGTGAGGATGAA
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GGCCAATGATTCGTGTTCCTCCAATAGAGGTCTTAACAATAGGGATAACATCAGCTAACT
CCGACTCAAATGCACTGTAAAAGTTCTCAGAGCCTCCAATAGCAACTAAGCA

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DS 

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AGGAAATATTCCGAGCCTACAAAAACCATAAAAGAACTGAAACTTTTAAGACATTTGACA
CTTGGAAATGTTGTTGTTGTGTCATCAAAACAAAGCAAAACTTAAACATAGGTATCGATC
AAAGACTTCCTCATCTCGTCGACAATAGAGCTAGGTTGGGCTTCCCTTAGCTTGAAGATG
CTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGAACCGCAGAAAGAAGTCCAATCA
TTGACGGTCATTCCCGCACCTATAACTTCACTACCACGGTTCACGGTTCCGGCAACGAGC
GGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCCAAGTCTTCCACAGAAGTGTGAGGATGAACA
ATGCCACCTCTGTTGGACAAGGCACAGTAGCTGCCCACAAGAATGTTGCCTGCAATTGTC
TGACGGAAAACTTCAACACCAAGAACATCAGCTATTATCTCCTCAGTTTCCTTGTCGAGA
TCGGTGTGAGCAAGAGCAACATGGTCATTGCAGGCAATGCAATTTCCAAGAGCAGAGAGA
CGCTCCTCGATTCGCTGGACCACAACTTGATCAGGTAGACTGTTCCTCAAGTGTTGAAGC
TCTTGGTCAGTAGTTGTGTGAGGCACAAGAAGCCCATTCTTGTTTCCAGCGCATAGACGG
CCAATGATTCGTGTTCCTCCAATAGAGGTCTTAACAATAGGGATAACATCAGCTAACTCC
GACTCAAATGCACTGTAAAAGTTCTCAGAGCCTCCAATAGCAACTAAGCAATAGGCATTA
GTGAGTTTTGAAA*GACACCAACTTCACAGTTGTTCTCAAA

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DS 

RD RR4B629TF 841 0 0
TAAGACATTTGACACTTGGAAATGTTGTTGTTGTGTCATCAAAACAAAGCAAAACTTAAA
CATAGGTATCGATCAAAGACTTCCTCATCTCGTCGACAATAGAGCTAGGTTGGGCTTCCC
TTAGCTTGAAGATGCTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTCGTGTCTGAACCGCAGA
AAGAAGTCCAATCATTGACGGTCATTCCCGCACCTATAACTTCACTACCACGGTTCACGG
TTCCGGCAACGAGCGGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCCAAGTCTTCCACAGAAG
TGTGAGGATGAACAATGCCACCTCTGTTGGACAAGGTACAGTAGCTGCCCACAAGAATGT
TGCCTGCAATTGTCTGACGGAAAACTTCAACACCAAGAACATCAGCTATTATCTCCTCAG
TTTCCTTGTCGAGATCGGTGTGAGCAAGAGCAACATGGTCATTGCAGGCAATGCAATTTC
CAAGAGCAGAGAGACGCTCCTCGATTCGCTGGACCACAACTTGATCAGGTAGACTGTTCC
TCAAGTGTTGAAGCTCTTGGTCAGTAGTTGTGTGAGGCACAAGAAGCCCATTCTTGTTTC
CAGCGCATAGACGGCCAATGATTCGTGTTCCTCCAATAGAGGTCTTAACAATAGGGATAA
CATCAGCTAACTCCGACTCAAATGCACTGTAAAAGTTCTCAGAGCCTCCAATAGCAACTA
AGCAATAGGCATTAGTGAGTTTTGAAAAGACACCAACTTCACAGTTGTTCTCAAACTGAA
GACGGGTGGCCATGGAGCGGATAAAGGTAGAAACTTTGCTAAGGTAAAC
AGCAGAGGATGC

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DS 

RD RR4A008TFB 800 0 0
AGCTTGAAGATGCTGTCTATAACAGACAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGAACCGCAGAAA
GAAGTCCAATCATTGACGGTCATTCCCGCACCTATAACTTCACTACCACGGTTCACGGTT
CCGGCAACGAGCGGGACTTGAAGTAGTGTTGAGAGCTCGTCCAAGTCTTCCACAGAAGTG
TGAGGATGAACAATGCCACCTCTGTTGGACAAGGCACAGTAGCTGCCCACAAGAATGTTG
CCTGCAATTGTCTGACGGAAAACTTCAACACCAAGAACATCAGCTATTATCTCCTCAGTT
TCCTTGTCGAGATCGGTGTGAGCAAGAGCAACATGGTCATTGCAGGCAATGCAATTTCCA
AGAGCAGAGAGACGCTCCTCGATTCGCTGGACCACAACTTGATCAGGTAGACTGTTCCTC
AAGTGTTGAAGCTCTTGGTCAGTAGTTGTGTGAGGCACAAGAAGCCCATTCTTGTTTCCA
GCGCATAGACGGCCAATGATTCGTGTTCCTCCAATAGAGGTCTTAACAATAGGGATAACA
TCAGCTAACTCCGACTCAAATGCACTGTAAAAGTTCTCAGAGCCTCCAATAGCAACTAAG
CAATAGGCATTAGTGAGTTTTGAAAAGACACCAACTTCACAGTTGTTCTCAAACTGAAGA
CGGGTGGCCATGGAGCGGATAAAGGTAGAAACTTTGCTAAGGTAAACTTGGGAGATTGGA
TGAATCGGCGGAGAAGAGAGAACAAATGGAGTTAAAAGGTTTTTGATGAAGAAGAAAAGG
GTTTGCCTTTTTAACACTCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 9

CO CL608Contig1 749 9 15 U
TTGTATTTAACACTGAATAAACTTCTTATTATAAAAATCCAAATGAGACCATTTAGTTTG
TTTCGATTCATCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAA
CAAACATGTTTCGAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAATGGAT
TAACTGCTGCCACCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCC
GTCTCTCTGTTTTTTT*GAGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCAT
GAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTAC
TTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCAGTACCATG
TGGACTCCTGGAGTATTTCCAAGCAAAAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCC
AGTAGCACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTAGCTGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATC
GGAGGCAATGAACTCATCGACGTCGGAGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTT
GGTGAACCTGGTGTAATTCTCCAGGAATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCC
ATCCATCTCTTTTTGATTCTTCTTCGCACGACGCTTTCTCTCAGATCGAAAACGATTTAC
TTTTTCTGATTGATTGAATTCGGAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 25 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG65JQ U 9
AF RR4EG65TF C 9
AF RR4FF71JQ U 9
AF RR4G841JQ U 45
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RD RR4EG65JQ 264 0 0
AACA
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TACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTTTC
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TTTT*GAGTTCAGGACC
CCT

QA 5 261 5 261
DS 

RD RR4EG65TF 264 0 0
AACA
CTGAATAAACTTCTTATTATAAAAATCCAAATGAGACCATTTAGTTTGTTTCGATTCATC
TACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTTTC
GAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAATGGATTAACTGCTGCCA
CCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCCGTCTCTCTGTTT
TTTT*GAGTTCAGGACC
CCT

QA 5 261 5 261
DS 

RD RR4FF71JQ 558 0 0
AACG
CTGAATAAACTTCTTATTAAAAAAATCCAAATGAGACCATTTAGTTTGTTTCGATTCATC
TACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTTTC
GAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAAAGTCTGAAAATGGATTAACTGCTGCCA
CCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAAAAAGTAGCACCCGTCTCT**GTTT
TTTT*GAGTTCAGGACCTTCCCTGAAACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACTTG
AGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCAAA
GGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCAGTACCATGTGGACTCCTGGA
GTATTTCCAAGCAAAAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCCAGTAGCACCAAA
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CTCATCGACGTCGG

QA 5 558 5 558
DS 

RD RR4G841JQ 517 0 0
GG
GACCATTTAGTTTGTTTCGATTCATCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTAT
TGAGACATGGAAAACAAACATGTTTCGAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAAA
GTCTGAAAGTGGATTAACTGCTGCCACCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCG
AAAAAGTAGCACCCGTCTCTCTGTTTTTTT*GAGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGT
TCCCACCATTCCATGAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATC
GTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAAAAGGAC
AGTGCAGTACCATGTGGACTCCTGGAGTATTTCCAAGCAAAAGCAGCAGTGGACACAGCT
CCAAGTGCGGCTCCAGTAGCACCAAAAGTCGCAGTTTCCCTAGCCGTTTTCAGGGTGGGT
CCATTGACGGGATCGGAGGCAATGAACTCATCGAC

QA 3 517 3 517
DS 

RD RR4FF71TF 704 0 0
TTGTATTTAACGCTGAATAAACTTCTTATTAAAAAA*TCCAAATGAGACCATTTAGTTTG
TTTCGATTCATCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAA
CAAACATGTTTCGAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAATGGAT
TAACTGCTGCCACCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCC
GTCTCT**GTTTTTTT*GAGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCAT
GAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTAC
TTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCAGTACCATG
TGGACTCCTGGAGTATTTCCAAGCAAAAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCC
AGTAGCACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTAGCTGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATC
GGAGGCAATGAACTCATCGACGTCGGAGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTT
GGTGAACCTGGTGTAATTCTCCAGGAATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCC
ATCCATCTCTTTTTGATTCTTCTTCGCACGACGCTTT
CTCTCCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4EP04JQ 702 0 0
AATTT
AACACTGAATAAACTTCTTATTATAAAAATCCAAATGAGACCATTTAGTTTGTTTCGATT
CATCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATG
TTTCGAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAATGGATTAACTGCT
GCCACCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCCGTCTCTCT
GTTTTTTT*GAGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAA
CTTGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCC
CAAAGGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCTGTACCATGTGGACTCC
TGGAGTATTTCCAAGCAAAAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCCAGTAGCAC
CAAAAGTCGCAGCTTCCCTAGCTGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATCGGAGGCAA
TGAACTCATCGACGTCGGAGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACC
TGGTGTAATTCTCCAGGAATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCT
CTTTTTGATTCTTCTTCGCACGACGCTTT
TCTCTCCC

QA 6 694 6 694
DS 

RD RR4BN10JQ 610 0 0
G
CATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTTTCGAGAGTGAGAACAT
AAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAATGGATTAACTGCTGCCACCATCTCACGTTGT
TTGCAAGACGAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCCGTATATCTGTTTTTTTTGAGTTCAGG
ACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGT
CCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAA
GACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCAGTACCATGTGGACTCCTGGAGTATTTCCAAGCAA
AAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCCAGTAGCACCAAAAGTCGCAGCTTCCC
TAGCTGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATCGGAGGCAATGAACTCATCGACGTCGG
AGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACCTGGTGTAATTCTCCAGGA
ATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCTCTTTTTGATTCTTCTTCG
CACGAC
CCC

QA 2 607 2 607
DS 

RD RR4BN10TF 609 0 0
CATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTTTCGAGAGTGAGAACAT
AAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAATGGATTAACTGCTGCCACCATCTCACGTTGT
TTGCAAGACGAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCCGTATATCTGTTTTTTTTGAGTTCAGG
ACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGT
CCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAA
GACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCAGTACCATGTGGACTCCTGGAGTATTTCCAAGCAA
AAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCCAGTAGCACCAAAAGTCGCAGCTTCCC
TAGCTGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATCGGAGGCAATGAACTCATCGACGTCGG
AGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACCTGGTGTAATTCTCCAGGA
ATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCTCTTTTTGATTCTTCTTCG
CACGAC
CCC

QA 1 606 1 606
DS 

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TCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTT
TCGAGAGTGAGAACATAAAGAAAGGTTCGAAAGAGAGTCTGAAAGTGGATTAACTGCTGC
CACCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCCGTCTCTCTGT
TTTTTT*GAGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACT
TGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCA
AAGGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAGAAGGACAGTGCAGTACCATGTGGACTCCTG
GAGTATTTCCAAGCAAAAGCAGCAGTGGACACAGCTCCAAGTGCGGCTCCAGTAGCACCA
AAAGTCGCAGTTTCCCTAGCCGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATCGGAGGCAATG
AACTCATCGACGTCGGAGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACCTG
GTGTAATTCTCCAGGAATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCTCT
TTTTGATTCTTCTTCGCACGACGCTTTCTCTCAGATCGAAAACGATTTACTTTTTCTGAT
TGATTGAATTCGGAGGCCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 8

CO CL609Contig1 1333 8 20 U
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TTTTGTTCTTGGTGACAATCTCAAGTTTCTCCTTTCGTTAGTTTCTTAGTCTTTCAATAA
ATCTCTATGAGCTATTGTTCTCTTCAATAAAGTTAGAATCTATCTTAGTTTCAACTTGCT
CACATGGTATCAGAGACCACGGTGGTTCATGGGATTTCATTTCACACACTTCTTGTACCA
ATAAAGCTCCAAACTTTTCATTTATCTTCTGCTAATGAAAAAAAAAAAGGGTTCCTCAAA
TCTGCTGAGTCTAGAGTTACACTTCCTTGCTCACGTCATCTATCTGCAATAAAAGAGAAG
CACGAGAGTGGGTTAAAGATCTGTTTTGCAAGAATTATGAAGAAGCCTGGTCACCTCAGA
GAAGACTTTGGTAACGCCGGAGACTATGGTCGCTCGTCCCTGAAGATGGGAAAGCAAAAT
CAACAAAGGAAAAGCTTCCGTTGACATAGCACGGGTTCTGCAAGGCTTCAAAGGCTGAAG
GTTTCAACTTCAAGAGATTATCGTCTGAAACTCAAGCCTCTCCTCACGGTAATTGCTTTC
TTGTCTT*GAAAAAAAAGGAGCTTGCCGTTGATCTATTAAGAAGAATGGGGCTTGTTGGT
CACTGATTGGTGCTTTATAGCTGCTTTTATCTACGTGATTGGAATGGCGTTGCTTGGTTG
GTTTTGGTTTGGGTCTGAAAAGAATTAAGTTAGGTGCAAGTCTCTGGTTTTACTAAGTGC
ACACAAGGTGCTCGAGTAAATGCCAAGAAGGTCAGATTATTGGAATGCAGATATGGTGGT
ACACTAATAAGAAGCTGAGAGTGATTAGAGTTCCAATAGATGTGGGAAGCAAATTTTATC
AGCCATGAGATAGCTTAGTTGAGCTAAGAGGGTAAAAAAAAAAAACCCCAACTCACGGTG
AGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAGATGTTCTCACCCTAATGACTATTCTCTAAGCTG
ATTGGAGTTATCTATCTACTTCACTTGGACCTCTGGCTGCTCAAGCTACTACCACAGCCA
TCTTCATTTGCTATTCAAACTTGTCATCCTGCTTCCACCGACACCAAGTTTGCGGGGGAG
TATTAAACTGAAGCCCAATACAAGCCCAGTGTATGAAGAATGGCCCATGTAACTAGGTAT
ACTAGCAAGTTTGACAGTAGTATAAATATTTCTGTTAGAGAACTTTTCTTGCAACTTTGG
CTGTGTTTCAAGCAGCCACTTTCTCCATCTTTTATGATATCAATATAATCTTTTGTTCTT
GGTGACAATCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 10 0 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI60TF U 1
AF RR4BG50TF U 12
AF RR4B851TF U 12
AF RR4GC73TF U 208
AF RR4GC73JQ C 309
AF RR4BG50JQ C 520
AF RR4B851JQ C 601
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RD RR4FI60TF 729 0 0
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CACATGGTATCAGAGACCACGGTGGTTCATGGGATTTCATTTCACACACTTCTTGTACCA
ATAAAGCTCCAAACTTTTCATTTATCTTCTGCTAATGAAAAAAAAAAAGGGTTCCTCAAA
TCTGCTGAGTCTAGAGTTACACTTCCTTGCTCACGTCATCTATCTGCAATAAAAGAGAAG
CACGAGAGTGGGTTAAAGATCTGTTTTGCAAGAATTATGAAGAAGCCTGGTCACCTCAGA
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CAACAAAGGAAAAGCTTCCGTTGACATAGCACGG*TTCTGCAAGGCTTCAAAGGCTGAAG
GTTTCAACTTCAAGAGATTATCGTCTGAAACTCAAGCCTCTCCTCACGGTAATTGCTTTC
TTGTCTT*GAAAAAAA*GGAGCTTGCCGTTGATCTATTAAGAAGAATGGGGCTTGTTGGT
CACTGATTGGTGCTTTATAGCTGCTTTTATCTACGTGATTGGAATGGCGTTGCTTGGTTG
GTTTTGGTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4BG50TF 739 0 0
GGGT
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CAATCTCAAGTTTCTCCTTTCGTTAGTTTCTTAGTCTTTCAATAAATCTCTATGAGCTAT
TGTTCTCTTCAATAAAGTTAGAATCTATCTTAGTTTCAACTTGCTCACATGGTATCAGAG
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GTTACACTTCCTTGCTCACGTCATCTATCTGCAATGAAAGAGAAGCACGAGAGTGGGTTA
AAGATCTGTTTTGCAAGAATTATGAAGAAGCCTGGTCACCTCAGAGAAGACTTTGGTAAC
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TTCCGTTGACATAGCACGG*TTCTGCAAGGCTTCAAAGGCTGAAGGTTTCAACTTCAAGA
GATTATCGTCTGAAACTCAAGCCTCTCCTCACGGTAATTGCTTTCTTGTCTT*GAAAAAA
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TATAGCTGCTTTTATCTACGTGATTGGAATGGCGTTGCTTGGTTGGTTTTGGTTTGGGTC
TGAAAAGAATTAAGT

QA 5 739 5 739
DS 

RD RR4B851TF 794 0 0
GGGT
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CAATCTCAAGTTTCTCCTTTCGTTAGTTTCTTAGTCTTTCAATAAATCTCTATGAGCTAT
TGTTCTCTTCAATAAAGTTAGAATCTATCTTAGTTTCAACTTGCTCACATGGTATCAGAG
ACCACGGTGGTTCATGGGATTTCATTTCACACACTTCTTGTACCAATAAAGCTCCAAACT
TTTCATTTATCTTCTGCTAATGAAAAAAAAAAAGGGTTCCTCAAATCTGCTGAGTCTAGA
GTTACACTTCCTTGCTCACGTCATCTATCTGCAATGAAAGAGAAGCACGAGAGTGGGTTA
AAGATCTGTTTTGCAAGAATTATGAAGAAGCCTGGTCACCTCAGAGAAGACTTTGGTAAC
GCCGGAGACTATGGTCGCTCGTCCCTGAAGATGGGAAAGCAAAATCAACAAAGGAAAAGC
TTCCGTTGACATAGCACGG*TTCTGCAAGGCTTCAAAGGCTGAAGGTTTCAACTTCAAGA
GATTATCGTCTGAAACTCAAGCCTCTCCTCACGGTAATTGCTTTCTTGTCTT*GAAAAAA
AAGGAGCTTGCCGTTGATCTATTAAGAAGAATGGGGCTTGTTGGTCACTGATTGGTGCTT
TATAGCTGCTTTTATCTACGTGATTGGAATGGCGTTGCTTGGTTGGTTTTGGTTTGGGTC
TGAAAAGAATTAAGTTAGGTGCAAGTCTCTGGTTTTACTAAGTGCACACAAG*TGCTCGA
GTAAATGCCA

QA 5 794 5 794
DS 

RD RR4GC73TF 636 0 0
G
ATGGGATTTCATTTCACACACTTCTTGTATCAATAAAGCTCCAAACTTTTTATTTATCTT
CTGCTAATGAAAAAAAAAAGGGGTTCTTCAAATCTGCTGAGTCTAGAGTTACACTTCCTT
GCTCACGTCATCTATCTTCAATAGAAGAGAAGCACGAGAGTGGGTTACAGATCTGTTTTG
CAAGAATTATGAAGAAGCCTGGTCACGTCAGAGAAGACTTTGGTAACGCCGGAGACTATG
GTCGCTCGTCCCTGAAGATGGGAAAGCAAAATCAACAAAGGAAAAGCTTCCGTTGACATA
GCACGGGTTCTGCAAGGCTTCAAAGGCTGAAGGTTTCAACTTCAAGAGATTATGGTCTGA
AACTTAAGCCTCTCCTCACGGTAATTGCTTTCTTGTCTTAGAAAAAAAAAGAGCTTGCCG
TTGATCTATTAAGAAGAATGGGGCTTGTTGGTCACTGATTGGTGCTTTATAGCTGCTTTT
ATCTACGTGATTGGAATGGCTTTGCTTGGTTGGTTTTGGTTTGGGTCTGAAAAGAATTAA
GTTAGGTGCAAGTCTCTGGTTTTACTAAGTGCACACAAGGTGCTCGAGTAAATGCCAAGA
AGGTCAGATTATTGGAATGCAGATATGGTGGTACA

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR4GC73JQ 582 0 0
GTCTAGAGTTACACTTCCTTGCTCACGTCATCTATCTTCAATAGAAGAGAAGCACGAGAG
TGGGTTACAGATCTGTTTTGCAAGAATTATGAAGAAGCCTGGTCACGTCAGAGAAGACTT
TGGTAACGCCGGAGACTATGGTCGCTCGTCCCTGAAGATGGGAAAGCAAAATCAACAAAG
GAAAAGCTTCCGTTGACATAGCACGGGTTCTGCAAGGCTTCAAAGGCTGAAGGTTTCAAC
TTCAAGAGATTATGGTCTGAAACTTAAGCCTCTCCTCACGGTAATTGCTTTCTTGTCTTA
GAAAAAAAAAGAGCTTGCCGTTGATCTATTAAGAAGAATGGGGCTTGTTGGTCACTGATT
GGTGCTTTATAGCTGCTTTTATCTACGTGATTGGAATGGCTTTGCTTGGTTGGTTTTGGT
TTGGGTCTGAAAAGAATTAAGTTAGGTGCAAGTCTCTGGTTTTACTAAGTGCACACAAGG
TGCTCGAGTAAATGCCAAGAAGGTCAGATTATTGGAATGCAGATATGGTGGTACACTAAT
AGGAAGCTGAGAGTGATTAGAGTTCCAATAGATGTGGGAAGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4BG50JQ 804 0 0
GCAAGGCTTCAAAGGCTGAAGGTTTCAACTTCAAGAGATTATCGTCTGAAACTCAAGCCT
CTCCTCACGGTAATTGCTTTCTTGTCTT*GAAAAAAAAGGAGCTTGCCGTTGATCTATTA
AGAAGAATGGGGCTTGTTGGTCACTGATTGGTGCTTTATAGCTGCTTTTATCTACGTGAT
TGGAATGGCGTTGCTTGGTTGGTTTTGGTTTGGGTCTGAAAAGAATTAAGTTAGGTGCAA
GTCTCTGGTTTTACTAAGTGCACACAAGGTGCTCGAGTAAATGCCAAGAAGGTCAGATTA
TTGGAATGCAGATATGGTGGTACACTAATAAGAAGCTGAGAGTGATTAGAGTTCCAATAG
ATGTGGGAAGCAAATTTTATCAGCCATGAGATAGCTTAGTTGAGCTAAGAGGGTAAAAAA
AAAAAACCCCAACTCACGGTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAGATGTTCTCACCC
TAATGACTATTCTCTAAGCTGATTGGAGTTATCTATCTACTTCACTTGGACCTCTGGCTG
CTCAAGCTACTACCACAGCCATCTTCATTTGCTATTCAAACTTGTCATCCTGCTTCCACC
GACACCAAGTTTGCGGGGGAGTATTAAACTGAAGCCCAATACAAGCCCAGTGTATGAAGA
ATGGCCCATGTAACTAGGTATACTAGCAAGTTTGACAGTAGTATAAATATTTCTGTTAGA
GAACTTTTCTTGCAACTTTGGCTGTGTTTCAAGCAGCCACTTTCTCCATCTTTTATGATA
TCAATATAATCTTTTGTTCTTGGT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4B851JQ 723 0 0
TTGTCTT*GAAAAAAAAGGAGCTTGCCGTTGATCTATTAAGAAGAATGGGGCTTGTTGGT
CACTGATTGGTGCTTTATAGCTGCTTTTATCTACGTGATTGGAATGGCGTTGCTTGGTTG
GTTTTGGTTTGGGTCTGAAAAGAATTAAGTTAGGTGCAAGTCTCTGGTTTTACTAAGTGC
ACACAAGGTGCTCGAGTAAATGCCAAGAAGGTCAGATTATTGGAATGCAGATATGGTGGT
ACACTAATAAGAAGCTGAGAGTGATTAGAGTTCCAATAGATGTGGGAAGCAAATTTTATC
AGCCATGAGATAGCTTAGTTGAGCTAAGAGGGTAAAAAAAAAAAACCCCAACTCACGGTG
AGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAGATGTTCTCACCCTAATGACTATTCTCTAAGCTG
ATTGGAGTTATCTATCTACTTCACTTGGACCTCTGGCTGCTCAAGCTACTACCACAGCCA
TCTTCATTTGCTATTCAAACTTGTCATCCTGCTTCCACCGACACCAAGTTTGCGGGGGAG
TATTAAACTGAAGCCCAATACAAGCCCAGTGTATGAAGAATGGCCCATGTAACTAGGTAT
ACTAGCAAGTTTGACAGTAGTATAAATATTTCTGTTAGAGAACTTTTCTTGCAACTTTGG
CTGTGTTTCAAGCAGCCACTTTCTCCATCTTTTATGATATCAATATAATCTTTTGTTCTT
GGT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4D353JQ 513 0 0
TGGAATGCAGATATGGTGGTACACTAATAAGAAGCTGAGAGTGATTAGAGTTCCAATAGA
TGTGGGAAGCAAATTTTATCAGCCATGAGATAGCTTAGTTGAGCTAAGAGGGTAAAAAAA
AAAA*CCCCAACTCACGGTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAGATGTTCTCACCCT
AATGACTATTCTCTAAGCTGATTGGAGTTATCTATCTACTTCACTTGGACCTCTGGCTGC
TCAAGCTACTACCACAGCCATCTTCATTTGCTATTCAAACTTGTCATCTTGCTTTCACCG
ACACCAAGTTTGCGGGGGAGTATTAAACTGAAGCCCAATACAAGCCCAGTGTATGAAGAA
TGGCCCATGTAACTAGGTATACTAGCAAGTTTGACAGTAGTATAAATATTTCTGTTAGAG
AACTTTTCTTGCAACTTTGGCTGTGTTTCAAGCAGCCACTTTCTCCATCTTTTATGATAT
CAATATAATCTTTTGTTCTTGGTGACAATCTCT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 2 6

CO CL610Contig1 851 4 13 U
GGAACACAGAAAACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACATAAGTATCATATTCGCTTGTA
CACAAGTTTAAGAGGGGATAGAGTTTCCTCTCGATCTCTTTCCTTTTTAAAAGGTTACAA
AAAGGATAACAAAAGCGGATAATAAGATAGCAGGTAGCATAAAGGGAAGGGATCATTGCA
AACACTTGTAATCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCATGTACGTGGACGTATCAATCTGCTCA
GGAAGTTCCTTGATATCAACCTCGAACCTATCTTGTACCTGGTTGAGAACTTCAGAATCA
GAAGCTGATGCCACGAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGAACCTTCCAGCTCTACCA
ACCCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAGTTGATAACAATGTTGACA
CGCTCAATGTCAATTCCTCTGCCTACCAAGTCTGTAGCCACCAGAATTCTCTTGTGCCCT
TCCTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCTCTTCCTGAGACATGCCAGAGTGAATGCAT
ATCGAAGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACTT*GTTCAGCTCCCCAGCTCTACTAACGCT
CTTCACAAAGATAACAACTTGATTGAAGTCCAGTGCATCGAGAAGGTCATTCAACTTGCG
GTTTTTCTCCATCTCGCTCAGTTTGATGTAGTGCTGGACAAGACCATGAAGAGTCAATTT
GGCTTCATCATCAACATATATCTCCATTGGATCTTGCATAAATTTCTTGCAGACTGGGCG
TATCTCTTTGCTGAGCGTTGCTGAGAACATCATAACTTGTTTGTCGTGAGGGTCATCTTG
AAATCTCCTGC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW22JQ U 1
AF RR4GW22TF C 1
AF RR4EP50JQ U 11
AF RR4CG62JQ U 1
BS 1 144 RR4CG62JQ
BS 145 145 RR4GW22JQ
BS 146 218 RR4CG62JQ
BS 219 219 RR4GW22JQ
BS 220 286 RR4CG62JQ
BS 287 287 RR4GW22JQ
BS 288 401 RR4CG62JQ
BS 402 402 RR4GW22JQ
BS 403 583 RR4CG62JQ
BS 584 584 RR4GW22JQ
BS 585 806 RR4CG62JQ
BS 807 807 RR4EP50JQ
BS 808 851 RR4CG62JQ

RD RR4GW22JQ 716 0 0
GA
AACACAGAAAACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACATAAGTATCATATTCGCTTGTACA
CAAGTTTAAGAGGGGATAGAGTTTCCTCTCGATCTCTTTCCTTTTTAAAAGGTTACAAAA
AGGATAACAAAAGCGGATAATAAGATAGCAGGTAGCATAAAGGGAAGGGATCATTGCAAA
CACTTGTAATCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCATGTACGTGGACGTATCAATCTGCTCAGG
AAGTTCCTTGATATCAACCTCGAACCTATCTTGTACCTGGTTGAGAACTTCAGAATCAGA
AGCTGATGCCACGAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGAACCTTCCAGCTCTACCAAC
CCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAGTTGATAACAATGTTGACACG
CTCAATGTCAATTCCTCTGCCTACCAAGTCTGTAGCCACCAGAATTCTCTTGTGCCCTTC
CTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCTCTTCCTGAGACATGCCAGAGTGAATGCATAT
CGAAGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACTT*GTTCAGCTCCCCAGCTCTACTAACGCTCT
TCACAAAGATAACAACTTGATTGAAGTCCAGTGCATCGAGAAGGTCATTCAACTTGCGGT
TTTTCTCCATCTCGCTCAGTTTGATGTAGTGCTGGACAAGACCATGAAGAGTC
C

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR4GW22TF 716 0 0
GA
AACACAGAAAACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACATAAGTATCATATTCGCTTGTACA
CAAGTTTAAGAGGGGATAGAGTTTCCTCTCGATCTCTTTCCTTTTTAAAAGGTTACAAAA
AGGATAACAAAAGCGGATAATAAGATAGCAGGTAGCATAAAGGGAAGGGATCATTGCAAA
CACTTGTAATCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCATGTACGTGGACGTATCAATCTGCTCAGG
AAGTTCCTTGATATCAACCTCGAACCTATCTTGTACCTGGTTGAGAACTTCAGAATCAGA
AGCTGATGCCACGAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGAACCTTCCAGCTCTACCAAC
CCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAGTTGATAACAATGTTGACACG
CTCAATGTCAATTCCTCTGCCTACCAAGTCTGTAGCCACCAGAATTCTCTTGTGCCCTTC
CTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCTCTTCCTGAGACATGCCAGAGTGAATGCATAT
CGAAGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACTT*GTTCAGCTCCCCAGCTCTACTAACGCTCT
TCACAAAGATAACAACTTGATTGAAGTCCAGTGCATCGAGAAGGTCATTCAACTTGCGGT
TTTTCTCCATCTCGCTCAGTTTGATGTAGTGCTGGACAAGACCATGAAGAGTC
C

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR4EP50JQ 818 0 0
G
AACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACATAAGTATCATATTCGCTTGTACACAAGTTTAA
GAGGGGATAGAGTTTCCTCTCGATCTCTTTCCTTTTTAAAAGGTTACAAAAAGGATAACA
AAAGCGGATAATAAGATAGCAGGTAGCATAAAGGGAAGGGATCATTGCAAACACTTGTAA
TCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCGTGTAAGTGGACGTATCAATCTGCTCAGGAAGTTCCTT
GATATCAACCTCGAACCTATCTTGTACCTGGTTGAGAACTTCAGAATCAGAAGCTGATGC
CACGAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGAACCTTCCAGCTCTACCAACCCTGTGAAG
ATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAGTTGATAACAATGTTGACACGCTCAATGTC
AATTCCTCTGCCTACCAAGTCTGTAGCCACCAGAATTCTCTTGTGCCCTTCCTTGAAACT
TTTGTAGTGAGTCAGCCTCTCTTCCTGAGACATGCCAGAGTGAATGCATATCGAAGGGAA
ATTGCATTCAATAAGCAACTTTGGTCAGCTCCCCAGCTCTACTAACGCTCTTCACAAAGA
TAACAACTTGATTGAAGTCCAGTGCATCGAGAAGGTCATTCAACTTGCGGTTTTTCTCCA
TCTCGCTCAGTTTGATGTAGTGCTGGACAAGACCATGAAGAGTCAATTTGGCTTCATCAT
CAACATATATCTCCATTGGATCTTGCATAAATTTCTTGCAGACTGGGCGTATCTCTTTGC
TGAGCGTTGCTGAGAACATCATAACTTGTTTGTCGTG

QA 2 818 2 818
DS 

RD RR4CG62JQ 851 0 0
GGAACACAGAAAACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACATAAGTATCATATTCGCTTGTA
CACAAGTTTAAGAGGGGATAGAGTTTCCTCTCGATCTCTTTCCTTTTTAAAAGGTTACAA
AAAGGATAACAAAAGCGGATAATACGATAGCAGGTAGCATAAAGGGAAGGGATCATTGCA
AACACTTGTAATCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCATGTAAGTGGACGTATCAATCTGCTCA
GGAAGTTCCTTGATATCAACCTCGAACCTATCTTGTACCTGGTTGAAAACTTCAGAATCA
GAAGCTGATGCCACGAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGAACCTTCCAGCTCTACCA
ACCCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAATTGATAACAATGTTGACA
CGCTCAATGTCAATTCCTCTGCCTACCAAGTCTGTAGCCACCAGAATTCTCTTGTGCCCT
TCCTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCTCTTCCTGAGACATGCCAGAGTGAATGCAT
ATCGAAGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACTT*GTTCAGCTCCTCAGCTCTACTAACGCT
CTTCACAAAGATAACAACTTGATTGAAGTCCAGTGCATCGAGAAGGTCATTCAACTTGCG
GTTTTTCTCCATCTCGCTCAGTTTGATGTAGTGCTGGACAAGACCATGAAGAGTCAATTT
GGCTTCATCATCAACATATATCTCCATTGGATCTTGCATAAATTTCTTGCAGACTGGGCG
TATCTCTTTGCTGAGCGTTGCTGAGA*CATCATAACTTGTTTGTCGTGAGGGTCATCTTG
AAATCTCCTGC

QA 1 851 1 851
DS 



CO CL610Contig2 1000 2 24 U
GGGTAGGCATTAAATTTTGTTTCCGTCAATCGATATCGAGATCCAACCAAATCTGCCTCT
CTCTCAGCTTGTTGAATTTGCTTACTATGGGAGACGCTAGGGACAACGAAGCTTATGAGG
AGGAGCTCCTAGACTACGAGGAAGAGGACGAGAAGGTTTTAGATTCTGGATCTAAAGTTA
ACGGCGATGCCGTTAAGAAAGGTTACGTTGGAATACACAGTTCAGGATTCAGAGACTTCC
TTTTGAAACCGGAGCTTCTCCGTGCTATTGTTGACTCTGGATTTGAACATCCATCTGAAG
TGCAACATGAATGTATCCCTCAAGCTATCTTGGGCATGGATGTTATCTGCCAAGCAAAAT
CCGGTATGGGGAAGACTGCTGTTTTTGTGCTTTCCACTCTACAACAGATCGAGCCCACTC
CAGGCCAGGTGTCTGCACTTATCCTGTGCCACACAAGAGAGTTAGCTTACCAGATCTGCA
ATGAGTTCGTGAGATTCAGTACCTACCTGCCTGATACGAAGGTTTCAGTGTTCTATGGAG
GAGTCAACAACAAAATTCACAAAGAATTGCTGAAGAATGAATGTCCTCACATTGTTGTTG
GAACACCTGGTCGGGTTCTTGGACTCGCCAGGGACAAAGATCCCTCTTTGAAGAATGTGA
GGCATTTTATTCTTGACGAGTGTGATAAAATGCTCGAGTCTCTAGACATGAGGAGGGATG
TGCAGGAGATTTTCAAGATGACTCCTCACGACAAACAAGCTATGATGTTCTCAGCAACGC
TCAGCAAAGAGATACGCCCAGTCTGCAAGAAATTTATGCAAGATCCAATGGAGATATATG
TTGATGATGAAGCCAAATTGACTCTTCATGGTCTTGTCCAGCACTACATCAAACTGAGCG
AGATGGAGAAAAACCGCAAGTTGAATGACCTTCTCGATGCATTGGACTTCAATCAAGTTG
TTATCTTTGTGAAGAGCGTTAGCAGAGCAGGGAGCTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP50TF U 1
AF RR4GU87TF U 256
BS 1 283 RR4EP50TF
BS 284 284 RR4GU87TF
BS 285 355 RR4EP50TF
BS 356 356 RR4GU87TF
BS 357 400 RR4EP50TF
BS 401 401 RR4GU87TF
BS 402 448 RR4EP50TF
BS 449 449 RR4GU87TF
BS 450 451 RR4EP50TF
BS 452 452 RR4GU87TF
BS 453 491 RR4EP50TF
BS 492 492 RR4GU87TF
BS 493 642 RR4EP50TF
BS 643 643 RR4GU87TF
BS 644 654 RR4EP50TF
BS 655 655 RR4GU87TF
BS 656 732 RR4EP50TF
BS 733 733 RR4GU87TF
BS 734 754 RR4EP50TF
BS 755 755 RR4GU87TF
BS 756 759 RR4EP50TF
BS 760 760 RR4GU87TF
BS 761 776 RR4EP50TF
BS 777 1000 RR4GU87TF

RD RR4EP50TF 784 0 0
GGGTAGGCATTAAATTTTGTTTCCGTCAATCGATATCGAGATCCAACCAAATCTGCCTCT
CTCTCAGCTTGTTGAATTTGCTTACTATGGGAGACGCTAGGGACAACGAAGCTTATGAGG
AGGAGCTCCTAGACTACGAGGAAGAGGACGAGAAGGTTTTAGATTCTGGATCTAAAGTTA
ACGGCGATGCCGTTAAGAAAGGTTACGTTGGAATACACAGTTCAGGATTCAGAGACTTCC
TTTTGAAACCGGAGCTTCTCCGTGCTATTGTTGACTCTGGATT*GAACATCCATCTGAAG
TGCAACATGAATGTATCCCTCAAGCTATCTTGGGCATGGATGTTATCTGCCAAGCTAAAT
CCGGTATGGGGAAGACTGCTGTTTTTGTGCTTTCCACTCTGCAACAGATCGAGCCCACTC
CAGGCCAGGTGTCTGCACTTATCCTGTGTCATACAAGAGAGTTAGCTTACCAGATCTGCA
ATGAGTTCGTGCGATTCAGTACCTACCTGCCTGATACGAAGGTTTCAGTGTTCTATGGAG
GAGTCAACAACAAAATTCACAAAGAATTGCTGAAGAATGAATGTCCTCACATTGTTGTTG
GAACACCTGGTCGGGTTCTTGGACTCGCCAGGGACAAAGATCTCTCTTTGAAGA*TGTGA
GGCATTTTATTCTTGACGAGTGTGATAAAATGCTCGAGTCTCTAGACATGAGGAGGGATG
TGCAGGAGATTT*CAAGATGACTCCTCACGACAA*CAAGTTATGATGTTCTCAGCA
CGCTCAGC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4GU87TF 745 0 0
G
TCTCCGTGCTATTGTTGACTCTGGATTTGAACATCCATCTGAAGTGCAACATGAATGTAT
CCCTCAAGCTATCTTGGGCATGGATGTTATCTGCCAAGCAAAGTCCGGTATGGGGAAGAC
TGCTGTTTTTGTGCTTTCCACTCTACAACAGATCGAGCCTACTCCTGGTCAGGTGTCTGC
ACTTATCCTGTGCCACACAAGAGAGTTAGCTTACCAGATCTGCAATGAGTTCGTGAGATT
CAGTACCTACCTGCCTGATACGAAGGTTTCAGTGTTCTATGGAGGAGTTAACAACAAGAT
TCACAAAGAATTGCTGAAGAATGAATGTCCTCACATTGTTGTTGGTACACCTGGTCGGGT
TCTTGGACTCGCCAGGGACAAAGATCCCTCTTTGAAGAATGTGAGGCATTTTATTCTTGA
CGAGTGTGATAAAATGCTCGAGTCTCTAGACATGAGGAGGGATGTGCAGGAGATTTTCAA
GATGACTCCTCACGACAAACAAGCTATGATGTTCTCAGCAACGCTCAGCAAAGAGATACG
CCCAGTCTGCAAGAAATTTATGCAAGATCCAATGGAGATATATGTTGATGATGAAGCCAA
ATTGACTCTTCATGGTCTTGTCCAGCACTACATCAAACTGAGCGAGATGGAGAAAAACCG
CAAGTTGAATGACCTTCTCGATGCATTGGACTTCAATCAAGTTGTTATCTTTGTGAAGAG
CGTTAGCAGAGCAGGGAGCTGAAC

QA 2 745 2 745
DS 



AS 1 9

CO CL611Contig1 732 9 12 U
ATAATAGTATGAGTAGCCTAATATTTCTACTTTTAATAATTAAAAATCAAAATCGGCATA
TAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCAAAAACTA
AAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAACCAGAACC
TTTTTT*GTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCTCCTCCAA
CTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAACTTGTCAG
TGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCGATAGGAC
CGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATCCCAAACA
CCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTGAAGAAAC
CATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCGTTCAGCT
CAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGCGTGCC
AGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGA
GAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGCCAAGAGA
ATCTGTAGTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 

AF RR4DY94JQ U 53
AF RR4DX88JQ U 1
AF RR4DX88TF C 22
AF RR4DY94TF C 319
AF RR4FZ46TF C 34
AF RR4FZ46JQ U 42
AF RR4B659JQ U 54
AF RR4EW58JQ U 54
AF RR4B659TF C 54
BS 1 186 RR4DX88JQ
BS 187 187 RR4FZ46JQ
BS 188 312 RR4DX88JQ
BS 313 313 RR4FZ46JQ
BS 314 450 RR4DX88JQ
BS 451 451 RR4FZ46JQ
BS 452 497 RR4DX88JQ
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BS 499 594 RR4DX88JQ
BS 595 595 RR4FZ46JQ
BS 596 731 RR4DX88JQ
BS 732 732 RR4FZ46JQ

RD RR4DY94JQ 630 0 0
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AAAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAA
CCAGAACCTTTTTTTGTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATC
TCCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAA
CTTGTCAGTGTGATGTAGCTAGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGC
GATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGAT
CCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAAACCAGGGACGAGTCCTTTATT
GAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGGTCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATC
GTTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGA
AGAGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACC
AACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4DX88JQ 731 0 0
ATAATAGTATGAGTAGCCTAATATTTCTACTTTTAATAATTAAAAATCAAAATCGGCATA
TAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCAAAAACTA
AAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAACCAGAACC
TTTTTTTGTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCTCCTCCAA
CTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAACTTGTCAG
TGTGATGTAGCTAGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCGATAGGAC
CGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATCCCAAACA
CCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAAACCAGGGACGAGTCCTTTATTGAAGAAAC
CATAAGAGAGCAGACCGGTCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCGTTCAGCT
CAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGAGTGCC
AGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGA
GAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGCCAAGAGA
ATCTGTAGTAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4DX88TF 711 0 0
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AAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCAAAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTG
TTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAACCAGAACCTTTTTTTGTATAATTTGATTC
TCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCTCCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTC
CAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAACTTGTCAGTGTGATGTAGCTAGTGAGCGG
CGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCGATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCA
CCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGC
CAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTGAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGGTCG
CAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCGTTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTT
TGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGAGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATC
TTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCT
CTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGCCAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DY94TF 414 0 0
CGGCGGCGACCTTCTGGAGATAAGGGACGTCAGCGATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGT
GCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGG
CGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTGAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGG
TCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCGTTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTG
GTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGAGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCC
ATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACA
TCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGCCAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4FZ46TF 699 0 0
TTTTTTTTG
AAAATCAAAATCGGCATATAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATG
ACAAAAGACCAAAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCT
CGACTCGGAACCAGAACCTTTTTT*GTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTA
ACTCCTCATCTCCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCG
CACCATCGAACTTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAG
GGACGTCAGCGATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACA
TGTAGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGA
GTCCTTTATTGAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTG
CAAATACATCGTTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGT
TCCAAAGAGAAGCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCA
CAGCAGCACCAACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTC
CCTCCATTTGCCAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 10 699 10 699
DS 

RD RR4FZ46JQ 691 0 0
G
AAAATCAAAATCGGCATATAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATG
ACAAAAGACCAAAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCT
CGACTCGGAACCAGAACCTTTTTT*GTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTA
ACTCCTCATCTCCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCG
CACCATCGAACTTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAG
GGACGTCAGCGATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACA
TGTAGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGA
GTCCTTTATTGAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTG
CAAATACATCGTTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGT
TCCAAAGAGAAGCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCA
CAGCAGCACCAACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTC
CCTCCATTTGCCAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4B659JQ 679 0 0
CGGCATATAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCA
AAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAAC
CAGAACCTTTTTT*GTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCT
CCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAAC
TTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCG
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CCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTG
AAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCG
TTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCGAAGAGAA
GCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCA
ACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGC
CAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4EW58JQ 679 0 0
CGGCATATAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCA
AAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAAC
CAGAACCTTTTTT*GTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCT
CCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAAC
TTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCG
ATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATC
CCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTG
AAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCG
TTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAA
GCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCA
ACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGC
CAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4B659TF 679 0 0
CGGCATATAATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCA
AAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAAC
CAGAACCTTTTTT*GTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCT
CCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAAC
TTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCG
ATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGTCAAACATGTAGGCGATC
CCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTG
AAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCG
TTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCGAAGAGAA
GCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCA
ACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGC
CAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 7

CO CL612Contig1 1132 7 10 U
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ACATGGCCTCGACCAAAAATGACTCACCTAAAAAACCCCTCAAAAGAAATATTACAAACG
AAAGTACGAGTTTATTATCCACACATACACCTATAGAATCAAACAACGAAAACATTCCGA
CAAATACCACCACAAGAGATTCCGCGCGCGACTACCAGTTCTCGATAACTTGAATGGATG
GCTTTTGCTTTCGACAGGCTTAGTAGCCGCCCATCGGAGGCATTCCATACGGTGGCATTG
GAGGCATTCCTGGCATTCCTCCCATCGGTGGTGGTGGACCATAACCCCCTCCCGTCCCTG
GACCTCCTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAGTAGTTGGGCGT
ACATGTTCTGTTGGGACATGACCTCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCT
GTGCTTCTAGCTTGTCCTTTATTAGCTCGTCCACTTTGCCAGAGTACTCTCGGATAAACT
GGAGGAGATACGGGAAGGCAAAGTCAATCATATTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAAAGCAA
CATCTGGTCTGATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGTGGCAAAACATTCCTTCTTCC
CCTGTTCAATGAAGTAAACCAAAAGTTGTTCTGCAAGGTCGTGGTCGCCGGATTGTGAAG
CAGTTTCCATACAGTCCTTGTACATGTTATCTTTCTTCGACAACGCAATTGATTGCTTCC
ATCTCCCTGCTTTCTTGTAGATATACGCAGCCACACGTCTCATCTCTACAAGCTCGTGTT
TCTCAGTCTTCTGAGCGAGGCCTATCTGGTCAAAGCGGTCATGCAAATCGATAGGCTCGC
GCAACCTGTCGTAGTCTTCTTCTTCTACGTATATCTCGTTCAGAGCTTCATTTACAGCAG
AGACATTGTTGCTCTGAACTGCAACCATGTAGGGCTTGATAAGACGCAACTGACCAGCCT
TGCGCATAATATCAACGACACGTGTGTGATCTAATCGCAGAGCAAGCACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT88JQ U 7
AF RR4GT88TF C 7
AF RR4A170JQD U 41
AF RR4EF30JQ U 1
AF RR4A170JQ U 41
AF RR4A170TFB C 180
AF RR4EF30TF C 429
BS 1 122 RR4EF30JQ
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BS 124 413 RR4EF30JQ
BS 414 414 RR4A170JQ
BS 415 518 RR4EF30JQ
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BS 814 1132 RR4EF30TF

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GCTTTCGACAGGCTTAGTAGCAGCCCATCGGAGGCATTCCATACGGTGGCATTGGAGGCA
TTCCTGGCATTCCTCCCATCGGTG
C

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4GT88TF 385 0 0
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ACAAGTAGACTAGTTGGGAGTTAACATCTCTCTCCGCTCAAAAGAAAAATAGTAACATGG
CCTCGACCAAAAATGACTCACCTAAAAAACCCCTCAAAAGAAATATTACAAACGAAAGTA
CGAGTTTATTATCCACACATACACCTATAGAATCAAACAACGAAAACGTTCCGACAAATA
CCACCACAAGAGATTCCGCGCGCGACTACCAGTTCTCGATAACTTGAATGGATGGCTTTT
GCTTTCGACAGGCTTAGTAGCAGCCCATCGGAGGCATTCCATACGGTGGCATTGGAGGCA
TTCCTGGCATTCCTCCCATCGGTG
C

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4A170JQD 550 0 0
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QA 1 550 1 550
DS 

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AAAGTACGAGTTTATTATCCACACATACACCTATAGAATCAAACAACGAAAACATTCCGA
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GCTTTTGCTTTCGACAGGCTTAGTAGCCGCCCATCGGAGGCATTCCATACGGTGGCATTG
GAGGCATTCCTGGCATTCCTCCCATCGGTGGTGGTGGACCATAACCCCCTCCCATCCCTG
GACCTCCTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAGTAGTTGGGCGT
ACATGTTCTGTTGGGACATGACCTCCTTCTCTTCCTGCCCTTTGGCCTTCACTTCTTTCT
GTGCTTCTAGCTTGTCCTTTATTAGCTCGTCCACTTTGCCAGAGTACTCTCGGATAAACT
GGAGGAGATACGGGAAGGCAAAGTCAATCATATTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAAAGCAA
CATCTGGTCTGATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGTGGCAAAACATTCCTTCTTCC
CCTGTT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4A170JQ 689 0 0
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CGCTCAAAAGAAAAATAGTAACATGGCCTCGACCAAAAATGACTCACCTAAAAAACCCCT
CAAAAGAAATATTACAAACGAAAGTACGAGTTTATTATCCACACATACACCTATAGAATC
AAACAACGAAAACATTCCGACAAATACCACCACAAGAGATTCCGCGCGCGACTACCAGTT
CTCGATAACTTGAATGGATGGCTTTTGCTTTCGACAGGCTTAGTAGCCGCCCATCGGAGG
CATTCCATACGGTGGCATTGGAGGCATTCCTGGCATTCCTCCCATCGGTGGTGGTGGACC
ATAACCCCCTCCCGTCCCTGGACCTCCTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGC
CAGTGGCAGTAGTTGGGCGTACATGTTCTGTTGGGACATGACCTCCTTCTCTTCCTGCTC
TTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCTTCTAGCTTGTCCTTTATTAGCTCGTCCACTTTGCC
AGAGTACTCTCGGATAAACTGGAGGAGATACGGGAAGGCAAAGTCAATCATATTGTTGAT
CCAAGCAAGTTCTAAAGCAACATCTGGTCTGATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGT
GGCAAAACATTCCTTCTTCCCCTGTTCAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4A170TFB 635 0 0
GAAAGTACGAGTTTATTATCCACACATACACCTATAGAATCAAACAACGAAAACATTCCG
ACAAATACCACCACAAGAGATTCCGCGCGCGACTACCAGTTCTCGATAACTTGAATGGAT
GGCTTTTGCTTTCGACAGGCTTAGTAGCCGCCCATCGGAGGCATTCCATACGGTGGCATT
GGAGGCATTCCTGGCATTCCTCCCATCGGTGGTGGTGGACCATAACCCCCTCCCGTCCCT
GGACCTCCTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAGTAGTTGGGCG
TACATGTTCTGTTGGGACATGACCTCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTC
TGTGCTTCTAGCTTGTCCTTTATTAGCTCGTCCACTTTGCCAGAGTACTCTCGGATAAAC
TGGAGGAGATACGGGAAGGCAAAGTCAATCATATTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAAAGCA
ACATCTGGTCTGATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGTGGCAAAACATTCCTTCTTC
CCCTGTTCAATGAAGTAAACCAAAAGTTGTTCTGCAAGGTCGTGGTCGCCGGATTGTGAA
GCAGTTTCCATACAGTCCTTGTACATGTTATCTT
C

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4EF30TF 704 0 0
CCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAGTAGTTGGGCGTACATGTTC
TGTTGGGACATGACCTCCTTCTCTTCCTGCCCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCTTCT
AGCTTGTCCTTTATTAGCTCGTCCACTTTGCCAGAGTACTCTCGGATAAACTGGAGGAGA
TACGGGAAGGCAAAGTCAATCATATTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAAAGCAACATCTGGT
CTGATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGTGGCAAAACATTCCTTCTTCCCCTGTTCA
ATGAAGTAAACCAAAAGTTGTTCTGCAAGGTCGTGGTCGCCGGATTGTGAAGCAGTTTCC
ATACAGTCCTTGTACATGTTATCTTTCTTCGACAACGCAATTGATTGCTTCCATCTCCCT
GCTTTCTTGTAGATATACGCAGCCACACGTCTCATCTCTACAAGCTCGTGTTTCTCAGTC
TTCTGAGCGAGGCCTATCTGGTCAAAGCGGTCATGCAAATCGATAGGCTCGCGCAACCTG
TCGTAGTCTTCTTCTTCTACGTATATCTCGTTCAGAGCTTCATTTACAGCAGAGACATTG
TTGCTCTGAACTGCAACCATGTAGGGCTTGATAAGACGCAACTGACCAGCCTTGCGCATA
ATATCAACGACACGTGTGTGATCTAATCGCAGAGCAAGCACATC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 9

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CCGACCATTCCTCCTCTTTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCCTCCT
CAAACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATCATCT
CCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCC
GAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAG
CTTGAAACAAAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATAC
CTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGA
GAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTG
ATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAA
GACTGAAATTGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAAAACAGTAATGATTTATC
AACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
30 30 30 30 30 

AF RR4DM96JQ C 8
AF RR4DM96TF U 8
AF RR4GM41JQ C 1
AF RR4BG72TF U 18
AF RR4GM41TF U 1
AF RR4G110TF U 11
AF RR4FZ02JQ C 18
AF RR4G110JQ C 110
AF RR4FZ02TF U 18
BS 1 9 RR4GM41JQ
BS 10 519 RR4DM96TF
BS 520 582 RR4BG72TF
BS 583 583 RR4GM41TF
BS 584 596 RR4BG72TF
BS 597 600 RR4GM41TF
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GG
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TCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGT
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AAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTAT
AACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGT
GAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTGATGTTGATA
TGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA

QA 3 512 3 512
DS 

RD RR4DM96TF 512 0 0
GG
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CCTCCTCTTTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCCTCCTCAAACCATC
ACAAACACTAAGGGTTCAAGACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACC
TCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGT
GAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACA
AAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTAT
AACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGT
GAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTGATGTTGATA
TGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA

QA 3 512 3 512
DS 

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CCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCC
GAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAG
CTTGAAACAAAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATAC
CTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGA
GAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTG
ATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAA
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TCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGAT
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DS 

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CCTCCTCTTTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCCTCCTCAAACCATC
ACAAACACTAAGGGTTCAAGACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACC
TCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGT
GAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACA
AAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTAT
AACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGT
GAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTGATGTTGATA
TGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAAT
TGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAAAACAGTAATGATTTATC

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DS 

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GG
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GATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAA
GTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAG
CCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAAC
ACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAA
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GTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGT
GAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAAAACAGTAATGATTTATCAACAC

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DS 

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TTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCCTCCTCAAACCATCACAAACAC
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TCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGAT
CAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCAT
CTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCC
TAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGG
CTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTG
TATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAATC
AAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAAAACAGTAATGATTTATCAACAC

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DS 

RD RR4G110JQ 496 0 0
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AATGATTTATCAACAC

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DS 

RD RR4FZ02TF 588 0 0
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TTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCCTCCTCAAACCATCACAAACAC
TAAGGGTTCAAGACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCCGATCC
TCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGAT
CAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCAT
CTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCC
TAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGG
CTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTG
TATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAATC
AAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAAAACAGTAATGATTTATCAACAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 9

CO CL614Contig1 1117 9 17 U
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TGAAGACGTTATGAGGAGACTCTCTTCGTGTGCAATATCTCTTAAGCATTCCCACCTCTA
TACAAATGATTTGGATGAGTGGGCCAATGCGAATCCTGCTCCGTGCACTATGATGATCAT
AGATGATCAGGAGCGAATAGGATGGATGGCTTCTCAACTTTCCGATCTTGAAAATGCTGG
ATACAGAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCCTTACCACGTCCCTTTTC
TGCCCATTGGAATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAG
GCTTGTTTTTAGTCAGGGCAAGTACAATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTT
TGTTGCTGTCAAAAGCTTTGAAGATTTCACCGCCCATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTT
TGGCGTGTGGGACACTTATGCTTCTAAAACGGGTCTTGATCGTACTATCCGTGCAAACTT
GCCCTTGGGTCAATCATCAGAGGAGATGGACAGGCTGCTTCTCGAAGACATGGAATGGCG
TCTTATGAAAAGGATGGAGCATAGCCACGGCTTTCGTGGTCGTCAAATCAGACTTAACCC
AACGCGGTCCAAGTATTGAAAGGAACATTTGAAGAAGGATAAGCTGGGAGAAGAAGCGAG
AAGAGGGCGTTTCGTTTTCATATGCATGGTTTAATAATGTAATAAATAAAATTACTGTGT
TACCTCTTGTTCGTCCGGATTCTTTTGCTTAAAGTTTAAACTTCGCAATTCTGTCAAGTT
TTAAGTATGTATGCTCATCTTTTAGATACTTGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT24TF U 4
AF RR4H047TF U 4
AF RR4F216TF U 1
AF RR4B059TF U 4
AF RR4B059JQ C 492
AF RR4BV72TF U 343
AF RR4BV72JQ C 456
AF RR4AT24JQ C 563
AF RR4F216JQ C 567
BS 1 294 RR4F216TF
BS 295 295 RR4AT24TF
BS 296 410 RR4F216TF
BS 411 411 RR4AT24TF
BS 412 673 RR4F216TF
BS 674 674 RR4B059TF
BS 675 694 RR4F216TF
BS 695 695 RR4B059TF
BS 696 742 RR4F216TF
BS 743 773 RR4B059TF
BS 774 921 RR4BV72TF
BS 922 922 RR4BV72JQ
BS 923 923 RR4AT24JQ
BS 924 1049 RR4BV72JQ
BS 1050 1050 RR4AT24JQ
BS 1051 1073 RR4BV72JQ
BS 1074 1117 RR4F216JQ

RD RR4AT24TF 559 0 0
GG
GCTCGCTCTCTCTTTCGCACACACATTGATCCGTCGCTCGCTCATCGTTTGCCGTTTCAG
ATTCGAGGAGAATGAACCAAATCGAGAACATGGCGACGCAGCAGCCTGGGCATGGGGGGG
CGGTGGAGAAAGCTTTTGTGCTATGGGACATAGGCAACTGTCCGATTCCAGATGGTCACG
ATCCTCTTATGGTAGTTGGGAAAATACTAATGGCGGTGGAAAAGTCAGGCCACGTCCGCC
GCAATGGTCAGATCTCTATCACTGCAATCGGCAGCGAACTAACAAAGATCCCTGGTGAAG
ACGTTATGAGGAGACTCTCTTCGTGTGCAATATCTCTTAAGCATTCCCACCTCTATACAA
ATGATTTGGATGAGTGGGCCAATGCGAATCCTGCTCCGTGCACTATGATGATCACAGATG
ATCAGGAGCGAATAGGATGGATGGCTTCTCAACTTTCCGATCTTGAAAATGCTGGATACA
GAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCCTTACCACGTCCCTTTTCTGCCC
ATTGGAATTGGGATGCC

QA 3 559 3 559
DS 

RD RR4H047TF 704 0 0
GG
GCTCGCTCTCTCTTTCGCACACACATTGATCCGTCGCTCGCTCATCGTTTGCCGTTTCAG
ATTCGAGGAGAATGAACCAAATCGAGAACATGGCGACGCAGCAGCCTGGGCATGGGGGGG
CGGTGGAGAAAGCTTTTGTGCTATGGGACATAGGCAACTGTCCGATTCCAGATGGTCACG
ATCCTCTTATGGTAGTTGGGAAAATACTAATGGCGGTGGAAAAGTCAGGCCACGTCCGCC
GCAATGGTCAGATCTCTATCACTGCAATCGGCAGCGAACTAACAAAGATCCCTGGTGAAG
ACGTTATGAGGAGACTCTCTTCGTGTGCAATATCTCTTAAGCATTCCCACCTCTATACAA
ATGATTTGGATGAGTGGGCCAATGCGGATCCTGCTCCGTGCACTATGATGATCATAGATG
ATCAGGAGCGAATAGGACGGATGGCTTCTCAACTTTCCGATCTTGAAAATGCTGGATACA
GAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCCTTACCACGTCCCTTTTCTGCCC
ATTGGAATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAGGCTTG
TTTTTAGTCAGGGCAAGTACAATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTTTGTTG
CTGTCAAA*GCTTTGAAGATTTCACCGCCCATCTCAAGAGTG

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR4F216TF 742 0 0
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TTCAGATTCGAGGAGAATGAACCAAATCGAGAACATGGCGACGCAGCAGCCTGGGCATGG
GGGGGCGGTGGAGAAAGCTTTTGTGCTATGGGACATAGGCAACTGTCCGATTCCAGATGG
TCACGATCCTCTTATGGTAGTTGGGAAAATACTAATGGCGGTGGAAAAGTCAGGCCACGT
CCGCCGCAATGGTCAGATCTCTATCACTGCAATCGGCAGCGAACTAACAAAGATTCCTGG
TGAAGACGTTATGAGGAGACTCTCTTCGTGTGCAATATCTCTTAAGCATTCCCACCTCTA
TACAAATGATTTGGATGAGTGGGCCAATGCGAATCCTGCTCCGTGCACTACGATGATCAT
AGATGATCAGGAGCGAATAGGATGGATGGCTTCTCAACTTTCCGATCTTGAAAATGCTGG
ATACAGAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCCTTACCACGTCCCTTTTC
TGCCCATTGGAATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAG
GCTTGTTTTTAGTCAGGGCAAGTACAATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTT
TGTTGCTGTCAAA*GCTTTGAAGATTTCACCGCC*ATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTT
TGGCGTGTGGGACACTTATGCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4B059TF 770 0 0
GG
GCTCGCTCTCTCTTTCGCACACACATTGATCCGTCGCTCGCTCATCGTTTGCCGTTTCAG
ATTCGAGGAGAATGAACCAAATCGAGAACATGGCGACGCAGCAGCCTGGGCATGGGGGGG
CGGTGGAGAAAGCTTTTGTGCTATGGGACATAGGCAACTGTCCGATTCCAGATGGTCACG
ATCCTCTTATGGTAGTTGGGAAAATACTAATGGCGGTGGAAAAGTCAGGCCACGTCCGCC
GCAATGGTCAGATCTCTATCACTGCAATCGGCAGCGAACTAACAAAGATCCCTGGTGAAG
ACGTTATGAGGAGACTCTCTTCGTGTGCAATATCTCTTAAGCATTCCCACCTCTATACAA
ATGATTTGGATGAGTGGGCCAATGCGAATCCTGCTCCGTGCACTATGATGATCACAGATG
ATCAGGAGCGAATAGGATGGATGGCTTCTCAACTTTCCGATCTTGAAAATGCTGGATACA
GAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCCTTACCACGTCCCTTTTCTGCCC
ATTGGAATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAGGCTTG
TTTTTAGTCGGGGCAAGTACAATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTTTGTTG
CTGTCAAAAGCTTTGAAGATTTCACCGCCCATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTTTGGCG
TGTGGGACACTTATGCTTCTAAAACGGGTCTTGATCGTACTATCCGTG

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4B059JQ 313 0 0
TTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCCTTACCACGTCCCTTTTCTGCCCATTGGA
ATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAGGCTTGTTTTTA
GTCGGGGCAAGTACAATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTTTGTTGCTGTCA
AAAGCTTTGAAGATTTCCCCGCCCATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTTTGGCGTGTGGG
ACACTTATGCTTTTAAAACGGGTTTTGATCGTACTATCCGTGCAAACTTGCCCTTGGGTC
AATCATCAGAGGA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR4BV72TF 579 0 0
G
AAGCATTCCCACCTCTATACAAATGATTTGGATGAGTGGGCCAATGCGAATCCTGCTCCG
TGCACTATGATGATCATAGATGATCAGGAGCGAATAGGATGGATGGCTTCTCAACTTTCC
GATCTTGAAAATGCTGGATACAGAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCACCACACCC
TTACCACGTCCCTTTTCTGCCCATTGGAATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGAACAGGAG
CTAACAACAACAATGAGGCTTGTTTTTAGTCAGGGCAAGTACAATGATGGATACCCCTGG
GCTTGCGAAGATTGCTTTGTTGCTGTCAAAAGCTTTGAAGATTTCACCGCCCATCTCAAG
AGTGTAGAACATGAGTTTGGCGTGTGGGACACTTATGCTTCTAAAACGGGTCTTGATCGT
ACTATCCGTGCAAACTTGCCCTTGGGTCAATCATCAGAGGAGATGGACAGGCTGCTTCTC
GAAGACATGGAATGGCGTCTTATGAAAAGGATGGAGCATAGCCACGGCTTTCGTGGTCGT
CAAATCAGACTTAACCCAACGCGGTCCAAGTATTGAAA

QA 2 579 2 579
DS 

RD RR4BV72JQ 620 0 0
AACTTTCCGATCTTGAAAATGCTGGATACAGAATTCTTCTTGCATATCGTTACCCAGCCA
CCACACCCTTACCACGTCCCTTTTCTGCCCATTGGAATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATG
AACAGGAGCTAACAACAACAATGAGGCTTGTTTTTAGTCAGGGCAAGTACAATGATGGAT
ACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTTTGTTGCTGTCAAAAGCTTTGAAGATTTCACCGCCC
ATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTTTGGCGTGTGGGACACTTATGCTTCTAAAACGGGTC
TTGATCGTACTATCCGTGCAAACTTGCCCTTGGGTCAATCATCAGAGGAGATGGACAGGC
TGCTTCTCGAAGACATGGAATGGCGTCTTATGAAAAGGATGGAGCATAGCCACGGCTTTC
GTGGTCGTCAAATCAGACTTAACCCAACGCGGTCCAAGTATTGAAAGTAACATTTGAAGA
AGGATAAGCTGGGAGAAGAAGCGAGAAGAGGGCGTTTCGTTTTCATATGCATGGTTTAAT
AATGTAATAAATAAAATTACTGTGTTACCTCTTGTTCGTCCGGATTCTTTTGCTCAAAGT
TTAAACTTCGCAATTCTG
GC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4AT24JQ 504 0 0
TTAGTCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAGGCTTGTTTTTAGTCGGGGCAAG
TACAATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTTTGTTGCTGTCAAAAGCTTTGAA
GATTTCACCGCCCATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTTTGGCGTGTGGGACACTTATGCT
TTTAAAACGGGTTTTGATCGTACTATCCGTGCAAACTTGCCCTTGGGTCAATCATCAGAG
GAGATGGACAGGCTGCTTTTTTAAGACATGGAATGGCGTTTTATGAAAAGGATGGAGCAT
AGCCACGGCTTTCGTGGTCGTCAAATCAGACTTAACCCAACGCGGTCCAAGTATTGAAAG
GAACATTTGAAGAAGGATAAGCTGGGAGAAGAAGCGAGAAGAGGGCGTTTCGTTTTCATA
TGCATGGTTTAATAATGTAATAAATAAAATTACTGTGTTACCTCTTGTTCGTCCGGATTC
TTTTGCTTAAAGTTTAAACTTC
GC

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4F216JQ 551 0 0
TCTTTGATGAACAGGAGCTAACAACAACAATGAGGCTTGTTTTTAGTCAGGGCAAGTACA
ATGATGGATACCCCTGGGCTTGCGAAGATTGCTTTGTTGCTGTCAAAAGCTTTGAAGATT
TCACCGCCCATCTCAAGAGTGTAGAACATGAGTTTGGCGTGTGGGACACTTATGCTTCTA
AAACGGGTCTTGATCGTACTATCCGTGCAAACTTGCCCTTGGGTCAATCATCAGAGGAGA
TGGACAGGCTGCTTCTCGAAGACATGGAATGGCGTCTTATGAAAAGGATGGAGCATAGCC
ACGGCTTTCGTGGTCGTCAAATCAGACTTAACCCAACGCGGTCCAAGTATTGAAAGGAAC
ATTTGAAGAAGGATAAGCTGGGAGAAGAAGCGAGAAGAGGGCGTTTCGTTTTCATATGCA
TGGTTTAATAATGTAATAAATAAAATTACTGTGTTACCTCTTGTTCGTCCGGATTCTTTT
GCTTAAAGTTTAAACTTCTCAATTCTGTCAAGTTTTAAGTATGTATGCTCATCTTTTAGA
TACTTGGTCCC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 2 7

CO CL615Contig1 701 4 13 U
CCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACACTTAATAAATAGAGAGTGTA
CTTATAAAAGTGGTAACAAAGACGGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCACAAGATCAAA
ATGTCAGGTCACTCACACCGGTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACT
GCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCT
TCGAGTCCCATCTCATTCCAGAGATGATTCTCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGT
CCCTGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAAAATGTCCT
CCGCATTGCACTTGTTCTTGTATAGACTGAAGAGATGGTTGGCATGGATCAAGTCATATG
TTCTCGGGTATGTCGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCTCGTT
CATACACAACTCCAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGGGACAACATTCATAACCCAAA
GCTTCTGCGATTCCAGAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCTGCGTTCATGTACATAATGT
TACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4GR51JQ U 24
AF RR4HA73JQB U 1
AF RR4CX39JQ U 1
AF RR4CX39TF C 8
BS 1 146 RR4CX39JQ
BS 147 147 RR4GR51JQ
BS 148 320 RR4CX39JQ
BS 321 321 RR4HA73JQB
BS 322 322 RR4CX39JQ
BS 323 323 RR4HA73JQB
BS 324 390 RR4CX39JQ
BS 391 391 RR4HA73JQB
BS 392 451 RR4CX39JQ
BS 452 452 RR4HA73JQB
BS 453 520 RR4CX39JQ
BS 521 521 RR4HA73JQB
BS 522 701 RR4CX39JQ

RD RR4GR51JQ 427 0 0
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AAATATAAACTATTACACTTAATAAATAGAGATTGTACTTATAAAAGTGGTAACAAAGAC
GGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCACAAGATCAAAATGTCAGGTCACTCACACCGGTA
CTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTC
TCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTC*AGAG
ATGATTCTCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGTCCCTGATTATAACCGCTCCTTCT
GGACGCAAAATCCTATCCATCTCCAGAAAAATGTCCTCCGCATTGCACTTGTTCTTGTAT
AGACTGA

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4HA73JQB 556 0 0
ACTTGAA
GCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTTCCAAGCT
TTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACACTTAATAAATAGAGATTGTACTTATAA
AAGTGGTAACAAAGACGGAAAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCACAAGATCAAAATGTCAG
GTCACTCACACCGGTACTTCAGTGAGACGCACTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCAC
AGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCTTCCAGTC
CCATCTCATTCCAGAGATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGTCCCTGAT
TATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAAAATGTCCTCCGCATT
GCACTTGTTCTTGTATAGACTGAAGAGATGGTTGGCATGGATCAAGTCATATGTTCTCGG
GTATGTCGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCTCTTTCATACAC
AACTCCAAG

QA 8 556 8 556
DS 

RD RR4CX39JQ 701 0 0
CCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACACTTAATAAATAGAGAGTGTA
CTTATAAAAGTGGTAACAAAGACGGAAAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCACAAGATCAAA
ATGTCAGGTCACTCACACCGGTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACT
GCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCT
TCGAGTCCCATCTCATTCCAAAAATGATTCTCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGT
CCCTGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAAAATCCTATCCATCTCCAGAAAAATGTCCT
CCGCATTGCACTTGTTCTTGTATAGACTGAAAAGATGGTTGGCATGGATCAAGTCATATG
TTCTCGGGTATGTCGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAAATACCAATGAGTCCTCGTT
CATACACAACTCCAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGGGACAACATTCATAACCCAAA
GCTTCTGCGATTCCAGAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCTGCGTTCATGTACATAATGT
TACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4CX39TF 694 0 0
GCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTTCCAAGCT
TTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACACTTAATAAATAGAGAGTGTACTTATAA
AAGTGGTAACAAAGACGGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCACAAGATCAAAATGTCAG
GTCACTCACACCGGTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCAC
AGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCTTCGAGTC
CCATCTCATTCCAGAGATGATTCTCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGTCCCTGAT
TATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAGAATGTCCTCCGCATT
GCACTTGTTCTTGTATAGACTGAAGAGATGGTTGGCATGGATCAAGTCATATGTTCTCGG
GTATGTCGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCTCGTTCATACAC
AACTCCAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGGGACAACATTCATAACCCAAAGCTTCTG
CGATTCCAGAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCTGCGTTCATGTACATAATGTTACGGTA
CCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTT
C

QA 1 693 1 693
DS 



CO CL615Contig2 1146 3 21 U
GGTCCTCCAATCAACTGGAAGATCAACTACAAGGCATGGCAACGTCCCAAGGAGGATCTT
GAAGAGGAACAAAGAAAGATCGAGGAAGCTGCTAAGCTTCTCTGCTGGGAGAAGAAGTAC
GAGCACGGAGAGATCGCCATTTGGCAGAAGAGAGTCAACGACGAGGCGTGCCGCTCGAGA
CAAGACGACCCTAGAGCCAACTTCTGCAAAGCCACTGATGACACCGATGACGTGTGGTAC
AAGAAAATGGAGGCGTGCATTACACCTTACCCCGAGACAAGTAGCTCGGACGAAGTGGCT
GGAGGAGAGCTTCAGGTTTTCCCTGATAGGCTCAACGCGGTGCCGCCTAGGATCTCTAGC
GGTTCGGTCTCTGGCGTCACGGCTGATGCGTATGAGGATGATAACAGACAGTGGAAGAAG
CATGTGAAGGCTTACAAGAGGATCAATAGTTTGATTGATACTGGGAGGTACCGTAACATC
ATGGACATGAACGCAGGGTTTGGTGGGTTTGCTGCTGCTTTGGAGTCACAGAAGCTTTGG
GTTATGAATGTTGTTCCAACCATTGCTGAGAAGAATAGGCTTGGAGTTGTGTATGAACGA
GGACTCATTGGTATCTACCATGACTGGTGCGAGGCTTTCTCGACATACCCGAGAACATAT
GACTTAATCCATGCGAACCATCTCTTCAGTCTTTACAAGAACAAGTGTAATGCGGAAGAC
ATTCTTCTGGAGATGGATAGGATTCTGCGTCCAGAAGGAGCGGTTATAATCCGGGACGAT
GTTGACACATTGATGAAGGTGAAGGGAATCATCTCTGGAATGAGATGGGACTCGAAGATG
GTTGACCATGAGGATGGTCCTTTGGTTCCTGAGAAGGTTTTGATTGCTGTGAAGCAGTAT
TGGGTCACCAACTCCACTGCGTCTCACTGAAGTAATGTTTACTACGTACCCGGTGTGAGT
GACCTGACATTTTGATCTTATGATAGAGCTTTCGAGCTACATTCTCTCTCTTTGTTACCA
CTTTTATAAGTACAATCTCTATTTATTAAATGTAATAGTTTATATTTGTTTCTTTGTCCC
AAAAGCTTGGAACTTTTGTGGTGTATCATTGAATTATCAACTTTTATAATGACCGAGTTA
TGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA73TF U 1
AF RR4A584TF U 297
AF RR4A584JQ C 351
BS 1 365 RR4HA73TF
BS 366 367 RR4A584TF
BS 368 395 RR4HA73TF
BS 396 396 RR4A584TF
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BS 420 420 RR4A584TF
BS 421 428 RR4HA73TF
BS 429 429 RR4A584TF
BS 430 479 RR4HA73TF
BS 480 480 RR4A584TF
BS 481 493 RR4HA73TF
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BS 495 500 RR4HA73TF
BS 501 501 RR4A584TF
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BS 596 1080 RR4A584TF
BS 1081 1146 RR4A584JQ

RD RR4HA73TF 595 0 0
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GAAGAGGAACAAAGAAAGATCGAGGAAGCTGCTAAGCTTCTCTGCTGGGAGAAGAAGTAC
GAGCACGGAGAGATCGCCATTTGGCAGAAGAGAGTCAACGACGAGGCGTGCCGCTCGAGA
CAAGACGACCCTAGAGCCAACTTCTGCAAAGCCACTGATGACACCGATGACGTGTGGTAC
AAGAAAATGGAGGCGTGCATTACACCTTACCCCGAGACAAGTAGCTCGGACGAAGTGGCT
GGAGGAGAGCTTCAGGTTTTCCCTGATAGGCTCAACGCGGTGCCGCCTAGGATCTCTAGC
GGTTCCATCTCTGGCGTCACGGCTGATGCGTATGAAGATGATAACAGACAGTGGAAGAAA
CATGTGAATGCTTACAAGAGGATCAATAGTTTGATTGATACTGGGAGGTACCGTAACATT
ATGGACATGAACG*AGGGTTAGGTGGGTTTGCTGCTGCTTTGGAATCACAGAAGCTTTGG
GTTATGAATGTTGTTCCAACCATTGCTGAGAAGAATAGACTTGGAGTTGTGTATG

QA 1 595 1 595
DS 

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GGCT
GGAGGAGAGCTTCAGGTTTTCCCTGATAGGCTCAACGCGGTGCCGCCTAGGATCTCTAGC
GGTTCGGTCTCTGGCGTCACGGCTGATGCGTATGAGGATGATAACAGACAGTGGAAGAAG
CATGTGAAGGCTTACAAGAGGATCAATAGTTTGATTGATACTGGGAGGTACCGTAACATC
ATGGACATGAACGCAGGGTTTGGTGGGTTTGCTGCTGCTTTGGAGTCACAGAAGCTTTGG
GTTATGAATGTTGTTCCAACCATTGCTGAGAAGAATAGGCTTGGAGTTGTGTATGAACGA
GGACTCATTGGTATCTACCATGACTGGTGCGAGGCTTTCTCGACATACCCGAGAACATAT
GACTTAATCCATGCGAACCATCTCTTCAGTCTTTACAAGAACAAGTGTAATGCGGAAGAC
ATTCTTCTGGAGATGGATAGGATTCTGCGTCCAGAAGGAGCGGTTATAATCCGGGACGAT
GTTGACACATTGATGAAGGTGAAGGGAATCATCTCTGGAATGAGATGGGACTCGAAGATG
GTTGACCATGAGGATGGTCCTTTGGTTCCTGAGAAGGTTTTGATTGCTGTGAAGCAGTAT
TGGGTCACCAACTCCACTGCGTCTCACTGAAGTAATGTTTACTACGTACCCGGTGTGAGT
GACCTGACATTTTGATCTTATGATAGAGCTTTCGAGCTACATTCTCTCTCTTTGTTACCA
CTTTTATAAGTACAATCTCTATTTATTAAATGTAATAGTTTATATTTGTTTCTTTGTCCC

QA 5 784 5 784
DS 

RD RR4A584JQ 796 0 0
GATCTCTAGCGGTTCGGTCTCTGGCGTCACGGCTGATGCGTATGAGGATGATAACAGACA
GTGGAAGAAGCATGTGAAGGCTTACAAGAGGATCAATAGTTTGATTGATACTGGGAGGTA
CCGTAACATCATGGACATGAACGCAGGGTTTGGTGGGTTTGCTGCTGCTTTGGAGTCACA
GAAGCTTTGGGTTATGAATGTTGTTCCAACCATTGCTGAGAAGAATAGGCTTGGAGTTGT
GTATGAACGAGGACTCATTGGTATCTACCATGACTGGTGCGAGGCTTTCTCGACATACCC
GAGAACATATGACTTAATCCATGCGAACCATCTCTTCAGTCTTTACAAGAACAAGTGTAA
TGCGGAAGACATTCTTCTGGAGATGGATAGGATTCTGCGTCCAGAAGGAGCGGTTATAAT
CCGGGACGATGTTGACACATTGATGAAGGTGAAGGGAATCATCTCTGGAATGAGATGGGA
CTCGAAGATGGTTGACCATGAGGATGGTCCTTTGGTTCCTGAGAAGGTTTTGATTGCTGT
GAAGCAGTATTGGGTCACCAACTCCACTGCGTCTCACTGAAGTAATGTTTACTACGTACC
CGGTGTGAGTGACCTGACATTTTGATCTTATGATAGAGCTTTCGAGCTACATTCTCTCTC
TTTGTTACCACTTTTATAAGTACAATCTCTATTTATTAAATGTAATAGTTTATATTTGTT
TCTTTGTCCCAAAAGCTTGGAACTTTTGTGGTGTATCATTGAATTATCAACTTTTATAAT
GACCGAGTTATGCTTC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 8

CO CL616Contig1 1470 8 17 U
GGAGTTTTTAAAATCTTGGTTAGCTATATAACCAACTTATGTTTCCTTGAAGCTCATTTT
GTGAATTCTCTGGTTTTCTTCTTAGGCTAGACAAGAAAAAGGTTCGTAGAGCGTTGGAAT
ATAAAATAGACATTAGTTTTTGAGAAAACTAATCAAAAAAGTACATTACAAAGAATCAAA
TATGTTACAGCATGTAGCAACAGATAAAATATCATCAACCTGAAAACTTCACCAGAAATA
AACAAACACACTCTGAGACGGCTTTCTTGAAATTGTTTCTTCAAGGCTTGATCTTGTGCC
TAAGTTTTTGAATGGTCAAGTCTGCACCTCCAAATCCATCCATTACACCTTTTGCTGATG
GAAACTCACCTCTTGCAGTTAAACTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCT
TTGCAGCAGAAACTCCAGATTGACTACCAGCAACAAGTACACAGTT***AACAGGTAATC
CAGTATACTCTGCAGCAGCACGCAATGCAACCACAATTTTCTCCAATCTCTCAGATGAGC
TTGTGTCAATGTCCACACTAAGCTTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTT
TCTCAGCGGATGCTGCTTTTTTGACTTCCTTGACTAGTTGCTCCTCTAGACTTGAAGAAA
CTCCTTTGCCAAGAACAAGTTGTCCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAA
CCTTCACACTGGGAAGTCTTTCTTCGCCAAGCATCTCCACAATGGATAAGGCTACTTTGT
CTCCACTCTTGAAGTAGGCTGTTGCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTAT
CGATAAACTCTTGGACTCCAGATCTGAGAGGTAAGCTTTTGGACATCAGAAACTCATCCA
TGGCATTTTTCTTTTCTCGCAATACACTTTTTACAAAAGTCCCTTTCTCATTGGTTGGCA
AGGAGGAAGGCCATCCAATCTGGTTGAAATACAAAACCAACATTTTCTCTTCATCAGCAG
CACCTTTTCTCAACAGGTCTGCATAAACTGGTTCAGACCAGTTAGCACAGTCAAGCCCAA
GCTTTTTAAAAGCTACATTGAAAGCCTGGCGATTACTAGACCATGTATCAATCATTACCC
CATCAACCTCAAGTATCACGGCGAGTTCTTCAGATGGGTTTGCATCTTCACGGCTCGCTG
ATAAGCAGCGCGTGGAGGAACTCTGTCTATGCACTCGCAGGCATTTTCCGAGAATCTGGG
ATCTTTCTGGGCAATCAAGAAAAGCCAAGGAACTTGGTCGTCTTCTTCCAGTGTCGTGTG
ACCACAGGTTAGTCGTGAAAGGATGAGACTTTGTGCAAGAAGAAAGCTGGAGATTGTTAA
GGATCGAACAAGAAGCGAAATCCATGGCTACCTTCTTCTTCTCTCTGTGTTTTCTGTTGA
TTCATACCAAACCAGAAAGTCTTCAATTCC


BQ
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45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS05JQ U 1
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AF RR4BB33TF C 672
AF RR4E374TF C 680
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BS 495 599 RR4BS05JQ
BS 600 600 RR4E374JQ
BS 601 764 RR4BS05JQ
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BS 794 859 RR4A186JQ
BS 860 931 RR4BB33JQ
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ATAAAATAGACATTAGTTTTTGAGAAAACTAATCAAAAAAGTACATTACAAAGAATCAAA
TATGTTACAGCATGTAGAAACAGATAAAATATCATCAACCTGAAAACTTCACCAGAAATA
AACAAACACACTCTGAGACGGCTTTCTTGAAATTGTTTCTTCAAGGCTTGATCTTGTGCC
TAAGTTTTTGAATGGTCAAGTCTGCACCTCCAAATCCATCCATTACACCTTTTGCTGATG
GAAACTCACCTCTTGCAGTTAAACTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCT
TTGCAGCAGAAACTCCAGATTGACTACCAGCAACAAGTACACAGTTTCTAACAGGTAATC
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TTGTGTCAATGTCCACACTAAGCTTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTC
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CTCCTTTGCCAAGAACAAGTTGTCCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAA
CCTTCACACTGGGAAGTCTTTCTTCGCCAAGCATCTCCACAATG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4E374JQ 671 0 0
AG
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TTACAGCATGTAGCAACAGATAAAATATCATCAACCTGAAAACTTCACCAGAAATAAACA
AACACGCTCTGAGACGGCTTTCTTGAAATTGTTTCTTCAAGGCTTGATCTTGTGCCTAAG
TTTTTGAATGGTCAAGTCTGCACCTCCAAATCCATCCACTACACCTTTTGCTGATGGAAA
CTCACCTCTTGCAGTTAAACTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCTTTGC
AGCAAAAACTCCAGATTGACTACCAGCAACAAGTACACAGTTTCTAACAGGTAATCCAGT
ATACTCTGCAGCAGCACGCAATGCAACCACAATTTTCTCCAATCTCTCAGATGAGCTTGT
GTCAATGTCCACACTAAGCTTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTTTCTC
AGCGGATGCTGCTTTTTTGACTTCCTTGACTAGTTGCTCCTCTAGACTTGAAGAAACTCC
TTTGCCAAGAACAAGTTGTCCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAACCTT
CACACTGGGAAGTCTTTCTTCGCCAAGCATCTCCACAATGGATAAGGCTACTTTGTCTCC
ACTCTTGAA

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CTGCACCTCCAAATCCATCCATTACACCTTTTGCTGATGGAAACTCACCTCTTGCAGTTA
AACTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCTTTGCAGCAGAAACTCCAGATT
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GCAATGCAACCACAATTTTCTCCAATCTCTCAGATGAGCTTGTGTCAATGTCCACACTAA
GCTTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTTTCTCAGCGGATGCTGCTTTTT
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GTCCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAACCTTCACACTGGGAAGTCTTT
CTTCGCCAAGCATCTCCACAATGGATACGGCTACTTTGTCTCCACTCTTGAAGTAGGCTG
TTGCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTATCGATAAACTCTTGGACTCC
C

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DS 

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AGATAAAATATCATCAACCTGAAAACTTCACCAGAAATAAACAAACACACTCTGAGACGG
CTTTCTTGAAATTGTTTCTTCAAGGCTTGATCTTGTGCCTAAGTTTTTGAATGGTCAAGT
CTGCACCTCCAAATCCATCCATTACACCTTTTGCTGATGGAAACTCACCTCTTGCAGTTA
AACTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCTTTGCAGCAGAAACTCCAGATT
GACTACCAGCAACAAGTACACAGTT***AACAGGTAATCCAGTATACTCTGCAGCAGCAC
GCAATGCAACCACAATTTTCTCCAATCTCTCAGATGAGCTTGTGTCAATGTCCACACTAA
GCTTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTTTCTCAGCGGATGCTGCTTTTT
TGACTTCCTTGACTAGTTGCTCCTCTAGACTTGAAGAAACTCCTTTGCCAAGAACAAGTT
GTCCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAACCTTCACACTGGGAAGTCTTT
CTTCGCCAAGCATCTCCACAATGGATACGGCTACTTTGTCTCCACTCTTGAAGTAGGCTG
TTGCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTATCGATAAACTCTTGGACTCC
C

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4A186TF 719 0 0
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AGATAAAATATCATCAACCTGAAAACTTCACCAGAAATAAACAAACACACTCTGAGACGG
CTTTCTTGAAATTGTTTCTTCAAGGCTTGATCTTGTGCCTAAGTTTTTGAATGGTCAAGT
CTGCACCTCCAAATCCATCCATTACACCTTTTGCTGATGGAAACTCACCTCTTGCAGTTA
AACTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCTTTGCAGCAGAAACTCCAGATT
GACTACCAGCAACAAGTACACAGTT***AACAGGTAATCCAGTATACTCTGCAGCAGCAC
GCAATGCAACCACAATTTTCTCCAATCTCTCAGATGAGCTTGTGTCAATGTCCACACTAA
GCTTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTTTCTCAGCGGATGCTGCTTTTT
TGACTTCCTTGACTAGTTGCTCCTCTAGACTTGAAGAAACTCCTTTGCCAAGAACAAGTT
GTCCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAACCTTCACACTGGGAAGTCTTT
CTTCGCCAAGCATCTCCACAATGGATACGGCTACTTTGTCTCCACTCTTGAAGTAGGCTG
TTGCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTATCGATAAACTCTTGGACTCC
C

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4BB33JQ 790 0 0
GG
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ATAAAATATCATCAACCTGAAAACTTCACCAGAAATAAACAAACACACTCTGAGACGGCT
TTCTTGAAATTGTTTCTTCAAGGCTTGATCTTGTGCCTAAGTTTTTGAATGGTCAAGTCT
GCACCTCCAAATCCATCCATTACACCTTTTGCTGATGGAAACTCACCTCTTGCAGTTAAA
CTGCTTCTCATGACTACACAAGGCATGCCTATCATCTTTGCAGCAGAAACTCCAGATTGA
CTACCAGCAACAAGTACACAGTTTCTAACAGGTAATCCAGTATACTCTGCAGCAGCACGC
AATGCAACCACAATTTTCTCCAATCTCTCAGATGAGCTTGTGTCAATGTCCACACTAAGC
TTTAGCATCGATGCAACTTCTTCTGCTATCCTCTGTTTCTCAGCGGATGCTGCTTTTTTG
ACTTCCTTGACTAGTTGCTCCTCTAGACTTGAAGAAACTCCTTTGCCAAGAACAAGTCGT
CCATACATACTCTGTTCCACCTCACTGTCTCCAATAACCTTCACACTGGGAAGTCTTTCT
TCGCCAAGCATCTCCACAATGGATAAGGCTACTTTGTCTCCACTCTTGAAGTAGGCTGTT
GCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTATCGATAAACTCTTGGACTCCAGAT
CTGAGAGGTAAGCTTTTGGACATCAGAAACTCATCCATGGCATTTTTCTTTTCTCGCAAT
ACACTTTT

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DS 

RD RR4BB33TF 799 0 0
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AAGTAGGCTGTTGCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTATCGATAAACTCT
TGGACTCCAGATCTGAGAGGTAAGCTTTTGGACATCAGAAACTCATCCATGGCATTTTTC
TTTTCTCGCAATACACTTTTTACAAAAGTCCCTTTCTCATTGGTTGGCAAGGAGGAAGGC
CATCCAATCTGGTTGAAATACAAAACCAACATTTTCTCTTCATCAGCAGCACCTTTTCTC
AACAGGTCTGCATAAACTGGTTCAGACCAGTTAGCACAGTCAAGCCCAAGCTTTTTAAAA
GCTACATTGAAAGCCTGGCGATTACTAGACCATGTATCAATCATTACCCCATCAACCTCA
AGTATCACGGCGAGTTCTTCAGATGGGTTTGCATCTTCACGGCTCGCTGATAAGCAGCGC
GTGGAGGAACTCTGTCTATGCACTCGCAGGCATTTTCCGAGAATCTGGGATCTTTCTGGG
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GTCGTGAAAGGATGAGACTTTGTGCAAGAAGAAAGCTGGAGATTGTTAAGGATCGGACAA
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CCAGAAAGTCTTCAATTCC

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DS 

RD RR4E374TF 787 0 0
G
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TCTTCGCCAAGCATCTCCACAATGGATAAGGCTACTTTGTCTCCACTCT*GAAGTAGGCT
GTTGCGATAGCAACGGGTACTTTCTCCGTGTATGCATTATCGATAAACTCTTGGACTCCA
GATCTGAGAGGTAAGCTTTTGGACATCAGAAACTCATCCATGGCATTTTTCTTTTCTCGC
AATACACTTTTTACAAAAGTCCCTTTCTCATTGGTTGGCAAGGAGGAAGGCCATCCAATC
TGGTTGAAATACAAAACCAACATTTTCTCTTCATCAGCAGCACCTTTTCTCAACAGGTCT
GCATAAACTGGTTCAGGCCAGTTAGCACAGTCAAGCCCACGCTTTTTAAAAGCTACATTG
AAAGCCTGGCGATTACTAGACCATGTATCAATCATTACCCCATCAACCTCAAGTATCACG
GCGAGTTCTTCAGATGGGTTTGCATCTTCACGGCTCGCTGATAAGCAGCGCGTGGAGGAA
CTCTGTCTATGCACTCGCAGGCATTTTCCGAGAATCTGGGATCTTTCTGGGCAATCAAGA
AAAGCCAAGGAACTTGGTCGTCTTCTTCCAGTGTCGTGTGACCACAGGTTAGTCGTGAAA
GGATGAGACTTTGTGCAAGAAGAAAGCTGGAGATTGTTAAGGATCGAACAAGAAGCGAAA
TCCATGGCTACCTTCTTCTTCTCTCTGTGTTTTCTGTTGATTCATACCAAACCAGAGAGT
CTTC
CC

QA 2 785 2 785
DS 



AS 1 8

CO CL617Contig1 1017 8 14 U
AGGGATATATCATTTCCAGGTCTTCTTCATCATCCAACTTCCCAAGCGTTGAGAACCGAA
CCTAGATTTGATATCCCTTGTCTGCATCTGACGATGGAATTCACTCCAGCCGATTTCGAT
AGGCTTATGATGGTCGACCTCGCTCGAAACGCTTGCGAGGAACAGTACATGAAGGATCCT
CTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCTTGAGCTTTCACAGTTCCAG
AGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATCCAAGTTCGAGGAGGTATTG
AAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCAACGCCTACTCTTCCCAA
GCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTGATAAAGCCGCTGATTAT
TTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCATGGAAGTT
CCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGATACAGCAG
GCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAATGCTAGCGGTGGTGG*TAA
GAAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGATAATTCT
CGCCTTTGGG*ATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCACCTCCCC
CTGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTTCTAAAG
TTGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGGTGGCTATTATTGGTTTTGTTTCGTTTACTCAGCC
CAGCAAACTGTTTTTGTTTACTTAATTACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCTATTTCC
GAGTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTTTTGTGATACGAACACATTTTCTTTCTCTCTGTGT
TTCACAGAAGGTGCTATGAGAATAAGCTCCGATGAAGCTCTAAACAAATTTAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS94TF U 1
AF RR4BT15TF U 36
AF RR4BB19TF U 42
AF RR4CN71JQ C 118
AF RR4DP28JQ C 183
AF RR4B886TF U 673
AF RR4BT15JQ C 182
AF RR4BB19JQ C 201
BS 1 474 RR4BS94TF
BS 475 475 RR4BT15TF
BS 476 620 RR4BS94TF
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BS 674 697 RR4BS94TF
BS 698 728 RR4BT15TF
BS 729 864 RR4BB19TF
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BS 899 950 RR4B886TF
BS 951 963 RR4BT15JQ
BS 964 1017 RR4BB19JQ

RD RR4BS94TF 707 0 0
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AGGCTTATGATGGTCGACCTCGCTCGAAACGCTTGCGAGGAACAGTACATGAAGGATCCT
CTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCTTGAGCTTTCACAGTTCCAG
AGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATCCAAGTTCGAGGAGGTATTG
AAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCAACGCCTACTCTTCCCAA
GCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTGATAAAGCCGCTGATTAT
TTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCATG*AAGTT
CCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGATACAGCAG
GCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAATGCTAGCGGTGGTGG*TAA
GAAGAACAAGAAGAAGAAGA*CAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGATAATTCT
CGCCTTTGGG**ATGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAA
TCCTTGGCCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4BT15TF 693 0 0
GGGTTCCC
AAGCGTTGAGAACCGAACCTAGATTTGATATCCCTTGTCTGCATCTGACGATGGAATTCA
CTCCAGCCGATTTCGATAGGCTTATGATGGTCGACCTCGCTCGAAACGCTTGCGAGGAAC
AGTACATGAAGGATCCTCTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCTTG
AGCTTTCACAGTTCCAGAGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATCCA
AGTTCGAGGAGGTATTGAAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCA
ACGCCTACTCTTCCCAAGCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTG
ATAAAGCCGCTGATTATTTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATC
TCAAGTCCATGGAAGTTCCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATG
GTGGAATGATACAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAATG
CTAGCGGTGGTGGGTAAGAAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTA
TGCGGTTGGATAATTCTCGCCTTTGGG**ATGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCT
TGGCCCTCCACCTCCCCCTGCTAGA

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DS 

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GG
AAGCGTTGAGAACCGAACCTAGATTTGATATCCCTTGTCTGCATCTGACGATGGAATTCA
CTCCAGCCGATTTCGATAGGCTTATGATGGTCGACCTCGCTCGAAACGCTTGCGAGGAAC
AGTACATGAAGGATCCTCTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCTTG
AGCTTTCACAGTTCCAGAGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATCCA
AGTTCGAGGAGGTATTGAAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCA
ACGCCTACTCTTCCCAAGCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTG
ATAAAGCCGCTGATTATTTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATC
TCAAGTCCATGGAAGTTCCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATG
GTGGAATGATACAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAATG
CTAGCGGTGGTGG*TAAGAAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTA
TGCGGTTGGATAATTCTCGCCTTTGGGGATTGTTGCCTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCT
TGGCCCTCCACCTCCCCCTGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAAC
AGAGAACGGTTCTAAAGTTGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGGTGGCTATTATTGGTTTT
GTTTCGTTTACTCAGCCCAGCAAACTGTTTTTGTTTACTTA*TTACATTAGGATGGTTTG
TTACTTGGTCTATTT

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DS 

RD RR4CN71JQ 815 0 0
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CCTCTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCTTGAGCTTTCACAGTTC
CAGAGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATCCAAGTTCGAGGAGGTA
TTGAAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCCCTTTGGTGTCTTGGCAACGCCTACTCTTCC
CAAGCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCTAGCTCTCTTTGATAAAGCCGCTGAT
TATTTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCATGGAA
GTTCCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGATACAG
CAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATTTGCTTCATCAAATGCTAGCGGTGGTGG*
TAAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGATAAT
TCTCGCCTTTGGG*ATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCACCTC
CCCCTGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTTCTA
AAGTTGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGGTGGCTATTATTGGTTTTGTTTCGTTTACTCA
GCCCAGCAAACTGTTTTTGTTTACTTAATTACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCTATT
TCCGAGTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTTTTG
CGG

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DS 

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GTTTCTCAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTGATAAAGCCGCTGATTATTT
CCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCATGGAAGTTCC
AACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGATACAGCAGGC
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AGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGATAATTCTCG
CCTTTGGG*ATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCTTGGCT*TCCACCTCCCCCT
GCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTTCTAAAGTT
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GCAAACTGTTTTTGTTTACTTAATTACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCTATTTCCGA
GTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTTTTG
CG

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DS 

RD RR4B886TF 278 0 0
GATTTCTTCTTAGC
GGCATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCACCTCCCCCTGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCT
TATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTTCTAAAGTTGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGG
TGGCTATTATTGGTTTTGTTTCGTTTACTCAGCCCAGCAAACTGTTTTTGTTTACTTAAT
TACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCTATTTCCGAGTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTT
TTGTGATACGAACACATTTTCTTT

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DS 

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AAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCAACGCCTACTCTTCCCAAG
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TCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCATGGAAGTTC
CAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGATACAGCAGG
CACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAATGCTAGCGGTGGTGG*TAAG
AAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGATAATTCTC
GCCTTTGGG*ATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCACCTCCCCC
TGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTTCTAAAGT
TGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGGTGGCTATTATTGGTTTTGTTTCGTTTACTCAGCCC
AGCAAACTGTTTTTGTTTACTTAATTACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCTATTTCCG
AGTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTTTTGTGATACGAACACATTTTCTTTCTCTCTGTGTT
TC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4BB19JQ 817 0 0
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CATGTTAGATGTTGCTCTATCCAAGTTCGAGGAGGTATTGAAAATAAACCCAGGGAAGCA
TGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCAACGCCTACTCTTCCCAAGCGTTTCTTAATCCAGACTC
CGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTGATAAAGCCGCTGATTATTTCCAGAGAGCTGAAACTTT
GGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCATGGAAGTTCCAACAGAGGGGCCTAAACT
GCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGATACAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGG
AGGTCCATCTGCTTCATCAAATGCTAGCGGTGGTGG*TAAGAAGAACAAGAAGAAGAAGA
ACAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGATAATTCTCGCCTTTGGG*ATTGTTGCC
TGGGTTGGCATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCACCTCCCCCTGCTAGATAAAAAAAATGC
TCTGCTTATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTTCTAAAGTTGAATAGATCTTTTAACGT
TTCTGGTGGCTATTATTGGTTTTGTTTCGTTTACTCAGCCCAGCAAACTGTTTTTGTTTA
CTTAATTACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCTATTTCCGAGTAAAGAGCAACTATGTT
TTGGTTTTGTGATACGAACACATTTTCTTTCTCTCTGTGTTTCACAGAAGGTGCTATGAG
AATAAGCTCCGATGAAGCTCTAAACAAATTTAAATCC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 9

CO CL618Contig1 747 9 16 U
GGGTCTTAAATTTCTACCTTTACTTTACTTCCTTCTCACTTCGATCCATACTCTCTCTCT
AACTCTCTCTCTCTCTCGAAAATGGCGAAACTAGTGATCTTGATGGTCCTCTGCATCTTG
CCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCATCGGAAAGAACACTCTTGTCGTG
CAAGGCATGACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACTGCTGAATCCTCCTAC
GTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAGACAGGAAGACGATGGAAGAGATC
TACACTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGAC
CATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAAGCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAA
ATCTCGAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAG
CAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTGTTTTGTTCT
GAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTAGTAGATCTGTTTT
CTTGTCTATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATATATTTATTTGTCTTGGATGATGA
TCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATTGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTG
TCTTTAATATTTGATTACTTTGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU56TF U 36
AF RR4EU56JQ C 115
AF RR4AW80TF U 1
AF RR4E124TF U 193
AF RR4B187JQ C 35
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AF RR4FF53TF U 251
AF RR4B187TF U 35
AF RR4E124JQ C 193
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BS 68 68 RR4EU56TF
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BS 76 77 RR4EU56TF
BS 78 278 RR4AW80TF
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RD RR4EU56TF 627 0 0
GG
ACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCTCTCTCGAAAATGGCGAAACTAGTGA
TCTTGATGGTCCTCTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCA
TCGGAAAGAACACTCTTGTCGTGCAAGGCATGACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTT
TCGAGACTGCTGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAG
ACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACACTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGT
ACATGTTCGTCGTCCACGAGGAGCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAA
GCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCGAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGA
ACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGG
ATGTTAGCGATGTGTTTTGTTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGA
TTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCTATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATA
TATTTATTTGTCTTGGATGATGA
CG

QA 3 625 3 625
DS 

RD RR4EU56JQ 506 0 0
ATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCATCGGAAAGAACACTCTT
GTCGTGCAAGGCATGACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACTGCTGAATCC
TCCTACGTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAGACAGGAAGACGATGGAA
GAGATCTACACTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCAC
GAGGAGCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAAGCTCCGACAAGGGTTGT
TCGAAAATCTCGAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATC
GCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTGTTT
TGTTTTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTAGTAGATC
TGTTTTCTTGTCTATGTTGTGATCTG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4AW80TF 691 0 0
GGGTCTTAAATTTCTACCTTTACTTTACTTCCTTCTCACTTCGATCCATACTCTCTCTCT
AACTCTCCCTCTCTC**GAAAATGGCGAAACTAGTGATCTTGATGGTCCTCTGCATCTTG
CCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCATCGGAAAGAACACTCTTGTCGTG
CAAGGCATGACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACTGCTGAATCCTCCTAC
GTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAGATAGGAAGACGATGGAAGAGATC
TACACTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGAC
CATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAAGCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAA
ATCTCGAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAG
CAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTGTTTTGTT*T
GAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGGAGATGAGATTTGAGATTAGTAGATCTGTTTT
CTTGTCTATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTTTAATATATTTATTTGTCTTGGATGATGA
TCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4E124TF 497 0 0
G
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CGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAGACAGGTAGACGATGGAAGAGATCTACACTGACGTGG
CCGTGTCGAACCTTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGA
TGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAAGCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCGAAGGGGC
GTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGTAGCAGATTAGGCATG
CTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTGTTTTGTTCTGAGTTGATTAAGA
AGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCTATGTTG
TGATCTGATGTTTTTTTTTTAATATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGT
TGTGTAAGCTTTCTTT

QA 2 497 2 497
DS 

RD RR4B187JQ 694 0 0
GGG
ACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCTCTCTCGAAAATGGCGAAACTAGTGA
TCTTGATGGTCCTCTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCA
TCGGAAAGAACACTCTTGTCGTGCAAGGCATGACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTT
TCGAGACTGCTGAATCCTCCTACTTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAG
ACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACACTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGT
ACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAA
GCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCGAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGA
ACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGG
ATGTTAGCGATGTGTTTTGTTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGA
TTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCTATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATA
TATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATTGATGT
GTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTA
AT

QA 4 692 4 692
DS 

RD RR4F238TF 255 0 0
G
ATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTG
TTTTGTTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTAGTAG
ATCTGTTTTCTTGTCTATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATATATTTATTTGTCTT
GGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATTGATGTGTTACTTCCCTGCT
TGGGAAGTGTCTTT

QA 2 255 2 255
DS 

RD RR4FF53TF 476 0 0
GCT
CGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAGACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACACTGACGTGG
CCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGA
TGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAAGCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCGAAGGGGC
GTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATG
CTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTGTTTTGTTCTGAGTTGATTAAGA
AGTATCAGGCTGATGAAGATGAGATTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCTATGTTG
TGATCTGATGTTTTTTTT**AATATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGT
TGTGTAAGCTTTCTTTATTGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTA

QA 4 476 4 476
DS 

RD RR4B187TF 692 0 0
GGG
ACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCTCTCTCGAAAATGGCGAAACTAGTGA
TCTTGATGGTCCTCTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCA
TCGGAAAGAACACTCTTGTCGTGCAAGGCATGACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTT
TCGAGACTGCTGAATCCTCCTACTTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAG
ACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACACTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGT
ACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAA
GCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCGAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGA
ACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGG
ATGTTAGCGATGTGTTTTGTTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGA
TTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCTATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATA
TATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATTGATGT
GTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTA

QA 4 692 4 692
DS 

RD RR4E124JQ 555 0 0
G
ACTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACTGCTGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCG
CGACGGTGAAGCTTTCGTGCAAAGACAGGTAGACGATGGAAGAGATCTACACTGACGTGG
CCGTGTCGAACCTTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGA
TGTGCGATGTGATGCTCGTGGAAAGCTCCGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCGAAGGGGC
GTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGTAGCAGATTAGGCATG
CTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGCGATGTGTTTTGTTTTGAGTTGATTAAGA
AGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCTATGTTG
TGATCTGATGTTTTTTTTTTAATATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGT
TGTGTAAGCTTTCTTTATTGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTAATATTTG
ATTACTTTGTTTCT

QA 2 555 2 555
DS 



AS 1 9

CO CL619Contig1 609 9 23 U
CGATAATGAATCCCATAAACATCAAATCACAAACCATTCCTCAGTTTGATTGTCATTACA
CAACAAATATAGAGAAGCAGATGAAAGATTACATCACAACCCACAAAACAGGACAGGACA
CAACACACAACCCTTTTTGGTTTTTT*ATATATAAATATACAGAAGAGACTCTCATTCAC
ATCTCTCAAGCGAACTTAGGGTTAGGCATGGCAGAGCGACCAAGGCCGCTGCTGCCGCTA
CTGCTGCCCCCTCCTGCTGCTCCTCCTTGCGGTCCAAGCTTCTTAATCCAATGTTTCAGA
CTCTTTCTTGGATCCTTGCAGATCTTGCTTGATGTCAGATTCAAGCTCCCTTCACGTTCC
AGTGAAACCCTAAACTGTTCAAGTACTTTCACTATCTGCCAGAACTCCGGTCTCTTGTCC
GGTGCAACCGACCAACACCGCTCAATCAGAGCTTTCATGGCTCCTGGGCAATCTTCAGGG
ATAGCCAGCCTAATGTTCTTGTGTACAACTGCGAAAGCAGCTTGAATAGGATTCATGTCC
TCGTAAGGTATAGCTCCAGCAACCATTTCCCATAGAACGAGTCCAAAGCTGTAAACATCA
GCCTTTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A076TF C 20
AF RR4EB56JQ U 1
AF RR4A076JQD U 20
AF RR4AC16JQ U 20
AF RR4AC29JQ U 20
AF RR4AC16TF C 20
AF RR4AC29TF C 20
AF RR4A076JQ U 353
AF RR4A076TFB C 20
BS 1 40 RR4EB56JQ
BS 41 41 RR4A076JQD
BS 42 68 RR4EB56JQ
BS 69 69 RR4A076JQD
BS 70 104 RR4EB56JQ
BS 105 105 RR4A076JQD
BS 106 146 RR4EB56JQ
BS 147 147 RR4A076JQD
BS 148 166 RR4EB56JQ
BS 167 168 RR4A076JQD
BS 169 170 RR4EB56JQ
BS 171 171 RR4A076JQD
BS 172 338 RR4EB56JQ
BS 339 339 RR4A076JQD
BS 340 359 RR4EB56JQ
BS 360 360 RR4A076JQD
BS 361 438 RR4EB56JQ
BS 439 439 RR4A076JQD
BS 440 486 RR4EB56JQ
BS 487 487 RR4A076JQD
BS 488 560 RR4EB56JQ
BS 561 599 RR4A076JQD
BS 600 609 RR4A076TFB

RD RR4A076TF 507 0 0
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QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4EB56JQ 560 0 0
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CAACACACAACCCTTTTTGGTTTTTTTATATATAAATATACAGAAG**ACACTCATTCAC
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GGTGCAACCGACCAACACTGCTCAATCAGAGCTTTCATGGCTCCTGGGCAATCTTCAGGG
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TCGTAAGGTATAGCTCCAGC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4A076JQD 580 0 0
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GTTTTTT*ATATATAAATATACAGAAGAGACTCTCATTCACATCTCTCAAGCGAACTTAG
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CTCCTCCTTGCGGTCCAAGCTTCTTAATCCAATGTTTCAGACTCTTTCTTGGATCCTTGC
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4AC16JQ 580 0 0
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4AC29JQ 580 0 0
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CTCCTCCTTGCGGTCCAAGCTTCTTAATCCAATGTTTCAAACTCTTTCTTGGATCCTTGC
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4AC16TF 580 0 0
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CTCCTCCTTGCGGTCCAAGCTTCTTAATCCAATGTTTCAGACTCTTTCTTGGATCCTTGC
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4AC29TF 580 0 0
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GTTTTTT*ATATATAAATATACAGAAGAGACTCTCATTCACATCTCTCAAGCGAACTTAG
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CTCCTCCTTGCGGTCCAAGCTTCTTAATCCAATGTTTCAGACTCTTTCTTGGATCCTTGC
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4A076JQ 213 0 0
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TCTTGTCCGGTGCAACCGACCAACACCGCTCAATCAGAGCTTTCATGGCTCCTGGGCAAT
TTTCAGGGATAGCCAGCCTAATGTTCTTGTGTACAACTGCGAAAGCAGCTTGAATAGGAT
TCATGTCCTCGTAAGGTATAGCTCCAGCAACCA

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR4A076TFB 590 0 0
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GTTTTTT*ATATATAAATATACAGAAGAGACTCTCATTCACATCTCTCAAGCGAACTTAG
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CTCCTCCTTGCGGTCCAAGCTTCTTAATCCAATGTTTCAGACTCTTTCTTGGATCCTTGC
AGATCTTGCTTGATGTCAGATTCAAGCTCCCTTCACGTTCCAGTGAAACCCTAAACTGTT
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TGTGTACAACTGCGAAAGCAGCTTGAATAGGATTCATGTCCTCGTAAGGTATAGCTCCAG
CAACCATTTCCCATAGAACGAGTCCAAAGCTGTAAACATCAGCCTTTCGG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 2 8

CO CL620Contig1 1017 6 11 U
TTGACGAGAGACTACAACACCGATCAGAAATTCAGCATCTCCACCTACAGTGCCTCCGGC
GTGGCACTTACGTCTACTGCTCTGAAGAAAGGAGGAGTTCATGCTGCTGATGTTACCTCC
CAATACAAGTACAAGAATGCTGTCTTCGATGTCAAAGTCGACACTGGTTCTACTATTTTG
ACAACTGTCACATTCAACGAGATTCTCCCATCCACCAAAGCCATTGCCTCCTTCAAAGTC
CCTGACAACAGCTCTGGCAAGCTCGAGGTTCAGTACTTCCACGACCACGCAACTGTTACC
GCTGCTGCAGCTTTGAAGCAGAACCCGTTGATCGACATAACAGCCACTCTAGGCACACCA
GTCATCTCATTTGGTGCTGAAGCTGGATATGACACCTCCCCCAAGACTTTCACCAAGTAC
AACGCTGGTATCAGTGTGACCAAACCTGATGCATGCGCTTCCATCATACTGGGAGACAAA
GGAGACTCGATCAAAGCATCTTACCTTCACCACCTTGACGAATCCAAGAGAAGCGCAGCA
GTTGGTGAGGTTTACAGGAAGTTCTCAACCAATGAAAACACGATAACGGTTGGTGGACTG
TATGCGATTGATCGTACGACTACAGTGAAAGCTAAGCTGAACAACAATGGCAAACTCGGT
GCTCTGCTTCAGCACGAGGTTGTGCCCAAATCACTAGTGACTGTTTCGAGTGAGATCGAC
ACTAAGGCCTTAGACAAGCATCCAAGGTTTGGTCTTTCTCTTGTTCTCAAACCTTGAAGG
AGTCTCCCAACCTTTCTCTCGTATTCTCTCACGGCAGAGGACCTCCCGAGAGTTTTCGTT
TTACTATTTTGGAATAAATAGTTCCGCAGTGAAAATTGACGGTTAATTCTTTTTCGGTTA
TGTGTTTTTTTCTTTTAACATTTTTTCACTAAGCAATATTCTTGGTACATTTTTTTTAGC
AAAGATGTCATTATCTCATCACTCACATATCAAATTTGAAATTAAATTTTAACTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4C668TF U 1
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AF RR4C668JQ C 246
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BS 521 567 RR4C668TF
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BS 987 1000 RR4AV21TF
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GCTAACT

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G
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GTACGACCACAGTGAAAGCTAAGCTGAACAACAATGGCAAACTCGGTGCTCTGCTTCAGC
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ACAAGCATCCAAGGTTTGGTCTTTCTCTTGTTCTCAAACCTTGAAGGAGTCTCCCAACCT
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TTTTTTCTTT*AACATTTTTTCACTAAGCAATATTCTTGGTACATTTTTTTTAGCAAAGA
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GTACGACCACAGTGAAAGCTAAGCTGAACAACAATGGCAAACTCGGTGCTCTGCTTCAGC
ACGAGGTTGTGCCCAAATCACTAGTGACTGTTTCGAGTGAGATCGACACTAAGGCCTTAG
ACAAGCATCCAAGGTTTGGTCTTTCTCTTGTTCTCAAACCTTGAAGGAGTCTCCCAACCT
TTCTCTCGTATTCTCTCACGGCAGAGGACCTCCCGAGAGTTTTCGTTTTACTATTTTGGA
ATAAATAGTTCCGCAGTGAAAATTGACGGTTAATTCTTTTTCGGTTATGTGTTTTTTTCT
TTTAACATTTTTTCACTAAGCAATATTCTTGGTACATTTTTTTTAGCAAAGATGTCATTA
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TTTTAACTAGG

QA 11 381 11 381
DS 



CO CL620Contig2 772 2 2 U
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BQ
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AF RR4E406TF U 1
AF RR4E406JQ C 276
BS 1 707 RR4E406TF
BS 708 772 RR4E406JQ

RD RR4E406TF 711 0 0
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ATCGACACTAAGGCCTTAGACAAGCATCCAAGGTTTGGTCTTTCTCTTGTTCTCAAACCT
TGAAGGAGTCTCCCAACCTTTCTCTCGTATTCTCTCACGGCAGAGGACCTCCCGAGAGTT
TTCGTTTTACTATTTTGGAATAAATAGTTCCGCAGTGAAAATTGACG
TTAA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4E406JQ 497 0 0
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TCGACCAAAGCCATTGCCTCCTTCAAAGTCCCTGACAACAGTTCTGGCAAGCTCGAGGTT
CAATACTTCCACGATAACGGTTGGTGGGCTATATGCGATCGATCGTACGACCACAGTGAA
AGTTAAGCTGAACAACAATGGCAAACTCGGTGTTCTGCTTCAGCACGAGGTTGTGCCCAA
ATCACTAGTGACTGTTTCGAGTGAGATCGACACTAAGGCCTTAGACAAGCATCCAAGGTT
TGGTCTTTCTCTTGTTCTCAAACCTTGAAGGAGTCTCCCAACCTTTCTCTCGTATTTTCT
CACGGCAGAGGACCTCCCGAGAGTTTTCGTTTTACTATTTTGGAATAAATAGTTCCGCAG
TGAAAATTGACGGTTAATTTTTTTTCGGTTATGTGTTTTTTTCTTTTAACATTTTTTCAC
TAAGCAATATTCTTGGC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 9

CO CL621Contig1 652 9 9 U
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CCGCTCGTCTTCAAGAGGAAAAGGTTGAGAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCCGTTGCAA
AGGGAAAGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGA
TCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAG
CTGGTGCGCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAAATCACTGTCACTT
CTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTACTTGAAGAAGC
ACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTTATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGT
TGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTATGCTC
GTACTTCTTGTTTCTGATTGTTTTGTTTTCTGCTCTTTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTA
TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTTGAGAGTTTGATAAAAAAAAAA*TATTTTTCTAAAGATCTTATGTTTGCG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 0 0 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 0 0 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 
50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4CF41JQ C 290
AF RR4CF41TF U 1
AF RR4F209JQ C 120
AF RR4DO28TF U 19
AF RR4H049TF U 1
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AF RR4F209TF U 1
BS 1 38 RR4CF41TF
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BS 41 403 RR4CF41TF
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RD RR4CF41JQ 122 0 0
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CTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTTATTGCGGCCAACAAGGATCGTAA
CC

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR4CF41TF 652 0 0
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CTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTACTTGAAGAAGC
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GTACTTCTTGTTTCTGATTGTTTTGTTTTCTGCTCTTTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTA
TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTTGAGAGTTTGATAAAAAAAAAAATATTTTTCTAAAGATCTTATGTTTGCG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4F209JQ 520 0 0
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GCTGGTGCGCTCGGTGATTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAAATCACTGTCACT
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CACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTTATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTTTACGAG
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ATCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGT
TTTTGAGAGTTTGATAAAAAAAAA**TATTTTTCTAAAG
C

QA 1 519 1 519
DS 

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GAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCCGTTGCAAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTC
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CACCCGTGAGAAGAACAAAATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGTACCT
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TGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACGA
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TCTGCTCTTTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTATCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTT
ATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTTTTTGAGAGTTTGATAA

QA 11 598 11 598
DS 

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CTGGTGCGCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAAATCACTGTCACTT
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TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTTGAGAGTTTGATAA

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DS 

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TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
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QA 1 649 1 649
DS 

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TGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTATGCTC
GTACTTCTTGTTTCTGATTGTTTTGTTTTCTGCTCTTTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTA
TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTTGAGAGTTTGATAAAAAAAAA**TATTTTTCTAAAGATCTTATGTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4FY51JQ 649 0 0
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TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
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QA 1 649 1 649
DS 

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AGGGAAAGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCGTTGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGA
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CTGGTGCGCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAAATCACTGTCACTT
CTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGCACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTACTTGAAGAAGC
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TGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAATGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTATGCTC
GTACTTCTTGTTTCTGATTGTTTTGTTTTCTGCTCTTTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTA
TCTCCGTTCTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTTGAGAGTTTGATAAAAAAAAA**TATTTTTCTAAAG
C

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 8

CO CL622Contig1 1569 8 12 U
ATAAAGAAAGAAGGTTTAATACACAAAAAGATTCAATGTAGCATCGTAAAGAAACACTAA
AATAATAACCGTTAGGCCCATTGCAAATACACATACAGTAACACGATTAAACTTATATTG
TTTGGTGAATTAAACAAGCGAGAAAAAAGTAAGTCCGAAAAGTAACTAAAGTACTTCAAG
CAGAGAAACATAAGACCAGAACAAGAAAAATAAAGATAGGTTCATAGGATTAAACTCTGA
TCACTTCTTCAGTCGCAACCTCTACTGGGCAGCTTTCGTCAACACCTTGCTCTCTGGGAA
AAGAGCTTTCGCGAGCGATAGCAGTCTCATGTGGTTGTTATGTCGAAAA*CGATCACAAA
*TATCCTCCTCATCACAGAGATGATTTAAAGTCCAGAGATGTCTGATGAATTCATCCAGG
AGTTTGAAATCAGAGTAGCACACTTTGCAATAAAACATTCCGGCAGATTCACCAACCCTT
TCAATACTACTTCCACTGCACTTCCGAAGGAAATCATGTCTTCTTGTCTCTGAAACTGCA
AGTAAGCTATCCCAGAGCCACTCGGCAGAAGTGAGCAGGATTGACATTTCACGAGGCCTA
AAAGAATAAGCCCGAAACAGGTTGTACTTATTAAATTGTTGTTGCCGGGCAATAGAATCT
CCAAAGACATACTCAGCGCCATCCGATATGATCATCATTGTAGCCGGAGCGGGATTGTCA
TATCCCCAATTCGTCAAATCTTTAGACATGCGCGAGAATATGACTTCCTGAATGACATGT
GCAACATCGATTCCAGTGGAAGAGAGGGCTTCAAGGTGGCCTTTGGGGGTTTTTTTATGG
TCACCAAAGGCAGTGATGGAGACAGGACCAGAATAGCCTAGTTCCTTGAACGCTCCTTCC
AAACTGGGACGGACCCGACGAGCATCGTAACCGTCGGGAATAGGACATTCAGACATGTTC
CAACACACATGGATTTTAGCTGTCGCATATTCAGGCGTAGCAGCATAGTTCTTTCCCCAC
TTGCTCGTTACAGATATGATTTCTGTAGGCGTAGGGTGTAAAACCTCTTCTAGTGCATGA
TTTTTAGTGGAGAGATGCTCCTTGAAACTCTTAAGGCTTAGGCAATCCAAAGAGCACGTT
TTGCAGTGAAACACGGCATCATCCGCCGTGTCTGCGCTGCTGCTTGTCACGGCCGCAGTC
GTCCCAAGTAGTAATTTTTCCCAGAGCCACTCTTTACGAGTGTGAACGTACAATGCTGCG
CGAGGTTGGACTGAATAAGCCAGAAAAAGGTTGTAAGTCGTGCGTTGTTGAAGCCGGGCC
AGATCCCAATGGAAAACATCTAGCATCTGATTGGTTATCATCGTCATTGTAGCCGGAGGA
GGATTATCCTCTCTCCATTTCACCATATCCATATACATGACTGCGCACGTGCTTTCAGAT
CTGATATGTACCACCACGACTCCAGTGGAAGAGAGAGCTTGTAGCTGGTGGTCAGGGGTT
TGTTTGTGGTCTCCATAGGCTCTGATGGAGACAGGACCAGAGTAGCCTAGTTGTCTGAAC
CCACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI63JQ U 54
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AF RR4AV51JQ U 38
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BS 280 322 RR4H339JQ
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BS 324 329 RR4H339JQ
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BS 331 789 RR4H339JQ
BS 790 811 RR4AV28JQ
BS 812 859 RR4AV51TF
BS 860 910 RR4AV28TF
BS 911 1224 RR4H339TF
BS 1225 1569 RR4AI63TF

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CTTCAAGCAGAAAAACGTAAGACCAGAACAAGAAAAATAAAGATAGGTTCATAGGATTAA
ACTCTGATCACTTCTTCAGTCGCAACCTCTACTGGGCAGCTTTCGTCAACACCTTGCTCT
CTGGGAAAAGAGCTTTCGCGAGCGATAGCAGTCTCAGGTGGTTGTTATGTCGAAAA*CGA
TCACAAA*TATCCTCCTCATCACAGAGATGATTTAAAGTCCAGAGATGTCTGATGAATTC
ATCCAGGAGTTTGAAATCAGAGTAGCACACTTTGCAATAAAACATTCCGGCAGATTCACC
AACCCTTTCAATACTACTTCCACTGCACTTCCGAAGGAAATCATGTCTTCTTGTCTCTG*
*****CAAGTAAGCTATCCCAGAGCCACTCGGCAGAAGTGAGCAGGATTGACATTTCACG
AGGCCTAAAAGAATAAGCCCGAAACAGGTTGTACTTATTAAATTGTTGTTGCCGGGCAAT
AGAATCTCCAAAGACATACTCAGCGCCATCCGATATGATCATCATTGTAGCCGGAGCGGG
ATTG

QA 1 664 1 664
DS 

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AATAATAACCGTTAGGCCCATTGCAAATACACATACAGTAACACGATTAAACTTATATTG
TTTGGTGAATTAAACAAGCGAGAAAAAAGTAAGTCCGAAAAGTAACTAAAGTACTTCAAG
CAGAGAAACATAAGACCAGAACAAGAAAAATAAAGATAGGTTCATAGGATTAAACTCTGA
TCACTTCTTCAGTCGCAACCTCTACTGGGCAGCTTTCGCCAACACCTTGCTCTCTGGGAA
AAGAGCTTTCGCGAGCGATAGCGGTCTCAGGTGGTTGTTATGTCGAAAA*CGATCACAAA
*TATCCTCCTCATCACAGAGATGATTTAAAGTCCAGAGATGTCTGATGAATTCATCCAGG
AGTTTGAAATCAGAGTAGCACACTTTGCAATAAAACATTCCGGCAGATTCACCAACCCTT
TCAATACTACTTCCACTGCACTTCCGAAGGAAATCATGTCTTCTTGTCTCTGAAACTGCA
AGTAAGCTATCCCAGAGCCACTCGGCAGAAGTGAGCAGGATTGACATTTCACGAGGCCTA
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CCAAAGACATACTCAGCGCCATCCGATATGATCATCATTGTAGCCGGAGCGGGATTGTCA
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GCAACATCG

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AAAAGTAACTAAAGTACTTCAAGCAGAGAAACATAAGACCAGAACAAGAAAAATAAAGAT
AGGTTCATAGGATTAAACTCTGATCACTTCTTCAGTCGCAACCTCTACTGGGCAGCTTTC
GTCAACACCTTGCTCTCTGGGAAAAGAGCTTTCGCGAGCGATAGCAGTCTCATGTGGTTG
TTATGTCGAAAA*CGATCACAAA*TATCCTCCTCATCACAGAGATGATTTAAAGTCCAGA
GATGTCTGATGAATTCATCCAGGAGTTTGAAATCAGAGTAGCACACTTTGCAATAAAACA
TTCCGGCAGATTCACCAACCCTTTCAATACTACTTCCACTGCACTTCCGAAGGAAATCAT
GTCTTCTTGTCTCTGAAACTGCAAGTAAGCTATCCCAGAGCCACTCGGCAGAAGTGAGCA
GGATTGACATTTCACGAGGCCTAAAAGAATAAGCCCGAAACAGGTTGTACTTATTAAATT
GTTGTTGCCGGGCAATAGAATCTCCAAAGACATACTCAGCGCCATCCGATATGATCATCA
TTGTAGCCGGAGCGGGATTGTCATATCCCCAATTCGTCAAATCTTTAGACATGCGCGAGA
ATATGACTTCCTGAATGACATGTGCAACATCGATTCCAGTGGAAGAGAGGGCTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AV51JQ 774 0 0
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GTAACACGATTAAACTTATATTGTTTGGTGAATTAAACAAGCGAGAAAAAAGTAAGTCCG
AAAAGTAACTAAAGTACTTCAAGCAGAGAAACATAAGACCAGAACAAGAAAAATAAAGAT
AGGTTCATAGGATTAAACTCTGATCACTTCTTCAGTCGCAACCTCTACTGGGCAGCTTTC
GTCAACACCTTGCTCTCTGGGAAAAGAGCTTTCGCGAGCGATAGCAGTCTCATGTGGTTG
TTATGTCGAAAA*CGATCACAAA*TATCCTCCTCATCACAGAGATGATTTAAAGTCCAGA
GATGTCTGATGAATTCATCCAGGAGTTTGAAATCAGAGTAGCACACTTTGCAATAAAACA
TTCCGGCAGATTCACCAACCCTTTCAATACTACTTCCACTGCACTTCCGAAGGAAATCAT
GTCTTCTTGTCTCTGAAACTGCAAGTAAGCTATCCCAGAGCCACTCGGCAGAAGTGAGCA
GGATTGACATTTCACGAGGCCTAAAAGAATAAGCCCGAAACAGGTTGTACTTATTAAATT
GTTGTTGCCGGGCAATAGAATCTCCAAAGACATACTCAGCGCCATCCGATATGATCATCA
TTGTAGCCGGAGCGGGATTGTCATATCCCCAATTCGTCAAATCTTTAGACATGCGCGAGA
ATATGACTTCCTGAATGACATGTGCAACATCGATTCCAGTGGAAGAGAGGGCTT

QA 1 774 1 774
DS 

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TTCAGTCGCAACCTCTACTGGGCAGCTTTCGTCAACACCTTGCTCTCTGGGAAAAGAGCT
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AATCAGAGTAGCACACTTTGCAATAAAACATTCCGGCAGATTCACCAACCCTTTCAATAC
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TATCCCAGAGCCACTCGGCAGAAGTGAGCAGGATTGACATTTCACGAGGCCTAAAAGAAT
AAGCCCGAAACAGGTTGTACTTATTAAATTGTTGTTGCCGGGCAATAGAATCTCCAAAGA
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AGGCAGTGATGG

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CCATGC
AATACACATACAGTAACACGAT*AAACT*ATATTGTTTGGTGAATTAAACAAGCGAGAAA
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AAAAATAAAGATAGGTTCATAGGATTAAACTCTGATCACTTCTTCAGTCGCAACCTCTAC
TGGGCAGCTTTCGTCAACACCTTGCTCTCTGGGAAAAGAGCTTTCGCGAGCGATAGCAGT
CTCATGTGGTTGTTATGTCGAAAA*CGATCACAAAATATCCTCCTCATCACAGAGATGAT
TTAAAGTCCAGAGATGTCTGATGAATTCATCCAGGAGTTTGAAATCAGAGTAGCACACTT
TGCAATAAAACATTCCGGCAGATTCACCAACCCTTTCAATACTACTTCCACTGCACTTCC
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CAGAAGTGAGCAGGATTGACATTTCACGAGGCCTAAAAGAATAAGCCCGAAACAGGTTGT
ACTTATTAAATTGTTGTTGCCGGGCAATAGAATCTCCAAAGACATACTCAGCGCCATCCG
ATATGATCATCATTGTAGCCGGAGCGGGATTGTCATATCCCCAATTCGTCAAATCTTTAG
ACATGCGCGAGAATATGACTTCCTGAATGACATGTGCAACATCGATTCCAGTGGAAGAGA
GGGCTTCAAGGTGGCCTTTGGGGGTTTTTTTATGGTCACCAAAGGCAGTGATGGAGACAG
GACCAGAATAGCCTAGTTCCTTGAACGCTCCTTCCAAACTGGGAC
C

QA 7 831 7 831
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TATTAAATTGTTGTTGCCGGGCAATAGAATCTCCAAAGACATACTCAGCGCCATCCGATA
TGATCATCATTGTAGCCGGAGCGGGATTGTCATATCCCCAATTCGTCAAATCTTTAGACA
TGCGCGAGAATATGACTTCCTGAATGACATGTGCAACATCGATTCCAGTGGAAGAGAGGG
CTTCAAGGTGGCCTTTGGGGGTTTTTTTATGGTCACCAAAGGCAGTGATGGAGACAGGAC
CAGAATAGCCTAGTTCCTTGAACGCTCCTTCCAAACTGGGACGGACCCGACGAGCATCGT
AACCGTCGGGAATAGGACATTCAGACATGTTCCAACACACATGGATTTTAGCTGTCGCAT
ATTCAGGCGTAGCAGCATAGTTCTTTCCCCACTTGCTCGTTACAGATATGATTTCTGTAG
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TCTTAAGGCTTAGGCAATCCAAAGAGCACGTTTTGCAGTGAAACACGGCATCATCCGCCG
TGTCTGCGCTGCTGCTTGTCACGGCCGCAGTCGTCCCAAGTAGTAATTTTTCCCAG
C

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DS 

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AATAGGACATTCAGACATGTTCCAACACACATGGATTTTAGCTGTCGCATATTCAGGCGT
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TAAAACCTCTTCTAGTGCATGATTTTTAGTGGAGAGATGCTCCTTGAAACTCTTAAGGCT
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GCTGCTTGTCACGGCCGCAGTCGTCCCAAGTAGTAATTTTTCCCAGAGCCACTCTTTACG
AGTGTGAACGTACAATGCTGCGCGAGGTTGGACTGAATAAGCCAGAAAAAGGTTGTAAGT
CGTGCGTTGTTGAAGCCGGGCCAGATCCCAATGGAAAACATCTAGCATCTGATTGGTTAT
CATCGTCATTGTAGCCGGAGGAGGATTATCCTCTCTCCATTTCACCATATCCATATACAT
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TTGTAGCTGGTGGTCAGGGGTTTGTTTGTGGTCTCCATAGGCTCTGATGGAGACAGGACC
AGAGTAGCCTAGTTGTCTGAACCCACCTTCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 2 7

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AAGTGAACTGGTCTTAGTAACTATTACACATGACAGACACACTAAGGCATAATCCACAGA
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GGACAATGTTGACACACGCAGCAAGCTTTTCTTGGACTATGCTATTAGCCAACTTCTTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 10 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ28JQ U 32
AF RR4AF24JQ U 1
AF RR4AF24TF C 11
AF RR4EO07JQ U 38
BS 1 338 RR4AF24JQ
BS 339 339 RR4FQ28JQ
BS 340 652 RR4AF24JQ
BS 653 738 RR4EO07JQ
BS 739 769 RR4AF24TF

RD RR4FQ28JQ 523 0 0
CATATAAA
AGTACAAATTTTACTTCACTTAAGTGAACTGGTCTTAGTAACTATTACACATGACAGACA
CACTAAGGCATAATCCACAGATGGTTGGGGGAAAGCTCTTTATTTGAGAAACGAAAAAAA
AA*CTCCAAAAGCCATTGATGGGGTGGACGGACAAGCTAGCGAGATGTCTCAGTTCCTTG
TACTGTTCTTCAACCATTCTAGATACTTGTCGCTCCCACCAGTTATGGGCAATGCAATTA
CTTCCGGCACATCGTATTCGTGATTAGCATTGTCGTGCTCCGTTAGAGACTCTAGAAAAG
ACTGCCTTGTTTTGATTATCAGTAGTTCCTCGGAATCACTCTGAACCTTTCCTTCCCACT
CGTACACCGATTCAACACCTGGGGCAATGTTGACACACGCAGCAAGCTTTTCTTGGACTA
TGCTATTAGCCAACTTCTTTCCTGCTTCTCTGTTAGGAACAGTGACGTAAACAACAATGC
TGGGCACAGTTTTGCTCCCCTCCTCCATTTTGATC

QA 9 523 9 523
DS 

RD RR4AF24JQ 652 0 0
GTAACTGGCATGGCTCTTTTGCTCTCACATATATATAAGAGTACAAATTTTACTTCACTT
AAGTGAACTGGTCTTAGTAACTATTACACATGACAGACACACTAAGGCATAATCCACAGA
TGGTTGGGGGAAAGCTCTTTATTTGAGAAACAAAAAAAAAAACTCCAAAAGCCATTGATG
GGGTGGACGGACAAGCTAGCGAGATGTCTCAGTTCCTTGTACTGTTTTTCAACCATTCTA
GATACTTGTCGCTCCCACCAGTTATGGGCAATGCAATTACTTCTGGCGCATCGTATTCGT
GATTAGCATTGACG*GCTCCGTTAGAGACTCTAGAAGAAACTGCCTTGTTTTGATTATCA
GTAGTTCCTCGGAATCACTCTGAACCTTTCCTTCCCACTCGTACACCGATTCAACACCTG
GGACAATGTTGACACACGCAGCAAGCTTTTCTTGGACTATGCTATTAGCCAACTTCTTTC
CTGCTTCTCTGTTAGGAACAGTGACGTAGACGACAATGCTGGGCACGGTTTTGCTCCCCT
CCTCCATTTTGATCGATGATGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCTTACTGCTAAACCTAG
ACCTTAAGAGAGGGGCAAAAGAGAGAGACTGTGCACACCCCGGTTTATAGGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4AF24TF 759 0 0
TGGCTCTTTTGCTCTCACATATATATAAGAGTACAAATTTTACTTCACTTAAGTGAACTG
GTCTTAGTAACTATTACACATGACAGACACACTAAGGCATAATCCACAGATGGTTGGGGG
AAAGCTCTTTATTTGAGAAACAAAAAAAAAAACTCCAAAAGCCATTGATGGGGTGGACGG
ACAAGCTAGCGAGATGTCTCAGTTCCTTGTACTGTTTTTCAACCATTCTAGATACTTGTC
GCTCCCACCAGTTATGGGCAATGCAATTACTTCTGGCGCATCGTATTCGTGATTAGCATT
GACG*GCTCCGTTAGAGACTCTAGAAGAGACTGCCTTGTTTTGATTATCAGTAGTTCCTC
GGAATCACTCTGAACCTTTCCTTCCCACTCGTACACCGATTCAACACCTGGGACAATGTT
GACACACGCAGCAAGCTTTTCTTGGACTATGCTATTAGCCAACTTCTTTCCTGCTTCTCT
GTTAGGAACAGTGACGTAGACGACAATGCTGGGCACGGTTTTGCTCCCCTCCTCCATTTT
GATCGATGATGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCTTACTGCTAAACCTAGACCTTAAGAG
AGGGGCAAAAGAGAGAGACTGTGCACACCCCGGTTTATAGGAAGACGATGAGAATGATGA
TAGACTCGAGAAACCCAAGCTTAACGCGCAAAACGCACCGACGAAAGGAATACGTCGTCG
TGTTAAGACGGAAGATCCGATTCTACTGCTCAGAGACCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4EO07JQ 701 0 0
GT
AGTACAAATTTTACTTCACTTAAGTGAACTGGTCTTAGTAACTATTACACATGACAGACA
CACTAAGGCATAATCCACAGATGGTTGGGGGAAAGCTCTTTATTTGAGAAACAAAAAAAA
AA*CTCCAAAAGCCATTGATGGGGTGGACGGACAAGCTAGCGAGATGTCTCAGTTCCTTG
TACTGTTTTTCAACCATTCTAGATACTTGTCGCTCCCACCAGTTATAGGCAATGCAATTA
CTTCTGGCACATCGTATTGGTGATTAGCATTGACGTGCTCGGTAAGAGACTCTAGAAGAG
ACTGCCTTGTTTTGATTATCAGTAGTTCCTCGGAATCACTCTGAACCTTTCCTTCCCACT
AGTACACCGATTCAACACCTGGGACAATGTTGACACACGCAGCAAGCTTTTCTTGGACTA
TGCTATTAGCCAACTTCTTTCCTGCTTCTCTGTTAGGAACAGTGACGTAGACGACAATGC
TGGGCACAGTTTTGCTCCCCTCCTCCATTTTGATCGATAGTGA***AGAAGAAGAAGAAG
AAGCCTTACTGCTAAACCTAGACCTTAAGAGAGGGGCAAAAGAGAGAGACTGTGCACACC
CCGGTTTAAAGGAAGACGATGAGAATGATGATAGACTCGAGAAACCCAAGCTTAACACGC
AAAACGCACCGACGAAAGGAATACGTCGTCGTGTTAAGA

QA 3 701 3 701
DS 



CO CL623Contig2 713 3 1 U
GGGATGGCTTTGTATCTGAGCAGTAGAATCGGATCTTCCGTCTTAACACGACGCCGTATT
CCTTTCGTCGGTGCGTTTTGCGTGCTAAGCTTGGGTATCTCCTCCTTCTCATCGTCTTCC
TTTAAACCGGGTTGTGCTGCACAGTCTCTCTCTTTTGCCCCTCTCTTAAGGTCTAGGTTT
AGCAGTAAGGCTTCTTCTTCATCATCATCATCGATCAAAATGGAGGAGAGCAGCAAAACT
GTGCCCAGCATTGTCGTCTACGTCACTGTTCCTAACAGAGAAGCAGGAAAGAAGTTGGCT
AATAGCATAGTCCAAGAAAAGCTTGCTGCCTGTGTCAACATTGTCCCAGGTGTTGAATCG
GTGTACGAGTGGGAAGGACAGGTTCAGAGTGATTCCGAGGAGCTACTGATAATCAAAACA
AGGCAGTCTCTTCTAGAGTCTCTTACCGAGCACGTCAATGCTAATCACCAATACGATGTG
CCAGAAGTAATTGCATTGCCTATAACTGGTGGGAGCGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAA
AACAGTACAAGGAACTGAGACATCTCGCTAGCTTGTCCGTCCACCCCATCAATGGCTTTT
GGAGTTTTTTTTGTTTCTCAAATAAACAGCTTTCTCCATCTGTGGATTCTGCCATAGTTT
GTCATGTGTAATAGTTACCAAGACCAGTTCACTTAAGTGTAGTAAAATTTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ89TF U 4
AF RR4EE18TF U 1
AF RR4FJ89JQ C 443
BS 1 713 RR4EE18TF

RD RR4FJ89TF 341 0 0
GGGGCTTTGTA
TCTGAGCAGTAGAATCGGATCTTCCGTCTTAACACGACGCCGTATTCCTTTCGTCGTTGC
GTTTTGCGTGCTAAGCTTGGGTATCTCCTCCTTCTCATCGTCTTCCTTTAAACCGGGTTG
TGCTGCACAGTCTCTCTCTTTTGCCCCTCTCTTAAGGTCTAGGTTTAGCAGTAAGGCTTC
TTCTTCATCATCATCATCGATCAAAATGGAGGAGAGCAGCAAAACTGTGCCCAGCATTGT
CGTCTACGTCACTGTTCCTAACAGAGAAGCAGGAAAGAAGTTGGCTAATAGCATAGTCCA
AGAAAAGCTTGCTGCCTGTGTCAACATTGT

QA 12 341 12 341
DS 

RD RR4EE18TF 713 0 0
GGGATGGCTTTGTATCTGAGCAGTAGAATCGGATCTTCCGTCTTAACACGACGCCGTATT
CCTTTCGTCGGTGCGTTTTGCGTGCTAAGCTTGGGTATCTCCTCCTTCTCATCGTCTTCC
TTTAAACCGGGTTGTGCTGCACAGTCTCTCTCTTTTGCCCCTCTCTTAAGGTCTAGGTTT
AGCAGTAAGGCTTCTTCTTCATCATCATCATCGATCAAAATGGAGGAGAGCAGCAAAACT
GTGCCCAGCATTGTCGTCTACGTCACTGTTCCTAACAGAGAAGCAGGAAAGAAGTTGGCT
AATAGCATAGTCCAAGAAAAGCTTGCTGCCTGTGTCAACATTGTCCCAGGTGTTGAATCG
GTGTACGAGTGGGAAGGACAGGTTCAGAGTGATTCCGAGGAGCTACTGATAATCAAAACA
AGGCAGTCTCTTCTAGAGTCTCTTACCGAGCACGTCAATGCTAATCACCAATACGATGTG
CCAGAAGTAATTGCATTGCCTATAACTGGTGGGAGCGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAA
AACAGTACAAGGAACTGAGACATCTCGCTAGCTTGTCCGTCCACCCCATCAATGGCTTTT
GGAGTTTTTTTTGTTTCTCAAATAAACAGCTTTCTCCATCTGTGGATTCTGCCATAGTTT
GTCATGTGTAATAGTTACCAAGACCAGTTCACTTAAGTGTAGTAAAATTTGTA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4FJ89JQ 233 0 0
TTACCGAGCACGTCAATGCTAATCACCAATACGATGTGCCAGAAGTAATTGCATTGCCTA
TAACTGGTGGGAGCGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAAAACAGTACAAGGAACTGAGACA
TCTCGCTAGCTTGTCCGTCCACCCCATCAATGGCTTTTGGAGTTTTTTTTGTTTCTCAAA
TAAACAGCTTTCTCCATCTGTGGATTCTGCCATAGTTTGTCATGTGTAATAGT

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 9

CO CL624Contig1 1021 9 10 U
GCTAAACTCTTTATGTTATTTTTTACTCATTAGACAGTAACAAACATTGGCCTTAATGAA
AACACTGCACAAAAGCTGCAGCAAAATGTTTGCTCTCAAGTACAAGACATTCCAGGAGAA
CAAAAACCTCAGGAGATTTATTCAAAAAGAAAACAAAAGAAGGCATAAAAGAGAGATTTA
GAACTCAATTCTCATGTGGACACAACCTTCTTCACCACTTTGGTCACCTCTTCCGGAGCC
TTCTCTGCTGGTATGTTCACCAGATTCCCCTTCTTCGCGTAGTAGTCAATAACCGGTTGC
GTCTGCTTGTGGAATGCATCCAGCCTTGACCTAAGAACATCCGCATTGTCATCTTTACGT
TGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGGAACTTTAGGAGGTGCGAATTTG
GTATGATAGCTCCTTCCACTTGAAGGGTGAATCCACCTTCCAGTAATTCTTTCTTCAAGA
ACCGAATCATCGATTGCAAAATTAAGCACTTTGTCAATCTGAGCTCCTCTTCTATTAAGC
ATCTCATCAAGCTTCTCAGCTTGTGTTACGGTCCTAGGGAAGCCATCAAGAATGAAACCT
TTCTGACATTTGGGTCTGTTCATTGCTTCATCCATGATACCAACAACCAAGTCATCGGAA
ACAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTTGCCTTGACACCAAGAGGGGACTTAGCAGCA
ACAGCAGCTCTAAGCATGTCACCAGTGGACAAATGACACAAGCAGAACTCATCCTTTATG
ACCGGAGACTGCGTACCTTTTCCTGAGACAGGTGGACCGATGAAAACGAGACGTTTGTCA
GGTTTAGAGGCACACTTCATGCGACGGAGGAGCTCAGACATGAGATCGACTGTCTTAATG
TCTTCCATATCTACACCGCTTTTCGCCATGTTCGTCGTCTTTTTTTGAGGAACAAGATTT
TAGTTTTCTCTGAAGTGCATGTAAAGATTCGATGCTCCCAATGCCCCAAAGCTGTGTTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4F684JQ U 74
AF RR4F684TF C 30
AF RR4E063JQ U 39
AF RR4FK65JQ U 1
AF RR4E621JQ U 39
AF RR4B587JQ U 32
AF RR4FK65TF C 302
AF RR4E621TF C 328
AF RR4E063TF C 462
BS 1 191 RR4FK65JQ
BS 192 192 RR4B587JQ
BS 193 619 RR4FK65JQ
BS 620 656 RR4B587JQ
BS 657 657 RR4E621JQ
BS 658 801 RR4B587JQ
BS 802 807 RR4FK65TF
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BS 809 982 RR4FK65TF
BS 983 1021 RR4E621TF

RD RR4F684JQ 386 0 0
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TGTTCACCAAATTCCCCTTCTTCGCGTAGTATTCAATAACCGGTTGCGTCTGCTTGTGGA
ATGCATCCAGCCTTGACCTAAAAACATCCGCATTGTCATCTTTACGTTGAATCAGTGGCT
CTCCAGTCACATCATCGACTCCAGGAACTTTAGGAGGTGCGAATTTGGTATGATAGCTCC
TTCCACTTGAAGGGTGAATCCA
ACTT

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DS 

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CT
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GCTCTCAAGTACAAGACATTCCAGGAGAACAAAAACCTCAGGAGATTTATTCAAAAAGAA
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TCACCACTTTGGTCACCTCTTCCGGAGCCTTCTCTGCTGGTATGTTCACCAGATTCCCCT
TCTTCGCGTAGTAGTCAATAACCGGTTGCGTCTGCTTGTGGAATGCATCCAGCCTTGACC
TAAGAACATCCGCATTGTCATCTTTACGTTGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGA
CTCCAGGAACTTTAGGAGGTGCGAATTTGGTATGATAGCTCCTTCCACTTGAAGGGTGAA
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TGTCAATCTGAGCTC

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DS 

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TTTGGTCACCTCTTCCGGAGCCTTCTCTGCTGGTATGTTCACCAAATTCCCCTTCTTCGC
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ATCCGCATTGTCATCTTTACGTTGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGG
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TCCAGTAATTCTTTCTTCAAGAACCGAATC***GATTGCAAAATTAAGCACTTTGTCAAT
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GAAGCCATCAA

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DS 

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CAAAAACCTCAGGAGATTTATTCAAAAAGAAAACAAAAGAAGGCATAAAAGAGAGATTTA
GAACTCAATTCCCATGTGGACACAACCTTCTTCACCACTTTGGTCACCTCTTCCGGAGCC
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TGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGGAACTTTAGGAGGTGCGAATTTG
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TTCTGACATTTGGGTCTGT

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GAAGGCATAAAAGAAAGATTTAAAACTCAATTCTCATGTGGACACAACCTTCTTCACCAC
TTTGGTCACCTCTTCCGGAGCCTTCTCTGCTGGTATGTTCACCAAATTCCCCTTCTTCGC
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ATCCGCATTGTCATCTTTACGTTGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGG
AACTTTAGGAGGTGCGAATTTGGTATGATAGCTCCTTCCACTTGAAGGGTGAATCCACCT
TCCAGTAATTCTTTCTTCAAGAACCGAATC***GATTGCAAAATTAAGCACTTTGTCAAT
CTGAGCTCCTCTTCTATTAAGCATCTCATCAAGCTTCTCAGCTTGTGTTACGGTCCTAGG
GAAGCCATCAAGAATGAAACCTTTCTGACATTTGGGTCTGTTCATTGCTTCATCCATGAT
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ACCAAGAGGGGAC

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DS 

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GTAGTAGTCAATAACCGGTTGCGTCTGCTTGTGGAATGCATCCAGCCTTGACCTAAGAAC
ATCCGCATTGTCATCTTTACGTTGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGG
AACTTTAGGAGGTGCGAATTTGGTATGATAGCTCCTTCCACTTGAAGGGTGAATCCACCT
TCCAGTAATTCTTTCTTCAAGAACCGAATCATCGATTGCAAAATTAAGCACTTTGTCAAT
CTGAGCTCCTCTTCTATTAAGCATCTCATCAAGCTTCTCAGCTTGTGTTACGGTCCTAGG
GAAGCCATCAAGAATGAAACCTTTCTGACATTTGGGTCTGTTCATTGCTTCATCCATGAT
ACCAACAACCAAGTCATCAGAAACAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTTGCCTTGAC
ACCAAGAGGGGACTTAGCAGCAACAGCAGCTCTAAGCATGTCACCAGTGGACAAATGACA
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TCTCATCAAGCTTCTCAGCTTGTGTTACGGTCCTAGGGAAGCCATCAAGAATGAAACCTT
TCTGACATTTGGGTCTGTTCATTGCTTCATCCATGATACCAACAACCAAGTCATCAGAAA
CAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTTGCCTTGACACCAAGAGGGGACTTAGCAGCAA
CAGCAGCTCTAAGCATGTCACCAGTGGACAAATGACACAAGCAGAACTCATCCTTTATGA
CCGGAGACTGCGTACCTTTTCCTGAGCCAGGTGGACCGATGAAAACGAGACGTTTGTCAG
GTTTAGAGGCACACTTCATGCGACGGAGGAGCTCAGACATGAGATCGACTGTCTTAATGT
CTTCCATATCTACACCGCTTTTCGCCATGTTCGTCGTCTTTTTTTGAGGAACAAGATTTT
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CC

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TGA
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GTCCTAGGGAAGCCATCAAGAATGAAACCTTTCTGACATTTGGGTCTGTTCATTGCTTCA
TCCATGATACCAACAACCAAGTCATCGGAAACAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTT
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GATGCTCCCAATGCCCCAAAGCTGTGTTTCC

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AACAACCAAGTCATCGGAAACAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTTGCCTTGACACC
AAGAGGGGACTTAGCAGCAACAGCAGCTCTAAGCATGTCACCAGTGGACAAATGACACAA
GCAGAACTCATCCTTTATGACCGGAGACTGCGTACCTTTTCCTGAGACAGGTGGACCGAT
GAAAACGAGACGTTTGTCAGGTTTAGAGGCACACTTCATGCGACGGAGGAGCTCAGACAT
GAGATCGACTGTCTTAATGTCTTCCATATCTACACCGCTTTTCGCCATGTTCGTCGTCTT
TTTTTGAGGAACAAGATTTTAGTTTTCTCTGAAGTGCATGTAAAGATTCGATGCTCCCAA
TGCCCCAAAGCTGTGTTTCC

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DS 



AS 1 6

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AAACTCTACATCTCCCCCATCTTAACCGAGTCAACCATTGATGCATCTTCCTTCTTATAT
ATAACATCATGGTAAAAACGGAATCCCTTCATCTCAAATACAGTCTTCGCCGTTATAGAT
TATACCAACTTTTCCAAAGTGTCTGTCTGTGGTGCTCGAGTTCCGCCGTCGTCCTCTACT
CAACGTTGGATTCACTCTGTCTTGGTTGCACTTCTCAGTCTATTTTCGGTTGGCTTTTCC
GCTTTTGGGATTCCCGTAACACCAAAACTGTGAATTTAGGGGAATCACTCATCTCTTTCC
AGATGAAAAGTTTCATCCGAGGAAGATATTCTTTTTGAAAAGGAAATATCAGTGTTCTCT
TTAGAGACTGGACATAGGAGTTTTCTAATGAAGAATCCACATTCGTTTGCTCAGAAAGAG
GTGACTAAAACCAACTAACTCTCTGATGCATACTCACACTCCTTGAAGCGTGTTGATATT
GGCGAAATAAGAGAAATTCAGTGTATGTTTGAAAAGAAATAAAGCAAGAGCAGCTCAAGA
GGAACAAGACTAAAACTGGTGGAGTGCTTGTCCTTCGGAGCCATAATTCACCACTTTGTA
GTATAGATTTCAAGGATGTTATCAGCTCTAACGAGTTCATAGATCAATTCACCAAGGAAG
AAACTGATAAAACCACTTCCTCATATTGACTATGTTACCCTCCCTGATAGCTAGTACACC
GATCATTGAGCCTCTCAAGGATATTAGAATCCAATTACAATTCCAGAAACAAAAACTCTC
CCTCTGAAGTCAAAGC*TCCAATCAAGTATCCCACAACAGTATGTAGCAACCTGCCGGTT
CCAGTGAAGTCAGAGAAAAGTTATTAAGAGCAGCGTGCTCATCTGGATTATTAAGAGTAA
TGAAATCACTAATTGTTCTCTCTATTTTTTTGAAATTCCATTTGTTTAGATGGAATTATT
CTTTATTATGTTTGACATACAAATTTCCTTTTCTAATAATCCAGAAAAACTTTTGATATA
TATAATTAAAGAAAAAGTTAAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4E365TF U 1
AF RR4DU35TF U 1
AF RR4FV46TF U 275
AF RR4FV46JQ C 399
AF RR4E365JQ C 487
AF RR4DU35JQ C 503
BS 1 427 RR4DU35TF
BS 428 428 RR4FV46TF
BS 429 712 RR4DU35TF
BS 713 990 RR4FV46TF
BS 991 993 RR4FV46JQ
BS 994 1026 RR4FV46TF
BS 1027 1027 RR4FV46JQ
BS 1028 1041 RR4FV46TF
BS 1042 1078 RR4FV46JQ
BS 1079 1102 RR4E365JQ
BS 1103 1105 RR4DU35JQ

RD RR4E365TF 483 0 0
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AAACTCTACATCTCCCCCATCTTAACCGAGTCAACCATTGATGCATCTTCCTTCTTATAT
ATAACATCATGGTAAAAACGGAATCCCTTCATCTCAAATACAGTCTTCGCCGTTATAGAT
TATACCAACTTTTCCAAAGTGTCTGTCTGTGGTGCTCGAGTTCCGCCGTCGTCCTCTACT
CAACGTTGGATTCACTCTGTCTTGGTTGCACTTCTCAGTCTATTTTCGGTTGGCTTTTCC
GCTTTTGGGATTCCCGTAACACCAAAACTGTGAATTTAGGGGAATCACTCATCTCTTTCC
AGATGAAAAGTTTCATCCGAGGAAGATATTCTTTTTGAAAAGGAAATATCAGTGTTCTCT
TTAGAGATTGGACATAGGAGTTTTCTAATGAAGAATCCACATTCGTTTGCTCAGAAAGAG
GTG

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4DU35TF 712 0 0
GGAGTTTCCTCTGGCAAACAGAAAATTACCCTTTCGGTTTCCATGGAGCACTGAATCTAC
AAACTCTACATCTCCCCCATCTTAACCGAGTCAACCATTGATGCATCTTCCTTCTTATAT
ATAACATCATGGTAAAAACGGAATCCCTTCATCTCAAATACAGTCTTCGCCGTTATAGAT
TATACCAACTTTTCCAAAGTGTCTGTCTGTGGTGCTCGAGTTCCGCCGTCGTCCTCTACT
CAACGTTGGATTCACTCTGTCTTGGTTGCACTTCTCAGTCTATTTTCGGTTGGCTTTTCC
GCTTTTGGGATTCCCGTAACACCAAAACTGTGAATTTAGGGGAATCACTCATCTCTTTCC
AGATGAAAAGTTTCATCCGAGGAAGATATTCTTTTTGAAAAGGAAATATCAGTGTTCTCT
TTAGAGATTGGACATAGGAGTTTTCTAATGAAGAATCCACATTCGTTTGCTCAGAAAGAG
GTGACTAAAACCAACTAACTCTCTGATGCATACTCACACTCCTTGAAGCGTGTTGATATT
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DS 

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G
CAGTCTATTTTCGGTTGGCTTTTCCACTTTTGGGATTCCCGTAACACCAAAACTGTGAAT
TTAGGGGAATCACTCATCTCTTTCTAGATGAAAAGTTTCATCCGAGGAAGATATTCTTTT
TGAAAAGGAAATATCAGTGTTCTCTTTAGAGACTGGACATAGGAGTTTTCTAATGAAGAA
TCCACATTCGTTTGCTCAGAAAGAGGTGACTAAAACCAACTAACTCTCTGATTCATACCC
ACACTCCTTGAAGCGTGTTGATATTGGCGAAATAAGAGAAATTCAGTGTATGTTTGAAAA
GAAATAAAGCAAGAGCAGCTCAAGAGGAACAAGACTAAAACTGGTAGAGTGCTTGTCCTT
CGGAGCCATAATTCACCACTTTGTAGTATAGATTTCAAGGATGTTATCAGCTTTAACGAG
TTCATAGATCAATTCACCAAGGAAGAAACTGATAAAACCACTTCCTCATATTGACTATGT
TACCCTCCCTGATAGCTAGTACACCGATCATTGAGCCTCTCAAGGATATTAGAATCCAAT
TACAATTCCAGAAACAAAAACTCTCCCTCTGAAGTCAAAGC*TCCAATCAAGTATCCCAC
AACAGTATGTAGCAACCTGCCGGTTCCAGTGAAGTCAGAGAAAAGTTATTAAGAGCAGCG
TGCTCATCTGGATTATTAAGAGTAATGAAATCACTAATTGTTCTCTCTATTTTTTG**AA
TTCCATTTGTTTAGATGGAATTATTCTTTAT*ATGTTTGACATACA

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR4FV46JQ 681 0 0
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ACATTCGTTTGCTCAGAAAGAGGTGACTAAAACCAACTAACTCTCTGATTCATACCCACA
CTCCTTGAAGCGTGTTGATATTGGCGAAATAAGAGAAATTCAGTGTATGTTTGAAAAGAA
ATAAAGCAAGAGCAGCTCAAGAGGAACAAGACTAAAACTGGTAGAGTGCTTGTCCTTCGG
AGCCATAATTCACCACTTTGTAGTATAGATTTCAAGGATGTTATCAGCTTTAACGAGTTC
ATAGATCAATTCACCAAGGAAGAAACTGATAAAACCACTTCCTCATATTGACTATGTTAC
CCTCCCTGATAGCTAGTACACCGATCATTGAGCCTCTCAAGGATATTAGAATCCAATTAC
AATTCCAGAAACAAAAACTCTCCCTCTGAAGTCAAAGC*TCCAATCAAGTATCCCACAAC
AGTATGTAGCAACCTGCCGGTTCCAGTGAAGTCAGAGAAAAGTTATTAAGAGCAGCGTGC
TCATCTGGATTATTAAGAGTAATGAAATCACTAATTGTTCTCTCTATTTTTTTGAAATTC
CATTTGTTTAGATGGAATTATTCTTTATTATGTTTGACATACAAATTTCCTTTTCTAATA
ATCCAGAAAAACTTTTGATA
C

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DS 

RD RR4E365JQ 619 0 0
AAAACCAACTAACTCTCTGATGCATACTCACACTCCTTGAAGCGTGTTGATATTGGCGAA
ATAAGAGAAATTCAGTGTATGTTTGAAAAGAAATAAAGCAAGAGCAGCTCAAGAGGAACA
AGACTAAAACTGGTGGAGTGCTTGTCCTTCGGAGCCATAATTCACCACTTTGTAGTATAG
ATTTCAAGGATGTTATCAGCTCTAACGAGTTCATAGATCAATTCACCAAGGAAGAAACTG
ATAAAACCACTTCCTCATATTGACTATGTTACCCTCCCTGATAGCTAGTACACCGATCAT
TGAGCCTCTCAAGGATATTAGAATCCAATTACAATTCCAGAAACAAAAACTCTCCCTCTG
AAGTCAAAGCATCCAATCAAGCATCCCACAACAGTATGTAGCAACCTGCCGGTTCCAGTG
AAGTCAGAGAAAAGTTATTAAGAGCAGCGTGCTCATCTGGATTATTAAGAGTAATGAAAT
CACTAATTGTTCTCTCTATTTTTTTGAAATTCCATTTGTTTAGATGGAATTATTCTTTAT
TATGTTTGACATACAAATTTCCTTTTCTAATAATCCAGAAAAACTTTTGATATATATAAT
TAAAGAAAAAGTTAAA
TCC

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DS 

RD RR4DU35JQ 603 0 0
CTGATGCATACTCACACTCCTTGAAGCGTGTTGATATTGGCGAAATAAGAGAAATTCAGT
GTATGTTTGAAAAGAAATAAAGCAAGAGCAGCTCAAGAGGAACAAGACTAAAACTGGTGG
AGTGCTTGTCCTTCGGAGCCATAATTCACCACTTTGTAGTATAGATTTCAAGGATGTTAT
CAGCTCTAACGAGTTCATAGATCAATTCACCAAGGAAGAAACTGATAAAACCACTTCCTC
ATATTGACTATGTTACCCTCCCTGATAGCTAGTACACCGATCATTGAGCCTCTCAAGGAT
ATTAGAATCCAATTACAATTCCAGAAACAAAAACTCTCCCTCTGAAGTCAAAGCATCCAA
TCAAGCATCCCACAACAGTATGTAGCAACCTGCCGGTTCCAGTGAAGTCAGAGAAAAGTT
ATTAAGAGCAGCGTGCTCATCTGGATTATTAAGAGTAATGAAATCACTAATTGTTCTCTC
TATTTTTTTGAAATTCCATTTGTTTAGATGGAATTATTCTTTATTATGTTTGACATACAA
ATTTCCTTTTCTAATAATCCAGAAAAACTTTTGATATATATAATTAAAGAAAAAGTTAAA
TCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 9

CO CL626Contig1 952 9 6 U
GGGATTCGTTTCTTCATAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGAT
CCCTTAAAGATGGCGACCGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAA
GCTAACCCCGATGTTATGAATCAGTTTATGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGATGAAGTG
GAGTGTAATGATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGACGGTTCCAAAGCCTGTC
CTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCGCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAA
GACAAGGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTT
GGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTAGCTCTGAAATC
AAGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGATGAGTCCT
ATGGAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTCGGCAGCT
GTTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT*AGC
TTGTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGG
TGCTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGA
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TTCTTTAGAAGCAAACCTCATCAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATGACGATGATCCACATAG
ATTGTTTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCTTGTTTATG
AAACTTTTTAACGTTTATGATCACCGTTTTAAGAGAATGCTTACATTTCTAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4AD76TF U 5
AF RR4EY62TF U 1
AF RR4CN58TF U 114
AF RR4GE42TF U 11
AF RR4A962TF U 1
AF RR4A962JQ C 99
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AF RR4EY62JQ C 246
AF RR4AD76JQ C 135
BS 1 396 RR4A962TF
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BS 398 492 RR4A962TF
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BS 494 823 RR4A962TF
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RD RR4AD76TF 636 0 0
TTCGTT
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ATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGACGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTC
TCTTCCTTTACCCGCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACAAGGAGA
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GAGGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTCGGCAGCTGTTACAGCTG
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GGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAA

QA 7 636 7 636
DS 

RD RR4EY62TF 723 0 0
GGGA
TTCGTTTCTTCATAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCTATCGAAAGACAGGCGATCCTT
**AAGATGGCGACCGTAGACGAGAGTTCATCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAAGCTA
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CTGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACA
AGGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTA
ATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTAGCTCTGAAATCAAGC
TTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGATGAGTCCTATGG
AGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTCGGCAGCTGTTA
CAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT*AGCTTGT
GTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAG*ACCAGTTTCACATGGTGCT
TCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGA
GATATTGAGAGAT

QA 5 710 5 710
DS 

RD RR4CN58TF 606 0 0
ACTCGAAGCTAACCCCGATGTTATGAATCAGTTTCTGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGA
TGAAGTGGAGTGTAATGATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAA
GCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAAT
CGAGCAAGACAAGGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACA
AACTGTTGGCAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTAGCTC
TGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGAT
GAGTCCTATGGAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTC
GGCAGCTGTTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTG
TTTTAGCTTGTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTG***GAAGAAA*GCAG*ACCAGTTT
CACATGGTGCTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGA
GATTGAGAA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4GE42TF 754 0 0
TCTTCATAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGATCCCTTAAAGA
TGGCGACCGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAAGCTAACCCCG
ATGTTATGAATCAGTTTATGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGATGAAGTGGAGTGTAATG
ATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTC
TCTTCCTTTACCCGCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACAAGGAGA
TCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAATGCTT
GCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTAGCTCTGAAATCAAGCTTTCTG
AGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGATGAGTCCTATGGAGCGTG
GAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTTGGCAGCTGTTACAGCTG
GTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT*AGCTTGTGTAAAC
GGGGAACTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCTTCCTCT
CCAGCTACCCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAGA*TCCG
*ACACGCTCA*CTTTAATGTGATGGCCATCTCTA

QA 1 754 1 754
DS 

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GGGATTCGTTTCTTCATAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGAT
CCCTTAAAGATGGCGACCGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAA
GCTAACCCCGATGTTATGAATCAGTTTATGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGATGAAGTG
GAGTGTAATGATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGACGGTTCCAAAGCCTGTC
CTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCGCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAA
GACAAGGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTT
GGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTGTTGGCAACATTAGCTCTGAAATC
AAGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGATGAGTCCT
ATGGAGCGTGGAGGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTCGGCAGCT
GTTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT*AGC
TTGTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGG
TGCTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGA
GAAGAATCCGGACACGCTCAACTTTAATGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACATGAGTCTC
TTCTTTAGAAGCAAACCTCATCAGTCTTGTGTTTTTAGTTTAT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4A962JQ 854 0 0
TAAGAGATGGCTTCCACTCGAAGCTAACCCCGATGTTATGAATCAGTTTATGTGGGGGCT
TGGTCTTGCCCCAGATGAAGTGGAGTGTAATGATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCT
TGAGACGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCGCTCACCAAAAAGAG
TGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACAAGGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGT
TTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTGT
TGGCAACATTAGCTTTGAAATCAAGCTTTTTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAA
AACCACCGCCAAGATGAGTCCTATGGAGCGTGGAGGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAAT
TGAAGATGCCCATTCGGCAGCTGTTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAA
CACACATTTCATCTGTTT*AGCTTGTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAA
AAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGA
AAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAGAATCCGGACACGCTCAACTTTAATGTGATGGCCA
TCTTTAAGAGAACATGAGTCTTTTCTTTAGAAGCAAACCTCATCAGTCTTGTGTTTTTAG
TTTATGACGATGATCCACATAGATTGTTTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTG
AATCTTATTTTTCTTGTTTATGAAACTTTTTAACGTTTATGATCACCGTTTTAAGAGAAT
GCTTACATTTCTAG

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4C452JQ 853 0 0
TCAGCTAGAGATGCTT
CACTCGAAGCTAACCCCGATGTTATGA*TCAGTT*CTGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAG
ATGAAGTGGAGTGTAATGATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAA
AGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAA
TCGAGCAAGACAAGGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAAC
AAACTGTTGGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTAGCT
CTGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGA
TGAGTCCTATGGAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATT
CGGCAGCTGTTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCT
GTTT*AGCTTGTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTT
TCACATGGTGCTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAG
ATTATTGAGAAGAATCCGGACACGCTCAACTTTAGTGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACA
TGAGTCTCTTCTTTAGAAGCAAACCTCATCAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATGACGATGAT
CCACATAGATTGTTTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCT
TGTTTATGAAACTTTTTAACGTTTATGATCACCGTTTTAAGAGAATGCTTACATTTC

QA 17 853 17 853
DS 

RD RR4EY62JQ 692 0 0
TGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACAA
GGAGATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAA
TGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTAGCTCTGAAATCAAGCT
TTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGATGAGTCCTATGGA
GCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTCGGCAGCTGTTAC
AGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT*AGCTTGTG
TAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCTT
CCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAGA
ATCCGGACACGCTCAACTTTAATGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACATGAGTCTCTTCTT
TAGAAGTAAACCTCATCAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATGACGATGATCCACATAGATTGT
TTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCTTGTTTATGAAACT
TTTTAACGTTTATGATCACCGTTTTAAGAGA
T

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4AD76JQ 818 0 0
TATGAATCAGTTTATGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGATGAAGTGGAGTGTAATGATGT
GTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGACGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTT
CCTTTACCCGCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACAAGGAGATCAA
GGAGAAGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAATGCTTGCGG
AACCATTGGTCTTCTTCATGCTGTTGGCAACATTAGCTCTGAAATCAAGCTTTCTGAGGG
ATCATTCTTGGATAAATTCTTCAAAACCACCGCCAAGATGAGTCCTATGGAGCGTGGAGG
GTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCCCATTCGGCAGCTGTTACAGCTGGTGA
AACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT*AGCTTGTGTAAACGGGG
AGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCTTCCTCTCCAG
CTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAGAATCCGGACA
CGCTCAACTTTAATGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACATGAGTCTCTTCTTTAGAAGCAA
ACCTCATCAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATGACGATGATCCACATAGATTGTTTATCTAGG
TGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCTTGTTTATGAAACTTTTTAACGT
TTATGATCACCGTTTTAAGAGAATGCTTACATTTC
TAG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 9

CO CL627Contig1 613 9 10 U
GGGATTCTCTCCCGAATCTCTCTCAGAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTATT
TGTTTCCGTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAAAGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAA
GAGGACAAGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGC
CAGGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATG
ACCGCTTACTGTGACCGTCAATCAGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTCGATGGC
CGTCGTCTCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAGGGAGATGAGATC
GATGCAATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGG
GTTTAGTGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAAC
AGTTTTCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAATATCTAATGGGCTTTGTT
TAATGAGGCGGTAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGTGTTTGGTAATTGATTAA
ATTTGTTCCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4DR07TF U 42
AF RR4BU29TF U 1
AF RR4BU29JQ C 309
AF RR4BY36JQ C 42
AF RR4BY36TF U 42
AF RR4B511TF U 8
AF RR4BC08JQ C 66
AF RR4BC08TF U 80
AF RR4CQ06TF U 65
BS 1 215 RR4BU29TF
BS 216 216 RR4B511TF
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BS 481 481 RR4B511TF
BS 482 516 RR4BU29TF
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BS 518 539 RR4BU29TF
BS 540 613 RR4B511TF

RD RR4DR07TF 382 0 0
GG
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AAGAGGGAGATGAGATCGATGCAATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTG
GCATGTCTGTGTTCTGGGTT

QA 3 382 3 382
DS 

RD RR4BU29TF 541 0 0
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TGTTTCCGTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAAAGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAA
GAGGACAAGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGC
CAGGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGCGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATG
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GATGCAATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGG
GTTTAGTGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAAC
GGTTTTCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATTATTAATATCTAATGGGCTTTGT
CC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4BU29JQ 233 0 0
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GCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGGGTTTAGTG
GCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACGGTTTTCA
ATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATTATTAATATCTAATGGGCTTTGT
CC

QA 1 231 1 231
DS 

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GG
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AGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGTGACCGTCAATCAGTGGATTTCAACTCAATTG
CTTTCTTGTTCGATGGCCGTCGTCTCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGG
AAGAGGGAGATGAGATCGATGCAATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTG
GCATGTCTATGTTCTGGGTTTAGTGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGT
CATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAAT
ATCTAATGGGCTTTG
CTT

QA 3 497 3 497
DS 

RD RR4BY36TF 500 0 0
GG
AGATCAGAGTTTGTATTTGTTTCCGTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAAAGGGAAGA
TGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACAAGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCA
ATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTC
AGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGTGACCGTCAATCAGTGGATTTCAACTCAATTG
CTTTCTTGTTCGATGGCCGTCGTCTCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGG
AAGAGGGAGATGAGATCGATGCAATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTG
GCATGTCTATGTTCTGGGTTTAGTGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGT
CATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAAT
ATCTAATGGGCTTTG
CTT

QA 3 497 3 497
DS 

RD RR4B511TF 606 0 0
TCTCCCGAATCTCTCTCAGAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTATTTGTTTCC
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AGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATG
GAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTT
ACTGTGACCGTCAATCAGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTCGATGGCCGTCGTC
TCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAGGGAGATGAGATCGATGCAA
TGCTCCATCAAGCCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGGGTTTAGT
GGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTC
AATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAG
GCGGTAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGTGTTTGGTAATTGATTAAATTTGTT
CCCCAC

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DS 

RD RR4BC08JQ 546 0 0
GG
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AAAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATG
GAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTT
ACTGTGACCGTCAATCAGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTCGATGGCCGTCGTC
TCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAGGGAGATGAGATCGATGCAA
TGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGGGTTTAGT
GGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTC
AATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAG
GCGGTAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGTGTTTGGTAATTGATTAAATTTGTT
CC
CC

QA 3 544 3 544
DS 

RD RR4BC08TF 532 0 0
CCGGAGAATCTGATAAAGGGAAGATGTCCGCTTTTCAGGAAGAGGACAAAAAGCCCGGAG
ACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTCT
TCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGTGACCGTC
AATCAGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTCGATGGCCGTCGTCTCCGTGCTGAAC
AGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAGGGAGATGAGATCGATGCAATGCTCCATCAAA
CCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGGGTTTAGTGGCCTTTGATGG
TGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAAGACGGTG
TGATGTTATTATTGGATCATTAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAGGCGGTAGCTTTA
ACTATAAAAGCTACTTTTAACCGTGTTTGGTAATTGATTAAATTTGTTCC
CC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4CQ06TF 545 0 0
GGG
GTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAAAGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACA
AGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATG
GAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTT
ACTGTGACCGTCAATCAGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTCGATGGCCGTCGTC
TCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAGGGAGATGAGATCGATGCAA
TGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGTTCTGGGTTTAGT
GGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTC
AATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAG
GCGGTAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGTGTTTGGTAATTGATTAAATTTGTT
CC

QA 4 545 4 545
DS 



AS 1 9

CO CL628Contig1 1043 9 25 U
GGACATTCATTCTCCCTCTTCCTCACAACAATCTTCTCTGCCTTCTCCCATCGACAAAAC
TAAAAAAAACTGCTTATCCCTTCCTCGGTCTCGATCATATTTTCTCTGTGGAATAGTTTT
GTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCGGTGATAAGTTCACTTTCTCCCTTCCCATCCAAAG
AGCGAGACTCCTCCTCTCTGCTTTCTCTTTCGGTTCCTACAAAGAAGGCTGGTACTTCCG
CTGCCTCGGCCTCGACCCGTGAATCTCCGTCAACACCTTCACGTAGATTTAGGGTTTTGC
TTTGTTCTGTTTTTCTTGAAATCTTTCGAAGATGTTGCTGTACAACAAGCAGAAGAAGAA
CGCTAAGGGACAAAGAATCCTTGTCAGCATTACGGTTCTCGGTAGCGCCGGTCCGATCCG
GTTCCTTGCGTACCAAGAAGATTTAGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGTTA
CGCTCGTGAAGGTCGTCTCCCTCTTCTAGGATCCGATTTTAATGATTTTATTCTCTATTG
TCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAAAGGGATTGGAACGCTTGGTGCGAG
GAACTTTACTCTGTGTAGGAAGCCAGAAGAGAAGAATAATAAGGTGGTTAAGGAAGGTGA
TGGAGCTAGAAAAGGAGGAAGCTTTAAGGCTTGGATCAACAAGTCCTCCAGCCTCAGAGT
CTCCACCCATTAAATTAAAGATTCAACTTCTATGTTTTTGTTTTTTTTGTTCTTTTCTCA
CCATTGACATTGCTGACGCTTAATTCTTCTACATCTCTCATTCGTAGGAAATAAAAGTTT
CAGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGAAACTAAGTTTCAGTTTTTCTTGCAAATTAGAATAAA
GGGTTTGGTGGCTTCAAGTAAACATCGTTTGTTTTTTACTTGTCTCCAAACACGTTTTTA
ATCGTGAGAAACAGAGTTGATTACAGTGGTATGCGTTGTGTGTCCCCGTAATGGGGGGGA
ATAATATTATTACCGTGTGTACC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EC44TF U 310
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TGGAGCTAGA

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C

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C

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CTT

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AGGTCGTCTCCCTCTTCTAGGATCCGATTTTAATGATTTTATTCTCTATTGTCCCATGGT
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TCTGTGTAGGAAGCCAGAAGAGAAGAATAATAAGGTGGTTAAGGAAGGTGATGGAGCTAG
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TTTGAAACTAAGTTTCAGTTTTTCTTGCAAATTAGAATAAAGGGTTTGGTGGCTTCAAGT
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TACC

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 7

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CTCTATTCCTTTTGCGTTTTACTTCACTTTCTTTTAGATCAATGAATATGGTGTCCTCTA
AGAGCAATTCGATATAATCTTCTATCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 

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TACT
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CC

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DS 



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GGAGTCACCGGGTTAGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCGGGAGGAGCT
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AACTTGAATAC


BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RR4BS63JQ C 6
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AF RR4G853JQ C 1
AF RR4G853TF U 1
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AF RR4AJ51JQ C 1
AF RR4AJ51TF U 1
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BS 240 240 RR4BS63TF
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BS 327 327 RR4G853TF
BS 328 333 RR4BR94TF
BS 334 334 RR4BS63TF
BS 335 470 RR4BR94TF
BS 471 471 RR4G853TF
BS 472 495 RR4BR94TF
BS 496 496 RR4G853TF
BS 497 523 RR4BR94TF
BS 524 545 RR4BS63TF
BS 546 546 RR4G853TF
BS 547 562 RR4BS63TF
BS 563 563 RR4G853TF
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GG
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GG
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QA 4 575 4 575
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QA 1 578 1 578
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G
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AACTTGAATAC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 2 9

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ATGTT


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4FP20JQ U 5
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GTCTGCTCCAACTCCACAGTAGTATGGCCCCT

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GAAAGTGTTGATATCAGCAGTCTCGTGTCTTCCAGTGAGACGACGCTCGTTGCCTTCACC
ATAAGCAGCGATGTGTTCCTTGTGACGCAATCCAAGCTTCTCTATCGCTTTCTTGATCAC
CTCGTACCCTCCATCTTCTCTCATCGACTTGGTACTGTAGTTTGTGTGTGCTCCTGCACC
ATTCCAATCTCCCGGGATTGGTTTAGGGTCAAGAAACAAAATCACTCCAGCCAATTCTGT
AATCCTCTCCAGGATGTAACGAGCGACCCAGACCTGATCAGCGGCCGCTATTCCAACGGT
TGGACCGACTTGGAATTCCCACTGTCCGGGCATGACTTCTCCGTTAGTGCCACTGACATT
GATTCCGGCGTAAAGACATGCTTTGTAATGAGCATCTACGATGTCTCTTCCAAAGGCTTT
GTCTGCTCCAACTCCACAGTA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4DT92JQ 845 0 0
GGCTGGAGAAAAGAACTATCATTATTTCTTGGAAAGAGTTTAAATCAAACATTCTTAAAC
AAAGAAAACACGAGAACTGTTTCATAATGAGAAAGAGAAAGTAGAAGAAATGAACATGAA
CTGATGATATAAGAGGTTTCTTCAATCATGGTTTCCAGAGGATTGTGGTTTCAGCAACCA
TGGAAGTCACAGTGTAAGGATCCATGTTAGACGCTGGCCTACGATCTTCAAAGTATCCTT
TTCCATCTTTCTCAGTGTCACGACCAACCCTAATCGATGCCCCACGGTTGGCAACACCCC
ATAAGAAAGTGTTGATATCAGCAGTCTCGTGTCTTCCAGTGAGACGACGCTCGTTGCCTT
CACCATAAGCAGCGATGTGTTCCTTGTGACGCAATCCAAGCTTCTCTATCGCTTTCTTGA
TCACCTCGTACCCTCCATCTTCTCTCATCGACTTGGTACTGTAGTTTGTGTGTGCTCCTG
CACCATTCCAATCTCCCGGAATTGGTTTAGGGTCAAGAGACAAAATCACTCCAGCCAATT
CTGTAATCCTCTCCAGGATGTAACGAGCGACCCAGACCTGATCAGCGGCCGCTATTCCAA
CGGTTGGACCGACTTGGAATTCCCACTGTCCGGGCATGACTTCTCCGTTAGTGCCACTGA
CATTGATTCCGGCGTAAAGACATGCTTTGTAATGAGCATCTACGATGTCTCTTCCAAAGG
CTTTGTCTGCTCCAACTCCACAGTAGTATGGCCCCTGAGGACCTGGGAAGCCACCGACGG
GCCAACCAACCGGCCACTTATATCCTTTTGTAGCAAGTATACTCTTGCTCATTCCATACC
ATGTT

QA 1 845 1 845
DS 



CO CL631Contig2 681 2 10 U
GGATACAAAAAAAAAGCTTAAGTATTCTTTTCAGATTCCTAGAAAATGTCGGCTCTTGCA
GATTTAATCAACCTCGATCTCTCTGACTCCTCTGAGAAGATCATTGCCGAGTACATATGG
ATTTGGTGGATCAGGCTTGGATATGAGAAGCAAAGCAAGGACTTTGCCAGGACCAGTGAA
GGATCCATCGGAGTTACCAAAATGGAACTATGACGGTTCAAGCACCGGCCAAGCACCCGG
CGATGACAGTGAAGTCATCATCTACCCTCAAGCTATCTTCAAAGATCCATTCAGAAGAGG
CAACAACATCCTTGTGATGTGTGACGCATATACACCTGCTGGCGAACCCATCCCAACAAA
CAAAAGGCATGCGGCGGCCAAGACCTTTAGCGACCCAGCCGTTGCCGCTGAAGAAACATG
GTATGGAATTCGAGCAAGAGTATACTTTGCTACAAAAGGATATTAAGTGGCCGGGTTGGT
TGGCCCGTCGGTGGCTTCCCAGGTCCTCAGGGGCCATACTACTGTGGAGTTGGAGCAGAC
AAAGCCTTTGGAAGAGACATCGTAGATGCTCATTACAAAGCATGTCTTTACGCCGGAATC
AATGTCAGTGGCACTAACAGAGAAGTCATGCCCGGACAGTGGGAATTCCAAGTCGGTCCA
ACCGTTGGAATAGCGGCCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT92TF U 1
AF RR4GE52TF U 102
BS 1 123 RR4DT92TF
BS 124 124 RR4GE52TF
BS 125 383 RR4DT92TF
BS 384 384 RR4GE52TF
BS 385 430 RR4DT92TF
BS 431 431 RR4GE52TF
BS 432 474 RR4DT92TF
BS 475 475 RR4GE52TF
BS 476 618 RR4DT92TF
BS 619 681 RR4GE52TF

RD RR4DT92TF 620 0 0
GGATACAAAAAAAAAGCTTAAGTATTCTTTTCAGATTCCTAGAAAATGTCGGCTCTTGCA
GATTTAATCAACCTCGATCTCTCTGACTCCTCTGAGAAGATCATTGCCGAGTACATATGG
ATT*GGTGGATCAGGCTTGGATATGAGAAGCAAAGCAAGGACTTTGCCAGGACCAGTGAA
GGATCCATCGGAGTTACCAAAATGGAACTATGACGGTTCAAGCACCGGCCAAGCACCCGG
CGATGACAGTGAAGTCATCATCTACCCTCAAGCTATCTTCAAAGATCCATTCAGAAGAGG
CAACAACATCCTTGTGATGTGTGACGCATATACACCTGCTGGCGAACCCATCCCAACAAA
CAAAAGGCATGCGGCGGCCAAGATCTTTAGCGACCCAGCCGTTGCCGCTGAAGAAACATG
GTATGGAATT*GAGCAAGAGTATACTTTGCTACAAAAGGATATTAAGTGGCCGG*TTGGT
TGGCCCGTCGGTGGCTTCCCAGGTCCTCAGGGGCCATACTACTGTGGAGTTGGAGCAGAC
AAAGCCTTTGGAAGAGACATCGTAGATGCTCATTACAAAGCATGTCTTTACGCCGGAATC
AATGTCAGTGGCACTAAC
GG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4GE52TF 580 0 0
AT
TTGCCGAGTACATATGGATTTGGTGGATCAGGCTTGGATATGAGAAGCAAAGCATGGACT
TTGCCAGGACCAGTGAAGGATCCATCGGAGTTACCAAAATGGAACTATGACGGTTCAAGC
ACCGGCCAAGCACCCGGCGATGACAGTGAAGTCATCATCTACCCTCAAGCTATCTTCAAA
GATCCATTCAGAAGAGGCAACAACATCCTTGTGATGTGTGACGCATATACACCTGCTGGC
GAACCCATCCCAACAAACAAAAGGCATGCGGCGGCCAAGACCTTTAGCGACCCAGCCGTT
GCCGCTGAAGAAACATGGTATGGAATTCGAGCAAGAGTATACTTTGCTACAAAAGGATAT
TAAGTGGCCGGGTTGGTTGGCCCGTCGGTGGCTTCCCAGGTCCTCAGGGGCCATACTACT
GTGGAGTTGGAGCAGACAAAGCCTTTGGAAGAGACATCGTAGATGCTCATTACAAAGCAT
GTCTTTACGCCGGAATCAATGTCAGTGGCACTAACAGAGAAGTCATGCCCGGACAGTGGG
AATTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATAGCGGCCGCT

QA 3 580 3 580
DS 



AS 1 9

CO CL632Contig1 1034 9 25 U
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AAAAGCTACTTGTCCCGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTT
CGTTATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCCGTTCCTGTCTCAGGCTCCTTCGACACCAC
CACTGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTTGCTGC
GCCGTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGG
ACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCT
TAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGA
GTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAG
GGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGA
GACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCT
AGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTAA
GAAGCCAACTATCTCTGTCATTCAAG*TCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAG
AATGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGCTCC
TCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGCTCC
TGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTGCTGCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTTGTTTT
TTTTT*CATTTGCTTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGTGAT
ATAAACAGCTTATCTACTATCGGATTATACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAATAAG
AGGAGTGGTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4C057TF U 8
AF RR4BP40TF U 1
AF RR4C124TF U 34
AF RR4D123TF U 64
AF RR4FN21TF U 64
AF RR4C057JQ C 808
AF RR4FN21JQ C 254
AF RR4BP40JQ C 332
AF RR4D123JQ C 478
BS 1 156 RR4BP40TF
BS 157 157 RR4C057TF
BS 158 647 RR4BP40TF
BS 648 648 RR4C124TF
BS 649 721 RR4BP40TF
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BS 742 747 RR4BP40TF
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BS 749 752 RR4BP40TF
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BS 754 766 RR4BP40TF
BS 767 767 RR4D123TF
BS 768 779 RR4BP40TF
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BS 906 1030 RR4FN21JQ
BS 1031 1034 RR4BP40JQ

RD RR4C057TF 467 0 0
GG
AATCAAACGTGAAAAGACAGATCCGTGAGTTGTCTCTCTTCAAACCAAACCAAAAGCTAC
TTGTCCCGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTTCGTTATACT
CGGAGACGATGCATCTGAGTCCGTTCCTGTCTCAGGCTCCTTCGACACCACCACTGATCA
TCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTTGCTGCGCCGTCTTC
CGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGGACACGACGG
TCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAGTG
GAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTTACGGAA
CCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAA

QA 3 467 3 467
DS 

RD RR4BP40TF 792 0 0
GGAAGTTTCAATCAAACGTGAAAAGACAGATCCGTGAGTTGTCTCTCTTCAAACCAAACC
AAAAGCTACTTGTCCCGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTT
CGTTATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCCGTTCCCGTCTCAGGCTCCTTCGACACCAC
CACTGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTTGCTGC
GCCGTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGG
ACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCT
TAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGA
GTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAG
GGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGA
GACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCT
AGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGGGCAAGACCCTAA
GAAGCCAACTATCTCTGTCATTCAAG*TCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAG
A*TGAGACAGATTT*GCTCA*GCTCAA*CAGA*CCCACCAGCTCAC*TGAAACTAGCTC
TCACTCACAGAGC

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DS 

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GG
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AGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTTCGTTATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCCGTTC
CTGTCTCAGGCTCCTTCGACACCACCACTGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATG
ACTCCATCGACGATGTTTTTGCTGCGCCGTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAG
ACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGGACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGA
TGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTG
AGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAAT
TCAAAGAGGATTTCCGTAAGAAGAGGTAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATA
GGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGAGACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGA
ACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCTAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAA
GAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTAAGAAGCCAACTATCTCTGTCATTCAAG*TCCCAAAC
CCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAGA*TGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAA
C

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR4D123TF 726 0 0
AGCTACTTGTCCCGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTTCGT
TATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCCGTTCCTGTCTCAGGCTCCTTC*ACACCACCAC
TGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTCGCTGCGCC
GTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGGACA
CGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAG
GGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTT
ACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGA
ACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGAGAC
ACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCTAGT
TCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTAAGAA
GCCAACTATCTCTGTCATTCAAG*TCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAGAAT
GAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGCTCCTCA
ACCTC
A

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FN21TF 730 0 0
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TATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCCGTTCCTGTCTCAGGCTCCTTCGACACCACCAC
TGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTCGCTGCGCC
GTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGGACA
CGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAG
GGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTT
ACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGA
ACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGAGAC
ACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCTAGT
TCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTAAGAG
GCCAACTATCTCTGTCATTCAAG*TCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAGAAT
GAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAA*CAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGCTCCTCA
ACCTCCAC
AG

QA 1 728 1 728
DS 

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QA 1 171 1 171
DS 

RD RR4FN21JQ 777 0 0
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ATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAGTGGAGA
AGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTTACGGAACCAA
ATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGAACTAACTTGT
GAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGAGACACAAGAGAAG
TTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCTAGTTCCTAAAGAA
GTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTAAGAGGCCAACTATC
TCTGTCATTCAAGGTCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAGAATGAGACAGATT
TTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGCTCCTCAACCTCCACCA
GAGGCGGCTGCTGCTGCTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGCTCCTGAAACCAAGCCC
ACCGAAGCAGTTGCTGCTGCTTAAGAAACCCTCCTTGGTTTTGTTTTTTTT**CATTTGC
TTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGTGATATAAACAGCTTAT
CTACTATCGGATTATACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAATAAGAGGAGTGGTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4BP40JQ 703 0 0
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CTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAAT
CAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCT
AATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGAGACACAAGAGAAGTTTTACGCGGAAGCCAGC
AAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCTAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAA
AGAAGAGGGAAGAAAGGGCAAGACCCTAAGAAGCCAACTATTTCTGTCATTCAAGGTCCC
AAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGAGAATGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAG
AACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGCTCCTCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCT
ACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGCTCCTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTGCT
GCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTTGTTTTTTTTTTCATTTGCTTACATCTATGTGATTCT
CTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGTGATATAAACAGCTTATCTACTATCGGATTATACT
CTATGACATTCATGTTTGAATTCAATAAGAGGAGTGGTTAAGC

QA 1 703 1 703
DS 

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GAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACAT
GGAGACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGA
GCTAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCC
TAAGAAGCCAACTATTTCTGTCATTCAAGGTCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGC
GAGAATGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGC
TCCTCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGC
TCCTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTGCTGCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTTGT
TTTTTTTT*CATTTGCTTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGT
GATATAAACAGCTTATCTACTATCGGATTATACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAAT
AAGAGGAGTGGTT
AAGC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 9

CO CL633Contig1 1182 9 12 U
GGACACATTCTCTCTCTCTCTCACATATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCT
CTCCACTGTTCCCTCCTTCACCAACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTC
TCATCGCTCTGTTCTCATTCAATGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAAAACTTT
ATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCTCTCGGAATGGAAATAAC
AGGTAATGGCTTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATCTGAATCAGCGCAG
GCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAA
ACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAA
GGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGC
AGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGA
CTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGAT*CTCATT*CAACTCGCAGGGCAA
TCAGCGGTGAAGGCAACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAG
AAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAGTGGGC*TTTGTTTGATAG
ACAATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGCCTGATCCAGAAGGTAGGATCCCGTTATGGGG
AAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGTTCATTGCCATTGGACTGGGTCCTCGACA
GTTAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCGCAACAGAAGAGCTCTTAGC
TAGCGACCCACAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCAACGTAGCCGTGAAACTGTATC
TCAGACAGATTACGAGGTTGATCTTATAACTGCATTGACAAAGCTAAGTGGTCTAGGACA
GCAAATCAACTATGAGGCATATACATATCCTGTCGAGCGGATCAATCTTAGCAAACTCAA
GCTATGAGCATAGAGCGTGACAACAAGTTTTAAGTCAGTGTA*****TGTATAACTTGAG
CAAACTTGAACTCATTAATATATA**TCCAAGATTTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AK80TF U 1
AF RR4GS93TF U 1
AF RR4C424TF U 534
AF RR4DI49TF U 3
AF RR4GF78TF U 12
AF RR4GS93JQ C 380
AF RR4GF78JQ C 394
AF RR4AK80JQ C 403
AF RR4DI49JQ C 502
BS 1 561 RR4AK80TF
BS 562 564 RR4GS93TF
BS 565 592 RR4AK80TF
BS 593 596 RR4GS93TF
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BS 1181 1182 RR4AK80JQ

RD RR4AK80TF 592 0 0
GGACACATTCTCTCTCTCTCTCACATATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCT
CTCCACTGTTCCCTCCTTCACCAACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTC
TCATCGCTCTGTTCTCATTCAATGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAAAACTTT
ATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCTCTCGGAATGGAAATAAC
AGGTAATGGCTTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATCTGAATCAGCGCAG
GCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAA
ACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAA
GGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGC
AGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGA
CTCGTTCTCAAAGGGTGGACC***TTCATATGCAGAT*CTCATT*CAACTCG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4GS93TF 659 0 0
GGACACATTC
TCTCTCTCTCTCACATATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTT
CCCTCCTTCACCAACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTCTCATCGCTCT
GTTCTCATTCAATGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAAAACTTTATCATTTCAC
CGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCTCTTGGAATGGAAATAACAGGTAATGGC
TTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATCTGAATCAGCGCAGGCAGCGATCC
GAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAAACCGGAGCTT
GTACCTTCTTTACTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAA
TCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCT
GGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCA
AAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGAT*CTCATT*CAACTCGCAGG*CAATCAGCGGTGA
AGGCAACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGA

QA 11 659 11 659
DS 

RD RR4C424TF 173 0 0
AGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATTCTCATTTCAACTCGC
AGGACAATCAGCGGTGAAGGCATCATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAA
TGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAGTGGG

QA 1 173 1 173
DS 

RD RR4DI49TF 754 0 0
GGACACAT
TCTCTCTCTCTCACATATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTT
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DS 

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DS 

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DS 

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TG

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DS 



AS 2 9

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4ER26JQ C 476
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RD RR4GE12TF 680 0 0
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CGATTCTTCCGAGAAGATCATTGCGGAGTACATATGGATTGGTGGATCAGGCTTGGATAT
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GAACTATGACGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCCGGCGATGACAGTGAAGTCATCATTTA
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CGCATATACACCTGCCGGTGAACCGATCCCGACGAACAAAAGGCATGCTGCGGCCAAGAT
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CATGCCAGGCCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATCGCTGCCGCTGATCA
G*TCTGGGTCGCTCGTTACA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4ER26TF 796 0 0
TTTTTTAAGATTCCTAAAAAAAATGTCGGCACTTGCAGATTTGATCAATCTTGATCTCTC
CGATTCTTCCGAGAAGATCATTGCGGAGTACATATGGATTGGTGGATCAGGCTTGGATAT
GAGAAGCAAAGCAAGGACTTTGCCGGGACCTGTCAAGGATCCATCGGAGTTACCGAAATG
GAACTATGACGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCCGGCGATGACAGTGAAGTCATCATTTA
CCCTCAAGCTATCTTCAAAGACCCCTTCAGAAGAGGCAACAACATCCTTGTGATGTGTGA
CGCATATACACCTGCCGGTGAACCGATCCCGACGAACAAAAGGCATGCTGCGGCCAAGAT
CTTTAGCGATCCCAGCGTTGCCGCCGAAGAAACATGGTATGGAATTGAGCAAGAGTATAC
TTTGCTACAAAAGGATATTAAATGGCCGGTAGGTTGGCCTGTCGGCGGCTTCCCAGGTTC
TCAGGGACCGTACTACTGCGGAGTTGGAGCAGACAAAGCCTTTGGAAGAGACATAGTAGA
TTCTCATTACAAAGCCTGTCTCTACGCTGGAATCAATGTCAGTGGCACTAACGGAGAAGT
CATGCCAGGCCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATCGCTGCCGCTGATCA
G*TCTGGGTCGCTCGTTACATCCTCGAGAGGATCACAGAGTTGGCTGGAGTCGTTCTGTC
TCTTGACCCTAAAC*AATTCCGG*AGAT*GGAATGGTGCAG*AGCACACACAAAT*ACAG
TACAAA
TCGATGGAGA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4ER26JQ 773 0 0
G
GTTCTCAGGGACCGTACTACTGCGGAGTTGGAGCAGACAAAGCCTTTGGAAGAGACATAG
TAGATTCTCATTACAAAGCCTGTCTCTACGCTGGAATCAATGTCAGTGGCACTAACGGAG
AAGTCATGCCAGGCCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATCGCTGCCGCTG
ATCAGGTCTGGGTCGCTCGTTACATCCTCGAGAGGATCACAGAGTTGGCTGGAGTCGTTC
TGTCTCTTGACCCTAAACCAATTCCGGGAGATTGGAATGGTGCAGGAGCACACACAAATT
ACAGTACAAAATCGATGGGAGAAGATGGAGGGTATGAAGTGATAAAGAAAGCGATAGAGA
AGCTTGGATTGCGTCACAAGGAACACATCTCTGCTTATGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTC
TCACTGGCAAACACGAGACCGCCGATATCAACACTTTCTTATGGGGTGTGGCCAACCGTG
GGGCATCCATTAGGGTTGGTCGCGACACTGAGCAAGCTGGGAAAGGATACTTTGAAGATC
GTAGGCCAGCGTCCAACATGGATCCGTACACTGTGACCTCCATGATTGCTGAAACCACAA
TCCTCTGGAAACCATGAAGAAAGAAAACTTGACCTTCAAGGAATTACACATCTAGTATCA
GTCCATGTTCGTTCTTCTATTGTCTCGTTCTCATGGCTTCTTTGTTTAAGTAATGTTTGA
TTTAAACTCTTAAAACCTGTTCTAGTTCTATATCGAATCTCTATGTTATTAC

QA 2 773 2 773
DS 

RD RR4E139TF 147 0 0
AACTTGTCCTTCAAGGAATTACACATCTAGTATCAGTCCATGTTCGTTCTTCTATTGTCT
CGTTCTCATGGCTTCTTTGTTTAAGTAATGTTTGATTTAAACTCTTAAAACCTGTTCTAG
TTCTATATCGAATCTCTATGTTATTAC

QA 1 147 1 147
DS 

RD RR4AK15JQ 670 0 0
G
ATGCCAGGCCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATCGCTGCCGCTGATCAG
GTCTGGGTCGCTCGTTACATCCTCGAGAGGATCACAGAGTTGGCTGGAGTCGTTCTGTCT
CTTGACCCTAAACCAATTCCGGGAGATTGGAATGGTGCAGGAGTACACACAAATTACAGT
ACAAAATCGATGAGAGAAGATGGAGGGTATGAAGTGATAAAGAAAGCGATAGAGAAGCTT
GGATTGCGTCACAAGGAACACATTTCTGCTTATGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACT
GGCAAACACGAGACCGCCGATATCAACACTTTCTTATGGGGTGCGGCCAACCGTGGGACA
TCCATTAGGGTTGGTCGCGACACTGAGCAAGCTGGGAAAGGATACTTTGAAGATCGTAGG
CCAGCGTCCAACATGGATCCGTACACTGTGACCTCCATGATTGCTGAAACCACAATCCTC
TGGAAACCATGAAGAAAGAAAACTTGACCTTCAAGGAATTACACATCTAGTATCAGTCCA
TGTTCGTTCTTCTATTGTCTCGTTCTCATGGCTTCTTTGTTTAAGTAATGTTTGATTTAA
ACTCTTAAAACCTGTTCTAGTTCTATATCGAATCTCTATGTTATTACAAAATGCAAATCT
CAGTTTTAG

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR4AK15TF 692 0 0
G
ATGCCAGGCCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATCGCTGCCGCTGATCAG
GTCTGGGTCGCTCGTTACATCCTCGAGAGGATCACAGAGTTGGCTGGAGTCGTTCTGTCT
CTTGACCCTAAACCAATTCCGGGAGATTGGAATGGTGCAGGAGTACACACAAATTACAGT
ACAAAATCGATGAGAGAAGATGGAGGGTATGAAGTGATAAAGAAAGCGATAGAGAAGCTT
GGATTGCGTCACAAGGAACACATCTCTGCTTATGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACT
GGCAAACACGAGACCGCCGATATCAACACTTTCTTATGGGGTGCGGCCAACCGTGGGACA
TCCATTAGGGTTGGTCGCGACACTGAGCAAGCTGGGAAAGGATACTTTGAAGATCGTAGG
CCAGCGTCCAACATGGATCCGTACACTGTGACCTCCATGATTGCTGAAACCACAATCCTC
TGGAAACCATGAAGAAAGAAAACTTGACCTTCAAGGAATTACACATCTAGTATCAGTCCA
TGTTCGTTCTTCTATTGTCTCGTTCTCATGGCTTCTTTGTTTAAGTAATGTTTGATTTAA
ACTCTTAAAACCTGTTCTAGTTCTATATCGAATCTCTATGTTATTACAAAATGCAAATCT
CAGTTTTAGATTTAAATTTTAAATCTCTAAA

QA 2 692 2 692
DS 



CO CL634Contig2 673 3 1 U
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AGGTTTTAAGAGTTTAAATCAAACATTACTTAAACAAAGAAGCCATGAGAACGAGACAAT
AGAAGAACGAACATGGACTGATACTAGATGTGTAATTCCTTGAAGGTCAAGTTTTCTTTC
TTCATGGTTTCCAGAGGATTGTGGTTTCAGCAATCATGGAGGTCACAGTGTACGGATCCA
TGTTGGACGCTGGCCCACGATCTTCAAAGTATCCTTTCCCAGCTTGCTCAGTGTCGCGAC
CAACCCTAATGGATGCCCCACGGTTGGCCACACCCCATAAGAAAGTGTTGATATCGGCGG
TCTCGTGTTTGCCAGTGAGACGACGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAGATGTGTTCCT
TGTGACGCAATCCAAGCTTCTCTATCGCTTTCTTTATCACTTCATACCCTCCATCTTCTC
TCATCGATTTTGTACTGTAATTTGTGTGTGCTCCTGCACCATTCCAATCTCCCGGTTGGC
GTACACAGCAATCAAAGTAGCAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTAACAC
TCCAGGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTGACAAAGATGAGAGCCTGACT
AATGATACTAACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GE12JQ U 19
AF RR4FW63JQ U 1
AF RR4FW63TF C 1
BS 1 673 RR4FW63JQ

RD RR4GE12JQ 508 0 0
C
GCATTTTGTAATAACATAGAGATTCGATATAGAACTAGAACAGGTTTTAAGAGTTTAAAT
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TGTGGTTTCAGCAATCATGGAGGTCACAGTGTACGGATCCATGTTGGACGCTGGCCTACG
ATCTTCAAAGTATCCTTTCCCAGCTTGCTCAGTGTCGCGACCAACCCTAATGGATGCCCC
ACGGTTGGCCACACCCCATAAGAAAGTGTTGATATCGGCGGTCTCGTGTTTGCCAGCGAG
ACGACGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAGATGTGTTCCTTGTGACGCAATCCAAGCTT
CTCTATCGCTTTCTTTATCACTTCATACCCTCCATCTTCTCTCATCGATTTTGTACTGTA
ATTTGTGTGTGCTCCTGCACCATTCCA

QA 2 508 2 508
DS 

RD RR4FW63JQ 673 0 0
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AGAAGAACGAACATGGACTGATACTAGATGTGTAATTCCTTGAAGGTCAAGTTTTCTTTC
TTCATGGTTTCCAGAGGATTGTGGTTTCAGCAATCATGGAGGTCACAGTGTACGGATCCA
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CAACCCTAATGGATGCCCCACGGTTGGCCACACCCCATAAGAAAGTGTTGATATCGGCGG
TCTCGTGTTTGCCAGTGAGACGACGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAGATGTGTTCCT
TGTGACGCAATCCAAGCTTCTCTATCGCTTTCTTTATCACTTCATACCCTCCATCTTCTC
TCATCGATTTTGTACTGTAATTTGTGTGTGCTCCTGCACCATTCCAATCTCCCGGTTGGC
GTACACAGCAATCAAAGTAGCAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTAACAC
TCCAGGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTGACAAAGATGAGAGCCTGACT
AATGATACTAACC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FW63TF 673 0 0
AAAT
CTAAAACTGAGATTTGCATTTTGTAATAACATAGAGATTCGATATAGAACTAGAACAGGT
TTTAAGAGTTTAAATCAAACATTACTTAAACAAAGAAGCCATGAGAACGAGACAATAGAA
GAACGAACATGGACTGATACTAGATGTGTAATTCCTTGAAGGTCAAGTTTTCTTTCTTCA
TGGTTTCCAGAGGATTGTGGTTTCAGCAATCATGGAGGTCACAGTGTACGGATCCATGTT
GGACGCTGGCCCACGATCTTCAAAGTATCCTTTCCCAGCTTGCTCAGTGTCGCGACCAAC
CCTAATGGATGCCCCACGGTTGGCCACACCCCATAAGAAAGTGTTGATATCGGCGGTCTC
GTGTTTGCCAGTGAGACGACGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAGATGTGTTCCTTGTG
ACGCAATCCAAGCTTCTCTATCGCTTTCTTTATCACTTCATACCCTCCATCTTCTCTCAT
CGATTTTGTACTGTAATTTGTGTGTGCTCCTGCACCATTCCAATCTCCCGGTTGGCGTAC
ACAGCAATCAAAGTAGCAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTAACACTCCA
GGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTGACAAAGATGAGAGCCTGACTAATG
ATACTAACC

QA 5 673 5 673
DS 



AS 1 6

CO CL635Contig1 780 6 22 U
GGATCTGACGACGCCTTCTCTCTCATTTGTTCTCCGATTCTCTTTGTGTGTTCCAAGCAG
CGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATCATGGCAGGAAGTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCC
GAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGAT
CATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGA
TATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAG
AGGTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAG
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TGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGCTGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGG
AGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGAGTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAA
GCTAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTGACCTCTGATGCTGCTTAACAAGCCAAGGA
GAAACCCAACCCTAACGGACATGATGGGTTTTATTTATTATTGGATATCAAA*CATGTTA
TTTTCGTTGTATTGCTTTGGGATTGGATATGATCCTTTGTGGTTCTCAGCTTTTATCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 15 15 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4G709TF U 1
AF RR4DM95TF U 34
AF RR4GE45TF U 34
AF RR4GH21TF U 11
AF RR4A687TF U 23
AF RR4CF05TF U 29
BS 1 75 RR4G709TF
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RD RR4G709TF 653 0 0
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CGAGAGTCGGGAGAGTGAAATCATCATGGCAGGAACTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCC
GAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGAT
CATGTTTCAGGACATAACGACACTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGA
TATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAG
AGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAG
GAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATATCGGAGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAAC
AGATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGA
TGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGCTGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGG
AGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGAGTCACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAA
GCTAGGAGAGACTCCACTTTTTATTCTTGTGACCTCTGATGCTGCTTAACAAG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4DM95TF 640 0 0
GG
GATTCTCTTTGTGTGTTCCAAGCAGCGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATCATGGCAGGAA
GTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCA
TCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTGGACA
CTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCATCT
CTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTA
TTGGTGTCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATATCGG
AGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTAGAGC
CTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGCTG
CTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGAGT
TACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTGACCT
CTGATGCTGCTTAACAAGCCAAGGAGAAACCCAACCCT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR4GE45TF 656 0 0
GG
GATTCTCTTTGTGTGTTCCAAGCAGCGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATCATGGCAGGT*
GTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCA
TCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTGGACA
CTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCATCT
CTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGTCTTGGCTA
TTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATATCGG
AGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGAGATGCATTTAGGTGCTGTAGAGC
CTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGCTG
CTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGAGT
TACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTGACCT
CTGATGCTGCTTAACAAGCCAAGGAGAAACCCAACCCTAACGGACATGATGGGT

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR4GH21TF 729 0 0
GG
GCCTTGTCTCTCATTTGTTCTCCGATTCTCTTTGTGTGTTCCAAGCAGCGAGAGTCGGGA
GAGGGAAATCATCATGGCAGGAAGTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAA
GATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGA
CATAACGACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGA
AAGATACAAAGGCAAAGGCATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTTATTTT
TGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAA
GCTTCCTGGGAAGGTAATATCGGAGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGA
GATGCATGTAGGTGCTGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGC
CACTGGTGGCACTCTCGCTGCTGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGC
TGAGTGTGCTTGCGTGATTGAGTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGAC
GCCACTATTTATTCTTGTGACCTCTGATGCTGCTTAACAAGCCAAGGAGAAACCCAACCC
TAACGGACATGATGGGTTTTATTTATTATTGGATATCAAA*CATGTTATTTTCGTTGTAT
TGCTTTG

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR4A687TF 756 0 0
GGATTTGTT
CTCCGATTCTCTTTGTGTGTTCCAAGCAGCGAGAGTCGGGAGAGTGAAATCATCATGGCA
GGAACTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGA
GTCATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTG
GACACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGC
ATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTG
GCTATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATA
TCGGAGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTA
GAGCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCT
GCTGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATT
GAGTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGACTCCACTTTTTATTCTTGTG
ACCTCTGATGCTGCTTAACAAGCTAAAGAGAAAACCCACCCTAAAGGACATGATGGGTTT
TATTTATTATTGGATATCAAAACATGTTATTTTCGTTGTATTACTTTGGGATTTGATATG
ATCCTTTGTTGTTCTCAGCTTTTATCA

QA 10 756 10 756
DS 

RD RR4CF05TF 758 0 0
GGG
CTCCGATTCTCTTTGTGTGTTCCAAGCAGCGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATCATGGCA
GGAAGTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGA
GTCATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTG
GACACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGC
ATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTG
GCTATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATA
TCGGGGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTA
GAGCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCT
GCTGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATT
GAGTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTG
ACCTCTGATGCTGCTTAACAAGCCAAGGAGAAACCCAGCCCTAACGGACATGATGGGTTT
TATTTATTATTGGATATCAAA*CATGTTATTTTCGT*GTAT*GCTTTGGGATTG***ATG
GTCCTTTGTG**TCTCAGCTTTTATCATA
TGCTCG

QA 4 752 4 752
DS 



AS 1 9

CO CL636Contig1 542 9 9 U
GTGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAA
TTTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAA
GCCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTG
AAACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGC
CGTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCT
AAATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGG
TATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTCTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATT
CAAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTT
TATTTTAGTTCAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAATTAACTTAAAA
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4AY03JQ C 5
AF RR4AY03TF U 5
AF RR4E974TF U 7
AF RR4G716TF U 1
AF RR4F863JQ C 2
AF RR4G716JQ C 23
AF RR4F863TF U 2
AF RR4A977TF U 7
AF RR4A977JQ C 7
BS 1 283 RR4G716TF
BS 284 284 RR4AY03TF
BS 285 402 RR4G716TF
BS 403 403 RR4F863TF
BS 404 486 RR4G716TF
BS 487 490 RR4F863TF
BS 491 491 RR4A977TF
BS 492 536 RR4F863TF
BS 537 542 RR4A977JQ

RD RR4AY03JQ 323 0 0
GG
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TTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGAT
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AAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTT
TGAATTTTTTAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGG

QA 3 323 3 323
DS 

RD RR4AY03TF 323 0 0
GG
ACAAACTAACAAAACATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCT
TTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGAT
GCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCA
AAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTT
TGAATTTTTTAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGG

QA 3 323 3 323
DS 

RD RR4E974TF 462 0 0
GG
AAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTTT
CTTTTGTATCGTTTTAGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGC
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ACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTG
AATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAATA
CATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGT
GGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTTAAGAAAT
TCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTG

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR4G716TF 488 0 0
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TTTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAA
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AAACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGC
CGTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTTAGTTTTATTCTAATCT
AAATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGG
TATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTCTTCTATTTATGGCCTTTTACAATTGGATT
CAAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTT
TATTTT
CC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4F863JQ 535 0 0
GGAAC
ACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCT
TTCTTTTGTATTGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGAT
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AAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTT
TGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATCTTAGTTTTATTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGTTATCTC
GTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTCTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAAGAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTT
AGTTTAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAATTAACTT

QA 6 535 6 535
DS 

RD RR4G716JQ 466 0 0
TTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTTTCTTTTGTATCGTTT
TGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGCAGCAGCACCAACAT
GCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAAAACGGTGCCTAGGTA
GCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTGAATTTTTCAAAAAT
AAATTTCTATATTATATATTTTAGTTTTATTCTAATCTAAATAATACATAGAAAGTTCTC
TACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGTGGAAGAGCTCAAGT
TTTTTTCTCTTCTATTTATGGCCTTTTACAATTGGATTCAAGAAATTCATATATGTTTCG
GGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTT
CC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4F863TF 535 0 0
GGAAC
ACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCT
TTCTTTTGTATTGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGAT
GCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCA
AAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTT
TGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATCTTAGTTTTATTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGTTATCTC
GTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTCTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAAGAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTT
AGTTTAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAATTAACTT

QA 6 535 6 535
DS 

RD RR4A977TF 536 0 0
GG
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CTTTTGTATCGTTTTAGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGC
AGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAAA
ACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTG
AATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAATA
CATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGT
GGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTT*ACAATTGGATTTAAGAAAT
TCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTTAG
TTCAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAATTAACTT
AAAAGC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR4A977JQ 536 0 0
GG
AAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTTT
CTTTTGTATCGTTTTAGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGC
AGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAAA
ACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTG
AATTTTTCAAAAATAAATTTTTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAATA
CATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGT
GGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTT*ACAATTGGATTTAAGAAAT
TCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTTAG
TTCAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAATTAACTTAAAAGC

QA 3 536 3 536
DS 



AS 3 9

CO CL637Contig1 550 2 9 U
CGAGTGGAACATAGTTTTAGCAGAGCATTGAAACAATAATTAGGAAAGAGATTCGAAATG
TTCTTCAAGACGATCCTTTTAATAGTTTTTTTTTTTTCTTATTTGCTACAAATCCCAACA
CCGATTCAAAGAAAACAGAAAACAAATGAAAGATTTTAAAGCAAAACCAGGCAAAAAGAT
TAGTCCAAAAGATTAAAAAACCAAGGAGATGAAAAAACTAAGCTACCCCCTCCTCAAGGT
CCTCATTTGGATGCTTGATTCTTCTCAAGGCTTGAGAGCGAGAGCAAACCCAACCTTGGC
ACTCTTCTCGATGGCCCTAGAGTCAACCTCTCCAAAAATGGTGATGAACGACTTTGGACG
CCACTGGTGTTGGATCAAAGCGTTGGCTAAACCATCATTGTTCACACGTGCCTTCACTGT
GGTCAATGGGTCAAGAGCATGCTGAGCACCAAAGGTTATGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAA
GCTGTGTGTAACCTCAGCTCCAACCACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTA
CGACGCATTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H729JQB U 1
AF RR4EX30JQ U 1
BS 1 96 RR4EX30JQ
BS 97 97 RR4H729JQB
BS 98 175 RR4EX30JQ
BS 176 176 RR4H729JQB
BS 177 195 RR4EX30JQ
BS 196 196 RR4H729JQB
BS 197 452 RR4EX30JQ
BS 453 453 RR4H729JQB
BS 454 550 RR4EX30JQ

RD RR4H729JQB 540 0 0
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TAGTCCAAAAGATTAAAAAACCAAGGAGATGAAAAAACTAAGCTACCCCCTCCTCAAGGT
CCTCATTTGGATGCTTGATTCTTCTCAAGGCTTGAGAGCGAGAGCAAACCCAACCTTGGC
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QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4EX30JQ 550 0 0
CGAGTGGAACATAGTTTTAGCAGAGCATTGAAACAATAATTAGGAAAGAGATTCGAAATG
TTCTTCAAGACGATCCTTTTAATAGTTTTTTTTTTT*CTTATTTGCTACAAATCCCAACA
CCGATTCAAAGAAAACAGAAAACAAATGAAAGATTTTAAAGCAAAACCAGGCAAAGAGAT
TAGTCCAAAAGATTAGAAAACCAAGGAGATGAAAAAACTAAGCTACCCCCTCCTCAAGGT
CCTCATTTGGATGCTTGATTCTTCTCAAGGCTTGAGAGCGAGAGCAAACCCAACCTTGGC
ACTCTTCTCGATGGCCCTAGAGTCAACCTCTCCAAAAATGGTGATGAACGACTTTGGACG
CCACTGGTGTTGGATCAAAGCGTTGGCTAAACCATCATTGTTCACACGTGCCTTCACTGT
GGTCAATGGGTCAAGAGCATGCTGAGCACCAACGGTTATGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAA
GCTGTGTGTAACCTCAGCTCCAACCACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTA
CGACGCATTC

QA 1 550 1 550
DS 



CO CL637Contig2 822 4 15 U
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AGAAACAATCAATCATCATGGTTAAAGGTCCAGGACTCTACACCGAAATCGGCAAAAAGG
CCAGAGATCTTCTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAACTCAGCATCACCACTTACT
CTTCCACCGGTGTTGCAATCACTACCACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGGG
ATGTATCTACCCAAGTCAAGAACAAGAACTTCACTGCTGATATCAAAGTCGCCACTGACT
CTTCTCTGCTGACCACTTTCACCTATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAAGGCAATCGTCA
GCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGGCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTATG
CTGGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGG*TGTG
GTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACCGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCCGGCGAT
TTCAAGCATTTCAATGCTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCTTACT
CTGAATGACAAGGGTGACAAACTGAATGCGTCGTACTACCACACCGTGAACCCGTCGAGC
AACACAGTGGTTGGAGCTGAG*TTACACACAGCTTCACTACCCAAAAGACGCCATAACCG
TTGGTGCTCAGCATGCTCTTGACCATTGACACAGTGAAGCACGTGTGAAAATGATGGTTT
AGCCACGCTTTGATCCACACCAGTGGCGTCAAAGTCGTCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H729TF U 1
AF RR4FK79TF U 1
AF RR4E504TF U 237
AF RR4EX30TF U 1
BS 1 122 RR4EX30TF
BS 123 123 RR4H729TF
BS 124 175 RR4EX30TF
BS 176 176 RR4H729TF
BS 177 291 RR4EX30TF
BS 292 292 RR4E504TF
BS 293 533 RR4EX30TF
BS 534 534 RR4E504TF
BS 535 536 RR4EX30TF
BS 537 537 RR4E504TF
BS 538 556 RR4EX30TF
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BS 558 706 RR4EX30TF
BS 707 707 RR4E504TF
BS 708 822 RR4EX30TF

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CTTCTCTGCTGACCACTTTCACCTATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAAGGCAATCGTCA
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QA 1 572 1 572
DS 

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CCAGAGATCTTCTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAACTCAGCATCACCACTTACT
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ATGTATCTACCCAAGTCAAGAACAAGAACTTCACTGCTGATATCAAAGTCGCCACTGACT
CTTCTCTGCTGACCACTTTCACCTATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAAGGCAATCGTCA
GCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGGCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTATG
CTGGCATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGG*TGTG
GTTGGGAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACCGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCCGGCGAT
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AACACAGTGGTTGGAGCTGAG*TTACACACAGCTTCACTACCC

QA 1 703 1 703
DS 

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TATGCTGGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGGG
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CGATTTCAAGCATTTCAATGCTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCT
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ACCGTTGGTGCTCAGCATGCTCTTGAC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4EX30TF 822 0 0
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CCTGAGATCTTCTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAACTCAGCATCACCACCTACT
CTTCCACCGGTGTTGCAATCACTACCACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGGG
ATGTATCTACCCAAGTCAAGAACAAGAACTTCACTGCTGATATCAAAGTCGGCACTGACT
CTTCTCTGCTGACCACTTTCACCTATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAAGGCAATCGTCA
GCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGGCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTATG
CTGGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGG*TGTG
GTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACCGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCTGGGGAT
TTCAAGCATTTCAATGTTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCTTACT
CTGAATGACAAGGGTGACAAACTGAATGCGTCGTACTACCACACCGTGAACCCGTCGAGC
AACACAGTGGTTGGAGCTGAG*TTACACACAGCTTCACTACCCAAA*GACGCCATAACCG
TTGGTGCTCAGCATGCTCTTGACCATTGACACAGTGAAGCACGTGTGAAAATGATGGTTT
AGCCACGCTTTGATCCACACCAGTGGCGTCAAAGTCGTCATC

QA 1 822 1 822
DS 



CO CL637Contig3 911 3 12 U
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GAAAGAGTTTCGCATTGTTCATCTTCAAGACGACCCTTTTAATAGTTTTTTCGTTCTTAT
TTGATACAAATCCCAACACCGATTCAAGGAAAACCAAAAAAACAAATGAAAGATTTTTAA
AGCAAAATCAGGCAGATAGATTAGTCCAAAAGATTAGAAAACCAAGGAGATGAAAAAACT
AAGCTACCCCCTCCTCAAGGGCCTCATTTGGATGCTTGATTCTTCTCAAGGCCTGAGAGC
GAGAGCAAACCCAACCTTGGCACTCTTCTCGATGGCCCTAGAGTCAACCTCTCCAGAAAT
GGTGATGAACGACTTTGGACGCCACTGGTGTTGGATCAAAGCGTTGGCTAAACCATCATT
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GGCGTTCTTTTGGGTAGTGAAGCTGTGTGTAACCTCAGCTCCAACCACTGTGTTGCTCGA
CGGGTTCACGGTGTGGTAGTACGACGCATTCAGTTTGTCACCCTTGTCATTCAGAGTAAG
AGAAGCAATCAAATCGTCCTTGGTGAAACTGAAACCAGCATTGAAATGCTTGAAATCCCC
AGACTGGGTGTTGAAGGAAACATCGGTACCAAGAGCCAAGACGTTGTTCCCAACCACACC
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GTGCAGATACTGGAGCTCAACCTTGCCAGATTTCTGATCAGCACCTTGGCGCTGACGATT
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GACTTTGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK79JQ U 1
AF RR4E877TF C 342
AF RR4E504JQ U 47
BS 1 111 RR4FK79JQ
BS 112 112 RR4E504JQ
BS 113 306 RR4FK79JQ
BS 307 307 RR4E504JQ
BS 308 444 RR4FK79JQ
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BS 661 661 RR4E877TF
BS 662 911 RR4E504JQ

RD RR4FK79JQ 571 0 0
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GAAAGAGTTTCGCATTGTTCATCTTCAAGACGACCCTTTTAATAGTTTTTTTGTTCTTAT
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AAGCTACCCCCTCCTCAAGGGCCTCATTTGGATGCTTGATTCTTCTCAAGGCCTGAGAGC
GAGAGCGAACCCAACCTTGGCACTCTTCTCGATGGCCCTAGAGTCAACCTCTCCAGAAAT
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CGGGTTCACGGTGTGGTAGTACGACGCATTC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4E877TF 477 0 0
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CGTTGGCTAAACCATCATTGTTCACACGTGCCTTCACTGTGGTCAATGGGTCAAGAGCAT
GCTGAGCACCAACGGTTATGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAAGCTGTGTGTAACCTCAGCTC
CAACCACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTACGACGCATTCAGTTTGTCAC
CCTTGTCATTCAGAGTAAGAGAAGCAATCAAATCGTCCTTGGTGAAACTGAAACCAGCAT
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CGTTGTTTCCAACCACACCGGAGAAATTGACAATGGGGCTAGCTGTCAAACCAACACTGG
TGCAGATACCAGCATAGTCGTGCAGATATTGGAGTTCAACCTTGCCAGATTTTTGAT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR4E504JQ 865 0 0
GAGACAATAATTAGGAAAGAGTTTCGCATTGTTCATCTTCAAGACGACCCTTTTAATAGT
TTTTTCGTTCTTATTTGATACAAATCCCAACACCGATTCAAGGAAAACCAAAAAAACAAA
TGAAAGATTTTTAAAGCAAAATCAGGCAGATAGATTAGTCCAAAAGATTAGAAAACCAAG
GAGATGAAAAAACTAAGCTACCCCCTCCTCAAGGGCCTCATTTGGATGCTTGATTCTTCT
CAAGGCTTGAGAGCGAGAGCAAACCCAACCTTGGCACTCTTCTCGATGGCCCTAGAGTCA
ACCTCTCCAGAAATGGTGATGAACGACTTTGGACGCCACTGGTGTTGGATCAAAGCGTTG
GCTAAACCATCATTGTTCACACGTGCCTTCACTGTG*TCAATGGGTCAAGAGCATGCTGA
GCACCAACGGTTACGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAAGCTGTGTGTAACCCCAGCTCCAACC
ACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTACGACGCATTCAGTTTGTCACCCTTG
TCATTCAGAGTAAGAGAAGCAATCAAATCGTCCTTGGTGAAACTGAAACCAGCATTGAAA
TGCTTGAAATCGCCGGACTGGGTGTTGAAGGAAACATCGGTACCAAGAGCCAAGACGTTG
TTCCCAACCACACCGGAGAAATTGACAATGGGGCTAGCTGTCAAACCAACACTGGTGCAG
ATACCAGCATAGTCGTGCAGATACTGGAGCTCAACCTTGCCAGATTTCTGATCAGCACCT
TGGCGCTGACGATTGCCTTCAAACCAGGGGTGGCCTCATCATAGTGAAAGTGGTCAGCAG
AGAGAGTCAGTGGCGACTTTGATAT

QA 1 865 1 865
DS 



AS 2 9

CO CL638Contig1 984 7 19 U
AAGAGAAAGATTTAGCATAAAGAATCAAACAAAGGTATAATGGGTTTTATGATATATTAT
TATAACTTCTTTTGTTTTTCTTAAAA*TCTTATTTCGTGAAAACTGAAAATAAAATGACT
TTCATTATAATTAGGTTATTCTTGCACACTATTACTTGGTTTAGAGCCTTGAGGGCATTC
CTCCAGCGACGACCAAAGTTTCACCGGTGATGTAAGAAGAATCATCAGATGCTAAGAAAG
CCGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTGTTAAGCAGAGTCTTCTCTTCGA
TGCTCTCCCTCACTTGGGAGTTTCCGGTGATGAAAGAAGCAAAGCGTGTGGGCACAAAAC
CGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGTGTCCGGACCCATCTCAGCAGCAAGAGCCTTGGTTA
GTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATGGAACCTTGTGGTTGAAATC
CAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCATATCCT
GAAGGAGAAGTATAGAGGATTTGACATTGATTTCCCAAAGCTTGTCGAGGACAGCTTCTT
TGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCGGCGTTACAGACAACGATATCTA
TCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCTCGGCGATGTTGAGCATTGGAAA
CATGACAGACGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTGGATTTGAGCTTTTCAACTGCTTCCT
CAACATTTGCCTGCTTGCGGGGAGAAACGACGACGGAAGCGCCTTCGAGACCGAAACGCT
CGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGTTACTATCGCCACCTTCCCTTCCA
ATCTCCTCGCTGCTATCTTCTTCCCCTCCATTTCTCTCTCACGTCTTTTTTTTTTCTTCC
CAACTTCTCTCTCTTAGCCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C117JQ U 39
AF RR4AD80JQ U 1
AF RR4H844JQB U 40
AF RR4BP87JQ U 33
AF RR4BP87TF C 280
AF RR4C117TF C 409
AF RR4AD80TF C 532
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RD RR4C117JQ 467 0 0
AATG
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AGTGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGTGTCCGGACCCATCTCAG
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AACCTTGTGGTTGAAATCCAGCGATGGAAGTAATGAAGATAAC

QA 5 467 5 467
DS 

RD RR4AD80JQ 674 0 0
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TATAACTTCTTTTGTTTTTCTTAAAA*TCTTATTTCGTGAAAACTGAAAATAAAATGACT
TTCATTATAATTAGGTTATTCTTGCACACTATTACTTGGTTTAGAGCCTTGAGGGCATTC
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CCGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTGTTAAGCAGAGTCTTCTCTTCGA
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CGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGTGTCCGGACCCATCTCAGCAGCAAGAGCCTTGGTTA
GTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATGGAACCTTGTGGTTGAAACC
CAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCATATCCT
GAAGGAGAAGTATAGAGGATTTGACATTGATTTCCCAAAGCTTGTCGAGGACAGCTTCTT
TGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCGGCGTTACAGACAACGATATCTA
TCTTTCCATATTTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4H844JQB 723 0 0
AAT
GGTTTTATGGTATATTATTATAACTTCTTTTGTTTTTCTTAAAAATCTTATTTCGTGAAA
ACTCAAAATAAAATGACTTTCATTATAATTAGTTTTTTCTT**AGACTATTACTTGGTTT
AGAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTTCACCGGTGATGTAAGAAGAAT
CATCAGATGCTAAGAAAGCTGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTGTTAA
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AGTGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACTGCGTTCACACGTGTGTCCGGACCCATCTCAG
CAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATGG
AACCTTGTGGTTGAAATCCAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCTCTA
AGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGAGGATTTGACATTGATTTCCCAAAGCT
TGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCGGCGT
TACAGACAAGGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCTCGGC
GATGTTGAGCATTGGAAACATGACAGACGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTTGATTTGA

QA 4 723 4 723
DS 

RD RR4BP87JQ 894 0 0
AGGTAT
AATGGGTTTTATGATATATTATTATAACTTCTTTTGTTTTTCTTAAAA*TCTTATTTCGT
GAAAACTGAAAATAAAATGACTTTCATTATAATTAGGTTATTCTTGCACACTATTACTTG
GTTTAGAGCCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTTCACCGGTGATGTAAGAA
GAATCATCAGATGCTAAGAAAGCCGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTG
TTAAGCAGAGTCTTCTCTTCGATGCTCTCCCTCACTTGGGAGTTTCCGGTGATGAAAGAA
GCAAAGCGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGTGTCCGGACCCATC
TCAGCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCC
ATGGAACCTTGTGGTTGAAATCCAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTC
TCTAAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGAGGATTTGACATTGATTTCCCAA
AGCTTGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCG
GCGTTACAGACAACGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCT
CGGCGATGTTGAGCATTGGAGACATGACAGACGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTGGAT
TTGAGCTTTTCAACTGCTTCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGGGAGAAACGACGACGGA*
GCGCCTTCGAGACCGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGT*
ACTATCGCC**CCTCCCT*CCAATCTCCTCGCTGCTATCT
CTTCCCTC

QA 7 886 7 886
DS 

RD RR4BP87TF 705 0 0
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CAAAGCGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGTGTCCGGACCCATCT
CAGCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCA
TGGAACCTTGTGGTTGAAATCCAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCT
CTAAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGAGGATTTGACATTGATTTCCCAAA
GCTTGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCGG
CGTTACAGACAACGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCTC
GGCGATGTTGAGCATTGGAGACATGACAGACGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTGGATT
TGAGCTTTTCAACTGCTTCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGGGAGAAACGACGACGGAAG
CGCCTTCGAGACCGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGTTA
CTATCGCCACCTTCCCTTCCAATCTCCTCGCTGCTATCTTCTTCCCCTCCATTTCTCTCT
CACGTCTTTTTTTTTTCTTCCCAACTTCTCTCTCTTAGCCGATCC

QA 1 705 1 705
DS 

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AAGAGCTT
GTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATGGAACCTTGTGGTTGA
AA*CCAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCATA
TCCTGAAGGAGAAGTATAGAGGATTTGACATTGATTTCCCAAAGCTTGTCGAGGACAGCT
TCTTTGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCGGCGTTACAGACAACGATA
TCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAACATCTCGGCGATGTTGAGCATTG
GAAACATGACAGACGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTGGATTTGAGCTTTTCAACTGCT
TCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGGAAGAAACGACGACGGAAACGCCTTCGAGACCGAAA
CGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGTTACTATCGCCACCTTCCCT
TCCAATCTCCTCGCTGCTATCTTCTTCCCCTCCATTTCTCTCTCACGTCTTCTTTTTTTC
TTCCCAACTTCTCTCTCTTAGCCGATCC

QA 9 576 9 576
DS 

RD RR4AD80TF 453 0 0
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CAGCTTCTTTGGTGGACAAGATCGGGTCCGTAGATGGATTAGCAGCGGCGTTACAGACAA
CGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCTCGGCGATGTTGAG
CATTGGAAACATGACAGACGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTGGATTTGAGCTTTTCAA
CTGCTTCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGGAAGAAACGACGACGGAAGCGCCTTCGAGAC
CGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGTTACTATCGCCACCT
TCCCTTCCGATCTCCTCGCTGCTATCTTCTTCCCCTCCATTTCTCTCTCACGTCTTTTTT
TTTTCTTCCCAACTTCTCTCTCTTAGCCGATCC

QA 1 453 1 453
DS 



CO CL638Contig2 978 2 10 U
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GAGAGAAATGGAGGGGAAGAAGATAGGGAGGAGACTGGAAGGAAAGGTGGCGATAGTAAC
GGCCTCGACGCAAGGGATCGGCTTCGGTATCATCGAGCGTTTCGGTCTCGAAGGCGCTTC
CGTCGTCGTTTCTTCCCGCAAGCAGGCAAATGTTGAGGAAGCAGTAGAAAAACTCAAATC
AAAAGGGATTGATGCTTATGGAATCGTCTGTCATGTTTCCAATGCTCAACATCGCCGAGA
TCTTGTCGAAAAAACTGTTCAGAAATATGGAAAGATAGATATCCTTGTCTGTAACGCCGC
TGCTAATCCATCTACGGACCCGATCTTGTCCACCAAAGAAGCTGTCCTCGACAGGCTTTG
GGAAATCAATGTCAAATCCTCTATACTTCTCCTTCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAA
GGGTTCTTCTGTTATCTTCATTACTTCCATCGCTGGATTTCAACCACAAGGTTCCATGGC
TATGTATGGTGTCACTAAGACTGCTCTTCTCGGACTAACCAAGGCTCTTGCTGCTGAGAT
GGGTCCGGACACACGTGTGAACGCGGTTGCTCCCGGTTTTGTGCCCACACACTTTGCTTC
TTTCATCACCGGAAACTCCCAAGTGAGGGAGAGTATCGAAGAGAAGACTCTGCTTAACAG
GTTGGGAACAACAGGAGACATGGCTGCTGCTGCAGCTTTCTTAGCATCTGATGATCCTTC
TTACATCACCGGTGAAACTTTGGTCGTCGCTGGAGGAATGCCCTCAAGACTCTAAACCAA
GTAATAGTTTAAGAAAAAACTAATTATAATGAAAGTCATTTTATTTTGAGTTTTCACGAA
ATAAGATTTTTAAGAAAAACAAAAGAAGTTATAATAATATACCATAAAACCATTATACCT
TTGTTTGGTTCTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F404TF U 1
AF RR4F404JQ C 367
BS 1 704 RR4F404TF
BS 705 705 RR4F404JQ
BS 706 720 RR4F404TF
BS 721 721 RR4F404JQ
BS 722 734 RR4F404TF
BS 735 735 RR4F404JQ
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BS 779 811 RR4F404TF
BS 812 978 RR4F404JQ

RD RR4F404TF 811 0 0
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GAGAGAAATGGAGGGGAAGAAGATAGGGAGGAGACTGGAAGGAAAGGTGGCGATAGTAAC
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AAAAGGGATTGATGCTTATGGAATCGTCTGTCATGTTTCCAATGCTCAACATCGCCGAGA
TCTTGTCGAAAAAACTGTTCAGAAATATGGAAAGATAGATATCCTTGTCTGTAACGCCGC
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GGGTCCGGACACACGTGTGAACGCGGTTGCTCCCGGTTTTGTGCCCACACACTTTGCTTC
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*TTGGGAACAACAG*AGACATGGCTGCTGCTGCAGCTTTCTTAGCATCTGATGATC**TC
TTACATCACCGGTGAAACTTTGGTCGTCGCT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4F404JQ 612 0 0
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TTCTGTTATCTTCATTACTTCCATCGCTGGATTTCAACCACAAGGTTCCATGGCTATGTA
TGGTGTCACTAAGACTGCTCTTTTCGGACTAACCAAGGCTCTTGCTGCTGAGATGGGTCC
GGACACACGTGTGAACGCGGTTGCTCCCGGTTTTGTGCCCACACACTTTGCTTCTTTCAT
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AACAACAGGAGACATGGCTGCTGCTGCAGCTTTCTTAGCATCTGATGATTCTTCTTACAT
CACCGGTGAAACTTTGGTCGTCGCTGGAGGAATGCCCTCAAGACTCTAAACCAAGTAATA
GTTTAAGAAAAAACTAATTATAATGAAAGTCATTTTATTTTGAGTTTTCACGAAATAAGA
TTTTTAAGAAAAACAAAAGAAGTTATAATAATATACCATAAAACCATTATACCTTTGTTT
GGTTCTTTATAC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 5

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TACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAAAAGGATACTCAAATCCAAAAAACACTTATTA
TTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATAATT
CGTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCACAATT
TACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCCAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACC
ACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGT
TCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCCCAA
CCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCAGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGTCCT
GGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAACCATCTCA
TTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGCTCACGGAAGTCTGACTTTGTC
AACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGCCCG
TCTCCCCACATCTCAAACCTATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAGCTGGA
GCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACCTTCCA
ATGCGGCACTCAATGCCAAAATCTTTGTTGTAATGCTTGCACAGCTCCTCCGTTGCAAGT
TTCTCCAAACCATAAGCATCTTGAGGCTCAGCAGGCCAAGCATCTGACTCCTTGAGGCTC
ACATTGGTAGTTTCCAGCTGCTTGAACTCCGGGTAGATACATGCACTTGAAGCATAGAAG
AACCTCTTGATTCCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G391JQ U 1
AF RR4BJ38JQ U 260
AF RR4FQ16JQ U 100
AF RR4G391TF C 1
AF RR4BJ38TF C 166
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TACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAAAAGGATACTCAAATCCAAAAAACACTTATTA
TTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATAATT
CGTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCACAATT
TACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCCAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACC
ACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGT
TCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCCCAA
CCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCAGAGTT

QA 1 455 1 455
DS 

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GCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGG
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GATTGTTGTCAGAGTTACGGC

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DS 

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CCTTATATCTAAAACATAATTCGTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAG
TAGTGAAACCCATCCACAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCCAGCTGA
ACCGGTGCTTGAGTCCCAACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTA
GCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCAAAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTC
AATCTCATTGTTGGAGCCCAACCAAGCTTCTCTTTGATCAAATTGTTGTCAAAATTACGG
CCACGAACACCTTCAGGTCCTGGAATG

QA 1 387 1 387
DS 

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TACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGAAGGATACTCAAATCCAAAAAACACTTATTA
TTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATAATT
CGTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCACAATT
TACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCCAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACC
ACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGT
TCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCCCAA
CCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCAGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGTCCT
GGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCATCTCA
TTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGCTCACGGAAGTCTGACTTTGTC
AACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGCCCG
TCTCCCCACATCTCAAACC
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4BJ38TF 811 0 0
ATCTAAAACATAATTCGTGAC*TTAAATTATTAAATAAGGCCAAGATTTGATAGTAGTGA
AACCCATCCACAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCCAGCTGAACCGGT
GCTTGAGTCCCAACCACTTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGC*TTC
TCTT*CTCAATCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTC
ATTGTTGGAGCCCAACCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCAGAGTTACGGCCACGA
ACACCTTCAGGTCCTGGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACC
ATCTCAACCATCTCATTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGTTCACGG
AAGTCTGACTTTGTCAACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAA
CGGGTCTGAAGCCCGTCTCCCCACATCTCAAACCTATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTG
CAGAAAGCAGCTGGAGCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATG
TTGTGGAACCTTCCAATGCGGCACTCAATGCCAAAATCTTTGTTGTAATGCTTGCACAGC
TCCTCCGTTGCAAGTTTCTCCAAACCATAAGCATCTTGAGGCTCAGCAGGCCAAGCATCT
GACTCCTTGAGGCTCACATTGGTAGTTTCCAGCTGCTTGAACTCCGGGTAGATACATGCA
CTTGAAGCATAGAAGAACCTCTTGATTCCAC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 8

CO CL640Contig1 1106 8 13 U
AAAATAGAAATACACATATAGAATATCTCTTATAATTTCCCAATATTTGCAATCTATTAA
ACCGAGAAGAAACATACAAGCGTGAAATCCAAATCCGGCGGAAGCACATTAAAATCTC*C
GGAAACTTAGCCCACAAATGGGAAACATGAACCCAAACAACAGGCAACACATACAACAAC
TACATGATCATTAGATAAAGCCACACTCCTACATCTAAACCCATAAACAATCCATAAGCA
GAGGAAAGAAGAAAGTCTTCTTATCATTGAACAGCCGGAGCTCTTGCCGAACCACACAAG
CACAAGAGAGAGTAAGCAATGCAGTGACCAACACGAGTACACAACTACTCGAGACTAAAA
CGTACCTGAACCTCTAGTTCAGGGTACCAAGCCAGAACCACTAAGCACCATCAAATCGAG
AAGAAACAAACACCCGAGATTAAAACCCCCTTCTCAACCGAACCTTCATCGGAAAGTCTA
AACCCTCAACCTCTTTATAATGCTTTACCAAACAGAAGCCAACAAGGAACAAGAGAGACC
TAAGACTATCCGGGAAACACTTATTAAAAGGCTGGGAGAAAGGCTCCTTCCTAACTGAGA
TGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCTGAAGAATAATAGGCCTGTTCTGCTCACCACA
CAACACCATACCACCAATACACCACCGCTTACACCGTTACTGAAACAAGACAGAAGACAA
CCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGATTCAACATCTCGAGATAAAGAGTAGAGGACC
CAGATCTGAGAAAACTCGAAACCCGTTCCATCCATTGATCTTCACGACTGCTAGACACGA
CCTCCACTTCAAACACGAAGAGAGACAAACCTAGAAACTTCTTCACTTCTCAGACAGTAT
GAAGCTAATGGGGAAGAGATGGCGCCAGAGAACAGGCTAAGAAACACCAACCACTACAAA
ACATATATGAAAGAAGACAAGAGAGCATCTCCGGTGCCGGCGAGGAGCGCCAAGCACCGG
AGAACGGTGGATCTGGATCGGGAGGGGGCTTGGAGGCGCACTTGGTTGAGAGAGATATTA
GGGTTTTTTGTGTAAAGAGTTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 15 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GF23JQ U 39
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AF RR4GP17JQ U 1
AF RR4BK41JQ U 39
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RD RR4GF23JQ 651 0 0
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TAGGCCTGTTCTGCTCACCACACAACACCATACCACCAATACACCACCGCT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4C153JQ 732 0 0
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*CGGAAACTTAGCCCACAAATGGGAAACATGAACCCAAACAACAGGCAACACATACAACA
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AACGTACCTGAACCTCTAGTTCAGGGTACCAAGCCAGAACCACTAAGCACCATCAAATCG
AGAAGAAACAAACACCCGAGATTAAAACCCCCTTCTCAACCGAACCTTCATCGGAAAGTC
TAAACCCTCAACCTCTTTATAATGCTTTACCAAACAGAAGCCAACAAGGAACAAGAGAGA
CCTAAGACTATCCGGGAAACACTTATTAAAAGGCTGGGAGAAAGGCTCCTTCCTAACTGA
GATGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCTGAAGAATAATAGGCCTGTTCTGCTCACCT
CACAACACCATACCACCAATACACCACCGCTTACACCGTTACTGAAACAAGACAGAAGAC
AACCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGATTCAACATCTCGAGATAAAGAGTAGAGGA
CCCAGATCTGAG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4GP17JQ 846 0 0
AAAATAGAAATACACATATAGAATATCTCTTATAATTTCCCAATATTTGCAATCTATTAA
ACCGAGAAGAAACATACAAGCGTGAAATCCAAATCCGGCGGAAGCACATTAAAATCTC*C
GGAAACTTAGCCCACAAATGGGAAACATGAACCCAAACAACAGGCAAAACATACAACAAC
TACATGATCATTAGATAAAGCCACAATCCTACATCTAAACCCATAAACAATCCATAAGCA
GAGGAAAGAAGAAAGTCTTCTTATCATTGAACAGCCGGAGCTCTTGCCGAACCACACAAG
CACAAGAGAGAGTAAGCAATGCAGTGACCAACACGAGTACACAACTACTCGAGACTAAAA
CGTACCTGAACCTCTAGTTCAGGGTACCAAGCCAGAACCACTAAGCACCATCAAATCGAG
AAGAAACAAACACCCGAGATTAAAACCCCCTTCTCAACCGAACCTTCATCGGAAAGTCTA
AACCCTCAACCTCTTTATAATGCTTTACCAAACAGAAGCCAACAAGGAACAAGAGAGACC
TAAGACTATCCGGGAAACACTTATTAAAAGGCTGGGAGAAAGGCTCCTTCCTAACTGAGA
TGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCTGAAGAATAATAGGCCTGTTCTGCTCACCACA
CAACACCATACCACCAATACACCACCGCTTACACCGTTACTGAAACAAGACAGAAGACAA
CCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGATTCAACATCTCGAGATAAAGAGTAGAGGACC
CAGATCTGAGAAA*CTCGAA*CCCGTTCCATCCATTGATCTTCACGACTGCTAGACACGA
CCTCCA

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4BK41JQ 812 0 0
CCCAATATTTGCAATCTATTAAACCGAGAAGAAACATACAAGCGTGAAATCCAAATCCGG
CGGAAGCACATTAAAATCTC*CGGAAACTTAGCCCACAAATGGGAAACATGAACCCAAAC
AACAGGCAACACATACAACAACTACATGATCATTAGATAAAGCCACACTCCTACATCCAA
ACCCATAAACAATCCATAAGCAGAGGAAAGAAGAAAGTCTTCTTATCATTGAACAGCCGG
AGCTCTTGCCGAACCACACAAGCACAAGAGAGAGTAAGCAATGCAGTGACCAACACGAGT
ACACAACTACTCGAGACTAAAACGTACCTGAACCTCTAGTTCAGGGTACCAAGCCAGAAC
CACTAAGCACCATCAAATCGAGAAGAAACAAACACCCGAGATTAAAACCCCCTTCTCAAC
CGAACCTTCATCGGAAAGTCTAAACCCTCAACCTCTTTATAATGCTTTACCAAACAGAAG
CCAACAAGGAACAAGAGAGACCTAAGACTATCCGGGAAACACTTATTAAAAGGCTGGGAG
AAAGGCTCCTTCCTAACTGAGATGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCTGAAGAATAA
TAGGCCTGTTCTGCTCACCACACAACACCATACCACCAATACACCACCGCTTACACCGTT
ACTAAAACAAGACAGAAGACAACCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGATTCAACATC
TCGAGATAAAGAGTAGAGGACCCAGATCTGAGAAAACTCGAAACCCGTTCCATCCATTGA
TATTCACGACTGCTAGACACGACCTCCACTTC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4BK41TF 758 0 0
C
ACACGAGTACACAACTACTCGAGACTAAAACGTAC*TGAAC*TCTAGTTCAGG*TACCAA
GCCAGAACCACTAAGCACCATCAAATCGAGAAGAAACAAACACCCGAGATTAAA*CCCCT
TTCTCAACCGAACTTTCATCGGAAAGTCTAAACCCTCAACCTCTTTATAATGCTTTACCA
AACAGAAGCCAACAAGGAACAAGAGAGACCTAAGACTATCCGGGAAACACTTATTAAAAG
GCTGGGAGAAAGGCTCCTTCCTAACTGAGATGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCTG
AAGAATAATAGGCCTGTTCTGCTCACCACACAACACCATACCACCAATACACCACCGCTT
ACACCGTTACTAAAACAAGACAGAAGACAACCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGAT
TCAACATCTCGAGATAAAGAGTAGAGGACCCAGATCTGAGAAAACTCGAAACCCGTTCCA
TCCATTGATATTCACGACTGCTAGACACGACCTCCACTTCAAACACGAAGAGAGACAAAC
CTAGAAACTTCTTCACTTCTCAGACAGTATGAAGCTAATGGGGAAGAGATGGCGCCAGAG
AACAGGCTAAGAAACACCAACCACTACAAAACATATATGAAAGAAGACAAGAGAGCATCT
CCGGTGCCGGCGAGGAGCGCCAAGCACCGGAGAACGGTGGATCTGGATCGGGAGGGGGCT
TGGAGGCGCACTTGGTTGAGAGAGATATTAGGGTTTT

QA 2 758 2 758
DS 

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ACAGAAGCCAACAAGGAACAAGAGAGACCTAAGACTATCCGGGAAACACTTATTAAAAGG
CTGGGGGAAAGGCTCCTTCCTAACTGAGATGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCTGA
AGAATAATAGGCCTGTTCTGCTCACCACACAACACCATACCACCAATACACCACCGCTTA
CACCGTTACTGAAACAAGACAGAAGACAACCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGATT
CAACATCTCGAGATAAAGAGTAGAGGACCCAGATCTGAGAAAACTCGAAACCCGTTCCAT
CCATTGATCTTCACGACTGCTAGACACGACCTCCACTTCAAACACGAAGAGAGACAAACC
TAGAAACTTCTTCACTTCTCAGACAGTATGAAGCTAATGGGGAAGAGATGGCGCCAGAGA
ACAGGCTAAGAAACACCAACCACTACAAAACATATATGAAAGAAGACAAGAGAGCATCTC
CGGTGCCGGCGAGGAGCGCCAAGCACCGGAGAACGGTGGATCTGGATCGGGAGGGGGCTT
GGAGGCGCACTTGGTTGAGAGAGATATTAGGGTTTTTTG
CGTCC

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DS 

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GGCTGGGAGAAAGGCTCCTTCCTAACTGAGATGGAGAGGTGACAGGAAATTGAAACTTCT
GAAGAATAATAGGCCTGTTCTGCTCACCACACAACACCATACCACCAATACACCACCGCT
TACACCGTTACTGAAACAAGACAGAAGACAACCACTCAAACCCAGCCAGGAAATCATAGA
TTCAACATCTCGAGATAAAGAGTAGAGGAGCCAGATCTGAGAAAACTCGAAACCCGTTCC
ATCCATTGATCTTCACGACTGCTAGACACGACCTCCACTTCAAACACGAAGAGAGACAAA
CCTAGAAACTTCTTCACTTCTCAGACAGTACGAATCTAATGGGGAAGAGATGGCGCCAGA
GAACAGGCTAAGAAACACCAACCACTACAAAACATATATGAAAGAAGACAAGAGAGCATC
TCCGGTGCCGGCGAGGAGCGCCAAGCACCGGAGAACGGTGGATCTGGATCGGGAGGGGGC
TTGGAGACGCACTTGGTTGAGAGAGATATTAGGGTTTTTTGTGTAAAGAGTTGTCCC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4C153TF 216 0 0
TCAGACAGTATGAAGCTAATGGGGAAGAGATGGCGCCAGAGAACAGGCTAAGAAACACCA
ACCACTACAAAACATATATGAAAGAAGACAAGAGAGCATCTCCGGTGCCGGCGAGGAGCG
CCAAGCACCGGAGAACGGTGGATCTGGATCGGGAGGGGGCTTGGAGGCGCACTTGGTTGA
GAGAGATATTAGGGTTTTTTGTGTAAAGAGTTGTCC

QA 1 216 1 216
DS 



AS 2 9

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GAGCTAACTCAGGCAATTGTACGTTTGTTTCAAACAAACTTATAAAAAAAACAAAGCCGA
GCTAGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCGTGTAACGAACTCATCACTTGCATT
CCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATCACTTTCCACACGTTCTTAAGAT
AATCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCA
CCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACTAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAA
CCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACAG
CAGCACCTTCCGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCAAGTGAACCAAAATGAGTATCAA
TAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGAT
TCTTCCAGAAAATAGAATGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGTGCTCTGCA
GCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCAT
TGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGGTGATGGATCTGCATGATCTCGC
CGCTTATCGCCGGCTCCAGCGCGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCT
GGATTCCTCTGAATCTTAGAAGCCTTGAAGATGTCTCCTTTAGGCCGGTTAGGGTTCTTC
TGCTCGCTACGGAACGAATCGCCATTGTTGATAGATAGATAGATGATGGGATGCACAACA
CACAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 15 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DM34JQ U 1
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AF RR4GK42JQ U 21
AF RR4EM37TF C 142
AF RR4GK42TF C 187
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RD RR4DM34JQ 492 0 0
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TAGCTCCACCAA

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4FB74JQ 544 0 0
AA
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AAAAA*CAAAGCCGAGCTAGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCGTGTAACGAA
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CAAAATGAGTATCAATAGCTCCACTAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCT
TGACAGGAGCAAGGTTCTTCCAGAAAATAGAATGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACT
TG

QA 3 544 3 544
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RD RR4EM37JQ 585 0 0
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CCTTTCGTCACTAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCT
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TTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGTGCTCTGCAGCTTA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4GK42JQ 697 0 0
AAAACAACGTTTATATTATTGCAACCACACACGGTCAACTGAGCTAACTCAGGCAATTGT
ACGTTTGTTTCAGACAAACTTATAAAAAAAACAAAGCCGAGCTAGGAACTGGTTCCTCTC
TTTATGTTTGTTATCGTGTAACGAACTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTT
GCATATTTCCAGTTGATCACTTTCCACACGTTCTTAAGATAATCCGGCCTCACATTCTTG
TACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCT
CCTTTCGTCACTAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCT
TTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCCGCACTCATC
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TTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATAGAATGG
TTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGTGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCG
TCTCCCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAA
GCCTGGTGATGCTTCTGGTGATGGATCTGCATGATCT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4EM37TF 767 0 0
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CATATTTCCAGTCGATCACTTTCCACACGTTCTTAAGATAATCCGGCCTCACATTCTTGT
ACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTC
CTTTCGTCACTAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTT
TGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCCGCACTCATCT
TCTTCACCAGACCTTCAAGTGAACCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCT
TCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATAGAATGGT
TCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGTGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGT
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CCTGGTGATGCTTCTGGTGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTTATCGCCGGCTCCAGCG
CGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTCCTCTGAATCTTAGAA
GCCTTGAAGATGTCTCCTTTAGGCCGGTTAGGGTTCTTCTGCTCGCTACGGAACGAGTCG
CCATTGTTGATAGATAGATAGATGATGGGATGCACAACACACAGTCC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4GK42TF 722 0 0
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GAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACTAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAA
GCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCAC
CTTCCGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCAAGTGAACCAAAATGAGTATCAATAGCTC
CACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCC
AGAAAATAGAATGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGTGCTCTGCAGCTTAA
CGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGT
AATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGGTGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTTA
TCGCCGGCTCCAGCGCGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTC
CTCTGAATCTTAGAAGCCTTGAAGATGTCTCCTTTAGGCCGGTTAGGGTTCTTCTGCTCG
CTACGGAACGAATCGCCATTGTTGATAGATAGATAGATGATGG*ATGCACAACACACAGT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL641Contig2 776 3 4 U
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AGCGGGCCTCAAGGAGACATCTTCGAGGCTTCTAGGATTCCGATCAATCCAGACCTTCAC
GCTTCCTGACCTCCCCTATGATTACAGCGCATTGGAGCCGGCGATCAGCGGCGAGATCAT
GCAGATCCATCACCAGAAGCACCACCAGGCTTACGTCACTAATTACAACAATGCCCTCGA
GCAGCTCGATCAGGCTGTCAACAAGGGAGACGCTTCCGCCGTCGTTAAGCTGCAGAGCGC
CATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCATTCTATTTTCTGGAAGAACCTTGCTCC
TGTCAAGGAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGATCTCTTAGTGGAGCTATTGATACTCA
TTTTGGCTCTCTCGAAGGTTTGGTGAAGAAGATGAGTGCTGAAGGTGCTGCTGTGCAAGG
CTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAAGAGCTTAAGAAGCTTGTGGTTGACACAAC
CGCAAATCAGGATCCACTTGTGACGAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTCTGGTGGGTATAGA
TGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTGCAGTACAAGAATGTGAGGCCGGATTATCTGAAGAA
CGTGTGGAAAGTGATCAACTGGAAATATGCAAGCGAAGTTTATGAGAAGGATGCAAGTGA
TGAGTTCGTTACACGATACAAACATAAGAGAGGACCAGTCCTAGCTCGGCTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4G306TF U 2
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DS 

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CAGGATCCACTTGTGACGAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTCTGGTGGGTATAGATGTTTGG
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GTTACACGATA

QA 7 737 7 737
DS 



AS 1 5

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GTTTGGCTTTTGATATATTTGAGTTATGGTTTTATCAGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4AW76TF U 1
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AF RR4C162JQ C 653
AF RR4C162TF U 653
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CCTTTCATCACCACTGAGTACATGACGTACATGTTCGAGTACGACAGTGTTCACGGTCAA
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TTCGTTGTTGAGTCTACCGGTGTTTTCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAG
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CCACTAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTTATCAACGACGGGTTCGGCATTGTTTGAG
GGGTCTTATGACCACAGTCCACTCCATCACTGCTACTCAGAAGACTGTTGATGGACCATC
AA*TGAAGGACTGGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCGTTCAACATCATTCTCAGCAGTACC
GGAGCTGCCAA*GGCTGTCGGGAAGGTGCTTCCACAGCTCAA*CGGAAA*GTTGACCGGA
*TGTCCTTCCGTGTTCCAACCGTCGATGTCCTCAGTTGTTGAACTCACGGTTAGACTACA
GAAAGCTGCA*CCTACGACGAGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4AW76JQ 482 0 0
TCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAGGGGTGGTGCCAAGAAGGTTGTCATC
TCTGCCCC*GAGCAAAGACGCTCCCATGTTTGTCGTTGGTGTCAACGAGCACGAGTACAA
GTCTGACCTTGACATTGTCTCCAACGCTAGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCCCTTGC
CAAGGTTATCAACGACGGGTTCGGCATTGTT*GAGGGGTCTTATGACCACAGTCCACTCC
ATCACTGCTACTCAGAAGACTGTTGATGGACCATCAAATGAAGGACTGG*AGAGGTGGAA
GAGCTGCTTCGTTCAACATCATTCCCAGCAGTACCGGAGCTGCCAAAGGCTGTCGGGAAG
GTGCTTCCACAGCTCAAACGGAAAAGTTGACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCCAACCGTCG
ATGTC*TCAGTTGTTGAACTCACGGTTAGACTACAGAAAGCTGCAACCTACGACGAGATC
AA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4C162JQ 524 0 0
G
GACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCCAACCGTCGATGTC*TCAGTTGTTGACCTCACGGTTA
GACTACAGAAAGCTGCAACCTACGACGAGATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAGG
GCAAGCTAAAGGGAATCCTTGGATACACCGAGGATGATGTGGTCTCAACTGACTTCGTTG
GTGGCAGCAGGTCGAGCATTTTCGATGCCAAGGCTGGAATCGCATTGAGTGACAACTTCG
TGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGA
TCGTCCACATGTCAAAGTGCTAAATCTGAGAAGATGATCTGGAATGATGTTTGGAGGAAG
TTTGAATCTGTTGTTTTTGAATAAATTTTCTTGGGGGTTTTATAACTCTTTGTTGGGTTT
TGGCTACTATCCCTCACTTTTACTCTGAGTCTGTAGCACGGTTGTTTTACGGAGAATAGC
CCTTTACGTTTGGCTTTTGATATATTTGAGTTATGGTTTTATC

QA 2 524 2 524
DS 

RD RR4C162TF 524 0 0
G
GACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCCAACCGTCGATGTC*TCAGTTGTTGACCTCACGGTTA
GACTACAGAAAGCTGCAACCTACGACGAGATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAGG
GCAAGCTAAAGGGAATCCTTGGATACACCGAGGATGATGTGGTCTCAACTGACTTCGTTG
GTGGCAGCAGGTCGAGCATTTTCGATGCCAAGGCTGGAATCGCATTGAGTGACAACTTCG
TGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGA
TCGTCCACATGTCAAAGTGCTAAATCTGAGAAGATGATCTGGAATGATGTTTGGAGGAAG
TTTGAATCTGTTGTTTTTGAATAAATTTTCTTGGGGGTTTTATAACTCTTTGTTGGGTTT
TGGCTACTATCCCTCACTTTTACTCTGAGTCTGTAGCACGGTTGTTTTACGGAGAATAGC
CCTTTACGTTTGGCTTTTGATATATTTGAGTTATGGTTTTATC

QA 2 524 2 524
DS 

RD RR4GE02TF 328 0 0
GT
GATGCCAAGGCTGGAATCGCATTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGAC
AACGAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGATCATCCACATGTCAAAGTGCTAA
ATCTGAGAAGATGATCTGGAATGATGTTTGGAGGAAGTTTGAATCTGTTGTTTTTGAATA
AATTTTCTTGGGGGTTTTATAACTCTTTGTTGGGTTTTGGCTACTATCCCTCACTTTTAC
TCTGAGTCTGTAGCACGGTTGTTTTACGGAGAATAGCCCTTTACGTTTGGCTTTTGATAT
ATTTGAGTTATGGTTTTATCAGATTT

QA 3 328 3 328
DS 



AS 1 9

CO CL643Contig1 1383 9 15 U
GCAAAGGCAAAGAGAGCTACACGTTTGAAAATCGAAATATCCGTTCTTTTTCTAATACCG
AGATGGCGGAGAAGCCGGCGCAGGAGCGGGAGCAGGAGCAGAAGCCAGCGATGGAACCGG
CGGTTCTAGACGATATCATCCGCCGTCTGGTAGAGTTTAGGAACACGAGGCCTGGATCTG
GGAAGCAAGTTCACCTCAGCGAAGGTGAAATCCGTCAGCTCTGTGCTGTCTCCAAAGAAA
TCTTTCTTCAACAACCTAATCTCCTCGAACTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATA
TTCATGGGCAGTATTCAGATCTATTGAGGCTATTTGAATATGGAGGCTTCCCTCCAGAAG
CCAATTATTTGTTCCTAGGTGATTACGTGGACCGTGGCAAGCAAAGCTTGGAGACAATAT
GCCTTCTCTTAGCATACAAAATCAAGTACCCTGAGAACTTCTTCTTGCTGAGAGGGAACC
ATGAATCTGCTTCCATCAATCGTATCTACGGGTTCTATGACGAGTGCAAACGCAGGTTCA
ACGTCAGG*CTCTGGAAGATATTCACCGATTGCTTCAACTGTCTTCCTGTGGCCGCTTTG
ATCGATGACAGGATACTGTGTATGCACGGTGGGATCTCCCC*GGAGTTGACGAGCTTGGA
CCAGATCAGGAACATCTCACGCCCAATGGATATTCCTGAATCAGGTTTGGTATGTGATTT
GCTCTGGTCGGATCCTAGTGCAGACGTCAAAGGATGGGGGGTGAATGATCGTGGTGTTTC
GTACACTTTTGGAGCTGACATT*GTTGCAGAGTTTTTGCAAAAAAA*TGACGTGGACCTT
ATCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTTGAAGATGGGTATGAGTTCTTTGCAGACAGACAGCTT
GTTACTGTATTTTCAGCTCCCAACTATTGCGGAGAGTTTGACAATGCTGGCGCAATGATG
AGCATTGACGAGAGCTTAATGTGCTCATTCCAAATTTTAAAGCCGTCGGATAAGAGATCA
TCACCGTTT*CTATGACAGGCAATCATCTAAGTTACCTCCATGCTTCAAGTTTAACATTA
CTCCAAAAAGCTGTACACTGGGGAGAGAGGATCTAGAAGCAGAAACTACTCAACTGTAAC
CTTAGTGGTTCTCCTGATGATAGAACACTTAAGCAAAAAACGCAGAGACGGTCTCCAACA
GAGTAAACCATTCAGGTCTCTACTGTAATTTTAGCTTCTTCTCACATCTATCTCCATGTT
TGTCTAAAACGTGTGTTTTCTTCTTCTTTCTGGATAATCTTTAGATTCTCTCATTTCTAC
ACACTTATTTTTTATGAAACTCCCAAGGACAAAACTTTTCTAGAGTCCCTAGTTTTCTTC
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B404TF U 1
AF RR4FE30TF U 82
AF RR4EN17TF U 442
AF RR4H809TF U 772
AF RR4EK74TF U 442
AF RR4B404JQ C 455
AF RR4FE30JQ C 847
AF RR4EK74JQ C 643
AF RR4EN17JQ C 660
BS 1 286 RR4B404TF
BS 287 287 RR4FE30TF
BS 288 665 RR4B404TF
BS 666 693 RR4FE30TF
BS 694 694 RR4EK74TF
BS 695 704 RR4FE30TF
BS 705 705 RR4EK74TF
BS 706 752 RR4FE30TF
BS 753 1172 RR4EK74TF
BS 1173 1234 RR4B404JQ
BS 1235 1235 RR4EK74JQ
BS 1236 1352 RR4B404JQ
BS 1353 1353 RR4EK74JQ
BS 1354 1367 RR4B404JQ
BS 1368 1383 RR4EK74JQ

RD RR4B404TF 665 0 0
GCAAAGGCAAAGAGAGCTACACGTTTGAAAATCGAAATATCCGTTCTTTTTCTAATACCG
AGATGGCGGAGAAGCCGGCGCAGGAGCGGGAGCAGGAGCAGAAGCCAGCGATGGAACCGG
CGGTTCTAGACGATATCATCCGCCGTCTGGTAGAGTTTAGGAACACGAGGCCTGGATCTG
GGAAGCAAGTTCACCTCAGCGAAGGTGAAATCCGTCAGCTCTGTGCTGTCTCCAAAGAAA
TCTTTCTTCAACAACCTAATCTCCTCGAACTCGAAGCTCCCATCAATATCTGCGGTGATA
TTCATGGGCAGTATTCAGATCTATTGAGGCTATTTGAATATGGAGGCTTCCCTCCAGAAG
CCAATTATTTGTTCCTAGGTGATTACGTGGACCGTGGCAAGCAAAGCTTGGAGACAATAT
GCCTTCTCTTAGCATACAAAATCAAGTACCCTGAGAACTTCTTCTTGCTGAGAGGGAACC
ATGAATCTGCTTCCATCAATCGTATCTACGGGTTCTATGACGAGTGCAAACGCAGGTTCA
ACGTCAGG*CTCTGGAAGATATTCACCGATTGCTTCAACTGTCTTCCTGTGGCCGCTTTG
ATCGATGACAGGATACTGTGTATGCACGGTGGGATCTCCCC*GGAGTTGACGAGCTTGGA
CCAGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4FE30TF 680 0 0
CGGCGCA
GGAGCGGGAGCAGAAGCCAGCGATGGAACCGGCGGTTCTAGACGATATCATCCGCCGTCT
GGTAGAGTTTAGGAACACGAGGCCTGGATCTGGGAAGCAAGTTCACCTCAGCGAAGGTGA
AATCCGTCAGCTCTGTGCTGTCTCCAAAGAAATCTTTCTTCAACAACCTAATCTCCTCGA
ACTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCATGGGCAGTATTCAGATCTATTGAG
GCTATTTGAATATGGAGGCTTCCCTCCAGAAGCCAATTATTTGTTCCTAGGTGATTACGT
GGACCGTGGCAAGCAAAGCTTGGAGACAATATGCCTTCTCTTAGCATACAAAATCAAGTA
CCCTGAGAACTTCTTCTTGCTGAGAGGGAACCATGAATCTGCTTCCATCAATCGTATCTA
CGGGTTCTATGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAACGTCAGGGCTCTGGAAGATATTCACCG
ATTGCTTCAACTGTCTTCCTGTGGCCGCTTTGATCGATGACAGGATACTGTGTATGCACG
GTGGGATCTCCCCCGGAGTTGACGAGCTTGGACCAGATCAGGAACATCTCACGCCCAATG
GATAT*CCTGAATCAG*TTTGGTATGTGATTTGCTCTGGTCGGATCCTAGTGCAGACGTC
AAAG
ATGGGGGGG

QA 8 671 8 671
DS 

RD RR4EN17TF 697 0 0
G
CAAGTACCCTGAGAACTTCTTCTTGCTGAGAGGGAACCATGAATCTGCTTCCATCAATCG
TATCTACGGGTTCTATGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAACGTCAGG*CTCTGGAAGATAT
TCACCGATTGCTTCAACTGTCTTCCTGTGGCCGCTTTGATCGATGACAGGATACTGTGTA
TGCACGGTGGGATCTCCCC*GGAGTTGACGAGCTTGGACCAGATCAGGAACATCTCACGC
CCAATGGATATTCCTGAATCAGGTTTGGTATGTGATTTGCTCTGGTCGGATCCTAGTGCA
GACGTCAAAGGATGGGGGGTGAATGATCGTGGTGTTTCGTACACTTTTGGAGCTGACATT
*GTTGCAGAGTTTTTGCAAAAAAA*TGACGTGGACCTTATCTGCCGTGCCCACCAGGTTG
TTGAAGATGGGTATGAGTTCTTTGCAGACAGACAGCTTGTTACTGTATTTTCAGCTCCCA
ACTATTGCGGAGAGTTTGACAATGCTGGCGCAATGATGAGCATTGACGAGAGCTTAATGT
GCTCATTCCAAATTTTAAAGCCGTCGGATAAGAGATCATCACCGTTT*CTATGACAGGCA
ATCATCTAAGTTACCTCCATGCTTCAAGTTTAACATTACTCCAAAAAGCTGTACACTGGG
GAGAGAGGATCTAGAAGCAGAAACTACTCAACTGTA

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR4H809TF 318 0 0
TGGTGTTTCGTACACTTTTGGAGCTGACATTTGTTGCAGAGTTTTTGCAAAAAAAATGAC
ATGGACCTTATCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTTGAAGATGGGTATGGGTTCTTTGCAGAC
AGACAGCTTGTTACTGTATTTTCAGCTCCCAACTATTGCGGAGAGTTTGACAATGCTGGC
GCAATGATGAGCATTGACGAGAGCTTAATGTGCTCATTCCAAATTTTAAAGCCGTCGGAT
AAGAGATCATCACCGTTTTCTATGACAGGCAATCATCTAAGTTACCTCCATGCTTCAAGT
TTAACATTACTCCAAAAA

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4EK74TF 731 0 0
G
CAAGTACCCTGAGAACTTCTTCTTGCTGAGAGGGAACCATGAATCTGCTTCCATCAATCG
TATCTACGGGTTCTATGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAACGTCAGG*CTCTGGAAGATAT
TCACCGATTGCTTCAACTGTCTTCCTGTGGCCGCTTTGATCGATGACAGGATACTGTGTA
TGCACGGTGGGATCTCCCC*GGAGTTGACGAGCTTGGACCAGATCAGGAACATCTCACGC
CCAATGGATATTCCTGAATCAGGTTTGGTATGTGATTTGCTCTGGTCGGATCCTAGTGCA
GACGTCAAAGGATGGGGGGTGAATGATCGTGGTGTTTCGTACACTTTTGGAGCTGACATT
*GTTGCAGAGTTTTTGCAAAAAAA*TGACGTGGACCTTATCTGCCGTGCCCACCAGGTTG
TTGAAGATGGGTATGAGTTCTTTGCAGACAGACAGCTTGTTACTGTATTTTCAGCTCCCA
ACTATTGCGGAGAGTTTGACAATGCTGGCGCAATGATGAGCATTGACGAGAGCTTAATGT
GCTCATTCCAAATTTTAAAGCCGTCGGATAAGAGATCATCACCGTTT*CTATGACAGGCA
ATCATCTAAGTTACCTCCATGCTTCAAGTTTAACATTACTCCAAAAAGCTGTACACTGGG
GAGAGAGGATCTAGAAGCAGAAACTACTCAACTGTAACCTTAGTGGTTCTCCTGATGATA
GAACACTTAA

QA 2 731 2 731
DS 

RD RR4B404JQ 913 0 0
GAACTTCTTCTTGCTGAGAGGGAACCATGAATCTGCTTCCATCAATCGTATCTACGGGTT
CTATGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAACGTCAGG*CTCTGGAAGATATTCACCGATTGCT
TCAACTGTCTTCCTGTGGCCGCTTTGATCGATGACAGGATACTGTGTATGCACGGTGGGA
TCTCCCC*GGAGTTGACGAGCTTGGACCAGATCAGGAACATCTCACGCCCAATGGATATT
CCTGAATCAGGTTTGGTATGTGATTTGCTCTGGTCGGATCCTAGTGCAGACGTCAAAGGA
TGGGGGGTGAATGATCGTGGTGTTTCGTACACTTTTGGAGCTGACATT*GTTGCAGAGTT
TTTGCAAAAAAA*TGACATGGACCTTATCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTTGAAGATGGGT
ATGAGTTCTTTGCAGACAGACAGCTTGTTACTGTATTTTCAGCTCCCAACTATTGCGGAG
AGTTTGACAATGCTGGCGCAATGATGAGCATTGACGAGAGCTTAATGTGCTCATTCCAAA
TTTTAAAACCGTCGGATAAGAGATCATCACCGTTT*CTATGACAGGCAATCATCTAAGTT
ACCTCCATGCTTCAAGTTTAACATTACTCCAAAAAGCTGTACACTGGGGAGAGAGGATCT
AGAAGCAGAAACTACTCAACTGTAACCTTAGTGGTTCTCCTGATGATAGAACATTTAAGC
AAAAAACGCAGAGACGGTCTCCAACAGAGTAAACCATTCAGGTCTCTACTGTAATTTTAG
TTTCTTCTCACATCTATCTCCATGTTTGTCTAAAACGTGTGTTTTCTTCTTCTTTCTGGA
TAATCTTTAGATTCTCTCATTTCTACACACTTATTTTTTATGAAACTCCCAAGGACAACA
CTTTTCTAGAGTC

QA 1 913 1 913
DS 

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GTATTTTCAGCTCCCAACTATTGCGGAGAGTTTGACAATGCTGGCGCAATGATGAGCATT
GACGAGAGCTTAATGTGCTCATTCCAAATTTTAAAGCCGTCGGATAAGAGATCATCACCG
TTT*TTATGACAGGCAATCATTTAAGTTACCTCCATGCTTCAAGTTTAACATTACTCCAA
AAAGCTGTACACTGGGGAGAGAGGATTTAGAAGCAGAAACTACTCAACTGTAACCTTAGT
GGTTTTCCTGATGATAGAACATTTAAGCAAAAAACGCAGAGACGGTCTCCAACAGAGTAA
ACCATTCAGGTCTTTACTGTAATTTTAGCTTCTTCTCACATCTATCTCCATGTTTGTTTA
AAACGTGTGTTTTTTTTTTCTTTCTGGATAATCTTTAGATTCTCTCATTTTTACACACTT
ATTTTTTATGAAACTCCCAAGGA
AAAAA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4EK74JQ 741 0 0
GGAGTTGACGAGCTTGGACCAGATCAGGAACATCTCACGCCCAATGGATATTCCTGAATC
AGGTTTGGTATGTGATTTGCTCTGGTCGGATCCTAGTGCAGACGTCAAAGGATGGGGGGT
GAATGATCGTGGTGTTTCGTACACTTTTGGAGCTGACATT*GTTGCAGAGTTTTTGCAAA
AAAA*TGACGTGGACCTTATCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTTGAAGATGGGTATGAGTTC
TTTGCAGACAGACAGCTTGTTACTGTATTTTCAGCTCCCAACTATTGCGGAGAGTTTGAC
AATGCTGGCGCAATGATGAGCATTGACGAGAGCTTAATGTGCTCATTCCAAATTTTAAAG
CCGTCGGATAAGAGATCATCACCGTTT*CTATGACAGGCAATCATCTAAGTTACCTCCAT
GCTTCAAGTTTAACATTACTCCAAAAAGCTGTACACTGGGGAGAGAGGATCTAGAAGCAG
AAACTACTCAACTGTAACCTTAGTGGTTCTCCTGATGATAGAACACTTAAGCAAAAAACG
CAGAGACGGTCTCCAACAGAGTAAACCATTCAGGTCTCTACTGTAATTTTAGCTTCTTCT
CACATCTATCTCCATGTTTGTCTAAAACGTGTGTTTTCTTCTTCTTTCTGGATAATCTTT
AGATTCTCTCATTTCTACACACTTATTTTTTATGAAACTCCCAAGGACAAAACTTTTCTA
GAGTCCCTAGTTTTCTTCACC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4EN17JQ 724 0 0
ACCAGATCAGGAACATCTCACGCCCAATGGATATTC*TGAATCAGGTTTGGTATGTGATT
TGCTCTGGTCGGATCCTAGTGCAGACGTCAAAGGATGGGGGGTGAATGATCGTGGTGTTT
CGTACACTTTTGGAGCTGACATT*GTTGCAGAGTTTTTGCAAAAAAA*TGACGTGGACCT
TATCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTTGAAGATGGGTATGAGTTCTTTGCAGACAGACAGCT
TGTTACTGTATTTTCAGCTCCCAACTATTGCGGAGAGTTTGACAATGCTGGCGCAATGAT
GAGCATTGACGAGAGCTTAATGTGCTCATTCCAAATTTTAAAGCCGTCGGATAAGAGATC
ATCACCGTTT*TTATGACAGGCAATCATCTAAGTTACCTCCATGCTTCAAGTTTAACATT
ACTCCAAAAAGCTGTACACTGGGGAGAGAGGATCTAGAAGCAGAAACTACTCAACTGTAA
CCTTAGTGGTTCTCCTGATGATAGAACACTTAAGCAAAAAACGCAGAGACGGTCTCCAAC
AGAGTAAACCATTCAGGTCTCTACTGTAATTTTAGCTTCTTCTCACATCTATCTCCATGT
TTGTCTAAAACGTGTGTTTTCTTCTTCTTTCTGGATAATCTTTAGATTCTCTCATTTCTA
CACACTTATTTTTTATGAAACTCCCAAGGACAAAACTTTTCTAGAGTCCCTAGTTTTCTT
CACC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 9

CO CL644Contig1 829 3 2 U
TTTTTCTCCCCTCTCGTCTCCAAACTTCTTCTTTGATCGTCTACGATCTCTTATCAATCC
CTACTCATCCAGAAGATCATTGCCTCGAGCATGGCATCGAAAGGGAACGATGATTTGTAT
GGTGTTCTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCACCACCGAGCTCCGTTCTGCTTACAAGAAG
CTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGGGATTCGGAGTTTGTAGAT
GAATCAAAGAAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGAGGCCTATTCTGGGAATGGGAGATTTTTG
AACGAGATGGCTACCATGATGAACCAGTCAAAGCCTAGTGAGAATAACTCAGTAGACAGG
TTTGAACAGTTACAAGATCTGTTCAATGAGATGTTTCAAGGAGACGCTTCAGCATTCTCC
TCATCTTCATCTTCTTCAACTTTCACTTCCTCTTGTAGCTTTGCTTTCGACACTAATGTT
CAGAAGTCACCGTTTGAGACAAACTCGAGGGGGATGAATGATCCTTTCGCGTTTGATCCC
AGAGCTCATCACACCTTCTCTTTAGGGGTGGAACATCAGCAGGATTTCAAGAAGGGGAAG
AACAATGGCGTGAGAAGAAACAGGAGGAAGAGCAATGCTCAGTCAGGTGCTCACGAGACG
TCTTCTTCAAACAACTACGGAGTCCCCACTTCATAGTCTTTTCGAAGACCATCTTTTTTT
TTTGCTAACTCATCTCCACATTTGTCGACTAGTCACACAGAAGAGGACTTGTTCTGGTCT
TCTCAACTCAAAGCGTTGTCGTTTGTAAACTACCCTTCTCGTTGGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV32TF U 7
AF RR4EV88TF U 1
AF RR4EV88JQ C 130
BS 1 467 RR4EV88TF
BS 468 829 RR4EV88JQ

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CTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCACCACCGAGCTCCGTTCTGCTTACAAGAAGCTTGCT
CTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGGGATTCGG

QA 1 223 1 223
DS 

RD RR4EV88TF 467 0 0
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CTACTCATCCAGAAGATCATTGCCTCGAGCATGGCATCGAAAGGGAACGATGATTTGTAT
GGTGTTCTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCACCACCGAGCTCCGTTCTGCTTACAAGAAG
CTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGGGATTCGGAGTTTGTAGAT
GAATCAAAGAAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGAGGCCTATTCTGGGAATGGGAGATTTTTG
AACGAGATGGCTACCATGATGAACCAGTCAAAGCCTAGTGAGAATAACTCAGTAGACAGG
TTTGAACAGTTACAAGATCTGTTCAATGAGATGTTTCAAGGAGACGCTTCAGCATTCTCC
TCATCTTCATCTTCTTCAACTTTCACTTCCTCTTGTAGCTTTGCTTT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR4EV88JQ 700 0 0
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AGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGGGATTCGGAGTTTGTAGATGAATCAAAG
AAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGAGGCCTATTCTGGGAATGGGAGATTTTTGAACGAGATG
GCTACCATGATGAACCAGTCAAAGCCTAGTGAGAATAACTCAGTAGACAGGTTTGAACAG
TTACAAGATCTGTTCAATGAGATGTTTCAAGGAGACGCTTCAGCATTCTCCTCATCTTCA
TTTTCTTCAACTTTCACTTCCTCTTGTAGCTTTGCTTTCGACACTAATGTTCAGAAGTCA
CCGTTTGAGACAAACTCGAGGGGGATGAATGATCCTTTCGCGTTTGATCCCAGAGCTCAT
CACACCTTCTCTTTAGGGGTGGAACATCAGCAGGATTTCAAGAAGGGGAAGAACAATGGC
GTGAGAAGAAACAGGAGGAAGAGCAATGCTCAGTCAGGTGCTCACGAGACGTCTTCTTCA
AACAACTACGGAGTCCCCACTTCATAGTCTTTTCGAAGACCATCTTTTTTTTTTGCTAAC
TCATCTCCACATTTGTCGACTAGTCACACAGAAGAGGACTTGTTCTGGTCTTCTCAACTC
AAAGCGTTGTCGTTTGTAAACTACCCTTCTCGTTGGTTCG

QA 1 700 1 700
DS 



CO CL644Contig2 1149 6 12 U
GGGGTTCTGGAGAGTTCCATTCTCTCTAAAACGTGTATGTTTGAGAGATACAGAGGAGAG
AAGAGGAGACACCAAAAAAAAAAAAACATTTTTCTCCCCTCTCGTCTCCAAACTTCTTCT
TTGATCGTCTACGATCTCTTATCAATCCCTACTCATCCAGAAGATCATTGCCTCGAGTAT
GGCATCGAAAGGGAACGATGATTTGTATGGTGTTCTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCAC
CACCGAGCTCCGTTCTGCTTACAAGAAGCTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTC
ATCAATGGGGGATTCGGAGTTTGTAGATGAATCAAAGAAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGA
GGCCTATTCTGTTTTGTCTGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTATGACGTTGGAGCTTACAA
TAGTGATGATGATGATCATGACCAAAACGGAATGGGAGATTTTTTGAACGAGATGGCTAC
CATGATGAACCAGTCAAAGCCTAGTGAGAATAACTCAGGAGACAGTTTTGAACAGTTACA
AGATCTGTTCAATGAGATGTTTCAAGGAGACGCTTCAGCATTCTCCTCATCTTCATCTTC
TTCAACTTTCACTTCCTCTTGTAGCTTTGCTTTCGACACTAATGTTCAGAAGTCACCGTT
TGAGACAAACTCGAGGGGGATGAATGATCCTTTCGCGTTTGATCCCAGAGCTCATCACAC
CTTCTCTTTAGGGGTGGAACATCAGCAGGATTTCAAGAAGGGGAAGAACAATGGCGTGAG
AAGAAACAGGAGGAAGAGCAATGCTCAGTCAGGTGCTCACGAGACGTCTTCTTCAAACAA
CTACGGAGTCCCCACTTCATAGTCTTTTCGAAGACCATCTTTTTTTTTTGCTAACTCATC
TCCACATTTGTCGACTAGTCACACAGAAGAGGACTTGTTCTGGTCTTCTCAACTCAAAGC
GTTGTCGTTTGTAAACTACCCTTCTCGTTGGTTCTCTCGGAGTTTTTATTTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTACTCTGTGATTGAATTGTTCTCCTAAGCAAGAGTCTTTAACAG
CATCTAGAGATTGATGAATTCAACGAATACTTGTCCTAAATTCTTAGTTGGTTTTCTCAA
CATTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4EY02TF U 52
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AF RR4AR81TF U 417
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TTCAACTTTCACTTCCTCTTGTAGCTTTGCTTTCGACACTAATGTTCAGAAGTCACCGTT
TGAGACAAACTCGAGGGGGATGAATGATCCTTTCGCGTTTGATCC*AGAGCTCATCACAC
CTTCTCT

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DS 

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G
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CATCACACCTTCTCTTTAGGG
TGGAACA

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CATGACCAAAACGGAATGGGAGAATTTTTGAACGAGATGGCTACCATGATGAACCAGTCA
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G
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DS 

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G
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AGCGTTGTCGTTTGTAAACTACCCTTCTCGTTGGTTCTCTCGGAGTTTTTATTTCTCTCT
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CAGCATCTAGAGATTGATGAATTCAACGAAT

QA 2 692 2 692
DS 

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TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 7

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AAGAACAA*GAATCGTTGCGCTTTCTTGTGAGATCTCCTCTTTTGAAAAAAACAAGAAAA
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AGAGGGATGAGTTCTTTGGTGTGTTGTTGTTGATGTACTATAACTATGTAGACTAATCTC
TTAATCCATGTTTTTTTTCTGTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 40 40 10 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

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TTGTAGATGGCAACACTGTGAATCTTGGATTGTGGGATACAGCTGGTCAAGAAGACTATA
ACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTA
TTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAAGAAGTGGATTCCTGAGCTTAGGCATTACG
CCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAACTAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGT
TCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAATCACTTCAAACCAGGGAGAGGA*CTAAAGA
AGCTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4D958TF 645 0 0
GG
ATTCATCTCTCTCATTGAACATTAACATCCCTTCTTCATTGTTCATTCTGCAATTCGAAT
TTTAGGGTTTCTTTTTTCTTCTAGAGTTAGTAGAAAAGTTCGCGACTTTATTGTTGGGTA
ATGGTTTGAGGAGAGAAAAGTCAAGAAGAAGTTTTTTTTTTGT*TTTTTTCGAATAAGCG
GCGGAGAATGAGTGCTTCGAGGTTCATAAAGTGTGTCACCGTCGGCGATGGCGCCGTCGG
AAAAACCTGTATGCTGATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTTCCAAC
AGTGTTCGACAACTTCAGTGCCAACGTGGTTGTAGATGGCAACACTGTGAATCTTGGATT
GTGGGATACAGCTGGTCAAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGC
AGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAA
GAAGTGGATCCCCGAGCTTAGGCATTACGCCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAAC
AAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAAT
CACTACAGACCAGGGAGAGGAACTAAAGAAGCTGATAGGATCT

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR4AM76TF 822 0 0
CTTCTAGAGTTAGTAGAAAAGTTCGCGACTTTATTGTTGGGTAATGGTTTGAGGAGAGAA
AAGTCAAGAAGAAGTTTTTTTTTTTTGTTTTTTCGAATTAGCGGCGGAGAATGAGTGCTT
CGAGGTTCATAAAGTGTGTCACCGTCGGCGATGGCGCCGTCGGAAAAACCTGTATGCTGA
TCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTTCCAACAGTGTTCGACAACTTCA
GTGCCAACGTGGTTGTAGATGGCAACACTGTGAATCTTGGATTGTGGGATACAGCTGGTC
AAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTTG
CTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAAGAAGTGGATTCCTGAGC
TTAGGCATTACGCCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAACTAAACTCGGTCTTCGAG
ATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAATCACTTCAAACCAGGGAG
AGGAACTAAAGAAGCTGATGGGATCTCCGGTTTACATTGAATGTAGTTCAAAGACGCAGC
AGAACGTGAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAA*GTGGTGCTTCAGCCCCCCAAGTCA
AAGAAGAAGAAAAAGAACAA*GAATCGTTGCGCTTTCTTGTGAGAT*TCCTCTTTTGAAA
AAA*CAAGAAAAAGTTTGGTAG*TAAGAAACGAAGCTGAAGAGAAGAAGAGAAAAAAA*C
GATTCAGAGCATCAA*TGCAGCGA*CTGTCTAGTTGTTGTTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AV08TF 797 0 0
G
AGAAAAGTTCGCGACTTTATTGTTGGGTAATGGTTTGAGGAGAGAAAAGTCAAGAAGAAG
TTTTTTTTTTGT**TTTTTCAAATTAGCGGCGGAGAATGAGTGCTTCGAGGTACATAAAG
TGTGTCACCGTCGGCGATGGCGCCGTCGGAAAAACCTGTATGCTGATCTCTTACACTAGC
AACACTTTCCCTACGGACTATGTTCCAACAGTGTTCGACAACTTCAGTGCCAACGTGGTT
GTAGATGGCAACACTGTGAATCTTGGATTGTGGGATACAGCTGGTCAAGAAGACTATAAC
AGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATT
AGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAAGAAGTGGATTCCTGAGCTTAGGCATTACGCC
CCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAACTAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGTTC
TTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAATCACTTCAAACCAGGGAGAGGAACTAAAGAAG
CTGATAGGATCTCCGGTTTACATTGAATGTAGTTCAAAGACGCAGCAGAACGTGAAAGCA
GTCTTTGACGCAGCTATAAAAAGTGGTGCTTCAGCCCCCCAAGTCAAAGAAGAAGAAAAA
GAACAAAGAATCGTTGCGCTTTCTTGTGAGATCTCCTCTTTTGAAAAAA*CAAGAAAAAG
TTTGGTAGGTAAGAAACGAAGCTGAAGAGAAGAAGAGAAAAAAA*CGATTCAGAGCATCA
A
TGCAGCGACTGTCTA

QA 2 782 2 782
DS 

RD RR4AV08JQ 695 0 0
AGTGTTCGACAACTTCAGTGCCAACGTGGTTGTAGATGGCAACACTGTGAATCTTGGATT
GTGGGATACAGCTGGTCAAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGC
AGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAA
GAAGTGGATTCCTGAGCTTAGGCATTACGCCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAAC
TAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAAT
CACTTCAAACCAGGGAGAGGAACTAAAGAAGCTGATAGGATCTCCGGTTTACATTGAATG
TAGTTCAAAGACGCAGCAGAACGTGAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAA*GTGGTGC
TTCAGCCCCCCAAGTCAAAGAAGAAGAAAAAGAACAA*GAATCGTTGCGCTTTCTTGTGA
GATCTCCTCTTTTGAAAAAAACAAGAAAAAGTTTGGTAGGTAAGAAACGAAGCTGAAGAG
AAGAAGAGAAAAAAAACGATTCAGAGCATCAAATGCAGCGAACTGTCTAGTTGTTGTTTG
TTCGGTTGAGAATCTAATCAGTAAGAAAGAGAGGGATGAGTTCTTTGGTGTGTTGTTGTT
GATGTACTATAACTATGTAGACTAATCT
CTTAATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4AM76JQ 773 0 0
GAAAAACCTGTATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTTCCAA
CAGTGTTCGACAACTTCAGTGCCAACGTGGTTGTAGATGGCAACACTGTGAATCTTGGAT
TGTGGGATACAGCTGGTCAAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTG
CAGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCA
AGAAGTGGATCCCTGAGCTTAGGCATTACGCCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAA
CTAAACTCGGTCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAA
TCACTTCAAACCAGGGAGAGGAACTAAAGAAGCTGATGGGATCTCCGGTTTACATTGAAT
GTAGTTCAAAGACGCAGCAGAACGTGAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAA*GTGGTG
CTTCAGCCCCCCAAGTCAAAGAAGAAGAAAAAGAACAA*GAATCGTTGCGCTTTCTTGTG
AGAT*TCCTCTTTTGAAAAAAACAAGAAAAAGTTTGGTAGGTAAGAAACGAAGCTGAAGA
GAAGAAGAGAAAAAAAACGATTCAGAGCATCAAATGCAGCGAACTGTCTAGTTGTTGTTT
GTTCGGTTGAGAATCTAATCAGTAAGAAAGAGAGGGATGAGTTCTTTGGTGTGTTGTTGT
TGATGTACTATAACTATGTAGACTAATCTCTTAATCCATGTTTTTTTTCTGTC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4FM27JQ 717 0 0
TCCAACAGTGTTCGACAACTTCAGTGCCAACGTGGTTGTAGATGGCAACACTGTGAATCT
TGGATTGTGGGATACAGCTGGTCAAGAATACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCG
TGGTGCAGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACAT
AGCCAAGAAGTGGATTCCTGAGCTTAGGCATTACGCCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGT
TGGAACTAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGT
ACCAATCACTTCAAACCAGGGAGAGGAACTAAAGAAGCTGATAGGATCTCCGGTTTACAT
TGAATGTAGTTCAAAGACGCAGCAGAACGTGAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAA*G
TGGTGCTTCAGCCCCCCAAGTCAAAGAAGAAGAAAAAGAACAA*GAATCGTTGCGCTTTC
TTGTGAGATCTCCTCTTTTGAAAAAAACAAGAAAAAGTTTGGTAGGTAAGAAACGAAGCT
GAAGAGAAGAAGAGAAAAAAAACGATTCAGAGCATCAAATGCAGCGAACTGTCTAGTTGT
TGTTTGTTCGGTTGAGAATCTAATCAGTAAGAAAGAGAGGGATGAGTTCTTTGGTGTGTT
GTTGTTGATGTACTATAACTATGTAGACTAATCTCTTAATCCATGTTTTTTTT
TCTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 2 9

CO CL646Contig1 955 5 20 U
GCCATACGGCCGGGGGGGTCGTCGTCTGTTTGATTGATCTTTAGAAATCGGAAATGGCAG
AGTCGAGGGTTGTAGTTCCGGAGTCAGTCCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGG
CTCTCGAGAAGAAGCAGAGCGCTGAAGCCGCCAAGAAGACGAACGCCGCC*AACAGGAAG
GTTATCTACAAAAGAGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTG
ATCTCATTGAAACGTGAGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTTGACCCTGAAGCTAAG
CTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATT
CTTCAGCTCTTGCGTTTGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAGGCT
ACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAG
AGTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCT
TTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAG
GATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTG
TGGCCATTCCAACTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTT
GAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAAAACTTCATCAACGAGCTTATCAGGAGAATGAAT
TAGATGTTTTCCTTTCCAGCTTATCAGGAGAATGATTTAGATGTTTTCCTTTCCAATCAG
TCTTTTTTTTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCTGGATTTTGATCTTTTTGT
TCAAGTTAAAAGATATTTTGAGCTTTCTCTTTTATTGTCTTTGGATCATAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G889TF U 20
AF RR4A653TF U 1
AF RR4A446TF U 16
AF RR4G889JQ C 132
AF RR4A653JQ C 294
BS 1 154 RR4A653TF
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BS 812 812 RR4A446TF
BS 813 833 RR4A653TF
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BS 850 933 RR4G889JQ
BS 934 955 RR4A653JQ

RD RR4G889TF 655 0 0
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TTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGA
GACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTC
GTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCT
ACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCG
TAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTC
TAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTGTGGCCATTCCAACT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4A653TF 833 0 0
GCCATACGGCCGGGGGGGTCGTCGTCTGTTTGATTGATCTTTAGAAATCGGAAATGGCAG
AGTCGAGGGTTGTAGTTCCGGAGTCAGTCCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGG
CTCTCGAGAAGAAGCAGAGCGCTGAAGCCGCCAATAAGACGAACGCCGCC*AACAGGAAG
GTTATCTACAAAAGAGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTG
ATCTCATTGAAACGTGAGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTTGACCCTGAAGCTAAG
CTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATT
CTTCAGCTCTTGCGTTTGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAGACT
ACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAG
AGTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCT
TTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATTATCTGCACTGAG
GATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTG
TGGCCATTCCAACTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTT
GAAG*TGGTGATGCTGGAAACCGTGAAAACTTCATCAACGAGCTTATCAG*AGA*TGAAT
TAGATGTTTTCCTTTCCAGCTTATCAG*AGA*TGATTTAGATGTTTTCCTTTC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4A446TF 835 0 0
GGGT
CGTCGTCTGTTTGATTGATCTTTAGAAATCGGAAATGGCAGAGTCGAGGGTTGTAGTTCC
GGAGTCAGTCCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTCTCGAGAAGAAGCAGGG
CGCTGAAGCCGCCAAGAAGACGAACGCCGCC*AACAGGAAGGTTATCTACAAAAGAGCCG
AGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCATTGAAACGTGAGG
CTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTTGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTA
TTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGA
GACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTC
GTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCT
ACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCG
TAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTC
TAACGGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTGTGGCCATTCCAACTCAAGG
CACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAA
ACCGTGAAAACTTCATCAACGAGCTTATCAGGAGAATGAATTAGATGTTTTCCTTTCCAG
CTTATCAGGAGAATGATTTAGATGTTTTCCTTTCCAATCAGTCTTTTTTT
A

QA 5 834 5 834
DS 

RD RR4G889JQ 803 0 0
G
AGCAGAGCGCTGAAGCCGCCAAGAAGACGAACGCCCCCCAACAGGAAGGTTATCTACAAA
AGAGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCATTGAAA
CGTGAGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTTGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATC
ATCCGTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTG
CGTTTGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAGGCTACAATGAACATG
CTTCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAA
TTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAAC
TCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCAC
GAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTGTGGCCATTCCAA
CTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGAT
GCTGGAAACCGTGAAAACTTCATCAACGAGCTTATCAGGAGAATGAATTAGATGTTTTCC
TTTCCAGCTTATCAGGAGAATGATTTAGATGTTTTCCTTTCCAATCAGTCTTTTTTTTAT
CTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCTGGATTTTGATCTTTTTGTTCAAGTTAAAAG
ATATTTTGAGCTTTCTCTTTT
G

QA 2 802 2 802
DS 

RD RR4A653JQ 662 0 0
AGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAA
GAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAA
CAAGACTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAA
TTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAG
GGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATTATCTG
CACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAA
CTTCTTGTGGCCATTCCAACTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCA
CTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAAAACTTCATCAACGAGCTTATCAGGAG
AATGAATTAGATGTTTTCCTTTCCAGCTTATCAGGAGAATGATTTAGATGTTTTCCTTTC
CAATCAGTCTTTTTTTTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCTGGATTTTGATC
TTTTTGTTCAAGTTAAAAGATATTTTGAGCTTTCTCTTTTATTGTCTTTGGATCATAGTT
TG

QA 1 662 1 662
DS 



CO CL646Contig2 399 4 7 U
GACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATC
GTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATT
CTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTGTGGCCATTCCAACTCAAG
GCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGA
AACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAATGTTTTCTTTTCA
AAATTCAGTCTTATTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCAGGATTTTGATCTT
CATTTTGTTCAAGTTAAATGACATTTTGAGTTATTTTTG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT04JQ C 1
AF RR4DT04TF U 1
AF RR4C004TF U 181
AF RR4C004JQ C 208
BS 1 1 RR4DT04JQ
BS 2 286 RR4DT04TF
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BS 370 370 RR4C004TF
BS 371 392 RR4DT04TF
BS 393 399 RR4C004JQ

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GTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATT
CTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTGTGGCCATTCCAACTCAAG
GCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGA
AACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAGTGTTTTCTTTTCA
AAATTCAGTCTTATTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCAGGATTTTGATCTT
CATTTTGTTTAAGTTAAATGACATTTTGAGTT

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR4DT04TF 392 0 0
G
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TAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTC
TAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCTTGTGGCCATTCCAACTCAAGG
CACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAA
ACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAGTGTTTTCTTTTCAA
AATTCAGTCTTATTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCAGGATTTTGATCTTC
ATTTTGTTTAAGTTAAATGACATTTTGAGTT

QA 2 392 2 392
DS 

RD RR4C004TF 219 0 0
GCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGA
AACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAATGTTTTCTTTTCA
AAATTCAGTCTTGTTATCTATGTTGTCTTCACCAAGTGCTTCCTCCAGGATTTTGATCTT
CATTTTGTTCAAGTTAAATGACATTTTGAGTT
ATTTTTG

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR4C004JQ 192 0 0
AGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTT
ATCAGGAGGATGAATTAGAATGTTTTCTTTTCAAAATTCAGTCTTGTTATCTATGTTGTC
TTCACCAAGTGCTTCCTCCAGGATTTTGATCTTCATTTTGTTCAAGTTAAATGACATTTT
GAGTTATTTTTG

QA 1 192 1 192
DS 



AS 1 8

CO CL647Contig1 966 8 17 U
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TCAAAGACATGCTTAAAACCAAGACTAGCAAAACCAATGTACAAGTGATCCCTCATGAGA
GAAACTGCTGGCAAAACATATTATTCTCAAAGAAACAAAAACAAAAACTCTTAGGGACTT
GTAGCAAGCTTGTTGAAGGCGGCGTGAACTCTCTCTTCAGTGAACATTCTGTGGTTCTCA
TAGAAATCTAATATCTCCATTGCGATATTCTTCACAATGTTCATGTCCACAGAGAGCTCT
TCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTAAACAGAAGCAACGTAAATGCAAGCGAGG
GTGATGAGATAAGGCGGGTGTGTAAGGATGAGATCCATTCTGTAAGTGTCGTTGACAATA
CCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACTCGGGG
AGAGATCGGTAAGGGTGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCTTCATC
TCCATCTCAAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAATTTTCTG
ATGTAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCTGCTTTGCAAGCCAGATAC
AAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTTGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTTGTGTAAACA
CGGCGCATATAGGTTATAGCAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGTGTTGTGCC
AGCTTCGATATATAATTAGACATATGAAGCTTAATGAGTCTCAAATCTTCGACAGAGATT
CCTCTCTGAGCATCGAGAGGATGAACAAAATTGATCTCTTCTGGGTCCTTGAGCTCTTTG
AAGTGCGTTGATGTCCAGAAATTGGAAGCCATTTTTTTTTTTGCTTTTCTTTTTCTTCAC
CCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 

AF RR4BV22JQ U 56
AF RR4C776JQ U 1
AF RR4EA95JQ U 53
AF RR4C776TF C 225
AF RR4AQ50JQ U 52
AF RR4AQ50TF C 174
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BS 1 242 RR4C776JQ
BS 243 243 RR4AQ50JQ
BS 244 332 RR4C776JQ
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BS 334 371 RR4C776JQ
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BS 390 605 RR4C776JQ
BS 606 606 RR4AQ50JQ
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BS 735 899 RR4AQ50JQ
BS 900 966 RR4AQ50TF

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CAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAG

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DS 

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TAAAAATCTAATATCTCCATTGCGATATTCTTCACAATGTTCATGTCCACAGAGAGCTCT
TCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTACACAGAAGCAACGTAAATGCAAGCGAGG
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CCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACTCGGGG
AGAGATCGGTAAGGGTGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCTTCATC
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ATGTAAAAAACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCTGCTTTGCAAGCCAGATAC
A

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DS 

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GTG
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TGAGAGAAACTGCTGGCAAAACATATTATTCTCAAAGAAACAAAAACAAAAACTCTTAGG
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CGAGGGTGATGAGATAAGGCGGGTGTGTAAGGATGAGATCCATTTTGTAAGTGTCGTTGA
CAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACT
CGGGGAGAGATCGGTAAGGGTGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCT
TCATCTCCATCTCAAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAATT
TTCTGATGTAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCTGCTTTGCAAGCCA
GATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTTGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTTGTGT
AAACACGGCGCATATAGGTTATAGTAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGTGTT
GTGC

QA 4 727 4 727
DS 

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GTCCACAGAGAGCTCTTCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTACACAGAAGCAAC
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AGTGTCGTTGACAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATC
CTGCAAGAACTCGGGGAGAGATCGGTAAGGGTGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGC
TTCCAAGATCTTCATCTCCATCTCAAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTCATC
AGCATACAATTTTCTGATGTAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCTGC
TTTGCAAGCCAGATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTTGGCTCATACTCTGTCAAACT
CTTCCTTGTGTAAACACGGCGCATATAGGTTATAGCAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAAT
CTTAATGTGTTGTGCCAGCTTCGATATATAATTAGACATATGAAGCTTAATGAGTCTCAA
ATCTTCGACAG

QA 1 611 1 611
DS 

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TGTG
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GCTCTTCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTAAACAGAAGCAACGTAAATGCAAG
CGAGGGTGATGAGATAAGGCGGGTGTGTAAGGATGAGATCCATTCTGTAAGTGTCGTTGA
CAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACT
CGGGGAGAGATCGGTAAGGGTGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCT
TCATCTCCATCTCAAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAATT
TTCTGATGAAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCTGCTTTGCAAGCCA
GATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTTGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTTGTGT
AAACACGGCGCATATAGGCTATAGCAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGTGTT
GTGCCAGCTTCGATATATAATTAGACATATGAAGCTTAATGAGTCTCAAATCTTCGACAG
AGATTCCTCTCTGAGCATCGAGAGGATGAACAAAATTGATCTCTTCTGGGTCCTTGAGCT
CTTT

QA 5 848 5 848
DS 

RD RR4AQ50TF 793 0 0
GGGACTTGTAGCAAGCTTGTTGAAGGCGGCGTGAACTCTCTCTTCAGTGAACATTCTGTG
GTTTTCATAGAAATCTAATATCTCCATTGCGATATTCTTCACAATGTTCATGTCCACAGA
GAGCTCTTCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTAAACAGAAGCAACGTAAATGCA
AGCGAGGGTGATGAGATAAGGCGGGTGTGTAAGGATGAGATCCATTCTGTAAGTGTCGTT
GACAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAA
CTCGGGGAGAGATCGGTAAGGGTGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGAT
CTTCATCTCCATCTCAAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAA
TTTTCTGATGAAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCTGCTTTGCAAGC
CAGATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTTGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTTGT
GTAAACACGGCGCATATAGGCTATAGCAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGTG
TTGTGCCAGCTTCGATATATAATTAGACATATGAAGCTTAATGAGTCTCAAATCTTCGAC
AGAGATTCCTCTCTGAGCATCGAGAGGATGAACAAAATTGATCTCTTCTGGGTCCTTGAG
CTCTTTGAAGTGCGTTGATGTCCAGAAATTGGAAGCCATTTTTTTTTTTGCTTTTCTTTT
TCTTCACCCTTCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4FA52TF 636 0 0
TACAC
CAGAAGCAACGTAAATGCAAGCGAGGGTGATGAGATAAGGCGGGTGTGTAAGGATGAGAT
CCATTCTGTAAGTGTCGTTGACAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATGCTTGTGTCATTGA
GTCCAGAATCCTGCAAGAACTCAGGGAGAGATCGGTATGGGTGGAAGACAACAAGATAGA
AGTTCAAAGCTTCCAAGATCTTCATCTCCATCTCCAGAATATCTTTAATCTCATACCTGA
ACTTCTCATCAGCATACAATTTTCTGATGTAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACAC
TCTCCTCTGCTTTGCAAGCCAGATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTAGGCTCATACT
CTGTCAAACTCTTCCTTGTGTAAACACGGCGCATATAGGTTATAGCAGTTGCAACAACCC
TTTGCCTAATCTTAATGTGTTGTGCCAGCTTCGATATATAATTAGACATATGAAGCTTAA
TGAGTCTCAAATCTTCGACAGAGATTCCTCTCTGAGCATCGAGAGGATGAACAACATTGA
TCTCTTCTGGGTCCTTGAGCTCTTTGAAGTGCGTTGATGTCCAGAAATTGGAAGCCATTT
TTTTTTTTGCTTTTCTTTTTCTTCACCCTTC

QA 6 636 6 636
DS 

RD RR4EA95TF 644 0 0
TCTCTTTGTAAACAGAAGCAACGTAAATGCAAGCGAGGGTGATGAGATAAGGCGGGTGTG
TAAGGATGAGATCCATTTTGTAAGTGTCGTTGACAATACCCCAAGTTAAGTGGGTCATAC
TTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACTCGGGGAGAGATCGGTAAGGGTGGAAGA
CAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCTTCATCTCCATCTCAAGAATATCTTTAA
TCTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAATTTTCTGATGTAGAAGACAAGAATCTTGG
CATGGACCACACTCTCCTCTGCTTTGCAAGCCAGATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCC
TTGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTTGTGTAAACACGGCGCATATAGGTTATAGTAG
TTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGTGTTGTGCCAGCTTCGATATATAATTAGACA
TATGAAGCTTAATGAGTCTCAAATCTTCGACAGAGATTCCTCTCTGAGCATCGAGAGGAT
GAACAACATTGATCTCTTCCGGGTCCTTGAGCTCTCTGAAGTGCGTTGATGTCCAGAAAT
TGGAAGCCATTTTTTTTTTTGCTTTTCTTTTTCTTCACCCTTC
C

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 9

CO CL648Contig1 920 9 13 U
GGGGAGTAGTGGACAATAGACAATAGACAACAGACAATAATGAGTTTTCTTTTTCTTTTG
ACATCACCACCAAGATACTAATGATTAAAGTTTGATCATCGACTAATACATTATTGTCAC
TTTTATCTAATCAAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTGTCTCTGATGCTCTGTCTCAT
AACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGA
CCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGT
CAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGA
GTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTA
ACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGG
GTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAAT
CATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAAT
GGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAAT
GAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTAT
TGGCTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATT
TTGTGTTTTATGTGTTGCTAGAACTTGAAACCGATCTTCTTTTTTATTTTGTTTGTGTTA
CTATGTAATCTTGTCTGCCAGATTCTGATTTCTAGGATCTTGAGTTGAGGTTAAAGACTT
TGACTTATAAGTCAAATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H342TF U 1
AF RR4GU93TF U 50
AF RR4DB56TF U 131
AF RR4DB56JQ C 168
AF RR4ES03TF U 163
AF RR4C732JQ C 136
AF RR4H342JQ C 115
AF RR4AT39JQ C 182
AF RR4AT39TF U 182
BS 1 227 RR4H342TF
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BS 229 695 RR4H342TF
BS 696 702 RR4GU93TF
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BS 704 711 RR4GU93TF
BS 712 712 RR4DB56TF
BS 713 764 RR4GU93TF
BS 765 781 RR4DB56TF
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BS 783 824 RR4DB56TF
BS 825 913 RR4AT39TF
BS 914 920 RR4H342JQ

RD RR4H342TF 695 0 0
GGGGAGTAGTGGACAATAGACAATAGACAACAGACAATAATGAGTTTTCTTTTTCTTTTG
ACATCACCACCAAGATACTAATGATTAAAGTTTGATCATCGACTAATACATTATTGTCAC
TTTTATCTAATCAAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTGTCTCTGATGCTCTGTCTCAT
AACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTTATCCTTGACCGA
CCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGT
CAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGA
GTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTA
ACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGG
GTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAAT
CATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAAT
GGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAAT
GAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GU93TF 722 0 0
TTTTTCTTTTGACATCACCACCAAGATACTAATGATTAAAGTTTGATCATCGACTAATAC
ATTATTGTCACTTTTATCTAATCAAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTGTCTCTGATG
CTCTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGA
TCCTTGACCTACCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAAC
TCAAAGAACGTCAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGG
TAATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGT
ATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAA
CTTATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAAT
GGAGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACA
AGAATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGAT
TCTTGAACAATGAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTT*ATTTTA
AA*TAAATTATTGGCTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTT
GTATATA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DB56TF 695 0 0
GG
AAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTGTCTCTGATGCTCTGTCTCATAACGTCTTCGTT
TACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGACCCGCTGATACA
GTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGTCAGTATCCATGT
ATTGTCCCCTTTGAGTCGGGAAAAGTCTACGGCAAGGTAATAACGGGAGTATCCGATGCT
GAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTT
GTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGGTTAACAAAGGT
GATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATCATGCGGATAAA
TTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATGGGAAGAAAAGA
GAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAATGAACTTAGACAT
AAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATTGGCTGCTAATC
TTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTT*GTGTTTTATG
TGTTGCTAGAACTTGAAACCGATCTTCTTTTT
A

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4DB56JQ 645 0 0
TGCTCTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGT
GATCCTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAA
ACTCAAAGAACGTCAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCGGGAAAAGTTTACGGCAA
GGTAATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGA
GTATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGA
AACTTATGTTTGGGTTAACAAAGGTGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGA
ATGGAGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAA
CAAGAATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATG
ATTCTTGAACAATGAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTT
TAAAATAAATTATTGGCTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGT
AATATATATTATTT*GTGTTTTATGTGTTGCTAGAACTTGAAACC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4ES03TF 655 0 0
GGG
GATGCTCTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCC
GTGATCCTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTAT
AAACTCAAAGAACGTCAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGC
AAGGTAATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAAT
GAGTATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTG
GAAACTTATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAG
GAATGGAGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGG
AACAAGAATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGA
TGATTCTTGAACAATGAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTAT
TTTAAAATAAATTATTGGCTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTT
GTAATATATATTATTT*GTGTTTTATGTGTTGCTAGAACTTGAAACC
AAAAA

QA 4 650 4 650
DS 

RD RR4C732JQ 707 0 0
GG
AAAACAGAGGAAGAAGATGAGTGTCTCTGATGCTCTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGG
CAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCC
CGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGTCAGTATCCATGTATTGT
CCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCT
AAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAG
GATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCC
TAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGT
GGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGA
TATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAATGAACTTAGACATAAGTT
GTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATTGGCTGCTAATCTTGGC
AGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTTTGTGTTTTATGTGTTG
CTAGAACTTGAAACCGATCTTCTTTTTTATTTTGTTTGTGTTACT

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DS 

RD RR4H342JQ 806 0 0
TTGTCAC
TTTATCTAATCAAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTGTCTCTGATGCTCTGTCTCATA
ACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTTATCCTTGACCGAC
CCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGTC
AGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGAG
TATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAA
CAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGG
TTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATC
ATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATG
GGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAATG
AACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATT
GGCTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTT
TGTGTTTTATGTGTTGCTAGAACTTGAAACCGATCTTCTTTTTTATTTTGTTTGTGTTAC
TATGTAATCTTGTCTGCCAGATTCTGATTTCTAGGATCTTGAGTTGAGGTTAAAGACTTT
GACTTATAAGTCAAATGGT

QA 8 806 8 806
DS 

RD RR4AT39JQ 733 0 0
GG
GTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGACCC
GCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGTCAG
TATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGAGTA
TCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAACA
GTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGGTT
AACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATCAT
GCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATGGG
AAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAATGAA
CTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATTGG
CTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTTTG
TGTTTTATGTGTTGCTAGAACTTGAAACCGATCTTCTTTTTTATTTTGTTTGTGTTACTA
TGTAATCTTGTCTGCCAGATTCTGATTTCTAGGATCTTGAGTTGAGGTTAAAGACTTTGA
CTTATAAGTC
G

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR4AT39TF 733 0 0
GG
GTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGACCC
GCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGAACGTCAG
TATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTGGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGAGTA
TCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAACA
GTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGGTT
AACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATCAT
GCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATGGG
AAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAATGAA
CTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATTGG
CTGCTAATCTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTTTG
TGTTTTATGTGTTGCTAGAACTTGAAACCGATCTTCTTTTTTATTTTGTTTGTGTTACTA
TGTAATCTTGTCTGCCAGATTCTGATTTCTAGGATCTTGAGTTGAGGTTAAAGACTTTGA
CTTATAAGTC
G

QA 3 732 3 732
DS 



AS 1 8

CO CL649Contig1 1372 8 30 U
ACAACTAGAGAACTTTTGTATGTTTCTTTTATCTTTGTGTTTGCTTACAGATTGTAACAG
CTACATATTCCAGAGTGACTAGGCAAATTGAGATTCAAACTCTGTATTTTTTT*****TT
AATTGATCATCTTAGTCCGGCTGGAGATGTTGGACTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGC
TCTTTGGGCAAGAGACCCATCATAATCCCGTTTCTCGAAGGAACTAACCTGCGAGTTAGC
TATCTTGTCTGCGATTCCATAGTCAATGGCTGCCTGTGCTTGGAGATATTTAGGTCGCTT
GATGTCCTCGTTGATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGTTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTA
GTACTCGGTATTTGCATCAAGTTCCTTGGCCTTTATCCACATGTCAATGGCAGCTCCGCT
CGATCTGTTTACTTTTGGCAGATACAATTTTGTTGACGAATGTGGCTGAACTGCACGGTA
ACCCTTTTTACCGAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATGCCACAGTTGAT
AGTGTATACATCTGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCCGTTTC
TGACCCAACAGTCTCCATCTTCTCATTCTGAGTCCCGGGTGAATTGATGTATAGGTAGAT
AGGCTTTGCTGGGTTGTCATAGTCTAACCACATAAACTGAGCAACGAGCAACTCAGTAAC
TGCAGGTACGATAGGCATGCCAAGGTAGCATATCCGAGCATCCAATAGCAAAGAAGGCAA
ATCTGGAGGAGCAGTTCTTGGTCTTGCAGATCCTCCTCCGCCGCCTCCACCACCTCTGTA
CATTTGGACACTCATGCTGTATCTCCTAGGATCTGCTGCATTCATACCAGACATACTCCA
TGTTCCTCCGTTGTCTAGATAATTACTTCTAGACGAGATGCTTTCCTCTGTAACTTTCTC
TGCTTGCCTACGGACAGGGCTGTCCTCAGTCATGAACATATCCATTTGAGCTGGATTAAG
GCCGTAGAAATACTGGGGTACATTCTTGAAGTTCTGCATCACTCCATCTTTGAGATTGTC
TCCACGAAACTGTTTGGGAATGTGTTCAAAGCTCATATCTTTAGCAGAAGCAAAGCAGTT
TGATCTTCTTGTGCGTCTTGGAACAGTGGAGCAAGGCATGTTCGAGGAGAAGAGCTTAGA
TCCCGACACGAACGGTGATTTGGGAAGAGCGAACTTGGAGCAGACAGATTCATGGTTGTG
CTGTGAGGTAAGAGGAGAGACCATCGAAGTCGCCATCTCCAATTGAGCAAAACCGATGAA
GAAGAAGAAGAAGATGATTGAAATGAAGACATTTCTTTTTGGGATGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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TCTTTGGGCAAGAGACCCATCATAATCCCGTTTCTCGAAGGAACTAACCTGCGAGTTAGC
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GATGTCCTCGTTGATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGTTCCTTTAGCTAACAGCTCGATGTA
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CGATCTGTTTACTTTTGGCAGATACAATTTTGTTGATGAATGTGGCTGAACTGCACGGTA
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AGTGTATACATCTGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCCGTTTC
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GGGCTTTGCTGGATTGTCATAGTCTAACCACATAAACTGAGCAACGAGTAACTCAGTAAC
TGCAGGTACGATAGGCATGCCAAGGTAGCAAATCCGAGC

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GATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGTTCCTTTAGCTAACAGCTCGATGTAGTACTCGGTATT
TGCATCAAGTTCCTTGGCCTTTATCCACATGTCAATGGCAGCTCCGCTCGATCTGTTTAC
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TGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCCGTTTCTGAGCCAACAGT
CTCCATCTTCTCATT*TGAGTCCCGGGTGAATTGATGTATAGGTAGATGGGCTTTGCTGG
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AGGCATGCCAAG
C

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A
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GTCTGCGATTCCATAGTCAATGGCTGCCTGTGCTTGGAGATATTTAGGTCGCTTGATGTC
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GTCTGCGATTCCATAGTCAATGGCTGCCTGTGCTTGGAGATATTTAGGTCGCTTGATGTC
CTCGTTGATCTGTTCTTTGGTTTTGCCTGTTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAGTACTC
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GTTTACTTTTGGCAGATACAATTTTGTTGACGAATGTGGCTGAACTGCACGGTAACCCTT
TTTACCGAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATGCCACAGTTGATAGTGTA
TACATCTGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCC
AACAGTCTCCGTCTTCTCATTCTGAGTCCCGGGTGAATTGATGTATAGGTAGATAGGCTT
TGCTGGGTTGTCATAGTCTAACCACATAAACTGAGCAACGAGCAACTCAGTAACTGCAGG
TACGATAGGCATGCCAAG*TAGCATATCCGAGCATCCAATAGCAAAGAAGG
AAATC

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ATAAACTGAGCAACGAGCAACTCAGTAACTGCAGGTACGATAGGCATGCCAAGGTAGCAT
ATCCGAGCATCCAATAGCAAAGAAGGCAAATCTGGAGGAGCAGTTCTTGGTCTTGCAGAT
CCTCCTCCGCCGCCTCCACCACCTCTGTACATTTGGACACTCATGCTGTATCTCCTAGGA
TCTGCTGCATTCATACCAGACATACTCCATGTTCCTCCGTTGTCTAGATAATTACTTCTA
GACGAGATGCTTTCCTCTGTAACTTTCTCTGCTTGCCTACGGACAGGGCTGTCCTCAGTC
ATGAACATATCCATTTGAGCTGGATTAAGGCCGTAGAAATACTGGGGTACATTCTTGAAG
TTCTGCATCACTCCATCTTTGAGATTGTCTCCACGAAACTGTTTGGGAATGTGTTCAAAG
CTCATATCTTTAGCAGAAGAAAAGCAGTTTGATCTTCTTGTGCGTCTTGGAACAGTGGAG
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TTTCTTTTTGGGATGTTTTCC

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AGCAGTTCTTGGTCTTGCAGATCCTCCTCCGCCGCCTCCACCACCTCTGTACATTTGGAC
ACTCATGCTGTATCTCCTAGGATCTGCTGCATTCATACCAGACATACTCCATGTTCCTCC
GTTGTCTAGATAATTACTTCTAGACGAGATGCTTTCCTCTGTAACTTTCTCTGCTTGCCT
ACGGACAGGGCTGTCCTCAGTCATGAACATATCCATTTGAGCTGGATTAAGGCCGTAGAA
ATACTGGGGTACATTCTTGAAGTTCTGCATCACTCCATCTTTGAGATTGTCTCCACGAAA
CTGTTTGGGAATGTGTTCAAAGCTCATATCTTTAGCAGAAGCAAAGCAGTTTGATCTTCT
TGTGCGTCTTGGAACAGTGGAGCAAGGCATGTTCGAGGAGAAGAGCTTAGATCCCGACAC
GAACGGTGATTTGGGAAGAGCGAACTTGGAGCAGACAGATTCATGGTTGTGCTGTGAGGT
AAGAGGAGAGACCATCGAAGTCGCCATCTCCAATTGAGCAAAACCGATGAAGAAGA
AGAAGAAGATGATTCC

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CCAATAGCAAAGAAGGCAAATCTGGAGGAGCAGTTCTTGGTCTTGCAGATCCTCCCCCGC
CGCCTCCATCACCTCTGTACATTTGGACACTCATGCTGCATCTCCTAGGATCTGCGGCAT
TCATACCAGACATACTCCATGTTCCTCCGTTGTCTAGATAATTACTTCTAGACGAGATGC
TTTCCTCTGTAACTTTCTCTGCTTGCCTACGGACAGGGCTGTCCTCAGTCATGAACATAT
CCATTTGAGCTGGATTAAGGCCGTAGAAATACTGGGGTACATTCTTGAAGTTCTGCATCA
CTCCATCTTTGAGATTGTCTCCACGAAACTGTTTGGGAATGTGTTCAAAGCTAATATCTT
TAGCAGAAGCAAAGCAGTTT**TCTTCTTGTGCGTCTTGGAACAGTGGAGCAAGGCATGT
TCGAGGAGAAGAGCTTAGATCCCGACACGAACGGTGATTTGGGAAGAGCGAACTTGGAGC
AGACAGATTCATGGTTGTGCTGTGAGGTAAGAGGAGAGACCATCGAAGTCGCCATCTCCA
ATTGAGCAAAACCGATGAAGAAGAAGAAGAAGATGATTGAAATGAAGACGTTTCTTTTTG
GGATGTTTTCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 7

CO CL650Contig1 766 3 12 U
CGATTGAAATATTTGTATGTGATTAAGAGACATATCTTTACAAGTGGAAGGAAACGAGCC
AAGTTTATAACTAAAAAGTTGAAGTTCACCAAAACACAAGAAAATGTTAGAGAAACCAAA
ACACACACAAAACAAGTTTTTTTCTGATTCAAACAGAAGAAGTAGCTTCGAGTTTGGGAA
GAAGAGCTCTCCAGGCATCAGCAATACCGTTTGCTAAGCGAGCTTGTCCTTTGGCGAACT
GATGGAACGCTACTCCCATCTCTTCCGTCTTCTGTTCTTGGAACCTCACTATCTCCTCGT
TCATTCTCTTCACTATCCTCTCAAATCTTATCGTTGCTTCCTCGCTCTCTGCTTTTATCT
CTCTGTATTCGATCTCAGCTTCTCCTACTTTGTCAGAACGTGTGAGCATGAGTTTGTCAA
GGTTTATTTCCTTTAGCTTTGTTGTTTCGGCCAATTCACAATGTTGCTTGAATGCAGTGG
CTCGTTCTCCTATGGTTGCCTTAATCGATTGCACATAACGAACATAGTCCTTCAAAGGTT
CCTCGAAGTTCATCAGGACTTGTTGAGCCTCTTTCTGGAGCTTAATCGATACCAGTTCTG
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GTTTAACAGCCTTGCCAAAATCCAACAGTGACTGGCCCAACTCTCTATGCCTCTTGACGA
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BQ
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TCACTATCTCCTCGTTCATTCTCTTCACTATCCTCTCAAATCTTATCGTTGCTTCCTCGC
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TG
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CAAATCTTATCGTTGCTTCCTCGCTCTCTGCTTTTATCTCTCTGTATTCGATCTCAGCTT
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DS 



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TGGTGAACTTCAACTTCTAGTTATAAACTTGGCTCATTTCCTTCCACTTGTAAAGATATG
TCTCTTAATTACATTACCAATC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY77TF U 18
AF RR4G247TF U 1
AF RR4FE82TF U 236
AF RR4FE82JQ C 613
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RD RR4FY77TF 664 0 0
GGG
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CCGTCACCGATCCCGTCAAATTAGGCAATGGCGTCCAAGCTTACATCTCTTACTTAGTCA
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CTCTCCCTGAGAAGAGTGCTGTTGAGAAGTTCCGGTTTAGTGCTGAATTTATCGAAATGA
GGCGAGCAGCATTGGATGTATTTGTTAATCGGACAGCATCACACCCTGAGCTCCAGCAGA
GTGAGGATCTTAGAACCTTTTTGCAAGCCGATGAAGGGACAATGGAAAGATTCAGGTTTC
AGGAAACTGGCATATTCAATAAGAAGCCTGCAGATTTTATGCAAATGTTCAGGGATGTGC
AATCAAAGGTTAGCGATGCTGTCCTAGGAAAAGAAAAACCTGTTGAAGAAACCACTCCTG
AATACGAGAAGCTTAAACACTACGCTTTCGAGCTTGAGAACCACTTAGCCGAGGCTCAAA
AGCATGCGTATCGCCTCGTCAAGAGGCATAGAGAGTTGGGCCAGTCACTGTTGGATTTTG
G

QA 4 664 4 664
DS 

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TCATCCCTTTCTGTCAGCCTCCGTCACCGATCCCGTCAAATTAGGCAATGGCGTCCAAGC
TTACATCTCTTACCGAGTCATCACCAAGACGAACTTGCCGGAGTATCAAGGACCGGAGAA
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CAAGGGTGTTTTCATTCCTCCTCTCCCTGAGAAGAGTGCTGTTGAGAAGTTCCGGTTTAG
TGCTGAATTTATTGAAATGAGGCGAGCAGCATTGGACATATTTGTTAATCGGATAGCATC
ACGCCCTGAGCTCCAGCAGAGTGAGGATCTTAGAACCTTTTTGCAAGCGGATGAAGAGAC
AATGGAAAGATTCAGGTTTCAGGAAACTGGTATATTCAATAAGAAGCCTGCAGATTTTAT
GCAAATGTTCAGGGATGTGCAATCAAAGGTTAGCGATGCTGTCCTAGGAAAAGAAAAACC
TGTCGAAGAAACCACTCCTGAATATGAGAAGCTTAAACACTACGTTTTCGAGCTCGAGAA
CCACTTAGCCGAGGCTCAAAAGCATGCGTATCGCCTCGTCAAGAGGCATAGAGAGTTGGG
CCAGTCACTTTTGGATTTTGGCAAG*CTGTTAAACTTCTTGGGGCTTGTGAGGGTGAACC
TACAGGAAA
CTATTTTC

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DS 

RD RR4FE82TF 780 0 0
G
AATACAAGGGTGTTTTCATTCCTCCTCTCCCCGAGAAGAGTGCTGTTGAGAAGTTCCGGT
TTAGTGCTGAATTTATTGAAATGAGGCGAGCATCATTGGATATATTTGTTAATCGGATAG
CATCACACCCTGAGCTCCAGCAGAGTGAGGATCTTAGAACCTTTTTGCAAGCGGATGAAG
AGACAATGGAAAGATTCAGGTTTCACGAAACTGGTATATTCAATAAGAAGCCTGCAGATT
TTATGCAAATGTTCAGGGATGTGCAATCAAAGGTTAGCGATGCTGTCCTAGGAAAAGAAA
AACCTGTCGAAGAAACCACTCCTGAATATGAGAAGCTTAAACACTACGTTTTCGAGCTTG
AGAACCACTTAGCCGAGGCTCAAAAGCATGCGTATCGCCTCGTCAAGAGGCATAGAGAGT
TGGGCCAGTCACTGTTGGATTTTGGCAAGGCTGTAAAGCTTCTTGGGGCTTGTGAGGGTG
AACCTACAGGAAAACTATTTTCCGATCTTGGAACTAAATCAGAACTGGTATCTATCAAGC
TCCAGAAAGAGGCTCAACAAGTCCTGATGAACTTCGAGGAACCCTTGAAGGACTATGTTC
GTTATGTGCAGTCGATTAAAGCAACCATAAGAGAACGAGCCACTGCATTCAAGCAACATT
GTGAATTGGCCGAAACAACAAAGCTAAAGGAA*TAAACCTTGACAAACTCATGCTCACAC
GTTCTGACAA*GTAG*AGAAGCTGAGATCGAATACAGAGAGATAAAAGCAGAGAGCGAG

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4FE82JQ 730 0 0
GGCTCAAAAGCATGCGTATCGCCTCGTCAAGAGGCATAGAGAGTTGGGCCAGTCACTGTT
GGATTTTGGCAAGGCTGTAAAGCTTCTTGGGGCTTGTGAGGGTGAACCTACAGGAAAACT
ATTTTCCGATCTTGGAACTAAATCAGAACTGGTATCTATCAAGCTCCAGAAAGAGGCTCA
ACAAGTCCTGATGAACTTCGAGGAACCCTTGAAGGACTATGTTCGTTATGTGCAGTCGAT
TAAGGCAACCATAAGAGAACGAGCCACTGCATTCAAGCAACATTGTGAATTGGCCGAAAC
AACAAAGCTAAAGGAAATAAACCTTGACAAACTCATGCTCACACGTTCTGACAAAGTAGG
AGAAGCTGAGATCGAATACAGAGAGATAAAAGCAGAGAGCGAGGAAGCAACGATAAGATT
CGAGAGGATAGTGAAGAGAATGAACGAGGAGATAGTGAGGTTCCAAGAACAGAAGACGGA
AGAGATGGGAGTAGCGTTCCATCAGTTCGCCAAAGGACAAGCTCGCTTAGCAAACGGTAT
TGCTGATGCCTGGAGAGCTCTTCTTCCCAAACTCGAAGCTGCTTCTTCTGTTTGAATAAA
AAAAATCTGGTTTTGTGTGTGTTTTGGTTTCTCTAACATTTTATGTTTTGGTGAACTTCA
ACTTCTAGTTATAAACTTGGCTCATTTCCTTCCACTTGTAAAGATATGTCTCTTAATTAC
ATTACCAATC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 7

CO CL651Contig1 1098 7 9 U
GTCTAAAACTGTGTTGCAAACATAAGTTCTGTCAACTTATTGAAGCTTATACAGTAACAG
TATCTTAAAACACACATGGGCTAAAGAAAGATTTGTTTATTTTGTGGACACACTTTGAAC
AGAAAGCAAAATGAGAATCAGACCTTTAACTCTTCCACTTCTGAACTTAATGGTTTAAAG
AGAGCCTCCACCTCGTTCTCGTCTACCTCTTCAACGCTTGCCGGGTTCCATTTAGGATTC
TGATCCTTGTCGATCAATACTGCTCTAACGCCTTCAGCAAAATCACCACGCAAGGCCGAT
CTTAGTGCGATGCGATATTCAGTCTTCATCACACCATTAAGGGTTGCTAATTCGTTTTCA
GCTTTACCCTTGGCACATGCAACATTTGAGAAGTACTTCTGTGTCAGGTAAAGAGAAAAC
GGTGCTCCTTT*CTCCAAACCTTTGAGTGCCTCTGTAGCCCATTCTACAACTGAAGGCTC
AGTGCTTTCCTGATACTTTTTGAGCTCTTCTATCGTTTCCTTAACAGACTTATTTGAGCT
AAACGCTGACTCTATTTGAGGCAAAAGTGATTTGAGATGGGCCTCAGATTCAGTATTCCC
ACTGTATTTCGACAAAGTTGCCTGGATGTCTTGATTAGGATCCTCCGACAGGTTGGCTGA
CAAAATGGCTTCTTTTAAAGAAGCTAGCTTTTCAGATGGCACATAATGCGTCCCAAGACC
AACGAACAATGCATCTGACGGCGTGGAGATTCTTTTTCCAGTTAAACCAAGATAAGCACC
AACAGATCCTCCCCCAGGGCTATGAGCTGCTATATATGAAAACCCTACATCTGAGAACAA
CCCGATTCCATTTTCCGGCATGGCAAGAACCGTCCTCTCTGTGATCACACGGTAGCGACC
ATGTCCAGAAAGGCCAAGGCCAAATCCCATTGTTATTCCATCCATTAATGAGATATACGG
TTTCTTGTAACCAGCAATTGCGCATATCAGGCTATATTCTGCTGTAAATACCTTTTGGAC
AAGAGGTGTGTTTTTGTCCTTTTGGATTTCTGCAGCAACTCCTTTAATATCCATCCCAGC
ACAAAAGGCACGAGGTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A370JQ U 107
AF RR4A370JQD U 1
AF RR4DV62JQ U 1
AF RR4FH11TF C 105
AF RR4C205JQ U 15
AF RR4C205TF C 562
AF RR4A370TFB C 287
BS 1 585 RR4A370JQD
BS 586 667 RR4DV62JQ
BS 668 668 RR4C205JQ
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BS 822 822 RR4A370TFB
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BS 834 834 RR4C205TF
BS 835 1098 RR4A370TFB

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ACAACTGAAGGCTCAGTGCTT

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR4A370JQD 585 0 0
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TATCTTAAAACACACATGGGCTAAAGAAAGATTTGTTTATTTTGTGGACACACTTTGAAC
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AGAGCCTCCACCTCGTTCTCGTCTACCTCTTCAACGCTTGCCGGGTTCCATTTAGGATTC
TGATCCTTGTCGATCAATACTGCTCTAACGCCTTCAGCAAAATCACCACGCAAGGCCGAT
CTTAGTGCGATGCGATATTCAGTCTTCATCACACCATTAAGGGTTGCTAATTCGTTTTCA
GCTTTACCCTTGGCACATGCAACATTTGAGAAGTACTTCTGTGTCAGGTAAAGAGAAAAC
GGTGCTCCTTT*CTCCAAACCTTTGAGTGCCTCTGTAGCCCATTCTACAACTGAAGGCTC
AGTGCTTTCCTGATACTTTTTGAGCTCTTCTATCGTTTCCTTAACAGACTTATTTGAGCT
AAACGCTGACTCTATTTGAGGCAAAAGTGATTTGAGATGGGCCTC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4DV62JQ 758 0 0
GTCTAAAACTGTGTTGCAAACATAAGTTCTGTCAACTTATTGAAGCTTATACAGTAACAG
TATCTTAAAACACACATGGGCTAAAGAAAGATTTGTTTATTTTGTGGACACACTTTGAAC
AGAAAGCAAAATGAGAATCAGACCTTTAACTCTTCCACTTCTGAACTTAATGGTTTAAAG
AGAGCCTCCACCTCGTTCTCGTCTACCTCTTCAACGCTTGCCGGGTTCCATTTAGGATTC
TGATCCTTGTCGATCAATACTGCTATAACGCCTTCAGCAAAATCACCACGCAAGGCCGAT
CTTAGTGCGATGCGATATTCAGTCTTCATCACACCATTAAGGGTTGCTAATTCGTTTTCA
GCTTTACCCTTGGCACATGCAACATTTGAGAAGTACTTCTGTGTCAGGTAAAGAGAAAAC
GGTGCTCCTTT*CTCCAAACCTTTGAGTGCCTCTGTAGCCCATTCTACAACTGAAGGCTC
AGTGCTTTCCTGATACTTTTTGAGCTCTTCTATCGTTTCCTTAACAGACTTATTTGAGCT
AAACGCTGAATCTATTTGAGGCAAAAGTGATTTGAGATGGGCCTCAGATTCAGTATTCCC
ACTGTATTTCGACAAAGTTGCCTGGATGTCTTGATTAGGATCCTCCGACAGGTTGGCTGA
CAAAATGACTTCTTTTAAAGAAGCTAGCTTTTCAGATGGCACATAATGCGTCCCAAGACC
AACGAACAATGCATCTGACGGCGTGGAGATTCTTTTTC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4FH11TF 622 0 0
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ACTTAATGGTTTAAAGAGAGCCTCCACCTCGTTCTCGTCTACCTCTTCAACGCTTGCCGG
GTTCCATTTAGGATTCTGATCCTTGTCGATCAATACTGCTCTAACGCCTTCAGCAAAATC
ACCACGCAAGGCCGATCTTAGTGCGATGCGATATTCAGTATTCATCACACCATTAAGGGT
TGCTAATTCGTTTTCAGCTTTACCCTTGGCACATGCAACATTTGAGAAGTACTTCTGTGT
CAGGTAAAGAGAAAACGGTGCTCCTTT*CTCCAAACCTTTGAGTGCCTCTGTAGCCCATT
CTACAACTGAAGGCTCAGTGCTTTCCTGATACTTTTTGAGCTCTTCTATCGTTTCCTTAA
CAGACTTATTTGAGCTAAACGCTGACTCTATTTGAGGCAAAAGTGATTTGAGATGGGCCT
CAGATTCAGTATTCCCACTGTATTTCGACAAAGTTGCCTGGATGTCTTGATTAGGATCCT
CCGACAGGTTGGCTGACAAAATGGCTTCTTTTAAAGAAGCTAGCTTTTCAGATGGCACAT
AATGCGTCCCAAGACCAACGA
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4C205JQ 821 0 0
G
GCAAACATAAGTTCTGTCAACTTATTGAAGCTTATACAGTAACAGTATCTTAAAACACAC
ATGGGCTAAAGAAAGATTTGTTTATTTTGTGGACACACTTTGAACAGAAAGCAAAATGAG
AATCAGACCTTTAACTCTTCCACTTCTGAACTTAATGGTTTAAAGGGAGCCTCCACCTCG
TTCTCGTCTACCTCTTCAACGCTTGCCGGGTTCCATTTAGGATTCTGATCCTTGTCGATC
AATACTGCTCTAACGCCTTCAGCAAAATCACCACGCAAGGCCGATCTTAGTGCGATGCGA
TATTCAGTCTTCATCACACCATTA*GGGTTGCTAATTCGTTTTCAGCTTTACCCTTGGCA
CATGCAACATTTGAGAAGTACTTCTGTGTCAGGTAAAGAGAAAACGGTGCTCCTTT*CTC
CAAACCTTTGAGTGCCTCTGTAGCCCATTCTACAACTGAAGGCTCAGTGCTTTCCTGATA
CTTTTTGAGCTCTTCTATCGTTTCCTTAACAGACTTATTTGAGCTAAACGCTGACTCTAT
TTGAGGCAAAAGTGATTTGGGATGGGCCTCAGATTCAGTATTCCCACTGTATTTCGACAA
AGTTGCCTGGATGTCTTGATTAGGATCCTCCGACAGGTTGGCTGACAAAATGGCTTCTTT
TAAAGAAGCTAGCTTTTCAGATGGCACATAATGCGTCCCAAGACCAACGAACAATGCATC
TGACGGCGTGGAGATTCTTTTTCCAGTTAAACCAAGATAAGCACCAACAGATCCTCCCCC
AGGGCTATGAGCTGCTATATATGAAA*CCCTACATCTG
AG

QA 2 819 2 819
DS 

RD RR4C205TF 283 0 0
CAAAAGTGATTTGGGATGGGCCTCAGATTCAGTATTCCCACTGTATTTCGACAAAGTTGC
CTGGATGTCTTGATTAGGATCCTCCGACAGGTTGGCTGACAAAATGGCTTCTTTTAAAGA
AGCTAGCTTTTCAGATGGCACATAATGCGTCCCAAGACCAACGAACAATGCATCTGACGG
CGTGGAGATTCTTTTTCCAGTTAAACCAAGATAAGCACCAACAGATCCTCCCCCAGGGCT
ATGAGCTGCTATATATGAAAACCCTACATCTGAGAACAACCC
C

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4A370TFB 812 0 0
CACGCAAGGCCGATCTTAGTGCGATGCGATATTCAGTCTTCATCACACCATTAAGGGTTG
CTAATTCGTTTTCAGCTTTACCCTTGGCACATGCAACATTTGAGAAGTACTTCTGTGTCA
GGTAAAGAGAAAACGGTGCTCCTTT*CTCCAAACCTTTGAGTGCCTCTGTAGCCCATTCT
ACAACTGAAGGCTCAGTGCTTTCCTGATACTTTTTGAGCTCTTCTATCGTTTCCTTAACA
GACTTATTTGAGCTAAACGCTGACTCTATTTGAGGCAAAAGTGATTTGAGATGGGCCTCA
GATTCAGTATTCCCACTGTATTTCGACAAAGTTGCCTGGATGTCTTGATTAGGATCCTCC
GACAGGTTGGCTGACAAAATGGCTTCTTTTAAAGAAGCTAGCTTTTCAGATGGCACATAG
TGCGTCCCAAGACCAACGAACAATGCATCTGACGGCGTGGAGATTCTTTTTCCAGTTAAA
CCAAGATAAGCACCAACAGATCCTCCCCCAGGGCTATGAGCTGCTATATATGAAAACCCT
ACATCTGGGAACAACCCGATTCCATTTTCCGGCATGGCAAGAACCGTCCTCTCTGTGATC
ACACGGTAGCGACCATGTCCAGAAAGGCCAAGGCCAAATCCCATTGTTATTCCATCCATT
AATGAGATATACGGTTTCTTGTAACCAGCAATTGCGCATATCAGGCTATATTCTGCTGTA
AATACCTTTTGGACAAGAGGTGTGTTTTTGTCCTTTTGGATTTCTGCAGCAACTCCTTTA
ATATCCATCCCAGCACAAAAGGCACGAGGTGC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 8

CO CL652Contig1 997 8 20 U
GGGTATCGGAAGCTCCCTCTCCTTCCTCCTGATCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTTTG
TCTCCGTCCATATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCC
TCTTAACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTT
TCACACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCATAACAAACACAAGTC
TATGCTGCAAAACCCTTAAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGT
TAGCGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAAC
CAAAACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGA
ACTACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGT
TGGCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGA
CTTGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTG
TTGGGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTA
AGACGTTTGGTATTAAGGTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCAT
TGTCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATTTGG*ATGTAATAATT*GATTAATATCATCG
TATAATGCC*TAAAGCGTCGTGTATGG*TGTATGTTTT*AGGTTTTATACATGTACGGAC
GGATATTCGAGATGATTGGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTATTTTTTTGT
TGATTACTATTTGATAGATTTTGATGACTCGAATAAAGACACTTCCGCTGTCGTTCGTTA
GTGGGGAGAATCATTTGTAACAGCAAGTGCAACGCTG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE83TF U 1
AF RR4AP57TF U 3
AF RR4B593JQ C 198
AF RR4B593TF U 716
AF RR4BF95TF U 198
AF RR4GC19JQ C 392
AF RR4FE83JQ C 292
AF RR4AP57JQ C 288
BS 1 15 RR4FE83TF
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BS 17 375 RR4FE83TF
BS 376 376 RR4AP57TF
BS 377 676 RR4FE83TF
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BS 695 724 RR4AP57TF
BS 725 753 RR4B593TF
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BS 790 790 RR4BF95TF
BS 791 807 RR4B593TF
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BS 809 818 RR4B593TF
BS 819 819 RR4BF95TF
BS 820 895 RR4B593TF
BS 896 997 RR4AP57JQ

RD RR4FE83TF 694 0 0
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TCTCCGTCCATATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCC
TCTTAACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTT
TCACACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCATAACAAACACAAGTC
TATGCTGCAAAACCCTTAAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGT
TAGCGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAAC
CAAAACACAAATCGAGCGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGA
ACTACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGT
TGGCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGA
CTTGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTG
TTGGGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTA
AGACGTTTGGTATTAA*GTGAAGCTTAACGAGGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4AP57TF 722 0 0
GG
ATCGGAAGCTCCCTCTCCTTCCTCCTGATCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTT*GTCTC
CGTCCATATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTCTT
AACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTCAC
ACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCATAACAAACACAAGTCTATG
CCGCAAAACCCTTAAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGTTAGC
GGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAAA
ACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGAACTA
CGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGC
TCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTG
TTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGG
GAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGAC
GTTTGGTATTAAAGTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTGTC

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4B593JQ 698 0 0
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AAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGTTAGCGGCTGCGACTGAA
TCTTCCGTGTAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAAAACACAAATCGAAC
GCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGAACTACGCGTTGGAAGAT
TTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGCTCATAACTATTTC
ACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTTTGGATGATATT
GATGATAATAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGGGAAGAATCTAAGC
AGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGACGTTTGGTATTAAG
GTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTGTCGAATTATTACTTC
TGATTAAATGATTTGG*ATGTAATAATT*GATTAATATCATCGTATAATGCC*TAAAGCG
TCGTGTATGG*TGTATGTTTT*AGGTTTTATACATGTACGGACGGATATTCGAGATGATT
GGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTATTTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4B593TF 180 0 0
CCAT
TTGTCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATTTGGGATGTAATAATTTGATTAATATCATC
GTATAATGCCCTAAAGCGTCGTGTATGGGTGTATGTTTTTAGGTTTTATACATGTACGGA
CGGATATTCGAGATGATTGGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTATTTT

QA 5 180 5 180
DS 

RD RR4BF95TF 698 0 0
GCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCATAACAAACACAAGTCTATGCTGCAAAACCCTT
AAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGTTAGCGGCTGCGACTGAA
TCTTCCGTGTAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAAAACACAAATCGAAC
GCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGAACTACGCGTTGGAAGAT
TTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGCTCATAACTATTTC
ACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTTTGGATGATATT
GATGATAATAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGGGAAGAATCTAAGC
AGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGACGTTTGGTATTAAG
GTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTGTCGAATTATTACTTC
TGATTAAATGATTTGG*ATGTAATAATT*GATTAATATCATCGTATAATGCC*TAAAGCG
TCGTGTATGG*TGTATGTTTT*AGGTTTTATACATGTACGGACGGATATTCGAGATGATT
GGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTATTTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4GC19JQ 511 0 0
G
GCGATTTACAGCTGCCAGAAAAACTTGAACTACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGG
AACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACG
TTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTG
TTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGGGAAGAATTTAAGCAGTAATACGTTTGAT
GTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGACGTTTGGTATTAAGCTGAAGCTTAACGAG
GAAGACACTTCGCCCCAACCCCCCCCATTGTCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATTTG
G*ATGTAATAATT*GATTAATATCATCGTATAATGCC*TAGAGCGTCGTGTATGT*TGTA
TGTCCT*AGGTTTTATACATGTACGGACGGATATTCGAGATGATTGGAAAGGATATATAT
TAATGAAATGTGATCTTTATTTT
TTTGTTG

QA 2 504 2 504
DS 

RD RR4FE83JQ 604 0 0
TCCGAGCGTTAGCGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCG
AGATCAAACCAAAACACAAATCGAGCGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGA
AAAACCTGAACTACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATG
TAACGACGTTGGCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGT
ATCACTGGACTTGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTG
GGATCAGTGTTGGGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAA
CTATTTTTAAGACGTTTGGTATTAAGGTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAAC
CCCCACCATTGTCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATTTGG*ATGTAATAATT*GATTA
ATATCATCGTATAATGCC*TAAAGCGTCGTGTATGG*TGTATGTTTT*AGGTTTTATACA
TGTACGGACGGATATTCGAGATGATTGGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTA
TTTT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4AP57JQ 710 0 0
TTGATCCGAGCGTTAGCGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTC
TCCGAGATCAAACCAAAACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGC
CAGAAAAACCTGAACTACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAA
GATGTAACGACGTTGGCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATG
GGGTATCACTGGACTTGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAG
ACTGGGATCAGTGTTGGGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTG
AAAACTATTTTTAAGACGTTTGGTATTAAGGTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCC
CAACCCCCACCATTGTCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATTTGG*ATGTAATAATT*G
ATTAATATCATCGTATAATGCC*TAAAGCGTCGTGTATGG*TGTATGTTTT*AGGTTTTA
TACATGTACGGACGGATATTCTAGATGATTGGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATC
TTTATTTTTTTGTTGATTACTATTTGATAGATTTTGATGACTCGAATAAAGACACTTCCG
CTGTCGTTCGTTAGTGGGGAGAATCATTTGTAACAGCAAGTGCAACGCTG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 2 9

CO CL653Contig1 866 3 14 U
GGGAAGCAGAGAGGTCCCTGAAGAAATCGATCTTCGTCGTCTTCGATTCTGGAACCAGTC
CTGTGAGAGTAGCAATCCCCCCCTCAAATCAACGAAGATGCCGCAAGTTAAGATCATAGC
GAAAAACTTCATGGACATGGTGGCGTCTCTTACTGCCATCAAGCTAGATAAACTCTACAA
CAATGTCTTCATCTGCGAGGCCATTCTCAGGTCTTTGCCACCACTCGCCAAGAAATACGT
ATTGCAGTTTCTGTTCACTGATGAACCTGTACCTGCCAAGGATATTAAGGAGTGGGTGCT
TGCTGATGGCGTCTCTAAACACGGAGTTGCTATTGACCGATTGATTCAACTCAGGATTTT
TACTGAAACGGTTGTAACCGTAGATAGGAAAAAGGAAACCTGTTACAGCCTAAATCCTAC
ATTTCAGAAAAATCTTCAGAAACATATAATTTCTGGTGGAGTTTTGCCTCGGGAGCCTAT
GAACTCCAACAATGCCATTAAGCTTCCAAGTCTACAAGAACTCGAAACCTATGCACTTCA
GCAGTGGGAGTGTTTTTTGCTACAACTCATAAACTCGGGTCAAGGTGAGAAGCTAACCGG
CATCAGTTCGTCCATGATGAAAGTCTTCCAGCGAGGTTTATTGAGTCAGAGAGACAGAGA
TGGGCCGAGATTAACTGAGAGTGGCTTTCAGTTTTTGCTGATGGATACAAATGCCCAGCT
TTGGTACATTATCCGAGAATACATATCGAATGCCGAGGAGAGAGATGTAGATCCAGCAGA
CTTGATTTCGTTTTTGTTAGAGCTCAGTTTCCACGTTACCGGTGAGCGTATACTTAAATA
CCTTGACAGATGTTCAGAGACTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL63TF U 1
AF RR4A518TF U 11
AF RR4BJ32TF U 10
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BS 220 220 RR4BJ32TF
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DS 

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GG
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G

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DS 

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GGA
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CTGCGAGGCCATTCTCAGGTCTTTGCCACCACTCGCCAAGAAATACGTATTGCAGTTTCT
GTTCACTGACGAACCTGTACCTGCCAAGGATATTAAGGAGTGGGTGCTTGCTGATGGCGT
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AACTGAGAGTGGCTTTCAGTTTTTGCTGATGGATACAAATGCCCAGCTTTGGTACATTAT
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TT*GTTAGAGCTCAGTTTCCACGTTACCGGTGAGCGTATACTTAAATACCTTGACAGATG
TTCAGAGACTACAC

QA 4 857 4 857
DS 



CO CL653Contig2 1652 6 10 U
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TTTTCTTCTCACTTGCTATGGGTGTGAAGATACTCACGCATCTGATTGTGAACTTCGGAT
TTCACAACAAGTCGCATTCTCTTAGAATCTTCCCAAAGAAGACCTCCCAATTGTCTAGTA
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GGAATAGATGGGACTCTATCGGCACATCGTGGATGAGAATTCTGCTGGAGAAAAGTTATA
ATCTGCTCTGATGTGATGCCATTGTCAAATGCATTGTACAAACTCTCCTTTGTAATTGCA
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GCATTCGATATGTATTCTAGATATGTACCAAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX64TF U 1
AF RR4D174TF U 3
AF RR4D174JQ C 308
AF RR4EL63JQ U 797
AF RR4A518JQ U 748
AF RR4BJ32JQ U 770
BS 1 105 RR4FX64TF
BS 106 106 RR4D174TF
BS 107 438 RR4FX64TF
BS 439 439 RR4D174TF
BS 440 667 RR4FX64TF
BS 668 702 RR4D174TF
BS 703 747 RR4D174JQ
BS 748 1176 RR4A518JQ
BS 1177 1177 RR4EL63JQ
BS 1178 1652 RR4A518JQ

RD RR4FX64TF 667 0 0
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ACCGAAAGTTTTAAACCGGAGTTTCTCAATCCGTAATTGAGTACCTAAACGGGAATCCAT
TTGACTCTTGTTTAGAAAGATGAAGAAGCTGCTGGAGTTTGGGAGAAAAGCAATGTTCTA
TGTGAGAGTACTCTCTGGGTATGAAGAAAGGAGAATCCGTAATTACAGGTTGCAACTCGA
GAAGCGTATTCAGCAGGCCCAACAAAGGAAAGCAGAAATAAACAGACTCCCAGAGAAGAT
TGTGTTATCTGAAGTCCGCCGCATGGTTGAACAGATGCAGAATTTGAATAAGCAGATTGA
GAATACGGAGGCTCAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGACAAGCAAGCTGGTACGAT
AATGGAGGTTCAGCTGGAGTCAGAGAAGAAAACGATGGGGACAATGATGAACGCAACACA
AGAGGAAACCATAAGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGGTCGGGCACATGGAACTGC
AAATGCAACTGTAGATGCAAACATGGGAGAGAAATTCCAAGATTCACAATCCTCTGCCAA
TGAGAAAGTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGAGTCTTCTGAAAA*GTCCA
ATGTTTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4D174TF 700 0 0
GG
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AAAGTTTTAAACCGGAGTTTCTCAATCCGTAATTGAGTACCAAAACGGGAATCCATTTGA
CTCTTGTTTAGAAAGATGAAGAAGCTGCTGGAGTTTGGGAGAAAAGCAATGTTCTATGTG
AGAGTACTCTCTGGGTATGAAGAAAGGAGAATCCGTAATTACAGGTTGCAACTCGAGAAG
CGTATTCAGCAGGCCCAACAAAGGAAAGCAGAAATAAACAGACTCCCAGAGAAGATTGTG
TTATCTGAAGTCCGCCGCATGGTTGAACAGATGCAGAATTTGAATAAGCAGATTGAGAAT
ACGGAGGCTCAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGACAAGCAAGCTGGTACGATAATG
GAGGTTCAGCTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGACAATGATGAACGCAACACAAGAG
GAAACCATAAGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGGTCGGGCACATGGAACTGCAAAT
GCAACTGTAGATGCAAACATGGGAGAGAAATTCCAAGATTCACAATCCTCTGCCAATGAG
AAAGTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGAGTCTTCTGAAAA*GTCCAATGT
TTCAGATTCTCTGTTGGATTTTAATAATATGAATTGAC

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DS 

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GAGGCTCAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGACAAGCAAGCTGGTACGATAATGGAG
GTTCAGCTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGACAATGATGAACGCAACACAAGAGGAA
ACCATAAGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGGTCGGGCACATGGAACTGCAAATGCA
ACTGTAGATGCAAACATGGGAGAGAAATTCCAAGATTCACAATCCTCTGCCAATGAGAAA
GTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGAGTCTTCTGAAAAAGTCCAATGTTTC
AGATTCTCTGTTGGATTTTAATAATATGAATTGACTGAATAGAATCAAGACCGAGATTGT
GTTCTGCTTAGCGTGCAAGAGAACTTATAAGCTGGCTCTGGTTGAACTATCCAACAGCAA
CCTCGTTTTTGTCAATATAGTATATTGCACCATC
GTGAC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4EL63JQ 759 0 0
C
GTCAATATAGTATATTGCACCATCGTGTCAAAAACATATGTTGTAGTATCGAAAACATGA
CTTTTTTTTTTAACAATAAGAAAAGAAAATGGTCTGAGCCTCCTTTTCTTCTCACTTGCT
ATGGGTGTGAAGATACTCACGCATCTGATTGTGAACTTCGGATTTCACAACAAGTCGCAT
TCTCTTAGAATCTTCCCAAAGAAGACCTCCCAATTGTCTAGTAAAGTTACAAGCTCCTTC
AAACACATCCTTTGAAGGAAATTCATCATAGAAGTGAGCTTGTGTCATCTCGATTCTCTT
CAGATCAGACTCCCAAAGCCGTATCTGGTCGGTGACATTTTCTGGAATAGATGGGACTCT
ATCGGCACATCGTGGATGAGAATTCTGCTGGAGAAAAGTTATAATCTGCTCTGATGTGAT
GCCATTGTCAAATGCATTGTACAAACTCTCCTTTGTAATTGCACACGCAATAAGGTTTGG
AAGTTGGTACTCTATCCTCGCAAACAGACGTAAAATTTCACATTGTAGCTTAGATGTTGA
GTAAGCATACATCCTGAAGTTTGTTTCCATCATCACATATCCCTCTTTTCGGACTGATGA
ATCTGCAAGACTGACTGATAAATTTGTAGCCAGCTTAGTAGGAATAAACCAACTGTCTTT
CCTTCCCTGTTGAAGCTTGACTAATCCCAAGTCTGCAAGGTCCTTAAGTGTAGTTCTCTG
AACATCTGTCAAGGTATTTAAGTTATACGCCTCACCGG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4A518JQ 905 0 0
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TATATTGCACCATCGTGTCAAAAACATATGTTGTAGTATCGAAAACATGACTTTTTTTTT
*AACAATAAGAAAAGAAAATGGTCTGAGCCTCCTTTTCTTCTCACTTGCTATGGGTGTGA
AGATACTCACGCATCTGATTGTGAACTTCGGATTTCACAACAAGTCGCATTCTCTTAGAA
TCTTCCCAAAGAAGACCTCCCAATTGTCTAGTAAAGTTACAAGCTCCTTCAAACACATCC
TTTGAAGGAAATTCATCATAGAAGTGAGCTTGTGTCATCTCGATTCTCTTCAGATCAGAC
TCCCAAAGCCGTATCTGGTCGGTGACATTTTCTGGAATAGATGGGACTCTATCGGCACAT
CGTGGATGAAAATTCTGCTGGAGAAAAGTTATAATCTGCTCTGATGTGATGCCATTGTCA
AATGCATTGTACAAACTCTCCTTTGTAATTGCACACGCAATAAGGTTTGGAAGTTGGTAC
TCTATCCTCGCAAACAGACGTAAAATTTCACATTGTAGCTTAGATGTTGAGTAAGCATAC
ATCCTGAAGTTTGTTTCCATCATCACATATCCCTCTTTTCGGACTGATGAATCTGCAAGA
CTGACTGATAAATTTGTAGCCAGCTTAGTAGGAATAAACCAACTGTCTTTCCTTCCCTGT
TGAAGCTTGACTAATCCCAAGTCTGCAAGGTCCTTAAGTGTAGTTCTCTGAACATCTGTC
AAGGTATTTAAGTTATACGCCTCACCGGTAACGTGGAAACTGAGCTCTAACAAAAACGAA
ATCAAGTCTGCTGGATCTACATCTCTCTCCTCGGCATTCGATATGTATTCTAGATATGTA
CCAAA

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DS 

RD RR4BJ32JQ 862 0 0
A
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ACATATGTTGTAGTATCGAAAACATGACTTTTTTTTT*AACAATAAGAAAAGAAAATGGT
CTGAGCCTCCTTTTCTTCTCACTTGCTATGGGTGTGAAGATACTCACGCATCTGATTGTG
AACTTCGGATTTCACAACAAGTC*CATTCTCTTAGAATCTTCCTAAAGAAGACCTCCCAA
TTGTCTAGTAAAGTTACAAGCTCCTTCAAACACATCCTTTGAAGGAAATTCATCATAGAA
GTGAGCTTGTGTCATCTCGATTCTCTTCAGATCAGACTCCCAAAGCCGTATCTGGTCGGT
GACATTTTCTGGAATAGATGGGACTCTATCGGCACATCGTGGATGAGAATTCTGCTGGAG
AAAAGTTATAATCTGCTCTGATGTGATGCCATTGTCAAATGCATTGTACAAACTCTCCTT
TGTAATTGCACACGCAATAAGGTTTGGAAGTTGGTACTCTATC*TCGCAAACAGACGTAA
AATTTCACATTGTAGCTCAGATGTTGAGTAAGCATACATCCTGAAGTTTGTTTCCATCAT
CACATATCCCTCTTTTCGGAATGATGAATCTGCAAGACTGACTGATAAATTTGTAGCCAG
CTTAGTAGGAATAAACCAACTGTCTTTACTTCCCTGTTGAAGCTTGACTAATCCCAAGTC
TGCAAGGTCCTTAAGTGTAGTTCTCTGAACATCTGTCAAGGTATTTAAGTTATACGCCTC
ACCGGTAACGTGGAAACTGAGCTCTAACAAAAACGAAATCAAGTCTGCTGGATCTACATC
TCTCTCCTCGGCATTCGATAT

QA 2 862 2 862
DS 



AS 1 9

CO CL654Contig1 1151 9 43 U
GGGTTTCAGTTTGGTCCGAACAAAAATCAAAAAATCTTAACACCCCCTACCTTGACCATA
TTATTATTCTCCTCTCAATTCACCATTGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGAT
TGTTAACGCTGAGTACACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCAT
CTCGAGCAAGAACTGTGCTCCGATCATGCTTAGATTAGCATGGCACGATGCTGGAACCTA
TGATGCACAGTCGAAGACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACAC
TCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAA
ACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTAGAGGT
TACTGGTGGACCTGACATCAGCTTCCAACCGGGAAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAG
GGAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAAAATTTCAACATCTTAGAGATGTTTTCTACC
GCATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGGG
CTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCCC*TGAAGTTTGAT
AACTCATACTTTGTGGAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCT
GACAAGACTTTGTTGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCCAAGGAT
GAAGATGCATTCTTCAGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTC
AACCCCAACGCCTCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTCTGGCTCAGGGAGCT
TTCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCGGTCGTTGCCTTAAGTTACTTTTACGAGATCCGAAAG
AAGATGAAGTAAAAGGAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTTTTGCATTAAAGATA
CTATCCATCATCTATAGAATGTGTCATGCATGCTCCAAAGATGTTAAAACTCTTTAATCC
ACGGTCATACTATGTTGTAGTAAGAAAAGACAAAGTTAATGGTTTGGTTCATTACAACGT
TAGGGGTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 25 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ34TF U 1
AF RR4AH23TF U 10
AF RR4DK46TF U 16
AF RR4A195TF U 14
AF RR4A195TFB U 14
AF RR4A195JQD C 278
AF RR4A195JQ C 287
AF RR4B566TF U 708
AF RR4AH23JQ C 540
BS 1 211 RR4CJ34TF
BS 212 212 RR4AH23TF
BS 213 216 RR4CJ34TF
BS 217 217 RR4AH23TF
BS 218 258 RR4CJ34TF
BS 259 259 RR4AH23TF
BS 260 414 RR4CJ34TF
BS 415 415 RR4AH23TF
BS 416 428 RR4CJ34TF
BS 429 429 RR4AH23TF
BS 430 441 RR4CJ34TF
BS 442 442 RR4AH23TF
BS 443 450 RR4CJ34TF
BS 451 451 RR4AH23TF
BS 452 453 RR4CJ34TF
BS 454 454 RR4AH23TF
BS 455 510 RR4CJ34TF
BS 511 512 RR4A195TF
BS 513 514 RR4CJ34TF
BS 515 515 RR4A195TF
BS 516 532 RR4CJ34TF
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BS 534 619 RR4CJ34TF
BS 620 620 RR4AH23TF
BS 621 631 RR4CJ34TF
BS 632 632 RR4AH23TF
BS 633 634 RR4CJ34TF
BS 635 635 RR4AH23TF
BS 636 646 RR4CJ34TF
BS 647 647 RR4A195TF
BS 648 653 RR4CJ34TF
BS 654 654 RR4AH23TF
BS 655 671 RR4CJ34TF
BS 672 672 RR4AH23TF
BS 673 677 RR4CJ34TF
BS 678 678 RR4AH23TF
BS 679 692 RR4CJ34TF
BS 693 806 RR4AH23TF
BS 807 821 RR4A195TFB
BS 822 940 RR4B566TF
BS 941 941 RR4A195JQD
BS 942 1129 RR4B566TF
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RD RR4CJ34TF 694 0 0
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TTATTATTCTCCTCTCAATTCACCATTGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGAT
TGTTAACGCTGAGTACACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCAT
CTCGAGCAAGAACTGTGCTCCGATCATGCTTCGATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTA
TGATGCACAGTCGAAGACTGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACAC
TCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAA
ACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGT
TACTGGTGCACCTGACATCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAG
GGAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAAT*TTCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACC
GCATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGGG
CTCATCCAGAGAGGTCCGGATTCGATGGTCCCTG*ACTCAAGAGCCTC*TGAAATTTGAT
AACTCATACTTCGTGGA*CTGCTGAAAGGAGA
TC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4AH23TF 797 0 0
GGGGGT
CCGAACAAAAATCAAAAAATCTTAACACCCCCTACCTTGACCATATTATTATTCTCCTCT
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CACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTG
TGCTCCGATCATGCTTAGATTAGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTCGAA
GACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAG
TGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCAC
CTATGCGGATCTGTACCTGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTAGAGGTTACTGGTGGACCTGA
CATCAGCTTCCAATCGGGAAGAAAAGATTCAAATGTTT*CCCTAGGGAAGGAAGACTTCC
TGATGCTACAAAAAAT*TTCCAACATCTTAGAGATGTTTTCTACCGCATGGGATTATCTG
ATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGT
CCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCTC*TGAAGTTTGATAACTCATACTTTGTG
GAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTG
GAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTC
AGAGACTACGC

QA 7 797 7 797
DS 

RD RR4DK46TF 779 0 0
GG
GAACAAAAATCAAAAAATCTTAACACCCCCTACCTTGACCATATTATTATTCTCCTCTCA
ATTCACCATTGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTACA
CGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTGTG
CTCCGATCATGCTTCGATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTCGAAGA
CTGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTG
GTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACCT
ATGCGGATCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGACA
TCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCTG
ATGCTACAAAAAAT*TTCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACCGCATGGGATTATCTGAT
AAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCC
GGATTCGATGGTCTCTGGACTCAAGAGCCTC*TGAAGTTTGATAACTCATACTTCGTGGA
ACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGA
*GACC*AGAGTCCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTT

QA 3 779 3 779
DS 

RD RR4A195TF 792 0 0
GG
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CAATTCACCATTGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTA
CACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTG
TGCTCCGATCATGCTTAGATTAGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTCGAA
GACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAG
TGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCAC
CTATGCGGATCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTAGAGGTTACTGGTGGACCTGA
CATCAGCTTCCAACCGGGAAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCC
TGATGCTACAAAAAAAATTTCAACATCTTAGAGATGTTTTCTACCGCATGGGATTATCTG
ATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGT
CCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCCCCTGAAGTTTGATAACTCATACTTTGTG
GAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTG
GA*GACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTC
AGAGACTACG

QA 3 792 3 792
DS 

RD RR4A195TFB 808 0 0
GG
CCGAACAAAAATCAAAAAATCTTAACACCCCCTACCTTGACCATATTATTATTCTCCTCT
CAATTCACCATTGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTA
CACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTG
TGCTCCGATCATGCTTAGATTAGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTCGAA
GACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAG
TGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCAC
CTATGCGGATCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTAGAGGTTACTGGTGGACCTGA
CATCAGCTTCCAACCGGGAAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCC
TGATGCTACAAAAAAAATTTCAACATCTTAGAGATGTTTTCTACCGCATGGGATTATCTG
ATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGT
CCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCCC*TGAAGTTTGATAACTCATACTTTGTG
GAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTG
GAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTC
AGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAA

QA 3 808 3 808
DS 

RD RR4A195JQD 852 0 0
ATAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAA
ATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTGTACCAGCTT
GCTGGTGTGGTAGCAGTAGAGGTTACTGGTGGACCTGACATCAGCTTCCAACCGGGAAGA
AAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAAAATTTCA
ACATCTTAGAGATGTTTTCTACCGCATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTC
AGGGGGTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCGTGGAC
TCAAGAGCCCC*TGAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAACTGCTGAAAGGAGAATCAG
AGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTT
ATGTTGACCTTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTCAGAGACTACGCAGAATCTCACA
AGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACA
GCACTGTTCTGGCTCAGGGAGCTTTCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCGGTCGTTGCCTTAA
GTTACTTTTACGAGATCCGAAAGAAGATGAAGTAAAAGGAGCCACGAAGCAAAACGATTA
TCTTATCTTTTGCATTAAAGATACTATCCATCATCTATAGAATGTGTCATGCATGCTCCA
AAGATGTTAAAACTCTTTAATCCACGGTCATACTATGTTGTAGTAAGAAAAGACAAAGTT
AATGGTTTGGTT

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4A195JQ 843 0 0
GAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAG
GGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTGTACCAGCTTGCTGGTGTG
GTAGCAGTAGAGGTTACTGGTGGACCTGACATCAGCTTCCAACCGGGAAGAAAAGATTCA
AATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAAAATTTCAACATCTTAG
AGATGTTTTCTACCGCATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCA
CACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCC
CC*TGAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGT
TGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACC
TTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTCAGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCT
CTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTC
TGGCTCAGGGAGCTTTCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCGGTCGTTGCCTTAAGTTACTTTT
ACGAGATCCGAAAGAAGATGAAGTAAAAGGAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTT
TTGCATTAAAGATACTATCCATCATCTATAGAATGTGTCATGCATGCTCCAAAGATGTTA
AAACTCTTTAATCCACGGTCATACTATGTTGTAGTAAGAAAAGACAAAGTTAATGGTTTG
GTT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR4B566TF 428 0 0
GAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTCGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCT
TTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTCAGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTC
TGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTCT
GGCTCAGGGAGCTTTCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCGGTCGTTGCCTTAAGTTCCTTTTA
CGAGATCCGAAAGAAGATGAAGTAAAAGGAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTTT
TGCATTAAAGATACTATCCATCATCTATAGAATGTGTCATGCATGCTCCAAAGATGTTAA
AACTCTTTAATCCACGGTCATACTATGTTGTAGTAAGAAAAGACAAAGTTAATGGTTTGG
TT
CATTAC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR4AH23JQ 612 0 0
CGCATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGGTCACACTCTGGGAAGG
GCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCTC*TGAAGTTTGA
TAACTCATACTTTGTGGAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATC
TGACAAGACTTTGTTGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCCAAGGA
TGAAGATGCATTTTTCAGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTTTGAGCTCGGTTT
CAACCCTAACGCCTCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTTTGGCTCAGGGAGC
TTTCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCGGTCGTTGCCTTAAATTACTTTTACGAGATCCGAAA
GAAGATGAAGTAAAAGGAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTTTTGCATTAAAGAT
ACTATCCATCATCTATAGAATGTATCATGCATGCTCCAAAGATGTTAAAACTCTTTAATC
CACGGTCATACTATGTTGTAGTAAGAAAAGACAAAGTTAATGGTTTGGTTCATTACAACG
TTAGGGGTTCTG

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 9

CO CL655Contig1 553 9 7 U
GGAGGGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCA
AAAAAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGACTTCTACTCCTTCTG
CTGCTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
AATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGG
ATTTTTCTCTAAGACATTGCTGGGATTTTTACATAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGAT
CTTGGTTTCAGTC


BQ
30 30 30 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 

AF RR4CG02TF U 4
AF RR4BM58TF U 169
AF RR4CS02JQ C 4
AF RR4CS02TF U 4
AF RR4BR63JQ C 1
AF RR4CG02JQ C 4
AF RR4CC16JQ C 1
AF RR4BR63TF U 1
AF RR4CC16TF U 1
BS 1 3 RR4BR63TF
BS 4 168 RR4CS02TF
BS 169 198 RR4BM58TF
BS 199 199 RR4CS02TF
BS 200 485 RR4BM58TF
BS 486 532 RR4CS02TF
BS 533 553 RR4BR63TF

RD RR4CG02TF 280 0 0
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AAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACA
GTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTG
AGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGG
AGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCAT

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4BM58TF 320 0 0
AAGATGCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGGAGTCAGTGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCA
TTGCTGCTGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGACTT
CTACTCCTTCTGCTGCTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAG
AGAAGAAAGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGA
GAACCGTTTTTTAATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTA
GTTTGTACTCGGATTTT
CTC

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR4CS02JQ 529 0 0
GGGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAAAA
AAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACA
GTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTG
AGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGG
AGAAGTTGGCTTCCGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGACTTCTACTCCTTCTGCTG
CTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGA
AGGAAGAATCCGATGATGACATAGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTTAAT
GCCATCTTCTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGGATT
TTTCTCTAAGACATTGCTGGGATTTTTACATAATTAGTAAGCTGCGGTC

QA 1 529 1 529
DS 

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CTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGA
AGGAAGAATCCGATGATGACATAGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTTAAT
GCCATCTTCTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGGATT
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CTGCTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
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CTTGGTTTCAGTC

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DS 

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AAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACA
GTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTG
AGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGG
AGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGACTTCTACTCCTTCTGCTG
CTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGA
AGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCTTTTTTTAAT
GCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGGATT
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GGTTTC
T

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DS 

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CTGCTGGTGGCGGTGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
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CTTGGTTTCAGTC

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DS 

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AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
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CTTGGTTTCAGTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4CC16TF 553 0 0
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AAAAAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
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AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
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CTTGGTTTCAGTC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 2 9

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ATTGTATATTCTGTTTCTCTGTTACATTTCCTTTTCCT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4EC33TF U 1
AF RR4EG31JQ C 74
AF RR4EG31TF U 1
AF RR4EC33JQ C 121
BS 1 638 RR4EC33TF

RD RR4EC33TF 638 0 0
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QA 1 638 1 638
DS 

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TCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGATTTAGAATACTTG
GGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTTTACGGCTTTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCT
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AAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGCTTCCTCCACCGGA
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QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4EG31TF 638 0 0
GGA
AACAAATTCTTAATCACCCATTGTTAGCCACAACAACAGAGAATAGTGATCAAACCTCAT
GGCGTCTCTTGCAACCGTCGCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTAAAAGGTCTTGGCGG
CAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCTTAAGCATCAAAACCAA
ATCAATTCGGTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGATTT
AGAATACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTCTACGGCTCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACAAAGAGAGG
ATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGCTTC
CTCCACCGGAGATGTTCTTCCCATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
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GTATATTCTGTTTCTCTGTTACATTTCCTTTTCCT

QA 4 638 4 638
DS 

RD RR4EC33JQ 518 0 0
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CAAATCAATTCGGTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGA
TTTAGAATACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTTTACGGCTTTGATGCTCCTTC
TCCTTACAACCCTTTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACAAAGAG
AGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGC
TTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCCATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGG
TCCTCGCGGCAAACTCTGATTTAGATTTTCATGCATATGTTTTGTTACCTTCTTTCCCCC
TCTTTATAATCCCATAAACATTTCTCAATACCGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTTT
ATTGTATATTCTGTTTCTCTGTTACATTTCCTTTTCCT

QA 1 518 1 518
DS 



CO CL656Contig2 657 5 5 U
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CAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGTCGCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAG
GCCTTGGGGGCAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCA
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CTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCGGCACCATTCA
CAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATG
TCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTA
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GATTTTATTGTATATTCTGTTTCTCTGTTACATTTCCTTTTCCTAATTTTACAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE78JQ C 1
AF RR4FE78TF U 1
AF RR4BP08TF U 28
AF RR4EO39JQ C 228
AF RR4EO39TF U 228
BS 1 10 RR4FE78JQ
BS 11 471 RR4FE78TF
BS 472 472 RR4BP08TF
BS 473 623 RR4FE78TF
BS 624 657 RR4BP08TF

RD RR4FE78JQ 625 0 0
GGATCTCTTCAACAAATTCTTAATCACCCATTGTTAGCCACAACAACAGAAAATAGTGAT
CAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGTCGCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAG
GCCTTGGGGGCAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCA
TCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTTT
ACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTGATG
CTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCGGCACCATTCA
CAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATG
TCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAGGGGAAGCCTA
AGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTAGATTCATGCACATGTTTTGTTACCTTCTTT
CCCCCTCTTTATAATCCCCAAAAACATTTCTCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGATTTT
GATTTTATTGTATATTCTGTTTC
CC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4FE78TF 625 0 0
GGATCTCTTC
AACAAATTCTTAATCACCCATTGTTAGCCACAACAACAGAAAATAGTGATCAAACCTCAT
GGCGTCTCTTGCAACCGTCGCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAGGCCTTGGGGG
CAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCATCAAAACCAA
ATCAATCCGGTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTTTACTTTGACTT
AGAAGACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCGGCACCATTCACAAAGAGAGG
ATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGCTTC
CTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAGGGGAAGCCTAAGCTCGGTCC
TCGCGGCAAACTCTGATTTAGATTCATGCACATGTTTTGTTACCTTCTTTCCCCCTCTTT
ATAATCCCCAAAAACATTTCTCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTTTATTG
TATATTCTGTTTC
CC

QA 11 623 11 623
DS 

RD RR4BP08TF 630 0 0
GG
ATTGTTAGCCACAACAACAGAAAATAGTGATCAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGTC
GCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAGGCCTTGGGGGCAGCTCACTCGCCGGAGCC
AAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCATCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGT
GTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTTTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACA
ACAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGC
AAGTTCTTTGAGACATTCGCGGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTG
ATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTT
CCTATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTT
AGATTCATGCACATGTTTTGTTACCTTCTTTCCCCCTCTTTATAATCCCCAAAAACATTT
CTCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTTTATTGTATATTCTGTTTCTCTGTT
ACATTTCCTTTTCCTAATTTTACAAATC

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR4EO39JQ 419 0 0
GACAAAAGTGTTTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTA
TACGGCTTTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTC
GCGGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCT
TTGCTTACTTATGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCT
CAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTTTGATTTAGATTCATGCACATGTTT
TGTTACCTTCTTTCCCCCTCTTTATAATCCCCAAAAACATTTCTCAATACTGCAAACTCT
TTTAAGTGATTTTGATTTTATTGTATATTCTGTTTCTCTGTTACATTTCCTTTTCCT
AG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4EO39TF 419 0 0
GACAAAAGTGTTTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTA
TACGGCTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTC
GCGGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCT
TTGCTTACTTATGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCT
CAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTAGATTCATGCACATGTTT
TGTTACCTTCTTTCCCCCTCTTTATAATCCCCAAAAACATTTCTCAATACTGCAAACTCT
TTTAAGTGATTTTGATTTTATTGTATATTCTGTTTCTCTGTTACATTTCCTTTTCCT
AG

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 8

CO CL657Contig1 1015 8 15 U
GAATTTTTAGAGATTTTGTACATAATTTGCGTTCATATATGCACAAAGAGAAACACATAA
ATGTAAGTTGGACAAGGAAAGAAAAAACTAACAAAAACTTCCACATTATCCACAATCAAG
AGTCAATGAATGTGTACACCATGTGCCTTTAACTTAAACTCAGTCTTGGTGGATTTCATC
AAAAGGGGCAGGAGCAAACCTAACATCTTCTGGCCGTGCAATCACCACAGGCTCATCAGC
GAAAAGGGCTTTGAGGAAAGATGGAGTCTTCAAGGGTCGCCTATCAGTCATTCGTGGATA
GACAAATGCCAAAAAGTAATAGGCGTGACCTGCTATCATTCCCAGTAAATCCCCCC*AGG
GACTTGCACCAACAAGGACAGAGAATCCAAGAAGCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAA
AAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACA
CCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAAT
AAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACAATGCCGGTAAGAACAGTTGCCCCGAACAAGAGCA
TGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTCCCCCTGAAAGAGTTTTCTTCCAGGAGTTTGCAGTATC
TAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAGAAGTCCAAATCCATATTGCGGAAATAAAGAAAAT
TGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTACTGCTTCACCACAAGGGTCGGATTCAGGTACAGAT
TATACGGTGATATTATCTCGAGGGAACATCCGACGGTGGTGACAACAGCAGCCGTGAGAT
ACGATCTTGTTATAATCGGCATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTTGAGCCATAAATT
TGACAACAGATATTCCACCTAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAGCTCTTCAGAAACGA
AAGCGATTGAAATTGTTTTCTTTTTTGCTTTTTCCTTTCCCGCACGTATGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EM15JQ U 1
AF RR4FP70JQ U 87
AF RR4AE45JQ U 21
AF RR4FW93JQ U 87
AF RR4EP13TF C 181
AF RR4FW93TF C 227
AF RR4AE45TF C 334
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BS 190 190 RR4AE45JQ
BS 191 226 RR4EM15JQ
BS 227 227 RR4AE45JQ
BS 228 308 RR4EM15JQ
BS 309 309 RR4AE45JQ
BS 310 358 RR4EM15JQ
BS 359 359 RR4AE45JQ
BS 360 550 RR4EM15JQ
BS 551 799 RR4AE45JQ
BS 800 832 RR4FW93JQ
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BS 988 1009 RR4EP13TF
BS 1010 1015 RR4AE45TF

RD RR4EM15JQ 550 0 0
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ATGTAAGTTGGACAAGGAAAGAAAAAACTAACAAAAACTTCCACATTATCCACAATCAAG
AGTCAATGAATGTGTACACCATGTGCCTTTAACTTAAACTCAGTCTTGGTGGATTTCATC
AAAAGGGGCGGGAGCAAACCTAACATCTTCTGGCCGTGCAATCACCGCAGGCTCATCAGC
GAAAAGGGCTTTGAGGAAAGATGGAGTCTTCAAGGGTCGCCTATCAGTCATTCGTGGATA
GACAAATGGCAAAAAGTAATAGGCGTGACCTGCTATCATTCCCAGTAAATCCCCCC*AAG
GACTTGCACCAACAAGGACAGAGAATCCAAGAAGCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAA
AAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACA
CCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAAT
AAGGTATGGT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4FP70JQ 670 0 0
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CTTTAACTTAAACTCAGTCTTGGTGGATTTCATCAAAAGGGGCAGGAGCAAACCTAACAT
CTTCTGGCCGTGCAATCACCACAGGCTCATCAGCGAAAAGGGCTTTGAGGAAAGATGGAG
TCTTCAAGGGTCGCCTATCAGTCATTCGTGGATAGACAAATGCCAAAAAGTAATAGGCGT
GACCTGCTGTCATTCCCAGTAAATCCCCCC*AGGGACTTGCACCAACAAGGACAGAGAAT
CCAAGAAGCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATG
TGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTG
AGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACA
ATGCCGGTAAGAACAGTTGCCCCGAACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTCCCC
CTGAAAGAGTTTTCTTCCAGGAGTTTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAG
AAGTCCAAATCCATATTGCGGAAATAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTAC
TGCTTCACCA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4AE45JQ 784 0 0
CAT
AATTTGCGTTCATATATGCACAAAGAGAAACACATAAATGTAAGTTGGACAAGGAAAGAA
AAAACTAACAAAAACTTCCACATTATCCACAATCAAGAGTCAATGAATGTGTACACCATG
TGCCTTTAACTTAAACTCAGTCTTGGGGGATTTCATCAAAAGGGGCAGGAGCAAACCTAA
CATCTTCTGGCCGTGCAATCACCACAGGCTCATCAGCGAAAAGGGCTTTGAGGAAAGATG
GAGTCTTCAAGGGTCGCCTATCAGTCATTCGTGGATAGACAAATGCCAAAAAGTAATAGG
CGTGACCTGCTATCATTCCCAGTAAATCCCCCC*AGGGACTTGCACCAACAAGGACAGAG
AATCCAAGAAGCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTC
ATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTG
CTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGG
ACAATGCCGGTAAGAACAGTTGCCCCGAACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTC
CCCCTGAAAGAGTTTTCTTCCAGGAGTTTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATGGAAC
AAGAAGTCCAAATCCATATTGCGGAAATAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGG
TACTGCTTCACCACAAGGGTCGGATTCAGGTACAGATTATACGGTGATATTATCTC
AGGGG

QA 4 779 4 779
DS 

RD RR4FW93JQ 746 0 0
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CTTTAACTTAAACTCAGTCTTGGTGGATTTCATCAAAAGGGGCAGGAGCAAACCTAACAT
CTTCTGGCCGTGCAATCACCACAGGCTCATCAGCGAAAAGGGCTTTGAGGAAAGATGGAG
TCTTCAAGGGTCGCCTATCAGTCATTCGTGGATAGACAAATGCCAAAAAGTAATAGGCGT
GACCTGCTGTCATTCCCAGTAAATCCCCCC*AGGGACTTGCACCAACAAGGACAGAGAAT
CCAAGAAGCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATG
TGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTG
AGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACA
ATGCCGGTAAGAACAGTTGCCCCGAACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTCCCC
CTGAAAGAGTTTTCTTCCAGGAGTTTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAG
AAGTCCAAATCCATATTGCGGAAATAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTAC
TGCTTCACCACAAGGGTCGGATTCAGGTACAGATTATACGGTGATATTATCTCGAGGGAA
CATCCGACGGTGGTGACAACAGCAGC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4EP13TF 831 0 0
ATCAAAAGGGCAGAGCAAA
CTAACATCTTCTG*CCGTGCAATCACCACAGGCTCATCAGCGAAAAGGGCTT*GAGGAAA
GATGGAGTCTTCAAGGGTCGC*TATCAGTCATTCGTGGATAGACAAATGCCAAAAAGTAA
TAGGCGTGAC*TGCTATCATTCCCAGTAAATCCCCCC*AGGGACTTGCACCAACAAGGAC
AGAGAATCCAAGAAGCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAA
ACTCATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACACCATCATGAAAGTCAAAGA
GTTGCTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAAT
TAGGACAGTGCCGGTAAGAACAGTTGCCCCGAACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGT
CTTCCCCCTGAAAGAGTTTTCTTCCAGGAGTTTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATG
GAACAAGAAGTCCAAATCCATATTGCGGAAATAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAA
CTGGTACTGCTTCACCACAAGGGTCGGATTCAGGTACAGATTATACGGTGATATTATCTC
GAGGGAACATCCGACGGTGGTGACAACAGCAGCCGTGAGATACGATCTTGTTATAATCGG
CATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTTGAGCCATAAATTTGACAACAGATATTCCACC
TAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAGCTCTTCAGAAACGAAAGCGATTGAAATTGTTTT
CTTTTTTTCTTTTTCCTTTCCCGCACGTAT
CC

QA 20 829 20 829
DS 

RD RR4FW93TF 765 0 0
CACA
GCTCATCAGCGAAAAGGGCTT*GAGGAAAGATGGAGTCTTCAAGG*TCGC*TATCAGTCA
TTCGTG*ATAGACAAATGCCAAAAAGTAATAGGCGTGAC*TGCTGTCATTCCCAGTAA*T
CCCCCC*AGGGACTTGCACCAACAAGGACAGAGAATCCAAGAAGCACCCATGGTAAATAC
GCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTC
CACACATACACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTGAG
ACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACAATGCCGGTAAGAACAGTTGCCCCG
AACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTCCCCCTGAAAGAGTTTTCTTCCAGGAGT
TTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAGAAGTCCAAATCCATATTGCGGAAA
TAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTACTGCTTCACCACAAGGGTCGGATTC
AGGTACAGATTATACGGTGATATTATCTCGAGGGAACATCCGACGGTGGTGACAACAGCA
GCCGTGAGATACGATCTTGTTATAATCGGCATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTTGA
GCCATAAATTTGACAACAGATATTCCACCTAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAGCTCT
TCAGAAACGAAAGCGATTGAAATTGTTTTCTTTTTT
TCTTT

QA 5 760 5 760
DS 

RD RR4AE45TF 682 0 0
TATCATTCCCAGTAAATCCCCCCCAGGGACTTGCACCAACAAGGACAGAGAATCCAAGAA
GCACCCATGGTAAATACGCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATGTGGACGT
AAGGATTCTGTTTGCTCCACACATACACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTGAGGAAAA
TGATCTGGGAGATTGAGACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACAATGCCGG
TAAGAACAGTTGCCCCGAACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTCCCCCTGAAAG
AGTTTTCTTCCAGGAGTTTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAGAAGTCCA
AATCCATATTGCGGAAATAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTACTGCTTCA
CCACAAGGGTCGGATTCAGGTACAGATTATACGGTGATATTATCTCAGGGGAACATCCGA
CGGTGGTGACAACAGCAGCCGTGAGATACGATCTTGTTATAATCGGCATCTGCTTGTACC
ATTCTTCCACCGCTTGAGCCATAAATTTAACAACAGATATTCCACCTAATCGCCCGATTG
GATTCAGAATCAGCTCTTCAGGAACGAAAGCGATTGAAATTGTTTTCTTTTTT*CTTTTT
CCTTTCCCGCACGTATGAATCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4AI90TF 663 0 0
ATCCCCCC*AGGGACTTGCACCAACAAGGACAGAGAATCCAAGAAGCACCCATGGTAAAT
ACGCTGCAGTAAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGC
TCCATACATACACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTG
GGACTGACAAATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACAATGCCGGTAAGAACAGTTGCCC
CGAACAAGAGCATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTTCCCCTGAAGGAGTTCTCTTCAAGGA
GTTTGCAGTATCTAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAGAAGTCCAAATCCATATTGCGGA
AATAAAGAAAATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTACTGCTTCACCACAAGGGTCGGAT
TCAGGTACAGATTATACGGTGATATTATCTCGAGGGAACATCCGACGGTGGTGACAACAG
CCGCCGTGAGATACGACCTTGTTATAATCGGCATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTT
GAGCCATAAATTTGACAACAGATATTCCACCTAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAGCT
CTACAGAAACGAAAGCGATTGAAATTGTTTTCTTTTTTGCTTTTTCCTTTCCCGCACGTA
T
CC

QA 1 661 1 661
DS 



AS 2 7

CO CL658Contig1 1170 3 8 U
GGAAACCAAAACACTGTCTGAACAAAAAAACTTGTCTTTCTGTTTGAACCAAAATCAAGA
ACAATGGCTTGCAGTAATCTAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGAT
TCCTCTTCCTTGTCCTTCCGTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTTCGTGAGCTCAGAGACCG
AATCGACTCAGTCAAAAACACCCAGAAGATCACTGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCAGC
AAAAGTCAGGAGAGCTCAAGAAGCGGTCGTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGT
CGAAGTTCTTTACAACATCAACGAACAGCTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTT*AA
CCAAGATAAGACCGGTTAAGAAGGTTGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTAT
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GCTTAGGTCTTGACTACACAGTCATTAGCGTGGGG*AAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTC
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TCGGACAGCAACTGCTGATTTCTCGCCGATCTTGCAGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGAT
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GTTTCTTAAATATATATCATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGAACTCCTATGA
TCTTTATATAATCATGCAATTACAAACATAATGCGGTTGTATTTATTTTTGTTTTTCATT
GGATAAATGATTAAGAAAAAACTTCGAGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AY46TF U 1
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T

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AATCGACTCAGTCAAAAACACCCAGAAGATCACTGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCAGC
AAAAGTCAGGAGAGCTCAAGAAGCGGTCGTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGT
CGAAGTTCTTTACAACATCAACGAACAGCTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTT*AA
CCAAGATAAGACCGGTTAAGAAGGTTGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTAT
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AGACGAGTTCT

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TGGATAAATGATTAAGAAAAAACTTCGAGAT

QA 1 871 1 871
DS 



CO CL658Contig2 733 4 5 U
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TGCTGGAGCTAATGCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAATATATATC
ATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGA*CTCCTATGATCTTTATATAATCATGCA
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AAACTTCGTGATG


BQ
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25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4CU07JQ C 1
AF RR4BZ23JQ C 136
AF RR4BZ23TF U 136
AF RR4G719TF U 180
BS 1 137 RR4CU07JQ
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RD RR4CU07JQ 714 0 0
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TGTCTTCTCTCTGTTTATAAGCGAGGAAGTCGACAAAGTGGAGCTCTTGTACACGAAGTT
TGTGTCTTTGGTCAGATCAGAACCCGTGATCCACACGCTACTGCCTCTATCACCCAAAGG
AGAGATCTGTGACATCAACGGGAACTGTGTTGACGCTGCTGAAGACGAGTTCTTCAGGTT
GACGACGAAAGAAGGGAAGCTGGCGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGTAACTGCTGA
TTTCTCGCCGATCTTGCAGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCC
TTTGTATCTGAACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGC
GGCTCGGATGAGTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCT
TTCCATGGTTTATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGT
TGCTGGAGCTAATGCACAGGCTTGATCCAATATGAGCAGGTTGTTTCTTAAATATATATC
ATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGAACTCCTATGATCTTTATATAATCATGCA
ATTACAAACATAATGCGGTTGTATTTATTTTTGTTTTTCATTGGATAAATGATT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4BZ23JQ 598 0 0
GG
CAGAACCCGTGATCCACACGCTACTGCCTCTATCACCCAAAGGAGAGATCTGTGACATCA
ACGGGAACTGTGTTGACGCTGCTGAAGACGAGTTCTTCAGGTTGACGACTAAAGAAGGGA
AGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTGATTTCTCGCCGATCTTGC
AGTTCGAGCAAGACCCCGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATTTGAACAGTC
AGATTTTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGCAGCTCGGATGAGTGCGA
TG*GTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCTTTCCATGGTTTATAATA
GAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCTAATGCAC
AGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAATATATATCATTTTCGGTCGTATAAT
GTATAATCGTCTAGA*CTCCTATGATCTTTATATAATCATGCAATTACAAACATAATGCG
GTTGTATTTATTTTGGTCTTTCATTGGATAAATGATTAAGAAAAAACTTCGTGATG

QA 3 598 3 598
DS 

RD RR4BZ23TF 598 0 0
GG
CAGAACCCGTGATCCACACGCTACTGCCTCTATCACCCAAAGGAGAGATCTGTGACATCA
ACGGGAACTGTGTTGACGCTGCTGAAGACGAGTTCTTCAGGTTGACGACTAAAGAAGGGA
AGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTGATTTCTCGCCGATCTTGC
AGTTCGAGCAAGACCCCGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATCTGAACAGTC
AGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGCAGCTCGGATGAGTGCGA
TG*GTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCTTTCCATGGTTTATAATA
GAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCTAATGCAC
AGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAATATATATCATTTTCGGTCGTATAAT
GTATAATCGTCTAGA*CTCCTATGATCTTTATATAATCATGCAATTACAAACATAATGCG
GTTGTATTTATTTTGGTCTTTCATTGGATAAATGATTAAGAAAAAACTTCG
TGATG

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR4G719TF 543 0 0
GAGAGATCTGTGACATCAACGGGAACTGTGTTGACGCTGCTGAAGACGAGTTCTTCAGGT
TGACGACTAAAGAAGGGAAGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTG
ATTTCTCGCCGATCTTGCAGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGC
CTTTGTATCTGAACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCG
CAGCTCGGATGAGTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGC
TTTCCATGGTTTATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTG
TTGCTGGAGCTAATGCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAATATATAT
CATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGA*CTCCTATGATCTTTATATAATCATGC
AATTACAAACATAATGCGGTTGTATTTATTTTGGTCTTTCATTGGATAAATGATTAAGAA
AAA

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 9

CO CL659Contig1 1316 9 34 U
GGACCACGCACTCTCTTTCTCTTCTTATATATTCATTACATACTCTCTCTCATTTTCTTG
TTCATGCATTCTTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACC
GAGCTTGCCGGAGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCC
AAGGTTGCCTACAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGAC
GATGTTGGTGGGAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGG
GGTGTTTTTCAGGTGGTCGATCATGGAGTTGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGT
CTCGCTCGTGACTTCTTCGCTCTAACTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGT
GGTAAAAAGGGAGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGG
AGAGAGATCGTGACGTATTCCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCG
ACTAAGCCGGAAGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTG
GCTTGTAAACTTCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACC
AATGCATGCGTCGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAG
CCTGATCTAACCCTCGGACTCAAGCGTCACACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTC
CAGGACCAAGTCGGTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTT
CAGCCTGTTGAAGGAGCTTTTGTTGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAAC
GGGAGGTTCAAGAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCA
ATAGCCACGTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAA
GGAGAGAAGCCGATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATG
AGTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAG
GAAGCTGCCAAGCCTCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTA
TTGTGTTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAATTTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAT
TTGTGTTGTATCTCTTTTCTATCATATATAAATAATGATAATAATGTCTATGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 10 40 40 40 10 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4G535TF U 1
AF RR4G422TF U 72
AF RR4DZ12TF U 841
AF RR4EG17TF U 545
AF RR4G422JQ C 552
AF RR4G535JQ C 726
AF RR4GZ25JQ C 740
AF RR4GZ25TF U 630
AF RR4H811JQB C 630
BS 1 119 RR4G535TF
BS 120 120 RR4G422TF
BS 121 270 RR4G535TF
BS 271 271 RR4G422TF
BS 272 392 RR4G535TF
BS 393 393 RR4G422TF
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BS 412 412 RR4G422TF
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BS 575 618 RR4G535TF
BS 619 619 RR4G422TF
BS 620 651 RR4G535TF
BS 652 792 RR4G422TF
BS 793 793 RR4EG17TF
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BS 810 1180 RR4EG17TF
BS 1181 1181 RR4GZ25TF
BS 1182 1190 RR4EG17TF
BS 1191 1191 RR4GZ25TF
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BS 1235 1235 RR4GZ25TF
BS 1236 1253 RR4EG17TF
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BS 1256 1258 RR4EG17TF
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BS 1261 1277 RR4EG17TF
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BS 1279 1288 RR4EG17TF
BS 1289 1293 RR4GZ25TF
BS 1294 1316 RR4G422JQ

RD RR4G535TF 654 0 0
GGACCACGCACTCTCTTTCTCTTCTTATATATTCATTACATACTCTCTCTCATTTTCTTG
TTCATGCATTCTTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACT
GAGCTTGCCGGAGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCC
AAGGTTGCCTACAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGAC
GATGTTGGTGGGAAAAGAGGAGAGATCTGTTGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGG
GGTGTTTTTCAGGTGGTCGATCATGGAGTTGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGT
CTCGCTCGTGACTTCTTCGCTCTAACTCCTGATGAGAAACTGAAGTTCGACGTGTCCGGT
GGTAAAAAGGGAGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGG
AGAGAGATCGTGACGTATTCCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCG
ACTAAGCCGGAAGGGTGGGTGAAAGTGGCGGAG*AGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTG
GCTTGTAAACTTCTTGAG*TTTTGTCTGAAGCTATGGGACTTGAGAAAGAG
CAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4G422TF 738 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTTGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTCTTCGCTTTAGCTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCAAGCGTCACACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCAAGT
CTGTGGTTTACAAGCCAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4DZ12TF 419 0 0
G
AGCCTGTTGAAGGAGCTTTTGTTGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACG
GGAGGTTCAAGAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAA
TAGCCACGTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAG
GAGAGAAGCCGATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGA
GTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGG
AAGCTGCCAAGCCTCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCATTGTGTTGGGCCCTTGCTAT
TGTGTTGGTTCGGTTGTGTACGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGG
TGACA

QA 2 414 2 414
DS 

RD RR4EG17TF 744 0 0
GGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCAAGCGTCCCACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCAAGT
CGGTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTTCAGCCTGTTGA
AGGAGCTTTTGTTGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAA
GAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTT
CCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCC
GATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATAT
TGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAA
GCCTCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCATTGTGTTGGGCCCTTGCTATTGTGTTGGTT
CGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAA*TTAAGTTATGTCATGTTGT*TGACATTGTGTTGTAT
CTCTTT*CTATCATATA

QA 8 744 8 744
DS 

RD RR4G422JQ 765 0 0
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCAAGCGTCACACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCAAGT
CGGTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTTCAGCCTGTTGA
AGGAGCTTTTGTTGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAA
GAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTT
CCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCC
GATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATAT
TGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAA
GCCTCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCATTGTGTTGGGCCCTTGCTATTGTGTTGGTT
CGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGG*TGACATTGTGTTGTAT
CTCTTTTCTATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGC

QA 1 765 1 765
DS 

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TCTAACCCTCGGACTCAAGCGTCACACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGA
CCAAGTCGGTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTTCAGCC
TGTTGAAGGAGCTTTTGTTGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAG
GTTCAAGAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGC
CACGTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGA
GAAGCCGATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAG
AGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGC
TGCCAAGCCTCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTG
TTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAATTTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAATTTGTG
TTGTATCTCTTTTCTATCATATATAAATAATGATAATAATGTCTATGAC
AC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4GZ25JQ 577 0 0
TCAAGCGTCACACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCAAGTCGGTGGTT
TACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTTCAGCCTGTTGAAGGAGCTT
TTGTTGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATTTGAGCAACGGGAGGTTCAAGAACGCGG
ATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTCCAGAATC
CGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGATCCTGG
AGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTGAGCTGG
CTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAGCCTCTCG
ACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTCGGTTGTG
TAAGTTGGTACTGAATTTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAATTTGTGTTGTATCTCTTTTC
TATCATATATAAATAATGATAATAATGTCTATGAC
GC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4GZ25TF 664 0 0
GGT
TATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTCGATATGGACCAGAAAATAGT
TGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAACCCTCGGACTCAAGCGTCACAC
CGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCAAGTCGGTGGTTTACAAGCCACACG
AGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTTCAGCCTGTTGAAGGAGCTTTTGTTGTTAATCT
CGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAGAACGCGGATCACCAGGCGGT
GGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGC
AACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGATCCTGGAGGAGCCTATTAC
GTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAA
GCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAGCCTCTCGACCAAATCATCGC
TTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTG
AATTTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAATTTGTGTTGTATCTCTTTTCTATCATATATAAA
T

QA 4 664 4 664
DS 

RD RR4H811JQB 687 0 0
GGT
TATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTCGATATGGACCAGAAAATAGT
TGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAACCCTCGGACTCAAGCGTCACAC
CGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCAAGTCGGTGGTTTACAAGCCACACG
AGACGATGGGAAGACATGGATCACGGTTCAGCCTGTTGAAGGAGCTTTTGTTGTTAATCT
CGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAGAACGCGGATCACCAGGCGGT
GGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGC
AACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGATCCTGGAGGAGCCTATTAC
GTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAA
GCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAGCCTCTCGACCAAATCATCGC
TTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTG
AATTTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAATTTGTGTTGTATCTCTTTTCTATCATATATAAA
TAATGATAATAATGTCTATGAC
GC

QA 4 685 4 685
DS 



AS 1 8

CO CL660Contig1 1296 8 7 U
TTTTTCACTTCACAAACAAATGGATAATATAACACCATAAAGGTAAAATTTAACCGTGGT
GCAGGTGCTATTATAGTAAGATCATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGTGAA
GCTAGACGAACATCATTCACTAAAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGATGG
TCCATTGTTTTGTAATACTAAACCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTT
CTACGATAACTTGCTTTAAGGTTTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTACCA
GCGTTTGTGGAGGAGCAAAGTACATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAAGA
AAAGCTGGACCGTTGGTTTGAAGCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCA
TCGCCATTGATGTAGAATACACCTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAGAGA
CGAGTAAGCCGGTGGATCCGAGATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGCCAT
CAAAGATACGTTGCCACCAAGGGCCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAA
GCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGC
TGTCATTGTTTCTCTTCACCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGG
CAGAGAGGATGCCCAACAAATAGCCTTGTATTGGTGCTGTGAATAGGGAATCACATGAAG
CTTCTCCGCAACCCTTGATCTGGCTGG*TGGTAGTTCCAACAGCTAAAAGACCAATAGCC
ATCCACTGAAGGTTTGATAATTTCCTCTTCAAAAATAACCTAAAGAGAATGGCAGTGGTG
ACGATCTTGAGGTTACCCATGATTTGATAAGTGGAAGTGTCGACAAAAGTGAGAGTAGCA
AACTGGACATTGTTATGGATGAGATAGATAATTGAAGGAATAACAAATAAGCGCACGCTC
TTCCAATCCTTAGTAATCTTTGCAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCTTGGTC
TCTCTCCAGAGAAACAAACCAGAAATGATCAGCTTGAGAACTTCGGCAAGAAAGGGAACG
GTAGCATAATCGTACTTATAACCTCCTTCATCACTTTGAGATAGAGTTGTTAGAACTCCC
TGGGAGCTGGTAAGAATAGTGAGAAGTAGTGCCACAAAGTACCAAGGACTGCCCATTCTT
CCTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DT57JQ U 5
AF RR4DT57TF C 1
AF RR4DP90JQ U 5
AF RR4DP90TF C 58
AF RR4AS87JQ U 19
AF RR4AX90JQ U 22
AF RR4AX90TF C 478
AF RR4AS87TF C 570
BS 1 7 RR4DT57TF
BS 8 726 RR4DP90JQ
BS 727 799 RR4AS87JQ
BS 800 807 RR4AX90JQ
BS 808 808 RR4AX90TF
BS 809 849 RR4AX90JQ
BS 850 1296 RR4AX90TF

RD RR4DT57JQ 693 0 0
CAC
CTTCACAAACAAATGGATAATATAACACCATAAAGGTAAAATTTAACCGTGGTGCAGGTG
CTATTATAGTAAGATCATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGTGAAGCTAGAC
GAACATCATTCACTAAAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGATGGTCCATTG
TTTTGTAATACTAAACCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTTCTACGAT
AACTTGCTTTAAGGTTTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTACCAGCGTTTG
TGGAGGAGCAAAGTACATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAAGAAAAGCTG
GACCGTTGGTTTGAAGCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCATCGCCAT
TGATGTAGAATACACCTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAGAGACGAGTAA
GCCGGTGGATCCGAGATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGCCATCAAAGAT
ACGTTGCCACCAAGGGCCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGC
AACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGCTGTCATT
GTTTCTCTTCACCAGAAACTCAGTGTAGAT

QA 4 693 4 693
DS 

RD RR4DT57TF 746 0 0
TTTTTCACTTCACAAACAAATGGATAATATAACACCATAAAGGTAAA*TTTAACCGTGGT
GCAGGTGCTATTATAGTAAGATCATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGTGAA
GCTAGACGAACATCATTCACTAAAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGATGG
TCCATTGTTTTGTAATACTAAACCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTT
CTACGATAACTTGCTTTAAGGTTTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTACCA
GCGTTTGTGGAGGAGCAAAGTACATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAAGA
AAAGCTGGACCGTTGGTTTGAAGCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCA
TCGCCATTGATGTAGAATACACCTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAGAGA
CGAGTAAGCCGGTGGATCCGAGATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGCCAT
CAAAGATACGTTGCCACCAAGGGCCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAA
GCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGC
TGTCATTGTTTCTCTTCACCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGG
CAGAGAGGATGCCCAACAAATAGCC
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4DP90JQ 722 0 0
CAC
CTTCACAAACAAATGGATAATATAACACCATAAAGGTAAAATTTAACCGTGGTGCAGGTG
CTATTATAGTAAGATCATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGTGAAGCTAGAC
GAACATCATTCACTAAAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGATGGTCCATTG
TTTTGTAATACTAAACCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTTCTACGAT
AACTTGCTTTAAGGTTTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTACCAGCGTTTG
TGGAGGAGCAAAGTACATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAAGAAAAGCTG
GACCGTTGGTTTGAAGCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCATCGCCAT
TGATGTAGAATACACCTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAGAGACGAGTAA
GCCGGTGGATCCGAGATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGCCATCAAAGAT
ACGTTGCCACCAAGGGCCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGC
AACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGCTGTCATT
GTTTCTCTTCACCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGGCAGAGA

QA 4 722 4 722
DS 

RD RR4DP90TF 689 0 0
GGTGCAGGTGCTATTATAGTAAGATCATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGT
GAAGCTAGACGAACATCATTCACTAAAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGA
TGGTCCATTGTTTTGTAATACTAAACCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTT
CTTCTACGATAACTTGCTTTAAGGTTTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTA
CCAGCGTTTGTGGAGGAGCAAAGTACATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCA
AGAAAAGCTGGACCGTTGGTTTGAAGCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTA
GCATCGCCATTGATGTAGAATACACCTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAG
AGACGAGTAAGCCGGTGGATCCGAGATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGC
CATCAAAGATACGTTGCCACCAAGGGCCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTA
TAAGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATA
AGCTGTCATTGTTTCTCTTCACCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAG
CGGCAGAGAGGATGCCCAACAAATAGCC
C

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4AS87JQ 781 0 0
TTTA
GATAATATAACACCATAAAGGTAAAATTTAACCGTGGGGCAGGGGCTATTATAGTAAGAT
CATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGTGAAGCTAGACGAACATCATTTACTA
AAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGATGGTCCATTATTTTGTAATACTAAA
CCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTTCTACGATAACTTGCTTTAAGGT
TTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTACCAGCGTTTGTGGAGGAGCAAAGTA
CATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAAGAAAAGCTGGACCGTTGGTTTGAA
GCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCATCGCCATTGATGTAGAATACAC
CTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAGAGACGAGTAAGCCGGTGGATCCGAG
ATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGCCATCAAAGATACGTTGCCACCAAGG
ACCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGA
ACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGCTGTCATTGTTTCTCTTCATCAG
AAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGGCAGAGAGGATGCCCAACAAATA
GCCTTGTATTGGTGCTGTGAATAGGGAATCACATGAAGCTTCTCCGCAACCCTTGAT

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DS 

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A
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CATTGTTTCAAAAAGTAGTCATTTACCAAGAAGGTGAAGCTAGACGAACATCATTTACTA
AAACGTAAAATTATAAATAAGACCATCTCGGTAGATGGTCCATTATTTTGTAATACTAAA
CCATTTCATCCACTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTTCTACGATAACTTGCTTTAAGGT
TTTGTGATGTGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCTACCAGCGTTTGTGGAGGAGCAAAGTA
CATATGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAAGAAAAGCTGGACCGTTGGTTTGAA
GCTGAAGAGATATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCATCGCCATTGATGTAGAATACAC
CTTGACGATATTGTCTGCATACTTCATTAACCAAGAGACGAGTAAGCCGGTGGATCCGAG
ATTGAGAACAACCAACCAAGTGGTGATGCTATAGCCATCAAAGATACGTTGCCACCAAGG
ACCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGA
ACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGCTGTCATTGTTTCTCTTCATCAG
AAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGGCAGAGAGGATGCCCAACAAATA
GCCTTGTATTGGTGCTGTGAATAGGGAATCACATGAAGCTTCTCCGCAACCCTTGATCTG
GCTGGGTGGTAGTTCCAACAGCTAAAAGACCAATAGCCATCCACTGA

QA 2 828 2 828
DS 

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CATCAAAGATACGTTGCCACCAAGGACCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTA
TAAGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATA
AGCTGTCATTGTTTCTCTTCATCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAG
CGGCAGAGAGGATGCCCAACAAATAGCCTTGTATTGGTGCTGTGAATAGGGAATCACATG
AAGCTTCTCCGCAACCCTTGATCTGGCTGG*TGGTAGTTCCAACAGCTAAAAGACCAATA
GCCATCCACTGAAGGTTTGATAATTTCCTCTTCAAAAATAACCTAAAGAGAATGGCAGTG
GTGACGATCTTGAGGTTACCCATGATTTGATAAGTGGAAGTGTCGACAAAAGTGAGAGTA
GCAAACTGGACATTGTTATGGATGAGATAGATAATTGAAGGAATAACAAATAAGCGCACG
CTCTTCCAATCCTTAGTAATCTTTGCAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCTTG
GTCTCTCTCCAGAGAAACAAACCAGAAATGATCAGCTTGAGAACTTCGGCAAGAAAGGGA
ACGGTAGCATAATCGTACTTATAACCTCCTTCATCACTTTGAGATAGAGTTGTTAGAACT
CCCTGGGAGCTGGTAAGAATAGTGAGAAGTAGTGCCACAAAGTACCAAGGACTGCCCATT
CTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCGTTCC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4AS87TF 727 0 0
TCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAACCAAAC
GTATACAACTGCAAGTTTTGCCAGTATAAGCTGTCATTGTTTCTCTTCATCAGAAACTCA
GTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGGCAGAGAGGATGCCCAACAAATAGCCTTGT
ATTGGTGCTGTGAATAGGGAATCACATGAAGCTTCTCCGCAACCCTTGATCTGGCTGG*T
GGTAGTTCCAACAGCTAAAAGACCAATAGCCATCCACTGAAGGTTTGATAATTTCCTCTT
CAAAAATAACCTAAAGAGAATGGCAGTGGTGACGATCTTGAGGTTACCCATGATTTGATA
AGTGGAAGTGTCGACAAAAGTGAGAGTAGCAAACTGGACATTGTTATGGATGAGATAGAT
AATTGAAGGAATAACAAATAAGCGCACGCTCTTCCAATCCTTAGTAATCTTTGCAGTTGG
TGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCTTGGTCTCTCTCCAGAGAAACAAACCAGAAATGAT
CAGCTTGAGAACTTCGGCAAGAAAGGGAACGGTAGCATAATCGTACTTATAACCTCCTTC
ATCACTTTGAGATAGAGTTGTTAGAACTCCCTGGGAGCTGGTAAGAATAGTGAGAAGTAG
TGCCACAAAGTACCAAGGACTGCCCATTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCT
TCGTTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 9

CO CL661Contig1 791 7 28 U
GTCGGCACGTGAAATCATGCATAAAATAGCCAAATATATGATTTAAAATGAAGAATGTCA
AACAGGCTAATAATCCAACACAACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTATTCAA
CCCTCAAATATCTTTTCTTCGAACCAACATCACACAATTCAGAAACCAAGACCAATGCCG
TAAGAAATGGCTCATGTTTCCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTC
TCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTA
CCTTCCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCA
AGCAGAGCACGGATTGCAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTC
TCCAGAAACTCCCTGATCGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAA*GCAGA
G*AAGGTACCAGACGGATCGGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAAC
CAACAATGAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGCT
GAAGGCCTGCTATGTAGCGGGTGATGTACTCAACAGTCACCGGATCCTCCAACGTAAGCC
TGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCC
CAGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTAT
CCTGGAGCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 15 15 15 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 20 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB28TF C 280
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AF RR4FC52JQ U 16
AF RR4FC52TF C 16
AF RR4DH79JQ U 1
AF RR4AB28JQ U 20
AF RR4CF67JQ U 23
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BS 375 375 RR4FC52JQ
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GCATTAGCCTTCCAAAGCAGAGGAAGGTACCAGAC

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DS 

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DS 

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TTCCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGC
CACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTTCCTCCCTTGTCAT
TAAAGCAACTTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCA*****CGGATTGC
AAGTTTAACAGTCTCTTACCCCGACGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGAT
CGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAA*GCAGAG*AAGGTACCAGACGGA
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C

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR4FC52TF 575 0 0
CG
TGCATAAAATAGCCAAATATATGATTTAAAATGAAGAATGTCAAACAGGCTAATAATCCA
ACACAACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTATTCGACCCTCAAATATCTTTTC
TTCGAACCAACATCACACAATTCAGAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGT
TTCCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGC
CACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTTCCTCCCTTGTCAT
TAAAGCAACTTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCA*****CGGATTGC
AAGTTTAACAGTCTCTTACCCCGACGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGAT
CGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAA*GCAGAG*AAGGTACCAGACGGA
TCGGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATGAGAGTGGAA
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C

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR4DH79JQ 781 0 0
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AACAGGCTAATAATCCAACACAACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTATTCAA
CCCTCAAATATCTTTTCTTCGAACCAACATCACACAATTCAGAAACCAAGACCAATGCCG
TAAGAAATGGCTCATGTTTCCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTC
TCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTA
CCTTCCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCA
AGCAGAGCACGGATCGCAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTC
TCCAGAAACTCCCTGATCGAGTTAGAGTTCCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAA*GCAGA
G*AAGGTACCGGATGGATCGGTCTGATAAAGCGAAGGAATACGAGTGTAGGGGTCAAAAC
CAACAATAAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTGTACTTCTGTT
GAAGCCCTGCTATGTAGCGGGTGATGTACTCAACAGTCACCGGATCCTCCAAAGTAAGCC
TGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCTTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCC
CAGCACAGGCCAGTGCGACGTGGTTATCAAG*CTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTAT
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AB28JQ 772 0 0
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CGAACCAACATCACACAATTCAAAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTT
CCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGTCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCA
CAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTTCCTCCCTTGTCATTA
AAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGGATTGCAA
GTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATCG
AGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAA*GCAAAA*AAGGTACCAAACGGATC
GGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATGAGAGCGGAAAG
ACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGCTGAAGGCCTGCTATGTAGCG
GGTGATGTACTCAACAGTCACCGGATCCTCCAACGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGAT
CCTCGCCTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAATGCGAC
GTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTATCCTGGAGCTTA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CF67JQ 759 0 0
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ACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTATTCAACCCTCAAATATCTTTTCTTCGA
ACCAACATCACACAATTCAAAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCCC
TAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCCTCAATCTCAGCCACAA
TCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTTCCTCCCTTGTCATTAAAG
CAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGGATTGCAAGTT
TAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATCGAGT
TAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAA*GCAGAA*AAGGTACCAGACGGATCGGT
CTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATGAGAGTGGAAAGACC
AAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGCTGAAGGCCTGCTATGTAGCGGGT
GATGTACTCAACAGTCACCGGATCCTCCAACGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCT
CGCCTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTG
GTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTATC

QA 1 759 1 759
DS 



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AAGAGAGGTCTTACTGAATCAGAAAGAACACTAATCACAAGAGAGAGAGTTGAGAGATGG
CGAGATACGATAGAGCAATCACAGTGTTTTCGCCAGACGGCCACCTTTTCCAGGTAGAGT
ACGCCCTAGAAGCTGTCCGCAAAGGTAACGCCGCCGTCGGCGTCCGAGGCACCGATACTG
TCGTCCTCGCCGTCGAGAAGAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACGAGATCGGCCAGAA
AGATTGTTAGCCTTGATAACCACGTCGCACTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTC
GTGTCCTGATAAACAAAGCGAGGATCGAGTGTCAAAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATC
CGGTGACTGTTGAGTACATCACCCGCTACATAGCAGGCCTTCAACAGAAGTACACTCAAA
GTGGTGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTCATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTC
GTATACCTTCGCTTTATCAGACCGATCCATCCGGTACCTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATG
CGACCGGGAGAAACTCTAACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCT
CGGGGCAAGAGACTGTTAAACTTGCAATCCGTGCTCTGCTTGAGGTAGTTGAGAGTGGTG
GAAAGAACATTGAGTTGCTTTAATGACAAGGGAGGAAGGTACTCTGAGCAGCTAGAAGAA
GCTGAAATCGATGCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF67TF U 75
AF RR4DH79TF U 1
BS 1 409 RR4DH79TF
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BS 744 797 RR4DH79TF

RD RR4CF67TF 673 0 0
G
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CAATCACAGTGTTTTCGCCAGACGGCCACCTTTTCCAGGTAGAGTACGCCCTAGAAGCTG
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AGGAGAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACGAGATCGGCCAGAAAGATTGTTAGCCTTG
ATAACCACGTCGCATTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTCGTGTCCTGATAAACA
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ACATCACCCGCTACATAGCAGGCCTTCAGCAGAAGTATACTCAAAGTGGTGGTGTGAGAC
CTTTTGGTCTTTCCACTCTCATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTCGTATACCTTCGCTTT
ATCAGACCGATCCGTCTGGTACCTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGAAACT
CTAACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCGGGGCAAGAGACTG
TTAAACTTGCAATCCGTGCTCTGCTTGAGGTAGTTGAGAGTGGTGGAAAGAACATTGAGT
TGCTTTAATGAC

QA 2 673 2 673
DS 

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AAGAGAGGTCTTACTGAATCAGAAAGAACACTAATCACAAGAGAGAGAGTTGAGAGATGG
CGAGATACGATAGAGCAATCACAGTGTTTTCGCCAGACGGCCACCTTTTCCAGGTAGAGT
ACGCCCTAGAAGCTGTCCGCAAAGGTAACGCCGCCGTCGGCGTCCGAGGCACCGATACTG
TCGTCCTCGCCGTCGAGAAGAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACGAGATCGGCCAGAA
AGATTGTTAGCCTTGATAACCACGTCGCACTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTC
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CGGTGACTGTTGAGTACATCACCCGCTACATAGCAGGGCTTCAACAGAAGTACACTCAAA
GTGGTGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTTATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTC
GTATTCCTTCGCTTTATCAGACCGATCCATCCGGTACCTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATG
CGACCGGGAGGAACTCTAACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCT
CGGGGCAAGAGACTGTTAAACTTGCGATCCGTGCTCTGCTTGAG*TAGTTGAGAGTGGTG
GAA*GAACATTGAGTTGCTTTA*TGACAAGGGAGGAAGGTACTCTGAGCAGCTAGAAGAA
GCTGAAATCGATGCGAT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 2 6

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AAAAAAAAAAAAAACTAGCATGCTATAAATCAAAAAGAAATGAACAAAAAAAAAAACTGT
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TGTGTGTGTTACTTAGTCTTGTGAACAAATCGGTTGCCCTACCTACTGATACTTCTTTTC
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CGAGTTCAGTTTCTCGTTAATGTGGTCTTGGTACTTCCCGTACACAAAAGGAAAAAAAAG
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BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A295JQ U 1
AF RR4A295JQD U 1
BS 1 51 RR4A295JQ
BS 52 52 RR4A295JQD
BS 53 315 RR4A295JQ
BS 316 316 RR4A295JQD
BS 317 337 RR4A295JQ
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BS 339 410 RR4A295JQ
BS 411 411 RR4A295JQD
BS 412 467 RR4A295JQ
BS 468 468 RR4A295JQD
BS 469 571 RR4A295JQ

RD RR4A295JQ 571 0 0
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AAAAAAAAAAAAAACTAGCATGCTATAAATCAAAAAGAAATGAACAAAAAAAAAAACTGT
ACTGCGATTCACTTTTTTTTCCGCTGCTTGATCATCTTCTTAAAGCAAGCAGTCCAGTAA
TGTGTGTGTTACTTATTCTTGTGAACAAATCGGTTGCGCTACCTACTGATACTTCTTTTC
TTTGCTTACGGGCATCATCATCGGAATCTTACTTGAAAAACTTCAAATGATTTTAAAAGT
CGAGTTCAGTTTCTCGTTAATGTGGTCTTGGTACTTCCCGTACACAAGAGGAAAAAAAAG
ACTCAAAAAAATCCCAACGTAAACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAACGTCCCCACGTAGGA
TACAGCCCACAAGACCAATGATATCTGAAGG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4A295JQD 571 0 0
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TTTCTTGATTCTACTGCAACAACAATCCCACAAAGCATTACTGTGTAAACTAAAAGACGA
GATGATGCCAAAAGAAAACAACCCCAGGAACTCATGAATATAGAACAGGACAAATATAGA
AAAAAAAAAAAAAACTAGCATGCTATAGATCAAAAAGAAATGAACAAAAAAAAAAACTGT
ACTGCGATTCACTTTTTTTTCCGCTGCTTGATCATCTTCTTAAAGCAAGCAGTCCAGTAA
TGTGTGTGTTACTTAGTCTTGTGAACAAATCGGTTGCCCTACCTACTGATACTTCTTTTC
TTTGCTTACGGGCATCATCATCGGAATCTTACTTGAAAGACTTCAAATGAGTTTAAAAGT
CGAGTTCAGTTTCTCGTTAATGTGGTCTTGGTACTTCTCGTACACAAAAGGAAAAAAAAG
ACTCAAAAAAATCCCAACGTAAACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAACGTCCCCACGTAGGA
TACAGCCCACAAGACCAATGATATCTGAAGG

QA 1 571 1 571
DS 



CO CL662Contig2 836 4 31 U
AATCTTCAAGATTCAGCCATTGTTATTGAACAAAAAACCACACAAATTGTATTAGTTTGT
ATCTTTCTTGATTCTACTGCAACAACAATCCCACAAAGCATTACTGTGTAAACTAAAAGA
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AGAAGAAGAAAAAAAAACTAGCATGCTATAGATCAGAAAGAAATGAAAAAAAAAAAA**A
ACTGTACTGCGATTCACTTTTTTT*CCGCTGCTTGATCATCTTCTTAGAGCAAGCAGTCC
AGTAATGTGTGTGTTACTTAGTCTTGTGAACAAA*TCGGTT****GCACTACCTACTGAT
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GAAGAGAAAGACTCAGAAGAATCCCAACGTAGACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAACGTCC
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CAATGGTGATATCACTTGCAATTGACAGTACACGATTGATCAAAACCCGAATATCATCAG
CAGCTTTGACTGCAAACTCCTCAGGGATCTCCATA**TTGGGA*****ACTGGTGGTAAA
GGTCGGTTGAGAAGTGAAGCAGACTTGGCCCATAAGAAGAGGATGGCAACAAGAAGAAGG
AGAACATTGGAGACGAAAGACAAGAGATTGTAACCAGCTCTCTCAAACAGAAACCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 15 30 15 30 30 30 15 30 15 15 30 15 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CP12JQ U 2
AF RR4A295TFB C 94
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ATCTTTCTTGATTCTACTGCAACAACAATCCCACAAAGCATTACTGTGTAAACTAAAAGA
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AGAAGAAGAAAAAAAAACTAGCATGCTATAGATCAGAAAGAAATGAATAAAAAAAA****
ACTGTACTGCGATTCACTTTTTTT*CCGCTGCTTGATCATCTTCTTAGAGCAAGCAGTCC
AGTAATGTGTGTGTTACTTAGTCTTGTGAACAAA*TCGGTTACTTGCACTACCTACTGAT
ACTTCTTTTCTTTGCTTACGGGCATCATCATCGGAATCTTACTTGAGAGACTTCGAATGA
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GGGA*****ACTGGTGGTAAAGGTCGGTTGAGAAGTGAAGCAGACTTGGCCCATAAGAAG
AG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4CP12JQ 792 0 0
GT
CTTCAAGATTCAGCCATTGTTATTGAACAAAAAACCACACAAATTGTATTAGTTTGTATC
TTTCTTGATTCTACTGCAACAACAATCCCACAAAGCATTACTGTGTAAACTAAAAGACGA
GATGATGCCAAAAGAAAACAACCCCAGGAACTCATGAATATAGAACAGGACAAATATAGA
AGAAGAAAAAAAA*CTAGCATGCTATAGATCAGAAAGAAATGAAAAAAAAAAAAGAAACT
GTACTGCGATTCACTTTTTTTTCCGCTGCTTGATCATCTTCTTAGAGCAAGCAGTCCAGT
AATGTGTGTGTTACTTAGTCTTGTGAACAAA*TCGGTT****GCACTACCTACTGATACT
TCTTTTCTTTGCTTACGGGCATCATCATCGGAATCTTACTTGAGAGACTTCGAATGAGTT
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GAGAAAGACTCAGAAGAATCCCAACGTAGACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAACGTCCCCA
CGTAGGATACAGCCCACAAGACCAATGATATCTGAAGGAGACGAATGGGATTTCTAGCAA
TGGTGATATCACTTGCAATTGACAGTACACGATTGATCAAAACCCGAATATCATCAGCAG
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CGGTTGAGAAGTGAAGCAGACTTGGCCCATAAGAAGAGGATGGCAACAAGAAGAAG*AGA
ACATTGGAGA

QA 3 792 3 792
DS 

RD RR4A295TFB 743 0 0
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CTCATGAATATAGAACAGGACAAATATAGAAGAAGAAAAAAAAACTAGCATGCTATAGAT
CAGAAAGAAATGAACAAAAAAAAA**AACTGTACTGCGATTCACTTTTTTT*CCGCTGCT
TGATCATCTTCTTAGAGCAAGCAGTCCAGTAATGTGTGTGTTACTTAGTCTTGTGAACAA
A*TCGGTT****GCGCTACCTACTGATACTTCTTTTCTTTGCTTACGGGCATCATCATCG
GAATCTTACTTGAGAGACTTCGAATGAGTTTAGAAGTCGAGTTCAGTTTCTCGTTAATGT
GGTCTTGGTACTTCTCGTACACAAGAGGAAGAGAAAGACTCAGAAGAATCCCAACGTAGA
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TCTGAAGGAGACGAATGGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTGCAATTGACAGTACAC
GATTGATCAAAACCCGAATATCATCAGCAGCTTTGACTGCAAACTCCTCAGGGATCTCCA
TA**TTGGGA*****ACTGGTGGTAAAGGTCGGTTGAGAAGTGAAGCAGACTTGGCCCAT
AAGAAGAGGATGGCAACAAGAAGAAGGAGAACATTGGAGACGAAAGACAAGAGATTGTAA
CCAGCTCTCTCAAACAGAAACCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 7

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AATTGTAAAGAGCTTCGTCTAATCTTGTCTTATAGATCTTCATGAATCAGTACACAAATC
TTTAACAAGCAAGCAAGAAGAGTGAAGAAAAAGGAAATGAACCAGCATAAACATGAATTA
ATCAGGATGATTATTGAATGTGATCCAATCTCAATTCAGATAAATGCTGTCCAATACAGC
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ATTCCATTCTGATTCAGACGGATAATCTCTAGGAGTATAGCCTGATCTGTAATAAACCAC
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AGCCAATGTTGATCGTACATGTTGCGTTCATCCGGCTGCACAACGACCATAACTACCGCT
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CCTGGAACCGTTCCTGATTTCTGATGAGTTTTGTCACCGACGACAAGGCCGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

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AF RR4H446JQB U 1
AF RR4H732JQB U 1
AF RR4H446TF C 734
AF RR4H732TF C 937
AF RR4GS59TF C 864
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GCTATAGAAGGGCACTTGACAGCTGAGGACTGCTCTATAAGCAACCTAGCATTCCATTCT
G

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DS 

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ACCACCTTCATCTGATGAAGAGACCTTTGTGCGCATCAAATAACCACTCTGCTCGTTTAT
TATAACTCTCTCCTTGTTCCTGAGGTAAGCCCCATAGACACCAAGTTCTGATATAGCTTG
ATTTTTGTGGTAAGCGCCGTCTCGCAGCAAGAACACGTTTGACACTTTTGGGAATATCCT
CTGCATTAGGATATACGCAGCGTTTTCTTCCTCTCCTTCTCTCCGCAACC*CAGAAGATT
CTCCCTCACATCATCTCCATAGATATTGTTACCTCCTCCTTCTCTCTGAGGCTTCATGAC
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AGACGGATAATCTCTAGGAGTATA

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TTCTGATATAGCTTGATTTTTGTGGTAAGCGCCGTCTCGCAGCAAGAACACGTTTGACAC
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CTGAGGCTTCATGACAAACAGCTCCGGTTTTTCAATAGCTTTCTTGATGATTTCTTGATC
GTCCAAGCTCCAAAGCCCAGCAAAGCATTTCCTAAGCTTAGCTATGTCATCTTTGTTCTC
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CGAGACTGCTTGG
CCGC

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AATTGTAAAG
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GCAACACCACCTTCATCTGATGAAGAGACCTTTGTGCGCATCAGATAACCACTCTGCTCG
TTTATTATAACTCTCTCCTTGTTCCTGAGGTAAGCCCCATAGACACCAAGTTCTGATATA
GCTTGATTTTTGTGGTAAGCGCCGTCTCGCAGCAAGAACACGTTTGACACTTTTGGGAAT
ATCCTCTGCATTAGGATATACGCAGCGTTTTCTTCCTCTCCTTCTCTCTGCAACCTCAGA
AGATTCTCCCTCACATCATCTCCATAGATATTATTACCTCCTCCTTCTCTCTGAGGCTTC
ATGACAAACAGCTCCGGTTTTTCAATAGCTTTCTTGATGATTTCTTGATCGTCCAAGCTC
CAAAGCCCAGCAAAGCATTTCCTAAGCTTAGCTATGTCATCTTTGTTCTCCATAAACCTC
TCGAGAACACCTGGTTTAGCGAGTTCTTGCTGGATTTTCTTGGTGCCAGCTAAGTGATAA
GCTATAGAAGGGCACTTGACAGCTGAGGACTGCTCTATAAGCAACCTAGCATTCCATTCT
GATTCAGACGGATAATCTCTAGGAGTATAGCCTGATCTGTAATAAACCACCGAGACTGCT
TGG

QA 11 793 11 793
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CGTACATGTTGCGTTCATCCGGCTGCACAACGACCATAACTACCGCTCTTGGGTTATTGT
ACTCCAACCAAGCTCTAGCCATTGCGTCAGCAAACTGGATCGTTGATGCATTTCTAGGTA
CACGTTCAGAGTCTAGCCCAAGATGATCCCCATGAGATCTAAGCAATGACTGGTGTAGCT
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GAAGCGATTTTGTTTGCTCGTCAAGCATATAATCTGACCGGTGTAAACCTAAACGAATGT
CCTCTCTCTTGTTGCTTTCTAGCATCTTGGAGTGAATGTCAAGAAGTCTAGATGTAAAGA
CATCAGCTTTTTTCGTTCTGGAGAGACTGTCTTGTATGAATTTGCCATCCAAGCTGACAC
GATCAACCAACTCGTTGAAGATGGGAGCAACTTCACAAGCTTGGTTCCAGAAACTTTCAG
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CTGATTTCTGATGAGTTTTGTCACCGACGACAAGGCC
C

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GCGTCAGCAAACTGGATCGTTGATGCATTTCTAGGTACACGTTCAGAGTCTAGCCCAAGA
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GGAAAGGAACACGAAATAGTGTTCATCTCTATCTGAAGAAGCGATTTTGTTTGCTCGTCA
AGCATATAATCTGACCGGTGTAAACCTAAACGAATGTCCTCTCTCTTGTTGCTTTCTAGC
ATCTTGGAGTGAATGTCAAGAAGTCTAGATGTAAAGACATCAGCTTTTTTCGTTCTGGAG
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GGAGCAACTTCACAAGCTTGGTTCCAGAAACTTTCAGGGAATGGAGTCGGTAGTAATGCA
ATGGGGGCGTGCATCATCCCAACCCCTGGAACCGTTCCTGATTTCTGATGAGTTTTGTCA
CCGACGACAAGGCC
C

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DS 

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TTTCTCTCAATACACTGCTTAGCCAATGTTGATCGTACATGTTGCGTTCATCCGGCTGCA
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CCCCATGAGATCTAAGCAATGACTGGTGTAGCTTGGTAACAAGAGGACCAAAGCCTGGAA
AGGAACACGAAATAGTGTTCATCTCTATCTGAAGAAGCGATTTTGTTTGCTCGTCAAGCA
TATAATCTGAACGGTGTAAACCTAAACGAATGTCCTCTCGCTTGTTGCTTTCTAGCATCT
TGGAGTGAATGTCAAGAAGTCTAGATGTAAAGACATCAGCTTTTTTCGTTCTGGAGAGAC
TGTCTTGTATGAATTTGCCATCCAAGCTGACACGATCAACCAACTCGTTGAAGATGGGAG
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GGGCGTGCATCATCCCAACCCCTGGAACCGTTCCTGATTTCTGATGAGTTTTGTCACCGA
CGACAAGGCCGT

QA 18 629 18 629
DS 



AS 1 9

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TTAAGAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAAAAATGAGGAAATGAATATTCATAAGTCTCAA
CTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTTCTGTTTTCTCTAAA
TTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAATAAAAACTGAGATAT
AATAATGTACTAC


BQ
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C849JQ C 143
AF RR4D215JQ C 1
AF RR4D215TF U 1
AF RR4G607TF U 1
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AF RR4C849TF U 2
AF RR4DC32JQ C 1
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AF RR4C330TF U 1
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GTGGTGAAAAA

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QA 1 523 1 523
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DS 

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DS 

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A
GC

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DS 

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A
GC

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4C330TF 553 0 0
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GTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGGTGCTTTGGATGGTG
TTAAGAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATATTCATAAGTCTCAA
CTGTTTATCTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTTCTGTTTTCTCTAAA
TTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAATAAAAACTGAGATAT
AATAATG
TACTAC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 9

CO CL665Contig1 418 9 5 U
GGGCACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAG
AAAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGT
TTCACAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTG
ACCAAGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTCTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCC
ATATTCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACTTTTATCATATA


BQ
10 35 35 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG60JQ C 2
AF RR4CH35JQ C 1
AF RR4A384TF U 2
AF RR4A384TFB U 2
AF RR4D226TF U 1
AF RR4EG60TF U 2
AF RR4CH35TF U 1
AF RR4HB91JQB C 3
AF RR4HB91TF U 3
BS 1 1 RR4CH35JQ
BS 2 4 RR4D226TF
BS 5 407 RR4A384TF
BS 408 409 RR4CH35TF
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AAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
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TCACAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTTTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGT

QA 1 354 1 354
DS 

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AAAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGT
TTCACAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTG
ACCAAGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTTTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCC
ATATTCTTT**TTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACTTT
CATC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR4A384TF 406 0 0
GGT
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AAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTACAAG
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CAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGACCA
AGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTCTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACCACCG
CTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCCATAT
TCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACT

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DS 

RD RR4A384TFB 406 0 0
GGT
ACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAGAAAA
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CAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGACCA
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CTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCCATAT
TCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACT

QA 4 406 4 406
DS 

RD RR4D226TF 402 0 0
G
GGCACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAGA
AAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGTT
TCACAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTCTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCCA
TATTCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTT

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DS 

RD RR4EG60TF 396 0 0
GGCACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAGA
AAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGTT
TCACAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTCTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACCA
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TATTCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4CH35TF 413 0 0
G
GGCACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAGA
AAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGTT
TCACAGCCTGTTCCATTGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTCTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCCA
TATTCTTT**TTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACTTT
CATC

QA 2 409 2 409
DS 

RD RR4HB91JQB 416 0 0
GG
ACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAGAAAA
AAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTACAAG
CATGCAATGGAGCCGATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGTTTCA
CAGCCTGTTCCATTGCCTTTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGACCA
AGTGTGGTCTCCCACAACGACCTTCTAAGCCAACAACATCTTCAGCACCTTCTACCACCG
CTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCCATAT
TCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACTTTTATCATATA

QA 3 416 3 416
DS 

RD RR4HB91TF 416 0 0
GG
ACAACTCAAATCTATCAAAAATTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAAGAAAA
AAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGATGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTACAAG
CATGCAATGGAGCCGATGTTGACGAGGCCAAGCCACAAGATTCAAGATTCGTTTGTTTCA
CAGCCTGTTCCATTGCCTTTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGATGGATGTTTGACCA
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CTTGATCTGATCTATTTTATTTGTGATTTGTGCCTTTATTGCCAAGGGTGTCATCCATAT
TCTTTTGTTTATTATGAAGAAGAATTGAGATTTATTTTATACTTT
TATCATATA

QA 3 407 3 407
DS 



AS 1 9

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AAGTCTTAAGTAAAAAGAGAAACAGAACCATTATCTTGTTGACACAAGACACTTAAAAGA
CTTTGATAATACAAACATAGTAGAAGAAGGACCCATACATTTACATTGGAATCCTTTTCT
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TTTAGGATGCTTGGCCTCAGCGTGCTCCCTGCATTTCACTTCCGATGTAGTGCAGATGAA
TGTTTGCATACAAACCTTGCACTGAAGGGACATAGCTTTCTTGTTCGCTTCCAACTGGCT
TCCTTTTCCAGCCTGCCTTGCCTTCTCGAGATTCTTCTCACGAGCCATCTTCGATTTCTG
CGCGTTTCCTCCACCCATCTCTCTCTCTGTGTCTGATTCGATTACACGCGGCGAAGGAAA
GAGAAGAAGAAAGATGAGAATACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGGAATAAT
CTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 

AF RR4GA40JQ U 1
AF RR4GA40TF C 1
AF RR4BR64JQ U 10
AF RR4CJ65JQ U 10
AF RR4CJ65TF C 235
AF RR4CT81JQ U 10
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AF RR4FD83TF C 10
AF RR4BR64TF C 10
BS 1 215 RR4GA40JQ
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BS 217 544 RR4GA40JQ

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GAGAAGAAGAAAGATGAGAATACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGGAATAAT
CTCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4GA40TF 544 0 0
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AAGTCTTAAGTAAAAAGAGAAACAGAACCATTATCTTGTTGACACAAGACACTTAAAAGA
CTTTGATAATACAAACATAGTAGAAGAAGGACCCATACATTTACATTGGAATCCTTTTCT
TTGCGAGAGATGATAGTTTCATCACTTCTTGAGAT*TGGGAAGCAAGCGACAACATCAGC
TTTAGGATGCTTGGCCTCAGCGTGCTCCCTGCATTTCACTTCCGATGTAGTGCAGATGAA
TGTTTGCATACAAACCTTGCACTGAAGGGACATAGCTTTCTTGTTCGCTTCCAACTGGCT
TCCTTTTCCAGCCTGCCTTGCCTTCTCGAGATTCTTCTCACGAGCCATCTTCGATTTCTG
CGCGTTTCCTCCACCCATCTCTCTCTCTGTGTCTGATTCGATTACACGCGGCGAAGGAAA
GAGAAGAAGAAAGATGAGAATACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGGAATAAT
CTCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4BR64JQ 535 0 0
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QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4CJ65JQ 535 0 0
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AAAGATGAGAATACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGGAATAATCTCC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4CJ65TF 310 0 0
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AGGAAAGAGAAGAAGAAAGATGAGAATACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGG
AATAATCTCC

QA 1 310 1 310
DS 

RD RR4CT81JQ 535 0 0
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QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4FD83JQ 535 0 0
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AAAGATGAGAACACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGGAATAATCTCC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4FD83TF 535 0 0
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AGCCTGCCTTGCCTTCTCGAGATTCTTCTCACGAGCCATCTTCGATTTCTGCGCGTTTCC
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QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4BR64TF 535 0 0
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TACAAACATAGTAGAAGAAGGACCCATACATTTACATTGGAATCCTTTTCTTTGCGGGAG
ATGATAGTTTCATCACTTCTTGAGATGTGGGAAGCAAGCGACAACATCAGCTTTAGGATG
CTTGGCCTCAGCGTGCTCCCTGCATTTCACTTCCGATGTAGTGCAGATGAATGTTTGCAT
ACAAACCTTGCACTGAAGGGACATAGCTTTCTTGTTCGCTTCCAACTGGCTTCCTTTTCC
AGCCTGCCTTGCCTTCTCGAGATTCTTCTCACGAGCCATCTTCGATTTCTGCGCGTTTCC
TCCACCCATCCCTCTCTCTGTGTCTGATTCGATTACACGCGGCGAAGGAAAGAGAAGAAG
AAAGATGAGAATACGCAAACCCTAATTTTTCAGAAAGAAATGGGGAATAATCTCC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 2 9

CO CL667Contig1 658 7 3 U
TCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGTTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAGG
CTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTACGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATG
TTTAAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCG
TAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAG
GTTTACGTTTTGTTGTTAAAAAGGTTTATGTTTTATTATATTCTTCTATATTCTTACT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 35 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD35JQ C 310
AF RR4FD35TF U 310
AF RR4AT38TF U 245
AF RR4AE71JQ C 232
AF RR4EP63JQ C 1
AF RR4EP63TF U 1
AF RR4AE71TF U 1
BS 1 579 RR4AE71TF
BS 580 580 RR4FD35TF
BS 581 658 RR4AE71TF

RD RR4FD35JQ 287 0 0
G
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CGCTTCAAATATTATGTACGCAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATGTTTAAGTGGT
TGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCGTAGTACTTTG
GTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATC

QA 2 287 2 287
DS 

RD RR4FD35TF 287 0 0
G
AACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTACAAGATC
AGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAGGCTAATGCGGA
CGCTTCAAATATTATGTACGCAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATGTTTAAGTGGT
TGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCGTAGTACTTTG
GTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATC

QA 2 287 2 287
DS 

RD RR4AT38TF 353 0 0
ACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTTCCCT
AGTCTCAACGCTGCCCGTTCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTAC
AAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAGGCTAA
TGCGGACGCTTCAAATATTATGTTCGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATGTTTA
AGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCGTAGT
**TTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4AE71JQ 386 0 0
CAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGC
TAACCCCTTCCCTAGTTTCAACGCTGCCCGGGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGGGGAGT
CAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCCCCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGT
CGGATGAGGCTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTACGTAATGGATGAGAGAATGCTAA
AATAAGATGTTTAAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTTTTTTATGTTG
TCATGCTCGTAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGT*ATATGAATTTC
AGATTTAAG
GTTTACGTTTTGTTGTT

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4EP63JQ 597 0 0
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GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
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QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4EP63TF 597 0 0
TCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGTTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAGG
CTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTACGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATG
TTTAAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCG
TAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4AE71TF 658 0 0
TCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGTTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
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TTTAAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCG
TAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGT*ATATGAATTTCAGATCTAAG
GTTTACGTTTTGTTGTTAAAAAGGTTTATGTTTTATTATATTCTTCTATATTCTTACT

QA 1 658 1 658
DS 



CO CL667Contig2 610 2 3 U
TTTTTTTTCAAACTTAGATCTGAAATTCATATAACGTTGATTGTGAACATATAGTACAGA
CGACCAAAGTACTAGGAGCATGACAACATAAAAGACGGGAAACTGAAAAACTCTAAAAAC
AACAACCACCTAAACATCTTATTTTAGCATTCTCTCATCCATTACATAATATTTGAAGCG
TCCGCATTAGCCTCATCCGACCGCAGCTCATTTCACACTGTTGCAGTTGGTGCTTTTGCT
GATCTTGTAAGGGATATTGACCCCACATGCCTTAGGAAGTCCAGCTGCACGGGCAGCGTT
GAGACTAGGGAAGGCGTTAGCGGCTACTACAAGGCAACGGCAAGCTTGCTGACGGTCCGG
GGTTGTACGGGCCAGGTTGTTTAGATTAGTAACGCCGCTGCAGCACGCTGGTGGAATGGC
CGGCGCACCCTGGGCTAGGTAGCCAATGCACGCTGCCACGTTGGAGTTAACGGTGCCACA
GTTTAAAGCCGCGTTCGATGCGATTGGACCGGCCACGATCATGCAGGCCAAGACCAAACA
TGCCAACTTCATTAGACCAGCCATATTTCTCTCTTAGATTTTGTTGTTTGCAAAATGAAA
TGTGAGTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ59JQ U 8
AF RR4BQ59TF C 1
BS 1 12 RR4BQ59TF
BS 13 573 RR4BQ59JQ
BS 574 610 RR4BQ59TF

RD RR4BQ59JQ 566 0 0
CAAAC
CTTAGATCTGAAATTCATATAACGTTGATTGTGAACATATAGTACAGACGACCAAAGTAC
TAGGAGCATGACAACATAAAAGACGGGAAACTGAAAAACTCTAAAAACAACAACCACCTA
AACATCTTATTTTAGCATTCTCTCATCCATTACATAATATTTGAAGCGTCCGCATTAGCC
TCATCCGACCGCAGCTCATTTCACACTGTTGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATCTTGTAAGG
GATATTGACCCCACATGCCTTAGGAAGTCCAGCTGCACGGGCAGCGTTGAGACTAGGGAA
GGCGTTAGCGGCTACTACAAGGCAACGGCAAGCTTGCTGACGGTCCGGGGTTGTACGGGC
CAGGTTGTTTAGATTAGTAACGCCGCTGCAGCACGCTGGTGGAATGGCCGGCGCACCCTG
GGCTAGGTAGCCAATGCACGCTGCCACGTTGGAGTTAACGGTGCCACAGTTTAAAGCCGC
GTTCGATGCGATTGGACCGGCCACGATCATGCAGGCCAAGACCAAACATGCCAACTTCAT
TAGACCAGCCATATTTCTCTC

QA 6 566 6 566
DS 

RD RR4BQ59TF 610 0 0
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CGACCAAAGTACTAGGAGCATGACAACATAAAAGACGGGAAACTGAAAAACTCTAAAAAC
AACAACCACCTAAACATCTTATTTTAGCATTCTCTCATCCATTACATAATATTTGAAGCG
TCCGCATTAGCCTCATCCGACCGCAGCTCATTTCACACTGTTGCAGTTGGTGCTTTTGCT
GATCTTGTAAGGGATATTGACCCCACATGCCTTAGGAAGTCCAGCTGCACGGGCAGCGTT
GAGACTAGGGAAGGCGTTAGCGGCTACTACAAGGCAACGGCAAGCTTGCTGACGGTCCGG
GGTTGTACGGGCCAGGTTGTTTAGATTAGTAACGCCGCTGCAGCACGCTGGTGGAATGGC
CGGCGCACCCTGGGCTAGGTAGCCAATGCACGCTGCCACGTTGGAGTTAACGGTGCCACA
GTTTAGAGCCGCGTTCGATGCGATTGGACCGGCCACGATCATGCAGGCCAAGACCAAACA
TGCCAACTTCATTAGACCAGCCATATTTCTCTCTTAGATTTTGTTGTTTGCAAAATGAAA
TGTGAGTGGA

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 8

CO CL668Contig1 772 8 23 U
GGCCCGATTCCACTTTTCCCGTCCGTCGGAGATTTCAAGCAACCCGAATCCCAAAAATGG
CGTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATGAGAGACATCAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCA
ACATCTCCGTAGGTGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTTCTGGAGCAGT
TGAGTGGTCAGACTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATACACTGTTCGTTCTTTCGGTATCA
GACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTGACCGTCAGGGGAGACAAGGCTATGCAACTCC
TTGAAAGTGGACTCAAAGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTG
GTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCATATTGATTTGGGTATCAAGTATGACCCGTCGA
CTGGAATCTACGGTATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTATCGTGTGGCGC
GTCGCAGAAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGTATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCA
TGAAATGGTTCCAAGTGAAGTATGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTG
GCTAAGACCATCCTCTCAAACAGAAGGATCTATAATCATATAAATCTGTGTGTTAATCGT
GTTTTCTTAGTTTTGCTATTTCGTTTATCAGACACTTGGGTATCATTACCTATTCTACAA
TGATTGCACGGATTAGACTTTGTGAAATTATCCAACAAACGCGTTTTTAAAG


BQ
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 

AF RR4DB70TF U -2
AF RR4A217JQ C 1
AF RR4AB65JQ C 52
AF RR4BJ79TF U 1
AF RR4BH42TF U 1
AF RR4A217JQD C 1
AF RR4A217TFB U 1
AF RR4DB70JQ C 29
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BS 158 169 RR4DB70TF
BS 170 171 RR4BJ79TF
BS 172 382 RR4DB70TF
BS 383 383 RR4BJ79TF
BS 384 423 RR4DB70TF
BS 424 424 RR4BJ79TF
BS 425 469 RR4DB70TF
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BS 471 483 RR4DB70TF
BS 484 484 RR4BJ79TF
BS 485 625 RR4DB70TF
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GGCTTTT
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TCTTA

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G

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DS 

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CAGACACTTGGGTATCATTGCCTATTCTACAGTGATTGCACGGATTAGACTTTGTGAAAT
TATCCAACAAACGCGTTT
CC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 2 7

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TGTAGCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A867TF U 1
AF RR4A867JQ C 129
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TCAGTCTCTCTCGTCCCCTCCCTCACTCTTCCCCAAATACTCCATCGCTCCGCCGCCGCA
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GATCGAAGCGGAGATGGTTCCGTCTCCTCCGCCATAGATTTTCTCACCCTCTGCTCTCGC
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GCTGATCACATGTATCGTATGGGTCTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGATATTCCCGGTGTT
AACAGAGACAAATGTATGAAATTGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGG
GATATCACACCTACTTGCGGGGTCTCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAACTGAAGCA
CTTGAACACATGTGCAAACTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTA
TGGAGAGAATATGAAGCAAATGAATCACCTGAAGCCAAGGTTGTTAAAGATTTCGATAAG
CTTGAGATGATTCTACAAGCTTTGGAATACGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTTAGATGAG
TTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATAGGCAAAGCTTGGGCCTTGGAG
ATTGCTTCA

QA 1 729 1 729
DS 

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AACTCCAAGAGCTGGATGGGTTAAAAGAGAAGTGAAGAATCCAGAATCAATAGCTGATCA
CATGTATCGTATGGGTCTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGATATTCCCGGTGTTAACAGAGA
CAAATGTATGAAATTGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGGGATATCAC
ACCTACTTGCGGGGTCTCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAACTGAAGCACTTGAACA
CATGTGCAAACTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTATGGAGAGA
ATATGAAGCAAATGAATCACCTGAAGCCAAGGTTGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGAT
GATTTTACAAGCTTTGGAATACGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTTAGATGAGTTTTTCCA
ATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATAGGCAAAGCTTGGGCCTTGGAGATTGCTTC
AAGAAGAACCAAGCGACATTAGTTAGTTCTCACTTGAGCTGAATACACTCTTTGCGCTCA
ACTTTAATCATTTTCAAGACTTATTGTGGATCTAGAACGTAAGGGTAACTCTTGTAGCTA

QA 1 720 1 720
DS 



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AGCTATTCACTGCATGGCAAAGGACTCCCCACTCTCTCAACCGGATCGAAGCGGAGATGG
TTCCGTCTCCGTTCCCCCTGCTTCTTCCGCTTCCTCCGCCATAGATTTTCTCTCCCTCTG
CTCTCGCCTCAAGACAACTCCGAGAGCAGGATGGGTTAAAAGACAAGTGAAGAATCCAGA
ATCAATAGCGGATCACATGTATCGGATGGGTCTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGATATTCC
CGGTGTTAACAGAGACAAATGTATGAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCAT
TGTAGGGGATATCACACCTACTTGCGGTGTCTCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAAC
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TGAGCTGTGGAGAGAATATGAAGCAAACGAATCACCTGAAGCCAAAGTTGTTAAAGATTT
CGATAAACTTGAGATGATTCTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTT
GGATGAGTTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATTGGCAAAGCTTGGGC
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CTCTCTTTACGCTCAGCTTTTTATCATTTTCAAGACTCATTGTGGATCTAGAACTTAAGG
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TTTTATGGGTGTATGCTAAAACTCTTGAGAAATTTGAAAAAAAAAAACAATTTAATGAAA
TTAAATTTTGAAAACAACAGTTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU75TF U 2
AF RR4E916TF U 1
AF RR4E282TF U 6
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AF RR4EU75JQ C 295
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CTTGAGATGATTCT

QA 7 560 7 560
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ATCAATAGCGGATCACATGTATCGGATGGGTCTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGATATTCC
CGGTGTTAACAGAGACAAATGTATGAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCAT
TGTAGGGGATATCACACCTACTTGCGGTGTCTCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAAC
TGAAGCGCTTCAACACATGTGCAAACTCTTGGGCGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGC
TGACCTGTGGAGAGAATATGAAGCTAACGAATCACCTGAAGCCAAAGTTGTTAAAGATTT
CGATAAGCTTGAGATGATTCTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTT
AGATGAGTTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATAGGCAAAGCTTGGGC
TTTGGAGATTGCTTCAAGAAGAC*AAAGCGACAGTAGTCAGTTCTCCCTTGAGCT*AATA
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TAAGGTACTCTTGTAGC

QA 1 774 1 774
DS 

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GG
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CACTGCATGGCAAAGGACTCCCCACTCTCTCAACCGGATCGAAGCGGAGATGGTTCCGTC
TCCGTTCCCCCTGCTTCTTCCGCTTCCTCCGCCATAGATTTTCTCTCCCTCTGCTCTCGC
CTCAAGACAACTCCGAGAGCAGGATGGGTTAAAAGACAAGTGAAGAATCCAGAATCAATA
GCGGATCACATGTATCGGATGGGTCTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGATATTCCCGGTGTT
AACAGAGACAAATGTATGAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGG
GATATCACACCTACTTGCGGTGTCTCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAACTGAAGCA
CTTGAACACATGTGCAAACTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTG
TGGAGAGAATATGAAGCAAACGAATCACCTGAAGCCAAAGTTGTTAAAGATTTCGATAAA
CTTGAGATGATTCTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTTGGATGAG
TTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATTGGCAAAGCTTGGGCGTTGGAG
ATTGCTTCAAGAAGACCAAAGCGACAATAGTTACTTCTCAATTGGGCTTAATACTCTCTT
TACGCTCAGCTTTTTATCATTTTCA*GACTCATTGTGGATCTAGAACT

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4E282JQ 719 0 0
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TCACACCTACTTGCGGTGTCTCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAACTGAAGCACTTG
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AGATGATTCTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTTGGATGAGTTTT
TCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATTGGCAAAGCTTGGGCGTTGGAGATTG
CTTCAAGAAGACCAAAGCGACAATAGTTACTTCTCAATTGGGCTTAATACTCTCTTTACG
CTCAGCTTTTTATCATTTTCAAGACTCATTGTGGATCTAGAACTTAAGGGTAACTCTTGT
AGCTAAATACTTTTGAGGGAGAAGCCTGAAATGGTTTAAAAAACGGATATTTTATGGGTG
TATGCTAAAACTCTTGAGAAATTTGAAAAAAAAA**CAATTTAATGAAATTAAATTTTG

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DS 

RD RR4EU75JQ 634 0 0
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AGAAACTGAAGCACTTGAACACATGTGCAAACTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGA
AATCGCTGAGCTGTGGAGAGAATATGAAGCAAACGAATCACCTGAAGCCAAAGTTGTTAA
AGATTTCGATAAACTTGAGATGATTCTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAA
AGATTTGGATGAGCTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGACTGATATTGGCAAAGC
TTGGGCGTTGGAGATTGCTTCAAGAAGACCAAAGCGACAATAGTTACTTCTCAATTGGGC
TTAATACTCTCTTTACGCTCAGCTTTTTATCATTTTCAAGACTCATTGTGGATCTAGAAC
TTAAGGGTAACTCTTGTAGCTAAATACTTTTGAGGGAGAAGCCTGAAATGGTTTAAAAAA
CGGATATTTTATGGGTGTATGCTAAAACTCTTGAGAAATTTGAAAAAAAAAAACAATTTA
ATGAAATTAAATTTTGAAAACAACAGTTCTTGCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 9

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CTCCTCCTCCAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCTGTCTCGGCCTATCTAGCGGAGACT
GGAAGACTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTCGATTAT
TTCGCTCTCTCTCTCCAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCC
AAAAACGCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGG
CCGGACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAG
GAGATCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGCTCT
CCATCATCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCATTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGG
ACTTGCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATC
TACTTCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGC
GAGAAGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCT
GAAGTAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATAAAGATTTC
AAGCCCAGGGACTGTGTTGGTTCAAAAGACATGACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGTAC
GTCAGTTTGCCGGAATACACGCCATTGGATGGTGAGGCTATGGTTCTGAAGATGCCAACA
GATGAATAAGATATTTCTTCTCTTCTTAGAGGCAATATTCACATACAGAACTTTCATGTT
GTAATTTATTGGCCAAACCTATAAACAACGAATAAAGATTGGCTTACACTTGTTCTATGG
CCTATGGGATATGAATCCGGGCTGGTTAATACTTTTTTCCTCTTTACAGTTACAATATTA
TTAAATCCATTACAAAAATCAAAATCTATCATAAATTCATAGT


BQ
10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 25 50 
50 35 35 50 45 20 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP82TF U 5
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AF RR4EH35TF U 2
AF RR4H554TF U 7
AF RR4BN35TF U 2
AF RR4EH35JQ C 368
AF RR4BN35JQ C 211
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AF RR4DP82JQ C 620
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TCC***AAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCTGTCTCGGCCTATCTAGCGGAGACTGGAA
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CTCTCTCTCTCCAGTGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAA
ACGCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCGG
ACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAGGAGA
TCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGCTCTCCAT
CATCTTGTCATGGTGGAAAAGGATCACTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTT
GCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACT
TCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGA
AGTATCCTC

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DS 

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CTCCTCCTCCAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCTGTCTCGGCCTATCTAGCGGAGACT
GGAAGACTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTCGATTAT
TTCGCTCTCTCTC**CAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCC
AAAAACGCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGG
CCGGACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAG
GAGATCTCAACGTTAATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTTCT
CCATCATCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCATTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGG
ACTTGCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATC
TACTTCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGC
GAGAAGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCT
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AGCCC*AGGGACTGTGTTGGTTCAAA*GACATGACGTCGAAAAA

QA 1 764 1 764
DS 

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GGG
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TCCTCCAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCTGTCTCGGCCTATCTAGCGGAGACTGGAA
GACTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTCGATTATTTCG
CTCTCTCTCTCCAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAA
ACGCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCGG
ACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAGGAGA
TCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTTCTCCAT
CATCTTACCATGGTGGAAAAGGATCATTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTT
GCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACT
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AGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCTGAAG
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CTCCAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCTGTCTCGGCCTATCTAGCGGAGACTGGAAGA
CTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTCGATTATTTCGCT
CTCTCTCTCCAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCGTTGCTGCTCCAAAAAC
GCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCGGAC
TATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAGGAGATC
TCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGCTCTCCATCA
TCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCATTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTTGC
TCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACTTC
AAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGAAG
TATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCTGAAGTA
GTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATAAAGATT*CAAGCC*
AGG*ACTGTGTTGGTTCAAA*GACATGACGTCGAAAAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4BN35TF 763 0 0
GGG
GGTTTCCAATCCGAATAGAGTCAATGGCGTTGCGTAGATCTCTTCTTCTCCTCCTCCTCC
TCCTCCAAGTCCTTTTGGTTTCGGTTCTTTCTGTCTCGGCCTATCTAGCGGAGACTGGAA
GACTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTTGATTATTTCG
CTCTCTCTCTCCAGTGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAA
ACGCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCGG
ACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAGGAGA
TCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGCTCTCCAT
CAT*TTGCCATGGTGGAAAAGGATCATTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTT
GCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACT
TCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATATTGCTTCCAACAGCGAGA
AGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCTGAAG
TAGTATGCAAA*GAGATGCAATCGATGAAATACTTATATGCTTCTATTAAGATTTCAAGC
CCAGGGACTGTGTTGGTTCAAA*GACATGACGTCGAAAAA

QA 4 763 4 763
DS 

RD RR4EH35JQ 583 0 0
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CTTACCATGGTGGAAAAGGATCATTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTTGCT
CTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACTTCA
AGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGAAGT
ATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCTGAAGTAG
TATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATAAAGATTTCAAGCCCA
GGGACTGTGTTGGTTCAAAAGACATGACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGTACGTCAGTT
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AAGATATTTCTTCTCTTCTTAGAGGCAATATTCACATACAGAACTTTCATGTTGTAATTT
ATTGGCCAAACCTATAAACAACGAATAAAGATTGGCTTACACT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4BN35JQ 823 0 0
TACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAAACGCTTGCTGTAGAGGCTCGAACACT
CCAACTCAAT*CACCATCCATGGACTATGGCCGGACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCA
TGTTGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAGGAGATCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAA
AAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGCTCTCCATCAT*TTGCCATGGTGGAAAAGGATCA
TTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTTGCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAG
TATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACTTCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTT
TATAAAGCTGGCTATATTGCTTCCAACAGCGAGAAGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACA
GCCATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCTGAAGTAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGAT
GAAATACTTATATGCTTCTATTAAGATTTCAAGCCCAGGGACTGTGTTGGTTCAAAAGAC
ATGACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGTACGTCAGTTTGCCGGAATACACGCCATTGGAT
GGTGAGGCTATGGTTCTGAAGATGCCAACAGATGAATAAGATATTTCTTCTCTTCTTAGA
GGGAATATTCACATACAGAACTTTCATGTTGTAATTTATTGGCCAAACCTATAAACAACG
AATAAAGATTGGCTTACACTTGTTCTATGGCCTATGGGATATGAATCCGGGCTGGTTAAT
ACTTTTTTCCTCTTTACAGTTACAATATTATTAAATCCATTAC

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DS 

RD RR4D290JQ 809 0 0
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ACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCGGACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGT
TGCTATAGATCCGACTTCAATGAGAAGGAGATCTCAACGTTAATGGATGGCATGGAAAAG
TACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTTCTCCATCATCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCATTT
TGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTTGCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTAT
AGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACTTCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTAT
AAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGAAGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCC
ATTCAGAATGCATTTCATATCACCCCTGAAGTAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAA
ATACGTATATGCTTCTATAAAGATTTCAAGCCCAGGGACTGTGTTGGTTCAAAAGACATG
ACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGTACGTCAGTTTGCCGGAATACACGCCATTGGATGGT
GAGGCTATGGTTCTGAAGATGCCAACAGATGAATAAGATATTTCTTCTCTTCTTAGAGGC
AATATTCACATACAGAACTTTCATGTTGTAATTTATTGGCCAAACCTATAAACAACGAAT
AAAGATTGGCTTACACTTGTTCTATGGCCTATGGGATATGAATCCGGGCTGGTTAATACT
TTTTTCCTCTTTACAGTTACAATATTATT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4DP82JQ 444 0 0
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ATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATAAAGATTTCAAGCCCAGGGACTGTGTTG
GTTCAAAAGACATGACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGTACGTCAGTTTGCCGGAATACA
CGCCATTGGATGGTGAGGCTATGGTTCTGAAGATGCCAACAGATGAATAAGATATTTCTT
CTCTTCTTAGAGGCAATATTCACATACAGAACTTTCATGTTGTAATTTATTGGCCAAACC
TATAAACAACGAATAAAGATTGGCTTACACTTGTTCTATGGCCTATGGGATATGAATCCG
GGCTGGTTAATACTTTTTTCCTCTTTACAGTTACAATATTATTAAATCCATTACAAAAAT
CAAAATCTATCATAAATTCATAGT

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 9

CO CL671Contig1 622 9 8 U
GGGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTA
GGATTTGTTCAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAA
GGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGAT
CATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGC
CGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTC
TGATGGCCAGTTTTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCA
CAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTT
GAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTAC
TGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCT
ATTGTTTTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTT
TTGTTTGAGAAAAAAATTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 30 30 30 30 30 30 

AF RR4D311JQ C 100
AF RR4D311TF U 5
AF RR4GB09TF U 1
AF RR4DR90TF U 5
AF RR4FT76TF U 5
AF RR4FT76JQ C 21
AF RR4AY01JQ C 15
AF RR4DR90JQ C 20
AF RR4AY01TF U 15
BS 1 48 RR4GB09TF
BS 49 49 RR4D311TF
BS 50 105 RR4GB09TF
BS 106 106 RR4D311TF
BS 107 145 RR4GB09TF
BS 146 146 RR4D311TF
BS 147 616 RR4GB09TF
BS 617 622 RR4DR90TF

RD RR4D311JQ 500 0 0
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CAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGA*
*ATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAA
GAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGAC
GAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAA
GGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGA
AGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGT
ACAATTTATCTTGGTCCTCCTATTGTTTTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTT
AAACTCTTGTTTCAGACACT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4D311TF 595 0 0
GG
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GTTCAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAA
GAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGA
GATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGA**ATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGC
CCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGG
CCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGT
GAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTA
CTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTC
TGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTCCTATTGTT
TTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTCTTGTTTCAGACACT

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR4GB09TF 616 0 0
GGGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGCCTCACCTTCTA
GGATTTGTTCAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGGGCAGCAGTCGCCAA
GGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCCCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGAT
CATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGC
CGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTC
TGATGGCCAGTTTTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCA
CAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTT
GAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTAC
TGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCT
ATTGTTTTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTT
TTGTTTGAGAAAAAAA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4DR90TF 618 0 0
GG
CCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTT
GTTCAAGAGAGAAGGGGGTCGAAAGATGAGTTGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAA
GAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGA
GATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGC
GCTCGGTGACTCCGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGG
CCAGTTCTCCAAGTGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGT
GAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTA
CTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTC
TGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCTATTGTT
TTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTT
GAGAAAAAAATTAAAG

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DS 

RD RR4FT76TF 612 0 0
GG
CCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTT
GTTCAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAA
GAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGA
GATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGC
TCTCGGTGACTCTGTCACAATCGCCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGG
CCAGTTTTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGT
GAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTA
CTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTC
TGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCTATTGTT
TTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTT
GAGAAAAAAA

QA 3 612 3 612
DS 

RD RR4FT76JQ 594 0 0
AAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGTTCAAGAGAGAAG
GGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCT
CCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCG
AGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCTCTCGGTGACTCTG
TCACAATCGCCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTTTGATGGCCAGTTTTCCAAGA
GGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGCTCA
GAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTTTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCTG
AGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTGGTTT
CTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCTATTGTTTTTTGTCAGATCTT
GTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAGAAAAA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4AY01JQ 608 0 0
GG
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GAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
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TCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTTTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGG
CTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTG
GTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCTATTGTTTTTTGTCAGA
TCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAGAAAAAAA
TTAAAG

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR4DR90JQ 603 0 0
TAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGTTCAAGAGAGAA
GGGGGTCGAAAGATGAGTTGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTC
TCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTC
GAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCGCTCGGTGACTCC
GTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCAAG
TGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTC
AGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCT
GAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTGGTT
TCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCTATTGTTTTTTGTCAGATCT
TGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAGAAAAAAATTA
AAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4AY01TF 608 0 0
GG
AGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGTTCAAGAGG
GAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
GTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCC
CTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCTCTCGGTGAC
TCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTTTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGG
CTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTG
GTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTTCTATTGTTTTTTGTCAGA
TCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTGAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAGAAAAAAA
TTAAAG

QA 3 608 3 608
DS 



AS 1 9

CO CL672Contig1 760 9 10 U
GGACCCTAGACGCAAAATCTTCTTCCTCTCTTTCGAGATCAGAAGACGCCGCACTTCCAT
CTTCTGAACTACAGGTACACTCTATTGCAGAGAGTTGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGG
AGCAGCTCCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGGAGTTTCCTTCACCATTGATTGTTCTAAGCC
TGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAA
GGTTGGTGGTGGTAAAGCAGGTGCTCTTGGTGATTCCGTCTCAATCACTCGTGACAAGAA
CAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTGACAAA
GAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGA
CCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGA
CTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTTTAGATA
TTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTT
CTATGGAGGCTTTTGTTTTCCCAGACAGTTTATTGGGTAAAACCAAGTGGAGTTGGCAGA
TCTTTTTGAACTATACAGGAAGATAGTATTACAAATGGAGTAAGTGGAGAAATAAAATGA
TTCGTGTTCTAGTCAATTATGGGTTTGGATTCAGTTGTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW64TF U 94
AF RR4A304TF U 176
AF RR4A304JQ C 1
AF RR4A304JQD C 1
AF RR4A304TFB U 1
AF RR4EX10JQ C 39
AF RR4EX10TF U 39
AF RR4H970TF U 190
AF RR4CW64JQ C 88
BS 1 151 RR4A304TFB
BS 152 152 RR4EX10TF
BS 153 175 RR4A304TFB
BS 176 282 RR4A304TF
BS 283 283 RR4EX10TF
BS 284 396 RR4A304TF
BS 397 624 RR4A304TFB
BS 625 657 RR4EX10TF
BS 658 673 RR4H970TF
BS 674 760 RR4CW64JQ

RD RR4CW64TF 107 0 0
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TTCCTTCACCATTGATTGTTCTCAGCCTGTTGATGACAAGATCATGG

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR4A304TF 221 0 0
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ATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCAGGTGCTCTTGGTGATTCCGTCTCGATCACTCGTGAC
AAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTG
ACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCT

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR4A304JQ 606 0 0
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CTTCTGAACTACAGGTACACTCTATTGCAGAGAGTTGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGG
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CAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTGACAAA
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CTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTTTAGATA
TTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTT
CTATGG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4A304JQD 624 0 0
GGACCCTAGACGCAAAATCTTCTTCCTCTCTTTCGAGATCAGAAGACGCCGCACTTCCAT
CTTCTGAACTACAGGTACACTCTATTGCAGAGAGTTGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGG
AGCAGCTCCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGGATTTTCCTTCACCATTGATTGTTCTAAGCC
TGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAA
GGTTGGTGGTGGTAAAGCAGGTGCTCTTGGTGATTCCGTCTCGATCACTCGTGACAAGAA
CAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTGACAAA
GAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGA
CCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGA
CTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTTTAGATA
TTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTT
CTATGGAGGCTTTTGTTTTCCCAG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4A304TFB 624 0 0
GGACCCTAGACGCAAAATCTTCTTCCTCTCTTTCGAGATCAGAAGACGCCGCACTTCCAT
CTTCTGAACTACAGGTACACTCTATTGCAGAGAGTTGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGG
AGCAGCTCCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGGATTTTCCTTCACCATTGATTGTTCTAAGCC
TGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAA
GGTTGGTGGTGGTAAAGCAGGTGCTCTTGGTGATTCCGTCTCGATCACTCGTGACAAGAA
CAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTGACAAA
GAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGA
CCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGA
CTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTTTAGATA
TTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTT
CTATGGAGGCTTTTGTTTTCCCAG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4EX10JQ 620 0 0
GG
AGAAGACGCCGCACTTCCATCTTCTGAGCTACAGGTACACTCTATTGCAGAGAGTTGGTG
AAAATGAGTCGTGGAAGTGGAGCAGCTCCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGGAGTTTCCTTC
ACCATTGATTGTTCTAAGCCTGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAG
TTTCTCCAGGAGAGGATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCGGGTGCTCTTGGTGATTCCGTC
TCAATCACTCGTGACAAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGA
TACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGA
GTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAG
AACGAAGCAGAGGAAGAAGACTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAAC
TCTCTGTTCTGTTTTAGATATTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTG
TTGCTGCGCATTTGAGCTTTCTATGGAGGCTTTTGTTTTCCCAGACAGTTTATTGGGTAA
AACCAAGTGGAGTTGGC
G

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4EX10TF 620 0 0
GG
AGAAGACGCCGCACTTCCATCTTCTGAGCTACAGGTACACTCTATTGCAGAGAGTTGGTG
AAAATGAGTCGTGGAAGTGGAGCAGCTCCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGGAGTTTCCTTC
ACCATTGATTGTTCTAAGCCTGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAG
TTTCTCCAGGAGAGGATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCGGGTGCTCTTGGTGATTCCGTC
TCAATCACTCGTGACAAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGA
TACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGA
GTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAG
AACGAAGCAGAGGAAGAAGACTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAAC
TCTCTGTTCTGTTTTAGATATTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTG
TTGCTGCGCATTTGAGCTTTCTATGGAGGCTTTTGTTTTCCCAGACAGTTTATTGGGTAA
AACCAAGTGGAGTTGGC
G

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4H970TF 486 0 0
CAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAAGGTTGGTGG
TGGTAAAGCAGGTGCTCTTGGTGATTCCGTCTCAATCACTCGTGACAAGAACAAGATCAC
CGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTATCT
GAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGAGTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCT
CTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGACTAAAAAAA
CCCATCATCTTTTCGTCTATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTTTAGATATTATATAGT
TTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTTCTATGGAGG
CTTTTGTTTTCCCAGACAGTTTATTGGGTAAA*CCAAGTGGAGTTGGCAGATCTTTTTGA
ACTA
AA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4CW64JQ 673 0 0
CAGAGAGTTGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGGAGCAGCTCCAAAGGGGAAGAAGAAGGG
AGGAGTTTCCTTCACCATTGATTGTTCTAAGCCTGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGC
TTCCTTAGAGAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCAGGTGCTCT
CGGTGATTCTGTCTCAATCACTCGTGACAAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCA
ATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAG
AGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTT
CAACATCGCCGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGACTAAAAAAACCCATCATCTTTTCGTCT
ATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTTTAGATATTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACAC
TTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTTTTATGGAGGCTTTTGTTTTCCCAGACA
GTTTATTGGGTAAAACCAAGTGGAGTTGGCAGATCTTTTTGAACTATACAGGAAGATAGT
ATTACAAATGGAGTAAGTGGAGAAATAAAATGATTCGTGTTCTAGTCAATTATGGGTTTG
GATTCAGTTGTTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 6

CO CL673Contig1 1056 2 6 U
AAGTTGAACAACATCCATATCTCTCTCCCTTCCTTTTGATCTTTCTACGTATTGGTTTAT
GAGCTCAAAGGAGAAGCCCACTCTCGGAGGAACGCGGATTAAGACCCGCAAAAGGAATAT
TGCTGCTCCTTTGGACCCTGCTGCTTTCTCTGATGCTGTTGTCCTGATTTATCTCGATAA
TGCTGGTGATCTCGAACTTGTTGCCAAGACCATTGAGTCATCTGATCTTAATTTCTCTCG
TTACGGCGATATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACCCAAACCGGTTCTGT
GAAATCTGATGAAGGGGAACGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGA
AGCCATCTTACCATCAGTTGTATACATTCAGAAAATCCTGCGCAGGAAACCTTTCCTCAT
AAAGAACCTCGAGAATGTCACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTCGAGGAGAG
CGAGAGGAAGAAGCTCGCCATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTCTCGGGGTT
ACCTGCTGAGACCGTCTTCCAGCCGCTGCTCAAGGACAACCTTGTTGCCAAAGGGATAGT
GCTCACTTTCGTGACGGACTTCTTCAATGAGTATTTGGTTGAGAACAGCCTCGACGACTT
GATTGCTATTCTGAGGCGTGGCAAGATGGAAGACAAGCTCTTGGACTTCTTGCCACCCAC
TAAGCGGACTACTGAATGTTTCTCTGAGCATTTCACCAAGGCAGGATTGACTGCTCTGGT
GGAGTACAATGAAAAGAAAATATTTGAGGTGAAGCTGAAGGAAATAAAAGAGGTGCTTAC
GAGCCAAGTGACGGAGGAGATTAACATAGATGAGGTGATTGAAACGGTGAAGCAACAGGT
GAAAGATGCTAAACTGCCAGAGATTGAGGTTGTGCGTGTCATCTGGGACGGGATAATGGA
TGCTGTTCAGTGGTCTGGTAAAACCAGCAGCAAACTCGACTCTGTATTACGCCAAGTGAG
ACATGGGCACACTTCTGACACGTTCTGCAGCACGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ18TF U 1
AF RR4CX55TF U 309
BS 1 595 RR4BZ18TF
BS 596 596 RR4CX55TF
BS 597 613 RR4BZ18TF
BS 614 614 RR4CX55TF
BS 615 635 RR4BZ18TF
BS 636 1056 RR4CX55TF

RD RR4BZ18TF 635 0 0
AAGTTGAACAACATCCATATCTCTCTCCCTTCCTTTTGATCTTTCTACGTATTGGTTTAT
GAGCTCAAAGGAGAAGCCCACTCTCGGAGGAACGCGGATTAAGACCCGCAAAAGGAATAT
TGCTGCTCCTTTGGACCCTGCTGCTTTCTCTGATGCTGTTGTCCTGATTTATCTCGATAA
TGCTGGTGATCTCGAACTTGTTGCCAAGACCATTGAGTCATCTGATCTTAATTTCTCTCG
TTACGGCGATATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACCCAAACCGGTTCTGT
GAAATCTGATGAAGGGGAACGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGA
AGCCATCTTACCATCAGTTGTATACATTCAGAAAATCCTGCGCAGGAAACCTTTCCTCAT
AAAGAACCTCGAGAATGTCACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTCGAGGAGAG
CGAGAGGAAGAAGCTCGCCATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTCTCGGGGTT
ACCTGCTGAGACCGTCTTCCAGCCGCTGCTCAAGGACAACCTTGTTGCCAAAGGGGTAGT
GCTCACTTTCGTGTCGGACTTCTTCAATGAGTATT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4CX55TF 748 0 0
G
TGAAGGGGAACGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGAAGCCATCTT
ACCATCAGTTGTATACATTCAGAAAATCCTGCGCAGGAAACCTTTCCTCATAAAGAACCT
CGAGAATGTCACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTCGAGGAGAGCGAGAGGAA
GAAGCTCGCCATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTCTCGGGGTTACCTGCTGA
GACCGTCTTCCAGCCGCTGCTCAAGGACAACCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTT
CGTGACGGACTTCTTCAATGAGTATTTGGTTGAGAACAGCCTCGACGACTTGATTGCTAT
TCTGAGGCGTGGCAAGATGGAAGACAAGCTCTTGGACTTCTTGCCACCCACTAAGCGGAC
TACTGAATGTTTCTCTGAGCATTTCACCAAGGCAGGATTGACTGCTCTGGTGGAGTACAA
TGAAAAGAAAATATTTGAGGTGAAGCTGAAGGAAATAAAAGAGGTGCTTACGAGCCAAGT
GACGGAGGAGATTAACATAGATGAGGTGATTGAAACGGTGAAGCAACAGGTGAAAGATGC
TAAACTGCCAGAGATTGAGGTTGTGCGTGTCATCTGGGACGGGATAATGGATGCTGTTCA
GTGGTCTGGTAAAACCAGCAGCAAACTCGACTCTGTATTACGCCAAGTGAGACATGGGCA
CACTTCTGACACGTTCTGCAGCACGGG

QA 2 748 2 748
DS 



CO CL673Contig2 852 4 4 U
GGCAAATATTTATTGTAGTTTTAATAAACTTGAAAACTTTAGAAAATCTTACTTTCACGA
ACGGAGAGAGTATTAATCATAAGAGAAACAGTTGTTGACAAAAAAAAAACATAAGAGAAA
CAGTTTAAAGACGTAGTCCAATAAACAAACAAACAATCCATTCCAAAGAAAAAAAAAA*G
CTTCAAGCATCTGACTTTCGTGTTTCCGAAATGCACCAAGGATAATCAAAGTTTTGTTTT
ATTAGAAGAGAGATAAGAAAAACAGATTTGTCTTCCGTCGCTCAGTCATTCAGTCACTCT
TCTTCCTCAGCCTCTTCCAGCCAATTCACAAACGGCTCCAACCCTTTCACAAACGTTTGC
CTGCCCTTGGGGTTGCTCCCTTTGCGATACCAATGGAGAATAGTGTCTTCAGCAAGCACA
TCAAGCTCATACAAAGACCTAACTACCTCTGGAAACACCTTCATCAGCTTTGCATCCTCA
TAGCATTGCATCTGTACTTTGTACATCAGCTCCATCTCCATTTTCCCGTTGCTGCAGAAC
GTGTTCAGAAGTGGTGCCCATGTCTTCACTTGGCGTAATACAGAGTTCGAGTTTTGCTGC
TGGTTTTTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTATCCCGTCCCAGATGACACACACAACC
TCAATCTCTGGCAGTTTAGCATCTTTCACCTGTTGCTTCACCGTTTCAATCACCTCATCT
ATGTTAATCTCCTCCGTCACTTGGCTCGTAAGCACCTCTTTTATTTCCTTCAGCTTCACC
TCAAATATTTTCTTTTCATTGTACTCCACCAGAGCAGTCAATCCTGCCTTGGTGAAATGC
TCAGAGAAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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C
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GCGATACCAATGGAGAATAGTGTCTTCAGCAAGCACATCAAGCTCATACAAAGACCTAAC
TACCTCTGGAAACACCTTCATCAGCTTTGCATCCTCATAGCATTGCATCTGTACTTTGTA
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DS 



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TATAAGCAATGTACTATACTATTTTTTGAAAAAAAACATTATAACACACTGCTTGTGAGT
GGGACTGACAAGTATTTCATTGGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO89TF U 15
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AF RR4BQ22TF U 9
AF RR4B292TF U 404
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DS 

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CGATTTTGATATAAATCTATACGATACACCTTCTCCTCGTATCAAGCTCGGTGTTGAA*G
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DS 

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TAAAAA
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ATGCAAATGCCACCAACGAGACTATCAACAACGCATCAATGTTCCCGGCGATTCTAGTGT
TCGGAGACTCCACAATCTACACCGGAAACAACAACTACATTAGTACAATCATCCGGGCTA
ACTTTCCTCCTTACGGCTGCAACTTCCCCGGCCACCACGCGACCGGAAGATTCTCTAACG
GTAGACTCATCCCTGACTTCATTGCATCCCTTATGGGAATCAAAGACACGGTTCCTCCAT
TCCTTGACCCGCATTTGTCGGATTCAGATATTCTCACGGGAGTGTGCTTTGCCTCGGCCG
GTTCAGGTTACGACAACTACACAGATCTCGCTACTTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGG
CAGACATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGGCTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGG
CTAAGATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATAGTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAA
ATCTATACGATACACCTTCTCCTCGTATCAAGCTCGGTGTTGAAAGTTATCAAGATTTCA
TTCTCTCGGGTGTACACAGCTTCGTTCAAGAACTATATAATATTGGCTGCCGGAAAATAA
TGGTATTAGGACTACCACCGAT*GGATGTTTACCGGTACAGATGACGTTTGCTAG
C

QA 7 721 7 721
DS 

RD RR4B292TF 694 0 0
GCTACTTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGGCAGACATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGG
CTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGGCTAAGATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATA
GTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAAATCTATACGATACACCTTCTCCTCGTATC
AAGCTCGGTGTTGAAGGTTATCAAGATTTCATTCTCTCGGGTGTACACAACTTCGTTCAA
GAACTATATAATATTGGCTGCCGGAAAATAATGGTATTAGGACTACCACCGATTGGATGT
TTACCGGTACAGATGACGTTTGCTAGGCAAAAACAGAACGAGAGACGATGCATCGACAAA
CAAAACTCAGATTCACAAGAGTATAATGAAAAACTAAAGAAGTCCTTGACGGATATTCAA
TCTAATCTCACTGGTAGTGTCATCTTCTACGCCGATATCTACGCAGCAATATTGGACATG
GCTACCAATCCCCAAAGTTACGGAATAAAGGAGACAACGAGAGGATGCTGCGGAACAGGA
GAGCTGGAGCTATCATACTTGTGCAATCCTTTAACTCGGACTTGTTCCGACGCTAATGAC
TACCTTTTCTGGGACGACATTCATCCTACACAACATGCTTACCTCGTCGTTAGTCTCAGT
CTTGTAGATCAAATCCTTCACGCACTTCAATGAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4AV76TF 765 0 0
GCTACTTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGGCAGACATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGG
CTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGGCTAAGATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATA
GTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAAATCTATACGATACACCTTCTCCTCGTATC
AAGCTCGGTGTTGAAGGTTATCAAGATTTCATTCTCTCGGGTGTACACAACTTCGTTCAA
GAACTATATAATATTGGCTGCCGGAAAATAATGGTATTAGGACTACCACCGATTGGATGT
TTACCGGTACAGATGACGTTTGCTAGGCAAAAACAGAACGAGAGACGATGCATCGACAAA
CAAAACTCAGATTCACAAGAGTATAATGAAAAACTAAAGAAGTCCTTGACGGATATTCAA
TCTAATCTCACTGGTAGTGTCATCTTCTACGCCGATATCTACGCAGCAATATTGGACATG
GCTACCAATCCCCAAAGTTACGGAATAAAGGAGACAACGAGAGGATGCTGCGGAACAGGA
GAGCTGGAGCTATCATACTTGTGCAATCCTTTAACTCGGACTTGTTCCGACGCTAATGAC
TACCTTTTCTGGGACGACATTCATCCTACACAACATGCTTACCTCGTCGTTAGTCTCAGT
CTTGTAGATCAAATCCTTCACGCACTTCAATGATAAAAAGATTCATTTGATATATCATCT
GTATACATGATGTTAATTATAAGCAATGTACTATACTATTTTTTG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4BQ22JQ 772 0 0
CGTGGCAAGGCTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGGCTAAGATAGTCAGTGAGGC
TCTGGTCATAGTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAAATCTATACGATACACCTTC
TCCTCGTATCAAGCTCGGTGTTGAAGGTTATCAAGATTTCATTCTCTCGGGTGTACACAG
CTTCGTTCAAGAACTATATAATATTGGCTGCCGGAAAATAATGGTATTAGGACTACCACC
GATTGGATGTTTACCGGTACAGATGACGTTTGCTAGGCAAAAACAGAACGAGAGACGATG
CATCGACAAACAAAACTCGGATTCACAAGAGTATAATGAAAAGCTAAAGAAGTCCTTGAC
GGATATTCAATTTAATCTCACTGGTAGTGTCATTTTTTACGCCGATATTTACGCAGCAAT
ATTGGACATGGCTACCAATCCCCAAAG******AATAAAGGAGACAACGAGAGGATGCTG
CGGAACAGGAGAGCTGGAGCTATCATACTTGTGCAATCCTTTAACTCGGACTTGTTCCGA
CGCTAATGACTACCTTTTTTGGGACGACATTCATCCTACACAACATGCTTACCTCGTCGT
TAGTCTCAGTCTTGTAGATCAAATCCTTCACGTACTTCAATGATAAAAA*ATTCATTTGA
TATATCATCTGTATACATGAGGTTAATTATAAGCAATGTACTATACTATTTTTTGAAAAA
AAACATTATAACACACTGCTTGTGAGTGGGACTGACAAGTATTTCATTGGTT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 8

CO CL675Contig1 744 8 18 U
GGATTCTCACAACTCTTCACCATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAAACTCATTTCAAG
TTCGATCAAGAAAACCAAGAACGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATT
TCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAG
ACACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCT
GGCTCGAATCCGGTTCTCCTCTTATACCGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGG
AGAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGA
AGAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTG
ATGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCC
TTCAAAGAATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTG
TCACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAA
ATAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTAT
TTGAAATATTGACACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTGATAATATTGAGAGGTGGCCTAT
AAGAGTCCAACGCTCATTCTCAAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4AS65TF U 1
AF RR4AH12JQ C 368
AF RR4EW62JQ C 1
AF RR4EM26TF U 2
AF RR4EW62TF U 1
AF RR4AS65JQ C 15
AF RR4AH12TF U 20
AF RR4EM26JQ C 131
BS 1 132 RR4AS65TF
BS 133 133 RR4EW62TF
BS 134 418 RR4AS65TF
BS 419 448 RR4EM26TF
BS 449 449 RR4EW62TF
BS 450 601 RR4EM26TF
BS 602 602 RR4EW62TF
BS 603 639 RR4EM26TF
BS 640 640 RR4EW62TF
BS 641 697 RR4EM26TF
BS 698 698 RR4EW62TF
BS 699 701 RR4EM26TF
BS 702 702 RR4EW62TF
BS 703 724 RR4EM26TF
BS 725 730 RR4EW62TF
BS 731 731 RR4AH12TF
BS 732 739 RR4EW62TF
BS 740 744 RR4AH12TF

RD RR4AS65TF 418 0 0
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TTCGATCAAGAAAACCAAGAACGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATT
TCTCGGAGAGCATCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAG
ACACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCT
GGCTCGAATCCGGTTCTCCTCTTATACCGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGG
AGAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGA
AGAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4AH12JQ 132 0 0
GGG
GCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGCTGTTAA
AGAACTCAAACTGGATTTTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCAAAGAAT
AATAATGGG

QA 4 132 4 132
DS 

RD RR4EW62JQ 741 0 0
G
GATTCTCACAACTCTTCACCATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAAACTCATTTCAAGT
TCGATCAAGAAAACTAAGAACGATGC*TAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATTT
CTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAGA
CACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTG
GCTCGAATCCGGTTCTCCTCTTATACCGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGGA
GAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCGTGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAA
GAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGA
TGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCT
TCAAAGAGTAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGT
CACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAAA
TAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTATT
TGAAATATTGACACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTGATAATATTGAGAGGTGGCCTATA
AGAGTCCAATGCTCATTC
TC

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR4EM26TF 723 0 0
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TCGATCAAGAAAACCAAGAACGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATTT
CTCGGAGAGCAACAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAGA
CACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTG
GCTCGAATCCGGTTCTCCTCTTATACAGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGGA
GAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAA
GAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGA
TGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCCATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCT
TCAAAGAATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGT
CACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAAA
AAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTT*CTTGCTTGTGTTTGTTCTATT
TGAAATATTGACACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTTATA*TATTGAGAGGTGGCCTATA
AGA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4EW62TF 741 0 0
G
GATTCTCACAACTCTTCACCATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAAACTCATTTCAAGT
TCGATCAAGAAAACTAAGAACGATGC*TAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATTT
CTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAGA
CACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTG
GCTCGAATCCGGTTCTCCTCTTATACCGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGGA
GAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCGTGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAA
GAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGA
TGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCT
TCAAAGAGTAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGT
CACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAAA
TAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTATT
TGAAATATTGACACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTGATAATATTGAGAGGTGGCCTATA
AGAGTCCAATGCTCATTC
TC

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR4AS65JQ 727 0 0
CTTCACCATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAAACTCATTTCAAGTTCGATCAAGAAAA
CCAAGAACGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATTTCTCGGAGAGCATC
AAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAGACACACTTTACATC
ATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTGGCTCGAATCCGGT
TCTCCTCTTATACCGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGGAGAACTACGGTGTC
AAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAAGAAAGAGGTGCAT
GTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGCTGTTAAAGAA
CTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCAAAGAATAATA
ATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGTCACCATTGTCAAG
GATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAAATAATGTTGCAGTC
TATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTATTTGAAATATTGACA
CATAATTTTCGCCTATGTGCGCTGATAATATTGAGAGGTGGCCTATAAGAGTCCAACGCT
CATTC
CC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4AH12TF 725 0 0
GG
ATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAGACTCATTTCAAGTTCGATCAAGAAAACCAAGAA
CGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACG
CACTCAAATGGGCCATCGAGGACTTAGCTGACAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACA
CGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTGGCTCGAATCCGGTTCTCCTC
TTATACCGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGGAGAACTACGGTGTCAAGATCG
ACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAAGAAAGAGGTGCATGTAGTGA
CAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGCTGTTAAAGAACTCAAAC
TGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCAAAGAATAATAATGGGAA
GCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGTCACCATTGTCAAGGATGACT
AGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAAATAATGTCGCAGTTTATGTTT
TTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTATTTGAAATATTGACACATAATT
TTCGCTTATGTGCGCTGATAATATTGAGAGGTGGCCTATAAGAGTCCAACGCTCATTCTC
AAC

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR4EM26JQ 605 0 0
CAA
CAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAGACACACTTTACAT
CATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTGGCTCGAATCCGG
TTCTCCTCTTATACAGTTGGCTGAATTTAGGGAACCGAAGATCATGGAGAACTACGGTGT
CAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAAGAAAGAGGTGCA
TGTAGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGCTGTTAAAGA
ACTCAAACTGGATTCCATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCAAAGAATAAT
AATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGTCACCATTGTCAA
GGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAAATAATGTCGCAGT
TTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTATTTGAAATATTGAC
ACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTTATAATATTGAGAGGTGGCCTATAAGAGTCCAACGC
TC

QA 4 605 4 605
DS 



AS 1 9

CO CL676Contig1 1139 9 22 U
TTTTTTGTTTGTCTCCTCCGCCGATTTTCAGACACTAGTTTCTGTCCGAAAAGAGTTTCA
GTTGTTAAAATTTAAATTACTTTTTTTCCCGTACAAAATTGGAAAAAAAATGTCATCGTT
TCTCAATTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCATCTGCTTTTCCCGGCGCTTCATTTCGTCC
TCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGTTAAGTGCACTTATGCTGAAGAAGC
TACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAGGGTTGTAGTTCTTGGAGGCAATGG
TTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAAGAAGCAATCTCCAACGGAATCGAGGTTGTAAGTGT
CAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTAC
TGGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTC
GACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCTAACGT
TATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCA
CGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCAAGCGGTTACTTCACCGGAAAGCGTAGCGC
AGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGTTTCAT
ATACGGGAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACT
AGACAAGATCTACGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGGCCGTTGAGGTCTCTCCCTGCGTC
TGATCTCATCTTGGCTCCACCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGC
CGTTAAAGATGACGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAGAAGCAGCTGC
AAAAATGAGAGCCTTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTTATACATAC
TTTGTAACCGTAAAATACCGTATATATATTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGCAATCGTA
AAATTTCGGGACCGGAGATTTATGTTATAACTAGGCCTTGCCCGCGTAAATGATATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BT29TF U 262
AF RR4DT79TF U 1
AF RR4DW46TF U 36
AF RR4CS38TF U 47
AF RR4BT29JQ C 484
AF RR4DT79JQ C 296
AF RR4CS38JQ C 613
AF RR4DW46JQ C 301
AF RR4AX05TF U 460
BS 1 669 RR4DT79TF
BS 670 681 RR4DW46TF
BS 682 682 RR4CS38TF
BS 683 699 RR4DW46TF
BS 700 700 RR4CS38TF
BS 701 716 RR4DW46TF
BS 717 740 RR4CS38TF
BS 741 741 RR4AX05TF
BS 742 746 RR4CS38TF
BS 747 747 RR4AX05TF
BS 748 751 RR4CS38TF
BS 752 752 RR4AX05TF
BS 753 776 RR4CS38TF
BS 777 777 RR4AX05TF
BS 778 785 RR4CS38TF
BS 786 786 RR4AX05TF
BS 787 803 RR4CS38TF
BS 804 1012 RR4AX05TF
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CAAGGAAGCAATCTCCAACGGAATTGAAGTTGTAAGCGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAG
CTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAAGTTACATGGGTTACTGGTGATGTTTTCTATTTTAA
CTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCGACCATTGGTGGTTTTGGTAA
TGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCTAA
AGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCACGACTACA*TCTTCCACCAT

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4DT79TF 669 0 0
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GTTGTTAAAATTTAAATTACTTTTTTTCCCGTACAAAATTGGAAAAAAAATGTCATCGTT
TCTCAATTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCATCTGCTTTTCCCGGCGCTTCATTTCGTCC
TCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGTTAAGTGCACTTATGCTGAAGAAGC
TACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAGGGTTGTAGTTCTTGGAGGCAATGG
TTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAAGAAGCAATCTCCAACGGAATCGAGGTTGTAAGTGT
CAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTAC
TGGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTC
GACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCTAACGT
TATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCA
CGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCAAGCGGTTACTTCACCGGAAAGCGTAGCGC
AGAGGCAGA

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DS 

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G
AGTTTCTGTCCGAAAAGAGTTTCAGTTGTTAAAATTTAAATTACTTTTTTTCCCGTACAA
AATTGGAAAAAAAATGTCATCGTTTCTCAATTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCATCTGC
TTTTCCCGGCGCTTCATTTCGTCCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGT
TAAGTGCACTTATGCTGAAGAAGCTACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAG
GGTTGTAGTTCTTGGAGGCAATGGTTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAAGAAGCAATCTC
CAACGGAATCGAGGTTGTAAGTGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATG
GTTGGATCAGGTTACATGGGTTACTGGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACT
TCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCGACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAA
AAGAATCAACGGTGAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCC
TAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCCCGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCAAGCGG
TTACTTCACCGGAAAGCGTAGCGCAGAGGCAGAACTCCTCTCCAA*TATCCCAACTCCGG
AGTCGTGCTGAGACCAGGTT
CATA

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DS 

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AAAATGTCATCGTTTCTCAATTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCATCTGCTTTTCCCGGC
GCTTCATTTCGTCCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGTTAAGTGCACT
TATGCTGAAGAAGCTACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAGGGTTGTAGTT
CTTGGAGGCAATGGTTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAAGAAGCAATCTTCAACGGAATC
GAGGTTGTAAGTGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAG
GTTACATGGGTTACTGGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCC
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GGTGAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTC
TTGATCACTGTTCACGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCAAGCGGTTACTTCACC
GGAAAGCGTAGCGCAGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTG
AGACCAGGTTTCATATACGGGAAACGAAAAGTGA*CGGAT*CGAG*TCCCGCTTGATCTG
GTCGGGGAGC*ACTAGACA*GATCTACGATGCTGCAG

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DS 

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CGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCACGA
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GGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAGCTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGTTTCATTTA
CGGGAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACTAGA
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TCTCATCTTGGCTCCACCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGCCGT
TAAAGATGACGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGTTCAAAGAAGCAGCTGCAAA
AATGAGAGCCTTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTT*TACATACTTT
GTAACCGTAAAATACCGTATATATTTTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGC

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DS 

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AGTGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTTACATGG
GTTACTGGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTA
GTTTCGACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCT
AACGTTATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACT
GTTCACGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCAAGCGGTTACTTCACCGGAAAGCGT
AGCGCAGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGT
TTCATATACGGGAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAG
CCACTAGACAAGATCTACGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGGCCTTTGAGGTCTCTCCCT
GCGTCTGATCTCATCTTGGCTCCACCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATT
AACGCCGTTAAAGATGACGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAGAAGCA
GCTGCAAAGATGAGAGCCTTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTTATA
CATACTTTGTAACCGTAAAATACCGTATATATATTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGCAA
TCGTAAAATTTCGGGACCGGAGATTTATGTTATAACTAGGCCTTGCCCGCGTAAATGATA
TCAT

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DS 

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CCTCTCAAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGTTTCATATACGGGAAACG
AAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACTAGACAAGATTTA
CGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGGCCTTTGAGGTCTCTCCCTGCGTCTGATTTCATCTT
GGCTCCCCCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGCCGTTAAAGATGA
CGACATTTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAGAAGCAGCTGCAAAGATGAGAGC
CTTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTTATATATACTTTGTAACCGTA
AAATACCGTATATATATTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGCAATCGTAAAATTTCGGGAC
CGGAGATTTATGTTATA

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DS 

RD RR4DW46JQ 839 0 0
GTTTCG
TGGCTCAGCTATCTGCAAAGAAGCAATCTCCAACGGAATCGAGGTTGTAAGTGTCAGCAG
GTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTACTGGTGA
TGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCGACCAT
TGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCTAACGTTATCGC
TGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCCCGACTA
CAATCTTCCACCATTTGTTCTATCAAGCGGTTACTTCACCGGAAAGCGTAGCGCAGAGGC
AGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTCGTGCTGAGACCAGGTTTCATATACGG
GAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACTAGACAA
GATCTACGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGGCCTTTGAGGTCTCTCCCTGCGTCTGATCT
CATCTTGGCTCCACCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGCCGTTAA
AGATGACGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAGAAGCAGCTGCAAAGAT
GAGAGCCTTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTTATACATACTTTGTA
ACCGTAAAATACCGTATATATATTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGCAATCGTAAAATTT
CGGGACCGGAGATTTATGTTATAACTAGGCCTTGCCCGCGTAAATGATATCAT

QA 7 839 7 839
DS 

RD RR4AX05TF 680 0 0
G
GGTGCCACTGCTGTAGTTTCGACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGA
ATCAACGGTGAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGTGTTCCTAAG
TTTGTCTTGATCACTGTTCACGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCCAGCGGTTAC
TTCACCGGAAAACGTAGCGCTGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTT
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GCACTTGCTGTGATTAACGCCGTTAAAGATGACGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAG
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TTCCTCTCCCTT*TACATACTTTGTAACCGTAAAATACCGTATATATTTTTGCTTGTTTC
GCGACGAGCGAGCAATCGTAAAATTTCGGGACCGGAGATTTATGTTATAACTAGGCCTTG
CCCGCGTAAATGATATCAT

QA 2 680 2 680
DS 



AS 1 5

CO CL677Contig1 1059 5 13 U
GGAGTTCAATCTTTCATTCTTTATGGTTCATTCATCTCTCTCAGAATCTACAAAAAGAAA
AAA*GAAAAAACTTTTCATTTCTGTGAGATTCTCAGAAACCAAATTCTTGTTTCACCAAC
TCCTCCAAGAATCATGCATGAGAAGAGTATTGTAGAGGACGTTATCGGCGATTTGGTTGA
TAACTTCACCGAGACGGTTCATAAGAAGAAAAACGTTTCTTTCTTCGAACAAGAAGAAGA
TACAGTCTCTTCTCGTTTCAACCGCTTGTTCGGTCGTGAGAAGCCGATTCATCATGTCTT
GGGCGGTGGCAAATCTGCTGATGTGTTGTTGTGGAGGAACAAGAAGATCTCTGCGAGTGT
TCTGATGGGAGCTACTGCAATCTGGGTGCTTTTCGAGTGGATCAACTTCCACTTTCTATC
TCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGCTTGGTATGATCGTGCAGTTCGTTTGGTCTAATGCCTC
AGGGGCTCTAAACCGCTCATCACAGTCTAGAGTGCCTCGCCTTGTTCTTCCAAAAGATTT
CTTTGCTGATGTTGGTGTAACCGTTGGTACAGAGGTTAACCGTGGTTTGATGTTTCTTCA
GGACTTGGCTTGTAGAGGGAGTTTGAAACAGTTCCTCATGGCTGTGATTGGACTATGGCT
AGCCGCAATAATAGGGAGCTGTTGCAACTTCCTAACTGTTTTGTATATTGGGTTTGTGGG
AGCACACACAATGCCGGTTCTGTATGAGAGATATGAAGACGAAGTTGATGGTTTTGTTGA
TTCTCTGCTCATGAAGTTTCATAGTCACTACAAGAAGATTGATACTGGTTTTCTCAGTCG
AATCCCAAGTGGAAAGTTTGGGTTCAAGAAGTATGACTAAAATCAATTTCCCTTTCTTGT
TAGAACAATGGATCATATTTTGCTCTTTGCCAAGTTAATGCTTTGAGAATAATCACGTAG
ATATTTGTTTATTGAATCTTCTTATTTTGTTATTACAAGCTTGTCTCGATTTGTTTCCTT
GTTTAGTTAGTTAGTTTGTCTCAAAGGAAGTAAATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAA*GAAAAAACTTTTCATTTCTGTGAGATTCTCAGAAACCAAATTCTTGTTTCACCAAC
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TCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGCTTGGTATGATCGTGCAGTTCGTTTGGTCTAATGCCTC
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G*ACTTGGCTTGTAGAGGGAGTTTGAAACAGTTCCTCATGGCTGTGATTGGAC

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DS 

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AGAAAAAGAACGTTTCTTTCTTCGAACAAGAAGAAGATACCGTCGCTTCTCGTTTCAACC
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GGGTGCTTTTCGAGTGGATCAACTTCCACTTTCTGTCTCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGC
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GGGG
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GTGAGATTCTCAGAAACCAAATTCTTGTTTCACCAACTCCTCCAAGAATCATGCATGAGA
AGAGTATTGTAGAGGACGTTATCGGCGATTTGGTTGATAACTTCACCGAGACGGTTCATA
AGAAGAAAAACGTTTCTTTCTTCGAACAAGAAGAAGATACAGTCTCTTCTCGTTTCAACC
GCTTGTTCGGTCGTGAGAAGCCGATTCATCATGTCTTGGGCGGTGGCAAATCTGCTGATG
TGTTGTTGTGGAGGAACAAGAAGATCTCTGCGAGCGTTCTGATGGGAGCTACTGCAATCT
GGGTGCTTTTCGAGTGGATCAACTTCCATTTTCTGTCTCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGC
TTGGTATGATCGTGCAGTTCGTTTGGTCTAATGCCTCAGGGGCTCTAAACCGCTCATCAC
AGTCTAGAGTGCCTCGCCTTGTTCTTCCAAAAGATTTCTTTGCTGATGTAGGTGTGACCG
TTGGTACAGAGGTTAACCGTGGTTTGATGTTTCTTCAGGACTTGGCTTGTAGAGGGAGTT
TGAAACAGTTCCTCATGGCTGTGATTGGACTATGGCTAGCCGCAATAATAAGGAGCTGTT
GCAACTTCCTAACTGTTTTGTATATTGGGTTTGTGGGAGCACACACAATGCCGGTTCTGT
ATGAGAGATATGAAGACGAAGTTGATGGTTTTGTTGATTCTCTGCTCATGAAGTTTCATA
GTCACTACAAGA

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DS 

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ATGGGAGCTACTGCAATCTGGGTGCTTTTCGAGTGGATCAACTTCCACTTTCTATCTCTC
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GCTGATGTTGGTGTAACCGTTGGTACAGAGGTTAACCGTGGTTTGATGTTTCTTCAGGAC
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GCGATAATAGGGAGCTGTTGCAACTTCCTAACTGTTTTGTATATTGGGTTTGTGGGAGCA
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CCAAGTGGAAAGTTTGGGTTCAAGAAGTATGACTAAAATCAATTTCCCTTTCTTGTTAGA
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AGTTAGTTAGTTTGTCTC

QA 1 798 1 798
DS 

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GAAGAACAAGAAGATCTCTGCGAGTGT*CTGATGGGAGCTACTGCAATCTGGGTGCTTTT
CGAGTGGATCAACTTCCACTTTCTATCTCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGCTTGGTATGAT
CGTGCAGTTCGTTTGGTCTAATGCCTCAGGGGCTCTAAACCGCTCATCACAGTCTAGAGT
GCCTCGCCTTGTTCTTCCAAAAGATTTCTTTGCTGATGTTGGTGTAACCGTTGGTACAGA
GGTTAACCGTGGTTTGATGTTTCTTCAGGACTTGGCTTGTAGAGGGAGTTTGAAACAGTT
CCTCATGGCTGTGATTGGACTATGGCTAGCCGCAATAATAGGGAGCTGTTGCAACTTCCT
AACTGTTTTGTATATTGGGTTTGTGGGAGCACACACAATGCCGGTTCTGTATGAGAGATA
TGAAGACGAAGTTGATGGTTTTGTTGATTCTCTGCTCATGAAGTTTCATAGTCACTACAA
GAAGATTGATACTGGTTTTCTCAGTCGAATCCCAAGTGGAAAGTTTGGGTTCAAGAAGTA
TGACTAAAATCAATTTCCCTTTCTTTTTAGAACAATGGATCATATTTTGCTCTTTGCCAA
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TACAAGCTTGTCTCGATTTGTTTCCTTGTTTAGTTAGTTAGTTTGTCTCAAAGGAAGTAA
ATATGC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 8

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CCGCCGACTCTGGATTTCCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACGGT
ACAAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCT
CTGCGCCGGTTTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGA
CGCCGTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCAC
AATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGC
CATGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTC
CGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTT
GTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAG
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AGAAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGA
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AGTCCTTTTGATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 0 35 35 35 35 35 35 15 0 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4BT78TF U 1
AF RR4C924TF U 4
AF RR4BU27TF U 83
AF RR4AA07TF U 11
AF RR4BT78JQ C 303
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AF RR4BU27JQ C 303
AF RR4C924JQ C 623
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GTACTTAGACGTGATTCTTGTGCCATTAGCTCTTGTGATGATGCTTTGTTACCACATCTA
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ACAAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCT
CTGCGCCGGTTTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGA
CGCCATTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCAC
AATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGC
CATGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTC
CGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTT
GTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAG
CGTTTTGGTA*TGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCA
CAT

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DS 

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GGGACGA
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ATGGTTCGAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAACTCTCGCGGCCGCCGACTC
TGGATT*CCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACGGTACAAACACTC
CGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCTCTGCGCCGGT
TTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCCGTTTAC
GGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATCTTCATC
TTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCATGCTCGTT
AACATCCCCAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCCGAGTACGTC
AGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTCTACGCA
GGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTTTTGGTA
ATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGACTTTGTGTCACT

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DS 

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CAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAACTCTCGCGGCCGCCGACTCTGGATTTCCGCT
ATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACGGTACAAACACTCCGTAACATAGTA
ATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCGCAGTC
ATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCCGTTTACGGTGCTCATGGA
GATATCGTCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTTTCTTC
TCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAAC
CTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCCGAGTACGTCAGCGAGTTGTTT
GACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTCTACGCAGGGTTTTCTCTG
ATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTTTTGGTAATGATTCTTACT
CTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAC**ATAAAGAAAAC**ACGTATAGTGGAT
TGTCCACGCGC
TCTGAGA

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DS 

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ATGGTTCGAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAACTCTCGCGGCCGCCGACTC
TGGATTTCCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACGGTACAAACACTC
CGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCTCTGCGCCGGT
TTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCCGTTTAC
GGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATCTTCATC
TTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCATGCTCGTT
AACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCCGAGTACGTC
AGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTCTACGCA
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ATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAGAAAAACAA
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AAATGTGAAA*TGGTATATCTATCATCACCTAAATAGT

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DS 

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CCATTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAA
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TTTTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAG
AAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGATG
ATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATACA
CATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATAGTTAAACATGGTGATT
TTAAGTATC

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CATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCCGTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGT
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CCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTC
TGGTGACTTGTTCCTCACGTCCGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCT
CAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGG
TCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTTTTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTT
TGTGTCACTCGGCAACAATAAAGAAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGA
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CA*TATGAAAGTGATAATATACACATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCAC
CTAAATAGTTAAACATGGTGATTTTAAGTATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCAT
GCTTAACAAGAACTGAGTTCGAGTTGTATTATTTACTATAGTGAATCAGTACTGTAGATC
GTAAATTTAAGAAAAATAAAAAGTCCTTTTGATTGG

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DS 

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CCGTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGTCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAA
TCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCA
TGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCCG
AGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTTTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGT
TCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCG
TTTTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAG
AAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGATG
ATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATACA
CATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCTTCACCTAAATAGTTAAACATGGTGATT
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TCCTTTTGATT
C

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DS 

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CTTTATCACGTGGACTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAGAAAAACAAAGTATAGTGGAT
TGTCCACGCGCCTTTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGATGATGCATAATACAATTCCATA
TGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATACACATTTTTCAAATGTGAAAAT
GGTATATCTATCATCACCTAAATAGTTAAACATGGTGATTTTAAGTATCACTACTTATTT
TGTTATTCATAATGCATGCTTAACAAGAACTGAGTTCGAGTTGTATTATTTACTATAGTG
AATCAGTACTGTAGATCGTAAATTTAAGAAAAATAAAAAGTCCTTTTGATT
G

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DS 



AS 2 7

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AGAGGATCTTCTTTTCAAAAGAAACACACGAAATAATAATAGTTCGTACAAAGGATTCGA
ACAATACAAAATCCCCGGAGAATCTGTACCGGAACCACCACCGTATCATGGGAATCACGG
GAAGTCTAACACCAGATCAGCTCGAGTTTTACAACTCTCAAGGGTATTTGGTAATCGAAT
CATTCGCGAGTGAGGATGAGATTGGCGGCTTGAGGAAGAGGATGGATGAGTTGTTGACTC
AATTTGATTGCTCTGTCTCTTCTATTTTCTCCACTAAAAACCAGAAGAACACAACCGATA
ATTACTTCTTTGAGAGCGCTGCAAAAATCTCCTTCTTTTTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCG
ACAATGGGGAACTGAAGCAACCGAAAGAGCTTTCTATAAACAAAGTTGGCCACGCACTGC
ACGAGCTTGACCCTTTGTACAAGGAGTTCACTTATTCGTCCAAGGTTTCAAGTTTGGTAT
CATCCCTAGGTTACAGAAGACCAGT***CATGCAGGCCATGTACATTTTCAAGCAACCTG
GAATTGGAGGAGAAGTTGTGCCGCATCAAGATAATTCTTTTGTCTACACGGATCCACCTA
GTTGTAATGGTCTCTGGATGGCTTTAGAAGATTCCACAACTGTTAACGGTTGTCTTTGGG
CCATACCTGGATCTCACAAGAACGGTCTGGTTAGAAGGTTTATCCGGGGTGAAAACGGTG
TAACGTTTGATAGGCCATCACCGTCTTACGACCAGAAAGATTTCGTGTCTATTGAAATGA
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CTGCCAAGTCAAGACATGCATATAGCTTACATGTGGTAGAATCTGACGGATGCAAATGGG
CACCAGACAACTGGATTCAAAGAGAAAAAATGCCTGAGCCTCTCTATGCCCCTTGATACA
AGCCAGTCTGCGTTTATCAAATTCCTTCTACCCGCGACCATTCGTTGTTAGTACTCTGAA
CATGGCTAAAGAGGCTCTTCTTTTGTCGTTTACTTGTCGAAATACAATTTGTTTCTGCTT
GGTATCTTTAGATAATGGTCGATAAAGTATGGCAGTGCTTACTTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF41TF U 1
AF RR4DG69TF U 20
AF RR4ET85TF U 421
AF RR4AF41JQ C 416
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BS 1064 1090 RR4ET85TF
BS 1091 1188 RR4AF41JQ

RD RR4AF41TF 762 0 0
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GAAGTCTAACACCAGATCAGCTCGAGTTTTACAACTCTCGAGGGTATTTGGTGATCGAAT
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ATTACTTCTTTGAGAGCGCTGCAAAAATCTCCTTCTTTTTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCG
ACAATGGGGAACTGAAGCAACCGAAAGAGCTTTCTATAAACAAAGTTGGCCACGCACTGC
ACGAGCTTGACCCTTTGTACAAGGAGTTCACTTATTCGTCCAAGGTTTCAAGTTTGGTAT
CATCCCTAGGTTACAGAAGACCAGT***CATGCAGGCCATGTACATTTTCAAGCAACCTG
GAATTGGAGGAGAAGTTGTGCCGCATCAAGATAATTCTTTTGTCTACACGGATCCACCTA
GTTGTAATGGTCTCTGGATGGCTTTAGAAGATTCCACAACTGTTAACGGTTGTCTTTGGG
CCATACCTGGATCTCACAAGAACGGTCTGGTTAGAAG
TTTAT

QA 1 757 1 757
DS 

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GG
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AAACACACGAAATAATAATAGTTCGTACAAAGGATTCGAACAATACAAAATCCCCGGAGA
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TTGGCGGCTTGAGGAAGAGGATGGATGAGTTGTTGACTCAATTTGATTGCTCTGTCTCTT
CTATTTTCTCCACTAAAAACCAGAAGAACACAACCGATAATTACTTCTTTGAGAGCGCTG
CAAAAATCTCCTTCTTTTTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCGACAATGGGGAACTGAAGCAAC
CGAAAGAGCTTTCTATAAACAAAGTTGGCCACGCACTGCACGAGCTTGACCCTTTGTACA
AGGAGTTCACTTATTCGTCCAAGGTTTCAAGTTTGGTATCATCCTTAGGTTACAGAAGAC
CAGTCGTCATGCAGGCCATGTACATTTTCAAGCAACCTGGG**TGGAGGAGAAGTTGTGC
CGCATCAAGATAATTCTTTTGTCTACACGGATCCACCTAGTTGTAATGGTCTCTGGATGG
CTTTAGAAGATTCCACAACTGTTAACGGTTGTCTTTGGGCCATACCTGGA
CTCACAA

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DS 

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GA
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GAGCTTGACCCTTTGTACAAGGAGTTCACGTATTCGTCCAAGGTTTCAAGTTTGGTATCA
TCCTTAGGTTACAGAAGACCAGTCGTCATGCAGGCTATGTACATTTTCAAGCAACCTGGA
ATTGGAGGAGAAGTTGTGCCGCATCAAGATAACTCTTTTGTCTACACGGATCCACCTAGT
TGTACTGGTCCCTGGATGGCTTTAGAAGATTCCACAACTGTTAACGGTTGTCTTTGGGCC
ATACCTGGATCTCACAAGAACGGTCTGGTTAGAAGGTTTATCCGTGGTGAAAATGGTGTA
ACGTTTGATAGGCCATCACCGTCTTACGACCAGAAAGATTTTGTGTCTATTGAAATGAAA
GCAGGCTCATTGATCGCCATTCATGGTGATCTAATCCATCAAAGTTTCGAGAATCTATCT
GTCAAGTCAAGACATGCATATAGCTTACATGTGGTAGAATCTGATGGATGCAAATGGGCA
CCAGACAACTGGATTCAAAGAGAAAAAATGCCTGAGCCTCTCTATGCCCCTTGATACAAG
CCAGTCTGCGTTTATCAAATTCCTTCTACCCGCGACCATTTGTTGTTAGTACTCTGAACA
TGGCTAAA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4AF41JQ 773 0 0
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GGTATCATCCCTAGGTTACAGAAGACCAGT***CATGCAGGCCATGTACATTTTCAAGCA
ACCTGGAATTGGAGGAGAAGTTGTGCCGCATCAAGATAATTCTTTTGTCTACACGGATCC
ACCTAGTTGTAATGGTCTCTGGATGGCTTTAGAAGATTCCACAACTGTTAACGGTTGTCT
TTGGGCCATACCTGGATCTCACAAGAACGGTCTGGTTAGAAGGTTTATCCGGGGTGAAAA
CGGTGTAACGTTTGATAGGCCATCACCGTCTTACGACCAGAAAGATTTCGTGTCTATTGA
AATGAAAGCAGGCTCATTGATCGCCATTCATGGTGATCTAATCCATCAAAGTTTCGAGAA
TCTATCTGCCAAGTCAAGACATGCATATAGCTTACATGTGGTAGAATCTGACGGATGCAA
ATGGGCACCAGACAACTGGATTCAAAGAGAAAAAATGCCTGC*CCTCTCTATGCCCCTTG
ATACAAGCCAGTCTGCGTTTATCAAATTTCTTCTACCCGCGACCATTCGTTGTTAGTACT
CTGAACATGGCTAAAGAGGCTCTTCTTTTGTCGTTTACTTGTCGAAATACAATTTGTTTC
TGCTTGGTATCTTTAGATAATGGTCGATAAAGTATGGCAGTGCTTACTTAAAG

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL679Contig2 1129 3 15 U
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GACAAGTAAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAGCCATGTCCAGAGTACAAACAACAAATG
GTCGTAGGACAGGAAATTTGATAAACGCAAACTGGCTTGTATCAAGGGGCATAGAGAGAC
TCAGGCATTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTCTGGGGCCCATTTGCATCCATCAAATTCT
ACCACATGTAAGCTATATGCGCGTCTTGACTTGGCAGATAGATTCTCGAAACTTTGATGG
ATTAAATCACCATGAATGGCGATCAATGAGCCTGCTTTCATTTCAATAAACACAAAATCT
TTCTGGTCGTAAGACGGTGATGGCCTATCAAACGTTACACCATTTTCACCCCGGATAAAC
CTTCTAACCAGACCGTTCTTGTGAGATCCAGGTATGGCCCAAAGACAACCGTTAACAGTT
GTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGTGGATCCGTGTAGACAAAA
GAATTATCTTGATGCGGCACAACTTCTCCTCCAATTCCAGGTTGCTTGAAAATGTACATG
GCCTGCATGACGACTGGCCTTCTGTAACCTAAGGATGATACCAAACTTGAAACCTGGACG
AATACGTGAACTCCTTGTACAGAGGGTCAGGCTCGTGCAGTGCGTGGCCAACTTTGTTTA
TAGAAAGCTCTTTCGGTTGCTTCAGTTCCCCATTGTCGCCAAAAGCTTTTTCTTCAAAAA
AGAAGGAGATTTTTTCAGCGCTCTCAAAGAAGTAATTATCGGTCGTGTTCTTCTGGTTTT
TAGTGGAGAAAATAGAAGAGACAGAGCAATCAAATTGAGTCAACAACTCATCCATCCTCT
TCCTCAAGCCGCCAATCTCATCCTCACTCGCGAAAGATTCGATCACCAAATAACCTTGAG
AGTTGTGAAACTCGAGCTGATCTGGTGTTAGACTTCCCGTGATTCCCATGATTCCCGGTG
GTGGTTCCGGTGCAGATTTCTCCGGGGATTTTGTGCGAACTATTATTATTTCGTGTGTTT
GACTTTAATTACCCCCAACCACGAAAGTACATACGAACAGAACAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DX30JQ U 1
AF RR4EA72JQ U 5
AF RR4EA72TF C 416
BS 1 43 RR4DX30JQ
BS 44 44 RR4EA72JQ
BS 45 149 RR4DX30JQ
BS 150 150 RR4EA72JQ
BS 151 215 RR4DX30JQ
BS 216 216 RR4EA72JQ
BS 217 234 RR4DX30JQ
BS 235 235 RR4EA72JQ
BS 236 261 RR4DX30JQ
BS 262 262 RR4EA72JQ
BS 263 304 RR4DX30JQ
BS 305 305 RR4EA72JQ
BS 306 338 RR4DX30JQ
BS 339 501 RR4EA72JQ
BS 502 1129 RR4EA72TF

RD RR4DX30JQ 338 0 0
GTGATGTCATACTTTATTGACCATTATCTAAAGAGACCAAGCAGAAACAAATTGTATTTC
GACAAGTAAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAGCCATGTCCAGAGTACAAACAACAAATG
GTCGTAGGACAGGAAATTTGATAAACGCAGACTGGCTTGTATCAAGGGGCATAGAGAGAC
TCAGGCATTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTCTGGTGCCCATTTGCATCCATCAGATTCT
ACCACATGTAAGCTATATGCGTGTCTTGACTTGGCAGATAGATTCTCGAAACTTTGATGG
ATTAGATCACCATGAATGGCGATCAATGAGCCTGCTTT

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR4EA72JQ 497 0 0
TGT
CATACTTTATTGACCATTATCTAAAGAGACCAAGCAAAAACAAATTGTATTTCGACAAGT
AAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAGCCATGTCCAGAGTACAAACAACAAATGGTCGTAG
GACAGGAAATTTGATAAACGCAAACTGGCTTGTATCAAGGGGCATAGAGAGGCTCAGGCA
TTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTCTGGGGCCCATTTGCATCCATCAAATTCTACCACAT
GTAAGCTATATGCGCGTCTTGACTTGGCAGATAGATTCTCGAAACTTTGATGGATTAAAT
CACCATGAATGGCGATCAATGAGCCTGCTTTCATTTCAATAAACACAAAATCTTTCTGGT
CGTAAGACGGTGATGGCCTATCAAACGTTACACCATTTTCACCCCGGATAAACCTTCTAA
CCAGACCGTTCTTGTGAGATCCAGGTATGGCCCAAAGACAACCGTTAACAGTTGTGGAAT
CTTCTAAAGCCATC

QA 4 497 4 497
DS 

RD RR4EA72TF 714 0 0
ATAAA
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GTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGTGGATCCGTGTAGACAAAA
GAATTATCTTGATGCGGCACAACTTCTCCTCCAATTCCAGGTTGCTTGAAAATGTACATG
GCCTGCATGACGACTGGCCTTCTGTAACCTAAGGATGATACCAAACTTGAAACCTGGACG
AATACGTGAACTCCTTGTACAGAGGGTCAGGCTCGTGCAGTGCGTGGCCAACTTTGTTTA
TAGAAAGCTCTTTCGGTTGCTTCAGTTCCCCATTGTCGCCAAAAGCTTTTTCTTCAAAAA
AGAAGGAGATTTTTTCAGCGCTCTCAAAGAAGTAATTATCGGTCGTGTTCTTCTGGTTTT
TAGTGGAGAAAATAGAAGAGACAGAGCAATCAAATTGAGTCAACAACTCATCCATCCTCT
TCCTCAAGCCGCCAATCTCATCCTCACTCGCGAAAGATTCGATCACCAAATAACCTTGAG
AGTTGTGAAACTCGAGCTGATCTGGTGTTAGACTTCCCGTGATTCCCATGATTCCCGGTG
GTGGTTCCGGTGCAGATTTCTCCGGGGATTTTGTGCGAACTATTATTATTTCGTGTGTTT
GACTTTAATTACCCCCAACCACGAAAGTACATACGAACAGAACAGAGCC

QA 6 714 6 714
DS 



AS 2 5

CO CL680Contig1 817 3 8 U
CATCAGATCAAAACAAAATTAAAAGAGGAATATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTAAA
AATATAATCCTAAAAGGTGGTTTAGATTTGATTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAG
ACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCACAAAGATTCATCTGCTGCTTCTT
CTTACCTTCTCTCTCTCTCT**TAGCTTAGGATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAA
ACGCAGGAGAGATGAATCACAGCATCTCTTGCGATCTTCGAACACAGCGACTCACTTTCT
TCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCTTTTGCTGCTTCCACATTGGCCGGTGACT
CATCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAA
CAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTACCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAA
GAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGA
ACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGA
AACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAGACGT
TATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCAACCGGGTTCTTACACAGATCTTTGA
GCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCTTGCTTGATCCTTTGCCATCTCAAGCCACCGGCGATAGA
GATCCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGTAGA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL88JQ U 1
AF RR4EL88TF C 3
AF RR4FD05JQ U 32
BS 1 84 RR4EL88JQ
BS 85 85 RR4FD05JQ
BS 86 248 RR4EL88JQ
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BS 482 706 RR4EL88JQ
BS 707 817 RR4FD05JQ

RD RR4EL88JQ 707 0 0
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AATATAATCCTAAAAGGTGGTTTAAATTTGATTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAG
ACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCACAAAGATTCATCTGCTGCTTCTT
CTTACCTTCTCTCTCTCTCT**TAGCTTAGGATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAA
ACGCAGGAAAGATGAATCACAGCATCTCTTGCGATCTTCGAACACAGCGACTCACTTTCT
TCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCTTTTGCTGCTTCCACATTGGCCGGTGACT
CATCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAA
CAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTACCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAA
AAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGA
ACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGA
AACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAGACGT
TATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCAACCGGGTTCTT
C

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EL88TF 705 0 0
TCAGATCAAAACAAAAT*AAAAGAGGAATATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTAAAAA
TATAATCCTAAAAGGTGGTTTAGATTTGATTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAGAC
AAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCACAAAGATTCATCTGCTGCTTCTTCT
TACCTTCTCTCTCTCTCT**TAGCTTAGGATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAAC
GCAGGAGAGATGAATCACAGCATCTCTTGCGATCTTCGAACACAGCGACTCACTTTCTTC
CTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCTTTTGCTGCTTCCACATTGGCCGGTGACTCA
TCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACA
GGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTACCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGA
ATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAAC
TTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAA
CCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAGACGTTA
TTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCAACCGGGTTCTT
C

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4FD05JQ 786 0 0
ATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTAAAAATATAATCCTAAAAGGTGGTTTAGATTTGA
TTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGA
TGAGCACAAAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTAGG
ATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCACAGCATCTCTTG
CGATCTTCGAACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTC
TTTTGCTGCTTCCACATTGGCCGGTGACTCATCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGAT
ACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTA
CCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATA
AACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATC
CGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACC
CATAATCGAAACGCTCCACTGGAAGACGTTATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACC
ATCAACCGGGTTCTTACACAGATCTTTGAGCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCTTGCTTGATC
CTTTGCCATCTCAAGCCACCGGCGATAGAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
AGTAGA

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL680Contig2 696 2 2 U
CATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTAAAAATATAATCCTAAAAGGGGGTTTAGATTTG
ATTCCACCACAATATTCCAAACCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGA
TGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCACTCTTAGCTTAG
GATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCTCATAGCATCTC
TTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCA
TTCCTTTGCTGCTTCAACGTTTGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATAT
GATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTC
GTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGA
ATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACGTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATA
ATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGG
ACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTCTCATCAACGAGACCAGCAGAGAA
ACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTTGAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F489JQ U 1
AF RR4C131JQ U 8
BS 1 650 RR4F489JQ
BS 651 696 RR4C131JQ

RD RR4F489JQ 650 0 0
CATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTAAAAATATAATCCTAAAAGGGGGTTTAGATTTG
ATTCCACCACAATATTCCAAACCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGA
TGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCACTCTTAGCTTAG
GATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCTCATAGCATCTC
TTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCA
TTCCTTTGCTGCTTCAACGTTTGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATAT
GATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTC
GTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGA
ATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACGTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATA
ATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGG
ACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTCTCATCAACGAGAC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4C131JQ 689 0 0
AGGAATCCATTAACGAGTGTAAAAATATAATCCTAAAAGGGGGTTTAGATTTGATTCCAC
CACAATATTCCAAACCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCAC
ACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCACTCTTAGCTTAGGATAGAA
ATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCTCATAGCATCTCTTGCGAT
CTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCCTTT
GCTGCTTCAACGTTTGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTC
AACACAATGCTCTCTGCCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTATCCA
TTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACA
TTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGT
GGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATA
ATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTCTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCA
ACCGGGTTCTTGCACAGATCTTTGAGCTG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 7

CO CL681Contig1 1138 7 17 U
ATGTAAACTCTAATGGATCCAAGTATTGATTTTCATAGTAGGTGTTACAAAA*GGACCCA
AGAACATTGAGAAAAGAAGAAAGTGTAGAGTATTTAAATAATAACTAGAAACACACTGGA
TCACTGGCAGACTGTAAATTTGCAAGTCCCCGAGTTAGCCTTGATGAAACGGATAGCTGT
CATGAGAACATCGTGCTGCGAGCTCCCAAGGAGAGCCATATTAGTATATGTGATCACAGC
AACGGAGTTATAAGGAAAGCCAAGAGAGTTGTATGAATTGAGTAATGCAGTTGTTGCTTC
CCTTAGGAGAGTCTTGTAGGCTTCTCCTCTCCCGATAAGCGCTTCCCGTAATGTCATATC
ATTACCATATCTCCTCCCGGCTACTAGTCCAAACGAGACCGCAACCTTCGTGTCTGGACC
TATCACCTTCCAGTAGCATCTGTATTCAGGTCTTATCCATAACTGGTGAGAACAAGCTGA
GGGCTCCACAAATGGAACTGGAGGGATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAAACTGAGGTGG
CGATGTAGCTGGAGGAGGACTCATGGCCGGGGCCTTAGGAGAAGGTAAGAACGGGACTTG
AGTAATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAACCTGAGGAGGAGGAATAACCGAAGCTGGTGG
TGGTTTAGGACAAGAAGACATTGGCTGAACCGGCTGAGCAAGAAGGGCATCCACAACGAA
GGTTTCAATCCCAAAGAAACTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGCAGGACCTGAAGCGAT
GCTGCAACTACTACTTGAGCCCTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCATAACAGTT
GCTTAGATCCGGTGTCCCGTCGAATCTCATCGCATATCCTCCAAGCCAGTTAGTGGTCTC
TTCTCTTGACATATAGACTTGTCCATTTTCATCCAA**ATGTGACA*TAACCTTGATTCC
GGAGACGGGAAAATCGAACAAAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCGCAAAACACCGT
GCCAGTGACCGTGGCATATCCGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAGAAAGGC
CACAAAGAGAATATTATGATTTGGATCCATTTGATATCTCAGACCTAGTAACCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

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AF RR4B330JQ U 15
AF RR4B330TF C 381
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ATTACCATATCTCCTCCCGGCTACTAGTCCAAACGCGACCGCAACCTTCGTGTCTGGACC
TATCACCTTCCAGTAGCATCTGTATTCAGGTCTTATCCATAACTGGTGAGAACAAGCTGA
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GCTGCGAGCTCCCAAGGAGAGCCATATTAGTATATGTGATCACAGCAACGGAGTTATAAG
GAAAGCCAAGAGAGTTGTATGAATTGAGTAATGCAGTTGTTGCTTCCCTTAGGAGAGTCT
TGTAGGCTTCTCCTCTCCCGATAAGCGCTTCCCGTAATGTCATATCATTACCATATCTCC
TCCCGGCTACTAGTCCAAACGAGACCGCAACCTTCGTGTCTGGACCTATCACCTTCCAGT
AGCATCTGTATTCAGGTCTTATCCATAACTGGTGAGAACAAGCTGAGGGCTCCACAAATG
GAACTGGAGGGATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAAACTGAGGTGGCGATGTAGCTGGAG
GAGGACTCATGGCCGGGGCCTTAGGAGAAGGTAAGAACGGGACTTGAGTAATTGGAGGCA
AAGGTGGAAGCTTAACCTGAGGAGGAGGAATAACCGAAGCTGGTGGTGGTTTAGGACAAG
AAGACATTGGCTGAACCGGCTGAGCAAGAAGGGCATCCACAACGAAGGTTTCAATCCCAA
AGAAACTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGCAGGACCTGAAGCGATGCTGCAACTACTAC
TT

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TCATGGCCGGGGCCTTAGGAGAAGGTAAGAACGGGACTTGAGTAATTGGAGGCAAAGGTG
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TAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGCAGGACCTGAAGCGATGCTGCAACTACTACTTGAGC
CCTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCATAACAGTTGCTTAGATCCGGTGTCCCGT
CGAATCTCATCGCATATCCTCCAAGCCAGTTAGTGGTCTCTTCTCTTGACATATAGACTT
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AAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCGCAAAACACCGTGCCAGTGACCGTGGCATATC
CGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAGAAAGGCCACAAAGAGAATATTATGAT
TTGGATCCATTTGATATCTCAGACCTAGTAACCAAT
CC

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AATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAACCTGAGGAGGAGGAATAACCGAAGCTGGTGGTGG
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TTCAATCCCAAAGAAACTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGCAGGACCTGAAGCGATGCT
GCAACTACTACTTGAGCCCTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCATAACAGTTGCT
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TCTTGACATATAGACTTGTCCATTTTCATCCAA**ATGTGACA*TAACCTTGATTCCGGA
GACGGGAAAATCGAACAAAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCGCAAAACACCGTGCC
AGTGACCGTGGCATATCCGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAGAAAGGCCAC
AAAGAGAATATTATGATTTGGATCCATTTGATATCTCAGACCTAGTAACCAATCC

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GAGGCAAAGGTGGAAGCTTAACCTGAGGAGGAGGCATAACCGAAGCTGGTGGTGGTTTAG
GACAAGAAGACATCGGCTGAACCGGCTGAGCAAGAAGGGCATCCACAACGAAGGTTTCAA
TCCCAAAGAAACTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGCAGGACCTGAAGCGATGCTGCAAC
TACTACTTGAGCCCTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCATAACAGTTGCTTAGAT
CCGGTGTCCCGTCGAATCTCATCACATATCCTCCAAACCAGTTAGTGGTCTCTTCTCTTG
ACATATAGACTTGTCCATTTTCATCCAAACATGTGACACTAACCTTGATTCCGGAGACGG
GAAAATCGAACAAAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCACAAAACACCGTGCCAGTGA
CCGTGGCATATCCGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAGAAAGGCCACAAAGA
GAATATTATGATTTGGATCCATTTGATATCTCAGACCTAATAACCAAT
CC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 2 8

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TTCAATGCTTCTGAAGAAGATGAAGAGGTGGTTAATGAATCTGCAAAGGCCTCGGCATGG
TATCACGTGACTTACCACCCAAGTTACTGGGGAGTTTATAATGAAGGTTTGAACCGCGAC
CATTTCTTGAGCTTTGCGTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAGGATTAAGAAGGCGAAT
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ATGTTTGGTGTGGAGTGCTCTTTGTACTAAATGTTTGGTTTGGACTAATAAATCAGTAAT
TTCGTTTCCTGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BP75JQ C 1
AF RR4AD79JQ C 261
AF RR4AD79TF U 261
AF RR4CB22JQ C 1
AF RR4BP75TF U 1
AF RR4CB22TF U 1
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C

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GG
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C

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TTCGTTTCCTGC

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TATCACGTGACTTACCACCCAAGTTACTGGGGAGTTTATAATGAAGGTTTGAACCGCGAC
CATTTCTTGAGCTTTGCGTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAGGATTAAGAAGGCGAAT
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TTCGTTTCCTGC

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4GY91JQ C 1
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G
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G

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AS 2 8

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CC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4A278TF C 320
AF RR4A913JQ U 2
AF RR4A913TF C 2
AF RR4A278JQD U 1
AF RR4A278TFB C 1
AF RR4A278JQ U 192
BS 1 27 RR4A278JQD
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GTG

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DS 

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ATCATAACATTGAAGTAGCGCATATTTTCCTCTGATGGAGACGCACTTATCCCAGGAGCA
GGTTCACTAAGCAGACGTTGAGTTTCCTTGATGATCCTTCGCGGAAGATTACTATTGGCC
ATTATTGCGTGCTATCCGATTTGATCGATCTCTCAGGGAATTTAGGTCCTTTTTTGAGAG
AGAACGAGCTTCTTTGTCT
CC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4A913TF 741 0 0
GCTCATAAGTTAGTTTGCAAATATGGACAAGCGAGTCTTAAATCCCCACCC*AAGTTATA
CATATTCATAGAGTACAAATCTTTTTCTTTCCTGTTTTAG**AAAAAAAGGATTCTAGAT
AAAACCTTGAGATAAGAGTGTTTCACCAGATAGATTGTTATTTAAAATGACAAGGAACTT
TCTCCTTTT*GCACTCTATATCAAGCGCCACTTGCATAAAGACGAGTCCACTCCTTAGCT
GTCTCCACAGCTTCTGCTTCATTGCTTTTCCAGTGCTTAGCTATGTTCTCAGAGAGGGGA
TCATCTGGGTTTGGTGCACTTAGAAGGGCTTGAATACTCAAGAGCACCGTCCTTATTTGT
AGAGCAGGACTCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATTCTTCCAAGCTTGTCAATG
TTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGCCATCGGATATTCTTCA
GGCAAAAAGAGCTCCAATTTGGAAACGCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGA
ATCATAACATTGAAGTAGCGCATATTTTCCTCTGATGGAGACGCACTTATCCCAGGAGCA
GGTTCACTAAGCAGACGTTGAGTTTCCTTGATGATCCTTCGCGGAAGATTACTATTGGCC
ATTATTGCGTGCTATCCGATTTGATCGATCTCTCAGGGAATTTAGGTCCTTTTTTGAGAG
AGAACGAGCTTCTTTGTCT
CC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4A278JQD 782 0 0
AGCTCACAAGTTAGTTTGCAAATATGGGCAAACGAGTCTTAAATCCCCACCC*AAGTTAT
ACATATTCATAGAGTACAAATCTTTTTCTTTCCTGTTTTAGAAAAAAAAAGGATTCTAGA
TAAAACCTTGAGATAAGAGTGTTTCACCAGATAGATTGTTATTTAAAATGACAAGGAACT
TTCTCCTTTTTGCACTCTATATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGC
TGTCTCCACAGCTTCTGCTTCATTGCTTTTCCAGTGCTTAGCTATGTTCTCAGAGAGGGG
ATCATCTGGGTTTGGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGCACGGTCCTTATTTG
TAGAGCAGGACTCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATTCTTCCAAGCTTGTCAAT
GTTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGCCATCGGATATTCTTC
AGGCAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACGCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAG
AATCATAACATTGAAGTAGCGCATATTTTCCTCTGATGGAGACGCACTTATCCCAGGAGC
AGGTTCACTAAGCAGACGTTGTGTTTCCTTGATGATCCTTCGTGGAAGATTACTATTGGC
CATTATTGCGTGCTATCCGATTTGATCGATCTCTCAGAGAATTTAGGT***TTTTTTAGA
GAGAACGAGCTTCTTCGTCTTTTGTCTCGTTGATATACCTTCAGACAATGTTTACGAACT
C
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4A278TFB 782 0 0
A
GCTCACAAGTTAGTTTGCAAATATGGGCAAACGAGTCTTAAATCCCCACCCCAAGTTATA
CATATTCATAGAGTACAAATCTTTTTCTTTCCTGTTTTAGAAAAAAAAAGGATTCTAGAT
AAAACCTTGAGATAAGAGTGTTTCACCAGATAGATTGTTATTTAAAATGACAAGGAACTT
TCTCCTTTTTGCACTCTATATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCT
GTCTCCACAGCTTCTGCTTCATTGCTTTTCCAGTGCTTAGCTATGTTCTCAGAGAGGGGA
TCATCTGGGTTTGGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGCACGGTCCTTATTTGT
AGAGCAGGACTCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATTCTTCCAAGCTTGTCAATG
TTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGCCATCGGATATTCTTCA
GGCAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACGCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGA
ATCATAACATTGAAGTAGCGCATATTTTCCTCTGATGGAGACGCACTTATCCCAGGAGCA
GGTTCACTAAGCAGACGTTGTGTTTCCTTGATGATCCTTCGTGGAAGATTACTATTGGCC
ATTATTGCGTGCTATCCGATTTGATCGATCTCTCAGAGAATTTAGGT***TTTTTTAGAG
AGAACGAGCTTCTTCGTCTTTTGTCTCGTTGATATACCTTCAGACAATGTTTACGAACTC
C

QA 2 781 2 781
DS 

RD RR4A278JQ 591 0 0
GCACTCTATATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACAG
CTTCTGCTTCATTGCTTTTCCAGTGCTTAGCTATGTTCTCAGAGAGGGGAACATCTGGGT
TTGGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGCACGGTCCTTATTTGTAGAGCAGGAC
TCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATTCTTCCAAGCTTGTCAATGTTAGGATGGT
ATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGCCATCGGATATTCTTCAGGCAAAAAGA
GCTCCAACTTGAAAACGCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGAATCATAACAT
TGAAGTAGCGCATATTTTCCTCTGATGGAGACGCACTTATCCCAGGAGCAGGTTCACTAA
GCAGACGTTGTGTTTCCTTGATGATCCTTCGTGGAAGATTACTATTGGCCATTATTGCGT
GCTATCCGATTTGATCGATCTCTCAGAGAATTTAGGT***TTTTTTAGAGAGAACGAGCT
TCTTCGTCTTTTGTCTCGTTGATATACCTTCAGACAATGTTTACGAACTCC

QA 1 591 1 591
DS 



CO CL683Contig2 824 2 2 U
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AGATCGTTCTCTCTAAAAAAGAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATCGATCAAATCGGATAG
CACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTG
CTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCATCGGAGGAAAATATGCGCTACTTC
AATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAG
CTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATA
TACCATCCTAACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTTACATATTGAAAGACAAGTGG
AGTCCTGCTCTACAAATAAGGACGGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCA
AACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAA
GCTGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAGGTGGCGCTTGATATAGAGTG
CAAAAAGGAGAAAGTTCATTTTTATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACTCTTAT
CTCAAGGTTCTATCTAGAATCCTTTTTTTCTCTCTAAAACAGGAAAGAAAAAGATTTGTA
CTCTTATGTATAACTTGGGGGGGATTTAAGACTCGTTTGCCCATATTTGGAAACTAACTT
ATGAGCTTTGTCTGTGTTGTTCTATAATATCATTTAATCACTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD93TF U 1
AF RR4DD93JQ C 131
BS 1 669 RR4DD93TF
BS 670 824 RR4DD93JQ

RD RR4DD93TF 670 0 0
GGACAAAAAAGAGTTCGTAAACATTGTCTGAAAGTATATCAACGAGACAAGAGACGAGGA
AGATCGTTCTCTCTAAAAAAGAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATCGATCAAATCGGATAG
CACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTG
CTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCATCGGAGGAAAATATGCGCTACTTC
AATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAG
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AGTCCTGCTCTACAAATAAGGACGGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCA
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CAAAAAGGAGAAAGTTCATTTTTATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACTCTTAT
CTCAAGGTT
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4DD93JQ 694 0 0
TGGCCAATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAAC
CTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCATCGGAGGAAAATATGCGCTACTTCAATGTTATGA
TTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGC
CTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTA
ACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTTACATATTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTC
TACAAATAAGGACGGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATG
ATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAGA
CAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAGGTGGCGCTTGATATAGAGTGCAAAAAGGAG
AAAGTTCATTTTTATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACTCTTATCTCAAGGTTC
TATCTAGAATCCTTTTTTTCTCTCTAAAACAGGAAAGAAAAAGATTTGTACTCTTATGTA
TAACTTGGGGGGGATTTAAGACTCGTTTGCCCATATTTGGAAACTAACTTATGAGCTTTG
TCTGTGTTGTTCTATAATATCATTTAATCACTGT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 8

CO CL684Contig1 1303 8 21 U
GGAAAAACAACGAATCTCATAGTCACAGAGAGATACGAGAAATAATATGGCGAAACCTCA
AGATCAAAACAAAGCATTTGGTTGGGCGGCTAACGACAAATCTGGTGTACTCTCTCCATT
TCATTTCTCTAGAAGAGAGAATGGTGAGAACGATGTAACAGTGAAGATATTGTTTTGTGG
TGTTTGCCACTCTGATCTTCATACTATCAAGAACGATTGGGGATTCTCTCATTACCCCAT
CATTCCCGGGCATGAAATCGTTGGAATAGCCACAAAAGTTGGCAAGAACGTAACAAAGTT
CAAAGAAGGAGACCGAGTAGGAGTAGGAGTAATAATCGGCTCATGCCAATCATGTGAATC
ATGTAACCAAGACTTAGAAAACTACTGTCCTCAGCTCGTATACACATACAACTCTCGTTC
CTCTGACGGAACAAGAAACCAAGGTGGTTACTCCGACAAAATCGTTGTCGACCAACGCTT
TGTCCTAAGCTTTCCGGATGGTTTACCCAGTGATTCAGGCGCGCCGCTGCTCTGTGCTGG
GATCACTGTGTATAGTCCGATGAAATATTACGGCATGACTGAAGAAAAAGGGAAACATTT
AGGTGTAAGTGGGCTTGGTGGGCTTGGTCATATCGCTGTGAAGATTGGTAAAGCCTTTGG
TTTAAAAGTTACCGTGATTAGTAGGTCATCTGAGAAAGAGAGTGAAGCAACTGATAGACT
CGGTGCTGACTCGTTTCTCGTCACAACGGATTCTCAAAAGATGAAGGATGCAATTGGGAC
TATGGATTTCGTGTTGGACACGGTGTCTGCAGAACATTCTCTGTTACCCTTGTTCAGTTT
GCTTAAAGTGAATGGAAAGCTTGTGGCTTTAGGGTTACCAGAGAAACCACTCCAGTTACC
AATCTTCCCTCTCGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGGAGTCAGATTGGAGGAATGAA
AGAGACACAAGAGATGCTTGACTTCTGTGCCAAGCATAATATCGTTGCGGATATTGAGCT
CATCAAGATGAGTGATATCAACTCGGTAATGGACCGCTTGGCTAAATCTGATGTCAGGTA
CCGGTTCGTGATCGATGTGGCCAACTCCATCAATTCTGCTTGAGTCATTAGCTGAGACTA
ATGAACGTGTCGACCATTAGGTCTCCGTTTAAAGTCTGCTGTGATG*TTTTTTTTTCTGC
TTTCAATTCTATTTTCTCGTCTTACATCTATGGTGTAATGAATAAAGCAAATATTTCAGT
TATAAAAAAAAA*GAATAAAGCAAATATTTTAAGGTTTTTCAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H457TF U 4
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AF RR4DK56TF U 3
AF RR4D024TF U 399
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C
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GACGGAACAAGAAACCAAGGTGGTTACTCCGACAAAATCGTTGTCGACCAACGCTTTGTC
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TTTAAAAGTTACCGTGATTAGT

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GG
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TTCTCTAGAAGAGAGAATGGTGAGAACGATGTAACAGTGAAGATATTGTTTTGTGGTGTT
TGCCACTCTGATCTTCATACTATCAAGAACGATTGGGGATTCTCTCATTACCCCATCATT
CCCGGGCATGAAATCGTTGGAATAGCCACAAAAGTTGGCAAGAACGTAACAAAGTTCAAA
GAAGGAGACCGAGTAGGAGTAGGAGTAATAATCGGCTCATGCCAATCATGTGAATCATGT
AACCAAGACTTAGAAAACTACTGTCCTCAGCTCGTATACACATACAACTCTCGTTCCTCT
GACGGAACAAGAAACCAAGGTGGTTACTCCGACAAAATCGTTGTCGACCAACGCTTTGTC
CTAAGCTTTCCGGATGGTTTACCCAGTGATTCAGGCGCGCCGCTGCTCTGTGCTGGGATC
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G
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GATGCAATTGGGACTATGGATTTCGTGTTGGACACGGTGTCTGCAGAACATTCTCTGTTA
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CCACTCCAGTTACCAATCTTCCCTCTCGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGGAGTCAG
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TT

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GCTGAGACTAATGAACGTGTCGACCATTAGGTCTCCGTTTAAAGTCTGCTGTGATG**TT
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TTC

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ATCGATGTGGCCAACTCCATCAATTCTGCTTGAGTCATTAGCTGAGACTAATGAACGTGT
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ATTTTCTCGTCTTACATCTATGGTGTAATGAATAAAGCAAATATTTCAGTTATAAAAAAA
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GTGGGAGGGAGTCAGATTGGAGGAATGAAAGAGACACAAGAGATGCTTGACTTCTGTGCC
AAGCATAATATCGTTGCGGATATTGAGCTCATCAAGATGAGTGATATCAACTCGGTAATG
GACCGCTTGGCTAAATCTGATGTCAGGTACCAGTTCGTGATCGATGTGGCCAACTCCATC
AATTCTGCTTGAGTCATTAGCTGAGACTAATGAACGTGTCGACCATTAGGTCTCCGTTTA
AAGTCTGCTGTGATG*TTTTTTTTTCTGCTGCCAATTCTATTTTCTCGTCTTACATCTAT
GGTGTAATGAATAAAGCAAATATTTCAGTTATAAAAAAAAA*GAATAAAGCAAATATTTT
AAGG
C

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DS 



AS 2 8

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GCGAAGCAGAGGATTCAATCCCGATGACTCCCCGAGGACGATCATTCCTTGTGTAAAAGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4B311JQ U 1
AF RR4DZ29JQ U 28
AF RR4DZ29TF C 116
BS 1 99 RR4B311JQ
BS 100 100 RR4DZ29JQ
BS 101 255 RR4B311JQ
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BS 257 272 RR4B311JQ
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BS 274 297 RR4B311JQ
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BS 699 810 RR4DZ29JQ
BS 811 811 RR4DZ29TF

RD RR4B311JQ 698 0 0
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ACCGTCACTGTTTCCATCTTCATGACCAGAAGAATCTCTAACACTCCGACCACCACCGTT
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QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4DZ29JQ 783 0 0
C
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CTGGTGCCACCAGATGTAACAATGTTACCATCACCGTCACTGTTTCCATCTTCATGACCA
GAAGAATCTCTAACACTCCGACCACCACCGTTGAAACTAAACCTAACCCAAATCTCTCTT
CCATCATTACTTTTCTTTCCAACCTCATCCCCATCAATAGGCATCTCGTACCTACAAACA
GGACACGACCCATGAAGCCCTAACCATTTCTCAATGCATCCTCCATGAAATTTATGCTTA
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CC

QA 2 783 2 783
DS 

RD RR4DZ29TF 696 0 0
TCTGT
ACCCTAATTCTCGGACTCAAGAACAGGTCTGGTGCCACCAGATGTAACAATGTTACCATC
ACCGTCACTGTTTCCATCTTCATGACCAGAAGAATCTCTAACACTCCGACCACCACCGTT
GAAACTAAACATAACCCAAATCTCTCTTCCATCATTACTTTTCTTTCCAACCTCATCCCC
ATCAATAGGCATCTCGTACCTACAAACAGGACACGACCCATGAAGCCCTAACCATTTCTC
AATGCATCCTCCATGAAATTTATGCTTACACGGCATCTCCTT*ACCGTCTCCTCCGCCTT
CCATTCCTCTAGACAAATCACACACTCTCCTACACAACTAACGACATCAACGTTAGGCAT
CGCGTCGATCGAAGCCTTGGACGCTGGAGGATGACCTTCCTCACGTGATCCAAATAAGCC
GCGAAGCAGAGGATTCAATCCCGATGACTCCCCGAGGACGATCATTCCTTGTGTAAAAGG
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TTGATCAGAAAAGCCTAAGAGGAAAGGCAAGAAGGGGTACAAGTCTCTCTTACAACTTCA
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TAGATGGCCTTTGACGATTTGAGAGTTGCCC

QA 6 696 6 696
DS 



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TCTACTCCATCAGTTAGTATCTATCCTCCATTCTTTTGTTTCCTATGGCGACAGAACAAG
AAGCTGAAGTTGTAAGAGAGACTTCCTCTGTTTCCGCAAGATTTCTAAGAAACAGAGACT
TGTACCCCTTCTTGCCTTTCCTCTTAGGCTTTTCTGATCAAGAGTCATCACATGGAGACG
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AGGAAGGTCATCCTCCAGCGTCCAAGGCTTCCATCGACGCGATGCTTAACGTTGATGTCG
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ATCCTTCTTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 15 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BP84TF U 1
AF RR4GB87TF U 1
AF RR4B311TF U 37
AF RR4GB87JQ C 127
AF RR4BP84JQ C 205
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RD RR4BP84TF 628 0 0
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AAGCTGAAGTTGTAAGAGAGACTTCCTCTGTTTCCGCAAGATTTCTAAGAAACAGAGACT
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AAAGTAATGATGGAAGAGAGATTTGGGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4GB87TF 658 0 0
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TCTACTCCATCAGTTAGTGTTTATCCTCCATTCTTTTGTTTCCTATGGCGACAGAACAAG
AAGCTGAAGTTGTAAGAGAGACTTCCTCTGTTTCCGCAAGATTTCTAAGAAACAGAGACT
TGTACCCCTTCTTGCCTTTCCTCTTAGGCTTTTCTGATCAAGAGTCATCACATGGAGACG
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TTAGCTGTGTAGGAGAGTGTGTGATTTGTCTAGAGGAATGGAAGGCGGAGGAGACGGTGA
AGGAGATGCCGTGTAAGCATAAATTTCATGGAGGATGCATAGAGAAATGGTTAGGGCTTC
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QA 1 658 1 658
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GG
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AACCCTTTTACACAAGGAATGATCGTCCTCGGGGAGTCATCGGGATTGAATCCTCTGCTT
CGCGGCTTATTTGGATCACGTGAGGAAGGTCATCCTCCAGCGTCCAAGGCTTCGATCGAC
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AT

QA 3 768 3 768
DS 

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TTGCTTCGACGCGTGACCGTATCATTCTGGTCAACCCTTTTACGCAAGGAATGGTCGTCC
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GCACCAGACCTGTTCTTGAGTCCGAGAATTAGGGTTACAGAAGAAGGAACTTGTGCCACT
CTTTTGGTCCCTTTGTTTTATGTTTTGTTTCTTGAATTCTTGTATCATAATGAAATCCTT
CTTTTCT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4BP84JQ 649 0 0
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GTATCATTCTGGTCAACCCTTTTACGCAAGGAATGATCGTCCTCGAGGAGTCATCGGGAT
TGAATCCTCTGCTTCGCGGCTTATTTGAATCACGTGAGGAAGGTCATCCTCCAGCGTCCA
AGGCTTCCATCGACGCGATGCTTAACGTTGATGTCGTTAGCTGTGTAGGAGAGTGTGTGA
TTTGTCTAGAGGAATGGAAGGCGGAGGAGACGGTGAAGGAGATGCCGTGTAAGCATAAAT
TTCATGGAGGATGCATAGAGAAATGGTTAGGGCTTCATGGGTCGTGTCCTGTTTGTAGGT
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GGGTTAGGTTT*GCTTCAACGGTGGTGGTCGGAGTGTTAGAGATTCTTCTGGTCATGACG
ATGGAAACAGTGACGGTGATGGTAACATTGTTACATCTGGTGGCACCAGACCTGTTCTTG
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TATGTTTTGTTTCTTGAATTCTTGTATCATAATGAAATCCTTCTTTTCT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 7

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CTTCCAAAATGCAATTTTTACATGAAATCATCATCGTCCATAGCGCCATAAGGACCCGAA
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ATGCGAAGTTTCTCAGAAACAGGATCTAAAGGTTCTTCCTTTGATGAAGCTTCAACAGTT
TTAGCCTTCTTCTCCACACCCTTTGCTGCTACTGCTGCTTTCTTTGCAGCCTTCTCAGTA
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AAGAAGACAGAAACGACAACGAGGAGAAAAGAAGTCTTTGGTGGATTTAGGGCTTTCTCT
GTCTGTCTCTCTCTCGAGTTTCCAGAACCTGCTCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 25 
40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA61JQ U 260
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AF RR4H715TF C 330
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AF RR4BZ21TF C 378
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GCATGCTTTACT

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DS 

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C
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CTTTT

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DS 

RD RR4BZ21JQ 840 0 0
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TGCGAAGTTTCTCAGAAACAGGATCTAAAGGTTCTTCCTTTGATGAAGCTTCAACAGTTT
TAGCCTTCTTCTCCACACCCTTTGCTGCTACTGCTGCTTTCTTTGCAGCCTTCTCAGTAG
CATGCTTTACTACAGGTGCAGGAGGAACAGGTTCATCATCCTCCTCCCAGGAGTCCTTGA
TATAATTCTCATCCACATCCTCGTCATCCCAGTTACTTTTGAGTACA*CTTTTGCAGGA
G

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4H715TF 783 0 0
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AGGTTCATCATCCTCCTCCCAGGAGTCCTTGATATCATTCTCATCCACATCCTCGTCATC
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T
CC

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DS 

RD RR4EF68TF 781 0 0
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TGAAGCTTCAACAGTTTTAGCCTTCTTCTCCACACCCTTTGCTGCTACTGCTGCTTTCTT
TGCAGCCTTCTCAGTAGCATGCTTTACTACAGGTGCAGGAGGAACAGGTTCATCATCCTC
CTCCCAGGAGTCCTTGATATCATTCTCATCCACATCCTCGTCATCCCAGTTAATTTTGAG
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ATTTAGGGCTTTCTCTGTCTGTCTCTCTCTCGAGTTTCCAGAACCT
CC

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DS 

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TGCAGGAGGAACAGGTTCATCATCCTCCTCCCAGGAGTCCTTGATATAATTCTCATCCAC
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AGCCTCCCAATCATCCATCTTTGTTGACAAATTATCAAGAACCGAAGTATCTGCTGTTCT
GAAGAACCCAACTAAAAACCTGAAACTCTAGAGAGAAGGGAAGAGAAGAGAAGAGAAATC
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GTTTCCAGAACCTGCTCTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 8

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CTCTGTTTTGTTGTAAAATAGTTTTTCGATTGAAAGGTCGAACTTCACCTTCCGCTTTGT
CGGATTTTCATTTCGCTCGGCGAATCTATAAATTTCCGGTTGCGGATTTGCTTTACTTTC
TTTTGTCGTGTCTGTTCTTAATCTTTCTGTGAAGCAATTTTTTAAAATTCCAGAGAATTC
GAGTCTTTTTCTTCTCTTTGTCAGTTTGCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGAT
TTCTTCAGTTTCCTTTATATGGAATGAAGTTTCTTTGTGTGATTGACAATCAAGGTTTTG
GTTTCAATCGGGTTGATTTGATGCAAGAAAAGTAGATTTGGAGCTTCTGCTTGAAGCGTT
CCAAAATATATCTTGATATTAATCTCTCCGATAGTCTCTTGTGCTAAATCAACTGGTGAA
GAGGAAGGAGTTCAACATATTCTCTGGCGATCATCACAGAAAGTTTGTAGCAGTATTTCT
ACGCCGTATTGATGTGGAAGGAGAGATCAAAGCCGGTTGAAGTGCGGTGGCGAAAAGACC
TATTCCGGTGAAAAGCAATGGCGGCGTCATGAAGACTCGAGGCTCTACACGTGTTATTTT
GGATTAGGTCTACGTTACATATGTCTGAACACGTGTTTGTATGTTTGTGTATCAAGATAA
TATTGGGCTTTCATATATGAGTCTTAGTCTGTACTGCTACTGTTATACCCATTTGGGTTT
ATAAAAACAAAAAGGTTGACAAAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EJ86JQ C 365
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AF RR4BG10TF U 1
AF RR4G754TF U 15
AF RR4BG55TF U 1
AF RR4G754JQ C 148
AF RR4BG55JQ C 1
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BS 838 864 RR4BG55JQ

RD RR4EJ86JQ 145 0 0
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CAATCGGGTTGATT*GATGCAAGAAAAGTAGATTTGGAGCTTCTGCTTGAAGCGTTCCAA
AATATATCTTGATATTAATCTCTCC

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DS 

RD RR4H744TF 604 0 0
GG
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TGTAAAATAGTTTTTCGATTGAAAGGTCGAACTTCACCTTCCGCTTTGTCGGATTTTCAT
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CTGTTCTTAATCTTTCTGTGAAGCAATTTTTTAAAATTCCAGAGAATTCGAGTCTTTTTC
TTCTCTTTGTCAGTTTGCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGATTTCTTCAGTTT
CCTTTATATGGAATGAAGTTTCTTTGTGTGATTGACAATCAAGGTTTTGGTTTCAATCGG
GTTGATTTGGTGCAAGAAAAGTAGAATTGGAGCTTCTGCTTGAAGCGTTCCAAAATATAT
CTTGATATTAATCTCTCCGATAGTCTCTTGTGCTAAATCAACTGGTGAAGAGGAAGGAGT
TCAACATATTCTCTGGCGATCATCACAGAAAGTTTGTAGCAGTATTTCTACGCCGTATTG
AT

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DS 

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CGGATTTTCATTTCGCTCGGCGAATCTATAAATTTCCGGTTGCGGATTTGCTTTACTTTC
TTTTGTCGTGTCTGTTCTTAATCTTTCTGTGAAGCAATTTTTTAAAATTCCAGAGAATTC
GAGTCTTTTTCTTCTCTTTGTCAGTTTGCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGAT
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GTTTCAATCGGGTTGATTTGATGCAAGAAAAGTAGATTTGGAGCTTCTGCTTGAAGCGTT
CCAAAATATATCTTGATATTAATCTCTCCGATAGTCTCTTGTGCTAAATCAACTGGTGAA
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ACGCCGTATTGATGTGGAAGGAGAGATCAAAGCCGGTTGAAGTGCGGTGGCGAAAAGACC
TATTCCGGTGAAAAGCAATGGCGGCGTCATGAAGACTCGAGGCTCTACACGTGTTATTTT
GGAT

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G
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AAATAGTTTTTCGATTGAAAGGTCGAACTTCACCTTCCGCTTTGTCGGATTTTCATTTCG
CTCGGCGAATCTATAAATTTCCGGTTGCGGATTTGCTTTACTTTCTTTTGTCGTGTCTGT
TCTTAATCTTTCTGTGAAGCAATTTTTTAAAATTCCAGAGAATTCGAGTCTTTTTCTTCT
CTTTGTCAGTTTGCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGATTTCTTCAGTCTCCTT
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ATATTAATCTCTCCGATAGTCTCTTGTGCTAAATCAACTGGTGAAGAGGAAGGAGTTCAA
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CAATGGCGGCGTCATGAAGACTCGAG*CTCTACACGTGTTATTTTGGATTAG*TCTACGT
TACATATGTCTGAACACGTGTT*GTATGTT*GTGTATCAAGA

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CGGATTTTCATTTCGCTCGGCGAATCTATAAATTTCCGGTTGCGGATTTGCTTTACTTTC
TTTTGTCGTGTCTGTTCTTAATCTTTCTGTGAAGCAATTTTTTAAAATTCCAGAGAATTC
GAGTCTTTTTCTTCTCTTTGTCAGTTTGCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGAT
TTCTTCAGTTTCCTTTATATGGAATGAAGTTTCTTTGTGTGATTGACAATCAAGGTTTTG
GTTTCAATCGGGTTGATTTGATGCAAGAAAAGTAGATTTGGAGCTTCTGCTTGAAGCGTT
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GAGGAAGGAGTTCAACATATTCTCTGGCGATCATCACAGAAAGTTTGTAGCAGTATTTCT
ACGCCGTATTGATGTGGAAGGAGAGATCAAAGCCGGTTGAAGTGCGGTGGCGAAAAGACC
TATTCCGGTGAAAAGCAATGGCGGCGTCATGAAGACTCGAGGCTCTACACGTGTTATTTT
GGATTAGGTCTACGTTACATATGTCTGAACACGTGTTTGTATGTTTGTGTATCAAGATAA
TATTGGGCTTTCATATATGAGTCTTAGTCTGTACTGCTACTGTTATACCCATTTGGG
TTTAT

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DS 

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GCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGATTTCTTCAGTCTCCTTTATATGGAATGA
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CGATCATCACAGAAAGTTTGTAGCAGTATTTTTACGCCGTATTGATGTGGAAGGAGAGAT
CAAAGCCGGTTGAAGTGCGGTGGCGAAAAGACCTATTCCGGTGAAAAGCAATGGCGGCGT
CATGAAGACTCGAGGCTCTACACGTGTTATTTTGGATTAGGTCTACGTTACATATGTCTG
AACACGTGTTTGTATGTTTGTGTATCAAGATAATATTGGGCTTTCATATATGGGTCTTAG
TCTGTACTGCTACTGTTATACCCATTTGGG

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DS 

RD RR4BG55JQ 864 0 0
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TAATCCTCTTACCAAATAAAAATCTTTCAGAGGTTAGAGTTTGATTAGAGAGGAAGAGAT
CTCTGTTTTGTTGTAAAATAGTTTTTCGATTGAAAGGTCGAACTTCACCTTCCGCTTTGT
CGGATTTTCATTTCGCTCGGCGAATCTATAAATTTCCGGTTGCGGATTTGCTTTACTTTC
TTTTGTCGTGTCTGTTCTTAATCTTTCTGTGAAGCAATTTTTTAAAATTCCAGAGAATTC
GAGTCTTTTTCTTCTCTTTGTCAGTTTGCTTGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGAT
TTCTTCAGTTTCCTTTATATGGAATGAAGTTTCTTTGTGTGATTGACAATCAAGGTTTTG
GTTTCAATCGGGTTGATTTGATGCAAGAAAAGTAGATTTGGAGCTTCTGCTTGAAGCGTT
CCAAAATATATCTTGATATTAATCTCTCCGATAGTCTCTTGTGCTAAATCAACTGGTGAA
GAGGAAGGAGTTCAACATATTCTCTGGCGATCATCACAGAAAGTTTGTAGCAGTATTTTT
ACGCCGTATTGATGTGGAAGGAGAGATCAAAGCCGGTTGAAGTGCGGTGGCGAAAAGACC
TATTCCGGTGAAAAGCAATGGCGGCGTCATGAAGACTCGAGGCTCTACACGTGTTATTTT
GGATTAGGTCTACGTTACATATGTCTGAACACGTGTTTGTATGTTTGTGTATCAAGATAA
TATTGGGCTTTCATATATGAGTCTTAGTCTGTACTGCTACTGTTATACCCATTTGGGTTT
ATAAAAACAAAAAGGTTGACAAAG

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DS 

RD RR4BG10JQ 834 0 0
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AATTTCCGGTTGCGGATTTGCTTTACTTTCTTTTGTCGTGTCTGTTCTTAATCTTTCTGT
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TGAGAATTCTCTCAACAGAGAGTAATTGATTTCTTCAGTTTCCTTTATATGGAATGAAGT
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GTACTGCTACTGTTATACCCATTTGGGTTTATAAAAACAAAAAGGTTGACAAAG

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 8

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GGGCATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCCAATTCACTGAGGAAGAATGGTCACAAG
GCCACTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCC
TCTCTTGATGACTACAACCAGCCTCTCAGTGACTTCCTCTCCAAACTTCCCCTCGACCAA
AAGGTCATCCTGGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAG
TATCCTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACC
GTAATTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAA
GCTGAGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATG
ATGATGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTAC
ACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGAT
ATCCCAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGAC
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T


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 

AF RR4DE49TF U 1
AF RR4EY41TF U 3
AF RR4EY41JQ C 425
AF RR4BD93JQ C 3
AF RR4DE49JQ C 512
AF RR4BD93TF U 3
AF RR4E001TF U 283
AF RR4E710TF U 283
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BS 349 349 RR4EY41TF
BS 350 618 RR4DE49TF
BS 619 619 RR4BD93TF
BS 620 633 RR4DE49TF
BS 634 648 RR4EY41TF
BS 649 837 RR4BD93TF
BS 838 838 RR4E001TF
BS 839 845 RR4BD93TF
BS 846 899 RR4E001TF
BS 900 901 RR4E710TF

RD RR4DE49TF 633 0 0
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GGGCATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCCAATTCACTGAGGAAGAATGGTCACAAG
GCCACTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCC
TCTCTTGATGACTACAACCAGCCTCTCAGTGACTTCCTCTCCAAACTTCCCCTCGACCAA
AAGGTCATCCTGGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAG
TATCCTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCATGGTCTAACCTGGTACC
GTAATTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAA
GCTGAGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATG
ATGATGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTAC
ACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGAT
ATCCCAGCAGCACCAGAG*CTGACAAAATCCCA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EY41TF 646 0 0
GG
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ATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCCAATTCACTGAGGAAGAATGGTCACAAGGCCA
CTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTC
TTGATGACTACAACCAGCCTCTCAGTGACTTCCTCTCCAAACTTCCCCTCGACCAAAAGG
TCATCCTGGTGAACCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATC
CTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACCGTAA
TTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGACTGATTGAGTCGGAAGCTG
AGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGA
TGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCC
CAGCAGCACCAGAG*CTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAG

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR4EY41JQ 318 0 0
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TGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACATTTTTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCC
CAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTTTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATA
TGTTCCAATCAAGTCGTCAGGACTTAATGGTTACCTTCTGGCCTCCTGCTCAATACTTCC
TTTTTCAAGAGAGTGATC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4BD93JQ 897 0 0
GG
ATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGACCATCATTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGC
ATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCCAATTCACTGAGGAAGAATGGTCACAAGGCCA
CTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTC
TTGATGACTACAACCAGCCTCTCAGTGACTTCCTCTCCAAACTTCCCCTCGACCAAAAGG
TCATCCTGGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATC
CTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACCGTAA
TTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTG
AGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGA
TGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCC
CAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATA
TGTTCCAATCAAGTCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTCTGGCCTCCTGCTCAATACTTCC
TTCTTCAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTCCCAACCTGAAGCTCTCTATAAAATCC
TCCTTGAAGCAGCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCTTTACACATATATCTTGAACTC
CTCCAAATCTCTGTTTTTAATAAACTAATTGAATAACACTGGATCATATTCATAT

QA 3 897 3 897
DS 

RD RR4DE49JQ 388 0 0
ATTACAACGAGCGCCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCC
CTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCC
CAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATATGTTCCAATCAAGTCGTCAGGACTTAA
TGGTTACCCTCTGGCCTCCTGCTCAATACTTCCTTCTTCAAGAGAGTGATCACTCTGCAT
TTTTCTCCCAACCTGAAGCTCTCTATAAAATCCTCCTTGAAGCAGCCTCATCTATCTCTC
CCTGATTTCTCTTTACACATATATCTGGAACTCCTCCAAATCTCTGTTTTTAATAAACTA
ATTGAATAACACTGGATCATATTCATAT

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4BD93TF 843 0 0
GG
ATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGACCATCATTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGC
ATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCCAATTCACTGAGGAAGAATGGTCACAAGGCCA
CTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTC
TTGATGACTACAACCAGCCTCTCAGTGACTTCCTCTCCAAACTTCCCCTCGACCAAAAGG
TCATCCTGGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATC
CTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACCGTAA
TTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTG
AGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGA
TGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCC
CAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATA
TGTTCCAATCAAGTCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTCTGGCCTCCTGCTCAATACTTCC
TTCTTCAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTCCCAACCTGAAGCTCTCTATAAAATCC
TCCTTGAAGCAGCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCTTTACACATATATCTTGAACTC
C

QA 3 843 3 843
DS 

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G
CGGCTGCCGTGTGCCAGTATCCTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCA
TGGTCAAACCTGGTACCGTAATTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAG
GGCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGA
ACCTCCCAACAAGCATGATGATGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGA
GCCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCAT
TTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACG
TTAAGACAGGCAAGGACCATATGTTCCAATCAAGCCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTCT
GGCCTCCTGCTCAATACTTCCTTCTTCAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTCCCAAC
CTGAAGCTCTCTATAAAATCCTCCTTGAAGCAGCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCT
TTACACATATATCTGGAACTCCTCCAAATCTCTGTTTTTAATAAACTAATTGAATAACAC
TGGATCATATTCATAT
A

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DS 

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G
CGGCTGCCGTGTGCCAGTATCCTTCCAAAGTCTCTATGGCTGTATACGTCGCAGCAGCCA
TGGTCAAACCTGGTACCGTAATTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAG
GGCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGA
ACCTCCCAACAAGCATGATGATGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGA
GCCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCCCCTGTCATGGCAT
TTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACG
TTAAGACAGGCAAGGACCATATGTTCCAATCAAGCCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTCT
GGCCTCCTGCTCAATACTTCCTTCTTCAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTCCCAAC
CTGAAGCTCTCTATAAAATCCTCCTTGAAGCAGCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCT
TTACACATATATCTGGAACTCCTCCAAATCTCTGTTTTTAATAAACTAATTGAATAACAC
TGGATCATATTCATATAT

QA 2 619 2 619
DS 



AS 1 7

CO CL689Contig1 1290 7 10 U
CAAAAAAGGATTCAAGGTAAAAAGTATAAACAGTAATATGTTTGTGAACCTCTTGGGCTG
TTCTCTTCCTTAATCACACTTTTGATATTGTTCTCAAAATAATTGAATCTGCGAATCTAG
ATATATTACTTATACATCCATGTTGAATGTGTGTGGAAAAGTTGTAGTTCATATTTTAAA
ATGGAGTAAAGCAGAGGTCCCATCAAGTCCTTTGGTATTGTAGTAAGCAGTGTACTCTCT
AATGGTTGTCTCTCTGTACTTTGGAGGGTTTTCTTTAGACAGAAGCTCTCTAATGGGTCC
GTACATTTTTGGATTTGGTCTTACACCAGTGGTGAAGAAACACGCGATGGAGACTCGAGC
TTGTGGGAATCTATTTGCCAATACACGATGCTCCAGACTGACGAACTTGTCATTTGTTAT
AAGCTGTAGAAGATCTCCGATGTTGATAATGAGTGCACCAGGAACATGAGGAACATCAAA
CCAATACCCTTCACGGTTGACTTGAAGACCTTCGATTTGATCTGGTAGAAGCACTGTAAG
GAAAGAGTTGTCTGAATGCTGACTTGTGCCTAAAGTTAGGTCAGGCTCTGGACAGGGTGG
GTAGTAATGGTTAAGCATGAGCAAACCCTTTGAGCAATCCATCTCATTCAAATGGTTAGG
GTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTCAAAGAGAAACTCTCCTAGAGTCATCACATG
CTTTGTGTATTCCAACATAACATCCCTACAAATCTCTGGTAAGTCCTCTGGTTCTGGAGG
ATCTGGAGCAATGGTACAAGAGAAAGTGTCTCTCCAGTTAGCAGCTGGAGCGCTAAAAAG
ATCAAAGTTACTCAAATACATAAACCTTCTGCTGAAATCTCTCCCGTAATATTGTTTCCT
CACTTCTGGTAGCTGCTCGTGAAACCCACGAACTCCATCTTTCATCTTTTCTAGAAGATC
GAGGGGAACTCCATGGTTAATCACCTGGAAGAAACCCCACTTCTCTGATGCCTCTTTAAT
CCCTTGGATCACGTTCTTGCGCTTAGTCTCGTCCTCGAAGACACGTCCTCCGATATCAAA
CGTTGGGATCGTTGTGAGATGTTGCAAGTCAGAGGAAAGCGGTTTAGGGTTTGATAGTTT
GAGAGATGAGTGATGGAATATGCGTGGAACCTCTGAGATCCCGGCGTCTACGAGGCCTTT
TACACCTGTCTTGGTGTTGTCGAAAGCTTTAAGCTCACTGACACGATCGAATGAAGATAT
CTTCATCGTCTCCATTGCTTTTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4FG69JQ U 1
AF RR4D033JQ U 111
AF RR4CJ30JQ U 36
AF RR4CJ30TF C 276
AF RR4AQ78JQ U 105
AF RR4AQ78TF C 511
AF RR4FG69TF C 631
BS 1 368 RR4FG69JQ
BS 369 369 RR4CJ30JQ
BS 370 427 RR4FG69JQ
BS 428 745 RR4CJ30JQ
BS 746 746 RR4AQ78JQ
BS 747 769 RR4CJ30JQ
BS 770 822 RR4AQ78JQ
BS 823 959 RR4AQ78TF
BS 960 960 RR4FG69TF
BS 961 1290 RR4AQ78TF

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TTCTCTTCCTTAATCACACTTTTGATATTGTTCTCAAAATAATTGAATCTGCGAATCTAG
ATATATTACTTATACATCCATGTTGAATGTGTGTGGAAAAGTTGTAGTTCATATTTTAAA
ATGGAGTAAAGCAGAGGTCCCATCAAGTCCTTTGGTATTGTAGTAAGCAGTGTACTCTCT
AATGGTTGTCTCTCTGTACTTTGGAGGGTTTTCTTTAGACAGAAGCTCTCTAATGGGTCC
GTACATTTTTGGATTTGGTCTTACACCAGTGGTGAAGAAACACGCGATGGAGACTCGAGC
TTGTGGGAGTCTATTTGCCAATACACGATGCTCCAGACTGACGAACTTGTCATTTGTTAT
AAGCTGT

QA 1 427 1 427
DS 

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GT
GAATCTAGATATATTACTTATACATCCATGTTGAATGTGTGTGGAAAAGTTGTAGTTCAT
ATTTTAAAATGGAGTAAAGCAGAGGTCCCATCAAGTCCTTTGGTATTGTAGTAAGCAGTG
TACTCTCTAATGGTTGTCTCTCTGTACTTTGGAGGGTTTTCTTTAGACAGAAGCTCTCTA
ATGGGTCCGTACATTTTTGGATTTGGTCTTACACCAGTGGTGAAGAAACACGCGATGGAG
ACTCGAGCTTGTGGGAATCTATTTGCCAATACACGATGCTCCAGACTGACGAACTTGCCA
TTTGTTATAAGCTGTAGAAGATCTCCGATGTTGATAATGAGTGCACCAGGAACATGAGGA
ACATCAAACCAATACCCTTCACGGTTGACTTGAAGACCTTCGATTTGATCTGGTAGAAGC
ACTGTAAGGAAAGAGTTGTCTGAATGCTGACTTGTGCCTAAAGTTAGGTCAGGCTCTGGA
CAGGGTGGGTAGTAATGGTTAAGCATGAGCAAACCCTTTGAGCAATCCATCTCATTCAAA
TGGTTAGGGTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTCAAAGAGAAACTCTCCTAGA

QA 3 599 3 599
DS 

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TTTA
GTTTGTGAACCTCTTGGGCTGTTCTCTTCCTTAATCACACTTTTGATATTGTTCTCAGAA
TAATTGGATCTGCGAATCTAGATATATTACTTATACATCCATGTTGAATGTGTGTGGAAA
AGTTGTAGTTCATATTTTAAAATGGAGTAAAGCAGAGGTCCCATCAAGTCCTTTGGTATT
GTAGTAAGCAGTGTACTCTCTAATGGTTGTTTCTCTGTACTTTGGAGGGTTTTCTTTAGA
CAGAAGCTCTCTAATGGGTCCGTACATTTTTGGATTTGGTCTTACACCAGTGGTGAAGAA
ACACGCGATGGAGACTCGAGCTTGTGGGAATCTATTTGCCAATACACGATGCTCCAGACT
GACGAACTTGTCATTTGTTATAAGCTGTAGAAGATCTCCGATGTTGATAATGAGTGCACC
AGGAACATGAGGAACATCAAACCAATACCCTTCACGGTTGACTTGAAGACCTTCGATTTG
ATCTGGTAGAAGCACTGTAAGGAAAGAGTTGTCTGAATGCTGACTTGTGCCTAAAGTTAG
GTCAGGCTCTGGACAGGGTGGGTAGTAATGGTTAAGCATGAGCAAACCCTTTGAGCAATC
CATCTCATTCAAATGGTTAGGGTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTCAAAGAGAAA
CTCTCCTAGAGTCATCACATGCTTTGTGTATTCCAACATAACATCC*TACAAATCTCTGG
TAAGTCCTCT

QA 5 734 5 734
DS 

RD RR4CJ30TF 461 0 0
TTAGACAG
AGCTCTCTAATGGGTC*GTACATTTT*GGATTTG*TCT*ACACCAGTGGTGAAGAAACAC
GCGATGGAGACTCGAGCTTGTGGGAATCTATTTGCCA*TACACGATGCTCCAGACTGACG
AACTTGTCATTTGTTATAAGCTGTAGAAGATCTCCGATGTTGATAATGAGTGCACCAGGA
ACATGAGGAACATCAAACCAATACCCTTCACGGTTGACTTGAAGACCTTCGATTTGATCT
GGTAGAAGCACTGTAAGGAAAGAGTTGTCTGAATGCTGACTTGTGCCTAAAGTTAGGTCA
GGCTCTGGACAGGGTGGGTAGTAATGGTTAAGCATGAGCAAACCCTTTGAGCAATCCATC
TCATTCAAATGGTTAGGGTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTCAAAGAGAAACTCT
CCTAGAGTCATCACATGCTTTGTGTATTCCAAC

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DS 

RD RR4AQ78JQ 718 0 0
GGATCTGC
GAATCTAGATATATTACTTATACATCCATGTTGAATGTGTGTGGAAAAGTTGTAGTTCAT
ATTTTAAAATGGAGTAAAGCAGAGGTCCCATCAAGTCCTTTGGTATTGTAGTAAGCAGTG
TACTCTCTAATGGTTGTCTCTCTGTACTTTGGAGGGTTTTCTTTAGACAGAAGCTCTCTA
ATGGGTCCGTACATTTTTGGATTTGGTCTTACACCAGTGGTGAAGAAACACGCGATGGAG
ACTCGAGCTTGTGGGAATCTATTTGCCAATACACGATGCTCCAGACTGACGAACTTGTCA
TTTGTTATAAGCTGTAGAAGATCTCCGATGTTGATAATGAGTGCACCAGGAACATGAGGA
ACATCAAACCAATACCCTTCACGGTTGACTTGAAGACCTTCGATTTGATCTGGTAGAAGC
ACTGTAAGGAAAGAGTTGTCTGAATGCTGACTTGTGCCTAAAGTTAGGTCAGGCTCTGGA
CAGGGTGGGTAGTAATGGTTAAGCATGAGCAAACCCTTTGAGCAATCCATCTCATTCAAA
TGGTTAGGGTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTCAAAGAGAAACTCTCCTAGAGTC
ATCACATGCTTTGTGTATTCCAACATAACATCCCTACAAATCTCTGGTAAGTCCTCTGGT
TCTGGAGGATCTGGAGCAATGGTACAAGAGAAAGTGTCTCTCCAGTTAGC

QA 9 718 9 718
DS 

RD RR4AQ78TF 780 0 0
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TAAAGTTAGGTCAGGCTCTGGACAGGGTGGGTAGTAATGGTTAAGCATGAGCAAACCCTT
TGAGCAATCCATCTCATTCAAATGGTTAGGGTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTC
AAAGAGAAACTCTCCTAGAGTCATCACATGCTTTGTGTATTCCAACATAACATCCCTACA
AATCTCTGGTAAGTCCTCTGGTTCTGGAGGATCTGGAGCAATGGTACAAGAGAAAGTGTC
TCTCCAGTTAGCAGCTGGAGCGCTAAAAAGATCAAAGTTACTCAAATACATAAACCTTCT
GCTGAAATCTCTCCCGTAATATTGTTTCCTCACTTCTGGTAGCTGCTCGTGAAACCCACG
AACTCCATCTTTCATCTTTTCTAGAAGAT*GAGGGGAACTCCATGGTTAATCACCTGGAA
GAAACCCCACTTCTCTGATGCCTCTTTAATCCCTTGGATCACGTTCTTGCGCTTAGTCTC
GTCCTCGAAGACACGTCCTCCGATATCAAACGTTGGGATCGTTGTGAGATGTTGCAAGTC
AGAGGAAAGCGGTTTAGGGTTTGATAGTTTGAGAGATGAGTGATGGAATATGCGTGGAAC
CTCTGAGATCCCGGCGTCTACGAGGCCTTTTACACCTGTCTTGGTGTTGTCGAAAGCTTT
AAGCTCACTGACACGATCGAATGAAGATATCTTCATCGTCTCCATTGCTTTTTTTCTTCC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4FG69TF 660 0 0
TGAGCAATCCATCTCATTCAAATGGTTAGGGTCTAACCCTAGAGCTTGTGATAAAAGCTC
AAAGAGAAACTCTCCTAGAGTCATCACATGCTTTGTGTATTCCAACATAACATCCCTACA
AATCTCTGGTAAGTCCTCTGGTTCTGGAGGATCTGGAGCAATGGTACAGGAGAAAGTGTC
TCTCCAGTTAGCAGCTGGAGCGCTAAAAAGATCAAAGTTACTCAAATACATAAACCTTCT
GCTGAAATCTCTCCCGTAATATTGTTTCCTCACTTCTGGTAGCTGCTCGTGAAACCCACG
AACTCCATCTTTCATCTTTTCTAGAAGATCGAGGGGAACTCCATGGTTAATCACCTGGAA
GAAACCCCACTTCTCTGATGCCTCTTTAATCCCTTGGATCACGTTCTTGCGCTTAGTCTC
GTCCTCGAAGACACGTCCTCCGATATCAAACGTTGGGATCGTTGTGAGATGTTGCAAGTC
AGAGGAAAGCGGTTTAGGGTTTGATAGTTTGAGAGATGAGTGATGGAATATGCGTGGAAC
CTCTGAGATCCCGGCGTCTACGAGGCCTTTTACACCTGTCTTGGTGTTGTCGAAAGCTTT
AAGCTCACTGACACGATCGAATGAAGATATCTTCATCGTCTCCATTGCTTTTTTTCTT
CC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 8

CO CL690Contig1 890 6 7 U
GGCATTGAGAAAAGAGCAAATATATAAGCAATGGTAGACACGGAAGAAAGCAATGTAGTA
CACTAATAATCAAATAGAATGAGAAGGAAAGCCACAGATTATCTCCAAACGAAATATCCT
GATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAGATAATAATCCAAAAGAATA
CGGTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAACATCAACATGAAAATAAATGCAAGGA
ACGCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGATCATAAACCAAACGAGAACAGATCCA
AGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTACTCCACTCTGGTCATTGGGACCTGTGGAAGGT
CCTGGAGAGAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGACCATCAGTCGCTGGGGAAGGAGGGCTA
GACGTCGGAGATACAGTGGGAGCGTCTGGCTTAGTAGGAGCAAGAGCTGGAACCTGAGCT
GGAGGAGATGCAAGAGGAGCTGGAGGAGGCGTTGCTGGAGGAGGAGTTGCGACGGGTGGA
GGAGTTGCTGGAGGAGGAGATGCGACGGGAGGGGGAGTTGCTGGAGGAGGAGTTGCGACG
GGGGGAGGAGTTGCGACGGGAGGAGGAGTTGCGACCGGAGGAGGAGTGGCTGGAGGAGGA
GAAGTTGTGACTGGTGGAGGAGCTGAGACTGGAGGAGGGGTCGCTGCTGGTGGGGGAGTT
GTTGTAGTTGGTGGTGCTGGTGTGGTGGTTGGTGGTGACGACGGAGCTTGGCCTCCGACG
CCGGCGATGAGGACGATGCAGATCGCAACAATGGCAAATTGTCTAGCCATTTTGTTTTTG
TTTGTTTGTTGTGTGAAGCGCACTACTCTCGGAGTGATGGTTCAGTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AJ91JQ U 1
AF RR4AJ91TF C 1
AF RR4A179JQ U 95
AF RR4A179JQD U 50
AF RR4A179TF C 94
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BS 1 327 RR4AJ91JQ
BS 328 328 RR4A179JQD
BS 329 386 RR4AJ91JQ
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BS 388 430 RR4AJ91JQ
BS 431 869 RR4A179JQD
BS 870 890 RR4A179TF

RD RR4AJ91JQ 431 0 0
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CACTAATAATCAAATAGAATGAGAAGGAAAGCCACAGATTATCTCCAAACGAAATATCCT
GATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAGATAATAATCCAAAAGAATA
CGGTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAACATCAACATGAAAATAAATGCAAGGA
ACGCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGATCATAAACCAAACGAGAACAGATCCA
AGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTGCTCCACTCTGGTCATTGGGACCTGTGGAAGGT
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GACGTCGGAG
C

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4AJ91TF 431 0 0
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CACTAATAATCAAATAGAATGAGAAGGAAAGCCACAGATTATCTCCAAACGAAATATCCT
GATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAGATAATAATCCAAAAGAATA
CGGTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAACATCAACATGAAAATAAATGCAAGGA
ACGCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGATCATAAACCAAACGAGAACAGATCCA
AGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTGCTCCACTCTGGTCATTGGGACCTGTGGAAGGT
CCTGGAGAGAGCTCACTGGTGCTTGGCCCAGGACCATCAGTCGCTGGGGAAGGAGGGCTA
GACGTCGGAG
C

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4A179JQ 460 0 0
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CCAAAAGATAATAATCCAAAAGAATACGGTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAA
CATCAACATGAAAATAAATGCAAGGAACGCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGA
CCATAAACCAAACGAGAACAGACCCAAGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTACTCCAC
TCTGGTCATTGGGACCTGTGGAAGGTCCTGGAGAGAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGAC
CATCAGTCGCTGGGGAAGGAGGGCTAGACGTCGGAAATACAGTGGGAGCGTCTGGCTTAG
TAGGAGCAAGAGCTGGAACCTGAGCTGGAGGAGATGCAAGAGGAGCTGGAGGAGGCGTTG
CTGGAGGAGGAGTTGCGACGGGTGGAGGAGTTGCTGGAGG

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4A179JQD 820 0 0
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CGAAATATCCTGATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAGATAATAAT
CCAAAAGAATACGGTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAACATCAACATGAAAAT
AAATGCAAGGAACGCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGATCATAAACCAAACGA
GAACAGATCCAAGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTACTCCACTCTGGTCATTGGGAC
CTGTGGAAGGTCCTGGAGAGAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGACCATCAGTCGCTGGGG
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CGACGGGTGGAGGAGTTGCTGGAGGAGGAGATGCGACGGGAGGGGGAGTTGCTGGAGGAG
GAGTTGCGACGGGGGGAGGAGTTGCGACGGGAGGAGGAGTTGCGACCGGAGGAGGAGTGG
CTGGAGGAGGAGAAGTTGTGACTGGTGGAGGAGCTGAGACTGGAGGAGGGGTCGCTGCTG
GTGGGGGAGTTGTTGTAGTTGGTGGTGCTGGTGTGGTGGTTGGTGGTGACGACGGAGCTT
GGCCTCCGACGCCGGCGATGAGGACGATGCAGATCGCAACAATGGCAAATTGTCTAGCCA
TTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTGTGTGAAGCGCACTACTCT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4A179TF 797 0 0
CACAGA
TATCTCCAAACGAAATATC*TGATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAA
AGATAATAATCCAAAAGAATACGGTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAACATCA
ACATGAAAATAAATGCAAGGAACGCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGATCATA
AACCAAACGAGAACAGATCCAAGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTACTCCACTCTGG
TCATTGGGACCTGTGGAAGGTCCTGGAGAGAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGACCATCA
GTCGCTGGGGAAGGAGGGCTAGACGTCGGAGATACAGTGGGAGCGTCTGGCTTAGTAGGA
GCAAGAGCTGGAACCTGAGCTGGAGGAGATGCAAGAGGAGCTGGAGGAGGCGTTGCTGGA
GGAGGAGTTGCGACGGGTGGAGGAGTTGCTGGAGGAGGAGATGCGACGGGAGGGGGAGTT
GCTGGAGGAGGAGTTGCGACGGGGGGAGGAGTTGCGACGGGAGGAGGAGTTGCGACCGGA
GGAGGAGTGGCTGGAGGAGGAGAAGTTGTGACTGGTGGAGGAGCTGAGACTGGAGGAGGG
GTCGCTGCTGGTGGGGGAGTTGTTGTAGTTGGTGGTGCTGGTGTGGTGGTTGGTGGTGAC
GACGGAGCTTGGCCTCCGACGCCGGCGATGAGGACGATGCAGATCGCAACAATGGCAAAT
TGTCTAGCCATTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTGTGTGAAGCGCACTACTCTCGGAGTGATG
GTTCAGTGTCC

QA 7 797 7 797
DS 

RD RR4A179TFB 768 0 0
TATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAGATAATAATCCAAAAGAATACG
GTTCCGAAAGTAATAACAATGGAACAAACAAACATCAACATGAAAATAAATGCAAGGAAC
GCCGAGCGAAAGGCTCCGCTCCCGCGCTTAGATCATAAACCAAACGAGAACAGATCCAAG
TACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTACTCCACTCTGGTCATTGGGACCTGTGGAAGGTCC
TGGAGAGAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGACCATCAGTCGCTGGGGAAGGAGGGCTAGA
CGTCGGAGATACAGTGGGAGCGTCTGGCTTAGTAGGAGCAAGAGCTGGAACCTGAGCTGG
AGGAGATGCAAGAGGAGCTGGAGGAGGCGTTGCTGGAGGAGGAGTTGCGACGGGTGGAGG
AGTTGCTGGAGGAGGAGATGCGACGGGAGGGGGAGTTGCTGGAGGAGGAGTTGCGACGGG
GGGAGGAGTTGCGACGGGAGGAGGAGTTGCGACCGGAGGAGGAGTGGCTGGAGGAGGAGA
AGTTGTGACTGGTGGAGGAGCTGAGACTGGAGGAGGGGTCGCTGCTGGTGGGGGAGTTGT
TGTAGTTGGTGGTGCTGGTGTGGTGGTTGGTGGTGACGACGGAGCTTGGCCTCCGACGCC
GGCGATGAGGACGATGCAGATCGCAACAATGGCAAATTGTCTAGCCATTTTGTTTTTGTT
TGTTTGTTGTGTGAAGCGCACTACTCTCGGAGTGATGGTTCAGTGTCC

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL690Contig2 385 2 2 U
GACTGTATCTCCGACGTCTAGCCCTCCTTCCCCAGCGACTGATGGTCCTGGACCAAGCAC
CAGTGAGCTCTCTCCAGGACCTTCCACAGGTCCCAATGACCGAGTGGAGCAAGCAAGACG
GTTTCAAGCTTGGTACTTGGATCTGTTCTCGTTTGGTTTATGATCTAAGCGCGGGAGCCT
TTCGCTCGGTGTTCGTTGCATTTATTTTCATGTTGATGTTTGTTTGTTCCATTGTTATTA
TACTTTCGGAACCGTATTCTTTTGGATTATTATCTTTTGGAGAGGATATTGTTGAGAGTT
GAGATGGAGATATCAGGATATTTCGTTTGGAGATAATTTGTGGCTTTCCTTCTCATTCTA
TTTGATTATTAGTGTACTACATTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DJ29JQ C 1
AF RR4DJ29TF U 1
BS 1 1 RR4DJ29JQ
BS 2 385 RR4DJ29TF

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GTTTCAAGCTTGGTACTTGGATCTGTTCTCGTTTGGTTTATGATCTAAGCGCGGGAGCCT
TTCGCTCGGTGTTCGTTGCATTTATTTTCATGTTGATGTTTGTTTGTTCCATTGTTATTA
TACTTTCGGAACCGTATTCTTTTGGATTATTATCTTTTGGAGAGGATATTGTTGAGAGTT
GAGATGGAGATATCAGGATATTTCGTTTGGAGATAATTTGTGGCTTTCCTTCTCATTCTA
TTTGATTATTAGTGTACTACATTGC

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR4DJ29TF 385 0 0
G
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AGTGAGCTCTCTCCAGGACCTTCCACAGGTCCCAATGACCGAGTGGAGCAAGCAAGACGG
TTTCAAGCTTGGTACTTGGATCTGTTCTCGTTTGGTTTATGATCTAAGCGCGGGAGCCTT
TCGCTCGGTGTTCGTTGCATTTATTTTCATGTTGATGTTTGTTTGTTCCATTGTTATTAT
ACTTTCGGAACCGTATTCTTTTGGATTATTATCTTTTGGAGAGGATATTGTTGAGAGTTG
AGATGGAGATATCAGGATATTTCGTTTGGAGATAATTTGTGGCTTTCCTTCTCATTCTAT
TTGATTATTAGTGTACTACATTGC

QA 2 385 2 385
DS 



AS 2 8

CO CL691Contig1 534 2 4 U
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TATATTAAAACCTACCCATGTTACATTATGGACCCCCACACGTTCGTTCTCTTTAAACCC
CAAACTTTTAAAGAGAGAAAAAACTAACCCAAAACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCC
TCCGGGAAAAAAAAAGGAAATAAAACCTCAAAAGTGACAAAAAGGTTGCCTTTCTTTGTG
CTGTAGTGAAGTGGCATCCCTTCTCCTTTAAACTTCTTCACTTCCTTGGGCTTTGTAATT
CCCTTGGAACCAATGTCAACTTCGTGCTCATCCAAGTGTTTGAATGATTTCTCAAATCCA
ACTAGCGCCTCAACGAGTGTAATGTTGACGGTCATGTGTAAATCGTTGCCATCTCTCCGG
AAGCGGGTATGTGGTGCAGTTTTTATTCGGAACTTAAGGTCACCAGGGTCACCG


BQ
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AF RR4A148JQ U 1
AF RR4A148JQD U 198
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BS 245 245 RR4A148JQD
BS 246 434 RR4A148JQ
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TATATTAAAACCTACCCATGTTACATTATGGACCCCCACACGTTCGTTCTCTTTAAACCC
CAAACTTTTAAAGAGAGAAAAAACTAACCCAAAACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCC
TCCGTGAAAAAAAAAGGAAATAAAACCTCAAAAGTGACAAAAAGGTTGCCTTTCTTTGTG
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DS 

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TCTCCTTTAAACTTCTTCACTTCCTTGGGCTTTGTAATTCCCTTGGAACCGATGTCAACT
TCGTGCTCATCCAAGTGTTTGAATGATTTCTCAAATCCAACTAGCGCCTCAACGAGTGTA
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DS 



CO CL691Contig2 1352 6 20 U
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GTTCCGAATTAAAACTGCACCACATTCCCGTTTCCGGAGAGATGGCAACGATCTACACAT
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4A148TF U 1
AF RR4A148TFB U 320
AF RR4BU74TF U 67
AF RR4GX26TF U 634
AF RR4BU74JQ C 593
AF RR4GX26JQ C 634
BS 1 383 RR4A148TF
BS 384 384 RR4BU74TF
BS 385 428 RR4A148TF
BS 429 494 RR4BU74TF
BS 495 495 RR4A148TFB
BS 496 694 RR4BU74TF
BS 695 695 RR4GX26TF
BS 696 729 RR4BU74TF
BS 730 730 RR4GX26TF
BS 731 733 RR4BU74TF
BS 734 734 RR4GX26TF
BS 735 756 RR4BU74TF
BS 757 757 RR4GX26TF
BS 758 766 RR4BU74TF
BS 767 814 RR4GX26TF
BS 815 815 RR4BU74JQ
BS 816 1250 RR4GX26TF
BS 1251 1251 RR4BU74JQ
BS 1252 1279 RR4GX26TF
BS 1280 1352 RR4BU74JQ

RD RR4A148TF 428 0 0
GGAGTGAGAGAGATTCGAGTTCCGATCAAAAGGAGATCTGCATTGAATCTCAGATTGTAG
TAATCCTTGGGAGAGATCTGATTCTCTCCTGATTTCCGTTTCCATGGCGATTCGGCGGTC
GAAGCTATGCATCGTATTGTTGTTCGCGCTCTCTTACGTCATCTTCGTCTTCGCCGGGAA
GAGTTACTACGATGTGTTGCAAGTGCCGAAAGGTGCGTCGGATGAACAGATTAAGAGAGC
TTACAGGAAACTCGCTTTGAAGTATCATCCCGATAAAAATCAGGGCAACGAAGAAGCCAC
TCGCAAATTCGCTGAGATCAACAACGCTTATGAAGTGCTATCGGATGAGGAGAAGAGGGA
GATATATAACAGATATGGTGAAGGAGGGCTCAAACAGCATGCTGCTAATGGTGGACGTGG
TGGTGGTG

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4A148TFB 358 0 0
AACAACGCTTATGAAGTGCTATCGGATGAGGAGAAGAGGGAGATATATAACAGATATGGT
GAAGAAGGGCTCAAACAGCATGCTGCTAATGGTGGACGTGGTGGTGGTGGAGGGGGCATG
AATATGCAAGACATCTTTAGCCAGTTTTTTGGTGGTGGTGGTTCGATGGAGGAAGAAGAG
AAGGTTGTTGAGGGTGATGACGTGATTGTGGAGCTTGAGGCCACTCTAGAAGATTTATAC
ATGGGAGGCTCTATGAAGGTATGGAGGGAGAAGAATGTAATAAAACCAGCTCCTGGAAAG
AGAAATTGCAACTGCAGGGATGAAGTTTATCACAGGCAAATTGGTCCTGG
GAATGTTC

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4BU74TF 705 0 0
GG
GGGAGAGATCTGATTCTCTCCTGATTTCCGTTTCCATGGCGATTCGGCGGTCGAAGCTAT
GCATCGTATTGTTGTTCGCGCTCTCTTACGTCATCTTCGTCTTCGCCGGGAAGAGTTACT
ATGATGTGTTGCAAGTGCCGAAAGGTGCGTCGGATGAACAGATTAAGAGAGCTTACAGGA
AACTCGCTTTGAAGTATCATCCCGATAAGAATCAGGGCAACGAAGAAGCCACTCGCAAAT
TCGCTGAGATCAACAACGCTTATGAAGTGCTATCGGATGAGGAGAAGAGGGAGATATATA
ACAGATATGGTGAAGAAGGGCTCAAACAGCATGCTGCTAATGGTGGACGTGGTGGTGGTG
GAGGGGGCATGAATATGCAAGACATCTCTAGCCAGTTTTTTGGTGGTGGTGGTTCGATGG
AGGAAGGAGAGAAGGTTGTTAAGGGTAATGACGTGATTGTGGAACTTGAGGCCACTCTAG
AAGATTTATACATGGGAGGCTCTATGAAGGTATGGAGGGAGAAGAATGTAATAAAACCAG
CCCCTGGAAAGAGAAATTGCAACTGCAGGGATGAAGTTTATCACAGGCAAATTGGTCCTG
GAATGCTCCAACAGATGACAGAGCAG*TCTGTGACAAATGCCCAAATGTTAAGTTCGAAC
GTGAAAGATACTTTGTCACAGTTGATATTGAGAAAGGA
TGAAA

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR4GX26TF 653 0 0
G
AGGGATGAGGTTTATCACAGGCAAATTGGTCCTGGAATGTTCCAACAGATGACAGAGCAG
GTCTGTGACAAATGCCCAAATGTTAAGTTCGAACGCGAAGGTTACTTTGTCACAGTTGAT
ATCGAGAAAGGAATGAAAGACGGAGAAGAAGTGTCTTTCTACGAGGATGGTGAGCCCATT
CTCGACGGTGACCCTGGTGACCTTAAGTTCCGAATTAAAACTGCACCACATTCCCGTTTC
CGGAGAGATGGCAACGATCTACACATGACCGTCAACATTACACTGGTTGAGGCGCTAGTT
GGATTTGAGAAATCATTCAAACACTTGGATGAGCACGAAGTTGACATCGGTTCCAAGGGA
ATTACAAAGCCCAAGGAAGTGAAGAAGTTTAAAGGAGAAGGGATGCCACTTCACTACAGC
ACAAAGAAAGGCAACCTTTTTGTCACTTTCGAGGTTTTATTTCCTTCTTCTCTCACGGAG
GATCAGAAGAAGAAGATTAAAGAAGTCTTGGCTTAGTTCTCTCTCTCTCTAGAAGTTTGG
GGTCTAAAGAGAACGAACGTGTGAGGGTCCATAATGTAACATGGCTAGGTTTTAATATAT
AGGAAGAACAAAAAAA*CAGGGGAGACGAAGAGGAAGATGAGAAA
GCCAACA

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR4BU74JQ 760 0 0
AATGTAATAAAACCAGCCCCTGGAAAGAGAAATTGCAACTGCAGGGATGAAGTTTATCAC
AGGCAAATTGGTCCTGGAATGCTCCAACAGATGACAGAGCAGGTCTGTGACAAATGCCCA
AATGTTAAGTTCGAACGTGAAGGATACTTTGTCACAGTTGATATTGAGAAAGGAATGAAA
GACGGAGAAGAAGTGTCTTTCTATGAAGATGGTGAGCCCATTTTCGACGGTGACCCTGGT
GACCTTAAGTTCCGAATAAAAACTGCACCACATACCCGTTTCCGGAGAGATGGCAACGAT
CTACACATGACCGTCAACATTACACTCGTTGAGGCGCTAGTTGGATTTGAGAAATCATTC
AAACACTTGGATGAGCACGAAGTTGACATCGGTTCCAAGGGAATTACAAAGCCCAAGGAA
GTGAAGAAGTTTAAAGGAGAAGGGATGCCACTTCACTACAGCACAAAGAAAGGCAACCTT
TTTGTCACTTTCGAGGTTTTATTTCCTTCTTCTCTCACGGAGGATCAGAAGAAGAAGATT
AAAGAAGTCTTGGCTTAGTTCTCTCTCTCTCTAAAAGTTTGGGGTCTAAAGAGAACGAAC
GTGTGAGGGTCCATAATGTAACATGGCTAGGTTTTAATATATAGGAAGAACAAAAAAAAC
AGGGGAGACGAAGAGGAAGATGAGAAAAGCCAACATGAGGTTTTGATAAAATTATATTTT
GCTTTTGTTGATCAAACTAATGAAAATATTTATAATTTCG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GX26JQ 719 0 0
G
AGGGATGAGGTTTATCACAGGCAAATTGGTCCTGGAATGTTCCAACAGATGACAGAGCAG
GTCTGTGACAAATGCCCAAATGTTAAGTTCGAACGCGAAGGTTACTTTGTCACAGTTGAT
ATCGAGAAAGGAATGAAAGACGGAGAAGAAGTGTCTTTCTACGAGGATGGTGAGCCCATT
TTCGACGGTGACCCTGGTGACCTTAAGTTCCGAATTAAAACTGCACCACATTCCCGTTTC
CGGAGAGATGGCAACGATCTACACATGACCGTCAACATTACACTGGTTGAGGCGCTAGTT
GGATTTGAGAAATCATTCAAACACTTGGATGAGCACGAAGTTGACATCGGTTCCAAGGGA
ATTACAAAGCCCAAGGAAGTGAAGAAGTTTAAAGGAGAAGGGATGCCACTTCACTACAGC
ACAAAGAAAGGCAACCTTTTTGTCACTTTCGAGGTTTTATTTCCTTCTTCTCTCACGGAG
GATCAGAAGAAGAAGATTAAAGAAGTCTTGGCTTAGTTCTCTCTCTCTCTAGAAGTTTGG
GGTCTAAAGAGAACGAACGTGTGAGGGTCCATAATGTAACATGGCTAGGTTTTAATATAT
AGGAAGAACAAAAAAAACAGGGGAGACGAAGAGGAAGATGAGAAAAGCCAACATGAGGTT
TTGATAAAATTATATTTTGCTTTTGTTGATCAAACTAATGAAAATATTTATAATTTC
C

QA 2 718 2 718
DS 



AS 1 8

CO CL692Contig1 620 8 6 U
ACAATGAAGAAACTTTTTTTTTTAGATAAGTTCAAACTTCTGCTTGGATAATTCTAGTTC
CCAAACCGGCAAATCAAGAACATAACATCTGCATTTCCATGTGAGTAACACAACCCGATA
CAAACTTTGAAATACACTCTCACACATACATACATAATCTAGCGCACACAATTTACATAT
TAATTTATCTATGCTTTTATTATAATTAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGAT
AAGTGGAGTAGTCTTAGACGTTGTATCGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTTGTTCT
TGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGT
TATAAGAAGCGACTCTTTTCTTTCTCTTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCAT
TGAAGCTATAGGAGTTTGAGGGATTCTGACCGTAACCGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGG
ACGAATACTCCGTGTAAGACTTGCTTCCCTTCATCATTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTT
CTTTTACGATTTGTAAGTAATGATGTTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTTATAGCTT
ATGTGAATGAAGGGGCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4E548TF C 145
AF RR4E548JQ U 145
AF RR4FH09JQ U 1
AF RR4FH09TF C 1
AF RR4DV40JQ U 97
AF RR4FT80JQ U 75
AF RR4FT80TF C 75
AF RR4DV40TF C 97
BS 1 127 RR4FH09JQ
BS 128 128 RR4FT80JQ
BS 129 165 RR4FH09JQ
BS 166 166 RR4FT80JQ
BS 167 586 RR4FH09JQ
BS 587 620 RR4FT80JQ

RD RR4E548TF 293 0 0
CG
TACATACATAATCTAGCGCACACAATTTACATATTAATTTATCTATGCTTTTATTATAAT
TAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGATAAGTGGAGTAGTCTTAGACGTTGTAT
CGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTTGTTCTTGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAA
GTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGTTATAAGAAGCGACTCTTTTCTTTCTC
TTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCATTGAAGCTATAGGAGTTT

QA 3 293 3 293
DS 

RD RR4E548JQ 360 0 0
CG
TACATACATAATCTAGCGCACACAATTTACATATTAATTTATCTATGCTTTTATTATAAT
TAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGATAAGTGGAGTAGTCTTAGACGTTGTAT
CGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTTGTTCTTGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAA
GTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGTTATAAGAAGCGACTCTTTTCTTTCTC
TTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCATTGAAGCTATAGGAGTTTGAGGGATTC
TGACCGTAACCGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGGACGAATACTCCGTGTAAGACTT
CC

QA 3 358 3 358
DS 

RD RR4FH09JQ 587 0 0
ACAATGAAGAAACTTTTTTTTTTAGATAAGTTCAAACTTCTGCTTGGATAATTCTAGTTC
CCAAACCGGCAAATCAAGAACATAACATCTGCATTTCCATGTGAGTAACACAACCCGATA
CAAACTTCGAAATACACTCTCACACATACATACATAATCTAGCGCGCACAATTTACATAT
TAATTTATCTATGCTTTTATTATAATTAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGAT
AAGTGGAGTAGTCTTAGACGTTGTATCGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTTGTTCT
TGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGT
TATAAGAAGCGACTCTTTTCTTTCTCTTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCAT
TGAAGCTATAGGAGTTTGAGGGATTCTGACCGTAACCGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGG
ACGAATACTCCGTGTAAGACTTGCTTCCCTTCATCATTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTT
CTTTTACGATTTGTAAGTAATGATGTTTGCTCTCTCTCTCTCTCTC
C

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4FH09TF 587 0 0
ACAATGAAGAAACTTTTTTTTTTAGATAAGTTCAAACTTCTGCTTGGATAATTCTAGTTC
CCAAACCGGCAAATCAAGAACATAACATCTGCATTTCCATGTGAGTAACACAACCCGATA
CAAACTTCGAAATACACTCTCACACATACATACATAATCTAGCGCGCACAATTTACATAT
TAATTTATCTATGCTTTTATTATAATTAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGAT
AAGTGGAGTAGTCTTAGACGTTGTATCGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTTGTTCT
TGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGT
TATAAGAAGCGACTCTTTTCTTTCTCTTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCAT
TGAAGCTATAGGAGTTTGAGGGATTCTGACCGTAACCGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGG
ACGAATACTCCGTGTAAGACTTGCTTCCCTTCATCATTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTT
CTTTTACGATTTGTAAGTAATGATGTTTGCTCTCTCTCTCTCTCTC
C

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4DV40JQ 480 0 0
CCATGTGAGTAACACAACCCGATACAAACTTTGAAATACACTCTCACACATACATACATA
ATCTAGCGCACACAATTTACATATTAATTTATCTATGCTTTTATTATAATTAAAAGTGAA
AAAAAAAAAAAAAGATCAAAAAATAAGTGGAGTAGTCTTAAACGTTGTATCGGATACTAT
TATCATCCCCAGAAAATTTGTTCTTGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGA
GCTTTTCCTCCGGGGCAAAAAAGTTATAAAAAGCGACTCTTTTCTTTCTCTTTATCTCAG
GATCTGTGTTGATGCAAGGACCATTGAAGCTATAGGAGTTTGAGGGATTCTGACCGTAAC
CGAACTCATCAGTTGAAAAAGAGGACAAATACTCCGTGTAAAACTTGCTTCCCTTCATCA
TTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTTCTTTTACAATTTGTAAGTAATGATGTTTGCTCTCTC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4FT80JQ 546 0 0
CAAGAACATAACATCTGCATTTCCATGTGAGTAACACAACCCGATACAAACTTTGAAATA
CACTCTCACACATACATACATAATCTAGCGCACACAATTTACATATTAATTTATCTATGC
TTTTATTATAATTAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGATAAGTGGAGTAGTCT
TAGACGTTGTATCGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTCGTTCTTGATCCACTTAAAA
CTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGTTATAAGAAGCGACT
CTTTTCTTTCTCTTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCATTGAAGCTATAGGAG
TTTGAGGGATTCTGACCGTAACCGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGGACGAATACTCCGTG
TAAGACTTGCTTCCCTTCATCATTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTTCTTTTACGATTTGT
AAGTAATGATGTTTGCTCTATCTCTCTCTCTCTCTGGTTATAGCTTATGTGAATGAAGGG
GCTTCC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4FT80TF 546 0 0
CAAGAACATAACATCTGCATTTCCATGTGAGTAACACAACCCGATACAAACTTTGAAATA
CACTCTCACACATACATACATAATCTAGCGCACACAATTTACATATTAATTTATCTATGC
TTTTATTATAATTAAAAGTGAAGAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGATAAGTGGAGTAGTCT
TAGACGTTGTATCGGATACTATTATCATCGCCAGAAAATTCGTTCTTGATCCACTTAAAA
CTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGAGCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGTTATAAGAAGCGACT
CTTTTCTTTCTCTTTATCTCAGGATCTGTGTTGATGCAAGGACCATTGAAGCTATAGGAG
TTTGAGGGATTCTGACCGTAACCGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGGACGAATACTCCGTG
TAAGACTTGCTTCCCTTCATCATTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTTCTTTTACGATTTGT
AAGTAATGATGTTTGCTCTATCTCTCTCTCTCTCTGGTTATAGCTTATGTGAATGAAGGG
GCTTCC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4DV40TF 524 0 0
CCATGTGAGTAACACAACCCGATACAAACTTTGAAATACACTCTCACACATACATACATA
ATCTAGCGCACACAATTTACATATTAATTTATCTATGCTTTTATTATAATTAAAAGTGAA
GAAAAAGAAGAAAGATCAGAAGATAAGTGGAGTAGTCTTAGACGTTGTATCGGATACTAT
TATCATCGCCAGAAAATTTGTTCTTGATCCACTTAAAACTGTTCTTAAAAGTGCTTTTGA
GCTTTTCCTCCGTGGCAAAGAAGTTATAAGAAGCGACTCTTTTCTTTCTCTTTATCTCAG
GATCTGTGTTGATGCAAGGACCATTGAAGCTATAGGAGTTTGAGGGATTCTGACCGTAAC
CGAACTCATCAGTTGAGAAAGAGGACGAATACTCCGTGTAAGACTTGCTTCCCTTCATCA
TTTTAGGCTCTTTTATTTTGATTTCTTTTACGATTTGTAAGTAATGATGTTTGCTCT***
*CTCTCTCTCTCTGGTTATAGCTTATGTGAATGAAGGGGCTTCC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 5

CO CL693Contig1 990 5 16 U
CGCTCAATGACATATACTGTAGAGAAATTCTGACAAATGTTGGGGTTAATACTAATTTTG
TAAAAGTTTTAAGCTACACAAAAGATGATGCTCCCAACAAATTCAGCATTGTATGTAAAA
ACAATCACACTTTGTCTTCTTCACACAACTTTTTTACATAACACACTAACACACACAAGA
TGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCTTACAAGGCAGGTGGATATGCAATGTTATTAAAGG
CTGTTTCACTCCTCTGAACTGCCCTCTGAACCGCTCTTCTCAAGCTCCACTCGTAGCAGA
ACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTTCCTAGCCCTAGCACCACTATCACTCCAATGATTA
TGTTAACCGGAAGCGCAGACACACCAAGTGTGATGGATATTAACACATCCAGCATTAGAC
CACCTATCAGAATTGAGAATGCTACCCATAGAGGATTGAAACATCCTCTCTCACGCTGCT
CTTGTCTATAGCTGGGATCAATCCTCCAAACCCAGTAATTTGTAGTTGGATGGGTCTCTG
GAGGTGGCACGTTGACAGCCACTGCCTGGCAGATCTCGCACTGATTAGAGCCTTTTGTGC
GAAACCAAGCATCTATGCATGACCTATGGGATTTAGCAAGGCCACCACGACATAGGCACC
CCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTCTCTTGCTGACAAACCCTACACTGCTCGTGAGAGC
TGGAGTTTCTGGACAAGCAAACCTTTTTGGGGGACTCTTCCCTCTCAGCTGCTGGCCCAT
AGATCTGAGCCAATTCTACGGTTTCATGTGCCCCACTTGAATCTCCATTGCAGACAACAA
TGGTGAGGTGGTTCACTTCCTTGGCAGACTCATGTACTGACTCGCTCTGCTTCTCTTGAG
CCTTGTCCTGCTGCTGCTGATTCTCAAAGTCACCAGCGGGGGTTGGAGCTAATACTATGC
ATCTGATCCTTGCCTGCCACAACAACAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B875JQ U 54
AF RR4B875TF C 54
AF RR4D807JQ U 1
AF RR4AX18JQ U 87
AF RR4DN80JQ U 90
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BS 77 77 RR4B875JQ
BS 78 298 RR4D807JQ
BS 299 299 RR4AX18JQ
BS 300 333 RR4D807JQ
BS 334 334 RR4B875JQ
BS 335 364 RR4D807JQ
BS 365 365 RR4B875JQ
BS 366 377 RR4D807JQ
BS 378 378 RR4AX18JQ
BS 379 429 RR4D807JQ
BS 430 430 RR4AX18JQ
BS 431 701 RR4D807JQ
BS 702 702 RR4AX18JQ
BS 703 796 RR4D807JQ
BS 797 990 RR4AX18JQ

RD RR4B875JQ 485 0 0
AATTTTGTAAAAGTTTTAAGCTACACAAAAAATGATGCTCCCAACAAATTCAGCATTGTA
TGTAAAAACAATCACACTTTGTCTTCTTCACACAACTTTTTTACATAACACACTAACACA
CACAAAATGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCTTACAAGGGAGGTGGATATGCAATGTTA
TTAAAGGCTGTTTCACTCCTCTGAACTGCC*TCTGAACCGCTCTTCTCAAGCTCCACTCG
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ATTAAACCACCTATCAAAATTGAAAATGCTACCCATAGAGGATTGAAACATCCTCTCTCA
CGCTGCTCTTGTCTATAGCTGGGATCAATCCTCCAAACCCAGTAATTTGTAGTTGGATGG
GTCTC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4B875TF 485 0 0
AATTTTGTAAAAGTTTTAAGCTACACAAAAGATGATGCTCCCAACAAATTCAGCATTGTA
TGTAAAAACAATCACACTTTGTCTTCTTCACACAACTTTTTTACATAACACACTAACACA
CACAAGATGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCTTACAAGGCAGGTGGATATGCAATGTTA
TTAAAGGCTGTTTCACTCCTCTGAACTGCC*TCTGAACCGCTCTTCTCAAGCTCCACTCG
TAGCAGAACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTTCCTAGCCCTAGCACCACTATCACTCCA
ATGATTATGTTAACCGGAAGCGCAGACACACCAAGTGTGATGGATATTAACACATCCAGC
ATTAGACCACCTATCAGAATTGAGAATGCTACCCATAGAGGATTGAAACATCCTCTCTCA
CGCTGCTCTTGTCTATAGCTGGGATCAATCCTCCAAACCCAGTAATTTGTAGTTGGATGG
GTCTC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4D807JQ 796 0 0
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TAAAAGTTTTAAGCTATACAAAAGATGATGCTCCCAACAAATTCAGCATTGTATGTAAAA
ACAATCACACTTTGTCTTCTTCACACAACTTTTTTACATAACACACTAACACACACAAGA
TGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCTTACAAGGCAGGTGGATATGCAATGTTATTAAAGG
CTGTTTCACTCCTCTGAACTGCCCTCTGAACCGCTCTTCTCAAGCTCCACTCGTAGCAAA
ACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTTCCTAGCCTTAGCACCACTATCACTCCAATGATTA
TGTTGACCGGAAGCGCAAACACACCAAGTGTGATGGATATTAACACATCCAGCATTAGAC
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CTTGTCTATAGCTGGGATCAATCCTCCAAACCCAGTAATTTGTAGTTGGATGGGTCTCTG
GAGGTGGCACGTTGACAGCCACTGCCTGGCAGATCTCGCACTGATTAGAGCCTTTTGTGC
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CCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTCTCTTGCTGACAAACCATACACTGCTCGTGAGAGC
TGGAGTTTCTGGACAAGCAAACCTTTTTGGGGGACTCTTCCCTCTCAGCTGCTGGCCCAT
AGATCTGAGCCAATTC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4AX18JQ 904 0 0
GATGCTCCCAACAAATTCAGCATTGTATGTAAAAACAATCACACTTTGTCTTCTTCACAC
AACTTTTTTACATAACACACTAACACACACAAGATGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCT
TACAAGGCAGGTGGATATGCAATGTTATTAAAGGCTGTTTCACTCCTCTGAACTGCCCTC
TGAACCGCTCTTCTCAAGCTCCACTCGTAGCAGAACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTT
CCTAGCCCTAGCACCACTATCACTCCAATGATTATGTTAACCGGAAGCGCAGACACACCA
AGTGTGATGGATATTAACACATCCAGCATTAGACCACCTATCAGAATTGAGAATGCTACC
CATAGAGGATTGAAACATCCTCTCTCACGCTGCTCTTGTCTATAGCCGGGATCAATCCTC
CAAACCCAGTAATTTGTAGTTGGATGGGTCTCTGGAGGTGGCACGTTGACAGCCACTGCC
TGGCAGATCTCGCACTGATTAGAGCCTTTTGTGCGAAACCAAGCATCTATGCATGACCTA
TGGGATTTAGCAAGGCCACCACGACATAGGCACCCCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTC
TCTTGCTGACAAACCCTACACTGCTCGTGAGAGCTGGAGTTTCTGGACAAGCAAACCTTT
TTGGGGGACTCTTCCCTCTCAGCTGCTGGCCCATAGATCTGAGCCAATTCTACGGTTTCA
TGTGCCCCACTTGAATCTCCATTGCAGACAACAATGGTGAGGTGGTTCACTTCCTTGGCA
GACTCATGTACTGACTCGCTCTGCTTCTCTTGAGCCTTGTCCTGCTGCTGCTGATTCTCA
AAGTCACCAGCGGGGGTTGGAGCTAATACTATGCATCTGATCCTTGCCTGCCACAACAAC
AAGT

QA 1 904 1 904
DS 

RD RR4DN80JQ 885 0 0
GCTCCCAACAAATTCAGCATTGTATGTAAAAACAATCACACTTTGTCTTCTTCACACAAC
TTTTTTACATAACACACTAACACACACAAGATGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCTTAC
AAGGCAGGTGGATATGCAATGTTATTAAAGGCTGTTTCACTCCTCTGAACTGCCCTCTGA
ACCGCTCTTCTCAAGCTCCACTCGTAGCAGAACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTTCCT
AGCCCTAGCACCACTATCACTCCAATGATTATGTTAACCGGAAGCGCAGACACACCAAGT
GTGATGGATATTAACACATCCAGCATTAGACCACCTATCAGAATTGAGAATGCTACCCAT
AGAGGATTGAAACATCCTCTCTCACGCTGCTCTTGTCTATAGCTGGGATCAATCCTCCAA
ACCCAGTAATTTGTAGTTGGATGGGTCTCTGGAGGTGGCACGTTGACAGCCACTGCCTGG
CAGATCTCGCACTGATTAGAGCCTTTTGTGCGAAACCAAGCATCTATGCATGACCTATGG
GATTTAGCAAGGCCACCACGACATAGGCACCCCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTCTCT
TGCTGACAAACCCTACACTGCTCGTGAGAGCTGGAGTTTCTGGACAAGCAAACCTTTTTG
GGGGACTCTTCCCTCTCAGCTGCTGGCCCATAGATCTGAGCCAATTCTACGGTTTCATGT
GCCCCACTTGAATCTCCATTGCAGACAACAATGGTGAGGTGGTTCACTTCCTTGGCAGAC
TCATGTACTGACTCGCTCTGCTTCTCTTGAGCCTTGTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCA**G
TCACCAGCGGGG*TTGGAGCTAATACTATGCATCTGATCCTTGCC

QA 1 885 1 885
DS 



AS 1 7

CO CL694Contig1 909 7 5 U
GAAATTTAAGAAATAGCATTGAAGTCAAGTGCATGAGCTTTTGACATAAAACATCAAACA
TAAAACAGTTGTTGGTTGGCTTCTGTATTAGTACAAGAGACGGAATAAAAGCCTTATAGA
TCATTCATCATACAGACAAGTAACAACACTTGTTCAATCACTTCATGTATCTGTGCAGGA
ATTTTCTGTGGAAGTCGTTCCTTATTGTATCATTGATGAAGCGCTTAGGTGCTTTCATTT
CACCACGAGCCTGATTCTTGAATACCACATCATCATCCCACCTCCTTTTGACACTAAACG
AGGTTGGAGTATTGTTATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTGGCGT
TTAGCTCCTCCATCTGCTGCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCTTTCT
TAATCTGGTCGAGTTCAGCCATGAGAGCTTCAGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCACTTT
CGTCATCACTATCATCATCACTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACACTGC
GAGGAACAATCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTCCCTC
TCCTGCGATCTCTATCATCACTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTCTCAC
GCTCCTCAAGCTCATCACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGCGTGTGTTGCCCTT
CCCTCCTTGGCTTTAGAGTAGTGTGAGCGGCGACATCGCGAGAGGAATACTTCTGAGAGG
CTCCGAAGATACGAGCACCACCCTGCTCGTTACCTCCCTTCGCCGGAGCCCACGTTGGTC
TAGCTGCAGTCGTCATCTTCGGTAGAAAAAAAAACCCTAAATTCCCAAATCAACCACGAT
CGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 20 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AR95JQ U 95
AF RR4D379JQ U 1
AF RR4DI88JQ U 1
AF RR4BT53JQ U 8
AF RR4DI88TF C 117
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AF RR4AR95TF C 300
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BS 539 727 RR4D379JQ
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BS 812 909 RR4DI88TF

RD RR4AR95JQ 197 0 0
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CAATCACTTCATGTATCTGTGCAGGAATTTTCTGTGGAAGTCGTTCCTTATTGTATCATT
GATGAAGCGCTTAGGTGCTTTCATTTCACCACGAGCCTGATTCTTGAATACCAGATCATC
ATCCCACCTCCTTTTGA

QA 1 197 1 197
DS 

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TAAAACAGTTGTTGGTTGGCTTCTGTATTAGTACAAGAGACGGAATAAAAGCCTTATAGA
TCATTCATCATACAGACAAGTAACAACACTTGTTCAATCACTTCATGTATCTGTGCAGGA
ATTTTCTGTGGAAGTCGTTCCTTATTGTATCATTGATGAAGCGCTTAGGTGCTTTCATTT
CACCACGAGCCTGATTCTTGAATACCACATCATCATCCCACCTCCTTTTGACACTAAACG
AGGTTGGAGTATTGTTATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTGGCGT
TTAGCTCCTCCATCTGCTGCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCTTTCT
TAATCTGGTCGAGTTCAGCCATGAGAGCTTCAGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCACTTT
CGTCATCACTATCATCATCACTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACAC*GC
GAGGAACAATCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTCCCTC
TCCTGCGATCTCTATCATCACTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTCTCAC
GCTCCTCAAGCTCATCACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGCGTGTGTTGCCCTT
CCCTCCT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4DI88JQ 811 0 0
GAAATTTAA
GAAATAGCATTGAAGTCAAGTGCATGAGCTTTTGACATAAAACATCAAACATAAAACAGT
TGTTGGTTGGCTTCTGTATTAGTACAAGAGACGGAATAAAAGCCTTATAGATCATTCATC
ATACAGACAAGTAACAACACTTGTTCAATCACTTCATGTATCTGTGCAGGAATTTTCTGT
GGAAGTCGTTCCTTATTGTATCATTGATGAAGCGCTTAGGTGCTTTCATTTCACCACGAG
CCTGATTCTTGAATACCACATCATCATCCCACCTCCTTTTGACACTAAACGAGGTTGGAG
TATTGTTATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTGGCGTTTAGCTCCT
CCATCTGCTGCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCTTTCTTAATCTGGT
CGAGTTCAGCCATGAGAGCTTCAGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCACTTTCGTCATCAC
TATCATCATCACTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACAC*GCGAGGAACAA
TCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTCCCTCTCCTGCGAT
CTCTATCATCACTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTCTCACGCTCCTCAA
GCTCATCACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGCGTGTGTTGCCCTTCCCTCCTTG
GCTTTAGAGTAGTGTGAGCGGCGACATCGCGAGAGGAATACTTCTGAGAGGCTCCGAAGA
TACGAGCACCACCCTGCTCGTT

QA 10 811 10 811
DS 

RD RR4BT53JQ 802 0 0
AG
GAAATAGCATTGAAGTCAAGTGCATGAGCTTTTGACATAAAACATCAAACATAAAACAGT
TGTTGGTTGGCTTCTGTATTAGTACAAGAGACGGAATAAAAGCCTTATAGATCATTCATC
ATACAGACAAGTAACAACACTTGTTCAATCACTTCATGTATCTGTGCAGGAATTTTCTGT
GGAAGTCGTTCCTTATTGTATCATTGATGAAGCGCTTAGGTGCTTTCATTTCACCACGAG
CCTGATTCTTGAATACCACATCATCATCCCACCTCCTTTTGACACTAAACGAGGTTGGAC
TATTGTTATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTGGCGTTTAGCTCCT
CCATCTGCTTCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCTTTCTTAATCTGGT
CGAGTTCAGCCATGAGAGCTTCGGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCACTTTCGTCATCAC
TATCATCATCAGTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACACTGCGAGGAACAA
TCCGATCTTCAGGGTCTCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTCCCTCTCCTGCGAT
CTCTATCATCATTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTCTCACGCTCCTCAA
GCTCATCACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGTGTGTGTTGCCCTTCCCTCCTTG
GCTTTAGAGTAGTGTGAGCGGCGACATCGCGAGAGGAATACTTCTGAGAGGCTCCGAAGA
TACGAGCACCACCCTGCTCG

QA 3 802 3 802
DS 

RD RR4DI88TF 793 0 0
TAGATCATTCATCATACAGACAAGTA*CAACACT*GTTCAATCACTTCATGTATCTGTGC
AGGAATTT*CTGTGGAAGTCGTTC*TTAT*GTATCATTGATGAAGCGCTTAGGTGCTTTC
ATTTCACCACGAGC*TGATTCTTGAATACCACATCATCATCCCACCTCCTTTTGACACTA
AACGAGGTTGGAGTATTGTTATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTG
GCGTTTAGCTCCTCCATCTGCTGCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCT
TTCTTAATCTGGTCGAGTTCAGCCATGAGAGCTTCAGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCA
CTTTCGTCATCACTATCATCATCACTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACA
C*GCGAGGAACAATCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTC
CCTCTCCTGCGATCTCTATCATCACTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTC
TCACGCTCCTCAAGCTCATCACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGCGTGTGTTGC
CCTTCCCTCCTTGGCTTTAGAGTAGTGTGAGCGGCGACATCGCGAGAGGAATACTTCTGA
GAGGCTCCGAAGATACGAGCACCACCCTGCTCGTTACCTCCCTTCGCCGGAGCCCACGTT
GGTCTAGCTGCAGTCGTCATCTTCGGTAGAAAAAAAAACCCTAAATTCCCAAATCAACCA
CGATCGTGTTTCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4BT53TF 654 0 0
TCTTGAATACCACATCATCATCCCACCTCCTTTTGACACTAAACGAGGTTGGACTATTGT
TATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTGGCGTTTAGCTCCTCCATCT
GCTTCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCTTTCTTAATCTGGTCGAGTT
CAGCCATGAGAGCTTCGGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCACTTTCGTCATCACTATCAT
CATCAGTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACACTGCGAGGAACAATCCGAT
CTTCAGGGTCTCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTCCCTCTCCTGCGATCTCTAT
CATCATTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTCTCACGCTCCTCAAGCTCAT
CACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGTGTGTGTTGCCCTTCCCTCCTTGGCTTTA
GAGTAGTGTGAGCGGCGACATCGCGAGAGGAATACTTCTGAGAGGCTCCGAAGATACGAG
CACCACCCTGCTCGTTACCTCCCTTCGCCGGAGCCCACGTTGGTCTAGCTGCAGTCGTCA
TCTTCGGTAGAAAAAAAAACC*TAAATTCCCAAATCAACCACGATCGTGTTTCC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4AR95TF 610 0 0
GAGGTTGGAGTATTGTTATTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGTTCTTCTTCTTTGGCG
TTTAGCTCCTCCATCTGCTGCTGCTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCCACTCTTTCTTTC
TTAATCTGGTCGAGTTCAGCCATGAGAGCTTCAGTGTCGTCCTCGTCATCATCATCACTT
TCGTCATCACTATCATCATCACTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCATCTACACTG
CGAGGAACAATCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTAGATCCTTCCAGGAGCAGCTGATTCCCT
CTACTGCGATCTCTATCATCACTGTAAGATTTGTCTTTGGAAGAGAAGTGTCTCCTCTCA
CGCTCCTCAAGCTCATCACGGAGATTCTTCTTCTCCACTTCCTCTTGCGTGTGTTGCCCT
TCCCTCCTTGGCTTTAGAGTAGTGTGAGCGGCGACATCGCGAGAGGAATACTTCTGAGAG
GCTCCGAAGATACGAGCACCACCCTGCTCGTTACCTCCCTTCGCCGGAGCCCACGTTGGT
CTAGCTGCAGTCGTCATCTTCGGTAGAAAAAAAA*CCCTAAATTCCCAAATCAACCACGA
TCGTGTTTCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 3 6

CO CL695Contig1 1124 2 4 U
GAAGGATTGCTGCTGTTCAGTCTCTCTCTGGAACTGGTGCTTGCCGACTCTTTGCTGACT
TCCAGAAACGTTTCCGTCCCGATTCCCAGATCTACATTCCTGTACCTACCTGGTCCAACC
ACCACAACATCTGGAGAGATGCACAAGTCCCTCAGAAGACATACCATTACCATCATCCAG
AAACCAAGGGCTTGGATTTCTCAGGATTGATGGACGATGTGAAGAATGCTCCCGAAGGCT
CCTTCTTCCTTCTTCATGCTTGTGCTCACAATCCTACTGGAGTAGACCCTACTGAGGAAC
AATGGAGAGAGATTTCACAGCTATTCAAGGCCAAAAACCATTTTGCGTTCTTCGATATGG
CCTATCAAGGTTTCGCAAGTGGTGATCCAAGGAAAGATGCCAAGTCCATCAGGATCTTTC
TCGAGGATGGTCATCATATTGGAATCTCTCAGTCTTATGCAAAGAACATGGGACTCTACG
GCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGCGTGCTTTGTGAAGATGAGAAGCAAGCTGTGACTGTGA
AAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCTAGACCAATGTACAGCAACCCACCTTTACATGGAGCTC
AAATAGTCTCAATCATTCTTGGAGACCCACAGTTAAAGAACCAGTGGCTACAGGAAGTTA
AGATAATGGCTGATCGGATAATTGGCATGAGAACTACGTTGAGAGAAAGCCTAGAGAACC
TAGGATCGCCTCTATCATGGGAGCACGTAACCAAGCAGATTGGAATGTTTTGCTACAGTG
GGCTAACACCAGAACAGGTTGACCGCTTAACTAGCGAGTATCACATCTATATGACCCGTA
ATGGCCGTATCAGTATGGCCGGTGTTACAACAGGAAACGTGGAATACCTTGCGAATGCCA
TACATGAAGTCACCAAGTCATTTTAAATTGTTTTAGATGTCTCAAGTGAGGGAGATAAAT
TTGTTTCTTTTTGAAAGAGTTAAATAATAAAGACAGAGGAAGTTACAACATTTGTTGCTC
CTCAATTGTTTTGATGGGGACTGAGTTTTACCCAGAAACAGTAACTTTATCAGCGCTATA
AATTCTTGAATTATCTTTAAAACCGCCCTTTAGTTGATTTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY74TF U 1
AF RR4BY74JQ C 409
BS 1 723 RR4BY74TF
BS 724 724 RR4BY74JQ
BS 725 753 RR4BY74TF
BS 754 1124 RR4BY74JQ

RD RR4BY74TF 755 0 0
GAAGGATTGCTGCTGTTCAGTCTCTCTCTGGAACTGGTGCTTGCCGACTCTTTGCTGACT
TCCAGAAACGTTTCCGTCCCGATTCCCAGATCTACATTCCTGTACCTACCTGGTCCAACC
ACCACAACATCTGGAGAGATGCACAAGTCCCTCAGAAGACATACCATTACCATCATCCAG
AAACCAAGGGCTTGGATTTCTCAGGATTGATGGACGATGTGAAGAATGCTCCCGAAGGCT
CCTTCTTCCTTCTTCATGCTTGTGCTCACAATCCTACTGGAGTAGACCCTACTGAGGAAC
AATGGAGAGAGATTTCACAGCTATTCAAGGCCAAAAACCATTTTGCGTTCTTCGATATGG
CCTATCAAGGTTTCGCAAGTGGTGATCCAAGGAAAGATGCCAAGTCCATCAGGATCTTTC
TCGAGGATGGTCATCATATTGGAATCTCTCAGTCTTATGCAAAGAACATGGGACTCTACG
GCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGCGTGCTTTGTGAAGATGAGAAGCAAGCTGTGACTGTGA
AAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCTAGACCAATGTACAGCAACCCACCTTTACATGGAGCTC
AAATAGTCTCAATCATTCTTGGAGACCCACAGTTAAAGAACCAGTGGCTACAGGAAGTTA
AGATAATGGCTGATCGGATAATTGGCATGAGAACTACGTTGAGAGAAAGCCTAGAGAACC
TAG*ATCGCCTCTATCATGGGAGCACGTAACCA
GC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4BY74JQ 716 0 0
TCAGGATCTTTCTCGAGGATGGTCATCATATTGGAATCTCTCAGTCTTATGCAAAGAACA
TGGGACTCTACGGCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGCGTGCTTTGTGAAGATGAGAAGCAAG
CTGTGACTGTGAAAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCTAGACCAATGTACAGCAACCCACCTT
TACATGGAGCTCAAATAGTTTCAATCATTTTTGGAGACCCACAGTTAAAGAACCAGTGGC
TACAGGAAGTTAAGATAATGGCTGATCGGATAATTGGCATGAGAACTACGTTGAGAGAAA
GCCTAGAGAACCTAGGATCGCCTTTATCATGGGAGCACGTAACCAAGCAGATTGGAATGT
TTTGCTACAGTGGGCTAACACCAGAACAGGTTGACCGCTTAACTAGCGAGTATCACATCT
ATATGACCCGTAATGGCCGTATCAGTATGGCCGGTGTTACAACAGGAAACGTGGAATACC
TTGCGAATGCCATACATGAAGTCACCAAGTCATTTTAAATTGTTTTAGATGTCTCAAGTG
AGGGAGATAAATTTGTTTCTTTTTGAAAGAGTTAAATAATAAAGACAGAGGAAGTTACAA
CATTTGTTGCTCCTCAATTGTTTTGATGGGGACTGAGTTTTACCCAGAAACAGTAACTTT
ATCAGCGCTATAAATTCTTGAATTATCTTTAAAACCGCCCTTTAGTTGATTTCACG

QA 1 716 1 716
DS 



CO CL695Contig2 994 2 6 U
GGGGAGCTAAAGAAAAAAAAAGAAAGCGTTATGGCGATGAGAATCCGCAACTTAGCTTCC
CGACGAACGATGATGATGATGAGTAGTCCGATCTCCGGTTTGAGAAGTATGTCTTCTTCA
TGGTGGAAGAACGTGGAGCCAGCTCCCAAAGATCCGATCCTCGGAGTTACCGAGGCTTTT
CTCGCTGATCCTAGTCCCGACAAAGTTAACGTTGGTGTGGGAGCATATCGTGATGATAAT
GGGAAGCCTGTTGTCTTGGATTGTGTTAGAGAAGCTGAACGAAGGATTGCTAGCACCTCC
TTCATGGAATACCTTCCTATGGGAGGGAGTGTGAAAATGGTGGAGGAAACATTGAAACTT
GCCTATGGGGACAACTCTGAATTTGTCATAGACAAAAGAATCGCTGCAGTTCAGTCTCTC
TCCGGAACTGGAGCTTGCCGACTCTTTGCTGACTTCCAGAAACGTTCCTGCCCCGGTTCA
CAGATCTACATTCCTGTCCCAACCTGGTCCAACCACCACAACATCTGGAGAGATGCACAA
GTCCCTCAAAAGACTTATCATTACTATCATCCAGAAACCAAGGGTTTAGATTTCAAAGGA
CTGATGGATGATGTGAAGAATGCTCCGGAAGGCTCCTTCTTCCTTCTCCATGCTTGTGCT
CATAATCCTACTGGAGTCGACCCTACAGAGGAACAATGGAGAGAGATCTCACAGCTTTTC
AAGGCCAAAAATCATTTTGCATTCTTCGATATGGCCTATCAAGGTTTCGCTAGTGGTGAT
CCAGCGAGAGATGCCAAGTCCATCAGGATCTTTCTCGAGGATGGTCACCATATTGGAATC
TCTCAGTCCTATGCCAAAAACATGGGTCTCTACGCCAGAGAGTCGTCGTCTCAGCGTGCT
CTGTGAAATGAAAAGCAAGCCGTGACTGTGAAAGTCAGTTGCAGCACTAGCTAGACCATG
TACAGCACCACTTTACATGGAGCTCAGATAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC65TF U 1
AF RR4GB89TF U 193
BS 1 228 RR4CC65TF
BS 229 229 RR4GB89TF
BS 230 291 RR4CC65TF
BS 292 292 RR4GB89TF
BS 293 626 RR4CC65TF
BS 627 994 RR4GB89TF

RD RR4CC65TF 626 0 0
GGGGAGCTAAAGAAAAAAAAAGAAAGCGTTATGGCGATGAGAATCCGCAACTTAGCTTCC
CGACGAACGATGATGATGATGAGTAGTCCGATCTCCGGTTTGAGAAGTATGTCTTCTTCA
TGGTGGAAGAACGTGGAGCCAGCTCCCAAAGATCCGATCCTCGGAGTTACCGAGGCTTTT
CTCGCTGATCCTAGTCCCGACAAAGTTAACGTTGGTGTGGGAGCATATTGTGATGATAAT
GGGAAGCCTGTTGTCTTGGATTGTGTTAGAGAAGCTGAACGAAGGATTGCTGGCACCTCC
TTCATGGAATACCTTCCTATGGGAGGGAGTGTGAAAATGGTGGAGGAAACATTGAAACTT
GCCTATGGGGACAACTCTGAATTTGTCATAGACAAAAGAATCGCTGCAGTTCAGTCTCTC
TCCGGAACTGGAGCTTGCCGACTCTTTGCTGACTTCCAGAAACGTTCCTGCCCCGGTTCA
CAGATCTACATTCCTGTCCCAACCTGGTCCAACCACCACAACATCTGGAGAGATGCACAA
GTCCCTCAAAAGACTTATCATTACTATCATCCAGAAACCAAGGGTTTAGATTTCAAAGGA
CTGATGGATGATGTGAAGAATGCTCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4GB89TF 802 0 0
G
GTCCCGACAAAGTTAACGTTGGTGTGGGAGCATATCGTGATGATAATGGGAAGCCTGTTG
TCTTGGATTGTGTTAGAGAAGCTGAACGAAGGATTGCTAGCACCTCCTTCATGGAGTACC
TTCCTATGGGAGGGAGTGTGAAAATGGTGGAGGAAACATTGAAACTTGCCTATGGGGACA
ACTCTGAATTTGTCATAGACAAAAGAATCGCTGCAGTTCAGTCTCTCTCCGGAACTGGAG
CTTGCCGACTCTTTGCTGACTTCCAGAAACGTTTCTGCCCCGGTTCACAGATCTACATTC
CTGTCCCAACCTGGTCCAACCGCCACAACATCTGGAGAGATGCACAAGTCCCTCAAAAGA
CTTATCATTACTATCATCCAGAAACCAAGGGTTTAGATTTCAAAGGACTGATGGATGATG
TGAAGAATGCTCCGGAAGGCTCCTTCTTCCTTCTCCATGCTTGTGCTCATAATCCTACTG
GAGTCGACCCTACAGAGGAACAATGGAGAGAGATCTCACAGCTTTTCAAGGCCAAAAATC
ATTTTGCATTCTTCGATATGGCCTATCAAGGTTTCGCTAGTGGTGATCCAGCGAGAGATG
CCAAGTCCATCAGGATCTTTCTCGAGGATGGTCACCATATTGGAATCTCTCAGTCCTATG
CCAAAAACATGGGTCTCTACGCCAGAGAGTCGTCGTCTCAGCGTGCTCTGTGAAATGAAA
AGCAAGCCGTGACTGTGAAAGTCAGTTGCAGCACTAGCTAGACCATGTACAGCACCACTT
TACATGGAGCTCAGATAGTCT

QA 2 802 2 802
DS 



CO CL695Contig3 331 2 3 U
AAAAAAAAAAAAATCAATGTTTGGCTGGAAATGAGTAAATAAAAATGACTTTAAAATGAC
TTGGTGACTTCATGTATAGCATTCCCAAGATATCCCACATTTCCTGTTGTAACACCAGCC
ATACTGATACGGCCATTACGAGTCATATAAATGTGATATTCCCTTGTTAAGCGGTCAACC
TGTTCTGGGGTTAGCCCACTGTAGCAAAACATTCCAATCTGCTTGGTTACGTGCTCCCAT
GATAAAGGCGATCCTAACTTCTCAAGGCTTTCTCTCAAAGTAGTTCTCATGCCAATTATC
CGATCAGCCATGATCTTAACTTCCTTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC65JQ U 120
AF RR4GB89JQ U 1
BS 1 188 RR4GB89JQ
BS 189 189 RR4CC65JQ
BS 190 331 RR4GB89JQ

RD RR4CC65JQ 162 0 0
CATACTGATACGGCCATTACGAGTCATATAGATGTGATATTCGCTTGTTAAGCGGTCAAC
CTGTTCTGGGGTTAGCCCACTGTAGCAAAACATTCCAATCTGCTTGGTTACGTGCTCCCA
TGATAAAGGCGATCCTAACTTCTCAAGGCTTTCTCTCAAAGT

QA 1 162 1 162
DS 

RD RR4GB89JQ 331 0 0
AAAAAAAAAAAAATCAATGTTTGGCTGGAAATGAGTAAATAAAAATGACTTTAAAATGAC
TTGGTGACTTCATGTATAGCATTCCCAAGATATCCCACATTTCCTGTTGTAACACCAGCC
ATACTGATACGGCCATTACGAGTCATATAAATGTGATATTCCCTTGTTAAGCGGTCAACC
TGTTCTGGTGTTAGCCCACTGTAGCAAAACATTCCAATCTGCTTGGTTACGTGCTCCCAT
GATAAAGGCGATCCTAACTTCTCAAGGCTTTCTCTCAAAGTAGTTCTCATGCCAATTATC
CGATCAGCCATGATCTTAACTTCCTTTAGCC

QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 8

CO CL696Contig1 1153 8 6 U
GAATCTGGCATATCTTAACCAAACCTTTTGCATGGGCTCGCCGCGCACTTGTATGGTCTG
GGGAGGCTTACTTGCCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCTGTTTGTGGTTTCATTGCTTGTT
GTTTTGTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAGTTTTACGGACCTACAGGGCCAG
AAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACG
TGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCCCCGACTGGAG
AAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGATCTGCGTGCTCCCTGGTTAGAAC
CTTTAAGGGGTCCTAATGGTTTGGACTTAAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGC
AAGAACGACGTTCTGCAGAATATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTAG
GGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCTA
CCTCTCATTTTGTTCTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGAG
CTCGGGCAGCGGCAGCAGGATTTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTT
CTATGACTCCTCTTAACTAAAGTAGTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATAGT
AAAAAGTCTTCTTTCTTTCTTTCAATTCAATCTCATTTTTTCTGGCTCGGCTATACTATC
CAGCCGAGCCATTCTCCTTTTTTATGATGCTAAGAAGTAAAAAAGCCAATAAATAAAAAA
ATCTATTCATCCAACAAAAGGAGAGACTATTAACGTCAAAGAAGATGGGTCTGTTCTTAA
GAGAATGGGTTGCTGCTCTAACTAGAGTGTGATTGTAGATTTGGTTTGGTCGGATTAAGG
TGGCTCGTGCAATAAAAAAAAAGATGAACCATGTTTATGATTTGGTAACTTTCGCCTGTA
AGGGCTTTTAAAATTGAATGTACATGATCATTATCTTGTCTTCCCCACCACTTATGAACT
TGTAATGAACTAGACAAATGCAAATCTTCACGCAAGTTATCTTTCAATTTCAAGACCAAA
CTGTTTATGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM10TF U 1
AF RR4BM10JQ C 6
AF RR4BE81TF U 141
AF RR4BH18JQ C 479
AF RR4BH18TF U 479
AF RR4GE75JQ C 366
AF RR4GE75TF U 366
AF RR4BE81JQ C 419
BS 1 485 RR4BM10TF
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BS 487 606 RR4BM10TF
BS 607 720 RR4BE81TF
BS 721 790 RR4GE75TF
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GGGAGGCTTACTTGCCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCTGTTTGTGGTTTCATTGCTTGTT
GTTTTGTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAGTTTTACGGACCTACAGGGCCAG
AAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACG
TGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCCCCGACTGGAG
AAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGATCTGCGTGCTCCCTGGTTAGAAC
CTTTAAGGGGTCCTAATGGTTTGGACTTAAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGC
AAGAACGACGTTCTGCAGAATATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTAG
GGGGCATAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCTA
CCTCTCATTTTGTTCTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGAG
CTCGGG

QA 1 606 1 606
DS 

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GCTTACTTGCCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCTGTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTTTT
GTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAGTTTTACGGACCTACAGGGCCAGAAGCT
TCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGG
TTTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCCCCGACTGGAGAAGTT
ATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGATTTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTA
AGGGGTCCTAATGGTTTGGACTTAAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAA
CGACGTTTTGCAGAATATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTAGGGGGC
ATAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTTTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCT
CATTTTGTTCTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGAGCTCGG
G

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DS 

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G
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TTACTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTA
CAGGTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCCCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAA
CAATGCGTTTTTGGGATCTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCTAATGGTT
TGGACTTAAGTAGGTTGAAAAAAGACACGCAACCTTGGCAAGAACGACGTTCTGCAGAAT
ATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTAGGGGGCGTAGCTACTGAGATCA
ATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCGTTTTGTTCTAGGAT
TCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGAGCTCGGGCAGCGGCAGCAGGAT
TTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCTATGACTCCTCTTAACTAAA
GTAGTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATAGT

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G
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ACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGA
GCTCGGGCAGCGGCAGCAGGATTTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTT
TATATGACTCCTTTTAACTAAAGTAGTAGTT

QA 2 212 2 212
DS 

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G
GGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCT
ACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGA
GCTCGGGCAGCGGCAGCAGGATTTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTT
TCTATGACTCCTCTTAACTAAAGTAGTAGTTAAAATAGG

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DS 

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G
GGGGTCCTAATGGTTTGGACTTAAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAAC
GACGTTCTGCAGAATATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTAGGGGGCG
TAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTC
ATTTTGTTTTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGAGCTCGGG
CAGCGGCAGCAGGATTTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCTATGA
CTCCTCTTAACTAAAGTAGTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATAGTAAAAAG
TCTTCTTTCTTTCTTTCAATTCAATCTCATTTTTTCTGGCTCGGCTATACTATCCAGCCG
AGCC

QA 2 425 2 425
DS 

RD RR4GE75TF 425 0 0
G
GGGGTCCTAATGGTTTGGACTTAAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAAC
GACGTTCTGCAGAATATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTAGGGGGCG
TAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTC
ATTTTGTTTTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGAGCTCGGG
CAGCGGCAGCAGGATTTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCTATGA
CTCCTCTTAACTAAAGTAGTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATAGTAAAAAG
TCTTCTTTCTTTCTTTCAATTCAATCTCATTTTTTCTGGCTCGGCTATACTATCCAGCCG
AGCC

QA 2 425 2 425
DS 

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GCAAGAACGACGTTCTGCAGAATATATGACTCATGCTCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGT
AGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTACGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATC
TACCTCTCGTTTTGTTCTAGGATTCTTCCTATTCGTGGGTCATTTATGGCACGCGGGAAG
AGCTCGGGCAGCGGCAGCAGGATTTGAAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCT
TTTTATGACTCCTCTTAACTAAAGTAGTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATA
GTAAAAAGTCTTCTTTCTTTCTTTCAATTCAATCTCATTTTTTCTGGCTCGGCTATACTA
TCCAGCCGAGCCATTCTCCTTTTTTATGATGCTAAGAAGTAAAAAAGCCAATAAATAAAA
AAATCTATTCATCCAACAAAAGGAGAGACTATTAACGTCAAAGAAGATGGGTCTGTTCTT
AAGAGAATGGGTTGCTGCTCTAACTAGAGTGTGATTGTAGATTTGGTTTGGTCGGATTAA
GGTGGCTCGTGCAATAAAAAAAAAGATGAACCATGTTTATGATTTGGTAACTTTCGCCTG
TAAGGGCTTTTAAAATTGAATGTACATGATCATTATCTTGTCTTCCCCACCACTTATGAA
CTTGTAATGAACTAGACAAATGCAAATCTTCACGCAAGTTATCTTTCAATTTCAAGACCA
AACTGTTTATGGTCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 8

CO CL697Contig1 1028 8 6 U
GGAAACTAAAAAGGTGTGACTGTAGGTCGCCCTAATTTCTCTCCCAATTCCAAGCGCCGC
CTAGCTTCATCTTGGTCCAGATCCGTCGCTCTCCGGTGTCGGACGCCTTTCGTCAGCATC
GGAGGGGCTCCTCTTGTTTTTGTTTCAGTCGTTTAGATTATATAGGAACTGCTTTTGTCG
GATCTGGAGGTTTGTTTATAGATCGGTTTTTATGGCGATGCTCTGTCTTACAGATTCTTG
CTCGTCTGAGCCAGGAGGAGGTCTCGATACTGGTTGTTTCGTTGTTGAGCGACGAGCGGT
CAGTCGGCGCCTACTCAGATATATGTCCTGGCCTCCAGGTTCTCTTGGATGAAAGGTTGG
CGTTTGGAATCTAGTTCTAGATTTGCAGGTTCGAGTTCGTGGTTGTAGAGGCTGCTGGTG
CTGGTTCTTGTGGGTTCTGTCGGTTCTGGTTTGGTCCTCTCTTATCAGCTCGGTCTCCCT
TTCCTGCTGGTTTGTGTTGTTTGCTTATGTGGTGGTCTCTTCGTGTTCTGGAGGATGTGC
TTATCCTTGGTCATTTGCGACGGCTGTTGTCCGTCTCGGTTCGTGGTTTTTCCGGCTAGT
GTCTCAAGGATTTGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAAT
GGTTAGTCTTCTTCCTCCTGGGTTTGATTCTCTGTGGTTTCTCGTGGCTCGTCAAGGTGT
GTCCGGAGGAGTATAAGAGTTCCAGAGTCTCCCCTTTAATAAGTTTGTCTTTTGGTGTGC
GCTTATCCTATCCTCCTCTCCTCGTTGACTCTGCTTTCTTAAGCTCTTATTTTAATTGTT
TCTAGATTCCTATCAGTTCATACTTTTATCCAGTTGTGTTCATAGCTTATGTTTGGCTCC
AAAGATCTCTTGTAGTTCTGTTGGCTTTTGGCTCCAGAGGACTCTTATGTTCCTGCTGGC
TTTCTGTATTTCATAAATATGCATTCCACCCCTGTATTTTCTTCAAGTTAATGGAAATTT
CAGTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

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TTCAGTCGTTTAAATTATATAGGAACTGCTTTTGTCGGATCTGGAGGTTTGTTTATACAT
CGGTTTTTAT

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DS 

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GG
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GGACGCCTTTCGTCAGCATCGGAGGGGCTCCTCTTGTTTTTGTTTCAGTCGTTTAGATTA
TATAGGAACTGCTTTTGTCGGATCTGGAGGTTTGTTTATAGATCGGTTTTTATGGCGATG
CTCTGTCTTACAGATTCTTGCTCGTCTGAGCCAGGAGGAGGTCTCGATACTGGTTGTTTC
GTTGTTGAGCGACGAGCGGTCAGTCGGCGCCTACTCAGATATATGTCCTGGCCTCCAGGT
TCTCTTGGATGAAAGGTTGGCGTTTAGAATCTAGTTCTAGATTTGCAGGTTCGAGTTCGT
GGTTGTAGAGGCTGCTGGTGCTGGTTCTTGTGGGTTCTGTCGGTTCCGGTTTGGTCCTCT
CTTATCAGCTCGGTCTCCCTTTCCTGCTGGTTTGTGTTGTTTGCTTATGTGGTGGTCTCT
TCGTGTTCTGGAGGATGTGCTTATCCTTGGTCATTTGCGACGGCTGTTGTCCGTCTCGGT
TCGTGGTTTTTCCGGCTAGTGTCTCAAGGATTTGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTGTTC
ATGGAGGTTTG

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DS 

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CTAGCTTCATCTTGGTCCAGATCCGTCGCTCTCCGGTGTCGGACGCCTTTCGTCAGCATC
GGAGGGGCTCCTCTTGTTTTTGTTTCAGTCGTTTAGATTATATAGGAACTGCTTTTGTCG
GATCTGGAGGTTTGTTTATAGATCGGTTTTTATGGCGATGCTCTGTCTTACAGATTCTTG
CTCGTCTGAGCCAGGAGGAGGTCTCGATACTGGTTGTTTCGTTGTTGAGCGACGAGCGGT
CAGTCGGCGCCTACTCAGATATATGTCCTGGCCTCCAGGTTCTCTTGGATGAAAGGTTGG
CGTTTGGAATCTAGTTCTAGATTTGCAGGTTCGAGTTCGTGGTTGTAGAGGCTGCTGGTG
CTGGTTCTTGTGGGTTCTGTCGGCTCTGGTTTGGTCCTCTCTTATCAGCTCGGTCTCCCT
TTCCTGCTGGTTTGTGTTGTTTGCTTATGTGGTGGTCTCTTCGTGTTCTGGAGGATGTGC
TTATCCTTGGTCATTTGCGACGGCTGTTGTCCGTCTCGGTTCGTGGTTTTTCCGGCTAGT
GTCTCAAGGATTTGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAAT
GGTTAGTCTT

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DS 

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GG
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TCCGTCGCTCTCCGGTGTCGGACGCCTTTCGTCAGCATCGGAGGGGCTCCTCTTGTTTTT
GTTTCAGTCGTTTAGATTATATAGGAACTGCTTTTGTCGGATCTGGAGGTTTGTTTATAG
ATCGGTTTTTATGGCGATGCTCTGTCTTACAGATTCTTGCTCGTCTGAGCCAGGAGGAGG
TCTCGATACTGGTTGTTTCGTTGTTGAGCGACGAGCGGTCAGTCGGCGCCTACTCAGATA
TATGTCCTGGCCTCCAGGTTCTCTTGGATGAAAGGTTGGCGTTTGGAATCTAGTTCTAGA
CTTGCAGGTTCGAGTTCGTGGTTGTAGAGGCTACTGGTGCTGGTTCTTGTGGGTTCTGTC
GGTTCTGGTTTGGTCCTCTCTTATCAGCTCGGTCTCCCTTTCCTGCTGGTTTGTGTTGTT
TGCTTATGTGGTGGTCTCTTCGTGTTCTGGAGGATGTGCTTATCCTTGGTCATTTGCGAC
GGCTGTTGTCCGTCTCGGTTCGTGGTTTTTCCGGCTAGTGTCTCAAGGATTTGGGGCTTC
GGTCCTTCTGCACCTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAATGGTTAGTCTTCTTCCTCCTGG
GTTTGATTCTCTGTGGTTTCTCGTGGCTCGTCAAGGTGTGTCCGGAGGAGTATAAGAGTT
CCAGAGTCTCCCCTTTAATAAGTTTGTCTTTTGGTGTGCGCTTATCCTATCCTCCTCTCC
TCGTTGACTCTGCTTTCTTAAGCTCTTATTT

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DS 

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TATAGATCGGTTTTTATGGCGATGCTCTGTCTTACAGATTCTTGCTCGTCTGAGCCAGGA
GGAGGTCTCGATACTGGTTGTTTCGTTGTTGAGCGACGAGCGGTCAGTCGGCGCCTACTC
AGATATATGTCCTGGCCTCCAGGTTCTCTTGGATGAAAGGTTGGCGTTTGGAATCTAGTT
CTAGATTTGCAGGTTCGAGTTCGTGGTTGTAGAGGCTGCTGGTGCTGGTTCTTGTGGGTT
CTGTCGGTTCTGGTTTGGTCCTCTCTTATCAGCTCGGTCTCCCTTTCCTGCTGGTTTGTG
TTGTTTGCTTATGTGGTGGTCTCTTCGTGTTCTGGAGGATGTGCTTATCCTTGGTCATTT
GCGACGGCTGTTGTCCGTCTCGGTTCGTGGTTTTTCCGGCTAGTGTCTCAAGGATTTGGG
GCTTCGGTCCTTCTGCACCTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAATGGTTAGTCTTCTTCCT
CCTGGGTTTGATCCTCTGTGGTTTCTCGTGGCTCGTCAAGGTGTGTCCGGAGGAGTATAA
GAGTTCCAGAGTCTCCCCTTTAATAAGTTTGTCTTTTGGTGTGCGCTTATCCTATCCTCC
TCTCCTCGTTGACTCTGCTTTCTTAAGCTCTTATTTTAATTGTTTCTAGATTCCTATCAG
TTCATACTTTTATCC

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DS 

RD RR4D773JQ 492 0 0
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CTCGGTTCGTGGTTTTTCCGGCTAGTGTCTCAAGGATTTGGGGCTTCGGTCCTTCTGCAC
CTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAATGGTTAGTCTTCTTCCTCCTGGGTTTGATCCTCTG
TGGTTTCTCGTGGCTCGTCAAGGTGTGTCCGGAGGAGTATAAGAGTTCCAGAGTCTCCCC
TTTAATAAGTTTGTCTTTTGGTGTGCGCTTATCCTATCCTCCTCTCCTCGTTGACTCTGC
TTTCTTAAGCTCTTATTTTAATTGTTTCTAGATTCCTATCAGTTCATACTTTTATCCAGT
TGTGTTCATAGCTTATGTTTGGCTCCAAAGATCTCTTGTAGTTCTGTCGGCTTTTGGCTC
CAGAGGACTCTTATGTTCCTGCTGGCTTTCTGTATTTCATAAATATGCATTCCCCCCCTG
TATTTTCTTCAA

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DS 

RD RR4GD18JQ 781 0 0
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CGCCTACTCAGATATATGTCCTGGCCTCCAGGTTCTCTTGGATGAAAGGTTGGCGTTTGG
AATCTAGTTCTAGATTTGCAGGTTCGAGTTCGTGGTTGTAGAGGCTGCTGGTGCTGGTTC
TTGTGGGTTCTGTCGGTTCTGGTTTGGTCCTCTCTTATCAGCTCGGTCTCCCTTTCCTGC
TGGTTTGTGTTGTTTGCTTATGTGGTGGTCTCTTCGTGTTCTGGAGGATGTGCTTATCCT
TGGTCATTTGCGACGGCTGTTGTCCGTCTCGGTTCGTGGCTTTTCCGGCTAGTGTCTCAA
GGATTTGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAATGGTTAGT
CTTCTTCCTCCTGGGTTTGATTCTCTGTGGTTTCTCGTGGCTCGTCAAGGTGTGTCCGGA
GGAGTATAAGAGTTCCAGAGTCTCCCCTTTAATAAGTTTGTCTTTTGGTGTGCGCTTATC
CTATCCTCCTCTCCTCGTTGACTCTGCTTTCTTAAGCTCTTATTTTAATTGTTTCTAGAT
TCCTATCAGTTCATACTTTTATCCAGTTGTGTTCATAGCTTATGTTTGGCTCCAAAGATC
TCTTGTAGTTCTGTTGGCTTTTGGCTCCAGAGGACTCTTATGTTCCTGCTGGCTTTCTGT
ATTTCATAAATATGCATTCCACCCCTGTATTTTCTTCAAGTTAATGGAAATTTCAGTGTG
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4C495TF 488 0 0
GG
ATCCTTGGTCATTTGCGACGGCTGTTGTCCGTCTCGGTTCGTGGTTTTTCCGGCTAGTGT
CTCAAGGATTTGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTGTTCATGGAGGTTTGTAAGTTAATGG
TTAGTCTTCTTCCTCCTGGGTTTGATTCTCTGTGGTTTCTCGTGGCTCGTCAAGGTGTGT
CCGGAGGAGTATAAGAGTTCCAGAGTCTCCCCTTTAATAAGTTTGTCTTTTGGTGTGCGC
TTATCCTATCCTCCTCTCCTCGTTGACTCTGCTTTCTTAAGCTCTTATTTTAATTGTTTC
TAGATTCCTATCAGTTCATACTTTTATCCAGTTGTGTTCATAGCTTATGTTTGGCTCCAA
AGATCTCTTGTAGTTCTGTTGGCTTTTGGCTCCAGAGGACTCTTATGTTCCTGCTGGCTT
TCTGTATTTCATAAATATGCATTCCACCCCTGTATTTTCTTCAAGTTAATGGAAATTTCA
GTGTGG

QA 3 488 3 488
DS 



AS 1 8

CO CL698Contig1 676 8 12 U
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ACCACCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAA
CTCCTCGTAGTTTATCTGACCATCTCCATCAACATCAGCTTCACGGACCATCTCCTCAAC
TTCTTCATCAGTCAGTTTCTCACCTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGA
TATGAACCCGTTCTGGTCTTTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGA
GTCCGTGTCTTTCATCTTTTTAGCCATGAGGTTCAGGAACTCAGGGAAGTCAATGGTGCC
GTTGCCGTCCGCGTCCACTTCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTG
TCCTAGAGACCTCATCACTGTCCCCAGCTCCTTGGTGGTGATGCAACCATCGCCATCCTT
GTCGAAGAGGCTAAAAGCTTCCTTGAACTCGGAGATCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGC
CATTTCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTTCAGAGACGACGAAACGCTCTTTGTTTTATTG
GACGCTGTTGAAACCC


BQ
10 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BS88JQ U 1
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AF RR4BF09JQ U 20
AF RR4BF09TF C 20
AF RR4B263JQ U 2
AF RR4BS88TF C 1
AF RR4B039TF C 2
AF RR4B263TF C 5
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BS 645 676 RR4BS88TF

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ACCACCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAA
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GTCGAAGAGGCTAAAAGCTTCCTTGAACTCGGAGGTCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGC
CATTTCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTTCA
AAGA

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DS 

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AACTACTAAGCTCAACAGATCGATCTTTTTTGTTCTAGATAATAAAAGGTTATGTCACCA
CCACCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAAC
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ATGAACCCGTTCTGGTCTTTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGAG
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TTGCCGTCCGCGTCCACTTCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTGT
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ATTTCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTT

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DS 

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ATCGATCTTTTTTGTTCTAGATAATAAAAGGTTATGTCACCACCACCTTTTAGTTTCTTA
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TCACCTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGATATGAACCCGTTCTGGTCT
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TTAGCCATGAGGTTAAAGAACTCAGGGAAGTCAATGGTGCCGTTGCCGTCCGCGTCCACT
TCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTGTCCTAGAGACCTCATCAAT
GTCCCCAGCTCCTTGGTGGTGATGCAACCATCGCCATCCTTGTCGAAGAGGCTAAAAGCT
TCCTTGAACTCGGAGATCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGCCATTTCTTTTGGTTTCGGG
GTTCTC
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4BF09TF 608 0 0
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ATCGATCTTTTTTGTTCTAGATAATAAAAGGTTATGTCACCACCACCTTTTAGTTTCTTA
CCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAACTCCTCGTAGTTTATCTGA
CCATCTCCATCAACATCAGCTTCACGGACCGTCTCCTCAACTTCTTCATCAGTCAGTTTC
TCACCTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGATATGAACCCGTTCTGGTCT
TTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGAGTCCGTGTCTTTCATCTTT
TTAGCCATGAGGTTAAAGAACTCAGGGAAGTCAATGGTGCCGTTGCCGTCCGCGTCCACT
TCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTGTCCTAGAGACCTCATCAAT
GTCCCCAGCTCCTTGGTGGTGATGCAACCATCGCCATCCTTGTCGAAGAGGCTAAAAGCT
TCCTTGAACTCGGAGATCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGCCATTTCTTTTGGTTTCGGG
GTTCTC
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4B263JQ 629 0 0
GAAAAAAACCCACAAAATAAAAAGATATTGGTTAACAACAAAGTTTGTTAAAACTTTGAA
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CCACCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAAC
TCCTCGTAGTTTATCTGACCATCTCCATCAACATCAGCTTCACGGACCATCTCCTCAACT
TCTTCATCAGTCAGTTTCTCACCTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGAT
ATGAACCCGTTCTGGTCTTTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGAG
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TTGCCGTCCGCGTCCACTTCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTGT
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ATTTCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTTC

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DS 

RD RR4BS88TF 676 0 0
C
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AACTACTAAGCTCAACAGATCGATCTTTTTTGTTCTAGATAATAAAAGGTTATGTCACCA
CCACCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAAC
TCCTCGTAGTTTATCTGACCATCTCCATCAACATCAGCTTCACGGACCATCTCCTCAACT
TCTTCATCAGTCAGTTTCTCAACTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGAT
ATGAACCCGTTCTGGTCTTTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGAG
TCCGTGTCTTTCATCTTTTTAGCCATGAGGTTCAGGAACTCAGGGAAGTCAATGGTGCCG
TTGCCGTCCGCGTCCACTTCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCGGCTTCTGTTGGGTTCTGT
CCTAGAGACCTCATCACTGTCCCCAGCTCCTTGGTGGTGATGCAACCATCGCCATCCTTG
TCGAAGAGGCTAAAAGCTTCCTTGAACTCGGAGGTCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGCC
ATTTCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTTCAGAGACGACGAAATGCTCTTTGTTTTATTGG
ACGCTGTTGAAACCC

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4B039TF 675 0 0
GAAAAAAACCCACAAAATAAAAAGATATTGGTTAACAACAAAGTTTGTTAAAACTTTGAA
AACTACTAAGCTCAACAGATCGATCTTTTTTGTTCTAGATAATAAAAGGTTATGTCACCA
CCACCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAAC
TCCTCGTAGTTTATCTGACCATCTCCATCAACATCAGCTTCACGGACCATCTCCTCAACT
TCTTCATCAGTCAGTTTCTCACCTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGAT
ATGAACCCGTTCTGGTCTTTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGAG
TCCGTGTCTTTCATCTTTTTAGCCATGAGGTTCAGGAACTCAGGGAAGTCAATGGTGCCG
TTGCCGTCCGCGTCCACTTCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTGT
CCTAGAGACCTCATCACTGTCCCCAGCTCCTTGGTGGTGATGCAACCATCGCCATCCTTG
TCGAAGAGGCTAAAAGCTTCCTTGAACTCGGAGATCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGCC
ATTTCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTTCAGAGACGACGAAACGCTCTTTGTTTTATTGG
ACGCTGTTGAAACCC

QA 1 675 1 675
DS 

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AAAAACCCACAAAATAAAAAGATATTGGTTAACAACAAAGTTTGTTAAAACTTTGAAAAC
TACTAAGCTCAACAGATCGATCTTTTTTGTTCTAGATAATAAAAGGTTATGTCACCACCA
CCTTTTAGTTTCTTACCTTACCATATACATCACTTAGCCATCATAATCTTGACAAACTCC
TCGTAGTTTATCTGACCATCTCCATCAACATCAGCTTCACGGACCATCTCCTCAACTTCT
TCATCAGTCAGTTTCTCACCTAGATTCGTCATGACATGGCGGAGCTCTGCAGCGGATATG
AACCCGTTCTGGTCTTTGTCGAACACCCTGAAAGCTTCTTTGAGCTCTTCCTCCGAGTCC
GTGTCTTTCATCTTTTTAGCCATGAGGTTCAGGAACTCAGGGAAGTCAATGGTGCCGTTG
CCGTCCGCGTCCACTTCGTTGATCATGTCCTGGAGCTCAGCTTCTGTTGGGTTCTGTCCT
AGAGACCTCATCACTGTCCCCAGCTCCTTGGTGGTGATGCAACCATCGCCATCCTTGTCG
AAGAGGCTAAAAGCTTCCTTGAACTCGGAGATCTGTTCGTCCGTTAGCTGATCCGCCATT
TCTTTTGGTTTCGGGGTTCTCGCTTCAGAGACGACGAAACGCTCTTTGTTTTATTGGACG
CTGTTGAAACCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 8

CO CL699Contig1 670 8 4 U
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ATATTTTAAGGGATTTAGAACAAAGTCCCAAAGGAGTGGCATAGCATTACAACATTAGGA
ATAAAATAGATAGAACAAGAAACACAAAACCAACAGTTGGATCAAAGGGAAATATAAATA
TCATCGAAAACTTTAATTATAAAATGGAACCGATAATATTAAAACGATTGGGATGTTTTC
AAGGGCATTTTGGTCCACCTTGTTGAGTTTTCCAGTTGTTGTAGCAAGAGCAAACTTGTT
TGTTCCCATAGTAACCCGGAGGCACACACAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAGAATA
AAATGCACGCGTTGTGGTACTGTGTTTGGCTACACCTCCTATCGCACTCCTTCGGGCATT
GGGAACGTTTTAGGCTTCCTGGTCCATAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCT
TTGAGGCCATAACCATGGTTTGGAGCAAGGAGAAGACAACGAGGGCCAAGAGGAAGAGAG
CTCCATATGACTTAGCCATTTTTGTCTTCTTAAAGAACCAAACACTCCTCTAGATCTACT
CAAACTAGTTTGGTTTCTTTTTGTTTGAGTTTCTAAAAGATGAGTACTGAGAGAGAAGTA
TTGGTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RR4E068JQ U 25
AF RR4DY75JQ U 29
AF RR4DZ27JQ U 25
AF RR4E068TF C 1
AF RR4FO81JQ U 25
AF RR4FO81TF C 25
AF RR4DY75TF C 18
AF RR4DZ27TF C 27
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BS 667 670 RR4DY75TF

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GAGTTTTCCAGTTGTTGTAGCAAGAGCAAACTTGTTTGTTCCCATAGTAACCCGGAGGCA
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CATAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCTTTGAGGCCATAACCATGGTTTGGA
GCAAGGAGAAGA

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4DY75JQ 488 0 0
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ACCGATAATATTAAAACGATTGGGATGTTTTCAAGGGCATTTTGGTCCACCTTGTTGAGT
TTTCCAGTTGTTGTAGCAAGAGCAAACTTGTTTGTTCCCATAGTAACCCGGAGGCACACA
CAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAAAATAAAATGCACGCGTTGTGGTACTGTGTTTG
GCTACACCTCCTATCGCACTCCTTCGGGCATTGGGAACGTTTTAGGCTTCCTGGTCCATA
ACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCTTTGAGGCCATAACCATGGTTTGGAGCAA
GGAGAAGA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4DZ27JQ 614 0 0
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TTGAGTTTCTAAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4E068TF 670 0 0
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TCATCGAAAACTTTAATTATAAAATGGAACCGATAATATTAAAACGATTGGGATGTTTTC
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TGTTCCCATAGTAACCCGGAGGCACACACAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAGAATA
AAATGCACGCGTTGTGGTACTGTGTTTGGCTACACCTCCTATCGCACTCCTTCGGGCATT
GGGAACGTTTTAGGCTTCCTGGTCCATAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCT
TTGAGGCCATAACCATGGTTTGGAGCAAGGAGAAGACAACGAGGGCCAAGAGGAAGAGAG
CTCCATATGACTTAGCCATTTTTGTCTTCTTAAAGAACCAAACACTCCTCTAGATCTACT
CAAACTAGTTTGGTTTCTTTTTGTTTGAGTTTCTAAAAGATGAGTACTGAGAGAGGAGTA
TTGGTT
CTCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4FO81JQ 642 0 0
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CACACAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAGAATAAAGTGCACGCGTTGTGGTACTGTG
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CATAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCTTTGAGGCCATAACCATGGTTTGGA
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QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4FO81TF 644 0 0
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CACACAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAGAATAAAGTGCACGCGTTGTGGTACTGTG
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CATAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCTTTGAGGCCATAACCATGGTTTGGA
GCAAGGAGAAGACAACGAGGGCCAAGAGGAAGAGAGCTCCATATGACTTAGCCATTTTTG
TCTTCTTAAAGAACCAAACACTCCTCTAGATCTACTCAAACTAGTTTGGTTTCTTTTTGT
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CC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4DY75TF 653 0 0
TTTTTTT
ATTTATGAAAATATCATTCATTTATAGGCCACTCTCATATTTTAAGGGATTTAGAACAAA
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CAAAACCAACAGTTGAATCAAAGGGAAATATAAATATCATCGAAAACTTTAATTATAAAA
TGGAACCGATAATATTAAAACGATTGGGATGTTTTCAAGGGCATTTTGGTCCACCTTGTT
GAGTTTTCCAGTTGTTGTAGCAAGAGCAAACTTGTTTGTTCCCATAGTAACCCGGAGGCA
CACACAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAGAATAAAATGCACGCGTTGTGGTACTGTG
TTTGGCTACACCTCCTATCGCACTCCTTCGGGCATTGGGAACGTTTTAGGCTTCCTGGTC
CATAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCTTTGAGGCCATAACCATGGTTTGGA
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TCTTCTTAAAGAACCAAACACTCCTCTAGATCTACTCAAACTAGTTTGGTTTCTTTTTGT
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QA 8 653 8 653
DS 

RD RR4DZ27TF 644 0 0
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AAACCAACAGTTGGATCAAAGGGAAATATAAATATCATCGAAAACTTTAATTATAAAATG
GAACCGATAATATTAAAACGATTGGGATGTTTTCAAGGGCATTTTGGTCCACCTTGTTGA
GTTTTCCAGTTGTTGTAGCAAGAGCAAACTTGTTTGTTCCCATAGTAACCCGGAGGCACA
CACAAACATTTTCTGCAGCATTTGTTGCAGAATAAAATGCACGCGTTGTGGTACTGTGTT
TGGCTACACCTCCTATCGCACTCCTTCGGGCATTGGGAACGTTTTAGGCTTCCTGGTCCA
TAACGTTTTGGGTTCCAATTCCCTCCAGATCCCTTTGAGGCCATAACCATGGTTTGGAGC
AAGGAGAAGACAACGAGGGCCAAGAGGAAGAGAGCTCCATATGACTTAGCCATTTTTGTC
TTCTTAAAGAACCAAACACTCCTCTAGATCTACTCAAACTAGTTTGGTTTCTTTTTGTTT
GAGTTTCTAAAAGATGAGTACTGAGAGAGGAGTATTGGTT
CTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 8

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TGTCCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGG
AACTGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGG
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GCTGAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGG
TGGGGCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGA
AGGAAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAAC
ATGTTACGTCGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTG
CTAGTTGAGGACAAAGACAATAATTAATGTTAATGTTGCAGTTCAAAAT


BQ
30 30 30 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4FO49JQ C 1
AF RR4D772TF U 17
AF RR4DX93JQ C 8
AF RR4DX93TF U 8
AF RR4FO49TF U 1
AF RR4G417JQ C 1
AF RR4G417TF U 1
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BS 1 9 RR4FO49TF
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RD RR4FO49JQ 644 0 0
GGAGATCCAGAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGATCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATC
CGCCATGAAAGCTGCTGGACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAA
GAAGTCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGA
TGTCCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGG
AACTGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGG
TCAAGTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAA
GCTGAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGG
TGGGGCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGA
AGGAAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAAC
ATGTTACGTCGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTG
CTAGTTGAGGACAAAGACAATAATTAATGTTAATGTTGCAGTTC

QA 1 644 1 644
DS 

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GG
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ACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAAGAAGTCAGCTGATGTGAC
AGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGATGTCCAGGCTCACAAAGG
GGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGGAACTGTGTTTGATTCAAG
TTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGGTCAAGTCATTCCAGGATG
GGACCAGGTTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCTGAAAATCCCTTCCAA
GCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGGTGGGGCGACATTGATATT
CGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGGAAAAACAAAGAGCGA
GCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACATGTTACGTCGTCAGCAT
TTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTGCTAGTTGAGGACAAAGAC
AATA

QA 3 606 3 606
DS 

RD RR4DX93JQ 624 0 0
GG
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AGCTTCTGGACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAAGAAGTCAGC
TGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGATGTCCAGGC
TCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGGAACTGTGTT
TGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGGTCAAGTCAT
TCCAGGATGGGACCAGGGTTTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCTGAAAAT
CCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGGTGGGGCGAC
ATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGGAAAAAC
AAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATTTTTTTTTTAATTTCCTTATGAAACATGTTACGT
CGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTGCTAGTTGAG
GACAAAGACAATAATTAATGTT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR4DX93TF 622 0 0
GG
GAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGATCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATCCGCCATGAA
AGCTTCTGGACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAAGAAGTCAGC
TGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGATGTCCAGGC
TCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGGAACTGTGTT
TGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGGTCAAGTCAT
TCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCTGAAAAT
CCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGGTGGGGCGAC
ATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGGAAAAAC
AAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACATGTTACGT
CGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTGCTAGTTGAG
GACAAAGACAATAATTAATG

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR4FO49TF 623 0 0
GGAGATCCAGAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGATCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATC
CGCCATGAAAGCTGCTGGACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAA
GAAGTCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGA
TGTCCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGG
AACTGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGG
TCAAGTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAA
GCTGAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGG
TGGGGCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGA
AGGAAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAAC
ATGTTACGTCGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTG
CTAGTTGAGGACAAAGACAATAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4G417JQ 644 0 0
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GAAGTCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGA
TGTCCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGG
AACTGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGG
TCAAGTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAA
GCTGAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGG
TGGGGCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGA
AGGAAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAAC
ATGTTACGTCGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTG
CTAGTTGAGGACAAAGACAATAATTAATGTTAATGTTGCAGTTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4G417TF 644 0 0
GGAGATCCAGAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGATCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATC
CGCCATGAAAGCTGCTGGACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAA
GAAGTCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGA
TGTCCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGG
AACTGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGG
TCAAGTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAA
GCTGAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGG
TGGGGCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGA
AGGAAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAAC
ATGTTACGTCGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTG
CTAGTTGAGGACAAAGACAATAATTAATGTTAATGTTGCAGTTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4H127TF 648 0 0
GG
GATCCAGAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGATCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATCCGC
CATGAAAGCTGCTGGACTTTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAAGAA
GTCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGATGT
CCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGGGGAAAGTTAACAGATGGAAC
TGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGATAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGGTCA
AGTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCT
GAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGACAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGGTGG
GGCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGG
AAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACATG
TTACGTCGTCAGCATTTGAATATCAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTGCTA
GTTGAGGACAAAGACAATAATTAATGT*AATGTTGCAGTTCAAAAT

QA 3 648 3 648
DS 



AS 1 8

CO CL701Contig1 439 8 1 U
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GTGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTG
GATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTAAATCACA
TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGCGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATAGAC
TTTTGTGATTGTTATTATT


BQ
35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 

AF RR4GG22JQ C 2
AF RR4B752JQ C 1
AF RR4DV64JQ C 1
AF RR4B752TF U 1
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AF RR4DG08TF U 1
AF RR4DV64TF U 1
BS 1 439 RR4B752TF

RD RR4GG22JQ 350 0 0
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GCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTTTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGA
ATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTTTTTTAGCCTTGACTTTT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4B752JQ 439 0 0
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AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTTTTTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
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TTTTGTGATTGTTATTATT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4DV64JQ 439 0 0
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TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGCGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTTTTTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATAGAC
TTTTGTGATTGTTATTATT

QA 1 439 1 439
DS 

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AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
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TTTTGTGATTGTTATTATT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4D663TF 311 0 0
G
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AACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTAAATCACATGCGT
GCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTCAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAA
AGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGTGTTTG
GTGTTTATTGTGTAATGTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATAGACTTTTG
TGATTGTTAT

QA 2 311 2 311
DS 

RD RR4GG22TF 424 0 0
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AAGAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATG
TGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTGG
ATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTAAATCACAT
GCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTTTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGA
ATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGACTTTTTCTCTATGTG
TTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATAGACT
TTTG

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4DG08TF 436 0 0
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GTGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTG
GATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTAAATCACA
TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAA*TATCTATAGAC
TTTTGTGATTGTTATT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4DV64TF 439 0 0
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AAATAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTTGATGCGGTTCCGCTTGCAAAT
GTGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTG
GATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTAAATCACA
TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGCGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATAGAC
TTTTGTGATTGTTATTATT

QA 1 439 1 439
DS 



AS 1 8

CO CL702Contig1 1004 8 10 U
ACTTTAAAACAAAGTCTTTCGTTTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCGGG
CATGAGGAAAAAATACAGATGCATAAACAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAAGA
GAACATAAAAGAATCACAACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACA
AACCGGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATCCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACA
ACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGTGCATCGAGTG
TGTTCTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGA
GACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAA
CCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCATCATCAAGAATAG
ATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACC
TTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGC
TGACGTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCG
CTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAA
CATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGA
CTAACTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCT
TCTCCTCAGCCTCTTGGCGGATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGACTCGACACGTCGG
CATCGTTCATCTTTGCCGGAGATCGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTTCGAGAAAT
CTGTGGCGCAGAGGGAGATTGGAGAGAGGGACGACGTAGATCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ55JQ U 1
AF RR4H450JQB U 1
AF RR4G633JQ U 29
AF RR4DZ37JQ U 37
AF RR4GZ55TF C 197
AF RR4H450TF C 426
AF RR4DZ37TF C 206
AF RR4G633TF C 509
BS 1 137 RR4GZ55JQ
BS 138 138 RR4G633JQ
BS 139 278 RR4GZ55JQ
BS 279 279 RR4G633JQ
BS 280 592 RR4GZ55JQ
BS 593 776 RR4H450JQB
BS 777 804 RR4G633JQ
BS 805 820 RR4DZ37JQ
BS 821 997 RR4GZ55TF
BS 998 1004 RR4DZ37TF

RD RR4GZ55JQ 592 0 0
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GAACATAAAAGAATCACGACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACA
AACCGGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATCCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACA
ACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCGCATCAAGACGTGCATCGAGTG
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GACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAA
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TTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4H450JQB 776 0 0
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CATGAGGAAAAAATACAGATGCATAAACAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAAGA
GAACATAAAAGAATCACGACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACA
AACCGGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATCCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACA
ACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCGCATCAAGACGTGCATCGAGTG
TGTTCTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGA
GACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAA
CCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCATCATCAAGAATAG
ATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACGCAACAACACAAAAGGCTCTTTCAACC
TTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGC
TGACGTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCG
CTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAA
CATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCC

QA 1 776 1 776
DS 

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AC
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AGAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAAGAGAACATAAAAGAATCACAACAAATAGAAAT
CTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACCGGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTT
TCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATAC
GGAATGCCACATCAAGACGTGCATCGAGTGTGTTCTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAG
AAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAG
GGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACCAG
CATACTCCTCCTTTGCATCATCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGC
AACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAA
GAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGT
CTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTA
ACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGT
CTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGACTAACTGCAGCTTCTCGATGTTGA
TT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR4DZ37JQ 784 0 0
CTATAGCCAATGATAACACTCGGGCATGAGGAAAAAATACAGATGCATAAACAAAGAGTT
CGATGGGTTTTATGGCATGAAAGAGAACATAAAAGAATCACAACAAATAGAAATCTTTCC
CAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACCGGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATTC
ATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATG
CCACATCAAGACGTGCATCGAGTGTGTTCTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCA
ACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAA
GGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACT
CCTCCTTTGCATCATCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACGCA
ACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCT
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TAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAACTGCA
TCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCC
TGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGACTAACTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAG
CGGA

QA 1 784 1 784
DS 

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TTCTCTGTCTCTTTTCATCCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGAC*TGCGGATCAC
TGGAAGTTTCATACGGAATGCCGCATCAAGACGTGCATCGAGTGTGTTCTCGCACACGAT
TTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCATGAGAATCACT
AGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTGGAGCATGAAC
ATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCATCATCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAA
ATCCTCTTCGCGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAACACTGGAC
AATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGATC
CTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTGAT
CCTTGACGCATTTAACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTC
CTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGACTAACTGCAGCTTCTC
GATGTTGAACTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCTCAGCCTCTTG
GCGGATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGACTCGACACGTCGGCATCGTTCATCTTTGC
CGGAGATCGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTTCGAGAAATCTGTGGCGCAGAGGGA
GATTGGAGAGAGGGACGACGT
CC

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DS 

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ACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGC
AAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACG
TTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGA
AGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCG
GCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGACTAAC
TGCAGCTTCTCGATGTTGAACTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCC
TCAGCCTCTTGGCGGATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGACTCGACACGTCGGCATCG
TTCATCTTTGCCGGAGATCGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTTCGAGAAATCTGTG
GCGCAGAGGGAGATTGGAGAGAGGGACGACGT
CC

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DS 

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TCTCTTTCAT
CATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACA*CGAC*TGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAAT
GCCACATCAAGACGTGCATCGAGTGTGTTCTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCC
AACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGA
AGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATAC
TCCTCCTTTGCATCATCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACGC
AACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGC
TGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTC
ATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAACTGC
ATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGC
CTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGACTAACTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCA
GCGGAGACGGAAATCTCGTTTGCCTTCTCCTCAGCCTCTTGGCGGATGAATCTCACCATC
TGCTGGATCTGACTCGACACGTCGGCATCGTTCATCTTTGCCGGAGATCGTTGACGATCG
GAGGTTTGGAGAGATTTCGAGAAATCTGTGGCGCAGAGGGAGATTGGAGAGAGGGACGAC
GTAGATCCC

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DS 

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AAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTG
GTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATT
TAACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATA
GTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCGACTAACTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTC
TTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCTCAGCCTCTTGGCGGATGAATCT
CACCATCTGCTGGATCTGACTCGACACGTCGGCGTCGTTCATCTTTGCCGGAGATCGTTG
ACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTTCGAGAAATCTGTGGCGC
CC

QA 1 461 1 461
DS 



AS 2 8

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TATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGA
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CAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTT**CTTCTTGTTACTGGATTA
GTAATTGTTCTCTTGAATCGTGTTTGGTTGTTGCTATAAAGACAGTTCCTGGATTGATAT
TTGTTCTGTCCTTTTTTGGGTTTTCAAAGTTTATTGTGTGAAAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EE85JQ C 27
AF RR4EE85TF U 1
AF RR4AY85TF U 1
AF RR4GQ19JQ C 1
AF RR4GQ19TF U 1
AF RR4AY85JQ C 46
BS 1 109 RR4AY85TF
BS 110 110 RR4EE85TF
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RD RR4EE85JQ 386 0 0
TTT
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GAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCATTATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGG
AGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCC
CCTTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAAGAACACAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTC
TTTTTTTTTTT**CTTCTTGTTACTGGATTAGTAATTGTTCTCTTGAATCGTGTTTGGTT
GTTGCTATAAAGACAGTTCCTGG

QA 4 386 4 386
DS 

RD RR4EE85TF 412 0 0
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CAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTT**CTTCTTGTTACTGGATTA
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QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4AY85TF 464 0 0
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TATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGA
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CAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTTTCCTTCTTGTTACTGGATTA
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TTGTTCTGTCTTTTTTTGGGTTTTCAAAGTTTATTGTGTGAAAC

QA 1 464 1 464
DS 

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TATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCCTTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAAGAACA
CAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTC**CTTCTTGTTACTGGATTA
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TTGTTCTGTCC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4GQ19TF 431 0 0
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CGTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATACCGTGGTGGTGAAAGTGATGGGACGTAC
GGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCAT
TATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCCTTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAAGAACA
CAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTC**CTTCTTGTTACTGGATTA
GTAATTGTTCTCTTGAATCGTGTTTGGTTGTTGCTATAAAGACAGTTCCTGGATTGATAT
TTGTTCTGTCC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4AY85JQ 419 0 0
TAAGCTCTTCACCTTCGTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCCGTGGTGGTGAA
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CTCTGATCGTTTCATTATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCAC
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GTGGAAGCAAGAACACAGAACCAAATGTTTGCTTAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTTTCCTT
CTTGTTACTGGATTAGTAATTGTTCTCTTGAATCGTGTTTGGTTGTTGCTATAAAGACAG
TTCCTGGATTGATATTTGTTCTGTCTTTTTTTGGGTTTTCAAAGTTTATTGTGTGAAAC

QA 1 419 1 419
DS 



CO CL703Contig2 428 2 1 U
GGATCTCTGGAAATTAGGGCTCTTGCTTCTTCGCTTTGCCGCCGCTAAGCTCTTCACCTT
CGTCTACAGAATGTATTCTCAGATTAAGCATGCCGTGGCGGTGAAAGTGATGGGACGTAC
GGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTGCGAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCAT
TATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCTTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAAGAACAC
AGAACCAAATGTCCGCTTAGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTTGTTATTGGATTAG
TGATTATGCACTCGGTTGTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCTTGGATTGATATTTG
TTCCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CA67TF U 1
AF RR4CA67JQ C 27
BS 1 428 RR4CA67TF

RD RR4CA67TF 428 0 0
GGATCTCTGGAAATTAGGGCTCTTGCTTCTTCGCTTTGCCGCCGCTAAGCTCTTCACCTT
CGTCTACAGAATGTATTCTCAGATTAAGCATGCCGTGGCGGTGAAAGTGATGGGACGTAC
GGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTGCGAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCAT
TATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGGAGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCTTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAAGAACAC
AGAACCAAATGTCCGCTTAGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTTGTTATTGGATTAG
TGATTATGCACTCGGTTGTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCTTGGATTGATATTTG
TTCCGTCC

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4CA67JQ 402 0 0
TTT
TTCGCTTTGCCGCCGCTAAGCTCTTCACCTTCGTTTACAGAATGTATTTTCAGATTAAGC
ATGCCGTGGCGGTGAAAGTGATGGGACGTACGGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTGC
GAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCATTATGCGCAATGTTAAAGGACCTGTGAGGG
AGGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCC
CTTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAAGAACACAGAACCAAATGTCCGCTTAGTTTTCTTTT
TTTTTTTTTTTTGTTCTTGTTATTGGATTAGTGATTATGCACTCGGTTGTGTTTGGTTGT
TGCTATAAGACAATTCTTGGATTGATATTTGTTCCGTCC

QA 4 402 4 402
DS 



AS 1 8

CO CL704Contig1 446 8 5 U
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACCAAGCTTTTTGGTGCC


BQ
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4B618JQ C 1
AF RR4CB24TF U 1
AF RR4GI14JQ C 1
AF RR4GI14TF U 1
AF RR4FB30JQ C 1
AF RR4G467TF U 1
AF RR4FB30TF U 1
AF RR4B618TF U 1
BS 1 60 RR4CB24TF
BS 61 62 RR4GI14TF
BS 63 247 RR4CB24TF
BS 248 248 RR4GI14TF
BS 249 446 RR4CB24TF

RD RR4B618JQ 446 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCT***CAGATCGATTTTTTAAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACCAAGCTTTTTGGTGCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4CB24TF 446 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
**ATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCATGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACCAAGCTTTTTGGTGCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4GI14JQ 433 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACCA
G

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4GI14TF 433 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACCA
G

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4FB30JQ 431 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4G467TF 428 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATA
TTT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4FB30TF 431 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCTTCTCAGATCGATTTTT*AAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4B618TF 446 0 0
TCTCTTTCTCTCTCGCTACACAGACTCTTCTTCT***CAGATCGATTTTTTAAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTCGTCACTGAGCTATACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACGAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCTTCTGTTCAGCTTAACATTGGCCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGGTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATACTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGT
TATGTTTCATTTGAATTCTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAA
AGATAATTACCAAGCTTTTTGGTGCC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 8

CO CL705Contig1 1274 8 19 U
AAATTATAATTCAAGTTGAAACATTTTGGGTACATGGAAGCTCTGTACTACATAGTTATA
TAGCAAATAAATGCAAACCCATGCATCACATACATTTCTGTGTACCTCATGAAGTGTGTC
CCTCTTTATTTCATAAACAAGGCAAAAGCCAAAAGTTGTAGAACATGTGAAGTAGTCTTT
AATCAATCATTTCATTGTCCACAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCT
TCAATAGATCCATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAACTTAACCATT
GAAGGGTTTTCCTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGG
TGAATCGATGCTACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAGATAGAGAGTG
CGTTGGACAGAAGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAAA
ACTTTCTTTACTTCCATGAACTTCTCACTGAAGTAGAGTTCCTTTTTCGGAATGCTTGCA
ACAGACTCGTACGAATACCTCCAAGATGCATTCACCTCTGTAGCAAGCATTCTCTCTCGA
GTATCAGGGAGAATGGTGTACATGTCTCTCACAAACTTCTCAAATCCTGACTGGGTTGTC
TTAAGCAGAGCTAGTCCTGAAACACCGGAAGTTAAAGTTAGTGCACCAGACTTATGTACT
GTAGCCTCCACAGTATGGTTCTCTGACCCAAGCTTGAAACCATGTAAATGGGGTTTTCCA
TCGATGCATACACGCTCCCATGGCTTATCAATGATATTAACAATAGCAGTGTAAACCTGT
GGATAAAAGGAGCAAAAGTGATTCCCTAAAAGTATTGCAAATTCCTCAACAGAGAGACGA
TCTCCACACTCTTTA*CCTTGACATAAACGGTGTTTTTCATGGTATCGGTGGCGACGATG
TCGGAGTTATCGTCACGGTGGTAAGAAGAGAGGCAGTGAGAGAGAAGACTGATGCTAACG
TTCCATTCGACAAAGTGATGAGATCCATCCAAGCCTTGACGCCAAACTCTCCCAACTCTA
ACTCTAGCCTTTCCATGTCTTTGATCTACTCTCAACCCTTCTTGTGCCATTAAAATTTGA
ACAGATAGTACGATTACTTAGAGAATCAAAAGGTTACAGTTTCTGAGATTCCTGGGAGAT
TAGTTGGATTGGTGGGGGCAAGAGAGATGAATAATAGAGGACAGGTATGATTATGAATAA
TAGAAAGCGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A965TF C 12
AF RR4CM81JQ U 1
AF RR4C149JQ U 1
AF RR4A965JQ U 12
AF RR4AY49JQ U 6
AF RR4C149TF C 681
AF RR4CM81TF C 745
AF RR4AY49TF C 485
BS 1 97 RR4C149JQ
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BS 99 184 RR4C149JQ
BS 185 185 RR4A965JQ
BS 186 370 RR4C149JQ
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BS 372 621 RR4C149JQ
BS 622 622 RR4AY49JQ
BS 623 646 RR4C149JQ
BS 647 647 RR4A965JQ
BS 648 796 RR4C149JQ
BS 797 842 RR4AY49JQ
BS 843 914 RR4AY49TF
BS 915 916 RR4C149TF
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BS 1147 1147 RR4C149TF
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TCATTGTCCACAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCTTCAATAGATCC
ATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAACTTAACCATTGAAGGGTTTTC
CTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGGTGAATCGATGC
TACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAGATAGAGAGTGCGTTGGACAGA
AGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAA

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DS 

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AAATTA
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ATAAATGCAAACCCATGCATCACATACATTTTTGTGTACCTCATGAAGTGTGTCCCTCTT
TATTTCATAAACAAGGCAAAAGCCAAAAGTTGTAAAACATGTGAAGTAGTCTTTAATCCA
TCATTTCATTGTCCACAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCTTCAATA
GATCCATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAACTTAACCATTGAAGGG
TTTTCCTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGGTGAATC
GATGATACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAGATAGAGAGTGCGTTGG
ACAGAAGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAAAACTTTC
TTTACTTCCATGAACTTCTCACTGAAGTAGAGTTCCTTTTTCGGAATGCTTGCAACAGAC
TCGTACGAATACCTCCAAGATGCATTCACCTCTGTAGCAAGCATTCTCTCTCGAGTATCA
GGGAGAATGGTGTACTTGTCTCTCACAAACTTCTCAAATCATGACTGGGTTGTCTTAAGC
AGAGCTAGTCCTGAAACACCGGAAGTTAAAGTTAGTGCACCAGACTTATGTACTGTAGCC
TCCACAGTATGGTTCTCTGACCCAAGCTTGA

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DS 

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TAGCAAATAAATGCAAACCCATGCATCACATACATTTTTGTGTACCTCATGAAGTGTGTC
CCTCTTTATTTCATAAACAAGGCAAAAGCCAAAAGTTGTAGAACATGTGAAGTAGTCTTT
AATCCATCATTTCATTGTCCACAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCT
TCAATAGATCCATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAACTTAACCATT
GAAGGGTTTTCCTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGG
TGAATCGATGATACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAGATAGAGAGTG
CGTTGGACAGAAGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAAA
ACTTTCTTTACTTCCATGAACTTCTCACTGAAGTAGAGTTCCTTTTTCGGAATGCTTGCA
ACAGACTCGTACGAATACCTCCAAGATGCATTCACCTCTGTAGCAAGCATTCTCTCTCGA
GTATCAGGGAGAATGGTGTACTTGTCTCTCACAAACTTCTCAAATCATGACTGGGTTGTC
TTAAGCAGAGCTAGTCCTGAAACACCGGAAGTTAAAGTTAGTGCACCAGACTTATGTACT
GTAGCCTCCACAGTATGGTTCTCTGACCCAAGCTTGAAACCATGTAAATGGGGTTTTCCA
TCGATGCATACACGCT

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DS 

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TGCAAACCCATGCATCACATACATTTCTGTGTACCTCATGAAGTGTGTCCCTCTTTATTT
CATAAACAAGGCAAAAGCCAAAAGTTGTAGAACATGTGAAGTAGTCTTTAATCAATCATT
TCATTGTCCACAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCTTCAATAGATCC
ATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAACTTAACCATTGAAGGGTTTTC
CTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGGTGAATCGATGC
TACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAAATAGAGAGTGCGTTGGACAGA
AGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAAAACTTTCTTTAC
TTCCATGAACTTCTCACTGAAGTAGAGTTCCTTTTTCGGAATGCTTGCAACAGACTCGTA
CGAATACCTCCAAGATGCATTCACCTCTGTAGCAAGCATTCTCTCTCGAGTATCAGGGAG
AATGGTGTACTTGTCTCTCACAAACTTCTCAAATCCTGACTGGGTTGTCTTAAGCAGAGC
TAGTCCTGAAACACCGGAAGTTAAAGTTAGTGCACCAGACTTATGTACTGTAGCCTCCAC
AGTATGGTTCTCTGACCCAAGCTTGAAACCATGTAAATGGGGTTTTCCATCGAT
C

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AY49JQ 837 0 0
GTAATT
CAAGTTGAAACATTTTGGGTACATGGAAGCTCTGTACTACATAGTTATATAGCAAATAAA
TGCAAACCCATGCATCACATACATTTTTGTGTACCTCATGAAGTGTGTCCCTCTTTATTT
CATAAACAAGGCAAAAGCCAAAAGTTGTAGAACATGTGAAGTAGTCTTTAACCCATCATT
TCATTGTCCACAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCTTCAATAGATCC
ATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAACTTAACCATTGAAGGGTTTTC
CTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGGTGAATCGATGC
TACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAGATAGAGAGTGCGTTGGACAGA
AGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAGAACTTTCTTTAC
TTCCATGAACTTCTCACTGAAGTAGAGTTCCTTTTTCGGAATGCTTGCAACATACTCGTA
CGAATACCTCCAAGATGCATTCACCTCTGTAGCAAGCATTCTCTCTCGAGTATCAGGGAG
AATGGTGTACATGTCTCTCACAAACTTCTCAAATCCTGACTGGGTTGTCTTAAGCAGAGC
TAGTCCTGAAACACCGGAAGTTAAAGTTAGTGCACCAGACTTATGTACTGTAGCCTCCAC
AGTATGGTTCTCTGACCCAAGCTTGAAACCATGTAAATGGGGTTTTCCATCGATGCATAC
ACGCTCCCATGGCTTATCAATGATATTAACAATAGCAGTGTAAACCTGTGG

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DS 

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CTCTGACCCAAGCTTGAAACCATGTAAATGGGGTTTTCCATCGATGCATACACGCTCCCA
TGGCTTCTCAATGATATTAACAATAGCAGTGTAAACCTGTGGATAAAAGGAGCAAAAGTG
ATTCCCTAAAAGTATTGCAAATTCCTCAACAGAGAGACGATCTCCACACTCTTTA*CCTT
GACATAAACGGTGTTTTTCATGGTATCGGTGGCGACGATGTCGGAGTTATCGTCACGGTG
GTAAGAAGAGAGGCAGTGAGAGAGAAGACTGATGCTAACGTTCCATTCGACAAAGTGATG
AGATCCATCCAAGCCTTGACGCCAAACTCTCCCAACTCTAACTCTAGCCTTTCCATGTCT
TTGATCTACTCTCAACCCTTCTTGTGCCATTAAAATTTGAACAGATAGTACGATTACTTA
GAGAATCAAAAGGTTACAGTTTCTGAGATTCCTGGGAGATTAGTTGGATTGGTGGGGGCA
AGAGAGAT
CC

QA 1 548 1 548
DS 

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TTCTCAATGATATTAACAATAGCAGTGTAAACCTGTGGATAAAAGGAGCAAAAGTGATTC
CCTAAAAGTATTGCAAATTCCTCAACAGAGAGACGATCTCCACACTCTTTA*CCTTGACA
TAAACGGTGTTTTTCATGGTATCGGTGGCGACGATGTCGGAGTTATCGTCACGGTGGTAA
GAAGAGAGGCAGTGAGAGAGAAGACTGATGCTAACGTTCCATTCGACAAAGTGATGAGAT
CCATCCAAGCCTTGACGCCAAACTCTCCCAACTCTAACTCTAGCCTTTCCATGTCTTTGA
TCTACTCTCAACCCTTCTTGTGCCATTAAAATTTGAACAGATAGTACGATTACTTAGAGA
ATCAAAAGGTTACAGTTTCTGAGATTCCTGGGAGATTAGTTGGATTGG

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DS 

RD RR4AY49TF 790 0 0
TCTTTACTTCCATGAACTTCTCACTGAAGTAGAGTTCCTTTTTCGGAATGCTTGCAACAT
ACTCGTACGAATACCTCCAAGATGCATTCACCTCTGTAGCAAGCATTCTCTCTCGAGTAT
CAGGGAGAATGGTGTACATGTCTCTCACAAACTTCTCAAATCCTGACTGGGTTGTCTTAA
GCAGAGCTAGTCCTGAAACACCGGAAGTTAAAGTTAGTGCACCAGACTTATGTACTGTAG
CCTCCACAGTATGGTTCTCTGACCCAAGCTTGAAACCATGTAAATGGGGTTTTCCATCGA
TGCATACACGCTCCCATGGCTTATCAATGATATTAACAATAGCAGTGTAAACCTGTGGAT
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CACACTCTTTCGCCTTGACATAAACGGTGTTTTTCATGGTATCGGTGGCGACGATGTCGG
AGTTATCGTCACGGTGGTAAGAAGAGAGGCAGTGAGAGAGAAGACTGATGCTAACGTTCC
ATTCGACAAAGTGATGAGATCCATCCAAGCCTTGACGCCAAACTCTCCCAACTCTAACTC
TAGCCTTTCCATGTCTTTGATCTACTCTCAACCCTTCTTGTGCCATTAAAATTTGAACAG
ATCGTACGATTACTTAGAGAATCAAAAGGTTACAGTTTCTGAGATTCCTAGGAGATTAGT
TGGATTGGTGGGGGCAAGAGAGATGAATAATAGAGGACAGGTATGATTATGAATAATAGA
AAGCGTGTTC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 8

CO CL706Contig1 1324 8 18 U
AATAAAATAGTATTTGAAATTTAAAGTTATGTGAGATAAACATTAGAGTGTCACTTAGGG
AGGATGAGATTGGTGCTCGCTAACGCGCCATGCACGAGAAAGACGCTTCGAATAAATGAA
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GTTGCTGAGTTGTACAGAGTGAAGTGATTTCTTGTTCATCACACATTAGCTGCTTTGAGG
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TCCAACATGGAGATTGAAGTAACACCAGAGAGGACAAGAAGAGTTTTACAACCACCATTC
TGCCCAAACAAAATATCAGTGTCCAATCTATCACCCACCATGCATATCTGTGACTTTTCG
ATTCCAAATTTGTCTGACAAATAGTCCATCATAAAAGTTGAGGGTTTTCCAACTACAAGA
GGTTCACGTTGACAGGATCCAACAAGAGCACCAACCATGGAGCCACCACCTGCCCATTCT
TGAGCATCGGTAAGGTGAGTGACAGCATCCCGGTTTGTAGCAATGAAAAGACAGCCCGGG
TTTTCGCGGATACAGAGAGTTCCATACTGAATTTTGTAGTAGTTGAAATAGCGGTCAAAT
CCAACCACCACAGCTCCCACATCATTATCATGCTCCATTAGAAATCCTGGCTTCAGTTCA
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TTTCAAAATACCCTCCTCACCAATCACGTAGACCTTCTTATCTTTGGGGAAATTAATAGA
CTGCAAGTATGCAGCTGCAGCAAAAGAAGAAGCAAATATTTCCTCCTCGTTAACATTCAG
GCCAAGAGTCTCAAATTTTTT*ACCATATTGTTTCCTAGATTTTGTTGAGTTGTTCGTCA
CAAAAACCAACCTCTTTCCCTTGGCACGGAGCATATCAAGAGTTTCAGGAACTCCCTCAA
TCAATTTATCTCCCTTCCAAATGACTCCGTCACAATCGAAGATAAAAGTTTCAACGGAAT
CGATGAGCTGATCGGCGTTCTCGAGCTGCTGTGCCGCCATAGCTCTCGGTGTCAAATTGG
GAGTCATCACACGGATAGGCTTATGGTCGATTCTGCGAATGAAGCCGCCGGAGAAGGAGG
AAGAACGAAATCCGGAGGAGACGAAAGGTTTTGAGTTCGGTAAGAGAGAAAGTGAGGAAG
AAGAAACAAGTGTTCTGTTCAGCATCATCTTTTCTTCTTCGGTTTCCGTTTCTTTTGGAA
TCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 

AF RR4GD95JQ U 1
AF RR4FW31JQ U 1
AF RR4AG62JQ U 30
AF RR4CW16JQ U 72
AF RR4FW31TF C 605
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AF RR4GD95TF C 578
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BS 94 94 RR4GD95JQ
BS 95 189 RR4FW31JQ
BS 190 190 RR4GD95JQ
BS 191 252 RR4FW31JQ
BS 253 253 RR4GD95JQ
BS 254 269 RR4FW31JQ
BS 270 270 RR4GD95JQ
BS 271 396 RR4FW31JQ
BS 397 397 RR4GD95JQ
BS 398 738 RR4FW31JQ
BS 739 797 RR4AG62JQ
BS 798 858 RR4CW16JQ
BS 859 859 RR4AG62TF
BS 860 864 RR4CW16JQ
BS 865 921 RR4AG62TF
BS 922 922 RR4CW16TF
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TCCAACATGGAGATTGAAGTAACACCAGAGAGGACAAGAAGAGTTTTACAACCACCATTC
TGCCCAAACAAAATATCAGTGTCCAATCTATCACCCACCATGCATATCTGTGACTTTTCG
ATTCCAAATTTGTCTGACAAATAGTCCATCATAAAAGTTGAGGGTTTTCCAACTACAAGA
GGTTCACGTTGACAGGATCCAACAAGAGCACCAACCATGGAGCCACCACCTGCCCATTCT
TGAGCATCGGTAAGGTGAGTGACAGCATCCCGGTTT
GTAG

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DS 

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AGGATGAGATTGGTGCTCGCTAACGCGCCATGCGCGAGAAAGACGCTTCGAATAAATGAA
GCTTGCCAAAACAAGCAAGAAAAAGTCTATACATAGATAAACGTATGGATTGACTCTGTA
GTTGCTGAGCTGTACAGAGTGAAGTGATTTCTTGTTCATCACACATTAGCTGCTTTGAGG
GAAAGAAAATCAAAAATCTTGCTGGTGTAAAAATCTGGTTGTATCTTGTTCTCAGGGCTT
TCCAACATGGAGATTGAAGTAACACCAGAGAGGACAAGAAGAGTTTTACAACCACCATTC
TGCCCAAACAAAATATCAGTGTCCAATCTATCACCCCCCATGCATATCTGTGACTTTTCG
ATTCCAAATTTGTCTGACAAATAGTCCATCATAAAAGTTGAGGGTTTTCCAACTACAAGA
GGTTCACGTTGACAGGATCCAACAAGAGCACCAACCATGGAGCCACCACCTGCCCATTCT
TGAGCATCGGTAAGGTGAGTGACAGCATCCCGGTTTGTAGCAATGAAAAGACAGCCCGGG
TTTTCGCGGATACAGAGAGTTCCATACTGAATTTTGTAGTAGTTGAAATAGCGGTCAAAT
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ATTTGTTTTTT*ACCATC

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DS 

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TACATAGATAAACGTATGGATTGACTCTGTAGTTGCTGAGTTGTACAGAGTGAAGTGATT
TCTTGTTCATCACACATTAGCTGCTTTGAGGGAAAGAAAATCAGAAATCTTGCTGGTGTA
GAAATCTGGTTGTATCTTGTTCTCAGGGCTTTCCAACATGGAGATTGAAGTAACACCAGA
GAGGACAAGAAGAGTTTTACAACCACCATTCTGCCCAAACAAAATATCAGTGTCCAATCT
ATCACCCACCATGCATATCTGTGACTTTTCGATTCCAAATTTGTCTGACAAATAGTCCAT
CATAAAAGTTGAGGGTTTTCCAACTACAAGAGGTTCACGTTGACAGGATCCAACAAGAGC
ACCAACCATGGAGCCACCACCTGCCCATTCTTGAGCATCGGTAAGGTGAGTGACAGCATC
CCGGTTTATAGCAATGAAAAGACAGCCCGGGTTTTCGCGGATACAGAGGGTTCCATACTG
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ATGCTCCATTAGAAATCCTGGCTTCAGTTCAATTTGTTTTTTTACCATCATCCGGACCTC
CAAGGTATTGAAAACCAGCAAGGTCGAGCTCTTTCAAAATACCCTCCT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4CW16JQ 798 0 0
A
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AAGCAAGAAAAAGTCTATACATAGATAAACGTATGGATTGACTCTGTAGTTGCTGAGTTG
TACAGAGTGAAGTGATTTCTTGTTCATCACACATTAGCTGCTTTGAGGGAAAGAAAATCA
GAAATCTTGCTGGTGTAGAAATCTGGTTGTATCTTGTTCTCAGGGCTTTCCAACATGGAG
ATTGAAGTAACACCAGAGAGGACAAGAAGAGTTTTACAACCACCATTCTGCCCAAACAAA
ATATCAGTGTCCAATCTATCACCCACCATGCATATCTGTGACTTTTCGATTCCAAATTTG
TCTGACAAATAGTCCATCATAAAAGTTGAGGGTTTTCCAACTACAAGAGGTTCACGTTGA
CAGGATCCAACAAGAGCACCAACCATGGAGCCACCACCTGCCCATTCTTGAGCATCGGTA
AGGTGAGTGACAGCATCCCGGTTTGTAGCAATGAAAAGACAGCCCGGGTTTTCGCGGATA
CAGAGAGTTCCATACTGAATTTTGTAGTAGTTGAAATAGCGGTCAAATCCAACCACCACA
GCTCCCACATCATCATCATGCTCCATTAGAAATCCTGGCTTCAGTTCAATTTGTTTTTT*
ACCATCATCCGGACCTCCAAGGTATTGAAAACCAGCAAGGTCGAGCTCTTTCAAAATACC
CTCCTCACCAATCACGTAGACCTTCTTATCTTTGGGGAAATTAATAGACTGCAAGTATGC
AGCTGCGGCAAA
GAAGA

QA 2 793 2 793
DS 

RD RR4FW31TF 698 0 0
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CCACCACAGCTCCCACATCATTATCATGCTCCATTAGAAATCCTGGCTTCAGTTCAATTT
GTTTTTT*ACCATCATCCGGACCTCCAAGGTATTGAAAACCAGCAAGGTCGAGCTCTTTC
AAAATACCCTCCTCACCAATCACGTAGACCTTCTTATCTTTGGGGAAATTAATAGACTGC
AAGTATGCAGCTGCAGCAAAAGAAGAAGCAAATATTTCCTCCTCGTTAACATTCAGGCCG
AGAGTCTCAAATTTTTT*ACCATATTGTTTCCTAGATTTTGTTGAGTTGTTCGTCACAAA
AACCAACCTCTTTCCCTTGGCACGGAGCATATCAAGAGTTTCAGGAACTCCCTCAATCAA
TTTATCTCCCTTCCAAATGACTCCGTCACAATCGAAGATAAAAGTTTCAACGGAATCGAT
GAGCTGATCGGCGTTCTCGAGCTGCTGTGCCGCCATAGCTCTCGGTGTCAAATTGGGAGT
CATCACGCGGATAGGCTTATGGTCGATTCTGCGAATGAAGCCGCCGGAGAAGGAGGAAGA
ACGAAATCCGGAGGAGACGAAAGGTTTTGAGTTCGGTAAGAGAGAAAGTGAGGAAGAAGA
AACAAGTGTTCTGTTCAGCATCATCTTTTCTTCTTC
CC

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RD RR4AG62TF 793 0 0
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CAGCCCGGGTTTTCGCGGATACAGAGAGTTCCATACTGAATTTTGTAGTAGTTGAAATAG
CGGTCAAATCCAACCACCACAGCTCCCACATCATTATCATGCTCCATTAGAAATCCTGGC
TTCAGTTCAATTTGTTTTTTTACCATCATCCGGACCTCCAAGGTATTGAAAACCAGCAAG
GTCGAGCTCTTTCAAAATACCCTCCTCACCAATCACGTAGACCTTCTTATCTTTGGGGAA
ATTAATAGACTGCAAGTATGCAGCTGCAGCAAAAGAAGAAGCAAATATTTCCTCCTCGTT
AACATTCAGGCCAAGAGTCTCAAATTTTTTTACCATATTGTTTCCTAGATTTTGTTGAGT
TGTTCGTCACAAAAACCAACCTCTTTCCCTTGGCACGGAGCATATCAAGAGTTTCAGGAA
CTCCCTCAATCAATTTATCTCCCTTCCAAATGACTCCGTCACAATCGAAGATAAAAGTTT
CAACGGAATCGATGAGCTGATCGGCGTTCTCGAGCTGCTGTGCCGCCATAGCTCTCGGTG
TCAAATTGGGAGTCATCACACGGATAGGCTTATGGTCGATTCTGCGAATGAAGCCGCCGG
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GTGAGGAAGAAGAAACAAGTGTTCTGTTCAGCATCATCTTTTCTTCTTCGGTTTCCGTTT
CTTTTGGAATCCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4CW16TF 793 0 0
CTGCCCA
TCTTGAGCATCGGTAAG*TGAGTGACAGCATCCCGGTT*GTAGCAATGAAAAGACAGCCC
GGGTTT*CGCGGATACAGAGAGTTCCATACTGAATTTTGTAGTAGT*GAAATAGCGGTCA
AATCCAACCACCACAGCTCCCACATCATCATCATGCTCCATTAGAAATCCTGGCTTCAGT
TCAATTTGTTTTTT*ACCATCATCCGGACCTCCAAGGTATTGAAAACCAGCAAGGTCGAG
CTCTTTCAAAATACCCTCCTCACCAATCACGTAGACCTTCTTATCTTTGGGGAAATTAAT
AGACTGCAAGTATGCAGCTGCGGCAAAAGAAGAAGCAAATATTTCCTCCTCGTTAACATT
CAGGCCAAGAGTCTCAAATTTTTT*ACCATATTGTTTCCTAGATTTTGTTGAGTTGTTCG
TCACAAAAACCAACCTCTTTCCCTTGGCACGGAGCATATCAAGAGTTTCAGGAACTCCCG
CAATCAATTTATCTCCCTTCCAAATGACTCCGTCACAATCGAAGATAAAAGTTTCAACGG
AATCGATGAGCTGATCGGCGTTCTCGAGCTGCTGTGCCGCCATAGCTCTCGGTGTCAAAT
TGGGAGTCATCACACGGATAGGCTTATGGTCGATTCTGCGAATGAAGCCGCCGGAGAAGG
AGGAAGAACGAAATCCGGAGGAGACGAAAGGTTTTGAGTTCGGTAAGAGAGAAAGTGAGG
AAGAAGAAACAAGTGTTCTGTTCAGCATCATCTTTTCTTCTTCGGTTTCCGTTTCTTTTG
GAATCC

QA 8 793 8 793
DS 

RD RR4GD95TF 746 0 0
TAGCAATGAAAAGACAGCCCGGGTTT*CGCGGATACAGAGAGTTCCATACTGAATTT*GT
AGTAGTTGAAATAGCGGTCAAATCCAACCACCACAGCTCCCACATCATTATCATGCTCCA
TTAGAAATCCTGGCTTCAGTTCAATTTGTTTTTT*ACCATCATCCGGACCTCCAAGGTAT
TGAAAACCAGCAAGGTCGAGCTCTTTCAAAATACCCTCCTCACCAATCACGTAGACCTTC
TTATCTTTGGGGAAATTAATAGACTGCAAGTATGCAGCTGCAGCAAAAGAAGAAGCAAAT
ATTTCCTCCTCGTTAACATTCAGGCCAAGAGTCTCAAATTTTTT*ACCATATTGTTTCCT
AGATTTTGTTGAGTTGTTCGTCACAAAAACCAACCTCTTTCCCTTGGCACGGAGCATATC
AAGAGTTTCAGGAACTCCCTCAATCAATTTATCTCCCTTCCAAATGACTCCGTCACAATC
GAAGATAAAAGTTTCAACGGAATCGATGAGCTGATCGGCGTTCTCGAGCTGCTGTGACGC
CATAGCTCTCGGTGTCAAATTGGGAGTCATCACACGGATAGGCTTATGGTCGATTCTGCG
AATGAAGCCGCCGGAGAAGGAGGAAGAACGAAATCCGGAGGAGACGAAAGGTTTTGAGTT
CGGTAAGAGAGAAAGTGAGGAAGAAGAAACAAGTGTTCTGTTCAGCATCATCTTTTCTTC
TTCGGTTTCCGTTTCTTTTGGAATCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 8

CO CL707Contig1 1311 8 20 U
GGATGGGTAACAATCCGATAACCAGGCTTTTAATAGTCAACATTGGATACAGCAGGGAGT
CTGTCGATCGTCTTCAACCCAACAACTGTAAGAAACTTTCGTCCTTCGATTTGATCCGAT
TCCTC**TCCGTCTCCGATCGAATTGAAGGTTGCTGTGATTAAGATCGAATCTTCTCAAT
CATGAACTATCTTCTTGGAGCTTTCAAGCCGGCGTGTAATGTTTCAATCACCTTCACTGA
TGGGAAGAATCGTAAACAGGTTCCCATTAAGAAAGATAATGGACAGACGGTTATGAACCC
GCTTTTCCAGAGTCAAGAAACTATTGCTGGCAAGGTTATTATTGAGCCATATCAAGGGAA
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CAGAGGGAACTTCTACGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCTTGATGTACCGGGAGAGAT
ATATGAAAAGAAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCCACTGTTGAGATGCCACATGAGACATA
CAATGGCGTCAATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGG
TGGAAGCATCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGTAACTATTCTCCACTACCTCCAAT
CAACAACAGCATCAAGATGGAAGTTGGAATCGAGGACTGCCTGCATATCGAGTTTGAGTA
CAACAAAAGCAAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAAGATATATTTTCTTCTGGT
GAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAGGCGAGAATCAACAGGAGCAGG
AGCTAATACTCACGTCGAGACAGAAACACTAGCCAAATTTGAGTTAATGGATGGCGCTCC
CGTTAGAGGTGAATCGATACCTGTGAGACTATTCTTGACACCATACGATCTGACACCAAC
ACTTACGAACATAAACAACAAATTCAGCGTTAAGTATTATTTGAATCTTGTTCTGGTGGA
CGAGGAGGATCGCCGTTACTTCAAGCAGCAAGAAATCACGCTGTACAGGCTCAAGGAGGA
GACATCTTGATGTTAACAAAAGGGGAAGAGAGAAGTGATAAATTTTCAGAACTTTGTAAA
GTTTTTTTTCTGTATGCAATTGGTTTGAGGACTTGGAGTGATGAAAGTTAAATCATGTAG
TTTGTTCAACGACCATAATGTTGTTTGCTTTGTTTGGAGTCAAACGACTTTTATTCTTTT
TGTTTTTGGAACACCGACTTTTATTTTTTTTTTTTATGTGTTTCCTTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN52TF U 1
AF RR4F644TF U 61
AF RR4AF02TF U 74
AF RR4AO71TF U 101
AF RR4AF02JQ C 448
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BS 831 893 RR4AO71TF
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BS 973 1242 RR4AF02JQ
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BS 1244 1257 RR4AF02JQ
BS 1258 1311 RR4AO71JQ

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TCCTC**TCCGTCTCCGATCGAATTGAAGGTTGCTGTGATTAAGATCGAATCTTCTCAAT
CATGAACTATCTTCTTGGAGCTTTCAAGCCGGCGTGTAATGTTTCAATCACCTTCACTGA
TGGGAAGAATCGTAAACAGGTTCCCATTAAGAAAGATAATGGACAGACGGTTATGAACCC
GCTTTTCCAGAGTCAAGAAACTATTGCTGGCAAGGTTATTATTGAGCCATATCAAGGGAA
AAAGGTGGAGCACAATGGTGTTAAAGTTGAGCTCCTTGGTCAAATAGAAATGTACTTTGA
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ATATGAAAAGAAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCCACTGTTGAGATGCCACATGAGACCTA
CAATGGCGTCAATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGG
TGGAAGCATCGTGGAGTAT

QA 1 619 1 619
DS 

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GG
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CTC**TCCGTCTCCGATCGAATTGAAGGTTGCTGTGATTAAGATCGAATCTTCTCAATCA
TGAACCATCTTCTTGGAGCTTTCAAGCCGGCGTGTAATGTTTCAATCACCTTCACTGATG
GGAAGAATCGTAAACAGGTTCCCATTAAGAAAGATAATGGACAGACGGTTATGAACCCGC
TTTTCCAGAGTCAAGAAACTATTGCTGGCAAGGTTATTATTGAGCCATATCAAGGGAAAA
AGGTGGAGCACAATGGTGTTAAAGTTGAGCTCCTTTGTCAAATAGAAATGTACTTTGACA
GAGGGAACTTCTACGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCTTGATGTACCGGGAGAGATAT
ATGAAAAGAAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCCACTGTTGAGATGCCACATGAGACCTACA
ATGGCGTCAATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGGTG
GAAGCATCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGTAACTATTCTCCACTACCTCCAATCA
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*CAAAAGCAAGTACC***TGAAAGATGTTATCCTTGGGAAGATATATTTTCTTCTGGTGA
GAATCA

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GG
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TGGAGCTTTCAAGCCGGCGTGTAATGTTTCAATCACCTTTACTGATGGGAAGAATCGTAA
ACAGGTTCCCATTAAGAAAGATAATGGACAGACGGCTATGAACCCGCTTTTCCAGAGTCA
AGAAACTATTGCTGGCAAGGTTATTATTGAGCCATATCAAGGGAGAAAGGTGGAGCACAA
TGGTGTTAAAGTTGAGCTCCTTGGTCAAATAGAAATGTACTTTGACAGAGGGAACTTCTA
CGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCTTGATGTACCGGGAGAGATATATGAAAAGAAGGC
ATACCCTTTTGAGTTTTCCACTGTTGAGATGCCACATGAGACATACAATGGCGTCAATGT
GCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGGTGGAAGCATCGTGGA
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GATGGAAGTTGGAATCGAGGACTGCCTGCATACCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTA
CCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAAGATATATTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAA
GAATATGGATCTTGAGATCAGAAAGCGAGAATCAA

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DS 

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GGGATTT
GATTTGATCCGATTCCTC**TCCGTCTCCGATCGAACTGAAGGTTGCTGTGATTAAGATC
GAATCTTCTCAATCATGAACTATCTTCTTGGAGCTTTCAAGCCGGCGTGTAATGTTTCAA
TCACCTTCACTGATGGGAAGAATCGTAAACAGGTTCCCATTAAGAAAGATAATGGACAGA
CGGTTATGAACCCGCTTTTCCAGAGTCAAGAAACTATTGCTGGCAAGGTTATTATTGAGC
CATATCAAGGGAAAAAGGTGGAGCACAATGGTGTTAAAGTTGAGCTCCTTGGTCAAATAG
AAATGTACTTTGACAGAGGGAACTTCTACGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCTTGATG
TACCGGGAGAGATATATGAAAAGAAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCCACTGTTGAGATGC
CACATGAGACCTACAATGGCGTCAATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAACAGTTA
CACGTGGTTATGGGGGAAGCATCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGCAACTATTCTC
CACTACCTCCAATCAACAACAGCATCAAGATGGAAGTTGGAATCGAGGACTGCCTGCATA
TCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAAGATAT
ATTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAGGCGAGAAT
CAACAGGAGCAGGAGCTAATACTCACGTCGAGACAGAAACACTAGCCAAATTTGAGTTAA
TGGATG

QA 8 793 8 793
DS 

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GTTTTCCACTGTTGAGATGCCACATGAGACATACAATGGCGTCAATGTGCGACTAAGGTA
TGTCCTCAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGGTGGAAGCATCGTGGAGTATCAGGACTT
TGTGGTCCGTAACTATTCTCCACTACCTCCAATCAACAACAGCATCAAGATGGAAGTTGG
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GAGAGAAGTGATAAATTTTCAGAACTTTGTAAAGTTTTTTTTCTGTATGCAATTGGTTTG
AGGACTTGGAGTGATGAAAGTTAAATCATGTAGTTTGTTCAACGACCATAATGTTGTTTG
CTTTGTTTGGAGTCATACGACTTTTATTCT
CTTC

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DS 

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TCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGTAACTATTCTCCACTACCTCCAATCAACAACA
GCATCAAGATGGAAGTTGGAATCGAGGACTGCCTGCATATCGAGTTTGAGTACAACAAAA
GCAAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAAGATATATTTTCTTCTGGTGAGAATCA
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CTCACGTCGAGACAGAAACTCTAGCCAAATTTGAGTTAATGGATGGCGCTCCCGTTAGAG
GTGAATCGATACCTGTGAGACTATTCTTGACACCATACGATTTGACACCAACACTTACGA
ACATAAACAACAAATTCAGCGTTAAGTATTATTTGAATCTTGTTTTGGTGGACGAGGAGG
ATCGCCGTTACTTCAAGCAGCAAGAAATCACGCTGTACAGGCTCAAGGAGGAGACATCTT
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TCTGTATGCAATTGGTTTGAGGACTTGGAGTGATGAAAGTTAAATCATGTAGTTTGTTCA
ACGACCATAATGTTGTTTGCTTTGTTTGGAGTCAAACGACTTTTATTCT
CTTCTTTTATGTG

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DS 

RD RR4F644JQ 683 0 0
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CTATTCTCCACTACCTCCAATCAACAACAGCATCAAGATGTAAGTTGGAATCGAGGACTG
CCTGCATATCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTACC***TGAAAGATGTTATCCTTGG
GAAGATATATTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAG
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TGGGTTAATGGATGGCGCTCCCGTTAGAGGTGAATCGATACCTGTGAGACTATTCTTGAC
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TCTGAATCTTGTTCTGGTGGACGAGGAGGATCGCCGTTACTTCAAGCAGCAAGAAATCAC
GCTGTACAGGCTCAAGGAGGAGACATCTTGATGTTAACAAAAGGGGAAGAGAGAAGTGAT
AAATTTTCAGAACTTTGTAAAGTTTTTTTTCTGTATGCAATTGGTTTGAGGACTTGGAGT
GATGAAAGTTAAATCATGTAGTTTGTTCAACGACCATAATGTTGTTTGCTTTGTTTGGAG
TCAAACGACTTTTATTCT
TTTCT

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DS 

RD RR4AO71JQ 666 0 0
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TATCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAAGAT
ATATTTTCTTTTGGTGAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAGGCGAGA
ATCAACAGGAGCAGGAGCTAATACTCACGTCGAGACAGAAACACTAGCCAAATTTGAGTT
AATGGATGGCGCTCCCGTTAGAGGTGAATCGATACCTGTAAGACTGTTCTTGACACCATA
CGATTTGACACCAACGCTTACGAACATAAACAACAAATTCAGCGTTAAGTATTATTTGAA
TCTTGTTTTGGTGGACGAGGAGGATCGCCGTTACTTCAAGCAGCAAGAAATCACGCTGTA
CAGGCTCAAGGAGGAGACATCTTGATGTTAACAAAACTGGAAGAGAGAAATGATAAATTT
TCAGAACTTTGTAAAGTTTTTTTTCTGTATGCAATTGGTTTGAGGACTTGGAGTGATGAA
AGTTAAATCATGTAGTTTGTTCAACGACCATAATGTTGTTTTTTTCGTGTTGAGTCATAC
GACTTTTATTCTTTTTGTTTTTGGAACACCGACTTTTATTTTTTTTTTTTATGTGTTTCC
TTCCAT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 7

CO CL708Contig1 835 7 36 U
GGTGTTTTGTCGAGAGAAGATGGAGGATTCATCGGCGTCGTTTGTAAGCAACAGATATTG
GGCGCTCCGACATGGAAAGAGCATTCCCAACGAGAGAGGCCTCGTCGTCTCTTCAATGGA
AAATGGTGTGCTCCCAGAGTACCAGTTATCCCCTGATGGTGTCGCTCAGGCTCAGCTCGC
TGGCCAATCCTTCCTCAAGCAACTGGAGGAAAGTAAGATATCACTGGACAAGGTCCGCAT
TTGCTACTCCCCCTTCTCTAGAACCACCCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTCAA
TCTCCCTTTTGATTCCCCTCAATGCAAGATGATGGAATCTCTGCGAGAACGCTACTTTGG
ACCTACATTTGAACTCAAGTCACATGACAAGTATCCGGAGATATGGGATCTTGATGAGAA
AGATCCATTCGTGGGACCAGAAGGAGGTGAAAGCGCTGACGATGTTGTGTCCAGACTCGC
CACTGCCATGTTATCTATGGAAGCAGAATTTCAAGGGTGTGCAATTCTGGTGGTGAGCCA
TGGAGATCCACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAGCAAAGCAGCA***TAGCGG
AGGAGATGTTGGTGGTTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCAGAGTTGCTTCTGTCTTGTC
ACAGCACCGCAAGTTTGCTTTGCTCACTGGCGAACTCCGACCCCTCGTCTGATTTTTTGC
AGACCAAAACAATAAAGTATTCAACTTTGGCTTTGTTGTGTTCCTATCTCTGCCAATTAC
AATTCGTGCAAAAACTTTTATTTGGAATAAGCAAAGGTTTGGTAATTTGGTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DE09TF U 7
AF RR4CU72TF U 1
AF RR4FH29JQ C 343
AF RR4FH29TF U 1
AF RR4ER54TF U 1
AF RR4ER54JQ C 169
AF RR4DE09JQ C 462
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BS 91 411 RR4CU72TF
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GG
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CCCCCTTCTCTAGAACCACCCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTCAATCTCCCTT
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DS 

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TTGCTACTCCCCCTTCTCTAGAACCACCCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTCAA
TCTCCCTTTTGATTCCCCTCAATGCAAGATGATGGAATCTCTGCGAGAACGCTACTTTGG
ACCTACATTTGAACTCAAGTCACATGACAAGTATCCGGAGATATGGGATCTCGATGAGAA
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CGGAGATCCACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAGCAAAGCAGCAACATAGCGG
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ACTGCACCGTAAGTTTGCTTTGCTC

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DS 

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TGTTGTGTCCAGACTCGCCACTGCCATGTTATCTATGGAAGCAGAATTTCAAGGGTGTGC
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AAAGCAGCA***TAGCGGAGGAGATGTTGGTGGTTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCAG
AGTTGCTTCTGTCTTGTCACAGCACCGCAAGTTTGCTTTGCTCACTGGCGAATTCCGACC
CC

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DS 

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GGTGTTTT
GTCGAGAGAAGATGGAGGATTCATCGGCGTCGTTTGTAAGCAACAGATATTGGGCGCTCC
GACATGGAAAGAGCATTCCCAACGAGAGAGGCCTCGTCGTCTCTTCAATGGAAAATGGTG
TGCTCCCAGAGTACCAGTTATCCCCTGATGGTGTCGCTCAGGCTCAGCTCGCTGGCCAAT
CCTTCCTCAAGCAACTGGAGGAAAGTAAGATATCACTGGACAAGGTCCGCATTTGCTACT
CCCCCTTCTCTAGAACCACCCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTCAATCTCCCTT
TTGATTCCCCTCAATGCAAGATGATGGAATCTCTGCGAGAACGCTACTTTGGACCTACAT
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ACAATTCGTG

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DS 

RD RR4ER54TF 796 0 0
GGTGTTTT
GTCGAGAGAAGATGGAGGATTCATCGGCGTCGTTTGTAAGCAACAGATATTGGGCGCTCC
GACATGGAAAGAGCATTCCCAACGAGAGAGGCCTCGTCGTCTCTTCAATGGAAAATGGTG
TGCTCCCAGAGTACCAGTTATCCCCTGATGGTGTCGCTCAGGCTCAGCTCGCTGGCCAAT
CCTTCCTCAAGCAACTGGAGGAAAGTAAGATATCACTGGACAAGGTCCGCATTTGCTACT
CCCCCTTCTCTAGAACCACCCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTCAATCTCCCTT
TTGATTCCCCTCAATGCAAGATGATGGAATCTCTGCGAGAACGCTACTTTGGACCTACAT
TTGAACTCAAGTCACATGACAAGTATCCGGAGATATGGGATCTTGATGAGAAAGATCCAT
TCGTGGGACCAGAAGGAGGTGAAAGCGCTGACGATGTTGTGTCCAGACTCGCCACTGCCA
TGTTATCTATGGAAGCAGAATTTCAAGGGTGTGCAATTCTGGTGGTGAGCCATGGAGATC
CACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAGCAAAGCAGCA***TAGCGGAGGAGATG
TTGGTGGTTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCAGAGTTGCTTCTGTCTTGTCACAGCACC
GCAAGTTTGCTTTGCTCACTGGCGAACTCCGACCCCTCGTCTGATTTTT*GCAGAC*AAA
ACAATAAAGTAT**CACTTTGGCTTTGTTGTGT*CCTATCTCTGC*AATTACA*TTCGTG
CAAAA
CTT

QA 9 793 9 793
DS 

RD RR4ER54JQ 663 0 0
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CTGATTTTTTGCAGACCAAAACAATAAAGTATTCAACTTTGGCTTTGTTGTGTTCCTATT
TCTGCCAATTACAATTCGTGCAAAAACTTTTATTTGGAATAAGCAAAGGTTTGGTAATTT
GGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4DE09JQ 374 0 0
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CAATTCTGGTGGTGAGCCATGGAGATCCACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAG
CAAAGCAGCA***TAGCGGAGGAGATGTTGGTGGTTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCA
GAGTTGCTTCTGTCTTGTCACAGCACCGCAAGTTTGCTTTGCTCACTGGCGAACTCCGAC
CCCTCGTTTGATTTTTTGCAGACCAAAACAATAAAGTATTCAACTTTGGCTTTGTTGTGT
TCCTATTTCTGCCAATTACAATTCGTGCAAAAACTTTTATTTGGAATAAGCAAAGGTTTG
GTAATTTGGTAACT

QA 1 374 1 374
DS 



AS 2 7

CO CL709Contig1 745 3 14 U
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TTACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCTTTTAAACC
TCCCAAGGTGGCTTTTAGGACTAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAGCAT
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AAAAATTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTCATTTAAATC
TCATGGAATTTGTAAACTTTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU95TF U 1
AF RR4GY77JQ C 1
AF RR4GY77TF U 1
BS 1 70 RR4BU95TF
BS 71 71 RR4GY77TF
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RD RR4BU95TF 745 0 0
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TTACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCTTTTAAACC
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CTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCT
GTCGATCTGTTCGTTGTTGACGGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGCTCCGGAGATTGC
TCACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTACCTGGACTCAAAA
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CTAAA*GAACTCTTCTCATTTCCGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTCTTATTAAA
AAAAATTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTCATTTAAATC
TCATGGAATTTGTAAACT
TTAAGTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4GY77JQ 745 0 0
GGAGG
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AAGCTCAGAAGCTGAACCAAAAACGTGAAAGGTGATTATCGGGGATGGCATCGAAACGGA
TATTGAAGGAATTGAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCATGCAGCGCAGGACCGG
TGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACT
CTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCTTTTAAACCTCCCA
AGGTGGCTTTTAGGACTAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAGCATCTGCC
TCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGTCGA
TCTGTTCGTTGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTCACA
TGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTACCTGGACTCAAAAGTACG
GAATGGGCTGACCACTCTCCCCCCC*GCAAGGACTTGCCCCTTCCTTTTAATAACCTAAA
AGAACTCTTCTCATTTCCGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTCTTATTAAAAAAAA
TTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTCATTTAAATCTCATG
GAATTTGTAAACTTTAAGCC

QA 6 745 6 745
DS 

RD RR4GY77TF 744 0 0
GGAGG
GAAGAACCATTTACAGTTTCCTTTCTCTCTCTTTTCTTTTCCTAAATAACGAAGAATCTA
AAGCTCAGAAGCTGAACCAAAAACGTGAAAGGTGATTATCGGGGATGGCATCGAAACGGA
TATTGAAGGAATTGAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCATGCAGCGCAGGACCGG
TGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACT
CTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCTTTTAAACCTCCCA
AGGTGGCTTTTAGGACTAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAGCATCTGCC
TCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGTCGA
TCTGTTCGTTGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTCACA
TGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTACCTGGACTCAAAAGTACG
GAATGGGCTGACCACTCTCCCCCCC*GCAAGGACTTGCCCCTTCCTTTTAATAACCTAAA
AGAACTCTTCTCATTTCCGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTCTTATTAAAAAAA*
TTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCC*ATTTTCATTTAA*TCTCATG
GAATTTGTAA
CTTTAAGCC

QA 6 735 6 735
DS 



CO CL709Contig2 743 4 16 U
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TGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTTTTTTTAACAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGA
TTACATAGAAATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTAATTAAAAGGGGAAAGTCCTTGAGGGGGA
GAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCATACTTGTT
CTTGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATC
CGACAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTG
CTCCCTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTT
TGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAAC
AAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATG
GAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATC
CTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTG
GTTCAGCTTCTTAGCTTTAGATTCTTCGTTATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAA
ACTGTAAATGGTTCTTCTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 10 10 

AF RR4F915JQ U 1
AF RR4F915TF C 6
AF RR4CA15JQ U 11
AF RR4CA15TF C 89
BS 1 127 RR4F915JQ
BS 128 128 RR4CA15JQ
BS 129 134 RR4F915JQ
BS 135 135 RR4CA15JQ
BS 136 137 RR4F915JQ
BS 138 138 RR4CA15JQ
BS 139 226 RR4F915JQ
BS 227 227 RR4CA15JQ
BS 228 302 RR4F915JQ
BS 303 303 RR4CA15JQ
BS 304 364 RR4F915JQ
BS 365 365 RR4CA15JQ
BS 366 381 RR4F915JQ
BS 382 382 RR4CA15JQ
BS 383 738 RR4F915JQ
BS 739 743 RR4CA15JQ

RD RR4F915JQ 738 0 0
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TGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTTTTTTTAACAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGA
TTACATAAAAATGAAAAAAGTTCTTTTAGGTAATTAAAAGGGGAAAGTCCTTGAGGGGGA
GAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAAACTCATACTTGTT
CTTGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATC
CGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTG
CTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTT
TGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAAC
AAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATG
GAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATC
CTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTG
GTTCAGCTTCTTAGCTTTAGATTCTTCGTTATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAA
ACTGTAAATGGTTCTTCT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4F915TF 736 0 0
AGTTTACAAATTCCATGAGATT*AAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTTACTGATC
TCAGTCTTCACAATTTTTTTTTTTTT*AACAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACA
TAGAAATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTAATTAAAAGGGGAAAGTCCTTGAGGGGGAGAGTG
GTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCATACTTGTTCTTGT
CAGTCTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATCCGTCA
ACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCT
TCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCC
TAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAA
AAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACA
TGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCCTTCA
ATTCCTTCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCA
GCTTCTTAGCTTTAGATTCTTCGTTATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAAACTGT
AAATGGTTCTTCTC
CC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4CA15JQ 733 0 0
G
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TTCACAATTTTTTTTTTTT**AACAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACATAGAAA
TGAGAAGAGTTCTTTTAGGTAATTAAAAGGGGAAAGTCCTTGAGGGGGAGAGTGGTCAGC
CCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCT
TGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATCCGACAACAACG
AACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCCTCAAGA
TGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAG
CCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACAC
CGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCTT
CCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAATTCCT
TCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTTCT
TAGCTTTAGATTCTTCGTTATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAAACTGTAAATGG
TTCTTCTCTTCC

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4CA15TF 655 0 0
TTTTAACAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATGAGAAGAGTTCTTTTA
GGTAATTAAAAGGGGAAAGTCCTTGAGGGGGAGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGA
GTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATC
TCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATCCGACAACAACGAACAGATCGACAGCAGC
ACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCCTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTC
CCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTA
AAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTG
TCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCG
CTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGAT
GCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTTCTTAGCTTTAGATTCTTCG
TTATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAAACTGTAAATGGTTCTTCTC
TTCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 8

CO CL710Contig1 783 8 7 U
GCCATAACCGAGACGAGCTACTATTAAAACTTTCTCAACAAGCAAAATCTGATTTAACAA
CTGATGAGTTCCAAGTCTGGTTTAACAGATTCTAAAACACTACAGATTCTAAAAGAGAAA
CAAGACAGAAGCAGAAACTGAAAAACAAACAAACTCCACAACACAAAAGGAGTTTCTAAG
CGGCAGTAGCAGCCTTGGCCTTCTTAGGGGCACGGTAGGAACCAACGACAC*AAGCATGG
TCACGCTCAAATGGCTCAAGCGTCACTTGCTCTGCCGGCTTGAACTGCTCTTGTTGGAGC
TTCTTCACTTCGCTCTGAAACACAGCTTCAGCTGGAACTGTTGAGTCGATACAGTTTGCC
TTGATTGAGATCACAAAGTGACCTCCAGTTTTGAGGAAGAAGCTTGCATTCAAAGCCACA
ATCCTAGCCTGATCAGGCTGTGCAACATCAGAGAAGATAACATCAACCATGCCTACAAGC
ATTCTGTACTTAGCAGGGTGTCTAGCATCTTCAATGATAGGGATAACGTTAGTCCTCTTC
TTCGCCATGTTCACCAAATCTCTACCACTTCTGTGAGAAAACTCAACTGCGTAGACACAT
CCCTCGGGTCCAACAAGATCAGACACATGAGAGACTGTGGTTCCAGAAGCAGCACCAAGG
TAAAGAACTTTAGCACCAGGTTTAATCCAAATGTTATCAACACCACCAAGAATAGCAGCC
GCAAGCTTAGAACGGAAAGGATTCCACACTCTGTATTCAATCTTGGTTCCATCTTCATTC
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR4H687JQB U 34
AF RR4H687TF C 34
AF RR4DN88JQ U 1
AF RR4AV33JQ U 17
AF RR4DN88TF C 53
AF RR4AU48JQ U 17
AF RR4AU48TF C 13
AF RR4AV33TF C 17
BS 1 16 RR4DN88JQ
BS 17 18 RR4AV33JQ
BS 19 332 RR4DN88JQ
BS 333 333 RR4H687JQB
BS 334 655 RR4DN88JQ
BS 656 767 RR4AU48JQ
BS 768 783 RR4AU48TF

RD RR4H687JQB 534 0 0
G
TCAACAAGCAAAATCTGATTTAACAACTGATGAGTTCCAAGTCTGGTTTAACAGATTCTA
AAACACTACAGATTCTAAAAGAGAAACAAGACAGAAGCAGAAACTGAAAAACAAACAAAC
TCCACAACACAAAAGGAGTTTCTAAGCGGCAGTAGCAGCCTTGGCCTTCTTAGGGGCACG
GTAGGAACCAACGACAC*AAGAATGGTCACGCTCAAATGGCTCAAGCGTCACTTGCTCTG
CCGGCTTGAACTGCTCTTGTTGGAGCTTCTTCACTTCGCTCTGAAACACAGCTTCAGCTG
GAACTGTTGAGTCGATACAGTTTGCCTTGATTGAGATCACAAAGTGACCTCCAGTTTTGA
GGAAGAAGCTCGCATTCAAAGCCACAATCCTAGCCTGATCAGGCTGTGCAACATCAGAGA
AGATAACATCAACCATGCCTACAAGCATTCTGTACTTAGCAGGGTGTCTAGCATCTTCAA
TGATAGGGATAACGTTAGTCCTCTTCTTCGCCATGTTCACCAAATCTCTACC
C

QA 2 533 2 533
DS 

RD RR4H687TF 534 0 0
G
TCAACAAGCAAAATCTGATTTAACAACTGATGAGTTCCAAGTCTGGTTTAACAGATTCTA
AAACACTACAGATTCTAAAAGAGAAACAAGACAGAAGCAGAAACTGAAAAACAAACAAAC
TCCACAACACAAAAGGAGTTTCTAAGCGGCAGTAGCAGCCTTGGCCTTCTTAGGGGCACG
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CCGGCTTGAACTGCTCTTGTTGGAGCTTCTTCACTTCGCTCTGAAACACAGCTTCAGCTG
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AGATAACATCAACCATGCCTACAAGCATTCTGTACTTAGCAGGGTGTCTAGCATCTTCAA
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C

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CGGCAGTAGCAGCCTTGGCCTTCTTAGGGGCACGGTAGGAACCAACGACAC*AAGCATGG
TCACGCTCAAATGGCTCAAGCGTCACTTGCTCTGCCGGCTTGAACTGCTCTTGTTGGAGC
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TTGATTGAGATCACAAAGTGACCTCCAGTTTTGAGGAAGAAGCTTGCATTCAAAGCCACA
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TTCGCCATGTTCACCAAATCTCTACCACTTCTGTGAGAAAACTCAACTGCGTAGACACAT
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GTTGGAGCTTCTTCACTTCGCTCTGAAACACAGCTTCAGCCGGAACTGTTGAGTCGATAC
AGTTTGCCTTGATTGAGATCACAAAGTGACCTCCAGTTTTGAGGAAGAAGCTTGCATTCA
AAGCCACAATCCTAGCCTGATCAGGCTGTGCAACATCAGAGAAGATAACATCAACCATGC
CTACAAGCATTCTGTACTTAGCAGGGTGTCTAGCATCTTCAATGATAGGGATAACGTTAG
TCCTCTTCTTCGCCATGTTCACCAAATCTCTACCACTTCTGTGAGAAAACTCAACTGCGT
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C

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AGTGACCTCCAGTTTTGAGGAAGAAGCTTGCATTCAAAGCCACAATCCTAGCCTGATCAG
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AAGGATTCCACACTCTGTATTCAATCTTGGT

QA 1 751 1 751
DS 

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GGCCTTCTTAGGGGCACGGTAGGAACCAACGACAC*AAGCATGGTCACGCTCAAATGGCT
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GCTGTGCAACATCAGAGAAGATAACATCAACCATGCCTACAAGCATTCTGTACTTAGCAG
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AATCTCTACCACTTCTGTGAGAAAACTCAACTGCGTAGACACATCCCTCGGGTCCAACAA
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GGCCTTCTTAGGGGCACGGTAGGAACCAACGACACCAAGCATGGTCACGCTCAAATGGCT
CAAGCGTCACTTGCTCTGCCGGCTTGAACTGCTCTTGTTGGAGCTTCTTCACTTCGCTCT
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AGTGACCTCCAGTTTTGAGGAAGAAGCTTGCATTCAAAGCCACAATCCTAGCCTGATCAG
GCTGTGCAACATCAGAGAAGATAACATCAACCATGCCTACAAGCATTCTGTACTTAGCAG
GGTGTCTAGCATCTTCAATGATAGGGATAACGTTAGTCCTCTTCTTCGCCATGTTCACCA
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CAGGTTTAATCCAAATGTTATCAACACCACCAAGAATAGCAGCCGCAAGCTTAGAACGGA
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QA 1 767 1 767
DS 



AS 2 7

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BF38JQ C 1
AF RR4BF38TF U 1
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QA 1 392 1 392
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TCTTTTACTTTGAGGCTGGACAGGGGAAAACCCCTCTAGGTGCCCTTGGTTTGTGAGAAT
GATATGGTTTTTTTTTTTGAGTATGTAGATATAACTTATCTCCTCTCCAAAACTTGATGC
TCTCTCTCTTCTTCAAGATGATTTCATTGTCT

QA 1 392 1 392
DS 



CO CL711Contig2 917 5 3 U
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GAACGAAGAACCAAGCCCGCTGAGCACAGCTCCGGAGACAGTCATCGCCATGAGATCTCT
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CTCTCTGTTTTCTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C123JQ U 1
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AF RR4F043JQ U 48
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AF RR4FZ45TF C 249
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RD RR4C123JQ 536 0 0
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QA 1 536 1 536
DS 

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GATGGCTCGTGGGTCAGCTCCGGCTTCGAACCACGGCACGCCGCTCCACGCCTGGCCAAC
GAAGATCCCGAGAACAGCTGCCATCGCCCATCGGCCGTGGATCAGCTCTGCCTCTC

QA 1 536 1 536
DS 

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AGATCAACATTGCAAGCATAGCGAGCCTAGAGTGTTTAATCTCCGCAACCTTCAACCGCT
CCAGCTTCTCCCTGTCCGGCTCGTAAACACCGTCCCGTGACTTCCCGGCGAGCCCCAACG
GATCAAAGAACCTCCCACCGGGATATCCTTGATCACCGGTGTAGTTTGCGAAATTCTCAG
CGGTCCTCGACCACGGCGTCGCCCACTCAACGGACTGAGAGTCAGGGTTGAAGAAGTCCA
CCCACCGTTTGCTCTCCACCCAGCCCATGAAAAGCAGCTGCGTCCCGAGAAGTGATCCGA
AAGAGAACGGCGCGATGGCTCGTGGGTCAGCTCCGGCTTCGAACCACGGCACGCCGCTCC
ACGCCTGGCCAACGAAGATCCCGAGAACAGCTGCCATCGCCCATCGGCCGTGGATCAGCT
CTGCCTCTCTGTACCATTTCAGAAAAG

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DS 

RD RR4FZ45JQ 749 0 0
ATAGACTCAA
AAAAAAGAAAAACATATCATTCTTATAAACCAAGGGCACCTAGAGGCGTTTTCCCCTGAC
CAGCCTCAAAGTAAAAGATCAACATTGCAAGCATAGCGAGCCTAGAGTGTTTAATCTCCG
CAACCTTCAACCGCTCCAGCTTCTCCCTGTCCGGCTCGTAAACACCGTCCCGTGACTTCC
CGGCGAGCCCCAACGGATCAAAGAACCTCCCACCGGGATATCCTTGATCACCGGTGTAGT
TTGCGAAATTCTCAGCGGTCCTCGACCACGGCGTCGCCCACTCAACCGACTGAGAGTCCG
GGTTGAAGAAGTCCACCCACCGTTTGCTCTTCACCCACCCCATGAGAAGCAGCTGCGTCC
CGAGAAGTGATCCGAAAGAGAACGGTGCGATGGCTCGTGGGTCAGCTCCGGCTTCGAACC
ACGGCACGCCGCTCCACGCCTGGCCAACGAAGATCCCGAGAACAGCTGCCATCGCCCATC
GGCCGTGGATCAGCTCTGCCTCTCTGTACCACTTCAGAAAAGCCGGGTCTTTTCCCAAAC
CCAACGGGTCGAACCCGAAATCTCCGGGTAGCGAGCCATCGAGCCATTCAGGGTCGAGGA
AGTTGCCGCCACCTTTAACGGCGGGGATCCACGATTTCTTGGGCTGAGCAGCCGCAGCAG
CAACGATCAGAGTTTTCCTGCCAACTCTCGCAGCTCCAGTGCCTACGCCGCTTCCTAGCG
CAGTGGCACTCCTCTTGCC

QA 11 749 11 749
DS 

RD RR4FZ45TF 669 0 0
GGATAT
CTTGATCACCGGTGTAGTTTGCGAAATTCTCAGCGGTCCTCGACCACGGCGTCGCCCACT
CAACCGACTGAGAGTCCGGGTTGAAGAAGTCCACCCACCGTTTGCTCTTCACCCACCCCA
TGAGAAGCAGCTGCGTCCCGAGAAGTGATCCGAAAGAGAACGGTGCGATGGCTCGTGGGT
CAGCTCCGGCTTCGAACCACGGCACGCCGCTCCACGCCTGGCCAACGAAGATCCCGAGAA
CAGCTGCCATCGCCCATCGGCCGTGGATCAGCTCTGCCTCTCTGTACCACTTCAGAAAAG
CCGGGTCTTTTCCCAAACCCAACGGGTCGAACCCGAAATCTCCGGGTAGCGAGCCATCGA
GCCATTCAGGGTCGAGGAAGTTGCCGCCACCTTTAACGGCGGGGATCCACGATTTCTTGG
GCTGAGCAGCCGCAGCAGCAACGATCAGAGTTTTCCTGCCAACTCTCGCAGCTCCAGTGC
CTACGCCGCTTCCTAGCGCAGTGGCACTCCTCTTGCCTCCGGCGAGGAACGAAGAACCAA
GCCCGCTGAGCACAGCTCCGGAGACAGTCATCGCCATGAGATCTCTACTAAGTCTCCTCT
GTTTTTTTTTTTTAACCTCAAGAGGGTGGAAACGAGTGTTTTGTTTCTCTCTGTTTTCTG
GCC

QA 7 669 7 669
DS 



AS 1 3

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AATCACAGAGTTTGAAAGTAAAAAAAAACATACAAAGACGAGAAAGGAAACGAGAAAGAA
GTGTTGCGGAATGAAAAACAAGAGAAGAAGGTTCAATGACAATAAAAGACAAATGCTATT
ATTATTACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACT
CACGTTTGCTTTCACTGAACATTCGTGCAGCTTCCGAGTTGGCAGGAGAGTTCGGATTAG
GATCACAGAGTAATGACTGGATAGACGTAAGGATAGCAGCGACATCGTATATTGGACTCC
ACTGGTTTTGGAGAATATCCAAGCATATACTCCCATCAGCATATATATTAGGATGGAACA
TCCTTGAAACAAACCGAACCGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAGTG
AGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGGGTATCATCAGGCCCGAAGATAACAGCATTCC
AGAGCATGATGTTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCA
ACCTCTTGAAATCCCTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTCCTTGTTGAG
CTAAAAAGGTAAAAGATAGAGGCGAGAACGGTGGAGGTCGACTTCAAGCGAGCATCTTCC
CTTCCGGCAACGAAAGGTCGGAACTTTAAGCGACGATGATGACGACAGGTGATGACAGAC
AAAGTGTCCGACCGATTTCAAGCTCCTCGATCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F639JQ U 1
AF RR4A436JQ U 34
AF RR4F639TF C 139
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BS 662 762 RR4A436JQ
BS 763 816 RR4F639TF

RD RR4F639JQ 661 0 0
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AATCACAGAGTTTGAAAGTAAAAAAAAACATACAAAGACGAGAAAGGAAACGAGAAAGAA
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AGAGCATGATGTTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCA
ACCTCTTGAAATCCCTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTCCTTGTTGAG
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4A436JQ 729 0 0
G
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AATGACAATAAAAGACAAATGCTATTATTATTACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCAC
AACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCACGTTTGCTTTCACTGAACATTCGTGCAGCTTC
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AGCAGCGACATCGTATATTGGACTCCACTGGTTTTGGAGAATGTCCAAGCATATACTCCC
ATCAGCATATATATTAGGATGGAACATCCTTGAAACAAACCGAACCGTTGGTGGTTTGTT
TGGATAATCTTCTGAAAACTGCAGCGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGGGTATC
ATCAGGCCCGAAGATAACAGCATTCCAGAACATGATGTTGTTGTCTTGAGGAGTACCGCT
GATTCCAGCAGGTGGGTATTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAATCTCTTCCTCGC
TGGTGTCGACATCCTTCCTTGTTGAGCTAAAAAGGTAAAAGATAGAGGCGAGAACGGTGG
AGGTCGACTTCAAGCGAGCATCTTCCCTTCCGGCAACGAAAGGTCGGAACTTTAAGCGAC
GATGATGA

QA 2 729 2 729
DS 

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ACATTCGTGCAGCTTCCGAGTTGGCAGGAGAGTTCGGATTAGGATCACAGAGTAATGACT
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CCAAGCATATACTCCCATCAGCATATATATTAGGATGGAACATCCTTGAAACAAACCGAA
CCGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTC
CATCCCATGGGGTATCATCAGGCCCGAAGATAACAGCATTCCAGAGCATGATGTTGTTGT
CTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCA
TCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTCCTTGTTGAGCTAAAAAGGTAAAAGATA
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CGGAACTTTAAGCGACGATGATGACGACAGGTGATGACAGACAAAGTGTCCGACCGATTT
CAAGCTCCTCGATCCTCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 7

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CAACCAAATGGCAAGAAAAACCTTGGAAAAATCTATATAGGGATAGACTTAACAGGCTTT
AGGTGTATGAACAATACTGTTTATTTCGAGAGCCAGTAGATGATTATAAACAAGGTACAA
GCAGCGATGACAGCGGAGAGGATAAGTGTGTCCCGAGAACGTCTCCTTCTAATTGAGCCA
AGTAAGCCACGAATCACTGGGAACTTGTCGCCGAGATTTTTCACTTTCCCTTGAACATCC
GAAAACAGAGACCGTTGAGAGCCAAGAACTGCTCTTGTCGCTTGAGCTTGGCCAATTACT
TCATCAATATGGGATATACTTCCATGGATTGAAGCTCTCTCTCTTAACACTTGCACACCT
GGTGACATACTACCAGAAGCCTTATATTCACTTATGTCATCCCTGACAGAACTCAGAAGC
TCAGCATGTTCCCTCATCGAGTTTATGTTCCCTTTTATCCTTCGAAACTCCTGAGTGTAT
TCGTGAAGAATGTCTCTGTGCCTTGCAAGCTTTTGAGTAACAGAGGTTGTAGGTGCAGCA
GAGGCAGCACATCTACTCATGGAATCATTAATGTCCAACAACTTCTCAAGCGAAGATTGA
ATCTCAATCTCCATTGACTTCCATGATCCTCCTGGAGATCCACCCTCAACACCATACCCG
CCTTGATTGAATCTGGCGCCGAGCTTAGCGTAAGAGGAGAGCCTGACGTCGAGATCGCCT
TCGATTTTACGAGCTTCTCTACGGAGCTCCTCCCAGCCAGATTCCTGCAGATCGAGGCTC
GCTTCTGTCATCTTCTCCGATCTTCGTTCAGTTTCAGATCCGATCAGATCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP95JQ U 1
AF RR4GJ70JQ U 1
AF RR4AK48TF C 103
AF RR4GJ70TF C 124
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BS 703 710 RR4EP95JQ
BS 711 752 RR4GJ70JQ
BS 753 791 RR4AK48TF
BS 792 792 RR4GJ70TF
BS 793 800 RR4AK48TF
BS 801 801 RR4GJ70TF
BS 802 852 RR4AK48TF
BS 853 855 RR4GJ70TF
BS 856 892 RR4AK48TF

RD RR4EP95JQ 710 0 0
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GGGTGTATGAACAATACTGTTTATTTCGAGAGCCAGTAGATGATTATAAACAAGGTACAA
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AGTAAGCCACGAATCACTGGGAACTTGTCGCCGAGATTTTTCACTTTCCCTTGAACATCC
GAAAACAGAGACCGTTGAGAGCCAAGAACTGCTCTTGTCGCTTGAGCTTGGCCAATTACT
TCATCAATATGGGATATACTTCCATGGATTGAAGCTCTCTCTCTTAACACTTGCACACCT
GGTGACATACTACCAGAAGCCTTATATTCACTTATGTCATCCCTGGCAGAACTCAGAAGC
TCAGCATGTTCCCTCATCGAGTTTATGTTCCCTTTTATCCTTCGAAACTCCTGAGTGTAT
TCGTGAAGAATGTCTCTGTGCCTTGCAAGCTTTTGAGTAACAGAGGTTGTAGGTGCAGCA
GAGGCAGCACATCTACTCATGGAATCATTAATGTCCAACAACTTCTCAAGCGAAGATTGA
ATCTCAATCTCCATTGACTTCCATGATCCTCCTGGAGATCCGCCCTCAAC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4GJ70JQ 752 0 0
GGA
ATTTTTAAGCTGTTTTATGATTAGGAGTGTGACATTACATCCTACGAACACATAACTCAA
CCAAATGGCAAGAAAAACCTTGGAAAAATCTATATAGGGATAGACTTAACAGGCTTTAGG
TGTATGAACAATACTGTTTATTTCGAGAGCCAGTAGATGATTATAAACAAGGTACAAGCA
GCGATGACAGCGGAGAGGATAAGTGTGTCCCGAGAACGTCTCCTTCTAATTGAGCCAAGT
AAGCCACGAATCACTGGGAACTTGTCGCCGAGATTTTTCACTTTCCCTTGAACATCCGAA
AACAGAGACCGTTGAGAGCCAAGAACTGCTCTTGTCGCTTGAGCTTGGCCAATTACTTCA
TCAATATGGGATATACTTCCATGGATTGAAGCTCTCTCTCTTAACACTTGCACACCTGGT
GACATACTACCAGAAGCCTTATATTCACTTATGTCATCCCTGACAGAACTCAGAAGCTCA
GCATGTTCCCTCATCGAGTTTATGTTCCCTTTTATCCTTCGAAACTCCTGAGTGTATTCG
TGAAGAATGTCTCTGTGCCTTGCAAGCTTTTGAGTAACAGAGGTTGTAGGTGCAGCAGAG
GCAGCACATCTACTCATGGAATCATTAATGTCCAACAACTTCTCAAGCGAAGATTGAATC
TCAATCTCCATTGACTTCCATGATCCTCCTGGAGATCCACCCTCAACACCATACCCGCCT
TGATTGAATCTGGCGCCGAGCTTAGCGTA

QA 4 752 4 752
DS 

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ATCGT
CTTAACAGGCTTTAGGTGTATGAACAATACTGTTTATTTCGAGAGCCAGTAGATGATTAT
AAACAAGGTACAAGCAGCGATGACAGCGGAGAGGATAAGTGTGTCCCGAGAACGTCTCCT
TCTAATTGAGCCAAGTAAGCCACGAATCACTGGGAACTTGTCGCCGAGATTTTTCACTTT
CCCTTGAACATCCGAAAACAGAGACCGTTGAGAGCCAAGAACTGCTCTTGTCGCTTGAGC
TTGGCCAATTACTTCATCAATATGGGATATACTTCCATGGATTGAAGCTCTCTCTCTTAA
CACTTGCACACCTGGTGACATACTACCAGAAGCCTTATATTCACTTATGTCATCCCTGAC
AGAACTCAAAAGCTCAGCATGTTCCCTCATCGAGTTTATGTTCCCTTTTATCCTTCGAAA
CTCCTGAGTGTATTCGTGAAGAATGTCTCTGTGCCTTGCAAGCTTTTGAGTAACAGAGGT
TGTAGGTGCAGCAGAGGCAGCACATCTACTCATGGAATCATTAATGTCCAACAACTTCTC
AAGCGAAGATTGAATCTCAATCTCCATTGACTTCCATGATCCTCCTGGAGATCCACCCTC
AACACCATACCCGCCTTGGTTGAATCTGGCGCCGAGCTTAGCGTAAGAGGAGAGCCTGAC
GTCGAGATCGCCTTCGATTTTACGGGCTTCTCTCCGGAGCTCCTCCCAGCCAGATTCCTG
CAGATCGAGGCTCGCTTCTGTCATC***TCCGATCTTCGTTCAGTTTCAGATCCGATCAG
ATCCC

QA 6 790 6 790
DS 

RD RR4GJ70TF 766 0 0
TGTATGAACAATACTGTTTATTTCGAGAGCCAGTAGATGATTATAA*CAAGGTACAAGCA
GCGATGACAGCGGAGAGGATAAGTGTGTCCCGAGAACGTCTCTTTCTAATTGAGCCAAGT
AAGCCACGAATCACTGGGAACTTGTCGCCGAGATTTTTCACTTTCCCTTGAACATCCGAA
AACAGAGACCGTTGAGAGCCAAGAACTGCTCTTGTCGCTTGAGCTTGGCCAATTACTTCA
TCAATATGGGATATACTTCCATGGATTGAAGCTCTCTCTCTTAACACTTGCACACCTGGT
GACATACTACCAGAAGCCTTATATTCACTTATGTCATCCCTGACAGAACTCAGAAGCTCA
GCATGTTCCCTCATCGAGTTTATGTTCCCTTTTATCCTTCGAAACTCCTGAGTGTATTCG
TGAAGAATGTCTCTGTGCCTTGCAAGCTTTTGAGTAACAGAGGTTGTAGGTGCAGCAGAG
GCAGCACATCTACTCATGGAATCATTAATGTCCAACAACTTCTCAAGCGAAGATTGAATC
TCAATCTCCATTGACTTCCATGATCCTCCTGGAGATCCACCCTCAACACCATACCCGCCT
TGATTGAATCTGGCGCCGAGCTTAGCGTAAGAGGAGAGCTTGACGTCGAGATCGCCTTCG
ATTTTACGAGCTTCTCTACGGAGCTCCTCCCAGCCGGATTCCTGCAGATCGAGGCTCGCT
TCTGTCATCTTCTCCGATCTTCGTTCAGTTTCAGATCCGATC
CCCT

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL713Contig2 988 3 13 U
GGGGTGATCTGATCGGATCTGAAACTGAACGAAGATCGGAGAAGATGACAGAAGCGAGCC
TCGATCTGCAGGAATCCGGCTGGGAGGAGCTCCGTAGAGAAGCTCGTAAAATCGAAGGCG
ATCTCGACGTCAAACTCTCCTCTTACGCTAAGCTCGGCGCCAGATTCAATCAAGGCGGGT
ATGGTGTTGAGGGCGGATCTCCAGGAGGATCATGGAAGTCAATGGAGATTGAGATTCAAT
CTTCGCTTGAGAAGTTGTTGGACATTAATGATTCCATGAGTAGATGTGCTGCCTCTGCTG
CACCTACAACCTCTGTTACTCAAAAGCTTGCAAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATACA
CTCAGGAGTTTCGAAGGATAAAAGGGAACATAAACTCGATGAGGGAACATGCTGAGCTTC
TGAGTTCTGTCAGGGATGACATAAGTGAATATAAGGCTTCTGGTAGTATGTCACCAGGTG
TGCAAGTGTTAAGAGAGAGAGCTTCAATCCATGGAAGTATATCCCATGTAAGATGATACT
TTAGCTCTCTCTTGTGATGTAAATGATATAATGATGGAGGATATACTATTCTTCGTTCTA
TAATCAATTTGGCTGCAGATTGATGAAGTAATTGGCCAAGCTCAAGCGACAAGAGCAGTT
CTTGGCTCTCAACGGTCTCTGTTTTCGGATGTTCAAGGGAAAGTGAAAAATCTCGGCGAC
AAGTTCCCAGTGATTCGTGGCTTACTTGGCTCAATTAGAAGGAGACGTTCTCGGGACACA
CTTATCCTCTCCGCTGTCATCGCTGCTTGTACCTTGTTTATAATCATCTACTGGCTCTCG
AAATAAACAGTATTGTTCATACACCTAAAGCCTGTTAAGTCTATCCCTATATAGATTTTT
CCAAGGTTTTTCTTGCCATTTGGTTGAGTTATGTGTTCGTAGGATGTAATGTCACACTCC
TAATCATAAAACAGCTTAAAAATTCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP95TF U 1
AF RR4FE19TF U 4
AF RR4FE19JQ C 319
BS 1 331 RR4EP95TF
BS 332 332 RR4FE19TF
BS 333 424 RR4EP95TF
BS 425 701 RR4FE19TF
BS 702 702 RR4FE19JQ
BS 703 709 RR4FE19TF
BS 710 710 RR4FE19JQ
BS 711 753 RR4FE19TF
BS 754 754 RR4FE19JQ
BS 755 761 RR4FE19TF
BS 762 762 RR4FE19JQ
BS 763 795 RR4FE19TF
BS 796 988 RR4FE19JQ

RD RR4EP95TF 424 0 0
GGGGTGATCTGATCGGATCTGAAACTGAACGAAGATCGGAGAAGATGACAGAAGCGAGCC
TCGATCTGCAGGAATCCGGCTGGGAGGAGCTCCGTAGAGAAGCTCGTAAAATCGAAGGCG
ATCTCGACGTCAAACTCTCCTCTTACGCTAAGCTCGGCGCCAGATTCAATCAAGGCGGGT
ATGGTGTTGAGGGCGGATCTCCAGGAGGATCATGGAAGTCAATGGAGATTGAGATTCAAT
CTTCGCTTGAGAAGTTGTTGGACATTAATGATTCCATGAGTAGATGTGCTGCCTCTGCTG
CACCTACAACCTCTGTTACTCAAAAGCTTGCGAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATACA
CTCAGGAGTTTCGAAGGATAAAAGGGAACATAAACTCGATGAGGGAACATGCTGAGCTTC
TGAG

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4FE19TF 792 0 0
GGGATCT
GATCGGATCTGAAACTGAACGAAGATCGGAGAAGATGACAGAAGCGAGCCTCGATCTGCA
GGAATCCGGCTGGGAGGAGCTCCGTAGAGAAGCTCGTAAAATCGAAGGCGATCTCGACGT
CAAACTCTCCTCTTACGCTAAGCTCGGCGCCAGATTCAATCAAGGCGGGTATGGTGTTGA
GGGTGGATCTCCAGGAGGATCATGGAAGTCAATGGAGATTGAGATTCAATCTTCGCTTGA
GAAGTTGTTGGACATTAATGATTCCATGAGTAGATGTGCTGCCTCTGCTGCACCTACAAC
CTCTGTTACTCAAAAGCTTGCAAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATACACTCAGGAGTT
TCGAAGGATAAAAGGGAACATAAACTCGATGAGGGAACATGCTGAGCTTCTGAGTTCTGT
CAGGGATGACATAAGTGAATATAAGGCTTCTGGTAGTATGTCACCAGGTGTGCAAGTGTT
AAGAGAGAGAGCTTCAATCCATGGAAGTATATCCCATGTAAGATGATACTTTAGCTCTCT
CTTGTGATGTAAATGATATAATGATGGAGGATATACTATTCTTCGTTCTATAATCAATTT
GGCTGCAGATTGATGAAGTAATTGGCCAAGCTCAAGCGACAAGAGCAGTTCTTGGCTCTC
AACGGTCTCTGTTTTCGGATGTTCAAGGGAA*GTGAAAA*TCTCGGCGACAAGTTCCCAG
TGATTCGTGGCTTACTTGGCTCA*TTAGAAG*AGACGTTCTCGGGACACACTTATCCTCT
CCGCT

QA 8 792 8 792
DS 

RD RR4FE19JQ 670 0 0
CTCAAAAGCTTGCAAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATACACTCAGGAGTTTCGAAGGA
TAAAAGGGAACATAAACTCGATGAGGGAACATGCTGAGCTTCTGAGTTCTGTCAGGGATG
ACATAAGTGAATATAAGGCTTCTGGTAGTATGTCACCAGGTGTGCAAGTGTTAAGAGAGA
GAGCTTCAATCCATGGAAGTATATCCCATGTAAGATGATACTTTAGCTCTCTCTTGTGAT
GTAAATGATATAATGATGGAGGATATACTATTCTTCGTTCTATAATCAATTTGGCTGCAG
ATTGATGAAGTAATTGGCCAAGCTCAAGCGACAAGAGCAGTTCTTGGCTCTCAACGGTCT
CTGTTTTCGGATGTTCAAGGGAAAGTGAAAAATCTCGGCGACAAGTTCCCAGTGATTCGT
GGCTTACTTGGCTCAATTAGAAGGAGACGTTCTCGGGACACACTTATCCTCTCCGCTGTC
ATCGCTGCTTGTACCTTGTTTATAATCATCTACTGGCTCTCGAAATAAACAGTATTGTTC
ATACACCTAAAGCCTGTTAAGTCTATCCCTATATAGATTTTTCCAAGGTTTTTCTTGCCA
TTTGGTTGAGTTATGTGTTCGTAGGATGTAATGTCACACTCCTAATCATAAAACAGCTTA
AAAATTCCAG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 2 8

CO CL714Contig1 832 6 3 U
GGATCACATTTCTATAAAATTCTCCGTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAAG
GGGCCAAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTTCCCTCTTTTTAAC
GCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACCG
AGCTAAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGG
AGCTAAACGACTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGA
TGATCGACAAGATCGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTCGGAGAGC
TTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAG
CGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGT
GTTGTCTTCCTTGGGGCTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGATGAATGCAGGAAGATGATCAT
ACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAA
AAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTTTTTGAGCTGATTAACTGTCTTTTTTTTCTTTCACTTTT
GTTTTATCTTTTTTTTTACCATTTATCTCTCGCATTGTAGAAGGAAAAAATTAGACGATT
GGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTAGAACTG
TTTGTTTATTAATTAATGTGATTTGTGATGCTTTTTAATAAGCTAATCCTGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4C791TF U 4
AF RR4AM24TF U 1
AF RR4A044TF U 1
AF RR4AM24JQ C 118
AF RR4A044JQ C 306
AF RR4A044JQD C 330
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GG
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AAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCTA
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AACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGTGTTGT
CTTCCTTGGGGCTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGATGAATGTAGGAAGATGATCATACAAG
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ACTTTTGTTTTAT

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DS 

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CTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACCGAGCTA
AAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCTA
AACGACTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATC
GACAAGATCGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTCGGAGAGCTTTAC
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AACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGTGTTGT
CTTCCTTGGGGCTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGATGAATGCAGGAAGATGATCATACAAG
TGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGG
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ATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGT

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DS 

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GCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACCG
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AGCTAAACGACTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGA
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GTTGTCTTCCTTGGGGCTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGATGAATGCAGGAAGATGATCAT
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AAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTTTTTGAGCTGATTAACTGTCTTTTTTTTCTTTCACTTTT
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TTTGTTTATTAATTAATGTGATTTGTGATGCTT

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DS 

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CATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGAT
GAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTTTTTGAGCTGATTAACTGTCTTTTTTTTCTTTCACT
TTTGTTTTATCTTTTTTTTTACCATTTATCTCTCGCATTGTAGAAGGAAAAAATTAGACG
ATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTAGAA
CTGTTTGTTTATTAATTAATGTGATTTGTGATGCTTTTTAATAAGCTAATC
CTGC

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DS 

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AACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGTGTTGT
CTTCCTTGGGGCTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGATGAATGCAGGAAGATGATCATACAAG
TGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGG
GTCGGTTTTTTTAGCTTTTTGAGCTGATTAACTGTCTTTTTTTTCTTTCACTTTTGTTTT
ATCTTTTTTTTTACCATTTATCTCTCGCATTGTAGAAGGAAAAAATTAGACGATTGGTAA
ATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTAGAACTGTTTGT
TTATTAATTAATGTGATTTGTGATGCTTTTTAATAAGCTAATCCTGC

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DS 

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GGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGTGTTGTCTTCCTTGGGGCTCAAGCAAGGTA
AGACCTTGGATGAATGCAGGAAGATGATCATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAG
TTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTTTTTGAGC
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GCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTAGAACTGTTTGTTTATTAATTAATGTGATTTGTGAT
GCTTTTTAATAAGCTAATC

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DS 



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TGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTTCTAACGCTTTCTTCATC
CACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACCGAGCTAAAACGCG
TGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCTAAACGATT
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TAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAACGTTT
TCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAATAGGTGTTGTCTTCCT
TGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAAGTGGATG
TTGATGGTGATGGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTCGG
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TAAAACCATTTATCTATCTCCCGCATTCTAGAATGAAAAATTAAACGATTGGTAAATGAA
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ATTAATGGGATTTGTGATGCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM20TF U 377
AF RR4BM20JQ C 1
BS 1 376 RR4BM20JQ
BS 377 640 RR4BM20TF
BS 641 641 RR4BM20JQ
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BS 700 805 RR4BM20JQ

RD RR4BM20TF 326 0 0
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TGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAATAGGTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGG
TAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGGTA
GAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTG
AGCTAATAATTAACGATCTTTTTT*CTCACTTTTGTTTTTTTTTTAAAACCATTTATCTA
TCTCCCGCATTCTAGAATGAAAA
TTA

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4BM20JQ 805 0 0
GGGTAACATCTCTTAGTTTCTGAACTCCCTTTACCGGTCTCCAAGAGGCCAAGAAAGTAT
TGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTTCTAACGCTTTCTTCATC
CACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACCGAGCTAAAACGCG
TGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCTAAACGATT
CATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATCGACAAGA
TCGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTCGGAGAGCTTTACAAGACGA
TAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAACGTTT
TCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAATAGGTGTTGTCTTCCT
TGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAAGTGGATG
TTGATGGTGATGG*TAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTCGG
TTTTTTTAGCTCTTTGAGCTAATAATTAACGATCTTTTTTTCTCACTTTTGTTTTTTTTT
TAAAACCATTTATCTATCTCCCGCATTCTAGAATGAAAAATTAAACGATTGGTAAATGAA
TTGTTTAATAGTCTACTTTGCGAGTGCACATTGTAAAAATGTAGAACTGTTTGTCTATTA
ATTAATGGGATTTGTGATGCTTTTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 8

CO CL715Contig1 692 8 10 U
GGATCCCTTCTCCAATGGCTATGCAGTTAAGTTTCCTAGCTTTGTTCCTTTTCACGGCAG
CTTTGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCGGTTTCGCTCGTCGAAGGAAGAGTCTCTTGTT
ACGACTGCCCCAGTGATTACGATTATTCAGGAATCATGATCACTGTTAGTTGTAGCCACT
CCAAGACGCGTTTCACCGTCTCAACCGACAAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAACTTCCCT
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TCTTTTTATATATGAAGCATAATTTAATAGTG


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD73TF U 1
AF RR4FP89JQ C 1
AF RR4FP89TF U 1
AF RR4EQ85TF U 1
AF RR4DN83TF U -3
AF RR4G968TF U -2
AF RR4EQ85JQ C 11
AF RR4BN08TF U 15
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DS 

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AAGTTGATCTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACC
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TTCCCCATCATCGGTATCCCATAAGATGCACCGTTTAAACATATATCTTTTGCGGCTCAT
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AATAG

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AATCGGATTGCAAAGCGGAGCTCCAAGGTAGCTTCAAGCAACTTTATGCTTCCAAAAGGA
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TCTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCGTTGATT
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TTTCACCGTCTCAACCGACAAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAACTTCCCTCGAGAGTCAA
ATCGGATTGCAAAGCGGAGCTCCAAGGTAGCTTCAAGCAACTTTATGCTTCCAAAAGGAA
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CTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCGTTGATTT
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TTT

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ATGTCGAAGATTGTTAAGCTCGAAGGTGACAAATATGGTCTCTCTTCGAAGTTGATCTTC
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AAGCATAA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 8

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AATATAGTACTTGATCAAGGACATTTTCAAGTCTACTATTAAGACAGAAGTAAACATTCA
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TGTAATTCTAATCGATTTTACTATATAACTTAAATCACTCTTTAAATAAATTTCTGCTTT
GTTTCTCATGTGAATAACTCAAATCTTGAAATAACATCAACCAGAGAGAGCCAACTTCTG
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TCTTGCGTAGAAACCTATAGAACCATTGCTGCTTCAAGTCCATCACGTTGTTACGTCCAC
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TGCTCACCCAATCCAATGGATCACCCTGAAGAGCGAAAACAGCAGCGTAAGCAATAGGAT
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CACTTAGCTTGTTTTAGTTAAAACTTACAAGTTGTATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 25 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4F604JQ U 2
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AF RR4CO16JQ U 3
AF RR4G740JQ U 147
AF RR4CO16TF C 345
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AF RR4G305TF C 615
AF RR4G740TF C 489
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BS 713 771 RR4CO16JQ
BS 772 886 RR4G740JQ
BS 887 1104 RR4CO16TF
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BS 1112 1166 RR4F604TF
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BS 1168 1239 RR4F604TF

RD RR4F604JQ 622 0 0
A
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TATAGTACTTGATCAAGGACATTTTCAAGTCTACTATTAAGACAGAAGTAAACATTCACA
TATTTTGGAAAACAACCATAATCTGGAAAATAAGTTTATTCTCAACTTATATGAATACTG
TAATTCTAATCGATTTTACTATATAACTTAAATCACTCTTTAAATAAATTTCTGCTTTGT
TTCTCATGTGAATAACTCAAATCTTGAAATAACATCAACCAGCGAGAGCCAACTTCTGTT
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TTACGAGATGTGTCTTTAGTTTTCCACGACCTCGAACCACAAATATGGCATGCTGAGTTT
ACAAGCCATGTCACGTGATACCCTAGCACACCTCCAACGCCCCCGCCGCAAGTAAGGTAA
GGTAAACCACCGTAGAGATAG

QA 2 622 2 622
DS 

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TGTAATTCTAATCGATTTTACTATATAACTTAAATCACTCTTTAAATAAATTTCTGCTTT
GTTTCTCATGTGAATAACTCAAATCTTGAAATAACATCAACCAGAGAGAGCCAACTTCTG
TTTTTGGTATTCCGAAGGCAATTTCACATCGGTGGCTAATCCGAAAACCTCAAGTAGTCG
AATGAGGTACCAAGTGATATCTATCTGCCACCACTCCAATCCTTGCCTCGCCGATGACTG
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AAGGTAAACCACCGTAGAGATAGAGAACGGTCCAAAACATTAAGACGTGGAAACCAATCG
TCTTGCGTAGAAACCTATAGAACCATTGCTGCTTCAAGTCCATCACGTTGTT

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DS 

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TATTTTGAAAAACAACCATAATCTAGAAAATAAGTTTATTCTCAGCTTATATGAATACTG
TAATTCTAATCGTTTTTACTATATAACTTAAATTACTCTTTAAATAAATTTCTGCTTTGT
TTCTCATGTGAATAACTCAAATCTTGAAATAACATCAACCACCGAGAGCCAACTTCTGTT
TTTGGTATTCCGAAGGCAATTTCACATCGGTGGCTAATCCGAAAACCTCAAGTAGTCGAA
TGAGGTACCAAGTGATATCTATCTGCCACCACTCCAATCCTTGCCTCGCCGATGACTGAA
ACGCGTGGTGGTTGTTGTGCCAACTCTCTCCC*ATCGTAAATAAGCTTAGCCACCAAACA
TTACGAGATGTGTCTTTAGTTTTCCACGACCTCGAACCACAAATATGGCATGCTGAGTTT
ACAAGCCATGTCACGTGATACCCTAGCACACCTCCAACGCCCCCGCCGCAAGTAAGGTAA
GGTAAACCACCGTAGAGATAGAGAACGGTCCAAAACATTAAGACGTGGAAACCAATCGTC
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DS 

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G
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GAAATAACATCAACCAGAGAGAGCCAACTTCTGTTTTTGGTATTCCGAAGGCAATTTCAC
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ATATGGCATGCTGAGTTTACAAGCCATGTCACGTGATACCCTAGCACACCTCCAACGCCC
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TGGTGGAACCTATGTATGCTCACCCAATCCAATGGATCACCCTGAAGAGCGAAAACAGCA
GCGTAAGCAATAGGATATTCAAGCCACTTTGGGAGCTTAAAGCTCCGATGAGCCAAGTTC
CTGTGGTACGAGAATGTGATGAGCAGGTTAGTCACTGAGACGAGAATCAAACCGAACCGT
AACGCTTCCCATTTGTAGTATAATGGCGCCAGGAGACACAAAAAGTGAACAATCGTAACG
GTTAGCGCTCTTGCTACATCGGCCCACGTCCAATATCTCT
CC

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CCACCAAACAT*ACGAGATGTGTCTT*AGTTT*CCACGACCTCGAACCACAAATATGGCA
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AGTAAGGTAAGGTAAACCACCGTAGAGATAGAGAACGGTCCAAAACATTAAGACGTGGAA
ACCAATCGTCTTGCGTAGAAACCTATAGAACCATTGCTGCTTCAAGTCCATCACGTTGTT
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CAAAAATCCGT****AGGGCTATGTGGGTCTCGATCTGAATCTGTGAACTGGTGGTGGAA
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CGAGAATGTGATGAGAAGGTTAGTCACTGAGACGAGAATCAAACCGAACCGTAACGCTTC
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TAATATTGCACTTAGCTTGTTTTAGTTAAAACTTACAAGTTGTATCC

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TGTGGGTCTCGATCTGAATCTGTGAACTGGTGGTGGAACCTATGTATGCTCACCCAATCC
AATGGATCACCCTGAAGAGCGAAAACAGCAGCGTAAGCAATAGGATATTCAAGCCACTTT
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TATTTTATATAAAGCGTGTCAAATATCCACATGACATGGCTGAACAAAAATCCTTCCTTA
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CACTTTGGGAGCTTAAAGCTCCGATGAGCCAAGTTCCTGTGGTACGAGAATGTGATGAGC
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GGCGCCAGGAGACACAAAAAGTGAACAATCGTAACGGTTAGCGCTCTTGCTACATCGGCC
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GAGACATTGTCTTTAGTGAGATTACACATCTCGGACGTGAGGAATAATATTGCACTTAGC
TTGTTTTAGTTAAAACTTACAAGTTGTATC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 6

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AAAATGAT**GTCTCTTTCCGTATTACATCACTGATAGTAACTTATACTACTCCAGACGG
AAGCCTGAGAACAAGCTGCCCTCCAAAAACGCTTTTGACGTAGTAGTAACAGAAATCTGC
AAGGATGAAAGTTTGAACAATTTCTGAGATGAGAACCATTGATGGCCACAATCCATAACC
TAATGCTACAAGCAATCTTCCCCTCGTGTCCACAACCTGTAAAACCCAATGGGCACAGCT
AAGGAACCTTGCTACTCCAAGTGCAAATACATAATGCGCCGTGAAGGGTTCAACAATCTT
GGTGTTCTGCATCACTCGCAGCTGAGGCAGTACTGAAACAGCTTCAAGGTATACACACAA
TGCCC*AAGAAATCCTGTTTAATATGTTGTGAGAGGTCGATGGATGGATCAACACAGCCA
GCACAACACACGGTACAAGCACGTAATAGAGAGCAAAGTTGTCTTTGTCCTCCATGTAAC
TAGCCTTCAACTTAAACCGGATCATAAAAATAACCCAGAGAGTTGTTCCCAGAGTAGCTA
GATCCAGAACGGTGTGTATATCATATTCCATCACAAAGCTGCAATACAGCCTCACAGCTA
GAAATATCGCCGTGAGCTCCTGAGATTTCAGTGACAATCCAGCGCAGGTTTTTTCTTTCA
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TTTTCTCGGTAAAGTGAGAAGAAAGGTTAACTTTTAATGAGAAGCAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 30 30 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 5 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G437JQ U 1
AF RR4EY68JQ U 39
AF RR4CV38JQ U 6
AF RR4EY68TF C 350
AF RR4G437TF C 313
AF RR4C822TF C 341
BS 1 10 RR4G437JQ
BS 11 11 RR4CV38JQ
BS 12 23 RR4G437JQ
BS 24 24 RR4CV38JQ
BS 25 88 RR4G437JQ
BS 89 89 RR4CV38JQ
BS 90 594 RR4G437JQ
BS 595 595 RR4CV38JQ
BS 596 699 RR4G437JQ
BS 700 700 RR4CV38JQ
BS 701 763 RR4G437JQ
BS 764 773 RR4CV38JQ
BS 774 774 RR4G437TF
BS 775 818 RR4CV38JQ
BS 819 939 RR4G437TF
BS 940 940 RR4C822TF
BS 941 949 RR4G437TF
BS 950 950 RR4C822TF
BS 951 1028 RR4G437TF
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BS 1030 1049 RR4G437TF
BS 1050 1050 RR4C822TF
BS 1051 1072 RR4G437TF

RD RR4G437JQ 763 0 0
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GAAACTAATTCGTTACCAAGTCATCTCAGACACAAACGTTAAGATCAAATGTAAAGGAAA
AAAATGAT**GTCTCTTTCCGTATTACATCACTGATAGTAACTTATACTACTCCAGACGG
AAGCCTGAGAACAAGCTGCCCTCCAAAAACGCTTTTGACGTAGTAGTAACAGAAATCTGC
AAGGATGAAAGTTTGAACAATTTCTGAGATGAGAACCATTGATGGCCACAATCCATAACC
TAATGCTACAAGCAATCTTCCCCTCGTGTCCACAACCTGTAAAACCCAATGGGCACAGCT
AAGGAACCTTGCTACTCCAAGTGCAAATACATAATGCGCCGTGAAGGGTTCAACAATCTT
GGTGTTCTGCATCACTCGCAGCTGAGGCAGTACTGAAACAGCTTCAAGGTATACACACAA
TGCCC*AAGAAATCCTGTTTAATATGTTGTGAGAGGTCGATGGATGGATCAACACAGCCA
GCACAACACACGGTACAAGCACGTAATAGAGAGCAAAGTTGTCTTTGTCCTCCACGTAAC
TAGCCTTCAACTTAAACCGGATCATAAAAATAACCCAGAGAGTTGTTCCCAGAGTAGCTA
GATCCAGAACGGTGTGTATATCATATTCCATCACAAAGCAGCAATACAGCCTCACAGCTA
GAAATATCGCCGTGAGCTCCTGAGATTTCAGTGACAATCCAGC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4EY68JQ 726 0 0
C
CAACAAAATATACAACACATTGAAACTAATTTGTTACCAAGTCATCTCAAACACAAACGT
TAAGATCAAATGTAAAGGAAAAAAATGAT**GTCTCTTTCCGTATTACATCACTGATAGT
AACTTATACTACTCCAGACGGAAGCCTGAGAACAAGCTGCCCTCCAAAAACGCTTTTGAC
GTAGTAGTAACAGAAATCTGCAAGGATGAAAGTTTGAACAATTTCTGAGATGAGAACCAT
TGATGGCCACAATCCATAACCTAATGCTACAAGCAATCTTCCCCTCGTGTCCACAACCTG
TAAAACCCAATGGGCACAGCTAAGGAACCTTGCTACTCCAAGTGCAAATACATAATGCGC
CGTGAAGGGTTCAACAATCTTGGTGTTCTGCATCACTCGCAGCTGAGGCAGTACTGAAAC
AGCTTCAAGGTATACACACAATGCCC*AAGAAATCCTGTTTAATATGTTGTGAGAGGTCG
ATGGATGGATCAACACAGCCAGCACAACACACGGTACAAGCACGTAATAGAGAGCAAAGT
TGTCTTTGTCCTCCATGTAACTAGCCTTCAACTTAAACCGGATCATAAAAATAACCCAGA
GAGTTGTTCCCAGAGTAGCTAGATCCAGAACGGTGTGTATATCATATTCCATCACAAAGC
TGCAATACAGCCTCACAGCTAGAAATATCGCCGTGAGCTCCTGAGATTTCAGTGACAATC
CAGC
A

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4CV38JQ 817 0 0
CAACCAGAAAGACATGGAAACACCAGTCAATAGTCAACAAAATATACAACACAGTGAAAC
TAATTCGTTACCAAGTCATCTCAAACACAAACGTTGAGATTAAATGTAAAGAAAAAAAAT
GATCCGTCTCTTTCCGTATTACATCACTGATAGTAACTTATACTACTCCAGACGGAAGCC
TTAGAACAAGCTGCCCTCCAAAAACGCTTTTGACGTAGTAGTAACAGAAGTCTACCAGGA
TGAAAGTTTGAACAATTTCTGAGATGAGAACCATTGATGGCCACAATCCATAACCTAATG
CTACAAGCAATCTTCCCCTGGTGTCGGCAACCTGTAAAACCCAGTGGGCACAGCTTAGGA
ACCTTGCTACTCCAAGTGCAAATACATAATGCGCCGTGAACGGTTCAACAATCTTGGTGT
TCTGCATCACTCGCAGCTGCGGCAGTACTGAAACAGCTTCAAGGTATACACATAATGCCC
*AAGAAATCCTGTTTAATATGTTGTGAGGGGTCGATGGATGGATCAACACAGCCAGCACA
ACACACGGCACAAGCACATAATAGAGAGCGAAGTTGTCTTTGTCCTCCATGTAACTAGCC
TTCAACTTAAACCGGATCATAAATATAACCCAGAGAGTTGTTCCCAGAGTAGCCAGATCC
AGAACGGTGTGTATATCATATTCCATCACAAAGCTGCAATACAGCCTAACAGCTAGAAAT
ATCGCCGTGAGCTCCTGAGATTTCAGTGACAATCCAGCGCAGGTTTTT*CTTTCATGAGT
TTGTAGATGAGAACGCAGATCCCGATGGAGTGA
CAGC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4EY68TF 588 0 0
TGGGCACAGCTAAGGAACCTTGCTACTCCAAGTGCAAATACATAATGCGCCGTGAAGGGT
TCAACAATCTTGGTGTTCTGCATCACTCGCAGCTGAGGCAGTACTGAAACAGCTTCAAGG
TATACACACAATGCCCCAAGAAATCCTGTTTAATATGTTGTGAGAGGTCGATGGATGGAT
CAACACAGCCAGCACAACACACGGTACAAGCACGTAATAGAGAGCAAAGTTGTCTTTGTC
CTCCATGTAACTAGCCTTCAACTTAAACCGGATCATAAAAATAACCCAGAGAGTTGTTCC
CAGAGTAGCTAGATCCAGAACGGTGTGTATATCATATTCCATCACAAAGCTGCAATACAG
CCTCACAGCTAGAAATATCGCCGTGAGCTCCTGAGATTTCAGTGACAATCCAGCACAGGT
TTTTTCTTTCATGAGTTTGTAGATGAGAACGCAGATCCCGATGGAGTGAACAGCTTCGGC
GGCGACGAAGAGATTGTCGTGATCGTGAACAATGAATCTGAGCAGAACCAAAGCCGCCAT
GCCGGTGACCACCGCGAGAAAAGCCTTCACCTTCGGTGGTTGCCT
CCT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4G437TF 760 0 0
GCAATCTT
CCCTCGTGTCCACA*CCTGTAAAACCCAATGGGCACAGCTAAGGAACCTTGCTACTCCAA
GTGCAAATACATAATGCGCCGTGAAGGGTTCAACAATCTTGGTGTTCTGCATCACTCGCA
GCTGAGGCAGTACTGAAACAGCTTCAAGGTATACACACAATGCCC*AAGAAATCCTGTTT
AATATGTTGTGAGAGGTCGATGGATGGATCAACACAGCCAGCACAACACACGGTACAAGC
ACGTAATAGAGAGCAAAGTTGTCTTTGTCCTCCACGTAACTAGCCTTCAACTTAAACCGG
ATCATAAAAATAACCCAGAGAGTTGTTCCCAGAGTAGCTAGATCCAGAACGGTGTGTATA
TCATATTCCATCACAAAGCAGCAATACAGCCTCACAGCTAGAAATATCGCCGTGAGCTCC
TGAGATTTCAGTGACAATCCAGCACAGGTTTTTTCTTTCATGAGTTTGTAGATGAGAACG
CAGATCCCGATGGAGTGAACAGCTTCGGCGGCGACGAAGAGATTGTCGTGATCGTGAACA
ATGAATCTGAGCAGAACCAAAGCCGCCATGCCGGTGACCACCGCGAGAAAAGCCTTCACC
TTCGGTGGTTGCCTCCTCACCCATGACCATACCGTGTGGATCGGACTTTTCACGGCCTTC
ATGCTCAAATTCTTCGCCTTTTCGCTTTTTTTTTCTCAGATTTTCTCGTTAAAGTGAGAA
GAAAGGTTAGCTTTTAATGAGAAGCAGAATCC

QA 9 760 9 760
DS 

RD RR4C822TF 732 0 0
AAAACCCAGTGAGCACAGCTTAGGAACCTTGCTACTCCAAGTGCAAATACATAATGCGCC
GTGAACGGTTCAACAATCTTGGTGTTCTGCATCACTCGCAGCTGGGGCAGTACTGAAACA
GCTTCAAGGTATACACATAATGCCC*AAGAAATCCTGTTTAATATGTTGTGAGAGGTCGA
TGGATGGATCAACACAGCCAGCACAACACACGGCACAAGCACATAATAGAGAGCGAAGTT
GTCTTTGTCCTCCATGTAACTAGCCTTCAACTTAAACCGGATCATAAATATAACCCAGAG
AGTTGTTCCCAGAGTAGCCAGATCCAGAACGGTGTGTATATCATATTCCATCACAAAGCT
GCAATACAGCCTAACAGTTAGAAATATCGCCGTGAGCTCCTGAGATTTCAGTGACAATCC
AGCGCAGGTTTTTTCTTTCATGAGTTTGTAGATGAGAACGCAGATCCCGATGGAGTGAAC
AGCTTCGGCGGCGACGAAGAGATTGTCGTGATCGTGAACAATGAATCTGAGCAGGACCAA
AGCCGCCATGCCGGTGACAACCGCGAGAAAAGCCTTCACCTTCGGTGGTTGCCTTCTCAA
CCATGACCACACCGTGTGGATCGGACTTTTCACGGCCTTCATGCTCAAATTCTTCGCCTT
TTCGCTTTTTTTTTCTCAGATTTTCTCGGTAAAGTGAGAAGAAAGGTTAACTTTTAATGC
GAAGCAGAATCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 8

CO CL718Contig1 724 8 20 U
GGGGGTTTCAGATCCAATGGAACAGCTTTCGACTTTAGGGTTTTCTGATCTGATCACTTG
TTTTGGGTTTCGTGTCTGAGCACCACATGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGG
ATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCC
ATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGG
TTTCCATTCACTTTCCTCCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTA
GGGTGTACCACCCAAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGC
AATGGAGTCCTGCTCTCACCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTG
ACCCGAACCCAGATGATCCACTTGTGCCAGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGATAAGT
CCAAGTACGAGTCAACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATA
AAAGACTCAGGAAGTGGTGGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCAT
CTAAAAATATAAAATGCATGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATC
CAGCAAACTTATATGCTCTTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTTTACTTTGG*TCTAA
GTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 

AF RR4CI13JQ C 1
AF RR4CI13TF U 1
AF RR4DX58JQ C 19
AF RR4DX58TF U 19
AF RR4B668JQ C 19
AF RR4B668TF U 467
AF RR4BJ18JQ C 19
AF RR4BJ18TF U 19
BS 1 18 RR4CI13TF
BS 19 20 RR4DX58TF
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BS 716 724 RR4B668TF

RD RR4CI13JQ 676 0 0
GGGGGTTTCAGATCCAATTCAACAGCTTTCGACTTTAGGGTTTTCTGATCTGATCACTTG
TTTTGGGTTTCGTGTCTGAGCACCACGTGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGG
ATTT*CAGAAGGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCC
ATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCTCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGG
TTTCCATTTACTTTCCTCCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTA
GGGTGTACCACCCAAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGC
AATGGAGTCCTGCTCTCACCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTG
ACCCGAACCCAGATGATCCACTTGTGCCAGAGATTGCTCACACGTACAAGACTGATAAGT
CCAAGTACGAGTCAACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATA
AAAGACTCAGGAAGTGGTGGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCAT
CTAAAAATATAAAATGCATGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATC
CAGCAAACTTATATGC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4CI13TF 663 0 0
GGGGGTTTCAGATCCAATTCAACAGCTTTCGACTTTAGGGTTTTCTGATCTGATCACTTG
TTTTGGGTTTCGTGTCTGAGCACCACGTGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGG
ATTT*CAGAAGGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCC
ATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCTCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGG
TTTCCATTTACTTTCCTCCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTA
GGGTGTACCACCCAAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGC
AATGGAGTCCTGCTCTCACCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTG
ACCCGAACCCAGATGATCCACTTGTGCCAGAGATTGCTCACACGTACAAGACTGATAAGT
CCAAGTACGAGTCAACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATA
AAAGACTCAG*AAGTGGTGGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCAT
CTAAAA*TATAAAATGCATGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATC
CAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4DX58JQ 693 0 0
GGAACAGCTTTCGACTTTAGGGTTTTCTGATCTGATCACTTGTTTTGGGTTTCGTGTCTG
AGCACCACATGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGGTTTCCATTCACTTTCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTAGGGTGTTC*ACCCAAACA
TCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGCAATGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTGACCCGAACCCAGATGATC
CACTTGTGCCAGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGATAAGTCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATAAAAGACTCAGGAAGTGGT
GGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCATCTAAAAATATAAAATGCA
TGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATCCAGCAAACTTATATGCTC
TTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTTTACT
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4DX58TF 693 0 0
GGAACAGCTTTCGACTTTAGGGTTTTCTGATCTGATCACTTGTTTTGGGTTTCGTGTCTG
AGCACCACATGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGGTTTCCATTCACTTTCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTAGGGTGTTC*ACCCAAACA
TCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGCAATGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTGACCCGAACCCAGATGATC
CACTTGTGCCAGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGATAAGTCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATAAAAGACTCAGGAAGTGGT
GGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCATCTAAAAATATAAAATGCA
TGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATCCAGCAAACTTATATGCTC
TTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTTTACT
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4B668JQ 706 0 0
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CTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGGTTTCCATTCACTTTCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTAGGGTGTACCACCCAAACA
TCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGCAATGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTGACCCGAACCCAGATGATC
CACTTGTGCCAGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGATAAGTCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATAAAAGACTCAGGAAGTGGT
GGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCATCTAAAAATATAAAATGCA
TGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATCCAGCAAACTTATATGCTC
TTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTTTACTTTGG*TCTAAGTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4B668TF 258 0 0
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GGGGATGAATAATAAAAGACTCAGGAAGTGGTGGGGGTCGAAGACAGAGCAAAATCATAA
CGTTATCTCAGCATCTAAAAATATAAAATGCATGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATT
ATGTGACCATAATCCAGCAAACTTATATGCTCTTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTT
TACTTTGGGTCTAAGTTT

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR4BJ18JQ 706 0 0
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AGCACCACATGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGGTTTCCATTCACTTTCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTAGGGTGTACCACCCAAACA
TCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGCAATGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTGACCCGAACCCAGATGATC
CACTTGTGCCAGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGATAAGTCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATAAAAGACTCAGGAAGTGGT
GGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCATCTAAAAATATAAAATGCA
TGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATCCAGCAAACTTATATGCTC
TTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTTTACTTTGG*TCTAAGTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4BJ18TF 706 0 0
GGAACAGCTTTCGACTTTAGGGTTTTCTGATCTGATCACTTGTTTTGGGTTTCGTGTCTG
AGCACCACATGGCGTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTTAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGGCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTTTTTTTGGTTTCCATTCACTTTCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTCAAGACTAGGGTGTACCACCCAAACA
TCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAGCAATGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTCTGCTGTCGATTTGCTCGTTGCTGACTGACCCGAACCCAGATGATC
CACTTGTGCCAGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGATAAGTCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG*ATGAATAATAAAAGACTCAGGAAGTGGT
GGGG*TCGAAGACAGAGCAAAATCATAACGTTATCTCAGCATCTAAAAATATAAAATGCA
TGTGTGTTGGCTTTTACTAAACGCTATTATGTGACCATAATCCAGCAAACTTATATGCTC
TTACTCTCCTCTAATAATCAGCTATTTTTACTTTGG*TCTAAGTTT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 7

CO CL719Contig1 889 7 7 U
GGGAGATCACTTGGGTTGACCCGAACATCGCCGATCTAAGGAGAGACGGTGGTTTCGATT
TTTGATTTGGTCGTAATATGGTAGTTCCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATCTTCTTGGTGG
TGAGAGTTCTGGGTTTCATCATTGCAGTTTTGGTTCTGACACGGACTGTCCACTACAGAG
GAGGCTTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGA
TGGTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAG
GTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTATCCTAA
GCTTAGTCGGAGTATGGGCTGCTCTTAAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAAATTTCT
ACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTT
CAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGC
CTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAG
GGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAGGTGATAACTCGGTATTCCACAG
AGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGC
TCGGTGTGGTTACTCCACTCCACGGCAAAGACCAAGTCCTTACTCAATAGAGAGAACTAA
TACTTTTCGTTCTTTTTTTTGTGCACCAAAACATATACTTTTCTTACAATCGCAATTTTC
TTTCAACATTTGGACCTTTTTCGAATCATCTGCGATAAAATCTTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU72TF U 11
AF RR4B529TF U 1
AF RR4C878TF U 11
AF RR4D208TF U 25
AF RR4C878JQ C 364
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RD RR4AU72TF 614 0 0
GG
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GTAATATGGTAGTTCCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATCTTCTTGGTGGTGAGAGTTCTGG
GTTTCATCATTGCATTTTTGGTTCTGACATGGACTGTCCACTACAGAGGAGGCTTAGCTC
TTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGC
TAATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGTACGAAGAACT
TGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTATCCTAAGCTTAGTCGGAG
TCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAAATTTCTACAGTCTGCATT
CATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTTCAGGGTTTGTGA
CTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGT
TCTTAGGGGTTGCCATCTATGCATTGGCACTGGTGACTGTGACTACAGGGATACTAGAGA
AGTTGACGTTCC

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR4B529TF 794 0 0
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TGAGAGTTCTGGGTTTCATCATTGCAGTTTTGGTTCTGACATGGACTGTCCACTACAGAG
GAGGCTTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGA
TGGTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAG
GTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTATCCTAA
GCTTAGTCGGAGTATGGGCTGCTCTTAAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAAATTTCT
ACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTT
CAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGC
CTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAG
GGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAGGTGATAACTCGGTATTCCACAG
AGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGC
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TACTTTTCGTTCTT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4C878TF 832 0 0
GG
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GTAATATGGTAGTTCCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATCTTCTTGGTGGTGAGAGTTCTGG
GTTTCATCATTGCAGTTTTGGTTCTGACATGGACTGTCCACTACAGAGGAGGCTTAGCTC
TTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGC
TCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGTACAAAGAACT
TGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTATCCTAAGCTTAGTCGGAG
TATGGGCTGCTCTTAAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAAATCTCTACAGTCTGCATT
CATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTTCAGGGTTTGTGA
CTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGT
TCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAGGGATACTGGAGA
AGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCTGGTGATAACTCGGTATTCCACAGAGGCCATGTTAG
TTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGCTCGGTGTGGTTA
CTCCACTCCACGGCAAAGAC*AAGTCCTTACTCAATAGAGAGA*CTAATACTTTTCGTTC
TTTTTTT*GTGCACCAAAACATATACTTTTCTTACA
ATCGCATTTTTTTC

QA 3 818 3 818
DS 

RD RR4D208TF 812 0 0
GG
ATCGCCGATCTAAGGAGAGACGGTGGTTTCGATTTTTGATTTGGTCGTAATATGGTAGTT
CCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATCTTCTTGGTGGTGAGAGTTCTGGGTTTCATCATTGCA
GTTTTGGTTCTGACACGGACTGTCCACTACAGAGGAGGCTTAGCTCTTTCCTCCGATAAC
AAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGCTCATACTCTTCAAT
GGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTT
CATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTATCCTAAGCTTAGTCGGAGTATGGGCTGCTCTT
AAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAAATTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTG
GCTTGTCTCTTTCTCTTCGCCTTTCAGTGGGCTTCAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCG
GGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCC
ATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAGG*ATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTG
CAAGTGAACCAGGTGATAACTCGGTATTCCACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGACGGGT
GTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTT*CGTG*TGCTCGGTGTGGTTACTCCACTCCACGGC
AAAGAC*AAGTCCTTACTCAATAGAGAGA*CTAATACTTTTCGTTCTTTTTTT*GTGCAC
CAAA*CATATACCTTTCTTACA
TCGCATTT

QA 3 804 3 804
DS 

RD RR4C878JQ 467 0 0
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GTCTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTTCAG
GGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTT
GGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAGGGA
TACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCTGGTGATAACTCGGTATTCCACAGAGG
CCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGCTCG
GTGTGGTTACTCCACTCCACGGCAAAGACCAAGTCCTTACTCAATAGAGAGAACTAATAC
TTTTCGTTCTTTTTTTTGTGCACCAAAACATATACTTTTCTTACAAT

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DS 

RD RR4D208JQ 775 0 0
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ACAGAGGAGGCTTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAG
TTTTGATGGTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAG
TTCAAGGTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTA
TCCTAAGCTTAGTCGGAGTATGGGCTGCTCTTAAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAA
ATTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTTTCTTCGCCTTTCAGT
GGGCTTCAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCT
TAATGCCTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAA
CCACAGG*ATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAGGTGATAACTCGGTATT
CCACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGACGGGTGTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTTTCG
TG*TGCTCGGTGTGGTTACTCCACTCCACGGCAAAGACCAAGTCCTTACTCAATAGAGAG
AACTAATACTTTTCGTTCTTTTTTTTGTGCACCAAAACATATACCTTTCTTACAATCGCA
ATTTTCTTTCAACATTTGGACCTTTTTCGAATCATCTGCGATAAAATCTTGCTAC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4B529JQ 446 0 0
ACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTTTTTTCGCTTTTCAGTGGGCTT
CAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGC
CTTGGCACGTGTTTTTAGGGGTCGCCATTTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAG
GGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAGGTGATAACTCGGTATTCCACAG
AGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTTTGATTCTTGTTTTCGGCGGTTTCGTGGTGC
TCGGTGTGGTTACTCCACTCCACGGCAAAGACCAAGTCCTTACTCAATAGAGAGAATTAA
TACTTTTCGTTCTTTTTTTTGTGCACCAAAACATATACTTTTTTTACAATCGCAATTTTC
TTTCAACATTTGGACCTTTTTGGAAT

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 7

CO CL720Contig1 1194 7 13 U
GGGGCGGGTGCGAGTGATTAATTTCGATCCTTCCATAGAAAGATAAAGAGAGAGAGAGAG
AAAAGGTTGCAACTTTGACGATTTCGACATCTAAAGGATTGTAATTGACCGCAAGAAAAA
GATTCCTCCCTCCTTCCCTCGGCTCAAAGCAAGAATCTTTCATTCATGACGACCAATTTA
GATGACTCTTCAAAGCAACTCGTCTTGCTTGCATCTGTTTGTTCCGGCATCCTCATGTGC
AAAATCGTTTATGACTTGACTGGTTTCATAAGTCCTTTGCTCTTCAGTGCTTATGGGAAA
CTCGACGGCAAAGTTAGAATGGAATGGAACAACAGGGGATTCTCAACGTTCCATGCTGTT
TTTGTTTCTGTGGCATCAATCTATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGTGTT
CATGGTGATTCAGTCATCAATAGTACAACGAGGTTGTCGGAATCTGTAATGGGGATCTCC
TTAGGCTATTTTGTAGCAGACTTAATGATGATCTTTTGGCATTTTCCTACTCTTGGTGGT
GTTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCATCATTCTTTCTGTCACAAGT
GGACAAGCACAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTGTCTGAGGCCACTACCCCGTTTGTC
AACCTACGGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAAAAAGGCTCTAAGGCGTACACTCTCAAT
GGGATTGCCCTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCGCGAGGATCCTTTTGTTTATCTACTTCTTT
GTACACATGTACTCCCATTTCCACCAGGTGAAACAAGTGTTTCCACTGGGATTTTACAGC
CTTATTGCGGTTGGACCGGTTCTGTCAGCGATGAATCTTCTTTGGTTCTGGAAAATCACC
AAAGGATTGATCAAAACAATCTCCAAGGCGACGGGAAAGAAAAAACAGTGATGGTTTCTG
CTTGACATGGAAAAAAGATTGGGATTGCATTGACTTTGATCTGTTCATGAAAAAAAGATC
CATTGATATCATATTTGTGACGTGTCTTTGAAGCCTTTTCGGTTTATAGGACTGCCTTTA
TATGGGAATTGTATATTCACAACCTTTCAGCTGTTTCTTAGGTATTCAACTTGTAAAGTT
TTAAGCAGAATCAGTGTTTAAGTTCACTTGGATTTTAGTGATGCTTGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 5 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTTTTTGTTTCTGTGGCATCAATCTATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGT
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GATCCTTTTGTTTATCTACTTCTTTGTACACATGTACTCCCATTTCCACC*GGTGAAACA
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GC

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DS 

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TTTGATCTGTTCATGAAAAAAAGATCCATTGATATCATATTTGTGACGTGTCTTTGAAGC
CTTTTCGGTTTATAGGACTGCCTTTATATGGGAATTGTATATTCACAACCTTTCAGCTGT
TTCTTAGGTATTCAACTTGTAAAGTTTTAAGCAGAATCAGTGTTTAAGTTCACTTGGATT
TTAGTGATGCTTGTTTTATC

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DS 



AS 2 8

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BQ
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CW10TF U 445
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G
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ATCGTTATTGTCT

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CTTTTATTGAGTGTTTCTTTAGTTTGGAGCCTTTTTTAATAATGAAGAGAAACTTTGATT
AGTAACTGATCCGGATTTCAATCAAGCATCAGTTGCTATAGCTCGTCGATCGTTATTGTC
T

QA 7 667 7 667
DS 



AS 1 7

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CCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B077JQ C 1
AF RR4C643JQ C 90
AF RR4B077TF U 1
AF RR4BX53TF U 1
AF RR4D335JQ C 5
AF RR4D335TF U 5
AF RR4D786TF U 5
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AGCCTTACTACCTCCACGCCAAGCACATGTACAACTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGCC
TCAAGATGTCCCTCGCTGTCTTCACTGCTTTCAGCATCGGTGTTGGTGTTCCCATCTTTG
CTGTTGTATTCCAGCAGAGGAAGACTGCTTCTGGCTGAATTGAATCTCTCTTCTCCCCTG
CTTGAATAATTTGTATGAATTCTTAAACTTTTGCTTCTGCAAAAGAGGATGTTTCTTGCT
TCTTTTGGAATATTGATAATCTGACAATTATGTATTTTAATTTGAATTCAAAGCTTGTGT

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ATGAAGATGAGCGGAGGACATGGCCATGACGAGCCTTACTACCTCCACGCCAAGCACATG
TACAACTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGCCTCAAGATGTCCCTCGCTGTCTTCACTGCT
TTCAGCATCGGTGTTGGTGTTCCCATCTTTGCTGTTGTATTCCAGCAGAGGAAGACTGCT
TCTGGCTGAATTGAATCTCTCTTCTCCCCTGCTTGAATAATTTGTATGAATTCTTAAACT
TTTGCTTCTGCAAAAGAGGATTTTTCTTGCTTCTTTTGGAATATTGATAATCTGACAATT
A

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DS 

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GTTTTTCAGTTCGAG

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TCAGATCTGTCTCAAGGCTCATAGCTTCTTCCGAATCATCAGTCTCCAGATCTGTGAGCA
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ACTACCTCCACGCCAAGCACATGTACAACTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGCCTCAAGA
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GTTTTTCAGTTCGAG

QA 3 497 3 497
DS 

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GG
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TCAGATCTGTCTCAAGGCTCATAGCTTCTTCCGAATCATCAGTCTCCAGATCTGTGAGCA
GGAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGACATGGCCATGACGAGCCTT
ACTACCTCCACGCCAAGCACATGTACAACTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGCCTCAAGA
TGTCCCTCGCTGTCTTCACTGCTTTCAGCATCGGTGTTGGTGTTCCCATCTTTGCTGTTG
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GGAATACTGATAATCTGACAATTATGTATTTTAATTTGAATTCAAAGCTTGTGTCTGAAG
GTTTTTCAGTTCGAGAAAACAATATGTGATCTGTATGAACCATAGAAAGATCACCCAAAA
A

QA 3 543 3 543
DS 



AS 1 7

CO CL723Contig1 1147 7 5 U
AAGAGTTAAACTATTCAATAAAAGTATATACTAAAAGGAAAACAAAACAAAGACTATACT
TACAAAATTCACAAAAAAGAAAACATACAAACGGAAACAAATCCAATAGTATATGTCATA
AAACTATTAAAAATAAAATATGATACTGAGTATCACATCCAAAAAAAAAATCAAATCCTT
ATATAATTGATCTTGACCAATCAAATCAGTTTAAACAGATTCACAAGTGCATTACTCTTG
CGACAAGGCTGAGGAACCATGACCTTTTGTTCTTGATCATTTCTTGTTACCACTTGAATG
GTTTGGTCATTACTTCTTCCATTCGTGTTAGTATTTTGATGATTATCTAATTCATCAATA
ACCACTCTTTGCTTTTGAAAATGCTCCATTTTGTCTTGAAATAGATAGAAGAGAACAAGA
CAAGAGAGTTGAGCTGTGAACAAGATTGTCCAAATACTTGAGTCTCTACTTGATGATGTC
TTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTATACGTTTATTATGCCAACTACTGACACTATT
GTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCATTTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAGTGGGC
CCGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCACATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAAGTCTT
TGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAATGTTCTTAAAGACATTATAGCTCCTATTGTT
GCCAAAACCACTGCTAGTATCTGGAAAATGACATGAAGGTAGAAGAACACTTTTACATTT
CTTCCATTTCCATTAGCTTTATTGGCCATTCTAATGAAGAGAATCCCCATTGGCATAAGA
AATCCCATTGAAGCCCATAAGAGAATGCCATGAAGCTTTATGCTGGCTATCATTTGATTA
CTCAACAGGGATCCGTTGTTCTTGAGATGGCTTGGTGAATGATTATCAATGGTGACGTCA
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ACAGTCCCTAGAGATGTGGAGAATTTCATTCCGATCTTAATTACACTACTATAGCTCACC
ACACTAAGAAAACAAACACTCTCTAGAACTCTCTTTAACTCTCTCTCCCTCTAAGTCAGT
TCCTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL45JQ U 1
AF RR4EV80JQ U 1
AF RR4EV80TF C 204
AF RR4FL45TF C 210
AF RR4A331JQD U 56
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AF RR4A331TFB C 416
BS 1 96 RR4EV80JQ
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BS 1002 1147 RR4A331TFB

RD RR4FL45JQ 655 0 0
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TACAAAATTCACAAAAAAGAAAACATACAAACGGAAGCAAATCCAATAGTATATGTCATA
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QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4EV80JQ 698 0 0
AAGAGTTAAACTATTCAATAAAAGTATATACTAAAAGGAAAACAAAACAAAGACTATACT
TACAAAATTCACAAAAAAGAAAACATACAAACGGAAGCAAATCCAATAGTATATGTCATA
AAACTATTAAAAATAAAATATGATACTGAGTATCACATCCAAAAAAAAAATCAAATCCTT
ATATAATTGATCTTGACCAATCAAATCAGTTTAAACAGATTCACAAGTGCATTACTCTTG
CGACAAGGCTGAGGAACCATGACCTTTTGTTCTTGATCATTTCTTGTTACCACTTGAATG
GTTTGGTCATTACTTCTTCCATTCGTGTTAGTATTTTGATGATTATCTAATTCATCAATA
ACCACTCTTTGCTTTTGAAAATGCTCCATTTTGTCTTGAAATAGATAGAAGAGAACAAGA
CAAGAGAGTTGAGCTGTGAACAAGATTGTCCAAATACTTGAGTCTCTACTTGATGATGTC
TTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTATACGTTTATTATGCCAACTACTGACACTATT
GTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCATTTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAGTGGGC
CCGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCACATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAAGTCTT
TGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAATGTTCTTAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4EV80TF 659 0 0
CAATCAG
TTAAACAGATTCACAAGTGCATTACTCT*GCGACAAGGCTGAGGAACCATGAC*TTTTGT
TCTTGATCATTTCTTGTTACCACTTGAATGGTTTGGTCATTACTTCTTCCATTCGTGTTA
GTATTTTGATGATTATCTAATTCATCAATAACCACTCTTTGCTTTTGAAAATGCTCCATT
TTGTCTTGAAATAGATAGAAGAGAACAAGACAAGAGAGTTGAGCTGTGAACAAGATTGTC
CAAATACTTGAGTCTCTACTTGATGATGTCTTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTAT
ACGTTTATTATGCCAACTACTGACACTATTGTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCAT
TTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAGTGGGCCCGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCAC
ATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAAGTCTTTGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAAT
GTTCTTAAAGACATTATAGCTCCTATTGTTGCCAAAACCACTGCTAGTATCTGGAAAATG
ACATGAAGGTAGAAGAACACTTTTACATTTCTTCCATTTCCATTAGCTTTATTGGCCATT
CTAATGAAGAGAATCCCCATTGGCATAAGAAATCCCATTGAAGCCCATAAG
C

QA 8 658 8 658
DS 

RD RR4FL45TF 653 0 0
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TTCTTGATCATTTCTTGTTACCACTTGAATGGTTTGGTCATTACTTCTTCCATTCGTGTT
AGTATTTTGATGATTATCTAATTCATCAATAACCACTCTTTGCTTTTGAAAATGCTCCAT
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CCAAATACTTGAGTCTCTACTTGATGATGTCTTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTA
TACGTTTATTATGCCAACTACTGACACTATTGTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCA
TTTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAGTGGGCCCGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCA
CATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAAGTCTTTGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAA
TGTTCTTAAAGACATTATAGCTCCTATTGTTGCCAAAACCACTGCTAGTATCTGGAAAAT
GACATGAAGGTAGAAGAACACTTTTACATTTCTTCCATTTCCATTAGCTTTATTGGCCAT
TCTAATGAAGAGAATCCCCATTGGCATAAGAAATCCCATTGAAGCCCATAAG
C

QA 1 652 1 652
DS 

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C
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CATAAAACTATTAAAAATAAAATATGATACTGAGTATCACATCCAAAAAAAAAATCAAAT
CCTTATATAATTGATCTTGACCAATCAAATCAGTTTAAACAGATTCACAAGTGCATTACT
CTTGCGACAAGGCTGAGGAACCATGACCTTTTGTTCTTGATCATTTCTTGTTACCACTTG
AATGGTTTGGTCATTACTTCTTCCATTCGTGTTAGTATTTTGATGATTATCTAATTCATC
AATAACCACTCTTTGCTTTTGAAAATGCTCCATTTTGTCTTGAAATAGATAGAAGAGAAC
AAGACAAGAGAGTTGAGCTGTGAACAAGATTGTCCAAATACTTGAGTCTCTACTTGATGA
TGTCTTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTATACGTTTATTATGCCAACTACTGACAC
TATTGTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCATTTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAGT
GGGCCTGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCACATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAAG
TCTTTGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAATGTTCTTAAAGACATTATAGCTCCTAT
TGTTGCCAAAACCACTGCTAGTATCTGGAAAATGACATGAAGGTAGAAGAACACTTTTAC
ATTTCTTCCATTTCCATTAGCTTTATTGGCCATTCTAATGAAGAGAATCCCCATTGGCAT
AAGAAATCCCATTGAAGCCCATAAGAGAATGCCATGAAGCTTTATGCTGGCTA

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DS 

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C
TACTTACAAAATTCACAAAAAAGAAAACATACAAACGGAAACAAATCCAATAGTATATGT
CATAAAACTATTAAAAATAAAATATGATACTGAGTATCACATCCAAAAAAAAAATCAAAT
CCTTATATAATTGATCTTGACCAATCAAATCAGTTTAAACAGATTCACAAGTGCATTACT
CTTGCGACAAGGCTGAGGAACCATGACCTTTTGTTCTTGATCATTTCTTGTTACCACTTG
AATGGTTTGGTCATTACTTCTTCCATTCGTGTTAGTATTTTGATGATTATCTAATTCATC
AATAACCACTCTTTGCTTTTGAAAATGCTCCATTTTGTCTTGAAATAGATAGAAGAGAAC
AAGACAAGAGAGTTGAGCTGTGAACAAGATTGTCCAAATACTTGAGTCTCTACTTGATGA
TGTCTTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTATACGTTTATTATGCCAACTACTGACAC
TATTGTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCATTTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAGT
GGGCCTGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCACATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAAG
TCTTTGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAATGTTCTTAAAGACATTATAGCTCCTAT
TGTTGCCAAAACCACTGCTAGTATCTGGAAAATGACATGAAGGTAGAAGAACACTTTTAC
ATTTCTTCCATTTCCATTAGCTTTATTGGCCATTCTAATGAAGAGAATCCCCATTGGCAT
AAGAAATCCCATTGAAGCCCATAAGAGAATGCCATGAAGCTTTATGCTGGCTATCATTTG
ATTACTCAACAGGGATCCGTTGTTCTTGAGATGGCTTGGTGAATGATTATCAATGGTGAC
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DS 

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ATGTCTTCTTTTGGTAAGCTCTTATGCCTGTGTATACGTTTATTATGCCAACTACTGACA
CTATTGTTCCAAGAATCCAATGCAATAAAAACCATTTCAACCTCCTTTTGCTCCCTCTAG
TGGGCCTGAAGATACCGGTCAAGAATTGGAGCCACATGGCAACATAAAGAGCCAGGCCAA
GTCTTTGATGGTTGTTGTTAAAGGAGTTCTCCAATGTTCTTAAAGACATTATAGCTCCTA
TTGTTGCCAAAACCACTGCTAGTATCTGGAAAATGACATGAAGGTAGAAGAACACTTTTA
CATTTCTTCCATTTCCATTAGCTTTATTGGCCATTCTAATGAAGAGAATCCCCATTGGCA
TAAGAAATCCCATTGAAGCCCATAAGAGAATGCCATGAAGCTTTATGCTGGCTATCATTT
GATTACTCAACAGGGATCCGTTGTTCTTGAGATGGCTTGGTGAATGATTATCAATGGTGA
CGTCAAGAGATGAACAGATGACAGATGGTGAGGCAGAGGATAGATAGAAGATAACAGAAA
CCAAAACAGTCCCTAGAGATGTGGAGAATTTCATTCCGATCTTAATTACACTACTATAGC
TCACCACACTAAGAAAACAAACACTCTCTAGAACTCTCTTTAACTCTCTCTCCCTCTAAG
TCAGTTCCTTCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 7

CO CL724Contig1 1390 7 14 U
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GGATCTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACG
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AAAGACTTTGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCAATCCAGACTTCTAT
AACTGGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAA
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GATGATCTTATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCA
GCCGGAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACA
GCTAAGGTCAAGTGTGTTTCCGACGCCGGTTTCTTCATCCACGGTAAGGATATCAGTGGA
GGATCTTACATAGAATCATACTACAGCAAAGTTGTAGCGACCCACGGATCTGCAAAGAGT
CTTCCTGCTTCATGTACCTCAAGTATGAAGCCAGAACTGTGTTTCTTCCCGCAATACGTT
GTAAAGACCATGCAGACACCACTTTTCGTAATCAATGCCGCCTTCGATTCTTGGCAGATC
AAGAATGTTTTGGCTCCAACCTCTGTTGATAAACGCAAAGAGTGGAAGGATTGTACGCTT
GATCTTAAGAAGTGTACAGCCGCTCAGCTTCAAACCGTTCAAGGGTATAGAGACCAAATG
TTGGCTGCGTTAGCACCTGTTCGAGCAACGACGACTAGCGGATTATTCCTAGATTCATGC
CACGCTCATTGCCAAGGTGGAAGTGCAGCCACTTGGTCCGGTGCTCAAGGCCCACAAGTC
GGCAATACGAAAATGGCAAAAGCAGTTGGAGACTGGTTTTATGAGCGGAGTACGTTTCAG
AACATAGATTGCCCATCCTTGAATTTCAACCCTACTTGTCCTGCAGTATCTACTGAAGAC
TAAAATGTATTGATGTTTTAAAATTCCAAAAAAAAATTATTTCTTTGAATATGTTGTTTA
AATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAAAACATGAATAATAAATAATC
ATTTCCACTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4BP15TF U 1
AF RR4GM52TF U 3
AF RR4FM46TF U 66
AF RR4BP15JQ C 564
AF RR4GM52JQ C 608
AF RR4E176JQ C 793
AF RR4E176TF U 793
BS 1 300 RR4BP15TF
BS 301 301 RR4GM52TF
BS 302 492 RR4BP15TF
BS 493 493 RR4GM52TF
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BS 689 689 RR4FM46TF
BS 690 699 RR4BP15TF
BS 700 801 RR4FM46TF
BS 802 1389 RR4E176TF
BS 1390 1390 RR4E176JQ

RD RR4BP15TF 699 0 0
GGATGAACTTGTAAACCTTACTCTTGAAGACTCCTCTTTTACACATTTCTCTACGTGAAT
AAGAATCTGAAGAGCCATTTCTCAAGGATGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTC
CTGGTCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATCACATATCTTGAATCT
GCTGTGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAA
GGATCTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACG
TATATAGCTACATGCGTAAAACGTCAAACTACGATGAAGGGTTCGTCTAAGTTTATGAAC
AAAGACTTTGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCAATCCAGACTTCTAT
AACTGGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAA
GCCGTTGATCCGGCAAACAAGCTCTTCTTCCGCGGTGCTAGGGTTTGGCGTGCGGTGATC
GATGATCTTATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCA
GCCGGAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAA*CA
GCTAAG*TCAAGTGTGTTTCCGACGCCG*TTTCTTCATC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4GM52TF 682 0 0
GG
GAACTTGTAAACCTTACTCTTGAAGACTCCTCTTTTACACATTTCTCTACGTGAATAAGA
ATCTGAAGAGCCATTTCTCAAGGATGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTCCTGG
TCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATCACATATCTTGAATCTGCTG
TGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAAGGAT
CTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACGGATA
TAGCTACATGCGTAAAACGTCAAACTACGATGAAGGGTTCGTCTAAGTTTATGAACAAAG
ACTTTGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCAATCCAGACTTCTATAACT
GGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAAGCCG
TTGATCCGACAAACAAGCTCTTCTTCCGCGGTGCTAGGGTTTGGCGTGCGGTGATCGATG
ATCTTATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCAGCCG
GAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACAGCTA
AG*TCAAGTGTGTTTCCGAC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4FM46TF 736 0 0
AGG
GAAGAGCCATTTCTCAAGGATGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTCCTGGTCTT
AGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATCACATATCTTGAATCTGCTGTGGC
TAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAAGGATCTGG
CTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACGGATATAGC
TACATGCGTAAAACGTCAAACTACGATGAAGGGTTCGTCTAAGTTTATGAACAAAGACTT
TGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCAATCCAGACTTCTATAACTGGAA
TAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAGGCCGTTGA
TCCGACAAACAAGCTCTTCTTCCGCGGTGCTAGGGTTTGGCGTGCGGTGATCGATGATCT
TATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCAGCCGGAGC
ATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACAGCTAAGGT
CAAGTGTGTTTCCGACGCCGGTTTCTTCATCCACGGTAAGGATATCAGTGGAGGATCTTA
CATAGAATCATACTACAGCAAAGTTGTAGCGACCCACGGATCTGCAAAGAGTCTTCCTGC
TTCATGTACCTCA

QA 4 736 4 736
DS 

RD RR4BP15JQ 724 0 0
GAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCAGCCGGAGCATTGGCTTCTATTCT
ACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACAGCTAAGGTCAAGTGTGTTTCCGA
CGCCGGTTTCTTCATCCACGGTAAGGATATCAGTGGAGGATCTTACATAGAATCATACTA
CAGCAAAGTTGTAGCGACCCACGGATCTGCAAAGAGTCTTCCTGCTTCATGTACCTCAAG
TATGAAGCCAGAACTGTGTTTCTTCCCGCAATACGTTGTAAAGACCATGCAAACACCACT
TTTCGTAATCAATGCCCCCTTCGATTCTTGGCAGATCAAGAATGTTTTGGCTCCAACCTT
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TCAGCTTCAAACCGTTCAAGGGTATAGAGACCAAATGTTGGCTGCGTTAGCACCTGTTCG
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TTCC

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AATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAAAACATGAATAATAAATAATCATTTCCA
CT

QA 1 782 1 782
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G
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G
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T

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DS 



AS 1 5

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CCAAGTGGAGCTTATAAAGCGTCGTCGTTTTGCCAGCGTTATCCAAACCAACGACGACGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AS17JQ U 1
AF RR4CI79JQ U 14
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DS 



AS 1 7

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TCTTCTGTACAATTAACTTGTACAACGAAACTGCTCACACTTTAAAATGTTAAATTATAT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 20 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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TCTTCTGTACAATTAACTTGTACAACGAAACTGCTCACACTTTAAAATGTTAAATTATAT
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GC
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DS 

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GCCTT
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GCA

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DS 

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AAAAAA

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TCCCTCAAAAGCAGCCATGTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTAACAAGGCAGATGAGAGAGG
AAAAAA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 7

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GACTGGAGAAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGGTTTTCAACTAGAGTTATCGTTTGA
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TATTGGTCGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4D915JQ C 104
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GTGGTGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATGTACAATACTTTGAAAA

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TGAAATCGGTTTGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGAT
GATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATTGTCTAC
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GTGGTGGTTTGCAATCTTTTGTGT

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TGTGGTGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATGTACAATACTTTGAAAAATCAGATTGG
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GG
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GCTGTGCATGATGATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGT
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A*TCTGATTGGAGTTTATTGGTCGAAAAAA

QA 3 752 3 752
DS 



AS 1 7

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BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AAGTAGGAACTGTGTGAAGCCATCTATTTCCAGTTGAGTTTCACGTAGCCTTCGCACCGG
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AAAGTCGCAAGCTTGGCTAGACCAGAACCCAAAGAGAGAAGTCCCAGACGATAGCCTCAA
ATCGTCGATTCATCACAGACACAAGATCT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4C954JQ 751 0 0
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AATGCATCAAGGATGCTATCTAAAGCAGAGGTCTAAACAAAGCCCCAAAAAAGTTAAAAA
AGACATTGCAAGACAATAAAGGTTTAGCCATGTCCCAAAGGAGATGAGTAAAGCTTAGCT
AAGTAGGAACTGTGTGAAGCCATCTATTTCCAGTTGAGTTTCACGTAGCCTTCGCACCGG
TCCCTGTAACGAAGCGTGAAACATCATAGGAGAATAACAGCCGGAGAACAAACCGAGGAG
CCGCGGTTTGTCCCGAAGGCGACCCCGAGAGGAGGACAGGCGAAGCGGGGTTGACTAAGT
CCCGGTCCGGCTATCAACAACCAATGGAGTCCACTCCAGACGCTGCAAGAACTCCGGAAG
ATGACAAATCGACTTCCCGGAAGTCCTAAACCGAGCAAGAGAAGCGAGCAATGGAGGCGC
AGAGATGATACTACCTGAGACAAGCGGAGGTTTAAGCTCTGGACTCCGGTCCCCTCATAG
TAGCAAACGCTCAAAAAGATTCAGCTTCACGTACGAGGAAGAGGCAGGACACACGAGAAT
CATCTCCTTTCTGAAAATACGAAGAACAGAGGAGCAAGCTCCAATCGACATACGACGCGA
AAAGTCGCAAGCTTGGCTAGACCAGAACCCAAAGAGAGAAGTCCCAGACGATAGCCTCAA
ATCGTCGATTCATCACAGACACAAGATCTAG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4BN50JQ 798 0 0
TTCATTATCATGGCAATGGTAATGACACAGAGGATACAATCAGGTTTTGAAACAAATCCT
AATGCATCAAGGATGCTATCTAAAGCAGAGGTCTAAACAAAGCCCCAAAAAAGTTAAAAA
AGACATTGCAAGACAATAAAGGTTTAGCCATGTCCCAAAGGAGATGAGTAAAGCTTAGCT
AAGTAGGAACTGTGTGAAGCCATCTATTTCCAGTTGAGTTTCACGTAGCCTTCGCACCGG
TCCCTGTAACGAAGCGTGAAACATCATAGGAGAATAACAGCCGGAGAACAAACCGAGGAG
CCGCGGTTTGTCCCGAAGGCGACCCCGAGAGGAGGACAGGCGAAGCGGGGTTGACTAAGT
CCCGGTCCGGCTATCAACAACCAATGGAGTCCACTCCAGACGCTGCAAGAACTCCAGAAG
ATGACAAATCGACTTCCCGGAAGTCCTAAACCGAGCAAGAGAAGCGAGCAATGGAGGCGC
AGAGATGATACTACCTGAGACAAGCGGAGGTTTAAGCTCTGGACTCCGGTCCCCTCATAG
TAGCAAGCACTCAAAAAGATTCAGCTTCACGTACGAGGAAGAGGCAGGACACACGAGAAT
CATCTCCTTTCTGAAAATACGAAGAACAGAGGAGCAAGCTCCAATCGACATACGACGCGA
AAAGTCGCAAGCTTGGCTAGACCAGAACCCAAAGAGAGAAGTCCCAGACGATAGCCTCAA
ATCGTCGATTCATCACAGACACAAGATCTAGAAAGGAAGTTCTACGAAAGCAACCGCCTG
A*GAGATAGGGGAGGAGA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4AB57TF 775 0 0
AACGAAGCGTGAAACATCATAGGAGAATAACAGCCGGAGAACAAACCGAGGAGCCGCGGT
TTGTCCCGAAGGCGACCCCGAGAGGAGGACAGGCGAAGCGGGGTTGACTAAGTCCCGGTC
CGGCTATCAACAACCAATGGAGTCCACTCCAGACGCTGCAAGAACTCCAGAAGATGACAA
ATCGACTTCCCGGAAGTCCTAAACCGAGCAAGAGAAGCGAGCAATGGAGGCGCAGAGATG
ATACTACCTGAGACAAGCGGAGGTTTAAGCTCTGGACTCCGGTCCCCTCATAGTAGCAAA
CACTCAAAAAGATTCAGCTTCACGTACGAGGAAGAGGCAGGACACACGAGAATCATCTCC
TTTCTGAAAATACGAAGAACAGAGGAGCAAGCTCCAATCGACATACGACGCGAAAAGTCG
CAAGCTTGGCTAGACCAGAACCCAAAGAGAGAAGTCCCAGACGATAGCCTCAAATCGTCG
ATTCATCACAGACACAAGATCTAGAAGGGAAGTTCTACGAAAGCAACCGCCTGAAGAGAT
AGGAGAGGAGAAGACGGAGAGACCATACCAGAAGAACAGAGGCAGCGACGCTCTGCAAGA
CGGCGAGCTCTCCAAACTGAAATCTGACCCAGATCCAACAAATCAAATCTCAGATCTACA
ACTGGAGTGAAGCTTCCTGCAGAAAATCGACCATACACCACCTCGCCAACACTCCGGAGG
CGACGAACACACACCCTACGCCTGATTTGAACCCTTGGATCCGGCCGAAATCTT
C

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4BN50TF 617 0 0
CATAGTAGCAAGCACTCAAAA*GAT*CAGCTTCACGTACGAGGAAGAGGCAGGACACACG
AGAATCATCTCCTTTCTGAAAATACGAAGAACAGAGGAGCAAGCTCCAATCGACATACGA
CGCGAAAAGTCGCAAGCTTGGCTAGACCAGAACCCAAAGAGAGAAGTCCCAGACGATAGC
CTCAAATCGTCGATTCATCACAGACACAAGATCTAGAAGGGAAGTTCTACGAAAGCAACC
GCCTGAAGAGATAGGAGAGGAGAAGACGGAGAGACCATACCAGAAGAACAGAGGCAGCGA
CGCTCTGCAAGACGGCGAGCTCTCCAAACTGAAATCTGACCCAGATCCAACAAATCAAAT
CTCAGATCTACAACTGGAGTGAAGCTTCCTGCAGAAAATCGACCATACACCACCTCGCCA
ACACTCCGGAGGCGACGAGCACACACCCTACGCCTGATTTGAACCCTTGGATCCGGCCGC
AATCTTAGGGTAAACTAGAGATGTTGAAGCAAAGAGGAAGTGGAAAAGCCAAGGAAACCA
CAAGAGAGGAGGCAGGGAAACATGGAACACTAAAAGGGGTGGCGACCGACGGCTAGGGAA
GGCACTGCCGGCCACCG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4C954TF 712 0 0
TCAGCTTCACGTACGAGGAAGAGGCAGGACACACGAGAATCATCTCCTTTCTGAAAATAC
GAAGAACAGAGGAGCAAGCTCCAATCGACATACGACGCGAAAAGTCGCAAGCTTGGCTAG
ACCAGAACCCAAAGAGAGAAGTCCCAGACGATAGCCTCAAATCGTCGATTCATCACAGAC
ACAAGATCTAGAAGGGAAGTTCTACGAAAGCAACCGCCTGAAGAGATAGGAGAGGAGAAG
ACGGAGAGACCATACCAGAAGAACAGAGGCAGCGACGCTCTGCAAGACGGCGAGCTCTCC
AAACTGAAATCTGACCCAGATCCAACAAATCAAATCTCAGATCTACAACTGGAGTGAAGC
TTCCTGCAGAAAATCGACCATACACCACCTCGCCAACACTCCGGAGGCGACGAGCACACA
CCCTACGCCTGATTTGAACCCTTGGATCCGGCCGCAATCTTAGGGTAAACTAGAGATGTT
GAAGCAAAGAGGAAGTGGAAAAGCCAAGGAAACCACAAGAGAGGAGGCAGGGAAACATGG
AACACTAAAAGGGGTGGCGACCGACGGCTAAGGAAAGCACTGCCGGCCACCGGAACAACA
AACGGAGAGGAGAGACTAGCGGGAGTGATTTGTGGGAGAAAGAGTTGAGAGAAACTTTCT
CTCTCCTCTCTCTAACTTTTTTTTATTTTTTGTTCAAGAGAAGTTATGTTCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 8

CO CL729Contig1 1010 8 8 U
GGGTCAGACCCTACAAAAGGATCCAGACTTTTATTAATATAAAAATATTACAAATATTAA
AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAGAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTGTTGAAAAGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCTGGCAACCCTAGTGA
AGTCAATCGGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGA
ACTTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTTTAATACAACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCT
TTTTTCCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTCCACGAGAAGGTGACTGGTGCCCCGTCGCACA
ATCCGCCCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCTTCGGAGCATATTCGGGGTGAGTGA
GCGTACCAGTGAAGACAGCGCCGTGAAAGTGGTGCACACCCTTGGCTTTGCCTCCGAAGA
CTTCTCCCTTGGACCTGCCCTTTGAGGACTCGGCGATGAGTACATGTCCTCTTTGTTTAT
CCAGCTTCTGGGTGATTTTGACCTCAGGCCTTTTGGGCTCGTGATGGTAGATCTCAATCA
ATTTGTCCGTCAACGACTCGGCCATGGTGTGTATAAGGGCGACTGTGGTGGGTTCGGCAA
TGTCTTTGAAGAGAATGATATCGCGAACGGAGCTCTCGAGGAAGTTGCCGAGGGACTGCC
AATGTCGCGTCCAATCCCTCGCGTTGTATGCGATACCCGCTCGTTCTAGAGAGTACACGG
TTCCGACTAGTGGGATATACTCCACTACGGAGTAGGCGACATCTTCGAGTTGGGTGAACC
ACTGAGACATGATGGCTTATATCTGTTGATAGGCGGTAAATGGATGATCC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E952JQ U 1
AF RR4E952TF C 1
AF RR4AS93JQ U 30
AF RR4DU92JQ U 1
AF RR4DU92TF C 1
AF RR4BR80JQ U 1
AF RR4AS93TF C 268
AF RR4BR80TF C 315
BS 1 379 RR4BR80JQ
BS 380 380 RR4DU92JQ
BS 381 468 RR4BR80JQ
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BS 736 1010 RR4AS93TF

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C

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DS 

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AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAGAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTATTGAAAAGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTTTGGCAACCCTAGTGA
AGTCAATCGGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCC
C

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4AS93JQ 504 0 0
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ACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGAACTTTGTGGGTGTGCCGGAAATCAGTTTA
ATACAACCATACGAGGCTTCAGGGACATTCTTTTTTCCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTC
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TCGCCCCTAGGAGCATATTCGGGG

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4DU92JQ 562 0 0
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AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAGAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTGTTGAAAAGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCTGGCAACCCTAGTGA
AGTCAATCAGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGA
ACTTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTTTAATACAACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCT
TTTT*CCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTACACGAGAAGGTGACTGGTGCCCCGTCGCACA
ATCCGCCCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCTTCGGAGCATATTCGGGGTGAGTGA
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QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4DU92TF 562 0 0
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AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAGAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTGTTGAAAAGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCTGGCAACCCTAGTGA
AGTCAATCAGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGA
ACTTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTTTAATACAACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCT
TTTT*CCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTACACGAGAAGGTGACTGGTGCCCCGTCGCACA
ATCCGCCCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCTTCGGAGCATATTCGGGGTGAGTGA
GCGTACCAGTGAAGACAGCGCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4BR80JQ 735 0 0
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AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAGAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTGTTGAAAAGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCTGGCAACCCTAGTGA
AGTCAATCGGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGA
ACTTTGTGGGTGTGCCGGAAATCAGTTTAATACAACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCT
TTTTTCCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTCCACGAGAAGGTGACTGGTGTCCCGTCGCACA
ATCCGCCCGGAATATCGAGCCGGATCTTCTCGCCCTTCGGAGCATATTCGGGGTGAGTGA
GCGTACCAGTGAAGACAGCGCCGTGAAAGTGGTGCACACCCTTGGCTTTGCCTCCGAAGA
CTTCTCCCTTGGACCTGCCCTTTGAGGACTCGGCGATGAGTACATGTCCTCTTTGTTTAT
CCAGCTTCTGGGTGATTTTGACCTCAGGCCTTTTGGGCTCGTGATGGTAGATCTCAATCA
ATTTGTCCGTCAACG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4AS93TF 743 0 0
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CCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGAACTTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTT
TAATACAACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCTTTTTTCCATAGTAGTTTGTAGTCCATT
TCCACGTGAAGGTGACTGGTGCCCCGTCGCACAATCCGCCCGGAATATCAAGCCGGATCT
TCTCGCCCCTAGGAGCATATTCGGGGTGAGTGAGCGTACCAGTGAAGACAGCGCCGTGAA
AGTGGTGCACACCCTTGGCTTTGCCTCCGAAGACTTCTCCCTTGGACCTGCCCTTTGAGG
ACTCGGCGATGAGTACATGTCCTCTTTGTTTATCCAGCTTCTGGGTGATTTTGACCTCAG
GCCTTTTGGGCTCGTGATGGTAGATCACAATCAATTTGTCCGTCAACGACTCGGCCATGG
TGTGTATAAGGGCGACTGTGGTGGGTTCGGCAATGTCTTTGAAGAGAATGATATCGCGAA
CGGAGCTCTCGAGGAAGTTGCCGAGGGACTGCCAATGTCGCGTCCAATCCCTCGCGTTGT
ATGCGATACCCGCTCGTTCTAGAGAGTACACGGTTCCGACTAGTGGGATATACTCCACTA
CGGAGTAGGCGACATCTTCGAGTTGGGTGAACCACTGAGACATGATGGCTTATATCTGTT
GATAGGCGGTAAATGGATGATCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4BR80TF 696 0 0
AAGTCATAAC*TGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGAACTTTGTGGGTGTG
CCGGAGATCAGTTTAATACAACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCTTTTTTCCATAGTAG
TTTGTAGTCCATTTCCACGAGAAGGTGACTGGTGTCCCGTCGCACAATCCGCCCGGAATA
TCGAGCCGGATCTTCTCGCCCTTCGGAGCATATTCGGGGTGAGTGAGCGTACCAGTGAAG
ACAGCGCCGTGAAAGTGGTGCACACCCTTGGCTTTGCCTCCGAAGACTTCTCCCTTGGAC
CTGCCCTTTGAGGACTCGGCGATGAGTACATGTCCTCTTTGTTTATCCAGCTTCTGGGTG
ATTTTGACCTCAGGCCTTTTGGGCTCGTGATGGTAGATCTCAATCAATTTGTCCGTCAAC
GACTCGGCCGTGGTGTGTATAAGGGCGACTGTGGTGGGTTCGGCAATGTCTTTGAAGAGA
ATGATATCGCGAACGGAGCTCTCGAGGAAGTTGCCGAGGGACTGCCAATGTCGCGTCCAA
TCCCTCGCGTTGTATGCGATACCCGCTCGTTCTAGAGAGTACACGGTTCCGACTAGTGGG
ATATATTCCACTACGGAGTAGGCGACATCTTCGAGTTGGGTGAACCACTGAGACATGATG
GCTTGTATCTGTTGATAGGCGGTAAATGGATGATCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 8

CO CL730Contig1 985 8 22 U
GGCTCCCCTCTCTCCTCCTGCTCTTACCCATAAGAAAATCGTCAGCCTCCATCTATTACT
CTTAGGATCGATTTGAAGCTTAAAAGTCTCTCCTTTCAGATGGATGCTGATTACAAGAGA
CTCTTGTCTACGCTTCGATCCCGATCTGAGGTTTTAATGGGCTTTGAAGAAATAGATGGT
GATGATGATTTCCAGGAGGAGTTTGCCTGCCCGTTCTGCGCAGAATCGTATGATATCATC
GCCTTGTGCTGTCACATAGACGATGAACATAATCTAGAGTCAAAGAACGCGGTATGCCCT
GTTTGCTCTCTAAGAGTGGGAATTGATATCGTAGCGCACATTACACTTCATCATGGGAGT
TTATTCAAGATGCCGCGAAAGAGGAAATCACGAAAAACTGGTTCACTTTCTCTTCTTCGG
AAAGAGCTAAGAGAAGGAGATCTACAAAAGTTGTTAGGAATTTCTTCTCGCATTGGTTCT
ACTACCGCATCTAGTGGAACTCCTGATCCTCTTCTTTCGTCATTTATCTCACCTACACGA
TCACATTTATTTCCGGTGACTCGGCAAACGGAAAAAGTATCGGACGAAAAACAAATAGAG
CGCAAGAGACAAGTGTGTATCCCACCTGTCTCGTTGAAGGATCAAGAAGAGACTAGGAAT
AGATCAGAGTTTGTTCAGAGGCTCTTGTCATCAGCTATTTTCTATGAGGTCTGATCAAAG
CAAAGAAAAAATAATTGCGGAACTATTACTGCGGGGAATCAGACTTGAGAAGATCTGGTT
TTGAGAAAGAAAGAAAAAAAAAGTGGCTGGGGTGAGAAGAAGACGGAGAAGAGATGCAGC
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ACGCTGCTGAATAAATTGTGTGGAATTGTGTGTGTTCTAAAGTTTATTAAGTAGTCAAAA
CGTAAGATGAAGAATATGCATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

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AF RR4EX13TF U 1
AF RR4CL60TF U 13
AF RR4E190TF U 13
AF RR4CL60JQ C 76
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AF RR4E190JQ C 303
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GGAAAAA

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ACGAAAAACTGGTTCACTTTCTCTTCTTCGGAAAGAGCTAAGAGAAGGAGATCTACAAAA
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GAAAAA

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CCCGTTCTGCGCAGAATCGTATGATATCATCGCCTTGTGCTGTCACATAGACGATGAACA
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ACGAAAAACTGGTTCACTTTCTCTTCTTCGGAAAGAGCTAAGAGAAGGAGATCTACAAAA
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TGCGGGGA*TCAGACTTGAGAAGATCTGGTTT
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QA 18 769 18 769
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DS 

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DS 

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QA 1 571 1 571
DS 

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ATTCAAGATGCCGCGAAAGAGGAAATCACGAAAAACTGGTTCACTTTCTCTTCTTCGGAA
AGAGCTAAGAGAAGGAGATCTACAAAAGTTGTTAGGAATTTCTTCTCGCATTGGTTCTAC
TACCGCATCTAGTGGAACTCCTGATCCTCTTCTTTCGTCATTTATCTCACCTACACGATC
ACATTTATTTCCGGTGATTCGGCAAACGGAAAAAGTATCGGACGAAAAACAAATAGAGCG
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ATCAGAGTTTGTTCAGAGGCTCTTGTCATCAGCTATTTTCTATGAGGTCTGATCAAAGCA
AAGAAAAAATAATTGCGGAACTATTACTGCGGGGAATCAGACTTGAGAAGATCTGGTTTT
GAGAAAGAAAGAAAAAAAAAGTGGCTGGGGTGAGAAGAAGACGGAGAAGAGATGCAGCTG
TGATATCTATTTCCATGTCTATGTATTGTGTATGTTTTAATTATAAGACCACAAGTAGAC
GCTGCTGAATAAATTGTGTGGAATTGTGTGTGTTCTAAAGTTTATTAAGTAGTCAAAACG
TAAGATGAAGAATATGCATTG
AC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 7

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AGAACAGGTCTCGTCACCATGTCTCCGCTATGAATGTAGCCACAGAAATCAACTCCACTG
AACAGGTAGGGAAGTTTGATTCAAAGAAGAGTGCGAGGCCTGTTTATCCATTTGCAGCTA
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GTGGTGTGATGATTATGGGAGACAGAGGAACCGGGAAGTCCACAACTGTCAGGTCCTTAG
TCGATCTGCTACCCGAGATCAAGGTGGTTGCAGGTGACCCTTACAACTCTGACCCGTTAG
ATCCCGAGTTCATGGGTGTTGAGGTGAGAGAGAGGGTGGAAAGAGGCGAGCAGGTTCCTG
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GTGGAACAATCGATATCGAGAAGGCTTTGACAGAAGGTGTGAAAGCCTTTGAGCCTGGCT
TGTTGGCTAAAGCCAACAGAGGGATACTCTATGTTGATGAAGTCAACCTCTTGGATGATC
ATTTGGTTGATGTGCTTCTTGATTCAGCTGCTTCCGGTTGGAACACGGTTGAGAGAGAAG
GGATCTCGATTTCTCACCCGGCGAGGTTTATCTTGATTGGTTCCGGGAATCCTGAGGAAG
GAGAGCTTAGGCCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATGCGCAAGTAGAGACGGTTA
GAGATGCTGATCTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTCGGTTTGATAGTAACCCAC
AGGATTTCCGTGAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTCAAGACCAGATTTCAAATG
CGAGAAGCAATCTTTCCTCTGTTCAGATTGACCGGGAGTTGAAGGTGAAGATCTCTAAGG
TGTGTTCGGAGCTCAATGTTGATGGGCTGAGAGGAGACATTGTGACTAACAGAGCAGCGA
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TGTTGGTTTCTGAGAAGTTCGCTGAGGTTTTCAGTTGAACAAGGAGAAAA*GATTATGTT
ATCATTTTCTTAACTTTTGTAAACGATGAGAA*GATCCTGAAACAAACAAACATGCAAAT
CTGATTCTATACTTTCTACATTGAGTTGATTGAATGTTCAAGCAAACAGTCTTATGTATT
CTGCTTTAAGTTGATTGGATAATATCTGTTCAAAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

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AACAGGTAGGGAAGTTTGATTCAAAGAAGAGTGCGAGGCCTGTTTATCCATTTGCAGCTA
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GTGGTGTGATGATTATGGGAGACAGAGGAACCGGGAAGTCCACAACTGTCAGGTCCTTAG
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ATCCCGAGTTCATGGGTGTTGAGGTGAGAGAGAGGGTGGAAAGAGGCGAGCAGGTTCCTG
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GTGGAACAATCGATA

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G
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AGTCGATCTGCTACCCGAGATCAAGGTGGTTGCAGGTGACCCTTACAACTCTGACCCGTT
AGATCCCGAGTTCATGGGTGTTGAGGTGAGAGAGAGGGTGGAAAGAGGCGAGCAGGTTCC
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CTGTGGAACAATCGATATCGAGAAGGCTTTGACAGAAGGTGTGAAAGCCTTTGAGCCTGG
CTTGTTGGCTAAAGCCAACAGAGGGATACTCTATGTTGATGAAGTCAACCTCTTGGATGA
TCATTTGGTTGATGTGCTTCTTGATTCAGCTGCTTCCGGTTGGAACACGGTTGAGAGAGA
AGGGATCTCGATTTCTCACCCGGCGGGGTTTATCTTGATTGGTTCCGGGAATCCTGAGGA
AGGAGAGCTTAGGCCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATGCGCAAGTAGGGACGGT
TAGAGATGCTGATCTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTCGGTTTGATAGTAACCC
A

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T

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DS 

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G
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GAAGGGATCTCGATTTCTCACCCGGCGAGGTTTATCTTGATTGGTTCCGGGAATCCTGAG
GAAGGAGAGCTTAGGCCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATGCGCAAGTAGAGACG
GTTAGAGATGCTGATCTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTCGGTTTGATAGTAAC
CCACAGGATTTCCGTGAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTCAAGACCAGATTTCA
AATGCGAGAAGCAATCTTTCCTCTGTTCAGATTGACCGGGAGTTGAAGGTGAAGATCTTT
AAGGTGTGTTCGGAGCTCAATGTTGATGGGCTGAGAGGAGACATTGTGACTAACAGAGCA
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GGAGTGTTGGTTTTTGAGAAGTTCGCTGAGGTTTTCAGTTGAACAAGGAGAAAA*GATTA
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AG

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AACCCACAGGATTTCCGTGAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTCAAGACCAGATT
TCAAATGCGAGAAGCAATCTTTCCTCTGTTCAGATTGACCGGGAGTTGAAGGTGAAGATC
TCTAAGGTGTGTTCGGAGCTCAATGTTGATGGGCTGAGAGGAGACATTGTGACTAACAGA
GCAGCGAAAGCACTTGCAGCTCTCAAAGGAAAATACCGAGTGACTGCAGATGATGTTGCA
ACCGTTATCCCTAACTGCTTGAGGCACCGTCTCAGGAAGGATCCATTGGAGTCTATCGAT
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TTATGTTATCATTTTCTTAACTTTTGTAAACGATGAGAAAGATCCTGAAACAAACAAACA
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ATGTATTCTGCTTTAAGTTGATTGGATAATATCTGTTCAAA
AG

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AGCTTAGGCCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATGCGCAAGTAGAGACGGTTAGAG
ATGCTGATCTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTCGGTTTGATAGTAACCCACAGG
ATTTCCGTGAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTCAAGACCAGATTTCAAATGCGA
GAAGCAATCTTTCCTCTGTTCAGATTGACCGGGAGTTGAAGGTGAAGATCTCTAAGGTGT
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CTAACTGCTTGAGGCACCGTCTCAGGAAGGATCCATTGGAGTCTATCGATTCAGGAGTGT
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ATTCTATACTTTCTACATTGAGTTGATTGAATGTTCAAGCAAACAGTCTTATGTATTCTG
CTTTAAGTTGATTGGATAATATCTGTTCAAA
AG

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DS 

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AGCGAAAGCACTTGCAGCTCTCAAAGGAAAATACCGAGTGACTGCAGATGATGTTGCAAC
CGTTATCCCTAACTGCTTGAGGCACCGTCTCAGGAAGGATCCATTGGAGTCTATCGATTC
AGGAGTGTTGGTTTCTGAGAAGTTCGCTGAGGTTTTCAGTTGAACAAGGAGAAAA*GATT
ATGTTATCATTTTCTTAACTTTTGTAAACGATGAGAA*GATCCTGAAACAAACAAACATG
CAAATCTGATTCTATACTTTCTACATTGAGTTGATTGAATGTTCAAGCAAACAGTCTTAT
GTATTCTGCTTTAAGTTGATTGGATAATATCTGTTCAAAGAAAA

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DS 



AS 2 8

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GCATATGTCAGCCATTACATTGCTACATATAAATAAAAGGATATCGCTAGTTTTAAAACC
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TCTTCAGAGCCTTGCGGTACGAAGCTGCTGCTTGATCAAGGGTCGAATGTATTCCTGGTA
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GTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAA
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ATTGGCCAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTG
TTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGATTGTTCAGCTGCTGCTTCACTCC
TCTGCCTCCTATGTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCA
ATGAGCGACTGCAGCCTCAACCAGCTCAGCCAATAGCTCTGAAAATCCTTCTTCTTGATT
CTCAAACTTGCTGAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAA
AGCTTCCACTACCGCAGCAGGGTTTAACCAATCCTCAGCTTTTTGAACACCAGAACGACA
TTGCAAAAGATGTTGTGCCCGAGCCATATAAGCAGTTGTGCCAACAGGAGCCTTTCCAGA
TCCCAGCTGGGACACTGTCTTCATGAGAAATCTAGCAACCTGTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS01TF C 99
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AF RR4H255JQ U 8
AF RR4H255TF C 8
AF RR4BG80JQ U 1
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RD RR4DS01TF 657 0 0
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AAGAAGAATGTATAAAGCAAACTCTTCAGAGCCTTGCGGTACGAAGCTGCTGCTTGATCA
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ATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCA
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AGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCCAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGG
TTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGAT
TGTTCAGCTGCTGCTTCACTCCTCTGCCTCCTATGTCTTGCTCTAGCTTAGATATGAACT
TGGAAACAACAATCGATTGGCAATGAGCGACTGCAGCCTCAACCAGCTCAGCCAATAGCT
CTGAAAATCCTTCTTCTTGATTCTCAAACTTGCTGAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCA
TTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAGCTTCCACTACCGCAGCAGGGTTTAACCAATCC
C

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4DS01JQ 715 0 0
CGGAT
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ATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAG
CGCAACCGCATTAGGGCGGACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCCAGAGA
GGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGAT
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GTCTTGCTCTAGCTTAGATATGAACTTGGAAACAACAATCGATTGGCAATGAGCGACTGC
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QA 6 715 6 715
DS 

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CGGAT
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CACCGAGTCGTTCAATGGGTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACC
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CGCAACCGCATTAGGGCGGACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCCAAAGA
GGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGAT
ATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGATTGTTCAGCTGCTGCATCACTCCTCTGCCTCCTAT
GTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGC
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GAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAGCTTCCACTAC
CGCA

QA 6 729 6 729
DS 

RD RR4H255TF 746 0 0
CGGAT
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TCAAGACAATAAGATACTGGAAAGAGAAGAAGAATGTATAAAGCAAACTCTTCAGAGCCT
TGCGGTACGAAGCTGCTGCTTGATCAAGGGTCGAATGCATTCCTGGTACCCATCAGGAAC
CACCGAGTCGTTCAATGGGTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACC
ATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAG
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GGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGAT
ATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGATTGTTCAGCTGCTGCATCACTCCTCTGCCTCCTAT
GTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGC
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GAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAGCTTCCACTAC
CGCAGCAGGGTTTAACCAATC

QA 6 746 6 746
DS 

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CGGCAATCAGAC
ATAACTTATGTTTAATATATAATTTGAAAATAGTACTAAAACTCCGCCGCATATGTCAGC
CATTACATTGCTACATATAAATAAAAGGATATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATT
TCAAGACAATAAAATACTGGAAAGAGAAGAAGAATGTATAAAGCAAACTCTTCAGAGCCT
TGCGGTACGAAGCTGCTGCTTGATCAAGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCCATCAGGAAC
CACCGAGTCGTTCAATGGGTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACC
ATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAG
CGCAACCGCATTAGGGCGGACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCCAGAGA
GGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGAT
ATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGATTGTTCAGCTGCTGCTTCACTCCTCTGCCTCCTAT
GTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGC
AGCCTTAACCAGCTCAGC*AATAGCTCTGAAAATCCTTCTTCTTGATTCTCAAACTTGCT
GAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGTTTCAAAAGCTTCCACTAC
CGCAGCAGGGTTTAACCAATCCTCAGCTTTTTGAACACCAGAACGACATTGCAAAAGATG
TTGTGCCCGAGCCATATAAGCAGTTGTGCCA

QA 13 823 13 823
DS 

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GGCGAATTTATTTCAAGACAATAAAATACTGGAAAGAGAAGAAGAATGTATAAAGCAAAC
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CCCATCAGGAACCACCGAGTCGTTCAATGGGTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGG
GTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAA
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ATTGGCCAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTG
TTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGATTGTTCAGCTGCTGCTTCACTCC
TCTGCCTCCTATGTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCA
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CTCAAACTTGCTGAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGTTTCAAA
AGCTTCCACTACCGCAGCAGGGTTTAACCAATCCTCAGCTTTTTGAACACCAGAACGACA
TTGCAAAAGATGTTGTGCCCGAGCCATATAAGCAGTTGTGCCAACAGGAGCCTTTCCAGA
TCCCAGCTGGGACACTGTCTTCATGAGAAATCTAGCAACCTGTAATT

QA 1 887 1 887
DS 



CO CL732Contig2 885 2 4 U
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GCTCGGGCACAACATCTTTTGCAATGTCGTTCTGGTGTTCAAAAAGCTGAGGATTGGTTA
AACCCTGCTGCGGTAGTGGAAGCTTTTGAAACAAGGGCTCTGAGAATGGCTGTTGCTTGT
GCCAAAAATCTCAGCAAGTTTGAGAATCAAGAAGAAAGATTTTCAGAGCTATTGCTGAGC
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CGCTCTCCATATCCTCCATAAACACCTCGGAGATTTCCTCTCAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B771TF U 1
AF RR4BG80TF U 1
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BS 697 697 RR4BG80TF
BS 698 850 RR4B771TF
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RD RR4B771TF 850 0 0
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AACCCTGCTGCGGTAGTGGAAGCTTTTGAAACAAGGGCTCTGAGAATGGCTGTTGCTTGT
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CGCTCTCCAT

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4BG80TF 885 0 0
GGTACTATGGTGTTTGTGAGACAAACAATTGTGGCAGATGCTTCAAATGCACTCTCTAGA
GCTGTTTGCATAGCTACAAGGTACAGCGCTGTGCGGAGGCAGTTTGGCGCCCGGAATGGT
GGCATTGAGACTCAGGTGATTGATTATAAAACTCAGCAAAACAGGCTATTTCCTCTGTTG
GCATCTGCATATGCATTCCGATTTGTAGGGGAGCGGCTTAAATGGCTGTACACGGATGTA
ACTGCAAGACTGCAGGCCAGCGATTTCGCAACATTACCTGAGGCTCATGCATGCACTGCA
GGATTGAAATCTCTCACCACCACAGCCACTGCGGATGGCATAGAAGAATGTCGTAAGTTA
TGTGGTGGACATGGTTACTTGTGGTGCAGTGGGCTCCCCGAGCTGTTTGCTGTATATGTT
CCTGCCTGTACATATGAAGGAGACAACATTGTGCTACAATTACAGGTTGCTAGATTTCTC
ATGAAGACAGTGTCCCAGCTGGGATCTGGAAAGGCTCCTGTTGGCACAACTGCTTATATG
GCTCGGGCACAACATCTTTTGCAATGTCGTTCTGGTGTTCAAAAAGCTGAGGATTGGTTA
AACCCTGCTGCGGTAGTGGAAGCTTTTGAAACAAGGGCTCTGAGAATGGCTGTTGCTTGT
GCCAAAAATCTCAGCAAGTTTGAGAATCAAGAAGAAAGATTTTCAGAGCTATTGCTGAGC
TGGTTAA*GCTGCAGTCGCTCATTGCCAATTGATTGTTGTTTCCAAGTTCATAGCTAAGC
TAGAGCA*GACATAGAGGCAGAGGAGTGAAGCAGCAGCTGAC**ATCTGTGTTACATTTA
CGCTCTC*ATATCCTCCATAAACACCTCGGAGATTTCCTCTCAAC

QA 1 885 1 885
DS 



AS 1 7

CO CL733Contig1 1076 7 12 U
GGGGGTACTGAAAAGAAAAATAGAAAACAAATGGTGAGAAATAAAAGGAAGAATCGGACA
CAATCTACACGTTCTTCTGATTCACTCTAACACTTGTGCCCGCTCTCTTCTTTGTCTTCT
TCCCTCCTTCCTCCGTCCTCAAATTTGCTTCGTTCACAGTGCCGGCTCTTGGCATGTGCT
TCGTTCACTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATGGAAA
CATTCCGAACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGACACACA
CTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACCGTACAATGTGCACGTCTTGCGACA
ATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCA
CGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACT
ATTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCG
ATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGC
CGAACCCAATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCG
TGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGTTT
TTGCTCTTTGTTTCAGTATGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTAAAGAATATGATAGAGGT
TACTTGTAGCAACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTATGCATATGA
GAGATCTTTACGCTACAGATTCAGAACGGTGAATGTTGTTTCTTCATTTTCCTTTTCTTT
TTCTTCACTTGTCTTCGCTTGTATGAGTAGATATATATTTGTAATTCCATCTCTTTTAAC
AATTTTATGAATGTAGTTTCTTCCCCTTTTTCATAATATTAAAAATAACATAAATGGGAA
TTGTCTCTATTTTGGGTTTTAGTTACTTTTATGTGAAATTGTTACTTTTATGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C049TF U 1
AF RR4FD82TF U 68
AF RR4BU76TF U 158
AF RR4AM77TF U 69
AF RR4C049JQ C 841
AF RR4FD82JQ C 359
AF RR4AM77JQ C 293
BS 1 283 RR4C049TF
BS 284 284 RR4FD82TF
BS 285 335 RR4C049TF
BS 336 336 RR4AM77TF
BS 337 387 RR4C049TF
BS 388 388 RR4FD82TF
BS 389 663 RR4C049TF
BS 664 721 RR4FD82TF
BS 722 722 RR4AM77TF
BS 723 755 RR4FD82TF
BS 756 861 RR4AM77TF
BS 862 1076 RR4AM77JQ

RD RR4C049TF 663 0 0
GGGGGTACTGAAAAGAAAAATAGAAAACAAATGGTGAGAAATAAAAGGAAGAATCGGACA
CAATCTACACGTTCTTCTGATTCACTCTAACACTTGTGCCCGCTCTCTTCTTTGTCTTCT
TCCCTCCTTCCTCCGTCCTCAAATTTGCTTCGTTCACAGTGCCGGCTCTTGGCATGTGCT
TCGTTCACTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATGGAAA
CATTCCGAACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATGTTCTTGACGACACACA
CTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTTGCGACA
ATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCTACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCA
CGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACT
ATTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCG
ATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGC
CGAACCCAATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCG
TGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FD82TF 688 0 0
GGG
GTTCTTCTGATTCACTCTAACACTTGTGCCCGCTCTCTTCTTTGCCTTCTTCCCTCCTTC
CTCCGTCCTCAAATTTGCTTCGTCCACAGTGCCGGCTCTTGGCATGTGCTTCGTTCACTT
ACGGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATGGAAACATTCCGAAC
ATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGACACACACTACGCTTAC
GTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTTGCGACAATCCTTGTCA
GCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCACTGC
CTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTACCC
ACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGGCTA
CGTTTATTCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGCCGAACCCAAT
CGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCGTGTTGTCTGG
ATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGTTTT*GCTCTTTG
TTTCAGTATGTTGCTTCTAAATAAT

QA 4 688 4 688
DS 

RD RR4BU76TF 599 0 0
CTTCCTCCGTCCTCAAATT
TGCTTCGTTCACTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATG
GAAACATTCCGAACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGACA
CACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTTGC
GACAATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCA
ACCACGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCT
TACTATTACTGCCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCAAACCGTCCACCACCGTCTTCCTCC
GGCGATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTATGCCG
CCGCCGAACCCAATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCT
GTCGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTA
GTTTTTGCTCTTTGTTTCAGTACTTTGCTTCTAAATAATA

QA 20 599 20 599
DS 

RD RR4AM77TF 793 0 0
GG
GTTCTTCTGATTCACTCTAACACTTGTGCCCGCTCTCTTCTTTGTCTTCTTCCCTCCTTC
CTCCGTCCTCAAATTTGCTTCGTTCACAGTGCCGGCTCTTGGCATGTGCTTCGTTCACTT
ACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATGGAAACATTCCGAAC
ATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGACACACACTACGCTTAC
GTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACCGTACAATGTGCACGTCTTGCGACAATCCTTGTCA
GCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCACTGC
CTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTACCC
ACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGGCTA
CGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGCCGAACCCAAT
CGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCGTGTTGTCTGG
ATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGTTTTTGCTCTTTG
TTTCAGTATGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTAAAGAATATGATAGAGGTTACTTGTAGC
AACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTATGCATATGAGAGATCTTTA
CGCTACAGATT

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR4C049JQ 160 0 0
GAGATCTTTACGCTACAGATTCAGAACGGTGAATGTTGTTTCTTCATTTTCCTTTTCTTT
TTCTTCACTTGTCTTCGCTTGTATGAGTAGATATATATTTGTAATTCCATCTCTTTTAAC
AATTTTATGAATGTAGTTTCTTCCCCTTTTTCAT
AATATT

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR4FD82JQ 629 0 0
CAATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAAC
CACGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTA
CTATTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGG
CGATGGTGGCTACGTTTATTCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCC
GCCGAACCCAATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGT
CGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGT
TTTTGCTCTTTGTTTCAGTATGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTAAAGAATATGATAGAG
GTTACTTGTAACAACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTATGCATAT
GAGAGATCTTTACGCTACAGATTCAGAACGGTGAATGTTGTTTCTTCATTTTCCTTTTCT
TTTTCTTCACTTGTCTTCGCTTGTATGAGTAGATATATATTTGTAATTCCATCTCTTTTA
ACAATTTTATGAATGTAGTTTCTTCCCC
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4AM77JQ 784 0 0
GACACACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACCGTACAATGTGCACGTC
TTGCGACAATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACC
TCCAACCACGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGG
TCCTTACTATTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTC
CTCCGGCGATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTAC
GCCGCCGCCGAACCCAATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCA
ATCTGTCGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGC
GTTAGTTTTTGCTCTTTGTTTCAGTATGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTAAAGAATATG
ATAGAGGTTACTTGTAGCAACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTAT
GCATATGAGAGATCTTTACGCTACAGATTCAGAACGGTGAATGTTGTTTCTTCATTTTCC
TTTTCTTTTTCTTCACTTGTCTTCGCTTGTATGAGTAGATATATATTTGTAATTCCATCT
CTTTTAACAATTTTATGAATGTAGTTTCTTCCCCTTTTTCATAATATTAAAAATAACATA
AATGGGAATTGTCTCTATTTTGGGTTTTAGTTACTTTTATGTGAAATTGTTACTTTTATG
TGCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 8

CO CL734Contig1 937 8 11 U
GGGACCTTTAACTTGTTACTATTTCTTTAGTCATCATCTTCTTTCCCGATTCGTTTTGGT
CATCTCCAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCT
CGTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCATCTCTAAGCCAGA
CAGGCATGATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCT
CAGCACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGA
TGGTCTGCCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAAC
CACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGG
AACTTGCAAGCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTT
GTTGCAACTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTCTATTCACTAA
GCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGACAT
CATCAATATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGAATA
CCTTCGTTACAAGGAGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATCTCTGCTGGAAATGAGC
AATAGGTGAAGAAGAAGGCATCATGAAACATGTATATTGAAACACGATAAAAGTGTATTC
AGCTCTTGTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATAACTTTCCTGTCGACATGATG
AATATAGAAATATTCATAAATTTACTGCAATCCAGATTCAAATGTACAATATAAAAATAT
ATTGCTATGAATAAAATTTACAAGTGTGCATTGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY71TF U 1
AF RR4BZ12TF U 45
AF RR4CL06TF U 56
AF RR4F872TF U 127
AF RR4E057TF U 66
AF RR4F872JQ C 194
AF RR4BZ12JQ C 122
AF RR4FY71JQ C 228
BS 1 671 RR4FY71TF
BS 672 672 RR4BZ12TF
BS 673 690 RR4FY71TF
BS 691 691 RR4BZ12TF
BS 692 714 RR4FY71TF
BS 715 715 RR4BZ12TF
BS 716 735 RR4FY71TF
BS 736 736 RR4BZ12JQ
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BS 758 907 RR4BZ12JQ
BS 908 937 RR4FY71JQ

RD RR4FY71TF 757 0 0
GGGACCTTTAACTTGTTACTATTTCTTTAGTCATCATCTTCTTTCCCGATTCGTTTTGGT
CATCTCCAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCT
CGTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCATCTCTAAGCCAGA
CAGGCATGATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCT
CAGCACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGA
TGGTCTGCCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAAC
CACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGG
AACTTGCAAGCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTT
GTTGCAACTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTCTATTCACTAA
GCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGACAT
CATCAATATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGAATA
CCTTCGTTACAGGGAGAACAAAGTCGCTTC*TTTTTATGAAATCTCTGCTGGAA*TGAGC
AATAGGTGAAGAAGA*GGCATCATGAAACATGTATAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4BZ12TF 688 0 0
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TCATCTTCTTCTTCCTCGTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAA
TCATCTCTAAGCCAGACAGGCATGATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGA
ACATTTGGGGTGTCCTCAGCACATTGTCCATTGAGCATGGTGGAGCACCTTTCGGGAATG
TTGTGTCATATAGTGATGGTCTGCCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGA
CAATTCTTGATCCAACCACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCA
GTGAATCTCCCATTGGAACTTGCAAGCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAA
CCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAACTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAA
AAGCTCTATTCACTAAGCATCCAGAGATGATGGATCGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTG
TCTTCAAACTGGACATCATCAATATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCA
TCACTGTAGATGAATACCTTCGTTACAAG*AGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATC
TCTGCTGGAAATGAGCAATAG
TGAAGAA

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DS 

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GG
GGTCATCTCCAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTT
CCTCGTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCATCTCTAAGCC
AGACAGGCATGATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGT
CCTCAGCACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAG
TGATGGTCTGCCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCC
AACCACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCAT
TGGAACTTGCAAGCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAA
GTTGTTGCAACTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTCTATTCAC
TAAGCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGA
CATCATCAATATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGA
ATACCTTCGTTACAAGGAGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATCTCTGCTGGAAATG
AGCAATAGGTGAAGA

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR4F872TF 595 0 0
G
GTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCATCTCTAAGCCAGACAGGCAT
GATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGG*TGTCCTCAGCACA
TTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTCTG
CCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACAAGA
AACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGC
AAGCGAGATCCAATGGACTCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAA
CTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTCTATTCACTAAGCATCCA
GAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGACATCATCAAT
ATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGAATACCTTCGT
TACAAGGAGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATCTCTGCTGGAAATGAGCA

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR4E057TF 667 0 0
GG
AAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCTCGTGACC
GTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCATCTCTAAGCCAGACAGGCAT
GATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCTCAGCACA
TTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTCTG
CCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACAAGA
AACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGC
AAGCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAA
CTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTCTATTCACTAAGTATCCA
GAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGACATCATCAAT
ATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGAATACCTTCGT
TACAAG*AGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATCTCTGCTGGAAATGAGCAATAG
TGAAGAA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4F872JQ 675 0 0
GCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGG*TGTCCTCAGCACATTGTCC
ATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTCTGCCCGGG
AAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACAAGAAACGCA
TTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGCAAGCGA
GATCCAATGGACTTTACTTGCTTTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAACTGGTT
GAAGGATTTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTTTATTCACTAAGCATCCAGAGATG
ATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTTTTCAAACTGGACATCATCAATATATTT
TTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGAATACCTTCGTTACAAG
GAGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATTTTTGCTGGAAATGAGCAATAGGTGAAGAA
GAAGGCATCATGAAACATGTATATTGAAACACGATAAAAGTGTATTCAGCTCTTGTGTAA
ATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATAACTTTCCTGTCGACATGATGAATATAGAAATAT
TCATAAATTTACTG
G

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4BZ12JQ 788 0 0
CGTGACCG
TCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGAT*CTTACAATCATCTCTAAGCCAGACAGGCATGA
TATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCTCAGCACATT
GTCCATTGAGCATGGTGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTCTGCC
CGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACAAGAAA
CGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGCAA
GCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTTTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAACT
GGTTGAAGGATTTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAGCTCTATTCACTAAGCATCCAGA
GATGATGGATCGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTTTTCAAACTGGACATCATCAATAT
ATTTTTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCACTGTAGATGAATACCTTCGTTA
CAAGGAGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATTTTTGCTGGAAATGAGCAATAGGTGA
AGAAGAAGGCATCATGAAACATGTATATTGAAACACGATAAAAGTGTATTCAGCTCTTGT
GTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATAACTTTCCTGTCGACATGATGAATATAGAA
ATATTCATAAATTTACTGCAATCCAGATTCAAATGTACAATATAAAAATATATTGCTA
CG

QA 9 786 9 786
DS 

RD RR4FY71JQ 710 0 0
TTTGGGGTGTCCTCAGCACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTG
TGTCATATAGTGATGGTCTGCCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAA
TTCTTGATCCAACCACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTG
AATCTCCCATTGGAACTTGCAAGCGAGATCCAATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCC
TCACCGGAAAGTTGTTGCAACTGGTTGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAGAAAAG
CTCTATTCACTAAGCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCT
TCAAACTGGACATCATCAATATATTTCTGATCAACTGGTACGGTGGAGCTAAATCCATCA
CTGTAGATGAATACCTTCGTTACAGGGAGAACAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAATCTCT
GCTGGAAATGAGCAATAGGTGAAGAAGAAGGCATCATGAAACATGTATATTGAAACACGA
TAAAAGTGTATTCAGCTCTTGTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATAACTTTCC
TGTCGACATGATGAATATAGAAATATTCATAAATTTACTGCAATCCAGATTCAAATGTAC
AATATAAAAATATATTGCTATGAATAAAATTTACAAGTGTGCATTGTTCG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 8

CO CL735Contig1 1457 8 15 U
TTTTTTCAGTATTGAAGTATTTCCCTGAACAGGAGTCTAGCAGCAAGTTATTTCTTCTTT
CGGAGATCATGGCTGTAACTGTGAGATCTATTCAGAAGGACGCAGAAGATAAAAAGACGT
CACTCAATCCAAGACCATATTTCAGATTGTTCATCAACTGGCTACTGGACTTATGTTCCC
TGGATCCTGGGACTGATGGAGCAAACTTTCAGGTTCTAACAGCTTTTGCCAATGCATTCC
ACGCGTTGCAGCCTCTCAAGGTTCCCGCTTTCAGCTTTGCATGGCTAGAGCTGGTCAGTC
ACAGAAGCTTCATGCCTAAGATGCTTACAGTAAATGGCCAGAAGGGTTGGCCATATGTTC
AACGCCTGCTGGTAGACTTGCTCCAGTTTCTTGAGCCATTTTTGAGAAATGCTGAACTCG
GAGGACCAGTTAATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTGTTACTGGTGCTGCTTCATG
ACTTCCCGGAGTTCCTCTGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGATGTGATTCCTTCAAGTT
GCATCCAAATGCGAAATATTATTCTCAGTTCTTTTCCACGGAACATGAGGCTCCCAGATC
CCTCTACCCCAAATCTGAAGATTGATTTACTGCCTGAGATAGTAGAAGCTCCCTGTATCC
TTTCCGAAGTTGATGCTGTACTAAAGGCGAAGCAAATGAAGAATGACGTAGACGAGTATC
TCACTTTGAGGCAACAGAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAAGCAGAAGCTGCTTCTCT
CGCCCAGCGAGGCCAGCTTAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACCATTGATCAACTCGCTTG
TGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAAGCGGGTGAGACGCAGGCTCAAA
ATGTGGTGGCCTTGCATATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACTAGATACAGAAGGGCGCT
ACTTGTTCCTTAACGCGATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCAACAACCACACTCATTATT
TCTCCTTCATCATGCTCTATCTCTTCTTCGAGTCTAACCAGGAGATCATCATACAGGAGC
AGATAACAAGAGTGTTGTTGGAAAGGCTAATTGTGAACAGGCCGCATCCTTGGGGACTCC
TAATAACGTTCATCGAGCTCATCAAGAACCCAAGATATGGCTTCTGGAAACATGCCTTCA
TTAGGTGTGCTCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTCGCCAGATCCTGTGGTGGTC
TCAAGACTGTTGACGAGGGAATGGTCTCCGGTTGGGTCGCCGACAGCAATCACTAGCTTG
TCTTTTTTTTCTCTTCTTTCAATTTCTAATACTGTATGTTTCCATCCTCCCCAGATTTGG
CATTAACATATGACACAGTAGGTATTTCAGTATTTAAAGTCTGCATATTTTTTTTAAAGA
ATTTATTTCATAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4G253TF U 1
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AF RR4H680TF U 354
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BS 641 683 RR4G253TF
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CACTCAATCCAAGACCATATTTCAGAT**TTCATCAACTGGCTACTGGACTTATGTTCCC
TGGATCCTGGGACTGATGGAGCAAACTTTCAGGTTCTAACAGCTTTTGCCAATGCATTCC
ACGCGTTGCAGCCTCTCAAGGTTCCCGCTTTCAGCTTTGCATGGCTAGAGCTGGTCAGTC
ACAGAAGCTTCATGCCTAAGATGCTTACAGTAAATGGCCAGAAGGGTTGGCCATATGTTC
AACGCCTGCTGGTAGACTTGCTCCAGTTTCTTGAGCCATTTTTGAGAAATGCTGAACTCG
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ACTTCCCGGAGTTCCTCTGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGATGTGATTCCTTCAAGTT
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CCTCTACCCCAAATCTGAAGATTGATTTACTGCCTGAGACAGTAGAAGCTCCCTGTATCC
TTTCCGAAGTTGATGCTGTACTA

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G
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AGGTTCCCGCTTTCAGCTTTGCATGGCTAGAGCTGGTCAGTCACAGAAGCTTCATGCCTA
AGATGCTTACAGTAAATGGCCAGAAGGGTTGGCCATATGTTCAACGCCTGCTGGTAGACT
TGCTCCAGTTTCTTGAGCCATTTTTGAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCAGTTAATTTCC
TATACAAAGGGGCATTGAGAGTGTTACTGGTGCTGCTTCATGACTTCCCGGAGTTCCTCT
GTGATTATCATTTTACTTTCTGTGATGTGATTCCTTCAAGTTGCATC*AAATGCGAAATA
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TACTAAAGGCTAAGCAAATGAAGAATGACGTAGACGAGTATCTCACTTTGAGGCAACA

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G
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AGTATCTCACTTTGAGGCAACAGAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAAGCAGAAGCTGC
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CGCTTGTGCTATATACTGGAAT

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G
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TCAGTTCTTTTCCACGGAACATGAGGCTCCCAGATCCCTCTACCCCAAATCTGAAGATTG
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CTTTCCTAAGTGAGTTGAAGCAGAAGCTGCTTCTCTCGCCCAGCGAGGCCAGCTTAGCTG
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ATCAGCTTCGATACCCCAACAACCACACTCATTATTTCTCCTTCATCATGCTCTATCTCT
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GACGCAGGCTCAAAATGTGGTGGCCTTGCATATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACTAGA
TACAGAAGGGCGCTACTTGTTCCTTAACGCGATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCAACAA
CCACACTCATTATTTCTCCTTCATCATGCTCTATCTTTTTTTCGAGTCTAACCAGGAGGT
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TTTCTAATACTGTATGTTTCCATCCTCCCCAGATTTGGCATTAACATATGACACAGTAGG
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AGAGTGTTGTTGGAAAGGCT**TTGTGAACAGGCCGCATCCTTGGGGACTCCTAATAACG
TTCATCGAGCTCATCAAGAACCCAAGATATGGCTTCTGGAAACATGCCTTCATTAGGTGT
GCCCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTCGCCAGATCCTGTGGTGGTCTCAAGACT
GTTGACGAGGGAATGGTCTCCGGTTGGGTCGCCGACAGCAATCACCAGCTTGTCTTTTTT
TTCTCTTCTTTCAATTTCTAATACTGTATGTTTCCATCCTCCCCAGATTTGGCATTAACA
TATGACACAGTAGGTATTTCAGTATTTAAAGTCTGCATATTTTTTTTAAAGAATTTATTT
CATAGA
GC

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DS 

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TAGATACAGAAGGGCGCTACTTGTTCCTTAACGCGATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCA
ACAACCACACTCATTATTTCTCCTTCATCATGCTCTATCTCTTCTTCGAGTCTAACCAGG
AGATCATCATACAGGAGCAGATAACAAGAGTGTTGTTGGAAAGGCTAATTGTGAACAGGC
CGCATCCTTGGGGACTCCTAATAACGTTCATCGAGCTCATCAAGAACCCAAGATATGGCT
TCTGGAAACATGCCTTCATTAGGTGTGCTCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTCG
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CATCCTCCCCAGATTTGGCATTAACATATGACACAGTAGGTATTTCAGTATTTAAAGTCT
GCATATTTTTTTTAAAGAATTTATTTCATAGATCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 8

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ATATTACTCAACAGTCAATAAATACATAGTTACATCATATTATTATTATGCATAGCTCTG
CTCCACAATCTCCATAACTTTCCTGTTGTACTCTCGTTTGTTCTCACTGAACAGCCTCGC
AGCTTCAGAGTTCGCTGGCGAGTTAGGATTTGGATCACAAAGCAGAGACTGAATAGATGT
GAGGATTGCTGAGACATCATAAATGGGACTCCACTGGTTTTGTAATATATCCAAGCAAAT
GCTTCCATCAGCATAAATGTTTGGATGAAACATCCTTGAAACAAAGCGAACTACTGGTGG
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ACTGTCATCAGGTCCAAAGATGAGAGCGTTCCAATGCATGATGTTGTTATCTTGAGGAGA
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CCGAGCTGGAGTTGCCATTTGCTTGAAAACAAACAAGACTGAAATTCAAAGCTTGATTGA
AGAACAATCCAGCAAAGGAGACGATGAAGAAAATGGGTAGAGGATAGCAACAGAATAATA
ACAGAGATTTTTTA*AGAGAGAGAATCAAAGAAGATCCTTTTCTTTCTTTTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 0 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 20 35 20 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 20 20 
20 20 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4H756TF C 1
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AF RR4GV62JQ U 45
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ATATATCCAAGCAAATGCTTCCATCAGCATAAATGTTTGGATGAAACATCCTTGAAACAA
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TACCTCCATCCCATGGACTGTCATCAGGTCCAAAGATGAGAGCGTTCCAATGCATGATGT
TGTTATCTTGAGGAGATCCACTGATCCCCAAGGGA

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CACTGAACAGCCTCCCAGCTTCAAAGTTCGCTGGCGAGTTAGGATTTGGATCACAAAGCA
AAAACTGAATAAATGTGAGGATTGCTGAAACATCATAAATGGGACTCCACTGGTTTTGTA
ATATATCCAAGCAAATGCTTCCATCACCATAAATGTTTGGATGAAACATCCTTGAAACAA
AGCGAACTACTGGTGGTTTGTTTGGGTAGTCCTCGGTGAACTGAAAAAACAACTTGAAGG
TACCTCCATCCCATGGACTGTCATCAGGTCCAAAAATGAAAGCGTTCCAATGCATGATGT
TGTTATCTTGAGGAAATCCACTGATCCCCAAGGGAGGATCTTTCTGTAGTCTCTTGAAGT
CCCACATGAGTCTCTTCCTAGCTGGAGTTGCCATTTGCTTGAAAACAAACAAAACTGAAA
TTCAAAGCTTGAT
GAAAAA

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TTTTT
TTTTGAACTAATAAGATAAAATATTACTCAACAGTCAATAAATACATAGTTACATCATAT
TATTATTATGCATAGCTCTGCTCCACAATCTCCATAACTTTCCTGCTGTACTCTCGTTTG
TTCTCACTGAACAGCCTCGCAGCTTCAGAGTTCGCTGGCGAGTTAGGATTTGGATCACAA
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TGTAATATATCCAAGCAAATGCTTCCATCAGCATAAATGTTTGGATGAAACATCCTTGAA
ACAAAGCGAACTACTGGTGGTTTGTTTGGGTAGTCCTCGGTGAACTGAAGAGACAACTTG
AAGGTACCTCCATCCCATGGACTGTCATCAGGTCCAAAGATGAGAGCGTTCCAATGCATG
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CCGAGCTGGAGTTGCCATTTGCTTGAAAACAAACAAGACTGAAATTCAAAGCTTGATTGA
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AC
CC

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CACAATCTCCATAACTTTCCTGTTGTACTCTCGTTTGTTCTCACTGAACAGCCTCGCAGC
TTCAGAGTTCGCTGGCGAGTTAGGATTTGGATCACAAAGCAGAGACTGAATAGATGTGAG
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TCCATCAGCATAAATGTTTGGATGAAACATCCTTGAAACAAAGCGAACTACTGGTGGTTT
GTTTGGGTAGTCCTCGGTGAACTGAAGAGACAACTTGAAGGTACCTCCATCCCATGGACT
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ACTGATCCCCAAGGGAGGATCTTTCTGTAGTCTCTTGAAGTCCCACATGAGTCTCTTCCG
AGCTGGAGTTGCCATTTGCTTGAAAACAAACAAGACTGAAATTCAAAGCTTGATTGAAGA
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CC

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GG
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GG
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CCTGTTGTACTCTCGTTTGTTCTCACTGAACAGCCTCGCAGCTTCAGAGTTCGCTGGCGA
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AGAATCAAAGAAGATCC

QA 3 679 3 679
DS 

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G
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AGACTGAATAGATGTGAGGATTGCTGAGACATCATAAATGGGACTCCACTGGTTTTGTAA
TATATCCAAGCAAATGCTTCCATCAGCATAAATGTTTGGATGAAACATCCTTGAAACAAA
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ACCTCCATCCCATGGACTGTCATCAGGTCCAAAGATGAGAGCGTTCCAATGCATGATGTT
GTTATCTTGAGGAGATCCACTGATACCCAAGGGAGGATCTTTCTGTAGTCTCTTGAAGTC
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TCAAAGCTTGAT*GAAGAACAATCCAGCAAAAGAGACGATGAAAAAAATGACTTGGATAT
AGCAAAAGAATA******GAGATTTTTAAGAGAGAGAGAATCAAAGAAGATATTTTTCTT
TCTTTTCC

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DS 



AS 1 8

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TTGTAAACGAAAGAAGCATCTTTCCCAATCGATCAATTAATCAGCTTCAATGGCAGGGAG
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GTTTTTTTCTCTTTACAGAATTACATTTCTTGCTCATTATGTAAAATCAAAGACAGTATC
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GTTTACTAATAACGAATAGTGCTTTCTCTGTTAC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A338TF U 45
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AF RR4B989JQ C 1
AF RR4B906TF U 1
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DS 

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DS 

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DS 

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DS 

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DS 

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CGCAGTACGTAAAGCAGGAAAATCCATTACCGAGCAAGAGGCT*GGCAGATTCTCGGTGT
GACCGAGCAGACCTCTTGGGAAGAGATAGTACAGAAATACGATAAGCTGTTTGAGAACAA
CGCCAAAGCTGGGAGCTTTTACCTTCAATCGAAAGTTCATCGAGCCAAAGAATGTCTTGA
AGAGGTGTACAGGAGCAAAGCCAACGGTACACCTAGTTAAAGACTTTTTTATCTTTAAAT
GTTTTTTTCTCTTTACAGAATTACATTTCTTGCTCATTATGTAAAATCAAAGACAGTATC
ACAGTTCTTTGAGATGATGTGTAAAACTTTGAAAGACGGCCATAGCTTTCTTCACCCATT
GTTTACTAATAACGAATAGTGCTTTCTCTGTTAC

QA 1 754 1 754
DS 

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CCA
AAAAAAAAAAAAAAACAAAAGAGAACCCTAGATTGTTCTATCGCCTTCCTGCCCAGGTTT
CTCTCTCTATTTCTCTCTCTCTCTCCCCCGCCCGCGAAAAACGAATCCGAATCTTGTAAA
CGAAAGAAGCATCTTTCCCAATCGATCAATTAATCAGCTTCAATGGCAGGGAGAATCATT
GCGCAACTGATTGTGATGGGTTCTGGAATATTGGGTCGTGCTTTCTTTCAAGCCTATCGT
CAGGCTCTTGCTAATGCTTCTAAAACTGGCGTAGCGCAGGAAGCAATGCAGAACGCAGTA
CGTAAAGCAGGAAAATCCATTACCGAGCAAGAGGCT*GGCAGATTCTCGGTGTGACCGAG
CAGACCTCTTGGGAAGAGATAGTACAGAAATACGATAAGCTGTTTGAGAACAACGCCAAA
GCTGGGAGCTTTTACCTTCAATCGAAAGTTCATCGAGCCAAAGAATGTCTTGAAGAGGTG
TACAGGAGCAAAGCCAACGGTACACCTAGTTAAAGACTTTTTTATCTTTAAATGTTTTTT
TCTCTTTACAGAATTACATTTCTTGCTCATTATGTAAAATCAAAGACAGTATCACAGTTC
TTTGAGATGATGTGTAAAACTTTGAAAGACGGCCATAGCTTTCTTCACCCATTGTTTACT
AATAACGAATAGTGCTTTCTCTGTTAC

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DS 

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AAAAAAAAAAAAAAACAAAAGAGAACCCTAGATTGTTCTATCGCCTTCCTGCCCAGGTTT
CTCTCTCTATTTCTCTCTCTCTCTCCCCCGCCCGCGAAAAACGAATCCGAATCTTGTAAA
CGAAAGAAGCATCTTTCCCAATCGATCAATTAATCAGCTTCAATGGCAGGGAGAATCATT
GCGCAACTGATTGTGATGGGTTCTGGAATATTGGGTCGTGCTTTCTTTCAAGCCTATCGT
CAGGCTCTTGCTAATGCTTCTAAAACTGGCGTAGCGCAGGAAGCAATGCAGAACGCAGTA
CGTAAAGCAGGAAAATCCATTACCGAGCAAGAGGCT*GGCAGATTCTCGGTGTGACCGAG
CAGACCTCTTGGGAAGAGATAGTACAGAAATACGATAAGCTGTTTGAGAACAACGCCAAA
GCTGGGAGCTTTTACCTTCAATCGAAAGTTCATCGAGCCAAAGAATGTCTTGAAGAGGTG
TACAGGAGCAAAGCCAACGGTACACCTAGTTAAAGACTTTTTTATCTTTAAATGTTTTTT
TCTCTTTACAGAATTACATTTCTTGCTCATTATGTAAAATCAAAGACAGTATCACAGTTC
TTTGAGATGATGTGTAAAACTTTGAAAGACGGCCATAGCTTTCTTCACCCATTGTTTACT
AATAACGAATAGTGCTTTCTCTGTTAC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 8

CO CL738Contig1 1431 8 8 U
TTTTTCTCTCTCTCTTTTCCCCGTCCTCTTTCTCTCTCTATACCTAAACGGCTAAACATA
TAGCTCTCCTACGCAAGCTCTTATCTCTTCCTCTTTAATCTTTTCCTATACTCAGACACA
CGGAACCGTTTGGTACTACAGATACCATCTTAAAAATGGAAACTTTGAGTCGTTTCTTAG
TGTTCATGTCTCTGTTCGCCGGTTTTGTTTCTGGATTCACTCTGCAAAACCTTCCAATCA
CATCTTTTGAAGAAAGTTACACGCAGCTTTTTGGTGACAAGAACTTGTTTGTTCATAAAG
ACGGCAAATCTGTCCGGTTAACGCTCGATGAAAGGACCGGTTCTGGGTTTGTCTCAAATG
ATCTTTATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAATTACCTTCTGATTATTCAGCTG
GAGTAGTTGTTGCCTTTTATATGTCAAATGGAGACATGTATGAGAAGAATCATGATGAGA
TTGATTTTGAGTTTCTTGGTAACATAAGAGGAAAAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTT
ACGGCAATGGAAGCACTCATTTAGGAAGAGAAGAGAGATATAATCTCTGGTTTGATCCAA
CTGAAGATTATCATCAGTACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAG
ACAATGTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCGAACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAA
AGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCA
AGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTC
ATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGG
ATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGA
GGAAACACATGACGTACTCATATTGCTATGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTG
AGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTG
GTGGGATTCCGAGGCGTCACCGCAACCGAAAGCACCGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATG
GAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTCCAACTATGTGATGGTGTTTGGAGGGGGTTCTA
TATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATTTTATGTTTGGTGCATTTTCACAGTTATAGTGGG
CATTTGTTGCTTGTATATGGAATAAAATAATTTATTTATTTATTTATTTGAGAGATTTGG
GGTTTTGCAATACTTATATGATAATAATGTGTAGTTTTTGTTTTTGTGGATACATATTCC
GTTCGCGAATATTTGAGTTGTAATTTTAACTTTCTGTTGATATTTATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP36TF U 1
AF RR4BE70TF U 6
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AF RR4FA35TF U 372
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BS 403 672 RR4CP36TF
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RD RR4CP36TF 672 0 0
TTTTTCTCTCTCTCTTTTCCCCGTCCTCTTTCTCTCTCTATACCTAAACGGCTAAACATA
TAGCTCTCCTACGCAAGCTCTTATCTCTTCCTCTTTAATCTTTTCCTATACTCAGACACA
CGGAACCGTTTGGTACTACAGATACCATCTTAAAAATGGAAACTTTGAGTCGTTTCTTAG
TGTTCATGTCTCTGTTCGCCGGTTTTGTTTCTGGATTCACTCTGCAAAACCTTCCAATCA
CATCTTTTGAAGAAAGTTACACGCAGCTTTTTGGTGACAAGAACTTGTTTGTTCATAAAG
ACGGCAAATCTGTCCGGTTAACGCTCGATGAAAGGACCGGTTCTGGGTTTGTCTCAAATG
ATCTTTATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAATTATCTTCTGATTATTCAGCTG
GAGTAGTTGTTGCCTTTTATATGTCAAATGGAGACATGTATGAGAAGAATCATGATGAGA
TTGATTTTGAGTTTCTTGGTAACATAAGAGGAAAAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTT
ACGGCAATGGAAGCACTCATTTAGGAAGAGAAGAGAGATATAATCTCTGGTTTGATCCAA
CTGAAGATTATCATCAGTACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAG
ACAATGTTCCTA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BE70TF 667 0 0
CTCTCTCTCTTTTCCCCGTCCTCTTTCTCTCTCTATACCTAAACGGCTAAACATATAGCT
CTCCTACGCAAGCTCTTACCTCTTCCTCTTTAATCTTTTCCTATACTCAGACACCCGGAA
CCGTTTGGTACTACAGATACCATCTTAAAAATGGAAACTTTGAGTCGTTTCTTAGTGTTC
ATGTCTCTGTTCGCCGGTTTTGTTTCTGGATTCACTCTGCAAAACCTTCCAATCACATCT
TTTGAAGAAAGTTACACGCAGCTTTTTGGTGACAAGAACTTGTTTGTTCATAAAGACGGC
AAATCTGTCCGGTTAACGCTCGATGCAAGGACCGGTTCTGGGTTTGTCTCAAATGATCTT
TATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAATTACCTTCTGATTATTCAGCTGGAGTA
GTTGTTGCCTTTTATATGTCAAATGGAGACATGTATGAGAAGAATCATGATGAGATTGAT
TTTGAGTTTCTTGGTAACATAAGAGGAAAAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTACGGC
AATGGAAGCACTCATTTAGGAAGAGAAGAGAGATATAATCTCTGGTTTGATCCAACTGAA
GATTATCATCAGTACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAGACAAT
GTTCCTA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BF84TF 739 0 0
CTCTCTCTCTTTTCCCCGTCCTCTTTCTCTCTCTATACCTAAACGGCTAAACATATAGCT
CTCCTACGCAAGCTCTTATCTCTTCCTCTTTAATCTTTTCCTATACTCAGACACACGGAA
CCGTTTGGTACTACAGATACCATCTTAAAAATGGAAACTTTGAGTCGTTTCTTAGTGTTC
ATGTCTCTGTTCGCCGGTTTTGTTTCTGGATTCACTCTGCAAAACCTTCCAATCACATCT
TTTGAAGAAGGTTACACGCAGCTTTTTGGTGACAAGAACTTGTTTGTTCATAAAGACGGC
AAATCTGTCCGGTTAACGCTCGATGAAAGGACCGGTTCTGGGTTTGTCTCAAATGATCTT
TATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAATTACCTTCTGATTATTCAGCTGGAGTA
GTTGTTGCCTTTTATATGTCAAATGGAGACATGTATGAGAAGAATCATGATGAGATTGAT
TTTGAGTTTCTTGGTAACATAAGAGGAAAAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTACGGC
AATGGAAGCACTCATTTAGGAAGAGAAGAGAGATATAATCTCTGGTTTGATCCAACTGAA
GATTATCATCAGTACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAGACAAT
GTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCGAACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCG
ATGTCTCTCTACACAACAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4FA35TF 757 0 0
G
ATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAATTACCTTCTGATTATTCAGCTGGAGTAGTTGTTG
CCTTTTATATGTCAAATGGAGACATGTATGAGAAGAATCATGATGAGATTGATTTTGAGT
TTCTTGGTAACATAAGAGGAAAAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTACGGCAATGGAA
GCACTCATTTAGGAAGAGAAGAGAGATATAATCTCTGGTTTGATCCAACTGAAGATTATC
ATCAGTACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAGACAATGTTCCTA
TCAGGGAGGTAAAGCGAACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTC
TCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAA
ACTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTG
TGGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGG
CTCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGA
CGTACTCATATTGCTATGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGA
ATCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGA
GGCGTCACCGCAACCGAAAGCACCGGGGCAAGAGAA

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR4BE70JQ 798 0 0
TTGAGTTTCTTGGTAACATAAGAGGAAAAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTACGGCA
ATGGAAGCACTCATTTAGGAAGAGAAGAGAGATATAATCTCTGGTTTGATCCAACTGAAG
ATTATCATCAGTACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAGACAATG
TTCCTATCAGGGAGGTAAAGCGAACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGA
TGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACG
GTGTAAACTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCT
GCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCC
GTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAAC
ACATGACGTACTCATATTGCTATGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGATTGCG
TAGTGAATCCCGCAGAGGCTCATCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGA
TTCCGAGTCGTCACCGCAACCGAAAGCACCGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAG
AGTCGATATGATGAATATAGTCCAACTATGTGATGGTGTTTGGAGGGGGTTCTATATAAT
AAGTCCATTTTTATTGGTATTTTATGTTTGGTGCATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTG
TTGCTTGTATATGGAATA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4FA35JQ 649 0 0
GATTCTCACATCATATTCTTTGTAGACAATGTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCGAACAGCA
TCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGT
TCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCCTTATGTC
ACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTTCCT
AAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCACAG
AGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTATGATCGG
AACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTT
AGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAGGCGTCACCGCAACCGAAAGCAC
CGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTCCAACTAT
GTGATGGTGTTTGGAGGGGGTTCTATATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATTTTATGTTT
GGTGCATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTGTTGCTTGTATATGGAATA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4C729JQ 712 0 0
TCACATCATATTCTTTGTAGACAATGTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCGAACAGCATCGAT
GGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAA
ATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCA
GCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTG
CGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGT
TAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTATGATCGGAACAG
GTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGT
TCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAGTCGTCACCGCAACCGAAAGCACCGGGG
CAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTCCAACTATGTGAT
TGTGTTTGGAGGGGGTTCTATATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATTTTATGTTTGGTGC
ATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTGTTGCTTGTATATGGAATAAAATAATTTATTTATT
TATTTATTTGAGAGATTTGGGGTTTTGCAATACTTATATGATAATAATGTGT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4CP36JQ 758 0 0
CAGGGATGTAAAGCGAACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCT
CTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAA
CTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTGT
GGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGC
TCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGAC
GTACTCATATTGCTATGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAA
TCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAG
GCGTCACCGCAACCGAAAGCACCGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGAT
ATGATGAATATAGTCCAACTATGTGATGGTGTTTGGAGGGGGTTCTATATAATAAGTCCA
TTTTTATTGGTATTTTATGTTTGGTGCATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTGTTGCTTG
TATATGGAATAAAATAATTTATTTATTTATTT****GAGAGATTTGGGGTTTTGCAATAC
TTATATGATAATAATGTGTAGTTTTTGTTTTTGTGGATACATATTCCGTTCGCGAATATT
TGAGTTGTAATTTTAACTTTCTGTTGATATTTATTGTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 8

CO CL739Contig1 662 8 13 U
GGAACCGGTGTCGTGCAAACACAGGAGAGACTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCC
GACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCT
CGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTA
TACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCAT
TTCTTAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACCCAAACTCACTCGACAAAATCAAC
CTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTC
TCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCA
GCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATA
AGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGTGTAT
CCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGTGATGCATGGATTTAC
AAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTTATACAATATGTTGTA
TC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 20 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 

AF RR4A261JQ C 45
AF RR4GX74JQ C 225
AF RR4GX74TF U 225
AF RR4A261JQD C 1
AF RR4AR20JQ C 1
AF RR4A261TFB U 1
AF RR4A261TF U 1
AF RR4AR20TF U 1
BS 1 225 RR4A261TFB
BS 226 243 RR4GX74TF
BS 244 245 RR4A261TFB
BS 246 266 RR4GX74TF
BS 267 267 RR4A261TFB
BS 268 272 RR4GX74TF
BS 273 273 RR4A261TFB
BS 274 276 RR4GX74TF
BS 277 277 RR4A261TFB
BS 278 362 RR4GX74TF
BS 363 363 RR4A261TFB
BS 364 647 RR4GX74TF
BS 648 662 RR4A261TFB

RD RR4A261JQ 203 0 0
ACCTCGCTCCACCCCCGACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCG
CCACTCTCCTCCTTCTGGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAG
TGAAGTTGGTAGAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGA
AGACCACAAGTCTCATTTCTTAG

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR4GX74JQ 423 0 0
G
GACCACAAGTCTCATTTCACAGACTTTGTCAAGCACGAGTTCCGCAATAACGCAAACTCA
CTCGACAAAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCAC
AAGGATCTGTTGTTTTCGTACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTT
CTTGGGAAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCA
TGCAAATGCATAATAAGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACT
GGAATAAGTGTGTATCCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGT
GATGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTT
AT

QA 2 423 2 423
DS 

RD RR4GX74TF 423 0 0
G
GACCACAAGTCTCATTTCACAGACTTTGTCAAGCACGAGTTCCGCAATAACGCAAACTCA
CTCGACAAAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCAC
AAGGATCTGTTGTTCTCGTACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTT
CTTGGGAAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCA
TGCAAATGCATAATAAGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACT
GGAATAAGTGTGTATCCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGT
GATGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTT
AT

QA 2 423 2 423
DS 

RD RR4A261JQD 662 0 0
GGAACCGGTGTCGTGCAAACACAGGAGAGACTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCC
GACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCT
CGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTA
TACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCAT
TTCTTAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACCCAAACTCACTCGACAAAATCAAC
CTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTC
TCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCA
GCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATA
AGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGTGTAT
CCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGTGATGCATGGATTTAC
AAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTTATACAATATGTTGTA
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4AR20JQ 662 0 0
GGAACCGGTGTCGTGCAAACACAGGAGAGACTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCC
GACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCT
CGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTA
TACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCAT
TTCTTAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACCCAAACTCACTCGACAAAATCAAC
CTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTC
TCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCA
GCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATA
AGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGTGTAT
CCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGTGATGCATGGATTTAC
AAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTTATACAATATGTTGTA
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4A261TFB 662 0 0
GGAACCGGTGTCGTGCAAACACAGGAGAGACTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCC
GACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCT
CGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTA
TACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCAT
TTCTTAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACCCAAACTCACTCGACAAAATCAAC
CTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTC
TCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCA
GCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATA
AGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGTGTAT
CCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGTGATGCATGGATTTAC
AAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTTATACAATATGTTGTA
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4A261TF 662 0 0
GGAACCGGTGTCGTGCAAACACAGGAGAGACTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCC
GACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCT
CGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTA
TACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCAT
TTCTTAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACCCAAACTCACTCGACAAAATCAAC
CTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTC
TCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCA
GCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATA
AGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGTGTAT
CCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGTGATGCATGGATTTAC
AAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTTATACAATATGTTGTA
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4AR20TF 662 0 0
GGAACCGGTGTCGTGCAAACACAGGAGAGACTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCC
GACAGAGAACTATCAAGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCT
CGTTTTGCTCTCCGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTA
TACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCAT
TTCTTAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACCCAAACTCACTCGACAAAATCAAC
CTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTC
TCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCA
GCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATA
AGCCATTCTGGTGTCTTCATTTCCTTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGTGTAT
CCTATTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATTAACAGATCTGTGATGCATGGATTTAC
AAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTCAGGTTCTTGATTTATACAATATGTTGTA
TC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 8

CO CL740Contig1 1221 8 21 U
AGGCTTGAGTTTTACTTTCATTTCATATGAGAAAATACAAATTGACTGTAATGGTAAAGA
GAGATTCACATGTAAAAA*GAACACCTTATACGATTGAATACAATTCCTCACCAGTATAT
ATATAT**AGCCAAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGCTATGAACTTGAGGTGGTGAACTATTT
CTTGTTAAAGCCAAACAAGGATTTGATAGCGTTAATGGCACTCTCGTTGATGAAAGATTC
ATCAAACTGCTTCATGAGTGGATCGAAAGCTTCCGACTTCCTGATGTTTTCCAGATCTGG
ATCGCTTCGGATTCTCTTGAAATCTTCATATCCTGACTTCAATGCTTCTTCCAGAGCCGA
GAGACCAGCTTGAACCTGATTAAGCTTAGAGTAGCAACAAGCAACATTGTAACTTGAAAT
TGATGCTTCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCCTAACACAGACTCAAACCTCTCCAGTGCTTC
CTCATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGC
TTTCAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAAT
GAATCCGGCATTTCTCTCAGCTCTGATTATCTCTTTCTCTGTTAGCTCACTAGAATCATC
CACCTTACCATATCGTTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATTCTCTGACGGATGGT
GTACATAGTCCTACCGTACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTTGT
GGCAATAACTCTGTCGCCGACAGTGAATTTTCCGGTTTTATCTGCGAAACCACCGGGCAA
AATAGCATCAATGTAAGTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAAACCATAAGGCTG
CTCCACTTCTATCTCATACGTTTCGTACTTCTCTTCTTCTTCTTCATTTCCTTCTCCACC
CTCTTTCTCTTTTCCTGCTTCAGGTTTGGCTGTTGAATCTGTCTCCGACGCTTTCAAAGC
GAAACTCCCCCGTTTTGCCACATGGGTATTGCTCGAAAGGAAGAGACTCTTCACCGAAAT
GAAACTGGGTTGAGTGATCAAGGCAGGGTTTTGCTTAGTCTGCTGGGTTCTTGGCAGTGA
ATAGAGAGATGGATAACTGGTCGGAGCTAAAGACATGTT***GGATTCTTATCTTTAGGT
TCGAGCTCAGACACAAGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D535JQ U 29
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AF RR4BU18JQ U 8
AF RR4DG72JQ U 25
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GG
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ACGATTGAATACAATTCCTCACCAGTATATATATATACAGCCAAGAAGAGAAGAAAAGAG
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CTCTTTCTCTGTTAGC

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DS 

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ATAT****AGCCAAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGCTATGAACTTGAGGTGGTGAACTATTT
CTTGTTAAAGCCAAACAAGGATTTGATAGCGTTAATGGCACTCTCGTTGATGAAAGATTC
ATCAAACTGCTTCATGAGTGGATCGAAAGCTTCCGACTTCCTGATGTTTTCCAGATCTGG
ATCGCTTCGGATTCTCTTGAAATCTTCATATCCTGACTTCAATGCTTCTTCCAGAGCCGA
GAGACCAGCTTGAACCTGATTAAGCTTAGAGTAGCAACAAGCAACATTGTAACTTGAAAT
TGATGCTTCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCCTAACACAGACTCAAACCTCTCCAGTGCTTC
CTCATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGC
TTTCAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAAT
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CACCTTACCACATCGTTTCTCCATTTGCATAA

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DS 

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ACATGTAAAAA*GAACACCTTATACGATTGAATACAATTCCTCACCAGTATATATAT***
*AGCCAAGAAGAAAAGAAAAGAGAAGCTATGAACTTGAGGTGGTGAACTATTTCTTGTTA
AAGCCAAACAAGGATTTGATAGCGTTAATGGCACTCTCGTTGATGAAAGATTCATCAAAC
TGCTTCATGAGTGGATCGAAAGCTTCCGACTTCCTGATGTTTTCCAGATCTGGATCGCTT
CGGATTCTCTTGAAATCTTCATATCCTGACTTCAATGCTTCTTCCAGAGCCGAGAGACCA
GCTTGAACCTGATTAAGCTTAAAGTAGCAACAAGCAACATTGTAACTTGAAATTGATGCT
TCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCCTAACACAGACTCAAACCTCTCCAGTGCTTCCTTATAT
TTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGCTTTCAGT
TCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAATGAATCCG
GCATTTCTCTCAGCTCTGATTGTCTCTTTCTCTGTTAGCTCACTAGAATCATCCACCTTA
CCATATCGTTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATTCTCTGACGGATGGTGTACATA
GCCCTACCGTACTCAGCTGCAG*CCAAATCTCTGTCC*AAACACTGCACTTGT

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DS 

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ACGATTGAATACAATTCCTCACCAGTATATATATAT**AGCCAAGAAGAGAAGAAAAGAG
AAGCTATGAACTTGAGGTGGTGAACTATTTCTTGTTAAAGCCAGACAAGGATTTGATAGC
GTTAATGGCACTCTCGTTGATGAAAGATTCATCAAACTGCTTCATGAGTGGATCGAAAGC
TTCCGACTTCCTGATGTTTTCCAGATCTGGATCGCTTCGGATTCTCTTGAAATCTTCATA
TCCTGACTTCAATGCTTCTTCCAGAGCCGAGAGACCAGCTTGAACCTGATTAGGCTTAGA
GTAGCAACAAGCAACATTGTAACTTGAAATTGATGCTTCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCC
TAACACAGACTCAAACCTCTCCAGTGCTTCCTCATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAG
CCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGCTTTCAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTG
CATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAATGAATCCGGCATTTCTCTCAGCTCTGATTAT
CTCTTTCTCTGTTAGCTCACTAGAATCATCCACCTTACCATATCGTTTCTCCATTTGCAT
AAGCAAAGGACCAATTCTCTGACGGATGGTGTACATAGTCCTACCGTACTCAGCTGCAGG
CCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTTGTGGCAATAACTCTGT

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DS 

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TGTCT
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GGTTCTT
GG

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AGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAATGAAT
CCGGCATTTCTCTCAGCTCTGATTATCTCTTTCTCTGTTAGCTCACTAGAATCATCCACC
TTACCACATCGTTTCTCCATTTGCATAAGCAAGGGACCAATTCTCTGACGGATGGTGTAC
ATAGTCCTACCGTACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTTGTGGCA
ATAACTCTGTCGCCGACTGTGAATTTTCCGGTTTTATCTGCGAAACCACCGGGCAAAATA
GCATCAATGTAAGTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAAACCATAAGGCTGCTCC
ACTTCTATCTCATACGTTTCGTACTTCTCTTCTTCTTCTTCATTTCCTTCTCCACCCTCT
TTCTCTTTTCCTGCTTCAGGTTTGGCTGTTGAATCTGTCTCCGACGCTTTCAAAGCGAAA
CTACCCCGTTTTGCCACATGGGTATTGCTCGAAAGGAAGAGACTCTTCACCGAAATGAAA
CTGGGTTGAGTGATCAAGGCAGGGTTTTGCTTAGTCTGCTGGGTTCTTGGCAGTGAATAG
AGAGATGGATAACTGGTCGGAGCTAAAGACATGTT***GGATTCTTATCTTTAGGTTCGA
GCTC
CC

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DS 

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CTT
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TCAGCTCTGATTATCTCTTTCTCTGTTAGCTCACCAGAATCATCCACCTTACCATATCGT
TTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATCCTCTGACGGATGGTGTACATGGTCCTACCG
TACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTTGTGGCAATAACTCTGTCG
CCGACAGTGAATTTGCCGGTTTTATCGGCGAGACCACCAGGCAAAATAGCATCAATGTAA
GTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAGACCATAAGGCTGCTCCACTTCTATCTCA
TACGTTTCGTACTTCTCTTCTTCTTCCTCATTTCCTTTTCCACCATCTTTCTCTTTTCCT
GCTTCAGGTTTGGCTGTTGAATCCGTCTCCGACGCTTTCAAAGCAAAACTCCCCCGTTTT
GCCACATGGCTATTGCTCGAAAGGAAGAGACTTCTCACCGAAATGAAACTAGGTTGAGTG
ATCAAGGCAGGGTTTTGCTTAGTCTGCTGGGTTCTTTGCAGTGAATAGAGAGATGGATAA
CTGGTCGGAGCTAAAGACATGATGGTGGATTCTTATCTTTAGGTTCGAGCTC
AGACACCC

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AATCATCCACCTTACCATATCGTTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATTCTCTGAC
GGATGGTGTACATAGTCCTACCGTACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTG
CACTTGTGGCAATAACTCTGTCGCCGACGGTGAATTTTCCGGTTTTATCTGCGAAACCAC
CGGGCAAAATAGCATCAATGTAAGTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAAACCAT
AAGGC*GCTCCACTTCTATCTCATACGTTTCGTACTTCTCTTCTTCTTCTTCATTTCCTT
CTCCACCCTCTTTCTCTTTTCCTGCTTCAGGTTTGGCTGTTGAATCTGTCTCCGACGCTT
TCAAAGCGAAACTCCCCCGTTTTGCCACATGGGTAATGCTCGAAAGGAAGAGACTCTTCA
CCGAAATGAAACTGGGTTGAGTGATCAAGGCAGGGTTTTGCTTAGTCTGCTGGGTTCTTG
GCAGTGAATAGAGAGATGGATAACTGGTCGGAGCTAAAGACATGTT***GGATTCTTATC
TTTAGGTTCGAGCTCAGACACAAGCCCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 8

CO CL741Contig1 1247 8 22 U
GGGTGTCTGCAACATTACCAAAACGAAACCTTCCCATTGGATTCCCACTACTTTTTCCTG
TTTTAAATTAATTCTTTTTTTGTCAGAAACAGAGAAATAAAATTGCTTAGTATTGTTCCT
TGTTTTGGTGTGAGATGGAAAGAGATTTTCTTGGTTTGAGCGACAAGCAGTATCTCAGCA
ACGTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGTGTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGAAGGCAG
CTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAG
ATTTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAA
GCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAACGCGAATCCGCTTTTACTTGGCGGATCAGTTC
CGTTAGCAAATCATTCTTCTTTCCATCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGAGTGA
CTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTA
ATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAG
GAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGAGAAACTGAAAGAGTTTATGGAA
AACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAA
GTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAAT
CATTCAACGCAGCAGGTCCTGGAAATATGATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTCGTAAAGCAT
CGTTTGCTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAAGAGAGGCTCATGAGTGCACTACCGTACAAGA
AGATGCTTCTTGATTTGTCGACCGGAGAATCCAGTGGAATGAATTACTCTTCTGCTTCGC
ATACCTAAAACCTTTCTTATTCTTCCTTTTCTAAAACCACTCGGAGGTTTTATTACGATG
GTAACTTGTAATATAATCAATAGATTATTATTATTAGCTACCATTTATTATGCTACGAGC
AGGAGAAGGCGTCAGGCGTCTATATATTTGAGCATTGTTGTAATGGTTTAGTCTGTTATC
GTAGGATCACTTTATTATTTCAAACACTAACATATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTA
AGAATAAAAACCACCATTGTTATTAATGTTATTGTTTTATTATCTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GP71TF U 182
AF RR4DK19TF U 1
AF RR4DI46TF U 1
AF RR4FT50TF U 112
AF RR4AL43TF U 158
AF RR4AL43JQ C 404
AF RR4GP71JQ C 557
AF RR4FT50JQ C 487
BS 1 105 RR4DI46TF
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BS 107 116 RR4DI46TF
BS 117 117 RR4DK19TF
BS 118 183 RR4DI46TF
BS 184 184 RR4DK19TF
BS 185 444 RR4DI46TF
BS 445 445 RR4DK19TF
BS 446 638 RR4DI46TF
BS 639 639 RR4DK19TF
BS 640 685 RR4DI46TF
BS 686 688 RR4DK19TF
BS 689 730 RR4DI46TF
BS 731 731 RR4DK19TF
BS 732 791 RR4DI46TF
BS 792 795 RR4FT50TF
BS 796 796 RR4AL43TF
BS 797 843 RR4FT50TF
BS 844 928 RR4AL43TF
BS 929 929 RR4AL43JQ
BS 930 975 RR4AL43TF
BS 976 1247 RR4AL43JQ

RD RR4GP71TF 531 0 0
G
GTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGTGTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGAAGGCAGCT
AGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAGAT
TTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAAGC
CAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAACGCGAATCCGCTTTTACTTGGCGGATCAGTTCCG
TTAGCAAATCATTCTTCTTTCCGTCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGAGTGACT
TCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTAAT
GATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGA
GAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGAGAAACTGAAAGAGTTTATGGAAAA
CAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTA

QA 2 531 2 531
DS 

RD RR4DK19TF 766 0 0
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TTTTAAATTAATTCTTTTTTTGTCAGAAACAGAGAAATAAAATTGCTTAGTATTGTTCCT
TGTTTTGGTGTGAGATGGAAAGAGATTTTCTTGGTTTGAGCGACAAGCAGTATCTCAGCA
ACGTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGTGTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGAAGGCAG
CTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAG
ATTTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAA
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CGTTAGCAAATCATTCTTCTTTCCATCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGAGTGA
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ATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAG
GAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGAGAAACTGAAAGAGTTTATGGAA
AACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAA
GTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4DI46TF 791 0 0
GGGTGTCTGCAACATTACCAAAACGAAACCTTCCCATTGGATTCCCACTACTTTTTCCTG
TTTTAAATTAATTCTTTTTTTGTCAGAAACAGAGAAATAAAATTGTTTAGTATTGTCCCT
TGTTTTGGTGTGAGATGGAAAGAGATTTTCTTGGTTTGAGCGACAAGCAGTATCTCAGCA
ACGCTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGTGTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGAAGGCAG
CTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAG
ATTTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAA
GCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAACGCGAATCCGCTTTTACTTGGCGGATCAGTTC
CGTTAGCAAATCATTCTTCTTTCCGTCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGAGTGA
CTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTA
ATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAG
GAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGATAAACTGAAAGAGTTTATGGAA
AACAAATCCATAACGCTACTGCTGC***AGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAA
GTTTCTCTAG*TGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAAT
CATTCAACGCA

QA 1 791 1 791
DS 

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ATCTCAGCAACGTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGTGTCGGAGAACTAGGGTTGAGCA
AGGAGGCAGCTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATTCCTG
CTGCTGCAGATTTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTCTGCGGCCAGCAATC
TCCGCATAAGCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAACGCGAATCCGCTTTTACTTGGCG
GATCAGTTCCGTTAGCAAATCATTCTTCTTTCCATCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATG
CACGAGTGACTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGGAACTGTTA
GCGTCTTTAATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGCCCGGAACG
GTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGGGAAACTGAAAGAG
TTTATGGAAAACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTT
ACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTA
TGATTGAATCATTCAACGCAGCAG*TCCTGGAAATATGATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTC
GTAAAGCATCGT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4AL43TF 822 0 0
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ACTAGGGTTGAGCAAGAAGGCAGCTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTC
AAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAGATTTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTC
TGCGGCCAGCAATCTCCGCATAAGCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAACGCGAATCC
GCTTTTACTTGGCGGATCAGTTCCGTTGGCAAATCATTCTTCTTTCCATCCTGCCTTGAA
CTCGTCGGCTGATGCACGAGTGACTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTA
TGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTAATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTC
ATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAG
AGAAACTGAAAGAGTTTATGGAAAACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATC
GAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGAC
TAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAGGTCCTGGAAATATGATTCCTTC
AGTTCCTCAAGCTCGTAAAGCATCGTTTGCTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAAGAGAGGCT
CATGAGTGCACTACCGTACAAGAAGATGCTTCTTGATTTGTCGACCGGAGA*TCCAGTGG
AATGAATTACTCTTCTGCTTCGCATACCTAAAACCTTT
CTAT

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AL43JQ 844 0 0
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GGCTGATGCACGAGTGACTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGG
AACTGTTAGCGTCTTTAATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGC
CCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGAGAAAC
TGAAAGAGTTTATGGAAAACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTC
TGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGC
AATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAGGTCCTGGAAATATGATTCCTTCAGTTCC
TCAAGCTCGTAAAGCATCGTTTGCTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAAGAGAGGCTCATGAG
TGCACTACCGTACAAGAAGATGCTTCTTGATTTGTCGACCGGAGAATCCAGTGGAATGAA
TTACTCTTTTGCTTCGCATACCTAAAACCTTTCTTATTCTTCCTTTTCTAAAACCACTCG
GAGGTTTTATTACGATGGTAACTTGTAATATAATCAATAGATTATTATTATTAGCTACCA
TTTATTATGCTACGAGCAGGAGAAGGCGTCAGGCGTCTATATATTTGAGCATTGTTGTAA
TGGTTTAGTCTGTTATCGTAGGATCACTTTATTATTTCAAACACTAACATATATTTTATA
TGTTTTCATGTCTGTTAAGAATAAAAACCACCATTGTTATTAATGTTATTGTTTTATTAT
CTCG

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR4GP71JQ 674 0 0
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TACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAG
AGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAGG
TCCTGGAAATATGATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTCGTAAAGCATCGTTGGCTCGGTTCTT
GGAGAAGCGCAAAGAGAGGCTCATGAGTGCACTACCGTACAAGAAGATGCTTCTTGATTT
GTCGACCGGAGAATCCAGTGGAATGAATTACTCTTCTGCTTCGCATACCTAAAACCTTTC
TTATTCTTCCTTTTCTAAAACCACTCGGAGGTTTTATTACGATGGTAACTTGTAATATAA
TCAATAGATTATTATTATTAGCTACCATTTATTATGCTACGAGCAGGGGAAGGCGTCAGG
CGTCTATATATTTGAGCATTGTTGTAATGGTTTAGTCTGTTATCGTAGGATCACTTTATT
ATTTCAAACACTAACATATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTAAGAATAAAAACCACCA
TTGTTATTAATGTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4FT50JQ 760 0 0
CAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTAATGATA
TATCTCCTGATAAGGCTCAAGCTATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAA
CTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGGGAAACTGAAAGAGTTTATGGAAAACAAA
TCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCT
CTAGGTGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCA
ACGCAGCAGGTCCTGGAAATATGATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTCGTAAAGCATCGTTGG
CTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAAGAGAGGCTCATGAGTGCACTACCGTACAAGAAGATGC
TTCTTGATTTGTCGACCGGAGAATCCAGTGGAATGAATTACTCTTTTGCTTCGCATACCT
AAAACCTTTTTTATTCTTCCTTTTCTAAAACCACTCGGAGGTTTTATTACGGTGGTAACT
TGTAATATAATCAATAGATTATTATTATTAGCTACCATTTATTATGCTACGAGCAGGAGA
AGGCGTCAGGCGTCTATATATTTGAGCATTGTTGTAATGGTTTAGTCTGTTATCGTAGGA
TCACTTTATTATTTCAAACACTAACATATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTAAGAATA
AAAACCACCATTGTTATTAATGTTATTGTTTTATTATCTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL742Contig1 854 3 3 U
GGAATTTCACAAATTCAGGGCCAAAGTCAAATACTTTTCTCTCACTCTCTCTCTCTCT**
TCTTCTTCTGTTGAAGAAGAAGCTGTTCTGTAAGAAAGATTATGGACGGAGGTGGCGCGT
ACAACCCACGCACGGTGGAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAGGGACGTAGGAGTGGCATGA
TTAAAGCTTTAACCACTGATGTTCAGGAGTTTTACCGACTTTGTGATCCCGAAAAGGAGA
ACCTGTGCCTTTATGGGCAACCAAATGAGCGCTGGGAAGTGAATCTACCAGCTGAAGAGG
TTCCCCCGGAGCTCCCAGAGCCTGTCTTGGGCATCAACTTTGCCCGGGACGGGATGCAGG
AAAAGGACTGGCTGTCCCTTGTTGCTGTCCACAGCGATGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTT
TCTTTTTCGGAGCCAGGTTTGGATTTGACAAAGCTGATAGGAAAAGGCTTTTCAATATGA
TGAATGACCTCCCTTCAATATTTGAGGTTGTGGCTGGCACTGCTAAGAAACAATCAAAGG
AGAAGTCTTCTGTTTCCAACAATAGCAGCAACAGATCCAAATCAAACTCAAAGCGAGGAT
CAGAACCGAGGCCCAAGCTCACAAAGCCTGAGGAGCCTGAAGATGAAGAGGAGGAAGAGG
AAGGTGTGGAAGAAGAGGAGGATGAGGATGATGAGCAAAGGGGAAACACAGTGTGGGGCA
TGTGGTGAGAGCTATGCAGCTGATGAGTTCTGGATCTGCTGTGATCTCTGTGAGAACTGG
TTCCATGGGAAGTGTGTGAAGATAACACCAGCCAGAGCCGAGCACATCAAGCAGTATAAG
TGCCCATCTTGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR45TF U 27
AF RR4HA56TF U 21
AF RR4BB81TF U 1
BS 1 520 RR4BB81TF
BS 521 521 RR4DR45TF
BS 522 854 RR4BB81TF

RD RR4DR45TF 645 0 0
GG
AAATACTTTTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCTTCTGTTGAAGAAGAAGCTGTTC
TGTAAGAAAGATTATGGACGGAGGTGGCGCGTACAACCCACGCACGGTGGAGGAGGTTTT
CAGAGATTTCAAGGGACGTAGGAGTGGCATGATTAAAGCTTTAACCACTGATGTTCAGGA
GTTTTACCGACTTTGTGATCCCGAAAAGGAGAACCTGTGCCTTTATGGGCAACCAAATGA
GCGCTGGGAAGTGAATCTACCAGCTGAAGAGGTTCCCCCGGAGCTCCCAGAGCCTGTCTT
GGGCATCAACTTTGCCCGGGACGGGATGCAGGAAAAGGACTGGCTGTCCCTTGTTGCTGT
CCACAGCGATGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTTTCTTTTTCGGAGCCAGGTTTGGATTTGA
CAAAGCTGATAGGAAAAGGCTTTTCAATATGATGAATGACCTCCCTTCAATATTTGAGGT
TGTGGCTGGCACTGCTAAGAAACAATCAAAGGAGAAGTCTTCTGTTTCCAACAATAGCAG
CAACAGATCCAAATCAAACTCAAAGCGAGGATCAGAACCGAGGCCCAAGCTCACAAAGCC
TTAG*AGCCTGAAGATGAAGAGGAGGAAGAGGAAGGTGTGGA
A

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR4HA56TF 650 0 0
GG
AAAGTCAAATACTTTTCTCTCACTCTCTCTCTCT****TCTTCTTCTGTTGAAGAAGAAG
CTGTTCTGTAAGAAAGATTATGGACGGAGGTGGCGCGTACAACCCACGCACGGTGGAGGA
GGTTTTCAGAGATTTCAAGGGACGTAGGAGTGGCATGATTAAAGCTTTAACCACTGATGT
TCAGGAGTTTTACCGACTTTGTGATCCCGAAAAGGAGAACCTGTGCCTTTATGGGCAACC
AAATGAGCGCTGGGAAGTGAATCTACCAGCTGAAGAGGTTCCCCCGGAGCTCCCAGAGCC
TGTCTTGGGCATCAACTTTGCCCGGGACGGGATGCAGGAAAAGGACTGGCTGTCCCTTGT
TGCTGTCCACAGCGATGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTTTCTTTTTCGGAGCCAGGTTTGG
ATTTGACAAAGCTGATAGGAAAAGGCTTTTCAATATGATGAATGACCTCCCTTCAATATT
TGAGGTTGTGGCTGGCACTGCTAAGAAACAATCAAAGGAGAAGTCTTCTGTTTCCAACAA
TAGCAGCAACAGATCCAAATCAAACTCAAAGCGAGGATCAGAACCGAGGCCCAAGCTCAC
AAAGCCTGAGGAGCCTGAAGATGAAGAGGAGGAAGAGGAAGGTGTGGA

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR4BB81TF 854 0 0
GGAATTTCACAAATTCAGGGCCAAAGTCAAATACTTTTCTCTCACTCTCTCTCTCTCT**
TCTTCTTCTGTTGAAGAAGAAGCTGTTCTGTAAGAAAGATTATGGACGGAGGTGGCGCGT
ACAACCCACGCACGGTGGAGGAGGTTTTCAGAGATTTCAAGGGACGTAGGAGTGGCATGA
TTAAAGCTTTAACCACTGATGTTCAGGAGTTTTACCGACTTTGTGATCCCGAAAAGGAGA
ACCTGTGCCTTTATGGGCAACCAAATGAGCGCTGGGAAGTGAATCTACCAGCTGAAGAGG
TTCCCCCGGAGCTCCCAGAGCCTGTCTTGGGCATCAACTTTGCCCGGGACGGGATGCAGG
AAAAGGACTGGCTGTCCCTTGTTGCTGTCCACAGCGATGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTT
TCTTTTTCGGAGCCAGGTTTGGATTTGACAAAGCTGATAGGAAAAGGCTTTTCAATATGA
TGAATGACCTCCCTTCAATATTTGAGGTTGTGGCTGGCACCGCTAAGAAACAATCAAAGG
AGAAGTCTTCTGTTTCCAACAATAGCAGCAACAGATCCAAATCAAACTCAAAGCGAGGAT
CAGAACCGAGGCCCAAGCTCACAAAGCCTGAGGAGCCTGAAGATGAAGAGGAGGAAGAGG
AAGGTGTGGAAGAAGAGGAGGATGAGGATGATGAGCAAAGGGGAAACACAGTGTGGGGCA
TGTGGTGAGAGCTATGCAGCTGATGAGTTCTGGATCTGCTGTGATCTCTGTGAGAACTGG
TTCCATGGGAAGTGTGTGAAGATAACACCAGCCAGAGCCGAGCACATCAAGCAGTATAAG
TGCCCATCTTGCAG

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 7

CO CL743Contig1 723 7 8 U
GGAAGTAGCATATAACTTGTTTCCCAATTTCTTCCTCATCCTTTCCGCTGAAGCCGTCAT
CGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACAT
GTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCAAT
CCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAAGCCCGTGCTCA
TGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGCTCA
GCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCT
CTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTG
GGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATG
CCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACAT
TGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTAT
CTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTTTGGAACATGAT
CAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCCAATTTAGTTGATGTTTTCCT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4E542JQ C 143
AF RR4CO70TF U 83
AF RR4CW86TF U 1
AF RR4CA11JQ C 83
AF RR4CA11TF U 48
AF RR4E542TF U 83
AF RR4DO19TF U 45
BS 1 525 RR4CW86TF
BS 526 527 RR4DO19TF
BS 528 653 RR4CW86TF
BS 654 654 RR4DO19TF
BS 655 658 RR4CW86TF
BS 659 659 RR4DO19TF
BS 660 697 RR4CW86TF
BS 698 723 RR4DO19TF

RD RR4E542JQ 284 0 0
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ACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAAGCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTC
CATGAGAGCGTTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGTTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGAC
TGCAACCAACCTGATTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTTTTTGCGCCGATCACAGCATCAAC
TTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGGGAGTGGGCTGG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4CO70TF 547 0 0
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CCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTG
ACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAAGCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTC
CATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGAC
TGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAAC
TTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGAC
TCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGT
GAGGATACAACTGCCCTCAATAT**TCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAA
GCATTCTCCAATGTTTT*CCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATT
TTAGCAG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4CW86TF 697 0 0
GGAAGTAGCATATAACTTGTTTCCCAATTTCTTCCTCATCCTTTCCGCTGAAGCCGTCAT
CGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACAT
GTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCAAT
CCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAAGCCCGTGCTCA
TGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGCTCA
GCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCT
CTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTG
GGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATG
CCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATAT**TCAAGAAGCACAT
TGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTAT
CTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTTTGGA*CATGGT
CAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4CA11JQ 618 0 0
TTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCT
CCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTG
ACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAATCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTC
CATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGTTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGAC
TGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTTTTTGCGCCGATCACAGCATCAAC
TTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGAC
TCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGT
GAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAA
GCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATT
TTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATAT
TCTACTCTTCCAAAG
CCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4CA11TF 653 0 0
GG
GAAGCCGTCATCGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAA
AGACACAACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAG
CCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAA
TCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAG
CGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTT
GTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACC
CTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTT
GGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTC
AAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAA
TGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTT
TGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAG
CCC

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR4E542TF 614 0 0
TTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCT
CCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTG
ACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAAGCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTC
CATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGAC
TGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAAC
TTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGAC
TCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGT
GAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAA
GCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATT
TTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATAT
TCTACTCTTCCAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4DO19TF 679 0 0
GGGCT
GAAGCCGTCATCGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAA
AGACACAACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGTTGAG
CCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAA
GCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAG
CGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTT
GTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACC
CTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTT
GGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTC
AAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAA
TGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTT
TGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCCAATTTAGTT
GATGTTTTCCTTCC

QA 6 679 6 679
DS 



AS 2 6

CO CL744Contig1 1167 4 7 U
GGTTGCTGCTTCCATCAAAGCTGGATTTTATGATATTGGTATTGGGGCTGGATTGGAGTC
CATGACTACTAATCCTATGGCATGGGAAGGGTCAGTCAACCCAGCGGTGAAGAAGTTTGA
GCAAGCACAGAACTGTCTCCTCCCTATGGGTGTTACTTCAGAAAATGTAGCACACCGTTT
TGGTGTCTCAAGGCAGGAGCAAGATCAAGCTGCTGTTGACTCGCACAGAAAGGCAGCTGC
TGCTACTGCTGCTGGTAAATTCAAGGATGAGATCATTCCGGTTAAAACCAAGCTTGTTGA
CCCAAAGACAGGAGATGAGACACCCATTACAGTTTCTGTTGATGATGGGATCCGACCAAG
TACAACCCTTGCTACTCTTGGAAAGCTGAAGCCAGTGTTTAAAAAGGATGGCACTACAAC
TGCTGGAAACTCCAGCCAAGTAAGTGATGGTGCAGGAGCGGTTCTCCTCATGAGGAGAAG
TGTTGCTACGCAAAAAGGACTTCCCGTCCTTGGTGTATTCAGGACATTTGCTGCAGTTGG
TGTTGATCCAGCAATCATGGGTGTGGGTCCAGCAGTTGCCATTCCTGCTGCAGTTAAGGC
TGCTGGTTTAGAACTCGATGATATCGACTTGTTTGAGATCAACGAGGCATTTGCATCTCA
GTTTGTTTATTGCCGTAACAAATTGGGACTTGACGCAGAGAAAATCAATGTCAACGGTGG
CGCAATGGCCATAGGACATCCTTTGGGAGCTACAGGAGCACGTTGCGTTGCTACTTTGTT
GCACGAGATGAAACGCCGTGGAAAAGACTGTCGTTTTGGGGTAGTGTCGATGTGCATTGG
GACGGGGATGGGTGCAGCGGCAGTGTTTGAGAGAGGAGATGGAGTTGATGAGCTTCGCAA
CGCAAGGAAAGTTGAAGCTCAAGGCTATTTGTCCAAGGACGCTCGTTAGAGATATAACTG
ATGTGTACAAGCATCAAACACACATTTCAATCTCCAAATATTACATCTTTTTTATCGTCT
TCAGTTTATCACAGTTATTTGAATAAAGCATCGCAACCAATGTTTGCCTGAGTCCTGTAT
TCTTCTTGACCAGGTCATGTTTTTTCTTAGTATATTGTTTTTACATGACGGGGAATCTTC
TATGAAATCTTTATTATGTATGGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
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AF RR4A633TF U 1
AF RR4BS73TF U 54
AF RR4A633JQ C 355
AF RR4H890JQB C 478
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GT
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AT
GGG

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TTCTATGAAATCTTTAT
TATGT

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DS 



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ATTC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4CN19TF U 1
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BS 720 724 RR4CN19JQ

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ACCCAACCCCCTTCACTCTTCAAAATATTTGTGACCTCAGCACTCTATATTCTCCTTGGA
GAGAATCTGGTCCATTTTTTTCCTTTCTGCAGTTTATTAATTATTATAGTTGTTTGAATA
AAGCAGCACAACCAATGTTTGCCTGAGTCTTGTATTCTTCTTGACCAGGTCATGTGCTTT
TAAGTATATTTTTTTTATTACGTGAAGGGAAATCTTCTATAATACAATCTTATATGTATG
GAATGATATTGGTCTTCTTTTATTTTTGACAGCAAAGTCTCCTGTAATTACAGTTGCTGC
TTCTGGAAATAACATAATTTTCAGCGGCAATTTTTATAAA*TTTCAACGGATATGTAAG
ATTC

QA 1 719 1 719
DS 

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TCAATGTGCATTGGGACGGGGATGGGTGCAGCGGCTGTGTTTGAGAGAGGAGATGGAGTT
GATGAGCTTCGCAACGCAAGGAAAGTTGAAGCGCAAGGCTATTTGTCCAAGGACGCTCGT
TAGAGAACAACAAATACCCAACCCCCTTCACTTTTCAAAATATTTGTGACCTCAGCACTT
TATATTTTCCTTGGAGAGAATTTGGTCCATTTTTTTCCTTTTTGCAGTTTATTAATTATT
ATAGTTGTTTGAATAAAGCAGCACAACCAATGTTTGCCTGAGTTTTGTATTTTTCTTGAC
CAGGTCATGTGCTTTTAAGTATATTTTTTTTATTACGTGAAGGGAAATTTTTTATAATAC
AATTTTATATGTATGGAATGATATTGGTTTTTTTTTATTTTTGACAGCAAAGTTTCCTGT
AATTACAGTTGCTGCTTCTGGAAATAACATAATTTTCAGCGGCAATTTTTATAAAATTTC
AACGGATATGTAAGGATTC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 2 8

CO CL745Contig1 830 4 20 U
AAAAATGAACAGTTTAGTGGGGTTTATTAGTCACACGACCTTTTAACATTCAACACTGAA
ACACAAATGAATGAAGAGAGACTAAAAACACAAAAAGAACGAACATTGAGATTTTTTAAA
AAAGAAGCCTACAAACATGTGTTTCTTGCTCCTCACGCTTTAACAAAAGACGCGGTAAGA
CTTTCACGTAAAACAGAGTAAACCGATCTCCACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCATCC
CAAAAGAAAGCAGCTTTAGGGTTATCACATATCACATACTTCTTCACTCCCTTCTCATCC
ACACTTCCACAGAAATACTCACTGCTCACGCCTACGCAACACGGCTTCAATGGACTCTGA
AACGTTGTACTTCCTGGGTAAGCTCCTTTATTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTGTAG
AGATCAAGGATGATGAAAGTCGACTGCTTGGTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACTTGT
TGCAGTAAACTGTTGTGAAGTTTCACTAAAGCGTTTTGTGACTCGTTGCAGCGCTGGAAC
GAGGAGGCAACGGTGATTCCAGGGATGCAACCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCTATT
TTCTTCACTCCCAAGGCATGGATCCGCCTCAAATTCACTTCCGTTTGATCCACTACTTGC
TTTATGAATGCCGGAAACTCAGAGTTAGGGCGGTTTTGCGCGATAAAAGTGGAATAGTCG
TTGCCGGCAACGCTGACTAGAGCGACGGAGGAAGAAAAGTCGGAGGAGGAGTAGATGTCT
CCGGCTGTGAGAATGTTCTGGAAGAAATCGATCTGCGTGGTCATGTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F010JQ U 133
AF RR4G550JQ U 10
AF RR4AU84JQ U 1
AF RR4F072JQ U 109
BS 1 21 RR4AU84JQ
BS 22 22 RR4G550JQ
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BS 109 109 RR4G550JQ
BS 110 163 RR4AU84JQ
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BS 391 517 RR4AU84JQ
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BS 714 714 RR4F072JQ
BS 715 743 RR4AU84JQ
BS 744 830 RR4F072JQ

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QA 1 326 1 326
DS 

RD RR4G550JQ 663 0 0
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AAAACAGAGTAAACCGATCTCCACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCATCCCAAAAGAAA
GCAGCTTTAGGGTTATCACATATCACATACTTCTTCTCTCCCTTCTCATCCACACTTCCA
CAGAAATACTCACTGCTCACGCCTACGCAACACGGCTTCAATGGACTCTGAAACGTTGTA
CTTCCTGGGTAAGCTCCTTTGTTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTGTAGAGATCAAGG
ATGATGAAAGTCGACTGCTTGGTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACTTGTTGCAGTAAA
CTGTTGTGAAGTTTCACTAAAGCGTTTTGTGACTCGTTGCAGCGCTGGAACGAAGAGGCA
ACGGTGATTCCAGGGATGCAACCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCTATTTTCTTCACT
CCCAAGGCATGGATCCGCCTCAAATTCACTTCCGTTTGATCCACTACTTGCTTTATGAAT
GCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4AU84JQ 743 0 0
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ACACAAATGAATGAAGAGAGACTAAAAACACAAAAAGAACGAACATTGCGATTTTTTAAA
AAAGAAGCCTACAAACATGTGTTTCTTGCTCCTCACGCTTTAATAAAAGACGCGGTAAGA
CTTTCACGTAAAACAGAGTAAACCGATCTCCACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCATCC
CAAAAGAAAGCAGCTTTAGGGTTATCACATATCACATACTTCTTCTCTCCCTTCTCATCC
ACACTTCCACAGAAATACTCACTGCTCACGCCTACGCAACACGGCTTCAATGGACTCTGA
AACGTTGTACTTCCTGGGTAAGCTCCTTTGTTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTGTAG
AGATCAAGGATGATGAAAGTCGACTGCTTGGTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACTTGT
TGCAGTAAACTGTTGTGAAGTTTCACTAAAGCGTTTTATGACTCGTTGCAGCGCTGGAAC
GAGGAGGCAACGGTGATTCCAGGGATGCAACCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCTATT
TTCTTCACTCCCAAGGCATGGATCCGCCTCAAATTCACTTCCGTTTGATCCACTACTTGC
TTTATGAATGCCGGAAACTCAGAGTTAGGGCGGTTTTGGGCGATGAAAGTGGAGTAGTCG
TTGCCGGCAACGCTGACTAGAGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4F072JQ 722 0 0
TTTTTTTAA
AAAAAAGAAGCCTAAAAACATGTGTTTCTTGCTCCTCATGCTTTAACAAAAGACGCGGTA
AGACTTTCACGTAAAACAGAGTAAACCGATCTCCACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCA
TCCCAAAAGAAAGCAGCTTTAGGGTTATCACATATCACATACTTCTTCACTCCCTTCTCA
TCCACACTTCCACAGAAATACTCACTGCTCACGCCTACGCAACACGGCTTCA*TGGACTC
TGAAACGTTGTACTTCCTGGGTAAGCTCCTTTATTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTG
TAGAGATGAAGGATGATGAAAGTCGACTGCTTGGTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACT
TGTTGCAGTAAACTGTTGTGAAGTTTCACTAAAGCGTTTTGTGACTCGTTGCAGCGCTGG
AACGAGGAGGCAACGGTGATTCCAGGGATGCAACCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCT
ATTTTCTTCACTCCCAAGGCATGGATCCGCCCCAAATTCACTTCCGTTTGATCCACTACT
TGCTTTATAAATGCCGGAAACTCAGAGTTAGGGCGGTTTTGCGCGATAAAAGTGGAATAG
TCGTTGCCGGCGACGCTGACTAGAGCGACGGAGGAAGAAAAGTCGGAGGAGGAGTAGATG
TCTCCGGCTGTGAGAATGTTCTGGAAGAAATCGATCTGCGTGGTCATGTTGGG

QA 10 722 10 722
DS 



CO CL745Contig2 848 4 11 U
GGTCAGTTCTCAAACTTGTTTCCTTTTAACTTCCCTTTTAAACCCCATCTTCTATCTCTT
ATCTCCTTGCCTTTCCTTTTCCTTTCTATTGTCACTAAAAGAGAAGCCTTTGCTCTGAGA
ATCTTGAAAATGGATTCTTTGATCAAACTCTTCTTCTGCCTCTCTGTATTTCTCCTCTTT
GGAGAAATAAATGAAGTTGAGGGCTCGGATAAAAATCAGCGCATGTACGGATTTAGACCA
ACGAAGCTGTTTGTGTTCGGAGATTCATATGCTGATACAGGGAACATTAAGAAGTCTCTC
TCTAGTTCTTGGAAATTCCCTTATGGTATCACTTTCCCTGGTAAACCAGCCGGCCGTTTT
TCCGACGGCCGCGTCTCCACCGATTTTCTTGCAAAATTCGTTGGGATAAAATCACCAATC
CCATACTTCTGGAAAGATTACGCGGGAAAGAAACGGTTACAATATGGAATGAATTTTGCG
TACGGAGGAACAGGAGTCTTCAACACTCAAGTCCCCTTGCCCAACATGACCACGCAGATC
GATTTCTTCCAGAACATTCTCACAGCCGGAGACATCTACGCCTCCTCCGACTTTTCTTCC
TCCGTCGCTCTAGTCAGCGTCGCCGGCAACGACTACTCCACTTTCATCGCCCAAAACCGC
CCTAACTCTGAGTTTCC*GGCATTCATAAAGCAAGTAGTGGATCAAACGGAAGTGAATTT
GAGGCGGATCCATGCCTTGGGAGTGAAGAAAATAGCAGTACCGTCGTTGCAGCCTCTCGG
TTGCATCCCTGGAATCACCGTTGCCTCCTCGTTCCAGCGCTGCAACGAGTCATAAAACGC
TTTAGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F010TF U 93
AF RR4F072TF U 93
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AF RR4AU84TF U 1
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G

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AGTGGATCAAACGGAAGTGAATTTGAGGCGGATCCATGCCTTGGGAGTGAAGAAA*TAGC
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TCCGACGGCCGCGTCTCCACCGATTTTCTTGCAAAATTCGTTGGGATAAAATCACCAATC
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TTGCATCCCTGGAATCACCGTTGCCTCCTCGTTCCAGCGCTGCAACGAGTCATAAAACGC
TTTAGTGA

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 7

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ATCATGACCTTGGCTAATCTCATTGAACATAGCAATGATAGACAAGAGTTTCTGAAGCTC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 5 5 5 5 0 20 5 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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BS 1006 1008 RR4BC70TF
BS 1009 1018 RR4CP14TF
BS 1019 1019 RR4BC70TF
BS 1020 1032 RR4CP14TF
BS 1033 1033 RR4BC70TF
BS 1034 1040 RR4CP14TF
BS 1041 1042 RR4BC70TF
BS 1043 1061 RR4CP14TF
BS 1062 1323 RR4BC70TF
BS 1324 1428 RR4CP14JQ
BS 1429 1429 RR4BC70JQ
BS 1430 1439 RR4CP14JQ
BS 1440 1440 RR4BC70JQ
BS 1441 1523 RR4CP14JQ
BS 1524 1524 RR4BC70JQ
BS 1525 1575 RR4CP14JQ
BS 1576 1576 RR4BC70JQ
BS 1577 1577 RR4CP14JQ
BS 1578 1584 RR4BC70JQ
BS 1585 1585 RR4CP14JQ
BS 1586 1586 RR4BC70JQ
BS 1587 1587 RR4CP14JQ
BS 1588 1589 RR4BC70JQ
BS 1590 1591 RR4CP14JQ
BS 1592 1592 RR4BC70JQ
BS 1593 1625 RR4CP14JQ
BS 1626 1627 RR4BC70JQ
BS 1628 1633 RR4CP14JQ
BS 1634 1634 RR4BC70JQ
BS 1635 1672 RR4CP14JQ
BS 1673 1702 RR4BC70JQ

RD RR4F719TF 812 0 0
GGAGTTAGGGACAAGAAGAAGGGTGCTTCAGTTATAATCCTGTTCTTTGTCTTAAAAAAA
TCATCGAGGATCTCCTATCTTCCTAAAATCGGATCTCCAAAAGAGATGGCGGCGGAACGG
AAAAAGGAAACGATTCGTCTGGAGCCCGAATCCGTCATCCCTATCCTCAAACCTAAGCTC
ATCATGACCTTGGCTAATCTCATTGAACATAGCAATGATAGACAAGAGTTTCTGAAGCTC
TGCAAGAGAATTGAATACACTGTCCGAGCTTGGTATAATCTTCAGTTTGAAGATTTGATG
CAACTCTACTCTCTTTTTGATCCTGTTCACGGTGCTCAGAAACTTCAGCAGCAGAACCTA
ACTTCTCAGGAAATTGATGTCCTTGAACAGAATTTCCTCGCTTACTTGTTTCAGGTTATG
GACAAGAGCAACTTTAAAATAACGACAGATGATGAGATCGAGGTTGCACGCTCTGGGCAG
TATCTTCTGAATCTTCCCATCAAAGTTGACGAGTCAAAGCTTGACAAGAAGATACTCAAG
ATATATTTTGAGGATCATCCACATGAAAATCTTCCAGACTTTTCTGATAATTATGTCATC
TTCAG*CGTGGTATTGGGATGGATAAAACCACAGATTTTTTTTTCATGGAGAAATTAGAT
GTGATCATATCACGTATTTGGTCATATTTCCTGAAAATCACTTGGTTAGATAAGCTACGT
GGCAA*CAGTCAG*CAGACATCAAAAGAA*GATCCCAAAAA*GATGATGAGACAA*CCCT
GA*GCAGATGATGAGGACT
GTATGTGAGCGTA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4FM70TF 727 0 0
GAACGGAAAAAGGATACGATTCGTCTGGAGCCCGAATCCGTCATCCCTATCCTCAAACCT
AAGCTCATCATGACCTTGGCTAATCTCATTGAACATAGCAATGATAGACAAGAGTTTCTG
AAGCTCT*CAAGAGAATTGAATACACTGTCCGAGCTTGGTATAATCTTCAGTTTGAAGAT
TTGATGCAACTCTACTCTCTTTTTGATCCTGTTCACGGTGCTCAGAAACTTCAGCAGCAG
AACCTAACTTCTCAGGAAATTGATGTCCTTGAACAGAATTTCCTCGCTTACTTGTTTCAG
GTTATGGACAAGAGCAACTTTAAAATAACGACAGATGATGAGATCGAGGTTGCACGCTCT
GGGCAGTATCTTCGGAATCTTCCCATCAAAGTTGACGAGTCAAAGCTTGACAAGAAGATA
CTCAAGAGATATTTTGAGGATCATCCACATGAAAATCTTCCAGACTTTTCTGATAATTAT
GTCATCTTCAGGCGTGGTATTGGGATGGATAAAACCACAGATTTTTTTTTCATGGAGAAA
TTAGATGTGATCATATCACGTATTTGGTCATATTTCCTGAAAATCACTTGGTTAGATAAG
CTACGTGGCAAACAGTCAGGCAGACATCAAAAGAAAGATCCCAAAAAAGATGATGAGACA
AACCCTGAAGCAGATGATGAGGACTTGTATGTGGAGCGTATTCGCCTTGAGAATACACAA
TTGAGCT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4CP14TF 818 0 0
G
TACACTGTCCGAGCTTGGTATAATCTTCAGTTTGAAGATTTGATGCAACTCTACTCTCTT
TTTGATCCTGTACACGGTGCTCAGAAACTTCAGCAGCAGAACCTAACTTCTCAGGAAATT
GATGTCCTTGAACAGAATTTCCTCGCTTACTTGTTTCAGGTTATGGACAAGAGCAACTTT
AAAATAACAACAGATGATGAGATCGAGGTTGCACGCTCTGGGCAGTATCTTCTGAATCTT
CCCATCAAAGTTGACGAGTCAAAGCTTGACAAGAAGATACTCAAGAGATATTTTGAGGAG
CATCCACATGAAAATCTTCCAGACTTTTCTGATAATTATGTCATCTTCAGGCGTGGTATT
GGGATGGATAAAACCACAGATTTCTTTTTCATGGAGAAATTAGATGTGATCATATCACGT
ATTTGGTCATATTTCCTGAAAATCACTTGGTTAGATAAGCTACGTGGCAAACGGTCAGGC
AGACATCAAAAGAAAGATCCCAAAAAAGATGATGAGACAAACCCTGAAGCAGATGATGAG
GACTTGTATGTGGAGCGTATTCGCCTTGAGAATACACAATTGAGCTTTAAGAGTTTCTTG
AGCAAGCTCACGATACAAGAGCCTACATTTGATAGAATGATTGTTGTTTATAGGCGAGCC
AGCTCTAAAACAAATCAG*AAAGAGGAATTTACGTCAAGCATTTCAAAA*CATTCCTATG
GCCGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAA**GAATCCTGGACAGACTCCAATGGAT*GG
GTCAA**TTCTGATATCTGCCGTAGT
GGTCTGGTGCG

QA 2 807 2 807
DS 

RD RR4BC70TF 822 0 0
G
AAGTTGACGAGTCAAAGCTTGACAAGAAGATACTCAAGAGATATTTTGAGGATCATCCAC
ATGAAAATCTTCCAGACTTTTCTGATAATTATGTCATCTTCAGGCGTGGTATTGGGATGG
ATAAAACCACAGATTTTTTTTTCATGGAGAAATTAGATGTGATCATATCACGTATTTGGT
CATATTTCCTGAAAATCACTTGGTTAGATAAGCTACGTGGCAAACAGTCAGGCAGACATC
AAAAGAAAGATCCCAAAAAAGATGATGAGGCAAACCCTGAAGCAGATGATGAGGACTTGT
ATGTGGAGCGTATTCGCCTTGAGAATACACAATTGAGCTTTAAGAGTTTCTTGAGCAAGC
TCACGATACAATAGCCTACATTTGATAGAATGATTGTTGTTTATAGGCGTGCCAGCTCTA
AAACAAATCAGGAAAGAGGAATTTACGTCAAGCATTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACA
TGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCTGGACTGACTCCAATGGATTGGGTCAAAT
TTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAG
CAGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACAT
ACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATAACGCAATCCATGTATG
ATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTGCACTTGTGCGATGACGTTATTCAGC
AAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATG

QA 2 822 2 822
DS 

RD RR4CP14JQ 785 0 0
TAGAATGAT
TGTTGTTTATAGGCGAGCCAGCTCTAAAACAAATCAGGAAAGAGGAATTTACGTCAAGCA
TTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCTGG
ACAGACTCCAATGGATTGGGTCAAATTTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGT
GGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAGCAGACCCATGGGTAATCTT*GCAGTTCTCTCCAC
AGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACATACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCA
GAACTTGATAACGCAATCCATGTATGATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATT
ACACTTGTGCGATGACGTTATTCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACAT
ACTAATGGAGCAGGGGAAAGCTACCTTGGAGGATCTGGATCTGAGATGTGAGGAACTGAT
AAAGGAAGAGTTTGGTGAGAGGTGTAACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGTAGCTAGA
GAATTTGGGGATCGTTGCCCGTGACACCATTGGAAGGTACTACTGCATGGGGCTGAAGCG
AGCCAACGAGATCATAGGGACCACCACGGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGCGT
CACTCCTTCTTGAACTTACTA*******TACCTT*ATCTTCTCTTCTCTTCTTTAACATT
TGTTCTCTCTCATTTCACTAAAACTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTAC

QA 10 785 10 785
DS 

RD RR4BC70JQ 796 0 0
AGGCGTGCCAGCTCTAAAACAAATCAGGAAAGAGGAATTTACGTCAAGCATTTCAAAAAC
ATTCCTATGGCCGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCTGGACTGACTCCA
ATGGATTGGGTCAAATTTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCA
GTTGAGATGCCGAAAGCAGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGT
TATTGTGCCAAAACATACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATA
ACGCAATCCATGTATGATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTGCACTTGTGC
GATGACGTTATTCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATGGAG
CAGGGGAAAGCTACCTTGGAGGATCTGGATCTGAGATGTGAGGAACTGATAAAGGAAGAG
TTTGGTGAGAGGTGTAACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGAAGCTAGAGAAGTTGGGG
ATCGTTGCCCGTGACACCATTGGAAGGCACTACTGCATGGGGCTGAAGCGAGCCAACGAG
ATCATAGGGACCACCACCGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGCGTCACTCCTTCT
TGAACTTACCACCTTCTCTTCTCT*CTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACATTTGTTCTCTC*
*ATTTCAGTAAAACTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAAAATCCAAATGCA
ACAAACCAATTCACCG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4FU79JQ 720 0 0
ATGGAGATTGTGCTTC*TGAGAAAAGAAATCCTGGACTGACTCCAATGGATTGGGTCAAA
TTTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAA
GCAGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACA
TACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATAACGCAATCCATGTAT
GATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTACACTTGTGCGATGACGTTATTCAG
CAATAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATGGAGCAGGGGAAAGCTCCC
TTGGAGGATCTGGATCTGAGATGTGAGGAACTGATAAAGGAAGAGTTTGGTGAGAGGTGT
AACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGAAGCTAGAGAAGTTGGGGATCGTTGCCCGTGAC
ACCATTGGAAGGTACTACTGCATGGGGCTGAAGCGAGCCAACGAGATCATAGGGACCACC
ACCGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGCGTCACTCCTTCTTGAACTTACCACCTT
CTTTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACATTTGTTCTCTC**ATTTCAGTAAAACT
CTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAAAATCCAAATGCAACAAACCAATTCACC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 2 8

CO CL747Contig1 818 3 21 U
GGGCCTCCAATCGCGCGACTTGTCTTCCGTCTCCAATCAAGCTGATGAGCTCTTCGTCTT
CCTCGTCCTCCCAGATGGGTGAGCTTGTAGCTGACAAGCATGTACGTTACATTCTTATGG
CAGAAAAGAAGAAAGAGAGTTTCGAGTCGGTGGTGATGGATCATCTAAGAATGAATGGTG
CCTACTGGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCTTCCCTCTGTTTCCGTTGATG
AAGTCGTTTCATGGCTCATGACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTG
GACATGATCCACATGTTTTATATACACTGAGTGCTGTACAAATCTTGGCCCTCTTTGACA
AACTAGACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAAGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACGAAG
ATGGATCCTTCTCTGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACACGAGGTTTTCCTACATTGCCA
TATGCTGTCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATT
ACATTGTTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTGCACACCCGGAGCAGAATCAC
ATGCAGGACAGATTTTCTGTTGCGTGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTGTCCATCATG
TCGATAAGGACTTACTCGGGTGGTGGTTATGTGAAAGACAAGTCAAGTCAGGGGTTTAAA
TGGACGACCCGAGAACTTCCTGATGTTTGCTATCTTGGTGGGTCTATCTAGCTATCATGA
TAGATAGAGTCACTGGATCACAAGCAAAGCTTGTCAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F961TF U 1
AF RR4FL20TF U 1
AF RR4CL22TF U 1
BS 1 20 RR4CL22TF
BS 21 21 RR4F961TF
BS 22 26 RR4CL22TF
BS 27 27 RR4F961TF
BS 28 142 RR4CL22TF
BS 143 143 RR4F961TF
BS 144 257 RR4CL22TF
BS 258 258 RR4F961TF
BS 259 337 RR4CL22TF
BS 338 338 RR4F961TF
BS 339 392 RR4CL22TF
BS 393 393 RR4F961TF
BS 394 433 RR4CL22TF
BS 434 434 RR4F961TF
BS 435 650 RR4CL22TF
BS 651 651 RR4F961TF
BS 652 655 RR4CL22TF
BS 656 656 RR4F961TF
BS 657 668 RR4CL22TF
BS 669 669 RR4FL20TF
BS 670 818 RR4CL22TF

RD RR4F961TF 674 0 0
GGGCCTCCAATCGCGCGACTTGTCTTCCGTCTCCAATCAAGCTGATGAGCTCTTCGTCTT
CCTCGTCCTCCCAGATAGGTGAGCTTGTAGCTGACAAGCATGTACGTTACATTCTTATGG
CAGAAAAGAAGAAAGAGAGTTTCGAGTCGGTGGTGATGGATCATCTAAGAATGAATGGTG
CCTACTGGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCTTCCCTCTGTTTCCGTTGATG
AAGTCGTTTCATGGCTCATGACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTG
GACATGATCCACATGTTTTATATACACTGAGTGCTGTACAAATCTTGGCCCTCTTTGACA
AACTAGACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAAGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACGAAG
ATGGATCCTTCTCTGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACACGAGGTTTTCCTACATTGCCA
TATGCTGTCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATT
ACATTGTTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTGCACACCCGGAGCAGAATCAC
ATGCAGGACAGATTTTCTGTTGCGTGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTGTCCATCATG
TCGATAAG
ACTTAC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4FL20TF 707 0 0
GGGCCTCCAATCGCGCGACTTGTCTTCCGTCTCCAATCAAGCTGATGAGCTCTTCGTCTT
CCTCGTCCTCCCAGATGGGTGAGCTTGTAGCTGACAAGCATGTACGTTACATTCTTATGG
CAGAAAAGAAGAAAGAGAGTTTCGAGTCGGTGGTGATGGATCATCTAAGAATGAATGGTG
CCTACTGGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCCTCCCTCTGTTCCCGTTGATG
AAGTCGTTTCATGGCACATGACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTG
GACATGATCCACATGTTTTATATACACTGAGTGCTGTACAAATCTTGGCCCTCTTTGACA
AACTAGACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAAGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACGAAG
ATGGATCCTTCTCTGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACACGAGGTTTTCCTACATTGCCA
TATGCTGCCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATT
ACATTGTTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTGCACACCCGGAGCAGAATCAC
ATGCAGGACAGATTTTCTGTTGCATGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTGTCCATCATG
TCGATAAGGACTTACTCGGGTGGTGGTTATGTGAAAGACAAGTCAAG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4CL22TF 818 0 0
GGGCCTCCAATCGCGCGACTCGTCTTTCGTCTCCAATCAAGCTGATGAGCTCTTCGTCTT
CCTCGTCCTCCCAGATGGGTGAGCTTGTAGCTGACAAGCATGTACGTTACATTCTTATGG
CAGAAAAGAAGAAAGAGAGTTTTGAGTCGGTGGTGATGGATCATCTAAGAATGAATGGTG
CCTACTGGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCTTCCCTCTGTTTCCGTTGATG
AAGTCGTTTCATGGCTCTTGACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTG
GACATGATCCACATGTTTTATATACACTGAGTGCTGTGCAAATCTTGGCCCTCTTTGACA
AACTAGACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAGGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACGAAG
ATGGATCCTTCTCAGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACACGAGGTTTTCCTACATTGCCA
TATGCTGTCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATT
ACATTGTTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTGCACACCCGGAGCAGAATCAC
ATGCAGGACAGATTTTCTGTTGCGTGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTCTCCAACATG
TCGATAAG*ACTTACTCGGGTGGTGGTTATGTGAAAGACAAGTCAAGTCAGGGGTTTAAA
TGGACGACCCGAGAACTTCCTGATGTTTGCTATCTTGGTGGGTCTATCTAGCTATCATGA
TAGATAGAGTCACTGGATCACAAGCAAAGCTTGTCAGT

QA 1 818 1 818
DS 



CO CL747Contig2 862 5 5 U
AGTTGCAATCATCACATCTTCCATTAGTAGATCACTTGAATCCACATGGTTCGTTTAATA
TTCCCAAATTACAATTGAGCATGCATTCAAATGAACTTCTAAAACCGTACTTCTAAAACC
GTCTAAGTAAACCAACCAATGAACAACGCAAAGAACTGCCATTGCCTTTATTTGGTTAGG
AGAATTCGATTGATGACATCAACAGGCAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTTTGACTCCA
GGATACTCAAGGAGGGATAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAGATATCAACAGCA
TCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGATGAACTTG
ACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTAGATAGGACC
CACCAAGAATAGCAAACATCAGGAAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCCCCTGACTTG
ACTTGTCTTTCACATAACCACCACCCGAGTAAGTCCTTATCGACATGATGGACACTCCCG
GTGATAGCAAGAGCACCCACGCAACAGAAAATCTGTCCTGCATGTGATTCTGCTCCGGGT
GTGCACCCAAAACCACCATCAAGGTTTTTGCAGCTAACAATGTAATCAACGGCCTTCTCT
ACATTGATTTTGTCAAGACATTTCAAAATTGAGAGACAGCATATGGCAATGTAGGAAAAC
CTCGTGTCTACTTCGCCCCACATATCTCCAGAGAAGGATCCATCTTCGTTCTGCAAACCA
GCAATATAGCCTGATACTTTTGCACGTCAGAATGTCTAGTTTGTCAAGAGGGCCAAGATT
GCACAGCACTCAGTGTAAAAAA


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TC

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CAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGATGAACTTGACAA
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TGTCTACTTCGCCCCACATATCTCCTGAGAAGGATCCATCTTCGTTCTGCAAACCAGCAA
TATAGCCTGATACTTTTGCACGTCAGAATGTCTAGTTTGTCAAGAGGGCCAAGATTGCAC
AGCACTCAGTGTAAAAAA

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DS 



AS 1 8

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY69JQ U 11
AF RR4BR88JQ U 79
AF RR4CC17JQ U 1
AF RR4AP18JQ U 69
AF RR4DY69TF C 330
AF RR4CC17TF C 335
AF RR4BR88TF C 539
AF RR4AP18TF C 629
BS 1 35 RR4CC17JQ
BS 36 36 RR4DY69JQ
BS 37 180 RR4CC17JQ
BS 181 181 RR4DY69JQ
BS 182 374 RR4CC17JQ
BS 375 375 RR4DY69JQ
BS 376 413 RR4CC17JQ
BS 414 414 RR4DY69JQ
BS 415 445 RR4CC17JQ
BS 446 446 RR4DY69JQ
BS 447 497 RR4CC17JQ
BS 498 498 RR4DY69JQ
BS 499 605 RR4CC17JQ
BS 606 606 RR4DY69JQ
BS 607 611 RR4CC17JQ
BS 612 612 RR4DY69JQ
BS 613 782 RR4CC17JQ
BS 783 783 RR4DY69TF
BS 784 840 RR4CC17JQ
BS 841 928 RR4DY69TF
BS 929 929 RR4CC17TF
BS 930 950 RR4DY69TF
BS 951 951 RR4CC17TF
BS 952 960 RR4DY69TF
BS 961 961 RR4CC17TF
BS 962 1056 RR4DY69TF
BS 1057 1107 RR4CC17TF
BS 1108 1108 RR4BR88TF
BS 1109 1142 RR4CC17TF
BS 1143 1246 RR4BR88TF
BS 1247 1247 RR4AP18TF
BS 1248 1259 RR4BR88TF
BS 1260 1344 RR4AP18TF

RD RR4DY69JQ 669 0 0
GGTCATAAGCTGTC
TTTTTTTTCTTCGAAAAAGGAAAACATCGTAAATGGATTGTACAAAGAAAACATAATAAA
AACCGTACTGCTCTTACTGGAAGATAAATAGTACACAGATTTGGTATCTTTCCACTACAA
AGGAATCTTATTGCTCTTATTGGAAGACTAAAAAA**GATACAACATTACACGTTTTCAC
GGCAAGAGTACAACGGAGCCAGATGTTATCCTATTCTCAAGGTCTGCGTGAGCATCAGCG
ACCCGAGACAACGGGTACTTGTGGTTCACACGAGCCTTTATAACCCCTGAAGCAACATTG
GCGAAAACCTCACCCGCACACTCCAACAGCTCTTCTCGAGTCTCGTTGTACTGCATCATG
GAAGGTCTCGTCAAGAAAAGCGACTTGGGAGCAAGATCGGATAACGGAACAGGATCCGGA
AATCCCGAGGACTGTCCGAAGCTCACCATGTATCCTCTGCTCTTTAAACACGCCAACGAT
CCCTTGAAGGTGTCTTTCCCCACCGAGTCGTAAACAACATCGACTCCTTTGCCTGATGTA
ATGTCCTTGACCCGTGAGACAAAGTCCTCGTTCTTGTACATGATAACATGGTGGCATCCA
TCTTCTTTGGCTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAGACGGTTCCAATAACAGTGG

QA 15 669 15 669
DS 

RD RR4BR88JQ 591 0 0
AATAAAAACCGTACTGCTCTTACTGGAAGATAAGTAGTACACAGGTTTGGTATTTTTCCA
CTACAAAGGAATCTTATTGCTCTTATTGGAAGACTAAAAAAA*GAAACAACATTACACGT
TTTCACGGCAAGAGGACAACGGAGCCAGATGTTATCCTATTCTCAAGGTCTGCGTGAGCA
TCGGCCACACGAGCCAACGGGTACTTGTGGTTCAAACGAGCCTTTATAACCCCTGAAGCA
ACATTGGCGAAAACCTCACCCGCACACTCCAACAGCTCTTCTCGAGTCTCGTTGTACTGC
ATCATGGAAGGTCTCGTCAAGAAGAGCGACTTGGGAGCAAGATCGGATAACGGAACAGGA
TCCGGAGATCCCGAGGACTGTCCGAAGCTCACCATGTATCCTCTGCTCTTTAAACACGCC
AACGACCCCTTGAAGGTGTCTTTCCCCACCGAGTCGTAAACAACATCGACTCCTTTGCCT
GATGTAATGTCCTTGACCCGTGAGACAAAGTCCTCGTTCTTGTACATGATAACATGGTGG
CATCCATCTTCTTTGGCTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAGACGGTTCCA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4CC17JQ 840 0 0
TTTTTTTTAGTCTAAGCTGTGTCTTTTTTTTTCTTTGAAAAAGGAAAACATCGTAAATAG
ATTGTACAAAGAAAACATAATAAAAACCGTACTGCTCTTACTGGAAGATAAGTAGTACAC
AGGTTTGGTATTTTTCCACTACAAAGGAATCTTATTGCTCTTATTGGAAGACTAAAAAAA
AGAAACAACATTACACGTTTTCACGGCAAGAGGACAACGGAGCCAGATGTTATCCTATTC
TCAAGGTCTGCGTGAGCATCAGCCACACGAGCCAACGGGTACTTGTGGTTCAAACGAGCC
TTTATAACCCCCGAAGCAACATTGGCGAAAACCTCACCCGCACACTCCAACAGCTCGTCT
CGAGTCTCGTTGTATTGCATCATGGAAGGTCTCGTCAAGAAGAGCGACTTCGGGGCAAGA
TCGGATAACGGAACAGGATCCGGAGTTCCCGAGGACTGTCCGAAGCTCACCATGTATCCT
CTGCTCTTTAAACACGCTAACGATCCCTTGAAGGTGTCTTTCCCCACCGAGTCGTAAACA
ACATCGACTCCTTTGCCTGATGTAATGTCCTTGACCCGTGAGACAAAGTCCTCGTTCTTG
TACATAATAACGTGGTGGCATCCATCTTCTTTGGCTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAG
ACGGTTCCAATAACAGTGGCTCCAAGAGCGTTTGCCCATTGACATAACAGAGACCCAACT
CCACCTGCTGCAGCGTGGACAAGGATTGTGTGCCCACGTTCCACCTTGAAACAACGGCGA
AG*AGAAACTGTGCAGTCATACCCTTGAGCATGATTGATGCTGCAACGATAGGATCAATA

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4AP18JQ 713 0 0
AAGAAAACATAATAAAAACCGTACTGCTCTTACTGGAAGATAAGTAGTACACAGGTTTGG
TATTTTTCCACTACAAAGGAATCTTATTGCTCTTATTGGAAGACTAAAAAAA*GAAACAA
CATTACACGTTTTCACGGCAAGAGGACAACGGAGCCAGATGTTATCCTATTCTCAAGGTC
TGCGTGAGCATCAGCCACACGAGCCAACGGGTACTTGTGGTTCACACGAGCCTTTATAAC
CCCCGAAGCAACATTGGCGAAAACCTCACCCGCACACTCCAACAGCTCGTCTCGAGTCTA
GTTGTATTGCATCATGGAAGGTCTCGTCAAGAAGAGCGACTTCGGGGCAAGATCGGATAA
CGGAACAGGATCCGGAGTTCCCGAGGACTGTCCGAAGCTCACCATGTATCCTCTGCTCTT
TAAACACGCTAACGATCCCTTGAAGGTGTCTTTCCCCACAGAGTCGTAAACAACATCGAC
TCCTTTGCCTGATGTAATGTCCTTGACCCGTGAGACAAAGTCCTCGTTCTTGTACATGAT
AACATGGTGGCATCCATCTTCTTTGGTTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAGACGGTTCC
AATAACAGTGGCTCCAAGAGCGTTTGCCCATTGACATAACAGAGACCCAACTCCACCTGC
TGCAGCGTGGACAAGGATTGTGTGCCCACGTTCCACCTTGAAACAACGGCGAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4DY69TF 728 0 0
AAA
CTCACCCGCACACTCCAACAGCTCTTCTCGAGTCTCGTTGTACTGCATCATGGAAGGTCT
CGTCAAGAAGAGCGACTTGGGAGCAAGATCGGATAACGGAACAGGATCCGGAGATCCCGA
GGACTGTCCGAAGCTCACCATGTATCCTCTGCTCTTTAAACACGCCAACGATCCCTTGAA
GGTGTCTTTCCCCACCGAGTCGTAAACAACATCGACTCCTTTGCCTGATGTAATGTCCTT
GACCCGTGAGACAAAGTCCTCGTTCTTGTACATGATAACATGGTGGCATCCATCTTCTTT
GGCTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAGACGGTTCCAATAACAGTGGCTCCAAGAGCGTT
TGCCCATTGACATAACAGAGACCCAACTCCACCTGCTGCAACGTGGACAAGGATTGTGTG
CCCACGTTCCACCTTGAAACAACGGCGAAGGAGAAACTGTGCAGTCATACCCTTGAGCAT
GATTGATGCTGCAACGATAGGATCAATAGATGAAGGAACAGGAACCACTTTATATGCCGG
GAGGATCTGTTCTTCAGCATAGGCACCCATAGGACTTCCAGCATACGCAACGAGATAACC
GATCTTTCTGCCAGTCAACCCTGAACCCGCAGCTACCACTTCTCCAACAGCCTCCATACC
TGGTGTGAAGGGCATAGAGGCTGGCTTGTAAACACCTTTCCTGTAGTAAACATCAATGAA
GTTA
C

QA 4 727 4 727
DS 

RD RR4CC17TF 809 0 0
TCA
CCGCACACTCCA*CAGCTCGTCTCGAGTCTCGT*GTA*TGCATCATGAA**GTCTCGTCA
AGAAGAGCGACTTCGG*GCAAGATCGGATAACGGA*CAGGATCCGGAGTTCCCGAGGACT
GTCCGAAGCTCACCATGTATCCTCTGCTCTTTAAACACGCTAACGATCCCTTGAAGGTGT
CTTTCCCCACCGAGTCGTAAACAACATCGACTCCTTTGCCTGATGTAATGTCCTTGACCC
GTGAGACAAAGTCCTCGTTCTTGTACATAATAACGTGGTGGCATCCATCTTCTTTGGCTT
GAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAGACGGTTCCAATAACAGTGGCTCCAAGAGCGTTTGCCC
ATTGACATAACAGAGACCCAACTCCACCTGCTGCAGCGTGGACAAGGATTGTGTGCCCAC
GTTCCACCTTGAAACAACGGCGAAGGAGAAACTGTGCAGTCATACCCTTGAGCATGATTG
ATGCTGCAACGATAGGATCAATAGATGAAGGAACAGGAACCACTTTATCTGCCGGGAGGA
TCTGTTCTTCAGCATAGGCACCCATAGGACTTCCAGCATACGCAACGAGATCACCGATCT
TTCTGCCAGTCAATCCTGAACCCACAGCTACCACTTCTCCAACAGCCTCCATACCTGGTG
TGAAGGGCATAGAGGCTGGCTTGTAAACACCTTTCCTGTAGTAAACATCAATGAAGTTAA
GCCCAATGGCCTTGTTCTTCACGCGTATCTCACCTTCCTTTGGCTCCCCATCTTCAACAT
CTTCCCATTTCAAAACCTCAGGACC
C

QA 4 808 4 808
DS 

RD RR4BR88TF 723 0 0
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*GTACATGATAACATGGTGGCATCCATCTTCTTTGGCTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGG
AGACGGTTCCAATAACAGTGGCTCCAAGAGCGTTTGCCCATTGACATAACAGAGACCCAA
CTCCACCTGCTGCAGCGTGGACAAGGATTGTGTGCCCACGTTCCACCTTGAAACAACGGC
GAAGGAGAAACTGTGCAGTCATACCCTTGAGCATGATTGATGCTGCAACGATAGGATCAA
TAGATGAAGGAACAGGAACCACTTTATATGCCGGGAGGATCTGTTCTTCAGCATAGGCAC
CCATAGGACTTCCAGCATACGCAACGAGATCACCGATCTTTCTGCCAGTCAATCCTGAAC
CCACAGCTACCACTTCTCCAACAGCCTCCATACCTGGTGTGAAGGGCATAGAGGCTGGCT
TGTAAACACCTTTCCTGTAGTAAACATCAATGAAGTTAAGCCCAATGGCCTTGTTCTTCA
CGCGTATCTCACCTTCCTTTGGCTCCCCAACTTCAACATCTTCCCATTTCAAAACCTCAG
GACCTCCATGCTCGTAAACTCTGATACCTTTCACCATCTTTTTCTTCTCCGGCGAACCCT
CCACCGCGACTGGACTCAGAGATTTTACAGCAACCGTAGACAGCCGAACGCTCGATGATT
T
CC

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AP18TF 716 0 0
CTTTGGTTTGAGCTGCTTTCTCGTTGGTGGAGACGGTTCCAATAACAGTGGCTCCAAGAG
CGTTTGCCCATTGACATAACAGAGACCCAACTCCACCTGCTGCAGCGTGGACAAGGATTG
TGTGCCCACGTTCCACCTTGAAACAACGGCGAAGGAGAAACTGTGCAGTCATACCCTTGA
GCATGATTGATGCTGCAACGATAGGATCAATAGATGAAGGAACAGGAACCACTTTATCTG
CCGGGAGGATCTGTTCTTCAGCATAGGCACCCATAGGACTTCCAGCATACGCAACGAGAT
CACCGATCTTTCTGCCAGTCAATCCTGAACCCACAGCTACCACTTCTCCAACAGCCTCCA
TACCTGGTGTGAAGGGCATAGAGGCTGGCTTGTAAACACCTTTCCTGTAGTAAACATCAA
TGAAGTTAAGCCCAATCGCCTTGTTCTTCACGCGTATCTCACCTTCCTTGGGCTCCCCAA
CTTCAACATCTTCCCATTTCAAAACCTCAGGACCTCCATGCTCGTAAACTCTGATACCTT
TCACCATCTTTTTCTTCTCCGGCGAACCCTCCACCGCGACTGGACTCAGAGATTTTACAG
CAACCGTAGACAGCCGAAAGCTCGATGATTTGGCAAGATTTTGACGAAAGGTGAGATTTT
TAACGGGATTTCGTGGATAACTCGAGAGCGTTTGGTGAGGAAGTGACAGATGTCGC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 2 8

CO CL749Contig1 631 2 2 U
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GCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGGACATGGACAACC
CTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTGGAGTCACTAAAT
CTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCAAGAGCACTCTTG
AGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTGTGGCTGGAGTTT
ACGTTGGAACAGAGTACGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTAGAGATTGGAAAAACGCAA
TGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTACTAACAAAGGCAAAGACA
AGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACA
ATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAAGTTTGTTATATCCAAAA
TTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAAGATGTAGTACTTTTG
TATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4AQ02JQ C 1
AF RR4AQ02TF U 1
BS 1 630 RR4AQ02TF
BS 631 631 RR4AQ02JQ

RD RR4AQ02JQ 631 0 0
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AGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACA
ATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAAGTTTGTTATATCCAAAA
TTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAAGATGTAGTACTTTTG
TATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4AQ02TF 631 0 0
GGAGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAATATCCAAAGAAAAGAGGAAGAAGATGCCTTCAA
GCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGGACATGGACAACC
CTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTGGAGTCACTAAAT
CTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCAAGAGCACTCTTG
AGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTGTGGCTGGAGTTT
ACGTTGGAACAGAGTACGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTAGAGATTGGAAAAACGCAA
TGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTACTAACAAAGGCAAAGACA
AGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACA
ATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAAGTTTGTTATATCCAAAA
TTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAAGATGTAGTACTTTTG
TATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTT
C

QA 1 630 1 630
DS 



CO CL749Contig2 671 6 10 U
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ACACACACAAAGAAAAGAAAGAGGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTT
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AAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATG
TGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGA
ATCGAACGTATCCGTGGCACTAGAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACA
GGAGCGGTGATCTCTGCCGCTACTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTCGATGCAATT
ATGGGTGGCGCTCTAGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTT
CTCAATCTTCTTATCAGGACCAAGTTTGTTATATCCAAATTTGGTCCTTATGGTGTGTGG
TTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAAGATGTAGTACTTCTGTATGAATTGCATTTTAGTAA
TATGAACGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 10 

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AF RR4HB83TF U 26
AF RR4BP39TF U 26
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GCATTTTAGT

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GATGTAGTACTTCTGTATGAATTGCATTTTAGTAATATGAACGTT

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DS 



AS 1 7

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CTTCTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAG
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GGACTATACGCTGGTAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
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TTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGG
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ATATATAAAAATATGACATGTATGTCCATATAAATGATATATGTGATATGGGGGAAGAGA
AACAACATGAAAATTTTGGGTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTAGTTCTTGATCGTCA
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TGGGGCTTATTAACATGTTGAAATAATTTTAATGTTCAAATTGGGTTTTCATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BS10TF U 1
AF RR4D322TF U 1
AF RR4EG41TF U 1
AF RR4CO14TF U 1
AF RR4C194TF U 10
AF RR4EG41JQ C 495
AF RR4D322JQ C 736
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BS 173 569 RR4BS10TF
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BS 827 827 RR4D322JQ
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BS 895 896 RR4D322JQ
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BS 1013 1065 RR4EG41JQ
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BS 1067 1086 RR4EG41JQ
BS 1087 1087 RR4D322JQ
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BS 1145 1193 RR4EG41JQ

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GGACTATACGCTGGTAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
TGACAAAGATGGTCTCGAGTGTTTCGCAA

QA 1 569 1 569
DS 

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CTTCTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAG
CAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCTTGAACCGATC
TGCAGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGA
TTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAA
TCTTGGTGGGTCCGCTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCG
GATCACGAGCGTT*CTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTT
CATGAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAGGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGA
GGACTATACGCTGGTAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
TGACAAAGATGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAG*TTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACT
TTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EG41TF 613 0 0
GGGTGGAGGTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTA
CTTCTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAG
CAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATC
TGCAGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGA
TTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAA
TCTTGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCG
GATCACGAGCGTTTCTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGT**CGGTTCAGTT
CATGAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAAGATGGGGAGATGTTCATAATGGACGAGGA
GGACTATACGCTGGTAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
TGACAAAGATGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGTTTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACT
TTTCGTGGTCGAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4CO14TF 778 0 0
GGGTGGAGGTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTA
CTTCTTATTTTGTTCGCTTGATT*GATCAAAGCCCTTCCCCCGATCAAGATCATGCTTAG
CAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATC
TGCAGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGA
TTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAA
TCTTGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCG
GATCACGAGCGTTTCTAGAAATGAACCGAATCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTT
CATGAGCCATGTCGGAGGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGA
GGACTATACGCTGGTAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
TGACAAAGATGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTTAACGAAGAACGTCGTGATAGACT
TTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGG
TTTCCTCAACTCGTGTTACTTATGCAG*AAGAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTA
CAGAGGAGAAAA*GCTTTT*GCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCA
GTGTTG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4C194TF 724 0 0
TTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTTCTCCCATCATCTTTTTGTTACTTCTTATT
TTGTTCGCTTGATT*GATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAGCAAAAGAAC
CCATCCCATTATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATCTGCAGCCGC
AGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGATTTCAAGAT
TCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAATCTTGGTGG
GTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCGGATCACGAG
CGTTTCTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTTCATGAGCCA
TGTCGGAAGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGACTATAC
GCTGGTAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTATGACAAAGA
TGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTTCGTGGT
CGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGGTTTCCTCAA
CTCGTGTTACTTATGCAG*A*GAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTACAGAGGAGA
AAA
G

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4EG41JQ 699 0 0
TAACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTATGACAAAGATGGTC
TCGAGTGTTTCGCAACTAAGTTTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTTCGTGGTCGATG
TCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGGTTTCCTCAACTCGT
GTTACTTATGCAGGAAGAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTACAGAGGAGAAAAAG
CTTTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAGTGTTGAAAGGAAAGAGAGAT
GTAGATCGAAGTTTTCAACCTCTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTTTTCCGCCGGAGTTC
TAGTGACTTAGCTGGAGTTCTTTTACTGAGTATATATATA**TGGGGGGAAGGGGTAAAT
AAAATAGTAACTAGGCATTAATAATATGCGAGAGAAATAAATTAGCATATATAAAAATAT
GACATGTATGTCCATATAAATGATATATGTGATATGGTGGAAGAGAAACAACATGAAAAT
TTTGGGTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTGGTTCTTGATCGTCAAGATGGTGAAAATG
GAATAACGCTCTTGTTTTTTTTTCTATTGTTATTGTGTTTTGTATTTGGTGCTTATTAAC
ATGTTGAAATAATTTTAATGTTCAAATTGGGTTTTCATT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4D322JQ 458 0 0
TTTTTGCACCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAGTGTTGAAAGGAAAGAGAGATG
TAGATCGAAGTTTTCAACCTCTCCTTACACCCCCGGTCAAATTTTTTCCCCCGGAGTTTT
AGTGACTTAGCTGGAGTTTTTTTACTGAGTATATATATATATGGGGGGAAGGGGTAAATA
AAATAGTAACTAGGCATTAATAATATGCGGGAGAAATAAATTAGCATATATAAAAATATG
ACATGTATGTCCATATAAATGATAT**GTGATATGGGGGAAGAGAAACAACATGAAAATT
TTGGGTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTAGTTTTTGATCGTCAAGATGGGGAAAATGG
AATAACGCTCTTGTTTTTTTTTCTATTGTTATTGTGTTTTGTATTTGGGGCTTATTAACA
TGTTGAAATAATTTTAATGTTCAAATTGGGTTTTCATT

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 8

CO CL751Contig1 676 8 5 U
GGCTCATCTCAAATCTCAAAAACCTAATCCTCCACTTCCAAAAAAGAAACCAAGAATCAA
AGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCGGCCGCCGCCGCGGAGA
AGCCAGCGGAAGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGA
AGCTGCCGAAGGAAGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCATCG
AGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCCGACATCGGGATCT
CGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCC
AGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCC
AGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTTCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGA
CCAAGGCTGTTACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATC
TGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAGAAGTCGTATGGGTTATGCTTTTATCTAGT
TTTTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTTTAATGAATC
TCAATCCCTTTTGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4E964TF U 1
AF RR4EB82TF U 1
AF RR4ES69JQ C 351
AF RR4ES69TF U 1
AF RR4E964JQ C 31
AF RR4G444JQ C 192
AF RR4G444TF U 192
AF RR4EB82JQ C 69
BS 1 172 RR4E964TF
BS 173 524 RR4EB82TF
BS 525 570 RR4ES69TF
BS 571 674 RR4G444TF
BS 675 676 RR4E964JQ

RD RR4E964TF 176 0 0
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AGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCGGCCGCCGCCGCGGAGA
AGCCAGCGGAAGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGC
GGGA

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR4EB82TF 524 0 0
GGCTCATCTCAAATCTCAAAAACCTAATCCTCCACTTCCAAAAAAGAAACCAAGAATCAA
AGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCGGCCGCCGCCGCGGAGA
AGCCAGCGGAAGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGA
AGCTGCCGAAGGAAGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCATCG
AGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCCGACATCGGGATCT
CGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCC
AGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCC
AGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTTCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGA
CCAAGGCTGTTACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4ES69JQ 182 0 0
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AGGGAGATCCAGACCGCTGTCAGGCTTGTTTTTCCTGGAGAGCTCGCTAAGCACGCCGTT
TTTGAGGGGACCAAGGCTGTTATTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGGTTAGGG
TT

QA 1 182 1 182
DS 

RD RR4ES69TF 573 0 0
GGCTCATCTCAAATCTCAAAAACCTAATCCTCCACTTCCAAAAAAGAAACCAAGAATCAA
AGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCGGCCGCCGCCGCGGAGA
AGCCAGCGGAAGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGA
AGCTGCCGAAGGAAGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGA*GCGTAACAAGAAGAGCATCG
AGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCC**CCCGACATCGGGATCT
CGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCC
AGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACCATCACCTCCAGGGAGATCC
AGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTTCCTGGAGAGCTCGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGA
CCAAGGCTGTTACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATC
TGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAA
AAA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4E964JQ 646 0 0
TCCACTTCCAAAAAAGAAACCAAGAATCAAAGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAG
CAGAGAAGAAACCGGCCGCCGCCGCGGAGAAGCCAGCGGAAGAGGTCGCCGAGAAAGCCC
CGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGAAGCTGCCGAAGGAAGCCGGGGCCATCGACA
AGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCATCGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGC
TGAAACAGGTCCACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCT
TCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCCAGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACA
AGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCCAGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTTCCTGGAG
AGCTAGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGACCAAGGCTGTTACTAAGTTCACTAGCTCTT
GAATCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATCTGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAA
GAAGTCGTATGGGTTATGCTTTTATCTAGTTTTTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGTCG
GAAGAACATATGTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCCTTTTGTTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4G444JQ 485 0 0
GAAGCCGGGGCCATCGACGAGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCATCGAGACGTACAAG
ATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCTACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCC
ATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCCAGGAGGCCTCC
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AGGCTTGTTCTTCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGACTAAGGCTGTT
ACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATCTGGTCGCTTTT
GGTTTTTATCTACTAAGAAGAAGTCGTATGGGTTATGCTTTTATCTAGTTTTTTTTAATG
ATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCCTTT
TGT
CC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4G444TF 485 0 0
GAAGCCGGGGCCATCGACGAGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCATCGAGACGTACAAG
ATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCTACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCC
ATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCCAGGAGGCCTCC
AAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCCAGACCGCTGTC
AGGCTTGTTCTTCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGACTAAGGCTGTT
ACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATCTGGTCGCTTTT
GGTTTTTATCTACTAAGAAGAAGTCGTATGGGTTATGCTTTTATCTAGTTTTTTTTAATG
ATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCCTTT
TGT
CC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4EB82JQ 608 0 0
CCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCGGCCGCCGCCGCGGAGAAGCCAGCG
GAAGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGAAGCTGCCG
AAGGAAGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCATCGAGACGTAC
AAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAG
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TCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCCAGACCGCT
GTCAGGCTTGTTCTTCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGGACCAAGGCT
GTTACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATCTGGTCGCT
TTTGGTTTTTATCTACTAAGAAGAAGTCGTATGGGTTATGCTTTTATCTAGTTTTTTTTA
ATGATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCC
TTTTGT
TC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 8

CO CL752Contig1 1120 8 11 U
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TGGCCGGTGGTTCTTACCTCCGCCGGTCACCCTTCTGTTTGATTATCTGTAATTTTGATC
TCTGCTACTCCTCTCTGTCTTTTATCTCTGTGACATGGTCTCTTTGTTGGTGTCTCTGGA
GCTTTCTCTTGTGGGAAATAGATCTGTGTTTTGGTTGTTCTTCTACACAGCTGGAGCACT
GACGAGACTATTGCCCATGACGTGAAGGCAGAGGGCTCGAGACTGGAGGTGGTTAGTGTG
GTTTTAACCGGATCTGGGTCAGATCTGACGGATCCGTGACAAGGTTGCGGTTGAGGCTTC
ACCGGTGGTGAAGAGGTTCTCCTCCCTTATCATATCTCGATTCCGTTTTTCCGTGACCTC
TCTGTTCTTCGATCTGTGGAGACTTTCGTTTTAGGTGGTTTAGAACAACTGTTTTCCATT
GTTGTCTGGAAGTTTTATGCTATGCTCTACTATCCTTGAAGTCCAGAGTGAATTGATGAC
TCTCTTTAGCTGTTTGGTCTCTATACTTGCAATTTATCGGGTTCTTGATGTGATAGTGAA
TGCGTTCTGTCTATTGCTGCCGGGTTCTTTATGTTTTCGGTGGGCTTGGATGGGATTGAC
TTCGGTTAACTCTAGATCTTTTGAGATTAGAGTGTTGGTTGTAGGACTGTTATCGAGGCG
TAGCTTGACGCATGAAGTGTGTCGCCGCCGTAACCAAAAGAGGACGGGAACTATGAGTGG
TTCCTTCTTGTCGGGTTAGAAAGTCTGGATCTTTGAGGGAGAGATGTGCTCTCAGTGTTC
GAAGAAGTTGATGTTATCGTTCGGTGGGCCGTGGGCGACAACGATAAGTCTCATTCAGAA
GCATCTCGAGGTATCAAAAGCTTGCAAGTTTAGTGTGCTAACATCATGGTGGAGTTTTTC
AATTTATCTTTGGTTTAACTTCTTTGATGTTCTCAAAAGTTGCCCCTGTGTGGGTTCAAG
TTGCCTTTTCTATAGGCTTGTGTTTCTGGGGATTTCTTGTTTTTCTGTCAGCTTATGTAG
TAAACTTTGTATTCTTCCTTTGAATGAAATTAACAATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GA41TF U 1
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AF RR4C904TF U 25
AF RR4GO60TF U 11
AF RR4BN69JQ C 321
AF RR4GA41JQ C 968
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AF RR4C904JQ C 412
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BS 665 665 RR4GO60TF
BS 666 675 RR4GA41TF
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BS 705 705 RR4BN69JQ
BS 706 743 RR4GO60TF
BS 744 787 RR4BN69JQ
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BS 971 1120 RR4BN69JQ

RD RR4GA41TF 675 0 0
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TCTGCTACTCCTCTCTGTCTTTTATCTCTGTGACATGGTCTCTTTGTTGGTGTCTCTGGA
GCTTTCTCTTGTGGGAAATAGATCTGTGTTTTGGTTGTTCTTCTACACAGCTGGAGCACT
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TCTGTTCTTCGATCTGTGGAGACTTTCGTTTTAGGTGGTTTAGAACAACTGTTTTCCATT
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TCTCTTTAGCTGTTTGGTCTCTATACTTGCAATTTATCGGGTTCTTGATGTGATAGTGAA
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TTCG*TTAACTCTAG

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DS 

RD RR4BN69TF 579 0 0
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TCG*TTAACTCTAGATCTTTTGAGATTAGAGTGTTGGTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4C904TF 688 0 0
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AAGGCAGAGGGCTCGAGACTGGAGGTGGTTAGTGTGGTTTTAACCGGATCTGGGTCAGAT
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CCTTATCATATCTCGATTCCGTTTTTCCGTGACCTCTCTGTTCTTCGATCTGTGGAGACT
TTCGTTTTAGGTGGTTTAGAACAACTGTTTTCCATTGTTGTCTGGAAGTTTTATGCTATG
CTCTACTATCCTTGAAGTCCAGAGTGAATTGATGACTCTCTTTAGCTGTTTGGTCTCTAT
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TTCTTTATGTTTTCGGTGGGCTTGGATGGGATTGACTTCGGTTAACTCTAGATCTTT*GA
GATTAGAGTGTTGGTTGTAG
ACTGTTAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GO60TF 733 0 0
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TTCTTACCTCCGCCGGTCACCCTTCTGTTTGATTATCTGTAATTTTGATCTCTGCTACTC
CTCTCTGTCTTTTATCTCTGTGACATGGTCTCTTTGTTGGTGTCTCTGGAGCTTTCTCTT
GTGGGAAATAGATCTGTGCTTTGGTTGTTCTTCTACACAGCTGGAGCACTGACGAGACTA
TTGCCCATGACGTGAAGGCAGAGGGCTCGAGACTGGAGGTGGTTAGTGTGGTTTTAACCG
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AAGAGGTTCTCCTCCCTTATCATATCTCGATTCCGTTTTTCCGTGACCTCTCTGTTCTTC
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AGTTTTATGCTATGCTCTACTATCCTTGAAGTCCAGAGTGAATTGATGACTCTCTTTAAC
TGTTTGGTCTCTATACTTGCAATTTATCGGGTTCTTGATGTGATAGTGAATGCGTTCTGT
CTATTGCTGCCGGGTTCTTTATGTTTTCGGTGGGCTTGGATGGGATTGACTTCGGTTAAC
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CATGAAGTGTGTC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4BN69JQ 800 0 0
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CCTCCCTTATCATATCTCGATTCCGTTTTTCCGTGACCTCTCTGTTCTTCGATCTGTGGA
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TATGCTCTACTATCCTTGAAGTCCAGAGTGAATTGATGACTCTCTTTAGCTGTTTGGTCT
CTATACTTGCAATTTATCGGGTTCTTGATGTGATAGTGAATGCGTTCTGTCTATTGCTGC
CGGGTTCTTTATGTTTTCGGTGGGCTTGGATGGGATTGACTTCGGTTAACTCTAGATCTT
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CTTGCAAGTTTAGTGTGCTAACATCATGGTGGAGTTTTTCAATTTATCTCTGGTTTAACT
TCTTTGATGTTCTCAAAAGTTGCCCCTGTGTGGGTTCAAGTTGCCTTTTCTATAGGCTTG
TGTTTCTGGGGATTTCTTGTTTTTCTGTCAGCTTATGTAGTAAACTTTGTATTCTTCCTT
TGAATGAAATTAACAATGGC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4GA41JQ 114 0 0
TCTTTGGTTT
ACTTCTTTGATGT*CTCAAAAGTTGCCCCTGTGTGGGTTCAAGTTGCCTTTTCTATAGGC
TTGTGTTTCTGGGGATTTCTTGTTTTTCTGTCAGCTTATGTAGT

QA 11 114 11 114
DS 

RD RR4GO60JQ 799 0 0
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CTCCCTTATCATATCTCGATTCCGTTTTTCCGTGACCTCTCTGTTCTTCGATCTGTGGAG
ACTTTCGTTTTAGGTGGTTTAGAACAACTGTTTTCCATTGTTGTCTGGAAGTTTTATGCT
ATGCTCTACTATCCTTGAAGTCCAGAGTGAATTGATGACTCTCTTTAACTGTTTGGTCTC
TATACTTGCAATTTATCGGGTTCTTGATGTGATAGTGAATGCGTTCTGTCTATTGCTGCC
GGGTTCTTTATGTTTTCGGTGGGCTTGGATGGGATTGACTTCGGTTAACTCTAGATCTTT
TGAGATTAGAGTGTTGGTTGTAGGACTGTTATCGAGGCGTAGCTTGACGCATGAAGTGTG
TCGCCGCCGTAACCAAAAGAGGACGGGAACTATGAGTGGTTCCTTCTTGTCGGGTTAGAA
AGTCTGGATCTTTGAGGGAGAGATGTGCTCTCAGTGTTCGAAGAAGTTGATGTTATCGTT
CGGTGGGCCGTGGGCGACAACGATAAGTCTCATTCAGAAGCATCTCGAGGTATCAAAAGC
TTGCAAGTTTAGTGTGCTAACATCATGGTGGAGTTTTTCAATTTATCTTTGGTTTAACTT
CTTTGATGTTCTCAAAAGTTGCCCCTGTGTGGGTTCAAGTTGCCTTTTCTATAGGCTTGT
GTTTCTGGGGATTTCTTGTTTTTCTGTCAGCTTATGTAGTAAACTTTGTATTCTTCCTTT
GAATGAAATTAACAATGG
G

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4C904JQ 691 0 0
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TTTTCCATTGTTGTCTGGAAGTTTTATGCTATGCTCTACTATCCTTGAAGTCCAGAGTGA
ATTGATGACTCTCTTTAGCTGTTTGGTCTCTATACTTGCAATTTATCGGGTTCTTGACGT
GATAGTGAATGCGTTCTGTCTATTGCTGCCGGGTTCTTTATGTTTTCGGTGGGCTTGGAT
GGGATTGACTTCGGTTAACTCTAGATCTTTTGAGATTAGAGTGTTGGTTGTAGGACTGTT
ATCGAGGCGTAGCTTGACGCATGAAGTGTGTCGCCGCCGTAACCAAAAGAGGACGGGAAC
TATGAGTGGTTCCTTCTTGTCGGGTTAGAAAGTCTGGATCTTTGAGGGAGAGATGTGCTC
TCAGTGTTCGAAGAAGTTGATGTTATCGTTCGGTGGGCCGTGGGCGACAACGATAAGTCT
CATTCAGAAGCATCTCGAGGTATCAAAAGCTTGCAAGTTTAGTGTGCTAACATCATGGTG
GAGTTTTTCAATTTATCTTTGGTTTAACTTCTTTGATGTTCTCAAAAGTTGCCCCTGTGT
GGGTTCAAGTTGCCTTTTCTATAGGCTTGTGTTTCTGGGGATTTCTTGTTTTTCTGTCAG
CTTATGTAGTAAACTTTGTATTCTTCCTT
CG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 3 8

CO CL753Contig1 1180 3 17 U
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TCATATGCGTTTCCCAGTCCTTCAATTCAGCAAACCCTAAGTTTCTCACTCGGCGTTGAA
GTTTCTCTCTCCATCTCTTTTGTGTGAGAGATTCGGTGGGTGCGAGAGGGATGATGTTGC
GTGCTGTCATAAGGAGAGCTTCCTCCACTAGAGGCTCTTATACATCTTCGGGATTGGGGA
AATCACTGCAATCTTCTCGCGTTGCAGCAGCATCTTCACAAAGCATTCATCCTCTTTCAG
CAACAGAGACTCTTGTGCCTCGTGGAAGCCCTGCTCGTAGCTTCCATCATCGTTCTTGTC
CAGGGTGTTCACAATGCTCCAGGACTCTTCTCGGCAGCTTCCGTGGCACAACCCTGCAAA
GATGGGTCAAGCCTTTTTCATCTGATACTGGAGATGTCGTTGAAGCTGTTGTGCCTCACA
TGGGTGAATCAATCACCGATGGAACCCTAGCCAACTTTCTCAAGAAACCTGGTGACAGAG
TAGAAGCTGATGAGGCTATTGCACAAATTGAAACTGACAAGGTGACAATTGATATTGCTA
GCCCAGCAAGTGGTGTGATCCAAGAGTTTCTTGTCAAGGAAGGAGATACTGTAGAACCTG
GAAACAAAGTAGCTATTATCTCCAAGTCCGCAGATGCTGTGTCTCATGTAGCACCCTCAG
AAAAGATACCGGAGAAAGCTGCTCCCAAACCTTCCCCTCCTGCTGAGGAATCCAAGGTTG
AAAGTCCTAAAGTTGCGGAGAAACCAAAGGCATCATCACCTCCACCGCCAACTAAACAGT
CAGCCAAAGAACCGCAACTTCCTCCTAAGGATAGGGAAAGACGGGTTCCTATGACAAGAC
TTCGCAAACGTGTGGCAACTAGGCTGAAAGACTCTCAAAACACTTTTGCGTTGCTTACAA
CATTCAATGAAGTTGATATGACCAATCTGATGAAGCTCCGATCTCAATACAAGGATGCAT
TTTTTGAGAAGCATGGAGTGAAGTTGGGTCTTATGCCTGGTTTCATCAAAGCTGCTGTCA
GTGCCCTCCAGCACCAACCAGTAGTAAATGCAGTTATCGATGGAGATGATATCATTTACA
GAGACTACGTAGATATCAGTATTGCTGTTGGTACCTCTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DU81TF U 1
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DS 

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G
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G
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CAAACCTTCCCCTCCTGCTGAGGAATCCAAGGTTGAAAGTCCTAAAGTTGCGGAGAAACC
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TCTGATGAAGCTCCGATCTCAATACAAGGATGCATTTTTTGAGAAGCATGGAGTGAAGTT
GGGTCTTATGCCTGGTTTCATCAAAGCTGCTGTCAGTGCCCTCCAGCACCAACCAGTAGT
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TGTTGGTACCTCTAA

QA 2 736 2 736
DS 



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BQ
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GGTGTATTGAGTTTTATTATTCATATACATATACAGTTTAAACA

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DS 

RD RR4E013TF 344 0 0
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GAGGCTGTGTATTTCTTGCGCCGTATCAAGGATGTTGTGGAAGATCCTCAGAGGCTTCCT
CTGGACATATGAATAAAGATCTGAGACCAGAAGAGATGGCAAGTCTCTCTGTCTTTTTTT
TTACCAGTTTCCGTTCAGGTAACCATGCAATCTGTGAAAGATACTTCGAAGAAAAAAAAC
AAACTTTTCTTTTTTTGAGTTTCTTAGTTTCAAGAGATTTTACCGGGCAGTGAAAGCATC
GGTGTATTGAGTTTTATTATTCATATACATATACAGTTTAAACA

QA 1 344 1 344
DS 



CO CL753Contig3 952 3 6 U
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GAAAGGAAACTGGTAAAAAAAAGGACAAAGAGACTTATCATCTCTTCTGGTGTCTGATCT
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TACGGCGCAAGAAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATCAGCCTATGATCATAGGTCAGTG
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TTCCATAGACACCACCATTAGATACTGTGAATGATCCTCCTGCCATCTCGTCGATTGAAA
TGGTTCCTTCATTAGCCTTCTTTGCAAGAGAGTTTATTGTTTTCTCTATGTCAGCAAAGT
TCATCTGGTCAGCACCTCTGATGACTGGAACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAA
TACTGATATCTACGTAGTCTCTGTAAATGATATCATCTCCATCGATAACTGCATTTACTA
CTGGTTGGTGCTGGAGGGCACTGACAGCAGCTTTGATGAAACCAGACATAAGCCCCAACT
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TCATATCAACTTCATTGAAAGTTGTAAGCAACGCAAAAGTGTTTTGAGAGTCTTTCAACC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ76JQ U 1
AF RR4F748JQ U 66
AF RR4D802TF C 277
BS 1 443 RR4FJ76JQ
BS 444 444 RR4F748JQ
BS 445 483 RR4FJ76JQ
BS 484 484 RR4F748JQ
BS 485 760 RR4FJ76JQ
BS 761 952 RR4D802TF

RD RR4FJ76JQ 760 0 0
CCCAATAAAAAATCAGTGGCATTATTTTAAGTAAAAATCATAACATTTTGTTTAAACTGT
ATATGAATAGAAACAAACTCAATGCATCAATGCTTTCCCTGCCTGGCAAGAACTCTTGGA
ACTATTAAGACACTTCACAAAGTATCATTCACAGATTGCAATATCTGTAACGGTTTACCG
GAAAGGAAACTGGTAAAAAAAAGGACAAAGAGACTTATCATCTCTTCTGGTGTCTGATCT
TTTTTATTCATCATCATATGTCGAGAAAAAGCCTCTGAGGATCTTCCACAACATCCTTGA
TACGGCGCAAGAAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATCAGCCTATGATCATAGGTCAGTG
CAACATACATCATTGGCCTTGGTACTACGCTTCCTCCCACAACCATTGGACGTTGCACGA
TTGAATGCATCCCAAGTATAGCAAACTGAGGAGGGTTGATGATAGGAGTGCTTATGAGAC
TTCAATAGACACCACCATTAGATACTGTGAATGATCCTCCTGCCATCTCGTCGATTGAAA
TGGTTCCTTCATTAGCCTTCTTTGCAAGAGAGTTTATTGTTTTCTCTATGTCAGCAAAGT
TCATCTGGTCAGCACCTCTGATGACTGGAACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAA
TACTGATATCTACGTAGTCTCTGTAAATGATATCATCTCCATCGATAACTGCATTTACTA
CTGGTTGGTGCTGGAGGGCACTGACAGCAGCTTTGATGAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4F748JQ 697 0 0
G
ATAGAAACAAACTCAATGCATCAATGCTTTCCCTGCCTGGCAAGAACTCTTGGAACTATT
AAGACACTTCACAAAGTATCATTCACAGATTGCAATATCTGTAACGGTTTACCGGAAAGG
AAACTGGTAAAAAAAAGGACAAAGAGACTTATCATCTCTTCTGGTGTCTGATCTTTTTTA
TTCATCATCATATGTCGAGAAGAAGCCTCTGAGGATCTTCCACAACATCCTTGATACGGC
GCAAGAAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATCAGCCTATGATCATAGGTCAGTGCAACAT
ACATCATTGGCCTTGGTACTACGCTTCCTCCCACAACCATTGGACGTTGCACGATTGAAT
GCATCCCAAGTATAGCAGACTGAGGAGGGTTGATGATAGGAGTGCTTATGAGACTTCCAT
AGACACCACCATTAGATACTGTGAATGATCCTCCTGCCATCTCGTCGATTGAAATGGTTC
CTTCATTAGCCTTCTTTGCAAGAGAGTTTATTGTTTTCTCTATGTCAGCAAAGTTCATCT
GGTCAGCACCTCTGATGACTGGAACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAATACTGA
TATCTACGTAGTCTCTGTAAATGATATCATCTCCATCGATAACTGCATTTACTACTGGTT
GGTGCTGGAGGGCACTGACAGCAGCTTTGATGAA
AC

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR4D802TF 676 0 0
GAGGATCTTCCACAACATCCTTGATACGGCGCAAGAAATACACAGCCTCTCTTCCATCGA
TAAGCCTATGATCATAGGTCAGTGCGACGTACATCATTGGCCTTGGTACTACGCTTCCTC
CCACAACCATTGGACGTTGCACGATTGAATGCATTCCAAGAATAGCAGACTGAGGAGGGT
TGATGATAGGAGTGCTTATGAGACTTCCATAGACACCACCATTAGATACTGTGAATGATC
CTCCAGCCATCTCGTCGATTGATATGGTTCCTTCATTGGCCTTCTTAGCAAGAGAGTTTA
TCGTTTTCTCTATGTCCGCAAAGTTCATCTGGTCAGCACCTCTGATGACTGGAACCACAA
GACCCTTAGAGGTACCAACAGCAATACTGATGTCTACGTAATCTCTGTAAATGATATCAT
CTCCATCGATCACTGCATTTACTACTGGTTGGTGCTGGAGTGCACTAACAGCAGCTTTAA
TGAAACCAGACATAAGCCCCAACTTCACTCCGTGCTTTTCAAAAAATGCGTCCTTGTATT
GAGATCGGAGCTTCATCAGATTAGTCATATCAACTTCATTGAAAGTTGTAAGCAACGCAA
AAGTGTTTTGAGAGTCTTTCAACCTAGTCGCCACACGCTTGCGTAGTCTTGTCATAGGAA
CCCGTCTTTCCCTATC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 8

CO CL754Contig1 703 8 15 U
ATCCAAAACGAAAATGTTCCAGTTTTAACTCTCTTGTTGTTTTCAATGGCGATTTCTCTG
CCCACCTCCTATGTCTCTCCCCCTGAGTCGTGTTTCTCCTTTTCATCCTCGTCGAAGTTA
TCTTCTCATTCATCCCTGCGCTTACCGTCTCAGATTCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAA
AGAGTGAACTCGCCGTCGTCTTCTCGCTGCGCCCCACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAG
AAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCTCAACTCCGACAAACCTTTACTTGTA
GACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCCAGCTTATGGTACCTATACTCAATGAAGTG
AGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATACTGAAAAGTACCCAAAG
GTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGG*CTTTACCTACATTCATTTTATTCAAAGACGGGAA
ACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTT*GCCAGCGAACCAACTTGTGGAACGGATCGAGA
CTTCATT*GCAAGTGAAGCAATAGATATGGTAACAAGTGAAGCAATAGATATGATAAACA
AAGAAAACTTGTCATTTCATGAACAAACAATCCGTTGTAACAAAACGTTCATTGTTGATT
GCTACCTATTCAATATATGGCATTAGCCATTTGAGATAGGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 35 10 10 10 

AF RR4CZ09TF U 19
AF RR4CM56TF U 1
AF RR4A124TF U 32
AF RR4AO85JQ C 123
AF RR4CM56JQ C 365
AF RR4CZ09JQ C 106
AF RR4AO85TF U 34
AF RR4A124TFB U 32
BS 1 374 RR4CM56TF
BS 375 375 RR4A124TF
BS 376 445 RR4CM56TF
BS 446 446 RR4A124TF
BS 447 507 RR4CM56TF
BS 508 508 RR4A124TF
BS 509 533 RR4CM56TF
BS 534 534 RR4A124TF
BS 535 547 RR4CM56TF
BS 548 548 RR4A124TF
BS 549 644 RR4CM56TF
BS 645 645 RR4A124TF
BS 646 696 RR4CM56TF
BS 697 700 RR4A124TF
BS 701 703 RR4A124TFB

RD RR4CZ09TF 284 0 0
GG
AGTTTTAACTCTCTTGTTGTTTTCAATGGCGATTTCTCTGCCCACCTCCTATGTCTCTCC
CCCTGAGTCGTGTTTCTCCTTTTCATCCTCGTCGAAGTTATCTTCTCATTCATCCCTGCG
CTTACCGTCTCAGATTCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAAAGAGTGAACTCGCCGTCGTC
TTCTCGCTGCGCCCCACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTT
TGATGATTTATTGCTCAACTCCGACAAACCTTTACTTGTAGA

QA 3 284 3 284
DS 

RD RR4CM56TF 696 0 0
ATCCAAAACGAAAATGTTCCAGTTTTAACTCTCTTGTTGTTTTCAATGGCGATTTCTCTG
CCCACCTCCTATGTCTCTCCCCCTGAGTCGTGTTTCTCCTTTTCATCCTCGTCGAAGTTA
TCTTCTCATTCATCCCTGCGCTTACCGTCTCAGATTCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAA
AGAGTGAACTCGCCGTCGTCTTCTCGCTGCGCCCCACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAG
AAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCTCAACTCCGACAAACCTTTACTTGTA
GACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCCAGCTTATGGTACCTATACTCAATGAAGTG
AGTGAAACTCTGAAGGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATACTGAAAAGTACCCAAAG
GTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGGGCTTTACCTACATTCATTTTATTCAAAGACGGGAA
ACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTTTGCCAGCGAACCAACTTGTGGAACGGGTCGAGA
CTTCATTTGCAAGTGAAGCAATAGATATGGTAACAAGTGAAGCAATAGATATGATAAACA
AAGAAAACTTGTCATTTCATGAACAAACAATCCGTTGTAACAAA*CGTTCATTGTTGATT
GCTACCTATTCAATATATGGCATTAGCCATTTGAGA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4A124TF 669 0 0
TCTTGTTGTTTTCAATGGCGATTTCTCTGCCCACCTCCTATGTCTCTCCCCCTGAGTCGT
GTTTCTCCTTTTCATCCTCGTCGAAGTTATCTTCTCATTCATCCCTGCGCTTACCGTCTC
AGATTCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAAAGAGTGAACTCGCCGTCGTCTTCTCGCTGCG
CCCCACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTAT
TGCTCAACTCCGACAAACCTTTACTTGTAGACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCC
AGCTTATGGTACCTATACTCAATGAAGTGAGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTG
TGAAAATCGATACTGAAAAGTACCCAAAGGTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGG*CTTTA
CCTACATTCATTTTATTCAAAGACGGGAAACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTT*GCC
AGCGAACCAACTTGTGGAACGGATCGAGACTTCATT*GCAAGTGAAGCAATAGATATGGT
AACAAGTGAAGCAATAGATATGATAAACAAAGAAAACTTGTCATTTCATGAACAAACAAT
CCGTTGTAACAAAACGTTCATTGTTGATTGCTACCTATTCAATATATGGCATTAGCCATT
TGAGATAGG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4AO85JQ 578 0 0
TTT
TCATTCATCCCTGCGCTTACCGTTTCAGATTCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAAAGAGT
GAACTCGCCGTTGTTTTCTCGCTGCGCCCCACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAGAAGCA
AACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCTCAACTCCGACAAACCTTTACTTGTAGACTT
TTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCCAGCTTATGGTACCTATACTCAATGAAGTGAGTGA
AACTTTGAAAGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATACTGAAAAGTACCCAAAGGTTGC
CAACAAATACCAGGTTGAGG*CTTTACCTACATTCATTTTATTCAAAGACGGGAAACTCT
GGGACCGTTTTGAGGGTGCCTT*GCCAGCGAACCAACTTGTGGAACGGATCGAGACTTCA
TT*GCAAGTGAAGCAATAGATATGGTAACAAGTGAAGCAATAGATATGATAAACAAAGAA
AACTTGTCATTTCATGAACAAACAATCCGTTGTAACAAAACGTTCATTGTTGATTGCTAC
CTATTCAATATATGGCATTAGCCATTTGAGATAGG

QA 4 578 4 578
DS 

RD RR4CM56JQ 336 0 0
AAACTTTGAAGGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATACTGAAAAGTACCCAAAGGTTG
CCAACAAATACCAGGTTGGGG*CTTTACCTACATTCATTTTATTCAAAGACGGGAAACTT
TGGGACCGTTTTGGGGGGGCCTT*GCCAGCGAACCAACTTGTGGAACGGGTCGGGACTTC
ATT*GCAAGGGAAGCAATAGATATGGTAACAAGGGAAGCAATAGATATGATAAACAAAGA
AAACTTGTCATTTCATGAACAAACAATCCGTTGTAACAAAACGTTCATTGTTGATTGCTA
CCTATTCAATATATGGCATTAGCCATTTGGGATAGG

QA 1 336 1 336
DS 

RD RR4CZ09JQ 595 0 0
TCCTCGTCGAAGTTATCTTCTCATTCATCCCTGCGCTTACCGTCTCAGATTCGCCGCTTC
GGAATCCGTCACGAAAGAGTGAACTCGCCGTCGTCTTCTCGCTGCGCCCCACTCACTATG
CAGGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCTCAACTCCGAC
AAACCTTTACTTGTAGACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCCAGCTTATGGTACCT
ATACTCAATGAAGTGAGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATACT
GAAAAGTACCCAAAGGTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGG*CTTTACCTACATTCATTTT
ATTCAAAGACGGGAAACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTT*GCCAGCGAACCAACTTG
TGGAACGGGTCGAGACTTCATT*GCAAGTGAAGCAATAGATATGGTAACAAGTGAAGCAA
TAGATATGATAAACAAAGAAAACTTGTCATTTCATGAACAAACAATCCGTTGTAACAAAA
CGTTCATTGTTGATTGCTACCTATTCAATATATGGTATTAGCCATTTGAGATAG
C

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4AO85TF 667 0 0
GG
GTTGTTTTCAATGGCGATTTCTCTGCCCACCTCCTATGTCTCTCCCCCTGAGTCGTGTTT
CTCCTTTTCATCCTCGTCGAAGTTATCTTCTCATTCATCCCTGCGCTTACCGTCTCAGAT
TCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAAAGAGTGAACTCGCCGTCGTCTTCTCGCTGCGCCCC
ACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCT
CAACTCCGACAAACCTTTACTTGTAGACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCCAGCT
TATGGTACCTATACTCAATGAAGTGAGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTGTGAA
AATCGATACTGAAAAGTACCCAAAGGTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGG*CTTTACCTA
CATTCATTTTATTCAAAGACGGGAAACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTT*GCCAGCG
AACCAACTTGTGGAACGGATCGAGACTTCATT*GCAAGTGAAGCAATAGATATGGTAACA
AGTGAAGCAATAGATATGATAAACAAAGAAAACTTGTCATTTCATGAACAAACAATCCGT
TGTAACAAAACGTTCATTGTTGATTGCTACCTATTCAATATATGGCATTAGCCATTTGAG
ATAGG

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR4A124TFB 672 0 0
TCTTGTTGTTTTCAATGGCGATTTCTCTGCCCACCTCCTATGTCTCTCCCCCTGAGTCGT
GTTTCTCCTTTTCATCCTCGTCGAAGTTATCTTCTCATTCATCCCTGCGCTTACCGTCTC
AGATTCGCCGCTTCGGAATCCGTCACGAAAGAGTGAACTCGCCGTCGTCTTCTCGCTGCG
CCCCACTCACTATGCAGGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTAT
TGCTCAACTCCGACAAACCTTTACTTGTAGACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCC
AGCTTATGGTACCTATACTCAATGAAGTGAGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTG
TGAAAATCGATACTGAAAAGTACCCAAAGGTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGG*CTTTA
CCTACATTCATTTTATTCAAAGACGGGAAACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTT*GCC
AGCGAACCAACTTGTGGAACGGATCGAGACTTCATT*GCAAGTGAAGCAATAGATATGGT
AACAAGTGAAGCAATAGATATGATAAACAAAGAAAACTTGTCATTTCATGAACAAACAAT
CCGTTGTAACAAAACGTTCATTGTTGATTGCTACCTATTCAATATATGGCATTAGCCATT
TGAGATAGGAAA

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 6

CO CL755Contig1 694 6 9 U
GGAATATATGTATATTTATACACATTAATTGTAAGAGATTATAGAGGTTGACATGCCAAC
TTCCAATTTCTCGTCTCGTGGTTCTCAAATGATGAACACCCTCGTTAAACCGATGCTTAG
GAAATCTATCCACAAGAAGAGCGCGTCACAAGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGAGTGA
TGGCGCCAGCGTCCGAGAGGCCGAGATGAAGACGATGAGAGGTTTCTCCGTGGCCGGAAC
GTCAACGTCGTCAGAGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAACCACGGGAATATACTATCCAAA
GGGACAAGAGAAGGTGATGCAAGATGTGCCCCCTCCTCCAGCTGGTAGCCATGTGGACGA
GCTAGTTAACTGGTTCTTTTGATCCTTATTTTCCTATTATCTCGATCTCACCATGATCGC
ACTACTGTTCTTGATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGACAAACTTTACTG
TTCTGTGTTGTATCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTATGTATAGTCATAT
AATCAATGATAATGAATAATGATGATGGTAGTAATTAAATGAATTAATGCAAGTACCAAT
GCATGCAGCAAGTAACTGCTACTTT*ATGCATGTTTTCATGAATTTGTTTGCTGATCACC
CTT*CTACAGACTAACTAAGTAAAGGCTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF66JQ C 1
AF RR4CF66TF U 1
AF RR4A192JQ C 4
AF RR4A192JQD C 13
AF RR4A192TFB U 4
AF RR4A192TF U 409
BS 1 5 RR4CF66JQ
BS 6 58 RR4CF66TF
BS 59 59 RR4A192TFB
BS 60 330 RR4CF66TF
BS 331 331 RR4A192TFB
BS 332 397 RR4CF66TF
BS 398 398 RR4A192TFB
BS 399 576 RR4CF66TF
BS 577 694 RR4A192TFB

RD RR4CF66JQ 576 0 0
GGAATATATGTATATTTATACACATTAATTGTAAGAGATTATAGAGGTTGACATGCCAGC
TTCCAATTTCTCGTCTCGTGGTTCTCAAATGATGAACACCCTCGTTAAACCGATGCTTAG
GAAATCTATCCACAAGAAGAGCGCGTCACAAGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGAGTGA
TGGCGCCAGCGTCCGAGAGGCCGAGATGAAGACGATGAGAGGTTTCTCCGTGGCCGGAAC
GTCAACGTCGTCAGAGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAACCACGGGAATATACTATCCAAA
GGGACAAGAGAAGGTGATGCAAGATGTGCCTCCTCCTCCAGCTGGTAGCCATGTGGACGA
GCTAGTTAACTGGTTCTTTTGATCCTTATTTTCCTATCATCTCGATCTCACCATGATCGC
ACTACTGTTCTTGATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGACAAACTTTACTG
TTCTGTGTTGTATCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTATGTATAGTCATAT
AATCAATGATAATGAATAATGATGATGGTAGTAATT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4CF66TF 576 0 0
GGAAT
ATATGTATATTTATACACATTAATTGTAAGAGATTATAGAGGTTGACATGCCAGCTTCCA
ATTTCTCGTCTCGTGGTTCTCAAATGATGAACACCCTCGTTAAACCGATGCTTAGGAAAT
CTATCCACAAGAAGAGCGCGTCACAAGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGAGTGATGGCG
CCAGCGTCCGAGAGGCCGAGATGAAGACGATGAGAGGTTTCTCCGTGGCCGGAACGTCAA
CGTCGTCAGAGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAACCACGGGAATATACTATCCAAAGGGAC
AAGAGAAGGTGATGCAAGATGTGCCTCCTCCTCCAGCTGGTAGCCATGTGGACGAGCTAG
TTAACTGGTTCTTTTGATCCTTATTTTCCTATCATCTCGATCTCACCATGATCGCACTAC
TGTTCTTGATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGACAAACTTTACTGTTCTG
TGTTGTATCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTATGTATAGTCATATAATCA
ATGATAATGAATAATGATGATGGTAGTAATT

QA 6 576 6 576
DS 

RD RR4A192JQ 690 0 0
GG
ATATGTATATTTATACACATTAATTGTAAGAGATTATAGAGGTTGACATGCCAACTTCCA
ATTTCTCGTCTCGTGGTTCTCAAATGATGAACACCCTCGTTAAACCGATGCTTAGGAAAT
CTATCCACAAGAAGAGCGCGTCACAAGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGAGTGATGGCG
CCAGCGTCCGAGAGGCCGAGATGAAGACGATGAGAGGTTTCTCCGTGGCCGGAACGTCAA
CGTCGTCAGAGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAACCACGGGAATATACTATCCAAAGGGAC
AAGAGAAGGTGATGCAAGATGTGCCCCCTCCTCCAGCTGGTAGCCATGTGGACGAGCTAG
TTAACTGGTTCTTTTGATCCTTATTTTCCTATTATCTCGATCTCACCATGATCGCACTAC
TGTTCTTGATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGACAAACTTTACTGTTCTG
TGTTGTATCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTATGTATAGTCATATAATCA
ATGATAATGAATAATGATGATGGTAGTAATTAAATGAATTAATGCAAGTACCAATGCATG
CAGCAAGTAACTGCTACTTT*ATGCATGTTTTCATGAATTTGTTTGCTGATCACCCTT*C
TACAGACTAACTAA
GTAAGGCTTTGTTT

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR4A192JQD 681 0 0
TATTTATACACATTAATTGTAAGAGATTATAGAGGTTGACATGCCAACTTCCAATTTCTC
GTCTCGTGGTTCTCAAATGATGAACACCCTCGTTAAACCGATGCTTAGGAAATCTATCCA
CAAGAAGAGCGCGTCACAAGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGAGTGATGGCGCCAGCGT
CCGAGAGGCCGAGATGAAGACGATGAGAGGTTTCTCCGTGGCCGGAACGTCAACGTCGTC
AGAGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAACCACGGGAATATACTATCCAAAGGGACAAGAGAA
GGTGATGCAAGATGTGCCCCCTCCTCCAGCTGGTAGCCATGTGGACGAGCTAGTTAACTG
GTTCTTTTGATCCTTATTTTCCTATTATCTCGATCTCACCATGATCGCACTACTGTTCTT
GATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGACAAACTTTACTGTTCTGTGTTGTA
TCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTATGTATAGTCATATAATCAATGATAA
TGAATAATGATGATGGTAGTAATTAAATGAATTAATGCAAGTACCAATGCATGCAGCAAG
TAACTGCTACTTT*ATGCATGTTTTCATGAATTTGTTTGCTGATCACCCTT*CTACAGAC
TAACTAA
GTAAGGCTTTGTTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4A192TFB 691 0 0
GG
ATATGTATATTTATACACATTAATTGTAAGAGATTATAGAGGTTGACATGCCAACTTCCA
ATTTCTCGTCTCGTGGTTCTCAAATGATGAACACCCTCGTTAAACCGATGCTTAGGAAAT
CTATCCACAAGAAGAGCGCGTCACAAGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGAGTGATGGCG
CCAGCGTCCGAGAGGCCGAGATGAAGACGATGAGAGGTTTCTCCGTGGCCGGAACGTCAA
CGTCGTCAGAGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAACCACGGGAATATACTATCCAAAGGGAC
AAGAGAAGGTGATGCAAGATGTGCCCCCTCCTCCAGCTGGTAGCCATGTGGACGAGCTAG
TTAACTGGTTCTTTTGATCCTTATTTTCCTATTATCTCGATCTCACCATGATCGCACTAC
TGTTCTTGATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGACAAACTTTACTGTTCTG
TGTTGTATCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTATGTATAGTCATATAATCA
ATGATAATGAATAATGATGATGGTAGTAATTAAATGAATTAATGCAAGTACCAATGCATG
CAGCAAGTAACTGCTACTTT*ATGCATGTTTTCATGAATTTGTTTGCTGATCACCCTT*C
TACAGACTAACTAAGTAAAGGCTTTGTTT

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4A192TF 287 0 0
CACCATGATCGCACTACTGTTCTTGATATCTAAGTCTAATTATTGTTGTAAGGGGGGGGA
CAAACTTTACTGTTCTGTGTTGTATCATACATATCTGTGTGTATAAGTGTGGATATGTAT
GTATAGTCATATAATCAATGATAATGAATAATGATGATGGTAGTAATTAAATGAATTAAT
GCAAGTACCAATGCATGCAGCAAGTAACTGCTACTTTTATGCATGTTTTCATGAATTTGT
TTGCTGATCACCCTTTCTACAGACTAACTAA
AGTAAAGGCTTTGTTT

QA 1 271 1 271
DS 



AS 1 5

CO CL756Contig1 1121 5 24 U
TTTTTAAGCGTTTTTACATGGTCATGGCTTCTTCTTCTTCTTC***TATCTCTGCGTTTC
CATCGCCTCACACTCCAAGATTCTCACAAACCCTAAGTTCTCATTTCCTCGCCCCTTGTT
CTGTTTTGAACCTAAAACACGCATCTTCGCTGCTTAAATCGAGGATTCGAATCTCCTCTC
GTCGTGTGCGGACAAAAACACTCGTTGTTGTGTCTGCCCAGACTAGTCTCCTGAAAGTTC
TTAGAATCGCGTGGAATATTGGGAAAGATGGAATCGAAGCAGGAACCAACCTAGTACCTG
TTTCTGTGCCTAGACCTGTTGCTAGGATCTCAGTGACAATTGCAGCATTGGCGGTTTCAT
TGTTTGTTCTCAAGTCGTTTGTATCAACTGCTTTCTTTGTATTGGGTACAATGGGATTTG
CATATTTCTTATTCATAGCCTTGAACAAAGACGAAGCTCCGAAACGGAGAGGAGAAGATA
CTATTTCTGGTTCCAACAAACCAATGGATGATCCACTTGAAGAAGCAAAGAAAATTATGG
ACAAGTACAAGTAAGCAGCTTATCAGTTTTTGAGAGAGAGAG**ATCTCTAATGTATACG
GATAAAACACTCTGGCAATGTTGGGTATGTGGTTTTGATGTTAAGATAAACTTGTAATAG
AGATCTCAAGAGAAAATCACAAAACAAGAATATGAATATAAATCAAACTTCGAGAGTGAA
AATAGGCCTAGATAGTCCAGTTGTTGCACCACCGTGGAAAATCTTCTTAAACGCTCTCAA
GCCGCCTAGCGAGTGCTTTCGGATTCCGCCAAATTTAATGGTGGACACTATGCTGCGACG
CAGATTTGCCAAACTACTTCCGACCATGACTTTCAATCGGAATATCTTCATACGTAGAAA
CAGCGACGTTGGAGGAGAACGATGAGAAATCAAGTCGGCTTCTTGAAGCTTTTTGTAGAT
CAAGAACTTGGCTCTCCTGTGAAGCAACTCCTCTGGGTCTTCCTTGTTCATCTTTGAGTA
ATCGCATGGCTTTTTGAAGAGGGTCATTTTCATTCTTTCGTGTATTTTTTTTTGACGATG
ATCTTTTCTGAAGAGAGGTAGAGAGATACTGGATTGAGGCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC86TF U 1
AF RR4CB21JQ C 1
AF RR4CB21TF U 1
AF RR4FH46TF C 396
AF RR4FH46JQ U 405
BS 1 43 RR4GC86TF
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BS 47 151 RR4GC86TF
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BS 153 246 RR4GC86TF
BS 247 247 RR4CB21TF
BS 248 337 RR4GC86TF
BS 338 338 RR4CB21TF
BS 339 458 RR4GC86TF
BS 459 459 RR4CB21TF
BS 460 460 RR4GC86TF
BS 461 461 RR4CB21TF
BS 462 465 RR4GC86TF
BS 466 466 RR4CB21TF
BS 467 526 RR4GC86TF
BS 527 527 RR4CB21TF
BS 528 582 RR4GC86TF
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BS 585 606 RR4GC86TF
BS 607 611 RR4CB21TF
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RD RR4GC86TF 608 0 0
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CTGTTTTGAACCTAAAACACGCATCTTCGCTTCTTAAATCGAGGATTCGAATCTCCTCTC
GTCGTGTGCGGACAAAAACACTCGTTGTTGTGTCTGCCCAGACTAGTCTCCTGAAAGTTC
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TGTTTGTTCTCAAGTCGTTTGTATCAACTGCTTTCTTTGTATTGGGTACAATGGGATTTG
CATATTTCTTATTCATAGCCTTGAACAAAGACGAAGCTTCTAAACAGAGAGGAGAAGATA
CTATTTCTGGTTCCAACAAACCAATGGATGATCCACTTGAAGAAGCCAAGAAAATTATGG
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GATAAA
CA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4CB21JQ 717 0 0
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CATCGCCTCACACTCCAAGATTCTCACAAACCCTAAGTTCTCATTTCCTCGCCCCTTGTT
CTGTTTTGAACCTAAAACACGCATCTTCGCTGCTTAAATCGAGGATTCGAATCTCCTCTC
GTCGTGTGCGGACAAAAACACTCGTTGTTGTGTCTGCCCAGACTAGTCTCCTGAAAGTTC
TTAGAATCGCGTGGAATATTGGGAAAGATGGAATCGAAGCAGGAACCAACCTAGTACCTG
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TGTTTGTTCTCAAGTCGTTTGTATCAACTGCTTTCTTTGTATTGGGTACAATGGGATTTG
CATATTTCTTATTCATAGCCTTGAACAAAGACGAAGCTCCGAAACGGATAGGAGAAGATA
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ACAAGTACAAGTAAGCAGCTTATCAGTTTTTGAGAGAGAGAG**ATCTCTAATGTATACG
GATAAAACACTTTGGCAATGTTGGGTATGTGGTTTTGATGTTAAGATAAACTTGTAATAG
AGATCTCAAGAGAAAATCACAAAACAAGAATATGAATATAAATCAAACTTCGAGAGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4CB21TF 717 0 0
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CTGTTTTGAACCTAAAACACGCATCTTCGCTGCTTAAATCGAGGATTCGAATCTCCTCTC
GTCGTGTGCGGACAAAAACACTCGTTGTTGTGTCTGCCCAGACTAGTCTCCTGAAAGTTC
TTAGAATCGCGTGGAATATTGGGAAAGATGGAATCGAAGCAGGAACCAACCTAGTACCTG
TTTCTGTGCCTAGACCTGTTGCTAGGATCTCAGTGACAATTGCAGCATTGGCGGTTTCAT
TGTTTGTTCTCAAGTCGTTTGTATCAACTGCTTTCTTTGTATTGGGTACAATGGGATTTG
CATATTTCTTATTCATAGCCTTGAACAAAGACGAAGCTCCGAAACGGATAGGAGAAGATA
CTATTTCTGGTTCCAACAAACCAATGGATGATCCACTTGAAGAAGCAAAGAAAATTATGG
ACAAGTACAAGTAAGCAGCTTATCAGTTTTTGAGAGAGAGAG**ATCTCTAATGTATACG
GATAAAACACTTTGGCAATGTTGGGTATGTGGTTTTGATGTTAAGATAAACTTGTAATAG
AGATCTCAAGAGAAAATCACAAAACAAGAATATGAATATAAATCAAACTTCGAGAGT

QA 1 717 1 717
DS 

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GATAAACTTGTAATAGAGATCTCAAGAGAAAATCACAAAACAAGAATATGAATATAAATC
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GAAGCTTTTTGTAGATCAAGAACTTGGCTCTCCTGTGAAGCAACTCCTCTGGGTCTTCCT
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QA 10 726 10 726
DS 

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ATCTCTAATGTATACGGATAGAACACTCTGGCAATGTTGGGTATGTGGTTTTGATGTTAA
GATAAACTTGTAATAGAGATCTCAAGAGAAAATCACAAAACAAGAATATGAATATAAATC
AAACTTCGAGAGTGAAAATAGGCCTAGATAGTCCAGTTGTTGCACCACCGTGGAAAATCT
TCTTAAACGCTCTCAAGCCGCCTAGCGAGTGCTTTCGGATTCCGCCAAATTTAATGGTGG
ACACTATGCTGCGACGCAGATTTGCCAAACTACTTCCGACCATGACTTTCAATCGGAATA
TCTTCATACGTAGAAACAGCGACGTTGGAGGAGAACGATGAGAAATCAAGTCGGCTTCTT
GAAGCTTTTTGTAGATCAAGAACTTGGCTCTCCTGTGAAGCAACTCCTCTGGGTCTTCCT
TGTTCATCTTTGAGTAATCGCATGGCTTTTTGAAGAGGGTCATTTTCATTCTTTCGTGTA
TTTTTTTTTGACGATGATCTTTTCTGAAGAGAGGTAGAGAGATACTGGAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 6

CO CL757Contig1 1030 6 16 U
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TCGAAGCAAACAACAATTGGAAACAAAATGCAATGACAAATTTTCAAAAAAGCGACAATG
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TGCTGCATCACAAACATGTTTTCTTAAGGGAAAACTCTCTCAAGGATAGATTTTCAGAGG
TTGCTGAGGTCAACAGGTTCACAGAGGAGCCTCTCCATCTGCTGTGCTCTTGTCCTGATT
GACATGTCCAACACCTTTTGCTGGAACTCTACTATTAGCCCTCCATATATACTCGGATCA
ATCTTCTGTTCCACAGTTACTTTCTTCCCTTCTCCAATGATCTCCTGAAGTGTCTCCTTA
AGTTCCTTCTCCTCAGCAGGGGGAAGCGGCATGACAGTGGTAACCAAGACTTTGACGTCT
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TTCCCATTCTCAGCTAACAAAGATAGGAAGTTCTTGGTGGGTTCTGCAAGCTTTGCTTTG
TCACAAACATCGACAATAGCAGCAAGTCTTGTCTCTCTAGGAACAGAGGGATCCTTAGTA
AACTGTGAGAAAGTAGGGCTGGTCTTCATCGCCTCAACCAGCTCAGAAAGATCCGACTCA
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GATTCACCAACTAAAGCCACAGGCACCTTAACATTGCCAGTTTTCTGAGCTGAAGCTGTT
GCATAATCTCTCAACGCAGGGATAAGAGGACGTCCACTGGGATAAGATCTCGCAGAGGAG
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AAAGCCATTTTTGTTGTTGTTGTTGCAGATATCTGATTGGAACCCTAGAAAATGATTAAA
AGCCGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E495JQ U 1
AF RR4A383JQ U 79
AF RR4A383JQD U 79
AF RR4E495TF C 320
AF RR4A383TFB C 205
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BS 1 111 RR4E495JQ
BS 112 112 RR4A383JQ
BS 113 161 RR4E495JQ
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BS 163 237 RR4E495JQ
BS 238 238 RR4A383JQ
BS 239 262 RR4E495JQ
BS 263 263 RR4A383JQ
BS 264 547 RR4E495JQ
BS 548 773 RR4A383JQ
BS 774 774 RR4A383JQD
BS 775 789 RR4A383JQ
BS 790 855 RR4A383JQD
BS 856 1008 RR4A383TFB
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BS 1010 1030 RR4A383TFB

RD RR4E495JQ 547 0 0
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TAATTGTTTTGTCCCAGGTGGAGGGTAATAATGTTTTATTTCTGTCAACTGGGTTTGGTT
TGCTGCATCACAAACATGTTTTCTTAAGGGAAAACTCTCTCAAGGATAGATTTTCAGGGG
TTGCTGAGGTCAACAGGTTCACGGAGGAGCCTCTCCATCTGCTGTGCTCTTGTCCTGATT
GACATGTCCAACACCTTTTGCTGGAACTCTACTATTAGCCCTCCATATATACTCGGATCA
ATCTTCTGTTCCACAGTTACTTTCTTCCCTTCTCCAATGATCTCCTGAAGTGTCTCCTTA
AGTTCCTTCTCCTCAGCAGGGGGAAGCGGCATGACAGTGGTAACCAAGACTTTGACGTCT
CCCCTATGTGCTGTCGTCAGCTGCATGAATTTTTTCACAATCACATCTAGGTTCTTCAAC
TTCCCAT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4A383JQ 711 0 0
GA
AAACAAAATGCAATGACAAATTTTCAAAAAAGCGACAATGTAATTGTTTTGTCCCAGGTG
GAGGGTAATAATGTTTTATTTTTGTCAACTGGGTTTGGTTTGCTGCATCACAAACATGTT
TTCTTAAGGGAAAACTCTCTCAAGGATAGATTTTCAGAGGTTGCTGAGGTCAACAGGTTC
ACAGAGGAGCCTCTCCATCTGCTGTGCTCTTGTCCTGATTGACATGTCCAACACCTTTTG
CTGGAACTCTACTATTAGCCCTCCATATATACTCGGATCAATCTTCTGTTCCACAGTTAC
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BQ
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G
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CATGTATCCAGCTGAAAGGAACCTTAGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCAT
CCAATCTCCTGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAATACTCTTGCGCTTTGTTTCCTTCAC
CCGAGAGCCCTGTCAAGTTCTCGATCTTCCACCTACCGACCAAAAACTCAAGAATGTCTG
CATAGTCTTTAGCAGTGTAGACACCGAGCCTCTGAGCCACGGAAGAGAAGTTGTCAAAGA
GCTTGTCATCACGCCCATCGTACATCAAGTGAGCAGGCATCGAGATTTTCTTTCTCAACA
TGTCTGCAAAAGCCACCACGGTACCATCAGGATCAATCTCAAGGAGCTTTTCGACTATCT
TGGTGTAAGCTGTTTCGTG
C

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR4EQ94JQ 705 0 0
AAACTAACTTTTAACTGAAACAAAACTCCACAGTGAAAACTGAATACAGACCAGACGTTC
AACTGTTTTTTTAACTACTACAAGTTTTGCTAAAGGACCAAACACAAAACATATAGTGAC
TGGAAAGAAAAAAGCACAAGTTTCTAAATCACTGCCTCTCAACTTTGTAACTAGAGACCC
ACGAACATTATAAGAAACCATAGTAATCTACACCAACTTCAAGAACAGACAGTTCAAATG
AGGAACGGAGAGAGAGAATGAGTTTATTAGTTCAGAGCTGCACTTCTCTGTCATGTATCC
AGCTGAAAGGAACCTTAGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCATCCAATCTCC
TGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAATACTCTTGCGCTTTGTTTCCTTCACCCGAGAGCC
CTGTCAAGTTCTCGATCTTCCACCTACCAACCAAAAACTCAAGAATGTCCGCATAGTCTT
TGGCAGTGTAAACACCGAGCCTCTGAGCCACGGAAGAGAAGTTGTCAAAGAGCTTGTCAT
CACGCCCATCGTACATCAAGTGAGCAGGCATCGAGATTTTCTTTCTCATCATGTCTGCAA
AAGCCACCACGGTACCATCAGGATCAATCTCAAGGAGCTTTTCAACTATCTTGGTGTAAG
CTGTTTCGTGACGCTTCTCGTCTGCAGCTATTGTTCCACATATCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4A215JQD 772 0 0
AACACAGAAAAACTAACTTTTAACTGAAACAAAACTCCACAGTGAAAACTGAGTACAGAC
CAGACGTTCAACTGTTTTTTTAACTACTACAAGTTTTGCTAAAGGACCAAACACAAAACA
TATAGTGACTGGAAAGAAAAAAGCACAAGTTTCTAAATCACTGCCTCTCAACTTTGTAAC
TAGAGACCCACGAACATTATAAGAAACCATAGTAATCTACACCAACTTCAAGAACAGACA
GTTCAAATGAGGAACGGAGAGAGAGAATGAGTTTATTAGTTCAGAGCTGCACTTCTCTGT
CATGTATCCAGCTGAAAGGGACCTTAGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCAT
CCAATCTCCTGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAATACTCTTGCGCTTTGTTTCCTTCAC
CCGAGAGCCCTGTCAAGTTCTCGATCTTCCACCTACCAACCAAAAACTCAAGAATGTCCG
CATAGTCTTTGGCAGTGTAAACACCGAGCCTCTGAGCCACGGAAGAGAAGTTGTCAAAGA
GCTTGTCATCACGCCCATCGTACATCAAGTGAGCAGGCATCGAGATTTTCTTTCTCATCA
TGTCTGCAAAAGCCACCACGGTACCATCAGGATCAATCTCAAGGAGCTTTTCAACTATCT
TGGTGTAAGCTGTTTCGTGACGCTTCTCGTCTGCAGCTATTGTTCCACATATCTGAGCTA
GCTTGAGGTCTCCATGCTCTTTGGCTTGGCGAGCTGTGTTCCCGTGAGAGAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4A215JQ 818 0 0
AACACAGAAAAACTAACTTTTAACTGAAACAAAACTCCACAGTGAAAACTGAGTACAGAC
CAGACGTTCAACTGTTTTTTTAACTACTACAAGTTTTGCTAAAGGACCAAACACAAAACA
TATAGTGACTGGAAAGAAAAAAGCACAAGTTTCTAAATCACTGCCTCTCAACTTTGTAAC
TAGAGACCCACGAACATTATAAGAAACCATAGTAATCTACACCAACTTCAAGAACAGACA
GTTCAAATGAGGAACGGAGAGAGAGAATGAGTTTATTAGTTCAGAGCTGCACTTCTCTGT
CATGTATCCAGCTGAAAGGGACCTTAGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCAT
CCAATCTCCTGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAATACTCTTGCGCTTTGTTTCCTTCAC
CCGAGAGCCCTGTCAAGTTCTCGATCTTCCACCTACCAACCAAAAACTCAAGAATGTCCG
CATAGTCTTTGGCAGTGTAAACACCGAGCCTCTGAGCCACGGAAGAGAAGTTGTCAAAGA
GCTTGTCATCACGCCCATCGTACATCAAGTGAGCAGGCATCGAGATTTTCTTTCTCATCA
TGTCTGCAAAAGCCACCACGGTACCATCAGGATCAATCTCAAGGAGCTTTTCAACTATCT
TGGTGTAAGCTGTTTCGTGACGCTTCTCGTCTGCAGCTATTGTTCCACATATCTGAGCTA
GCTTGAGGTCTCCATGCTCTTTGGCTTGGCGAGCTGTGTTCCCGTGAGAGACGAAGGTCG
CTCTCTCTTGGAATGAAGTGTAGATGAAGCCAAGGTAA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4A215TF 121 0 0
TGCGGTGGCATGGAGTGCAAGACTTGAACGTGCACTTCCTTTGGCGGCGTGAATGGCTTC
TTCAAACTCTCGACCCCCTTGGAGCTGAGAGCGGGTGAAGAAGAAGCGTGGCAGAGGAAC
T

QA 1 121 1 121
DS 

RD RR4A215TFB 807 0 0
GAGAGACGAAGGTCGCTCTCTCTTGGAATGAAGTGTAGATGAAGCCAAGGTAAGGATTGT
TCTCTGTGCGTGGATCCATTCCGGAACCAATCAAGTACTGAATGGTCTTCTCAATCTGCC
TCATGTCAACACGACCAGACAAGTAAAGATACTTATTGAGAAGATCACCATGTCGGTTCT
CTTCAGCAGTCCAAGCTCTTGTCCAAACAGCCCATGAAGTGGGACTAGCACCAGTCTCAT
CCCTTACTCCATCCAAAGTGTTGAGCATAGTTTGATAGGTCGGAAGAGCTTCTTCTGTGA
TCATGTCTCCCAACAAAACAACAAAGTAATCATCGGGGAGCTCTCTTGCCCTCTCTCTTA
GCTCCTTCACCTGATCTTCGAACCCGTCGGATGCAGGGTCGGGTAAGAAATCCTGGGGCT
GCCATGACTTCTCCACGTCCTTGAGATGGGTAAGAAGGTTCTGCTCGGCCCAGTCTTCCA
TGGATTTGAAGATCTCGATCTTCTGCGGTGGCATGGAGTGCAAGACTTGAACGTGCACTT
CCTTTGGCGGCGTGAATGGCTTCTTCAAACTCTCGACCCCCTTGGAGCTGAGAGCGGGTG
AAGAAGAAGCGTGGCAGAGGAACTTGGGAGATCTGAAAGTAGAGATTGGCGGACGAGTCG
AGGAAGCGAGTTTGTATGGCTGACATGCCAAAGAGTTTAGCTTCAATGCCATTTTGGTCT
CTTGTCTTTGAGTCTCTCTCTCTAGGCTAATGCTCACTGGCGCTACGTCTTCTTTAAGGG
TTGAGTTTCGTCCACAGAAAGAGAAT
C

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4EQ94TF 775 0 0
TCCGGAACCA*TCAAGTACTGAATGGTCT*CTCAATCTGCCTCATGTCAACACGACCAGA
CAAGTAAAGATACTTATTGAGAAGATCACCATGTCGGTTCTCTTCAGCAGTCCAAGCTCT
TGTCCAAACAGCCCATGAAGTGGGACTAGCACCAGTCTCATCCCTTACTCCATCCAAAGT
GTTGAGCATAGTTTGACAGGTCGGAAGAGCTTCTTCTGTGATCATGTCTCCCACCAAAAC
AACAAAGTAATCATCGGGGAGCTCTCTTGCCCTCTCTCTTAGCTCCTTCACCTGATCTTC
GAACCCGTCGGATGCAGGGTCGGGTAAGAAATCCTGGGGCTGCCATGACTTCTCCACGTC
CTTGAGATGGGTAAGAAGGTTCTGCTCGGCCCAGTCTTCCATGGATTTGAAGATCTCGAT
CTTCTGCGGTGGCATGGAGTGCAAGACTTGAACGTGCACTTCCTTTGGTGGCGTGAATGG
CTTCTTCAAACTCTCGACCCCCTTGGAGCTGAAAGCGGGTGAAGAAGAAGCGTGGCAGAG
GAACTTGGGAGATCTGAAAGTAGAGATTGGCGGACGAGTCGAGGAAGCGAGTTTGTATGG
CTGACATGCCAAAGAGTTTAGCTTCAATGCCATTTTGGTCTCTTGTCTTTGAGTCTCTCT
CT**AGGCTAATGCTCTCTGGCGCTACGTCTTCTTTAAGGGTTGAGTTTCGTCCACAGAA
AGAGAATGGTTGGTAATGAGAAACAGCGGTGTGAGGGAAGAAGAGTCTCTCATCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 6

CO CL759Contig1 943 6 11 U
GGAGTTTCATCTTCATCTTTCTAGATTCTTCTCCTCTCCTTCGTCCCTCCGTAGATCGTC
AATCAGATCAATGGCCGATTCCGCTTTCAAGAAAATCCAAATCCAAAGAGACGACACTAC
ATTTGATGCGTATGTGGTCGGAAAAGACGACGCACCAGGGATCGTCGTGATACAAGAATG
GTGGGGTGTTGACTTCGAAATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCCTCGACAC
CGGTTTCAAAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTCGACACTGCGGA
GGCACAGCATCTGATGGACGGACTCGACTGGCAAGGTGCTATCAAAGACATTCGCGCTTC
TGTTAAGTGGCTTAAGGCTAATGGCTCCAA**ATGTTGGCGTCACTGGGATGTGTATGGG
AGGTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGTTGATGCTGTTGTTGG*TT
CTATGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGCCAAGGTGCCTGTTCAGGC
TCATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCGGCAAAGAATCT
TGAAGAGAAGCTGAAAGCGTCTGGAGTGGCGCATGAGGTTCATATTTACGAGGGGAACGG
GCACGCGTTCTTGAACAGGAGTCCTGAAGGAGTGAGCAGAAGGAAGAGCATGGGGCTTTC
TGACGAAGATGAAGCTGCGGTGGAGCTTGCTTGGTCTCGCTTCACTTCCTGGATGAAACA
TTACTTGGCTTAATTAAGCATTATGCTTTTTTCCCCTCAGATTGTGTTCTTTGTACGTCC
TGAAACGTTTTGTGATGCCCCGATCGATCTCAAATAAGGATTTGCTCCTATGACTTGTGT
CAGAGTCAAATAAAGTGGTTTGCTTGTGGGGTTTTGTGTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG35TF U 1
AF RR4E608TF U 173
AF RR4DW81TF U 173
AF RR4DG35JQ C 287
AF RR4DW81JQ C 403
AF RR4E608JQ C 363
BS 1 390 RR4DG35TF
BS 391 392 RR4DW81TF
BS 393 477 RR4DG35TF
BS 478 478 RR4DW81TF
BS 479 592 RR4DG35TF
BS 593 873 RR4DW81TF
BS 874 874 RR4DG35JQ
BS 875 878 RR4DW81TF
BS 879 879 RR4DG35JQ
BS 880 926 RR4DW81TF
BS 927 943 RR4DG35JQ

RD RR4DG35TF 592 0 0
GGAGTTTCATCTTCATCTTTCTAGATTCTTCTCCTCTCCTTCGTCCCTCCGTAGATCGTC
AATCAGATCAATGGCCGATTCCGCTTTCAAGAAAATCCAAATCCAAAGAGACGACACTAC
ATTTGATGCGTATGTGGTCGGAAAAGACGACGCACCAGGGATCGTCGTGATACAAGAATG
GTGGGGTGTTGACTTCGAAATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCCTCGACAC
CGGTTTCAAAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTCGACACTGCGGA
GGCACAGCATCTGATGGACGGACTCGACTGGCAAGGTGCTATCAAAGACATTCGCGCTTC
TGTTAAGTGGCTTAAGGCTAATGGCTCCAAGAATGTTGGCGTCACTGGGATGTGTATGGG
AGGTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGTTGATGCTGTTGTTGGGTT
CTATGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGCCAAGGTGCCTGTTCAGGC
TCATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCGGCA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4E608TF 463 0 0
G
AAGAATGGTGGGGTGTTGACTTCGAAATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCC
TCGACACCGGTTTCAAAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTCGACA
CTGCGGAGGCACAGCATCTGATGGACGGACTCGACTGGCAAGGTGCTATCAAAGACATTC
GCGCTTCTGTTAAGTGGCTTAAGGCTAATGGCTCCAA**ATGTTGGCGTCACTGGGATGT
GTATGGGAGGTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGTTGATGCTGTTG
TTGG*TTCTATGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGCCAAGGTGCCTG
TTCAGGCTCATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCGGCAA
AGAATCTTGAAGAGAAGCTGAAAGCGTCTGGAGTGGCGCATG

QA 2 463 2 463
DS 

RD RR4DW81TF 754 0 0
G
AAGAATGGTGGGGTGTTGACTTCGAAATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCC
TCGACACCGGTTTCAAAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTCGACA
CTGCGGAGGCACAGCATCTGATGGACGGACTCGACTGGCAAGGTGCTATCAAAGACATTC
GCGCTTCTGTTAAGTGGCTTAAGGCTAATGGCTCCAA**ATGTTGGCGTCACTGGGATGT
GTATGGGAGGTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGTTGATGCTGTTG
TTGG*TTCTATGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGCCAAGGTGCCTG
TTCAGGCTCATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCGGCAA
AGAATCTTGAAGAGAAGCTGAAAGCGTCTGGAGTGGCGCATGAGGTTCATATTTACGAGG
GGAACGGGCACGCGTTCTTGAACAGGAGTCCTGAAGGAGTGAGCAGAAGGAAGAGCATGG
GGCTTTCTGACGAAGATGAAGCTGCGGTGGAGCTTGCTTGGTCTCGCTTCACTTCCTGGA
TGAAACATTACTTGGCTTAATTAAGCATTATGCTTTTTTCCCCTCAGATTGTGTTCTTTG
TACGTCCTGAAACGTTTTGTGATGCCCCGATCGATCTCAA*TAAG*ATTTGCTCCTATGA
CTTGTGTCAGAGTCAAATAAAGTGGTTTGCTTG

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR4DG35JQ 657 0 0
CTCGACACTGCGGAGGCACAGCATCTGATGGACGGACTCGACTGGCAAGGTGCTATCAAA
GACATTCGCGCTTCTGTTAAGTGGCTTAAGGCTAATGGCTCCAAGAATGTTGGCGTCACT
GGGATGTGTATGGGAGGTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGTTGAT
GCTGTTGTTGGGTTCTATGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGCCAAG
GTGCCTGTTCAGGCTCATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTTTCTGATGTCACG
GCGGCAAAGAATCTTGAAGAGAAGCTGAAAGCGTCTGGAGTGGCGCATGAGGTTCATATT
TACGAGGGGAACGGGCACGCGTTCTTGAACAGGAGTCCTGAAGGAGTGAGCAGAAGGAAG
AGCATGGGGCTTTCTGACGAAGATGAAGCTGCGGTGGAGCTTGCTTGGTCTCGCTTCACT
TCCTGGATGAAACATTACTTGGCTTAATTAAGCATTATGCTTTTTTCCCCTCAGATTGTG
TTCTTTGTACGTCCTGAAACGTTTTGTGATGCCCCGATCGATCTCAAATAAGGATTTGCT
CCTATGACTTGTGTCAGAGTCAAATAAAGTGGTTTGCTTGTGGGGTTTTGTGTGGAC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4DW81JQ 524 0 0
CACTGGGATGTGTATGGGAGGTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGT
TGATGCTGTTGTTGG*TTTTATGGTACTCCTTCCTTTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGC
CAAGGTGCCTGTTCAGGCTCATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTTTTTGATGT
CACGGCGGCAAAGAATTTTGAAGAGAAGCTGAAAGCGTTTGGAGTGGCGCATGAGGTTCA
TATTTACGAGGGGAACGGGCACGCGTTTTTGAACAGGAGTCCTGAAGGAGTGAGCAGAAG
GAAGAGCATGGGGCTTTTTGACGAAGATGAAGCTGCGGTGGAGCTTGCTTGGTCTCGCTT
CACTTCCTGGATGAAACATTACTTGGCTTAATTAAGCATTATGCTTTTTTCCCCCCAGAT
TGTGTTTTTTGTACGTCCTGAAACGTTTTGTGATGCCCCGATCGATCTCAAATAAGGATT
TGCTCCTATGACTTGTGTCAGAGTCAAATAAAGTGGTTTGCTTG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4E608JQ 564 0 0
TTAAGTGGCTTAAGGCTAATGGCTCCAA**ATGTTGGCGTCACTGGGATGTGTATGGGAG
GTGCACTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCTGAGGTTGATGCTGTTGTTGG*TTTT
ATGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGGGAAAGCCAAGGTGCCTGTTCAGGCTC
ATTTTGGGGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTTTTTGATGTCACGGCGGCAAAGAATCTTG
AAGAGAAGCTGAAAGCGTCTGGAGTGGCGCATGAGGTTCATATTTACGAGGGGAACGGGC
ACGCGTTTTTGAACAGGAGTCCTGAAGGAGTGAGCAGAAGGAAGAGCATGGGGCTTTTTG
ACGAAGATGAAGCTGCGGTGGAGCTTGCTTGGTCTCGCTTCACTTCCTGGATGAAACATT
ACTTGGCTTAATTAAGCATTATGCTTTTTTCCCCTCAGATTGTGTTCTTTGTACGTCCTG
AAACGTTTTGTGATGCCCCGATCGATCTCAAATAAGGATTTGCTCCTATGACTTGTGTCA
GAGTCAAATAAAGTGGTTTGCTTG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 2 7

CO CL760Contig1 1000 3 4 U
GTAAACAAAGTTTCTTTTTAGTTGTGAAACACATAAAAACTATTACATATATAGGATGTG
AAGTATATTGATATACAAAGACATTGGTCCAAATGAAACGTGATCAATTAACATAGACTG
ATGATACTTTGAGATAAACTGTGTATTGCAAATATCCTTTTCGTTTTGCATCCATCTTAG
TACTTCTGTTGCTCTCTTTTGAGAGCTTTTGTGGTGGGAAGTGTACCAAACACTATGTCC
CATAGCGACCAAGTTACTCCATATCCCCTGTCCTGAATCCTGAAGTGATGGTTCAAATGG
GATTTCTTGAGTTTTTTGGTCACTGGTATACTTGGGTTGGCATGGTGAAGGTAGTAGTGA
GTGACATCGTACATCACATAGCCGAACAGGCCGCCTCCAAACAATGCAGGTGCAGTTGAA
GGAGTTGCAATAAGTTGCGCAAGGTTCCAGAAAGGAATGCACATAATAGCTGTTAAGGCG
GGAGGAAAGACGAGACGAAGGTGGTCCATTGGGTGCTTGTGATGGTATCCGTGAATAAGA
TAGTGTGCTGTGTTTCCCCAGTAACTTTTCGTCTTCATGTGGAAAAGGAAACGGTGAAGA
CAGTATTCTATAAAGGTCCAGATAAATATTCCCAAGGCTGCCGAAGAGACAACCTCGGGG
AGTGAACAGCCCATGCTTACTGACATGGAGATACACCAGGAAACAACTGGCAACCAAATA
ACAGGAACTGCCCACCAAACTGTAAGTGTCAAGAACTCCCAAAAGTCGCTCTGGAAAAAC
CTAGGGCCTTCCTTGGTTACAATAGGTTGGTGAACCCATTCGTCGTAAGCTTCTCCGAGA
TGACCAACCTGGAAAACAAGGGGCTTGTCAAGATCTACAGTGAACCCTTGAGCAACCATT
CTGCTGATCTTTTACACAACTAAATGCGAGATATCGGATCTCAGTGACTCTAACAAACTG
ACAGCCGTCGGGAAGAGTAGAGTACCGCCGAAGAGTATAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4E487JQ U 46
AF RR4DQ43JQ U 1
AF RR4E487TF C 314
BS 1 249 RR4DQ43JQ
BS 250 250 RR4E487JQ
BS 251 493 RR4DQ43JQ
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AATTAACATAGACTGATGATACTTTGAGATAAACTGTGTATTGCAAATATCCTTTTCGTT
TTGCATCCATCTTAGTACTTCTGTTGCTCTCTTTTGAGAGCTTTTGTGGTGGGAAGTGTA
CCAAACACTATGTCCCATAGCGACCAAGTTACTCCATATCCCCTGTCCTGAATCCTGAAG
TGATGGTTCAAATGGGATTTCTTGAGTTTTTTGGTCACTGGTATACTTGGGTTGGCATGG
TGAAGGTAGTAGTGAGTGACATCGTACATCACATAGCCGAACAGGCCGCCTCCAAACAAT
GCAGGTGCAGTTGAAGGAGTTGCAATAAGTTGCGCAAGG

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DS 

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AAGTATATTGATATACAAAGACATTGGTCCAAATGAAACGTGATCAATTAACATAGACTG
ATGATACTTTGAGATAAACTGTGTATTGCAAATATCCTTTTCGTTTTGCATCCATCTTAG
TACTTCTGTTGCTCTCTTTTGAGAGCTTTTGTGGTGGGAAGTGTACCAAACACTATGTCC
CATAGCGACGAAGTTACTCCATATCCCCTGTCCTGAATCCTGAAGTGATGGTTCAAATGG
GATTTCTTGAGTTTTTTGGTCACTGGTATACTTGGGTTGGCATGGTGAAGGTAGTAGTGA
GTGACATCGTACATCACATAGCCGAACAGGCCGCCTCCAAACAATGCAGGTGCAGTTGAA
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GGAGGAAAGACGA

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DS 

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GTTGCGCAAGGTTCCAGAGAGGAATGCACATAATAGCTGTTAAGGCGGGAGGAAAGACGA
GACGAAGGTGGTCCATTGGGTGCTTGTGATGGTATCCGTGAATAAGATAGTGTGCTGTGT
TTCCCCAGTAACTTTTCGTCTTCATGTGGAAAAGGAAACGGTGAAGACAGTATTCTATAA
AGGTCCAGATAAATATTCCCAAGGCTGCCGAAGAGACAACCTCGGGGAGTGAACAGCCCA
TGCTTACTGACATGGAGATACACCAGGAAACAACTGGCAACCAAATAACAGGAACTGCCC
ACCAAACTGTAAGTGTCAAGAACTCCCAAAAGTCGCTCTGGAAAAACCTAGGGCCTTCCT
TGGTTACAATAGGTTGGTGAACCCATTCGTCGTAAGCTTCTCCGAGATGACCAACCTGGA
AAACAAGGGGCTTGTCAAGATCTACAGTGAACCCTTGAGCAACCATTCTGCTGATCTTTT
ACACAACTAAATGCGAGATATCGGATCTCAGTGACTCTAACAAACTGACAGCCGTCGGGA
AGAGTAGAGTACCGCCGAAGAGTATAC

QA 1 687 1 687
DS 



CO CL760Contig2 1085 4 7 U
GGAAAAGAGAAGTGCGCCTCTACTCTTCGGCGGTACTCTACTCTTCCCGTCGGCTGTCAG
TGATCCGATATCTCGCATTTAGTATATCTGCTTATGTATATGGTGGTGGGGTCCTTGGAG
GAGAATAAGTGACGGGCTGTATAATTTTTTATTTTGGTTGTGTGAAAGATCAGCAAAATG
GTTGCTCAAGGGTTCACTGTAGATCTTGACAAGCCCCTTGCTTTCCAGGTTGGTCATCTC
GGAGAAGCTTACGACGAATGGGTTCACCAACCTATTGTAACCAAGGAAGGCCCTAGGTTT
TTCCAGAGCGACTTTTGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAGTTCCTGTCATT
TGGTTGCCAGTTGTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCTGTTCACTCCCC
GAGGTTGTCTCTTTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACCTTTATAGAATACTGTCTT
CACCGTTTCCTTTTCCACATGAAGACGAAAAGTTACTGGGGAAACACGGCACACTATCTT
ATTCACGGATACCATCACAAGCACCCAATGGACCACCTTCGTCTCGTCTTTCCTCCTGCC
TTAACAGCTATTATGTGCTTGCCTCTCCGGAACCTTGCGCAACTTATTGCAACTCCTTCA
ACTGCACCTGCATTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGGTACGTGATGTACGATATCACTCAC
TACTACCTTCACCATGCCAACCCAAATATACCAGTGACCAAAAACCTCAAGAAATCCCAT
TTGAACCATCACTTCAGGATTCAGGACAAGGGATATGGTGTAACTTCGTCGCTATGGGAC
ATAGTGTTTGGTACACTTCCCACCAAAAAAGCTCTCAAAAGAGAGCAACAGAAGTACTAA
TTAAGATGGATGCAAAACGAAAAGGATCGATATTTGCAATACACAGTTTATCTTAAAGTA
TCATCAGTCTATGTTAATTGATCACGTTTCATTTGGACCAATGTCTTTGTATATCAATAT
ACTTCACATCCTATATATGTAATAGTTTTTATGTGTTTCACAACTGAAAAGAAACTTTGT
TTACG


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10 10 10 10 10 

AF RR4H311TF U 1
AF RR4AQ37TF U 255
AF RR4H311JQ C 682
AF RR4AQ37JQ C 303
BS 1 623 RR4H311TF
BS 624 624 RR4AQ37TF
BS 625 627 RR4H311TF
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BS 737 900 RR4AQ37TF
BS 901 1085 RR4AQ37JQ

RD RR4H311TF 736 0 0
GGAAAAGAGAAGTGCGCCTCTACTCTTCGGCGGTACTCTACTCTTCCCGTCGGCTGTCAG
TGATCCGATATCTCGCATTTAGTATATCTGCTTATGTATATGGTGGTGGGGTCCTTGGAG
GAGAATAAGTGACGGGCTGTATAATTTTTTATTTTGGTTGTGTGAAAGATCAGCAAAATG
GTTGCTCAAGGGTTCACTGTAGATCTTGACAAGCCCCTTGCTTTCCAGGTTGGTCATCTC
GGAGAAGCTTACGACGAATGGGTTCACCAACCTATTGTAACCAAGGAAGGCCCTAGGTTT
TTCCAGAGCGACTTTTGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAGTTCCTGTCATT
TGGTTGCCAGTTGTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCTGTTCACTCCCC
GAGGTTGTCTCTTTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACCTTTATAGAATACTGTCTT
CACCGTTTCCTTTTCCACATGAAGACGAAAAGTTACTGGGGAAACACGGCACACTATCTT
ATTCACGGATACCATCACAAGCACCCAATGGACCACCTTCGTCTCGTCTTTCCTCCTGCC
TTAACAGCTATTATGTGCTTGCC*CTCTGGAACCTTGCGCAACTTATTGCAACTCCTTCA
ACTGCACCTGCATTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGGTACGTGATGTACGATATCACTCAC
TACTACCTTCACCATG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4AQ37TF 665 0 0
G
GAATGGGTTCACCAACCTATTGTAACCAAGGAAGGCCCTAGGTTTTTCCAGAGCGACTTT
TGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAGTTCCTGTCATTTGGTTGCCAGTTGTT
TCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCTGTTCACTCCCCGAGGTTGTCTCTTTG
GCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACCTTTATAGAATACTGTCTTCACCGTTTCCTTTTC
CACATGAAGACGAAAAGTTACTGGGGAAACACGGCACACTATCTTATTCACGGATACCAT
CACAAGCACCCAATGGACCACCTTCGTCTCGTCTTTCCTCCTGCCTTAACAGCTATTATG
TGCTTGCCTCTCCGGAACCTTGCGCAACTTATTGCAACTCCTTCAACTGCACCTGCATTG
TTTGGAGGCGGCCTGTTCGGGTACGTGATGTACGATATCACTCACTACTACCTTCACCAT
GCCAACCCAAATATACCAGTGACCAAAAACCTCAAGAAATCCCATTTGAACCATCACTTC
AGGATTCAGGACAAGGGATATGGTGTAACTTCGTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGTACA
CTTCCCACCAAAAAAGCTCTCAAAAGAGAGCAACAGAAGTACTAA
TTAAGATGGATGCAAAACG

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR4H311JQ 380 0 0
GGCGGCCTGTTCGGGTACGTGATGTACGATATCACTCATTACTACCTTCACCATGCCAAC
CCAAATATACCAGTGACCAAAAACCTCAAGAAATCCCATTTGAACCATCACTTCAGGATT
CAGGACAAGGGATATGGTGTAACTTCGTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGTACACTTCCC
ACCAAAAAAGCTCTCAAAAGAGAGCAACAGAAGTACTAATTAAGATGGATGCAAAACGAA
AAGGATCGATATTTGCAATACACAGTTTATCTTAAAGTATCATCAGTTTATGTTAATTGA
TCACGTTTCATTTGGACCAATGTCTTTGTATATCAATATACTTCACATCCTATATATGTA
ATAGTTTTTATGTGTTTCAC

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4AQ37JQ 783 0 0
CCAGAGCGACTTTTGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAGTTCCTGTCATTTG
GTTGCCAGTTGTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCTGTTCACTCCCCGA
GGTTGTCTCTTTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACCTTTATAGAATACTGTCTTCA
CCGTTTCCTTTTCCACATGAAGACGAAAAGTTACTGGGGAAACACGGCACACTATCTTAT
TCACGGATACCATCACAAGCACCCAATGGACCACCTTCGTCTCGTCTTTCCTCCTGCCTT
AACAGCTATTATGTGCTTGCCTTTCCGGAACCTTGCGCAACTTATTGCAACTCCTTCAAC
TGCACCTGCATTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGGTACGTGATGTACGATATCACTCACTA
CTACCTTCACCATGCCAACCCAAATATACCAGTGACCAAAAACCTCAAGAAATCCCATTT
GAACCATCACTTCAGGATTCAGGACAAGGGATATGGTGTAACTTCGTCGCTATGGGACAT
AGTGTTTGGTACACTTCCCACCAAAAAAGCTCTCAAAAGAGAGCAACAGAAGTACTAATT
AAGATGGATGCAAAACGAAAAGGATCGATATTTGCAATACACAGTTTATCTTAAAGTATC
ATCAGTCTATGTTAATTGATCACGTTTCATTTGGACCAATGTCTTTGTATATCAATATAC
TTCACATCCTATATATGTAATAGTTTTTATGTGTTTCACAACTGAAAAGAAACTTTGTTT
ACG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 6

CO CL761Contig1 1234 6 17 U
GGATTAACGATTAACATCACCAAAGACATTAATTAAGTTGCGAGTTAAGAAAACAGTGAC
TTTACAAAATAATATTGAGAGAGTCCAGAGTAATGGAGAAGAACATCAAGTTTCCTGTTG
TAGACTTGTCTAAGCTCAATGGTGAAGAGAGAGACCAAACCATGGCTTTGATCGACGATG
CTTGTCAAAACTGGGGCTTCTTTGAGCTGCTAAACCATGGAATACCATATGATCTAATGG
ACAACATTGAGAGGATGACAAAAGAACACTACAAGAAATTTATGGAACAAAAGTTTAAGG
AAATGCTTCGTTCCAAAGGTTTAGATACTCTTGAGACCGAAGTGGAAGATATCGATTGGG
AAAGCACTTTCTTCCTTCGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGACATCCCTAATATGT
CAGACGAATACCGAGCGGCTATGAAAGATTTTGGGAAGAGGCTAGAGAGCCTAGCAGAAG
AACTGTTGGATTTGCTGTGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTACCTGAAGAAGGTGT
TTCGTGGTGCGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTATCCACCATGTCCTA
ATCCTGAGATGATCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGCCTCATCTTGCTGT
TTCAAGATGATAAGGTCAGCGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGTGTCTGGGTTGATGTTC
CTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTGATAACAAACG
GGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAAGGAAACAGGATGTCTA
TTGCGTCGTTCTACAACCCTGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCGGCGCAGTCTCTTGTGG
ACAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATGAAACTCTATGCCGGAG
TCAAGTTCCAGCCTGAGGAGCCACGGTTTGAGGCCATGAAAAATGCTGCAGCAACCAAGG
ATGCAAATCCGCTTGCCGCGGTGGAGACATTCTAATTGGAAGTGGGGTATTCTATGAAGG
CAAGAAAGATGAAAAATAACAAAGTGGGTTTGATGTGTGGGTAATAACGCAATAAGTATT
GAAGTTAATGTTATTAGAAGCAAAAACTAAGTGACTAGTGATCACTGGTGTGGTTAAGTA
AGTGTGGGGGTGTTTTTAAAACATATGAATATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EM81TF U 1
AF RR4DK54TF U 347
AF RR4DN50TF U 347
AF RR4EM81JQ C 533
AF RR4DN50JQ C 585
AF RR4DK54JQ C 1054
BS 1 420 RR4EM81TF
BS 421 422 RR4DK54TF
BS 423 697 RR4EM81TF
BS 698 977 RR4DK54TF
BS 978 978 RR4DN50TF
BS 979 992 RR4DK54TF
BS 993 993 RR4DN50TF
BS 994 1002 RR4DK54TF
BS 1003 1003 RR4EM81JQ
BS 1004 1019 RR4DK54TF
BS 1020 1020 RR4EM81JQ
BS 1021 1033 RR4DK54TF
BS 1034 1034 RR4EM81JQ
BS 1035 1050 RR4DK54TF
BS 1051 1051 RR4EM81JQ
BS 1052 1079 RR4DN50TF
BS 1080 1234 RR4EM81JQ

RD RR4EM81TF 703 0 0
GGATTAACGATTAACATCACCAAAGACATTAATTAAGTTGCGAGTTAAGAAAACAGTGAC
TTTACAAAATAATATTGAGAGAGTCCAGAGTAATGGAGAAGAACATCAAGTTTCCTGTTG
TAGACTTGTCTAAGCTCAATGGTGAAGAGAGAGACCAAACCATGGCTTTGATCGACGATG
CTTGTCAAAACTGGGGCTTCTTTGAGCTGCTAAACCATGGAATACCATATGATCTAATGG
ACAACATTGAGAGGATGACAAAAGAACACTACAAGAAATTTATGGAACAAAAGTTTAAGG
AAATGCTTCGTTCCAAAGGTTTAGATACTCTTGAGACCGAAGTGGAAGATATCGATTGGG
AAAGCACTTTCTTCCTTCGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGACATCCCTAATATGT
**GACGAATACCGAGCGGCTATGAAAGATTTTGGGAAGAGGCTAGAGAGCCTAGCAGAAG
AACTGTTGGATTTGCTGTGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTACCTGAAGAAGGTGT
TTCGTGGTGCGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTATCCACCATGTCCTA
ATCCTGAGATGATCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGCCTCATCTTGCTGT
TTCAAGATGATAAGGTCAGCGGCCTTCAGCTTCTCAA
GATGGT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DK54TF 709 0 0
A
GATATCGATTGGGAAAGCACTTTCTTCCTTCGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGAC
ATCCCTAATATGTCAGACGAATACCGAGCGGCTATGAAAGATTTTGGGAAGAGGCTAGAG
AGCCTAGCAGAAGAACTGTTGGATTTGCTGTGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTAC
CTGAAGAAGGTGTTTCGTGGTGCGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTAT
CCACCATGTCCTAATCCTGAGATGATCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGC
CTCATCTTGCTGTTTCAAGATGATAAGGTCAGCGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGTGTC
TGGGTTGATGTTCCTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAG
GTGATAACAAACGGGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAAGGA
AACAGGATGTCTATTGCGTCGTTCTACAACCCTGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCGGCG
CAGTCTCTTGTGGACAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATGAAA
CTCTATGCCGGAGTCAAGTTCCAGCCTGAG*AGCCACGGTTTGAG*CCATGAAAA*TGCT
GCAGCAACCAAG*ATGCAAATCCGCT*GCCGCGGTGGAGACAT
CTAAT

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR4DN50TF 736 0 0
A
GATATCGATTGGGAAAGCACTTTCTTCCTTCGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGAC
ATCCCTAATATGTCAGACGAATACCGAGCGGCTATGAAAGATTTTGGGAAGAGGCTAGAG
AGCCTAGCAGAAGAACTGTTGGATTTGCTGTGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTAC
CTGAAGAAGGTGTTTCGTGGTGCGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTAT
CCACCATGTCCTAATCCTGAGATGATCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGC
CTCATCTTGCTGTTTCAAGATGATAAGGTCAGCGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGTGTC
TGGGTTGATGTTCCTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAG
GTGATAACAAACGGGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAAGGA
AACAGGATGTCTATTGCGTCGTTCTACAACCCTGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCGGCG
CAGTCTCTTGTGGACAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATGAAA
CTCTATGCCGGAGTCAAGTTCCAGCCTGAGGAGCCACGGTTTGAGGCCATGAAAA*TGCT
GCAGCAACCAAG*ATGCAAATCCGCT*GCCGCGGTGGAGACAT*CTAATTGGAAGTGGGG
TATTCTATGAAG
CAG

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4EM81JQ 702 0 0
GAAGGTGTTTCGTGGTGCGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTATCCACC
ATGTCCTAATCCTGAGATGATCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGCCTCAT
CTTGCTGTTTCAAGATGATAAGGTCAGCGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGTGTCTGGGT
TGATGTTCCTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTGAT
AACAAACGGGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAAGGAAACAG
GATGTCTATTGCGTCGTTCTACAACCCTGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCGGCGCAGTC
TCTTGTGGACAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATGAAACTCTA
TGCCGGAGTCAAGTTCCAGCCTAAGGAGCCACGGTTTGAGGCCATGAAAAATGCTGCAGC
AACCAAGGATGCAAATCCGGTTGCCGCGGTGGAGACATTCTAATTGGAAGTGGGGTATTC
TATGAAGGCAAGAAAGATGAAAAATAACAAAGTGGGTTTGATGTGTGGGTAATAACGCAA
TAAGTATTGAAGTTAATGTTATTAGAAGCAAAAACTAAGTGACTAGTGATCACTGGTGTG
GTTAAGTAAGTGTGGGGGTGTTTTTAAAACATATGAATATTG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4DN50JQ 650 0 0
TATCCACCATGTCCTAATCCTGAGATGATCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGA
GGCCTCATCTTGCTGTTTCAAGATGATAAGGTCAGCGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGT
GTCTGGGTTGATGTTCCTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATTTTGGTGACCAACTT
GAGGTGATAACAAACGGGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAA
GGAAACAGGATGTTTATTGCGTCGTTTTACAACCCTGGAAGCGATGCTGAGATCTTTCCG
GCGCAGTTTCTTGTGGACAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATG
AAACTTTATGCCGGAGTCAAGTTCCAGCCTGAGGAGCCACGGTTTGAGGCCATGAAAAAT
GCTGCAGCAACCAAGGATGCAAATCCGGCTGCCGCGGTGGAGACATTTTAATTGGAAGTG
GGGTATTCTATGAAGGCAAGAAAGATGAAAAATAACAAAGTGGGTTTGATGTGTGGGTAA
TAACGCAATAAGTATTGAAGTTAATGTTATTAGAAGCAAAAACTAAGTGACTAGTGATCA
CTGGTGTGGTTAAGTAAGTGTGGGGGTGTTTTTAAAACATATGAATATTG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DK54JQ 181 0 0
AATTGGAAGTGGGGTATTCTATGAAGGCAAGAAAGATGAAAAATAACAAAGTGGGTTTGA
TGTGTGGGTAATAACGCAATAAGTATTGAAGTTAATGTTATTAGAAGCAAAAACTAAGTG
ACTAGTGATCACTGGTGTGGTTAAGTAAGTGTGGGGGTGTTTTTAAAACATATGAATATT
G

QA 1 181 1 181
DS 



AS 2 8

CO CL762Contig1 808 6 11 U
GGATATAAAATCGCCATTCTCATTCAATTGGCCAAGAGAAAACAAAGATACGTACATATA
ACATTGCAAAAGAAAAACAGAGAGATACATATTTCATCAAAACCTAGTTTTGGCTACTAT
ATTTTCTTGGAAGAAAAGTTATTGAAAATCAAACAAAAACACAAAACATGAAATATAATG
TCTTCTTCACGCCTCTTCACTTGGCACTGGAGAGCTGGGAGCGGATGAGCTTGGCCGCAT
CAACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTACTTCCTCGTCTTCAGACCACAGT
CAGGGTTAACCCACAAGACGTTCTTCTCAAGAACCGCAAGCATCTTGTTGACCCTGTCTG
CAATCTCATCCGCGGATGGGATTCTCGGCGAGTGGATGTCGTAAACACCAGGACCAATAA
CTGCACCGTACTTCACTCCGTCACGGAACACAGAGAGAAGCTTCTCATCTGAACGAGAGT
TCTCAATGGTGATAACATCAGCGTCCATGTCAATGATGGAGTGGATGATGTCATTAAAGT
GTGAGTAGCACATGTGAGTGTGGATCTGAGTACTGTCTTGAACACCACAGTTAGTGATTC
TGAAAGAATGAACAGCCCAGTCCAAGTAGAAAGAGTGTTCTGCTTTCCTAAGAGGCAACC
CTTCTCTAAGCGCAGCTTCATCGATCTGAATCACTCCAATACCGCCTTTCTCTAGGTCTT
CCACTTCATCTTTGATAGCCAAAGCAATCTGGTAGCACGTCTCGTGCCTAGGCTGGTCAT
TTCTGACAAAAGACCAGTTCAGAATCGC


BQ
10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C379JQ U 1
AF RR4C379TF C 1
AF RR4AW79JQ U 1
AF RR4CK80JQ U 1
AF RR4GI93JQ U 1
AF RR4GI93TF C 39
BS 1 214 RR4AW79JQ
BS 215 215 RR4C379JQ
BS 216 320 RR4AW79JQ
BS 321 321 RR4C379JQ
BS 322 419 RR4AW79JQ
BS 420 420 RR4GI93JQ
BS 421 545 RR4AW79JQ
BS 546 546 RR4CK80JQ
BS 547 561 RR4AW79JQ
BS 562 705 RR4CK80JQ
BS 706 808 RR4GI93TF

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ATTGCAAAAGAAAAACAGAGAGATACATATTTCATCAAAACCTAGTTTTGGCTACTATAC
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ACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTACTTCCTCGTCTTCAGACCACAGTCA
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QA 3 328 3 328
DS 

RD RR4C379TF 328 0 0
GA
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ATTGCAAAAGAAAAACAGAGAGATACATATTTCATCAAAACCTAGTTTTGGCTACTATAC
TTTCTTGGAAGAAAAGTTATTGAAAATCAAACAAAAACACAAAACATGAAATATAATGTC
TTCTTCACGCCTCTTCACTTGGCGCTGGAGAGCTGGGAGCGGATGAGCTTGGCCGCATCA
ACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTACTTCCTCGTCTTCAGACCACAGTCA
GGGTTAACCCACAAGACGTTCTTCTC

QA 3 328 3 328
DS 

RD RR4AW79JQ 561 0 0
GGATATAAAATCGCCATTCTCATTCAATTGGCCAAGAGAAAACAAAGATACGTACATATA
ACATTGCAAAAGAAAAACAGAGAGATACATATTTCATCAAAACCTAGTTTTGGCTACTAT
ATTTTCTTGGAAGAAAAGTTATTGAAAATCAAACAAAAACACAAAACATGAAATATAATG
TCTTCTTCACGCCTCTTCACTTGGCACTGGAGAGTTGGGAGCGGATGAGCTTGGCCGCAT
CAACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTACTTCCTCGTCTTCAGACCACAGT
CAGGGTTAACCCACAAGACGCTCTTCTCAAGAACCGCAAGCATCTTGTTGACCCTGTCTG
CAATCTCATCCGCGGATGGGATTCTCGGCGAGTGGATGTCGTAAACACCAGGACCAATAC
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TCTCAATGGTGATAACATCAGCGTCCATGTCAATGATGGAGTGGATGATGTCATTAAAGT
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QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4CK80JQ 711 0 0
GG
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ATTGCAAAAGAAAAACAGAGAGATACATATTTCATCAAAACCTAGTTTTGGCTACTATAT
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TTCTTCACGCCTCTTCACTTGGCACTGGAGAGCTGGGAGCGGATGAGCTTGGCCGCATCG
ACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTACTTCCTCGTCTTCAGACCACAGTCA
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TCAATGGTGATAACATCAGCGTCCATGTCAATGATGGAGTGGATGATGTCATTAAAGTGT
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TCTCTAAGCGCAGCTTCATCGATCTGAATCACTCCAATACCGC
CTTTCT

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR4GI93JQ 711 0 0
GG
ATATAAAATCGCCATTCTCATTCAATTGGCCAAGAGAAAACAAAGATACGTACATATAAC
ATTGCAAAAGAAAAACAGAGAGATACATATTTCATCAAAACCTAGTTTTGGCTACTATAT
TTTCTTGGAAGAAAAGTTATTGAAAATCAAACAAAAACACAAAACATGAAATATAATGTC
TTCTTCACGCCTCTTCACTTGGCACTGGAGAGCTGGGAGCGGATGAGCTTGGCCGCATCA
ACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTACTTCCTCGTCTTCAGACCACAGTCA
GGGTTAACCCACAAGACGTTCTTCTCAAGAACCGCAAGCATCTTGTTGACCCTGTCTGCA
ATCTCATCCGCGGATGGGATTCTCGGCGAGTGGATGTCGTAAACACCAGGACCAATAACT
GCACCGTACTTCACTCCGTCACGGAACACAGAGAGAAGCTTCTCATCTGAACGAGAGTTC
TCAATGGTGATAACATCAGCGTCCATGTCAATGATGGAGTGGATGATGTCATTAAAGTGT
GAGTAGCACATGTGAGTGTGGATCTGAGTACTGTCTTGAACACCACAGTTAGTGATTCTG
AAAGAATGAACAGCCCAGTCCAAGTAGAAAGAGTGTTCTGCTTTCCTAAGAGGCAACCCT
TCTCTAAGCGCAGCTTCATCGATCTGAATCACTCCAATACCGC
CTTTCT

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR4GI93TF 770 0 0
AAAACAAAGATACGTACATATAACAT*GCAAAAGAAAA*CAGAGAGATACATATTTCATC
AAAAC*TAGTTTTGGCTACTATATTTTCTTGGAAGAAAAGTTATTGAAAATCAAACAAAA
ACACAAAACATGAAATATAATGTCTTCTTCACGCCTCTTCACTTGGCACTGGAGAGCTGG
GAGCGGATGAGCTTGGCCGCATCAACCATGTTCTTAAGTGCTGGCTTAACCTCAGTGTAC
TTCCTCGTCTTCAGACCACAGTCAGGGTTAACCCACAAGACGTTCTTCTCAAGAACCGCA
AGCATCTTGTTGACCCTGTCTGCAATCTCATCCGCGGATGGGATTCTCGGCGAGTGGATG
TCGTAAACACCAGGACCAATAACTGCACCGTACTTCACTCCGTCACGGAACACAGAGAGA
AGCTTCTCATCTGAACGAGAGTTCTCAATGGTGATAACATCAGCGTCCATGTCAATGATG
GAGTGGATGATGTCATTAAAGTGTGAGTAGCACATGTGAGTGTGGATCTGAGTACTGTCT
TGAACACCACAGTTAGTGATTCTGAAAGAATGAACAGCCCAGTCCAAGTAGAAAGAGTGT
TCTGCTTTCCTAAGAGGCAACCCTTCTCTAAGCGCAGCTTCATCGATCTGAATCACTCCA
ATACCGCCTTTCTCTAGGTCTTCCACTTCATCTTTGATAGCCAAAGCAATCTGGTAGCAC
GTCTCGTGCCTAGGCTGGTCATTTCTGACAAAAGACCAGTTCAGAATCGC

QA 1 770 1 770
DS 



CO CL762Contig2 882 2 5 U
GCTTATTAACAAGACTAAGCTGGATGCTGAAATCAAGTCTTGGCTGGCATTCGCTGCTCA
GAAGGTTGTTGAAGTTGATGCATTGGCCAAGGCTTTGGCTGGTCAGACTAATCAGAGCTT
CTTCTCTGCCAACGCAGAGGCTTTGTCTTCAAGGAGGTCTTCTCCAAGAGTCACCAACCA
GTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGATTTGAAGGGATCAGACCATCGCCGTGCTACTGAAGT
TACCGCAAGACTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCCTCCCAACCACAAC
CATTGGTTCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGGGTTCGCCGTGAGTACAAGGCCAA
GAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAGGTTGTTGA
CATCCAAGAGGATCTTGATATCGATGTTCTTGTCCATGGAGAGCCTGAGAGAAACGACAT
GGTTGAGTACTTTGGAGAGCAGTTGTCAGGTTTTGCATTCACAGCAAATGGATGGGTGCA
ATCCTACGGATCTCGTTGTGTGAAGCCACCGATCATCTACGGTGACGTGAGCCGTCCCAA
GCCAATGACAGTCTTCTGGTCTTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAACGTCCCATGAAAGG
TATGCTTACAGGACCAGTCACGATTCTGAACTGGTCTTTTGTCAGAAACGACCAGCCTAG
GCACGAGACGTGCTACCAGATCGCTTTGGCTATCAAAGATGAAGTGGAAGACCTAGAGAA
AGCGGTATTGGAGTGATTCAGATCGATGAAGCTGCGCTTAGAGAAGGGTTGCCTCTTAGA
AAGCAGACACTCTTTCTACTCGGACTGGGCTGTTCATTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK80TF U 540
AF RR4AW79TF U 1
BS 1 588 RR4AW79TF
BS 589 589 RR4CK80TF
BS 590 720 RR4AW79TF
BS 721 721 RR4CK80TF
BS 722 882 RR4AW79TF

RD RR4CK80TF 206 0 0
AATCCTACGGATCTCGTTGTGTGAAGCCACCGATCATCTACGGTGACGTGAGCCGTCCCA
AGCCAATGACAGTCTTCTGGTCTTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAACGTCCCATGAAAG
GTATGCTTACAGGACCAGTCACGATTCTGAACTGGTCTTTTGTCAGAAACGACCAGCCTA
GGCACGAGACGTGCTACCAGAT
CGCT

QA 1 202 1 202
DS 

RD RR4AW79TF 882 0 0
GCTTATTAACAAGACTAAGCTGGATGCTGAAATCAAGTCTTGGCTGGCATTCGCTGCTCA
GAAGGTTGTTGAAGTTGATGCATTGGCCAAGGCTTTGGCTGGTCAGACTAATCAGAGCTT
CTTCTCTGCCAACGCAGAGGCTTTGTCTTCAAGGAGGTCTTCTCCAAGAGTCACCAACCA
GTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGATTTGAAGGGATCAGACCATCGCCGTGCTACTGAAGT
TACCGCAAGACTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCCTCCCAACCACAAC
CATTGGTTCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGGGTTCGCCGTGAGTACAAGGCCAA
GAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAGGTTGTTGA
CATCCAAGAGGATCTTGATATCGATGTTCTTGTCCATGGAGAGCCTGAGAGAAACGACAT
GGTTGAGTACTTTGGAGAGCAGTTGTCAGGTTTTGCATTCACAGCAAATGGATGGGTGCA
ATCCTACGGATCTCGTTGTGTGAAGCCACCGATCATCTACGGTGACGTTAGCCGTCCCAA
GCCAATGACAGTCTTCTGGTCTTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAACGTCCCATGAAAGG
TATGCTTACAGGACCAGTCACGATTCTGAACTGGTCTTTTGTCAGAAACGACCAGCCTAG
*CACGAGACGTGCTACCAGATCGCTTTGGCTATCAAAGATGAAGTGGAAGACCTAGAGAA
AGCGGTATTGGAGTGATTCAGATCGATGAAGCTGCGCTTAGAGAAGGGTTGCCTCTTAGA
AAGCAGACACTCTTTCTACTCGGACTGGGCTGTTCATTCTTT

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 8

CO CL763Contig1 640 8 5 U
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATCAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATCTCTGGTCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTT
TGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAA
AGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTG
GATCTACGAATGATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACT
GTTATCTCTGTTGCTTTCCAACTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATG
ACTTTGTTTTTTTTTGTGTGGGGTTTTTTTTACTCGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G549JQ C 159
AF RR4DX86TF U 1
AF RR4DX86JQ C 18
AF RR4G549TF U 5
AF RR4GR03TF U 5
AF RR4CM57JQ C 11
AF RR4CM57TF U 11
AF RR4FC79TF U 354
BS 1 355 RR4DX86TF
BS 356 356 RR4G549TF
BS 357 591 RR4DX86TF
BS 592 596 RR4G549TF
BS 597 640 RR4CM57TF

RD RR4G549JQ 235 0 0
TCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTTT
TCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATTTTTGGTCCAGTCGTTGCAATGATTTGGGAGGGAA
AGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGGGGCAACCAACCCTGCAGTTTTTGAAC
CAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGG

QA 1 235 1 235
DS 

RD RR4DX86TF 593 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATCAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATCTCTGGTCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGG*ATTT
TGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAA
AGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTG
GATCTACGAATGATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACT
GTTATCTCTGTTGCTTTCCAACTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCT
CA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4DX86JQ 575 0 0
GTAACAGCATCAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATCAAGCCCG
ACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGGTTTCA
CTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTACCAAG
ATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGTCCAGTCG
TTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGGAGCAA
CCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGG*ATTTTGCAATTGACATTGGCA
GGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAAGAATGTGCGTTGTGGT
TCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTGGATCTACGAATGATTCT
ATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACTGTTATCTCTGTTGCTTT
CCAACTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCT
C

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4G549TF 592 0 0
GGATCGCC
GACGAGTAACAGCATCAAAAAAAA*GAATCGACAATGGAGTAAACTTTCATCATGATCAA
GCCCGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGG
TTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTA
CCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGTCC
AGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGG
AGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACAT
TGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAAGAATGTGCGTT
GTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTGGATCTACGAATG
ATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACTGTTATCTCTGTT
GCTTTCCAACTTT*CATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAA

QA 9 592 9 592
DS 

RD RR4GR03TF 588 0 0
GGATCGCC
GACGAGTAACAGCATCAAAAAAAA*GAATCGACAATGGAGTAAACTTTCATCATGATCAA
GCCCGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGG
TTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTA
CCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGTCC
AGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGG
AGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACAT
TGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAAGAATGTGCGTT
GTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTGGATCTACGAATG
ATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACTGTTATCTCTGTT
GCTTTCCAACTTT*CATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTT

QA 9 588 9 588
DS 

RD RR4CM57JQ 630 0 0
GG
GACGAGTAACAGCATCAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATCAA
GCCCGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGG
TTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTA
CCAAGATTTGTT***TAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGTCC
AGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGG
AGCAACCAACCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACAT
TGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAAGAATGTGCGTT
GTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTGGATTTACGAATG
ATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACTGTTATCTCTGTT
GCTTTCCAACTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACTTTGTTTTTT
TTTGTGTGGGGTTTTTTTTACTCGTCTT

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR4CM57TF 630 0 0
GG
GACGAGTAACAGCATCAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATCAA
GCCCGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGG
TTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTA
CCAAGATTTGTC***TAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGTCC
AGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGG
AGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACAT
TGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAAGAATGTGCGTT
GTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCACTCTTGGATCTACGAATG
ATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGTTATTACTGTTATCTCTGTT
GCTTTCCAACTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACTTTGTTTTTT
TTTGTGTGGGGTTTTTTTTACTCGTCTT

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR4FC79TF 257 0 0
GGGATTTTGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGTAGTGACTCTGTTGATAGCG
CTAACAAAGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTC
ACTCTTGGATCTACGAATGATTCTATCGTTTTTGTGATTCAAATCATGTTTCTCCACTGT
TATTACTGTTATCTCTGTTGCTTTCCAACTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTA
AAACATGACTTTGTTTT

QA 1 257 1 257
DS 



AS 1 8

CO CL764Contig1 988 8 21 U
GGCTTCCCCAAACCCTAGACAATCGATTCGGATTCTGAGCTCTGATACCACGAAAATGTT
GGAGCTACGTCTTGTTCAGGGCTCTCTGCTGAAGAAGGTTCTAGAATCGATCAAGGATCT
CGTCAACGACGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTC
CAGCCACGTGGCGCTCGTCTCCCTCCTGCTAAGATCCGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTG
CGACAGAAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCTAAGATGCTCAAATGCGC
CGGAAACGATGACATCATCACTATCAAAGCTGACGACGGCGGTGACACCGTCACCTTCAT
GTTCGAGAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGA
CAGTGAGCATCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTGTGAGGATGCCTTCCAA
TGAGTTCTCAAGGATTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGT
GACTAAAGAAGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTT
AAGACAGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCTATTGTGATAGAGATGAAGGAACC
AGTGTCACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCATTCACAAAGGCAACTCCATTGTC
AGACACGGTGACTATCAGCTTATCGTCTGAGCTCCCAGTTGTGGTGGAGTATAAGGTGGC
TGAGATGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCAAAGATTGAAGAAGATGAAGAAGACAC
CAAGGCCTAAGACCCCTTTGTATCCAGAACTTCTTCTGTCCGTCCTAAAATGTCCAAAGA
TTCATGATGTTTTTGTGTGATTCCATTAAATTACCCTTTAGAATCAGTTGTTTTGTTTGA
CTTGGTATGTTCTAATGACATGTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 0 25 25 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FH91TF U 1
AF RR4AM72TF U 8
AF RR4F841JQ C 315
AF RR4F841TF U 46
AF RR4FP54TF U 35
AF RR4FP54JQ C 305
AF RR4AM72JQ C 285
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GGAGCTACGTCTTGTTCAGGGCTCTCTGCTGAAGAAGGTTCTAGAATCGATCAGGGATCT
CGTCAACGACGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTC
GAGCCACGTGGCGCTCGTCTCCCTCTTGCTGAGATCCGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTG
CGACAGAAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCTAAGATGCTCAAATGCGC
CGGAAACGATGACATCATCACTATCAAAGCTGACGACGGCGGTGACACCGTCACCTTCAT
GTTCGAGAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGA
CAGTGAGCATCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTGTGAGGATGCTTTCCAA
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GACTAAAGAAGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTT
AAGACAGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCTATTGTGATAGAGATGAAGGAACC
AGTGTCACTCTCGTTTGCCC

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DS 

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GG
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TCTTGTTCAGGGCTCTCTGCTGAAGAAGGTTCTAGAATCGATCAAGGATCTCGTCAACGA
CGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCACGT
GGCGCTCGTCTCTCTCCTTCTAAGATCCGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGAAA
CCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCTAAGATGCTCAAATGCGCCGGAAACGA
TGACATCATCACTATCAAAGCTTACGACGGCGGTGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAG
TCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCA
TCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTGTGAGGATGCCTTCCAATGAGTTCTC
AAGGATTTGCAAAGATCTCTGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGA
AGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGATAGCTAACATTGTGTTAAGACAGAA
CACAACTGTTGACAAGTCGGAAGATGCTATTGTGATAGAGATGAAGGAACCAGTGTCACT
CTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCATTCACAAAGGCAACTCCATTGTCAGACACGGT
GACTATCAGCTTATCGTCTGAGCTC

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DS 

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AGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATCTGG
GTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTGTGAGGATGCTTTCCAATGAGTTCTCAAGGA
TTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGG
TTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTTAAGACAGAACACAA
CTGTTGACAAGCCGGAAGATGCTATTGTGATAGAGATGAAGGAACCAGTGTCACTTTCGT
TTGCCCTGAGGTACATGAATTCATTCACAAAGGCAACTCCATTGTCAGACACGGTGACTA
TCAGCT

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DS 

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TACT
ACGAAAATGTTGGAGCTACGTCTTGTTCAGGGCTCTCTGCTGAAGAAGGTTCTAGAATCG
ATCAGGGATCTCGTCAACGACGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAA
GCCATGGACTCGAGCCACGTGGCGCTCGTCTCCCTCTTGCTGAGATCCGAAGGCTTCGAG
CACTACAGGTGCGACAGAAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCTAAGATG
CTCAAATGCGCCGGAAACGATGACATCATCACTATCAAAGCTGACGACGGCGGTGACACC
GTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTG
ATGGATATAGACAGTGAGCATCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTGTGAGG
ATGCTTTCCAATGAGTTCTCAAGGATTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTT
GTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCT
AACATTGTGTTAAGACAGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCTATTGTGATAGAG
ATGAAGG*ACCAGTGTCACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCATTCACAAAGGCA
*CTCCAT*GTCAGACACG*TGACTATCAGCTTATCGTCTGAG

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DS 

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GG
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GGTTCTAGAATCGATCAAGGATCTCGTCAACGACGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGG
CTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCACGTGGCGCTCGTCTCTCTCCTTCTAATATC
CGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGAAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAA
CATGTCTAAGATGCTCAAATGCGCCGGAAACGATGACATCATCACTATCAAAGCTGACGA
CGGCGGTGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTT
TGAAATGAAGCTGATGGATATAGGCAGTGAGCATCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGA
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TGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGA
CATTGGGACAGCTAACATTGTGTTAAGACAGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGC
TATTGTGATAGAGATGAAGGGACCAGTGTCACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTC
ATTCACAAAGGCAACTCCATTGTCAGACACGGTGACTATCAGCTTATCGTCTGAGCTCCC
AGTTGTGGTGGAGTATAAG*TGGCTGAGATGGGTTACATTCGTTACTACTTG

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DS 

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GAGAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGGCAGT
GAGCATCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTGTGAGGATGCCTTCCAATGAG
TTCTCAAGGATTTGCAAAGATCTCTGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACT
AAAGAAGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTTAAGA
CAGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCTATTGTGATAGAGATGAAGGGACCAGTG
TCACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCATTCACAAAGGCAACTCCATTGTCAGAC
ACGGTGACTATCAGCTTATCGTCTGAGCTCCCAGTTGTGGTGGAGTATAAGGTGGCTGAG
ATGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCAAAGATTGAAGAAGATGAAGAAGACACCAAG
GCCTAAGACCCCTTTGTATCCAGAACTTCTTCTGTCCGTCCTAAAATGTCCAAAGATTCA
TGATGTTTTTGTGTGATTCCATTAAATTACCCTTTAGAATC

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DS 

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AGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATCTGGGTATACCTGATGCTGAATACGAGTCCATTG
TGAGGATGCCTTCCAATGAGTTCTCAAGGATTTGCAAAGATCTCTGTAGCATTGGTGACA
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AAGATGAAGAAGACACCAAGGCCTAAGACCCCTTTGTATCCAGAACTTCTTCTGTCCGTC
CTAAAATGTCCAAAGATTCATGATGTTTTTGTGTGATTCCATTAAATTACCCTTTAGAAT
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DS 

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AATGAGTTCTCAAGGATTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCT
GTGACTAAAGAAGGGGTTAAGTTCTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTG
TTAAGACAGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCTATTGTGATAGAGATGAAGGAA
CCAGTGTCACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCATTCACAAAGGCAACTCCATTG
TCAGACACGGTGACTATCAGCTTATCGTCTGAGCTCCCAGTTGTGGTGGAGTATAAGGTG
GCTGAGATGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCAAAGATTGAAGAAGATGAAGAAGAC
ACCAAGGCCTAAGACCCCTTTGTATCCAGAACTTCTTCTGTCCGTCCTAAAATGTCCAAA
GATTCATGATGTTTTTGTGTGATTCCATTAAATTACCCTTTAGAATCAGTTGTTTTGTTT
GACTTGGTATGTTCTAATGACATGTTTGGC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 8

CO CL765Contig1 1385 8 12 U
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AGAAAGAAAAAAAGCATTACAAATAAAAACAAAATCTTCAGGTACTAATTAAAAGAAAGA
GAAAAACACACAGCCGTACGGGGAAGAATCCATCGGTACCATACCGGAAACTATAAACCG
GTTAAGGAATGATAACAGTTTGGTCTTTACATATACTTAAAACGCCTCCCTCACTCCACT
CCATATAGTAAACAGATTCAACCAACTATAAAAATTGCTCAAGAGAGAAACGAAAGTTAC
CTTGTGCGCCACCATCCAAGGCCTCAGCTACTACCCTTCTGTTTGAGGGTGATCTTGTCC
CCAAGACTTAGAGCAATCCCTTGCGTCTTGCTCCTTATCCTTATGTACCCACTCAATACT
CCATCAGTTTGCTTCTCGATACTCACGTTCACAAGAGCATCCTCACCAAACACACTCTTT
GCATATAGGTTTGCTGCAAGGAACCCGCATTCTCCTT*CTATTGCAGATGGGGCAGTGAG
ACACTTCATGTTTGTGGATTTGATAATGTGATCGAGGAACTCTCTCTCGTTCTGAATCGT
GGTGTTCACAGCAACCTTGTTCTCCCATTCAAACTCTGCCCACATGGTTCTGAAAGCAAC
CTCTGAGCAAACAGCAGGGGAGATATAGTCCATGATATCAATGTGTATGTCGTTGAGAAC
CACGACGTTTCGCTCCATTACGTTTGATGTCTCATAGACGATGTTTCCGAATATGACTCC
GGTCTCTGTGGACGAGACCTTTATGTTTGCTTTTATCTGCATGCTCGTTCCCGGTGCCAG
ACTATAGTTTTGAGGACGCTCAACAAGCTTGAGATCACCCATGGTTGCTAACTCCAAGCA
CATATTCTGAAGGGTTTCCTTTGTACGGTTGATAACGGTAACTTCGAGTGCAATGTCATA
GTGATGGACCGTCACGTATGCTTCAGCATAGACCGGATCACTGAATCCTGTGAGTTGAAG
AATGCGGTTGAGTTTGTTGGCATCGTTCTCGTCCTTGGTGAATTCTCCAGTTGCACGCTT
TAGGTCATCTTGTACCTGGTCTTCCAACTCAAGTTGACTCATTCCCTTCCGGCTCTTTAG
ATGGAAGAAGTCAATGAGATCATCAGGCTGAGCATTAGTTGTTTGGGTCTTTGCCTTAAG
TTCGGCCATCTCGGTCAGCTGTTTTTCAGAAATCATCTTGACAAAACTCTGGCGGCAGGA
TTCCAGCCATATCTTTTTCATCTCATCATTCCTATGGCAAAGCAATTTTATGCACAAGAC
AATCCTCTCGTACGAATCATTATCAATAGGGTGTGGAGAAGCAGGAGATTGACCAAATTG
CAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FS38JQ U 1
AF RR4GB02JQ U 1
AF RR4EN21JQ U 42
AF RR4EM82JQ U 139
AF RR4GB02TF C 406
AF RR4EN21TF C 445
AF RR4FS38TF C 526
AF RR4EM82TF C 607
BS 1 229 RR4FS38JQ
BS 230 230 RR4EN21JQ
BS 231 434 RR4FS38JQ
BS 435 503 RR4GB02JQ
BS 504 504 RR4EN21JQ
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BS 634 634 RR4EN21JQ
BS 635 651 RR4GB02JQ
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BS 794 875 RR4EM82JQ
BS 876 1138 RR4GB02TF
BS 1139 1385 RR4EM82TF

RD RR4FS38JQ 434 0 0
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AGAAAGAAAAAAAGCATTACAAATAAAAACAAAATCTTCAGGTACTAATTAAAAGAAAGA
GAAAAACACACAGCCGTACGGGGAAGAATCCATCGGTACCATACCGGAAACTATAAACCG
GTTAAGGAATGATAACAGTTTGGTCTTTACATATACTTAAAACGCCTCCTTCACTCCACT
CCATATAGTAAACAGATTCAACCAACTATAAAAATTGCTCAAGAGAGAAACGAAAGTTAC
CTTGTGCGCCACCATCCAAGGCCTCAGCTACTACCCTTCTGTTTGAGGGTGATCTTGTCC
CCAAGACTTAGAGCAATCCCTTGCGTCTTGCTCCTTATCCTTATGTACCCACTCAATACT
CCATCAGTTTGCTT

QA 1 434 1 434
DS 

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AGAAAGAAAAAAAGCATTACAAATAAAAACAAAATCTTCAGGTACTAATTAAAAGAAAGA
GAAAAACACACAGCCGTACGGGGAAGAATCCATCGGTACCATACCGGAAACTATAAACCG
GTTAAGGAATGATAACAGTTTGGTCTTTACATATACTTAAAACGCCTCCTTCACTCCACT
CCATATAGTAAACAGATTCAACCAACTATAAAAATTGCTCAAGAGAGAAACGAAAGTTAC
CTTGTGCGCCACCATCCAAGGCCTCAGCTACTACCCTTCTGTTTGAGGGTGATCTTGTCC
CCAAGACTTAGAGCAATCCCTTGCGTCTTGCTCCTTATCCTTATGTACCCACTCAATACT
CCATCAGTTTGCTTCTCGATACTCACGTTCACAAGAGCATCCTCACCAAACACACTCTTT
GCATATAGGTTTGCTGCAAGGAAACCGCATTCTCCTT*CTATTGCAGATGGGGCAGTGAG
ACACTTCATGTTTGTGGATTTGATAATGTGATCGAGGAACTCTCTCTCGTTCTGAATCGT
GGTGTTCACAGCAACCTTGTTCTCCCATTCAAATTCTGCCCACATGGTTCT

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DS 

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GTACTAATTAAAAGAAAGAGAAAAACACACAGCCGTACGGGGAAGAATCCATCGGTACCA
TACCGGAAACTATAAACCGGTTAAGGAATGATAACAGTTTGGTCTTTACATATACTTAAA
ACGCCTCCCTCACTCCACTCCATATAGTAAACAGATTCAACCAACTATAAAAATTGCTCA
AGAGAGAAACGAAAGTTACCTTGTGCGCCACCATCCAAGGCCTCAGCTACTACCCTTCTG
TTTGAGGGTGATCTTGTCCCCAAGACTTAGAGCAATCCCTTGCGTCTTGCTCCTTATCCT
TATGTACCCACTCAATACTCCATCAGTTTGCTTCTCGATACTCACGTTCACAAGAGCATC
CTCACCAAACACACTCTTTGCATATAGGTTTGCTGCAAGGAACCCGCATTCCCCTT*CTA
TTGCAGATGGGGCAGTGAGACACCTCATGTTTGTGGATTTGATAATGTGGTCGAGGAACT
CTCTCTCGTTCTGAATCGTGGTGTTCACAGCAACCTTGTTCTCCCATTCAAACTCTGCCC
ACATGGTTCTGAAAGCAACCTCTGAGCAAACAGCAGGGGAGATATAGTCCATGATATCAA
TGTGTATGTCGTTGAGAACCACGACGTTTCGCTCCATTACGTTTGATGTCTCATAGACGA
TGTTTCCGAATATGACTCCGGTCTCTGTGGAC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4EM82JQ 737 0 0
G
GGGGAAGAATCCATCGGTACCATACCGGAAACTATAAACCGGTTAAGGAATGATAACAGT
TTGGTCTTTACATATACTTAAAACGCCTCCCTCACTCCACTCCATATAGTAAACAGATTC
AACCAACTATAAAAATTGCTCAAGAAAGAAAAGAAAGTTACCTTGTGCGCCACCATCCAA
GGCCTCAGCTACTACCCTTCTGTTTGAGGGTGATCTTGTCCCCAAGACTTAAAGCAATCC
CTTGCGTCTTGCTCCTTATCCTTATGTACCCACTCAATACTCCATCAGTTTGCTTCTCGA
TACTCACGTTCACAAGAGCATCCTCACCAAACACACTCTTTGCATATAGGTTTGCTGCAA
GGAACCCGCATTCTCCTT*CTATTGCAGATGGGGCAGTGAGACACTTCATGTTTGTGGAT
TTGATAATGTGGTCGAGGAACTCTCTCTCGTTCTGAATCGTGGTGTTCACAGCAACCTTG
TTCTCCCATTCAAACTCTGCCCACATGGTTCTGAAAGCAACCTCTGAGCAAACAGCAGGG
GAGATATAGTCCATGATATCAATGTGTATGTCGTTGAGAACCACGACGTTTCGCTCCATT
ACGTTTGATGTCTCATAGACGATGTTTCCGAATATGACTCCGGTCTCTGTGGACGAGACC
TTTATGTTTGCTTTTATCTGCATGCTCGTTCCCGGTGCCAGACTATAGTTTTGAGGACGC
TCAACAAGCTTGAGAT

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR4GB02TF 734 0 0
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CCAAACACACTCTTTGCATATAGGTTTGCTGCAAGGAAACCGCATTCTCCTT*CTATTGC
AGATGGGGCAGTGAGACACTTCATGTTTGTGGATTTGATAATGTGATCGAGGAACTCTCT
CTCGTTCTGAATCGTGGTGTTCACAGCAACCTTGTTCTCCCATTCAAATTCTGCCCACAT
GGTTCTGAAAGCAACCTCTGAGCAAACAGCAGGGGAGATATAGTCCATGATATCAATGTG
TATGTCGTTGAGAACCACGACGTTTCGCTCCATTACGTTTGACGTCTCATAGACGATGTT
CCCGAATATGACTCCGGTCTCTGTGGACGAGACCTTTATGTTTGCTTTTATCTGCATGCT
CGTTCCCGGTGCCAGACTATAGTTTTGAGGACGCTCAACAAGCTTGAGATCACCCATGGT
TGCTAACTCCAAGCACATATTCTGAAGGGTTTCCTTTGTACGGTTGATAACGGTAACTTC
GAGTGCAATGTCATAGTGATGGACCGTCACGTATGCTTCAGCATAGACCGGATCACTGAA
TCCTGTGAGTTGAAGAATGCGGTTGAGTTTGTTGGCATCGTTCTCGTCCTTGGTGAATTC
TCCAGTTGCACGCTTTAGGTCATCTTGTACCTGGTCTTCCAACTCAAGTTGACTCATTCC
CTTCCGGCTCTTT
C

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DS 

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ACGTTCACAAGAGCATCCTCACCAAACACACTCTTTGCATATAGGTTTGCTGCAAGGAAC
CCGCATTCCCCTTTCTATTGCAGATGGGGCAGTGAGACACCTCATGTTTGTGGATTTGAT
AATGTGGTCGAGGAACTCTCTCTCGTTCTGAATCGTGGTGTTCACAGCAACCTTGTTCTC
CCATTCAAACTCTGCCCACATGGTTCTGAAAGCAACCTCTGAGCAAACAGCAGGGGAGAT
ATAGTCCATGATATCAATGTGTATGTCGTTGAGAACCACGACGTTTCGCTCCATTACGTT
TGATGTCTCATAGACGATGTTTCCGAATATGACTCCGGTCTCTGTGGACGAGACCTTTAT
GTTTGCTTTTATCTGCATGCTCGTTCCCGGTGCCAGACTATAGTTTTGAGGACGCTCAAC
AAGCTTGAGATCACCCATGGTTGCTAACTCCAAGCACATATTCTGAAGGGTTTCCTTTGT
ACGGTTGATAACGGTAACTTCGAGTGCAATGTCATAGTGATGGACCGTCACGTATGCTTC
AGCATAGACCGGATCACTGAATCCTGTGAGTTGAAGAATGCGGTTGAGTTTGTTGGCATC
GTTCTCGTCCTTGGTGAATTCTCCAGTTGCACGCTTTAGGTC
C

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DS 

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AGATGGGGCAGTGAGACACTTCATGTTTGTGGATTTGATAATGTGATCGAGGAACTCTCT
CTCGTTCTGAATCGTGGTGTTCACAGCAACCTTGTTCTCCCATTCAAATTCTGCCCACAT
GGTTCTGAAAGCAACCTCTGAGCAAACAGCAGGGGAGATATAGTCCATGATATCAATGTG
TATGTCGTTGAGAACCACGACGTTTCGCTCCATTACGTTTGACGTCTCATAGACGATGTT
CCCGAATATGACTCCGGTCTCTGTGGACGAGACCTTTATGTTTGCTTTTATCTGCATGCT
CGTTCCCGGTGCCAGACTATAGTTTTGAGGACGCTCAACAAGCTTGAGATCACCCATGGT
TGCTAACTCCAAGCACATATTCTGAAGGGTTTCCTTTGTACGGTTGATAACGGTAACTTC
GAGTGCAATGTCATAGTGATGGACCGTCACGTATGCTTCAGCATAGACCGGATCACTGAA
TCCTGTGAGTTGAAGAATGCGGTTGAGTTTGTTGGCATCGTTCTCGTCCTTGGTGAATTC
TCCAGTTGCACGCTTTAGGTCATCTTGTACCTGGTCTTCCAACTCAAGTTGACTCATTCC
CTTCCGGCTCTTT
C

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DS 

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TCACAGC
ACCTTGTTCTCCCATTCAAACTCTGCCCACATGGTTCTGAAAGCAAC*TCTGAGCAAACA
GCAGGGGAGATATAGTCCATGATATCAATGTGTATGTCGTTGAGAACCACGACGTTTCGC
TCCATTACGTTTGATGTCTCATAGACGATGTTTCCGAATATGACTCCGGTCTCTGTGGAC
GAGACCTTTATGTTTGCTTTTATCTGCATGCTCGTTCCCGGTGCCAGACTATAGTTTTGA
GGACGCTCAACAAGCTTGAGATCACCCATGGTTGCTAACTCCAAGCACATATTCTGAAGG
GTTTCCTTTGTACGGTTGATAACGGTAACTTCGAGTGCAATGTCATAGTGATGGACCGTC
ACGTATGCTTCAGCATAGACCGGATCACTGAATCCTGTGAGTTGAAGAATGCGGTTGAGT
TTGTTGGCATCGTTCTCGTCCTTGGTGAATTCTCCAGTTGCACGCTTTAGGTCATCTTGT
ACCTGGTCTTCCAACTCAAGTTGACTCATTCCCTTCCGGCTCTTTAGATGGAAGAAGTCA
ATGAGATCATCAGGCTGAGCATTAGTTGTTTGGGTCTTTGCCTTAAGTTCGGCCATCTCG
GTCAGCTGTTTTTCAGAAATCATCTTGACAAAACTCTGGCGGCAGGATTCCAGCCATATC
TTTTTCATCTCATCATTCCTATGGCAAAGCAATTTTATGCACAAGACAATCCTCTCGTAC
GAATCATTATCAATAGGGTGTGGAGAAGCAGGAGATTGACCAAATTGCAGCC

QA 8 779 8 779
DS 



AS 1 7

CO CL766Contig1 856 7 5 U
GCATATGCAACATGGTTTAACTTTCTCAACACTTACCTTAGTTCAACTTTTGCGACATTA
TTTTTGAACCAACAAATAATTTATAACATGACGAAAACCTGATATTCGTATCATACCTAA
GATAACAAAAGTTCAAAAGATGCAAACTTAAGATTTTCAAGAGACATACTCCCAATGGTG
TTTTTGTTCAGACTTGAGGAACAAGAACCCTAATCTGATCTGGTTGGAAAAGGATAAGGC
CAAACATGCAAGATTGGTTTTACATGAAAAGGTTGGGCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCT
TGAGCTTCCTGGTTGGTGGCCTGACCTTCCTGAAAACAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGT
TGTGGAACTGCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCACAGACTTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGA
TGATCTGAATGCAAGGGAACCTCACTCTATGGCGAGAAGCCATCTCAGTGTACATCTGCT
CCACCGCACCATTGAGCGTGGTGTCACGGAACTCCTTGTACATGTTGTGGTACCCAGTTC
GGCTCTGGTAACGCAGCCAGATACCGTAGTTCTTGATCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAA
TCTCATTGATGGCAAGCATCTGTCCGTTGCTCTTCTTAACCTTCTTCAGCTTCCTCAGGA
AGTACCAGAACTTGGACTTGGCACGGACTTCATTAGTAGCCCATAGCTTCATCCTATAGA
TCTTAGGCTGCACATCTTTCTCCGTAGGGAGGGCTCTCCCAACCACTTGATACTGGTGAA
ACCGGAAAGCAACCATTTCAAGGGAGAGATCAAGCTCCAACGAAATGAGCTTGAAGGAAA
CAGAGAGGAGAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4C534JQ U 300
AF RR4GR24JQ U 14
AF RR4DW88JQ U 1
AF RR4HB93JQB U 67
AF RR4GR24TF C 257
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AF RR4HB93TF C 213
BS 1 722 RR4DW88JQ
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BS 744 840 RR4DW88TF
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BS 842 856 RR4DW88TF

RD RR4C534JQ 156 0 0
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TTGTGGAACTGCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCACAGCTTTGCAGGGACTGTGGCGGTCTTG
ATGATCTGAATGCAAGGGAACCTCACTCTATGGCGA

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR4GR24JQ 623 0 0
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AAATGATTTATAACATGACGAAAACCTGATATTCGTATCATACCTAAGATAACAAAAGTT
CAAAAGATGCAAACTTAAGATTTTCAAGAGACATACTCCCAATGGTGTTTTTGTTCAGAC
TTGAGGAACAAGAACCCTAATCTGATCTGGTTGGAAAAGGATAAGGCCAAACATGCAAGA
TTGGTTTTACATGAAAAGGTTGGGCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCTTGAGCTTCCTGGT
TGGTGGCCTGACCTTCCTGAAAACAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGTTGTGGAACTGCTT
GGTGCTCTCTCTCTTGCACAGACTTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGATGATCTGAATGCA
AGGGAACCTCACTCTATGGCGAGAAGCCATCTCAGTGTACATCTGCTCTACCGCACCATT
GAGCGTGGTGTCACGGAACTCCTTGTACATGTTGTGGTACCCAGTTCGGCTCTGGTAACG
CAGCCAGATACCGTAGTTCTTGATCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAATCTCATTGATGGC
AAGCATCTGTCCGTTGCTCTTCT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4DW88JQ 722 0 0
GCATATGCAACATGGTTTAACTTTCTCAACACTTACCTTAGTTCAACTTTTGCGACATTA
TTTTTGAACCAACAAATAATTTATAACATGACGAAAACCTGATATTCGTATCATACCTAA
GATAACAAAAGTTCAAAAGATGCAAACTTAAGATTTTCAAGAGACATACTCCCAATGGTG
TTTTTGTTCAGACTTGAGGAACAAGAACCCTAATCTGATCTGGTTGGAAAAGGATAAGGC
CAAACATGCAAGATTGGTTTTACATGAAAAGGTTGGGCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCT
TGAGCTTCCTGGTTGGTGGCCTGACCTTCCTGAAAACAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGT
TGTGGAACTGCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCACAGACTTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGA
TGATCTGAATGCAAGGGAACCTCACTCTATGGCGAGAAGCCATCTCAGTGTACATCTGCT
CCACCGCACCATTGAGCGTGGTGTCACGGAACTCCTTGTACATGTTGTGGTACCCAGTTC
GGCTCTGGTAACGCAGCCAGATACCGTAGTTCTTGATCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAA
TCTCATTGATGGCAAGCATCTGTCCGTTGCTCTTCTTAACCTTCTTCAGCTTCCTCAGGA
AGTACCAGAACTTGGACTTGGCACGGACTTCATTAGTAGCCCATAGCTTCATCCTATAGA
TC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4HB93JQB 677 0 0
AACCAACAAATAATTTATAAAATGACGAAAACCTGATATTCGTATCATACCTAAGATAAC
AAAAGTTCAAAAGATGCAAACTTAAGATTTTCAAGAGACATACTCCCAATGGTGTTTTTG
TTCAGACTTGAGGAACAAGAACCCTAATCTGATCTGGTTGGAAAAGGATAAGGCCAAACA
TGCAAGATTGGTTTTACATGAAAAGGTTGGGCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCTTGAGCT
TCCTGGTTGGTGGCCTGACCTTCCTGAAAACAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGTTGTGGA
ACTGCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCACATACTTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGATGATCT
GAATGCAAGGGGACCTCACTCTATGGCGAGAAGCCATCTCAGTGTACATCTGCTCCACCG
CACCATTGAGTGTGGTGTCACGGAACTCCTTGTACATGTTGTGGTACCCAGTTCGGCTCT
GGTAACGCAGCCAGATACCGTAGTTCTTGATCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAATCTCAT
TGATGGCAAGCATCTGTCCGTTGCTCTTCTTAACCTTCTTCAGCTTCCTCAGGAAGTACC
AGAACTTGGACTTGGCACGGACTTCATTAGTAGCTCATAGCTTCATCCTATAGATCTTAG
GCTGCACATCTTTCTCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GR24TF 578 0 0
GTTTTACATGAAAAGGTTGGGCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCTTGAGCTTCCTGGTTGG
TGGCCTGACCTTCCTGAAAACAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGTTGTGGAACTGCTTGGT
GCTCTCTCTCTTGCACAGACTTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGATGATCTGAATGCAAGG
GAACCTCACTCTATGGCGAGAAGCCATCTCAGTGTACATCTGCTCTACCGCACCATTGAG
CGTGGTGTCACGGAACTCCTTGTACATGTTGTGGTACCCAGTTCGGCTCTGGTAACGCAG
CCAGATACCGTAGTTCTTGATCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAATCTCATTGATGGCAAG
CATCTGTCCGTTGCTCTTCTTAACCTTCTTCAGCTTCCTCAGGAAGTACCAGAACATGGA
CTTGGCACGGACTTCATTAGTAGCCCATAGCTTCATCCTATAGATCTTAGGCTGCACATC
TTTCTCCGTAGGGAGGGCTCTCCCAACCACTTGATACTGGTGAAACCGGAAAGCAACCAT
TTCAAGGGAGAGATCAAGCTCCAACGAAATGAGCTT
CC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4DW88TF 700 0 0
TCAAGAGACATACTCCCAATGGTGTTTTG**TCAGACTTGAGGAACAAGAACCCTAATCT
GATCTGGTTGGAAAAGGATAAGGCCAAACATGCAAGATTGGTTTTACATGAAAAGGTTGG
GCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCTTGAGCTTCCTGGTTGGTGGCCTGACCTTCCTGAAAA
CAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGTTGTGGAACTGCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCACAGAC
TTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGATGATCTGAATGCAAGGGAACCTCACTCTATGGCGAG
AAGCCATCTCAGTGTACATCTGCTCCACCGCACCATTGAGCGTGGTGTCACGGAACTCCT
TGTACATGTTGTGGTACCCAGTTCGGCTCTGGTAACGCAGCCAGATACCGTAGTTCTTGA
TCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAATCTCATTGATGGCAAGCATCTGTCCGTTGCTCTTCT
TAACCTTCTTCAGCTTCCTCAGGAAGTACCAGAACTTGGACTTGGCACGGACTTCATTAG
TAGCCCATAGCTTCATCCTATAGATCTTAGGCTGCACATCTTTCTCCGTAGGGAGGGCTC
TCCCAACCACTTGATACTGGTGAAACCGGAAAGCAACCATTTCAAGGGAGAGATCAAGCT
CCAACGAAATGAGCTTGAAGGAAATAGAGAGGAGAGAAAA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4HB93TF 644 0 0
ATCTGATCTGGTTGGAAAAGGATAAGGCCAAACATGCAAGATTGGTTTTACATGAAAAGG
TTGGGCTTTGAGGCCTTGTATGTAGTCTTGAGCTTCCTGGTTGGTGGCCTGACCTTCCTG
AAAACAAGAGGGAACTTGATCTTGGAGTTGTGGAACTGCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCAC
ATACTTGCAGGGACTGTAGCGGTCTTGATGATCTGAATGCAAGGGGACCTCACTCTATGG
CGAGAAGCCATCTCAGTGTACATCTGCTCCACCGCACCATTGAGTGTGGTGTCACGGAAC
TCCTTGTACATGTTGTGGTACCCAGTTCGGCTCTGGTAACGCAGCCAGATACCGTAGTTC
TTGATCTTCGTGGGGTTCTTCTCGAAAATCTCATTGATGGCAAGCATCTGTCCGTTGCTC
TTCTTAACCTTCTTCAGCTTCCTCAGGAAGTACCAGAACTTGGACTTGGCACGGACTTCA
TTAGTAGCTCATAGCTTCATCCTATAGATCTTAGGCTGCACATCTTTCTCCGTAGGGAGG
GCTCTCCCAACCACTTGATACTGGTGAAACCGGAAAGCAACCATTTCAAGGGAGAGATCA
AGCTCCGACGAAATGAGCTTGAAGGAAACAGAGTGGAGAGAAA
G

QA 1 643 1 643
DS 



AS 2 7

CO CL767Contig1 890 4 2 U
GACTAGGTGCACAAACGAGGCTCTTGTTGCTTCTCAGAAGGAAACTAAGAGAGATTCCGA
AGAGATCCAAGTTGTACTGTCTTGGTTCGACACAATGGCTTCACTACTTGGTCTAGAAGA
TTCACCTTCCACTGATGCTCGCAGTCACCTAAACCTCTACATGGAGCCACTTGAGAAAAG
GATCGCATCTATACTATCTGAAACAGAAGAGTTACGGCTGGTCGGACAAAGCAAGGATTC
GCTGCTTGAAGCTGAGAGGAGTAGAGTGGCTGAGCTCAGACAGAGAGAAGCAACTCTTGA
GAAAATATTACATGACAAGGAATCCCAACCAAGAAGCTCGACTTCGGAGATCGTTGAAGT
GGAACCTCTGATAAATAAGCGGACGACGATTGGAGCATCGATCCCATCTCAAGTCCGGAG
TTTGCGTAAGGGAAACAACGATCAAGTAGCCATTAGTATAGATGCTGATCAACCTGATCA
AAGCCTGAGCTTAGAAGACGACGATGATAAAGCTCATGGATTTAGATCACTCACCACGTC
AAGAATCATTCCGAGATTTACAAGACCAGTGACAAACATGATCGATGGTTTATGGGTCTC
GTGTGACCGGACGCTTATGAGACAACCTGCATTACGGTTAGGCATAATGATATACTGGGC
GATACTGCATGCTCTTTTGGCTAGTTTCGTAGTCTAACGAAAAATTTTAATCTCTTAGTT
TCTCGCTATGGAACGGGCTCAAAGTGGTGTGCTGTTTTCACCTATATGCTTTGTTTTCTA
TACATTGTTTTGCTTTTTATTAACCAAGCAAACCGTGGTTTCGCCATTTTTATTGATCAG
AATCACAAACTGCTTGACTTTACATCCGAATAAGAAAAAAGGTTTTATGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EC82TF U 1
AF RR4FD19TF U 1
AF RR4EC82JQ C 153
AF RR4FD19JQ C 153
BS 1 696 RR4EC82TF
BS 697 890 RR4EC82JQ

RD RR4EC82TF 700 0 0
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AGAGATCCAAGTTGTACTGTCTTGGTTCGACACAATGGCTTCACTACTTGGTCTAGAAGA
TTCACCTTCCACTGATGCTCGCAGTCACCTAAACCTCTACATGGAGCCACTTGAGAAAAG
GATCGCATCTATACTATCTGAAACAGAAGAGTTACGGCTGGTCGGACAAAGCAAGGATTC
GCTGCTTGAAGCTGAGAGGAGTAGAGTGGCTGAGCTCAGACAGAGAGAAGCAACTCTTGA
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GGAACCTCTGATAAATAAGCGGACGACGATTGGAGCATCGATCCCATCTCAAGTCCGGAG
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AAGCCTGAGCTTAGAAGACGACGATGATAAAGCTCATGGATTTAGATCACTCACCACGTC
AAGAATCATTCCGAGATTTACAAGACCAGTGACAAACATGATCGATGGTTTATGGGTCTC
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ACGA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FD19TF 702 0 0
G
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TCACCTTCCACTGATGCTCGCAGTCACCTAAACCTCTACATGGAGCCACTTGAGAAAAGG
ATCGCATCTATACTATCTGAAACAGAAGAGTTACGGCTGGTCGGACAAAGCAAGGATTCG
CTGCTTGAAGCTGAGAGGAGTAGAGTGGCTGAGCTCAGACAGAGAGAAGCAACTCTTGAG
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GAACCTCTGATAAATAAGCGGACGACGATTGGAGCATCGATCCCATCTCAAGTCCGGAGT
TTGCGTAAGGGAAACAACGATCAAGTAGCCATTAGTATAGATGCTGATCAACCTGATCAA
AGCCTGAGCTTAGAAGACGACGATGATAAAGCTCATGGATTTAGATCACTCACCACGTCA
AGAATCATTCCGAGATTTACAAGACCAGTGACAAACATGATCGATGGTTTATGGGTCTCG
TGTGACCGGACGCTTATGAGACAACCTGCATTACG*TTAGGCATAATGATATACTGGGCG
ATACTGCATGCTCTTT*GGCTAGTTTCGTAGTCTA
CGAAAA

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR4EC82JQ 738 0 0
ACCTCTACATGGAGCCACTTGAGAAAAGGATCGCATCTATACTATCTGAAACAGAAGAGT
TACGGCTGGTCGGACAAAGCAAGGATTCGCTGCTTGAAGCTGAGAGGAGTAGAGTGGCTG
AGCTCAGACAGAGAGAAGCAACTCTTGAGAAAATATTACATGACAAGGAATCCCAACCAA
GAAGCTCGACTTCGGAGATCGTTGAAGTGGAACCTCTGATAAATAAGCGGACGACGATTG
GAGCATCGATCCCATCTCAAGTCCGGAGTTTGCGTAAGGGAAACAACGATCAAGTAGCCA
TTAGTATAGATGCTGATCAACCTGATCAAAGCCTGAGCTTAGAAGACGACGATGATAAAG
CTCATGGATTTAGATCACTCACCACGTCAAGAATCATTCCGAGATTTACAAGACCAGTGA
CAAACATGATCGATGGTTTATGGGTCTCGTGTGACCGGACGCTTATGAGACAACCTGCAT
TACGGTTAGGCATAATGATATACTGGGCGATACTGCATGCTCTTTTGGCTAGTTTCGTAG
TCTAACGAAAAATTTTAATCTCTTAGTTTCTCGCTATGGAACGGGCTCAAAGTGGTGTGC
TGTTTTCACCTATATGCTTTGTTTTCTATACATTGTTTTGCTTTTTATTAACCAAGCAAA
CCGTGGTTTCGCCATTTTTATTGATCAGAATCACAAACTGCTTGACTTTACATCCGAATA
AGAAAAAAGGTTTTATGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FD19JQ 738 0 0
ACCTCTACATGGAGCCACTTGAGAAAAGGATCGCATCTATACTATCTGAAACAGAAGAGT
TACGGCTGGTCGGACAAAGCAAGGATTCGCTGCTTGAAGCTGAGAGGAGTAGAGTGGCTG
AGCTCAGACAGAGAGAAGCAACTCTTGAGAAAATATTACATGACAAGGAATCCCAACCAA
GAAGCTCGACTTCGGAGATCGTTGAAGTGGAACCTCTGATAAATAAGCGGACGACGATTG
GAGCATCGATCCCATCTCAAGTCCGGAGTTTGCGTAAGGGAAACAACGATCAAGTAGCCA
TTAGTATAGATGCTGATCAACCTGATCAAAGCCTGAGCTTAGAAGACGACGATGATAAAG
CTCATGGATTTAGATCACTCACCACGTCAAGAATCATTCCGAGATTTACAAGACCAGTGA
CAAACATGATCGATGGTTTATGGGTCTCGTGTGACCGGACGCTTATGAGACAACCTGCAT
TACGGTTAGGCATAATGATATACTGGGCGATACTGCATGCTCTTTTGGCTAGTTTCGTAG
TCTAACGAAAAATTTTAATCTCTTAGTTTCTCGCTATGGAACGGGCTCAAAGTGGTGTGC
TGTTTTCACCTATATGCTTTGTTTTCTATACATTGTTTTGCTTTTTATTAACCAAGCAAA
CCGTGGTTTCGCCATTTTTATTGATCAGAATCACAAACTGCTTGACTTTACATCCGAATA
AGAAAAAAGGTTTTATGG

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL767Contig2 1121 3 4 U
GCTATCAATCACCGTGGATAAATTCGACGAGCTCCATCATCTCTCTGAAAATCTTCTTGC
TGAAATCGAGAAACTTCAAAAACAAGTGCAAGATCGGGATACGGAGGTTTCTTTCTTAAG
ACAAGAAGTCACTAGGTGCACCAATCAGGCTCTTGCTACTTCTCAAATGGAGACTAGAAG
AGATTCAGAAGAGATTCAAACTGTACTGTCTTGGTTCGACACAATGGCTTCACTACTTGG
TCTAGAAGATTCACCTTCCACTGATGCTAATAGACACTTAAACCGCTACAAGGAGACGCT
TGAGAAAAAGATTGCGTCTATACTATCTGAAACAGAAGAACTACGGCTGGTCGGACAAAG
CAAGGATTCGTTGCTAGAGGCTGAGAGGAGTAGAGTGGCTGAGCTCAGACAGAAAGAAGC
AACTCTTGAGAAGTTATTGCATGACAAGGAATCCCGACCAAGCAGCTTGACTTCAGAGAT
CGTTGAAGTAGAACCTCTGATAAACAAGTGGACAACGAGTGGAACGTCGATCCCATCTCA
AGTCCGGAGCTTGCGTAAGGGAAACAACAATGATCAAGTCGCCATTAGTATAGATGCAGA
TCAAGCAGATCAAAGCCTTAGCTTAGAAGAAGACGATGATAAAGCTCATGGATTTAGATC
ACTCACCTCGTCAAGAATCATTCCTAGATTCACAAGACCAGCGACAAACATGATTGATGG
TTTATGGGTCTCGTGTGACCGGACGCTTATGAGACAACCTGCCTTACGGTTAGCCATAAT
GATATACTGGGCGATGTTACATGCTCTTTTGGCTACAGTCATGGTCTAACCAAAAGCTTG
TAATCTCGTAAGCGACTTTTTTTTCCTTAAATGATGTAGCAAACAGTTGCTTCTCCAGTT
TTTTTTCTGAAGATTTAATTCGTGTTTTTATTACATCTTTCGCAGTTGGTTTCGCACGGG
CTCAAAGTGGTGTGTTGTCTTCAGTATTATGTTTTTGTCTTTCTATTCATTGTTATTAGC
TTTTCATTAACCAAGCAGATTGTGGTTTCAACATTTTTATTGATTCGAATCACAGACTGG
CTTGGCTTTACAACAATAAATTTTAAAAAAGGTTATGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FS94TF U 1
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AF RR4H861TF U 577
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TCTAGAAGATTCACCTTCCACTGATGCTAATAGACACTTAAACCGCTACAAGGAGACGCT
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DS 

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T

QA 5 545 5 545
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AAAGCTCATGGATTTAGATCACTCACCTCGTCAAGAATCATTCCTAGATTCACAAGACCA
GCGACAAACATGATTGATGGTTTATGGGTCTCGTGTGACCGGACGCTTATGAGACAACCT
GCCTTACGGTTAGCCATAATGATATACTGGGCGATGTTACATGCTCTTTTGGCTACAGTC
ATGGTCTAACCAAAAGCTTGTAATCTCGTAAGCGACTTTTTTTTCCTTAAATGATGTAGC
AAACAGTTGCTTCTCCAGTTTTTTTTCTGAAGATTTAATTCGTGTTTTTATTACATCTTT
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TGATTCGAATCACAGACTGGCTTGGCTTTACAACAATAAATTTTAAAAAAGGTTATGTAG
T

QA 5 545 5 545
DS 



AS 1 7

CO CL768Contig1 1226 7 8 U
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GTTGCTCAACAAATTATTCTACAAACAAGGAAATATCATAACCGAAACATTTAGAATAAT
TCAAAAGACACGATTGAGATATAATAAGCAGTCTCTGATGATAACATATGGTACTAGCTC
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GCATCATAGTAGAAGAAGTTCTTTAACGGCTCTCCTTTCCCTGATACAGCTTTTATCACT
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TCACATTCCACCTTCTCTTCAAGCTTTTTCTTTGTGTATTTGTAATCCTGAAGGTCCACA
AAGATTTCACCACATGAGTCTCTACAATCCACTGTATAGAATGCCACTCGTTTAGATAGC
TTCCTACATTTTTCATTAACAGCTTTTTTGGTAGCAAGAGAACCGTAGCCTATAACCACT
ACATCGAACTTCTCAAAAAACTCAGTGTTGCATGCCGACAAATCACCTTTCTCTACAGAA
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ACTAAACTATCATCCATTAAAGTCACGCTACCGACTCCTGCCAGCACAATGTTCTTGCAA
AACTCAGCAACAGTCCCCTTTATTCCAGAGACCAAGATATGAGATTTGGTCAATCTTCGC
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AGCTCTTCTCCGTCCATTCTCAAATTCAACCCTAGTATTGTAACTGGTTCAACTTTTTTT
TGGTCCAAGTTCTCCGAGTGTGCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C549TF C 43
AF RR4C751JQ U 43
AF RR4C549JQ U 43
AF RR4F119JQ U 43
AF RR4DY70JQ U 1
AF RR4E240TF C 499
AF RR4DY70TF C 437
BS 1 42 RR4DY70JQ
BS 43 43 RR4C751JQ
BS 44 792 RR4DY70JQ
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RD RR4C549TF 523 0 0
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CGAAACATTTAGAATAATTCAAAAGACACGATTGAGATATAATAAGCAGTCTCTGATGAT
AACATATGGTACTAGCTCTCGCTGGTTTAAGAGGTAAAAGAGTTGGAAATGTCTTCCATC
ACACCTTTGCCATCTTGAGCATCATAGTAGAAGAAGTTCTTTAACGGCTCTCCTTTCCCT
GATACAGCTTTTATCACTTCCTGTGCTAGTATTCCTCCTATGATGGCACAAGCTGGTGGG
AATTCGATAGTACCGGTGATAAGTCTCTCCAAGAGACTATCTGGTACATGGCTCTCGCTC
ACAGCGTTGGCCTCACAGAGCTTCTTTTTGATTTCCAAGACTGTGGGAAGATCAAGCAGT
GAGCATTCTCCATGTTTACGCCCTTCATTCTCCTCAAACACTTCTATTACTCTCATGGCG
AAGTAGAGCTTTGCTGTTCTCCTCGGAATCGGTTTCCAAGGT
C

QA 1 522 1 522
DS 

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CGAAACATTTAGAATAATTCAAAAGACACGATTGAGATATAATAAGCAGTCTCTGATGAT
AACATATGGTACTAGCTCTCGCTGGTTTAAGAGGTAAAAGAGTTGGAAATGTCTTCCATC
ACACCTTTGCCATCTTGAGCATCATAGTAGAAGAAGTTCTTTAACGGCTCTCCTTTCCCT
GATACAGCTTTTATCACTTCCTGTGCTAGTATTCCTCCTATGATGGCACAAGCTGGTGGG
AATTCGATAGTACCGGTGATAAGTCTCTCCAAGAGACTATCTGGTACATGGCTCTCGCTC
ACAGCGTTGGCCTCACAGAGCTTCTTTTTGATTTCCAAGACTGTGGGAAGATCAAGCAGT
GAGCATTCTCCATGTTTACGCCCTTCATTCTCCTCAAACACTTCTATTACTCTCATGGCG
AAGTAGAGCTTTGCTGTTCTCCTCGGAATCGGTTTCCAAGGT
C

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4C549JQ 523 0 0
CGACAATTCAAAATATCCGTTGCTCAACAAATTATTCTACAAACAAGGAAATATCATAAC
CGAAACATTTAGAATAATTCAAAAGACACGATTGAGATATAATAAGCAGTCTCTGATGAT
AACATATGGTACTAGCTCTCGCTGGTTTAAGAGGTAAAAGAGTTGGAAATGTCTTCCATC
ACACCTTTGCCATCTTGAGCATCATAGTAAAAGAAGTTCTTTAACGGCTCTCCTTTCCCT
GATACAGCTTTTATCACTTCCTGTGCTAGTATTCCTCCTATGATGGCACAAGCTGGTGGG
AATTCGATAGTACCGGTGATAAGTCTCTCCAAGAGACTATCTGGTACATGGCTCTCGCTC
ACAGCGTTGGCCTCACAGAGCTTCTTTTTGATTTCCAAGACTGTGGGAAGATCAAGCAGT
GAGCATTCTCCATGTTTACGCCCTTCATTCTCCTCAAACACTTCTATTACTCTCATGGCG
AAGTAGAGCTTTGCTGTTCTCCTCGGAATCGGTTTCCAAGGT
C

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4F119JQ 607 0 0
CGACAATTCAAAATATCCGTTGCTCAACAAATTATTCTACAAACAAGGAAATATCATAAC
CGAAACATTTAGAATAATTCAAAAGACACGATTGAGATATAATAAGCAGTCTCTGATGAT
AACATATGGTACTAGCTCTCGCTGGTTTAAGAGGTAAAAGAGTTGGAAATGTCTTCCATC
ACACCTTTGCCATCTTGAGCATCATAGTAAAAGAAGTTCTTTAACGGCTCTCCTTTCCCT
GATACAGCTTTTATCACTTCCTGTGCTAGTATTCCTCCTATGATGGCACAAGCTGGTGGG
AATTCGATAGTACCGGTGATAAGTCTCTCCAAGAGACTATCTGGTACATGGCTCTCGCTC
ACAGCGTTGGCCTCACAGAGCTTCTTTTTGATTTCCAAGACTGTGGGAAGATCAAGCAGT
GAGCATTCTCCATGTTTACGCCCTTCATTCTCCTCAAACACTTCTATTACTCTCATGGCG
AAGTAGAGCTTTGCTGTTCTCCTCGGAATCGGTTTCCAAGGTACTGATACCGCTTCCTGG
AAACTTGGAAAGTTTAGTTCACATTCCACCTTCTCTTCAAGCTTTTTCTTTGTGTATTTG
TAATCCT

QA 1 607 1 607
DS 

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GTTGCTCAACAAATTATTCTACAAACAAGGAAATATCATAACCGAAACATTTAGAATAAT
TCAAAAGACACGATTGAGATATAATAAGCAGTCTCTGATGATAACATATGGTACTAGCTC
TCGCTGGTTTAAGAGGTAAAAGAGTTGGAAATGTCTTCCATCACACCTTTGCCATCTTGA
GCATCATAGTAGAAGAAGTTCTTTAACGGCTCTCCTTTCCCTGATACAGCTTTTATCACT
TCCTGTGCTAGTATTCCTCCTATGATGGCACAAGCTGGTGGGAATTCGATAGTACCGGTG
ATAAGTCTCTCCAAGAGACTATCTGGTACATGGCTCTCGCTCACAGCGTTGGCCTCACAG
AGCTTCTTTTTGATTTCCAAGACTGTGGGAAGATCAAGCAGTGAGCATTCTCCATGTTTA
CGCCCTTCATTCTCCTCAAACACTTCTATTACTCTCATGGCGAAGTAGAGCTTTGCTGTT
CTCCTCGGAATCGGTTTCCAAGGTACTGATACCGCTTCCTGGAAACTTGGAAAGTTTAGT
TCACATTCCACCTTCTCTTCAAGCTTTTTCTTTGTGTATTTGTAATCCTGAAGGTCCACA
AAGATTTCACCACATGAGTCTCTACAATCCACTGTATAGAATGCCACTCGTTTAGATAGC
TTCCTACATTTTTCATTAACAGCTTTTTTGGTAGCAAGAGAACCGTAGCCTATAACCACT
ACATCGAACTTC

QA 1 792 1 792
DS 

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AACACTTCTATTACTCTCATGGCGAAGTAGAGCTT*GCTGT*CTCCTCGGAATCGGTTTC
CAAGGTACTGATACCGCTTCCTGGAAACTTGGAAAGTTTAGTTCACATTCCACCTTCTCT
TCAAGCTTTTTCTTTGTGTATTTGTAATCCTGAAGGTCCACAAAGATTTCACCACATGAG
TCTCTACAATCCACTGTATAGAATGCCACTCGTTTCGATAGCTTCCTACATTTTTCATTA
ACAGCTTTTTTGGTAGCAAGAGAACCGTAGCCTATAACCACTACATCGAACTTCTCAAAA
AACTCAGTGTTGCATGCCGACAAATCACCTTTCTCTACAGAAACAAGGACCATAGGGTTA
AAGTCCTTGAGTGAATCACAACAAATCTCAGCCACGGTTTTGCCTTTGTAAGCATTTTCA
TCAGGTGGAATCAAGAAGTTGGCGTTCAATGGCTCCTCGTTCACTAAACTATCATCCATT
AAAGTCACGCTACCGACTCCTGCCAGCACAATGTTCTTGCAAAACTCAGCAACAGTCCCC
TTTATTCCAGAGACCAAGATATGAGATTTGGTCAATCTTCGCTGAGCATTAGCGCCCCAA
ACCCTAATCTGACGGTCGTACAAGGCAGTCTCCTGCTCGGTGAGCTCTTCTCCGTCCATT
CTCAAATT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4DY70TF 790 0 0
CCAAGACTGTGG*AAGATCAAGCAGTGAGCAT*CTCCATGTTTACGCC*TTCATTCTCCT
CAAACACTTCTATTACTCTCATGGCGAAGTAGAGCTTTGCTGT*CTCCTCGGAATCGGTT
TCCAAGGTACTGATACCGCTTCCTGGAAACTTGGAAAGTTTAGTTCACATTCCACCTTCT
CTTCAAGCTTTTTCTTTGTGTATTTGTAATCCTGAAGGTCCACAAAGATTTCACCACATG
AGTCTCTACAATCCACTGTATAGAATGCCACTCGTTTAGATAGCTTCCTACATTTTTCAT
TAACAGCTTTTTTGGTAGCAAGAGAACCGTAGCCTATAACCACTACATCGAACTTCTCAA
AAAACTCAGTGTTGCGTGCCGACAAATCACCTTTCTCTACAGAAACAAGGACCATAGGGT
TAAAGTCCTTGAGTGAATCACAACAAATCTCAGCCACGGTTTTGCCTTTGTAAGCATTTT
CATCAGGTGGAATCAAGAAGTTAGCGTTCAATGACTCCTCGTTCACTAAACTATCATCCA
TTAAAGTCACGCTACCGACTCCTGCCAGCACAATGTTCTTGCAAAACTCAGCAACAGTCC
CCTTTATTCCAGAGACCAAGATATGAGATTTGGTCAATCTTCGCTGAGCATTAGCGCCC*
AAACCCTAATCTGACGGTCGTACAAGGCAGTCTCCTGCTCGGTGAGCTCTTCTCCGTCCA
TTCTCAAATTCAACCCTAGTATTGTAACTGGTTCAACTTTTTTTTGGTCCAAGTTCTCCG
AGTGTGCTCC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 7

CO CL769Contig1 1482 7 17 U
GGACTCCTCTCTGTATTATCCAATTATCTCCCATACTTTGATGATAACAGTGGAGTCCTA
CGACGGCGACAACAACGACAACGAAGACGTTAGGGTTTGATGGCGGTGAAGAAGGCAAGC
GAGATGTTCTCGAAGAGCTTGATCGAGGACGTTCACAGATGGGGATGCATGAAGCAAACG
GGTGTGAGCCTCAGGTACATGAAGGAGTTCGGTTCCACTCCCACCGAGAGAAACCTTCTG
ATCTCCGCCCAGTTTCTCCACAAGGAGCTCCCGATTCGGATCGCCAGGCGCGCGATCGAA
CTCGAGACGCTGCCTTATGGTCTCTCTGAAAAACCTGCCGTTTTGAAGGTGAGGGATTGG
TATGTGGAGTCGTTCAGGGACATGAGAGCGTTTCCAGAGATCAAGGATACTGCTGACGAG
AAAGAGTTCACTCAGATGATTAAGGCTGTTAAAGTAAGGCACAACAACGTGGTTCCCATG
ATGGCTCTGGGTGTTAACCAGCTTAAGAAGGGATGAGACTCTACGAGAATGTTGATGAGA
TTCATCAGTTTCTTGATCGCTTCTACTTGTCTCGAATAGGGATCCGTATGCTTATCGGGC
AGCATGTTGAGTTGCATAATCCGAACCCTCCGCTTCACACCGTGGGTTACATACACACCA
AGATGTCTCCTATGGAGGTAGCAAGGAATGCTAGTGAAGATGCGAGGTCAATTTGTTTCA
GAGAGTATGGTTCTGCTCCGGAGATAAACATATATGGAGATCCAAGTTTCACCTTTCCGT
ATGTACCAACCCATTTACATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAAGAACTCTCTACGCGCTG
TCCAAGAGCGATTCGTTGACTCTGATAGGGTTGCACCACCAATCCGTATCATAGTTGCTG
ATGGAATCGAAGATGTTACAATAAAGGTCTCAGATGAAGGTGGAGGTATACCGAGAAGCG
GTCTCCCCAAAATATTCACCTACCTCTACAGCACAGCAAGAAACCCGCTTGAAGAAGATG
TGGACTTGGGAATAGCTGATGTCCCCATAACTATAGCTGGTTATGGTTATGGTCTGCCTA
TTAGTCGCTTGTATGCTCGATACTTTGGTGGAGATTTGCAGATCATATCCATGGAAGGAT
ACGGGACTGATGCTTACTTGCACTTGTCTCGTCTTGGAGACTCGCAAGAGCCTTTGCCAT
GAGAGTATCATCTCTCAAGTCAGGCTAGTGAAGAAAGCCTTGAGATATTAATGGTAGACG
AGGGGG*ATCTACTTTACTCAGTTTAATATGCTTCTTTAATGTACATACATTATTTCTCG
TATTTACGATTTCTTTGATTATAAACTCAGACATGGAGACTTCCCAAGTGAGTTGATCTC
ATCTGGTTTGATTTGAGCTGATTCAGAACTGTTTATCCTTTGTTTGTTGCAACATTTCTC
TTGTATCCGCAAGTAAAAAAAGTTAATTTTATTGGTAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
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AF RR4CW94TF U 1
AF RR4DU26TF U 58
AF RR4E616TF U 1228
AF RR4DU26JQ C 603
AF RR4E236TF U 729
AF RR4E616JQ C 729
AF RR4E236JQ C 780
BS 1 176 RR4CW94TF
BS 177 177 RR4DU26TF
BS 178 257 RR4CW94TF
BS 258 258 RR4DU26TF
BS 259 311 RR4CW94TF
BS 312 312 RR4DU26TF
BS 313 329 RR4CW94TF
BS 330 330 RR4DU26TF
BS 331 405 RR4CW94TF
BS 406 786 RR4DU26TF
BS 787 787 RR4E236TF
BS 788 825 RR4DU26TF
BS 826 826 RR4E236TF
BS 827 842 RR4DU26TF
BS 843 1453 RR4E236TF
BS 1454 1470 RR4DU26JQ
BS 1471 1482 RR4E616JQ

RD RR4CW94TF 405 0 0
GGACTCCTCTCTGTATTATCCAATTATCTCCCATACTTTGATGATAACAGTGGAGTCCTA
CGACGGCGACAACAACGACAACGAAGACGTTAGGGTTTGATGGCGGTGAAGAAGGCAAGC
GAGATGTTCTCGAAGAGCTTGATCGAGGACGTTCACAGATGGGGATGCATGAAGCAGACG
GGTGTGAGCCTCAGGTACATGAAGGAGTTCGGTTCCACTCCCACCGAGAGAAACCTTCTG
ATCTCCGCCCAGTTTCTTCACAAGGAGCTCCCGATTCGGATCGCCAGGCGCGCGATCGAA
CTCGAGACGCTTCCTTATGGTCTCTCTGAGAAACCTGCCGTTTTGAAGGTGAGGGATTGG
TATGTGGAGTCGTTCAGGGACATGAGAGCGTTTCCAGAGATCAAG

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4DU26TF 785 0 0
GG
ACGACGGCGACAACAACGACAGCGAAGACGTTAGGGTTTGATGGCGGTGAAGAAGGCTAG
CGAGATGTTCTCGAAGAGCTTGATCGAGGACGTTCACAGATGGGGATGCATGAAGCAAAC
GGGTGTGAGCCTCAGGTACATGATGGAGTTCGGTTCCACTCCCACCGAGCGAAACCTTCT
GATCTCCGCCCAGTTTCTCCACAAGGAGCTCCCGATTCGGATCGCGAGGCGCGCGATCGA
ACTCGAGACGCTGCCTTATGGTCTCTCTGAAAAACCTGCCGTTTTGAAGGTGAGGGATTG
GTATGTGGAGTCGTTCAGGGACATGAGAGCGTTTCCTGAGATCAAGGATACTGCTGACGA
GAAAGAGTTCACTCAGATGATTAAGGCTGTTAAAGTAAGGCACAACAACGTGGTTCCCAT
GATGGCTCTGGGTGTTAACCAGCTTAAGAAGGGATGAGACTCTACGAGAATGTTGATGAG
ATTCATCAGTTTCTTGATCGCTTCTACTTGTCTCGAATAGGGATCCGTATGCTTATCGGG
CAGCATGTTGAGTTGCATAATCCGAACCCTCCGCTTCACACCGTGGGTTACATACACACC
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TATGTAC*AACCCATTTACATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAAGA*CTCTCTACGCGCT
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TATGCTTCTTTAATGTACATACATTATTTCTCGTATTTACGATTTCTTTGATTATAAACT
CAGACATGGAGACTTCCCAAGTGAG

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ATGTCTC*TATGGAGGTAGCAAGGAATGCTAGTGAAGATGCGAGGTCAATTTGTTTCAGA
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GCAAG

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ACCCATTTACATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAAGAACTCTTTACGCGCTGTCCAAGAG
CGATTCGTTGACTCTGATAGGGTTGCACCACCAATCCGTATCATAGTTGCTGATGGAATC
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GGAATAGCTGATGTCCCCATAACTATAGCTGGTTATGGTTATGGTCTGCCTATTAGTCGC
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GATGCTTACTTGCACTTGTCTCGTCTTGGAGACTCGCAAGAGCCTTTGCCATGAGAGTAT
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TCTACTTTACTCAGTTTAATATGCTTCTTTAATGTACATACATTATTTCTCGTATTTACG
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TGATTTGAGCTGATTCAGAACTGTTTATCCTTTGTTTGTTGCAACATTTCTCTTGTATCC
GCAAGTAAAAAAAGTTAATTTTATTGGTAAGTTT

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DS 

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TATGTACCAACCCATTTACATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAAGAACTCTCTACGCGCT
GTCCAAGAGCGATTCGTTGACTCTGATAGGGTTGCACCACCAATCCGTATCATAGTTGCT
GATGGAATCGAAGATGTTACAATAAAGGTCTCAGATGAAGGTGGAGGTATACCGAGAAGC
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CATCTGGTTTGATTTGAGCTGATTCAGAACTGTTTATCCTTTGTTTGTTGCAACATTTCT
CTTGTATCCGCAAGTAAAAAAAGTTAATTTTATTGGTAAGTTT

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DS 



AS 1 8

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ATGGTTTCGAGAAGCAGGATGGAGTAATTTTGATGGCTACTACCCGAAATCATAAGCAGA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TCATTGATCTGGTGGATTGGCGTAAGGTTTCTGAGAAGACATCTATATTACGACCGATAG
AACTGAAACTTGTTCCAATGGCTCTTGAAAGTAGTGCCTTCAGGAGCAGGTTTCTGGATG
CAGATGAACTTCTGAGTTACGTTAGCTGGTTTGCGACGTTTAGCCGTATCGTGCCCTCAT
GGTTGCGGAAGACTAAAGTTGCCAATAAAATGGGCAAGATGCTTGTTAATCATCTTGGAC
TCAACTTAACCAAAGAAGATTTGGAGAATGTGGTTGATCTGATGGAACCATATGGACAGA
TAAGCAATGGAATAGAACTTTTGAATCCACCTGTTGATTGGACGAGGGAGACAAAGTTCC
CGCATGCTGTCTGGGCGGCTGGTCGTGCTCTGATCGCACTTCTAATACCAAACTTCGACG
TTGTAGACAATCTGTGGCTTGAGCCTAGTTCCTGGGAAGGA*TTGGGTGCA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4E948TF 678 0 0
G
GGATGGAGTAATTTTGATGGCTACTACCCGAAATCATAAGCAGATTGATGAAGCGTTAAG
AAGGCCAGGTCGTATGGATAGAATATTTCATCTTCAAAGTCCAACTGAAACGGAAAGGGA
GAGGATTTTACACACTGCTGCAGAAGAAACCATGGACAGAGATCTCATTGATCTGGTGGA
TTGGCGTAAGGTTTCTGAGAAGACATCTATATTACGACCGATAGAACTGAAACTTGTTCC
AATGGCTCTTGAAAGTAGTGCCTTCAGGAGCAAGTTTCTGGATGCAGATGAACTTCTGAG
TTACGTTAGCTGGTTTGCGACGTTTAGCCGTATAGTGCCCTCATGGTTGCGGAAGACTAA
AGTTGCCAATAAAATGGGCAAGATGCTTGTTAATCATCTTGGACTCAACTTAACCAAAGA
AGATTTGGAGAATGTGGTTGATCTGATGGAACCATATGGACAGATAAGCAATGGAATAGA
ACTTTTGAATCCTCCTGTTGATTGGACGAGGGAGACAAAGTTCCCACATGCTGTCTGGGC
TGCTGGTCGTGCTCTGATCGCACTTCTAATACCAAACTTCGATGTCGTAGACAATCTGTG
GCTTGAGCCTAGTTCATGGGAAGGAATTGGGTGCACAAAGATCACCAAAGTCACAAGCGG
TGGCTCTGCAAGTGGGA

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR4A176TF 333 0 0
TGATGGAACCATATGGACAGATAAGCAATGGAATAGAACTTTTGAATCCTCCTGTTGATT
GGACGAGGGAGACAAAGTTCCCACATGCTGTCTGGGCTGCTGGTCGTGCTCTGATCGCAC
TTCTAATACCAAACTTCGATGTCGTAGACAATCTGTGGCTTGAGCCTAGTTCATGGGAAG
GAATTGGGTGCACAAAGATCACCAAGGTCACAAGTGGTGGCTCTGCAAGTGGGAATACGG
AATCAAGATCATATCTTGAAAAGAAGCTCGTTTTCTGCTTTTGGATTCTCACATTTGCAT
CCCCAAATGCTTCTTCCTCCCTGGAGAAGAAAA

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR4A176TFB 535 0 0
GTTGATC
TGATGGAACCATATGGACAGATAAGCAATGGAATAGAACTTTTGAATCCTCCTGTTGATT
GGACGAGGGAGACAAAGTTCCCACATGCTGTCTGGGCTGCTGGTCGTGCTCTGATCGCAC
TTCTAATACCAAACTTCGATGTCGTAGACAATCTGTGGCTTGAGCCTAGTTCATGGGAAG
GAATTGGGTGCACAAAGATCACCAAGGTCACAAGTGGTGGCTCTGCAAGTGGGAATACGG
AATCAAGATCATATCTTGAAAAGAAGCTCGTTTTCTGCTTT*GGAT*CTCACATT*GCAT
CCC*AAATGCTTCTTCCTCC*TGGAGAAGAAAATTTTCTTTCGTCCTCAGAGATAACACA
AGCACAAGAGATTGCAACACGGATGGTACTTCAGTATGGCTGGGGACCCGATGACAGTCC
TGCAGTTTACTATGCCACTAACGCGGTATCAGCTTTTGAGTATGGGAAACCATCACGAAT
ACGAAATGGCTAGTAAAGTTGAAAAGATTTATGACTTAGCGTACGAAA

QA 8 535 8 535
DS 

RD RR4A176JQ 347 0 0
CCCGATGACAGTCCTGCAGTTTACTATGCCACTAACGCGGTATCAGCTTT*GAGTATGGG
AAACCATCACGAATACGAAATGGCTAGTAAAGTTGAAAAGATTTATGACTTAGCGTACGA
AAAGGCAAAGGGAATGCTCCTCAAAAATCGCCGTGTGCTTGAGAAAATCACTGAGGAGCT
GCTCGAATTTGAGATATTGACCCGAAAGGATCTAGAAAGACTTGTTCATGAGAATGGTGG
GGTTCGGGAGAAGGAACCTTTCTTTCTCTCTGGAACCAATTACAACGAGCCATTGTCAAG
GAGCTTCCTTGATGCCGGAGATTCTTCAGAAACCGTGCTTCTTAGTA

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4A176JQD 934 0 0
CCACATGCTGTCTGGGCTGCTGGTCGTGCTCTGATCGCACTTCTAATACCAAACTTCGAT
GTCGTAGACAATCTGTGGCTTGAGC*TAGTTCATGGGAAGGAATTGGGTGCACAAAGATC
ACCAAGGTCACAAGTGGTGGCTCTGCAAGTGGGAATACGGAATCAAGATCATATCTTGAA
AAGAAGCTCGTTTTCTGCTTT*GGAT*CTCACATT*GCATCCC*AAATGCTTCTTCCTCC
*TGGAGAAGAAAATTTTCTTTCGTCCTCAGAGATAACACAAGCACAAGAGATTGCAACAC
GGATGGTACTTCAGTATGGCTGGGGACCCGATGACAGTCCTGCAGTTTACTATGCCACTA
ACGCGGTATCAGCTTT*GAGTATGGGAAACCATCACGAATACGAAATGGCTAGTAAAGTT
GAAAAGATTTATGACTTAGCGTACGAAAAGGCAAAGGGAATGCTCCTCAAAAATCGCCGT
GTGCTTGAGAAAATCACTGAGGAGCTGCTCGAATTTGAGATATTGACCCGAAAGGATCTA
GAAAGACTTGTTCATGAGAATGGTGGGGTTCGGGAGAAGGAACCTTTCTTTCTCTCTGGA
ACCAATTACAACGAGCCATTGTCAAGGAGCTTCCTTGATGCCGGAGATTCTTCAGAAACC
GTGCTTCTTAGTACACAAACCTAGAGAGACCCATGGAGTTTGATGATAGAGTAAAATTTC
TTGCAGATTGCAAGTTTTGTTCTTTTGTTCACCAGATATGCCACCACTTGAGACTAGTTT
AGTCTACCAAAGCTTGAGACTTGAGGATTCATTTTCAAAACTGAAATTTTCTTGTCCTGA
TCTCTTATTTTTCTTGGGACATGTCTCTTATTGTTCTTACTGCTACATGTCTGTGTACAA
TAAATTCATCACTGCTTCAAAGTACATTCTGG
GC

QA 1 932 1 932
DS 

RD RR4E948JQ 578 0 0
AGTTTACTATGCCACTAACGCGGTATCAGCTTT*GAGTATGGGAAACCATCACGAATACG
AAATGGCTAGTAAAGTTGAAAAGATTTATGACTTAGCGTACGAAAAGGCAAAGGGAATGC
TCCTCAAAAATCGCCGTGTGCTTGAGAAAATCACTGAGGAGCTGCTCGAATTTGTGATAT
TGACCCGAAAGGATCTAGAAAGACTTGTTCATGAGAATGGTGGGGTTCGGGAGAAGGAAC
CTTTCTTTCTTTCTGGAACCAATTACAACGAGCCATTGTCAAGGAGCTTCCTTGATGCCG
GAGATTCTTCAGAAACCGTGCTTCTTAGTACACAAACCTAGAGAGACCCATGGAGTTTGA
TGATAGGGTAAAATTTCTTGCAGATTGCAAGTTTTGTTCTTTTGTTCACCAGATATGCCA
CCACTTGAGACTAGTTTAGTCTACCAAAGCTTGAGACTTGAAGATTCATTTTCAAAACTG
AAATTTTCTTGTCCTGATCTCTTATTTTTCTTGGGACATGTCTCTTATTGTTCTTACTGC
TACATGTCTGTGTACAATAAATTCATCACTGCTTCAAA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4BT35JQ 831 0 0
TGCACAAAGATCACCAAGGTCACAAGTGGTGGCTCTGCAAGTGGGAATACGGAATCAAGA
TCATATCTTGAGAAGAAGCTCGTTTTCTGCTTT*GGAT*CTCACATT*GCATCCC*AAAT
GCTTCTTCCTCC*TGGAGAAGAAAATTTTCTTTCGTCCTCAGAGATAACACAAGCGCAAG
AGATTGCAACACGGATGGTACTTTAGTATGGCTGGGGACCCGATGACAGTCCTGCAGTTT
ACTATGCCACTAACGCGGTATCAGCTTT*GAGTATGGGAAACCATCACGAATACGAAATG
GCTAGTAAAGTTGAAAAGATTTATGACTTAGCGTACGAAAAGGCGAAGGGAATGCTCCTC
AAAAATCGCCGTGTGCTTGAGAAAATCACTGAGGAGCTGCTCGAATTTGAGATATTGACC
CGAAAGGATCTAGAAAGACTTGTTCATGAGAATGGTGGGGTTCGGGAGAAGGAACCTTTC
TTTCTCTCTGGAACCAATTACAACGAGCCATTGTCAAGGAGCTTCCTTGATGCCGGAGAT
TCTTCAGAAACCGTGCTTCTTAGTACACAAACCTAGAGAGACCCATGGAGTTTGATGATA
GAGTAAAATTTCTTGCAGATTGCAAGTTTTGTTCTTTTGTTCACCAGATATGCCACCACT
TGAGACTAGTTTAGTCTACCAAAGCTTGAGACTTGAGGATTCATTTTCAAAACTGAAATT
TTCTTGTCCTGATCTCTTATTTTTCTTGGGACATGTCTCTTATTGTTCTTACTGCTACAT
GTCTGTGTACAATAAATTCATCACTGCTTCAAAGTACATTCTGGTCCTCTG

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 8

CO CL771Contig1 725 8 12 U
AGGGGAGCTTATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCG
AATCCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCG
GTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGG
AATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCA
TAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCC
GGAAAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGA
AACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACAC
AATGGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCT
TGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTA
AAGTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATA
AAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGTTTGATTGATCATCTGAAGTTTA
TCCTTGTGTGCAAATTATCCCAAAAAAACAGTGTCTTCCCCGATTCATGTGTTCAATCTT
CCGAA


BQ
10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 

AF RR4E768TF U 4
AF RR4E661TF U 128
AF RR4FM05TF U 4
AF RR4CW75JQ C 1
AF RR4CW75TF U 1
AF RR4FT06TF U 3
AF RR4E768JQ C 34
AF RR4E661JQ C 60
BS 1 3 RR4CW75JQ
BS 4 64 RR4E768TF
BS 65 65 RR4FM05TF
BS 66 127 RR4E768TF
BS 128 605 RR4E661TF
BS 606 606 RR4CW75JQ
BS 607 679 RR4CW75TF
BS 680 680 RR4FT06TF
BS 681 687 RR4CW75TF
BS 688 688 RR4CW75JQ
BS 689 704 RR4CW75TF
BS 705 725 RR4E768JQ

RD RR4E768TF 489 0 0
GGAGCTTATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAAT
CTACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTT
GCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAAT
GGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAA
CACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGA
AAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAAC
AGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAAT
GGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGT
TCAACCTCC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4E661TF 478 0 0
GAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGAT
GATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACT
GTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAA
CCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGA
GTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAG
ACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAA
CCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTAAAGTATG
TATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAA

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4FM05TF 598 0 0
GGAGCTTATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCCCATAAACTAAATCGGATCGAAT
CCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTT
GCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTACGGAAT
GGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAA
CACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGA
AAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAAC
AGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAAT
GGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGT
TCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTAAAG
TATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4CW75JQ 706 0 0
AGGGGAGCTTATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCG
AATCCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTCGTTGTTCCGAGGAATTTCCG
GTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGG
AATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCA
TAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCC
GGAAAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGA
AACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACAC
AATGGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCT
TGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTA
AAGTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATA
AAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGTTTGATTGATCATCTGAAGTTTA
TCCTTGTGTGCAAATTATCCCAAAAAAACAGTGTCTTCCCCGAT
CC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4CW75TF 706 0 0
AGG
GGAGCTTATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAAT
CCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTCGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTT
GCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAAT
GGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAA
CACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGA
AAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAAC
AGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAAT
GGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGT
TCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTAAAG
TATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAA
AA*TTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGTTTGATTGATCATCTGAAGTTTATCC
TTGTGTGCAAATTATCACAAAAAA*CAGTGTCTTCCCCGAT
CC

QA 4 704 4 704
DS 

RD RR4FT06TF 685 0 0
GGC
AGCTTATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAATCC
ACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGC
TAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGG
ATGATGGAGATGA**TTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACA
CTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAA
AACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAG
GAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGG
AGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTC
AACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTAAAGTA
TGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAA
*TTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGTTTGATTGATCATCTGAAGTTTATCCTT
GTGTGCAAATTATCCCAAAAAA

QA 4 685 4 685
DS 

RD RR4E768JQ 692 0 0
TCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAATCTACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATC
GAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGG
GATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTC
TTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTT
GAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACG
TATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCT
TCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGA
GATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTA
GTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACTAAAGTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTC
TCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGAT
GATGTTTGATTGATCATCTGAAGTTTATCCTTGTGTGCAAATTATCCCAAAAAAACAGTG
TCTTCCCCGATTCATGTGTTCAATCTTCCGAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4E661JQ 664 0 0
GAATCTACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCC
GGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATG
GAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTC
ATAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACC
CGGAAAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATG
AAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACA
CAATGGAGACCATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGC
TTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAGAATCTTTGCCCCTTTAATACT
AAAGTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGAT
AAAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGTTTGATTGATCATCTGAAGTTT
ATCCTTGTGTGCAAATTATCCCAAAAAAACAGTGTCTTCCCCGATTCATGTGTTCAATCT
TCCG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 6

CO CL772Contig1 981 4 5 U
GGAGGTTATAAACTTTACTAATGGAAAATTAAGTTTTCTGGATTTGGGGGACAATGTGAT
TGATATTCAAGCAAAGGATTGTTTAGCACAAATGAAAAGAAGAAAAAAAAA**CACTCTG
CTCACATACAACAAAGGGTTTGGTACCTTTGAGCTATTCTAAATAGCTGAAAAGTACTCT
TTGCTGAGCTTTGGGTCAGGTTTCATCGACTTCTCACCTGGTTTCCACCCTGCGGGGCAG
ACTTCATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAGGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCGTCA
ACGCTTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATCACTCCTTCTTTGTCG
ATGATGAAAAGCCCCCTCAGTGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCGAAGGACTTT
GAGATTGATTTAGTTACATCTGAAATCAGAGGATAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGAT
TTTCTGTCTGTCTGGACCCACGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAAC
ACTTCTGTGTTCGACTTCTCGAACTCTGCGTACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTT
GGGCAGACGAAAGTGAAGTCTAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATG
TACTCAGAGAGCTTAACCTTGATGAACTCCTGATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCA
GGCGCCTTGTTTCCAACCAGTGGAAGATCATCGGCCTGAGCCTTGACGGCGAGGCTCCGG
CGAGAAACGGAGCTGAGTGAAGAGCGTTGAGCAAACCCAGAGCGGAGAGGAGCGGATGCG
GGAGGAGAGGATAGGGTACGAAGGAAAGAGAGGGAGGGAGAAGGAAGGGAAGAAGACTTG
GCTGGGAAAGCCCTAGTTGAGGAGATGAGAGTGGTTGAAGAAGTAACCGACGCCATTGAT
AACACACACTTTTGTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CN39JQ U 1
AF RR4CN39TF C 1
AF RR4C708JQ U 5
AF RR4C708TF C 361
BS 1 239 RR4CN39JQ
BS 240 240 RR4C708JQ
BS 241 365 RR4CN39JQ
BS 366 764 RR4C708JQ
BS 765 981 RR4C708TF

RD RR4CN39JQ 366 0 0
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TGATATTCAAGCAAAGGATTGTTTAGCACAAATGAAAAGAAGAAAAAAAAA**CACTCTG
CTCACATACAACAAAGGGTTTGGTACCTTTGAGCTATTCTAAATAGCTGAAAAGTACTCT
TTGCTGAGCTTTGGGTCAGGTTTCATCGACTTCTCACCTGGTTTCCACCCTGCGGGGCAA
ACTTCATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAGGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCGTCA
ACGCTTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATCACTCCTTCTTTGTCG
ATGAT
C

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4CN39TF 366 0 0
GGAG
GTTATAAACTTTACTAATGGAAAATTAAGTTTTCTGGATTTGGGGGACAATGTGATTGAT
ATTCAAGCAAAGGATTGTTTAGCACAAATGAAAAGAAGAAAAAAAAA**CACTCTGCTCA
CATACAACAAAGGGTTTGGTACCTTTGAGCTATTCTAAATAGCTGAGAAGTACTCTTTGC
TGAGCTTTGGGTCAGGTTTCATCGACTTCTCACCTGGTTTCCACCCTGCGGGGCAGACTT
CATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAGGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCGTCAACGC
TTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATCACTCCTTCTTTGTCGATGA
T
C

QA 5 365 5 365
DS 

RD RR4C708JQ 760 0 0
GTTATAAACTTTACTAATGGAAAATTAAGTTTTCTGGATTTGGGAGACAATGTGACTGAT
ATTCAAGCAAAGGATTGTTTAGCACAAATGAAAAGAAGAAAAAAAAAAACACTCTGCTCA
CATACAACAAAGGGTTTGGTACCTTTGAGCTATTCTAAATAGCTGAAAAGTACTCTTTGC
TGAGCTTTGGGTCAGGTTTCATTGACTTCTCACCTGGTTTCCACCCTGCGGGGCAGACTT
CATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAGGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCGTCAACGC
TTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATCACTCCTTCTTTGTCGATGA
TGAAAAGCCCCCTCAGTGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCGAAGGACTTTGAGA
TTGATTTAGTTACATCTGAAATCAGAGGATAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTTTC
TGTCTGTCTGGACCCACGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTT
CTGTGTTCGACTTCTCGAACTCTGCGTACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGC
AGACGAAAGTGAAGTCTAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACT
CAGAGAGCTTAACCTTGATGAACTCCTGATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCAGGCG
CCTTGTTTCCAACCAGTGGAAGATCATCGGCCTGAGCCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4C708TF 621 0 0
ATG
ATGAAAAGCCCCCTCAGTGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCGAAGGACTTTGAG
ATTGATTTAGTTACATCTGAGATCAGAGGATAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTTT
CTGTCTGTCTGGACCCACGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAACACT
TCTGTGTTCGACTTCTCGAACTCTGCGTACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGG
CAGACGAAAGTGAAGTCTAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTAC
TCAGAGAGCTTAACCTTGATGAACTCCTGATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCAGGC
GCCTTGTTTCCAACCAGTGGAAGATCATCGGCCTGAGCCTTGACGGCGAGGCTCCGGCGA
GAAACGGAGCTGAGTGAAGAGCGTTGAGCAAACCCAGAGCGGAGAGGAGCGGATGCGGGA
GGAGAGGATAGGGTACGAAGGAAAGAGAGGGAGGGAGAAGGAAGGGAAGAAGACTTGGCT
GGGAAAGCCCTAGTTGAGGAGATGAGAGTGGTTGAAGAAGTAACCGACGCCATTGATAAC
ACACACTTTTGTTCTCCC

QA 4 621 4 621
DS 



CO CL772Contig2 661 2 4 U
GGAGAGATAAGTGTTTTGTTTGTAGCTCTGAGTAAACAGAGAGGAGAATCGCAAAGTGTT
ATCAAATGGCTGCGTCGTCTATAGCTTCTTCGACCACTCTCATCTCCTCCTCCACTCGAG
TTTCTCCAGCCAAGTCTTCGCTTCCATCTCCCTCCTCCGTCTCTTTCCTTCCAACCATCA
TACCCTCTCCTCTCCGCTCTGGTTTTGCTCTCCGCTCTTCTCTCAGCTCCACCTCACGCC
GTAGCTTTGCTGTCAAGGCCCAGGCCGATGATCTCCCATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTG
ATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTTTCTGAGTACA
TTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAA
CAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTACGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGT
TAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGACAAT
CTGGAGGGCTTGGTGATCTGAACTACCCCCTTGTTTCAGATGTAACTAAATCCATCTCAA
AGTCTTTTGGAGTGCTCATCCATGATCAGGGAATAGCACTGAGAGGGCTTTTCATAATCG
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EH77TF U 1
AF RR4H965TF U 63
BS 1 403 RR4EH77TF
BS 404 404 RR4H965TF
BS 405 604 RR4EH77TF
BS 605 661 RR4H965TF

RD RR4EH77TF 617 0 0
GGAGAGATAAGTGTTTTGTTTGTAGCTCTGAGTAAACAGAGAGGAGAATCGCAAAGTGTT
ATCAAATGGCTGCGTCGTCTATAGCTTCTTCGACCACTCTCATCTCCTCCTCCACTCGAG
TTTCTCCAGCCAAGTCTTCGCTTCCATCTCCCTCCTCCGTCTCTTTCCTTCCAACCATCA
TACCCTCTCCTCTCCGCTCTGGTTTTGCTCTCCGCTCTTCTCTCAGCTCCACCTCACGCC
GTAGCTTTGCTGTCAAGGCCCAGGCCGATGATCTCCCATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTG
ATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTTTCTGAGTACA
TTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACTTTCGTCTGCCCAA
CAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTACGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGT
TAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGACAAT
CTGGAGGGCTTGGTGATCTGAACTACCCCCTTGTTTCAGATGTAACTAAATCCATCTCAA
AGTC
TTTTGGATTGCTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4H965TF 599 0 0
CAAATGGCTGCGTCGTCTATAGCTTCTTCGACCACTCTCATCTCCTCCTCCACTCGAGTT
TCTCCAGCCAAGTCTTCGCTTCCATCTCCCTCCTCCGTCTCTTTCCTTCCAACCATCATA
CCCTCTCCTCTCCGCTCTGGTTTTGCTCTCCGCTCTTCTCTCAGCTCCACCTCACGCCGT
AGCTTTGCTGTCAAGGCCCAGGCCGATGATCTCCCATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGAT
TTTGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTTTCTGAGTACATT
GGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACA
GAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTACGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGTTA
GGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGACAATCT
GGAGGGCTTGGTGATCTGAACTACCCCCTTGTTTCAGATGTAACTAAATCCATCTCAAAG
TCTTTTGGAGTGCTCATCCATGATCAGGGAATAGCACTGAGAGGGCTTTTCATAATCGA

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 8

CO CL773Contig1 844 8 14 U
CTTTTGAATCAACTGCAAATCCAGCAATTGAGTAATCGAAGAAGAAGATGAGCGACGTGT
TCGAAGGGTACGAGCGGCAGTACTGCGAGCTATCAACTAATCTCACCCGTAAATCCAATT
CAGCTTCCCTTCTCCCCCATGGAGATGATAAGAAAGGGAAGCTTGGTGAGATCAAATCTG
GAATTGATGAAGCTGATGTCTCGATCCGAAAAATGGACCTTGAGGCGAGGAGTTTACAGC
CAAGTGCTAAGGCTACCTGTCTTGCTAAACTCAGAGAATACAAATCTGACCTCAACCAGT
TGAAGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGT
TGATGGAATCTGGAATGGCCGATCCCCACTCGGTTTCTACTGATCAAAGAGAGAGGTTGG
CAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACCA
TGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAA
CTCTCCTTCACTCCCACAGCAAGCTTCATGGTGTGGATGAAGCCATTGACAAGAGCAAGA
AGGTCTTGACGGCTATGTCGAGAAGAATGACGAGGAACAAATGGATCGTTACTTCAGTGA
TCATTGCTCTCATTCTCGCCATCATTCTCATCATTTCATTCAAACTTTCTCATTGATATA
TGCTTTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGG
ATCTCTTTGTCTCCCCCAGGTTTCCACTTGTATGACCCAAAAATGTGTTATGACATGTTT
TTAC


BQ
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 

AF RR4E038TF U 1
AF RR4E253TF U 1
AF RR4BS09TF U 1
AF RR4CL86TF U 1
AF RR4CL86JQ C 1
AF RR4E038JQ C 197
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AF RR4BS09JQ C 64
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BS 203 268 RR4BS09TF
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BS 270 703 RR4BS09TF
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BS 768 777 RR4CL86TF
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TGAAGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGT
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CAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAATAACCA
TGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAA
CTCTCCTTCA

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DS 

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TCGAAGGGTACGAGCGGCAGTACTGCGAGCTATCAACTAATCTCACCCGTAAATCCAATT
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TGAAGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGT
TGATGGAATCTGGAATGGCCGATCCCCACTCGGTTTCTACTGATCAAAGAGAGAGGTTGG
CAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAATAACCA
TGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAA
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DS 

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TGAAGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGT
TGATGGAATCTGGAATGGCCGATCCCCACTCGGTTTCTACTGATCAAAGAGAGAGGTTGG
CAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACCA
TGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAA
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TGCTCTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTA
TGA

QA 1 766 1 766
DS 

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CAGCTTCCCTTCTCCCCCATGGAGATGATAAGAAAGGGAAGCTTGGTGAGATCAAATCTG
GAATTGATGAAGCTGATGTCTTGATCCGAAAAATGGACCTTGAGGCGAGGAGTTTACAGC
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TGAAGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGT
TGATGGAATCTGGAATGGCCGATCCCCACTCGGTTTCTACTGATCAAAGAGAGAGGTTGG
CAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACCA
TGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAA
CTCTCCTTCACTCCCACAGCAAGCTTCATGGTGTGGATGAAGCCATTGACAAGAGCAAGA
AGGTCTTGACGGCTATGTCGAGAAGAATGACGAGGAACAAATGGATCGTTACTTCAGTGA
TCATTGCTCTCATTCTCGCCATCATTCTCATCATTTCATTCAAACTTTCTCATTGATATA
TGCTCTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTA*TGAATGGGCT*GG
ATCTCTTTGTCTCCCC
A

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4CL86JQ 844 0 0
TC
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GAAGGGTACGAGCGGCAGTACTGCGAGCTATCAACTAATCTCACCCGTAAATCCAATTCA
GCTTCCCTTCTCCCCCATGGAGATGATAAGAAAGGGAAGCTTGGTGAGATCAAATCTGGA
ATTGATGAAGCTGATGTCTTGATCCGAAAAATGGACCTTGAGGCGAGGAGTTTACAGCCA
AGTGCTAAGGCTACCTGTCTTGCTAAGCTCAGAGAATACAAATCTGACCTCAACCAGTTG
AAGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGTTG
ATGGAATCTGGAATGGCCGATCCCCACTCGGTTTCTACTGATCAAAGAGAGAGGTTGGCA
ATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACCATG
ATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAACT
CTCCTTCACTCCCACAGCAAGCTTCATGGTGTGGATGAAGCCATTGACAAGAGCAAGAAG
GTCTTGACGGCTATGTCGAGAAGAATGACGAGGAACAAATGGATCGTTACTTCAGTGATC
ATTGCTCTCATTCTCGCCATCATTCTCATCATTTCATTCAAACTTTCTCATTGATATATG
CTTTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGGAT
CTCTTTGTCTCCCCCAGGTTTCCACTTGTATGACCCAAAAATGTGTTATGACATGTTTTT
AC

QA 3 844 3 844
DS 

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GAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGTTGATGGAATCTGGAAT
GGCCGATCCCCACTCGGTTTCTACTGATCAAAGAGAGAGGTTGGCAATGTCCGTGGAGAG
GCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAATAACCATGATGGAGACCGAAGA
GCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAACTCTCCTTCACTCCCA
CAGCAAGCTTCATGGTGTGGATGAAGCCATTGACAAGAGCAAGAAGGTCTTGACGGCTAT
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CGCCATCATTCTCATCATTTCATTCAAACTTTCTCATTGATATATGCTTTCAGCCGTTTG
TGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGGATCTCTTTGTCTCCCC
CAGGTTTCCACTTGTATGACCCAAAAATGTGTTATGACATGTTTTTAC

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DS 

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GAGAGAGGTTGGCAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGA
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CTCATTGATATATGCTTTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAAT
GAATGGGCTTGGATCTCTTTGTCTCCCCCAGGTTTCCACTTGTATGACCCAAAAATGTGT
TATGACATGTTTTTAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4BS09JQ 781 0 0
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GTGCTAAGGCTACCTGTCTTGCTAAGCTCAGAGAATACAAATCTGACCTCAACCAGTTGA
AGAAGGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGTTGA
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TGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACCATGA
TGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTTAGTCAGCAGCGCCAAACTC
TCCTTCACTCCCACAGCAAGCTTCATGGTGTGGATGAAGCCATTGACAAGAGCAAGAAGG
TCTTGACGGCTATGTCGAGAAGAATGACGAGGAACAAATGGATCGTTACTTCAGTGATCA
TTGCTCTCATTCTCGCCATCATTCTCATCATTTCATTCAAACTTTCTCATTGATATATGC
TTTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGGATC
TCTTTGTCTCCCCCAGGTTTCCACTTGTATGACCCAAAAATGTGTTATGACATGTTTTTA
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 2 7

CO CL774Contig1 896 3 6 U
GGAAAAACGAAAGTTAAGTAATGAAAAGTAAATAGCAGACACGACAAAACTTGCAAAAGG
AGCAACATAGAAATAGCAAAAATATCATTTCACAAAGATTCATAATACTGAATGTGTCCA
AACTAAAAAACTTAACAATAATTTCAAGGATAAAAGTAAAATGATTCGGACTCAATATAA
CTCTTGACGGGAGAGGAAAGAGTAGACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTGGCTGGCAA
AAATGCACTTCCCGGCTGACGGTTAGCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAACTTAGCATT
AACACCATCAGGGACAACACGCTTCTCTTGCCTCAACTTGGTAAAGTCTGCTCTGTTAAA
CTTGGTAAAACCCCATTTCCTGCTGACGATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTT
AGCCCTCCTCAAAGCCTCTTGAGCATGATGACCATGAGCATCCTTGCACCTCACAGACAA
AAGCACCTGACCAATCGCAACACGAGCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAAGCACCTCT
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ATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTGAGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGATTTCACCAT
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CTTACCCTTGATCTGACGTAACACCTAGCCGTCTTCTTCCCATGGCGTCTCACTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP50JQ U 53
AF RR4DW72JQ U 1
AF RR4DO32JQ U 53
BS 1 351 RR4DW72JQ
BS 352 352 RR4DO32JQ
BS 353 598 RR4DW72JQ
BS 599 599 RR4DO32JQ
BS 600 854 RR4DW72JQ
BS 855 896 RR4DO32JQ

RD RR4DP50JQ 685 0 0
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TGTGTCCAAACTAAAAAACTTAACAATAATTTCAAGGATAAAAGTAAAATGATTCGGACT
CAATATAACTCTTGACGGGAGAGGAAAGAGTAGACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTG
GCTGGCAAAAATGCACTTCCCGGCTGACGGTTAGCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAAC
TTAGCATTAACACCATCAGGGACAACACGCTTCTCTTGCCTCAACTTGGTAAAGTCCGCT
CTGTTAAACTTGGTAAAACCCCATTTCCTGCTGACGATAATCTTCTGACGACCAGGGAAC
TTAAACTTAGCCCTCCTCAAAGCCTCTTGAGCATGATGACCATGAGCATCCTCGCACCTC
ACAGACAAAAGCACCTGACCAATCGCAACACGAGCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAA
GCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCAGCACACGAAAGCATCTTGTTGATC
CTCAGAACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTGAGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGAT
TTCACCATGTACTTGTTGCAAGCGATACGCGAAGCTTCGAGTGCTTCGCTTGAGACGTTC
TCCTTCTCCCATGAGACGAGGTGGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4DW72JQ 854 0 0
GGAAAAACGAAAGTTAAGTAATGAAAAGTAAATAGCAGACACGACAAAACTTGCAAAAGG
AGCAACATAGAAATAGCAAAAATATCATTTCACAAAGATTCATAATACTGAATGTGTCCA
AACTAAAAAACTTAACAATAATTTCAAGGATAAAAGTAAAATGATTCGGACTCAATATAA
CTCTTGACGGGAGAGGAAAGAGTAGACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTGGCTGGCAA
AAATGCACTTCCCGGCTGACGGTTAGCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAACTTAGCATT
AACACCATCAGGGACAACACGCTTCTCTTGCCTCAACTTGGTAAAGTCTGCCCTGTTAAA
CTTGGTAAAACCCCATTTCCTGCTGACGATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTT
AGCCCTCCTCAAAGCCTCTTGAGCATGATGACCATGAGCATCCTTGCACCTCACAGACAA
AAGCACCTGACCAATCGCAACACGAGCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAAGCACCTCT
CATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCAGCACACGAAAGCATCTTGTTGATCCTCAAAGC
ATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTGAGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGATTTCACCAT
GTACTTGTTGCAAGCGATACGCGCAGCTTCGAGTGCTTCGCTTGAGACGTTCTCCTTCTC
CCATGAGACGAGGTGGACGCAGAAAGGGAACTCATCGACACCCTTCCTCTTCATTCCGAC
ATCGTAGATCCTGATCTTGGGATCAGGGACACCACGGCAGTAGCGAGATTTAGGGTATGG
CTTACCCTTGATCT

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4DO32JQ 844 0 0
GCAAAAGGAGCAACATAGAAATAGCAAAAATATCATTTCACAAAGATTCATAATACTGAA
TGTGTCCAAACTAAAAAACTTAACAATAATTTCAAGGATAAAAGTAAAATGATTCGGACT
CAATATAACTCTTGACGGGAGAGGAAAGAGTAGACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTG
GCTGGCAAAAATGCACTTCCCGGCTGACGGTTAGCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAAC
TTAGCATTAACACCATCAGGGACAACACGCTTCTCTTGCCTCAACTTGGTAAAGTCTGCT
CTGTTAAACTTGGTAAAACCCCATTTCCTGCTGACGATAATCTTCTGACGACCAGGGAAC
TTAAACTTAGCCCTCCTCAAAGCCTCTTGAGCATGATGACCATGAGCATCCTTGCACCTC
ACAGACAAAAGCACCTGACCAATCGCAACACGAGCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAA
GCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTTCAGCACACGAAAGCATCTTGTTGATC
CTCAAAACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTGAGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGAT
TTCACCATGTACTTGTTGCAAGCAATACGCGCAGCTTCGAGTGCTTCGCTTGAGACGTTC
TCCTTCTCCCATGAGACGAGGTGGACGCAGAAAGGGAACTCATCGACACCCTTCCTCTTC
ATTCCGACATCGTAGATCCTGATCTTGGGATCAGG*ACACCACGGCAGTAGCGAGATTTA
GG*TATGGCTTACCCTTGATCTGACGTAACACCTAGCCGTCTTCTTCCCATGGCGTCTCA
CTGA

QA 1 844 1 844
DS 



CO CL774Contig2 831 4 8 U
GGAAGTCTTCGTCGAGCAGCAGTAGCAGCAGCCCTGTTGTCAGGTTGAGACGCCATGGGA
AGAAGACCGGCTAGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGTAAGCCATACCCTAAATCTCGCTAC
TGCCGTGGTGTCCCTGATCCCAAGATCAGGATCTACGATGTCGGAATGAAGAGGAAGGGT
GTCGATGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCATGGGAGAAGGAGAACGTCTCAAGC
GAAGCACTCGAAGCTGCGCGTATCGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCTGGGAAA
GATGCGTTCCATCTCAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTTTTGAGGATCAACAAGATG
CTTTCGTGTGCTGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCTTTTGGAAAGGCG
TTGGGTACTTGTGCTCGTGTTGCGATTGGTCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGCAAGGAT
GCTCATGGTCATCATGCTCAAGAGGCTTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGT
CAGAAGATTATCGTCAGCAGGAAATGGGGTTTTACCAAGTTTAACAGAGCAGACTTTACC
AAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTGTCCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGT
CATGGACCTTTGGCTAACCGTCAGCCGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTAAAGT
TTCAGGACTGTAGTCTACTCTTTCCTCTCCCGTCAAGAGTTATATTGAGTCCGAATCATT
TTACTTTTATCCTTAAAATTATTGTTAAGTTTTTTAGTTTGGACACACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO32TF U 3
AF RR4DP50TF U 9
AF RR4DW72TF U 1
AF RR4AI33TF U 12
BS 1 340 RR4DW72TF
BS 341 341 RR4DO32TF
BS 342 587 RR4DW72TF
BS 588 588 RR4DO32TF
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BS 726 726 RR4AI33TF
BS 727 776 RR4DW72TF
BS 777 831 RR4AI33TF

RD RR4DO32TF 718 0 0
GGGTCTTC
GTCGAGCAGCAGTAGCAGCAGCCCTGTTGTCAGGTTGAGACGCCATGGGAAGAAGACCGG
CTAGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGTAAGCCATACCCTAAATCTCGCTACTGCCGTGGTG
TCCCTGATCCCAAGATCAGGATCTACGATGTCGGAATGAAGAGGAAGGGTGTCGATGAGT
TCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCATGGGAGAAGGAGAACGTCTCAAGCGAAGCACTCG
AAGCTGCGCGTATTGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCTGGGAAAGATGCGTTCC
ATCTCAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTTTTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGTG
CTGAAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCTTTTGGAAAGGCGTTGGGTACTT
GTGCTCGTGTTGCGATTGGTCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGCAAGGATGCTCATGGTC
ATCATGCTCAAGAGGCTTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAGAAGATTA
TCGTCAGCAGGAAATGGGGTTTTACCAAGTTTAACAGAGCAGACTTTACCAAGTTGAGGC
AAGAGAAGCGTGTTGTCCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGTCATGGACCTT
TGGCTAACCGTCAGCCGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTAAAGT

QA 9 718 9 718
DS 

RD RR4DP50TF 675 0 0
GGGTCGAGCAGCAGT
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GATCAGGATCTACGATGTCGGAATGAAGAGGAAGGGTGTCGATGAGTTCCCTTTCTGCGT
CCACCTCGTCTCATGGGAGAAGGAGAACGTCTCAAGCGAAGCACTCGAAGCTTCGCGTAT
CGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCTGGGAAAGATGCGTTCCATCTCAGGATTAG
GGTTCACCCTTTCCATGTTCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGTGCTGGAGCTGATAG
GCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCTTTTGGAAAGGCGTTGGGTACTTGTGCTCGTGTTGC
GATTGGTCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGCGAGGATGCTCATGGTCATCATGCTCAAGA
GGCTTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAGAAGATTATCGTCAGCAGGAA
ATGGGGTTTTACCAAGTTTAACAGAGCGGACTTTACCAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGT
TGTCCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGTCATGGACCTTTGGCTAACCGTCA

QA 16 675 16 675
DS 

RD RR4DW72TF 776 0 0
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AGAAGACCGGCTAGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGTAAGCCATACCCTAAATCTCGCTAC
TGCCGTGGTGTCCCTGATCCCAAGATCAGGATCTACGATGTCGGAATGAAGAGGAAGGGT
GTCGATGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCATGGGAGAAGGAGAACGTCTCAAGC
GAAGCACTCGAAGCTGCGCGTATCGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCTGGGAAA
GATGCGTTCCATCTCAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGCTTTGAGGATCAACAAGATG
CTTTCGTGTGCTGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCTTTTGGAAAGGCG
TTGGGTACTTGTGCTCGTGTTGCGATTGGTCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGCAAGGAT
GCTCATGGTCATCATGCTCAAGAGGCTTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGT
CAGAAGATTATCGTCAGCAGGAAATGGGGTTTTACCAAGTTTAACAGGGCAGACTTTACC
AAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTGTCCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGT
CATGGACCTTTGGCTAACCGTCAGCCGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTAAAGT
TTCAG*ACTGTAGTCTACTCTTTCCTCTCCCGTCAAGAGTTATATTGAGTCCGAAT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4AI33TF 820 0 0
GGGTCGAGGAGC
AGCAGCAGCCCTGTTGTCAGATTGAGACGCCATGGGAAGAAGACCGGCTAGGTGTTACCG
TCAGATCAAGGGTAAGCCATACCCTAAATCTCGCTACTGCCGTGGTGTCCCTGACCCCAA
GATCAGGATCTACGATGTCGGAATGAAGAGGAAGGGTGTCGATGAGTTCCCTTTCTGCGT
CCACCTCGTCTCATGGGAGAAGGAGAACGTCTCAAGCGAAGCACTCGAAGCTGCGCGCAT
CGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCTGGGAAAGATGCGTTCCATCTGAGGATTAG
GGTTCACCCTTTCCATGTTTTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGTGCTGGAGCTGATAG
GCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCCTTTGGAAAGGCGTTGGGTACTTGTGCTCGTGTTGC
GATTGGTCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCACCATGCTCAAGA
GGCTTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGCCAAAAGATTATCGTCAGCAGGAA
ATGGGGTTTTACTAAGTTCAACAGAGCAGACTTTACCAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGT
TGTCCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGTCACGGACCTTTGGCTAACCGTCA
GCCGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTAAAGTTTCAGGACTGTAGTCTACTCTTT
CCTCTCCCGTGAAGAGTTGTATTGAGTCTGAATCATTTTACTTTTATCCTTAAAATTATT
GTTAAGTTTTTTAGTTTGGACACACATT

QA 13 820 13 820
DS 



AS 2 7

CO CL775Contig1 909 5 11 U
ACGAGGACAATCCACAAAAGATATCATTCAAAACTAGGGTTTATAACAAATTTAAATAAG
TTGAGCTACGCTGCGTAATTTCTTGAACAAGAGTCAATGAAAACTGTAAACAAGGTTGTC
CGAAAGTTTTTTTTTT*GTGTTTCTCGACTGAAGATTATGAAAGGAAAACTATATCGCAT
TACCCGTAGACTTCAGTTGAAAAGTCCAGGGTTTAGCCAGTCCTTGGTGATATCATCAAG
ATGGTCATCAACATCTGTGACGTCCTTCCATTTCTCAGATGAAATGTAATCTGACAAAAC
TACATTCGCCGAGGGCTCTTTCAACAGTAGCTTGCTTCCTCCATCTGCCCCAACCACTCT
CCAGTTCTTGGAAGCATCTTTCACACAAAGCTGCATCACAGGGCTTCGCTCTTTACCCTT
TGATAAGGCTTCAAGCTTTTTGTTGTTCAACAAGAGAATAGGTGCAGGAGGGAAATAGCG
AGAGATGTGATCACCAATGTTCTTAGCCACACCACAGAGATCCACATCATCAAACCTCTC
GTTGGCGTGAAAGTAGCCAACAATACTCAAACCTTGAGCCACGTAATGCTCCTCTATCAT
GATGAGGGAGATCTCGAGAGGAGGAAGAAGAGCGAGGTTAGAGTGAAAGAGCGGCACGGA
ATCGGAGATCTCCACGAGGCCTTCGTCCTTAGGGCTGATTCGACCGACGAGGACTCCGTT
GACCGCCGCCGTCTTGTGACGCAGCGAGTGGAGAACGAGTTTGATGTACGCGTCCTGCGA
GATCTCGTACTTCAATTCCCCGTTGTTACTCCCCATCCCTACCTAACTCGATTCGATCGG
AGGAGACTCACTGATGATGATTCAGTTCTTAAATCTCCACTCGCTGAGAATTATCAAGTC
GCAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GL68JQ U 1
AF RR4BK52JQ U 6
AF RR4AX53JQ U 43
AF RR4AX53TF C 55
AF RR4BK52TF C 192
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BS 279 455 RR4GL68JQ
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BS 457 612 RR4GL68JQ
BS 613 631 RR4AX53JQ
BS 632 909 RR4AX53TF

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CGAAAGTTTTTTTTT**GTGTTTCTCGACTGAAGATTATGAAAGGAAAACTATATCGCAT
TACCCGTAGACTTCAGTTGAAAAGTCCAGGGTTTAGCCAGTCCTTGGTGATATCATCAAG
ATGGTCATCAACATCTGTGACATCCTTCCATTTCTCAAATGAAATGTAATCTGACAAAAC
TACATTCGCCGAGGGCTCTTTCAACAGTAGCTTGCTTCCTCCATCTGCCCCAACCACTCT
CCAGTTCTTGGAAGCATCTTTCACACAAAGCTGCATCACAGGGCTTCGCTCTTTACCCTT
TGATAAGGCTTCAAGCTTTTTGTTGTTCAACAAGAAAATAGGTGCAGGAGGGAAATAGCG
AGAGATGTGATCACCAATGTTCTTAGCCACACCACAGAGATCCACATCATCAAACCTCTC
GTTGGCGTGAAAGTAGCCAACAATACTCAAACCTTGAGCCACGTAATGCTCCTCTATCAT
GATGAGGGAGAT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4BK52JQ 603 0 0
GG
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ACGCTGCGTAATTTCTTGAACAAGAGTCAATGAAAACTGTAAACAAGGTTGTCCGAAAGT
TTTTTTTTTTGTGTTTCTCGACTGAAGATTATGAAAGGAAAACTATATCGCATTACCCGT
AGACTTCAGTTGAAAAGTCCAGGGTTTAGCCAGTCCTTGGTGATATCATCAAGATGGTCA
T*AACATCTGTGACGTCCTTCCATTTCTCAGATGAAATGTAATCTGACAAAACTACATTC
GCCGAGGGCTCTTTCAACAGTAGCTTGCTTCCTCCATCTGCCCCAACCACTCTCCAGTTC
TTGGAAGCATCTTTCACACAAAGCTGCATCACAGGGCTTCGCTCTTTACCCTTTGATAAG
GCTTCAAGCTTTTTGTTGTTCAACAAGAAAATAGGTGCAGGAGGGAAATAGCGAGAGATG
TGATCACCAATGTTCTTAGCCACACCACAGAAATCCACATCATCAAACCTCTCGTTGGCG
TGAAAGTAGCCAACAATACTCAAACCTTGAGCCACGTAATGCTCCTCTATCATGATGAGG
G

QA 3 603 3 603
DS 

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ACTGTAAACAAGGTTGTCCGAAAGTTTTTTTTTT*GTGTTTCTCGACTGAAGATTATGAA
AGGAAAACTATATCGCATTACCCGTAGACTTCAGTTGAAAAGTCCAGGGTTTAGCCAGTC
CTTGGTGATATCATCAAGATGGTCATCAACATCTGTGACGTCCTTCCATTTCTCAGATGA
AATGTAATCTGACAAAACTACATTCGCCGAGGGCTCTTTCAACAGTAGCTTGCTTCCTCC
ATCTGCCCCAACCACTCTCCAGTTCTTGGAAGCATCTTTCACACAAAGCTGCATCACAGG
GCTTCGCTCTTTACCCTTTGATAAGGCTTCAAGCTTTTTGTTGTTCAACAAGAGAATAGG
TGCAGGAGGGAAATAGCGAGAGATGTGATCACCAATGTTCTTAGCCACACCACAGAGATC
CACATCATCAAACCTCTCGTTGGCGTGAAAGTAGCCAACAATACTCAAACCTTGAGCCAC
GTAATGCTCCTCTATCATGATGAGGGAGATCTCGAGAGGAGGAAGAAGA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4AX53TF 855 0 0
AAATAAG
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GAGAGTTTTTTTTTT*GTGTTTCTCGACTGAAGATTATGAAAGGAAAACTATATCGCATT
ACCCGTAGACTTCAGTTGAAAAGTCCAGGGTTTAGCCAGTCCTTGGTGATATCATCAAGA
TGGTCATCAACATCTGTGACGTCCTTCCATTTCTCAGATGAAATGTAATCTGACAAAACT
ACATTCGCCGAGGGCTCTTTCAACAGTAGCTTGCTTCCTCCATCTGCCCCAACCACTCTC
CAGTTCTTGGAAGCATCTTTCACACAAAGCTGCATCACAGGGCTTCGCTCTTTACCCTTT
GATAAGGCTTCAAGCTTTTTGTTGTTCAACAAGAGAATAGGTGCAGGAGGGAAATAGCGA
GAGATGTGATCACCAATGTTCTTAGCCACACCACAGAGATCCACATCATCAAACCTCTCG
TTGGCGTGAAAGTAGCCAACAATACTCAAACCTTGAGCCACGTAATGCTCCTCTATCATG
ATGAGGGAGATCTCGAGAGGAGGAAGAAGAGCGAGGTTAGAGTGAAAGAGCGGCACGGAA
TCGGAGATCTCCACGAGGCCTTCGTCCTTAGGGCTGATTCGACCGACGAGGACTCCGTTG
ACCGCCGCCGTCTTGTGACGCAGCGAGTGGAGAACGAGTTTGATGTACGCGTCCTGCGAG
ATCTCGTACTTCAATTCCCCGTTGTTACTCCCCATCCCTACCTAACTCGATTCGATCGGA
GGAGACTCACTGATGATGATTCAGTTCTTAAATCTCCACTCGCTGAGAATTATCAAGTCG
CAGCGTCC

QA 8 855 8 855
DS 

RD RR4BK52TF 718 0 0
GACTTCAGTGAAAGT
CAGGGTTTAGCCAGTC*TTGGTGATATCATCAAGATGGTCAT*AACATCTGTGACGTC*T
TCCATTTCTCAGATGAAATGTAATCTGACAAAACTACATTCGCCGAGGGCTCTTTCAACA
GTAGCTTGCTTCCTCCATCTGCCCCAACCACTCTCCAGTTCTTGGAAGCATCTTTCACAC
AAAGCTGCATCACAGGGCTTCGCTCTTTACCCTTTGATAAGGCTTCAAGCTTTTTGTTGT
TCAACAAGAGAATAGGTGCAGGAGGGAAATAGCGAGAGATGTGATCACCAATGTTCTTAG
CCACACCACAGAGATCCACATCATCAAACCTCTCGTTGGCGTGAAAGTAGCCAACAATAC
TCAAACCTTGAGCCACGTAATGCTCCTCTATCATGATGAGGGAGATCTCGAGAGGAGGAA
GAAGAGCGAGGTTAGAGTGAAAGAGCGGCACGGAATCGGAGATCTCCACGAGGCCTTCGT
CCTTAGGGCTGATTCGACCGACGAGGACTCCGTTGACCGCCGCCGTCTTGTGACGCAGCG
AGTGGAGAACGAGTTTGATGTACGCGTCCTGCGAGATCTCGTACTTCAATTCCCCGTTGT
TACTCCCCATCCCTACCTAACTCGATTCGATCGGAGGAGACTCACTGATGATGATTCAGT
TCTTAAATCTCCACTCGCTGAGAATTATCAAGTCGCAGCGT
CC

QA 16 716 16 716
DS 



CO CL775Contig2 942 2 20 U
GGGATTACGCCGCGACTTGATAATTCTCAGCGAGTGGAGATTTAAGAACTGAATCATCAT
CAGTGAGTCTCCTCCGTCCGATCGATCGAGTTAGGTAGGGATGGGGAGTAACAACGGGGA
ATTGAAGTACGAGATCTCGCAGAACGCGTACATCAAACTCGTTCTCCACTCGCTGCGTCA
CAAGACGGCGGCGGTCAACGGAGTCCTCGTCGGTCGAATCAGCCCCAAGGACGAAAGCCT
CGTGGAGATCTCCGATTCCGTGCCGCTCTTTCACTCTAACCTCGCTCTCCTTCCTCCTCT
CGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACGTGGCTCAAGGTTTGAGTATTGTTGG
CTACTTTCACGCCAACGAGAGGTTTGATGATGTGGAGCTCTGTGGTGTGGCTAAGAACAT
TGGTGATCACATCTCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTGAACAACAAAAA
GCTTGAAGCCTTATCAAAGGGTAAAGAGCGAAGCCCTGTGATGCAGCTTTGTGTGAAAGA
TGCTTCCAAGAACTGGAGAGTGGTTGGGGCAGATGGAGGAAGCAAGCTACTGTTGAAAGA
GCCATCGGCGAATGTAGTTTTGTCAGATTACATTTCATCTGAGAAATGGAAGGACGTCAC
AGATGTTGATGACCATCTTGATGATATCACAAAGGACTGGCTAAACCCTGGACTTTTCAA
CTGAAGACTACGGGTAATGCAATATAGTTTTCCTTTCATAATTTTCAATCGAGAAACAAA
ACAAGAAAAAAACTCTCGGAGAACCTTGTTACAATTTTCGTCGACTCTTGTTCAAGAATT
ATGCAGCGTAGCTCAAGTTATTTGAATTTGTTATATCTTAAAATAGTTTTTTTTATAACT
TGAACTAGGTGATAACCTGCCCATTGCGCAGGGTGAATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL68TF U 1
AF RR4BZ25JQ C 134
BS 1 142 RR4GL68TF
BS 143 143 RR4BZ25JQ
BS 144 225 RR4GL68TF
BS 226 226 RR4BZ25JQ
BS 227 235 RR4GL68TF
BS 236 236 RR4BZ25JQ
BS 237 288 RR4GL68TF
BS 289 289 RR4BZ25JQ
BS 290 396 RR4GL68TF
BS 397 397 RR4BZ25JQ
BS 398 603 RR4GL68TF
BS 604 604 RR4BZ25JQ
BS 605 652 RR4GL68TF
BS 653 653 RR4BZ25JQ
BS 654 654 RR4GL68TF
BS 655 655 RR4BZ25JQ
BS 656 694 RR4GL68TF
BS 695 695 RR4BZ25JQ
BS 696 715 RR4GL68TF
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RD RR4GL68TF 715 0 0
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CAGTGAGTCTCCTCCGTCCGATCGATCGAGTTAGGTAGGGATGGGGAGTAACAACGGGGA
ATTGAAGTACGAGATCTCGCAGGACGCGTACATCAAACTCGTTCTCCACTCGCTGCGTCA
CAAGACGGCGGCGGTCAACGGAGTCCTCGTCGGTCGAATCAGCCCTAAGGACGAAGGCCT
CGTGGAGATCTCCGATTCCGTGCCGCTCTTTCACTCTAACCTCGCTCTTCTTCCTCCTCT
CGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACGTGGCTCAAGGTTTGAGTATTGTTGG
CTACTTTCACGCCAACGAGAGGTTTGATGATGTGGATCTCTGTGGTGTGGCTAAGAACAT
TGGTGATCACATCTCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTGAACAACAAAAA
GCTTGAAGCCTTATCAAAGGGTAAAGAGCGAAGCCCTGTGATGCAGCTTTGTGTGAAAGA
TGCTTCCAAGAACTGGAGAGTGGTTGGGGCAGATGGAGGAAGCAAGCTACTGTTGAAAGA
GCCCTCGGCGAATGTAGTTTTGTCAGATTACATTTCATCTGAGAAATGGAAG*ATGTCAC
AGATGTTGATGACCATCTTGATGATATCACAAAG*ACTGGCTAAACCCTGGACTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4BZ25JQ 809 0 0
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GTCAACGGAGTCCTCGTCGGTCGAATCAGCCCCAAGGACGAAAGCCTCGTGGAGATCTCC
GATTCTGTGCCGCTCTTTCACTCTAACCTCGCTCTCCTTCCTCCTCTCGAGATCTCCCTC
ATCATGATAGAGGAGCATTACGTGGCTCAAGGTTTGAGTATTGTTGGCTACTTTCACGCC
AACGAGAGGTTTGATGATGTGGAGCTCTGTGGTGTGGCTAAGAACATTGGTGATCACATC
TCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTGAATAACAAAAAGCTTGAAGCCTTA
TCAAAGGGTAAAGATCGAAGCCCTGTTATGCAGCTTTGTGTGAAAGATGCTTCCAAGAAC
TGGAGAGTGGTTGGGGCAGATGGAGGAAGCAAGCTACTGTTGAAAGAGCCATCGGCGAAT
GTAGTTTTGTCAGATTACATTTCATTTGAGAAATGGAAGGACGTCACAGATGTTGATGAT
CATCTTGATGATATCACCAAGGACTGGCTAAACCCTGGACTTTTCAACTGAAGACTACGG
GTAATGCAATATAGTTTTCCTTTCATAATTTTCAATCGAGAAACAAAACAAGAAAAAAAC
TCTCGGAGAACCTTGTTACAATTTTCGTCGACTCTTGTTCAAGAATTATGCAGCGTAGCT
CAAGTTATTTGAATTTGTTATATCTTAAAATAGTTTTTTTTATAACTTGAACTAGGTGAT
AACCTGCCCATTGCGCAGGGTGAATGACG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 2 7

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GAATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAA
TCGGTCAAGAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGCTAGCTCCAAATCGGAAACTC
ATCATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATGTAATAATTACAAGTCATTT
ATTACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTG
GGCAAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTTGCCCGCGGC
ACCCAATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAAACCGTCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTATCG
CACGTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATT
TTATTGTCTCTTAAACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGAGC
CTATCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCA
CCGCCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BI38TF C 1
AF RR4B728JQ U 3
AF RR4B728TF C 3
AF RR4BI38JQ U 3
BS 1 4 RR4BI38TF
BS 5 637 RR4B728JQ

RD RR4BI38TF 637 0 0
TTAGAATGAATGAAATTTTCATACAAAAGTGGAGATTCAAAAATCTATAGTATACAATCT
GAATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAA
TCGGTCAAGAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGCTAGCTCCAAATCGGAAACTC
ATCATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATGTAATAATTACAAGTCATTT
ATTACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTG
GGCAAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAGAAACCCTAGGCTTTGCCCGCGGC
ACCCAATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAGACCGTCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTATCG
CACGTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATT
TTATTGTCTCTTAGACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGAGC
CTATCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCA
CCGCCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATC

QA 1 637 1 637
DS 

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AG
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TCAAGAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGCTAGCTCCAAATCGGAAACTCATCA
TTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATGTAATAATTACAAGTCATTTATTA
CTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGGCA
AACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTTGCCCGCGGCACCC
AATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAAACCGTCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTATCGCACG
TGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTAT
TGTCTCTTAAACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTAT
CGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCGC
CTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATC

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR4B728TF 635 0 0
AG
AATGAATGAAATTTTCATACAAAAGTGGAGATTCAAAAATCTATAGTATACAATCTGAAT
TCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAATCGG
TCAAGAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGCTAGCTCCAAATCGGAAACTCATCA
TTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATGTAATAATTACAAGTCATTTATTA
CTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGGCA
AACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAGAAACCCTAGGCTTTGCCCGCGGCACCC
AATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAGACCGTCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTATCGCACG
TGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTAT
TGTCTCTTAGACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTAT
CGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCGC
CTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATC

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR4BI38JQ 635 0 0
AA
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TCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAATCGG
TCAAGAAAAGACTACGTCGTTGAAACACATTCCGGCTAGCTCCAAATCGGAAACTCATCA
TTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATGTAATAATTACAAGTCATTTATTA
CTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGGCA
AACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTTGCCCGCGGCACCC
AATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAAACCGTCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTATCGCACG
TGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTAT
TGTCTCTTAAACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTAT
CGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCGC
CTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATC

QA 3 635 3 635
DS 



CO CL776Contig2 1009 3 10 U
TTTTTCTCCCTTTCTTTGGATTTTAAAACCGATGGATCGGCAAAATTCCGATGACATTAT
GAGATTTCTCGATGGAATGGCTAGCTCCGACGACGTTCTATTCGGTTTCCTTGACGAAGG
AAACCAGTCACCGGAAGACTTCCCGGACTCCGGTAACCCCAACGGTGGTGAAGATACAGA
CGACGTTGACGAAAATAGCAATTGCAATTCTGAAGAAAACAAAGCTTTCTGGCAGGAACA
AGAACAACTTCTTCAGGGAACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAAACAAAGATTAGACA
AGCGACAAAGGAAGCCCTGAGAGAAGTTAAATCAAAGGGTCTTCATTGTGTCTGCCGACG
ACCCATTGCTGGTGGTTGCCGGAGCTGCTTACGTGGTGAAACCTCTCGACACCTTAGAGA
TGTGGCCGGCTACGACTGCGTTATCTCCAAATCCAAGTGGAGAAGCTCTCAAGACATCCC
AGCAGGGGAACACGAATACATAGAGATCGTGGACCGATCTGATCCGAAGAAAGGCGAGAT
GCGAGTGGTGATTGAGTTATCATTCAGGGCAGAGTTCGAGATTGCAAAAGGCGGTGAAGA
GTACAAAAGGCTTATCAGCCGATTGCCGGAGGTTTACGTCGGGAAAACCGAGAGACTCAG
ATCCCTGATCAAGATATTATGCATCGCCGGGAAGAAATGCTTGAGAGACAAGAAAATGCA
TATGGGACCTTGGAGAAAACACAAGTATATGCAAGCCAAGTGGCTTGGCACGTGCGATAG
ATCGAGCTCCTTGGAAGCGGCCGTGGTTTCCGAGATGACTGAACCGGAGAATTGGGTACC
GCTGGTGAAGCCTAGGGTTTCCATGCTGAACTACGATGGCAGTTTTTCTAACGGGATGGG
CCGTTCTGCCGCTGTAACAGTCTTGTGATATGTGAATGTGTGTGACGCAAATACTATTGA
TGACTTGTAATTATTTATTTATTTGATCAGGGGAAGTAAGAGTTACATT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B342TF U 6
AF RR4DP60TF U 1
AF RR4B342JQ C 412
BS 1 158 RR4DP60TF
BS 159 159 RR4B342TF
BS 160 356 RR4DP60TF
BS 357 357 RR4B342TF
BS 358 609 RR4DP60TF
BS 610 610 RR4B342JQ
BS 611 634 RR4DP60TF
BS 635 635 RR4B342JQ
BS 636 651 RR4DP60TF
BS 652 1009 RR4B342JQ

RD RR4B342TF 558 0 0
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TTCTCGATGGAATGGCTAGCTCCGACGACGTTCTATTCGGTTTCCTTGACGAAGGAAACC
AGTCACCGGAAGACTTCCCGGACTCCGGTAACCCCAACGGTGGTGAAGATACAGACGACG
TTGACGAAAATAGCAATTGCAATTCTGAAGAAAACAAAGCTTTCTGGCAGGAACAAGAAC
AACTTCTTCAGGGAACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAAACAAAGATTAGACAAGCGA
CAAAGGAAGCCCTGAGAGAAGTTAAATCAAAGGGTCTTCATTGTGTCTGCCGACGACCCA
TTGCTGGTGGTTGCCGGAGCTGCTTACGTGGTGAAATCTCTCGACACCTTAGAGATGTGG
CCGGCTACGACTGCGTTATCTCCAAATCCAAGTGGAGAAGCTCTCAAGACATCCCAGCAG
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TGGTGATTGAGTTATCAT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4DP60TF 658 0 0
TTTTTCTCCCTTTCTTTGGATTTTAAAACCGATGGATCGGCAAAATTCCGATGACATTAT
GAGATTTCTCGATGGAATGGCTAGCTCCGACGACGTTCTATTCGGTTTCCTTGACGAAGG
AAACCAGTCACCGGAAGACTTCCCGGACTCCGGTAACCTCAACGGTGGTGAAGATACAGA
CGACGTTGACGAAAATAGCAATTGCAATTCTGAAGAAAACAAAGCTTTCTGGCAGGAACA
AGAACAACTTCTTCAGGGAACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAAACAAAGATTAGACA
AGCGACAAAGGAAGCCCTGAGAGAAGTTAAATCAAAGGGTCTTCATTGTGTCTGCCTACG
ACCCATTGCTGGTGGTTGCCGGAGCTGCTTACGTGGTGAAACCTCTCGACACCTTAGAGA
TGTGGCCGGCTACGACTGCGTTATCTCCAAATCCAAGTGGAGAAGCTCTCAAGACATCCC
AGCAGGGGAACACGAATACATAGAGATCGTGGACCGATCTGATCCGAAGAAAGGCGAGAT
GCGAGTGGTGATTGAGTTATCATTCAGGGCAGAGTTCGAGATTGCAAAAGGCGGTGAAGA
GTACAAAAG*CTTATCAGCCGATTGCCGGAGGTT*ACGTCGGGAAAACCGA
GAGACTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4B342JQ 598 0 0
CCTTAGAGATGTGGCCGGCTACGACTGCGTTATCTCCAAATCCAAGTGGAGAAGCTCTCA
AGACATCCCAGCAGGGGAACACGAATACATAGAGATCGTGGACCGATTTGATCCGAAGAA
AGGCGAGATGCGAGTGGTGATTGAGTTATCATTCAGGGCAGAGTTCGAGATTGCAAAAGG
CGGTGAAGAGTACAAAAGGCTTATCAGCCGATTGCCGGAGGTTTACGTCGGGAAAACCGA
GAGACTCAGATCCCTGATCAAGATATTATGCATCGCCGGGAAGAAATGCTTGAGAGACAA
GAAAATGCATATGGGACCTTGGAGAAAACACAAGTATATGCAAGCCAAGTGGCTTGGCAC
GTGCGATAGATCGAGCTCCTTGGAAGCGGCCGTGGTTTCCGAGATGACTGAACCGGAGAA
TTGGGTACCGCTGGTGAAGCCTAGGGTTTCCATGCTGAACTACGATGGCAGTTTTTCTAA
CGGGATGGGCCGTTCTGCCGCTGTAACAGTCTTGTGATATGTGAATGTGTGTGACGCAAA
TACTATTGATGACTTGTAATTATTTATTTATTTGATCAGGGGAAGTAAGAGTTACATT

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 8

CO CL777Contig1 664 8 10 U
CTCTCTTTCGGTCTTTCCTCTCACACTCTCTAAAGAAAATGCAAAACAGAAACTTACAAC
AAATTTTCATCTATATAACACCTCTATATCCCTTACCCACTAATAAAGGACGTCTCACTT
CTTTTATCTTTCTCCCTTCTTCCTCCCTCTATAATCTCCAAAGATGTGTTTACGTTCTTC
AGAACCATTCTCATACACACCCACGAGATTAGTTTTGTACCTCAAAACACATACACACGT
TCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAAAGGAGATGGAAAT
GAACAATATAAAGCTTTACACTGAGAATCAACACATCATACGGGAGAACGAAAAACTTAA
GAAGAAAGCTCTTCTTCTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTCTTCTCTCTGCTTCAGACCAA
AACAAGTTCCCATGTTCTTTAAAAACCTTACCATCACCAAGATCATAGTCTTCTACTTCT
TTAGTGATTTAATAATAAATATCTAAATGGCTCTAGTTATCTAAGTGGTCTGTTTGTTTT
GTTCAAATCTAAGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATTTCTGGGTTTACAT
CTAATTTTTTTTTCTTTGTTATCGTGTAATAATAATCTCTGTACTGTATGCGTGTTCTTT
TGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4BM17TF U 1
AF RR4BR09TF U 108
AF RR4BR09JQ C 108
AF RR4C037JQ C 492
AF RR4BR21TF U 108
AF RR4C037TF U 108
AF RR4BR21JQ C 108
AF RR4CW93TF U 109
BS 1 107 RR4BM17TF
BS 108 109 RR4BR09TF
BS 110 145 RR4BM17TF
BS 146 146 RR4BR09TF
BS 147 341 RR4BM17TF
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BS 343 355 RR4BM17TF
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BS 651 664 RR4CW93TF

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AAATTTTCATCTATATAACACCTCTATATCCCTTACCCACTAATAAAACACGTCTCACTT
CTTTTATCTTTCTCCCTTCTTCCTCTCTCTATAATCTCCAAAGATGTGTTTACGTTCTTC
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TCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAAAGGAGATGGAAAT
GAACAATATAAAGCTTTACACTGAGAATCAACACATCATACAGGAGAACGAAAAA

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR4BR09TF 303 0 0
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GTTTACGTTCTTCAGAACCATTCTCATACACACCCACGAGATTAGTTTTGTACCTCAAAA
CACATACACACGTTCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAA
*GGAGATGGAAATGAACAATATAAAGCTTTACACTGAGAATCAACACATCATACGGGAGA
ACGAAAAACTTAAGAAGAAAGCTCTTCTTCTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTCTTCTCTC
TGC

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR4BR09JQ 543 0 0
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CACATACACACGTTCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAA
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ACGAAAAACTTAAGAAGAAAGCTCTTTTTCTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTTTTCTTTT
TGCTTCAGACCAAAACAAGTTCCCATGTTCTTTAAAAACCTTACCATCACCAAGATCATA
GTCTTCTACTTCTTTAGTGATTTAATAATAAATATCTAAATGGCTCTAGTTATCTAAGTG
GTCTGTTTGTTTTGTTCAAATTTAAGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATT
TCTGGGTTTACATCTAATTTTTTTTTCTTTGTTATCGTGTAATAATAATCTCTGTACTGT
ATG

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DS 

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AGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATTTCTGGGTTTACATCTAATTTTTTT
TTCTTTGTTATCGTGTAATAATAATCTCTGTACTGTATG

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR4BR21TF 543 0 0
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CACATACACACGTTCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAA
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ACGAAAAACTTAAGAAGAAAGCTCTTCTTCTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTCTTCTCTC
TGCTTCAGACCAAAACAAGTTCCCATGTTCTTTAAAAACCTTACCATCACCAAGATCATA
GTCTTCTACTTCTTTAGTGATTTAATAATAAATATCTAAATGGCTCTAGTTATCTAAGTG
GTCTGTTTGTTTTGTTCAAATCTAAGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATT
TCTGGGTTTACATCTAATTTTTTTTTCTTTGTTATCGTGTAATAATAATCTCTGTACTGT
ATG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4C037TF 543 0 0
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CACATACACACGTTCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAA
AGGAGATGGAAATGAACAATATAAAGCTTTACACTGAGAATCAACACATCATACGGGAGA
ACGAAAAACTTAAGAAGAAAGCTCTTCTTCTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTCTTCTCTC
TGCTTCAGACCAAAACAAGTTCCCATGTTCTTTAAAAACCTTACCATCACCAAGATCATA
GTCTTCTACTTCTTTAGTGATTTAATAATAAATATCTAAATGGCTCTAGTTATCTAAGTG
GTCTGTTTGTTTTGTTCAAATCTAAGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATT
TCTGGGTTTACATCTAATTTTTTTTTCTTTGTTATCGTGTAATAATAATCTCTGTACTGT
ATG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4BR21JQ 543 0 0
GGACGTCTCACTTCTTTTATCTTTCTCCCTTCTTCCTCCCTCTATAATCTCCAAAGATGT
GTTTACGTTTTTCAGAACCATTTTCATACACACCCACGAGATTAGTTTTGTACCTCAAAA
CACATACACACGTTCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAA
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ACGAAAAACTTAAGAAGAAAGCTTTTTTTTTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTTTTCTTTT
TGCTTCAGACCAAAACAAGTTCCCATGTTCTTTAAAAACCTTACCATCACCAAGATCATA
GTCTTCTACTTCTTTAGTGATTTAATAATAAATATCTAAATGGCTCTAGTTATCTAAGTG
GTCTGTTTGTTTTGTTCAAATCTAAGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATT
TCTGGGTTTACATCTAATTTTTTTTTCTTTGTTATCGTGTAATAATAATCTCTGTACTGT
ATG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4CW93TF 556 0 0
GGG
GTCTCACTTCTTTTATCTTTCTCCCTTCTTCCTCTCTCTATAATCTCCAAAGATGTGTTT
ACGTCCTTCAGAACCATTCTCATACACACCCACGAGATTAGTTTTGTACCTCAAAACACA
TACACACGTTCGTATCCCTCGCCTGTCAAGGAGGAGAATGAAGTGGCAGAAAAAAAAGGA
GATGGAAATGAACAATATAAAGCTTTACACTGAGAATCAACACATCATACAGGAGAACGA
AAAACTTAAGAAGAAAGCTCTTCTTCTTCACCAAGAAAACAAAGCTCTCTTCTCTCTGCT
TCAGACCAAAACAAGTTCCCATGTTCTTTAAAAACCTTACCATCACCAAGATCATAGTCT
TCTACTTCTTTAGTGATTTAATAATAAATATCTAAATGGCTCTAGTTATCTAAGTGGTCT
GTTTGTTTTGTTCAAATCTAAGTTGTCTTATAATTTACAATCAAGGGTTTAGCATTTCTG
GGTTTACATCTAATTTTTTTTTCTTTGTTATCGTGTAACAATAATCTCTGTACTGTATGC
GTGTTCTTTTGTT

QA 4 556 4 556
DS 



AS 1 5

CO CL778Contig1 1133 5 32 U
GGACTCACGGAACTCGCAACCAGTGAAATCACGTTCTCCCTCTCTCTCTCACTCTTCGAA
AAATTCGAAGCTGAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCT
TTTTTGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCTACACCGACACCGTCGTTCG
AAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCCGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGA
TCTGGAATCTCGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATATGTACA
GATTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTCGTTA
CCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTG
AATTTCTAGGGAACCGTACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAGAACG
GAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACA
CTTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTC
GAGTGTACAAGAACAGCGATAAGGTACCAAACAATGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGA
TGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGA
AGACCGACTGGAAAAAAGCTCCGTTCGTCTCTTCTTACAAGGACTTCGCCGTCGAAGGAT
GCCGCTGGAAGGATCCGTTCCCTGCTTGCGTCTCCACCACCACGGACAACTGGTGGGACC
AGTACGACGCATGGCACTTGTCAAAGACACAGAAGATGGACTATGCGTGGGTGCAACGTA
ACCTTGTCGTATACGATTATTGTCAGGACCGTGAGAGATTCCCTAAAATGCCTTGGGAGT
GTTCCATTAGCCCTTGGGCTTAATCTCAAATTTTGGTCTTTCATTCAAATGTATTAAGTT
GAAATGGTTGCTGTAATAATTTTGTACGTTTTTTCTTCTTCATTTCATTTCTCATTGATT
GTATCATCTGTTATTTGATTGATTATTTAGTCGGCTATGTCCCATAACTTTGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF16TF U 72
AF RR4H521TF U 1
AF RR4G061TF U 1
AF RR4FQ20JQ C 342
AF RR4DF16JQ C 565
BS 1 53 RR4G061TF
BS 54 55 RR4H521TF
BS 56 77 RR4G061TF
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BS 83 113 RR4G061TF
BS 114 114 RR4H521TF
BS 115 124 RR4G061TF
BS 125 125 RR4H521TF
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BS 161 161 RR4H521TF
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BS 206 206 RR4H521TF
BS 207 292 RR4G061TF
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BS 446 446 RR4H521TF
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BS 737 737 RR4FQ20JQ
BS 738 777 RR4G061TF
BS 778 956 RR4FQ20JQ
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BS 958 987 RR4FQ20JQ
BS 988 988 RR4DF16JQ
BS 989 1133 RR4FQ20JQ

RD RR4DF16TF 277 0 0
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GCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCTACACCGACACCGTCGTTCGAA**AAATTTC
AATATAATGTGGTCCGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGATCTGGAATCTC
GCCTTACACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATATGTACAGATTTGGATGG
TTCGTTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAG

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR4H521TF 611 0 0
G
GACTCACGGAACTCGTAACCAGTGAAATCACGTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAAA
AATTCGAAGCTGAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCTT
TTTTGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCTACACCGACACCGTCGTTCGA
AGAAAATTTCAATATAATGTGGTCCGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGAT
CTGGAATCTCGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATATGTACAG
ATTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTCGTTAC
CGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTGA
ATTTCTAGGGAACCGTACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAGAACGG
AACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACAC
TTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGGGTACCGATTCG
AGTGTACAAG

QA 2 611 2 611
DS 

RD RR4G061TF 779 0 0
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AAATTCGAAGCTGAGACAACAAAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTTTGTTCT
TTTTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCAACACCGACACCGTCGTTCG
AAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGA
TCTGGAATCTCGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCACATGTACA
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CCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTG
AATTCCTAGGGAACCGAACCGGAGAACCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAGAACG
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CTTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTC
GAGTGTACAAGAACAGCGATAAGGTACCAAACAATGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGA
TGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGA
AGACCGACTGGAAAAA*GCTCCGTTCGTCTCTTCTTACAAGGACTTCGCCGTCGAAG
AT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4FQ20JQ 792 0 0
CGACTCAG
CGGCGTCGTTACCG*TTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGA
GATAGATTTTGAATTTCTAGGGAACCGTACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGT
GTTTAAGAACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAA
GGACTACCACACTTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAG
AGTACCGATTCGAGTGTACAAGAACAGTGATAAGGTACCAAACAATGATTTCTTCCCGAA
CCAGAAGCCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGG
TGGTCTCGAGAAGACCGACTGGAAAAAAGCTCCGTTCGTCTCTTCTTACAAGGACTTCGC
CGTCGAAGGATGCCGCTGGAAGGATCCGTTCCCTGCTTGCGTCTCCACCACCACGGACAA
CTGGTGGGACCAGTACGACGCATGGCACTTGTCAAAGACACAGAAGATGGACTATGCGTG
GGTGCAACGTAACCTTGTCGTATACGATTATTGTCAGGACCGTGAGAGATTCCCTAAAAT
GCCTTGGTAGTGTTCCATTAGCCCTTGGGCTTAATCTCGAATTTTGGTCTTTCATTCAAA
TGTATTAAGTTGAAATGGTTGCTGTAATAATTTTGTACGTTTTTTCTTCTTCATTTCATT
TCTCATTGATTGTATCATCTGTTATTTGATTGATTATTTAGTCGGCTATGTCCCATAACT
TTGT

QA 9 792 9 792
DS 

RD RR4DF16JQ 563 0 0
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TACCAAACAATGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGA
ACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGAAGACCGACTGGAAAAAAGCTCCGT
TCGTCTCTTCTTACAAGGACTTCGCCGTCGAAGGATGCCGCTGGAAGGATCCGTTCCCTG
CTTGCGTCTCCACCACCACGGACAACTGGTGGGACCAGTACGACGCATGGCACTTGTCAA
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AGGACCGTGAGAGATTCCCTAAAATGCCTTGGGAGTGTTCCATTAGCCCTTGGGCTTAAT
CTCAAATTTTGGTCTTTCATTCAAATGTATTAAGTTGAAATGGTTGCTGTAATAATTTTG
TACGTTTTTTCTTCTTCATTTCATTTCTCATTGATTGTATCATCTGTTATTTGATTGATT
ATTTAGTCGGCTATGTCCCATAA

QA 1 563 1 563
DS 



AS 2 5

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ACCTTCCTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCGTACGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACA
ACTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTTTGTACTTTGCGGTAAAGACATTGAAGG
AGACGGGACATGAAAATGTCTACGTCGCCGTCGAGAAGCCTCTCCAGCTTGCTCAGACCG
CCGCTGTTCTCGAGATTTTTCATGGATTAGTAGGTTTGGTCAGATCTCCTGTCTCTGCTA
CTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGCTGTTTCTCACTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAG
AGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTA
TCCGATACTCCTTCCTTGGACTTAAGGAAGCTCTAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGT
GGCTCAGATGCAGCAGCTTTTTAGTGCTATATCCTACCGGTATCACCAGTGAAGTAGGTC
TTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAAGACGTCTGAGATGTACAGCGTTAGGATGCCTA
ACACATTAAACTTCTCATT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E432TF U 2
AF RR4E656TF U 1
BS 1 619 RR4E656TF

RD RR4E432TF 517 0 0
GG
GCCATAAAGTCTTTACTCTTTCGCTCTCTCTTTGGTGAGTCCGAAGTCGCTTTCTCCACC
TTCCTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCGTACGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACAACT
GGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTTTGTACTTTGCGGTAAAGACATTGAAGGAGA
CGGGACATGAAAATGTCTACGTCGCCGTCGAGAAGCCTCTCCAGCTTGCTCAGACCGCCG
CTGTTCTCGAGATTTTTCATGGATTAGTAGGTTTGGTCAGATCTCCTGTCTCTGCTACTC
TGCCGCAGATAGGTTCAAGGCTGTTTCTCACTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGG
TCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTATCC
GATACTCCTTCCTTGGACTTAAGGAAGCTCTAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGC
TCAGATGCAGCAGCTTTTTAGTGCTATATCC
TACC

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR4E656TF 619 0 0
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ACCTTCCTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCGTACGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACA
ACTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTTTGTACTTTGCGGTAAAGACATTGAAGG
AGACGGGACATGAAAATGTCTACGTCGCCGTCGAGAAGCCTCTCCAGCTTGCTCAGACCG
CCGCTGTTCTCGAGATTTTTCATGGATTAGTAGGTTTGGTCAGATCTCCTGTCTCTGCTA
CTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGCTGTTTCTCACTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAG
AGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTA
TCCGATACTCCTTCCTTGGACTTAAGGAAGCTCTAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGT
GGCTCAGATGCAGCAGCTTTTTAGTGCTATATCCTACCGGTATCACCAGTGAAGTAGGTC
TTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAAGACGTCTGAGATGTACAGCGTTAGGATGCCTA
ACACATTAAACTTCTCATT

QA 1 619 1 619
DS 



CO CL779Contig2 943 3 23 U
GGATTCATAAATGCTTTCACTTCCGATCTCTCCGCCATAAAGTCTCTACTCTTTTGCGCC
TCTCTTTGGTGAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCCTTTCCATGGCAGGGTCTTTCTC
CTTCATACGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACAACTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCA
AGTTTTGTACTTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACAGGACATGAAAATGTCTACGACGC
CGTCGAGAAGCCTCTACAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATT
AGTAGGTCTGGTCAGATCTCCTGTTTCTGCTACTCTGCCACAGATAGGTTCAAGGCTGTT
TCTCACTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTC
GCTGGTCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGACTTAAGGA
AGCTCTAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGCTCAGATACAGCAGCTTCTTAGTGCT
ATATCCGACCGGTATCACCAGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAA
GACGTCTGAGATGTACAGCGTGAGGATGCCTAACACATTGAACTTCTCATTCGACTTCTT
CTACGCAACGATACTCGTCCTTGCAATCTATGTCCCTGGCAGTCCACACATGTACAGGTA
CATGCTTGGTCAGCGTAAGAGAGCTCTCTCCAAATCCAAGAGGGAATAAGAAAAGCTTAT
AGAGAGACCAAGGCTCGTACATCAACTGCTTCTCTTCTCTTGCCTAGTTTGTTTCATGTA
CTTCCCTTTGTTAGACTCTTTAAGTCTTTCGTCTTCTGGACTTACTCAATTAAGAGTAAT
GTAATGTTTTAAGATTTAATACGAAAAGTAACGTCTCCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G839TF U 1
AF RR4D631TF U 69
AF RR4D631JQ C 656
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BS 757 943 RR4D631JQ

RD RR4G839TF 712 0 0
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TCTCTTTGGTGAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCCTTTCCATGGCAGGGTCTTTCTC
CTTCGTACGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACAACTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCA
AGTTTTGTACTTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACGGGACATGAAAATGTTTATGAGGC
CGTTGAGAAGCCTCTACAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATT
AGTAGGTCTGGTCAGATCTCCTGTTTCTGCTACTCTGCCACAGATAGGTTCAAGGCTGTT
TCTCACTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTC
GCTGGTCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGACTTAAGGA
AGCTCTAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGCTCAGATACAGCAGCTTCTTAGTGTT
ATATCCGACCGGTATCACCAGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAA
GACGTCTGAGATGTACAGCGTGAGGATGCCTAACACATTGAACTTCTCATTCGACTTCTT
CTACGCAACCATACTCGTTCTTGCA*TCTATGTCCC
AGTAGTCCGCACATGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4D631TF 690 0 0
GG
GAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCCTTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCATCCGT
CGCGTGTACCTCACTCTCTACAACTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTTTGTAC
TTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACAGGACATGAAAATGTCTACGACGCCGTCGAGAAG
CCTCTCCAGCTTGCTCATACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATTAGTAGGTTTG
GTCAGATCTCCTGTTTCTGCTACTCTGCCACAGATAGGTTCAAGGCTGTTTCTCACTTGG
GGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATA
AGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGATTTAAGGAAGCTCTAGGC
TTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGCTCCGATACAGCAGCTTCTTAGTGCTATATCCTACC
GGTATCACCAGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTTGCCACACATTAAGACGTCTGAG
ATGTACAGTGTTAGGATGCCTAACACATTGAACTTCTCATTCGACTTCTTCTACGCAACG
ATACTCGTCCTTGCAATCTATGTCCCTGGCAGTCCACACATGTACAGGTACATGCTTGGT
CAGCGTAAGAGAGCTCTCTCCAAATC
CA

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR4D631JQ 288 0 0
TTC
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TACATGCTTGGTCAGCGTAAGAGAGCTCTCTCCAAATCCAAGAGGGAATAAGAAAAGCTT
ATAGAGAGACCAAGGCTCGTACATCAACTGCTTCTCTTCTCTTGCCTAGTTTGTTTCATG
TACTTCCCTTTGTTAGACTCTTTAAGTCTTTCGTCTTCTGGACTTACTCAATTAAGAGTA
ATGTAATGTTTTAAGATTTAATACGAAAAGTAACGTCTCCTTCCC

QA 4 288 4 288
DS 



AS 1 6

CO CL780Contig1 910 6 15 U
GAGCCTGGGTCTCATGAACCAAGGGGAGGAGCTAAACAGGAACGGAGAGGTGTATATTGA
CAAGCATCCAGAAATGAAAGTAAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAGCAGCCGTTGT
GATCAATAGTCTACCCAAATCAACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCACAAAGGT
GGCCTACACCATCGCCTCTGCTCTTTGCCAGAGAGGAGTTCAGGTCTCGACCCTATTACC
AGAAAAGTATGAGAACCTAAGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGAGACCGTTTGGTCCT
TTTAACCTCTGAAGCACTCGCTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAG
AGAGGAGCAGGAAATGGCCACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACAGTTCCCCCT
CAAGCAGTTTCGTAGAGATTGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATC
TCTAGTGAATATCCACTCCTGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGAGTGCAACTAG
AGTGGCTGGCATATTGCACGCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCGGCACATCCAT
TCTTCTCTCAGATTTGGACCAAGTATGGGAAGCTTGTCTCAGCCACGGCTTCCAGCCTCT
GCTGCTTCCGCATCACTTCAAATACCCCTGATTCCCTACTTTCAAATGATGTGTGTTGTT
TCCGTAATTGATCATATATGATGTACAATAAGCTTCTAGACAATGGATCCAGAATTTCAC
CTCTGTACTTGTTTTCATACTTTTAAATGATGTATGTTGTTCGCTGATGGTTTCACTCAA
TCTATGACAACCTACTATACTATTGCAATGCATGTGTTGTACGTTGCTGAATATCTACTT
CTGATTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI37TF U 1
AF RR4DH49TF U 79
AF RR4GI37JQ C 231
AF RR4BJ04TF U 111
AF RR4DH49JQ C 80
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RD RR4GI37TF 756 0 0
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CAAGCATCCAGAAATGAAAGTAAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAGCAGCCGTTGT
GATCAATAGTCTACCCAAATCAACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCACAAAGGT
GGCCTACACCATCGCCTCTGCTCTTTGCCAGAGAGGAGTTCAGGTCTCGACCCTATTACC
AGAAAAGTATGAGAACCTAAGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGATACCGTTTGGTCCT
TTTAACCTCTGAAGCACTCGCTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAG
AGAGGAGCAGGAAATGGCCACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACAGTTCCCCCT
CAAGCAGTTTCGTAGAGATTGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATC
TCTAGTGAATATCCACTCCTGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGAGTGCAACTAG
AGTGGCTGGCATATTGCATGCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCGGCACATCCAT
TCTTCTCTCAGATTTGGACCAAGTATGGGAAGCTTGTCTCAGCCACG*CTTCCAGCCTCT
GCTGCTTCCGCATCACTTCAA*TACCCCTGATTCCCTACTTTCAA*TGATGTGTGTTGTT
TCCGTAATTGATCATATATGATGTACAATAAGCTTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4DH49TF 681 0 0
G
GTAAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAGCAGCCGTTGTGATCAATAGTCTACCCAAA
TCAACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCACAAAGGTGGCCTACACCATCGCCTCT
GCTCTTTGCCAGAGAGGAGTTCAGGTCTCGACCCTATTACCAGAAAAGTATGAGAACCTA
AGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGAGACCGTTTGGTCCTTTTAACCTCTGAAGCACTC
GCTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCC
ACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACAGTTCCCCCTCAAGCAGTTTCGTAGAGAT
TGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATCTCTAGTGAATATCCACTCC
TGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGAGTGCAACTAGAGTGGCTGGCATATTGCAC
GCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCGGCACATCCATTCTTCTCTCAGATTTGGAC
CAAGTATGGGAAGCTTGTCTCAGCCACGGCTTCCAGCCTCTGCTGCTTCCGCATCACTTC
AAATACCCCTGATTCCCTACTTTCAAATGATGTGTGTTGTTTCCGTAATTGATCATATAT
GATGTACAATAAGCTTCTAG

QA 2 681 2 681
DS 

RD RR4GI37JQ 602 0 0
CCCTATTACCAGAAAAGTATGAGAACCTAAGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGATACC
GTTTGGTCCTTTTAACCTCTGAAGCACTCGCTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAG
GAACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCCACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCAC
AGTTCCCCCTCAAGCAGTTTCGTAGAGATTGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAA
TTCCAAAATCTCTAGTGAATATCCACTCCTGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGA
GTGCAACTAGAGTGGCTGGCATATTGCATGCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCG
GCACATCCATTCTTCTTTCAGATTTGGACCAAGTATGGGAAGCTTGTTTCAGCCACGGCT
TCCAGCCTCTGCTGCTTCCGCATCACTTCAAATACCCCTGATTCCCTACTTTCAAATGAT
GTGTGTTGTTTCCGTAATTGATCATATATGATGTACAATAAGCTTCTAGACAATGGATCC
AGAATTTCACCTCTGTATTTGTTTTCATACTTTTAAATGATGTATGTTGTTCGCT
GATGGTC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4BJ04TF 715 0 0
G
AGCCGTTGTGATCAATAGTCTACCCAAATCAACGACAAAAGTAGTGGTGACAGGCAATCT
CACAAAGGTGGCCTACACCATCGCCTCTGCTCTTTGCCAGAGAGGAGTTCAGGTCTCGAC
CCTATTACCAGAAAAGTATGAGAACCTAAGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGAGACCG
TTTGGTCCTTTTAACCTCTGAAGCACTCGCTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAGG
AACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCCACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACA
GTTCCCCCTCAAGCAGTTTCGTAGAGATTGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAAT
TCCAAAATCTCTAGTGAATATCCACTCCTGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGAG
TGCAACTAGAGTGGCTGGCATATTGCACGCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCGG
CACATCCATTCTTCTCTCAGATTTGGGCCAAGTATGGGAAGCTTGTCTCAGCCACGGCTT
CCAGCCTCTGCTGCTTCCGCATCACTTCAAATACCCCTGATTCCCTACTTTCAAATGATG
TGTGTTGTTTCCGTAATTGATCATATATGATGTACAATAAGCTTCTAGACAATGGATCCA
GAATTTCACCTCTGTACTTGTTTTCATACTTTTAAATGATGTATGTTGTTCGCT

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR4DH49JQ 787 0 0
GTAAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAGCAGCCGTTGTGATCAATAGTCTACCCAAA
TCAACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCACAAAGGTGGCCTACACCATCGCCTCT
GCTCTTTGCCAGAGAGGAGTTCAGGTCTCGACCCTATTACCAGAAAAGTATGAGAACCTA
AGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGAGACCGTTTGGTCCTTTTAACCTCTGAAGCACTC
GCTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCC
ACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACAGTTCCCCCTCAAGCAGTTTCGTAGAGAT
TGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATCTCTAGTGAATATCCACTCC
TGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGAGTGCAACTAGAGTGGCTGGCATATTGCAC
GCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCGGCACATCCATTCTTCTTTCAGATTTGGAC
CAAGTATGGGAAGCTTGTTTCAGCCACGGCTTCCAGCCTCTGCTGCTTCCGCATCACTTC
AAATACCCCTGATTCCCTACTTTCAAATGATGTGTGTTGTTTCCGTAATTGATCATATAT
GATGTACAATAAGCTTCTAGACAATGGATCCAGAATTTCACCTCTGTATTTGTTTTCATA
CTTTTAAATGATGTATGTTGTTCGCTGATGGTTTCACTCAATCTATGACAACCTACTATA
CTATTGC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4EI48JQ 650 0 0
GATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGAGACCGTTTGGTCCTTTTAACCTCTGAAGCACTCG
CTTCAAACAAGATATGGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCCA
CAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACAGTTCCCCCTCAAGCAGTTTCGTAGAGATT
GTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATCTCTAGTGAATATCCACTCCT
GTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCTATGAGTGCAACTAGAGTGGCTGGCATATTGCACG
CCTTAGAAGGATGGGAAATGCGTGAGTGCGGCACATCCATTCTTCTCTCAGATTTGGACC
AAGTATGGGAAGCTTGTTTCAGCCACGGCTTCCAGCCTCTGCTGCTTCCGCATCACTTCA
AATACCCCTGATTCCCTACTTTCAAATGATGTGTGTTGTTTCCGTAATTGATCATATATG
ATGTACAATAAGCTTCTAGACAATGGATCCAGAATTTCACCTCTGTACTTGTTTTCATAC
TTTTAAATGATGTATGTTGTTCGCTGATGGTTTCACTCAATCTATGACAACCTACTATAC
TATTGCAATGCATGTGTTGTACGTTGCTGAATATCTACTTCTGATTTGGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 8

CO CL781Contig1 988 8 13 U
GGACAAACCAAAAACATACTTTTGTTCATATCTCATCATCTTCCCCACATTATTGTTCAT
TTATGGATGCAGATGATGAGATCGTGAAAGTAACCGAAATTTACGGTGCAAGTTTCATTG
AAAAAAAAGACTTGGCAAACAAACATTTATGTCATCTTAACTTGGGAGCAAAATTCTTCA
GTCGGATGATTTACAGGCAACCCAATCATCATGACGTGTTCGTGGAGCAAGCTGTCTACA
ATGGACGGAGGATGATTCTAAACAGATGTTTACCGGCGCATTCGAGAAACAGTCGACTTG
CGTTTCGTGACGAGATCGTTCAACATAGACCGGAAGAATTGGAAAACCCTGGAACTGTCA
TACTTGAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTAACTGGAATATCGTTTCTG
ATACTTTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATATGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGG
TAAGAGGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGACCAGAGGGGGG*ATGGGAA
GAATCATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATGATACAGAGTGTCCTTTCTGTTAT
GATCCCTACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATCAGGTTGTTGAGATTCCTTGCCGT
CATGTCTTTCACAAGACATGCATCTACAAGTGGATCTGGCTTAACCAAGTCTATAATTGC
AATGAAACCAACAACTTTTGCTACTGTCCAAATTGCGATAGCTTCATATGTTGAGAGAAA
CGTCGAGGCTTGCTACTTGCTAGCAATTATATCGAATAGTTAAGTATTATGTGTGGTTTA
ATTTGAGTGTGCTTGTGGTTTATTAAGTATTGTTTGTGTTAATTTTAATTATGTGTGTTG
TTGAATAATATGATTATGTATTGTAATGCTCTATATATGTTTGTGTATGATATGGTTTTA
TAATATATGAATGTGTTTCTTATAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC87TF U 1
AF RR4CW73TF U 29
AF RR4CX57TF U 4
AF RR4AI21TF U 3
AF RR4CW73JQ C 138
AF RR4CX57JQ C 158
AF RR4EC87JQ C 344
AF RR4AI21JQ C 163
BS 1 43 RR4EC87TF
BS 44 44 RR4AI21TF
BS 45 232 RR4EC87TF
BS 233 233 RR4AI21TF
BS 234 248 RR4EC87TF
BS 249 249 RR4AI21TF
BS 250 639 RR4EC87TF
BS 640 640 RR4AI21TF
BS 641 663 RR4EC87TF
BS 664 830 RR4AI21TF
BS 831 925 RR4CW73JQ
BS 926 982 RR4CX57JQ
BS 983 988 RR4AI21JQ

RD RR4EC87TF 663 0 0
GGACAAACCAAAAACATACTTTTGTTCATATCTCATCATCTTCTCCACATTATTGTTCAT
TTATGGATGCAGATGATGAGATCGTGAAAGTAACCGAAATTTACGGTGCAAGTTTCATTG
AAAAAAAAGACTTGGCAAACAAACATTTATGTCATCTTAACTTGGGAGCAAAATTCTTCA
GTCGGATGATTTACAGGCAACCCAATCATCATGACGTGTTCGTGGAGCAAGCAGTCTACA
ATGGACGGGGGATGATTCTAAACAGATGTTTACCGGCGCATTCGAGAAACAGTCGACTTG
CGTTTCGTGACGAGATCGTTCAACATAGACCGGAAGAATTGGAAAACCCTGGAACTGTCA
TACTTGAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTAACTGGAATATCGTTTCTG
ATACTTTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATATGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGG
TAAGAGGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGACCAGAGGGGGG*ATGGGAA
GAATCATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATGATACAGAGTGTCCTTTCTGTTAT
GATCCCTACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATCAGTTTGTTGAGATTCCTTGCCGT
CAT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CW73TF 677 0 0
G
ATCTCATCATCTTCCCCACATTATTGTTCATTTATGGATGCAGATGATGAGATCGTGAAA
GTAACCGAAATTTACGGTGCAAGTTTCATTGAAAAAAAAGACTTGGCAAACAAACATTTA
TGTCATCTTAACTTGGGAGCAAAATTCTTCAGTCGGATGATTTACAGGCAACCCAATCAT
CATGACGTGTTCGTGGAGCAAGCTGTCTACAATGGACGGAGGATGATTCTAAACAGATGT
TTACCGGCGCATTCGAGAAACAGTCGACTTGCGTTTCGTGACGAGATCGTTCAACATAGA
CCGGAAGAATTGGAAAACCCTGGAACTGTCATACTTGAAGGACCCGACAGAGCTTTTCTT
GCTAACGATATTAACTGGAATATCGTTTCTGATACTTTATCCAGATATGCTGACTATTCT
GGGGCATATGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGAGGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTC
CGAGTTATGAGACCAGAGGGGGG*ATGGGAAGAATCATACTATCGTGATCCAGAAG*TAA
TGTTAATGATACAGAGTGTCCTTTCTGTTATGATCCCTACGATTTCCAATACCCTGATCA
TATTAATCAG*TTGTTGAGATTC*TTGC*GTCATGTCTTTCACAAGACATGCATCTACA*
GTGGATCTG
CTTACAG

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR4CX57TF 776 0 0
GG
AACCAAAAACATACTTTTGTTCATATCTCATCATCTTCCCCACATTATTGTTCATTTATG
GATGCAGATGATGAGATCGTGAAAGCAACCGAAATTTACGGTGCAAGTTTCATTGAAAAA
AAAGACTTGACAAACAAACATTTATGTCATCTTAACTTGGGAGCAAAATTCTTCAGTCGG
ATGATTTACAGGCAACCCAATCATCATGACGTGTTCGTGGAGCAAGCTGTCTACAATGGA
CGGAGGATGATTCTAAACAGATGTTTACCGGCGCATTCGAGAAACAGTCGACTTGCGTTT
CGTGACGAGATCGTTCAACATAGACCGGAAGAATTGGAAAACCCTGGAACTGTCATACTT
GAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTAACTGGAATATCGTTTCTGATACT
TTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATATGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGA
GGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGACCAGAGGGGGGGATGGGAAGAATC
ATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATGATACAGAGTGTCCTTTCTGTTATGATCC
CTACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATCAGGTTGTTGAGATTCCTTGCCGTCATGT
CTTTCACAAGACATGCATCTACAAGTGGATCTGGCTTAACCAAGTCTATAATTGCAATGA
AACCAACA*CTTTTGCTACTGTCCAA*TTGCGATAGCTTCATATGTTGAGAGAA

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR4AI21TF 828 0 0
GGA
AACCAAAAACATACTTTTGTTCATATCTCATCATCTTCCCCACATTATTGTTCATTTATG
GATGCAGATGATGAGATCGTGAAAGTAACCGAAATTTACGGTGCAAGTTTCATTGAAAAA
AAAGACTTGGCAAACAAACATTTATGTCATCTTAACTTGGGAGCAAAATTCTTCAGTCGG
ATGATTTACAGGCAACCCAATCATCATGACGTGTTCGTGGAGCAAGCTGTCTACAATGGA
CGGAGGATGATTCTAAACAGATGTTTACCGGCGCATTCGAGAAACGGTCGACTTGCGTTT
CGTGACGAGATCGTTCAACATAGACCGGAAGAATTGGAAAACCCTGGAACTGTCATACTT
GAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTAACTGGAATATCGTTTCTGATACT
TTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATATGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGA
GGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGACCAGAGGGGGG*ATGGGAAGAATC
ATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATGATACAGAGTGTCCTTTCTGTTATGATCC
*TACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATCAGGTTGTTGAGATTCCTTGCCGTCATGT
CTTTCACAAGACATGCATCTACAAGTGGATCTGGCTTAACCAAGTCTATAATTGCAATGA
AACCAACAACTTTTGCTACTGTCCAAATTGCGATAGCTTCATATGTTGAGAGAAACGTCG
AGGCTTGCTACTTGCTAGCAATTATATCGAATAGTTAAGTATTAT

QA 4 828 4 828
DS 

RD RR4CW73JQ 789 0 0
AACAAACATTTATGTCATCT*AACTTGGGAGCAAAATTCTTCAGTCGGATGATTTACAGG
CAACCCAATCATCATGACGTGTTCGTGGAGCAAGCTGTCTACAATGGACGGAGGATGATT
CTAAACAGATGTTTACCGGCGCATTCGAGAAACAGTCGACTTGCGTTTCGTGACGAGATC
GTTCAACATAGACCGGAAGAATTGGAAAACCCTGGAACTGTCATACTTGAAGGACCCGAC
AGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTAACTGGAATATCGTTTCTGATACTTTATCCAGATAT
GCTGACTATTCTGGGGCATATGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGAGGCGACGTAGCA
TTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGACCAGAGGGGGG*ATGGGAAGAATCATACTATCGTGA
TCCAGAAGGTAATGTTAATGATACAGAGTGTCCTTTCTGTTATGATCCCTACGATTTCCA
ATACCCTGATCATATTAATCAGGTTGTTGAGATTCCTTGCCGTCATGTCTTTCACAAGAC
ATGCATCTACAAGTGGATCTGGCTTAACCAAGTCTATAATTGCAATGAAACCAACAACTT
TTGCTACTGTCCAAATTGCGATAGCTTCATATGTTGAGAGAAACGTCGAGGCTTGCTACT
TGCTAGCAATTATATCGAATAGTTAAGTATTATGTGTGGTTTAATTTGAGTGTGCTTGTG
GTTTATTAAGTATTGTTTGTGTTAATTTTAATTATGTGTGTTGTTGAATAATATGATTAT
GTATTGTA
C

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4CX57JQ 826 0 0
TAACTTGGGAGCAAAATT*TTCAGTCGGATGATT*ACAGGCAACCCAATCATCATGACGT
GTTCGTGGAGCAAGCTGTCTACAATGGACGGAGGATGATTCTAAACAGATGTTTACCGGC
GCATTCGAGAAACAGTCGACTTGCGTTTCGTGACGAGATCGTTCAACATAGACCGGAAGA
ATTGGAAAACCCTGGAACTGTCATACTTGAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGA
TATTAACTGGAATATCGTTTCTGATACTTTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATA
TGGGAGAAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGAGGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTAT
GAGACCAGAGGGGGG*ATGGGAAGAATCATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATG
ATACAGAGTGTCCTTTCTGTTATGATCCCTACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATC
AGGTTGTTGAGATTCCTTGCCGTCATGTCTTTCACAAGACATGCATCTACAAGTGGATCT
GGCTTAACCAAGTCTATAATTGCAATGAAACCAACAACTTTTGCTACTGTCCAAATTGCG
ATAGCTTCATATGTTGAGAGAAACGTCGAGGCTTGCTACTTGCTAGCAATTATATCGAAT
AGTTAAGTATTATGTGTGGTTTAATTTGAGTGTGCTTGTGGTTTATTAAGTATTGTTTGT
GTTAATTTTAATTATGTGTGTTGTTGAATAATATGATTATGTATTGTAATGCTCTATATA
TGTTTGTGTATGATATGGTTTTATAATATATGAATGTGTTTCTTA
C

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4EC87JQ 640 0 0
AAACCCTGGAACTGTCATACTTGAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTAA
CTGGAATATCGTTTCTGATACTTTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATATGGGAG
AAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGAGGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGACC
AGAGGGGGG*ATGGGAAGAATCATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATGATACAG
AGTGTCCTTTCTGTTATGATCCCTACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATCAGTTTG
TTGAGATTCCTTGCCGTCATGTCTTTCACAAGACATGCATCTACAAGTGGATCTGGCTTA
ACCAAGTCTATAATTGCAATGAAACCAACAACTTTTGCTACTGTCCAAATTGCGATAGCT
TCATATGTTGAGAGAAACGTCGAGGCTTGCTACTTGCTAGCAATTATATCGAATAGTTAA
GTATTATGTGTGGTTTAATTTGAGTGTGCTTGTGGTTTATTAAGTATTGTTTGTGTTAAT
TTTAATTATGTGTGTTGTTGAATAATATGATTATGTATTGTAATGCTCTATATATGTTTG
TGTATGATATGGTTTTATAATATATGAATGTGTTTCTTA
T

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AI21JQ 826 0 0
TGGGAGCAAAATTCTTCAGTCGGATGATTTACAGGCAACCCAATCATCATGACGTGTTCG
TGGAGCAAGCTGTCTACAATGGACGGAGGATGATTCTAAACAGATGTTTACCGGCGCATT
CGAGAAACGGTCGACTTGCGTTTCGTGACGAGATCGTTCAACATAGACCGGAAGAATTGG
AAAACCCTGGAACTGTCATACTTGAAGGACCCAACAGAGCTTTTCTTGCTAACGATATTA
ACTGGAATATCGTTTCTGATACTTTATCCAGATATGCTGACTATTCTGGGGCATATGGGA
GAAGGGAAGTTTTCGGGGTAAGAGGCGACGTAGCATTTGGTGAGGTCCGAGTTATGAGAC
CAGAGGGGGG*ATGGGAAGAATCATACTATCGTGATCCAGAAGGTAATGTTAATGATACA
GAGTGTCCTTTCTGTTATGATCC*TACGATTTCCAAGACCCTGATCATATTAATCAGGTT
GTTGAGATTCCTTGCCGTCATGTCTTTCACAAGACATGCATCTACAAGTGGATCTGGCTT
AACCAAGTCTATAATTGCAATGAAACCAACAACTTTTGCTACTGTCCAAATTGCGATAGC
TTCATATGTTGAGAGAAACGTCGAGGCTTGCTACTTGCTAGCAATTATATCGAATAGTTA
AGTATTATGTGTGGTTTAATTTGAGTGTGCTTGTGGTTTATTAAGTATTGTTTGTGTTAA
TTTTAATTATGTGTGTTGTTGAATAATATGATTATGTATTGTAATGCTCTATATATGTTT
GTGTATGATATGGTTTTATAATATATGAATGTGTTTCTTATAAGCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 2 6

CO CL782Contig1 725 3 8 U
GGGCTTTCACAAACGATTTTTTCCTATGCAATTTAATAAGCTAAAATGTAGGTTACAATA
TCACATTAGTGCAATGAAACGATTTTAAGACAAGAAAGAAAACATTACAACCTTGAAATA
AAAGTGTGATTCTATTTGCGAGATATATAAAGTTTTTTAATTCACTGCCAAGAACATGTA
TACACATTTGATAAGATGAAAATATTTACATTTGGACATGAATCAAGAGGTAGTTGGGAG
GGGGAGCCAGAGGAGGAGCCGTTGTGGCCTGTTGAGGTATCGAGCTTGCCACGCCGGCTC
AGCACTCTCTTGCACGAACCCACATTTCATGTATAACCTCTTCGCTGCTTCATTGACCAC
CGTCACATGCACGTACATATCCGTTATCCCCCATTCTCTAGCAACTCCTTTGGACTTTTC
AATGAGTTTGTAACCAACTCCATTACGATGCAGCTCTTTTGCTACACAGACGTTGCTCAA
GTATGCCCTCGCAAAATCCACACTAAGCCCCTCTGGTTTTGTTCCAGCGATTTCATCAGG
AAGCCAACGGCATTGGTTAAGATCAAGGCTCCCCACCACAACTCTATCTTCTATCCCATC
AGAATACTTACATGCAGAGCATAAATCCTCAGAAGAAGTTGATAGTTGCGACAAAGGAAG
AGTAGCATTTACGCAGGACACCCGCGTAAAACCTTCCCTCTTTCCTGAAACTCTCTCTTT
AAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 

AF RR4CG77JQ U 1
AF RR4EZ74JQ U 115
AF RR4EZ74TF C 115
BS 1 267 RR4CG77JQ
BS 268 268 RR4EZ74JQ
BS 269 590 RR4CG77JQ
BS 591 591 RR4EZ74JQ
BS 592 639 RR4CG77JQ
BS 640 640 RR4EZ74JQ
BS 641 670 RR4CG77JQ
BS 671 725 RR4EZ74JQ

RD RR4CG77JQ 670 0 0
GGGCTTTCACAAACGATTTTTTCCTATGCAATTTAATAAGCTAAAATGTAGGTTACAATA
TCACATTAGTGCAATGAAACGATTTTAAGACAAGAAAGAAAACATTACAACCTTGAAATA
AAAGTGTGATTCTATTTGCGAGATATATAAAGTTTTTTAATTCACTGCCAAGAACATGTA
TACACATTTGATAAGATGAAAATATTTACATTTGGACATGAATCAAGAGGTAGTTGGGAG
GGGGAGCCAGAGGAGGAGCCGTTGTGGTCTGTTGAGGTATCGAGCTTGCCACGCCGGCTC
AGCACTCTCTTGCACGAACCCACATTTCATGTATAACCTCTTCGCTGCTTCATTGACCAC
CGTCACATGCACGTACATATCCGTTATCCCCCATTCTCTAGCAACTCCTTTGGACTTTTC
AATGAGTTTGTAACCAACTCCATTACGATGCAGCTCTTTTGCTACACAGACGTTGCTCAA
GTATGCCCTCGCAAAATCCACACTAAGCCCCTCTGGTTTTGTTCCAGCGATTTCATCAGG
AAGCCAACGGCATTGGTTAAGATCAAGGCTCCCCACCACAACTCTATCTTATATCCCATC
AGAATACTTACATGCAGAGCATAAATCCTCAGAAGAAGTCGATAGTTGCGACAAAGGAAG
AGTAGCATTT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4EZ74JQ 611 0 0
GAAATAAAAGTGTGATTCTATTTGCGAGATATATAAAGTTTTTTAATTCACTGCCAAGAA
CATGTATACACATTTGATAAGATGAAAATATTTACATTTGGACATGAATCAAGAGGTAGT
TGGGAGGGGGAGCCAGAGGAGGAGCCGTTGTGGCCTGTTGAGGTATCGAGCTTGCCACGC
CGGCTCAGCACTCTCTTGCACGAACCCACATTTCATGTATAACCTCTTCGCTGCTTCATT
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CTTTTCAATGAGTTTGTAACCAACTCCATTACGATGCAGCTCTTTTGCTACACAGACGTT
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AGGAAGAGTAGCATTTACGCAGGACACCCGCGTAAAACCTTCCCTCTTTCCTGAAACTCT
CTCTTTAAGCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4EZ74TF 611 0 0
GAAATAAAAGTGTGATTCTATTTGCGAGATATATAAAGTTTTTTAATTCACTGCCAAGAA
CATGTATACACATTTGATAAGATGAAAATATTTACATTTGGACATGAATCAAGAGGTAGT
TGGGAGGGGGAGCCAGAGGAGGAGCCGTTGTGGCCTGTTGAGGTATCGAGCTTGCCACGC
CGGCTCAGCACTCTCTTGCACGAACCCACATTTCATGTATAACCTCTTCGCTGCTTCATT
GACCACCGTCACATGCACGTACATATCCGTTATCCCCCATTCTCTAGCAACTCCTTTGGA
CTTTTCAATGAGTTTGTAACCAACTCCATTACGATGCAGCTCTTTTGCTACACAGACGTT
GCTCAAGTATGCCCTCGCAAAATCCACACTAAGCCCCTCTGGTTTTGTTCCAGCGATTTC
ATCAGGAAGCCAACGGCATTGGTTAAGATCAAGGCTCCCCACCACAACTCTATCTTCTAT
CCCATCAGAATACTTACATGCAGAGCATAAATCCTCAGAAGAAGTTGATAGTTGCGACAA
AGGAAGAGTAGCATTTACGCAGGACACCCGCGTAAAACCTTCCCTCTTTCCTGAAACTCT
CTCTTTAAGC
C

QA 1 610 1 610
DS 



CO CL782Contig2 970 3 6 U
GGAGGACATGGTTAGTCCGCGAAAAGATGGCGTCTCTCTGTTCATCTCTTCCCACATACT
CCTCTATCCCCATTTTCAGCAAGTCAAACACGCATGGATTCCGGTCGTCCTCCTCCTGTA
GACTCCGGTTACGACCGATATCTGCCTCGCACGTTCTTGCTCCATCGATCGACAGGTCAG
CGATCGTCATATCCGAAACAGTGTCGGAGGACGAGCTCTGGGCAGCAGCTAGCCTCCGCG
TGCGGACCTTCAACGAACTGAACCCTTCTTCTTACAATATCCAAGATCACAGAAGATACT
TGGCAGAGCGCGAGTTCGAGGCGCTTAAAGAGAGAGTTTCAGGAAAGAGGGAAGGTTTTA
CGCGGGTCTCCTGCGTAAATGCTACTCTTCCTTTGTCGCAACTATCAACTTCTTCTGAGG
ATTTATGCTCTGCATGTAAGTATTCTGATGGGATAGAAGATAGAGTTGTGGTGGGGAGCC
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TTAGTGTGGATTTTGCGAGGGCATACTTGAGCAACGTCTGTGTAGCAAAAGAGCTGCATC
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AATGTGGGTTCGTGCAAGAGAGTGCTGAGCCGGCGTGGCAAGCTCGATACCTCAACAGGC
CACAACGGCTACTCCTCTGGCTTCCCCTCCCAACTACCTCTTGATTCATGTCCAAATGTA
AATATTTTCATCTTATCAAATGTGTGTATACATGTTCTTGGCAGTCAATTATATAACTCG
AAAGTAGAATCAGACTTTTATTTCAAGGTTGTAATGTTTTCTTTCTTGTCTTAAAATCGT
TTCATTGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG77TF U 16
AF RR4F585TF U 1
AF RR4F585JQ C 300
BS 1 112 RR4F585TF
BS 113 113 RR4CG77TF
BS 114 711 RR4F585TF
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BS 713 734 RR4F585TF
BS 735 970 RR4F585JQ

RD RR4CG77TF 453 0 0
GGG
GCGAAAAGATGGCGTCTCTCTGTTCATCTCTTCCCACATACTCCTCTATCCCCATTTTCA
GCAAGTCAAACACGCATGGATTCCGGTCGTCCTCCTCCTGTAGACTCCGGTTACGACCGA
TATCTGCCTCGCACGTTCTTGCTCCATCGATCGACAGGTCAGCGATCGTCATATCCGAAA
CAGTGTCGGAGGACGAGCTCTGGGCAGCAGCTAGCCTCCGCGTGCGGACCTTCAACGAAC
TGAACCCTTCTTCTTACAATATCCAAGATCACAGAAGATACTTGGCAGAGCGCGAGTTCG
AGGCGCTTAAAGAGAGAGTTTCAGGAAAGAGGGAAGGTTTTACGCGGGTGTCCTGCGTAA
ATGCTACTCTTCCTTTGTCGCAACTATCGACTTCTTCTGAGGATTTATGCTCTGCATGTA
AGTATTCTGATGGGATATAAGATAGAGT
GT

QA 4 451 4 451
DS 

RD RR4F585TF 734 0 0
GGAGGACATGGTTAGTCCGCGAAAAGATGGCGTCTCTCTGTTCATCTCTTCCCACATACT
CCTCTATCCCCATTTTCAGCAAGTCAAACACGCATGGATTCCGGTCGTCCTCTTCCTGTA
GACTCCGGTTACGACCGATATCTGCCTCGCACGTTCTTGCTCCATCGATCGACAGGTCAG
CGATCGTCATATCCGAAACAGTGTCGGAGGACGAGCTCTGGGCAGCAGCTAGCCTCCGCG
TGCGGACCTTCAACGAACTGAACCCTTCTTCTTACAATATCCAAGATCACAGAAGATACT
TGGCAGAGCGCGAGTTCGAGGCGCTTAAAGAGAGAGTTTCAGGAAAGAGGGAAGGTTTTA
CGCGGGTCTCCTGCGTAAATGCTACTCTTCCTTTGTCGCAACTATCAACTTCTTCTGAGG
ATTTATGCTCTGCATGTAAGTATTCTGATGGGATAGAAGATAGAGTTGTGGTGGGGAGCC
TTGATCTTAACCAATGCCGTTGGCTTCCTGATGAAATCGCTGGTACAAAACCAGAGGGGC
TTAGTGTGGATTTTGCGAGGGCATACTTGAGCAACGTCTGTGTAGCAAAAGAGCTGCATC
GTAATGGAGTTGGATACAAACTCATTGAAAAGTCCAAAGGAGTTGCTAGAGAATGGGGAA
TAACGGATATGTACGTGCATGTGACGGTGGTCAATGAAGCAGCGAAGAGGT*ATACATGA
AATGTGGGTTCGTG

QA 1 734 1 734
DS 

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ACGCGGGTCTCCTGCGTAAATGCTACTCTTCCTTTGTCGCAACTATCAACTTCTTCTGAG
GATTTATGCTCTGCATGTAAGTATTCTGATGGGATAGAAGATAGAGTTGTGGTGGGGAGC
CTTGATCTTAACCAATGCCGTTGGCTTCCTGATGAAATCGCTGGTACAAAACCAGAGGGG
CTTAGTGTGGATTTTGCGAGGGCATACTTGAGCAACGTCTGTGTAGCAAAAGAGCTGCAT
CGTAATGGAGTTGGATACAAACTCATTGAAAAGTCCAAAGGAGTTGCTAGAGAATGGGGA
ATAACGGATATGTACGTGCATGTGACGGTGGTCAATGAAGCAGCGAAGAGGTTATACATG
AAATGTGGGTTCGTGCAAGAGAGTGCTGAGCCGGCGTGGCAAGCTCGATACCTCAACAGG
CCACAACGGCTACTCCTCTGGCTTCCCCTCCCAACTACCTCTTGATTCATGTCCAAATGT
AAATATTTTCATCTTATCAAATGTGTGTATACATGTTCTTGGCAGTCAATTATATAACTC
GAAAGTAGAATCAGACTTTTATTTCAAGGTTGTAATGTTTTCTTTCTTGTCTTAAAATCG
TTTCATTGCGC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 8

CO CL783Contig1 557 8 22 U
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AAAAAGTAAAATATAGTATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGCGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCG
AAACCGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTAGTAGATAACTTTCGGAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTATTGTTTTGATAAA
AAACAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAAT
ATATTAACCATTTTAAC


BQ
10 10 10 10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F475JQ C 1
AF RR4F475TF U 1
AF RR4E161JQ C 1
AF RR4E161TF U 1
AF RR4E627JQ C 1
AF RR4E627TF U 136
AF RR4B280JQ C 6
AF RR4B280TF U 6
BS 1 4 RR4E161JQ
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BS 18 18 RR4E161TF
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BS 23 23 RR4E161TF
BS 24 40 RR4F475TF
BS 41 43 RR4E161TF
BS 44 51 RR4F475TF
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BS 53 76 RR4F475TF
BS 77 77 RR4E161TF
BS 78 162 RR4F475TF
BS 163 163 RR4E161TF
BS 164 368 RR4F475TF
BS 369 369 RR4E161TF
BS 370 381 RR4F475TF
BS 382 383 RR4E161TF
BS 384 432 RR4F475TF
BS 433 433 RR4E161TF
BS 434 467 RR4F475TF
BS 468 537 RR4E161TF
BS 538 557 RR4B280TF

RD RR4F475JQ 477 0 0
GGAA
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AGTTTTCTGTATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTA
ATTTTTTTAC

QA 5 467 5 467
DS 

RD RR4F475TF 477 0 0
GGAA
ACAATACACATAACATACCTTCAAATTAAAAAAAAAC***GAAAAGAAAAGAAGTAAAAA
AGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTTAT
TATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGGCA
GCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCGAAAC
CGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCA
CTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAAT
ATTACTAGATAACTTTCTAAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATA
AGTTTTCTGTATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTA
ATTTTTTTAC

QA 5 467 5 467
DS 

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AAAAAGTAAAATATAGTATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
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AAACAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTAC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4E161TF 537 0 0
GGGT
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GCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCGAAAC
CGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCA
CTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAAT
ATTAGTAGATAACTTTCGGAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATA
AGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTATTGTTTTGATAAAAAAC
AATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTAC

QA 5 537 5 537
DS 

RD RR4E627JQ 537 0 0
GGGT
ACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAAAAA
AGTAAAATATAGTATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTTAT
TATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGCGCAGAAGTCATGCAAGAGGCA
GCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCGAAAC
CGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCA
CTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAAT
ATTAGTAGATAACTTTCGGAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATA
AGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTATTGTTTTGATAAAAAAC
AATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTAC

QA 5 537 5 537
DS 

RD RR4E627TF 402 0 0
CTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGCGCAGAAGTCATGCAAGAGGCAGCCTAATTCTG
GGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCGAAACCGAGAAAGCAT
TACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCACTTTCCATGTT
AATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAATATTAGTAGATA
ACTTTCGGAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATAAGTTTTCTATA
TAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTATTGTTTTGATAAAAAACAATGAATCTTT
TTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTAC

QA 1 402 1 402
DS 

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G
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QA 2 552 2 552
DS 

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G
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TAAAATATAGTATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTTATTA
TCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGCGCAGAAGTCATGCAAGAGGCAGC
CTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCGAAACCG
AGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCACT
TTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAATAT
TAGTAGATAACTTTCGGAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATAAG
TTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTATTGTTTTGATAAAAAACAA
TGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAATATATTA
ACCATTTTAAC

QA 2 552 2 552
DS 



AS 2 8

CO CL784Contig1 883 5 10 U
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AAAGAGTAGTGAACAGGGAGGACAATACAAAACTCAAAAGACTTCAAAAGTTTTTCAGAC
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TCAAGATGTTGAACCCATCTTCAGCGGTTGAGATGATCATCCCTGGAATCTGGTTGTGCC
AGTGAAGTTCCTTCAAGTCCTTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAAGT
CTTGAGGTGTATTAACTTGTTCCTTAGTCTGTGCTTTGAGCTCTGCTTCCTCTTCTTCAT
CCTTCTCTAATGATAAATCCCATATCGTGAGCTGGTTATCGCCAGAAGAGACTGCAAGTG
TTGAGGATTCATGAGCGCTCCACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAAAT
GTGCTACCTTAGCATCTCCCTCCTTGATAACCCTAAGATCATGGATAGAGAATGCCCCGT
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CTGCGTTATGTGCTTTGAAAGATAACGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAGTG
CAATAGTCCCATCCACAGAACACGACGCAAACACGTTGGCTTCAGCTGGACTCCATTGTA
AATCTTCAACACTTGCGGTGTGTCCTGTTAACGGAATAGGATCAACAGTCCATGAACCAG
AAACTGGTTCCCACAGATGAATCATACTCATGCAGTCCCCGGAAAGAAGTCTTCCAGCAG
TAGCAGGACTCCAATCTATAGCATAGCCTTCATCTTTGTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EP83JQ U 1
AF RR4EU57JQ U 1
AF RR4F866JQ U 1
AF RR4EP83TF C 59
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QA 1 622 1 622
DS 

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AGAAGACAATATCTTCTCAGGCAGCAAGATCAGGAAGTGTGTTCTGGATGTTGTAAGGCA
TCAAGATGTTGAACCCATCTTCAGCGGTTGAGATGATCATCCCTGGAATCTGGTTGTGCC
AGTGAGGTTCCTTCAAGTCCTTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAAGT
CTTGAGGTGTATTAACTTGTTCCTTAGTCTGTGCTTTGAACTCTGCTTCCTCTTCTTCAT
CCTTCTCTAATGATAAATCCCATATCGTGAGCTGGTTATCGCCAGAAGAGACTGCAAGTG
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GTGCTACCTTAGCATCTCCCTCCTTGATAACTCTAAGATCATGGATAGAGAATGCCCCGT
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CTGCGTTATGTGCTTTGAAAGATAACGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAGTG
CAATA

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DS 

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AGAAGACAATATCTTCTCAGGCAGCAAGATCAGGAAGTGTGTTCTGGATGTTGTAAGGCA
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AGTGAAGTTCCTTCAAGTCCTTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAAGT
CTTGAGGTGTATTAACTTGTTCCTTAGTCTGTGCTTTGAGCTCTGCTTCCTCTTCTTCAT
CCTTCTCTAATGATAAATCCCATATCGTGAGCTGGTTATCGCCAGAAGAGACTGCAAGTG
TTGAGGATTCATGAGCGCTCCACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAAAT
GTGCTACCTTAGCATCTCCCTCCTTGATAACCCTAAGATCATGGATAGAGAATGCCCCGT
CATCACTCCCTGAGGCCAACATGCAACTAGCCAACCTGTTCCATGAGATGACATTCACAT
CTGCGTTATGTGCTTTGAAAGATAACGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAGTG
CAATAGTCCCATCCACAGAACACGACGCAAACACGTTGGCTTCAGCTGGACTCCATTGTA
AATCTTCAACACTTGCGGTGTGTCCTGTTAACGGAATAG*ATCAACAGTCCATGAACCAG
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QA 1 822 1 822
DS 

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CATCAAGATGTTGAACCCATCTTCAGCGGTTGAGATGATCATCCCTGGAATCTGGTTGTG
CCAGTGAAGTTCCTTCAAGTCCTTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAA
GTCTTGAGGTGTATTAACTTGTTCCTTAGTCTGTGCTTTGAGCTCTGCTTCCTCTTCTTC
ATCCTTCTCTAATGATAAATCCCATATCGTGAGCTGGTTATCGCCAGAAGAGACTGCAAG
TGTTGAGGATTCATGAGCGCTCCACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAA
ATGTGCTACCTTAGCATCTCCCTCCTTGATAACCCTAAGATCATGGATAGAGAATGCCCC
GTCATCACTCCCTGAGGCCAACATGCAACTAGCCAACCTGTTCCATGAGATGACATTCAC
ATCTGCGTTATGTGCTTTGAAAGATAACGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAG
TGCAATAGTCCCATCCACAGAACACGACGCAAACACGTTGGCTTCAGCTGGACTCCATTG
TAAATCTTCAACACTTGCGGTGTGTCCTGTTAACGGAATAGGATCAACAGTCCATGAACC
AGAAACTGGTTCCCACAGATGAATCATACTCATGCAGTCCCCGGAAAGAAGTCTTCCAGC
AGTAGCAGGACTCCAATCTATAGCATAGCCTTCATCTTTGTGGCC

QA 1 825 1 825
DS 

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TATCTTCTCAG*CAGCAAGATCAGGAAGTGTGTTCTGGATGT*GTAAGGCATCAAGATGT
TGAACCCATCTTCAGCGGT*GAGATGATCATCCCTGGAATCTGGTTGTGCCAGTGAAGTT
CCTTCAAGTCCTTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAAGTCTTGAGGTG
TATTAACTTGTTCCTTAGTCTGTGCTTTGAGCTCTGCTTCCTCTTCTTCATCCTTCTCTA
ATGATAAATCCCATATCGTGAGCTGGTTATCGCCAGAAGAGACTGCAAGTGTTGAGGATT
CATGAGCGCTCCACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAAATGTGCTACCT
TAGCATCTCCCTCCTTGATAACCCTAAGATCATGGATAGAGAATGCCCCGTCATCACTCC
CTGAGGCCAACATGCAACTAGCCAACCTGTTCCATGAGATGACATTCACATCTGCGTTAT
GTGCTTTGAAAGATAACGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAGTGCAATAGTCC
CATCCACAGAACACGACGCAAACACGTTGGCTTCAGCTGGACTCCATTGTAAATCTTCAA
CACTTGCGGTGTGTCCTGTTAACGGAATAGGATCAACAGTCCATGAACCAGAAACTGGTT
CCCACAGATGAATCATACTCATGCAGTCCCCGGAAAGAAGTCTTCCAGCAGTAGCAGGAC
TCCAATCTATAGCATAGCCTTCATCTTTGTGGCC

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL784Contig2 846 3 4 U
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CCAGTCTTTGTATTAAAACTTTTCGTAGTCCTAAAATAAAGAATCTGTTTTCGTTAGTCT
TTATCTTCAGACTTTGTTCTGTCCCCTGGTCGTTATTTCCATCCAGGCAGCTAGTCGTGA
ATCAACACATTGTCTTTTCTTGTGAAACATCAAGTTGTGAAATAGTAGTTCTTCAAGTAG
TAAACAGGGAGGGAGGGGAATACAAAACTCTCAAGAGACTACAAAAGTTTTTCAGTAAAA
AAAAAGACGCAAGCTTTTCAGGCAGCAAGATCAGGAAGTGTGTTCTGAATGTTGTAAGGC
ATCAAGATGTTGAACCCATCTTCAGCAGTTGAGATGATCATCCCTGGAATCTGGTTGTGC
CAGTGAAGTTCCTTCAAGTCCTTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAAG
TCTTGAGGTGTGTTAACTTGTTCCTTAGTCTGTGCTTTGAACTCTGCTTCCTCTTCTTCA
TCCTTCTCTAATGATAAATCCCATATCGTGAGCTGGTTATCGCCGGAAGAGACAGCAAGT
GTTGAGGATTCATGAGCGCTCCACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAAA
TGTGCTACCTTAGCATCTCCCTCCTTGATAACTCTAAGATCATGGATAGAGAATGCTCCG
TCATCACTCCCTGAGGCCAACATGCAACTAGCCAACCTGTTCCATGAGATGACATTCACA
TCTGCGTTATGTGCTTTGAAAGATAATGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAGT
GCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 

AF RR4GK63JQ U 1
AF RR4F842JQ U 202
AF RR4F842TF C 202
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RD RR4GK63JQ 698 0 0
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GTTGAGGATTCATGAGCGCTCCACTCAATCGACGCGATAGGATGCTTATGATACTCAAAA
TGTGCTACCTTAGCATCTCCCTCCTTGATAACTCTAAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4F842JQ 645 0 0
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CACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAAATGTGCTACCTTAGCATCTCCC
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QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4F842TF 645 0 0
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TCAGCAGTTGAGATGATCATCCCTGGAATCTGGTTGTGCCAGTGAAGTTCCTTCAAGTCC
TTTTGTCCCTGGTGAACGAAAAGAAGCTGAGGAGGCAAGTCTTGAGGTGTGTTAACTTGT
TCCTTAGTCTGTGCTTTGAACTCTGCTTCCTCTTCTTCATCCTTCTCTAATGATAAATCC
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CACTCAATCGACGTGATAGGATGCTTATGATACTCAAAATGTGCTACCTTAGCATCTCCC
TCCTTGATAACTCTAAGATCATGGATAGAGAATGCTCCGTCATCACTCCCTGAGGCCAAC
ATGCAACTAGCCAACCTGTTCCATGAGATGACATTCACATCTGCGTTATGTGCTTTGAAA
GATAATGCAGGCGTCTTCCCAACTCGGACATCCCATAGTGCAAT
C

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 7

CO CL785Contig1 1421 7 12 U
GGATTCACCAACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTATCCAAACCGCATCTCTTCCCAC
AACTATGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTAC
TTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGA
CAATGGAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTAT
CGATTACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACAT
TATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACCGG
AGAAAATCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATCCTCAACGACAC
TGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATACTTCCAACAGTA
CCAGCAACGAGTGAGCGCATTGATCGGATCAGAAGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGC
TCTTGTCTTAATCACACTCGGTGGAAACGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTT
CTCTGCCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGAATA
CGGAAAGATCCTTAGGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAAC
TGGTGCGATGGGATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTA
TGGTGCTCTACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATC
AGTCAACGCTGAGATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAAATGAACAT
GGATTATCTAACTAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGTTGTGG
ACAAGGACCGTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAG
AGATTTATATGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGGATCATTGT
TAATCAGATCCTCACTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCAT
GCTCTTGGATTCTTCTAGAATCTAATCTAAGTGAATTTATTTCAGTTAAATGTCAAGGCA
TTGCCTCCTTTTGTAGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAAC
TTTTCGTGTTGGTGATGTGGTTTGATGTTTCTGCTTGTTGTACCTTGATGATTAGCTTAG
TTTAGTCATTTTTTTCATGTATGTGTGCCAACTATCATGTAATATTTGGAGTCATTGTTA
TATGGTTTTCTGTTTTACTCGAGATTATTGATTCAACTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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AAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTATCGATTA
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TCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAAT
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CTTAATCACACTCGGTGGAAACGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTGC
CCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGAATACG
AAAGATCC

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TTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGA
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TGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATACTTCCAACAGTA
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TCTTGTCTTAATCACACTCGGTGGAAACGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTT
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TGGTGCGATGGGATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTA
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AGTCAA
TG

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G
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TGGATTCTTCTAGAATCTAATCTAAGTGAATTTATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCC
TCCTTTTGTAGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAACTTTTC
GTG
GT

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G
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GTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTATGGTGCTCTACAAA
CAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATCAGTCAACGCTGAGA
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TCATGTATGTGTGCCAACTATCATGTAATATTTGGAGTCATTGTTATATGGTTTTCTGTT
T
TACT

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CTTTCTCTGCCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCG
AATACGGAAAGATCCTTAGGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCG
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DS 

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AATGACATAGGACTATTCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTATATGCG
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TCTAGAATCTAATCTAAGTGAATTTATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCCTCCTTTTG
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TT
C

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 8

CO CL786Contig1 1007 8 28 U
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GTCGCCGGACTTGTAGCTTGTGCTTTGGTGGAAGATGACGCTATTTCACTTCTTCAACTG
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GGCATTTGCGGATTCTGTTTTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGCTCGAGGACT
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TCTAAGGAGAGTCATGGGATGGCATTTCCCCAAAGTTGTTGGGTTTGAGCTGATGACTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW44TF U 1
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AF RR4B261TF U 21
AF RR4AL64TF U 92
AF RR4D413JQ C 225
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BS 242 470 RR4BW44TF
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BS 646 646 RR4D413TF
BS 647 666 RR4BW44TF
BS 667 667 RR4D413TF
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BS 915 928 RR4D413JQ
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BS 953 988 RR4BW44JQ
BS 989 1007 RR4B261JQ

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TCAGCTGACACACAGGAACATCTCCCAAAACCATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATG
GGCATTTGCGGATTCTGTTTTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGTTCGAGGACT
TGAGTTCACTTGGGATTATGTTTTACAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTAC
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GATCCCCATCATATACACGTGTGCAGTGATCATCGCTACAATGCCCTCAATCACGAGCTA
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CTCTGGT

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DS 

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CTGCAAGTCTCTGAGACTGGAGTATTTGATCCTTACCAGGAAGCACTGAAAGCAATGATT
GGCTTCATTGACGTCGCTGGTCTCTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACACAGGAACATC
TCCCAAAACCATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATCCTGTTTTG
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TTACAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACGATATCTTTAGCTGCGCTAGAT
TCTTTGATGTGGCTACGCAAGAACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACGTGT
GCAGTGATCATCGCTACAATGCCTTCAATCACGAGCTATCTAAGGAGAGTCATGGGATGG
CATTTCCCCAAAGTTGTTGGGTTTGAGCTGATGACTTCTCTGGTTATGGCTTTCATCAGC
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ATGT

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GG
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CTTTGGTGGAAGATGACGCTATTTCACTTCTTCAACTGTGCGATTCTCACCTTCGGTCCC
CACGCCGTCTACTACTCCGCCACTCCATTATCTGAGTATGACACTCTTGGAACCTCCGTG
AAGGCTGCTGTTGTTTACCTCGCTACAGCACTGGTTAAGCTTGTTTGCTTGGCAACTTTT
CTGCAAGTCTCTGAGACTGAAGTATTTGATCCTTACCAGGAAGCACTGAAAGCAATGATT
GGCTTCATTGACGTCGCTGGTCTCTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACACAGGAACATC
TCCCAAAACCATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATTCTGTTTTG
CATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGCTCGAGGACTTGAGTTCACTTGGGATTATGTT
TTACAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACGATATCTTTAGCTGCGCTAGGT
TCTTTGATGTGGCTACGCAAGAACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACGTGT
GCAGTGATCATCGCTACAATGCCTTCAATCACGAGCTATCTAAGGAGAGTCATGGGATGG
CATTTCCCCAAAGTTGTTGGGTTTGAGCTGATGACTTCTCTGGTTATGGCTTTCATCAGC
TGTCAACTCTTCATTCTTTGTCAGAGACCGTCTTTGTGACTCCACTCCTATCGAGAGACT
AAACTCACTTGAACTGCTCTTTTGGC

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DS 

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G
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CTGAGACTGAAGTATTTGATCCTTACCAGGAAGCACTGAAAGCAATGATTGGCTTCATTG
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ATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATTCTGTTTTGCATAGGTTGG
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TTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACGATATCTTTAGCTGCGCTAGGTTCTTTGATGT
GGCTACGCAAGAACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACGTGTGCAGTGATCA
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AAGTTGTTGGGTTTAAGCTGATGACTTCTCTGGTTATGGCTTTCATCAGCTGTCAACTCT
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DS 

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TCTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACACAGGAACATCTCCCAAAACCATAAGTTTCAAG
CTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATCCTGTTTTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGG
TTGGTGCTCGAGGACTTTAGTTCACTTGGGATTATGTTTTACAAGGGCTTGAAGCCAATG
CAAATCTGGTGTTTACGATATCTTTAGCTGCGCTAGATTCTTTGATGTGGCTACGCAAGA
ACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACGTGTGCAGTGATCATCGCTACAATGC
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TTGAGCTGATGACTTCTCTGGTTATGGCTTTCATCAGCTGTCAACTCTTCATTCTTTGTC
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TGGCAGAAGAGAGTTTATGTTTATGGGTAACTCTTGAGACGTACTTGCCTTGTTTTTCGG
TTGCTTGAAACTTTTGATCTTTACATTGTAGAAGAATATTGAACTATATATTCAAGAGAT
CCTTACAC
T

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DS 

RD RR4AL64JQ 596 0 0
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ATGGGCATTTGCGGATTCTGTTTTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGCTCGAGG
ACTTGAGTTCACTTGGGATTATGTTTTACAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTT
TACGATATCTTTAGCTGCGCTAGGTTCTTTGATGTGGCTACGCAAGAACAAGCCAAAGAC
TCTGATCCCCATCATATACACGTGTGCAGTGATCATCGCTACAATGCCTTCAATCACGAG
CTATCTAAGGAGAGTCATGGGATGGCATTTCCCCAAAGTTGTTGGGTTTAAGCTGATGAC
TTCTCTGGTTATGGCTTTCATCAGCTGTCAACTCTTCATTCTTTGTCAGAGACCGTCTTT
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TTTATGTTTATGGGTAACTCTTGAGACGTACTTGCCTTGTTTTTCGGTTGCTTGAAACTT
TTGATCTTTACATTGTAGAAGAATATTGAACCATATATTCAAGAGATCCTTACAC
C

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AA
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GAGTTCACTTGGGATTATGTTTTACAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACG
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ATCCCCATCATATACACGTGTGCAGTGATCATCGCTACAATGCCCTCAATCACGAGCTAT
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CTGGTTATGGCTTTCATCAGCTGTCAACTCTTCATTCTTTGTCAGAGACCGTCTTTGTGA
TTCCACTCCTATCGAGAGACTAAACTCACTTGAACTGCTCTTTTGGCAGAAGAGAGTTTA
TGTTTATGGGTAACTCTTGAGACGTACTTGCCTTGTTTTTCGGTTGCTTGAAACTTTTGA
TCTTTACATTGTAGAAGAATATTGAACCATATATTCAAGAGATCCTTACACTTGAGGTCT
CTCTTGTAAGGGATCAACAAGAGCTTA
C

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR4B261JQ 665 0 0
TCTCTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACACAGGAACATCTCCCAAAACCATAAGTTTCA
AGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATTCTGTTTTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTG
GGTTGGTGCTCGAGGACTTGAGTTCACTTGGGATTATGTTTTACAAGGGCTTGAAGCCAA
TGCAAATCTGGTGTTTACGATATCTTTAGCTGCGCTAGGTTCTTTGATGTGGCTACGCAA
GAACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACGTGTGCAGTGATCATCGCTACAAT
GCCTTCAATCACGAGCTATTTAAGGAGAGTCATGGGATGGCATTTCCCCAAAGTTGTTGG
GTTTGAGCTGATGACTTCTCTGGTTATGGCTTTCATCAGCTGTCAACTCTTCATTCTTTG
TCAGAGACCGTCTTTGTGACTCCACTCCTATCGAGAGACTAAACTCACTTGAACTGCTCT
TTTGGCAGAAGAGAGTTTATGTTTATGGGTAACTCTTGAGACGTACTTCCCTTGTTTTTC
GGTTGCTTGAAACTTTTGATCTTTACATTGTAGAAGAATATTGAACCATATATTCAAGAG
ATCCTTACACTTGAGGTCTCTCTTGTAAGGGATCAACAAGAGCTTATAAACGTCAAGCGT
TCACC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 6

CO CL787Contig1 649 6 11 U
GGATTCATCTCTCATTCAGTTGGATAACATCGAAGAGACCTAAAACGTCTTCCATGGATA
CTCTCTCAGCATCCGTTTCATCCTTCAACCTCCCTCCACTCTCTCGTAGATCCATCTCCG
GTCGCTTTAAACCTACCGTTAACGCAAACGCTACCAATCTTTCCAAACCACCAACATCGT
CTTCTCCATCGTCCTTCTCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATCTCTTTAA
CTCTTCCGAACGCAAAACCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGC
ACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACT
GTCTTGGTCGGACTCAAGAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACA
AAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTGGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTA
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ATGTCTTAATGGAGTTTGAGAGAGTCTGTAATGAATTGTTCCTTGTCCGTACAACAAAAC
TTGTCTGAAACAACTAAAGATTGTAATAAGATTACATCATCAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM31TF U 1
AF RR4CL65TF U 16
AF RR4DM36JQ C 27
AF RR4DM36TF U 27
AF RR4CM60TF U 16
AF RR4CN02TF U 16
BS 1 52 RR4AM31TF
BS 53 53 RR4CL65TF
BS 54 376 RR4AM31TF
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BS 378 541 RR4AM31TF
BS 542 542 RR4CL65TF
BS 543 578 RR4AM31TF
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BS 580 640 RR4AM31TF
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CTCTCTCAGCATCCGTTTCATCCTTCAACCTCCCTCCACTCTCTCGTAGATCCATCTCCG
GTCGCTTTAAACCTACCGTTAACGCAAACGCTACCAATCTTTCCAAACCACCAACATCGT
CTTCTCCATCGTCCTTCTCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATCTCTTTAA
CTCTTCCGAACGCAAAACCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGC
ACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACT
GTCTTGGTCGGACTCATGAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACA
AAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTGGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTA
AACATTTGAAGGGCTTGGTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTG
ACGTCTTAATGGAGTTTGAGAGAGTCTGTAATGAATTGGTCCTTGTCCGTACAACAAAAC
TTGTCTGAAACAACTAAAGATTGTAATAAGATTACATCAT

QA 1 640 1 640
DS 

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GG
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TCATCCTTCAACCTCCCTCCACTCTCTCGTAGATCCATCTCCGGTCGCTTTAAACCTACC
GTTAACGCAAACGCTACCAATCTTTCCAAACCACCAACATCGTCTTCTCCATCGTCCTTC
TCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATCTCTTTAACTCTTCCGAACGCAAAA
CCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGCACGAGAAAGCGGCGTCA
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GAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACAAAAAGAGGAACAACAAC
AAGGTCTTGGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTAAACATTTGAAGGGCTTG
GTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTGATGTCTTAATGGAGTTT
GAGAGAGTCTGTAATGAATTGTTCCTTGTCCGTACAACAAAACTTGTCTGAAACAACTAA
AGATTGTAATAAGATTACATCATC

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR4DM36JQ 615 0 0
GG
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TCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGCACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGC
GGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACTGTCTTGGTCGGACTCAAGAAGATGTCAG
AAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACAAAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTGGT
CAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTAAACATTTGAAGGGCTTGGTCAAGATGTT
GGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTGATGTCTTAATGGAGTTTGAGAGAGTCTG
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AGATTACATCA
CC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RR4DM36TF 615 0 0
GG
ATCGAAGAGACCTAAAACGTCTTCCATGGATACTCTCTCAGCATCCTTTTCATCCTTCAA
CCTCCCTCCACTCTCTCGTAGATCCATCTCCGGTCGCTTTAAACCTACCGTTAACGCAAA
CGCTACCAATCTTTCCAAACCACCAACATCGTCTTCTCCATCGTCCTTCTCCCACCACAA
AAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATCTCTTTAACTCTTCCGAACGCAAAACCCTCAAGAGC
TCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGCACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGC
GGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACTGTCTTGGTCGGACTCAAGAAGATGTCAG
AAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACAAAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTGGT
CAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTAAACATTTGAAGGGCTTGGTCAAGATGTT
GGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTGATGTCTTAATGGAGTTTGAGAGAGTCTG
TAATGAATTGTTCCTTGTCCGTACAACAAAACTTGTCTGAAACAACTAAAGATTGTAATA
AGATTACATCA
CC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RR4CM60TF 626 0 0
GG
AGTTGGATAACATCGAAGAGACCTAAAACGTCTTCCATGGATACTCTCTCAGCATCCGTT
TCATCCTTCAACCTCCCTCCACTCTCTCGTAGATCCATCTCCGGTCGCTTTAAACCTACC
GTTAACGCAAACGCTACCAATCTTTCCAAACCACCAACATCGTCTTCTCCATCGTCCTTC
TCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATCTCTTTAACTCTTCCGAACGCAAAA
CCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGCACGAGAAAGCGGCGTCA
GGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACTGTCTTGGTCGGACTCAA
GAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACAAAAAGAGGAACAACAAC
AAGGTCTTGGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTAAACATTTGAAGGGCTTG
GTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTGATGTCTTAATGGAGTTT
GAGAGAGTCTGTAATGAATTGTTCCTTGTCCGTACAACAAAACTTGTCTGAAACAACTAA
AGATTGTAATAAGATTACATCATC

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR4CN02TF 634 0 0
GG
AGTTGGATAACATCGAAGAGACCTAAAACGTCTTCCATGGATACTCTCTCAGCATCCGTT
TCATCCTTCAACCTCCCTCCACTCTCTCGTAGATCCATCTCCGGTCGCTTTAAACCTACC
GTTAACGCAAACGCTACCAATCTTTCCAAACCACCAACATCGTCTTCTCCATCGTCCTTC
TCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATCTCTTTAACTCTTCCGAACGCAAAA
CCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGCACGAGAAAGCGGCGTCA
GGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACTGTCTTGGTCGGACTCAA
GAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACAAAAAGAGGAACAACAAC
AAGGTCTTGGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTAAACATTTGAAGGGCTTG
GTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTGATGTCTTAATGGAGTTT
GAGAGAGTCTGTAATGAATTGTTCCTTGTCCGTACAACAAAACTTGTCTGAA*CAACTAA
AGATTGTAATAAGATTACATCATCAATAAAAA

QA 3 634 3 634
DS 



AS 1 7

CO CL788Contig1 789 7 28 U
GCACGGAAAAAACATCACCTGATAAATGGTATTAATAAGAAAGCAATCTGAGATTCAGTA
CAAGGCACAAAGCCCGACAACATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAAAAACAA*GATAATAA
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GCATCGGGGATGGCAAACGGAAGAGATTAGAAAAACAAACACAAGCGAAATAACATAATA
GTTGGATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCTTCTTCAGCAGGC
TTTGTTGCTGCCGCTTCTTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAG
AGAGTAAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCG
CCTAGAGTATCCAACTCAGCGATTGCATCATCAAATGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCA
CGGTCTGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGA
CGGATCGGGTGCGTTGGAGCCAATTCAGCGTTAGCAATTTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCG
GTTAGGGTATGCTCTGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTAC
CTATGGTAATCCCCCTTCATCTTCAGGTAAAAAACCTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCC
GGGACGAGCCTCTCGTCGAGGAGCTTGAGGATGCCGTCGCAGATCTTCGAGAGCTCCGAC
TCGATCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ31JQ U 6
AF RR4CZ31TF C 196
AF RR4BK56JQ U 5
AF RR4BK56TF C 21
AF RR4AL54JQ U 1
AF RR4AL54TF C 22
AF RR4C875JQ U 34
BS 1 29 RR4AL54JQ
BS 30 30 RR4BK56JQ
BS 31 49 RR4AL54JQ
BS 50 50 RR4BK56JQ
BS 51 72 RR4AL54JQ
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BS 105 105 RR4BK56JQ
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BS 580 745 RR4AL54JQ
BS 746 789 RR4C875JQ

RD RR4CZ31JQ 606 0 0
GG
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GGTGCGTTGGAGCCAATTCAGCGTTAGCAATTTCCTGAGCGGCTTTGTAAAGGGTTAGGG
TAT
C

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR4CZ31TF 416 0 0
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AATACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCTTCTTCAGCAGGCTTTGTTGCTGCCGCT
TCTTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCA
CGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAAC
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AGAATCTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTT
GGAGCCAATTCAGCGTTAGCAATTTCCTGAGCGGCTTTGTAAG*GGTTAGGGTAT
C

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4BK56JQ 718 0 0
CGG
AAAAACATCACCTGATAAATGGTATTAATAAGAAAGCAATCTGAG*TTCAGTACAAGGCA
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AGCATCCACGATTAGGAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGACCTTAGAAGCATCGG
GGATGGCAAACGGAAGAGATTAGAAAAACAAACACAAGCGAAATAACATAATAGTTGGAT
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CTGCCGCTTCTTTGATCTCATCTGTACCTTCGTCCTGCATGTAAGAAGTCCAGAGAGTAA
GGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAG
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GAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCG
GGTGCGTTGGAGCCAATTCAGCGTTAGCAATTTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGGG
TATGCTCTGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGT
AATCCCCCTTCATCTTCAGGTAGAAAACCTTGGAATCTCCGTTCGCGGAGGCC
CA

QA 4 716 4 716
DS 

RD RR4BK56TF 702 0 0
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CATTCAATCAAATAAGAAGAAAATAAAACAA*GATAATAAACCCAGCAGCATCCACGATT
AGGAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGACCTTAGAAGCATCGGGGATGGCAAACGG
AAGAGATTAGAAAAACAAACACAAGCGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAATAC
TGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCTTCTTCAGCAGGCTTTGTTGCTGCCGCTTCTTT
GATCTCATCTGTACCTTCGTCCTGCATGTAAGAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCACGGAG
AAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTCAGC
GATTGCATCATCAAATGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAGAAT
CTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGGAGC
CAATTCAGCGTTAGCAATTTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGGGTATGCTCTGCGGC
GTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGTAATCCCCCTTCAT
CTTCAGGTAGAAAACCTTGGAATCTCCGTTCGCGGAGGCC
CA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4AL54JQ 746 0 0
GCACGGAAAAAACATCACCTGATAAATGGCATTAATAAGAAAGCAATCTTAGATTCAGTA
CAAGGCACAAAGTCCGACAACATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAA*GATAATAA
ACCCAGCAGCATCCACGATTAGGAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAA
GCTTCGGGGATGGCAAACGGAAGAGATTAGAAAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATA
GTTGGATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCGGCAGGC
TTTGCTGCTGCCGCTTCTTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAG
AAAGTAAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCG
CCTAGAGTATCCAACTCAGCGATTGCATCATCAAACGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCA
CGGTCTGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGA
CGGATCGGGTGCGTTGGAGCCAATTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCG
GTTAGGGTATGCTCTGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTAC
CTATGGTAATCCCCCTTCATCTTCAGGTAAAAAACCTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCC
GGGACGAGCCTCTCGTCGAGGAGCT
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4AL54TF 725 0 0
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ATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAAAGATAATAAACCCAGCAGCATCCACGATTA
GGAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCTTCGGGGATGGCAAACGGA
AGAGATTAGAAAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAATACT
GAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCGGCAGGCTTTGCTGCTGCCGCTTCTTTG
ATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCACGGAGA
AGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTCAGCG
ATTGCATCATCAAACGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAGAATC
TCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGGAGCC
AATTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGGGTATGCTCTGCGGCG
TCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGTAATCCCCCTTCATC
TTCAGGTAAAAAACCTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCCGGGACGAGCCTCTCGTCGAGG
AGCT
C

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4C875JQ 756 0 0
AG
TAAGAAAGCAATCTTAGATTCAGTACAAGGCACAAAGTCCGACAACATTCAATCAAATAA
GAAGAAAAAGAAACAA*GATAATAAACCCAGCAGCATCCACGATTAGGAAGAGCAAACAA
AGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCTTCGGGGATGGAAAACGGAAGAGATTAGAAAAA
CAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAATACTGAATAACAAACTTA
AGTCTCCTTCTCCTCTTCGGCAGGCTTTGCTGCTGCCGCTTCTTTGATCTCCTCTGTACC
TTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAA
AGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTCAGCGATTGCATCATCAAA
CGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAAAGAC
GGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGGAGCCAATTCAGCGTTAGC
AATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGGGTATGCTCTGCGGCGTCTTTCCTCTCCTG
CCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGTAATCCCCCTTCATCTTCAGGTAAAAAAC
CTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCCGGGACGAGCCTCTCGTCGAGGAGCTTGAGGATGCC
GTCGCAGATCTTCGAGAGCTCCGACTCGATCTTG

QA 3 756 3 756
DS 



AS 1 8

CO CL789Contig1 907 8 18 U
GGCTCTACGATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGA
AGGTCAGCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGATGT
ACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACG
ATGCTAAACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAG
ATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCA
TCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCT
TCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTG
TGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCT
CTGGTGTTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGGTGAGAAGAAGA
ACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCAC
AAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTG
TTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCAC
ATGAGCTTGTCTTCTAGATTTTCAATAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGT
TTTTGTTCTTGTCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGC
ATTTGGTATCTGAATGTGAACTCTGAAGCAATATATTTCAATAGATAGTAGTGCTCTTGT
TATGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD56TF U 1
AF RR4BC78TF U 5
AF RR4BD18TF U 297
AF RR4EN93TF U 3
AF RR4BD18JQ C 5
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AF RR4EN93JQ C 135
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BS 272 566 RR4FD56TF
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BS 591 633 RR4FD56TF
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BS 765 765 RR4BC78TF
BS 766 800 RR4EN93TF
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BS 841 907 RR4EN93JQ

RD RR4FD56TF 688 0 0
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ATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAGGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCA
TCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCT
TCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTG
TGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCT
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ACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCAAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAAGTGTTCCCAC
AAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACG*AGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTG
TTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGC

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RD RR4BC78TF 775 0 0
GG
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AGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAGGGTGTTCCCACAAGGGA
AGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAG
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TTGTCTTCTAGATTTTCAATAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTG

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4BD18TF 448 0 0
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GTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAAT
GGTGTGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGAC
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AAGAACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAGGGTGTTC
CCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAG
TCTGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAG
CCACATGAGCTTGTCTTCTAGATTTTCA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4EN93TF 798 0 0
GGCT
ACGATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGAAGGTCA
GCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGATGTACCACA
AGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTA
AACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTA
AGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCC
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AGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTGCCTT
TGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCTCTGGTG
TTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGGTGAGAAGAAGAACAAGA
AGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGA
AGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAG
AGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGA*TGAAGCCACATGAGC
TTGTCTTCTAGATTTTCA*TAAACTTTTATTTGTGTGT*ACTCCCAACGTTTGTTTTTGT
TCTTGTCCACTTAC

QA 5 798 5 798
DS 

RD RR4BD18JQ 843 0 0
GG
ACGATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGAAGGTCA
GCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGATGTACCACA
AGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTA
AACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTA
AGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCC
CAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGA
AGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTGCCTT
TGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCTCTGGTG
TTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGGTGAGAAGAAGAACAAGA
AGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAGGGTGTTCCCACAAGGGA
AGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAG
AGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACATGAGC
TTGTCTTCTAGATTTTCAATAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGT
TCTTGTCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGC
ATTTGGT

QA 3 836 3 836
DS 

RD RR4BC78JQ 788 0 0
AAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGATG
TACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCAC
GATGCTAAACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAA
GATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGC
ATCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTC
TTCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGT
GTGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATC
TCTGGTGTTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGGTGAGAAGAAG
AACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAGGGTGTTCCCA
CAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCT
GTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCA
CATGAGCTTGTCTTCTAGATTTTCAATAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTG
TTTTTGTTCTTGTCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCG
C
ATTTGGT

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DS 

RD RR4FD56JQ 629 0 0
GAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAG
GGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGC
TGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCT
TGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGT
GATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTTAGCCTTGATAAATTCGATGATAA
GTATTTTGGAAAGGTGGGTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCAAAGC
AGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGA
CGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAG
GTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTCCTCTAGATTTTCAATAAACT
TTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGTTCTTGTCCACTTACTAGAATTTTGG
TTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4EN93JQ 773 0 0
CTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTT*CCCTCGCCACGATGCTAAACCCAAG
GTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAACCT
CTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCAGGAACT
GTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTT
CCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTGCCTTTGAGACGT
GTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTTAGCCTT
GATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGGTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAA
GGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGAT
GACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAGAGTTGAAG
ACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTTTTC
TAGATTTTCAATAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGTTCTTGTCC
ACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGCATTTGGTATCTGAA
TGTGAACTCTGAAGCAATATATTTCAATAGATAGTAGTGCTCTTGTTATGTCG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 2 8

CO CL790Contig1 766 6 5 U
GGACCCACACCAGTGAGAGTTCAGAGAAAGAGAAGATGATTCTGATGCTCTCTTACTCTC
CGGCGATAATCTCAGCCGTTAAATATCTGGGCTCGTCTCCGTTCAACACTCGACGACTTT
CTCAGCCTAGTATCTCGATCTCTAGACACAAAAGCTTCTTCTTACACTTGACAGAGACGA
AAGAGAAAAGAAGAAGAAGAGAAAATGGGAGAGTATCGATCGTGTGTGACGCAGGAGGGA
T*TTTCCGGTGGACCCCTGGGCTCCAACCATTGATTCACAGAGCATAGCATCGCAGCTCT
TCGCGGTGTCTCTGTTTCCATACATAGGTTTCCTCTACTTCCTCACTAAATCCAAAACTG
CTCCGAAGCTCACACTTTTCGGATTCTACTTCTTGCTTGCCTTCGTTGGAGCTACAATAC
CTGCTGGGATATATGCTAAGGTGCATTATGGAACATCATTGTCAAACGTTGATTGGTTAC
ATGGAGGAGCTGAATCACTTCTTGCTCTCACCAATTTGTTCATCGTGTTGGGTCTCAGAC
AAGCTTTGCGCAAGTCTGAAGATAATGATGAAGATACTCCAACCACAACGAGTCAACAAG
AACAAGAAAAATCTTCAGTCTAGTAAAATATGGAATGATATGTATTCTTCTTCCTTTTTT
GTCGCCATCAGATTTTATTAATAACGAGGTGAGATTGATACAACACCAATGTCGAGCTTG
ATATGTATTCTTTTTACTTTTAGGAATTTTACTCAAAAGTTTAATT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4H301TF U 1
AF RR4H301JQ C 200
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AF RR4FO26JQ C 1
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AF RR4FQ42TF U 1
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AA

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TT

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AACAAGAAAAATCTTCAGTCTAGTAAAATATGGAATGATATGTATTCTTCTTCCTTTTT*
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ATATGTATTCTTTT
TACTTTAGATT

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM73TF U 1
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QA 1 591 1 591
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TATTTTCATTTTTAGGAATTTTACTCAAAAGTTTAACT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 2 7

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GAAACGAGTGGGTAGTTCAAATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCAC
GCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCA
AACTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGAGG
GAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAAAAGAGAGAAGGCTTGGAGGGGAGAACTC
TAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTCTG
CTCTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGCTCTACAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ49JQ U 1
AF RR4H565JQB U 5
AF RR4E329JQ U 59
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BS 144 144 RR4H565JQB
BS 145 642 RR4DJ49JQ
BS 643 813 RR4E329JQ

RD RR4DJ49JQ 642 0 0
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ACATAAGTAATGAAGATTAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAA
ACTGAGCTCTCAACACAGGAAAAAATAAACATGTCCTCTGCTTTTCACCAAACATATGTT
CTATATGAAAAGCCTCTTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGT
TTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAAACTTCATCAGGGTTTTCTTGA
ACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCAACACTTCGGCCAATACCGAGG
TTGTTGATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAAT
GCAATGCCCTGATCAGGGATGAAAACTCCAAACGATTTAAAAATGGATTTGGTGATATCC
GAAACGAGTGGGTAGTTCAAATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCAC
GCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCA
AACTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4H565JQB 632 0 0
GAACATATAAATTTCATTATTTTAATTCAACTTTTTAGGAGAATCACACAGAAGAAACAT
AAGTAATGAAGATTAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTG
AGCTCTCAACACAGGAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTCACCAAACATATGTTCTAT
ATGAAAAGCCTCTTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCA
TCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACTTCATCAGGGTTTTCTTGAACAT
ACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCAACACTTCGGCCAATACCGAGGTTGT
TGATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAA
TGCCCTGATCAGGGATGAGAACTCCAAACGATTTAGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGA
CGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAA
GATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACT
CTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4E329JQ 755 0 0
AAACATAAGTAATGAAGATTAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAA
AAACTGAGCTCTCAACACAGGAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTCACCAAACATATG
TTCTATATGAAAAGCCTCTTTAAACAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAG
GTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAAACTTCATCAGGGTTTTCTT
GAACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCAACACTTCGGCCAATACCGA
GGTTGTTGATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCA
ATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAAAACTCCAAACGATTTAAAAATGGATTTGGTGATAT
CCGAAACGAGTGGGTAGTTCAAATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCC
ACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCT
CAAACTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGA
GGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAAAAGAGAGAAGGCTTGGAGGGGAGAAC
TCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTC
TGCTCTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGCTCTACAA

QA 1 755 1 755
DS 



CO CL791Contig2 792 4 10 U
TTTTTTGTAGAGCACTGTGTCACACGGAGAGAGAGAGCAGAGTACTTTCAGTCCATGGCG
TCCTTAGCTTCATCCACCACCCTTATCTCTTCCGCTAGAGTTCTCCCCTCCAAGCCTTCT
CTCTTTTCTCCCGCCGCCTCTTTCCTCCGAACTCTTCCCTCTTCATCTGCATCATCACCG
TCTTCTCTCTGCTCCGGTTTCTCCCGCATCGGTCCCCTCACCTCCAACAGCAGCTCTTCC
ACTCGCCGTAGCTTCGCCGTCAAGGCCCAGGCCGATGATTTGCCACTAGTTGGTAATAAG
GCGCCTGATTTTGAGGCAGAGGCTGTTTTTGATCAAGAGTTCATCAAGGTGAAGCTCTCA
GAGTACATTGGTAAAAAATATGTGATTCTATTTTTCTACCCATTGGACTTCACTTTTGTC
TGCCCCACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGTTATGAAGAGTTTGAGAAGCTAAACACC
GAAGTGTTAGGTGTCTCAGTCGACAGTGTGTTCTCGCATCTTGCGTGGGTCCAAACAGAC
AGAAAGTCAGGAGGGCTCGGTGATCTGAACTACCCACTCGTCTCGGATATCACCAAATCC
ACTTCTAAATCGTTTGGAGTTCTCATCCCTGATCAGGGCATTGCATTGAGAGGGCTTTTC
ATCATCGACAAAGAAGGAGTCATCCAGCATTCCACCATCAACAACCTCGGTATTGGCCGA
AGTGTTGATGAGACTATGAGACCCTCCAGGCATTACAGTATGTTCAGAAACCCTGATGAG
TCTGCCCCGCGG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H565TF U 1
AF RR4DJ49TF U 1
AF RR4E356TF U 33
AF RR4DY50TF U 33
BS 1 425 RR4DJ49TF
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BS 678 792 RR4DY50TF

RD RR4H565TF 546 0 0
TTTT
TTGTAGAGCACTGTGTCACACGGAGGGAGAGAGCAGAGTACTTTCAGTCCATGGCGTCCT
TAGCTTCATCCACCACCCTTATCTCTTCCGCTAGAGTTCTCCCCTCCAAGCCTGCTCTCT
TTTCTCCCGCCGCCTCTTTCCTCCGAACTCTTCCCTCTTCATCTGCATCATCACCGTCTT
CTCTCTGCTCCGGTTTCTCCCGCATCGGTCCCCTCACCTCCAACAGCAGCTCTTCCACTC
GCCGTAGCTTCGCCGTCAAGGCCCAGGCCGATGATTTGCCACTAGTTGGTAATAAGGCGC
CTGATTTTGAGGCAGAGGCTGTTTTTGATCAAGAGTTCATCAAGGTGAAGCTCTCAGAGT
ACATTGGTAAAAAATATGTGATTCTATTTTTCTACCCATTGGACTTCACTTTTGTCTGCC
CTACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGTTATGAAGAGTTTGAGAAGCTAAACACCGAAG
TGTTAGGTGTCTCAGTCGACAGTGTGTTCTCGCATCTTGCGTGGGTCCAAACAGACAGAA
AG

QA 5 546 5 546
DS 

RD RR4DJ49TF 669 0 0
TTTTTTGTAGAGCACTGTGTCACACGGAGAGAGAGAGCAGAGTACTTTCAGTCCATGGCG
TCCTTAGCTTCATCCACCACCCTTATCTCTTCCGCTAGAGTTCTCCCCTCCAAGCCTTCT
CTCTTTTCTCCCGCCGCCTCTTTCCTCCGAACTCTTCCCTCTTCATCTGCATCATCACCG
TCTTCTCTCTGCTCCGGTTTCTCCCGCATCGGTCCCCTCACCTCCAACAGCAGCTCTTCC
ACTCGCCGTAGCTTCGCCGTCAAGGCCCAGGCCGATGATTTGCCACTAGTTGGTAATAAG
GCGCCTGATTTTGAGGCAGAGGCTGTTTTTGATCAAGAGTTCATCAAGGTGAAGCTCTCA
GAGTACATTGGTAAAAAATATGTGATTCTATTTTTCTACCCATTGGACTTCACTTTTGTC
TGCCCTACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGTTATGAAGAGTTTGAGAAGCTAAACACC
GAAGTGTTAGGTGTCTCAGTCGACAGTGTGTTCTCGCATCTTGCGTGGGTCCAAACAGAC
AGAAAGTCAGGAGGGCTCGGTGATCTGAACTACCCACTCGTCTCGGATATCACCAAATCC
ATTTCTAAATCGTTTGGAGTTCTCATCCCTGATCAGGGCATTGCATTGAGAGGGCTTTTC
ATCATCGAC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4E356TF 673 0 0
GG
GAGCAGAGTACTTTCAGTCCATGGCGTCCTTAGCTTCATCCACCACCCTTATCTCTTCCG
CTAGAGTTCTCCCCTCCAAGCCTTCTCTCTTTTCTCCCGCCGCCTCTTTCCTCCGAACTC
TTCCCTCTTCATCTGCATCATCACCGTCTTCTCTCTGCTCCGGTTTCTCCCGCATCGGTC
CCCTCACCTCCAACAGCAGCTCTTCCACTCGCCGTAGCTTCGCCGTCAAGGCCCAGGCCG
ATGATTTGCCACTAGTTGGTAATAAGGCGCCTGATTTTGAGGCAGAGGCTGTTTTTGATC
AAGAGTTCATCAAGGTGAAGCTCTCAGAGTACATTGGTAAAAAATATGTGATTCTATTTT
TCTACCCATTGGACTTCACTTTTGTCTGCCCCACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGTT
ATGAAGAGTTTGAGAAGCTAAACACCGAAGTGTTAGGTGTCTCAGTCGACAGTGTGTTCT
CGCATCTTGCGTGGGTCCAAACAGACAGAAAGTCAGGAGGGCTCGGTGATCTGAACTACC
CACTCGTCTCGGATATCACCAAATCCACTTCTAAATCGTTTGGAGTTCTCATCCCTGATC
AGGGCATTGCATTGAGAGGGCTTTTCATCATCGACAAAGAAGGAGTCATCCAGCATTCCA
CCATCAACAAC

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4DY50TF 760 0 0
GG
GAGCAGAGTACTTTCAGTCCATGGCGTCCTTAGCTTCATCCACCACCCTTATCTCTTCCG
CTAGAGTTCTCCCCTCCAAGCCTTCTCTCTTTTCTCCCGCCGCCTCTTTCCTCCGAACTC
TTCCCTCTTCATCTGCATCATCACCGTCTTCTCTCTGCTCCGGTTTCTCCCGCATCGGTC
CCCTCACCTCCAACAGCAGCTCTTCCACTCGCCGTAGCTTCGCCGTCAAGGCCCAGGCCG
ATGATTTGCCACTAGTTGGTAATAAGGCGCCTGATTTTGAGGCAGAGGCTGTTTTTGATC
AAGAGTTCATCAAGGTGAAGCTCTCAGAGTACATTGGTAAAAAATATGTGATTCTATTTT
TCTACCCATTGGACTTCACTTTTGTCTGCCCCACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGTT
ATGAAGAGTTTGAGAAGCTAAACACCGAAGTGTTAGGTGTCTCAGTCGACAGTGTGTTCT
CGCATCTTGCGTGGGTCCAAACAGACAGAAAGTCAGGAGGGCTCGGTGATCTGAACTACC
CACTCGTCTCGGATATCACCAAATCCACTTCTAAATCGTTTGGAGTTCTCATCCCTGATC
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CCATCAACAACCTCGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACTATGAGACCCTCCAGGCATT
ACAGTATGTTCAGAAACCCTGATGAGTCTGCCCCGCGG

QA 3 760 3 760
DS 



AS 1 4

CO CL792Contig1 1349 4 12 U
AACAATTAAAAATCATCGATCTATTATAAATGTTATACATAACAAATTGAATAAACACAT
ACGGATGTATGTTTGTGCAATCATTACATTTTTGTCTTGTGAGAAAAATGATATATGTTT
TATAAAACAAAACACTCATGCGGCTGCATGGTCTAGTAAGCTCTAGTTGCTTTTAAGACG
TAAATTTGGCGTAGCTTTCTTTAACCATTGTCTTGACAAAAAGCTCTCCTGCTCTGTATG
AAGATCTCACCAGTGGACCACTTGCTACATAGCGGAATCCAATTGATTCTCCGTATGTTT
TCCAGAAATCAAACTTCTCAGGCGTAACATATTCTTTGACCGTCAAATGCAGTGGGGTTG
GCTGTAAATATTGACCAAGTGTTAGGATGTCAACATCTATCGCTCTTAGATCAGCCATTG
CTTCTTTCAACTCTTCGTCTGTTTCTCCAAGACCAAGCATTATGGAAGTCTTTGTGATCA
TTCCTGGTTTGCTGATCTTTGCGTGTTTCAACACCGACATGCTCTGCTCATATCCAGCCC
TAGGATCCCTGACAAGTCGCTGGAGCCTTTTCACAGTCTCGATATTGTGAGCAAAAACGT
CCAATCCAGAGTGAACAAGAGAGTCTACAGCCTCCAAGTCTCCACGGAAATCAGAAGTTA
AACACTCTATCATTATATCCGGCTTAAGTCTCTTCATAGCTTTAACAGTCTGTGCAAAAT
GTCCACTTCCACCATCAGGTAAATCGTCACGATCTACACTGGTAATAACTATGTAGTCTA
CACCCCAACTGGTAATGGCCTTGGCAGTGTTCTCCGGTTCCATTGGATCAGGAGGAGCAG
GATTTCTACTCGTTTTGACAGCACAGAACCTACAGCCACAAGTACAGGTGTCACCAAGAA
CCATGATGGTTGCAGTAGCTATACCATCACCACCTCCATTCCAACACTCGCCGATATTAG
GACACTGAGCTTCCTCACAAACAGTGTTGAGCTTGAGACGAGTCAACGACTCCTTCACCT
CCTGAAACCTCTCCCCCTGCGGCGCCTTCTGTCTCAACCACGCAGGCTTCTTCACATTCG
GATCTCTCCCCGTGAAAGGACCCATCTTTGGCATCCCTCCCGGGTAAGGCTCGCTCTTTT
TTACTCCAGACTCCATCATATTCTTCTTCAACGACGAATCCTCCTTCTCCGACGACAAGG
ACACCGCATTGGTCCGCTTCGACGCATCCCCGGATCCGCATCGGACTCTGAAACCGAAGA
AGCTAGTGGAGCGACGTTGCCTGTGCGTCGAGATCGAAGCTGAGAAAGTAGGTTTCGTGA
TGGAGCAGTGATGAATCATTTCTGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GC14JQ U 1
AF RR4H216JQ U 12
AF RR4GC14TF C 369
AF RR4D705TF C 605
BS 1 60 RR4GC14JQ
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BS 62 652 RR4GC14JQ
BS 653 735 RR4H216JQ
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BS 880 880 RR4D705TF
BS 881 1005 RR4GC14TF
BS 1006 1006 RR4D705TF
BS 1007 1037 RR4GC14TF
BS 1038 1349 RR4D705TF

RD RR4GC14JQ 652 0 0
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GCGGATGTATGTTTGTGCAATCATTACATTTTTGTCTTGTGAGAAAAATGATATATGTTT
TATAAAACAAAACACTCATGCGGCTGCATGGTCTAGTAAGCTCTAGTTGCTTTTAAGACG
TAAATTTGGCGTAGCTTTCTTTAACCATTGTCTTGACAAAAAGCTCTCCTGCTCTGTATG
AAGATCTCACCAGTGGACCACTTGCTACATAGCGGAATCCAATTGATTCTCCGTATGTTT
TCCAGAAATCAAACTTCTCAGGCGTAACATATTCTTTGACCGTCAAATGCAGTGGGGTTG
GCTGTAAATATTGACCAAGTGTTAGGATGTCAACATCTATCGCTCTTAGATCAGCCATTG
CTTCTTTCAACTCTTCGTCTGTTTCTCCAAGACCAAGCATTATGGAAGTCTTTGTGATCA
TTCCTGGTTTGCTGATCTTTGCGTGTTTCAACACCGACATGCTCTGCTCATATCCAGCCC
TAGGATCCCTGACAAGTCGCTGGAGCCTTTTCACAGTCTCGATATTGTGAGCAAAAACGT
CCAATCCAGAGTGAACAAGAGAGTCTACAGCCTCCAAGTCTCCACGGAAATC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4H216JQ 724 0 0
CTCC
TCGATCTATTATAAATGTTATACATAACAAATTGAATAAACACATACGGATGTATGTTTG
TGCAATCATTACATTTTTGTCTTGTGAGAAAAATGATATATGTTTTATAAAACAAAACAC
TCATGCGGCTGCATGGTCTAGTAAGCTCTAGTTGCTTTTAAGACGTAGATTTGGCGTAGC
TTTCTTTAACCATTGTCTTGACAAAAAGCTCTCCTGCTCTGTATGAAGATCTCACCAGTG
GACCACTTGCTACATAGCGGAATCCAATTGATTCTCCGTATGTTTTCCAGAAATCAAACT
TCTCAGGCGTAACATATTCTTTGACCGTCAAATGCAGTGGGGTTGGCTGTAAATATTGAC
CAAGTGTTAGGATGTCAACATCTATCGCTCTTAGATCAGCCATTGCTTCTTTCAACTCTT
CGTCTGTTTCTCCAAGACCAAGCATTATGGAAGTCTTTGTGATCATTCCTGGTTTGCTGA
TCTTTGCGTGTTTCAACACCGACATGCTCTGCTCATATCCAGCCCTAGGATCCCTGACAA
GTCGCTGGAGCCTTTTCACAGTCTCGATATTGTGAGCAAAAACGTCCAATCCAGGGTGAA
CAAGAGAGTCTACAGCCTCCAAGTCTCCACGGAAATCAGAAGTTAAACACTCTATCATTA
TATCCGGCTTAAGTCTCTTCATAGCTTTAACAGTCTGTGCAAAATGTCCACTTCCACCAT

QA 5 724 5 724
DS 

RD RR4GC14TF 669 0 0
TATTGACCAAGTGTTAGGATGTCAACATCTATCGCTCTTAGATCAGCCATTGCTTCTTTC
AACTCTTCGTCTGTTTCTCCAAGACCAAGCATTATGGAAGTCTTTGTGATCATTCCTGGT
TTGCTGATCTTTGCGTGTTTCAACACCGACATGCTCTGCTCATATCCAGCCCTAGGATCC
CTGACAAGTCGCTGGAGCCTTTTCACAGTCTCGATATTGTGAGCAAAAACGTCCAATCCA
GAGTGAACAAGAGAGTCTACAGCCTCCAAGTCTCCACGGAAATCAGAAGTTAAACACTCT
ATCATTATATCCGGCTTAAGTCTCTTCATAGCTTTAACAGTCTGTGCAAAATGTCCACTT
ACACCATCAGGTAAATCGTCACGATCTACACTGGTAATAACTATGTAGTCTACACCCCAA
CTGGTAATGGCCTTGGCAGTGTTCTCCGGTTCCATTGGGTCAGGAGGAGCAGGATTTCTA
CTCGTTTTGACAGCACAGAACCTACAGCCACGAGTACAGGTGTCACCAAGAACCATGATG
GTTGCAGTAGCTATACCATCACCACCTCCATTCCAACACTCGCCGATATTAGGACACTGA
GCTTCCTCACAAACAGTGTTGAGCTTGAGACGAGTCAGCGACTCCTTCACCTCCTGAAAC
CTCTCCCCC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4D705TF 745 0 0
TCCAGAGTGAACA
AGAGAGTCTACAGCCTCCAAGTCTCCACGGAAATCAGAAGTTAAACACTCTATCATTATA
TCCGGCTTAAGTCTCTTCATAGTTTTAACAGTCTGTGCAAAATGTCCACCTCCACCATCA
GGTAAATCGTCACGATCTACACTTGTAATAACTATGTAGTCTACACCCCAACTGGTAATG
GCCTTGGCAGTGTTCTCCGGTTCCATTGGATCAGGAGGAGCAGGGTTTCTACTCGTTTTG
ACAGCACAGAACCTACAGCCACAAGTACAGGTGTCACCAAGAACCATGATGGTTGCAGTT
GCTATACCATCACCACCTCCATTCCAACACTCTCCGATATTAGGACACTGAGCTTCTTCA
CAAACAGTGTTGAGCTTGAGACGAGTCAACGACTCCTTCACCTCCTGAAACCTCTCCCCC
TGCGGCGCCTTCTGTCTCAACCACGCAGGCTTCTTCACATTCGGATCTCTCCCCGTGAAA
GGACCCATCTTTGGCATCCCTCCCGGGTAAGGCTCGCTCTTTTTTACTCCAGACTCCATC
ATATTCTTCTTCAACGACGAATCCTCCTTCTCCGACGACAAGGACACCGCATTGGTCCGC
TTCGACGCATCCCCGGATCCGCATCGGACTCTGAAACCGAAGAAGCTAGTGGAGCGACGT
TGCCTGTGCGTCGAGATCGAAGCTGAGAAAGTAGGTTTCGTGATGGAGCAGTGATGAATC
ATTTCTGCTCCC

QA 14 745 14 745
DS 



AS 1 7

CO CL793Contig1 1073 7 17 U
GGAAAACCCTAGATACTGGTTTAAATTCAACAAGCGCCGTAGGTTCTATATCTTTTGTCT
TTACTTCGTCGTCGACCCTAACTTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCG
AATCTCCAAAGGAAGAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGA
TTGGTATGACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACCCACAGAAATGTCGGAAA*GACACTTG
TTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCTTCAGAGGGTTTGAAGCACAGAGTTTTCGAGG
TGTCTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAGGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAG
CTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTG
ATAAACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTA
AAACCACCGACAACTACACTCTGAGACTGTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTA
ACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGA
TGAGGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGT
TTATTCCAGAATCTATTGGTAAGGAGATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTC
AGAATGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGC
TCATGGAGGTTCATGGAGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGG
CCGATGAGACTGTGGTCGAAGAACCTACTGAGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTCA
AGAAATGTTAGAGTTGAGCAATCGTTTTGACTTCTAAGCTTTAGTTTCTTCAATGCTTTG
TGTCTTCTCACACTCGTTTGGTCCCTCAGCTTCTTGTTTTTGATATATTTGTACCTTTTC
TCAGTATAAACTTGTCAGTTTTGGATAATTTATGCAACGCTTCTTTCAGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR29TF U 1
AF RR4H392TF U 49
AF RR4GG56TF U 47
AF RR4DW22TF U 61
AF RR4DR29JQ C 191
AF RR4DW22JQ C 214
AF RR4GG56JQ C 355
BS 1 196 RR4DR29TF
BS 197 197 RR4H392TF
BS 198 619 RR4DR29TF
BS 620 620 RR4H392TF
BS 621 683 RR4DR29TF
BS 684 684 RR4H392TF
BS 685 695 RR4DR29TF
BS 696 698 RR4DW22TF
BS 699 714 RR4DR29TF
BS 715 755 RR4DW22TF
BS 756 756 RR4DR29JQ
BS 757 788 RR4DW22TF
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BS 790 815 RR4DW22TF
BS 816 1046 RR4DR29JQ
BS 1047 1067 RR4DW22JQ
BS 1068 1073 RR4GG56JQ

RD RR4DR29TF 719 0 0
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TTACTTCGTCGTCGACCCTAACTTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCG
AATCTCCAAAGGAAGAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGA
TTGGTATGACATCAAGACTCCCTCTAACTTCACCCACAGAAATGTCGGAAA*GACACTTG
TTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCTTCAGAGGGTTTGAAGCACAGAGTTTTCGAGG
TGTCTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAGGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAG
CTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTG
ATAAACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTA
AAACCACCGACAACTACACTCTGAGACTGTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTA
ACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGA
TGAGGGAGATTATGATCAAAGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGT
TTATTCCAGAATCTATTGGTAAG*AGATTGAGAAGC**ACTCAGGGCATCTACC
TCTTC

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DS 

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GGATCTTTGCTTCTG
CTTCGTCGTCGACCCCAACTTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCGAAT
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GTATGACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACCCATAGAAATGTCGGGAA*GACACTTGTTT
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CTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAGGATAACGCATACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTG
AAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACCGATA
AACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAGA
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AAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGA
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TTCCAGAATCTATTGGGAAGGAGATTGA

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DS 

RD RR4GG56TF 647 0 0
GGGATCTTTTGTCTTTA
CTTCGTCGTCGACCCTAACTTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCGAAT
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GTATGACGTCAAGGCTCCCTCTAACTTCACCCACAGAAATGTCGGAAAAGACACTTGTTT
CCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCTTCAGAGGGTTTGAAGCACAGAGTTTTCGAGGTGT
CTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAGGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTG
AAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATA
AACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAAA
CCACCGACAACTACACTCTGAGACTGTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACC
AAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGA
GGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTA
TTCCAGAATCTATTGGTAAG*AGATTGAGA

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DS 

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GGA
CTTCGTCGTCGACCCTAACTTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCGAAT
CTCCAAAGGAAGAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTG
GTATGACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACCCACAGAAATGTCGGAAA*GACACTTGTTT
CCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCTTCAGAGGGTTTGAAGCACAGAGTTTTCGAGGCGT
CTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAGGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTG
AAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATA
AACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAAA
CCACCGACAACTACACTCTGAGACTGTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACC
AAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGA
GGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTA
TTCCAGAATCTATTGGTAAGGAGATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGA
ATGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAG*CTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCA
TGGAG*TTCATGGAGACTACACAGCAGAGGAT

QA 4 755 4 755
DS 

RD RR4DR29JQ 856 0 0
GACATCAGACTCCCTCTAC
TCACCCACAGAAATGTCGGAAA*GACACTG**TTCCAGA*CTCAGGGTACCAAGATTGCT
TCAGAGGGTTTGAAGCACAGAGTTT*CGAGGTGTCTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAG
GATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTG
ACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATAAACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGG
CAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAAACCACCGACAACTACACTCTGAGACTG
TTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAG
TCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGAGGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCC
TCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATTGGTAAGGAGATT
GAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATC
CTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCATGGAGACTACACAGCA
GAGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCGATGAGACTGTGGTCGAAGAACCTACT
GAGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTCAAGAAATGTTAGAGTTGAGCAATCGTTTTG
ACTTCTAAGCTTTAGTTTCTTCAATGCTTTGTGTCTTCTCACACTCGTTTGGTCCCTCAG
CTTCTTGTTTTTGATATATTTGTACCTTTTCTCAGTATAAACTTGTCAGTTTTGGAT

QA 20 856 20 856
DS 

RD RR4DW22JQ 855 0 0
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AGGGTT*GAAGCACAGAGTTT*CGAGGCGTCTCTTGCTGATCTTCAAAATGATGAGGATA
ACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCTTGACTC
AGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATAAACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGA
CTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAAACCACCGACAACTACACTCTGAGACTGTTCT
GCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAA
GCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGAGGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCCTCTT
CTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATTGGTAAGGAGATTGAGA
AGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCA
AGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCATGGAGACTACACAGCAGAGG
ATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCGATGAGACTGTGGTCGAAGAACCTACTGAGA
TTATTGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTCAAGAAATGTTAGAGTTGAGCAATCGTTTTGACTT
CTAAGCTTTAGTTTCTTCAATGCTTTGTGTCTTCTCACACTCGTTTGGTCCCTCAGCTTC
TTGTTTTTGATATATTTGTACCTTTTCTCAGTATAAACTTGTCAGTTTTGGATAATTTAT
GCAACGCTTCTTTC
C

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4GG56JQ 719 0 0
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CCACTGATAAACTCAGATCCTTGGTGAAAAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTG
ATGTTAAAACCACCGACAACTACACTCTGAGACTGTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGAC
GTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCA
GCAAGATGAGGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTG
CCAAGTTTATTCCAGAATCTATTGGTAAGGAGATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACC
CTCTTCAGAATGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCG
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GGCCGGCCGATGAGACTGTGGTCGAAGAACCTACTGAGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGT
TTTTCAAGAAATGTTAGAGTTGAGCAATCGTTTTGACTTCTAAGCTTTAGTTTCTTCAAT
GCTTTGTGTCTTCTCACACTCGTTTGGTCCCTCAGCTTCTTGTTTTTGATATATTTGTAC
CTTTTCTCAGTATAAACTTGTCAGTTTTGGATAATTTATGCAACGCTTCTTTCAGACAT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 7

CO CL794Contig1 658 7 35 U
GGAAACTAAAACCCTAGCTTCTTCTCCTCTCATACTTTCTCTCTCAGAACTCGGAGGCGC
CAAGATGACGGTTGAAGCAGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCCGATTCTCAGCTAGC
GATTACCATCCTCGATCTTGTCCAGCAAGCCACGAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGC
TAATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGA
TGCTGAGCCTCTCGAGATTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCC
GTATGTGTTTGTGCCATCGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGT
GATTGCTTGTTCGGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAAGCTCAGATTCAGCAGCT
TAAGGATGCTATCGAGAAGCTTCTCATCTAAGGTTTTGGGGTGGGGATATGAATGAATGA
TGAGTCTCCTCCATTTAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATT
CTACTATGAGTTTTTGAAGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGC
CTAATGCTTCTTTGAACAAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGTTTTATTTTTCG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AF42JQ C 1
AF RR4AW20TF U 15
AF RR4AF52JQ C 2
AF RR4AF52TF U 2
AF RR4AF42TF U 1
AF RR4B683JQ C 15
AF RR4B683TF U 76
BS 1 1 RR4AF42JQ
BS 2 17 RR4AF52TF
BS 18 25 RR4AW20TF
BS 26 26 RR4AF52TF
BS 27 32 RR4AW20TF
BS 33 33 RR4AF52TF
BS 34 34 RR4AW20TF
BS 35 36 RR4AF52TF
BS 37 46 RR4AW20TF
BS 47 47 RR4AF52TF
BS 48 123 RR4AW20TF
BS 124 124 RR4AF52TF
BS 125 150 RR4AW20TF
BS 151 151 RR4AF52TF
BS 152 180 RR4AW20TF
BS 181 181 RR4AF52TF
BS 182 210 RR4AW20TF
BS 211 211 RR4AF52TF
BS 212 252 RR4AW20TF
BS 253 253 RR4AF52TF
BS 254 403 RR4AW20TF
BS 404 404 RR4AF52TF
BS 405 450 RR4AW20TF
BS 451 451 RR4AF52TF
BS 452 457 RR4AW20TF
BS 458 458 RR4AF52TF
BS 459 459 RR4AW20TF
BS 460 460 RR4AF52TF
BS 461 487 RR4AW20TF
BS 488 488 RR4AF52TF
BS 489 577 RR4AW20TF
BS 578 578 RR4AF52TF
BS 579 647 RR4AW20TF
BS 648 650 RR4AF42TF
BS 651 658 RR4B683TF

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TAATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGA
TGCTGAGCCTCTCGAGATTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCC
GTATGTGTTTGTGCCATCGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGT
GATTGCTTGTTCGGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAAGCTCAGATTCAGCAGCT
TAAGGATGCTATCGAGAAGCTTCTCATCTAAGGTTTTGGGGTGGGGATATGAATGAATGA
TGAGTCTCCTCCATTTAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATT
CTACTATGAGTTTTTGAAGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGC
CTAATGCTTCTTTGAACAAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGTTTT

QA 1 650 1 650
DS 

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CTT
CTTCTTCTTCTCTCAAAGCTTCTCTCTCAAAACTCGGAGGCGCCAAGATGACGGTTGAAG
CAGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCCGATTCTCAGCTAGCGATAACCATCCTCGATC
TTGTCCAGCAAGCTACGAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCCAATGAAGCTACCAAGA
CTTTGAACCGTGGGATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGATGCTGAGCCTCTTGAGA
TTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCCGTATGTGTTTGTGCCAT
CGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGTGATTGCTTGTTCGGTTA
CATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTTAAGGATGCTATCGAGA
AGCTTCTCATCTA*GGTTTTTGTGTGGGGATATGAATGAATGATGAGTCTACTCCATTTA
ATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATTCTACTATGAGTTTTTGA
AGTTTGTAATGTTTTTTTTTTAAATTTCAGATTGTGTTACTGCCTAATGCTTCTTTGAAC
AAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGT

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DS 

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AATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGAT
GCTGAGCCTCTCGAGATTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCCG
TATGTGTTTGTGCCATCGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGTG
ATTGCTTGTTCGGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGATGAAAGCTCAGATTCAGCAGCTT
AAGGATGCTATCGAGAAGCTTCTCATCTAAGGTTTTGGGGTGGGGATATGAATGAATGAT
GAGTCTCCTCCATTTAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATTC
TACTATGAGTTTTTGAAGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGCC
TAATGCTTCTTTGAACAAGAACAATAATTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4AF52TF 630 0 0
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ATTACCATCCTCGATCTTGTCCAGCAAGCCACGAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCT
AATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGAT
GCTGAGCCTCTCGAGATTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCCG
TATGTGTTTGTGCCATCGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGTG
ATTGCTTGTTCGGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGATGAAAGCTCAGATTCAGCAGCTT
AAGGATGCTATCGAGAAGCTTCTCATCTAAGGTTTTGGGGTGGGGATATGAATGAATGAT
GAGTCTCCTCCATTTAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATTC
TACTATGAGTTTTTGAAGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGCC
TAATGCTTCTTTGAACAAGAACAATAATTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4AF42TF 650 0 0
G
GAAACTAAAACCCTAGCTTCTTCTCCTCTCATACTTTCTCTCTCAGAACTCGGAGGCGCC
AAGATGACGGTTGAAGCAGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCCGATTCTCAGCTAGCG
ATTACCATCCTCGATCTTGTCCAGCAAGCCACGAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCT
AATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGAT
GCTGAGCCTCTCGAGATTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCCG
TATGTGTTTGTGCCATCGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGTG
ATTGCTTGTTCGGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAAGCTCAGATTCAGCAGCTT
AAGGATGCTATCGAGAAGCTTCTCATCTAAGGTTTTGGGGTGGGGATATGAATGAATGAT
GAGTCTCCTCCATTTAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATTC
TACTATGAGTTTTTGAAGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGCC
TAATGCTTCTTTGAACAAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGTTTT

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4B683JQ 644 0 0
CTT
CTTCTTCTTCTCTCAAAGCTTCTCTCTCAAAACTCGGAGGCGCCAAGATGACGGTTGAAG
CAGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCCGATTCTCAGCTAGCGATAACCATCCTCGATC
TTGTCCAGCAAGCTACGAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCCAATGAAGCTACCAAGA
CTTTGAACCGTGGGATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGATGCTGAGCCTCTTGAGA
TTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCCGTATGTGTTTGTGCCAT
CGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGTGATTGCTTGTTCGGTTA
CATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTTAAGGATGCTATCGAGA
AGCTTCTCATCTA*GGTTTTTGTGTGGGGATATGAATGAATGATGAGTCTACTCCATTTA
ATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATTCTACTATGAGTTTTTGA
AGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGCCTAATGCTTCTTTGAAC
AAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGTTTTATTTTTCG

QA 4 644 4 644
DS 

RD RR4B683TF 583 0 0
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TCTTGTCCAGCAAGCTACGAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCCAATGAAGCTACCAA
GACTTTGAACCGTGGGATCTCCGAGTTCGTGGTCATGGCTGCCGATGCTGAGCCTCTTGA
GATTCTTCTCCATCTCCCTCTTCTCGCCGAAGACAAGAATGTGCCGTATGTGTTTGTGCC
ATCGAAACAAGCTCTTGGAAGAGCGTGTGGTGTTACAAGGCCCGTGATTGCTTGTTCGGT
TACATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTTAAGGATGCTATCGA
GAAGCTTCTCATCTA*GGTTTTTGTGTGGGGATATGAATGAATGATGAGTCTACTCCATT
TAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAATGAAGAAACGATGATTCTACTATGAGTTTTT
GAAGTTTGTAATGTTTTTTTTT*AAATTTCAGATTGTGTTACTGCCTAATGCTTCTTTGA
ACAAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGTTTTATTTTTCG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 8

CO CL795Contig1 707 8 9 U
GGAGGAAGGAAAGATCTCATCTAGACAAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAG
ATGGGGCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGT
TCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTT
GCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATC
CCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTT
GCACCTGAGATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAG
CACTCGGAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGC
AGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAG
TACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGT
TCTTCAAGAATTCTCATTTCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTT
CGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAA
CAAACGTGCTTAAATTTTATGGTCATGGTTACTAAACGAAAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F254JQ C 1
AF RR4F254TF U 1
AF RR4G959JQ C 11
AF RR4G959TF U 11
AF RR4CH87JQ C 17
AF RR4CO47JQ C 17
AF RR4CH87TF U 17
AF RR4CO47TF U 17
BS 1 328 RR4F254TF
BS 329 329 RR4G959TF
BS 330 364 RR4F254TF
BS 365 365 RR4CH87TF
BS 366 555 RR4F254TF
BS 556 556 RR4CH87TF
BS 557 654 RR4F254TF
BS 655 676 RR4G959TF
BS 677 707 RR4CH87TF

RD RR4F254JQ 616 0 0
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TCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTT
GCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATC
CCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTT
GCACCTGAGATTCCTGAGGATCTATACCGCTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAG
CACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGC
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TACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGT
TCTTCAAGAATTCTCGTTTCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTT
CGTGTTAGTGCTTGTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4F254TF 654 0 0
GGAGGAAGGAAAGATCTCATCTAGACAAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAG
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TCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTT
GCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATC
CCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTT
GCACCTGAGATTCCTGAGGATCTATACCGCTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAG
CACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGC
AGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAG
TACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGT
TCTTCAAGAATTCTCGTTTCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTT
CGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4G959JQ 667 0 0
GG
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TGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGT
TTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAG
AGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATTTTGAAAGCACACGGTCTTGCCCCTGATATT
CCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGG
AACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGT
CTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACT
ACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATT
CTCGTTTCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCT
TGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACGTGCTTA
AATT
C

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4G959TF 667 0 0
GG
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CATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGCT
TGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGT
TTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAG
AGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATTTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGATATT
CCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGG
AACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGT
CTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACT
ACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATT
CTCGTTTCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCT
TGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACGTGCTTA
AATT
C

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4CH87JQ 682 0 0
GG
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AGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGCTTGGCTC
AGGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACA
CCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTT
ACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAG
GATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTCGGAGAGGAACAGG
AAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCT
CGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCC
AGCACCCTTGTTGCTTATAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATTCTCATT
TCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTT
GTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACGTGCTTAAATTTT
ATGGTCATGGTTACTAAACG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4CO47JQ 682 0 0
GG
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AGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGCTTGGCTC
AGGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACA
CCATCTCAGATTGGTGTCATTTTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTT
ACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAG
GATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTCGGAGAGGAACAGG
AAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCT
CGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCC
AGCACCCTTGTTGCTTATAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATTCTCATT
TCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTT
GTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACGTGCTTAAATTTT
ATGGTCATGGTTACTAAACG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4CH87TF 691 0 0
GG
ATCTAGACAAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAGATGGGGCGTGTGCATTCA
AGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGCTTGGCTC
AGGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACA
CCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTT
ACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAG
GATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTCGGAGAGGAACAGG
AAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCT
CGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCC
AGCACCCTTGTTGCTTATAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATTCTCATT
TCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTT
GTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACGTGCTTAAATTTT
ATGGTCATGGTTACTAAACGAAAAAAAAA

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4CO47TF 683 0 0
GGAG
CTAGACAAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAGATGGGGCGTGTGCATTCAAG
AGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGCTTGGCTCAG
GACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACACC
ATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTTAC
CGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAGGA
TCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTCGGAGAGGAACAGGAA
AGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCG
CTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCCAG
CACCCTTGTTGCTTATAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATTCTCATTTC
TATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTTGT
TTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACGTGCTTAAATTTTAT
GGTCATGGTTACTAAACG
A

QA 5 682 5 682
DS 



AS 1 7

CO CL796Contig1 1092 7 13 U
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CGTAGACATGGGAGCAATGCTTACATATAAAATCATCATTACATGGATTTGTGCATGTGT
GAGTTTTTACATCTTTTTGAGCAGCTCAATAACGTAAACACCAAAAGCATTGCAGGCAAC
TTTGATGCCTTTGAAGCCTGATTCTTTAGCTAATGCTTCAAACTCTTTCTCAGTCCGTTC
TTTGCCTCCAGGGTTGTGAGCCAACATAATGCAATCAACATGGACCACTTGTTTGGTCGA
GAGGCTGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTC
TGGAAGCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATTTCACACAGTGTTCATCACTCCAGTCGTG
GCATATCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCC
AACGTGTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATGGGGG*AGATCAAAGT
TGATGCCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCATTTTGAGAGTGGCACCAATACCAC
CACCAACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACCCTT*ATAGGTCTCAAGAATCTTC
TTCATTGTGATGGTTGAATGGTTAGACATTCCGTTGTTAAAGACCGTGTTGAACCTTAGG
TCCTTACCGTGGTACTCAAAGGCGGTCATTCCATAAGCCTTGTTGAATGGAATCCCACCA
TCAAGAATTGCATCTTTCAAATGGTACCAGCTTTCCATGAGAACCTTGTCTTGGTTCATA
AGACAAAGAGCAGCTATCGAGACACCATCTTCGTTCTTGGTCAAGTACTTGCAAACTGGA
CCAAGCCCGTAAATCCTCTCGACGCCGTCTCCGCCGGGAGTAGTACGGTTGGAGCAGGTG
AGGATGGAGTAAGACGTGAGAAGCCGGAGGATACGGTCGAGCATGACCGGAGCTTCGGGG
TTTTTGGTCTGAAGTTTAGAAGCAATCTCAGACGGAGACATTGGAGAAGAGTTCTTGGCC
ATGATCTCGAGG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC08JQ U 1
AF RR4C531JQ U 2
AF RR4D145JQ U 5
AF RR4AV41JQ U 2
AF RR4C901TF C 278
AF RR4FC08TF C 286
AF RR4AV41TF C 598
BS 1 64 RR4FC08JQ
BS 65 65 RR4AV41JQ
BS 66 122 RR4FC08JQ
BS 123 123 RR4AV41JQ
BS 124 300 RR4FC08JQ
BS 301 301 RR4AV41JQ
BS 302 362 RR4FC08JQ
BS 363 364 RR4AV41JQ
BS 365 505 RR4FC08JQ
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BS 1020 1036 RR4FC08TF
BS 1037 1092 RR4AV41TF

RD RR4FC08JQ 505 0 0
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TTTGCCTCCAGGGTTGTGAGCCAACATAATGCAATCAACATGGACCACTTGTTTGGTCGA
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TG**AGCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATTTCACACAGTGTTCATCACTCCAGTCGTG
GCATATCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCC
AACGTGTTCAATACCGGGATGAGAA

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4C531JQ 551 0 0
GATC
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TGCCTTTGAAGCCTGACTCTTTAGCTAATGCTTCAAACTCTTTCTCAGTCCGTTCTTTGC
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GTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATGGGGGGAGATCAAAGTTGATG
CCTTTAA

QA 5 551 5 551
DS 

RD RR4D145JQ 634 0 0
A
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ACATGGGAGCAATGCTTACATATAAAATCATCATTACATGGATTTGTGCATGTGTGAGTT
TTTACATCTTTTTGAGCAGCTCAATAACGTAAACACCAAAAGCATTGCAGGCAACTTTGA
TGCCTTTGAAGCCTGATTCTTTAGCTAATGCTTCAAACTCTTTCTCAGTCCGTTCTTTGC
CTCCAGGGTTGTGAGCCAACATAATGCAATCAACATGGACCACTTGTTTGGTCGAGAGGC
TGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTCTGGAA
GCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATTTCACACAGTGTTCATCACTCCAGTCGTGGCATA
TCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCCAACGT
GTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATGGGGG*AGATCAAAGTTGATG
CCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCATTTTGAGAGTGGCACCAATACCACCACCA
ACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACCC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR4AV41JQ 824 0 0
AATC
TCTTAACAAACCTTTATTAAACATCATGGTTTTAAAACAAAGGTGGTGAAGTACACGTAG
ACATGGGAGCAATGCTTACATATAAAATCATCATTACATGGATTTGTGCATGTGTGAGTT
TTTACATCTTTTTGAGCAGCTCAATAACGTAAACACCAAAAGCATTGCAGGCAACTTTGA
TGCCTTTGAAGCCTGATTCTTTAGCTAATGCTTCAAACTCTTTCTCAGTCCGTTCTTTGC
CTCCAGGGTTGTGAGCCAACATAATGCAATCAACACGGACCACTTGTTTGGTCGAGAGGC
TGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTCTGGAA
GCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATTTCACACAGTGTTCATCACTCCAGTCGTGGCATA
TCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCCAACGT
GTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATGGGGG*AGATCAAAGTTGATG
CCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCATTTTGAGAGTGGCACCAATACCACCACCA
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ACCGTGGTACTCAAAGGCGGTCATTCCATAAGCCTTGTTGAATGGAATCCCACCATCAAG
AATTGCATCTTTCAAATGGTACCAGCTTTCCATGAGAACC

QA 5 824 5 824
DS 

RD RR4C901TF 744 0 0
ACATGGACCACTTGTTTG*TCGAGAGGCTGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCT
GCTAGTATCACTTTTCCATCCTCTGGAAGCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATTTCACA
CAGTGTTCATCACTCCAGTCGTGGCATATCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGG
ACACTTACAAACATATCTCCTCCAACGTGTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCA
ATGACATGGGGG*AGATCAAAGTTGATGCCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCAT
TTTGAGAGTGGCACCAATACCACCACCAACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACC
CTT*ATAGGTCTCAAGAATCTTCTTCATTGTGATGGTTGAATGGTTAGACATTCCGTTGT
TAAAGACCGTGTTGAACGTTAGGTCCTTACCGTGGTACTCAAAAGCGGTCATTCCATAAG
CCTTGTTGAATGGAATCCCACCATCAAGAATTGCATCTTTCAAATGGTACCAGCTTTCCA
TGAGAACCTTGTCTTGGTTCATAAGACAAAGAGCAGCTATCGAGACACCATCTTCGTTCT
TGGTCAAGTACTTGCAAACTGGACCAAGCCCGTAAATCCTCTCGACGCCGTCTCCGCCGG
GAGTAGTACGGTTGGAGCAGGTGAGGATGGAGTAAGACGTGAGAAGCCGGAGGATACGGT
CGAGCATGACCGGAGCTTCGGG
CC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4FC08TF 752 0 0
CACTTGTTTG*TCGAGAGGCTGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTAT
CACTTTTCCATCCTCTG**AGCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATTTCACACAGTGTTC
ATCACTCCAGTCGTGGCATATCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTAC
AAACATATCTCCTCCAACGTGTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATG
GGGG*AGATCAAAGTTGATGCCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCATTTTGAGAG
TGGCACCAATACCACCACCAACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACCCTT*ATAG
GTCTCAAGAATCTTCTTCATTGTGATGGTTGAATGGTTAGACATTCCGTTGTTAAAGACC
GTGTTGAACCTTAGGTCCTTACCGTGGTACTCAAAAGCGGTCATTCCATAAGCCTTGTTG
AATGGAATCCCACCATCAAGAATTGCATCTATCAAATGGTACCAGCTTTCCATGAGAACC
TTGTCTTGGTTCATAAGACAAAGAGCAGCTATCGAGACACCATCTTCGTTCTTGGTCAAG
TACTTGCAAACCGGACCAAGCCCGTAAATCCTCTCGACGCCGTCACCGCCGGGAGTAGTA
CGGTTGGAGCAGGTGAGGATGGAGTAAGACGTGAGAAGACGGAGGATACGGTCGAGCATG
ACCGGAGCTTCGGGGTTTTTGGTCTGAAGTT
C

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4AV41TF 495 0 0
ACCCC
CCAACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACCCTTTATAGGTCTCAAGAATCTTCTT
CATTGTGATGGTTGAATGGTTAGACATTCCGTTGTTAAAGACCGTGTTGAACCTTAGGTC
CTTACCGTGGTACTCAAAGGCGGTCATTCCATAAGCCTTGTTGAATGGAATCCCACCATC
AAGAATTGCATCTTTCAAATGGTACCAGCTTTCCATGAGAACCTTGTCTTGGTTCATAAG
ACAAAGAGCAGCTATCGAGACACCATCTTCGTTCTTGGTCAAGTACTTGCAAACTGGACC
AAGCCCGTAAATCCTCTCGACGCCGTCTCCGCCGGGAGTAGTACGGTTGGAGCAGGTGAG
GATGGAGTAAGACGTGAGAAGCCGGAGGATACGGTCGAGCATGACCGGAGCTTCGGGGTT
TTTGGTCTGAAGTTTAGAAGCAATCTCAGACGGAGACATTGGAGAAGAGTTCTTGGCCAT
GATCTCGAGG

QA 6 495 6 495
DS 



AS 1 8

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TGGTTTTTGATCATGTTTCCCGATTCAAACGATGTTGCAGAGGTCAAAGAAGATGTTTTG
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GAGTCGAGTATGGAGGAGACGGACGATGGAGGAAGCGACTCGAGTATGGTGGAGAGCGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAG***AAAGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGAC
AGCTTCGAAGACAGAGACTACTTCTCCTTCTCCGAAGGCGAACTTGCTGAGGATTTCTCC
GACCAAGAGTATTTAAAGCCTTACCTTGACTACAGGCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGT
TTTGAGGTGGATCCGGATAGCATTCCTGATGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGAC
TTGAATGATACACGCTTTGGCTGGCCCAAATCACCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATG
GAACGTATGGTCCAAATGTGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAA
ATGGATCATGTTGTGAGGGCGATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACC
TTTATGGCACAAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCCAAAACCGAGTGG
AAGATTCGTCAAGTTCACACTTATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGAT
CTTAAGGACAAGGCACGCAAAAGCACCAGGGTCAGGCCAAGAAAATAATTAAATTAACTT
AAATTTCGCTTTGGGATTCTTACATACATATATATATATATCAACTCTAGAAACAAAACA
GTTATGCTATTATGTAAATATCGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAATATAATTAAA
TCGATTTTGTGTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 0 50 50 40 40 40 25 40 0 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4EZ07TF U 1
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AF RR4FZ26TF U 92
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GAGTCGAGTATGGAGGAGACGGACGATGGAGGAAGCGACTCGAGTAGGGTGGAGAGCGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAG***AAAGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGAT
AGCTTCGAAGACAGAGACTACTTCTCCTTCTCCGAAGGCGAACTTGCTGAAGATTTCTCC
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TTTGAGGTGGATCCGGATAGCATTCCTGAGGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGAC
TTGAATGATACACGCTTTGGCTGGCCCAAATCACCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATG
GAACGTATGGTCCAAATGTGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAA
ATGGATCATGTTGTGAGGGCGATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACC
TTTATGGCACAAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCCAAA*CCGAGTGG
AAGATTCGTCAAGTTCACACTTATCCTATCTTT*GCAGACCCTCTC*TCCACCAGTCGAT
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GG
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AGGCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGTTTTGAGGTGGATCCGGATAGCATTCCTGATGAC
ATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGACTTGAATGATGCACGCTTTGGCTGGCCCAAATCA
CCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATGGAACGTATGGTCCAAATGTGTCTCGATAAGTAC
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TCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACCTTTATGGCACAAGAGATTCCAACTGGGCCTTTG
GTATAGTACCAAGCTAAAACCGAGTGGAAGATTCGTCAAGTTCACACTTATCCTATCTTT
TGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGATCTTAAG*ACAAG*CACGCAAAAGCACCAGGGTC
AG*CCAAGAAAA
AA

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DS 

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GG
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TTTTGAGGTGGATCCGGATAGCATTCCTGAGGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGA
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GGAACGTATGGTCCAAATGTGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAA
AATGGATCATGTTGTGAGGGCGATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCAC
CTTTATGGCACAAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCCAAAACCGAGTG
GAAGATTCGTCAAGTTCACACTTATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGA
TCTTAAG*AC

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DS 

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GG
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GGAAAGCGCAAGGCGGAGGAGGATAGTGAGTCGAGTATGGAGGAGACGGACGATGGAGGA
AGCGACTCGAGTATGGTGGAGAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG***AAAGCGAACCT
GAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGACAGCTTCGAAGACAGAGACTACTTCTCCTTCTCC
GAAGGCGAACTTGCTGAGGATTTCTCCGACCAAGAGTATTTAAAGCCTTACCTTGACTAC
AGGCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGTTTTGAGGTGGATCCGGATAGCATTCCTGATGAC
ATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGACTTGAATGATACACGCTTTGGCTGGCCCAAATCA
CCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATGGAACGTATGGTCCAAATGTGTCTCGATAAGTAC
AACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAAATGGATCATGTTGTGAGGGCGATCGCAATGAAA
TCTGCCGGG**CAAGTGCTATATCACCTTTATGGCACAAGATATTCCAACTGGGCCTTTG
GTAGAGTACCAAGCCAAAACCAAGTGGAAGATTCGTCAAGTTCACACTTATCCTATCTTT
TGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGATCTTAAG*AC
A

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******AGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGACAGCTTCGAAGACAGAGAC
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TGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAAATGGATCATGTTGTGAGG
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CTTACATACATATATATATATATCAACTCTAGAAACAAAACAGTTATGCTATTATGTAAA
TATCGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAGTATGATTAAATCGATTTTGTGT
T

QA 1 834 1 834
DS 

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AGAAGAAGAAGAAGAAG***AAAGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGACAG
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GGATCATGTTGTGAGGGCGATCGCAATGAAATCTGCCGGG**CAAGTGCTATATCACCTT
TATGGCACAAGATATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCCAAAACCAAGTGGAA
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ATTTCGCTTTGGGATTCTTACATACATATATATATATATCAACTCTAGAAACAAAACAGT
TATGCTATTATGTAAATATCGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAGTATGATTAAATC
GATTTTGTGT
TT

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DS 

RD RR4EZ07JQ 653 0 0
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TACCTTGACTACAGGCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGTTTTGAGGTGGATCCGGATAGC
ATTCCTGAGGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGACTTGAATGATACACGCTTTGGC
TGGCCCAAATCACCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATGGAACGTATGGTCCAAATGTGT
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ATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACCTTTATGGCACAAGAGATTCCA
ACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCCAAAACCGAGTGGAAGATTCGTCAAGTTCACACT
TATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGATCTTAAGGACAAGGCGCGCAAA
AGCACCAGGGTCAGGCCAAGAAAATAATTAAATTAATTTAAATTTCGCTTTGGGATTCTT
ACATA**TATTTATATATATCAACTCTAGAAACAAAA*AGTTATGTTATTATGTAAATAT
CGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAATATAATTAAATCGATTTTGTGT
CC

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DS 

RD RR4E867JQ 444 0 0
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ATGTGAAAATGGATCATGTTGTGAGGGCGATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCT
ATATCACCTTTATGGCACAAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCCAAAA
CCGAGTGGAAGATTCGTCAAGTTCACACTTATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCAC
CAGTCGATCTTAAGGACAAGGCGCGCAAAAGCACCAGGGTCAGGCCAAGAAAATAATTAA
ATTAATTTAAATTTCGCTTTGGGATTCTTACATA**TATTTATATATATCAACTCTAGAA
ACAAAA*AGTTATGTTATTATGTAAATATCGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAATA
TAATTAAATCGATTTTGTGTTCAG

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 8

CO CL798Contig1 1604 8 9 U
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AGATCAATCTGATTTCGAGTTTGAACAGACAAGACAACATGAGAACGTTTAAGATGGGAT
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CTCCATCATTCCTCTGCAGCACTAGCTGCGTTAAGGTCCACACTTAGATCCAGTTCCTTT
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GCATCATAACTCGTTGATATGAAGCAGTTGTCCAGAGTGGGTTCGTTGACAGGCTCGTAT
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AGCTCGGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCGTCGGTCGACACAAATGCTATGAATTTCCCC
TTGGGAGCAACGTTGTGCGAATACGAACAACAGAAGACATACATGTCTGATTTGCGACCC
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TGGCTCATAATGGCAATCGCCCTAGCAACATTGCCAATCTTCCTCACCTTGTTGGGAAGG
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GGATAGATATATGGTGAACCTCCTTGGAAACGAGCAAGGGACTCTGCGTAGAGCTTCATT
CTCATCACAGTATCATAAGCAGGTTGATGGAGATGGCTATCATTACTGTGAAGTGCCACA
GCATGACCAATAAAGTCAATAGTGTTTTCATCAAGACCGAATTTCGCAATCAACTCCTTG
GTAGTGACTCTCTTCAAATCAACTCCATCATGTGTTTTAGGATCCTTCTCATCATACTCC
TGAACATAGCTGAAGAACTTTCCAGCACGACGTTTCTCAAAAGTACCCATAAGAGGAGAT
TTGTGTGCCTCCATTGGAGTTGCTGGCACCTTTTGAACCTTGCCTTTGACGAAGACATAG
CTGCCATCAACAGCCTTAAAAGACAGGTACTTGGTCACATCAGTGTGAATGAGGACGCGG
ACAAGCTTGCCATTCGCCATCATAAACTTGGGCATCATGTCAACATTGTAGTCTCTGCTA
GAGCCTAAATGAGCAGGAGCCTTATCTTCTCCTCTAAACTTCTTCCACAGCTGATTGAGA
TTAAGTGATGTTGACTCTCCACCGTAATAGTCATTCCTGTCCATGTGAAGTACCTTGATA
CCATCGACGGAGAGGAGACCACTGAGGATGCACTCCTTGAGACCAGTACCGAGAACGATA
ACTTCGTACTCTTCATCCATGATGATGGCTGATGATCTGCTAAAGAAAGATTGACTTTGT
TTTTTTGGTAGGAGGAAGGAGACAAGACCGTCTAGAGAGATCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AATTGCTTTTGAGGTAGGATGACTTGCACTGAGTGAGAATCATTGGTGTTTGGAATAGGG
TGGCTCATAATGGCAATCGCCCTAGCAAC
CC

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AAAGACAACCAGTACATCAAGTTGTTTTTGACTAGAGAGGAAGAGAGCTTTTGAATTATT
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CCCGTGATCAATTTATACATGTTCAACACATCAACAACAGTTGTATCAAAGTGTGTTGTA
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CTATCATAAATGTCGAAGAATAGCTCATCAACTTGACCAAGAAGGTCGATTCCAGGCTTC
AGCTCGGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCGTCGGTCGACACAAATGCTATGAATTTCCCC
TTGGGAGCAACGTTGTGCGAATACGAACAACAGAAGACATACATGTCTGATTTGCGACCC
AATTGCTTTTGAGGTAGGATGACTTGCACTGAGTGAGAATCATTGGTGTTTGGAATAGGG
TGGCTCATAATGGCAATCGCCCTAGCAAC
CC

QA 1 629 1 629
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CCCGTGATCAATTTATACATGTTCAACACATCAACAACAGTTGTATCAAAGTGTGTTGTA
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CTATCATAGATGTCGAAAAACAGCTCATCAACTTGACCAAGAAGGTCGATTCCAGGCTTC
AGCTCGGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCGTCTGTCGACACAAATGCTATGAATTTCCCC
TTGGGAGCAACGTTGTGGGAATACGAACAACAGAAGACATACATGTCTGATTTGCGACCC
AATTGCTTTTGAGGTAGGATGACTTGCACCGAGTGAGAATCATTGGTGTTTGGAATAGGG
TGGCTCATAATGGCAATCGCCCTAGCAAC
CTTG

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CAAAGTGTGTTGTAGCATCATAACTCGTTGATATGAAGCAGTTGTCCAGAGTGGGTTCGT
TGACAGGCTCGTATCTATCATAGATGTCGAAGAACAGCTCATCAACTTGACCAAGAAGGT
CGATTCCAGGCTTCAGCTCGGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCGTCTGTCGACACAAATG
CTATGAATTTCCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAATACGAACAACAGAAGACATACATGT
CTGATTTGCGACCCAATTGCTTTTGAGGTAGGATGACTTGCACCGAGTGAGAATCATTGG
CGTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATGGCAATCGCCCTAGCAACATTGCCAATCTTCCTCA
CCTTGTTGGGAAGGTATGAAGGATCGCAGACAACTTTCTTGCATTTGGCAGTCTCTCCCT
CAGACGTAACACCCATAACCTTACCTTCCTCATAGAGCTCTACCTTGCACTCAGGTTTAT
TCAACATGTAAGTCCCACCATAGACAGCACTAAGTCGTGCAAATGCCTGAGGCAATTCTC
CCAACCCATAGAGAGGATAGATATATGGTGAACCTCCTTGGAAACGAGCAAGGGACTCTG
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GG
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G
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DS 



AS 1 8

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TTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BX65JQ C 1
AF RR4BX65TF U 1
AF RR4EB45JQ C 458
AF RR4EB45TF U 66
AF RR4B892TF U 24
AF RR4CL26JQ C 15
AF RR4CL26TF U 15
AF RR4GI07TF U 24
BS 1 82 RR4BX65TF
BS 83 85 RR4EB45TF
BS 86 120 RR4BX65TF
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BS 122 478 RR4BX65TF
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BS 480 654 RR4BX65TF
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RD RR4BX65JQ 654 0 0
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TCTCTCCAATCTCGCAAAACCA***GACAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCA
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TAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGC
TGAGCACAAAACCAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGA
TTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAA
GAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTTTCAAACATGTCACCAC
TGTCAACAACTGATGATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATT*GT*A
TTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTC
AACTGTTGTTGCTATTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGA
AGACTTGACTTTT*GTGTTTGTAATATTCAGAATAAAGGG*AACCCCATTGGAT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BX65TF 657 0 0
GGAACGAACACGATCTAAAACATTTGAGTCATTCATCAAAGCATCTCTCTCTCTTCTCTT
TCTCTCCAATCTCGCAAAACCA***GACAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCA
CGGAGGGATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGC
TAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGC
TGAGCACAAAACCAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGA
TTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAA
GAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCAC
TGTCAACAACTGATGATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATT*GT*A
TTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTC
AACTGTTGTTGCTATTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGA
AGACTTGACTTTT*GTGTTTGTAATATTCAGAATAAAGGG*AACCCCATTGGAT
AAA

QA 1 654 1 654
DS 

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TTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTTGTTGCTATTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGA
GTTGTTGTATTCATCTTTCCAGAAGACTTGACTTTT*GTGTTTGTAATATTCAGAATAAA
GGG*AACCCCATTGGAT

QA 1 197 1 197
DS 

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GG
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ATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACC
GCAAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCAC
AAAACCAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGT
GCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAA
GCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAAC
AACTGATGATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATT*GTTATTTTGAG
TGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTT
GTTGCTATTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTG
ACTTTT*GTGTTTGTAATATTCAGAATAAAGGG*AACCCCATTGGAT

QA 3 589 3 589
DS 

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GG
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GACAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCATGGAGGGATCCAGCAACTGCTTGCT
GCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATACTGCTAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTG
AAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACTGAGCAT
GGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTT
GAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGA
GATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATGATATATATAC
ACCATCATCGTCTT**AGATGGTGTGAATT*GTTATTTTGAGTGGATTTATTTATTCGTT
TCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTTGTTGCTATTGATTTTCAG
TTTCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTGACTTTT*GTGTTTGTAAT
ATTCAGAATAAAGGG*AACCCCATTGG

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DS 

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GG
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ACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTG
AAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGG
ATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATGA
TATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATT*GTTATTTTGAGTGGATTTAT
TCATTCGTTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTTGTTGCTATT
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GTTTGTAATATTCAGAATAAAGGG*AACCCCATTGG

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DS 

RD RR4CL26TF 638 0 0
GG
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AAACCAGAAGACAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCATGGAGGGATCCAGCAA
CTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACCGCAAAAATG
GCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGT
ACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTG
AAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGG
ATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATGA
TATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATTTGTTATTTTGAGTGGATTTAT
TCATTCGTTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTTGTTGCTATT
GATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTGACTTTTTGT
GTTTGTAATATTCAGAATAAAGGG*AACCCCATTGG

QA 3 638 3 638
DS 

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GG
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GACAGATCTTAAAACATGGAGTCAATGGGTAATTATGGAGGGATCCAGCAACTGCTTGCT
GCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTG
AAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACTGAGCAT
GGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTT
GAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGA
GATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATGATATATATAC
ACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATT*GTTATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTT
TCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTTGTTGCTATTGATTTTCAG
TTTCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTGACTTTT*GTGTTTGTAAT
ATTCAGAATAAAGGGGAACCCCATTGGATATTTCGTTTTC

QA 3 642 3 642
DS 



AS 1 7

CO CL800Contig1 1556 7 22 U
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ATTTTTACTCAAACCAAAGAAATAAGCAAAGTGAATCAAGGAACACACTTAACACATATT
TTTTTTTTT*ACAGAAAGATCCGATCTTTCTCGGAGAAACCTCAGTAAGTTATATCAAAC
TAAATTCCCAAAATATATTGCAAGAAGATGAACAAGAGAGATCTACTTTGTTAGTAGAGT
TTTATTCTTGTCTGGATCGGTGCACGGCAAATTGGACACATTTCAAGATCCGGTCCACAT
TCGCAACAAGTCTGATGACCACAACCAAAAGCCATGTCTTTAGGGTTGCTCAGACAAATC
GGACATATCTGGTAATCAGAAGAAGCTGAGGTCGTAGCGGGTGGCGGAGGAGGACTAGAC
CTTACATGATAGTTTTCAGTTGGATAAGAAGGTACACTCGGTTTGAAACTTGGAACACGA
TCATTAGCCTTTGGCTTGTTGTAGGACGATGCTCCACCTTGCATTGGAGGTGGAAGAGGA
AACCGTTCCGTTATATTCCCATTTCTTCTTCCTAAAAGGTTAAGCTCCAAGGTGGCCTTG
TATTGTTGAGGAATCTCCATGAGAGCAGAAAGAGCAAACTCTGTTTCTTTCAAGGACTGA
GCTTTGTTCTTTGCCATAATCTCTGTGAAGTTGACGAATTGGAAGTTATCAAAAGCTCGT
GCAGGAATGTTATCATCAAACTCCCTCATCATGTCCCATGGTCCATCCCCTACACCGACC
AAGACGATCGATAGAGGAAGCTTACTCGCTTGCACGATAGCATCAACAGTCTTCAGTTCT
TGCGGACTTAACTGTCCATTTTCAGTGTCAACGCTTCTTGTAACCTGCCCATCTGCTATA
ATCACTAGGACGTGATATTGTCCACCACTCTCCTCAACAATGGTCATTGCCATATCAATG
ATAGGAGCAAAGGAGGTGGGACCTGCAAGCTTAAGCTGAGGGACAATCTCTTTATACCGA
CCAAGCACTTCCTCGAAGCCATTACAGAACCCATCATCAGGATTGAAACTAAACACGTCT
TGATCGTGCGTCGACGCATCTCCGAAACCGTAACACGGAATCAAGTTGTCCCCGTCAAAA
GCGGCTAAGGTTCTTCCTATGATAGCTATGGCTTGCTCGTAAGGATTGGGGGTAGTACTG
CCTATGAAGTGTAGGCTTTTCCTATTGAAGGACCTAGCCCCTGTCCATTCGTTGCTCTTA
GTGAAATCAATACCGACAATGAGATTTGAAGATTCTAGACCCGCACGAGCAAGAGCCTCT
GTCACCTGGTCCAAAGAGGAGTAATCATCGGAGATTTTGGAGTACTTGCGCTCCAACCTC
TTCTTATCATTGCCGTAACTTTGAGAGTAAGGCGGCTGAGTAGTATATGAAGAAGGTGAA
GGAGGTTGGGGGTACTCAGGAGGTGGAGGAGGATAGTTATAGCTTCCAGAACCGTATTGA
GGATAGGTTTGATGAGAAGCCCATGGAGATGAAGAAGCTGAAGTTGACCTAAACGA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN15JQ U 1
AF RR4GW26JQ U 5
AF RR4GW26TF C 5
AF RR4EL03JQ U 44
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AF RR4GN15TF C 601
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TTTTTTTT**ACAGAAAGATCCGATCTTTCTCGGAGAAACCTCAGTAAGTTATATCAAAC
CAAATTCCCAAAATATATTGCAAGAAGATGAACAAGAGAGATCTACTTTGTTAGTAGAGT
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TCGCAACAAGTCTGATGACCACAACCAAAAGCCATGTCTTTAGGGTTGCTCAAACAAATC
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CTTACATGATAGTTTTCAGTTGGATAAAAAGGTACACTCGGTTTGAAACTTGGAACACGA
TCATTAGCCTTTGGCTTGTTGTAGGACGATGCTCCACCTTGCATTGGAGGTGGA

QA 1 534 1 534
DS 

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G
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TACTCAAACCAAAGAAATAAGCAAAGTGAATCAAGGAACACACTTAACACATATTTTTTT
TTTT*ACAGAAAGATCCGATCTTTCTCGGAGAAACCTCAGTAAGTTATATCAAACTAAAT
TCCCAAAATATATTGCAAGAAGATGAACAAGAGAGATCTACTTTGTTAGTAGAGTTTTAT
TCTTGTCTGGATCGGTGCACGGCAAATTGGACACATTTCAAGATCCGGTCCACATTCGCA
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TTCCGTTATATTCCCATTTCTTCTTCCTAAAAGGTTAAGCTCCAAGGTGGCCTTGTATT
C

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DS 

RD RR4GW26TF 601 0 0
G
CACAAAACTAAAGTAACTCTATTATAGAATAACTTTTTCTCCGATAGTTCTAACAATTTT
TACTCAAACCAAAGAAATAAGCAAAGTGAATCAAGGAACACACTTAACACATATTTTTTT
TTTT*ACAGAAAGATCCGATCTTTCTCGGAGAAACCTCAGTAAGTTATATCAAACTAAAT
TCCCAAAATATATTGCAAGAAGATGAACAAGAGAGATCTACTTTGTTAGTAGAGTTTTAT
TCTTGTCTGGATCGGTGCACGGCAAATTGGACACATTTCAAGATCCGGTCCACATTCGCA
ACAAGTCTGATGACCACAACCAAAAGCCA*GTCTTTAGGGTTGCTCAGACAAATCGGACA
TATCTGGTAATCAGAAGAAGCTGAGGTCGTAGCGGGTGGCGGAGGAGGACTAGACCTTAC
ATGATAGTTTTCAGTTGGATAAGAAGGTACACTCGGTTTGAAACTTGGAACACGATCATT
AGCCTTTGGCTTGTTGTAGGACGATGCTCCACCTTGCATTGGAGGTGGAAGAGGAAACCG
TTCCGTTATATTCCCATTTCTTCTTCCTAAAAGGTTAAGCTCCAAGGTGGCCTTGTATT
C

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR4EL03JQ 714 0 0
G
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ACACTTAACACATATTTTTTTTTTTTACAGAAAGATCCGATCTTTCTCGGAGAAACCTCA
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GTTGCTCAGACAAATCGGACATATCTGGTAATCAGAAGAAGCTGAGGTCGTAGCGGGTGG
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TGGAGGTGGAAGAGGAAACCGTTCCGTTATATTCCCATTTCTTCTTCCTAAAAGGTTAAG
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TTCTTTCAAGGACTGAGCTTTGTTCTTTGCCATAATCTCTGTGAAGTTGACGAATTGGAA
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QA 2 714 2 714
DS 

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AAATATATTGCAAGAAGATGAACAAGAGAGATCTACTTTGTTAGTAGAGTTTTATTCTTG
TCTGGATCGGTGCACGGCAAATTGGACACATTTCAAGATCCGGTCCACATTCGCAACAAG
TCTGATGACCACAACCAAAAGCCATGTCTTTAGGGTTGCTCAAACAAATCGGACATATCT
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TTGCCATAATCTCTGTGAAGTTGACGAATTGGAAGTTATCAAAAGCTCGTGCAGGAATGT
TATCATCAAACTCCCTCATCATGTCCCATGGTCCATCCCCTACACCGACCAAGACGATCG
ATAGAGGAAGCTTACTCGCTTGCACGATAGCATCAACAGTCTTCAGTTCTTGCGGACTTA
ACTGTCCATTTTCAGTGTCA*CGCTTCTTGTAACCTGCCCATCTGCTATAATCA

QA 1 774 1 774
DS 

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TGCGGACTTAACTGTCCATTTTCAGTGTCAACGCTTCTTGTAACCTGCCCATCTGCTATA
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GCGGCTAAGGTTCTTCCTATGATAGCTAT
C

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DS 

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T*GCGGACTTAACTGTCCATTT*CAGTGTCAACGCTTCTTGTAAC*TGCCCATCTGCTAT
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TTGATCGTGCGTCGACGCATCTCCGAAACCGTAACACGGAATCAAGTTGTCCTCGTCAAA
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GCCTATGAAGTGTAGGCTTTTCCTATTGAAGGACCTAGCCCCTGTCCATTCGTTGCTCTT
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TGTCACCTGGTCCAAAGAGGAGTAATCATCGGAGATTTTGGAGTACTTGCGCTCCAACCT
CTTCTTATCATTGCCGTAACTTTGAGAGTAAGGCGGCTGAGTAGTATATGAAGAAGGTGA
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AGGATAGGTTTGATGAGAAGCCCATGGAGATGAAGAAGCTGAAGTTGACCTAAACGA

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DS 



AS 1 8

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TCATTAGTGTTTTCCATTCATTACCTATAAAGTTAAAGAACATATAAGCAATGGAAAGCT
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TGTCACAGAGAGTACAATACGCCTTCTTCGCTTGGATTTTAATTTTTAAAACAAACCCTG
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TGAGCTATATTCAAAAACGCTGCAATTGTTGCTCCGTGTAAAAAAGCCTCAGGACTCTCT
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TTTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCAATGGCAGGAGCAATCA*A
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TCTACC*AGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCAGATTAATCGCATCTGCTTGATCAACTTC
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CCGTCTGTACTGTCCGAAAAGATATCCCATTTCCCGAGTACCAACACCAACCTCTTCTGA
CGGAAGGTCTTTGTCCGGACCCATATATCTGTACATCTCATTCATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A021TF C 513
AF RR4EH38JQ U 1
AF RR4A021JQ U 106
AF RR4AR03JQ U 106
AF RR4A021JQD U 106
AF RR4EH38TF C 325
AF RR4A021TFB C 401
AF RR4AR03TF C 485
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BS 138 194 RR4EH38JQ
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BS 196 229 RR4EH38JQ
BS 230 230 RR4A021JQ
BS 231 331 RR4EH38JQ
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BS 341 341 RR4A021JQ
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BS 344 344 RR4A021JQ
BS 345 390 RR4EH38JQ
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BS 392 481 RR4EH38JQ
BS 482 482 RR4A021JQ
BS 483 539 RR4EH38JQ
BS 540 540 RR4A021JQ
BS 541 611 RR4EH38JQ
BS 612 612 RR4A021JQ
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BS 641 695 RR4EH38JQ
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BS 697 789 RR4EH38JQ
BS 790 916 RR4A021JQ
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BS 1002 1002 RR4A021TFB
BS 1003 1034 RR4EH38TF
BS 1035 1188 RR4A021TFB

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TCAGCTGTACACGGGCATGTTTGAACCTTCTACCCAGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCA
GATTAATCGCATCTGCTT

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR4EH38JQ 789 0 0
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TCATTAGTGTTTTCCATTCATTACCTATAAAGTTAAAGAACATATAAGCAATGGAAAGCT
ATGTTTATATAGCTAAAAAACATTAATGCTATCAAAGTATATAGTTTCTAAATAATGACA
TGTCACAGAGAGTAGAATACGCCTTCTTCGCTTGGATTTTAATTTTTAAGACAAACCCTG
CTGGGACTCTTAGATGCAGGATCATTTTATAGCTAGACACAACCTTGGTCCGTCATAGCT
TGAGCTATATTCAAAAACGCTGCAATTGTTGTTCCGTGTAGAAGAGCCTCAGGACTCTCT
TTCTGATAACCGAAATCATTAGCTGCTTTGGGAGCTTTCTCATAAGTCTGCTTCAGTGCT
TCCTGTAATCTAGACTCAAAATCTTCTGCTGACCATTGCATTGAATTAGATTCACGGAGT
TCTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCAATGGCAGGAGCAATCA*G
AACATTCGCCTTTCTGAAAACATCAA*CTGCTTCAGCTGTACACGG*CATGTTTGAACCT
TCTACC*AGTAGGCGACAGCCTGCATTGACCAGATTAATAGCATCTGCTTGATCAACTTC
ATTCTGAGAAGCACAGGGGAACGCCACATCACACCTTTCATTCCATGGCTTTACTTCATC
AAAGTACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAATAGTCTCTCAGACTTCTCTGTTGGGATTT
TATATCTCT

QA 1 789 1 789
DS 

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AAA
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TAAATAATGACATGTCACAGAGAGTACAATACGCCTTCTTCCCTTGGATTTTAATTTTTA
AAACAAACCCTGCTGGGACTCTTAAATGCAGGATCATTTTATAGCTAGACACAACCTTGG
TCCGTCATAGCTTGAGCTATATTCAAAAACGCTGCAATTGTTGCTCCGTGTAAAAAAGCC
TCAGGACTCTCTTTCTGATAACCGAAATCATTAGCTGCTTTGAAAGCTTTCTCATAAGTC
TGCTTCAGTGCTTCCTGTAATCTAAACTCAAAATCTTCTGCTGACCATTGCATTGAATTA
AATTCACGGAGTTTTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCAATGGCA
GGAGCAATCA*AAACATTCGCCTTTCTGAAAACATCAA*CTGCTTCAGCTGTACACGG*C
ATGTTTGAACCTTCTACC*AGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCAAATTAATCGCATCTGC
TTGATCAACTTCATTCTGAAAAGCACAGGGGAACGCCACATCACACCCTTCATTCCATGG
CTTTACTTCATCAAAGTACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAATAGTCTCTCAAACTTCT
CTGTTGGGATTTTATATCTCTCAAGAAGGCAAGTTTCATATAATCAAATCCATCGTCATC
CACCAAATATCCTTTTGAATCTGAAACTGTAACAGGGTGAGCCCCACTGGCAATTAGCTT
CTCTACAACATGCATCGCTATCTTCCCG

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DS 

RD RR4AR03JQ 811 0 0
AAA
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TAAATAATGACATGTCACAGAGAGTACAATACGCCTTCTTCGCTTGGATTTTAATTTTTA
AAACAAACCCTGCTGGGACTCTTAGATGCAGGATCATTTTATAGCTAGACACAACCTTGG
TCCGTCATAGCTTGAGCTATATTCAAAAACGCTGCAATTGTTGCTCCGTGTAAAAAAGCC
TCAGGACTCTCTTTCTGATAACCGAAATCATTAGCTGCTTTGAGAGCTTTCTCATAAGTC
TGCTTCAGTGCTTCCTGTAATCTAAACTCAAAATCTTCTGCTGACCATTGCATTGAATTA
AATTCACGGAGTTTTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCAATGGCA
GGAGCAATCA*AAACATTCGCCTTTCTGAAAACATCAA*CTGCTTCAGCTGTACACGG*C
ATGTTTGAACCTTCTACC*AGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCAGATTAATCGCATCTGC
TTGATCAACTTCATTCTGAGAAGCACAGGGGAACGCCACATCACACCCTTCATTCCATGG
CTTTACTTCATCAAAGTACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAATAGTCTCTCAGACTTCT
CTGTTGGGATTTTATATCTCTCAAGAAGGCAAGTTTCATATAATCAAATCCATCGTCATC
CACCAAATATCCTTTTGAATCTGAAACTGTAACAGGGTGAGCCCCACTGGCAATTAGCTT
CTCTACAACATGCATCGCTATCTTCCCG

QA 4 811 4 811
DS 

RD RR4A021JQD 897 0 0
AAA
CAATGGAAAGCTATGTTTATATAGCTAATAAACATTAATGCTATCAAAGTATATAGTTTC
TAAATAATGACATGTCACAGAGAGTACAATACGCCTTCTTCGCTTGGATTTTAATTTTTA
AGACAAACCCTGCTGGGACTCTTAGATGCAGGATCATTTTATAGCTAGACACAACCTTGG
TCCGTCATAGCTTGAGCTATATTCAAAAACGCTGCAATTGTTGCTCCGTGTAAAAAAGCC
TCAGGACTCTCTTTCTGATAACCGAAATCATTAGCTGCTTTGAGAGCTTTCTCATAAGTC
TGCTTCAGTGCTTCCTGTAATCTAAACTCAAAATCTTCTGCTGACCATTGCATTGAATTA
AATTCACGGAGTTTTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCAATGGCA
GGAGCAATCA*AAACATTCGCCTTTCTGAAAACATCAA*CTGCTTCAGCTGTACACGG*C
ATGTTTGAACCTTCTACC*AGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCAGATTAATCGCATCTGC
TTGATCAACTTCATTCTGAGAAGCACAGGGGAACGCCACATCACACCCTTCATTCCATGG
CTTTACTTCATCAAAGTACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAATAGTCTCTCAGACTTCT
CTGTTGGGATTTTATATCTCTCAAGAAGGCAAGTTTCATATAATCAAATCCATCGTCATC
CACCAAATATCCTTTTGAATCTGAAACTGTAACAGGGTGAGCCCCACTGGCAATTAGCTT
CTCTACAACATGCATCGCTATCTTCCCGCAACCACTCACAACACATCTTAATCCCTTTAT
TTCTTTATTCATATCTGCAAGCATTAGTCGTGCAAAGTACACCACGCCATAGC
T

QA 4 896 4 896
DS 

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AATTGTTG
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AGCTTTCTCATAAGTCTGCTTCAGTGCTTCCTGTAATCTAGACTCAAAATCTTCTGCTGA
CCATTGCATTGAATTAGATTCACGGAGTTCTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGC
TCCAGCAGCAATGGCAGGAGCAATCA*GAACATTCGCCTTTCTGAAAACATCAA*CTGCT
TCAGCTGTACACGG*CATGTTTGAACCTTCTACC*AGTAGGCGACAGCCTGCATTGACCA
GATTAATAGCATCTGCTTGATCAACTTCATTCTGAGAAGCACAGGGGAACGCCACATCAC
ACCTTTCATTCCATGGCTTTACTTCATCAAAGTACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAAT
AGTCTCTCAGACTTCTCTGTTGGGATTTTATATCTCTCCAGAAGGCAAGTTTCATATAAT
CAAATCCATCGTCATCCACCAAATATCCTTTTGAATCTGAAACTGTAACAGGGTGAGCCC
CACAGGCAATTAGCTTCTCTACAACATGCATCGCTATCTTCCCGCAACCACTCACAACAC
ATCTTAATCCCTTTATTTCTTTATTCATATCTGCAAGCATTAGTCGTGCAAAGTACACCA
CGCCATAGCCACTAGCTTCAGTTCTGAGGCTAGAAGCAGCCC
C

QA 9 710 9 710
DS 

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TTGAATTAGATTCACGGAGTTTTTCAATTTCTCCGGCAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAG
CAATGGCAGGAGCAATCA*GAACATTCGCCTTTCTGAAAACATCAA*CTGCTTCAGCTGT
ACACGG*CATGTTTGAACCTTCTACC*AGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCAGATTAATC
GCATCTGCTTGATCAACTTCATTCTGAGAAGCACAGGGGAACGCCACATCACACCCTTCA
TTCCATGGCTTTACTTCATCAAAGTACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAATAGTCTCTC
AGACTTCTCTGTTGGGATTTTATATCTCTCAAGAAGGCAAGTTTCATATAATCAAATCCA
TCGTCATCCACCAAATATCCTTTTGAATCTGAAACTGTAACAGGGTGAGCCCCACTGGCA
ATTAGCTTCTCTACAACATGCATCGCTATCTTCCCGCAACCACTCACAACACATCTTAAT
CCCTTTATTTCTTTATTCATATCTGCAAGCATTAGTCGTGCAAAGTACACCACGCCATAG
CTACTAGCTTCAGTTCTGAGGCTAGAAGCAGCCCAATATATCCGTGGTCCTGTAAAACTT
CCCTGAAACTGACCAGCAAGCCGTCTGTACTGTCCGAAAAGATATCCCATTTCCCGAGTA
CCAACACCAACCTCTTCTGACGGAAGGTCTTTGTCCGGACCCATATATCTGTACATCTCA
TTCATGAC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AR03TF 704 0 0
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TTCGCCTT*CTGAAAACATCAA*CTGCTTCAGCTGTACACGG*CATGTTTGAACCTTCTA
CC*AGTAAGCGACAGCCTGCATTGACCAGATTAATCGCATCTGCTTGATCAACTTCATTC
TGAGAAGCACAGGGGAACGCCACATCACACCCTTCATTCCATGGCTTTACTTCATCAAAG
TACTTCGCCCTTGCATACGTCTTTGAATAGTCTCTCAGACTTCTCTGTTGGGATTTTATA
TCTCTCAAGAAGGCAAGTTTCATATAATCAAATCCATCGTCATCCACCAAATATCCTTTT
GAATCTGAAACTGTAACAGGGTGAGCCCCACTGGCAATTAGCTTCTCTACAACATGCATC
GCTATCTTCCCGCAACCACTCACAACACATCTTAATCCCTTTATTTCTTTATTCATATCT
GCAAGCATTAGTCGTGCAAAGTACACCACGCCATAGCTACTAGCTTCAGTTCTGAGGCTA
GAAGCAGCCCAATATATCCGTGGTCCTGTAAAACTTCCCTGAAACTGACCAGCAAGCCGT
CTGTACTGTCCGAAAAGATATCCCATTTCCCGAGTACCAACACCAACCTCTTCTGACGGA
AGGTCTTTGTCCGGACCCATATATCTGTACATCTCATTCATGAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 8

CO CL802Contig1 1648 8 12 U
GCAGAGAGTATCAGGACAAAATCACTCAAGTATTATCCTTCTGAGACGCTACAGAATAAC
GGAAGTCTGTATGCTCATGTCTTCTTTGCTCGATCTGGATTCCCTATAGACCCCACTGAT
CCTGAATACCAACCTCTTAATAGCTTTAGCAGGACTCACCCTGTTGCGACTTACTTTCCA
AAGCGAAAAGCAAATAAGAAGAAGAGCCTCTTAGGTAATGCTAAAGACTCTGATGAATCC
CAACCAGAGGTTGAGACAGTCGTTGATAAGAACTCGGAAGTCAAGGAAGAAGTCCCTGTG
GAGTGGGTATCCCTCTGGAAACCCAATGTCACGATTAACCTGGTCGATGATTTCACTCAC
TATTCACAGAATGCAGTACCACCAAACATTGCTCCCCACTTGCTGGTAGAGCCTAGCACG
GGGAATTACTATCCTACAATTTACTTCAATGAGTTTTGGCTGCTAAGGGACAAGATGATT
CAAATGAATGAGACAGTCTCAGAAGTACCACTTGAACTTGAAATAAGCCCCATAAGCATG
ATGAAGTGGCAACTGTTTCAGCAAGTTGATCAGTCTTTCCAGATGCAGCGTAGCTATGGA
AGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTAT
CTGTTGGGCATAACGATGTTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTGTTCGACTTCTTGGCATTC
AAAAATGATATCCAGTTCTGGAACAAAAACAAATCTATGGAAGGATTGTCTGCAAAGTCT
GTTGTACTGAACTTTATCTGTCAGTTCGTCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACT
TCATGGATGATACTGGCCAGTTCCGGAGTTGGTGTCTGCATTGAATTCTGGAAAATTGGG
AAAGCCATGCGCATAGAGGTTGATCGAAGTGGAATGATTCCAAGGTTGAGGTTCCACGAT
CGTGAGTCCTATGCAAGCAATAAAACCAAAGAGTATGATGACATTGCCATCAAATTCTTA
TCCTATGTGCTCCTCCTCCTTGTCGTGGGGTTATCCATATATTCTCTCGCTTACGAACGC
CACAAGAGCTGGTATTCGTGGATCCTGTCTTCACTAACAAGTTGTGTCTACATGTTTGGT
TTCATCATGATGTGTCCTCAGCTATTCATCAACTATAAACTAAAATCAGTGGCACATTTA
CCATGGAGGCAGATGACTTACAAGTTCCTCAACACCATTATCGATGATCTCTTTGCCTTC
GTCATCAAAATGCCGCTTTTGCATCGGCTTTCTGTATTCCGAGATGATGTGATATTCTTG
ATATACTTATACCAAAGGTGGGTCTACCCTGTGGACAAGACACGTGTTAACGAGTTTGGT
TTTGGAGGTGAGGATGAAACTGCAGAGAAGAAGTTGATTACTGAGAAAGAAGAAGAAGAC
AACAAGAAAACAAACTAAGCTTCTCCGTTCTTCCTTTTATTTATGTGATAGTGTTACAGT
TTCTTAAATTTTTTTGTTTTGTTTTTGCTTTCACTTTGTTTACGTTAATGTTAACTTTCA
GAAAAACATTATAAGAGAAACTCAAACTTTTGATTGTTTTCTTAAAGTTGTTACTTATTA
ATATCAAACCAAATAATTTCAGTGACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ16JQ C 21
AF RR4GQ16TF U 21
AF RR4GQ01JQ C 21
AF RR4GM66TF U 1
AF RR4AL79TF U 610
AF RR4CI15TF U 1100
AF RR4AL79JQ C 827
AF RR4GM66JQ C 1045
BS 1 107 RR4GM66TF
BS 108 108 RR4GQ16TF
BS 109 724 RR4GM66TF
BS 725 725 RR4AL79TF
BS 726 742 RR4GM66TF
BS 743 1336 RR4AL79TF
BS 1337 1337 RR4CI15TF
BS 1338 1379 RR4AL79TF
BS 1380 1514 RR4AL79JQ
BS 1515 1515 RR4GM66JQ
BS 1516 1587 RR4AL79JQ
BS 1588 1648 RR4GM66JQ

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G
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TTCTTTGCTCGATCTGGATTCCCTATAGACCCCACTGATCCTGAATACCAACCTCTTAAT
AGCTTTAGCAGGACTCACCCTGTTGCGACTTACTT
TCCAAAG

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DS 

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G
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TTCTTTGCTCGATCTGGATTCCCTATAGACCCCACTGATCCTGAATACCAACCTCTTAAT
AGCTTTAGCAGGACTCACCCTGTTGCGACTTACTT

QA 2 156 2 156
DS 

RD RR4GQ01JQ 165 0 0
G
TCACTCAAGTATTATCCTTCTGAGACGCTACAGAATAACGGAAGTCTGTATGCTCATGTC
TTCTTTGCTCGATCTGGATTCCCTATAGACCCCACTGATCCTGAATACCAACCTCTTAAT
AGCTTTAGCAGGACTCACCCTGTTGCGACTTACTTTCCAAAG
CG

QA 2 163 2 163
DS 

RD RR4GM66TF 742 0 0
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GGAAGTCTGTATGCTCATGTCTTCTTTGCTCGATCTGGATTCCCTATGGACCCCACTGAT
CCTGAATACCAACCTCTTAATAGCTTTAGCAGGACTCACCCTGTTGCGACTTACTTTCCA
AAGCGAAAAGCAAATAAGAAGAAGAGCCTCTTAGGTAATGCTAAAGACTCTGATGAATCC
CAACCAGAGGTTGAGACAGTCGTTGATAAGAACTCGGAAGTCAAGGAAGAAGTCCCTGTG
GAGTGGGTATCCCTCTGGAAACCCAATGTCACGATTAACCTGGTCGATGATTTCACTCAC
TATTCACAGAATGCAGTACCACCAAACATTGCTCCCCACTTGCTGGTAGAGCCTAGCACG
GGGAATTACTATCCTACAATTTACTTCAATGAGTTTTGGCTGCTAAGGGACAAGATGATT
CAAATGAATGAGACAGTCTCAGAAGTACCACTTGAACTTGAAATAAGCCCCATAAGCATG
ATGAAGTGGCAACTGTTTCAGCAAGTTGATCAGTCTTTCCAGATGCAGCGTAGCTATGGA
AGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTAT
CTGTTGGGCATAACGATGTTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTGTTCGACTTCTTGGCATTC
AAAA*TGATATCCAGTTCTGGA

QA 1 742 1 742
DS 

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ATAACGATGTTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTGTTCGACTTCTTGGCATTCAAAAATGAT
ATCCAGTTCTGGAACAAAAACAAATCTATGGAAGGATTGTCTGCAAAGTCTGTTGTACTG
AACTTTATCTGTCAGTTCGTCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCATGGATG
ATACTGGCCAGTTCCGGAGTTGGTGTCTGCATTGAATTCTGGAAAATTGGGAAAGCCATG
CGCATAGAGGTTGATCGAAGTGGAATGATTCCAAGGTTGAGGTTCCACGATCGTGAGTCC
TATGCAAGCAATAAAACCAAAGAGTATGATGACATTGCCATCAAATTCTTATCCTATGTG
CTCCTCCTCCTTGTCGTGGGGTTATCCATATATTCTCTCGCTTACGAACGCCACAAGAGC
TGGTATTCGTGGATCCTGTCTTCACTAACAAGTTGTGTCTACATGTTTGGTTTCATCATG
ATGTGTCCTCAGCTATTCATCAACTATAAACTAAAATCAGTGGCACATTTACCATGGAGG
CAGATGACTTACAAGTTCCTCAACACCATTATCGATGATCTCTTTGCCTTCGTCATCAAA
ATGCCGCTTTTGCATCGGCTTTCTGTATTCCGAGATGATGTGATATTCTTGATATACTTA
TACCAAAAGTGGGTCTACCCTGTGGACAAGACACGTGTTAACGAGTTTGG
TTTT

QA 1 770 1 770
DS 

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AGCTATTCATCAACTATAAACTAAAATCAGTGGCGCATTTACCATGGAGGCAGATGACTT
ACAAGTTCCTCAACACCATTATCGATGATCTCTTTGCCTTCGTCATCAAAATGCCGCTTT
TGCATCGGCTTTCTGTATTCCGAGATGATGTGATATTCTTGATATACTTATACCAAAGGT
GGGTCTACCCTGTGGACAAGACACGTGTTAACGAGTTTGG

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4AL79JQ 762 0 0
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TCTGGAAAATTGGGAAAGCCATGCGCATAGAGGTTGATCGAAGTGGAATGATTCCAAGGT
TGAGGTTCCACGATCGTGAGTCCTATGCAAGCAATAAAACCAAAGAGTATGATGACATTG
CCATCAAATTCTTATCCTATGTGCTCCTCCTCCTTGTCGTGGGGTTATCCATATATTCTC
TCGCTTACGAACGCCACAAGAGCTGGTATTCGTGGATCCTGTCTTCACTAACAAGTTGTG
TCTACATGTTTGGTTTCATCATGATGTGTCCTCAGCTATTCATCAACTATAAACTAAAAT
CAGTGGCACATTTACCATGGAGGCAGATGACTTACAAGTTCCTCAACACCATTATCGATG
ATCTCTTTGCCTTCGTCATCAAAATGCCGCTTTTGCATCGGCTTTCTGTATTCCGAGATG
ATGTGATATTCTTGATATACTTATACCAAAGGTGGGTCTACCCTGTGGACAAGACACGTG
TTAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAAACTGCAGAGAAGAAGTTGATTACTGAGA
AAGAAGAAGAAGACAACAAGAAAACAAACTAAGCTTCTCCGTTCTTCCTTTTATTTATGT
GATAGTGTTACAGTTTCTTAAATTTTTT*GTTTTGTTTTTGCTTTCACTTTGTTTACGTT
AATGTTAACTTTCAGAAAAACATTATAAGAGAAACTCAAAC
C

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DS 

RD RR4GM66JQ 604 0 0
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CTGTCTTCACTAACAAGTTGTGTCTACATGTTTGGTTTCATCATGATGTGTCCTCAGCTA
TTCATCAACTATAAACTAAAATCAGTGGCACATTTACCATGGAGGCAGATGACTTACAAG
TTCCTCAACACCATTATCGATGATCTCTTTGCCTTCGTCATCAAAATGCCGCTTTTGCAT
CGGCTTTCTGTATTCCGAGATGATGTGATATTCTTGATATACTTATACCAAAGGTGGGTC
TACCCTGTGGACAAGACACGTGTTAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAAACTGCA
GAGAAGAAGTTGATTACTGAGAAAGAAGAAGAAGACAACAAGAAAACAAACTAAGCTTCT
CCGTTCTTCCTTTTATTTATGTGATAGTGTTACAGTTTCTTAAATTTTTTTGTTTTGTTT
TTGCTTTCACTTTGTTTACGTTAATGTTAACTTTCAGAAAAACATTATAAGAGAAACTCA
AACTTTTGATTGTTTTCTTAAAGTTGTTACTTATTAATATCAAACCAAATAATTTCAGTG
ACAC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 8

CO CL803Contig1 1186 8 19 U
GCTTTCAATGTAATATTATTATTATTATCCAATCTTCATGTTTGTTTCAGAATTTCAAAC
AACAAAGTAGTAGCATTCATAGTTTGTTCTGAAAATACCACTCATTCCTAAAAAACCATG
AAGAAAAGTCGAGCAAAAGTTTCTCCAAAGCTGTAAATTCACTCTACTTTATTGTACTCT
ACCCGCCATTATTCAAACCAGAGACCAGAACATAACCTTCTTGAGACATCTCATACATAC
TATCAAGGTTTCGATCAGAAAACATACCCCAGAAAAAATCAGTTCAGGTTTTAAGGACGC
TTGGCTTCTCGGGCCCTATGTTGTTAGGGAGTTTAAGCTCTGGTGGAGTTTCTCTCACAA
TACCAAGCATTGAGTCATACTCCTCGTCTTTTCCAGCATGCCTCTTGCGTAGAACCTTCT
CAAACTCGATCGCATTTAGTGGCTTTGCATTCTCTGCAGCGTGAACCTTCGCGAGGTTTG
AGTAGTTTTCAGCTGACCTTGGGATAAAATCAATTTCCTTACTCTTGAGCTTCCTGAGGA
ACTTCGCTGGGTTGCCTCCCCATATCTCTCCGGAAGGAATTCTAGTGTTTTGTCGCACAA
GCGCACCAGCAGCAACCAGAGCATGCTTCTCAACCACGACACCGTCCAGAACCGTCGCTC
CCATCCCGATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAACAGCACTATGACCAA
TGGTTACATTGTCTCCGATGATGGTTGCAGGGACCTTCCCGCTCAAGTTAGATTTCGCCA
CGTGCACAAGGGAGTTGTCCTGAATATTCGTCCCTGATCCAACACTAATGGTGTTCACAT
CTCCTCGTAGTACGCATCCATACCAAATAGAAGATCCTCTTCCGATCTGGACGTTCCCAA
*TGACTGAGGCGCTTGGTGCTACAAAAGCTTCCTTATCCACAACCGGAGCCTTATCGAAC
ACGTTCATCAGCGTCCGATGCCTTGATAGTTGTTCTCGGAAGCAGTTTTTGCCTTGAAGG
CGACATCCGAGGCGATCGAGAGCCTGGCCGGTCTCACGGATCCAAAATCCGACGGAGTAG
AATGCTCTGCCTAGGGTTCCCATTGGTCTTCGTCGCCTTCCTAGAGTCCACAGGCGAGGG
AATCTGCTGTGACGAAGGCGGAAGATGGTGGAAGTGAAGGGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F583JQ U 1
AF RR4F848JQ U 143
AF RR4EY75JQ U 284
AF RR4AP34JQ U 29
AF RR4AP34TF C 406
AF RR4F583TF C 521
AF RR4F848TF C 538
AF RR4EY75TF C 575
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CCATCCCGATAA

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CTTTGCATTCTCTGCAGCGTGAACCTTCGCGAGGTTTGAGTAGTTTTCAGCTGACTTTGG
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TATCTCTCCGGAAGGAATTCTAGTGTTTTGTCGCACAAGCGCACCAGCAGCAACCAGAGC
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GGTTGCAGGGACCTTCCCG

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GAGGTTTGAGTAGTTTTCAGCTGACTTTGGGATAAAATCAATTTCCTTACTCTTGAGCTT
CCTGAGGAACTTTGCTGGGTTTCCTCCCCATATCTCTCCTGAAGGAATTCTAGTGTTTTG
TCGCACAAGCGCACCAGCAGCAACCAGGGCATGCTTCTCAACCACGACACCGTCCAGAAC
CGTCGCTCCCATCCCGATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAACAGCACT
ATGACCAATGGTTAC

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DS 

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CTGAAAATACCACTCATTCCTAAGAAACCATGAAGAAAAGTCGAGCAAAAGTTTCTCCAA
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ATCAATTTCCTTACTCTTGAGCTTCCTGAGGAACTTCGCTGGGTTGCCTCCCCATATCTC
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AGGGACCTTCCCGCTCAAGTTAGATTTCGCCACGTGCA

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TGTTTTGTCGCACAAGCGCACCAGCAGCAACCAGAGCATGCTTCTCAACCACGACACCGT
CCAGAACCGTCGCTCCCATCCCGATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAA
CAGCACTATGACCAATGGTTACATTGTCTCCGATGATGGTTGCAGGGACCTTCCCGCTCA
AGTTAGATTTCGCCACGTGCACAAGGGAGTTGTCCTGAATATTCGTCCCTGATCCAACAC
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TCTGGACGTTCCCAAATGACTGAGGCGCTTGGTGCTACAAAAGCTTCCTTATCCACAACC
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AATCCGACGGAGTAGAATGCTCTGCCTAGGGTTCCCATTGGTCTTCGTCGCCTTCCTAGA
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ACCC

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TAAAACAGCACTATGACCAATGGTTACATTGTCTC*GATGATGGTTGCAGGGACCTTCCC
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CC

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CCACGTGCACAAGGGAGTTGTCCTGAATATTCGTCCCTGATCCAACACTAATGGTGTTCA
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CAA*TGACTGAGGCGCTTGGTGCTACAAAAGCTTCCTTATCCACAACCGGAGCCTTATCG
AACACGTTCATCAGCGTCCGATGCCTTGATAGTTGTTCTCGGAAGCAGTTTTTGCCTTGA
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CC

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TGATCCAACACTAATGGTGTTCACATCCCCTCGTAGTACGCATCCATACCAAATAGAAGA
TCCTCTTCCGATCTGGACGTTCCCGA*TGACTGAGGCGCTTGGTGCTACAAAAGCTTCCT
TATCCACAACCGGAGCCTTATCGAATACGTTCATCAGCGTCCGATGCCTTGATAGTTGTT
CTCGGAAGCAGTTTTTGCCTTGAAGGCGACATCCGAGGCGATCGAGAGCCTGGCCGGTCT
CACGGATCCAAAATCCGACGGAGTAGAATGCTCTGCCTAGGGTTCCCATTGGTCTTCGTC
GCCTTCCTAGAGTCCACAGGCGAGGGAATCTGCTGTGGCGAAGGCGGAAGATGGTGGAAG
TGAAGGGGACCC

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DS 



AS 2 8

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TGCTGAACCAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP37JQ U 1
AF RR4C268JQ U 46
AF RR4DV29JQ U 1
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RD RR4BP37JQ 612 0 0
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CTTTTTGACTCTGAAAATCTCTCCTTGTCATACGCATCCACGAGGTAGACAACAGCATCA
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DS 

RD RR4C268JQ 593 0 0
GACT
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GAGAGAGCCATTTGAACCCCTCGCCGTAGCCCATTTTACGGACAATGCTGCACATGAAGA
CTTCAAGAGGGCGAACACCAGAATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGG
TGAGGTTGGTGAGACCCAAGTGATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATAT
CAATCTTGTTTCCGAAAATAAGAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTCGTCTGAGAGAAGAG
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CAACAGCATCAACCTTGGCATAGTAATCTTTCCAAACTCTACGAGCAATCTGATGGCCAC
CCAAATCAAAAGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTAAGTTCCTCAGA

QA 5 593 5 593
DS 

RD RR4DV29JQ 706 0 0
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CAAGTTTGGAAATGCAAGTCACCAAACTTTAAATTAAAAACAAGAAAACTACAAAAACCA
AAAGGGTGAAAAGAGTTTTATGATATCATCATCGACAAATCTTTTAACTCAAGAAAAGAC
AGATGTAGTGAGAGACAGACATGATGATGTCTCTTTTAGTTGATGTATTGAGAGAGCCAT
TTGAACCCCTCGCCGTAGCCCATTTTACGGACAATGCTGCACATGAAGACTTCAAGAGGG
CGAACACCAGAATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGGTGAAGTTGGTG
AGACCCAAGTGATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATATCAATCTTGTTT
CCGAGAATAAGAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTCGTCTGAGAGAAGAGCGTCTAGCTCT
CTTTTTGACTCTGAAAATCTCTCCTTGTCATACGCATCCACGAGGTAGACAACAGCATCA
ACCTTGGCATAGTAATCTTTCCAAACTCTACGAGCAATCTGATGGCCACCCAAATCAAAA
GCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTAAGTTCCTCAGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCTGG
TGCTGAACCAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTT

QA 1 706 1 706
DS 



CO CL804Contig2 881 5 38 U
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CTTCTGTGAGATCAGCGAAGGAGACAATGTTTTTGTTCGATTGGTTCTACGGAATCCTGG
CGTCGTTGGGGTTATGGCAGAAGGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGCCTCGACAATGCCG
GAAAAACCACACTCCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAGCCAACAC
AACATCCAACCTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGG
GTGGCCATCAGATTGCTCGTAGAGTTTGGAAAGATTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTG
TCTACCTCGTGGATGCGTATGACAAGGAGAGATTTTCAGAGTCAAAAAGAGAGCTAGACG
CTCTTCTCTCAGACGAAGCTCTTGCAACTGTGCCGTTTCTTATTCTCGGAAACAAGATTG
ATATCCCTTATGCAGCCTCCGAAGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCA
CCACCGGTAA*GGGCAAAGTGACAACAGCTGGAGGAGATTCTGGTGTTCGCCCTCTTGAA
GTCTTCATGTGCAGCATTGTCCGTAAAATGGGCTACGGCGAGGGGTCCAAATGGCTCTCT
CAATACATCAACTAAAGATACATCATCGTGTCTGTCTCTCAGTACATCTGTCTTTTCTTG
AGTTAAA*GATTTGTCAATGATGATATCATAACACTCTTTTCACCCTTTTGGTTTTTCTT
GTTTTTAATTTAAGTTTGGTGACTTGCATTTCCAAACTTGTTCATTGTCTCGGTCCACAT
TTTTGTCAACAGCTTGTGCCTTTTATTGAAACATTATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP37TF U 1
AF RR4C268TF U 37
AF RR4DV29TF U 37
AF RR4GD46TF U 38
AF RR4GD46JQ C 199
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BS 357 547 RR4BP37TF
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CCACCGG

QA 1 547 1 547
DS 

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T
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TTT*CAC
CTTTGGT

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR4DV29TF 727 0 0
T
TTTTTATTTGCGCTTTTCGGTTTCTTCTGTGAGATCAGCGAAGGAGACAATGTTTTTGTT
CGATTGGTTCTACGGAATCCTGGCGT***TGGGGTTATGGCAGAAGGAGGCGAAGATCTT
GTTTCTCGGCCTCGACAATGCCGGAAAAACCACACTCCTTCACATGCTCAAAGACGAGAG
ATTGGTTCAGCACCAGCCAACACAACATCCAACCTCTGAGGAACTTAGCATTGGCAAAAT
CAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTAGAGTTTGGAAAGATTA
CTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTCTACCTCGTGGATGCGTATGACAAGGAGAGATTTTC
AGAGTCAAAAAGAGAGCTAGACGCTCTTCTCTCAGACGAAGCTCTTGCAACTGTGCCGTT
TCTTATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTATGCAGCCTCCGAAGACGAGCTTAGGTA
TCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAAGGGCAAAGTGACAACAGCTGGAGGAG
ATTCTGGTGTTCGCCCTCTTGAAGTCTTCATGTGCAGCATTGTCCGTAAAATGGGCTACG
GCGAGGGGTTCAAATGGCTCTCTCAATACATCAACTAAAGAGACATCATCATGTCTGTCT
CTCACTACATCTGTCTTTC**TGAGT*AAA*GATTTGTCGATGATGATATCATAA*A
CTCTTTCAC

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR4GD46TF 735 0 0
TTTTTATTTGCGCTTTTCGGTTTCTTCTGTGAGATCAGCGAACGAGACAATTTTTTTGTT
CGATTGGTTCTACGGAATCCTGGCGTCGTTGGGGTTATGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTT
GTTTCTCGGCCTCGACAATGCCGGAAAAACCACACTCCTTCACATGCTCAAAGACGAGAG
ATTGGTTCAGCACCAGCCAACACAACATCCAACCTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAAT
CAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTAGAGTTTGGAAAGATTA
CTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGACAAGGAGAGATTTTC
AGAGTCAAAAAGAGAGCTAGACGCTCTTCTCTCAGATGAAGCTCTTGCAACTGTGCCGTT
TCTTATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTATGCAGCCTCCGAAGACGAGCTTAGGTA
TCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAA*GGGCAAAGTGACAACAGCTGGAGGAG
ATTCTGGTGTTCGCCCTCTTGAAGTCTTCATGTGCAGCATTGTCCGTAAAATGGGCTACG
GCGAGGGGTCCAAATGGCTCTCTCAATACATCAACTAAA*ATACATCATCGTGTCTGTCT
CTCAGTACATCTGTCTTTTCTTGAGTTAAA*GATTTGTCAATGATGATATCATAACACTC
TTTTCACCCTTTTGG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GD46JQ 683 0 0
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AACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTC
GTAGAGTTTGGAAAGATTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTT
ATGACAAGGAGAGATTTTCAGAGTCAAAAAGAGAGCTAGACGCTCTTCTCTCAGATGAAG
CTCTTGCAACTGTGCCGTTTCTTATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTATGCAGCCT
CCGAAGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAA*GGGCAAA
GTGACAACAGCTGGAGGAGATTCTGGTGTTCGCCCTCTTGAAGTCTTCATGTGCAGCATT
GTCCGTAAAATGGGCTACGGCGAGGGGTCCAAATGGCTCTCTCAATACATCAACTAAAAA
TACATCATCGTGTCTGTCTCTCAGTACATCTGTCTTTTCTTGAGTTAAAAGATTTGTCAA
TGATGATATCATAACACTCTTTTCACCCTTTTGGTTTTTCTTGTTTTTAATTTAAGTTTG
GTGACTTGCATTTCCAAACTTGTTCATTGTCTCGGTCCACATTTTTGTCAACAGCTTGTG
CCTTTTATTGAAACATTATTCCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 2 7

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TCATAAACGTTCTCGTATCTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCA
GACTCTACTCGCAGGAGCTTTCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAATCACTATT
CGAAAGATAAAACTAAAAGCGTTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTA
ACACCTTTCGCAATACTCCCTCCAAGCTCTTTCTTTGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCG
TATTCGTTCAATGGTCCGAGACCGTACACTTCATCTACCCCACATCTTCCTAGACGCACC
TTTGATGCGAAGAAGGGAAGCTCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCACACTCGACAATG
TTTGCATCGCCTCTTAAACCCTTGAGGCAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCC
ATTGATAATGTTGCAGAACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTT
TGGATGCGGTCTGTGAGATATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGCTTCACC
TGAGAAAGCAGAAGCAAGATTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACAACCGGAACATCAACT
TCTCGAGGATCAAGACTCATTACTTCCGCCACAAAAGTATTAGCTCTAACAACATCAAGC
ATGGTGACTCCCATGAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C312JQ U 44
AF RR4E576JQ U 80
AF RR4DV89JQ U 1
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G
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CCAAACAATCACTATTCGAAAGATAAAACTAAAAGCGTTTTTTATCAATTCTCTTTACTA
CTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACTCCCTCCAAGCTCTTTCTTTGCCTTCTC
TAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCCGAGACCGTACACTTCATCTACCCCACA
TCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAAGCTCAGTCACATGAGATGCCACAAA
TGCACACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCTTAAACCCTTGAGGCAAGCATCTGCAAACTT
CATTGCTGCGTAAGCCATTGATAATGTTGCAGAACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAAC
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TTCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAATCACTATTCGAAAGATAAAACTAAAAG
CGTTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACTCC
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GACCGTACACTTCATCTACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAA
GCTCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCACACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCTTAAAC
CCTTGAGGCAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATTGATAATGTTGCAGAAC
CTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAGAT
ATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGCTTCACCTGAGAAAGCAGAAGCAAGA
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TCGA

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DS 

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TCATAAACGTTCTCGTATCTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCA
GACTCTACTCGCAGGAGCTTTCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAATCACTATT
CGAAAGATAAAACTAAAAGCGTTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTA
ACACCTTTCGCAATACTCCCTCCAAGCTCTTTCTTTGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCG
TATTCGTTCAATGGTCCGAGACCGTACACTTCATCTACCCCACATCTTCCTAGACGCACC
TTTGATGCGAAGAAGGGAAGCTCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCACACTCGACAATG
TTTGCATCGCCTCTTAGACCCTTGAGGCAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCC
ATTGATAATGTTGCAGAACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTT
TGGATGCGGTCTGTGAGATATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGCTTCACC
TGAGAAAGCAGAGGCAAGATTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACAACCGGAACATCAACT
TCTCGAGGATCAAGACTCATTACTTCCGCCACAAAAGTATTAGCTCTAACAACATCAAGC
ATGGTGACTCCCATGAGTTTC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL805Contig2 1369 4 16 U
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GGTTACGCCACGCTTCCCAATACATATAACCATTTCTGACGTCATCTTCTATCTTTATCC
AATATATAAAACCTTCGTGCCGATTCCTCTTCTTCAGACAATCAAATAATCAAACCTCTA
ATCGAACGCAAAAAAAAAGAAGAAGCAGAGCTATGGATGCAAACCAACGGATCGCAAGAA
TCTCTGCTCATCTCAACCCCCCTAACCTCGATCAGAATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGAC
GGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCAGGATTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAG
CGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGTTGATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTC
TTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGTGTCACCACTGATATTAGTCACATGGACA
CTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCAACCGCAGTTAGAGGAGGCACTAACGGGTA
TGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCGAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATC
TTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTCAGGACACTCTCCGAAGCTATAGCCAAGTGCTGTC
CCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCCCGTGAACTCCACGGTGCCAATCGCAGCGG
AGGTTTTCAAGAGAGCTGGTACTTTTGATCCTAAGAAACTCATGGGAGTCACCATGCTTG
ATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTGTGGCGGAAGTAATGAGTCTTGATCCTCGTGAAGTTG
ATGTTCCCGGTTGTTGGAGGACACGCAGGAGTTACAATCTTGCCTCTGCTTTCTCAGGTG
AAGCCTCCTTGCTCTTTCACTCAGAAAGAGATTGAATATCTCACAGACCGCATCCAAAAT
GGTGGCACTGAAGTTGTCGAGGCAAAAGCTGGTGCTTGCCTCAAGGGTCTAAGAAGCGAT
GCAAACATTGTCGAGTGTGCATTTGTGGCATCTCATGTGACTGAGCTTCCCTTCTTCGCA
TCAAAGGTGCGTCTAGGAAGATGTGGGGTAGATGAAGTGTACGGTCTCGGACCATTGAAC
GAATACGAGAGGATGGGATTAGAGAAGGCAAAGAAAGAGCTTGGAGGGAGTATTGCGAAA
GGTGTTACCTTTGTCAAGAAGTAGTAAAGAGAATTGATAAAAAACGCTTTTAGTTTTATC
TTTCGAATAGTGATTGTTTGGAATAAGAACAATGCCTCGCAATGAAAGCTCCTGCGAGTA
GAGTCTGATTTTGAAGATTTAATAAACTGCAATCACTTTGTTCTTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E576TF U 1
AF RR4DV89TF U 154
AF RR4BC69TF U 297
AF RR4BC69JQ C 452
BS 1 197 RR4E576TF
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BS 199 458 RR4E576TF
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BS 460 526 RR4E576TF
BS 527 589 RR4DV89TF
BS 590 590 RR4BC69TF
BS 591 731 RR4DV89TF
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BS 733 832 RR4DV89TF
BS 833 833 RR4BC69TF
BS 834 842 RR4DV89TF
BS 843 897 RR4BC69TF
BS 898 898 RR4BC69JQ
BS 899 958 RR4BC69TF
BS 959 1369 RR4BC69JQ

RD RR4E576TF 526 0 0
GGGTTAAGTATGATGGATCGAGAAGAGGGCGGCGTGAAGGAAGAAGAAGATAAGCTCTCT
GGTTACGCCACGCTTCCCAATACATATAACCATTTCTGACGTCATCTTCTATCTTTATCC
AATATATAAAACCTTCGTGCCGATTCCTCTTCTTCAGACAATCAAATAATCAAACCTCTA
ATCGAACGCAAAAAAAA*GAAGAAGCAGAGCTATGGATGCAAACCAACGGATCGCAAGAA
TCTCTGCTCATCTCAACCCCCCTAACCTCGATCAGAATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGAC
GGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCAGGATTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAG
CGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGTTGATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTC
TTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGTGTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACA
CTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCAACCGCAGTTAGAGGA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4DV89TF 689 0 0
GG
AGACAATCAAATAATCAAACCTCTAATCGAACGCAAAAAAAAAGAAGAAGCAGAGCTATG
GATGCAAACCAACGGATCGCAAGAATCTCTGCTCATCTCAACCCTCCTAACCTCGATCAG
AATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAGGGCGGGTCTCCAGGA
TTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGTTGATG
AAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTCTTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGTGTC
ACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCAACCG
CAGTTAGAGGAGGCACTAACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCGAGG
AAGCCAGGGATGACTAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTCAGGACACTC
TCCGAAGCTATAGCCAAGTGCTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCCCGTG
AACTCCACGGTGCCAATCGCAGCGGAGGTTTTCAAGGGAGCTGGTACTTTTGATCCTAAG
AAACTCATGGGAGTCACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTGTGGCGGAAGTA
ATGAGTCTTGATCCTCGAGAAGTTGAT

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR4BC69TF 662 0 0
AGACGGGTGGGTTTTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCAGGATTCAAAGTGGCGACACTTGGA
GCAGCGGGAGGGATAGTACAGCCACTAGCGATGTTGATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCG
CTTCTTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGTGTCACCACTGATATTAGTCACATG
GACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCAACCGCAGTTAGAGGAGGCACTAACG
GGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCGAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGAT
GACCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTCAGGACACTCTCCGAAGCTATAGCCAAGTGC
TGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCCCGTGAACTCCACGGTGCCAATCGCA
GCGGAGGTTTTCAAGAGAGCTGGTACTTTTGATCCTAAGAAACTCATGGGAGTCACCATG
CTTGATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTGTGGCGGAAGTAATGAGTCTTGATCCTCGTGAA
GTTGATGTTCCCGGTTGTTGGAGGACACGCAGGAGTTACAATCTTGCCTCTGCTTTCTCA
G*TGAAGCCTCCTTGCTCTTTCACTCAGAAAGAGATTGAATATCTCACAGACCGCATCCA
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4BC69JQ 918 0 0
TGTCACCACTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATT*CTCGGGCA
ACCGCAGTTAGAGGAGGCACTAACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCC
GAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTCAGGAC
ACTCTCCGAAGCTATAGCCAAGTGCTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCC
CGTGAACTCCACGGTGCCAATCGCAGCGGAGGTTTTCAAGAGAGCTGGTACTTTTGATCC
TAAGAAACTCATGGGAGTCACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTGTGGCGGA
AGTAATGAGTCTTGATCCTCGTGAAGTTGATGTTCC*GGTTGTTGGAGGACACGCAGGAG
TTACAATCTTGCCTCTGCTTTCTCAGGTGAAGCCTCCTTGCTCTTTCACTCAGAAAGAGA
TTGAATATCTCACAGACCGCATCCAAAATGGTGGCACTGAAGTTGTCGAGGCAAAAGCTG
GTGCTTGCCTCAAGGGTCTAAGAAGCGATGCAAACATTGTCGAGTGTGCATTTGTGGCAT
CTCATGTGACTGAGCTTCCCTTCTTCGCATCAAAGGTGCGTCTAGGAAGATGTGGGGTAG
ATGAAGTGTACGGTCTCGGACCATTGAACGAATACGAGAGGATGGGATTAGAGAAGGCAA
AGAAAGAGCTTGGAGGGAGTATTGCGAAAGGTGTTACCTTTGTCAAGAAGTAGTAAAGAG
AATTGATAAAAAACGCTTTTAGTTTTATCTTTCGAATAGTGATTGTTTGGAATAAGAACA
ATGCCTCGCAATGAAAGCTCCTGCGAGTAGAGTCTGATTTTGAAGATTTAATAAACTGCA
ATCACTTTGTTCTTAGAT

QA 1 918 1 918
DS 



AS 1 8

CO CL806Contig1 1029 8 17 U
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AAAGTCCTAAGATCTCCCTCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGC
CGGTGAATTAAAGCAAGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAA
AGGTGGAGAACAATGCTCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTTGAGATGCTAG
AGAAGAAGGAGAAGGTACTCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAAT
ACACTCGTGCTAAGAACAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATG
AGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGT
TGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTTGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAA
TGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCA
ATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGCCTTGTCTACTCCAATCGGGGCAG
CAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGC
TTGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCCACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCGGTGCCTGCAGGGC
GTCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTAC
AGGCTGAGATGGCCCTCTAAGGGTTTATTCACGAACTGGAGCAGACCTGTATGCATTGAT
AAACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAATCGGAGCGAA
ACTTAATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAATGTTATTTTTATCAAACATTTGACTGTTTC
TTCTTC***ACATATACTATT***ATCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCTGATGGGTTAC
TTACTACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FZ34TF U 1
AF RR4CF11TF U 15
AF RR4EY27TF U 56
AF RR4FZ34JQ C 212
AF RR4CF11JQ C 306
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AF RR4E407TF U 711
AF RR4E407JQ C 559
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BS 681 708 RR4CF11TF
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BS 714 1022 RR4E407TF
BS 1023 1029 RR4CF11JQ

RD RR4FZ34TF 330 0 0
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AAAGTCCTAAGATCTCCCTCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGT**TTTTCTTCATAGC
CGGTGAATTAAAGCAAGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAA
AGGTGGAGAACAATGCTCTCCAGACATTAAACAAGCTTAACGAGACACTTGAGATGCTAG
AGAAGAAGGAGAAGGTACTCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAAT
ACACTCGTGCTAGGAACAAACGCGCGGCTA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4CF11TF 698 0 0
GG
GTGAACACAAAAAACACGGAAGAACATAACCAAACCAAACCAGCAAAGTCCTAAGATCTC
CCTCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGCCGGTGAATTAAAGCAA
GATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAAAGGTGGAGAACAATGC
TCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTTGAGATGCTAGAGAAGAAGGAGAAGGT
ACCCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAATACACTCGTGCTAAGAA
CAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATGAGCAACAAGTCGAACA
GCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAGC
AACAACTGAAACTGTCGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAATGAAAGCAATGCAGAA
AGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAGCAGACAGAGAA
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TCA*CCCACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCGG
GCCT

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4EY27TF 658 0 0
GG
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AGCCGGTGAATTAAAGCAAGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATTGTCTGTTCGGGAAAC
CAAAGGTGGAGAACAATGCTCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTTGAGATGC
TAGAGAAGAAGGAGAAGGTACTCTTGAAAAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAG
AATACACTCGTGCTAAGAACAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTAT
ATGAGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTA
TGTTGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTTGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCG
CAATGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGA
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CAGCAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAAGTGCAG
AGCTTGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCCACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCCGTGCCT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR4FZ34JQ 729 0 0
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TGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAATACACTCGTGCTAGGAACAAACGCGCGGCTAT
ACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATGAGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCA
GCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGT
TGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAATGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGA
TGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCA
AGAAGCCTTGTCTACTCCAATCGGGGCAGCAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGC
AGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCCACCACAGT
ATTGCCTTCAGTTCCGGTGCCTGCAGGGCGTCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGAC
CGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAGGTTGTATTCA
CGAACCGGAGCAGACCTGTATGCATTGATAAACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATC
TCAATGTCAAAATTTAAAATCGGAGCGAAACTTAATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAAT
GTTATTTTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4CF11JQ 724 0 0
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CAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTGGAA
GGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTCGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAATGAAA
GCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAG
CAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGCCTTGTTTACTCCAATCGGGGCAGCAGCC
GACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGCTTGAA
GAGCAGCTTCTTCAACCCACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCGGTGCCTGCAGGGCGTCAA
GCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTACAGGCT
GAGATGGCCCTCTAAGGTTGTATTCACGAACCGGAGCAGACCTGTATGCATTGATAAACC
AAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAATCGGAGCGAAACTTA
ATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAATGTTATTTTTAATCAACATTTGACTGTTTCTTCTT
CTTCACATATACTATTTTTATCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCTGATGGGTTACTTACT
ACGT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4EY27JQ 677 0 0
GGTTATATGAGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAA
TGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTTGATGCGTTGAGGAGTGGAG
CTTCCGCAATGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGG
ATGAGATCGATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGCCTTGTCTACTCCAA
TCGGGGCAGCAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAG
GTGCAGAGCTTGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCCACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCGGTGC
CTGCAGGGCGTCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTG
CTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAGGGTTTATTCACGAACTGGAGCAGACCTGTA
TGCATTGATAAACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAAT
CGGAGCGAAACTTAATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAACGTTATTTTTATCAAACATTT
GACTGTTTCTTCTTC***ACATATACTATT***ATCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCTG
ATGGGTTACTT
ACTACG

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DS 

RD RR4E407TF 312 0 0
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GCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAGGGTTTATTCACGAACTGGAGCAGACCTGT
ATGCATTGATAAACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAA
TCGGAGCGAAACTTAATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAATGTTATTTTTATCAAACATT
TGACTGTTTCTTCTTC***ACATATACTATT***ATCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCT
GATGGGTTACTT

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR4E407JQ 464 0 0
G
GAAACAGATCCAAGAAGCCTTGTTTACTCCAATCGGGGCAGCAGCCGACTTCGATGAGGA
TGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAGCAGCTTTTTCA
GCCCACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCGGTGCCTGCAGGGCGTCAAGCAGCACGTCCTAC
TCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTTTA
AGGGTTTATTCACGAACTGGAGCAGACCTGTATGCATTGATAAACCAAGAACAGGCGATG
TATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAATCGGAGCGAAACTTAATAATAAATAATCC
TCGTCGTGCAATGTTATTTTTATCAAACATTTGACTGTTTTTTCTTC***ACATATACTA
TT***ATCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCTGATGGGTTACTT

QA 2 464 2 464
DS 



AS 1 7

CO CL807Contig1 944 7 20 U
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GTCTCTGGCTCTCTTATAAGACCATAACACAGAACAAGGCTTTTGTCGTGTGTAACGATG
GCGTCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAGCGGAGAAGGTAAGGAGCCA
ATGGGAGATCCGACGAAGACAACTACAGCGATATTAGACAAAGGAACGGCGATGTTGCAG
TCTATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTCGCTTGCTATAGCCAC
GATCCTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTC
CAATGTGCCGTCTACGATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCGGGATCGAATATATA
GTGTCCGAGAAGTTATTCGAGAGTTTCTCACCGGATGAACAAAAGCTTTGGCACTCGCAT
GACTACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTTGTTGCGAAG
CCGGAGCTTAAGAATCTTGCCAGATCTTACGGCAAATTTTGGTGCACATGGCAGATCGAT
CGCGGAGATAGATTACCATTAGGTGTACCATCATTAATGGTTTCTCCACAAGACGTGGAT
CTCGGTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACG
GAATCGTTGAAGCCGTCACGAGAAGGGATTTGCGGACCGGAGAAAAAGAATCTGATCGCT
GATTATTGGGTTCGGTTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTTGTTGAGACAGATATGAAG
AGAACAGCTCCCTTCCCGTGACTACTTCCTTTTTTTTTACTGAGACATTATAACTTCTTA
AGCTTATAGTATTATATGGAATAAAACTTATAGTATTATCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GU10TF U 47
AF RR4D621TF U 38
AF RR4BU78TF U 42
AF RR4FO28TF U 1
AF RR4BU78JQ C 125
AF RR4GU10JQ C 196
AF RR4FO28JQ C 543
BS 1 73 RR4FO28TF
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BS 75 224 RR4FO28TF
BS 225 227 RR4D621TF
BS 228 584 RR4FO28TF
BS 585 585 RR4D621TF
BS 586 623 RR4FO28TF
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BS 625 642 RR4FO28TF
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BS 644 691 RR4FO28TF
BS 692 692 RR4BU78JQ
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BS 722 746 RR4FO28TF
BS 747 934 RR4BU78JQ
BS 935 943 RR4GU10JQ
BS 944 944 RR4FO28JQ

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GG
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TGTGTAACGATGGCGTCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAGCGGAGAA
GGTAAGGAGCCAATGGGAGATCCGA

QA 3 147 3 147
DS 

RD RR4D621TF 656 0 0
GGAC
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TTTGTCGTGTGTAACGATGGCATCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAG
CGGAGAAGGTAAGGAGCCAATGGGAGATCCGACGAAGACAACTACCGCGATGTT*GACAA
AGGAACGGCGATGTTGCAGTCTATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTC
ATTTGCTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCG
TGTAAACCAAGACTTTCTCCAATGTGCCGTCTACGATTCCAGTTCCTCTAAGGCTCATCT
CATCGGGATCGAATATATAGTGTCCGAGAAGTTATTCGAGAGTCTCTCACCGGATGAACA
AAAGCTTTGGCACTCGCATGACTACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGT
CCCAGAGCTTGTTGCGAAGCCGGAGCTTAAGAATCTTGCCAAATCTTACGGCAAATTTTG
GTGCACATGGCAGATCGATCGCGGAGATAGATTACCATTAGGTGTACCATCATTAATGGT
TTCGCCACAAGACGTGGATCTCGGGAGGATCAAACCGGAGTTGGTGAAAA*A

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DS 

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CTCATGC
AAGGTCACTTATGTCTCTGGCTCTCTTATAAGACCATAACACAGAACAAGGCTTTTGCCG
TGTGTAACGATGGCGTCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAGCGGAGAA
GGTAAGGAGCCAATGGGAGATCCGACGAAGACAACTACAGCGATATTAGACAAAGGAACG
GCGATGTTGCAGTCTATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTCGCT
TGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAAAC
CAAGACTTTCTCCAATGTGCCGTCTACGATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCGGG
ATCGAATATATAGTGTCCGAGAAGTTATTCGAGAGTTTCTCACCGGATGAACAAAAGCTT
TGGCACTCGCATGACTACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAG
CTTGTTGCGAAGCCGGAGCTTAAGAATCTTGCCAGATCTTACGGCAAATTTTGGTGCACA
TGGCAGATCGATCGCGGAGATAGATTACCATTAGGTATACCATCATTAATGGTTTCTCCA
CAAGACGTGGATCTCGGTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAA*GAGAGATGA
G

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DS 

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GTCTCTGGCTCTCCTATAAGACCATAACACAGAACAAGGCTTTTGTCGTGTGTAACGATG
GCGTCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAGCGGAGAAGGTAAGGAGCCA
ATGGGAGATCCGACGAAGACAACTACAGCGATATTAGACAAAGG**GGGCGATGTTGCAG
TCTATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTCGCTTGCTATAGCCAC
GATCCTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTC
CAATGTGCCGTCTACGATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCGGGATCGAATATATA
GTGTCCGAGAAGTTATTCGAGAGTTTCTCACCGGATGAACAAAAGCTTTGGCACTCGCAT
GACTACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTTGTTGCGAAG
CCGGAGCTTAAGAATCTTGCCAGATCTTACGGCAAATTTTGGTGTACATGGCAGATCGAT
CGCGGAGATAGATTACCATTAGGAGTACCATCATTAATGGTT*CTCCACAAGACGTGGAT
CTCGGTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAA*GAGAGATGA*GAACATGGAATCTCGACG
*AATCGTTGAAGCCGTCACGAGAAGG
ATTGCGGACGGAGAAAAAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4BU78JQ 810 0 0
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GAGATCCGACGAAGACAACTACAGCGATATTAGACAAAGGAACGGCGATGTTGCAGTCTA
TGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTCGCTTGCTATAGCCACGATC
CTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTCCAAT
GTGCCGTCTACGATTCCAATTCCTTTAAGGCTCATTTCATCGGGATCGAATATATAGTGT
CCGAGAAGTTATTCGAGAGTTTCTCACCGGATGAACAAAAGCTTTGGCACTCGCATGACT
ACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTTGTTGCGAAGCCGG
AGCTTAAGAATCTTGCCAGATCTTACGGCAAATTTTGGTGCACATGGCAGATCGATCGCG
GAGATAGATTACCATTAGGTATACCATCATTAATGGTTTCTCCACAAGACGTGGATCTCG
GTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACGGAAT
CGTTGAAGCCGTCACGAGAAGGGATTTGCGGACCGGAGAAAAAGAATCTGATCGCTGATT
ATTGGGTTCGGTTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTTGTTGAGACAGATATGAAGAGAA
CAGCTCCCTTCCCGTGACTACTTCCTTTTTTTTTACTGAGACATTATAACTTCTTAAGCT
TATAGTATTATATGGAATAAAACTTATAGT

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DS 

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AGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTCGCTC*CTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAG
ATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTCCAATGTGCCGTCTAC
GATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCGGGATCGAATATATAGTGTCCGAGAAGTTA
TTCGAGAGTTTCTCACCGGATGAACAAAAGCTTTGGCACTCGCATGACTACGAGATCCAA
ATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTTGTTGCGAAGCCGGAGTTTAAGAAT
CTTGCCAGATCTTACGGCAAATTTTGGTGCACATGGCAGATCGATCGCGGAGATAGATTA
CCATTAGGTGTACCATCATTAATGGTTTCTCCACAAGACGTGGATCTCGGTAGGATCAAA
CCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACGGAATCGTTGAAGCCG
TCACGAGAAGGGATTTGTGGACCGGAGAAAAAGAATCTGATCGCTGATTATTGGGTTCGG
TTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTTGTTGAGACAGATATGAAGAGAACAGCTCCCTTC
CCGTGACTACTTCCTTTTTTTT*ACTGAGACATTATAACTTCTTAAGCTTATAGTATTAT
ATGGAATAAAACTTATAGTATTATCACC
G

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4FO28JQ 402 0 0
GGAGCTTAAGAATCTTGCCAGATCTTACGGCAAATTTTGGTGTACATGGCAGATCGATCG
CGGAGATAGATTACCATTAGGAGTACCATCATTAATGGTT*CTCCACAAGACGTGGATCT
CGGTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACGGA
ATCGTTGAAGCCGTCACGAGAAGGGATTTGCGGACCGGAGAAAAAGAATCTGATCCCTGA
TTATTGGGTTCGGTTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTTGTTGAGACAGATATGAAGAG
AACAGCTCCCTTCCCGTGACTACTTCCTTTTTTTTTACTGAGACATTATAACTTCTTAAG
CTTATAGTATTATATGGAATAAAACTTATAGTATTATCACCC

QA 1 402 1 402
DS 



AS 2 7

CO CL808Contig1 1145 4 7 U
TTTTTATTAGGGTTCCTTTCCTTCCTTCGTTCCCAGATTTTGATTTTAACCGGAAATATA
AAGTCACTTTCCTCCGGCGATTGTGAGGCTAATTGATCCTCCGGCGAGGTTCGATAAAAA
ATGGAGGTAATCACCCATCCAACACCTCGAACTGTCGAAGAGGTCTTTACTGACTTCAGA
GGTCGTCGTGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGATATGGTGAAGTTTTACCAAACG
TGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGACTTCCAAACGAGACATGGGAGGTG
AATCTTCCCGTCGACGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGCGCCTGCTCTAGGCATCAACTTC
GCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCC
TGGCTGCTCACTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCTCGTTTTGGGTTTGGTAAGAATGAGAGG
AAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCATTTTCGAGATTGTGACAGGCAAT
GCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAATCCAAC
GGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCGAAAGAAGAAGACGAGAGTGAGGAC
GAGGACGAAGACGACGAACAAGGTGCGGTCTGTGGCGCTTGTGGAGACAGTGACGGTACA
GACGAGTTCTGGATCTGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTTAGA
TAACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATGCCCAACTTGCAGTAACAAGA
GAGCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAGCAAAGGTAAAAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGA
AAGGAGGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCCAAAGATAAATGGGTTTTAGAAG
ATGTAAGAAGGTTTAAAAAACACGTTTGCTTGCTTAGTCTTTGTTTATGGATTCAGACTA
TTTACTATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTAATGTCAAT
GCTACTACTGATTTGGCCCTGCTTAAGTCTGTTTAAAGTATCCTAGACTCCTGCTTAAAT
ATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR4BV02TF U 1
AF RR4C794TF U 51
AF RR4BV02JQ C 366
AF RR4C794JQ C 663
BS 1 659 RR4BV02TF
BS 660 668 RR4C794TF
BS 669 669 RR4BV02JQ
BS 670 682 RR4C794TF
BS 683 683 RR4BV02JQ
BS 684 715 RR4C794TF
BS 716 1145 RR4BV02JQ

RD RR4BV02TF 659 0 0
TTTTTATTAGGGTTCCTTTCCTTCCTTCGTTCCCAGATTTTGATTTTAACCGGAAATATA
AAGTCACTTTCCTCCGGCGATTGTGAGGCTAATTGATCCTCCGGCGAGGTTCGATAAAAA
ATGGAGGTAATCACCCATCCAACACCTCGAACTGTCGAAGAGGTCTTTACTGACTTCAGA
GGTCGTCGTGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGATATGGTGAAGTTTTACCAAACG
TGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGACTTCCAAACGAGACATGGGAGGTG
AATCTTCCCGTCGACGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGCGCCTGCTCTAGGCATCAACTTC
GCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCC
TGGCTGCTCACTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCTCGTTTTGGGTTTGGTAAGAATGAGAGG
AAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCATTTTCGAGATTGTGACAGGCAAT
GCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAATCCAAC
GGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCGAAAGAAGAAGACGAGAGTGAGGA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4C794TF 666 0 0
CGGAAATATAAAGTCACTTTCCTCCGGCGATTGTGAGGCTAATTGATCCTCCGGCGAGGT
TCGATAAAAAATGGAGGTAATCACCCATCCAACACCTCGAACTGTCGAAGAGGTCTTTAC
TGACTTCAGAGGTCGTCGTGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGATATGGTGAAGTT
TTACCAAACGTGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGACTTCCAAACGAGAC
ATGGGAGGTGAATCTTCCCGTCGACGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGCGCCTGCTCTAGG
CATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTTCA
CAGTGATTCCTGGCTGCTCACTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCTCGTTTTGGGTTTGGTAA
GAATGAGAGGAAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCATTTTCGAGATTGT
GACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAGTAGCAAAAG
CAAATCCAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCGAAAGAAGAAGACGA
GAGTGAGGACGAGGACGA*GACGACGAACAAG*TGCGGTCTGTGGCGCTTGTGGAGACAG
TGACG
T

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4BV02JQ 780 0 0
AGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCT
GCTCACTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCTCGTTTTGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAA
GCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCATTTTCGAGATTGTGACAGGCAATGCAAA
GCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTT
GAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCGAAAGAAGAAGACGAGAGTGAGGACGAGGA
CGAAGACGACGAACAAGGTGCGGTCTGTGGCGCTTGTGGAGACAGTGACGGTACAGACGA
GTTCTGGATCTGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTTAGATAACA
CCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATGCCCAACTTGCAGTAACAAGAGAGCC
AGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAGCAAAGGTAAAAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAAGGA
GGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCCAAAGATAAATGGGTTTTAGAAGATGTA
AGAAGGTTTAAAAAACACGTTTGCTTGCTTAGTCTTTGTTTATGGATTCAGACTATTTAC
TATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTAATGTCAATGCTAC
TACTGATTTGGCCCTGCTTAAGTCTGTTTAAAGTATCCTAGACTCCTGCTTAAATATGCT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4C794JQ 483 0 0
GGACGAAGACGACGAACAAGGTGCGGTCTGTGGCGCTTGTGGAGACAGTGACGGTACAGA
CGAGTTCTGGATCTGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTTAGATA
ACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATGCCCAACTTGCAGTAACAAGAGA
GCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAGCAAAGGTAAAAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAA
GGAGGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCCAAAGATAAATGGGTTTTAGAAGAT
GTAAGAAGGTTTAAAAAACACGTTTGCTTGCTTAGTCTTTGTTTATGGATTCAGACTATT
TACTATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTAATGTCAATGC
TACTACTGATTTGGCCCTGCTTAAGTCTGTTTAAAGTATCCTAGACTCCTGCTTAAATAT
GCT

QA 1 483 1 483
DS 



CO CL808Contig2 938 3 35 U
GGACTTCAGAGGTCGTCGAGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGATATGGCGAAGTT
TTACCAAACGTGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTATGGACTTCCTAACGAGAC
ATGGGAGGTTAATCTTCCCGTCGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGAGCCTGCTCTTGG
CATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTTCA
CAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCACGTTTTGGGTTTGGTAA
GAACGAGAGGAAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTTCCAACCATTTTCGAGATTGT
GACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAACAACA***G
TAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCTAAAGA
AGAAGACGAGAGTGAGGACGAGGACGAAGACGACGAACAAGGTGCGGTCTGTGGCGCTTG
TGGAGACAGTGACGGTACAGATGAGTTCTGGATCTGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTT
CCATGGGAAATGTGTGAAGATAACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATG
CCCAACTTGCAGTAACAAGGGAGCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAGCAAAGGTAAAA
GAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAAGGAGGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCCAA
AGATAAATGGGGTTTTAGAAGATGTAAGAAGGTTAAAAAAAACACGTTTGCTTGCTTAGT
CTTTGTTTATGGATTCAGACTATTTACTATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTAATGTCAATGCTACTACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL37TF U 1
AF RR4HB62TF U 154
AF RR4HB62JQB C 175
BS 1 226 RR4GL37TF
BS 227 227 RR4HB62TF
BS 228 339 RR4GL37TF
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BS 710 713 RR4GL37TF
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BS 777 791 RR4HB62TF
BS 792 938 RR4HB62JQB

RD RR4GL37TF 722 0 0
GGACTTCAGAGGTCGTCGAGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGATATGGCGAAGTT
TTACCAAACGTGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTATGGACTTCCTAACGAGAC
ATGGGAGGTTAATCTTCCCGTCGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGAGCCTGCTCTTGG
CATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTTTGGTCGCTGTTCA
CAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCACGTTTTGGGTTTGGTAA
GAACGAGAGGAAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCATTTTCGAGATTGT
GACAGGCAATGCAAAGCAGTCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAACAACAACAG
TAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTTAAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCTAAAGA
**AAGACGAGAGTGAGGACGAGGACGAAGACTACGAGCAAGGTGCGGTGTGTGGCGCTTG
TGGAGACAGTGACGGTGCAGATGAGTTCTGGATCCGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTT
CCATGGGAAATGTGTGAAGATAACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATG
CCCAACCTGCAGTAACAAGAGAGCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAACAAAAGTAAA
GAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4HB62TF 652 0 0
TCCCGAGCTTCCTGAGCCTGCTCTTGGCATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAA
GGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTCTA
CTTTGGTGCACGTTTTGGGTTTGGTAAGAACGAGAGGAAGAAGCTCTTCCAGATGATAAA
CGAGCTTCCAACCATTTTCGAGATTGTGACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTATC
TGCCAACAACAACAACAACAACA***GTAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTTGAAGGTTCC
AAAGATGTCATCTCCACCGCCTAAAGAAGAAGACGAGAGTGAGGACGAGGACGAAGACGA
CGAACAAGGTGCGGTCTGTGGCGCTTGTGGAGACAGTGACGGTACAGATGAGTTCTGGAT
CTGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTGAAGATAACACCTGCAAA
AGCGGAACACATCAAGCATTACAAATGCCCAACTTGCAGTAACAAGGGAGCCAGGCCTTG
ATGATGCCTAAGTGAGCAAAGGTAAAAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAAGGAGGAGAAGT
TCCCAGTTTATTGAACGAAAAG*CCAAAGATAAATGGG
GTTTTAGAGATGTA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4HB62JQB 764 0 0
TCTT
GGCATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTCTGGTCGCTGTT
CACAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTCTACTTTGGTGCACGTTTTGGGTTTGGT
AAGAACGAGAGGAAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTTCCAACCATTTTCGAGATT
GTGACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAACAACA**
*GTAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATTTCCACCGCCTAAA
GAAGAAGACGAGAGTGAGGACGAGGACGAAGACGACGAACAAGGTGCGGTCTGTGGCGCT
TGTGGAGACAGTGACGGTACAGATGAGTTCTGGATTTGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGG
TTCCATGGGAAATGTGTGAAGATAACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAA
TGCCCAACTTGCAGTAACAAGGGAGCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAGCAAAGGTAA
AAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAAGGAGGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCC
AAAGATAAATGGGGTTTTAGAAGATGTAAGAAGGTTAAAAAAAACACGTTTGCTTGCTTA
GTCTTTGTTTATGGATTCAGACTATTTACTATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAATGTCAATGCTACTACTG

QA 5 764 5 764
DS 



AS 1 8

CO CL809Contig1 906 8 38 U
GGACTTTCTTCTTTGTCTGGAACCATCACACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCTCCC
GGAAATATCTCATCTCAAAAAAAAAAAAAATCTTT*CCGACCATGTCTTCTCGCCGGAGA
GTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTCGGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAAT
CAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGCAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTG
ACCAAAGAGGTTCAAATCGATGACAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGG
CAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGAGTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTT
GTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTC
TTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAG
ACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGT
GCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGAC
GCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTAC
ATGCCTGACACTATTGATGTTGCAAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGC
TAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGGTTACCATACAACTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTG
ATCCACAGATTCTAAAGGATTGAGTTCCTTTCTTTTATAATTCAGACGCAATATAATGTC
ACAAAACTCTCATCTATGATCTTTCTCTGTCTCTTCTTGTGTATACATTGCCTTGAACTT
GATTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 15 0 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 25 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 0 25 10 40 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR4AK01TF U 23
AF RR4BU96TF U 1
AF RR4BY59TF U 1
AF RR4D549TF U 20
AF RR4G264TF U 22
AF RR4D549JQ C 272
AF RR4AK01JQ C 110
AF RR4G264JQ C 150
BS 1 85 RR4BU96TF
BS 86 86 RR4D549TF
BS 87 95 RR4BU96TF
BS 96 96 RR4D549TF
BS 97 99 RR4BU96TF
BS 100 100 RR4D549TF
BS 101 101 RR4BU96TF
BS 102 102 RR4D549TF
BS 103 364 RR4BU96TF
BS 365 365 RR4D549TF
BS 366 408 RR4BU96TF
BS 409 409 RR4D549TF
BS 410 505 RR4BU96TF
BS 506 506 RR4D549TF
BS 507 575 RR4BU96TF
BS 576 576 RR4D549TF
BS 577 593 RR4BU96TF
BS 594 594 RR4D549TF
BS 595 596 RR4BU96TF
BS 597 597 RR4D549TF
BS 598 683 RR4BU96TF
BS 684 684 RR4D549TF
BS 685 692 RR4BU96TF
BS 693 710 RR4BY59TF
BS 711 711 RR4D549TF
BS 712 745 RR4BY59TF
BS 746 746 RR4AK01JQ
BS 747 748 RR4D549TF
BS 749 749 RR4BY59TF
BS 750 782 RR4D549TF
BS 783 800 RR4G264TF
BS 801 801 RR4AK01JQ
BS 802 805 RR4G264TF
BS 806 806 RR4AK01JQ
BS 807 815 RR4G264TF
BS 816 816 RR4AK01JQ
BS 817 828 RR4G264TF
BS 829 906 RR4AK01JQ

RD RR4AK01TF 635 0 0
GG
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AAAAAA*CTTT*CCGACCATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTC
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AATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAA*GAGGTTCAAATCGATGAC
AGGATCCTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGA
GTCGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAG
TCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGAT
CCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGC
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TTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAG
AATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCG

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR4BU96TF 692 0 0
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GGAAATATCTCATCTCAAAAAAAAAGAAAATCTTTTCCGTCAATGTCTTCTCGCCGGAGA
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TTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAG
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GCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCTAAAGAAGGATTCAACGTAGAC
GCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTAC
ATGCCTGACACTATTGATGTTGCTAGAGGTCA

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DS 

RD RR4BY59TF 759 0 0
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GGAAATATCTCATCTCAAAAAAAAAGAAAATCTTTTCCGTCAATGTCTTCTCGCCGGAGA
GTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTCGGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAAT
CAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGCAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTG
ACCAAAGAGGTTCAAATCGATGACAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGG
CAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGAGTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTT
GTTAGCGATGTCAATGTTATGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGGGAGAAGAGTTC
TTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAG
ACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCTAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGT
GCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCTAAAGAAGGATTCAACGTAGAC
GCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTAC
ATGCCTGACACTATTGATGTTGCTAGAG*TCAGCAACAAAGATCAACAGG*TGTGAATGC
TAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGGT*TAC
ATACACTATA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4D549TF 763 0 0
GGGGA
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AAAAAAACTTT*CCGACCATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTC
GGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGC
AATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGAC
AGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCCGGGCAAGAAAGATTCCAAAGTCTGGGA
GTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAG
TCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGAT
CCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGC
CGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTAC
TTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAG
AATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCA
AGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGG
T*ACCATACAACTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGAT

QA 6 763 6 763
DS 

RD RR4G264TF 807 0 0
GGA
ATCACACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCTCCCGGAAATATCTCATCTCAAAAAAAA
AAAA***CTTT*CCGACCATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTC
GGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGTAAGTTTAGC
AATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTCGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGAC
AGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGA
GTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAG
TCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGAT
CCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGC
CGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTAC
TTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAG
AATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCA
AGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGG
T*A*CATACAGCTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGATCCACAGATTCTAAAGGAT*GAG
T*CCTTTCTTT*ATAATTCAGACG

QA 4 807 4 807
DS 

RD RR4D549JQ 602 0 0
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TCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTTCG
AGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAGA
ACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGTGG
TTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGA
CATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCT
TCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCAAGAGGTC
AGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGGTTACCAT
ACAACTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGATTCACAGATTCTAAAGGATTGAGTTCCTTT
CTTTTATAATTCAGACACAATATAATGTCACAAAACTCTCATCTATGATCTTTCTCTGTC
CG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4AK01JQ 797 0 0
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CGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGCAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAG
CTGATTTCTTGACCAA*GAGGTTCAAATCGATGACAGGATCCTCACTTTACAGATTTGGG
ATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGAGTCGCTTTCTACAGAGGAGCTGATT
GTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGA
GAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGT
TGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAA
AGGCATGGTTTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGAT
TCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAG
AAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCAAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAG
GGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCGGAGGGTTACCATACAACTATAAAGTTAATT
TCAGTTCATTGATTCACAGATTCTAAAGGATTGAGTTCCTTTCTTTTATAATTCAGACAC
AATATAATGTCACAAAACTCTCATCTATGATCTTTCTCTGTCTCTTCTTGTGTATACATT
GCCTTGAACTTGATTAC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4G264JQ 757 0 0
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GTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTCGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGACAGGAT
CTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGAGTTGC
TTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTT
CGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGA
GAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGT
GGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGA
GACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGC
CTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCAAGAGG
TCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGGTTACC
ATACAGCTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGATCCACAGATTCTAAAGGATTGAGTTCCT
TTCTTTTATAATTCAGACGCAATATAATGTCACAAAACTCTCATCTATGATCTTTCTCTG
TCTCTTCTTGTGTATACATTGCCTTGAACTTGATTAC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 8

CO CL810Contig1 335 2 3 U
GCAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCTGGTTCCTC
GCACTGCCATTCTTCCAATTGCTATGTCCATCTACAAGCTCATTCGACCCGAAGGGGCCA
GTGACAAGTACAGCATGTACTGAGTATATGCCTGCAACTCCCTCTGCTGATGAATGCAGG
AGAAGGATGTTTTACGTTATTTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCTCTTCACTTTAATAAAA
CTCTTGTTGAGATTTTCTTGAAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGAATATTACCCTATCGGA
TTGTATCAGTATTTCGTCAATTTCAGTAATTCACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4BE33JQ C 1
AF RR4BE33TF U 1
BS 1 1 RR4BE33JQ
BS 2 333 RR4BE33TF
BS 334 335 RR4BE33JQ

RD RR4BE33JQ 335 0 0
GCAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCTGGTTCCTC
GCACTGCCATTCTTCCAATTGCTATGTCCATTTACAAGCTCATTCGACCCGAAGGGGCCA
GTGACAAGTACAGCATGTACTGAGTATATGCCTGCAACTCCCTCTGCTGATGAATGCAGG
AGAAGGATGTTTTACGTTATTTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCTCTTCACTTTAATAAAA
CTCTTGTTGAGATTTTCTTGAAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGAATATTACCCTATCGGA
TTGTATCAGTATTTCGTCAATTTCAGTAATTCACC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR4BE33TF 335 0 0
G
CAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCTGGTTCCTCG
CACTGCCATTCTTCCAATTGCTATGTCCATCTACAAGCTCATTCGACCCGAAGGGGCCAG
TGACAAGTACAGCATGTACTGAGTATATGCCTGCAACTCCCTCTGCTGATGAATGCAGGA
GAAGGATGTTTTACGTTATTTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCTCTTCACTTTAATAAAAC
TCTTGTTGAGATTTTCTTGAAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGAATATTACCCTATCGGAT
TGTATCAGTATTTCGTCAATTTCAGTAATTCA
CC

QA 2 333 2 333
DS 



CO CL810Contig2 1263 6 18 U
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ATCGGGTAAAGCTTCTGCAGAAGAAGCAATGGAGAGAGGAATTGAAGAGGATGAGGGAGA
TGAAGAAAAACGGGAAGAAGGTGGGTGAAAGTGAGTTTGGTTATCCGGGTGAAGAAGAGG
ATCCGGAGAACGGTGCTCCAGCTGCAGTGCCAGTTCCATTACCAGATATGGTCTTGCCAC
CTTCATTTGACAGTGATAATTCAGCTTACCGATACCGTTTCCTGGAACCCACTTCACAGC
TCCTAACTAGGCCAGTATTGGATACCCATGGTTGGGACCATGACTGTGGGTATGACGGTG
TGAATGCAGAATACAGTCTTGCTATAGCAAGCCGGTTCCCTGCTACAGCTACTGTCCAAA
CCACCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACATTCATCTGGACTCCTCCGTGTCTGCTAAGCACG
GTGAAAGTGGCTCCACCATGGCAGGTTTCGATATCCAGAATGTAGGTAAGCAGCTTGCAT
ATGTGGTCAGAGGAGAAACCAAATTCAAGAACTTGAAGAAGAACAAGACAACTCTCGGAG
GTTCAGTGACTTCCTTGGGCTAGAACATTGCCACTGGTGTCAAAGTCGAGGACCAAATAT
CACTTGGTAAAAGATTTGTGCTTGTGGGCAGTACAGGGACCATGCGATCACAGGGAGACG
CGGCTTATGGTGCGAACCTGGAGGTCAGGCTCAAGGAAGCTGATTTCCCAATAGGCCAGG
ACCAACACTCTTTAGGACTGTCTCTGGTGAAGTGGAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGGCA
ACCTCCAATCTCAAGTCTCTGTTGGAAGGAACTCAAAGATAGCCCTTCGTGCAGGGCTTA
ACAACAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAGATTG
CTCTCACTGCCATTCTTCCAATTGCTATGTCCATCTACAAGCTCATTCGACCCGAAGGGG
CCAGTGACAAGTACAGCATGTACTGAGTATATGCCTGCAACTCCCTCTGCTGATGAATGC
AGGAGAAGGATGTTTTATGTTATTTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCTCTTCACTTTAATA
AAACTCTTGTTGAGATTTTCTTGAAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGAATATTACCCTATC
GGATTGTATCAGTATTTCGTCAATTTCAGTAATTCATCAAAAAGAATGGAGTCCAGTCCT
GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FZ09TF U 1
AF RR4CX45TF U 454
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AF RR4CX45JQ C 468
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AF RR4EH07JQ C 662
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BS 1237 1263 RR4EH07JQ

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ATCGGGTAAAGCTTCTGCAGAAGAAGCAATGGAGAGAGGAATTGAAGAGGATGAGGGAGA
TGAAGAAAAACGGGAAGAAGGTGGGTGAAAGTGAGTTTGGTTATCCGGGTGAAGAAGAGG
ATCCGGAGAACGGTGCTCCAGCTGCAGTGCCAGTTCCATTACCAGATATGGTCTTGCCAC
CTTCATTTGACAGTGATAATTCAGCTTACCGATACCGTTTCCTGGAACCCACTTCACAGC
TCCTAACTAGGCCAGTATTGGATACCCATGGTTGGGACCATGACTGTGGGTATGACGGTG
TGAATGCAGAATACAGTCTTGCTATAGCAAGCCGGTTCCCTGCTACAGCTACTGTCCAAA
CCGCCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACATTCATCTGGACTCCTCCGTGTCTGCTAAGCACG
GTGAAAGTGGCTCCACCATGGCAGGTTTCG

QA 1 510 1 510
DS 

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G
GGACTCCTCCGTGTCTGCTAAGCACGGTGAAAGTGGCTCCACCATGGCAGGTTTCGATAT
CCAGAATGTAGGTAAGCAGCTTGCATATGTGGTCAGAGGAGAAACCAAATTCAAGAACTT
GAAGAAGAACAAGACAACTCTCGGAGGTTCAGTGACTTCCTTGGGCTAGAACATTGCCAC
TGGTGTCAAAGTCGAGGACCAAATATCACTTGGTAAAAGATTTGTGCTTGTGGGCAGTAC
AGGGACCATGCGATCACAGGGAGACGCGGCTTATGGTGCGAACCTGGAGGTCAGGC**AA
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GAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGGCAACCTCCAATCTCAAGTCTCTGTTGGAAGGAACTC
AAAGATATCCCTTCGTGCAGGGCTTAACAACAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCG

QA 2 478 2 478
DS 

RD RR4EH07TF 707 0 0
G
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TGGTTGGGACCATGACTGTGGGTATGACGGTGTGAATGCAGAATACAGTCTTGCTATAGC
AAGCCGGTTCCCTGCTACAGCTACTGTCCAAACCACCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACAT
TCATCTGGACTCCTCCGTGTCTGCTAAGCACGGTGAATGTGGCA**ACCATGGCAGGTTT
CGATATCCAGAATGTAGGTAAGCAGCTTGCATATGTGGTCAGAGGAGAAACCAAATTCAA
GAACTTGAAGAAGAACAAGACAACTCTCGGAGGTTCAGTGACTTTCTTGGGCGAGAACAT
TGCTACTGGTGTCAAAGTCGAGGACCAAATATCACTTGGTAAAAGATTTGTGCTTGTGGG
CAGTACAGGGACCATGCGGTCACAGGGAGACGCGGCTTATGGTGCGAACCTGGAGGTCAG
GCTCAAGGAAGCTGATTTCCCAATAGGCCAGGACCAACACTCTTTAGGACTGTCTCTGGT
GAAGTGGAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGGCAACCTCCAATCTCGAGTCTCTGTTGGAAG
GAACTCAAAGATAGCCCTTCGTGCAGGGCTTAACAACAAGATGAGCGGGCAGATCACAGT
CCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAGATTGCTCTCACTGCCATT

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR4CX45JQ 771 0 0
TCTGCTAAGCACGGTGAAAGTGGCTCCACCATGGCAGGTTTCGATATCCAGAATGTAGGT
AAGCAGCTTGCATATGTGGTCAGAGGAGAAACCAAATTCAAGAACTTGAAGAAGAACAAG
ACAACTCTCGGAGGTTCAGTGACTTCCTTGGGCTAGAACATTGCCACTGGTGTCAAAGTC
GAGGACCAAATATCACTTGGTAAAAGATTTGTGCTTGTGGGCAGTACAGGGACCATGCGA
TCACAGGGAGACGCGGCTTATGGTGCGAACCTGGAGGTCAGGC**AAGGAAGCTGATTTC
CCAATAGGCCAGGACCAACACTCTTTAGGACTGTTTCTGGTGAAGTGGAGAGGTGATTTA
GCCCTCGGAGGCAACCTCCAATCTCAAGTTTCTGTTGGAAGGAACTCAAAGATATCCCTT
CGTGCAGGGCTTAACAACAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGAT
CAGTTGCAGATTGCTCTCACTGCCATTCTTCCAATTGCTATGTCCACCTACAAGCTCATT
CGACCCGAAGGGGCCAGTGACAAGTACAGCATGTACTGAGTATATGCCTGCAACTCCCTC
TGCTGATGAATGCAGGAGAAGGATGTTTTATGTTATTTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCT
CTTCACTTTAATAAAACTCTTGTTGAGATTTTCTTGAAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGA
ATATTACCCTATCGGATTGTATCAGTATTTCGTCAATTTCAGTAATTCA
GC

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DS 

RD RR4FZ09JQ 440 0 0
CTGGTGAAGTGGAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGGCAACCTCCAATCTCAAGTCTCTGTT
GGAAGGAACTCAAAGATAGCCCTTCGTGCAGGGCTTAACAACAAGATGAGCGGGCAGATC
ACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAGATTGCTCTCACTGCCATTCTTCCAATT
GCTATGTCCATCTACAAGCTCATTCGACCCGAAGGGGCCAGTGACAAGTACAGCATGTAC
TGAGTATATGCCTGCAACTCCCTCTGCTGATGAATGCAGGAGAAGGATGTTTTATGTTAT
TTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCTCTTCACTTTAATAAAACTCTTGTTGAGATTTTCTTG
AAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGAATATTACCCTATCGGATTGTATCAGTATTTCGTCAA
TTTCAGTAATTCA
TCAAAAA

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4EH07JQ 602 0 0
ACTTGGTAAAAGATTTGTGCTTGTGGGCAGTACAGGGACCATGCGGTCACAGGGAGACGC
GGCTTATGGTGCGAACCTGGAGGTCAGGCTCAAGGAAGCTGATTTCCCAATAGGCCAGGA
CCAACACTCTTTAGGACTGTTTCTGGTGAAGTGGAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGGCAA
CCTCCAATCTCGAGTTTCTGTTGGAAGGAACTCAAAGATAGCCCTTCGTGCAGGGCTTAA
CAACAAGATGAGCGGGCAGATCACAGTCCGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAGATTGC
TCTCACTGCCATTCTTCCAATTGCTATGTCCATTTACAAGCTCATTCGACCCGAAGGGGC
CAGTGACAAGTACAGCATGTACTGAGTATATGCCTGCAACTCCCTCTGTTGATGAATGCA
GGAGAAGGATGTTTTATGTTATTTTGTTTTTGGTTCATGTTTTTCTTTTCACTTTAGTAA
AACT**TGTTGAGATTTTCTTGAAGTTGTATTTTGTTCTGTTGAGAATATTACCCTATCG
GATTGTATCAGTATTTCGTCAATTTCAGTAATTCATCAAAAAGAATGGAGTCCAGTCCTG
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 2 8

CO CL811Contig1 760 4 15 U
GGGCCTTTTGTCAACTATCTCTCTCCATCTTTTGTTTTCGTGTGTGCCGTGCCTCTGCTT
CGACAGGTTTTCTGTGATATCCGATGGCTTCAAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAA
ACGATTCCAAGAGCAAGAGCCCTAAACAGGGATCTGCCCCAGGAGCTTCTCCTTCACCTT
CAC******CTGCTGATTTTGGTATTGACTTCAATGCTTTCGATTTCTCAAGCATGGCGG
GTATTCTCAATGACCCAAGCATCAAGGAATTGGCTGAGCAAATAGCCAAAGATCCCACCT
TTAACCAGTTAGCTGAGCAGCTTCAGAAATCTGTTCCAAGTGCATCAGGAGAAGGAGGAG
GTCTCCCTAACTTTGATCCGGAACAGTACATGGCTACAATGAATCAGGTTATGGGAAACC
CTGAGTTCAGAACCATGGCTGAGAAACTCGGCAACGCCTTGGTACAGGATCCACAAATGT
CTTCGTTTATGGAGGTTTTTGCTAACCCTGGAGCAACAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGG
CACAGATGAAAGAAGATCCTACCTTGAAACCTATATTAGCTGAGATAGATGCTGATCCTT
CCGCCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTTTTGAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGG
GTATAGCTGTTGGAGCTGAGCAGAATGTTGCAGCTGAACCTGAACCTGAGGAGGTGGAAG
AAGTTGAAGATGAAGAAGAGTCTATTGTTCATCAGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D411TF U 15
AF RR4E117TF U 11
AF RR4DM89TF U 1
AF RR4E811TF U 11
BS 1 20 RR4DM89TF
BS 21 21 RR4E811TF
BS 22 86 RR4DM89TF
BS 87 87 RR4E811TF
BS 88 158 RR4DM89TF
BS 159 159 RR4E811TF
BS 160 374 RR4DM89TF
BS 375 375 RR4E811TF
BS 376 703 RR4DM89TF
BS 704 704 RR4E811TF
BS 705 711 RR4DM89TF
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BS 713 721 RR4DM89TF
BS 722 722 RR4E811TF
BS 723 760 RR4DM89TF

RD RR4D411TF 704 0 0
GG
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TCCTACCTTGAAACCTATATTAGCTGAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTA
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AGGCGGAA

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DS 

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GGAACT
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GAGCCCTAAACAGGGATCTGCCCCAGGAGCTTCTCCTTCACCTTCAC******CTGCTGA
TTTTGGTATTGACTTCAATGCTTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATTCTCAATGACCC
AAGCATCAAGGAATTGGCTGAGCAAATAGCCAAAGATCCCACCTTTAACCAGTTAGCTGA
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AGGTGGAGAGTTGAG

QA 7 700 7 700
DS 

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GTATTCTCAATGACCCAAGCATCAAGGAATTGGCTGAGCAAATAGCCAAAGATCCCACCT
TTAACCAGTTAGCTGAGCAGCTTCAGAAATCTGTTCCAAGTGCATCAGGAGAAGGAGGAG
GTCTCCCTAACTTTTATCCGGAACAGTACATGGCTACAATGAATCAGGTTATGGGAAACC
CTGAGTTCAGAACCATGGCTGAGAAACTCGGCAACGCCTTGGTACAGGATCCACAAATGT
CTTCGTTTATGGAGGTTTTTGCTAACCCTGGAGCAACAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGG
CACAGATGAAAGAAGATCCTACCTTGAAACCTATATTAGCTGAGATAGATGCTGATCCTT
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A*GTTGAAGATGAAGAAGAGTCTATTGTTCATCAGACTGC

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DS 

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GGAACT
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ATATCCGATGGCTTCAAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAAACGATTCCAAGAGCAA
GAGCCCTAAACAGGGATCTGCCCCAGGAGCTTCTCCTTCACCTTCAC******CTGCTGA
TTTTGGTATTGACTTCAATGCTTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATTCTCAATGACCC
AAGCATCAAGGAATTGGCTGAGCAAATAGCCAAAGATCCCACCTTTAACCAGTTAGCTGA
GCAGCTTCAGAAATCTGTTCCAAGTGCATCAGGAGAAGGAGGAGGTCTCCCTAACTTTGA
TCCGGAACAGTACATGGCTACAATGAATCAGGTTATGGGAAACCCTGAGTTCAGAACCAT
GGCTGAGAAACTCGGCAACGCCTTGGTACAGGATCCACAAATGTCTTCGTTTATGGAGGT
TTTTGCTAACCCTGGAGCAGCAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCACAGATGAAAGAAGA
TCCTACCTTGAAACCTATATTAGCTGAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTA
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TGAGCAGAATGTTGCAGCTGAACCTGAACCTGAGGAGGTGGAAGAAGTTGAAGATGA

QA 7 723 7 723
DS 



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AAATGCAATGCTGTCCTTCCCTCAAAGTCTTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCTAAC
GCAGCTTTCAGACCCTCAACATCACCAAGACTAGCAGTCTGATGAACAATAGACTCTTCT
TCATCTTCAACTTCTTCCACCTCCTCAGGTTCAGGTTCAGCTGCAACATTCTGCTCAGCT
CCAACAGCTATACCCATTGCTTCTCCCAGCTTCTTCAAAACATCTTTATCATTCCAGTAC
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TCTTTCATCTGTGCCATACGCTCAGTAAACTGCTCTGTTGCTCCAGGGTTAGCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E811JQ U 88
AF RR4E117JQ U 1
AF RR4D411JQ U 58
AF RR4DM89JQ U 58
BS 1 69 RR4E117JQ
BS 70 70 RR4D411JQ
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BS 708 778 RR4DM89JQ

RD RR4E811JQ 133 0 0
AGGT
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TAAGCTTTG

QA 5 133 5 133
DS 

RD RR4E117JQ 707 0 0
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AGGTAATAT*GAAAAAGACCAAGTCGAAGGTTTGTAGAAAGCAATGGCCTGTGAAACTAT
TACAGAACACAGAAGAGCCACAAGACATGTTCTCAAATCTCTTAGAGGAATGCATCCTTC
TCAAGGAGCTTCACAACTTCGAGCTGATTGTTAAGCTTTGCCACATCAACCGGAGTTTTA
CTGTCTGTGTTTTGCAGAGTGACTGCAGCACCATTCTCTAAGAGAAGGCTTACACACTCT
TTCCGTCCGTAACCAGCGGCATAATGCAATGGAGTGTTTTTGTTTTTGTCCACTGCATTG
ACATTTGCTCCAGCATCCACAAGAACTTGAGCACATTTCACCTCGCCATATCCACATGCA
AAATGCAATGCTGTCCTTCCCTCAGAGTCTTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCTAAC
GCAGCTTTCAGACCCTCAACATCACCAAGACTAGCAGTCTGATGAACAATAGACTCTTCT
TCATCTTCAACTTCTTCCACCTCCTCAGGTTCAGGTTCAGCTGCAACATTCTGCTCAGCT
CCAACAGCTATACCCATTGCTTCTCCCAGCTTCTTCAAAACATCTTTATCATTCCAGTAC
TTCATCATGGCGGAAGGATCAGCATCTATCTCAGCTAATATAGGTTT

QA 1 707 1 707
DS 

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TTACTGTCTGTGTTTTGCAGAGTGACTGCAGCACCATTCTCTAAGAGAAGGCTTACACAC
TCTTTCCGTCCGTAACCAGCGGCATAATGCAATGGAGTGTTTTTGTTTTTGTCCACTGCA
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AACGCAGCTTTCAGACCCTCAACATCACCAAGACTAGCAGTCTGATGAACAATAGACTCT
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QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4DM89JQ 721 0 0
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TTACTGTCTGTGTTTTGCAGAGTGACTGCAGCACCATTCTCTAAGAGAAGGCTTACACAC
TCTTTCTGTCCGTAACCAGCGGCATAATGCAATGGAGTGTTTTTGTTTTTGTCCACTGCA
TTGACATTTGCTCCAGCATCCACAAGAACTTGAGCACATTTCACCTCGCCATATCCACAT
GCAAAATGCAATGCTGTCCTTCCCTCAAAGTCTTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCT
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TCTTCATCTTCAACTTCTTCCACCTCCTCAGGTTCAGGTTCAGCTGCAACATTCTGCTCA
GCTCCAACAGCTATACCCATTGCTTCTCCCAGCTTCTTCAAAACATCTTTATCATTCCAG
TACTTCATCATGGCGGAAGGATCAGCATCTATCTCAGCTAATATAGGTTTCAAGGTAGGA
TCTTCTTTCATCTGTGCCATACGCTCAGTAAACTGCTCTGTTGCTCCAGGGTTAGCAAAA
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 8

CO CL812Contig1 634 8 4 U
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AAACATTTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAG
GAGTATACTTGTCCTCTCGCTGTCAGCCCTGCCCCCCGGGCTCCTCCAACTGTTATACTA
TCAGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACAC
GCTCCGAGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATA
TATTATCGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTG
CGTGCTGTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGATACTTGTGTTT
GTCTATGATATATACTAGCTAGTATCTGTTGAAC


BQ
35 35 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 10 10 

AF RR4AG22TF U 4
AF RR4AJ44JQ C 1
AF RR4BK12JQ C 1
AF RR4BK12TF U 1
AF RR4H469TF U 0
AF RR4AJ44TF U 1
AF RR4D573TF U 1
AF RR4D160TF U 4
BS 1 91 RR4BK12TF
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BS 93 631 RR4BK12TF
BS 632 634 RR4D160TF

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GGA
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TTCTTCTTCTCCTGGTGTTTTCGCTTCATATGGATGACGCATTTGGTGCTCAAACTGAAA
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TTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAGGAGTAT
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GCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACACGCTCCG
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CGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTTTCTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTGCGTGCT
GTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGAT

QA 4 587 4 587
DS 

RD RR4AJ44JQ 631 0 0
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AAACATTTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAG
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TCAGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACAC
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GTCTATGATATATACTAGCTAGTATCTGTTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BK12JQ 631 0 0
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TCAGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACAC
GCTCCGAGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATA
TATTATCGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTG
CGTGCTGTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGATACTTGTGTTT
GTCTATGATATATACTAGCTAGTATCTGTTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BK12TF 631 0 0
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AAACATTTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAG
GAGTATACTTGTCCTCTCGCTGTCAGCCCTGCCCCCCGGGCTCCTCCAACTGTTATACTA
TCAGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACAC
GCTCCGAGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATA
TATTATCGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTG
CGTGCTGTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGATACTTGTGTTT
GTCTATGATATATACTAGCTAGTATCTGTTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4H469TF 630 0 0
GGC
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CTATTTCTTCTTCTCCTGGTGTTTTCGCTTCATATGGATGACGCATTTGGTGCTCAAACT
GAAATCCGTAAACTTAAAGAGTCGGTCAAGAAGAGCAGAATTTTGGAAGGAGGTGAAAAC
AGAAGCTCCAAAATGGCGGCTGCAAGGAGTGAAACGAAGCGTTGCAAGGGCCTCGCCAAA
ACATTTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAGGA
GTATACTTGTCCTCTCGCTGTCAGCCCTGCCCCCCGGGCTCCTCCAACTGTTATACTATC
AGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACACGC
TCCGAGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATATA
TTATCGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTGCG
TGCTGTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGATACTTGTGTTTGT
CTATGATATATACTAGCTAGTATCTGT

QA 4 630 4 630
DS 

RD RR4AJ44TF 631 0 0
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ACATAAGCTCCAAAATGGCGGCTGCAAGGAGTGAAACGAAGCGTTGCAAGGGCCTCGCCA
AAACATTTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAG
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TCAGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACAC
GCTCCGAGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATA
TATTATCGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTG
CGTGCTGTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGATACTTGTGTTT
GTCTATGATATATACTAGCTAGTATCTGTTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4D573TF 633 0 0
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ACAGAAGCTCCAAAATGGCGGCTGCAAGGAGTGAAACGAAGCGTTGCAAGGGCCTCGCCA
AAACATTTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAG
GAGTATACTTGTCCTCTCGCTGTCAGCCCTGCCCCCCGGGCTCCTCCAACTGTTATACTA
TCAGTTGCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACAC
GCTCCGAGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATA
TATTATCGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTG
CGTGCTGTGTTGCCATTTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTGATACTTGTGTTT
GTCTATGATATATACTAGCTAGTATCTGTTG
AA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4D160TF 631 0 0
GGA
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TTCTTCTTCTCCTGGTGTTTTCGCTTCATATGGATGACGCATTTGGTGCTCAAACTGAAA
TCCGTAAACTTAAAGAGTCGGTCAAGAAGAGCAGAATTTTGGAAGGAGGTGAAAACAGAA
GCTCCAAAATGGCGGCTGCGAGGAGTGAAACGAAGCGTTGCAAGGGCCTCGCCAAAACAT
TTAAAAACATGGCGACCACTTATCGTCCTGATGGTCAGTTCCGTCCTCTTTCAGGAGTAT
ACTTGTCCTCTCGCTGTCAGCCCTGCCCCCCGGGCTCCTCCAACTGTTATACTATCAGTT
GCGTTACCACCGTACGCTGTCAATCCATCAACGGCTCACCAGATACGTGCACACGCTCCG
AGAACTGTACACGCATATCTGGCAAATGATCAGATCATAAAACTTTAAATTATATATTAT
CGTGTTTTTGGTTTTTGCTTTTT*CTATGGTTCTTCGTTTCATACATATGTTTGCGTGCT
GTGTTGCCATGTATATTTTACATTTATCGGATGTAAAATTTTATACTTGTGTTTGTCTAT
GATATATACTAGCTAGTATCTGTTGAAC

QA 4 631 4 631
DS 



AS 1 8

CO CL813Contig1 627 8 2 U
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ATTGTGAAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAG
AAATCCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGT
TACTGGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTT
CAATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTTC
TCCTTTCAATTTTCTTTTCACATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ20JQ C 365
AF RR4B520JQ C 5
AF RR4B520TF U 14
AF RR4EJ20TF U 1
AF RR4FG57JQ C 66
AF RR4FG57TF U 14
AF RR4AH19JQ C 5
AF RR4AH19TF U 5
BS 1 621 RR4EJ20TF
BS 622 627 RR4AH19JQ

RD RR4EJ20JQ 228 0 0
TGAAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAAT
CCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACT
GGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTCAAT
TCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTA

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR4B520JQ 538 0 0
GG
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GCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGTG
AAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAACTCC
TATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGG
TTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTC
G

QA 3 537 3 537
DS 

RD RR4B520TF 529 0 0
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TATACCGTTCTCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCC
CTGGTGGTAAATTGACATTCCTGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTAAATGTCCCG
TTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTC
GATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGG
CTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGTGAAGAAGG
TCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAACTCCTATTTTC
ACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGGTTGCAGA
ATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTC
G

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4EJ20TF 621 0 0
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GTGCAGCGTCTTGTATACCGTTCTCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGG
ATCCTCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGA
CCTAAATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAG
TACAAGAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTT
TTGTCTGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAG
ATTGTGAAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAG
AAATCCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGT
TACTGGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTT
CAATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTTC
TCCTTTCAATTTTCTTTTCAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4FG57JQ 542 0 0
GCGTCTTGTATACCGTTCTCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCT
CAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTAA
ATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAA
GAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTC
TGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGT
GAAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAATC
CTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTG
GTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTCAATT
CGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTTCTCCTT
CC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4FG57TF 594 0 0
GG
AGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGCAGCGTCTTGTA
TACCGTTCTCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCT
GGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTAAATGTCCCGTT
ACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTCGA
TTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGCT
GTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGTGAAGAAGGTC
TTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAATCCTATTTTCAC
TTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGGTTGCAGAAT
ATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTCAATTCGTTTTTGGT
CTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTTCTCCTT
CC

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR4AH19JQ 623 0 0
GG
GCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGCAG
CGTCTTGTATACCGTTCTCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTC
AAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTAAA
TGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAG
AGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCT
GCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGTG
AAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAATCC
TATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGG
TTGCAGAATATGAGAGAAACATTATATATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTCAATTC
GTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTTCTCCTTT
CAATTTTCTTTTCACATTTCT

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR4AH19TF 623 0 0
GG
GCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGCAG
CGTCTTGTATACCGTTCTCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTC
AAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTAAA
TGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAG
AGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCT
GCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGTG
AAGAAGGTCTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAATCC
TATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGG
TTGCAGAATATGAGAGAAACATTATATATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTCAATTC
GTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTTCTCCTTT
CAATTTTCTTTTCAC
ATTTCT

QA 3 617 3 617
DS 



AS 1 8

CO CL814Contig1 1031 8 7 U
AAAAGGAATACAGCCACACATATATAGCATAGCAAGGTTTACACACTTTTGTGTTCATCA
CATAAATGAGAGAAAAATACCAACAAAATCAACAAACCAGATGATACCAAAGATTTTAGT
GCATAAACCAGAGTACTAATACTTGCAAAGCAACCCCATAACTGAAGAAAATAGCTGAAC
AATAGTAACAACAACACTTTGACACACGATATGAAGATATTGGTTTGAATTTTCTCAATG
TTGGGGATAACCGGGAGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAGA
TGCAGGAGGGTAGCCGACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGG
TGGAACGCCCATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTG
TTGAGTCTGCATACACGCGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTAT
CTGAGAAGCTTCAGAAAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCA
AGCGACTTGGCTTAGGCAGAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTG
GATGTTGAATTCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAG
GAAAACCTCAGTAGCAAGGCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACA
GGGCATGTATCCAGCACAGCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCG
AAGCAAGTAAGAAACACACGGTACACAGACACACGACAAGCAACAATAGGGAGTGTCGGC
GGTGACGGTTCCCATGAGATCAGAGTGCCATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTCAT
CTTCTCGGCCTTATCCGCCATTTCTTTGAATTGAAACTGCAAACTTGTCTGTCGTCTTCT
GACTCTTCTCCCTCACTCCCTCTTCTCTCTCTCTCTTTTTAATTCTTTTCTTTTCAACGA
AGAAACTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ83JQ U 6
AF RR4FL35JQ U 10
AF RR4GX20JQ U 1
AF RR4EX59JQ U 40
AF RR4EX59TF C 247
AF RR4GX20TF C 256
AF RR4DZ83TF C 318
AF RR4FL35TF C 319
BS 1 561 RR4GX20JQ
BS 562 562 RR4DZ83JQ
BS 563 683 RR4GX20JQ
BS 684 825 RR4EX59JQ
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BS 967 1000 RR4DZ83TF
BS 1001 1031 RR4FL35TF

RD RR4DZ83JQ 631 0 0
GAAT
ACAGCCACACATATATAGCATAGCAAGGTTTACACACTTTTGTGTTCATCACATAAATGA
GAGAAAAATACCAACAAAATCAACAAACCAGATGATACCAAAGATTTTAGTGCATAAACC
AAA**ACTAATACTTGCAAAGCAACCCCATAACTGAAGAAAATAGCTGAACAATAGTAAC
AACAACACTTTGACACACGATATGAAGATATTGGTTTGAATTTTCTCAATGTTGGGGATA
ACCGGGAGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAAATGCAGGAGG
GTAGCCGACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCC
CATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTG
CATACACGCGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGGGTATCTGAAAAGC
TTCAAAAAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGACTTG
GCTTAGGCAGAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAA
TTCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGA

QA 5 631 5 631
DS 

RD RR4FL35JQ 650 0 0
ACAGCCACACATATATAGCATAGCAAGGTTTACACAATTTTGTGTTCATCACATAAATGA
GAGAAAAATACCAACAAAATCAACAAACCAGATGATACCAAAGATTTTAGTGCATAAACC
AGAGTACTAATACTTGCAAAGCAACCCCATAACTGAAGAAAATAGCTGAACAATAGTAAC
AACAACACTTTGACACACGATATGAAGATATTGGTTTGAATTTTCTCAATGTTGGGGATA
ACCGGGAGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAGATGCAGGAGG
GTAGCCGACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCC
CATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTG
CATACACGCGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTATCTGAGAAGC
TTCAGAAAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGACTTG
GTTTAGGCAGAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAA
TTCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4GX20JQ 683 0 0
AAAAGGAATACAGCCACACATATATAGCATAGCAAGGTTTACACACTTTTGTGTTCATCA
CATAAATGAGAGAAAAATACCAACAAAATCAACAAACCAGATGATACCAAAGATTTTAGT
GCATAAACCAGAGTACTAATACTTGCAAAGCAACCCCATAACTGAAGAAAATAGCTGAAC
AATAGTAACAACAACACTTTGACACACGATATGAAGATATTGGTTTGAATTTTCTCAATG
TTGGGGATAACCGGGAGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAGA
TGCAGGAGGGTAGCCGACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGG
TGGAACGCCCATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTG
TTGAGTCTGCATACACGCGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTAT
CTGAGAAGCTTCAGAAAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCA
AGCGACTTGGCTTAGGCAGAA*ATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTG
GATGTTGAATTCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAG
GAAAACCTCAGTAGCAAGGCAGA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4EX59JQ 786 0 0
CATACAC
TTTTGTGTTCATCACATAAATGAGAGAAAAATACCAACAAAATCAACAAACCAGATGATA
CCAAAGATTTTAGTGCATAAACCAGAGTACTAATACTTGCAAAGCAACCCCATAACTGAA
GAAAATAGCTGAACAATAGTAACAACAACACTTTGACACACGATATGAAGATATTGGCTT
GAATTTTCTCAATGTTGGGGATAACCGGGAGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGA
GCCGGTGGGTAAGATGCAGGAGGGTAGCCGACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGAC
ATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCCCATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCC
ATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTGCATACACGCGCAAACCGTGCAGTAAACCATATCGGCA
CAGCAAGAGAGTATCTGAAAAGCTTCAGAAAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACA
ATAGAGAAAATGCAAGCGACTTGGCTTAGGCAGAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCG
CATTTTGTAGTCTGGATGTTGAATTCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAG
TTTCCGAAACAGAGGAAAACCTCAGTAGCAAGGCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCA
CACCTCCCACTACAGGGCATGTATCCAGCACAGCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAA
AGTGCTCTTCTCCGAAGCAAGTAAGAAACACACGGTACACAGACACACGACAAGCAACA

QA 8 786 8 786
DS 

RD RR4EX59TF 722 0 0
ATAACCGGGAGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAGATGCAGG
AGGGTAGCCGACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAAC
GCCCATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGT
CTGCATACACGCGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTATCTGAGA
AGCTTCAGAAAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGAC
TTGGCTTAGGCAGAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTT
GAATTCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAGGAAAAC
CTCAGTAGCAAGGCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACAGGGCAT
GTATCCAGCACAGCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCGAAGCAA
GTAAGAAACACACGGTACACAGACACACGACAAGCAACAATAGGGAGTGTCGGCGGTGAC
GGTTCCCATGAGATCAGAGTGCCATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTCATCTTCTC
GGCCTTATCCGCCATTTCTTTGAATTGAAACTGCAAACTTGTCTGTCGTCTTCTGACTCT
CC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GX20TF 717 0 0
AGGCGGGTAAGGTGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGG*TAAGATGCAGGAGGGTAGCC
GACTGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCCCATTGG
CTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTGCATACA
CGCGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTATCTGAGAAGCTTCAGA
AAGTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGACTTGGCTTAG
GCAGAA*ATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAATTCATC
CTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAGGAAAACCTCAGTAGC
AAGGCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACAGGGCATGTATCCAGC
ACAGCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCGAAGCAAGTAAGAAAC
ACACGGTCCACAGACACACGACAAGCAACAATAGGGAGTGTCGGCGGTGACGGTTCCCAT
GAGATCAGAGTGCCATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTCATCTTCTCGGCCTTATC
CGCCATTTCTTTGAATTGAAACTGCAAACTTGTCTGTCGTCTTCTGACTCT
TCTCCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DZ83TF 685 0 0
CTGGAGGGGCAGGTTGGTCAGAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCCCATTGGCT
GAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTGCATACACG
CGCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGGGTATCTGAGAAGCTTCAGAAA
GTTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGACTTGGCTTAGGC
AGAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAATTCATCCT
GGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGGCACAGAGTTTCCGAAACAGAGGAAAACCTCAGTAGCAA
GGCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACAGGGCATGTATCCAGCAC
AGCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCGAAGCAAGTAAGAAACAC
ACGGTCCACAGACACACGACAAGCAACAATAGGGAGTGTCGGCGGTGACGGTTCCCATGA
GATCAGAGTGCCATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTCATCTTCTCGGCCTTATCCG
CCATTTCTTTGAATTGAAACTGCAAACTTATCTGTCGTCTTCTGACTCTTCTCCCTCACT
CCCTCTTCTCTCTCTCTCTTTTT
CC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4FL35TF 713 0 0
TGGAGGGGCAGGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCCCATTGGCTG
AGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTGCATACACGC
GCAAACCGTGCAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTATCTGAGAAGCTTCAGAAAG
TTCCTCGCTACCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGACTTGGTTTAGGCA
GAACATAAATCCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAATTCATCCTG
GAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAGGAAAACCTCAGTAGCAAG
GCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACAGGGCATGTATCCAGCACA
GCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCGAAGCAAGTAAGAAACACA
CGGTCCACAGACACACGACAAGCAACAATAGGGAGTGTCGGCGGTGACGGTTCCCATGAG
ATCAGAGTGCCATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTAATCTTCTCGGCCTTATCCGC
CATTTCTTTGAATTGAAACTGCAAACTTGTCTGTCGTCTTCTGACTCTTCTCCCTCACTC
CCTCTTCTCTCTCTCTCTTTTTAATTCTTTTCTTTTCAACGAAGAAACTTCCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 8

CO CL815Contig1 831 8 4 U
GCTCTCTCATTTCTCTCTCTGCTCGGGAACAGACATAAGCTTCGCCAATGGCTTCTTCCG
CTTTGTCACTCTCGTGGAGCTCCTCGCTTTGTTCGTCTCACACC*TTCAATGTCGTCGGA
AATGAAACCCTAAAAATATCCCAGCGAAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAA
GCCAAGAAACTCCGCAAGGTAATCTTGAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGGAAGCAAGGG
CAATTACTGGACGTGAAAGCTGGATTCTTCAGAAACTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCT
CAGCTCATGACTCCGCTTCTGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCA
GAAAAGCAAAGGGTGAAAGAAAAGGCACTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGG
GCTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCA
CAAGACCTCGTTGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTC
TCTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGGAGAATACATAACCGAACTCAAACTTCACCCTGAT
GTCACTGCTCGAGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTA
CTGCTGCATCCCAAGGTTGCAGGAACATAGAGAAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCA
AGTTTGTGAAGTTTTTTCTTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAA
AGAATATTTTGGAATCTTGGAAATGTTATAATATTTTCATCAAGTTATTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM69TF U 95
AF RR4AR35TF U 1
AF RR4AR47TF U 1
AF RR4AC61JQ C 17
AF RR4AR35JQ C 122
AF RR4AR47JQ C 128
AF RR4BM69JQ C 122
AF RR4AC61TF U 17
BS 1 669 RR4AR35TF
BS 670 678 RR4AR47TF
BS 679 824 RR4AC61TF
BS 825 831 RR4AC61JQ

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ATGTGTCGG

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR4AR35TF 669 0 0
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CTTTGTCACTCTCGTGGAGCTCCTCGCTTTGTTCGTCTCACACC*TTCAATGTCGTCGGA
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GCTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCA
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CTGCTGCAT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4AR47TF 678 0 0
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CTTTGTCACTCTCGTGGAGCTCCTCGCTTTGTTCGTCTCACACC*TTCAATGTCGTCGGA
AATGAAACCCTAAAAATATCCCAGCGAAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAA
GCCAAGAAACTCCGCAAGGTAATCTTGAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGGAAGCAAGGG
CAATTACTGGACGTGAAAGCTGGATTCTTCAGAAACTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCT
CAGCTCATGACTCCGCTTCTGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCA
GAAAAGCAAAGGGTGAAAGAAAAGGCACTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGG
GCTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCA
CAAGACCTCGTTGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTC
TCTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGGAGAATACATAACCGAACTCAAACTTCACCCTGAT
GTCACTGCTCGAGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTA
CTGCTGCATCCCAAGGTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4AC61JQ 815 0 0
GG
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ACGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTCGTTGACATC
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CTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGTT
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GGAAATGTTATAATATTTTCATCAAGTTATTAT

QA 3 815 3 815
DS 

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CTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCAC
AAGACCTCGTTGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCT
TTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGGAGAATACATAACCGAACTCAAACTTCACCCTGATG
TCACTGCTCGAGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTAC
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GTTTGTGAAGTTTTTTCTTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAA
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DS 

RD RR4AR47JQ 697 0 0
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TGGACGTGAAAGCTGGATTCTTCAGAAACTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCTCAGCTCA
TGACTCCGCTTCTGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGC
AAAGGGTGAAAGAAAAGGCACTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGGGCTTTCA
AGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACC
TCGTTGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTTTCTTC
CGGAGATCCGTGAAACCGGAGAATACATAACCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTG
CTCGAGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGC
ATCCCAAGGTTGCAGGAACATAGAGAAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCAAGTTTGT
GAAGTTTTTTCTTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATAT
TTTGGAATCTTGGAAATGTTATAATATTTTCATCAAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4BM69JQ 710 0 0
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CCAAGAAACTCCGCAAGGTAATCTTGAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGGAAGCAAGGGC
AATTACTGGACGTGAAAGCTGGATTCTTCAGAAACTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCTC
AGCTCATGACTCCGCTTCTGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAG
AAAAGCAAAGGGTGAAAGAAGAGGCGCTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGGG
CTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCAC
AAGACCTCGTTGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCT
CTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGGAGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATG
TCACTGCTCGAGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTAC
TGCTGCATCCCAAGGTTGCAGGAACATAGAGAAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCAA
GTTTGTGAAGTTTTTTCTTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAA
GAATATTTTGGAATCTTGGAAATGTTATAATATTTTCATCAAG
TTATTAC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4AC61TF 813 0 0
GG
CTGCTCGGGAACAGACATAAGCTTCGCCAATGGCTTCTTCCGCTTTGTCACTCTCGTGGA
GCTCCTCGCTTTGTTCGTCTCACACC*TTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAATA
TCCCAGCGAAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACTCCGCAAG
GTAATCTTGAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGGAAGCAAGGACAATTACTGGACGTGAAA
GCTGGATTCTTCAGAAACTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCTCAGCTCATGACTCCGCTT
CTGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGCAAAGGGTGAAA
GAAGAGGCGCTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGTTAAACGC
ACGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTCGTTGACATC
ATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGAGATCCGT
GAAACCGGAGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCGAGTTAGG
CTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGTT
GCAGGAACATAGAGAAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTC
TTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATATTTTGGAATCTT
GGAAATGTTATAATATTTTCATCAAG
TTATT

QA 3 808 3 808
DS 



AS 1 7

CO CL816Contig1 1041 7 38 U
GGAATCAAGATCTCCAGAAAGAATCTCCGTCTTTGTTTCGCCAGATTCTCTCTCAGGTAA
GAAGTTGAATTGAGATTCAAAATATGAGACCCGTACTCGCCTTCTAATGTCACTGTTTCG
GATCTTCATTAATCAGGACGACGACGATATGGCTACTTCGAAGAAAGTGATAACGCGTGA
AGAGTGGGAGAAGAAGCTAAACGCTGTAAAGCTTAGGAAAGAAGACATGAACACTCTCGT
CATGAACTTTCTCGTCACCGAGGGTTATGTTGAAGCTGCTGACAAGTTCCAAAGGGAGTC
TGACACCAAACCAGAGATAGATCTTGCCACCATCACTGATCGAATGGCTGTTAAAAAGGC
TGTTCAAAACGGCAATGTAGAGGATGCTATTGAAAAAGTTAATGACTTGAATCCTGAGAT
ACTAGACACAAACCCCGAGCTCTTCTTTCATCTTCAGCAGCAAAGGTTGAGGGAACTTAT
TCGACAAGGCAAGACCGAAGAAGCCTTGGAGTTTGCTCAGGAGGAACTTGCTCCACGTGG
CGAGGAAAACCAAGCGTTTCTGCAAGAACTGGAAAAAACTGTAGCGCTGCTTGTTTTTGA
AGATGCCTCTAACTGTCCTGTTAAAGATCTTCTCGACATCTCCCACCGTCTTAAGACTGC
AAGTGAAGTGAACGCAGCAATTCTTACAAGCCAGAGTCATGAAAAAGATCCCAAACTTCC
AAGCTTGTTGAAGATGCTGGTTTGGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGAAAGCAGTGTATCC
GCACATCAATGATCTGTCTACTGCCCAGCTCCAAGACCCGTCTGAATAATTTTGTACCTG
CTAAAGGGAACAACAATCAAATGATATGCCCTCTCTCCCATTTCAATTTCAATAAGTCAA
GCTTCATTTTGTTTTAGCGAATGTTTTCTTCTTTCCCTTTTTCTTCTGCATTGGATGGAG
TTGTTTATGATATGTGCAAGGGAACATAAAGCTGTTTCTAGGCAATGAATTACGCTCTAG
TCAAATGTTGTGATGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 

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CGAAGAAAATCAAGCGTTTCTGCAAGAACTGGAAAAAACTGTAGCTCTGCTTGTTTTTGA
AGATGCCTCTAACTGTCCTGTTAAAGATCTTCTCGACATCTCCCACCGTCTTAAGACTGC
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GCACATCAATGATTTGTCTACTG

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DS 

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GATCTTGCCACCATCACTGATCGAATGGCTGTTAAAAAGGCTGTTCAAAACGGCAATGTC
GAGGATGCTATTGAAAAAGTTAATGACTTGAATCCTGAGATACTAGACACAAATCCCGAG
CTCTTCTTTCATCTTCAGCAGCAAAGGTTGATTGAACTTATTCGACAAGGCAAGACCGAA
GAAGCCTTGGAGTTTGCTCAGGAGGAACTTGCTCCACGTGGCGAGGAAAACCAAGCGTTT
CTGCAAGAACTGGAAAAAACTGTAGCGCTGCTTGTTTTTGAAGATGCCTCTAACTGTCCT
GTTAAAGATCTTCTCGACATCTCCCACCGTCTTAAGACTGCAAGTGAAGTGAACGCAGCA
ATTCTTACAAGCCAGAGTCATGAAAAAGATCCCAAACTTCCAAGCTTGTTGAAGATGCTG
GTTTGGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGAAAGCAGTGTATCCGCACATCAATGATCTGTCT
ACTGCCCAGCTCCAAGACCCGTCTGAATAATTTTGTACCTGCTAAAGGGAACAACAATCA
AATGATATGCCCTCTCTCCCATTTCAATTTCAATAAGTCAAGCTTCATTTTGTTTTAGCG
AATGCTTTCTTCTTTCCCTTTTC**TCTGCATTGGATGGAGT
GTTTAGATATG

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DS 

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G
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CCCAAACTTCCAAGCTTGTTGAAGATGCTGGTTTGGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGAAA
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QA 1 572 1 572
DS 

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CCCAAACTTCCAAGCTTGTTGAAGATGCTGGTTTGGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGAAA
GCAGTGTATCCGCACATCAATGATCTGTCTACTGCCCAGCTCCAAGACCCGTCTGAATAA
TTTTGTACCTGCTAAAGGGAACAACAATCAAATGATATGCCCTCTCTCCCATTTCAATTT
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ATTGGATGGAGTTGTTTATGATATGTGCAAGGGAACATAAAGCTGTTTCTAGGCAATGAA
TTACGCTCTAGTCAAATGTTGTGATGATTGTC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 7

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TCAGATCAGACCTATGGTGAAGCTTGGTTGCCTTGGCTTGTGTGGACAAAAAGTTGACGC
AATTGAACATTACATGGCTGAAGTTGATAAAACATCAAAAGAGATTGCTGAAGAAAGGGT
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TTGGGCTGCTGCTGTCTGCGCCCAGACCACACAGACTCGAAACCCAACCGAATGGTTAAC
TGAATGGGCCCCAGAGCCACGTGATGTGTTTTGGGCAAACCTTGCAGTTCCATATGTTTC
TTTGACTATAAGAAGATTAGCCATGAGTGTAGCCTTCTTCTTCCTCACCTTCTTTTTCAT
CGTCCCTATTGCATTTGTACAAACTCTTGCTACCATTGAGGGAATTGAGAAAGTTGCTCC
CTTCTTGAAAGTCATTATCGAACGTGATTTCATTAAAGCGTTGATAACAGGTTTGCTATC
TGGTATTGTGCTGAAGCTTTTCCTCATCTTTCTGCCATCCATACTGATGACCATGTCCAA
GTTTGAAGGCTTTACAGCGATTTCATTGCTGGAAAGACGATCAGCGTCTAGATATTACAT
ATTCAACTTGGTGAACGTCTTTCTTGCAAACGTTATCACTGGAGCTGCGTTTGAGCAGCT
CAGCTCTTTCCTCAACCAGTCGCCAAATCAGATTCCTCAGACCATTGGTGTGGCGATACC
GATGAAAGCAACCTTCTTTATCACATATATAATGGTTGATGGGTGGGCAGGAATTGCAGG
AGAGATTCTCATGTTGAAACCTCTCATCATATACCATCTCAAAAACGCTTTCTTGGTGAA
AACGGAGAAAGACAGAGAGGAAGCAATGGACCCGGGAAGCATCGGTTTCAACACGGGAGA
GCCTCAGATACAGCTCTACTTCCTTCTCGGTCTTGTCTACGCTCCTGTGACACCAATGCT
TCTTCCTTTCATCTTAGTCTTCTTTGCACTTGCTTACATTGTCTACCGTCACCAGATCAT
AAATGTGTATAATCAAGAGTATGAGAGCGCTGCTGCGTTTTGGCCAGATTTTCATGGACG
TATTATAACGGCACTGATCATATCTCAGTTGCTTCTGATGGGTTTGTTGGTTACAAAGCG
TGCTGCTATGGCTGCACCCTTTATCATCGCTCTTCCAGTCATCACCATCGGTTTCCACCG
CTTCTGTAAAGGCCGTTATGAGCCCGCCTTCGTCCGTTACCCCTTGCAGGAGGCTATGAT
GAAAGATACGTTGGAAAGAGCAAAAGAGCCGAACCTGAACCTGAAAGGCTACCTGCAAGA
AGCTTATGTTCATCCTGTTTTCAAAGGATGTGATGGTGATGATGATGACGACCACAGTGT
GCTTGGGAAGTTGGAGAGTGAAGTCATCATAGTGCCAACAAAGCGCCAGTCCCGGAGGAA
CACTCCGGCTCCAAGCAGGATCAGCGGCGAGTCTTCACCGTCTTTAGCCTTAGCCGTTAT
TAACGGTAAAGAAGTCTAGTCAAGGATTTGTATAAAACAGCTTATATGCATACTAAAAAA
GTATGAACATGGTGTGACATGTGTGGTACATATAAGCCTACTTTTATATGTACATAGAGA
ACGTTTGGTCATTGCTTGATATAGGTTTGTGTTTGCTGAGACGTTGATGTGTTTTCATGT
TTTATAATCAAAATTTCCATGGCTTTTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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TGGTATTGTGCTGAAGCTTTTCCTCATCTTTCTGCCATCCATACTGATGACCATGTCCAA
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ATTCAACTTGGTGAACGTCTTTCTTGCAA*CGTTATCACTGGAGCTGCGTTTGAGCAGCT
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G
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TGGGTGGGCAGGAATTGCAGGAGAGATTCTCATGTTGAAACCTCTCATCATATACCATCT
CAAAAACGCTTTCTTGGTGAAAACGGAGAAAGACAGAGAGGAAGCAATGGACCCGGGAAG
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C*CTCCTGTGACACCAATGCTTCTTCCTTTCATCTTAGTCTTCTTTGCACTTGCTTACAT
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G

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TTTTTTT
C

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ATCAAAATTTC
GATGGCT

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ACGTTGGAAAGAGCAAAAGAGCCGAACCTGAACCTGAAAGGCTACCTGCAAGAAGCTTAT
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AAGTTGGAGAGTGAAGTCATCATAGTGCCAACAAAGCGCCAGTCCCGGAGGAACACTCCG
GCTCCAAGCAGGATCAGCGGCGAGTCTTCACCGTCTTTAGCCTTAGCCGTTATTAACGGT
AAAGAAGTCTAGTCAAGGATTTGTATAAAACAGCTTATATGCATACTAAAAAAGTATGAA
CATGGTGTGACATGTGTGGTACATATAAGCCTACTTTTATATGTACATAGAGAACGTTTG
GTCATTGCTTGATATAGGTTTGTGTTTGCTGAGACGTTGATGTGTTTTCATGTTTTATAA
TCAAAATTTCGATGGCTTTTTTTTTCC

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DS 



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CCCATACGTGGGAGGAAACGCAAAGGCTCCAACAAAAGATTGTTGTGGAGGATTTGATCA
GGTGATAACAAAGAGTGAGAAGTGTGTTTGCATTTTGGTCAAAGACAAAGATGATCCTAA
TCTTGGCCTAAAGTTTAACGCAACACTAGCCGCTCATATTCCCACCCTTTGTCATATTAC
GGCTCCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTACATTTATCTCCAAACTCAACATTGGC
TAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAAAGACCAACTCCACATCTCC
TTCCCCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAGCTGAACAAGTAAAGAGTACTGG
AGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGGCTCTGTTCTCTCATCTTCT
TTTCATTATCTCTTCCCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAATGTTCTTTTGCTTTGAATAT
GCTATATAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGCAA
ATGATTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAATATTTAATCGGTATTGAAATTTTAAT
AATGAAAGCGTAGCTTTAAATCTTGTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CE55JQ C 342
AF RR4GL48TF U 40
AF RR4CE55TF U 1
AF RR4H937TF U 40
AF RR4H937JQB C 40
AF RR4BW04JQ C 215
AF RR4BW04TF U 215
BS 1 522 RR4CE55TF
BS 523 523 RR4GL48TF
BS 524 617 RR4CE55TF
BS 618 618 RR4GL48TF
BS 619 630 RR4CE55TF
BS 631 631 RR4GL48TF
BS 632 633 RR4CE55TF
BS 634 634 RR4GL48TF
BS 635 635 RR4H937TF
BS 636 656 RR4CE55TF
BS 657 657 RR4H937TF
BS 658 672 RR4CE55TF
BS 673 673 RR4H937TF
BS 674 676 RR4CE55TF
BS 677 677 RR4H937TF
BS 678 680 RR4CE55TF
BS 681 681 RR4H937TF
BS 682 687 RR4CE55TF
BS 688 688 RR4H937TF
BS 689 696 RR4CE55TF
BS 697 697 RR4H937TF
BS 698 720 RR4CE55TF
BS 721 721 RR4H937TF
BS 722 725 RR4CE55TF
BS 726 726 RR4H937TF
BS 727 746 RR4CE55TF
BS 747 758 RR4H937TF
BS 759 810 RR4BW04TF

RD RR4CE55JQ 248 0 0
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CTCTGTTC

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DS 

RD RR4GL48TF 595 0 0
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CTCCAAACTCAACATTGGCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAA
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AACAAGTAAAGAGTACTGGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGG
CTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTCATTATCTCTTCCCCAGTATCTTCCTCCTTT

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR4CE55TF 755 0 0
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TCTTGGCCTAAAGTTTAACGCAACACTAGCCGCTCATATTCCCACCCTTTGTCATATTAC
GGCTCCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTACATTTATCTCCAAACTCAACATTGGC
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GCTATATAGTTT*ATA*TGT*CTCAGT*ACATCTAA*TTTATATATGCATGTGCATGCAA
*TGAT*ATGTATGCATGAGAGTGCAA
CTGTATATT

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DS 

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GG
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CCACCCTTTGTCATATTACGGCTCCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTACATTTAT
CTCCAAACTCAACATTGGCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAA
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AACAAGTAAAGAGTACTGGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGG
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GG
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TGGTAGGGTTTGGAAGCTCAGATCTGGATCAAGACAGAGAAGAGTGTACGGACCAGTTGA
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CTCCAAACTCAACATTGGCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAA
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AACAAGTAAAGAGTACTGGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGG
CTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTCATTATCTCTTCCCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAAT
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G

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G
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TATTGGCTCTGTTCTTTCATCTTCTTTTCATTATCTCTTCCCCAGTATCTTCCTCCTTTA
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G
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ATATTCCCACCCTTTGTCATATTACGGCTCCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTAC
ATTTATCTCCAAACTCAACATTGGCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATG
AAGGAAAGACCAACTCCACATCTCCTTCCCCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAA
AAGCTGAACAAGTAAAGAGTACTGGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAA
TATTGGCTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTCATTATCTCTTCCCCAGTATCTTCCTCCTTTA
TTTAATGTTCTTTTGCTTTGAATATGCTATATAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTA
AATTTATATATGCATGTGCATGCAAATGATTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAAT
ATTTAATCGGTATTGAAATTTTAATAATGAAAGCGTAGCTTTAAATCTTGTTGAC

QA 2 596 2 596
DS 



AS 1 8

CO CL819Contig1 568 8 22 U
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TTTTTTTCAA*******GAAGAATCTAAATGGCGGGAGTTGGAACATCGATGCTCGGATC
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ACTATGAAATTTAGAATTTTCCCCAACT


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 10 

AF RR4GB26JQ C 1
AF RR4GB26TF U 1
AF RR4A005JQ C 6
AF RR4A005JQD C 6
AF RR4A005TF U 8
AF RR4A005TFB U 6
AF RR4EW53TF U 6
AF RR4EW53JQ C 123
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BS 151 151 RR4A005TF
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BS 185 195 RR4GB26TF
BS 196 196 RR4A005TF
BS 197 219 RR4GB26TF
BS 220 220 RR4A005TF
BS 221 292 RR4GB26TF
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BS 352 352 RR4A005TF
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RD RR4GB26JQ 563 0 0
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TTTTTTTCAA*******G***AATCTAAATGGCGGGAGTTGGAACATCGATGCTCGGATC
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T

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RD RR4GB26TF 563 0 0
TTTTT
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T

QA 6 562 6 562
DS 

RD RR4A005JQ 562 0 0
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RD RR4A005JQD 562 0 0
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TCTTGTTCTCTGCTGGGCTGTTTTACGAGATGAACAAGATCTCAGGATACATGCTCTCCA
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GAAATTTAGAATTTTCCCCAAC

QA 1 562 1 562
DS 

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AATTTAGAATTTTCCCCAAC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4A005TFB 562 0 0
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GAAATTTAGAATTTTCCCCAAC

QA 1 562 1 562
DS 

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GG
GCGGTGCTGAGGAAGTGACGAGAAGAGAGAGGGGGTTTCTCGATCTGCTAGGGTTTTTTT
CAAGTTAAAAGAAGAATCTAAATGGCGGGAGTTGGAACATCGATGCTCGGATCTATTCTT
CTCTTCACAGTGGTGCTCTCGCTGCAAGAAGTGTACCGAGGGAAACTAGCTTCTTCTGAG
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QA 3 562 3 562
DS 

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TTGAGCTGTTCACGATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCTCTCCTCTTTTTTTTCTCTCTCA
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QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 7

CO CL820Contig1 1611 7 14 U
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AAGCTTTGAAAACCGCTAGCTTTAGTCCTATGTCAGTTTTATCCGACAAAAGATCAGAAC
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AAAGCTCTTCCTGCACCTGCAGCAGTTGCAGCAGAAGCACCTACTACAACCACGGTCGAG
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GCGTACCCTGACTTGAAGCCTCCAACATCTCCTACACCATCGCAGCCCTGAAGAGCCCGT
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TTTTTTTTT*ATCTTCGAGGACTTAGATGCTACCTTCTTTCGAATCTGGGTTAAGTTTAA
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BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GE06TF U 4
AF RR4BG73TF U 1
AF RR4G542TF U 264
AF RR4CQ43TF U 663
AF RR4BG73JQ C 801
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AF RR4G542JQ C 1118
BS 1 814 RR4BG73TF
BS 815 815 RR4G542TF
BS 816 880 RR4BG73TF
BS 881 970 RR4G542TF
BS 971 971 RR4CQ43TF
BS 972 993 RR4G542TF
BS 994 1363 RR4CQ43TF
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BS 1365 1372 RR4CQ43TF
BS 1373 1373 RR4BG73JQ
BS 1374 1400 RR4CQ43TF
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GG
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AGCTTCTTAAGGAGCTTCAACGGCGGATTAGCTCTTCTAACCTCTGTTCTAATCAGTGCC
ACAGCTCCTGCAAAGTCCCTGACCTACGAGGAAGCCCTGCAACAATCCGTGACCTCTCCT
TCATCTTTTGATTCAGACGGTTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACTGACAATCCT
CTGGTGATCGCCGGTGGAGTTGCTGCATTTGCCGTCCCTTTTGTTCTCTCTCAGGTTCTG
AACAAGAAGCCCAAATCTTTTGGAGTTGAGTCTGCTAAGAATGCTTATACCAAGTTTGGG
CACTGATGAAAATGCTCAGTTGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGACAAGTGGG
CACTCCTAATGTCAAGGGTCTAGGTAAAAAGACAGTTTCGGTTGTTTATAACGGAGAAGA
CAAGGATGGTTTCTTGAAGAAGCTTTCCTTGAAGTTTAAAGATCCTGAGAACACCACATT
GTTCATTCTTGACAAGTTTGATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGAATTGGTGACCCTTAA
TGGA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4BG73TF 880 0 0
GGGATGATACAGAGAGGACAACTCTTGGTGTAGAAGGCGAGAGAGAGATAAGAGCCATGG
AAGCTTTGAAAACCGCTAGCTTTAGTCCTATGTCAGTTTTATCCGACAAAAGATCAGAAC
CACGAAGACCCTTCTCGCTGCCTAGCCTCTTTCCACCGAAAACACCTAAACCAACCTCCC
AAGAAAGCTTCTTAAGGAGCTTCAACGGCGGATTAGCTCTTCTAACCTCTGTTCTAAGCA
GTGCCACAGCTCCTGCAAAGTCCCTGACCTACGAGGAAGCCCTGCAACAATCCGTGACCT
CTCCTTCATCTTTTGATTCAGACGGTTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACTGACA
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T*GGGCACTGATGAAAATGCTCAGTTGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGACAA
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ACATTGTTCATTCTTGACAAGTTTGATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGAATTGGTGACC
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QA 1 880 1 880
DS 

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GG
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TTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACTGACAATCCTCTGGTGATCGCCGGTGGAGT
TGCTGCATTTGCCGTCCCTTTTGTTCTCTCTCAGGTTCTGAACAAGAAGCCCAAACCTTT
TGGAGTTGAGTCTGCTAAGAATGCTTATACCAAGTT*GGGCACTGATGAAAATGCTCAGT
TGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGACAAGTGGGCACTCCTAATGTCAAGGGTC
TAGGTAAAAAGACAGTTTCGGTTGTTTATAACGGAGAAGACAAGGATGGTTTCTTGAAGA
AGCTTTCCTTGAAGTTTAAAGATCCTGAGAACACCACATTGTTCATTCTTGACAAGTTTG
ATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGAATTGGTGACCCTTAATGGATTCAAAACTGCTTACG
CTATCAAAGATGGTGCAGAGGGACCTAGAGGCTGGTTGAATAGCGATTTGCCTTGGATAG
AGCCAAAGAAGACTCTCAGTCTTGATTTGAGCAGTTTGGCTGATAGTATCAGCGGTGTAT
TTGGCGAGAGTGCTGATGGTGTCTCTGTTGCAATTGGAGTAGCTGCTGCTGCTGGATTAA
GTGCTTTAGCATTTACTGAGATTGAAACCATACTCCAACTACTAG*CTCAGCTGCACTTG
TTCAGCTT

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR4CQ43TF 757 0 0
G
TTGTTCATTCTTGACAAGTTTGATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGAATTGGTGACCCTT
AATGGATTCAAAACTGCTTACGCTATCAAAGATGGTGCAGAGGGACCTAGAGGCTGGTTG
AATAGCGATTTGCCTTGGATAGAGCCAAAGAAGACTCTCGGTCTTGATTTGAGCAGTTTG
GCTGATAGTATCAGCGGT*TATTTGGCGAGAGTGCTGATGGTGTCTCTGTTGCAATTGGA
GTAGCTGCTGCTGCTGGATTAAGTGCTTTAGCATTTACTGAGATTGAAACCATACTCCAA
CTACTAGGCTCAGCTGCACTTGTTCAGCTTGCAGGCAAGAAACTTCCATTTGCTGAGGAC
CGAAAGCAAACTCTAAAACAAGTGGATGAGTTCTTGAACACAAAGATTGCACCTAAAGAA
CTTGTTGATGAATTAAAGGACATAGGAAAGGCTCTTCTTCCTCCATCAACAAGCAGCAAA
GCTCTTCCTGCACCTGCAGCAGTTGCAGCAGAAGCACCTACTACAACCACGGTCGAGAAA
CCAGAACCTGAGCCAGTAATCAAAGCCGCCACTGCACAGGTAAACTCAGAGACAGCCGCC
ACTGCACAAGCAGTCTCGGAGCCAACGGCTGAAGCGGCCACTGCACAAGTAATCACAGAA
CCAACCAAGACAGAAGACAAACCAAAATCTTATTCAAGAC*ACTCTCAC*ATATGCAGCG
TACCCTGACTTGAAGCC
CCACATCTCTACACCATCG

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4BG73JQ 811 0 0
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TGTATTTGGCGAGAGTGCTGATGGTGTCTCTGTTGCAATTGGAGTAGCTGCTGCTGCTGG
ATTAAGTGCTTTAGCATTTACTGAGATTGAAACCATACTCCAACTACTAGGCTCAGCTGC
ACTTGTTCAGCTTGCAGGCAAGAAACTTCTATTTGCTGAGGACCGAAAGCAAACTCTAAA
ACAAGTGGATGAGTTCTTGAACACAAAGATTGCACCTAAAGAACTTGTTGATGAATTAAA
GGACATAGGAAAGGCTCTTCTTCCTCCATCAACAAGCAGCAAAGCTCTTCCTGCACCTGC
AGCAGTTGCAGCAGAAGCACCTACTACAACCACGGTCGAGAAACCAGAACCTGAGCCAGT
AATCAAAGCCGCCACTGCACAGGTAAACTCAGAGACAGCCGCCACTGCACAAGCAATCTC
GGAGCCAACGGCTGAAGCGGCCACTGCACAAGTAATCACAGAACCAACCAAGACAGAAGA
CAAACCAAAATTTTATTCAAGACCACTCTCACCATATGCAGCGTACCCTGACTTGAAGCC
TCCAACATCTCCTACACCATCGCAGCCCTGAAGAGCCCGTAATAAAGCAGTCTTTCCTCC
TTCAAACATATGAGCAAATATCTATCGAATCTTTGTGAACTTTTTTTTTTATCTTCGAGG
ACTTAGATGCTACCTTCTTTCGAATCTGGGTTAAGTTTAATGTGTACTATGGTGTCCCCC
TTTTATACCGCCATTAAGAGTTGCTATGTTC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4CQ43JQ 749 0 0
TT
TTTGGCGAGAGTGCTGATGGTGTCTCTGTTGCAATTGGAGTAGCTGCTGCTGCTGGATTA
AGTGCTTTAGCATTTACTGAGATTGAAACCATACTCCAACTACTAGGCTCAGCTGCACTT
GTTCAGCTTGCAGGCAAGAAACTTCCATTTGCTGAGGACCGAAAGCAAACTCTAAAACAA
GTGGATGAGTTCTTGAACACAAAGATTGCACCTAAAGAACTTGTTGATGAATTAAAGGAC
ATAGGAAAGGCTCTTCTTCCTCCATCAACAAGCAGCAAAGCTCTTCCTGCACCTGCAGCA
GTTGCAGCAGAAGCACCTACTACAACCACGGTCGAGAAACCAGAACCTGAGCCAGTAATC
AAAGCCGCCACTGCACAGGTAAACTCAGAGACAGCCGCCACTGCACAAGCAGTTTCGGAG
CCAACGGCTGAAGCGGCCACTGCACAAGTAATCACAGAACCAACCAAGACAGAAGACAAA
CCAAAATCTTATTCAAGACCACTCTCACCATATGCAGCGTACCCTGACTTGAAGCCCCCA
ACATCTCCTACACCATCGCAGCCCTGAAGAGCCCGTAATAAAGCAGTCTTTCCTCCTTCA
AACATATGAGCAAATATCTATCGAATCTTTGTGAACTTTTTTTTT*ATCTTCGAGGACTT
AGATGCTACCTTCTTTCGAATCTGGGTTAAGTTTAATGTGTACTATGGTGTCCCCCTTTT
ATACCGCCATTAAGAGTTGCTATGTTC

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR4G542JQ 494 0 0
TTT
TTCCTCCATCAACAAGCAGCAAAGCTCTTCCTGCACCTGCAGCAGTTGCAGCAGAAGCAC
CTACTACAACCACGGTCGAGAAACCAGAACCTGAGCCAGTAATCAAAGCCGCCACTGCAC
AGGTAAACTCAGAGACAGCCGCCACTGCACAAGCAATTTCGGAGCCAACGGCTGAAGCGG
CCACTGCACAAGTAATCACAGAACCAACCAAGACAGAAGACAAACCAAAATCTTATTCAA
GACCACTCTCACCATATGCAGCGTACCCTGACTTGAAGCCTCCAACATCTCCTACACCAT
CGCAGCCCTGAAGAGCCCGTAATAAAGCAGTCTTTCCTCCTTCAAACATATGAGCAAATA
TCTATCGAATCTTTGTGAACTTTTTTTT**ATCTTCGAGGACTTAGATGCTACCTTCTTT
CGAATCTGGGTTAAGTTTAATGTGTACTATGGTGTCCCCCTTTTATATCGCCATTAAGAG
TTGCTATGTTC

QA 4 494 4 494
DS 



AS 2 8

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ACAGGAATCAGATCTATCTCAAAGATAATAGCTTCATCCGAATTATCAGTCTCCAGATCT
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CATGACGAGCCATACTACCTCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTAC
CAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCT
ATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTCACTCTCTCTCT
CTCTTCTTCTCTGCTTCAATAATTTGTTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAGAG
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TTTTATTCATCCTCCTTTTTACTGTCTGTTTGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGA
ATCGCAAGTTAATTGTTTGAATATTTTTCAGTTTGAGCAAACAATTTGTTTTATTCACCA
TGTAAATGTGTTCTATCAGGTATACATGATCAGCCTGTTTTGATGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ80JQ C 1
AF RR4FJ80TF U 1
AF RR4DB76TF U 1
AF RR4BK65JQ C 1
BS 1 557 RR4FJ80TF
BS 558 561 RR4DB76TF
BS 562 646 RR4BK65JQ

RD RR4FJ80JQ 367 0 0
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CTCTT
TT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4FJ80TF 559 0 0
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CAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCT
ATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTCACTCTCTCTCT
CTCTTCTTCTCTGCTTCAATAATTTGTTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAGAG
ACCTTTCTTGCTTCTTTTTGGGATCTTAGCCACAAGTCTGATTGTTATGGTAAAACTACA
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ATCGCAAGTTAATTGTT
CG

QA 1 557 1 557
DS 

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CAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCT
ATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTCACTCTCTCTCT
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ATCGCAAGTTAATTGTTTGAA

QA 1 561 1 561
DS 

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CAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCT
ATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTCACTCTCTCTCT
CTCTTCTTTTCTGCTTCAATAATTTGTTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAGAG
ACCTTTCTTGCTTCTTTTTGGGATCTTAGCCACAAGTCTGATTGTTATGGTAAAACTACA
TTTTATTCATCCTCCTTTTTACTGTCTGTTTGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGA
ATCGCAAGTTAATTGTTTGAATATTTTTCAGTTTGAGCAAACAATTTGTTTTATTCACCA
TGTAAATGTGTTCTATCAGGTATACATGATCAGCCTGTTTTGATGC

QA 1 646 1 646
DS 



CO CL821Contig2 641 4 4 U
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CCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAG
GGCATGGTCATGATGAGCCATACTACCTCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCA
TGAAGTACCAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTG
GAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTTAAT
CTCTCTTCTTTTCTGCTTGAATAATTTTGTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAG
AGACTTTCTTTCTTCTTTTTGGATCTTAGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTCAAGTACAT
TATTCATCCTCCTTTACTGGCTGTTTGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAATCGC
AAGTTAATTGTTTGAATATTTTCAGTTGAGCAAACAATTTGTTTTATTCAGCATGTAAAT
GTGTTCTATCAGGTATACATGATCAGTCTGTTTTGATATAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4CE21JQ C 88
AF RR4BR17TF U 1
AF RR4CE21TF U 1
AF RR4BR17JQ C 88
BS 1 611 RR4BR17TF
BS 612 612 RR4BR17JQ
BS 613 637 RR4BR17TF
BS 638 641 RR4BR17JQ

RD RR4CE21JQ 336 0 0
CAAAGATAATAGCTTCATCCGAATTATCAGTCTCCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTCCACT
CAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAGGGCATGGTCATGATGAGCCATACTACC
TCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTACCAAGGTCTCAAGATGTCTC
TCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTCTTCC
AGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTTAATCTCTCTTCTTTTCTGCTTGAATAATTT
TGTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAGAGA

QA 1 336 1 336
DS 

RD RR4BR17TF 639 0 0
GGGCGCCGTAGTCGTAGCCTATCTTATTCTTAAAGTTTCTCGATTGATTTCTGATCATGG
CGATGAACACAGGAATCAGATCTATCTCAAAGATAATAGCTTCATCCGAATTATCAGTCT
CCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAG
GGCATGGTCATGATGAGCCATACTACCTCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCA
TGAAGTACCAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTG
GAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTTAAT
CTCTCTTCTTTTCTGCTTGAATAATTTTGTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAG
AGACTTTCTTTCTTCTTTTTGGATCTTAGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTCAAGTACAT
TATTCATCCTCCTTTACTGGCTGTTTGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAATCGC
AAGTTAATTGTTTGAATATTTTCAGTTGAGCAAACAATTTGTTTTATTCAGCATGTAAAT
GTGTTCTATCATGTATACATGATCAGTCTGTTTTGAT
AT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4CE21TF 608 0 0
GGGCGCCGTAGTCGTAGCCTATCTTATTCTTAAAGTTTCTCGATTGATTTCTGATCATGG
CGATGAACACAGGAATCAGATCTATCTCAAAGATAATAGCTTCATCCGAATTATCAGTCT
CCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAG
GGCATGGTCATGATGAGCCATACTACCTCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCA
TGAAGTACCAAGGTCTCAAGATGTCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTG
GAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTTAAT
CTCTCTTCTTTTCTGCTTGAATAATTTTGTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAG
AGACTTTCTTTCTTCTTTTTGGATCTTAGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTCAAGTACAT
TATTCATCCTCCTTTACTGGCTGTTTGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAATCGC
AAGTTAATTGTTTGAATATTTTCAGTTGAGCAAACAATTTGTTTTATTCAGCATGTAAAT
GTGTTCTA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4BR17JQ 554 0 0
CAAAGATAATAGCTTCATCCGAATTATCAGTCTCCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTCCACT
CAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAGGGCATGGTCATGATGAGCCATACTACC
TCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTACCAAGGTCTCAAGATGTCTC
TCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTCTTCC
AGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTTAATCTTTCTTCTTTTCTGCTTGAATAATTT
TGTTTTAATTCTCAAACTCTGCCTCTGCAAGAGAGACTTTCTTTCTTCTTTTTGGATCTT
AGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTCAAGTACATTATTCATCCTCCTTTACTGGCTGTTTG
ACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAATCGCAAGTTAATTGTTTGAATATTTTCAGTT
GAGCAAACAATTTGTTTTATTCAGCATGTAAATGTGTTCTATCAGGTATACATGATCAGT
CTGTTTTGATATAC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 7

CO CL822Contig1 877 7 15 U
GTGCAATCATAAACTGTCGCTTTTATTAACAATAATCTTTACCTGATGGAAACAAGAACA
CAAACACAACACAACACAACACAAGAGTTCTAAAGTAGACAGTAGACAAAAGAGATCAGA
AACTAATCTCCTTTGTTGTCGGCTGAGAAGTAAATCTCACAAGACCGAGGAAGAAACACA
GGCAACAAGAGACCAAACAGATTGTAAAACCACATGACAGTGTTAACAGAAGCAATGGCT
CTTCCTCCGTACAATCTTACTGGACCACCAGGACGCTGAGTATCTGTGAACTCAGCTTTA
ACCCAATCCAACAGCGCGAAGATACGACGAGCGTTGTAGAAAACAGGTCCAAGAATACCA
ATGGGAGTCGCAAACCGGTCAGAGAAACCAATTGGTTCTGTGAAGGCTTGACCGGAGAGG
AGGAAGAGATGTGGAGCTGCGGCTCTAACACCGTGAATGTCTCCCCGGTATAGTCCATCT
CCGATGTAGCAAATCGGGAACAGTAGGCCGATAATAGCAGTGGCGAGGAAGTAAGTTTGA
AAGAGTTTGTTTTTAGGGTTTGAGAGCCTCCTCTTCTGCTCGTTCTGCTTGCGTGGGAAG
GCAAACCTAGAGAGGAACTCATACAAGTATATGTAAGATAGTATCACAAACGCTACTTCT
CCTATCCCCACGAGTCCTTTTGCGGCTAGTAATATCATGAGGGAGAGAAACACGAGCTGT
CTCTTGCGGCTGATGAGACCACGTTTTGGCGGCGGTGGAGAAGGTTTAGGGTTGGTGTCA
CTACCGTGCTCGCGTATCTCTTCCGACATTAGAGAAGTCTTTGGTTTCAAGAGTTGTTCA
GAAGCTGTTTGAAGTTTGAGGTTTTGTGTTTGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 10 0 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D782JQ U 3
AF RR4FZ32JQ U 1
AF RR4G870JQ U 3
AF RR4DQ81JQ U 7
AF RR4D782TF C 266
AF RR4FZ32TF C 139
AF RR4G870TF C 136
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BS 384 384 RR4G870JQ
BS 385 427 RR4FZ32JQ
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BS 453 712 RR4FZ32JQ
BS 713 735 RR4G870JQ
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BS 773 773 RR4G870TF
BS 774 774 RR4D782TF
BS 775 877 RR4G870TF

RD RR4D782JQ 110 0 0
GTAAT
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CACACAACACAACACAAGAGTTCTAAAGTAGACAGTAGACAAAAG

QA 6 110 6 110
DS 

RD RR4FZ32JQ 712 0 0
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CAAACACAACACAACACAACACAAGAGTTCTAAAGTAGACAGTAGACAAAAGAGATCAGA
AACTAATCTCCTTTGTTGTCGGCTGAGAAGTAAATCTCACAAGACCGAGGAAGAAACACA
GGCAACAAGAGACCAAACAGATTGTAAAACCACATGACAGTGTTAACAGAAGCAATGGCT
CTTCCTCCGTACAATCTTACTGGACCACCAGGACGCTGAGTATCTGTGAACTCAGCTTTA
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CCTATCCCCACGAGTCCTTTTGCGGCTAGTAATATCATGAGGGAGAGAAACA

QA 1 712 1 712
DS 

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GAAAT
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***ACAACACAACACAAGAGTTCTAAAGTAGACAGTAGACAAAAGAGATCAGAAACTAAT
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GGCTGATG

QA 6 733 6 733
DS 

RD RR4DQ81JQ 727 0 0
C
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AACACAACACAACACAAGAGTTCTAAAGTAGACAGTAGACAAAAGAGATCAGAAACTAAT
CTCCTTTGTTGTCGGCTGAGAAGTAAATCTCACAAGACCGAGGAAGAAACACAGGCAACA
AGAGACCAAACAGATTGTAAAACCACATGACAGTGTTAACAGAAGCAATGGCTCTTCCTC
CGTACAATCTTACTGGACCACCAGGACGCTGAGTATCTGTGAACTCAGCTTTAACCCAAT
CCAACAGCGCGAAGATACGACGAGCGTTGTAGAAAACAGGTCCAAGAATACCAATGGGAG
TCGCAAACCGGTCAGAGAAACCAATTGGTTCTGTGAAGGCTTGACCGGAGAGGAGGAAGA
GATGTGGAGCTGCGGCTCTAACACCGTGAATGTCTCCCCGGTATAGTCCATCTCCGATGT
AGCAAATCGGGAACAGTAGGCCGATAATAGCAGTGGCGAGGAAGTAAGTTTGAAAGAGTT
TGTTTTTAGGGTTTGAGAGCCTCCTCTTCTGCTCGTTCTGCTTGCGTGGGAAGGCAAACC
TAGAGAGGAACTCATACAAGTATATGTAAGATAGTATCACAAACGCTACTTCTCCTATCC
CCACGAGTCCTTTTGCGGCTAGTAATATCATGAGGGAGAGAAACACGAGCTGTATCTTGC
GGCTGA

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR4D782TF 574 0 0
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GACGAGCGTTGTAGAAAACAGGTCCAAGAATACCAATGGGAGTCGCAAACCGGTCAGAGA
AACCAATTGGTTCTGTGAAGGCTTGACCGGAGAGGAGGAAGAGATGTGGAGCTGCGGCTC
TAACACCGTGAATGTCTCCCCGGTATAGTCCATCTCCGATGTAGCAAATCGGGAACAGTA
GGCCGATAATAGCAGTGGCGAGGAAGTAAGTTTGAAAGAGTTTGTTTTTAGGGTTTGAGA
GCCTCCTCTTCTGCTCGTTCTGCTTGCGTGGGAAGGCAAACCTAGAGAGGAACTCATACA
AGTATATGTAAGATAGTATCACAAACGCTACTTCTCCTATCCCCACGAGTCCTTTTGCGG
CTAGTAATATCATGAGGGAGAGAAACACGAGCTGTCTCTTGCGGATGATGAGACCACGTT
TTGGCGGCGGTGGAGAAGGTTTAGGGTTGGTGTCACTACCGTGCTCGCGTATCTCTTCCG
ACATTAGAGAAGTCTTTGGTTTCAAGAGTTGT
CC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4FZ32TF 701 0 0
TCGGCTGAGAAGTAA*TCTCACAAGACCGAGGAAGAAACACAGGCAACAAGAGACCAAAC
AGATTGTAAAACCACATGACAGTGTTAACAGAAGCAATGGCTCTTCCTCCGTACAATCTT
ACTGGACCACCAGGACGCTGAGTATCTGTGAACTCAGCTTTAACCCAATCCAACAGCGCG
AAGATACGACGAGCGTTGTAGAAAACAGGTCCAAGAATACCAATGGGAGTCGCAAACCGG
TCAGAGAAACCAATTGGTTCTGTGAAGGCTTGACCGGAGAGGAGGAAGAGATGTGGAGCT
GCGGCCCTAACACTGTGAATGTCTCCCCGGTATAGTCCATCTCCGATGTAGCAAATCGGG
AACAGTAGGCCGATAATAGCAGTGGCGAGGAAGTAAGTTTGAAAGAGTTTGTTTTTAGGG
TTTGAGAGCCTCCTCTTCTGCTCGTTCTGCTTGCGTGGGAAGGCAAACCTAGAGAGGAAC
TCATACAAGTATATGTAAGATAGTATCACAAACGCTACTTCTCCTATCCCCACGAGTCCT
TTTGCGGCTAGTAATATCATGAGGGAGAGAAACACGAGCTGTCTCTTGCGGCTGATGAGA
CCACGTTTTGGCGGCGGTGGAGAAGGTTTAGGGTTGGTGTCACTACCGTGCTCGCGTATC
TCTTCCGACATTAGAGAAGTCTTTGGTTTCAAGAGTTGT
CC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4G870TF 742 0 0
TTGTCGGCTGAGAAGTAAATCTCACGAGACCGAGGAAGAAACACAGGCAACAAGAGACCA
AACAGATTGTAAAACCACATGACAGTGTTAACAGAAGCAATGGCTCTTCCTCCGTACAAT
CTCACTGGACCACCAGGACGCTGAGTATCTGAGAACTCAGCTTTAACCCAATCCAACAGC
GCGAAGATACGACGAGCGTTGTAGAAAACCGGTCCAAGAATACCAATGGGAGTCGCAAAC
CGGTCAGAGAAACCAATTGGTTCTGTGAAGGCTTGACCGGAGAGGAGGAAGAGATGTGGA
GCTGCGGCTCTAACACCGTGAATGTCTCCCCGGTATAGTCCATCTCCGATGTAGCAAATC
GGGAAGAGTAGGCCGATAATAGCAGTGGCGAGGAAGTAAGTTTGAAAGAGTTTGTTTTTA
GGGTTTGAGAGTCTCCTCTTCTGCTCGTTTTGCTTGCGTGGGAAGGCAAACCTAGAGATG
AACTCATACAAGTATATGTAAGATAGTATCACAAACGCTACTTCTCCTATCCCCACGAGT
CCTTTTGCGGCTAGTAATATCATGAGGGAGAGAAACACGAGCTGTCTCTTGCGGCTGATG
AGACCACGTTTTGGCGGCGGTGGAGAAGGTTTAGGGCTAGTGTCACTACCGTGCTCGCGT
ATCTCTTCCGACATTAGAGAAGTCTTTGGTTTCAAGAGTTGTTCAGAAGCTGTTTGAAGT
TTGAGGTTTTGTGTTTGGTTTC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 2 7

CO CL823Contig1 957 5 27 U
CCACACAATTATAGCACATAACTTTAAACGAAATACTACTAAAGCCGAAAACGTTCCACA
ATTATACTACTAGACTTCAAACGAAATACATCAAACTCTAGTTAATAATAACATTACATG
AGTGAATAATAAGATGGTTTTAAACAAAGTAAAACGCAAAGAAAAATAAGTACCGCTTGA
AATTGAAACATAGACAAGAAACGAAAAACAAGAGCTTCTTCAAGGACTGATGATGACCTG
GAAACAATTTCACCACATGTTTTGAGATTTTGGAGCTCTACGTCGAGAGCCACCACGACG
ACGTCTGCAGGTTTGAGATTTACGAGCTCCAAGTGGACGTAAATGATTATCAAGCAGACG
AAAACCCGTCCGGCATGCCTTCCTCATACGTTTGATATTTGGAGAACCTTTTACCTGTCG
CAATTGCTCTCGATGCTCTCGATCGTACTGGGCTAAGAGAGATAGATGCCTATTCTTCAT
TTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCTTCTTGCAAATGTTCTCCAGTTGAGAG
ATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATCACAGCACAATTT
GCAATAAAACATTGCGCTAGATCCAACACCCCTATCACTTTCACTACCGCATTTCTGAAG
AATGTGTTTCCTTTTCTCTGAAACTTCAAGTAAGCTATGCCAGAGCCACTCGGCAGAAGG
GAGCAGGACTAACATTTGGTAAGGCCTAGATGAATAAGCCAGAAAAAGGTTGTGTTTCTG
CATTTGTACTAGGTCGGCAACGGCAGTTGAGAAGACCTCATGTGCATCTGTATCAGATAT
GACCATAATATTAGTCGGAGTAGGACTAGGTTCTTGCTCATCCAGCAAATCTTGATACAT
GCGCTTGTATGAGACATCGCGACGCATGTGCAGACTGACTCCAGTGGAGCGAGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DO06JQ U 44
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AF RR4GO82JQ U 35
AF RR4DV65JQ U 44
AF RR4GO82TF C 172
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GGCCG
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GATGATAACCTGGAAACGATTTCACCACATGTTTTGAGGTTTTGGAGCTCTACGTCGAGA
GCCACCATGACGACGTCTGCAGGTTTGAGATTTACGAGCTCTAAGTGGACGTAAATGATT
ATCAAGCAGACGAAAACCCGTCCGGCCTGCCTTCCTCATACGTTTGATATTTGGAGAACC
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CCTATTCTTCATTTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCTTCTTGCAAATGTTC
TTCAGTTGAGAGATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATC
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GCATTTCTGAAGAATGTGTTTCCTTTTCTCTGAAACTTCAAGTAAGCTATGCCAGAGCCA
CTCGGCA

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DS 

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AAAACCCGTCCGGCATGCCTTCCTCATACGTTTGATATTTGGAGAACCTTTTACCTGTCG
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TTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCTTCTTGCAAATGTTCTTCAGTTGAGAG
ATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATCACAGCACAATTT
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GAGCAGGACTAACATTTGGTAAGGCCTAGATGAATAAGCCAGAA

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DS 

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ACTCTAGTTACTAATAACATTACATGAGTGAATAATAAGATGGTTTTAAACAAAGTAAAA
CGCAATGAAAAATAAGTACCGCTTGAAATTGAAACATAGACAAGAAACGAAAAACAAGAG
CTTCTTCAAGGACTGATGATGACCTGGAAACAATTTCACCACATGTTTTGAGATTTTGGA
GCTCTACGTCGAGAGCCACCACGACGACGTCTGCAGGTTTGAGATTTACGAGCTCCAAGT
GGACGTAAATGATTATCAAGCAGACGAAAACCCGTCCGGCATGCCTTCCTCATACGTTTG
ATATTTGGAGAACCTTTTACCTGTCGCAATTGCTCTCGATGCTCTCGATCGTACTGGGCT
AAGAGAGATAGATGCCTATTCTTCATTTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCT
TCTTGCAAATGTTCTCCAGTTGAGAGATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCA
GGGCCTTTGCCATCACAGCACAATTTGCAATAAAACATTGCGCTAGATCCAACACCCCTA
TCACTTTCACTACCGCATTTCTGAAGAATGTGTTTCCTTTTCTCTGAAACTTCAAGTAAG
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TAAGCCAGAAAAA

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DS 

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GGCCG
AAACGTTCCACAATTATACTACTAGACTTCAAACGAAATACATCAAACTCTAGTTAATAA
TAACATTACATGAGTGAATAATAAGGTGGTTTTAAACAAAGTAAAACGCAAAGAAAAATA
AGTACCGCTTGAAATTGAAACATAGACAAGAAACGAAAAACAAGAGCTTCTTCAACGACT
GATGATAACCTGGAAACGATTTCACCACATGTTTTGAGGTTTTGGAGCTCTACGTCGAGA
GCCACCATGACGACGTCTGCAGGTTTGAGATTTACGAGCTCTAAGTGGACGTAAATGATT
ATCAAGCAGACGAAAACCCGTCCGGCCTGCCTTCCTCATACGTTTGATATTTGGAGAACC
TTTTACCTGTCGCAATTGCTCTCGATGCTCTCGATCGTACTGGGCTAAGAGAGATAGATG
CCTATTCTTCATTTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCTTCTTGCAAATGTTC
TTCAGTTGAGAGATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATC
ACAGCACAATTTGCAATAAAACATTGCGCTAGATCCAACACCCCTATCACTTTCACTACT
GCATTTCTGAAGAATGTGTTTCCTTTTCTCTGAAACTTCAAGTAAGCTATGCCAGAGCCA
CTCGGCAGAAGGGAGCAGGACTAACATTTGGTAAGGCCTAGATGAATAAGCCAGAAAAAG
GTTGTGTTTCTGCATTTGTACTAG*TCGGCAACGGCAGTTGAGAAG*CCTCATGTGCATC
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*TCTTGATACATGCGCTTGTATGAGACATCGCGACGCATGTGCAGACTGACTCCAGTGGA
GCGAGTCCT

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DS 

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GATGACCTGGAAACAATTTCACCACATGTTTTGAGATTTTGGAGCTCTACGTCGAGAGCC
ACCACGACGACGTCTGCAGGTTTGAGATTTACGAGCTCCAAGTGGACGTAAATGATTATC
AAGCAGACGAAAACCCGTCCGGCATGCCTTCCTCATACGTTTGATATTTGGAGAACCTTT
TACCTGTCGCAATTGCTCTCGATGCTCTCGATCGTACTGGGCTAAGAGAGATAGATGCCT
ATTCTTCATTTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCTTCTTGCAAATGTTCTCC
AGTTGAGAGATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATCACA
GCACAATTTGCAATAAAACATTGCGCTAGATCCAACACCCCTATCACTTTCACTACCGCA
TTTCTGAAGAATGTGTTTCCTTTTCTCTGAAACTTCAAGTAAGCTATGCCAGAGCCACTC
GGCAGAAGGGAGCAGGACTAACATTTGGTAAGGCCTAGATGAATAAGCCAGAAAAAGGTT
GTGTTTCTGCATTTGTACTAGGTCGGCAACGGCAGTTGAGAAGACCTGATGTGCATCTGT
ATCAGATATGACCATAATATTAGTCGGAGTAGGATTAGGTTCTTGCTCATCCAGCAAATC
TTGATACATGCGCTTG
C

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DS 



CO CL823Contig2 1253 2 2 U
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AGGCTGCTAAAATAGCTGTGTGGTGGGATATGAAGGAGTGTCCGATTCCGGAGGGTTATG
ATGCTGGTGGAATCCGGCCGAGTTTAGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGTC
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GGCTCTTATCTACTGGAGTTTCGGTAGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATCA
TGTATCGGGATATAGTGGAATGGCGAGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATCA
TATCAAATCCGGTGAGAGGTGACTTGTCTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCGC
AATACAATCTGTTTCTGGCTTATCCGAAGTCGCTTTGCTTTATCTCACCCCTGCTAACTT
CTGAAGAGTGGGTATGGGGAAAATTACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAGA
CCAGAAGCGCACCACTTGCCATGCTTTGTTGCAAATCGTGCAACTTCGATTGCCAAATCC
CTGAGAAATTGAGAAAGCATCTCTCGAGTTATAAGCATGCACGCCAAGTGTCTGTATACC
CTACGTACGAAGAAATCACCCGGGTAACGGAGCATTGGGGAAGGAACTACCCGGCAACGC
CTGAATATGCGACAGCTAAAATACTGGTGTGGTGGGACATGTTTTACTGTCCTATCCCCG
AGGGATATGATGCTCGTCGGGTCCGTCCGAGTTTAGAAGAGGCATTTAAGAAACTTGGCT
ACTCTGGTCCTGTCTCCATCACTGCCTATGGCAACTTAAACCACATCCCTGAGCACCTCC
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CATTCTTCAGAAATGCAGTAGTGAAGTGATAGGGGTGTTGGATCTAGCGCAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ48TF U 1
AF RR4DO06TF U 497
BS 1 645 RR4CQ48TF
BS 646 1253 RR4DO06TF

RD RR4CQ48TF 645 0 0
GGCGTCTGTGCCTGTTTAGGTTTAGAGGATCGATGTCGTGGTGGGGGGAGGAAGCGGCGA
AGGCTGCTAAAATAGCTGTGTGGTGGGATATGAAGGAGTGTCCGATTCCGGAGGGTTATG
ATGCTGGTGGAATCCGGCCGAGTTTAGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGTC
CAGTTTCCTCCATCACTGCCTATGGGGACCAAACAGAAACCCCTGTTCACATCCTGAAAC
GGCTCTTATCTACTGGAGTTTCGGTAGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATCA
TGTATCGGGATATAGTGGAATGGCGAGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATCA
TATCAAATCCGGTGAGAGGTGACTTGTCTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCGC
AATACAATCTGTTTCTGGCTTATCCGAAGTCGCTTTGCTTTATCTCACCCCTGCTAACTT
CTGAAGAGTGGGTATGGGGAAAATTACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAGA
CCAGAAGCGCACCACTTGCCATGCTTTGTTGCAAATCGTGCAACTTCGATTGCCAAATCC
CTGAGAAATTGAGAAAGCATCTCTCGAGTTATAAGCATGCACGCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4DO06TF 757 0 0
GGGAAAATTACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAGACCAGAAGCGCACCACT
TGCCATGCTTTGTTGCAAATCGTGCAATTTCGATTGCCAAATCCCTGAGAAATTGAGGAA
GCATCTCTCGAGTTATAAGCATGCACGCCAAGTGTCTGTATACCCTACGTACGAAGAAAT
CACCCGGGTAACGGAGCATTGGGGAAGGAACTACCCGGCAACGCCTGAATATGCGACAGC
TAAAATACTGGTGTGGTGGGACATGTTTTACTGTCCTATCCCCGAGGGATATGATGCTCG
TCGGGTCCGTCCGAGTTTAGAAGAGGCATTTAAGAAACTTGGCTACTCTGGTCCTGTCTC
CATCACTGCCTATGGCAACTTAAACCACATCCCTGAGCACCTCCAGCGAGGACTCGCTTC
CACTGGAGTCAGTCTTGCACATGCCGTTCGCGATGTCTCATACAAGCGCATGTATCAAGA
TTTGCTGGATGAGCAAGAACCTAGTCCTACTCCGACTAATATTATGGTCATATCTGATAC
AGATGCACATGAGGCCTTCTCAACTGCCGTTGCCGACCTAGTACAAATGCAGAAACACAA
CCTTTTTCTGGCTTATTCATCTAGGCCTTACCAAATGTTAGTCCTGCTCCCTTCTGCCGA
GTGGCTCTGGCATAGCTTACTTGAAGTTTCAGAGAAAAGAAACACATTCTTCAGAAATGC
AGTAGTGAAGTGATAGGGGTGTTGGATCTAGCGCAAT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 6

CO CL824Contig1 782 3 5 U
CTGAAATTTTAATATTGGTAAAGTTCTTTTGAGACCAACAAGTACTCATTTAAAAAAAAG
GTCATAGTCTTGAATAGGTAGATGATGATGATTTACAGCAAAAGAAGTATACATCAGTTG
GCCTCTCATCAAAAGGGGGAGTTTTCTAAACGGTGACAGTGATGGCTTCATCAAGAGCGA
TCACACCGGGAAGTACTTTACCTTCCAAGAGCTCCAAGCTGGCTCCACCACCAGTGGAGA
TGTGACTCATGACTCCTGCAACTCCTACTTTCTCCACTGCAGCCACTGAGTCTCCTCCTC
CTATTATAGTTGTCACTCCTTTCTCACTTAGCTCTGCTAGTTTATTCGCAACTGCCTCTG
TTCCAGCAGCAAACTTCTCCATCTCGAAAACTCCCATAGGTCCATTCCAAATGACTGTCT
GTGTTGTGTCCAGAGCCTCGTTGAATGTTTTCACCGAGTCCGGACCTATGTCCAGTCCCA
TCCATCCGTCCTCAATACCTGATGCTGGCACAACCTTGCTGTTGGCATCAGGGGCGAACT
TGTCAGCAACCACAACATCGGTTGGCAACAAAAGAGAGACGCCTTTAGCCTTAGCTTTAG
CAAGGAGAGACGAGCCAACAGAAAGACCTTGTGCCTTGTAGAACGTAAAGATCATTCCAC
CTCCAAGAAGAAGGATATCACACTTCCCAAGAAGCGATTCAATAACTCCAATCTTGGACG
ACACCTTGGAACCACCAACAATGGCTGCAAACGGTCTCTTTGGGGTTGAAACAGCGCCCA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4DQ91JQ U 1
AF RR4GU27JQ U 245
AF RR4DQ91TF C 127
BS 1 530 RR4DQ91JQ
BS 531 531 RR4GU27JQ
BS 532 558 RR4DQ91JQ
BS 559 607 RR4GU27JQ
BS 608 782 RR4DQ91TF

RD RR4DQ91JQ 558 0 0
CTGAAATTTTAATATTGGTAAAGTTCTTTTGAGACCAACAAGTACTCATTTAAAAAAAAG
GTCATAGTCTTGAATAGGTAGATGATGATGATTTACAGCAAAAGAAGTATACATCAGTTG
GCCTCTCATCAAAAGGGGGAGTTTTCTAAACGGTGACAGTGATGGCTTCATCAAGAGCGA
TCACACCGGGAAGTACTTTACCTTCCAAGAGCTCCAAGCTGGCTCCACCACCAGTGGAGA
TGTGACTCATGACTCCTGCAACTCCTACTTTCTCCACTGCAGCCACTGAGTCTCCTCCTC
CTATTATAGTTGTCACTCCTTTCTCACTTAGCTCTGCTAGTTTATTCGCAACTGCCTCTG
TTCCAGCAGCAAACTTCTCCATCTCGAAAACTCCCATAGGTCCATTCCAAATGACTGTCT
GTGTTGTGTCCAGAGCCTCGTTGAATGTTTTCACCGAGTCCGGACCTATGTCCAGTCCCA
TCCATCCGTCCTCAATACCTGATGCTGGCACAACCTTGCTGTTGGCATCAAGGGCGAACT
TGTCAGCAACCACAACAT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4GU27JQ 363 0 0
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TATAGTTGTCACTCCTTTCTCACTTAGCTCTGCTAGTTTATTCGCAACTGCCTCTGTTCC
AGCAGCAAACTTCTCCATCTCGAAAACTCCCATAGGTCCATTCCAAATGACTGTCTGTGT
TGTGTCCAGAGCCTCGTTGAATGTTTTCACCGAGTCCGGACCTATGTCCAGTCCCATCCA
TCCGTCCTCAATACCTGATGCTGGCACAACCTTGCTGTTGGCATCAGGGGAGAACTTGTC
AGCAACCACAACATCGGTTGGCAACAAAAGAGAGACGCCTTTAGCCTTAGCTTTAGCAAG
GAG

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR4DQ91TF 656 0 0
CATCAAAAGGGGGAGTTTTCTAAACGGTGACAGTGATGGCTTCATCAAGAGCGATCACAC
CGGGAAGTACTTTACCTTCCAAGAGCTCCAAGCTGGCTCCACCACCAGTGGAGATGTGAC
TCATGACTCCTGCAACTCCTACTTTCTCCACTGCAGCCACTGAGTCTCCTCCTCCTATTA
TAGTTGTCACTCCTTTCTCACTTAGCTCTGCTAGTTTATTCGCAACTGCCTCTGTTCCAG
CAGCAAACTTCTCCATCTCGAAAACTCCCATAGGTCCATTCCAAATGACTGTCTGTGTTG
TGTCCAGAGCCTCGTTGAATGTTTTCACCGAGTCCGGACCTATGTCCAGTCCCATCCATC
CGTCCTCAATACCTGATGCTGGCACAACCTTGCTGTTGGCATCAGGGGCGAACTTGTCAG
CAACCACAACATCGGTTGGCAACAAAAGAGAGACGCCTTTAGCCTTAGCTTTAGCAAGGA
GAGACGAGCCAACAGAAAGACCTTGTGCCTTGTAGAACGTAAAGATCATTCCACCTCCAA
GAAGAAGGATATCACACTTCCCAAGAAGCGATTCAATAACTCCAATCTTGGACGACACCT
TGGAACCACCAACAATGGCTGCAAACGGTCTCTTTGGGGTTGAAACAGCGCCCACC

QA 1 656 1 656
DS 



CO CL824Contig2 1436 3 11 U
CGCACACTCTCTCTCAGTCTCATCTCCTCCTGATCATACTTCAACCTCCACATGGCTTCC
GTCGCCGCAAGTCCGCCTTCTCCCCCCTCAAGTCCACCGGAGCCGCCGCAACTCGCTCGC
GCGCCTCCCTTCTATCAATCCCCTCCTTCAAATCCATCTCCTCCCGTCCTCTCGGCTTCT
CCGCCGTCCTCGACTCCCACCGTTTCACCCTCCACGTGGCCTCAAAGGTTCGCTCAGTGC
GCGGGAGAGGGACCAGGGGAGTCGTCTCCATGGCGAAGAAGAGCGTGGGTGACTTGAGCT
CAGCTGATTTGAAAGGGAAGAAGGTATTCGTGAGAGCTGATCTCAATGTGCCTCTCGATG
ATAACCAGACGATCACTGACGATACGAGGATCCGTGCCGCAATTCCGACGATCAAGTATT
TGATTGACAATGGTGCTAAAGTCATCCTCTCTACTCATCTGGGAAGACCAAAGGGAGTGA
CACCAAAGTTCAGTTTAGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTGTCTGAACTTCTCGGTATTGAGG
TCAAAAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTGGAGAGCTTGGTGGCTTCTCTCCCCG
AAGGTGGAGTTCTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTTTACAAAGAGGAAGAGAAGAACGATC
CTGAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTTTACGTCAACGATGCTTTCGGAA
CTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCACCGAGGGAGTCACAAAGTTCTTGAAACCTTCAGTTG
CTGGTTTCCTTCTTCAAAAGGAGCTTGATTACCTTGTGGGCGCTGTTTCAACCCCAAAGA
GACCGTTTGCAGCCATTGTTGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTGGAGTTATTGAAT
CGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGAGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACA
AGGCACAAGGTCTTTCTGTTGGCTCGTCTCTCCTTGCTAAAGCTAAGGCTAAAGGCGTCT
CTCTTTTGTTGCCAACCGGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCCCCTGATGCCAACAGCAAG
GTTGTGCCAGCATCAGGTATTGAGGACGGATGGATGGGACTGGACATAGGTCCGGACTCG
GTGAAAACATTCAACGAGGCTCTGGACACAACACATACAGTCATTTGGAATGGACCTATG
GGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAGGCAGTTGCGAATAAACTAGCA
GAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTG
GAGAAAGTATGAGTTGCAGAGTCATGATCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCAGCTGGAGC
TCTTGGAAGTAAGTACTTCCCGGTGTGATCCTCTTGATGAACCATCACTGTCACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU27TF U 1
AF RR4BR77TF U 356
AF RR4HA17TF U 663
BS 1 400 RR4GU27TF
BS 401 401 RR4BR77TF
BS 402 631 RR4GU27TF
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BS 741 963 RR4BR77TF
BS 964 1436 RR4HA17TF

RD RR4GU27TF 740 0 0
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GTCGCCGCAAGTCCGCCTTCTCCCCCCTCAAGTCCACCGGAGCCGCCGCAACTCGCTCGC
GCGCCTCCCTTCTATCAATCCCCTCCTTCAAATCCATCTCCTCCCGTCCTCTCGGCTTCT
CCGCCGTCCTCGACTCCCACCGTTTCACCCTCCACGTGGCCTCAAAGGTTCGCTCAGTGC
GCGGGAGAGGGACCAGGGGAGTCGTCTCCATGGCGAAGAAGAGCGTGGGTGACTTGAGCT
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ATAACCAGACGATCACTGACGATACGAGGATCCGTGCCGCCATTCCGACGATCAAGTATT
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CACCAAAGTTCAGTTTAGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTGTCTGAACTTCTCGGTATTGAGG
TCAAAAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTGGAGAGCTTGGTGGCTTCTCTCCCCG
AAGGTGGAGTTCTGCTTCTTGAGAACGTCAG*TTTTACAAAGAGGAAGAGAAGAACGATC
CTGAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTTTACGTCAACGATGCTTTTGGA*
CTGCTCACAGAGCTCATGCT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4BR77TF 608 0 0
G
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TATTTGATTGACAATGGTGCTAAAGTCATCCTCTCTACTCATCTGGGAAGACCAAAGGGA
GTGACACCAAAGTTCAGTTTAGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTGTCTGAACTTCTCGGTATT
GAGGTCAAAAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTGGAGAGCTTGGTGGCTTCTCTC
CCCGAAGGTGGAGTTCTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTTTACAAGGAGGAAGAGAAGAAC
GATCCTGAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTCTACGTCAACGATGCTTTC
GGAACTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCACCGAGGGAGTCACAAAGTTCTTGAAACCTTCA
GTTGCTGGTTTCCTTCTTCAAAAGGAGCTTGATTACCTTGTGGGCGCTGTTTCAACCCCA
AAGAGACCGTTTGCAGCCATTGTTGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTGGAGTTATT
GAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGAGGTGGAATGATCTTTACGTTC
TACAAGG

QA 2 608 2 608
DS 

RD RR4HA17TF 774 0 0
GAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTTTACGTCAACGATGCTTT*GGAACT
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GGTTTCCTTCTTCAAAAGGAGCTTGATTACCTTGTGGGCGCTGTTTCAACCCCAAAGAGA
CCGTTTGCAGCCATTGTTGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTGGAGTTATTGAATCG
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TGTGCCAGCATCAGGTATTGAGGACGGATGGATGGGACTGGACATAGGTCCGGACTCGGT
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GAAAGTATGAGTTGCAGAGTCATGATCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCAGCTGGAGCTC
TTGGAAGTAAGTACTTCCCGGTGTGATCCTCTTGATGAACCATCACTGTCACGT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 2 7

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TGGTCATGACCCCTCTCTCTACATGCAACCCTAGCCCTCCTACCAACAGACTCGTCACGG
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AACTGGTCACCCCTCTAGTTGTCACCCTCTCCCTCTGATTTCAAACTAAATTAAGCATCC
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AGTATTGGTCGTAAGTTCTGTTACCAGGTCTTAGTTGGCGTGCAAATGCTGCAATGTAAT
GAAATAAAATAATTTCCTTTT


BQ
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AF RR4B296TF U 1
AF RR4B296JQ C 1
BS 1 425 RR4B296TF
BS 426 741 RR4B296JQ

RD RR4B296TF 425 0 0
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TGGTCATGACCCCTCTCTCTACATGCAACCCTAGCCCTCCTACCAACAGACTCGTCACGG
TACGT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4B296JQ 741 0 0
GCTATACTCTCTACTCTTTAATATCCTAACAACATGGCAATGCTCACCAGAAACAAAAAC
ATGACCATAACCTTCTCAATGGTCTTGATATGTCTAATTCTTGTGTTACAATGGCTAAGG
CTCAACTTGATGGGCTTCTTGGCAGGGATCGTAATATCTCCAGTATACAAGGGCGTATCA
TTTGCTCTATCGATGGTAATCCGACTTCCACTCCTCCAGCTGGTTCCCCCGTTATGCTTC
AGTGTGGTGGAAAAAATGTTGCAACTACGAATACGGGCGTTGATGGAGGATTCACGTTTC
CTTCCAACACAGTGTCTACGATCTCGCTTTCAGAAGTCATCTACGACGGTTGTAGTGCCA
TGGTCATGACCCCTCTCTCTACATGCAACCCTAGCCCTCCTACCAACAGACTCGTCACGG
TACGTGCAGGTCCCATCGTAGTCGTCGTTTCCAACGAGAGAAACATGGATGTATTCAAAG
AACTGGTCACCCCTCTAGTTGTCACCCTCTCCCTCTGATTTCAAACTAAATTAAGCATCC
CTTCTTGATTTGGTTACGGTGTGTTTCCGTTCAGCTGTTTTATGTTTTCTGTGATGACCA
TTAAAGTTTGCTTGCGTATGCATGAATAAGGTCTACATAATAAAGCGTATGTATGTTCAA
AGTATTGGTCGTAAGTTCTGTTACCAGGTCTTAGTTGGCGTGCAAATGCTGCAATGTAAT
GAAATAAAATAATTTCCTTTT

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL825Contig2 580 5 9 U
AAAAGGAAATTATTTTATTTCATTACATTGCAGCATTTGCACGCCAACTAAGACCTGGTA
ACAGAACTTACGACCAATACTTTGAACATACATACGCTTTATTATGTAGACCTTATTCAT
GCATACGCAAGCAAACTTTAATGGTCATCACAGAAAACATAAAACAGCTGAACGGAAACA
CACCGTAACCAAATCAAGAAGGGATGCTTAATTTAGTTTGAAATCAGAGGGAGAGGGTGA
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TAGAGAGAGGGGTCATGACCATGGCACTACAACCGTCGTAGATGACTTCTGAAAGCGAGA
TCGTAGACACTGTGTTGGAAGGTGTGAGTATGGGCTTGACTCCGGGTTTCGTCTAACACA
TGTGGGCTTCTGAGTAACTCATTGATCAGCTGAAGCTTCTTGGACTCGAATCAGTCACGG
CCCATGCCAGCTCAGATTACTGAGACTCATTTATCTGTAA


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4BU62JQ U 1
AF RR4BE46JQ U 3
AF RR4DR39JQ U 79
AF RR4DR39TF C 79
AF RR4BE46TF C 3
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BS 294 294 RR4BE46JQ
BS 295 383 RR4BU62JQ
BS 384 384 RR4BE46JQ
BS 385 400 RR4BU62JQ
BS 401 401 RR4BE46JQ
BS 402 554 RR4BU62JQ
BS 555 555 RR4BE46JQ
BS 556 580 RR4BU62JQ

RD RR4BU62JQ 580 0 0
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ACAGAACTTACGACCAATACTTTGAACATACATACGCTTTATTATGTAGACCTTATTCAT
GCATACGCAAGCAAACTTTAATGGTCATCACAGAAAACATAAAACAGCTGAACGGAAACA
CACCGTAACCAAATCAAGAAGGGATGCTTAATTTAGTTTGAAATCAGAGGGAGAGGGTGA
CAACTAGAGGGGTGACCAGTTCTTTGAATACATCCATGTTTCTCTCGTTGGAATCGACGA
CTACGATGGGACCTGCACGTACCGTGACGAGTCTGTTGGTAGGAGGGCTAGGGTTGCATG
TAGAGAGAGGGGTCATGACCATGCCACTACAACCGTCGTAAATGACTTCTGAAAGCGAGA
TCGTAGACACTGTGTTGGAAGGTGTGAGTATGGGCTTGACTCCGGGTTTCGTCTAACACA
TGTGGGCTTCTGAGTAACTCATTGATCAGCTGAAGCTTCTTGGACTCGAATCAGTCACGG
CCCATGCCAGCTCAAATTACTGAGACTCATTTATCTGTAA

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G
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GAACTTACGACCAATACTTTGAACATACATACGCTTTATTATGTAGACCTTATTCATGCA
TACGCAAGCAAACTTTAATGGTCATCACAGAAAACATAAAACAGCTGAACGGAAACACAC
CGTAACCAAATCAAGAAGGGATGCTTAATTTAGTTTGAAATCAGAGGGAGAGGGTGACAA
CTAGAGGGGTGACCAGTTCTTTGAATACATCCATGTTTCTCTCGTTGGAAACGACGACTA
CGATGGGACCTGCACGTACCGTGACGAGTCTGTTGGTAGGAGGGCTAGGGTTGCATGTAG
AGAGAGGGGTCATGACCATGGCACTACAACCGTCGTAGATGACTTCTGAAAGCGAGATCG
TAAACACTGTGTTGGAAGGTGTGAGTATGGGCTTGACTCCGGGTTTCGTCTAACACATGT
GGGCTTCTGAGTAACTCATTGATCAGCTGAAGCTTCTTGGACTCGAATCAGTCACGGCCC
ATGCCAGCTCAGATTACTGAGACTCATTTATCTGTAA

QA 2 578 2 578
DS 

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CCATGGCACTACAACCGTCGTAGATGACTTCTGAAAGCGAGATCGTAGACACTGTGTTGG
AAGGTGTGAGTATGGGCTTGACTCCGGGTTTCGTCTAACACATGTGGGCTTCTGAGTAAC
TCATTGATCAGCTGAAGCTTCTGGGACTCGAATCAGTCACGGCCCATGCCAGCTCAGATT
ACTGAGACTCATTTATCTGTAA

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DS 

RD RR4DR39TF 502 0 0
ACTTTGAACATACATACGCTTTATTATGTAGACCTTATTCATGCATACGCAAGCAAACTT
TAATGGTCATCACAGAAAACATAAAACAGCTGAACGGAAACACACCGTAACCAAATCAAG
AAGGGATGCTTAATTTAGTTTGAAATCAGAGGGAGAGGGTGACAACTAGAGGGGTGGCCA
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GTACCGTGACGAGTCTGTTGGTAGGAGGGCTAGGGTTGCATGTAGAGAGAGGGGTCATGA
CCATGGCACTACAACCGTCGTAGATGACTTCTGAAAGCGAGATCGTAGACACTGTGTTGG
AAGGTGTGAGTATGGGCTTGACTCCGGGTTTCGTCTAACACATGTGGGCTTCTGAGTAAC
TCATTGATCAGCTGAAGCTTCTGGGACTCGAATCAGTCACGGCCCATGCCAGCTCAGATT
ACTGAGACTCATTTATCTGTAA

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4BE46TF 578 0 0
G
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GAACTTACGACCAATACTTTGAACATACATACGCTTTATTATGTAGACCTTATTCATGCA
TACGCAAGCAAACTTTAATGGTCATCACAGAAAACATAAAACAGCTGAACGGAAACACAC
CGTAACCAAATCAAGAAGGGATGCTTAATTTAGTTTGAAATCAGAGGGAGAGGGTGACAA
CTAGAGGGGTGACCAGTTCTTTGAATACATCCATGTTTCTCTCGTTGGAAACGACGACTA
CGATGGGACCTGCACGTACCGTGACGAGTCTGTTGGTAGGAGGGCTAGGGTTGCATGTAG
AGAGAGGGGTCATGACCATGGCACTACAACCGTCGTAGATGACTTCTGAAAGCGAGATCG
TAGACACTGTGTTGGAAGGTGTGAGTATGGGCTTGACTCCGGGTTTCGTCTAACACATGT
GGGCTTCTGAGTAACTCATTGATCAGCTGAAGCTTCTTGGACTCGAATCAGTCACGGCCC
ATGCCAGCTCAGATTACTGAGACTCATTTATCTGTAA

QA 2 578 2 578
DS 



AS 1 8

CO CL826Contig1 739 8 12 U
GGACTCTCCTGGATCTGTGTCGAGCTCATTTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATC
CTTTTGTGAGTTTCGTCAAACGGAAGAGGAAGATGGTTGTGCGGCTACGATTATCGAGAC
TAGGATGCAAGAACCGACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAG
ACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTA
AGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCAT
CAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGG
CTATGGGACGTAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCT
TTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGA
GTCCATGATTCCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTT
CGTGAACTAATGGCGTTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTT
TCTAGCTGATCTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTT*GATGTGTT
TAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCAGGTTATAAGTTTTGAGGTTTATGA
TGTGCTTATTACCACTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 10 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4CF54JQ C 11
AF RR4EV41TF U 20
AF RR4D619TF U 1
AF RR4CF54TF U 11
AF RR4BU84TF U 11
AF RR4BU84JQ C 11
AF RR4BB32TF U 15
AF RR4D619JQ C 144
BS 1 10 RR4D619TF
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BS 640 677 RR4D619TF
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TTTCGTCAAACGGAAGAGGAAGATGGTTGTGCGGCTACGATTATCGAGACTAGGATGCAA
GAACCGACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCA
CATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGG
TCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGT
TCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACG
TAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGC
TGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATT
CCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAA
TGGCGTTTAGCCTTTTGTCTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4EV41TF 605 0 0
GG
GAGCTCATTTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCCTTTTGTGAGTTTCGTCAAAC
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TCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCT
TGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCG
ATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCC
TTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGTG
AAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATG***G*TCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAAC
CACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAGACTTA
AGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAATGGCGTTTAGC
CTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGCTGATCTTGGTTCTAT
TTT

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR4D619TF 677 0 0
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CTTTTGTGAGTTTCGTCAAACGGAAGAGGAAGATGGTTGTGCGGCTACGATTATCGAGAC
TAGGATGCAAGAACCGACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAG
ACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTA
AGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCAT
CAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGG
CTATGGGACGTAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTG*TCGCT
TTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGA
GTCCATGATTCCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTT
CGTGAACTAATGGCGTTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTT
TCTAGCTGATCTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAA*TTCACTATGTTT*GATGTGTT
TAAACGGAAAGGCGTGT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4CF54TF 699 0 0
GGATCTGTGTCGAGCTCATTTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCCTTTTGTGAG
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GAACCGACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCA
CATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGG
TCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGT
TCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACG
TAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGC
TGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATT
CCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAA
TGGCGTTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGCTGAT
CTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAA*TTCACTATGTTT*GATGTGTTTAA*CGGAAA
G*CGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCAG*TTATAAGTTTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4BU84TF 684 0 0
GGATCTGTGTCGAGCTCATTTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCCTTTTGTGAG
TTTCGTCAAACGGAAGAGGAAGATGGTTGTGCGGCTACGATTATCGAGACTAGGATGCAA
GAACCGACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCA
CATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGG
TCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGT
TCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACG
TAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGC
TGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATT
CCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAA
TGGCGTTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGCTGAT
CTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTT*GATGTGTTTAAACGGAAA
GGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BU84JQ 726 0 0
GGATCTGTGTCGAGCTCATTTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCCTTTTGTGAG
TTTCGTCAAACGGAAGAGGAAGATGGTTGTGCGGCTACGATTATCGAGACTAGGATGCAA
GAACCGACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCA
CATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGG
TCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGT
TCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACG
TAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGC
TGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATT
CCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAA
TGGCGTTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGCTGAT
CTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTT*GATGTGTTTAAACGGAAA
GGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCAGGTTATAAGTTTTGAGGTTTATGATGTGCTTATT
ACCAC
G

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4BB32TF 722 0 0
GG
GTGTCGAGCTCATTTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCCTTTTGTGAGTTTCGT
CAAACGGAAGAGGAAGATGGTTGTGCGGCTACGATTATCGAGACTAGGATGCAAGAACCG
ACCCTTCTTTCGGGTAATGGCGGCGGACAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCTA
GGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGCAAGAGAATGGGTCTCAA
GTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGTTCAGCG
TCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACGTAAAGG
TGGTGAAAGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAA
GAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAG
ACTTAAGGAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAATGGCGT
TTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGCTGATCTTGGT
TCTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTG
TTGAGGTCTTGAGGGACTCACGTTATAAGTTTTGAGGTTTATGATGTGCTTATTACCAC
T

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR4D619JQ 596 0 0
TTTCGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCTTG
GGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGAT
CGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCCCAGGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTT
TTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCGATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGTGAA
AGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTG*TCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCA
CCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAGACTTAAG
GAAGAAGAAGATGATGCAGAAGACGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAATGGCGTTTAGCCT
TTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGCTGATCTTGGTTCTATTT
TATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTT*GATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGT
CTTGAGGGACTCAGGTTATAAGTTTTGAGGTTTATGATGTGCTTATTACCACTACC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 4

CO CL827Contig1 904 4 17 U
GGATCATCATCATCTCTTGTCCAATTTACCCCCATCGTCTCCCTCTTTGCTTTCTCTGAC
AAGCTCTCATCTCATCATATAACAACAATGTTGGCGTCTTCGCTGTGCCTATCGAACTCT
CCCGTTTGCACTCACTCTCTTCCTAATGTCTCGACCCAGCCACTCCTCTCTTTCTCCCGT
TCCCTCAGGCCATTCGTTTCCAAGTCCAAACCTTTGGCCTCGCAGCAGAAGAAGAAGAGA
GAGAGCTCTGTGGTGGTGAAATCACAGGCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGAAGGT
GGATTCGGCTCCGACGATGACCCTTCTTCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGACAAA
CCCGAACCTCAGTGCCCGCCTGGTCTCCGACAGTACGAGACAATGGCCGTCTTGAGACCC
GACATGTCTGAAGATGAGCGCCTTGGTCTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCT
GGGGGTGGAATGTATGTGGAAGTATTCAACAGAGGAGTGATTCCTTTGGCTTACAGTATC
AGGAAGAAAAACAAAGCAGGAGAGACTAACACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTCTTC
ACTTATTTCACCAAACCTGAATCCATCACCCCCCTCGAGACAGTTCTCACTGCCGATGAC
GACGTTATCCGATCTTCTTCCTTCAAGATCAAGAAGAGGAAGTACAACTGAAACAGACAC
CATCAACAACATTGTGCGTTGTGAATGCATGTGACTAAAGTTTGATTCTTTTTGTATTAT
CTATTTGTGTTCTGTGTCTATGTATCTTCTTGTGAAATGCTCTGTGTTTCAAGTGTGAGA
AACTCTAACGCAAACTTTGAGAAACTTCCATAGTATATGCTTTTTCAAAACAAATTATTA
GCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4GD08TF U 55
AF RR4AJ13TF U 1
AF RR4GD08JQ C 148
AF RR4AJ13JQ C 179
BS 1 153 RR4AJ13TF
BS 154 154 RR4GD08TF
BS 155 179 RR4AJ13TF
BS 180 180 RR4GD08TF
BS 181 182 RR4AJ13TF
BS 183 183 RR4GD08TF
BS 184 215 RR4AJ13TF
BS 216 216 RR4GD08TF
BS 217 416 RR4AJ13TF
BS 417 417 RR4GD08TF
BS 418 528 RR4AJ13TF
BS 529 529 RR4GD08TF
BS 530 736 RR4AJ13TF
BS 737 737 RR4GD08TF
BS 738 806 RR4AJ13TF
BS 807 843 RR4GD08JQ
BS 844 904 RR4AJ13JQ

RD RR4GD08TF 696 0 0
GCT
GACAAGCTCTCATCTCATCATATAACAACAATGTTGGCGTCTTCGCTGTGCGTATCGAAC
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AGAGAGAGCTCTGTGGTGGTGAAATCACAGGCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGGA
GGTGGATTCGGCTCCGACGATGACCCTTCTTCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGAC
AAACCCGAACCTCAGTGCCCGCCTGGTCTCCGACAGTACGAGACAATGGCCGTCTTGAGA
CCCGACATGTCTGAAGATGAGCGCCTTGGTCTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTG
GCTGGGGGTGGAATGTATGTGGAAGTATTCAACAGAGGAGTGATTCCTTTGGCTTACAGT
ATCAGGAAGAAAAACAAAGCAGGAGAGACTAACACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTC
TTCACTTATTTCACCAAACCTGAATCCATCACCCCCCTCGAGACAGTTCTCACTGCCGAT
GACGACGTTATCCGATCTTCTTCCTTCAAGATCAAGAAGAGGAAGTACAACTGAA*CAGA
CACCATCAACA*CATTGTGCGTTGTGAATGCAT

QA 4 696 4 696
DS 

RD RR4AJ13TF 806 0 0
GGATCATCATCATCTCTTGTCCAATTTACCCCCATCGTCTCCCTCTTTGCTTTCTCTGAC
AAGCTCTCATCTCATCATATAACAACAATGTTGGCGTCTTCGCTGTGCCTATCGAACTCT
CCCGTTTGCACTCACTCTCTTCCTAATGTCTCGTCCCAGCCACTCCTCTCTTTCTCCCGC
TCTCTCAGGCCATTCGTTTCCAAGTCCAAACCTTTTGCCTCGCAGCAGAAGAAGAAGAGA
GAGAGCTCTGTGGTGGTGAAATCACAGGCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGAAGGT
GGATTCGGCTCCGACGATGACCCTTCTTCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGACAAA
CCCGAACCTCAGTGCCCGCCTGGTCTCCGACAGTACGAGACAATGGCCGTCTTGAGCCCC
GACATGTCTGAAGATGAGCGCCTTGGTCTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCT
GGGGGTGGAATGTATGTGGAAGTATTCAACAGAGGAGTGATTCCTTTGTCTTACAGTATC
AGGAAGAAAAACAAAGCAGGAGAGACTAACACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTCTTC
ACTTATTTCACCAAACCTGAATCCATCACCCCCCTCGAGACAGTTCTCACTGCCGATGAC
GACGTTATCCGATCTTCTTCCTTCAAGATCAAGAAGAGGAAGTACAACTGAAACAGACAC
CATCAACAACATTGTGTGTTGTGAATGCATGTGACTAAAGTTTGATTCTTTTTGTATTAT
CTATTTGTGTTCTGTGTCTATGTATC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4GD08JQ 714 0 0
GTCTCGACCCAGCCACTCCTCTCTTTCTCCCGTTCCCTCAGGCCATTCGTTTCCAAGTCC
AAACCTTTGGCCTCGCAG***AAGAAGAAGAGAGAGAGCTCTGTGGTGGTGAAATCACAG
GCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGGAGGTGGATTCGGCTCCGACGATGACCCTTCT
TCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGACAAACCCGAACCTCAGTGCCCGCCTGGTCTC
CGACAGTACGAGACAATGGCCGTCTTGAGACCCGACATGTCTGAAGATGAGCGCCTTGGT
CTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCTGGGGGTGGAATGTATGTGGAAGTATTC
AACAGAGGAGTGATTCCTTTGGCTTACAGTATCAGGAAGAAAAACAAAGCAGGAGAGACT
AACACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTCTTCACTTATTTCACCAAACCTGAATCCATC
ACCCCCCTCGAGACAGTTCTCACTGCCGATGACGACGTTATCCGATCTTCTTCCTTCAAG
ATCAAGAAGAGGAAGTACAACTGAAACAGACACCATCAACAACATTGTGCGTTGTGAATG
CATGTGACTAAAGTTTGATTCTTTTTGTATTATCTATTTGTGTTCTGTGTCTATGTATCT
TCTTGTGAAATGCTCTGTGTTTCAAGTGTGAGAAAC
TCTAACGCAAACTTTGAG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4AJ13JQ 726 0 0
GCTCT
CTCAGGCCATTCGTTTCCAAGTCCAAACCTTTTGCCTCGCAGCAGAAGAAGAAGAGAGAG
AGCTCTGTGGTGGTGAAATCACAGGCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGAAGGTGGA
TTCGGCTCCGACGATGACCCTTCTTCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGACAAACCC
GAACCTCAGTGCCCGCCTGGTCTCCGACAGTACGAGACAATGGCCGTCTTGAGCCCCGAC
ATGTCTGAAGATGAGCGCCTTGGTCTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCTGGG
GGTGGAATGTATGTGGAAGTATTCAACAGAGGAGTGATTCCTTTGTCTTACAGTATCAGG
AAGAAAAACAAAGCAGGAGAGACTAACACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTCTTCACT
TATTTCACCAAACCTGAATCCATCACCCCCCTCGAGACAGTTCTCACTGCCGATGACGAC
GTTATCCGATCTTCTTCCTTCAAGATCAAGAAGAGGAAGTACAACTGAAACAGACACCAT
CAACAACATTGTGTGTTGTGAATGCATGTGACTAAAGTTTGATTCTTTTTGTATTATCTA
TTTGTGTTCTGTGTCTATGTATCTTCTTGTGAAATGCTCTGTGTTTCAAGTGTGAGAAAC
TCTAACGCAAACTTTGAGAAACTTCCATAGTATATGCTTTTTCAAAACAAATTATTAGCT
C

QA 6 726 6 726
DS 



AS 1 8

CO CL828Contig1 534 8 4 U
GTGAGTAGCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTT
GCAGATGCAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGA
TATCACTACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTT
TTCACAGCACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCT
GATGTCCCGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTA
GCATTGGCTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCG
TGCTTCTTCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCT
TTCTCTCTCTCT**AACTCGCTCGGCTCCTCACAATCAGTGATATTTGTTATGTTAATTA
CTTTTAAATTATTTTTCTTAAAACATTCAGTGCAATTAGAGATTTTGCTATCCT


BQ
10 10 30 30 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4D427JQ U 1
AF RR4FB23JQ U 2
AF RR4FB23TF C 2
AF RR4D427TF C 1
AF RR4AW41JQ U 8
AF RR4AW92JQ U 8
AF RR4AW41TF C 8
AF RR4AW92TF C 8
BS 1 181 RR4D427JQ
BS 182 182 RR4AW41JQ
BS 183 448 RR4D427JQ
BS 449 534 RR4AW41JQ

RD RR4D427JQ 456 0 0
GTGAGTAGCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTT
GCAGATGCAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGA
TATCACTACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTT
T*CACAGCACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCT
GATGTCCCGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTA
GCATTGGCTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCG
TGCTTCTTCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCT
TTCTCTCTCTCT**AACTCGCTCGGCTC
GATCTCCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4FB23JQ 449 0 0
C
GAGTAGCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTTGC
AAATGCAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGATA
TCACTACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTT*
CACAGCACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGA
TGTCCCGCACGCCTTTAAAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGC
ATTGGCTTTACAAGTAAAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTG
CTTCTTCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTT
CTCTCTCTCTCTAACTCGCTCGGCTC
CC

QA 2 447 2 447
DS 

RD RR4FB23TF 449 0 0
C
GAGTAGCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTTGC
AGATGCAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGATA
TCACTACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTT*
CACAGCACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGA
TGTCCCGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGC
ATTGGCTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTG
CTTCTTCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTT
CTCTCTCTCTCTAACTCGCTCGGCTC
CC

QA 2 447 2 447
DS 

RD RR4D427TF 456 0 0
GT
GAGTAGCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTTGC
AGATGCAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGATA
TCACTACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTT*
CACAGCACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGA
TGTCCCGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGC
ATTGGCTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTG
CTTCTTCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTT
CTCTCTCTCT**AACTCGCTCGGCTC
GATCTCCC

QA 3 448 3 448
DS 

RD RR4AW41JQ 527 0 0
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ACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTTTCACAG
CACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGATGTCC
CGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGCATTGG
CTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTGCTTCT
TCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTTCTCTC
TCT****AACTCGCTCGGCTCCTCACAATCAGTGATATTTGTTATGTTAATTACTTTTAA
ATTATTTTTCTTAAAACATTCAGTGCAATTAGAGATTTTGCTATCCT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4AW92JQ 527 0 0
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CAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGATATCACT
ACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTTTCACAG
CACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGATGTCC
CGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGCATTGG
CTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTGCTTCT
TCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTTCTCTC
TCT****AACTCGCTCGGCTCCTCACAATCAGTGATATTTGTTATGTTAATTACTTTTAA
ATTATTTTTCTTAAAACATTCAGTGCAATTAGAGATTTTGCTATCCT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4AW41TF 527 0 0
GCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTTGCAGATG
CAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGATATCACT
ACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTTTCACAG
CACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGATGTCC
CGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGCATTGG
CTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTGCTTCT
TCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTTCTCTC
TCT****AACTCGCTCGGCTCCTCACAATCAGTGATATTTGTTATGTTAATTACTTTTAA
ATTATTTTTCTTAAAACATTCAGTGCAATTAGAGATTTTGCTATCCT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4AW92TF 527 0 0
GCTGACCAATAATTTTCTTGATCACAATAACAACACAAAAGTCTCTTGTTGTTGCAGATG
CAACATGTTTAAAAACCAATATAACCTAACAAGTAAACACCACAAAGTTGAGATATCACT
ACAGTAACGACCATGTTTGTAGCTTCTCATCCTCCTCCTCCTCACTCATTTTTTTCACAG
CACTGGCACATGTTTCTGTGTTGCTGCTAACTCCCGGAGAAATTGATGCATCTGATGTCC
CGCACGCCTTTAGAACAGCCTCATTCTGCCAAACGCGACGGAGGCGGGTTTTAGCATTGG
CTTTACGAGTAGAGGTAAGCTTGATTCTCTTCCAAATGAGACCACCTGAATCGTGCTTCT
TCACTATTTCCATCACCCTAGTTCCCCAAAACGCTCCCATCGCCGCCTACTCTTTCTCTC
TCT****AACTCGCTCGGCTCCTCACAATCAGTGATATTTGTTATGTTAATTACTTTTAA
ATTATTTTTCTTAAAACATTCAGTGCAATTAGAGATTTTGCTATCCT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 2 5

CO CL829Contig1 617 2 8 U
GGAGATTCACAGAGCTTAACAAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAAATC
AAAAGACGGTAACTTTCGAGTGAAGAAAGATGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGG
ACCAGTCAACGGTGGCGATAAAGGAAACGTTTGGGAAGTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTG
GTTGCCATTTTCCCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTTGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGC
TTCAGCAGTTGGATGTTCGTTGCGAGACTAAGACTAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTG
TTGCATCGATTCAGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAGCTTA
GTAACACTAGGAGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCA
AGCTGATTCTTGATGATGTCTTTGAGCAGAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGG
AGCTCGAGAAGGCAATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATCGTTGACA
TCGAGCCTGACGAACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCAAGGATGA
GGTTGGCTGCGAACGAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F617TF U 1
AF RR4EP55TF U 3
BS 1 68 RR4F617TF
BS 69 78 RR4EP55TF
BS 79 192 RR4F617TF
BS 193 193 RR4EP55TF
BS 194 365 RR4F617TF
BS 366 367 RR4EP55TF
BS 368 591 RR4F617TF
BS 592 617 RR4EP55TF

RD RR4F617TF 591 0 0
GGAGATTCACAGAGCTTAACAAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAAATC
AAAAGACG**********AGTGAAGAAAGATGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGG
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GTTGCCATTTTCTCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTTGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGC
TTCAGCAGTTGGATGTTCGTTGCGAGACTAAGACTAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTG
TTGCATCGATTCAGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAGCTTA
GTAAC**TAGGAGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCA
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AGCTCGAGAAGGCAATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATCGTTGACA
TCGAGCCTGACGAACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4EP55TF 615 0 0
G
GATTCACAGAGCTTAACAAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAGAATCAAA
AGACGGTAACTTTCGAGTGAAGAAAGATGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGGACC
AGTCAACGGTGGCGATAAAGGAAACGTTTGGGAAGTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTGGTT
GCCATTTTCCCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTTGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGCTTC
AGCAGTTGGATGTTCGTTGCGAGACTAAGACTAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTGTTG
CATCGATTCAGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAGCTTAGTA
ACACTAGGAGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGC
TGATTCTTGATGATGTCTTTGAGCAGAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGC
TCGAGAAGGCGATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATCGTTGACATCG
AGCCTGACGAACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCAAGGATGAGGT
TGGCTGCGAACGAA

QA 2 615 2 615
DS 



CO CL829Contig2 1084 3 12 U
GGAATATAATAACGAAAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAACACAAGAGAT
CATAGGATCTTAACACACAGCAAGCTTAGTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCT
ATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGACCATCTCTGATCTGAGTAGCC
ACATCGCGAACAGCTACTGGCTCGTGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCA
CCAATCTCCTTCATCGTGTCAAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTA
GCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAAAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACA
ATGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCTAAACCAAACAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCT
TCAGCTCGATTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTCGCAGCCAACCTC
ATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATG
TCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCC
TCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCAAGAATCAGCTTG
GGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTG
AGTTTGTAGAAGGCATCATTGGCATTATTAGCCAAGGCACGGTACTGAATCGATGCAACA
ACGTTAACAAACACATTGTCCTTGGTCTTAGTCTCGCAGCGAACATCCAACTGCTGAAGC
CTGAGAGAGAGGTGACCAGCAACTTGCTGACCAAGACACCATGGGAGAAAATGGCAACCA
GGCTCTAGAACATCTTCGAACTTCCCAAACGTTTCTTTGATCGCCACCGTTGATTGGTCC
ACTTGTACACGGCACAGTAAATTCCCCATCTTTCTTCACGGATTCTCGAAGGTTGTCGTC
TTTTGATTTTCTTCTGGGTTTGATTTTAGATGAGACGTTTTTTTTTGTTAAGCTCTGTGA
ATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4CU67JQ U 220
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GCAA
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TGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAAAAACCAAGGACGCTGT
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TGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGATTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTT
CGTTCGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCATTTGACAT
GTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACA
TTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGC

QA 5 414 5 414
DS 

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CCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTA
GCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACA
ATGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCTAGACCAGAGAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCT
TCAGCTCGATTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTCGCAGCCAACCTC
ATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATG
TCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCC
TCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCAAGAATCAGCTTG
GGG

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DS 

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ATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTCGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAGCGTTGATT
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ATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTTTGGCAATT
TCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCAAGAATCAGCTTGGGGACACTTGCTCTGATAACA
TCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTGTAGAAGGCATCATTG
GCATTATTAGCCAAGGCACGGTACTGAATCGATGCAACAACGTTAACAAACACATTGTCC
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ACTTGCTGACCAAGACACCATGGGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAACATCTTCGAAC
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TTCCCCATCTTTCTTCACGGATTCTCGAAGGTTGTCGTCTTTTGATTTTCTTCTGGGTTT
GATTTTAGATGAGACGTTTTTTTTTGTTAAGCTCTGTGAATCC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 8

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TATCTGTATTGTCTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTAGCTAGACACTCCT
GGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATT
AAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAATGC
AGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTTCTGAGAAGAAGCAGCGGT
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TGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTT
CATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCT
TGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTGATCTAGCTGTAGAAGA
ATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAG
CTTCTCGAAGAAGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATAT
GAATGAACTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGA
TGAACTTGAGCTCTCGCTTTTCTCGCTTTTGGATTGTTGTTGATTCATGGAAGAAGCAGC
ACTTCCAGCGTTGGATTCTTGCTTACTGGAAGAAGCAGCAGCCTTTCCACTCTCTTTTTT
AGAGGACTTACCCTTAGCAGAAGTGGGACTTGCTTCCGGGCTTCCTGAGGTTCTATCCTC
ACCAGAAGTGGGACTTCCTGTCGGGCTTCCCGCAGATGCACCTGTCGTGTCATCAAAAGT
AACACCAGCTTTGGTCGAAGAACTAGCACCAGCTTTGGTCGAAGAACTAGCACCAGCCTT
GGTCGAGGAGGCTTCTTTGGTTTTGGCTGATGAACCACTCTTCTCCTTCTGCTCCTCCTT
CTTCCCCTCCTTCTTCGCCTCCCTCTTCTCAGCCTTCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTTATC
CTTCTTCTCAGTCTTATCCTTCTTCTCACCCTTCTCCTCCTTCTTCTCAGCCTTCTCACC
CTTCTCAGCCTGCTCACCCTTCTTCTCCTCCTTCTCAGCCTTCTCACCCTTCTCACCCTT
CTTCTCCTCCTTCTCAGCCTTCTCACCCTTCTCGGTGGTTTCTTTAGCCCTTCCTGAAGA
GCCACTTTCTGCTCCAGCCTTTGCTGAAGAGCCAGCTTGTGCTCTAGCCTTTGCTGAAGA
TTCAGTTTCTGCTCTAGCGGCATAACTCGAAGAGTTTGATGAGGATTCGGAACTGGATTT
TTGGGATGAAGAGCTACTATGGCTGCTTCCACTAACAGTCATGATAGATTTGTCATTGAC
ATCAACATCAAGTCCAAAAGAGTTTATATCGACTTTCTTTCCTTTCTTCTCAGCTGCTGT
CTTCACGACTGTAGCAATCGATTTAGTCCACTGCACCATTGATGTGACTAGAGTTTTCTT
TTCAGTAGACGTTATCGTCTTTGTGCTCTGTTTCTGTTCAACCAAAGTCTTTGCCATAGA
GGCCATGGTAGATTTGAAACTCCCTGCTTCCGCAGATTGTTGGCCTGCACCACCACTTAT
TGCAGACACAGCTTTCGAAAGCCCGTCCATGTTTTGTGATGAGGAGGACGAGGACGATGA
CGATGACGATGACGATGATGTTTGGATGGAGCTCATGTAAGACCTGCATTCTGTGAAGAA
ACCTTTGAACTCTGGAGTCGGTGGACAAATACGTTCAAGGTCGGTCAAGAACTCTGTCAA
ACCCTTCTTAGCGTATGGCGCAAATTCGTTGCTCTTGCTTGGAAACTGAGTCGTCAAGTA
ATTCTTCAACAAGAAATGTCCTTGCGCTTCATAAATCACACTTGATGTTACTACTAACAT
CAGACACAACCCTAGTGAAATCCTTGCCATGTTTTTCAATAAAAGAACACAAAATGAAAT
AACAAAACAAAGTAAAAGTGTCTTTTTTTCGTTTTCTTTTTAATTAATTATTTTCTTTTT
TTCTTCTTTTCGAATTGTTTCC


BQ
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK47JQ U 1
AF RR4FM95JQ U 1
AF RR4GM56JQ U 1
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BS 429 515 RR4FM95JQ
BS 516 516 RR4GK47JQ
BS 517 746 RR4FM95JQ
BS 747 885 RR4GK47TF
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CATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCT
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AGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTTCTGAGAAGAAGCAGCGGT
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CTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTACTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGA
TGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTT
CATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCT
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AGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTTCTGAGAAGAAGCAGCGGT
CTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAAAAGAAGCAGCTGTATGTTTCTGAAAAGA
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TTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGAAGCTGAGCTTGAAGAAGCAGCAGTCTCAACAAA
CTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGA
TGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTT
CATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTTTGATTTGCTAAATCT
TGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTGGTCTAGCTGTAGAAGA
ATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAG
AAACCC

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DS 

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CTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAACCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCT
GTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTT
CTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGA
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AGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTG
TTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCAC

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TCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTT
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CTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGG
TTGATCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGG
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TCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTTGAGCTC
C

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AGGACTTACCCTTAGCAGAAGTGGGACTTGCTTCCGGGCTTCCTGAGGTTCTATCCTCAC
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TCGAGGAGGCTTCTTTGGTTTTGGCTGATGAACCACTCTTCTCCTTCTGCTCCTCCTTCT
TCCCCTCCTTCTTCGCCTCCCTCTTCTCAGCCTTCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTTATCCT
TCTTCTCAGTCTTATCCTTCTTCTCACCCTTCTCCTCCTTCTTCTCAGCCTTCTCACCCT
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TCTCCTCCTTCTCAGCCTTCTCACCCTTCTCGGTGGTTTCTTTAGCCCTTCCTGAAGAGC
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CAGTTTCTGCTCTA
C

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AGCCTTTGCTGAAGATTCAGTTTCTGCTCTAGCGGCATAACTCGAAGAGTTTGATGAGGA
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GACTAGAGTTTTCTTTTCAGTAGACGTTATCGTCTTTGTGCTCTGTTTCTGTTCAACCAA
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GCATTCTGTGAAGAAACCTTTGAACTCTGGAGTCGGTGGACAAATACGTTCAAGGTCGGT
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CTGAGTCGTCAAGTAATTCTTCAACAAGAAATGTCCTTGCGCTTCATAAATCACACTTGA
TGTTACTACTAACATCAGACACAACCCTAGT

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DS 

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TGTGCTCTAGC*TTTGCTGAAGAT*CAGTTTCTGCTCTAGCGGCATA*CTCGAAGAGTTT
GATGAGGAT*CGGAACTGGATTTT*GGGATGAAGAGCTACTATGGCTGCT*CCACTAACA
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TTTCCTTTCTTCTCAGCTGCTGTCTTCACGACTGTAGCAATCGATTTAGTCCACTGCACC
ATTGATGTGACTAGAGTTTTCTTTTCAGTAGACGTTATCGTCTTTGTGCTCTGTTTCTGT
TCAACCAAAGTCTTTGCCATAGAGGCCATGGTAGATTTGAAACTCCCTGCTTCCGCAGAT
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GATGAGGAGGACGAGGACGATGACGATGACGATGACGATGATGTTTGGATGGAGCTCATG
TAAGACCTGCATTCTGTGAAGAAACCTTTGAACTCTGGAGTCGGTGGACAAATACGTTCA
AGGTCGGTCAAGAACTCTGTCAAACCCTTCTTAGCGTATGGCGCAAATTCGTTGCTCTTG
CTTGGAAACTGAGTCGTCAAGTAATTCTTCAACAAGAAATGTCCTTGCGCTTCATAAATC
ACACTTGATGTTACTACTAACATCAGACACAACCCTAGTGAAATCCTTGCCATGTTTTTC
AATAAAAGAACACAAAATGAAATAACAAAACAAAGTAAAAGTGTCTTTTTTTCGTTTTCT
TTTTAATTAATTATTTTCTTTTTTTCTTCTTTTCGAATTGTTTCC

QA 5 829 5 829
DS 



AS 1 7

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ATACTAAACACAAGCACTTAGATCTTATAAGATCAGAACAGAGCAGTAAACTTGATCCTT
CTTAATAACTCCACGCATCACAAAGGCTTAAATAGCAGTTTCAACATCACTACCATCACC
ATCAACACCATCATCGTCATATTAATATTCTTCCAATCCCCAAGTTAACCAAAAAAAATA
TGAATAAAATATGCTACAAGAGCACAAGTACAAATCTTGGTGATAAAATAACA***GATG
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AGGAAAAACAAATATAGCTTGAACTGTGGGTGAAATCCTCCATAAAAGACCCTAATTTGT
TTTTTT*ATAAGAATGGCAATGTAAAAAGATAATTAATTAATGAGGATGATGATGTTGCT
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AAAAATAAAGAACCAAACCAAGAACAGATATTCCATTTTTCTTCCCTTTCACACTTTGCA
TATGAAATCAAGATTGTTGATTTATTCTTTCTCTGCCCACAATGAAAGATCTCAGACATG
GCAACCAAAGCAATTGCAGGATTTGGGAGTGAAGGAGCAATAACCAAAGGGTCTATTTGG
GATGTTGCAGTTAATTGCAAAGCAACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCC
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TACCATAAACTTCTCCTCCATTAATGGCTCCATTCTCACCTCTCCTTCTCCTTCTTTTTT
AGATTGTGCTGTTAGCTAATTTGCCTGGAGACTGAAAGTGACGAAGACTGAGAAGCAAAG
AAGCAGCAGAACAATAGAGATCTTAGATTCTTCTAAAGCTCTCATCTTCTTTTTTCCTTT
CGTTGTGAAAGAGTTGTGTTTTTTTTAGTAAAGTAGCTAATGACTTAATTTTCTCTCTTA
TTTCACTTTCGCCTTCTTCGTCCTCAACTCTCTCGAGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 10 10 10 25 25 
10 25 10 10 10 10 10 10 10 25 25 10 10 25 25 25 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G625JQ U 1
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AF RR4AZ51TF C 122
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AF RR4B359JQ U 442
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AAAAATAAAGAACCAAACCAAGAACAGATATTCCATTTTTCTTCCCTTTCACACTTCGCA
TATGAAATCAAGAT*GTTGGTTTATTCTTCCTCTGCCCACAATGAAAGATCTCAGACATG
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GATGTTGCAGTTAATTGCAAAGCAACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCC
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AGAAACTGAATGAAGAGAGAAGGAAAAACAAATATAGCTTGAAGTGTGGGTGAAATCCTC
CATAAAAGACCCTAATTTGTTTTTTT*ATAAGAATGGCAATGTAAAAAGATAATTAATTA
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AAATTATAAACAAAAATAATAAAAATAAAGAACCAAACCAAGAACAGATACTCCATTTTT
CTTCCCTTTCACACTTTGCATATGAAATCAAGATTGTTGATTTATTCTTTCTCTGCCCAC
AATGAAAGATCTCAGACATGGCAACCAAAGCAATTGCAGGATTTGGGAGTGAAGGAGCAA
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TTAATAATTT
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CATCGTCATATTAATATTCTTCCAATCCCCAAGTTAACCAAAAAAAATATGAATAAAATA
TGCTACAAGAGCACAAGTACAAATCTTGGTGATAAAATAACA***GATGGGAAACAAAAT
GGAGAGAACAGAAAGAAAAAAACAGATATAGAAACTGAATGAAGAGAGAAGGAAAAACAA
ATATAGCTTGAAGTGTGGGTGAAATCCTCCATAAAAGACCCTAATTTGTTTTTTT*ATAA
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GATTGTTGATTTATTCTTTCTCTGCCCACAATGAAAGATCTCAGACATGGCAACCAAAGC
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TAATTGCAAAGCAACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCCACAACAAGTGC
AAACTGAACATATCTGGAAACTCCCA
C

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TTAAAGAAGACTGAAAATAAAATTATAAACAAAAATAATAAAAATAAAGAACCAAACCAA
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TAATGGCTCCATTCTCACCTCTCCTTCTCCTTCTTTTTTAGATTGTGCTGTTAGCTCATT
TGCCTGGAGACTGAAAGTGACGAA

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DS 

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CCATTTTTCTTCCCTTTCACACTTCGCATATGAAATCAAGAT*GTTGGTTTATTCTTCCT
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AGGAGCAATAACCAAAGGGTCTATTTGGGATGTTGCAGTTAATTGCAAAGCAACAAGGTA
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T

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DS 

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TCTGGAAACTCCCAAGCTTCCTTCTTGTTTCATTCATTACCATAAACTTCTCCTCCATTA
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TTTAGTAAAGTAGCTAATGACTTAATTTTCTCTCTTATTTCACTTTCGCCTTCTTCGTCC
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DS 

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GC
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AAAGAAGACTGAAAATAAAATTATAAACAAAAA*AATAAAAATAAAGAACCAAACCAAGA
ACAGATATTCCATTTTTCTTCCCTTTCACACTTTGCATATGAAATCAAGATTGTTGATTT
ATTCTTTCTCTGCTCACAATGAAAGATCTCAGACATGGCAGCCAAAGCAATTGCAGGATT
TGGGAGTGAAGGAGCAGTAACCAAAGGGTCTATTTGGGATGTTGCAGTTAATTGCAAAGC
AACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCCACAACAAGTGCAAACTGAACATA
TCTGGAAACTCCCAAGCTTCCTTCTTGTTTCATTCATTACCATAAACTTCTCCTCCATTA
ATGGCTCCATTCTCACCTCTCCTTCTCCTTCTTTTTTAGATTGTGCTGTTAGCTAATTTG
CCTGGAGACTGAAAGTGACGAAGACTGAGAAGCAAAGAAGCAGCAGAACAATAGAGATCT
TAGATTCTTCTAAAGCTCTCATCTTCTTTTTTCCTTTCGTTGTGAAAGAGTTGTGTTTTT
TTTAGTAAAGTAGCTAATGACTTAATTTTCTCTCTTATTTCACTTTCGCCTTCTTCGTCC
TCAACTCTCTCGAGCTCCC

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DS 



AS 1 8

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TTAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATAGCGATCTTTG
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TGCATTTTTATAATAATAAATAACATAAATATGAATC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 10 50 50 50 50 35 50 10 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BX26TF U 1
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AF RR4BY73TF U 10
AF RR4BY86TF U 1
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DS 

RD RR4BY73JQ 391 0 0
TT
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DS 

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T
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TAATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTT

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RD RR4BY73TF 461 0 0
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TTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTAACATTC
TGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATAGCGATCTTTGAAGT*TTTT
TTTTTTAAATTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTATAATAAAG
TATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTT

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4BY86TF 470 0 0
T
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AAAAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTTGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATAGCGATCTTTGA
AGT*TTTTTTTTTTAAATTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTA
TAATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTT

QA 2 470 2 470
DS 

RD RR4GR89TF 516 0 0
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AAAAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGA
AGTATTTTTTTTTTAAATTTCT*TCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTA
TAATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTTGTT
GCATTTTTATAATAATGAATAACATAAATATGAATC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4FR94JQ 518 0 0
GGAC
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AAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTTTTGACCGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAAT
GATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGA
TGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGG
GAAGAGTTTGTGTTTTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTA
ACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATTATATCGATTTCTGAAG
TATTTTTTTTTTAAATTTCTCTCTTGTTTTTCCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTATA
ATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTTGTTGC
ATTTTTATAATAATAAATAACATAAATATGAATC

QA 5 518 5 518
DS 

RD RR4FR94TF 518 0 0
GGAC
ATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATGAA
AAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTTTTGACCGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAAT
GATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGA
TGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGG
GAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTA
ACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATTATATCGATCTCTGAAG
TATTTTTTTTTTAAATTTCTCTCTTGTTTTTCCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTATA
ATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTTGTTGC
ATTTTTATAATAATAAATAACATAAATATGAATC

QA 5 518 5 518
DS 



AS 1 8

CO CL833Contig1 574 8 5 U
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GCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGTTAAACCCAACACAGTCGAGTC
TAAGAACAGAGTCTCACTCAGTGCGTACAACTTGAGCAACAGTCATGGAAGAAGAAGAGC
AGTGATTGTGAAAGCAGCTGCTTCTGGAGTAGACGGAGCTGAGCCCGAGAGCAATGAGGA
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AGCTAAAGAGAAGTTACTGCTTGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAG
GCTACGCAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGTTGGCCACC
TTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAACGCTGATCCCTTTGCTTCCTTTC
ATTTGAATTTTTTCTTTTGTAATGGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTTGGAT
TAATATCAAGCTGAGTTATTTAAAAGGATTCATT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GX69JQ C 24
AF RR4GX69TF U 1
AF RR4GD61JQ C 1
AF RR4GD61TF U 1
AF RR4GR87JQ C 1
AF RR4GR87TF U 1
AF RR4BV17JQ C 10
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GGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTTGGAT
G

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR4GX69TF 541 0 0
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AGTGATTTTGAAAGCAGCTGCTTCTGGAGTAGACGGAGCTGAGCCCGAGAGCAATGAGGA
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G

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DS 

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T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4GD61TF 541 0 0
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T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4GR87JQ 561 0 0
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TAATATCAAGCTGAGTTATTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4GR87TF 561 0 0
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TAAGAACAGAGTCTCACTCAGTGCGTACAACTTGAGCAACAGTCATGGAAGAAGAAGAGC
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AGCTAAAGAGAAGTTACTGCTTGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAG
GCTACGCAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGTTGGCCACC
TTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAACGCTGATCCCTTTGCTTCCTTTC
ATTTGAATTTTTTCTTTTGTAATGGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTTGGAT
TAATATCAAGCTGAGTTATTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4BV17JQ 565 0 0
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QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4BV17TF 565 0 0
GAAGATGGCTCTTCTCTGTCTCAATTCTCTCGCTCCTCTTTCTTCTCCAAGGCTTCAACT
TTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGTTAAACCCAACACAGTCGAGTCTAAGAACAG
AGTCTCACTCAGTGCGTACAACTTGAGCAACAGTCATGGAAGAAGAAGAGCAGTGATTGT
GAAAGCAGCTGCTTCTGGAGTAGACGGAGCTGAGCCCGAGAGCAATGAGGAACCACCTAA
GACTGTTGTCGCTGCTGTTCCAGTTGACAAACTACCATTGGAATCAAAAGAAGCTAAAGA
GAAGTTACTGCTTGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTACGCAG
GAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGAT
GAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAACGCTGATCCCTTTGCTTCCTTTCATTTGAATT
TTTTCTTTTGTAATGGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTTGGATTAATATCAA
GCTGAGTTATTTAAAAGGATTCATT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 8

CO CL834Contig1 1525 8 24 U
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GTTTGGCGATTGAATTGAAGAACTAGTTTCTAGATAACTGCCCAGCGAGGGGGACTCTTT
TATCTCTCTAGGAAGATCCAGAAGAATCATAGACAGCCGAGTAACCTCGCCGGAACATCA
GATCCAATCTCCATTTTCGAGAACTTCAAACTTGTGATCGAAAGAGGGAGGAAGCACCCA
AGGCAATCTGCGTTGCGTTGCGTTGTGGTGAATGTGATTCGCGATCTGAAAAAAAAAATG
GCGAGGAAAGGGACGAGTATTAGATTATCGAGCTCCAGAATCTCTTCTTCCCTTTTGCTC
TCAATGTTCGCTACTTTCGCTTCCTTCTACGTCGCTGGCCGTCTATGGCAAGAATCGCAA
ACCAGGGTTCATCTTCTAAGCGAGCTCCACCGAGTTACCGGACAGGGGAAATCTGCCATC
TCAGTGGATGATACTTTGAAGATCATAGCTTGCAGGGAACAGAAGAAGACACTAGCAGCT
CTTGAGATGGAGCTTAGTGCTGCTAGGCAACAAGGCTTTGTTCCAAAGCGTACTACTGAT
GGAACCGAGACCAAGAAAAGACCACTTGTGGTTATCGGTATTATGACTTCTTTGGGTAAC
AAGAAGAAAAGGGATGCAGTCCGGCAAGCATGG*ATGGGAACTGGTGCATCACTGAAAAA
AATTGAAACTGAAAAGGGTGTGATTGCACGTTTTGTTATTGGTAGAAGCGCAAACAAAGG
GGACAGCATGGACAAGAGCATTGACGCTGAAAACAGTCAAACCGATGACTTCATTATTCT
TGATGATGTAGTTGAGGCACCCGAAGAAGCTTCTAAGAAGGTAAAGCTGTTCTTTGCCTA
TGCTGCGGATAGGTGGGATGCACAGTTTTATACAAAGGCCAACGATAATATCTACGTAAA
TATGGATGTACTCGGGAGTACACTTGCAGCACATCTAGGGAACCCGAGGGCTTACATTGG
TTGCATGAAATCAGGCGAAGTTTTCTCAGAACCGAACCAAAAATGGTATGAACCAGAATG
GTGGAAATTCGGTGACAAGAAATCATACTTCCGGCATGCTTATGGGGAGATGTATGTTAT
AACACATGCATTGGCTAGATTTGTATCGATCAATAGGGACATACTTCATGCGTATGCTCA
TGATGACGTGAGCACGGGGTCATGGTTCGTGGGACTTGATGTGAAACATGTAGATGAAGG
AAAGTTTTGCTGTTCCGCTTGGTCCTCAGAAGCTATATGCGCAGGAGTGTAGCCGGACCA
AATTTACATAGAAGTGTGAGGGCTTTGCTGCTTATAGAGAAGCACACACATAACATATCT
GTCTGAAAAGGGATAATACACCATTTACTTCTTTATGTATCTTTATACTTTACCATCGTA
TAACTTCATCCTTACCCTTTTGTGGGTTGTGGCATGAGTCATTGCATTATACTATAAAAG
GTTTTGGTTGTGAGCTGGTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 35 35 35 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D704TF U 1
AF RR4DW17TF U 55
AF RR4AF29TF U 19
AF RR4AL30TF U 19
AF RR4DW17JQ C 675
AF RR4AF29JQ C 714
AF RR4AL30JQ C 718
AF RR4D704JQ C 905
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BS 621 621 RR4AF29TF
BS 622 716 RR4D704TF
BS 717 775 RR4AF29TF
BS 776 812 RR4AL30TF
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BS 1458 1512 RR4AF29JQ
BS 1513 1525 RR4D704JQ

RD RR4D704TF 716 0 0
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GTTTGGCGATTGAATTGAAGAACTAGTTTCTAGATAACTGCCCAGCGAGGGGGACTCTTT
TATCTCTCTAGGAAGATCCAGAAGAATCATAGACAGCCGAGTAACCTCGCCGGAACATCA
GATCCAATCTCCATTTTCGAGAACTTCAAACTTGTGATCGAAAGAGGGAGGAAGCACCCA
AGGCAATCTGCGTTGCGTTGCGTTGTGGTGAATGTGATTCGCGATCTGAAAAAAAAA*TG
GCGAGGAAAGGGACGAGTATTAGATTATCGAGCTCCAGAATCTCTTCTTCCCTTTTGCTC
TCAATGTTCGCCACTTTCGCTTCCTTCTACGTCGCTGGCCGTCTATGGCAAGAATCGCAA
ACTAGGGTTCATCTTCTAAGCGAGCTCCACCGAGTTACCGGACAGGGGAAATCTGCCATC
TCAGTGGATGATACTTTGAAGATCATAGCTTGCGGGGAACAGAAGAAGACACTAGCAGCT
CTTGAGATGGAGCTTAGTGCTGCTAGGCAACAAGGCTTTGTTCCAAAGCGTACTACTGAT
GGAACCGAGACCAAGAAAAG*CCACTTGTGGTTATCGGTATTATGACTTCTTTGGGTAAC
AAGAAGAAAAGGGATGCAGTCCGGCAAGCATGG*ATGGGAACTGGTGCATCACTGA

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DS 

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GG
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CTTTTATCTCTCTAGGAAGATCCAGAAGAATCATAGACAGCCGAGTAACCTCGCCGGAAC
ATCAGATCCAATCTCCATTTTCGAGAACTTCAAACTTGTGATCGAAAGAGGGAGGAAGCA
CCCAAGGCAATCTGCGTTGCGTTGCGTTGTGGTGAATGTGATTCGCGATCTGAAAAAAAA
AATGGCGAGGAAAGGGACGAGTATTAGATTATCGAGCTCCAGAATCTCTTCTTCCCTTTT
GCTCTCAATGTTCGCTACTTTCGCTTCCTTCTACGTCGCTGGCCGTCTATGGCAAGAATC
GCAAACTAGGGTTCATCTTCTAAGCGAGCTCCACCGAGTTACCGGACAGGGGAAATCTGC
CATCTCAGTGGATGATACTTTGAAGATCATAGCTTGCAGGGAACAGAAGAAGACACTAGC
AGCTCTTGAGATGGAGCTTAGTGCTGCTAGGCAACAAGGCTTTGTTCCAAAGCGTACTAC
TGATGGAACCGAGACCAAGAAAAGACCACTTGTGGTTATCGGTATTATGACTTCTTTGGG
TAACAAGAAGAAAAGGGATGCAGTCCGGCAAGCATGG*ATGGGAACTGGTGC

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AACTAGTTTCTAGATAACTGCCCAGCGAGGGGGACTCTTTTATCTCTCTAGGAAGATCCA
GAAGAATCATAGACAGCCGAGTAACCTCGCCGGAACATCAGATCCAATCTCCATTTTCGA
GAACTTCAAACTTGTGATCGAAAGAGGGAGGAAGCACCCAAGGCAATCTGCGTTGCGTTG
CGTTGTGGTGAATGTGATTCGCGATCTGAAAAAAAAAATGGCGAGGAAAGGGACGAGTAT
TAGATTATCGAGCTCCAGAATCTCTTCTTCCCTTTTGCTCTCAATGTTCGCTACTTTCGC
TTCCTTCTACGTCGCTGGCCGTCTATGGCAAGAATCGCAAACCAGGGTTCATCTTCTAAG
CGAGCTCCACCGAGTTACCGGACAGGGGAAATCTGCCATCTCAGTGGATGATACTTTGAA
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TGCTAGGCAACAAGGCTTTGTTCCAAAGCGTACTACTGATGGAACCGAGACCAAGAAAAG
ACCACTTGTGGTTATCGGTATTATGACTTCTTTGGGTAACAAGAAGAAAAGGGATGCAGT
CCGGCAAGCATGG*ATGGGAACTGGTGCATCACTGAAAAAAATTGAAACTGAAAAGGGTG
TGATTGCACGTTTTGTTATTGGTAGAAGCGCAAAC

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DS 

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GG
ACACTTTATAGTAAAGTATCCTTCCCCTATGATCTCATAGGTTTGGCGATTGAATTGAAG
AACTAGTTTCTAGATAACTGCCCAGCGAGGGGGACTCTTTTATCTCTCTAGGAAGATCCA
GAAGAATCATAGACAGCCGAGTAACCTCGCCGGAACATCAGATCCAATCTCCATTTTCGA
GAACTTCAAACTTGTGATCGAAAGAGGGAGGAAGCACCCAAGGCAATCTGCGTTGCGTTG
CGTTGTGGTGAATGTGATTCGCGATCTGAAAAAAAAAATGGCGAGGAAAGGGACGAGTAT
TAGATTATCGAGCTCCAGAATCTCTTCTTCCCTTTTGCTCTCAATGTTCGCTACTTTCGC
TTCCTTCTACGTCGCTGGCCGTCTATGGCAAGAATCGCAAACCAGGGTTCATCTTCTAAG
CGAGCTCCACCGAGTTACCGGACAGGGGAAATCTGCCATCTCAGTGGATGATACTTTGAA
GATCATAGCTTGCAGGGAACAGAAGAAGACACTAGCAGCTCTTGAGATGGAGCTTAGTGC
TGCTAGGCAACAAGGCTTTGTTCCAAAGCGTACTACTGATGGAACCGAGACCAAGAAAAG
ACCACTTGTGGTTATCGGTATTATGACTTCTTTGGGTAACAAGAAGAAAAGGGATGCAGT
CCGGCAAGCATGGGATGGGAACTGGTGCATCACTGAAAAAAATTGAAACTGAAAAGGGTG
TGATTGCACGTTTTGTTATTGGTAGAAGCGCAAACAAAGGGGACAGCATGGACAAGAGCA
TTGACGCTGAAA*CAGTCAAACCGATGACTTCATTATTCTTGATGATGTAGTTGAG*CAC
CCGAAGA
GCTTC

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AGAGCATTGACGCTGAAAACAGTCAAACCGATGACTTCATTATTCTTGATGATGTAGTTG
AGGCACCCGAAGAAGCTTCTAAGAAGGTAAAGCTGTTCTTTGCCTATGCTGCGGATAGGT
GGGATGCACAGTTTTATGCAAAGGCCAACGATAATATCTACGTAAATATGGATGTACTCG
GGAGTACACTTGCAGCACATCTAGGGAACCCGAGGGCTTACATTGGTTGCATGAAATCAG
GCGAAGTTTTTTCAGAACCGAACCAAAAATGGTATGAACCAGAATGGTGGAAATTCGGTG
ACAAGAAATCATACTTCCGGCATGCTTATGGGGAGATGTATGTTATAACACATGCATTGG
CTAGATTTGTATCGATCAATAGGGACATACTTCATGCGTATGCTCATGATGACGTGAGCA
CGGGGTCATGGTTCGTGGGACTTGATGTGAAACATGTAGATGAAGGAAAGTTTTGCTGTT
CCGCTTGGTCCTCAGAAGCTATATGCGCAGGAGTGTAGCCGGACCAAATTTACATAGAAG
TGTGAGGGCTTTGCTGCTTATAGAGAAGCACACACATAACATATCTGTCTGAAAAGGGAT
AATACACCATTTACTTCTTTATGTATCTTTATACTTTACCATCGTATAACTTCATCCTTA
CCC

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RD RR4AF29JQ 799 0 0
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ACAAAGGGGACAGCATGGACAAGAGCATTGACGCTGAAAACAGTCAAACCGATGACTTCA
TTATTCTTGATGATGTAGTTGAGGCACCCGAAGAAGCTTCTAAGAAGGTAAAGCTGTTCT
TTGCCTATGCTGCGGATAGGTGGGATGCACAGTTTTATACAAAGGCCAACGATAATATCT
ACGTAAATATGGATGTACTCGGGAGTACACTTGCAGCACATCTAGGGAACCCGAGGGCTT
ACATTGGTTGCATGAAATCAGGCGAAGTTTTCTCAGAACCGAACCAAAAATGGTATGAAC
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ATGTTATAACACATGCATTGGCTAGATTTGTATCGATCAATAGGGACATACTTCATGCGT
ATGCTCATGATGACGTGAGCACGGGGTCATGGTTCGTGGGACTTGATGTGAAACATGTAG
ATGAAGGAAAGTTTTGCTGTTCCGCTTGGTCCTCAGAAGCTATATGCGCAGGAGTGTAGC
CGGACCAAATTTACATAGAAGTGTGAGGGCTTTGCTGCTTATAGAGAAGCACACACATAA
CATATCTGTCTGAAAAGGGATAATACACCATTTACTTCTTTATGTATCTTTATACTTTAC
CATCGTATAACTTCATCCTTACCCTTTTGTGGGTTGTGGCATGAGTCATTGCATTATACT
ATAAAAGGTTTTGGTTGTG

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DS 

RD RR4AL30JQ 795 0 0
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AGGGGACAGCATGGACAAGAGCATTGACGCTGAAAACAGTCAAACCGATGACTTCATTAT
TCTTGATGATGTAGTTGAGGCACCCGAAGAAGCTTCTAAGAAGGTAAAGCTGTTCTTTGC
CTATGCTGCGGATAGGTGGGATGCACAGTTTTATACAAAGGCCAACGATAATATCTACGT
AAATATGGATGTACTCGGGAGTACACTTGCAGCACATCTAGGGAACCCGAGGGCTTACAT
TGGTTGCATGAAATCAGGCGAAGTTTTCTCAGAACCGAACCAAAAATGGTATGAACCAGA
ATGGTGGAAATTCGGTGACAAGAAATCATACTTCCGGCATGCTTATGGGGAGATGTATGT
TATAACACATGCATTGGCTAGATTTGTATCGATCAATAGGGACATACTTCATGCGTATGC
TCATGATGACGTGAGCACGGGGTCATGGTTCGTGGGACTTGATGTGAAACATGTAGATGA
AGGAAAGTTTTGCTGTTCCGCTTGGTCCTCAGAAGCTATATGCGCAGGAGTGTAGCCGGA
CCAAATTTACATAGAAGTGTGAGGGCTTTGCTGCTTATAGAGAAGCACACACATAACATA
TCTGTCTGAAAAGGGATAATACACCATTTACTTCTTTATGTATCTTTATACTTTACCATC
GTATAACTTCATCCTTACCCTTTTGTGGGTTGTGGCATGAGTCATTGCATTATACTATAA
AAGGTTTTGGTTGTG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4D704JQ 621 0 0
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GATGTACTCGGGAGTACACTTGCAGCACATCTAGGGAACCCGAGGGCTTACATTGGTTGC
ATGAAATCAGGCGAAGTTTTCTCAGAACCGAACCAAAAATGGTATGAACCAGAATGGTGG
AAATTCGGTGACAAGAAATCATACTTCCGGCATGCTT*TGGGGAGATGTATGTTATAACA
CATGCATTGGCTAGATTTGTATCGATCAATAGGGACATACTTCATGCGTATGCTCATGAT
GACGTGAGCACGGGGTCATGGTTCGTGGGACTTGATGTGAAACATGTAGATGAAGGAAAG
TTTTGCTGTTCCGCTTGGTCCTCAGAAGCTATATGCGCAGGAGTGTAGCCGGACCAAATT
TACATAGAAGTGTGAGGGCTTTGCTGCTTATAGAGAAGCACACACATAACATATCTGTCT
GAAAAGGGATAATACACCATTTACTTCTTTATGTATCTTTATACTTTACCATCGTATAAC
TTCATCCTTACCCTTTTGTGGGTTGTGGCATGAGTCATTGCATTATACTATAAAAGGTTT
TGGTTGTGAGCTGGTTTACTT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 2 8

CO CL835Contig1 717 2 3 U
GGAAGTGGAGTCGAGAGGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGGGAGAAGCCAAT
ACACAGAAGCTACTGGAAGGAGGCAACGATCTCAGTCAAATCCAACAGGGACTGTTCATA
GGCTCAGTAGCTGAAGCAAACAACAAGGATTTGCTCAAAGCCTCCAACGTCACTCATGTC
TTAACCATAGCTGTCGCCCTCTCTCCTCCCTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATC
GAAGTCGTGGACAGATCAGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTC
ATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATCTCA
AGGAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAGA
GCTATGGAGCTCGTTAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCT
CAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGGATTCTTCTTCAGCTGAT
AAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATAATG
ACCAAATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGATGG
TGAGCTAGTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTACG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4AH21JQ C 1
AF RR4AH21TF U 1
BS 1 2 RR4AH21JQ
BS 3 716 RR4AH21TF
BS 717 717 RR4AH21JQ

RD RR4AH21JQ 717 0 0
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AGGAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAGA
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AAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATAATG
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QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AH21TF 717 0 0
GG
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CTCAGTAGCTGAAGCAAACAACAAGGATTTGCTCAAAGCCTCCAACGTCACTCATGTCTT
AACCATAGCTGTCGCCCTCTCTCCTCCCTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATCGA
AGTCGTGGACAGATCAGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCAT
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GAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAGAGC
TATGGAGCTCGTTAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCA
GCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGGATTCTTCTTCAGCTGATAA
GAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATAATGAC
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AGCTAGTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTAC
G

QA 3 716 3 716
DS 



CO CL835Contig2 729 6 4 U
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CATCGAAGTCGTGGACAGATCAGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGG
ATTCATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGAT
CTCAAGGAGTGTGACAATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTC
TAAAGCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGT
TTCTCAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCCGATTCTTCTTCAGC
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ACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK94JQ C 438
AF RR4B627TF U 10
AF RR4B627JQ C 434
AF RR4DK94TF U 1
AF RR4GC66TF U 6
AF RR4BB66TF U 9
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QA 1 108 1 108
DS 

RD RR4B627TF 696 0 0
G
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QA 2 696 2 696
DS 

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CTT
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QA 4 230 4 230
DS 

RD RR4DK94TF 722 0 0
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CTCAAGGAGTGTGACAATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCTTGGTATGGGTTTCTC
TAAAGCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGT
TTCTCAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCCGATTCTTCTTCAGC
TGATAAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAACCCCCC
ATGATGACCAAATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGAT
TGATGGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAA*CGCAGATACT
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4GC66TF 724 0 0
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GAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCAGCTT
CAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCCGATTCTTCTTCAGCTGATAAGAAG
ATAGTGTCATGAACTCCCAAGTGATTATGAAGAAGTCTCATGAATCCCCCATGATGACCA
AATAAAA*CTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGA*CGATTGATGGTGAG
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QA 6 724 6 724
DS 

RD RR4BB66TF 714 0 0
GG
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GTAGCTGAAGCAAACAACAAGGATTTGCTCAAAGCCTCCAACGTCACTCATGTCTTAACC
ATAGCTGTCGCCCTCTCTCCTCCCTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATCGAAGTC
GTGGACAGATCAGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCGAC
CAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATCTCAAGGAGT
GTGACAATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATG
GAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCAGCTT
CAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCCGATTCTTCTTCAGCTGATAAGAAG
ATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAACCCCCCATGATGACCA
AATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTAAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGATGGTGAG
CTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTAC

QA 3 714 3 714
DS 



AS 1 8

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ACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATA
AGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATC
TACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCT
CCAGTCT*AATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTAATAGTTCTTTTAT
GTTTGAACTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTA
CTTAATATTCCGGAATTGATTTTTATATTTGTTCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR4EM24JQ C 1
AF RR4EM24TF U 1
AF RR4DA90JQ C 8
AF RR4BF26JQ C 12
AF RR4BF26TF U 12
AF RR4DS45TF U 13
AF RR4E375TF U 13
AF RR4DA90TF U 8
BS 1 9 RR4EM24JQ
BS 10 46 RR4EM24TF
BS 47 47 RR4BF26TF
BS 48 325 RR4EM24TF
BS 326 326 RR4BF26TF
BS 327 400 RR4EM24TF
BS 401 401 RR4BF26TF
BS 402 415 RR4EM24TF
BS 416 416 RR4BF26TF
BS 417 427 RR4EM24TF
BS 428 428 RR4BF26TF
BS 429 448 RR4EM24TF
BS 449 449 RR4BF26TF
BS 450 467 RR4EM24TF
BS 468 468 RR4BF26TF
BS 469 519 RR4EM24TF
BS 520 520 RR4BF26TF
BS 521 543 RR4EM24TF
BS 544 576 RR4BF26TF
BS 577 578 RR4DS45TF

RD RR4EM24JQ 543 0 0
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GCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGA
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ACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATA
AGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGACCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATC
TACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCCTTGTCAATGTTTTGGTTCT
CCAGTCTTAATCTCTTTTGATGTATACGCTACTCATCAGAGCTCTTA*TAGTTCTTTTAT
GTTTGAACTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCCGTTTTGAGATATTATGTCTA
CTT

QA 1 543 1 543
DS 

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GGTCTCTCG
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AAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGAT
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ATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTA
ATGGCTAAAGGTGTGACCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGT
GCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCCTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAGTCTTA
ATCTCTTTTGATGTATACGCTACTCATCAGAGCTCTTA*TAGTTCTTTTATGTTTGAACT
CCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCCGTTTTGAGATATTATGTCTACTT

QA 10 543 10 543
DS 

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GA
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AAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAG
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CAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCC
ATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTA
ATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGT
GCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCTCCAGTCT*A
ATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTAATAGTTCTTTTATGTTTGAACT
CCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATT
CCGGAATTGATTTTTATATTTGTTCCCTC

QA 3 571 3 571
DS 

RD RR4BF26JQ 567 0 0
G
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AAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAG
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CTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATG
GCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCC
ACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCTCCAGTCT*AATC
TCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTAATAGTTCTTTTATGTCTGAACTCCT
TCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCG
GAATTGATTTTTATATTTGTTCCC
CC

QA 2 565 2 565
DS 

RD RR4BF26TF 567 0 0
G
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GCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCC
ACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCTCCAGTCT*AATC
TCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTAATAGTTCTTTTATGTCTGAACTCCT
TCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCG
GAATTGATTTTTATATTTGTTCCC
CC

QA 2 565 2 565
DS 

RD RR4DS45TF 566 0 0
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CTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATG
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TCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCG
GAATTGATTTTTATATTTGTTCCCTC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4E375TF 566 0 0
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CTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATG
GCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCC
ACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCTCCAGTCT*AATC
TCTTTTGACGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTAATAGTTCTTTTATGTTTGAACTCCT
TCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCG
GAATTGATTTTTATATTTGTTCCCTC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4DA90TF 571 0 0
GA
TCTCCATAGCCTACCTGCCGATTGTTACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAG
AAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAG
AAGAAG***TGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGAT
CAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCC
ATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTA
ATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGT
GCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCTCCAGTCT*A
ATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTAATAGTTCTTTTATGTTTGAACT
CCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATT
CCGGAATTGATTTTTATATTTGTTCCCTC

QA 3 571 3 571
DS 



AS 1 7

CO CL837Contig1 791 7 13 U
TTTCTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCC
ATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAG
AACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTC
TTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATT
GAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAAT
GATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAATTT
GTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGAC
AAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACC
GTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCTGATGATATCCTCAAG
GCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGA
AGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCCTCTCTTTTATTATAATAATGTA
CTTAGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTTCACCTTTA
GATGCATTCCAAATACAACCATTTTGATGTGGGCTCCAAATGATATGAAAGTTTACCTTA
AAATTAAATGC


BQ
10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 10 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW31TF U 4
AF RR4GO43TF U 4
AF RR4AW13TF U 4
AF RR4G731JQ C 1
AF RR4G731TF U 4
AF RR4CW31JQ C 124
AF RR4GO43JQ C 159
BS 1 3 RR4G731JQ
BS 4 269 RR4CW31TF
BS 270 272 RR4GO43TF
BS 273 288 RR4CW31TF
BS 289 397 RR4GO43TF
BS 398 398 RR4AW13TF
BS 399 645 RR4GO43TF
BS 646 666 RR4AW13TF
BS 667 705 RR4G731TF
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BS 707 730 RR4G731TF
BS 731 740 RR4G731JQ
BS 741 791 RR4CW31JQ

RD RR4CW31TF 288 0 0
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GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
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AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGG**CAATGAGATCATTTGT
ATG

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR4GO43TF 656 0 0
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GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
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GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGAT
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GCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCTGATGATATCCTCAAGGCT
CTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGT
TGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCCTCTCTTT
ATTATATATGTACT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4AW13TF 663 0 0
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GCTCCTATTGCTGTTGGTAATGCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGAT
CCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAATTTGTC
TCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAG
GGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACCGTC
GCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCTGATGATATCCTCAAGGCT
CTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGT
TGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCCTCTCTTTTATTATAATAATGTACTT
AGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4G731JQ 740 0 0
TTTCTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCC
ATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAG
AACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTC
TTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATT
GAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAAT
GATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAATTT
GTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGAC
AAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACC
GTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCTGATGATATCCTCAAG
GCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGA
AGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCCTCTCTTTTATTATAATAATGTA
CTTAGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTTCACCTTTA
GATGCATTCCAAATACAACC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4G731TF 727 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGAT
CCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAATTTGTC
TCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAG
GGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACCGTC
GCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCTGATGATATCCTCAAGGCT
CTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGT
TGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCCTCTCTTTTATTATAATAATGTACTT
AGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAGAGTTCA*GTGGTTCACCTTTAGAT
GCATTCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4CW31JQ 668 0 0
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGAT
CCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAATTTGTC
TCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTTTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAG
GGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACCGTC
GCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCTGATGATATCCTCAAGGCT
CTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGT
TGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCCTCTCTTTTATTATAATAATGTACTT
AGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTACACCTTTAGAT
GCATTCCAAATACAACCATTTTGATGTGGGCTCCAAATGATATGAAAGTTTACCTTAAAA
TTAAATGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GO43JQ 627 0 0
GGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTT
GCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGA
GATCATTTGTTATGGCATGAATGATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCC
AGAGAACAAGCATGTCAAATTTGTTTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCG*
ACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTT
GCTCGATAACCTCAAGGTAACCGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTC
CAGTGCTGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATTTGAATTGAGAGGATCTC
TAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTCC
TCTCTTTTATTATAATAATGTACTTAGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGTA
GAGTTCGAGTGGTTCACCTTTAGATGCATTCCAAATACAACCATTTTGATGTGGGCTCCA
AATGATATGAAAGTTTACCTTGAAATT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 8

CO CL838Contig1 1008 8 7 U
GGGGTTTTCCAAAAAAATCAATCCTCCTCCAGATCTGTCTCGAAGACCGTTTCCCTGAGA
GCCATGGAGAAACCGTACGGATACGCGAGCGTGAGCATGAGCGGCGTAGATCGCTCCGCC
GGGAAGGATATCGACTTGGAGATGGGAGGCGGAGAGGCGACGCTTTACCCTGGGCTAAGC
TACGGCGAGAATCAGCTCCGCTGGGGATTCATCCGCAAGGTCTACGGGATTCTCTCCGCC
CAGCTCCTCCTAACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTCAATCCTCCGGTCAACGAT
CTCCTTACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATC
TGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTC
ACTATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTC
CTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGG
GCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATC
ATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCA
ATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAAT
CTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGAT
ATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGC
CACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTT
ACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTTTTTTTACTATATGCTGCTATGTG
GTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAGTGAAAATTTCAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4CT62TF U 1
AF RR4CJ91TF U 308
AF RR4CJ91JQ C 308
AF RR4CT62JQ C 338
AF RR4CT60JQ C 447
AF RR4CW19JQ C 493
AF RR4CT60TF U 447
AF RR4CW19TF U 447
BS 1 729 RR4CT62TF
BS 730 884 RR4CJ91TF
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BS 942 942 RR4CT60TF
BS 943 960 RR4CJ91TF
BS 961 1008 RR4CT60TF

RD RR4CT62TF 729 0 0
GGGGTTTTCCAAAAAAATCAATCCTCCTCCAGATCTGTCTCGAAGACCGTTTCCCTGAGA
GCCATGGAGAAACCGTACGGATACGCGAGCGTGAGCATGAGCGGCGTAGATCGCTCCGCC
GGGAAGGATATCGACTTGGAGATGGGAGGCGGAGAGGCGACGCTTTACCCTGGGCTAAGC
TACGGCGAGAATCAGCTCCGCTGGGGATTCATCCGCAAGGTCTACGGGATTCTCTCCGCC
CAGCTCCTCCTAACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTCAATCCTCCGGTCAACGAT
CTCCTTACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATC
TGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTC
ACTATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTC
CTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGG
GCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATC
ATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCA
ATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAAT
CTCATCAAG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4CJ91TF 653 0 0
G
CGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTGGCCTCT
GCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCACTATCTC
TTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGC
CTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAA
GAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGT
GGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGG
AGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAA
GCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAA
TCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATA
AGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATAAACCCAACGCATCTATGTGATTTACATTTGT
GTGTATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTTTTTT*ACTATATGCTGCTATGTG

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR4CJ91JQ 674 0 0
G
CGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTGGCCTCT
GCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCACTATCTC
TTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGC
CTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAA
GAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGT
GGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGG
AGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAA
GCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAA
TCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATA
AGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGT
GTGTATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTTTTTTTACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACG
TTTGGTAAAACAA

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR4CT62JQ 671 0 0
GCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTA
ACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCACTATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTG
CCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGAT
CTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGAC
CCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCC
CGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGT
ACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTG
CATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATTCTGA
GGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATTAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATA
AACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTT
TTTTTACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAGTGAA
AATTTCAATGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CT60JQ 562 0 0
G
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GTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGC
TTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAG
ATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTG
TTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAA
TACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTG
CGTATTTTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATG
GGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATG
TTTCGAGTTTTTTTTACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAA
GCGAAGTGAAAATTTCAATGT

QA 2 562 2 562
DS 

RD RR4CW19JQ 516 0 0
ATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAAA
GGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGTGGTG
ACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGGAGGA
ATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGT
TTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTC
TTCTTGACCATTTTGCGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGAT
GAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGT
ATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTTTTTTTACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACGTTTG
GTAAAACAAAGTCAAGCGAAGTGAAAATTTCAATGT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4CT60TF 562 0 0
G
GTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCC
GTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGC
TTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAG
ATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTG
TTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAA
TACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTG
CGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATG
GGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATG
TTTCGAGTTTTTTTTACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAA
GCGAAGTGAAAATTTCAATGT

QA 2 562 2 562
DS 

RD RR4CW19TF 562 0 0
G
GTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCC
GTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGC
TTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTCATCATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAG
ATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTG
TTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAA
TACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTG
CGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATG
GGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATG
TTTCGAGTTTTTTTTACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAA
GCGAAGTGAAAATTTCAATGT

QA 2 562 2 562
DS 



AS 1 4

CO CL839Contig1 841 4 1 U
GAGCTGCAACACGTGACATGTTAAGACTTATCCAAAACAAAACAAGTTGCAACAAAGGTT
TTTTTAGGAACACTGCAATAAAAGGAGATGAAACAGAACAAACAAAAAAACAAATTGAGA
AATCTGTCAACTTCACTCGACCTACGATGATCATCAATCTCTCATCACGCTCATTCTGGC
TTCCGGGCCAAGAAAAAATACATTGGCGTGAATATCTCTCTCCTTCCACCGTCGACTAAT
CCTTCCGCGGCCTTCTCCAGAAAATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAGGTGCCAGTCTT
ATGTACTCAAGGAGCTTCACCATGTTTTTGGTTATGAAACGTCCAACAGCTGTTAGGCGG
AAGCTACTGAGCGAAAAGTGATTTTTGTCTAGAGGTAAGTACCATGGGACTGGCGAGTCC
TTGGCCAGATCCTTTTCCCATATTACTTCAAAACCGGCCTGCTTGAGAGCTTCTAGGCAC
TTT*AAGTCAGCCTAATGTCAGGGAGACCATCTCCAATCTCTATCTCTGCCTTTATCTTC
TGATGTTGGGCGTTATCAGGGTCAAGTGCATCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAA
CATTGCCCCGGCTTTAGCACCCTGTAGATCTCTTTGTAGCATCCATATGCATCAGGTGCG
TGGCAGGTTGCCTCTATAGCATAAACTGCATCAAAAGTGTTTTCAGGAAATGGCATCTTC
ATGAAGTCAGCCTTGACAAAGCTACATGTCTTATCGACACCTGCAAGTCGGTTTAGTTCC
TTGCCTCTGGTGATCTGGTATTCATTATTGTTGATCCCGGTAACAGATGAATTGCTGAAT
C


BQ
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AG
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GAAGTGAACTAAGAAACGAGAACAATTGCGAGCTTCTGCAACTCAACCTATGTAGTGAGC
TCCATAATGGCAGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCC
TTTGAGACACCAGCTTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCAGTCTCG
TCAACATCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTGTGCAGCAGTGGCTGCTTCAGAGGCATCAGCG
TTAGGGATCATAGATGCAACGTCTGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGC
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TTCTCGCTTCTACTTTGCTTAGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCG
TCGTCGTCGTCATCAACATCGTCTTCCTCATCTCCGTCTTTGACATCTTCAACGACAACA
TCATCTTCCTTCTCGAGCTTCGTTTGCTCTTTGATGGCGTCCTTCAACAGCTCCTCAACC
TTCACTTCGTCGACGACGGGGCCTGGCATATTCTTCAGACGAAACGAAACGAAACCCTTT
CTAGAA

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DS 

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ACCTATGTAGTGAGCTCCATAATGGCAGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCC
TTAGTGGCTTTGGCCTTTGAGACACCAGCTTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCT
TCAACACCAGTCTCATCAACATCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTGTGCAGCAGTGGCTGCT
TCAGAGGCATCAGCGTTAGGGATCATAGATGCAACGTCTGGCATCTTGAACCTCTGAGCA
GCTTGAGCTTGTAGCTGAAAGCTCATATCGTCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAG
GTGTCCGAGTTTGGGCTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTG
GATCTCTTGATTGTGACTCTGCTAACATCAGTAACAGGTTTCATTCCAAGTTTGAGCATT
GCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTACTTTGCTTAGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCA
TCGACGTTGTCATCGTCGTCGTCGTCATCAACATCGTCTTCCTCATCTCCGTCTTTGACA
TCTTCAACGACAACATCATCTTCCTTCTCGAGCTTCGTTTGCTCTTTGATGGCGTCCTTC
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GAAACGAAACCCTTTCTAGAACAGCGCAGC

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DS 

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ACCTATGTAGTGAGCTCCATAATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCC
TTAGTGGCTTTGGCCTTTGAGACACCAGCTTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCT
TCAACACCAGTCTCATCAACATCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTGTGCAGCAGTGGCTGCT
TCAGAGGCATCAGCGTTAGGGATCATAGATGCAACGTCTGGCATCTTGAACCTCTGAGCA
GCTTGAGCTTGTAGCTGAGAGCTCATATCGTCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAG
GTGTCCGAGTTTGGGCTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTG
GATCTCTTGATTGTGACTCTGCTAACATCAGTAACAGGTTTCATTCCAAGTTTGAGCATT
GCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTACTTTGCTTAGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCA
TCGACGTTGTCATCGTCGTCGTCGTCATCAACATCGTCTTCCTCATCTCCGTCTTTGACA
TCTTCAACGACAACATCATCTTCCTTCTCGAGCTTCGTTTGCTCTTTGATGGCGTCCTTC
AACAGCTCCTCAACCTTCACTTCGTCGACGACGGGGCCTGGCATCTTCTTCAGACGAAAC
GAAACGAAACCCTTTCTAGAACAGCGCAGCGAAAAT
CC

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DS 

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TCTCATCAACATCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTGTGCAGCAGTGGCTGCTTCAGAGGCAT
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GTAGCTGAGAGCTCATATCGTCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAGGTGTCCGAGT
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TTGTGACTCTGCTAACATCAGTAACAGGTTTCATTCCAAGTTTGAGCATTGCTTTGCGGC
TTTTCTTCTCGCTTCTACTTTGCTTAGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGT
CATCGTCGTCGTCGTCATCAACATCGTCTTCCTCATCTCCGTCTTTGACATCTTCAACGA
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CAACCTTCACTTCGTCGACGACGGGGCCTGGCATCTTCTTCAGACGAAACGAAACGAAAC
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GGTC

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DS 

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AGACACCAGCTTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCAGTCTCGTCAA
CATCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTGTGCAGCAGTGGCTGCTTCAGAGGCATCAGCGTTAG
GGATCATAGATGCAACGTCTGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAG
AGCTCATATCGTCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAGGTGTCCGAGTTTGGGCTCT
TGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTGGATCTCTTGATTGTGACTC
TGCTAACATCAGTAACAGGTTTCATTCCAAGTTTGAGCATTGCTTTGCGGCTTTTCTTCT
CGCTTCTACTTTGCTTAGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCGT
CGTCGTCATCAACATCGTCTTCCTCATCTCCGTCTTTGACATCTTCAACGACAACATCAT
CTTCCTTCTCGAGCTTCGTTTGCTCTTTGATGGCGTCCTTCAACAGCTCCTCAACCTTCA
CTTCGTCGACGACGGGGCCTGGCATATTCTTCAGACGAAACGAAACGAAACCCTTTCTAG
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QA 1 823 1 823
DS 

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GCTTCTGCAACTCAACCTATGTAGTGAGCTCCATAATGGCAGAAACGATATCTCCATCAT
TGGCTTTAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTTGAGACACCAGCTTGAGTCATCACGAGCT
CAACATCCTTGGCTTCAACACCAGTCTCGTCAACATCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTGTG
CAGCAGTGGCTGCTTCAGAGGCATCAGCGTTAGGGATCATAGATGCAACGTCTGGCATCT
TGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAAAGCTCATATCGTCAATCTTGGCCTCAC
CGAATATCACATAGGTGTCCGAGTTTGGGCTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAA
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CAAGTTTGAGCATTGCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTACTTTGCTTAAAGCTCTCAT
TCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCGTCGTCGTCATCAACATCGTCTTCCTCAT
CTCCGTCTTTGACATCTTCAACGACAACATCATCTTCCTTCTCGAGCTTCGTTTGCTCTT
TGATGGCGTCCTTCAACAGCTCCTCAACCTTCACTTCGTCGACGACGGGGCCTGGCATAT
TCTTCAGACGAAACGAAACGAAACCCTTTCTAGAACAGCGCAGCGAAAATGGTACCCTTT
TTGTTTCAGTGGCTCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 7

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TAATAATAACATGTTTCAGGAGTTAATTCTTTTATACCAAAAAAAAA*GAAAACAACAGA
TATACAGAAAGTTAAGCTTAGTGTTTGCTTTGAGCAACCAAAGATGGTTGCAGTAACAAG
TCTACAAGTGTGGCACTTCAACTTGATCCAGCTGGTTTGGCTGCATTCGTCTGCACGGAT
AATGATTCCAATGTAAACCCTTCAGGTCCCTTGGCTGGACCAATGCTGCAACGATCGGTG
TTGTGCAGTCTGATGCCATCTTTTATCTTCTGAAACTTAGCAAGAGAACATGAGAAGGAC
TCGAGCTGGCCATCAGCTCCACGGTAAAAGTGGAAGTAAGGAAGCACTTTCACGTTCAAA
CTCTTGCACATTGGTTTATTCTCATCAAAGTTGATTTTGAGGAACAATATATTGGGATTT
TCCACCGCCGTTTTGCAAAGCTTAGGGAACAATGCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCA
TAAAACTCTACAATGACTAGTCTTTCTCCAGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAACTCCTCG
GTAGAATGAATGTCCACCATGTTTGGTCCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCT
GTCTCGGCCACACTCTCATCTACCTTGACACGAACCAACTTGCTCTTGTGTCCTCTCAGG
GGGATATGGCTTCCGAGACCAGAAGATGGGTGATGAGAAGACGAGCAGGAGGGAGAAGAT
GAGAGCGGACGCAATCTCCTGTCGGAATTCAGATTCGGAGTCGGAGATAAGTAAGGAGAA
GTGAGAGTGGCTGCAAAGGAGGTGAAGGACGAAGAAGAGACGCCAAGGGCCTGAAACGAC
GCCGCTGATAATAATCGCACAACTCCAGCCATCTAAAATTCACCCACACACAGAGAGATA
GGGAAGAGAAGAGAGTAAGACTGTTGTAGAGATCCTCCAGAGAAGATCAGGAAGAAACTG
TCTGGTTCAGATTCCAGTTATGTTTCTCTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN63JQ U 50
AF RR4D605JQ U 50
AF RR4DX82JQ U 1
AF RR4GF34JQ U 28
AF RR4GF34TF C 263
AF RR4DX82TF C 281
AF RR4D605TF C 333
BS 1 282 RR4DX82JQ
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G
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QA 2 345 2 345
DS 

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G
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AAACAACAGATATACAGAAAGTTAAGCTTAGTGTTTGCTTTGAGCAACCAAAGATGGTTG
CAGTAACAAGTCTACAAGTGTGGCACTTCAACTTGATCCAGCTGGTTTGGCTGCATTCGT
CTGCACGGATAATGATTCCAATGTAAACCCTTCAGGTCCCTTGGCTGGACCAATGCTGCA
ACGATCGGTGTTGTGCAGTCTGATGCCATCTTTTATCTTCTGAAACTTAGCAAGAGAACA
TGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCACGGTAAAAGTGGAAGTAAGGAAACACTTT
CACGTTCAAACTCTTGCACATTGGTTTATTCTCATCAAAGTTGATTTTGAGGAACAATAT
ATTGGGATTTTCCACCGCCGTTTTGCAAAGC

QA 2 452 2 452
DS 

RD RR4DX82JQ 688 0 0
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GTCTCGGCCACACTCTCATCTACCTTGA

QA 1 688 1 688
DS 

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TCTTTTATACCAAAAAAAA**GAAAACAACAGATATACAGAAAGTTAAGCTTAGTGTTTG
CTTTGAGCAACCAAAGATGGTTGCAGTAACAAGTCTACAAGTGTGGCACTTCAACTTGAT
CCAGCTGGTTTGGCTGCATTCGTCTGCACGGATAATGATTCCAATGTAAACCCTTCAGGT
CCCTTGGCTGGACCAATGCTGCAACGATCGGTGTTGTGCAGTCTGATGCCATCTTTTATC
TTCTGAAACTTAGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCACGGTAA
AAGTGGAAGTAAGGAAGCACTTTCACGTTCAAACTCTTGCACATTGGTTTATTCTCATCA
AAGTTGATTTTGAGGAACAATATATTGGGATTTTCCACCGCCGTTTTGCAAAGCTTAGGG
AACAATGCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTACAATGACTAGTCTTTCT
CCAGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAACTCCTCGGTAGAATGAATGTCCACCATGTTTGGT
CCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCGGC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GF34TF 743 0 0
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TTATCTTCTGAAACTTAGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCAC
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TTTCTCCAGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAACTCCTCGGTAGAATGAATGTCCACCATGT
TTGGTCCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCGGCCACACTCTCATCTA
CCTTGACACGAACCAACTTGCTCTTGTGTCCTCTCAGGGGGATATGGCTTCCGAGACCAG
AAGATGGGTGATGAGAAGACGAGCAGGAGGGAGAAGATGAGAGCGGACGCAATCTCCTGT
CGGAATTCAGATTCGGAGTCGGAGATAAGTAAGGAGAAGTGAGAGTGGCTGCAAAGGAGG
TGAAGGACGAAGAAGAGACGCCAAGGGCCTGAAACGACGCCGCTGATAATAATCGCACAA
CTCCGGCCATCTAAAATTCACCCACACACAGAGAGATAGGGAAGAGAAGAGAGTAAGACT
GTTGTAGAGATCCTCCAGAGA
CC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4DX82TF 730 0 0
CAG
TGCTGCAACGATCGGTGTTGTGCAGTCTGATGCCATCTTTTATCT*CTGAAACTTAGCAA
GAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCACGGTAAAAGTGGAAGTAAGGAA
GCACTTTCACGTTCAAACTCTTGCACATTGGTTTATTCTCATCAAAGTTGATTTTGAGGA
ACAATATATTGGGATTTTCCACCGCCGTTTTGCAAAGCTTAGGGAACAATGCTCTGCAAG
AAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTACAATGACTAGTCTTTCTCCAGCTTCGCTTAAAG
CCTTCAAGAACTCCTCGGTAGAATGAATGTCCACCATGTTTGGTCCAGCATTCCTCTCCC
ACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCGGCCACACTCTCATCTACCTTGACACGAACCAACTTGC
TCTTGTGTCCTCTCAGGGGGATATGGCTTCCGAAACCAGAAGATGGGTGATGAGAAGACG
AGCAGGAGGGAGAGGATGAGAGCGGACGCAATCTCATGTCGGAATTCAGATTCGGAGTCG
GAGATAAGTAAGGAGAAGTGAGAGTGGCTGCAAAGGAGGTGAAGGACGAAGAAGAGACGC
CAAGGGCCTGAAACGACGCCGCTGATAATAATCGCACAACTCCAGCCATCTAAAATTCAC
CCACACACAGAGAGATAGGGAAGAGAAGAGAGTAAGACTGTTGTAGAGATCCTCCAGAGA
AGATCCC

QA 4 723 4 723
DS 

RD RR4D605TF 723 0 0
AAACTTAGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCACGGTAAAAGTG
GAAGTAAGGAAACACTTTCACGTTCAAACTCTTGCACATTGGTTTATTCTCATCAAAGTT
GATTTTGAGGAACAATATATTGGGATTTTCCACCGCCGTTTTGCAAAGCTTAGGGAACAA
TGCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTACAATGACTAGTCTTTCTCCAGC
TTCGCTTAAAGCCTTCAAGAACTCCTCGGTAGAACGAATGTCCACCATGTTTGGTCCAGC
ATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCGACCACACTCTCATCTACCTTGACACG
AACCAACTTGCTCTTGTGTCCTCTCAGGGGGATATGGCTTCCGAGACCAGAAGATGGGTG
ATGAGAAGACGAGCAGGAGGGAGAAGATGAGAGCGGACGCAATCTCCTGTCGGAATTCAG
ATTCGGAGTCGGAGATAAGTAAGGAGAAGTGAGAGTGGCTGCAAAGGAGGTGAAGGACGA
AGAAGAGACGCCAAGGGCCTGAAACGACGCCGCTGATAATAATCGCACAACTCCAGCCAT
CTAAAATTCACCCACACACAGAGAGATAGGGATGAGAAGAGAGTAAGACTGTTGTAGAGA
TCCTCCAGAGAAGATCAGGAAGAAACTGTCTGGTTCAGATTCCAGTTATGTTTCTCTCGT
CCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 6

CO CL842Contig1 1373 6 18 U
GGAGGGCTTTTAAAATCATCGGCGAGACGAAACTTTTAAACCGGCGAAACTTAGAGACGG
CGGCGGCGGCGGCGAGGTGAGAGTTTGAAGGAAGACCGATGAAGATGAAATCAGTATTCG
ATGCGCCGGAGATCAAATCGGAGTTCGAGTCAGCGGGAATAAACCCTAATTTCATGATCC
CGATCTGGAAGTACGTAATTCAGAATCCCGATTGCGTTTGGGACGAGATCCCTTCGTTGC
CCACCGCCGCATACACTCTCCTCCATTCAAAGTTCAAGACTTTCACTTCCTCTCTCCACT
CCCTCTTCCACTCCTCCGATGGCACCACCTCTAAACTCCTCATCAAGCTCCAGAATGGAG
CTTTTGTGGAGGCTGTGATAATGAGATACGATACTCGGTTGGGGATGTGTGGAGGGAAGC
CACGTCCAGGTGGTGTGAGATCTACATTATGCATTTCATCACAGGTTGGTTGCAAAATGG
GTTGCACGTTCTGTGCAACTGGTAGCATGGGATTCAAAAGCAATTTAACATCGGGAGAAA
TTGTGGAGCAGCTTGTGCACGCCTCTCGCTTAGCTGATATACGCAACATTGTCTTCATGG
GAATGGGAGAACCTTTGAATAACTACAATGCTGTTGTTGAAGCTGTCCGTGCCATGTTAA
AACAGCCTTTTCAGCTCTCACCCAAGAGAATTACCATTTCAACTGTTGGAGTTGTTCATG
CGATAAACAAGCTTCACAATGATCTACCAGGCATAAGTTTAGCGGTATCTCTTCATGCAC
CAGTTCAAGAAATCCGCTGCCAAATCATGCCAGCAGCTAGAGCCTTTCCTCTTCAAAAGC
TTATGGATGCACTTCAAGCTTTCCAGAAAAGCAGTCAGCAGAAGATCTTCATTGAGTACA
TCATGCTTGATGGAGTAAATGATCAAGAGGAGAACGCTCATCAACTCGGTGAATTGCTAA
AGACATTTCAAGTGGTGATAAATTTGATACCATTCAACCCAATTGGGTCCACGAGCCAGT
TCAAAACCAGTACTAAACAAAGCGTCTCAAGCTTCCAGAAGATCCTGAGGGAAACCTACA
ATATACGAACCACGGTTCGCAAAGAAATGGGTCAGGATATTAGTGGTGCTTGTGGTCAGC
TAGTTGTGAACCAACCTGACAACAAGAGAACTCCGGAACCACTTAGAGACATTGAAGATC
TGCATCTCTAACTTTAGGACCCAGACACATGAAACAGACATGAGAAAAGATATCTGGTTT
GGTTTGTATGATCTTCGAAGTCACTCTTCATAACTCTCTTCTTGAACTTCACATTTTGTT
CCTCACTATCCAATGGAAAACACTTAGGCCTACCCTTATAATGCAAGTAAGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD35TF U 1
AF RR4FR17TF U 1
AF RR4FY47TF U 1
AF RR4FY47JQ C 702
AF RR4BH02JQ C 548
AF RR4CD35JQ C 627
BS 1 726 RR4CD35TF
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BS 728 769 RR4CD35TF
BS 770 802 RR4BH02JQ
BS 803 803 RR4CD35JQ
BS 804 870 RR4BH02JQ
BS 871 871 RR4CD35JQ
BS 872 946 RR4BH02JQ
BS 947 947 RR4CD35JQ
BS 948 949 RR4BH02JQ
BS 950 950 RR4CD35JQ
BS 951 952 RR4BH02JQ
BS 953 953 RR4CD35JQ
BS 954 961 RR4BH02JQ
BS 962 962 RR4CD35JQ
BS 963 1272 RR4BH02JQ
BS 1273 1273 RR4CD35JQ
BS 1274 1373 RR4BH02JQ

RD RR4CD35TF 769 0 0
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CGGCGGCGGCGGCGAGGTGAGAGTTTGAAGGAAGACCGATGAAGATGAAATCAGTATTCG
ATGCGCCGGAGATCAAATCGGAGTTCGAGTCAGCGGGAATAAACCCTAATTTCATGATCC
CGATCTGGAAGTACGTAATTCAGAATCCCGATTGCGTTTGGGACGAGATCCCTTCGTTGC
CCACCGCCGCATACACTCTCCTCCATTCAAAGTTCAAGACTTTCACTTCCTCTCTCCACT
CCCTCTTCCACTCCTCCGATGGCACCACCTCTAAACTCCTCATCAAGCTCCAGAATGGAG
CTTTTGTGGAGGCTGTGATAATGAGATACGATACTCGGTTGGGGATGTGTGGAGGGAAGC
CACGTCCAGGTGGTGTGAGATCTACATTATGCATTTCATCACAGGTTGGTTGCAAAATGG
GTTGCACGTTCTGTGCAACTGGTAGCATGGGATTCAAAAGCAATTTAACATCGGGAGAAA
TTGTGGAGCAGCTTGTGCACGCCTCTCGCTTAGCTGATATACGCAACATTGTCTTCATGG
GAATGGGAGAACCTTTGAATAACTACAATGCTGTTGTTGAAGCTGTCCGTGCCATGTTAA
AACAGCCTTTTCAGCTCTCACCCAAGAGAATTACCATTTCAACTGTTGGAGTTGTTCATG
CGATAA*CAAGCTTCACAATGATCTACCAGGCATAAGTTTAGCGGTATC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4FR17TF 745 0 0
GGAGGGCTTTTAAAATCATCGGCGAGACGAGACTTTTAAACCGGCGAAACTTAGAGACGG
CGGCGGCGGCGGCGAGGTGAGAGTTTGAAGGAAGACCGATGAAGATGAAATCAGTATTCG
ATGCGCCGGAGATCAAATCGGAGTTCGAGTCAGCGGGAATAAACCCTAATTTCATGATCC
CTATCTGGAAGTACGTAATTCAGAATCCCGATTGCGTTTGGGACGAGATCCCTTCGTTGC
CCACCGCCGCATACACTCTCCTCCATTCAAAGTTCAAGACTTTCACTTCCTCTCTCCACT
CCCTCTTCCACTCCTCCGATGGCACCACCTCTAAACTCCTCATCAAGCTCCAGAATGGAG
CTTTTGTGGAGGCTGTGATAATGAGATACGATACTCGGTTGGGGATGTGTGGAGGGAAGC
CACGTCCAGGTGGTGTGAGATCTACATTATGCATTTCATCACAGGTTGGTTGCAAAATGG
GTTGCACGTTCTGTGCAACTGGTAGCATGGGATTCAAAAGCAATTTAACATCGGGAGAGA
TTGTGGAGCAGCTTGTGCACGCCTCTCGCTTAGCTGATATACGCAACGTTGTCTTCATGG
GAATGGGAGAACCTTTGAATAACTACAATGCTGTTGTTGAAGCTGTCCGTGCCATGTTAA
AACAGCTTTTTCAGCTCTCACCCAAGAGAAT*ACCATTTCAACTGTTGGAGTTGTTCATG
CGATAA*CA*GCTTCACAATGATCT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4FY47TF 762 0 0
GGAGGGCTTTTAAAATCATCGGCGAGACGAAACTTTTAAACCGGCGAAACTTAGAGACGG
CGGCGGCGGCGGCGAGGTGAGAGTTTGAAGGAAGACCGATGAAGATGAAATCAGTATTCG
ATGCGCCGGAGATCAAATCGGAGTTCGAGTCAGCGGGAATAAACCCTAATTTCATGATCC
CGATCTGGAAGTACGTAATTCAGAATCCCGATTGCGTTTGGGACGAGATCCCTTCGTTGC
CCACCGCCGCATATACTCTCCTCCATTCAAAGTTCAAGACTTTCACTTCCTCTCTCCACT
CCCTCTTCCACTCCTCCGATGGCACCACCTCTAAACTCCTCATCAAGCTCCAGAATGGAG
CTTTTGTGGAGGCTGTGATAATGAGATACGATACTCGGTTGGGGATGTGTGGAGGGAAGC
CACGTCCAGGTGGTGTGAGATCTACATTATGCATTTCATCACAGGTTGGTTGCAAAATGG
GTTGCACGTTCTGTGCAACTGGTAGCATGGGATTCAAAAGCAATTTAACATCGGGAGAAA
TTGTGGAGCAGCTTGTGCACGCCTCTCGCTTAGCTGATATACGCAACATTGTCTTCATGG
GAATGGGAGAACCTTTGAATAACTACAATGCTGTTGTTGAGGCTGTCCGTGCCATGTTAA
AACAGCCTTTTCAGCTCTCACCCAAGAGA*TTACCATTTCAACTGTTGGAGTTGTTCATG
CGATAAACAAGCTTCACAATGATCTACCAG*CATAAGTTTAG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4FY47JQ 608 0 0
ACTGTTGGAGTTGTTCATGCGATAAACAAGCTTCACAATGATCTACCAGGCATAAGTTTA
GCGGTATCTCTTCATGCACCAGTTCAAGAAATCCGCTGCCAAATCATGCCAGCAGCTAGA
GCCTTTCCTCTTCAAAAGCTTATGGATGCACTTCAAGCTTTCCAGAAAAGCAGTCAGCAG
AAGATCTTCATTGAGTACATCATGCTTGATGGAGTAAATGATCAAGAGGAGAACGCTCAT
CAACTCGGTGAATTGCTAAAGACATTTCAAGTGGTGATAAATTTGATACCATTCAACCCA
ATTGGGTCCACGAGCCAGTTCAAAACCAGTACTAAACAAAGCGTCTCAAGCTTCCAGAAG
ATCCTGAGGGAAACCTACAATATACGAACCACGGTTCGCAAAGAAATGGGTCAGGATATT
AGTGGTGCTTGTGGTCAGCTAGTTGTGAACCAACCTGACAACAAGAGAACTCCGGAACCA
CTTAGAGACATTGAAGATCTGCATCTCTAACTTTAGGACCCAGACACATGAAACAGACAT
GAGAAAAGATATCTGGTTTGGTTTGTATGATCTTCGAAGTCACTCTTCATAACTCTCTTC
TTGAACT
C

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4BH02JQ 826 0 0
GCAGCTTGTGCACGCCTCTCGCTTAGCTGATATACGCAACATCGTCTTCATGGGAATGGG
AGAACCTTTGAATAACTACAATGCTGTTGTTGAAGCTGTCCGTGCCATGTTAAAACAGCC
TTTTCAGCTCTCACCCAAGAGAATTACCATTTCAACTGTTGGAGTTGTTCATGCGATAAA
CAAGCTTCACAATGATCTACCAGGTATAAGTTTAGCGGTATCTCTTCATGCACCAGTTCA
AGAAATCCGCTGCCAGATCATGCCAGCAGCTAGAGCCTTTCCTCTTCAAAAGCTTATGGA
TGCACTTCAAGCTTTCCAGAAAAACAGTCAGCAGAAGATCTTCATTGAGTACATCATGCT
TGATGGAGTAAATGATCAAGAGGAGAACGCTCATCAACTTGGCGAGTTGCTAAACACATT
TCAAGTGGTGATAAATTTGATACCATTCAACCCAATTGGGTCCACGAGCCAGTTCAAAAC
CAGTACTAAACAAAGCGTCTCAAGCTTCCAGAAGATCCTGAGGGAAACCTACAATATACG
AACCACGGTTCGCAAAGAAATGGGTCAGGATATTAGTGGTGCTTGTGGTCAGCTAGTTGT
GAACCAACCTGACAACAAGAGAACTCCGGAACCACTTAGAGACATTGAAGATCTGCATCT
CTAACTTTAGGACCCAGACACATGAAACAGACATGAGAAAAGATATCTGGTTTGGTTTGT
ATGATTTTCGAAGTCACTCTTCATAACTCTCTTCTTGAACTTCACATTTTGTTCCTCACT
ATCCAATGGAAAACACTTAGGCCTACCCTTATAATGCAAGTAAGAG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4CD35JQ 701 0 0
AATGCTGTTGTTGAAGCTGTCCGTGCCATGTTAAAACAGCCTTTTCAGCTCTCACCCAAG
AGAATTACCATTTCAACTGTTGGAGTTGTTCATGCGATAAACAAGCTTCACAATGATCTA
CCAGGCATAAGTTTAGCGGTATCTCTTCATGCACCAGTTCAAGAAATCCGCTGCCAAATC
ATGCCAGCAGCTAGAGCCTTTCCTCTTCAAAAGCTTATGGATGCACTTCAAGCTTTCCAG
AAAAGCAGTCAGCAGAAGATCTTCATTGAGTACATCATGCTTGATGGAGTAAATGATCAA
GAGGAGAACGCTCATCAACTCGGTGAATTGCTAAAGACATTTCAAGTGGTGATAAATTTG
ATACCATTCAACCCAATTGGGTCCACGAGCCAGTTCAAAACCAGTACTAAACAAAGCGTC
TCAAGCTTCCAGAAGATCCTGAGGGAAACCTACAATATACGAACCACGGTTCGCAAAGAA
ATGGGTCAGGATATTAGTGGTGCTTGTGGTCAGCTAGTTGTGAACCAACCTGACAACAAG
AGAACTCCGGAACCACTTAGAGACATTGAAGATCTGCATCTCTAACTTTAGGACCCAGAC
ACATGAAACAGACATGAGAAAAGATATCTGGTTTGGTTTGTATGATCTTCGAAGTCACTC
TTCATAACTCTCTTCTTGAACTTCACATTTTGTTCCTCAC
C

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 7

CO CL843Contig1 1152 7 10 U
CGCATCTTAAGTTCGTAATGTCGGATTTGAATCCAATCTAACTGGAGTAGCAGTATATAT
CTTTACTTTTATTGGAGACTTGAAAGCGTAGAAGGACAAGTTGCATTAACAATAACAAAC
TGATATCTTTGACAAATCCGTGAATGATGATCCACAGCTCCTGAGATCTCATATCTCACC
GTCCCAAAGTTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATGAACAAATGACATGCCTCT
CACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACTTGGATAACATGTCATCGGGTATGGACCA
ATCAAAAACATCCAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGTGCTCTTTGGAAGCACGCT
CTGACCCATTTGGAGACCCCAACGTAATGCAACTTGTGCAGGAGTCTTGCCTAGCTTCTC
AGCAACTGTGGCTAGAATCGGGTTCGTCAGAACATCGCTCTTGAGCCAAGTTGTCCCTGG
AGAACCCAACGG*AGAGTATCCAGAGAGGTGAACGCCTTTAGATTTGCAGAAATCCCTGA
GAACAGTTTGTTGCCAAGAAGGGTGACACTCCACCTGGTTAACAGCTGGAGGGACACGAG
CCACCTCCAAGAGATCTGCCAGTTTCTTTGTGGAGAAGTTGCTTACACCAATAGCTCTGG
CCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGTTTGGAACATCAGTTGGTA
AAATGTTCTCTGGCTTGAAACCAGTAGAACCTTTCTTGAGGATAACAGGCCAGTGGATGA
GATACAAATCAACATAGTCAAGCTGTAGATCCTGTAGAGTTCTGTTGAGAGCCTCTGGCA
CATCTTGAGGATCATGATCAGTACACCAGAGTTTAGAGGTGATGAAGATCTCCTCACGCT
TAACAACTCCATCATCAAACAGTTTCTTCAGGACTAACCCTATCTCTTTTTCGTTACCAT
AGATTTGAGCACAATCAATGTGGCGATAACCGATCTTAACGGCGGCTTCGACAGCGTTTC
CGACGAGACCAGGATCAGACTGCCAAGTCCCGAGACCGACTGATGGTATCTTCGCTCCGG
TGTTGAGCTCGAAACATCTGATTTCCTCTGCCATGAGTCTCGCCACAGAGAGTTGGTGAG
AGAGTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H762TF C 1
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AF RR4DO95JQ U 49
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AF RR4C179JQ U 49
AF RR4BH47TF C 359
AF RR4C179TF C 374
BS 1 49 RR4H762TF
BS 50 248 RR4BH47JQ
BS 249 249 RR4DO95JQ
BS 250 670 RR4BH47JQ
BS 671 671 RR4C179JQ
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BS 875 898 RR4C179JQ
BS 899 1152 RR4BH47TF

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CTTTACTTTTATTGGAGACTTGAAAGCGTAGAAGGACAAGTTGCATTAACAATAACAAAC
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CACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACTTGGATAACATGTCATCGGGTATGGACCA
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CTGACCCATTTGGAGACCCCAACGTAATGCAACTTGTGCAGGAGTCTTGCCTAGCTTCTC
AGCAACTGTGGCTAGAATCGGGTTCGTCAGAACATCGCTCTTGAGCCAAGTTGTCCCTGG
AGAACCCAACGG*AGAGTATCCAGAGAGGTGAACGCCTTTAGATTT
ACAC

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DS 

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G
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CATATCTCACCGTCCCAAAGTTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATGAACAAAT
GACATGCCTCTCACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACTTGGATAACATGTCATCG
GGTATGGACCAATCAAAAACATCCAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGTGCTCTTT
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GTTGTCCCTGGAGAACCC

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DS 

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G
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CATATCTCACCGTCCCAAAGTTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATGAACAAAT
GACATGCCTCTCACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACTTGGATAACATGTCATCG
GGTATGGACCAATCAAAAACATCCAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGTGCTCTTT
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QA 2 562 2 562
DS 

RD RR4BH47JQ 826 0 0
A
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CAATAACAAACTGATATCTTTGACAAATCCGTGAATGATGATCCACAGCTCCTGAGATCT
CATATCTCACCGTCCCAAAGTTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATGAACAAAT
GACATGCCTCTCACCAACCCTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACTTGGATAACATGTCATCG
GGTATGGACCAATCAAAAACATCCAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGTGCTCTTT
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AGGGACACGAGCCACCTCCAAGAGATCTGCCAGTTTCTTTGTGGAGAAGTTGCTTACACC
AATAGCTCTGGCCTTTCCCGAGTCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGTTTGGAAT
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CCAGTGGATGAGATACAAATCAACATAGTCAAGCTGTAGATCCTGTAGAGTTCTGTTGAG
AGCCTCTGGCACATCTTGAGGATCATGATCAGTACACCAGAGTTT

QA 2 826 2 826
DS 

RD RR4C179JQ 850 0 0
C
GCAGTATATATCTTTACTTTTATTGGAGACTTGAAAGCGTAGAAGGACAAGTTGCATTAA
CAATAACAAACTGATATCTTTGATAAATCCGTGAATGATGATCCACAGCTCCTGAGATCT
CATGTCTCACCGTCCCAAAGTTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATGAACAAAT
GACATGCCTCTCACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACTTGGATAACATGTCATCG
GGTATGGACCAATCAAAAACATCCAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGTGCTCTTT
GGAAGCACGCTCTGACCCATTTGGAGACCCCAACGTAATGCAACTTGTGCAGGAGTCTTG
CCTAGCTTCTCAGCAACTGTGGCTAGAATCGGGTTCGTCAGAACATCGCTCTTGAGCCAA
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GAAATCCCTGAGAACAGTTTGTTGCCAAGAAGGGTGACACTCCACCTGGTTAACAGCTGG
AGGGACACGAGCCACCTCCAAGAGATCTGCCAGTTTCTTTGTGGAGAAGTTGCTTACACC
AATAGCTCTGGCCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGTTTGGAAC
ATCAGTTGGTAAAATGTTCTCTGGCTTGAAACCAGTAGAACCTTTCTTGAGGATAACAGG
CCAGTGGATGAGATACAAATCAACATAGTCAAGCTGTAGATCCTGTAGAGTTCTGTTGAG
AGCCTCTGGCACATCTTGAGGATCATGATCAGTACACCAGAGTTTAGAGGTGATGAAGAT
CTCCTCACG

QA 2 850 2 850
DS 

RD RR4BH47TF 794 0 0
CTCTGACCCATTTGGAGACCCCAACGTAATGCAACTTGTGCAGGAGTCTTGCCTAGCTTC
TCAGCAACTGTGGCTAGAATCGGGTTCGTCAGAACATCGCTCTTGAGCCAAGTTGTCCCT
GGAGAACCCAACGGGAGAGTATCCAGAGAGGTGAACGCCTTTAGATTTGCAGAAATCCCT
GAGAACAGTTTGTTGCCAAGAAGGGTGACACTCCACCTGGTTAACAGCTGGAGGGACACG
AGCCACCTCCAAGAGATCTGCCAGTTTCTTTGTGGAGAAGTTGCTTACACCAATAGCTCT
GGCCTTTCCCGAGTCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGTTTGGAATATCAGTTGG
TAAAATGTTCTCTGGCTTGAAACCAGTAGAACCTTTCTTGAGGATAACAGGCCAGTGGAT
GAGATACAAATCAACATAGTCAAGCTGTAGATCCTGTAGAGTTCTGTTGAGAGCCTCTGG
CACATCTTGAGGATCATGATCAGTACACCAGAGTTTAGAGGTGATGAAGATCTCCTCACG
CTTAACAACTCCATCATCAAACAGTTTCTTCAGGACTAACCCTATCTCTTTTTCGTTACC
ATAGATTTGAGCACAATCAATGTGGCGATAACCGATCTTAACGGCGGCTTCGACAGCGTT
TCCGACGAGACCAGGATCAGACTGCCAAGTCCCGAGACCGACTGATGGTATCTTCGCTCC
GGTGTTGAGCTCGAAACATCTGATTTCCTCTGCCATGAGTCTCGCCACAGAGAGTTGGTG
AGAGAGTGAGATCC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4C179TF 771 0 0
GAGA
CCCAACGTAATGCAACT*GTGCAG*AGTCT*GCCTAGCT*CTCAGCAACTGTGGCTAGAA
TCGGGTTCGTCAGAACATCGCTCTTGAGCCAAGTTGTCCCTGGAGAACCCAACGG*AGAG
TATCCAGAGAGGTGAACGCCTTTAGATTTGCGGAAATCCCTGAGAACAGTTTGTTGCCAA
GAAGGGTGACACTCCACCTGGTTAACAGCTGGAGGGACACGAGCCACCTCCAAGAGATCT
GCCAGTTTCTTTGTGGAGAAGTTGCTTACACCAATAGCTCTGGCCTTTCCCGAATCAAAG
AGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGTTTGGAACATCAGTTGGTAAAATGTTCTCTGGCTTG
AAACCAGTAGAACCTTTCTTGAGGATAACAGGCCAGTGGATGAGATACAAATCAACATAG
TCAAGCTGTAGATCCTGTAGAGTTCTGTTGAGAGCCTCTGGCACATCTTGAGGATCATGA
TCAGTACACCAGAGTTTAGAGGTGATGAAGATCTCCTCACGCTTAACAACTCCATCATCA
AACAGTTTCTTCAGGACTAACCCTATCTCTTTTTCGTTACCATAGATTTGAGCACAATCA
ATGTGGCGATAACCGATCTTAACGGCGGCTTCGACAGCGTTTCCGACGAGACCAGGATCA
GACTGCCAAGTCCCGAGACCGACTGATGGTATCTTCGCTCCGGTGTTGAGCTCGAAACAT
CTGATTTCCTCTGCCATGAGTCTCGCCACAGAGAGTTGGTGAGAG
CC

QA 5 769 5 769
DS 



AS 2 7

CO CL844Contig1 1491 5 3 U
GGGATAGATTAGAGTAGAGAGCAGAGAAAAAAAGTTAAAAAGGTAGATCGAATGAACAGA
AATGGAGAGGACGAAAAAAGGAGGAGGAGGAGGGAGGGGGTTCAGGTGTCCCTCAGAGGA
GGCTGCTTGGCTGCTTCAGCCACTGCTATGGCGGTAATGCTGATGGCAAAAGAGGAGGGT
GTAGCTCACGTCTATGGCTTCCCGCTCACTCTCAACTCCAAGTGGTCTTTCTCTCCCTCC
TACCAGTATGTGGTGGGGGCATGCACGGTGACCATTCTCTACTCCCTGGTCCACCTCTGT
CTGGGAATTTACAGGCTCCTCACTGGATCACCCATCACACCCTCCCGTTCCCAAGCTTGG
CTTTGCTTCATCTTCGATCAGCTCTTCAGCTATTTGATAATGAGCGCTGGATCAGCCGCT
ATTGGAGTAACAAACCTCAACAAAACCGGCATCAAACACACTCCTCTCCCAGACTTCTGC
AAGACCCTTTCTTCTTTCTGCAATCGCGTCGCCCTCTCCCTCCTCCTAGTCTTGCTCTCC
TTCATCTTTCTCGCCTCCTCTTCCCTCTTTAATGTCCTTGTCCTCTCCACTCCCTAGTCT
TTCTCTTCTTGTTGCTTTACTTTATACTACTATATTAATCTAAGAGATACTTATTATTAT
GATCACTTGCATTCCCGAAACCAATGTATTGTTCTTTCCGAGTGTATTTTTACAAATTAC
ATCCAAGACGTAATCAAATATTGGGTAGAGAGACGTTGATCCCTAGATACGAGAGATCCT
TGAGGAGGGAATCTGCATTCTCAAAAACTAACCCACGCATCCCAATCTCTACTGCACACT
TGACGTTGCTTGGCCTGTCATCAATAAATACACAGTCGCAAGGTTCAACACCGAGATGGT
GCACAACCTCGAGATAGAACTCAGGATCAGGCTTTCTCTTTCCTGTATGACAGGAACAAA
AAGTCCATGACAAGTAGGCTGAAAGCTTCAACTTGTCTTCGATCATTTTATACCAGATGG
GGTAGTTGGTGAAAGCA*GAATCTCGAAGTCGTCAGCACTCAAAGTTTGGAGAAGATCTT
GCATTCCATCTAAGTAAGAGTATCCTGATCTAATACAATCCTTCAGCCCTTCCAAATCAA
AGTCCCTCTTA***TCAATGAAGAACTTTCTTGCTAGCTCCTCCTCGTCGATCAATCCCT
TTTCGAATTCGATCCAGGCGGTGGGATGCTTGCACTCGAGTAGCTCCTTCATCGGCATTC
CGAAGAAGGCTGGAATGTCTTGGTAGAATGGATCACGGACGATGGTGTCCATCACATCGA
AGAGGAGAACCGGAAGCTTCCTTTTCGGAGCCTCGCTGCGAGCGTAAGAAACCGAAGCCG
GATCACGCTTCTTCCCGATGCTGCTGTTCGGATTCAGATTGAACAATTCCCCTTTCCGTG
TATTCATCGCCGCCACCGCCGCCGCCGTGGAAGACATCAGAAATGATCTCC


BQ
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ86TF U 1
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TCTATGGCTTCCCGCTCACTCTCAACTCCAAGTGGTCTTTCTCTCCCTCCTACCAGTATG
TGGTGGGGGCATGCACGGTGACCATTCTCTACTCCCTGGTCCACCTCTGTCTAGGAATTT
ACAGGCTCTTCACTGGATCACCCATCACACCCTCCCGCTCCCAAGCTTGGCTTTGCTTTA
TCTTCGATCAGCTCTTCAGCTATTTGATAATGAGCGCTGGATCAGCCGCTATTGGAGTAA
CAAACCTCAACAAAACCGGCATCAAACACACTCCTCTCCCTGACTTCTGCAAGACCCTTT
CTTCTTTCTGCAATCACGTCGCTCTCTCCCTCCTCCTAGTCTTGCTCTCCTTCATCTTTC
TCGCCTCCTCTTCCCTCTTTAATGTCCTTGTGCTCTCCACTCCCTAGTCTTTATGTTCTT
GTTGCTTTACTTTATACTA
TATTAATCTAAGAGAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4GQ86JQ 682 0 0
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GCCACTGCTATGGCGGTAATGCTGATGGCAAAAGAGGAGGGTGTAGCTTACGTCTATGGC
TTCCCGCTCACTCTCAACTCCAAGTGGTCTTTCTCTCCCTCCTACCAGTATGTGGTGGGG
GCATGCACGGTGACCATTCTCTACTCCCTGGTCCACCTCTGTCTAGGAATTTACAGGCTC
TTCACTGGATCACCCATCACACCCTCCCGCTCCCAAGCTTGGCTTTGCTTTATCTTCGAT
CAGCTCTTCAGCTATTTGATAATGAGCGCTGGATCAGCCGCTATTGGAGTAACAAACCTC
AACAAAACCGGCATCAAACACACTCCTCTCCCTGACTTCTGCAAGACCCTTTCTTCTTTC
TGCAATCACGTCGCTCTCTCCCTCCTCCTAGTCTTGCTCTCCTTCATCTTTCTCGCCTCC
TCTTCCCTCTTTAATGTCCTTGTGCTCTCCACTCCCTAGTCTTTATGTTCTTGTTGCTTT
ACTTTATACTATATTAATCTAAGAGATACTTATTTTTATAATCACTTGGATTCTCGAAAC
AAATGTATTGTTCTTTTTTCGAGTGTATTTTTACTAAACAAATTACATCAATCAAATATT
GGGTAGAGAGACGTTGATCCCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 8

CO CL845Contig1 607 8 5 U
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GGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGT
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AGCTTCC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4F691TF U 1
AF RR4AR14JQ C 1
AF RR4GL53JQ C 1
AF RR4GL53TF U 1
AF RR4AR14TF U 1
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AF RR4BZ34TF U 324
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QA 1 293 1 293
DS 

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ATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCTACTGTTTCATAATAGATATACTTAACTTT
C

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DS 

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G

QA 1 599 1 599
DS 

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ATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCTACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTT
G

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4AR14TF 600 0 0
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CCCATTGACATCAAAGG******AGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTATGCCTGCGGTGGCC
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ATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCTACTGTTTCATAATAGATATACTTAACTTT
C

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4CV05TF 113 0 0
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DS 

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CACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGTAATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCT
ACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTT
T

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR4BZ34TF 284 0 0
G
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TCAGTTTATGGCTGTATTCGCAACCTTTTTTTCTTTGTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTT
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GTTTCTACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTTTAGCTTCC

QA 2 284 2 284
DS 



AS 2 7

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TTAACCTACCAGAAGCACGGTCTTTCAATCATGAGTACTGTTCCAAGGCGTGCACTGTTG
AGGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCACAGACATGGGAGCGCACACA
CAGACTGTATTGTGACAGAGGATCCTGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTAGACA
GTGCTGCTGTGTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTCTGATGGTTTTCGATTTGGACTTG
GTGCTGAGGTTGGGATAAGCACAGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTGGGAGTCGAGG
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GGATTGCTTACACCCATCAAGACATTCCTATCCAAGCTTAAAAAGACTTTTGTGTCGAAG
TCTAGGAGAGGATGGGCTTTTTGTTTCCTCTCTGTCTAATATCATATCCTATATTATAAT
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AAGATATTGTAAGCTACACTTTTCTTATTTATCAATTATTTGTTTGGATTTGCATTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B074JQ C 1
AF RR4D917JQ C 130
AF RR4D917TF U 130
AF RR4H576TF U 45
BS 1 45 RR4B074JQ
BS 46 130 RR4H576TF
BS 131 297 RR4D917TF
BS 298 298 RR4H576TF
BS 299 572 RR4D917TF
BS 573 573 RR4H576TF
BS 574 826 RR4D917TF
BS 827 839 RR4B074JQ

RD RR4B074JQ 839 0 0
TGGATATGGCTAAGCGCATAGTTTCTGATGCAAAGTTGGATTATCCAGCAGCTTGTAATG
CCATGGAAACTCTTCTTGTGCATAAGGATCTGGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTA
TATTTGCTCTGCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAAGGCAAGTAAAATAC
TTAACCTACCAGAAGCACGGTCTTTCAATCATGAGTACTGTTCCAAGGCGTGCACTGTTG
AGGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCACAGACATGGGAGCGCACACA
CAGACTGTATTGTGACAGAGGATCCTGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTAGACA
GTGCTGCTGTGTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTCTGATGGTTTTCGATTTGGACTTG
GTGCTGAGGTTGGGATAAGCACAGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTGGGAGTCGAGG
GATTACTTACAACCAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATG
GGATTGCTTACACCCATCAAGACATTCCTATCCAAGCTTAAAAAGACTTTTGTGTCGAAG
TCTAGGAGAGGATGGGCTTTTTGTTTCCTCTCTGTCTAATATCATATCCTATATTATAAT
TGTTATTGAAACCCTCTCTTATGAAGTGAAGTGGTTTTGATTTTAGAGTTTAGGGATTGC
ACCAAAAATAAGTTCCTTTGTTCTGTTTGTTTTTACCACTTTGGTCTTTGGCTCATAAGT
AAGATATTGTAAGCTACACTTTTCTTATTTATCAATTACTTGTTTGGATTTGCATTGCG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4D917JQ 698 0 0
G
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AGAAGCACGGTCTTTCAATCATGAGTACTGTTCCAAGGCGTGCACTGTTGAGGTTGTAGA
AGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCACAGACATGGGAGCGCACGCACAGACTGTAT
TGTGACAGAGGATCCTGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTAGACAGTGCTGCTGT
GTTCCACAATGCAAGCACAAGATTTTTTGATGGTTTTCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGT
TGGGATAAGCACAGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTGGGAGTCGAGGGATTACTTAC
AACCAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGGATTGCTTA
CACCCATCAAGACATTCCTATC*AAGCTTAAAAAGACTTTTGTGTCGAAGTCTAGGAGAG
GATGGGCTTTTTGTTTCCTCTCTGTCTAATATCATATCCTATATTATAATTGTTATTGAA
ACCCCCTCTTATGAAGTGAAGTGGTTTTGATTTTAGAGTTTAGGGATTGCACCAAAAATA
AGTTCCTTTGTTCTGTTTGTTTTTACCACTTTGGTCTTTGGCTCATAAGTAAGATATTGT
AAGCTACACTTTTTTTATTTATCAATTATTTGTTTG
C

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR4D917TF 698 0 0
G
GCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAAGGCAAGTAAAATACTTAACCTACC
AGAAGCACGGTCTTTCAATCATGAGTACTGTTCCAAGGCGTGCACTGTTGAGGTTGTAGA
AGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCACAGACATGGGAGCGCACGCACAGACTGTAT
TGTGACAGAGGATCCTGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTAGACAGTGCTGCTGT
GTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTCTGATGGTTTTCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGT
TGGGATAAGCACAGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTGGGAGTCGAGGGATTACTTAC
AACCAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGGATTGCTTA
CACCCATCAAGACATTCCTATC*AAGCTTAAAAAGACTTTTGTGTCGAAGTCTAGGAGAG
GATGGGCTTTTTGTTTCCTCTCTGTCTAATATCATATCCTATATTATAATTGTTATTGAA
ACCCCCTCTTATGAAGTGAAGTGGTTTTGATTTTAGAGTTTAGGGATTGCACCAAAAATA
AGTTCCTTTGTTCTGTTTGTTTTTACCACTTTGGTCTTTGGCTCATAAGTAAGATATTGT
AAGCTACACTTTTCTTATTTATCAATTATTTGTTTG
C

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR4H576TF 759 0 0
G
CAGCAGCTTGTAATACCATGGAAACTCTTCTTGTGCATAAGGATCTGGAGCAGAATGCTG
TGCTCAATGAGCTTATATTTGCTCTGCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTATGGTGGACCAA
AGGCAAGTAAAATACTTAACCTACCAGAAGCACGGTCTTTCAATCATGAGTACTGTTCCA
AGGCGTGCACTGTTGAGGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCACAGAC
ATGGGAGCGCACACACAGACTGTATTGTGACAGAGGATCCTGAAGCTGCAGAGCTATTCC
TTCGCCAAGTAGACAGTGCTGCTGTGTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTCTGATGGTT
TTCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTTGGGATAAGCACAGGCAGGATCCATGCTCGTGGTC
CAGTGGGAGTCGAGGGATTACTTACAACCAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTG
TGGATGGAGACAATGGGATTGCTTACACCCATCAAGACATTCCTATCCAAGCTTAAAAAG
ACTTTTGTGTCGAAGTCTAGGAGAGGATGGGCTTTTTGTTTCCTCTCTGTCTAATATCAT
ATCCTATATTATAATTGTTATTGAAACCCTCTCTTATGAAGTGAAGTGGTTTTGATTTTA
GAGTTTAGGGATTGCACCAAAAATAAGTTCCTTTGTTCTGTTTGTTTT*ACCACTTTGGT
CTTTGGCTCATAAGTAAGATATTGTAAGCTACACTTTT

QA 2 759 2 759
DS 



CO CL846Contig2 960 3 14 U
GGGCTTTCACAGAATCAAAAGAAGAACACACTAAACCCGTTGCCAATGGGTTTCGCTTGG
TGCGTACGCAGGTCAGCATCTAGGTTAGCTTCCGTGTGTAGCACTCGGATGGGTAGAGTC
CGGTCAATCTCCGCCGTTGTTTACCGTAGTCATTCTCTTGCTCGCAACCCATCTCCGTTT
CGCTCTTTGGCCCTTTACTCGACGGCTATTGATCGGATAAGCTCCGAGCAATCGCTTCTC
CGCGTGATTGACTCCGAGATCAACACTGCTCTCCAAATCGATGATCCCGATCTGGATGAA
GAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAATCCTGGGCATCAGACTGTA
ACATTGACTAGAGATTACAAAGGGGAGCATATTAAAGTTGTAGTAAGTATGCCTAGTCTT
GACGGTGATGATAATGATGATGAGGACGATGATGATGATGATGGTCATAGCAATGGATCA
AGTATTCCACTAGTTGTGACTGTTACCAAGAAGAGCGGGCTCAGCTTAGAGTTTAGCTGT
ATGGCTTTCCCGGATGAGATTGCCATTGATGCTTTATCTGTGAGCAATCAGGGGAGTACT
TTGGAGGATAAGTTAGCGAACGAAGGGCCTGATTTCGAGTGCTTGGACGAGAATCTGAAG
AAGACATTCTACAAGTATCTGGAGATTAGAGGAGTGAAAGCAAGCACTACAAACTTCTTG
CACCAGTACATGATGAGGAAAGTGAAGAGAGAGTACTTGCTCTGGTTGAAGAATGTTAAG
ACGTTTATGGAAGAGTAATAGGTAAGGTCAAAATGTATGAATGAGTTTATGTTCGTTATT
TGCATACATGTGTTTTTCCCATTTACAGAATCTTTGAGAATTTATGGTAATGACTTTAAG
TTCATTTTCTACTTTGTATCAAGGTTTGATTCACAATGCAAATCCAAACAAATAATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 0 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD40TF U 52
AF RR4DV54TF U 1
AF RR4DV54JQ C 223
BS 1 593 RR4DV54TF
BS 594 594 RR4DV54JQ
BS 595 628 RR4DV54TF
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BS 653 653 RR4DV54JQ
BS 654 658 RR4DV54TF
BS 659 661 RR4DV54JQ
BS 662 673 RR4DV54TF
BS 674 674 RR4DV54JQ
BS 675 686 RR4DV54TF
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BS 688 698 RR4DV54TF
BS 699 960 RR4DV54JQ

RD RR4FD40TF 331 0 0
TTCGCTTGGTGCGTACGCAGGTCAGCATCTAGGTTAGCTTCCGTGTGTAGCACTCGGATG
GGTAGAGTCCGGTCAATCTCCGCCGTTGTTTACCGTAGTCATTCTCTTGCTCGCAACCCA
TCTCCGTTTCGCTCTTTGGCCCTTTACTCGACGGCTATTGATCGGATAAGCTCCGAGCAA
TCGCTTCTCCGCGTGATTGACTCCGAGATCAACACTGCTCTCCAAATCGATGATCCCGAT
CTGGATGAAGAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAATCCTGGGCAT
CAGACTGTAACATTGACTAGAGATTACAAAG

QA 1 331 1 331
DS 

RD RR4DV54TF 707 0 0
GGGCTTTCACAGAATCAAAAGAAGAACACACTAAACCCGTTGCCAATGGGTTTCGCTTGG
TGCGTACGCAGGTCAGCATCTAGGTTAGCTTCCGTGTGTAGCACTCGGATGGGTAGAGTC
CGGTCAATCTCCGCCGTTGTTTACCGTAGTCATTCTCTTGCTCGCAACCCATCTCCGTTT
CGCTCTTTGGCCCTTTACTCGACGGCTATTGATCGGATAAGCTCCGAGCAATCGCTTCTC
CGCGTGATTGACTCCGAGATCAACACTGCTCTCCAAATCGATGATCCCGATCTGGATGAA
GAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAATCCTGGGCATCAGACTGTA
ACATTGACTAGAGATTACAAAGGGGAGCATATTAAAGTTGTAGTAAGTATGCCTAGTCTT
GACGGTGATGATAATGATGATGAGGACGATGATGATGATGATGGTCATAGCAATGGATCA
AGTATTCCACTAGTTGTGACTGTTACCAAGAAGAGCGGGCTCAGCTTAGAGTTTAGCTGT
ATGGCTTTCCCGGATGAGATTGCCATTGATGCTTTATCTGTGAGCAATCAGGG*AGTACT
TTGGAGGATAAGTTAGCGAACGAAGGGC*TGATTTCGAGTGCTTGGACGAGA*TCTGA**
GAGACATTCTACA*GTATCTGGAGAT*AGAGGAGTGAA
GCAGCACTA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4DV54JQ 738 0 0
TCCGAGCAATCGCTTCTCCGCGTGATTGACTCCGAGATCAACACTGCTCTCCAAATCGAT
GATCCCGATCTGGATGAAGAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAAT
CCTGGGCATCAGACTGTAACATTGACTAGAGATTACAAAGGGGAGCATATTAAAGTTGTA
GTAAGTATGCCTAGTCTTGACGGTGATGATAATGATGATGAGGACGATGATGATGATGAT
GGTCATAGCAATGGATCAAGTATTCCACTAGTTGTGACTGTTACCAAGAAGAGCGGGCTC
AGCTTAGAGTTTAGCTGTATGGCTTTCCCGGATGAGATTGCCATTGATGCTTTATCTGTG
AGCAATCAGGGGAGTACTTTGGAGGATAAGTTAGCGAACGAAGGGCCTGATTTCGAGTGC
TTGGACGAGAATCTGAAGAAGACATTCTACAAGTATCTGGAGATTAGAGGAGTGAAAGCA
AGCACTACAAACTTCTTGCACCAGTACATGATGAGGAAAGTGAAGAGAGAGTACTTGCTC
TGGTTGAAGAATGTTAAGACGTTTATGGAAGAGTAATAGGTAAGGTCAAAATGTATGAAT
GAGTTTATGTTCGTTATTTGCATACATGTGTTTTTCCCATTTACAGAATCTTTGAGAATT
TATGGTAATGACTTTAAGTTCATTTTCTACTTTGTATCAAGGTTTGATTCACAATGCAAA
TCCAAACAAATAATTGAC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 2 8

CO CL847Contig1 631 4 1 U
GGGATCTCTGTCGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAGAGAGAGAAATGGAGTCTAGC
AGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCTCAACACATCGTC
AATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAAGGAAGAGGCTGAGAAA
GAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACAGAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAGGAGACA
AGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGCGGCTGGAGCAAGAGACAGATGAGAAAATCGAA
CAGCTGAAGAAGGAAGCAGCCAGGATTTCGAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACAT
GTCACGACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATAAAAAAAAAGTCATTTAT
GAGTGTTTATACTCCTCCTCTGTTTTTCTTTCTCTCATTCACGCGTGTTGTGTTACTGGA
TGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAATGTGTTGCTTGTTTTTTGTTTTGTTT
GTAATTTGTTCTCTACCATCTTTTGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTCCCCT
TTGAGGATTGTAATAAAAAAACACTGAAATC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AC52JQ C 1
AF RR4AK54JQ C 1
AF RR4AC52TF U 1
AF RR4AK54TF U 1
BS 1 631 RR4AC52TF

RD RR4AC52JQ 631 0 0
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QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4AK54JQ 631 0 0
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TTGAGGATTGTAATAAAAAAACACTGAAATC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4AC52TF 631 0 0
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TTGAGGATTGTAATAAAAAAACACTGAAATC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4AK54TF 631 0 0
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TGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAATGTGTTGCTTGTTTTTTGTTTTGTTT
GTAATTTGTTCTCTACCATCTTTTGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTCCCCT
TTGAGGATTGTAATAAAAAAACACTGAAATC

QA 1 631 1 631
DS 



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TTTTTTTTTTTTT**TGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTGTTGTTGTTGTTTGTTGTTT
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AATAAGATTTACATAAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ49TF U 1
AF RR4B976TF U 11
AF RR4BH56TF U 11
AF RR4BQ49JQ C 25
BS 1 545 RR4BQ49TF
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BS 547 572 RR4BQ49TF
BS 573 589 RR4B976TF
BS 590 681 RR4BQ49JQ

RD RR4BQ49TF 572 0 0
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AGAAAATCGAACAGCTGAAGAAGGAAGCAGCCAGGATTTCCAACGATGTTGTGGAGATGC
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AAAAAGGTCATTTATGAGTTTATGCTCCTCCTCTGTTTCTGCTTCTCTCATTCACGCGTG
TGGTGTTACTGGGATGGGG*ATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAAATGTGTTGCTT
TTTTTGTTTTTTT**TGTAATTTATTCTCTAC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4B976TF 583 0 0
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GG*ATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAAATGTGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
TAATTTATTCTCTACCATCTTCTGTTGTTGTT
GGTT

QA 8 579 8 579
DS 

RD RR4BH56TF 563 0 0
GGCTCTC
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ACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATAAAAAAAAA*GGTCATTTATGA
GTTTATGCTCCTCCTCTGTTTCTGCTTCTCTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGGATGG
GGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAAATGTGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
TAATTTATTCTCTACC

QA 8 563 8 563
DS 

RD RR4BQ49JQ 657 0 0
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CTCCTCCTCTGTTTCTGCTTCTCTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGGATGGGG*ATCT
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TTCTCTACCATCTTCTGTTGTTGTTGTTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCC
CTTTTGAGGATTGTAATAAAAAAAACATTGAAATCTAATAAGATTTACATAAATACC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 8

CO CL848Contig1 750 8 9 U
GGGAACCCCCTAAGGTCTCTTCTCAGAGACGGACTCATTCACAGGAAGAAACCATGACCG
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AGTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATATCAGCTGCACCTTCGTTTTTGCCTGAAGCTC
CTTTGAGTATCTCAGCTTCACCTCCTCTGGAGGCTATTACGTCTCCAGATATCTCTCCTC
TGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGTCTCCTTCTCCGGCAGGATCTTTTGACATGC
CGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAAATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTT
CTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCAC
TCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTATGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTA
TTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTTGTTCAAAACAAAAAAAAAA*GGAAAAAAAG
AATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGT
ATAATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTATTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATCTGGC
CGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGTAACAGTGATATATGGGTTTTGTGTATGGAT
TGGATCCAATTATGAATAATCTCTCTCACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DQ38TF U 1
AF RR4F432TF U 30
AF RR4DQ38JQ C 165
AF RR4E931TF U 1
AF RR4G666TF U 30
AF RR4B405JQ C 31
AF RR4B405TF U 31
AF RR4E931JQ C 429
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AGTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATATC

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR4F432TF 457 0 0
G
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ATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTT
CCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTA
TGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTATTGTGG

QA 2 457 2 457
DS 

RD RR4DQ38JQ 547 0 0
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CCAGATATCTTCCCTCTGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGTCTCCTTTTCCGGCA
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TCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTTCCTCTGTTTCTTTG
GTCTCCTTGACACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTATGCTACCTTACTGC
AGACTCTAATAAATTATTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTTGTTCAAAACAAAAA
AAAAA*GGAAAAAAAGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTATTCTTCTCATGGAA
CTTTATTTTTCTTTGTATAATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTATTGTTCGGGTGAGG
CTCTCTGCAATCTGGCCGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGTAACAGTGATATATG
GGTTTTG

QA 1 547 1 547
DS 

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TCGTCTCTCTGTTAGTCGCCTTAACCGTTCTTTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAG
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CTTTGAGTATCTCAGCTTCACCTCCTCTGGAGGCTATTACGTCTCCAGATATCTCTCCTC
TGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGTCTCCTTCTCCGGCAGGATCTTTTGACATGC
CGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAAATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTT
CTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCAC
TCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTATGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTA
TTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTTGTTCAAAACAAAAAAAAAA*GGAAAAAAAG
AATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGT
ATAATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTATTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATCTGGC
CGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGTA*CAGTGATATATGGGTTT*GTGTATGGAT
TGGATCCAATTATGAATAATCTCTCTCAC
T

QA 1 749 1 749
DS 

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G
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TTTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAGAGTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATAT
CAGCTGCACCTTCGTTTTTGCCTGAAGCTCCTTTGAGTATCTCAGCTTCACCTCCTCTGG
AGGCTATTACGTCTCCAGATATCTCTCCTCTGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAAGGT
CTCCTTCTCCGGCAGGATCTTTTGACATGCCGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAA
ATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTT
CCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTA
TGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTATTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTT
GTTCAAAACAAAAAAAAA**GGAAAAAAAGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTA
TTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGTATAATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTA
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CTCTCAC

QA 2 713 2 713
DS 

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AGGCTATTACGTCTCCAGATATCTCTCCTCTGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGT
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ATCCGGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTT
CCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTA
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GTTCAAAACAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTA
TTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGTATAATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTA
TTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATCTGGCCGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGT
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QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4B405TF 712 0 0
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TTTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAGAGTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATAT
CAGCTGCACCTTCGTTTTTGCCTGAAGCTCCTTTGAGTATCTCAGCTTCACCTCCTCTGG
AGGCTATTACGTCTCCAGATATCTCTCCTCTGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGT
CTCCTTCTCCGGCAGGATCTTTTGACATGCCGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAA
ATCCGGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTT
CCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTA
TGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTATTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTT
GTTCAAAACAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTA
TTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGTATAATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTA
TTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATCTGGCCGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGT
AACAGTGATATATAGGTTTTGTGTATGGATTGGATCCAATTATGAATAATCT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4E931JQ 322 0 0
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AATAAGCCCTATTTGACATCTTGTTCAAAACAAAAAAAAAA*GGAAAAAAAGAATTCACA
ATGTATTCTTCTTTTTACTCTATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGTATAATATA
ATGTTTACACTTCTTTTAATTATTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATCTGGCCGGTGCAG
ACCGTGCAGTTGTTGTACTTGTAACAGTGATATATGGGTTTTGTGTATGGATTGGATCCA
ATTATGAATAATCTCTCTCACT

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 6

CO CL849Contig1 733 6 4 U
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CAAATCTCAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAACCTCCGAGGGAAAGAGTTC
AACTTGACACTGCACTGGCATGTTATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATA
GTCATGTCTGGTTATCGTTTACCCAATGCATACAGATGATTTTATGAAGAGTAGTAGGCC
TTCATGCATAATGTCATCTAGTTGTGTGTTTTCAGTTGTTCAGTCGTTGAAACATTGTTT
TGTAATGGAACTTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAATCCTTTTGATTCACAAACTATAA
AAAAATCCATAGT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS75TF U 1
AF RR4FW92JQ C 163
AF RR4FW92TF U 37
AF RR4DS75JQ C 1
AF RR4DZ03JQ C 163
AF RR4DZ03TF U 1
BS 1 594 RR4DS75TF
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BS 712 724 RR4DZ03TF
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RD RR4DS75TF 594 0 0
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AACCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATT
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AACTTGACACTGCACTGGCATGTTATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATA
GTCATGTCTGGTTATCGTTTACCCAATGCATACAGATGATTTTATGAAGAGTAG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4FW92JQ 549 0 0
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TTGATTCAC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4FW92TF 675 0 0
GG
GACTTTCGTTACGAACCAGACGAGTGATTTGAAGAAGATGCATTCTTTTGGATACAGAGC
GAATGCGCTGCTAACGTTCGCTGTCACGATACTTGCCTTCATATGCGCGATCGCGTCCTT
CTCTGATAACTTCAGTAACCAAACACCCTCTGCTCGGATCCAGATATTGAATATCAATTG
GTTTCAGAAGCAACCCCATGGAAATGATGAGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCAGA
CTTGCAGTCACTATTTACTTGGAACACAAAGCAGGTATTCGCTTTCGTAGCAGCAGAGTA
TAAAACCTCAAAGAATTCTCTGAACCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAA
GGAGCAAGTCAACTTCTGGATTCAAATCTCAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACA
CAACCTCCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGTTATGCCCAAGACTGG
CAAGATGTTTGCTGACAAAATAGTCATGTCTGGTTATCGTTTACCCAATGCATACAGATG
ATTTTATGAAGAGTAGTAGGCCTTCATGCATAATGTCATCTAGTTGTGTGTTTTCAGTTG
TTCAGTCGTTGAAACATTGTTTTGTAATGGAACTTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAAT
CCTTTTGATTCAC

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AACCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATT
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AACTTGACACTGCACTGGCATGTTATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATA
GTCATGTCTGGTTATCGTTTACCCAATGCATACAGATGATTTTATGAAGAGTAGTAGGCC
TTCATGCATAATGTCATCTAGTTGTGTGTTTTCAGTTGTTCAGTCGTTGAAACATTGTTT
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AAAAATCCATAGT

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ACCTCAAAGAATTCTCTGAACCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAG
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ATGTTTGCTGACAAAATAGTCATGTCTGGTTATCGTTTACCCAATGCATACAGATGATTT
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GTCGTTGAAACATTGTTTTGTAATGGAACTTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAATCCTT
TTGATTCACAAACTATAAAAAA
ATCCATAGT

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AGTGATTTGAAGAAGATGCATTCTTTTGGATACAGAGCGAATGCGCTGCTAACGTTCGCT
GTCACGATACTTGCCTTCATATGCGCGATCGCGTCCTTCTCTGATAACTTCAGTAACCAA
ACACCCTCTGCTCAGATCCAGATATTGAATATCAATTGGTTTCAGAAGCAACCCCATGGA
AATGATGAGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCAGACTTGCAGTCACTATTTACTTGG
AACACACAGCAGGTATTCGCTTTCGTAGCAGCAGAGTATAAAACCTCAAAGAATTCTCTG
AACCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATT
CAAATCTCAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAACCTCCGAGGGAAAGAGTTC
AACTTGACACTGCACTGGCATGTTATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATA
GTCATGTCTGGTTATCGTTTACCCAATGCATACAGATGATTTTATGAAGAGTAGTACGCC
TTCATGCATAATGTCATCTAGTTGTGTGTTTTCAGTTGTTCAGTCGTTGAAACATTGTTT
TGTAATGGAACTTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAATCCTTTTGATTCACAAACTATAA
AAAA
TCCATAGT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 8

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AATGGCAATGGCTGTTTTCCGTCGCGAAGGGAGGCGTCTCCTCCCTTCAATAGCCGCTCG
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TGATGTGAAGAAGAGTGTGGTGGTCACTCTCTCTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAAT
TAACTCCACTGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTGTACGAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAA
GGAGGTGAAGTTTGTTATTGTGGGAGAGAAAGCAAAGGCTATAATGTTTCGTGACTCAAA
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TGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATTCTGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTG
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CACCTTGAAGGAGACAGTGTGTTTTGAA*TTCTCTAAGGACTACTGAGTCAGTTTTCCTT
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TCCCCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4BP71TF U 203
AF RR4BA59TF U 1
AF RR4E757TF U 56
AF RR4BB39TF U 1
AF RR4BP71JQ C 560
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GTCACTTTCTCTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTG
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QA 1 452 1 452
DS 

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CCCAATCGCCGCCATCCGATCTCCTCTCTCTTCTGACCAGGAGGAAGGACCTCTTGGAGT
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TGATGTGAAGAAGAGTGTGGTGGTCACTCTCTCTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAAT
TAACTCCACTGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTGTACGAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAA
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GATTATTGAGAAG
AGTCTGA

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DS 

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TGAGCAATGGCAATGGCTGTTTTCCGTCGCGAAGGGAGGCGTCTCCTCCCTTCAATAGCC
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GGAGTTCGTTCTATCTCAACTCAAGTTGTGCGTAACCGGATGAAGAGTGTGAAGAACATC
CAAAAGACCACAAAGGCCATGAAGATGGTTGCTGCTTCCAAGCTAAGAGCTGTTCAAGGC
AGAGCTGAGAACTCCCGTGGACTTTGGCAGCCTTTTACTGCTCTTCTTGGAGACAATCCC
**CATTGATGTGAAGAAGAGTGTGGTGGTCACTCTCTCTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGT
GGAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTGTACAAGTTGAATGCTGGTCCT
GAAAAGGAGGTGAAGTTTGTTATTGTGGGAGAGAAAGCAAAGGCTATAATGTTTCGTGAC
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CCTGAGATT

QA 1 729 1 729
DS 

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TATCTGCCTTTTATCATCCGACTAGAGAAGAAGAAGAAGAAGACCAACCCCGATCTGAGC
AATGGCAATGGCTGTTTTCCGTCGCGAAGGGAGGCGTCTCCTCCCTTCAATAGCCGCTCG
CCCAATCGCCGCCATCCGATCTCCTCTCTCTTCTGACCAGGAGGAAGGACCTCTTGGAGT
TCGTTCTATCTCAACTCAAGTTGTGCGTAACCGGATGAAGAGTGTGAAGAACATCCAAAA
GATCACAAAGGCCATGAAGATGGTTGCTGCTTCCAAGCTAAGAGCTGTTCAAGGCAGAGC
TGAGAACTCCCATGGACTTTGGCAACCTTTTACTGCTCTTCTTGGAGACAATCCCAGCAT
TGATGTGAAGAAGAGTGTGGTGGTCACTCTCTCTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAAT
TAACTCCACTGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTGTACGAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAA
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CTCAGTTTTAGCTGATGACATCCTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTCGCGCATTGTTTA
CAACAAGTTCCATTCTGTCGTCGCATTTCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTCACCTGA
GATTATTGAGAAG*AGTCTGAAG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4BP71JQ 733 0 0
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GTTACAGAGCTGAATAAGAATCCACTCAACTATGCTCAGGTCTCAGTTTTAGCTGATGAC
ATCTTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTTGCGCATTGTTTACAACAAGTTCCATTCTGTC
GTCGCATTTCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTCACCTGAGATTATTGAGAAGGAGTCT
GAAGTGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTCGACTCATACGAGATTGAAGGTGGTGAAACAAAG
GGAGAAATTCTGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTGTGTAATGTTCAATGCGGTG
CTGGAGAATGCGTGTAGTGAGATGGGAGCTAGGATGTCTGCCATGGACAGCTCAAGCAGA
AACGCAGGAGAAATGCTTGACCGTCTCACCCTCACTTACAACAGGACTCGTCAAGCTTCT
ATCACAACAGAGCTTATCGAGATTATCTCTGGAGCCTCTGCACTTGAAGCCGCTAAATAA
GCACATTCTTGTTTGCGTTGACTTGGTTTTTGATACTCGTCCACCTTGAAGGAGACAGTG
TGTTTTGAA*TTCTCTAAGGACTTCTGAGTCAGTTTTCCTTTGCTGGCTTCTCGTTGAGG
CTACCAGTCTTTGCTCAAAGGATTTTTCAGAATAATATCCCTGTAATTTCCAGCAGGATT
ACTGATGATTGCA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4EB94TF 702 0 0
G
GGGAGAGAAAGCAAAGGCTATAATGTTTCGTGACTCAAAGAACGACATTTCCCTTACTGT
TACAGAGCTGAATAAGAATCCACTCAACTATGCTCAGGTCCCAGTTTTAGCTGATGACAT
CCTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTTGCGCATTGTTTACAACAAGTTCCATTCTGTCGT
CGCATTTCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTCACCTGAGATTATTGAGAAGGAGTCTGA
AGTGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTCGACTCATACGAGATTGAAGGTGGTGAAACAAAGGG
AGAAATTCTGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTGTGTAATGTTCAATGCGGTGCT
GGAGAATGCGTGTAGTGAGATGGGAGCTAGGATGTCTGCCATGGACAGCTCAAGCAGAAA
CGCAGGAGAAATGCTTGACCGTCTCACCCTCACTTACAACAGGACTCGTCAAGCTTCTAT
CACAACAGAGCTTATCGAGATTATCTCTGGAGCCTCTGCACTTGAAGCCGCTAAATAAGC
ACATTCTTGTTTGCGTTGACTTGGTTTTTGATACTCGTCCACCTTGAAGGAGACAGTGTG
TTTTGAA*TTCTCTAAGGACTACTGAGTCAGTTTTCCTTTGCTGGCTTCTCGTTGAGGCT
ACCAGTCTTTGCTCAA*GGATTTTTCAGAATAATATCCCTG

QA 2 702 2 702
DS 

RD RR4BA59JQ 824 0 0
GCAGGGCTTTGTACGAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAAGGAGGTGAAGTTTGTTATTGTGG
GAGAGAAAGTAAAGGCTATAATGTTTCGTGACTCAAAGAACGACATTTCCCTTACTGTTA
CAGAGCTGAATAAGAATCCACTCAACTATGCTCAGGTCTCAGTTTTAGCTGATGACATCC
TGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTCGCGCATTGTTTACAACAAGTTCCATTCTGTCGTCG
CATTTCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTCACCTGAGATTATTGAGAAGGAGTCTGAAG
TGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTCGACTCATACGAGATTGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAG
AAATTCTGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAGTTCTCTTGTGTAATGTTCAATGCGGTGCTGG
AGAATGCGTGTAGTGAGATGGGAGCTAGGATGTCTGCCATGGACAGCTCAAGCAGGAACG
CAGGAGAAATGCTTGACCGTCTCACCCTCACTTACAACAGGACTCGTCAAGCTTCTATCA
CAACAGAGCTTATCGAGATTATCTCTGGAGCCTCTGCACTTGAAGCCGCTAAATAAGCAC
ATTCTTGTTTGCGTTGACCTGGTTTTTGATACTCGTCCACCTTGAAGGAGACAGTGTGTT
TTTAAATTCTCTAAGGACTACTGAGTCAGTTTTCCTTTGCTGGCTTCTCGTTGAGGCTAC
CAGTCTTTGCTCAAAGGATTTTTCAGAATAATATCCCTGTAATTTCCAGCAGGATTACTG
ATGATTGCATTAACATTTGTTCTGATTTCAGTACACTTCCCCCC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4BB39JQ 681 0 0
AACTATGCTCAGGTCTCAGTTTTAGCTGATGACATCCTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCT
TCGCGCATTGTTTACAACAAGTTCCATTCTGTCGTCGCATTTCTACCGACTGTGGCCACT
GTTTTGTCACCTGAGATTATTGAGAAGGAGTCTGAAGTGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTC
GACTCATACGAGATTGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATTCTGCAGAATCTGGCCGAG
TTCCAGTTCTCTTGTGTAATGTTCAATGCGGTGCTGGAGAATGCGTGTAGTGAGATGGGA
GCTAGGATGTCTGCCATGGACAGCTCAAGCAGGAACGCAGGAGAAATGCTTGACCGTCTC
ACCCTCACTTACAACAGGACTCGTCAAGCTTCTATCACAACAGAGCTTATCGAGATTATC
TCTGGAGCCTCTGCACTTGAAGCCGCTAAATAAGCACATTCTTGTTTGCGTTGACCTGGT
TTTTGATACTCGTCCACCTTGAAGGAGACAGTGTGTTTTTAAATTCTCTAAGGACTACTG
AGTCAGTTTTCCTTTGCTGGCTTCTCGTTGAGGCTACCAGTCTTTGCTCAAAGGATTTTT
CAGAATAATATCCCTGTAATTTCCAGCAGGATTACTGATGATTGCATTAACATTTGTTCT
GATTTCAGTACACTTCCCCCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 6

CO CL851Contig1 558 6 5 U
GGATTCGCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTC************GATTT
CTTCTCCGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTTGTTCG
CCGCTACAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAA
ACCCTGAAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAG
AGGGAGAGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAA
TCATGCCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGAACCCACCATTTTTCTC
AAGACTTTCGCACTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGT
GTCTCTTAATAAAAATATCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGT
TGTCGCTTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACT
GGAGTTTATTTTGACAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 

AF RR4C850JQ C 1
AF RR4D319JQ C 133
AF RR4CM77JQ C 5
AF RR4D319TF U 5
AF RR4CM77TF U 5
AF RR4C850TF U 1
BS 1 6 RR4C850TF
BS 7 41 RR4D319TF
BS 42 43 RR4CM77TF
BS 44 557 RR4D319TF
BS 558 558 RR4CM77TF

RD RR4C850JQ 558 0 0
GGATTCGCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGATTT
CTTCTCCGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTTGTTCG
CCGCTACAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAA
ACCCTGAAGTCAGATGTACTAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAG
AGGGAGAGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAA
TCATGCCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACCGATCCTACTTACTGAACCTACCATTTTTCTC
AAGACTTTCGCACTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGT
GTCTCTTAATAAAAATATCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGT
TGTCGCTTTT*AAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACT
GGAGTTTATTTTGACAGG

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4D319JQ 425 0 0
CTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAAACCCTGAAGTCA
GATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAGAGGGAGAGAAGT
ACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAATCATGCCTGGCC
TCAACAAGTTTTTCACTGATCCTACTTACTGAACCCACCATTTTTTTCAAGACTTTCGCA
CTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGTGTCTCTTAATAA
AAATATCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGTTGTCGCTTTTTA
AGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACTGGAGTTTATTTT
GACAG

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4CM77JQ 554 0 0
GG
GCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTC************GATTTCTTCTC
CGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTCGTTCGCCGCTA
CAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAAACCCTG
AAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAGAGGGAG
AGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAATCATGC
CTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGAACCCACCATTTTTCTCAAGACT
TTCGCACTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGTGTCTCT
TAATAAAAATATTATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGTTGTCGC
TTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACTGGAGTT
TATTTTGACAGG

QA 3 554 3 554
DS 

RD RR4D319TF 553 0 0
GG
GCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCTCTCTCTCTCTC**************GATTTCTTCTC
CGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTTGTTCGCCGCTA
CAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAAACCCTG
AAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAGAGGGAG
AGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAATCATGC
CTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGAACCCACCATTTTTCTCAAGACT
TTCGCACTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGTGTCTCT
TAATAAAAATATCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGTTGTCGC
TTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACTGGAGTT
TATTTTGACAG

QA 3 553 3 553
DS 

RD RR4CM77TF 554 0 0
GG
GCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTC************GATTTCTTCTC
CGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTCGTTCGCCGCTA
CAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAAACCCTG
AAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAGAGGGAG
AGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAATCATGC
CTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGAACCCACCATTTTTCTCAAGACT
TTCGCACTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGTGTCTCT
TAATAAAAATATTATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGTTGTCGC
TTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACTGGAGTT
TATTTTGACAGG

QA 3 554 3 554
DS 

RD RR4C850TF 558 0 0
GGATTCGCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGATTT
CTTCTCCGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTTGTTCG
CCGCTACAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAA
ACCCTGAAGTCAGATGTACTAAGGAGAACAGGGCTGCTGGAATTTTGGATAACCATGCAG
AGGGAGAGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAA
TCATGCCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACCGATCCTACTTACTGAACCTACCATTTTTCTC
AAGACTTTCGCACTATTGTTTTTCCTGGAATATTGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGT
GTCTCTTAATAAAAATATCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGT
TGTCGCTTTT*AAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTCTTTGGATACATAACT
GGAGTTTATTTTGACAGG

QA 1 558 1 558
DS 



AS 2 7

CO CL852Contig1 897 4 9 U
GTCCTCTTCATCAAACTCAGGATCCTTCACTGTTTCTTCTACTTTCGCCTTTGAATCAGT
ATCAGAACCAGACGACTTCTTTCTCTTTGACTTGGTGTGTTACGAAGCACTAATCTCAGA
TCCGATTCACTGTTGTATTATGTATCTATTCTTCCTCATATGTCCCTGCTTCTTCTTGCT
ACTACTTGTGCTCTTCATCTTCCTCTTTCTTCCTCGCCTTCTAATATTGGGCCATATACA
AAAATAAAGCCCAACTAAAGTTTATCGAACATCTTCGATCTTCATTACAAAGCAGAGCCC
CAAATGTTTTGATTAGGGTCGATTGATTCCTCTAATCCTTTTTT*ATCTTCTTTCAAATG
GGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGGATTCAGACTCAAACCCGA
TTTACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAATCTCAAGCAGCCAAGGATT
TGCACGAAATTTAGAGGTCTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCTGAATGATTCGAGATTCGTC
GATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCTCTCGAATACGACTCTGTA
TGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAATA
GTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTTTCATCGCTTGCCGTTGGTTTA
ATTGGTGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTATAGCTACCCAAAGTAGCTGATGGTTTTGAAG
ATATATACGGCAAAAACAAGACTTCGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATGTTCGAAA
TATCATTCGTCGCTTTAAAACCTTGTATCTATCTATCTATATATTAGTTTTTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO01TF U 1
AF RR4A664JQ C 298
AF RR4BO01JQ C 734
AF RR4A664TF U 298
BS 1 326 RR4BO01TF
BS 327 327 RR4A664TF
BS 328 344 RR4BO01TF
BS 345 345 RR4A664TF
BS 346 404 RR4BO01TF
BS 405 405 RR4A664TF
BS 406 686 RR4BO01TF
BS 687 890 RR4A664TF
BS 891 897 RR4A664JQ

RD RR4BO01TF 686 0 0
GTCCTCTTCATCAAACTCAGGATCCTTCACTGTTTCTTCTACTTTCGCCTTTGAATCAGT
ATCAGAACCAGACGACTTCTTTCTCTTTGACTTGGTGTGTTACGAAGCACTAATCTCAGA
TCCGATTCACTGTTGTATTATGTATCTATTCTTCCTCATATGTCCCTGCTTCTTCTTGCT
ACTACTTGTGCTCTTCATCTTCCTCTTTCTTCCTCGCCTTCTAATATTGGGCCATATACA
AAAATAAAGCCCAACTAAAGTTTATCGAACATCTTCGATCTTCATTACAAAGCAGAGCCC
CAAATGTTTTGATTAGGGTCGATTGAGTCCTCTAATCCTTTTTTTATCTTCTTTCAAATG
GGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGGATCCAGACTCAAACCCGA
TTTACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAATCTCAAGCAGCCAAGGATT
TGCACGAAATTTAGAGGTCTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCTGAATGATTCGAGATTCGTC
GATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCTCTCGAATACGACTCTGTA
TGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAATA
GTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4A664JQ 600 0 0
GG
CCAAATGTTTTGATTAGGGTCGATTGATTCCTCTAATCCTTTTTT*ATCTTCTTTCAAAT
GGGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGGATTCAGACTCAAACCCG
ATTTACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAATCTCAAGCAGCCAAGGAT
TTGCACGAAATTTAGAGGTCTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCTGAATGATTCGAGATTCGT
CGATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCTCTCGAATACGACTCTGT
ATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAAT
AGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTTTCATCGCTTGCCGTTGGTTT
AATTGGTGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTATAGCTACCCAAAGTAGCTGATGGTTTTGAA
GATATATACGGCAAAAACAAGACTTCGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATGTTCGAA
ATATCATTCGTCGCTTTAAAACCTTGTATCTATCTATCTATATATTAGTTTTTATCAC

QA 3 600 3 600
DS 

RD RR4BO01JQ 112 0 0
GGTACATTTTCCTTTATAGCTACCCAAAGTAGCTGATGGTTTTGAAGATATATACGGCAA
AAACAAGACTTGGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATGTTCGAAATATCA

QA 1 112 1 112
DS 

RD RR4A664TF 600 0 0
GG
CCAAATGTTTTGATTAGGGTCGATTGATTCCTCTAATCCTTTTTT*ATCTTCTTTCAAAT
GGGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGGATTCAGACTCAAACCCG
ATTTACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAATCTCAAGCAGCCAAGGAT
TTGCACGAAATTTAGAGGTCTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCTGAATGATTCGAGATTCGT
CGATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCTCTCGAATACGACTCTGT
ATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAAT
AGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTTTCATCGCTTGCCGTTGGTTT
AATTGGTGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTATAGCTACCCAAAGTAGCTGATGGTTTTGAA
GATATATACGGCAAAAACAAGACTTCGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATGTTCGAA
ATATCATTCGTCGCTTTAAAACCTTGTATCTATCTATCTATATATTAGTTT
TTATCAC

QA 3 593 3 593
DS 



CO CL852Contig2 636 3 2 U
TTTTTTATCTTCTTTCAAATGGGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTT
CGGATTCAGACTCAAACCCGATTTACGATTATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTC
AATCTCAAGCAGCCAAGGATTTGCACGAAAGTTGGAGGTTTGGGAGGAAATCGAAGAGAG
CAGAATGATTCGAGATTCGTCGATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTC
CCTCTCGAATACGACTCTGTATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATA
GTGGTGACGGGTTTGTCAATAGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTT
TCATCGCTTGCCGTTGGTTTAATTGGTGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTATAGCTACCCA
AAGGCTTGCTCAGAAATGATTGCTGAAAGAAGGAAAAGAGTAGCTGATGGTTTTGAAGAT
ATATACGGCAAAAACAAGACTTCGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATGTTCGAAATA
TCATTCTATCTATATATTAGTTTTTATCTCAGTTTCATTCATCAGATGTTTTTATAACAA
AGCTCTTGAATTTTGAAGATCATATGCAAACAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4EW61TF U 32
AF RR4H210TF U 1
AF RR4H210JQ C 52
BS 1 634 RR4H210TF
BS 635 636 RR4H210JQ

RD RR4EW61TF 299 0 0
GG
ATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGGATTCAGACTCAAACCCGATTTACGATAATC
AGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAATCTCAAGCAGACAAGGATTTGCACGAAAGTT
GGAGGTTTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCAGAATGATTCGAGATTCGTCGATGAAAATGAC
GACATGGAAGGTTACTTGAATCATCTCTCTCTCGAATACGACTCCGTATGGAATACAAAG
CCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAATAGTGGCTTGT

QA 3 299 3 299
DS 

RD RR4H210TF 634 0 0
TTTTTTATCTTCTTTCAAATGGGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTT
CGGATTCAGACTCAAACCCGATTTACGATTATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTC
AATCTCAAGCAGCCAAGGATTTGCACGAAAGTTGGAGGTTTGGGAGGAAATCGAAGAGAG
CAGAATGATTCGAGATTCGTCGATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTC
CCTCTCGAATACGACTCTGTATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCATGGACGATA
GTGGTGACGGGTTTGTCAATAGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTT
TCATCGCTTGCCGTTGGTTTAATTGGTGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTATAGCTACCCA
AAGGCTTGCTCAGAAATGATTGCTGAAAGAAGGAAAAGAGTAGCTGATGGTTTTGAAGAT
ATATACGGCAAAAACAAGACTTCGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATGTTCGAAATA
TCATTCTATCTATATATTAGTTTTTATCTCAGTTTCATTCATCAGATGTTTTTATAACAA
AGCTCTTGAATTTTGAAGATCATATGCAAACAGA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4H210JQ 585 0 0
TCGCCGTTTCGGATTCAGACTCAAACCCGATTTACGATTATCAGTACCCAAACGAATACC
GGATCATTCAATCTCAAGCAGCCAAGGATTTGCACGAAAGTTGGAGGTTTGGGAGGAAAT
CGAAGAGAGCAGAATGATTCGAGATTCGTCGATGAAAATGGCGACATGGAAGGTTACTTG
GATCATCTCCCTCTGGAATACGACTCTGTATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAACCA
TGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAATAGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCG
GTTTTAGTTTCATCGCTTGCCGTTGGTTTAATTGGTGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTAT
AGCTACCCAAAGGCTTGTTCAGAAATGATTGCTGAAAGAAGGAAAAGAGTAGCTGATGGT
TTTGAAGATATATACGGCAAAAACAAGACTTGGTAGTCAATCAATCCCCTACTCCTAATG
TTCGAAATATCATTCTATCTATATATTAGTTTTTATCTCAGTTTCATTCATCAGATGTTT
TTATAACAAAGCTCTTGAATTTTGAAGATCATATGCAAACAGAGC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 2 8

CO CL853Contig1 969 4 13 U
GGATACAACGAGTTCCAAAAAGAAAAAGCAAAAAGAAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGA
GCCTCTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCCGCT
GATACAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAGCC
ATCCAGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCCCTCCCAACCAAC
ACCCACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCACCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACC
GGCTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGGAACCGTCTC
GAGTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACTCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCAC
GGTGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGCGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCAACGTTCCG
ATGACAGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGAC
CTCTTGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGATCAGGACACGGTGGG*CACGTGGT
GGCGTGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGTGCTGTAGGAATCATTA
CAACAGTCCTCAGACGTGTCGTGCTTCGACACACTCTCTGTTCTTTAAGCACGCGTGCCC
TTCGACTATGACTTTTGCTCACGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCTTCTCCTAG
AGAGCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGTTCGGCTTGTTCTATGGTG
TTGTAACAGTGATAATATCGCACCGATCTCTCATATCTATCTTTCTGGTTTTGATTGGTT
TAGTTTGCGATTTCCCGGTTCAGTTATGTAGTTGTTTAAAAGGTATTGTAGTCCAACTAT
GAAATTACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AT57TF U 1
AF RR4AV53TF U 1
AF RR4AT57JQ C 233
AF RR4AV53JQ C 234
BS 1 591 RR4AT57TF
BS 592 592 RR4AV53TF
BS 593 647 RR4AT57TF
BS 648 651 RR4AV53TF
BS 652 652 RR4AT57JQ
BS 653 797 RR4AV53TF
BS 798 798 RR4AT57JQ
BS 799 822 RR4AV53TF
BS 823 823 RR4AT57JQ
BS 824 825 RR4AV53TF
BS 826 828 RR4AT57JQ
BS 829 854 RR4AV53TF
BS 855 969 RR4AT57JQ

RD RR4AT57TF 647 0 0
GGATACAACGAGTTCCAAAAAGAAAAAGCAAAAAGAAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGA
GCCTCTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCCGCT
GATACAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAGCC
ATCCAGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCCCTCCCAACCAAC
ACCCACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCACCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACC
GGCTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGGAACCGTCTC
GAGTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACTCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCAC
GGTGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGCGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCAACGTTCCG
ATGACAGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGAC
CTCTTGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGATCAGGACACGGTGGGGCACGTGGT
GGCGTGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGTGCT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4AV53TF 863 0 0
GGATACAACGAGTTCCAAAAAGAAAAAGCAAAAAGAAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGA
GCCTCTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCCGCT
GATACAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAGCC
ATCCAGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCCCTCCCAACCAAC
ACCCACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCACCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACC
GGCTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGGAACCGTCTC
GAGTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACTCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCAC
GGTGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGCGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCAACGTTCCG
ATGACAGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGAC
CTCTTGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGATCAGGACACGGTGGG*CACGTGGT
GGCGTGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGTGCTGTAG*AATCATTA
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TTCGACTATGACTTTTGCTCACGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCTTCTCCTAG
AGAGCTCAAAGTCATCT*CTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGT*CGC**TGTTCTATGGTG
TTGTAACAGTGATA
TATCGCACG

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ACCGTCTCGAGTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACTCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACC
TCCACCACGGTGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGCGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCA
ACGTTCCGATGACAGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCC
GTGAAGACCTCTTGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGATCAGGACACGGTGGG*
CACGTGGTGGCGTGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGTGCTGTAGG
AATCATTACAACAGTCCTCAGACGTGTCGTGCTTCGACACACTCTCTGTTCTTTAAGCAC
GCGTGCCCTTCGACTATGACTTTTGCTCACGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCT
TCTCCTAGAGAGCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGTTCGGCTTGTT
CTATGGTGTTGTAACAGTGATAATATCGCACCGATCTCTCATATCTATCTTTCTGGTTTT
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CCAACTATGAAATTACG

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DS 

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TCGAACCGGCTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGGAA
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CCACCACGGTGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGCGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCAA
CGTTCCGATGACAGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCG
TGAAGACCTCTTGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGATCAGGACACGGTGGG*C
ACGTGGTGGCGTGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGTGCTGTAGGA
ATCATTACAACAGTCCTCAGACGTGTCGTGCTTCGACACACTCTCTGTTCTTTAAGCACG
CGTGCCCTTCGACTATGACTTTTGCTCACGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCTT
CTCCTAGAGAGCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGTTCGGCTTGTTC
TATGGTGTTGTAACAGTGATAATATCGCACCGATCTCTCATATCTATCTTTCTGGTTTTG
ATTGGTTTAGTTTGCGATTTCCCGGTTCAGTTATGTAGTTGTTTAAAAGGTATTGTAGTC
CAACTATGAAATTA

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL853Contig2 984 4 9 U
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GAGCCTCTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCCG
CTGACACAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAG
CCATTCAGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGTTCTCCCAACCA
ACACCCACCGCTCTTTCCCCGCGCCAACCTCCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAA
CCGGCTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTC
TCGAGTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACCCCCGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACC
ACGGCGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGTGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCAACATTC
CGATGACTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAG
ACCTCTTGAAAACATGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGGTCGGGACACGGTGGACACGTGG
TGGCATGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACCGACGAGCTGTGTTGTAGGAATCATT
ACAATAGTCCTCAGACCTGTCGTGCTTCGACCCATTCTCTGTTCTTTAAGCACGCGTGCC
CTTCGACTATGACTTTTGCTCATGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCTTCTCCTA
GAGAGCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGTTCGGCTTGTTCTATATG
GTTGTACTAGTGATATCGCACCGATCTCATATCTATCTTCTATCTTTCTGGTTTTGATTG
GTTTAGTTTGCGATTTCCCGGTTCAGTTATGTAGTTTTTTTCAAAAATTATTGTAGTCCA
ACTATGAAATTATGACTTATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D672TF U 1
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AF RR4B612TF U 6
AF RR4CH22JQ C 214
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QA 3 696 3 696
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GG
ATACAACAGAGTTCCAAAAAAGCAAAAAAGAAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGAGCCTC
TCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCCGCTGACAC
AGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCCGGTCGGCCATTCA
GCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCTCTCCCAACCAACACCCA
CCGCTCTTTCCCCGCGCCAACCTCCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACCGGCTG
CTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTCTCGAGTG
CAACGGTCTCGGCGGCGCAACCCCCGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCACGGCGG
ACACCAAGACTTATCCCCCTACGGTGTCTCTCTCGTCGACGGTTTCAACATTCCGATGAC
TGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCTCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGACCTCTT
GAAAACATGTCCGGCTCATCTTCAGCTCCGGTCGGGACACGGTGGACACGTGGTGGCATG
TAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACCGACGAGCTGTGTTGTAGGAATCATTACAATAG
TCCTCAGACCTGTCGTGCTTCGACCCATTCTCTGTTCTTTAAGCACGCGTGCCCTTCGAC
TATGACTTTTGCTCATGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCTTCTCCTAGAGAGCT
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ATGGT

QA 3 832 3 832
DS 

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GCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTCTCGAGTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACCCCCG
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TCTCTCTCGTCGACGGTTTCAACATTCCGATGACTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTG
TTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGACCTCTTGAAAACATGTCCGGCTCATCTTCAGC
TCCGGTCGGGACACGGTGGACACGTGGTGGCATGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTA
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ATTTTCTGTTCTTTAAGCACGCGTGCCCTTCGACTATGACTTTTGCTCATGACAGTCCTT
CGCTTATGCATGACTGTTCTTCTCCTAGAGAGCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTG
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TATCTTCTATCTTTCTGGTTTTGATTGGTTTAGTTTGCGATTTCCCGGTTCAGTTATGTA
GTTTTTTTCAAAAATTATTGTAGTCCAACTATGAAATTATGACTTATGTTT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 2 7

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ACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGATTGTGGAGAAACTCG
GCGAACCTGGTCAATCACACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGAT
ACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCA
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ACAGTGTCTTGCTTAGGACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAA
ACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4AO55JQ C 363
AF RR4ES91TF U 229
AF RR4AK79JQ C 1
AF RR4AK79TF U 1
AF RR4AO55TF U 33
BS 1 229 RR4AK79TF
BS 230 597 RR4ES91TF
BS 598 598 RR4AK79TF
BS 599 686 RR4ES91TF
BS 687 749 RR4AK79TF
BS 750 750 RR4AK79JQ

RD RR4AO55JQ 128 0 0
GTCGCATGGTTTCCGGACACAGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATTTATGCGAGCTCCAAG
GACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAATTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCGACT
GAGATGGA

QA 1 128 1 128
DS 

RD RR4ES91TF 458 0 0
G
GGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCACACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGA
TGAATGCCGATACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAG
CAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTA
TGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGC
AACCGATCCGACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGT
TGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTG
CTGTGACGACACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTC
TTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGGACTTAAGAG

QA 2 458 2 458
DS 

RD RR4AK79JQ 750 0 0
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CAGATACTCTTATTCGTCTCTGAAACTAATTTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTG
GAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTT
ACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGATTGTGGAGAAACTCG
GCGAACCTGGTCAATCACACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGAT
ACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTT
TCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATCCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCGA
CTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAA
ACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCA
CCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTCTTTTGGTTCTT
ACAGTGTCTTGCTTAGGACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAA
ACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AK79TF 750 0 0
GGGCTGAGGAAAAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCGCAGACTCCATCGTCTCTC
CAGATACTCTTATTCGTCTCTGAAACTAATTTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTG
GAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTT
ACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGATTGTGGAGAAACTCG
GCGAACCTGGTCAATCACACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGAT
ACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATCCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCGA
CTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAA
ACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCA
CCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTCTTTTGGTTCTT
ACAGTGTCTTGCTTAAGACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAA
ACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCC
C

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AO55TF 705 0 0
GG
ACACACCGCAGACTCCATCGTCTCTCCAGATACTCTTATTCGTCTCTGAAACTAATTTGA
TTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTT
TCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCA
GAAACAAGTGATTGTGGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCACACGATGACTTTGCAGC
AAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGA
GAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGAG
AAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCA
ATTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCGACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGC
CAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTT
TATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGT
CTTGAGTGTTTTTTCTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTA*GACTTAAGAGAATTGGCT
TGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATC

QA 3 705 3 705
DS 



CO CL854Contig2 793 2 6 U
GGGGACGCACACACCCGTAGACTCCATCGTCTCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCT
AACGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAG
GCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTC
GTGGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCCCATGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCT
GATGAATGCAGATACGCCATCTTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAG
AGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCGGACACTGCGAGAGTGAGAAGCAAGATGATC
TATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAA
GCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGAACGG
TTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCCTTTAGTTT
GCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTT
TTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGGACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTAC
AGTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCTATTGGAACATTGTGTCT
CATCTACGCGAGATGCCTAGTGACCCATGGATTTACATAAATGATATTATAATGTAAGGT
TGCTTAAGTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX14TF U 1
AF RR4FX14JQ C 82
BS 1 745 RR4FX14TF
BS 746 746 RR4FX14JQ
BS 747 760 RR4FX14TF
BS 761 761 RR4FX14JQ
BS 762 774 RR4FX14TF
BS 775 793 RR4FX14JQ

RD RR4FX14TF 774 0 0
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GCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTC
GTGGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCCCATGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCT
GATGAATGCAGATACGCCATCTTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAG
AGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCGGACACTGCGAGAGTGAGAAGCAAGATGATC
TATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAA
GCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGAACGG
TTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCCTTTAGTTT
GCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTT
TTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGGACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTAC
AGTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCTATTGGAACATTGTGTCT
CATCTACGCGAGATGCCTAGTGACC*ATGGATTTACATAA*TGATATTATAATG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4FX14JQ 712 0 0
GTCCACGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTC
ATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTGGAGAAACTCGGCGAACCT
GGTCAATCCCATGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCCATC
TTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATCGCA
TGGTCTCCGGACACTGCGAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGG
TTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATG
GATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTT
CTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCCTTTAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAA
ACAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTTTTTTGGTTCTTACAGTGTC
TTGCTTAGGACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCAAAC
CGTTTTATCAACAGATTACCCTATTGGAACATTGTGTCTCATCTACGCGAGATGCCTAGT
GACCCATGGATTTACATAAATGATATTATAATGTAAGGTTGCTTAAGTAGGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 8

CO CL855Contig1 1719 8 9 U
ACAATGAATTTCTTAATACTTTATTTAATATTGTAAAAATGATATTTGCGGGGAACAACC
ATGATAATAGAAATAGAGACACATGCACGCATAAGATAGTACAAGTAACATCACACTTAT
GGTTATAACTAATACTTCAGATGATATTTGCGCCGAACAAACGCATATTATACTAGTAAC
CCAATTACCAATAAGAATCATATCTTCTTAGTGACTGTGACACAGAGACCATGCTTCATA
CGGAGAAGGATAGAAGGGATTGCTTCAATCTTGTGACCTTCAGTGACCTTAAAGTCATAG
TTTCGTATGATCTCCACAGCTACCATCTTCATCTGCGCCAGAGCCAAATTTTTACCCAAG
CAAGCTCTCGGACCGGCATTAAAAGCCATGAACTTGTATGAAGGTTCATGTCTTAGATCT
CCACTTTCTGAAATCCATCTCTCCGGTTTAAAATCCAATGCGTCTTTTCCCCATATAGAT
CTCATTCTACCAAATGCATACATACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGC
CCGGTTGGAAGTACATCTGGCTTTGCAGGAGACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAG
AGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTAGCATGTAGATACACGAGCTTCTCTAGATCTTTAGGA
TCATACTTTGTTTTGATCTCCTCTCGGATCTTGCTCAAAACTTGAGGATGCTTAGAAAGA
AGCCAGAAGAACCAAGTGAGAACCGAGCTTGTGGTGTCCCTTCCTGCCAACACTAGACTG
AAAGCAACGTCTCTTATAAACGTATCATCACTTGGTTTCAAGAGCTTATATTTGGTCGTG
TCCACGTTCATATAGTACGTTAACGCGTCCATTGATTGCACGCCTTCCCCGCGACGTATC
TCCTCTCTTCTTGTAGATATGATCTTCGCAAACATACGATTGACAGTCGCCAAAGAAGAC
CGCATCTTCCTCTCAAGTCCAATACCCAACCAGTTTTGAAGCCTCCACAAGGTGACCGGT
TTGAAATGCCTATAATAGATCGCTTCTTCACCGGTTTCCGCAGCTTCACCGAACTCGACT
CCGGCATCTCGATGGACAGTGACATTGGATCATAACCAGTCATCAAAATCGAAGAAGTAT
CAAACATGAATCTCTTGAACAAATCTTGCAAGTCTATGACAATGTTTTCCTCAGCAGCAT
TATCAAGAAAAGGAACAAGACCTTCCTTTAACTTGCTTGTATTGCTACTTACCGACAGCT
CCAGGAAATCTGGATGATGAAAGAGGACGTAGTTCGACTTCCTCAGATCCTCCCACAGCT
CCATATCAACACTCAAGATTCCGTCTCCCAGGACATCGAAGATTTTCTGGAACTCAGGTC
CTTTGGGGTAATTCCCAAAGTTTAGGTTTAGTATGTGATTGATGTTCCTTGGGTCGGCGG
TGAATAGCATGTCCGTTCCACTAAGCCATGGCCCTTTGAAAAAAAAAGTGAGGTTGGTGG
CGTCGAGAACTTCGTACGTCCAGTCGAAGATGCGAGGGATATGGGGGAGCATTCCTGGAA
GCATCCCGAGGACAGGCCAGCTTTTGAGAACAGGATGGCCAGGAGATTTCATGTGGAGGA
AGAATTTTTTGAATACAAGGGAAAAAAGGAATGCTACGAAGACTTCAAGTAAGCCTATGA
TCGCCATATTTTGAACAAACGTTTTATGAGTATGGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ23JQ U 48
AF RR4DN07JQ U 1
AF RR4DN63JQ U 1
AF RR4CS01JQ U 82
AF RR4DN63TF C 158
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AF RR4CZ23TF C 494
AF RR4CS01TF C 1025
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BS 756 756 RR4CS01JQ
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BS 758 877 RR4CS01JQ
BS 878 942 RR4DN63TF
BS 943 1079 RR4CZ23TF
BS 1080 1719 RR4CS01TF

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ACATCACACTTATAGTTATAACTAATACTTGAGATGATATTTGCGCCGAACAAACGCATA
TTATACTAGTAACCCAATTACCAATAAGAATCATATTTTCTTAGTAACCGTGACACAGAG
ACCATGTTTCATACGGAGAAGGATAGAAGGGATTGCTTCAATCTTGTGACCTTCAGTGAC
CTTAAAGTCATAGTTTCGTATGATCTCCACAGCTACCATCTTCATCTGCGCCAGAGCCAA
ATTTTTACCCAAGCAAGCTCTTGGACCGGCATTAAAAGG*ATGAACTTGTTTGAAGGTTC
ATGTCTTAGATCTCCACTTTCTGAAATCCATCTCTCTGGTTTAAAATCCAATGCGTCTTT
TCCCCATATAGATCTCATTCTACCCAATGCATACATACAGAGTACGATCTTTGAATTTTC
TTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAAGTA**TCTGGCTTTGCAGGAGACTTATGGTTAAAGGG
AAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTAGCATGTAGATACACGAGCTTCTC
TAGATCT
GTAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4DN07JQ 755 0 0
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ATGATAATAGAAATAGAGACACATGCACGCATAAGATAGTACAAGTAACATCACACTTAT
GGTTATAACTAATACTTCAGATGATATTTGCGCCGAACAAACGCATATTATACTAGTAAC
CCAATTACCAATAAGAATCATATCTTCTTAGTGACTGTGACACAGAGACCATGCTTCATA
CGGAGAAGGATAGAAGGGATTGCTTCAATCTTGTGACCTTCAGTGACCTTAAAGTCATAG
TTTCGTATGATCTCCACAGCTACCATCTTCATCTGCGCCAGAGCCAAATTTTTACCCAAG
CAAGCTCTCGGACCGGCATTAAAAGCCATGAACTTGTATGAAGGTTCATGTCTTAAATCT
CCACTTTCTGAAATCCATCTCTCCGGTTTAAAATCCAATGCGTCTTTTCCCCATATAGAT
CTCATTCTACCAAATGCATACATACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGC
CCGGTTGGAAGTACATCTGGCTTTGCAGGAGACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAG
AGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTAGCATGTAGATACACGAGCTTCTCTAGATCTTTAGGA
TCATACTTTGTTTTGATCTCCTCTCGGATCTTGCTCAAAACTTGAGGATGCTTAGAAAGA
AGCCAGAAGAACCAAGTGAGAACCGAGCTTGTGGT

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ATGATAATAGAAATAGAGACACATGCACGCATAAGATAGTACAAGTAACATCACACTTAT
GGTTATAACTAATACTTCAGATGATATTTGCGCCGAACAAACGCATATTATACTAGTAAC
CCAATTACCAATAAGAATCATATCTTCTTAGTGACTGTGACACAGAGACCATGCTTCATA
CGGAGAAGGATAGAAGGGATTGCTTCAATCTTGTGACCTTCAGTGACCTTAAAGTCATAG
TTTCGTATGATCTCCACAGCTACCATCTTCATCTGCGCCAGAGCCAAATTTTTACCCAAG
CAAGCTCTCGGACCGGCATTAAAAGCCATGAACTTGTATGAAGGTTCATGTCTTAAATCT
CCACTTTCTGAAATCCATCTCTCCGGTTTAAAATCCAATGCGTCTTTTCCCCATATAGAT
CTCATTCTACCAAATGCATACATACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGC
CCGGTTGGAAGTACATCTGGCTTTGCAGGAGACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAG
AGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTAGCATGTAGATACACGAGCTTCTCTAGATCTTTAGGA
TCATACTTTGTTTTGATCTCCTCTCGGATCTTGCTCAAAACTTGAGGATGCTTAGAAAGA
AGCCAG

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TGATATTTGCGCCGAACAAACGCATATTATACTAGTAACCCAATTACCAATAAGAATCAT
ATCTTCTTAGTGACTGTGACACAGAGACCATGTTTCATACGGAGAAGGATAGAAGGGATT
GCTTCAATCTTGTGACCTTCAGTGACCTTAAAGTCATAGTTTCGTATGATCTCCACAGCT
ACCATCTTCATCTGCGCCAGAGCCAAATTTTTACCCAAGCAAGCTCTCGGACCGGCATTA
AAAGCCATGAACTTGTATGAAGGTTCATGTCTTAAATCTCCACTTTCTGAAATCCATCTC
TCCGGTTTAAAATCCAATGCGTCTTTTCCCCATATAGATCTCATTCTACCCAATGCATAC
ATACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAGGTACATCTGGC
TTTGCAGGAAACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAAC
GTAGCATGTAGATACACGAGCTTCTCTAGATCTTTAGGATCATACTTTGTTTTGATCTCC
TCTCGGATCTTGCTCAAAACTTGAGGATGCTTAGAAAGAAGCCAGAAGAACCAAGTGAGA
ACCGAGCTTGTGGTGCCCCTTCCTGCCAACACTAGACTGAAAGCAACGTCTCTTATAAAC
GTATCATCACTTGGTTTCAAGAGCTTATATTTGGTCGTGTCCACGTTCATATAGTACGTT
AACGCGTCCATTGATT
GCA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4DN63TF 786 0 0
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TGACACAGAGACCATGCTTCATACGGAGAAGGATAGAAGGGATTGCTTCAATCTTGTGAC
CTTCAGTGACCT*AAAGTCATAGTTTCGTATGATCTCCACAGCTACCATCTTCATCTGCG
CCAGAGCCAAATTTTTACCCAAGCAAGCTCTCGGACCGGCATTAAAAGCCATGAACTTGT
ATGAAGGTTCATGTCTTAGATCTCCACTTTCTGAAATCCATCTCTCCGGTTTAAAATCCA
ATGCGTCTTTTCCCCATATAGATCTCATTCTACCAAATGCATACATACAGAGTACGATCT
TTGAATTTTCTTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAAGTACATCTGGCTTTGCAGGAGACTTAT
GGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTAGCATGTAGATACA
CGAGCTTCTCTAGATCTTTAGGATCATACTTTGTTTTGATCTCCTCTCGGATCTTGCTCA
AAACTTGAGGATGCTTAGAAAGAAGCCAGAAGAACCAAGTGAGAACCGAGCTTGTGGTGT
CCCTTCCTGCCAACACTAGACTGAAAGCAAC**CTCTTATAAACGTATCATCACTTGGTT
TCAAGAGCTTATATTTGGTCGTGTCCACGTTCATATAGTACGTTAACGCGTCCATTGATT
GCACGCCTTCCCCGCGACGTATCTCCTCTCTTCTTGTAGATATGATCTTCGCAAACATAC
GATTG
C

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4DN07TF 734 0 0
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CTTGTGACCTTCAGTGACCT*AAAGTCATAGTTTCGTATGATCTCCACAGCTACCATCTT
CATCTGCGCCAGAGCCAAATTTTTACCCAAGCAAGCTCTCGGACCGGCATTAAAAGCCAT
GAACTTGTATGAAGGTTCATGTCTTAGATCTCCACTTTCTGAAATCCATCTCTCCGGTTT
AAAATCCAATGCGTCTTTTCCCCATATAGATCTCATTCTACCAAATGCATACATACAGAG
TACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAAGTACATCTGGCTTTGCAGG
AGACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTAGCATG
TAGATACACGAGCTTCTCTAGATCTTTAGGATCATACTTTGTTTTGATCTCCTCTCGGAT
CTTGCTCAAAACTTGAGGATGCTTAGAAAGAAGCCAGAAGAACCAAGTGAGAACCGAGCT
TGTGGTGTCCCTTCCTGCCAACACTAGACTGAAAGCAAC**CTCTTATAAACGTATCATC
ACTTGGTTTCAAGAGCTTATATTTGGTCGTGTCCACGTTCATATAGTACGTTAACGCGTC
CATTGATTGCACGCCTTCCCCGCGACGTATCTCCTCTCTTCTTGTAGATATGATCTTCGC
AAACATACGATTG
C

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4CZ23TF 592 0 0
ATGCATACATACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAAGTA
**TCTGGCTTTGCAGGAGACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTT
CGTTCAACGTAGCATGTAGATACACGAGCTTCTCTAGATCTGTAGGATCATACTTAGTGT
TGATCCCTTGTCGGATCTTGCTCAAAACTTGAGGATGCTTGGAAAGAAGCCAGAAGAACC
AAGTGAGAACTGAGCTTGTGGTGTCCCTTCCTGCCAACACTAGACTGAAAGCAACGTCTC
TTATAAACGTATCATCACTTGGTTTCAAGAGCTTATATTTGGTCGTGTCCACGTTCATAT
AGTACGTTAACGCGTCCATTGATTCCACGCCTTCCCCGCGACGTACCTCCTCTCTTCTTG
TAGATATGATCTTCGCAAACATACGATTGACAGTCGCCAAAGAAGACCGCATCTTCCTCT
CAAGTCCAATACCCAACCAGTTTTGAAGCCTCCACAAGGTGACCGGTTTGAAATGCCTAT
AATAGATCGCTTCTTCACCGGTTTCCGCAGCTTCACCGAACTCGAC
CTCCGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4CS01TF 695 0 0
AATGCCTATAATAGATCGCTTCTTCACCGGTTTCCGCAGCTTCACCGAACTCGACTCCGG
CATCTCGATGGACAGTGACATTGGATCATAACCAGTCATCAAAATCGAAGAAGTATCAAA
CATGAATCTCTTGAACAAATCTTGCAAGTCTATGACAATGTTTTCCTCAGCAGCATTATC
AAGAAAAGGAACAAGACCTTCCTTTAACTTGCTTGTATTGCTACTTACCGACAGCTCCAG
GAAATCTGGATGATGAAAGAGGACGTAGTTCGACTTCCTCAGATCCTCCCACAGCTCCAT
ATCAACACTCAAGATTCCGTCTCCCAGGACATCGAAGATTTTCTGGAACTCAGGTCCTTT
GGGGTAATTCCCAAAGTTTAGGTTTAGTATGTGATTGATGTTCCTTGGGTCGGCGGTGAA
TAGCATGTCCGTTCCACTAAGCCATGGCCCTTTGAAAAAAAAAGTGAGGTTGGTGGCGTC
GAGAACTTCGTACGTCCAGTCGAAGATGCGAGGGATATGGGGGAGCATTCCTGGAAGCAT
CCCGAGGACAGGCCAGCTTTTGAGAACAGGATGGCCAGGAGATTTCATGTGGAGGAAGAA
TTTTTTGAATACAAGGGAAAAAAGGAATGCTACGAAGACTTCAAGTAAGCCTATGATCGC
CATATTTTGAACAAACGTTTTATGAGTATGGATCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 7

CO CL856Contig1 871 5 13 U
GGGCTCGTCGTCGTCGTCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGACGAGAAAATGGTG
AGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACAGC
GGCCGATTCTACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTTAT
CAGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACCAT
CTAGAGGCAATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCTGAGGTTTTCAAGAAGCAGATT
GATAATCTCAAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGATGG
CTATCTCGTGTCTCAATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTCCA
GGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCATA
AGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCCTT
CCCACTTGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTCCT
CTCATTTTCAGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACTTTCAAGGACGATAAAGAGTCT
TTGAGTCCTAAGAGATTCAACTAAAAGCCCTTCTC**AAGGCTTCTGTTTGCTGCAGCTT
CTTCCAATTCTCACAACTTTGAATTCCCTTCCCTGTAAAACAATATTTGAATGCCTAGTG
GGCCTATCTCGTCCTAAAAAGCCTGTTAAGTAAGCTTTGCCATTTTTAGTCATGACTTTG
AATTCCGACTTTGGTATAGTTTTTGTCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL93TF U 1
AF RR4FH57TF U 1
AF RR4C824TF U 4
AF RR4EA12TF U 8
AF RR4C824JQ C 182
BS 1 37 RR4DL93TF
BS 38 39 RR4FH57TF
BS 40 262 RR4DL93TF
BS 263 263 RR4FH57TF
BS 264 322 RR4DL93TF
BS 323 323 RR4FH57TF
BS 324 573 RR4DL93TF
BS 574 574 RR4FH57TF
BS 575 645 RR4DL93TF
BS 646 646 RR4FH57TF
BS 647 694 RR4DL93TF
BS 695 749 RR4C824TF
BS 750 871 RR4C824JQ

RD RR4DL93TF 694 0 0
GGGCTCGTCGTCGTCGTCGAAAGAGAGAGAGAGAGAG**GAGAGAGACGAGAAAATGGTG
AGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACAGC
GGCCGATTCTACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTTAT
CAGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACCAT
CTAGAGGCAATCAAGTTTATCT*TAAAGACTTCTGGTCTGAGGTTTTCAAGAAGCAGATT
GATAATCTCAAGACTAATCACCAGGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGATGG
CTATCTCGTGTCTCAATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTCCA
GGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCATA
AGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCCTT
CCCACTTGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTCGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTCCT
CTCATTTTCAGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACTTTCAAG*ACGATAAAGAGTCT
TTGAGTCCTAAGAGATTCAACTAAAAGCCCTTCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4FH57TF 681 0 0
GGGCTCGTC
GTCGTTGTCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGACGAGAAAATGGTGAGAGAAGTG
GCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACAGCGGCCGATTC
TACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTTATCAGGTCGGC
CACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACCGTCTAGAGGCA
ATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCCGGTCTGAGGTCTTCAAGAAGCAGATTGATAATCTC
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AAGAGATTTAAC

QA 10 681 10 681
DS 

RD RR4C824TF 752 0 0
GGGGTC
GTCGTCGTCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGACGAGAAAATGGTGAGAGAAGTG
GCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACAGCGGCCGATTC
TACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTTATCAGGTCGGC
CACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACCATCTAGAGGCA
ATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCTGAGGTTTTCAAGAAGCAGATTGATAATCTC
AAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGATGGCTATCTCGT
GTCTCAATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTCCAGGGGAAAGC
AAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCATAAGAGGTGTC
CTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCCTTCCCACTTGC
TCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTCCTCTCATTTTC
AGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACTTTCAAGGACGATAAAGAGTCTTTGAGTCCT
AAGAGATTCAACTAAAAGCCCTTCTC**AAGGCTTCTGTTTGCTGCAGCTTCTTCCAATT
CTCACAACTTTGAATTCCCT
TCCCTG

QA 7 746 7 746
DS 

RD RR4EA12TF 743 0 0
GGGTCGTCGTCGAAAG
AGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGACGAGAAAATGGTGAGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGT
AGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACAGCGGCCGATTCTACGCCAACAAGCC
GGAACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTTATCAGGTCTGCCACCAGCTCTCCGA
GAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACCATCTAGAGGCAATCAAGTTTATCTG
TAAAGACTTCTGGTCTGAGGTCTTCAAGAAGCAGATTGATAACCTCAAGACTAATCACCG
GGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGATGGCTATCTCGTGTCTCAATTGACCC
TTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTCCAGGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGC
GGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCATAAGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGG
GATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCCTTCCCACTTGCTCCTTCGTGATTCG
GGTCAAGGCTTGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTCCTCTCATTTTCATATTCCAGCTCGG
CTTTATGGTTTCAACTTTCAAGGAAGATAA*GAGTCTTTGAGTCCTAAGAGATTTAACTA
AAAGCCCTTCCCCAAAGGCTTCTGTTTGCTGCGGCTTCTGCCAATTCTCACAACTTTGAA
TTCCCT
G

QA 17 742 17 742
DS 

RD RR4C824JQ 690 0 0
AGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACCATC
TAGAGGCAATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCTGAGGTTTTCAAGAAGCAGATTG
ATAATCTCAAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGATGGC
TATCTCGTGTCTCAATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTCCAG
GGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCATAA
GAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCCTTC
CCACTTGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTCCTC
TCATTTTCAGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACTTTCAAGGACGATAAAGAGTCTT
TGAGTCCTAAGAGATTCAACTAAAAGCCCTTCTC**AAGGCTTCTGTTTGCTGCAGCTTC
TTCCAATTCTCACAACTTTGAATTCCCTTCCCTGTAAAACAATATTTGAATGCCTAGTGG
GCCTATCTCGTCCTAAAAAGCCTGTTAAGTAAGCTTTGCCATTTTTAGTCATGACTTTGA
ATTCCGACTTTGGTATAGTTTTTGTCTTCG

QA 1 690 1 690
DS 



CO CL856Contig2 647 2 6 U
CACACTTGCAAGCAAATCGATAAAAGACAAAAACTATACCAAAGTCGGAGTTCAAAGTCG
TGCGTGACTAAAAATGGAAAAGCTTACTTAACAGGCTTTTTAGGACGAGATAGGCACATT
AAGCATTCAAATATTGTTTTACAGGGAATTCAAAGTTGTGAGAATTGGCAGAAGCCGCAG
CAAACAGAAGCCTTTGGGGAAGGGCTTTTAGTTAAATCTCTTAGGACTCAAAGACTCTTA
TCTTCCTTGAAAGTTGAAACCATAAAGCCGAGCTGGAATATGAAAATGAGAGGACTCCCA
AGCTAATGCCAGAATCAAGCCTTGACCCGAATCACGAAGGAGCAAGTGGGAAGGCTGGAT
ATGTCTGCAGAGACAGCACAAGGTATCCCCAAGTTGGAGAGGACACCTCTTATGATTCAA
CATGGGAAATACAGGTACATGCTCACCGCTTGTGCTGCTTTGCTTTCCCCTGGAGTAGAC
GGATCTTCGGTTTCCTTCTCAGACGAAGGGTCAATTGAGACACGAGATAGCCATCTGAAC
TTGTTGTCTTGCAATACAAAAGTACCCCGGTGATTAGTCTTGAGATTATCAATCTGCTTC
TTGAAGACCTCAGACCGGAAGTCTTTACAGATAAACTTGATTGCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA12JQ U 1
AF RR4FH57JQ U 34
BS 1 418 RR4EA12JQ
BS 419 419 RR4FH57JQ
BS 420 584 RR4EA12JQ
BS 585 585 RR4FH57JQ
BS 586 604 RR4EA12JQ
BS 605 647 RR4FH57JQ

RD RR4EA12JQ 604 0 0
CACACTTGCAAGCAAATCGATAAAAGACAAAAACTATACCAAAGTCGGAGTTCAAAGTCG
TGCGTGACTAAAAATGGAAAAGCTTACTTAACAGGCTTTTTAGGACGAGATAGGCACATT
AAGCATTCAAATATTGTTTTACAGGGAATTCAAAGTTGTGAGAATTGGCAGAAGCCGCAG
CAAACAGAAGCCTTTGGGGAAGGGCTTTTAGTTAAATCTCTTAGGACTCAAAGACTCTTA
TCTTCCTTGAAAGTTGAAACCATAAAGCCGAGCTGGAATATGAAAATGAGAGGACTCCCA
AGCTAATGCCAGAATCAAGCCTTGACCCGAATCACGAAGGAGCAAGTGGGAAGGCTGGAT
ATGTCTGCAGAGACAGCACAAGGTATCCCCAAGTTGGAGAGGACACCTCTTATGATTCCA
CATGGGAAATACAGGTACATGCTCACCGCTTGTGCTGCTTTGCTTTCCCCTGGAGTAGAC
GGATCTTCGGTTTCCTTCTCAGACGAAGGGTCAATTGAGACACGAGATAGCCATCTGAAC
TTGTTGTCTTGCAATACAAAAGTACCCCGGTGATTAGTCTTGAGGTTATCAATCTGCTTC
TTGA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4FH57JQ 614 0 0
CTATACCAAAGTCGGAGTTCAAAGTCGTGCGTGACTAAAAATGGAAAAGCTTA**TAACA
GGCTTTTTAGGACGAGATAGGCACATTAAGCATTCAAATATTGTTTTACAGGGAATTCAA
AGTTGTGAGAATTGGCAGAAGCCGCAGCAAACAGAAGCCTTTGGGGAAGGGCTTTTAGTT
AAATCTCTTAGGACTCAAAGACTCTTATCTTCCTTGAAAGTTGAAACCATAAAGCCGAGC
TGGAATCTGAAAATGAGAGGACTCCCAAGCTAATGCCAGAATCAAGCCTTGACCCGAATC
ACGAAGGAGCAAGTGGGAAGGCTGGATATGTCTGCAGAGACAGCACAAGGTATCCCCAAG
TTGGAGAGGACACCTCTTATGATTCAACATGGGAAATACAGGTACATGCTCACCGCTTGT
GCTGCTTTGCTTTCCCCTGGAGTAGACGGATCTTCGGTTTCCTTCTCAGACGAAGGGTCA
ATTGAGACACGAGATAGCCATCTGAACTTGTTGTCTTGCAATACAAAAGTACCCCGGTGA
TTAGTCTTGAGATTATCAATCTGCTTCTTGAAGACCTCAGACCGGAAGTCTTTACAGATA
AACTTGATTGCCTC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 2 8

CO CL857Contig1 614 3 1 U
GGATTAACATAGATACCTTAAAATATGAGTAATCACTACACAAACACCGTTTCTGCTGTT
TTTGTCTTGTTTTTTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCAATAC
ACTGATGACATCAACACAAACTTTCAACAGGAGAATGGAGCAGTACCAGACGCAATCCGG
GGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAACGTCG
AAAAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGAATCTGGTTGGGGTT
ATCATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATG
ATGTGCTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTT
AGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTCCATGTGTGTTTGCTTTGTCATAAAA
ACCACCTAAAATAATAAGTTTGTGTTTGCGTTTCAAATAAGTTAAAGTTTGTATTCTCAG
CATGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTATAATAATACAACAAG
AACTCGAATTTGAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C043JQ C 380
AF RR4BA43TF U 1
AF RR4BA73TF U 1
BS 1 614 RR4BA43TF

RD RR4C043JQ 195 0 0
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ATGGAACTTGCAACTCCATGTGTGTTTGCTTTGTCATAAAAACCACCTAAAATAATAAGT
TTGTGTTTGCGTTTCAAATAAGTTAAAGTTTGTATTCTCAGCATGTATGCTTTTTAAATA
TTAATTGTGTTCATG

QA 1 195 1 195
DS 

RD RR4BA43TF 614 0 0
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TTTGTCTTGTTTTTTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCAATAC
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GGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAACGTCG
AAAAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGAATCTGGTTGGGGTT
ATCATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATG
ATGTGCTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTT
AGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTCCATGTGTGTTTGCTTTGTCATAAAA
ACCACCTAAAATAATAAGTTTGTGTTTGCGTTTCAAATAAGTTAAAGTTTGTATTCTCAG
CATGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTATAATAATACAACAAG
AACTCGAATTTGAT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4BA73TF 614 0 0
GG
ATTAACATAGATACCTTAAAATATGAGTAATCACTACACAAACACCGTTTCTGCTGTTTT
TGTCTTGTTTTTTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCAATACAC
TGATGACATCAACACAAACTTTCAACAGGAGAATGGAGCAGTACCAGACGCAATCCGGGG
AAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAACGTCGAA
AAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGAATCTGGTTGGGGTTAT
CATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATGAT
GTGCTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTTAG
ATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTCCATGTGTGTTTGCTTTGTCATAAAAAC
CACCTAAAATAATAAGTTTGTGTTTGCGTTTCAAATAAGTTAAAGTTTGTATTCTCAGCA
TGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTATAATAATACAACAAGAA
CTCGAATTTGAT

QA 3 614 3 614
DS 



CO CL857Contig2 1392 5 25 U
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TGTTTTTGTCTTGTTTTTTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCA
ATACACTGATGACATCAACACAAACTTTCAACAGGAGAATGGAGCAGTACCAGACGCAAT
CCGGGGAGAAGCGCATTACTTACGTAAACATGATCAAGAGATCTCGTCACGTGACTATAA
AGTCTCAGCTTCAAACACAGTTAAGGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCTTCTTACTCTTT
GAAGATGGAGTCTTTTAACACGCTCCTCAAGTCAACCTACGCAGACAAATATGTTTCACG
TCCTTTCTCGGCTGCCGGATATAAGTGGACACTTGTTGTGTACCCGAACGGGAACAAGAA
TGATAATGGTGCAGGGTTCCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCTCTCC
ACACCAAGAGGTTTACGTGGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTA
CTTCACGATCCAAGATACCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTT
CTCTCAGGTTCTACCTGTTAATACATTTAAAGACTCGAACAACGGATACCTCTACGATGG
AGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACT
TTTCACTGTTACTGACAAGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTC
CACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTCTCTGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAA
TATAAAAGTGTATCC*GGGTGGTTCTGCCACGGGGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACC
TAATCCTTAATGAGAACGAGAAATTCAGACCCTATGAGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGC
TTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAACGTCGAAAAGACAATTGATAATTGGTACA
ATGGTCCGGGATATGGAGATGGATCTGG*TTGGGGTTATCATGAATTTATCCCATTCTCT
GATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATGATGTGTTGATGGTTCAAGTCGAA
ATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTTAGATTTTCTCTAACCATGGATGG
AACTTGCAACTCCATGCGTGTTTGCTTTGTCATAAAAACCACCTAAAATAATAAGTTTGT
GTTTGCGTTTCAAATAAGTTAAAGTTTGTATTCTCAGCATGTATGCTTTTTAAATATTAA
TTGTGTTCATGGAAAGATCGTGTAATATTAAATAAACAGTGGTGACAACAAGAACTCGAA
TTTGATTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW55TF U 1
AF RR4C043TF U 333
AF RR4BH58TF U 509
AF RR4EW55JQ C 748
AF RR4BH58JQ C 772
BS 1 644 RR4EW55TF
BS 645 645 RR4C043TF
BS 646 708 RR4EW55TF
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BS 710 740 RR4EW55TF
BS 741 810 RR4C043TF
BS 811 811 RR4BH58TF
BS 812 855 RR4C043TF
BS 856 856 RR4BH58TF
BS 857 912 RR4C043TF
BS 913 913 RR4BH58TF
BS 914 927 RR4C043TF
BS 928 1048 RR4BH58TF
BS 1049 1049 RR4EW55JQ
BS 1050 1208 RR4BH58TF
BS 1209 1209 RR4EW55JQ
BS 1210 1237 RR4BH58TF
BS 1238 1238 RR4EW55JQ
BS 1239 1247 RR4BH58TF
BS 1248 1248 RR4EW55JQ
BS 1249 1273 RR4BH58TF
BS 1274 1274 RR4BH58JQ
BS 1275 1308 RR4BH58TF
BS 1309 1347 RR4EW55JQ
BS 1348 1392 RR4BH58JQ

RD RR4EW55TF 745 0 0
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TGTTTTTGTCTTGTTTTTTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCA
ATACACTGATGACATCAACACAAACTTTCAACAGGAGAATGGAGCAGTACCAGACGCAAT
CCGGGGAGAAGCGCATTACTTACGTAAACATGATCAAGAGATCTCGTCACGTGACTATAA
AGTCTCAGCTTCAAACACAGTTAAGGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCTTCTTACTCTTT
GAAGATGGAGTCTTTTAACACGCTCCTCAAGTCAACCTACGCAGACAAATATGTTTCACG
TCCTTTCTCGGCTGCCGGATATAAGTGGACACTTGTTGTGTACCCGAACGGGAACAAGAA
TGATAATGGTGCAGGGTTCCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCTCTCC
ACACCAAGAGGTTTACGTGGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTA
CTTCACGATCCAAGATACCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTT
CTCTCAGGTTCTACCTGTTAATACATTTAAAGACTCGAACAACGAATACCTCTACGATGG
AGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCTTTAA*GAATCCGAACT
TTTCACTGTTACTGACAAGT
CTATA

QA 1 740 1 740
DS 

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G
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TGTTGTGTACCCGAACGGGAACAAGAATGATAATGGTGCAGGGTTCCTTTCGCTTTACGT
AGCCATAGACAACTCAACTCTCTCTCCACACCAAGAGGTTTACGTGGATCTCAGGTTTTA
CGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTACTTCACGATCCAAGATACCGATGGATGGAGGTT
TAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTACCTGTTAATACATTTAAAGA
CTCGAACAACGGATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCAC
TCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTACTGACAAGTTCTATAACGCGAA
GTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTCTCTGACGT
GTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATCCCGGGTGGTTCTGCCACGG
GGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGCGAACGAGAAATTCA

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR4BH58TF 800 0 0
AGG
TACGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTACTTCACGATCCAAGATACCGATGGATGGAGG
TTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTACCTGTTAATACATTTAAA
GACTCGAACAACGGATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACC
ACTCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTACTGACAAGTTCTATAACGCG
AAGTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTCTCTGAT
GTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATCC*GGGTGGTTCTGCCAC
GGGGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGAGAACGAGAAATTCAGACC
CTATGAGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAA
CGTCGAAAAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGGATCTGGGTT
GGGGTTATCATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTG
TGAATGATGTGTTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACTTCC
CTAGTTAGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCA*CTCCATGCGTGTTTGCTTTGTC
ATAAAA*CCACCTAAA*TAATAAGTTTGTGTTTGCGTTTCAA*TAAGTTAAAGTTTGTAT
TCTCAGCATGTATGCTT

QA 4 800 4 800
DS 

RD RR4EW55JQ 617 0 0
CGCGAAGTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTTTC
TGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATCC*GGGTGGTTCTG
CCACGGGGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGCGAACGAGAAATTCA
GACCCTATGAGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCA
ATAACGTCGAAAAGACAATTGATAATTGGTGCAATGGTCCGGGATATGGAGATGAATCTG
G*TTGGGGTTATCATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTT
CTTGTGAATGATGTGTTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTAC
TTCCCTAGTTAGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTCCATGTGTGTTTGCTT
TGTCATAAAAACCACCTAAAATAATAAGTTTGTGTTTGCGTTTCAAGTAAGTTAAAGTTT
GTATTCTCAGCATGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTGTAATA
TTAAATACAACAAGAAC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4BH58JQ 621 0 0
GAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTTTCTGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAG
AAGATGGAATATAAAAGTGTATCC*GGGTGGTTCTGCCACGGGGAAGGGAAAAGCTGTGT
CCATCTACCTAATCCTTAATGAGAACGAGAAATTCAGACCCTATGAGAAAATTTATGTTG
GAGCCAAGCTTCGAGTTTTTAACCAACGCAACCTCAATAACGTCGAAAAGACAATTGATA
ATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGGATCTGG*TTGGGGTTATCATGAATTTATC
CCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATGATGTGTTGATGGTT
CAAGTCGAAATTGAAGCCATTTTTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTTAGATTTTTTCTAAC
CATGGATGGAACTTGCAACTCCATGCGTGTTTGCTTTGTCATAAAAACCACCTAAAATAA
TAAGTTTGTGTTTGCGTTTCAAATAAGTTAAAGTTTGTATTCTCAGCATGTATGCTTTTT
AAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTGTAATATTAAATAAACAGTGGTGACAACAA
GAACTCGAATTTGATTTTACT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 2 7

CO CL858Contig1 872 2 5 U
GGAACCTGTGAAATTTGATTCTGCATCCTCCTGTCTTCTCACTCCTCATCGTTCGTATCG
TCGTTACACTCTGTAATCTCATTCTTAGACTTACACTCTCTGTTCTCGAATCCTCATTTT
TCTCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGTTCCGAAGATTAAAATCTCAGGGGTAGAACT
AAGTAGAGTAAGATCTGGAAGCTTACAGATTCCACACGGTCAAAGATCATTGTTTGCTCA
AAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGACAAGTGTTGGATCTTTGAAAGCTGTCCAACT
GTCTACTGTCACAGCTGCGGAAACAGCTGCTACTGTGGAAGTAGAAGATGCTGAGAAGAC
CAAGTCATCTCCGTTGAACGCTCAGCTTGTTCCCAAGCCCTCTGAGGTGGAAGCTCTTGT
CACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTGGGAGGTTTCCG
CCTATATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAACATTAGTCCACCACAACCTCAGCCAAT
TCCTGCTGCCTTTTCTGCAACTACAGAGAGTGCTGATTCTAATGGATCAGCTTCCTCTAC
TTCATTAACTATCACAAAACCAGCATCTCCAGCTGCTGATCAGGGTTTGATTATCCTCCA
ATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAGGAGATCCAAAACCATAAAGGGTAAACGCACTCCTTC
CTCCTGTAAAGAGAAAGACCAAGTGAAAGAAGATGGAGAGCCTGTAGGATACAATGATGC
TCTTATCTCGATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTTAGTAAAAACCAAATCC
GAGCTTGGTTTTTTGAGTGTGGACTGTGCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS36TF U 39
AF RR4A628TF U 1
BS 1 270 RR4A628TF
BS 271 271 RR4GS36TF
BS 272 628 RR4A628TF
BS 629 629 RR4GS36TF
BS 630 872 RR4A628TF

RD RR4GS36TF 601 0 0
GG
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TGTTCTCGAATCCTCATTTTTCTCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGTTCCGAAGATT
AAAATCTCAGGGGTAGAACTAAGTAGAGTAAGATCTGGAAGCTTACAGATTCCACACGGT
CAAAGATCATTGTTTGCTCAAAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGACAAGTGTTGGA
TCTTTGAAAGCTGTCCAACTGTCTACTGTCACAGCTGCGGAAACAGCTGCTACTGTGGAA
GTAGAGGATGCTGAGAAGACCAAGTCATCTCCGTTGAACGCTCAGCTTGTTCCCAAGCCC
TCTGAGGTGGAAGCTCTTGTCACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAA
CTGAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAACATTAGT
CCACCACAACCTCAGCCAATTCCTGCTGCCTTTTCTGCAACTACAGAGAGTGCTGATTCT
AATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCTATTACAAAACCAGCATCTCCATCTGCTGA

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR4A628TF 872 0 0
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TCGTTACACTCTGTAATCTCATTCTTAGACTTACACTCTCTGTTCTCGAATCCTCATTTT
TCTCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGTTCCGAAGATTAAAATCTCAGGGGTAGAACT
AAGTAGAGTAAGATCTGGAAGCTTACAGATTCCACACGGTCAAAGATCATTGTTTGCTCA
AAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGACGAGTGTTGGATCTTTGAAAGCTGTCCAACT
GTCTACTGTCACAGCTGCGGAAACAGCTGCTACTGTGGAAGTAGAAGATGCTGAGAAGAC
CAAGTCATCTCCGTTGAACGCTCAGCTTGTTCCCAAGCCCTCTGAGGTGGAAGCTCTTGT
CACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTGGGAGGTTTCCG
CCTATATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAACATTAGTCCACCACAACCTCAGCCAAT
TCCTGCTGCCTTTTCTGCAACTACAGAGAGTGCTGATTCTAATGGATCAGCTTCCTCTAC
TTCATTAACTATCACAAAACCAGCATCTTCAGCTGCTGATCAGGGTTTGATTATCCTCCA
ATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAGGAGATCCAAAACCATAAAGGGTAAACGCACTCCTTC
CTCCTGTAAAGAGAAAGACCAAGTGAAAGAAGATGGAGAGCCTGTAGGATACAATGATGC
TCTTATCTCGATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTTAGTAAAAACCAAATCC
GAGCTTGGTTTTTTGAGTGTGGACTGTGCCTT

QA 1 872 1 872
DS 



CO CL858Contig2 804 5 10 U
GTAAGTATCAGAATGTTTTTAATATATAAAAGAACATAATAAAACAATGTCTTGAAGAAA
AACTTTCAGACAAACAGAAATACAAAGATATGAATGAAGTTTATTTTGTTCTAAAAGCAT
ACACACAAGGCACAGTTCCACAACTCAAAAAACCAAGCTCGGATTTGGTTTTTACTGAAG
CTTCTTGATCCCAGGGAAGGAAGGAAGGATCGAGATAAGAGCATCATTGTATCCTACAGG
CTCTCCATCTTCTCGGAGTATCTTGACAACCTCACCGGAAACATCAGACTCGATAGGGAA
CTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGAACTTGACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTC
TTTACAGGAGGAAGGAGTGCGTTTACCCTTTATGGTTTTGGATCTCCTGAAGAATCCTAC
TTTAGGAGATTGGAGGATAATCAAACCCTGATCAGCAGCTGAAGATGCTGGTTTTGTGAT
AGCTAATGAAGTAGAGGAAGCTGATCCATTAGAATCAGCACTCTCTGTAGTTGCAGAAAA
GGCAGCAGGAATTGGCTGAGGTTGTGGTGGACTAATGTTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGC
TACATATAGGCGGAAACCTCCCAGTTTCAGTTCAAACTCTGCAATTGATGAGGAATCACA
TATCTCAGTGACAAGAGCTTCCACCTCAGAGGGCTTGGGAACAAGCTGAGCGTTCAACGG
AGATGACTTGGTCTTCTCAGCATCCTCTACTTCCACAGTAGCAGCTGTTTCCGCAGCTGT
GACAGTAGACAGTTGGACAGCTTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW06JQ U 1
AF RR4GN23JQ U 2
AF RR4GN23TF C 60
AF RR4GS36JQ U 2
AF RR4EW06TF C 103
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RD RR4EW06JQ 690 0 0
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DS 

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A
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ACACAAGGCACAGTTCCACAACTCAAAAAACCAAGCTCGGATTTGGTTTTTACTGAAGCT
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CTCCATCTTCTCGGAGTATCTTGACAACCTCACCGGAAACATCAGACTCGATAGGGAACT
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C

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C

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A
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CTTTCAGACAAACAGAAATACAAAGATATGAATGAAGTTTATTTTGTTCTAAAAGCATAC
ACACAAGGCACAGTTCCACAACTCAAAAAACCAAGCTCGGATTTGGTTTTTACTGAAGCT
TCTTGATCCCAGGGAAGGAAGGAAGGATCGAGATAAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCT
CTCCATCTTCTCGGAGTATCTTGACAACCTCACCGGAAACATCAGACTCGATAGGGAACT
GGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGAACTTGACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTT
TACAGGAGGAAGGAGTGCGTTTACCCTTTATGGTTTTGGATCTCCTGAAGAATCCTACTT
*AGGAGATTGGAGGATAATCAAACCCTGATCAGCAGATGGAGATGCTGGTTTTGTAATAG
CTAATGAAGTAGAGGAAGCTGATCCATTAGAATCAGCACTCTCTGTAGTTGCAGAAAAGG
CAGCAGGAATTGGCTGAGGTTGTGGTGGACTAATGTTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGCTA
CATATAGGCGGAAACCTCCCAGTTTCAGTTCAAACTCTGCAATTGATGAGGAATCACATA
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TCAACGGAGATGACTTGGTCTTCTCAGCATCTTCTACTTCCACAGTAGCAGCTGTTTCCG
CAGCTGTGACAGTAGACAGTTGGACAGCTTT

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DS 



AS 1 8

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AACAACATATCTAAACAATGCCAATAAGAAAAAAAGTTAGGAAAGTTATGTGTGCCTGCG
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CGGGTTCTCAGCAGTGGAACGGTGATCAAACAAGGTATAGTCAATATCTAGAACAAGCAG
TTTCTTGCCTTTGCGACATGGATTAACAAGCTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCT
CAGCTTCTGCTTATTAAGTTCTTTGTCCTTAACATCGACCACTTCGTACTTACCAAGCTC
AAGGTCATCAACAATGTCATCCGATGTTACTTGATCTACTATTATATCATCCTCCGTAGT
ACCGATCATGGTCATCTTGAGAGAGGGCTTGAGAGGGATCTGCGAGAGCAGAAGAGAGTC
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BQ
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35 35 35 35 0 0 0 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 25 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E016JQ U 1
AF RR4E016TF C 1
AF RR4EQ71JQ U 2
AF RR4BN93JQ U 14
AF RR4B922JQ U 21
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QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4E016TF 660 0 0
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ATCTAAACAATGCCAATAAGAAAAAAAGTTAGGAAAGTTATGTGTGCCTGCGCCTTTTGA
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CATGAGCTTTCCTAAACGGCCTGATTTTGAGACCGTTTTGAGGGTTCATCACAAAATTCC
TTCGCAGATCATCGAACATGATAGTGTTTTGGGAGTTGTAGAACTCAGGCAAAAGTGCCC
AAATTAAGCCTAGTGGCTTGCAATCAAAGATTCCACGAGAGTCTGACTGAACTGTGATCA
TGGCTAGATGGTCGAGAAGGGCTGTGATCTTGTAGTTGGGATTGTTCAGCACACCAAGCT
CTCCCATCTTTAACTCAACCCACTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGATATCATATT
CTGCATAAGCAGCAGTAAGAAACTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAAGGGGTTCT
CAGCAGTGGAACGGTGATCAAACAAAGTGTAGTCAATATCCAGAACAAGCAG

QA 9 660 9 660
DS 

RD RR4EQ71JQ 769 0 0
AAAAGAT
AAACTGGTTGTATTTCTAAACCATAAAAACATGCGGAGTAGCGAGCAACAACAACA***T
ATTTAAACAATGCCAATAAAAAAAAAAGTTAGGAAAGTTATGTGTGCCTGCGCCTTTTGA
CACTGTCTTCTGAGAATGTCTCCCATCTGCTATGATCCAAAGAACTCAAATCATCAAGCT
CTGATATTGCCAGAAGATACCGAGTCAGCAGTACAAGCTCGTCATCCTTGTCTCGGTTCA
CATGAGCTTTCCTGAACGGCCTGATTTTAAGACCGTTTTGAGGGTTCATCACGAAGTTCC
TTCGCAGATCATCGAACATGATAGTGTTTTGGGAGTTGTAGAACTCAGGCAAAAGTGCCC
AAATTAAGCCTAGTGGCTTGCAATCAAAGATTCCACGAGAGTCTGACTGAACTGTGATCA
TGGCTAGATGGTCGAGAAGGGCTGTTATCTTGTAGTTGGGATTGTTCAGCACACCAAGCT
CTCCCATCTTTAACTCAACCCACTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGATATCATATT
CTGCATAAGCAGCAGTAAGAAACTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAACGGGTTCT
CAGCAGTGGAACGGTGATCAAACAAGGTATAGTCAATATCTAGAACA*GCAGTTTCTTGC
CTTTGCGACATGGATTAACAAGCTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCTCAGCTTCT
GCTTATTAAGTTCTTTGTCCTTAACATCGACCACTTCGT
CCT

QA 8 766 8 766
DS 

RD RR4BN93JQ 719 0 0
GG
TTGTATTTCTAAACCATAAAAACATGCGGAGTAGCGAGCAACAACAACA***TATTTAAA
CAATGCCAATAA**AAAAAAGTTAGGAAAGTTATGTGTGCCTGCGCCTTTTGACACTGTC
TTCTGAAAATGTCTCCCATCTGCTATGATCCAAAGAACTCAAATCATCAAGCTCTGATAT
TGCCAGAAGGTACCGAGTCAGCAATACAAGCTCGTCATCCTTGTCTCGGTTCACATGAGC
TTTCCTGAACGGCCTGATTTTAAAACCGTTTTGAGGGTTCATCACGAAGTTCCTTCCCAA
ATCATCGAACATGATAGTGTTTTGGGAGTTGTAAAACTCAGGCAAAAGTGCCCAAATTAA
GCCTAGTGGCTTGCAATCAAAGATTCCACGAGAGTCTGACTGAACTGTGATCATGGCTAG
ATGGTCGAAAAGGGCTGTTATCTTGTAGTTGGGATTGTTCAGCACACCAAGCTCTCCCAT
CTTTAACTCAACCCACTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGATATCATATTCTGCATA
AGCAGCAGTAAGAAACTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAACGGGTTCTCAGCAGT
GGAACGGTGATCAAACAAGGTATAGTCAATATCTAGAACAAGCAGTTTCTTGCCTTTGCG
ACATGGATTAACAAGCTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCTCAGCTTCTGCTT

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR4B922JQ 774 0 0
TTTCTAAACCATAAAAACATGCGGAGTAGCGAGCAACAACAACA***TATTTAAACAATG
CCAATAA**AAAAAAGTTAGGAAAGTTATGTGTGCCTGCGCCTTTTGACACTGTCTTCTG
AGAATGTCTCCCATCTGCTATGATCCAAAGAACTCAAATCATCAAGCTCTGATATTGCCA
GAAGGTACCGAGTCAGCAATACAAGCTCGTCATCCTTGTCTCGGTTCACATGAGCTTTCC
TGAACGGCCTGATTTTAAGACCGTTTTGAGGGTTCATCACGAAGTTCCTTCGCAGATCAT
CGAACATGATAGTGTTTTGGGAGTTGTAGAACTCAGGCAAAAGTGCCCAAATTAAGCCTA
GTGGCTTGCAATCAAAGATTCCACGAGAGTCTGACTGAACTGTGATCATGGCTAGATGGT
CGAGAAGGGCTGTTATCTTGTAGTTGGAATTGTTCAGCACACCAAGCTCTCCCATCTTTA
ACTCAACCCACTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGATATCATATTCTGCATAAGCAG
CAGTAAGAAACTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAACGGGTTCTCAGCAGTGGAAC
GGTGATCAAACAAGGTATAGCCAATATCTAGAACAAGCAGTTTCTTGCCTTTGCGACATG
GATTAACAAGCTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCTCAGCTTCTGCTTATTAAGTT
CTTTGTCCTTAACATCGACCACTTCGTACTTACCAAGCTCAAGGTCATCAACAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4B922TF 870 0 0
GATTTTAAGACCGTTT*GAGGGT*CATCACGAAGT*CCTTCGCAGATCATCGAACATGAT
AGTGTTTTGGGAGTTGTAGAACTCAGGCAAAAGTGCCCAAATTAAGCGTAGTGGCTTGCA
ATCAAAGATTCCACGAGAGTCTGACTGAACTGTGATCATGGCTAGATGGTCGAGAAGGGC
TGTTATCTTGTAGTTGGAATTGTTCAGCACACCAAGCTCTCCCATCTTTAACTCAACCCA
CTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGATATCATATTCTGCATAAGCAGCAGTAAGAAA
CTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAACGGGTTCTCAGCAGTGGAACGGTGATCAAA
CAAGGTATAGCCAATATCTAGAACAAGCAGTTTCTTGCCTTTGCGACATGGATTAACAAG
CTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCTCAGCTTCTGCTTATTAAGTTCTTTGTCCTT
AACATCGACCACTTCGTACTTACCAAGCTCAAGGTCATCAACAATGTCATCCGATGTTAC
TTGATCTACTATTATATCATCCTCCGTAGTACCGATCATGGTCATCTTGAGAGAGGGCTT
GAGAGGGATCTGCGAGAGCAGAAGAGAGTCGTCGGAGAGCTTGTTTCCGACTTTGGGGTA
AAGAAGCTTCTGGCGCTTGGGCAAGACGTTGGTGAGAAAGCAGATGCGACGTTTCAGCTC
AGCAACTGAGTCGTCCGCGCAGATTCGAAGTGTGTACTCCTTTCCGCTCCATTTTACTAT
TAGAGTCAGCTCCTCCTCCATCGCGGTCACTGCAGCATCCGGCGTCGGAGATGATGATGA
AGAAGCCATCTACGCAACCAAAATCGACCC

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4EQ71TF 827 0 0
AGATCATCGAACATGATAGTGTTT*GGGAGT*GTAGA*CTCAGGCAAAAGTGCCCAAAT*
AAGC*TAGTGGCTTGCAATCAAAGATTC*ACGAGAGTCTGACTGAACTGTGATCATGGCT
AGATGGTCGAGAAGGGCTGTTATCT*GTAGTTGGGATTGTTCAGCACACCAAGCTCTCCC
ATCTTTAACTCAACCCACTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGATATCATATTCTGCA
TAAGCAGCAGTAAGAAACTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAACGGGTTCTCAGCA
GTGGAACGGTGATCAAACAAGGTATAGTCAATATCTAGAACA*GCAGTTTCTTGCCTTTG
CGACATGGATTAACAAGCTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCTCAGCTTCTGCTTA
TTAAGTTCTTTGTCCTTAACATCGACCACTTCGTCCTTACCAAGCTCAAAGTCATCAACA
ATGTCATCCGATGTTACTTGATCTACTATTATATCATCCTCCGTAGTACCGATCATGGTC
ATCTTGAGAGAGGGCTTGAGAGGGATCTGCGAGAGCAGAAGAGAGTC**CGGAGAGCTTG
TTTCCGACTTTGGGGTAAAGAAGCTTCTGGCGCTTGGGCAAGACGTTGGTGAGAAAGCAG
ATGCGACGTTTCAGCTCAGCAACTGAGTCGTCCGCGCAGATTCGAAGTGTGTACTCCTTT
CCGCTCCATTTTACTATTAGAGTCAGCTCCTCCTCCATCGCGGTCACTGCAGCATCCGGC
GTCGGAGATGATGATGAAGAAGCCATCTACGCAACCAAAATCGACCC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4BN93TF 691 0 0
TGTGATCATGGCTAGATGGTCGAGAAGGGCTGTTATCT*GTAGTTGGGATTGTTCAGCAC
ACCAAGCTCTCCCATCTTTAACTCAACCCACTTCATGCTAGTGGCAGACCATATGATGAT
ATCATATTCTGCATAAGCAGCAGTAAGAAACTCATGAAGATAAGGACGCATAAGCTGCAA
CGGGTTCTCAGCAGTGGAACGGTGATCAAACAAGGTATAGTCAATATCTAGAACAAGCAG
TTTCTTGCCTTTGCGACATGGATTAACAAGCTTAATCTTGTACTGATCGATTCTCCTCCT
CAGCTTCTGCTTATTAAGTTCTTTGTCCTTAACATCGACCACTTCGTCCTTACCAAGCTC
AAAGTCATCAACAATGTCATCCGATGTTACTTGATCTACTATTATATCATCCTCCGTAGT
ACCGATCATGGTCATCTTGAGAGAGGGCTTGAGAGGGATCTGCGAGAGCAGAAGAGAGTC
GTCGGAGAGCTTGTTTCCGACTTTGGGGTAAAGAAGCTTCTGGCGCTTGGGCAAGACGTT
GGTGAGAAAGCAGATGCGACGTTTCAGCTCAGCAACTGAGTCGTCCGCGCAGATTCGAAG
TGTGTACTCCTTTCCGCTCCATTTTACTATTAGAGTCAGCTCCTCCTCCATCGCGGTCAC
TGCAGCATCCGGCGTCGGAGATGATGATGAA

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 7

CO CL860Contig1 1759 7 29 U
AATTTCCAAGTAAAGTTGCTGTTCAAATGAATGACACACACCCAACTCTTGCAATTCCTG
AGCTCATGCGATTGCTAATGGATGACAATGGACTTGGATGGGATGAAGCTTGGGATGTGA
CATCAAAGACCGTTGCTTACACCAATCACACTGTCCTTCCTGAAGCCTTGGAGAAATGGT
CACAATCTTTAATGTGGAAGCTTCTTCCTCGTCATATGGAGATCATAGAGGAAATTGATA
AAAGGTTTGTGCAAACTATTCGCAGCACGCGGGTAGATCTCGAGGATAAGCTTTCAAGTT
TGAGCATCTTAGATCACAATCCGCAGAAGCCAGTTGTGAGAATGGCTAACTTATGTGTTG
TATCGTCGCACACAGTGAATGGCGTTGCTCAGTTGCATAGTGATATCTTAAAGGATGAGT
TATTCGCCGACTATGTCTCTATTTGGCCAAACAAGTTTCAAAACAAGACTAATGGCATCA
CACCTCGAAGGTGGCTTCGTTTCTGCAGCCCTGATCTCAGTGATATAATCACAAAGTGGT
TGAAGACTGACAAATGGATCACCGATCTTGATCTACTAACTGGTCTTCGACAGTTTGCGG
ACAATGAAGAACTCCAATCTGAGTGGGCTTCTGCAAAGGCGGCCAATAAGCAACGTTTGG
CTCAGTATATAGAGCGTGTCACTGGTGTGAGTATTGATCCAAACAGCTTGTTTGACATAC
AAGTTAAGCGTATCCACGAATACAAGAGGCAGCTTATGAACATTCTCGGAGTAATATACA
GATTCAAGAAACTAAAGGAGATGAAGCCTGAGGAAAGGAAGAAAACAACTCCTCGTACTA
TCATGATTGGGGGTAAAGCCTTTGCAACCTATACAAATGCAAAACGGATTGTGAAGCTAG
TGAATGATGTGGGCGACGTTGTTAACAGTGATCCAGAGGTCAACGAATACCTGAAGGTTG
TATTTGTTCCAAACTACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCTTT
CTCAGCACATCAGCACAGCAGGCATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTC
TCAACGGTTGCCTTATCATAGGAACCCTTGATGGCGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGAGA
TTGGCGAAGAAAATTTCTTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCGTA
AAGAAAGAGAAGACGGACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTG
CCAAAAGTGGAGTGTTTGGAACCTATGACTATGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAA
ACACTGGTTATGGGCGTGGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATGG
ATGCTCAGGCCAAAGTTGATGAAGCTTACAAGGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCGA
TAATGAGCACAGCCGGGTCAGGAAAGTTCAGCAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCCA
AAGAGATTTGGAACATTGAGGCATGCCCCGTTCCTTAACTCCTTATGTCGTTGCAACAGA
CTCTGCCTTTTACCATGGCCTCTCTACATCCACACAGCTCCAAAGTCAATATATATA**T
CTTATATAAATCTCATAACTGAATAAGTAATAAACCTTTTCGTATTTATATGTTCATTAT
GTTTGCATAAGTTAAATGTTTGTTCAAGTAAAACGTGGTTCAGCAAGTATATGAATGACA
TTCTGGATTATTTTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ32TF U 1
AF RR4E835TF U 608
AF RR4C307TF U 781
AF RR4H662TF U 838
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AF RR4E835JQ C 1284
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BS 681 743 RR4GZ32TF
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BS 760 862 RR4E835TF
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BS 864 1114 RR4E835TF
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AGCTCATGCGATTGCTAATGGATGACAATGGACTTGGATGGGATGAAGCTTGGGATGTGA
CATCAAAGACCGTTGCTTACACCAATCACACTGTCCTTCCTGAAGCCTTGGAGAAATGGT
CACAATCTTTAATGTGGAAGCTTCTTCCTCGTCATATGGAGATCATAGAGGAAATTGATA
AAAGGTTTGTGCAAACTATTCGCAGCACGCGGGTAGATCTCGAGGATAAGCTTTCAAGTT
TGAGCATCTTAGATCACAATCCGCAGAAGCCAGTTGTGAGAATGGCTAACTTATGTGTTG
TATCGTCGCACACAGTGAATGGCGTTGCTCAGTTGCATAGTGATATCTTAAAGGATGAGT
TATTCGCCGACTATGTCTCTATTTGGCCAAACAAGTTTCAAAACAAGACTAATGGCATCA
CACCTCGAAGGTGGCTTCGTTTCTGCAGCCCTGATCTCAGTGATATAATCACAAAGTGGT
TGAAGACTGACAAATGGATCACCGATCTTGATCTACTAACTGGTCTTCGACAGTTTGCGG
ACAATGAAGAACTCCAATCTGAGTGGGCTTCTGCAAAGGCGGCCAATAAGCAACGTTTGG
CTCAGTATATAGAGCGTGTGACTGGTGTGAGTATTGATCCAAACAGCTTGTTTGACATAC
AAGTTAAGCGTATCCACGAATACGAGAGGCAGCTTATGA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4E835TF 736 0 0
G
GAACTCCAATCTGAGTGGGCTTCTGCAAAGGTGGCCAATAAGCAACGTTTGGCTCAGTAT
ATAGAGCGTGTCACTGGTGTGAGTATTGATCCAAACAGCTTGTTTGACATACAAGTTAAG
CGTATCCACGAATACAAGAGGCAGCTTATGAACATTCTCGGAGTAATATACAGATTCAAG
AAACTAAAGGAGATGAAGCCTGAGGAAAGGAAGAAAACAACTCCTCGTACTATCATGATT
GGGGGTAAAGCCTT*GCAACCTATACAAATGCAAAACGGATTGTGAAGCTAGTGAATGAT
GTGGGCGACGTTGTTAACAGTGATCCAGAGGTCAACGAATACCTGAAGGTTGTATTTGTT
CCAAACTACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCTTTCTCAGCAC
ATCAGCACAGCAGGCATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTCTCAACGGT
TGCCTTATCATAGGAACCCTTGATGGGGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGAGATTGGCGAA
GAAAATTTCTTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCGTAAAGAAAGA
GAAGACGGACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTGCCAAAAGT
GGAGTGTTTGGAACCTATGACTATGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAA*CACTTGT
TATGGGCGTGGTGAT

QA 2 736 2 736
DS 

RD RR4C307TF 669 0 0
GATTCAAGAAACTAAAGGAGATGAAGCCTGAGGAAAGGAAGAAAACAACTCCTCGTACTA
TCATGATTGGGGGTAAAGCCTTTGCCACCTATACAAATGCAAAACGGATTGTGAAGCTAG
TGAATGATGTGGGCGACGTTGTTAACAGTGATCCAGAGGTCAACGAATACCTGAAGGTTG
TATTTGTTCCAAACTACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCTTT
CTCAGCACATCAGCACAGCAGGCATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTC
TCAACGGTTGCCTTATCATAGGAACCCTTGATGGCGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGAGA
TTGGCGAAGAAAATTTCTTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCGTA
AAGAAAGAGAAGACGGACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTG
CCAAAAGTGGAGTGTTTGGAACCTATGACTATGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAA
ACACTGGTTATGGGCGTGGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATGG
ATGCTCACGCCAAAGTTGATGAAGCTTACAAG*ACCGGAAGAG*TGGCTGA*GATGTCGA
TAATGAGCA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4H662TF 614 0 0
G
TATCATGATTGGGGGTAAAGCCTTTGCAACCTATACAAATGCAAAACGGATTGTGAAGCT
AGTGAATGATGTGGGCGACGTTGTTAACAGTGATCCAGAGGTCAACGAATACCTGAAGGT
TGTATTTGTTCCAAACTACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCT
TTCTCAGCACATCAGCACAGCAGGCATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGC
TCTCAACGGTTGCCTTATCATAGGAACCCTTGATGGTGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGA
GATTGGCGAAGAAAATTTCTTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCG
TAAAGAAAGAGAAGACGGACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTT
TGCCAAAAGTGGAGTGTTTGGAACCTATGACTATGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGG
AAACACTGGTTATGGGCGTGGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCTAGCTACAT
GGATGCTCAGGCCAAAGTTGGTGAAGCTTACAAG*ACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTC
GATAATGAGCACA

QA 2 614 2 614
DS 

RD RR4EC34TF 633 0 0
GCAGGCATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTCTCAACGGTTGCCTTATC
ATAGGAACCCTTGATGGCGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGAGATTGGCGAAGAAAATTTC
TTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCGTAAAGAAAGAGAAGACGGA
CTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTGCCAAAAGTGGAGTGTTT
GGAACCTATGACTATGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAAACACTGGTTATGGGCGT
GGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATGGATGCTCAGGCCAAAGTT
GATGAAGCTTACAAGGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCGATAATGAGCACAGCCGGG
TCAGGAAAGTTCAGCAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCCAAAGAGATTTGGAACATT
GAGGCATGCCCCGTTCCTTAACTCCTTATGTCGTTGCAACAGACTCTGCCTTTTACCATG
GCCTCTCTACATCCACACAGCTCCAAAGTCAATATATATA**TCTTATATAAATCTCATA
ACTGAATAAGTAATAAACCTTTTCGTATTTATA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EC34JQ 518 0 0
TCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTGCCAAAAGTGGAGTGTTTGGAACCTATGACTA
TGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAAACACTGGTTATGGGCGTGGTGATTACTTCCT
GGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATGGATGCTCAGGCCAAAGTTGATGAAGCTTACAA
GGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCGATAATGAGCACAGCCGGGTCAGGAAAGTTCAG
CAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCCAAAGAGATTTGGAACATTGAGGCATGCCCCGT
TCCTTAACTCCTTATGTCGTTGCAACAGACTCTGCCTTTTACCATGGCCTCTCTACATCC
ACACAGCTCCAAAGTCAATATATATA**TCTTATATAAATCTCATAACTGAATAAGTAAT
AAACCTTTTCGTATTTATATGTTCATTATGTTTGCATAAGTTAAATGTTTGTTCATGTAA
AACGTGGTTCAGCAAGTATATGAATGACATTCTGGAT
C

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DS 

RD RR4E835JQ 476 0 0
TATGAATATGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAAACACTTGTTATGGGCGTGGTGAT
TACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCTAGCTACATGGATGCTCAGGCCAAAGTTGATGAA
GCTTACAAGGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCGATAATGAGCACAGCCGGGTCAGGA
AAGTTCAGCAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCCAAAGAGATTTGGAACATTGAGGCA
TGCCCTGTTCCTTAATTCCTTATATCGTTGCCACAGACT**GCCTTTTACCATGGCCTCT
CTACATCCACACAGCTCCAAAGTCAATATATATATATCTTATATAAATCTCATAACTGAA
TAAGTAATAAACCTTTTCGTATTTATATGTTCATTATGTTTGCATAAGTTAAATGTTTGT
TCAAGTAAAACGTGGTTCAGCAAGTATATGAATGACATTCTGGATTATTTTGTCCC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 2 6

CO CL861Contig1 1831 4 4 U
GTCCGGCCGTACCAATCCTCAAATGGCTTCAATAACAACAATTCCAGACGCTGATGTCTT
CCCTACAGTCACCATGCCCGTCACAGTAGTCTTAACCGGCGGTCTTCTCTTTATCATTGT
CGCCGGATTCTCTCTCTCTTCTTCTGGAGATGCCTTCTGAATCGCTTGTCTTCAGCTTGG
ACCCTTCAGAGAACATCCTACGGCGACTTAATCCACGTCACCACTCCCCCTGAAAACGCA
GGCCTCGATCCGTTTATCATCAAGTCCTTTCCCGTGTTCCTCTACTCATCCGCAACGATG
AGAAACCAATGTACTGAATGTGCTATCTGCTTGTCAGAGTTTTCAGATGATGACACTGTT
AGGCTTATAACGGTGTGTCGTCACGGGTTTCACTCAGCTTGCATTGATCTTTGGTTTGCG
TCACACAAGACTTGTCCTGTTTGCCGGTGCGAGTTAGACCCGGGACTGGTCGGATCTGGA
AGCCATGAGTCATTGCACAACACGGTTACAATCACTATTCAAGACTTAAACCATGAAGAA
GCGAATCCTCCTTCCGCTAACTCAAGCAAAAGGTTTTTCCCTGAAGCCTTCTCTAGGTCA
CATTCCACAGGGCATTTCATGTTTAAGACGACGGATGTCGTCAATGTGAAGACCGAAGGA
AAACATTACCAAACAGCAGGAAGCAGTGTCATGACCACTACTAGTTCAAGCAAAATGCTT
ATGGAAGCCTCCTCCGCTTGGCGGTTCTCGAGGTCACATTCTACAGGGCATTTCATGTTT
AAGACGATGGATACTAAGACCAAGAGAAAACATTACCAAACGGGCAGCAGTGTCATGATG
TTTGAGGAAAACACACCTACTACTACTACAACTAGCTCAAGCAAAAGGCTTACGGAAGCC
TCATCGGCTTGGCGATTTTCGAGGTCATATTCTACAGGGCAGTTCATGGGTAAGACGAGG
GATGTAACTACGAAGATCAAAGGTAGACACTACCAAACAGGAAGCTGTGCCTCTTTTGAT
GAACTTACTAGGTATGATGAAGCTACAGGATACGGAATTGCTTGGTGATTGATTCATCAT
TACATTAGCAAGGATTTTGAAGTCTTAGTTTGCCCAATAAATTCTATTTTTGTGTTCTTA
CATATTCAAAACTTGTAATAAAAATATGTAGTGAAGAATAAACTGAGAAAGAATAAAAGT
CATCACTCCACAGGGCTTTCTTCAGAGGTATTGTTGTCTTCTATTGTGTCACCAGCCACT
TCAGGTTCTTCTTCAGAAGTATTGTTGTCTTCTATTGTGTTACTATCTTCAGGTTCACTA
GCGCTTCTCAAACTAAACTTTAGATTGATAGGTCTGCCCATTAGCTCCTTCCCGTCGAGT
TTAGAGATTGCATCCTCAGCTTCTTCTCTAGTAAGGAACGAGACAAAGCCATAGCCAGAA
GCTCTACCTCCAGGGTCAGCGAAAACAACACGAGCTGAGACCAGGTTGAAGTCAGCAGCA
GTGAAGAACTCACGGAGATGAGTGGATCTCGCTTTCCAAGCGAGGTTAGAGACGTAGAGT
TTGTGACCGTTTCTCCAGGGGAAGAAGAAGAAGCAGAAGGAGGAAGGGGCTTAGGAGGCT
TCTTGAACTTTCTTGCAAAGCTAACCCTTATGATCCTCCCTGAGACTTGGAAAGAATCGA
ACTTTTCAACAGCGGATTGAGCTTCTTCACCAGAGGACATGGTTACGAAAGCGAAGCCTC
TGTTTTTCCCATCTTTTTGCTTTATTATCTCGACGCCGGAGACAGTTCCGCATTGTCCGA
AGAGGTTGGAGATGTCGTTGACACTCATAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ03TF U 1
AF RR4FJ03JQ C 441
AF RR4BQ52JQ U 1052
AF RR4BX46JQ U 1052
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GGCCTCGATCCGTTTATCATCAAGTCCTTTCCCGTGTTCCTCTACTCATCCGCAACGATG
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AGGCTTATAACGGTGTGTCGTCACGGGTTTCACTCAGCTTGCATTGATCTTTGGTTTGCG
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GCGAATCCTCCTTCCGCTAACTCAAGCAAAAGGTTTTTCCCTGAAGCCTTCTCTAGGTCA
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QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4FJ03JQ 783 0 0
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GTTTAAGACGACGGATGTCGTCAATGTGAAGACCGAAGGAAAACATTACCAAACAGCAGG
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AGGTAGACACTACCAAACAGGAAGCTGTGCCTCTTTTGATGAACTTACTAGGTATGATGA
AGCTACAGGATACGGAATTGCTTGGTGATTGATTCATCATTACATTAGCAAGGATTTTGA
AGTCTTAGTTTGCCCAATAAATTCTATTTTTGTGTTCTTACATATTCAAAACTTGTAATA
AAAATATGTAGTGAAGAATAAACTGAGAAAGAATAAAAGTCATCA
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DS 

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C
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AC

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C
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GAAGAATAAACTGAGAAAGAATAAAAGTCATCACTCCACAGGGCTTTCTTCAGAGGTATT
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TCTGCCCATTAGCTCCTTCCCGTCGAGTTTAGAGATTGCATCCTCAGCTTCTTCTCTAGT
AAGGAACGAGACAAAGCCATAGCCAGAAGCTCTACCTCCAGGGTCAGCGAAAACAACACG
AGCTGAGACCAGGTTGAAGTCAGCAGCAGTGAAGAACTCACGGAGATGAGTGGATCTCGC
TTTCCAAGCGAGGTTAGAGACGTAGAGTTTGTGACCGTTTCTCCAGGGGAAGAAGAAGAA
GCAGAAGGAGGAAGGGGCTTAGGAGGCTTCTTGAACTTTCTTGCAAAGCTAACCCTTATG
ATCCTCCCTGAGACTTGGAAAGAATCGAACTTTTCAACAGCGGATTGAGCTTCTTCACCA
GAGGACATGGTTACGAAAGCGAAGCCTCTGTTTTTCCCATCTTTTTGCTTTATTATCTCG
ACGCCGGAGACAGTTCCGCATTGTCCGAAGAGGTTGGAGATGTCGTTGACACTCATAGA

QA 2 780 2 780
DS 



CO CL861Contig2 1051 2 4 U
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TCTCCTCATCCTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCAAAACCTCACCTCTTCTCTA
GGCAAACTAAACCCATCTCCTTAAGTATTCGAACTCCCACTAACCTCTCTCCCGTCTCCC
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TCGATTCTTTCCAAGTCTCAGGGAGGATCATAAGGGTTAACTTTGCAAGAAAGTTCAAGA
AGCCTCCTAAGCCCCTTCCTCCTTCTGCTTCTTCTTCTTCCCCTGGAGAAACACGTCACA
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AACTCGACGGGAAGGAGCTAATGGGCAGACCTATCAATCTAAAGTTTAGCTTGAGAAGCG
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AAGAGGCTAGTGACACAACAGAAGCCTCTGAAGAAAAACCTGTGGAGTGATGATGACTCT
TATTCTTTCTCAGTTTATTCTTCACTACACATCTTTATTACAAAGTTTTGAATATGTAAG
AACACAAAAAATAGAATTTATTGGGCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G254TF U 1
AF RR4G254JQ C 357
BS 1 714 RR4G254TF
BS 715 715 RR4G254JQ
BS 716 757 RR4G254TF
BS 758 1051 RR4G254JQ

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TCTCCTCATCCTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCAAAACCTCACCTCTTCTCTA
GGCAAACTAAACCCATCTCCTTAAGTATTCGAACTCCCACTAACCTCTCTCCCGTCTCCC
CTCTCAGTATTCCTCTTCGTGCTCGGCTACTCGTCTCTGTATTCTCTTCCGTCGCAGAGG
AAGAAACTTCCCTTACGGATGAGAAGACCGAAGAAACCACCCAGACGACGAATCTCAAAA
GGAAGCTCTTTGTGTTCAATCTCCCCTGGTCTATGAGTGTCAACGACATCTCCAACCTCT
TCGGACAATGCGGAACTGTCTTAAGCGTCGAGATAATAAAGCAAAAAGATGGGAAAAACA
GAGGCTTTGCTTTCGTAACCATGTCCTCTGGTGAAGAAGCTCAATCCGCTGTTGAAAAGT
TCGATTCTTTCCAAGTCTCAGGGAGGATCATAAGGGTTAACTTTGCAAGAAAGTTCAAGA
AGCCTCCTAAGCCCCTTCCTCCTTCTGCTTCTTCTTCTTCCCCTGGAGAAACACGTCACA
AACTCTATGTGTCTAACCTCGCTTGGAAAGCGAGATCGACTCATCTCCGTGAGTTCTTCA
CTGCTGCTGACTTCAACTTGGTTTCAGCTCGTGTTGTTTTCGCTGACCCTGGAG*TAGAG
CTTCTGGCTATGGCTTTGTCTCGTTCCTTACTAGAGA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4G254JQ 695 0 0
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AACAGAGGCTTTGCTTTCGTAACCATGTCCTCTGGTGAAGAAGCTCAATCCGCTGTTGAA
AAGTTCGATTCTTTCCAAGTCTCAGGGAGGATCATAAGGGTTAACTTTGCAAGAAAGTTC
AAGAAGCCTCCTAAGCCCCTTCCTCCTTCTGCTTCTTCTTCTTCCCCTGGAGAAACACGT
CACAAACTCTATGTGTCTAACCTCGCTTGGAAAGCGAGATCGACTCATCTCCGTGAGTTC
TTCACTGCTGCTGACTTCAACTTGGTTTCAGCTCGTGTTGTTTTCGCTGACCCTGGAGGT
AGAGCTTCTGGCTATGGCTTTGTCTCGTTCCTTACTAGAGAAGAAGCCGAGGATGCAATC
TCTAAACTCGACGGGAAGGAGCTAATGGGCAGACCTATCAATCTAAAGTTTAGCTTGAGA
AGCGCTGGTGAATCTGAAGATGGTAACACAATAGAAGACAACAATACTTCTGAAGAAGAA
CCTGAAGAGGCTAGTGACACAACAGAAGCCTCTGAAGAAAAACCTGTGGAGTGATGATGA
CTCTTATTCTTTCTCAGTTTATTCTTCACTACACATCTTTATTACAAAGTTTTGAATATG
TAAGAACACAAAAAATAGAATTTATTGGGCAAACT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 5

CO CL862Contig1 898 5 2 U
GGGATTCCCACCTTCTCATCAGTAGCGAAGCTCTCAGCTTAGGGATATTGTTTTTCGAAT
TCGACAGCGATGGATCTAAATCTGGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACAATCATCGGC
GTCACTTACAATGGAGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGTATGTAC
GTAGCGAATCGGGCTTCAGACAT*ATCACGCAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGTCGT
TCCGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAG
CACACGATTCAGCTGGTGCAGCCTGCAACCGTGAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATG
CTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTCCAAACCGGGCTCATTGTTGGTGGCTGGGACAAA
TACGAAGGTGGGAAGATCTATGGGATTCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTT
GCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTTTACGGTTTCTTTGATCAAGCATGGAAAGAA
AACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATAGCC
CGTGATGGAGCCAGTGGTGGGGTTGTACGGACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACC
AGAAACTTCTATCCTGGTGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCACAGAAC
TCTTTGTTAGACATCTTGAACGCTGCTGGTCCCGAGCCAATGGCCATGTGATGCCAGCAA
CGACCATTTCTCTTACTCTGTTAAACAAACGTGTTAGACGCTTCTTTACCATTACCGATG
TTTTACTCTAAACTCTGTTTGAAGTTATGTTTTTTTTCTATGTATACACATGTTATTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV83TF U 1
AF RR4CX29TF U 10
AF RR4AT48TF U 1
AF RR4AV83JQ C 118
AF RR4AT48JQ C 164
BS 1 707 RR4AT48TF
BS 708 898 RR4AV83JQ

RD RR4AV83TF 281 0 0
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GTAGCGAATCGGGCTTCAGACAT*ATCACGCAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGTCGT
TCCGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGT

QA 1 281 1 281
DS 

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GG
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GGATCTAAATCTGGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACAATCATCGGCGTCACTTACAA
TGGAGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCGCCGGTATGTACGTAGCGAATCG
GGCTTCAGACAAGATCACGCAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGTCGTTCCGGTTCGGC
TGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAGCACACGATTCA
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TAACAAGAACATGCTCCAAACCGGTCTCATTGTTGGTGGCTGGGACAAATACGAAGGTGG
GAAGATCTATGGGATTCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGG
CTCTGGCTCCAGTTACCTTTACGGTTTCTTTGATCAAGCATGGAAAGAAAACATGACCAA
AGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGT

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR4AT48TF 707 0 0
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TCGACAGCGATGGATCTAAATCTGGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACAATCATCGGC
GTCACTTACAATGGAGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGTATGTAC
GTAGCGAATCGGGCTTCAGACAT*ATCACGCAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGTCGT
TCCGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAG
CACACGATTCAGCTGGTGCAGCCTGCAACCGTGAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATG
CTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTCCAAACCGGGCTCATTGTTGGTGGCTGGGACAAA
TACGAAGGTGGGAAGATCTATGGGATTCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTT
GCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTTTACGGTTTCTTTGATCAAGCATGGAAAGAA
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CGTGATGGAGCCAGTGGTGGGGTTGTACGGACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACC
AGAAACTTCTATCCTGGTGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4AV83JQ 781 0 0
GGCGTCACTTACAATGGAGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGTATG
TACGTAGCGAATCGGGCTTCAGACAT*ATCACGCAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGT
CGTTCCGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCGCTACTTCCTTCAC
CAGCACACGATTCAGCTGGTGCAGCCTGCAACCGTGAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGG
ATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTCCAAACCGGGCTCATTGTTGGTGGCTGGGAC
AAATACGAAGGTGGGAAGATCTATGGGATTCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCG
TTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTTTACGGTTTCTTTGATCAAGCATGGAAA
GAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATA
GCCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGGGTTGTACGGACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTG
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AACTCTTTGTTAGACATCTTGAACGCTGCTGGTCCCGAGCCAATGGCCATGTGATGCCAG
CAACGACCATTTCTCTTACTCTGTTAAACAAACGTGTTAGACGCTTCTTTACCATTACCG
ATGTTTTACTCTAAACTCTGTTTGAAGTTATGTTTTTTTTCTATGTATACACATGTTATT
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AT48JQ 715 0 0
CCAGCACCGGTATGTACGTAGCGAATCGGGCTTCAGACAT*ATCACGCAACTCACAGACA
ATGTCTACGTCTGTCGTTCCGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCC
GCTACTTCCTTCACCAGCACACGATTCAGCTGGTGCAGCCTGCAACCGTGAAGGTTTCTG
CCAACCTTATCAGGATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTCCAAACCGGGCTCATTG
TTGGTGGCTGGGACAAATACGAAGGTGGGAAGATCTATGGGATTCCTCTCGGTGGAACTG
TAGTGGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTTTACGGTTTCTTTG
ATCAAGCATGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGG
TTTCACTAGCCATAGCCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGGGTTGTACGGACTGTCATAATAA
ACTCAGAGGGAGTGACCAGAAACTTCTATCCTGGTGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGG
AGTTGGAGCCACAGAACTCTTTGTTAGACATCTTGAACGCTGCTGGTCCCGAGCCAATGG
CCATGTGATGCCAGCAACGACCATTTCTCTTACTCTGTTAAACAAACGTGTTAGACGCTT
CTTTACCATTACCGATGTTTTACTCTAAACTCTGTTTGAAGTTATGTTTTTTTTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 8

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GAAACATACATACACACCTCAAAATCTCTCTCAAATCAGAGCAGAAGAAGCGACAAGAAA
ACCCTTCTTTCTTTCTTTCT****CTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTAAAGCTTCACCAG
TCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCCTTGTAGTA
CCCTCAGGCTCAGGCCACTTCCCCTCCGAACATCCTTCTTCGGAAACTCCGGTGGAGCTT
TGAGAGTGAACGAGCTGAGACTAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGTGCAATGCTCATGGTC
CTACCATGAATCTTTTCGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATATGCCAATGCACTTA
TAAGCTCCTTCGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTG
ATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGAGA
ACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAACTTGCTC
TTGCTAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTTGCTG
ACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTTG
TCTCGAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATACGC
TCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTCCAAGAGATGATAGGGACAG
TGAATACAAGCGGTGCTCTCTCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAAAGTGATGGCTATGG
AGTCTGAAGCAGATGCACTTACTCAGATTGGAACGGATGAACTCGAGGGAAAGTTTCAAA
TGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTCCGGAA
GCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCACGGTCGCAGCAAACACGGGATACC
CATTCAAGGACTCGGAGATCGAGAACGAGTTAAACGAATTACGAAGGAAAGCTAACGAGT
TTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTAAACTATTT
TTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATATCCAGCTA
CCTAATCTTCATTTATGACTTGGTTAAATTTGGTATTTTCATCTGAATCACTGGTTTTGA
AAGGATC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4F060TF U 4
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GG
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ACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACATGTTTTAGCTTCGCAAAAGCAGCTGGAGAACAAA
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GCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAA

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DS 

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ACCCTTCTTTCTTTCTTTCT****CTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTAAAGCTTCACCAG
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TGAGAGTGAACGAGCTGAGACTAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGTGCAATGCTCATGGTC
CTACCATGAATCTTTTCGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATGTGCCAATGCACTTA
TAAGCTCCTTCGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTG
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ACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTTG
TCTCGAATACGAG*TTATTGGAGAGCAAGATACAAG

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DS 

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GG
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GGA
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ATTGAAATGGCTCTTAAAGCTTCACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCAACT
GCTTCCACTTCTAATCGCCCCTGTAGTACCCTCAGGCTCAGGCCACTTCCCCTCCGAACA
TCCTTCTTCGGAAACTCCGGTGGAGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGACTAGCTTGTGCA
AATAGGTTGAAGTGCAATGCTCATGGTCCTACCATGAATCTTTTCGAAAGATTTTCTAGG
GTTGTCAAGTCATATGCCAATGCACTTATAAGCTCCTTCGAAGACCCTGAGAAGATCCTC
GAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAG
GTTTTAGCTTCACAAAAGTAGCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGAT
GATTGGTACAAAAGAGCACAACTTGCTCTTGCTAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAA
GCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTTGCCGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGAT
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CAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCA
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A

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DS 

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TGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTAAACTATTTTTGTTTCTTGAA
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DS 

RD RR4GJ87JQ 781 0 0
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GACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTT
GTCTCGAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATACG
CTCCTTGCACGTGCTCTCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTCCAAGAGATGATAGGGACA
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GAGTCTGAAGCAGATGCACTTACTCAGATTGGAACGGATGAACTCGAGGGAAAGTTTCAA
ATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTCCGGA
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TTTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTAAACTATT
TTTGTTTCTTGAA**AAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATATCCAGCT
G

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DS 

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CTTCCTCCAGGGAGTAGTACGGTCGCAGCAAACCCGGGATACCCATTCAAGGACTCGGAG
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TTGCTAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTTGCCG
ACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTTG
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TGAATACAAGCGGTGCTCTCTCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAAAGTGATGGCTATGG
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TGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTCCGGAA
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CATTCAAGGACTCTGAGATCGAGAACGAGTTAAACGAATTACGAAGGAAAGCTAACGAGT
TTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTAAACTATTT
TTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATATCCAGCTA
CCTAATCTTCATTTATGACTTGGTTAAATTTGGTATTTTCATCTGAATCACTGGTTTTGA
AAGGATC

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DS 



AS 3 7

CO CL864Contig1 773 2 11 U
GGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACCGAAGGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTCGAGC
AGAACATCGTCCCCGGTATCAAAGTCGACAAGGGTTTGGTGCCACTAGTTGGCTCTAACA
ATGAGCCATGGTGCCAAGGACTCGATGGTCTATCCTCTCGAACCGCTGCTTACTACCAAC
AGGGTGCTCGTTTCGCCAAATGGCGTACTGTGGTGAGCATTCCCAACGGTCCGTCTGCTC
TCGCTGAGAAAGAAGCTGCTTGGGGACTTGCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAGTG
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CTTACGAAGTAGCAGAGAAGGTTTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAATG
TCATGTTTGAAGGTATCCTCCTGAAGCCAAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAAG
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TGAACCTCAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGTCCTTCTCCTACGCAC
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TCAGACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAGGCAATTCATTGGCTCAGCTCGGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E434TF U 29
AF RR4C614TF U 1
BS 1 194 RR4C614TF
BS 195 195 RR4E434TF
BS 196 478 RR4C614TF
BS 479 479 RR4E434TF
BS 480 553 RR4C614TF
BS 554 554 RR4E434TF
BS 555 580 RR4C614TF
BS 581 581 RR4E434TF
BS 582 583 RR4C614TF
BS 584 584 RR4E434TF
BS 585 773 RR4C614TF

RD RR4E434TF 564 0 0
G
GGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTCGAGCAGAACATCGTCCCCGGTATCAAAGTTGAC
AAGGGTTTGGTGCCACTTGTTGGTTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGGACTCGATGGT
CTATCCTCTCGCACCGCTGCTTACTACCAACAGGGTGCTCGTTTCGCTAAATGGCGTACT
GTTGTGAGCATTCCCAACGGTCCGTCTGCTCTCGCTGCGAAAGAAGCTGCTTGGGGGCTT
GCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATTGTGGAGCCTGAGATC
TTGTTGGACGGAGAGCACGACATTGACAGGACTTACGAAGTGGCCGAGAAGGTTTGGGCT
GAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGGTATCCTCCTTAAGCCG
AGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAAGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCC
TACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACAGAATCCCTCCGGCCGTCCCCGGAATCATGTTCTTG
TCCGGAGGACAATCAGAGTTGGA

QA 2 564 2 564
DS 

RD RR4C614TF 773 0 0
GGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACCGAAGGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTCGAGC
AGAACATCGTCCCCGGTATCAAAGTCGACAAGGGTTTGGTGCCACTAGTTGGCTCTAACA
ATGAGCCATGGTGCCAAGGACTCGATGGTCTATCCTCTCGAACCGCTGCTTACTACCAAC
AGGGTGCTCGTTTCTCCAAATGGCGTACTGTGGTGAGCATTCCCAACGGTCCGTCTGCTC
TCGCTGAGAAAGAAGCTGCTTGGGGACTTGCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAGTG
GATTGGTTCCAATAGTGGAGCCAGAGATATTGTTGGACGGAGAACACGACATTGACAGGA
CTTACGAAGTAGCAGAGAAGGTTTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAATG
TCATGTTTGAAGGTATCCTCCTGAAGCCAAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAGG
ACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACAGAATCC
CTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCTGAGTTGGAGGCAACGT
TGAACCTCAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGTCCTTCTCCTACGCAC
GTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGC
TCAGACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAGGCAATTCATTGGCTCAGCTCGGAAAT

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL864Contig2 619 3 8 U
GAACTTCAATATATTAAAGCTTTATTATTAAAAAGGAGTAGCTAATACAAATTTAGTAGA
GAAAGTAAATGATTCGACATTATAATAACAACCAAACGCAAAAAAACAAATGCCATCAAA
ACATTTGTTTCAGTCTCCTTTCACAGCATCATGATCTCTTTTTCGATGTTGTCTTCAGTA
GGTGTAGCCTTTGACGAACATACCCTCCTTAGCATCTTCAGACTCACCTTCTCCGGTGTA
TTTTCCGAGCTGAGCCAACGAATTGGCCTTGGCACGAGCCAAGAGAGTGGTCTGAGCTGC
ATTCACGTTCTCAACTCTGCATCCCCATGTTTTCAGACAAGTGTTCTGGAGAGCACGTGC
GTAGGAAAAGGACACGTGCCATGGGTTTGGTGCCTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAAGT
TGCCTCCAACTCTGATTGTCCTCCGGACAAGAACATGATTCCGGGGACGGCCGGAGGGAT
TCTGTTGCGGAGGAGTTTAAGGGTGTAGGAGGCAACTTGTTCAGGAGTAGCTCTGTCTTT
AGACTCGGCTCCGGGAGTCACCATGCTCGGCTTAAGGAGGATACCTTCAAACATGACATT
GTTCTGAGCAAGGTAAAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F913JQ U 1
AF RR4F913TF C 1
AF RR4E434JQ U 22
BS 1 60 RR4F913JQ
BS 61 61 RR4E434JQ
BS 62 132 RR4F913JQ
BS 133 133 RR4E434JQ
BS 134 450 RR4F913JQ
BS 451 451 RR4E434JQ
BS 452 504 RR4F913JQ
BS 505 619 RR4E434JQ

RD RR4F913JQ 504 0 0
GAACTTCAATATATTAAAGCTTTATTATTAAAAAGGAGTAGCTAATACAAATTTAGTAGA
AAAAGTAAATGATTCGACATTATAATAACAACCAAACGCAAAAAAACAAATGCCATCAAA
ACATTTGTTTCAATCTCCTTTCACAGCATCATGATCTCTTTTTCGATGTTGTCTTCAGTA
GGTGTAGCCTTTGACGAACATACCCTCCTTAGCATCTTCAGACTCACCTTCTCCGGTGTA
TTTTCCGAGCTGAGCCAACGAATTGGCCTTGGCACGAGCCAAGAGAGTGGTCTGAGCTGC
ATTCACGTTCTCAACTCTGCATCCCCATGTTTTCAGACAAGTGTTCTGGAGAGCACGTGC
GTAGGAAAAGGACACGTGCCATGGGTTTGGTGCCTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAAGT
TGCCTCCAACTCTGATTGTCCTCCGGACAAAAACATGATTCCGGGGACGGCCGGAGGGAT
TCTGTTGCGGAGGAGTTTAAGGGT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4F913TF 540 0 0
GAACTTCAATATATTAAAGCTTTATTATTAAAAAGGAGTAGCTAATACAAATTTAGTAGA
GAAAGTAAATGATTCGACATTATAATAACAACCAAACGCAAAAAAACAAATGCCATCAAA
ACATTTGTTTCAGTCTCCTTTCACAGCATCATGATCTCTTTTTCGATGTTGTCTTCAGTA
GGTGTAGCCTTTGACGAACATACCCTCCTTAGCATCTTCAGACTCACCTTCTCCGGTGTA
TTTTCCGAGCTGAGCCAACGAATTGGCCTTGGCACGAGCCAAGAGAGTGGTCTGAGCTGC
ATTCACGTTCTCAACTCTGCATCCCCATGTTTTCAGACAAGTGTTCTGGAGAGCACGTGC
GTAGGAGAAGGACACGTGCCATGGGTTTGGTGCCTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAAGT
TGCCTCCAACTCTGATTGTCCTCCGGACAAGAACATGATTCCGGGGACGGCCGGAGGGAT
TCTGTTGCGGAGGAGTTTAAGGGTGTAGGAGGCAACTTGTTCAGGAGTAGTTCTGTCTT
C

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4E434JQ 598 0 0
TTATTATTAAAAAGGAGTAGCTAATACAAATTTAGTAAAGAAAGTAAATGATTCGACATT
ATAATAACAACCAAACGCAAAAAA*CAAATGCCATCAAAACATTTGTTTCAGTCTCCTTT
CACAGCATCATGATCTCTTTTTCGATGTTGTCTTCAGTAGGTGTAGCCTTTGACGAACAT
ACCCTCCTTAGCATCTTCAGACTCACCTTCTCCGGTGTATTTTCCGAGCTGAGCCAACGA
ATTGGCCTTGGCACGAGCCAAGAGAGTGGTCTGAGCTGCATTCACGTTCTCAACTCTGCC
TCCCCATGTTTTCAGACAAGTGTTCTGGAGAGCACGTGCGTAGGAAAAGGACACGTACCA
TGGGTTTGGTGCCTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAAGTTGCCTCCAACTCTGATTGTCC
TCCGGACAAGAACATGATTCCGGGGACGGCCGGAGGGATTCTGTTGCGGAGGAGCTTAAG
GGTGTAGGAGGCAACTTGTTCAGGAGTAGCTCTGTCTTTAGACTCGGCTCCGGGAGTCAC
CATGCTCGGCTTAAGGAGGATACCTTCAAACATGACATTGTTCTGAGCAAGGTAAAAG

QA 1 598 1 598
DS 



CO CL864Contig3 789 2 13 U
GCCGACAAGCATACCGGACATTGCTGGTCTCTGCACCAGGACTCGGACAGTACATCTCCG
GTGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACGGAAGGCAAGAAAATGGTCG
ACGTCCTCGTCGAGCAGAACATCGTCCCTGGTATCAAAGTCGACAAGGGTTTAGTGCCAC
TTGTTGGCTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGGACTCGATGGTCTATCCTCCCGAACCG
CTGCTTACTACCAACAAGGTGCTCGTTTCGCCAAATGGCGTACTGTCGTGAGCATTCCCA
ACGGCCCGTCTGCTCTAGCTGTTAAAGAAGCTGCATGGGGCCTTGCTCGATACGCTGCCA
TTTCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATAGTAGAGCCAGAGATATTGTTGGACGGAGAAC
ACGACATTGACAGGACTTACGAAGTAGCGGAGAAGGTCTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACC
TTGCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGGTATCCTACTGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCG
GAGCCGAGTCTAAAGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAACTCC
TCCGCAACAGAATCCCTCCCGCTGTACCCGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCTG
AGTTGGAGGCAACGCTGAACCTGAACGCGATGAACCAAGCACCAAACCCGTGGCATGTAT
CTTTCTCTTACGCACGTGCACTGCAGAACACATGTCTGAAACATGGGGAGGCAGAGCTGA
GATGTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF58TF U 36
AF RR4GQ77TF U 1
BS 1 112 RR4GQ77TF
BS 113 113 RR4CF58TF
BS 114 304 RR4GQ77TF
BS 305 305 RR4CF58TF
BS 306 354 RR4GQ77TF
BS 355 355 RR4CF58TF
BS 356 391 RR4GQ77TF
BS 392 392 RR4CF58TF
BS 393 615 RR4GQ77TF
BS 616 616 RR4CF58TF
BS 617 646 RR4GQ77TF
BS 647 647 RR4CF58TF
BS 648 789 RR4GQ77TF

RD RR4CF58TF 631 0 0
G
CAGGACTCGGACAGTACATCTCCGGTGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTGTATCAGTCTA
CTACGGAAGGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTCGAGCAGAACATCGTCCCTGGTATCA
AAGTCGACAAGGGTTTAGTGCCACTTGTTGGCTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGGAC
TCGATGGTCTATCCTCCCGAACCGCTGCTTACTACCAACAAGGTGCTCGTTTCGCCAAAT
GGCGTACTGTCGTGAGCATTCCCAACGGCCCGTCTGCTCTAGCTGTTAAAGAAGCTGCAT
GGGGCCTTGCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATAGTAGAGC
CAGAGATATTGTTGGACGGAGAACACGACATTGACAGGACTTACGAAGTAGCGGAGAAGG
TCTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGTTATCCTAC
TGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAAGACAGAGCTACTCCTGAACAAG
TTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACAGAATCCCTCCCGCTGTACCCGGAATCA
TGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCTGAGTTGG

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR4GQ77TF 789 0 0
GCCGACAAGCATACCGGACATTGCTGGTCTCTGCACCAGGACTCGGACAGTACATCTCCG
GTGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACGGAAGGCAAGAAGATGGTCG
ACGTCCTCGTCGAGCAGAACATCGTCCCTGGTATCAAAGTCGACAAGGGTTTAGTGCCAC
TTGTTGGCTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGGACTCGATGGTCTATCCTCCCGAACCG
CTGCTTACTACCAACAAGGTGCTCGTTTCGCCAAATGGCGTACTGTCGTGAGCATTCCCA
ACGGTCCGTCTGCTCTAGCTGTTAAAGAAGCTGCATGGGGCCTTGCTCGATACGTTGCCA
TTTCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATAGTGGAGCCAGAGATATTGTTGGACGGAGAAC
ACGACATTGACAGGACTTACGAAGTAGCGGAGAAGGTCTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACC
TTGCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGGTATCCTACTGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCG
GAGCCGAGTCTAAAGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAACTCC
TCCGCAACAGAATCC*TCCCGCTGTACCCGGAATCATGTTCTTGTCGGGAGGACAGTCTG
AGTTGGAGGCAACGCTGAACCTGAACGCGATGAACCAAGCACCAAACCCGTGGCATGTAT
CTTTCTCTTACGCACGTGCACTGCAGAACACATGTCTGAAACATGGGGAGGCAGAGCTGA
GATGTGACG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 8

CO CL865Contig1 863 8 6 U
AAATCTCAGAATTTGATTGAAAAAAGTGATTGTTCAGTAAACAAAATGTTTGATCAATAT
GGTTTCGGTGATTGATATGAATGACATTCTCAGATGAATTTGAAAGACTTGACTGCCTTC
TGGATCTTGGAGCTTTGATCAGCAGATTCTTCGTCATTAAATTGTCCTGTGACGGTGTAT
AAACGGTTGTACCAACCGTTAGTTGCCATCCCAATGGCAGAGTACAAATGCTTACGAGCT
TCTCCAGGGTTTTGTAATGTATACTCAATGTAATAGAACCCTTTGGAAGATCTGCTATCG
ACTAGCTTTGCAGTAACTCCTGCTGGTTTCTGCCAGCTTCTATCCAATCCACTGACAAGT
GTTTCTGCAAAAGCTTCGACCTTTCCAAAAGATTCCATCCTAGTGAAATCTGGACCTAGT
CCAGTGATCGCTACGCTCACATTGTAAGATGAAGTTTCTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATT
GACTTGAACCCGTTAGGTTCTGCTGCTTGTCCGACTTGCCACTCTTGTGGAATTGATATC
TCGAACTTGTTAGCTTCATCTGTGTACACACGGAAAGCCTCCGATGAATTTGTCTCTGCA
AATGCAGGTGGAAGTAAGAAAGCAGAGGAAGAAGCTATGTTTAACATGACTTCCCTTCAC
TTCATCCCAACCTCATCTCTTGACAGTATCTGATGCTGTTCCTCATTGGAACTGACGAGA
GCAGGAAGTGATGTGCATCTTGCTGAAC***TATATCGAGTGGAAACGCGGGGACTCGAG
AAGCTCTGTGGAGAAGAAAGCCATGGAGAAATCGCTGCCATGTGTTTCAAGATATGTGTC
CTGCTTCTCAGAAAATCTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT94JQ U 88
AF RR4G786JQ U 1
AF RR4DT32JQ U 15
AF RR4AY80TF C 122
AF RR4AY80JQ U 130
AF RR4G786TF C 226
AF RR4DT94TF C 264
AF RR4DT32TF C 338
BS 1 621 RR4G786JQ
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BS 627 628 RR4AY80JQ
BS 629 629 RR4G786TF
BS 630 828 RR4AY80JQ
BS 829 863 RR4DT94TF

RD RR4DT94JQ 209 0 0
TCTCAGATGAATTTGAAAGACTTGACTGCCTTCTGGATCTTGGAGCTTTGATCAGCAGAT
TCTTCGTCATTAAATTGTCCTGTGACGGTGTATAAACGGTTGTACCAACCGTTAGTTGCC
ATCCCAATGGCAGAGTACAAATGCTTACGAGCTTCTCCAGGGTTTTGTAATGTATACTCA
ATGTAATACAACCCTTTGGAAAATCTGCT

QA 1 209 1 209
DS 

RD RR4G786JQ 621 0 0
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GGTTTCGGTGATTGATATGAATGACATTCTCAGATGAATTTGAAAGACTTGACTGCCTTC
TGGATCTTGGAGCTTTGATCAGCAGATTCTTCGTCATTAAATTGTCCTGTGACGGTGTAT
AAACGGTTGTACCAACCGTTAGTTGCCATCCCAATGGCAGAGTACAAATGCTTACGAGCT
TCTCCAGGGTTTTGTAATGTATACTCAATGTAATAGAACCCTTTGGAAGATCTGCTATCG
ACTAGCTTTGCAGTAACTCCTGCTGGTTTCTGCCAGCTTCTATCCAATCCACTGACAAGT
GTTTCTGCAAAAGCTTCGACCTTTCCAAAAGATTCCATCCTAGTGAAATCTGGACCTAGT
CCAGTGATCGCTACGCTCACATTGTAAGATGAAGTTTCTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATT
GACTTGAACCCGTTAGGTTCTGCTGCTTGTCCGACTTGCCACTCTTGTGGAATTGATATC
TCGAACTTGTTAGCTTCATCTGTGTACACACGGAAAGCCTCCGATGAATTTGTCTCTGCA
AATGCAGGTGGAAGTAAGAAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DT32JQ 612 0 0
GG
TTGAAAAAAGTGATTGTTCAGTAAACAAAATGTTTGATCAATATGGTTTCGGTGATTGAT
ATGAATGACATTCTCAGATGAATTTGAAAGACTTGACTGCCTTCTGGATCTTGGAGCTTT
GATCAGCAGATTCTTCGTCATTAAATTGTCCTGTGACGGTGTATAAACGGTTGTACCAAC
CGTTAGTTGCCATCCCAATGGCAGAGTACAAATGCTTACGAGCTTCTCCAGGGTTTTGTA
ATGTATACTCAATGTAATAGAACCCTTTGGAAGATCTGCTATCGACTAGCTTTGCAGTAA
CTCCTGCTGGTTTCTGCCAGCTTCTATCCAATCCACTGACAAGTGTTTCTGCAAAAGCTT
CGACCTTTCCAAAAGATTCCATCCTAGTGAAATCTGGACCTAGTCCAGTGATCGCTACGC
TCACATTGTAAGATGAAGTTTCTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATTGACTTGAACCCGTTAG
GTTCTGCTGCTTGTCCGACTTGCCACTCTTGTGGAATTAATATCTCGAACTTGTTAGCTT
CATCTGTGTACACACGGAAAGCCTCCGATGAATTTGTCTCTGCAAATGCAGGTGGAAGTA
AGAAAGCAGA

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DS 

RD RR4AY80TF 709 0 0
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AACGGTTGTACCAACCGTTAGTTGCCATCCCAATGGCAGAGTACAAATGCTTACGAGCTT
CTCCAGGGTTTTGTAATGTATACTCAATGTAATAGAACCCTTTGGAAGATCTGCTATCGA
CTAGCTTTGCAGTAACTCCTGCTGGTTTCTGCCAGCTTCTATCCAATCCACTGACAAGTG
TTTCTGCAAAAGCTTCGACCTTTCCAAAAGATTCCATCCTAGTGAAATCTGGACCTAGTC
CAGTGATCGCTACGCTCACATTGTAAGATGAAGTTTCTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATTG
ACTTGAACCCGTTAGGTTCTGCTGCTTGTCCGACTTGCCACTCTTGTGGAATTGATATCT
CGAACTTGTTAGCTTCATCTGTGTACACACGGAAAGCCTCCGATGAATTTGTCTCTGCAA
ATGCAGGTGGAAGTAAGAAAGCAGAGGGAGAAGCTATGTTTAACATGACTTCCCTTCACT
TCATCCCAACCTCATCTCTTGACAGTATCTGATGCTGTTCCTCATTGGAACTGACGAGAG
CAGGAAGTGATGTGCATCTTGCTGAAC***TATATCGAGTGGAAACGCGGGGACTCGAGA
AGCTCTGTGGAGAAGAAAGCCATGGAGAAATCGCTGCCATGTGTTTC
CC

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DS 

RD RR4AY80JQ 699 0 0
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TACCAACCGTTAGTTGCCATCCCAATGGCAGAGTACAAATGCTTACGAGCTTCTCCAGGG
TTTTGTAATGTATACTCAATGTAATAGAACCCTTTGGAAGATCTGCTATCGACTAGCTTT
GCAGTAACTCCTGCTGGTTTCTGCCAGCTTCTATCCAATCCACTGACAAGTGTTTCTGCA
AAAGCTTCGACCTTTCCAAAAGATTCCATCCTAGTGAAATCTGGACCTAGTCCAGTGATC
GCTACGCTCACATTGTAAGATGAAGTTTCTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATTGACTTGAAC
CCGTTAGGTTCTGCTGCTTGTCCGACTTGCCACTCTTGTGGAATTGATATCTCGAACTTG
TTAGCTTCATCTGTGTACACACGGAAAGCCTCCGATGAATTTGTCTCTGCAAATGCAGGT
GGAAGTAAGAAAGCAGAGGGAGAAGCTATGTTTAACATGACTTCCCTTCACTTCATCCCA
ACCTCATCTCTTGACAGTATCTGATGCTGTTCCTCATTGGAACTGACGAGAGCAGGAAGT
GATGTGCATCTTGCTGAAC***TATATCGAGTGGAAACGCGGGGACTCGAGAAGCTCTGT
GGAGAAGAAAGCCATGGAGAAATCGCTGCCATGTGTTTC

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DS 

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AAATGCTTACGAGCTTCTCCAGGGTTTTGTAATGTATACTCAATGTAATAGAACCCTTTG
GAAGATCTGCTATCGACTAGCTTTGCAGTAACTCCTGCTGGTTTCTGCCAGCTTCTATCC
AATCCACTGACAAGTGTTTCTGCAAAAGCTTCGACCTTTCCAAAAGATTCCATCCTAGTG
AAATCTGGACCTAGTCCAGTGATCGCTACGCTCACATTGTAAGATGAAGTTTCTTCAGGG
TAAAAAGCTGTGATTGACTTGAACCCGTTAGGTTCTGCTGCTTGTCCGACTTGCCACTCT
TGTGGAATTGATATCTCGAACTTGTTAGCTTCATCTGTGTACACACGGAAAGCCTCCGAT
GAATTTGTCTCTGCAAATGCAGGTGGAAGTAAGAAAGCAGAGGAAGAAGCTATGTTTAAC
ATGACTTCCCTTCTCTTCATCCCAACCTCATCTCTTGACAGTATCTGATGCTGTTCCTCA
TTGGAACTGACGAGAGCAGGAAGTGATGTGCATCTTGCTGAAC***TATATCGAGTGGAA
ACGCGGGGACTCGAGAAGCTCTGTGGAGAAGAAAGCCATGGAGAAATCGCTGCCATGTGT
TTC
AAGATCC

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DS 

RD RR4DT94TF 600 0 0
CTCAATGTAATAGAACCCTTTGGAAGATCTGCTATCGACTAGCTTTGCAGTAACTCCTGC
TGGTTTCTGCCAGCTTCTATCCAATCCACTGACAAGTGTTTCTGCAAAAGCTTCGACCTT
TCCAAAAGATTCCATCCTAGTGAAATCTGGACCTAGTCCAGTGATCGCTACGCTCACATT
GTAAGATGAAGTTTCTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATTGACTTGAACCCGTTAGGTTCTGC
TGCTTGTCCGACTTGCCACTCTTGTGGAATTGATATCTCGAACTTGTTAGCTTCATCTGT
GTACACACGGAAAGCCTCCGATGAATTTGTCTCTGCAAATGCAGGTGGAAGTAAGAAAGC
AGAGGAAGAAGCTATGTTTAACATGACTTCCCTTCTCTTCATCCCAACCTCATCTCTTGA
CAGTATCTGATGCTGTTCCTCATTGGAACTGACGAGAGCAGGAAGTGATGTGCATCTTGC
TGAACCTGTATATCGAGTGGAAACGCGGGGACTCGAGAAGCTCTGTGGAGAAGAAAGCCA
TGGAGAAATCGCTGCCATGTGTTTCAAGATATGTGTCCTGCTTCTCAGAAAATCTATTCC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4DT32TF 508 0 0
TTCTATCCAATCCACTGACAAGTGTTTCTGCAAAAGCTTCGACCTTTCCAAAAGATTCCA
TCCTAGTGAAATCTGGACCTAGTCCAGTGATCGCTACGCTCACATTGTAAGATGAAGTTT
CTTCAGGGTAAAAAGCTGTGATTGACTTGAACCCGTTAGGTTCTGCTGCTTGTCCGACTT
GCCACTCTTGTGGAATTAATATCTCGAACTTGTTAGCTTCATCTGTGTACACACGGAAAG
CCTCCGATGAATTTGTCTCTGCAAATGCAGGTGGAAGTAAGAAAGCAGAGGAAGAAGCTA
TGTTTAACATGACTTCCCTTCTCTTCATCCCAACCTCATCTCTTGACAGTATCTGATGCT
GTTCCTCATTGGAACTGACGAGAGCAGGAAGTGATGTGCATCTTGCTGAAC***TATATC
GAGTGGAAACGCGGGGACTCGAGAAGCTCTGTGGAGAAGAAAGCCATGGAGAAATCGCTG
CCATGTGTTTCAAGATATGTGTCCT
CCC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 2 7

CO CL866Contig1 706 4 15 U
AAAGTTTCAAAAAAAAAAAAAATAATAAAACTTTGATTAAAAATACCATCCCTATCGAGA
AAATTACAAATCAAAAATAAAACAAAACAACAAGCAACAACAGAAAAATACAGTTACAAT
CTTCTTCATCCCCTCCTCCTCCTCATCATCATCATCTTCCAACAGACTGAAAGCTTTTGT
TTCAAGTAAACCTCCTTCTCCTAGGCGGGCGAGAATCAGCACTGTCTACATCAGGAACCC
TCGACCCATTCTCATTCCTTCTCCTTGAAGAAAATGTGGAAAGAGTGACCATGGAATCAA
TCTCAACTGCAGTGTCCACTTGACTCTCAAAGTTTATAACAGCTGCAATGCTTGAAAAAG
AGTCTCTGTCATCAACCACAACAGGAGAATGATGGTTTAGCTCTTGGTGGTTGTGGTTCC
TCCCCAGCGGATGGGTTCTAAAATACGCATCCACAAGCCGCTCAGCAAAACTCAATGCAA
AAGTGAAATTCGAGATCCTCGCCACTCTGTGTGACTGTAACTGTCTCCTGATCAACAGAG
GATGGAATCTCGTGGTGGTTTCTCCTTCAAGATCAGGAGCAGCAATGTCTGGACTTAAAT
TAATATCCTCAGCTGCTGCTGCTGGTGCTGCAGAACTAGACTGGTTCTGCTCTGATCGAA
CTCCCCTAGAAGTCATCAACCGGTTAAGAATCGAGTTGGCTCTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK37JQ U 1
AF RR4CW82JQ U 1
AF RR4FY53JQ U 13
AF RR4FY55JQ U 13
BS 1 153 RR4BK37JQ
BS 154 154 RR4FY53JQ
BS 155 205 RR4BK37JQ
BS 206 206 RR4CW82JQ
BS 207 212 RR4BK37JQ
BS 213 213 RR4FY53JQ
BS 214 233 RR4CW82JQ
BS 234 235 RR4FY53JQ
BS 236 269 RR4CW82JQ
BS 270 270 RR4FY53JQ
BS 271 329 RR4CW82JQ
BS 330 330 RR4FY53JQ
BS 331 354 RR4CW82JQ
BS 355 611 RR4FY53JQ
BS 612 706 RR4FY55JQ

RD RR4BK37JQ 215 0 0
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AAATTACAAATCAAAAATAAAACAAAACAACAAGCAACAACAGAAAAATACAGTTACAAT
CTTCTTCATCCCCTCCTCCTCCTCATCATCATCTTCTTCCAACAGACTGAAAGCTTTTGT
TTCAAGTAAACCTCCTTCTCCTAGGGGGGCGA
GAA

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR4CW82JQ 354 0 0
AAAGTTTCAAAAAAAAAAAAAATAATAAAACTTTGATTAAAAATACCATCCCTATCGAGA
AAATTACAAATCAAAAATAAAACAAAACAACAAGCAACAACAGAAAAATACAGTTACAAT
CTTCTTCATCCCCTCCTCCTCCTCATCATCATCTTCTTCCAACAGACTGAAAGCTTTTGT
TTCAAGTAAACCTCCTTCTCCTAGGCGGGCGAAAATCAGCACTGTCTACATCAAAAACCC
TCGACCCATTCTCATTCCTTCTCCTTGAAAAAAATGTGGAAAGAGTGACCATGGAATCAA
TCTCAACTGCAGTGTCCACTTGACTCTCAGAGTTTATAACAGCTGCAATGCTTG

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR4FY53JQ 599 0 0
CGG
AAAAAAATAATAAAACTTTGATTAAAAATACCATCCCTATCGAGAAAATTACAAATCAAA
AATACAACAAACCAACAAGCAACAACAGAAAAATACAGTTACAATCTTCTTCATCCCCTC
CTCCTCCTCATCATCATCATCTTCCAACAGACTGAAAGCTTTTGTTTCAAGTAAACCTCC
TTCTCCTAGGCGGGCGAGAATCAGCACTGTCTACATCAGGAACCCTCGACCCATTCTCAT
TCCTTCTCCTTGAAGAAAATGTGGAAAGAGTGACCATGGAATCAATCTCAACTGCAGTGT
CCACTTGACTCTCAAAGTTTATAACAGCTGCAATGCTTGAAAAAGAGTCTCTGTCATCAA
CCACAACAGGAGAATGATGGTTTAGCTCTTGGTGGTTGTGGTTCCTCCCCAGCGGATGGG
TTCTAAAATACGCATCCACAAGCCGCTCAGCAAAACTCAATGCAAAAGTGAAATTCGAGA
TCCTCGCCACTCTGTGTGACTGTAACTGTCTCCTGATCAACAGAGGATGGAATCTCGTGG
TGGTTTCTCCTTCAAGATCAGGAGCAGCAATGTCTGGACTTAAATTAATATCCTCA

QA 4 599 4 599
DS 

RD RR4FY55JQ 694 0 0
CGG
AAAAAAATAATAAAACTTTGATTAAAAATACCATCCCTATCGAGAAAATTACAAATCAAA
AATACAACAAACCAACAAGCAACAACAGAAAAATACAGTTACAATCTTCTTCATCCCCTC
CTCCTCCTCATCATCATCATCTTCCAACAGACTGAAAGCTTTTGTTTCAAGTAAACCTCC
TTCTCCTAGGCGGGCGAGAATCAGCACTGTCTACATCAGGAACCCTCGACCCATTCTCAT
TCCTTCTCCTTGAAGAAGATGTGGAAAGAGTGACCATGGAATCAATCTCAACTGCAGTGT
CCACTTGACTCTCAAAGTTTATAACAGCTGCAATGCTTGAAAAAGAGTCTCTGTCATCAA
CCACAACAGGAGAATGATGGTTTAGCTCTTGGTGGTTGTGGTTCCTCCCCAGCGGATGGG
TTCTAAAATACGCATCCACAAGCCGCTCAGCAAAACTCAATGCAAAAGTGAAATTCGAGA
TCCTCGCCACTCTGTGTGACTGTAACTGTCTCCTGATCAACAGAGGATGGAATCTCGTGG
TGGTTTCTCCTTCAAGATCAGGAGCAGCAATGTCTGGACTTAGATTAATATCCTCAGCTG
CTGCTGCTGGTGCTGCAGAACTAGACTGGTTCTGCTCTGATCGAACTCCCCTAGAAGTCA
TCAACCGGTTAAGAATCGAGTTGGCTCTATC

QA 4 694 4 694
DS 



CO CL866Contig2 1124 3 5 U
GGGTCAGCTAAAGCTTCAAAGCTTGTTCTTCTAAGCTGAATTGATCAACCCATGGCCTTA
TGAAGTTCACCTTCCCTAATCCCCAGCTCCAGGTCTCCTTCATTCTTCTCTTCCCAGCTC
CTTGTGAATAATAAAGTTCCCCACCGGGGTAGAGACTTTGTCTACCACAAGTGAAAGAAA
GAGCCTTTAGTTGTTTGTTTTATTGATGGGTGGGGAGTTGGCTGACACGATGAACCTGGA
TTTGAACCTAGGCCCTGGTCCCGAGTCAGATCTCCAGCTTCTGTCTAACGAAACTGTCAA
CTTGGCTGATTGGACTAGTATCACCCCATCTCAGAGATCATCCTCTGAAGCTATTGTGAC
CAGGATCAGAACCCGCCATAGGACGCGGTTCCGACAGCTTAACCTCCCCATCCCTGTTCT
CTCTGAAACCCATGCCATGGATATAGAGCTTAACCAGTTGATGGGAACTGGAGCTGCTGC
TTTGCAGACTGGGGAAGGTAGCGAAAGAGGCAATGAGGATCTAAAAATGTGTGAGAGCGG
AGGGGAAGCTATTGGAGACGGAGAGAAGAAAGGGGATGTTGAGAAAAGCAGTGGCGGCGA
TGGTAACTTTTTCGATTGTAATATATGTTTGGATTTGTCAAAGGAGCCGGTTCTCACCTG
TTGTGGCCATCTCTACTGTTGGCCTTGTCTGTTCCAATGGTTACATATCTCTGACGCCAA
GGAATGTCCTGTTTGCAAAGGAGAGGTGACTGCTAAAACCGTGACGCCGATATACGGGCG
TGGGAACCATAAGAGAGAAGTCGAGGAGAGTTTAGATACCAAGATTCCTATGAGACCGCA
TGCTAAACGCATCGAGAGTTTGAGGAATACGATTCAAAGGTCTCCTTTTACTATACCGAT
GGAGGAGATGATTAGACGTATACAGAGTAGGTTTGAGAGGGACTCAACCCCTGTCCCTGA
TTTTAGCAACCGAGAGGCTTCAGAAAGAGTGAACGATAGAGCCAACTCGATTCTTAACCG
GTTGATGACTTCTAGGGGAGTTCGATCAGAGCAGACCAGTCTAGTTCTGCAGCACAGCAG
CAGCAGCTGAGATATAATCTAAGTCAGACATGCTGCTCTGATCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW82TF U 1
AF RR4BK37TF U 5
AF RR4FY55TF U 395
BS 1 639 RR4CW82TF
BS 640 721 RR4BK37TF
BS 722 722 RR4FY55TF
BS 723 753 RR4BK37TF
BS 754 1124 RR4FY55TF

RD RR4CW82TF 639 0 0
GGGTCAGCTAAAGCTTCAAAGCTTGTTCTTCTAAGCTGAATTGATCAACCCATGGCCTTA
TGAAGTTCACCTTCCCTAATCCCCAGCTCCAGGTCTCCTTCATTCTTCTCTTCCCAGCTC
CTTGTGAATAATAAAGTTCCCCACCGGGGTAGAGACTTTGTCTACCACAAGTGAAAGAAA
GAGCCTTTAGTTGTTTGTTTTATTGATGGGTGGGGAGTTGGCTGACACGATGAACCTGGA
TTTGAACCTAGGCCCTGGTCCCGAGTCAGATCTCCAGCTTCTGTCTAACGAAACTGTCAA
CTTGGCTGATTGGACTAGTATCACCCCATCTCAGAGATCATCCTCTGAAGCTATTGTGAC
CAGGATCAGAACCCGCCATAGGACGCGGTTCCGACAGCTTAACCTCCCCATCCCTGTTCT
CTCTGAAACCCATGCCATGGATATAGAGCTTAACCAGTTGATGGGAACTGGAGCTGCTGC
TTTGCAGACTGGGGAAGGTAGCGAAAGAGGCAATGAGGATCTAAAAATGTGTGAGAGCGG
AGGGGAAGCTATTGGAGACGGAGAGAAGAAAGGGGATGTTGAGAAAAGCAGTGGCGGCGA
TGGTAACTTTTTCGATTGTAATATATGTTTGGATTTGTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4BK37TF 749 0 0
CAGCTAAAGCTTCAAAGCTTGTTCTTCTAAGCTGAATTGATCAACCCATGGCCTTATGAA
GTTCACCTTCCCTAATCCCCAGCTCCAGGTCTCCTTCATTCTTCTCTTCCCAGCTCCTTG
TGAATAATAAAGTTCCCCACCGGGGTAGAGACTTTGTCTACCACAAGTGAAAGAAAGAGC
CTTTAGTTGTTTGTTTTATTGATGGGTGGGGAGTTGGCTGACACGATGAACCTGGATTTG
AACCTAGGCCCTGGTCCCGAGTCAGATCTCCAGCTTCTGTCTAACGAAACTGTCAACTTG
GCTGATTGGACTAGTATCACCCCATCTCAGAGATCATCCTCTGAAGCTATTGTGACCAGG
ATCAGAACCCGCCATAGGACGCGGTTCCGACAGCTTAACCTCCCCATCCCTGTTCTCTCT
GAAACCCATGCCATGGATATAGAGCTTAACCAGTTGATGGGAACTGGAGCTGCTGCTTTG
CAGACTGGGGAAGGTAGCGAAAGAGGCAATGAGGATCTAAAAATGTGTGAGAGCGGAGGG
GAAGCTATTGGAGACGGAGAGAAGAAAGGGGATGTTGAGAAAAGCAGTGGCGGCGATGGT
AACTTTTTCGATTGTAATATATGTTTGGATTTGTCAAAGGAGCCGGTTCTCACCTGTTGT
GGCCATCTCTACTGTTGGCCTTGTCTGTTCCAATGGTTACATATCTCTGACGCCAAG*AA
TGTCCTGTTTGCAAAGGAGAGGTGACTGC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4FY55TF 730 0 0
G
AGCTTAACCTCCCCATCCCTGTTCTCTCTGAAACCCATGCCATGGATATAGAGCTTAACC
AGTTGATGGGAACTGGAGCTGCTGCTTTGCAGACTGGGGAAGGTAGTGAAAGAGGCAATG
AGGATCTAAAAATGTGTGAGAGCGGAGGGGAAGCTATTGGAGACGGAGAGAAGAAAGGGG
ATGTTGAGAAAAGCAGTGGCG***ATGGTAACTTTTTCGATTGTAATATATGTTTGGATT
TGTCAAAGGAGCCGGTTCTCACCTGTTGTGGCCATCTCTACTGTTGGCCTTGTCTGTTCC
AATGGTTACATATCTCTGACGCCAAGGAATGTCCTGTTTGCAAAGGAGAGGTGACTGCTA
AAACCGTGACGCCGATATACGGGCGTGGGAACCATAAGAGAGAAGTCGAGGAGAGTTTAG
ATACCAAGATTCCTATGAGACCGCATGCTAAACGCATCGAGAGTTTGAGGAATACGATTC
AAAGGTCTCCTTTTACTATACCGATGGAGGAGATGATTAGACGTATACAGAGTAGGTTTG
AGAGGGACTCAACCCCTGTCCCTGATTTTAGCAACCGAGAGGCTTCAGAAAGAGTGAACG
ATAGAGCCAACTCGATTCTTAACCGGTTGATGACTTCTAGGGGAGTTCGATCAGAGCAGA
CCAGTCTAGTTCTGCAGCACAGCAGCAGCAGCTGAGATATAATCTAAGTCAGACATGCTG
CTCTGATCT

QA 2 730 2 730
DS 



AS 1 8

CO CL867Contig1 845 8 16 U
GCAAGGCACTTAGAGAGAAGGGACTTGAGGGAGAAGATCCAAGAGATTATCTAACATTCT
TCTGTCTCGGTAACCGAGAGGTCAAGAAAGATGGAGAGTATGTGCCTACAGAGAAACCTG
AACCGGACTCAGACTATATGCGAGCACAAGAAGCACGCCGCTTCATGATCTATGTTCACA
CTAAAATGATGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGA
GATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATC
TCTCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATG
AACATTTAGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGA
AAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATG
ATCTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAGACATCACTG
AGCTTCCTGGATGCGAATGCTTCCCGGACACGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTG
ATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAAT
AACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTAT
AATATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCACTCTTAAGG
TTTTTGGAGAGAATGTAGTCTTGTGCCATTTGGTACTTAATTATTTTGATGCTAATTTCT
TATGG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 
50 50 45 25 15 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 

AF RR4BT47JQ C 1
AF RR4BT47TF U 1
AF RR4BU31JQ C 1
AF RR4BU31TF U 1
AF RR4EI87TF U 70
AF RR4EI87JQ C 123
AF RR4AO40JQ C 171
AF RR4AO40TF U 171
BS 1 569 RR4BT47TF
BS 570 570 RR4EI87TF
BS 571 721 RR4BT47TF
BS 722 722 RR4EI87TF
BS 723 762 RR4BT47TF
BS 763 763 RR4EI87TF
BS 764 766 RR4BT47TF
BS 767 767 RR4EI87TF
BS 768 779 RR4BT47TF
BS 780 780 RR4AO40TF
BS 781 784 RR4BT47TF
BS 785 785 RR4AO40TF
BS 786 793 RR4BT47TF
BS 794 830 RR4EI87TF
BS 831 841 RR4AO40TF
BS 842 845 RR4AO40JQ

RD RR4BT47JQ 782 0 0
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TCTGTCTCGGTAACCGAGAGGTCAAGAAAGATGGAGAGTATGTGCCTACAGAGAAACCTG
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CTAAAATGATGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGA
GATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATC
TCTCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATG
AACATTTAGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGA
AAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATG
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AGCTTCCTGGATGCGAATGCTTCCCGGACGCGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTG
ATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAAT
AACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTAT
AATATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCACTCTTAAGG
TT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4BT47TF 794 0 0
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TCTGTCTCGGTAACCGAGAGGTCAAGAAAGATGGAGAGTATGTGCCTACAGAGAAACCTG
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CTAAAATGATGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGA
GATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATC
TCTCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATG
AACATTTAGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGA
AAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATG
ATCTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAGACATCACTG
AGCTTCCTGGATGCGAATGCTTCCCGGACGCGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTG
ATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAAT
AACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTAT
A*TATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTT*CGT*CGCACTCTTAAGT
TTTT*GGAGAGAA
A

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4BU31JQ 791 0 0
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TCTGTCTCGGTAACCGAGAGGTCAAGAAAGATGGAGAGTATGTGCCTACAGAGAAACCTG
AACCGGACTCAGACTATATGCGAGCACAAGAAGCACGCCGCTTCATGATCTATGTTCACA
CTAAAATGATGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGA
GATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATC
TCTCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATG
AACATTTAGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGA
AAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATG
ATCTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAGACATCACTG
AGCTTCCTGGATGCGAATGCTTCCCGGACGCGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTG
ATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAAT
AACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTAT
AATATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCACTCTTAAGG
TTTTTGGAGAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4BU31TF 789 0 0
GCAAGGCACTTAGAGAGAAGGGACTTGAGGGAGAAGATCCAAGAGATTATCTAACATTCT
TCTGTCTCGGTAACCGAGAGGTCAAGAAAGATGGAGAGTATGTGCCTACAGAGAAACCTG
AACCGGACTCAGACTATATGCGAGCACAAGAAGCACGCCGCTTCATGATCTATGTTCACA
CTAAAATGATGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGA
GATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATC
TCTCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATG
AACATTTAGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGA
AAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATG
ATCTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAGACATCACTG
AGCTTCCTGGATGCGAATGCTTCCCGGACGCGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTG
ATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAAT
AACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTAT
A*TATCGTTTGGTGTGATGTTTCAC*ACTATGCTTTTGATTT*CGT*CGCACTCTTAAGT
TTT
GGAGAG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4EI87TF 761 0 0
GTAACCGAGAGGTCAAGAAAGATGGAGAGTATGTGCCTACAGAGAAACCTGAACCGGACT
CAGACTATATGCGAGCACAAGAAGCACGCCGCTTCATGATCTATGTTCACACTAAAATGA
TGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGAGATCAATGG
ATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATCTCTCAATAA
GACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATGAACATTTAG
GAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGAAAGTTAACC
GTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATGATCTTCCTG
GCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAGACATCACTGAGCTTCCTG
GATGCGAATGCTTCCCGGACACGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTGATTACCTGC
CTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAATAACTTTCTC
TCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTATAATATCGTT
TGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCACTCTTAAGTTTT**GGAG
AGAATGTAGTCTTGTGCCATTTGGTACTTAATTATTTTGAT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EI87JQ 719 0 0
CCGGACTCAGACTATATGCGAGCACAAGAAGCACGCCGCTTCATGATCTATGTTCACACT
AAAATGATGATCGTTGATGATGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATATCAACCAGAGA
TCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAACCGTATCATCTC
TCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCATTATGGTATGAA
CATTTAGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAATGTGTCCAGAAA
GTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCACTCGAACATGAT
CTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAGACATCACTGAG
CTTCCTGGATGCGAATGCTTCCCGGACACGAAAGCTCGTATCCTCGGTACTAAATCTGAT
TACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTAAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAGGTACTAAATAA
CTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCATTAGCTTATAA
TATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCACTCTTAAGGTT
TTTGGAGAGAATGTAGTCTTGTGCCATTTGGTACTTAATTATTTTGATGCTAATTTCTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4AO40JQ 675 0 0
G
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TCAACCAGAGATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAAC
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TATGGTATGAACATT*AGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAAT
GTGTCCAGAAAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCAC
TCGAACATGATCTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAG
ACATCACTGAGCTTCCTGGATGCTAATGCTTCCCGGACACGAAAGCTCGTATCCTCGGTA
CTAAATCTGATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTGAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAG
GTACTAAATAACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCA
TTAGCTTATAATATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCA
CTCTTAAGGTTTTTGGAGAGAATGTAGTCTTGTGCCATTTGGTACTTAATTATTTTGATG
CTAATTTCTTATGG

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR4AO40TF 675 0 0
G
ATGTTCACACTAAAATGATGATCGTTGATGAGGAGTACATTATTATTGGATCCGCAAATA
TCAACCAGAGATCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCCATGGGAGGCTATCAAC
CGTATCATCTCTCAATAAGACAACCAGCTCGAGGTCATATCCATGGATTCCGCATGTCAT
TATGGTATGAACATT*AGGAATGCTTGATGAAACTTTCCTTGATCCATCGAGCCAAGAAT
GTGTCCAGAAAGTTAACCGTATTGCTGATAAGTATTGGGATCTTTACTCAAGTGAGTCAC
TCGAACATGATCTTCCTGGCCATCTACTTCGCTACCCGATTGGTATTGCTAGTCAAGGAG
ACATCACTGAGCTTCCTGGATGCTAATGCTTCCCGGACACGAAAGCTCGTATCCTCGGTA
CTAAATCTGATTACCTGCCTCCAATTCTTACAACCTGAGGCTCTGTGGCAGAATCTATAG
GTACTAAATAACTTTCTCTCGTCTTTTCTTCTGCTGATAATAGCTTTATTAATAAAACCA
TTAGCTTATAATATCGTTTGGTGTGATGTTTCACCACTATGCTTTTGATTTTCGTTCGCA
CTCTTAAGGTTTTTGGAGAGAATGTAGTCTTGTGCCATTTGGTACTTAATTATTTTGATG
CTAATTTCTT
ATGG

QA 2 671 2 671
DS 



AS 1 8

CO CL868Contig1 431 8 3 U
GGGTCTGAGACAGAAGGAAAGAGAGGACGAACCCTAATCCCAATCATGCCACCGAATCTG
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CTGTTCACATGTGCAGGGCTTGGATATGGCTGTTACACCACTTGGCAACTCATTCAACTC
TATGAATATCGCCGCACGCTGTGGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCT
TCGCAAACCAAAAACTAAAAATACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGAT
GATGCTCTTCTTGCTTTTGAAAAATTAAAAAGAAGGTTAAATTAATGTATGGTTTGCAAT
TGCTTAGTTAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CA04JQ C 1
AF RR4CA53JQ C 1
AF RR4CA04TF U 1
AF RR4CA53TF U 1
AF RR4E574JQ C 22
AF RR4DB37TF U 22
AF RR4BQ19TF U 20
AF RR4E574TF U 95
BS 1 390 RR4CA04TF
BS 391 429 RR4BQ19TF
BS 430 431 RR4E574TF

RD RR4CA04JQ 390 0 0
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AGAACCCTAGTTGCCAAGTGCCATGGAGGGATGGACTCTCTCCTCAGATTCTCTTCAAGC
ACTGCTTCGAACGCTCCTGAGATTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAAT
CTGTTCACATGTGCAGGGCTTGGATATGGCTGTTACACCACTTGGCAACTCATTCAACTC
TATGAATATCGCCGCACGCTGTGGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCT
TCGCAAACCAAAAACTAAAAATACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGAT
GATGCTCTTCTTGCTTTTGAAAAATTAAAA

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4CA53JQ 390 0 0
GGGTCTGAGACAGAAGGAAAGAGAGGACGAACCCTAATCCCAATCATGCCACCGAATCTG
AGAACCCTAGTTGCCAAGTGCCATGGAGGGATGGACTCTCTCCTCAGATTCTCTTCAAGC
ACTGCTTCGAACGCTCCTGAGATTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAAT
CTGTTCACATGTGCAGGGCTTGGATATGGCTGTTACACCACTTGGCAACTCATTCAACTC
TATGAATATCGCCGCACGCTGTGGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCT
TCGCAAACCAAAAACTAAAAATACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGAT
GATGCTCTTCTTGCTTTTGAAAAATTAAAA

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4CA04TF 390 0 0
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AGAACCCTAGTTGCCAAGTGCCATGGAGGGATGGACTCTCTCCTCAGATTCTCTTCAAGC
ACTGCTTCGAACGCTCCTGAGATTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAAT
CTGTTCACATGTGCAGGGCTTGGATATGGCTGTTACACCACTTGGCAACTCATTCAACTC
TATGAATATCGCCGCACGCTGTGGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCT
TCGCAAACCAAAAACTAAAAATACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGAT
GATGCTCTTCTTGCTTTTGAAAAATTAAAA

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4CA53TF 390 0 0
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ACTGCTTCGAACGCTCCTGAGATTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAAT
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TCGCAAACCAAAAACTAAAAATACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGAT
GATGCTCTTCTTGCTTTTGAAAAATTAAAA

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4E574JQ 350 0 0
G
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TTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAATCTGTTCACATGTGCAGGGCTTG
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GGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCTTCGCAAACCAAAAACTAAAAAT
ACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGATGATGCTTTTCT

QA 2 350 2 350
DS 

RD RR4DB37TF 369 0 0
G
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GTGGAGGGATGGACTCTCTCCTCAGATTCTCTTCAAGCACTGCTTCGAACGCTCCTGAGA
TTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAATCTGTTCACATGTTCAGGGCTTG
GATATGGCTGTTACTCCACTTGGCAACTCATTCAACTCTATGAATATCGCCGCACGCTGT
GGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCTTCGCAAACCAAAAACTAAAAAT
ACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGATGATGCTCTTCTTGCTTTTGAAA
AATTAAAA

QA 2 369 2 369
DS 

RD RR4BQ19TF 410 0 0
G
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GATTAAGACTTTGCTGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAATCTGTTCACATGTGCAGGGCT
TGGATATGGCTGTTACACCACTTGGCAACTCATTCAACTCTATGAATATCGCCGCACGCT
GTGGAGAAATATGGTAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCTTCGCAAACCAAAAACTAAAA
ATACTAATTTCTCTAGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGATGATGCTCTTCTTGCTTTTGA
AAAATTAAAAAGAAGGTTAAATTAATGTATGGTTTGCAATTGCTTAGTT

QA 2 410 2 410
DS 

RD RR4E574TF 337 0 0
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TGTTGGCTGAGATTACGAACCCTAATCTGTTCACATGTGCAGGGCTTGGATATGGCTGTT
ACACCACTTGGCAACTCATCCAACTCTATGAATATCGCCGCACGCTGTGGAGAAATATGG
TAGAGGAAGTCCTGGATGCTTGGTCTTCGCAAACCAAAAACTAAAAATACTAATTTCTCT
AGTTTCATGTTAATCTCTGTAGTGATGATGCTCTTCTTGCTTTTGAAAAATTAAAAAGAA
GGTTAAATTAATGTATGGTTTGCAATTGCTTAGTTAG

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 8

CO CL869Contig1 520 8 6 U
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ATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAAAT
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TTTTGTTTAAAACCTATATTTTCATATAATAATAAGATAATCCAGGGGCTATTATTGTAA
TGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT


BQ
30 30 30 30 30 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR4AR51JQ C 6
AF RR4FK88JQ C 1
AF RR4DK30TF U 5
AF RR4GW41JQ C 1
AF RR4GW41TF U 1
AF RR4FK88TF U 1
AF RR4AR51TF U 6
AF RR4CS83TF U 8
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G
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GCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGCGGCAGAAGAGGAGAAGACTGTTGAAGTA
AAGACAGCCTAAGAT

QA 2 376 2 376
DS 

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QA 1 520 1 520
DS 

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GG
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QA 3 481 3 481
DS 

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CC

QA 1 518 1 518
DS 

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CC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4FK88TF 520 0 0
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ATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAAAT
ACAGAAGAGAAGACGACGACCGAAGCAACGACTATTGAGACGCCTAAGGAAACCATCCAT
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GTAGAGAAAGAGGCTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGTCGAA
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QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4AR51TF 515 0 0
G
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GACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCAAAGGTAGAG
AAAGAGGCTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGTCGAAACTCCG
GCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGCGGCAGAAGAGGAGAAGACTGTTGAAGTA
AAGACAGCCTAAGATGCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAGAACATTTCTGTTTTGTTTTGT
TTAAAACCTATATTTTCATATAATAATAAGATAATCCAGGGGCTATTATTGTAATGTTTA
TTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT

QA 2 515 2 515
DS 

RD RR4CS83TF 513 0 0
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TAAAACCTATATTTTCATATAATAATAAGATAATCCAGGGGCTATTATTGTAATGTTTAT
TTAATATGTAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 7

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GACTAGCTCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTT
TCTTAACCGAGTTCCCGATCGTGTGAAGATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATGA
CCTCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAGGGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCA
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GATTACAGATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCT
CAAACAGAATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATCAAGCCTTTGGCGTTGT
AAGGAGTCGAGCAAGCAACCATCTGGATCCCAGGAATGGACTGGAAGTAAGACTCTAGCC
TCTGTGAATGCTCAGCGCCAAGCTGGCGTCCCACTCCACCGGGACCACGGAAGACAACCG
GGATAGTGAACTGGCCACCAGATGTGTAGTGAAGCATTCCACAGTTGTTGGAGATTTGGT
TGAAGGCCAGGAGGAGGAAACCCATGTTCATACCTTCGATGACGGGTCTTAGACCAGTCA
TGGCGACTCCAATGCCCATACCAGTGAATGCATTTTCACAAATAGGAGTGTCGAGAACCC
TGAGGTCGCCGAACTTATCAGCAAGGCCTTTGGTAACTTTGTAGGAGCCACCGTAATGGC
CCACGTCTTCACCCATAACACATACATGTGGATCTCTGTCCATCTCTTCTTCAAGACCTT
CCTGAAGAGCCTCGAAAAGCAGTAGTTCATGTCCAGTGCCAGTGGTCGCGGATGTCTCCG
CCTTCGTCGCAACAGCAGCATTCGCAATCAGTTTCTGAGAGTGACGAACTCTGAGGAGGC
TCTTCTTACTCCCATCAGATCCAGCAGCAGCAGACACAATGCATCTCTTGCTGCTCCTCG
CTGGGAGATTGGTGCAAGAAGGAGGGGCAACGAGTTTCTTCCGATTAAACGTCGACAAGG
CCGTAGCAGCTCCAGCTCCTCCATGGATTCTCGCTGCCATTTCTTTTTCTTTCCAAGGGA
GGGAGAGAGTGACGAAGCGGAGAAATCGAAGGGAGACTGTGAAATCGATTTCTTCTGTTA
AAACTTATAAAAATAAATAAATTTTGTTTGTGCGATCAAATCCACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM53JQ U 5
AF RR4C604JQ U 1
AF RR4GG91JQ U 248
AF RR4CW87JQ U 29
AF RR4AP17JQ U 6
AF RR4CW87TF C 432
AF RR4AP17TF C 755
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BS 774 884 RR4AP17JQ
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TTG
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TCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTTTCTTAAC
CGAGTTCCCGATCGTGTGAAGATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATGACCTCAGG
GTCATACCCTTTGTTCACCAGGGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCATCCGCGA
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GATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTC

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DS 

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TTCTTGCGAACTAAGCTAAAGAGAAAGTAAATGGAGAGGTAAATGGTAAACAATGGCTCA
CCGGATAAAATAACGATTTTCACTGGCAAAGCTGCTCAACGGCAGTCACGATCTGAGCCG
GTTGAACAACGGTCCACTCCTCCAGCGTACCAGCGTACGGTGTAGGAACGTCCTGAGAAG
ACAAACACATCACCGGAGCATCTAAATAGTCATGAAAGTTCTCATTAATTGCAGCAGTAA
GACTAGCTCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTT
TCTTAACCGAGTTCCCGATCGTGTGAAGATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATGA
CCTCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAGGGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCA
TCCGCGAGTAAGTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAA
GATTACAGATGTAATCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTCGTAAAGCAGAACGTGCT
CAAACAGAATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATCAAGCCTTTGGC
ATTG

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DS 

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CATCACCGGAGCATCTAAATAGTCATGAAAGTTCTCATTAATTGCAGCAGTAAGACTAGC
TCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTTTCTTAAC
CGAGTTCCCGATCGTGTGAAGATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATGACCTCAGG
GTCATACCCTTTGTTCACCAGGGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCATCCGCGA
GTAAGTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAAGATTACA
GATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCTCAAACAG
AATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCGTCAA

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DS 

RD RR4CW87JQ 759 0 0
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AAGCTGCTCAACGGCAGTCACGATCTGAGCCGGTTGAACAACGGTCCACTCCTCCAGCGT
ACCAGCGTACGGTGTAGGAACGTCCTGAGAAGACAAACACATCACCGGAGCATCTAAATA
GTCATGAAAGTTCTCATTAATTGCAGCAGTAAGACTAGCTCCAATCCCACCGGTTCTCAT
ACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTTTCTTAACCGAGTTCCCGATCGTGTGAAG
ATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATGACCTCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAG
GGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCATCCGCGAGTAAGTGAGGATGGTGATGTG
CTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAAGATTACAGATGTACTCTTCGTCCGGGAT
TTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCTCAAACAGAATCACAGGGTTCTCGCTCCT
GATCGCAGCTTTCATCAAGCCTTTGGCGTTGTAAGGAGTCGAGCAAGCAACCATCTGGAT
CCCAGGAATGGACTGGAAGTAAGACTCTAGCC
GCTGCGA

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DS 

RD RR4AP17JQ 879 0 0
AA
AAAATAAAAATGTGAGAGATTGGATTAACAAACGAAGCAGTATGAGTTTCAAAACCATAT
TCCAAAACACAAGAAAAGAGACAACAAAACGTTAAGAAAAACAAACAGACAAGTTCTTGC
GAACTAAGCTAAAGAGAAAGTAAATGGAGAGGTAAATGGTAAACAATGGCTCACCGGATA
AAATAACGATTTTCACTGGCAAAGCTGCTCAACGGCAGTCACGATCTGAGCCGGTTGAAC
AACGGTCCACTCCTCCAGCGTACCAGCGTACGGTGTAGGAACGTCCTGAGAAGACAAACA
CATCACCGGAGCATCTAAATAGTCATGAAAGTTCTCATTAATTGCAGCAGTAAGACTAGC
TCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTTTCTTAAC
CGAGTTCCCGATCGTGTGAAGATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATGACCTCAGG
GTCATACCCTTTGTTCACCAGGGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCATCCGCGA
GTAAGTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAAGATTA*A
GATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCTCAAACAG
AATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATCAAGCCTTTGGCATTGTAAGGAGT
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ATGCTCAGCGCCAAGCTGGCGTCCCACTCCACCGGGACCACGGAAGACAACCGGGATAGT
GAACTGGCCACCAGATGTGTAGTGAAGCATTCCACAG

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DS 

RD RR4CW87TF 753 0 0
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TACC*TTTGTTCACCAGGGTTTTAGCTGCGTGCATCACATGGTACCTCATCCGCGAGTAA
GTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAAGATTACAGATG
TACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCTCAAACAGAATC
ACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATCAAGCCTTTGGCGTTGTAAGGAGTCGAG
CAAGCAACCATCTGGATCCCAGGAATGGACTGGAAGTAAGACTCTAGCCGCTGCGAATGC
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AGGAGGAAACCCATGTTCATACCTTCGATGACGGGTCTTAGACCAGTCATGGCGGCTCCA
ATGCCCATACCAGTGAATGCATTTTCACAAATAGGAGTGTCGAGAACCCTGAGGTCGCCG
AATTTGTCAGCAAGGCCTTTGGTAACTTTGTAGGAGCCACCGTAATGGCCCACGTCTTCA
CCCATAACACATACATGTGGATCTCTGTCCATCTCTTCTTCCAGACCTTCCTGAAGAGCC
TCGAAAAGCAGTAGTTCATGTCCAGTGCCAGT
C

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4AP17TF 795 0 0
AATG
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CCGGGACCACGGAAGACAACCGGGATAGTGAACTGGCCACCAGATGTGTAGTGAAGCATT
CCACAGTTGTTGGAGATTTGGTTGAAGGCCAGGAGGAGGAAACCCATGTTCATACCTTCG
ATGACGGGTCTTAGACCAGTCATGGCGACTCCAATGCCCATACCAGTGAATGCATTTTCA
CAAATAGGAGTGTCGAGAACCCTGAGGTCGCCGAACTTATCAGCAAGGCCTTTGGTAACT
TTGTAGGAGCCACCGTAGTGGCCCACGTCTTCACCCATAACACATACATGTGGATCTCTG
TCCATCTCTTCTTCAAGACCTTCCTGAAGAGCCTCGAAAAGCAGTAGTTCATGTCCAGTG
CCAGTGGTCGCGGATGTCTCCGCCTTCGTCGCAACAGCAGCATTCGCAATCAGTTTCTGA
GAGTGACGAACTCTGAGGAGGCTCTTCTTACTCCCATCAGATCCAGCAGCAGCAGACACA
ATGCATCTCTTGCTGCTCCTCGCTGGGAGATTGGTGCAAGAAGGAGGGGCAACGAGTTTC
TTCCGATTAAACGTCGACAAGGCCGTAGCAGCTCCAGCTCCTCCATGGATTCTCGCTGCC
ATTTCTTTTTCTTTCCAAGGGAGGGAGAGAGTGACGAAGCGGAGAAATCGAAGGGAGACT
GTGAAATCGATTTCTTCTGTTAAAACTTATAAAAATAAATAAATTTTGTTTGTGCGATCA
AATCCACATCC

QA 5 795 5 795
DS 



AS 1 5

CO CL871Contig1 1225 5 20 U
GGAAACATTAAGATATTTAATTGAGGAAGAAAAGGAGAAAATAATCTCCCGGGGTTTGAC
GAGATCTACCGTCAGGATCCGAGATTCGTTACACTCTCCGGCGGCGACAATGAGCTCTCC
GGGAATAGCGAGTATGTTCACCAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGACTTGCTCTTGTGCT
TGTGGTGGGACACCTCTTGGTTCAGTTCGTTCCCGCCACCGTCCCTTACCTCGCTCTCAT
TCCCGCCAGGACTATTCCTTTTGGCTGGAATCTGATTACAAGCGGCTACTTTGAACTCTC
TGTATATGGGGTTGTCATCAGCACGGTCTCTCTCCTCTTTATGGGGAAGTTCCTTGAGCC
TGTGTGGGGTTCTAAGGAGTTTCTTAAGTTCATCTTCGTCGTGAACTTCCTTACCTACCT
CTGTGTTTTCGTTACAGACATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAATCTACCTATA
TATGCCCTTTGCAGGTTTTCATGGTGTCGTGGCAGGCCTTCTTGTCGGGATAAAGCAGAT
TATACCTGACCAGGAGGTATTGCTCGTTAAGATCAAAGCAAAGTGGATGCCCTCTATTAC
GCTAGTTCTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTCAATTCAGCAGTGTATCTCCCCAC
TTTGATATTTGGTACATATATGGGATGGTTATACCTCAGATACTTACAGAGGAGGCCAGA
AACTAAGCTAAGAGGTGATCCGAGTGATGACTTTGCATTCTCTACTTTCTTTCCTGAACT
TCTCAGACCGTTAATTGACCCTATAGCCTCAATCTTTCATCGGATGCTTTGTGGACGATC
AAATCCCACCAGCGAGGACCATGGTTATTCTACCAGCGGTGCTCCTTTACCGGGTTCTGA
CTCTGCTGAAGCTTCTAGGAGGAGAGAAAGAGGAGCAAGGGCTCTAGAGGAGAGACTTGC
AACGGAAAGGGGGGTTCCTCCAAGGAACAAAGAAGAATCACAGAGTGATGCTTTGGATAG
CGTTTAAGTGGAGACTGCAAACTAGCGATGTGTGGGGGGGTTCTTACTTGGTTCAGGGGG
GCAGTGTTTTTTTTTCTAAATGAAAATTGGCTTTATATCAATCAGCTTCTCCGTAAATTA
CCTATGACTGCTCTGAAAATAGTGCTTCCCTTGGACAGACAAACAAGTTTACTTGGACTA
GAGTATATAAAGTTATACCTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 0 15 15 15 
0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV01TF U 1
AF RR4A166TFB U 49
AF RR4A166TF U 179
AF RR4A166JQD C 878
AF RR4BV01JQ C 527
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BS 207 408 RR4BV01TF
BS 409 409 RR4A166TFB
BS 410 437 RR4BV01TF
BS 438 438 RR4A166TFB
BS 439 708 RR4BV01TF
BS 709 828 RR4A166TFB
BS 829 865 RR4A166TF
BS 866 866 RR4BV01JQ
BS 867 869 RR4A166TF
BS 870 870 RR4BV01JQ
BS 871 896 RR4A166TF
BS 897 971 RR4BV01JQ
BS 972 972 RR4A166JQD
BS 973 1054 RR4BV01JQ
BS 1055 1055 RR4A166JQD
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BS 1079 1225 RR4BV01JQ

RD RR4BV01TF 708 0 0
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GAGATCTACCGTCAGGATCCGAGATTCGTTACACTCTCCGGCGGCGACAATGAGCTCTCC
GGGAATAGCGAGTATGTTCACCAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGACTTGCTCTTGTGCT
TGTGGTGGGACACCTCTTGGTTCAGCTCGTTCCCGCCACCGTCCCTTACCTCGCTCTCAT
TCCCGCCAGGACTATTCCTTTTGGCTGGAATCTGATTACAAGCGGCTACTTTGAACTCTC
TGTATATGGGGTTGTCATCAGCACGGTCTCTCTCCTCTTTATGGGGAAGTTCCTTGAGCC
TGTGTGGGGTTCTAAGGAGTTTCTTAAGTTCATCTTCGTCGTGAACTTTCTTACCTACCT
CTGTGTTTTCGTTACAGCCATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAATCTACCTATA
TATGCCCTTTGCAGGTTTTCATGGTGTCGTGGCAGGCCTTCTTGTCGGGATAAAGCAGAT
TATACCTGACCAGGAGGTATTGCTCGTTAAGATCAAAGCAAAGTGGATGCCCTCTATTAC
GCTAGTTCTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTCAATTCAGCAGTGTATCTCCCCAC
TTTGATATTTGGTACATATATGGGATGGTTATACCTCAGATACTTACA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4A166TFB 780 0 0
GG
GGGGTTTGACGAGATCTACCGTCAGGATCTGAGATTCGTTACACTCTCCGGCGGCGACAA
TGAGCTCTCCGGGAATAGCGAGTATGTTCACCAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGACTTG
CTCTTGTGCTTGTGGTGGGACACCTCTTGGTTCAGTTCGTTCCCGCCACCGTCCCTTACC
TCGCTCTCATTCCCGCCAGGACTATTCCTTTTGGCTGGAATCTGATTACAAGCGGCTACT
TTGAACTCTCTGTATATGGGGTTGTCATCAGCACGGTCTCTCTCCTCTTTATGGGGAAGT
TCCTTGAGCCTGTGTGGGGTTCTAAGGAGTTTCTTAAGTTCATCTTCGTCGTGAACTTCC
TTACCTACCTCTGTGTTTTCGTTACAGACATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAA
TCTACCTATATATGCCCTTTGCAGGTTTTCATGGTGTCGTGGCAGGCCTTCTTGTCGGGA
TAAAGCAGATTATACCTGACCAGGAGGTATTGCTCGTTAAGATCAAAGCAAAGTGGTTGC
CCTCTATTACGCTAGTTCTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTCAATTCAGCAGTGT
ATCTCCCCACTTTGATATTTGGTACATATATGGGATGGTTATACCTCAGATACTTACAGA
GGAGGCCAGAAACTAAGCTAAGAGGTGATCCGAGTGATGACTTTGCATTCTCTACTTTCT
TTCCTGAACTTCTCAGACCGTTAATTGACCCTATAGCCTCAATCTTTCATCGGATGCT

QA 3 780 3 780
DS 

RD RR4A166TF 735 0 0
CTTGTGGTGGGACACCTCTCGGTTCAGTTCGTTCCCGCCACCGTCCCTTACCTCGCTCTC
ATTCCCGCCAGGACTATTCCTTTTGGCTGGAATCTGATTACAAGCGGCTACTTTGAACTC
TCTGTATATGGGGTTGTCATCAGCACGGTCTCTCTCCTCTTTATGGGGAAGTTCCTTGAG
CCTGTGTGGGGTTCTAAGGAGTTTCTTAAGTTCATCTTCGTCGTGAACTTCCTTACCTAC
CTCTGTGTTTTCGTTACAGACATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAATCTACCTA
TATATGCCCTTTGCAGGTTTTCATGGTGTCGTGGCAGGCCTTCTTGTCGGGATAAAGCAG
ATTATACCTGACCAGGAGGTATTGCTCGTTAAGATCAAAGCAAAGTGGTTGCCCTCTATT
ACGCTAGTTCTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTCAATTCAGCAGTGTATCTCCCC
ACTTTGATATTTGGTACATATATGGGATGGTTATACCTCAGATACTTACAGAGGAGGCCA
GAAACTAAGCTAAGAGGTGATCCGAGTGATGACTTTGCATTCTCTACTTTCTTTCCTGAA
CTTCTCAGACCGTTAATTGACCCTATAGCCTCAATCTTTCATCGGATGCTTTGTGGACGA
TCAAATCCCACCAGCGAGGACCATGGT*ATT*TACCAGCGGTGCTCCTTTACCGGGTT
CTGACTCTGCTGAGCTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4A166JQD 281 0 0
GGTGCTCCTTTACCGGGTTTTGATTTTGCTGAAGCTTTTAGGAGGAGAGAAAGAGGAGCA
AGGGCTCTAGAGGAGAGACTTGCAACGGAAAGGGGGGTTCCTCCAAGGAACAAAGAAGAA
TCACAGAGTGATGCTTTGGATAGCGTTTAAGTGGAGACTGCAAACTAGCGATGTGTGGGG
GGGTTTTTACTTGGTTCAGGGGGGCAGTGTTTTTTTTTTTAAATGAAAATTGGCTTTATA
TCAATCAGCTTCTCCGTAAATTAC
CTATGACTGCTCTGAAA

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR4BV01JQ 699 0 0
GGGATAAAGCAGATTATACCTGACCAGGAGGTATTGCTCGTTAAGATCAAAGCAAAGTGG
ATGCCCTCTATTACGCTAGTTCTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTCAATTCAGCA
GTGTATCTCCCCACTTTGATATTTGGTACATATATGGGATGGTTATACCTCAGATACTTA
CAGAGGAGGCCAGAAACTAAGCTAAGAGGTGATCCGAGTGATGACTTTGCATTCTCTACT
TTCTTTCCTGAACTTCTCAGACCGTTAATTGACCCTATAGCCTCGATCTTTCATCGGATG
CTTTGTGGACGATCAAATCCCACCAGCGAGGACCATGGTTATTCTACCAGCGGTGCTCCT
TTACCAGGTTCTGACTCTGCTGAAGCTTCTAGGAGGAGAGAAAGAGGAGCAAGGGCTCTA
GAGGAGAGACTTGCAACGGAAAGGGTGGTTCCTCCAAGGAACAAAGAAGAATCACAGAGT
GATGCTTTGGATAGCGTTTAAGTGGAGACTGCAAACTAGCGATGTGTGTGGGGGTTCTTA
CTTGGTTCAGGTGGGCAGTGTTTTTTTTTCTAAATGAAAATTGGCTTTATATCAATCAGC
TTCTCCGTAAATTACCTATGACTGCTCTGAAAATAGTGCTTCCCTTGGACAGACAAACAA
GTTTACTTGGACTAGAGTATATAAAGTTATACCTTCACC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 7

CO CL872Contig1 953 7 10 U
CGTATCAAATTTTGACCAAGCTTTACTGCAACGACAAGTAGAGATATATATACACTACAC
CCAATATGTATCGGGTTTTACGTCTTTACAAATACATACCAAATGAACACGTTTTACTGA
ACGAAGTACATCAAAGTTTTATGTCCCCTATAAACTACAGGAGGAGAGGAGATAGAGTCT
TGACTCTACGATAAAGAAACAATGATGTCTTTTCAAGCGCAACACGCTTTTAGGATCTCT
TCAACAGGCGGATCATCTCCAGCTTCTTTGTCCTTGCGGATGTAAGAGATGTTGTTTTTC
CCAGGCCCAGCAACTAGGATTCCACCTTGTTGCCAGCCGCCTCTTTCAACAGTATCTTTC
ATAAACGAGAGTTTCCAGTCTTGGCGGTATCCTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCATA
GCAGCTTTGGGAGTAAATGTGACAGAAACCCCTGAAGCAAACTTAAGCGCCTCGTATGAT
GCGTGGTTTGGATCTGCATACACCTCTCCTTCAAATTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTTTG
GCCTGATCGATACTTCCAGGTCCAATGAGAACAAGAGTAACACCAGACGCATCCATCACA
TCCTTCTTTTCCGCAAGATAAGCTGCTCGTTTCCGACACAGCACGCATCCGAAATGACGA
GCGAACGCAACGACAGCTTTCCTATCCTTCCATAAATCAGAGATCGGAATCTCGTTTCCT
CTCAAGTCCGAGACTTTCACCGTCTCTAGCAAATCAGCAGTTTCAGTTCCTGAAGCGCCG
GTGATGGCCGACACGACCACGACGCTTCGCCGGAGAGAGACGCCGTGAGAATTCACCGAA
TAACCACCGAAATTTACTGTCCCTAAGCCGTAAATAGTTTTCGGTTTCGGCTGCAGCGTA
ATGGAAGTGATCGACGACGACGACGAGAGCGAAACAGCCATTGTTGGTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4F111JQ U 25
AF RR4F481JQ U 25
AF RR4DS05JQ U 1
AF RR4H087JQ U 25
AF RR4H087TF C 204
AF RR4F481TF C 359
AF RR4DS05TF C 396
BS 1 472 RR4DS05JQ
BS 473 473 RR4F481JQ
BS 474 595 RR4DS05JQ
BS 596 596 RR4H087JQ
BS 597 780 RR4DS05JQ
BS 781 781 RR4H087JQ
BS 782 797 RR4DS05JQ
BS 798 806 RR4H087JQ
BS 807 952 RR4H087TF
BS 953 953 RR4DS05TF

RD RR4F111JQ 423 0 0
A
CTGCAACGACAAGTAGAGATATATATACACTACACCCAATATGTATCGGGTTTTACGTCT
TTACAAATACATACCAAATGAACACGTTTTACTGAACGAAGTACATCAAAGTTTTATGTC
CCCTATAAACTACAGGAGGAGAGGAGATAGAGTCTTGACTCTACGATAAAAAAACAATGA
TGTCTTTTCAAGCGCAACACGCTTTTAGGATCTCTTCAACAGGCGGATCATCTCCAGCTT
CTTTGTCCTTGCGGATGTAAGAAATGTTGTTTTTCCCAGGCCCAGCAACTAGGATTCCAC
CTTGTTGCCAGCCGCCTCTTTCAACAGTATCTTTCATAAACGAGAGTTTCCAGTCTTGGC
GGTATCCTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCATAGCAGCTTTGGGAGTAAATGTGACAG
AA

QA 2 423 2 423
DS 

RD RR4F481JQ 567 0 0
G
CTGCAACGACAAGTAGAGATATATATACACTACACCCAATATGTATCGGGTTTTACGTCT
TTACAAATACATACCAAATGAACACGTTTTACTGAACGAAGTACATCAAAGTTTTATGTC
CCCTATAAACTACAGGAGGAGAGGAGATAGAGTCTTGACTCTACGATAAAGAAACAATGA
TGTCTTTTCAAGCGCAACACGCTTTTGGGATCTCTTCAACAGGCGGATCATCTCCAGCTT
CTTTGTCCTTGCGGATGTAAGAGATGTTGTTTTTCCCAGGCCCAGCAACTAGGATTCCAC
CTTGTTGCCAGCCGCCTCTTTCAACAGTATCTTTCATAAACGAAAGTTTCCAGTCTTGGC
GGTATCCTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCATAGCAGCTTTGGGAGTAAATGTGACAG
AAACCCCTGAAGCAAACTTAAGCGCCTCGTATGATGCGTGGTTTGGATCTGCATACACCT
CTCCTTCAAATTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTTTGGCCTGATCGATACTTCCAGGTCCAA
TGAGAACAAGAGTAACACCAGACGCA

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR4DS05JQ 797 0 0
CGTATCAAATTTTGACCAAGCTTTACTGCAACGACAAGTAGAGATATATATACACTACAC
CCAATATGTATCGGGTTTTACGTCTTTACAAATACATACCAAATGAACACGTTTTACTGA
ACGAAGTACATCAAAGTTTTATGTCCCCTATAAACTACAGGAGGAGAGGAGATAGAGTCT
TGACTCTACGATAAAGAAACAATGATGTCTTTTCAAGCGCAACACGCTTTTAGGATCTCT
TCAACAGGCGGATCATCTCCAGCTTCTTTGTCCTTGCGGATGTAAGAGATGTTGTTTTTC
CCAGGCCCAGCAACTAGGATTCCACCTTGTTGCCAGCCGCCTCTTTCAACAGTATCTTTC
ATAAACGAGAGTTTCCAGTCTTGGCGGTATCCTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCATA
GCAGCTTTGGGAGTAAATGTGACAGAAACCCCTGAAGCAAACTTAAGCGCCTAGTATGAT
GCGTGGTTTGGATCTGCATACACCTCTCCTTCAAATTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTTTG
GCCTGATCGATACTTCCAGGTCCAATGAGAACAAGAGTAACACCAGACGCATCCACCACA
TCCTTCTTTTCCGCAAGATAAGCTGCTCGTTTCCGACACAGCACGCATCCGAAATGACGA
GCGAACGCAACGACAGCTTTCCTATCCTTCCATAAATCAGAGATCGGAATCTCGTTTCCT
CTCAAGTCCGAGACTTTCACCGTCTCTAGCAAATCAGCAGTTTCAGTTCCTGAAGCGCCG
*TGATGGCCGACACGAC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4H087JQ 782 0 0
A
CTGCAACGACAAGTAGAGATATATATACACTACACCCAATATGTATCGGGTTTTACGTCT
TTACAAATACATACCAAATGAACACGTTTTACTGAACGAAGTACATCAAAGTTTTATGTC
CCCTATAAACTACAGGAGGAGAGGAGATAGAGTCTTGACTCTACGATAAAGAAACAATGA
TGTCTTTTCAAGCGCAACACGCTTTTAGGATCTCTTCAACAGGCGGATCATCTCCAGCTT
CTTTGTCCTTGCGGATGTAAGAGATGTTGTTTTTCCCAGGCCCAGCAACTAGGATTCCAC
CTTGTTGCCAGCCGCCTCTTTCAACAGTATCTTTCATAAACGAGAGTTTCCAGTCTTGGC
GGTATCCTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCATAGCAGCTTTGGGAATAAATGTGACAG
AAACCCCTGAAGCAAACTTAAGCGCCTCGTATGATGCGTGGTTTGGATCTGCATACACCT
CTCCTTCAAATTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTTTGGCCTGATCGATACTTCCAGGTCCAA
TGAGAACAAGAGTAACACCAGACGCATCCATCACATCCTTCTTTTCCGCAAGATAAGCTG
CTCGTTTCCGACACAGCACGCATCCGAAATGACGAGCGAACGCAACGACAGCTTTCCTAT
CCTTCCATAAATCAGAGATCGGAATCTCGTTTCCTCTCAAGTCCGAGACTTTCACCGTCT
CTAGCAAATCAGCAGTTTCAGTTCCTGAAGCGCGGGTGATGGCCGACACGACCACGACGC
T

QA 2 782 2 782
DS 

RD RR4H087TF 750 0 0
GATGTCTTCTCAAGCGCAACACGCTTTTAGGATCTCTTCAACAGGCGGATCATCTCCAGC
TTCTTTGTC*TTGCGGATGTAAGAGATGTTGTTTT*CCCAGGCCCAGCAACTAGGATTCC
ACCTTGTTGCCAGCCGCCTCTTTCAACAGTATCTTTCATAAACGAGAGTTTCCAGTCTTG
GCGGTATCCTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCATAGCAGCTTTGGGAATAAATGTGAC
AGAAACCCCTGAAGCAAACTTAAGCGCCTCGTATGATGCGTGGTTTGGATCTGCATACAC
CTCTCCTTCAAATTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTTTGGCCTGATCGATACTTCCAGGTCC
AATGAGAACAAGAGTAACACCAGACGCATCCATCACATCCTTCTTTTCCGCAAGATAAGC
TGCTCGTTTCCGACACAGCACGCATCCGAAATGACGAGCGAACGCAACGACAGCTTTCCT
ATCCTTCCATAAATCAGAGATCGGAATCTCGTTTCCTCTCAAGTCCGAGACTTTCACCGT
CTCTAGCAAATCAGCAGTTTCAGTTCCTGAAGCGCCGGTGATGGCCGACACGACCACGAC
GCTTCGCCGGAGAGAGACGCCGTGAGAATTCACCGAATAACCACCGAAATTTACTGTCCC
TAAGCCGTAAATAGTTTTCGGTTTCGGCTGCAGCGTAATGGAAGTGATCGACGACGACGA
CGAGAGCGAAACAGCCATTGTTGGTGGTC
C

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4F481TF 594 0 0
TCATAAACGAGAGTTTCCAGTCTTGGCGGTATCTTTCCATGTAAGACTCTATTATCTTCA
TAGCAGCTTTGGGAGTAAATGTGACAGAAACCCCTGAAGCAAACTTAAGCGCCTCGTATG
ATGCGTGGTTTGGATCTGCATACACCTCTCCTTCAAATTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTT
TGGCCTGATCGATACTTCCAGGTCCAATGAGAACAAGAGTAACACCAGACGCATCCATCA
CATCCTTCTTTTCCGCAAGATAAGCTGCTCGTTTCCGACACAGCACGCATCCGAAATGAC
GAGCGAACGCAACGACAGCTTTCCTATCCTTCCATAAATCAGAGATCGGAATCTCGTTTC
CTCTCAAGTCCGAGACTTTCGCCGTCTCTAGCAAATCAGCAGTTTCAGTTCCTGAAGCGC
CGGTGATGGCCGACACGACCACGGCGCTTCGCCGGAGAGAGACGCCGTGAGAATTCACCG
AATAACCACCGAAATTTACTGTCCCTAAGCCGTAAATAGTTTTCGGTTTCGGCTGCAGCG
TAATGGAAGTGATCGACGACGACGACGAGAGCGAAACAGCCATTGTTGGTGGTC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4DS05TF 558 0 0
CATGTAAGACTCTATTATCTTCATAGCAGCTTTGGGAGTAAATGTGACAGAAACCCCTGA
AGCAAACTTAAGCGCCTAGTATGATGCGTGGTTTGGATCTGCATACACCTCTCCTTCAAA
TTTCGTCTGTTCCACAAAAGTTTTGGCCTGATCGATACTTCCAGGTCCAATGAGAACAAG
AGTAACACCAGACGCATCCACCACATCCTTCTTTTCCGCAAGATAAGCTGCTCGTTTCCG
ACACAGCACGCATCCGAAATGACGAGCGAACGCAACGACAGCTTTCCTATCCTTCCATAA
ATCAGAGATCGGAATCTCGTTTCCTCTCAAGTCCGAGACTTTCACCGTCTCTAGCAAATC
AGCAGTTTCAGTTCCTGAAGCGCCGGTGATGGCCGACACGACCACGGCGCTTCGCCGGAG
AGAGACGCCGTGAGAATTTACCGAATAACCACCGAAATTTACTGTCCCTAAGCCGTAAAT
AGTTTTCGGTTTCGGCTGCAGCGTAATGGAAGTGATCGACGACGACGACGAGAGCGAAAC
AGCCATTGTTGGTGGTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 2 8

CO CL873Contig1 808 3 7 U
GTCAAATTTCACATTTTTATTAAACACACACACACACACAAACACATACATGGGAAAAGC
AGACTTTGGGGGGCCTTATTTATTATTATTTTTTTTTTTTGAACAACCAAAAAAAAGATG
GGCTTATTTTATATTTTTATGTAATCAAAGAAAAAGGATTTAAATGGCAAGCCTGTAATT
GGCGATAATGGACTCGGATCTGATGAAACTAAACACCAGCTCTTTAGTGGAACTCGGCGA
TCTTTTAACCAAAACCAGTCTCGAAGTGAGCCCCAATGGCATCGATGGCAGTACCATCAC
GTCCATAAAGTCCAAAAAGCTTTCCTCCATTTTCACCTTTGAGTTCGAAGTCTTTGCCCT
TTTTCTCACCAAATAATGGAGAGGTAAATCCCTAAAAGGTTGTGAAGTACAATGATGTGA
TAAGCGTTGTATCATATTTGAAAATATGATTGTAGCTTCCACCAACAGCCACAATATTGT
CTTCCGGATAGTTCACCGAGAACTCATCTGATCCAACGGTTAACTTTTTCACACCATCGA
AAACACCATCGTCGAATGTGTTCCCCTTGTTACCACCAAGCGGTCCGAAGTGAGCCCCAA
TGGCATCGATGGCAGTACCACCACGTCCATAAAATCCACGAAGCTTTTCTCCATTTTCAC
CTTTGAGCTCGAACTCGTTTCCCTTGGCCTCACCAAAGAATGGAGAGGTAAATCCCTTGG
AGGTGGTGAAGTACAAAGATGTGATAAGCGTTGTATCATAGTTGAAAATATGTTTGTAGG
TTCCACCAACTTCTACAATATTGTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA05JQ U 1
AF RR4CO29JQ U 13
AF RR4AS27TF C 530
BS 1 98 RR4BA05JQ
BS 99 100 RR4CO29JQ
BS 101 393 RR4BA05JQ
BS 394 394 RR4CO29JQ
BS 395 535 RR4BA05JQ
BS 536 689 RR4CO29JQ
BS 690 808 RR4AS27TF

RD RR4BA05JQ 535 0 0
GTCAAATTTCACATTTTTATTAAACACACACACACACACAAACACATACATGGGAAAAGC
AGACTTTGGGGGGCCTTATTTATTATTATTTTTTTTTT**GAACAACCAAAAAAAAGATG
GGCTTATTTTATATTTTTATGTAATCAAAGAAAAAGGATTTAAATGGCAAGCCTGTAATT
GGCGATAATGGACTCGGATCTGATGAAACTAAACACCAGCTCTTTAGTGGAACTCGGCGA
TCTTTTAACCAAAACCAGTCTCGAAGTGAGCCCCAATGGCATCGATGGCAGTACCATCAC
GTCCATAAAGTCCAAAAAGCTTTCCTCCATTTTCACCTTTGAGTTCGAAGTCTTTGCCCT
TTTTCTCACCAAATAATGGAGAGGTAAATCCCTTAAAGGTTGTGAAGTACAATGATGTGA
TAAGCGTTGTATCATATTTGAAAATATGATTGTAGCTTCCACCAACAGCCACAATATTGT
CTTCCGGATAGTTCACCGAGAACTCATCTGATCCAACGGTTAACTTTTTCACACC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4CO29JQ 681 0 0
ATTTTTATTAAACACACACACACACACAAACACATACATGGTAAAAGCAGACTTTGGGTG
GCCTTATTTATTATTATTTTTTTTTTTTGAACAACCAAAAAAA*GATGGGCTTATTTTAT
ATTTTTATGTAATCAAAGAAAAAGGATTTAAATGGCAAGCCTGTAATTGGCGATAATGGA
CTCGGATCTGATGAAACTAAACACCAGCTCTTTAGTGGAACTCGGCGATCTTTTAACCAA
AACCAGTCTCGAAGTGAGCCCCAATGGCATCGATGGCAGTACCATCACGTCCATAAAGTC
CAAGAAGCTTTCCTCCATTTTCACCTTTGAGTTCGAAGTCTTTGCCCTTTTTCTCACCAA
ATAATGGAGAGGTAAATCCCTAAAAGGTTGTGAAGTACAATGATGTGATAAGCGTTGTAT
CATATTTGAAAATATGATTGTAGCTTCCACCAACAGCCACAATATTGTCTTCCGGATAGT
TCACCGAGAACTCATCTGCTCCAACGGTTAACTTTTTCACACCATCGAAAACACCATCGT
CGAATGTGTTCCCCTTGTTACCACCAAGCGGTCCGAAGTGAGCCCCAATGGCATCGATGG
CAGTACCACCACGTCCATAAAATCCACGAAGCTTTTCTCCATTTTCACCTTTGAGCTCGA
ACTCGTTTCCCTTGGCC
ACAC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4AS27TF 279 0 0
CACG
CCATCGAAAACACCATCGTCGAATGTGTTTCCCTTGTTACCCCCAAGCGGTCCGAAGTGA
GCCCCAATGGCATCGATGGCAGTACCACCACGTCCATAAAATCCACGAAGCTTTTCTCCA
TTTTCACCTTTGAGCTCGAACTCGTTTCCCTTGGCCTCACCAAAGAATGGAGAGGTAAAT
CCCTTGGAGGTGGTGAAGTACAAAGATGTGATAAGCGTTGTATCATAGTTGAAAATATGT
TTGTAGGTTCCACCAACTTCTACAATATTGTCTTC

QA 5 279 5 279
DS 



CO CL873Contig2 1158 5 30 U
GGACTCTCATCTTGCCATTTAGTTGTGCAAAGCTAAGAAAGAAAATAATGGCCAAAAGGG
TGGGACCAGTGGGTAACTACTTGGGAAATGCATTCGACGATGGTGCTTTCGATGGTGTAA
AGAAAATAATTGTCTCAGTACAGGGAAGTCCTTATAACTGTATAACAATGATCAAGATCG
AATATGAAAAGGACGGGAAACTTGAATCCCGTCAACATGGAACGGTTCTTGGGGAACTAA
AAGAGTTTGTAGTGGATCATCCGAATGAATATATAACATCTGTTGGTGGGAGCTATGATA
TTGTTCAAACATACTATCATACACTCCTGATCAAATCGCTAATCTTTAAAACCAACACTG
GAAGAGCATCTCCAGTACTCGGTGGGACAACAGAATCTGGACAACCAGCTGGGACAGAAT
TCACCTTGGAGGGTCAATATGGAGAAAAGTTTCTTGGGTTCTTTGGACGTTCTGGTCAAG
CTCTTGATGCCATTGGAGCTTACTTGGGACCTCTGGGTGGTAACAAGGGAAACAAATTCG
ATGATGGTATTCTCGATGGTGTGAAAAAAGTAACTGTTGCGGCAGATCAGTATAGTGTAA
CTTATATCAAGATCGAATACGAAGACAATGGAAAAGTTGAAGTCCGTGAACATGGGACAA
ACCGGGGGGAGCTAAAAGAGTTTTCGGTGAACTATCCAGAAGACACTATTGTAGCCGTTG
GTGGAAGCTACAATCATATTTTCACCTATCATACAACGCTTATTACATCTTTGTACTTCA
CAACCTCCAAGGGTTATACCTCCCCACTATTTGGTGTGGCCAAGGGAAACGAGTTCGAGC
TCAAAGGTGAAAATGGAGAAAAGCTTCGTGGATTTTATGGACGTGTTGGTACTGCCATCG
ATGCCATTGGGGCTCACTTCGGACCGCTTGGTGGTAACAAGGGAAACACATTCGACGATG
GTGTTTTCGATGGTGTGAAAAAGTTAACCGTTGGAGCAGATGAGGTCAGTGTAACTTATA
TCAAGATCGAATACCAAAAGGATGGAAACGTCATAGTCCGTGAACATGGGACGTTTAACG
GGATTCTAAGAGCATGTGCATTGCAAACAACCTTATTTGTTGCTTAATCAATTTTTAATT
ATTAAAATTTACTGAAAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EQ50TF U 1
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AF RR4CO29TF U 261
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AF RR4BA88TF U 613
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AATATGAAAAGGACGGGAAACTTTAATCCCGTCAACATGGAACGGTTCTTGGGGAACTAA
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CACC
T

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DS 

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TGTTCAAACATACTATCATACACTCCTGATCAAATCGCGAATCTTTAAAACCAACACTGG
AAGAGCATCTCCAGTACTCGGTGGGACAACAGAATCTGGACAACCAGCTGGGACAGAATT
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ACCCTCCAAGGGTTATACCTCCC*ACTATTTGGTGTGGCCA**GGAAACGAGTTCGAGCT
C

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DS 

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GGAGAAAAGTTTCTTGGGTTCTTTGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGAGCT
TACTTGGGACCTCTGGGTGGTAACAAGGGAAACAAATTCGATGATGGTATTCTCGATGGT
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TTCACCTATGATACAACGCTTATTACATCTTTGTACTTCACAACCTCCAAGGGTTATACC
TCCCCACTATTTGGTGTGGCCAAGGGAAACGAGTTCGAGCTCAAAGGTGAAAATGGAGAA
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G
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DS 

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G
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AAAAGAGTTTTCGGTGAACTATCCAGAAGACACTATTGTAGCCGTTGGTGGAAGCTACAA
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TGTGAAAAAGTTAACCGTTGGAGCAGATGAGGTCAGTGTAACTTATATCAAGATCGAATA
CCAAAAGGATGGAAACGTCATAGTCCGTGAACATGGGACGTTTAACGGGATTCTAAGAGC
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GAAAC

QA 2 546 2 546
DS 



AS 2 7

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GAAGAACAGCATCATAAGTAATTATATCTACAGACTCTAA*GACATAGTTCCCATAAACC
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ATGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B091JQ U 20
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AF RR4D962JQ U 1
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RD RR4B091JQ 308 0 0
GCTAAT
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TGATTGCCACTTCAAAGCAATGATCTGATATTCTTGAAGAACAGCATCATAAGTAATTAT
ATCTACAGACTCTAA*GACATAGTTCCCATAAACCAAGAGCACCAAGAGGCGTTTTACCC
TGCCCGGCCTCAAAGTAAAAGATCAGCATTGCAAGCATTGCGAGCCTAGAGTGCTTAATC
TCCGCAAGTTTCAGCCGCTCCAGCTTCTCTCTGTCTGGCTCGTAAACACCGTCCCGTGTC
TT

QA 7 308 7 308
DS 

RD RR4B091TF 308 0 0
GCTAAT
ATAAGCCTTTTCATGATATAATTATTAATTTCACATTGTTCACAAGCTGAACTCATGATT
TGATTGCCACTTCAAAGCAATGATCTGATATTCTTGAAGAACAGCATCATAAGTAATTAT
ATCTACAGACTCTAA*GACATAGTTCCCATAAACCAAGAGCACCAAGAGGCGTTTTACCC
TGCCCGGCCTCAAAGTAAAAGATCAGCATTGCAAGCATTGCGAGCCTAGAGTGCTTAATC
TCCGCAAGTTTCAGCCGCTCCAGCTTCTCTCTGTCTGGCTCGTAAACACCGTCCCGTGTC
TT

QA 7 308 7 308
DS 

RD RR4D962JQ 772 0 0
CCGATAATAGAGTAGTTATATACTAATAAGCCTTTTCATGATATAATTATTAATTTCACA
TTGTTCACAAGCTGAACTAATGATTTGATTGCCACTTCAAAGCAATGATCTGATATTTTT
GAAGAACAGCATCATAAGTAATTATATCTACAGACTCTAAAGACATAGTTCTCACAAACC
AAGTGCACCAAGAGGCGTTTTACCCTGCCCGGCCTCAAAGTAAAAGATCAGCATTGCAAG
CATTGCGAGCCTAGAGTGCTTAATCTCCGCAAGTTTCAGCCGCTCCAGCTTCTCTCTGTC
TGGCTCGTAAACACCGTCCCGTGACTTCCCCGCTAGACCCAACGGATCAAAGAATCTCCC
TCCTGGGTACCCTTGATATCCTGTGTAGTTAGCGAAGTTCTCGGCGGTCCTCGACCACGG
CGTCGCCCACTCAACGGACTGAGAGTCAGGGTTGAAGAAGTCGACCCACCGTTTGCTCTC
CACCCAACCCATGAGAAGCAGTTGGGTCCCGAGAAGCGATCCGAAAGAGAAGGGTGCGAT
GGCACGTGGATCAGCTCCGGCTTCGAACCATGGCACGCCGCTCCAAGCCTGACCAACGAA
GATCCCAAGAACAGCAGCCATCGCCCACCGGCCGTGGATCAGCTCTGCCTCTCTGTACCA
TTTAAGAAGAGCCGGGTCTTTTCCCAAACCCAATGGGTCGAACCCGAAATCTCCGGGTAG
CGAGCCATCGAGCCATTCAGG*TCGAGGAAGTCGCCGCCACCTTTAACGGCG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4EW29JQ 821 0 0
CACAAGCTGAACTCATGATTTGATTGCCACTTCAAAGCAATGATCTGATATTTTTGAAGA
ACAGCATCATAAGTAATTATATCTACAGACTCTAA*GACATAGTTCTCATAAACCAAGAG
CACCAAGAGGCGTTTTACCCTGCCCGGCCTCAAAGTAAAAGATCAGCATTGCAAGCATTG
CGAGCCTAGAGTGCTTAATCTCCGCAAGTTTCAGCCGCTCCAGCTTCTCTCTGTCTGGCT
CGTAAACACCGTCCCGTGTCTTCCCGGCTAGACCCAACGGATCAAAGAATCTTCCTCCTG
GGTACCCTTGATCTCCTGTGTAGTTAGCGAAGTTCTCGGCGGTCCTCGACCACGGCGTCG
CCCACTCAACGGACTGAGAGTCAGGGTTGAAGAAGTCGACCCACTGTTTGCTCTCCACCC
AACCCATGAGAAGCAGTTGGGTCCCGAGAAGCGATCCGAAAGAGAAGGGTGCGATGGCAC
GTGGATCAGCTCCGGCTTCGAACCATGGCACGCCGCTCCAAGCCTGACCAACGAAGATAC
CAAGAACAGCAGCCATCGCCCACCGGCCGTGGATCAGCTCTGCTTCTCTGTACCATTTAA
GAAAAGCCGGGTCTTTTCCCAAACCCAACGGGTCGAACCCGAAATCTCCGGGTAGCGAGC
CATCGAGCCATTCAGGGTCGAGGAAGTTGCCGCCACCTTTAACGGCGGGGATCCACGATT
TCTTGGGTTGAGCAGCCGCAGCAGCGACAATCAGAGTTTTCCGGCCAACTATCGCAGCTC
CAGTACCTACACCGCTCCC*AGTGCCGTGGCACTTCTCTTG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4EW29TF 753 0 0
TCAAAGT
AAAGATCAGCATTGCAAGCAT*GCGAGC*TAGAGTGCTTA*TCTCCGCAAGTTTCAGCCG
CTCCAGCTTCTCTCTGTCTGGCTCGTAAACAC*GTCCCGTGTCTTCCCGGCTAGACCCAA
CGGATCAAAGAATCTTCCTCCTGGGTACCCTTGATCTCCTGTGTAGTTAGCGAAGTTCTC
GGCGGTCCTCGACCACGGCGTCGCCCACTCAACGGACTGAGAGTCAGGGTTGAAGAAGTC
GACCCACTGTTTGCTCTCCACCCAACCCATGAGAAGCAGTTGGGTCCCGAGAAGCGATCC
GAAAGAGAAGGGTGCGATGGCACGTGGATCAGCTCCGGCTTCGAACCATGGCACGCCGCT
CCAAGCCTGACCAACGAAGATACCAAGAACAGCAGCCATCGCCCACCGGCCGTGGATCAG
CTCTGCTTCTCTGTACCATTTAAGAAAAGCCGGGTCTTTTCCCAAACCCAACGGGTCGAA
CCCGAAATCTCCGGGTAGCGAGCCATCGAGCCATTCAGGGTCGAGGAAGTTGCCGCCACC
TTTAACGGCGGGGATCCACGATTTCTTGGGTTGAGCAGCCGCAGCAGCGACAATCAGAGT
TTTCCGGCCAACTATCGCAGCTCCAGTACCTACACCGCTCCCCAGTGCCGTGGCACTTCT
CTTGCCTCCGGTGAGGAAGGAAGAACCAAGCCCACTGAGCACAGCTCCGGAGATAGCCAT
CGCCATGAGATCTCTAATATGTCTCC

QA 8 753 8 753
DS 



CO CL874Contig2 451 2 1 U
GGGATTCTCTTTGCTCCATAAAAACAAGAGAAAAAAAAAACAGAGGAGACATATTAGAGA
TCTCTTCGGATCGCTTCTCTCAGTCCGTTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCCG
AGAACTTCGCTAACTACACAGGAGATCAAGGGTACCCAGGAGGAAGATTCTTTGATCCGT
TGGGTCTAGCCGGGAAGACACGGGACGGTGTTTACGAGCCAGACAGAGAGAAGCTGGAGC
GGCTGAAACTTGCGGAGATTAAGCACTCTAGGCTCGCAATGCTTGCAATGCTGATCTTTT
ACTTTGAGGCCGGGCAGGGTAAAACGCCTCTTGGTGCTCTTGGTTTATGAGAACTATGTC
TTAGAGTCTGTAGATATAATTACTTATGATGCTGTTCTTCAAAAATATCAGATCATTGCT
TTGAAGTGGCAATCAGATCATGAGTTCAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GJ82JQ C 1
AF RR4GJ82TF U 1
BS 1 451 RR4GJ82TF

RD RR4GJ82JQ 451 0 0
GGGATTCTCTTTGCTCCATAAAAACAAGAGAAAAAAAAAACAGAGGAGACATATTAGAGA
TCTTTTCGGATCGCTTCTCTCAGTCCGTTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCCG
AGAACTTCGCTAACTACACAGGAGATCAAGGGTACCCAGGAGGAAGATTCTTTGATCCGT
TGGGTCTAGCCGGGAAGACACGGGACGGTGTTTACGAGCCAGACAGAGAGAAGCTGGAGC
GGCTGAAACTTGCGGAGATTAAGCACTCTAGGCTCGCAATGCTTGCAATGCTGATCTTTT
ACTTTGAGGCCGGGCAGGGTAAAACGCCTCTTGGTGCTCTTGGTTTATGAGAACTATGTC
TTAGAGTCTGTAGATATAATTACTTATGATGCTGTTCTTCAAAAATATCAGATCATTGCT
TTGAAGTGGCAATCAGATCATGAGTTCAGCT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4GJ82TF 451 0 0
GGGATTCTCTTTGCTCCATAAAAACAAGAGAAAAAAAAAACAGAGGAGACATATTAGAGA
TCTCTTCGGATCGCTTCTCTCAGTCCGTTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCCG
AGAACTTCGCTAACTACACAGGAGATCAAGGGTACCCAGGAGGAAGATTCTTTGATCCGT
TGGGTCTAGCCGGGAAGACACGGGACGGTGTTTACGAGCCAGACAGAGAGAAGCTGGAGC
GGCTGAAACTTGCGGAGATTAAGCACTCTAGGCTCGCAATGCTTGCAATGCTGATCTTTT
ACTTTGAGGCCGGGCAGGGTAAAACGCCTCTTGGTGCTCTTGGTTTATGAGAACTATGTC
TTAGAGTCTGTAGATATAATTACTTATGATGCTGTTCTTCAAAAATATCAGATCATTGCT
TTGAAGTGGCAATCAGATCATGAGTTCAGCT

QA 1 451 1 451
DS 



AS 2 7

CO CL875Contig1 747 2 2 U
GAAGGTGTTAGGACTATGGATGACGATAATTTCATTGATGATACTGGTGTGGATCCTTCT
GAGAGGTATGGAGGTGATGGGGGAGACCGCTCTCCAACTCACTATCCTCAGGCAGAGGAG
GGAGAGGATGATGATGAGGTTAATAACCTTTTCAAAATGGGGAAGAAAAAGAAGAAGGCT
GAAAGGAATCCTGCGGAAATCGCTCTCTTGGTTGAGAATGTGATGGCTGAGCTTGAGGTC
ACTGCTGAGGAAGACGCAGATCTTAACAGACATGGGAAGCCTGCTATCAACAAGCTTAAG
AAACTTTCCCTTCTTACCAATGTACTTGGAAAGAAGCAGCTTCAAACAGAATTCTTGGAC
CATGGAGTTCTAACTCTGCTGAAGAACTGGCTTGAGCCTCTTCCTGATGGAAGCTTGCCA
AATATAAACATTCGTGCAGCTATTCTGAGGGTTCTTACTGATTTTCCAATTGACCTGGAG
CAGTTTGATCGGAGGGAGCAATTGAAAAAGAGCGGGCTTGGAAAGGTCATTATGTTCTTA
TCGAAGTCCGATGAGGAAACTACTTCAAACAGAAGACTTGCTAAGGACTTGGTTGATAAA
TGGTCTCGTCCAATTTTCAACAAGAGCACAAGGTTTGAAGACATGAACTCTTGATGAAGA
TAGGGCTCCCTATAGAAGACACCAGTGAAGAAACCTGTCAACAAAGCTTCGACATGGAGT
CCAGGGATGGTGACTTTGACTTAGATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK38TF U 1
AF RR4GM16TF U 1
BS 1 741 RR4GK38TF
BS 742 747 RR4GM16TF

RD RR4GK38TF 741 0 0
GAAGGTGTTAGGACTATGGATGACGATAATTTCATTGATGATACTGGTGTGGATCCTTCT
GAGAGGTATGGAGGTGATGGGGGAGACCGCTCTCCAACTCACTATCCTCAGGCAGAGGAG
GGAGAGGATGATGATGAGGTTAATAACCTTTTCAAAATGGGGAAGAAAAAGAAGAAGGCT
GAAAGGAATCCTGCGGAAATCGCTCTCTTGGTTGAGAATGTGATGGCTGAGCTTGAGGTC
ACTGCTGAGGAAGACGCAGATCTTAACAGACATGGGAAGCCTGCTATCAACAAGCTTAAG
AAACTTTCCCTTCTTACCAATGTACTTGGAAAGAAGCAGCTTCAAACAGAATTCTTGGAC
CATGGAGTTCTAACTCTGCTGAAGAACTGGCTTGAGCCTCTTCCTGATGGAAGCTTGCCA
AATATAAACATTCGTGCAGCTATTCTGAGGGTTCTTACTGATTTTCCAATTGACCTGGAG
CAGTTTGATCGGAGGGAGCAATTGAAAAAGAGCGGGCTTGGAAAGGTCATTATGTTCTTA
TCGAAGTCCGATGAGGAAACTACTTCAAACAGAAGACTTGCTAAGGACTTGGTTGATAAA
TGGTCTCGTCCAATTTTCAACAAGAGCACAAGGTTTGAAGACATGAACTCTTGATGAAGA
TAGGGCTCCCTATAGAAGACACCAGTGAAGAAACCTGTCAACAAAGCTTCGACATGGAGT
CCAGGGATGGTGACTTTGACT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GM16TF 747 0 0
GAAGGTGTTAGGACTATGGATGACGATAATTTCATTGATGATACTGGTGTGGATCCTTCT
GAGAGGTATGGAGGTGATGGGGGAGACCGCTCTCCAACTCACTATCCTCAGGCAGAGGAG
GGAGAGGATGATGATGAGGTTAATAACCTTTTCAAAATGGGGAAGAAAAAGAAGAAGGCT
GAAAGGAATCCTGCGGAAATCGCTCTCTTGGTTGAGAATGTGATGGCTGAGCTTGAGGTC
ACTGCTGAGGAAGACGCAGATCTTAACAGACATGGGAAGCCTGCTATCAACAAGCTTAAG
AAACTTTCCCTTCTTACCAATGTACTTGGAAAGAAGCAGCTTCAAACAGAATTCTTGGAC
CATGGAGTTCTAACTCTGCTGAAGAACTGGCTTGAGCCTCTTCCTGATGGAAGCTTGCCA
AATATAAACATTCGTGCAGCTATTCTGAGGGTTCTTACTGATTTTCCAATTGACCTGGAG
CAGTTTGATCGGAGGGAGCAATTGAAAAAGAGCGGGCTTGGAAAGGTCATTATGTTCTTA
TCGAAGTCCGATGAGGAAACTACTTCAAACAGAAGACTTGCTAAGGACTTGGTTGATAAA
TGGTCTCGTCCAATTTTCAACAAGAGCACAAG*TTTGAAGACATGAACTCTTGATGAAGA
TAGGGCTCCCTATAGAAGACACCAGTGAAGAAAC*TGTCA*CAAAGCTTCGACATGGAGT
CCAGGGATGGTGACTTTGACTTAGATA

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL875Contig2 851 5 10 U
GTGTAAGGTACTGAAAATTGATTTGATGGTAAGAGTAGCTTGTGCTCTCAAAGAGGAGCG
TTTCACTTTTCCATTACATTAGAGACTCAAAGCAAATAGTTTATAGTAAAAAGCATATAA
GTATACCCCCAATGCCTTTTAAGTCTTTAACTTCAAACAATGATCCAATCAAAGTTGAAG
ATTACAAGATAGAAGAGCCCAGTTCCTTCCAACGCTGCCCCATGGCTTGGTTGCAACCTC
TCTACAGGTACTTGGTCATACCCCGACCTTCCACGCTAACCGTGGTGGCTTGCAAACGCT
TCTTCTTAGGTCCTTTTAGCTGCTGCAGTTTCTTGTTCATCTTCACTCGGCGCTAGTCCT
GAGAAACCTGTTTAGCACGGGCTCTGACCTCATCTGGGTCAATCTTGGACTGAGGACGAA
TCACAAAGTCCATTGGAGTTGCTTCTGGTCTCATGGTCATGTTCCTGTACGAATCTCCCC
TCGAACTCTGGCCCGAAGTCAGACCTGATTTTCGTTGCCGAATATCTAAGTCAAAGTCAC
CATCCCTGGACTCCATTGTCGAAGCTTTGTTGACAGGTTTCTTCACTGGTGGTCTTCTAT
AGGGAGCCCTATCTTCATCAAGAGTTCTCATGTCTTCAAACCTTGTGCTCTTGTTGAAAA
TTGGACGAGACCATTTATCAACCAAGTCCTTAGCAAGTCTTCTGTTTGAAGTAGTTTCCT
CATCGGACTTCGATAAGAACATAATGACCTTTCCAAGCCCGCTCTTTTTCAATTGCTCCC
TCCGATCAAACTGCTCCAGGTCAATTGGAAAATCAGTAAGAACCCTCAGAATAGCTGCAC
GAATGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM16JQ U 1
AF RR4GK38JQ U 11
AF RR4EC20JQ U 44
AF RR4FG94JQ U 44
AF RR4FG94TF C 334
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BS 443 443 RR4EC20JQ
BS 444 627 RR4GM16JQ
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BS 630 764 RR4GM16JQ
BS 765 765 RR4GK38JQ
BS 766 767 RR4FG94JQ
BS 768 851 RR4FG94TF

RD RR4GM16JQ 764 0 0
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TTTCACTTTTCCATTACATTAGAGACTCAAAGCAAATAGTTTATAGTAAAAAGCATATAA
GTATACCCCCAATGCCTTTTAAGTCTTTAACTTCAAACAATGATCCAATCAAAGTTGAAG
ATTACAAGATAGAAGAGCCCAGTTCCTTCCAACGCTGCCCCATGGCTTGGTTGCAACCTC
TCTACAGGTACTTGGTCATACCCCGACCTTCCACGCTAACCGTGGTGGCTTGCAAACGCT
TCTTCTTAGGTCCTTTTAGCTGCTGCAGTTTCTTGTTCATCTTCACTCGGCGCTGGTCCT
GAGAAACCTGTTTAGCACGGGCTCTGACCTCATCTGGGTCAATCTTGGACTGAGGACGAA
TCACAAAGTCCATTGGAGTTGCCTCTGGTCTCATGGTCATGTTCCTGTACGAATCTCCCC
TCGAACTCTGGCCCGAAGTCAGACCTGATTTTCGTTGCCGAATATCTAAGTCAAAGTCAC
CATCCCTGGACTCCATTGTCGAAGCTTTGTTGACAGGTTTCTTCACTGGTGGTCTTCTAT
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TTGGACGAGACCATTTATCAACCAAGTCCTTAGCAAGTCTTCTGTTTGAAGTAGTTTCCT
CATCGGACTTCGATAAGAACATAATGACCTTTCCAAGCCCGCTC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4GK38JQ 755 0 0
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CCATTACATTAGAGACTCAAAGCAAATAGTTTATAGTAAAAAGCATATAAGTATACCCCC
AATGCCTTTTAAGTCTTTAACTTCAAACAATGATCCAATCAAAGTTGAAGATTACAAGAT
AGAAGAGCCCAGTTCCTTCCAACGCTGCCCCATGGCTTGGTTGCAACCTCTCTACAGGTA
CTTGGTCATACCCCGACCTTCCACGCTAACCGTGGTGGCTTGCAAACGCTTCTTCTTAGG
TCCTTTTAGCTGCTGCAGTTTCTTGTTCATCTTCACTCGGCGCTGGTCCTGAGAAACCTG
TTTAGCACGGGCTCTGACCTCATCTGGGTCAATCTTGGACTGAGGACGAATCACAAAGTC
CATTGGAGTTGCCTCTGGTCTCATGGTCATGTTCCTGTACGAATCTCCCCTCGAACTCTG
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ATCTTCATCAAGAGTTC**ATGTCTTCAAACCTTGTGCTCTTGTTGAAAATTGGACGAGA
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CACTCGGCGCTAGTCCTGAGAAACCTGTTTAGCACGGGCTCTGACCTCATCTGGGTCAAT
CTTGGACTGAGGACGAATCACAAAGTCCATTGGAGTTGCTTCTGGTCTCATGGTCATGTT
CCTGTACGAATCTCCCCTCGAACTCTGGCCCGAAGTCAGACCTGATTTTCGTTGCCGAAT
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CACTGGTGGTCTTCTATAGGGAGCCCTATCTTCATCAAGAGTTCTCATGTCTTCAAACCT
TGTGCTCTTGTTGAAAATTGGACGAGACCATTTATCAACCAAGTCCTTAGCAAGTCTTCT
GTTTGAAGTAGTTTCCTCATCGGA

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DS 

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GGCTTGGTTGCAACCTCTCTACAGGTACTTGGTCATACCCCGACCTTCCACGCTAACCGT
GGTGGCTTGCAAACGCTTCTTCTTTGGTCCTTTTAGCTGCTGCAGTTTCTTGTTCATCTT
CACTCGGCGCTAGTCCTGAGAAACCTGTTTAGCACGGGCTCTGACCTCATCTGGGTCAAT
CTTGGACTGAGGACGAATCACAAAGTCCATTGGAGTTGCTTCTGGTCTCATGGTCATGTT
CCTGTACGAATCTCCCCTCGAACTCTGGCCCGAAGTCAGACCTGATTTTCGTTGCCGAAT
ATCTAAGTCAAAGTCACCATCCCTGGACTCCATTGTCGAAGCTTTGTTGACAGGTTTCTT
CACTGGTGGTCTTCTATAGGGAGCCCTATCTTCATCAAGAGTTCTCATGTCTTCAAACCT
TGTGCTCTTGTTGAAAATTGGACGAGACCATTTATCAACCAAGTCCTTAGCAAGTCTTCT
GTTTGAAGTAGTTTCCTCATCGGACTTCGATAAGAACATAATGACCTTTCCAAGCCCGCT
CTTT

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DS 

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CTGGGTCAATCTTGGACTGAGGACGAATCACAAAGTCCATTGGAGTTGCTTCTGGTCTCA
TGGTCATGTTCCTGTACGAATCTCCCCTCGAACTCTGGCCCGAAGTCAGACCTGATTTTC
GTTGCCGAATATCTAAGTCAAAGTCACCATCCCTGGACTCCATTGTCGAAGCTTTGTTGA
CAGGTTTCTTCACTGGTGGTCTTCTATAGGGAGCCCTATCTTCATCAAGAGTTCTCATGT
CTTCAAACCTTGTGCTCTTGTTGAAAATTGGACGAGACCATTTATCAACCAAGTCCTTAG
CAAGTCTTCTGTTTGAAGTAGTTTCCTCATCGGACTTCGATAAGAACATAATGACCTTTC
CAAGCCCGCTCTTTTTCAATTGCTCCCTCCGATCAAACTGCTCCAGGTCAATTGGAAAAT
CAGTAAGAACCCTCAGAATAGCTGCACGAATGTTTATC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 2 7

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AAGAGAGTCATCATTTGGTTGGTTCTTTAAATGAGCTCCCATCAACAAAAACATGTTTTA
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TTGAATCGATAGCCAATATCTTCTTCATCATCATCATCTTTCTTCTTCACTCAGGGGTCG
AGTTTAGAGGTACTTGAAAAGGATACCACCGTGAGTGGCAAAGAAGGGAGCAAAGACGAG
AGACTCAACAGCCATGAGCTTGATCAAGATGTTCAACGAGGGTCCTGATGTATCCTTCAA
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AAGGCAACCAGGAGGAATCATCTCCTTGATGGAAGCGTCTGTTGAGATTTTTCGCGGGAT
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CACCGTACATAGCAGCAAAGCTGAGCTAACGAATATACTGACGGCATAGCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT75TF C 4
AF RR4DT31JQ U 111
AF RR4DT31TF C 111
AF RR4D372JQ U 1
AF RR4B565JQ U 11
BS 1 117 RR4D372JQ
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BS 461 642 RR4D372JQ
BS 643 954 RR4B565JQ

RD RR4CT75TF 203 0 0
CTCAAATAC
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CAAAACAAACATAAGAAAAACAAAGCAGGGAGAAGTAACGGCTAAGAACAAGTCTCAAAT
ACTTGGTGGTTTTCTAAATTCTAGACAGCACAAAAAGATATAAAGAGAAAGAGAGTCATC
ATTTGGTTGGTT
GC

QA 10 201 10 201
DS 

RD RR4DT31JQ 362 0 0
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TATAAAGAGAAAGAGAGTCATCATTTGGTTGGTTCTTTAAATGAGCTCCCATCAACAAAA
ACATGTTTTAACTTTTAACCACCTACGCAAAACGAAAAACAAGAATGGTAAAA***GAAA
GAAGAGGGTTTTGAATCGATAGCCAATATCTTCTTCATCATCATCATCTTTCTTCTTCAC
TCAGGGGTCGAGTTTAGAGGTACTTGAAAAGGATACCACCGTGAGTGGCAAAGAAGGGAG
CAAAGACGAGAGACTCAACAGCCATGAGCTTGATCAAGATGTTCAACGAGGGTCCTGATG
T
C

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4DT31TF 362 0 0
CGGCTAAGAACAAGTCTCAAATACTTGGTGGTTTTCTAAATTCTAGACAGCACAAAAAGA
TATAAAGAGAAAGAGAGTCATCATTTGGTTGGTTCTTTAAATGAGCTCCCATCAACAAAA
ACATGTTTTAACTTTTAACCACCTACGCAAAACGAAAAACAAGAATGGTAAAA***GAAA
GAAGAGGGTTTTGAATCGATAGCCAATATCTTCTTCATCATCATCATCTTTCTTCTTCAC
TCAGGGGTCGAGTTTAGAGGTACTTGAAAAGGATACCACCGTGAGTGGCAAAGAAGGGAG
CAAAGACGAGAGACTCAACAGCCATGAGCTTGATCAAGATGTTCAACGAGGGTCCTGATG
T
C

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4D372JQ 642 0 0
AGTCTCAAATACTTGGTGGTTTTCTAAATTCTAGACAGCACAAAAAGATAAGAAACAAAC
ATAGTTCAAGACCAAAACAAACATAAGAAAAACAAAGCAGGGAGAAGTAACGGCTAAAAA
CAAGTCTCAAATACTTGGTGGCTTTCTAAATTCTAGACAGCACAAAAAGATATAAAGAGA
AAGAGAGTCATCATTTGGTTGGTTCTTTAAATGAGCTCCCATCAACAAAAACATGTTTTA
ACTTTTAACCACCTACGCAAAACGAAAAACAAGAATGGTAAAAAAAGAAAGAAGAGGGTT
TTGAATCGATAGCCAATATCTTCTTCATCATCATCATCTTTCTTCTTCACTCAGGGGTCG
AGTTTAGAGGTACTTGAAAAGGATACCACCGTGAGTGGCAAAGAGGGGAGCAAAGACGAG
AGACTCAACAGCCATGAGCTTGATCAAGATGTTCAACGAAGGTCCTGATGTATCCTTCAA
TGGGTCTCCGATAGAGTCTCCAATCACAGCTGCCTTGTGTGGCTCTGAGCCCTTTGGTCC
TAGACTCTTTGCATGCTCTGATACACCCGCCTCGATGTATTTCTTGGCGTTGTCCCAGGC
ACCACCAGTGTTAGATGCAGAAATAGCAATCTGAACACCGGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4B565JQ 944 0 0
AT
TTGGGGGTTTTCTAAATTCTAGACAGCACAAAAAGATAAGAAACAAACATAGTTCAAGAC
CAAAACAAACATAAGAAAAACAAAGCAGGGAGAAGTAACGGCTAAGAACAAGTCTCAAAT
ACTTGGTGGTTTTCTAAATTCTAGACAGTACAAAAAGATATAAAGAGAAAGAGAGTCATC
ATTTGGTTGGTCCTTTAAATGAGCTCCCATCAACAAAAACATGTTTTAACTTTTAACCAC
CTACGCAAAACGAAAAACAAGAATGGTAAAAAGAGAAAGAAGAGGGTTTTGAATCGATAG
CCAATATCTTCTTCATCATCATCATCTTTCTTCTTCACTCAGGGGTCGAGTTTAGAGGTA
CTTGAAAAGGATACCACCGTGAGTGGCAAAGAAGGGAGCAAAGACGAGAGACTCAACAGC
CATGAGCTTGATCAAGATGTTCAACGAAGGTCCTGATGTATCCTTCAATGGGTCTCCGAT
AGTGTCTCCAATCACAGCTGCCTTGTGTGGCTCTGAGCCCTTTGGTCCTAGACTCTTTGC
ATGCTCTGATACACCCGCCTCGATGTATTTCTTGGCGTTGTCCCAGGCACCACCAGTGTT
AGATGCAGAAATAGCAATCTGAACACCGGAAACAAGGGAGCCAGCCAAAACACCAGAGAG
AGTCTCAACACCAAAGAAGAAACCAACAATGAGAGGCGTGAGCATGACAAGGCAACCAGG
AGGAATCATCTCCTTGATGGAAGCGTCTGTTGAGATTTTTCGCGGGATACGGTGGCTCAT
TCCAGCCATCTCAGCGATACCACCAGCATTGTCACTGATGGGACCGTAAGCATCAATGGC
CAAACCGGGTGGCGATGGTACTTAGCATGCCTAGAGCGGCAACGGCGACACCGTACATAG
CAGCAAAGCTGAGCTAACGAATATACTGACGGCATAGCAAAG

QA 3 944 3 944
DS 



CO CL876Contig2 935 2 4 U
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CTATTGGAAAAGGATTTGCTATTGGCTCTGCCGCGCTCGTCTCCTTGGCTCTGTTCGGTG
CCTTTGTGAGCCGTGCTGGTGTCCACACCGTGGATGTTTTGACTCCAAAGGTTATCATTG
GGCTTCTCGTCGGTGCCATGCTTCCTTACTGATTCTCGGCCATGACGATGAAGAGTGTGG
GGAGTGCAGCTCTTAAGATGGTTGAAGAAGTTCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGAC
TCATGGAAGGTACCGCGAAACCAGACTACGCCACGTTCGTCAAGATCTCAACAGACGCTT
CCATCAAGGAGATGATTCCTCCTGGTTGCCTTGTCATGCTCACGCCTCTCATTGTTGGTT
TCTTCTTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTTTGGCTGGCTCCCTTGTTTCCGGTGTTC
AGATTGCTATTTCTGCATCTAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCG
AGGCGGGTGTATCAGAGCATGCAAAGAGTCTAGGACCAAAGGGCTCAGAGCCACACAAGG
CAGCTGTGATTGGAGACACTATCGGAGACCCATTGAAGGATACATCAGGGCCTTCGTTGA
ACATCTTGATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTC
ACGGTGGTATCCTTTTCAAGTACCTCTAAACTCGACCCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGAT
GATGAAGAAGAAGATATTGGCTATCGATTCAAAACCCTCTCTTCTTTCTTTTTTTACCAT
TCTTGTTTTCCGTTTTGCGTAGGTGGTTAAAAGTTGAAACATGTTTTTGTTGATGGGAGC
TCATTTAAAGAACCAACCAAATGATGACTCACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D372TF U 1
AF RR4AQ89TF U 325
BS 1 617 RR4D372TF
BS 618 618 RR4AQ89TF
BS 619 634 RR4D372TF
BS 635 935 RR4AQ89TF

RD RR4D372TF 634 0 0
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CTATTGGAAAAGGATTTGCTATTGGCTCTGCCGCGCTCGTCTCCTTGGCTCTGTTCGGTG
CCTTTGTGAGCCGTGCTGGTGTCCACACCGTGGATGTTTTGACTCCAAAGGTTATCATTG
GGCTTCTCGTCGGTGCCATGCTTCCTTACTGATTCTCGGCCATGACGATGAAGAGTGTGG
GGAGTGCAGCTCTTAAGATGGTTGAAGAAGTTCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGAC
TCATGGAAGGTACCGCGAAACCAGACTACGCCACGTTCGTCAAGATCTCAACAGACGCTT
CCATCAAGGAGATGATTCCTCCTGGTTGCCTTGTCATGCTCACGCCTCTCATTGTTGGTT
TCTTCTTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTTTGGCTGGCTCCCTTGTTTCCGGTGTTC
AGATTGCTATTTCTGCATCTAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCG
AGGCGGGTGTATCAGAGCATGCAAAGAGTCTAGGACCAAAGGGCTCAGAGCCACACAAGG
CAGCTGTGATTGGAGACTCTATCGGAGACCCATT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4AQ89TF 611 0 0
GCTACGCCACGTGCGTC
AAGATCTCGACAGACGCTTCCATCAAGGAGATGATTCCTCCTGGTTGCCTTGTCATGCTC
ACGCCTCTCATTGTTGGTTTCTTCTTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTTTGGCTGGC
TCCCTTGTTTCTGGTGTTCAGATTGCTATTTCTGCATCTAACACTGGTGGTGCCTGGGAC
AACGCCAAGAAATACATCGAGGCGGGTGTATCAGAGCATGCAAAGAGTCTAGGACCAAAG
GGCTCAGAGCCACACAAGGCAGCTGTGATTGGAGGCACTATCGGAGACCCATTGAAGGAT
ACATCAGGGCCTTCGTTGAACATCTTGATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTT
GCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGTATCCTTTTCAAGTACCTCTAAACTCGACCCCTG
AGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGAAGAAGATATTGGCTATCGATTCAAAACCCTCTC
TTCTTTCTTTTTTTACCATTCTTGTTTTCCGTTTTGCGTAGGTGGTTAAAAGTTGAAACA
TGTTTTTGTTGATGGGAGCTCATTTAAAGAACCAACCAAATGATGACTCACAAA

QA 18 611 18 611
DS 



AS 2 7

CO CL877Contig1 861 3 9 U
GGACCTTAATATCCACAAAATAAAAAATAATTACTAGAGCTTGAGAGAAACCTTAAATGG
CTGAGGGACAACAAAACTCAGGTAACAGCAATGGTGAAAACATCATCCCTCCCGAAGATG
TTGCTAAGTTCCTGCCCAAAACTGTTGAAGAAGGTGGATGGGAAAAATGTTGGGAAGATG
GGGTAACACCATGGGACCAAGGAAGAGCCACACCCCTCGTTGTCCATCTTGTTGAATCTT
CTTCTCTTCCTCTTGGTCGTGCTCTTGTCCCCGGCTGTGGCGGAGGTCACGATGTGGTTG
CGATGGCAAGTCCCGAACGTTACGTTGTTGGTTTGGATATTTCTGAAAGTGCCCTCGAGA
AAACTGCTGAGACTTACGCCTCCTCACCGAAGGCCAAGTACTTTACGTTCGTGAAGGAAG
ACTTCTTCACATGGCGTCCTAGTGAATTATTCGACCTCATCTTCGATTATGTGGTCTTCT
GTGCCATTGAGCCGGAGATGAGAGCTGCATGGGCCAAAGCCATGTATGAACTCTTAAAAC
CCGACGGCGAACTCATTACTCTCATGTATCCGATTACTGATCATGATGGTGGACCTCCTT
ACAAAGTAGCTGTCTCTACCTACGAAGATGTTTTGGTTCCGGTAGGATTCAAGGCAGTGT
CCATTGAGGAGAATCCATACTCCATTGCCACTCGTAAGGGTAAAGAGAAGCTTGGTAGGT
GGAAGAAGATCAACTGATCCAAGAAAGATCTCTCTTAGTCTTTACTAAGAGTCTTATATG
CATATTTTACCCATGTATTAAGAATAAAATGAATATTCTACAAATTTGCTGATTATTAAT
AATAAACGTAATGTTTCTGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO89TF U 1
AF RR4FB44TF U 1
AF RR4FB44JQ C 136
BS 1 346 RR4BO89TF
BS 347 347 RR4FB44TF
BS 348 358 RR4BO89TF
BS 359 359 RR4FB44TF
BS 360 362 RR4BO89TF
BS 363 363 RR4FB44TF
BS 364 650 RR4BO89TF
BS 651 694 RR4FB44TF
BS 695 861 RR4FB44JQ

RD RR4BO89TF 650 0 0
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CTTCTCTTCCTCTTGGTCGTGCTCTTGTCCCCGGCTGTGGCGGAGGTCACGATGTGGTTG
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GTGCCATTGAGCCGGAGATGAGAGCTGCATGGGCCAAAGCCATGTATGAACTCTTAAAAC
CCGACGGCGAACTCATTACTCTCATGTATCCGATTACTGATCATGATGGTGGACCTCCTT
ACAAAGTAGCTGTCTCTACCTACGAAGATGTTTTGGTTCCGGTAGGATTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4FB44TF 694 0 0
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CTGAGGGACAACAAAACTCAGGTAACAGCAATGGTGAAAACATCATCCCTCCCGAAGATG
TTGCTAAGTTCCTGCCCAAAACTGTTGAAGAAGGTGGATGGGAAAAATGTTGGGAAGATG
GGGTAACACCATGGGACCAAGGAAGAGCCACACCCCTCGTTGTCCATCTTGTTGAATCTT
CTTCTCTTCCTCTTGGTCGTGCTCTTGTCCCCGGCTGTGGCGGAGGTCACGATGTGGTTG
CGATGGCAAGTCCCGAACGTTACGTTGTTGGTTTGGATATTTCTGAAAGTGCCCTCGAGA
AAACTGCTGAGACTTACGCCTCCTCACCGAAGGCCAAGTACTTTACGTTCGTGAAGGAAG
ACTTCTTCACATGGCGTCCTAGTGAATTATTCGACCTCATCTTCGATTATGTGGTCTTCT
GTGCCATTGAGCCGGAGATGAGAGCTGCATGGGCCAAAGCCATGTATGAACTCTTAAAAC
CCGACGGCGAACTCATTACTCTCATGTATCCGATTACTGATCATGATGGTGGACCTCCTT
ACAAAGTAGCTGTCTCTACCTACGAAGATGTTTTGGTTCCGGTAGGATTCAAGGCAGTGT
CCATTGAGGAGAATCCATACTCCATTGCCACTCG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4FB44JQ 726 0 0
CCAAAACTGTTGAAGAAGGTGGATGGGAAAAATGTTGGGAAGATGGGGTAACACCATGGG
ACCAAGGAAGAGCCACACCCCTCGTTGTCCATCTTGTTGAATCTTCTTCTCTTCCTCTTG
GTCGTGCTCTTGTCCCCGGCTGTGGCGGAGGTCACGATGTGGTTGCGATGGCAAGTCCCG
AACGTTACGTTGTTGGTTTGGATATTTCTGAAAGTGCCCTCGAGAAAACTGCTGAGACTT
ACGCCTCCTCACCGAAGGCCAAGTACTTTACGTTCGTGAAGGAAGACTTCTTCACATGGC
GTCCTAGTGAATTATTCGACCTCATCTTCGATTATGTGGTCTTCTGTGCCATTGAGCCGG
AGATGAGAGCTGCATGGGCCAAAGCCATGTATGAACTCTTAAAACCCGACGGCGAACTCA
TTACTCTCATGTATCCGATTACTGATCATGATGGTGGACCTCCTTACAAAGTAGCTGTCT
CTACCTACGAAGATGTTTTGGTTCCGGTAGGATTCAAGGCAGTGTCCATTGAGGAGAATC
CATACTCCATTGCCACTCGTAAGGGTAAAGAGAAGCTTGGTAGGTGGAAGAAGATCAACT
GATCCAAGAAAGATCTCTCTTAGTCTTTACTAAGAGTCTTATATGCATATTTTACCCATG
TATTAAGAATAAAATGAATATTCTACAAATTTGCTGATTATTAATAATAAACGTAATGTT
TCTGAC

QA 1 726 1 726
DS 



CO CL877Contig2 647 4 3 U
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CTTAATACATGGGTAGAATATGCATATAAAACTCTTAGTAAAGACTAAAAAAGATCTTTC
TTGGATCAGTTGATCTTCTTCCACCTACCAAGCTTCTCTTTACCCTTACGAGTGGCAATG
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TGGGTAGAGACAGCTACTTTGTAAGGAGGTCCACCATCATGATCAGTAATCGGATACATG
AGAGTAATGAGTTCGCCGTCGGGTTTTAAGAGTTCATACATGGCTTTGGCCCATGCAGCT
CTCATCTCCGGCTCAATGGCACAGAAGACCACATAATCGAAGATGAGGTCGAATAATTCA
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TAACGTTCGGGACTCGCCATCGCAACCACATCGTGACCCTTCTTCAACAGTTTTGGGCAG
GAACTTAGCAACATCTTCGGGAGGGATGATGTTTTCACCATTGCTCC


BQ
10 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EW43JQ U 2
AF RR4FJ31JQ U 2
AF RR4EW43TF C 1
AF RR4FJ31TF C 1
BS 1 1 RR4EW43TF
BS 2 386 RR4EW43JQ
BS 387 647 RR4EW43TF

RD RR4EW43JQ 385 0 0
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TCATCTCCGGCTCAATGGCACAGAA

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR4FJ31JQ 385 0 0
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TTAATACATGGGTAGAATATGCATATAAAACTCTTAGTAAAGACTAAAAAAGATCTTTCT
TGGATCAGTTGATCTTCTTCCACCTACCAAGCTTCTCTTTACCCTTACGAGTGGCAATGG
AGTATGGATTCTCCTCAATGGACACTGCCTTGAATCCTACCGGAACCAAAACATCTTCGT
GGGTAGAGACAGCTACTTTGTAAGGAGGTCCACCATCATGATCAGTAATCGGATACATGA
AAGTAATGAGTTCGCCGTCGGGTTTTAAAAATTCATACATGGCTTTGGCCCATGCAGCTC
TCATCTCCGGCTCAATGGCACAGAA

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR4EW43TF 647 0 0
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CTTAATACATGGGTAGAATATGCATATAAGACTCTTAGTAAAGACTAAGAGAGATCTTTC
TTGGATCAGTTGATCTTCTTCCACCTACCAAGCTTCTCTTTACCCTTACGAGTGGCAATG
GAGTATGGATTCTCCTCAATGGACACTGCCTTGAATCCTACCGGAACCAAAACATCTTCG
TGGGTAGAGACAGCTACTTTGTAAGGAGGTCCACCATCATGATCAGTAATCGGATACATG
AGAGTAATGAGTTCGCCGTCGGGTTTTAAGAGTTCATACATGGCTTTGGCCCATGCAGCT
CTCATCTCCGGCTCAATGGCACAGAAGACCACATAATCGAAGATGAGGTCGAATAATTCA
CTAGGACGCCATGTGAAGAAGTCTTCCTTCACGAACGTAAAGTACTTGGCCTTCGGTGAG
GAGGCGTAAGTCTCAGCAGCTTTCTCAAGGGCACTTTCAGAAATATCCAAACCAACAACG
TAACGTTCGGGACTCGCCATCGCAACCACATCGTGACCCTTCTTCAACAGTTTTGGGCAG
GAACTTAGCAACATCTTCGGGAGGGATGATGTTTTCACCATTGCTCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4FJ31TF 647 0 0
T
ATCAGAAACATTACGTTTATTATTAATAATCAGCAAATTTGTAGAATATTCATTTTATTC
TTAATACATGGGTAGAATATGCATATAAGACTCTTAGTAAAGACTAAGAGAGATCTTTCT
TGGATCAGTTGATCTTCTTCCACCTACCAAGCTTCTCTTTACCCTTACGAGTGGCAATGG
AGTATGGATTCTCCTCAATGGACACTGCCTTGAATCCTACCGGAACCAAAACATCTTCGT
GGGTAGAGACAGCTACTTTGTAAGGAGGTCCACCATCATGATCAGTAATCGGATACATGA
GAGTAATGAGTTCGCCGTCGGGTTTTAAGAGTTCATACATGGCTTTGGCCCATGCAGCTC
TCATCTCCGGCTCAATGGCACAGAAGACCACATAATCGAAGATGAGGTCGAATAATTCAC
TAGGACGCCATGTGAAGAAGTCTTCCTTCACGAACGTAAAGTACTTGGCCTTCGGTGAGG
AGGCGTAAGTCTCAGCAGCTTTCTCAAGGGCACTTTCAGAAATATCCAAACCAACAACGT
AACGTTCGGGACTCGCCATCGCAACCACATCGTGACCCTTCTTCAACAGTTTTGGGCAGG
AACTTAGCAACATCTTCGGGAGGGATGATGTTTTCACCATTGCTCC

QA 2 647 2 647
DS 



AS 1 8

CO CL878Contig1 1350 8 15 U
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CGCAACCGCTGTCTCCGTCGCGATCCTCTTCCTATTCACCATCTCCTCCGCCTCGCCAAC
TCTCGGCGTCCGTCGTCCGTTCAACAGAATCTACGCCTTCGGCGACTCTTTCACCGACAC
AGGAAACTCACGAGCCGGCGAAGGCCCCGCTGGGTTCGGACACTTGTCAAGCTTCCCTTA
CGGCATGACTTACTTCAAACGGCCGACGAACCGTTACTCCGACGGGCGGCTCACCATCGA
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TGCCTACACCGTTGGATCCACTGTGTCAAGCGACACCATTAGAGAACTTAGTATTACAAC
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ACATCCAGCAACTGGATGCTTGACGTTAGCGATGTCGCTGGCTGCAGAAGACGATCGAGA
CTATCTAGGATGTGTTCAGAGTGTCAATAACCAGAGTTACACTCACAATCTTGCATTGCA
ATACAAACTTAAACAACTTAGGATCAAGTATCCGAACGCTACAATAGTCTACGCAGACTA
CTGGAACGCGTACCGTGAGGTGATAAAGAACCCTAGCAAGTACGGCATCTCCGAAAAGTT
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AGCTACAGCAACCGCGTGTAAGGACCCGAGTCGGTACATTAACTGGGATGGAGTCCACTT
AACCGAGGGCATGTATAAGGTTATGGCCGACATGTTCCTCGGCGGCAGTTTCACTCGACC
TAAGTTTAGTTACTTGTTGAACAAGAAACTAAAAGGTTTATGATGAAAAAGGTTTTACCG
ATTTCCATATATATGATTGTATGGTTTTGGAGTTTTGACATTTTTGTTGAATTATGATCA
CGTGAATCATTTTAGACTCCTACTTACTAAAGCAAATCTGATGACACCGATGAAAAAAGT
TAAAGAAGCTATCCCATGCATCTTTCAATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD16TF U 1
AF RR4C337TF U 4
AF RR4H194TF U 4
AF RR4CD16JQ C 487
AF RR4H194JQ C 510
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AF RR4E520TF U 680
AF RR4C337JQ C 629
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BS 53 481 RR4CD16TF
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BS 483 539 RR4CD16TF
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BS 639 695 RR4H194TF
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BS 715 857 RR4E520TF
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BS 1281 1350 RR4C337JQ

RD RR4CD16TF 539 0 0
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TCTCGGCGTCCGTCGTCCGTTCAACAGAATCTACGCCTTCGGCGACTCTTTCACCGACAC
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CGGCATGACTTACTTCAAACGGCCGACGAACCGTTACTCCGACGGGCGGCTCACCATCGA
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CGACGGCAGTAACGGCACCGCCACGGATAGTTACGGCGTCAACTTCGCCGTCTCCGGAGC
GACCGTGATAAAACACGCTTTCTTCGCCGAGAACAATCTCACGCTTGATATGACTCCTGA
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DS 

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GG
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CCGCTGTCTCCGTCGCGATCCTCTTCCTATTCACCATCTCCTCCGCCTCGCCAACTCTCG
GCGTCCGTCGTCCGTTCAACAGAATCTACGCCTTCGGCGACTCTTTCACCGACACAGGAA
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TGATAAAACACGCTTTCTTCGCCGAGAACAATCTCACGCTTGATATGACTCCTGAGTCTT
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ACACCGTTGGATCCACTGTGTCAAGCGACACCA

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DS 

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GG
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CCGCTGTCTCCGTCGCGATCCTCTTCCTATTCACCATCTCCTCCGCCTCGCCAACTCTCG
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ACTCACGAGCCGGCGAAGGCCCCGCTGGGTTCGGACACTTGTCAAGCTTCCCTTACGGCA
TGACTTACTTCAAACGGCCGACGAACCGTTACTCCGACGGGCGGCTCACCATCGACTTCG
TGGCGCAGTCGATGAACTTGCCGTTTCTGCCACCTTACCTCAGCCTCAGATCCACCGACT
GCAGTAACGGCACCGCCACGGATAGTTACGGCGTCAACTTCGCCGTCTCCGGAGCGACCG
TGATAAAACACGCTTTCTTCGCCGAGAACAATCTCACGCTTGATATGACTCCTGAGTCTT
TAGAG*CGGAGCTTGGCTGGTTCGAAAAGTATCTGGAGACACTCGGAACGAGCCAGAAGG
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TATGATTGTATGGTTTTGGAGTTTTGACATTTTTGTTGAATTA

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DS 

RD RR4H194JQ 778 0 0
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TTTGGATCGGAGAGATCGGAGTTAACGACTATGCCTACACCGTTGGATCCACTGTGTCAA
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ACAAAGGTGTGAGACATTTGGTTGTACAAGGACATCCAGCAACTGGATGCTTGACGTTAG
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ACCAGAGTTACACTCACAATCTTGCATTGCAATACAAACTTAAACAACTTAGGATCAAGT
ATCCGAACGCTACAATAGTCTACGCAGACTACTGGAACGCGTACCGTGAGGTGATAAAGA
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TAAAAGGTTTATGATGAAAAAGGTTTTACCGATTTCCATATATATGATTGTATGGTTTTG
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TACTTAC

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AGAGCCGTACAACTTCCAAGTATTCGAGACGTGTGGGTCAGCTACAGCAACCGCGTGTAA
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TGGTTTTGGAGTTTTGACATTTTTGTTGAATTATGATCACGTGAATCATTTTAGACTCC

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DS 

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G
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AGGACCCGAGTCGGTACATTAACTGGTATGGAGTCCACTTAACCGAGGGCATGTATAAGG
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ATGGTTTTGGAGTTTTGACATTTTTGTTGAATTATGATCACGTGAATCATTTTAGACTCC

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DS 

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GCGATGTCGCTGGCTGCAGAAGACGATCGAGACTATCTAGGATGTGTTCAGAGTGTCAAT
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TATCCGAACGCTACAATAGTCTACGCAGACTACTGGAACGCGTACCGTGAGGTGATAAAG
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TACAACTTCCAAGTATTCGAGACGTGTGGGTCAGCTACAGCAACCGCGTGTAAGGACCCG
AGTCGGTACATTAACTGGGATGGAGTCCACTTAACCGAGGGCATGTATAAGGTTATGGCC
GACATGTTCCTCGGCGGCAGTTTCACTCGACCTAAGTTTAGTTACTTGTTGAACAAGAAA
CTAAAAGGTTTATGATGAAAAAGGTTTTACCGATTTCCATATATATGATTGTATGGTTTT
GGAGTTTTGACATTTTTGTTGAATTATGATCACGTGAATCATTTTAGACTCCTACTTACT
AAAGCAAATCTGATGACACCGATGAAAAAAGTTAAAGAAGCTATCCCATGCATCTTTCAA
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 8

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GGTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTA
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CAGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACT
GTCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTA
TTGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTT
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ACTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAG
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TTTTTTTTAATTACCAAATCGTTTATTCC


BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CJ59TF U 2
AF RR4EN11TF U -1
AF RR4BJ47JQ C 1
AF RR4CJ59JQ C 2
AF RR4EJ05JQ C -3
AF RR4EJ05TF U -3
AF RR4CU34JQ C 2
AF RR4BJ47TF U 1
BS 1 1 RR4BJ47JQ
BS 2 209 RR4CJ59TF
BS 210 210 RR4EN11TF
BS 211 367 RR4CJ59TF
BS 368 368 RR4EN11TF
BS 369 399 RR4CJ59TF
BS 400 400 RR4EN11TF
BS 401 424 RR4CJ59TF
BS 425 425 RR4EN11TF
BS 426 432 RR4CJ59TF
BS 433 433 RR4EN11TF
BS 434 440 RR4CJ59TF
BS 441 441 RR4EN11TF
BS 442 452 RR4CJ59TF
BS 453 630 RR4EN11TF
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TGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGG
GTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCA*TTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAG
CCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGT
TCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATC
AGTAGA*AATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGT*CATGGACAATCCTCCAGACTG
TCA*ACTCTTC*TAAGGGA*TATTCGCTGCG

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DS 

RD RR4EN11TF 632 0 0
GGGA
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AACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGTT
GTGCAGGACACCGAGGTGCAATACAACTATTGTGCGTATGATTCTGACAGAGCCACAGGG
TATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAGC
CGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGTT
CTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATCA
GTAGAGAGTGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGGCAATCCTCCAGACTGT
CAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTATT
GTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTAC
TAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTTATTTCTTATATGCTATGTGATATATAC
TATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTT

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DS 

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TCAACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGG
TTGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAG
GGTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTA
GCCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTG
TTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTTTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGAT
CAGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACT
GTCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTTTTCTTCAACTCTA
TTGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTT
ACTAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTTATTTCTTATATGCTATGTGATATAT
ACTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAG
CTGAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTT
TTTTTTTTAATTACCAAATCGTTTATTCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4CJ59JQ 734 0 0
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CAACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGT
TGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGG
GTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAG
CCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGT
TCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATC
AGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTG
TCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTAT
TGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTA
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CTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAGC
TGAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTTT
TTTTTTTAATTACC

QA 1 734 1 734
DS 

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AACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGTT
GTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGGG
TATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAGC
CGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGTT
CTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATCA
GTAGAGAATGCATACCA*****AGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTGT
CAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTATT
GTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTAC
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TATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAGCT
GAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTTTT
TTTTTTAATT

QA 7 736 7 736
DS 

RD RR4EJ05TF 734 0 0
GGAAGA
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AACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGTT
GTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGGG
TATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAGC
CGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGTT
CTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATCA
GTAGAGAATGCATACCA*****AGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTGT
CAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTATT
GTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTAC
TAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTTATTTCTTATATGCTATGTGATATATAC
TATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAGCT
GAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTTTT
TTTTT
ATT

QA 7 731 7 731
DS 

RD RR4CU34JQ 734 0 0
GGAGCGAGAGTAAGGTGAACCCATGGCGTCGAAGATTGTCTCAGCCATAGTCTTTGTATT
CAACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGT
TGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGG
GTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAG
CCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGT
TCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATC
AGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTG
TCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTAT
TGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTA
CTAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTTATTTCTTATATGCTATGTGATATATA
CTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAGC
TGAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTTT
TTTTTTTAATTACC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4BJ47TF 749 0 0
G
GGAGCGAGAGTAAGGTGAACCCATGGCGTCGAAGATTGTCTCAGCCATAGTCTTTGTATT
CAACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGT
TGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGG
GTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAG
CCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGT
TCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATC
AGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTG
TCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACTCTAT
TGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTA
CTAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTTATTTCTTATATGCTATGTGATATATA
CTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAGC
TGAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTTT
TTTTTTTAATTACCAAATCGTTTATTCC

QA 2 749 2 749
DS 



AS 1 7

CO CL880Contig1 684 7 16 U
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGT**GCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAAGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACGGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTTGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTT
CGTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATTTGAGCAATT
TTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTT*GTTACATTATAAGATAA
TATTTTGTTACTGTGTCTTTTCCA


BQ
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4FA28TF U 1
AF RR4B616JQ C 52
AF RR4B616TF U 2
AF RR4B988TF U 2
AF RR4B988JQ C 2
AF RR4AP65JQ C 1
AF RR4AP65TF U 1
BS 1 1 RR4AP65JQ
BS 2 90 RR4FA28TF
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BS 92 154 RR4FA28TF
BS 155 156 RR4B616TF
BS 157 184 RR4FA28TF
BS 185 185 RR4B616TF
BS 186 298 RR4FA28TF
BS 299 299 RR4B616TF
BS 300 327 RR4FA28TF
BS 328 328 RR4B616TF
BS 329 510 RR4FA28TF
BS 511 511 RR4B616TF
BS 512 531 RR4FA28TF
BS 532 655 RR4B616TF
BS 656 684 RR4AP65TF

RD RR4FA28TF 531 0 0
G
GACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTTC
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GTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACCGT
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AAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAA
TCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCA
AGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAA

QA 2 531 2 531
DS 

RD RR4B616JQ 604 0 0
TCTTCTCTTCCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTG
CGTGTGCTCAACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGT**GCCCTTACCTCCATC
AAGGGTATTGGCAAGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAAC
AAGAGGGCTGGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAAC
CCAAAACAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACGGACAGAAAGACTACAAGGATGGA
AAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGC
CTCAAGAAAATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGT
CAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTTGTGTCTCTAAGAAGCGTTAA
GCCAGTGTTCGTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATT
TGAGCAATTTTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTT*GTTACATT
ATAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4B616TF 654 0 0
GACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTTC
CAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCA
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GCAAGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTG
GTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAGT
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AAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAA
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AGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTTGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTTC
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TGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTT*GTTACATTATAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4B988TF 654 0 0
GACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTTC
CAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCA
ACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGT**GCCCTTACCTCCATCAAGGGTATTG
GCAAGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTG
GTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAGT
ACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACGGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCTC
AAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAA
TCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCA
AGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTTGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTTC
GTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATTTGAGCAATTT
TGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTTTGTTACATTATAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4B988JQ 654 0 0
GACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTTC
CAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCA
ACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGT**GCCCTTACCTCCATCAAGGGTATTG
GCAAGCGTTTGGCCAACATCGTTTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTG
GTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAGT
ACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACGGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCTC
AAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAA
TCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCA
AGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTTGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTTC
GTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATTTGAGCAATTT
TGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTT*GTTACATTATAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4AP65JQ 683 0 0
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGCCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTT
CGTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATTTGAACAATT
TTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTT*GTTACATTATAAGATAA
TATTTTGTTACTGTGTCTTTTCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4AP65TF 684 0 0
G
GACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGCCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTTC
CAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCA
ACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATTG
GCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTG
GTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAGT
ACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCTC
AAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAA
TCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCA
AGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTTC
GTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATTTGAACAATTT
TGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTT*GTTACATTATAAGATAAT
ATTTTGTTACTGTGTCTTTTCCA

QA 2 684 2 684
DS 



AS 1 8

CO CL881Contig1 890 8 25 U
GGAGAACTGATATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCG
CCTTTATTCGCATCTTCCAAGAGAGCAGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTC
GAGACTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATT
CAGCCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGT
GCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTTGTTGGGAAAG
ACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCAT
CCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCT
GATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAA
GCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCT
CACCTCCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGAT
AGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTT
TCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAAAAAACAATGA*GATGTGGTTTG
TTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAG**GCTTTGTGTACTGTGTGGGT*G
TCTGGTTTCAGTTCAGTGTCTTTTGGTTCTAATAAAAAGTAAAAACTCTGTTTTATAAAT
ATCAAAGGTTGTAATAAAGGGGGAAAAAGAATCCTTCCTTTGTCAGGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 10 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 0 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW79TF U 1
AF RR4F293TF U 4
AF RR4EK07TF U 1
AF RR4CL62TF U 12
AF RR4CL62JQ C 65
AF RR4F293JQ C 104
AF RR4GW79JQ C 185
AF RR4EK07JQ C 220
BS 1 80 RR4EK07TF
BS 81 81 RR4F293TF
BS 82 86 RR4EK07TF
BS 87 87 RR4F293TF
BS 88 134 RR4EK07TF
BS 135 135 RR4F293TF
BS 136 296 RR4EK07TF
BS 297 297 RR4F293TF
BS 298 360 RR4EK07TF
BS 361 361 RR4F293TF
BS 362 545 RR4EK07TF
BS 546 546 RR4F293TF
BS 547 697 RR4EK07TF
BS 698 698 RR4CL62TF
BS 699 701 RR4EK07TF
BS 702 702 RR4CL62JQ
BS 703 708 RR4EK07TF
BS 709 709 RR4CL62TF
BS 710 731 RR4EK07TF
BS 732 758 RR4CL62TF
BS 759 759 RR4CL62JQ
BS 760 817 RR4CL62TF
BS 818 818 RR4CL62JQ
BS 819 836 RR4GW79JQ
BS 837 890 RR4EK07JQ

RD RR4GW79TF 579 0 0
GGAGAACTGAT
ATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTATTCGC
ATCTTCCAAAAGAGCTGTGGTGACGTTAGTTGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTGTCAA
TGTTGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTTTCGG
TAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAG
GTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGTACCAGACTTGTTGTGGAAGACAATTGAAGA
GAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATTCACCACTACT
AGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGT
TATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCACAGCTTTC
AAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACCTTCCCTT
CACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGG

QA 12 579 12 579
DS 

RD RR4F293TF 684 0 0
GGGAACTG
ATAGGGAAGAAATAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTATTCGC
ATCTTCCAAGAGAGCAGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTGTCAA
TGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTC**CCTTTCGG
TAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAG
GTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTGAAGA
GAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCACTACT
AGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGT
TATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCACAGCTTTC
AAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTT
CACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGT
GAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTCTGAGAAATA
TGCATTGCCGGTTTAG

QA 9 684 9 684
DS 

RD RR4EK07TF 731 0 0
GGAGAACTGATATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCG
CCTTTATTCGCATCTTCCAAAAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTC
GAGACTGTCAATGTTGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATT
CAGCCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGT
GCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTTGTTGGGGAAG
ACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCAT
TCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCT
GATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAA
GCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCT
CACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGAT
AGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTT
TCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAGAAA*CAATGAAGATGTGGTTTG
TTTGTTGTTGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4CL62TF 814 0 0
GG
AGGGAAGAAATAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTATTCGCAT
CTTCCAAGAGAGCAGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTGTCAATG
TCGATCTCTTGAAAGGAGAGCGGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTTTCGGTA
AGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGT
ACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTGAAGAGA
GGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCACTACTAG
CACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTA
TAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCACAGCTTTCAA
AGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCA
CCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGA
GCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAAGAAGTTTCTGAGAAATATG
CATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAAAAA*CAATGA*GATGTGGTTTGTTTGTTGTTGTGA
TGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAG***CTTTGTGTACTGTGTGGGT*GTCTGGTTTCAGTT
CAGTGTCTTTTGGTTCTAATAAAA
CTGTTTTT

QA 3 806 3 806
DS 

RD RR4CL62JQ 763 0 0
TATTCGCATCTTCCAAGAGAGCAGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGA
CTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCGGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGC
CTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCA
TCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTTGTTGGGAAAGACAA
TTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCAC
CACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATG
AGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCAC
AGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACC
TCCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGA
AGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTTTG
AGAAATATGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAAAAAACAATGA*GATGTGGTTTGTTTG
TTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAG**GCTTTGTGTACTGTGTGGGT*GTCTG
GTTTCAGTTCAGTGTCTTTTGGTTCTAATAAAAA
CTGTTTTAT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4F293JQ 724 0 0
AGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGC
CTGAGTATATTGCCATTC**CCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACA
AAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGAC
CAGACTTGTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGG
AAGCAACAAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCAC
TCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAG
TGCTTGACGTGTACGAAGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGA
GTCTAGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGG
CTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTG
CTGCGTGGAAGGAAGTTTCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAAAAAAC
AATGA*GATGTGGTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAG**GCTTT
GTGTACTGTGTGGGT*GTCTGGTTTCAGTTCAGTGTCTTTTGGTTCTAATAAAAA
CTGTTTTAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4GW79JQ 652 0 0
CTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCA
TCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGTACCAGACTTGTTGTGGAAGACAA
TTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATTCAC
CACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATG
AGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCAC
AGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACC
TTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGA
AGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTTTG
AGAAATATGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAGAAAACAATGA*GATGTGGTTTGTTTG
TTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGTGTGGCTTTGTGTACTGTGTGGGTCGTCTG
TTTTGAGGTCAATGTCTTTTGGTTATAATAAAAAGTAAAAACTCTGTTTTAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4EK07JQ 671 0 0
TACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAA
GGACCAGACTTGTTGGGGAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGAC
GTGGAAGCAACAAGCTACCATTCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCA
CCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCT
GAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTC
GTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGG
AAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAAC
CGTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAAGAAGA
AAACAATGA*GATGTGGTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGTATGG
CTTTGTGTACTGTGTGGGTCGTCTGTTTTGAGGTCAATGTCTTTTGGTTATAATAAAAAG
TAAAAACTCTGTTTTATAAATATCAAAGGTTGTAATAAAGGGGGAAAAAGAATCCTTCCT
TTGTCAGGCAG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 8

CO CL882Contig1 676 8 13 U
GGGGGTCTCGGAGATTCTCGCTCACTTGTTTGTTCAGGTCTGTAGAAAATGAAGCCGGTG
ATAGGTACGGTGGTGTCGAACAAGATGCAGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTC
TTCCACAACAAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGAC
GAGAAGAACGCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGC
AAGCATAAGAATTGGATTGTTGCTGAAATCATAAAGAAAGCAAGAATCTATTCTCCACAG
GCTGCTGCTGCTCTCAATTTCTCAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTCTTCGATTCCCCCT
GTTTCATCTTCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTCTTCTTGGTTT
TGAGTCTTATTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGT
TGAGGAACGTCATGTGACTTTGCTGTTTCTGAAAAATAAGTTATCTGACATTCGGCATAT
GTGGCAATGTAGCTTTGTTGGGCATTTCGGTTTTACGTTTTTGAAGTTGTTAGAACCATT
TTGCTGGTGGCTACTTTGTCTTGGTTACCGGTCGCTTTCTCCTAAAGGGTTACCACAGTT
ATTGTGGTGCATCTAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4CE58TF U 10
AF RR4CE58JQ C 235
AF RR4F062JQ C 10
AF RR4F062TF U 10
AF RR4GM26JQ C 1
AF RR4GM26TF U 2
AF RR4B217JQ C 10
AF RR4B217TF U 10
BS 1 1 RR4GM26JQ
BS 2 9 RR4GM26TF
BS 10 68 RR4F062TF
BS 69 69 RR4GM26TF
BS 70 88 RR4F062TF
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BS 411 413 RR4CE58TF
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AAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGATGAGAAGAAC
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AATTGGATTGTTGCTGAAATCATAAAGAAAGCAAGAATCTATTCTCCACAGGCTGCTGCT
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TCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTCTTCTTGGTTTTGAGTCTTA
TTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCACTGTTGAGGAACG
TCATGTGACTTTGCTTTTTCTGAAAAATAAGTTATCTGACATTCG
AC

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CCCCCTGTTTCATCTTCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTCTTCT
TGGTTTTGAGTCTTATTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTT
CACTGTTGAGGAACGTCATGTGACTTTGCTTTTTCTGAAAAA

QA 1 282 1 282
DS 

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GTGGTGTCGAACAAGATGCGGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACAAC
AAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAGAAC
GCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGCAAGCATAAG
AATTGGATTGTTGCTGAAATCATAAAGAAAGCAAGAATCTATTCTCCACAGGCTGCTGCT
GCTCTCAATTTTTCAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTCTTCGATTCCCCCTGTTTCATCT
TCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTC***TTGGTTTTGAGTCTTA
TTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGTTGAGGAACG
TCATGTGACTTTGCTGTTTCTGAAAAATAAGTTATCTGACATTCGGCATATGTGGCAATG
TATCTTTGTTGG
AC

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DS 

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GTGGTGTCGAACAAGATGCGGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACAAC
AAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAGAAC
GCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGCAAGCATAAG
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GCTCTCAATTTCTCAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTCTTCGATTCCCCCTGTTTCATCT
TCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTC***TTGGTTTTGAGTCTTA
TTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGTTGAGGAACG
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TATCTTTGTTGG
AC

QA 1 552 1 552
DS 

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ATAGGTACGGTGGTGTCGAACAAGATGCAGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTC
TTCCACAACAAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGAC
GAGAAGAACGCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGC
AAGCATAAGAATTGGATTGTTGCTGAAATCATAAAGAAAGCAAGAATCTATTCTCCACAG
GCTGCTGCTGCTCTCAATTTTTCAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTTTTCGATTCCCCCT
GTTTCATCTTCTTAAGCCGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTC***TTGGTTT
TGAGTTTTATTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGT
TGAGGAACGTCATGTGACTTTGCTGTTTTTGAAAAATAAGTTATTTGACATTCGGCATAT
GTGGCAATGTAGCTTTGTTGGGCATTTCGGTTTTACGTTTTTGAAGTTGTTAGAACCATT
TTGCTGGTGGCTACTTTGTCTTGGTTACCGGTCGCTTTCTCCTAAAGGGTTACCACAGTT
ATTGTGGTGCA
TCG

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DS 

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TAGGTACGGTGGTGTCGAACAAGATGCAGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTCT
TCCACAACAAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACG
AGAAGAACGCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGCA
AGCATAAGAATTGGATTGTTGCTGAAATCATAAAGAAAGCAAGAATCTATTCTCCACAGG
CTGCTGCTGCTCTCAATTTCTCAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTCTTCGATTCCCCCTG
TTTCATCTTCTTAAGCCGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTC***TTGGTTTT
GAGTCTTATTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGTT
GAGGAACGTCATGTGACTTTGCTGTTTCTGAAAAATAAGTTATCTGACATTCGGCATATG
TGGCAATGTAGCTTTGTTGGGCATTTCGGTTTTACGTTTTTGAAGTTGTTAGAACCATTT
TGCTGGTGGCTACTTTGTCTTGGTTACCGGTCGCTTTCTCCTAAAGGGTTACCACAGTTA
TTGTGGTGCA

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DS 

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AAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAGAAC
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TCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTCTTCTTGGTTTTGAGTCTTA
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CATCTAT

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DS 

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GTGGTGTCGAACAAGATGCAGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACAAC
AAGCTATACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAGAAC
GCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGCAAGCATAAG
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GCTCTCAATTTCTTAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTCTTCGATTCCCCCTGTTTCATCT
TCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTCTTCTTGGTTTTGAGTCTTA
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TCATGTGACTTTGCTGTTTCTGAAAAATAAGTTATCTGACATTCGGCATATGTGGCAATG
TAGCTTTGTTGGGCATTTCGGTTTTACGTTTTTGAAGTTGTTAGAACCATTTTGCTGGTG
GCTACTTTGTCTTGGTTACCGGTCGCTTTCTCCTAAAGGGTTACCA**GTTATTGTGGTG
CA
TCTAT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 8

CO CL883Contig1 757 8 14 U
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GAGATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCC
TTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAG
AAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTG
CCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGC
TTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAACAAG
CATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTT
GACCTCACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAAC
CTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGAT
GATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCAT
GTGCTAGTGAAGAGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAATTAGGCATAATAATAA
AGCGGTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTCTTGTTGTGTCATTCTTCGTA
TATTTATGAAATAAATTTGAGTGATCACAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED19TF U 7
AF RR4FF51TF U 5
AF RR4C705TF U 86
AF RR4C510TF U 1
AF RR4ED19JQ C 167
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AF RR4C510JQ C 58
AF RR4CE28TF U 7
BS 1 37 RR4C510TF
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BS 39 272 RR4C510TF
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RD RR4ED19TF 638 0 0
GGAGAC
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TTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATT
GAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAAT
GATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTT
GTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGAC
AAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACT
GTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAG
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AGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAA

QA 7 638 7 638
DS 

RD RR4FF51TF 640 0 0
GGAGACAC
ACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAACTCTTTTATACCTTCTCCGCCGAGATCTCCTCC
ATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAG
AACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTC
TTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATT
GAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAAT
GATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTT
GTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGAC
AAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACT
GTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAG
GCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTGAAG
AGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAA

QA 9 640 9 640
DS 

RD RR4C705TF 561 0 0
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AGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTG
GTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAGG
AGCTCAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCA
TGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTT
CAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGCCTTGGTG
TTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTG
AATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAA
CTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTGAAGAGTGTATCTCTGG
CCTTATTTCTGACAATGAATT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4C510TF 714 0 0
GCCGGGGGGAGAACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAGACTCTTTTATACCTTCTCCGCC
GAGATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCC
TTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAG
AAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTG
CCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAGGAGCTCAATTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGC
TTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAACAAG
CATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTT
GACCTTACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAAC
CTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGGGTTCACTGTTTCCAGCGCCGAT
GATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCAT
GTGCTAGTGAAGAGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAATTAG*CATAATAATAA
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TGTCATT

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GTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGTGTTG
ACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACAT
ACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTC
TTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTC
TGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTG
TTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGT
GGAACCCGCTGCGTGTGCTAGTGAAGAGTGTATTTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAATT
AGGCATAATAATAAAGCGGTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTCTTGTTG
T
TGTCATT

QA 1 541 1 541
DS 

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T
TGCAGTATGAAGCATGTGCCTTGATTCATTGAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGT
GTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAG
ACATACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAG
CTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTT
GCTCTGTTGCTCGATAACCCCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTC
ACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGT
ATGTGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTGAAGAGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATG
AATTAGGCATAATAATAAAGCGGTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTCTT
GTT

QA 2 484 2 484
DS 

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GCCGAGATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATC
TCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGT
AAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCAT
GTGCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAGGAGCTCAATTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATT
TGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAAC
AAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAG
CTTGACCTTACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGAT
AACCTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGGGTTCACTGTTTCCAGCGCC
GATGATATCCTCAAGGCTCTTTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTG
CATGTGCTAGTGAAGAGTGTATCTCTGGCCTTATTTTTGACAATGAATTAGGCATAATAA
TAAATCGGTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTCTTGTTGT
TGTCATT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4CE28TF 751 0 0
GGACAC
ACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAACTCTTTTATACCTTCTCCGCCGATATCTCCTCC
ATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAG
AACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTC
TTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATT
GAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAAT
GATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTT
GTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGAC
AAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACT
GTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAG
GCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTGAAG
AGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAATTAG*CATA*TAATAAAGCGGTTTAAGT
TGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTCTTGTTGTGTCATTCTTCGTATATTTATGAAAT
AAATTTGAGTGATCACAAAAAAAAA

QA 7 751 7 751
DS 



AS 2 5

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ACATCTCCAAATATCCAAACTTAAACAAAGCATTCCAATTTTGTAGCACACGCTAAATCT
ATCCGTACAAAAATAAACTGGAACTGTTCCGAAAAAAATTTTACAGAAATCACAGTTATA
ACAAAAAGAAAAAAAAAAGGCAAAAGCAAAACAGAAAATTTGGTTTTATGTGGAAGCTTC
TACAGAGTTGTCTCAACGTTTTGTGTCAGAAAACTAATATCGTCTACTTCACGAGTTTTC
TCAATACGGACTCTGCACGCTGCTCGAATCGAGGTAAAGCCCAATCGTGCTGAATTATGT
CCAGACCATCTTTCTCCGCACCCAAGCTCTTTGATGCATCAAATCCAAACCCACCCATTT
GCATCATACGTTGCGTGTCATCAATGGCATTTTCATCCCCGAAAATGAAACTGAACAAGC
CTCTTAATCCAAACAAGTTTAAAAAGTACCAGGAACGACTACTCACATAGCTAACACCGA
CAGTACTCAAGTCGATGCCATTTTGTAACATGGATCTGAACCTCTGGGTCAGTGGGAACG
GTATTTTGGCTGCAACAAATCCAGAGAAGAAGAAGTTGACCCATGCAAAAGTGAGCGTCT
GGGGAATAATCATGGAAAGGTTCTTCTTCATCATATCCATGGCCATGTTAGGATCAGAAA
ACATCTGAGCTTGAGGGTTTGTGGCTTGGCCCTTGGGAACATGTAGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H154JQ U 26
AF RR4DO16JQ U 1
BS 1 38 RR4DO16JQ
BS 39 39 RR4H154JQ
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BS 337 337 RR4H154JQ
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BS 572 572 RR4H154JQ
BS 573 769 RR4DO16JQ

RD RR4H154JQ 596 0 0
GTCCCATG
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QA 9 596 9 596
DS 

RD RR4DO16JQ 769 0 0
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GCATCATACGTTGCGTGTCATCAATGGCATTTTCATCCCCGAGAATGAGACTGAACAAGC
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CAGTACTCAAGTCGATGCCATTTTGTAACATTGATCTGAACCTCTGGGTCAGTGGGAACG
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GGGGAATAATCATGGAAAGGTTCTTCTTCATCATATCCATGGCCATGTTAGGATCAGAAA
ACATCTGAGCTTGAGGGTTTGTGGCTTGGCCCTTGGGAACATGTAGCAA

QA 1 769 1 769
DS 



CO CL884Contig2 798 3 12 U
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ACAAGTAGGAGAGAAGATAACTAGGGTTTTAGAAGAGAATGGCGGAGGATCTGGTTCTAG
ATACGGCGATTAGAGATTGGGTTCTGATCCCTCTCTCTGTTGTGATGGTTCTCATCGGTA
TCCTCCGATACTTGGTCTCCAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCTGATGCTAAGATGG
TCAAAGAAGGTCAAGTTATTATCAGAGCTCGGAATCTTAAAGCTGCCGCCAATTTCATCC
CGTTGAGATCATTCCGCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTAC
ATGTTCCCAAGGGCCAAGCCACAAACCCTCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGG
CCATGGATATGATGAAGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCAT
GGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGA
GGTTCAGATCAATGTTACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGA
GTAGTCGTTCCTGGTACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCTTGTTCAGTCTCATTC
TCGGGGATGAAAATGCCATTGATGACACGCAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGAT
TTGATGCATCAAAGAGCTTGGGTGCGGAGAAAGATGTCTGGACATATTCAGCACGATGGG
CTCTACTCGATTCGAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H154TF U 1
AF RR4EX02TF U 35
AF RR4DO16TF U 5
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BS 644 700 RR4H154TF
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BS 733 733 RR4EX02TF
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RD RR4H154TF 700 0 0
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ATGTTCCCAAGGGCCAAGCCACAAACCCTCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGG
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GTAGTCGTTCCTGGTACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAG*CTTGTTCAGTCTCATTC
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DS 

RD RR4EX02TF 717 0 0
GG
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CTGTTGTGATGGTTCTCATCGGTATCCTCCGATACTTGGTCTCCAAGCTCATGCGTTCTT
CTCCATCTCCTGATGCTAAGATGGTCAAAGAAGGTCAAGTTATTATCAGAGCTCGGAATC
TTAAAGCTGCCGCCAATTTCATCCCGTTGAGATCATTCCGCACTCGTAGACTCTACTTTA
GCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACACGTTCCCAAGGGCCAAGCCACAAACCCTCAAGCTC
AGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAGAATCTTTCCATGATTA
TTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCA
AAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCAATGTTACAAAATGGCATCGACTTGA
GTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCCTGGTACTTTTTAAACTTGTTTGGAT
TAAGAGGCTTGTTCAGTCTCATTCTCGGGGATGAAAATGCCATTGATGACACACAACGGA
TGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCATCAAAGAGCTTGGGTGCGGAGAA

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR4DO16TF 794 0 0
GG
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AGGAGAGAAGATAACTAGGGTTTTAGAAGAGAATGGCGGAGGATCTGGTTCTAGATACGG
CGATTAGAGATTGGGTTCTGATCCCTCTCTCTGTTGTGATGTTTCTCATCGGTATCCTCC
GATACTTGGTCTCCAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCTGATGCTAAGATGGTCAAAG
AAGGTCAAGTTATTATCAGAGCCCGGAATCTTAAAGCTGCCGCCAATTTCATCCCGTTGA
GATCATTCCGCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACATGTTC
CCAAGGGCCAAGCCACAAACCCTCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGG
ATATGATGAAGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCA
ACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCA
GATCAATGTTACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGGTGTTAGCTATGTGAGTAGTC
GTTCCTGGTACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCTTGTTCAGTCTCATTCTCGGGG
ATGAAA*TGCCATTGATGACACGCAACGTATGATGCAA*TGGGTGGGTTTGGATT*GATG
CATCAA*GAGCTTGGGTGCGGAGAAAGATGTCTGGACATATTCAGCACGATGGGCTCTAC
TCGATTCGAGCA

QA 3 794 3 794
DS 



AS 1 6

CO CL885Contig1 929 6 5 U
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GTTAAGATAGACTCTTAGGACACTGCAATAACAATCCTTGGAGAAAAACGTAAAATGATA
AAACAGGTCTAACAAACCTGTACAGACACTATCATACAACACAGAAGCAGCATAGACGAT
TACATTATCATAAGTTCATAACGTTTCACTTAGTAGGGGAATGATATATTCGTTAAACTT
TATTACAGCCTTGAA*GGTTGGTTGATCTTCTGCTAAGCAGTGGGATACTCCTCCTTAAC
AGAAGCATCGTCTCTTGGGACATCTGTCTTCTTGTCTGAAGCAGGGTAAGGATTCTTGCT
GACCAATCTGTCCCGTCTCTTCTCAAGGAATCGTTGAAGCGAATGCCTCCTTGCAATTGG
CAGATCAGCAGCAGATCTGCAGAACGAAATAGGGTGAACGGGGAATGACTGCGCAGCTGG
GGAAGCTGCATTGGAGGTGCTTGAGAGAGAAGGAGCTCTGTTCAGTGCTGGAGAAGCGAC
AGGACTGGTGTTCGTGGAGTTCTTTGTCTCAATGGATTTAGCAGCAGTAGCAGCAGCAAT
ACGGATAATTTCTTGAATCTTGTCTGCTGGAATCCCATCAAAGACGCGAACTTTCCCACC
AAAGAAGATAGTAAGTTGATTAGGACGGATGGTTGAAGCTTCTGGCTCAGAGGAAGGGAC
TTCCATGCACCTAGCTTCGTGAATTGGTTTCTCAGCACCTTCTCCGGCGACAGATCCGGC
GATGGAACCATGTACAGTGACATTATCGCCGCCAAACCGCATCCACCTTCGACGGGAGCT
CGTGGCTCCTCTTCCACCTTATCCATGGTCATTCTCTTGGAACTCGTCGATATGTCTTCT
CCAGTTTCGATTTGCTTTCTTCGTCTTTC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C007JQ U 2
AF RR4A105JQ U 1
AF RR4BR66JQ U 1
AF RR4A105JQD U 1
AF RR4A105TF C 540
AF RR4A105TFB C 62
BS 1 532 RR4A105JQ
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BS 694 816 RR4A105JQD
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RD RR4C007JQ 193 0 0
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ACATTATCATAAG

QA 1 193 1 193
DS 

RD RR4A105JQ 693 0 0
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TACATTATCATAAGTTCATAACGTTTCACTTAGTAGGGGAATGATATATTCGTTAAACTT
TATTACAGCCTTGAA*GGTTGGTTGATCTTCTGCTAAGCAGTGGGATACTCCTCCTTAAC
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GACCAATCTGTCCCGTCTCTTCTCAAGGAATCGTTGAAGCGAATGCCTCCTTGCAATTGG
CAGATCAGCAGCAGATCTGCAGAACGAAATAGGGTGAACGGGGAATGACTGCGCAGCTGG
GGAAGCTGCATTGGAGGTGCTTGAGAGAGAAGGAGCTCTGTTCAGTGCTGGAAAAGCGAC
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AAAGAAGATAGTAAGTTGATTAGGACGGATGGT

QA 1 693 1 693
DS 

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G
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G
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GGACTGGTGTTCGTGGAGTTCTTTGTCTCAATGGATTTAGCAGCAGTAGCAGCAGCAATA
CGGATAATTTCTTGAATCTTGTCTGCTGGAATCCCATCAAAGACGCGAACTTTCCCACCA
AAGAAGATAGTAAGTTGATTAGGACGGATGGTTGAAGCTTCTGGCTCAGAGGAAGGGACT
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CCGCA

QA 2 816 2 816
DS 

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TACGGATAATTTCTTGAATCTTGTCTGCTGGAATCCCATCAAAGACGCGAACTTTCCCAC
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CTTCCATGCACCTAGCTTCGTGAATTGGTTTCTCAGCACCTTCTCCGGCGACAGATCCGG
CGATGGAACCATGTACAGTGACATTATCGCCGCCAAACCGCATCCACC
TTCGAC

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR4A105TFB 868 0 0
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AACAGGTCTAACAAACCTGTACAGACACTATCATACAACACAGAAGCAGCATAGACGATT
ACATTATCATAAGTTCATAACGTTTCACTTAGTAGGGGAATGATATATTCGTTAAACTTT
ATTACAGCCTTGAAAGGTTGGTTGATCTTCTGCTAAGCAGTGGGATACTCCTCCTTAACA
GAAGCATCGTCTCTTGGGACATCTGTCTTCTTGTCTGAAGCAGGGTAAGGATTCTTGCTG
ACCAATCTGTCCCGTCTCTTCTCAAGGAATCGTTGAAGCGAATGCCTCCTTGCAATTGGC
AGATCAGCAGCAGATCTGCAGAACGAAATAGGGTGAACGGGGAATGACTGCGCAGCTGGG
GAAGCTGCATTGGAGGTGCTTGAGAGAGAAGGAGCTCTGTTCAGTGCTGGAGAAGCGACA
GGACTGGTGTTCGTGGAGTTCTTTGTCTCAATGGATTTAGCAGCAGTAGCAGCAGCAATA
CGGATAATTTCTTGAATCTTGTCTGCTGGAATCCCATCAAAGACGCGAACTTTCCCACCA
AAGAAGATAGTAAGTTGATTAGGACGGATGGTTGAAGCTTCTGGCTCAGAGGAAGGGACT
TCCATGCACCTAGCTTCGTGAATTGGTTTCTCAGCACCTTCTCCGGCGACAGATCCGGCG
ATGGAACCATGTACAGTGACATTATCGCCGCCAAACCGCATCCACCTTCGACGGGAGCTC
GTGGCTCCTCTTCCACCTTATCCATGGTCATTCTCTTGGAACTCGTCGATATGTCTTCTC
CAGTTTCGATTTGCTTTCTTCGTCTTTC

QA 1 868 1 868
DS 



AS 3 6

CO CL886Contig1 1114 2 8 U
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CTCCATCTTCTTTTTCCCCCAAATCCTCTTGCTTAGGGTTTCTCCTCAGTCTTCCAGATC
CTCCACCTCCCAATCTTTACTTCTTCAAGATGACGAGGCAATCTTCTGATTGAGCTCAGA
GTATCCGTTGTCTCGCATCTTAGATTGCCTATCGGGCTTTATCACTGAGTACATCTATCA
AATGAGCTAACCTAACCTCTCTAAGGGGATTCAAGTAGAAGGTTTTGTTGTTGTGGTTTT
ATTTGAGAGTCCACAGCATAAGGAGACAAAATGTCAAGCGGTGGAAACACCCACTGGTGT
CATAGATGCGAGCGTGCTGTCCGGCTACACGGACGAGAGACTCTATGTTCTTATTGTGGA
GGAGGGTTTGTTGAACTGCTTGAACTCCCTCAAGCCAGCCCGTTTGGTATGTTCAGATCT
CACAGGGACGTTGCGGTGGAACCTGATCCTACTTTCGATCTCATGGATGCTCTCTCCGAC
TTTATGAGGGACCGAGAAAACAGAGCAAGAGGAGGCATCACTCCTGGTCTGGCTCCTCTG
TTGATCTTTGGTGGTCAGGTTCCTTATAGACTATCTGGAGTAGAAGCCCTCTTCAACGGC
GGGTCGCCTGGCATTGGCACCACACGTGGTAACACCGGTGACTATTTCTTCGGTCCTGGT
CTTGAAGAGCTCTTTGAGCAGCTTTCAGCTGGAGCTACTACTCGCAGAGGTCCGCCACCT
GCTCCTAGATCATCAATAGATGCATTGCCGACCATCAAGATCTCGCAGAGGCATCTTAGG
TCGTCTGACTCGAACTGTCTGTCGCCAAGAGTTGCCATCGAGTAGAGGACCTTCGAGTAG
TAGTCAAAACAGAACCAACACCAGAAACAGTGGTAGTAACAATCGTGAGAGCAGCAATGA
GAGAAGGAACCCTTTCTCTTCCTTCTGGCCATTTCGTTCGTCTGGTTCAGCTTCAAACTC
CGCTCAGAACCGTGGAGGCACGAGAAACTCGGACACAACGGATGAGAACCATAACTACCA
TCACCAGCAACAGCAACAGTCACATATGGGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B365TF U 1
AF RR4D667TF U 408
BS 1 453 RR4B365TF
BS 454 454 RR4D667TF
BS 455 679 RR4B365TF
BS 680 680 RR4D667TF
BS 681 752 RR4B365TF
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BS 754 766 RR4B365TF
BS 767 1114 RR4D667TF

RD RR4B365TF 766 0 0
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ATTTGAGAGTCCACAGCATAAGGAGACAAAATGTCAAGCGGTGGAAACACCCACTGGTGT
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GGAGGGTTTGTTGAACTGCTTGAACTCCCTCAATCCAGCCCGTTTGGTATGTTCAGATCT
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TTTATGAGGGACCGAGAAAACAGAGCAAGAGGAGGCATCACTCCTGGTCTGGCTCCTCTG
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CTTGAAGAGCTCTTTGAGCAGCTTTCAGCTGGGGCTACTACTCGCA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4D667TF 707 0 0
GG
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TCTTCAACGGCGGGTCGCCTGGCATTGGCACCACACGTGGTAACACCGGTGACTATTTCT
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CATAACTACCATCACCAGCAACAGCAACAGTCACATATGGGTTAC

QA 3 707 3 707
DS 



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BQ
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AF RR4EU25JQ U 69
AF RR4EU38JQ U 1
BS 1 759 RR4EU38JQ

RD RR4EU25JQ 233 0 0
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QA 1 233 1 233
DS 

RD RR4EU38JQ 759 0 0
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CTACTCGATGGCAACTCTTGGCGACAGACAGGGCACGAGTTATGCTGAACCAGCCACGGG
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TCACCGGTGTTACCACGTGTGATGCCAATGCCAGGCGAC

QA 1 759 1 759
DS 



CO CL886Contig3 734 2 4 U
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TCAGTCTTCCAGATCCTCCACCTCCCAATCTTTACTTCTTCAAGATGACGAGGCAATCTT
CTGATTGAGCTCAGAGTATCCGTTGTCTCGCATCTTAGATTGCCTATCGGGCTTTACCAC
TGAGTAGATCTGTCAAATGAGCTAACCTAACCTCTAAGGGGATTCAAGTAGAAGGTTTTG
TTGTTGTGGTTTTAGTTGAGAGTCCACAACATAAAGGAGACAAAACAGTGAGAAAAAAAA
ATGTCAAGCGGTGGAAACACCCACTGGTGTCATAGATGCGAGCGTGCTGTCCGGCTACAC
GGACGAGAGACTCTATGTTCTTATTGTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCTTGAACTCCCT
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ACTTTCGATCTCATGGATGCTCTCTCCGACTTTATGAGGTACCGAGAAAACAGAGCAAGA
GGAGGCATCACTCCTGGTCTGGCTCCTCTGTTGATCTTTGGTGGTCAGTTCCTTATAGAC
TATTTGGAGTAGAAGCCCTCTTCAACGGCGGGTCGCCTGGCATGGCATCACACGTGGTAC
ACCGGTGACTATTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU38TF U 1
AF RR4FX92TF U 1
BS 1 123 RR4EU38TF
BS 124 124 RR4FX92TF
BS 125 510 RR4EU38TF
BS 511 734 RR4FX92TF

RD RR4EU38TF 510 0 0
GGATACAGCGAGTTTTCAGAGTGTTAATTACACAGAAACGAAAGAGATTCTTCCAGAGTC
CTTCCTCTACGTCTTCTCCATCTTCTTTTTCCCCCAAATCCTCTTGCTTAGGGTTTCTCC
TCATTCTTCCAGATCCTCCACCTCCCAATCTTTACTTCTTCAAGATGACGAGGCAATCTT
CTGATTGAGCTCAGAGTATCCGTTGTCTCGCATCTTAGATTGCCTATCGGGCTTTACCAC
TGAGTAGATCTGTCAAATGAGCTAACCTAACCTCTAAGGGGATTCAAGTAGAAGGTTTTG
TTGTTGTGGTTTTAGTTGAGAGTCCACAACATAAAGGAGACAAAACAGTGAGAAAAAAAA
ATGTCAAGCGGTGGAAACACCCACTGGTGTCATAGATGCGAGCGTGCTGTCCGGCTACAC
GGACGAGAGACTCTATGTTCTTATTGTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCTTGAACTCCCT
CAAGCCAGCCCGTTTGGTATGTTCAGATCT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4FX92TF 734 0 0
GGATACAGCGAGTTTTCAGAGTGTTAATTACACAGAAACGAAAGAGATTCTTCCAGAGTC
CTTCCTCTACGTCTTCTCCATCTTCTTTTTCCCCCAAATCCTCTTGCTTAGGGTTTCTCC
TCAGTCTTCCAGATCCTCCACCTCCCAATCTTTACTTCTTCAAGATGACGAGGCAATCTT
CTGATTGAGCTCAGAGTATCCGTTGTCTCGCATCTTAGATTGCCTATCGGGCTTTATCAC
TGAGTAGATCTGTCAAATGAGCTAACCTAACCTCTAAGGGGATTCAAGTAGAAGGTTTTG
TTGTTGTGGTTTTAGTTGAGAGTCCACAACATAAAGGAGACAAAACAGTGAGAAAAAAAA
ATGTCAAGCGGTGGAAACACCCACTGGTGTCATAGATGCGAGCGTGCTGTCCGGCTACAC
GGACGAGAGACTCTATGTTCTTATTGTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCTTGAACTCCCT
CAAGCCAGCCCGTTTGGTATGTTCAGATCTCACAGGGACGTTGCGGTGGAACCTGATCCT
ACTTTCGATCTCATGGATGCTCTCTCCGACTTTATGAGGTACCGAGAAAACAGAGCAAGA
GGAGGCATCACTCCTGGTCTGGCTCCTCTGTTGATCTTTGGTGGTCAGTTCCTTATAGAC
TATTTGGAGTAGAAGCCCTCTTCAACGGCGGGTCGCCTGGCATGGCATCACACGTGGTAC
ACCGGTGACTATTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 8

CO CL887Contig1 850 8 21 U
GGGAGCTACCTAAAGAGCATCCATCTCTCCCTCTCTGCCCAAATCAAAAGGAGGATTTAA
AGTCAACGGCGAGAACATGAGTACTCCAAGGTTAAAGTGTGTCATCGTCGGTGACGGCGC
CGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATTTCCTACACTAGAAACACTTTCACCACCGATGATAT
GCCAACTGTTTTTGAAAATGTCAGCGTCCATGTGATTGTCGATGGGAGCACCATCAACTT
GGACTTGTTTGACACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAACTAAGACCATTAAGCTATCC
ATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGACAAAGCTAGCTATGAAAATGT
TGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCTAATGTTCCCATCTTACTTGT
TGGAACAAAGCTCGATGCTCGAGATGATAAGCAGTACTTTCTTGAGCACCCTGGAGCTGT
GCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTAAAGAGGCTAGTTGGAGCTTCTACTTATAT
AGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTTAAAGCTGTCTTTGATGAGGCCATCAAAGT
AGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAACAACATTAGTACAGCTCAGAAAGGCTGTTC
CATACTGTGATTCGAGAAAAGAATAAACATGAATCAACAGTTAACTAATCATTGTTTCCG
AGTGCCCATTTTCTCTCATTTCCGTTAAACAAGAATTTGTCATTTGTAGTCCTAAAAGCA
GACATATCCGAACTCATTGGTCAAGTATTTAAACTTTGGGGTTGTATCTTTAAATTCTTC
CCAAGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE96TF U 189
AF RR4BS81TF U 1
AF RR4DN25TF U 37
AF RR4FV49TF U 39
AF RR4FH45TF U 17
AF RR4FH45JQ C 227
AF RR4FV49JQ C 39
AF RR4EE96JQ C 152
BS 1 65 RR4BS81TF
BS 66 66 RR4FH45TF
BS 67 185 RR4BS81TF
BS 186 186 RR4FH45TF
BS 187 649 RR4BS81TF
BS 650 679 RR4FH45TF
BS 680 680 RR4DN25TF
BS 681 726 RR4FH45TF
BS 727 729 RR4FV49TF
BS 730 748 RR4FH45TF
BS 749 751 RR4FV49JQ
BS 752 754 RR4FH45TF
BS 755 755 RR4FV49JQ
BS 756 771 RR4FH45TF
BS 772 774 RR4FV49JQ
BS 775 791 RR4FH45TF
BS 792 792 RR4FV49JQ
BS 793 803 RR4FH45TF
BS 804 804 RR4FV49JQ
BS 805 817 RR4FH45TF
BS 818 850 RR4FV49JQ

RD RR4EE96TF 321 0 0
TTTTTGAAAATGTCAGCGTCCATGTGATTGTCGATGGGAGCACCATCAACTTGGACTTGT
TTGACACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAACTAAGACCATTAAGCTATCCATTAACTG
ATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGACAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAGA
AGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCTAATGTTCCCATCTCACTTGTTGGAACAA
AGCTCGAC*CTCGAGATGATAAGCAGTACTTTCTTGAGCACCCTGGGGCTGTGCCTATAT
CTACTGCTCAGGGTGAAGAAC

QA 1 321 1 321
DS 

RD RR4BS81TF 649 0 0
GGGAGCTACCTAAAGAGCATCCATCTCTCCCTCTCTGCCCAAATCAAAAGGAGGATTTAA
AGTCAGCGGCGAGAACATGAGTACTCCAAGGTTAAAGTGTGTCATCGTCGGTGACGGCGC
CGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATTTCCTACACTAGAAACACTTTCACCACCGATGATAT
GCCAA*TGTTTTTGAAAATGTCAGCGTCCATGTGATTGTCGATGGGAGCACCATCAACTT
GGACTTGTTTGACACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAACTAAGACCATTAAGCTATCC
ATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGACAAAGCTAGCTATGAAAATGT
TGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCTAATGTTCCCATCTTACTTGT
TGGAACAAAGCTCGATGCTCGAGATGATAAGCAGTACTTTCTTGAGCACCCTGGAGCTGT
GCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTAAAGAGGCTAGTTGGAGCTTCTACTTATAT
AGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTTAAAGCTGTCTTTGATGAGGCCATCAAAGT
AGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAACAACATTAGTACAGCTCAG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4DN25TF 697 0 0
GGAA
AAATCAAAAGGAGGATTTAAAGTCAACGGCGAGAACATGAGTACTCCAAGGTTAAAGTGT
GTCATCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATTTCCTACACTAGAAAC
ACTTTCACCACCGATGATATGCCAACTGTTTTTGAAAATGTCAGCGTCCATGTGATTGTC
GATGGGAGCACCATCAACTTGGACTTGTTTGGCACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAA
CTAAGACCATTAAGCTATCCATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGAC
AAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCT
AATGTTCCCATCTTACTTGTTGGAACAAAGCTCGATGCTCGAGATGATAAGCAGTACTTT
CTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTAAAGAGGCTA
GTTGGAACTTCTACTTATATAGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTTAAAGCTGTC
TTTGATGAGGCCATCAAAGTAGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAACAACATTAGT
ACAGCTCAGAAAGGCTGTTCCATACTGTGATTCGAGAAAAGAATAAACATGAATCAACAG
TTAACTAATCATTGTTTCCGAGTGCC
ATTTCTC

QA 5 690 5 690
DS 

RD RR4FV49TF 706 0 0
GG
AAATCAAAAGGAGGATTTAAAGTCAACGGCGAGAACATGAGTACTCCAAGGTTAAAGTGT
GTCATCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATTTCCTACACTAGAAAC
ACTTTCACCACCGATGATATGCCAACTGTTTTTGAAAATGTCAGCGTCCATGTGATTGTC
GATGGGAGCACCATCAACTTGGACTTGTTTGACACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAA
CTAAGACCATTAAGCTATCCATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGAC
AAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCT
AATGTTCCCATCTTACTTGTTGGAACAAAGCTCGATGCTCGAGATGATAAGCAGTACTTT
CTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTAAAGAGGCTA
GTTGGAGCTTCTACTTATATAGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTTAAAGCTGTC
TTTGATGAGGCCATCAAAGTAGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAACAACATTAGT
ACAGCTCAGAAAGGCTGTTCCATACTGTGATTCTAGAAAAGAATAAACATGAATCAACAG
TTAACTAATCATTGTTTCCGAGTGCTCATTTTCTCTCATTTCCG

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR4FH45TF 801 0 0
GGATCTC
TCTCTCTCTCTCTGCCCAAATCAAAAGGAGGATTTAAAGTCAACGGCGAGAACATGAGTA
CT**AAGGTTAAAGTGTGTCATCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCA
TTTCCTACACTAGAAACACTTTCACCACCGATGATATGCCAACTGTTTTTGAAAATGTCA
GCGTCCATGTGATTGTCGATGGGAGCACCATCAACTTGGACTTGTTTGACACTGCAGGAC
AAGATGACTACAATAAACTAAGACCATTAAGCTATCCATTAACTGATGTCTTCTTGCTCG
CATTCTCTCTTGTTGACAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAAC
TCAGACATCATGCTCCTAATGTTCCCATCTTACTTGTTGGAACAAAGCTCGATGCTCGAG
ATGATAACAAGTACTTTCTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTG
AAGAACTAAAGAGGCTAGTTGGAGCTTCTACTTATATAGAATGCAGTTCCAAGACACAAC
TGAATGTTAAAGCTGTCTTTGATGAGGCCATCAAAGTAGTTCTCAAGCCACCCAATAACT
ACAACAACAACATTAGTACAGCTCAGAAAGGCTGTTCCATACTGTGATTCGAGAAA*GAA
TAAACATGAATCAACAGTTAACTAATCATTGTTTCCGAGTGCC**ATTTCTCTCATTTCC
GTTAAC**AGA*TTTGTCATTTGTAGTC**TAAAGCAGACATATCCGA*CTCATTGGTCA
*GTATTTAAACTTT

QA 8 801 8 801
DS 

RD RR4FH45JQ 602 0 0
AGCACCATCAACTTGGACTTGTTTGACACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAACTAAGA
CCATTAAGCTATCCATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGACAAAGCT
AGCTATGAAAATGTTGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCTAATGTT
CCCATCTTACTTGTTGGAACAAAGCTCGATGCTCGAGATGATAACAAGTACTTTCTTGAG
CACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTAAAGAGGCTAGTTGGA
GCTTCTACTTATATAGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTTAAAGCTGTCTTTGAT
GAGGCCATCAAAGTAGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAACAACATTAGTACAGCT
CAGAAAGGCTGTTCCATACTGTGATTCGAGAAAAGAATAAACATGAATCAACAGTTAACT
AATCATTGTTTCCGAGTGCCCATTTTCTCTCATTTCCGTTAAACAAGAATTTGTCATTTG
TAGTCCTAAAAGCAGACATATCCGAACTCATTGGTCAAGTATTTAAACTTTGGGGTTGTA
CT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4FV49JQ 812 0 0
GG
AAATCAAAAGGAGGATTTAAAGTCAACGGCGAGAACATGAGTACTCCAAGGTTAAAGTGT
GTCATCGTCGGTGACGGCGC*GTCGGCAAGACTTGTCTACTCATTTCCTACACTAGAAAC
ACTTTCACCACCGATGATATGCCAACTGTTTTTGAAAATGTCAGCGTCCATGTGATTGTC
GATGGGAGCACCATCAACTTGGACTTGTTTGACACTGCAGGACAAGATGACTACAATAAA
CTAAGACCATTAAGCTATCCATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTTGTTGAC
AAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATCATGCTCCT
AATGTTCCCATCTTACTTGTTGGAACAAAGCTCGATGCTCGAGATGATAAGCAGTACTTT
CTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTAAAGAGGCTA
GTTGGAGCTTCTACTTATATAGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTTAAAGCTGTC
TTTGATGAGGCCATCAAAGTAGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAACAACATTAGT
ACAGCTCAGAAAGGCTGTTCCATACTGTGATTCTAGAAAAGAATAAACATGAATCAACAG
TTAACTAATCATTGTTTCCGAGTGCCCATTTTCTCTCATTTCCGTTAAACAAGAATTTGT
CATTTGTAGTCCTAAAAGCAGACATATCCGAACTCATTGGTCAAGTATTTAAACTTTGGG
GTTGTATCTTTAAATTCTTCCCAAGTGTTC

QA 3 812 3 812
DS 

RD RR4EE96JQ 690 0 0
ACTAGAAACACTTTCACCACCGATGATATGCCAACTGTTTTTGAAAATGTCAGCGTCCAT
GTGATTGTCGATGGGAGCACCATCAACTTGGACTTGTTTGACACTGCAGGACAAGATGAC
TACAATAAACTAAGACCATTAAGCTATCCATTAACTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCT
CTTGTTGACAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAGAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACAT
CATGCTCCTAATGTTCCCATCTCACTTGTTGGAACAAAGCTCGAC*CTCGAGATGATAAG
CAGTACTTTCTTGAGCACCCTGGGGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTA
AAGAGGCTAGTTGGAGCTTCTACTTATATAGAATGCAGTTCCAAGACACAACTGAATGTT
AAAGCTGTCTTTGATGAGGCCATCAAAGTAGTTCTCAAGCCACCCAATAACTACAACAAC
AACATTAGTACAGCTCAGAAAGGCTGTTCCATACTGTGATTCGAGAAAAGAATAAACATG
AATCAACAGTTAACTAATCATTGTTTCCGAGTGCCCATTTTCTCTCATTTCCGTTAAACA
AGAATTTGTCATTTGTAGTCCTAAAAGCAGACATATCCGAACTCATTGGTCAAGTATTTA
AACTTTGGGGTTGTATCTTTAAATTCTTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 8

CO CL888Contig1 804 8 20 U
TTTTTCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATCTTCGTCAAAAAAA*C
AAAAGAGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAATGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGC
GCACCGTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTAA
CTTTGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACTATTGTTTAG
CCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGA
AAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCACAGACCAAAA
TGATTTGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGA
TGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTG
GATTGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGCA
CAAGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTA
TCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCG
AGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGTTTTTTTT*AACTAATGATTCTTGATTTTAATAT
GAAACAAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATACAATTCTCTCTGT
CTCGACAGATGATTATTGAACACG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU64JQ C 96
AF RR4BK48TF U 1
AF RR4F425TF U 1
AF RR4H051TF U 136
AF RR4FP13TF U 1
AF RR4F425JQ C 108
AF RR4FP13JQ C 6
AF RR4BK48JQ C 59
BS 1 58 RR4BK48TF
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BS 60 178 RR4BK48TF
BS 179 179 RR4F425TF
BS 180 349 RR4BK48TF
BS 350 351 RR4F425TF
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BS 476 476 RR4F425TF
BS 477 687 RR4BK48TF
BS 688 693 RR4F425TF
BS 694 694 RR4FP13TF
BS 695 734 RR4F425TF
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BS 753 764 RR4FP13TF
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RD RR4BU64JQ 106 0 0
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AGGTGATGACAATAACAGACGGTAACTTTGCCGTCACTGACGTCAA

QA 1 106 1 106
DS 

RD RR4BK48TF 687 0 0
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AAAAGAGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAATGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGC
GCACCGTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTGA
CTTTGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACTATTGTTTAG
CCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGA
AAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCT*AGACCAAAA
TGATTTGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGA
TGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAGGTTG
GATTGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGCA
CAAGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTA
TCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCG
AGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4F425TF 734 0 0
TTTTT
CAAGAATCATAAAAGGAAAAGGGAGAGACAGAGATTCATCTTCGTCAAAAAAA*CAAAAG
AGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAATGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGCGCACC
GTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTAACTTTG
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CCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGAAAATA
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TGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGATGTGT
TTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATTG
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ACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTATCCGA
ATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCGAGAAG
ATTCTGATGACTAAACTAATGTTTTTTT**AACTAATGATTCTTGATTTTAATATGAAAC
AAGAATTCA

QA 6 734 6 734
DS 

RD RR4H051TF 638 0 0
G
GATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTAACTTTGCCGTCACTGAC
GTCAACGGAAACCTCCTTTCCAAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAAAGG
ATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGTCTG
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AACAAGGAAATGAAGGTATGCGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATTGACCGGTCATGT
GTCATCTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGCACAAGAACCATACCGCA
CAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTATCCGAATGTTGATTAT
GCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGAC
TAAACTAATGTTTTTT***AACTAATGATTCTTGATTTTAATATGAAACAAGAATTCATG
AAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATACAATTC

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR4FP13TF 804 0 0
TTTTT
CAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATCTTCGTCAAAAAAA*CAAAAG
AGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAATGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGCGCACC
GTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTAACTTTG
CCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACTATTGTTTAGCCTCT
CCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGAAAATA
GGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATT
TGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGATGTGT
TTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATTG
ACCGGTCATGTGTCGTCTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGCACAAGA
ACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTATCCGA
ATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCGAGAAG
ATTCTGATGACTAAACTAATGTTTTTTTT*AACTAATGATTCTTGATTTTAATATGAA*C
AG**ATTCATGAAAGTGTTGAGGTTT*GTTTGGATATGA*TACA*TTCTCTCTGTCTCGA
CAGATGATTAT
TGAAAAAA

QA 6 796 6 796
DS 

RD RR4F425JQ 691 0 0
CCCTCAATTTTGCGCACCGTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAA
TAACAGACGGTAACTTTGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAG
AACTATTGTTTAGCCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTC
TGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGA
GCACAGACCAAAATGATTTGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCA
AGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATG
TTAAAGGAAGTTGGATTGACCGGTCATGTGTCGTTTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTG
TTGCTCAGATGCACAAGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCT
CGGTCACGGTTTATCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTG
ATGACATTAACCGAGAAGATTTTGATGACTAAACTAATGTTTTTTT**AACTAATGATTC
TTGATTTTAATATGAAACAAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATA
CAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTAT
CG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4FP13JQ 793 0 0
CAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATCTTCGTCAAAAAAA*CAAAAG
AGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAATGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGCGCACC
GTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTAACTTTG
CCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACTATTGTTTAGCCTCT
CCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGAAAATA
GGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATT
TGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGATGTGT
TTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATTG
ACCGGTCATGTGTCGTTTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGCACAAGA
ACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTATCCGA
ATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCGAGAAG
ATTCTGATGACTAAACTAATGTTTTTTTTTAACTAATGATTCTTGATTTTAATATGAAAC
AAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGA
CAGATGATTAT
TG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4BK48JQ 746 0 0
ACAAAAGAGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAATGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTT
GCGCACCGTACCC*AGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGT
GACTTTGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACTATTGTTT
AGCCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGA
GAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCT*AGACCAA
AATGATTTGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTA
GATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAGGT
TGGATTGACCGGTCATGTGTCGTTTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATG
CACAAGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTT
TATCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAAC
CGAGAAGATTTTGATGACTAAACTAATGTTTTTTTT*AACTAATGATTCTTGATTTTAAT
ATGAAACAAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATACAATTCTCTCT
GTCTCGACAGAGGATTATTGAACACG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 2 8

CO CL889Contig1 769 5 4 U
GAACAAACTTGTAAATACAATAATAAACACACACACACAAGAATAAGTACAAAACAAGAG
CCTGATCATGTCAAAGCACGCATTCACACATACACATGTACAAGTACAACAAAAGAGCTT
GATCATGTCAAAGCACGCATTACACACACAGAGAGAGCGAGGTACAAGTACAGCAAGAAC
CTGATCATGTCAAAGCACGTGATCACACTTGCG*CAAGGGGAGCCTTCTGTGGGCTAGAA
CTATACACGAAACACCCACAAACCATTGACGAGTCTGGAAGAAACTCGTGTCGGAGAAAA
ATATAGGTGCTACTAACTTATAGAAAGCAGCGAAAACAATAGCGATATAGAGCTCTTCTA
GAATCGACATTTTATTTTCAGTGAACATGTGAGGTAGCTGGCTCTTAACATCATCAACAA
TCGCGTCAACAAGATTGCTATCAATGCTGATTCT**GTGAGGTGAAGCCGGTGTTGGAGG
AAACAGACTTCACAGAACTCTTCCAACTTTCTGCCGTATTCCTCTCTTCAGAGGACAGTC
TCTGCAACGTTTCTTCAAAACAGCTTCCAAATTTACCTGTGAAATTTTTCACGTCGGTTG
TGTTCACCCTGTAGAAGACAGGGATCACTCTGAGTTTGCCGCCCTTCACGCGCTTATCTA
TCCTCGACACCTCATTTAAGCACCACTCTGACTCCGAGAACCGGTCAGAGAATATCACAA
GTGCTATTTTCGAGTCGTCGATCCTCTTGAAGAGGTTTTCAAGGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES51JQ U 37
AF RR4FR25JQ U 8
AF RR4AP86JQ U 1
AF RR4AP86TF C 1
AF RR4BO70JQ U 1
BS 1 212 RR4AP86JQ
BS 213 213 RR4BO70JQ
BS 214 744 RR4AP86JQ
BS 745 769 RR4BO70JQ

RD RR4ES51JQ 265 0 0
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TGTACAAGTACAACAAAAGAGCTTGATCATGTCAAAGCACGCATTACACACACAGAGAGA
GCGAGGTACAAGTTCAGCAAGAACCTGATCATGTCAAAGCACGTGATCACACTTGCGCTA
AGGGGAGCCTTCTGTGGGCTAGAACTATACACGAAACACCCACAAACCATTGACGAGTCT
GGAAGAAACTCGTGTCGGAAAAAAA

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR4FR25JQ 676 0 0
CTTGTAAATACAATAATAAACACACACACACAAGAATAAGTACAAAACAAGAGCCTGATC
ATGTCAAAGCACGCATTCACACATACACATGTACAAGTACAACAAAAGAGCTTGATCATG
TCAAAGCACGCATTACACACACAGAGAGAGCGAGGTACAAGTACAGCAAGAACCTGATCA
TGTCAAAGCACGTGATCACACTTGCGTTAAGGGGAGCCTTCTGTGGGCTAGAACTATACA
C*AAACACCCACAAACCATTGACGAGTCTGGAAGAAACTCGTGTCGGAAAAAAATATAGG
TGCTACTAACTTATAGAAAGCAGCGAAAACAATAGCGATATAGAGCTCTTCTAGAATCGA
CATTTTATTTTCAGTGAACATGTGAGGTAGCTGGCTCTTAACATCATCAACAATCGCGTC
AACAAGATTGCTATCAATGCTGATTCTTTGTGAGGTGAAGCCGGTGTTGGAGGAAACAGA
CTTCACAGAACTCTTCCAACTTTCTGCCGTATTCCTCTCTTCAGAGGACAGTCTCTGCAA
CGTTTCTTCAAAACAGCTTCCAAATTTACCTGTGAAATTTTTCACGTCGGTTGTGTTCAC
CCTGTAGAAGACAGGGATCACTCTGAGTTTGCCGCCCTTCACGCGCTTATCTATCCTCGC
CACCTCATTTAAGCAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AP86JQ 744 0 0
GAACAAACTTGTAAATACAATAATAAACACACACACACAAGAATAAGTACAAAACAAGAG
CCTGATCATGTCAAAGCACGCATTCACACATACACATGTACAAGTACAACAAAAGAGCTT
GATCATGTCAAAGCACGCATTACACACACAGAGAGAGCGAGGTACAAGTACAGCAAGAAC
CTGATCATGTCAAAGCACGTGATCACACTTGC**CAAGGGGAGCCTTCTGTGGGCTAGAA
CTATACACGAAACACCCACAAACCATTGACGAGTCTGGAAGAAACTCGTGTCGGAGAAAA
ATATAGGTGCTACTAACTTATAGAAAGCAGCGAAAACAATAGCGATATAGAGCTCTTCTA
GAATCGACATTTTATTTTCAGTGAACATGTGAGGTAGCTGGCTCTTAACATCATCAACAA
TCGCGTCAACAAGATTGCTATCAATGCTGATTCT**GTGAGGTGAAGCCGGTGTTGGAGG
AAACAGACTTCACAGAACTCTTCCAACTTTCTGCCGTATTCCTCTCTTCAGAGGACAGTC
TCTGCAACGTTTCTTCAAAACAGCTTCCAAATTTACCTGTGAAATTTTTCACGTCGGTTG
TGTTCACCCTGTAGAAGACAGGGATCACTCTGAGTTTGCCGCCCTTCACGCGCTTATCTA
TCCTCGACACCTCATTTAAGCACCACTCTGACTCCGAGAACCGGTCAGAGAATATCACAA
GTGCTATTTTCGAGTCGTCGATCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4AP86TF 744 0 0
GAACAAA
CTTGTAAATACAATAATAAACACACACACACAAGAATAAGTACAAAACAAGAGCGTGATC
ATGTCAAAGCACGCATTCACACATACACATGTACAAGTACAACAAAAGAGCTTGATCATG
TCAAAGCACGCATTACACACACAGAGAGAGCGAGGTACAAGTACAGCAAGAACCTGATCA
TGTCAAAGCACGTGATCACACTTGC**CAAGGGGAGCCTTCTGTGGGCTAGAACTATACA
CGAAACACCCACAAACCATTGACGAGTCTGGAAGAAACTCGTGTCGGAGAAAAATATAGG
TGCTACTAACTTATAGAAAGCAGCGAAAACAATAGCGATATAGAGCTCTTCTAGAATCGA
CATTTTATTTTCAGTGAACATGTGAGGTAGCTGGCTCTTAACATCATCAACAATCGCGTC
AACAAGATTGCTATCAATGCTGATTCT**GTGAGGTGAAGCCGGTGTTGGAGGAAACAGA
CTTCACAGAACTCTTCCAACTTTCTGCCGTATTCCTCTCTTCAGAGGACAGTCTCTGCAA
CGTTTCTTCAAAACAGCTTCCAAATTTACCTGTGAAATTTTTCACGTCGGTTGTGTTCAC
CCTGTAGAAGACAGGGATCACTCTGAGTTTGCCGCCCTTCACGCGCTTATCTATCCTCGA
CACCTCATTTAAGCACCACTCTGACTCCGAGAACCGGTCAGAGAATATCACAAGTGCTAT
TTTCGAGTCGTCGATCC

QA 8 744 8 744
DS 

RD RR4BO70JQ 769 0 0
GAACAAA
CTTGTAAATACAATAATAAACACACACACACAAGAATAAGTACAAAACAAGAGCCTGATC
ATGTCAAAGCACGCATTCACACATACACATGTACAAGTACAACAAAAGAGCTTGATCATG
TCAAAGCACGCATTACACACACAGAGAGAGCGAGGTACAAGTACAGCAAGAACCTGATCA
TGTCAAAGCACGTGATCACACTTGCGTTAAGGGGAGCCTTCTGTGGGCTAGAACTATACA
CGAAACACCCACAAACCATTGACGAGTCTGGAAGAAACTCGTGTCGGAGAAAAATATAGG
TGCTACTAACTTATAGAGAGCAGCGAAAACAATAGCGATATAGAGCTCTTCTAGAATCGA
CATTTTATTTTCAGTGAACATGTGAGGTAGCTGGCTCTTAACATCATCAACAATCGCGTC
AACAAGATTGCTATCAATGCTGATTCTTTGTGAGGTGAAGCCGGTGTTGGAGGAAACAGA
CTTCACAGAACTCTTCCAACTTTCTGCCGTATTCCTCTCTTCAGAGGACAGTCTCTGCAA
CGTTTCTTCAAAACAGCTTCCAAATTTACCTGTGAAATTTTTCACGTCGGTTGTGTTCAC
CCTGTAGAAGACAGGGATCACTCTGAGTTTGCCGCCCTTCACGCGCTTATCTATCCTCGC
CACCTCATTTAAGCACCACTCTGACTCCGAGAACCGGTCAGAGAATATCACAAGTGCTAT
TTTCGAGTCGTCGATCCTCTTGAAGAGGTTTTCAAGGGATCT

QA 8 769 8 769
DS 



CO CL889Contig2 790 3 12 U
GGAGTTGTTGGCTTAGTTTGACAAACCTATACCCTCACCAAACTCTATCAAAACACATGG
TTAAACGAGTTGGTCCTCCGCCGTTCCTGATTTCAGATATCGGACTTTTTTATGTTCTTT
TATTCTTATCTTTTTTTGTCTATTTTGCGGTTGTTTGCCAACAACCATCGCGACCTCAGC
TGTTTGTCAGTTTCCGGGGAGAAGAACTACGCAACGGCTTCGTGAGCCATGTAGTTAAAG
CTTTGGAAGATGCAAGGGTCAACGTTTTCATAGATACCCATGAGCTGAAAGGGAGATCCC
TTGAAAACCTCTTCAAGAGGATCGACGACTCGAAAATAGCACTTGTGATATTCTCTGACC
GGTTCTCGGAGTCAGAGTGGTGCTTAAATGAGGTGGCGAGGATAGATAAGCGCGTGAAGG
GCGGCAAACTCAGAGTGATCCCTGTCTTCTACAGGGTGAACACAACCGACGTGAAAAATT
TCACAGGTAAATTTGGAAGCTGTTTTGAAGAAACGTTGCAGAGACTGTCCTCTGAAGAGA
GGAATACGGCAGAAAGTTGGAAGAGTTCTGTGAAGTCTGTTTCCTCCAACACCGGCTTCA
CCTCACAAAGAATCAGCATTGATAGCAATCTTGTTGACGCGATTGTTGATGATGTTAAGA
GCCAGCTACCTCACATGTTCACTGAAATAAAATGTCGATTCTAGAGAGCTCTATATCGCT
ATTGTTTCGCTGCTCTCTATAGTTAGTAGCACCTATATTTTCTCCGACACGAGTTTCTTC
AGACTCGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4ES51TF U 5
AF RR4BO70TF U 1
AF RR4FR25TF U 5
BS 1 136 RR4BO70TF
BS 137 137 RR4ES51TF
BS 138 691 RR4BO70TF
BS 692 692 RR4FR25TF
BS 693 743 RR4BO70TF
BS 744 744 RR4FR25TF
BS 745 752 RR4BO70TF
BS 753 753 RR4FR25TF
BS 754 775 RR4BO70TF
BS 776 776 RR4FR25TF
BS 777 788 RR4BO70TF
BS 789 790 RR4FR25TF

RD RR4ES51TF 527 0 0
GG
GTTGGCTTAGTTTGACAAACCTATACCCTCACCAAACTCTATCAAAACACATGGTTAAAC
GAGTTGGTCCTCCGCCGTTCCTGATTTCAGATATCGGACTTTTTTATGTTCTTTTATTCT
TATCTTTTTTTGTCTATTTTGCGGTTGTTTGCCAACAACCATCGCGACCTCAGCTGTTTG
TCAGTTTCCGGGGAGAAGAACTACGCAACGGCTTCGTGAGCCATGTAGTTAAAGCTTTGG
AAGATGCAAGGGTCAACGTTTTCATAGATACCCATGAGCTGAAAGGGAGATCCCTTGAAA
ACCTCTTCAAGAGGATCGACGACTCGAAAATAGCACTTGTGATATTCTCTGACCGGTTCT
CGGAGTCAGAGTGGTGCTTAAATGAGGTGGCGAGGATAGATAAGCGCGTGAAGGGCGGCA
AACTCAGAGTGATCCCTGTCTTCTACAGGGTGAACACAACCGACGTGAAAAGTTTCACAG
GTAAATTTGGAAGCTGTTTTGAAGAAACGGTGCAGAGACTGTCCT

QA 3 527 3 527
DS 

RD RR4BO70TF 788 0 0
GGAGTTGTTGGCTTAGTTTGACAAACCTATACCCTCACCAAACTCTATCAAAACACATGG
TTAAACGAGTTGGTCCTCCGCCGTTCCTGATTTCAGATATCGGACTTTTTTATGTTCTTT
TATTCTTATCTTTTTT*GTCTATTTTGCGGTTGTTTGCCAACAACCATCGCGACCTCAGC
TGTTTGTCAGTTTCCGGGGAGAAGAACTACGCAACGGCTTCGTGAGCCATGTAGTTAAAG
CTTTGGAAGATGCAAGGGTCAACGTTTTCATAGATACCCATGAGCTGAAAGGGAGATCCC
TTGAAAACCTCTTCAAGAGGATCGACGACTCGAAAATAGCACTTGTGATATTCTCTGACC
GGTTCTCGGAGTCAGAGTGGTGCTTAAATGAGGTGGCGAGGATAGATAAGCGCGTGAAGG
GCGGCAAACTCAGAGTGATCCCTGTCTTCTACAGGGTGAACACAACCGACGTGAAAAATT
TCACAGGTAAATTTGGAAGCTGTTTTGAAGAAACGTTGCAGAGACTGTCCTCTGAAGAGA
GGAATACGGCAGAAAGTTGGAAGAGTTCTGTGAAGTCTGTTTCCTCCAACACCGGCTTCA
CCTCACAAAGAATCAGCATTGATAGCAATCTTGTTGACGCGATTGTTGATGATGTTAAGA
GCCAGCTACCTCACATGTTCACTGAAATAAA*TGTCGATTCTAGAGAGCTCTATATCGCT
ATTGTTTCGCTGCTCTCTATAGT*AGTAGCAC*TATATTTTCTCCGACACGAGTT*CTTC
AGACTCGT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4FR25TF 786 0 0
GG
GTTGGCTTAGTTTGACAAACCTATACCCTCACCAAACTCTATCAAAACACATGGTTAAAC
GAGTTGGTCCTCCGCCGTTCCTGATTTCAGATATCGGACTTTTTTATGTTCTTTTATTCT
TATCTTTTTTTGTCTATTTTGCGGTTGTTTGCCAACAACCATCGCGACCTCAGCTGTTTG
TCAGTTTCCGGGGAGAAGAACTACGCAACGGCTTCGTGAGCCATGTAGTTAAAGCTTTGG
AAGATGCAAGGGTCAACGTTTTCATAGATACCCATGAGCTGAAAGGGAGATCCCTTGAAA
ACCTCTTCAAGAGGATCGACGACTCGAAAATAGCATTTGTGATATTCTCTGACCGGTTCT
CGGAGTCAGAGTGGTGCTTAAATGAGGTGGCGAGGATAGATAAGCGCGTGAAGGGCGGCA
AACTCAGAGTGATCCCTGTCTTCTACAGGGTGAACACAACCGACGTGAAAAATTTCACAG
GTAAATTTGGAAGCTGTTTTGAAGAAACGTTGCAGAGACTGTCCTCTGAAGAGAGGAATA
CGGCAGAAAGTTGGAAGAGTTCTGTGAAGTCTGTTTCCTCCAACACCGGCTTCACCTCAC
AAAGAATCAGCATTGATAGCAATCTTGTTGACGCGATTGTTGATGATGTTAAGAGCCAGC
TACCTCACATGTTCACTGAAATAAAATGTCGATTCTAGAGAGCTCTATATCGCTAT*GTT
TCGCTGCTTTCTATAGTTAGTAGCACCTATATTTTCTCCGACACGAGTTTCTTCAGACTC
GTCA

QA 3 786 3 786
DS 



AS 1 8

CO CL890Contig1 1063 8 11 U
AATTTAGAAGACATGTATTTTTTGTGGATTCACACATGCAATTCAATTTAAAATATTTTT
CGTCTGAATTTGAAAATCAATCAACCTTATATCCAAAAATCTACACACAAGACACAAATT
CATAACACTAATATCAGTGAAAGAAGAAGATCCATGAGTATCTCTCGTAAAACAGAACAT
TATATTCGAGGTCAGCTTTTCAAAGCTGATCATGTTCACACTCTTGTCTCTCAAAGCATA
CGGTTCATGTCAACCGTGAATCTCCTCCCTCTTCGGCAGCCATTGAATCCGATGATGGTT
CTGCAGCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACAAGCTGTCGTCATTGTCTCTGATG
GTTCATCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCATTGCGTCATCAACATCTGCTTCTTCTACCT
CTGTCATTATCTCATCCTTGTCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCCATTTGGTGTATTTG
TGTCTTCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGTGGGTCCGTAC
TGATGGATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAA*GAGAAA*GCTTCGA
GAGCTTTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTCTGCAGTGTAA
ATGGAGGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGCTTCATCCAATCGAGTGACGAGCACTGAAT
ATGTTTCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGCCTCAGGATATTCTG
ACAGAACCTTCGTCAACCACCACGAAAGCATTCCCTTTAGTTTCTCCCAGTCCTGCCAGA
ACTTTCCAGTAGATGCTACTGCTTGTAATGTGCCCTTTACTTCTTCCTCTGACATTTCTG
GTTCCTGCACAGCCACTGGATGCTCGGGAAGTAGGGCGTTATCCTGCCGTGGAGCACCGT
CACTGGGAGGAGGGAGGGAGGAGGGAGTTTCATGATCCGATGATGATTGCATCTCCATTT
CTGGCTCCTTCAACTAAGCAATCTCCCAATAATATCCCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EC83JQ U 1
AF RR4AO12JQ U 6
AF RR4AO59JQ U 6
AF RR4HA04JQB U 81
AF RR4HA04TF C 282
AF RR4EC83TF C 281
AF RR4AO59TF C 291
AF RR4AO12TF C 473
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BS 196 196 RR4AO12JQ
BS 197 589 RR4EC83JQ
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BS 591 679 RR4EC83JQ
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BS 780 781 RR4AO59JQ
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BS 783 853 RR4HA04JQB
BS 854 1022 RR4EC83TF
BS 1023 1063 RR4AO59TF

RD RR4EC83JQ 679 0 0
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CGTCTGAATTTGAAAATCAATCAACCTTATATCCAAAAATCTACACACAAGACACAAATT
CATAACACTAATATCAGTGAAAGAAGAAGATCCATGAGTATCTCTCGTAAAACAGAACAT
TATATTCGAGGTCAGTTTTTCAAAGCTGATCATGTTCACACTCTTGTCTCTCAAAGCATA
CGGTTCATGTCAACCGTGAATCTCCTCCCTCTTCGGCAGCCATTGAATCCGATGATGGTT
CTGCAGCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACAAGCTGTCGTCATTGTCTCTGATG
GTTCATCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCATTGCGTCATCAACATCTGCTTCTTCTACCT
CTGTCATTATCTCATCCTTGTCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCCATTTGGTGTATTTG
TGTCTTCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGTGGGTCCGTAC
TGATGGATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAA*GAGCAA*GCTTCGA
GAGCTTTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTCTGCAGTGTAA
ATGGAGGACCTTCGTCGAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4AO12JQ 774 0 0
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TCGAGGTCAGCTTTTCAAAGCTGATCATGTTCACACTCTTGTCTCTCAAAGCATACGGTT
CATGTCAACCGTGAATCTCCTCCCTCTTCGGCAGCCATTGAATCCGATGATGGTTCTGCA
GCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACAAGCTGTCGTCATTGTCTCTGATGGTTCA
TCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCATTGCGTCATCAACATCTGCTTCTTCTACCTCTGTC
ATTATCTCATCCTTATCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCCATTTGGTGTATTTGTGTCT
TCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGTGGGTCCGTACTGATG
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TTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTCTGCAGTGTAAATGGA
GGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGCTTCATCCAATCGAGTGACGAGCACTGAATATGTT
TCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGCCTCAGGATATTCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AO59JQ 777 0 0
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GAATTTGAAAATCAATCAACCTTATATCCAAAAATCTACACACAAGACACAAATTCATAA
CACTAATATCAGTGAAAGAAGAAGATCCATGAGTATCTCTCGTAAAACAGAACATTATAT
TCGAGGTCAGCTTTTCAAAGCTGATCATGTTCACACTCTTGTCTCTCAAAGCATACGGTT
CATGTCAACCGTGAATCTCCTCCCTCTTCGGCAGCCATTGAATCCGATGATGGTTCTGCA
GCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACAAGCTGTCGTCATTGTCTCTGATGGTTCA
TCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCATTGCGTCATCAACATCTGCTTCTTCTACCTCTGTC
ATTATCTCATCCTTATCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCCATTTGGTGTATTTGTGTCT
TCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGTGGGTCCGTACTGATG
GATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAA*GAGAAA*GCTTCGAGAGCT
TTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTCTGCAGTGTAAATGGA
GGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGCTTCATCCAATCGAGTGACGAGCACTGAATATGTT
TCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGCCTCAGGATATTCTGA
C

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4HA04JQB 773 0 0
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AAGAAGAAGATCCATGAGTATCTCTCGTAAAACAGAACATTATATTCGAGGTCAGTTTTT
CAAAGCTGATCATGTTCACACTCTTGTCTCTCAAAGCATACGGTTCATGTCAACCGTGAA
TCTCCTCCCTCTTCGGCAGCCATTGAATCCGATGATGGTTCTGCAGCATTGGTTTCACTT
GGCTTCTCACTCTCACTAACTGTCGTCATTGTCTCTGATGGTTCATCGATAGTTTCCATG
TCAATCGTCATTGCGTCATCAACATCTGCTTCTTCTACCTCTGTCATTATCTCATCCTTG
TCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCCATTTGGTGTATTTGTGTCTTCCGTTGCTGCTGCG
TTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGTGGGTCCGTACTGATGGATAACATCGAAGTA
ACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAA*GAGCAA*GCTTCGAGAGCTTTGGGTAGATACTCC
TTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTCTGCAGTGTAAATGGAGGACCTTCGTCGAAA
CTAAGAAGGGATTCATCCAATCGAGTGACGAGTACTGAATATGTTTCTCCTAAGGCTTCC
TTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGCCTCAGGATATTCTGAGAGAACCTTCGTCAACCAC
CACGAAAGCATTCCCTTTAGTTTCTCCCAGTCCTGCCAGAACTTTCCAGTAGA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4HA04TF 688 0 0
CCATG
ATCCGATGATGGTTCTGCAGCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACTAGCTGTCGT
CAT*GTCTCTGATGGTTCATCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCAT*GCGTCATCAACATC
TGCTTCTTCTACCTCTGTCATTATCTCATCCTTGTCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCC
ATTTGGTGTATTTGTGTCTTCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAA
TTGTGGGTCCGTACTGATGGATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAAA
GAGCAAAGCTTCGAGAGCTTTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAAAGGATCTCACAGAG
TCTCTGCAGTGTAAATGGAGGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGATTCATCCAATCGAGT
GACGAGTACTGAATATGTTTCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGC
CTCAGGATATTCTGAGAGAACCTTCGTCAACCACCACGAAAGCATTCCCTTTAGTTTCTC
CCAGTCCTGCCAGAACTTTCCAGTAGATGCTACTGCTTGTAATGTGCCCTTTACTTCTTC
CTCTGACATTTCTGGTTCCTGCACAGCCACTGGATGCTCGGGAAGTAGGGCGTTATCCTG
CCGTGGAGCACCGTCACTGGGAG

QA 6 688 6 688
DS 

RD RR4EC83TF 744 0 0
CATTGAATCCGATGATGGTTCTGCAGCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACAAGC
TGTCGTCATTGTCTCTGATGGTTCATCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCATTGCGTCATC
AACATCTGCTTCTTCTACCTCTGTCATTATCTCATCCTTGTCGCCTCCCACCACTGCTTC
AATTCCATTTGGTGTATTTGTGTCTTCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGT
TTGCAATTGTGGGTCCGTACTGATGGATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAA
AGCAA*GAGCAA*GCTTCGAGAGCTTTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTC
ACAGAGTCTCTGCAGTGTAAATGGAGGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGCTTCATCCAA
TCGAGTGACGAGCACTGAATATGTTTCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCAT
CTTTGCCTCAGGATATTCCGACAGAACCTTCGTCAACCACCACGAAAGCATTCCCTTTAG
TTTCTCCCAGTCCTGCCAGAACTTTCCAGTAGATGCTACTGCTTGTAATGTGCCCTTTAC
TTCTTCCTCTGACATTTCTGGTTCCTGCACAGCCACTGGATGCTCGGGAAGTAGGGCGTT
ATCCTGCCGTGGAGCACCGTCACTGGGAGGAGGGAGGGAGGAGGGAGTTTCATGATCCGA
TGATGATTGCATCTCCATTTCT
CC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4AO59TF 773 0 0
GATGATGGTTCTGCAGCATTGGTTTCACTTGGCTTCTCACTCTCACAAGCTGTCGTCATT
GTCTCTGATGGTTCATCGATAGTTTCCATGTCAATCGTCATTGCGTCATCAACATCTGCT
TCTTCTACCTCTGTCATTATCTCATCCTTATCGCCTCCCACCACTGCTTCAATTCCATTT
GGTGTATTTGTGTCTTCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGT
GGGTCCGTACTGATGGATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAA*GAGA
AA*GCTTCGAGAGCTTTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTC
TGCAGTGTAAATGGAGGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGCTTCATCCAATCGAGTGACG
AGCACTGAATATGTTTCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGCCTCA
GGATATTCTGACAGAACCTTCGTCAACCACCACGAAAGCATTCCCTTTAGTTTCTCCCAG
TCCTGCCAGAACTTTCCAGTAGATGCTACTGCTTGTAATGTGCCCTTTACTTCTTCCTCT
GACATTTCTGGTTCCTGCACAGCCACTGGATGCTCGGGAAGTAGGGCGTTATCCTGCCGT
GGAGCACCGTCACTGGGAGGAGGGAGGGAGGAGGGAGTTTCATGATCCGATGATGATTGC
ATCTCCATTTCTGGCTCCTTCAACTAAGCAATCTCCCAATAATATCCCTATCC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4AO12TF 591 0 0
TGTATTTGTGTCTTCCGTTGCTGCTGCGTTTGTATCCTCCTCAGTGGTTTGCAATTGTGG
GTCCGTACTGATGGATAACATCGAAGTAACCAACAGATTCTTTTCTAAAGCAA*GAGAAA
*GCTTCGAGAGCTTTGGGTAGATACTCCTTGCAGCCAAAA*GGATCTCACAGAGTCTCTG
CAGTGTAAATGGAGGACCTTCGTCGAAACTAAGAAGGGCTTCATCCAATCGAGTGACGAG
CACTGAATATGTTTCTCCTAAGGCTTCCTTTTGTTGTTCGTCCGTCATCTTTGCCTCAGG
ATATTCTGACAGAACCTTCGTCAACCACCACGAAAGCATTCCCTTTAGTTTCTCCCAGTC
CTGCCAGAACTTTCCAGTAGATGCTACTGCTTGTAATGTGCCCTTTACTTCTTCCTCTGA
CATTTCTGGTTCCTGCACAGCCACTGGATGCTCGGGAAGTAGGGCGTTATCCTGCCGTGG
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CTCCATTTCTGGCTCCTTCAACTAAGCAATCTCCCAATAATATCCCTATCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 6

CO CL891Contig1 1062 6 11 U
GGACATCGATAGATTCCATCTCAAATTCGTTCTTATCATCAAAAGTCTCTCTCTCTCATC
TACTTAATTTTCTTTCTAGTTCATTCCTTCAAATAATTGAGAGGACAATAATGTGTGCCT
TAACACCAATGTTTCCTTGTTACCAACAAGAATGGTACTCTACTTCAACAATGGAGTCTC
CATGGCTAGATTCCTTCTCTCCTACTCTTCCATCTTTTCTTTATCCTTCTCTCGACCAAC
CTGATGAATTCAAGAACCATAACATCAATTTTCATCCTCATCACATGAATCTTGCTCACA
TAAATGGTAGTAACAAGAACAGTAACAATGATCAAAAAGAAGATGAAAGAGAATTGGTTT
TGGAGAAGAAACTGAACCACAACGCTAGCGAACGCGACCGCCGTAGAAAGCTAAACGCCT
TATACTCTTCACTTCGTGCTCTCTTGCCTCCTTCTGATCAAAAGAGGAAGTTGAGCATTC
CAATGACCGTAGCGGGAGTGGTGAAGTATATACCAGAGCAGGAGCAAGAACTTGAACGTT
TGTCTAGGAGGAAAGAAGAGCTCATGAAGACAATCTCCAGTAAGACAGCGACTTTGAGTC
ATCAACAAGAACAGCTGAGACATAGAGCAATGATGGACTCAGCAGATTCGTCTCCTCAAA
AGATTGCAGCAAATTGGATTACAGACACAGAGATAGCTGTCCAGATTGCTACATGGAAAT
GGGCATCTATCTCAGACATGTTGCTTAGGTTAGAAGAAAACGGGCTTAATGTCACAAGCG
TCTCTTCTTCTGTTTCTTCCACCGCAAGGATCTTCTACACGATGCATCTTCAGATGAGAG
GAGATTGCAGAGTGAGGTTGGAGGAACTCAGCGATATGCTATTCGGATTACGCAAATCAT
ACTGAGAGATGAGAGTTTCAAGAAGTGAATCTTATTAGTTATTAATGTTATAGACTTTTA
TCAGATTTTAGAACTGTACTCTTTTGTAACGTTTTCTTGTTATACTTTTTTTCTTTCTTA
TTGTTAAATTAACGATATTATTTGAATTCAGAAATTTTATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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CATGGCTAGATTCCTTCTCTCCTACTCTTCCATCTTTTCTTTATCCTTCTCTCGACCAAC
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T

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G
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DS 



AS 1 8

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BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT61TF U 1
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AF RR4G068TF U 2
AF RR4G068JQ C 59
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BS 199 311 RR4D178TF
BS 312 312 RR4DR16TF
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BS 744 754 RR4DR16TF
BS 755 755 RR4DR16JQ
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BS 765 765 RR4DR16JQ
BS 766 799 RR4G068JQ
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G
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GATCTTTCTAGTTCTATTCCTGTCAACAACCATTCTCCAATCTTCATCCGCAATTCCAAA
TCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCCGATATCCACTACT
ATGCGTACATACTCTCTCTGCTTACGCCACCGTGATTCGACACAAAAACGACCAGGATCT
TGCCCAAACCGCTCTCACCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGTCGC
TAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGATTG
CGTTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGTCG
AGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAGCGTTCAGACGTG
GGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAAACCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCCA
TGGAAGGCAAAGTAAAGGGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCTCAAGTCACTA
GCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAA*CGAAGTGTGAAGT

QA 2 652 2 652
DS 

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CGATCTTTCTAGTTCTATTCCTGTCAACAACCATTCTCCAATCTTCATCCGCAATTCCAA
ATCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCCGATATCCACTAC
TATGCGTACATACTCTCCCTGCTTACGCCACCGTGATTCGACACAAAAACGACCAGGATC
TTGCCCAAACCGCTCTCACCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGTCG
CTAAACTAACCGAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGATT
GCATTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGTC
GAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAACGTTCAGACGT
GGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCC
ATGGAAGGCAAAGTAAAGAGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCTCAAGTCACT
AGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCTAA
ATGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAA*TTTTGGCTTGTATGT
AAA
TAA

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DS 

RD RR4DR16TF 754 0 0
G
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TCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCCGATATCCACTACT
ATGCGTACATACTCTCTCTGCTTACGCCACCGTGATTCGACACAAAAACGACCAGGATCT
TGCCCAAACCGCTCTCACCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGTCGC
TAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGATTG
CGTTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGTCG
AGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAGCGTTCAGACGTG
GGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCCA
TGGAAGGCAAAGTAAAGGGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCTCAAGTCACTA
GCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCTAAA
TGGAGTTGAAATTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGGCTTGTATGTA
AA*TAAA*TCTCTGATCTTTA*AGCTGTAAAAA

QA 2 754 2 754
DS 

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GATCTTTCTAGTTCTATTCCTGTCAACAACCATTCTCCAATCTTCATCCGCAATTCCAAA
TCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCCGATATCCACTACT
ATGCGTACATACTCTCTCTGCTTACGCCACCGTGATTCGACACAAAAACGACCAGGATCT
TGCCCAAACCGCTCTCACCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGTCGC
TAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGATTG
CATTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGTCG
AGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAACGTTCAGACGTG
GGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCCA
TGGAAGGCAAAGTAAAGAGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCTCAAGTCACTA
GCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCTAAA
TGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGGCTTGTATGTA
AA*TAAAATCTCTGATCTTTAGAGCTGTAAAA
TGTTTTCTTCTTGT

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DS 

RD RR4G068JQ 745 0 0
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AAATCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCCGATATCCACT
ACTATGCGTACATACTCTCTCTGCTTACGCCACCGTGATTCGACACAAAAACGACCAGGA
TCTTGCCCAAACCGCTCTCACCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGT
CGCTAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGA
TTGCATTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGG
TCGAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAACGTTCAGAC
GTGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAG
CCATGGAAGGCAAAGTAAAGAGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCTCAAGTCA
CTAGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCT
AAATGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGGCTTGTAT
GTAAAATAAAATCTCTGATCTTTAGAGCTGTAAAAA*TGTTTTCTTCTTGTCGTTCGGAA
AGAAAACTAAATCTTTGGTTC
TGAC

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DS 

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GTTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGTCGA
GCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAGCGTTCAGACGTGG
GTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAGATGGATTTTCCGGTCGAGCCAT
GGAAGGCAAAGTAAAGGGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCTCAAGTCACTAG
CAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCTAAAT
GGAGTTGAAATTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGGCTTGTATGTAA
AATAAAATCTCTGATCTTTAAAGCTGTAAAAAATGTTTTCTTTTTGTCGTTCGGAAAGAA
AACTAAATCTTTGGTTC
GGT

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DS 

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ATCCGTTGCTATATTCGTCGCTAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGA
ATATTTAGCAATCAAAGATTGCGTTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCA
GTCGGTTAAAGAACTAGGTCGAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAA
AATGAGTAGCGTTCAGACGTGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAG
ATGGATTCTCCGGTCGAGCCATGGAAGGCAAAGTAAAGGGGCTGATTCGTTTAAAAGTGG
TTCACGTGGCTCAAGTCACTAGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAAC
GAAGTGTGAAGTTTCCCTAAATGGAGTTGAAATTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATG
TGAAATTTTGGCTTGTATGTAAAATAAAATCTCTGATCTTTAAAGCTGTAAAAAATGTTT
TCTTTTTGTCGTTCGGAAAGAAAACTAAATCTTTGGTTC
GGT

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DS 

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TCAAAGATTGCATTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAG
AACTAGGTCGAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAACG
TTCAGACGTGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAA*CCACGTGTCTAGATGGATTCTCC
GGTCGAGCCATGGAAGGCAAAGTAAAGAGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTTCACGTGGCT
CAAGTCACTAGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAG
TTTCCCTAAATGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGG
CTTGTATGTAAAATAAAATCTCTGATCTTTAAAGCTGTAAAAA*TGTTTTCTTTTTGTCG
TTCGGAAAGAAAACTAAATCTTTGGTTCTGTATAAATATTGTATCATAATCAAATCTCAT
ATAAGTTTTTTTTTAT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 8

CO CL893Contig1 887 8 18 U
GGAACTCAACTCAAAAGGAAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATA
TCAATCACAATGACGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCT
GCAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAGCACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTT
CTAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTT
CTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTT*GTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGT
TACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT*CTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCT
ATGTTAACGAAGGGCAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCAT
GGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAAT*CCTCATCGGCTTCC
GAGGAGCCTGCGATTCTCATT*GGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAAT
TGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAAC
CATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATAC
TGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAG
TCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATATATGTTCCCATTCTACTAGTCAACAAGCCAAAATC
ACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCT
CATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 

AF RR4CT32TF U 206
AF RR4GJ73TF U 1
AF RR4GT38TF U 405
AF RR4GT38JQ C 211
AF RR4F205TF U 6
AF RR4GJ73JQ C 65
AF RR4CT32JQ C 174
AF RR4GJ59TF U 213
BS 1 590 RR4GJ73TF
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BS 694 694 RR4GJ59TF
BS 695 718 RR4F205TF
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CCCTTTCGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTT
AGCTTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGGCAAGCTGTAAA
TATCGAGTTTAGGTCCG

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR4GJ73TF 590 0 0
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GCAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAGCACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTT
CTAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTT
CTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTT*GTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGT
TACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT*CTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCT
ATGTTAACGAAGGGCAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCAT
GGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAAT*CCTCATCGGCTTCC
GAGGAGCCTGCGATTCTCATT*GGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAAT
TGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4GT38TF 322 0 0
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TTCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATTTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAA
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CCACCTTAACCGGAACCATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAG
TTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCCTCATGAA*TTCCATAGGGT*CATGATGATA
CTACTTCTACTTCA
GTCTGTAG

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DS 

RD RR4GT38JQ 454 0 0
TACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTT
T*GTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT
*CTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGGCAAGCTGTAAATATCG
AGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACT
GGGAAGTAGATGAAT*CCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATT*GGTGGTAA
GAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGGGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGT
TGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACCATCGGAACCGTCCCAGGCCCTTGGGAAAA
TGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4F205TF 775 0 0
GG
AACTCAAAAGGAAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATATCAATCA
CAATGACGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCAGCTG
TATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTAACGA
CTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCG
TCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTT*GTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCC
TTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT*CTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAA
CGAAGGGCAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGG
ATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAAT*CCTCATCGGCTTCCGAGGAGC
CTGCGATTCTCATT*GGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGA
AAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACCATCGGA
ACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAG
ACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGT*CATGATGATACTACTTCTACTTCA*GTCTGTAG
A*GTTAG*TCTAAG*ATATATGTTCTCATTCTACTAGTCA*CAAGCCAAA
TCA

QA 3 772 3 772
DS 

RD RR4GJ73JQ 690 0 0
TCACAATGACGTCCTCGTTCCCACTG*TCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCAG
CTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAGCACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTAA
CGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTC
CCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTT*GTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACA
GCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT*CTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGT
TAACGAAGGGCAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCC
GGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAAT*CCTCATCGGCTTCCGAGG
AGCCTGCGATTTTCATT*GGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACCATT
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTG
TAGAAGTTAGGTCTAAGGATATATGTTCCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4CT32JQ 714 0 0
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TGGTCTTCTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTT*GTCCACTTGGCATCAGCCAAT
CCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT*TTCATATCCATACGCGCTCATG
GACACCTATGTTAACGAAGGGCAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCG
GAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAAT*CCTCATC
GGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATT*GGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGT
TTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAA
CCGGAACCATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTCATCACCA
ATGATACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTA
CTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATATATGTTCCCATTCTACTAGTCAACAAGC
CAAAGTCACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATA
ATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTATTTTTGCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GJ59TF 674 0 0
G
TCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTT*G
TCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTT*CT
CATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGGCAAGCTGTAAATATCGAGT
TTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGG
AAGTAGATGAAT*CCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATT*GGTGGTAAGAA
GCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGC
TTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACCATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGC
ACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGT
TCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATATATGTTCC
CATTCTACTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCC
TAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATC
AAGTTATGTTTGC

QA 2 674 2 674
DS 



AS 1 5

CO CL894Contig1 1041 5 10 U
GGAACTAAATCGAAACTTTAAATGGATAAAAGATTACAATACAAGTGAAAAATCAAATCG
TAGTAGGGGTTAATGTTCAGACAACAGATCTCCAGAAGAGAACAACAACAACAACAACAA
GCTACGAAGCAGAGTATTAGAACAGTGTCAGGAACACGTGCTTATTCAAAATCCAAATAT
CAGACAAATTCTTGTTTTGTTTTCTTTTTCCTCTGCTACAAAATCTGAGATTGGCAGAGC
AAAAATTTGGCAGGAATGTTCTTGTTTTATCTCCTCAGGGTGTGAAGAATGTACTCAGCG
TAAAGGTCCATTGAGTATTGAATGGCTTCAACGGCAGGACCATTAGGTAGAAAATCATTT
ACAGCAATTTCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGATTTCTGAG
AGACGATGCGGTGGAAGTTCTTTTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGATCATCAACA
CAAACCGCAATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATA
GCTCGTGCGCGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTAGCACATCT
AAAGGGTCATTGTCTTCACATAATGTGCGGGGGATAAAACCATAGTTATGAGGATACACG
ACCGATGAATATAGAATACGATCAACCTTGATGAGTCCTGTCTTTTTGTCAAGTTCGTAT
TTGACCTTGCTACCCTTTGAGATCTCAATAACCACATTGAAGATCGCCGGAGCTCCAGGT
CCGATTTCAAGATCATGCCATGGATGAGCAGCAACCGATCTCCTTGATAAAGATGAGAGT
ATCCTCTCGTTCAAACGTGGAGCTGTTCTCTGAAGCTTGTCAGATTGATTCTCTTTCATT
TTTTCACTCATTCAAAAGATTGACCACTCAAAGTCAGAATCTACTACAACTAATCAACAA
AACCCTACAACATATCGTTATCCATCAATCATCTTCAACCTAAGATAATTTAGAGCGTCA
AAAACTTCAAAAGATTGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX58JQ U 3
AF RR4EX58TF C 285
AF RR4ES55JQ U 7
AF RR4AY16JQ U 1
AF RR4C845TF C 376
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RD RR4EX58JQ 649 0 0
GAAC
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GCAATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATAGCTCGT
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TCACTGTCTTCACATAATGTGCGGGGGATAAAACCATAGTTAT
CT

QA 5 647 5 647
DS 

RD RR4EX58TF 366 0 0
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AGGTA*AAAATCATTTACAGCAATTTCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAA
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CTCAGGATCATCAACACAAACCGCAATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCAT
AGGCATTAATCCAATAGCTCGTGCGCGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCAT
GATGACTAGCACATCTAAAGGGTCACTGTCTTCACATAATGTGCGGGGGATAAAACCATA
GTTA
CT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR4ES55JQ 642 0 0
AAATCGAAACTTTAAATGGATAAAAGATTACAATACAAGTGAAAAATCAAATCGTAGTAG
GGGTTAATGTTCAGACAACAGATCTCCAGAAGAGGACAACAACAACAACAACAAGCTACG
AAGCAGAGTATTAGAACAGTGTCAGGAACACGTGCTTATTCAAAATCCAAATATCAGACA
AATTCTTGTTTTGTTTTCTTTTTCCTCTGCTACAAAATCTGAGATTGGCAGAGCAAAAAT
TTGGCAGGAATGTTCTTGTTTTATCTCCTCAGGGTGTGAAGAATGTACTCAGCGTAAAGG
TCCATTGAGTATTGAATGGCTTCAACGGCAGGACCATTAGGTAGAAAATCATTTACAGCA
ACTTCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGATTTCTGAGAGACGA
TGCGGTGGAAGTTCTTTTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGATCATCAACACAAACC
GCAATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATAGCTCGT
GCGCGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTAGCACATCTAAAGGG
TCATTGTCTTCACATAATGTGCGAGGGATAAAACCATAGTTA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4AY16JQ 872 0 0
GGAACTAAATCGAAACTTTAAATGGATAAAAGATTACAATACAAGTGAAAAATCAAATCG
TAGTAGGGGTTAATGTTCAGACAACAGATCTCCAGAAGAGAACAACAACAACAACAACAA
GCTACGAAGCAGAGTATTAGAACAGTGTCAGGAACACGTGCTTATTCAAAATCCAAATAT
CAGACAAATTCTTGTTTTGTTTTCTTTTTCCTCTGCTACAAAATCTGAGATTGGCAGAGC
AAAAATTTGGCAGGAATGTTTTTGTTTTATCTCCTCAGGGTGTGAAGAATGTACTCAGCG
TAAAGGTCCATTGAGTATTGAATGGCTTCAACGGCAGGACCATTAGGTAGAAAATCATTT
ACAGCAACTTCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGATTTCTGAG
AGACGATGCGGTGGAAGTTCTTTTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGATCATCAACA
CAAACCGCAATGACCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATA
GCTCGTGCGCGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTAGCACATCT
AAAGGGTCATTGTCTTCACATAATGTGCGGGGGATAAAACCATAGTTATGAGGATACACG
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TTGACCTTGCTACCCTTTGAGATCTCAATAACCACATTGAAGATCGCCGGAGCTCCAGGT
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ATCCTCTCGTTCAAACGTGGAGCTGTTCTCTG

QA 1 872 1 872
DS 

RD RR4C845TF 666 0 0
GTTCTCA
TCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGATTTCTGAGAGACGATGCGGTGGAAGTTCTT
TTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGATCATCAACACAAACCGCAATGATCCTGTCAT
CTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATAGCTCGTGCGCGTAGAAAACAAC
CTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTAGCACATCTAAAGGGTCATTGTCTTCACATA
ATGTGCGGGGGATAAAACCATAGTTATGAGGATACACGACCGATGAATATAGAATACGAT
CAACCTTGATGAGTCCTGTCTTTTTGTCAAGTTCGTATTTGACCTTGCTACCCTTTGAGA
TCTCAATAACCACATTGAAGATCGCCGGAGCTCCAGGTCCGATTTCAAGATCATGCCATG
GATGAGCAGCAACCGATCTCCTTGATAAAGATGAGAGTATCCTCTCGTTCAAACGTGGAG
CTGTTCTCTGAAGCTTGTCAGATTGATTCTCTTTCATTTTTTCACTCATTCAAAAGATTG
ACCACTCAAAGTCAGAATCTACTACAACTAATCAACAAAACCCTACAACATATCGTTATC
CATCAATCATCTTCAACCTAAGATAATTTAGAGCGTCAAAAACTTCAAAAGATTGAGAT

QA 8 666 8 666
DS 



AS 1 8

CO CL895Contig1 778 8 1 U
GATATAACTCTGGCTTTTATTTCATCCAATATATATCAAAGTTTTATATTAACAACTTTC
ACTATTTAGGTGACAAATATTATTTCTTTATTTGAACAAAAGCACAAATATGTGACAAGA
ACTGAGTAAACAATACATAGAAATGCACCACAATGCTCTCTGCTTAATGAGCTTGAATGC
TTTCTCCAAACTTGTGGGTTAAGCTCTTTATATACTCCTTCCTAACCGGGTGATCTTCCT
GAGGTCGGTTATATGGTGTCCAAACCGGTTCTCCCACAAACAGCCTCATCAGCTTGATGT
AGTTGCTGGTGTCGAGTGTGAACCGGTGGTAGATCCCAGCAGGAAGAACAATTAGATCGC
CCGGTTTCATCCAAATTCGGATCCAACGGTCATCCTTGTCCCTAACATCAAAATAGCCAC
TTCCTGCTAGGCAGTAGCGAATCTCTTCGTCCTGGTGAATGTGTTCTGTGAAAAAGTTCT
TCAGCTTCTCCTCGTAGTTGCTGACTTTCTCGGGACACAGATCCAGCAAATCCATGTAAT
CGTAACCCCTTTCATCTCTAATCTTGGCTAGCTCGGAATCATTCTCGTAGTTCTCAGGGT
TCAACTTCCAGTAGAATACTCCCAGTTCTGCCAAGTAATCCATAGGGAGGAGCTCTTTGG
GGTTAGGATGATGAGGAAGTCTCTGATCTTCATTGCTATCATCCATTAACCATGCCTCGA
GAGCCATTCTTGATCTTCGTTCTGTCTGTGTGAGTGCTTCGATTTCAATCTCATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 15 35 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DM94JQ U 41
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AF RR4CS67TF C 450
AF RR4CS67JQ U 1
AF RR4D992TF C 15
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AF RR4CP33JQ U 22
AF RR4CP33TF C 49
BS 1 778 RR4CS67JQ

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GG
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CACAAATATGTGACAAGAACTGAGTAAACAATACATAGAAATGCACCACAATGCTCTCTG
CTTAATGAGCTTGAATGCTTTCTCCAAACTTGTGGGTTAAGCTCTTTATATACTCCTTCC
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GCCTCATCAGCTTGGTGTAGTTGCTGGTGTCGAGTGTGAACCGGTGATAGATCCCAGCAG
GAAGAACAATTAGATCGCCCGGTTTCATCCAAATTCGGA

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DS 

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GGCTTTTAT
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TATTTCTTTATTTGAACAAAAGCACAAATATGTGACAAGAACTGAGTAAACAATACATAG
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AAGCTCTTTATATACTCCTTCCTAACCGGGTGATCTTCCTGAGGTCGGTTATATGGTGTC
CAAACCGGTTCTCCCACAAACAGCCTCATCAGCTTGATGTAGTTGCTGGTGTCGAGTGTG
AACCGGTGGTAGATCCCAGCAGGAAGAACAATTAGATCGCCCGGTTTCATCCAAATTCGG
ATCCAACGGTCATCCTTGTCCCTGACATCAAAATAGCCACTTCCTGCTAGGCAGTAGCGA
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CTGACTTTCTCGGGACACAGATCCAGCAAATCCATGTAATCGTAACCCCTTTCATCTCTA
ATCTTGGCTAGCTCGGAATCATTCTCGTAGTTCTCAGGGTTCAACTTCCAGTACAATACT
CCCAGTTCTGCCAAGTAATCCATAGGGAGGAGCACTTTGGGGTTAGGATGATGAGGAAGT
CTCTGATCT

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DS 

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AGCTCGGAATCATTCTCGTAGTTCTCAGGGTTCAACTTCCAGTAGAATACTCCCAGTTCT
GCCAAGTAATCCATAGGGAGGAGCTCTTTGGGGTTAGGATGATGAGGAAGTCTCTGATCT
T

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DS 

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AGTTGCTGGTGTCGAGTGTGAACCGGTGGTAGATCCCAGCAGGAAGAACAATTAGATCGC
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GAGCCATTCTTGATCTTCGTTCTGTCTGTGTGAGTGCTTCGATTTCAATCTCATCTCC

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GCTTTATT
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CCGGTGGTAGATCCCAGCAGGAAGAACAATTAGATCGCCCGGTTTCATCCAAATTCGGAT
CCAACGGTCATCCTTGTCCCTGACATCAAAATAGCCACTTCCTGCTAGGCAGTAGCGAAT
CTCTTCGTCCTGGTGAATGTGTTCTGTGAAAAAGTTCTTCAGCTTCTCCTCGTAGTTGCT
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AATCTCATCTCC

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G
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ATGCACCACAATGCTCTCTGCTTAATGAGCTTGAATGCTTTCTCCAAACTTGTGGGTTAA
GCTCTTTATATACTCCTTCCTAACCGGGTGATCTTCCTGAGGTCGGTTATATGGTGTCCA
AACCGGTTCTCCCACAAACAGCCTCATCAGCTTGATGTAGTTGCTGGTGTCGAGTGTGAA
CCGGTGGTAGATCCCAGCAGGAAGAACAATTAGATCGCCCGGTTTCATCCAAATTCGGAT
CCAACGGTCATCCTTGTCCCTAACATCAAAATAGCCACTTCCTGCTAGGCAGTAGCGAAT
CTCTTCGTCCTGGTGAATGTGTTCTGTGAAAAAGTTCTTCAGCTTCTCCTCGTAGTTGCT
GACTTTCTCGGGACACAGATCCAGCAAATCCATGTAATCGTAACCCCTTTCATCTCTAAT
CTTGGCTAGCTCGGAATCATTCTCGTAGTTCTCAGGGTTCAACTTCCAGTAGAATACTCC
CAGTTCTGCCAAGTAATCCATAGGGAGGAGCTCTTTGGGGTTAGGATGATGAGGAAGTCT
CTGATCTTCATTGCTATCATCCATTAACCATGCCTCGAGAGCCATTCTTGATCTTCGTTC
TGTCTGTGTGAGTGCTTCG

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DS 

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AGTTCTTCAGCTTCTCCTCGTAGTTGCTGACTTTCTCGGGACACAGATCCAGCAAATCCA
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CAGGGTTCAACTTCCAGTAGAATACTCCCAGTTCTGCCAAGTAATCCATAGGGAGGAGCT
CTTTGGGGTTAGGATGATGAGGAAGTCTCTGATCTTCATTGCTATCATCCATTAACCATG
CCTCGAGAGCCATTCTTGATCTTCGTTCTGTCTGTGTGAGTGCTTCGATTTCAATCTCAT
CTCC

QA 7 730 7 730
DS 



AS 1 8

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CTCTCCTTCAACCAAAAGTCTCTGTTTCTTCTCCCCTTAGACCAAAAGCTGTAAAGACTT
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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA60TF U 2
AF RR4DK52TF U 1
AF RR4GR67TF U 1
AF RR4DA60JQ C 555
AF RR4F704JQ C 845
AF RR4GR67JQ C 689
AF RR4DK52JQ C 728
AF RR4F704TF U 590
BS 1 293 RR4DK52TF
BS 294 294 RR4GR67TF
BS 295 526 RR4DK52TF
BS 527 527 RR4GR67TF
BS 528 643 RR4DK52TF
BS 644 646 RR4GR67TF
BS 647 647 RR4F704TF
BS 648 706 RR4GR67TF
BS 707 1207 RR4F704TF
BS 1208 1227 RR4DA60JQ

RD RR4DA60TF 595 0 0
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TCTCCTTCAACCAAAAGTCTCTGTTTCTTCTCCCCTTAGACCAAAAGCTGTAAAGACTTC
GATTTCAACTCCTCAGACACAGACAATAACGGAAGGACTTGAAGAAAAATTCGGACGAAA
AGGCATAAAATTCTCGGAACCAAACATGGTCGAGCTCAAGGTCAGAAACGGAAGCTCTTT
AAAGCTGAGTCTATCGGACGCTCATGTTGTTTCATATCAACCAAAAGTGTACTGGAAAGA
CGATGGGTTCGAGGAAGTCCTTTACACAGTAGAGGACGGTAATAAAACCAGAGGCGGGGT
TGGTCTTGTCATCATAAACGAAGAAGAAAAAGCTTCTTCAGTACTATCAGGTTGTAATTG
GACTGTTAAAGACACTGATTCAGACGCCATTGACGCTATTCAGATTGAATTGAGCTGCAC
GGCAGGATTTCTCGACATAACCTACATCGTCTCTCTCTATCCAGTAAGCATAGCAACAGC
AGTGGTGGTGAAGAACAACGGTCGCAAACCGGTTTCCCTTAAACCGGGGATTATA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4DK52TF 643 0 0
TTTTTTTTTCTTCTCCTTCCTTACTCTCTCGATCAATGGCTTCTCTTTTTTCTTTTTCTT
CTCTCCTTCAACCAAAAGTCTCTGTTTCTTCTCCCCTTAGACCAAAAGCTGTAAAGACTT
CGATTTCAGCTCCTCAGACACAGACAATAACGGAAGGACTTGAAGAAAAATTCGGACGAA
AAGGCATAAAATTCTCGGAACCAAACATGGTCGAGCTCAAGGTCAGAAACGGAAGCTCTT
TAAAGCTGAGTCTATCGGACGCTCATGTTGTTTCATATCAACCAAAAGTGTACCGGAAAG
ACGATGGGTTCGAGGAAGTCCTTTACACAGTAGAGGACGGTAATAAAACCAGAGGCGGGG
TTGGTCTTGTCATCATAAACGAAGAAGAAAAAGCTTCTTCAGTACTATCAGGTTGTAATT
GGACTGTTAAAGACACTGATTCAGACGCCATTGACGCTATTCAGATTGAATTGAGCTGCA
CGGCCGGATTTCTTGACATAACGTACATCGTCTCTCTCTATCCAGTGAGCATAGCAACAG
CAGTGGTGGTGAAGAACAACGGTCGCAAACCGGTTTCCCTTAAACCGGGGATTATAAGTT
CCTTGAGATTCAAGAAACGGAGTGGTGCTGGAATTCAAGGGCT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4GR67TF 706 0 0
T
TTTTTTTTCTTCTCCTTCCTTACTCTCTCGATCAATGGCTTCTCTTTTTTCTTTTTCTTC
TCTCCTTCAACCAAAAGTCTCTGTTTCTTCTCCCCTTAGACCAAAAGCTGTAAAGACTTC
GATTTCAGCTCCTCAGACACAGACAATAACGGAAGGACTTGAAGAAAAATTCGGACGAAA
AGGCATAAAATTCTCGGAACCAAACATGGTCGAGCTCAAGGTCAGAAACGGAAGCTCTTT
AAAGCTGAGTCTATCGGACGCTCATGTTGTTTCATATCAACCAAAAGTGTACTGGAAAGA
CTATGGGTTCGAGGAAGTCCTTTACACAGTAGAGGACGGTAATAAAACCAGAGGCGGGGT
TGGTCTTGTCATCATAAACGAAGAAGAAAAAGCTTCTTCAGTACTATCAGGTTGTAATTG
GACTGTTAAAGACACTGATTCAGACGCCATTGACGCTATTCAGATTGAATTGAGCTGCAC
GGCCGGATTTCTTGACATAACGTACATCGTCTCTCTCTATCCAGTAAGCATAGCAACAGC
AGTGGTGGTGAAGAACAACGGTCGCAAACCGGTTTCCCTTAAACCGGGGATTATAAGTTC
CTTGAGATTCA*GAAACGGAGTGGTGCTGGAATTCAAGGGCTTAA*GGCTGCTCCTATTG
TCCCAGTCCTCCATTATCTTCGCCTTTCGAGCTACTGTCTCCTTC

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DS 

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AAACGGAGTGGTGCAGGAATTCAAGGGCTTAAAGGCTGCTCCTATTGTCCCAGTCCTCCA
TTATCTTCGCCTTTCGAGCTACTGTCTCCTTCTGAGGCAATGAAGGCGGACTCTTCCGGG
TGGTTCGGGTCAGAAGATGGGGAAAAACCAGGGATTTGGGCAGTTGAAGACTCTGTTATT
ACACTTCTTGAGAAGAAGATGAGTAGAGTCTATGGTGCCCATCCGGCTGAGAGACTTAAG
GCCGTCTATAACACTCCACCTTCTAAATATGAAACCATTGATCAGGGACGAGGATTGTTC
TTCAGGATGATAAGGATGGGGTTCGAGGACATGTACGTGGGATCTCCAGGATCAATGTGG
GACAAGTTTGGGAAGCAACAATATTTTGTGTGCACGGGTCCTGCATCTATGCTCGTTCCC
ATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGCAATGGTAATTGAACATGATAATTTG
TAAACTTCTTTTACTATATATCTATCATCTTTATTTTCTTACTTATTTTTGTCATTCTGC
AACAAATATGATGTTGTTTCATATTGTATATATGAAAAGTCACAACTACAAGTGCATTCC
TCATTTTCTATGC

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DS 

RD RR4F704JQ 365 0 0
GAGACTTAAGGCCGTTTATAACACTCCACCTTTTAAATATGAAACCATTGATCAGGGACG
AGGATTGTTCTTCAGGATGATAAGGATGGGGTTCGAGGACATGTACGTGGGATCTCCAGG
ATCAATGTGGGACAAGTTTGGGAAGCAACAATATTTTGTGTGCACGGGTCCTGCATCTAT
GCTCGTTCCCATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGCAATGGTAATTGAACA
CGATAATTTGTAAACTTCTTTTACTATATATCTATCATCTTTATTTTCTTACTTATTTTT
GTCATTCTGCAACAAATATGATGTTGTTTCATATTGTATATATGAAAAGTCACAACTACA
AGT
AC

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR4GR67JQ 525 0 0
CGAGCTACTGTCTCCTTCTGAGGCAATGAAGGCGGACTCTTCCGGGTGGTTCGGGTCAGA
AGATGGGGAAAAACCAGGGATTTGGGCAGTTGAAGACTCTGTTATTACACTTCTTGAGAA
GAAGATGAGTAGAGTCTATGGCGCCCATCCGGCTGAGAGACTTAAGGCCGTCTACAACAC
TCCACCTTCTAAATATGAAACCATTGATCAGGGACGAGGATTGTTCTTCAGGATGATAAG
GATGGGGTTCGAGGACATGTACGTGGGATCCCCAGGATCAATGTGGGACAAGTTTGGGAA
GCAACAATACTTTGTGTGCACGGGTCCTGCATCTATGCTCGTTCCCATTGATGTTGGTGC
CGGTGAAACCTGGAGAGGAGCAATGGTAATTGAACATGATAATTTGTAAACTTCTTTTAC
TATATATCTATCATCTTTATTTTCTTACTTATTTTTGTCATTCTGCAACAAATATGATGT
TGTTTCATATTGTATATATGAAAAGTCACAACTACAAGT
GCATTC

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DS 

RD RR4DK52JQ 476 0 0
TTCCGGGTAGTTCGGGTCAGAAGATGGGGAAAAACCAGGGATTTGGGCAGTTGAAGACTC
TGTTATTACACTTCTTGAGAAGAAGATGAGTAGAGTTTATGGCGCCCATCCGGCTGAGAG
ACTTAAGGCCGTTTACAACACTCCACCCTCTAAATATGAAACCATTGATCAGGGACGAGG
ATTGTTTTTCAGGATGATAAGGATGGGGTTCGAGGACATGTACGTGGGATCCCCAGGATC
AATGTGGGACAAGTTTGGGAAGCAACAATATTTTGTGTGCACGGGTCCTGCATTTATGCT
CGTTCCCATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGCAATGGTAATTGAACATGA
TAATTTGTAAACTTCTTTTACTATATATCTATCATCTTTATTTTCTTACTTATTTTTGTC
ATTCTGCAACAAATATGATGTTGTTTCATATTGTATATATGAAAAGTCACAACTAC

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DS 

RD RR4F704TF 620 0 0
GATTATAAGTTCCTTGAGATTCAAGAAACGGAGTGGTGCTGGAATTCAAGGGCTTAAAGG
CTGCTCTTATTGTCCCAGTCCTCCATTATCTTCGCCTTTCGAGCTACTGTCTCCTTCTGA
GGCAATGAAGGCGGACTCTTCCGGGTGGTTCGGGTCAGAAGATGGGGAAAAACCAGGGAT
TTGGGCAGTTGAAGACTCTGTTATTACACTTCTTGAGAAGAAGATGAGTAGAGTCTATGG
TGCCCATCCGGCTGAGAGACTTAAGGCCGTCTATAACACTCCACCTTCTAAATATGAAAC
CATTGATCAGGGACGAGGATTGTTCTTCAGGATGATAAGGATGGGGTTCGAGGACATGTA
CGTGGGATCTCCAGGATCAATGTGGGACAAGTTTGGGAAGCAACAATATTTTGTGTGCAC
GGGTCCTGCATCTATGCTCGTTCCCATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGC
AATGGTAATTGAACACGATAATTTGTAAACTTCTTTTACTATATATCTATCATCTTTATT
TTCTTACTTATTTTTGTCATTCTGCAACAAATATGATGTTGTTTCATATTGTATATATGA
AAAGTCACAACTACAAGT
AC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 2 8

CO CL897Contig1 752 6 10 U
GGATCTCAATCTCAAATTCTCTCTGTACACAATCAACAACAGTCTCGGCCTCTGGCCTCC
ACCCTCACAGATCGATTTTGGTGTTGACAGATCTGACGCATACGACCAATGTTGTTCTTC
ACCAAAACCGCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAATCTCCATTCCTCATATCCTCTCTTT
CCCTAGATCTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCTCTATAGAAATGTGTTTTTGATTTCTCATTT
TTCTTAACCTTTTGAATGCGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTTGTGTTTATAAATCTGGG
TTTCAGAGACGCCTCCTCTCTTCCTCTGCTCCGTCACGAAGTGACGCCTTTATCTCTTCC
TGTCGACAAAGTACAGATGTAGCAAGCTTCTAAAGCTCACACGAAAGAGACGGGTTTGGA
GAGGGAGAAAGGAAAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGACCAGATC
TTGCGGAGAGCATAACGATGGAGGACGTGGCTGACGGCGTGGCTTAAGTGTCGAGGATGG
AGGAGGATTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTT*CTGTTTATTTTTTT*GGTTTACATGTAAACCA
AATTTGAATTATTTTTTATATGTAAACCAATTTAACTTATGAATCATTTGTAATTAAAGT
TATTAATAACAAAAAAACAAACGCTATTAAGG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 

AF RR4A376JQ C 1
AF RR4BJ89JQ C 1
AF RR4BJ89TF U 1
AF RR4A376TF U 1
AF RR4A376TFB U 1
AF RR4A376JQD C 1
BS 1 481 RR4BJ89TF
BS 482 482 RR4A376TF
BS 483 515 RR4BJ89TF
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BS 629 750 RR4BJ89TF
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RD RR4A376JQ 752 0 0
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AGGAGGATTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTT*CTGTTTATTTTTTT*GGTTTACATGTAAACCA
AATTTGAATTATTTTTTATATGTAAACCAATTTAACTTATGAATCATTTGTAATTAAAGT
TATTAATAACAAAAAAACAAACGCTATTAAGG

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DS 

RD RR4BJ89JQ 752 0 0
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ACCAAAACCGCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAATCTCCATTCCTCATATCCTCTCTTT
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TTCTTAACCTTTTGAATGCGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTTGTGTTTATAAATCTGGG
TTTCAGAGACGCCTCCTCTCTTCCTCTGCTCCGTCACGAAGTGACGCCTTTATCTCTTCC
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GAGGGAGAAAGGAAAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGACCAGATC
TGGCGGAGAGCATAACGATGGAGGACGTGGCTGACAGCGTGGCTTAAGTGTCGAGGATGG
AGGAGGAGTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTT*CTGTTTATTTTTTT*GGTTTACATGTAAACCA
AATTTGAATTATTTTTTATATGTAAACCAATTTAACTTATGAATCATTTGTAATTAAAGT
TATTAATAACAAAAAAACAAACGCTATTAA
AG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4BJ89TF 752 0 0
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GAGGGAGAAAGGAAAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGACCAGATC
TGGCGGAGAGCATAACGATGGAGGACGTGGCTGACAGCGTGGCTTAAGTGTCGAGGATGG
AGGAGGAGTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTTTCTGTTTATTTTTTT*GGTTTACATGTAAACCA
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TATTAATAACAAAAAAACAAACGCTATTAA
AG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4A376TF 752 0 0
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TTCTTAACCTTTTGAATGCGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTTGTGTTTATAAATCTGGG
TTTCAGAGACGCCTCCTCTCTTCCTCTGCTCCGTCACGAAGTGACGCCTTTATCTCTTCC
TGTCGACAAAGTACAGATGTAGCAAGCTTCTAAAGCTCACACGAAAGAGACGGGTTTGGA
GAGGGAGAAAGGAAAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGACCAGATC
TTGCGGAGAGCATAACGATGGAGGACGTGGCTGACGGCGTGGCTTAAGTGTCGAGGATGG
AGGAGGATTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTT*CTGTTTATTTTTTT*GGTTTACATGTAAACCA
AATTTGAATTATTTTTTATATGTAAACCAATTTAACTTATGAATCATTTGTAATTAAAGT
TATTAATAACAAAAAA*CAAACGCTATTAA
AG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4A376TFB 752 0 0
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TTCTTAACCTTTTGAATGCGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTTGTGTTTATAAATCTGGG
TTTCAGAGACGCCTCCTCTCTTCCTCTGCTCCGTCACGAAGTGACGCCTTTATCTCTTCC
TGTCGACAAAGTACAGATGTAGCAAGCTTCTAAAGCTCACACGAAAGAGACGGGTTTGGA
GAGGGAGAAAGGAAAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGACCAGATC
TTGCGGAGAGCATAACGATGGAGGACGTGGCTGACGGCGTGGCTTAAGTGTCGAGGATGG
AGGAGGATTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTT*CTGTTTATTTTTTTTGGTTTACATGTAAACCA
AATTTGAATTATTTTTTATATGTAAACCAATTTAACTTATGAATCATTTGTAATTAAAGT
TATTAATAACAAAAAAACAAACGCTATTAA
GG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4A376JQD 752 0 0
GGATCTCAATCTCAAATTCTCTCTGTACACAATCAACAACAGTCTCGGCCTCTGGCCTCC
ACCCTCACAGATCGATTTTGGTGTTGACAGATCTGACGCATACGACCAATGTTGTTCTTC
ACCAAAACCGCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAATCTCCATTCCTCATATCCTCTCTTT
CCCTAGATCTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCTCTATAGAAATGTGTTTTTGATTTCTCATTT
TTCTTAACCTTTTGAATGCGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTTGTGTTTATAAATCTGGG
TTTCAGAGACGCCTCCTCTCTTCCTTTGCTCCGTCACGAAGTGACGCCTTTATCTCTTCC
TGTCGACAAAGTACAGATGTAGCAAGCTTCTAAAGCTCACACGAAAGAGACGGGTTTGGA
GAGGGAGAAAGGAAAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGACCAGATC
TTGCGGAGAGCATAACGATGGAGGACGTGGCTGACGGCGTGGCTTAAGTGTCGAGGATGG
AGGAGGATTTCCTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAAT
TAGGGTTCTGTTAGATTTAGTTTTTTT*CTGTTTATTTTTTT*GGTTTACATGTAAACCA
AATTTGAATTATTTTTTATATGTAAACCAATTTAACTTATGAATCATTTGTAATTAAAGT
TATTAATAACAAAAAAACAAACGCTATTAA
GG

QA 1 750 1 750
DS 



CO CL897Contig2 763 2 2 U
GGATCTCACCATTCTCTTTCTCACAAATCTCTCTGTGTCTCACCATCTCCAATCTCAAAT
TCTCTCTGTACACAATCAACAACAGTCTCGGCCTCTGGCCTCCACCCTCACAGATCGATT
TTGGTGTTGACAGATCTGACGCATCCGACCAATGTTGATCTTCACCAAAACCGCTTCAAC
TTCAAACCCATCTCCCAATCTCCATTCCTCATATCCTCTCTTTCCCTAGATTTCTCTTTT
CTTTTCAGTTTCTCCATAGAAATGTGTTTTTGATTTCTCATTTTCTTAACCTTTTGAATG
TGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTCTGTGTTTATAAAACTGGGTTTCAGAGACGCCTCCT
CTCTTCCTCTGCTCCGTGACGAAGTGACGCCTTTCTCTTCTTCCTGTCGACAAAGTACAG
ATGTAGCAAGCTCCTAAAGCTCACACGAAAGAGACGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAAC
GAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGATCAGATCTGGCGGAGAGCAT
AACGATGGAGGACGTGGCTGACGGCGTGGCTGAAATGTCGAGGATGGAGGAGGAGTTCGT
GATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAATTAGGTATCTGTTA
GGTTTAGTTTTTTTCTGTTTATTTTTTTTTGGTTTACGTGTAAACCAAATTTGAATTATC
TTTTATATGTAAACCAGTTTAACTTATGAATCATTTGTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4BF82TF U 1
AF RR4BF82JQ C 92
BS 1 761 RR4BF82TF
BS 762 763 RR4BF82JQ

RD RR4BF82TF 763 0 0
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TCTCTCTGTACACAATCAACAACAGTCTCGGCCTCTGGCCTCCACCCTCACAGATCGATT
TTGGTGTTGACAGATCTGACGCATCCGACCAATGTTGATCTTCACCAAAACCGCTTCAAC
TTCAAACCCATCTCCCAATCTCCATTCCTCATATCCTCTCTTTCCCTAGATTTCTCTTTT
CTTTTCAGTTTCTCCATAGAAATGTGTTTTTGATTTCTCATTTTCTTAACCTTTTGAATG
TGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTCTGTGTTTATAAAACTGGGTTTCAGAGACGCCTCCT
CTCTTCCTCTGCTCCGTGACGAAGTGACGCCTTTCTCTTCTTCCTGTCGACAAAGTACAG
ATGTAGCAAGCTCCTAAAGCTCACACGAAAGAGACGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAAC
GAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAGTAGAGGATCAGATCTGGCGGAGAGCAT
AACGATGGAGGACGTGGCTGACGGCGTGGCTGAAATGTCGAGGATGGAGGAGGAGTTCGT
GATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGAGGATGTGTCTGAATTAGGTATCTGTTA
GGTTTAGTTTTTTTCTGTTTATTTTTTTTTGGTTTACGTGTAAACCAAATTTGAATTATC
TTTTATATGTAAACCAGTTTAACTTATGAATCATTTGTAAT
CC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4BF82JQ 672 0 0
CT
TCTGGCCTCCACCCTCACAGATCGATTTTGGTGTTGACAGATCTGACGCATCCGACCAAT
GTTGATCTTCACCAAAACCGCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAATCTCCATTCCTCATA
TCCTCTCTTTCCCTAGATTTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCTCCATAGAAATGTGTTTTTGA
TTTCTCATTTTCTTAACCTTTTGAATGTGTAAAGTTTGATTCTTTTTCTGTCTGTGTTTA
TAAAACTGGGTTTCAGAGACGCCTCCTCTCTTCCTCTGCTCCGTGACGAAGTGACGCCTT
TCTCTTCTTCCTGTCGACAAAGTACAGATGTAGCAAGCTCCTAAAGCTCACACGAAAGAG
ACGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAACGAGACGAACGAAGAAGCTGCAGAGGCAGAGGAG
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AATGTCGAGGATGGAGGAGGAGTTCGTGATGGAAGCGGCTAGGGTAAGGATAACGATGGA
GGATGTGTCTGAATTAGGTATCTGTTAGGTTTAGTTTTTTTCTGTTTATTTTTTTTTGGT
TTACGTGTAAACCAAATTTGAATTATCTTTTATATGTAAACCAGTTTAACTTATGAATCA
TTTGTAATCC

QA 3 672 3 672
DS 



AS 1 8

CO CL898Contig1 740 8 4 U
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TACAAATTTATAAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATG
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GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
ACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGAC
AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
ATCC*TCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
AAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATT*GTCTCTAACGAGGTTCGAA
CCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCA
AGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTAC
ATATGCACCGATCTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATA
TAAAACTTTTTTTCTCGAAA


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ57TF U 1
AF RR4BL12JQ C 1
AF RR4CQ37TF U 1
AF RR4D735TF U 1
AF RR4BL12TF U 1
AF RR4CQ37JQ C 1
AF RR4BL17JQ C 39
AF RR4BL17TF U 39
BS 1 280 RR4AJ57TF
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BS 282 734 RR4AJ57TF
BS 735 740 RR4BL17TF

RD RR4AJ57TF 734 0 0
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAATTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATAT
TACAAATTTATAAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATG
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GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
ACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCCCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGAC
AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
ATCC*TCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
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CCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCA
AGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTAC
ATATGCACCGATCTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATA
TAAAACTTTTTTTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4BL12JQ 736 0 0
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAATTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATAT
TACAAATTTATAAAGTCCTCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATG
GCCAAATTCTTCATCGTCTTCCTTGCCTCTGCCCTATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTT
GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
ACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGAC
AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
ATCC*TCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
AAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATT*GTCTCTAACGAGGTTCGAA
CCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCA
AGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTAC
ATATGCACCGATCTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATA
TAAAACTTTTTTTCT
T

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4CQ37TF 727 0 0
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAATTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATAT
TACAAATTTATAAAGTCCTCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATG
GCCAAATTCTTCATCGTCTTCCTTGCCTCTGCCCTATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTT
GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
ACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGAC
AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
ATCC*TCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
AAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATT*GTCTCTAACGAGGTTCGAA
CCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCA
AGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTAC
ATATGCACCGATCTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCA*CATATTATA
TAAAACT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4D735TF 729 0 0
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAATTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATAT
TACAAATTTATAAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATG
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GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
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AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
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AAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATT*GTCTCTAACGAGGTTCGAA
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TAAA
CTTTT

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GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
ACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGAC
AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
ATCC*TCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
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AGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTAC
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TAAAACT

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DS 

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GCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGAT
ACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGAC
AAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATC
ATCC*TCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
AAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATT*GTCTCTAACGAGGTTCGAA
CCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCA
AGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTAC
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TAAAACTTTTTTTCT
T

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DS 

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CG

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DS 

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CCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACT
GACGAAAGAAGCCGTGACCGACAAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCA
CGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCCTCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGG
TGAACAACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCA
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GCTGATTGTCCTCTAGTTTTCAAGGAGCTCGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCT
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AACTCTTTT*CA*CATATTATATAAAACTTTTTTTCTCGAAA

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DS 



AS 1 7

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TTTTTCCAAAGATCCTAT*ACTTCTCTAGACATTTAAACAGCAACGTTAGGAGACGCTGG
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AGTATGTGTCTTTGTCCCGACAAGCAACACTTTGTTCAAAACAATCTGGTCATCAACATT
CGCATCTTTGAGCCGCTGAGTGTAGAGATATCTCCCTGGGAAAACAATGTACTGACGTCC
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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4GA06JQ U 1
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TTTTTCCAAAGATCCTAT*ACTTCTCTAGACATTTAAACAGCAACGTTAGGAGACGCTGG
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TTTCCAAAGATCCTAT*ACTTCTCTAGACATTTAAACAGCAACGTTAGGAGACGCTGGAT
ACTCTTCGTACCCTGAGATTCCTGTAATCCTAATCCTCGTATTTGGCTGTCGGTGACCGA
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TATGTGTCTTTGTCCCGACAAGCAACACTTTGTTCAAAACAATCTGGTCATCAACATTAG
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GTAGTCTCTGGTTCAGCCACGACGGCTGATTCGGCGAATTTCGGAGCGGCGGGGAATGCG
GGACGAGA

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DS 

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GACCTTGATTTTCCACTACAGCATGCACAGTGGCATTGGTAACAACCGGTTTGCCGATGT
AAGTATGTGTCTTTGTCCCGACAAGCAACACTTTGTTCAAAACAATCTGGTCATCAACAT
TCGCATCTTTGAGCCGCTGAGTGTAGAGATATCTCCCTGGGAAAACAATGTACTGACGTC
CACCAACCATAACAACGGCGAAGATCTCTTCTCGTTTAGGCTTATCCTCCTCTGAGACCA
CCACAGCTTCAATATCGGTAGTCTCTGGTTCAGCCACGACGGCTGATTCGGCGAATTTCG
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AATGAGCAGAGAAAGCAGAGCACAGAGAAAGCGCCGCTGAGGGAGAAGCCATGTTTTTTT
CGCCGAAAGCTCTCTTAAGCTCAGAACT
CC

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DS 

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TCTTCTTTGGCTTGTACTTGAAGACCACCACTTTATCATTCAGACCTTGATTTTCCACTA
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CGACAAGCAACACTTTGTTCAAAACAATCTGGTCATCAACATTAGCATCTTTGGGCCGCT
GAGTGTAGAGATATCTCCCTGGGAAAACAATGTACTGGCGTCCACCAACCACAACAACGG
CGAAGATCTCTTCTCGTTTAGGCTTATCCTCCTCTGGGACCACCACAGCTTCAATATCGG
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GACGAGACGTAGACGCAGCAGCGGAAGTAGAAAGAAACCCAATCGCTGGTCTAGCCAGAC
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GCTCAGAACT
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CAATCTGGTCATCAACATTCGCATCTTTGAGCCGCTGAGTGTAGAGATATCTCCCTGGGA
AAACAATGTACTGACGTCCACCAACCATAACAACGGCGAAGATCTCTTCTCGTTTAGGCT
TATCCTCCTCTGAGACCACCACAGCTTCAATATCGGTAGTCTCTGGTTCAGCCACGACGG
CTGATTCGGCGAATTTCGGAGCGGCGGGGAATGCGGGACGAGACGTAGACGCAGAAGCGG
AAGTAGAAAGAAACCCAATCGCTGGTCTAGCCAGACTCAACGAAGGCTTAGAGAGGGAGC
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GAGAAGCCATGTTTTTTTCGCCGAAAGCTCTCTTAAGCTCAGAACTGAGACCC

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DS 



AS 2 6

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GCTGGAATACGAGAGAGATATGGGAGAGAGATTCGTGTTTTCGAGACTTCGAGCATTTCT
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ACACCCACAGATTACTACCGTCTTGTAGCATCTAAGAAAGAAGATAAATCTTTGAAGACA
AGAAAGCTCCGTGAAGCAGAAGAAGCTGCTCGACGAGCCAAGCTCACTAAGGCTGTGATG
CGGGTTCGTTTTCCTGATAACCACACATTGGAGGCGACATTTCATCCCTCAGAAAAGATC
CAATGCTTGATTGATCTTGTTAAAAGAGTACTTGCGCAGCCAGAGATTCCTTTCTACTTG
TACACAACGCCTCCCAAGAAGCAGATTAAGGATTTCTCACAAGACTTCTACTCTGCTGGC
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TCAACTCCTTACCTTAATGAAGAGATCTTGTCACTGAAAGATGTAGAGGACATGGCCAAA
GTAGAGGAACCCACTGAGCCATCATCTTCAGAACCAGCCACGAGCGATGCTGGTACTGTA
CCACTTGACCAAGAGCCCAAACCCGCGGAGAAGAAGAGCACAAAGCTAGTGGTTAAATGT
GATTGAACATGGTTGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B978TF U 34
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TCAACCAAAAGATGATGGTGCAAGTTCAACTCCTTACCTTAATGAAGAGATCTTGTCACT
GAAAGATGTAGAGGACATGGCCAAAGTAGAGGAACCCGCTGAGCCATC***TTCAGAACC
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GAGCA

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DS 

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GCTGGAATACGAGAGAGATATGGGAGAGAGATTCGTGTTTTCGAGACTTCGAGCATTTCT
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CGGGTTCGTTTTCCTGATAACCACACATTGGAGGCGACGTTTCATCCCTCAGAAAAGATC
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TACACAACTCCTCCCAAGAAGCAGATTAAGGATTTCTCACAAGACTTCTACTCTGCTGGC
TTCATTCCTGGTGCAATTGTCTACTTTGCAAATGATCAACCAAAAGATGATGGTGCAAGT
TCAACTCCTTACCTTAATGAAGAGATCTTGTCTCTGAAAGATGTAGAGGACATGGCCAAA
GTAGAGGAACCCACTGAGCCATCATCTTCAGAACCAGC*ACGAGCGA*GTTGGTACTGTA
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GATTGAACATGGTTGATAG

QA 1 799 1 799
DS 



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CATTTCTCAGAGGCCTAGTCAAGCTTCTTCTGTTGCTCAAGAGGAGTCTGATGAGTTCTA
CGAGCTCACACCCACAGATTACTACCGTCTTGTAGCCTCTAAGAAAGAAGATAAATCTTT
GAAGACAAGAAAGCTCCGTGAAGCTGAAGAAGCTGCTCGTCGAGCTAAGCTCACTAAGGC
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GAAGATCCAATGCTTGATCGATCTTGTTAAAAGAGTACTTGCGCAGCCAGAGATTCCTTT
CTACTTGTACACAACGCCTCCCAAGAAGCAGATTAAGGATTTCTCACAAGACTTCTACTC
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GGCCAAAGTAGAGGAACCCGCTGAGCCATCATCTTCAGAACCAGCCACGAGCGAGGTTGG
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TTGAATTGAAACGTGACAGTTAGTGTGACGGTAACAGTCTTATTGTGTCGGTCATGGCTT
GTTTGGATTTCCTCCGGCCTAAAAGGGATGTTTATCCATAATTTGAGTATATCATTTCTT
CTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RR4GO72TF U 1
AF RR4EM83TF U 12
AF RR4EM83JQ C 486
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GCTGAAGAAGCTGCTCGTCGAGCTAAGCTCACTAAGGCTGTAATCCGGGTTCGTTTTCCT
GATAACCACACATTGGAGGCGACATTTCATCCTTCGGAGAAGATCCAATGCTTGATCGAT
CTTGTTAAAAGAGTACTTGCGCAGCCAGAGATTCCTTTCTACTTGTACACAACGCCTCCC
AAGAAGCAGATTAAGGATTTCTCACAAGACTTCTACTCTGCTGGCTTCATTCCTGGTGCA
ATTGTCTACTTTGCAAATGATCAACCAAAAGATGATGGTGCAAGTTCAACCCCTTACCTT
AATGAAGAGAACTTGTCACTGAAAGATGTAGAGGACATGGCCAAAGTAGAGGAACCCGCT
GAGCCATCATCTTCAGAACCAGCCACGAGCGAGGT*GGTACTGTACCAGTTGACCAAGAG
CCCAAACCCGTGGAAA*GAAGAGCACAAAGCCTA
GTGGTT

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DS 

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GGT

QA 1 460 1 460
DS 

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GCTCAAGAGGAGTCTGATGAGTTCTACGAGCTCACACCCACAGATTACTACCGTCTTGTA
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QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 6

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TCTCTCGTAAAGCCTCAGCCGTCAAGTTTCAGATCTCCGTCGACCGGCGCGTGGTGGCTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4GX78TF U 1
AF RR4B894TF U 27
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AF RR4EM36JQ C 680
AF RR4ED41JQ C 747
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CGATAGCGCCACCGCCGGTCTCCTTTTCTTCCGTTCTCTGTCTACTGTAAGTCTTGTTGG
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TTGGGGGAAAGATCTGTTTTCTCGGTGGATTCTCGATACTCGAACTAGGTTGGAGGTTCC
GCAGGTTGAGGTCTTGCTAGGTTCTGTGCGGTGGTTGCGGGATTGAGGTTAGGGTTCC
CACAC

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4B894TF 718 0 0
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AAGAAAAAAGAAGCGACTTCGTCTCTCTCGTAAAGCCTCAGCCGTCAAGTTTCAGATCTC
CGTCGACCGGCGCGTGGTGGCTCCGATAGCGCCACCGCCGGTCTCCTTTTCTTCTCTTCT
CTGTCTTCTGTAAGTCTTATTGGTAGTTCCGTGTCTCTTCACCTCGGTTCTCTCAACGCT
TTTGTTAGAAGGTTCGATCTGGTTTGGGGGAAAGATCTGTCTTCTCGGTGGATTCTCGAT
ACGCGAACTAGGTTGGAGGTTCCGCAGGTTGAGGTCTTGCTAGGTTCTGTGCGGTGGTTG
CGGGATTGAGGTTAGGGTTCCGACGCCGGAATTTGGGGATCTCGTTCTGTTTTCGAACAT
CTCCCGTTTGTTCCTTCTCTCAAAGTGTTGAGTTTGGTGAAGCTAGTTCTTTAGGTTGGC
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TGGTTAGCTTGGATTGCTTCTCTGGGTTCGAATCTGTTTTCTGGTGCGCGGTGGCAAGTT
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GCGTCTCATTGGTGATTCATCAAGCTTGTATCTCATCCTTGGTTTCTTGGAGTTGAAGGT
GTGTTAGAGGGTCGTAGTGTGCTGGAGTGTGCTTGGTTTGGTGACTT

QA 12 718 12 718
DS 

RD RR4EM36TF 583 0 0
G
ATAGCCGGCTCTGATGTGGGTGTTTAATTCTTCCATCGAACCTGGTCAAGCGACATTCAA
GCGTCTCATTGGTGATTCATCAAGCTTGTATCTCATCCTTGGTTTCTCGGAGTTGAAGGT
GTGTTAGAGGTTCGTAGTGTGCTGGAGTGTGTTTGGTTTGGTGACTTAGTAGGATGGAGC
TCTTGCTCGGGCCATCGGTTGGAAATTATCTGCTGTGGTCTTTGAGCGGTCTGTCTCTTC
TTTCATCATTGGTTCTGATCTTATAATTTCAGTCTATGAAGCATCAAAGCGGGGAAGTTA
TGCAGTTCTTTGGTTTGCAACCGACGGGTTTCTCCGGATTTCTTGGTAAGGAGCTGTGGA
GCTTATGCTCAATGGCGACGGTCTTGGAGTAGTCGATCGCCAAAAGCGTATGTTTCTCAT
CGTTTGGCTGCTCGAGTTGATGGCTTGTTCTATGGTGGCTTCTCTGGTTGA*GAAGTGGT
AAGTGTGTTGGTTACTGGTTTGGTTTCTAAAGGACTGGTTCTAAGAGATAACAGTTCAAC
TCTAATAAGATAGGCTGGCTTCGCTTTCCTTCTCAATCCTG
C

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR4B894JQ 799 0 0
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ATTCATCAAGCTTGTATCTCATCCTTGGTTTCTTGGAGTTGAAGGTGTGTTAGAGGGTCG
TAGTGTGCTGGAGTGTGCTTGGTTTGGTGACTTAGTAGGATGGAGCTCTTGCTAGGGCCA
TCGGTTGGAAATTATCTGCTGTGGTATTTGAGCGGTCTGTCTCTTCTTTCATCATTGGTT
CTGATCCTATAATTTCAGTCTATGAAGCATCGAAGCGGGGAAGTTATACAGTTCTTTGGT
TTGCAACCGACGGGTTTCTCCGGATTTCTTGGTAAGGAGCCGTGGAGCTTATGCTCAATC
GCGACGGTCTTGGAGTAGTCGATCGCCAAAAGCGTATGTTTCTCTTCGTTTGGCTGCTCG
AGTTGATGGCTTGTTCTATGGTGGCTTCTCTGGTTGAAGAAGTGGTAAGTGTATTGGTTA
CTGGTTTGGTTTCTAAAGGAATGGTTCTAAGAGATAA**GCTCAACTCTAATAAGATAGG
CCAGCTTCGCTTTCCTTCTCAATCCTGTTTCCGGCTTCGATATGCTTTCTTGTTCTTGAA
GTTTATGCTTAACCTTCAGTATGTTTTAGACTCTTTTTCTCTCTTTCGTTCTCTTAAGTT
TGTGAAATCAGTTTTAGTTTCATCGTTTGTCTCCGGGTGTATCTTGTTTCACGCCGGCTT
GTGGTTCCGGAAAGGTGTTATACCTTTGCCGGCTTTGTGTAAGTACCGGTGCTAATCCTC
TTTTAATCTAATAGATGAC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4EM36JQ 711 0 0
TTTCTCGGAGTTGAAGGTGTGTTAGAGGTTCGTAGTGTGCTGGAGTGTGTTTGGTTTGGT
GACTTAGTAGGATGGAGCTCTTGCTCGGGCCATCGGTTGGAAATTATCTGCTGTGGTCTT
TGAGCGGTCTGTCTCTTCTTTCATCATTGGTTCTGATCTTATAATTTCAGTCTATGAAGC
ATCAAAGCGGGGAAGTTATGCAGTTCTTTGGTTTGCAACCGACGGGTTTCTCCGGATTTC
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AAAGCGTATGTTTCTCATCGTTTGGCTGCTCGAGTTGATGGCTTGTTCTATGGTGGCTTC
TCTGGTTGA*GAAGTGGTAAGTGTGTTGGTTACTGGTTTGGTTTCTAAAGGACTGGTTCT
AAGAGATAACAGTTCAACTCTAATAAGATAGGCTGGCTTCGCTTTCCTTCTCAATCCTGC
TTCCGGCTTCGATATGCTTTCTTGTTCTTGAAGTTTATGCTTAACCTCCAGTATGTTTTA
GACTCTTTTTCTCTCTTCCATTCTCTTAAGTTTGTGAAATCAGTTTTAGTTTCATCGTTT
GTCTCCGGGTGTATCCTGTTTCACGCCGGCTTGTGGTTCCGGAAAGGTGTTATACCTTTG
CCGGCTTTGTGTAAGTACTGGTGTTAATCCTCTTTTAATCTAATAGATGAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4ED41JQ 645 0 0
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TCTGTCTCTTCTTTCATCATTGGTTCTGATCTTATAATTTCAGTCTATGAAGCATCAAAG
CGGGGAAGTTATGCAGTTCTTTGGTTTGCAACCGACGGGTTTCTCCGGATTTCTTGGTAA
GGAGCTGTGGAGCTTATGCTCAATGGCGACGGTCTTGGAGTAGTCGATCGCCAAAAGCGT
ATGTTTCTCATCGTTTGGCTGCTCGAGTTGATGGCTTGTTCTATGGTGGCTTCTCTGGTT
GAAGAAGTGGTAAGTGTGTTGGTTACTGGTTTGGTTTCTAAAGGACTGGTTCTAAGAGAT
AACAGCTCAACTCTAATAAGATAGGCTGGCTTCGCTTTCCTTCTCAATCCTGCTTCCGGC
TTCGATATGCTTTCTTGTTCTTGAAGTTTATGCTTAACCTCCAGTATGTTTTAGACTCTT
TTTCTCTCTTTCATTCTCTTAAGTTTGTGAAATCAGTTTTAGTTTCATCGTTTGTCTCCG
GGTGTATCCTGTTTCACGCCGGCTTGTGGTTCCGGAAAGGTGTTATACCTTTGCCGGCTT
TGTGTTAGTACTGGTGTTAATCCTCTTTTAATCTAATAGATGACG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 7

CO CL902Contig1 927 7 31 U
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GATCCCGACAACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTACCCTAGCTTCAAGCTC
GTCATTGTTGGTGACGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACAGGA
GAGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACAATTGGTGTGGAGGTTCATCCTCTAGATTTCTTC
ACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGT
GGCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTAATCATGTTCGACGTGACG
GCGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGAGTGTGCGAG
AACATCCCCATCGTTCTGT*CGGGAACAAGGTGGACGGGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCG
AAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGC
AACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTTGCGGGAGACCAGAAC
CTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCACCTGAGGTTCACATTGACTTTGCTGAG
CAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCTGATGATGAT
GATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCTGCTTCCACTATGTCTGAGAAGCTGTTTGCTTT
GGTCTCTGATTCTCTCTTTTGTTTTTTGGTTTCTTCTCTGTGTTGCATTGATGTTAACAT
ATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTGTTTCGTTTGGGAATAGAGCAACTTGTTTTTTAAC
CTAAAGAGATAAAATGAGACTTGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4EV96TF U 1
AF RR4BY35TF U 3
AF RR4BY35JQ C 111
AF RR4DV96JQ C 458
AF RR4DV96TF U 458
AF RR4E154JQ C 458
AF RR4E154TF U 458
BS 1 33 RR4EV96TF
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BS 35 40 RR4EV96TF
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BS 177 177 RR4BY35TF
BS 178 197 RR4EV96TF
BS 198 198 RR4BY35TF
BS 199 224 RR4EV96TF
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BS 250 272 RR4EV96TF
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BS 330 330 RR4BY35TF
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GCGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGCGTGTGCGAG
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AACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCGGGAGACCAGAAC
CTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCTTGCTCC
CC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4BY35TF 633 0 0
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ACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTG
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AGAAGTATGAACCTACAATTGGTGTGGAGGTTCATCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGTG
GCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAG
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CGTTCCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACT
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TCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCACC

QA 9 633 9 633
DS 

RD RR4BY35JQ 759 0 0
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GAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTAATCATGTT
CGACGTGACGGCGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCG
AGTGTGCGAGAACATCCCCATCGTTCTGT*CGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCA
GGTGAAGGCGAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATC
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QA 1 759 1 759
DS 

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AGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATTTCATCGCCGCCGCGG
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CTGTGTTGCATTGATGTTAACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTGTTTCGTTTGGG
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QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4DV96TF 470 0 0
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ACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTA
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AGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGG
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ATGTCTGAGAAGCTGTTTGCTTTGGTCTCTGATTCTCTCTTTTGTTTTTTGGTTTCTTCT
CTGTGTTGCATTGATGTTAACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTGTTTCGTTTGGG
AATAGAGCAACTTGTTTTTTAACCTAAAGAGATAAAATGAGACTTGCAGC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4E154JQ 470 0 0
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ACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTA
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AGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGG
CTCAGCCTCTTCCTGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCTGCTTCCACT
ATGTCTGAGAAGCTGTTTGCTTTGGTCTCTGATTCTCTCTTTTGTTTTTTGGTTTCTTCT
CTGTGTTGCATTGATGTTAACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTGTTTCGTTTGGG
AATAGAGCAACTTGTTTTTTAACCTAAAGAGATAAAATGAGACTTGCAGC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4E154TF 470 0 0
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ACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTA
GGAAGCTTGCGGGAGACCAGAACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCACCTG
AGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGG
CTCAGCCTCTTCCTGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCTGCTTCCACT
ATGTCTGAGAAGCTGTTTGCTTTGGTCTCTGATTCTCTCTTTTGTTTTTTGGTTTCTTCT
CTGTGTTGCATTGATGTTAACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTGTTTCGTTTGGG
AATAGAGCAACTTGTTTTTTAACCTAAAGAGATAAAATGAGACTTGCAGC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 8

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AGAAATATGGCTATGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAA
CAAATCAACCTCTTAATAACAGATGAAGATGAACAGATCCCTATCACACTCTCCTCTTCT
GTCTTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGATGTAC
CATGAGCAGAATTACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGA
TGTACTCAGTCAAGAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCC
GGTTCCCTCATCTCGAAGCAACAGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACT
CTCAACAGCAACCAAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGA
GCATATAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATT
TGTGTCATTAATTCGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATCTTATAGCTTTTTT*AT
GTTTGTAAGATCAGAAAA*TAATAAGAATGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTTG
GTTGTGATTTATATAGCTGTATACACAGATTAATTTATTAACTCTTAACAGTTAGATTAG
ACATTTGTCTAATTGTTTTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV39TF U 1
AF RR4DT43TF U 14
AF RR4FV39JQ C 175
AF RR4AP72TF U 6
AF RR4DT43JQ C 14
AF RR4DU88TF U 14
AF RR4DU88JQ C 14
AF RR4AP72JQ C 175
BS 1 165 RR4FV39TF
BS 166 166 RR4DT43TF
BS 167 382 RR4FV39TF
BS 383 383 RR4DT43TF
BS 384 633 RR4FV39TF
BS 634 636 RR4AP72TF
BS 637 654 RR4FV39TF
BS 655 687 RR4AP72TF
BS 688 744 RR4AP72JQ

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AGAAATATGGCTATGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAA
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GTCTTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGATGTAC
CATGAGCAGAATTACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGA
TGTACTCAGTCAAGAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCC
GGTTCCCTCATCTCGAAGCAACTGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACT
CTCAACAGCAACCAAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGA
GCATATAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATT
TGTGTCATTAATTCGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATCTTATAGCTTTTTT*AT
GTTTGTAAGATCAGAAAA*TAATAAGAATGAAG**AGAACCATCAATCTAAAGG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4DT43TF 634 0 0
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TGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAAATCAACCTCT
TAATAACAGATGAAGATGAACAGATCCCTATCACACTCTCCTCTTCTGTCTTCCAGGGTT
TGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGATGTACCATGAGCAGAATT
ACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTACTCAGTCAA
GAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCCGGTTCCCTCATCT
CGAAGCAACAGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACTCTCAACAGCAACC
AAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGAGCATATAGAGATG
CAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATT
CGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATGTTATAGCTTTTTT*ATGTTTGTAAGATCA
GAAAA*TAATAAGAATGAAG
AGAACCATCAATCT

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DS 

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CCAAGATGTACTCAGTCAAGAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGG
AGTGCCGGTTCCCTCATCTCGAAGCAACTGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTAC
ACAACTCTCAACAGCAACCAAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTTTACCAACTCA
AGAAGAGCATATAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACA
TGGATTTGTGTCATTAATTCGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATCTTATAGCTTT
TTT*ATGTTTGTAAGATCAGAAAA*TAATAAGAATGAAGGAGGAACCATCAATTTAAAGG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4AP72TF 682 0 0
CTA
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GGCTATGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAAATCAA
CCTCTTAATAACAGATGAAGATGAACAGATCCCTATCTCACTCTCCTCTTCTGTCTTCCA
GGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGACGTACCATGAGCA
GAATTACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTACTCA
GTCAAGAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCCGGTTCCCT
CATCTCGAAGCAACTGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACTCTCAACAG
CAACCAAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGAGCATATAG
AGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATTTGTGTCAT
TAATTCGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATCTTATAGCTTTTTT*ATGTTTGTAA
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TTATATAGCTGTATACACA

QA 4 682 4 682
DS 

RD RR4DT43JQ 657 0 0
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TGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAAATCAACCTCT
TAATAACAGATGAAGATGAACAGATCCCTATCACACTCTCCTCTTCTGTCTTCCAGGGTT
TGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGATGTACCATGAGCAGAATT
ACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTACTCAGTCAA
GAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCCGGTTCCCTCATCT
CGAAGCAACAGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACTCTCAACAGCAACC
AAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGAGCATATAGAGATG
CAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATT
CGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATGTTATAGCTTTTTT*ATGTTTGTAAGATCA
GAAAA*TAATAAGAATGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTTGGTTGTGATTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4DU88TF 657 0 0
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TGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAAATCAACCTCT
TAATAACAGATGAAGATGAACAGATCCCTATCACACTCTCCTCTTCTGTCTTCCAGGGTT
TGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGATGTACCATGAGCAGAATT
ACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTACTCAGTCAA
GAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCCGGTTCCCTCATCT
CGAAGCAACAGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACTCTCAACAGCAACC
AAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGAGCATATAGAGATG
CAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATT
CGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATGTTATAGCTTTTTTTATGTTTGTAAGATCA
GAAAA*TAATAAGAATGAAG**AGAACCATCAATCTAAAGGGATTTGGTTGTGATTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4DU88JQ 657 0 0
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TGGACCTTGAGCTTGATGATGAGGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAAATCAACCTCT
TAATAACAGATGAAGATGAACAGATCCCTATCACACTCTCCTCTTCTGTCTTCCAGGGTT
TGTTCAGAGAAAACTACCAAACATCATCAACACCACATATGATGTACCATGAGCAGAATT
ACAACCTGCTTAGGGAGAGAAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTACTCAGTCAA
GAAGGAAACAACATAATCATCCTCGTCAGAAGAAGCAAGGGAGTGCCGGTTCCCTCATCT
CGAAGCAACAGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTACACAACTCTCAACAGCAACC
AAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCAAGAAGAGCATATAGAGATG
CAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATT
CGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATGTTATAGCTTTTTT*ATGTTTGTAAGATCA
GAAAA*TAATAAGAATGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTTGGTTGTGATTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4AP72JQ 570 0 0
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AGTGCCGGTTCCCTCATCTCGAAGCAACTGTTTTCTCATCATGTTTATGAAAACAACTAC
ACAACTCTCAACAGCAACCAAGAACGCATCACCCTTCATCATGCACCTTCTACCAACTCA
AGAAGAGCATATAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAGTCTCCATCAAAATTCAAGACA
TGGATTTGTGTCATTAATTCGTATTATATTTATAATTGGTTATTGATATCTTATAGCTTT
TTT*ATGTTTGTAAGATCAGAAAA*TAATAAGAATGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGG
GATTTGGTTGTGATTTATATAGCTGTATACACAGATTAATTTATTAACTCTTAACAGTTA
GATTAGACATTTGTCTAATTGTTTTTAAGC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 8

CO CL904Contig1 1174 8 21 U
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CCGTTTTCACACATAACCAACATACATGACTAACAAAAGGCCATTAGAACCACAACGACG
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ATTAAACGAAGCTGGGATAAGGGGGGTCCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACG
GATCCCTTT*CTCAGCAAGCTGAAGTGCAAGACCTCGAGTAAACGCCACAATCGCTCCTT
TTGTAGCGGTGTAGTCGAGAAGCGATGCATGTCCCTTATAGGCGTTCACAGATGTTGTGT
TTATTATGCTGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGCATGCCTTGTGAGGAAGAAATAAG
AGAAAATGTTTGTCCGGAAGACACGTTCCAGCCTAGGCTCATCGATCTCTTCAATGGAAT
TGCTCTCGTACTGCTCCGCTGCGTTATTGATCAAGACATCAATACGTCCAAACGCATTAA
CAACCTCGTCTACAACCCTCTTGCAGTGCTCATCGAATCCTAAATCCGTTGGAATTGCAA
TCGGGTCCTTAGCCTCCGAGGTATTTGCTTCCTTCAACATTTGTAGAGTCTCTTGTGCGT
CCTTTTCCTCTTGGCCCTTCACGTACGTGAAGGCAATTGTGGCACCTTCAAGTGCAAAAC
AGTAACTCACGGCTCTACCAATCCCCGAGTCTCCGCCCGTTATCAGGGCGACCTTTCCAC
GGAGCTTGTTGGAGGGTTGGTAGTCTGAACTAGAGAATTGTGGAGTTGGGTCCATGACGT
GTTCTTTGCCAGGTTGTACTCCTCCTTGTTTTTGTCTTTCAGATGCCATCTCTCTTACGT
ACACAAGTTGAGATAATATTCGAGTTCTTCCTCTCTTTTCAGGTAGAAGTGACCAGTCGA
TACAACCCCTTCATGGACATATATAGATGCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ51JQ U 1
AF RR4F791JQ U 3
AF RR4CQ77JQ U 3
AF RR4AB12JQ U 6
AF RR4AB12TF C 362
AF RR4F791TF C 388
AF RR4EJ51TF C 458
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BS 48 106 RR4EJ51JQ
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BS 217 253 RR4EJ51JQ
BS 254 254 RR4CQ77JQ
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BS 452 469 RR4EJ51JQ
BS 470 498 RR4CQ77JQ
BS 499 499 RR4F791JQ
BS 500 548 RR4CQ77JQ
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BS 755 834 RR4AB12JQ
BS 835 853 RR4AB12TF
BS 854 854 RR4F791TF
BS 855 1124 RR4AB12TF
BS 1125 1174 RR4CQ77TF

RD RR4EJ51JQ 469 0 0
CAGGTCAAACTTCATCTTTATTTCAACACTTCTGATACTTCCAGAAAATTACAAAATATA
CCGTTTTCACACATAACCAACATACATGACTAACAAAAGGCCATTAAAACCACAACGACG
GAACAACTTAAAGAAAAAAAAA*CGACGCAACAACTTCTATCAGCATAATAAGTCCATTG
TCACGGTCGAGCCATGCCTTAGGCATTCACAACAGTACCTCCGTTAGGGTGAAAAACTTG
GCCTGTGAAGTAAAATGAACAATGGTTACAAGCCAGGAAAACGTAGGAAGGTGCCACCTC
AATGGGCTGCCCGGCTCGTTTCATTGGGACTTCTGTCCCGAAACTCTTAATTTTCTCCTC
ATTAAACGAAGCTGGGATAAGGGGGGTCCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACG
GATCCCTTT*CTCAGCAAGCTGAAGTGCAAAACCTCGAGTAAACGCCAC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR4F791JQ 585 0 0
GAT
CAAACTTCATCTTTATTTCAACACTTCTGATACTTCCAGAAGATTACAAAATATACCGTT
TTCACACATAACCAACATACATGACTAACAAAAGGCCATTAGAACCACAACGACGGAACA
ACTTAAAGAAAAAAAAAACGACGCAACAACTTCTATCAGCATAATAAGTCCATTGTCACG
GTCGAGCCATGCCTTAGGCATTCACAACAGCACCTCCGTTAGGGTGAAAAACTTGGCCTG
TGAAGTAAGATGAACAATGGTTACAAGCCAGGAAAACGTAGGAAGGTGCCACCTCAATGG
GCTGCCCGGCTCGTTTCATTGGGACTTCTGTCCCGAAACTCTTAATTTTCTCCTCATTAA
ACGAAGCTGGGATAAGGGGGGTCCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACGGATCC
CTTT*CTCAGCAAGCTGAAGTGCAAGACCTCGAGTAAACGCCACAATCGCTCCTTTTGTA
GCGGTGTAGTCGAGAAGCGATGCATGTCCCTTATAGGCGTTCACAGATGTTGTGTTTATT
ATGCTGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGCATGCCTTGTG

QA 4 585 4 585
DS 

RD RR4CQ77JQ 752 0 0
GGT
CAAACTTCATCTTTATTTCAACACTTCTGATACTTCCAGAAGATTACAAAATATACCGTT
TTCACACATAACCAACATACATGACTAACAAAAGGCCATTAGAACCACAACGACGGAACA
ACTTAGAGAAAAAAAAA*CGACGCAACAACTTCTATCAGCATAATAAGTCCATTGTCACG
GTCGAGCCATGCCTTAGGCATTCACAACAGCACCTCCGTTAGGGTGAAGAACTTGGCCTG
TGAAGTAAGATGAACAATGGTTACAAGCCAGGAAAACGTAGGAAGGTGCCACCTCAATGG
GCTGCCCGGCTCGTTTCATTGGGACTTCTGTCCCGAAACTCTTAATTTTCTCCTCATTAA
ACGAAGCTGGGATAAGGGGGGTCCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACGGATCC
CTTT*CTCAGCAAGCTGAAGTGCAAGACCTCGAGTAAACGCCACAATCGCTCCTTTTGTA
GCGGTGTAGTCGAAAAGCGATGCATGTCCCTTATAGGCGTTCACAGATGTTGTGTTTATT
ATGATGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGCATGCCTTGTGAGGAAGAAATAAGAGAAA
ATGTTTGTCCGGAAGACACGTTCCAGCCTAGGCTCATCGATCTCTTCAATGGAATTGCTC
TCGTACTGCTCCGCTGCGTTATTGATCAAGACATCAATACGTCCAAACGCATTAACAACC
TCGTCTACAACCCTCTTGCAGTGCTCATC

QA 4 752 4 752
DS 

RD RR4AB12JQ 829 0 0
CAAACTTCATCTTTATTTCAACACTTCTGATACTTCCAGAAGATTACAAAATATACCGTT
TTCACACATAACCAACATACATGACTAACAAAAGGCCATTAGAACCACAACGACGGAACA
ACTTAGAGAAAAAAAAA*CGACGCAACAACTTCTATCAGCATAATAAGTCCATTGTCACG
GTCGAGCCATGCCTTAGGCATTCACAACAGCACCTCCGTTAGGGTGAAGAACTTGGCCTG
TGAAGTAAGATGAACAATGGTTACAAGCCAGGAAAACGTAGGAAGGTGCCACCTCAATGG
GCTGCCCGGCTCGTTTCATTGGGACTTCTGTCCCGAAACTCTTAATTTTCTCCTCATTAA
ACGAAGCTGGGATAAGGGGGGTCCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACGGATCC
CTTT*CTCAGCAAGCTGAAGTGCAAGACCCCGAGTAAACGCCACAATCGCTCCTTTTGTA
GCGGTGTAGTCGAGAAGCGATGCATGTCCCTTATAGGCGTTCACAGATGTTGTGTTTATT
ATGCTGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGCATGCCTTGTGAGGAAGAAATAAGAGAAA
ATGTTTGTCCGGAAGACACGTTCCAGCCTAGGCTCATCGATCTCTTCAATGGAATTGCTC
TCGTACTGCTCCGCTGCGTTATTGATCAAGACATCAATACGTCCAAACGCATTAACAACC
TCGTCTACAACCCTCTTGCAGTGCTCATCGAATCCTAAATCCGTTGGAATTGCAATCGGG
TCCTTAGCCTCCGAGGTATTTGCTTCCTTCAACATTTGTAGAGTCTCTT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4AB12TF 770 0 0
TTAAACGAAGCTGGGATAAGGGGGGTCCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACGG
ATCCCTTTTCTCAGCAAGCTGAAGTGCAAGACCCCGAGTAAACGCCACAATCGCTCCTTT
TGTAGCGGTGTAGTCGAGAAGCGATGCATGTCCCTTATAGGCGTTCACAGATGTTGTGTT
TATTATGCTGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGCATGCCTTGTGAGGAAGAAATAAGA
GAAAATGTTTGTCCGGAAGACACGTTCCAGCCTAGGCTCATCGATCTCTTCAATGGAATT
GCTCTCGTACTGCTCCGCTGCGTTATTGATCAAGACATCAATACGTCCAAACGCATTAAC
AACCTCGTCTACAACCCTCTTGCAGTGCTCATCGAATCCTAAATCCGTTGGAATTGCAAT
CGGGTCCTTAGCCTCCGAGGTATTTGCTTCCTTCAACATTTGTAGAGTCTCTTGTGCGTC
CTTTTCCTCTTGACCCTTCACGTACGTGAAGGCAATTGTGGCACCTTCAAGTGCAAAACA
GTAACTCACGGCTCTACCAATCCCCGAGTCTCCGCCCGTTATCAGGGCGACCTTTCCACG
GAGCTTGTTGGAGGGTTGGTAGTCTGAACTAGAGAATTGTGGAGTTGGGTCCATGACGTG
TTCTTTGCCAGGTTGTACTCCTCCTTGTTTTTGTCTTTCAGATGCCATCTCTCTTACGTA
CACAAGTTGAGATAATATTCGAGTTCTTCCTCTCTTTTCAGGT
AGAAGTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4F791TF 739 0 0
CCATATAGGACCAGGTGCTACACCATTAACACGGATCCCTTT*CTCAGCAAGCTGAAGTG
CAAGACCTCGAGTAAACGCCACAATCGCTC*TTTTGTAGCGGTGTAGTCGAGAAGCGATG
CATGTCCCTTATAGGCGTTCACAGATGTTGTGTTTATTATGCTGCTTCCTTCCTTCATAT
GTTTCAACGCATGCCTTGTGAGGAAGAAATAAGAGAAAATGTTTGTCCGGAAGACACATT
CCAGCCTAGGCTCATCGATCTCTTCAATGGAATTGCTCTCGTACTGCTCCGCTGCGTTAT
TGATCAAGACATCAATACGTCCAAACGCATTAACAACCTCGTCTACAACCCTCTTGCAGT
GCTCATCGAATCCTAAATCCGTTGGAATTGCAATCGGGTCCTTAGCCTCCGAGGTATTTG
CTTCCTTCAACATTTGTAGAGTCTCTTGTGCGTCCTTTTCCTCTTGGCCCTTCACGTACG
TGAAGGCAATTGTGGCACCTTCAAGTGCAAAACAGTAACTCACGGCTCTACCAATCCCCG
AGTCTCCGCCCGTTATCGGGGCGACCTTTCCACGGAGCTTGTTGGAGGGTTGGTAGCCTG
AACTAGAGAATTGTGGAGTTGGGTCCATGACGTGTTCTTTGCCAGGTTGTACTCCTCCTT
GTTTTTGTCTTTCAGATGCCATCTCTCTTACGTACACAAGTTGAGATAATATTCGAGTTC
TTCCTCTCTTTTCAGGT
CC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4EJ51TF 675 0 0
AGTAAACGCCACAATCGCTC*TTTTGTAGCGGTGTAGTCGAGAAGCGATGCATGTCCCTT
ATAGGCGTTCACAGATGTTGTGTTTATTATGCTGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGC
ATGCCTTGTGAGGAAGAAATAAGAGAAAATGTTTGTCCGGAAGACACGTTCCAGCCTAGG
CTCATCGATCTCTTCAATGGAATTGCTCTCGTACTGCTCCGCTGCGTTATTGATCAAGAA
ATCAATACGTCCAAACGCATTAACAACCTCGTCTACAACCCTCTTGCAGTGCTCATCGAA
TCCTAAATCCGTTGGAATTGCAATCGGGTCCTTAGCCTCCGAGGTATTTGCTTCCTTCAA
CATTTGTAGAGTCTCTTGTGCGTCCTTTTCCTCTTGGCCCTTCACGTACGTGAAGGCAAT
TGTGGCACCTTCAAGTGCAAAACAGTAACTCACGGCTCTACCAATCCCCGAGCCTCCGCC
CGTTATCAGGGCGACCTTTCCACGGAGCTTGTTGGAGGGTTGGTAGTCTGAACTAGAGAA
TTGTGGAGTTGGGTCCATGACGTGTTCTTTGCCAGGTTGTACTCCTCCTTGTTTTCGTCT
TTCAGATGCCATCTCTCTTACGTACACAAGTTGAGATAATATTCGAGTTCTTCCTCTCTT
TTCAGGT
AGAAGTCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CQ77TF 708 0 0
CACAATCGCTC*TTTTGTAGCGGTGTAGTCGAGAAGCGATGCATGTCCCT*ATAGGCGTT
CACAGATGTTGTGTTTATTATGATGCTTCCTTCCTTCATATGTTTCAACGCATGCCTTGT
GAGGAAGAAATAAGAGAAAATGTTTGTCCGGAAGACACGTTCCAGCCTAGGCTCATCGAT
CTCTTCAATGGAATTGCTCTCGTACTGCTCCGCTGCGTTATTGATCAAGACATCAATACG
TCCAAACGCATTAACAACCTCGTCTACAACCCTCTTGCAGTGCTCATCGAATCCTAAATC
CGTTGGAATTGCAATCGGGTCCTTAGCCTCCGAGGTATTTGCTTCCTTCAACATTTGTAG
AGTCTCTTGTGCGTCCTTTTCCTCTTGGCCCTTCACGTACGTGAAGGCAATTGTGGCACC
TTCAAGTGCAAAACAGTAACTCACGGCTCTACCAATCCCCGAGTCTCCGCCCGTTATCAG
GGCGACCTTTCCACGGAGCTTGTTGGAGGGTTGGTAGTCTGAACTAGAGAATTGTGGAGT
TGGGTCCATGACGTGTTCTTTGCCAGGTTGTACTCCTCCTTGTTTTTGTCTTTCAGATGC
CATCTCTCTTACGTACACAAGTTGAGATAATATTCGAGTTCTTCCTCTCTTTTCAGGTAG
AAGTGACCAGTCGATACAACCCCTTCATGGACATATATAGATGCGCCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 2 8

CO CL905Contig1 914 2 2 U
AATTTAAAATGGAGAGAGTATTATTTAAGGCATGTAAATCGATAGAATTTTTTTTTAAAG
TTATGCCGATTTTTAGAACATTGATTAACATTGTAATTGCAACCAAACAACAATGCACCA
TTTAGTCAGAAAAGCCCAAGCACCAGTTATTATCTTTCACAACTTAATAAAGATCGTTTC
CAAGCTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCCATACTTATTGCAT
TCACATTATTTCTTCTTGGGATCCAAGTTTGCTCGTTCTTTAGTGTTATGGGTGAAAAAA
CTTACTCTTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTCTGTCTCAAAAAGCTCATCTGAT
CTTTTTCATTCTTGCACACTGTTTTCTCATCGTTGTCAACACTTATCCATCATCTCACTA
GACCGTCATGAACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGA
AGAATTAATAACCGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGTCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGC
AGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGG
TGGGGATGGTGGCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGG
TGAAGATGATGTATAAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCT
AATATGAAGCACCGAGATGTTAAACGGCTCCGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCGTC
AAGGAGAGAACCATAAACCGCAGATCCAAACATAACGTCGCCGTTATTGTTAACGGTTAC
GTTTATGAACCCTTGTTTGCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTAA
CGCTGTTTTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX70JQ U 1
AF RR4H847JQB U 166
BS 1 742 RR4GX70JQ
BS 743 914 RR4H847JQB

RD RR4GX70JQ 742 0 0
AATTTAAAATGGAGAGAGTATTATTTAAGGCATGTAAATCGATAGAATTTTTTTTTAAAG
TTATGCCGATTTTTAGAACATTGATTAACATTGTAATTGCAACCAAACAACAATGCACCA
TTTAGTCAGAAAAGCCCAAGCACCAGTTATTATCTTTCACAACTTAATAAAGATCGTTTC
CAAGCTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCCATACTTATTGCAT
TCACATTATTTCTTCTTGGGATCCAAGTTTGCTCGTTCTTTAGTGTTATGGGTGAAAAAA
CTTACTCTTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTCTGTCTCAAAAAGCTCATCTGAT
CTTTTTCATTCTTGCACACTGTTTTCTCATCGTTGTCAACACTTATCCATCATCTCACTA
GACCGTCATGAACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGA
AGAATTAATAACCGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGTCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGC
AGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGG
TGGGGATGGTGGCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGG
TGAAGATGATGTATAAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCT
AATATGAAGCACCGAGATGTTA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4H847JQB 749 0 0
AATAAAGATCGTTTCCAAGCTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCT
CCATACTTATTGCATTCACATTATTTCTTCTTGGGATCCAAGTTTGCTCGTTCTTTAGTG
TTATGGGTGAAAAAACTTACTCTTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTCTGTCTCA
AAAAGCTCATCTGATCTTTTTCATTCTTGCACACTGTTTTCTCATCGTTGTCAACACTTA
TCCATCATCTCACTAGACCGTCATGAACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGC
CAAGTCAAGCTGAGAAGAATTAATAACCGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGTCTTTGCTAGA
AGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTT
AGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGC
TTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATAAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTAT
AGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAAACGGCTCCGACGCAACCGACTC
TAAAAGCTGAGCGTCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAGATCCAAACATAACGTCGCCGTT
ATTGTTAACGGTTACGTTTATGAACCCTTGTTTGCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTGGAA
GAGAGTGGTGAGTAACGCTGTTTTCTTGC

QA 1 749 1 749
DS 



CO CL905Contig2 1202 6 33 U
GGAAAGGAACCTCATCTATCTATCATCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTCTTCGTATTC
TTCACTAACACTCTTCATCTTCTTATTCGCCTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTC
ATTCAACATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCT
CTCCCAGACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCT
CTCCAACGACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTT
CAGCCTCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAA
AACAGCGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTT
CATAAACGTAACCGTTAATAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTC
TCTCCTTGACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCT
TCATATTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAGTAATTCTGATTTTGTTTATACATC
ATCTTCACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACC
ATCCCCACCATCATCCTCTGCTAAGGCTAAGGCTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGGCTGC
TGATACTGCTCCTACGGCGTCTTCTAGCAAAGCCAACTCAACAAGTTCAGCTTCGGTTAT
TAATTCTTCTCAGCTTGACTTGGCGTTTGCGGTCGTGATTTCATCCTTCTGGTTGTTCAT
GACGGTCTAGTGAGATGGTGGTGTTAAGAGTTGATAACAGCGTGAAAGAATGAAAAAGAT
CAGATGAGCTTTTTTGAGACCAAGAAAATAAAAGAAGATTGGCAGGGAAAAGAGTTCAAG
TTTTTCACCCAAAACACTAAAGAAGGAGCAAACTTGGATCACAAGAAGAAATAATGTGAA
TGCAATAAGGATGGAGAAAGTTGTAAAACTCATTAACTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGG
AAATGATCTTTATTAAGTTGTGAAACATAATAATTGGTGCTTAGGCTTTTCTGACTAAAT
GGTGCATTGTTGTTTGGTTGCATTACAATGTTAATCAATGTTCCAAAACTAGGTCAAGCT
TT


BQ
10 10 10 10 10 20 5 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 0 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4H847TF U 1
AF RR4GX70TF U 6
AF RR4A764TF U 6
AF RR4E838TF U 6
AF RR4A764JQ C 323
AF RR4E838JQ C 543
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TTCACTAACACTCTTCTTCTTCTTATTCGCTTCTGTCTTCCTCTACACTCCATCAAACTC
ATTCAACATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAGATGCT
CTCCCAGACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCT
CTCCAACGACGCAATGTCCTTTTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAGCAAGAGAGCCTT
CAGCCTCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAA
AACAGCGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTT
CATAAACGTAACCGTTAACAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTC
TCTCCTTGACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCT
TCATATTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATC
ATCTTCACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACC
ATCCCCAC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GX70TF 674 0 0
GG
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ACACTCTTCTTCTTCTTATTCGCTTCTGTCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAAC
ATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAGATGCTCTCCCAG
ACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAAC
GACGCAATGTCCTTTTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTC
CACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCG
TTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAAC
GTAACCGTTAACAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTT
GACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATT
AGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATCATCTTCA
CCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCA
CCATCATCCTCT

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DS 

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TTACACTCTTCATCTTCTTATTCGCCTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCA
ACATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCC
AGACCCAGCTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCA
ACGACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCC
TCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAG
CGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCGAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAA
ACGTAACCGTTAATAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCC
TTGACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATA
TTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAGTAATTTTGATTTTGTTTATACATCATCTT
CACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCC
CACCATCATCCTCTGCTAAGGCTA

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DS 

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TTACACTCTTCATCTTCTTATTCGCCTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCA
ACATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCC
AGACCCAGCTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCA
ACGACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCC
TCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAG
CGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAA
ACGTAACCGTTAATAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCC
TTGACGCTCGGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATA
TTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAGTAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTT
CACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCC
CAC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4A764JQ 811 0 0
TACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCC*GAGCAAGAAAACAGCGTTACTCACCACTCTC
TTCCAATCGAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACGTAACCGTTAATAAT
AACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTGACGCTCAGCTTTTA
GAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTAGCACTTCTATACCT
ATAATGGATCCTAGTAATTTTGATTTTGTTTATACATCATCTTCACCACTTCCTGCACAA
GCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCACCATCATCCTCTGCT
AAGGCTAAGGCTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGGCTGCTGATACTGCTCCTACGGCGTCT
TCTAGCAAAGCCAACTCAACAAGTTCAGCTTCGGTTATTAATTCTTCTCAGCTTGACTTG
GCTTTTGCGGTCGTGATTTCATCCTTCTGGTTGTTCATGACGGTCTAGTTAGATGGTGGT
GTTAAGAGTTGATAACAGCGTGAAAGAATGAAAAAGATCAGATGAGCTTTTTTGAGACCA
AGAAAATAAAAGAAGATTGGCAGGGAAAAGAGTTCAAGTTTTTCACCCAAAACACTAAAG
AAGGAGCAAACTTGGATCACAAGAAGAAATAATGTGAATGCAATAAGGATGGAGAAAGTT
GTAAAACTCATTAACTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGAAATGATCTTTATTAAGTTGTG
AAACATAATAATTGGTGCTTAGGCTTTTCTG

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DS 

RD RR4E838JQ 660 0 0
ATATTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAGTAATTCTGATTTTGTTTATACATCAT
CTTCACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCAT
CCCCACCATCATCCTCTGCTAAGGCTAAGGCTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGGCTGCTG
ATACTGCTCCTACGGCGTCTTCTAGCAAAGCCAACTCAACAAGTTCAGCTTCGGTTATTA
ATTCTTTTCAGCTTGACTTGGCGTTTGCGGTCGTGATTTCATCCTTCTGGTTGTTCATGA
CGGTCTAGTGAGATGGTGGTGTTAAGAGTTGATAACAGCGTGAAAGAATGAAAAAGATCA
GATGAGTTTTTTTGAGACCAAGAAAATAAAAGAAGATTGGCAGGGAAAAGAGTTCAAGTT
TTTCACCCAAAACACTAAAGAAGGAGCAAACTTGGATCACAAGAAGAAATAATGTGAATG
CAATAAGGATGGAGAAAGTTGTAAAACTCATTAACTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGAA
ATGATCTTTATTAAGTTGTGAAACATAATAATTGGTGCTTAGGCTTTTCTGACTAAATGG
TGCATTGTTGTTTGGTTGCATTACAATGTTAATCAATGTTCCAAAACTAGGTCAAGCTTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 8

CO CL906Contig1 532 8 5 U
GGACCAAAAACACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAATAACGTGGT
TAGTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAA
CTGCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAG
CGTGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAA
CAATGCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTC
CACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTAC
TACTATTAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGAT
GTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 

AF RR4CS57JQ C 1
AF RR4DK68JQ C 67
AF RR4DN68JQ C 67
AF RR4DK68TF U 67
AF RR4DN68TF U 67
AF RR4AV09JQ C 5
AF RR4AV09TF U 5
AF RR4CS57TF U 1
BS 1 5 RR4CS57JQ
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BS 68 346 RR4DK68TF
BS 347 347 RR4AV09TF
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TAGTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAG
CTGCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAG
CGTGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTTTTCTAGCAACCTCAA
CAATGCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTC
CACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTAC
TACTATTAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGAT
GTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 532 1 532
DS 

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TCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACTGCTG
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CCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATGC
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CTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTAT
TAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATGTATCT
TCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4DN68JQ 466 0 0
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CCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATGC
TCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCTGGATCAGCCCTTCCACCAA
CTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTAT
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TCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4DK68TF 466 0 0
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CAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTGTG
CCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATGC
TCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCTGGATCAGCCCTTCCACCAA
CTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTAT
TAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATGTATCT
TCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4DN68TF 466 0 0
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TCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACTGCTG
CAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTGTG
CCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATGC
TCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCTGGATCAGCCCTTCCACCAA
CTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTAT
TAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATGTATCT
TCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4AV09JQ 528 0 0
G
AAAAACACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCTTGT
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ATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACTGCT
GCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTGT
GCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATG
CTCTGTCTTTGCCTTCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCACCA
ACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTA
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TTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGC
C

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR4AV09TF 528 0 0
G
AAAAACACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCTTGT
TCCTAGTTCTTGCTTTTCACCACGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAATAACGTGGTTAGTG
ATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACTGCT
GCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTGT
GCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATG
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TTAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATGTATC
TTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGC
C

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR4CS57TF 532 0 0
GGACC
AAAAACACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCTTGT
TCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTAGTG
ATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAGCTGCT
GCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTGT
GCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCTAGCAACCTCAACAATG
CTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCACCA
ACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTA
TTAATACAAGAAGTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATGTATC
TTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 6 532 6 532
DS 



AS 2 7

CO CL907Contig1 845 4 14 U
GTCTATGGTGTCTTCTCTTTCTTGATTGACAAAGAAAACTAGTTACAAACCTGTTCTTGT
GTCTTCCCTTTCATACAATATAGAGAAAATGTAAATACCACACAATCACTGAGATTTCTG
AGCTAAGTTAGATGAGTGAATCCATGAATCCAGCGTCTTCATAGCTTTCCCTGATGATTG
TACTTCACGGGCCAAGGTTACTCCTTCCCCTAGCTTTTGGACTCTGTTGCTAACCAGAAG
AGCCGCAGCGGCGTTTAGGATCAATGAATCTGCTATTGACCCTTTCTCTCCTGAAAGCAC
ACGTCTTAGCACATCAGCATTGTAGTCTGGACCTCCACCTCGCAAATCCTCAAGTGTGCA
ACGAGGTATACCAAAGTCCAATGGGTCGAATGAGAACTCTTCAATCTTTTCAGGTGTTAC
ATCATAAACTAGCCCTCCTCCTAACGGACTCATTTCGTCTAAACCATATGAATGAACAAC
CAATGCTCTTTTCACACCGAAGAGTTGCAATGCCTTTGCCATCTTAAGTACCAGACTTTT
GTGGTAAACACCAACGACGGCATAAGAGACTCTAGCAGGATTAAGCATAGGTCCCAATAC
GTTAAAAACAGTTTTTATTTTAAGTTTTTTACGGACGGGACCAACGATCTTCATAGCTGG
ATGGTACATTGGTGCCATCATAAAACCAATCCCTGATTCTTCAACACATTTTTTTATCCC
TTCTGGTCCCAAGTCCATCACCACTCCTAGTGCCTCTAATACATCAGCACTTCCACAGGC
AGAGGAACTCGAACGACTGCCTTGCTTTGCTACTTTTGCACCACAAGCAGCAGCGAGTAT
TGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4E670JQ U 8
AF RR4C713JQ U 1
AF RR4FE40JQ U 1
AF RR4DT24JQ U 8
BS 1 221 RR4C713JQ
BS 222 222 RR4FE40JQ
BS 223 433 RR4C713JQ
BS 434 434 RR4FE40JQ
BS 435 494 RR4C713JQ
BS 495 495 RR4DT24JQ
BS 496 629 RR4C713JQ
BS 630 630 RR4FE40JQ
BS 631 724 RR4C713JQ
BS 725 725 RR4FE40JQ
BS 726 786 RR4C713JQ
BS 787 787 RR4FE40JQ
BS 788 820 RR4C713JQ
BS 821 845 RR4DT24JQ

RD RR4E670JQ 766 0 0
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CTTTTCACACCGAAGAGTTGCAATGCCTTTGCCATCTTAAGTACCAGACTTTTGTGGTAA
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ACAGTTTTTATTTTAAGTTTTTTACGGACGGGACCAACGATCTTCATAGCTGGATGGTAC
ATTGGTGCCATCATAAAACCAATCCCTGATTCTTCAACACATTTTTTTATCCCTTCTGGT
CCCAAGTCCATCACCACTCCTAGTGCCTCTAATACATCAGCACTTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4C713JQ 820 0 0
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GTCTTCCCTTTCATACAATATAGAGAAAATGTAAATACCACACAATCACTGAGATTTCTG
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TACTTCACGGGCCAAGGTTACTCCTTCCCCTAGCTTTTGGAATCTGTTGCTAACCAGAAG
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ACGTCTTAGCACATCAGCATTGTAGTCTGGACCTCCACCTCGCAAATCCTCAAGTGTGCA
ACGAGGTATACCAAAGTCCAATGGGTCGAATGAGAACTCTTCAATCTTTTCAGGTGTTAC
ATCATAAACTAGCGCTCCTCCTAACGGACTCATTTCGTCTAAACCATATGAATGAACAAC
CAATGCTCTTTTCATACCGAAGAGTTGCAATGCCTTTGCCATCTTAAGTACCAGACTTTT
GTGGTAAACACCAACGACGGCATAAGAGACTCTAGCAGGATTAAGCATAGGTCCCAATAC
GTTAAAAACAGTTTTTATTTTAAGTTTTT*ACGGACGGGACCAACGATCTTCATAGCTGG
ATGGTACATTGGTGCCATCATAAAACCAATCCCTGATTCTTCAACACATTTTTTTATCCC
TTCTTGTCCCAAGTCCATCACCACTCCTAGTGCCTCTAATACATCAGCACTTCCACAGGC
AGAGGA*CTCGAACGACTGCCTTGCTTTGCTACTTTTGCA

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4FE40JQ 810 0 0
ATATATG
GTGTCTTCTCTTTCTTGATTGACAAAGAAAACTAGTTACAAACCTGTTCTTGTGTCTTCC
CTTTCATACAATATAGAGAAAATGTAAATACCACACAATCACTGAGATTTCTGAGCTAAG
TTAGATGAGTGAATCCATGAATCCAGCGTCTTCATAGCTTTCCCTGATGATTGTACTTCA
CGGGCCAAGGTTACTCCTTCCCCTAGCTTTTGGACTCTGTTGCTAACCA*AAGAGCCGCA
GCGGCGTTTAGGATCAATGAGTCTGCTATTGACCCTTTCTCTCCTGAAAGCACACGTCTT
AGCACATCAGCATTGTAGTCTGGACCTCCACCTCGCAAATCCTCAAGTGTGCAACGAGGT
ATACCAAAGTCCAATGGGTCGAATGAGAACTCTTCAATCTTTTCAGGTGTTACACCATAA
ACTAGCCCTCCTCCTAACGGACTCATTTCGTCTAAACCATATGAATGAACAACCAATGCT
CTTTTCATACCGAAGAGTTGCAATGCCTTTGCCATCTTAAGTACCAGACTTTTGTGGTAA
ACACCAACGACGGCATAAGAGACTCTAGCAGGATTAAGCATAGGTCCCAATACGTTAAAA
ACAGTTTTTATTTTAAGTTTTTTACGGACGGGACCAACGATCTTCATAGCTGGATGGTAC
ATTGGTGCCATCATAAAACCAATCCCTGATTCTTCAACACATTTTTTTATCCCTTCTGGT
CCCAAGTCCATCACCACTCCTAGTGCCTCTAATACATCAGCACTTCCACAGGCAGAGGAA
CTCGAACGACTGCCTTGCTTTGC

QA 8 810 8 810
DS 

RD RR4DT24JQ 838 0 0
GTGTCTTCTCTTTCTTGATTGACAAAGAAAACTAGTTACAAACCTGTTCTTGTGTCTTCC
CTTTCATACAATATAGAGAAAATGTAAATACCACACAATCACTGAGATTTCTGAGCTAAG
TTAGATGAGTGAATCCATGAATCCAGCGTCTTCATAGCTTTCCCTGATGATTGTACTTCA
CGGGCCAAGGTTACTCCTTCCCCTAGCTTTTGGACTCTGTTGCTAACCAGAAGAGCCGCA
GCGGCGTTTAGGATCAATGAATCTGCTATTGACCCTTTCTCTCCTGAAAGCACACGTCTT
AGCACATCAGCATTGTAGTCTGGACCTCCACCTCGCAAATCCTCAAGTGTGCAACGAGGT
ATACCAAAGTCCAATGGGTCGAATGAGAACTCTTCAATCTTTTCAGGTGTTACATCATAA
ACTAGCCCTCCTCCTAACGGACTCATTTCGTCTAAACCATATGAATGAACAACCAATGCT
CTTTTCACACCGAAGAGTTGCAATGCCTTTGCCATCTTAAGTACCAGACTTTTGTGGTAA
ACACCAACGACGGCATAAGAGACTCTAGCAGGATTAAGCATAGGTCCCAATACGTTAAAA
ACAGTTTTTATTTTAAGTTTTTTACGGACGGGACCAACGATCTTCATAGCTGGATGGTAC
ATTGGTGCCATCATAAAACCAATCCCTGATTCTTCAACACATTTTTTTATCCCTTCTGGT
CCCAAGTCCATCACCACTCCTAGTGCCTCTAATACATCAGCACTTCCACAGGCAGAGGAA
CTCGAACGACTGCCTTGCTTTGCTACTTT*GCACCACAAGCAGCAGCGAGTATTGAGA

QA 1 838 1 838
DS 



CO CL907Contig2 760 3 2 U
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CCTTCAGGGATCGCGACTTCCTTCAACACCCCAGCTGATGTCTCGAGTCCCGGAAGAATC
ATGTGTGTTCAAGTTAACCCGGCGTTGACACGGCGGCGCTTGTCGTCGATCGGAGCCGTA
CCCTCAATTCGCGGATCTTCCTTTCCGTCTTCTAGTCGCGTCTCTTTCGCTCTTGAAGCT
C***CAAGTGTTTGTGAAAATGCCACCGCTTCTTCCGTCAAATCTTTCAGCCAGTTGATT
GAATCTTTGATTGATCGGGTTGATCTATCTGAATCCGAGGCTGAATCATCTCTCGAGTTT
CTTCTGAACGAGGCAAACGAGGCGCTCATTAGTGCCTTTCTTGTTCTACTCAGAGCTAAA
GGAGAGACATATGAAGAGATTGTAGGACTGGCTAGGGCAATGATGAAGCATGCCAGGAAA
GTAGAAG*GGTTAGTTGATGCGGTGGACATAGTAGTAACAGGTGGTGATGGAGCAAACAC
TGTCAACATATCAACTGGCTCTTCAATACTCGCTGCTGCTTGTGGTGCAAAAGTAGCAAA
GCAAGGCAGTCGTTCGAGTTCCTCTGCCTGTGGAAGTGCTGATGTATTAGAGGCACTAGA
GTGGTGATGGACTTGGGACCAGAAGGATAAAAAATGTGTTGAGAATCAGGATTGGTTTAT
GATGGCACCATGTACATCAGCTATGAAGATCGTTGGTCCG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT24TF U 1
AF RR4FE40TF U 164
AF RR4E670TF U 1
BS 1 655 RR4DT24TF
BS 656 760 RR4E670TF

RD RR4DT24TF 655 0 0
GGAAATCAATCGAGCGATATAGTTATGGCAGTGCCCACCTCCATTGTTTCTGGCATCAAG
CCTTCAGGGATCGCGACTTCCTTCAACACCCCAGCTGATGTCTCGAGTCCCGGAAGAATC
ATGTGTGTTCAAGTTAACCCGGCGTTGACACGGCGGCGCTTGTCGTCGATCGGAGCCGTA
CCCTCAATTCGCGGATCTTCCTTTCCGTCTTCTAGTCGCGTCTCTTTCGCTCTTGAAGCT
C***CAAGTGTTTGTGAAAATGCCACCGCTTCTTCCGTCAAATCTTTCAGCCAGTTGATT
GAATCTTTGATTGATCGGGTTGATCTATCTGAATCCGAGGCTGAATCATCTCTCGAGTTT
CTTCTGAACGAGGCAAACGAGGCGCTCATTAGTGCCTTTCTTGTTCTACTCAGAGCTAAA
GGAGAGACATATGAAGAGATTGTAGGACTGGCTAGGGCAATGATGAAGCATGCCAGGAAA
GTAGAAG*GGTTAGTTGATGCGGTGGACATAGTAGTAACAGGTGGTGATGGAGCAAACAC
TGTCAACATATCAACTGGCTCTTCAATACTCGCTGCTGCTTGTGGTGCAAAAGTAGCAAA
GCAAGGCAGTCGTTCGAGTTCCTCTGCCTGTGGAAGTGCTGATGTATTAGAGGCA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4FE40TF 485 0 0
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CTTTCGCTCTTGAAGCTCTGCCAAGTGTTTGTGAAAATGCCACCGCTTCTTCCGTCAAAT
CTTTCAGTCAGTTGATTGAATCTTTGATTGATCGGGTTGATCTATCTGAATCCGAGGCTG
AATCATCTCTCGAGTTTCTTCTGAACGAGGCAAACGAGGCGCTCATTAGTGCCTTTCTTG
TTCTACTCAGAGCTAAAGGAGAGACATATGAAGAGATTGTAGGACTGGCTAGGGCAATGA
TGAAGCATGCCAGGAAAGTAGAAGAGGTTAGTTGATGCGGTGGACATAGTAGGAACAGGT
GGTGATGGAGCAAACACTGTCAACATATCAACTGGCTCTTCAATACTCGCTGCTGCTTGT
GGTGCAAAAGTAGCAAAGCAAGGCAGTCGTTCGAGT*CCTCTGCCTGTGGAAGTGCTGAT
GTATT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4E670TF 760 0 0
GG
AAATCAATCGAGCGATATAGTTATGGCAGTGCCCACCTCCATTGTTTCTGGCATCAAGCC
TTCAGGGATCGCGACTTCCTTCAACACCCCAGCTGATGTCTCGAGTCCCGGAAGAATCAT
GTGTGTTCAAGTTAACCCGGCGTTGACACGGCGGCGCTTGTCGTCGATCGGAGCCGTACC
CTCAATTCGCGGATCTTCCTTTCCGTCTTCTAGTCGCGTCTCTTTCGCTCTTGAAGCTC*
**CAAGTGTTTGTGAAAATGCCACCGCTTCTTCCGTCAAATCTTTCAGCCAGTTGATTGA
ATCTTTGATTGATCGGGTTGATCTATCTGAATCCGAGGCTGAATCATCTCTCGAGTTTCT
TCTGAACGAGGCAAACGAGGCGCTCATTAGTGCCTTTCTTGTTCTACTCAGAGCTAAAGG
AGAGACATATGAAGAGATTGTAGGACTGGCTAGGGCAATGATGAAGCATGCCAGGAAAGT
AGAAG*GGTTAGTTGATGCGGTGGACATAGTAGTAACAGGTGGTGATGGAGCAAACACTG
TCAACATATCAACTGGCTCTTCAATACTCGCTGCTGCTTGTGGTGCAAAAGTAGCAAAGC
AAGGCAGTCGTTCGAGTTCCTCTGCCTGTGGAAGTGCTGATGTATTAGAG*CACTAGAGT
GGTGATGGACTTGGGACCAGAAGGATAAAAAATGTGTTGAGAATCAGGATTGGTTTATGA
TGGCACCATGTACATCAGCTATGAAGATCGTTGGTCCG

QA 3 760 3 760
DS 



AS 1 7

CO CL908Contig1 476 7 2 U
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CTAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAACAACAAGAACTACGATGAAGA
TGAGAATTAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAA
AGGGATACTACAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCT
CCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCG
CAGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCT
CCTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTT
TTTTTAAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 10 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4G281JQ U 157
AF RR4C343JQ U 1
AF RR4C343TF C 105
AF RR4C129JQ U 41
AF RR4BL26JQ U 2
AF RR4C129TF C 195
AF RR4G281TF C 2
BS 1 475 RR4C343JQ
BS 476 476 RR4G281TF

RD RR4G281JQ 142 0 0
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GCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTCCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTG
TTATCTTCTGCCCCGCGGTTTG

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR4C343JQ 475 0 0
GGAGCTTAAATCAGATGTTCATTAGCGGGAAATTAAATACATAAACATCCAAACTTACAC
CTAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAACAACAAGAACTACGATGAAGA
TGAGAATTAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAA
AGGGATACTACAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCT
CCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCG
CAGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCT
CCTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTT
TTTTTAAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4C343TF 371 0 0
AAGAACT
CGATGAAGATGAGAATTAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAA*CCACAACGATTAATT
TTTTTAAAAAGGGATACTACAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGC
CGGTCTTCTCCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCG
CGGTTTGCGCAGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTCCACCAGCACAT
TAGTCTTCTCCTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTG
CCATTTTTTTTTTTAAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTG
ATCC

QA 8 371 8 371
DS 

RD RR4C129JQ 390 0 0
ATAAACATCCAAACTTACACCTAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAAC
AACAAGAACTACGATGAAGATGAGAATTAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCAC
AACGATTAATTTTTTTAAAAAGGGATACTACAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTA
CTTCTTCATGCCGGTCTTCTCCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTAT
CTTCTGCCCCGCGGTTTGCGCAGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTC
CACCAGCACATTAGTCTTCTCCTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTG
CTTGTTGTCTGCCATTTTTTTTTTTAAAA
A

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4BL26JQ 474 0 0
GAGCTTAAATCAGATGTTCATTAGCGGGAAATTAAATACATAAACATCCAAACTTACACC
TAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAACAACAAGAACTACGATGAAGAT
GAGAATTAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAA
GGGATACTATAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTC
CTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGC
AGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTC
CTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTT
TT**AAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4C129TF 281 0 0
TCCCAGTTTTATGCTCGAATGGG*TA*TTCTTCATGCCGGTCTTCTCCTTCACAAGATTA
ACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGCAGAAGCTCCAGCT
GAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTCCTCAGCACGACCA
GCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTTTTTTAAAACGATA
TATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCC

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4G281TF 475 0 0
GAGCTTAAATCAGATGTTCATTAGCGGGAAATTAAATACATAAACATCCAAACTTACACC
TAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAACAACAAGAACTACGATGAAGAT
GAGAATTAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAA
GGGATACTATAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTC
CTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGC
AGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTAATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTC
CTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTT
TTT*AAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCCC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 2 8

CO CL909Contig1 1112 6 7 U
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TTATACATGATTTATGATGATGGTAAGTTTAGATAAAGATCGGTTGCTTGATCTTCACGT
TGCAACTCGGAAGAGGTGCACCACACAAGCACTTGTTGTGTAAATAGGCATAAGCATCAA
AACTCTGAAGGTCACCTCCCTGGGGAATGCGTCCACACAATCTGTTATAGCTAACGTTGA
AAGTCTGAAGATCAAGTTGGGTCCATTGATCCGGGATACTCCCTGTGAGGCTGTTGTGAT
TCAAGTCCAAGAAACGAACTGTCATAGCGACCTTAACCTTGGAGATATCGAACTGGAACA
TGTTTCTAGATAAGTCGATGTGCCATGTCTTCTTTTTGGCTCCAAACAACATCGACGCAT
CACCTTCAAGCTTGTTCCGGGAAAGATCAATCGTGTTAAAGTCGAGGTTGCCTAGTGATT
TTGGTATAGAACCGGACAGCTGGTTGTGTGATAGGTAAATCCCATATACATCTCCTTTAA
ACGATCCAAATGACTCTGGTATCGTACCTGTAAGCTTGTTCCTGCTGAGTTCTAGTGCAG
TCAGATTAGGTAACAAAGAGAGTGAACCGGGTATGGAACCGGAGAGTTTATTGAAGGAAA
GGTTTATGTACTCTAGATTCTTGAGTTGACTCAGAAATTCAGGAACCGGGCCGGTCAGGT
TGTTCCAGCTGAGCCAGAGAAATTTGAGATACTTGAGCTTGGCAATGGTGGGTGGGATTT
CACCGGTGAGGTTAGGGAGTTTGCGGAGTGTGAGGTATTGTAGATACGGTAAGTCGCCGA
CTTCAGGAGGGATCTGACCGGAGACGTCGATGTTGGATATGGCTAGAGAGATGACTCGGT
TTGCGTTGTCGCAATCAACAGAGTACCAGGTGCAGCAGTCGTCCTCGAGGACCCAGGAGA
TGTTCATGGCTTTCAGGATCTTGAGGAGGGTGTTTTTGTCATCTTTGTGACAGAGGTCTT
TGGATAAAGATGTCGTTAGTAGAAGAGCGAACAAGACCAAGAGCAGTGTCGTTGTTTTAC
CAACCATAGTGTGTTGTTGTGTTTGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK15JQ U 8
AF RR4AR31JQ U 3
AF RR4BC15JQ U 1
AF RR4BC15TF C 310
AF RR4EK15TF C 265
AF RR4AR31TF C 342
BS 1 582 RR4BC15JQ
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BS 925 1006 RR4EK15TF
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AAGGTCACCTCCCTGGGGAATGCGTCCACACAATCTGTTATAGCTAACGTTGAAAGTCTG
AAGATCAAGTTGGGTCCATTGATCCGGGATACTCCCTGTGAGGCTGTTGTGATTCAAGTC
CAAGAAACGAACTGTCATAGCGACCTTAACCTTGGAGATATCGAACTGGAACATGTTTCT
AGATAAGTCGATGTGCCATGTCTTCTTTTTGGCTCCAAACAACATCGACGCATCACCTTC
AAGCTTGTTCCGGGAAAGATCAATCGTGTTAAAGTCGAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTAT
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AAATGACTCTGGTATCGTACCTGTAAGCTTGTTCCTGCTGAGTTCTAGTGCAGTCAGATT
AGGTAACAAAGAGAGTGAACCGGGTATGGAA

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DS 

RD RR4AR31JQ 762 0 0
CAAAT
GAAATATGATTCATTCTTTTATTAATTGTTCCGAATGGATAATACAGCTATCCTTATACA
TGATTTATGATGATGGTAAGATTAGATAAAGATCGGTTGCTTGATCTTCACGTTGCAACT
CGGAAGAGGTGCACCACACAAGCACTTGTTGTGTAAATAGGCATAAGCATCAAAACTCTG
AAGGTCACCTCCCTGGGGAATGCGTCCACACAATCTGTTATAGCTAACGTTGAAAGTCTG
AAGATCAAGTTGGGTCCATTGATCCGGGATACTCCCTGTGAGGCTGTTGTGATTCAAGTC
CAAGAAACGAACTGTCATAGCGACCTTAACCTTGGAGATATCGAACTGGAACATGTTTCT
AGATAAGTCGATGTGCCATGTCTTCTTTTTGGATCCAAACAACATCGACGCATCACCTTC
AAGCTTGTTCCGGGAAAGATCAATCGTGTTAAAGTCGAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTAT
AGAACCGGACAGCTGGTTGTGTGATAGGTAAATCCCATATACATCTCCTTTAAACGATCC
AAATGACTCTGGTATCGTACCTGTAAGCTTGTTCCTGCTGAGTTCTAGTGCAGTCAGATT
AGGTAACAAAGAGAGTGAACCGGGTATGGAACCGGAGAGTTTATTGAAGGAAAGGTTTAT
GTATTCTAGATTCTTGAGTTGACTCAGAAATTCAGGAACCGGGCCGGTCAGGTTGTTCCA
GCTGAGCCAGAGAAATTTGAGATACTTGAGCTTGGCA

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DS 

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TTATACATGATTTATGATGATGGTAAGTTTAGATAAAGATCGGTTGCTTGATCTTCACGT
TGCAACTCGGAAGAGGTGCACCACACAAGCACTTGTTGTGTAAATAGGCATAAGCATCAA
AACTCTGAAGGTCACCTCCCTGGGGAATGCGTCCACACAATCTGTTATAGCTAACGTTGA
AAGTCTGAAGATCAAGTTGGGTCCATTGATCCGGGATACTCCCTGTGAGGCTGTTGTGAT
TCAAGTCCAAGAAACGAACTGTCATAGCGACCTTAACCTTGGAGATATCGAACTGGAACA
TGTTTCTAGATAAGTCGATGTGCCATGTCTTCTTTTTGGCTCCAAACAACATCGACGCAT
CACCTTCAAGCTTGTTCCGGGAAAGATCAATCGTGTTAAAGTCGAGGTTGCCTAGTGATT
TTGGTATAGAACCGGACAGCTGGTTGTGTGATAGGTAAATCCCATATACATCTCCTTTAA
ACGATCCAAATGACTCTGGTATCGTACCTGTAAGCTTGTTCCAGCTGAGTTCTAGTGCAG
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GGTTTATGTACTCTAGATTCTTGAGTTGACTCAGAAATTCAGGAACCGGGCCGGTCAGGT
TGTTCCAGCTGAGCCAGAGAAATTTGAGATACTTGAGCTTGGCAATGGTGGGTGGGATTT
CA

QA 1 782 1 782
DS 

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ATAAGTCGATGTGCCATGTCTTCTTTT*GGCTCCAAACAACATCGACGCATCACCTTCAA
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AACCGGACAGCTGGTTGTGTGATAGGTAAATCCCATATACATCTCCTTTAAACGATCCAA
ATGACTCTGGTATCGTACCTGTAAGCTTGTTCCAGCTGAGTTCTAGTGCAGTCAGATTAG
GTAACAAAGAGAGTGAACCGGGTATGGAACCGGAGAGTTTATTGAAGGAAAGGTTTATGT
ACTCTAGATTCTTGAGTTGACTCAGAAATTCAGGAACCGGGCCGGTCAGGTTGTTCCAGC
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GGTTCTGACCGGAGACGTCGATGTTGGATATGGCTAGAGAGATGACTCGGTTTGCGTTGT
CGCAATCAACAGAGTACCAGGTGCAGCAGTCGTCCTCGAGGACCCAGGAGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4EK15TF 744 0 0
CA
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GCGACCTTAACCTTGGAGATATCGAACTGGAACATGTTTCTAGATAAGTCGATGTGCCAT
GTCTTCTTTTTGGCTCCAAACAACATCGACGCATCACCTTCAAGCTTGTTCCGGGAAAGA
TCAATCGTGTTAAAGTCGAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATAGAACCGGACAGCTGGTTG
TGTGATAGGTAAATCCCATATACATCTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATCGTA
CCTGTAAGCTTGTTCCTGCTGAGTTCTAGTGCAGTCAGATTAGGTAACAAAGAGAGTGAA
CCGGGTATGGAACCGGAGAGTTTATTGAAGGAAAGGTTTATGTACTCTAGATTCTTGAGT
TGACTCAGAAATTCAGGAACCGGGCCGGTCAGGTTGTTCCAGCTGAGCCAGAGAAATTTG
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AGTGTGAGGTATTGTAGATACGGTAAGTCGCCGACTTCAGGAGGGATCTGACCGGAGACG
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AGGGTGTTTTTGTCATCTTT
CC

QA 3 742 3 742
DS 

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TCGAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATAGAACCGGACAGCTGGTTGTGTGATAGGTAAATC
CCATATACATCTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATCGTACCTGTAAGCTTGTTC
CTGCTGAGTTCTAGTGCAGTCAGATTAGGTAACAAAGAGAGTGAACCGGGTATGGAACCG
GAGAGTTTATTGAAGGAAAGGTTTATGTATTCTAGATTCTTGAGTTGACTCAGAAATTCA
GGAACCGGGCCGGTCAGGTTGTTCCAGCTGAGCCAGAGAAATTTGAGATACTTGAGCTTG
GCAATGGTGGGTGGGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAGTTTGCGGAGTGTGAGGTATTGT
AGATACGGTAAGTCGCCGACTTCAGGAGGGATCTGACCGGAGACGTCGATGTTGGATATG
GCTAGAGAGATGACTCGGTTTGCGTTGTCGCAATCAACAGAGTACCAGGTGCAGCAGTCG
TCCTCGAGGACCCAGGAGATGTTCATGGCTTTCAGGATCTTGAGGAGGGTGTTTTTGTCA
TCTTTGTGACAGAGGTCTTTGGATAAAGATGTCGTTAGTAGAAGAGCGAACAAGACCAAG
AGCAGTGTCGTTGTTTTACCAACCATAGTGTGTTGTTGTGTTTGTGTTTCC

QA 1 771 1 771
DS 



CO CL909Contig2 1099 2 12 U
AGGGAAACACAAACACAACAACACACTATGGGTGGTAAAACAACGACACTGCTCTTGGTC
TTGTTCGCTCTTCTACTAACGACATCTTTATCCAAAGACCTCTGTCACAAAGATGACAAA
AACACCCTCCTCAAGATCCTGAAAGCCACCATCTCCTGGGTCCTCGAGGACGTCTGCTGC
ACCTGGTACTCTGTTGATTGCGACAACGCAAACCGAGTCATCTCTCTAGCCATATCCAAC
ATCGACGTCTCCGGTCAGATCCCTCCTGAAGTCGGCGACTTACCGTATCTACAATACCTC
ACACTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCCACCCACCATTGCCAAGCTCAAG
TATCTCAAATTTCTCTGGCTCAGCTGGAACAACCTGACCGGCCCGGTTCCTGAATTTCTG
AGTCAACTCAAGAATCTAGAGTACATAAACCTTTCCTTCAATAAACTCTCCGGTTCACTC
TCTTTGTTACCTAATCTGACTGCACTAGAACTCAGCAGGAACAAGCTTACAGGTACGATA
CCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGATGTATATGGGATTTACCTATCACACAACCAG
CTGTCCGGTTCTATACCAAAATCACTAGGCAACCTCGACTTTAACACGATTGATCTTTCC
CGGAACAAGCTTGAAGGTGATGCGTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAAAGAAGACATGGCAC
ATCGACTTATCTAGAAACATGTTCCAGTTCGATATCTCCAAGGTTAAGGTCGCTATGACA
GTTCGTTTCTTGGACTTGAATCACAACAGCCTCACAGGGAGTATCCCGGATCAATGGACC
CAACTTGATCTTCAGACTTTCAACGTTAGCTATAACAGATTGTGTGGACGCATTCCCCAG
GGGGGTGACCTTCAGAGTTTTGATGCTTATGCCTATTTACACAACAAGTGCTTGTGTGGT
GCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATCAAGCAACCGATCTTTATCTAAACTTACCAT
CATCATAAATCATGTATAAGGATAGCTGTATTATCCATTCGGAACAATTAATAAAAGAAT
GAATCATATTTCATTTGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GF18TF U 1
AF RR4GF18JQ C 326
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ACACTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCCACCCACCATTGCCAAGCTCAAG
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AGTCAACTCAAGAATCTAGAGTACATAAACCTTTCCTTCAATAAACTCTCCGGTTCACTC
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ATCGACT*ATCTAGAAACATGTTCCAGT*CGATATCTC

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TAGGCAACCTCGACTTTAACACGATTGATCTTTCCCGGAACAAGCTTGAAGGTGATGCGT
CGATGTTGTTTGGAGCCAAAAAGAAGACATGGCACATCGACTTATCTAGAAACATGTTCC
AGTTCGATATCTCCAAGGTTAAGGTCGCTATGACAGTTCGTTTCTTGGACTTGAATCACA
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TTAGCTATAACAGATTGTGTGGACGCATTCCCCAGGGGGGTGACCTTCAGAGTTTTGATG
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CTGTATTATCCATTCGGAACAATTAATAAAAGAATGAATCATATTTCATTTGAT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 8

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TGTTTTTTTCACTTCTTCTCCCTCGAGAGAGGGCTTTTAGTGACAATCTTGCATTGTTAT
CTC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 10 

AF RR4FY95TF U 1
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AF RR4FU85TF U 37
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QA 1 287 1 287
DS 

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QA 4 571 4 571
DS 

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CGACTTCGACGTCGCCGTTGACTTATACTCCAAAGCCATTGACTTGGATCCCAATTGCGC
CGCCTTCTTCGCCGATCGTGCTCAGGCCAACATCAAAATCCTTAATTTCACCGAAGCTGT
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GGCTTCCGTTGCACCAAATGAATCAAAGTTTAAGAAGATGATAGATGAATGCAATCTTCA
CATTGCAGAAGAAGAGAAAGATTTGGTTCAGCAGATGCCCCCAACCTTGCCTTCAAGCTC
TACCTCACCACCACTAGCAGCGGCCGCTGATTCTCCTCCTGCAGCACCTGCCAAACCCAT
GTTCAGACACGAGTTCTACCAGAAGCCGGAAGAAGTGGTGGTGACGATCTTCGCTAAA*G
AATACCAAAGCAGAACGTGAATGTTGAGTTTGGTGAC*AGATTCTGAGTGTTGTGAT

QA 1 717 1 717
DS 

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GG
ATAAACTCATAAGTCTAAGGATCGTGTGGTCTCTTTACCTCTAGTCAGTCTTGTGCGTCT
CGTCTCCTCGAAAGAGTGAAAAGAAAATCCAATCAATGGCGAAGGAGTTAGCGGAAAAAG
CCAAAGAGGCCTTCTTAGATGACGACTTCGACGTTGCCGTTGACTTATACTCCAAAGCCA
TTGACTTGGATCCCAATTGCGCCGCCTTCTTCGCCGATCGTGCTCAGGCCAACATCAAAA
TCCTTAATTTCACCGAAGCTGTTGCAGACGCCAACAAAGCCATAGAGTTGGAGCCGACGT
TGGCTAAAGCCTACCTCAGAAAAGGCACTGCTTGTATGAAGCTGGAGGAATACAGTACTG
CTAAAGCAGCCCTTGAAAAGGGGGCTTCCGTTGCACCAAATGAATCAAAGTTTAAGAAGA
TGATAGATGAATGCAATCTTCACATTGCAGAAGAAGAGAAAGATTTGGTTCAGCAGATGC
CCCCAACCTTGCCTTCAAGCTCTACCTCACCACCACTAGCAGCGGCCGCTGATTCTCCTC
CTGCAGCACCTGCCAAACCCATGTTCAGACACGAGTTCTACCAGAAGCCGGAAGAAGTGG
TGGTGACAATCTTCGCTAAATGAATACCAAAGCAGAACGTGAATGTTGAGTTTGGTGACC
AGATTCTGAGTGTTGTGATTGATGTTGCTGGAGAGGAAGCTTATCACT

QA 3 710 3 710
DS 

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TACCAGAAGCCGGAAGAAGTGGTGGTGACAATCTTCGCTAAAGGAATACCAAAGCAGAAC
GTGAATGTTGAGTTTGGTGACCAGATTCTGAGTGTTGTGATTGATGTTGCTGGAGAGGAA
GCTTATCACTTCCAGCCAAGATTGTTTGGGAAGATAATACCAGAGAAGTGCAGATATGAA
GTATTGTCAACCAAAGTTGAGATCCGTCTTGCAAAAGCAGAGATGGTCACTTGGGCCTCC
CTTGAACATGGCAAAGGGCAAGCTCTTCTGCCTAAACCCAATGTTGCACCAGCGGTTTCT
CAGAGGCCGGTTTACCTATCATCTAAGCCGGCAAAAGACTGGGACAAGCTAGAAGCTGAA
GTGAAGAAACAGGAGAAGGATGAGAAGCTAGATGGAGATGCAGCTATGAACAAGTTTTTC
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GAGTCAAATGGGACAGTGCTGTCTACTAACTGGAAAGAGGTTGGGACTAAGAAAGTGGAG
AGCACTCCACCAGATGGCATGAAGCTTAAGAAATGGGAGTATTGATGATCTTTTTAAATC
ATGGCCTTGTCAAATATCTCTGAAGTTTCTTTTGG
CTTTCAGTGCATTCGTTG

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GAAGAAGTGGTGGTGACAATCTTCGCTAAAGGAATACCAAAGCAGAACGTGAATGTTGAG
TTTGGTGACCAGATTCTGAGTGTTGTGATTGATGTTGCTGGAGAGGAAGCTTATCACTTC
CAGCCAAGATTGTTTGGGAAGATAATACCAGAGAAGTGCAGATATGAAGTATTGTCAACC
AAAGTTGAGATCCGTCTTGCAAAAGCAGAGATGGTCACTTGGGCCTCCCTTGAACATGGC
AAAGGGCAAGCTCTTCTGCCTAAACCCAATGTTGCACCAGCGGTTTCTCAGAGGCCGGTT
TACCTATCATTTAAGCCGGCAAAAGACTGGGACAAGCTAGAAGCTGAAGTGAAGAAACAG
GAGAAGGATGAGAAGCTAGATGGAGATGCAGCTATGAACAAGTTTTTCAGCGATATATAC
CAGAGTGCGGATGAGGACATGAGGCGAGCCATGAACAAATCATTTGCGGAGTCAAATGGG
ACAGTGCTGTCTACTAACTGGAAAGAGGTTGGGACTAAGAAAGTGGAGAGCACTCCACCA
GATGGCATGAAGCTTAAGAAATGGGAGTATTGATGATCTTTTTAAATCATGGCCTTGTCA
AATATCTCTGAAGTTTCTTTTGGCTTTTCAAGTGCATTCGTTGTGGTTTGAGAAAACGTT
TTGATAGTGTACTAGAAGACCTCGCAAGTTGGTGTTTTTTTCACTTCTTCTCCCTCGAGA
GAGGGCTTTTAGTGAC

QA 1 796 1 796
DS 

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TGACCAGATTCTGAGTGTTGTGATTGATGTTGCTGGAGAGGAAGCTTATCACTTCCAGCC
AAGATTGTTTGGGAAGATAATACCAGAGAAGTGCAGATATGAAGTATTGTCAACCAAAGT
TGAGATCCGTCTTGCAAAAGCAGAGATGGTCACTTGGGCCTCCCTTGAATATGGCAAAGG
GCAAGCTCTTCTGCCTAAACCCAATGTTGCATCAGCGGTTTCTCAGAGGCCGGTTTACCC
ATCATTTAAGCCGGCAAAAGACTGGGACAAGCTAGAAGCTGAAGTGAAGAAACAGGAGAA
GGATGAGAAGCTAGATGGAGATGCAGCTATGAACAAGTTTTTCAGCGATATATACCAGAG
TGCGGATGAGGACATGAGGCGAGCCATGAACAAATCATTTGCGGAGTCAAATGGGACAGT
GCTGTCTACTAACTGGAAAGAGGTTGGGACTAAGAAAGTGGAGAGCACTCCACCAGATGG
CATGGAGCTTAAGAAATGGGAGTATTGATGATCTTTTTAAATCATGGCCTCGTCAAATAT
CTCTGAAGTTTCTTTTGGTTTTTCAAGTGCATTCGTTGTGGTTTGAGAAAACGTTTTGAT
AGTGTACTAGAAGACCTCGCAAGTTGGTGTTTTTTTCACTTCTTCTCCCTCGAGAGAGGG
CTTTTAGTGACAATCTTGCATTGTTATCT

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DS 

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CACTTCCAGCCAAGATTGTTTGGGAAGATAATACCAGAGAAGTGCAGATATGAAGTATTG
TCAACCAAAGTTGAGATCCGTCTTGCAAAAGCAGAGATGGTCACTTGGGCCTCCCTTGAA
TATGGCAAAGGGCAAGCTCTTCTGCCTAAACCCAATGTTGCATCAGCGGTTTCTCAGAGG
CCGGTTTACCCATCATCTAAGCCGGCAAAAGACTGGGACAAGCTAGAAGCTGAAGTGAAG
AAACAGGAGAAGGATGAGAAGCTAGATGGAGATGCAGCTATGAACAAGTTTTTCAGCGAT
ATATACCAGAGTGCGGATGAGGACATGAGGCGAGCCATGAACAAATCATTTGCGGAGTCA
AATGGGACAGTGCTGTCTACTAACTGGAAAGAGGTTGGGACTAAGAAAGTGGAGAGCACT
CCACCAGATGGCATGGAGCTTAAGAAATGGGAGTATTGATGATCTTTTTAAATCATGGCC
TTGTCAAATATCTCTGAAGTTTCTTTTGGTTTTTCAAGTGCATTCGTTGTGGTTTGAGAA
AACGTTTTGATAGTGTACTAGAAGACCTCGCAAGTTGGTGTTTTTTTCACTTCTTCTCCC
TCGAGAGAGGGCTTTTAGTGACAATCTTGCATTGTTATCTC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 7

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TTTTTGAGCTCCGATGGGAGCCTCACTGTTCATGCCGGTGAGAGATTAGGTCGTGGAATA
GTCACGGATGCTATCACCACTCCTGTAGTCAACACATCTGCCTACTTCTTCAACAAAACT
GCTGACCTTATTGACTTCAAGGAGAAACGGAGTGTGAGTTTCGAGTATGGTCGTTATGGA
AACCCTACGACTATCGTTCTTGAGGAGAAGATAAGTGCACTTGAAGGTTCTGAATCAACC
TTGGTTATGGCTTCTGGGATGTGTGCAAGCACTGTTATGCTTTTGGCTTTGGTTCCTGCT
GGTGGCCACATTGTCACTACTACTGATTGTTACAGGAAGACTAGAATCTTCATGGAGAAT
TTTTCTTCCCAAGATGGGGATCACTGTCACTGTGATTGATCCTGCTGACGTCGCGGGGCT
TGAAGCTGCTGTGAATAAGTACCAAGTTTCTCTGTTCTTCACCGAGTCACCGACAAACCC
ATTCCTTAGATGTGTCGACATTGAGCTAGTTTCGGAAATATGCCACAAAAGGGGAACTCT
TGTTTGCATCGATGGTACCTTTGCAACACCCCTGAATCAGAAAGCCCTTGCTTTTGGTGC
TGATCTTGTCGTCCACTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGACACAACGATGTTCTTGGTGG
ATGCATCTGTGGCCCACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGG
AGGCACACTTAATCCGAACGCTGCGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCT
TCGTGTAAAGCAACAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCC
TAAGGTGAGTCATGTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAA
GCGACAAATGACTGGTTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTAAAAG
AACGATAAAGTTTGTGGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTG
CGAAAGCATCGTGGACCAACCGGCCATCATGTCTTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAG
GCTAAAGTATGGAATCAAAGACAACTTGGTACGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGA
AGATGTCAAAGCTGACATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCCCAATTATTTCA
CCCCCAAAAACACAATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTATTGTCTGTTTCCTTTGTCT
CTTTTCTTTTTATCGCTCTCTATTTGAACGGTTGGTCATTGTAATAATGTTGTCTTTGAA
CTATTGCTCGGCGACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTATTTATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CP85TF U 1
AF RR4AC45TF U 92
AF RR4AC45JQ C 606
AF RR4CP85JQ C 612
BS 1 377 RR4CP85TF
BS 378 681 RR4AC45TF
BS 682 682 RR4AC45JQ
BS 683 726 RR4AC45TF
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BS 1327 1327 RR4CP85JQ
BS 1328 1372 RR4AC45JQ

RD RR4CP85TF 377 0 0
TTTTTGAGCTCCGATGGGAGCCTCACTGTTCATGCCGGTGAGAGATTAGGTCGTGGAATA
GTCACGGATGCTATCACCACTCCTGTAGTCAACACATCTGCCTACTTCTTCAACAAAACT
GCTGACCTTATTGACTTCAAGGAGAAACGGAGTGTGAGTTTCGAGTATGGTCGTTATGGA
AACCCTACGACTATCGTTCTTGAGGAGAAGATAAGTGCACTTGAAGGTTCTGAATCAACC
TTGGTTATGGCTTCTGGGATGTGTGCAAGCACTGTTATGCTTTTGGCTTTGGTTCCTGCT
GGTGGCCACATTGTCACTACTACTGATTGTTACAGGAAGACTAGAATCTTCATGGAGAAT
TTTTCTTCCCAAGATGG

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR4AC45TF 635 0 0
G
CACATCTGCCTACTTCTTCAACAAAACTGCTGACCTTATTGACTTCAAGGAGAAACGGAG
TGTGAGTTTCGAGTATGGTCGTTATGGAAACCCTACGACTATCGTTCTTGAGGAGAAGAT
AAGTGCACTTGAAGGTTCTGAATCAACCTTGGTTATGGCTTCTGGGATGTGTGCAAGCAC
TGTTATGCTTTTGGCTTTGGTTCCTGCTGGTGGCCACATTGTCACTACTACTGATTGTTA
CAGGAAGACTAGAATCTTCATGGAGAATTTT*CTTCCCAAGATGGGGATCACTGTCACTG
TGATTGATCCTGCTGACGTCGCGGGGCTTGAAGCTGCTGTGAATAAGTACCAAGTTTCTC
TGTTCTTCACCGAGTCACCGACAAACCCATTCCTTAGATGTGTCGACATTGAGCTAGTTT
CGGAAATATGCCACAAAAGGGGAACTCTTGTTTGCATCGATGGTACCTTTGCAACACCCC
TGAATCAGAAAGCCCTTGCTTTTGGTGCTGATCTTGTCGTCCACTCTCTTACAAAGTACA
TCGGAGGACACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCCACTGAATGTGGTTTCAG
AAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCAC

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR4AC45JQ 767 0 0
TTGTCGTC
CACTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGACACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGC
CCACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCACACTTAAT
CCGAACGCTGCGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAA
CAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCAT
GTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGACT
GGTTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTAAAAGAACGATAAAGTTT
GTGGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTG
GACCAACCGGCCATCATGTCTTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGA
ATCAAAGACAACTTGGTACGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCT
GACATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCCCAATTATTTCACCCCCAAAAACAC
AATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTATTGTCTGTTTCCTTTGTCTCTTTTCTTTTTAT
CGCTCTCTATTTGAACGGTTGGTCATTGTAATAATGTTGTCTTTGAACTATTGTTCGGCG
ACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTATTTATGTT

QA 9 767 9 767
DS 

RD RR4CP85JQ 761 0 0
CC
CACTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGACACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGC
CCACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCACACTTAAT
CCGAACGCTGCGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAA
CAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCAT
GTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGACT
GGTTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTT
GTGGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTG
GACCAACCGGCCATCATGTCTTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGA
ATCAAAGACAACTTGGTACGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCT
GACATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCCCAATTATTTCACCCCCAAAAACAC
AATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTATTGTCTGTTTCCTTTGTCTCTTTTCTTTTTAT
CGCTCTCTATTTGAACGGTTGGTCATTGTAATAATGTTGTCTTTGAACTATTGCTCGGCG
ACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTATTTATGT
C

QA 3 760 3 760
DS 



CO CL911Contig2 1373 3 7 U
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CCACAAAGCTATGTTCACATTGGTCGCTCACATGCAGCGACCAAATTTATTTAACTTTCG
ATATGGTGGAGGCCCTGTTTCTTAACAAAGATACAATGGTTCGCTTGTGTTTAAGCCCAA
CAAACATAAAATAGTTATACGATTATTACCGAACCGCATATGTGGCGGAACATTATTACC
GTGAAAACAGAGAAAGGTAACAAGAAGCAAGGAAACAGAGAAGACAACGTTTTCAAGGGG
TGAAATAAATTGGGAATTTCAGATGGCTTCGAGAGCTTGAAGAACGTCAGCTTTGACATC
TTCAAAATCTTCAACTCCAAAGCTGAAACGTACCAAGTTGTCTTTTATTCCATACTTTAG
CCTCTCCTCCTGTGTCAGATCCCAGTAAGACATGATGGCCGGTTGGTCCACGATGCTTTC
GCAGCCACCAAAAGATGGTGCGATGTAAGGGATCTTAAGAGAATCCACAAACCTGATCGT
AGCTTCAATGTCTCCATGAATCTCGAAACTGACCACACCTCCAAAACCAGTCATTTGTCG
CTTGGCGATGTGATGCTCAGGATGACTTGCAAGGCCTGGATAGTATAAATGACTCACCTT
AGGATGTGCCTCTAAAATTTCGGCCATCCTTGAGGCAGTAGAATTCTGTTGCTTTACACG
AAGATGCATTGTCTTCATGCCTCGGATCATTAGGTACGCTGCGTTCGGATTAAGTGTGCC
TCCCAACACATGATGCAGATTGCGAATTTCTGAAACCACCTTCAGTGGGCCACAGATGCA
TCCACCAAGAACATCGTTGTGTCCTCCTATGTACTTTGTAAGAGAGTGCAGGACAAGATC
AGCACCAAGAGCAAGAGCTTTCTGATTCAGAGGTGTTGCAAAGGTGCCATCAATGCAAAC
AAGAGTTCCCCTTTTGTGGCATATTTCTGGAACTAGCTCAATGTCTACACATCTAAGGAA
TGGGTTTGTCGGTGACTCAGTGAAGAACAGAGAAACTTGGTACTTATTCACAGCAGCTTC
AGGCCCCGCTACATCAGCAGGATCAATCACAGTGACAGTGATCCCCATCTTGGGAAGAAA
AGTCTCCATGAAGATTCTAGTCTTCCTATAACAGTCTGTAGTAGTGACAATGTGGCCACC
AGCAGGAACCAAAGCCAAAAGCATAACAGTGCTTGCACACATCCCAGAAGCCATAACCAA
GGTTGATTCCGCACCTTCGAGTGCACTAATCTTCTCCTCAAGAACGATGGTGGTAGGGTT
TCCATAACGACCATACTCGAAACTGACACTCCGTTTCTCCTTGAAGTCAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D941JQ U 1
AF RR4E389JQ U 173
AF RR4E389TF C 678
BS 1 502 RR4D941JQ
BS 503 503 RR4E389JQ
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RD RR4D941JQ 749 0 0
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ATATGGTGGAGGCCCTGTTTCTTAACAAAGATACAATGGTTCGCTTGTGTTTAAGCCCAA
CAAACATAAAATAGTTATACGATTATTACCGAACCGCATATGTGGCGGAACATTATTACC
GTGAAAACAGAGAAAGGTAACAAGAAGCAAGGAAACAGAGAAGACAACGTTTTCAAGGGG
TGAAATAAATTGGGAATTTCAGATGGCTTCGAGAGCTTGAAGAACGTCAGCTTTGACATC
TTCAAAATCTTCAACTCCAAAGCTGAAACGTACCAAGTTGTCTTTTATTCCATACTTTAG
CCTCTCCTCCTGTGTCAGATCCCAGTAAGACATGATGGCCGGTTGGTCCACGATGCTTTC
GCAGCCACCAAAAGATGGTGCGGTGTAAGGGATCTTAAGAGAATCCACAAACCTGATCGT
AGCTTCAATGTCTCCATGAATCTCGAAACTGACCACACCTCCAAAACCAGTCATTTGTCG
CTTGGCGATGTGATGCTCAGGATGACTTGCAAGGCCTGGATAGTATAAATGACTCACCTT
AGGATGTGCCTCTAAAATTTCGGCCATCCTTGAGGCAGTAGAATTCTGTTGCTTTACACG
AAGATGCATTGTCTTCATGCCTCGGATCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4E389JQ 733 0 0
G
AGCCCAACAAACATAAAATAGTTATACGATTATTACCGAACCGCATATGTGGCGGAACAT
TATTACCGTGAAAACAGAGAAAGGTAACAAGAAGCAAGGAAACAGAGAAGACAACGTTTT
CAAGGGGTGAAATAAATTGGGAATTTCAGATGGCTTCGAGAGCTTGAAGAACGTCAGCTT
TGACATCTTCAAAATCTTCAACTCCAAAGCTGAAGCGTACCAAGTTGTCTTTTATTCCAT
ACTTTAGCCTCTCCTCCTGTGTCAGATCCCAGTAAGACATGATGGCCGGTTGGTCCACGA
TGCTTTCGCAGCCACCAAAAGATGGTGCGATGTAAGGGATCTTAAGAGAATCCACAAACC
TGATCGTAGCTTCAATGTCTCCATGAATCTCGAAACTGACCACACCTCCAAAACCAGTCA
TTTGTCGCTTGGCGATGTGATGCTCAGGATGACTTGCAAGGCCTGGATAGTATACATGAC
TCACCTTAGGATGTGCCTCTAAAATTTCGGCCATCCTTGAGGCAGTAGAATTCTGTTGCT
TTACACGAAGATGCATTGTCTTCATGCCTCGGATCATTAGGTACGCTGCGTTCGGATTAA
GTGTGCCTCCCAACACATGATGCAGATTGCGAATTTCTGAAACCACCTTCAGTGGGCCAC
AGATGCATCCACCAAGAACATCGTTGTGTCCTCCTATGTACTTTGTAAGAGAGTGCAG*A
CAAGATCAGCAC

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4E389TF 696 0 0
A
TTCGGCCATC*TTGAGGCAGTAGAATTCTGTTGCTTTACACGAAGATGCATTGTCTTCAT
GCCTCGGATCATTAGGTACGCTGCGTTCGGATTAAGTGTGCCTCCCAACACATGATGCAG
ATTGCGAATTTCTGAAACCACCTTCAGTGGGCCACAGATGCATCCACCAAGAACATCGTT
GTGTCCTCCTATGTACTTTGTAAGAGAGTGCAGGACAAGATCAGCACCAAGAGCAAGAGC
TTTCTGATTCAGAGGTGTTGCAAAGGTGCCATCAATGCAAACAAGAGTTCCCCTTTTGTG
GCATATTTCTGGAACTAGCTCAATGTCTACACATCTAAGGAATGGGTTTGTCGGTGACTC
AGTGAAGAACAGAGAAACTTGGTACTTATTCACAGCAGCTTCAGGCCCCGCTACATCAGC
AGGATCAATCACAGTGACAGTGATCCCCATCTTGGGAAGAAAAGTCTCCATGAAGATTCT
AGTCTTCCTATAACAGTCTGTAGTAGTGACAATGTGGCCACCAGCAGGAACCAAAGCCAA
AAGCATAACAGTGCTTGCACACATCCCAGAAGCCATAACCAAGGTTGATTCCGCACCTTC
GAGTGCACTAATCTTCTCCTCAAGAACGATGGTGGTAGGGTTTCCATAACGACCATACTC
GAAACTGACACTCCGTTTCTCCTTGAAGTCAAGAC

QA 2 696 2 696
DS 



AS 1 8

CO CL912Contig1 1030 8 6 U
CTTTGTTTTCTAAATATGATATAAAATGAGTGTTTAATATGGTGTATACATGTTAACTTA
GAATTCCTAGCGACGTAATAAAAAAATAAGAAAAAAAAAATCCTGGCAACTAAAGTAGAT
GCATTCGTATAGTTGATATAAATACCAAAAAATGCAAGTAATTTTGGCTATGTAGAACAA
GTTGTATTCTCATCTGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGTTACTACTCGTAAAGA
TGCTGCATAATTATGTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTG
TGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAAAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTT
TTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTT
GATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCA
CCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTC
CTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTG
ACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTAT
TTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTT
TATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAA
TTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGAGGGCGATCGCCGATGCTCCAAGCCTACCAGAAG
CTAAGAACCCCGTGACCAAGAAACTCGAAGTGATAACCGCCGTTACGAGAATCGGACTAA
GAACTAAAAAAAACCGGCGTCATAACCATTAACACCACGGCCGTACCGGCAAGTGCTAAA
CCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATATAGCTGCAGCATTAGCTAGCGGTTTATCA
TTTGTCCCCT


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4EV30JQ U 25
AF RR4A012JQ U 12
AF RR4A012JQD U 12
AF RR4AC05JQ U 1
AF RR4AC05TF C 260
AF RR4EV30TF C 303
AF RR4A012TF C 171
AF RR4A012TFB C 293
BS 1 99 RR4AC05JQ
BS 100 100 RR4A012JQ
BS 101 803 RR4AC05JQ
BS 804 899 RR4A012TF
BS 900 900 RR4AC05TF
BS 901 1030 RR4A012TF

RD RR4EV30JQ 642 0 0
AATGAGTGTTTAATATGGTGTATACATGTTAACTTAGAATTCCTAGCGACGTAATAAAAA
AATAAGAAAAAAAAA*TCCTGGCAACTAAAGTAGATGCATTCGTATAGTTGATATAAATA
CCAAAAA*TGCAAGTAATTTTGGCTATGTAGAACAAGTTGTATTCTCATCTGACTTAGCA
TCATTGTGGGTATTATAATGTTACTACTCGTAAAGATGCTGCATAATTATGTAGTTGTTT
TGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAA
AATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTAATCTTTCATGAAAATAG
ATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTG
GACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAG
GGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCG
GATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGT
CTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4A012JQ 738 0 0
CTT
TATGATATAAAATGAGTGTTTAATATGGTGTATACATGTTAACTTAGAATTCCTAGCGAC
GTAATAAAAAAATAAAAAAAAAAAAATCCTGGCAACTAAAGTAAATGCATTCGTATAGTT
GATATAAATACCAAAAAATGCAAGTAATTTTGGCTATGTAGAACAAGTTGTATTCTCATC
TGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGTTACTACTCGTAAAGATGCTGCATAATTAT
GTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCG
CGCGATGTAAAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTC
ATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGC
AAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTT
GATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTT
TCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCC
TCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGC
CTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGT
CGAACTCGGGCATGC

QA 4 738 4 738
DS 

RD RR4A012JQD 713 0 0
CTT
TATGATATAAAATGAGTGTTTAATATGGTGTATACATGTTAACTTAGAATTCCTAGCGAC
GTAATAAAAAAATAAGAAAAAAAAAATCCTGGCAACTAAAGTAGATGCATTCGTATAGTT
GATATAAATACCAAAAAATGCAAGTAATTTTGGCTATGTAGAACAAGTTGTATTCTCATC
TGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGTTACTACTCGTAAAGATGCTGCATAATTAT
GTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCG
CGCGATGTAAAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTC
ATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGC
AAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTT
GATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTT
TCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCC
TCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGC
CTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATC

QA 4 713 4 713
DS 

RD RR4AC05JQ 803 0 0
CTTTGTTTTCTAAATATGATATAAAATGAGTGTTTAATATGGTGTATACATGTTAACTTA
GAATTCCTAGCGACGTAATAAAAAAATAAGAAAAAAAAA*TCCTGGCAACTAAAGTAGAT
GCATTCGTATAGTTGATATAAATACCAAAAAATGCAAGTAATTTTGGCTATGTAGAACAA
GTTGTATTCTCATCTGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGTTACTACTCGTAAAGA
TGCTGCATAATTATGTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTG
TGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAAAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTT
TTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTT
GATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCA
CCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTC
CTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTG
ACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTAT
TTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTT
TATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAA
TTAACTCCTTGTAGAGCCAGACG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4AC05TF 768 0 0
TGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGA
TGTAGAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAA
AATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGT
ACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATAT
CTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTC
CGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGC
CTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGCCTTTC
TTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAAC
TCGCGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCA
GACGAAGAGGGCGATCGCCGATGCTCCAAGCCTACCAGAAGCTAAGAACCCCGTGACCAA
GAAACTCGAAGTGATAACCGCCGTTACGAGAATCGGACTAAGAACTAAAAAAA*CCGGCG
TCATAACCATTAACACCACGGCCGTACCGGCAAGTGCTAAACCGGTGAGGATCATGAGAG
GCACGGCGGATATAGCTGCAGCATTAGCTAGCGGTTTATC
ATTTGTCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4EV30TF 720 0 0
TGTATTC
TGTCGCGCGATGTAGAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTAAT
CTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATC
TTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAA
CCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCG
ATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGT
ATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAG
ACGCCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGT
TAGGTCGAACTCGCGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCT
TGTAGAGCCAGACGAAGAGGGCGATCGCCGATGCTCCAAGCCTACCAGAAGCTAAGAACC
CCGTGACCAAGAAACTCGAAGTGATAACCGCCGTTACGAGAATCGGACTAAGAACTAAAA
AAA*CCGGCGTCATAACCATTAACACCACGGCCGTACCGGCAAGTGCTAAACCGGTGAGG
ATCATGAGAGGCACGGCGGATATAGCTGCAGCATTAGCTAGCGGTTTATC
CTC

QA 8 717 8 717
DS 

RD RR4A012TF 860 0 0
TGTAGAACAAGTTGTATTCTCATCTGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGTTACTA
CTCGTAAAGATGCTGCATAATTATGTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGA
AAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAGAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACA
CGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCA
AATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAA
TTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCA
TGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTT
TCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCC
GCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGC
TTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGGGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCT
TCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGAGGGCGATCGCCGATGCTCCAAGC
CTACCAGAAGCTAAGAACCCCGTGACCAAGAAACTCGAAGTGATAACCGCCGTTACGAGA
ATCGGACTA*GAACTAAAAAAAACCGGCGTCATAACCATTAACACCACGGCCGTACCGGC
AAGTGCTAAACCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATATAGCTGCAGCATTAGCTAG
CGGTTTATCATTTGTCCCCT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4A012TFB 738 0 0
ATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAGAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACG
AGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAA
TCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATT
TTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATG
CTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTC
TATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGC
CGTCTTATTTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTT
CGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGGGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCTTC
TTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGAGGGCGATCGCCGATGCTCCAAGCCT
ACCAGAAGCTAAGAACCCCGTGACCAAGAAACTCGAAGTGATAACCGCCGTTACGAGAAT
CGGACTA*GAACTAAAAAAAACCGGCGTCATAACCATTAACACCACGGCCGTACCGGCAA
GTGCTAAACCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATATAGCTGCAGCATTAGCTAGCG
GTTTATCATTTGTCC
CCT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 8

CO CL913Contig1 507 8 20 U
GAAGCTTTGGTCTGTTTTTATTTACGGCATAAGAAACTTCTTTAGTTAACCGGATAAACG
ATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGTTTCATAAACATAGTTCGATAAAATATTATTTA
TCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGATTTTTAGCAAC
TTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACT
GAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGCTTTG
CACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCT
GCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGGAGCCGCAAATG
ATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTCATGACTAGTTAGT
TAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 5 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 

AF RR4BL52JQ U 1
AF RR4BL52TF C 1
AF RR4E414JQ U 27
AF RR4AW74JQ U 48
AF RR4AW74TF C 48
AF RR4E414TF C 27
AF RR4AQ55JQ U 29
AF RR4AQ55TF C 29
BS 1 32 RR4BL52JQ
BS 33 33 RR4E414JQ
BS 34 45 RR4BL52JQ
BS 46 46 RR4E414JQ
BS 47 52 RR4BL52JQ
BS 53 53 RR4E414JQ
BS 54 103 RR4BL52JQ
BS 104 104 RR4E414JQ
BS 105 167 RR4BL52JQ
BS 168 168 RR4E414JQ
BS 169 175 RR4BL52JQ
BS 176 176 RR4E414JQ
BS 177 187 RR4BL52JQ
BS 188 188 RR4E414JQ
BS 189 242 RR4BL52JQ
BS 243 243 RR4E414JQ
BS 244 266 RR4BL52JQ
BS 267 267 RR4E414JQ
BS 268 387 RR4BL52JQ
BS 388 507 RR4E414JQ

RD RR4BL52JQ 387 0 0
GAAGCTTTGGTCTGTTTTTATTTACGGCATAAAAAACTTCTTTAGCTAACCGTATAAACG
ATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGTTTCATAAACATAGTTTGATAAAATATTATTTA
TCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAAATTTTTACCAAC
TTGGATACGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACT
GACCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACACACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGCTTTG
CACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCT
GCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAG

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4BL52TF 507 0 0
GAAGCTTTGGTCTGTTTTTATTTACGGCATAAGAAACTTCTTTAGCTAACCGTATAAACG
ATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGTTTCATAAACATAGTTTGATAAAATATTATTTA
TCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGATTTTTAGCAAC
TTGGATACGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACT
GAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACACACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGCTTTG
CACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCT
GCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGGAGCCGCAAATG
ATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTCATGACTAGTTAGT
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AA
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AAAATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTA
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GAGCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGC
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GGAGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTC
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GAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAATCC
ACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGCTTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCC
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QA 1 479 1 479
DS 



AS 2 8

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CATTTCTATGCATGTATATCGCCAAAGGTCTGGAATACAAAGTAGATATTATTATTTCGG
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AAGCTAACACGAGGTCAAAACCATGAGATATGTAAGAAGATTGTCAAAGGGGGTGGGTGG
TGTCTCTTAGATAACAGTTCCACTAGGAATGAGAGCATCCTTGATCACTGTAACAATGCC
GCTCTTGATGAAGTATCCATCCGTCTCTCTGGCAGCTTCTTGCACATTGTCCGTGTTGAT
GATCTTGACGTTGTCGCCAATACGAGCATTCTTGTCAATGATAGCTCTTTTAATGTGTGA
GTCTCGGCCAATGCCAATCGGAATGCTGCCTTTTGCAGCCAGGAGTGTCCTATCCGCATC
AGTCTCGTAGTAGTCTGCACCCATCAACAAGGTGTCTTCTATGATAGCACCCTCCGATAT
GCAAGACCGAAGACCAATCACGGAATGGTGGATTTTGCAATTCTTGATGACACAACCTTC
ACCGATCACACTGTCGGTAACATCAGCATCAAGCATCTTGGATGGAGGTAAGTACCGAGG
CTGTGTGTAGATTGGTGCTGAACGGTCGTAGAAGCTGAAATCTGGTACTGGTTTCTTGGT
GATCCCAAGATTAGCATTGTAAAACGCCTCAATGGTACCAATGTCTTCCCAATACCCATC
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AACATATC


BQ
10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP53JQ U 1
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AF RR4AB76JQ U 5
AF RR4E273TF C 254
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C

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C

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DS 

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C
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TCTATGCATGTATATCGCCAAAGGTCTAGAATACAAAGTAAATATTATTATTTCGGGATA
AGGGAAGAGGATGAATAGGCCCTGACCGCGGATAACATTACAGATAGCATCAGTGGAAGC
TAACACGAGGTCAAAACCATGAAATATGTAAGAAGATTGTCAAAGGGGGTGGGTGGTGTC
TCTTAAATAACAGTTCCACTAGGAATGAGAGCATCCTTGATCACTGTAACAATGCCGCTC
TTGATGAAGTATCCATCCGTCTCTCTGGCAGCTTCTTGCACATTGTCCGTGTTGATGATC
TTGACGTTGTCGCCAATACGAGCATTCTTGTCAATGATAGCTCTTTTAATGTGTGAGTCT
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GTA

QA 2 768 2 768
DS 

RD RR4AB76JQ 848 0 0
GG
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ACACGAGGTCAAAACCATGAGATATGTAAGAAGATTGTCAAAGGGGGTGGGTGGTGTCTC
TTAGATAACAGTTCCACTAGGAATGAGAGCATCCTTGATCACTGTAACAATGCCGCTCTT
GATGAAGTATCCATCCGTCTCTCCGGCAGCTTCTTGCACATTGTCCGTGTTGATGATCTT
GACGTTGTCGCCAATACGAGCATTCTTGTCAATGATAGCTCTTTTAATGTGTGAGTCTCG
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GTAGTAGTCTGCACCCATCAACAAGGTGTCTTCTATGATAGCACCCTCCGATATGCAAGA
CCGAAGACCAATCACGGAATGGTGGATTTTGCAATTCTTGATGACACAACCTTCACCGAT
CACACTGTCGGTAACATCAGCATCAAGCATCTTGGATGGAGGTAAGTACCGAGGCTGTGT
GTAGATTGGTGCTGAACGGTCGTAGAAGCTGAAATCTGGTACTGGTTTCTTGGTGATCCC
AAGATTAGCATTGTAAAACGCCTCAATGGTACCAATGTCTTCCCAGTATCCATCATACAG
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DS 

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TATCCATCCGTCTCTCTTGCAGCTTCTTGCACATTGTCCGTGTTGATGATCTTGACGTTG
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CCAATCGGAATGCTGCCTTTTGCAGCCAGGAGTGTCCTATCCGCATCAGTCTCGTAGTAG
TCTGCACCCATCAACAAGGTGTCTTCTATGATAGCACCCTCCGATATGCAAGACCGAAGA
CCAATCACGGAATGGTGGATTTTGCAATTCTTGATGACACAACCTTCACCGATCACACTG
TCGGTAACATCAGCATCAAGCATCTTGGATGGAGGTAAGTACCGAGGCTGTGTGTAGATT
GGTGCTGAACGGTCGTAGAAGCTGAAATCTGGTACTGGTTTCTTGGTGATCCCAAGATTA
GCATTGTAAAACGCCTCAATGGTACCAATGTCTTCCCAATACCCATCATACAGATAAGCT
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CCAGGGAACTGGTCTCTAAGCAAGTCCAACATCACATTCTTGCTAACAACATATC

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DS 



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ACAAGTTCTGCATTTCTATGCATGTATATCGCCAAAGATCTAGAATACAAAGTAGAGATT
ATTATTTCGGGATAAGGGAAGAGGATGAATAGGCCCTGACCGCGGATAACATTACAGATA
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GCTCTTAGATAACAGTTCCACTAGGAATGAGAGCATCCTTGATCACTGTAACAATGCCGC
TCTTGATGAAGTATCCATCCGTCTCTCTTGCAGCTTCTTGCACATTGTCCGTGTTGATGA
TCTTGACGTTGTCGCCAATACGAGCATTCTTGTCAATGATAGCTCTTTTAATGTGTGAGT
CTCGGCCAATGCCAATCGGAATGCTGCCTTTTGCAGCCAGGAGTGTCCTATCCGCATCAG
TCTCGTAGTAGTCTGCACCCATCAACAAGGTGTCTTCTATGATAGCACCCTCCGATATGC
AAGACCGAAGACCAATCACGGAATGGTGGATTTTGCAATTCTTGATGACACAACCTTCAC
CGATCACACTGTCGGTAACATCAGCATCAAGCATCTTGGATGGAGGTAAGTACCGAGGCT
GTGTGTAGATTGGTGCTGAACGGTCGTAGAAGCTGAAATCTGGTACTGGTTTCTTGGTGA
TCCCAAGATTAGCATTGTAAAACGCCTCAATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4E273JQ U 1
AF RR4H184JQ U 107
AF RR4H184TF C 107
BS 1 152 RR4E273JQ
BS 153 153 RR4H184JQ
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BS 202 736 RR4E273JQ
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RD RR4E273JQ 736 0 0
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QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4H184JQ 649 0 0
AT
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QA 3 649 3 649
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AT
AAAGTAGAGATTATTATTTCGGGATAAGGGAAGAGGATGAATAGGCCCTGACCGCGGATA
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CCGTGTTGATGATCTTGACGTTGTCGCCAATACGAGCATTCTTGTCAATGATAGCTCTTT
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TATCCGCATCAGTCTCGTAGTAGTCTGCACCCATCAACAAGGTGTCTTCTATGATAGCAC
CCTCCGATATGCAAGACCGAAGACCAATCACGGAATGGTGGATTTTGCAATTCTTGATGA
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GTTTCTTGGTGATCCCAAGATTAGCATTGTAAAACGCCTCAATGGT
C

QA 3 648 3 648
DS 



AS 2 8

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CCATGGGTGACGGTAAAGTGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAA
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CTCCACTCTCTTGTCTCTGTTGTCTCTGCTCTTGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCT
GATTCCCTTCTTCTTCATTCCCTCAACGAACTCATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGC
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TAAACCTGAGACAAGACTTGAGACAGGTCTTTGCCTGCTCTTGCTGTCACAATGGTGTTG
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TGTACAGTACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ34JQ U 65
AF RR4EZ34TF C 65
AF RR4EP19JQ U 1
AF RR4EL40JQ U 19
AF RR4H257JQ U 42
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C
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C

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C
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GGTGACGGTAAAGTGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGA
TGGAACGAGCAAGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCT
CTTGCTTAGTGAACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTC
CATCAACGTTGAGTACGAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGCGTGTAGCTTTCCACCGTTACTG
CGTACTCCATGTACTTCACTGATGGGAAGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCA
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C

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR4EP19JQ 678 0 0
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CCATGGGTGACGGTAAAGTGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAA
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GTCCTTGAAGTATCTAGC

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DS 

RD RR4EL40JQ 725 0 0
C
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GCGTCATCAATGGCACCACCGAATCTAGGGCCAATGGTTAATAAACCTGAGACAAGACTT
GAGA

QA 2 725 2 725
DS 

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GG
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AATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCAAGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCG
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AAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCATCAACGTTGAGTACGAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGC
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TGCACATCTCATGATTTTGTACAGTACGA

QA 3 811 3 811
DS 



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ACAGATCCCGGAGGATCTCAGTTCTGCAATCAAGAGTGGGAAAGTCCGAGCTCCTACTCA
CATTATCTCCACCATTTCTGATGACAGAGGGGAGGAACCATGCTATGCTGGTGTTCCGAT
GTCTTCCATCATCGAACAAGGCTTAGGAGTTGGTGATGTCATCTCCCTTCTATGGTTCAA
ACGTAGCCTTCCTCGTTACTGTACAAAATTCATTGAGATGTGCATAATGCTGTGTGCTGA
TCATGGTCCATGCGTCTCGGGCGCTCACAACACCATTGTGACAGCAAGAGCAGGCAAAGA
CCTTGTCTCAAGTCTTGTCTCAGGTTTATTAACCATTGGCCCTAGATTCGGTGGTGCCAT
TGATGACGCTGCTAGATACTTCAAGGACGCTTGTGACAGGAACCTCACACCTTATGAGTT
CGTTGAGGGAATGAAGAAGAAGGGAATCAGAGTCCCTGGGATGGGACACAGATCAAGAGC
AGAGACAACAGAGACAAGAGAGTGGAGCTGCTCAGAAATTTGCTAGGTCTACTTCTCATC
AGTGAAGTACATGGAGTACGCAGTAACGTGGAAAGCTACACGCTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP19TF U 1
AF RR4H257TF U 151
AF RR4EL40TF U 367
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BS 862 871 RR4H257TF
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RD RR4EP19TF 708 0 0
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TGTCTCCAAATCTGGTGGAATGTCTAATGAAATGTACAATACTGTTGCTCGTGTCACTGA
TGGGATCTATGAAGGGATTGCTATTGGTGGAGACGTGTTCCCTGGATCCACTTCGTCTGA
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TGTTGTTGCTTGGGTCAGTGGGACTTGTGCACGTCTCTTCAAGTCTGAAGTACAGTTTGG
TTACGCGGGTGCTAAAAGTGGTGGCGAGATGGAGTCTGCACAAGCCAAGAATCAAGCTCT
CATGGATGCTGGAGCCATTGTTCCCACTTCATTCGAAGCTCTTGAAGCTGCAATCAAAGA
GACGTTTGAGAAACTGGTTGAAGAAAGAAAGGTCTCTCCAATAAAGGAAGTCACTCCTCC
ACAGATCCCGGAGGATCTCAGTTCTGCAATCAAGAGTGGGAAAGTCCGAGCTCCTACTCA
CATTATCTCCACCATTTCTGATGACAGAGGG*AGGAACCATGCTATGC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4H257TF 721 0 0
G
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GACGTGTTCCCTGGATCCACTTTGTCTGATCACATCCTGAGGTTTAACAACATCCCACAG
ATAAAAATGATGGTGGTACTTGGAGAGCTTGGAGGAAGAGATGAGTACTCTCTTGTTGAG
GCTTTGAAACAGGGGAAAGTGAATAAACCTGTTGTTGCTTGGGTCAGTGGGACTTGTGCA
CGTCTCTTCAAGTCTGAAGTACAGTTTGGTCACGCGGGTGCTAAAAGTGGTGGCGAGATG
GAGTCTGCACAAGCCAAGAATCAAGCTCTCATGGATGCTGGAGCCATTGTTCCCACTTCA
TTCGAAGCTCTTGAAGCTGCAATCAAAGAGACGTTTGAGAAACTGGTTGAAGAAGGAAAG
GTCTCTCCAATAAAGGAAGTCACTCCTCCACAGATCCCGGAGGATCTCAGTTCTGCAATC
AAGAGTGGGAAAGTCCGAGCTCCTACTCACATTATCTCCACCATTTCTGATGACAGAGGG
GAGGAACCATGCTATGCTGGTGTTCCGATGTCTTCCATCATCGAACAAGGCTTAGGAGTT
GGTGATGTCATCTCCCTTCTATGGTTCAAACGTAGCCTTCCTCGTTACTGTACAAA*TTC
ATTGAGATGTGCATAATGCTGTGTGCTGATCATGGTCCATGCGTCTCGG*CGCTCACAAC

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR4EL40TF 821 0 0
G
GCTTGGGTCAGTGGGACTTGTGCACGTCTCTTCAAGTCTGAAGTACAGTTTGGTCACGCG
GGTGCTAAAAGTGGTGGCGAGATGGAGTCTGCACAATCCAAGAATCAAGCTCTCATGGAT
GCTGGAGCCATTGTTCCCACTTCATTCGAAGCTCTTGAAGCTGCAATCAAAGAGACGTTT
GAGAAACTGGTTGAAGAAGGAAAGGTCTCTCCAATAAAGGAAGTCACTCCTCCACAGATC
CCGGAGGATCTCAGTTCTGCAATCAAGAGTGGGAAAGTCCGAGCTCCTACTCACATTATC
TCCACCATTTCTGATGACAGAGGGGAGGAACCATGCTATGCTGGTGTTCCGATGTCTTCC
ATCATCGAACAAGGCTTAGGAGTTGGTGATGTCATCTCCCTTCTATGGTTCAAACGTAGC
CTTCCTCGTTACTGTACAAAATTCATTGAGATGTGCATAATGCTGTGTGCTGATCATGGT
CCATGCGTCTCGGGCGCTCACAACACCATTGTGACAGCAAGAGCAGGCAAAGACCTTGTC
TCAAGTCTTGTCTCAGGTTTATTAACCATTGGCCCTAGATTCGGTGGTGCCATTGATGAC
GCTGCTAGATACTTCAAGGACGCTTGTGACAGGAACCTCACACCTTATGAGTTCGTTGAG
GGAATGAAGAAGAAGGGAATCAGAGTCCCTGGGATGGGACACAGATCAAGAGCAGAGACA
ACAGAGACAAGAGAGTGGAGCTGCTCAGAAATTTGCTAGGTCTACTTCTCATCAGTGAAG
TACATGGAGTACGCAGTAACGTGGAAAGCTACACGCTCTC

QA 2 821 2 821
DS 



AS 1 8

CO CL916Contig1 759 8 11 U
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ATTTCCAAAAGGGGTACCCTGAGATCACAAAGGATTCACATACTATGGGCAAGGGAGTTG
CAGTGTTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACG
GTGCCACCACTGTGACTGGAACTGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATG
TCCATGCCCTTGGTGACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTG
ATGGTAAAACCCACGGTGCACCAGAGGATGCTAATCGTCATGCTGGAGATCTAGGAAACA
TAACTGTTGGGGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTG
ATGGACCTAACTCTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTT*GTCCACGCAGACCC*TGATGACCT
CGGAAAGGGAGGCCATGAACTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAGGAGGTCGTGTT*GCTT
*GTGGTATTATT*GGTC*TTCAGGGCTAAGCTGTTGCTATTCGAGGAAGGGAGTGATTTA
ATAA*GAGG*AGGTTCTTACCTCTAGACCTGGCTAGTTTGTGTATCGTTTGTGTGTGGCT
GTAATCATTGAGTTAGTGGCTCAATACATTTGATTTAAGACAAAAAAAAAA*CAGAGCAA
ACTTTTCTATTTCAATGAATAACAGAGTTGGTTGAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 0 50 50 50 50 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 10 10 10 10 10 

AF RR4GP49TF U 4
AF RR4FO53TF U 1
AF RR4BF05JQ C 5
AF RR4BF05TF U 156
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AF RR4GP49JQ C 48
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AF RR4A534JQ C 345
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RD RR4GP49TF 584 0 0
GG
AACCACAAAGCTAAG*CATTAATTCAGTTCCAGGCATTTCATCTTCATTTCATTCATTTC
CAAAAGGGGTACCCTGAGATCACAAAGGATTCACATACTATGGGCAAGGGAGTTGCAGTG
TTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGAAGGAAACGGTGCC
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GCCCTTGGTGACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGT
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GTTGGGGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGA
CCTAACTCTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTT*GTCCACGCAGACCC*CGATGACCTCGGTA
AGGGAGGCCATGAACTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAGGAGGTCGTGTT*GCTT*GTGG
TATTATT*GGTC*TTCAGG*CTAAGCTGTTGCTATTCGAGGA

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CAGTGTTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACG
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TCCATGCCCTTGGTGACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTG
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G
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CAAAAGGGGTACCCTGAGATCACAAAGGATTCACATACTATGGGCAAGGGAGTTGCAGTG
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ACCACTGTGACTGGAACTGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATGTCCAT
GCCCTTGGTGACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGT
AAAACCCACGGTGCACCAGAGGATGCTAATCGTCATGCTGGAGATCTAGGAAACATAACT
GTTGGGGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGA
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CATTGAGTTAGTGGCTCAATACATTTGATTTAAGACAAGAAAAAA**CAGAGCAAACTTT
TCTATTTCAATGAATAACAGAGTTGGTTG
G

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DS 

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AAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATGTCCATGCCCTTGGTGACACCACTAATGGTTGCATG
TCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGTAAAACCCACGGTGCACCAGAGGATGCTAAT
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ATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGACCTAACTCTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTT
TGTCCACGCAGACCCCTGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCATGAACTCAGCTTGGCTACTG
GAAACGCAGGAGGTCGTGTTTGCTTTGTGGTATTATTTGGTCCTTCAGGGCTAAGCTGTT
GCTATTCAAGGAAGGGAGTGATTTAATAAAGAGGGAGGTTCTTACCTCTAGACCTGGCTA
GTTTGTGTATCGTTTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTAGTGGCTCAATACATTTGATT
TAAGACAAGAAAAA***CAGAGCAAACTTTTCTATTTCAATGAATAACAGAGTTGGTTG
G

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DS 

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TGTTAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACGGTGCCACCACTGTGACTGGAAC
TGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATGTCCATGCCCTTGGTGACACCAC
TAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGTAAAACCCACGGTGCACC
AGAGGATGCTAATCGTCATGCTGGAGATCTAGGAAACATAACTGTTGGGGATGATGGAAC
TGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGACCTAACTCTATTGTGGG
AAGGGCTGTTGTT*GTCCACGCAGACCC*TGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCATGAACTC
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GGGCTAAGCTGTTGCTATT*AAGGAAGGGAGTGATTTAATAA*GAGG*AGGTTTTTACCT
CTAGACCTGGCTAGTTTGTGTATCGTTTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTAGTGGCTC
AATACATTTGATTTAAGACAAAAAAAAAA*CAGAGCAAACTTTTCTATTTCAATGAATAA
CAGAGTTGGTTG

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T
TTCATT*****CATTTCCAAAAGGGGTACCCTGAGATCACAAAGGATTCACATACTATGG
GCAAGGGAGTTGCAGTGTTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACCATCTTCTTCACCC
AGGAAGGAAACGGTGCCACCACTGTGACTGGAACTGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCC
ATGGTTTCCATGTCCATGCCCTTGGTGACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGC
ATTTCAACCCTGATGGTAAAACCCACGGTGCACCAGAGGATGCTAATCGTCATGCTGGAG
ATCTAGGAAACATAACTGTTGGGGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCC
AGATACCTCTTGATGGACCTAACTCTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTT*GTCCACGCAGAC
CC*CGATGACCTCGGTAAGGGAGGCCATGAACTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAGGAGG
TCGTGTT*GCTT*GTGGTATTATT*GGTC*TTCAGGGCTAAGCTGTTGCTATTCGAGGAA
GAGAGTGATGTAATAA***GG*AGGTTCTTACCTCTAGACCTGGCTAGTTTGTGTATCGT
TTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTAGTGGCTCAATACATTTGATTTAAGACAAAAAAA
AAA*CAGAGCAAACTTTTCTATTTCAATGAATAACAGAGTTGGT
GG

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DS 

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GG
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GCGAGGGTGTTAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGAAGGAAACGGTGCCACCACTATGA
CTGGAACTGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATGTCCATGCCCTTGGTG
ACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGTAAAACCCACG
GTGCACCAGAGGATGCTAATCGTCATGCTGGAGATCTAGGAAACATAACTGTTGGGGATG
ATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGACCTAACTCTA
TTGTGGGAAGGGCTGTTGTT*GTCCACGCAGACCC*TGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCA
TGAACTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAGGAGGTCGTGTT*GCTT*GTGGTATTATT*GG
TC*TTCAGGGCTAAGCTGTTGCTATTCGAGGAAGAGAGTGATGTAATAA***GG*AGGTT
CTTACCTCTAGACCTGGCTAGTTTGTGTATCGTTTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTA
GTGGCTCAATACATTTGATTTAAGACAAAAAAAAAAACAGAGCAAACTTTTCTATTTCAA
TGAATAACAGAGTTGGTTG
AAAAC

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DS 

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AGCCAGATACCTCTTGATGGACCTAACTTTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTT*GTCCACGC
AGACCC*TGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCATGAATTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAG
GAGGTCGTGTT*GCTT*GTGGTATTATT*GGTC*TTCAGGGTTAAGCTGTTGCTATTCGA
GGAAGAGAGTGATGTAATAA***GG*AGGTTCTTACCTCTAGACCTGGCTAGTTTGTGTA
TCGTTTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTAGTGGCTCAATACATTTGATTTAAGACAAA
AAAAAAAACAGAGCAAACTTTTCTATTTCAATGAATAACAGAGTTGGTTGAAAAC

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DS 



AS 2 6

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GAACAGAGTAAAAGCAGAGGATCTGAATCTCAATCACAGTATATGATATGAAAAGAACAG
AACAAAAATAAACAAAAAAACAGAGGATCTGATCTCAGTAGTCATCTCCCTTGGACACAA
CTTCCTTGCAAGTCGGTCGGAGTAAGATGGTGTGCTCGTACTGTGATACATAGCTTCCCT
TCACATCACATAGAGGAGGACGGCTGAACAATGCCAGCATCGCACAGGTTCTTTAAAGCC
ATCAAGTATTTGGTTTCACCAATGCGGTCCAAGTACCTTCTGCAGAAGGCTAGAGTCGAA
AAATTGTTGTTGATGGTGGCAAGGAGTTGTTTTGCTCTAGGCAACCTCAAGGGGGCATGG
CCAGCGTCAAAGTTCTTCATGTAGTGGCTGCATTCCAAGTCTTCTCTCACAAATCCTTTC
CCAGTTGATCCGAATGTTTCAATGGCATAAAATTCTCCCTCTTCCATCTTTGTCTGTTCG
CCTCCTTTAACAATTGGAACGGATTTCCCGCATGTATCTGATATGGTCCGATGCTATGCC
CATTCAAGTTCCGGATACTTTTAACTGGGAAGACCTTTCCATTGATTTCAACTTTATACG
ACTCCATGACCTCCTGAATGGCAGCACCAATATCGCAGAGACGAACATCGATACCAGCTT
CCTTGATACCGGTATACGTAGCTTCACGGGAAGCTGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E649TF C 1
AF RR4E649JQ U 2
BS 1 18 RR4E649TF
BS 19 736 RR4E649JQ
BS 737 758 RR4E649TF

RD RR4E649TF 758 0 0
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AAATTGTTGTTGATGGTGGCAAGGAGTTGTTTTGCTCTAGGCAACCTCAAGGGGGCATGG
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CATTCAAGTTCCGGATACTTTTAACTGGGAAGACCTTTCCATTGATTTCAACTTTATACG
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CCTTGATACCGGTATACGTAGCTTCACGGGAAGCTGCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4E649JQ 738 0 0
GAAAAAAACAAGCAGTG
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GGATCTGAATCTCAATCACAGTATATGATATGAAAAGAACAGAACAAAAATAAACAAAAA
AACAGAGGATCTGATCTCAGTAGTCATCTCCCTTGGACACAACTTCCTTGCAAGTCGGTC
GGAGTAAGATGGTGTGCTCGTACTGTGATACATAGCTTCCCTTCACATCACATAGAGGAG
GACGGCTGAACAATGCCAGCATCGCACAGGTTCTTTAAAGCCATCAAGTATTTGGTTTCA
CCAATGCGGTCCAAGTACCTTCTGCAGAAGGCTAGAGTCGAAAAATTGTTGTTGATGGTG
GCAAGGAGTTGTTTTGCTCTAGGCAACCTCAAGGGGGCATGGCCAGCGTCAAAGTTCTTC
ATGTAGTGGCTGCATTCCAAGTCTTCTCTCACAAATCCTTTCCCAGTTGATCCGAATGTT
TCAATGGCATAAAATTCTCCCTCTTCCATCTTTGTCTGTTCGCCTCCTTTAACAATTGGA
ACGGATTTCCCGCATGTATCTGATATGGTCCGATGCTATGCCCATTCAAGTTCCGGATAC
TTTTAACTGGGAAGACCTTTCCATTGATTTCAACTTTATACGACTCCATGACCTCCTGAA
TGGCAGCACCAATATCGCAGAGACGAACATCGATACCAGCTTCCTTGATACCGGTATA
CGT

QA 18 735 18 735
DS 



CO CL917Contig2 933 4 3 U
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TTGTTGACTGTGCATTTACAGTTGCGTTCAATCCTATGTATGATCCTCTCTTAGCAGCCT
CTCGTGAAGCTACTTATACCGGTATCAAGGAAGCTGGTATTGATGTTCGTCTCTGCGATA
TTGGTGCTGCCATTCAGGAGGTCATGGAGTCATATGAAGTTGAAATCAATGGAAAGGTCT
TCCCAGTTAAAAGTATCCGAAACTTGAATGGGCATAGCATCGGACCGTATCAGATACATG
CTGGTAAATCCGTTCCAATTGTTAAAGGAGGCGGGCAGACAAAGATGGAAGAAGGAGAAT
TTTATGCCATTGAAACATTCGGATCAACTGGGAAAGGATTTGTGAGAGAAGACTTGGAAT
GCAGCCACTACATGAAGAACTTCGATGCTGGTCATGTCCCCTTGAGGTTGCCTAGGGCAA
AACAACTCCTCGCCACCATCAACAACAACTTCTCGACTCTAGCCTTCTGCAGAAGGTACT
TGGACCGCATTGGTGAAACCAAATACTTGATGGCTCTAAAGAACCTGTGCGATGCTGGCA
TTGTTCAGCCGTATCCACCTCTATGTGATGTGAAGGGAAGCTATGTATCTCAGTATGAGC
ACACAATCTTACTCCGACCGACTTGCAAGGAAGTTGTGTCCAAGGGAGATGACTACTGAG
TCATCAGTTCCTCTGTGGTTTTTTTTGGTTCTGTTCTTTTCTTTCATATCATATGTTTTG
TGATTGAGATTCAGATCCTCTGTTTTTTACTCTGGTTTTTCATATCATATACTGTTCTTG
AGAGTTGAGATTGTAGTTGTACACTGCTTGTTTTTTTTTCTGGTCGTTAAAACACATCTG
TGAATCACTTTTATAAAGCTTCAATGTCTGTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GY72TF U 1
AF RR4H148TF U 1
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AF RR4GY72JQ C 189
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TTGTT

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TTTATGCCATTGAAACATTCGGATCAACTGGGAAAGGATTTGTGAGAGAAGACTTGGAAT
GCAGCCACTACATGAAGAACTTCGATGCTGGTCATGTCCCCTTGAGGTTGCCTAGGGCAA
AACAACTCCTCGCCACCATCAACAACAACTTCTCGACTCTAGCCTTCTGCAGAAGGTACT
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DS 



AS 1 7

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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DS 

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C

QA 7 727 7 727
DS 

RD RR4BG68TF 700 0 0
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GCAGTAAACAAATCTTTAACTGCAACAAGGATTCGCCGGTTTAGTCCACTTGTTTGACCT
TTTCCTCACATCAATCGTTGATATTAAAAGCTTTCATGCCTCCTCCAGATGTTAATTTCA
GTGAACAGCTTCATAAAAGTTTGAGGAAGAGACTTTGTTGAAACACTTCTCTGTATGAGA
AGCTTCAACTTTACTGAGTCCTCTAAAACTTCGAAGATTAATCAAATAACTCACAGACAT
AGTTTGATCGGATACTCTGCCCAAAGGCCTTATGGCCAATACTTTTGAAAAGGCAAAGAT
TGACTCCTTCCAAACTCTAGCCTTGAGAATGACCGGAAGAAAACATTGATTCTCTAAATA
ACCAACGAGATTTAAGAAAATTGAAGATCAGAGGAAAAGGGAAGGATTAACTTTACTAAA
AAAGACATCAAAACATCGCCTTGCAAAACATAGATCCGCTACCGGAAACTTTAAATCGAT
CTAAAAGATCGAAAATATTATACATAAACAGAACATAAAC

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DS 

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AAAGGG
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GCAATATATTGATAAGTTCAAAACACGTGTTTGGATCCTGAACTTGCATGCTCCTCCACG
TGTCACGATAAGAATTTGTTGAGGAACGAGCCGCTGCTTGGTGTTGCCGGAGATCTCACA
GATATTCTTCTACTCTTTGAAGCAGTAAACAAATCTTTAACTGCAACAAGGATTCGCCGG
TTTAGTCCACTTGTTTGACCTTTTCCTCACATCAATCGTTGATATTAAAAGCTTTCATGC
CTCCTCCAGATGTTAATTTCAGTGAACAGCTTCATAAAAGTTTGAGGAAGAGACTTTGTT
GAAACACTTCTCTGTATGAAAAGCTTCAACTTTACTGAGTCCTCTAAAACTTCGAAGATT
AATCAAATAACTCACAGACATAGTTTGATCGGATACTCTGCCCAAAGGCCTTATGGCCAA
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AAAACATTGATTCTCTAAATAACCAACGAGATTTAAGAAAATTGAAGATCAGAGGAAAAG
GGAAGGATTAACTTTACTAAAAAAGACATCAAAACATCGCCTTGCAAAACATAGATCCGC
TACCGGAAACTTTAAATCGATCTAAAAGATCGAAAATATTATACATAAACAGAACATAAA
C

QA 7 727 7 727
DS 

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ACATAAACCAATTACAACAAGCCCATTCAAGCCCATCAATATATTGATAAGTTCAAAACA
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ACGAGCCGCATCTTGGTGTTGCCGGAGATCTCACCGATCTTCTTCTACTCTTTGAAGCAG
TAAACAAATCTTTGACTGCAGCAAGGATTCGCCGGTTTAGTCCACTTGTTTGACCTTTTC
CTCACATCAATCGTTGATATTAAAAGCTTTCATGCTTCCTCCAGATGTTAATTTCAGTGA
ACAGCTTCATAAAAGTTTGAGAAAGAGACTTTGTTGAAACACTTCTCTGTATGAGAAGCT
TCAACTCTACTGAGTCCTCTAAAACTTCGAAGATTAATCAAATAACTC**AGACATAGTT
TGATCGGATACTCTGCCCAAAGGCCTTATGGCCAATACTTTTCAAAAGGCAAAGATTGAC
TCCTTCCAAACTCTAGCCTTGAGAATGACCGGAAGAAAACATTGATTCTCTAAATAACCA
ATGAGATTTAAGAAAATTGAAGATCAGAGGAAAAGGGAAGGAACAACTTTACTAAAAAAG
ACAACAAAATATCGCCTTGCGAAACATAGATCCGCTACCGGAAACTTTAAATCGATCCAA
AAGATCGAAAATATTATACATAAACAGAACATAAACAAAAAGGAGGTGGCGACCGGCGGC
GAGATGCCAACCGGCCACTGGAAACAATATCTCTTTTGAGGAACTAGAGAGAAGTTAGAG
TGTTTAGAGAGAGAGAGAGA
TTATAAATC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4AR49TF 696 0 0
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AAGCAGTAAACAAATCTTTGACTGCAGCAAGGATTCGCCGGTTTAGTCCACTTGTTTGAC
CTTTTCCTCACATCAATCGTTGATATTAAAAGCTTTCATGCTTCCTCCAGATGTTAATTT
CAGTGAACAGCTTCATAAAAGTTTGAGAAAGAGACTTTGTTGAAACACTTCTCTGTATGA
GAAGCTTCAACTCTACTGAGTCCTCTAAAACTTCGAAGATTAATCAAATAACTC**AGAC
ATAGTTTGATCGGATACTCTGCCCAAAGGCCTTATGGCCAATACTTTTCAAAAGGCAAAG
ATTGACTCCTTCCAAACTCTAGCCTTGAGAATGACCGGAAGAAAACATTGATTCTCTAAA
TAACCAATGAGATTTAAGAAAATTGAAGATCAGAGGAAAAGGGAAGGAACAACTTTACTA
AAAAAGACAACAAAATATCGCCTTGCGAAACATAGATCCGCTACCGGAAACTTTAAATCG
ATCCAAAAGATCGAAAATATTATACATAAACAGAACATAAACAAAAAGGAGGTGGCGACC
GGCGGCGAGATGCCAACCGGCCACTGGAAACAATATCTCTTTTGAGGAACTAGAGAGAAG
TTAGAGTGTTTAGAGAGAGAGAGAGATTATAAATCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 2 8

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GGAGACACTCTCTCTCTATCTTCGTGGTTCGGCATAACTCGTCCTCCACCAACAAGTCTG
TCTTTCTGTTTCTCTTATCAGATCTCTTCGTTACTTGTGTAACCAAAGAATCAATGGCTC
TCAAGTTCGCCTCTGGAGCTATTTTCTTTCTACTCACAATATTTCCTTCTTTCTCGTCAT
CCAGTTTCATTTCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCTTTAGTTAATGGAA**AACCTAC
TTCAGACCAAGAAAACATGTCCGGTGAACTTTGAATTTATGAACTACACAATCATAACAA
GCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTTT
CGTGTCCTTACACCGATGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCTACCACTATGTTCA
GTTACACCAACCTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAA
GTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCCGCAGACGTAAACGCAG
CCATCACCACCGCTTCTTCTCCACTTTGGCTGACCATTTTTGCAGCTTT*CTTGGTTTTT
GTTAAATTGTTATGAGGCCATGAAAGCTATTGCAATGTACTAGTAACAACCTGAGGAAGG
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CTTCAAAACCTTGTAATTGATAATCCATATGAATTTTGTGTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4E578TF U 35
AF RR4B318TF U 1
AF RR4E578JQ C 50
AF RR4B318JQ C 513
BS 1 129 RR4B318TF
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BS 131 231 RR4B318TF
BS 232 233 RR4E578TF
BS 234 288 RR4B318TF
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BS 290 293 RR4B318TF
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BS 360 360 RR4E578TF
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BS 395 426 RR4B318TF
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RD RR4E578TF 622 0 0
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QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4B318TF 766 0 0
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CC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4E578JQ 703 0 0
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TTTCTCGTCATCCAGTTTCATTTCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCTTTAGTTAATGG
AA**AACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCGGTGAACTTTGAATTTATGAACTACAC
AATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTT
TTTGGACTTTTCGTGTCCTTACACCGATGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCTAC
CACTATGTTCAGTTACACCAACCTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCA
GTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCCGCAGA
CGTAAACGCAGCCATCGCCACCGCTTCTTCTCCACTTTGGCTGACCATTTTTGCAGCTTT
*CTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCCATGAAAGCTATTGCAATGTACTAGTAACAA
CCTGAGGAAGGGTGTGTGTTTGTGTGCCCCACGATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTG
ATCTTAGGAAACTTCAAAACCTTGTAATTGATAATCCATATG
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4B318JQ 254 0 0
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CAATGTACTAGTAACAACCTGAGGAAGGGTGTGTGTTTGTGTGCCCCCCGATTTGTTTTA
TTTGTATCATTCTTTTGATTTTAGGAAACTTCAAAACCTTGTAATTGATAATCCATATGA
ATTTTGTGTGTCCC

QA 1 254 1 254
DS 



CO CL919Contig2 688 4 7 U
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TTTTCTTTCTACTCACAATATTTCCTTCTTTCTCGTCATCCAGTTTCATTTCAGATGGCG
TGTTCGGATCTCAGGCTTTAGTTAATGGAAGAAACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTC
CGGTGAACTTTGAATTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAAT
TCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTACACCGATGAGC
TCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCTACTACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGGA
AATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCC
CTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTTCTTCTC
CTCTTTGGCTGACCGTTTTTGCAGCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCCAAG
AAAGCCAGATATCTGCAATGTACTTGTAACAACCTGAGGAAGGGAGTGTTTGTCTGCCTC
ACTATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTGATCTTAGGAAACTTCAAAACCTTCTAATTG
ATAATCCATATGACTTTTGTGTGTCTCT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4CR88JQ C 1
AF RR4C234TF U 22
AF RR4CR88TF U 1
AF RR4C234JQ C 22
BS 1 2 RR4CR88JQ
BS 3 494 RR4CR88TF
BS 495 495 RR4C234TF
BS 496 602 RR4CR88TF
BS 603 603 RR4C234TF
BS 604 685 RR4CR88TF
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RD RR4CR88JQ 476 0 0
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TTTTCTTTCTACTCACAATATTTCCTTCTTTCTCGTCATCCAGTTTCATTTCAGATGGCG
TGTTCGGATCTCAGGCTTTAGTTAATGGAAGAAACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTC
CGGTGAACTTTGAATTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAAT
TCCCACCAAAGGAATGCTGTTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTACACCGATGAGC
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AATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCC
CTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTT
TT

QA 1 474 1 474
DS 

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GG
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AACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCT
GCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTTCTTCTCCTCTTTGGCTGACCGTTTTTGCA
GCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCCAAGAAAGCCAGATATCTGCAATGTAC
TTGTAACAACCTGAGGAAGGGAGTGTTTGTCTGCCTCACTATTTGTTTTATTTGTATCAT
TCTTTTGATC

QA 3 612 3 612
DS 

RD RR4CR88TF 686 0 0
GG
CTCTTCGTTACTTGTGTAACCAAAGAATCAATGGCTCTCAAGTTCGTCTCTGGAGCTATT
TTCTTTCTACTCACAATATTTCCTTCTTTCTCGTCATCCAGTTTCATTTCAGATGGCGTG
TTCGGATCTCAGGCTTTAGTTAATGGAAGAAACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCG
GTGAACTTTGAATTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTC
CCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTACACCGATGAGCTC
AACGACCTGAGCAATGACTGTGCTACTACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGGAAA
TACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCT
GCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTTCTTCTCCT
CTTTGGCTGACCATTTTTGCAGCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCCAAGAA
AGCCAGATATCTGCAATGTACTTGTAACAACCTGAGGAAGGGAGTGTTTGTCTGCCTCAC
GATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTGATCTTAGGAAACTTCAAAACCTTCTAATTGAT
AATCCATATGACTTTTGTGTGTC
C

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR4C234JQ 667 0 0
GG
AAAGAATCAATGGCTCTCAAGTTCGTCTCTGGAGCTATTTTCTTTCTACTCACAATATTT
CCTTCTTTCTCGTCATCCAGTTTCATTTCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCTTTAGTT
AATGGAAGAAACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCGGTGAACTTTGAATTTATGAAC
TACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCC
GCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTACACCGATGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGT
GCTACTACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCT
AACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCT
GCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTTCTTCTCCTCTTTGGCTGACCGTTTTTGCA
GCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCCAAGAAAGCCAGATATCTGCAATGTAC
TTGTAACAACCTGAGGAAGGGAGTGTTTGTCTGCCTCACTATTTGTTTTATTTGTATCAT
TCTTTTGATCTTAGGAAACTTCAAAACCTTCTAATTGATAATCCATATGACTTTTGTGTG
TCTCT

QA 3 667 3 667
DS 



AS 2 8

CO CL920Contig1 732 2 2 U
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TGCACTGGTATGTAGGTGAAGGAATGGAGGAAGGTGAGTTCTCAGAGGCACGTGAGGACT
TGGCGGCATTGGAGAAAGATTATGAAGAAGTGGGTGCTGAAGGTGGAGACGATGAAGAAG
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CCTTTTGTGTTTCTTTATCGTTGGTTTAATTCATTGGTAGAGTGAGCATTGTGAGTTCCA
GAGTTTATCACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B710JQ C 1
AF RR4B710TF U 1
BS 1 1 RR4B710JQ
BS 2 732 RR4B710TF

RD RR4B710JQ 732 0 0
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TGCACTGGTATGTAGGTGAAGGAATGGAGGAAGGTGAGTTCTCAGAGGCACGTGAGGACT
TGGCGGCATTGGAGAAAGATTATGAAGAAGTGGGTGCTGAAGGTGGAGACGATGAAGAAG
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GAGTTTATCACC

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DS 

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G
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TGACCCGAGGCATGGGAAATACATGGCTTGTTGTTTGATGTACCGTGGAGATGTTGTTCC
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CTGGTGCCCAACAGGGTTCAAATGTGGAATCAACTACCAACCTCCAACAGTTGTTCCGGG
AGGTGACCTCGCTAAGGTTCAGAGAGCTGTATGCACGATCAGCAACAACACAGCAGTTGC
AGAGGTGTTCTCAAGGATCGATCACAAGTTCGATCTGATGTATGCGAAGAGGGCGTTTGT
GCACTGGTATGTAGGTGAAGGAATGGAGGAAGGTGAGTTCTCAGAGGCACGTGAGGACTT
GGCGGCATTGGAGAAAGATTATGAAGAAGTGGGTGCTGAAGGTGGAGACGATGAAGAAGA
TGAAGGTGAAGACTACTGACACCTTCTTCTATCAAGCAATGTGTTTTTATCTTTTTGGCT
TTGCTTAAGATTCTTGTTGATTACTTGTGTTTGTTTTAATCCTCGTTGAACTTTCTCCGC
CTTTTGTGTTTCTTTATCGTTGGTTTAATTCATTGGTAGAGTGAGCATTGTGAGTTCCAG
AGTTTATCACC

QA 2 732 2 732
DS 



CO CL920Contig2 834 6 12 U
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TCTTCTTCATCATCTCCACCTTCAGCACCCACTTCTTCATAATCTTTCTCCAATGCCGCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DF19JQ U 1
AF RR4AJ01JQ U 212
AF RR4A673JQ U 215
AF RR4A673TF C 54
AF RR4EX66TF C 117
AF RR4AJ01TF C 191
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BS 98 206 RR4DF19JQ
BS 207 207 RR4A673TF
BS 208 236 RR4DF19JQ
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BS 238 572 RR4DF19JQ
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BS 574 585 RR4DF19JQ
BS 586 683 RR4AJ01JQ
BS 684 724 RR4A673JQ
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RD RR4DF19JQ 585 0 0
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ATTGAACCAAAATAAAAAACAGGACGGCGGTGGAGAGTGTGCAAACGTAAATTGTACAGG
ATTAAAAAAAGAAACATGTAATCAACAAGAATCACAAGTAGAAACATAATTTTGAAAATA
AAACTTTTTTGGTTGCACACTGATTCGGAGTAGAAAGGTGGTCAGTAGTCTTCACCCTCA
TCTTCTTCATCATCTCCACCTTCAGCACCCACTTCTTCATAATCTTTCTCCAATGCCGCC
AAGTCCTCACGTGCCTCTGAGAACTCACCTTCCTCCATTCCTTCACCGACGTACCAGTGC
ACAAACGCCCTCTTCGCGTACATCAGATCAAACTTGTGGTCGATCCTTGAGAACACCTCT
GCAACTGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCATACAGCTCTCTGAACCTTAGCGAGGTCACCT
CCCGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAGTTGATTCCACATTTGAACCCTGTTGGGCACCAG
TCAACAAACTGAACGGTCCTTTTAGTCTTGATGGTACCAACAGCA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4AJ01JQ 472 0 0
AA
AAAGGTGGTCAGTAGTCTTCACCTTCATCTTCTTCATCATCTCCACCTTCAGCACCCACT
TCTTCATAATCTTTCTCCAATGCCGCCAAGTCCTCACGTGCCTCTGAAAACTCACCTTCC
TCCATTCCTTCACCGACGTACCAGTGCACAAACGCCCTCTTCGCGTACATCAAATCAAAC
TTGTGGTCGATCCTTGAGAACACCTCTGCAACTGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCATACA
GCTCTCTGAACCTTAACGAGGTCACCTCCCGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAGTTGATT
CCACATTTGAACCCTGTTGGGCACCAGTCAACAAACTGAACGGTCCTTTTAGTCTTGATA
GTACCAACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCTCCACGGTACATCAAACAACAA
GCCATATACTTCCCATGCCTCGGGTCACACTTAGCCATCATGCTAGCTGG

QA 3 472 3 472
DS 

RD RR4A673JQ 510 0 0
AAGGGGGTCAGTAGTCTTCACCTTCATCTTCTTCATCATCTCCACCTTCAGCACCCACTT
CTTCATAATCTTTCTCCAATGCCGCCAAGTCCTCACGTGCCTCTGAAAACTCACCTTCCT
CCATTCCTTCACCGACGTACCAGTGCACAAACGCCCTCTTCGCGTACATCAAATCAAACT
TGTGGTCGATCCTTGAGAACACCTCTGCAACTGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCATACAG
CTCTCTGAACCTTAACGAGGTCACCTCCCGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAGTTGATTC
CACATTTGAACCCTGTTGGGCACCAGTCAACAAACTGAACGGTCCTTTTAGTCTTGATAG
TACCAACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCTCCACGGTACATCAAACAACAAG
CCATATACTTCCCATGCCTCGGGTCACACTTAGCCATCATGCTAGCTGGCTCAAACACGG
CGTTAGTGATCTCAGGGACTGATAGCTGCT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4A673TF 781 0 0
CCAATGAATTGAACCAAAATAAAAAACAGGACGGCGGTGGAGAATGTGCAAACGTAAATT
GTACAGGATTAAAAAAAGAAACATGTAATCAACAAGAATCACAAGTAGAAACATAATTTT
GAAAATAAAACTTTTTTGGTTGCACACTGATTCAGAGTAGAAAGGTGGTCAGTAGTCTTC
ACCTTCATCTTCTTCATCATCTCCACCTTCAGCACCCACTTCTTCATAATCTTTCTCCAA
TGCCGCCAAGTCCTCACGTGCCTCTGAGAACTCACCTTCCTCCATTCCTTCACCGACGTA
CCAGTGCACAAACGCCCTCTTCGCGTACATCAGATCAAACTTGTGGTCGATCCTTGAGAA
CACCTCTGCAACTGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCATACAGCTCTCTGAACCTTAGCGAG
GTCACCTCCCGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAGTTGATTCCACATTTGAACCCTGTTGG
GCACCAGTCAACAAACTGAACGGTCCTTTTAGTCTTGATAGTACCAACAGCAGCATTAAC
ATCTTTAGGAACAACATCTCCACGGTACATCAAACAACAAGCCATATACTTCCCATGCCT
CGGGTCACACTTAGCCATCATGCTAGCTGGCTCAAACACGGCGTTAGTGATCTCAGGGAC
TGATAGCTGCTCATGGTAAGCCTTTGCAGCTGAGATGACTGGCGCATAAGAGGAAAGCAT
GAAATGGATGCAGGATAGGGAACAAGGTTGGTCTGGAACTCAGTGATATCCACGTTGATG
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4EX66TF 680 0 0
ACA
GATTAAAAAAAGAAACATGTAATCAACAAGAATCACAAGTAGAAACATAATTTTGAAAAT
CAAACTTTTTTGGTTGCAC******TCAGAGTAGAAAGGTG*TCAGTAGTCTTCACCTTC
ATCTTCTTCATCATCTCCACCTTCAGCACCCACTTCTTCATAATCTTTCTCCAATGCCGC
CAAGTCCTCACGTGCCTCTGAGAACTCACCTTCCTCCATACCTTCAACAACGTACCAGTG
CACAAACGCCCTCTTCGCGTACATCAGATCAAACTTGTGGTCGATCCTTGAGAACACCTC
TGCAACTGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCACACTGCTCTCTGAACCTTAGCGAGGTCACC
TCCCGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAGTTGATTCCACATTTGAACCCTGTTGGGCACCA
GTCAACAAACTGAACGGTCCTATTAGTCTTGATAATACCAACAGCAGCATTAACATCTTT
AGGAACAACATCTCCACGGTACATCAAACAACAAGCCATATACTTCCCATGCCTCGGGTC
ACACTTAGCCATCATGCTAGCTGGCTCAAACACGGCGTTAGTGATCTCAGGGACTGATAG
CTGCTCATGGTAAGCCTCTGCAGCTGAGATGACTGGCGCATAAGAGGAAAGCATGAAATG
GATGC
GAGGATAGAGAA

QA 4 668 4 668
DS 

RD RR4AJ01TF 644 0 0
GGTTGCACACTGAT
TCAGAGTAGAAAGGTGGTCAGTAGTCTTCACCTTCATCTTCTTCATCATCTCCACCTTCA
GCACCCACTTCTTCATAATCTTTCTCCAATGCCGCCAAGTCCTCACGTGCCTCTGAGAAC
TCACCTTCCTCCATTCCTTCACCGACGTACCAGTGCACAAACGCCCTCTTCGCGTACATC
AGATCAAACTTGTGGTCGATCCTTGAGAACACCTCTGCAACTGCTGTGTTGTTGCTGATC
ATGCATACAGCTCTCTGAACCTTAGCGAGGTCACCTCCCGGAACAACTGTTGGAGGTTGG
TAGTTGATTCCACATTTGAACCCTGTTGGGCACCAGTCAACAAACTGAACGGTCCTTTTA
GTCTTGATAGTACCAACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCTCCACGGTACATC
AAACAACAAGCCATATACTTCCCATGCCTCGGGTCACACTTAGCCATCATGCTAGCTGGC
TCAAACACGGCGTTAGTGATCTCAGGGACTGATAGCTGCTCATGGTAAGCCTTTGCAGCT
GAGATGACTGGCGCATAAGAGGAAAGCATGAAATGGATGCAGGATAGGGAACAAGGTTGG
TCTGGAACTCAGTGATATCCACGTTGATGC

QA 15 644 15 644
DS 



AS 2 8

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GGGAATCATCCTCTTTTGAAACCTAAATTAAATTCGATTCGAGACGGAAAAGCTCGACGA
GTCGCCGGCGGCGGAGTAAAACAAAAACAGTCGGAGCTATGGCGATGCAAACCGGAATCG
GCTTATCCAGGATCTTTCTCTTAGCCGGAGCAGGTTATACGGGTACGATCATGATGAAGA
ACGGCAAATTATCTGATATATTGGGTGAATTACAGTCTCTGGTGAAAGGTATGGAGAGAT
CTGGAGATGAGGGAGATTCTGATGTCTCCGATGCTATAGCTGCTCAGGTTCGTCGGTTGG
CTATGGAGGTTCGACAGCTAGCTTCAGCAAGGCAGATAACCGTCATGAATGGAGTTTCTG
GTGCAAACTTACAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGCGGCATTGGGAGCTTTAGGATATGGTT
ATATGTGGTGGAAGGGACTCTCTTTCACTGACCTTATGTATGTGACAAAAGCCAACATGG
CTACTGCCGTGGCTAACTTGACTAAGAATCTGGAGCAAGTTTCAGCCACCCTTGCGGCTG
CAAAAAGGCATTTAACGCAAAAGATTCAGAATATGGATGATAAGGTAGAGCAGCAGATTG
ATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACTAGGTCACCTTGGCTCGTGGGATATCAACTCGCTTGA
GAGTGAGTTGCAGTCATTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGACACGCT
GGAATACAAGCAGGATGTTACAAATGTTTGCATGCGACACTTGTATAACTATTTTGGGGG
CAAGAGCACAAAACTACCTGACATGGAGCAGCTTCAACTTCCTGTAAACCAGAAAGCTCG
TAATTTGCTTGGAGATGTTGGAACCAAGGGTTTGAAAAACTTTGCTGAACAACTGCTTAT
AAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTTAGAAGAATTGGTATAGCCAAGGCCAA
TGACAAGTTTAGGCCGGTCTTATCAAGGGTCACTTCAGCTGGGTGTTGATGTGGAAATTT
CCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTTATACAAAATTGTCT
CGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATTTATATTCGTTGGCTTGGTTTCTCTCCT
CCCCTCTAAACTATGTTGGTTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAGTTTGTTT
ATTGGCATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTGAAGCAAATAAAATAAAGT
TGATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ96TF U 1
AF RR4BQ96JQ C 538
BS 1 738 RR4BQ96TF
BS 739 739 RR4BQ96JQ
BS 740 767 RR4BQ96TF
BS 768 1267 RR4BQ96JQ

RD RR4BQ96TF 772 0 0
GGGAATCATCCTCTTTTGAAACCTAAATTAAATTCGATTCGAGACGGAAAAGCTCGACGA
GTCGCCGGCGGCGGAGTAAAACAAAAACAGTCGGAGCTATGGCGATGCAAACCGGAATCG
GCTTATCCAGGATCTTTCTCTTAGCCGGAGCAGGTTATACGGGTACGATCATGATGAAGA
ACGGCAAATTATCTGATATATTGGGTGAATTACAGTCTCTGGTGAAAGGTATGGAGAGAT
CTGGAGATGAGGGAGATTCTGATGTCTCCGATGCTATAGCTGCTCAGGTTCGTCGGTTGG
CTATGGAGGTTCGACAGCTAGCTTCAGCAAGGCAGATAACCGTCATGAATGGAGTTTCTG
GTGCAAACTTACAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGCGGCATTGGGAGCTTTAGGATATGGTT
ATATGTGGTGGAAGGGACTCTCTTTCACTGACCTTATGTATGTGACAAAAGCCAACATGG
CTACTGCCGTGGCTAACTTGACTAAGAATCTGGAGCAAGTTTCAGCCACCCTTGCGGCTG
CAAAAAGGCATTTAACGCAAAAGATTCAGAATATGGATGATAAGGTAGAGCAGCAGATTG
ATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACTAGGTCACCTTGGCTCGTGGGATATCAACTCGCTTGA
GAGTGAGTTGCAGTCATTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGACACGCT
GGAATACAAGCAGGATGT*ACAAATGTTTGCATGCGACACTTGTATA
CTATT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BQ96JQ 730 0 0
CTGCAAAAAGGCATTTAACGCAAAAGATTCAGAATATGGATGATAAGGTAGAGCAGCAGA
TTGATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACTAGGTCACCTTGGCTCGTGGGATATCAACTCGCT
TGAGAGTGAGTTGCAGTCATTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGACAC
GCTGGAATACAAGCAGGATGTTACAAATGTTTGCATGCGACACTTGTATAACTATTTTGG
GGGCAAGAGCACAAAACTACCTGACATGGAGCAGCTTCAACTTCCTGTAAACCAGAAAGC
TCGTAATTTGCTTGGAGATGTTGGAACCAAGGGTTTGAAAAACTTTGCTGAACAACTGCT
TATAAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTTAGAAGAATTGGTATAGCCAAGGC
CAATGACAAGTTTAGGCCGGTCTTATCAAGGGTCACTTCAGCTGGGTGTTGATGTGGAAA
TTTCCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTTATACAAAATTG
TCTCGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATTTATATTCGTTGGCTTGGTTTCTCT
CCTCCCCTCTAAACTATGTTGGTTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAGTTTG
TTTATTGGCATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTGAAGCAAATAAAATAA
AGTTGATGTG

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL921Contig2 1285 6 35 U
GGGATTTGAGACGGACAAGCTCGACGAGTCGTCTGCGGCGGAGTGAAAAAAAAAACAGTC
GGAGCTATGGCGATGCAAACCGGAATCGGCTTATCAAGGATCTTTCTCTTAGCCGGAGCA
GGTTATACTGGTACGATCATGATGAAACGGCAAATTATCTGATATATTGGGTGAATTGCA
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GATAACCGTCATGAATGGAGTTTCTGGTGCAAACTTGCAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGC
GGCGGTTGGGAGCTTTAGGATATGGTTATATGTGGTGGAAGGGACTTTCATTCACTGACC
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AGCAAGTTTCAGCCACCCTTGCGGCTGCAAAAAGGCATTTAACGCAAAAGATTCAGAATA
TGGATGATAAGGTAGAGCAGGATTGATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACCAGGTCACCTTG
GCTCGTGGAGATATCAACTCGCTTGAGAGTGAGTTACAGTCGTTGAATGATTTGATTAGT
GGTCTGGATGGGAAGTTGGACACGCTGGAATACAAGCAGAATGTCACAAATGTTTGCATG
CTACACTTGTATAACTATTTTGGAGGCAAGAGCACTAAACTGCCTGACATGGAGCAGCTT
CAACTTCCTGTAAACCAGAAAGCTCGTAATTTGCTTGGAGATGTTGGAACTAAGGGGCTG
AAAAACTTTGCTGAACAACTGCTTATAAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTG
AGAAGAATTGGTATAGCCAAGGCCAATGACAAGTCGAGGCCAGTGTTATCAAGGGTTACT
TCAGCTGGGTGTTGATGTGGAAGTTTCCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAAC
AACAAAACTCTAATACAAAATTGTCTCGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATTT
ATATTCGTTGGCTTGGTTTGTCTCTCCTCCCCCCTAAACTATGTCTGGCTTGTACTTTGG
GAGTATTTACTTGAACTTGGAGTTTGTTTATTGACATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTT
TTGGACCTTTAAAGCAAATAAAATAAAGTTGATGTGGAGGATTAGTGTTACCTGCTCATG
TGATGTGAGTATACAAGCCAATTCG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DW01TF U 1
AF RR4DW62TF U 1
AF RR4F073JQ C 868
AF RR4F073TF U 549
AF RR4DW01JQ C 502
AF RR4DW62JQ C 626
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BS 1212 1231 RR4F073TF
BS 1232 1285 RR4DW01JQ

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GGTTATACTGGTACGATCATGATGAAACGGCAAATTATCTGATATATTGGGTGAATTGCA
GTCTCTGGTGAAGGGTATGGAGAGATCGGGAGAAGAGGGAGATTCTGATGTCTCCGATGC
TATAGCTGCTCAGGTTCGTCGGTTGGCTATGGAGGTTCGACAGCTAGCTTCAGCAAGGCA
GATAACCGTCATGAATGGAGTTTCTGGTGCAAACTTGCAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGC
GGCGGTTGGGAGCTTTAGGATATGGTTATATGTGGTGGAAGGGACTTTCATTCACTGACC
TTATGTATGTGACAAAAGCCAACATGGCTACTGCTGTGGCTAACTTGACTAAGAATCTGG
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DS 

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GG
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TTATACTGGTACGATCATGATGAAACGGCAAATTATCTGATATATTGGGTGAATTGCAGT
CTCTGGTGAAGGGTATGGAGAGATCGGGAGAAGAGGGAGATTCTGATGTCTCCGATGCTA
TAGCTGCTCAGGTTCGTCGGTTGGCTATGGAGGTTCGACAGCTAGCTTCAGCAAGGCAGA
TAACCGTCATGAATGGAGTTTCTGGTGCAAACTTGCAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGCGG
CGGTTGGGAGCTTTAGGATATGGTTATATGTGGTGGAAGGGACTTTCATTCACTGACCTT
ATGTATGTGACAAAAGCCAACATGGCTACTGCTGTGGCTAACTTGACTAAGAATCTGGAG
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GATGATAAGGTAGAGCAGGATTGATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACCAGGTCACCTTGGC
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GTT

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CTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTTTATAACAACAAAAC

QA 1 161 1 161
DS 

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GGTAGAGCACCA
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GCTTGAGAGTGAGTTGCAGTCACTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGA
CACGCTGGAATACAAGCAGGATGTCACAAATGTTTGCATGCTACACTTGTATAACTATTT
TGGAGGAAAGAGCACAAAGCTACCTGACATGGAGCAGCTTCAACTTCCTGTAAACCAGAA
AGCTCGTAATCTGCTTGGAGATGCTGGAACCAAGGGGCTGAAAAACTTTGCTGAACAACT
GCTTATAAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTGAGAAGAATTGGTATAGCCAA
GGCCAATGACAAGTCGAGGCCAGTGTTATCAAGGGTTACTTCAGCTGGGTGTTGATGTGG
AAGTTTCCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTAATACAAAA
TTGTCTCGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATCTATATTCGTTGGATTGGTTTG
TCTCTCCTCCCTC*TAAACTATGT*TGGTTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGG
AGTTTGTTTATTGACATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTGAAGCAAATA
AAATAAAGTTG

QA 13 683 13 683
DS 

RD RR4DW01JQ 784 0 0
CGG
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GATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACCAGGTCACCTTGGCTCGTGGAGATATCAACTCGCTT
GAGAGTGAGTTACAGTCGTTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGACACG
CTGGAATACAAGCAGAATGTCACAAATGTTTGCATGCTACACTTGTATAACTATTTTGGA
GGCAAGAGCACTAAACTGCCTGACATGGAGCAGCTTCAACTTCCTGTAAACCAGAAAGCT
CGTAATTTGCTTGGAGATGTTGGAACTAAGGGGCTGAAAAACTTTGCTGAACAACTGCTT
ATAAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTTAGAAGAATTGGTATAGCCAAGGCC
AATGACAAGTTTAGGCCAGTCTTATCAAGGGTCACTTCTGCTGGGTGTTGATGTGGAAAT
TTCCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTAATACAAAATTGT
CTCGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATTTATATTCGTTGGCTTGGTTTGTCTC
TCCTCCCCCCTAAACTATGTCTGGCTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAGTT
TGTTTATTGACATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTAAAGCAAATAAAAT
AAAGTTGATGTGGAGGATTAGTGTTACCTGCTCATGTGATGTGAGTATACAAGCCAATTC
G

QA 4 784 4 784
DS 

RD RR4DW62JQ 660 0 0
AGAGTGAGTTACAGTCGTTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGACACGC
TGGAATACAAGCAGAATGTCACAAATGTTTGCATGCTACACTTGTATAACTATTTTGGAG
GCAAGAGCACTAAACTGCCTGACATGGAGCAGCTTCAACTTCCTGTAAACCAGAAAGCTC
GTAATTTGCTTGGAGATGTTGGAACTAAGGGGCTGAAAAACTTTGCTGAACAACTGCTTA
TAAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTTAGAAGAATTGGTATAGCCAAGGCCA
ATGACAAGTTTAGGCCAGTCTTATCAAGGGTCACTTTTGCTGGGTGTTGATGTGGAAATT
TCCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTTTAATACAAAATTGTC
TCGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATTTATATTCGTTGGCTTGGTTTGTCTCT
CCTCCCCCCTAAACTATGTCTGGCTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAGTTT
GTTTATTGACATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTAAAGCAAATAAAATA
AAGTTGATGTGGAGGATTAGTGTTACCTGCTCATGTGATGTGAGTATACAAGCCAATTCG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 8

CO CL922Contig1 768 8 10 U
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TATTACTTTTCGCCGAAGAAGAAGAGAGATTCCCTCTCTACCTACGTCGATAAATCTACG
AGGGAGCTTGACCTTGAGAACAAGAGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTT
CTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTTGAT
GGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGCCAAGTCACACCTATCT
TCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTT
GCGTTGAAAGGAGTTGGAGGCTTACTCTTTGTTATCGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTT
CTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTTTGATTTCTACAACTACGGACCT
GAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACCGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGA
GCATTACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGG
ACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCACACTTAATACCTTT*CAGT
TTTGTTTTTGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTG
TATTATTCTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCTTTTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR4DC40TF U 70
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AF RR4AN62JQ C 23
AF RR4D596JQ C 103
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BS 242 248 RR4AP87TF
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TTTCTCTCCATTGTTGACCGAGTTCTTGC

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CTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTTGAT
AGTGGTCCCGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGCCAAGTCACACCTATCT
TCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTT
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GCATTACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGG
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TTTGT

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AGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTC
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GCTCCAAAGCTTCATCTAGCCAAGTCACACCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCT
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TATCTTCTGGATTGCCACACTTAATACCTTT*CAGTTTTGTTTTTGTTTTGTTCGGACAA
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TATCATATTATTATCTTTTCCTTC

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DS 

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AATGACTTTGGAGTCGATGGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTA
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ATCTTCGGTGCTTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTTTGAT
TTCTACAACTACGGACCTGAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACCGAGTTCTTGCAG
AGCGTT*CACTCTTTGGAGCATTACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACT
AAGAGGAATCTGAAGAGGACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCAC
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TCCTTC

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GG
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TACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTC
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GG
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AGCTTGACCTTGAGAACAAGAGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCTCT
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TGAAAGGAGTTGGAGGCTTACTCTTTGTTATCGGAAACACCTTCGGTGCTTATCTTCTGG
CTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTTTGATTTCTACAACTACGGACCTGAGG
AGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACCGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGAGCAT
TACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTC
CTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCACACTTAATACCTTT*CAGTTTTG
TTTTTGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAACACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATT
ATTCTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCTTTTCCTTC

QA 3 706 3 706
DS 

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GG
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AGCTTGACCTTGAGAACAAGAGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCTCT
TCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTCGATGGTG
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GATTAGGTGTAACTTTGCCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGCGT
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CTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTTTGATTTCTACAACTACGGACCTGAGG
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TACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTC
CTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCACACTTAATACCTTT*CAGTTTTG
TTTTTGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATT
ATTCTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCTTTTCCTTC

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RD RR4AN62TF 746 0 0
GG
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AGAGATTCCCTCTCTACCTACGTCGATAAATCTACGAGGGAGCTTGACCTTGAGAACAAG
AGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTC
TCCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTTGATGGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTG
GCTCCAAAGCTTCATCTAGCCAAGTCACACCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCT
AGCGTAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGCGTTGAAAGGAGTTGGAGGCTTA
CTCTTTGCTATCGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTC
AGTCCTATTCTGTTTGATTTCTACAACTACGGACCTGAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTG
TTGACCGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGAGCATTACTCTTCTTTATTGGAATG
AAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAG
TATCTTCTGGATTGCCACACTTAATACCTTTTCAGTTTTGTTTTTGTTTTGTTCGGACAA
ATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATTATTCTTAGATTGGCTCATGA
TATCATATTATTATCTTTTCCTTC

QA 3 746 3 746
DS 



AS 1 5

CO CL923Contig1 1491 5 19 U
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CGCCGACGGAAAGCAAGAAGAGGATCCGAGACCACCGGATAATCCTGACAATCCTTACGG
GTTCTTGAAGCTCCCAATGGGTTACACCGTCGAGCTCGCTTCTTTGCCGTTGAAAATCAG
AGGAGATGTTCGACGGTGCTGCTGCGTCGTCTCCGGTGGAGTGTACGAGAATCTACTCTT
CTTCCCGACGATTCAGCTACTTAAAGACAGGTATCCTGGTGTTCAGGTAGATGTCTTAAC
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CGATCCAGACGATCATTGGCCTGAGCCTGCTGAATATACAGACATGATCGGACTTCTCAA
AGGAAGGTACTATGACATGATTCTGTCAACGAAGCTCGCAGGGCTAGGCCACGCAGCGTT
CTTGTTCATGACAACGGCTAGAGACAGAGTTAGTTACATTTACCCGAATGTTAACTCTGC
TGGAGCTGGTCTGATGCTATCTGAGACCTTTACAGCAGAAAACACCAACCTTTCAGAATT
AGGTTACAAAATGTATGACCAGATGGAGGATTGGTTAGGAAGGCCGTTTAGGAGTGTTCC
AAGGACTCCTGTGCTGCCACTTAGGGTGTCGGTTTCACGGAGATTGAAAGAGGTTGTGGC
TGACAAGTATAGGAAAGCTGGAGTGGAGACAGGGAAGTTTATAGTGATCCATGGGATCGA
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AAAATGGGGTCAGATATCAAGGGGTATAAGGGGATTCAAGCCGGTCTATGTGATTCCACA
TGAGAAAGAGAGAGAAAACGTCGAAGAATTT*GTGGGTGATGATACATCTATAGTGTTCA
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TACATATATATATATATAGCATTTATGTGTATAAATCATTTATTCAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G593TF U 1
AF RR4D025TF U 288
AF RR4AV18TF U 838
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BS 1453 1491 RR4AV18JQ

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CATTTATCCCTTCTTCAAAACGCCGCCGTTTCCAACCACCAAACCACTCGTCTTCCTCAA
CTTCCAAACCCGGCTAACCTCGAAACCCTTGGATGTATCAGTCAATCTCAAGAAGAAGAG
CGTGTGGCTCGACCCCTTTGACGACGGTGAAGACCTCAACAACGAATACGGGTCACTGTT
CGCCGACGGAAAGCAAGAAGAGGATCCGAGACCACCGGATAATCCTGACAATCCTTACGG
GTTCTTGAAGTTCCCAATGGGTTACACCGTCGAGCTCGCTTCTTTGCCGTTGAAAATCAG
AGGAGATGTTCGACGGTGCTGCTGCGTCGTCTCCGGTGGAGTTTACGAGAATCTACTCTT
CTTCCCGACGATTCAGCTACTTAAAGACAGGTATCCTGGTGTTCAGGTAGATGTCTTAAC
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CGATCCAGACGATCATTGGCCTGAGCCTGCTGAATATACAGACATGATCGGACTTCTCAA
AGGAAGGTACTATGACATGATTCTGTCAACGAAGCTCGCAGGGCTAGGCCACGCAGCGTT
CTTGTTCATGACAACGGCTAGAGACAGAGTTAGTTACATTTACCCGAATGTTAACTCTGC
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DS 

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G
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AGATGTCTTAACGACAGAGAGAGGAAAACAAACGTACGAGTTAAACAAAAACGTGAGGTG
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CCTTTCAGAATTAGGTTACAAAATGTATGACCAGATGGAGGATTGGTTAGGAAGGCCGTT
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AGAGGTTGTGGCTGACAAGTATAGGAAAGCTGGAGTGGAGACA

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DS 

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DS 

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ATGCTCGAGACAAACCCAGTATTGGGTTGTTCTCGTCAGAAGAGAAAGCGAAGCTCTTTG
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CAGATATTGACGTAGGAGCTGTTAAAAATGCAATGCAGGTCTTTGAGGGATCATTGGCTC
TCGTGTAAATAATCTTAAAAAGTTTGTGAAACAAGTTACATATTTATA
TA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4AV18JQ 759 0 0
GATGCTATCTGAGACCTTTACAGCAGAAAACACCAACCTTTCAGAATTAGGTTACAAAAT
GCATGACCAGATGGAGGATCGGTTAGGAAGGCCGTTTAGGAGTGTTCCAAGGACTCCTGT
GCTGCCACTTAGGGTGTCGGTTTCACGGAGATTGAAAGAGGTTGTGGCTGACAAGTATAG
GAAAGCTGGAGTGGAGACAGGGAAGTTTATAGTGATCCATGGGATCGAATCAGATTCTAA
GGCATCAATGCAATCAAAAGGAGATAGTGATAGTTTGCTTCCACTTACAAAATGGGGTCA
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AGAAAACGTCGAAGAATTT*GTGGGTGATGATACATCTATAGTGTTCATCACAACACCAG
GACAGTTGGCTGCTCTGATAAACGATTCTGCTGGAGTTATCGCTACAAACACAGCTGCTA
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CGAAGCCATTTGTACCAGACGCAGAAGAGAGGAGTAACTGTGTCATTGTTGCTTCAAAGA
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GATCATTGGCTCTCGTGTAGATAATCTTAAAAAGTTTGTGAAACAAGTTACATATATATA
TATATAGCATTTATGTGTATAAATCATTTATTCAGCACC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 7

CO CL924Contig1 1586 7 14 U
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GTAGACTTGTGACATGAAACCAGTGTGACAAAAAAAACAAACAACCAAAACTACTGTCCT
TTAAAAGAAAAAATCAAGATGGAGGCCACCATTTGTTATTCTATCACCTAATCTACGTTT
TCTTAAACCAACATCATCATCATCATAATCACATAACCGGTGGAGGAGGCAGTTTCCAGA
AATTCCATGTATTAAAGTCCTCCGGTTCTGAAGAGGTTGTTGTAGCTGGGAACATTCCAT
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CCCGAAACAGCGAAGGAAAGAGGCCATCGGGAGAAATAACAACAGGCCCATCCGGCAATG
CTTTCCCATCCTGCTTAAGATTAACTAGAAACTGTCTTGTGACTGACGCCTGAGAAATTG
CGCGTGCACTTAAGAACATCAGCTGATATCCGTTTTCCTTAACAGCCGAAAATAAATGTG
TAACACCAGTTTGTGACCAATCTATTCCAACCAAAGGCATGAACTGGCCTAACACATCAG
ATCTTGTGATGGTACCATCTACATCTGAAACAACTATCCGAGCATCCCATTTCCATAAGT
AGATCCTCGCGTCTACCTGTTGTGTACCCACAATATTCGTGGAGAACGTGAAGTTCACTT
TATTCATCCCTTCTTTCAGATTCAGCGAAGCTAATTGTTCAGACGTTGGAGTCAATGCCC
TGACTGTCTTCTTCACTGGTCTTGGCAACGACTTCTCTTGTTTCTTCTCCTCAGGCTCAG
CAGCATCCTTAGAAGAAGCTTCGCTATCATTCCTTGATCGTCGTTGAGAGAAAGGCCAAA
GGTTCCAGCTTCCACCGCTCGGAGCTAATACAGCATCAGCTTTCTCATTTCGGCCAACAG
CTATCATGCCCTTGGGCTCAAATACTTGAGAAGTCCCGAATGAAACCGCTCCTAAGATAA
TAGGAGCTGCTGCATCCCATGGAAAATAACACCCACCAATCTTCACTATAAGCATATCAT
TCTCCAAGACTGATGGTCCCAAAGAAGCAAATTTTTCCATATCCAGTTTTTCTGAATCGA
AGGCCTGAGAAGCCGCTTCTGCTCCCATTCCTTCACGTAATAAATGCTTGCAGAGAGAGA
GCTCGACCACTTGAGGATTAGTGATAACATGTTTGTATGCCTGCAAGTTTGGTCTACCGT
CAGCAACGTTTTCGGCATCTAAACCCTTCAAAGTATTGGAACTTGGGTCAAATGAGTGGC
TCATAGGCTGACAAGGACTAGCATCGATATCATTGTTGTTGTGAAGCCGCATAATCGGTA
ATGATTCAGCCAACCGCTCCATCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ65JQ U 1
AF RR4EZ65TF C 1
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AF RR4FA55JQ U 3
AF RR4C168JQ U 16
AF RR4FA55TF C 711
AF RR4C168TF C 907
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BS 74 96 RR4CG34JQ
BS 97 97 RR4EZ65JQ
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BS 306 744 RR4CG34JQ
BS 745 778 RR4C168JQ
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BS 780 807 RR4C168JQ
BS 808 1133 RR4FA55TF
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BS 1385 1586 RR4C168TF

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GA
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DS 

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GA
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AAAAGAAAAAATCAAGATGGAGGCCACCATTTGTTATTCTATCACCTAATCTACGTTTTC
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CCCTTTGGGTTAATAGTGAAGATCTTTCCCCGGGGAATTCCGACTTTAAGGTAGCTTATC
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CGAAACAGCGAAGGAAAGAGGCCATCGGGAGAAATAACAACAGGCCC

QA 3 589 3 589
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TCTTAAACCAACATCATCATCATCATAATCACATAACCGGTGGAGGAGGCAGTTTCCAGA
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CTTTCCCATCCTGCTTAAGATTAACTAGAAACTGTCTTGTGACTGACGCCTGAGAAATTG
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TAACACCAGTTTGTGACCAATCTA

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CTA
TTCCA

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GAGGCCACCATTTGTTATTCTATCACCTAATCTACGTTTTCTTAAACCAACATCATCATC
ATCATAATCACATAACCGGTGGAGGAGGCAGTTTCCAGAAATTCCATGTATTAAAGTCCT
CCGGTTCTGAAGAGGTTGTTGTAGCTGGGAACATTCCATTGACAAGAGCATGAAGATTTG
TGTATGACCTTGTATCCACCCTACGATTCACAGCTACTTCTCCCTTTGGGTTAATAGTGA
AGATCTTTCCCCGGGGAATTCCGACTTTAAGGTAGCTTATCTCATCCGTGTCTCTGTTTC
CAAAACCAGCATAGAACGGGTTGTGTTCCGGAGGAAACAAGGCTCGTATTTCCTCCAAGC
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GGCCATCGGGAGAAATAACAACAGGCCCATCCGGCAATGCTTTCCCATCCTGCTTAAGAT
TAACTAGAAACTGTCTTGTGACTGACGCCTGAGAAATTGCGCGTGCACTTAAGAACATCA
GCTGATATCCGTTTTCCTTAACAGCCGAAAATAAATGTGTAACACCAGTTTGTGACCAAT
CTATTCCAACCAAAGGCATGAACTGGCCTAACACATCGGATCTTGTGATGGTACCATCTA
CATCTG

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DS 

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TTCCATAAGTAGATCCTCGCGTCTACCTGTTGTGTACCCACAATATTCGTGGAGAACGTG
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CAGAGAGAGAGCTC
C

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DS 

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CATCC
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CCACCGCTCGGAGCTAATACAGCATCAGCTTTCTCATTTCGGCCAACAGCTATCATGCCC
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AACCGCTCCATCTCC

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DS 



AS 2 8

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ATGTTTAGATGCGAATAAGAAAAACGAGAAGTACACAAAGGTGTGTTCCCAACATTCATA
TACTGCTTAGTCTTTCCTCAAGTCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAGAAT
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GTAATCCGATCCAGCTATGGCCACACATGTTCCTCCGTTGTTATCG


BQ
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20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4ED83JQ U 2
AF RR4CB31JQ U 1
AF RR4H331JQ U 22
AF RR4CB31TF C 49
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BS 804 818 RR4CB31JQ
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RD RR4ED83JQ 761 0 0
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GCTGCTTAGTCTTTCCTCAAGTCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAGAATC
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CGCTTAAAGTAAAGCGTGTTGGAGAGAAGCTGAGCCATTGCAGGACAGCTCATCTGCTTG
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TCAGCCTGAAAGCCAGAGGAAGAGAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAG
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QA 1 761 1 761
DS 

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TACTGCTTAGTCTTTCCTCAAGTCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAGAAT
CATGATCTCAAGCTTGTCTCCAGTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGT
CTTGACCAAGTCAACTGCTTCAGGTTCGGAAAGGGGTGTGATAGCATCCTGTGCAGGGAG
CAGAAGTGGGCTGGGACTCTTGAGTTGATTGTCAAGGAAAGGCATGATTAGAGTGGAACC
AGAACCTTGAGCACTGTATCCAACCTTCTCATACGAACCAACAGCATCATAAGTAAAGAC
GCAGCCTTTACCTTCCTCGTCAAGCCCTCCAAGAACATTAAAGGCATAGTAAGGAAAAAA
GCGCTTAAAGTAAAGCGTGTTGGAGAGAAGCTGAGCCATTGCGGGACAGCTCATCTGCTT
GTTATGCTGATGCTGATAAACCAAGTGACTTGATTTCAAAACTTTCTGCAACGCTTTCAC
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DS 

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C
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AACGAGAAGTACACAAAGGTGTGTTCCTAACATTCATATGCTGCTTAGTCTTTCCTCAAG
TCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAGAATCATGATCTCAAGCTTGTCTCCA
GTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTCTTGACCAAGTCAACTGCTTCA
GGTTCGGAAAGGGGTGTGATAGCATCCTGTGCAGGGAGCAAAAGTGGGCTGGGACTCTTG
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ACCTTCTCATACGAACCAACAGCATCATAAGTAAAGACGCAGCCTTTACCTTCCTCGTCA
AGCCCTCCAAGAACATTAAAGGCATAGTAAGGAAAAAAGCGCTTAAAGTAAAGCGTGTTG
GAGAGAAGCTGAGCCATTGCAGGACAGCTCATCTGCTTGTTATGCTGATGCTGATAAACC
AAGTGCCTTGATTTCAAAACTTTCTGCAACGCTTTCACATCAGCCTGAAAGCCAGAGGAA
GAGAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAGTAATCGCGAGTGAGAATACTG
TAACCGGTAGACATCCGAGTATCGGCGGCGATAACGCAGTAATCCGATCCAGCTATGGCC
ACACATGTTCCTCCGTTGTTATCG

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DS 

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GTCATAAAGAAAC
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TGTTTAGATGCGAATAAGAAAAACGAGAAGTACACAAAGGTGTGTTCCCAACATTCATAT
ACTGCTTAGTCTTTCCTCAAGTCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAGAATC
ATGATCTCAAGCTTGTCTCCAGTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTC
TTGACCAAGTCAACTGCTTCAGGTTCGGAAAGGGGTGTGATAGCATCCTGTGCAGGGAGC
AGAAGTGGGCTGGGACTCTTGAGTTGATTGTCAAGGAAAGGCATGATTAGAGTGGAACCA
GAACCTTGAGCACTGTATCCAACCTTCTCATACGAACCAACAGCATCATAAGTAAAGACG
CAGCCTTTACCTTCCTCGTCAAGCCCTCCAAGAACATTAAAGGCATAGTAAGGAAAAAAG
CGCTTAAAGTAAAGCGTGTTGGAGAGAAGCTGAGCCATTGCGGGACAGCTCATCTGCTTG
TTATGCTGATGCTGATAAACCAAGTGACTTGATTTCAAAACTTTCTGCAACGCTTTCACA
TCAGCCTGAAAGCCAGAGGAAGAGAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAG
TAATCGCGAGTGAGAATACTGTAACCGGTAGACATCCGAGTATCGGCGGCGATAACGCAG
TAATCCGATCCAGCTATGGCCACACATGTTCCTCCGTTGTT
C

QA 14 774 14 774
DS 



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ACGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTC
GGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAG
ACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCCGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTT
TGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGA
TGGCTCAGCTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCATTTA
ATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGACGGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGATGCTGTTG
GTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGATTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTT
TCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTCCCTGCACAGGATGCTATCA
CACCCCTTTCCGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTG
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CGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAACACTCTC
ACCTTCGTCCTTTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTATCTTGT
ACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCACTCATGCTTGAAGTTTCCTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4ED83TF U 1
AF RR4H331TF U 55
AF RR4B784TF U 61
AF RR4B784JQ C 114
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BS 134 142 RR4ED83TF
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BS 144 262 RR4ED83TF
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BS 515 701 RR4ED83TF
BS 702 897 RR4B784TF
BS 898 898 RR4B784JQ

RD RR4ED83TF 701 0 0
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QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4H331TF 645 0 0
TTTTTT
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ACGGAGGAACATGTGTGGCCATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTC
GGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAG
ACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTT
TGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCAA
TGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTTAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCCTTTA
ATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGCTGCGTCTTTACTTATGATGCTGTTG
GTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTT
TCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTCCCTGCACAGGATGCTATCA
CACCCCTTTCCGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTG
AGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGA

QA 7 645 7 645
DS 

RD RR4B784TF 837 0 0
GCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATAACA
ACGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTC
GGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAG
ACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCCGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTT
TGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGA
TGGCTCAGCTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCATTTA
ATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGACGGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGATGCTGTTG
GTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGATTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTT
TCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTCCCTGCACAGGATGCTATCA
CACCCCTTTCCGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTG
AGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCA
CGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAACACTCTC
ACCTTCGTCCTTTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTATCTTGT
ACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCACTCATGCTTGAAGTTTCCTTTAC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4B784JQ 785 0 0
GATAACAACGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCC
GATACTCGGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAA
CTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCCGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAG
AAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGT
CCTGCGATGGCTCAGCTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTAT
GCATTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGACGGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGAT
GCTGTTGGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGATTCTGGTTCCACTCTAATC
ATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTTTGCTCCCTGCACAGGAT
GCTATCACACCCCTTTCCGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCT
GCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGAT
GGCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAA
CACTCTCACCTTCGTCCTTTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTT
ATCTTGTACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCACTCATGCTTGAAGTTTCCT
TTACG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 8

CO CL926Contig1 510 8 8 U
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATAAAACTATATCTTATTATTT


BQ
35 35 35 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E971TF U 1
AF RR4EL23TF U 1
AF RR4AX62JQ C 1
AF RR4EM86TF U 1
AF RR4E971JQ C 1
AF RR4AX62TF U 1
AF RR4AW68TF U 3
AF RR4CB77TF U 0
BS 1 105 RR4E971TF
BS 106 200 RR4EM86TF
BS 201 203 RR4EL23TF
BS 204 431 RR4EM86TF
BS 432 432 RR4EL23TF
BS 433 482 RR4EM86TF
BS 483 493 RR4AX62TF
BS 494 510 RR4AW68TF

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DS 

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GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTAT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4AX62JQ 507 0 0
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CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
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GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
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GGGAAATTGCACCC

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DS 

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CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
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GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
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GCCCTTGTCTCCTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4E971JQ 482 0 0
GGC
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CAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAG
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CCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAA
GCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGGCC
CTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTTTG

QA 4 482 4 482
DS 

RD RR4AX62TF 507 0 0
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CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATAAA
GGGAAATTGCACCC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4AW68TF 508 0 0
GG
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AGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAGA
CCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAGG
AATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCCA
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CTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAAG
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ATACATAAAACTATATCTTATTATTT

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DS 

RD RR4CB77TF 491 0 0
GGCACAG
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AGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAGACC
CAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAGGAA
TCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCCATC
AAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTTCCT
TTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAAGCC
ATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTAT*GAAGGGTTGTTGGCCCTT
GTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTTTGAAAT
AC
GT

QA 8 489 8 489
DS 



AS 1 8

CO CL927Contig1 868 8 14 U
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TAACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGC
TTGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTA
TCTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACG
TCACTTCCGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAA
ATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTA
TCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCA
CCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCG
GAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCG
TCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTG
TTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCG
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TGTAACTTCCTTTTAACCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGACATGTGATAA
AATAATATGAAAAAAACTTCCTTTATCG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C329TF U 2
AF RR4EJ79TF U 1
AF RR4AA16JQ C 2
AF RR4G278JQ C 326
AF RR4G278TF U 326
AF RR4AA16TF U 203
AF RR4C329JQ C 92
AF RR4EJ79JQ C 114
BS 1 624 RR4EJ79TF
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BS 626 648 RR4EJ79TF
BS 649 649 RR4G278TF
BS 650 655 RR4EJ79TF
BS 656 656 RR4G278TF
BS 657 678 RR4EJ79TF
BS 679 679 RR4G278TF
BS 680 698 RR4EJ79TF
BS 699 699 RR4G278TF
BS 700 722 RR4EJ79TF
BS 723 838 RR4G278TF
BS 839 844 RR4C329JQ
BS 845 868 RR4EJ79JQ

RD RR4C329TF 646 0 0
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QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4EJ79TF 722 0 0
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TTGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTA
TCTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACG
TCACTTCCGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAA
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TCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCA
CCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCG
GAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCG
TCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCG*TTAAGTATGCTTTATGTTTGATCGCGTACG*TGTG
TTTCCCTTCTGTTTGTTT*ACGTTTTGTGTCATGACCA*TAATGTTTGCTTGCCTATGCG
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4AA16JQ 836 0 0
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TTGAAATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACAT
AACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCT
TGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTAT
CTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGT
CACTTCTGTTCCTCCTCCTTGCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAA
TGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTAT
CTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCAC
CAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCGG
AGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGT
CCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGT
TTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGC
ATGAATAAGGTCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTT
GTAACTTCCTTTTAACCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGACAT
TAAG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4G278JQ 513 0 0
GG
ATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTA
ATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACT
CCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCG
GTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCA
TCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTT
AAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTG
TGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAAGGTCTACATAATAATTAA
GGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACTTCCTTTTAACCACGTTTAAT
TTGCATTTGTAATGCTGTAACGACATGTGAT

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR4G278TF 513 0 0
GG
ATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTA
ATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACT
CCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCG
GTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCA
TCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTT
AAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTG
TGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAAGGTCTACATAATAATTAA
GGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACTTCCTTTTAACCACGTTTAAT
TTGCATTTGTAATGCTGTAACGACATGTGAT

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR4AA16TF 636 0 0
CGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATCTTTAATATCCAAGGTCTTCT
TAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCTGTTCCTCCTCCTTG
CCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAA
CGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCT
CAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCC
TGCCGGTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCT
CAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGT
CGGTTAAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACG
TTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAAAGTCTACATAATA
ATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACTTCCTTTTAACCACGT
TTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGACAT
TAAGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4C329JQ 757 0 0
AAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATAACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCAT
TGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTTGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCT
TGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATCTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTC
TGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCCA***CACCTCCTTTCCCTAATGC
GGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGG
AGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGG
TTGTAGGATCATCGTCACGACCC*TCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGG
ATTACTCATGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCT
CGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGT
ATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTC
ATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAAGGTCTACATAATAATTAAGGCG
TGTGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACTTCCTTTTACCCACGTTTAATTTGC
ATTTGTAATGCTGTAACGACATGTGATAAAATA
GTAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EJ79JQ 755 0 0
AAAAACATAACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAAT
GCTCAGCTTGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATT
ACTAGTATCTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACC
AATAACGTCACTTCCGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCT
GGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATG
GGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACC
CCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCATGGCACCTTTAGCT
CTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTT
AGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATGTTTGATCGCGTA
CGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGC
CTATGCGCATGAATAAGGTCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTA
TTGTTGTTGTAACTTCCTTTTAACCACGTTTAATTTGCACTTGTAATGCTGTAACGACAT
GTGATAAAATAATATGAAAAAAACTTCCTTTATCG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 8

CO CL928Contig1 508 8 6 U
GAGAGTTGGGCCCCGCTGAGTTCTTATGTCTTCACGTCTATAACTCAGTTCATCCAATTT
CTACAGGGATGAACCTAATCCTGAATAGGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCA
ACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATGGCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCC
CTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGCTCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCA
CCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACCGTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCT
GCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTCTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAG
GGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAA
AATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTA
ATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 5 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 20 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 

AF RR4CG82JQ C 178
AF RR4BQ87JQ C 1
AF RR4ET76JQ C 88
AF RR4ET76TF U 88
AF RR4CG82TF U 88
AF RR4BQ87TF U 1
AF RR4B242JQ C 88
AF RR4B242TF U 293
BS 1 87 RR4BQ87TF
BS 88 125 RR4ET76TF
BS 126 130 RR4CG82TF
BS 131 162 RR4ET76TF
BS 163 163 RR4CG82TF
BS 164 508 RR4ET76TF

RD RR4CG82JQ 294 0 0
GCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGCTCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCA
GCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACCGTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTT
GTTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTCTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAG
GAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATG
GAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATGTATAATCTCATTGTATAAGTT

QA 1 294 1 294
DS 

RD RR4BQ87JQ 508 0 0
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CTACAGGGATGAACCTAATCCTGAATATGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCA
ACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATGGCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCC
CTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGCGAGCTCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCA
CCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACCGTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCT
GCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTCTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAG
GGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAA
AATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTA
ATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4ET76JQ 421 0 0
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TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGGTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAGGGGCTTTACGAGATAACAAAACTCTTT
TTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTG
ATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAAT
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4ET76TF 421 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAA*****CAAAAAA*GAAATAATG
GCAATGAAGAACATCCACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGC
TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTT
TTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTG
ATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAAT
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4CG82TF 421 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAAAGAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGC
TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGTTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTT
TTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTG
ATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAAT
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4BQ87TF 508 0 0
GAGAGTTGGGCCCCGCTGAGTTCTTATGTCTTCACGTCTATAACTCAGTTCATCCAATTT
CTACAGGGATGAACCTAATCCTGAATATGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCA
ACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATGGCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCC
CTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGCGAGCTCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCA
CCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACCGTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCT
GCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTCTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAG
GGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAA
AATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTA
ATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4B242JQ 421 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCAGTTGTGTTAGTGGGT
TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCTGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATAT****TGAGGGGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTT
TTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTG
ATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAAT
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4B242TF 216 0 0
TCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTCTCTTGCAGTAAATATATATAT***
*TGAGGGGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAAT
CTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATGTATAATCTCATTGTATAAGTTA
TTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 216 1 216
DS 



AS 1 8

CO CL929Contig1 928 8 14 U
GGATCAATGTTCCTTTGAGACCAGTGCTCTTCCTTTTCTTCTCCATATAAACCACATATC
CTCGCCTCCATATCTTAACAATTTCTCATAGAACCCTAAAAACTGAGAAAAGAGAGCTAG
AGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAG
AGTGGTGACGTTCTCAAAAAGGAGGAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAAATCACAGT
TCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTA
TTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAA
GAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATCGATATGATCAAAAAGGA
GAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAA
CTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCATGGCGTGGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGA
CCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAA
TCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAACAGCAGGAGATGGCAATAGCTAGCAACGCAAGAGG
AATGATGATGAAAGATCATGATGCGCAATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAA
TCTCCAGGAAAAGATTATGTCATTGGTCATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTC
ATGGCCAATCTATATGTCGTGTGGTTATTTAATTTGTCTTTATAACTGTGTGTCCTTTCA
ATCTCGAGCCACATATAAACTCTCTATCCTGCTTTCTTATGAACTCTCTATGTATTGGTT
GTGATTGATGTGTGTTGCTTTCACTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 0 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 20 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
25 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ84TF U 1
AF RR4FT70TF U 86
AF RR4GV11TF U 75
AF RR4GF51TF U 86
AF RR4GV11JQ C 116
AF RR4GF51JQ C 145
AF RR4FT70JQ C 146
AF RR4AJ84JQ C 213
BS 1 198 RR4AJ84TF
BS 199 199 RR4GF51TF
BS 200 267 RR4AJ84TF
BS 268 268 RR4GV11TF
BS 269 513 RR4AJ84TF
BS 514 514 RR4GF51TF
BS 515 785 RR4AJ84TF
BS 786 791 RR4GV11TF
BS 792 792 RR4GF51TF
BS 793 825 RR4GV11TF
BS 826 826 RR4GF51TF
BS 827 871 RR4GV11TF
BS 872 922 RR4GV11JQ
BS 923 928 RR4AJ84JQ

RD RR4AJ84TF 785 0 0
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CTCGCCTCCATATCTTAACAATTTCTCATAGAACCCTAAAAACTGAGAAAAGAGAGCTAG
AGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAG
AGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAAATCACAGT
TCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCATGGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTA
TTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAA
GAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATCGATATGATCAAAAAGGA
GAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAA
CTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCATGGCGTTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGA
CCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAA
TCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAACAGCAGGAGATGGCAATAGCTAGCAACGCAAGAGG
AATGATGATGAAAGATCATGATGCGCAATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAA
TCTCCAGGAAAAGATTATGTCATTGGTCATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTC
ATGGC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4FT70TF 761 0 0
GG
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AGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAAAGGAGGAA
TGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAGATCACAGTTCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCAT
AGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGC
TATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAA
CCTCAACAATGAGATTGATATGATCAAAAAGGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAG
GCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCA
TGGCGTGGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAA
GAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAATCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAACA
GCAGGAGATGGCAATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAAAGATCATGATGCGCA
ATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAATCTTCAG*AAAAGATTATGTCATTGGT
CATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTCATGGCCA*TCTATATGTCGTGTGGTTA
TTTAATTTGTCTTTATAACTGTGTGTCCTTTCA
TCTCGA

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DS 

RD RR4GV11TF 797 0 0
GG
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AGAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCA
AAGAGGAGGAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAAATCACAGTTCTCTGTGATGCAAAA
GTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATG
GATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCT
AAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATCGATATGATCAAAAAGGAGAATGATAGCTTACAA
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GCCGTAGAGCATGGCGTTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTC
CTTATGACAAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAATCGGCAGCTCAGTTTC
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CATGATGCGCAATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAATCTCCAGGAAAAGATT
ATGTCATTGGTCATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCGATCTCATGGCCAATCTCTATG
TCGTGTGGTTATTTAATTTGTCTTTATAATTGTGTGTCCTTTCAATCTCGAGCCACATAT
AAACTCTCTATCCTG

QA 3 797 3 797
DS 

RD RR4GF51TF 787 0 0
GG
ATAGAACCCTAAAAACTGAGAAAAGAGAGCTAGAGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGAT
AGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAAAGGAGGAA
TGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAGATCACAGTTCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCAT
AGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGC
TATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAA
CCTCAACAATGAGATTGATATGATCAAAAAGGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAG
GCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCA
TGGCGTGGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAA
GAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAATCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAACA
GCAGGAGATGGCAATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAAAGATCATGATGCGCA
ATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAATCTTCAG*AAAAGATTATGTCATTGGT
CATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTCATGGCCA*TCTATATGTCGTGTGGTTA
TTTAATTTGTCTTTATAACTGTGTGTCCTTTCA*TCTCGAGC*ACATATAA*CTCTCTAT
C
TGCT

QA 3 783 3 783
DS 

RD RR4GV11JQ 811 0 0
GCTAGAGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAAC
AACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAAATC
ACAGTTCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACT
GATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCT
GGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATCGATATGATCAAA
AAGGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCT
CTCAACTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCATGGCGTTGAACATGGCCTCGACAAAGTC
CGAGACCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAG
GAGAATCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAACAGCAGGAGATGGCAATAGCTAGCAACGCA
AGAGGAATGATGATGAAAGATCATGATGCGCAATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAG
CCAAATCTCCAGGAAAAGATTATGTCATTGGTCATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCG
ATCTCATGGCCAATCTCTATGTCGTGTGGTTATTTAATTTGTCTTTATAATTGTGTGTCC
TTTCAATCTCGAGCCACATATAAACTCTCTATCCTGCTTTCTTATGAACTCTCTATGTAT
TGGTTGTGATTGATGTGTGTTGCTTTC
ACTT

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DS 

RD RR4GF51JQ 778 0 0
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GAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAGATCACAGTTCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCT
CATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGG
TGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGA
GAACCTCAACAATGAGATTGATATGATCAAAAAGGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCT
CAGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGA
GCATGGCGTGGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTTATGAC
AAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAATCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCA
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GCAATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCATT
GGTCATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTCATGGCCAATCTATATGTCGTGTGG
TTATTTAATTTGTCTTTATAACTGTGTGTCCTTTCAATCTCGAGCCACATATAAACTCTC
TATCCTGCTTTCTTATGAACTCTCTATGTATTGGTTGTGATTGATGTGTGTTGCTTTC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4FT70JQ 777 0 0
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AATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAGATCACAGTTCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTC
ATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGT
GCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAG
AACCTCAACAATGAGATTGATATGATCAAAAAGGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTC
AGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAG
CATGGCGTGGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTTATGACA
AAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAATCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAA
CAGCAGGAGATGGCAATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAAAGATCATGATGCG
CAATTCGGGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCATTG
GTCATCGATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTCATGGCCAATCTATATGTCGTGTGGT
TATTTAATTTGTCTTTATAACTGTGTGTCCTTTCAATCTCGAGCCACATATAAACTCTCT
ATCCTGCTTTCTTATGAACTCTCTATGTATTGGTTGTGATTGATGTGTGTTGCTTTC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4AJ84JQ 716 0 0
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TTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGT
TGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCA
ACAATGAGATCGATATGATCAAAAAGGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATT
TGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCATGGCG
TTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAAGAGGA
GAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGAATCGGCAGCTCAGTTTCCAGCTGCAACAGCAGG
AGATGGCAATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAAAGATCATGATGCGCAATTCG
GGTATAGAGTTCAACCCATTCAGCCAAATCTCCAGGAAAAGATTATGTCATTGGTCATCG
ATTGATCATATTTGAGATTAGCAATCTCATGGCCAATCTCTATGTCGTGTGGTTATTTAA
TTTGTCTTTATAATTGTGTGTCCTTTCAATCTCGAACCACATATAAACTCTCTATCCTGC
TTTCTTATGAACTCTCTATGTATTGGTTGTGATTGATGTGTGTTGCTTTCACTTGG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 8

CO CL930Contig1 816 8 6 U
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GATAATAAGTGATGATTTTAGCATCAGCTACTATGAGATCTCTCTTCCTAACAATATCTC
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CCATACTAAGACACGACAACCAAAGCAGCGACCTCTTCTCCGCCATTTCCGACATGAGAA
GAGAATCATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCACGTCCTCAACGACACAGGCTTCTTCA
GGAACCAAGAGATCACTTTCTTGATGCCTAACGACGAGGATATCTCTCAAGCAGACATGA
CTCAAGAGAGTCTTGAGACGTTTATACTAAGACACACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCA
ACCACATGCTTCGCTTCCCTAACAAAACTCTTGTCCCTTGTAGCATCCCTGATAAAATGT
TCACAATTACAAAGTCTGGTGGGTCTGGACTTTATGTGAACAATGCGAGGATTGTTTCTC
CTAATATTTGTCAGAACTCTCGCATATCGTGTCATGGAATCAGTAATGTTATTACGTTCG
ATGAAGACTCGTTTCCAAAGGGAAAATTACCACACAAAATGTTATCATCAAGAATCACTT
CGCCGAGGCACTGAGGGTGTGAGGAGATCTTCTAATGTTTTTTTTT**AATAAATAAGAG
TTGTAGTGTGACTAATAAACTCTAGACTATGTTCTCCTCTACCAGGATTTCGGATTAAAT
GTTACTAGACTAATTAATGTAAAAGAGTTGCATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G304TF U 63
AF RR4G738TF U 1
AF RR4G783TF U 5
AF RR4GX86TF U 62
AF RR4G738JQ C 35
AF RR4G304JQ C 63
AF RR4G783JQ C 223
AF RR4GX86JQ C 215
BS 1 671 RR4G738TF
BS 672 753 RR4GX86TF
BS 754 788 RR4G738JQ
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BS 790 795 RR4G738JQ
BS 796 816 RR4G304JQ

RD RR4G304TF 297 0 0
GG
ATAAGTGATGATTTTAGCATCAGCTACTATGAGATCTCTCTTCCTAACAATATCTCCCTT
GTTCTTCTTCCTTCTCACGATTCTTGCATCCACCGTGACCGAGCCACGTCCAACTCCCAT
ACTAAGACACGACAACCATAGCAGCGACCTCTTCTCCGCCATTTCCGACATGAGAAGAGA
ATCATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCACGTCCTCAACGACACAGGCTTCTTCAGGAA
CCAAGAGATCACTTTCTTGATGCCTAACGACGAGGATATCTCTCAAGCAGACATG

QA 3 297 3 297
DS 

RD RR4G738TF 671 0 0
GGATTCATGAACTTCTGAGTTTTCAGTTTCCTATAAGTTCGTTTTCAACGTAATAGAATT
GATAATAAGTGATGATTTTAGCATCAGCTACTATGAGATCTCTCTTCCTAACAATATCTC
CCTTGTTCTTCTTCCTTCTCACGATTCTTGCATCCACCGTGACCGAGCCACGTCCAACTC
CCATACTAAGACACGACAACCAAAGCAGCGACCTCTTCTCCGCCATTTCCGACATGAGAA
GAGAATCATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCACGTCCTCAACGACACAGGCTTCTTCA
GGAACCAAGAGATCACTTTCTTGATGCCTAACGACGAGGATATCTCTCAAGCAGACATGA
CTCAAGAGAGTCTTGAGACGTTTATACTAAGACACACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCA
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CTAATATTTGTCAGAACTCTCGCATATCGTGTCATGGAATCAGTAATGTTATTACGTTCG
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TCTTCTTCCTTCTCACGATTCTTGCATCCACCGTGACCGAGCCACGTCCAACTCCCATAC
TAAGACACGACAACCAAAGCAGCGACCTCTTCTCCGCCATTTCCGACATGAGAAGAGAAT
CATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCACGTCCTCAACGACACAGGCTTCTTCAGGAACC
AAGAGATCACTTTCTTGATGCCTAACGACGAGGATATCTCTCAAGCAGACATGACTCAAG
AGAGTCTTGAGACGTTTATACTAAGACACACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCAACCACA
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ACTCGTTTCCAAAGGGAAAATTACCACACAAAATGTTATCATCAAGAATCACTTCGCC
TAGCAC

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TACTAAGACACGACAACCAAAGCAGCGACCTCTTCTCCGCCATTTCCGACATGAGAAGAG
AATCATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCACGTCCTCAACGACACAGGCTTCTTCAGGA
ACCAAGAGATCACTTTCTTGATGCCTAACGACGAGGATGTCTCTCAAGCAGACATGACTC
AAGAGAGTCTTGAGACGTTTATACTAAGACACACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCAACC
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AAGACTCGTTTCCAAAGGGAAAATTACCACACAAAATGTTATCATCAAGAATCACTTCGC
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CTTTTCCGCCATTTCCGACATGAGAAGAGAATCATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCA
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GTTCTTCTTCCTTCTCACGATTCTTGCATCCACCGTGACCGAGCCACGTCCAACTCCCAT
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ATCATACTACGGTTTTGTCACACTTCTTCACGTCCTCAACGACACAGGCTTCTTCAGGAA
CCAAGAGATCACTTTCTTGATGCCTAACGACGAGGATATCTCTCAAGCAGACATGACTCA
AGAGAGTCTTGAGACGTTTATACTAAGACACACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCAACCA
CACGCTTCGCTTCCCTAACAAAACTCTTGTCCCCTGTAGCATCCCTGATAAAATGTTCAC
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AGACTCGTTTCCAAAGGGAAAATTACCACACAAAATGTTATCATCAAGAATCACTTCGCC
GAGGCACTGAGGGTGTGAGGAGATGTTCTAATGTTTTTTTTT**AATAAATAAGAGTTGT
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CTAGACTAATTAATGTAAAAGAGTTGCATGGT

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CCCTTGTAGCATCCCTGATAAAATGTTCACAATTACAAAGTCTGGTGGGTCTGGACTTTA
TGTGAACAATGCGAGGATTGTTTCTCCTAATATTTGTCAGAACTCTCGCATATCGTGTCA
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CAAAATGTTATCATCAAGAATCACTTCGCCGAGGCACTGAGGGTGTGAGGAGATCTTCTA
ATGTTTTTTTTT**AATAAATAAGAGTTGTAGTGTGACTAATAAACTCTAGACTATGTTC
TCCTCTACCAGGATTTCGGATTAAATGTTACTAGACTAATT
AATGC

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RR4AI60TF U 1
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QA 1 530 1 530
DS 



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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G929JQ U 1
AF RR4GB71JQ U 41
AF RR4GB71TF C 41
AF RR4EN67JQ U 5
AF RR4EN67TF C 14
BS 1 22 RR4G929JQ
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RD RR4G929JQ 207 0 0
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CGC

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G
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CAAGAATAC

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DS 

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G
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GAATCCGAACAGAACAGAAAGCTCCTTGCTAATAAGCTTCCTGTAACAAGAATACAAAAA
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ATGTGGGAGAGAGATTAGGAGAGTGAGACAGAGAAA
AA

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DS 

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TAATTACAAACATTAAACCAAACCATAATTAACCTAAGGTTTACACGTAAACCTAGTTTA
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QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 8

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CAAGCTTTTGAAGGAAGGTGAAGATTTGACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCT
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CCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCGGGCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAA
GAATGTTCTTGTTGACATGGGGATCTACTTCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTT
TGCTGACCCAGAGACACTTGGCAAGATAGGAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 35 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO05TF U 35
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AF RR4EM35TF U 78
AF RR4AE19TF U 74
AF RR4EO05JQ C 900
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AF RR4EM35JQ C 570
AF RR4AE19JQ C 673
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G
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AATCCCGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACCGGGAGGGAAGCTGAATC
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AAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCTTATTTCC
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ACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTTGATCTCT
TTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACCACCTTCG
AA
AGCG

QA 2 603 2 603
DS 

RD RR4CY91TF 805 0 0
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TGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCTTATTTCCTTGTGCTGGATGACATTATGGATAA
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GA*TGTTCTTGT*GACATGGGGATC

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DS 

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GG
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GGAGGGAAGCTGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACAGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGGT
GAAGATTTGACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGG
CTTCAAGCTTATTTCCTTGTGCTGGATGACATTATGTATAACTCTGTCACTCGACGTGGA
CAACCTTGCTGGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTA
CTTCGCAATCACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTT
GACCTCGTTGATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGAT
CTGATCACCACCTTCGAAGGCGAGAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGG
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CTTATGGCGGGCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATG
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QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4AE19TF 836 0 0
GGATCC
AGTCTCTATCATCGTATCCAAAGTAGGCACCTTTCATCCTCCTCTTCAATGGCCGATCTC
AAGTCAACCTTCCTCAACGTCTACTCCACCCTCAAATCCGACCTCCTCCACGACCCTTCC
TTCGAATTCACCGATGAATCCCGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACCG
GGAGGGAAGCTGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACAGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGGT
GAAGATTTGACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGG
CTTCAAGCTTATTTCCTTGTGCTGGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGGA
CAACCTTGCTGGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTA
CTTCGCAATCACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTT
GACCTCGTTGATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGAT
CTGATCACCACCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGG
CGTATTGTCCAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTA
CTTATGGCGGGCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATG
GGGATCTACTTCCAAGTGCACGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGACACTT
GGCAAGATAGGAACGGATATAGAAGACTTCAA*TGCTCCTGGTTGGTGGT

QA 7 836 7 836
DS 

RD RR4EO05JQ 234 0 0
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ACCTTGAGGGAGTCTTCAAGGAGTATGAGAGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGTGA
TTGAGGCTCACAAAAGTAAAGCAATCCAAGCAGTGCTCAAATCCTTCTTGG
TTA

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DS 

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CAATCACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCT
CGTTGATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGAT
CACCACCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTAT
TGTCCAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTAT
GGCGGGCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGGAT
CTACTTCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGACACTTGGCAA
GATAGGAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAAGGCATTGGAACG
CTGCAGCAAAGAACAAACTGAGATATTATATGAGAACTACGGTAAACCCGACCCATCAAA
CGTTGCTAAAGTGAAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTCTTCAAGGAGTA
TGAGAGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGTGATTGAGGCTCACAAAAGTAAAGCAAT
CCAAGCAGTGCTCAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTT
TAAGCCTTCCCAGATTATGTCTTTGATTCTTCTTTGGTGATTTGTGTAATTCTGTTAAGT
GCTCTTCATTTTCTTAAACTAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTATTCAC
G

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4EM35JQ 720 0 0
ATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACCA
CCTTCGAAGGCGAGAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTCC
AATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCGG
GCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGGATCTACT
TCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGACACTTGGCAAGATAG
GAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAAGGCATTGGAACGCTGCA
GCAAAGAACAAACTGAGATATTATATGAGAACTACGGTAAACCCGACCCATCAAACGTTG
CTAAAGTGAAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTCTTCAAGGAGTATGAGA
GCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGTGATTGAGGCTCACAAAAGTAAAGCAATCCAAG
CAGTGCTCAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTTTAAGC
CTTCCCAGATTATGTCTTTGATTCTTCTTTGGTGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTCT
TCATTTTCTTAAACTAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTATTCACAAAATTTCGTCCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AE19JQ 638 0 0
CCACCGGCGTATTGTCCAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTG
TGCGTTACTTATGGCGGGCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGT
TGACATGGGGATCTACTTCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGA
GACACTTGGCAAGATAGGAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAA
GCCATTGGAACGCTGCAGCAAAGAACAAACTGAGATATTATATGAGAACTACGGTAAACC
CGACCCATCAAACGTTGCTAAAGTGAAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGT
CTTCAAGGAGTATGAGAGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGTGATTGAGGCTAACAA
AAGTAAAGCAATCCAAGCAGTGCTCAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAA
GTAGTCAGTCTTTAAGCCTTCCCAGATTATGTCTTTGATTCTTCTTTGGTGATTTGTGTA
ATTCTGTTAAGTGCTCTTCATTTTCTTAAACTAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTAT
TCACAAAATTTCGTCCCTTTAAAAAAATATTATATATT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 8

CO CL933Contig1 849 8 19 U
TTTTTTGATATAAACGGTCTGACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCACATTACA
ATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTT*GAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAAGAAGAA
TCCATCAAAGGGAAAAGAAAAAACAAACAGGCATTGTTGTTCCTAAGTCCTTTTTTATTC
TTTAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAG
TAGTAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGACTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCT
GGAGACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTACCGGCAT
TGATCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTTAGCGTCT
GCACGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGA
AGAGAACCTCAGAGGCACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGT
CAAGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGTTGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCCCG
GCGTGACCGCAGCGCTGATGATGTTGGTGGTGTTACCAGGAGTGCCTAGGCTGAAGACGA
AGTCCGAGGCTTTGACATGGATGGGGCGAATGCAAGGGTAGCCAGCTGGGGTCTCAGCGC
GTTTCAGGTTGGCCACACAGAAGTCTTGAACTGAGGCATTGGATAGAGCAAAGAGGAGAG
ATAAGAGGAAGATAATGCACAACATTTTTTGATTGATTGGTTGGTTGGTGTAAGTTTTTT
TTGCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4DM76JQ U 39
AF RR4GQ54TF C 1
AF RR4G455JQ U 58
AF RR4GQ54JQ U 386
AF RR4H540JQB U 33
AF RR4DM76TF C 184
AF RR4G455TF C 184
AF RR4H540TF C 211
BS 1 38 RR4GQ54TF
BS 39 200 RR4H540JQB
BS 201 201 RR4DM76JQ
BS 202 250 RR4H540JQB
BS 251 251 RR4DM76JQ
BS 252 427 RR4H540JQB
BS 428 428 RR4DM76JQ
BS 429 481 RR4H540JQB
BS 482 482 RR4G455JQ
BS 483 483 RR4H540JQB
BS 484 484 RR4G455JQ
BS 485 491 RR4H540JQB
BS 492 492 RR4G455JQ
BS 493 790 RR4H540JQB
BS 791 798 RR4DM76TF
BS 799 799 RR4G455TF
BS 800 809 RR4DM76TF
BS 810 810 RR4G455TF
BS 811 849 RR4DM76TF

RD RR4DM76JQ 404 0 0
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GTTCCTAAGTCCTTTTTTATTCTTTAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGCCTTG
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AATAGGGCAAAGTCAAAAATCTGGAGACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCT
GCAGCAGCGGTTTTACCGGCATTGATCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATG
ACCTGTCCTGGTTTTAGCGTCTGCACGTAGACAGAGTTGGCGGA

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4GQ54TF 627 0 0
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ATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTTTGAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAAGAAGAA
TCCATCAAAGGGAAAAGAAAAAACAAACAGGCATTGTTGTTCCAAAGTCCTTTTTT***C
TTTAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAG
TAGTAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGACTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCT
GGAGACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCGGTTTTACCGGCAT
TGATCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTTAGCGTCT
GCACGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGA
AGAGAACCTCAGAGGCACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGT
CAAGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGTTGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCCCG
GCGTGACCGCAGCGCTGATGATGTTG
C

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4G455JQ 597 0 0
G
CAATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTT*GAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAAGAAG
AATCCATCAAAGGGAAAAGAAAAAACAAACAGGCATTGTTGTTCCTAAGTCCTTTTTTAT
TCTTTAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAA
AGTAGTAGCCGAAACGAGTTCAGTGGAAAGACTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAAT
CTGGAGACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGCCAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTACCGGC
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CTGCACGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGAC
GAAGAGAACCTCAGAGGCACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAG
GTCAAGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGTTGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCC
CGGCGTGACCGCAGCGCTGATGATGTTGGTGGTGTTACCAGGAGTGCCTAGGCTGA

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR4GQ54JQ 242 0 0
CGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTTAGCGTCTGCACGTAGACAGAGTTGGCGGAGGA
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AGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAAGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAG
ACCGTTGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCCCGGCGTGACCGCAGCGCTGATGATGTT
G
C

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4H540JQB 758 0 0
CGGTAT
GAAATGAAAAGCTCACATTACAATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTT*GAAGAATTACA
AAACAGACAAAGACAAGAAGAATCCATCAAAGGGAAAAGAAAAAACAAACAGGCATTGTT
GTTCCTAAGTCCTTTTTTATTCTTTAGCCAGTTCCACCAAGAGCACCCTTAAGCGTCTTG
ATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTAGTAGCCGAAACGAGTTCAGTGGAAAGACTGTTGGCG
AATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGGAGACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCT
GCAGCAGCTGTTTTACCGGCATTGATCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATG
ACCTGTCCCGGTTTTAGCGTCTGCACGTAAACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCG
GTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAAAAAACCTCAAAGGCACCAGGGTGAGTGTGCATTGGG
ATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAAGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGTTGAGAGCC
GGGAACTGAGCGACGAAGCCCGGCGTGACCGCAGCGCTGATGATGTTGGTGGTGTTACCA
GGAGTGCCTAGGCTGAAGACGAAGTCCGAGGCTTTGACATGGATGGGGCGAATGCAAGGG
TAGCCAGCTGGGGTCTCAGCGCGTTTCAGGTTGGCCACACAGAAGTCTTGAACTGAGGCA
TTGGATAGAGCAAAGAGGAGAGATAAGAGGAA

QA 7 758 7 758
DS 

RD RR4DM76TF 666 0 0
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TAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGACTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAAAATCTGGA
GACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCGGTTTTACCGGCATTGA
TCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCTGGTTTTAGCGTCTGCA
CGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAGA
GAACCTCAGAGGCACCAGGGTGGGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAA
GCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGGCCGTTGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCCCGGCG
TGACCGCAGCGCTGATGATGTTGGTGGTGTTGCCAGGAGTGCCTAAGCTGAAGACGAAGT
CCGAGGCTTTGACATGGATGGGGCGAATGCAAGGGTAGCCAGCAGGGGTCTCAGCGCGTT
TCAGGTTGGCCACACAGAAGTCTTGAACTGAGGCATTGGATAGAGCGAAGAGGAGAGATA
TGAGGAAGATAATGCGCAACATTTTT*GATTGATTGGTTGGTTGGTGTAAGTTTTTTTTG
CTCTCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4G455TF 665 0 0
AGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTAG
TAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGACTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGGA
GACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGCCAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTACCGGCATTGA
TCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTTAGCGTCTGCA
CGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAGA
GAACCTCAGAGGCACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAA
GCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGTTGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCCCGGCG
TGACCGCAGCGCTGATGATGTTGGTGGTGTTACCAGGAGTGCCTAGGCTGAAGACGAAGT
CCGAGGCTTTGACATGGATGGGGCGAATGCAAGGGTAGCCAGCTGGGGTCTCAGCGCGTT
TCAGGTTGGCCACACAGAAGTCTTGAACTGAGGCATTGGATAGAGCAAAGAGGAGAGATA
AGAGGAAGATAATGCACAACATTTTTTGATTGATTGGTTGGTTGGTGTAAGTTTTTTTTG
CTC
CC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4H540TF 639 0 0
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TGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGGAGACCAGGACTAGCGCTGCTGAAAGTGA
CAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTACCGGCATTGATCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGA
ACACCATGACCTGTCCCGGTTTTAGCGTCTGCACGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGA
ACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAGAGAACCTCAGAGGCACCAGGGTGAGTGT
GCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAAGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGT
TGAGAGCCGGGAACTGAGCGACGAAGCCCGGCGTGACCGCAGCGCTGATGATGTTGGTGG
TGTTACCAGGAGTGCCTAGGCTGAAGACGAAGTCCGAGGCTTTGACATGGATGGGGCGAA
TGCAAGGGTAGCCAGCTGGGGTCTCAGCGCGTTTCAGGTTGGCCACACAGAAGTCTTGAA
CTGAGGCATTGGATAGAGCAAAGAGGAGAGATAAGAGGAAGATAATGCACAACATTTTTT
GATTGATTGGTTGGTTGGTGTAAGTTTTTTTTGCTC
TCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 8

CO CL934Contig1 603 8 2 U
CAGATGCATAAACTTAATTATGATAGGGCAGAGCCAAAAACATTTTCAGTAAACCGTTTC
AATCAATCACACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAG
TTTTACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGT
GTTTGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTT
TACCATTTTTCACCAGTACAAAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACAT
CGGGAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCAACATCAGTGAACTTGGCAGACATGG
CAATGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCA
CCAGCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGC
TGAACTTCATGACGCGATTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTC
CTAACACAGATGATAATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCTGAA
CCC


BQ
10 10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 
10 10 10 

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AF RR4E128TF C 1
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AF RR4DR48TF C 2
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ACGATCCTTTCGATCTCTTTACCATTTTTCACCAGTACAAAAGTTGGCATCCCCGTCACG
TTGAACTCTTTAGCCACATCGGGAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCAACATCA
GTGAACTTGGCAAACATGGCAATGA

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DS 

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AATCAATCACACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAG
TTTTACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGT
GTTTGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTT
TACCATTTTTCACCAGTACAAAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACAT
CGGGAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCAACATCAGTGAACTTGGCAGACATGG
CAATGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCA
CCAGCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGC
TGAACTTCATGACGCGATTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTC
CTAACACAGATGATAATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCT
GACCC

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DS 

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GC
ATGCATAAACTTAATTATGATAGGGCAGAGCCAAAAACATTTTCAGTAAACCGTTTCAAT
CAATCACACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAGTTT
TACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGTGTT
TGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTTTAC
CATTTTTCACCAGTACAAAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACATCGG
GAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCAACATCAGTGAACTTGGCAGACATGGCAA
TGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCACCA
GCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGCTGA
ACTTCATGACGCGATTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTCCTA
A

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DS 

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TCAATCGCACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAGTT
TTACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGTGT
TTGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTTTA
CCATTTTTCACCAGTACAGAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACATCG
GGAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCGACATCAGTGAACTTGGCAGACATGGCA
ATGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCACC
AGCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGCTA
AACTTCATGACGCGACTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTCCT
AACACAGATGATAATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCT
CC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4EA36TF 597 0 0
GATGCATAAACTTAATTATGATAGGGCAGAGCCAAAAACATTTTCAGTAAACCGTTTCAA
TCAATCGCACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAGTT
TTACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGTGT
TTGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTTTA
CCATTTTTCACCAGTACAGAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACATCG
GGAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCGACATCAGTGAACTTGGCAGACATGGCA
ATGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCACC
AGCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGCTA
AACTTCATGACGCGACTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTCCT
AACACAGATGATAATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCT
CC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4E128TF 602 0 0
CA
GATGCATAAACTTAATTATGATAGGGCAGAGCCAAAAACATTTTCAGTAAACCGTTTCAA
TCAATCACACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAGTT
TTACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGTGT
TTGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTTTA
CCATTTTTCACCAGTACAAAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACATCG
GGAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCAACATCAGTGAACTTGGCAGACATGGCA
ATGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCACC
AGCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGCTG
AACTTCATGACGCGATTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTCCT
AACACAGATGATAATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCT
GACCC

QA 3 597 3 597
DS 

RD RR4FS35TF 344 0 0
GTACAAAAGTTGGCATCCCGGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACATCGGGAAGTTCATCGA
CATCCAATTTGACGAATTCAACATCAGTGAACTTGGCAGACATGGCAATGAAGGCAGGCT
CGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCACCAGCAGTTTGGAGG
ATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGCTGAACTTCATGACGC
GATTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTCCTAACACAGATGATA
ATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCT
CC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR4DR48TF 602 0 0
GC
ATGCATAAACTTAATTATGATAGGGCAGAGCCAAAAACATTTTCAGTAAACCGTTTCAAT
CAATCACACAGAAGGGAGAAAGAGGGATCAACAAAGCCAATTATTAATAGTAATAAGTTT
TACACAATGGCTATATCCGGTGAAGGTGTGTTAACTCAATGGATCACTATGCCCTGTGTT
TGAGAACTTTCTTCTCAAGTTCATCTTTCCTTGCTCCAACGATCCTTTCAATCTCTTTAC
CATTTTTCACCAGTACAAAAGTTGGCATCCCCGTCACGTTGAACTCTTTAGCCACATCGG
GAAGTTCATCGACATCCAATTTGACGAATTCAACATCAGTGAACTTGGCAGACATGGCAA
TGAAGGCAGGCTCGATCATCCTACAAGGTCCACACCAGGATGCTGAGAAGTCAACCACCA
GCAGTTTGGAGGATTCTTTGATCTCGTTGAAGTGAAGCTGCCACCGAGCCGATGAGCTGA
ACTTCATGACGCGATTTTCGGATTCATTCCCTGCGACTGCTTCTTCTCCACCACCTCCTA
ACACAGATGATAATACACCTCCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCTTCTCTGAACCC

QA 3 602 3 602
DS 



AS 1 8

CO CL935Contig1 1543 8 19 U
GGAATCAATCATACACATGCATTTTAAAAGATTCCTCTCCATCTAAACCGATCTTAAGCT
CAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGACTAGCAT
TGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTGTGGCTCA
GAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTAAATTGAT
GGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAGGAGCTGC
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TGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCAACACACG
GAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGGAGAAAGT
TTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTTTCAACTG
GAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTGAGGACCA
GAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAGAACTGCT
CTCTAAAGGCATGCAAAAAGCAGATCAGGCTCTGCTTTCTGGATGTTCAGCTGGAGGATT
AGCTTCCATCCTGCACTGCGATAAGTTCAAGGGACTCTTACCCGGTACTACCAAAGTTAA
ATGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTCATGGATGCAGTGGATGTCTCTGGTGGCCACTCGCT
CAGGAACATGTTCCAAGGTGTTGTTACAGTCCAGAACCTCCAAAAGGAACTGTCCACTAC
TTGTACAAAGCATTTGGATCCAACTTCGTGCTTCTTTCCCCAAAACTTGGTTTCAGAGAT
TAAGACTCCCATGTTTCTTCTAAATGCAGCTTACGACGCTTGGCAGGTACAAGAGAGCTT
AGCTCCTCCATCTGCTGACAGAACCGGCTCTTGGAAACCATGCACATCAGATCACTCTCG
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AAAGTCTTTTTCGGCCTCGACTCAGAACGGTCTGTTCATAAACTCATGCTTCGCTCACTG
CCAATCCGAAAGACAGGACACTTGGTTTGCACCTGATTTTCCTAAGCTTAATGGCAAGAC
GGTTGCTGAATCTGTTGGTGATTGGTACTTTGACCGAAAAGCAGTCAAAGCCATTGACTG
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AAAAAATCCTCAAACTCAAACAGCTTCTTGATTCTTTCACATTATTTATGATGCTATCTT
CTCCTTGTTGTCCGTTTTTATTTGTGTTTGAGTATATGCATTGGATTTAAAAGTGTATAC
ATTTAAATGAAGCTTAAAAATTAATAAAAAGATCACATTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD87TF U 1
AF RR4DX14TF U 55
AF RR4F105TF U 42
AF RR4FN91TF U 54
AF RR4BC39TF U 54
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AF RR4BC39JQ C 1036
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BS 354 354 RR4F105TF
BS 355 674 RR4BD87TF
BS 675 688 RR4F105TF
BS 689 689 RR4BC39TF
BS 690 719 RR4F105TF
BS 720 720 RR4BC39TF
BS 721 747 RR4F105TF
BS 748 843 RR4BC39TF
BS 844 844 RR4F105JQ
BS 845 880 RR4BC39TF
BS 881 1104 RR4F105JQ
BS 1105 1105 RR4BC39JQ
BS 1106 1149 RR4F105JQ
BS 1150 1150 RR4BC39JQ
BS 1151 1238 RR4F105JQ
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BS 1240 1369 RR4F105JQ
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RD RR4BD87TF 674 0 0
GGAATCAATCATACACATGCATTTTAAAAGATTCCTCTCCATCTAAACCGATCTTAAGCT
CAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGACTAGCAT
TGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTGTGGCTCA
GAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTAAATTGAT
GGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAGGAGCTGC
CTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATCATATACACCATGGTTT
TGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCAACACACG
GAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGGAGAAAGT
TTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTTTCAACTG
GAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTGAGGACCA
GAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAGAACTGCT
CTCTAAAGGCATGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4DX14TF 625 0 0
G
AAGCTCAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGACT
AGCATTGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTGTG
GCTCAGAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTAAA
TTGATGGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAGGA
GCTGCCTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATCATATACACCAT
GGTTTTGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCAAC
ACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGGAG
AAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTTTC
AACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTGAG
GACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAGAA
CTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAA

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR4F105TF 706 0 0
GGG
AAACCGATCTTAAGCTCAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTG
TGGAGATGACTAGCATTGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTG
TCGGGTGTGTGGCTCAGAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGA
TGGAAAGTAAATTGATGGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCT
TGATTCAAGGAGCTGCCTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATC
ATATACACCGTGGTTTTGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAG
GATGGTGCAACACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGA
ATCACATGGAGAAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATC
CTGACTTTTTCAACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTG
GCGATAGTGAGGACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAG
CTATGGAAGAACTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAAGCAGATCAG*CTCTGCTTTCTGGAT
GTTCAGCTGGAGGAT*AGCTTCCATCCTGCACTGCGATAAGTT

QA 4 706 4 706
DS 

RD RR4FN91TF 699 0 0
GG
AAGCTCAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGACT
AGCATTGCGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTGTG
GCTCAGAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTAAA
TTGATGGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAGGA
GCTGCCTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATCATATACACCGT
GGTTTTGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCAAC
ACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGGAG
AAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTTTC
AACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTGAG
GACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAGAA
CTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAAGCAGATCAGGCTCTGCTTTCTGGATGTTCAGCTGGA
GGATTAGCTTCCATCCTGCACTGCGATAAGTT
CAAGG

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4BC39TF 827 0 0
GG
AAGCTCAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGACT
AGCATTGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTGTG
GCTCAGAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTAAA
TTGATGGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAGGA
GCTGCCTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATCATATACACCGT
GGTTTTGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCAAC
ACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGGAG
AAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTTTC
AACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTGAG
GACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAGAA
CTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAAGCAGATCAGGCTCTGCTTTCTGGATGTTCCGCTGGA
GGATTAGCTTCCATCCTGCACTGCGATAAGTTCAAGGGACTCTTACCCGGTACTACCAAA
GTTAAATGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTCATGGATGCAGTGGATGTCTCTGGTGGCCAC
TCGCTCAG*AACATGTTCCAAGGTGTTGTTACAGTCCAGAACCTC

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DS 

RD RR4F105JQ 636 0 0
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CTGGAATGTTCATGGATGCAGTGGATGTCTCTGGTGGCCACTCGCTCAGGAACATGTTCC
AAGGTGTTGTTACAGTCCAGAACCTCCAAAAGGAACTGTCCACTACTTGTACAAAGCATT
TGGATCCAACTTCGTGCTTCTTTCCCCAAAACTTGGTTTCAGAGATTAAGACTCCCATGT
TTCTTCTAAATGCAGCTTACGACGCTTGGCAGGTACAAGAGAGCTTAGCTCCTCCATCTG
CTGACAGAACCGGCTCTTGGAAACCATGCACATCAGATCACTCTCGTTGTAACTCATCTC
AAATCCAGTTCTTCCAAGACTTCAGGAGTAAAATGGTGAATGTTGTAAAGTCTTTCTCGG
CCTCGACTCAGAACGGTCTGTTCATAAACTCATGCTTCGCTCACTGCCAATCCGAAAGAC
AGGACACTTGGTTTGCACCTGATTCTCCTAAGCTTAATGGCAAGACGGTTGCTGAATCTG
TTGGTGATTGGTACTTTGACCGAAAAGCAGTCAAAGCCATTGACTGTCCTTACCCTTGTG
ACAAAACATGCCACAACCTCATCTTCAAATGAGTT
C

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DS 

RD RR4BC39JQ 317 0 0
TGACAGAACCGGCTCTTGGAAACCATGCACATCAGATCACTCTCGTTGTAACTCATCTCA
AATCCAGTTTTTCCAAGACTTCAGGAGTAAAATGGTGAATGTTGTAAAGTCTTTTTCGGC
CTCGACTCAGAACGGTCTGTTCATAAACTCATGCTTCGCTCACTGCCAATCCGAAAGACA
GGACACTTGGTTTGCACCTGATTTTCCTAAGCTTAATGGCAAGACGGTTGCTGAATCTGT
TGGTGATTGGTACTTTGACCGAAAAGCAGTCAAAGCCATTGACTGTCCTTACCCTTGTGA
CAAAACATGCCACAACC

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DS 

RD RR4FN91JQ 496 0 0
TTT
TTGGAAACCATGCACATCAGATCACTCTCGTTGTAACTCATTTCAAATCCAGTTTTTCCA
AGACTTCAGGAGTAAAATGGTGAATGTTGTAAAGTTTTTTTCGGCCTCGACTCAGAACGG
TCTGTTCATAAACTCATGCTTCGCTCACTGCCAATCCGAAAGACAGGACACTTGGTTTGC
CCCTGATTTTCCTAAGCTTAATGGCAAGACGGTTGCTGAATCTGTTGGTGATTGGTACTT
TGACCGAAAAGCAGTCAAAGCCATTGACTGTCCTTACCCTTGTGACAAAACATGCCACAA
CCTCATTTTCAAATGAGTTGAAAAAAAAAAAAAAAATCCTCAAACTCAAACAGCTTCTTG
ATTCTTTCACATTATTTATGATGCTATCTTCTCCTTGTTGTCCGTTTTTATTTGTGTTTG
AGTATATGCATTGGATTTAAAAGTGTATACATTTAAATGAAGCTTAAAAATTAATAAAAA
GATCACATTTCGC

QA 4 496 4 496
DS 



AS 1 7

CO CL936Contig1 1185 7 6 U
GAGGGAGGGGCTCCCTGTATTTCGATTTATAAAATCGGTTACTATTCCTGAATCCTACAA
AAGAAAAAGAGATAAAAAACTGGGGATATTGTGTGATTAGTTTAGTTGGTATCCAAAACT
AAAATAGAAAATTCAAGTAAATAAGTAAAAAAAAAAGGGGGGGGTCTTGAATCAAAATAA
TTTAAAGTTCTTATTTCTGTCAGAGGGCAATATGAATGTTTTATCATGTTCCATCAATAC
ACTAATAAAAGAAGGGTTATATGAGATATCTGGTGTGGAAGTAGGCCAACATTTCTATTG
GCAAATAGGGGGGTTCCAAGTCCATGCGCAAGTCCTTATTACTTCTTGGGTTGTAATTGC
TATCTTATTAGGTTCCGCAGCTCTAGCGGTTCGCAATCCACAAACCATTCCAACTGGCGG
CCAAAACTTCTTTGAATTTGTCCTTGAATTCATTCGAGATGTGAGTCAAACCCAGATTGG
AGAAGAATACGGTCCTTGGGTTCCCTTTATTGGAACCCTGTTTTTATTTATTTTTGTTTC
TAACTGGTCAGGAGCCCTTTTACCGTGGAAAATTATCCAGTTACCTCAAGGGGAGTTAGC
AGCACCAACGAATGATATAAATACGACGGTTGCTTTAGCTTTACTCACATCAGTAGCATA
TTTTTATGCGGGTCTTAGCAAAAAAGGATTAGGGTATTTCAGTAAATACATTCAACCAAC
TCCAATTCTTTTACCCATTAACATCTTAGAAGATTTTACAAAACCCCTATCACTTAGTTT
TCGACTTTTCGGAAATATATTAGCCGATGAATTAGTAGTTGTTGTACTTGTTTCTTTAGT
ACCTTTAGTGGTTCCTATACCTGTTATGTTCCTTGGATTATTTACAAGCGGGATTCAAGC
TCTCATTTTTGTCACTTTAGCTGCGGCTTATATAGGTGAATCTATGGAGGGTCATCATTA
ACTATTTTTTTTCAAATTTAGGTTAGCCCAATTATCGAATAGTTGGTTTGCGTTATGTAA
GAAACACTTGTATATGTCATATTTGATATTGACTAGGTATATAAGTTAAAGATCCATATA
ATCTGCCCCACTACTTTTGTGAATTTCTATTTAGATAACGATTCAATTATAAGTTCTTAC
TTTTTATCTGTGAATTGGCTGAAAAAAACGATCAAAAAAGGAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A936TF U 1
AF RR4A345JQ C 163
AF RR4A345TF U 316
AF RR4A345JQD C 163
AF RR4A345TFB U 278
AF RR4AK18JQ C 535
AF RR4AK18TF U 535
BS 1 276 RR4A936TF
BS 277 277 RR4A345JQ
BS 278 419 RR4A936TF
BS 420 420 RR4A345TF
BS 421 682 RR4A936TF
BS 683 1185 RR4AK18TF

RD RR4A936TF 682 0 0
GAGGGAGGGGCTCCCTGTATTTCGATTTATAAAATCGGTTACTATTCCTGAATCCTACAA
AAGAAAAAGAGATAAAAAACTGGGGATATTGTGTGATTAGTTTAGTTGGTATCCAAAACT
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TTTTTATGCGGGTCTTAGCAAA

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ATCATGTTCCATCAATACACTAATAAAAGAAGGGTTATATGAGATATCTGGTGTGGAAGT
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A

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ATTTGTCCTTGAATTCATTCGAGATGTGAGTCAAACCCAGATTGGAGAAGAATACGGTCC
TTGGGTTCCCTTTATTGGAACCCTGTTTTTATTTATTTTTGTTTCTAACTGGTCAGGAGC
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TAGC

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ATCATGTTCCATCAATACACTAATAAAAGAAGGGTTATATGAGATATCTGGTGTGGAAGT
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TTCTTGGGTTGTAATTGCTATCTTATTAGGTTCCGCAGCTCTAGCGGTTCGCAATCCACA
AACCATTCCAACTGGCGGCCAAAACTTCTTTGAATTTGTCCTTGAATTCATTCGAGATGT
GAGTCAAACCCAGATTGGAGAAGAATACGGTCCTTGGGTTCCCTTTATTGGAACCCTGTT
TTTATTTATTTTTGTTTCTAACTGGTCAGGAGCCCTTTTACCGTGGAAAATTATCCAGTT
ACCTCAAGGGGAGTTAGCAGCACCAACGAATGATATAAATACGACGGTTGCTTTAGCTTT
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ATTACTTCTTGGGTTGTAATTGCTATCTTATTAGGTTCCGCAGCTCTAGCGGTTCGCAAT
CCACAAACCATTCCAACTGGCGGCCAAAACTTCTTTGAATTTGTCCTTGAATTCATTCGA
GATGTGAGTCAAACCCAGATTGGAGAAGAATACGGTCCTTGGGTTCCCTTTATTGGAACC
CTGTTTTTATTTATTTTTGTTTCTAACTGGTCAGGAGCCCTTTTACCGTGGAAAATTATC
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G
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TTAGCAGCACCAACGAATGATATAAATACGACGGTTGCTTTAGCTTTACTCACATCAGTA
GCATATTTTTATGCGGGTCTTAGCAAAAAAGGATTAGGGTATTTCAGTAAATACATTCAA
CCAACTCCAATTCTTTTACCCATTAACATCTTAGAAGATTTTACAAAACCCCTATCACTT
AGTTTTCGACTTTTCGGAAATATATTAGCCGATGAATTAGTAGTTGTTGTACTTGTTTCT
TTAGTACCTTTAGTGGTTCCTATACCTGTTATGTTCCTTGGATTATTTACAAGCGGGATT
CAAGCTCTCATTTTTGTCACTTTAGCTGCGGCTTATATAGGTGAATCTATGGAGGGTCAT
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ATATAATCTGCCCCACTACTTTTGTGAATTTCTATTTAGATAACGATTCAATTATAAGTT
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G
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TTAGCAGCACCAACGAATGATATAAATACGACGGTTGCTTTAGCTTTACTCACATCAGTA
GCATATTTTTATGCGGGTCTTAGCAAAAAAGGATTAGGGTATTTCAGTAAATACATTCAA
CCAACTCCAATTCTTTTACCCATTAACATCTTAGAAGATTTTACAAAACCCCTATCACTT
AGTTTTCGACTTTTCGGAAATATATTAGCCGATGAATTAGTAGTTGTTGTACTTGTTTCT
TTAGTACCTTTAGTGGTTCCTATACCTGTTATGTTCCTTGGATTATTTACAAGCGGGATT
CAAGCTCTCATTTTTGTCACTTTAGCTGCGGCTTATATAGGTGAATCTATGGAGGGTCAT
CATTAACTATTTTTTTTCAAATTTAGGTTAGCCCAATTATCGAATAGTTGGTTTGCGTTA
TGTAAGAAACACTTGTATATGTCATATTTGATATTGACTAGGTATATAAGTTAAAGATCC
ATATAATCTGCCCCACTACTTTTGTGAATTTCTATTTAGATAACGATTCAATTATAAGTT
CTTACTTTTTATCTGTGAATTGGCTGAAAAAAACGATCAAAAAAGGAACG

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DS 



AS 1 7

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TTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGGCGGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCAAAACTGGTCCT
TAATAAAAAAAATATTTTGTGGTTGGGAGAGGAGTTCGCACGGGTTATTTTTTTTATCCC
GGGTTCTCCTCTCTTTGTGTGCGTGTCTTGCTCTCTCTTTCTCTATTTTTTTATTATGCA
CCACAGCACAAAGAGACCATCATGAAACACCGCTTAGTTTTGAGCTATCAACCTGGAGCT
GTGCCCCTCATATTCTTCATGAAACCCAAGAAGCACCCGTAAGTTTGTTAATTTACGTTC
TTTAATTTCTGTAAGTATATCGCAAACCAACCACCATACCAGACTTTCCAAAGAATACGG
TATATATAACAACACCACCGCAATTGGTCGTTCTAATTTTATCTTAAATCTATTTGTGGA
AGTGTTTTTTTATGAGACCCTTGGAAAGTCATTGAGCATACAATCCGAATTATTTAGATT
ATTCGTAAACCATTGACCTTAATTTAATACAGAACATGAACATTTACCTCAATCTTCTAC
CGTACACGTTATATCTGTTGGAGATGTATGATTCTTGAATTTTTAATTTTTGTTGGTACC
ATAATACAGAACTTGTGTTTGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGCAGGTTGTTGTGGGCC
CTTCCTCAGGCCCAGCCTAAAAAGTTTCCCGACTTCCGAATTGAAGGTATTATCAAGCAA
AAGTTTGCCACTGTTATATATCTTAAATTTTTTATGTATCTCTCTTTATCAATTTTAAAA
GAATGTTTATGTTAATTTTTGGCTATTTTTGGGTATGTGATTAGACTATTTTCTGTAACA
GTTCGTATTATGTCCTTGCAATACATTTGAAACTTCTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E010TF U 51
AF RR4E919TF U 1
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AF RR4AS75TF U 401
AF RR4B186TF U 401
BS 1 720 RR4E919TF
BS 721 941 RR4AS75TF

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TTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGGCGGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCAAAACTGGTCCT
TAATAAAAAAAATATTTTGTGGTTGGGAGAGGAGTTCGCACGGGTTATTTTTTTTATCCC
GGGTTCTCCTCTCTTTGTGTGCGTGTCTTGCTCTCTCTTTCTCTATTTTTTTATTATGCA
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ATAATACAGAACTTGTGTTTGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGCAGGTTGTTGTGGGCC

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QA 1 143 1 143
DS 

RD RR4E010JQ 688 0 0
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ATGCACCACAGCACAAAGAGACCATCATGAAACACCGCTTAGTTTTGAGCTATCAACCTG
GAGCTGTGCCCCTCATATTCTTCATGAAACCCAAGAAGCACCCGTAAGTTTGTTAATTTA
CGTTCTTTAATTTCTGTAAGTATATCGCAAACCAACCACCATACCAGACTTTCCAAAGAA
TACGGTATATATAACAACACCACCGCAATTGGTCGTTCTAATTTTATCTTAAATCTATTT
GTGGAAGTGTTTTTTTATGAGACCCTTGGAAAGTCATTGAGCATACAATCCGAATTATTT
AGATTATTCGTAAACCATTGACCTTAATTTAATACAGAACATGAACATTTACCTCAATCT
TCTACCGTACACGTTATATCTGTTGGAGATGTATGATTCTTGAATTTTTAATTTTTGTTG
GTACCATAATACAGAACTTGTGTTTGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGCAGGTTGTTGT
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AGCAAAAGTTTGCCACTGTTATATATCTTAAATTTTTTATGTATCTCTCTTTATCAATTT
TAAAAGAATGTTTATGTTAATTTTTGGC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4E919JQ 638 0 0
TTTTTTTATTATGCACCACAGCACAAAGAGACCATCATGAAACACCGCTTAGTTTTGAGC
TATCAACCTGGAGCTGTGCCCCTCATATTCTTCATGAAACCCAAGAAGCACCCGTAAGTT
TGTTAATTTACGTTCTTTAATTTCTGTAAGTATATCGCAAACCAACCACCATACCAGACT
TTCCAAAGAATACGGTATATATAACAACACCACCGCAATTGGTCGTTCTAATTTTATCTT
AAATCTATTTGTGGAAGTGTTTTTTTATGAGACCCTTGGAAAGTCATTGAGCATACAATC
CGAATTATTTAGATTATTCGTAAACCATTGACCTTAATTTAATACAGAACATGAACATTT
ACCTCAATCTTCTACCGTACACGTTATATCTGTTGGAGATGTATGATTCTTGAATTTTTA
ATTTTTGTTGGTACCATAATACAGAACTTGTGTTTGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGC
AGGTTGTTGTGGGCCCTTCCTCAGGCCCAGCCTAAAAAGTTTCCCGACTTTTGAATTGAA
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TTATCAATTTTAAAAGAATGTTTATGTTAATTTTTGGC

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DS 

RD RR4AS75TF 541 0 0
G
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TCTTAAATCTATTTGTGGAAGTGTTTTTTTATGAGACCCTTGGAAAGTCATTGAGCATAC
AATCCGAATTATTTAGATTATTCGTAAACCATTGACCTTAATTTAATACAGAACATGAAC
ATTTACCTCAATCTTCTACCGTACACGTTATATCTGTTGGAGATGTATGATTCTTGAATT
TTTAATTTTTGTTGGTACCATAATACAGAACTTGTGTTTGAAGTTCGGAGCCAGTGATAT
ATGCAGGTTGTTGTGGGCCCTTCCTCAGGCCCAGCCTAAAAAGTTTCCCGACTTCCGAAT
TGAAGGTATTATCAAGCAAAAGTTTGCCACTGTTATATATCTTAAATTTTTTATGTATCT
CTCTTTATCAATTTTAAAAGAATGTTTATGTTAATTTTTGGCTATTTTTGGGTATGTGAT
TAGACTATTTTCTGTAACAGTTCGTATTATGTCCTTGCAATACATTTGAAACTTCTCAAT

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DS 

RD RR4B186TF 541 0 0
G
GACTTTCCAAAGAATACGGTATATATAACAACACCACCGCAATTGGTCGTTCCAATTTTA
TCTTAAATCTATTTGTGGAAGTGTTTTTTTATGAGACCCTTGGAAAGTCATTGAGCATAC
AATCCGAATTATTTAGATTATTCGTAAACCATTGACCTTAATTTAATACAGAACATGAAC
ATTTACCTCAATCTTCTACCGTACACGTTATATCTGTTGGAGATGTATGATTCTTGAATT
TTTAATTTTTGTTGGTACCATAATACAGAACTTGTGTTTGAAGTTCGGAGCCAGTGATAT
ATGCAGGTTGTTGTGGGCCCTTCCTCAGGCCCAGCCTAAAAAGTTTCCCGACTTCCGAAT
TGAAGGTATTATCAAGCAAAAGTTTGCCACTGTTATATATCTTAAATTTTTTATGTATCT
CTCTTTATCAATTTTAAAAGAATGTTTATGTTAATTTTTGGCTATTTTTGGGTATGTGAT
TAGACTATTTTCTGTAACAGTTCGTATTATGTCCTTGCAATACATTTGAAACTTCTCAAT

QA 2 541 2 541
DS 



AS 1 8

CO CL938Contig1 1090 8 8 U
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CTTTGGATCCAAACATCGTTTTTTAATTCGAAATCAAGGTATAAGGAAAGCTTTGAGGGA
TCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAA
GCTTTCCATTTGTAGGAGCTTTGCACTCCAAGTCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTT
GCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGT
TTAAAACTATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTC
AAAGAGCCATTCCTGTTCTCAAAAATGCTTACGGGGACAGCATGCGGAAAGTCTTGCACG
TGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCAT
GGGGTGTTGAGCCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTATTGCGTA
AAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTT
CTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCG
TTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTA
AGCAAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCT
CGTCCTGGTGGAGCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCA
AGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACC
TCAAGCCATTACATTAGAACGTTATTAGTATTATTGTTACTTGTCTTCGAACCAAATATA
TCTTCCACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAA
AAATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCATAAGTTAACTATTTAATAAATTAGCCTG
CCTTTATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D991TF U 1
AF RR4DF36TF U 5
AF RR4AP05TF U 30
AF RR4DF36JQ C 627
AF RR4D991JQ C 252
AF RR4DB26JQ C 790
AF RR4DB26TF U 790
AF RR4AP05JQ C 579
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BS 26 649 RR4D991TF
BS 650 668 RR4DF36TF
BS 669 704 RR4AP05TF
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BS 790 1049 RR4DB26TF
BS 1050 1090 RR4AP05JQ

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GCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGT
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AAAGAGCCATTCCTGTTCTCAAAAATGCTTACGGGGACAGCATGCGGAAAGTCTTGCACG
TGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCAT
GGGGTGTTGAGCCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTATTGCGTA
AAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTT
CTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCT

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DS 

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GG
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ATCCAAACATCGTTTTTTAATTCGAAATCAAGGTATAAGGAAAGCTTTGAGGGATCTTAG
TCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTC
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TTGAGCCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCCATTGCGTAAAGGCC
TTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTG
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AA

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TCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGCCTTCTCATT
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GGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACT
CTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCGTATGATGTAGAGGATGCA
GACTCCAAATGCAAAAGTCTATTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTC
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AGTATTATTGTTACTTGTCTTCGAACCAAATATATCTTCCACTCTCTGTTATATGCCTTA
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TCCATTCTCAACGTTTTGAT
CCAT

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TACATTAGAACGTTATTAGTATTATTGTTACTTGTCTTCGAACCAAATATATCTTCCACT
CTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAAAATTGTAT
TCCATTCTCAACGTTTTGAT
CCAT

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CGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGTAGCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTA
GAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAA
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AAAGAAGCAGATGTTCAAAAAAAAATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCATAAGTT
AACTATTTAATAAATTAGCCTGCCTTTATTGC

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DS 



AS 1 8

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ACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACTGGTGTATCA
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ATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGA
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GCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTC
AATACCAAACTCTCCAGAAGCTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTG
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TTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGC
AACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTAC
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CCTTTCTATGACAAATAGATTTAAGATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAA
GGTGTAACTCATTTGGTTTAATGTTTCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATGTATAATATT
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BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4A461TF U 48
AF RR4B911TF U 1
AF RR4B830TF U 1
AF RR4BE95JQ C 363
AF RR4BE95TF U 363
AF RR4B830JQ C 153
AF RR4B911JQ C 164
AF RR4A461JQ C 153
BS 1 790 RR4B830TF
BS 791 791 RR4BE95TF
BS 792 808 RR4B830TF
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BS 810 817 RR4B830TF
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BS 819 854 RR4B830TF
BS 855 855 RR4BE95TF
BS 856 863 RR4B830TF
BS 864 864 RR4BE95TF
BS 865 875 RR4B830TF
BS 876 916 RR4BE95TF
BS 917 966 RR4A461JQ

RD RR4A461TF 658 0 0
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CACTGGTGTATCATTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGT
AAGCGCGATACCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAA
AGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGT
TGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATA
TGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACT
ATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACC
GATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGC
AGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGA
AAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCC
AAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4B911TF 707 0 0
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ACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACTGGTGTATCA
TTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGTAAGCGCGATACCG
ATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGA
AAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGAT
GATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATATGACATCGATGCA
TATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGA
GCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACC
GCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTC
AATACCAAACTCTCCAGAAGCTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTG
GTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGA
TTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4B830TF 888 0 0
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ACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACTGGTGTATCA
TTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGTAAGCGCGATACCG
ATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGA
AAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGAT
GATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATATGACATCGATGCA
TATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGA
GCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACC
GCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTC
AATACCAAACTCTCCAGAAGCTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTG
GTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGA
TTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGC
AACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTAC
CATCCAACGATAAGAGCTTATAGAATTT*AACCAAAA*GTTTATAGAGACTGACATGAGC
CCTTTCTATGACAA*TAGATTTA*GATGTGTCTGT
GTGATAAATTTGC

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DS 

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AAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTGTACCGATACAAAGAACCGC
AAGAGGGGGACTTAAGGGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAA
TACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGT
GTATATTGATGTTTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATT
TGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAA
CCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTACCA
TCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACTGACATGAGCCC
TTTTTATGACAAATAGATTTAAGATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGG
TGTAACTCATTTGG
TTT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4BE95TF 557 0 0
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AAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTGTACCGATACAAAGAACCGC
AAGAGGGGGACTTAAGGGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAA
TACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGT
GTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATT
TGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAA
CCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTACCA
TCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACTGACATGAGCCC
TTTCTATGACAAATAGATTTAAGATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGG
TGTAACTCATTTGG
TTT

QA 1 554 1 554
DS 

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CATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAG
TCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGC
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TTTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACC
AATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGA
TGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGCTTGCATTCAGT
GGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTTTACGCTCTCTTCGCTCA
AATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGAC
GGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTTTGTGCAGCAATGT
ATCTTTTTATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGATAAGAGCTTATAGAATTTTAAC
CAAAAAGTTTATAGAGACTGACATGAGCCCTTTTTATGACAAATAGATTTAAGATGTGTC
TGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4B911JQ 753 0 0
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TGAAAGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTG
TGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTAT
TATATGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGC
AACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTA
TACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACG
TTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGCTTGCATTCAGTGGCTGAGACCT
TGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTTTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAA
ACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCG
AATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTTATA
TGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGATAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAAGTTTA
TAGAGACTGACATGAGCCCTTTCTATGACAAATAGATTTAAGATGTGTCTGTTGTGATAA
AATTTGGCTAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4A461JQ 814 0 0
GACACCTATCGTTGTAAGCGCGATACCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATA
CATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAG
TCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGC
AGAAGAATTATTATATGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAG
TTTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACC
AATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGA
TGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGT
GGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCA
AATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGAC
GGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGT
ATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAAC
CAAAAAGTTTATAGAGACTGACATGAGCCCTTTCTATGACAAATAGATTTAAGATGTGCC
TGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGGTTTAATGTTTCTTTTG
GTACTTATTTGGTATAATGTATAATATTAACAAG

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 8

CO CL940Contig1 804 8 10 U
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GAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAACACTTCCTCGATGCTTACTCAATACGACATCGA
AGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTATTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTATCA
AAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGGGATTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTC
TGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTT
GAACTTTAAAGACTTTGTGGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACA
AAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTATGACTCGGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAA
AGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCTGGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGA
GCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACT
GGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGT
GGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAATCTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAG
AATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCC
CAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGAATAACTTTCATCTTAAAAGCATTTTTTTTCTA
TTAGTGAATTGCACTCAGTCGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 25 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 5 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY44TF U 7
AF RR4DY44JQ C 29
AF RR4D375TF U 1
AF RR4BG86TF U 27
AF RR4G464TF U 85
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AF RR4GG83JQ C 36
AF RR4D375JQ C 152
BS 1 107 RR4D375TF
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BS 109 220 RR4D375TF
BS 221 221 RR4DY44TF
BS 222 748 RR4D375TF
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RD RR4DY44TF 546 0 0
GGGAATCAGA
TCAAACGCCTACGACCAAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACATAAAAGTTTG
AAGATGGGCAACACTTCCTCGATGCTTACTCAATACGACATCGAAGAAGTCCAGAGCCAT
TGCCAGGATCTATTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTATCAAAGGTTCTGCCAGTTA
GATCGAAACGCAAAGGGATTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCC
ATGAACCCACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATG*TTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTT
GTGGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATC
TTCCAAGTCTAT**CTCGGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTG
TTGCGGGACTTATCTGGGACATTCGTGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAG
GTTTCGAAGGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCAT

QA 11 546 11 546
DS 

RD RR4DY44JQ 687 0 0
GACCAAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAAC
ACTTCCTCGATGCTTACTCAATACGACATCGAAGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTA
TTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTATCAAAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCA
AAGGGATTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTC
TCTCAGAGGCTGCTTAAGATG*TTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTTGTGGCCTTCTTG
TCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTAT
**CTCGGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTA
TCTGGGACATTCGTGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTCGAAGGAA
GCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGT
GGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAAT
CTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCA
AAATACCATCTCAAGCATGTTTTTG
CC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4D375TF 773 0 0
GGAGACTGAATCAGTCTCAAACGCCTACGACCAAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGAC
GAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAACACTTCCTCGATGCTTACTCGATACGACATCGA
AGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTATTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTATCA
AAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGGGATTTATACCATCTGATGAGTTTCTCTC
TGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTT
GAACTTTAAAGACTTTGTGGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACA
AAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTATGACTCGGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAA
AGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCTGGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGA
GCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACT
GGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGT
GGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAATCTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAG
AATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCC
CAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGA*TA*CTTTCATCTTAAA
GCATTTTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4BG86TF 746 0 0
GG
GACCAAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAAC
ACTTCCTCGATGCTGACTCAATACGACATCGAAGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTA
TTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTATCAGAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCA
AAGGGATTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTC
TCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTTGTTGCCTTCTTG
TCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTAT
GATTCGGACGGCAACGGGAAGGTGTCCTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTA
TCTGGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAA
GCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGT
GGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAAT
CTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTT*GATCA
AAATACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCCCAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGA
*TAACTTTCATCTTAAA
AGCATTT

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR4G464TF 676 0 0
CAACACTTCCTCGATGCTGACTCAATACGACATCGAAGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGA
TCTATTTGAGCAGCAGGAGATACTCCCTCTGTATCAGAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAA
CGCAAAGGGATTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCC
ACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTTGTTGCCTT
CTTGTCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGT
CTATGATTCGGACGGCAACGGGAAGGTGTCCTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGA
CTTATCTGGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAA
GGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGG
GAGTGGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAA
AAATCTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTT*G
ATCAAA*TACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCCCAAA*CTGACTTCAGCTTACATGT
ACAA*TAACTTTCATC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4GG83TF 730 0 0
GG
AAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAACACTTCCTCG
ATGCTTACTCAATACGACATCGAAGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTATTTGAGCAG
CAGGAGATACTCTCTCTGTATCAAAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGGGATTT
ATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGG
CTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTTGTGGCCTTCTTGTCTGCTTTC
AGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTATGACTCGGAC
GGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCTGGGACA
TTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTAC
ACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCG
GAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAATCTCAATCAT
GTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCAT
CTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCCCAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGAATAACTTTC
ATCTT
AAA

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR4GG83JQ 727 0 0
GG
AAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAACACTTCCTCG
ATGCTTACTCAATACGACATCGAAGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTATTTGAGCAG
CAGGAGATACTCTCTCTGTATCAAAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGGGATTT
ATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGG
CTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTTGTGGCCTTCTTGTCTGCTTTC
AGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTATGACTCGGAC
GGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATTTGGGACA
TTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTAC
ACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCG
GAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAATCTCAATCAT
GTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCAT
CTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCCCAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGAATAACTTTC
ATCTT

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR4D375JQ 653 0 0
GAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTATCAAAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAG
GGATTTATACCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCT
CAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTTTAAAGACTTTGTGGCCTTCTTGTCT
GCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTGATCTTCCAAGTCTATGAC
TCGGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCT
GGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCA
GGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGT
AAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAAATCTC
AATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAA
TACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCCCAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGAATA
ACTTTCATCTTAAAAGCATTTTTTTTCTATTAGTGAATTGCACTCAGTCGTCG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 6

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GGAAACACAAAACTCGATAGAGAGACAGGAAGAGCTACTGTTCTATTCGAACTGTTTCAG
ATCTGAACGATTTGTCTTAAAAGTCTCGTCTTTTGAGGATCAGGATTAGTAATCGGAGCT
GGGTTTTGGGTCTGTGAGAGAGAGAAAGTCAACGGATATGCCGGAGGAGGAGTCGGTGGA
TATCAAATTCAGGCTCTACGATGGCTCCGACATCGGACCCTTCCACTATTCGTCTTCATC
TACCGTCGACTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTGATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTGT
TCCGAAAGGGATAAACGAAGTGAAGTCGATTAGTTCGGGTAAGATCTTGGAGAATAACAA
GACCGTTGGTCAGTGTAAGACACCTTTTGGGGAGGCTACTGGTGGTGTCACTGTGATGCA
TGTT*GTTGTACAGCC*TTCTCTCGCCAAAACTAAAACAGAGAAAAAGGTCGATAAAGCA
CCCAAGGCGGTTATATGCACATGCACCATTTTGTGAAAGGAGCAAGACATGTATCATACA
TACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAGAAGAAAACAAAAGAAAAACAAAAAGAAAGGTGAA
AAGTAAAGTATAGCTTCCCTATAAGCTGTGGAGTATCATCATAACCTCGCAATGCAAGCT
TTGAAATCTGTAGAAAATGATTTAGATTCTTTTGAAGTATCTGTTGTTCCTTGTTTGTTT
TTGTTCACACTATCTGGTATACTTCATTCGTGTCGTACTGTAATAAACGGAAGTTGTATA
GGTTACTTTAGCTCTAAATGTTATTATGTGTGATGAAGATGATTATGTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ87JQ C 1
AF RR4DQ87TF U 1
AF RR4BT62TF U 394
AF RR4BT62JQ C 18
BS 1 566 RR4DQ87TF
BS 567 831 RR4BT62JQ

RD RR4DQ87JQ 566 0 0
GGAAACACAAAACTCGATAGAGAGACAGGAAGAGCTACTGTTCTATTCGAACTGTTTCAG
ATCTGAACGATTTGTCTTAAAAGTCTCGTCTTTTGAGGATCAGGATTAGTAATCGGAGCT
GGGTTTTGGGTCTGTGAGAGAGAGAAAGTCAACGGATATGCCGGAGGAGGAGTCGGTGGA
TATCAAATTCAGGCTCTACGATGGCTCCGACATCGGACCCTTCCACTATTCGTCTTCATC
TACCGTCGACTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTGATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTGT
TCCGAAAGGGATAAACGAAGTGAAGTCGATTAGTTCGGGTAAGATCTTGGAGAATAACAA
GACCGTTGGTCAGTGTAAGACACCTTTTGGGGAGGCTACTGGTGGTGTCACTGTGATGCA
TGTT*GTTGTACAGCC*TTCTCTCGCCAAAACTAAAACAGAGAAAAAGGTCGATAAAGCA
CCCAAGGCGGTTATATGCACATGCACCATTTTGTGAAAGGAGCAAGACATGTATCATACA
TACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4DQ87TF 566 0 0
GGAAACACAAAACTCGATAGAGAGACAGGAAGAGCTACTGTTCTATTCGAACTGTTTCAG
ATCTGAACGATTTGTCTTAAAAGTCTCGTCTTTTGAGGATCAGGATTAGTAATCGGAGCT
GGGTTTTGGGTCTGTGAGAGAGAGAAAGTCAACGGATATGCCGGAGGAGGAGTCGGTGGA
TATCAAATTCAGGCTCTACGATGGCTCCGACATCGGACCCTTCCACTATTCGTCTTCATC
TACCGTCGACTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTGATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTGT
TCCGAAAGGGATAAACGAAGTGAAGTCGATTAGTTCGGGTAAGATCTTGGAGAATAACAA
GACCGTTGGTCAGTGTAAGACACCTTTTGGGGAGGCTACTGGTGGTGTCACTGTGATGCA
TGTT*GTTGTACAGCC*TTCTCTCGCCAAAACTAAAACAGAGAAAAAGGTCGATAAAGCA
CCCAAGGCGGTTATATGCACATGCACCATTTTGTGAAAGGAGCAAGACATGTATCATACA
TACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4BT62TF 158 0 0
GTT
TACTGGTGGTGTCACTGTGATGCATGTTTGTTGTACAGCCCTTCTCTCGCCAAAACTAAA
ACAGAGAAAAAGGTCGATAAAGCACCCAAG*CGGTTATATGCACATGCACCATTTTGTGA
AAG*AGCAAGACATGTATCATACATACCATTCTCA

QA 4 158 4 158
DS 

RD RR4BT62JQ 814 0 0
AAGAGAGGAAGAGCTACT
TACTATTCTATTCGAACTGTTTCAGATCTGAACGATTTGTCTTAAAAGTCTCGTCTTTTG
AGGATCAGGATTAGTAATCGGAGCTGGGTTTTGGGTCTGTGAGAGAGAGAAAGTCAACGG
AGATGCCGGAGGAGGAGTCGGTAGATATCAAATTCAGGCTCTACGATGGCTCCGACATCG
GACCCTTCCACTATTCATCTTCATCTACCGTCGACTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTG
ATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTGTTCCGAAAGGGATAAACGAAGTGAAGTTGATTAGTT
CGGGTAAGATCTTGGAGAATAACAAGACCGTTGGTCAGTGTAAGACCCCTTTTGGAGAGG
TTACTGGTGGTGTCACTGTGATGCATGTT*GTTGTACAGCC*TTCTCTCGCCAAAACTAA
AACAGAGAAAAAGGTCGATAAAGCACCCAAGGCGGTTATATGCACATGCACCATTTTGTG
AAAGGAGCAAGACATGTATCATACATACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAGAAGAAAACA
AAAGAAAAACAAAAAGAAAGGTGAAAAGTAAAGTATAGCTTCCCTATAAGCTGTGGAGTA
TCATCATAACCTCGCAATGCAAGCTTTGAAATCTGTAGAAAATGATTTAGATTCTTTTGA
AGTATCTGTTGTTCCTTGTTTGTTTTTGTTCACACTATCTGGTATACTTCATTCGTGTCG
TACTGTAATAAACGGAAGTTGTATAGGTTACTTTAGCTCTAAATGTTATTATGTGTGATG
AAGATGATTATGTATC

QA 19 814 19 814
DS 



CO CL941Contig2 1043 2 2 U
GTAAATCATGGATAAAAATGTTTATGCTTGGCGAACATTTTGAGCTGTCCTCTAGAAGGT
TTGAATGAACAAACATCATACTAGTTGCTTATCATGATAACCGGTAAAAGCTCAACTATT
TTTCCGATGTGACATGCCTCTTCAAAATTTTATAGCTTGACTTTGCTTTGTTTCAAACAA
GAACAAAAACAACAACCAGAAACTTAGGGGATCATAGTCATTAACTAACTTGCTCATGCA
TTTACTATTTATAGTGATCTTAATCTCCCAAACAAACACAAAAATACTCCAGACTCTGAT
GCATTTTACTTATTTTATCATGACCCTAGTCACCGACTAACTTGCTGATGCACAACGTGT
TAGTGGATACACACTTGTTATGAGCCTCATGCATGTATATGAGTAGATGCAAATGATATT
ACAAGAAGTAAAACTGAGCCACAAAACGAATATAACAATCAATACATGATGAAAACATAT
GGAAGCTCTAAGCAAACACAGATTCTCCAATGCCAAAGCAAGAGAAAAAAAATAAAGAAA
AAAAGCAGAACACTTTTTTACCTGTTTTAGTTTTGGCGAGAGAAGGCTGTACAACAACAT
GCATCACAGTGACACCACCAGTAACCTCTCCAAAAGGTGTCTTACACTGACCAACGGTCT
TGTTATTCTCCAAGATCTTACCCGAACTAATCAACTTCACTTCGTTTATCCCTTTCGGAA
CAACTGTTTTGCCTTTGGGCCAATCAGAGACGACCCTTTGCTTCAAAAAGTCGACGGTAG
ATGAAGATGAATAGTGGAAGGGTCCGATGTCGGAGCCATCGTAGAGCCTGAATTTGATAT
CTACCGACTGCTCCTCCGGCATCTCCGTTGACTTTCTCTCTCTCACAGACCCAAAACCCA
GCTCCGATTACTAATCCTGATCCTCAAAAGACGAGACTCTTAAGACAAATCGTTCAGATC
TGAAACAGTTCGAATCTGCAGCGAGAAAGAGAAAAAGAAAAGGTGGAATCAGAGGTTGCT
TGGAACACAGAGAAGGGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GM08JQ U 1
AF RR4DS63TF C 556
BS 1 718 RR4GM08JQ
BS 719 1043 RR4DS63TF

RD RR4GM08JQ 718 0 0
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TTTACTATTTATAGTGATCTTAATCTCCCAAACAAACACAAAAATACTCCAGACTCTGAT
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TAGTGGATACACACTTGTTATGAGCCTCATGCATGTATATGAGTAGATGCAAATGATATT
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AAAAGCAGAACACTTTTTTACCTGTTTTAGTTTTGGCGAGAGAAGGCTGTACAACAACAT
GCATCACAGTGACACCACCAGTAACCTCTCCAAAAGGTGTCTTACACTGACCAACGGTCT
TGTTATTCTCCAAGATCTTACCCGAACTAATCAACTTCACTTCGTTTATCCCTTTCGG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4DS63TF 488 0 0
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CACCAGTAACCTCTCCAAAAGGTGTCTTACACTGACCAACGGTCTTGTTATTCTCCAAGA
TCTTACCCGAACTAATCAACTTCACTTCGTTTATCCCTTTCGGAACAACTGTTTTGCCTT
TGGGCCAATCAGAGACGACCCTTTGCTTCAAAAAGTCGACGGTAGATGAAGATGAATAGT
GGAAGGGTCCGATGTCGGAGCCATCGTAGAGCCTGAATTTGATATCTACCGACTGCTCCT
CCGGCATCTCCGTTGACTTTCTCTCTCTCACAGACCCAAAACCCAGCTCCGATTACTAAT
CCTGATCCTCAAAAGACGAGACTCTTAAGACAAATCGTTCAGATCTGAAACAGTTCGAAT
CTGCAGCGAGAAAGAGAAAAAGAAAAGGTGGAATCAGAGGTTGCTTGGAACACAGAGAAG
GGGAATCC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 2 8

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TTTGGTTTGGGCTTTGCAGTGAATCAGGTTACTTTGGCACC


BQ
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AF RR4BV06TF U 189
AF RR4BV06JQ C 1
BS 1 188 RR4BV06JQ
BS 189 535 RR4BV06TF
BS 536 701 RR4BV06JQ

RD RR4BV06TF 347 0 0
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ATGTGCATCGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGCGGCAAGATGCACAAGAAGGTT
TGGATCGCGGCAGGTGATATCATACTTGTCGGTCTGAGAGACTACCAGGATGACAAGGCT
GATGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCGAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTT
CCCGAGAACACTCGTCTCAACGAAGGTATTGCTGGTGATCTTGACGATGATGAGGAGAAT
GGCGCTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGAT

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4BV06JQ 701 0 0
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AGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCCGATGACGAGAAGCGTGAGCTTA
TATTCAAAGAAGACGGACAAGAGTACGCGCAAGTCCTTCGTATGCTCGGCAACGGGAGAT
GCGAGTGCATGTGCATCGACGGCACCAAACGTTTCTGCCATATCCGCGGCAAGATGCACA
AGAAGGTTTGGATCGCGGCAGGTGATATCATACTTGTCGGTCTGAGAGACTACCAGGATG
ACAAGGCTGATGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCGAGGCTTCTCAAGGCCTATG
GTGAGCTTCCCGAGAACACTCGTCTCAACGAAGGTATTGCTGGTGATCTTGACGATGATG
AGGAGAATGGCGCTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGATCTAAG
GTGCTTGTTTGGTTTTTGTTTTTGCTTTAAACCTTTTCTGGCAGCTTTGTATTGTCAGTT
TGAGACGCATGACTTCTGAGTTTACAGAAAAGTATACTTTACAACTATTATGTTCTTTAG
TTTGGTTTGGGCTTTGCAGTGAATCAGGTTACTTTGGCACC

QA 1 701 1 701
DS 



CO CL942Contig2 667 6 3 U
GGAGAAAACGTTGATCCAAATTCAAAGAGAATCTCCTCACCTCATCGCATCCAAGAAGTT
TTCTTCTCAGCTTTGTTTCAGATCGCTTCTTAGCTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAA
AGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCCGATGACGAGAAGCGTGAGCTTA
TATTCAAAGAAGACGGACAAGAGTACGCGCAAGTCCTTCGTATGCTCGGCAACGGAAGAT
GCGAGTGCATGTGCATCGACGGCACCAAACGTCTCTGCCACATCCGCGGCAAGATGCACA
AGAAGGTTTGGATCGCGGCAGGTGATATCATACTTGTTGGTCTGAGAGACTACCAGGATG
ACAAGGCTGATGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCAAGGCTTCTCAAGGCCTATG
GTGAGCTTCCCGAGAACACTCGTCTCAACGAAGGTATTGCTGGTGATCTTGACGATGATG
AGGAGAATGGCGCTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGATCTAAG
GTGTTTGTTTGGTTTTT**GTTTTTGCTTTGAACCTTTTCTGGCAGCTTTGTATTGTCAG
TTTGAGACGCATGACTTCTGAGTTTACAGAAGAGTATACTTTACAACTATTATGTTCTTT
AAAAAAA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DR41TF U 1
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AF RR4E354TF U 1
AF RR4BY65JQ C 11
AF RR4BY65TF U 11
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DS 

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GCGAGTGCATGTGCATCGACGGCACCAAACGTCTCTGCCACATCCGCGGCAAGATGCACA
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AAA

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GG
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GG
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CTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGATCTAAGGTGTTTGTTTGG
TTTTTTGTTTTTTGCTTTGAACCTTTTCTGGCAGCTTTGTATTGTCAGTTTGAGACGCAC
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QA 3 657 3 657
DS 



AS 1 8

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GTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGC
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AGTTATATAGATTTTGGTGTCTTTTTGTTCAGAATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTC
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BQ
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35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4G485TF U 11
AF RR4G856TF U 11
AF RR4AB41JQ C 1
AF RR4FZ25JQ C 294
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AF RR4FZ25TF U 4
AF RR4G485JQ C 186
AF RR4AB41TF U 8
BS 1 13 RR4AB41JQ
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QA 4 417 4 417
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GGA
AAAGAAAAA*CAAATATCCATACAAACACAATACATATTTGAGAGACACAGAGGAAGAGA
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GTCTT

QA 4 687 4 687
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GTCTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGC
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RD RR4FZ25JQ 468 0 0
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TGCTTTCTGTTTGTGTTACAAGAATGTTAATTAATTTTAATAAATGCC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4G856JQ 478 0 0
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GGCTGTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGC
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TATGAGTTATATAGATTTTGGTGTTTTTTTGTTCAGAATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGC
TTTCTGTTTGTGTTACAAGAATGTTAATTAATTTTAATAAATGCCTATTATATAGA
CC

QA 1 476 1 476
DS 

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AAAGAAAAA*CAAATATCCATACAAACACAATACATATTTGAGAGACACGGAGGAAGAGA
ATAACCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAATAGAAAAAAACAAGCCAAAAATCAGAACGAGA
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ATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAGCTCAAAGTGAGAA
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GCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATATGGCCTTACGTTC
CCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATAGCTCAGGCTTACGACAAGAAGGCGCCGCCTG
GTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCTGTTTACAACGATG
ACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGCTCCATTATGTAAT
TACTAAATCAATAATACAGACGGTTTATATGTATATGTATAAATATGAGTTATTTAGATT
TTGGTGT*TTTTTGTTCAGAATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTCTGTTTGTGTTACA
AGAATG

QA 11 736 11 736
DS 

RD RR4G485JQ 549 0 0
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AGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCTCTAAA
AGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGTTACGC
GGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATATGGCC
TTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATAGCTCAGGCTTACGACAAGAAGGC
GCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCTGTTTA
CAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGCTCCAT
TATGTAATTACTAAATCAATAATACAGACGGTTTATATGTATATGTATAAATATGAGTTA
TATAGATTTTGGTGTTTTTTTGTTCAGAATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTCTGTTT
GTGTTACAA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4AB41TF 765 0 0
AGATTG
AAAGAAAAA*CAAATATCCATACAAACACAATACATATTTGAGAGACACAGAGGAAGAGA
ATAACCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAATAGAAAAAAACAAGCCAAAAATCAGAACGAGA
AGATGGGAGTTGGAGGGACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGAAGTGGAGGAAGTC
ATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAGCTCAAAGTGAGAA
TGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCTCTAAAAGGAGTTA
AATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGTTACGCGGAACCGA
GCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATATGGCCATACGTTC
CCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATAGCTCAGGCTTACGACAAGAAGGCGCCGCCTG
GTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCTGTCTACAACGATG
ACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGCTCCATTATGTAAT
TACTAAATCAATAATACAGACGGTTTATATGTATATGTATAAATATGAGTTATATAGATT
TTGGTGTCTTTTTGTTCACGATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTCTGTTTGTGTTACA
AGAATGTTAATTAATTTTAATAAATGCCTATTATATAGA

QA 7 765 7 765
DS 



AS 1 8

CO CL944Contig1 635 8 9 U
GGGTCACACACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTT
TCTCCAGGCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAG
AGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACA
AACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACT
CTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATT
ACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGA
AGCCCCAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGAC
ATGATCATGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAA
ACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AA
ACTTGTCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTC*GAGTCCTTTCCTTTTCTGAGGCTCATTCAT
ATAAAATGCATCTATCTAGAAGCACTTTCTTTCAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR60TF U 9
AF RR4FE57TF U 1
AF RR4FF22TF U 1
AF RR4EL90TF U 6
AF RR4EL90JQ C 6
AF RR4GE20JQ C 1
AF RR4GE20TF U 1
AF RR4GR60JQ C 9
BS 1 315 RR4FE57TF
BS 316 316 RR4EL90TF
BS 317 491 RR4FE57TF
BS 492 492 RR4EL90TF
BS 493 586 RR4FE57TF
BS 587 613 RR4FF22TF
BS 614 614 RR4EL90TF
BS 615 623 RR4FF22TF
BS 624 635 RR4GR60JQ

RD RR4GR60TF 466 0 0
G
ACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTT*GATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCGCACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAATAAGCCCCAAG
AACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGACATGATCATG
ACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAAC

QA 2 466 2 466
DS 

RD RR4FE57TF 586 0 0
GGGTCACACACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTT
TCTCCAGGCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAG
AGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACA
AACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACT
CTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATT
ACTTGCTCAACCCCAGGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGA
AGCCCCAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGAC
ATGATCATGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAA
ACTTTTGTTTTCGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AA
ACTTGTCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTC*GAGTCCTTTCCTTTTC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4FF22TF 632 0 0
GGGTCACACACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTT
TCTCCAGGCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAG
AGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACA
AACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACT
CTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATT
ACTTGCTCAACCCCAGGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGA
AGCCCCAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGAC
ATGATCATGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAA
ACTTTTGTTTTCGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AA
ACTTGTCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTC*GAGTCCTTTCCTTTTCTGAGGCTCATTCAT
ATAAAATGCATCTCTCTAGAAGC
GCTTTCTTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4EL90TF 624 0 0
GG
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GCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGAT
CTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAAGCGCCGGTCACAAACAAGG
ACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACTC
TGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCT
CAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCCCA
AGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGACATGATCA
TGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAAACTTTTG
TTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGGGAAACTTGGC
TGTTTGAGTTCCAAATGTACTCTGAGTCCTTTCATTTTCTGAGGCTCATTCATATAAAAT
GCATCTATCTAGAAGC
AAAAAA

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR4EL90JQ 618 0 0
GG
ACACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCAG
GCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGAT
CTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAAGCGCCGGTCACAAACAAGG
ACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACTC
TGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCT
CAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCCCA
AGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGACATGATCA
TGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAAACTTTTG
TTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AAACTTGGC
TGTTTGAGTTCCAAATGTACTCTGAGTCCTTTCATTTTCTGAGGCTCATTCATATAAAAT
GCATCTATCTAGAAGC

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR4GE20JQ 620 0 0
GGGTCACACACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTTTTTGTTT
TCTCCAGGCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAG
AGAAGATTTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACA
AACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACT
CTTACTTTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATT
ACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGA
AGCCCCAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGAC
ATGATCATGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAA
ACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AA
ACTTGTCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTC*GAGTCCTTTCCTTTTTTGAGGCTCATTCAT
ATAAAATGCATCTCTCTAG
T

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4GE20TF 620 0 0
GGGTCACACACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTT
TCTCCAGGCGAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAG
AGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACA
AACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACT
CTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATT
ACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGA
AGCCCCAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGAC
ATGATCATGACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAA
ACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AA
ACTTGTCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTC*GAGTCCTTTCCTTTTCTGAGGCTCATTCAT
ATAAAATGCATCTCTCTAG
T

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4GR60JQ 627 0 0
G
ACCTAACAGAAACCCTCAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTT*GATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCGCACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAATCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAATAAGCCCCAAG
AACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGACATGATCATG
ACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAGATATTCTTTTGACAAATAAAACCTCCAAACTTTTGTT
TTTGGTTTTCGGAAGTGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGG*AAACTTGGCTG
TTTGAGTTCCAAATGTACTCTGAGTCCTTTCATTTCCTGAGGCTCATTCATATAAAATGC
ATCTATCTAGAAGCACTTTCTTTCAT

QA 2 627 2 627
DS 



AS 2 7

CO CL945Contig1 885 4 6 U
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TACAGAGAAGTGTGTTGTGGGGGTTTAGGTGTGGAAAGAATGGAAGGAAGGAAGAAGAGC
GGTTCGTCTTCTTCTCCATCGTTAACCTCTGAGCTTTTTGGTTCCAGAGATAATCCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTTTTGCTCCTCCTTCTCATAAGGTTATG
CGACAAGAGACTGTGACTGGTGGTGGCTGGAACGATAAATCCTCCAAGACTGGTGATGCT
GACAGAAACAGAGAAGAGCAAGACAACTATGGTTCAGTTTATCATCAGGAACAAGAGAGA
GTTCAACCTTGCCATCTCAGCTCTTCCATCTATTACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAG
CCTCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGA
AGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTATTACTAAGTAGAGTTGTTGCTA
CTTAAGCCAGTGTTATACTACAAAAGCAGCCAGGGTATATAGGAAGGAAGGGAAAAA*GT
AGAGTAGTAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAACTTCTCTATCTTATTATTACAAAAAAA
GTATGGAAGAAGTTTGTAAGGGTTGGTTAGATGCAAAGACGCCAGGAAAGCTTGTCTGAG
GGGTTTTTTTTGGTCGTGGTTTAGTTATTAACCCGACCGCTTCAGATTTAGCTTCCGTAG
TATGTATAATGGATAAAAACAATGATATGGTTTTGTAAGAAAACTACTCTAGTAAGTTTC
TACATTTACAAGCATTGAAATAAATCACAACCTGTTGTTGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED24TF U 2
AF RR4BP69TF U 1
AF RR4DX94TF U 4
AF RR4DX94JQ C 155
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GGCCC
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GAAGTGTGTTGTGGGGGTTTAGGTGTGGAAAGAATGGAAGGAAGGAAGAAGAGCGGTTCG
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TCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTTTTGCTCCTCCTTCTCATAAGGTTATGCGACAA
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AATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCT
TCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTATTACTAAGTAGAGTTGTTGCTACTTAAG
CCAGTGTTA

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DS 

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TACAGAGAAGTGTGTTGTGGGGGTTTAGGTGTGGAAAGAATGGAAGGAAGGAAGAAGAGC
GGTTCGTCTTCTTCTCCATCGTTAACCTCTGAGCTTTTTGGTTCCAGAGATAATCCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTTTTGCTCCTCCTTCTCATAAGGTTATG
CGACAAGAGACTGTGACTGGTGGTGGCTGGAACGATAAATCCTCCAAGACTGGTGATGCT
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GTTCAACCTTGCCATCTCAGCTCTTCCATCTATTACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAG
CCTCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATAATTCCGGA
AGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTATTACTAAGTAGAGTTGTTGCTA
CTTAAGCCAGTGTTATACTACAAAAGCAGCCAGGGTATATAGGAAGGAAGGGAAAAA*GT
AGAGTAGCAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAACTTCTCTATCTTATTAT
TACAAAAAA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DX94TF 655 0 0
GGG
CTGTTCTGTCTCTCAAACATCATCAGATATTCATACAAACACGTCTCCATAGAATACAGA
GAAGTGTGTTGTGGGGGTTTAGGTGTGGAAAGAATGGAAGGAAGGAAGAAGAGCGGTTCG
TCTTCTTCTCCATCGTTAACCTCTGAGCTTTTTGGTTCCAGAGATAATCCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTTTTGCTCCTCCTTCTCATAAGGTTATGCGACAA
GAGACTGTGACTGGTGGTGGCTGGAACGATAAATCCTCCAAGACTGGTGATGCTGACAGA
AACAGAGAAGAGCAAGACAACTATGGTTCAGTTTATCATCAGGAACAAGAGAGAGTTCAA
CCTTGCCATCTCAGCTCTTCCATCTATTACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAGCCTCAG
AATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCT
TCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTATTACTAAGTAGAGTTGTTGCTACTTAAG
CCAGTGTTATACTACAAAAGCAGCCAGGGTATATAGGAAGGAAGGGAAAAA*GTAGAGTA
GTAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAACTTCTCTATCTTATTAT
ACAAAAAA

QA 4 647 4 647
DS 

RD RR4DX94JQ 731 0 0
TTTTTGGTTCCAGAGATAATCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTT
TTGCTCCTCCTTCTCATAAGGTTATGCGACAAGAGACTGTGACTGGTGGTGGCTGGAACG
ATAAATCCTCCAAGACTGGTGATGCTGACAGAAACAGAGAAGAGCAAGACAACTATGGTT
CAGTTTATCATCAGGAACAAGAGAGAGTTCAACCTTGCCATCTCAGCTCTTCCATCTATT
ACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAGCCTCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGA
AAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTC
TGTATTACTAAGTAGAGTTGTTGCTACTTAAGCCAGTGTTATACTACAAAAGCAGCCAGG
GTATATAGGAAGGAAGGGAAAAAAGTAGAGTAGTAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAAC
TTCTCTATCTTATTATTACAAAAAAAGTATGGAAGAAGTTTGTAAGGGTTGGTTAGATGC
AAAGACGCCAGGAAAGCTTGTCTGAGGGGTTTTTTTTGGTCGTGGTTTAGTTATTAACCC
GACCGCTTCAGATTTAGCTTCCGTAGTATGTATAATGGATAAAAACAATGATATGGTTTT
GTAAGAAAACTACTCTAGTAAGTTTCTACATTTACAAGCATTGAAATAAATCACAACCTG
TTGTTGTTTCT

QA 1 731 1 731
DS 



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TACAGAGAAGTGTGTTGTGGGGGGGGTTTAGGTGTGGAAAGAATGGAAGGAAGGAAGAAG
AGCGGTTCGTCTTCTTCTCCATCGTTAACCTCTGAGCTTTTTGGTTCCAGAGATAATCCT
TCTTCTTCTTCTCCCTCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTTTTGCTCCTCCTTCCCAT
AAGGTTATGGGACCAGAATCTATGCGACAAGAGACCGTGACTGGTGGTGGTGGCTGGAAC
GACAAATCCTCCAAGACTGGTGATGTTGACAGAAACAGAGAAGAGCAAGACAAGTATGTA
TATGGTTCAGTTTATCATCAGGAACAAGAGAGAGTTCAACCTTGTCATCTGAGCTCTTCC
ATCTATTACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAGCATCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACG
AAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAA
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GATGCAAAGACACCAGGAAAGCTTGTCTGGGGAAGTTTTTATTGGTCGTGGTTTAGTGAT
TAAACCCGTCCGCTTCAGATTTAGCTTTCGTAGTATGTGTAATGGATAAAAACAATGATA
TGGTTTTGTAAGAAAACTACTCTAGTAAGTTTCTACGTTTACAAGCATAGAAATAAATCA
CAACTTTTGTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT96TF U 8
AF RR4G295TF U 1
AF RR4G295JQ C 393
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BS 70 70 RR4BT96TF
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RD RR4BT96TF 157 0 0
G
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GTCTTCTTCTCCATCGTTAACCTCTGAGCTTTTTGG

QA 2 157 2 157
DS 

RD RR4G295TF 629 0 0
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TACAGAGAATTGTGTTGTGGGGGGGGTTTAGGTGTGGAAAGAATGGAATGAAGGAAGAAG
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TCTTCTTCTTCTCCCTCTTCTTCTGGGTTTTTCGGATCTATTTTTGCTCCTCCTTCCCAT
AAGGTTATGGGACCAGAATCTATGCGACAAGAGACCGTGACTGGTGGTGGTGGCTGGAAC
GACAAATCCTCCAAGACTGGTGATGTTGACAGAAACAGAGAAGAGCAAGACAAGTATGTA
TATGGTTCAGTTTATCATCAGGAACAAGAGAGAGTTCAACCTTGTCATCTGAGCTCTTCC
ATCTATTACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAGCCTCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACG
AAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAA
GGGTCTCTGTATTACTAAGTAGAGATGTTGCTACTTAAGCCAGTGTTATATTGCAAAAGC
AGCAAGGGTATATAGGAAGGAAG
AAAAAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4G295JQ 522 0 0
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GCATCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGAAAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGG
AAGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTATTACTAAGTAGAGATGTTGCT
ACTTAAGCCAGTGTTATATTGCAAAAGCAGCAAGGGTATATAGGAAGGAAGAAAAAAGTA
GAGTGGCAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAACTTCTCTATCTTATTATTACAAAAAGAG
TATGGAAGAAGTTTGTAAGGGTTGGTTAGATGCAAAGACACCAGGAAAGCTTGTCTGGGG
AAGTTTTTATTGGTCGTGGTTTAGTGATTAAACCCGTCCGCTTCAGATTTAGCTTTCGTA
GTATGTGTAATGGATAAAAACAATGATATGGTTTTGTAAGAAAACTACTCTAGTAAGTTT
CTACGTTTACAAGCATAGAAATAAATCACAACTTTTGTTGTC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 8

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GTCGGCATGGGGCGACTCCACTCTAAAGGGAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCCGTAC
AAGCGTTCACCCCCGAGTTGGCTCAAGACAACCTCTCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGC
AAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACTCCGTCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCAC
GGTATCCCACAGGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGAAAGCTCAT
GGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTTTACCACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCCATC
CGCAAGCATCTTGAGAGGAACAGGAAGGACAAGGACTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTG
GAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTC
TGGAAGTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAGGGAATCATAGAGTTGGGC
AAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTGCATTGCAAACTCAATTTCTATGTCAATG
GATTTTGTATCTGTTTTTTAGTTCTTCTGATGAGTTACAGTTATAATACGATTTTGGATT
AAAGAGAGTACTCTTGTTTATGTTATCCTTCAGTTTTGACTTTAAATCCGTGTTGAAGCC
TCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E740TF U 343
AF RR4E727TF U 33
AF RR4B045TF U 1
AF RR4H161TF U 1
AF RR4B045JQ C 416
AF RR4H161JQ C 451
AF RR4FF33TF U 4
AF RR4FF33JQ C 109
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BS 252 701 RR4B045TF
BS 702 731 RR4FF33TF

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TTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACC
AAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAAGTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAG
GGAATCATAGAGTTGGGCAAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTGCATTGCAAAC
TCAATTTCTATGTCAATGGATTTTGTATCTGTTTTTTAGTCCTTCTGATGAGTTACAGTT
ATAATACGATTTTGGA

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DS 

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GG*AATCTCAGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCCCCGAGTTGGCTCAAGACAAC
CTCTCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACTCCGTCTCA
GATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCACAGGTGAAGAGTGTTACTGGAAA
CAAGATTTTGAGATTCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTTTA
CCACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCCATCCGCAAGCATCTTGAGAGGAACAGGAAGGACAA
GGACTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTA
CAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAAGTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCT
TGTCGCTTAGGGAATCATAGAGTTGGGCAAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTG
CATTGCAAACTCAATTTCTATGTCAATGGATTTTGTATCTGTTTTTTAGTCCTTCTGATG
AGTTACAGT*ATAATACGATTTTGG

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DS 

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GTCGGCATGGGGCGACTCCACTCTAAAGGGAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCCGTAC
AAGCGTTCACCCCCGAGTTGGCTCAAGACAACCTCTCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGC
AAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACTCCGTCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCAC
GGTATCCCACGGGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGAAAGCTCAT
GGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTTTACCACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCCATC
CGCAAGCATCTTGAGAGGAACAGGAAGGACAAGGACTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTG
GAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTC
TGGAAGTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAGGGAATCATAGAGTTGGGC
AAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTGCATTGCAAACTCAATTTCTATGTCAATG
GATTTTGTATCTGTTTTTTAGTTCTTCTGATGAGTTACAGTTATAATACGATTTTGGATT
AAAGAGAGTACTCTTGTTTATGTTATCCTTCAGTTTTGACT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4H161TF 686 0 0
GGAGC
GCAGTCGCAGCCGGACGAAGAACGTTCTCAGAGAAAGCAAACTCCGTTAACAAACGTCGG
CATGGGGCGACTCCACTCTAAAGGGAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCA
TTCACCCCCGAGTTGGCTCAAGACAACCTCTCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCAAGTT
TGCAAAGAAGGGTTTGACTCCGTCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCACGGTAT
CCCACAGGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGAAAGCTCATGGTCT
TGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTTTACCACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCCATCCGCAA
GCATCTTGAGAGGAACAGGAAGGACAAGGACTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAG
CAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAA
GTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAGGGAATCATAGAGTTGGGCAAAGT
CCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTGCATTGCAAACTCAATTTCTATGTCAATGGATTT
TGTATCTGTTTTTTAGTTCTTCTGATGAGTTACAGTTATAATACGATTTTGGATTAAAGA
GAGTACTCTTGTTTATGTTAT

QA 6 686 6 686
DS 

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CCGTTTGGAAGTATGAATTTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAGGGAATCATAGAGT
TGGGCAAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGTTGCATTGCAAACTCAATTTTTATGT
CAATGGATTTTGTATTTGTTTTTTAGTTTTTTTGATGAGTTACAGTTATAATACGATTTT
GGATTAAAGAGAGTACTTTTGTTTATGTTATCCTTCAGTTTTGACTTT

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR4H161JQ 253 0 0
TACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAAGTATGAATCTACAACCGCAAGCACT
CTTGTCGCTTAGGGAATCATAGAGTTGGGCAAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGC
TGCATTGCAAACTCAATTTCTATGTCAATGGATTTTGTATCTGTTTTTTAGTTCTTCTGA
TGAGTTACAGTTATAATACGATTTTGGATTAAAGAGAGTACTCTTGTTTATGTTATCCTT
CAGTTTTGACTTT

QA 1 253 1 253
DS 

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GG
GCAGTCGCAGCCGGACGAAGAACGTTCTCAGAGAAAGCAAACTCCGTTAACAAACGTCGG
CATGGGGCGACTCCACTCTAAAGGGAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCG
TTCACCCCCGAGTTGGCTCAAGACAACCTCTCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCAAGTT
TGCAAAGAAGGGTTTGACTCCGTCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCACGGTAT
CCCACAGGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATTTTGAGAATCTTGAAAGCTCATGGTCT
TGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTTTACCACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCCATCCGCAA
GCATCTTGAGAGGAACAGGAAGGACAAGGACTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAG
CAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAA
GTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAGGGAATCATAGAGTTGGGCAAAGT
CCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTGCATTGCAAACTCAATTTCTATGTCAATGGATTT
TGTATCTGTTTTTTAGTTCTTCTGATGAGTTACAGTTATAATACGATTTTGGATTAAAGA
GAGTACTCTTGTTTATGTTATCCTTCAGTTTTGACTTTAAATCCGTGTTGAAGCCTCAAA
AAAAAA

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR4FF33JQ 614 0 0
GCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCCCCGAGTTGGCTCAAGACAACCTCTCAGGATGTTGAT
GAGTCCATTTGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACTCCGTCTCAGATTGGTGTCATTCTT
CGTGACTCTCACGGTATCCCACAGGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATTTTGAGAATC
TTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTTTACCACCTGATCAAGAAA
GCTGTTGCCATCCGCAAGCATCTTGAGAGGAACAGGAAGGACAAGGACTCCAAGTTCAGG
TTGATTCTTGTGGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAG
CTCCCTCCCGTCTGGAAGTATGAATCTACAACCGCAAGCACTCTTGTCGCTTAGGGAATC
ATAGAGTTGGGCAAAGTCCTTGATGAACTACAATTTCATTGCTGCATTGCAAACTCAATT
TCTATGTCAATGGATTTTGTATCTGTTTTTTAGTTCTTCTGATGAGTTACAGTTATAATA
CGATTTTGGATTAAAGAGAGTACTCTTGTTTATGTTATCCTTCAGTTTTGACTTTAAATC
CGTGTTGAAGCCTC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 8

CO CL947Contig1 1155 8 18 U
GGGATAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTG
TTAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCCCAAACACCATTCTTCTCTTCAT
CCTCTAACATATTGATCCAAGAGAGATTTTTGAATAGCTTTTGAAGTTGGTATATCAATG
GCGAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCT
GGAGCTTCGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTG
GGGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAAGTATCAAA
GAAGTCAGCAAAGTTACAAGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCT
GTTCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACA
TGCTCTGTCGTTTCCACTCTCTTAAAAGAAGATGAGACTGAAGCATGGGGTGTCGAACCC
TATGACATCGAGGATGCTGACTCTCACTGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTGCGT
GTCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAGGCGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTC
TCAGATGCTCTCGACTATCTCTCTCCCAAGTACCTCAACAAGACCGTCCCTGAACTCGCA
AGGGTCGCTTCAGATGGTCTTGTTCTTTTTGCAGGTCTCCCTGGTCAGCAGAGAGCTAAA
GTTGCTGAACTGTCTAAGTTCGGTCGTCCCGCTAAAATGCGTAGCGCTTCGTGGTGGAAC
CGATTCTTCGTGCAGACAAGTTTAGAAGAAAACGAAGGACCAAGCAAGAAGTTTGAACAG
GCTGTTTCCAAAGGATTATACAAACCAGCCTGCCAAGTCTCCCACCTTAAGCCACTACAT
TAACCAGCCACCACCAAGCCCCCACACTAAAAGCACATTCACACGTAGAGCCACTCCCGA
AACAAGAACAACAAAAAAATAGCGTAAGCGATATTCTCCTTGTATTTTGTAACAAGTCAG
TTTTTTTTTTGTCAACACATGAACACTTGTATCCATCAACACAGTTTTTTCTTATTGAAT
TTTAATCAATCGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 0 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C914TF U 1
AF RR4C920TF U 1
AF RR4GU50TF U 233
AF RR4AK08TF U 43
AF RR4GU50JQ C 685
AF RR4AK08JQ C 388
AF RR4C914JQ C 677
AF RR4C920JQ C 684
BS 1 488 RR4C914TF
BS 489 489 RR4AK08TF
BS 490 560 RR4C914TF
BS 561 561 RR4AK08TF
BS 562 629 RR4C914TF
BS 630 693 RR4C920TF
BS 694 694 RR4AK08TF
BS 695 713 RR4C920TF
BS 714 752 RR4AK08TF
BS 753 753 RR4GU50JQ
BS 754 816 RR4AK08TF
BS 817 817 RR4AK08JQ
BS 818 858 RR4AK08TF
BS 859 940 RR4AK08JQ
BS 941 941 RR4C914JQ
BS 942 1089 RR4AK08JQ
BS 1090 1090 RR4GU50JQ
BS 1091 1155 RR4AK08JQ

RD RR4C914TF 629 0 0
GGGATAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTG
TTAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCCCAAACACCATTCTTCTCTTCAT
CCTCTAACATATTGATCCAAGAGAGATTTTTGAATAGCTTTTGAAGTTGGTATATCAATG
GCGAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCT
GGAGCTTCGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTG
GGGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAAGTATCAAA
GAAGTCAGCAAAGTTACAAGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCT
GTTCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACA
TGCTCTGTTGTTTCCACTCTCTTAAAAGAAGATGAGACTGAAGCATGGGGTGTCGAACCC
TATGACATCGAGGATGCTGATTCTCACTGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTGCGT
GTCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTA

QA 1 629 1 629
DS 

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GGGATAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTG
TTAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCCCAAACACCATTCTTCTCTTCAT
CCTCTAACATATTGATCCAAGAGAGATTTTTGAATAGCTTTTGAAGTTGGTATATCAATG
GCGAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCT
GGAGCTTCGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTG
GGGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAAGTATCAAA
GAAGTCAGCAAAGTTACAAGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCT
GTTCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACA
TGCTCTGTTGTTTCCACTCTCTTAAAAGAAGATGAGACTGAAGCATGGGGTGTCGAACCC
TATGACATCGAGGATGCTGATTCTCACTGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTGCGT
GTCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAGGCGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTC
TCAGATGCTCTCGACTATCTCTCTCCCAAGTAC*TCAACAAGACCGTCCCTGA
CTCG

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DS 

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TTCTCGTGGGGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAA
GTATCAAAGAAGTTAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAG
CCGTTTCTGTTCTTAACAAGGCCTATGGAGACGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCC
CTGAGACATGCTCTGTTGTTTCCACTCTCTTAAAAGAAGATGAGACTGAAGCATGGGGTG
TCGAACCCTATGACATCGAGGATGCTGATTCTCACTGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCC
TTGTGCGTGTCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAGGCGAAATCCTTCTCTCTTG
TGATAGTCTCAGATGCTCTCTACTATCTCTCTCCCAAGTACCTCAACAAGACCGTCCCTG
AACTCGCAAGG
TCGCT

QA 1 491 1 491
DS 

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GTGAGAGAGAGAGAG
GTGTTAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCCCAAATACCATTCTTCTCTT
CATCCTCTAACATATTGATCCAAGAGA***TTTTGAATAGCTTTTGAGGTTGGTATATCA
ATGGCGAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTT
GCTGGAGCTTTGCACTCCAAGTCTCGTTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTC
GTGGGGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAAGTATC
AAAGAAGTCAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTT
TCTGTTCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAG
ACATGCTCTGTCGTTTCCACTCTCTTAAAAGAAGATGAGACTGAAGCATGGGGTGTCGAA
CCCTATGACATCGAGGATGCTGACTCTCACTGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTG
CGTGTCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAGGCGAAATCCTTCTCTCTTGTGATC
GTCTCAGATGCTCTCGACTATCTCTCTCCCAAGTACCTCAACAAGACCGTCCCTGAACTC
GCAAGGGTCGCTTCAGATGGTCTTGTTCTTTTTGCGGGTCTCCCTGGTCAGCAGAGAGCT
AAAGTTGCTGAACTGTCTAAGTTCGGTCGTCCCGCTAAA*TGCGTAGCGCTTCGTGGTGG
AACCGATTCTTCGTGCAGACA
GTTTAGAGAAACGAAG

QA 16 816 16 816
DS 

RD RR4GU50JQ 417 0 0
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CTTTTTGCAGGTCTCCCTGGTCAGCAGAGAGCTAAAGTTGCTGAACTGTCTAAGTTCGGT
CGTCCCGCTAAAATGCGTAGCGCTTCGTGGTGGAACCGATTTTTCGTGCAGACAAGTTTA
GAAGAAAACGAAGGACCAAGCAAGAAGTTTGAACAGGCTGTTTGCAAAGGATTATACAAA
CCAGCCTGCCAAGTCTTCCACCTTAAGCCACTACATTAACCAGCCACCACCAAGCCCCCA
CACTAAAAGCACATTCACACGTAGAGCCACTCCCGAAACAAGAACAACAAAAAAATAGCG
TAAGCGATATTCTCCTTGTATTTTGTAACAAGTCAGTTTTTTTTTTGTCAACACATG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4AK08JQ 768 0 0
TCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTGTTCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGG
ATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACATGCTCTGTCGTTTCCACTCTCTTAAAA
GAAGATGAGACTGAAGCATGGGGTGTCGAACCCTATGACATCGAGGATGCTGACTCTCAC
TGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTGCGTGTCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCC
TACAAGGCGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTCTCAGATGCTCTCGACTATCTCTCTCCC
AAGTACCTCAACAAGACCGTCCCTGAACTCGCAAGGGTCGCTTCAGATGGTCTTGTTCTT
TTTGCGGGTCTCCCTGGTCAGCAGAGAGCTAAAGTTGCTGAACTGTCTAAGTTCGGTCGT
CCCGCTAAAATGCGTAGCGCTTCGTGGTGGAACCGATTCTTCGTGCAGACAAGTTTAGAA
GAAAACGAAGGACCAAGCAAGAAGTTTGAACAGGCTGTTTCCAAAGGATTATACAAACCA
GCCTGCCAAGTCTTCCACCTTAAGCCACTACATTAACCAGCCACCACCAAGCCCCCACAC
TAAAAGCACATTCACACGTAGAGCCACTCCCGAAACAAGAACAACAAAAAAATAGCGTAA
GCGATATTCTCCTTGTATTTTGTAACAAGTCAGTTTTTTTTT*GTCAACACATGAACACT
TGTATCCATCAACACAGTTTTTTCTTATTGAATTTTAATCAATCGTTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4C914JQ 479 0 0
ATCTTTC
TCCCAAGTACCTCAACAAGACCGTCCCTGAACTCGCAAGGGTCGCTTCAGATGGTCTTGT
TCTTTTTGCAGGTTTCC*TGGTCAGCAGAGAGCTAAAGTTGCTGAATTGTTTAAGTTCGG
TCGTCCCGCTAAAATGCGTAGCGCTTCGTGGTGGAACCGATTTTTCATGCAGACAAGTTT
AGAAGAAAACGAAGGACCAAGCAAGAAGTTTGAACAGGCTGTTTCCAAAGGATTATACAA
ACCAGCCTGCCAAGTCTCCCACCTTAAGCCACTACATTAACCAGCCACCACCAAGCCCCC
ACACTAAAAGCACATTCACACGTAGAGCCACTCCCGAAACAAGAACAACAAAAAA*TAGC
GTAAGCGGTATTCTCCTTGTATTTTGTAACAAGTCAGTTTTTTTTTTGTCAACACATGAA
CACTTGTATCCATCAACACAGTTTTTTCTTATTGAATTTTAATCAATCGTTG

QA 8 479 8 479
DS 

RD RR4C920JQ 472 0 0
TCCCAAGTACCTCAACAAGACCGTCCCTGAACTCGCAAGGGTCGCTTCAGATGGTCTTGT
TCTTTTTGCAGGTCTCC*TGGTCAGCAGAGAGCTAAAGTTGCTGAATTGTCTAAGTTCGG
TCGTCCCGCTAAAATGCGTAGCGCTTCGTGGTGGAACCGATTTTTCATGCAGACAAGTTT
AGAAGAAAACGAAGGACCAAGCAAGAAGTTTGAACAGGCTGTTTCCAAAGGATTATACAA
ACCAGCCTGCCAAGTCTCCCACCTTAAGCCACTACATTAACCAGCCACCACCAAGCCCCC
ACACTAAAAGCACATTCACACGTAGAGCCACTCCCGAAACAAGAACAACAAAAAA*TAGC
GTAAGCGGTATTCTCCTTGTATTTTGTAACAAGTCAGTTTTTTTTTTGTCAACACATGAA
CACTTGTATCCATCAACACAGTTTTTTTTTATTGAATTTTAATCAATCGTTG

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 7

CO CL948Contig1 1146 7 12 U
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AATACAGTGTGACAAGATACAATTCCATTGGCACTTAATAAATTACACATATACAATGCT
ACAATATCGAACTCCAGTGGCACATTAAGATAGAATCTGCCACTGAAGATATATAGAGAT
TATTTAGAGGAATGCACATGGAATACAAGATTGATACATATTGTAGCTTGATGATTATCA
AAGAATATGCTGGAAGCTTTATGTCTTGGACTTGAAAGGAATAGCTCTGATGACTATTTG
ATGGTACAGAGCAGCAAGAGCAGCACCAATGAATGGACCGACCCAGAAGATCCAATGGTC
GTCCCAAGCATGATCCTTGTTGTAGATGATGGCAGCTCCAAGACTCCTGGCCGGGTTAAT
ACCAGTTCCAGTGATTGGAATAGTGGCCAAATGCACCAAGAAGACAGCAAACGCAATTGG
AAGCGGAGCCAATATAGGGACATGCGAGTCTCTGGCACTTCTCTTAGCATCAGTAGCTGG
GAAGACAGTATAGACAAGAACAAAAGTGCCAATAATCTCTGCACCAAGACCTGAACCCTT
TGTGTAGCCATGAGCCACCATGTTGGCTCCACCTCCATTAGCCTGATATGGCCCTGGCTG
AAAACCCTTGACCACACCAGCACCACAGATAGCTCCAAGGCACTGCATTACTATGTAGAA
GACAGCTCTTGTTAAAGAAAGCTTCCTCGCCAAGAACAAACCGAATGTCACCGCCGGGTT
AATGTGTCCTCCTGAGATTCCAGCAGTACAGTAGACAAGAGCGAAGATCATGCCGCCGAA
CGCCCAAGCGATGCCTTGTATACCGACGGAGGAGCACATGTTGGGAGCTCTCTTGACGCC
CATGACCGTTAAAACGGTGACGTAGAGGAAAAGGAAAGTGGCTATGAACTCTGCTATGCC
TGCTCTGTAGAAGGACCACGACTTGAGCTCGCCGGGTTCGAAGAACGGAGCAGGAGGTGG
TTCCTTGTAGTCCTTACCCTCCGTCTGCGCCGCCGTACCGATCGGCTGCCTCTCCGGGAA
CTTGTTTGCTCCCACATTCACGTCTTCTTCTTTCCCCTCCATTGTTTCTCTTCTCTCTTA
CTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4AK06JQ U 1
AF RR4D568JQ U 67
AF RR4CO79JQ U 30
AF RR4GE16JQ U 21
AF RR4GE16TF C 276
AF RR4CO79TF C 381
AF RR4AK06TF C 384
BS 1 467 RR4AK06JQ
BS 468 468 RR4GE16JQ
BS 469 552 RR4AK06JQ
BS 553 553 RR4GE16JQ
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BS 588 601 RR4AK06JQ
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BS 1081 1146 RR4CO79TF

RD RR4AK06JQ 601 0 0
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AAGAATATGCTGGAAGCTTTATGTCTTGGACTTGAAAGGAATAGCTCTGATGACTATTTG
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AAGCGGAGCCAATATAGGGACATGCGAGTCTCTGGCACTTCTCTTAGCATCAGTAGCTGG
GAAGACAGTATAAACAAGAACAAAAGTGCCAATAATCTCTGCACCAGGACCTGAACCCTT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4D568JQ 706 0 0
C
TGTGACAAGATACAATTCCATTGGCACTTAATAAATTACACATATACAATGCTACAATAT
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AGAGCAGCAAGAGCAGCACCAATGAATGGACCGACCCAGAAGATCCAATGGTCGTCCCAA
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CCATGAGCCACCAAGTTGGCTCCACCTCCATTAGACTGATACGGCCCTGGCTGAAAACCC
TTGACCACACCAGCACCACAGATAGCTCCAAGACACTGCATTACTATGTAGAAGACAGCT
CTTGTTAAA*AAAGCTTCCTCGCCAAGAACAAACCGAATGTCACC

QA 2 706 2 706
DS 

RD RR4CO79JQ 711 0 0
G
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GCACTTAATAAATTACACATATACAATGCTACAATATCGAACTCCAGTGGCACATTAAGA
TAGAATCTGCCACTGAAGATATATAGAGATTATTTAGAGGAATGCACATGGAATACAAGA
TTGATACATATTGTAGCTTGATGATTATCAAAGAATATGCTGGAAGCTTTATGTCTTGGA
CTTGAAAGGAATAGCTCTGATGACTATTTGATGGTACAGAGCAGCAAGAGCAGCACCAAT
GAATGGACCGACCCAGAAGATCCAATGGTCGTCCCAAGCATGATCCTTGTTGTAGATGAT
GGCAGCTCCAAGACTCCTGGCCGGGTTAATACCAGTTCCAGTGATTGGAATAGTGGCCAA
ATGCACCAAGAAGACAGCAAACGCAATTGGAAGCGGAGCCAATATAGGGACATGCGAGTC
TCTGGCACTTCTCTTAGCATCAGTAGCTAGGAAGACAGTATAGACAAGAACAAAAGTGCC
AATAATCTCTGCACCAAGACCTGAACCCTTTGTGTAGCCATGAGCCACCATGTTGGCTCC
ACCTCCATTAGCCTGATATGGCCCTGGCTGAAAACCCTTGACCACACCAGCACCACAGAT
AGCCCCAAGGCACTGCATTACTATGTAGAAGACAGCTCTTGTTAAAGAAA

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR4GE16JQ 786 0 0
GG
TACAATTCCATTGACATAGTTACTTGCACATATAGAATAATACAGTGTGACAAGATACAA
TTCCATTGGCACTTAATAAATTACACATATACAATGCTACAATATCGAACTCCAGTGGCA
CATTAAGATAGAATCTGCCACTGAAGATATATAGAGATTATTTAGAGGAATGCACATGGA
ATACAAGATTGATACATATTGTAGCTTGATGATTATCAAAGAATATGCTGGAAGCTTTAT
GTCTTGGACTTGAAAGGAATAGCTCTGATGACTATTTGATGGTACAGAGCAGCAAGAGCA
GCACCAATGAATGGACCGACCCAGAAGATCCAATGGTCGTCCCAAGCATGATCCTTGTTG
TAGATGATGGCAGCTCCAAGACTCCTGGCCGGGTTAATACCAGTTCCAGTGATTGGAATA
GTGGCCAAATGCACCAAGAAGACAGCAAACGCAATTGGAAGCGGAGCCAACATAGGGACA
TGCGAGTCTCTGGCACTTCTCTTAGCATCAGTAGCTGGGAAGACAGTATAGACAAGAACA
AAAGTGCCAATAATCTCTGCACCAAGACCTGAACCCTTTGTGTAGCCATGAGCCACCATG
TTGGCTCCACCTCCATTAGCCTGATATGGCCCTGGCTGAAAACCCTTGACCACACCAGCA
CCACAGATAGCTCCAAGGCACTGCATTACTATGTAGAAGACAGCTCTTGTTAAAGAAAGC
TTCCTCGCCAAGAACAAACCGAATGTCACCGCCGGGTTAATGTGTCCTCCTGAGATTCCA
GCAG

QA 3 786 3 786
DS 

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AAA
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CGACCCAGAAGATCCAATGGTCGTCCCAAGCATGATCCTTGTTGTAGATGATGGCAGCTC
CAAGACTCCTGGCCGGGTTAATACCAGTTCCAGTGATTGGAATAGTGGCCAAATGCACCA
AGAAGACAGCAAACGCAATTGGAAGCGGAGCCAACATAGGGACATGCGAGTCTCTGGCAC
TTCTCTTAGCATCAGTAGCTGGGAAGACAGTATAGACAAGAACAAAAGTGCCAATAATCT
CTGCACCAAGACCTGAACCCTTTGTGTAGCCATGAGCCACCATGTTGGCTCCACCTCCAT
TAGCCTGATATGGCCCTGGCTGAAAACCCTTGACCACACCAGCACCACAGATAGCTCCAA
GGCACTGCATTACTATGTAGAAGACAGCTCTTGTTAAAGAAAGCTTCCTCGCCAAGAACA
AACCGAATGTCACCGCCGGGTTAATGTGTCCTCCTGAGATTCCAGCAGTACAGTAGACAA
GAGCGAAGATCATGCCGCCGAACGCCCAAGCGATGCCTTGTATACCGACGGAGGAGCACA
TGTTGGGAGCTCTCTTGACGCCCATGACCGTTAAAACGGTGACGTAGAGGAAAAGGAAAG
TGGCTATGAACTCTGCTATGCCTGCTCTGTAGAAGGACCACGACTTGAGCTCGCCGGGTT
CGAAGAACGGAGCAGGAGGTGGTTCCTTGTAGTCCTTACCCTCCGTCTGCGCCGCCGTAC
CGATC
C

QA 4 788 4 788
DS 

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TAGTGGCCAAATGCACCAAGAAGACAGCAAACGCAATTGGAAGCGGAGCCAATATAGGGA
CATGCGAGTCTCTGGCACTTCTCTTAGCATCAGTAGCTAGGAAGACAGTATAGACAAGAA
CAAAAGTGCCAATAATCTCTGCACCAAGACCTGAACCCTTTGTGTAGCCATGAGCCACCA
TGTTGGCTCCACCTCCATTAGCCTGATATGGCCCTGGCTGAAAACCCTTGACCACACCAG
CACCACAGATAGCCCCAAGGCACTGCATTACTATGTAGAAGACAGCTCTTGTTAAAGAAA
GCTTCCTCGCCAAGAACAAACCGAATGTCACCGCCGGGTTAATGTGTCCTCCTGAGATTC
CAGCAGTACAGTAGACAAGAGCGAA*ATCATACCGCCGAACGCCCAAGCGATGCCTTGTA
TACCGACGGAGGAGCACATGTTGGGAGCTCTCTTGACGCCCATGACCGTTAAAACGGTGA
CGTAGAGGAAAAGGAAAGTGGCTATGAGCTCTGCTATGCCTGCTCTGTAGAAGGACCACG
ACTTGAGCTCGCCGGGTTCGAAGAACGGAGCAGGAGGTGGTTCCTTGTAGTCCTTACCCT
CCGTCTGCGCCGCCGTACCGATCGGCTGCCTCTCCGGGAGCTTGTTTGCTCCCACATTCA
CGTCTTCTTCTTTCCCCTCCATTGTTTCTCTTCTCTCTTACTATCC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4AK06TF 763 0 0
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TGGCCAAATGCACCAAGAAGACAGTAAACGCAATTGGAAGCGGAGCCAATATAGGGACAT
GCGAGTCTCTGGCACTTCTCTTAGCATCAGTAGCTGGGAAGACAGTATAGACAAGAACAA
AAGTGCCAATAATCTCTGCACCAAGACCTGAACCCTTTGTGTAGCCATGAGCCACCATGT
TGGCTCCACCTCCATTAGCCTGATATGGCCCTGGCTGAAAACCCTTGACCACACCAGCAC
CACAGATAGCTCCAAGGCACTGCATTACTATGTAGAAGACAGCTCTTGTTAAAGAAAGCT
TCCTCGCCAAGAACAAACCGAATGTCACCGCCGGGTTAATGTGTCCTCCTGAGATTCCAG
CAGTACAGTAGACAAGAGCGAAGATCATGCCGCCGAACGCCCAAGCGATGCCTTGTATAC
CGACGGAGGAGCACATGTTGGGAGCTCTCTTGACGCCCATGACCGTTAAAACGGTGACGT
AGAGGAAAAGGAAAGTGGCTATGAACTCTGCTATGCCTGCTCTGTAGAAGGACTACGACT
TGAGCTCGCCGGGTTCGAAGAACGGAGCAGGAGGTGGTTCCTTGTAGTCCTTACCCTCCG
TCTGCGCCGCCGTACCGATCGGCTGCCTCTCCGGGAACTTGTTTGCTCCCACATTCACGT
CTTCTTCTTTCCCCTCCATTGTTTCTCTTCTCTCTTACTATCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 2 8

CO CL949Contig1 1354 4 26 U
GGATGGCCAAAATGGAATCAATCAGCTTCTCTCTGGCCATCACCACATCTTATTCTTCCT
GAACCTATCTTCTGCTCACTTCTGCATTCCTTCCTTCTTCTTTTATAGTTTATATTTTTC
CCTTCAATCGATCGAGAGTGAAAATGGCTCAATCCTGCGTTAAAGTCGCTCGAACCAACA
ATCTCAAGAACCTAGTGAACCGTCGGGTTCTAATTCTCCGTCGATTCACGCGCATTCTCC
TGAACAGAATCGTCCCTTGCACTCCCGGCAAATCACAGAGTTATCTCCTGTTGTCACGCG
CCGCCACTCCCTCTCCCAGTGTCTCTCGTTCTCTCCCTCCTCCGGTCGTGGACAGTGAGG
TCGCACGCCGCACATCGGTACACGACCACGACAGCAGCAACCGGAGATCTGACTCTGATC
TTGTCTCTCTGAAAATCAGCCTCTTAGGAGATCCCGACACCGGAAAGACTTGCTTCCTGG
CCAAGTATGTTGGCGGAGAGAAACAAGTTGAGATGAGAGAGTTGGAGAAAGGGATCCATT
GTACGGACAAGACGTTATCCATGGGAGGAGCTCGCATTTCCTACAGTATCTGCGAGTTAC
AAGGCGCTGAGAAATCACGTGATCTAATCCCCACGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCCATTC
TCTTCATGTTCGATCTCACCAGTCGTTGCACACTCAACAATGTGATTAGCTGGTATCAAC
AAGCTAGAAAGTCTAACCAGACGGCGATTCCAGTTATGGTAGGAACAAAGTTTGATGAGC
TTATTCAGCTTCCTATTGATCTGCAATGGACTATTGCTAGCCAGGCGAGGACCTACGCCA
AGGCGCTAAACGCGACGCTCTTCTTCTCGAGTGCTTCATACAACATAAACGTAAATAAGA
TCTTCAAGTTTGTGACCGCGAAGCTCTTCGACTTACCATGGACTGTGGAGAGAAATCTCA
CCGTCGGAGAACCTATCATCGACTACTAGCATCTTCCAAAAAGTATTTGTAGATAATATC
TAATATAAAAAGAAGTGAACCCGATGATAGTGTGTTTTTTTTTGTTTCATTCACCGCCGT
GGGATTGATCGGAGCACCGTTTCTAGCCGTCTTTAAAGCGAAATGGAGAGATGAGGCGGC
GGAGATTTCGCCCGCTTTCTTCTGTTTCTTTTTTTATTTAAACAAGAAAAAAAAAACAGA
GAACAAATGGTATCGAGAGAAAATTAGCAGAAAGAAAAGAAAAGAGAGAGGAGATTGTGG
ATTTTTTTCTTTATTCTTTTTGTAATGTTTCTGCCTTCGATTACCGCTGGAGAATTTTGG
TTCCAGTAAAGTCTAAATAGTAAATACCATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG24TF U 1
AF RR4GO11TF U 23
AF RR4B481JQ C 492
AF RR4EG24JQ C 712
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RD RR4EG24TF 697 0 0
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GAACCTATCTTCTG***ACTTCTGCATTCCTTCCTTCTTCTTTTATAGTTTATATTTTTC
CCTTCAATCGATCGAGAGTGAAAATGGCTCAATCCTGCGTTAAAGTCGCTCGAACCAACA
ATCTCAAGAACCTAGTGAACCGTCGTGTTTTGATTCTCCGTCGATTCACGCGCATTCTCC
TGAACAGAATCGTCCCTTGCACTCCCGGCAAATCACAGAGTTATCTCTTGTTGTCACGCG
CCGCCACTCCCTCTCCCAGTGTCTCTCGTTCTCTCCCTCCTCCGGTCGTGGACAGTGATG
TCGCACGCCGCACATCGGTACACGACCACGACAGCAGCAACCGGAGATCTGACTCTGATC
TTGTCTCTCTGAAAATCAGCCTCTTAGGAGATCCCGACACCGGAAAGACTTGCTTCCTGG
CGAAGTATGTTGGCGGAGAGAAACAAGTTGAGATGAGAGAGTTGGAGAAAGGGATCCATT
GTACGGACAAGACGTTATCCATGGGAGGAGCTCGCATTTCCTACAGTATCTGCGAGTTAC
AAAGCGCTGAGAAATCACGTGATCTAATCCCCACGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCCATTC
TCTTCATGTTCGATCTCACCAGTCGTTGCACACTCA
C

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4GO11TF 713 0 0
CAGCTTCTCTCTGGCCATCACCACATCTTATTCTTCCTGAACCTATCTTCTTCTCATTTC
TGCATTCCTTCCTTCTTCTTTTATATTTT*****TTTCCCTTCAATCGATCGAGAGTGAA
AATGGCTCAATCCTGCGTTAAAGTCGCTCGAACCAACAATCTCAAGAACCTAGTGAACCG
TCGGGTTCTAATTCTCCGTCGATTCACGCGCATTCTCCTGAACAGAATCGTCCCTTGCAC
TCCCGGCAAATCACAGAGTTATCTCCTGTTGTCACGCGCCGCCACTCCCTCTCCCAGTGT
CTCTCGTTCTCTCCCTCCTCCGGTCGTTGACGGTGAGGTCGCACGCCGCACATCGGTACA
CGACCTCGATAGCAGCAACCGGAGATCTGACTCTGATCTTGTTTCTCTGAAAATCAGCCT
CTTAGGAGATCCCGACACCGGAAAGACTTGCTTCCTGGCCACGTATGTTGGTGGAGAGAA
ACAAGTTGAGATGAGAGAGTTGGAGAAAGGGATCCATTGTACTGACAAGACGTTATCCAT
GGGAGGAGCTCGCATTTCCTACAGTATCTGCGAGTTACAAGGCGCTGAGAAATCACGTGA
TCTAATCCCCACGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCCATTCTCTTCATGTTCGATCTCACCAG
TCGTTGCACACTCAACAATGTGATTAGCTGGTATCAACAAGCTAGAAAGTCTA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4B481JQ 829 0 0
GGC
GGAGAGAAGCAAGTTGAGATGAGAGAGTTGGAGAAAGGGATCCATTGTACGGACAAGACG
TTATCCATGGGAGGAGCTCGCATTTCCTACAGTATCTGCGAGTTACAAGGCGCTGAGAAA
TCACGTGATCTAATCCCCACGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCCATTCTCTTCATGTTCGAT
CTCACCAGTCGTTGCACACTCAACAATGTGATTAGCTGGTATCAACAAGCTAGAAAGTCT
AACCAGACGGCGATTCCAGTTATGGTAGGAACAAAGTTTGATGAGTTTATTCAGCTTCCT
ATTGATCTGCAATGGACTATTGCTAGCCAGGCGAGGACCTACGCCAAGGCGCTAAACGCG
ACGCTCTTCTTCTCGAGTGCTTCATACAACATAAACGTAAATAAGATCTTCAAGTTTGTG
ACCGCGAAGCTCTTCGACTTACCATGGACTGTGGAGAGAAATCTCACCGTCGGAGAACCT
ATCATCGACTACTAGCATCTTCCAAAACGTATTTGTAGATAATATCTAATATAAAAAGAA
GTGAACCCGATGATAGTGTGTTTTTTTTTGTTTCATTCACCGCCGTGGGATTGATCGGAG
CACCGTTTCTAGCCGTCTTTAAAGCGAAATGGAGAGATGAGGCGGCGGAGATTTCGCCCG
CTTTCTTCTGTTTCTTTTTTTATTTAAACAAGAAAAAAA**ACAGAGAACAAATGGTATC
GAGAGAAAATTAGCAGAAAGAAAAGAAAAGAGAGAGGAGATTGTGGATTTTTTTCTTTAT
TCTTTTTGTAATGTTTCTGCCTTCGATTACCGCTGGAGAATT
GGTT

QA 4 825 4 825
DS 

RD RR4EG24JQ 643 0 0
GGTATCAACAAGCTAGAAAGTCTAACCAGACGGCGATTCCAGTTATGGTAGGAACAAAGT
TTGATGAGCTTATTCAGCTTCCTATTGATCTGCAATGGACTATTGCTAGCCAGGCGAGGA
CCTACGCCAAGGCGCTAAACGCGACGCTTTTCTTCTCGAGTGCTTCATACAACATAAACG
TAAATAAGATTTTCAAGTTTGTGACCGCGAAGCTTTTCGACTTACCATGGACTGTGGAGA
GAAATCTCACCGTCGGAGAACCTATCATCGACTACTAGCATTTTCCAAAAAGTATTTGTA
GATAATATTTAATATAAAAAGAAGTGAACCCGATGATAGTGTGTTTTTTTT*GTTTCATT
CACCGCCGTGGGATTGATCGGAGCACCGTTTCTAGCCGTCTTTAAAGCGAAATGGAGAGA
TGAGGCGGCGGAGATTTCGCCCGCTTTTTTCTGTTTCTTTTTTTATTTAAACAAGAAAAA
AAAAACAGAGAACAAATGGTATCGAGAGAAAATTAGCAGAAAGAAAAGAAAAGAGAGAGG
AGATTGTGGATTTTTTTCTTTATTCTTTTTGTAATGTTTCTGCCTTCGATTACCGCTGGA
GAATTTTGGTTCCAGTAAAGTCTAAATAGTAAATACCATTTCG

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL949Contig2 851 4 13 U
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CTTTTGTTTTCTTTCTGCTAATTTTCTCTCGATACCATTTGTTCTCTGTTTTTTT*CTTT
CTTGTTTAAATAAAAAAAAAGAAACAGAAGAAAGCGGGCGAAATCTCCGCCGCCTCATCT
CTCCATTTCGCTTTAAAGACGGCTAGAAACGGTGCTCCGATCAATCCCACGGCGGTGGAT
GAAAAAAAA*CACACTATCTTCGGGTTCACTTCTTTTTATATTAGATATTATCTACAAAT
ACGTTTTGGAAGAGATGCTAGTAGTCGATGATTGGTTCTCCGATGGTGAGATTTCTCTCC
ACAGTCCATGGTAAGTCGAAGAGCTTCGCGGTCACAAACTTGAAGATCTTATTTACGTTT
ATGTTGCATGAAGCACTCGAGAAGAAGAGCGTCGCGTTTAGCGCCTTGGCGTAGGTCCTC
GCCTGGCTAGCAATAGTCCATTGCGGATCAATAGGAAGCTGAATAAACTCATCAAACTTT
GTTCCTACCATAACTGGAATCGCCGTCTGGTTAGACTTTCTAGCTTGTTGATACCAGCTA
ATCACATTGTTGAGTGTGCAACGACTGGTGAGATCGAACATGAAGAGAATGGCTACAGAG
TCCTTGCAAGCCGTGGGGATTAGATCACGTGATTTCTCAGCGCCTTGTAACTCGCAGATA
CTGTAGGAAATGCGAGCTCCTCCCATGGATAACGTCTTGTCAGTACAATGGATCCCTTTC
TCCAACTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO11JQ U 1
AF RR4BH21JQ U 98
AF RR4H840JQB U 105
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BS 756 782 RR4H840JQB
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ATCACATTGTTGAGTGTGCAACGACTGGTGAGATCGAACATGAAGAGAATGGCTACAGAG
TCCTTGCAAGCCGTGGGGATTAGATCACGTGATTT

QA 1 755 1 755
DS 

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GCGAAATCTCCGCCGCCTCATCTCTCCATTTCGCTTTAAAGACGGCTAGAAACGGTGCTC
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CTCCGATGGTGAGATTTCTCTCCACAGTCCATGGTAAGTCGAAAAGCTTCGCGGTCACAA
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ACATGAAGAGAATGGCTACAGAGTCCTTGCAAGCCGTGGGGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4H840JQB 678 0 0
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TCTGTTTTTTT*CTTTCTTGTTTAAATAAAAAAAAAGAAACAGAAGAAAGCGGGCGAAAT
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TCCCACGGCGGTGGATGAAAAAAAAACACACTATCTTCGGGTTCACTTCTTTTTATATTA
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GGTGAGATTTCTCTCCACAGTCCATGGTAAGTCGAAAAGCTTCGCGGTCACAAACTTGAA
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CTTGGCGTAGGTCCTCGCCTGGCTAGCAATAGTCCATTGCAGATCAATAGGAAGCTGAAT
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TTGTAACTCGCAGATACT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4BH21TF 850 0 0
GGCT
AAAACGATATGGTATTTACTATTTAGACTTTACTGGAGCCAAAATTCTCCAGCGGTAATC
GAAGGCAGAAACATTACAAAAAGAATAGAGAAAAAAA*TCCACAATCTCCTCTCTCTTTT
GTTTTCTTTCTGCTAATTTTCTCTCGATACCATTTGTTCTCTGTTTTTTT*CTTTCTTGT
TTAAATAAAAAAAAAGAAACAGAAGAAAGCGGGCGAAATCTCCGCCGCCTCATCTCTCCA
TTTCGCTTTAAAGACGGCTAGAAACGGTGCTCCGATCAATCCCACGGCGGTGGATGAAAA
AAAA*CACACTATCTTCGGGTTCACTTCTTTTTATATTAGATATTATCTACAAATACGTT
TTGGAAGAGATGCTAGTAGTCGATGATTGGTTCTCCGATGGTGAGATTTCTCTCCACAGT
CCATGGTAAGTCGAAGAGCTTCGCGGTCACAAACTTGAAGATCTTATTTACGTTTATGTT
GCATGAAGCACTCGAGAAGAAGAGCGTCGCGTTTAGCGCCTTGGCGTAGGTCCTCGCCTG
GCTAGCAATAGTCCATTGCGGATCAATAGGAAGCTGAATAAACTCATCAAACTTTGTTCC
TACCATAACTGGAATCGCCGTCTGGTTAGACTTTCTAGCTTGTTGATACCAGCTAATCAC
ATTGTTGAGTGTGCAACGACTGGTGAGATCGAACATGAAGAGAATGGCTACAGAGTCCTT
GCAAGCCGTGGGGATTAGATCACGTGATTTCTCAGCGCCTTGTAACTCGCAGATACTGTA
GGAAATGCGAGCTCCTCCCATGGATAACGTCTTGTCAGTACAATGGATCCCTTTCTCCAA
CTCTCC

QA 5 850 5 850
DS 



AS 1 8

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ACGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATC
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AGATTAAGGAGATGTAGGCTTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGTTCGAGCGCC
ACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTT
ATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTCCTTCTTCATCTTCAAACTGATCGAACAGTGAAC
GAAGACGTCATATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTTTT
TTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACT
TGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGATTCTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACT
TTCTGAAATGTGATAATTTTTTTCTAATGTTCTTAAAAGTTTGTTGCTTAATAGATTAGA
TTCTTGATAACACATAAAACACACGAATCACAATTTTACACCAACAAGAAATGAAACACT
TGCTAAAGCTACAAACCAAGTTCTGTGATCATTTACACAAGTTTCCCAACCCAACAAGCC
AGACTCCAAAGACTACAAATTTCACAAATGTTTCAATCGGTGTCCGAATCAAACGACGAC
GATTTGTTTCCATCAGAAGCAGTGGTAGTATCTCCTTTTTTTTGCGCTGCATCTTCTTCC
TTTTCATAAGCCTTGACAATGTCATCAACAGGAACCAAAGGAAGATAACCAACCACAGGG
TAACCCCTCTTTGTCATGTCAGTCACCAAATCGTTGTACATACCACACAAATTTGCAGCC
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GCTTTAGGACCACCGGTACGAGCCTCTTTCACAAAGCTTTGAGCCTTCTCTGCAGTCGCC
TGGATCAACACACTTGCTTGACTTACTACTTGCTTAGCCATTGGAGGAGCATGCTTATCA
AACTTGTTCGAAACTTCACCTACCTTGTGATCAAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGAACA
TCTTTGAATTTGTTGTAGACAGGTGTGACCACTGTGGTGATGACGCCTTCCACCTTTCCG
ACGGCCGGTTTAAGAGGACCGGAGTTTTGTTTTGCGTAGTGGTAGAGATTTGAGAGGGTA
ACAAGAACTTGGATCGCCGCAACTCTCACGAACCCTAGGTGATTAAGCCCTAGCTCCTTA
CTGTTCTTCTCTGTTTCCATCTACACACCAAAGAAACAACTCAACAGCTCTCTCTTTACC
TAGTTTTCTTTTGCTGTGTGTTGAGATCTTTCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 0 5 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO82JQ C 1
AF RR4CO82TF U 21
AF RR4CW36JQ C 1
AF RR4CW36TF U 1
AF RR4CI93JQ U 537
AF RR4G871JQ U 776
AF RR4G871TF C 846
AF RR4CI93TF C 772
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BS 21 103 RR4CO82TF
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BS 424 565 RR4CO82TF
BS 566 589 RR4CW36TF
BS 590 795 RR4CI93JQ
BS 796 796 RR4G871JQ
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BS 957 957 RR4G871JQ
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BS 1021 1148 RR4CI93JQ
BS 1149 1149 RR4G871JQ
BS 1150 1171 RR4CI93JQ
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BS 1399 1534 RR4CI93TF

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AGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGTTCGAGCGTC
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ATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTCCTTCTTCATCTTCAAACTGATCGAACAGTGAAC
GAAGACGTCATATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTTTT
TT*GTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACT
TGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGATTCTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACT
TTCTGAAATGTGATAATTTTTTTCT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4CO82TF 545 0 0
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GAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCT****TTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAG
GCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGTAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCT
TTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGTTCGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGG
GATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGATGATCTCCTCCAGGAC
CATCCTCCTTCTTCATCTTCAAACTGATCGAACAGTGAACGAAGACGTCATATGATACTG
TCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTTTTTT*GTTCTTCAGGTGCCTGG
AAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACTTGTTTTCAAATGAGAGAGTA
CTCATTGATTCTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACTTTCTGAAATGTGATAATTTT
TTTCT

QA 1 545 1 545
DS 

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CGGAGGTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGTAAGA
AGATTAAGGAGATGTAGGCTTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGTTCGAGCGCC
ACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTT
ATGATGATTTCCTCCAGGACCATCCTCCTTTTTCATTTTCAAACTGATCGAACAGTGAAC
GAAGACGTCATATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTTTT
TTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACT
TGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGATTCTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACT
TTCTGAAATGTGATAATTTTTTTCTAATGTTCTTAAAAGTTTGTTGCTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4CW36TF 589 0 0
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ACGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATC
CGGAGGTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGTAAGA
AGATTAAGGAGATGTAGGCTTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGTTCGAGCGCC
ACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTT
ATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTCCTTCTTCATCTTCAAACTGATCGAACAGTGAAC
GAAGACGTCATATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTTTT
TTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACT
TGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGATTCTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACT
TTCTGAAATGTGATAATTTTTTTCTAATGTTCTTAAAAGTTTGTTGCTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4CI93JQ 753 0 0
C
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AGATTCTTGATAACACATAAAACACACGAATCACAATTTTACACCAACAAGAAATGAAAC
ACTTGCTAAAGCTACAAACCAAGTTCTGTGATCATTTACACAAGTTTCCCAACCCAACAA
GCCAGACTCCAAAGACTACAAATTTCACAAATGTTTCAATCGGTGTCCGAATCAAACGAC
GACGATTTGTTTCCATCAAAAGCAGTGGTAGTATCTCCTTTTTTTTGCGCTGCATCTTGT
TCCTTTTCATAAGCCTTGACAATGTCATCAACAGGAACCAAAGGAAGATAACCAACCACA
GGGTAACCCCTCTTTGTCATGTCGGTCACCAAATCGTTGTACATACCACACAAATTTGCG
GCCAGGGGCAAAGCTTTGTTTCCCACTGCATGAATCGGTTTGTACTGGTTGAGTTTAGCC
CAAACTTTAACCGAGCTGGTCACAACGAAGTACTTGTACTCAGTTGCAGCATAGTTAAAG
GCAGCTTTAGGACCACCGGTACGAGCCTCTTTCACAAAGCTTTGAGCCTTCTCTGCAGTC
GCCTGGATCAATACACTTGCTTGACTTACTACTTTCTTAGCCATTGGAGGAGCATGCTTA
TCAAACTTGTTCGAAACTTCACCTACCTTGTGATCAAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGA
ACATCTTTGAATTTGTTGTAGACAGGTGTGAC

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR4G871JQ 543 0 0
ACGACGATTTGT
TTCCATCAGAAGCAGTGGTAGTATCTCCTTTCTTTTGCGCTGCATCTTCTTCCCTTTCAT
AAGCCTTGACAATGTCATCAACAGGAACCAAAGGAAGATAACCAACCATAGGGTAACCCC
TCTTTGTCATGTCAGTCACCAAATCGTTGTACCTACCACACAAGTTTGCAGCCAGGGGCA
AAGCTTTGTTTCCCACTACATGAATCGGTTTGTACTGGTTGAGTTTAGCCCAGACTTTAA
CCGAGCTGGTCACAACGAAGTACTTGTACTCAGTTGCAGCATAGTTAAAGGCAGCTTTAG
GACCACCGGTACGAGCCTCTTTCACAAAGCTTTGAGCCTTCTCTGTAGTTGTCTGGATCA
ACACCTTTGCTTGACTTACTACTTGCTTAGCCATTGGAGGAGCATGCTTATCAAATTTGT
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ATTTGTTGTAGACAGGTGTGACCACTGTGGTGATGACGCCTTCCACCTTTC

QA 13 543 13 543
DS 

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CATAAG
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TGTCATGTCAGTCACCAAATCGTTGTACCTACCACACAAGTTTGCAGCCAGGGGCAAAGC
TTTGTTTCCCACTACATGAATCGGTTTGTACTGGTTGAGTTTAGCCCAGACTTTAACCGA
GCTGGTCACAACGAAGTACTTGTACTCAGTTGCAGCATAGTTAAAGGCAGCTTTAGGACC
ACCGGTACGAGCCTCTTTCACAAAGCTTTGAGCCTTCTCTGTAGTTGTCTGGATCAACAC
CTTTGCTTGACTTACTACTTGCTTAGCCATTGGAGGAGCATGCTTATCAAATTTGTTCGA
AACTTCACCTACCTTGTGATCAAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGAACATCTTTGAATTT
GTTGTAGACAGGTGTGACCACTGTGGTGATGACGCCTTCCACCTTTCCGACGGCCGGTTT
AAGAGGACCGGAGTTTTGTTTTGCGTAGTGGTAGAGATTTGAGAGGGTAACAAGAACTTG
GATCGCCGCAACTCTCACGAACCCTAGGTGATTAAGCCCTAGCTCCTTACTGTTCTTCTC
TGTTTCCATCTA

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DS 

RD RR4CI93TF 763 0 0
CAGACGACGACGATTG
TTCCATCAGAAGCAGTGGTAGTATCTCCTTTTTTT*GCGCTGCATCTG**TCCTTTTCAT
AAGCCT*GACAATGTCATCAACAGGAACCAAAGGAAGATAACCAACCACAGGGTAACCCC
TCTTTGTCATGTCGGTCACCAAATCGTTGTACATACCACACAAATTTGCGGCCAGGGGCA
AAGCTTTGTTTCCCACTGCATGAATCGGTTTGTACTGGTTGAGTTTAGCCCAGACTTTAA
CCGAGCTGGTCACAACGAAGTACTTGTACTCAGTTGCAGCATAGTTAAAGGCAGCTTTAG
GACCACCGGTACGAGCCTCTTTCACAAAGCTTTGAGCCTTCTCTGCAGTCGCCTGGATCA
ATACACTTGCTTGACTTACTACTTTCTTAGCCATTGGAGGAGCATGCTTATCAAACTTGT
TCGAAACTTCACCTACCTTGTGATCAAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGAACATCTTTGA
ATTTGTTGTAGACAGGTGTGACCACTGTGGTGACGACGCCTTCCACCTTTCCGACGGCCG
GTTTAAGAGGACCGGAGTTTTGTTTTGCGTAGTGGTAGAGATTTGAGAGGGTAACAAGAA
CTTGGATCGCTGCAACTCTCACGAACCCTAGGTGATTAAGCCCTAGCTCCTTACTGTTCT
TCTCTGTTTCCATCTACACACCAAAGAAACAACTCAACAGCTCTCTCTTTACCTAGTTTT
CTTTTGCTGTGTGTTGAGATCTTTCCC

QA 17 763 17 763
DS 



AS 2 8

CO CL951Contig1 1216 5 8 U
GGGTTCCAACCCTTTTACAGACTAAATCGATCCTTGTAAGAAAATATCTTACGAATCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCCCGTTCACGTGTTTGTATTCGAATGGCGAGTAA
CGGAGTTAACGACACGGTTACGGTGGCGAATGGCGCAGGGATTGAAATCCCTAAGAAAAT
CGTAGACCTCAACATTGCGGAGCCGGATGAGATTCTCGACGGAGAAGTGAAGGGACTATC
TGATGTTTCTGGTGAGAAGAAGGACGAATCCGACACTAAGGCTGTTGGATCGACGACTGC
GGCGGCTGGGGATGATGTATCTCCTCCGGTGGATGATGATGTTGAGAAGAAGATTCGACG
TGCTGAGAGGTTTGGCGTTTCGGTTAAGCTAACCGAAGAGGAGAAGCGCAATTCTCGTGC
TGAGAGGTTCGGTACTGTAGCAGCAGCGGTTAAGGACTCACAGGGAACGAAGAAAGGAGA
AGAATTGAAGAGAAAGGCTAGAGCTGACAGATTTGGTGTTCCTGCATCATCATCATCATC
CACTGCTAAAGCTGATAAGACTGAGGAAGAGGCGAAGAGGAAAGCTAGGCTCGCTCGTTT
TGGGAAGGATACCACTAAAGTTGATTCTGCTGAGGAAGATAAACGCAAAGCTAGAGCGCT
CAGGTTTTCGAAACCTGCTTCTGAGTCATCTTCAGGTTTACCTGGCAAGGAGGCAGTTGT
TTCAGGAAACGCTGTCTAACGTTCCTGAATGAAGTTTCTTTTTTTTAGTTAGGTAGGCGT
TATGTAATTCCCTCTCTGGCTGCTTGATTGGTTCTCCCTTTATTTCTGCAATTTGAAGTC
CCCCGTGTGTAGTATCTTAATTAAAGTTGCAAGTTTGGTCGTGGTGGAGCAATGATTCTC
TCAGATGGTTGGAAGCTAAGCAAGTTGTCACCGGATGAGACCATGAGAAATCAACAAGTA
ACCTGTAGTTCTGATTGTCTTAAAAAGGCAATTATCAATGTGTTAGGACTTTGGTCCTAG
GAATTCTGAAGTGGTTGGTGTTGACTTTTTTCCATGTTGCAGGTGCTTGAAGTGGTAAGT
GTAGACTAAACGCATGTTCGTACCAAGCTTGTTAGAAACTAGTAGTGTTGATTGCTTTTG
AGTTGTTGTGCCAATGCGTTTTTCTTGAAAAACCAGCCTTAAGTTGCTAGCTTATCTATC
AAACTAAGTGTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4H040TF U 579
AF RR4H381TF U 579
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QA 1 638 1 638
DS 



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ATAGTTGAAAATAAGAAACAACTCTAAACATTACATTCCCTTTCATAAAAGTATTTCTGG
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BQ
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AF RR4F824JQ U 1
AF RR4E239JQ U 13
AF RR4F824TF C 355
BS 1 353 RR4F824JQ
BS 354 354 RR4E239JQ
BS 355 632 RR4F824JQ
BS 633 695 RR4E239JQ
BS 696 696 RR4F824TF
BS 697 780 RR4E239JQ
BS 781 1064 RR4F824TF

RD RR4F824JQ 632 0 0
GCTAGTAAAATTTAATTTTTAGATTACCTTGCAGCATATAAGCGTTTAGGCACAAGCACA
ATAGTTGAAAATAAGAAACAACTCTAAACATTACATTCCCTTTCATAAAAGTATTTCTGG
CTGCTTGATTCAAAATGTATGAACAAAGTTTTATCTAAAAACTATTACGGACGCATAAAA
AATTGTGTAGCCATCAAAAAGCACGCAAAGTACAAGTCCCACGAACAGAGATTCTTCGGC
GTCTGAGGCTCTCTTCTCTTCAACTGTCATAGGGACCAGAGATATGGAAACCAACAAGTA
CCCTCTAGTGTTCTAATGATGTCTTACATGACAAAGGAACTCTGAAGTGGTGGTTTGACA
GGTCATATTATATATTAATAAGCAAAACCAACAACGAACACAAGGTAATGGGATCTATTT
TGCACGCGATATTCGCAAAACAAGCACACAACTCAGTATGAGAAAAACACTTAGTTTGAT
AGATAAGCTAGCAACTTAAGGCTGGTTTTTCAAGAAGAACGCATTGGCACAACAACTCAA
AAGCAATCAACACTACTAGTTTCTAACAAGATTGGTACGAACATGCGTTTAGTCTACACT
TACCACTTCAAGCACCTGCAACATGGAAAAAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4E239JQ 768 0 0
TAATTTTTAGATTACCTTGCAGCATATAAGCGTTTAGGCACAAGCACAATAGTTGAAAAT
AAGAAACAACTCTAAACATTACATTCCCTTTCATAAAAGTATTTCTGGCTGCTTGATTCA
AAATGTATGAACAAAGTTTTATCTAAAAACTATTACGGACGCATAAGAAATTGTGTAGCC
ATCAGAAAGCACGCAAAGTACAAGTCCCACGAACAGAGATTCTTCGGCGTCTGAGGCTCT
CTTCTCTTCAACTGTCATAGGGACCAGAGATATGGAAACCAACAAGTACCCTCTAGTGTT
CTAATGATGTCTTACATGACAAAGGAACTCTGAAGTGGTGGCTTGACAGGTCATATTATA
TATTAATAAGCAAAACCAACAACGAACACAAGGTAATGGGATCTATTTTGCACGCGATAT
TCGCAAAACAAGCACACAACTCAGTATGAGAAAAACGCTTAGTTTGATAGATAAGCTAGC
AACTTAAGGCTGGTTTTTCAAGAAGAACGCATTGGCACAACAACTCAGAAGCAATCAACA
CTACTAGTTTCTAACAAGATTGGTACGAACATGCGTTTAGTCTACACTTACCACTTCAAG
CACCTGCAACATGGAAAAAAGTCAACACCAACCACTTCAGAATTCCTAGGTCCTAAGTCC
CTTTTTAAGACAATCAGAACTACGGGTTACTTGTTGGTTTCTCATGGTCTCATCTGGTGA
CGACATACTTAGCTTCCAACCATCTGAGAGAATCATTGCTCCACCACG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4F824TF 710 0 0
TTGACAGGTCATATTATATATTAATAAGCAAAACCAACAACGAACACAAGGTAATGGGAT
CTATTTTGCACGCGATATTCGCAAAACAAGCACACAACTCAGTATGAGAAAAACACTTAG
TTTGATAGATAAGCTAGCAACTTAAGGCTGGTTTTTCAAGAAGAACGCATTGGCACAACA
ACTCAAAAGCAATCAACACTACTAGTTTCTAACAAGATTGGTACGAACATGCGTTTAGTC
TACACTTACCACTTCAAGCACCTGCAACATGGAAAAAAGTCAACACCAACCACTTCAGAA
TTCCTAGGTCCTAAGTCCCTTTTTAAGACAATCAGAACTACAGGTTACTTGTTGGTTTCT
CATGGTCTCATCTGGTGACGACATACTTAGCTTCCAACCATCTGAGAGAATCATTGCTCC
ACCACGACCAAACTTGCGACTTTAACTAAGATACTACAAACGGGGAAGGACTTCTAATTG
CAGAAATAAGGGGAGAACCAATCAAGCAGCCAGAGAGGGAATTACATAACGCCTACCTAA
CTAAAAAAGAAACTTTATTCAAGAACGTTAAGCAGCGTTTCCTGAAACAACTGCCTCCTT
GCCAGGTAAATCTGAAGATGACTCAGAAGCAGGTTTCGAAAACCTGAGTGCCCTAGCTTT
GCGTTTATCTTCCTCAGCAGAATCAACTTTAGTAGTATCCTTCCCAAAAC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 2 7

CO CL952Contig1 749 2 2 U
GCCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCGTGATGTGTTCCGTCTTGCCAAGGAGAATGCTC
CAGGTATCATCTTTATTGATGAGGTAGATGCCATAGCTACTGCTAGGTTCGATGCTCAAA
CTGGAGCTGATAGGGAAGTTCAGCGTATTCTCATGGAACTACTTAATCAGATGGATGGAT
TTGACCAGACCGTGAATGTCAAGGTCATAATGGCAACCAACAGGGCAGACACGCTTGATC
CTGCCCTCTTACGTCCTGGAGACTTGATCGTAAGATTGAGTTCCCCCTTCCTGATAGACG
TCAAAAGAGGCTTGTTTTCCAGGTATGCACCGCCAAAATGAACCTCAGCGATGAGGTTGA
CTTGGAAGACTATGTTTCACGTCCTGATAAAATTAGCGCTGCTGAGATAGCAGCAATCTG
CCAGGAAGCTGGAATGCATGCGGTGCGTAAGAACAGATATGTGATACTGCCCAAGGATTT
CGAGAAGGGTTACCGCTCAAATGTGAAGAAGCCAGACACGGACTTTGAGTTCTACAAGTG
AGGAGAAAGCAGAGATGGGAAGTAGAGTATGCGTGTTGTTAAAATGGACGTGGATTTACC
TGTTTAATGTATGAGCTAAGTTGCATCTCTAATTTATGAAGCTCAAGTTCACACATGTTT
GTGTTTTCTTTAGTTACTCAGCCTTTGCAGTTCAATTTTTAAGAAAACGGTGGCAGTGTA
ACATATATATTAGCTAAGTTGCATCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE17TF U 1
AF RR4CE17JQ C 20
BS 1 283 RR4CE17TF
BS 284 749 RR4CE17JQ

RD RR4CE17TF 283 0 0
GCCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCGTGATGTGTTCCGTCTTGCCAAGGAGAATGCTC
CAGGTATCATCTTTATTGATGAGGTAGATGCCATAGCTACTGCTAGGTTCGATGCTCAAA
CTGGAGCTGATAGGGAAGTTCAGCGTATTCTCATGGAACTACTTAATCAGATGGATGGAT
TTGACCAGACCGTGAATGTCAAGGTCATAATGGCAACCAACAGGGCAGACACGCTTGATC
CTGCCCTCTTACGTCCTGGAGACTTGATCGTAAGATTGAGTTC

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4CE17JQ 730 0 0
TATGGTTCGTGATGTGTTCCGTCTTGCCAAGGAGAATGCTCCAGGTATCATCTTTATTGA
TGAGGTAGATGCCATAGCTACTGCTAGGTTCGATGCTCAAACTGGAGCTGATAGGGAAGT
TCAGCGTATTCTCATGGAACTACTTAATCAGATGGATGGATTTGACCAGACCGTGAATGT
CAAGGTCATAATGGCAACCACCAGGGCAGACACGCTTGATCCTGCCCTCTTACGTCCTGG
AGACTTGATCGTAAGATTGAGTTCCCCCTTCCTGATAGACGTCAAAAGAGGCTTGTTTTC
CAGGTATGCACCGCCAAAATGAACCTCAGCGATGAGGTTGACTTGGAAGACTATGTTTCA
CGTCCTGATAAAATTAGCGCTGCTGAGATAGCAGCAATCTGCCAGGAAGCTGGAATGCAT
GCGGTGCGTAAGAACAGATATGTGATACTGCCCAAGGATTTCGAGAAGGGTTACCGCTCA
AATGTGAAGAAGCCAGACACGGACTTTGAGTTCTACAAGTGAGGAGAAAGCAGAGATGGG
AAGTAGAGTATGCGTGTTGTTAAAATGGACGTGGATTTACCTGTTTAATGTATGAGCTAA
GTTGCATCTCTAATTTATGAAGCTCAAGTTCACACATGTTTGTGTTTTCTTTAGTTACTC
AGCCTTTGCAGTTCAATTTTTAAGAAAACGGTGGCAGTGTAACATATATATTAGCTAAGT
TGCATCTCTC

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL952Contig2 1384 5 8 U
GGCTACTCCAAGAACTCATCCCACAGATCTCTCTCCGACAATGGCTGCAGCGATGGTTCT
CGACCCCAAATCATCATCTCCCCCACTGATGGATCTCTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGA
TCCCTACTCCCGTCTCAAATCGCTCGAGCGCCAGCTGGAGTTCACCGACATCCAAGAGGA
ATACGTGAAAGACGAGCAGAAGAATCTCAAACGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGT
CAAGCGAATCCAATCCGTGCCCTTAGTGATAGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAA
CAACGGCATCGTTGGATCCACCACGGGCTCCAATTACTATGTTCGGATTCTCAGCACCAT
CAACAGAGAAGACTTAAAGCCTTCTGCTTCCGTGGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCT
TGTTGATGTCTTGCCGCCTGAGGCTGATTCGAGCATCTCCCTTCTCAGCCAGTCTGAGAA
GCCTGACGTCTCCTACAATGATATTGGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGA
GGCTGTTGAGTTGCCACTTACCCACCACGAGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCC
ACGAGGTGTCTTACTCTATGGACCTCCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGGCTAAGGCTGT
TGCTAACCACACAACCGCTGCTTTCATTAGGGTTGTTGGGTCTGAGTTCGTGCAGAAGTA
CCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCGTGATGTCTTCCGCCTTGCCAAGGAGAATGCTCC
AGCTATCATATTTATTGATGAGGTGGATGCCATCGCTACTGCTAGGTTCGATGCTCAAAC
AGGAGCTGATAGGGAAGTTCAGCGTATTCTCATGGAACTACTTAATCAGATGGATGGATT
TGACCAGACCGTGAATGTCAAGGTCATAATGGCAACCAACAGGGCAGACACTCTTGATCC
TGCTTTCTTACGTCCTGGCAGACTTGATCGTAAGATTGAGTTCCCCCTTCCTGATAGACG
TCAAAAGAGGCTTGTTTTCCAGGTATGCACTGCCAAAATGAACCTCAGCGATGAGGTTGA
CTTGGAAGACTATGTTTCACGTCCTGATAAAATTAGCGCTGCTGAGATAGCAGCAATCTG
CCAGGAAGCTGGAATGCATGCGGTGCGTAAGAACAGATATGTGATACTGCCTAAGGACTT
CGAGAAGGGTTACCGCTCAAATGTGAAGAAGCCAGACACGGACTTTGAGTTCTACAAGTG
AGGAGAAAGCAGAGATGGGAAAGCAGATTATGCGTGTTGTTAAAACTCCTGTGTTTTTTT
TTTTTAATATATCTGCATGGATCTGCAATTTAATGTATGAACTAAGTTGCATCTCTAATT
AATG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RR4CQ29TF U 16
AF RR4GA27TF U 3
AF RR4DL92TF U 1
AF RR4GA27JQ C 570
AF RR4DL92JQ C 641
BS 1 654 RR4DL92TF
BS 655 655 RR4GA27TF
BS 656 792 RR4DL92TF
BS 793 978 RR4GA27JQ
BS 979 979 RR4DL92JQ
BS 980 1137 RR4GA27JQ
BS 1138 1138 RR4DL92JQ
BS 1139 1384 RR4GA27JQ

RD RR4CQ29TF 635 0 0
CTCAT
CCACAGATCTCTCTCCGACAATGGCTGCAGCGATGGTTCTCGACCCCAAATCATCATCTC
CCCCACTGATGGATCTCTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGATCCCTACTCCCGTCTCAAAT
CGCTCGAGCGCCAGCTGGAGTTCACCGACATCCAAGAGGAATACGTGAAAGACGAACAGA
AGAATCTCAAACGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGTCAAGCGAATCCAATCCGTGC
CCTTAGTGATTGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAACAACGGCATCGTTGGATCCA
CCACGGGCTCCAATTACTATGTCAGGATTCTCAGCACCATCAACAGAGAAGACCTGAAGC
CTTCTGCTTCCGTCGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCTCGTCGATGTCTTGCCGCCTG
AGGCTGATTCTAGCATCTCCCTTCTCAGCCAATCTGAGAAGCCTGACGTCTCCTACAATG
ATATTGGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGAGGCTGTTGAGTTGCCACTTA
CCCACCACGAGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCCACGAGGTGTCTTACTCTATG
GACCTCCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGG

QA 6 635 6 635
DS 

RD RR4GA27TF 681 0 0
GG
ACTCCAAGAACTCATCCCACAGATCTCTCTCCGACAATGGCTGCAGCGATGGTTCTCGAC
CCCAAATCATCATCTCCCCCACTGATGGATCTCTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGATCCC
TACTCCCGTCTCAAATCGCTCGAGCGCCAGCTGGAGTTCACCGACATCCAAGAGGAATAC
GTGAAATACGAGCAGAAGAATCTCAAACGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGTCAAG
CGAATCCAATCCGTGCCCTTAGTGATAGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAACAAC
GGCATCGTTGGATCCACCACGGGCTCCAATTACTATGTTCGGATTCTCAGCACCATCAAC
AGAGAAGACTTAAAGCCTTCTGCTTCCGTGGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCTTGTT
GATGTCTTGCCGCCTGAGGCTGATTCGAGCATCTCCCTTCTCAGCCAGTCTGAGAAGCCT
GACGTCTCCTACAATGATATTGGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGAGGCT
GTTGAGTTGCCACTTACCCACCACGAGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCCACGA
GGTGTCTTACTCTATGGACCTCCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGGCTAAGGCTGTTGCT
AACCACACAACCGCTGCTT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR4DL92TF 792 0 0
GGCTACTCCAAGAACTCATCCCACAGATCTCTCTCCGACAATGGCTGCAGCGATGGTTCT
CGACCCCAAATCATCATCTCCCCCACTGATGGATCTCTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGA
TCCCTACTCCCGTCTCAAATCGCTCGAGCGCCAGCTGGAGTTCACCGACATCCAAGAGGA
ATACGTGAAAGACGAGCAGAAGAATCTCAAACGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGT
CAAGCGAATCCAATCCGTGCCCTTAGTGATAGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAA
CAACGGCATCGTTGGATCCACCACGGGCTCCAATTACTATGTTCGGATTCTCAGCACCAT
CAACAGAGAAGACTTAAAGCCTTCTGCTTCCGTGGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCT
TGTTGATGTCTTGCCGCCTGAGGCTGATTCGAGCATCTCCCTTCTCAGCCAGTCTGAGAA
GCCTGACGTCTCCTACAATGATATTGGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGA
GGCTGTTGAGTTGCCACTTACCCACCACGAGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCC
ACGAGGTGTCTTACTCTATGGACCTCCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGGCTAAAGCTGT
TGCTAACCACACAACCGCTGCTTTCATTAGGGTTGTTGGGTCTGAGTTCGTGCAGAAGTA
CCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCGTGATGTCTTCCGCCTTGCCAAGGAGAATGCTCC
AGCTATCATATT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4GA27JQ 815 0 0
AGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCCACGAGGTGTCTTACTCTATGGACCTCCTG
GTACCGGGAAGACTATGTTGGCTAAGGCTGTTGCTAACCACACAACCGCTGCTTTCATTA
GGGTTGTTGGGTCTGAGTTCGTGCAGAAGTACCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCGTG
ATGTCTTCCGCCTTGCCAAGGAGAATGCTCCAGCTATCATATTTATTGATGAGGTGGATG
CCATCGCTACTGCTAGGTTCGATGCTCAAACAGGAGCTGATAGGGAAGTTCAGCGTATTC
TCATGGAACTACTTAATCAGATGGATGGATTTGACCAGACCGTGAATGTCAAGGTCATAA
TGGCAACCAACAGGGCAGACACTCTTGATCCTGCTTTCTTACGTCCTGGTAGACTTGATC
GTAAGATTGAGTTCCCCCTTCCTGATAGACGTCAAAAGAGGCTTGTTTTCCAGGTATGCA
CTGCCAAAATGAACCTCAGCGATGAGGTTGACTTGGAAGACTATGTTTCACGTCCTGATA
AAATTAGCGCTGCTGAGATAGCAGCAATTTGCCAGGAAGCTGGAATGCATGCGGTGCGTA
AGAACAGATATGTGATACTGCCTAAGGACTTCGAGAAGGGTTACCGCTCAAATGTGAAGA
AGCCAGACACGGACTTTGAGTTCTACAAGTGAGGAGAAAGCAGAGATGGGAAAGCAGATT
ATGCGTGTTGTTAAAACTCCTGTGTTTTTTTTTTTTAATATATCTGCATGGATCTGCAAT
TTAATGTATGAACTAAGTTGCATCTCTAATTAATG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4DL92JQ 744 0 0
ACTATGTTGGCTAAGGCTGTTGCTAACCACACAACCGCTGCTTTCATTAGGGTTGTTGGG
TCTGAGTTCGTGCAGAAGTACCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCGTGATGTCTTCCGC
CTTGCCAAGGAGAATGCTCCAGCTATCATATTTATTGATGAGGTGGATGCCATCGCTACT
GCTAGGTTCGATGCTCAAACAGGAGCTGATAGGGAAGTTCAGCGTATTCTCATGGAACTA
CTTAATCAGATGGATGGATTTGACCAGACCGTGAATGTCAAGGTCATAATGGCAACCAAC
AGGGCAGACACTCTTGATCCTGCTTTCTTACGTCCTGGCAGACTTGATCGTAAGATTGAG
TTCCCCCTTCCTGATAGACGTCAAAAGAGGCTTGTTTTCCAGGTATGCACTGCCAAAATG
AACCTCAGCGATGAGGTTGACTTGGAAGACTATGTTTCACGTCCTGATAAAATTAGCGCT
GCTGAGATAGCAGCAATCTGCCAGGAAGCTGGAATGCATGCGGTGCGTAAGAACAGATAT
GTGATACTGCCTAAGGACTTCGAGAAGGGTTACCGCTCAAATGTGAAGAAGCCAGACACG
GACTTTGAGTTCTACAAGTGAGGAGAAAGCAGAGATGGGAAAGCAGATTATGCGTGTTGT
TAAAACTCCTGTGTTTTTTTTTTTTAATATATCTGCATGGATCTGCAATTTAATGTATGA
ACTAAGTTGCATCTCTAATTAATG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 8

CO CL953Contig1 739 8 12 U
GGATAAAAAAAAACATGTGGACTTAAAGATAACTATCTGTTAATTGGTCGTCTTCTTCTA
ATATTACACGTTTTCTTCCCCTCCTCCTCAGCTCGGGCGATTTCGTTCCGGGATGGCGTC
GTTCGCTGGAATCACGACTTCGAATCCAACGTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACGAG
TTTACGTTCTGTTGCTCCGTGTAATTCGGTTTCATTTCCTCGTTCTTCGTTATACGTGAA
TCTCAATAAGAGAAGCCGTCTCTATGTTCGATCCAGTTCAGCTCCAGTGGCACCAGCAAT
GGAGGGACTGAAGCCGGCGATATCTCTTACGGATAGTGCACTTAAGCATCTGAATAAGAT
GAGATCAGAACGCGGGGAAGATCTGTGTTTGAGGATCGGTGTCAAACAAGGAGGTTGCTC
GGGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCAAGACCAGATGATTCCAC
CATCGAGTACCAAGGATTCACTATAATCTGTGATCCGAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGG
AATGCAGCTTGATTACAATGATGCTTTAATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCGAACCCTAA
CGCTACACAAACATGCGGATGTGGAAAGTCTTTTGCTGCAGAGATGTGAAACCGTTATAT
TGCAGTCGAACATATATAATTGTGGACTTTTATAGCTAATGAAACATTTATAATATATAA
CTATAAACCTATAGTCACA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 

AF RR4BA90JQ C 1
AF RR4C951JQ C 143
AF RR4C951TF U 79
AF RR4CY15JQ C 93
AF RR4CY15TF U 93
AF RR4BH20JQ C 1
AF RR4BA90TF U 1
AF RR4BH20TF U 1
BS 1 80 RR4BA90TF
BS 81 186 RR4C951TF
BS 187 187 RR4CY15TF
BS 188 367 RR4C951TF
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BS 369 512 RR4C951TF
BS 513 513 RR4CY15TF
BS 514 557 RR4C951TF
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BS 559 609 RR4C951TF
BS 610 610 RR4BA90TF
BS 611 739 RR4C951TF

RD RR4BA90JQ 739 0 0
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ATATTACACGTTTTCTTCCCCTCCTCCTCAGCTCGGGCGATTTCGTTCCGGGATGGCGTC
GTTCGCTGGAATCACGACTTCGAATCCAACGTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACGAG
TTTACGTTCTGTTGCTCCGTGTAATTCGGTTTCATTTCCTCGTTCTTCGTTATATGTGAA
TCTCAATAGGAGAAGCCGTCTCTATGTTCGATCCAGTTCAGCTCCAGTGGCACCAGCAAT
GGAGGGACTGAAGCCGGCGATATCTCTTACGGATAGTGCACTTAAGCATCTGAATAAGAT
GAGATCAGAACGCGGGGAAGATCTGTGTTTGAGGATCGGTGTCAAACAAGGAGGTTGCTC
GGGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCAATGCTAGACCAGATGATTCCAC
CATTGAGTACCAAGGCTTCACTATAATCTGTGATCCGAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGG
GATGCAGCTTGATTACAATGATGCTTTAGTCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCTAACCCTAA
CGCTACACAAACATGCGGATGTGGAAAGTCTTTTGCTGCAGAGATGTGAAACCGTTATAT
TGCAGTCGAACATCTATAATTGTGGACTT**ATAGCTAATGAAACATTTATAATATATAA
CTATAAACCTATAGTCACA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4C951JQ 597 0 0
AATCCAACGTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACGAGTTTACGCTCTGTTGCTCCGTGT
AATTCGGTTTCATTTCCTCGTTTTTCGTTATACGTGAATCTCAATAAGAGAAGCCGTCTC
TATGTTCGATCCAGTTCAGCTCCAGTGGCACCAGCAATGGAGGGACTGAAGCCGGCGATA
TTTTTTACGGATAGTGCACTTAAGCATTTGAATAAGATGAGATCATAACGCGGGGAAGAT
CTGTGTTTGAGGATCGGTGTCAAACAAGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACCATGGAC
TTTGAGAACAGAGCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACCATCGAGTACCAAGGATTCACT
ATAATCTGTGGTCCGAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGCAGCTTGATTACAGTGAT
GCTTTAATCGGTGGAGGCTTTTCTTTCTCGAACCCTAACGCTACACAGACATGCGGATGT
GGAAAGTCTTTTGCTGCAGAGATGTGAAACCGTTATATTGCAGTCGAACATATATAATTG
TGGACTTTTATAGCTAATGAAACATTTATAATATATAACTATAAACCTATAGTCACA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4C951TF 661 0 0
GG
CTCCTCCTCAGCTCGGGCGATTTCGTTCCGGGATGGCGTCGTTCGCTGGAATCACGACTT
CGAATCCAACGTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACGAGTTTACGCTCTGTTGCTCCGT
GTAATTCGGTTTCATTTCCTCGTTCTTCGTTATACGTGAATCTCAATAAGAGAAGCCGTC
TCTATGTTCGATCCAGTTCAGCTCCAGTGGCACCAGCAATGGAGGGACTGAAGCCGGCGA
TATCTCTTACGGATAGTGCACTTAAGCATCTGAATAAGATGAGATCATAACGCGGGGAAG
ATCTGTGTTTGAGGATCGGTGTCAAACAAGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACCATGG
ACTTTGAGAACAGAGCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACCATCGAGTACCAAGGATTCA
CTATAATCTGTGGTCCGAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGCAGCTTGATTACAGTG
ATGCTTTAATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCGAACCCTAACGCTACACAGACATGCGGAT
GTGGAAAGTCTTTTGCTGCAGAGATGTGAAACCGTTATATTGCAGTCGAACATATATAAT
TGTGGACTTTTATAGCTAATGAAACATTTATAATATATAACTATAAACCTATAGTCACA

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR4CY15JQ 647 0 0
GG
GGGCGATTTCGTTCCGGGATGGCGTCGTTCGCTGGAATCACGACTTCGAATCCAACGTTT
CTCCAGCTAAGGATCTCTACCACGAGTTTACGTTCTGTTGCTCCGTGTAATTCGGTTTCA
TTTCCTCGTTCTTCGTTATACGTGAATCTCAATAAGAGAAGCCGTCTCTATGTTCGATCC
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AGTGCACTTAAGCATCTGAATAAGATGAGATCAGAACGCGGGGAAGATCTGTGTTTGAGG
ATCGGTGTCAAACAAGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGA
GCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACCATCGAGTACCAAGGATTCACTATAATCTGTGAT
CCGAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGCAGCTTGATTACAGTGATGCTTTAATCGGT
GGAGGCTTTTCTTTCTCGAACCCTAACGCTACACAGACATGCGGATGTGAAAAGTCTTTT
GCTGCAGAGATGTGAAACCGTTATATTGCAGTCGAACATATATAATTGTGGACTTTTATA
GCTAATGAAACATTTATAATATATAACTATAAACCTATAGTCACA

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR4CY15TF 647 0 0
GG
GGGCGATTTCGTTCCGGGATGGCGTCGTTCGCTGGAATCACGACTTCGAATCCAACGTTT
CTCCAGCTAAGGATCTCTACCACGAGTTTACGTTCTGTTGCTCCGTGTAATTCGGTTTCA
TTTCCTCGTTCTTCGTTATACGTGAATCTCAATAAGAGAAGCCGTCTCTATGTTCGATCC
AGTTCAGCTCCAGTGGCACCAGCAATGGAGGTACTGAAGCCGGCGATATCTCTTACGGAT
AGTGCACTTAAGCATCTGAATAAGATGAGATCAGAACGCGGGGAAGATCTGTGTTTGAGG
ATCGGTGTCAAACAAGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGA
GCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACCATCGAGTACCAAGGATTCACTATAATCTGTGAT
CCGAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGCAGCTTGATTACAGTGATGCTTTAATCGGT
GGAGGCTTCTCTTTCTCGAACCCTAACGCTACACAGACATGCGGATGTGAAAAGTCTTTT
GCTGCAGAGATGTGAAACCGTTATATTGCAGTCGAACATATATAATTGTGGACTTTTATA
GCTAATGAAACATTTATAATATATAACTATAAACCTATAGTCACA

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR4BH20JQ 739 0 0
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DS 

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QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4BH20TF 739 0 0
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CTATAAACCTATAGTCACA

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 7

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TCGTGAGTGGCGATGGTTTTCTAGGAATTGATCTATGGTTCCAGTTTGCCTTTCTGCTTC
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GGGTCTGATTCGGATGTGTGTTCTTCTGTCCGCACCGAGGTCGTCTTTCTTTCCGGCTCG
TCTCTAAGGATTTGGGGCTTCGGCCCGTTTTGCATCTGGCGTGGAGGTTGATTGGTAAAA
GATGGTGTGAATCTCTTTCTTCCTCTGGGGTTAGTGTTCTGCGGTATCTCGTGGCTCGTC
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GGGTGTGTGCTTATATCTTCCTTCCTCTCTCGGTTCATCTTCTTACTTGGGTGTTTTGTT
GATGTGATCTAGTTCTATAGTTTGGTCTTACTTTAAGCTTTGTGTATATTGTCTTGTTGT
ATCTACCGGAGAATTTTCTCAATTCTGTCGGTCTTTGTCTCCAGAGTTCTTTATTACTGC
TGGCTTAAGTTTCTAGGAGTTGTATTACTCGTTAGTTTGTGTATCACCATGTGTAACAAT
CTGGTTATTATCAATGATTCTCTTAGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4GN26TF U 1
AF RR4CP71TF U 86
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AF RR4AU80TF U 42
AF RR4AU80JQ C 173
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TCTCTC

QA 1 666 1 666
DS 

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GG
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QA 3 680 3 680
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G
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GCATGTCCTTAGTCTGGCTTGGAGTATTACTGAGCTTTGTCCTAGATCCAGATCTGTAGA
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QA 2 818 2 818
DS 

RD RR4AU80JQ 818 0 0
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TCTGCTTCTGTGTTCTCTCTCTTGTGGCCTATTAGCAATTGACGAGTCCTTTCTCTCTTT
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TGTTTTGCTTCTTGTGGTGGATTTGCTGAGATTGGAAGGATGTGCTTATCCTTGGTTTCA
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TGGTAAAAGATGGTGTGAATCTCTTTCTTCCTCTGGGGTTAGTGTTCTGCGGTATCTCGT
GGCTCGTCAGGAAGTGGTCCGGAGCAATATAATGAGATGCAGATTTCCCCTTAATAAAGT
TCGCTTGTGGGTGTGTGCTTATATCTTCCTTCCTCTCTCGGTACATCTTCTTACTTGGGT
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ATTACTGCTGGCTTAAGTTTCTAGGAGTTGTATTACTCGTTAGTTTGTGTATCACCATGT
GTAACAATCTGGTTATTATCAATGATTCTCTTAGAGGG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4CP71JQ 664 0 0
TAGC
ATTGACGAGTCCTTTCTCTCTTTACTGAGCGAAAGTATCTCTGATCTTGTTTGGTCCGGT
TGATTTGATCTGCATGTGTGTTGTGTTTTGCTTCTTGTGGTGGATTTGCTGAGATTGGAA
GGATGTGCTTATCCTTGGTTTCACTTGCAACGGGTCTGATTCGGATGTGTGTTCTTCTGT
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TTGCATCTGGCGTGGAGGTTGATTGGTAAAAGATGGTGTGAATCTCTTTCTTCCTCTGGG
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TGCAGATTTCCCCTTAATAAAGTTCGCTTGTGGGTGTGTGCTTATATCTTCCTTCCTCTC
TCGGTTCATCTTCTTACTTGGGTGTTTTGTTGATGTGATCTAGTTCTATAGTTTGGTCTT
ACTTTAAGCTTTGTGTATATTGTCTTGTTGTATCTACCGGAGAATTTTCTCAATTCTGTC
GGTCTTTGTCTCCAGAGTTCTTTATTACTGCTGGCTTAAGTTTCTAGGAGTTGTATTACT
CGTTAGTTTGTGTATCACCATGTGTAACAATCTGGTTATTATCAATGATTCTCTTAG
AGG

QA 5 661 5 661
DS 

RD RR4FJ90JQ 693 0 0
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CTGAGCGAAAGTATCTCTGATCTTGTTTGGTCCGGTTGATTTGATCTGCATGTGTGTTGT
GTTTTGCTTCTTGTGGTGGATTTGCTGAGATTGGAAGGATGTGCTTATCCTTGGTTTCAC
TTGCAACGGGTCTGATTCGGATGTGTGTTCTTCTGTCCGCACCGAGGTCGTCTTTCTTTC
CGGCTCGTCTCTAAGGATTTGGGGCTTCGGCCCGTTTTGCATTTGGCGTGGAGGTTGATT
GGTAAAAGATGGTGTGAATCTCTTTCTTCCTCTGGGGTTAGTGTTCTGCGGTATCTCGTG
GCTCGTCAGGAAGTGGTCCGGAGCAATATAATGAGATGCAGATTTCCCCTTAATAAAGTT
CGCTTGTGGGTGTGTGCTTATATCTTCCTTCCTCTCTCGGTTCATCTTCTTACTTGGGTG
TTTTGTTGATGTGATCTAGTTCTATAGTTTGGTCTTACTTTAAGCTTTGTGTATATTGTC
TTGTTGTATCTACCGGAGAATTTTCTCAATTCTGTCGGTCTTTGTCTCCAGAGTTCTTTA
TTACTGCTGGCTTAAGTTTCTAGGAGTTGTATTACTCGTTAGTTTGTGTATCACCATGTG
TAACAATCTGGTTATTATCAATGATTCTCTTAG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 5

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AATTAACAAAACAAAACTATCTCGATAAATATTAGCGTATAGAAAACATTCATAAGTAGA
AAGAGTCCATTGGGATGGGCCCTTTTAAGAAAAAAGACATGTTACACTGCAATATCATCT
CATCCTCTAGACGTCGAAAGTGTCGTTTGATGCAGCCACAAGTGGTTTTGTGAGTTACTC
AGACCCTTTTTGCTTTTTGGAAGCAGACCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGCTTACCCTC
TCTTCGCTCTCTCTTCACTCCCTTTGATTTATCCAGCAAAGGATTTTTTCCAACCTCCTG
CTCAGGAATATAAATCCTCCCTCTCTTCCCTAGTACATCATCTTGATCAACATTCTTCAC
CTTCTTCTTGGGCTTATCTTTAGATGATTTCATCGCTTCTTTCCTTAGGCCTTCGTTGGG
AAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCTACTTCAACAAGCTCTATCCT
AGGCACGATGGTCCCTGACTTTTTAAGCTTAATAGCGCAGTAAGTAAGGAAAACCTTAGT
AGGCGATATCGCTGTGCATATGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGGTTTAGATTATCCAC
AACCTCGCCTCGAAACAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTCAGCTCTGGCACATT
CTCAAAACCTTCTCCAGTAAAGCAAATGAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGTGCTATTTT
CTTGTCGTAGGAAAACGACAGCAAAGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACTTCAATCAGATC
GTAGACATGGTGATCATACATTCTTCCGAGCACAAGATTGTCAGGTCGTTTCTTTGTGTG
AGAGCCATAAGCGAAAATGCTACAATCAGTTTTGAGAGAGAAGAACTCCAAAGAGGTTTC
GCCACCACTCTCAAAGGGTCTGATATTCTCATTCCTCCTCGAGTACTTGATGGCACCTCC
CTTCTTCAAACGGTACAGTTCCATCAACACAGCGCTAAGCGTAGCGCTCGTCTTGGTTCC
GTGAAGTATCAATGTCTTCTTCCCATTCTCAACGAGCTTAGGAGCTCGCTTTTCGAGCAC
ACGCTTGGCTTTGTGGGTCTTCGGAGTTCGTATTTCCATCATGGCTGGTGATTTTCCGGC
GACTTCCAACAAAGCGACGGGCTCCGAGAGAGACGAAGAAGCGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AATTAACAAAACAAAACTATCTCGATAAATATTAGCGTATAAAAAACATTCATAAGTAAA
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CATCTTCTAAACGTCAAAAGTGTCGTTTGATGCACCCACAAGTGGTTTTGTGAGTTACTC
AAACCCTTTTTGCTTTTTGGAAGCAAACCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGCTTACCCTC
TCTTCGCTCTCTCTTCACTCCCTTTGATTTATCCGGCAAAGGATTTTTTCCAACCTCCTG
CTCAGGAATATAAATCCTCCCTCTCTTCCCTAGTACATCATCTTGATCAACATTCTTCAC
CTTCTTCTTGGGCTTATCTTTAAATGATTTCATCGCTTCTTTCCTTAGGCCTTCGTTGGG
AAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCTACTTCAACAAGCTCTATCCT
AGGCACGATGGTCCCTGACTTTTTAAGCTTA

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TTCTTGGGCTTATCTTTAGATGATTTCATCGCTTCTTTCCTTAGGCCTTCGTTGGGAAGA
CGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCTACTTCAACAAGCTCTATCCTAGGC
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CGCTCTCTCTTCACTCCCTTTGATTTATCCAGCAAAGGATTTTTTCCAACCTCCTGCTCA
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CGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCTACTTCAACAAGCTCTATCCTAGGC
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TCGTAGGAAAA
CGACAG

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TAGGCGATATAGCTGTGCATATGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGGTTTAGATTATCCA
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TCTCAAAACCTTCTCCAGTAAAGCAAATGAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGTGCTATTT
TCTTGTCGTAGGAAAACGACAGCAAAGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACTTCAATCAGAT
CGTAGACATGGTGATCATACATTCTTCCGAGCACAAGATTGTCAGGTCGTTTCTTTGTGT
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CGCCACCACTCTCAAAGGGTCTGATATTCTCATTCCTCCTCGAGTACTTGATGGCACCTC
CCTTCTTCAAACGGTACAGTTCCATCAACACAGCGCTAAGCGTAGCGCTCGTCTTGGTTC
CGTGAAGTATCAATGTCTTCTTCCCATTCTCAACGAGCTTAGGAGCTCGCTTTTCGAGCA
CACGCTTGGCTTTGTGGGTCTTCGGAGTTCGTATTTCCATCATGGCTGGTGATTTTCCGG
CGACTTCCAACAAAGCGACGGGCTCCGAGAGAGACGAAGAAGCGGTCC

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DS 

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AGCACGGTCTAATCCAGTAAGGTTTAGATTATCCACAACCTCGCCTCGAAACAGATCAGT
GAGGACTTCTTTAAGCTGCTTCAGCTCTGGCACATTCTCAAAACCTTCTCCAGTAAAGCA
AATGAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGTGCTATTTTCTTGTCGTAGGAAAACGACAGCAA
AGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACTTCAATCAGATCGTAGACATGGTGATCATACATTCT
TCCGAGCACAAGATTGTCAGGTCGTTTCTTTGTGTGAGAGCCATAAGCGAAAATGCTACA
ATCAGTTTTGAGAGAGAAGAACTCCAAAGAGGTTTCGCCACCACTCTCAAAGGGTCTGAT
ATTCTCATTCCTCCTCGAGTACTTGATGGCACCTCCCTTCTTCAAACGGTACAGTTCCAT
CAACACAGCGCTAAGCGTAGCGCTCGTCTTGGTTCCGTGAAGTATCAATGTCTTCTTCCC
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AGTTCGTATTTCCATCATGGCTGGTGATTTTCCGGCGACTTCCAACAAAGCGACGGGCTC
CGAGAGAGACGAAGAAGC
CCC

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DS 



AS 1 7

CO CL956Contig1 842 7 8 U
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CCTCTCCGATATTTTCTCCAAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTC
GATGCTTTAGAATTAAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCGTTGGAGAC
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ATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTTTCCGATGTCCGCGC
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CGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGA
CGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGA
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CC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 

AF RR4BN62TF U 289
AF RR4EE57TF U 1
AF RR4AP39JQ C 96
AF RR4AP39TF U 96
AF RR4BN62JQ C 142
AF RR4B052TF U 588
AF RR4EE57JQ C 213
BS 1 166 RR4EE57TF
BS 167 168 RR4AP39TF
BS 169 629 RR4EE57TF
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BS 691 821 RR4AP39TF
BS 822 839 RR4B052TF
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GAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTC
TGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCC

QA 1 176 1 176
DS 

RD RR4EE57TF 690 0 0
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CCTCTCCGATATTTTCTCCAAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTC
GATGCTTTAGAATTAAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG**ATCGTTGGAGAC
GCGGCTGTGACTGAAACAGAGGAGAGATCCGAAAATGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAG
ATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTTTCCGATGTCCGCGC
TGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGT
CGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGA
CGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGA
TGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCAATGATGAACAATGTCAAAGGCGAGGG
AGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTTGGTGGAGATGGCGTGAT
CTTT*GACTGTAACAACAATCCAAGGGACGGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGA
GTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTT

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DS 

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GG
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GAGAGAGAGAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGGAGAGATCCGAAAATG
GAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGAT
GCCTCTGTTTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCTATGAAATGGCATCCGGAT
AGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAA
GAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTAC
GATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCAATG
ATGAACAATGTTAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGAT
ATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTT*GACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAG
ACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTTCTCTTTT
GTGTTTGTGTCGTTTCTTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATTGTCAT
TTCGTGTTTCATTTTCTAGTGTCAA

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DS 

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GG
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GAGAGAGAGAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGGAGAGATCCGAAAATG
GAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGAT
GCCTCTGTTTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCTATGAAATGGCATCCGGAT
AGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAA
GAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTAC
GATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCAATG
ATGAACAATGTTAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGAT
ATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTT*GACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAG
ACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTTCTCTTTT
GTGTTTGTGTCGTTTCTTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATTGTCAT
TTCGTGTTTCATTTTCTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAATATCTCGGACGCGT
GCTA
AAA

QA 3 726 3 726
DS 

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GG
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GAGATCCGAAAATGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCG
GTATTCGGAAAGATGCCTCTGTTTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGA
AATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGAT
TTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATG
ACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAG
AGATGATCTCAATGATGAACAATGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAAC
GGATGTTCACGGATATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTT*GACTGTAACAACAATCCA
AGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGC
TCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTTTCTTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAA
GTCTCAATTGTCATTTCGTGTTTCATTTTCTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAA
TATCTCGGACGCGTGCTA
CCG

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DS 

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AATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGT
CGTTTCTTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATTGTCATTTCGTGTTTC
ATTTTCTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAATATCTCGGACGCGTGCTACCGAAA
TTGATTTTGCTT

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DS 

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AAATGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGA
AAGATGCCTCTGTTTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATC
CGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAA
TCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGAC
TCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCT
CAATGATGAACAATGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCA
CGGATATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTT*GACTGTAACAACAATCCAAGGGACGGC
AAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTTCT
CTTTTGTGTTTGTGTCGTTTCTTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATT
GTCATTTCGTGTTTCATTTTCTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAATATCTCGGA
CGCGTGCTACCGAAATTGATTTTGCTTCCC

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DS 



AS 1 5

CO CL957Contig1 1155 5 9 U
GGGCTGCTAGCTCCTCTCAGCTTCTTTCTTTCGGATCTGGGCAATCGATCCTTGAAGAAT
TTGAAATCCTTTGCAAATATGATGGCGCGACAGAGGAATCATAATCATCGTCGGAAAACG
TCTTATTCAACTCTCATCTTCACGGTATTGATTATGTTCACTTTTCTGATTTTGTTCCTT
CTCGCGCTTGGAATCGTCTCGCTGCCCACCAACAATGGCGGGTCCTCCAAAGCCAATGAT
CTCACTTCCATTGTTCGAAAAAACCTTCAGAGAAGTGGCAAAGATGTTACGGAGGAGAAC
GAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAATTTCTTG
ACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCTCATATGGAGAAGTCAACT
GTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTGAGAACGAGCTCTGGGACA
TTTCTTCCAAGAGGACGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGATTTT
ACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGGCAA
AAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAATGGAGGGCAG
CGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGATGTTGAGG*AGGGGGGTGAAACAGTGTT
TCCTTCAGCCAAGGGAAACTATAGCGCAGTGCCATGGTGGAATGAGCTGTCAGAGTGCGG
GAAAGGAGGGCTCTCCGTGAAACCAAAGATGGGAGATGCATTGCTTTTCTGGAGCATGAC
ACCTGATGCCACTCTAGACCCATCTAGTCTTCACGGTGGGTGCGCCGTAATCAAAGGGAA
CAAGTGGTCATCCACAAAATGGTTGCGTGTGCACGAGTACAAGGTTTGATCGAATTACTG
AGGAGGAAGAAGCAAAAAGAGAGACAGAGAGTGAGAGACGAAGCGTAGGAAAAGGTCAGA
AGAATTGGAGCCCTCTGCTTTCATCCTTGAGATACTTTTGTTATATTTAAGAGTAGATAT
TTTGTATCTCAAAAAAGACAACCACCATTTGAGTTGATTTTATTTGATTAATACCACTAC
CATTTGATGGGGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4DT47TF U 1
AF RR4BF21TF U 55
AF RR4DW04TF U 1
AF RR4DW04JQ C 309
AF RR4BF21JQ C 344
BS 1 356 RR4DT47TF
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BS 712 734 RR4DW04TF
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BS 884 1155 RR4DW04JQ

RD RR4DT47TF 711 0 0
GGGCTGCTAGCTCCTCTCAGCTTCTTTCTTTCGGATCTGGGCAATCGATCCTTGAAGAAT
TTGAAATCCTTTGCAAATATGATGGCGCGACAGAGGAATCATAATCATCGTCGGAAAACG
TCTTATTCAACTCTCATCTTCACGGTATTGATTATGTTCACTTTTCTGATTTTGTTCCTT
CTCGCGCTTGGAATCGTCTCGCTGCCCACCAACAATGGCGGGTCCTCCAAAGCCAATGAT
CTCACTTCCATTGTTCGAAAAAACCTTCAGAGAAGTGGCAAAGATGTTACGGAGGAGAAC
GAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAATTTTTTG
ACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCTCATATGGAGAAGTCAACT
GTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTGAGAACGAGCTCTGGGACA
TTTCTTCCAAGAGGACGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGATTTT
ACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGGCAA
AAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAATGGAGGGCAG
CGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGATGTTGAGG*AGGGGGGTGA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BF21TF 631 0 0
AAGAATTTGAAATCCTTTGCAAATATGATGGCGCGACAGAGGAATCATAATCATCGTCGG
AAAACGTCCTATTCAACTCTCATCTTCACGGTATTGATTATTTTCACTTTTCTGATTTTG
TTCCTTCTCGCGCTTGGAATCCTCTCGCTGCCCACCAACAATGGCGGGTCCTCCAAAGCC
AATGATCTCACTTCCATTGTTCGCAAAAACCTTCAGAGAAGTGGCAAGGATGTTACGGAG
GAGAACGAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAAT
TTCTTGACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCTCATATGGAGAAG
TCAACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTGAGAACGAGCTCT
GGGACATTTCTTCCAAGAGGACGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCA
GATTTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATA
GGGCAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAATGGA
GGGCAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGTACC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4DW04TF 750 0 0
GGGCTGCTAGCTCCTCTCAGCTTCTTTCTTTCGGATCTGGGCAATCGATCCTTGAAGAAT
TTGAAATCCTTTGCAAATATGATGGCGCGACAGAGGAATCATAATCATCGTCGGAAAACG
TCTTATTCAACTCTCATCTTCACGGTATTGATTATGTTCACTTTTCTGATTTTGTTCCTT
CTCGCGCTTGGAATCGTCTCGCTGCCCACCAACAATGGCGGGTCCTCCAAAGCCAATGAT
CTCACTTCCATTGTTCGAAAAAACCTTCAGAGAAGTGGCAAAGATGTTACGGAGGAGAAC
GAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAATTTTTTG
ACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCTCATATGGAGAAGTCAACT
GTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTGAGAACGAGCTCTGGGACA
TTTCTTCCAAGAGGACGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGATTTT
ACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGGCAA
AAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAATGGAGGGCAG
CGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGATGTTGAGGGAGGGGGGTGAAACAGTGTT
TCCTTCAGCCAAGG*AAACTATAGCGCAGT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4DW04JQ 847 0 0
TTGGGTGAAATATCTC
TGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAATTT*TTGACCAAGGAGGAATGCAAGTATT*A
ATAGAGCTAGCTAAACCTCATATGGAGAAGTCAACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAG
AGCACAGATAGCAGGGTGAGAACGAGCTCTGGGACATTTCTTCCAAGAGGACGCGACAAA
ATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGATTTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGG
GAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGGCAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTAC
TTTATGGATGAGTATAACACTAGGAATGGAGGGCAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGTAC
CTGTCAGATGTTGAGG*AGGGGGGTGAAACAGTGTTTCCTTCAGCCAAGGGAAACTATAG
CGCAGTGCCATGGTGGAATGAGCTGTCAGAGTGCGGGAAAGGAGGGCTCTCCGTGAAACC
AAAGATGGGAGATGCATTGCTTTTCTGGAGCATGACACCTGATGCCACTCTAGACCCATC
TAGTCTTCACGGTGGGTGTGCCGTAATCAAAGGGAACAAGTGGTCATCCACAAAATGGTT
GCGTGTGCACGAGTACAAGGTTTGATCGAATTACTGAGGAGGAAGAAGCAAAAAGAGAGA
CAGAGAGTGAGAGACGAAGCGTAGGAAAAGGTCAGAAGAATTGGAGCCCTCTGCTTTCAT
CCTTGAGATACTTTTGTTATATTTAAGAGTAGATATTTTGTATCTCAAAAAAGACAACCA
CCATTTGAGTTGATTTTATTTGATTAATACCACTACCATTTGATGGGGACT

QA 17 847 17 847
DS 

RD RR4BF21JQ 809 0 0
TTTACCACAATTTCTTGACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCTC
ATATGGAGAAGTCAACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTGA
GAACGAGCTCTGGGACATTTCTTCCAAGAGGACGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGA
AAAGGATATCAGATTTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGC
ACTATGAAATAGGGCAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACA
CTAGGAATGGAGGGCAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGATGTTGAGG*AG
GGGGGTGAAACAGTGTTTCCTTCAGCCAAGGGAAACTATAGCGCAGTGCCATGGTGGAAT
GAGCTGTCAGAGTGCGGGAAAGGAGGGCTCTCCGTGAAACCAAAGATGGGAGATGCATTG
CTTTTTTGGAGCATGACACCTGATGCCACTCTAGACCCATCTAGTCTTCACGGTGGGTGC
GCCGTAATCAAAGGGAACAAGTGGTCATCCACAAAATGGTTGCGTGTGCACGAGTACAAG
GTTTGATCGAATTACTGAGGAGGAAGAAGCAAAAAGAGAGACAGAGAGTGAGAGACGAAG
CGTAGGAAAAGGTCAGAAGAATTGGAGCCCTCTGCTTTCATCCTTGAGATACTTTTGTTA
TATTTAAGAGTAGATATTTTGTATCTCAAAAAAGACAACCACCATTTGAGTTGATTTTAT
TTGATTAATACCACTACCATTTGATGGGG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 3

CO CL958Contig1 1237 3 16 U
GATACAAAGTTCTCTCTTTCTTATTCTCTGATCTTTTACAAAGTTCGATACATCAAAAGT
GTATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTACTAAGAATACAAACAACAACACAATC
AGGTTGAGACATGGCGTAGCACAAGCTGAAGCTGATCCATCTCCGGACCAATCAGGTTCA
TAACGGAGTTCCCTAAATTAGGAAGCTCGGAAACTGCCATTGTTATTATAGAAGATGATG
ATTTGTCAGACAGGTATGGCACTATATGCTTCTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAAGAT
GGTTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTTTCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAACCGA
TCCAGTCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTGTGGTGGAAGAATGGTCTTAAAAGACCCAT
CAGGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTTAGGTATCAGTATCGTATCGTGCTCAAACA
TAATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTTGAGAACCTCTCTTTATAAGTCGAATTTTTAACTG
GGAGTTCGTTGTTTAACTTTGGGAGAAACCTACAACCTTCCATGTAACCCGCAATGTCAG
TAGGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGCCAAATGTTCCTGCATATAGTCGCTATAGATCT
CTGTTTTGATCATACTATCCAACATGATACAAATCCAGGTAACACCACAGAAAGGAATGG
ATGCAGTGCCAGCATGAGGCCCCCCTATCGATACAAAACTCTTAACAGGTGGTGCATCAT
CGCAGAACTCAATGAGAGCTCGACCAATCATGTTACCCTGAGAAAGCCCCACGATGCTGT
AACCATCACTCAGCTCAGGCATACTTTTCACCTTCTCACAAACAACAGCTGTCTGATCAA
GAAGAGGCATGGTCCATGAGTCCCATGAGCCACTCCCAATCTCCAAGCAATAGCCTTGAG
AAGAAGACCAATCACTTAATAGCTCCGTGAAATGTTTCACTCCTGAATTACTGCATTTAT
CCCCAATTCCATGTAGAACTATGAAAGGAACAGACGAAGCGACTGTAATGAAAGTGCAGA
TTAGGGCAATAATAGTAATCGCTGCCTTATGAACAGCCATTCTCTAGGACTTCGGGTGTG
GGAGACTAGAAGGGTAATCAAAAAGATTCGTAATCTCTCCGGTACCAGAACGATCTCCGC
CGGCGAATTTAGTTTCGTCGCTGACTGATCGTCGCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET31JQ U 1
AF RR4BT86JQ U 1
AF RR4ET31TF C 666
BS 1 110 RR4BT86JQ
BS 111 113 RR4ET31JQ
BS 114 406 RR4BT86JQ
BS 407 407 RR4ET31JQ
BS 408 739 RR4BT86JQ
BS 740 740 RR4ET31TF
BS 741 756 RR4BT86JQ
BS 757 757 RR4ET31TF
BS 758 764 RR4BT86JQ
BS 765 765 RR4ET31TF
BS 766 768 RR4BT86JQ
BS 769 769 RR4ET31TF
BS 770 843 RR4BT86JQ
BS 844 844 RR4ET31TF
BS 845 858 RR4BT86JQ
BS 859 1237 RR4ET31TF

RD RR4ET31JQ 720 0 0
GC
TACAAAGTTCTTTCTTTCTTATTCTCTGATCTTTTACAAAGTTCGATACATCAAAAGTGT
ATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTACTAAGAATACAAACAACAACACAATCAG
GTTGAGACATGGCGTAGCACAAGCTGAAGCTGATCCATCTCCGGACCAATCAGGTTCATA
ACGGAGTTCCCTAAATTAGGAAGCTCGGGAACTGCCATTGTTATTATAGAAGATGATGAT
TTGTCAGACAGGTATGGCACTATATGCTTCTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAAGATGG
TTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTTTCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAACCGATC
CA*TCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTGTGGTGGAAGAATGGTCTTAAAAGACCCATCA
GGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTTAGGTATCAGTATCGTATCGTGCTCAAACATA
ATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTTGAGAACCTCTCTTTATAAGTCGAATTTTTAACTGGG
AGTTCGTTGTTTAACTTTGGGAGAAACCTACAACCTTCCATGTAACCCGCAATGTCAGTA
GGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGCCAAATGTTCCTGCATATAGTCGCTATAGATCTCT
GTTTTGATCATACTATCCAACATGATACAAATCCAGGTAACACCACAGAAAGGAATGG

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR4BT86JQ 862 0 0
GATACAAAGTTCTCTCTTTCTTATTCTCTGATCTTTTACAAAGTTCGATACATCAAAAGT
GTATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTACTAAGAATACAAACAA***CACAATC
AGGTTGAGACATGGCGTAGCACAAGCTGAAGCTGATCCATCTCCGGACCAATCAGGTTCA
TAACGGAGTTCCCTAAATTAGGAAGCTCGGAAACTGCCATTGTTATTATAGAAGATGATG
ATTTGTCAGACAGGTATGGCACTATATGCTTCTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAAGAT
GGTTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTTTCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAACCGA
TCCAGTCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTGTGGTGGAAGAATGGTTTTAAAAGACCCAT
CAGGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTTAGGTATCAGTATCGTATCGTGCTCAAACA
TAATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTTGAGAACCTCTCTTTATAAGTCGAATTTTTAACTG
GGAGTTCGTTGTTTAACTTTGGGAGAAACCTACAACCTTCCATGTAACCCGCAATGTCAG
TAGGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGCCAAATGTTCCTGCATATAGTCGCTATAGATCT
CTGTTTTGATCATACTATCCAACATGATACAAATCCAGGTAACACCACAGAAAGGAATGG
ATGCAGTGCCAGCATGAGGTCCCCCTATCGATACAAGACTCTTAGCAG*TGGTGCATCAT
CGCAGAACTCAATGAGAGCTCGACCAATCATGTTACCCTGAGAAAGCCCCACGATGCTGT
AAC*ATCACTCAGCTCAG
CATA

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR4ET31TF 572 0 0
TTGATCATACTATCCAACATGATACAAATCCAGGTAACACCACAGAAAGGAATGGATGCA
GTGCCAGCATGAGGCCCCCCTATCGATACAAAACTCTTAACAGGTGGTGCATCATCGCAG
AACTCAATGAGAGCTCGACCAATCATGTTACCCTGAGAAAGCCCCACGATGCTGTAACCA
TCACTCAGCTCAGGCATACTTTTCACCTTCTCACAAACAACAGCTGTCTGATCAAGAAGA
GGCATGGTCCATGAGTCCCATGAGCCACTCCCAATCTCCAAGCAATAGCCTTGAGAAGAA
GACCAATCACTTAATAGCTCCGTGAAATGTTTCACTCCTGAATTACTGCATTTATCCCCA
ATTCCATGTAGAACTATGAAAGGAACAGACGAAGCGACTGTAATGAAAGTGCAGATTAGG
GCAATAATAGTAATCGCTGCCTTATGAACAGCCATTCTCTAGGACTTCGGGTGTGGGAGA
CTAGAAGGGTAATCAAAAAGATTCGTAATCTCTCCGGTACCAGAACGATCTCCGCCGGCG
AATTTAGTTTCGTCGCTGACTGATCGTCGCCC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 7

CO CL959Contig1 704 7 4 U
GTGGAGAAAAAAAATGGATACGATGAAAACAACAAAAGTGAAGTTCACAAAAGAGATGCT
AGACTCTATCAAAGACAAGCTCCCAAGGCTCAGCCTTCTCCTCCTCTTCCTCCGACAATG
CTACGGCGGTTGTGGAGACCGGACTCACTTACTCCCTTGCTCGATCACCACTTCCTCCAC
CCGCTTCTGGAACCTCTCTGATCGTCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGATCGATCCT
TAAACGTGTCCACACTCTCAAACCGGGACGTTCCAAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCG
TAGAGCCTACGTTCCTGACCAGGAAGGACGTCGATGGTTGTACTACGACGACACATGTTT
ACCGTACGTATGGGTTCATGAGACGGGTACAGACTTGTCGAAGATGGTGAAGCAACAGTA
CGTGAGTCTTGATGATCTGAGAGATTGCTCGGAGATTAGGATTTTTAAGGATCTACAGAG
AGGTTGTGTCTCTGTTGAGAAGAAAGACAGAACTTCCGCTTTGTGTTGATTGTGAAATTT
TTTCTAATTGATTACTTCATCTATATAATTATGAGTACTACATATAAGCTAAATATGCAT
TTCATTGTTTGAAACATGATGCATGTATACATCTATATGTAACTCCATCTCCAGTATCGA
CTCTTGTTGATCTTAGACTTATTGGATTACACAATGTTATCACC


BQ
10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4CQ84TF U 1
AF RR4B884TF U 2
AF RR4CQ84JQ C 105
AF RR4DE12TF U 2
AF RR4BS15JQ C 3
AF RR4BS15TF U 3
AF RR4DE12JQ C 23
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ACC

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G
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ACC

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G
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TCTAATTGATTACTTCATCTATATAATTATGAGTACTACATATAAGCTAAATATGCATTT
CATTGTTTGAAACATGATGCATGTATACATCTATATGTAACTCCATCTCCAGTATCGACT
CTTGTTG
GT

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AACGTGTCCACACTCTCAAACCGGGACGTTCCAAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCGTA
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CATTGTTTGAAACATGATGCATGTATACATCTATATGTAACTCCATCTCCAGTATCGACT
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C

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DS 

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GCTTCTGGAACCTCTCTGATCGTCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGATCGATCCTTA
AACGTGTCCACACTCTCAAACCGGGACGTTCCAAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCGTA
GAGCCTACGTTCCTGACCAGGAAGGACGTCGATGGTTGTACTACGACGACACATGGTTAC
CGTACGTATGGGTTCATGAGACGGGTACAGACTTGTCGAAGATGGTGAAGCAACAGTACG
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TCTAATTGATTACTTCATCTATATAATTATGAGTACTACATATAAGCTAAATATGCATTT
CATTGTTTGAAACATGATGCATGTATACATCTATATGTAACTCCATCTCCAGTATCGACT
CTTGTTGATC
C

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DS 

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CGCCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGATCGATCCTTAAACGTGTCCACACTCTCAAA
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TGGATTACACAATGTTATC
GC

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DS 



AS 3 7

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GCCTCAAGCTTTGAGATTTCGTCTCTCAACTTAGCTGCCAAACCATAGTCCTCACCGTCA
ATAGCATTCTGGAGATCTGCACGTAGCCTTAT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D326JQ U 48
AF RR4CY89JQ U 1
AF RR4DM63TF C 5
BS 1 102 RR4CY89JQ
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ATA
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ATCCTCATCTTGTGAATCAAAAGGAACTTCATGCCGAGGTTTGTTGTACTTCTCACGCAG
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TAATGACTCAGCCTCAAGCTTTGAGATTTCGTCTCTCAACTTAGCT

QA 4 649 4 649
DS 

RD RR4CY89JQ 752 0 0
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ATTCTTGCTTTGTCGTGTGGTCTTAAAGCTCAAATCTTGCTTTCATCTTAATCCTCATCT
TGTGAATCAAAAGGAACTTCATGCCGAGGTTTGTTGTACTTCTCACGCAGTTGTTGGATT
GGGATGAAATCTCCAGCTGTATCCGCACCATAGAAGAGGAAAGAAATGTATGGATGATCA
AACCTTTCTTTGTCCGGTTTCTCAGGAGCTAATAGACTGTCTTCAGGAACGTATGCCACT
AGTAGATCAGGGTGGGTGCGAACATCGACAAGAACCTGATAAAATGGCTGATTGGAACCA
CGAGGCAGCTTTTCAACTTCTGCAGTTTCCATCCATGAGCTTGATTCACAGCAAACTGGA
TCCATCCCGCAAACTACAGCCCTGTAACCAAAAGCTTTGTGTTTCAGTTTCTGTCCCAAA
CGAAAGGCATACTCAGCATTCTCAAAAGCCAAAGCTTTGGCAGACACAGCTAATGACTCA
GCCTCAAGCTTTGAGGTTTCGTCTCTCAACTTAGCTGCCAAACCATAGTCCTCACCGTCA
ATAGCATTCTGGAGATCTGCACGTAGCCTTAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4DM63TF 719 0 0
CAGAGTTGTCTCATAGCTTT*CTGGATGAACAAAGAATCATATATACACAAAAAGCATTC
TTGAATAACGTTGATTTGTTTTTAGTCTACAGAGCAAGAACAGTTGTGTTGACTACATCA
ACGAGGATATATATAAAATAACCAACAGTGAACTAACAGCTCTGGGCGATGCTACGATTC
TTGCTTTGTCGTGTGGTCTTAAAGCTCAAATCTTGCTTTCATCTTAATCCTCACCTTGTG
AATCAAAAGGAACTTCATGCCGAGGTTTGTTGTACTTCTCACGCAGTTGTTGGATTGGGA
TGAAATCTCCAGCTGTATCCGCACCATAGAAGAGGAAAGAAATGTATGGATGATCAAACC
TTTCTTTGTCCGGTTTCTCAGGAGCTAATAGACTGTCTTCAGGAACGTATGCCACTAGTA
GATCAGGGTGGGTGCGAACATCGACAAGAACCTGATAAAACGGCTGATTGGAACCACGAG
GCAGCTTTTCAACTTCTACAGTTTCCATCCATGAGCTTGATTCACAGCAAACTGGATCCA
TCCCGCAAACTACAGCCCTGTAACCAAAAGCTTTGTGTTTCAGTTTCTGTCCCAAACGAA
AGGCATACTCAGCATTCTCAAAAGCCAAAGCTTTGGCAGACACAGCTAACGACTCAGCCT
CAAGCTTTGAAATTTCGTCTCTCAACTTAGCTGCCAAACCATAGTCCTCACCGTCAAT
C

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL960Contig2 789 2 2 U
GGAAGAAAGAGAGAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCGGCAACTT
TCTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCTATAGGACTCCCCTAACCACTTTAACGA
TTACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTCAATAAATTAAAAAAAAAAATGGTGCAAAG
CCATTCGCTAAGCACGTTAACAATCTGTGGAAGTGTACAAGTTTACAGCTCGTGGAGGAG
GAACCGTGTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGATTGATTGGCGTATCATGTCAGTTCTCAGT
TAGACCATCATCGTTTCTAAGAAGCCACTGGAAGTCGTTAAAGCAAAAAAATCTGTCGAG
GGTCGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGTGGTGACCACCAAGGTCTAGACCCGAACTC
TGAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTCTTCTTTCAGCTTGACTTAGC
TACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCGCAACAACTAAGAGA
GAAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGGGATAAGACTGCAAGAAGCTAAAAGAGGATCATC
ATCAAAAAGTGAAGCACAAGACAAGGGTATTAGCCTTATAAGCTACGTGCAGATCTCCAG
AATGCTATTGACGGTGAGGACTATGGTTTGGCAGCTAAGTTGAGAGACGAAATCTCAAGC
TTGAGCTGAGTCATTAGCTGTGTCTGCCAAAGCTTTGGCTTTGAGATGCTGAGTATGCCT
TTCGTTTGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY89TF U 1
AF RR4D326TF U 2
BS 1 586 RR4CY89TF
BS 587 789 RR4D326TF

RD RR4CY89TF 594 0 0
GGAAGAAAGAGAGAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCGGCAACTT
TCTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCTATAGGACTCCCCTAACCACTTTAACGA
TTACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTCAATAAATTAAAAAAAAAAATGGTGCAAAG
CCATTCGCTAAGCACGTTAACAATCTGTGGAAGTGTACAAGTTTACAGCTCGTGGAGGAG
GAACCGTGTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGATTGATTGGCGTATCATGTCAGTTCTCAGT
TAGACCATCATCGTTTCTAAGAAGCCACTGGAAGTCGTTAAAGCAAAAAAATCTGTCGAG
GGTCGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGTGGTGACCACCAAGGTCTAGACCCGAACTC
TGAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTCTTCTTTCAGCTTGACTTAGC
TACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCGCAACAACTAAGAGA
GAAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGGGATAAGACTGCAAGAAGCT
AAAAGAGG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4D326TF 788 0 0
GAAGAAAGAGAGAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCGGCAACTTT
CTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCTATAGGACTCCCCTAACCACTTTAACGAT
TACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTCAATAAATTAAAAAAAAAAATGGTGCAAAGC
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AACCGTGTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGATTGATTGGCGTATCATGTCAGTTCTCAGTT
AGACCATCATCGTTTCTAAGAAGCCACTGGAAGTCGTTAAAGCAAAAAAATCTGTCGAGG
GTCGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGTGGTGACCACCAAGGTCTAGACCCGAACTCT
GAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTCTTCTTTCAGCTTGACTTAGCT
ACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCGCAACAACTAAGAGAG
AAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGGGATAAGACTGCAAGAAGCTAAAAGAGGATCATCA
TCAAAAAGTGAAGCACAAGACAAGGGTATTAGCCTTATAAGCTACGTGCAGATCTCCAGA
ATGCTATTGACGGTGAGGACTATGGTTTGGCAGCTAAGTTGAGAGACGAAATCTCAAGCT
TGAGCTGAGTCATTAGCTGTGTCTGCCAAAGCTTTGGCTTTGAGATGCTGAGTATGCCTT
TCGTTTGG

QA 1 788 1 788
DS 



CO CL960Contig3 1182 2 2 U
GGAAGAAAGAGAGAAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCGGCAACT
TTCTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCTATAGGACTCCCCTAACCACTTTAACG
ATTACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTCAATAAATTAAAAAAAAATGGTGCAAAGC
CATTCGCTAAGCACGTTAACAATCTGTGGAAGTGTACAAGTTTACAGCTCGTGGAGGAGG
AACCGTTTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGATTGATTGGCGTATCATGTCAGTTCTCAGTT
AGACCATCATCGTTTCTAAGAAGCCACTGGAAGTCGTTAAAGCAAAAAAATCTGTCGAGG
GTCGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGTGGTGACCACCAAGGTCTAGACCCGAACTCT
GAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTCTTCTTTCAGCTTGACTTAGCT
ACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCGCAACAACTAAGAGAG
AAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGGGATAAGACTGCAAGAAGCTGTGTCTGCCAAAGCT
TTGGCTTTTGAGAATGCTGAGTATGCCTTTCGTTTGGGACAGAAACTGAAACACAAAGCT
TTTGGTTACAGGGCTGTGGTTTGCGGGATGGACCCAGTTTGCTGTGAATCAAGCTCATGG
ATGGAAACTGCAGAAGTTGAAAAGCTGCCTCGTGGTTCCAATCAGCCATTTTATCAGGTT
CTTGTCGATGTTCGCACCCACCCTGATCTACTAGTGGCATACGTTCCTGAAGACAGTCTA
TTAGCTCCTGAGAAACCGGACAAAGAAAGGTTTGATCATCCATACATTTCTTTCCTCTTC
TATGGTGCGGATACAGCTGGAGATTTCATCCCAATCCAACAACTGCGTGAGAAGTACAAC
AAACCTCGGCATGAAGTTCCTTTTGATTCACAAGATGGTGATTAAGATGAAAGCAAGATT
TGAGCTTTAAGACCACACGACAAAGCAAGAATCGTAGCATCGCCCAGAGCTGTTAGTTCA
CTGTTGGTTATTTTATATATATCCTCGTTGATGTAGTCAACACAACTGTTCTTGCTCTGT
AGACTAAAAACAAATCAACGTTATTCAAGAATGCTTTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT20TF U 1
AF RR4DT20JQ C 315
BS 1 715 RR4DT20TF
BS 716 1182 RR4DT20JQ

RD RR4DT20TF 715 0 0
GGAAGAAAGAGAGAAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCGGCAACT
TTCTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCTATAGGACTCCCCTAACCACTTTAACG
ATTACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTCAATAAATTAAAAAAAAATGGTGCAAAGC
CATTCGCTAAGCACGTTAACAATCTGTGGAAGTGTACAAGTTTACAGCTCGTGGAGGAGG
AACCGTTTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGATTGATTGGCGTATCATGTCAGTTCTCAGTT
AGACCATCATCGTTTCTAAGAAGCCACTGGAAGTCGTTAAAGCAAAAAAATCTGTCGAGG
GTCGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGTGGTGACCACCAAGGTCTAGACCCGAACTCT
GAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTCTTCTTTCAGCTTGACTTAGCT
ACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCGCAACAACTAAGAGAG
AAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGGGATAAGACTGCAAGAAGCTGTGTCTGCCAAAGCT
TTGGCTTTTGAGAATGCTGAGTATGCCTTTCGTTTGGGACAGAAACTGAAACACAAAGCT
TTTGGTTACAGGGCTGTGGTTTGCGGGATGGACCCAGTTTGCTGTGAATCAAGCT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DT20JQ 868 0 0
TTCTAA
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*CAAGGAGGTGGTGACCACCAAGGTCTAGACCCGAACTCTGAGCGAAGCGAGAGTGCCAA
TGAAGATATTTTGATCTTCTTCTTTCAGCTTGACTTAGCTACTCGTGTTCAGTGTGCTTT
GAATATGGAGCAGTATGATATTGCGCAACAACTAAGAGAGAAGCTAAATGAGGTTGAAGA
GGAGGGGATAAGACTGCAAGAAGCTGTGTCTGCCAAAGCTTTGGCTTTTGAGAATGCTGA
GTATGCCTTTCGTTTGGGACAGAAACTGAAACACAAAGCTTTTGGTTACAGGGCTGTGGT
TTGCGGGATGGACCCAGTTTGCTGTGAATCAAGCTCATGGATGGAAACTGCAGAAGTTGA
AAAGCTGCCTCGTGGTTCCAATCAGCCATTTTATCAGGTTCTTGTCGATGTTCGCACCCA
CCCTGATCTACTAGTGGCATACGTTCCTGAAGACAGTCTATTAGCTCCTGAGAAACCGGA
CAAAGAAAGGTTTGATCATCCATACATTTCTTTCCTCTTCTATGGTGCGGATACAGCTGG
AGATTTCATCCCAATCCAACAACTGCGTGAGAAGTACAACAAACCTCGGCATGAAGTTCC
TTTTGATTCACAAGATGGTGATTAAGATGAAAGCAAGATTTGAGCTTTAAGACCACACGA
CAAAGCAAGAATCGTAGCATCGCCCAGAGCTGTTAGTTCACTGTTGGTTATTTTATATAT
ATCCTCGTTGATGTAGTCAACACAACTGTTCTTGCTCTGTAGACTAAAAACAAATCAACG
TTATTCAAGAATGCTTTTTGTG

QA 7 868 7 868
DS 



AS 1 7

CO CL961Contig1 667 7 4 U
GGAAAAATTATATCTCACAAAAAAATATTCCAAAAAAATATGAATAAATTCATAGTGTTT
CTGTTTGCTATTAAAATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGAC
CTCAAGAACGAACTCGGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCA
ACCAGAGATTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGG
CCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCG
AAAAGTCCGGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCC
GGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATT
TACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACA
CTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGA
TTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCC*TAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATAT
GTAGCAAAAAATGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCGTTT
CAAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 
30 30 30 30 30 

AF RR4E751TF U 262
AF RR4DL49TF U 1
AF RR4DL49JQ C 131
AF RR4A094JQ C 177
AF RR4A094TF U 334
AF RR4A094JQD C 177
AF RR4A094TFB U 177
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BS 637 661 RR4DL49TF
BS 662 667 RR4A094TF

RD RR4E751TF 386 0 0
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GGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCCGGGGGCTCGAATAGTAGATGT
GGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTCAGAAGAAATGCTAAT
AGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATTTTAAATAAGTTTT
TTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTATTTGTATTTGTAAATAAC
TAATCCC*TAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAGCAAAAAATGTAATAAAA
TGTGAGATTATTAAATGATTATAGAT

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4DL49TF 661 0 0
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CTGTTTGCTATTAAAATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGAC
CTCAAGAACGAACTCGGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCA
ACCAGAGATTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGG
CCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCG
AAAAGTCCGGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCC
GGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATT
TACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACA
CTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGA
TTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCC*TAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATAT
GTAGCAAAAAATGTAATAAAATGTGAGATTATTAATTGATTATAGATACTCCATCCGTTT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4DL49JQ 531 0 0
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TGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGGCCTCTTGTTG
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ATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTCAGAA
GAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATTTT
AAATAAGTTTTTTTTTTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTATTTGTAT
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ATGTAATAAAATGTGAGATTATTAATTGATTATAGATACTCCATCCGTTTC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4A094JQ 491 0 0
G
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TGGCCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATTTATGGCATACGATT
CCGAAAAGTCCGGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTT
GCCGGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGG
ATTTACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTT
ACACTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGT
TGATTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCC*TAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAA
TATGTAGCAAAAAATGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCG
TTTCAAAATG

QA 2 491 2 491
DS 

RD RR4A094TF 334 0 0
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GAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAA
CGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAAC
TTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCCCTAAG
TTTGTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAGCAAAAAATGTAATAAAATGTGAGATTATT
AAATGATTATAGATACTCCATCCGTTTCAAAATG

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4A094JQD 491 0 0
G
CCAACCAGAGATTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTC
TGGCCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATT
CCGAAAAGTCCGGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTT
GCCGGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGG
ATTTACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTT
ACACTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGT
TGATTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCC*TAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAA
TATGTAGCAAAAAATGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCG
TTTCAAAATG

QA 2 491 2 491
DS 

RD RR4A094TFB 491 0 0
G
CCAACCAGAGATTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTC
TGGCCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATT
CCGAAAAGTCCGGCACATCCTCTCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTT
GCCGGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGG
ATTTACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTT
ACACTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGT
TGATTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCC*TAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAA
TATGTAGCAAAAAATGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCG
TTTCAAAATG

QA 2 491 2 491
DS 



AS 1 7

CO CL962Contig1 1034 7 12 U
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CGGCGATATTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTTTCTCTCCGGCGGTCAGAGAATATTGAGGAA
TGGCGTTGAATCTTTAGTGGTGAGCGTTGAAACCTTGAAAAGAAAGAAAGAGAGGGAAGA
AGTGAAAATGCTGTGCCGGAAAAACTCAAGCGTGGTGGATAGAGGTAACGTTCCGGTATA
TCTGAATGTATACGATCTAACTCCCATCAATGGCTACGCTTACTGGTTTGGTCTTGGCGT
TTACCATTCTGGTGTTGAAGTTCATGGTATAGAGTATGCATTTGGAGCGCATGAATATCC
AAGTACGGGGATTTTCGAAGGGGAACCGAAGCAATGCGAAGGGTTTACGTTTAGGAAATC
GATTTTGATTGGTAAAACGGATCTTGGGCCATTGGAAGTGAGAGCTACGATGGAGGAACT
TGCAGAGATTTACAAAGGAAGCTCGTACAACCTCATCACCAAGAACTGCAACCATTTCTG
CGACGAGATTTGTATTAAGTTAACCGGGAATCCAATTCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGC
AAGAATCGGATTCATGTGCAACTGTGTGCTTCCTGCGACCATAAACGCGACCAAGCTCGG
TAATAACCGAATCAATCAAGAGAAATCATGTGAAGCAGCAGAAACTGAGAAGAAGAAACT
GACGAGTGGAGGATCAA*CAGAGAGAGCTCTACGATGATTGATACTCCTTCGTCATCATC
TTCGTCTCCTTCAGTTCAAGTTCGTGGTCGAAGCAGGAAAAGGCGTCCTCGTGCCATGCA
TCCTTCATCGCCAGTGATTCTCGGATCTTCCACCGTTTGATTTGCTCTGTTTGTTAAAAC
ATCTTCTCTGTTTTGTTTCCATGTAATTGCGAATGTGCTTTGTAATCTTGTTAATATGCA
AACCTTTTTTTCTCTGTAATCTCATTATTTACACTTCCAGTTTTTGGATAACAAATTTTA
CACAATTGAATATC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 

AF RR4DU23TF U 1
AF RR4E823TF U 1
AF RR4DU23JQ C 273
AF RR4AE15JQ C 349
AF RR4AK13JQ C 349
AF RR4AE15TF U 349
AF RR4AK13TF U 349
BS 1 348 RR4DU23TF
BS 349 349 RR4AE15TF
BS 350 648 RR4DU23TF
BS 649 649 RR4AE15TF
BS 650 713 RR4DU23TF
BS 714 714 RR4E823TF
BS 715 737 RR4DU23TF
BS 738 738 RR4AE15TF
BS 739 751 RR4DU23TF
BS 752 767 RR4E823TF
BS 768 1031 RR4AE15TF
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CGGCGATATTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTTTCTCTCCGGCGGTCAGAGAATATTGAGGAA
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TCTGAATGTATACGATCTAACTCCCATCAATGGCTACGCTTACTGGTTTGGTCTTGGCGT
TTACCATTCTGGTGTTGAAGTTCATGGTATAGAGTATGCATTTGGAGCACATGAATATCC
AAGTACGGGGATTTTCGAAGGGGAACCGAAGCAATGCGAAGGGTTTACGTTTAGGAAATC
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TGCAGAGATTTACAAAGGAAGCTCGTACAACCTCATCACCAAGAACTGCAACCATTTCTG
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GACGAGTGGAGGATCAAGCAGAGAGAGCTCT

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DS 

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GGA
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GAAAATGCTGTGCCGGAAAAACTCAAGCGTGGTGGATAGAGGTAACGTTCCGGTATATCT
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CCATTCTGGTGTTGAAGTTCATGGTATAGAGTATGCATTTGGAGCACATGAATATCCAAG
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TTTGATTGGTAAAACGGATCTTGGGCCATTGGAAGTGAGAGCTACGATGGAGGAACTTGC
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CGAGATTTGTATTAAGTTAACCGGGAATCCAATTCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGCAAG
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AATGCGAAGGGTTTACGTTTAGGAAATCGATTTTGATTGGTAAAACGGATCTTGGGCCAT
TGGAAGTGAGAGCTACGATGGAGGAACTTGCAGAGATTTACAAAGGAAGCTCGTACAACC
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CTGCGACCATAAACGCTACCAAGCTCGGTAATAACCGAATCAATCAAGAGAAATCATGTG
AAGCAGCAGAAACTGAGAAGAAGAAACTGACGAGTGGAGGATCAAGCAGAGAGAGCTCTA
CGATGATTGATACTCCTTCGTCATCATCTTCGTCTCCTTCAGTTCAAGTTCGTGGTCGAA
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QA 1 683 1 683
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TTCGTCATCATCTTCGTCTCCTTCAGTTCAAGTTCGTGGTCGAAGCAGGAAAAGGCGTCC
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GTTTGTTAAAACATCTTCTCTGTTTTGTTTCCATGTAATTGCGAATGTGCTTTGTAATCT
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QA 1 683 1 683
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TGTTAATATGCAAACCTTTTTTTCTCTGTAATCTCATTATTTACACTTCCAGTTTTTGGA
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QA 1 683 1 683
DS 



AS 2 7

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CTTAATCGTATAGTTAATGGAATCTCTTCGATTTCTCATTCTGAACTCTATGGAACGTTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DR12TF U 23
AF RR4EA90TF U 23
AF RR4AY21TF U 1
AF RR4AY21JQ C 770
AF RR4FJ59JQ C 972
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BS 265 278 RR4AY21TF
BS 279 279 RR4DR12TF
BS 280 831 RR4AY21TF
BS 832 832 RR4AY21JQ
BS 833 842 RR4AY21TF
BS 843 1035 RR4AY21JQ
BS 1036 1036 RR4FJ59JQ
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GG
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TCTTCGATTTCTCATTCTGAACTCTATGGAACGTTTCGGTTTGATTCCTGTTAGATCCTA
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TCATTACGATGACGTTATCCGACTCACAGAAAATGATCGGCGAATCCGTGGTCTCCTCCA
GTCCGGTCAAACCCTTCGATCAGACAAGGCTTCTGGGCCAATAATAATTCTTAGTGGTCC
CACTTGAACCCCATCTCAAAAAACCTATAAACTCCGATGAGAGCGATTATCGATCGACTT
CTCTTCGTCGTCGTTTGGAATCACAGCAATTCACCGTTATCAGATACCCTTTTTGGTTTA
GCTTGATGGGTTGTGATTAAATTCTCAAGCTTTTGGCTTCCATGAGCTTCGTGTACTGTT
TTTTTTTCTGCTTTGTTGTTTTGTTGTTGCTGTTACAGTTTGTTCATTGGAACTTGGATT
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TTGAACGTTTCGTAGTTCTCTTAAGCTTTGTTTTTGTTTTTCTTTAAGCTGATTCTTGGT
AGTATGTTGATTTGCTAGATAACAATGAAAGTCACAAGAAGCAAGAACGTCC

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DS 

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GG
ACGATCAATCAATTCTCTCCCCACTCCTGATTGCTCCTTAATCGTATAGTTAATGGAATC
TCTTCGATTTCTCATTCTGAACTCTATGGAACGTTTCGGTTTGATTCCTGTTAGATCCTA
TATAAATATCTCCTTAGGTTTTAGTTTTTCTCCAAACAATTGTTCAATCCTCTCGACTGC
TCATTACGATGACGTTATCCGACTCACAGAAAATGATCGGCGAATCCGTGGTCTCCTCCA
GTCCGGTCAAACCCTTCGATCAGACAAGGCTTCTGGGCCAATAATAATTCTTAGTGGTCC
CACTTGAACCCCATCTCAAAAAACCTATAAACTCCGATGAGAGCGATTATCGATCGACTT
CTCTTCGTCGTCGTTTGGAATCACAGCAATTCACCGTTATCAGATACCCTTTTTGGTTTA
GCTTGATGGGTTGTGATTAAATTCTCAAGCTTTTGGCTTCCATGAGCTTCGTGTACTGTT
TTTTTTTCTGCTTTGTTGTTTTGTTGTTGCTGTTACAGTTTGTTCATTGGAACTTGGATT
AAGGACAGTCTCATGAGACATTACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGGGTTTTTTCTTTC
TTGAACGTTTCGTAGTTCTCTTAAGCTTTGTTTTTGTTTTTCTTTAAGCTGATTCTTGGT
AGTATGTTGATTTGCTAGATAACAATGAAAGTCACAAGAAGCAAGA

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DS 

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CGGTTTGATTCCTGTTAGATCCTATATAAATATCTCCTTAGGTTTTAGTTTTTCTCCAAA
CAATTGTTCAATCCTCTCGACTGCTCATTACGATGACGTTATCCGACTCACAGAAAATGA
TCGGCGAATCCGTGGTCTCCTCCGGTCCGGTCAAACCCGTCGATCAGACAAGGCTTCTGG
GCCAATAATAATTCTTAGTGGTCCCACTTGAACCCCATCTCAAAAAACCTATAAACTCCG
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TTATCAGATACCCTTTTTGGTTTAGCTTGATGGGTTGTGATTAAATTCTCAAGCTTTTGG
CTTCCATGAGCTTCGTGTACTGTTTTTTTTTCTGCTTTGTTGTTTTGTTGTTGCTGTTAC
AGTTTGTTCATTGGAACTTGGATTAAGGACAGTCTCATGAGACATTACTTCTTCAGTGCA
TGAGCTCTCTGGGTTTTTTCTTTCTTGAACGTTTCGTAGTTCTCTTAAGCTTTGTTTTTG
TTTTTCTTTAAGCTGATTCTTGGTAGTATGTTGATTTGCTAGATAACAATGAAAGTCACA
AGAAGCAAGAACGTCCAGATTCCCAAACCCCACCACCGACCGGCTCCTTCAGACCGTGTT
CTGAATCTACAAGCTCCGTCTACTCTGAGCCGATGATTCGATGTGGCATCA*TAGACTGA
GA
CTCAA

QA 1 842 1 842
DS 

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AG
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ATAGACTGAGAACTCAAGTGGTGCTATTGGAGCTAGGCTTTCTGCTGATGTTGCCACGGA
TTGTGGTTTAAAGTTCATTTATGTCCACTTTTGAGTTAGTTTTAGTCCAAAGTTTTAATG
TATTCTTTGTCTAATGAAAATATTGAAAAACTGTAGGACGAGAATGAACGAGGAAACAAG
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CATATATGAAGAAATCTGCAATGTTCTACAAAAGCAAGAATACTTCAAAACATAGTTAGT
GCTTTGGTTTGAGAGAGCGGAATCAGGAAAGCAACAGTAACTGAGCTGCTGTTGAAGTTT
TGCAATCCTGGATGAGGTCAACACTTTTGACGGATTGGAGATTAGTACCTTCAGCTGGAA
TGGCCAGCACAGCAAACCGGGCTATGATCATTGGTGGGTGAAAAAGGAGTTCAATGATCA
GGCGGTCATAAGTTGAGAGTGGCCATAGTCAGATAAAATTTTGAACCCCCTCCGCTGTTG
CTGCTGAATGAAGCAACAATTGCTTTGATGCTTAGTCAGTGTGTGGTTCAATATACAGTG
GACCGGATCGTTGTTAACACATCGGTTTTCAACAATCAACTCTTATTATCAACAATCAAG
AACTCATGTATTTTTTATTTATTTAATTAACTCATGTAATTATAGTGGTTAAAAATGGAG
TCAACGTGGTGGAGAAAGGAAGGCAAGAGACTTAGATAGATATAAAAGATGGAGAATTAT
TCGAAAA

QA 3 849 3 849
DS 

RD RR4FJ59JQ 604 0 0
CTACTCTGAGCCGAT
GGACGAGAATGAACGAGGAAACAAGCCTAGAAGCGGACATGAGTATAAGAACCGCTCCTT
CATTCTCAGGAGAAAGTGATGAAAACATATATGAAGAAATCTGCAATGTTCTACAAAAGC
AAGAATACTTCAAAACATAGTTAGTGCTTTGGTTTGAGAGAGCGGAATCGGGAAAGCAAC
AGTAACTGAGCTGCTGTTGAAGTTTTGCAATCCTGGATGAGGTCAACACTTTTGACGGAT
TGGAGATTAGTACCTTCAGCTGGAATGGCCAGCACAGCAAACCGGGCTATGATCATTGGT
GGGTGAAAAAGGAGTTCAATGATCAGGCGGTCATAAGTTGAGAGTGGCCATAGTCAGATA
AAATTTTGAACACCCTCCGCTGTTGCTGCTGAATGAAGCAACAATTGCTTTGATGCTTAG
TCAGTGTGTGGTTCAATATACAGTGGACCGGATCGTTGTTAACACATCGGTTTTCAACAA
TCAACTCTTATTATCAACAATCAAGAACTCATGTATTTTTTATTTATTTAATTAACTCAT
GTAATTATAGTGGTTAAAAATGGAGTCAACGTGGTGGAGAAAGGAAGGC

QA 16 604 16 604
DS 



CO CL963Contig2 1338 2 4 U
GGACGATCAATCAATTCTCTCCCTACTCATGATTGCTCCTTAATCGTATAGTTAATGGAA
TCTCTTCGATTTCTCATTCTGAACTCTATGGAACGTTTCGGTTTGATTCCTATTAGATCC
TATATAAATCTCTCTTTAGGTTTTAGTTTTTCTCCAAACAATTGTTCAATCCTCTCGACT
GCTCATTACGATGACGTTATCCGACTCGATCGGCGAATCTGTGGTCTCCTCCGGTCCGGT
CAAACCCGTCGATCAGACAAGGCTTCTGGGCCAATAATAATTCTTAGTGGTCCCACTTGA
ACCCCATCTCAAAAAACCTAAAAACTCCGATGAGAGCGATTATCGGTCGACTTCTCTTCG
TCGTCGTTTGGAATCACAGCAATTCACCGTTATCAGATACCCTTTTTGGTTTAGCTTGAT
GGGTTGTGATTAAATTCTCAAGCTTTTGGCTTCCATGAGCTTCGTGTACTGTTTTTTTTT
TCTGCTTTGTTGTTTTGTTGTTGCTGTTACAGTTTGTTCATTGGAACTTGGATTAAGGAC
AGTCTCATGAGACATTACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGGGTTTTTTCTTTCTTGACC
GTTTCGTAGTTCTCTTAAGCTTTGTTTTTGTTTTTCTTTAAGCTGATTCTTGGTAGTATG
TTGATTTGCTAGATAACAATGAAAGTCACAAAAAGCAAGAACGTCCAGATTCCCAAACCC
CACCACCGACCGGCTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTACAAGCTCCGTCTACTTTGAG
CCGATGGACGAGAATGAACGAGGAAACAAGCCTAGAAGCGGACATGAGTATAAGAACCGC
TCCTTCATTCTCAGGAGAAAGTGATGAAAACATATATGAAGAAATCTGCAATGTTCTACA
AAAGCAAGAATACTTCAAAACATACTTTGGTTTTAGAGAGCGGAATCAGGAAAGCAACAG
TAACTGAGCTGCTGTTGAAGTTTTGCAATCCTGGATGAAGTCAACACTTTTGACGGATTG
GAGATTAGTACCTTCAGCTGGAATGGCCAGCACAGCAAACCGGTATGGGCTATGATCATT
GGTGGGTGAAAAAGGAGTTCAATGATCAGGCGGTCATAAGTTGAGAGTGGCCATAGTCAG
ATAAAATTTTGAACACCCTCCGCTGTTGCTGCTGAATGAAGCAACAATTGCTTTGATGCT
TAGTCAGTGTGTGGTTCAATATACAGTGGACCGGATCGTTGTTAACGCATCGGTTTTCAA
CAATCAACTCTTATTATCAACAATCAAGAACTCATGTATTTTTTATTTATTTAATTAACT
CATGTAATTATAGTGGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ59TF U 1
AF RR4BM68JQ C 635
BS 1 654 RR4FJ59TF
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BS 656 766 RR4FJ59TF
BS 767 1338 RR4BM68JQ

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TCTCTTCGATTTCTCATTCTGAACTCTATGGAACGTTTCGGTTTGATTCCTATTAGATCC
TATATAAATCTCTCTTTAGGTTTTAGTTTTTCTCCAAACAATTGTTCAATCCTCTCGACT
GCTCATTACGATGACGTTATCCGACTCGATCGGCGAATCTGTGGTCTCCTCCGGTCCGGT
CAAACCCGTCGATCAGACAAGGCTTCTGGGCCAATAATAATTCTTAGTGGTCCCACTTGA
ACCCCATCTCAAAAAACCTAAAAACTCCGATGAGAGCGATTATCGGTCGACTTCTCTTCG
TCGTCGTTTGGAATCACAGCAATTCACCGTTATCAGATACCCTTTTTGGTTTAGCTTGAT
GGGTTGTGATTAAATTCTCAAGCTTTTGGCTTCCATGAGCTTCGTGTACTGTTTTTTTTT
TCTGCTTTGTTGTTTTGTTGTTGCTGTTACAGTTTGTTCATTGGAACTTGGATTAAGGAC
AGTCTCATGAGACATTACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGGGTTTTTTCTTTCTTGACC
GTTTCGTAGTTCTCTTAAGCTTTGTTTTTGTTTTTCTTTAAGCTGATTCTTGGTGGTATG
TTGATTTGCTAGATAACAATGAAAGTCACAAAAAGCAAGAACGTCCAGATTCCCAAACCC
CACCACCGACCGGCTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTACAAGCT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BM68JQ 704 0 0
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AATCTACAAGCTCCGTCTACTTTGAGCCGATGGACGAGAATGAACGAGGAAACAAGCCTA
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TATGAAGAAATCTGCAATGTTCTACAAAAGCAAGAATACTTCAAAACATACTTTGGTTTT
AGAGAGCGGAATCAGGAAAGCAACAGTAACTGAGCTGCTGTTGAAGTTTTGCAATCCTGG
ATGAAGTCAACACTTTTGACGGATTGGAGATTAGTACCTTCAGCTGGAATGGCCAGCACA
GCAAACCGGTATGGGCTATGATCATTGGTGGGTGAAAAAGGAGTTCAATGATCAGGCGGT
CATAAGTTGAGAGTGGCCATAGTCAGATAAAATTTTGAACACCCTCCGCTGTTGCTGCTG
AATGAAGCAACAATTGCTTTGATGCTTAGTCAGTGTGTGGTTCAATATACAGTGGACCGG
ATCGTTGTTAACGCATCGGTTTTCAACAATCAACTCTTATTATCAACAATCAAGAACTCA
TGTATTTTTTATTTATTTAATTAACTCATGTAATTATAGTGGCG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 2 7

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GCTTCAAATATTTCATCTCCATCTGACTCCAATGTCTTATCCATTGTAACAGGAGATGAT
ACAGTAGTATTTAGTATTTGAGAAATTAGGATTAATCCGAGGTTGTATTAAACATGACAT
AATTGCAATAAAGATGGAGACAGGTCTAGAAGAAAAGGTACGAAAGAAGATGTCACTGCC
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CCATTCACCTCCTTGACAATTCTCATTGTCACAGGCAATCATGTCCCCAAAGGACACCTG
ATGGCAGACACAGTACGTCGGTTCGTTTGGATCGATTGGCTGCTCATCAATAAGGGTGAA
GTCTTTCCGATGGCTTCCTGGAGGAGGCATGAGCTCGAAGTCCCTGTCACGATCCCACTC
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GTCAATAAGATCATAAGCTTGCCGGGCCAATAAGACCTTCTCCGTACACAAACTTAACGC
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ACCAGTGTTGTAATGATTATTGCCACTGCCCTTCTTGGAACTTTGTGGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D977JQ U 156
AF RR4D602JQ U 73
AF RR4BK63JQ U 1
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TGAGGCCAACGCATGTATAGTGAAACCATTCACCTCCTTGACAATTCTCATTGTCACAGG
CAATCATGTCCCCAAAGGACACCTGATGGCAGACACAGTACGTCGGTTCGTTTGGATCGA
TTGGCTGCTCATCAATAAGGGTGAAGTCTTTCCGATGGCTTCCTGGAGGAGGCATGAGCT
CGAAGTCCCTGTCACGATCCCACTCTCTATCTCTGTAATCAATCTTCTTAGGCTGTGGTG
TGCCATAAAAAGACTTGCGCTTTTCCTGCTTAGGAGCTATAGGTAGTGGAGGAAGAACAG
AGGGCTCGTCTGGTGGAATTTTCCCCTCTTGCTTCAAATCTTCAGCAAAATTATTGAGAT
CTCCATCAAGTCGTTTTATGTGACTGTCAATAAGATCATAAGCTTGCCGGGCCAATAAGA
CCTTCTCCGTACACAAACTTAACGCATTTTCCTGGCTGGACTCAATCTCTTTACGCATTT
TATCAATGGT

QA 1 610 1 610
DS 

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CCCTTTGAATCTGGTTTCGGGGGTGAGGCCAACGCATGTATAGTGAAACCATTCACCTCC
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GTACGTCGGTTCGTTTGGATCGATTGGCTGCTCATCAATAAGGGTGAAGTCTTTCCGATG
GCTTCCTGGAGGAGGCATGAGCTCGAAGTCCCTGTCACGATCCCACTCTCTATCTCTGTA
ATCAATCTTCTTAGGCTGTGGTGTGCCATAAAAAGACTTGCGCTTTTCCTGCTTAGGAGC
TATAGGTAGTGGAGGAAGAACAGAGGGCTCGTCTGGTGGAATTTTCCCCTCTTGCTTCAA
ATCTTCAGCAAAATTATTGAGATCTTCATCAAGTCGTTTTATGTGACTGTCAATAAGATC
ATAAGCTTGCCGGGCCAATAAGACCTTCTCCGTACACAAACTTAACGCATTTTCCTGGCT
GGACTCAATCTCTTTACGCATTTTATCAATGGTTTCTTCT

QA 1 700 1 700
DS 

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GCTTCAAATATTTCATCTCCATCTGACTCCAATGTCTTATCCATTGTAACAGGAGATGAT
ACAGTAGTATTTAGTATTTGAGAAATTAGGATTAATCCGAGGTTGTATTAAACATGACAT
AATTGCAATAAAGATGGAGACAGGTCTAGAAGAAAAGGTACGAAAGAAGATGTCACTGCC
ACCTTGTCACAACAAGAACGAATGATACTAATGTGACTGTGGGAGGATCCTGCAGGTAGG
GCAATACCATTTCCCTTTGAATCTGATTTCGGGGGTGAGGCCAACGCATGTATAGTGAAA
CCATTCACCTCCTTGACAATTCTCATTGTCACAGGCAATCATGTCCCCAAAGGACACCTG
ATGGCAGACACAGTACGTCGGTTCGTTTGGATCGATTGGCTGCTCATCAATAAGGGTGAA
GTCTTTCCGATGGCTTCCTGGAGGAGGCATGAGCTCGAAGTCCCTGTCACGATCCCACTC
TCTATCTCTGTAATCAATCTTCTTAGGCTGTGGTGTGTCATAAAAAGACTTGCGCTTTTC
CTGCTTAGGAGCTATAGGTAGTGGAGGAAGAACAGAGGGCTCGTCTGGTGGAATTTTCCC
CTCTTGCTTCAAATCTTCAGCAAAATTATTGAGATCTTCATCAAGTCGTTTTATGTGACT
GTCAATAAGATCATAAGCTTGCCGGGCCAATAAGACCTTCTCCGTACACAAACTTAACGC
ATTTTCCTGGCTGGACTCAATCTCTTTACGCATTTTATCAATGGTTTCTTCTTCATCAAG
ACCAGTGTTGTAATGATTATTGCCACTGCCCTTCTTGGAACTTTGTGGGGC

QA 1 831 1 831
DS 



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TTTCGGGTTCGTTCGTGTTTCTTGTGTCCTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAAT
AAGAAGAGCATGCGAAGTGAAGAGCTTTTGTGATTTAGGATTTTTTTTTTGCGTGGGTCT
GATTCCGAAATCAAGAAGCTCGATTTCATTTAGTTGCTCGATTTCATTTAGTTCCTAAGG
TCAACAATACATGGCAATAGCGCGAACTGGAGTTTATGTTGATGATTACCTTGAGTATGC
TAGCACTTTCCCTGCGGAGCTTCAGAGATTGCTGAATACAGTTCGCGAACTGGACGAGAG
ATCTCAATCGCTCATAAACCAGACGAGGCAGCAAACTAAGTATTGCTTAGGGCTTGCCTC
ACAAAGTTCCAAGAAGGGCAGTGGCAATAATCATTACAACACTGGTCTTGATGAAGAAGA
AACCATTGATAAAATGCGTAAAGAGATTGAGTCCAGCCAGGAAAATGCGTTAAGTTTGTG
TACGGAGAAGGTCTTATTGGCCCGGCAAGCTTATGATCTTATTGACAGTCACATAAAACG
ACTTGATGAAGATCTCAATAATTTTGCTGAAGATTTGAAGCAAGAGGGGAAAATTCCACC
AGACGAGCCCTCTGTTCTTCCTCCACTACCTATAGCTCCTAAGCAGAAAGCGCAAGTCTT
TTATGGCACACACAGCCTAGAGATGATACAGAGATAGAGAGTGGGATCGTGACAGGACTC
GAGCTCATGCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK63TF U 89
AF RR4D977TF U 8
AF RR4GD30TF U 1
AF RR4D602TF U 1
BS 1 793 RR4D602TF

RD RR4BK63TF 100 0 0
CTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAATTAGAAGAGCATGCGAAGTGAAGAGCTTT
TGTGATTTAGGATTTTTTTTT
TTTTTTTTGCGTGGGTCTG

QA 1 81 1 81
DS 

RD RR4D977TF 637 0 0
GG
ACCGGCACCACAGACGATTTCTAGAGAGGTTAGGATTCAAGGGTTTGGGGGTTTCGGGTT
CGTTCGTGTTTCTTGTGTCCTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAATAAGAAGAGC
ATGCGAAGTGAAGAGCTTTTGTGATTTAGGATTTTTTTTTTGCGTGGGTCTGATTCCGAA
ATCAAGAAGCTCGATTTCATTTAGTTGCTCGATTTCATTTAGTTCCTAAGGTCAACAATA
CATGGCAATAGCGCGAACTGGAGTTTATGTTGATGATTACCTTGAGTATGCTAGCACTTT
CCCTGCGGAGCTTCAGAGATTGCTGAATACAGTTCGCGAACTGGACGAGAGATCTCAATC
GCTCATAAACCAGACGAGGCAGCAAGCTAAGTATTGCTTAGGGCTTGCCTCACAAAGTTC
CAAGAAGGGCAGTGGCAATAATCATTACAACACTGGTCTTGATGAAGAAGAAACCATTGA
TAAAATGCGTAAAGAGATTGAGTCCAGCCAGGAAAATGCGTTAAGTTTGTGTACGGAGAA
GGTCTTATTGGCCCGGCAAGCTTATGATCTTATTGACAGTCACATAAAACGACTTGATGG
AGATCTCAATAATTTTGCTGAAGATTTGAAGCAAG

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR4GD30TF 723 0 0
GGGTTCCCC
ACCGGCACCACATACGATTTCTAGAGAGGTTAGGATTCAAGGGTTTGGGGGTTTCGGGTT
CGTTCGTGTTTCTTGTGTCCTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAATAATAAGAGC
ATGCGAAGTGAAGAGCTTTTGTGATTTAGGATTTTTTTTT*GCGTGGGTCTGATTCCGAA
ATCAAGAAGCTCGATTTCATTTAGTTGCTCGATTTCATTTAGTTCCTAAGGTCAACAATA
CATGGCAATAGCGCGAACTGGAGTTTATGTTGATGATTACCTTGAGTATGCTAGCACTTT
CCCTGCGGAGCTTCAGAGATTGCTGAATACAGTTCGCGAACTGGACGAGAGATCTCAATC
GCTCATAAACCAGACGAGGCAGCAAACTAAGTATTGCTTAGGGCTTGCCTCACAAAGTTC
CTA**AGGGCAGTGGCAATAATCATTACAACACTGGTCTTGATGAAGAAGAAACCATTGA
TAAAATGCGTAAAGAGATTGAGTCCAGCCAGGAAAATGCGTTAAGTTTGTGTACGGAGAA
GGTCTTATTGGCCCGGCAAGCTTATGATCTTATTGACAGTCACATAAAACGACTTGATGA
AGATCTCAATAATTTTGCTGAAGATTTGAAGCAAGAGGGGAAAATTCCACCAGACGAGCC
CTCTGTTCTTCCTCCACTACCTATAGCTCCTAAGCAG
AAAGCGCGAGTCTTTTA

QA 10 706 10 706
DS 

RD RR4D602TF 793 0 0
GGGTTCCCCACCGGCACCACAGACGATTTCTAGAGAGGTTAGGATTCAAGGGTTTGGGGG
TTTCGGGTTCGTTCGTGTTTCTTGTGTCCTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAAT
AAGAAGAGCATGCGAAGTGAAGAGCTTTTGTGATTTAGGATTTTTTTTTTGCGTGGGTCT
GATTCCGAAATCAAGAAGCTCGATTTCATTTAGTTGCTCGATTTCATTTAGTTCCTAAGG
TCAACAATACATGGCAATAGCGCGAACTGGAGTTTATGTTGATGATTACCTTGAGTATGC
TAGCACTTTCCCTGCGGAGCTTCAGAGATTGCTGAATACAGTTCGCGAACTGGACGAGAG
ATCTCAATCGCTCATAAACCAGACGAGGCAGCAAACTAAGTATTGCTTAGGGCTTGCCTC
ACAAAGTTCCAAGAAGGGCAGTGGCAATAATCATTACAACACTGGTCTTGATGAAGAAGA
AACCATTGATAAAATGCGTAAAGAGATTGAGTCCAGCCAGGAAAATGCGTTAAGTTTGTG
TACGGAGAAGGTCTTATTGGCCCGGCAAGCTTATGATCTTATTGACAGTCACATAAAACG
ACTTGATGAAGATCTCAATAATTTTGCTGAAGATTTGAAGCAAGAGGGGAAAATTCCACC
AGACGAGCCCTCTGTTCTTCCTCCACTACCTATAGCTCCTAAGCAGAAAGCGCAAGTCTT
TTATGGCACACACAGCCTAGAGATGATACAGAGATAGAGAGTGGGATCGTGACAGGACTC
GAGCTCATGCCTC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 7

CO CL965Contig1 800 7 6 U
TTTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCA
GATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCTCAATCTGATGTGAAGAAAAG
AATCTCCGACGCCGTTGAAGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGA
GGAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCT
CAACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA
GGAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGATTTGAACAGAAGATGGA
AGCACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCC
TCTGGATGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTT
CGAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAA*GAAGGG
TTTCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTTCTCACAGGCCACTTCAATT
TGTAAACTGTGTCTCTAATCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAAT
GTAAACAAATAATTTGGTTGAACTTTTCATTTGCATGGGAAATGTAAACAAAAATATGTA
GGGCTCATGCCCCAGTGAAGACCAATCAATCATTTGTTGTGACCATCCCTTTACGGGACT
GTCTAATTGTATGAGCAATT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL95JQ C 132
AF RR4FL95TF U 2
AF RR4GS45TF U 70
AF RR4GB08JQ C 2
AF RR4GB08TF U 2
AF RR4HA87TF U 14
AF RR4HA87JQB C 1
BS 1 1 RR4HA87JQB
BS 2 536 RR4FL95TF
BS 537 537 RR4GS45TF
BS 538 705 RR4FL95TF
BS 706 713 RR4HA87TF
BS 714 800 RR4HA87JQB

RD RR4FL95JQ 306 0 0
CCGTTGAAGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCT
TGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGCGT
TTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAGGAGGAGATGG
CGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGATTTGAACAGAAGATGGAAGCACAACAGC
AATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGATGACC
AATCTG

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR4FL95TF 704 0 0
TTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAG
ATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCTCAATCTGATGTGAAGAAAAGA
ATCTCCGACGCCGTTGAAGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAG
GAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTC
AACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAG
GAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGATTTGAACAGAAGATGGAA
GCACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCT
CTGGATGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTC
GAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAA*GAGGGGT
TTCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTTCTCACAGGCCACTTCAATTT
GTAAACTGTGTCTCTAATCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATG
TAAACAAATAATTTGGTTGAACTTTTCATTTGCATGGGAAATGT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4GS45TF 623 0 0
TCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCTCAATCTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGA
CGCCGTTGAAGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATT
CTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGC
GTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAGGAGGAGAT
GGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGATTTGAACAGAAGATGGAAGCACAACA
GCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGATGA
CCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCTGA
GGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAAGAAGGGTTTCACCAG
TTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTTCTCACAGGCCACTTCAATTTGTAAACTG
TGTCTCTAATCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATGTAAACAAA
TAATTTGGTTGAACTTTTCATTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4GB08JQ 694 0 0
TTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAGAGAGCAG
ATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCTCAATCTGATGTGAAGAAAAGA
ATTTCCGACGCCGTTGAAGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAG
GAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTC
AACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAG
GAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGATTTGAACAGAAGATGGAA
GCACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCT
CTGGATGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTC
GAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAA*GAAGGGT
TTTACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTTCTCACAGGCCACTTCAATTT
GTAAACTGTGTCTCTAATCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATG
TAAACAAATAATTTGGTTGAACTTTTCATTTGC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4GB08TF 694 0 0
TTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAGAGAGCAG
ATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCTCAATCTGATGTGAAGAAAAGA
ATCTCCGACGCCGTTGAAGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAG
GAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTC
AACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAG
GAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGATTTGAACAGAAGATGGAA
GCACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCT
CTGGATGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTC
GAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAA*GAAGGGT
TTTACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTTCTCACAGGCCACTTCAATTT
GTAAACTGTGTCTCTAATCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATG
TAAACAAATAATTTGGTTGAACTTTTCATTTGC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4HA87TF 705 0 0
GTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGATGGTTTATCTC
TTTGATCGATTCGATTATTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGACGCC
GTTGAGGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCTTG
GAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGCGTTT
GAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAGGAGGAGATGGCG
TGCGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAACAGCAA
TTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTT*CCTCTGGATGACCAA
TCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCTGAGGCA
TCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAA*GAAGGGTTTCACCAGTTTT
TGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTT*CTCACAGGCCACTTCAATTTGTAAACTGTCTC
T***TTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATGTAAACATAAAAT
TTGGTTGAACTTTTCATTTGCATGGGAAATGTAAACAAAA
TATGT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4HA87JQB 800 0 0
TTTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCA
GATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTATTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAGAAAAG
AATCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGA
GGAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCT
CAACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA
GGAGGAGATGGCGTGCGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGA
AGCACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTT*CC
TCTGGATGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTT
CGAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAA*GAAGGG
TTTCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTT*CTCACAGGCCACTTCAATT
TGTAAACTGTCTCT***TTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAAT
GTAAACATAAAATTTGGTTGAACTTTTCATTTGCATGGGAAATGTAAACAAAAATATGTA
GGGCTCATGCCCCAGTGAAGACCAATCAATCATTTGTTGTGACCATCCCTTTACGGGACT
GTCTAATTGTATGAGCAATT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 7

CO CL966Contig1 556 7 12 U
GGTTATAAAACTAAAAAAATCTCTTGAGAATTGCAGGAATGTCAAAAAGATAGCCATCGG
GTACAAACTAAGAAAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAGA
CGACAAAAACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCG
GATTCTTCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAGCAGCACCT
CCTCCACCACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCACCACCGCTTGGAACAGAA
GCCAGCTTCTCCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTC
AACAAAAGCTCAATCTGAGAGTCTTCAGATTCACAACCAACAGATCCGAGGATGGTCTTG
ACATCGGCACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGCAAGTAAGCGGCGACA
ACCTTCATTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGGAGGAAAGCTCACGAGAGTTT
TTGAAGACGGCGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 15 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 10 

AF RR4GT29JQ U 7
AF RR4EW73JQ U 1
AF RR4GD84JQ U 1
AF RR4EW73TF C 1
AF RR4CZ95JQ U 8
AF RR4GD84TF C 41
AF RR4CZ95TF C 8
BS 1 89 RR4EW73JQ
BS 90 90 RR4GD84JQ
BS 91 310 RR4EW73JQ
BS 311 311 RR4GD84JQ
BS 312 362 RR4EW73JQ
BS 363 367 RR4GD84JQ
BS 368 386 RR4EW73JQ
BS 387 387 RR4GD84JQ
BS 388 464 RR4EW73JQ
BS 465 465 RR4GD84JQ
BS 466 555 RR4EW73JQ
BS 556 556 RR4CZ95JQ

RD RR4GT29JQ 488 0 0
AAAACTAAAAAAATCTCTTGAGAATTGCAGGAATGTCAAAAAGATAGCCATCGGGTACAA
ACTAAAAAAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAAACGACAA
AAACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCT
TCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAACAGCACCTCCTCCA
CCACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCCCCCCCGCTTGGAACAAAAGCCAGC
TTCTCCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTCAACAAA
AGCTCAATCTGAAAGTCTTCAAATTCACAACCAACAAATCCGAGGATGGTCTTGACATCG
GCACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGCAAGTAAGCGGCGACAACCTTC
ATTTTAGC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4EW73JQ 555 0 0
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GTACAAACTAAGAAAAAACAAGATAAAGGGTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAGA
CGACAAAAACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCG
GATTCTTCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAGCAGCACCT
CCTCCACCACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCACCACCGCTTGGAACAGAA
GCCAGCTTCTTCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTC
AA*****GCTCAATCTGAGAGTCTTCGGATTCACAACCAACAGATCCGAGGATGGTCTTG
ACATCGGCACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGAAAGTAAGCGGCGACA
ACCTTCATTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGGAGGAAAGCTCACGAGAGTTT
TTGAAGACGGCGACC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4GD84JQ 553 0 0
GGTTAT
AAAACTAAAAAAATCTCTTGAGAATTGCAGGAATGTCAAAAAGATAGCCATCGGGTACAA
ACTAAGAAAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAGACGACAA
AAACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCT
TCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAGCAGCACCTCCTCCA
CCACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCACCACCGCTTGGAACAGAAGCCAGC
TTCTCCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTCAACAAA
AGCTCAATCTGAGAGTCTTCAGATTCACAACCAACAGATCCGAGGATGGTCTTGACATCG
GCACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGCAAGTAAGCGGCGACAACCTTC
ATTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGGAGGAAAGCTCACGAGAGTTTTTGAAG
ACGGC
CC

QA 7 551 7 551
DS 

RD RR4EW73TF 555 0 0
GGTTAT
AAAACTAAAAAAATCTCTTGAGAATTGCAGGAATGTCAAAAAGATAGCCATCGGGTACAA
ACTAAGACAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAGACGACAA
AAACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCT
TCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAGCAGCACCTCCTCCA
CCACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCACCACCGCTTGGAACAGAAGCCAGC
TTCTTCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTCAA****
*GCTCAATCTGAGAGTCTTCGGATTCACAACCAACAGATCCGAGGATGGTCTTGACATCG
GCACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGAAAGTAAGCGGCGACAACCTTC
ATTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGGAGGAAAGCTCACGAGAGTTTTTGAAG
ACGGCGACC

QA 7 555 7 555
DS 

RD RR4CZ95JQ 549 0 0
AAACTAAAAAAATCTCTTGAGAATTGCAGGAATGTCAAAAAGATAGCCATCGGGTACAAA
CTAAGAAAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAGACGACAAA
AACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCTT
CCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAGCAGCACCTCCTCCAC
CACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCACCACCGCTTGGAACAGAAGCCAGCT
TCTCCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTCAACAAAA
GCTCAATCTGAGAGTCTTCAGATTCACAACCAACAGATCCGAGGATGGTCTTGACATCGG
CACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGCAAGTAAGCGGCGACAACCTTCA
TTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGGAGGAAAGCTCACGAGAGTTTTTGAAGA
CGGCGACCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4GD84TF 513 0 0
GTCAAAAAGATAGCCATCGGGTACAAACTAAGAAAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGT
TTAACACAAAATGAAAAAGACGACAAAAACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGAC
TGAAACCCATGTCATCATCGGATTCTTCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCT
CAGCCGCAGGAGCAGCACCTCCTCCACCACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACAC
CACCACCGCTTGGAACAGAAGCCAGCTTCTCCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGT
CTTTCCCATTCACTTCCTTCAACAAAAGCTCAATCTGAGAGTCTTCAGATTCACAACCAA
CAGATCCGAGGATGGTCTTGACATCGGCACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGG
CGAGCAAGTAAGCGGCGACAACCTTCATTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGG
AGGAAAGCTCACGAGAGTTTTTGAAGACGGC
CC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR4CZ95TF 549 0 0
AAACTAAAAAAATCTCTTGAGAATTGCAGGAATGTCAAAAAGATAGCCATCGGGTACAAA
CTAAGAAAAAACAAGATAAAGGTTCCAAAGGGTTTAACACAAAATGAAAAAGACGACAAA
AACAGAATGCGGACAAGCATTACTCGAAAAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCTT
CCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCCTTCTTGGCCTCAGCCGCAGGAGCAGCACCTCCTCCAC
CACCGGCAGATGGAGCAGAGGCCATGGCAACACCACCACCGCTTGGAACAGAAGCCAGCT
TCTCCCTACCAGCAGCGATCAATTCGCACAAGTCTTTCCCATTCACTTCCTTCAACAAAA
GCTCAATCTGAGAGTCTTCAGATTCACAACCAACAGATCCGAGGATGGTCTTGACATCGG
CACTGGTTGGGGAAGCTTTCCCGCTCAAAGCGGCGAGCAAGTAAGCGGCGACAACCTTCA
TTTTAGCAGAAGTTGATGGAGATCTCGAGGAGGAGGAAAGCTCACGAGAGTTTTTGAAGA
CGGCGACC
C

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 5

CO CL967Contig1 860 5 8 U
TTTGATGAAAAATGTGAATCTTCTCATTCAGTGCATCATTGACAAAAATATTCTCCATTG
ATCGTAGTCCACTCACATAAATTAAAAGTACATATTAAACCCACCGACAATAATTTTGAC
ACGTTGCTCAATACGATTCTTGCACTGTCAAGGGTTGTCTTTACTGTCAAACAGAAGTGA
CGGTGCAGTTGTTCGTGAGTGCAATGTGTTTATTGAGTTTCTTGTGTTCGAAGTTAATCA
AACACACGATTCTCTTGTAGAACTTGGGATGAACCAATTTTCCCAACACGTAAGCATGAG
ATCTAACGGTGAAGTTTAACCTCATCGGCACCGGAGCAGGAGGTGCCGGTGGCTCGACGA
TCACGATGGGTCCTTTCTTCTTCTTGCTGCTCTTTATTGGAATTGGTGCAGGAGGTGGTG
GTGGCACTAAGGTAGAACCACTTCCGTAGAGAGGAGTCTTGTCTCCAATCATATTTACTG
TCACTGTTCTTTGGCTTTTT*CTTGATTGATAAAA*TTTCTT*AATAGTTCCAGAACCAA
TAGTGATCTGAGAGAAACTCAGATCGATGGG*AGAAGAAGTAACATGAACACCAAA*GAA
TGTCCCCGTGTTACGGTACATCATTCTCAAA*GTCGCGTTCATCGTGATCATGTCGGTTC
CTATACCTCCCGCATCTTGTCCAGCTTGGACCTTAAGTTCCTCAAATGTTATACTCTTGA
CTAAGATCTTAGGCTTCTGAGGCTTAGCAGCTGCATAAAGGATCAAAGAGAAGAAAGCGA
AGAGCAAGGAGAATCCAACAACGAAGGCTAAGACATAGCAACGACGAGGCAAACCTTTGT
CTTCTCTGTCACCATCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D541JQ U 8
AF RR4A193TFB C 381
AF RR4A193JQD U 4
AF RR4A193JQ U 1
AF RR4FB10TF C 71
BS 1 14 RR4A193JQ
BS 15 15 RR4D541JQ
BS 16 164 RR4A193JQ
BS 165 165 RR4D541JQ
BS 166 448 RR4A193JQ
BS 449 449 RR4D541JQ
BS 450 802 RR4A193JQ
BS 803 860 RR4FB10TF

RD RR4D541JQ 552 0 0
AAAAATGTGAATCTTCTCATTCAGTGCACCATTGACAAAAATATTCTCCATTGATCGTAG
TCCACTCACATAAATTAAA*GTACATATTAAACCCACCGACAATGATTTTGACACGTTGC
TCAATTCGATTCTTGCACTGTCAAGGGTTGTCTTTACTGTCAAACAGAAGTGACGGTGCA
GTTGTTCGTGAGTGCAATGTGTTTATTGAGTTTCTTGTGTTCGAAGTTAATCAAACACAC
GATTCTCTTGTAGAACTTGGGATGAACCAATTTTCCCAACACGTAAGCATGAGATCTAAC
GGTGAAGTTTAACCTCATCGGCACCGGAGCAGGAGGTGCCGGTGGCTCGACGATCACGAT
GGGTCCTTTCTTCTTCTTGCTGCTCTTTATTGGAATTGGTGCAGGAGGTGGTGGTGGCAC
TAAGGTAGAACCACTTCCGTAGAGAGGAGTCTTGTCTCCAATCATATTTATTATCACTGT
TCTTTGGCTTTTT*CTTGATTGGTAAAA*TTTCTT*AATAGTTCCAGAACCAATAGTGAT
CTGAGAGAAACT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4A193TFB 285 0 0
TTCTTGCTGCTCTTTATTGGAATTGGTGCAGGAGGTGGTGGTGGCACTAAGGTAGAACCA
CTTCCGTAGAGAGGAGTCTTGTCTCCAATCATATTTACTGTCACTGTTCTTTGGCTTTTT
TCTTGATTGATAAAAATTTCTTTAATAGTTCCAGAACCAATAGTGATCTGAGAGAAACTC
AGATCGATGGGGAGAAGAAGTAACATGAACACCAAAAGAATGTCCCCGTGTTACGGTACA
TCATTCTCAAAAGTCGCGTTCATCGTGATCATGTCGGTTCCTATA

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR4A193JQD 740 0 0
GATG
AAAAATGTGAATCTTCTCATTCAGTGCATCATTGACAAAAATATTCTCCATTGATCGTAG
TCCACTCACATAAATTAAAAGTACATATTAAACCCACCGACAATAATTTTGACACGTTGC
TCAATACGATTCTTGCACTGTCAAGGGTTGTCTTTACCGTCAAACAGAAGTGACGGTGCA
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CTTAGGCTTCTGAGGC

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TCTCTTGTAGAACTTGGGATGAACCAATTTTCCCAACACGTAAGCATGAGATCTAACGGT
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TCCTTTCTTCTTCTTGCTGCTCTTTATTGGAATTGGTGTAGGAGGTGGTGGTGGCACTAA
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TTGGCTTTTT*CTTGATTGATAAAA*TTTCTT*AATAGTTCCAGAACCAATAGTGATCTG
AGAGAAACTCAGATCGATGGG*AGAAGAAGTAACATGAACACCAAA*GAATGTCCCCGTG
TTACGGTACATCATTCTCAAA*GTCGCGTTCATCGCGATCATGTCGGTTCCTATACCTCC
CGCATCTTGTCCAGCTTGGACCTTAAGTTCCTCAAATGTTATACTCTTGACTAAGATCTT
AGGCTTCTGAGGCTTAGCAGCTGCATAAAGGATCAAAGAGAAGAAAGCGAAGAGCAAGGA
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ACCATCATGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 6

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TTTCCTGACCAGCGGTGTCCCATATCTGTAAAGTGAAAAGGCGGTCTTCATAGTGTACTT
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GGAT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

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CCTT
C

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T
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C

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TCTTCAACATTGGTGCCTTCTTTAGCAGAAGTTTCATAGTAGGGGATGTTTCCTTTTGAA
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C

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ATTTC
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CACCCCGCTATCGCCGAGGATGATGACTTTGAGGAGAGTTCTTCTACGGGAAGTCATCGA
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DS 



AS 1 7

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CAATATCTGCATGGGGTCTCCAATCGGGCAAGGATATGGATTGACTGAAACGTGTGCTGG
AGCTACGTTTTCTGAGTGGGACGACCCTACTGTTGGACGCGTGGGACCACCACTTCCATG
TGGCTACATAAAGCTTGTTTCTTGGGAAGAAGGTGGCTATAGAATTTCAGACAAACCAAT
GCCTCGAGGGGAGATTGTGGTAGGTGGTAACAGTGTAACAGCTGGTTACTTCAACAATCA
AGAAAAAACAGATGAGGTTTACAAGGTTGATGAGAAGGGAACGAGGTGGTTCTACACGGG
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CGTTAAACTTCAACATGGGGAATATGTATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTC
AAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCGC
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TACCAAGGCAGCAAAGGCGGCAAAGCTAGAAAAGTTTGAAATCCCAGCAAAGATAAAGTT
ATTGCCGGAGCCGTGGACACCAGAGTCGGGACTAGTCACAGCTGCTCTCAAGATAAAGAG
GGAGCAAATAAAGGCAAAGTTCAAAGATGAACTCCACAAGCTGTATGCCTAAAAGTCTTT
ATATATGTAACACTTGTAACAAAACTTCATATTTGCTTGTGTTTTTTGACTTTACTTTCC
ATTAATAAAGTTTGATCATAAGGGGGTTTTTCTCCCTCTTTTGGTTTCTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4DM24TF U 1
AF RR4EA05TF U 138
AF RR4GX18TF U 178
AF RR4DM24JQ C 399
AF RR4EA05JQ C 507
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AF RR4GX18JQ C 407
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BS 145 145 RR4EA05TF
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BS 278 429 RR4DM24TF
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BS 431 734 RR4DM24TF
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BS 848 1099 RR4H179TF
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TAACTTTGCTTACAATCGCCGGTTAGCAGCTGTGAACGGAAGTTGGTTTGGTGCCTGGGG
TCTGGAGAAAATGTTTTGGGATACTCTAGTCTTCAAAAAAATACGCGCTGTGCTTGGAGG
ACGCATCCGATTTATGCTCGTTGGAGGGGCTCCTCTGTCTCCTGATTCGCAACGCTTCAT
CAATATCTGCATGGGGTCTCCAATCGGGCAAGGATACGGATTGACTGAAACGTGTGCTGG
AGCTACGTTTTCTGAGTGGGACGACCCTACTGTTGGACGCGTGGGACCACCACTTCCATG
TGGCTACATAAAGCTTGTTTCTTGGGAAGAAGGTGGCTATAGAATTTCAGACAAACCAAT
GCCTCGAGGAGAGATTGTGGTAGGTGGTAACAGTGTAACAGCTGGTTACTTCAACAATCA
AGAAAAAACAGATGAGGTTTACAAGGTTGATGAGAAGGGAACGAGGTGGTTCTACACGGG
AGACATAGGGAGATTCCACCCTGATGGATGTCTTGAAGTTATCGACAGAAAGAAAGATAT
CGTTAAACTTCAACATGGGGAATATGTATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTC
AAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCGC
TCTTGTTGTACCGT

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DS 

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TCGTTGGAGGGGCTCCTCTGTCTCCTGATTCGCAACGCTTCATCAATATCTGCATGGGGT
CTCCAATCGGGCAAGGATATGGATTGACTGAAACGTGTGCTGGAGCTACGTTTTCTGAGT
GGGACGACCCTACTGTTGGACGCGTGGGACCACCACTTCCATGTGGCTACATAAAGCTTG
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TGGTAGGTGGTAACAGTGTAACAGCTGGTTACTTCAACAATCAAGAAAAAACAGATGAGG
TTTACAAGGTTGATTAGAAGTGAACGAGGTGGTTCTACATGGGAGACATAGGGAGATTCC
ACCCTGATGGATGTCTTGAAGTTATCGACAGAAAGAAAGATATCGTTAAACTTCAACATG
GGGAATATGTATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTCAAGCAATTACGTTGACA
CCATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCGCTCTTGTTGTACCGTCAC
ACGGAGCATTGGAGAAATGGGCAGAGGAA

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DS 

RD RR4GX18TF 674 0 0
G
GGACGCATCCGATTTATGCTCGTTGGAGGGGCTCCTCTGTCTCCTGATTCGCAACGCTTC
ATCAATATCTGCATGGGGTCTCCAATCGGGCAAGGATATGGATTGACTGAAACGTGTGCT
GGAGCTACGTTTTCTGAGTGGGACGACCCTACTGTTGGACGCGTGGGACCACCACTTCCA
TGTGGCTACATAAAGCTTGTTTCTTGGGAAGAAGGTGGCTATAGAATTCCAGACAAACCA
ATGCCTCGAGGGGAGATTGTGGTAGGTGGTAACAGTGTAACAGCTGGTTACTTCAACAAT
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GGAGACATAGGGAGATTCCACCCTGATGGATGTCTTGAAGTTATCGACAGAAAGAAAGAT
ATCGTTAAACTTCAACATGGGGAATATGTATCCCTTGGAAAGGTG*AGGCAGCTTTGGGT
TCAAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTC
GCTCTTGTTGTACCGTCACACGGAGCATTGGAGAAATGGGCAGAGGAAGCAGGAATTAAA
TCCAGCGACTTCTCTGAGTTATGCGAGAACGGGGAAGCAGTCAAGGAGGTTCAACAATCT
CTTACCAAG
CAGC

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DS 

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GAACGAGGTGGTTCTACACGGGAGACATAGGGAGATTCCACCCTGATGGATGTCTTGAAG
TTATCGACAGAAAGAAAGATATCGTTAAACTTCAACATGGGGAATATGTATCCCTTGGAA
AGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTCAAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACC
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CAAAGGAAGCAGGAGTTAAATCCAGCGACTTCTCTGAGTTATGCGAGAACGGGGAAGCAG
TCAAGGAGGTTCAACAATCTCTTACCAAGGCAGCAAAGGCGGCAAAGCTAGAAAAGTTTG
AAATCCCAGCAAAGATAAAGTTATTGCCGGAGCCGTGGACACCAGAGTCGGGACTAGTCA
CAGCTGCTCTCAAGATAAAGAGGGAGCAAATAAAGGCGAAGTTCAAAGATGAACTCCACA
AGCTGTATGCCTAAAAGTCTTTATATATGTAACACTTGTAACAAAACTTCATATTTGCTT
GTGTTTTTTGACTTTACTTTCCATTAATAAAGTTTGATCATAAGGGGGTTTTTCTCCCTC
TTTTGGTTTCTCACT

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DS 

RD RR4EA05JQ 626 0 0
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GATGTCTTGAAGTTATCGACAGAAAGAAAGATATCGTTAAACTTCAACATGGGGAATATG
TATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTCAAGCAATTACGTTGACACCATTATGG
TACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCGCTCTTGTTGTACCGTCACACGGAGCAT
TGGAGAAATGGGCAGAGGAAGCAGGAGTTAAATCCAGCGACTTTTTTGAGTTATGCGAGA
ACGGGGAAGCAGTCAAGGAGGTTCAACAATCTCTTACCAAGGCAGCAAAGGCGGCAAAGC
TAGAAAAGTTTGAAATCCCAGCAAAGATAAAGTTATTGCCGGAGCCGTGGACACCAGAGT
CGGGACTAGTCACAGCTGCTCTCAAGATAAAGAGGGAGCAAATAAAGGCAAAGTTCAAAG
ATGAACTCCACAAGCTGTATGCCTAAAAGTCTTTATATATGTAACACTTGTAACAAAACT
TCATATTTGCTTGTGTTTTTTGACTTTACTTTCCATTAATAAAGTTTGATCATAAGGGGG
TTTTTCTCCCTCTTTTGGTTTC
TCAG

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DS 

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G
AAGAAAAAACAGATGAGGTTTACAAGGTTGATGAGAAGGGAACGAGGTGGTTCTACACGG
GAGACATAGGGAGATTCCACCCTGATGGATGTCTTGAAGTTATCGACAGAAAGAAAGATA
TCGTTAAACTTCAACATGGGGAATATGCATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTT
CAAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCG
CTCTTGTTGTACCGTCACACGGAGCATTGGAGAAATGGGCAGAGGAAGCAGGAGTTAAAT
CCAGCGACTTCTCTGAGTTATGCGGGAACGGGGAAGCAGTCAAGGAGGTTCAACAATCTC
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TATTGCCGGAGCCGTGGACACCAGAGTCGGGACTAGTCACAGCTGCTCTCAAGATAAAGA
GGGAGCAAATAAAGGCAAAGTTCAAAGATGAACTCCACAAGCTGTATGCCTAAAAGTCTT
TATATATGTAACACTTGTAACAAAACTTCATATTTGCTTGTGTTTTTTGACTTTACTTTC
CATTAATAAAGTTTGATCAT

QA 2 621 2 621
DS 

RD RR4GX18JQ 725 0 0
C
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GGTTCTACACGGGAGACATAGGGAGATTCCACCCTGATGGATGTCTTGAAGTTATCGACA
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CAGCTTTGGGTTCAAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACA
GCTACTGTGTCGCTCTTGTTGTACCGTCACACGGAGCATTGGAGAAATGGGCAGAGGAAG
CAGGAATTAAATCCAGCGACTTCTTTGAGTTATGCGAGAACGGGGAAGCAGTCAAGGAGG
TTCAACAATCTCTTACCAAGGCAGCAAAGGCGGCAAAGCTAGAAAAGTTTGAAATCCCAG
CAAAGATAAAGTTATTGCCGGAGC*GTGGACACCAGAGTCGGGACTAGTCACAGCTGCTC
TCAAGATAAAGAGGGAGCAAATAAAGGCAAAGTTCAAAGATGAACTCCACAAGCTGTATG
CCTAAAAGTCTTTATATATGTAACACTTGTAACAAAACTTCATATTTGCTTGTGTTTTTT
GACTTTACTTTCCATTAATAAAGTTTGATCATAAGGGGGTTTTTCTCCCTCTTTTGGTTT
C
CCG

QA 2 722 2 722
DS 



AS 1 6

CO CL970Contig1 928 6 11 U
GGTAACTTCTCCTCTATTCGAAATTACATATATTCAGTTTCTGATGACGTCGCCAGCGAT
TGATCAAGAGAACGTCGCTCCTATGGAGGGAGTCAACACGTCGGTGAGCGAGAAGAAGAA
GCCTGCAGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAGAGCTAAGGAAGTGAAGGTGAAGGAGAAGAA
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GATCGTTACGCTGAAGGAGAGGACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGA
GGAGAAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGCTGCTTCTCAATCTGAAGAG
ACTCGTCGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAA
ACCATCATCATCCCCTAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGGAGAAGAAGAAGAA
GAAACCTGCCACTGCCGCGGCGGCTTCCAAGCCGAAGGGGAAGAAGGTAACCTCAGCTTC
CAAATCTAAGGGAGCAAAGGTGTCTAAGAAACAAACTGCTCATAAGGCCACTGTTGCGCC
CAAGAAGAAAGCTGTTAAGGCTGAGGAGAGACCAGCCAAGGCAGCGAAAACATCGAAGGT
AACATCTCCGGGGAAAAAGGCTGTTCCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCGTGATGGCAACGAA
GAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGAGTGTCAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAG
GGCTTCAAGGATGGCCAAGAAGTGAAATTAGGGCTTAGTGTTGACGAGACTCTCTAGGCG
ACAATCTTGTATATTGATATCATGAAGTGTTTTCTTTGCTTTTATATCTAAAAGTTCTTG
TTGTTCATATATAAAAATCCTTTTCAAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CJ80JQ C 224
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GATCGTTACGCTGAAGGAGAGAACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGA
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ACTCGTCGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAA
ACCATCATCATCCCCTAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGGAGAAGAAGAAGAA
GAAACCTGCCACTGCCGCGGCGGCTTCCAAGCCGAAGGGGAAGAAGGTAACCTCAGCTTC
CAAATCTAAGGGAGCAAAGGTGTCTAAGAAACAAACTGCTCATAAGGCCACTGTTGCGCC
CAAGAAGAAAGCTGTTAAG
CT

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DS 

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ATCAAGAGAACGTCGCTCCTATGGAGGGAGTCAACACGTCGGTGAGCGAGAAGAAGAAGC
CTGCAGCGAATGGAGGCAAGACGAAGAGAGCTAAGGAGGTGAAGGTGAAGGAGAAGAAGA
AGACTGTGAAGAAAGCTGTCTCAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGA
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AGAAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGCTGCTTCTCAATCTGAAGAGAC
TCGTCGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAAC
CATCATCATCCCCTAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGGAGAAGAAGAAGAAGA
AACCTGCCACTGCCGCGGCGGCTTCCAAGCCGAAGGGGAAGAAGGTAACCTCAGCTTCCA
AATCTAAGGGAGCAAAGGTGTCTAAGAAACAAACTGCTCATAAGGCCACTGTTGCGCCCA
AGAAGAAAGCTGTTAAGGCTGAGGAGAGACCAGCCAAG*CAGCGAAAACATCGAAG*TAA
CATCTCCGGG
A

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DS 

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ATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGCTG
CTTCTCAATCTGAAGAGACTCGTCGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTT
AAGATTCCGTCGGCTAAACCATCATCATCCCCTAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCG
GTGGAGAAGAAGAAGAAGAAACCTGCCACTGCCGCGGCGGCTTCCAAGCCGAAGGGGAAG
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AAGGCCACTGTTGCGCCCAAGAAGAAAGCTGTTAAGGCTGAGGAGAGACCAGCCAAGGCA
GCGAAAACATCGAAGGTAACATCTCCGGGGAAAAAGGCTGTTCCTGCTAAGAAGAAGGTT
CCCGTGATGGCAACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGAGTGTCAAGCCAAAGACGGTG
AAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAGGATGGCCAAGAAGTGAAATTAGGGCTTAGTGTTG
ACGAGACTCTCTAGGCGACAATCTTGTATATTGATATCATGAAGTGTTTTCTTTGCTTTT
ATATCTAAAAGTTCT

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DS 

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AAGAGAGCTAAGGAAGTGAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAGACTGTGAAGAAAGCTGTCTCA
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GGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCATAAGGTGCTCTCGCCT
TCGTTCAGGAAGCTGCTGCTTCTCAATCTGAAGAGACTCGTCGCTTCCGAGAAGCTTGTC
AAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAACCATCATCATCCCCTAAAGCGGCG
GCTGCGACATCTGCTCCGGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAACCTGCCACTGCCGCGGCGGCT
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AAGAAACAAACTGCTCATAAGGCCACTGTTGCGCCCAAGAAGAAAGCTGTTAAGGCTGAG
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CCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCGTGATGGCAACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGAGT
GTCAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAGGATGGCCAAGAAGTGA
AATTAGGGCTTAGTGTTGACGAGACTCTCTAGGCGACAATCTTGTATATTGATATCATGA
AGTGTTTTCTTTGCTTTTATATCTAAAAGTTCTTGTTGTTCATATAT

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DS 

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ATGCGATCGTTACGCTGAAGGAGAGGACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCA
TCGAGGAGAAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGCTGCTTCTCAATCTGA
AGAGACTCGTCGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGG
CTAAACCATCATCATCCCCTAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGGAGAAGAAGA
AGAAGAAACCTGCCACTGCCGCGGCGGCTTCCAAGCCGAAGGGGAAGAAGGTAACCTCAG
CTTCCAAATCTAAGGGAGCAAAGGTGTCTAAGAAACAAACTGCTCATAAGGCCACTGTTG
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CGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGAGTGTCAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGA
AGAGGGCTTCAAGGATGGCCAAGAAGTGAAATTAGGGCTTAGTGTTGACGAGACTCTCTA
GGCGACAATCTTGTATATTGATATCATGAAGTGTTTTCTTTGCTTTTATATCTAAAAGTT
CTTGTTGTTCATATAT

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DS 

RD RR4B278TF 310 0 0
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GGCTGTTCCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCGTGATGGCAACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAA
GAAGAGTGTCAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAGGATGGCCAA
GAAGTGAAATTAGGGCTTAGTGTTGACGAGACTCTCTAGGCGACAATCTTGTATATTGAT
ATCATGAAGTGTTTTCTTTGCTTTTATATCTAAAAGTTCTTGTTGTTCATATATAAAAAT
CCTTTTCAAG

QA 1 310 1 310
DS 



AS 1 7

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TAAAATAAACTTTAGTCCAAAACTTTTTCCAAGTCTGAAAATATAAAGAGCTTTCAGTCT
TACCTTTAAAAGCCAACAACACAACACAAGACATCACTCATCGACCTCTGCTCTGATCTC
TCTTTGCAGATCTTCCTTGTACTCTTCAAACGTGCCATCGAAGAAAGACACTGTTCCGTC
TTCCACAACCCAAATCTGACTCTTCTCCTCATCCTCACAGACACGCGAAATAAGTCTAGA
GTCGTGACTCACCAGCACAACTCCTCCACTGAACTCCTCTAGCGCATCAGCCAACGCATC
TATGCTCTGCATGTCTAAGTGATTCGTAGGCTCGTCAAGAAGCAAAATGTGTGGCTTAGA
CATTGAGATCGAAGTGAACACAACTCTAGCTTTTTGTCCACCGGACAGTTTCATGATCGG
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TTTGCTAAATCCCTCTTGGTCAGGATGAAGGCGGAGCAGATACTGAACTGGTGTCTCCCC
CATTGTTAACAGGTCAACAAAGTGCTGAGAATATCTCCCAATCCTCAGCTTCTGGCTTCT
TCTCACTTCACCTTCACTGGGAACTAAATCTCCAGCAAGAAGGTTCAAAAGAGTGGACTT
TCCAGCTCCATTAGGCCCAACTATAGCGACCCTTGTACCCATATCGATACCCACATCAAC
ATCCGAGAGCCTGAAGTCTGGTCTATTCGGGTAGCAGAAGCTAACCTCGATCAACTGCAG
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CTTC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4AA14JQ U 2
AF RR4E370JQ U 1
AF RR4E191JQ U 1
AF RR4CN68JQ U 2
AF RR4AA14TF C 259
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AF RR4E191TF C 396
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BS 161 162 RR4AA14JQ
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RD RR4AA14JQ 688 0 0
G
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QA 2 688 2 688
DS 

RD RR4E370JQ 679 0 0
AA
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TGCTAAATCCCTCTTGG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR4E191JQ 728 0 0
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ACAT***ATCCTTGCTTCCCACAAAACATAATACTACACTCGACTATGTAACATGGGGAA
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TCTTTGCAGATCTTCCTTGTACTCTTCAAACGTGCCATCGAAGAAAGACACTGTTCCGTC
TTCCACAACCCAAATCTGACTCTTCTCCTCATCCTCACAGACACGCGAAATAAGTCTAGA
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TATGCTCTGCATGTCTAAGTGATTCGTAGGCTCGTCAAGAAGCAAAATGTGTGGCTTAGA
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TTTGCTAAATCCCTCTTGGTCAGGATGAAGGCGGAGCAGATACTGAACTGGTGTCTCCCC
CATTGTTA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CN68JQ 816 0 0
A
GAGAATTGTTGTTTATTATGCTCAATGAAACACACATTCATGAAATAAAAAATGAAAGAC
AT***ATCCTTGCTTCCCACAAAACATAATACTACACTCGACTATGTAACATGGGGAAAA
CGTATATGGTTTCATGCCATTAACGTATATATGACGAAAAAAACACACACAATGTCTATA
AAATAAACTTTAGTCCAAAACTTTTTCCAAGTCTGAAAATATAAAGAGCTTTCAGTTTTA
CCTTTAAAAGCCAACAAC**AACACAAGACATCACTCATCGACCTCTGCTCTGATCTCTC
TTTGCAGATCTTCCTTGTACTCTTAAAACGTGCCATCGAAAAAAGACACTGTTCCGTCTT
CCACAACCCAAATCTGACTCTTCTCCTCATCCTCACAGACACGCGAAATAAGTCTAGAGT
CGTGACTCACCAGCACAACTCCTCCACTGAACTCCCCTAGCGCATCAGCCAACGCATCTA
TGCTCTGCATGTCTAAGTGATTCGTAGGCTCGTCAAGAAGCAAAATGTGTGGCTTAAACA
TTGAGATCGAAGTGAACACAACTCTAGCTTTTTGTCCACCGGACAGTTTCATGATCGGAG
TCAAGTGGTTGTGACTCGGTAGCCCAAACTTGTCTAGCTTAGCACGCACAGCTTCCTGTT
TGCTAAATCCCTCTTGGTCAGGATGAAGGCGGAGCAGATACTGAACTGGTGTCTCCCCCA
TTGTTAACAGGTCAACAAAGTGCTGAGAATATCTCCCAATCCTCAGCTTCTGGCTTCTTC
TCACTTCACCTTCACTGGGAACTAAATCTCCAGCA

QA 2 816 2 816
DS 

RD RR4AA14TF 717 0 0
AC
ACAACACAAGACATCACTCATCGACCTCTGCTCTGATCTCTCTTTGCAGATCTTCCTTGC
ACTCTTCAAACGTGCCATCGAAGAAAGACACAGTTCCGTCTTCCACAACCCAAATCTGAC
TCTTCTACTCATCCTCACAGACACGCGAAATAAGCCTAGAGTCGTGACTCACCAGCACAA
CTCCTCCACTGAACTCCTCTAGCGCATCAGCCAACGCATCTATGCTCTGCATGTCTAAGT
GATTCGTAGGCACGTCAAGAAGTAAAATGTGTGGCTTAGACATTGAGATAGAGGTGAACA
CAACTCTAGCTTTTTGTCCACCGGACAGTTTCATGATCGGAGTCAAGTGGTTGTGACTCG
GTAGCCCAAACTTGCCTAGCTTAGCACGCACAGCTTCCTGTTTGCTAAATCCCTCTTGGT
CAGGATGAAGGCGGAGCAGATACTGAACTGGTGTCTCCCCCATTGTTAACAGGTCAACAA
AGTGCTGAGAGTATCTCCCAATCCTAAGCTTCTGGCTTCTTCTCACTTCACCTTCACTCG
GAACTAAATCTCCAGCAAGAAGGTTCAAAAGAGTGGACTTTCCAGCTCCATTAGGCCCAA
CTATAGCGACCCTTGTACCCATATCGATACCCACATCAACATCTGAGAGCCTGAAGTCTG
GTCTATTCGGGTAGCAGAAGCTAACCTCGATCAACTGCAGGAGAGGAGGAGTGA
C

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR4E370TF 752 0 0
ATCACTCATCGACCTCTGCTCTGATCTCTCTT*GCAGATCTTC*TTGTACTCT*CAAACG
TGCCATCGAAGAAAGACACTGTTCCGTCTTCCACAACCCAAATCTGACTCTTCTCCTCAT
CCTCACAGACACGCGAAATAAGTCTAGAGTCGTGACTCACCAGCACAACTCCTCCACTGA
ACTCCTCTAGCGCATCAGCCAACGCATCTATGCTCTGCATGTCTAAGTGATTCGTAGGCT
CGTCAAGAAGCAAAATGTGTGGCTTAGACATTGAGATCGAAGTGAACACAACTCTAGCTT
TTTGTCCACCGGACAGTTTCATGATCGGAGTCAAGTGGTTGTGACTCGGTAGCCCAAACT
TGCCTAGCTTAGCACGCACAGCTTCCTGTTTGCTAAATCCCTCTTGGTCAGGATGAAGGC
GGAGCAGATACTGAACTGGTGTCTCCCCCATTGTTAACAGGTCAACAAAGTGCTGAGAAT
ATCTCCCAATCCTCAGCTTCTGGCTTCTTCTCACTTCACCTTCACTGGGAACTAAATCTC
CAGCAAGAAGGTTCAAAAGAGTGGACTTTCCAGCTCCATTAGGCCCAACTATAGCGACCC
TTGTACCCATATCGATACCCACATCAACATCCGAGAGCCTGAAGTCTGGTCTATTCGGGT
AGCAGAAGCTAACCTCGATCAACTGCAGGAGAGGAGGAGTGAGCTCGGTTGGTTCTGGGA
AATGAAACTCAACGCTATAGTCTCTCCACTTC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4E191TF 629 0 0
CACAGACACGCGAAATAAGTCTAGAGTCGTGACTCACCAGCACAACTCCTCCACTGAACT
CCTCTAGCGCATCAGCCAACGCATCTATGCTCTGCATGTCTAAGTGATTCGTAGGCTCGT
CAAGAAGCAAAATGTGTGGCTTAGACATTGAGATCGAAGTGAACACAACTCTAGCTTTTT
GTCCACCGGACAGTTTCATGATCGGAGTCAAGTGGTTGTGACTCGGTAGCCCAAACTTGC
CTAGCTTAGCACGCACAGCTTCCTGTTTGCTAAATCCCTCTTGGTCAGGATGAAGGCGGA
GCAGATACTGAACTGGTGTCTCCCCCATTGTTAACAGGTCAACAAAGTGCTGAGAATATC
TCCCAATCCTCAGCTTCTGGCTTCTTCTCACTTCACCTTCACTGGGAACTAAATCTCCAG
CAAGAAGGTTCAAAAGAGTGGACTTTCCAGCTCCATTAGGCCCAACTATAGCGACCCTTG
TACCCATATCGATACCCACATCAACATCCGAGAGCCTGAAGTCTGGTCTATTCGGGTAGC
AGAAGCTAACCTCGATCAACTGCAGGAGAGGAGGAGTGAGCTCGGTTGGTTCTGGGAAAT
GAAACTCAACGCTATAGTCTCTCCACTTC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 7

CO CL972Contig1 986 7 21 U
GCAATGGTCTCTTCTTGAAGGTGGATCTGCCGGAGAATTGGGACACGCCGTACGTGCTGC
ATTACACGGAGTACGACGGGAAGACGGGAGCTACGGGGCAGAAGAAGACGATGGAGGTTG
ACGCCGTTATTGGAGCTGACGGGGCTAACTCTAGAGTTGCGAAGTCCATCGGCGCCGGAG
ATTACGACTACGCCATTGCGTTTCAGGAGAGAATTAGAATCCCAGATGATAAGATGACAT
ACTACGAGGATCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACGTGTCACCCGATTTCTACGGAT
GGGTTTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGAACAGGCACTGTGACTCACAAAGGTG
ACATCAAGAAGTGCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAA
AGATCATCCGCGTCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGGCTATCCA
AGCGTGTGGCTCTTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCTGGTGAAGGGA
TCTATTTCGCTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATTGTTGAAGGCTCGCAGA
ATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTGGAGAAATGGGACAAGA
CATACTTGCCTACGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCTAATC
CGGCTAGAGAAGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACGTTCG
ATAGTTATCTGTACAAGAGGGTTGCACCGGGTAGTCCATTGGAGGATTTGAAGTTGGCTG
TGAACACCATTGGGAGTGTGTTTAGAGCTAATGCTTCGAGGAGAGAGATTGAGAAGCTAA
ATGTTTAAGACA**AATAATAAGAGATTATTTCTTGTCTTTTTTAATTTTAAAAGTATGT
TTATGTTATCTGTTTATTGAATGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BV65TF U 1
AF RR4H050TF U 70
AF RR4BV65JQ C 220
AF RR4BG75JQ C 373
AF RR4BH40JQ C 373
AF RR4BG75TF U 373
AF RR4BH40TF U 373
BS 1 372 RR4BV65TF
BS 373 373 RR4BG75TF
BS 374 469 RR4BV65TF
BS 470 470 RR4BG75TF
BS 471 529 RR4BV65TF
BS 530 530 RR4BG75TF
BS 531 583 RR4BV65TF
BS 584 584 RR4BG75TF
BS 585 589 RR4BV65TF
BS 590 590 RR4BG75TF
BS 591 595 RR4BV65TF
BS 596 596 RR4BG75TF
BS 597 643 RR4BV65TF
BS 644 644 RR4BG75TF
BS 645 675 RR4BV65TF
BS 676 703 RR4H050TF
BS 704 704 RR4BG75TF
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BS 722 722 RR4BG75TF
BS 723 791 RR4H050TF
BS 792 986 RR4BG75TF

RD RR4BV65TF 675 0 0
GCAATGGTCTCTTCTTGAAGGTGGATCTGCCGGAGAATTGGGACACGCCGTACGTGCTGC
ATTACACGGAGTACGACGGGAAGACGGGAGCTACGGGGCAGAAGAAGACGATGGAGGTTG
ACGCCGTTATTGGAGCTGACGGGGCTAACTCTAGAGTTGCGAAGTCCATCGGCGCCGGAG
ATTACGACTACGCCATTGCGTTTCAGGAGAGAATTAGAATCCCAGATGATAAGATGACAT
ACTACGAGGATCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACGTGTCACCCGATTTCTACGGAT
GGGTTTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGAACAGGCACTGTGACTCACAAAGGTG
ACATCAAGAAGTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAA
AGATCATCCGCGTCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGGAGGCTATCCA
AGCGTGTGGCTCTTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCCGGTGAAGGGA
TCTATTTCGCTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAGGGCTCACAGA
ATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTAGAGAAATGGGACAAGA
CATACTTGCCTACGT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4H050TF 722 0 0
G
GTACGACGGGAAGACGGGAGCTACGGGGCAGAAGAAGACGATGGAGGTTGACGCCGTTAT
TGGAGCTGACGGGGCTAACTCTAGAGTTGCGAAGTCCATCGGCGCCGGAGATTACGACTA
CGCCATTGCGTTTCAGGAGAGAATTAGAATCCCAGATGATAAGATGACATACTACGAGGA
TCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACGTGTCACCCGATTTCTACGGATGGGTTTTCCC
GAAATGCGACCTCGTAGCTGTCGGAACAGGCACTGTGACTCACAAAGGTGACATCAAGAA
GTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATCCG
CGTCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGGAGGCTATCCAAGCGTGTGGC
TCTTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCCGGTGAAGGGATCTATTTCGC
TGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAGGGCTCACAGAATGGTAAGAA
GATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTAGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCC
TACGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTATTTTACAGATCTAATCCCGCTAGAGA
AGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACGTTCGATAGTTATCT
G

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR4BV65JQ 771 0 0
TCCCAGATGATAAGATGACATACTACGAGGATCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACG
TGTCACCCGATTTCTACGGATGGGTTTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGAACAG
GCACTGTGACTCACAAAGGTGACATCAAGAAGTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCA
AGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATCCGCGTCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACC
CGCGGCCACGGAGGCTATCCAAGCGTGTGGCTCTTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGA
CTAAATGCTCCGGTGAAGGGATTTATTTCGCTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAG
CCATCGTTGAGGGCTCACAGAATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGT
ACTTAGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTACGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGA
AAGTATTTTACAGATTTAATCCGGCTAGAGAAGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGT
ATGTTCAGAAGATGACGTTCGATAGTTATCTGTACAAGAGGGTTGCACCGGGTAGTCCAT
TGGAGGATTTGAAGTTGGCTGTGAACACCATTGGGAGTGTGTTTAGGGCTAATGCTTTGA
GGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATGTTTAAGACATAAATAAGAAGAGATTCTTTCTTGTCT
TTTTTC*TTTTAAAAATATGTTTGTGTTATCTGTT
GAATGATCAGTCAAAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4BG75JQ 614 0 0
GCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATCCGCG
TCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGGCTATCCAAGCGTGTGGCTC
TTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCTGGTGAAGGGATCTATTTCGCTG
CAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATTGTTGAAGGCTCGCAGAATGGTAAGAAGA
TGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTGGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTA
CGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCTAATCCGGCTAGAGAAG
CGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACGTTCGATAGTTATCTGT
ACAAGAGGGTTGCACCGGGTAGTCCATTGGAGGATTTGAAGTTGGCTGTGAACACCATTG
GGAGTGTGTTTAGAGCTAATGCTTCGAGGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATGTTTAAGACA
**AATAATAAGAGATTATTTCTTGTCTTTTTTAATTTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTG
TTTATTGAATGGAC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4BH40JQ 614 0 0
GCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATCCGCG
TCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGGCTATCCAAGCGTGTGGCTC
TTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCTGGTGAAGGGATCTATTTCGCTG
CAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATTGTTGAAGGCTCGCAGAATGGTAAGAAGA
TGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTGGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTA
CGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCTAATCCGGCTAGAGAAG
CGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACGTTCGATAGTTATCTGT
ACAAGAGGGTTGCACCGGGTAGTCCATTGGAGGATTTGAAGTTGGCTGTGAACACCATTG
GGAGTGTGTTTAGAGCTAATGCTTCGAGGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATGTTTAAGACA
**AATAATAAGAGATTATTTCTTGTCTTTTTTAATTTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTG
TTTATTGAATGGAC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4BG75TF 614 0 0
GCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATCCGCG
TCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGGCTATCCAAGCGTGTGGCTC
TTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCTGGTGAAGGGATCTATTTCGCTG
CAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATTGTTGAAGGCTCGCAGAATGGTAAGAAGA
TGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTGGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTA
CGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCTAATCCGGCTAGAGAAG
CGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACGTTCGATAGTTATCTGT
ACAAGAGGGTTGCACCGGGTAGTCCATTGGAGGATTTGAAGTTGGCTGTGAACACCATTG
GGAGTGTGTTTAGAGCTAATGCTTCGAGGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATGTTTAAGACA
**AATAATAAGAGATTATTTCTTGTCTTTTTTAATTTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTG
TTTATTGAATGGAC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4BH40TF 614 0 0
GCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATCCGCG
TCGAGGCTCATCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGGCTATCCAAGCGTGTGGCTC
TTGTGGGTGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCTGGTGAAGGGATCTATTTCGCTG
CAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATTGTTGAAGGCTCGCAGAATGGTAAGAAGA
TGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTACTTGGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTA
CGTACAGGGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCTAATCCGGCTAGAGAAG
CGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACGTTCGATAGTTATCTGT
ACAAGAGGGTTGCACCGGGTAGTCCATTGGAGGATTTGAAGTTGGCTGTGAACACCATTG
GGAGTGTGTTTAGAGCTAATGCTTCGAGGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATGTTTAAGACA
**AATAATAAGAGATTATTTCTTGTCTTTTTTAATTTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTG
TTTATTGAATGGAC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 7

CO CL973Contig1 1123 7 20 U
GGTTGGCCCATGGAATCACTACCCTTCATATCTACACTTTGAACGTGGACAAATCAGCTA
TTGGAATACTAATGAATCTTGGTCTGATTGATGAGTCTAAAATCACTCGTTCTTTACCTT
GGAGACGCCCTGCAAATGTTTTCCGTACTAAGGAAGATGTTCGCCCCATTTTCTGGGCAA
ACCGTCCCAAGAGCTACATATCTAGGACTAAGGGCTGGAATGACTTCCCACAGGGACGAT
GGGGTGATTCACGCAGTGCATCATATGGCACACTTTCGGATTATCAGTTCATGCGCCCAC
GAGCACGTGACAAGAAGCTCCAGCAAGAATGGGCTGTCCCACTGAAAGGCATTGAAGATG
TTCAAGAGAAATTCAAAGAGCTCTGTCTTGGAAACTTAAAAAGCAGTCCATGGTCTGAGT
TAGATGGACTCCAGCCAGAAACAAAGATCATAAACGAGAAACTTGGAAAAATAAACTCCA
ACGGCTTCCTGACCATCAATAGCCAACCATCAGTCAATGCAGCCAAATCTGATTCCCCAG
CTATTGGATGGGGTGGTCCTGGTGGTTACGTCTACCAGAAAGCTTACCTAGAGTTCTTCT
GCTCTAAGGATAAGTTAGACACACTTGTGGAGAAGTCCAAAGCTTTTCCTTCCATCACCT
TCATGGCGGTGAACAAAGCAGAGAACTGGGTATCAAACATTGGTGAATCCAATGTGAATG
CAGTTACCTGGGGAGTGTTCCCAGCTAAGGAGGTTATCCAACCGACAATTGTGGATCCAG
CCAGTTTCAAAGTCTGGAAAGACGAAGCCTTTGAGATTTGGTCAAGAAGCTGGGCTAACT
TGTACCCTGAGGATGACCCTTCTAGAAAGCTGCTCGAAGAGGTGAAGAACAGCTACTATT
TGGTAAGCTTAGTGGACAACGATTACATCAGTGGTGATATATTCTCAGTCTTTGCCTGAT
CTCTGAGAAACCCCAATGGGGGAAATGAGGAAACCATTCGATTTTCACGATTTGTTGTAA
CTTTTCTAAAGATATTTGTGATGTATCAACAGTACTCATCAGTTTCATTGTGGCTTGTTC
TTTTATCTATGTCGAAACAAATAAATTAAGAAATGTTGCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
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CAGTTACCTGGGGAGTGTTCCCAGCTAA

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G
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G
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GGGCTGTCCCACTGAAAGGCATTGAAGATGTTCAAGAGAAATTCAAAGAGCTCTGTCTTT
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AGGTTATCCAACCGACAATTGTGGATCCAGCCAGTTTCAAAGTCTGGAAAGACGAAGCCT
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CTTCT

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CTGAGAAACCCCAATGGGGGAAATGAGGAAACCATTCGATTTTCACGATTTGTTGTAACT
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CG

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G
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TCAAAGAGCTCTGTCTTGGAAACTTAAAAAGCAGTCCATGGTCTGAGTTAGATGGACTCC
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CCATCAATAGCCAACCATCAGTCAATGCAGCCAAATCTGATTCCCCAGCTATTGGATGGG
GTGGTCCTGGTGGTTACGTCTACCAGAAAGCTTACCTAGAGTTCT***GCTCTAAGGATA
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ACAAAGCAGAGAACTGGGTATCAAACATTGGTGAATCCAATGTGAATGCAGTTACCTGGG
GAGTGTTCCCAGCTAAGGAGGTTATCCAACCGACAATTGTGGATCCAGCCAGTTTCAAAG
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CCAATGGGGGAAATGAGGAAACCATTCGATTTTCACGATTTGTTGTAACTTCCCTAAAGA
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CAAAACAAATAAATT

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G
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G
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TATCCAACCGACAATTGTGGATCCAGCCAGTTTCAAAGTCTGGAAAGATGAAGCCTTTGA
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CGAAGAGGTGAAGAACAGCTACTATTTGGTAAGCTTAGTGGACAACGATTACATCAGTGG
TGATATATTCTCAGTCTTTGCCTGATCTCTGAGAAACCCCAATGGGGGAA*TGAGGAAAC
CATTCGATTTTCACGATTTGTTGTAACTTTTCTAAAGATATTTGTGATGTATCAACAGTA
CTCATCAGTTTCATTGTGGCTTGTTCTTTTATCTATGTCGAAACAAATAAATTAAGAAAT
GTTGCTTGC

QA 2 550 2 550
DS 



AS 1 7

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CCGCGGTCGTTACCATGCTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTG
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ATGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACT
GATCGTGGATCACACGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTG
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TTGTGTTGTTGTT***CTGTCTAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTA
TTTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 30 

AF RR4FX20TF U 1
AF RR4FX20JQ C 10
AF RR4BB62JQ C 142
AF RR4DL44TF U 318
AF RR4BD62JQ C 142
AF RR4BB62TF U 142
AF RR4BD62TF U 142
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BS 788 788 RR4BB62TF

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TACAGGGTTCCATGGACGAGCTGGTTCAACTATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCC
AGTAGGCACCATCCCCTTGACTCCTGCCGAACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGG
TGAGGGAGGAACATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGCGTAAGAAAAAGTCTCTGTAG
GACAAGCCCAAGATGGTATATCAGCGGTTAAGTTTGTGTACAACAAAGGTTCTTCTGAAA
TCATAGGAGACGAACATGGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTCGACT
ATCCAAGGGAATACATCACAGAAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACT
CCGCGGTCGTTACCATGCTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTG
GGCTTACCGCTGGTGAGGCCTTCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCC
ATGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACT
GATCGTGGATCACATGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCCCTCTCTCATAATGGTCTTTG
AACTTTAAATAAGTTGTTTCTACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCA*GTTCTTCTCTT
TTGTGTTGTTGTTGT*CTGTCTA*GATGGATTTGTGATCCCT

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DS 

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CCATGGACGAGCTGGTTCAACTATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCAC
CATCCCCTTGACTCCTGCCGAACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGG
AACATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGCGTAAGAAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCC
AAGATGGTATATCAGCGGTTAAGTTTGTGTACAACAAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAG
ACGAACATGGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTCGACTATCCAAGGG
AATACATCACAGAAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCG
TTACCATGCTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCG
CTGGTGAGGCCTTCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTG
CTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGA
TCACATGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCCCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAA
TAAGTTGTTTCTACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGT
TGTTGTTCTGTCTAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTG

QA 1 775 1 775
DS 

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AAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCGTTACCATGCTTA
CGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAGGCCT
TCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGC
TTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACACGAATTT
GTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCT
ACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTT***CTGTC
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QA 1 647 1 647
DS 

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ACGGAAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCGTTACCATG
CTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAG
GCCTTCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGAT
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ATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGT
TTCTACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTTGTTC
TGTCTAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTATTGAATAAATTTTATTTGAAT
TATTTGTC

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DS 

RD RR4BD62JQ 647 0 0
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AAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCGTTACCATGCTTA
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TTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACACGAATTT
GTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCT
ACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTT***CTGTC
TAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTGAATC

QA 1 647 1 647
DS 

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AAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCGTTACCATGCTTA
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TCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGC
TTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACACGAATTT
GTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCT
ACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTT***CTGTC
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DS 

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AAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCGTTACCATGCTTA
CGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAGGCCT
TCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGC
TTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACACGAATTT
GTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCT
ACCTATTACTATTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTT***CTGTC
TAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTGAATC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 7

CO CL975Contig1 1741 7 4 U
GACCTCAATTTTAGTGTTCGATTTACCAAAAAAAAAACAGCAATAAAAAGGTTCGTAATA
ACAATATCCACACCTTGCACGAACCAGTGTTCTCGAATTGTACAAGTTTTTCAAGATTAA
CCACTGCAATAGCTTAATTCTTTATTGGGTTTCACGTAAGCTTTTTATAGAGAAGACCAT
CCGCTTCAGAAATTTATGAGTTCAGCTATAACTGACTAACATAACCTCTCAACTCTGAGA
TAGATAGACTTAAGATTCAGTAGAGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATGCCAGA
ATCCACAAGGATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAAAGTGCATG
TGCTATACCAAACCTAGGACAGTTTTTAGCCCAGAGTGGCTTGAAATGAACAGTCAGGCA
AATCTTCCCACCTCGATACATAAGGTAAATATTGTATAATTGCTCGGTTTTCTGCAATTT
TTTCCATTCCTCTGTGTAAATAACCCAATATGGGTTCACAATCAACAACATCCTCACCGT
CTAGAGTAACAATTAAGCGAAGAACACCGTGCATGGATGGGTGGTGAGGTCCCATATTGA
CTATCATAAGATCTTTTCCTGTAACTGGTTTCTTCATAAGTTTTTCCTTGATTCGTTCTG
GTATGAATTAGATTGCTGAAAAAGAAGTTTATTCAAAAATTCAAGATCTAAAAAATTAAC
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ATTCTTTATAACGTACTCTATTTTTTTTTGACAAATAAGCCAGCAGTCGTTGGCGTTTTC
CCAGAATTTTTCGTAAACCTCTCTGAGATAAATAATCTTTTCTGTGTAATTCCAAATGTG
AAGTAAGTCTTCGTATCTTATTAGTGAAACTGAATACTTGAAATTCAACAGATCCCTTGC
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CCCTTTTTAATATGAATTGAAAGATATGAATTTTACTGATCAGTAATAATAATGGTAGTT
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AAGTTTTAATTTCGATCTAAAAAAGGAAGATTTTAAAAATTTATTTATGGATCCGCTCTG
AGTGGTATCTATATCATTAATTCAATGAATCTCATGTATAAAGATTTAATTTAAAGCAAT
ACCTCACGTTTGTGCATCCAATTGTTTTCATATACCGTAACTTATATTATATATTTTTCA
TATACCGTAACTTAATATTATATATATATAGTCAAAATATAGTAAAAAGGATCTACCATT
AATGCATTTGAAATCGCGTATACATGTGTATTCTTATCATACTGAAATGATTTCCGTTAG
TCGTATTAAACCAATAGCGATTCATACAAGCTAAATCTTCTAATCGAAAATTGGGCCAAA
GAAAGGATTTTAATTTAATTAGGTTTTTTTTATCCTTATCAAGATCTTTCTTTTTATTCA
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TTTTTTTTAAATTGAAACAAATTAGAATTCGAAATTCTTTACGTCGTTTAGGGGATAGAA
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RR4CH37JQ U 1
AF RR4CH37TF C 209
AF RR4E452JQ U 618
AF RR4ET39JQ U 979
AF RR4ET39TF C 979
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AF RR4EA10TF C 1027
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TAGATAGACTTAAGATTCAGTAGAGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATGCCAGA
ATCCACAAGGATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAAAGTGCATG
TGCTATACCAAACCTAGGACAGTTTTTAGCCCAGAGTGGCTTGAAATGAACAGTCAGGCA
AATCTTCCCACCTCGATACATAAGGTAAATATTGTATAATTGCTCGGTTTTCTGCAATTT
TTTCCATTCCTCTGTGTAAATAACCCAATATGGGTTCACAATCAACAACATCCTCACCGT
CTAGAGTAACAATTAAGCGAAGAACACCGTGCATGGATGGGTGGTGAGGTCCCATATTGA
CTATCATAAGATCTTTTCCTGTAACTGGTTTCTTCATAAGTTTTTCCTTGATTCGTTCTG
GTAT

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ATATTGTATAATTGCTCGGTTTTCTGCAATTTTTTCCATTCCTCTGTGTAAATAACCCAA
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TGACAAATAAGCCAGCAG
C

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C

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AAAAAAGGAAGATTTTAAAAATTTATTTATGGATCCGCTCTGAGTGGTATCTATATCATT
AATTCAAT*AATCTCATGTATAAAGATTTAATTTAAAGCAATACCTCACGTTTGTG

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GAAAGATATGA*TTTTACTGATCAGTAATAATAATGGTAGTTTTTTTGTACAAGGATCCG
AATTTAATTATCAACTTCTTAATTCTTAATTTTATAAATTAAAAGTTTTAATTTCGATCT
AAAAAAGGAAGATTTTAAAAATTTATTTATGGATCCGCTCTGAGTGGTATCTATATCATT
AATTCAAT*AATCTCATGTATAAAGATTTAATTTAAAGCAATACCTCACGTTTGTG

QA 1 296 1 296
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GAAATGAAATGAATGTATTTTTTATCATAAAAAGAAATCCTTCCCTTTTTAATATGAATT
GAAAGATATGAATTTTGCTGATCAGTAATAATAATGGTAGTTTTTTTGTACAAGGATCCG
AATTTAATTATCAACTTCTTAATTCTTAATTTTATAAATTAAAAGTTTTAATTTCGATCT
AAAAAAGGAAGATTTTAAAAATTTATTTATGGATCCGCTCTGAGTGGTATCTATATCATT
AATTCAATGAATCTCATGTATAAAGATTTAATTTAAAGCAATACCTCACGTTTGTGCATC
CAATTGTTTTCATATACCGTAACTTATATTATATATTTTTCATATACCGTAACTTAATAT
TATATATATATAGTCAAAATATAGTAAAAAGGATCTACCATTAATGCATTTGAAATCGCG
TATACATGTGTATTCTTATCATACTGAAATGATTTCCGTTAGTCGTATTAAACCAATAGC
GATTCATACAAGCTAAATCTTCTAATCGAAAATTGGGCCAAAGAAAGGATTTTAATTTAA
TTAGGTTTTTTTTATCCTTATCAAGATCTTTCTTTTTATTCAAAACTGTGGTCAAGTTTT
GAATATTTGTATCAAATTTTGAATTTCTATCCCTTGCATTTTTTTTTTTTAAATTGAAAC
AAATTA

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TACAAGGATCCGAATTTAATTATCAACTTCTTAATTCTTAATTTTATAAATTAAAAGTTT
TAATTTCGATCTAAAAAAGGAAGATTTTAAAAATTTATTTATGGATCCGCTCTGAGTGGT
ATCTATATCATTAATTCAATGAATCTCATGTATAAAGATTTAATTTAAAGCAATACCTCA
CGTTTGTGCATCCAATTGTTTTCATATACCGTAACTTATATTATATATTTTTCATATACC
GTAACTTAATATTATATATATATAGTCAAAATATAGTAAAAAGGATCTACCATTAATGCA
TTTGAAATCGCGTATACATGTGTATTCTTATCATACTGAAATGATTTCCGTTAGTCGTAT
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ATTTTAATTTAATTAGGTTTTTTTTATCCTTATCAAGATCTTTCTTTTTATTCAAAACTG
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TTAAATTGAAACAAATTAGAATTCGAAATTCTTTACGTCGTTTAGGGGATAGAATAGTTT
CAGGGACAAAGAAATCATAATTATTTTTTTATAAATATAGCTTTTTTTTTGATCC

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DS 



AS 1 7

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AATCGAAATAAAAACTAAATAAAAACATGTGGGAATAAAACAATTTCTTTCTTTTTTATT
TCCTCTTCATCTTCTGATTTTGTGATTACTCAGTGTCCCTAAGGCTTTCACTGGTGAGCC
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GCTCCGAACCTGCAGTTACTTTCTCCGACGCCACAACCTCCCAATACAAAGCTTTCATAT
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GAAGAATCCTATCCATCTCAATCAACAGATCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCTAATGT
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GACCGTCCGGAGAGACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGCTGCGA
AAGAACCCATGTGTGCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGACTTTTG
ACGACATTAGATTCCAGTAGCTGTCCACTTGCTGTTTCCAAAGTTCCGTGTCTTTCTCAA
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CAGTTTGGTTTCTCTTAGCAGCGATTCTCCAGCACATTCTCTCAACAAGAGCGCTCATCT
CCTTCCATATCCTCAAATCCTCTTCGTCTTGCGCGTAAGCCTCAGGGGAAGAATAAGCGA
AGTAGCCTCCAGGTCTCC


BQ
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20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGGGAATAAAACAATTTCTTTCTTTTTTATTTCCT*TTCATCTTCTGATTTTG**ATTAC
TCAGTGTCCCTAAGGCTTTCACTGGTGAGCCACAGTTTCTTCTGGACGATAAAAACGACA
TTGCTCTCACCATCCTCACTCTCCTGGTCGAGCTCCGAACCTGCAGTTACTTTCTCCGAC
GCCACAACCTCCCAATGCAAAGCTTTCATATACTTCTTGATCGATTCAACAACGCTCTCC
TTATCTCTGATGATGACGAACCCCGTGGGTCGAAGAATCCTATCCATCTCAATCAACAGA
TCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCTAATGTTTGAGAAAACAGTCCACGCGTGCAAGAGA
TCGTACGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCTTCACACCAGTTATGATTAGTTCCGATTAAA
CCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGTGTTGGGACCGTCCGGA

QA 1 522 1 522
DS 

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AATCGAAATAAAAACTACATAAAAACATGGGGGAATAAAACAATTTCTTTCTTTTTTATT
TCCTCTTCATCTTCTGATTTTGTGATTACTCAGTGTCCCTAAGGCTTTCACTGGTGAGCC
ACAGTTTCTTCTGGACGATAAAAACGACATTGCTCTCACCATCTTCGCTCTCCTGGTCGA
GCTCCGAACCTGCAGTTACTTTCTCCGACGCCACAACCTCCCAATACAAAGCTTTCATAT
ACTTCTTGATCGATTCAACGACGCTCTCCTTATCTCTGATGATAACGAACCCCGTGGGTC
TAAGAATCCTATCCATCTCAATCAACAGATCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCTAATGT
CTGAAAAAACAGTCCACGCGTGCAAGAGATCGTATGTTCTAGGGTATGTAGAGAAAGCCT
CACACCAGTTATGATTAGTGCCGATTAAACCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGTGTTAG
GACCGTCGGGAGAGACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGCTGCGA
AAGAACCCATGTGTGCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGACTTTTG
ACGACATT

QA 1 668 1 668
DS 

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AACTAAATAAAAACATGTGGGAATAAAACAATTTCTTTCTTTTTTATTTCCT*TTCATCT
TCTGATTTTG**ATTACTCAGTGTCCCTAAGGCTTTCACTGGTGAGCCACAGTTTCTTCT
GGACGATAAAAACGACATTGCTCTCACCATCCTCACTCTCCTGGTCGAGCTCCGAACCTG
CAGTTACTTTCTCCGACGCCACAACCTCCCAATGCAAAGCTTTCATATACTTCTTGATCG
ATTCAACAACGCTCTCCTTATCTCTGATGATGACGAACCCCGTGGGTCGAAGAATCCTAT
CCATCTCAATCAACAGATCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCTAATGTTTGAGAAAACAG
TCCACGCGTGCAAGAGATCGTACGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCTTCACACCAGTTAT
GATTAGTTCCGATTAAACCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGTGTTGGGACCGTCCGGAG
AGACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGCTGCGAAAGAACCCATGT
GTGCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGACTTTTGACGACATTAGAT
TCCAGTAGCTGTCCACTTGCTGTTTCCAAAGTTCCGTGTCTTTCTCAAACGAATGGGTTG
AATAACCAAAGTCCGCAAGACGGGGAGGA

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DS 

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GAAAAAAAAAGTAATGAATAATTTCAATAATTAATTATATAATGTTGCTTATGTGTTACA
AATCGAAATAAAAACTACATAAAAACATGTGGGAATAAAACAATTTCTTTCTTTTTTATT
TCCTCTTCATCTTCTGATTTTGTGATTACTCAGTGTCCCTAAGGCTTTCACTGGTGAGCC
ACAGTTTCTTCTGGACGATAAAAACGACATTGCTCTCACCATCTTCGCTCTCCTGGTCGA
GCTCCGAACCTGCAGTTACTTTCTCCGACGCCACAACCTCCCAATACAAAGCTTTCATAT
ACTTCTTGATCGATTCAACGACGCTCTCCTTATCTCTGATGATAACGAACCCCGTGGGTC
TAAGAATCCTATCCATCTCAATCAACAGATCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCTAATGT
CTGAAAAAACAGTCCACGCGTGCAAGAGATCGTATGTTCTAGGGTATGTAGAGAAAGCCT
CACACCAGTTATGATTAGTGCCGATTAAACCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGTGTTAG
GACCGTCGGGAGAGACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGCTGCGA
AAGAACCCATGTGTGCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGACTTTTG
ACGACATTAGATTCCAGTAGCTGTCCACTTGCTGTTTCCAAAGTTCCGTGTCTTTCTCAA
ACGTATGGGTTGAATAACCAAAGTCCGCAAGACGGGGAGGAGGAGAAGTCATCCTAGCTG
GCCATGGAGCTAAACCACTTCCCTTCGTCTT

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DS 

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TTATTTCCTCTTCATCTTCTGATTTTGTGATTACTCAGTGTCCCTAAGGCTTTCACTGGT
GAGCCACAGTTTCTTCTGGACGATAAAAACGACATTGCTCTCACCATCTTCGCTCTCCTG
GTCGAGCTCCGAACCTGCAGTTACTTTCTCCGACGCCACAACCTCCCAATACAAAGCTTT
CATATACTTCTTGATCGATTCAACGACGCTCTCCTTATCTCTGATGATAACGAACCCCGT
GGGTCTAAGAATCCTATCCATCTCAATCAACAGATCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCT
AATGTCTGAGAAAACAGTCCACGCGTGCAAGAGATCGTATGTTCTAGGGTATGTAGAGAA
AGCCTCACACCAGTTATGATTAGTGCCGATTAAACCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGT
GTTAGGACCGTCGGGAGAGACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGC
TGCGAAAGAACCCATGTGTGCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGAC
TTTTGACGACATTAGATTCCAGTAGCTGTCCACTTGCTGTTTCCAAAGTTCCGTGTCTTT
CTCAAACGTATGGGTTGAATAACCAAAGTCCGCAAGACGGGGAGGAGGAGAAGTCATCCT
AGCTGGCCATGGAGCTAAACCACTTCCCTTCGTCTTATGGTCGTGTTTGGAGTAAGGAGT
GATGCAAGCTTCCATTGAGACACCATAAACCGCATC
C

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DS 

RD RR4FJ35TF 738 0 0
TATACTTCTTGATCGATTCAACAACGCTCTCCTTATCTCTGATGATGACGAACCCCGTGG
GTCGAAGAATCCTATCCATCTCAATCAACAGATCCTCCGCGCTGCATCCTTTGCTTCTAA
TGTTTGAGAAAACAGTCCACGCGTGCAAGAGATCGTACGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAG
CTTCACACCAGTTATGATTAGTTCCGATTAAACCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGTGT
TGGGACCGTCCGGAGAGACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGCTG
CGAAAGAACCCATGTGTGCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGACTT
TTGACGACATTAGATTCCAGTAGCTGTCCACTTGCTGTTTCCAAAGTTCCGTGTCTTTCT
CAAACGAATGGGTTGAATAACCAAAGTCCGCAAGACGGGGAGGAGGAGAAGTCATCCTAG
CTGGCCATGGAGCTAAACCACTTCCCTTGGTCTTATGGTCGTGCTTGGAGTAAGGAGTGA
TGCAAGCCTCCATTGAGACACCATAAACCGCATCAGGATCAGCATCCGAGCGACAAAGAG
GAGGCTGAGTCCCAGGCTCTCTCTCCAAGTAACAGTCATTACTCAACGGTTTCTGCCAAA
CAACAGTTTGGTTTCTCTTAGCAGCGATTCTCCAGCACATTCTCTCAACAAGAGCGCTCA
TCTCCTTCCATATCCTC
C

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4GZ18TF 789 0 0
ATCGA
TCAACAACGCTCTC**TATCTCTGATGATGACGAACCC*GTGGGTCGAAGAATCCTATCC
ATCTCAATCAACAGATC*TCCGCGCTGCATC*TTTGCTTCTAATGTTTGAGAAAACAGTC
CACGCGTGCAAGAGATCGTACGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCTTCACACCAGTTATGA
TTAGTTCCGATTAAACCGCGGTCGTAGATGAGTTTAAGAGTGTTGGGACCGTCCGGAGAG
ACAACGTTCATAACCCACACGTCTTTGTCTTTGAGAGCAGCTGCGAAAGAACCCATGTGT
GCTTTCATGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTTTGCTTTGACTTTTGACGACATTAGATTC
CAGTAGCTGTCCACTTGCTGTTTCCAAAGTTCCGTGTCTTTCTCAAACGAATGGGTTGAA
TAACCAAAGTCCGCAAGACGGGGAGGAGGAGAAGTCATCCTAGCTGGCCATGGAGCTAAA
CCACTTCCCTTGGTCTTATGGTCGTGCTTGGAGTAAGGAGTGATGCAAGCCTCCATTGAG
ACACCATAAACCGCATCAGGATCAGCATCCGAGCGACAAAGAGGAGGCTGAGTCCCAGGC
TCTCTCTCCAAGTAACAGTCATTACTCAACGGTTTCTGCCAAAAAACAGTTTGGTTTCTC
TTAGCAGCGATTCTCCAGCACATTCTCTCAACAAGAGCGCTCATCTCCTTCCATATCCTC
AAATCCTCTTCGTCTTGCGCGTAAGCCTCAGGGGAAGAATAAGCGAAGTAGCCTCCAGGT
CTCC

QA 6 789 6 789
DS 



AS 1 7

CO CL977Contig1 937 7 9 U
CGAACGTTGGAACTTTATATTTAGAAGTAATGAAATGGTAAATGTAACAAACCCAAAGGC
AAAATCTGGTTCATATACTGATTAAAAAAAAAGACAAAAGTTATTCTGGAAGGTTTACCA
AACACGGGAATATATGTGATAAATCAAACCGATCCTGCACAGGTTGAGCCATGAAAGAGT
CTTCAGGCCACAGATTGAACCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCGGCTGATGATACACGCTTC
ACGAGCACATGTTCTGGATGTGATAGTTTCAGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTG
CCAACATGAAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCTTG
TTGAGTGCTTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAA
ACTGCTTTGCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAA
ATGAGATAAGCTTCCTGTATCTTCGAGCCACCCACTGCCAGGTTAAACCAGGCGGTAGCA
AGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCGTCATATTGCTGCATAACTCCAAGCTGCTTCTCAGCA
TAATCTGTTCTATGCATCTTAATGAATATCTGGACATTCAGCGCATGCAGATCCATAGTC
CCTCCAGCATGAGTGTGCTTCAGAGCTTCACTATAATCTTCCTCATGCATGAAAACAACA
CCAGCAACCAGTCGCAAAGTCGCATTGTTTCCTATTGTTGGATCTGCCAACCACTCCCTC
AAGCTCGAAATCGTTGATTCCTTATTTGCAGGACTCGATAGATACATCGCGAGGAGCTTA
ACTGCCTGCAGTGGAGTAGCGGCGGATTCATCGATCTCGCTGATGACGAGCTGATAGCTA
CCGAGGGCGATGTAAGATCGGAAGACGAGGCAGTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY54JQ U 9
AF RR4EY54TF C 9
AF RR4E552JQ U 2
AF RR4DZ78JQ U 2
AF RR4E207JQ U 1
AF RR4DZ78TF C 151
AF RR4E207TF C 230
BS 1 89 RR4E207JQ
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RD RR4EY54JQ 488 0 0
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GTTCATATACTGATTAAAAAAAAAGACAAAAGTTATTCTGGAAGGTTTACCAAACACGGG
AATATATGTGATAAATCAAACCGATCCTGTACAGGTTGAGCCATGAAAGAGTCTTCAGGC
CACAGATTGAACCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCGGCTGATGATACACGCTTCACGAGCAC
ATGTTCTGGATGTGATAGTTTCAGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTGCCAACATG
AAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCTTGTTGAGTGC
TTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAAACTGCTTT
GCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAAATGAGATA
AGCTTCCT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4EY54TF 488 0 0
GGAACTTTATATTTAGAAGTAATGAAATGGTAAATGTAACAAACCCAAAGGCAAAATCTG
GTTCATATACTGATTAAAAAAAAAGACAAAAGTTATTCTGGAAGGTTTACCAAACACGGG
AATATATGTGATAAATCAAACCGATCCTGTACAGGTTGAGCCATGAAAGAGTCTTCAGGC
CACAGATTGAACCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCGGCTGATGATACACGCTTCACGAGCAC
ATGTTCTGGATGTGATAGTTTCAGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTGCCAACATG
AAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCTTGTTGAGTGC
TTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAAACTGCTTT
GCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAAATGAGATA
AGCTTCCT

QA 1 488 1 488
DS 

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GTACGTT
GGAACTTTATATTTAGAAGTAATGAAATGGTAAATGTAACAAACCCAAAGGCAAAATCTG
GTTCATATACTGATTAAAAAAA*AGACAAAAGTTATTCTGGAAGGTTTACCAAACACGGG
AATATATGTGATAAATCAAACCGATCCTGCACAGGTTGAGCCATGAAAGAGTCTTCAGGC
CACAGATTGAACCGCTCTCTAGAAGTTATCTTAGGCTGATGATACACGCTTCACGAGCAC
ATGTTCTGGATGTGATAGTTTCAGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTGCCAACATG
AAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCTTGTTGAGTGC
TTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAAACTGCTTT
GCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAAATGAGATA
AGCTTCCTGTATCTTCGAGCCACCCACTGCCAGGTTAAACCAGGCGGTAGCAAGTTGAGT
GAGAGTGTGGTCTTCGTCATATTGCTGCATAACTCCAAGCTGCTTCTCAGCATAATCTGT
TCTATGCATCTTAATGAATATCTGGACATTCAGCGCATGCAGATCCATAGTCCCTCCAGC
ATGAGTGTGCTTCAGA

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DS 

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GGACGTT
GGAACTTTATATTTAGAAGTAATGAAATGGTAAATGTAACAAACCCAAAGGCAAAATCTG
GTTCATATACTGATTAAAAAAAAAGACAAAAGTTATTCTGGAAGGTTTACCAAACACGGG
AATATATGTGATAAATCAAACCGATCCTGCACAGGTTGAGCCATGAAAGAGTCTTCAGGC
CACAGATTGAACCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCGGCTGATGATACACGCTTCACGAGCAC
ATGTTCTGGATGTGATAGTTTCAGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTGCCAACATG
AAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCCTGTTGAGTGC
TTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAAACTGCTTT
GCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAAATGAGATA
AGCTTCCTGTATCTTCGAGCCACCCACTGCCAGGTTAAACCAGGCGGTAGCAAGTTGAGT
GAGAGTGTGGTCTTCGTCATATTGCTGCATAACTCCAAGCTGCTTCTCAGCATAATCTGT
TCTATGCATCTTAATGAATATCTGGACATTCAGCGCATGCAGATCCATAGTCCCTCCAGC
ATGAGTGTGCTTCAGAGCTTCACTATAATCTTCCTCATGCATGAAAACAACACCAGCAAC
CAGTCGCAAAGTCGCATT

QA 8 745 8 745
DS 

RD RR4E207JQ 789 0 0
CGAACGTTGGAACTTTATATTTAGAAGTAATGAAATGGTAAATGTAACAAACCCAAAGGC
AAAATCTGGTTCATATACTGATTAAAAAA**AGACAAAAGTTATTCTGGAAGGTTTACCA
AACACGGGAATATATGTGATAAATCAAACCGATCCTGCACAGGTTGAGCCATGAAAGAGT
CTTCAGGCCACAGATTGAACCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCGGCTGATGATACACGCTTC
ACGAGCACATGTTCTGGATGTGATAGTTTCAGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTG
CCAACATGAAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCTTG
TTGAGTGCTTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAA
ACTGCTTTGCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAA
ATGAGATAAGCTTCCTGTATCTTCGAGCCACCCACTGCCAGGTTAAACCAGGCGGTAGCA
AGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCGTCATATTGCTGCATAACTC*AAGCTGCTTCTCAGCA
TAATCTGTTCTATGCATCTTAATGAATATCTGGACATTCAGCACATGCAGATCCATAGTC
CCTCCAGCATGAGTGTGCTTCAGAGCTTCACTATAATCTTCCTCATGCATGAAAACAACA
CCAGCAACCAGTCGCAAAGTCGCATTGTTTCCTATTGTTGGATCTGCCAACCACTCCCTC
AAGCTCGAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4DZ78TF 759 0 0
GATCCTGCACAGGT*GAGCCATGAAAGAGTCT*CAGGCCACAGAT*GAACCGCTCTCTCG
AAGT*ATCT*CGGCTGATGATACACGCTTCACGAGCACATGTTCTGGATGTGATAGTTTC
AGCTGGCTTAAGTAACGTGAAGATGATTTGCCAACATGAAGACTGCAGACGACAAGGTTT
GCAAGAGTTTCTGGGTCCTTAGCATCCCTGTTGAGTGCTTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCT
TCATCAAAGTTACCCATTTGCATACAGCAAACTGCTTTGCCATTCAAGATCAAGCATGTC
ATGGGATACTTCTCACAGAAATCCTGGAAAATGAGATAAGCTTCCTGTATCTTCGAGCCA
CCCACTGCCAGGTTAAACCAGGCGGTAGCAAGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCGTCATAT
TGCTGCATAACTCCAAGCTGCTTCTCAGCATAATCTGTTCTATGCATCTTAATGAATATC
TGGACATTCAGCGCATGCAGATCCATAGTCCCTCCAGCATGAGTGTGCTTCAGAGCTTCA
CTATAATCTTCCTCATGCATGAAAACAACACCAGCAACCAGTCGCAAAGTCGCATTGTTT
CCTATTGTTGGATCTGCCAACCACTCCCTCAAGCTCGAAATCGTTGATTCCTTATTTGCA
GGACTCGATAGATACATCGCGAGGAGCTTAACTGCCTGCAGTGGAGTAGCGGCGGATTCA
TCGATCTCGCTGATGACGAGCTGATAGCTACCGAGGGC
C

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4E207TF 708 0 0
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AAGATGATTTGCCAACATGAAGACTGCAGACGACAAGGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTC*T
TAGCATC*TTGTTGAGTGCTTCAAGGAGCAGTGTTTCAGCTTCATCAAAGTTACCCATTT
GCATACAGCAAACTGCTTTGCCATTCAAGATCAAGCATGTCATGGGATACTTCTCACAGA
AATCCTGGAAAATGAGATAAGCTTCCTGTATCTTCGAGCCACCCACTGCCAGGTTAAACC
AGGCGGTAGCAAGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCGTCATATTGCTGCATAACTC*AAGCT
GCTTCTCAGCATAATCTGTTCTATGCATCTTAATGAATATCTGGACATTCAGCACATGCA
GATCCATAGTCCCTCCAGCATGAGTGTGCTTCAGAGCTTCACTATAATCTTCCTCATGCA
TGAAAACAACACCAGCAACCAGTCGCAAAGTCGCATTGTTTCCTATTGTTGGATCTGCCA
ACCACTCCCTCAAGCTCGAAATCGTTGATTCCTTATTTGCAGGACTCGATAGATACATCG
CGAGGAGCTTAACTGCCTGCAGTGGAGTAGCGGCGGATTCATCGATCTCGCTGATGACGA
GCTGATAGCTACCGAGGGCGATGTAAGATCGGAAGACGAGGCAGTCGC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 7

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GGGATAAGGTCTCTGTCTTCTGTAAAAAAGCAGGAGTGTGAAGAAGCAACTCTCTGTTTT
CTCTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATT
CTTCTAGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAACTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGCAGAGAA
GACGTTCTCTTCGGTCAGGAGATGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCC
CTCCTTATCCTCTTGATGCTTTGGAACCATATATGAGTCAAAGAACACTAGAAGTGCATT
GGGGTAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTAAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATA
GACTCTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTT
TACCTGAGTTCAACAACGCTGCCCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGC
AACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTG
GGTCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTTACTAATGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTG
GCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCTCAA
ACGCCATTAACCCACTAGTGTGGGATGATATTCCAATCATCAGCTTGGATGTGTGGGAGC
ACTCTTATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTCTGAACC
ATTTGGTGTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGAACC
TTGGTGAACCCAACATCCCAGTTGCCTAAGCTAATAAAAGAAGAACTCTTTCTCGAGAGT
CCATGTGAAAGCGTATCGTGGACAGCTTGAGCAGTCTCATTTTTGCAACAGGGGTCCCAA
ACAAGAAACAATTTCTGCTTCCTCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGA
GAGTCTAATATGACATAGACTTGTTTGTTTGTTGTATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTT
AAAATTGCTGCACATCACAATCTCTTATTACTCGCGGCCTTCCATATAGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H691TF U 3
AF RR4DH36TF U 1
AF RR4CU01TF U 63
AF RR4DH41TF U 64
AF RR4DH41JQ C 284
AF RR4CU01JQ C 351
AF RR4H691JQB C 543
BS 1 680 RR4DH36TF
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BS 1090 1130 RR4H691JQB

RD RR4H691TF 503 0 0
GGG
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ACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATTCTTCT
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TATCCTCTTGATGCTTTGGAACCATATATGAGTCAAAGAACACTAGAAGTGCATTGGGGT
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GGTGGTGGAGACATGCCTCA

QA 4 503 4 503
DS 

RD RR4DH36TF 731 0 0
GGGATAAGGTCTCTGTCTTCTGTAAAAAAGCAGGAGTGTGAAGAAGCAACTCTCTGTTTT
CTCTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATT
CTTCTAGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAACTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGCAGAGAA
GACGTTCTCTTCGGTCAGGAGATGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCC
CTCCTTATCCTCTTGATGCTTTGGAACCATATATGAGTCAAAGAACACTAGAAGTGCATT
GGGGTAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTAAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATA
GACTCTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTT
TACCTGAGTTCAACAACGCTGCCCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGC
AACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTG
GGTCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTTACTAATGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTG
GCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCTCAA
ACGCCATTAACCCACTAGTG***GATGATATTCCAATCATCAGCTTGGATGTGTGGGAGC
ACTCTTATTAT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4CU01TF 749 0 0
GGA
ACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATTCTTCT
AGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAACTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGCAGAGAAGACGT
TCTCTTCGGTCAGGAGATGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCCCTCCT
TATCCTCTTGATGCTTTGGAACCATATATGAGTCAAAGAACACTAGAAGTGCATTGGGGT
AAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTAAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATAGACTC
TATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTACCT
GAGTTCAGCAACGCTGCCCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACCT
GGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTCG
TTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTTACTAATGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTGG
GTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCTCAAGCGCC
ATTAACCCACTAGTGTGGGATGATATTCCAATCATCAGCTTGGATGTGTGGGAGCACTCT
TATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTCTGAACCATTTG
GTGTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAG

QA 4 749 4 749
DS 

RD RR4DH41TF 776 0 0
GG
ACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATTCTTCT
AGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAACTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCGGCAGAGAAGACGT
TCTCTTCGGTCAGGAGATGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCCCTCCT
TATCCTCTTGATGCTTTGGAACCATATATGAGTCAAAGAACACTGGAAGTGCATTGGGGT
AAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTAAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATAGACTC
TATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTACCT
GAGTTCAACAACGCTGCCCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACCT
GGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTCG
TTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTTACTAATGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTGG
GTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCTCAAACGCC
ATTAACCCACTAGTGTGGGATGATATTCCAATCATCAGCTTGGATGTGTGGGAGCACTCT
TATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGTGCTAG*TACATAAACACGTTTCTGA*CCATTTG
GTGTCGTG*AACGCTGCA*TGAGTAGGATGGCC*GTGCTGAGGCGTTTGTGA
CC

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR4DH41JQ 791 0 0
AACACTGGAAGTGCATTGGGGTAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTAAATAAACA
GTTAGGGAAAGACGATAGACTCTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATA
CAACAACGGCAATCCTTTACCTGAGTTCAACAACGCTGCCCAGGTCTATAACCATGATTT
CTTCTGGGAGTCGATGCAACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCA
GATTGAGAAAGATTTTGGGTCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTTACTAATGCAGCTCT
TACTCAGTTTGGTTCTGGCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGA
AGTGGTCAAAACCTCAAACGCCATTAACCCACTAGTGTGGGATGATATTCCAATCATCAG
CTTGGATGTGTGGGAGCACTCTTATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGTGCTAGGTACAT
AAACACGTTTCTGAACCATTTGGTGTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAGGATGGCCCGTGC
TGAGGCGTTTGTGAACCTTGGTGAACCCAACATCCCAGTTGCCTAAGCTAATAAAAGAAG
AACTCTTTCTCGAGAGTCCATGTGAAAGCGTATCGTGGACAGCTTGAGCAGTCTCATTTT
TGCAACAGGGGTCCCAAACAAGAAACAATTTCTGCTTCCTCCCTCATGTGACCCATCTTT
TTGTCATGTGTAGTTGAGAGTCTAATATGACATAGACTTGTTTGTTTGTTGTATACCAAA
ACGATTTTGC
C

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4CU01JQ 743 0 0
AAAGACGATAGACTCTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAAC
GGCAATCCTTTACCTGAGTTCAGCAACGCTGCCCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGG
GAGTCGATGCAACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAG
AAAGATTTTGGGTCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTTACTAATGCAGCTCTTACTCAG
TTTGGTTCTGGCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTC
AAAACCTCAAGCGCCATTAACCCACTAGTGTGGGATGATATTCCAATCATCAGCTTGGAT
GTGTGGGAGCACTCTTATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACG
TTTTTGAACCATTTGGTGTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCG
TTTGTGAACCTTGGTGAACCCAACATCCCAGTTGCCTAAGCTAATAAAAGAAGAACTCTT
TCTCGAGAGTCCATGTGAAAGCGTATCGTGGACAGCTTGAGCAGTTTCATTTTTGCAACA
GGGGTCCCAAACAAGAAACAATTTCTGCTTCCTCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCAT
GTGTAGTTGAGAGTCTAATATGACATAGACTTGTTTGTTTGTTGTATACCAAAACGATTT
TGCTAGTGTTAAAATTGCT
ACAC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4H691JQB 588 0 0
TCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTT*ACTAATGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGC
TGGGTCTGGCTTGTTTTGAGGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCTCAAAC
GCCATTAACCCACTAGTGTGGGATGATATTCCAATCATCAGCTTGGATGTGTGGGAGCAC
TCTTATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTTTGAACCAT
TTGGTGTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGAACCTT
GGTGAACCCAACATCCCAGTTGCCTAAGCTAATAAAAGAAGAACTCTTTCTCGAGAGTCC
ATGTGAAAGCGTATCGTGGACAGCTTGAGCAGTCTCATTTTTGCAACAGGGGTCCCAAAC
AAGAAACAATTTCTGCTTCCTCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGAGA
GTCTAATATGACATAGACTTGTTTGTTTGTTGTATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTTAA
AATTGCTGCACATCACAATCTCTTATTACTCGCGGCCTTCCATATAGT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 7

CO CL979Contig1 872 7 22 U
GGGGGAAACGGAAGCGGAAGCGAGAGGTCGAGTTCGAGAGGGAGAGAGAGATGTCTTATT
ACTCGAGGAGAACCACACGCAGCTCTGTAAAACAAAGGCTCCAGTATATACAAGTTATCC
AAGATTTGCAGGAGGAGATCAAGTTGTTACAGATTTCAAACGAGAAACTGAATGGTGTGG
GTCTAGACGATCTGAGCTACACCGAGCTGGCTTCGCTTAAAAGTATGTTAAACGAGGGCA
TCCCCAATCTGTAAGAACACACGGATAAGGCATTCGAGGAGTTATCAGTCAAGCAGGTTG
TTGAGTGCGATGTTATGGGATGGGATTGGCTTAACCAAAAAGAGAAAGATGACCTGGCCT
ACCAATCTCTTCAGGCTAAGAGAAGAAGAGAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCC
TCAGCCCTCCTCAAAAAA*GCCAACAGCAGTATAGCTACAACCCTGAAAGACTGATGTTA
GACATCGACTCTTTGAAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATT
GGTAAAGAGCTCGACGGTATGGGTTACTTTGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGAGGTACTG
CAAGGTTTGATGAATGCCACGAGGAAGATAGAACGTGCATGGCTGGTCAACAAAGAGCCA
ATCTCCCCGGGGACAGATATGATGGTGACTTTATAGGTGGGCAGGTTCTTTGGCTCGGTG
ACATTAAGAGAGAGTGAGATGGAATCGTTTTTTCTCTTTTTTTTTTAAAATAAAAAGAGT
CTTTGTGAGACTATCTACTTGAAAGATAATTTTATTGTTTTCCTGACTTTGTGTTTTGTC
TCTCTCTGGTTATATATATATGGTTAAGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H586TF U 10
AF RR4G294TF U 20
AF RR4BT94TF U 1
AF RR4E873TF U 11
AF RR4DR31TF U 11
AF RR4DR31JQ C 215
AF RR4E873JQ C 390
BS 1 97 RR4BT94TF
BS 98 98 RR4H586TF
BS 99 165 RR4BT94TF
BS 166 166 RR4H586TF
BS 167 251 RR4BT94TF
BS 252 252 RR4DR31TF
BS 253 293 RR4BT94TF
BS 294 294 RR4H586TF
BS 295 506 RR4BT94TF
BS 507 507 RR4H586TF
BS 508 598 RR4BT94TF
BS 599 599 RR4DR31TF
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BS 655 700 RR4BT94TF
BS 701 701 RR4DR31JQ
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BS 766 872 RR4DR31JQ

RD RR4H586TF 584 0 0
GGAA
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CACACGCAGCTCTGTAAAACAAAGGCTCCAGTATATACAAGTTATCCAAGATTTGCAGGA
GGAGATCAAGTTGTTACAGATTTCAAACGAGAAACTGAATGGTGTGGGTCTAGACGATCT
GAGCTACACCGAGCTGGCTTCGCTTAAAAGTATGTTAAACGAGGGCATCCCCAATCTGGA
AGAACACACGGATAAGGCATTCGAGGAGTTATCAGTCAAGCAGGTTGTTGAGTGCGATGT
TATGGGATGGGATTGGCTTAACCAAAAAGAGAAAGATGACCTGGCCTACCAATCTCTTCA
GACTAAGAGAAGAAGAGAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTCA
AAAAAAGCCAACAGCAGTATATCTACAACCCTGAAAGACTGATTTTAGACATCGGCTCTT
TGAAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTCG
ACGGTATGGGTTACTTTGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGA

QA 5 584 5 584
DS 

RD RR4G294TF 575 0 0
GG
GAGAGGTCGAGTTCGAGAGGGAGAGAGAGATGTCTTATTACTCGAGGAGAACCACACGCA
GCTCTGTAAAACAAAGGCTCCAGTATATACAAGTTATCCAAGATTTGCAGGAGGGGATCA
AGTTGTTACAGATTTCAAACGAGAAACTGAATGGTGTGGGTCTAGACGATCTGAGCTACA
CCGAGCTGGCTTCGCTTAAAAGTATGTTAAACGATGGCATCCCCAATCTGGAAGAACACA
CGGATAAGGCATTCGAGGAGTTATCAGTCAAGCAGGTTGTTGAGTGCGATGTTATGGGAT
GGGATTGGCTTAACCAAAAAGAGGAAGATGACCTGGCCTACCAATCTCTTCAGGCTAAGA
GAAGAAGAGAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTCAAAAAA*GC
CAACAGCAGTATAGCTACAACCCTGGAAGACTGATGTTAGACATCGACTCTTTGAAGATC
GAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTCGACGGTATG
GGTTACTTTGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGAG

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR4BT94TF 700 0 0
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ACTCGAGGAGAACCACACGCAGCTCTGTAAAACAAAGACTCCAGTATATACAAGTTATCC
AAGATTTGCAGGAGGAGATCAAGTTGTTACAGATTTCAAACGAGAGACTGAATGGTGTGG
GTCTAGACGATCTGAGCTACACCGAGCTGGCTTCGCTTAAAAGTATGTTAAACGAGGGCA
TCCCCAATCTGGAAGAACACACGGATAAGGCATTCGAGGAGTTATCAGTCAAGTAGGTTG
TTGAGTGCGATGTTATGGGATGGGATTGGCTTAACCAAAAAGAGAAAGATGACCTGGCCT
ACCAATCTCTTCAGGCTAAGAGAAGAAGAGAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCC
TCAGCCCTCCTCAAAAAA*GCCAACAGCAGTATAGCTACAACCCTGAAAGACTGATGTTA
GACATCGACTCTTTGAAGATCGAGAAGGAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATT
GGTAAAGAGCTCGACGGTATGGGTTACTTTGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGAGGTACCG
CAAGGTTTGATGAATGCCACGAGGAAGATAGAACGTGCATGGCTGGTCAACAA*GAGCCA
ATCTCCCCGGGGACAGATATGATGGTGACTTTATAGGTGG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4E873TF 690 0 0
GAG
GCGGAAGCGAGAGGTCGAGTTCGAGAGGGAGAGAGAGATGTCTTATTACTCGAGGAGAAC
CACACGCAGCTCTGTAAAACAAAGGCTCCAGTATATACAAGTTATCCAAGATTTGCAGGA
GGAGATCAAGTTGTTACAGATTTCAAACGAGAAACTGAATGGTGTGGGTCTAGACGATCT
GAGCTACACCGAGCTGGCTTCGCTTAAAAGTATGTTAAACGAGGGCATCCCCAATCTGTA
AGAACACACGGATAAGGCATTCGAGGAGTTATCAGTCAAGCAGGTTGTTGAGTGCGATGT
TATGGGATGGGATTGGCTTAACCAAAAAGAGAAAGATGACCTGGCCTACCAATCTCTTCA
GGCTAAGAGAAGAAGAGAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTCA
AAAAA*GCCAACAGCAGTATAGCTACAACCCTGAAAGACTGATGTTAGACATCGACTCTT
TGAAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTCG
ACGGTATGGGTTACTTTGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGAGGTACTGCAAGGTTTGATGA
ATGCCACGAGGAAGATAGAACGTGCATGGCTGGTCAACAAAGAGCCAATCTCCCCGGGGA
CAGATATGATGGTGACTTTATAGGTGG

QA 4 690 4 690
DS 

RD RR4DR31TF 764 0 0
GAG
GCGGAAGCGAGAGGTCGAGTTCGAGAGGGAGAGAGAGATGTCTTATTACTCGAGGAGAAC
CACACGCAGCTCTGTAAAACAAAGGCTCCAGTATATACAAGTTATCCAAGATTTGCAGGA
GGAGATCAAGTTGTTACAGATTTCAAACGAGAAACTGAATGGTGTGGGTCTAGACGATCT
GAGCTACACCGAGCTGGCTTCGCTTAAAAGTATGTTAAACGAGGGCATCCCCAATCTGTA
AGAACACACGGATAAGGCATTCGAGGAGTTATCAGTCAAGCAGGTTGTTGAGTGCGATGT
TATGGGATGGGATTGGCTTAACCAAAAAGAGAAAGATGACCTGGCCTACCAATCTCTTCA
GGCTAAGAGAAGAAGAGAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTCA
AAAAA*GCCAACAGCAGTATAGCTACAACCCTGAAAGACTGATGTTAGACATCGACTCTT
TGAAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTCG
ACGGTATGGGTTACTTTGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGAGGTACTGCAAGGTTTGATGA
ATGCCACGAGGAAGATAGAACGTGCATGGCTGGTCAACAAAGAGCCAATCTCCCCGGGGA
CAGATATGATGGTGACTTTATAGTGGG*CAG*TTCTTTGGCTCGGTGACAT*AAGAGAGA
GTGAGATGGAATCGTTTTTTCTCTTTTTTTTT
AAATAAAAA

QA 4 755 4 755
DS 

RD RR4DR31JQ 658 0 0
GCTTAAAAGTATGTTAAACGAGGGCATCCCCAATCTGTAAGAACACACGGATAAGGCATT
CGAGGAGTTATCAGTCAAGCAGGTTGTTGAGTGCGATGTTATGGGATGGGATTGGCTTAA
CCAAAAAGAGAAAGATGACCTGGCCTACCAATCTCTTCAGGCTAAGAGAAGAAGAGAATT
AAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTCAAAAAA*GCCAACAGCAGTATA
GCTACAACCCTGAAAGACTGATGTTAGACATCGACTCTTTGAAGATCGAGAAAGAGAGAC
TACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTCGACGGTATGGGTTACTTTGAAG
CGTTGGTGTTTAAAGCTGAGGTACTGCAAGGTTTGATGAATGCCACGAGGAAGATAGAAC
GTGCATGGCTGGTCAACAAGGAGCCAATCTCCCCGGGGACAGATATGATGGTGACTTTAT
AGGTGGGCAGGTTCTTTGGCTCGGTGACATTAAGAGAGAGTGAGATGGAATCGTTTTTTC
TCTTTTTTTTTTAAAATAAAAAGAGTCTTTGTGAGACTATCTACTTGAAAGATAATTTTA
TTGTTTTCCTGACTTTGTGTTTTGTCTCTCTCTGGTTATATATATATGGTTAAGCTAC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4E873JQ 483 0 0
GAATTAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTCAAAAAA*GCCAACAGCA
GTATAGCTACAACCCTGAAAGACTGATGTTAGACATCGACTCTTTGAAGATCGAGAAAGA
GAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTCGACGGTATGGGTTACTT
TGAAGCGTTGGTGTTTAAAGCTGAGGTACTGCAAGGTTTGATGAATGCCACGAGGAAGAT
AGAACGTGCATGGCTGGTCAACAAGGAGCCAATCTCCCCGGGGACAGATATGATGGTGAC
TTTATAGGTGGGCAGGTTCTTTGGCTCGGTGACATTAAGAGAGAGTGAGATGGAATCGTT
TTTTCTCTTTTTTTTTTAAAATAAAAAGAGTCTTTGTGAGACTATCTACTTGAAAGATAA
TTTTATTGTTTTCCTGACTTTGTGTTTTGTCTCTCTCTGGTTATATATATATGGTTAAGC
TAC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 7

CO CL980Contig1 1269 7 30 U
GACTCCTCGCCTTAATCCTGAAGAGTCAGAGATTCTTTGGTTTCGCTTTCTTGACACTTT
CTCAGAGCCTTTAATGGATTCATATCGGGAACCAAGGAATGTCGGTGAAATAAACAAAGT
CCCCGCCAGTGTTAAATCATTGGAACTACGTGTAGATGAAGCAGTTGAAACAATCAAGTG
GAGGATTCCACGATCTGATACGGCTTTGACACAGATCCTAAGGAAGCTCATGTCTCAGTT
TATCAAAGAGATTGTTGAAGGAATGATAGGGTACGTTCGTCTTCCAACAATCATGTCAAA
ACTTCTTTCTGACAACGGTACTCAAGAGTTTGGTGATTTCAAACTTACAATACTGGGAAT
GCTTGGAACATATGGGTTTGAGCGGAGAATACTGGATACGGCAAAGTCTTTAATCGAAGA
GGATACATTCTACACCATGAGTCTACTCAAGAAAGGTGCTTCTCACGGGTATGCACCAAG
AAGTTTGCTTTGTTGTATTATGCAATTGTCCACTCACCAAGACGTTCTCTACTCTTCGTG
TACGTGTTTTCAACTGTGGCCATGCAACACATCTGCAATGTGAAGTGTCGGAGAGTGAAA
CGTCATCATCTTCATCAGGTTGTCCTGTTTGTATGACCAAGAAGACCACTCAAAGTTCAT
CTAAAGGTAAATCATTCTATCTAGACTACGGACTGATAAGCACAGTTTCTTCAAGCACGG
GAACTTCACAACGCACTTCGCCTTACTCTTATGAGAATGAAATGATCGATCATTCTCATA
GCCAGCAAATATCACGATTTGAAATGCTAACGAAGCTACAGAAAGATCAGAGACTGGTAC
AGATAGAGAGCTTGCCTCGACTAAGGCTTTCACCTCCGGCTGTGTACCACGAGAAAGTGA
GCAGAGTCTCGGGTTTTACACCGGGAGAGAGCAGCGGTAAAGACACGAAACCATCCCAAA
GTGGAGTGAGTAAGAAAATGAAAGCGAAAGGATCTATCTTTCGGCCAAGACTTGCTTTTG
GAAAGGACAAGACGAGCAGAAGATAAGGAAGCTTCTTACAGTTTGATATCTGAAACCGGT
GCGGCCTAGTGACAACAAACTTGATTGGTATGAAGGACTCGAGACTCGAGAGTTGTTATG
TGGCGAGACTTTTTTGTTTGTTCTGTTGTGTAATTAGAAGAAAAATTTAGTTTAAGGTAC
TTTATTTGACTTCTTGATATATTGTATAGTACCAAGATTAATAAAATTTACAAAATACTC
TTGTGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 

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AF RR4C707TF U 598
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AGGGTACGTTCGTCTTCCAACAATCATGTCAAAACTTCTTTCTGACAACGGTACTCAAGA
GTTTGGTGATTTCAAACTTACAATACTGGGAATGCTTGGAACATATGGGTTTGAGCGGAG
AATACTGGATACGGCAAAGTCTTTAATCGAAGAGGATACATTCTACACCATGAGTCTACT
CAAGAAAGGTGCTTCTCACGGGTATGCACCAAGAAGTTTGCTTTGTTGTAT*ATGCAATT
GTCCACTCACCAAGACGTTCTCTACTCTTCGTGTACGTGTTTTCAACTGTGGCCATGCAA
CACATCTGCAATGTGAAGTGTCGGAGAGTGAAACGTCATCATCTTCATCAGGTTGTCCTG
TTTGTATGACCAAGAAGACCACTCAAAGTTCATCTAAAGGTAAATCATTCTATCTAGACT
ACGGACTGATAAGCACAGTTTCTTCAAGCACGGGAACTTCACAACGCACTTCGCCTTACT
CTTATGAGAATGAAATGATCGATCATTCTCAT

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DS 

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CCTCGCCAGTGTTAAATCATTGGAACTACGTGTAGATGAAGCAGTTGAAACAATCAAGTG
GAGGATTCCACGATCTGATACGGCTTTGACACAGATCCTAAGGAAGCTCATGTCTCAGTT
TATCAAAGATATTGTTGAAGGAATGATAGGGTACGTTCGTCTTCCAACAATCATGTCAAA
ACTTCTTTCTGACAACGGTACTCAAGAGTTTGGTGATTTCAAACTTACAATACTGGGAAT
GCTTGGAACATATGGGTTTGAGCGGAGAATACTGGATACGGCAAAGTCTTTAATCGAAGA
GGATACATTCTACACCATGAGTCTACTCAAGAAAGGTGCTTCTCACGGGTATGCACCAAG
AAGTTTGCTTTGTTGTTTTATGCAATTGTCCACTCACCAAGACGTTCTCTACTCTTCGTG
TACGTGTTTTCAACTGTGGCCATGCAACACATCTGCAATGTGAAGTGTCGGAGAGTGAAA
CGTCATCATCTTCATCAGGTTGTCCTGTTTGT*TGACCAAGAAGACCACTCAAAGTTCAT
CTAAAGGTAAATCATTCTATCTAGACTACGGACTGATAAGCACAGTTTCTTCAAGCACGG
GAACTTCACAACGCACTTCGCCTTACTCTTATGAGAATGAA*TGATCGATCATTCTCATA
GC*AGCAAATATCA

QA 1 794 1 794
DS 

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G
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ACTGGGAATGCTTGGAACATATGGGTTTGAGCGGAGAATACTGGATACGGCAAAGTCTTT
AATCGAAGAGGATACATTCTACACCATGAGTCTACTCAAGAAAGGTGCTTCTCACGGGTA
TGCACCAAGAAGTTTGCTTTGTTGTAT*ATGCAATTGTCCACTCACCAAGACGTTCTCTA
CTCTTCGTGTACGTGTTTTCAACTGTGGCCATGCAACACATCTGCAATGTGAAGTGTCGG
AGAGCGAAACGTCATCATCTTCATCAGGTTGTCCTGTTTGTATGACCAAGAAGACCACTC
AAAGTTCATCTAAAGGTAAATCATTCTATCTAGACTACGGACTGATAAGCACAGTTTCTT
CAAGCACGGGAACTTCACAACGCACTTCGCCTTACTCTTATGAGAATGAAATTATCGATC
ATTCTCATAGCCAGCAAATATCACGATTTGAAATGCTAACGAAGCTACAGAAAGATCAGA
GACTGGTACAGATAGAGAGCTTGCCTCGACTAAGGCTTTCACCTCCGGCTGTGTACCACG
AGAAAGTGAGCAGAGTCTCGGGTTTTACACCGGGAGAGAGCAGCGGTAAAGACACGAAAC
CATCCCAAAGTGGAGTGAGTAAGAAAATGAA*GCGAAAG*ATCTATCTTTCGGC*AAGAC
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GAA
CCGTGCG

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DS 

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TATCACGATTTGAAATGCTAACGAAGCTACAGAAAGATCAGAGACTGGTACAGATAGAGA
GCTTGCCTCGACTAAGGCTTTCACCTCCGGCTGTGTACCACGAGAAAGTGAGCAGAGTCT
CGGGTTTTACACCGGGAGAGAGCAGCGGTAAAGACACGAAACCATCCCAAAGTGGAGTGA
GTAAGAAAATGAAAGCGAAAGGATCTATCTTTCGGCCAAGACTTGCTTTTGGAAAGGACA
AGACGAGCAGAAGATAAGGAAGCTTCTTACAGTTTGATATCTGAAACCGGTGCGGCCTAG
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TTTTTTGTTTGTTCTGTTGTGTAATTAGAAGAAAAATTTAGTTTAAGGTACTTTATTTGA
CTTCTTGATATATTGTATAGTACCAAGATTAATAAAATTTAC

QA 1 642 1 642
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RD RR4GN19JQ 776 0 0
TTGTTT
TATGCAATTGTCCACTCACCAAGACGTTCTCTACTCTTCGTGTACGTGTTTTCAACTGTG
GCCATGCAACACATCTGCAATGTGAAGTGTCGGAGAGTGAAACGTCATCATCTTCATCAG
GTTGTCCTGTTTGT*TGACCAAGAAGACCACTCAAAGTTCATCTAAAGGTAAATCATTCT
ATCTAGACTACGGACTGATAAGCACAGTTTCTTCAAGCACGGGAACTTCACAACGCACTT
CGCCTTACTCTTATGAGAATGAAATGATCGATCATTCTCATAGCCAGCAAATATCACGAT
TTGAAATGCTAACGGAGCTACAGAAAGATCAGAGACTGGTACAGATAGAGAGCTTGCCTC
GACTAAGGCTTTCACCTCCGGCTGTGTACCACGAGAAAGTGAGCAGAGTCTCGGGTTTTA
CACCGGGAGAGAGCAGCGGTAAAGACACGAAACCATCCCAAAGTGGAGTGAGTAAGAAAA
TGAAAGCGAAAGGATCTATCTTTCGGCCAAGACTTGCTTTTGGAAAGGACAAGACGATCA
GAAGATAAGGAAGCTTCTTACAGTTTGATATCTGAAACCGGTGCGGCCTAGTGACAACAA
ACTTGATTGGTATGAAGGACTCGAGACTCGAGAGTTGTTATGTGGCGAGACTTTTTTGTT
TGTTCTGTTGTGTAATTAGAAGAAAAATTTAGTTTAAAGTACTTTATTTGACTTCTTGAT
ATATTGTATAGTACCAAGATTAATAAAATTTACAAAATACTCTTGTGTTC

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DS 

RD RR4C707JQ 691 0 0
G
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AGAAGACCACTCAAAGTTCATCTAAAGGTAAATCATTCTATCTAGACTACGGACTGATAA
GCACAGTTTCTTCAAGCACGGGAACTTCACAACGCACTTCGCCTTACTCTTATGAGAATG
AAATGATCGATCATTTTCATAGCCAGCAAATATCACGATTTGAAATGCTAACGAAGCTAC
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CTGTGTACCACGAGAAAGTGAGCAGAGTCTCGGGTTTTACACCGGGAGAGAGCAGCGGTA
AAGACACGAAACCATCCCAAAGTGGAGTGAGTAAGAAAATGAAAGCGAAAGGATCTATCT
TTCGGCCAAGACTTGCTTTTGGAAAGGACAAGACGAGCAGAAGATAAGGAAGCTTCTTAC
AGTTTGATATCTGAAACCGGTGCGGCCTAGTGACAACAAACTTGATTGGTATGAAGGACT
CGAGACTCGAGAGTTGTTATGTGGCGAGACTTTTTTGTTTGTTCTGTTGTGTAATTAGAA
GAAAAATTTAGTTTAAGGTACTTTATTTGACTTCTTGATATATTGTATAGTACCAAGATT
AATAAAATTTACAAAATACTCTTGTGTTCT

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DS 

RD RR4C707TF 672 0 0
AAACGTCATCATCTTCATCAGGTTGTCCTGTTTGTATGACCAAGAAGACCACTCAAAGTT
CATCTAAAGGTAAATCATTCTATCTAGACTACGGACTGATAAGCACAGTTTCTTCAAGCA
CGGGAACTTCACAACGCACTTCGCCTTACTCTTATGAGAATGAAATGATCGATCATTCTC
ATAGCCAGCAAATATCACGATTTGAAATGCTAACGAAGCTACAGAAAGATCAGAGACTGG
TACAGATAGAGAGCTTGCCTCGACTAAGGCTTTCACCTCCGGCTGTGTACCACGAGAAAG
TGAGCAGAGTCTCGGGTTTTACACCGGGAGAGAGCAGCGGTAAAGACACGAAACCATCCC
AAAGTGGAGTGAGTAAGAAAATGAAAGCGAAAGGATCTATCTTTCGGCCAAGACTTGCTT
TTGGAAAGGACAAGACGAGCAGAAGATAAGGAAGCTTCTTACAGTTTGATATCTGAAACC
GGTGCGGCCTAGTGACAACAAACTTGATTGGTATGAAGGACTCGAGACTCGAGAGTTGTT
ATGTGGCGAGACTTTTTTGTTTGTTCTGTTGTGTAATTAGAAGAAAAATTTAGTTTAAGG
TACTTTATTTGACTTCTTGATATATTGTATAGTACCAAGATTAATAAAATTTACAAAATA
CTCTTGTGTTC
T

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 5

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CAGATGCCTTAAACACTTCCACTAAACACAGTCTTATTAAAGAAGAAGAACGATTTGATG
AAGAAACATTGAGCTTACAAGCAGAGAGGATCGTGTACTCCGTTGCATTCCCTATGGTTC
TCAAAACCGCCTTGGAACTTGGCGTTATTGACGCGATCGTAGCTGCAGAAGGTGTATGGC
TCTCGGCTTCTGATATTGCACTTCGTCTCCCAACAAAACCCACCAACCCGGAGGCACCGG
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TTGAAGCCGGAGAGAAAGGTCAAACTGGAAATGGTGAGAGGCTATATGCTGCTGAACCGG
TTTGCATGTATTTCTTAAACCGTAGAGAAGGTTCAGGTTCACTCGCGACACTGTTTATGG
TTGTTCTAAGCGAAGTCTATTTTAAGAGTTGGACTCATCTCAAAGATATGATTTTAAAAG
GAAAAGATGCATTCGCCTCTGCTCATGGCATGACACTCTTTGAATACATTAATTCAAAGG
AACCGTTCGGTGAGCTGTTTAACCGGGCAATGTCAGAAGCCTCTACCCTGACCATGAAGA
AAGTTTTAGAAGTTTATAGAGGATTTGAAGATGTAAATACTTTAGTGGATGTTGGAGGAG
GAATAGGAACTGTTATAAGTCTAGTGGTTTCCAAGTATCCTCACATCAAAGGCATCAATT
TTGACCTACCCTCAGTATTAGCCCATCCTTCTGTTTATCCAGGAGTGGAGAATGTTTCAG
GAGATATGTTTAAAGAAATTCCAAACGGAGATGCCATCTTCTTGAAATGGATACTACATG
ATTGGACAGATGAAGATTGTATAAAAATTCTAAAAAATTGCTGGCAAAGTCTTTTTGAGG
GAGGAAAAGTGATAATAGTCGAAATGACTATTCCCGAAAATAAAAAGATCAACGACTTCT
CTTCGAATATTGTGTATGCAATGGACATGCTTATGTTAACCCAATGCTCGGGTGGTAAGG
AGAGGTCTTTCTCCCAGATCAAGAATCTAGCCGGTGATTCAGGTTTTGTTCTTTGTGAAA
TCAAATGTCATGCCTATTCATATTGTGTTATTGAGCTCCACAAATAGATTAAAAATGTTA
AGAAAGAAGTTTCGTCCCGTCCTTGTGAAGACTAGAAACCCGAGGAGCTTCTTTGTTTTT
TTCTTTTTGTGGTAAAATGTTAAATAAGGAGCTTATTTGTTTTCAATGGTTTTCGTTATT
AATGTGTGTAGAATGTTTTACCGTTGATGGTTCTTTATTCAAGATTGTAGTGATGGATTA
GTGTGAAGAAGGTGAATAATTGTTTCGCATTAGTAAGGGTTGTTGTTCG


BQ
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
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QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 6

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FY42TF U 1
AF RR4FX56TF U 19
AF RR4CQ75TF U 274
AF RR4FX56JQ C 331
AF RR4CQ75JQ C 334
AF RR4FY42JQ C 654
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BS 500 727 RR4FY42TF
BS 728 729 RR4FX56TF
BS 730 928 RR4CQ75TF
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BS 930 978 RR4CQ75TF
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BS 1051 1051 RR4CQ75JQ
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GATGACGGGTGGGAGCTACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTC
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TACATTTTCTGGGAATGGTAATGGTGGTACAGACGAACCTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCA
TAAGTTCACTGTTGGTGCTTACAAGCCTTTCTTTGATGTCGACATTTCTGATGTTGTGGA
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GCCTGACTTGTATGGTCCATTTTGGATATGCACGACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTAT
TGGCACATTTGTCACCTATGTAGCACACAAATGGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATAT
CAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTATGGCTATGTCACGCTTGTTCCTCTCGC
GTTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCTTCAGGACTAGTCCAGCTCTTCTGTCT
CTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTATCCCCGCATTGTGCCTCTCGGTCGTGCCAGTGGA
GATCTTC

QA 1 727 1 727
DS 

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GG
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CGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGTTCCAGATCCAGGCCATA
CCACCGTCAAATTCGCAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTACTCAGGGCA
AGATCTCTGGTGGTAGTAATCCTCCTCGAGATGCTGACGATACATTTTCTGGGAATGGTA
ATGGTGGTACAGACGAACCTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCACTGTTGGTGCTT
ACAAGCCTTTCTTTGATGTCGACATTTCTGATGTTGTGGACAGGCTCAAAGAATCTCTCT
TCCCGTTCCGTGGAACCTTTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCAT
TTTGGATATGCACGACTTTGGTATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACG
TAGCACACAAATGGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAG
CAGGAGTGTTCTATGGCTATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAAT
ACTTCTCTGCACCTTCAGGACTAGTCCAGCTCTTCTGTCTCTACGGCTATTCCCTCTTCA
TCTTTATCCCCGCATTGTGCCTCTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAG

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DS 

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G
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ACTTTGATATTCGTGGTGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAAATGG
AAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTAT
GGCTATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCT
TCAGGACTAGTCCAGCTCTTCTGTCTCTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTATCCCCGCA
TTGTGCCTCTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTCATCGCGGGTGTAGCAGGG
TTCATGTCTGCAACATTTGTGGCTTTGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCCGCTGGAGAG
AGATCGATCCTGATAATAGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTAGGGCTTGCGGTTGTTTTG
AAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGATTCACAAAAGGGTGTATTGAAAAG*TTTTG
TGTAGATCCATCCATAAACGTTTTCTCCTCATATCTTATACAAT

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DS 

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TGGAACCTTTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCATTTTGGATATG
CACGACTTTGGTATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAA
ATGGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTT
CTATGGCTATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTTTTTGC
ACCTTCAGGACTAGTCCAGCTTTTCTGTCTTTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTATCCC
CGCATTGTGCCTTTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTCATCGCGGGTGTAGC
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AGAGAGATCGATCCTGATAATAGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTAGGGCTTGCGGTTGT
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TTTGTGTAGATCCATCCATAAACGTTTTCTCCTCATATTTTATACAATTTTTTGGTACTG
CTTGGAAACTGAGCTC*ATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTTT*A
TTTGTAGAAAATAGTGTCATAATAAT

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DS 

RD RR4CQ75JQ 743 0 0
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AACCTTTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCATTTTGGATATGCAC
GACTTTGATATTCGTGGTGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAAATG
GAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTTTA
TGGCTATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTTTTTGCACC
TTCAGGACTAGTCCAGCTTTTCTGTCTTTACGGCTATTCCCTTTTCATCTTTATCCCCGC
ATTGTGCCTTTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTCATCGCGGGTGTAGCAGG
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GAGATCGATCCTGATAATAGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTAGGGCTTGCGGTTGTTTT
GAAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGATTCACAAAAGGGTGTATTGAAAAGGTTTT
GTGTAGATCCATCCATAAACGTTTTCTCCTCATATTTTATACAATTTTTTGGTACTGCTT
GGAAACTGAGCTCCATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTTTTACTT
GTAGAAAATAGTGTCATAATAAT

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DS 

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TGGCTTTGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCCGCTGGAGAGAGATCGATCCTGATAATAG
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TCACCGTATGATTCACAAAAGGGTGTATTGAAAAGGTTTTGTGTAGATCCATCCATAAAC
GTTTTCTCCTCATATCTTATACAATTTTTTGGTACTGCTTGGAAACTGAGCTCCATGATT
CCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTTTTACTTGTAGAAAATAGTGTCATAAT
AAT

QA 1 423 1 423
DS 



AS 2 7

CO CL983Contig1 889 4 23 U
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TTTCTTCTCCGTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGA
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CCATCGCCAGTGATCGTAGGCTCGGTGTGCAGCTCCAGACGATCGCTACCGATTTCCAGA
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AAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAG
ACATGAAGCCTGAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTG
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GCACCATGGACTCCATTGGAGCTAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTATCTGGAACTG
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AATTGTTCGAGACTATTTCACAGGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTG
GTTGGGGAGGGCATGTCTACGTTGTAACACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGG
GAAGGATGGACTGATCCGACTCGCCACGCCATCATCATCTGCTTCCATCCAAGATGTTTT
TCGCTGTAATCCGGTTTAATCATAGAACCATTCAGTCTCTGATGTTATGTTATGACTTGT
GGATGAAGTTTGAATTTCCATCTCTTTGGATATTTTATTTTAATTCCTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F739TF U 1
AF RR4BP81TF U 9
AF RR4BP81JQ C 189
AF RR4F739JQ C 403
BS 1 131 RR4F739TF
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BS 773 780 RR4BP81TF
BS 781 781 RR4BP81JQ
BS 782 788 RR4BP81TF
BS 789 789 RR4BP81JQ
BS 790 796 RR4BP81TF
BS 797 797 RR4BP81JQ
BS 798 806 RR4BP81TF
BS 807 807 RR4BP81JQ
BS 808 830 RR4BP81TF
BS 831 831 RR4BP81JQ
BS 832 846 RR4BP81TF
BS 847 889 RR4BP81JQ

RD RR4F739TF 686 0 0
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TTTCTTCTCCGTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGA
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GAATCTCCAAGATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCC
AAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAG
ACATGAAGCCTGAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTG
GTCCTTACTTATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGAGAAGATGACAAGCCTTTCATCT
GCACCATGGACTCCATTGGAGCTAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTATCTGGAACTG
CTTCAGAATCACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCTGAGG
AATTGTTCGAGACTATTTCACAGGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTG
GTTGGGGAGGGCATGTCTACGTTGTA

QA 1 686 1 686
DS 

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GG
GTCGAGTTCATTTACTTTATACTGTCTCTCTCTCTCTCCTCCGTCTCAGATTTCTTCTCC
GTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGATGTCGATCTT
CGAGTACAATGGAGGTGCCGTTGTGGCTATGGTTGGGAAGAACTGCTTCGCCATCGCCAG
TGATCGTAGGCTCGGTGTGCAGCTCCAGACGATCGCTACCGATTTCCAGAGAATCTCCAA
GATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTGTA
CCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCC
TGAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCTTACTT
ATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGAGAAGATGACAAGCCTTTCATCTGCACCATGGA
CTCCATTGGAGCTAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTATCTGGAACTGCTTCAGAATC
ACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCTGAGGAATTGTTCGA
GACTATTTCACAGGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGG
GCATGTCTACGTTGTAACACCAACGGAGAT*AAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGA
CTGATCCGACTCGC*ACGCCATCATCATCTGCT*CCATCCA*GATGTTTT*CGCTGTA*T
CCGGTT*AATCATAGA*CCATTCAGTCTCTGATGTTATGT*ATGACTTGTGGATGA
GTTGATTTCA

QA 3 838 3 838
DS 

RD RR4BP81JQ 701 0 0
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AAGATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTG
TACCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAG
CCTGAGACTTTCGCCAGTTTCGTTTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCTTAC
TTATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGAGAAGATGACAAGCCTTTCATCTGCACCATG
GACTCCATTGGAGCTAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTATCTGGAACTGCTTCAGAA
TCACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCTGAGGAATTGTTC
GAGACTATTTCACAGGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGA
GGGCATGTTTACGTTGTAACACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATG
GACTGATCCGACTCGCCACGCCATCATCATCTGCTTCCATCCAAGATGTTTTTCGCTGTA
ATCCGGTTTAATCATAGAACCATTCAGTCTCTGATGTTATGTTATGACTTGTGGATGAAG
TTTGAATTTCCATCTCTTTGGATATTTTATTTTAATTCCTA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4F739JQ 487 0 0
TCTACGAGAAAAGATTTGGTCCTTACTTATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGAGAAG
ATGACAAGCCTTTCATCTGCACCATGGACTCCATTGGAGCTAAGGAGTTGGCTAAAGATT
TTGTTGTATCTGGAACTGCTTCAGAATCACTTTATGGTGCCTGGGAAGCTATGTACAAGC
CAGATATGGAAGCTGAGGAATTGTTCGAGACTATTTCACAGGCACTTCTATCGTCAGTTG
ACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGGGCATGTTTACGTTGTAACACCAACGGAGATTA
AAGAGAGTATCCTAAAGGGAAGGATGGACTGATTCGACTCGCCACGCCATCATCATCTGC
TTCCATCCAAGGTGTTTTTCGCTGTAATCCGGTTTAATCATAGAACCATTCAGTTTCTGA
TGTTATGTTATGACTTGTGGATGAAGTTTGAATTTCCATCTCTTTGGATATTTTATTTTA
ATTCCTA

QA 1 487 1 487
DS 



CO CL983Contig2 904 3 9 U
GGAAGCCACCGTCGAGTTCATTTACTTTATACTGTCTCTCTCTCTCTCCTCCGTCTCAGA
TTTCTTCTCCGTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGA
TGTCGATCTTCGAGTACAATGGAAGTGCCGTTGTGGCTATGGTTGGGAAGAACTGCTTCG
CCATCGCCAGTGATCGTAGGCTCGGGGTGCAGCTCCAGACGATCGCTACCGATTTCCAGA
GAATCTCCAAGATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCC
AAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTACCAGCTTCGTGAAGAGAGAG
ACATGAAGCCTGAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTG
GTCCTTACTTATGCCAACCAGTGATTGCCGGATTGGGTGAAGATGACAAGCCCTTTATTT
GCACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCT**GACTG
CTTCAGAATCACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGG
AACTGTTTGAGACGATATCCCAAGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTG
GTTGGGGAGGGCATGTCTACGTTGTAACACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGG
GAAGGATGGACTGATCCGACTCGCCACGCCATCATCATCACTTGCTTCCATCCAAGATGT
TTTTCGCTGTAATCCGGTTTAATCATAGAATCATTCATTCTCTGAAGTTATGTTATGACT
TGTGGATGAAATTTGAATTTCCTCTCTTTGGATATTTTATTTTAATTCCTACTAGAGTTA
ACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4GT87TF U 1
AF RR4AD92TF U 8
AF RR4GT87JQ C 388
BS 1 48 RR4GT87TF
BS 49 49 RR4AD92TF
BS 50 661 RR4GT87TF
BS 662 828 RR4AD92TF
BS 829 829 RR4GT87JQ
BS 830 841 RR4AD92TF
BS 842 842 RR4GT87JQ
BS 843 856 RR4AD92TF
BS 857 904 RR4GT87JQ

RD RR4GT87TF 664 0 0
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TTTCTTCTCCGTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGA
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GAATCTCCAAGATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCC
AAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTACCAGCTTCGTGAAGAGAGAG
ACATGAAGCCTGAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTG
GTCCTTACTTATGCCAACCAGTGATTGCCGGATTGGGTGAAGATGACAAGCCCTTTATTT
GCACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCT**GACTG
CTTCAGAATCACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGG
AACTGTTTGAGACGATATCCCAAGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTG
G
GTG

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4AD92TF 858 0 0
ACC
GTCGAGTTCATTTACTTTATACTGTCTCTCTCTCTCTCCTCCGTCTCAGATTTCTTCTCC
GTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGATGTCGATCTT
CGAGTACAATGGAAGTGCCGTTGTGGCTATGGTTGGGAAGAACTGCTTCGCCATCGCCAG
TGATCGTAGGCTCGGGGTGCAGCTCCAGACGATCGCTACCGATTTCCAGAGAATCTCCAA
GATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTGTA
CCAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTACCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCC
TGAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCTTACTT
ATGCCAACCAGTGATTGCCGGATTGGGTGAAGATGCCAAGCCCTTTATTTGCACCATGGA
CTCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCTGGGACTGCTTCAGAATC
ACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAACTGTTTGA
GACGATATCCCAAGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGG
GCATGTCTACGTTGTAACACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGA
CTGATCCGACTCGCCACGCCATCATCATCACTTGCTTCCATCCAAGATGTTTTTCGCTGT
AATCCGGTTTAATCATAGAATCATTCATTCTCTGAAGT*ATGTTATGACTTTTGGATGAA
ATTTGA
TTTCCTCTC

QA 4 849 4 849
DS 

RD RR4GT87JQ 517 0 0
TCGTCTCCGCCATTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCTTACTTATGCCAACCAGTGATTG
CCGGATTGGGTGAAGATGACAAGCCCTTTATTTGCACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGG
AGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCT**GACTGCTTCAGAATCACTTTATGGTGCCTGCG
AAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAACTGTTTGAGACGATATCCCAAGCAC
TTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGGGCATGTCTACGTTGTAA
CACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGACTGATCCGACTCGCCAC
GCCATCATCATCACTTGCTTCCATCCAAGATGTTTTTCGCTGTAATCCGGTTTAATCATA
GAATCATTCATTCTCTGAAGTTATGTTATGACTTGTGGATGAAATTTGAATTTCCTCTCT
TTGGATATTTTATTTTAATTCCTACTAGAGTTAACGC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 6

CO CL984Contig1 1427 6 16 U
GGATCTTCGAGGTTAAGGCTACTGCTGGAGACACTCATCTCGGCGGGGAGGATTTTGATA
ACAGGATGGTTAACCATTTTGTTCTAGAGTTTAAGAGGAAGAGCAAGAAGGATATTAGCG
GTAACCCTAGAGCTTTGAGAAGGTTGAGGACGGCTTGTGAGAGAGCAAAGAGGACTCTCT
CTTCCACCGCGCAGACCACAATTGAGACTGACTCTTTGTTCGAGGGGATTGACTTCTACT
CTGCGCTAACTCGCGCTAGGTTCGAGGAGCTCAACATGGATCTTTTCAGGAAGTGCATGG
AGCCTGTTGAGAAGTGTCTCCGCGATGCAAAGATGGACAAGAGTACGGTCCACGATGTTG
TTCTTGTTGGTGGCTCCACGCGTATCCCGAAAGTCCAGCAGCTTCTTCAGGATTTCTTCA
ATGGGAAAGAGCTTTGCAAGTCTATTAACCCTGACGAGGCTGTGGCTTACGGTGCTGCGG
TTCAGGGTGCGATTCTTAGCGGGGAAGGGAATGAGAAGGTGCAGGATCTTCTTCTCTTGG
ACGTGACTCCTCTTTCTCTTGGTCTTGAGACCGCAGGTGGGGTTATGACCACGTTGATCC
AGAGGAACACGACGATACCGACGAAGAAGGAGCAGGTGTTCTCCACCTACTCTGACAACC
AGCCGGGCGTGTTGATCCAGGTCTACGAAGGTGAGAGGGCTAGGACCAAGGACAACAACC
TCCTGGGAAAGTTTGAGCTCTCCGGCACCCCTCCTGCTCCGCGTGGTGTCCCTCAGATCA
CAGTCTGTTTCGACATTGACGCAAACGGCATCCTCAACGTTTCTGCAGAGGACAAGACCA
CGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCACCAACGACAAGGGTCGCTTGTCCAAGGACGAGA
TCGAGAAGATGGTGCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAGA
AGGTGGAAGCCAAGAATGCTCTTGAGAACTATGCTTACAACATGAGGAACACCATCCGTG
ACGACAAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCTGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTTG
AGGAGGCAATCCAATGGCTTGATGGTAACCAAACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGACA
AGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTATCAAGGAGCTG
GTGGTGAAGCAGGTCCTGCTGATGATGAAGCTCCACCTGCTTCTGGAGGTGCTGGTCCCA
AGATTGAGGAGGTCGACTAAACTGGTTCTTTTAGAACTGTTTTCCGTTATCAATTTCAGT
GTTGTTTGGTTTAAGTGTTCTGCTCTTTATTTTTATGTACTTTTATCTTCGGGTTGCAGT
TTCGAACTTGACATGTAGAAATTTTTATTTAATGGGTTTTTCTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4EQ47TF U 1
AF RR4AK35TF U 295
AF RR4FW51TF U 643
AF RR4AK35JQ C 656
AF RR4FW51JQ C 745
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BS 826 1108 RR4AK35TF
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BS 1309 1312 RR4FW51TF
BS 1313 1313 RR4AK35JQ
BS 1314 1353 RR4FW51TF
BS 1354 1354 RR4AK35JQ
BS 1355 1363 RR4FW51TF
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BS 1365 1374 RR4FW51TF
BS 1375 1427 RR4AK35JQ

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CTTCCACCGCGCAGACCACAATTGAGACTGACTCTTTGTTCGAGGGGATTGACTTCTACT
CTGCGCTAACTCGCGCTAGGTTCGAGGAGCTCAACATGGATCTTTTCAGGAAGTGCATGG
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TTCTTGTTGGTGGCTCCACGCGTATCCCGAAAGTCCAGCAGCTTCTTCAGGATTTCTTCA
ATGGGAAAGAGCTTTGCAAGTCTATTAACCCTGACGAGGCTGTGGCTTACGGTGCTGCGG
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ACGTGACTCCTCTTTCTCTTGGTCTTGAGACCGCAGGTGGGGTTATGACCACGTTGATCC
AGAGGAACACGACGATACCGACGAAGAAGGAGCAG*TGTTCTCCACCTACTCTGAC

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TCTTCAATGGGAAAGAGCTTTGCAAGTCTATTAACCCTGACGAGGCTGTGGCTTACGGTG
CTGCGGTTCAGGGTGCGATTCTTAGCGGGGAAGGGAATGAGAAGGTGCAGGATCTTCTTC
TCTTGGACGTGACTCCTCTTTCTCTTGGTCTTGAGACCGCAGGTGGGGTTATGACCACGT
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ACAACCAGCCGGGCGTGTTGATCCAGGTCTACGAAGGTGAGAGGGCTAGGACCAAGGACA
ACAACCTCCTGGGAAAGTTTGAGCTCTCCGGCACCCCTCCTGCTCCGCGTGGTGTCCCTC
AGATCACAGTCTGTTTCGACATTGACGCAAACGGCATCCTCAACGTTTCTACAGAGGACA
AGACCACGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCACCAACGACAAGGGTCGCTTGTCCAAGG
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TCCGTGACGACAAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCTGACAAGAAGAAGATTGAGGATT
CGGTTGAGGAGGCAATCCAATGGCTTGATGGTAA

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DS 

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G
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TGCAGAGGACAAGACCACGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCACCAACGACAAGGGTCG
CTTGTCCAAGGACGAGATCGAGAAGATGGTGCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGA
TGGGGAGCACAAGAAGAAGGTGGAAGCCAAGAATGCTCTTGAGAACTATGCTTACAACAT
GAGGAACACCATCCGTGACGACAAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCTGACAAGAAGAA
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AGACGAGTTTGAAGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAA
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*ATCTTCGGGT

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CAACCTCCTGGGAAAGTTTGAGCTCTCCGGCACCCCTCCTGCTCCGCGTGGTGTCCCTCA
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TCAGTGTTGTTTGGTTTAAGTGTTCTGCTCTTTATTTTTATGTACTTTTATCTTCGGGTT
GCAGTTTCGAACTTGACATGTAGAAATTTTTATTTAATGGGTTTTTCTCTCT

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DS 

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GCAT
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CATCCTCAACGTTTCTGCAGAGGACAAGACCACGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCAC
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CCAAACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAA
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ATTTTTATGTACTTTTATCTTCGGGTTGCAGTTTCGAACTTGACATGTAGAAATTTTTAT
TT

QA 5 666 5 666
DS 

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CGTTTCTGCAGAGGACAAGACCACGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCACCAACGACAA
GGGTCGCTTGTCCAAGGACGAGATCGAGAAGATGGTGCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTC
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TGAAGCAGACGAGTTTGAAGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCAT
TGCTAAGATGTATCAAGGAGCTGGTGGTGAAGCAGGTCCTGCTGATGATGAAGCTCCACC
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TGTTTTCCGTTATCAATTTCAGTGTTGTTTGGTTTAAGTGTTCTGCTCTTTATTTTTATG
TACTTTTATCTTCGGGTTGCAGTTTCGAACTTGACATGTAGAAATTTTTATTTAATGGGT
TTTTCTC
CC

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DS 



AS 1 7

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ATATCTTAAATAAATTTAGTCCAACATCAATACATCGAAAAACGTTCACATTGCATTTAC
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CGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTACCAAGA
GATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATGGTGATT
GTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTC
ATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCAC
GTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAG
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ATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAG
ATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGACTATG
TGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAATCGAT
CGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGGCACAATAGGCTAAGAGATACTCGAGCCATTTAGG
GACTTTGAAACTCCGGTGAGCCAAGTTCCGGTGATACGACACCGTAATACCAAGACCACC
AATCGTATAGAAAAAAAAACGTTACCCAAAGAGCCGACCAGCTGAAATAAAACGGCGCCA
AGAGAGCCATTGAATGCACAAACAGTGAAGCTGTTAGTTTGACGTAATCCAATCTCCTCC
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CTCTCTTCCTTGGAAACCTTTTCTGATTTAGAGAATAATAGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT72JQ U 54
AF RR4BO46TF C 55
AF RR4EQ75JQ U 1
AF RR4FO14JQ U 54
AF RR4C744JQ U 54
AF RR4FO14TF C 437
AF RR4EQ75TF C 505
BS 1 708 RR4EQ75JQ
BS 709 763 RR4FO14JQ
BS 764 786 RR4C744JQ
BS 787 912 RR4FO14TF
BS 913 913 RR4EQ75TF
BS 914 918 RR4FO14TF
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BS 920 1134 RR4FO14TF
BS 1135 1135 RR4EQ75TF
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A
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ATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAAT
TTTACATAAAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAAA
TTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTA
CCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTC
CCC

QA 2 281 2 281
DS 

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ATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAAT
TTTACATGGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAGCGGACAATAGCCCTCCTACGTCTTTGAGA
TTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTA
CCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATG
GTGATTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGA
AGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCA
AGTCACGTGCACCTCCAGTGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCC
ACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTATTTGAAG
GAACCTATAGAACCATTGC

QA 1 559 1 559
DS 

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ATATCTTAAATAAATTTAGTCCAACATCAATACATCGAAAAACGTTCACATTGCATTTAC
CCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAATTTTACA
TAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAGATTCCGT
CGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTACCAAGA
GATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATGGTGATT
GTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTC
ATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCAC
GTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAG
ATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCT
ATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAG
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DS 

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G
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ATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAAT
TTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAGA
TTCCGTCGGGAGTTTCACATCAT**GCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTA
CCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATG
GTGATTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGA
AGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCA
AGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCC
ACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAG
GAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGA
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GT
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TTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAATT
TTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAGAT
TCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTAC
CAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATGG
TGATTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGAA
GTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAA
GTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCA
CCAAGATAGTAGAGGATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGG
AACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAA
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CTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAA
TCGATCGGATC

QA 3 733 3 733
DS 

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GCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGA
CCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCATTGCTTC
TTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAA
ATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAA
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TGAGCCAAGTTCCGGTGATACGACACCGTAATACCAAGACCACCAATCGTATAGAACAAA
AA*CGTTACCCAAAGAGCCGACCAGCTGAAATAAAACGGCGCCAAGAGAGCCATTGAATG
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CACCCATCTCTGTCTCCTCTTCTCCGCCTCTTTCTCCGACGAATAAGGCTTTTTACGGTG
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CCTTTTCTGATTTAGAGAATAATAGAGAGCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4EQ75TF 662 0 0
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CTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAG
AAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAA
CTGGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAATCGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAG
GGCACAATAGGCTAAGAGATACTCGAGCCATTTAGGGACTTTGAAACTCCGGTGAGCCAA
GTTCCGGTGATACGACACCGTAATACCAAGACCACCAATCGTATAGAAAAAAAAACGTTA
CCCAAAGAGCCGACCAGCTGAAATAAAACGGCGCCAAGAGAGCCATTGAATGCACAAACA
GTGAAGCTGTTAGTTTGACGTAATCCAATCTCCTCCACTTTCTCCCCCAAAACACCCATC
TCTGTCTCCTCTTCTCCGCCTCTTTCTCCGACGAATAAGGCTTTTTACGGTGGTTCTCCT
CCACCGTGGATGTCACCGACATTTCTCTCTACGTTTCTCTCTTCCTTGGAAACCTTTTCT
CC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 6

CO CL986Contig1 1022 6 20 U
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GCTGACGCGATTAACGGTCGAACCTGCACAGGTTATGCAACTGTTGGACCTGCTCTTATA
GCTGCAGGGGCAAAGTGGGTGGAACCAACAACACCTGATGTCTGTGTCGTTGATGGTAGT
TTGATTACTGCAGCTACTTATGAGGGGCATCCTGAGTTTATCCAGCTCTTTCTCAAGGCC
CTTGGCGGTAAAGTAACTGGAGAAAATAAAAGAATCTTGTTTCTTTGTGGGGATTATATG
GAGGACTATGAAGTCAAAGTCCCGTTTCAGTCCCTTCAAGCTTTGGGGTGTCAAGTTGAT
TCGGTTTGTCCAGAGAAAAAGGCTGGTGATCGTTGCCCAACTGCAATCCACGACTTTGAG
GGTGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGGGCATACTTTTGCTTTAACTGCTAATTTTGAT
GGAGTAGATTCCTCTGGTTATGATGCTCTGGTCATTCCAGGAGGCAGAGCTCCAGAATAT
CTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCTGGTTAAAGAGTTTATGAGTTCTGGGAAACCG
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GAACCAGATCCAATCCACCGATGCTTCACTGACGGGAATCTGGTAACTGGCGCAGCATGG
CCGGGACACCCAGAGTTTGTGTCACAGCTTATGGTTTTGTTGGGCGTTCAGGTTTCATTC
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TAAAACTTGTGGCTCATGTCGTTAGCGGTCTGTCATGTTGAGGTTTGTGTCTTTGATGTT
TGTCTAAACTGAAAACTTTGTTTGAATTGGCAATAAAAAGTTTCTGAAATTTTCTTTAAA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4DV82TF U 1
AF RR4BE86TF U 51
AF RR4A756TF U 351
AF RR4DV82JQ C 338
AF RR4CR63JQ C 270
AF RR4BE86JQ C 159
BS 1 364 RR4DV82TF
BS 365 365 RR4BE86TF
BS 366 412 RR4DV82TF
BS 413 413 RR4BE86TF
BS 414 422 RR4DV82TF
BS 423 423 RR4BE86TF
BS 424 625 RR4DV82TF
BS 626 626 RR4BE86TF
BS 627 635 RR4DV82TF
BS 636 866 RR4BE86TF
BS 867 871 RR4A756TF
BS 872 872 RR4BE86JQ
BS 873 874 RR4A756TF
BS 875 875 RR4BE86JQ
BS 876 895 RR4A756TF
BS 896 896 RR4BE86JQ
BS 897 920 RR4A756TF
BS 921 921 RR4BE86JQ
BS 922 988 RR4A756TF
BS 989 1022 RR4BE86JQ

RD RR4DV82TF 635 0 0
GTCTCAACCTCCGGAAAGCCCATTGCCTCTATTTGCTATGGCCAGTTGATACTAGCAGCT
GCTGACGCGATTAACGGTCGAACCTGCACAGGTTATGCAACTGTTGGACCTGCTCTTATA
GCTGCAGGGGCAAAGTGGGTGGAACCAACAACACCTGATGTCTGTGTCGTTGATGGTAGT
TTGATTACTGCAGCTACTTATGAGGGGCATCCTGAGTTTATCCAGCTCTTTCTCAAGGCC
CTTGGCGGTAAAGTAACTGGAGAAAATAAAAGAATCTTGTTTCTTTGTGGGGATTATATG
GAGGACTATGAAGTCAAAGTCCCGTTTCAGTCCCTTCAAGCTTTGGGGTGTCAAGTTGAT
TCGGCTTGTCCAGAGAAAAAGGCTGGTGATCGTTGCCCAACTGCAATCCACGGCTTTGAG
GGCGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGGGCATACTTTTGCTTTAACTGCTAATTTTGAT
GGAGTAGATTCCTCTGGTTATGATGCTCTGGTCATTCCAGGAGGCAGAGCTCCAGAATAT
CTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCTGGTTAAAGAGTTTATGAGTTCTGGGAAACCG
GTTGCATCTATCTGCCACGGACAACGGATCTTAGC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4BE86TF 816 0 0
G
CTAGCAGCTGCTGACGCGATTAACGGTCGAACCTGCACAGGTTATGCAACTGTTGGACCT
GCTCTTATAGCTGCAGGGGCAAAGTGGGTGGAACCAACAACACCTGATGTCTGTGTCGTT
GATGGTAGTTTGATTACTGCAGCTACTTATGAGGGGCATCCTGAGTTTATCCAGCTCTTT
CTCAAGGCCCTTGGCGGTAAAGTAACTGGAGAAAATAAAAGAATCTTGTTTCTTTGTGGG
GATTATATGGAGGACTATGAAGTCAAAGTCCCGTTTCAGTCCCTTCAAGCTTTGGGGTGT
CAAGTTGATTCGGTTTGTCCAGAGAAAAAGGCTGGTGATCGTTGCCCAACTGCAATCCAC
GACTTTGAGGGTGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGGGCATACTTTTGCTTTAACTGCT
AATTTTGATGGAGTAGATTCCTCTGGTTATGATGCTCTGGTCATTCCAGGAGGCAGAGCT
CCAGAATATCTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCTGGTTAAAGAGTTTATGAGTTCT
GGGAAACCGGTTGCATCTATCCGCCACGGACAACAGATCTTAGCTGCTGCCGGTGTCCTC
AAGGGAAGGAAATGCACTGCTTATCCAGCAGTGAAAATGAATGTGGTACTTGGAGGAGGA
ACTTGGTTAGAACCAGATCCAATCCACCGATGCTTCACTGACGGGAATCTGGTAACTGGC
GCAGCATGGCCGGGACACCCAGAGTTTGTGTCACAGCTTATGGTTTTGTTGGGCGTTCAG
GTTTCATTCTAGTTATGTAAACCGTCCCTTTCATG

QA 2 816 2 816
DS 

RD RR4A756TF 644 0 0
G
CAAGTTGACGCGGTTTGTCCAGAGAAAAAGGCTGGTGATCGCTGCCCAACTGCAATTCAT
GACTTTGAGGGTGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGGGCATACTTTTGCTTTAACTGCT
ACTTTTGATGGAGTAGATTCCTCCGGTTATGATGCTCTGGTCATTCCAGGAGGCAGAGCT
CCAGAATATCTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCTGGTTAAAGAGTTTATGAGTTCT
GGGAAACCAGTTGCATCTATCTGCCACGGACAACAGATCTTAGCTGCTGCCGGTGTCCTC
AAGGGAAGGAAATGCACTGCTTATCCAGCAGTGAAACTGAATGTGGTACTTGGAGGAGGA
ACTTGGTTAGAACCAGATCCAATCCACCGATGCTTCACTGACGGGAATCTGGTTACTGGC
GCAGCATGGCCAGGACACCCAGAGTTTGTGTCACAGCTTATGGTTTTGTTGGCC*TTCAG
GTTTCATTCTAGTTATGTAAACCTTCCCTTTCGTGCGGAATCAACTCGTCTGCTATGTAG
TAATATGTGTAAAACTTGTGGCTCATGTCATTAGCGGTCTGTCATGTTGAGGTTTGTGTC
TTTGATGTTTGTCTAAACTGAAAACTTTGTTTGAATT
GGCAAT

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR4DV82JQ 651 0 0
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CAACTGCAATCCACGGCTTTGAGGGCGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGGGCATACTT
TTGCTTTAACTGCTAATTTTGATGGAGTAGATTCCTCTGGTTATGATGCTCTGGTCATTC
CAGGAGGCAGAGCTCCAGAATATCTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCTGGTTAAAG
AGTTTATGAGTTCTGGGAAACCGGTTGCATCTATCTGCCACGGACAACGGATCTTAGCTG
CTGCCGGTGTCCTCAAGGGAAGGAAATGCACTGCTTATCCAGCAGTGAAAATGAATGTGG
TACTTGGAGGAGGAACTTGGTTAGAACCAGATCCAATCCACCGATGCTTCACTGACGGGA
ATCTGGTAACTGGCGCAGCATGGCCGGGACACCCAGAGTTTGTGTCACAGCTTATGGTTT
TGTTGGGCGTTCAGGTTTCATTCTAGTTATGTAAACCGTCCCTTTCATGCGGAACCAGCT
CGTCTGCTATGTAGTAATGTGTGTAAAACTTGTGGCTCATGTCGTTAGCGGTCTGTCATG
TTGAGGTTTGTGTCTTTGATGTTTGTCTAAACTGAAAACTTTGTTTGAATT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4CR63JQ 719 0 0
AAGAATCTTGTTTCTTTGTGGGGATTATATGGAGGACTATGAAGTCAAAGTCCCGTTTCA
GTCCCTTCAAGCTTTGGGGTGTCAAGTTGATTCGGTTTGTCCAGAGAAAAAGGCTGGTGA
TCGTTGCCCAACTGCAATCCACGACTTTGAGGGTGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGG
GCATACTTTTGCTTTAACTGCTAATTTTGATGGAGTATATTCCTCTGGTTATGATGCTCT
GGTCATTCCAGGAGGCAGAGCTCCAGAATATCTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCT
GGTTAAAGAGTTTATGAGTTCTGGGAAACCGGTTGCATCTATCTGCCACGGACAACAGAT
CTTAGCTGCTGCCGGTGTCCTCAAGGGAAGGAAATGCACTGCTTGTCCAGCAGTGAAAAT
GAATGTGGTACTTGGAGGAGGAACTTGGTTAGAACCAGATCCAATCCACCGATGCTTCAC
TGACGGGAATCTGGTAACTGGCGCAGCGTGGCCGGGACACCCAGAGTTTGTGTCACAGCT
TATGGTTTTGTTGGGCGTTCAGGTTTCATTCTAGTTATGTAAACCGTCCCTTTCATGCGG
AACCAGCTCGTCTGCTATGTAGTAATGTGTGTAAAACTTGTGGCTCATGTCGTTAGCGGT
CTGTCATGTTGAGGTTTGTGTCTTTGATGTTTGTCTAAACTGAAAACTTTGTTTGAATT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BE86JQ 864 0 0
TGTCTGTGTCGTTGATGGTAGTTTGATTACTGCAGCTACTTATGAGGGGCATCCTGAGTT
TATCCAGCTCTTTCTCAAGGCCCTTGGCGGTAAAGTAACTGGAGAAAATAAAAGAATCTT
GTTTCTTTGTGGGGATTATATGGAGGACTATGAAGTCAAAGTCCCGTTTCAGTCCCTTCA
AGCTTTGGGGTGTCAAGTTGATTCGGTTTGTCCAGAGAAAAAGGCTGGTGATCGTTGCCC
AACTGCAATCCACGACTTTGAGGGTGACCAGACTTACAGTGAAAAGCCAGGGCATACTTT
TGCTTTAACTGCTAATTTTGATGGAGTAGATTCCTCTGGTTATGATGCTCTGGTCATTCC
AGGAGGCAGAGCTCCAGAATATCTGGCCTTGAACCAACAAGTTCTTAACCTGGTTAAAGA
GTTTATGAGTTCTGGGAAACCGGTTGCATCTATCCGCCACGGACAACAGATCTTAGCTGC
TGCCGGTGTCCTCAAGGGAAGGAAATGCACTGCTTATCCAGCAGTGAAAATGAATGTGGT
ACTTGGAGGAGGAACTTGGTTAGAACCAGATCCAATCCACCGATGCTTCACTGACGGGAA
TCTGGTAACTGGCGCAGCATGGCCGGGACACCCAGAGTTTGTGTCACAGCTTATGGTTTT
GTTGGGCGTTCAGGTTTCATTCTAGTTATGTAAACCGTCCCTTTCATGCGGAACCAGCTC
GTCTGCTATGTAGTAATGTGTGTAAAACTTGTGGCTCATGTCGTTAGCGGTCTGTCATGT
TGAGGTTTGTGTCTTTGATGTTTGTCTAAACTGAAAACTTTGTTTGAATTGGCAATAAAA
AGTTTCTGAAATTTTCTTTAAAAG

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 6

CO CL987Contig1 1337 6 16 U
GGAAGCTAACAACAGCTAGTGTTACACACGTCTCTTCAACCAACATATTTGCCTCTTGAA
AATAATGCCGATTAGTGAGAAAATTCCGACTTGGGCCGTTGTTCCGGCTACTTTTGCCGT
CTTTTCCGTAATTTCGTATCAGATCCTAATCGCGCCGGACAATTTGAACGGCACCAAAAA
TGTATTGTCGATGGCTAAGACCATACCACTTCCTGTCGATGGACCAGAGAGCATCGAGTG
GGATCCGCAAGGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGGCG
TGGAGATGGTCTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGTTC
ACGGCATGAAGTAGTACCTACATGTGGAAGGCCGCTTGGACTTAGTTTCGAGAAGAAAAC
AGGAGACTTGTACATCTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAAGTGGGGCCAGAAGGAGG
CTTGGCTGAGTTGGTAGTGGACCAGGTTGAAGGTCGCAAAGTAATGTTTGCGAACCAGAT
GGATATTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTT
CAGGGAAGTATTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAGTGATCAGATACAA
CAAGAAGACGAAAGAGGCCAAAGTTGTCATGGACAATCTCCGTTGTAACAACGGTTTGGC
TCTAAACAAAGATAGATCTTTCTTAATCTCATGTGAGTCTGCCACTGGCCTTGTCCATAG
ATATTGGATTAAAGGTCCTAAAGCCGGGACTCGTGATATCTTCGCCAAGGTTCCTGGTTA
TCCTGACAACATCCGTTTAACACCCACGGGTGATTTTTGGATTGGCATACACTGTAAGAA
AAACTTATTTGGAAGACTGGCCGTGAATAATTATCAGTGCTTAGGTAAGTTGGTTGAAAA
GACGGTGAAGTTAGAGTTGTTGATTGGGTTAGTGAACGGGTTTAAGCCGCATGGGGTCGC
CGTCAAAATATCCGGGGAGACGGGGGAGATAGTTGAGATACTTGAGGACAAAGAAGGGAA
GACAATGCAGTATGTGAGTGAGGCTTATGAGGGAGATGATGGTAAGATATGGTTTGGGTC
GGTTTTTAAGCCTGCCGTATGGGTTCTTGATCGCAAGTGAGTAGTTCCGTTTGTTGTATG
TACGTAGTCATGTTATGTAAGTTCAAGTGTCTCTTGTTTGGTGCTTGTACTTTTGAATAT
AGACATGCTTGCAGAGTATATGCATCCATATTGTACCATGTAAACTTTCAGTTACTAAAG
TACTTCTTGCTGGTACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AF61TF U 1
AF RR4AF31TF U 1
AF RR4ER75TF U 250
AF RR4ER75JQ C 419
AF RR4AF61JQ C 431
AF RR4AF31JQ C 468
BS 1 803 RR4AF31TF
BS 804 902 RR4ER75TF
BS 903 903 RR4ER75JQ
BS 904 944 RR4ER75TF
BS 945 945 RR4ER75JQ
BS 946 959 RR4ER75TF
BS 960 1089 RR4ER75JQ
BS 1090 1090 RR4AF61JQ
BS 1091 1111 RR4ER75JQ
BS 1112 1112 RR4AF61JQ
BS 1113 1194 RR4ER75JQ
BS 1195 1195 RR4AF61JQ
BS 1196 1257 RR4ER75JQ
BS 1258 1258 RR4AF61JQ
BS 1259 1272 RR4ER75JQ
BS 1273 1337 RR4AF61JQ

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AATAATGCCGATTAGTGAGAAAATTCCGACTTGGGCCGTTGTTCCGGCTACTTTTGCCGT
CTTTTCCGTAATTTCGTATCAGATCCTAATCGCGCCGGACAATTTGAACGGCACCAAAAA
TGTATTGTCGATGGCTAAGACCATACCACTTCCTGTCGATGGACCAGAGAGCATCGAGTG
GGATCCGCAAGGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGGCG
TGGAGATGGTCTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGTTC
ACGGCATGAAGTAGTACCTACATGTGGAAGGCCGCTTGGACTTAGTTTCGAGAAGAAAAC
AGGAGACTTGTACATCTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAAGTGGGGCCAGAAGGAGG
CTTGGCTGAGTTGGTAGTGGACCAGGTTGAAGGTCGCAAAGTAATGTTTGCGAACCAGAT
GGATATTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTT
CAGGGAAGTATTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAGTGATCAGATACAA
CAAGAAGAC

QA 1 669 1 669
DS 

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AATAATGCCGATTAGTGAGAAAATTCCGACTTGGGCCGTTGTTCCGGCTACTTTTGCCGT
CTTTTCCGTAATTTCGTATCAGATCCTAATCGCGCCGGACAATTTGAACGGCACCAAAAA
TGTATTGTCGATGGCTAAGACCATACCACTTCCTGTCGATGGACCAGAGAGCATCGAGTG
GGATCCGCAAGGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGGCG
TGGAGATGGTCTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGTTC
ACGGCATGAAGTAGTACCTACATGTGGAAGGCCGCTTGGACTTAGTTTCGAGAAGAAAAC
AGGAGACTTGTACATCTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAAGTGGGGCCAGAAGGAGG
CTTGGCTGAGTTGGTAGTGGACCAGGTTGAAGGTCGCAAAGTAATGTTTGCGAACCAGAT
GGATATTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTT
CAGGGAAGTATTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAGTGATCAGATACAA
CAAGAAGACGAAAGAGGCCAAAGTTGTCATGGACAATCTCCGTTGTAACAACGGTTTGGC
TCTAAACAAAGATAGATCTTTCTTAATCTCATGTGAGTCTGCCACTGGCCTTGTCCATAG
ATATTGGATTAAAGGTCCTAAAG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4ER75TF 710 0 0
G
GGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGGCGTGGAGATGGT
CTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGTTCACGGCATGAA
GTAGTACCTACATGTGGAAGGCCACTTGGACTTAGTTTCGAGAAGAAAACAGGAGACTTG
TACATCTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAAGTGGGGCCAGAAGGAGGCTTGGCTGAG
TTGGTAGTGGACCAGGTTGAAGGTCGCAAAGTAATGTTTGCGAACCAGATGGATATTGAC
GAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTTCAGGGAAGTA
TTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAGTGATCAGATACAACAAGAAGACG
AAAGAGGCCAAAGTTGTCATGGACAATCTCCGTTGTAACAACGGTTTGGCTCTAAACAAA
GATAGATCTTTCTTAATCTCATGTGAGTCTGCCACTGGCCTTGTCCATAGATATTGGATT
AAAGGTCCTAAAGCCGGGACTCGTGATATCTTCGCCAAGGTTCCTGGTTATCCTGACAAC
ATCCGTTTAACACCCACGGGTGATTTTTGGATTGGCATACACTGTAAGAAAA*CTTATTT
GGAAGACTGGCCGTGAATAATTATCAGTGCTTAG*TAAGTTGGTTGAAA

QA 2 710 2 710
DS 

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AACA
GAGACTTGTACATCTGTGATGGT*ACTTTGGG*TCATGAAAGTGGGGCCAGAAGGAGGCT
TGGCTGAGTTGGTAGTGGACCAGGTTGAAGGTCGCAAAGTAATGTTTGCGAACCAGATGG
ATATTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTTCA
GGGAAGTATTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAGTGATCAGATACAACA
AGAAGACGAAAGAGGCCAAAGTTGTCATGGACAATCTCCGTTGTAACAACGGTTTGGCTC
TAAACAAAGATAGATCTTTCTTAATCTCATGTGAGTCTGCCACTGGCCTTGTCCATAGAT
ATTGGATTAAAGGTCCTAAAGCCGGGACTCGTGATATCTTCGCCAAGGTTCCTGGTTATC
CTGACAACATCCGTTTAACACCCACGGGTGATTTTTGGATTGGCATACACTGTAAGAAAA
ACTTATTTGGAAGACTGGCCGTGAATAATTATCAGTGCTTAGGTAAGTTGGTTGAAAAGA
CGGTGAAGTTAGAGTTGTTGATTGGGTTAGTGAACGGGTTTAAGCCGCATGGGGTCGCCG
TCAAAATATCCGGGGAGACGGGGGAGATAGTTGAGATACTTGAGGACAAAGAAGGGAAGA
CAATGCAATATGTGAGTGAGGCTTATGAGAGAGATGATGGTAAGATATGGTTTGGGTCGG
TTTTTAAGCCTGCCGTATGGGTTCTTGATCGCAAGTGAGTAGTTCCGTTTGTAGTATGTA
CGTAGTCATGTTATGTAAGTTCAAGTGTCTCTTGTTTGGTGCTTGTACTTTTGAACATAG
ACATGCTTGC

QA 5 854 5 854
DS 

RD RR4AF61JQ 907 0 0
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TTGGTAGTGGACCAGGTTGAAGGTCGCAAAGTAATGTTTGCGAACCAGATGGATATTGAC
GAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTTCAGGGAAGTA
TTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAGTGATCAGATACAACAAGAAGACG
AAGGAGGCCAAAGTTGTCATGGACAATCTCCGTTGTAACAACGGTTTGGCTCTAAACAAA
GATAGATCTTTCTTAATCTCATGTGAGTCTGCCACTGGCCTTGTCCATAGATATTGGATT
AAAGGTCCTAAAGCCGGGACTCGTGATATCTTCGCCAAGGTTCCTGGTTATCCTGACAAC
ATCCGTTTAACACCCACGGGTGATTTTTGGATTGGCATACACTGTAAGAAAAACTTATTT
GGAAGACTGGCCGTGAATAATTATCAGTGCTTAGGTAAGTTGGTTGAAAAGACGGTGAAG
TTAGAGTTGTTGATTGGGTTAGTGAACGGGTTTAAGCCGCATGGGGTCGCCGTCAAAATA
TCCGGGGAGACGGGGGAGATAGTTGAGATACTTGAGGACAAAGAAGGGAAGACAATGCAG
TATGTGAGTGAGGCTTATGAGGGAGATGATGGTAAGATATGGTTTGGGTCGGTTTTTAAG
CCTGCCGTATGGGTTCTTGATCGCAAGTGAGTAGTTCCGTTTGTTGTATGTACGTAGTCA
TGTTATGTAAGTTCAAGTGTCTCTTGTTTGGTGCTTGTACTTTTGAATATAGACATGCTT
GCAGAGTATATGCATCCATATTGTACCATGTAAACTTTCAGTTACTAAAGTACTTCTTGC
TGGTACG

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DS 

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TTGCGAACCAGATGGATATTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCTACTTCAATGATAGTAGTG
ACAAGTATCATTTCAGGGAAGTATTTTACGTGACTGTCAACGGTGAGCGGTCAGGAAGAG
TGATCAGATACAACAAGAAGACGAAGGAGGCCAAAGTTGTCATGGACAATCTCCGTTGTA
ACAACGGTTTGGCTCTAAACAAAGATAGATCTTTCTTAATCTCATGTGAGTCTGCCACTG
GCCTTGTCCATAGATATTGGATTAAAGGTCCTAAAGCCGGGACTCGTGATATCTTCGCCA
AGGTTCCTGGTTATCCTGACAACATCCGTTTAACACCCACGGGTGATTTTTGGATTGGCA
TACACTGTAAGAAAAACTTATTTGGAAGACTGGCCGTGAATAATTATCAGTGCTTAGGTA
AGTTGGTTGAAAAGACGGTGAAGTTAGAGTTGTTGATTGGGTTAGTGAACGGGTTTAAGC
CGCATGGGGTCGCCGTCAAAATATCCGGGGAGACGGGGGAGATAGTTGAGATACTTGAGG
ACAAAGAAGGGAAGACAATGCAGTATGTGAGTGAGGCTTATGAGGGAGATGATGGTAAGA
TATGGTTTGGGTCGGTTTTTAAGCCTGCCGTATGGGTTCTTGATCGCAAGTGAGTAGTTC
CGTTTGTTGTATGTACGTAGTCATGTTATGTAAGTTCAAGTGTCTCTTGTTTGGTGCTTG
TACTTTTGAATATAGACATGCTTGCAGAGTATATGCATCCATATTGTACCATGTAAACTT
TCAGTTACTAAAGTACTTCTTGCTGGTACG

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 7

CO CL988Contig1 1107 7 16 U
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GAAATGAGATACATCCAACAATAATATAACAAAAAAAAAA*GTTAGAAGTACAAATTGTT
GTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGTTGTGTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGA
GCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACGCAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCA
TCTGAACATGCGGGTTCCACAAGACAGCATCCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTT
GATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCATTAGGTGCATCAAGATAGACGCAATCCA
CAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTCTTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGGAT
CAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTTAAACCTTTCACGGATGCTCCAGTGACAG
AAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTAAAAGAGAACGGTTTGCTGTCTGTGTTTG
TAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGA
AAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAG
CATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACAGACCAGTCCATGTTCCTTCCAAACCCAT
GCTGCTGAATAACTCCAGGTCCAAACTGAGGGAAACAATGTGGAATCCCTCCGCTGATGG
GTTTGATCTTATTGAAGACAGCATCAGGTCTAACAAAAAGAAGATCTTTCCCACTCGCAA
CTTTCCACGATGTTACGCATCCTCCAAACAGATATATCTCCGCCTCGCTCTTGTCCGGAG
AAGTGAGGACGAGTTTTGGCAAATTGCCTTGTCCTTCTGTGACTCTCACGCCAGTAGTAG
CCATCGCACAGAATCCTCTTCTTCGGCTGGTTCGGAGATGATTGGGAGAATTAAAGGTGG
GAAATGAGTTGGAGACGGATACCATCATCGCCATCTTTCTCTCCTTCACTCACTCTCTCT
ATCTAGATTAAGTCGATGAAGTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F632TF C 46
AF RR4DX84JQ U 29
AF RR4BZ80JQ U 30
AF RR4AJ23JQ U 33
AF RR4CU21JQ U 1
AF RR4AJ23TF C 290
AF RR4DX84TF C 460
BS 1 144 RR4CU21JQ
BS 145 145 RR4DX84JQ
BS 146 214 RR4CU21JQ
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BS 392 764 RR4CU21JQ
BS 765 765 RR4AJ23TF
BS 766 795 RR4CU21JQ
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BS 797 813 RR4CU21JQ
BS 814 814 RR4AJ23TF
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BS 909 909 RR4DX84TF
BS 910 1107 RR4AJ23TF

RD RR4F632TF 656 0 0
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GAAGTACAAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGTTGTGTTGCTGTCCAAG
ACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACGCAGACAAAGTCTC
TGTAACAAGCTTCCATCTGAACATGCGGGCTCCACAAGACAGCATCCGACCAGTTGGTGT
TTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCATTAGGTGCATCAA
GATAGACGCAATCCACAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTCTTCTTGACCCTCTA
TTGGGTTTTTAGGATCAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTTAAACCTTTCACGG
ATGCTCCAGTGACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTAAAAGAGAACGGTT
TGCTGTCTGTGTTTGTAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCGCCAACAACGACCT
TGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGACCATCCTTGAGCT
CAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACAGACCAGTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4DX84JQ 737 0 0
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AAAAAAA**GTTAGAAGTACAAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGTTGT
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TTAGGTGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTCT
TCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGGATCAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTT
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AAAGAGAACGGTTTGCTGTCTGTGTTTGTAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCG
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GACCAGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGAATAACTCCAGGTCCAAACTGAGGG
AAACAATGTGGA
A

QA 5 736 5 736
DS 

RD RR4BZ80JQ 734 0 0
ACT
GGTGAATACAAACTTTTTATTGCTTACGGAAATGAGATACATCCAACAATAATATAACAA
AAAAAAAA*GTTAGAAGTACAAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAAAAGTTGT
GTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACG
CAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGAACATGCGGGTTCCACAAGACAGCATCC
GACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCA
TTAGGTGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTCT
TCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGGATCAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTT
AAACCTTTCACGGATGCTCCAGTGACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTA
AAAGAGAACGGTTTGCTGTCTGTGTTTGTAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCG
CCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGA
CCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACA
GACCAGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGAATAACTCCAGGTCCAAACTGAGGG
AAACAATGTGG

QA 4 734 4 734
DS 

RD RR4AJ23JQ 694 0 0
GGTGAATACAAACTTTTTATTGCTTACGGAAATGAGATACATCCAACAATAATATAACAA
AAAAAAAAAGTTAGAAGTACAAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGTTGT
GTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACG
CAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGAACATGCGGGTTCCACAAGACAGCATCC
GACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTACTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCA
TTAGGTGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTCT
TCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGGATCAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTT
AAACCTTTCACGGATGCTCCAGTGACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTA
AAAGAGAACGGTTTGCTGTCTGTGTTTGTAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCG
CCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGA
CCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACA
GACCAGTCCATGTTACTTCCAAACCCATGCTGCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4CU21JQ 818 0 0
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GAAATGAGATACATCCAACAATAATATAACAAAAAAAAAA*GTTAGAAGTACAAATTGTT
GTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAAAAGTTGTGTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGA
GCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACGCAAACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCA
TCTGAACATGCGGGTTCCACAAGACAGCATCCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTT
GATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCATTAGGTGCATCAAGATAGACGCAATCCA
CAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTTTTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGGAT
CAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTTAAACCTTTCACGGATGCTCCAGTGACAG
AAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTAAAAGAGAACGGTTTGCTGTCTGTGTTTG
TAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGA
AAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAG
CATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACAGACCAGTCCATGTTCCTTCCAAACCCAT
GCTGCTGAATAACTCCAGGTCCAAACTGAGGGAAACAATGTGGA*TCCCTCCGCTGATGG
GTTTGATCTTATTGA*GACAGCATCAGGTCTAAAAAAA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AJ23TF 818 0 0
GATGATTACTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCATTAGGTGCATCAAGATA
GACGCAATCCACAAATCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTCTTCTTGACCCTCTATTGG
GTTTTTAGGATCAGGATCCTTATTGAGTGTTTTACAACCCTTTAAACCTTTCACGGATGC
TCCAGTGACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTAAAAGAGAACGGTTTGCT
GTCTGTGTTTGTAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCGCCAACAACGACCTTGTA
AAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAG
AGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACAGACCAGTCCATGTTACT
TCCAAACCCATGCTGCTGAATAACTCCAGGTCCAAACTGAGGGAAACAATGTGGAATCCC
TCCGCTGATGGGTTTGATCTTATTGAAGACAGCATCAGGTCTAACAAAAAGAAGATCTTT
CCCACTCGCAACTTTCCACGATGTTACGCATCCTCCAAACAGATATATCTCCGCCTCGCT
CTTGTCCGGAGAAGTGAGGGCGAGTTTTGGCAAATTGCCTTGTCCTTCTGTGACTCTCAC
GCCAGTAGTAGCCATCGCACAGAATCCTCTTCTTCGGCTGGTTCGGAGATGATTGGGAGA
ATTAAAGGTGGGAAATGAGTTGGAGACGGATACCATCATCGCCATCTTTCTCTCCTTCAC
TCACTCTCTCTATCTAGATTAAGTCGATGAAGTATTCC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4DX84TF 632 0 0
TCACGGATGCTCCAGTGACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTGTTAAAAGAGA
ACGGTTTGCTGTCTGTGTTTGTAATTTTAAGCTCGGTGGAAAGGCAGTCCGCGCCAACAA
CGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCCACATGGATCGACTATAAGGACCATCCT
TGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCAACAACAGACCAGT
CCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGAATAACTCCAGGTCCAAACTGAGGGAAACAAT
GTGGAATCCCTCCGCTGATGGGTTTGATCTTATTGAAGACAGCATCAGGTCTAACAAAAA
GAAGATCTTTCCCACTCGCAACTTTCCACGATGTTACGCATCCTCCAAACAGATATATCT
CCGCCTCGCTCTTGTCCGGAGAAGTGAGGACGAGTTTTGGCAAATTGCCTTGTCCTTCTG
TGACTCTCACGCCAGTAGTAGCCATCGCACAGAATCCTCTTCTTCGGCTGGTTCGGAGAT
GATTGGGAGAATTAAAGGTGGGAAATGAGTTGGAGACGGATACCATCATCGCCATCTTTC
TCTCCTTCACTCACTCTCTCTATCTAGATT
CC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 6

CO CL989Contig1 702 6 5 U
AGAGAAACCATTTTTTAGTAAATCGGATACATTTTTT*AGTTCTTACAACAACAGATAAA
CATAGGATAATAAGAAGCATTGCAAATATGGATTAAAATCATCATTACAATATTTCTTTG
GTACTTAAACTTGTGGTGGCTTAGTCTCGGCTTCAACGAGTTTCGGTTCAACATCAGCCT
TAGCATCGACCTTAGGATCAACCTTGGCATCAAGTATCTCATCATCAACCTTACCCTCGG
TCTTAGTCTCAGTTTCTGCGTGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGGCTCGACCTTAGCAT
CAACCTTAACCTCCGGTACCTCAGCATCAACCTTACCCTCAGTCTTAGTCTCACCTTCAG
GTTTTGTCTCAGTCTCGTCCTTAGGCTCAACCTCAGCCTCCACGGGCCAGTAAGAAGTCT
TCTTTCCAGTCTTAGAAACTGTTTGAAAAACTGCCTCAGGCTCAACTTTTCCTTTCACTG
TCACCTTTTGTTCCTTGATATCAATGTCAAATGACTCAACGCCTTCCATTTTGCCTAGGA
CTCTATTGACGGCACCAACGCAACCTTGGCATGACATACCAACTTTGAGGACAACGGTCT
GAGACATGGCTACAACTTTAGATAAAACGAACCGAAAGCTTTGAGATCGGTGATCCGAAT
TAGATAAAATGAGAAATGAGAAGATGTTTGTTTTTAGAATCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 

AF RR4FE79JQ U 1
AF RR4G823JQ U 1
AF RR4G823TF C 12
AF RR4DK48JQ U 2
AF RR4EG62TF C 602
AF RR4DK48TF C 2
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RD RR4FE79JQ 605 0 0
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GTACTTAAACTTGTGGTGGCTTAGTCTCGGCTTCAACGAGTTTCGGTTCAACATCAGCCT
TAGCATCGACCTTAGGATCAACCTTGGCATCAAGTATCTCATCATCAACCTTACCCTCGG
TCTTAGTCTCAGTTTCTGCGTGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGGCTCGACCTTAGCAT
CAACCTTAACCTCCGGTACCTCAGCATCAACCTTACCCTCAGTCTTAGTCTCACCTTCAG
GTTTTGTCTCAGTCTCGTCCTTAGGCTCAACCTCAGCCTCCACGGGCCAGTAAGAAGTCT
TCTTTCCAGTCTTAGAAACTGTTTGAAAAACTGCCTCAGGCTCAACTTTTCCTTTCACTG
TCACCTTTTGTTCCTTGATATCAATGTCAAATGACTCAACGCCTTCCATTTTGCCTAGGA
CTCTATTGACGGCACCAACGCAACCTTGGCATGACATACCAACTTTGAGGACAACGGTCT
G
CATG

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4G823JQ 701 0 0
C
GAGAAAACATTTTTTAGTAAATCGGATACATTTTTTTAGTTCTTACAACAACAGATAAAC
ATAGGATAATAAGAAGCATTGCAAATATGGATTAAAATCATCATTACAATATTTCTTTGG
TACTTAAACTTGTGGTGGCTTAGTCTCGGCTTCAACGAGTTTCGGTTCAACATCAGCCTT
AGCATCGACCTTAGGATCAACCTTGGCATCAAGTATCTCAACATCAACCTTACCCTCGGT
CTTAGTCTCAGTTTCTGCGTGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGGCTCGACCTTAGCATC
AACCTTAACCTCCGGTACCTCAGCATCAACCTTACCCTCAGTCTTAGTCTCACCTTCAGG
TTTTGTCTCAGTCTCGTCCTTAGGCTCAACCTCAGCCTCCACGGGCCAGTAAGAAGTCTC
CTTTCCAGTCTTAGAAACTGTTTGAAAAACTGCCTCAGGCTCAACTTTTCCTTTCACTGT
CACCTTTTGTTCCTTGATATCAATGTCAAATGACTCAACGCCTTCCATTTTGCCTAGGAC
TCTATTGACGGCACCAACGCAACCTTGGCATGACATACCAACTTTGAGGACAACGGTCTG
AGACATGGCTACAACTTTAGATAAAACGAACCGAAAGCTTTGAGATCGGTGATCCGAATT
AGATAAAATGAGAAATGAGAAGATGTTTGTTTTTAGAATC

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR4G823TF 690 0 0
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AAGAAGCATTGCAAATATGGATTAAAATCATCATTACAATATTTCTTTGGTACTTAAACT
TGTGGTGGCTTAGTCTCGGCTTCAACGAGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGCATCGACC
TTAGGATCAACCTTGGCATCAAGTATCTCAACATCAACCTTACCCTCGGTCTTAGTCTCA
GTTTCTGCGTGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGGCTCGACCTTAGCATCAACCTTAACC
TCCGGTACCTCAGCATCAACCTTACCCTCAGTCTTAGTCTCACCTTCAGGTTTTGTCTCA
GTCTCGTCCTTAGGCTCAACCTCAGCCTCCACGGGCCAGTAAGAAGTCTCCTTTCCAGTC
TTAGAAACTGTTTGAAAAACTGCCTCAGGCTCAACTTTTCCTTTCACTGTCACCTTTTGT
TCCTTGATATCAATGTCAAATGACTCAACGCCTTCCATTTTGCCTAGGACTCTATTGACG
GCACCAACGCAACCTTGGCATGACATACCAACTTTGAGGACAACGGTCTGAGACATGGCT
ACAACTTTAGATAAAACGAACCGAAAGCTTTGAGATCGGTGATCCGAATTAGATAAAATG
AGAAATGAGAAGATGTTTGTTTTTAGAATC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4DK48JQ 701 0 0
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AGCATCGACCTTAGGATCAACCTTGGCATCAAGTATCTCATCATCAACCTTACCCTCGGT
CTTAGTCTCAGTTTCTGCGTGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGGCTCGACCTTAGCATC
AACCTTAACCTCCGGTACCTCAGCATCAACCTTACCCTCAGTCTTAGTCTCACCTTCAGG
TTTTGTCTCAGTCTCGTCCTTAGGCTCAACCTCAGCCTCCACGGGCCAGTAAGAAGTCTT
CTTTCCAGTCTTAAAAACTGTCTGAAAAACTGCCTCAGGCTCAACTTTTCCTTTCACTGT
CACCTTTTGTTCCTTGATATCAATGTCAAATGACTCAACGCCTTCCATTTTGCCTAGGAC
TCTATTGACGGCACCAACGCAACCTTGGCATGACATACCAACTTTGAGGACAACGGTCTG
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AGATAAAATGAGAAATGAGAAGATGTTTGTTTTTAGAATCC

QA 1 701 1 701
DS 

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AGATAAAATGAGAAATGAGAAGATGTTTGTTTTTAGAATCC

QA 1 101 1 101
DS 

RD RR4DK48TF 701 0 0
GAGAAACCATTTTTTGGTAAATCGGATACATTTTTT*AGTTCTTACAACAACAGATAGAC
ATAGGATAATAAGAAGCATTGCAAATATGGATTAAAATCATCATTACAATATTTCTTTGG
TACTTAAACTTGTGGTGGCTTAGTCTCGGCTTCAACGAGTTTCGGTTCAACATCAGCCTT
AGCATCGACCTTAGGATCAACCTTGGCATCAAGTATCTCATCATCAACCTTACCCTCGGT
CTTAGTCTCAGTTTCTGCGTGTTTCGGTTCAACATCAGCCTTAGGCTCGACCTTAGCATC
AACCTTAACCTCCGGTACCTCAGCATCAACCTTACCCTCAGTCTTAGTCTCACCTTCAGG
TTTTGTCTCAGTCTCGTCCTTAGGCTCAACCTCAGCCTCCACGGGCCAGTAAGAAGTCTT
CTTTCCAGTCTTAGAAACTGTCTGAAAAACTGCCTCAGGCTCAACTTTTCCTTTCACTGT
CACCTTTTGTTCCTTGATATCAATGTCAAATGACTCAACGCCTTCCATTTTGCCTAGGAC
TCTATTGACGGCACCAACGCAACCTTGGCATGACATACCAACTTTGAGGACAACGGTCTG
AGACATGGCTACAACTTTAGATAAAACGAACCGAAAGCTTTGAGATCGGTGATCCGAATT
AGATAAAATGAGAAATGAGAAGATGTTTGTTTTTAGAATCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 7

CO CL990Contig1 997 7 22 U
GGAAGGAAACGCTAGAAGAAAACTTTGACAAAACAGGTTGATTGCTTCGTTGGATTTGCT
GGAAATTAACCGCCTCCCTCATCATTTATAGCAACAAAAAAAACAGAGAGAATCTTGTCT
GAAACTGCACAAATTCGATTTTCTTCAACTTCAAATGTCTTACGCTTATCTCTTCAAGTA
TATCATCATCGGCGATACTGGAGTAGGGAAATCATGCCTACTGCTTCAGTTCACAGACAA
GAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTAACCATCGGTGTTGAGTTTGGGGCTAGGATGATCAC
CATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACCGCTGGTCAAGAATCATTTAG
GTCTATTACGAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCTGGGGCTTTGCTTGTCTACGACATCAC
TAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGTTAGAGGATGCAAGGCAGCATGCAAA
TGCTAACATGACCATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAAGGGCTGT
CACCACTGAGGAAGGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATCTTCATGGAAGCCTC
TGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAACAATATACAA
AAAGATTCAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCGAATGAGTCATATGGAATAAAAGTTGGATA
TGGAGGAATCCCAGGACCATCAGGTGGAAGAGACGGATCCACGTCGCAAGGAGGAGGTTG
CTGCAGCTAATAAGATAGTGAACAGTGTCTATATCCTCCTCATCATGTAAAAAAGAAAAT
CATCACTTATGGCGTAAGCCAAAAAAAAAAA*TATATCTACGCACGCTTTTCAATTAGAA
CTTGTAAATCGTTTTGGTGTTCGATTTGGTGACAGTGTTGTTTGTGGTGGAATTCGAAAC
TGATTATTCATTTATCTAAAAAGATGTGTGTTTACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 5 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GC43TF U 1
AF RR4CW79TF U 171
AF RR4BR91TF U 79
AF RR4ET09TF U 112
AF RR4CW79JQ C 365
AF RR4BR91JQ C 426
AF RR4ET09JQ C 434
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BS 663 663 RR4BR91TF
BS 664 711 RR4GC43TF
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BS 743 743 RR4CW79TF
BS 744 773 RR4BR91TF
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BS 777 777 RR4CW79TF
BS 778 789 RR4BR91TF
BS 790 790 RR4ET09TF
BS 791 801 RR4BR91TF
BS 802 802 RR4ET09TF
BS 803 833 RR4BR91TF
BS 834 836 RR4CW79JQ
BS 837 856 RR4BR91TF
BS 857 865 RR4ET09TF
BS 866 997 RR4CW79JQ

RD RR4GC43TF 730 0 0
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GGAAATTAACCGCCTCCCTCATCATTTATAGCAACAAAAAAAACAGAGAGAATCTTGTCT
GAAACTGCACAAATTCGATTTTCTTCAACTTCAAATGTCTTACGCTTATCTCTTCAAGTA
TATCATCATCGGCGATACTGGAGTAGGGAAATCATGCCTACTGCTTCAGTTCACAGACAA
GAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTAACCATCGGTGTTGAGTTTGGGGCTAGGATGATCAC
CATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACCGCTGGTCAAGAATCATTTAG
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TGCTAACATGACCATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAAGGGCTGT
CACCACTGAGGAAGGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATCTTCATGGAAGCCTC
TGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAACTATATACAA
AA*GATTCAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCGAATGAGTCATATGGAATAAA
GTGGATATGGAGGATCCCA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4CW79TF 623 0 0
G
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CGACATCACTAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGTTAGAGGATGCAAGGCA
GCATGCAAATGCTAACATGACCATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAG
AAGGGCTGTCACCACTGAGGAAGGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCATGGTCTTATCTTCAT
GGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAAC
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AGGAGGTTGCTGCAGCTAATAA

QA 2 623 2 623
DS 

RD RR4BR91TF 780 0 0
GG
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ATCTAACCATCGGTGTTGAGTTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCA
AACTCCAGATCTGGGATACCGCTGGTCAAGAATCATTTAGGTCTATTACGAGGTCTTACT
ATAGAGGTGCTGCTGGGGCTTTGCTTGTCTACGACATCACTAGGAGGGAGACGTTTAACC
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TCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAAGGGCTGTCACCACTGAGGAAGGTGAGC
AGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATCTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATG
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A*CAGTGTCTATATCCTCCTCATCATGTAAAAA**GAAATCATCACTTATGGCGTA
GC

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DS 

RD RR4ET09TF 754 0 0
GG
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TCAAGTATATCATCATCGGCGATACTGGAGTAGGGAAATCATGCCTACTGCTTCAGTTCA
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TGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACCGCTGGTCGAGAAT
CATTTAGGTCTATTACGAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCTGGGGCTTTGCTTGTCTACG
ACATCACTAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGTTAGAGGATGCAAGGCAGC
ATGCAAATGCTAACATGACCATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAA
GGACTGTCACCACTGAGGAAGGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATCTTCATGG
AAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAACAA
TATACAAAAAGATTCAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCGAATGAGTCATATGGAATAAAAG
TTGGATATGGAGGAATCCCAGGACCATCACGTGGAAGAGACGGATCCACGTCGCAAGGAG
GAG*TTGCTGCAGCTAATAAGATAGTGAACAGTGTCTATATCCTCCTCATCATGTAAAAA
**GAAATCATCACTTATGGCGTAAGCCAAAAA

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR4CW79JQ 633 0 0
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AACATGACCATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAAGGGCTGTCACC
ACTGAGGAAGGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCATGGTTTTATTTTCATGGAAGCCTCTGCC
AAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAACAATATACAAAAAG
ATTCAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCGAATGAGTCATATGGAATAAAAGTTGGATATGGA
GGAATCCCAGGACCATCAGGTGGAAGAGACGGATCCACGTCGCAAGGAGGAGGTTGCTGC
AGCTAATAAGATAGTGAACAGTGTCTATATCCTCCTCATCATGTAAAAAAGAAAATCATC
ACTTATGGCGTAAGCCAAAAAAAAAAA*TATATCTACGCACGCTTTTCAATTAGAACTTG
TAAATCGTTTTGGTGTTCGATTTGGTGACAGTGTTGTTTGTGGTGGAATTCGAAACTGAT
TATTCATTTATCTAAAAAGATGTGTGTTTACGG

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DS 

RD RR4BR91JQ 551 0 0
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ACATGACCATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAAGGGCTGTCACCA
CTGAGGAAGGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTTTTATTTTCATGGAAGCCTCTGCCA
AGACTGCTCAGAATGTCGAGGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAACAATATACAAAAAGA
TTCAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCGAATGAGTCATATGGAATAAAAGTTGGATATGGAG
GAATCCCAGGACCATCAGGTGGAAGAGACGGATCCACGTCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCA
GCTAATAAGATAGTGAACAGTGTCTATATCCTCCTCATCATGTAAAAAAGAAAATCATCA
CTTATGGCGTAAGCCAAAAAAAAAAAATATATCTACGCACGCTTTTCAATTAGAACTTGT
AAATCGTTTTGGTGTTCGATTTGGTGACAGTGTTGTTTGTGGTGGAATTCGAAACTGATT
ATTCATTTATC

QA 1 551 1 551
DS 

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ATTATGCTCATTGGGAATAAGTGTGATCTTTCCCACAGAAGGACTGTCACCACTGAGGAA
GGTGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTTTTATCTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCT
CAGAATGTCGAAGAGGCATTCATTAAGACAGCGGCAACAATATACAAAAAGATTCAAGAT
GGTGTGTTTGATGTGTCGAATGAGTCATATGGAATAAAAGTTGGATATGGAGGAATCCCA
GGACCATCAGGTGGAAGAGACGGATCCACGTCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCAGCTAATAA
GATAGTGAACAGTGTCTATATCCTCCTCATCATGTAAAAAAGAAAATCATCACTTATGGC
GTAAGCCAAAAAAAAAA**TATATCTACGCACGCTTTTCAATTAGAACTTGTAAATCGTT
TTGGTGTTCGATTTGGTGACAGTGTTGTTTGTGGTGGAATTCGAAACTGATTATTCATTT
ATCTAAAAAGATGTGTGTTTACG
C

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 7

CO CL991Contig1 781 7 17 U
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TCCATTACCCATCGAGAGCCCGTCTTCACATAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCC
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CCTACGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCAGTGAACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAA
AAGACGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCGGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAG
GTCCTCAATGGGATGGTTTAGGGTTCTTCATTCAGTACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCT
TCGCGTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGTACTTCA
AGGAGACGCAAGTGTATAAGGAGGCGATGGAGTCACGTGCCCTTCTTGATGAAGCAGAGG
GTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAAT
AGTTTTTAAGTTCTGTGTGTTTTAGATGTGTTTAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTC
ATAAATGTTACAGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTATTAAACCAAGAGTTCCGTG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 

AF RR4AL63TF U 1
AF RR4BI08JQ C 91
AF RR4B891JQ C 77
AF RR4B891TF U 36
AF RR4BI08TF U 36
AF RR4C779TF U 17
AF RR4C779JQ C 1
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BS 104 286 RR4AL63TF
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BS 450 450 RR4B891TF
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BS 550 550 RR4B891TF
BS 551 579 RR4AL63TF
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BS 581 744 RR4AL63TF
BS 745 778 RR4B891TF
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RD RR4AL63TF 744 0 0
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GTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAAT
AGTTTTTAAGTTCTGTGTGTTTTAGATGTGTTTAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTC
ATAAATGTTACAGTTACAGAATCA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4BI08JQ 688 0 0
TTCTCGTAATCCCTTCTCCACC*TCCAAACTCCATTACCCATCGAGAGCCCGTCTTCACA
TAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTC
GGACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGCCAGAAGATAGCAACGGTCTCTACG
ACGAGAACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGACGAAGATAGGTTTG
CAGTGAACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAAAAGACGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATC
TTCCGGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAATGGGATGGTTTAGGGTTCTTCA
TTCAGTACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGG
GGACGTACAACGAAGGTGCGACGTACTTCAAGGAGACGCAAGTGTATAAGGAGGCGATGG
AGTCACGTGCCCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTA
ATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTGTGTGTTTTAGATGTG
TTTAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGTTACAGAATCAAAAAGC
TAAAGTGATTATTAAACCAAGAGTTCCG

QA 1 688 1 688
DS 

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GACCTCACGAATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACC*TCCAAACTCCATTACCCATCGAG
AGCCCGTCTTCACATAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGA
CAGCAAGAAGCGTCGGACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGCCAGAAGATAG
CAACGGTCTCTACGACGAGAACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGA
CGAAGATAGGTTTGCAGTGAACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAAAAGACGCGCCAAAGAT
TTCGGTTAAGGATCTTCCGGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAATGGGATGG
TTTAGGGTTCTTCATTCAGTACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGG
TGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGTACTTCAAGGAGACGCAAGTGTA
TAAGGAGGCGATGGAGTCACGTGCCCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGA
TGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTGT
GTGTTTTAGATGTGTTTAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGTTA
CAGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTATTAAACCAAGAGTTCCG

QA 1 702 1 702
DS 

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G
GTGAGCACCGGTGGCGGAGGAGCTATCCTCCGCTCC*ATAGACCTCACGAATTCTTCTCG
TAATCCCTTCTCCACC*TCCAAACTCCATTACCCATCGAGAGCCCGTCTTCACATAGTCT
CTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGGACCC
TCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGCCAGAAGATAGCAACGGTCTCTACGACGAGA
ACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCAGTGA
ACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAAAAGACGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCGG
GGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAATGGGATGGTTTAGGGTTCTTCATTCAGT
ACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGT
ACAACGAAGGTGCGACGTACTTCAAGGAGACGCAAGTGTATAAGGAGGCGATGGAGTCAC
GTGCCCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGA
CAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTGTGTGTTTTAGATGTGTTTAAA
GTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGT
GATTATTAAACCAAGAGTTCCG

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DS 

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G
GTGAGCACCGGTGGCGGAGGAGCTATCCTCCGCTCC*ATAGACCTCACGAATTCTTCTCG
TAATCCCTTCTCCACC*TCCAAACTCCATTACCCATCGAGAGCCCGTCTTCACATAGTCT
CTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGGACCC
TCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGCCAGAAGATAGCAACGGTCTCTACGACGAGA
ACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCAGTGA
ACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAAAAGACGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCGG
GGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAATGGGATGGTTTAGGGTTCTTCATTCAGT
ACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGT
ACAACGAAGGTGCGACGTACTTCAAGGAGACGCAAGTGTATAAGGAGGCGATGGAGTCAC
GTGCCCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGA
CAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTGTGTGTTTTAGATGTGTTTAAA
GTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGT
GATTATTAAACCAAGAGTTCCG

QA 2 743 2 743
DS 

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A
AAAAAAAATGGCACTCACCGTGAGCACCGGTGGCGGAGGAGCTATCCTCCGCTCC*ATAG
ACCTCACGAATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACC*TCCAAACTCCATTACCCATCGAGA
GCCCGTCTTCACATAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGAC
AGCAAGAAGCGTCGGACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGCCAGAAGATAGC
AACGGTCTCTACGACGAGAACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGAC
GAAGATAGGTTTGCAGTGAACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAAAAGACGCGCCAAAGATT
TCGGTTAAGGATCTTCCGGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAATGGGATGGT
TTAGGGTTCTTCGTTCAGTACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGT
GCTATTGCGGCTGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAGGAGACGCCAGTGTAT
AAGGAGGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGAT
GTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGA*TAGTTTTTAAGTTCTGTG
TGTTTTAGATGTGTTTAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGTTAC
AGAATCAAAA*GCTAAAGTGAT
ATAAAC

QA 2 743 2 743
DS 

RD RR4C779JQ 781 0 0
GGCTCACATATCCACAC
AAAAAAAATGGCACTCACCGTGAGCACCGGTGGCGGAGGAGCTATCCTCCGCTCCCATAG
ACCTCACGAATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACCCTCCAAACTCCATTACCCATCGAGA
GCCCGTCTTCACATAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGAC
AGCAAGAAGCGTCGGACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGCCAGAAGATAGC
AACGGTCTTTACGACGAGAACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGAC
GAAGATAGGTTTGCAGTGAACACGCGTTTCAGAGGTGATCCAAAAGACGCGCCAAAGATT
TCGGTTAAGGATCTTCCGGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAATGGGATGGT
TTAGGGTTCTTCGTTCAGTACCTATGGGCTTTCGGAATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGT
GCTATTGCGGCTGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAGGAGACGCCAGTGTAT
AAGGAGGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGAT
GTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTGTG
TGTTTTAGATGTGTTTAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGTTAC
AGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTATTAAACCAAGAGTTCCGTGG

QA 18 781 18 781
DS 



AS 1 7

CO CL992Contig1 818 7 12 U
GGGTCGAGAAAAAAAAAAAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTC
TCTTTTCTGCACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCG
AAGTATGCCTCAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCA
AGCTTCACGATGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAA
ACCCTCAGCCGTTGGTTGAAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACAT
TACCCCAGCCGTCGACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACCTAGACGCGT
GGTGGTACGGAGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGA
CCAAACATTTGTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACG
GTGAATGGGTTCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCGTCTTAGATTCTCCGAT
GTTTCTTGGTCGCTAGTTGTTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTT
TT*ATATCGGTTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGA
AACGACTTCTAGAACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCAC
AGCCACTTGTTTTGCTGTTGCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAAACTATGTTATTTGAT
TACTCTGTTTTGAATTTATGAAGCGAAACCTTGACAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 0 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP88TF U 2
AF RR4C203TF U 3
AF RR4C203JQ C 3
AF RR4AO17TF U 1
AF RR4CP88JQ C 6
AF RR4C103TF U 3
AF RR4C103JQ C 39
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GGGTCGAGA
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AGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTT
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CGCTAGTTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTTTATATCGG
TTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCT
AGAACAAATCGT*AGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTA
TCATGCACAGC

QA 10 709 10 709
DS 

RD RR4C203TF 671 0 0
GGGTCGAG
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CAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCAAGCTTCACGA
TGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCC
GTTGGTTGAAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTACCCCAGCC
GTCGACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGTTGCTTTTGACCTAGACGCGTGGTGGTACGG
AGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTT
GTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGT
TCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCGTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGT
CGCTAGTTGTTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTT*ATATCGG
TTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGAA*CGACTTCT
AGA

QA 9 671 9 671
DS 

RD RR4C203JQ 670 0 0
GGGTCGAG
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TGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCC
GTTGGTTGAAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTACCCCAGCC
GTCGACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGTTGCTTTTGACCTAGACGCGTGGTGGTACGG
AGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTT
GTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGT
TCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCGTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGT
CGCTAGTTGTTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTT*ATATCGG
TTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCT
AG

QA 9 670 9 670
DS 

RD RR4AO17TF 781 0 0
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TCCTTTCTGCACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCG
AAGTATGCCTCAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCA
AGCTTCACGATGGAACTTTCTACGAAGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAA
ACCCTCAGCCGTTGGTTGAAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACAT
TACCCCAGCCGTCGACGCTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACCTAGACGCGT
GGTGGTACGGAGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGA
CCAAACATTTGTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACG
GTGAATGGGTTCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGAT
GTTTCTTGGTCGCTAGTTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTT
TT*ATATCGGTTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGA
AACGACTTCTAGAACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCAC
AGCCACTTGTTTTGCTGTTGCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAAACTATGTT
ATTTGATT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4CP88JQ 773 0 0
CGAGA
AAAAAAAAAAGAGGTTTGCAGAT*CTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTCTCCTTTCTGC
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CAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCAAGCTTCACGA
TGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCC
GTTGGTTGAAACCATTTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTACCCCAGCC
GTCGACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACCTAGACGCGTGGTGGTACGG
AGAGATTTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTT
GTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGCTGACGGTGAATGGGT
TCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTTTTAGATTTTCCGATGTTTCTTGGT
CGCTAGTTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTT*ATATCGG
TTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCT
AGAACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACAGCCACTTGT
TTTGCTGTTGCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAAACTATGTT
ATTTG

QA 6 768 6 768
DS 

RD RR4C103TF 783 0 0
GGGTCGAG
AAAAAAATAAGAGGTTTGCAGATTCTTTCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTCTCTTTTCTGC
ACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCGAAGTATGCCT
CAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCAAGCTTCACGA
TGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCC
GTTGGTTAAAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTACCCCAGCC
GTCGACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACCTAGACGCGTGGTGGTACGG
AGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTT
GTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGT
TCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCGTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGT
CGCTAGTTGTTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTT*ATATCGG
TTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCT
AGAACAAATCGTTAGCCCTA*AAAGTTTGATCATTTTGTAATCA*TGCACAGCCACTTGT
TTTGCTGTTGCTTTCACAATGA*TGTTGTATTCAACCTATGTT
TTTGATACTCTG

QA 9 771 9 771
DS 

RD RR4C103JQ 780 0 0
CTCTCGATCTCTCGTCCAAGTCTCTTTTCTGCACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAG
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TTTGAGGCCAAGGTATTGTCCAAGCTTCACGATGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAG
AACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCCGTTGGTTAAAACCATCTCCGCCGACGAC
ATCCGTCCGATGCCACCTACATTACCCCAGCCGTCGACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTT
GATGCTTTTGACCTAGACGCGTGGTGGTACGGAGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACG
TACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTTGTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGA
AAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGTTCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGT
TGAGCGTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGTCGCTAGTTGTTGTTCTTAATAATCCGCA
ACGTTTATCGTTGTAATACTTTTT*ATATCGGTTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTA
AGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCTAGAACAAATCGTTAGCCCTAAAAAGTTT
GATCATTTTGTAATCAATGCACAGCCACTTGTTTTGCTGTTGCTTTCACAATGAATGTTG
TATTCAACCTATGTTATTTGATTACTCTGTTTTGAATTTATGAAGCGAAACCTTGACAGG

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 7

CO CL993Contig1 807 7 11 U
GGATTTTCATTGATATATATAGTTGTTTGTGTGTGTATGAAGTCTATAGCCGATCGTCGT
CAGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAGTCTATAGCCGATAAATCTTGAAAATTTAATCAG
ATACAGAGTACCCATTTCCACCAACCCCAAAAGGTCTAAAACTATCAGAAACAGAACCAC
CGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCATAACCGATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGC
TCGACAAGAACCAAGACGGTCTCGTGACCCTCGACGAGCTTCATTGGATTCTAGAGCGAC
TCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAACTCGAACTGTTCGTTGGGAAGAAGAGCCTCG
ACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTACGACGACGCCGTTTCAAATAGGAAGGAAACAAAGA
GCAATAGTGTTGTTGATAATGATGATGATGCTATTGTGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATG
TGAACGGAGACGGTTATATTTCGTCGGAGGAGCTTCGAACGGTGTTGGAACGACTCGGAT
TTGAGGAGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTGGGAGGATGATTCGAGCTCATGACAAGAATC
TTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTAAGAACATGATGTTACATGTCCAATGATGCT
TGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGTTTTGTGTGTTGTGTGTAAACTCCTTAAAAG
TAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTAATGTAAAATATACACATCTCTGTTACTTTT
TTGCCAAATCATATGTTAAGTATAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 10 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 25 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F494TF U 1
AF RR4DP81TF U 89
AF RR4F919TF U 89
AF RR4D222TF U 44
AF RR4D222JQ C 87
AF RR4DP81JQ C 93
AF RR4F494JQ C 157
BS 1 82 RR4F494TF
BS 83 83 RR4D222TF
BS 84 110 RR4F494TF
BS 111 111 RR4DP81TF
BS 112 654 RR4F494TF
BS 655 657 RR4D222TF
BS 658 718 RR4F494TF
BS 719 719 RR4D222TF
BS 720 755 RR4F494TF
BS 756 781 RR4D222TF
BS 782 807 RR4F494JQ

RD RR4F494TF 755 0 0
GGATTTTCATTGATATATATAGTTGTTTGTGTGTGTATGAAGTCTATAGCCGATCGTCGT
CAGAAAAAAAAGAAAAAAAAAA*GAAGTCTATAGCCGATAAATCTTGAAACTTTAATCAG
ATACAGAGTACCCATTTCCACCAACCCCAAAAGGTCTAAAACTATCAGAAACAGAACCAC
CGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCATAACCGATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGC
TCGACAAGAACCAAGACGGTCTCGTGACCCTCGACGAGCTTCATTGGATTCTAGAGCGAC
TCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAACTCGAACTGTTCGTTGGGAAGAAGAGCCTCG
ACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTACGACGACGCCGTTTCAAATAGGAAGGAAACAAAGA
GCAATAGTGTTGTTGATAATGATGATGATGCTATTGTGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATG
TGAACGGAGACGGTTATATTTCGTCGGAGGAGCTTCGAACGGTGTTGGAACGACTCGGAT
TTGAGGAGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTGGGAGGATGATTCGAGCTCATGACAAGAATC
TTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTAAGAACATGATGTTACATGTCCAAT***GCT
TGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGTTTTGTGTGTTGTGTGTAAACTCCTTAAA*G
TAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTAATGTA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4DP81TF 664 0 0
GG
ATAGACGATAAATCTTGAAAAATTATTCAGATACAGAGTACCCATTTCCACCAACC**AA
AAGGTCTAAAACTATCAGAAACAGAACCACCGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCA
TAACCGATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGCTCGACAAGAACCACGACGGTCTCGTGACCC
TCGACGAGCTTCATTGGATTCTAGAGAGACTCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAAC
TCGAACTTTTCGTTGGGAAAAAGAGCCTCGACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTATGACG
ACGCCGTTTCTAATAGGAAGGAAACAAAGAGCAATAGTGTTGTTGATAATGACGATGATG
CTATTGTGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATGTGAACGGAGATGGTTATATTTCGTCGGAGG
AGCTTCGAACGGTGTTGGAACGGCTCGGATTTGAGGAGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTG
GGAGGATGATTCGAGCTCATGACAAGAATCTTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTA
AGAACATGATGTTACATGTCCAATGATGCTTGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGT
TTTGTGTGTTGTGTGTAAACTCCTTAAAAGTAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTA
AT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4F919TF 658 0 0
GG
ATAGACGATAAATCTTGAAAATTTATTCAGATACAGAGTACCCAATTCCTA*AAC***AA
AAGGTCTAAAACTATCAGAAACAGAACCACCGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCA
TAAACGATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGCTCGACAAGAACCAAGACGGTCTAGTGACCC
TCGACGAGCTTCATTGGATTCTAGAGAGACTCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAAC
TCGAACTTTTCGTTGGGAAAAAGAGCCTCGACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTACGACG
ACGCCGTTTCTAATAGGAAGGAAACAAAGAGCAATAGTGTTGTTGATAATGACGATGATG
CTATTGTGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATGTGAACGGAGACGGTTATATTTCGTCGGAGG
AGCTTCGAACGGTGTTGGAACGGCTCGGATTTGAGGAGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTG
GGAGGATGATTCGAGCTCATGACAAGAATCTTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTA
AGAACATGATGTTACATGTCCAATGATGCTTGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGT
TTTGTGTGTTGTGTGTAAACTCCTTAAA*GTAAGTATATATGCTTATATGTTATGT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR4D222TF 741 0 0
GG
ATAGCCGATCGTCGTCAGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAGTCTATAGCCGATAAATCT
TGAAACTTTAATCAGATACAGAGTACCCATTTCCACCAACCCCAAAAGGTCTAAAACTAT
CAGAAACAGAACCACCGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCATAACCGATCTCCAAA
GAATGTTCCAAATGCTCGACAAGAACCAAGACGGTCTCGTGACCCTCGACGAGCTTCATT
GGATTCTAGAGCGACTCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAACTCGAACTGTTCGTTG
GGAAGAAGAGCCTCGACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTACGACGACGCCGTTTCAAATA
GGAAGGAAACAAAGAGCAATAGTGTTGTTGATAATGATGATGATGCTATTGTGAGTGCGT
TTAATGTGTTCGATGTGAACGGAGACGGTTATATTTCGTCGGAGGAGCTTCGAACGGTGT
TGGAACGACTCGGATTTTTG*AGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTGGGAGGATGATTCGAG
CCCATGACAAGAATCTTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTAAGAACATGATGTTAC
ATGTCCAATGATGCTTGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGTTTTGTGTGTTGTGTG
TAAACTCCTTAAAAGTAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTAATGTAAAATATACAC
ATCTCTGTTACTTTTT
GCC

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR4D222JQ 699 0 0
GTCT
ATAGCCGATAAATCTTGAAACTTTAATCAGATACAGAGTACCCATTTCCACCAACCCCAA
AAGGTCTAAAACTATCAGAAACAGAACCACCGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCA
TAACCGATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGCTCGACAAGAACCAAGACGGTCTCGTGACCC
TCGACGAGCTTCATTGGATTCTAGAGCGACTCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAAC
TCGAACTGTTCGTTGGGAAGAAGAGCCTCGACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTACGACG
ACGCCGTTTCAAATAGGAAGGAAACAAAGAGCAATAGTGTTGTTGATAATGATGATGATG
CTATTGTGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATGTGAACGGAGACGGTTATATTTCGTCGGAGG
AGCTTCGAACGGTGTTGGAACGACTCGGATTTTTG*AGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTG
GGAGGATGATTCGAGCCCATGACAAGAATCTTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTA
AGAACATGATGTTACATGTCCAATGATGCTTGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGT
TTTGTGTGTTGTGTGTAAACTCCTTAAAAGTAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTA
ATGTAAAATATACACATCTCTGTTACTTTTT
TGCC

QA 5 695 5 695
DS 

RD RR4DP81JQ 693 0 0
AGA
CGATAAATCTTGAAAAATTATTCAGATACAGAGTACCCATTTCCACCAACC**AAAAGGT
CTAAAACTATCAGAAACAGAACCACCGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCATAACC
GATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGCTCGACAAGAACCACGACGGTCTCGTGACCCTCGAC
GAGCTTCATTGGATTCTAGAGAGACTCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAACTCGAA
CTTTTCGTTGGGAAAAAGAGCCTCGACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTATGACGACGCC
GTTTCTAATAGGAAGGAAACAAAGAGCAATAGTGTTGTTGATAATGACGATGATGCTATT
GTGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATGTGAACGGAGATGGTTATATTTCGTCGGAGGAGCTT
CGAACGGTGTTGGAACGGCTCGGATTTGAGGAGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTGGGAGG
ATGATTCGAGCTCATGACAAGAATCTTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTAAGAAC
ATGATGTTACATGTCCAATGATGCTTGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGTTTTGT
GTGTTGTGTGTAAACTCCTTAAAAGTAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTAATGTA
AAATATATACATCTCTGTTACTTTTT
TGCC

QA 4 689 4 689
DS 

RD RR4F494JQ 651 0 0
TAAAACTATCAGAAACAGAACCACCGAGAGATATGGATTGTTCATTCATAAGCATAACCG
ATCTCCAAAGAATGTTCCAAATGCTCGACAAGAACCAAGACGGTCTCGTGACCCTCGACG
AGCTTCATTGGATTCTAGAGCGACTCGGCTGGTCCGAACACACTCCCGAAGAACTCGAAC
TGTTCGTTGGGAAGAAGAGCCTCGACTTAGAGGAATTCCTTCGGTTTTACGACGACGCCG
TTTCAAATAGGAAGGAAACAAAGAGCAATAGTGTTGTTGATAATGATGATGATGCTATTG
TGAGTGCGTTTAATGTGTTCGATGTGAACGGAGACGGTTATATTTCGTCGGAGGAGCTTC
GAACGGTGTTGGAACGACTCGGATTTGAGGAGGAGACAAAGAGTTGGGATTGTGGGAGGA
TGATTCGAGCTCATGACAAGAATCTTGATGGTGTTATTGATATTGAAGAGTTTAAGAACA
TGATGTTACATGTCCAAT***GCTTGCATATGTGTGTATAGTCCGGTGACATGTTTTGTG
TGTTGTGTGTAAACTCCTTAAAAGTAAGTATATATGCTTATATGTTATGTGTTAATGTAA
AATATATACATCTCTGTTACTTTTTTGCCAAATCATATGTTAAGTATAGCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 2 6

CO CL994Contig1 815 4 2 U
GGCTTAGGAAAACTAGAAATTTAATAACCATCAATATAAGAGTAGATGCCCTTGTAAAGG
ACCAATGGAAACATAATTAAGAGTAAAACTAAGAACAGTAACCGACATGGTCTGAAACAG
AAGACTCAAAAGACACGCAAAACCAAAGTCATGAAAACCCAAAGCCATTTCATACAACCA
AATCTAGCTGGTGAAAAGGCTTTTTCAGACACGAGACAAGGACAATAGGAAGAACGTAGC
AATGAGTACGGTGGTGAAGGAGATCGGAACCAAGGAAGATCCGTCGTTCCCTGGAGATGG
GTTTGGAGCTAGAACTCTAACTAAGTCGGGTCCAGCAGCTGCAGAAGCTCCTCCTGGAGC
TAGACCTGGAGCCATAGTAGGAGCGACGGACAATCCACAAGCAGCGATGGAAGGAGCGTG
AAGCTTGCATGCAGCGGGAAGTGTAGTTGCTTTAGTCATGTTCAAGGTAACGCCTAGAGA
AGCGCTGCTTTTAAACGCCTCACAGAGACACTCTGCGTCAGTCTTGAGAACCGTCTTGAG
CCCGTTGCAGCACGAACTAGCCGGCTTAGCCTCCGTGCCTCCAGCGGAAACGAAAGACAG
ACAGTCAGCCATGTTGAGTATGAGCGTCGAACAGTCTACGGCAGGAGCTGGAGCCGCAGT
GTGGTGATGAGAAGCGCCAAGAACGGAGGGGATGGATAGAAGGAGGATGAAAAGAAAAGG
TGTCAAGGTAGAGAAGGAAGTGGCCATTGTAGGTGTTTTTAGGTGAAAGATGAGAGGAGT
TTTAATGGAGAAGAAGTGTGTGGTGGAGAGTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4E075JQ U 6
AF RR4C680TF C 118
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GA

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GCTT
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CTGGAGCCATAGTAGGAGCGACGGACAATCCACAAGCAGCGATGGAAGGAGCGTGAAGCT
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GATGAGAAGCGCCAAGAACGGAGGGGATGG

QA 5 694 5 694
DS 

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TGGAAACATAATTAAGAGTAAAACTAAGAACAGTAACCGACATGGTCTGAAACAGAAGAC
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GAGCTAGAACTCTAACTAAGTCGGGTCCAGCAGCTGCAGAAGCTCCTCCTGGAGCTAGAC
CTGGAGCCATAGTAGGAGCGACGGACAATCCACAAGCAGCGATGGAAGGAGCGTGAAGCT
TGCATGCAGCGGGAAGTGTAGTTGCTTTAGTCATGTTCAAGGTAACGCCTAGAGAAGCGC
TGCTTTTAAACGCCTCACAGAGACACTCTGCGTCAGTCTTGAGAACCGTCTTGAGCCCGT
TGCAGCACGAACTAGCCGGCTTAGCCTCCGTGCCTCCAGCGGAAACGAAAGACAGACAAT
CAGCCATGTTGAGTATGAGCGTCGAACAGTCTACGGCAGGAGCTGGAGCCGCAGAGTGGT
GATGAGAAGCGCCAAGAACGGAGGGGATGGA
GAG

QA 1 691 1 691
DS 

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CCAAATCTAGCTGGTGAAAAGGCTTTTTCAGACACGAGACAAGGACAATAGGAAGAACGT
AGCAATGAGTACGGTGGTGAAGGAGATCGGAACCAAGGAAGATCCGTCGTTCCCTGGAGA
TGGGTTTGGAGCTAGAACTCTAACTAAGTCGGGTCCAGCAGCTGCAGAAGCTCCTCCTGG
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GAGCCCGTTGCAGCACGAACTAGCCGGCTTAGCCTCCGTGCCTCCAGCGGAAACGAAAGA
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DS 



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TCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTAGCTCCAGGAGGAGCTTCTGCAGCTGCTGGACCCG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO84TF U 6
AF RR4E075TF U 1
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GGG
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GGCGCTTCTCATCACCACTCTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGACGCTCATA
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CTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTCCG
TCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTAGCTCCAGGAGGAGCTTCTGCAGCTGCTGGACCCG
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TTAATTATGTT

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DS 



AS 1 7

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TACCAAGAGCGATGTAAGCGCGGTGGACGAGGCAATCGCGCTCGATGATATCTTCCTGCG
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TTCTCAGATTAAAGAGGTGATCTGGTCCTGCCGCCATGGATGATGCCATTTGCTGCTGCT
TCTTCGTCTTCTTCCTCTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU56JQ U 165
AF RR4EL07JQ U 1
AF RR4A293JQD U 4
AF RR4G406JQ U 46
AF RR4G406TF C 33
AF RR4A293JQ U 4
AF RR4A293TFB C 421
BS 1 44 RR4EL07JQ
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BS 46 102 RR4EL07JQ
BS 103 103 RR4A293JQ
BS 104 428 RR4EL07JQ
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BS 430 712 RR4EL07JQ
BS 713 812 RR4A293JQ
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RD RR4BU56JQ 368 0 0
AAAAGCAGCGACTCTAGGGGAGACAAAGAGTCCTTATGCATTGTTTTAGCAGTGAACCAC
GGATTTTGAGTTCTTTCAGGCGAAAGATTGAAGCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCAGCAAA
TGCTGCTCTCTTCACAAGTACATGTTCTGGATGCGACAGTTTCAGCTGGCTTAGGTAACG
TGATGATGATTGTTTCCCCACATGAATACTGCACACAACTAAGTTTGCAAGAGTTTCTGG
GTCTTTCCCATCCTTGTTGAGTGCTTCAAGCAAAAAAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCC
CATATGCATGCAACAAACCGCCTT*GCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCT
CA
AAAAAA

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DS 

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TAGAAATCAAAGAAAATGCTACATGTCCAATGAAAAAAAACCGGTTCATATACTAGTTTC
ACGATAGGGTTGTACGAATAAGATGCTCATTCTGATAGATCTATAAAAGCAGCGACTCTA
GGTGAGACAAAGAGTCCTTATGCATTGTTTTAGCAGTGAACCACGGATTTTGAGTTCTTT
CAGGCGAAAGATTGAAGCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCAGCAGATGCTGCTCTCTTCACA
AGTACATGTTCTGGATGCGACAGTTTCAGCTGGCTTAGGTAACGTGATGATGATTGTTTC
CCCACATGAATACTGCACACAACTAAGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCTTTCGCATCCTTG
TTGAGTGCCTCAAGCAGAAGAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCCCATATGCATGCAACAA
ACCGCCTT*GCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCTCAGAGAAATCCTGGAA
GATTAGATAAGCTTCCTGTATCTTGGAACCCCC*AACTGCCAGGTTCAACCATGCACTGG
CGAGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCATCAAACTGTTGCATCACTCTCAGCTGTTTCTCAG
CATAATCTGACCTGTGCATCTTTATGAATATCTGGACATTCAAAGCATGCAG
TCCATGGTTCCT

QA 1 712 1 712
DS 

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AAATCAAAGAAAATGCTACATGTCCAATGAAAAAAAACCAGTTCATATACTAGTTTCACG
ATAGGGTTGTACGAATAAGATGCTCATTCTGATAGATCTATAAAAGCAGCGACTCTAGGT
GAGACAAAGAGTCCTTATGCATTGTTTTAGCAGTGAACCACGGATTTTGAGTTCTTTCAG
GCGAAAGATTGAAGCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCAGCAGATGCTGCTCTCTTCACAAGT
ACATGTTCTGGATGCGACAGTTTCAGCTGGCTTAGGTAACGTGATGATGATTGTTTCCCC
ACATGAATACTGCACACAACTAAGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCTTTCGCATCCTTGTTG
AGTGCTTCAAGCAGAAGAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCCCATATGCATGCAACAAACC
GCCTT*GCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCTCAGAGAAATCCTGGAAGAT
TAGATAAGCTTCCTGTATCTTGGAACCCCC*AACTGCCAGGTTCAACCATGCACTGGCGA
GTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCATCAAACTGTTGCATCACTCTCAGCTGTTTCTCAGCAT
AATCTGACCTGTGCATCTTTATGAATATCTGGACATTCAAAGCATGCAGGTCC
ATGG

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DS 

RD RR4G406JQ 672 0 0
AAAAGCTTCGGTGAGTAGAAATCAAAGAAAATGCTACATGTCCAATGAAAAAAAACCAGT
TCATATACTAGTTTCACGATAGGGTTGTACGAATAAGATGCTCATTCTGATAGATCTATA
AAAGCAGCGACTCTAGGTGAGACAAAGAGTCCTTATGCATTGTTTTAGCAGTGAACCACG
GATTTTGAGTTCTTTCAGGCGAAAGATTGAAGCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCAGCAGAT
GCTGCTCTCTTCACAAGTACATGTTCTGGATGCGACAGTTTCAGCTGGCTTAGGTAACGT
GATGATGATTGTTTCCCCACATGAATACTGCACACAACTAAGTTTGCAAGAGTTTCTGGG
TCTTTCGCATCCTTGTTGAGTGCTTCAAGCAGAAGAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCCC
ATATGCATGCAACAAACCGCCTT*GCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCTC
AGAGAAATCCTGGAAGATTAGATAAGCTTCCTGTATCTTGGAACCCCC*AACTGCCAGGT
TCAACCATGCACTGGCGAGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCATCAAACTGTTGCATCACTC
TCAGCTGTTTCTCAGCATAATCTGACCTGTGCATCTTTATGAATATCTGGACATTCAAAG
CATGCAGGTCC
C

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DS 

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TTTTTTTTTCGAC
AAAAGCTTCGGTGAGTAGAAATCAAAGAAAATGCTACATGTCCAATGAAAAAAAACCAGT
TCATATACTAGTTTCACGATAGGGTTGTACGAATAAGATGCTCATTCTGATAGATCTATA
AAAGCAGCGACTCTAGGTGAGACAAAGAGTCCTTATGCATTGTTTTAGCAGTGAACCACG
GATTTTGAGTTCTTTCAGGCGAAAGATTGAAGCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCAGCAGAT
GCTGCTCTCTTCACAAGTACATGTTCTGGATGCGACAGTTTCAGCTGGCTTAGGTAACGT
GATGATGATTGTTTCCCCACATGAATACTGCACACAACTAAGTTTGCAAGAGTTTCTGGG
TCTTTCGCATCCTTGTTGAGTGCTTCAAGCAGAAGAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCCC
ATATGCATGCAACAAACCGCCTT*GCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCTC
AGAGAAATCCTGGAAGATTAGATAAGCTTCCTGTATCTTGGAACCCCC*AACTGCCAGGT
TCAACCATGCACTGGCGAGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCATCAAACTGTTGCATCACTC
TCAGCTGTTTCTCAGCATAATCTGACCTGTGCATCTTTATGAATATCTGGACATTCAAAG
CATGCAGGTCC
C

QA 14 684 14 684
DS 

RD RR4A293JQ 809 0 0
GAACAAATCTCTAGTACTGTCGAATTCGAACAGAAAGACAACAAAAGCTTCGGTGAGTAG
AAATCAAAGAAAATGCTACATGTCCAATGAAAAAAAACCAGTTCATATACTAGTTTCACG
ATAGGGTTGTACGAATAAGATGCTCATTCTGATAGATCTATAAAAGCAGCGACTCTAGGT
GAGACAAAGAGTCCTTATGCATTGTTTTAGCAGTGAACCACGGATTTTGAGTTCTTTCAG
GCGAAAGATTGAAGCGCTCTCTCGAAGTTATCTTCAGCAGATGCTGCTCTCTTCACAAGT
ACATGTTCTGGATGCGACAGTTTCAGCTGGCTTAGGTAACGTGATGATGATTGTTTCCCC
ACATGAATACTGCACACAACTAAGTTTGCAAGAGTTTCTGGGTCTTTCGCATCCTTGTTG
AGTGCTTCAAGCAGAAAAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCCCATATGCATGCAACAAACC
GCCTT*GCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCTCAAAAAAATCCTGGAAGAT
TAAATAAGCTTCCTGTATCTTGGAACCCCC*AACTGCCAGGTTCAACCATGCACTGGCGA
GTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCATCAAACTGTTGCATCACTCTCAGCTGTTTCTCAGCAT
AATCTGACCTGTGCATCTTTATGAATATCTGGACATTCAAAGCATGCAGGTCCATGGTTC
CCCCAGAATGAGTGTGCTTAAGAGCCTCGCTATAGTCTTCCTCATGCATGAAGATAGTAC
CAGCAATCAACCTAACAGTAGCATTGTTT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4A293TFB 740 0 0
TTGAGTGCTTCAAGCAGAAGAGTCTCAGCTTCTTCAAAGTTGCCCATATGCATGCAACAA
ACCGCCTTTGCTGTTCAAGATCAAGCTTGTCATTGGGTACTTCTCAGAGAAATCCTGGAA
GATTAGATAAGCTTCCTGTATCTTGGAACCCCCCAACTGCCAGGTTCAACCATGCACTGG
CGAGTTGAGTGAGAGTGTGGTCTTCATCAAACTGTTGCATCACTCTCAGCTGTTTCTCAG
CATAATCTGACCTGTGCATCTTTATGAATATCTGGACATTCAAAGCATGCAGGTCCATGG
TTCCCCCAGAATGAGTGTGCTTAAGAGCCTCGCTATAGTCTTCCTCATGCATGAAGATAG
TACCAGCAATCAACCTAACAGTAGCATTGTTTCCACCAGTTGGATCTGCCAACCATTCCC
TCAAGCTAGCAATGGTTGATTCCTTATTTTCAGGGCTCGATAGATACATAGCGAGGAGAT
TCACTGCCTGAAGAGGAGTAGCCGACGCTTCGTCGATCTCATTGATGACAAGCTGGTAGC
TACCAAGAGCGATGTAAGCGCGGTGGACGAGGCAATCGCGCTCGATGATATCTTCCTGCG
AAAGATTAGGGATCTCGCTGTTGTTGATCGCCGCTTGATACGCACCTAGGTAAAAACTGC
TTCTCAGATTAAAGAGGTGATCTGGTCCTGCCGCCATGGATGATGCCATTTGCTGCTGCT
TCTTCGTCTTCTTCCTCTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 7

CO CL996Contig1 1055 7 24 U
GGGATATCAGATTCAGTTTCTCTCTCGAAATTCCAAATTTCAAACCACCACTCAGATCTT
TAGACGAAGAACAAAGGATTCAAAAGATGACATCATCATCACGGGAAGAGAATGTGTACA
TGGCGAAACTAGCGGAGCAGGCGGAGCGTTACGAAGAAATGGTGGAGTTCATGGAGAAAG
TTGCCAAATCCGTTGACAACGAAGAACTCACCGTCGAGGAGAGGAACCTTCTCTCCGTTG
CTTACAAGAACGTGATCGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGC
AGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGGA
AGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGATTTTGAATGTCCTCGAAGCTCATC
TCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATT
ATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCA
CTTTGGTTTCTTACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACC
CCATCAGGCTTGGTCTTGCGCTCAACTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATACTTAACTCCC
CTGACCGTGCCTGCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATA
CGTTGGGTGAGGAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTTAGAGACAATC
TCACTCTCTGGACTTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAA
AGCCAGAAGGTGCAGCAGAGTAAAGCTGAAGACTAGGAACTGGTAGAAACTTCCTAGAAG
GTTATGTGATAATTCTGAGTGATAGCTCAGAACTCGTACCAGATATCACTCTTATTGTTT
GTTTTGTTTGTTTGGATACCAAATTTGAAAACCACTTTGCGAATTTGCGATTGATTCCAT
ATAAATTTCCTATTTTTCAGTGAAATTTCGGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GF11TF U 1
AF RR4G105TF U 29
AF RR4A875TF U 42
AF RR4AH56TF U 229
AF RR4AH56JQ C 229
AF RR4GF11JQ C 492
AF RR4G105JQ C 307
BS 1 256 RR4GF11TF
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BS 258 337 RR4GF11TF
BS 338 339 RR4G105TF
BS 340 349 RR4GF11TF
BS 350 350 RR4G105TF
BS 351 357 RR4GF11TF
BS 358 358 RR4G105TF
BS 359 406 RR4GF11TF
BS 407 407 RR4G105TF
BS 408 412 RR4GF11TF
BS 413 413 RR4G105TF
BS 414 563 RR4GF11TF
BS 564 688 RR4G105TF
BS 689 689 RR4AH56TF
BS 690 733 RR4G105TF
BS 734 734 RR4A875TF
BS 735 743 RR4G105TF
BS 744 744 RR4A875TF
BS 745 777 RR4G105TF
BS 778 778 RR4A875TF
BS 779 812 RR4G105TF
BS 813 896 RR4AH56TF
BS 897 1055 RR4AH56JQ

RD RR4GF11TF 563 0 0
GGGATATCAGATTCAGTTTCTCTCTCGAAATTCCAAATTTCAAACCACCACTCAGATCTT
TAGACGAAGAACAAAGGATTCAAAAGATGACATCATCATCACGGGAAGAGAATGTGTACA
TGGCGAAACTAGCGGAGCAGGCGGAGCGTTACGAAGAAATGGTGGAGTTCATGGAGAAAG
TTGCCAAATCCGTTGACAACGAAGAACTCACCGTCGAGGAGAGGAACCTTCTCTCCGTTG
CTTACAAGAACGTGATTGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGC
AGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCCGTCATCAAGGATTACAGGGCGA
AGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGATTTTGAATGTTCTCGAGGCTCATC
TCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATT
ATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCA
CTTTGGTTTCTTACAAGTCTGCT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4G105TF 784 0 0
G
ATTCCAAATTTCAAACCACCACTCAGATCTTTAGACGAAGAACAAAGGATTCAAAAGATG
ACATCATCATCACGGGAAGAGAATGTGTACATGGCGAAACTAGCGGAGCAGGCGGAGCGT
TACGAAGAAATGGTGGAGTTCATGGAGAAAGTAGCCAAATCCGTTGACAACGAAGAACTC
ACCGTCGAAGAGAGGAACCTTCTCTCGGTCGCTTACAAGAACGTGATCGGAGCCAGGAGG
GCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGAT
CACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGGAAGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGC
GACGGGATTTTGAATGTCCTCGAAGCTCATCTCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCT
AAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCT
GGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTTCTTACAAGTCTGCTCAGGAC
ATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTTGGTCTTGCGCTCAACTTC
TCTGTGTTTTACTATGAGATACTTAACTCCCCTGACCGTGCCTGCAGCCTCGCCAAGCA*
GCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGGA*TCATACAAG*ACAGT
ACACTGATCATGCAGCTTCTTAGAGACA*TCTCACTCTCTGGACTTCAGACATGACAGAC
GAA

QA 2 784 2 784
DS 

RD RR4A875TF 770 0 0
AAACCACCACTCAGATCTTTAGACGAAGAACAAAGGATTCAAAAGATGACATCATCATCA
CGGGAAGAGAATGTGTACATGGCGAAACTAGCGGAGCAGGCGGAGCGTTACGAAGAAATG
GTGGAGTTCATGGAGAAAGTTGCCAAATCCGTTGACAACGAAGAACTCACCGTCGAGGAG
AGGAACCTTCTCTCCGTTGCTTACAAGAACGTGATTGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGG
ATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCCGTC
ATCAAGGATTACAGGGCGAAGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGATTTTG
AATGTTCTCGAGGCTCATCTCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCTAAAGTGTTTTAC
CTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGG
AAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTTCTTACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCT
GAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTTGGTCTTGCGCTCAACTTCTCTGTGTTTTAC
TATGAGATACTTAACTCCCCTGACCGTGCCTGCATCCTCGCCAAGCACGCTTTTGATGAA
GCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGGAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATG
CAGCTTCTTAGAGACAATCTCACTCTCTGGACTTCAGACATGACAGACGA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4AH56TF 668 0 0
GACTCTCGGTC
GCTTACAAGAACGTGATCGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAG
CAGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGG
AAGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGATTTTGAATGTCCTCGAAGCTCAT
CTCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGAT
TATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGC
ACTTTGGTTTCTTACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCAC
CCCATCAGGCTTGGTCTTGCGCTCAACTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATACTTAACTCC
CCTGACCGTGCCTGCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGAT
ACGTTGGGTGAGGAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTTAGAGACAAT
CTCACTCTCTGGACTTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCA
AAGCCAGAAGGTGCAGCAGAGTAAAGCTGAAGACTAGGAACTGGTAGAAACTTCCTA

QA 12 668 12 668
DS 

RD RR4AH56JQ 827 0 0
GACTCTCGGTC
GCTTACAAGAACGTGATCGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAG
CAGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGG
AAGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGATTTTGAATGTCCTCGAAGCTCAT
CTCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGAT
TATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGC
ACTTTGGTTTCTTACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCAC
CCCATCAGGCTTGGTCTTGCGCTCAACTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATACTTAACTCC
CCTGACCGTGCCTGCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGAT
ACGTTGGGTGAGGAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTTAGAGACAAT
CTCACTCTCTGGACTTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCA
AAGCCAGAAGGTGCAGCAGAGTAAAGCTGAAGACTAGGAACTGGTAGAAACTTCCTAGAA
GGTTATGTGATAATTCTGAGTGATAGCTCAGAACTCGTACCAGATATCACTCTTATTGTT
TGTTTTGTTTGTTTGGATACCAAATTTGAAAACCACTTTGCGAATTTGCGATTGATTCCA
TATAAATTTCCTATTTTTCAGTGAAATTTCGGTTCT

QA 12 827 12 827
DS 

RD RR4GF11JQ 564 0 0
CTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTTCT
TACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTT
GGTCTTGCGCTCAACTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATACTTAACTCCCCTGACCGTGCC
TGCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAG
GAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTTAGAGACAATCTCACTCTCTGG
ACTTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAAAGCCAGAAGGT
GCAGCAGAGTAAAGCTGAAGACTAGGAACTGGTAGAAACTTCCTAGAAGGTTATGTGATA
ATTCTGAGTGATAGCTCAGAACTCGTACCAGATATCACTCTTATTGTTTGTTTTGTTTGT
TTGGATACCAAATTTGAAAACCACTTTGCGAATTTGCGATTGATTCCATATAAATTTCCT
ATTTTTCAGTGAAATTTCGGTTCT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4G105JQ 724 0 0
AAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGGAAGATCG
AAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGATTTTGAATGTCCTCGAAGCTCATCTCATCC
CGTCTGCTTCGCCTCCAGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACA
GGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGG
TTTCTTACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCA
GGCTTGGTCTTGCGCTCAACTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATACTTAACTCCCCTGACC
GTGCCTGCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGG
GTGAGGAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTTAGAGACAATCTCACTC
TCTGGACTTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAAAGCCAG
AAGGTGCAGCAGAGTAAAGCTGAAGACTAGGAACTGGTAGAAACTTCCTAGAAGGTTATG
TGATAATTCTGAGTGATAGCTCAGAACTCGTACCAGATATCACTCTTATTGTTTGTTTTG
TTTGTTTGGATACCAAATTTGAAAACCACTTTGCGAATTTGCGATTGATTCCATATAAAT
TTCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL997Contig1 1219 3 9 U
GGGAGGCACATCGAAGTCACTGCTGATTGATTGCCACCGTACGATCAATCAATCATAGGG
AACTAAACGAATCGTTCTCATCACTGCGCCAAGCTATGATGGATGCGAATCAAGTAGCAG
AGCTCCGAAGATTCATCCAACAGTTGAAACTGAATCCTTCTCTCCTCCACGATCCTTCTC
TGACTTTCTTCAAGGATTATCTCCAAAGTTTAGGAGCTCAACTTCCCAAGATAGTCAAAA
CTGAAAGAGATTACGAGGATACGGCTGAGACTAAACCTAGCTTCTCTTCTGAACATGATG
ATGATGAAATCACCGAGCCTGATGTTGAGCTGGATGATTCTGATGTTGTTGAACCAGACA
ACGAGCCTCCTCAGCAGATGGGAGATCCTACAGCTGAAGTGAGGGATGAAGATAGGGATG
CTGCTCAGTCTGAGAAGAGCAAAGCTATGGAGGCAATCTCTCAAGGAAAGTTCGACGAGA
GTATTGATCATCTAACAAAAGCCATCATGCTGAACCCCACTTCTGCTATTCTCTACGCCT
CTAGAGCTACTGTGTTTCTAACTGTTAAGAAACCAAATGCTGCGATCCGCGATGCGGACA
TGGCTTTACAGTTCAACCCTGATTCAGCTAAGGGGTACAAAGCAAGAGGTATGGCTAGGG
CCATGTTAG*CCAATGGGAAGAAGCTGCGGCTGATCTTCATGTAGCTTCAAAATTAGATT
ACGATGAGGAGATAGGGTCGGCACTTAAGAAGGTTGAACCAAATGCAAAGAGAATCGAAG
AGCACCGCAGGAAATATCAACGTCTGAGGAAAGAAAAAGAACTCCGAAGGGCTGAACGCG
AGAGAAGAGAACAGCAAGAAGCCCAGGAGCGTGAAGCCCTGTCTGCACTTAAAGACGGAC
AAGTGATTAGTATCCACTCTACGAGCGAGTTAGAAGCGAAGACAAAGGCATCAAAGAAGG
CATCGCGTCTGCTAATAATGTACTTCACAGCAACATGGTGTGGACCGTGCCGTTACATGT
CTCCTGTTTACACAAACCTGGCCACGCAACACCCTAGAGTGGTCTTCTTGAAAGTTGACA
TAGATGAGGCCAATGACGTGGCTGCTTCTTGGAACATAAGCAGCGTCCCGACCTTTTGCT
TCATCAGAGATGGGAACAGTAGACAAAGTTGTGGGAGCTGATAAAGTTCGCTTGAGAGAG
ATAGCACAGCACTCTTCTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D412TF U 1
AF RR4DM87TF U 6
AF RR4AK05TF U 384
BS 1 317 RR4D412TF
BS 318 318 RR4DM87TF
BS 319 631 RR4D412TF
BS 632 632 RR4DM87TF
BS 633 648 RR4D412TF
BS 649 649 RR4DM87TF
BS 650 686 RR4D412TF
BS 687 708 RR4DM87TF
BS 709 1219 RR4AK05TF

RD RR4D412TF 686 0 0
GGGAGGCACATCGAAGTCACTGCTGATTGATTGCCACCGTACGATCAATCAATCATAGGG
AACTAAACGAATCGTTCTCATCACTGCGCCAAGCTATGATGGATGCGAATCAAGTAGCAG
AGCTCCGAAGATTCATCCAACAGTTGAAACTGAATCCTTCTCTCCTCCACGATCCTTCTC
TGACTTTCTTCAAGGATTATCTCCAAAGTTTAGGAGCTCAACTTCCCAAGATAGTCAAAA
CTGAAAGAGATTACGAGGATACGGCTGAGACTAAACCTAGCTTCTCTTCTGAACATGATG
ATGATGAAATCACCGAGTCTGATGTTGAGCTGGATGATTCTGATGTTGTTGAACCAGACA
ACGAGCCTCCTCAGCAGATGGGAGATCCTACAGCTGAAGTGAGGGATGAAGATAGGGATG
CTGCTCAGTCTGAGAAGAGCAAAGCTATGGAGGCAATCTCTCAAGGAAAGTTCGACGAGA
GTATTGATCATCTAACAAAAGCCATCATGCTGAACCCCACTTCTGCTATTCTCTACGCCT
CTAGAGCTACTGTGTTTCTAACTGTTAAGAAACCAAATGCTGCGATCCGCGATGCGGACA
TGGCTTTACAGTTCAACCCTGATTCAGCTAAAGGGTACAAAGCAAGAG*TATGGCTAGGG
CCATGTTAG*CCAATGGGAAGAAGCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DM87TF 703 0 0
GG
ACATCGAAGTCACTGCTGATTGATTGTCACCGTACGATCAATCGATCATAGGGAACTAAA
CGAATCGTTCTCATCACTGCGCCAAGCTATGATGGATGCGAATCAAGTAGCAGAGCTCCG
AAGATTCATCCAACAGTTGAAACTGAATCCTTCTCTTCTCCACGATCCTTCTCTGACTTT
CTTCAAGGATTATCTCCAAAGTTTAGGAGCTCAACTTCCCAAGATAGTCAAAACTGAAAG
AGATTACGAGGATACGGCTGAGACTAAACCTAGCTTCTCTTCTGAACATGATGATGATGA
AATCACCGAGCCTGATGTTGAGCTGGATGATTCTGATGTTGTTGAACCAGACAACGAGCC
TCCTCAGCAGATGGGAGATCCTACAGCTGAAGTGAGGGATGAAGATAGGGATGCTGCTCA
GTCTGAGAAGAGCAGAGCCATGGAGGCAATCTCTCAATGAAAGTTCGACGAGAGTATTGA
TCATCTAACAAAAGCCATCATGCTGAACCCCACTTCTGCTATTCTCTACGCCTCTAGAGC
TACTGTGTTTCTAACTGTTAAGAAACCAAATGCTGCGATCCGCGATGCGGACATGGCTTT
ACAGTTCAACCCCGATTCAGCTAAGGGGTACAAAGCAAGAGGTATGGCTAGGGCCATGTT
AG*CCAATGGGAAGAAGCTGCGGCTGATCTTCATGTAGCTT

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR4AK05TF 836 0 0
GATCCTACAGCTGAAGTGAGGGATGAAGATAGGGATGCTGCTCAGTCTGAGAAGAGCAAA
GCTATGGAGGCAATCTCTCAAGGAAAGTTCGACGAGAGTATTGATCATCTAACAAAAGCC
ATCATGCTGAACCCCACTTCTGCTATTCTCTACGCCTCTAGAGCTACTGTGTTTCTAACT
GTTAAGAAACCAAATGCTGCGATCCGCGATGCGGACATGGCTTTACAGTTCAACCCTGAT
TCAGCTAAGGGGTACAAAGCAAGAGGTATGGCTAGGGCCATGTTAGGCCAATGGGAAGAA
GCTGCGGCTGATCTTCATGTAGCTTCAAAATTAGATTACGATGAGGAGATAGGGTCGGCA
CTTAAGAAGGTTGAACCAAATGCAAAGAGAATCGAAGAGCACCGCAGGAAATATCAACGT
CTGAGGAAAGAAAAAGAACTCCGAAGGGCTGAACGCGAGAGAAGAGAACAGCAAGAAGCC
CAGGAGCGTGAAGCCCTGTCTGCACTTAAAGACGGACAAGTGATTAGTATCCACTCTACG
AGCGAGTTAGAAGCGAAGACAAAGGCATCAAAGAAGGCATCGCGTCTGCTAATAATGTAC
TTCACAGCAACATGGTGTGGACCGTGCCGTTACATGTCTCCTGTTTACACAAACCTGGCC
ACGCAACACCCTAGAGTGGTCTTCTTGAAAGTTGACATAGATGAGGCCAATGACGTGGCT
GCTTCTTGGAACATAAGCAGCGTCCCGACCTTTTGCTTCATCAGAGATGGGAACAGTAGA
CAAAGTTGTGGGAGCTGATAAAGTTCGCTTGAGAGAGATAGCACAGCACTCTTCTT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 6

CO CL998Contig1 1003 6 21 U
GGGTTACCTTTCACTCACATCAGCTAGCTACCGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCCCGACC
ATGGCGACCTTCTCGATGACTCTGTCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGA
CTTTCTCCAATCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGTTTGAATTTGAACGCCAAGTCTACC
TTCGACTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCA
TCCACCAGAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCTGAG
CCGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGG
AAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGACGTTCCCCAAACTGTTGAG
AACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGCTACAAGGGTTCAACTTTCCAC
CGTGTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGA
GGTAAAAGTGTATATGGCCGGACCTTCAAGGATGAGAACTTCAATTTATCCCATGTCGGA
CCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATC
TGCACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAA
GGAATGGATGTGGTGAGGCTGATAGAGGAACAAGAGACAGACAGAGGAGACCGTCCCAGG
AAGAAAGTGATCATCGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGCCTGAAGTTTAAGTGACAACA
TCCAAAACCCAAAACCTTGCGACAGTGAGATGGAACTATTAATATAGTTTGCATTTGTTC
ACACGCTTTTTTCTTTTGTGAAATGGATTCTAGTCCCTT*GTAATAAGATCAATTTCACT
TTCTTCTTTTTGATCACTTTGACTTTGAGAGGTATAGCTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A533TF U 4
AF RR4C468TF U 66
AF RR4D012TF U 1
AF RR4A533JQ C 295
AF RR4GS57TF U 552
AF RR4GS57JQ C 528
BS 1 55 RR4D012TF
BS 56 56 RR4A533TF
BS 57 95 RR4D012TF
BS 96 96 RR4A533TF
BS 97 689 RR4D012TF
BS 690 690 RR4A533TF
BS 691 723 RR4D012TF
BS 724 724 RR4GS57TF
BS 725 749 RR4D012TF
BS 750 750 RR4GS57TF
BS 751 785 RR4D012TF
BS 786 786 RR4GS57TF
BS 787 809 RR4D012TF
BS 810 810 RR4GS57TF
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BS 820 820 RR4GS57TF
BS 821 824 RR4D012TF
BS 825 825 RR4GS57TF
BS 826 837 RR4D012TF
BS 838 990 RR4GS57TF
BS 991 1003 RR4A533JQ

RD RR4A533TF 715 0 0
GG
ACCTTTCACTCACATCAGCTAGCTACCGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCCCGACCATGGC
GACCTTCTCGATGACTCTGTCAAATCCTAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTC
TCCAATCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGTTTGAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGA
CTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCAC
CAGAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCTGAGCCGCA
ATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATT
AGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGACGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTT
CCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGCTACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGT
CATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAA
AAGTGTATATGGCCGGACCTTCAAGGATGAGAACTTCAATTTATCCCATGTCGGACCAGG
AGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCAC
TGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAG

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR4C468TF 620 0 0
GACCTTCTCGATGACTCTGTCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTC
TCCAATCAACACCTCTTCCACCACTTTCCGATTGAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGA
CTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCAC
CAGAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCAAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCA
ATCGAAGATAACACACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATT
AGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTT
CCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGGTACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGT
CATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGGACTGGAGGTAA
AAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAATTTATCCCATGTCGGACCAGG
AGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCAC
TGTTAAGACGTCATGG
CTGG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4D012TF 841 0 0
GGGTTACCTTTCACTCACATCAGCTAGCTACCGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCCTGACC
ATGGCGACCTTCTCGATGACTCTGTCAAATCCGAGATCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGA
CTTTCTCCAATCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGTTTGAATTTGAACGCCAAGTCTACC
TTCGACTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCA
TCCACCAGAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCTGAG
CCGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGG
AAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGACGTTCCCCAAACTGTTGAG
AACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGCTACAAGGGTTCAACTTTCCAC
CGTGTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGA
GGTAAAAGTGTATATGGCCGGACCTTCAAGGATGAGAACTTCAATTTATCCCATGTCGGA
CCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATC
TGCACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGG*AGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAA
GGA*TGGATGTGGTGAGGCTGATAGAGGA*CAAGAGACAGACAGAGGAGACCGTCCCAGG
AAGAA*GTGATCATCGCAGACTGTGGTCA*CTTCCAATGTCTGA*GTTTAAGTGACA
CATC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4A533JQ 709 0 0
GCT
GAGCCGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTG
GGGAAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGACGTTCCCCAAACTGTT
GAGAACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGCTACAAGGGTTCAACTTTC
CACCGTGTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACT
GGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACCTTCAAGGATGAGAACTTCAATTTATCCCATGTC
GGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTC
ATCTGCACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATA
GAAGGAATGGATGTGGTGAGGCTGATAGAGGAACAAGAGACAGACGGAGGAGACCGTCCC
AGGAAGAAAGTGATCATCGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTCTGAAGTTTAAGTGACA
ACATCCAAAACCCAAAACCTTGCGACAGTGAGATGGAACTATTAATATAGTTTGCATTTG
TTCACACGCTTTTTT*TTTTGTGAAATGGATTCTAGTCCCTTTGTAATAAGATCAATTTC
ACTTTCTTCTTTTTGATCACTTTGACTTTGAGAGGTATAGCTGAGC

QA 4 709 4 709
DS 

RD RR4GS57TF 444 0 0
ATATGGCCGGACCTTCAAGGATGAGAACTTCAATTTATCCCATGTCGGACCAGGAGTTGT
GAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCACTGTTAA
GACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAAGGAATGGATGT
GGTGAGGCTGATAGAGGAACAAGAGACAGACAGAGGAGACCGTCCCAGGAAGAAAGTGAT
CATCGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGCCTGAAGTTTAAGTGACAACATCCAAAACCCA
AAACCTTGCGACAGTGAGATGGAACTATTAATATAGTTTGCATTTGTTCACACGCTTTTT
TCTTTTGTGAAATGGATTCTAGTCCCTT*GTAATAAGATCAATTTCACTTTCTTCTTTTT
GATCACTTTGACTTTGAGA
GGTAC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4GS57JQ 463 0 0
G
AATGGAACTGGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACCTTCAAGGATGAGAACTTCAATTTA
TCCCATGTCGGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGT
CAGTTCTTCATCTGCACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGG
CAAGTTATAGAAGGAATGGATGTGGTGAGGCTGATAGAGGAACAAGAGACAGACAGAGGA
GACCGTCCCAGGAAGAAAGTGATCATCGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGCCTGAAGTT
TAAGTGACAACATCCAAAACCCAAAACCTTGCGACAGTGAGATGGAACTATTAATATAGT
TTGCATTTGTTCACACGCTTTTTTCTTTTGTGAAATGGATTCTAGTCCCTT*GTAATAAG
ATCAATTTCACTTTCTTCTTTTTGATCACTTTGACTTTGAGA

QA 2 463 2 463
DS 



AS 1 7

CO CL999Contig1 1214 7 9 U
GGAATAACCAGGAATCTGAGCGTCGAGGTCACACTAGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCCTAATCCGCTTCCTCTAGTTCCGGCGAAGAAGACCCTTTTTGGATTTCCATTTC
GTTGACAAACGATCTCTCCGCTGTGTGGAAAAAAAAAACGATGTCGATGGGAAAGGCATT
CTACAGCGTAGGGTTCTGGATCCGTGAAACTGGTCAAGCACTCGATCGGCTCGGCTGTCG
CCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGCGAACAACTATCCAGGCACCGTACCCTTATGAATGT
TTTTGACAAATCCCCTAGTGTCGATAAGCAGGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCCTCTCTCAT
TGGCAATGTCCATGTCGGACGAGGTTCTTCCATTTGGTATGGATGCGTCTTGAGAGGAGA
TGCGAACAGCATCAGTGTCGGCGCTGGGACCAATATCCAAGATAACACCCTCGTCCACGT
TGCTAAGTCCAACTTAAGCGGCAAGGTTTTGCCTACTCTCATTGGAGACAATGTCACTGT
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TCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAAGGCCTTCTTCTCTAGTTCAGCTGTGGATTACTC
CAGCTTAGCTCAAGTTCACGCCGCGGAAAACACAAAAAACTTGGACGAGGCGGATTTCAA
GAAGCTTCTTTACAAGAAGAACGCTCGCGATGCAGAATACGACTCAGTTCTCGGTGATCT
CAGTCTCTCTGAGAATGTACCAAAATCAGCTTGAGAAGTTTTGATTCGTGTTGGATTTGA
AAGAAACAAAACACACACAAGAACTTCATTTTCATGCTTCTTCAATAAAGTTTTCAGCTT
TTTTAAAGACTTTCGATTTCTCTGTAAAACATTCTCTGAGGAGGTTTTGTTCTCTTGTAA
GGAAAAAGGTTGTGGCGACAAGGTTGTGTAATAAGTGGTTGGAACATACATTTCTCACTT
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TCTGCTTGCTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4HB78JQB C 320
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TTA

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TGCGAACAGCATCAGTGTCGGCGCTGGGACCAATATCCAAGATAACACCCTCGTCCACGT
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TGT

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GG
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TCGGCTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGCGAACAACTATCCAGGCACCGTACCC
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CCTCTCTCATTGGCAATGTCCATGTCGGACGAGGTTCTTCCATTTGGTATGGATGCGTCT
TGAGAGGAGATGCGAACAGCATCAGTGTCGGCGCTGGGACCAATATCCAAGATAACACCC
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CAG

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G
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ATTCCTTCCG*CGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGGTTTCTGAGGAAGGTGACTGAA
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AGAACTTCATTTTCATGCTTCTTCAATAAAGTTTTCAGCTTTTTTAAAGACTTTCGATTT
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TGATCTCAGTCTCTCTGAGAATGTACCAAAATCAGCTTGAGAAGTTTTGATTCGTGTTGG
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DS 

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AGTCCAACTTAAGCGGCAAGGTTTTGCCTACTCTCAT*GGAGACAATGTCACTGTTGGTA
ACAGTGCTGTTTTGCGTGGCTGCACTGTCGAAGACGAGGCCTACATTGGTGCTAGTGCTA
CCGTCTTGGATGGAGCTCATGTTGAAAAGCATGCCGTGGTTGAGTCCGGAGCTCTTGTCC
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GGAAGGTGACTGAAGAAGAAAAGGCCTTCTTCTCTAGTTCAGCTGTGGATTACTCCAGCT
TAGCTCGAGTTCACGCCGCGGAAAACACAAAAAACTTGGACGAGGCGGATTTCAAGAAGC
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TTGCTTCTG

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DS 



AS 1 7

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AGGTACGAGAGATTATGATGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAGTCTT
CTTGATCAGGACATTCTCTTATTCGGACCATTGTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCA
ATCGATGCTTTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTT
CCTTTGACATATCAAGCAAGTGAAGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTC
TCAACATGTTTCTGGTCTTCGAACTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCA
ACAGCCTTCATTGTGTAGAAATATACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACA
ACCGCGTTCTTGCTTTTGGGGCCTAGAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCA
AAAGTCTTTTTTATAACCCTGGTCCTGTGTACGTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAA
GAGACACAAAGTTAGAATCTTTTTTACACAGAGAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTT
AAAGGTTTCTTATTTAGGTGACGAGACAACTGGTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATT
GAAACCCTTAAAACCCAGAAAAGAGGTATAGATGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTT
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 30 30 30 

AF RR4CW84JQ U 10
AF RR4BV87TF C 1
AF RR4BV87JQ U 10
AF RR4CW84TF C 10
AF RR4DO27JQ U 31
AF RR4DO27TF C 31
AF RR4E654JQ U 31
BS 1 9 RR4BV87TF
BS 10 147 RR4BV87JQ
BS 148 148 RR4CW84JQ
BS 149 445 RR4BV87JQ
BS 446 446 RR4CW84JQ
BS 447 720 RR4BV87JQ
BS 721 724 RR4DO27JQ

RD RR4CW84JQ 604 0 0
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GACATTCTCTTATTCGGACCATTGTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCAATCGATGCT
TTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTGACA
TATCAAGCAAGTGAAGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGT
TTCTGGTCTTCGAACTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACAGCCTTC
ATTGTGTAGAAATATACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTC
TTGCTTTTGGGGCCTAGAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCAAAAGTCTTT
TTTATAACCCTGGTCCTGTGTACGTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAAGAGACACAA
AGTTAGAATCTTTTTTACACAGAGAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTC
TTAT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4BV87TF 725 0 0
TTTTTTTTTGGCGGGAGTAACATATATTT*ATGGATAACGAAACATTGTAACATACATAT
AGGTACGAGAGATTATGATGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAGTCTT
CTTGATCAGGACATTCTCTTATTCGGAACATTGTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCA
ATCGATGCTTTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTT
CCTTTGACATATCAAGCAAGTGAAGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTC
TCAACATGTTTCTGGTCTTCGAACTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCA
ACAGCCTTCATTGTGTAGAAATATACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACA
ACCGCGTTCTTGCTTTTGGGGCCTAGAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCA
AAAGTCTTTTTTATAACCCTGGTCCTGTGTACGTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAA
GAGACACAAAGTTAGAATCTTTTTTACACAGAGAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTT
AAAGGTTTCTTATTTAGGTGACGAGACAACTGGTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATT
GAAACCCTTAAAACCCAGAAAAGAGGTATAGATGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTT
CCCCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4BV87JQ 716 0 0
GGCGGGAGTAACATATATTTTATGGATAACGAAACATTGTAACATACATATAGGTACGAG
AGATTATGATGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAGTCTTCTTGATCAG
GACATTCTCTTATTCGGAACATTGTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCAATCGATGCT
TTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTGACA
TATCAAGCAAGTGAAGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGT
TTCTGGTCTTCGAACTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACAGCCTTC
ATTGTGTAGAAATATACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTC
TTGCTTTTGGGGCCTAAAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCAAAAGTCTTT
TTTATAACCCTGGTCCTGTGTACGTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAAGAGACACAA
AGTTAGAATCTTTTTTACACAGAGAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTC
TTATTTAGGTGACGAGACAACTGGTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATTGAAACCCTT
AAAACCCAGAAAAGAGGTATAGATGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTT
CCCCT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4CW84TF 715 0 0
GGCGGGAGTAACATATATTTTATGGATAACGAAACATTGTAACATACATATAGGTACGAG
AGATTATGATGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAGTCTTCTTGATCAG
GACATTCTCTTATTCGGACCATTGTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCAATCGATGCT
TTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTGACA
TATCAAGCAAGTGAAGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGT
TTCTGGTCTTCGAACTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACAGCCTTC
ATTGTGTAGAAATATACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTC
TTGCTTTTGGGGCCTAGAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCAAAAGTCTTT
TTTATAACCCTGGTCCTGTGTACGTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAAGAGACACAA
AGTTAGAATCTTTTTTACACAGAGAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTC
TTATTTAGGTGACGGGACAACTGGTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATTGAAACCCTT
AAAACCCAGAAAAGAGGTATAGATGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTTGTCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DO27JQ 694 0 0
AC
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AATGACAATAACATCAAAACGAAGTCTTCTTGATCAGGACATTCTCTTATTCGGACCATT
GTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCAATCGATGCTTTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAA
GAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTGACATATCAAGCAAGTGAAGATCTTCA
TGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGTTTCTGGTCTTCGAACTTGTCTAT
AGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACAGCCTTCATTGTGTAAAAATATACCCCAAA
TACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTCTTGCTTTTGGGGCCTAAAAAACT
CAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCAAAAGTCTTTTTTATAACCCTGGTCCTGTGTAC
GTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAAGAAACACAAAGTTAGAATCTTTTTTACACAGA
GAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTCTTATTTAGGTGACGAGACAACTG
GTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATTGAAACCCTTAAAACCCAGAAAAGAGGTATAGA
TGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTTGTCC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4DO27TF 694 0 0
AC
GGATAACGAAACATTGTAACATACATATAGGTACGAGAGATTATGATGACAACTTAACAC
AATGACAATAACATCAAAACGAAGTCTTCTTGATCAGGACATTCTCTTATTCGGACCATT
GTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCAATCGATGCTTTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAA
GAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTGACATATCAAGCAAGTGAAGATCTTCA
TGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGTTTCTGGTCTTCGAACTTGTCTAT
AGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACAGCCTTCATTGTGTAGAAATATACCCCAAA
TACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTCTTGCTTTTGGGGCCTAGAAAACT
CAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCAAAAGTCTTTTTTATAACCCTGGTCCTGTGTAC
GTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAAGAGACACAAAGTTAGAATCTTTTTTACACAGA
GAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTCTTATTTAGGTGACGAGACAACTG
GTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATTGAAACCCTTAAAACCCAGAAAAGAGGTATAGA
TGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTTGTCC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4E654JQ 694 0 0
AC
GGATAACGAAACATTGTAACATACATATAGGTACGAGAGATTATGATGACAACTTAACAC
AATGACAATAACATCAAAACGAAGTCTTCTTGATCAGGACATTCTCTTATTCGGACCATT
GTATCAAGGACTGGAAACACAGATGCCAATCGATGCTTTTGAAAAAAGACAAAAAAAAAA
GAAAATAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTGACATATCAAGCAAGTGAAGATCTTCA
TGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGTTTCTGGTCTTCGAACTTGTCTAT
AGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACAGCCTTCATTGTGTAAAAATATACCCCAAA
TACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTCTTGCTTTTGGGGCCTAAAAAACT
CAAACCTGGAAATCCTGACATTGTTTCAAAAGTCTTTTTTATAACCCTGGTCCTGTGTAC
GTTTGAAAGATGACTCGGAAGTTCGAAAGAGACACAAAGTTAGAATCTTTTTTACACAGA
GAAGTGTTCCCAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTCTTATTTAGGTGACGAGACAACTG
GTTCGATGATGCTACTCGCTAATCTATTGAAACCCTTAAAACCCAGAAAAGAGGTATAGA
TGCAGTCTGCAGAGAACAAAGCCGTCTTGTCC

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 7

CO CL1001Contig1 685 7 4 U
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCAGCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACA
AAGGTGATTACGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAGCA
GCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGA
AAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAA
GTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATA
TGAGCTTCACTACTATGAATCTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO07JQ C 1
AF RR4DO07TF U 1
AF RR4GH62JQ C 354
AF RR4EB43JQ C 238
AF RR4GH62TF U 354
AF RR4AD23TF U 8
AF RR4EB43TF U 1
BS 1 9 RR4DO07JQ
BS 10 660 RR4DO07TF
BS 661 661 RR4GH62TF
BS 662 685 RR4DO07TF

RD RR4DO07JQ 679 0 0
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ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
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AAGGTGATTACGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAGCA
GCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGA
AAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAA
GTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATA
CGAGCTTCACTACTATGA
A

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4DO07TF 685 0 0
GGACACACA
GCACAAATTGAAAACATAAAACTCAGCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTACGAAACAC
GTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCAGAACC
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ATTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGG
ATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATG
GACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACAAAGGTGATT
ACGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGAGCACA
AGAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCG
ACAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTGTA
TAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAAGTAGACTAA
ATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATACGAGCTTCA
CTACTATGAATCTAAT

QA 10 685 10 685
DS 

RD RR4GH62JQ 324 0 0
G
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ATAAGAAAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATA
AAGTAAGTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGT
GTTATATGAGCTTCACTACTA
CG

QA 2 322 2 322
DS 

RD RR4EB43JQ 442 0 0
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ACAAAGGTGATTACGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGC
AAAATGAGCACAAGAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCTATA
AGAAAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAG
TAAGTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTT
ATATGAGCTTCACTACTATGA
G

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4GH62TF 324 0 0
G
CAAACAAAGGTGATTACGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGA
AGCAAAATGAGCACAAGAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAA
GCAGCAGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCT
ATAAGAAAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATA
AAGTAAGTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGT
GTTATATGAGCTTCACTACTA
CG

QA 2 322 2 322
DS 

RD RR4AD23TF 672 0 0
GGG
CACAAATTGAAAACATAAAACTCAGCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTACGAAACACG
TGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCAGAACCA
CCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGACTCTGAA
TTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGGA
TCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATGG
ACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACAAAGGTGATTA
CGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAAAAACATAAGAAGCAAAATGAGCACAA
GAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAGCAGCG*TAGCGA
CAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTGTAT
AAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAAGTAGACTAAA
TGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTTCAC
TACTATGA
A

QA 4 671 4 671
DS 

RD RR4EB43TF 679 0 0
GGACACACAA
CACAAATTGAAAACATAAAACTCAGCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTACGAAACACG
TGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCAGAACCA
CCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGACTCTGAA
TTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGGA
TCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATGG
ACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACAAAGGTGATTA
CGGCCTAGGAACGTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGAGCACAA
GAAGAAGAAGAAGGATGGGCATGGAAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCGA
CAGCGACTAAATGAAATGATTTCAATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTGTAT
AAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAAGTAGACTAAA
TGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTTCAC
TACTATGA
G

QA 11 678 11 678
DS 



AS 1 7

CO CL1002Contig1 734 7 5 U
GGGTGGAAAGAAAAAGAATCAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTCCCAAAGAAAAAAAAA
*TGGCGGATCAACTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTC
GATAAGGATGGAGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTA
GGGCAAAACCCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGT
AACGGTACCATAGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACT
GACTCTGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTC
ATCTCCGCGGCTGAGCTTCGACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAG
GAAGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGAT
GAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATT
ATCCCTTGTTAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTG
GTTTGTGTTCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCT
TAAGCTATCTCTTTAGTGTTATGTCATGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTTTGACA
ATTTATATTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH26TF U 1
AF RR4EJ01TF U 19
AF RR4E905TF U 13
AF RR4DE77JQ C 19
AF RR4DE77TF U 19
AF RR4EJ01JQ C 129
AF RR4EH26JQ C 116
BS 1 144 RR4EH26TF
BS 145 145 RR4E905TF
BS 146 611 RR4EH26TF
BS 612 712 RR4E905TF
BS 713 734 RR4EH26JQ

RD RR4EH26TF 611 0 0
GGGTGGAAAGAAAAAGAATCAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTCCCAAAGAAAAAAAAA
*TGGCGGATCAACTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTC
GATAAGGATGGAGATGGTTGCATCGCAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTA
GGGCAAAACCCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGT
AACGGTACCATAGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACT
GACTCTGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTC
ATCTCCGCGGCTGAGCTTCGACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAG
GAAGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGAT
GAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATT
ATCCCTTGTTAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTG
GTTTGTGTTCT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4EJ01TF 642 0 0
GG
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TGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTG
CATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTAGGGCAAAACCCAACCGAAGC
TGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTACCATAGATTTCCC
GGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGCTCAA
GGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTTCG
ACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATCCG
TGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGAT
GGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATTATCCCTTGTTAAAAATTAAA
AGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAGGACAT
GTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCT

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR4E905TF 705 0 0
GGGGAATC
AGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTCCCAAAGAAAAAAAAA*TGGCGGATCAACTGACCGA
TGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTG
CATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTAGGGCAAAACCCAACCGAAGC
TGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTACCATAGATTTCCC
GGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGCTCAA
GGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGGCCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTTCG
ACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATCCG
TGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGAT
GGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATTATCCCTTGTTAAAAATTAAA
AGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAGGACAT
GTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAGTGTT
ATGTCATGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATC
TGCAT

QA 9 700 9 700
DS 

RD RR4DE77JQ 705 0 0
GG
AGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTCCCAAAGAAAAAAAAA*TGGCGGATCAACTGACCGA
TGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTG
CATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTAGGGCAAAACCCAACCGAAGC
TGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTACCATAGATTTCCC
GGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGCTCAA
GGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGATCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTTCG
ACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATCCG
TGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGAT
GGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATTATCCCTTGTTAAAAATTAAA
AGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAGGACAT
GTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAGTGTT
ATGTCATGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATC
CTTTGACAATC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4DE77TF 680 0 0
GG
AGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTCCCAAAGAAAAAAAAA*TGGCGGATCAACTGACCGA
TGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTG
CATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTAGGGCAAAACCCAACCGAAGC
TGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTACCATAGATTTCCC
GGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGCTCAA
GGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGATCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTTCG
ACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATCCG
TGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGAT
GGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATTATCCCTTGTTAAAAATTAAA
AGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAG*ACAT
GTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAGTGTT
ATGTCATGTATGAACTTC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR4EJ01JQ 596 0 0
TGGAGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCGCTAGGGCAAAA
CCCAACCGAAGATGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTAC
CATAGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTTTGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGC
GGCTGAGCTTCGACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGA
TGAGATGATCCGGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
TAAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTCTTATTATCCCTTG
TTAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGT
TCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTTTGCTTTTGGCTTAAGCTAT
CTCTTTAGTGTTATGTCATGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATC
CTTTGACAATTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4EH26JQ 619 0 0
TCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCGCAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGT
CGCTAGGGCAAAACCCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAG
ACGGTAACGGTACCATAGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGG
ACACTGACTCTGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACG
GTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTTCGACATGTCATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCG
ATGAGGAAGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACT
ATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGAAAGACAGTC
TTATTATCCCTTGTTAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGA
TTCTGGTTTGTGTTCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTATTTGTCTGCTTT
TGGCTTAAGCTATCTCTTTAGTGTTATGTCATGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTT
TGACAATTTATATTCTCCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 6

CO CL1003Contig1 927 6 17 U
GGAGAGCTCAGCTGCTGCAATGGAGGCGACTGGTGCGAATGAACCAGATACGAAAAGCTC
CAGTTCCTCTCCGGGAGTAACGATACCGAACTTCTTCGTATCGCTCTCCTCGGCATTTAC
GCAAACACCTTCCGTGCGTACGAACAAGCCCGGTTTGCGACTTCTACCACCACCAGCTTC
AGACTCCGTCAAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGACTGAGAAATT
CGGAGGCTTCATCCACTCACTCGCCGCTAAGAACCCTCTGTTTCGGGAAGCGGTTCGCTT
GTCCTCCGAGTTTCGCGGTGTTTGCGACGAGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGT
TAGGTTTGGTATGTCTGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTGCAGG
AATGGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTGTCCTTGTTGT
CCGTCTAGTACTCACCTGGTTCCCCACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCAC
TTTATGTGATCCGTACTTGAACATATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGA
TTTATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTGTTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCT
TCCTTGCGAGCTCCCACCAGCCGAAGGAGCGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACCAAGTG
GATGAGAAGGAGAAGGCTGAGCAGCAACAAGAACCAAACACCCAGCTCGGCTTCTATGAA
CTGACCTTATTAAAAACATTACTCTTTTCTACGCTTCAGAATGTGACATATAACTTTTGA
GTAATTTTATTCATTTGCATCTCTGGATTCCGAGTTATATTTGTGTAAATTTTCTTTATA
AAATGAATAAAAAAAAATGTTGTTCTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY93TF U 1
AF RR4GZ05TF U 39
AF RR4AR50TF U 2
AF RR4CY93JQ C 191
AF RR4AR50JQ C 201
AF RR4GZ05JQ C 327
BS 1 23 RR4CY93TF
BS 24 24 RR4AR50TF
BS 25 410 RR4CY93TF
BS 411 411 RR4GZ05TF
BS 412 504 RR4CY93TF
BS 505 505 RR4GZ05TF
BS 506 593 RR4CY93TF
BS 594 594 RR4GZ05TF
BS 595 685 RR4CY93TF
BS 686 686 RR4CY93JQ
BS 687 735 RR4CY93TF
BS 736 736 RR4CY93JQ
BS 737 746 RR4CY93TF
BS 747 749 RR4CY93JQ
BS 750 770 RR4CY93TF
BS 771 916 RR4CY93JQ
BS 917 927 RR4AR50JQ

RD RR4CY93TF 770 0 0
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CAGTTCCTCTCCGGGAGTAACGATACCGAACTTCTTCGTATCGCTCTCCTCGGCATTTAC
GCAAACACCTTCCGTGCGTACGAACAAGCCCGGTTTGCGACTTCTACCACCACCAGCTTC
AGACTCCGTCAAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGACTGAGAAATT
CGGAGGCTTCATCCACTCACTCGCCGCTAAGAACCCTCTGTTTCGGGAAGCGGTTCGCTT
GTCCTCCGAGTTTCGCGGTGTTTGCGACGAGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGT
TAGGTTTGGTATGTCTGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTTGGTTGCAGG
AATGGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTGTCCTTGTTGT
CCGTCTAGTACTCACCTGGTTCCC*ACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCAC
TTTATGTGATCCGTACTTGAACATATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGTATTAGA
TTTATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTGTTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCT
TCCTTGCGAGCTCCCACCAGCCGAA*GAGCGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACCAAGTG
GATGAGAAGGAGAAG*CTGAGCAGCA**CAGAACCAAACACCCAGCTCGG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4GZ05TF 688 0 0
GG
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TCGCTCTCCTCGGCATTTACGCAACCACCTTCCGTGCGTACGAACAAGCCCAGTTTGCGA
CTTCTACCACCACCAGCTTCAGACTCCGTCAAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTA
CTCTCCGCGACTGAGAAATTCGGAGGCTTCATCCACTCACTCGCCGCTAAGAACCCTCTG
TTTCGGGAAGCGGTTCGCTTGTCCTCCGAGTTTCGCGGTGTTTGCGACGAGATTCGTTTG
AGGAACAACACTACAAGGGTTAGGTTTGGTATGTCTGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTG
CCTGGAGATTCGGTTATAGGAATGGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATC
TATAACACTGTCCTTGTTGTCCGTCTAGTACTCACCTGGTTCCCCACTGCTCCTCCTGCC
ATTGTTAACCCCCTCAGCACTTTATGTGATCCGTACTTGAACATATTCCGGGGAGTCATA
CCGCCTCTTGGAGGATTAGATTTATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTGTTCTCAACGCCTTC
ACCAGCACTGCTATGGCGCTTCCTTGCGAGCTCCCACCAGCCGAA*GAGCGGCTTCTCCA
TCGTCTTGTGAGACCAAGTGGATGAG

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR4AR50TF 732 0 0
GG
GAGCTCAGCTGCTGCAATGGAGGCGACTGGTGCGAATGAACCAGATACGAAAAGCTCCAG
TTCCTCTCCGGGAGTAACGATACCGAACTTCTTCGTATCGCTCTCCTCGGCATTTACGCA
AACACCTTCCGTGCGTACGAACAAGCCCGGTTTGCGACTTCTACCACCACCAGCTTCAGA
CTCCGTCAAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGACTGAGAAATTCGG
AGGCTTCATCCACTCACTCGCCGCTAAGAACCCTCTGTTTCGGGAAGCGGTTCGCTTGTC
CTCCGAGTTTCGCGGTGTTTGCGACGAGATTCGTTTGAGGAATAACACTACAAGGGTTAG
GTTTGGTATGTCTGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTGCAGGAAT
GGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTGTCCTTGTTGTCCG
TCTAGTACTCACCTGGTTCCCCACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGC*CTTT
ATGTGATCCGTACTTGAACATATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGATTT
ATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTGTTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCTTCC
TTGCGAGCTCCCACCAGCCGAAAGAGCGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACCAAGTGGAT
GAGAA
AGGAG

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR4CY93JQ 726 0 0
AAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGACTGAGAAATTCGGAGGCTTC
ATCCACTCACTCGCCGCTAAGAACCCTCTGTTTCGGGAAGCGGTTCGCTTGTCCTCCGAG
TTTCGCGGTGTT*GCGACGAGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGTTAGGTTTGGT
ATGTCTGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTTGGTTGCAGGAATGGTGGTT
GCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTGTCCTTGTTGTCCGTCTAGTA
CTCACCTGGTTCCC*ACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCACTTTATGTGAT
CCGTACTTGAACATATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGTATTAGATTTATCTCCC
ATTTTGGCTTTCCTTGTTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCTTCCTTGCGAG
CTCCCACCAGCCGAAGGAGCGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACCAAGTGGATGAGAAGG
AGAAGGCTGAGCAGCAACAAGAACCAAACACCCAGCTCGGCTTCTATGAACTGACCTTAT
TAAAAACATTACTCTTTTCTACGCTTCAGAATGTGACATATAACTTTTGAGTAATTTTAT
TCATTTGCATCTCTGGATTCCGAGTTATATTTGTGTAAATTTTCTTTATAAAATGAATAA
AAAAAA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4AR50JQ 727 0 0
AAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGACTGAGAAATTCGGAGGCTTCATCCACTCAC
TCGCCGCTAAGAACCCTCTGTTTCGGGAAGCGGTTCGCTTGTCCTCCGAGTTTCGCGGTG
TTTGCGACGAGATTCGTTTGAGGAATAACACTACAAGGGTTAGGTTTGGTATGTCTGAAC
ACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTGCAGGAATGGTGGTTGCTAACGGGT
TGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTGTCCTTGTTGTCCGTCTAGTACTCACCTGGT
TCCCCACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGC*CTTTATGTGATCCGTACTTGA
ACATATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGATTTATCTCCCATTTTGGCTT
TCCTTGTTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCTTCCTTGCGAGCTCCCACCAG
CCGAAGGAGCGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACCAAGTGGATGAGAAGGAGAAGGCTGA
GCAGCAACAAGAACCAAACACCCAGCTCGGCTTCTATGAACTGACCTTATTAAAAACATT
ACTCTTTTTTACGCTTCAGAATGTGACATATAACTTTTGAGTAATTTTATTCATTTGCAT
CTCTGGATTCCGAGTTATATTTGTGTAAATTTTCTTTATAAAATGAATAAAAAAAAATGT
TGTTCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4GZ05JQ 590 0 0
ACGAGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGTTAGGTTTGGTATGTCTGAACACGGGT
TTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTATAGGAATGGTGGTTGCTAACGGGTTGATAA
ACTTTTTCAACATCTATAACACTGTCCTTGTTGTCCGTCTAGTACTCACCTGGTTCCCCA
CTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCACTTTATGTGATCCGTACTTGAACATAT
TCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGATTTATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTG
TTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCTTCCTTGCGAGCTCCCACCAGCCGAAG
GAGCGGCTTTTCCATCGTCTTGTGAGACCAAGTGGATGAGAAGGAGAAGGCTGAGCAGCA
ACAAGAACCAAACACCCAGCTCGGCTTCTATGAACTGACCTTATTAAAAACATTACTCTT
TTCTACGCTTCAGAATGTGACATATAACTTTTGAGTAATTTTATTCATTTGCATCTCTGG
ATTCCGAGTTATATTTGTGTAAATTTTCTTTATAAAATGAATAAAAAAAA

QA 1 590 1 590
DS 



AS 2 7

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GGTCTCTGTTAAACTTTTTATTTCCAATGAAATAGTTTCTGATTTGCTAAAGACAAGACA
ATGGACGTGAAAGCTATGAAAAAACAGAAATCTTAAAGAGTGGTATGTATGTATGTATGA
CCTTGCTTGTATGAAGAAGAATCATGTGAGAGTTTTTTGATTTTGTGGGTATCAGAATAC
AACAGTCTTGTGTGTGCCGTAAGGCAATACTCGGAGTTCGCAGTAAGATTTTATAGCTTT
CATTAGGCACTTCTTCTCGAGGTCCTCTGATTTTTGGACAAAGCTCGTCAAGTTGTCTCG
GTGGGAAACTCTCTCAACCATTTGTTCAATGATAGGACCTGAATCAAGTTCCTCTGTAAC
AAAGTAAGTGGTTGCACCAATTAGTTTCACACCTGCATCAAATGCCTACCAACAGAATCT
AAAATATGAATTAACACAACTCATGGCAAGGTTAGAGGAATCAAAGAACTCAGAAACCTG
TTTTGCTGGGCTTCTCCCTTTGAATGATGGTAAGAGGCCATGGTGTATGTTGATAACATC
TTTTCCATAACCTTTCAAGAAGTTACCAGACAGTACCTGCATGTATCTAGCGAGAACAAT
AAAATCGGTATCCTTGACCAACTCAAAAATCTCCTCCTCTATCTTGTTCTGATCAGTTGT
TGGTAAATAATGATAGGAGATGCCATGCCTCTGGAGAAAGCGCATAATATGTGTGTTTGG
AGCTCTTTCATGATTACTTATCACACATGTTAAATCA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E888JQ U 1
AF RR4E121JQ U 1
BS 1 757 RR4E121JQ

RD RR4E888JQ 629 0 0
GG
TCTCTGTTAAACTTTTTATTTCCAATGAAATAGTTTCTGATTTGCTAAAGACAAGACAAT
GGACGTGAAAGCTATGAAAAAACAGAAATCTTAAAGAGTGGTATGTATGTATGTATGACC
TTGCTTGTATGAAGAAGAATCATGTGAGAGTTTTTTGATTTTGTGGGTATCAGAATACAA
CAGTCTTGTGTGTGCCGTAAGGCAATACTCGGAGTTCGCAGTAAGATTTTATAGCTTTCA
TTAGGCACTTCTTCTCGAGGTCCTCTGATTTTTGGACAAAGCTCGTCAAGTTGTCTCGGT
GGGAAACTCTCTCAACCATTTGTTCAATGATAGGACCTGAATCAAGTTCCTCTGTAACAA
AGTAAGTGGTTGCACCAATTAGTTTCACACCTGCATCAAATGCCTACCAACAGAATCTAA
AATATGAATTAACACAACTCATGGCAAGGTTAGAGGAATCAAAGAACTCAGAAACCTGTT
TTGCTGGGCTTCTCCCTTTGAATGATGGTAAGAGGCCATGGTGTATGTTGATAACATCTT
TTCCATAACCTTTCAAGAAGTTACCAGACAGTACCTGCATGTATCTAGCGAGAACAATAA
AATCGGTATCCTTGACCAACTCAAAAA

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR4E121JQ 757 0 0
GGTCTCTGTTAAACTTTTTATTTCCAATGAAATAGTTTCTGATTTGCTAAAGACAAGACA
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AACAGTCTTGTGTGTGCCGTAAGGCAATACTCGGAGTTCGCAGTAAGATTTTATAGCTTT
CATTAGGCACTTCTTCTCGAGGTCCTCTGATTTTTGGACAAAGCTCGTCAAGTTGTCTCG
GTGGGAAACTCTCTCAACCATTTGTTCAATGATAGGACCTGAATCAAGTTCCTCTGTAAC
AAAGTAAGTGGTTGCACCAATTAGTTTCACACCTGCATCAAATGCCTACCAACAGAATCT
AAAATATGAATTAACACAACTCATGGCAAGGTTAGAGGAATCAAAGAACTCAGAAACCTG
TTTTGCTGGGCTTCTCCCTTTGAATGATGGTAAGAGGCCATGGTGTATGTTGATAACATC
TTTTCCATAACCTTTCAAGAAGTTACCAGACAGTACCTGCATGTATCTAGCGAGAACAAT
AAAATCGGTATCCTTGACCAACTCAAAAATCTCCTCCTCTATCTTGTTCTGATCAGTTGT
TGGTAAATAATGATAGGAGATGCCATGCCTCTGGAGAAAGCGCATAATATGTGTGTTTGG
AGCTCTTTCATGATTACTTATCACACATGTTAAATCA

QA 1 757 1 757
DS 



CO CL1004Contig2 1219 5 22 U
GGATACAAGGTGGTTGCTTTGCTCTGCCTCTGCGATGATGATGATGATGACAAGAAGAAG
AGTCTCAACAACCTCGTCTCTATCCGCCACAGCTTTCGGATCATTTATGAAATGGTCCTT
CAAATCTTGTAAGTTTCACGGCGAGTCCCTAGATTCCTCTGTCTCCCCACTTCTCATCCC
CGGCGTCCACGTCTTCCATTGTCCGGATGTGGTTGGGATTGTAGCGAAGCTATCAGATTG
CATTGCTGCAAAGGGAGGCAACATTCTTGGTTACGATGTGTTTGTTCCTGAGAACAATAA
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GAGTGAAGATTTTCACACTATTGCAAAGAAATTCAATGCTATGAGCTCTGTTGTACGAGT
CCCCTCTTTAGACCCCAAGTACAAGATTGCTCTTTTACTCTCTAAACAGGACCATTGTCT
GGTTGAAATGTTACATAAATGGCAGGACGGAAAGCTTCCTGTTGATATAACATGTGTGAT
AAGTAATCATGAAAGAGCTCCAAACACACATATTATGCGCTTTCTCCAGAGACATGGCAT
CTCCTATCATTATTTGCCAACAACTGATCAGAACAAGATAGAGGAGGAGATTTTTGAGTT
GGTCAAGGATACCGATTTTATTGTTCTCGCTAGATACATGCAGGTACTGTCTGGTAACTT
CTTGAAAGGTTATGGAAAAGATGTTATCAACATACACCATGGCCTCTTACCATCATTCAA
AGGGAGAAGCCCAGCAAAACAGGCATTTGATGCAGGTGTGAAACTAATTGGTGCAACCAC
TCACTTTGTTACAGAGGAACTTGATTCAGGTCCTATCATTGAACAAATGGTTGAGAGAGT
TTCCCACCGAGACAACTTGACGAGCTTTGTCCAAAAATCAGAGGACCTCTAGAAGAAGTG
CCTAATGAAAGCTATAAAATCTTACTGCGAACTCCGAGTATTGCCTTACAGCACACACAA
GACTGTTGTATTCTGATACCCACAAAATCAAAAAACTCTCACATGATTCTTCTTCATACA
AGCAAGGTCATACATACATACATACCACTCTTTAAGATTTCTGTTTTTTCATAGCTTACA
CGTCCATTGTCTTGTCTTTAGCAAATCAGAAACTATTTCATTGGAAATAAAAAGTTTAAC
AGAGATCAATCCTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E888TF U 3
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AF RR4E121TF U 3
AF RR4B639TF U 52
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GGT

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AACAACCTCGTCTCTATCCGCCACAGCTTTCGGATCATTTATGAAATGGTCCTTCAAATC
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CTACGTCTTCCATTGTCCGGATGTGGTTGGGATTGTAGCGAAGCTATCAGATTGCATTGC
TGCAAAGGGAGGCAACATTCTTGTTTACGATGTGTTTGTTCCTGAGAACAATAACGTCTT
CTACTCTCGAAGCGGGTTCATTTTTGATCCAGTGAAGTGGCCAAGGAGTCAGATGAGTGA
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AAGCCCAGCAAAAC

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ATCATTCAAAGGGAGAAGCCCGGCAAAACAG
AGGAACTTGAT

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DS 

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TTCTGTTTTTTCATAGCTTACACGTCCATTGTCTTGTCTTTAGCAAATCAGAAACTATTT
CATTGGAAATAAAAAGTTTAACAGAGATCAATCCTTCTCTC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 6

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CTTTTGGGTCATCCAAAGAAATGGCAACAATCTTCCAGTCTAGCTCTCCTTCATCAATCA
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CCTGAGATGGATCTTCCCATGTCTGTGGAAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTACG
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TAGCAACCTCCATCTTTGCTTTAGACTCTTTAGGGATCTCAACTATAAAGTTGAAAACTC
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CTCGCTTGGCTCTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

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AF RR4B092JQ U 116
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AF RR4BB64TF C 313
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DS 

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G
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TAG
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CC

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ATCTGAGCTTGCCCTTCTTAGTGTCTTGCTTAATAGGAGTGAAGTCTTCATCAGTAGCAA
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TGGCTCTCCC

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DS 



AS 1 6

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD94TF U 1
AF RR4AT09TF U 34
AF RR4AD12TF U 427
AF RR4AD12JQ C 515
AF RR4B544JQ C 543
AF RR4AT09JQ C 689
BS 1 164 RR4FD94TF
BS 165 165 RR4AT09TF
BS 166 652 RR4FD94TF
BS 653 774 RR4AT09TF
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BS 1239 1268 RR4AD12JQ
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TATAATAAATATCTTCACATAGCATTCATCTCCAAAAAAAACCATTCAAGATCAAATAAA
GGGTTTAATTAAGGTTTCTTGAAGGGACAAAAAATGGAGACGTTTTGTGGGTTTCAGAAA
GAAGAAGAGCAGATGGATTTACCTCCAGGGTTCAGGTTTCATCCAACAGATGAAGAACTC
ATAAGTCACTATCTCCACAAGAAGGTTCTTGACATCAGCTTCTCAGCCAAAGCTATTGGT
GAAGTTGACTTGAACAAATCTGAACCATGGGAGTTACCATGGATGGCAAAAATGGGCGAG
AAAGAATGGTACTTCTTCTGTGTGAGGGACAGAAAGTATCCAACCGGTTTGAGGACTAAC
CGGGCAACTGAAGCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGGAAGGATAAGGAGATTTACCGTGGT
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TTACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATGTAGGGTGTTCCAGAAGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4AT09TF 746 0 0
GG
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AAAAAACCATTCAAGATCAAATAAAGGGTTTAATTAGGGTTTCTTGAAGGGACAAAAAAT
GGAGACGTTCTGTGGGTTTCAGAAGGAAGAAGAGCAGATGGATTTACCTCCAGGGTTCAG
GTTTCATCCAACAGATGAAGAACTCATAAGTCACTATCTCCACAAGAAGGTTCTTGACAT
CAGCTTCTCAGCCAAAGCTATTGGTGAAGTTGACTTGAACAAATCTGAACCATGGGAGTT
ACCATGGATGGCAAAAATGGGCGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTGTGTGAGGGACAGAAA
GTATCCAACCGGTTTGAGGACTAACCGGGCAACTGAAGCCGGTTATTGGAAAGCAACCGG
GAAGGATAAGGAGATTTACCGTGGTAAATCCCTTGTGGGGATGAAGAAGACACTTGTTTT
CTATAGAGGCAGGGCTCCCAAAGGTCAGAAAACAAACTGGGTGATGCATGAGTATAGGCT
TGAAGGCAAACTCTCTGCCCATAATTTACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATG
TAGGGTGTTCCAGAAGAGTGCTGGAGGGAAGAAGATCCCTATTTCGAGTCTAATCCGTAT
CGGTACACTGGGAACCGACTTTATCCCTTCCCTTATGCCTTCTTTAACCGATGCTTCACC
TTTCAACGATAAAACCAAA
CAGAC

QA 3 741 3 741
DS 

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G
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TTGTGGGGATGAAGAAGACACTTGTTTTCTATAGAGGCAGGGCTCCCAAAGGTCAGAAAA
CAAACTGGGTGATGCATGAGTATAGGCTTGAAGGCAAACTCTCTGCCCATAATTTACCTA
AAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATGTAGGGTGTTCCAGAAGAGTGCTGGAGGGAAGA
AGATCCCTATTTCGAGTCTAATCCGTATCGGTACACTGGGAACCGACTTTATCCCTTCCC
TTATGCCTTCTTTAACCGATGCTTCACCTTTCAACGATAAAACCAAAACAGAACCGGTTT
ACGTGCCCTGCTTCTCCAACCAAACTGATCAAGCCCAAGGAAACACACTTAATTGTTTCA
GCAGTCCTGACATTTTCCACAGGATCCCACTCTACCAAACTCAATCCCTCCAAGTCTCTG
GTAATTTACAGAGTCCCATTCTCGGTCAAGAACATTCGGTTCTGCATGCTATGATTGATA
ACAACAGAAGGCAGAATCTCAAAGTGATGAGTGTCTCACAAGAAACAGCAGTTTCTACTG
ACATGAATACCGATATTTCGTCGGATTTTGAATACGGTAAAAGGCATGCTCAAGAAGATC
CGTCTTCCTCGGCTGGACCTGTTGATCTTGAACCTTTCTGGAATTACTGAAGAAGATTCA
AGAGTCTAGTGTTCACTAATTTACTGTCATAAAAAAAGTAAGAAAACAATTTCAGCTTTT
GTCTGGTGTGTCAACGTTTGTATAGATTATT

QA 2 812 2 812
DS 

RD RR4AD12JQ 754 0 0
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TTGAAGGCAAACTCTCTGCCCATAATTTACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATAT
GTAGGGTGTTCCAGAAGAGTGCTGGAGGGAAGAAGATCCCTATTTCGAGTCTAATCCGTA
TCGGTACACTGGGAACCGACTTTATCCCTTCCCTTATGCCTTCTTTAACCGATGCTTCAC
CTTTCAACGATAAAACCAAAACAGAACCGGTTTACGTGCCCTGCTTCTCCAACCAAACTG
ATCAAGCCCAAGGAAACACACTTAATTGTTTCAGCAGTCCTGACATTTTCCACAGGATCC
CACTCTACCAAACTCAATCCCTCCAAGTCTCTGGTAATTTACAGAGTCCCATTCTCGGTC
AAGAACATTCGGTTCTGCATGCTATGATTGATAACAACAGAAGGCAGAATCTCAAAGTGA
TGAGTGTCTCACAAGAAACAGCAGTTTCTACTGACATGAATACCGATATTTCGTCGGATT
TTGAATACGGTAAAAGGCATGCTCAAGAAGATCCGTCTTCCTCGGCTGGACCTGTTGATC
TTGAACCTTTCTGGAATTACTGAAGAAGATTCAAGAGTCTAGTGTTCACTAATTTACTGT
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TATTACAATCTCAACTTCCACTATATGTTATACT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4B544JQ 754 0 0
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ACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATGTAGGGTGTTCCAGAAGAGTGCTGGAGG
GAAGAAGATCCCTATTTCGAGTTTAATCCGTATCGGTACACTGGGAACCGACTTTATCCC
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GGTTTACGTGCCCTGCTTTTCCAACCAAACTGATCAAGCCCAAGGAAACACACTTAATTG
TTTCAGCAGTCCTGACATTTTCCACAGGATCCCACTTTACCAAACTCAATCCCACCAAGT
TTTTGGTAATTTACAGAGTCCCATTTTCGGTCAAGAACATTCGGTTTTGCATGCTATGAT
TGATAACAACAGAAGGCAGAATCTCAAAGTGATGAGTGTCTCACAAGAAACAGCAGTTTT
TACTGACATGAATACCGATATTTCGTCGGATTTTGAATACGGTAAAAGGCATGCTCAAGA
AGATCCGTTTTCCTCGGCTGGACCTGTGGATCTTGAACCTTTCTGGAATTACTGAAGAAG
ATTCAAGAGTTTAGTGTTCACTAATTTACTGTCATAAAAAAAGTAAGAAAACAATTTCAG
CTTTTGTTTGGTGTGTCAACGTTTGTATAGATTATTACAATCTCAACTTCCACTATATGT
TATACTCAAAAAGAAACTTAAAATATAGTTTGTT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AT09JQ 581 0 0
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CTTCACCTTTCAACGATAAAACCAAAACAGAACCGGTTTACGTGCCCTGCTTCTCCAACC
AAACTGATCAAGCCCAAGGAAACACACTTAATTGTTTCAGCAGTCCTGACATTTTCCACA
GGATCCCACTCTACCAAACTCAATCCCTCCAAGTTTCTGGTAATTTACAGAGTCCCATTT
TCGGTCAAGAACATTCGGTTTTGCATGCTATGATTGATAACAACAGAAGGCAGAATCTCA
AAGTGATGAGTGTCTCACAAGAAACAGCAGTTTCTACTGACATGAATACCGATATTTCGT
CGGATTTTGAATACGGTAAAAGGCATGCTCAAGAAGATCCGTCTTCCTCGGCTGGACCTG
TGGATCTTGAACCTTTCTGGAATTACTGAAGAAGATTCAAGAGTCTAGTGTTCACTAATT
TACTGTCATAAAAAAAGTAAGAAAACAATTTCAGCTTTTGTCTGGTGTGTCAACGTTTGT
ATAGATTATTACAATCTCAACTTCCCCCATATGTTATACT
C

QA 1 580 1 580
DS 



AS 2 5

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TGCGGGACAAAAAAAGGCAAAACAGAGATCCAAAAGACAGAGGAGAGAGAGATAGATAAG
CTACCTATGGCCGCCGCCGCTATGACCGAGAAGGAAGCTATGGTGGATCCTTTCCTGGTC
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AAGTTCTTTCAAAACCCTGACCAGCTTCAGTTCGAGTTCCAACCCTTTCCAACATCATAC
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AGCGGGTCAGGAGTGCAGCAGAATCTTCTGAGGAGTGTTGAGGAGAGGAAAGAAGAGTAT
GATAAGGCCCGTGCTCGGATCTTTAATAGTCCCAGCAGTTCTGACTCTGAAGATCTTCAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW92TF U 1
AF RR4CX90TF U 1
BS 1 737 RR4CW92TF
BS 738 747 RR4CX90TF

RD RR4CW92TF 745 0 0
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TGCGGGACAAAAAAAGGCAAAACAGAGATCCAAAAGACAGAGGAGAGAGAGATAGATAAG
CTACCTATGGCCGCCGCCGCTATGACCGAGAAGGAAGCTATGGTGGATCCTTTCCTGGTC
GAGGCTCTCCAGAACCCTCGTCATCGTCTCACCATTTTGCGTATGGAGCTCGACATACAA
AAGTTCTTTCAAAACCCTGACCAGCTTCAGTTCGAGTTCCAACCCTTTCCAACATCATAC
CTGCGCCTCGCTGCGCATCGAGTCGCTCAGCATTACGGACTAGTAACCATGTCTTTGGAG
AACGGTAACGGTGCTTTAGACGGATCCGACAACAGAATCCTGGTAACGAAGATAGCTGAG
AGCAGGTTTCCTTCCGTCTGTTTGTCTGAAATCCCTGTTAAGCAGCCTGAGAACGGTAGA
CCAGAGGGTTTCAAGATCGCCATCAAGGCTAGACCCAAGAGAGGCTCTGGGAGCGGAGGT
AGCGGGTCAGGAGTGCAGCAGAATCTTCTGAGGAGTGTTGAGGAGAGGAAAGAAGAGTAT
GATAAGGCCCGTGCTCGGATCTTTAATAGTCCCAGCAGTTCTGACTCTGAAGATCTTCAT
CGCTACTACGAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTGAAGTGTAAACCGGATGAGACTGAA
GTTGCGGTAGTAATAGT
CTGTTGAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4CX90TF 747 0 0
GGCTCATC
AGAAACAATCTCCTTTGTTTCTCTTTGATGTCTTTTCTCTTCTAAGCTCCTCTGCGGGAC
AAAAAAAGGCAAAACAGAGATCCAAAAGACAGAGGAGAGAGAGATAGATAAGCTACCTAT
GGCCGCCGCCGCTATGACCGAGAAGGAAGCTATGGTGGATCCTTTCCTGGTCGAGGCTCT
CCAGAACCCTCGTCATCGTCTCACCATTTTGCGTATGGAGCTCGACATACAAAAGTTCTT
TCAAAACCCTGACCAGCTTCAGTTCGAGTTCCAACCCTTTCCAACATCATACCTGCGCCT
CGCTGCGCATCGAGTCGCTCAGCATTACGGACTAGTAACCATGTCTTTGGAGAACGGTAA
CGGTGCTTTAGACGGATCCGACAACAGAATCCTGGTAACGAAGATAGCTGAGAGCAGGTT
TCCTTCCGTCTGTTTGTCTGAAATCCCTGTTAAGCAGCCTGAGAACGGTAGACCAGAGGG
TTTCAAGATCGCCATCAAGGCTAGACCCAAGAGAGGCTCTGGGAGCGGAGGTAGCGGGTC
AGGAGTGCAGCAGAATCTTCTGAGGAGTGTTGAGGAGAGGAAAGAAGAGTATGATAAGGC
CCGTGCTCGGATCTTTA*TAGTCCCAGCAGTTCTGACTCTGAAGATCTTCATCGCTACTA
CGAGCTCCTCCTCCTCCTC*TCCTCTTGAAGTGTAAACCGGATGAGACTGAAGTTGCGTT
AGTAATAGTTCTGTTGATG

QA 9 747 9 747
DS 



CO CL1007Contig2 844 3 46 U
CCACCATCAAAGATTGGTTAGGGTTCATTCAAAGTTCGATAATAACATAATTAAGAAAGA
AATTCAAAAGAGAGAG**GGAGTAGATGTCTTGTTATACAAGAAGGAAGCAGCCAGTGTT
CTGAACAGAACAGAGAGCTCAGCTCCTAAAGACTAGATAATATCTATATAAATTCTGTTA
CTTAATACAGACATTGGAAGTACTCAAAACACTAAACTGTCGTCAGGGATTGCTTGCAGA
AGGATGCCTGAAGTCTGGACGGTTCAACGACTGCACATAGTTCATAGACGGCAGGTTTGG
CCACGGTGTATAAGCCGCCGGGTTGTTAACAAAGGGACTCATAGCCGGATGCCCGTAGTT
TAGATTAGCTTGAGGACCTCTAGGAATCTGCGGGAAGCCTCCATCGTGAAAAGGAATGTG
CATTGGCATCGGACTGAAGCCTTGGCCAGGTGACATAACCCTAACGTACCTGTAGGAAGG
ATCCACCACATATCTTTCATAGCTCCTGTCGTAATCAGGATCATACCGATCTTTCTCTCT
ATCTCTGATGATAGCTACTCTAGAAGTCCGAGAACCAGCATCAACAGAACTATTACTAAC
CGCAACTTCAGTCTCATTCCGGTTTACACCTTCAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTCG
TAGTAGCGATGAAGAATCTTCAGAGTCAGAACTGCTGGGACTATTAAAGATCCGAGCACG
GGCCTTATCATACTCTTCTTTCCTCTCCTCAACACTCCTCAGAAGATTCTGCTGCACTCC
TGACCCGCTACCTCCGCTCCCAGAGCCTCTCTTGGGTCTAGCCTTGATGGCGATCTTGAA
ACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4DE29JQ U 1
AF RR4CX90JQ U 37
AF RR4CW92JQ U 37
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BS 196 198 RR4CW92JQ
BS 199 288 RR4DE29JQ
BS 289 289 RR4CW92JQ
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BS 293 315 RR4DE29JQ
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BS 473 476 RR4DE29JQ
BS 477 477 RR4CW92JQ
BS 478 495 RR4DE29JQ
BS 496 496 RR4CW92JQ
BS 497 527 RR4DE29JQ
BS 528 528 RR4CW92JQ
BS 529 534 RR4DE29JQ
BS 535 535 RR4CW92JQ
BS 536 549 RR4DE29JQ
BS 550 550 RR4CW92JQ
BS 551 603 RR4DE29JQ
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BS 605 653 RR4DE29JQ
BS 654 800 RR4CW92JQ
BS 801 801 RR4CX90JQ
BS 802 815 RR4CW92JQ
BS 816 816 RR4CX90JQ
BS 817 844 RR4CW92JQ

RD RR4DE29JQ 671 0 0
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AATTCAAAAGAGAGAGAGGGAGTAGACGTCTTGTTATACAAGAAGGAAGCAGCCAGTGTT
CTGAACAGAACAGAGAGCTCAGCTCCTAAAGACTAGATAATATCTATATAAATTCTGTTT
CTTAATACAGACATT**TAGTACTCAAAACACTAAACTGTCGTCAGGGATTGCTTGCAGA
AGGATGCCTGAAGTCTGGACGGTTCAACGACTGCACATAGTTCATAGAGGGAAGGTTTGG
CCACGGTGTATAAGCAGCCGGGTTGTTAACAAAGGGACTCATAGCCGGATGCCCGTAGTT
TAGATTAGCTTGAGGACCTCTTGGCATCTGCGGGAAGCCTCCATCGTGAAACGGAATGTG
CATTGGCATCGGATTGAAGCTTTGGCCAGGTGGCATAACCCTAACGTACCTATAGGCAGG
ATCCACCACATATCTGTCATAGCTCCTGTCGTAATCAGGATCATACCAATCTTTATCTCT
ATCTCTGATAATAGCTACTCTAGAAGTCCGAGAACCAGCATCAACAGAACTATTACTAAC
CGCCACTTCAGTCTCATTCCGGTTTACACCTTCAAGAGGAGGAGGAGGAGGAG
CTCGTAGTAGCGACGAAG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4CX90JQ 789 0 0
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ATAATATCTATATAAATTCTGTTACTTAATACAGACATTGGAAGTACTCAAAACACTAAA
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ATAGTTCATAGACGGCAGGTTTGGCCACGGTGTATAAGCCGCCGGGTTGTTAACAAAGGG
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GCCTCCATCGTGAAAAGGAATGTGCATTGGCATCGGACTGAAGCCTTGGCCAGGTGACAT
AACCCTAACGTACCTGTAGGAAGGATCCACCACATATCTTTCATAGCTCCTGTCGTAATC
AGGATCATACCGATCTTTCTCTCTATCTCTGATGATAGCTACTCTAGAAGTCCGAGAACC
AGCATCAACAGAACTATTACTAACCGCAACTTCAGTCTCATTCCGGTTTACACCTTCAAG
AGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTCGTAGTAGCGATGAAGAATCTTCAGAGTCAGAACTGCT
GGGACTATTAAAGATCCGAGCACGGGCCTTATCATACTCTTCTTTCCTCTCCTCAACACT
CCTCAGAAGATTCTGCTGCACTCCTGACCCGCTACCTCCGCTCCCAGAGCCTCTCTTGGG
TCTAGCCTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4CW92JQ 808 0 0
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TACAAGAAGGAAGCAGCCAGTGTTCTGAACAGAACAGAGAGCTCAGCTCCTAAAGACTAG
ATAATATCTATATAAATTCTGTTACTTAATACAGACATTGGAAGTACTCAAAACACTAAA
CTGTCGTCAGGGATTGCTTGCAAAAGGATGCCTGAAGTCTGGACGGTTCAACGACTGCAC
ATAGTTCATAGACGGCAGGTTTGGCCACGGTGTATAAGCCGCCGGGTTGTTAACAAAGGG
ACTCATAGCCGGATGCCCGTAGTTTAGATTAGCTTGAGGACCTCTAGGAATCTGCGGGAA
GCCTCCATCGTGAAAAGGAATGTGCATTGGCATCGGACTGAAGCCTTGGCCAGGTGACAT
AACCCTAACGTACCTGTAGGAAGGATCCACCACATATCTTTCATAGCTCCTGTCGTAATC
AGGATCATACCGATCTTTCTCTCTATCTCTGATGATAGCTACTCTAGAAGTCCGAGAACC
AGCATCAACAGAACTATTACTAACCGCAACTTCAGTCTCATTCCGGTTTACACCTTCAAG
AGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTCGTAGTAGCGATGAAGAATCTTCAGAGTCAGAACTGCT
GGGACTATTAAAGATCCGAGCACGGGCCTTATCATACTCTTCTTTCCTCTCCTCAACACT
CCTCAGAAGATTCTGCTGCACTCCTGACCCGCTACCTCCGCTCC*AGAGCCTCTCTTGG*
TCTAGCCTTGATGGCGATCTTGAAACCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 4

CO CL1008Contig1 813 4 16 U
GGTCCGCATCCTCTCTACTATCTCTCCTTAATTGCGTCTCTTAGATAAACCCTAGATCTC
TCCTCGAGAAGCAGCGACGATGGCAGACGCTGAGACTTTTGCCTTCCAGGCCGAGATCAA
CCAATTGCTCTCCCTCATCATCAACACCTTTTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGA
GCTCATCAGTAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATCAGATTCGAGTCCTTGACCGATAA
GAGCAAGCTCGATGGACAGCCTGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGACAAGACTAACAA
CACCTTGACCATCATCGATAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCGATTTGGTCAACAACCT
TGGAACTATTGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAAGCGTTGGCTGCTGGTGCTGA
TGTTAGCATGATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTCGCTGACAA
GGTCATTGTGACCACCAAGCACAATGATGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGG
TGGGTCTTTCACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGG*AGAGTCTTGGTAGGGGTACAAAGA
TGGTACTTCACCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCTCAAGGATT
TGGTCAAGAAGCATTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCCCTGTGGATCGAGAAGACTA
TTGAGAAGGAGATCTCTGATGACGAGGATGAGGAGGAAAAGAAGGACGAGGAAGGAAAGG
TTGAGGAAGTAGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F789TF U 1
AF RR4CD20TF U 6
AF RR4CD20JQ C 30
AF RR4F789JQ C 110
BS 1 66 RR4F789TF
BS 67 67 RR4CD20TF
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BS 91 91 RR4CD20TF
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BS 544 544 RR4CD20TF
BS 545 617 RR4F789TF
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BS 653 714 RR4CD20TF
BS 715 715 RR4CD20JQ
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BS 730 752 RR4CD20TF
BS 753 797 RR4CD20JQ
BS 798 813 RR4F789JQ

RD RR4F789TF 652 0 0
GGTCCGCATCCTCTCTACTATCTCTCCTTAATTGCGTCTCTTAGATAAACCCTAGATCTC
TCCTCGGGAAGCAGCGACGATGGCAGACGCCGAGACTTTTGCCTTCCAGGCCGAGATCAA
CCAATTGCTCTCCCTCATCATCAACACCTTTTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGA
GCTCATCAGTAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATCAGATTCGAGTCCTTGACCGATAA
GAGCAAGCTCGATGGACAGCCTGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGACAAGACTAACAA
CACCTTGACCATCATCGATAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCGATTTGGTCAACAACCT
TGGAACTATTGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAAGCGTTGGCTGCTGGTGCTGA
TGTTAGCATGATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTCGCTGACAA
GGTCATTGTGACCACCAAGCACAATGATGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGG
TGG*TCTTTCACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGG*AGAGTCTTGGTAGGGGTACAAAGA
TGGTACTTCACCTTAAG*AGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4CD20TF 750 0 0
GGAG
CCTCTCTACTATCTCTCCTTAATTGCGTCTCTTAGATAAACCCTAGATCTCTCCTCGAGA
AGCAGCGACGATGGCAGACGCTGAGACTTTTGCCTTCCAGGCCGAGATCAACCAATTGCT
CTCCCTCATCATCAACACCTTTTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAGCTCATCAG
TAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATCAGATTCGAGTCCTTGACCGATAAGAGCAAGCT
CGATGGACAGCCTGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGACAAGACTAACAACACCTTGAC
CATCATCGATAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCGATTTGGTCAACAACCTTGGAACTAT
TGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAAGCGTTGGCTGCTGGTGCTGATGTTAGCAT
GATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTCGCTGACAAGGTCATTGT
GACCACCAAGCACAATGATGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTT
CACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGGGAGAGTCTTGGTAGGGGTACAAAGATGGTACTTC
ACCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAG*CTCAAGGATTTGGTCAAGA
AGCATTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCCCTGTGGATCGAGA*GACTATTGAGAAG*
AGATCTCTGATGACGAGGATGAG
AGA

QA 5 747 5 747
DS 

RD RR4CD20JQ 768 0 0
TATTGCGTCTCTTAG
ATAAACCCTAGATCTCTCCTCGAGAAGCAGCGACGATGGCAGACGCTGAGACTTTTGCCT
TCCAGGCCGAGATCAACCAATTGCTCTCCCTCATCATCAACACCTTTTACAGCAACAAGG
AGATCTTCCTTCGTGAGCTCATCAGTAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATCAGATTCG
AGTCCTTGACCGATAAGAGCAAGCTCGATGGACAGCCTGAGCTTTTCATTCACATCATTC
CTGACAAGACTAACAACACCTTGACCATCATCGATAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCG
ATTTGGTCAACAACCTTGGAACTATTGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAAGCGT
TGGCTGCTGGTGCTGATGTTAGCATGATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTTTACTCTGCTT
ACTTGGTCGCTGACAAGGTCATTGTGACCACCAAGCACAATGATGATGAGCAGTACGTGT
GGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTTCACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGG*AGAGTCTT
GGTAGGGGTACAAAGATGGTACTTCACCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAG
AGGAGGCTCAAGGATTTGGTCAAGAAGCATTTTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCCCTG
TGGATCGAGAAGACTATTGAGAAGGAGATCTCTGATGACGAGGATGAGGAGGAAAAGAAG
GACGAGGAAGGAAAGGTTGAGGAAGTAGATGAG

QA 16 768 16 768
DS 

RD RR4F789JQ 704 0 0
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TTCCTTCGTGAGCTCATCAGTAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATCAGATTCGAGTCC
TTGACCGATAAGAGCAAGCTCGATGGACAGCCTGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGAC
AAGACTAACAACACCTTGACCATCATCGATAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCGATTTG
GTCAACAACCTTGGAACTATTGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAAGCGTTGGCT
GCTGGTGCTGATGTTAGCATGATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTG
GTCGCTGACAAGGTCATTGTGACCACCAAGCACAATGATGATGAGCAGTACGTGTGGGAG
TCTCAGGCTGGTGG*TCTTTCACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGG*AGAGTCTTGGTAG
GGGTACAAAGATGGTACTTCACCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAG
GCTCAAGGATTTGGTCAAGAAGCATTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCCCTGTGGAT
CGAGAAGACTATTGAGAAGGAGATCTCTGATGACGAGGATGAGGAGGAAAAGAAGGACGA
GGAAGGAAAGGTTGAGGAAGTAGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 6

CO CL1009Contig1 1141 6 16 U
GGGTAACTCATTGGTGTTCTTCATTTGATTTCGAGAGGTCAATAAAGTGACCAACTTTTG
TTGCTTTTTTCTCATTCAATCAAAACCCTTCTGCACTTTTCTCTCTCCTTCTTCTTCATC
TCAAGAATCTCTGAGTCTTCCTCCTGTAGACAGACATGGATGCTGTTTCACCTCTCAGAG
CTGTGTGTGGAAGCGGTGCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCTTTCTGGGT
TTTGTTCATTTTCTCAGGAAAACAAATCAAAACCGAAACTTTCACCGGTTATGAGCCTAG
ATTTGAAGGAACATCCCATGGCTTCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTCTTCTTCTT
CT**CTATGTTGTTCCTACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGT
GGGAGAAGTCAACGAAAGACAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACT
CTTTGCTTAACGCTGGTGATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTG
GCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAAACAAACCCAAACGTGATGT
TTCTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGTGC
TTCCTTTCTTCAAGTTTTATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCA
CCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGTAGCGAGAGGTGCAGCC
TCGGGCCAGCGAAAGGTTTAGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTAGCGTCTGTAGGGGAAC
TTAAAATGAATCTGGATGTGTTGTTGTCGTCGTCATCATCAACTAGCAACTTCTGTTATG
AAACAGAGCAACAGCATCAGAAGATGGTGGTATAAAGAGACGGGTCTTTTCCATCAGGGC
TCTTATTGATTTGTAGATATGATTATTGATTAGTATCATTGTGTTTTTGCTTGGAATCTA
TGGTTAGTTATTATGATTTACTAGTAGCTTAGTAAATCAAAACAGAACAAAAGTGAAGGT
AAAGAGAGTTGGTTTATGCATCAGAGAGATTCCCATTAAAGACTAAAAGTCAACACAGAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH79TF U 1
AF RR4C972TF U 77
AF RR4EG06TF U 31
AF RR4C972JQ C 465
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AF RR4EH79JQ C 380
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BS 606 606 RR4EG06TF
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RD RR4EH79TF 680 0 0
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TTGCTTTTTTCTCATTCAATCAAAACCCTTCTGCACTTTTCTCTCTCCTTCTTCTTCATC
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CTGTGTGTGGAAGCGGTGCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCTTTCTGGGT
TTTGTTCATTTTCTCAGGAAAACAAATCAAAACCGAAACTTTCACCGGTTATGAGCCTAG
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CTTCCTATGTTGTTCCTACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGT
GGGAGAAGTCAACGAAAGACAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACT
CTTTGCTTAACGCTGGTGATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTG
GCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAAACAAACCCAAACGTGATGT
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TTCCTTTCCTCAAGTTTTAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4C972TF 610 0 0
G
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TTCCTCCTGTAGACAGACATGGATGCTGTTTCACCTCTCAGAGCTGTGTGTGGAAGCGGT
GCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCTTTCTGGGTTTTGTTCATTTTCTCAG
GAAAACAAATCAAAACCGAAACTTTCACCGGTTATGAGCCTAGATTTGAAGGAACATCCC
ATGGCTTCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCCTATGTTGTTCCT
ACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGGGAGAAGTCAACGAAA
GACAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACGCTGGT
GATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCAC
CCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAAACAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAAAGTGAATCAA
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TATAGAGGA

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR4EG06TF 753 0 0
GG
GAGAGGTCAATAAAGTGACCAACTTTTGTTGCTTTTTTCTCATTCAATCAAAACCCTTCT
GCACTTTTCTCTCTCCTTCTTCTTCATCTCAAGAATCTCTGAGTCTTCCTCCTGTAGACA
GACATGGATGCTGTTTCACCTCTCAGAGCTGTGTGTGGAAGCGGTGCTCAATACTCCGGG
ACTAGAATCGATCACGGGCTTTCTGGGTTTTGTTCATTTTCTCAGGAAAACAAATCAAAA
CCGAAACTTTCACCGGTTATGAGCCTAGATTTGAAGGAACATCCCATGGCTTCAAACCAA
ACACTCACCGCCTTGTCTTCTTCTTCTTC***CTATGTTGTTCCTACAAAGACATCATCA
ATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGGGAGAAGTCAACGAAAGACAACATGTTAGAG
ATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACGCTGGTGATGGATTAGTTGTT
CTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTATCAA
TTGGCTGAAACAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACA
ATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGTGCTTCCTTTCTTCAAGTTTTATAGAGGAGCAGAG
GGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCACCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTG
GACA*GCACGGTAGCGAGAG*TGCAGCCTCG

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR4C972JQ 568 0 0
AATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACGCTGGTGATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTAC
TCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAAACA
AACCCAAACGTGATGTTTCTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATG*C
CTTAACGTCCACGTGCTTCCTTTCTTCAAGTTTTATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGT
AGTTTCAGCTGCACCATCGCCGCCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGT
AGCGAGAGGTGCAGCCTCGGGCCAGCGAAAGGTCTAGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTA
GCGTCTGTAGGGGAACTTAAAATGAATCTGGATGTGTTGTTGTCGTCGTCATCATCAACT
AGCAACTTCTGTTATGAAACAGAGCAACAGCATCAGAAGATGGTGGTATAAAGAGACGGG
TCTTTTCCATCAGGGCTCTTATTGATTTGTAGATATGATTATTGATTAGTATCATTGTGT
TTTTGCTTGGAATCTATGGTTAGTTATT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4EG06JQ 808 0 0
GAGCTAGA
TTGAAGGAACATCCCATGGCTTCAAACCAAACACTCACCGC*TTGTCTTCTTCTTCTTCT
***TATGTTGTTCCTACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGG
GAGAAGTCAACGAAAGACAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCT
TTGCTTAACGCTGGTGATGGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGC
TGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTATCAATTGGCTGAAACAAACCCAAACGTGATGTTT
CTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGTGCTT
CCTTTCTTCAAGTTTTATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCACC
GCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGTAGCGAGAGGTGCAGCCTC
GGGCCAGCGAAAGGTTTAGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTAGCGTCTGTAGGGGAACTT
AAAATGAATCTGGATGTGTTGTTGTCGTCGTCATCATCAACTAGCAACTTCTGTTATGAA
ACAGAGCAACAGCATCAGAAGATGGTGGTATAAAGAGACGGGTCTTTTCCATCAGGGCTC
TTATTGATTTGTAGATATGATTATTGATTAGTATCATTGTGTTTTTGCTTGGAATCTATG
GTTAGTTATTATGATTTACTAGTAGCTTAGTAAATCAAAACAGAACAAAAGTGAAGGTAA
*GAGAGTTGGTTTATGCA
CC

QA 9 806 9 806
DS 

RD RR4EH79JQ 762 0 0
AAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGGGAGAAGTCAACGAAAGA
CAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACGCTGGTGA
TAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCACCC
AAAGATCTGTCAATTGGCTGAAACAAACCCAAACGTGATGTTTCTCGAAGTGAATCAAGA
AGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGTGCTTCCTTTCCTCAAGTTTTA
TAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAATAAGTT
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AGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTAGCGTCTGTAGGGGAACTTAAAATGAATCTGGATGT
GTTGTTGTCGTCGTCATCATCAACTAGCAACTTCTGTTATGAAACAGAGCAACAGCATCA
GAAGATGGTGGTATAAAGAGACGGGTCTTTTCCATCAGGGCTCTTATTGATTTGTAGATA
TGATTATTGATTAGTATCATTGTGTTTTTGCTTGGAATCTATGGTTAGTTATTATGATTT
ACTAGTAGCTTAGTAAATCAAAACAGAACAAAAGTGAAGGTAAAGAGAGTTGGTTTATGC
ATCAGAGAGATTCCCATTAAAGACTAAAAGTCAACACAGATC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 7

CO CL1010Contig1 949 7 20 U
GGGTTCCAACACAAACTCTCTCTCTAAAACCTCCAACTTCTCACTAAAAAGCGTCTAATT
GAAGTTTGCTTCGGGGGCCGGCGGTTCCCCACCGTCGGTCACCACCCCTTTTGTTTGTAA
CATATTAGTATTTTCTTTGCCTTTTGTTTTTTGATGTTTATACTTCCGTTTAGCGGATAT
GTTCTTTCGTTGCAGATCAAACTTCGCTAGGCGATGGTTTAGTTTTCAAGTTCCAACCTT
TCGCATGCGTAACTCTAATCCCGTCAACTCTTGATCATATATGATGTTTCTCCTAATCAG
CTTTTCCACTGTTTAATGGAGAATCAGTCTTTGCTGACTTAGATCTAGCCATGTTTGGCT
TAAGGCAAAGCTTCTCTAATAAAAAAGGGTAAAGTTTGTTTGGATTTCTTAGGTCTTTTG
AAGAAGATTCAGCAGAGATGGCGTTTCTAACGGTCCGTCAAAGAATCTCTATTTCAACTG
ACTTAAGTTTCCTCAGGATTAAACATTGGTGAAACATGACTTTCTGGTTAATGAGTTTCG
GTTTAAAGCGAGAGGTTTCGTTGGGAGTACAAGTCTTGGCAAATCAAGGTGTTGTGGCGG
CTCCTGATGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTTCTCCGGTGACAAAGTCGAAGGCGGTT
ACGTCAAGAGCTCAAGAGCGGTGGAGAAGATTGGTGTCCTCGTTAACATCAAGTTCCTGC
CACGTAGCAGCATCTCAAAAATTACCCTACACGTGTTATAAGCTGTGTCATCCTTTTGTT
TATTTGTGTTGGGCCTTAATGCCAATATTGTACTCTTCTTTAGTCCAAGAGGCTTTTATA
AAAAGAAGTTGACAAAAAAAAAAA*GAAAGTTGTTCCAGATTTCAATGTTTATGTTGTAA
TGCTCTATAATATTAGAATTGCATATGATTGTATTTATATTATTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4FY81TF U 1
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GCTTCGGGGGCCGGCGGTTCCCCACCGTCGGTCACCACCCCTTTTGTTTGTAACATATTA
GTATTTTCTTTGCCTTTTGTTTTTTGA

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GTTCTTTCGTTGCAGATCAAACTTCGCTAGGCGATGGTTTAGTTTTCAAGTTCCAACCTT
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CTTTTCCACTGTTTAATGGAGAATCAGTCTTTGCTGACTTAGATCTAGCCATGTTTGGCT
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DS 

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GCTTCGGGGGCCGGCGGTTCCCCACCGTCGGTCACCACCCCTTTTGTTTGTAACATATTA
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CGTTGCAGATCAAACTTCGCTAGGCGATGGTTTAGTTTTCAAGTTCCAACCTTTCGCATG
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TGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTTCTCCGGTGACAAAGTCGAAG*CGGTTACGTCAA
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G
AAGTTCCAACCTTTCGCATGCGTAACTCTAATCCCGTCAACTCTTGATCATATATGATGT
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GCCATGTTTGGCTTAAGGCAAAGCTTCTCTAATAAAAAAGGGTAAAGTTTGTTTGGATTT
CTTAGGTCTTTTGAAGAAGATTCAGCAGAGATGGCGTTTCTAACGGTCCGTCAAAGAATC
TCTATTTCAACTGACTTAAGTTTCCTCAGGATTAAACATTGGTGAAACATGACTTTCTGG
TTAATGAGTTTCGGTTTAAAGCGAGAGGTTTCGTTGGGAGTACAAGTCTTGGCAAATCAA
GGTGTTGTGGCGGCTCCTGATGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTTCTCCGGTGACAAA
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TCATCCTTTTGTTTATTTGTGTTGGGCCTTAATGCCAATATTGTACTCTTCTTTAGTCCA
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GTTTATGTTGTAATGCTCTATAATATTAGAATTGCATATGATTGTATTTATAT
CAAAAAA

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TTCGGTTTAAAGCGAGAGGTTTCGTTGGGAGTACAAGTCTTGGCAAATCAAGGTGTTGTG
GCGGCTCCTGATGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTTTTCCGGTGACAAAGTCGAAGGC
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CTGCCACGTAGCAGCATCTCAAAAATTACCCTACACGTGTTATAAGCTGTGTCATCCTTT
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TATAAAAAGAAGTTGACAAAAAAAAAAA*GAAAGTTGTTCCAGATTTCAATGTTTATGTT
GTAATGCTCTATAATATTAGAATTGCATATGATTGTATTTATAT
C

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DS 



AS 1 6

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ACAAATCTTAAAAGTTTAGGGATTAAATAAAAGAGCAAAGCAATGGAAACATAAGAATAA
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ACAGAAGCACCCAAGCTGACGACATCTTAGTTTTTTTTTTCACTTAAAACTTCAATTTTT
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AGCTGCCTGGTCAGTCTGGCTTATCCTGATCGTCGCAGGCTCAGCCTTGGAGTCAGTGTC
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GATGAGGGGAGAGGGGGAACGATTCTTCCTTCACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C635JQ U 1
AF RR4AG25JQ U 66
AF RR4GO89JQ U 70
AF RR4C635TF C 407
AF RR4AG25TF C 475
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BS 130 130 RR4AG25JQ
BS 131 134 RR4C635JQ
BS 135 135 RR4AG25JQ
BS 136 209 RR4C635JQ
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BS 577 577 RR4AG25JQ
BS 578 622 RR4C635JQ
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ACAAATCTTAAAAGTTTAGGGATTAAATAAAAGAGCAAAGCAATGGAAACATAAAAATAA
AAAAAGGCAGTTTAAAAGGAATCAAGACATGTTGGAGGATAAAACAAAACAAAAAAAATT
ACAGAAGCACCCAAGCTGACGACATCTTATTTTTTTTTTTCACTTAAAACTTCAATTTTT
ATATTTTTTTTCTTATTAGCTTCCACAGCATGCAAACTTCTGTGTGGCCTGGGCGGCTCC
AGCTGCCTGGTCAGTCTGACTTATCCTGATCGTCGCAGGCTCACCCTTGGAGTCAGTGTC
AAAAAGCCTCTGCTTTATGTCCCTCCCTATGGAAAAAAAAACTTCTTCCACGTTTAGGTT
TGTCTTACCACTAGTTTCAAAGAACTTAATCCCGTACTCATCAGCGAGAGCCTGACCCTT
TGCTGTAGGAACCGCCC*TCTTGCTTTCGTCCATGTCAGCCTTGTTCCCTACCAAAATCT
TGTTAACATTATCTGAAGCATGCTGTTCAATATTACAAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGA
AGGAGGACTCGTCGGTGACATC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4AG25JQ 733 0 0
CCTT
AGAAGTTTAGGGATTAAATAAAAGAGCAAAGCAATGGAAACATAAGAATAAGAAAAGGCA
ATTTAGAAGGAATCAAGACATGTTGGAGGATAAAACAAAACAAAAAAAATTACAGAAGCA
CCCAAGCTGACGACATCTTAGTTTTTTTT**CACTTAAAACTTCAATTTTTATATTTTTT
T*CTTATTAGCTTCCACAGCATACAGACTTCTGTGTGGCCTGGGCGGCTCCAGCTGCCTG
GTCAGTCTGGCTTATCCTGATCGTCGCAGGCTCAGCCTTGGAGTCAGTGTCAAAAAGCCT
CTGCTTTATGTCCCTCCCTATGGAGAAAAAAACTTCTTCCACGTTTAGGTTTGCCTTAGC
ACTAGTTTCAAAGAACTTAATCCCGTACTCATCAGCGAGAGCCTGACCCTTTGCTGTAGG
AACCGCCC*TCTTGCTTTCGTCCATGTCAGCCTTGTTCCCTACCAAGATCTTGTTAACAT
TATCTGAAGCATGCTGTTCAATATTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGAGGACT
CGTCGGTGACATCATAGACCAGCAAAATGCCCATTGCCCCACGGTAATAAGCGGTGGTGA
TGGTGCGAAAGCGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATCTGGAGCTTGATACGTTTGCCAT
CAAGCTCAATGGTTCTGATCTTAAAGTCAATGCCAATGGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGA
AGGAGCCAT

QA 5 733 5 733
DS 

RD RR4GO89JQ 774 0 0
AG
AAGTTTAGGGATTAAATAAAAGAGCAAAGCAATGGAAACATAAGAATAAGAAAAGGCAAT
TTAGAAGGAATCAAGACATGTTGGAGGATAAAACAAAACAAAAAAAATTACAGAAACACC
CAAGCTGACGACATCTTAGTTTTTTTTTTCACTTAAAACTTCAATTTTTATATTTTTTT*
CTTATTAGCTTCCACAGCATGCAGACTTCTGTGTGGCCTGGGCGGCTCCAGCTGCCTGGT
CAGTCTGGCTTATCCTGATCGTCGCGGGCTCAGCCTTGGAGTCAGTGTCAGAAAGCCTCT
GCTTTATGTCCCTCCCTATGGAGAAGAAAACTTCTTCCACGTTTAGGTTTGTCTTAGCAC
TAGTTTCAAAGAACTTAATCCCGTACTCATCAGCGAGAGCCTGACCCTTTGCTGTAGGAA
CCGCCC*TCTTGCTTTCGTCCATGTCAGCCTTGTTCCCTACCAAGATCTTGTTAACATTA
TCTGAAGCATGCTGTTCAATATTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGAGGACTCG
TCGGTGACATCATAGACCAGCAAAATGCCCATTGCCCCACGGTAATAAGCGGTGGTGATG
GTGCGAAAGCGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATCTGGAGCTTGATACGTTTGCCATCA
AGCTCAATGGTTCTGATCTTAAAGTCAATGCCAATGGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGAAG
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QA 3 774 3 774
DS 

RD RR4C635TF 647 0 0
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CCCTACCAAGATCTTGTTAACATTATCTGAAGCATGCTGTTCAATATTACGAATCCAGTT
CCTAATGTTGTTGAAGGAGGACTCGTCGGTGACATCATAGACCAGCAAAATGCCCATTGC
CCCACGGTAATAAGCGGTGGTGATGGTGCGAAAGCGTTCTTGATCAGCAGTGTCCCAAAT
CTGGAGCTTGATACGTTTGCCATCAAGCTCAAGGGTTCTGATCTTAAAGTCAATGCCAAT
GGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGAAGGAGCCATCAGAGAAACGTAGAAGCAGACAACTTTT
ACCCACACCGCTATCTCCAATCAAAAGAAGCTTGATGAGATAGTCGTAATCAGCTCTGGC
CCTAGCAGGTGGAGCAGCCATCGATGATGATTCGGATGGAAGGAAACAGAGAAGAAACCG
ATGTAATCGGAGCTAAGGACGGCTAAAATGCGCCACTCCTCGATTTAGATTCCCTCTTCT
CCCTGCTTCTTCTTCGTCTTAGTCTTCTTCGCTGTGCACGATAGGAT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4AG25TF 642 0 0
ACCCTTTGCTGTAGGAACCGCCC*TCTTGCTTTCGTCCATGTCAGCCTTGTTCCCTACCA
AGATCTTGTTAACATTATCTGAAGCATGCTGTTCAATATTACGAATCCAGTTCCTAATGT
TGTTGAAGGAGGACTCGTCGGTGACATCATAGACCAGCAAAATGCCCATTGCCCCACGGT
AATAAGCGGTGGTGATGGTGCGAAAGCGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATCTGGAGCT
TGATACGTTTGCCATCAAGCTCAATGGTTCTGATCTTAAAGTCAATGCCAATGGTGGTGA
TGAAGCTAGTGGTGAAGGAGCCATCAGAGAAACGTAGAAGCAGACAACTTTTACCCACAC
CGCTATCTCCAATCAAAAGAAGCTTGATGAGATAGTCGTAATCAGCTCTGGCCCTAGCAG
GTGGAGCAGCCATCGATGATGATTCGGATGGAAGGAAACAGAGAAGAAACCGATGTAATC
GGAGCTAAGGACGGCTAAAATGCGCCACTCCTCGATTTAGATTCCCTCTTCTCCCTGCTT
CTTCTTCGTCTTCGTCTTCTTCGCTGTGCACGATAGGATACCACGCGCACGTTAGTACTA
GAAAATGATGAGGGGAGAGGGGGAACGATTCTTCCTTCACCC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4GO89TF 634 0 0
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GATCTTGTTAACATTATCTGAAGCATGCTGTTCAATATTACGAATCCAGTTCCTAATGTT
GTTGAAGGAGGACTCGTCGGTGACATCATAGACCAGCAAAATGCCCATTGCCCCACGGTA
ATAAGCGGTGGTGATGGTGCGAAAGCGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATCTGGAGCTT
GATACGTTTGCCATCAAGCTCAATGGTTCTGATCTTAAAGTCAATGCCAATGGTGGTGAT
GAAGCTAGTGGTGAAGGAGCCATCAGAGAAACGTAGAAGCAGACAACTTTTACCCACACC
GCTATCTCCAATCAAAAGAAGCTTGATGAGATAGTCGTAATCAGCTCTGGCCCTAGCAGG
TGGAGCAGCCATCGATGATGATTCGGATGGAAGGAAACAGAGAAGAAACCGATGTAATCG
GAGCTAAGGACGGCTAAAATGCGCCACTCCTCGATTTAGATTCCCTCTTCTCCCTGCTTC
TTCTTCGTCTTCGTCTTCTTCGCTGTGCACGATAGGATACCACGCGCACGTTAGTACTAG
AAAATGATGAGGGGAGAGGGGGAACGATTCTTCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 2 7

CO CL1012Contig1 1006 5 9 U
GGGCCTCTCTCTGTTTATTGTTTTCATCTCTCTCTCAATTCTCTTATCATATTCTTGCTT
GTATCTCTCTCAACTCTCTTATTTGATTCTTTGATCATGATACTAAGCAAGAGACCTCAT
CTAATGATCCGAAAACTGTCGGAGATGCTGGTTCCAAGAAGCCGGTCTGCTATTAAACCG
GAAGATTATTCGGCGAGTCCGAGAGGTCCGTTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAAC
TCGAAACGGTACGGTTCCGGTGGTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGT
AACACTGGGATTAACCGGTACGATCCGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAG
ATTGATCTGTCGGAAGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTG
TATTATAACGAAGACGGGTTTGAATTGTTTGAAAATGGTTCGGAGTACGATGATCGGAGA
AGGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGGTTACGAAGAGACAGGTTCGTAAGGAACCGACA
GAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATG
TACAAAGGAGAGATGGGATTCTGCAGTGCAGAGTGTAGAGCAGTGCAGATAATGAACGAC
GAGCGAAATGAGCAATCTAAACCGCAAGTTTCAAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCT
TACGCCACCGGCGAACAAACTTTTTCCGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATA
ATTTACATTTAGAATAAAAAAAGAGTGATCACCATTCTATTTATCAGAAAAAAATAAGAA
AACAAAACAAAATGAATTGATAAAAAAATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGT
ATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGATTTTGGAATAACGATTAATGTTTATATGTTTGGTT
TCTATATCAAATAAATCAATAAAAAAGCTAGAGATGATTTAACAGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H541TF U 2
AF RR4DD66TF U 24
AF RR4DG05TF U 1
AF RR4H541JQB C 193
AF RR4DD66JQ C 360
BS 1 743 RR4DG05TF
BS 744 744 RR4H541JQB
BS 745 765 RR4DG05TF
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BS 954 1006 RR4DD66JQ

RD RR4H541TF 578 0 0
GGCCTCTCTCTGTTTATTGTTTTCATCTCTCTCTCAATTCTCTTATCATATTCTTGCTTG
TATCTCTCTCAACTCTCTTATTTGATTCTTTGATCATGATACTAAGCAAGAGACCTCATC
TAATGATCCGAAAACTGTCGGAGATGCTGGTTCCAAGAAGCCGGTCTGCTATTAAACCGG
AAGATTATTCGGCGAGTCCGAGAGGTCCGTTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAACT
CGAAACGGTACGGTTCCGGTGGTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTA
ACACTGGGATTAACCGGTACGATCCGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGA
TTGATCTGTCGGAAGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGT
ATTATAACGAAGACGGGTTTGAATTGTTTGAAAATGGTTCGGAGTACGATGATCGGAGAA
GGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGGTTACGAAGAGACAGGTTCGTAAGGAACCGACAG
AGTTCCTGAGCTCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGGGACTT

QA 1 578 1 578
DS 

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GG
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ATTCTTTGATCATGATACTAAGCAAGAGACCTCATCTAATGATCCGAAAACTGTCGGAGA
TGCTGGTTCCAAGAAGCCGGTCTGCTATTAAACCGGAAGATTATTCGGCGAGTCCGAGAG
GTCCGTTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAACTCGAAACGGTACGGTTCCGGTGGTG
TCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATTAACCGGTACGATC
CGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGATTGATCTGTCGGAAGAGGAATACA
CTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTATAACGAAGACGGGTTTGAAT
TGTTTGAAAATGGTTCGGAGTACGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCGATGGTTGAACCAC
CGGTTACGAAGAGACAGGTTCGTAAGGAACCGACAGAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCTTGT
GTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAAGGAGAGATGGGATTCTGCA
GTGCAGAGTGTAGAGCAGTGCAGATAATGAACGACGAGCGAAATGAGCAATCTAAACCGC
AAGTTTCAAGAAACGTCGACGTTTTGAGT
CTCCTT

QA 3 691 3 691
DS 

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GGGCCTCTCTCTGTTTATTGTTTTCATCTCTCTCTCAATTCTCTTATCATATTCTTGCTT
GTATCTCTCTCAACTCTCTTATTTGATTCTTTGATCATGATACTAAGCAAGAGACCTCAT
CTAATGATCCGAAAACTGTCGGAGATGCTGGTTCCAAGAAGCCGGTCTGCTATTAAACCG
GAAGATTATTCGGCGAGTCCGAGAGGTCCGTTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAAC
TCGAAACGGTACGGTTCCGGTGGTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGT
AACACTGGGATTAACCGGTACGATCCGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAG
ATTGATCTGTCGGAAGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTG
TATTATAACGAAGACGGGTTTGAATTGTTTGAAAATGGTTCGGAGTACGATGATCGGAGA
AGGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGGTTACGAAGAGACAGGTTCGTAAGGAACCGACA
GAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATG
TACAAAGGAGAGATGGGATTCTGCAGTGCAGAGTGTAGAGCAGTGCAGATAATGAACGAC
GAGCGAAATGAGCAATCTAAACCGCAAGTTTCAAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCT
TACGCCACCGGCGAACAAACTTTCTCCGCCGGGATATTCGTATTT*AGGATAGCATAATA
ATTTACATTTA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4H541JQB 761 0 0
GCGAGTCCGAGAGGTCCGTTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAACTCGAAACGGTAC
GGTTCCGGTGGTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATT
AACCGGTACGATCCGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGATTGATCTGTCG
GAAGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTATAACGAA
GACGGGTTTGAATTGTTTGAAAATGGTTCGGAGTACGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCG
ATGGTTGAACCACCGGTTACGAAGAGACAGGTTCGTAAGGAACCGACAGAGTTCCTGAGC
TCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGGGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAAGGAGAG
ATGGGATTCTGCAGTGCAGAGTGTAGAGCAGTGCAGATAATGAACGACGAGCGAAATGAG
CAATTTAAACCGCAAGTTTCAAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTACGCCACCGGC
GAACAAACTTTTTCCGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATAATTTACATTTAG
AATAAAAAAAGAGTGATCACCATTCTATTTATCAGAAAAAAATAAGAAAACAAAACAAAA
TGAATTGATAAAAAA*TGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTG
CTTTTGGTTTTGATTTTGGAATAACGATTAATGTTTATATG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4DD66JQ 647 0 0
GATTGATCTGTCGGAAGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGT
GTATTATAACGAAGACGGGTTTGAATTGTTTGAAAATGGTTCGGAGTACGATGATCGGAG
AAGGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGGTTACGAAGAGACAGGTTCGTAAGGAACCGAC
AGAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACAT
GTACAAAGGAGAGATGGGATTCTGCAGTGCAGAGTGTAGAGCAGTGCAGATAATGAACGA
CGAGCGAAATGAGCAATCTAAACCGCAAGTTTCAAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCC
TTACGCCACCGGCGAACAAACTTTTTCCGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAAT
AATTTACATTTAGAATAAAAAAAGAGTGATCACCATTCTATTTATCAGAAAAAAATAAGA
AAACAAAACAAAATGAATTGATAAAAAAATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTG
TATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGATTTTGGAATAACGATTAATGTTTATATGTTTGGT
TTCTATATCAAATAAATCAATAAAAAAGCTAGAGATGATTTAACAGG

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL1012Contig2 918 2 2 U
GTCCGGTGGTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATTAA
CCGGTACGATCCGGTTTTTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGATTGATCTGTCGGA
GGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGAAGA
CGGGTTTGAATTGGTTGAAAATGGGTCGGAGTTCGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCGAT
GGTTGAACCACCGGTTACTAAGAGACAGGTTTTTAGGGAACCGACAGAGTTCCTGAGCTC
GTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAGTAAGTCCT
CTCCGCATTATAATTTTTTTATAATTCGGATCAATAATTAATATCGAATCTTTATCAACT
AATCTGAATTAAAAAAAAAAAGATTTGTGAAGTCGAGACAAATCCAAGATTGTAAATCCC
AAGATTTCTAATTTTATTATTTTTGTTGGGTTGTGTGCAGAGGAGAGATGGGATTCTGCA
GTGCAGAGTGTAGGTCAGTGCAGATAATGAACGACGAGCGAAATGAGCAATCTAAACCCC
AAGTTCAGAGAAAAGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTATGCCGCCGGCGAACAGGCTTTTT
CTGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAAAATTTACATTTAGAATAAAAAAGAGTG
ATCACCATTCTATTTATAAGAAAAAAAATAAGAAAGAAAAGAAAATGAATTGATAAAAAA
AATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGAT
TTTGGAATAACGTTTAATGTTTATATGTTTGGTTTCTATATCAAATAAATCAATAAAAAG
CTAGAGATGATTTAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA30TF U 1
AF RR4FA30JQ C 159
BS 1 640 RR4FA30TF
BS 641 918 RR4FA30JQ

RD RR4FA30TF 640 0 0
GTCCGGTGGTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATTAA
CCGGTACGATCCGGTTTTTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGATTGATCTGTCGGA
GGAGGAATACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGAAGA
CGGGTTTGAATTGGTTGAAAATGGGTCGGAGTTCGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCGAT
GGTTGAACCACCGGTTACTAAGAGACAGGTTTTTAGGGAACCGACAGAGTTCCTGAGCTC
GTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAGTAAGTCCT
CTCCGCATTATAATTTTTTTATAATTCGGATCAATAATTAATATCGAATCTTTATCAACT
AATCTGAATTAAAAAAAAAAAGATTTGTGAAGTCGAGACAAATCCAAGATTGTAAATCCC
AAGATTTCTAATTTTATTATTTTTGTTGGGTTGTGTGCAGAGGAGAGATGGGATTCTGCA
GTGCAGAGTGTAGGTCAGTGCAGATAATGAACGACGAGCGAAATGAGCAATCTAAACCCC
AAGTTCAGAGAAAAGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTATGC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4FA30JQ 760 0 0
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ATCGGAGAAGGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGGTTACTAAGAGACAGGTTTTTAGGG
AACCGACAGAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACA
TTTACATGTACAAGTAAGTCCTCTCCGCATTATAATTTTTTTATAATTCGGATCAATAAT
TAATATCGAATCTTTATCAACTAATCTGAATTAAAAAAAAAAAGATTTGTGAAGTCGAGA
CAAATCCAAGATTGTAAATCCCAAGATTTCTAATTTTATTATTTTTGTTGGGTTGTGTGC
AGAGGAGAGATGGGATTCTGCAGTGCAGAGTGTAGGTCAGTGCAGATAATGAACGACGAG
CGAAATGAGCAATCTAAACCCCAAGTTCAGAGAAAAGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTAT
GCCGCCGGCGAACAGGCTTTTTCTGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAAAATTT
ACATTTAGAATAAAAAAGAGTGATCACCATTCTATTTATAAGAAAAAAAATAAGAAAGAA
AAGAAAATGAATTGATAAAAAAAATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAG
AAGCTTTGCTTTTGGTTTTGATTTTGGAATAACGTTTAATGTTTATATGTTTGGTTTCTA
TATCAAATAAATCAATAAAAAGCTAGAGATGATTTAACAT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 7

CO CL1013Contig1 881 4 5 U
ATTTAATAGTGAGATTTGTGAAATCATTATTAAGTTAACAATAAACAAAGTATAATTTGG
TTTTGTCTTCCCACCTCG*AAATTACATAACAGAATACAGATAATTTTGAGAAATACATA
CACAACTCTTCAAAAGTGGGACTTAAATGCAAAACCAAAATGAATACACATTTGATTAAT
CATTGTGAAGCAGCAGCTGAGATGTGGTTTGGAGACCTGATGATCAATAAGGGTTCCTAT
GTGGAGTAGAACGAGGATGGTTTAGAAGAGGTTGAAGTGCCTTCACCACAATGCTCATGT
TTGGTCTAAAATTTGCCTCATACTGCACGCACAGGGCAGCCACCGCAGCTAGCTTGGCAA
CAGCTTTGGAGGGGTACTCTCCAAGTAGTCTTGCATCAACACATAGCTTCACCTTGTCTT
CGCTCAGTTTAGGGGTTGCCCATGTCACTAGACTTTGTTGTCCACGAGGTAAGGTATGGT
CGACTGGTTTACGACCAGTAAGGAGCTCCAACAGAACAACGCCAAAACTGTACACGTCGC
TCTTTGTGCTCAATGTTCCAGTCATTGCATACTCAGGAGCGTGATAGCCAAAGGTTCCTA
GGACACGAGTTGAGTGAAGCCGAGCAGCCATGTCAGGCGCTTGATTAGAGAGATCGAAAT
CACCAATCTTGGCAACATCATCATCAAACAGAAGGACGTTGCTGGATTTGATGTCTCGGT
GGATAACCTGAGGGTTGACCTTCTCGTGCAAGTACTCGAGTCCTCTGGCTGCACCAACAG
CGATTTTGACTCTCTGTTGCCACGTCATAACAGGACCCCGCAGCGCTCCTTTCACACCTT
TTCGGCCATGAAGAACATCATGAAGAGATCCGTTAGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ87JQ U 9
AF RR4B412JQ U 1
AF RR4AB49JQ U 31
AF RR4A986TF C 44
BS 1 180 RR4B412JQ
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BS 182 779 RR4B412JQ
BS 780 867 RR4AB49JQ
BS 868 881 RR4A986TF

RD RR4EJ87JQ 646 0 0
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TCCCACCTCGGAAATTACATAACAGAATACAGATAATTTTGAGAAATACATACACAACTC
TTCAAAAGTGGGACTTAAATACAAAACCAAAATGAATACACATTTGATTAATCATTGTGA
AGCAGCAGCTGAAATGTGGTTTGGAGACCTGATGATCAGTAAGGGTTTCTATGTGGAGTA
GAACGAGGATGGTTTAAAAGAGGTTGAAGTGCCTTCACCACAATGCTCATGTTTGGTCTA
AAGTTTGCCTCATACTGCACGCACAGGGCAGCCACCGCAGCTAGCTTGGCAACAGCTTTG
GAAGGGTACTCTCCGAGTAATCTTGCATCAACACATAGCTTCACCTTGTCTTCGCTCAGT
TTAGGGGTTGCCCATGTCACTAGACTTTGTTGTCCACGAGGTAAGGTATGGTCGACTGGT
TTACGACCAGTAAGGAGCTCCAACAGAACAACGCCAAAACTGTACACGTCGCTCTTTGTG
CTCAATGTTCCGGTCATTGCATACTCAGGAGCGTGATAGCCAAAGGTTCCTAAGACACGA
GTTGAGTGAAGCCGAGCAGCCATGTCAGGCGCTTGATTAGAGAGAT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4B412JQ 779 0 0
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TTTTGTCTTCCCACCTCG*AAATTACATAACAGAATACAGATAATTTTGAGAAATACATA
CACAACTCTTCAAAAGTGGGACTTAAATGCAAAACCAAAATGAATACACATTTGATTAAT
TATTGTGAAGCAGCAGCTGAGATGTGGTTTGGAGACCTGATGATCAATAAGGGTTCCTAT
GTGGAGTAGAACGAGGATGGTTTAGAAGAGGTTGAAGTGCCTTCACCACAATGCTCATGT
TTGGTCTAAAATTTGCCTCATACTGCACGCACAGGGCAGCCACCGCAGCTAGCTTGGCAA
CAGCTTTGGAGGGGTACTCTCCAAGTAGTCTTGCATCAACACATAGCTTCACCTTGTCTT
CGCTCAGTTTAGGGGTTGCCCATGTCACTAGACTTTGTTGTCCACGAGGTAAGGTATGGT
CGACTGGTTTACGACCAGTAAGGAGCTCCAACAGAACAACGCCAAAACTGTACACGTCGC
TCTTTGTGCTCAATGTTCCAGTCATTGCATACTCAGGAGCGTGATAGCCAAAGGTTCCTA
GGACACGAGTTGAGTGAAGCCGAGCAGCCATGTCAGGCGCTTGATTAGAGAGATCGAAAT
CACCAATCTTGGCAACATCATCATCAAACAGAAGGACGTTGCTGGATTTGATGTCTCGGT
GGATAACCTGAGGGTTGACCTTCTCGTGCAAGTACTCGAGTCCTCTGGCTGCACCAACA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4AB49JQ 837 0 0
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CAGAATACAGATAATTTTGAGAAATACATACACAACTCTTCAAAAGTGGGACTTAAATGC
AAAACCAAAATGAATACACATTTGATTAATTATTGTGAAGCAGCAGCTGAAATGTGGTTT
GGAGACCTGATGATCAATAAGGGTTCCTATGTGGAGTAGAACGAGGATGGTTTAAAAGAG
GTTGAAGTGCCTTCACCACAATGCTCATGTTTGGTCTAAAATTTGCCTCATACTGCACGC
ACAGGGCAGCCACCGCAGCTAGCTTGGCAACAGCTTTGGAGGGGTACTCTCCAAGTAGTC
TTGCATCAACACATAGCTTCACCTTGTCTTCGCTCAGTTTAGGGGTTGCCCATGTCACTA
GACTTTGTTGTCCACGAGGTAAGGTATGGTCGACTGGTTTACGACCAGTAAGGAGCTCCA
ACAGAACAACGCCAAAACTGTACACGTCGCTCTTTGTGCTCAATGTTCCAGTCATTGCAT
ACTCAGGAGCGTGATAGCCAAAGGTTCCTAGGACACGAGTTGAGTGAAGCCGAGCAGCCA
TGTCAGGTGCTTGATTAGAGAGATCGAAATCACCAATCTTGGCAACATCATCATCAAACA
GAAGGACGTTGCTGGATTTGATGTCTCGGTGGATAACCTGAGGGTTGACCTTCTCGTGCA
AGTACTC*AGTCCTCTGGCTGCACCAACAGCGATTTTGACTCTCTGTTGCCACGTCATAA
CAGGACCCCGCAGCGCTCCTTTCACACCTTTTCGGCCATGAAGAACATCATGAAGAG

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4A986TF 838 0 0
AACAAAGTATAATTTGGTTT*GTCTTCCCACCTCG*AAATTACATAACAGAATACAGATA
ATTTTGAGAAATACATACACAACTCTTCAAAAGTGGGACTTAAATGCAAAACCAAAATGA
ATACACACTTGATTAATCATTGTGAAGCAGCAGCTGAGATGTGGTTTGGAGACCTGATGA
TCAATAAGGGTTCCTATGTGGAGTAGAACGAGGATGGTTTAGAAGAGGTTGAAGTGCCTT
CACCACAATGCTCATGTTTGGTCTAAAATTTGCCTCATACTGCACGCACAGGGCAGCCAC
CGCAGCTAGCTTGGCAACAGCTTTGGAGGGGTACTCTCCAAGTAGTCTTGCATCAACACA
TAGCTTCACCTTGTCTTCGCTCAGTTTAGGGGTTGCACATGTCACTAGACTTTGTTGTCC
ACGAGGTAAGGTATGGTCGACTGGCTTACGACCAGTAAGGAGCTCCAACAGAACAACGCC
AAAACTGTACACGTCGCTCTTTGTGCTCAATGTTCCAGTCATTGCATACTCAGGAGCGTG
ATAGCCAAAGGTTCCTAGGACACGAGTTGAGTGAAGCCGAGCAT**ATGTCAGGCGCTTG
ATTAGAGAGATCGAAATCACCAATCTTGGCAACATCATCATCAAACAGAAGCACGTTGCT
GGATTTGATGTCTCGGTGGATAACCTGAGGGTTCACCTTCTCGTGCAAGTACTCGAGTCC
TCTGGCTGCACCAACAGCGATTTTGACTCTCTGTTGCCACGTCATAACAGGACCTCGCAG
CGCTCCTTTCACACCTTTTCGGCCATGAAGAACATCATGAAGAGATCCGTTAGGAGCC

QA 1 838 1 838
DS 



CO CL1013Contig2 886 3 4 U
GGACCAAAGCTTAAACACTAAGCAGAGATATAGCAATTTCAAAAATTATATCTCTCTCTC
TCTCTCTACTTTCCCAACTTCGTCGCCAAACAGTTAACTTGTCGTGTAATAGAAGAGTTA
GTTGTTGT****AATCATGAGCTGTTTCGGTTGGTGTGGGAACGATGATGGTTTCCGTAA
TGCTGATGATACTAGACCAATGCCAACCCTCATCCCTGCAGGTGACAGTGGAAGCCACTA
TCTAAGATCTGATCCACCCATGAATCAGCCTGTCCTTCAGATGGAGCCTATTGCTGTACC
AGCCATTCCTGCTGATGAGCTGAGTGATGTAACCGATAACTATGGTTCCAAGGCCTTGGT
CGGTGAGGGTTCTTATGGAAGGGTGTTTCACGGTGTTCTTAAAAGCGGTGTAACATCTGC
AATTAAGAAACTTGACTCTAGCAAGCAGCCTGACCAAGAATTTCTTTCCCAGATATCAAT
GGTTTCGAGATTGCGACACGAGAATGTTATTGCACTTGTGGGTTATTGTGTTGATGGCCC
TCTCCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCTCCCAACGGATCTCTTCATGATGTTCTTCATGG
CCGAAAAGGTGTGAAAGGAGCGCTGCGGGGTCCTGTTATGACGTGGCAACAGAGAGTCAA
AATCGCTGTTGGTGCAGCCAGAGGACTCGAGTACTTGCACGAGAAGGTCAACCCTCAGGT
TATCCACCGAGACATCAAATCCAGCAACGTCCTTCTGTTTGATGATGATGTTGCCAAGAT
TGGTGATTTCGATCTCTCTAATCAAGCACCTGACATGGCTGCTCGGCTTCACTCAACTCG
TGTCCTAGAACCTTTGGCTATCACGCTCCTGAGTATGCAATGACTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ87TF U 1
AF RR4B412TF U 1
AF RR4AB49TF U 43
BS 1 575 RR4B412TF
BS 576 576 RR4EJ87TF
BS 577 702 RR4B412TF
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RD RR4EJ87TF 604 0 0
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TCTCTCTACTTTCCCAACTTCGTCGCCAAACAGTTAACTTGTCGTGTAATAGAAGAGTTA
GTTGTTGT****AATCATGAGCTGTTTCGGTTGGTGTGGGAACGATGATGGTTTCCGTAA
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TCTAAGATCTGATCCACCCATGAATCAGCCTGTTCTTCAGATGGAGCCTATTGCTGTACC
AGCCATTCCTGCTGATGAGCTGAGTGATGTAACCGATAACTACGGTTCCAAGGCCTTGGT
CGGTGAGGGTTCTTATGGAAGGGTGTTTCACGGTGTTCTTAAAAGCGGTGTGACATCTGC
TATCAAGAAACTTGACTCTAGCAAGCAGCCTGACCAAGAATTTCTTTCCCAGATATCAAT
GGTTTCGAGATTGCGACACGAGAATGTTATTGCACTTGTGGGTTATTGTGTTGATGGCCC
TCTCCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCTCCCAACGGATCTCTTCATGATGTTCTTCATGG
CCGA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4B412TF 702 0 0
GGACCAAAGCTTAAACACTAAGCAGAGATATAGCAATTTCAAAAATTATATCTCTCTCTC
TCTCTCTACTTTCCCAACTTCGTCGCCAAACAGTTAACTTGTCGTGTAATAGAAGAGTTA
GTTGTTGT****AATCATGAGCTGTTTCGGTTGGTGTGGGAACGATGATGGTTTCCGTAA
TGCTGATGATACTAGACCAATGCCAACCCTCATCCCTGCAGGTGACAGTGGAAGCCACTA
TCTAAGATCTGATCCACCCATGAATCAGCCTGTCCTTCAGATGGAGCCTATTGCTGTACC
AGCCATTCCTGCTGATGAGCTGAGTGATGTAACCGATAACTATGGTTCCAAGGCCTTGGT
CGGTGAGGGTTCTTATGGAAGGGTGTTTCACGGTGTTCTTAAAAGCGGTGTAACATCTGC
AATTAAGAAACTTGACTCTAGCAAGCAGCCTGACCAAGAATTTCTTTCCCAGATATCAAT
GGTTTCGAGATTGCGACACGAGAATGTTATTGCACTTGTGGGTTATTGTGTTGATGGCCC
TCTCCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCTCCCAACGAATCTCTTCATGATGTTCTTCATGG
CCGAAAAGGTGTGAAAGGAGCGCTGCGGGGTCCTGTTATGACGTGGCAACAGAGAGTCAA
AATCGCTGTTGGTGCAGCCAGAGGACTCGAGTACTTGCACGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AB49TF 844 0 0
AAATTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTACTTTCCCAACTTCGTCGCCAAACAGTTAACCTGTCGTGTAAT
AGAAGAGTTAGTTGTTGTTGTAAATCATGAGCTGTTTCGGTTGGTGTGGGAACGATGATG
GTTTCCGTAATGCTGATGATACTAGACCAATGCCAACCCTCGTCCCTGCAGGTGACAGTG
GAAGCCACTATCTAAGATCTGATCCACCCATGAATCAGCCTGTCCTTCAGATGGAGCCTA
TTGCTGTACCAGCCATTCCTGCTGATGAGCTGAGTGATGTAACCGATAACTATGGTTCCA
AGGCCTTGGTCGGTGAGGGTTCTTATGGAAGGGTGTTTCACGGTGTTCTTAAAAGCGGTG
TAACATCTGCAATTAAGAAACTTGACTCTAGCAAGCAGCCTGACCAAGAATTTCTTTCCC
AGATATCAATGGTTTCGAGATTGCGACACGAGAATGTTATTGCACTTGTGGGTTATTGTG
TTGATGGCCCTCTCCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCTCCCAACGGATCTCTTCATGATG
TTCTTCATGGCCGAAAAGGTGTGAAAGGAGCGCTGCGGGGTCCTGTTATGACGTGGCAAC
AGAGAGTCAAAATCGCTGTTGGTGCAGCCAGAGGACT*GAGTACTTGCACGAGAAGGTCA
ACCCTCAGGTTATCCACCGAGACATCAAATCCAGCAACGTCCTTCTGTTTGATGATGATG
TTGCCAAGATTGGTGATTTCGATCTCTCTAATCAAGCACCTGACATGGCTGCTCGGCTTC
ACTCAACTCGTGTCCTAGAACCTTTGGCTATCACGCTCCTGAGTATGCAATGACTG

QA 9 844 9 844
DS 



AS 1 7

CO CL1014Contig1 462 7 11 U
GGAAGGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGT
GCCAGCCTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGT
TGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGG
TAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAA
AGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATT
GTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCC
AATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 

AF RR4A725JQ C 1
AF RR4E753JQ C 95
AF RR4E753TF U 95
AF RR4G774JQ C 6
AF RR4G774TF U 6
AF RR4AD24TF U 11
AF RR4A725TF U 1
BS 1 7 RR4A725JQ
BS 8 16 RR4G774TF
BS 17 17 RR4AD24TF
BS 18 94 RR4G774TF
BS 95 137 RR4E753TF
BS 138 138 RR4G774TF
BS 139 248 RR4E753TF
BS 249 249 RR4G774TF
BS 250 424 RR4E753TF
BS 425 425 RR4AD24TF
BS 426 462 RR4E753TF

RD RR4A725JQ 462 0 0
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GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCATGCTAGTCTTCATGAATGT
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TGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGG
TAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAA
AGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATT
GTTCTG*TTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCC
AATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATTTTATTATACG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4E753JQ 368 0 0
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CGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTAGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCT
AAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGG
CATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTA
AGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCATTTAGCATCATTACCATTAATATAATATT
ATTATACG

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4E753TF 368 0 0
TTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCTGGAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCT
CTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAG
CGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTAGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCT
AAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGG
CATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTA
AGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCATTTAGCATCATTACCATTAATATAATATT
ATTATACG

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4G774JQ 457 0 0
GG
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C*AATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACC
TGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTT
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TAGCATCATTGCCATTAATATAATATTATTATAC
C

QA 3 456 3 456
DS 

RD RR4G774TF 457 0 0
GG
ATCCTACAACAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCA
AATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCTAGCC
TGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCT
C*AATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACC
TGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTT
ATTTACCGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGG
TTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCGTT
TAGCATCATTGCCATTAATATAATATTATTATAC
C

QA 3 456 3 456
DS 

RD RR4AD24TF 452 0 0
GG
ACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTT
GCTTCATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCGTGGAA
AAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAAT
ACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGGG
CCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTTATACAATAAAACAAAGCATTTATTTA
CAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTGT
TTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTTTAGCA
TCATTACCATTAATATAATATTATTATAC
T

QA 3 451 3 451
DS 

RD RR4A725TF 462 0 0
GGAAGGC
ATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCA
AATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCATGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCC
TGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCT
CCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACC
TGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTT
ATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTG*
TTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTT
TAGCATCATTACCATTAATATAATTTTATTATACG

QA 8 462 8 462
DS 



AS 1 7

CO CL1015Contig1 681 7 10 U
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CAGGCTTAAAGAAACCGTCAAAAAGCCACCGTTCGTTCAGACTTTTCCATTTCTCGATCA
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AACTTGAACGGATTGTTTGGAAGGCAATCTGGAACGACTCCAGGGTATTCTTACTCTGCT
GCCAACAAGAACATGGCCGTCATGTGGGAGGAGAAGACTCTCTACGATTACTTGTTGAAC
CCCAAGAAGTACATTCCTGGGACGAAAATGGTGTTTCCTGGATTGAAAAAGCCACAAGAC
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AATGAAGCCTTTAATTCCCCGTGCATTTTTTTTTCTCACAGAAAAAA*TAAAATCAGACC
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AGTTGCCTCGTAAAAAGTCGAATATTCGTTTTTGATGTGAAGAACCTATCTCTACCACGA
AATTTGATTAGATTTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4E581JQ C 28
AF RR4E581TF U 28
AF RR4F793TF U 1
AF RR4D121TF U 60
AF RR4DJ08JQ C 60
AF RR4DJ08TF U 60
AF RR4D121JQ C 169
BS 1 117 RR4F793TF
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BS 119 502 RR4F793TF
BS 503 503 RR4E581TF
BS 504 527 RR4F793TF
BS 528 528 RR4D121TF
BS 529 574 RR4F793TF
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BS 576 667 RR4F793TF
BS 668 681 RR4D121TF

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GG
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TTTTGATG
C

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR4E581TF 611 0 0
GG
AAAAGAGCCATAAACCAAAAAAAAAAAAGGTCAGGCTTAAAGAAACCGTCAAAAAGCCAC
CGTTCGTTCAGACTTTTCCATTTCTCGATCACAAATGGCGTCGTTCGATGAAGCACCTCC
TGGAAACCCTAAGGCCGGAGAGAAGATCTTCAGAACCAAGTGTGCGCAGTGCCACACCGT
CGACAAAGGTGCCGTTCACAAACAAGGACCAAACTTGAACGGATTGTTTGGAAGGCAATC
TGGAACGACTCCAGGGTATTCTTACTCTGCTGCCAACAAGAACATGGCCGTCATGTGGGA
GGAGAAGACTCTCTACGATTACTTGTTGAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGGACGAAAAT
GGTGTTTCCTGGATTGAAAAAGCCACAAGACCGTGCCGATCTCATTGCTTATTTGAAGGA
AAGTACTGCATAGAGTGGCTCGCTCGGTTATAATGAAGCCTTTAATTCCCCGTGCATTTT
TTTTTCTCACAGAAAAAAATAAAATCAGACCAGAAGTATTGTGGTCATGAACTGGTTATA
TGTTTTCTTTCTTTTCTTTGTCAATGAGGCGAGTTGCCTCGTAAAAAGTCGAATATTCGT
TTTTGATG
C

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR4F793TF 667 0 0
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CAGGCTTAAAGAAACCGTCAAAAAGCCACCGTTCGTTCAGACTTTTCCATTTCTCGACCA
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AACTTGAACGGATTGTTTGGAAGGCAATCTGGAACGACTCCAGGGTATTCTTACTCTGCT
GCCAACAAGAACATGGCCGTCATGTGGGAGGAGAAGACTCTCTACGATTACTTGTTGAAC
CCCAAGAAGTACATTCCTGGGACGAAAATGGTGTTTCCTGGATTGAAAAAGCCACAAGAC
CGTGCCGATCTCATTGCTTATTTGAAGGAAGGTACTGCATAGAGTGGCTCGCTCGGTTAT
AATGAAGCCTTTAATTCCCCGTACATTTTTTTTTCTCACAGAAAAAAATAAAATCAGACC
AGAAGTATTGTGGTCATGAACTGGTTATATGTTTTCTTTCTTTTCTTTGTCAATGAGGCG
AGTTGCCTCGTAAAAAGTCGAATATTCGTTTTTGATGTGAAGAACCTATCTCTACCACGA
AATTTGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4D121TF 622 0 0
GG
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ATTTGATTAGATTTTATTTT

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR4DJ08JQ 622 0 0
GG
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ACTTGAACGGATTGTTTGGAAGGCAATCTGGAACGACTCCAGGGTATTCTTACTCTGCTG
CCAACAAGAACATGGCCGTCATGTGGGAGGAGAAGACTCTTTACGATTACTTGTTGAACC
CCAAGAAGTACATTCCTGGGACGAAAATGGTGTTTCCTGGATTGAAAAAGCCACAAGACC
GTGCCGATCTCATTGCTTATTTGAAGGAAGGTACTGCATAGAGTGGCTCGCTCGGTTATA
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ATTTGATTAGATTTTATTTT

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR4DJ08TF 622 0 0
GG
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AAATGGCGTCGTTCGATGAAGCACCTCCTGGAAACCCTAAGGCCGGAGAGAAGATCTTCA
GAACCAAGTGTGCGCAGTGCCACACCGTCGACAAAGGTGCCGGTCACAAACAAGGACCAA
ACTTGAACGGATTGTTTGGAAGGCAATCTGGAACGACTCCAGGGTATTCTTACTCTGCTG
CCAACAAGAACATGGCCGTCATGTGGGAGGAGAAGACTCTCTACGATTACTTGTTGAACC
CCAAGAAGTACATTCCTGGGACGAAAATGGTGTTTCCTGGATTGAAAAAGCCACAAGACC
GTGCCGATCTCATTGCTTATTTGAAGGAAGGTACTGCATAGAGTGGCTCGCTCGGTTATA
ATGAAGCCTTTAATTCCCCGTGCATTTTTTTTTCTCACAGAAAAAA*TAAAATCAGACCA
GAAGTATTGTGGTCATGAACTGGTTATATGTTTCCTTTCTTTTCTTTGTCAATGAGGCGA
GTTGCCTCGTAAAAAGTCGAATATTCGTTTTTGATGTGAAGAACCTATCTCTACCACGAA
ATTTGATTAGATTTTATTTT

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR4D121JQ 513 0 0
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AAACAAGGACCAAACTTGAACGGATTGTTTGGAAGGCAATCTGGAACGACTCCAGGGTAT
TCTTACTCTGCTGCCAACAAGAACATGGCCGTCATGTGGGAGGAGAAGACTCTCTACGAT
TACTTGTTGAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGGACGAAAATGGTGTTTCCTGGATTGAAA
AAGCCACAAGACCGTGCCGATCTCATTGCTTATTTGAAGGAAGGTACTGCATAGAGTGGC
TCGCTCGGTTATAATGAAGCCTTTAATTCCCCGTGCATTTTTTTTTCTCACAGAAAAAA*
TAAAATCAGACCAGAAGTATTGTGGTCATGAACTGGTTATATGTTTCCTTTCTTTTCTTT
GTCAATGAGGCGAGTTGCCTCGTAAAAAGTCGAATATTCGTTTTTGATGTGAAGAACCTA
TCTCTACCACGAAATTTGATTAGATTTTATTTT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 7

CO CL1016Contig1 736 7 27 U
GGGATCTCCACTGCACTCCACGGTAGAGAGAGAGAGACTGCTCTCCGGCGAAACTGCGCA
AACCCTAGCTCCGTTCAATGGCGGATCCGAGCTCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTA
ATCTAAGGAATCCTTCTGGGAGTAGCAAGAAGATGGGAGATCGTGCAAGTAACCAGCAGA
ACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCTCTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACT*TGA
AGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTATCAGCTTTTAAACGAACGCTGGGCAATTGCAATGC
ATCAATACAACGACCCAACCGTGGATTTATCTGAACGGCCAATCATGTACTATGGAGGGA
GTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAGATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAA
AGATATCGCCAGCGGATTACAGAGCTGAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTT
CAAGTTCTAGCAACTGAACGGTCTTTAGACTAGTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGA
GATGGCACAAGCGATTATGTGTCAATGACGTTCTTCTTCTTCTTTCCTGGTAGGATAAAA
ATGATATCTTTCTTGCTCGAGTCTGTTGTTTCCTCTGGTCCCTGAAAGTGTAAAAACCTA
AACCAGAAGGTTTGACTAACAATGACGTTAACATTTTGTATAATTTGGCTTGCAAATGCA
TCGCTGCTTTTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA24JQ C 51
AF RR4G787TF U 1
AF RR4G787JQ C 14
AF RR4BA24TF U 13
AF RR4BE87TF U 13
AF RR4EA06TF U 22
AF RR4BE87JQ C 93
BS 1 67 RR4G787TF
BS 68 68 RR4BA24TF
BS 69 138 RR4G787TF
BS 139 139 RR4BA24TF
BS 140 141 RR4G787TF
BS 142 142 RR4BA24TF
BS 143 154 RR4G787TF
BS 155 155 RR4BA24TF
BS 156 156 RR4G787TF
BS 157 157 RR4BA24TF
BS 158 166 RR4G787TF
BS 167 167 RR4BA24TF
BS 168 171 RR4G787TF
BS 172 172 RR4BA24TF
BS 173 236 RR4G787TF
BS 237 237 RR4BA24TF
BS 238 357 RR4G787TF
BS 358 358 RR4BA24TF
BS 359 424 RR4G787TF
BS 425 425 RR4BA24TF
BS 426 466 RR4G787TF
BS 467 467 RR4BA24TF
BS 468 498 RR4G787TF
BS 499 499 RR4BA24TF
BS 500 601 RR4G787TF
BS 602 729 RR4BA24TF
BS 730 736 RR4BE87JQ

RD RR4BA24JQ 492 0 0
AAACTGCGCAAACCCTAGCTCCGTTCAATGGCGGATCCGAGCTCCAACGCGAATAAATAC
ACTCCCCCTAATCTAAGGAATCCTTCTGGGAGTAGCAAGAAGATGGGAGATCGTGCAAGT
AACCAGCAGAACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCTCTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATT
GTCACT*TGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTATCAGCTTTTAAACGAACGCTGGGCA
ATTGCAATGCATCAATACAACGACCCAACCGTGGATTTATCTGAACGGCCAATCATGTAC
TATGGAGGGAGTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAGATCCTGGCTGCAGCAAACAATACA
TTGCCTTCAAAGATATCGCCAGCGGATTACAGAGCTGAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACT
CCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAACGGTCTTTAGACTAGTGTGATATGGTGTTTGG
TGCTTGTTGAGA

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4G787TF 601 0 0
GGGATCTCCACTGCACTCCACGGTAGAGAGAGAGAGACTGCTCTCCGGCGAAACTGCGCA
AACCCTAACTCCGTTCAATGGCGGATCCGAGCTCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTA
ATCTAAGGAATCCTTCTGTGAATAGCAAGAAGATAGTAGATCGTGCCAGTAGCCAGCAGA
ACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCTCTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACTCTGA
AGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTATCAGCTTTTAAACGAACGCTGGGCAATTGCAATGC
ATCAATACAACGACCCAACCGTGGATTTATCTGAACGGCCAATCATGTACTATGGAGTGA
GTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAGATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAA
AGATCTCGCCAGCGGATTACAGAGCTGAAGTGCGCCGAGGATTGCTTACTCCAAGAACTT
CAAGTTCTAGCAACTGAATGGTCTTTAGACTAGTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGA
GATGGCACAAGCGATTATGTGTCAATGACGTTCTTCTTCTTCTTTCCTGGTAGGATAAAA
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4G787JQ 690 0 0
CACTCCACGGTAG
AGAGAGAGAGACTGCTCTCCGGCGAAACTGCGCAAACCCTAACTCCGTTCAATGGCGGAT
CCGAGCTCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTAATCTAAGGAATCCTTCTGTGAATAGC
AAGAAGATAGTAGATCGTGCCAGTAGCCAGCAGAACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCT
CTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACTCTGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTAT
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TTATTTGAACGGCCAATCATGTACTATGGAGTGAGTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAG
ATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAAAGATCTCGCCAGCGGATTACAGAGCT
GAAGTGCGCCGAGGATTGCTTACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAATGGTCTTT
AGACTAGTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGAGATGGCACAAGCGATTATGTGTCAAT
GACGTTTTTCTTCTTCTTTCCTGGTAGGATAAAAATGATATCTTTCTTGCTCGAGTCTGT
TGTTTCCTCTGGTCCCTGAAAGTGTAAAAACCTAAACCAGAAGGTTTGACTAACAATGAC
GTTAACATTTTG
CATAG

QA 14 685 14 685
DS 

RD RR4BA24TF 717 0 0
GGGCACTCCACGGT
AGAGAGAGAGACTGCTCTCCGGCGAAACTGCGCAAACCCTAGCTCCGTTCAATGGCGGAT
CCGAGCTCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTAATCTAAGGAATCCTTCTGGGAGTAGC
AAGAAGATGGGAGATCGTGCAAGTAACCAGCAGAACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCT
CTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACT*TGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTAT
CAGCTTTTAAACGAACGCTGGGCAATTGCAATGCATCAATACAACGACCCAACCGTGGAT
TTATCTGAACGGCCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAG
ATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAAAGATATCGCCAGCGGATTACAGAGCT
GAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAACGGTCTTT
AGACTAGTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGAGATGGCACAAGCGATTATGTGTCAAT
GACGTTCTTCTTCTTCTTTCCTGGTAGGATAAAAATGATATCTTTCTTGCTCGAGTCTGT
TGTTTCCTCTGGTCCCTGAAAGTGTAAAAACCTAAACCAGAAGGTTTGACTAACAATGAC
GTTAACATTTTGTATAATTTGGCTTGCAAATGCATCGCTGCTT

QA 15 717 15 717
DS 

RD RR4BE87TF 724 0 0
GGGCACTCCACGGT
AGAGAGAGAGACTGCTCTCCGGCGAAACTGCGCAAACCCTAGCTCCGTTCAATGGCGGAT
CCGAGCTCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTAATCTAAGGAATCCTTCTGGGAGTAGC
AAGAAGATGGGAGATCGTGCAAGTAACCAGCAGAACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCT
CTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACT*TGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTAT
CAGCTTTTAAACGAACGCTGGGCAATTGCAATGCATCAATACAACGACCCAACCGTGGAT
TTATCTGAACGGCCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAG
ATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAAAGATATCGCCAGCGGATTACAGAGCT
GAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAACGGTCTTT
AGACTAGTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGAGATGGCACAAGCGATTATGTGTCAAT
GACGTTCTTCTTCTTCTTTCCTGGTAGGATAAAAATGATATCTTTCTTGCTCGAGTCTGT
TGTTTCCTCTGGTCCCTGAAAGTGTAAAAACCTAAACCAGAAGGTTTGACTAACAATGAC
GTTAACATTTTGTATAATTTGGCTTGCAAATGCATCGCTGCTT
TTCTACC

QA 15 717 15 717
DS 

RD RR4EA06TF 709 0 0
GGGGT
AGAGAGAGAGACTGCTCTCCGGCGAAACTGCGCAAACCCTAGCTCCGTTCAATGGCGGAT
CCGAGCTCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTAATCTAAGGAATCCTTCTGGGAGTAGC
AAGAAGATGGGAGATCGTGCAAGTAACCAGCAGAACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCT
CTGGCTACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACTCTGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTAT
CATCTTTTAAACGAACGCTGGGCAATTGCAATGCATCAATACAACGACCCAACCGTGGAT
TTATCTGAACGGCCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAG
ATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAAAGATATCGCCAGCGGATTACAGAGCT
GAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAACGGTCTTT
AGACTAGTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGAGATGGCGCAAGCGATTATGTGTCAAT
GACGTTCTTCTTCTTCTTTCCTGGTAGGATAAAAATGATATCTTTCTTGCTCGAGTCTGT
TGTTTCCTCTGGTCCCTGAAAGTGTAAAAACCTAAACCAGAAG*TTTGACTAACAATGAC
GTTAACATTTTGCATAATTTGGCTTGCAAATGCATCGCTGCTT
T

QA 6 708 6 708
DS 

RD RR4BE87JQ 644 0 0
TCCAACGCGAATAAATACACTCCCCCTAATCTAAGGAATCCTTCTGGGAGTAGCAAGAAG
ATGGGAGATCGTGCAAGTAACCAGCAGAACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGTCTCTGGCT
ACTGGTTCTCAAAAGATTGTCACT*TGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTTATCAGCTT
TTAAACGAACGCTGGGCAATTGCAATGCATCAATACAACGACCCAACCGTGGATTTATCT
GAACGGCCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGTAAACTACCTCACCAGATCCTG
GCTGCAGCAAACAATACATTGCCTTCAAAGATATCGCCAGCGGATTACAGAGCTGAAGTG
CGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAACGGTCTTTAGACTA
GTGTGATATGGTGTTTGGTGCTTGTTGAGATGGCACAAGCGATTATGTGTCAATGACGTT
CTTCTTTTTCTTTCCTGGTAGGATAAAAATGATATCTTTCTTGCTAGAGTCTGTTGTTTC
CTCTGGTCCCTGAAAGTGTAAAAACCTAAACCAGAAGGTTTGACTAACAATGACGTTAAC
ATTTTGTATAATTTGGCTTGCAAATGCATCGCTGCTTTTCTACC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 2 7

CO CL1017Contig1 669 2 3 U
GAATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTCGGACGTCTCGTCGTTCATCTCGC
TGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAGCGATCGTGGAAACGTCCATATGGCGTGGGTTTGTT
GGTATGTGGATTGGATGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAGCGGAAACTA
CTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGACTTATCTGGA
GCGTAGGTTTGAGAGCTTTGAGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTCT
GGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCACAGTCTCTGT
TCTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGAAACTATCCAGAAAGTGATTGA
CACATTTGAGAAAGTACCTGAAGAAGAGGAAGGTGAGGCTGGCGAGGGTGAGGCTGAAGC
TGCACCAGCGGAGCAGGGTGGTGATGGTGGTGGTGCAGGTGACCAAGACGTGGCTCCGAT
GGAAATGTGAGGCCTTTGTGCGGAACGCTGTGAACTGTTTTAATTGAATGTTTGTCGAAT
TTACTTTGGATAATTTCATTTGCAAATCGCAGCGGTTTTAGATTATATGCTCGAAAAACT
CGTGGGGTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK14TF U 1
AF RR4FK14JQ C 1
BS 1 1 RR4FK14JQ
BS 2 610 RR4FK14TF
BS 611 669 RR4FK14JQ

RD RR4FK14TF 610 0 0
G
AATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTCGGACGTCTCGTCGTTCATCTCGCT
GATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAGCGATCGTGGAAACGTCCATATGGCGTGGGTTTGTTG
GTATGTGGATTGGATGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAGCGGAAACTAC
TTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGACTTATCTGGAG
CGTAGGTTTGAGAGCTTTGAGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTCTG
GCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCACAGTCTCTGTT
CTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGAAACTATCCAGAAAGTGATTGAC
ACATTTGAGAAAGTACCTGAAGAAGAGGAAGGTGAGGCTGGCGAGGGTGAGGCTGAAGCT
GCACCAGCGGAGCAGGGTGGTGATGGTGGTGGTGCAGGTGACCAAGACGTGGCTCCGATG
GAAATGTGAGGCCTTTGTGCGGAACGCTGTGAACTGTTTTAATTGAATGTTTGTCGAATT
TACTTTGGA

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR4FK14JQ 669 0 0
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TGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAGCGATCGTGGAAACGTCCATATGGCGTGGGTTTGTT
GGTATGTGGATTGGATGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAGCGGAAACTA
CTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGACTTATCTGGA
GCGTAGGTTTGAGAGCTTTGAGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTCT
GGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCACAGTCTCTGT
TCTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGAAACTATCCAGAAAGTGATTGA
CACATTTGAGAAAGTACCTGAAGAAGAGGAAGGTGAGGCTGGCGAGGGTGAGGCTGAAGC
TGCACCAGCGGAGCAGGGTGGTGATGGTGGTGGTGCAGGTGACCAAGACGTGGCTCCGAT
GGAAATGTGAGGCCTTTGTGCGGAACGCTGTGAACTGTTTTAATTGAATGTTTGTCGAAT
TTACTTTGGATAATTTCATTTGCAAATCGCAGCGGTTTTAGATTATATGCTCGAAAAACT
CGTGGGGTC

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL1017Contig2 1077 5 9 U
GGGAAGCAAAAGAAAAGTTCCCGAGCTGCTCTATAAACCTTTCTCCAACAACGCAACAAG
AGCAGCAGCAAAGCAAGCAAGAAGAAGAAAAATGTTCAGGAATCAGTACGACACGGACGT
GACGACATGGAGCCCAACGGGCCGTCTCTTCCAAGTGGAATACGCCATGGAAGCAGTGAA
GCAAGGCTCCGCGGCGATCGGACTCAGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTGCGTCAA
CAAGGCCCAATCCGAGCTCTCCTCTCACCAGAAGAAGATCTTCAAAGTCGATGATCATAT
TGGCGTCGCAATCGCCGGTCTCACCGCCGACGGCCGTGTTCTCTCCCGTTACATGAGATC
GGAGGCTATCAATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTTGGACGTCTCGTCGT
TCACCTCGCCGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAACGATCATGGAAACGTCCATATGGTGT
GGGTTTGTTGGTAGGTGGATTGGACGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAG
CGGAAACTACTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGAC
CTATCTGGAGCGTAGGTTTGAGAGCTTTGGGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGA
TGCTATTCTGGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCAC
GGTCTCTGTCCTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGAAACTATCCAGAA
AGTGATTGACACATTTGAGAAAGTACCTGAAGAAGAGGAAGGTGAGGCTGGTGAGGGTGA
GGCTGAAGCTGCACCAGCGGAGCAGGGTGGTGATGGTGGTGGTGCAGGTAACCAAGACGT
GGCTCCAATGGAAATGTAAGGCCTTTGTGTGGAACGCTGTGAACTGTTTTAATTGAATGT
TTGTCGAATTTACTTTGGATAATTTCATTTGCAAATCGCAGCGGTTTTAGATTATATGCT
CGAAAAACTCGTGGGGTTGAAATCATTTGGTCATTTTAATTTCATAGCTATCGTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4HB13TF U 90
AF RR4GI72TF U 1
AF RR4FN60TF U 228
AF RR4HB13JQB C 306
AF RR4D231TF U 369
BS 1 410 RR4GI72TF
BS 411 411 RR4FN60TF
BS 412 734 RR4GI72TF
BS 735 865 RR4FN60TF
BS 866 918 RR4D231TF
BS 919 919 RR4HB13JQB
BS 920 1026 RR4D231TF
BS 1027 1027 RR4HB13JQB
BS 1028 1077 RR4D231TF

RD RR4HB13TF 178 0 0
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TCCAAGTGGAATACGCCATGGAAGCAGTGAAGCAAGGCTCCGCGGCGATCGGACTCAGAT
CTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTGCGTCAACAAGGCCCAATCCGAGCTCTCCTCTCA

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR4GI72TF 736 0 0
GGGAAGCAAAAGAAAAGTTCCCGAGCTGCTCTATAAACCTTTCTCCAACAACGCAACAAG
AGCAGCAGCAAAGCAAGCAAGAAGAAGAAAAATGTTCAGGAATCAGTACGACACGGACGT
GACGACATGGAGCCCAACGGGCCGTCTCTTCCAAGTGGAATACGCCATGGAAGCAGTGAA
GCAAGGCTCCGCGGCGATCGGACTCAGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTGCGTCAA
CAAGGCCCAATCCGAGCTCTCCTCTCACCAGAAGAAGATCTTCAAAGTCGATGATCATAT
TGGCGTCGCAATCGCCGGTCTCACCGCCGACGGCCGTGTTCTCTCCCGTTACATGAGATC
GGAGGCTATCAATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTTGGACATCTCGTCGT
TCACCTCGCCGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAACGATCATGGAAACGTCCATATGGTGT
GGGTTTGTTGGTAGGTGGATTGGACGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAG
CGGAAACTACTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGAC
CTATCTGGAGCGTAGGTTTGAGAGCTTTGGGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGA
TGCTATTCTGGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCAC
GGTCTCTGTCCTAG
TG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4FN60TF 638 0 0
G
CGCCTGCGTCAACAAGGCCCAATCCGAGCTCTCCTCTCACCAGAAGAAGATCTTCAAAGT
CGATGATCATATTGGCGTCGCAATCGCCGGTCTCACCGCCGACGGCCGTGTTCTCTCCCG
TTACATGAGATCGGAGGCTATCAATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTTGG
ACGTCTCGTCGTTCACCTCGCCGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAACGATCATGGAAACG
TCCATATGGTGTGGGTTTGTTGGTAGGTGGATTGGACGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTA
CAACTGCCCAAGCGGAAACTACTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCA
AGCCGCAAAGACCTATCTGGAGCGTAGGTTTGAGAGCTTTGGGGATTCTTCAAAGGAAGA
TCTGATCAAAGATGCTATTCTGGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAG
TTCTCTCTGCACGGTCTCTGTCCTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGA
AACTATCCAGAAAGTGATTGACACATTTGAGAAAGTACCTGAAGAAGAGGAAGGTGAGGC
TGGTGAGGGTGAGGCTGAAGCTGCACCAGCGGAGCAG

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR4HB13JQB 770 0 0
TCGCAATCGCCGGTCTCACCGCCGACGGCCGTGTTCTCTCCCGTTACATGAGATCGGAGG
CTATCAATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTTGGACGTCTCGTCGTTCACC
TCGCCGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAACGATCATGGAAACGTCCATATGGTGTGGGTT
TGTTGGTAGGTGGATTGGACGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAGCGGAA
ACTACTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGACCTATT
TGGAGCGTAGGTTTGAGAGCTTTGGGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGATGCTA
TTCTGGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCACGGTCT
CTGTCCTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGAAACTATCCAGAAAGTGA
TTGACACATTTGAGAAAGTACCTGAAGAAGAGGAAGGTGAGGCTGGTGAGGGTGAGGCTG
AAGCTGCACCAGCGGAGCAGGGTGGTGATGGTGGTGGTGCAGGTGACCAAGACGTGGCTC
CAATGGAAATGTAAGGCCTTTGTGTGGAACGCTGTGAACTGTTTTAATTGAATGTTTGTC
GAATTTACTTTGGATAATTTCATTTGCAAATCGCAGCGGTTTTAGATTATATGCTCGAAA
AACTCGTGGGGTTGAAATCATTTGGTCATTTTAATTTCATAGCTATCGTC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4D231TF 709 0 0
G
CAATCACTCCTTCACCTATGAGTCTCCGCTCCCCGTTGGACGTCTCGTCGTTCACCTCGC
CGATAAGGCCCAGGTCTGTACCCAACGATCATGGAAACGTCCATATGGTGTGGGTTTGTT
GGTAGGTGGATTGGACGAGTCCGGAGCCCATCTTTACTACAACTGCCCAAGCGGAAACTA
CTTTGAGTATCAAGCTTTTGCTATCGGGTCCCGTTCTCAAGCCGCAAAGACCTATCTGGA
GCGTAGGTTTGAGAGCTTTGGGGATTCTTCAAAAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTCT
GGCTGTGAGGGAGACATTGCAAGGAGAAACACTGAAGAGTTCTCTCTGCACGGTCTCTGT
CCTAGGTGTCGGTGAGCCGTTCCACTTCTTGGACCAGGAAACTATCCAGAAAGTGATTGA
CACATTTGAGAAAGTACCAGAAGAAGAGGAAGGTGAGGCTGGTGAGGGTGAGGCTGAAGC
TGCACCAGCGGAGCAGGGTGGTGATGGTGGTGGTGCAGGTAACCAAGACGTGGCTCCAAT
GGAAATGTAGGGCCTTTGTGTGGAACGCTGTGAACTGTTTTAATTGAATGTTTGTCGAAT
TTACTTTGGATAATTTCATTTGCAAATCGCAGCGGTTTTAGATTATATGCTCGAAAA*CT
CGTGGGGTTGAAATCATTTGGTCATTTTAATTTCATAGCTATCGTCAG

QA 2 709 2 709
DS 



AS 1 7

CO CL1018Contig1 872 7 7 U
TGAACACCAAGCTATGAACCTCAATCATTAAGGAATTCTAATCAAATATTGTACTTAATA
CATATATTAAGTCAACAGCACACGAAAGTCCTAAAATAAAACCATTTATTCTTGATTAAG
GTAGTGGGGTTTTGCAACCAACCTAATGGTTGATATGATAAGCCCACCTAAACCATGGTT
TCCTCTTTTATTTGTTCTGACATTTTCCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGAT
GGTGCTCTAGAGTGTTGCAATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGC
GACTTGATATGTGGATCTTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTAAATCTCGTT
CACTTTCTTGAAGTCGCCCAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGAGTA
ATCAACACCACTAGCTTTTAGTATCTCACCCATGTTCTTGAGGACCTGCTCAGTCTGATC
TTCAACGTCGTCCGAAACAAACTTTCCAGTCTCAGGTATAAGACCAAGAACACCGGAGAC
GAAAACGAGATTATTGGCTTTGATGGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGCTGGTGCTTT
CTCTGTAGCCACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAGCAGAAGCTGAGACACTGAGAGAAGC
GAAAGGAGGAGATCTCGAAGACATTCGGAAGAGAGAGACACCAGCGAGTGTTGTTGCGCA
GCCTGCACCTGCGGCGAACAAAGGGCTACGAGTGGAGCGAAGTGCGGCGGAGATGTCGAG
AGTTTGAGGGTTTATGGATCTGAAGACCGACCAAGTCATTTCACTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTC**CGGCGCTGTCGAGAGGTACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4B781JQ U 16
AF RR4DX44JQ U 1
AF RR4C214JQ U 13
AF RR4BH33JQ U 16
AF RR4C214TF C 190
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AF RR4DX44TF C 221
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TCTGACATTTTCCTGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATGGTGCTCTAGAGTGT
TGCGATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCGACTTGATATGTGGA
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GCCCAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGAGTAATCAACACCACTAGC
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GGATCTGAAGACCGACCAAGTCATTTCACTCTCTCTCTCTC

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TCCTCTTTTATTTGTTCTGACATTTTCCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGAT
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CACTTTCTTGAAGTCGCCCAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGAGTA
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TCTC

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DS 

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CGT
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CAGCACACGAAAGTCCTAAAATAAAACCATTTATTCTTGATTAAGGTAGTGGGGTTTTGC
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TCTGACATTTTCCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATGGTGCTCTAGAGTGT
TGCAATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCGACTTGATATGTGGA
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CGAAGACATTCGGAAGAGAGAGACACCAGCGAGTGTTGTTGCGCAGCCTGCACCTGCGGC
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GGATCTGAAGACCGACCAAGTCATTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCT

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DS 

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AACCAACCTAATGGTTGATATGATAAGCCCACCTAAACCATGGTTTCCTCTTTTATTTGT
TCTGACATTTTCCTGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATGGTGCTCTAGAGTGT
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GCCCAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGAGTAATCAACACCACTAGC
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CGAAGACATTCGGAAGAGAGAGACACCAGCGAGTGTTGTTGCGCAGCCTGCACCTGCGGC
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GTCGAGAGGTAC
AA

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CAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGAGTAATCAACACCACTAGCTTTTAGTA
TCTCACCCATGTTCTTGAGGACCTGCTCAGTCTGATCTTCAACGTCGTCCGAAACAAACT
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TTCGGAAGAGAGAGACACCAGCGAGTGTTGTTGCGCAGCCTGCACCTGCGGCGAACAAAG
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CGGCGC

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DS 

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DS 

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GCTGAGACACTGAGAGAAGCGAAAGGAGGAGATCTCGAAGACATTCGGAAGAGAGAGACA
CCAGCGAGTGTTGTTGCGCAGCCTGCACCTGCGGCGAACAAAGGGCTACGAGTGGAGCGA
AGTGCGGCGGAGATGTCGAGAGTTTGAGGGTTTATGGATCTGAAGACCGACCAAGTCATT
TCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGGCGCTGTCGAGAGGTACAAAAA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 6

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GTGAGAGACACACACACAC**TCCTTTAGTTTCAGCATACTCAATACAATGTCACAACTC
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GTCCTGGTCCTTCCTCGAATGTAAACTCACAATCCATGGCGAATCCATCAGGGAGACGTT
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TGAAGATTCCGACAGAGATTTTGGTCGGAAACCTTTCCATAGCGAGAGAGGTTCCAATGC
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CCAGCTTGAACCAGCACCATGCTCCATGACATGATCCGTGGACAAGCACGAAATGGTGGT
GGTGGTGTTGTTGCATGTGCTGTGTTTGCATTTGATATTGTTTGGTAAGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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AF RR4H724TF C 476
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TTTTTTTTCAGTTGTATTCTGCTGCTATTTCCTGTAGCAGTTGAAAAAGCTGTTGAGGTT
TAGTGATCATAGCCATGTGACCAGCTTCTTCAACCACTTTCACTTCGTTAGGTTCGTAGT
TACTAATCATCCACTTCTGAATCTCCTCTGGAACCACATTGTCGCCTTCGCAGACGATAT
ACACTCTCTTCCCAGATCCATACCCTTCCTTGGTCAGCAAATCTTTACTTTCCATTTCCT
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AATTACTGTAAGCCTTCTCCTTCATGAAACTATTACCGAGCATAACTGAACTTGGCGGCT
GTCCTGGTCCTTCCTCGAATGTAAACTCACAATCCATGGCGAAT

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DS 

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ACGTAAGAATATTAAGTATCCCACAAAACCCCCTCTTATTCATATCATAAATATAACGAA
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TCTTTTTTTTCAGTTGTATTCTGATGCTATTTCCTGTAGCAGTTGAAAAAGCTGTTGAGG
TTTAGTGATCATAGCCATGTGACCAGCTTCTTCAACCACTTTCACTTCGTTAGGTTCGTA
GTTACTAATCATCCACTTCTGAATCTCCTCTGGAACCACATTGTCGCCTTCGCAGACGAT
ATACACTCTCTTCCCAGATCCATACCCTTCCTTGGTCAGCAAATCTTTACTTTCCATTTC
CTTTGGGTATAACCAGCTCGGTTTCACCAACGCCATGGCTAGTTCTATATCCTCTGACTG
GCAATTACTGTAAGCCTTCTCCTTCATGAAACTATTACCGAACATAACTGAACTTGGCGG
CTGTCCTGGTCCTTCCTCGAATGTAAACTCACAATCCATGGCGAATCCATCAGGGAGACG
TTTGAAATACTCTTGAATGAGAACGGAAGGAGGAGACTCATGGT

QA 1 644 1 644
DS 

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AC**TCCTTTAGTTTCAGCATACTCAATACAATGTCACAACTCTTTTTTTTCAGTTGTAT
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TGACCAGCTTCTTCAACCACTTTTACTTCATTAGGTTCGTAGTTACTAATCATCCACTTC
TGAATCTCCTCTGGAACCACATTGTCGCCTTCGCAGACGATATACGCTCTCTTCCCAGAT
CCATACCCTTCCTTGGTCAGCAAATCTTTACTTTCCATTTCCTTTGGGTATAACCAGCTC
GGTTTCGCCAACGCCATGGCTAGTTCTATATCCTCTGACTGGCAATTACTGTAAGCCTTC
TCCTTCATGAAACTATTACCGAACATAACTGAACTTGGCGGCTGTCCTGGTCCTTCCTCG
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ATTTTGGTCGGAAACCTTTCCATAGCGAGAGAGGTTCCAATGCCACCATAGCTATGACCA
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TGAATCTCCTCTGGAACCACATTGTCGCCTTCGCAGACGATATACGCTCTCTTCCCAGAT
CCATACCCTTCCTTGGTCAGCAAATCTTTACTTTCCATTTCCTTTGGGTATAACCAGCTC
GGTTTCGCCAACGCCATGGCTAGTTCTATATCCTCTGACTGGCAATTACTGTAAGCCTTC
TCCTTCATGAAACTATTACCGAACATAACTGAACTTGGCGGCTGTCCTGGTCCTTCCTCG
AATGTAAACTCACAATCCATGGCGAATCCATCAGGGAGACGTTTGAAATACTCTTGAATG
AGAACGGAAGGAGGAGACTCATGGTGTGGCATATAAGCAGAGATGAAGATTCCGACAGAG
ATTTTGGTCGGAAACCTTTCCATAGCGAGAGAGGTTCCAATGCCACCATAGCTATGACCA
ACAAGGACCACCTTCTCTTCCTCAGGAAGGGCCTCCATGAAACTCATCAAAGGCTCTAGA
TACTCGGAAACAGAACGAACCTCGTCGAGCCTCCTCTTGTCGATACCGGACCCACCTAGT
TCAATAGCTGTCACTCGTTGACCGTTGGCCTTGAGCTTTCCAGCCAGCTTGAACCAGCAC
CATGCTCCATGACATGATCCGTGGACAAGCACGAAATGGTGGTGGTGGTGTTGTTGCATG
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GATCC

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DS 

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ACATTGTCGCCTCCGCAGACGATATACACTCTCTTCCCAGATCCATACCCTTCCTTGGTC
AGCAAATCTTTACTTTCCATTTCCTTTGGGTATAACCAGCTCGGTTTCACCAACGCCATG
GCTAGTTCTATATCCTCTGACTGGCAATTACTGTAAGCCTTCTCCTTCATGAAACTATTA
CCGAACATAACTGAACTTGGCGGCTGTCCTGGTCCTTCCTCGAATGTAAACTCACAATCC
ATGGCGAATCCATCAGGGAGACGTTTGAAATACTCTTGAATGAGAACGGAAGGAGGAGAC
TCATGGTGTGGCATATAAGCAGAGATGAAGATTCCGACAGAGATTTTGGTCGGAAACCTT
TCCATAGCGAGAGAGGTTCCAATGCCACCATAGCTATGACCAACAAGGACCACCTTCTCT
TCCTCAGGAAGGGCCTCCATGAAACTCATCAAAGGCTCTAGATACTCGGAAACAGAACGA
ACCTCGTCGAGCCTCCTCTTGTCGATACCGGACCCACCTAGTTCAATAGCTGTCACTCGT
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CCGTGGACAAGCACGAAATGGTGGTGGTGGTGTTGTTGCATGTGCTGTGTTTGCATTTGA
TATTGTTTGGTAAGCGATCC

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DS 

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TTT
CTTTGGGTATAACCAGCTCGGTTTCACCAACGCCATGGCTAGTTCTATATCCTCTGACTG
GCAATTACTGTAAGCCTTCTCCTTCATGAAACTATTACCGAACATAACTGAACTTGGCGG
CTGTCCTGGTCCTTCCTCGAATGTAAACTCACAATCCATGGCGAATCCATCAGGGAGACG
TTTGAAATACTCTTGAATGAGAACGGAAGGAGGAGACTCATGGTGTGGCATATAAGCAGA
GATGAAGATTCCGACAGAGATTTTGGTCGGAAACCTTTCCATAGCGAGAGAGGTTCCAAT
GCCACCATAGCTATGACCAACAAGGACCACCTTCTCTTCCTCAGGAAGGGCCTCCATGAA
ACTCATCAAAGGCTCTAGATACTCGGAAACAGAACGAACCTCGTCGAGCCTCCTCTTGTC
GATACCGGACCCACCTAGTTCAATAGCTGTCACTCGTTGACCGTTGGCCTTGAGCTTTCC
AGCCAGCTTGAACCAGCACCATGCTCCATGACATGATCCGTGGACAAGCACGAAATGGTG
GTGGTGGTGTTGTTGCATGTGCTGTGTTTGCATTTGATATTGTTTGGTAAGC
CC

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DS 



AS 1 7

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TCAAAAAAATGGCGGAGAAAGATGCGATGGCGAGAAGCGAGGGTGCGATTAGGGTAAGCG
GAATGCAGTTTTCGTACGCAGTCCAGGATCCTATATTCTTCGATTTCAGCCTCGATCTCC
CCGCCGGATCTCGTTGCCTCTTGGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGACGACATTGTTGA
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CTGCTTTTCACGACACAGACCTTGTCTGCAGTGGTGACTTGTCTTACCTTGGAGGCTCTT
GGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCTGGTGAGATTCCTCTTCAGGGTGATTTCTCAGCAGAGC
ATATGATATTCGGAGTTGAAGGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAGACTGATTGATCTTC
TTGATATCAACCTTAAGTGGCGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGC
AAATATGCATGGGTCTTTTACTTCCATTCAAGGTACTGTTACTGG*ACGAGGTCACTGTT
GACCTCGACGTTGTTGCTAGGATGG*ACTTGTTGG*AATTCTTCAAAGAAGAATGTGAAC
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GTCATTTGGCCTATATCCATGGAGGAGAGCTGAAGCTCTCTGCTAAACTAAAGGAGATCA
AGGATTTAGAAACGTCACCGAATTTGCTCTCTGCGGTTGAGAATTGGCTTCGGTCTGAAA
CCAAAGTGGAGAAGAAGACTAAGAAGAAACCTGTTGCTTCGTCTCCATTTATGTCATCTA
GACAAATGGCGTATTACCGATGAAATCTCAACATCTTTGAGAGATCATCAGTAAGAATAA
AGAGTTTTTCACATTTGCAATTGTTTTTCTCTATTACTTTGTTTGCTTTAATTCTCTCAT
TCTAAATATAAGTTTAAACTAAGATGTAACAGACTTAGGTTTGGATATAAATCAGATAAT
ACACGCCTTCGCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4C501TF U 1
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AF RR4BJ81TF U 47
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AF RR4BJ81JQ C 325
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CTAAAGAGATCAAGAT

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DS 

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GG
ACTGTTCGATCCTCAAAAAAATGGCGGAGAAAGATGCGATGGCGAGAAGCGAGGGTGCGA
TTAGGGTAAGCGGAATGCAGTTTTCGTACGCAGTCCAGGATCCTATATTCTTCGATTTCA
GCCTCGATCTCCCCGCCGGATCTCGTTGCCTCTTGGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGA
CGACATTGTTGAAGATTCTAGCAGGAAAGCATATGGTCGGAGGGAAGAACATTGTGCAGG
TCCTGAATCGCTCTGCTTTTCACGACACAGACCTTGTCTGCAGTGGTGACTTGTCTTACC
TTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCTGGTGAGATTCCTCTTCAGGGTGATT
TCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAGAC
TGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTAAGTGGCGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGA
GGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTCCATTCAAGGTACTGTTACTGGGAC
GAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATGGGACTTGTTGGGAATTCTTCAAAG
AAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATACGCAACGCATATTTTCGACGGGCTAG
AGACATGGGCTAGTCATTTGGCCTATATC

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4FR71TF 780 0 0
GG
ACTGTTCGATCCTCAAAAAAATGGCGGAGAAAGATGCGATGGCGAGAAGCGAGGGTGCGA
TTAGGGTAAGCGGAATGCAGTTTTCGTACGCAGTCCAGGATCCTATATTCTTCGATTTCA
GCCTCGATCTCCCCGCCGGATCTCGTTGCCTCTTGGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGA
CGACATTGTTGAAGATTCTAGCAGGAAAGCATATGGTCGGAGGGAAGAACATTGTGCAGG
TCCTGAATCGCTCTGCTTTTCACGACACAGACCTTGTCTGCAGTGGTGACTTGTCTTACC
TTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCTGGTGAGATTCCTCTTCAGGATGATT
TCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAAAC
TGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTAAGTGGCGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGA
GGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTCCATTCAAGGTACTGTTACTGG*AT
GAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATGG*ACTTGTTGG*AATTCTTCAAAG
AAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATACGCAACGCATATTTTCGACGGGCTAG
AGACATGGGCTAGTCATTGGGC*TATATCCATGGAGGAGAGCTGA*GCTCTCTGCTAAAC
TAAAG*AGATCAAG*ATTTAGAAACGTCACCGAATTTGCTCTCTGTGGTTGAGAATTG

QA 3 780 3 780
DS 

RD RR4BJ81TF 890 0 0
GG
ACTGTTCGATCCTCAAAAAAATGGCGGAGAAAGATGCGATGGCGAGAAGCGAGGGTGCGA
TTAGGGTAAGCGGAATGCAGTTTTCGTACGCAGTCCAGGATCCTATATTCTTCGATTTCA
GCCTCGATCTCCCCGCCGGATCTCGTTGCCTCTTGGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGA
CGACATTGTTGAAGATTCTAGCAGGAAAGCATATGGTCGGAGGGAAGAACATTGTGCAGG
TCCTGAATCGCTCTGCTTTTCACGACACAGACCTTGTCTGCAGTGGTGACTTGTCTTACC
TTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCTGGTGAGATTCCTCTTCAGGGTGATT
TCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAGAC
TGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTAAGTGGCGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGA
GGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTCCATTCAAGGTACTGTTACTGG*AC
GAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATGG*ACTTGTTGG*AATTCTTCAAAG
AAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATACGCAACGCATATTTTCGACGGGCTAG
AGACATGGGCTAGTCATTTGGCCTATATCCATGGAGGAGAGCTGAAGCTCTCTGCTAAAC
TAAAGGAGATCAAGGATTTAGAAACGTCACCGAATTTGCTCTCTGCGGTTGAGAATTGGC
TTCGGTCTGAA*CCAAAGTGGAGAG**AGACTAG**AGAAACCTGT*GCTTCGTCTC*AT
TTATGTCATCTAGACAA*TGGCGTATTACCGATGAA
TCTCACATCTTT

QA 3 878 3 878
DS 

RD RR4BI81JQ 771 0 0
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GTGAGATTCCTCTTCAGGGTGATTTCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGGA
TTGATCCTGAGAGAAGAGAGAGACTGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTAAGTGGCGTA
TGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTC
CATTCAAGGTACTGTTACTGG*ACGAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATG
G*ACTTGTTGG*AATTCTTCAAAGAAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATACG
CAACGCATATTTTCGACGGGCTAGAGACATGGGCTAGTCATTTGGCCTATATCCATGGAG
GAGAGCTGAAGCTCTCTGCTAAACTAAAGGAGATCAAGGATTTAGAAACGTCACCGAATT
TGCTCTCTGCGGTTGAGAATTGGCTTCGGTCTGAAACCAAAGTGGAGAAGAAGACTAAGA
AGAAACCTGTTGCTTCGTCTCCATTTATGTCATCTAGACAAATGGCGTATTACCGATGAA
ATCTCAACATCTTTGAGAGATCATCAGTAAGAATAAAGAGTTTTTCACATTTGCAATTGT
TTTTCTCTATTACTTTGTTTGCTTTAATTCTCTCATTCTAAATATAAGTTTAAACTAAGA
TGTAACAGACTTAGGTTTGGATATAAATCAGATAATACACGCCTTCGCAAC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4C501JQ 698 0 0
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GAGAAGAGAGAAACCGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTAAGTGGCGTATGCACAAGGT
TTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTCCATTCAAGGT
ACTGTTACTGG*ATGAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATGG*ACTTGTTG
G*AATTCTTCAAAGAAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATACGCAACGCATAT
TTTCGACGGGCTAGAGACATGGGCTAGTCATTTGGCCTATATCCATGGAGGAGAGCTGAA
GCTTTCTGCTAAACTAAAGGAGATCAAGGATTTAGAAACGTCACCGAATTTGCTCTCTGT
GGTTGAGAATTGGCTTCGGTCTGAAACCAAAGTGGAGAAGAAGACTAAGAAGAAACCTGT
TGCTTCGTCTCCATTTATGTCATCTAGACAAATGGCGTATTACCGATGAAATCTCAACAT
CTTTGAGAGATCATCAGTAAGAATAAAGAGTTTTTCACATTTGCAATTGTTTTTCTCTAT
TACTTTGTTTGCTTTAATTCTCTCATTCTAAATATAAGTTTAAACTAAGATGTAACAGAC
TTAGGTTTGGATATAAATCAGATAATACACGCCTTCGC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4BJ81JQ 771 0 0
TCTGCAGTGGTGACTTGTCTTACCTTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCTG
GTGAGATTCCTCTTCAGGGTGATTTCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGGA
TTGATCCTGAGAGAAGAGAGAGACTGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTAAGTGGCGTA
TGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTC
CATTCAAGGTACTGTTACTGG*ACGAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATG
G*ACTTGTTGG*AATTCTTCAAAGAAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATACG
CAACGCATATTTTCGACGGGCTAGAGACATGGGCTAGTCATTTGGCCTATATCCATGGAG
GAGAGCTGAAGCTCTCTGCTAAACTAAAGGAGATCAAGGATTTAGAAACGTCACCGAATT
TGCTCTCTGCGGTTGAGAATTGGCTTCGGTCTGAAACCAAAGTGGAGAAGAAGACTAAGA
AGAAACCTGTTGCTTCGTCTCCATTTATGTCATCTAGACAAATGGCGTATTACCGATGAA
ATCTCAACATCTTTGAGAGATCATCAGTAAGAATAAAGAGTTTTTCACATTTGCAATTGT
TTTTCTCTATTACTTTGTTTGCTTTAATTCTCTCATTCTAAATATAAGTTTAAACTAAGA
TGTAACAGACTTAGGTTTGGATATAAATCAGATAATACACGCCTTCGC
AAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 7

CO CL1021Contig1 1260 7 14 U
GCTTACAACAATAAAGACATATCTTTCTCTCCGTATAATGATTACTGGAAAGAACTAAGG
AAGCTATGTGTGCAAGAACTCTTTAGTGCCAAACAAATTCAGTCGTTTCAACCCATCAAA
GACGAGGAAATAAAAAAAGTGATTGCTCAGATCTCTGAATCAGCTTCTCTTAATCATCCG
GTTAACTTAAGCAAGACGTTTCTTGCGTTAACTGTAAGTGTGGTATGCAAGGCAGCATTT
GGTGTGAGTTTTGAGGGAACTGTGCTTAGCAACGACAGATTCAACAAGTTAGTCCGTGAG
GCATTCGAGACGTTGGCAAGCTTCTCTGCCACAGATTTTATTCCGTACG*TTGGTTGGAT
CATCGACCAATTCACGGGTTTACAAAAGATGAGAGAGAAAAGCTTCCGAGATTTGGATGC
GTTCTATGAACAGTTGTTTGTTCTGCATAAAGAGAGAGATGGACAAGGGCTTGAAGATTT
TGTGGACATGCTTTTGAGGTTTGAAAGGGAAGGAACTGTTATTGGAACTGACAACCTCAC
AAGAAATCATATCAAAGCAATCTTGATGAACGTTCTTTTAGGAGGAATCGACACGTCTGC
AATTACAATGACATGGGCAATGGCAGAACTTGTCAGAAACCCTAGAGTGATGAAGAAACT
TCAAACCGAAATCAGAATCCAAATCAAGAACAAAGAAAGAATCAACTCCGATGACACGGA
TCAGCTAAAATACCTGAAAATGGTGATCAAAGAGACATGGAGGCTACATCCTCCAATACC
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CAAGACACGTCTTCATGTGAATGTCTGGGCTATTGGGCGTGATCCGGATACCTGGAAGGA
TCCAGAGATGTTTTTCCCAGAGAGGTTTATGGATAATAACATTGATGCAAAAGGACAAAA
CTTTGAGCTGTTATCGTTTGGGAGTGGTAGGAGAATCTGTCCTGGAATGTACATGGGGAC
AACTTCGGTGGAGTTTGGTCTGGCGAGTCTGTTGTATCATTTTGACTGGAAGTTACCTGA
AGGCATGGTGGTTGAAGATGTCGACATGGAGGAAGCTCATGGGCTTACTGTGAGCAAGAA
AAGTGAGCTTCTGCTTGTTCCTCTGAAGTACTTAGATCAATGATCACTTTAAAATAAATT
CTTCATCGATTGTACCTTTTTCGATTGTACTCAATATTAAATAAAATCTACCTTTATCGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4A024TFB U 1
AF RR4A024TF U 1
AF RR4FT25TF U 324
AF RR4A024JQD C 391
AF RR4FT25JQ C 505
AF RR4A024JQ C 517
AF RR4DU19TF U 588
BS 1 821 RR4A024TF
BS 822 822 RR4FT25TF
BS 823 863 RR4A024TF
BS 864 939 RR4FT25TF
BS 940 940 RR4DU19TF
BS 941 946 RR4FT25TF
BS 947 1058 RR4DU19TF
BS 1059 1059 RR4A024JQD
BS 1060 1118 RR4DU19TF
BS 1119 1119 RR4A024JQD
BS 1120 1240 RR4DU19TF
BS 1241 1241 RR4A024JQD
BS 1242 1258 RR4DU19TF
BS 1259 1260 RR4A024JQ

RD RR4A024TFB 789 0 0
GCTTACAACAATAAAGACATATCTTTCTCTCCGTATAATGATTACTGGAAAGAACTAAGG
AAGCTATGTGTGCAAGAACTCTTTAGTGCCAAACAAATTCAGTCGTTTCAACCCATCAAA
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GGTGTGAGTTTTGAGGGAACTGTGCTTAGCAACGACAGATTCAACAAGTTAGTCCGTGAG
GCATTCGAGACGTTGGCAAGCTTCTCTGCCACAGATTTTATTCCGTACG*TTGGTTGGAT
CATCGACCAATTCACGGGTTTACAAAAGATGAGAGAGAAAAGCTTCCGAGATTTGGATGC
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TGTGGACATGCTTTTGAGGTTTGAAAGGGAAGGAACTGTTATTGGAACTGACAACCTCAC
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AATTACAATGACATGGGCAATGGCAGAACTTGTCAGAAACCCTAGAGTGATGAAGAAACT
TCAAACCGAAATCAGAATCCAAATCAAGAACAAAGAAAGAATCAACTCCGATGACACGGA
TCAGCTAAAATACCTGAAAATGGTGATCAAAGAGACATGGAGGCTACATCCTCCAATACC
ACTTCTACT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4A024TF 863 0 0
GCTTACAACAATAAAGACATATCTTTCTCTCCGTATAATGATTACTGGAAAGAACTAAGG
AAGCTATGTGTGCAAGAACTCTTTAGTGCCAAACAAATTCAGTCGTTTCAACCCATCAAA
GACGAGGAAATAAAAAAAGTGATTGCTCAGATCTCTGAATCAGCTTCTCTTAATCATCCG
GTTAACTTAAGCAAGACGTTTCTTGCGTTAACTGTAAGTGTGGTATGCAAGGCAGCATTT
GGTGTGAGTTTTGAGGGAACTGTGCTTAGCAACGACAGATTCAACAAGTTAGTCCGTGAG
GCATTCGAGACGTTGGCAAGCTTCTCTGCCACAGATTTTATTCCGTACG*TTGGTTGGAT
CATCGACCAATTCACGGGTTTACAAAAGATGAGAGAGAAAAGCTTCCGAGATTTGGATGC
GTTCTATGAACAGTTGTTTGTTCTGCATAAAGAGAGAGATGGACAAGGGCTTGAAGATTT
TGTGGACATGCTTTTGAGGTTTGAAAGGGAAGGAACTGTTATTGGAACTGACAACCTCAC
AAGAAATCATATCAAAGCAATCTTGATGAACGTTCTTTTAGGAGGAATCGACACGTCTGC
AATTACAATGACATGGGCAATGGCAGAACTTGTCAGAAACCCTAGAGTGATGAAGAAACT
TCAAACCGAAATCAGAATCCAAATCAAGAACAAAGAAAGAATCAACTCCGATGACACGGA
TCAGCTAAAATACCTGAAAATGGTGATCAAAGAGACATGGAGGCTACATCCTCCAATACC
ACTTCTACTTCCAAGAGAAGTAACCTCAGAATTTGAGATCGGCGGCTACATGATTCCCGT
CAAGACACGTCTTCATGTGAATG

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4FT25TF 623 0 0
CTCTGCCACAGATTTTATTCCGTACGATTGGTTGGATCATCGACCAATTCACGGGTTTAC
AAAAGATGAGAGAGAAAAGCTTCCGAGATTTGGATGCGTTCTATGAACAGTTGTTTGTTC
TGCATAAAGAGAGAGATGGACAAGGGCTTGAAGATTTTGTGGACATGCTTTTGAGGTTTG
AAAGGGAAGGAACTGTTATTGGAACTGACAACCTCACAAGAAATCATATCAAAGCAATCT
TGATGAACGTTCTTTTAGGAGGAATCGACACGCCTGCAATTACAATGACATGGGCAATGG
CAGAACTTGTCAGAAACCCTAGAGTGATGAAGAAACTTCAAACCGAAATCAGAAGCCAAA
TCAAGAACAAAGAAAGAATCAACTCCGATGACACGGATCAGCTAAAATACCTGAAAATGG
TGATCAAAGAGACATGGAGGCTACATCCTCCAATACCACTTCTACTTCCAAGAGAAGTAA
CCTCAGAATTTGAGATCGACGGCTACATGATTCCCGTCAAGACACGTCTTCATGTGAATG
TCTGGGCTATTGGGCGTGATCCGGATACCTGGAAGGATCCAGAGATGTTTTTCCCAGAGA
GGTTTATGGATAATAATATTGAT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4A024JQD 870 0 0
GAGAGAGAAAAGCTTCCGAGATTTGGATGCGTTCTATGAACAGTTGTTTGTTCTGCATAA
AGAGAGAGATGGACAAGGGCTTGAAGATTTTGTGGACATGCTTTTGAGGTTTGAAAGGGA
AGGAACTGTTATTGGAACTGACAACCTCACAAGAAATCATATCAAAGCAATCTTGATGAA
CGTTCTTTTAGGAGGAATCGACACGTCTGCAATTACAATGACATGGGCAATGGCAGAACT
TGTCAGAAACCCTAGAGTGATGAAGAAACTTCAAACCGAAATCAGAATCCAAATCAAGAA
CAAAGAAAGAATCAACTCCGATGACACGGATCAGCTAAAATACCTGAAAATGGTGATCAA
AGAGACATGGAGGCTACATCCTCCAATACCACTTCTACTTCCAAGAGAAGTAACCTCAGA
ATTTGAGATCGGCGGCTACATGATTCCCGTCAAGACACGTCTTCATGTGAATGTCTGGGC
TATTGGGCGTGATCCGGATACCTGGAAGGATCCAGAGATGTTTTTCCCAGAGAGGTTTAT
GGATAATAACATTGATGCAAAAGGACAAAACTTTGAGCTGTTATCTTTTGGGAGTGGTAG
GAGAATCTGTCCTGGAATGTACATGGGGACAACTTCGGTGGAGTTTGGTCTGGCGAGTCT
GTTGTATCATTTTGACTGGAAGTTACCTGAAGGCATGGTGGTTGAAGATGTCGACATGGA
GGAAGCTCATGGGCTTACTGTGAGCAAGAAAAGTGAGCTTCTGCTTGTTCCTCTGAAGTA
CTTAGATCAATGATCACTTTAAAATAAATTCTTCATCGATTGTACCTTTTTCGATTGTAC
TCAATATTAAATAAAATCTACCTTTATC
GG

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR4FT25JQ 756 0 0
AAGGGAAGGAACTGTTATTGGAACTGACAACCTCACAAGAAATCATATCAAAGCAATCTT
GATGAACGTTCTTTTAGGAGGAATCGACACGCCTGCAATTACAATGACATGGGCAATGGC
AGAACTTGTCAGAAACCCTAGAGTGATGAAGAAACTTCAAACCGAAATCAGAAGCCAAAT
CAAGAACAAAGAAAGAATCAACTCCGATGACACGGATCAGCTAAAATACCTGAAAATGGT
GATCAAAGAGACATGGAGGCTACATCCTCCAATACCACTTCTACTTCCAAGAGAAGTAAC
CTCAGAATTTGAGATCGACGGCTACATGATTCCCGTCAAGACACGTCTTCATGTGAATGT
TTGGGCTATTGGGCGTGATCCGGATACCTGGAAGGATCCAGAGATGTTTTTCCCAGAGAG
GTTTATGGATAATAATATTGATGCAAAAGGACAAAACTTTGAGCTGTTATCGTTTGGGAG
TGGTAGGAGAATCTGTCCTGGAATGTACATGGGGACAACTTCGGTGGAGTTTGGTCTGGC
GAGTCTGTTGTATCATTTTGACTGGAAGCTACCTGAAGGCATGGTGGTTGAAGATGTCGA
CATGGAGGAAGCTCATGGGCTTACTGTGAGCAAGAAAAGTGAGCTTCTGCTTGTTCCTTT
GAAGTACTTAGATCAATGATCACTTTAAAATAAATTCTTCATCGATTGTACCTTTTTCGA
TTGTACTCAATATTAAATAAAATCTACCTTTATC
CG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4A024JQ 744 0 0
TGTTATTGGAACTGACAACCTCACAAGAAATCATATCAAAGCAATCTTGATGAACGTTCT
TTTAGGAGGAATCGACACGTCTGCAATTACAATGACATGGGCAATGGCAGAACTTGTCAG
AAACCCTAGAGTGATGAAGAAACTTCAAACCGAAATCAGAATCCAAATCAAGAACAAAGA
AAGAATCAACTCCGATGACACGGATCAGCTAAAATACCTGAAAATGGTGATCAAAGAGAC
ATGGAGGCTACATCCTCCAATACCACTTCTACTTCCAAGAGAAGTAACCTCAGAATTTGA
GATCGGCGGCTACATGATTCCCGTCAAGACACGTCTTCATGTGAATGTCTGGGCTATTGG
GCGTGATCCGGATACCTGGAAGGATCCAGAGATGTTTTTCCCAGAGAGGTTTATGGATAA
TAACATTGATGCAAAAGGACAAAACTTTGAGCTGTTATCTTTTGGGAGTGGTAGGAGAAT
CTGTCCTGGAATGTACATGGGGACAACTTCGGTGGAGTTTGGTCTGGCGAGTCTGTTGTA
TCATTTTGACTGGAAGTTACCTGAAGGCATGGTGGTTGAAGATGTCGACATGGAGGAAGC
TCATGGGCTTACTGTGAGCAAGAAAAGTGAGCTTCTGCTTGTTCCTCTGAAGTACTTAGA
TCAATGATCACTTTAAAATAAATTCTTCATCGATTGTACCTTTTTCGATTGTACTCAATA
TTAAATAAAATCTACCTTTATCGG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DU19TF 671 0 0
G
CGACACGTCTGCAATTACAATGACATGGGCAATGGCAGAACTTGTCAGAAACCCTAGAGT
GATGAAGAAACTTCAAACCGAAATCAGAA*CCAAATCAAGAACAAAGAAAGAATCAACTC
CGATGACACGGATCAGCTAAAATACCTGAAAATGGTGATCAAAGAGACATGGAGGCTACA
TCCTCCAATACCACTTCTACTTCCAAGAGAAGTAACCTCAGAATTTGAGATCGACGGCTA
CATGATTCCCGTCAAGACACGTCTTCATGTGAATGTCTGGGCTATTGGGCGTGATCCGGA
TACCTGGAAGGATCCAGAGATGTTTTTCCCAGAGAGGTTTATGGATAATAACATTGATGC
AAAAGGACAAAACTTTGAGCTGTTATCGTTTGGGAGTGGTAGGAGAATCTGTCCTGGAAT
GTACATGGGGACAACTTCGGTGGAGTTTGGTCTGGCGAGTCTGTTGTATCGTTTTGACTG
GAAGTTACCTGAAGGCATGGTGGTTGAAGATGTCGACATGGAGGAAGCTCCTGGGCTTAC
TGTGAGCAAGAAAAGTGAGCTTCTGCTTGTTCCTCTGAAGTACTTAGATCAATGATCACT
TTAAAATAAATTCTTCATCGATTGTACCTTTTTCGATTGTACTCAATATTAA*TAAAATC
TACCTTTATC

QA 2 671 2 671
DS 



AS 1 7

CO CL1022Contig1 619 7 8 U
GGGAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAGATTCGCTGCTTTGCTCTTCCTGA
TCTCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTTCGTCTGAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGT
GACATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATCTTCAGAAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGC
CGGACGTTTCTGTCTATCATCGCTGGAGTCCTTGCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTG
ACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGTTGATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAG
GCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTGATTCGTGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTT
CTTGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGTTCTGGACATTTGCTTATGACTTGGTGCACATA
TTCTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAATGAAGATGGTGAAACAACAGACAAGACGAAGTGAT
TTAACTTATTGGACGATGTTTCTCTGCCTCCCTTTTTGAACAACAGATTATGAATCTATT
ACTTTCCC*TTTGTTTCAAATTTTACTTGAGATCACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTG
AGTAGTTGAAGTTTTTAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 

AF RR4CX76TF U 32
AF RR4BB78JQ C 1
AF RR4CX76JQ C 32
AF RR4BB78TF U 1
AF RR4D571JQ C 27
AF RR4D571TF U 27
AF RR4AM47TF U 63
BS 1 33 RR4BB78TF
BS 34 332 RR4CX76TF
BS 333 333 RR4BB78TF
BS 334 363 RR4CX76TF
BS 364 472 RR4BB78TF
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RD RR4CX76TF 332 0 0
GG
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AAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGCCGGACGTTTCTGTCTATCATCGCTGGAGTCCTT
GCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTGACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGTTG
ATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAGGCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTGATTC*
TGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTTCTT

QA 3 332 3 332
DS 

RD RR4BB78JQ 616 0 0
GGGAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAGATTCGCTGCTTTGCTCTTCCTGA
TCTCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTTCGTCTGAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGT
GACATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATCTTCAGAAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGC
CGGACGTTTCTGTCTATCATCGCTGGAGTCCTTGCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTG
ACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGTTGATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAG
GCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTGATTCGTGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTT
CTTGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGTTCTGGACATTTGCTTATGACTTGGTGCACATA
TTCTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAATGAAGATGGTGAAACAACAGACAAGACAAAGTGAT
TTAACTTATTGGACGATGTTTCTCTGCCTCCCTTTTTGAACAACAGATTATGAATCTATT
ACTTTCCC*TTTGTTTCAAATTTTACTTGAGATCACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTG
AGTAGTTGAAGTTTTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4CX76JQ 585 0 0
GG
ACAGATTCGCTGCTTTGCTCTTCCTGATCTCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTTCGTCT
GAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGTGACATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATCTTCAG
AAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGCCGGACGTTTCTGTCTATCATCGCTGGAGTCCTT
GCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTGACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGTTG
ATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAGGCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTGATTCG
TGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTTCTTGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGTTCTGG
ACATTTGCTTATGACTTGGTGCACATATTCTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAATGAAGATG
GTGAAACAACAGACAAGACGAAGTGATTTAACTTATTGGACGATGTTTCTCTGCCTCCCT
TTTTGAACAACAGATTATGAATCTATTACTTTCCC*TTTGTTTCAAATTTTACTTGAGAT
CACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTGAGTAGTTGAAGTTTTT

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR4BB78TF 616 0 0
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TCTCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTTCGTCTGAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGT
GACATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATCTTCAGAAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGC
CGGACGTTTCTGTCTATCATCGCTGGAGTCCTTGCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTG
ACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGTTGATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAG
GCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTGATTCGTGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTT
CTTGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGTTCTGGACATTTGCTTATGACTTGGTGCACATA
TTCTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAATGAAGATGGTGAAACAACAGACAAGACAAAGTGAT
TTAACTTATTGGACGATGTTTCTCTGCCTCCCTTTTTGAACAACAGATTATGAATCTATT
ACTTTCCC*TTTGTTTCAAATTTTACTTGAGATCACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTG
AGTAGTTGAAGTTTTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4D571JQ 593 0 0
GG
CTCTCACAGATTCGCTGCTTTGCTCTTCCTGATCTCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTT
CGTCTGAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGTGACATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATC
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TCCTTGCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTGACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGA
TGTTGATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAGGCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTG
ATTCGTGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTTCTTGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGT
TCTGGACATTTGCTTACGACTTGGTGCACATATTCTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAGTGA
AGATGGTGAAACAACAGACCAGACGAAGTGATTTAACTTATTAGACGATGTTTTTCTGCC
TCCCTTTTTGAACAACAGATTATGAATCTATTACTTTCCCCTTTGTTTCAAATTTTACTT
GAGATCACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTGAGTAGTTCAAGTTTTT
AAA

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR4D571TF 593 0 0
GG
CTCTCACAGATTCGCTGCTTTGCTCTTCCTGATCTCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTT
CGTCTGAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGTGACATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATC
TTCAGAAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGCCGGACGTTTCTGTCTATCATTGCTGGAG
TCCTTGCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTGACTGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGA
TGTTGATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAGGCAGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTG
ATTCGTGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTTCTTGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGT
TCTGGACATTTGCTTACGACTTGGTGCACATATTCTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAGTGA
AGATGGTGAAACAACAGACCAGACGAAGTGATTTAACTTATTAGACGATGTTTCTCTGCC
TCCCTTTTTGAACAACAGATTATGAATCTATTACTTTCCCCTTTGTTTCAAATTTTACTT
GAGATCACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTGAGTAGTTCAAGTTTTT
AAA

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR4AM47TF 557 0 0
TCGTTTCTAACTATTTGCAATGGGTTCGTCTGAGAAGAGATCAAAGGATGCCATGAGTGA
CATACCAACCTTCAGTGGAGAGAATCTTCAGAAGAATTTGAAAGTCATACAGAACAGCCG
GACGTTTCTGTCTATCATCGCTGGAGTCCTTGCGGGGATTATTGGATTCACGGGGTTGAC
TGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGTTGATCACATCTGTTGGACTCATGGCTAAGGC
AGGATTCTCCGCAGACTTGTACTTTGATTCGTGGAATCGTGTTCTTTTTGACGGCTTTCT
TGGTGGCCTTATGTCTTTTGTGCTGTTCTGGACATTTGCTTATGACTTGGTGCACATATT
CTAAAGGAATCTTCAGCTGCAAATGAAGATGGTGAAACAACAGACAAGACGAAGTGATTT
AACTTATTGGACGATGTTTCTCTGCCTCCCTTTTTGAACAACAGATTATGAATCTATTAC
TTTCCC*TTTGTTTCAAATTTTACTTGAGATCACATTAATTGTGAAACCTTTGGATTGAG
TAGTTGAAGTTTTTAAA

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 5

CO CL1023Contig1 1495 5 17 U
GGATGTGACTTCATCATTGCTTTTGTCATTTACTCTTGGAAAGATTTGATAAGGAAACCT
CAAAAAAGGTCTCATGTTTTAATAATATAGACAAATACAAATTTTATCTTCGAGAAGGAA
ACGCTATGGTTTTAAGAATTATACTTCAACTGCCGACAATGGAGGAACCTCTACTAACCG
TTCAATTGTTTCCAGCTGGTCATACGGAGCAATCTGGCTAAACCCGTCCGGCCAGGTTAT
CGAGACGGCATAGTTTCCCATTGGTCGTATTTCCTCAGGCTCGATATCTTCTGCCACATC
TCCGAACTGAATCTTTTGTTCACCAGTCCATTCGTCCACACTTTGTGCTGATCGATCATT
TCTTCTGACAGTTGCAGGGTGAAGTAAGAACTCTTCATCTGAGTTTGGCACTTTCACTCT
GATTGCTTTAAGATATTTGTCGTATGTCACAGCTGTGGAAACTTGCTGGCGTATCTTGGC
GCATTGTTGGACTACACATACACCAAGATCTTGGAACGTTCTCGCAACTTCACTTAAAGG
ATCTGAAACAACTTCAGGAACTCCGCTATCTCCCGAAGCAGATAACGTTGGCCTAATGGG
GAGGTCAAAGAGGTGAGGTATTCCGAATTGCTGGACAACCTGAGAACCTGAACCTTTCCC
AAAAGGGTAATAACGTTTCCCGTCAGCGTCAAAATGACACATATTCTCCACAACAGCAAC
ACAAGGAACCTTTAGCTTTGAGAACATTCGTACACCTTTGGCAACATCTATAAATGCCAA
TTTTTGAGGTGTGGTCACAATTACCGCTGCTGTTAACGGCGCAACCTGGCACAGGGTTAG
TTGAATGTCACCGGTTCCAGGAGGCATGTCGATAACAAGATAATCCAGCGCTCCCCATTC
AGTTGTTGTAAGGAGTTGATTTATGACACCAGACACCATTGGACCTCTCATTATGGCACG
TCCTTGCCCTGCAAATCCAAATGACACTAGCTTCACCCCTAAGTACTCTGTTGGGATGAT
AGTCTTCTTCTCAGGATCCATTTCAAGAATACGGCTCTCGGGATTGACCATAGTTGGTGA
ACTAGGACCATAGACATCAGCATCAAAGATGCCAACTCTTGCACCCATACCAGCTAACGT
ATAAGCAAGATTTACAGCTACTGTAGATTTCCCAACACCTCCCTTGCAACTAGAAACAGC
GACAATGCTTGAGATTCTAGATAACCCAGGTGGAAGCTGCCCTGCAAATATGGGCTTAGC
TGGTTGTGCAGACATTGTCACGTTCACCTTCTTCACCAATGGAAGCACTGCAACTACCTC
ATTTGCCTGCTTCTCAAACATATCTTTGACTGGACATGCCGGTGTTGTTAGCTCCAAACG
GAAAGAAACCTCACCAAGAGCTTGGTCAATAACCAGATCTTTAACAAAACCACAGGAAAC
TATATCTGTCCCAAAATCAGGATCAATGATCTGAGACAAGGCCTTGTACACCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BW25JQ U 25
AF RR4EC88TF C 367
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CAAAAAAGGTCTCATGTTTTAATAATATAGACAAATACAAATTTTATCTTCGAGAAGGAA
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CATGTTTTAATAATATAGACAAATACAAATTTTATCTTCGAGAAGGAAACGCTATGGTTT
TAAGAATTATACTTCAACTGCCGACAATGGAGGAACCTCTACTAACCGTTCAATTGTTTC
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GTTTCCCATTGGTCGTATTTCCTCAGGCTCGATATCTTCTGCCACATCTCCGAACTGAAT
CTTTTGTTCACCAGTCCATTCGTCCACACTTTGTGCTGATCGATCATTTCTTCTGACAGT
TGCAGGGTGAAGTAAGAACTCTTCATCTGAGTTTGGCACCTTCACTCTGATTGCTTTAAG
ATATTTGTCGTATGTCACAGCTGTGGAAACTTGCTGGCGTATCTTGGCGCATTGTTGGAC
TACACATACACTAAGATCTTGGAACGTTCTCGCAACTTCACTTAAAGGATCTGAAACAAC
TTCAGGAACTCCGCTATCTCCCGAA

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DS 

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ATATAGACAAATACAAATTTTATCTTCGAGAAGGAAACGCTATGGTTTTAAGAATTATAC
TTCAACTGCCGACAATGGAGGAACCTCTACTAACCGTCCAATTGTTTCCAGCTGGTCATA
CGGAGCAATCTGGCTAAACCCGTCCGGCCAGGTTATCGAGACGGCATAGTTTCCCATTGG
TCGTATTTCCTCAGGCTCGATATCTTCTGCCACATCTCCGAACTGAATCTTTTGTTCACC
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TAAGAACTCTTCATCTGAGTTTGGCACTTTCACTCTGATTGCTTTAAGATATTTGTCGTA
TGTCACAGCTGTGGAAACTTGCTGGCGTATCTTGGCGCATTGTTGGACTACACATACACC
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GCTATCTCCCGAAGCAGATAACGTTGGCCTAATGGGGAGGTCAAAGAGGTGAGGTATTCC
GAATTGCTGGACAACCTGAGAACCTGAACCTTTCCCAAAAGGGTAATAACGTTTCCCGTC
AGCGTCAAAATGACACATATTCTCCACAACAGCAACACAAGGAACCTTTAGCTTTGAGAA
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CGCTGCTGTT

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TTGGACTACACATACACCAAGATCTTGGAACGTTCTCGCAACTTCACTTAAAGGATCTGA
AACAACTTCAGGAACTCCGCTATCTCCCGAAGCAGATAACGTTGGCCTAATGGGGAGGTC
AAAGAGGTGAGGTATTCCGAATTGCTGGACAACCTGAGAACCTGAACCTTTCCCAAAAGG
GTAATAACGTTTCCCGTCAGCGTCAAAATGACACATATTCTCCACAACAGCAACACAAGG
AACCTTTAGCTTTGAGAACATTCGTACACCTTTGGCAACATCTATAAATGCCAATTTTTG
AGGTGTGGTCACAATTACCGCTGCTGTTAACGGCGCAATCTGGCACAGGGTTAGTTGAAT
GTCACCGGTTCCAGGAGGCATGTCGATAACAAGATAATCCAGCTCTCCCCATTCAGTTGT
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CCCTGCAAATCCAAATGACACTAGCTTCACC

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DS 

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CTTTGGCAACATCTATAAATGCCAATTTT*GAGGTGTGGTCACAATTACCGCTGCTGTTA
ACGGCGCAACCTGGCACAGGGTTAGTTGAATGTCACCGGTTCCAGGAGGCATGTCGATAA
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CCATTGGACCTCTCATTATGGCACGTCCTTGCCCTGCAAATCCAAATGACACTAGCTTCA
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TCTCGGGATTGACCATAGTTGGTGAACTAGGACCATAGACATCAGCATCAAAGATGCCAA
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CACCTCCCTTGCAACTAGAAACAGCGACAATGCTTGAGATTCTAGATAACCCAGGTGGAA
GCTGCCCTGCAAATATGGGCTTAGCTGGTTGTGCAGACATTGTCACGTTCACCTTCTTCA
CCAATGGAAGCACTGCAACTACCTCATTTGCCTGCTTCTCAAACATATCTTTGACTGGAC
ATGCCGGTGTTGTTAGCTCCAAACGGAAAGAAACCTCACCAAGAGCTTGGTCAATAACCA
GATCTTTAACAAAACCACAGGAAACTATATCTGTCCCAAAATCAGGATCAATGATCTGAG
ACAAGGCCTTGTACACCCCT

QA 19 758 19 758
DS 



AS 1 7

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GGATAACTTCACTCTCTAATAATCTATAAGA*****AAAATGATAATCCATATTTTCTTC
ACCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGAT
CCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAG
AATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCT
GCAGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATG
GCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCG
GAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAA
GTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCAT
TTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCT
CCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTT
GAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTGGAGGA
ACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTC
AAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGT
GCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGAACTAAGGAATAAACATTCCATATTGCAC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H471TF U 1
AF RR4A891TF U 1
AF RR4A891JQ C 9
AF RR4BS17JQ C 24
AF RR4BS17TF U 24
AF RR4AI49JQ C 419
AF RR4AI49TF U 419
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BS 656 802 RR4A891TF
BS 803 806 RR4BS17TF
BS 807 835 RR4AI49TF

RD RR4H471TF 626 0 0
GA
ATAACTTCACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTCCAC
CCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCC
AAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAA
TGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGC
AGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGC
TCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGA
AGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTTGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGT
TTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTT
TCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCC
GGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGA
AGCCACTACGTTCCTTAGCGATGC

QA 3 626 3 626
DS 

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GGATAACTTCACTCTCTAATAATCTATAAGA*****AAAATGATAATCCATATTTTCTTC
ACCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGAT
CCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAG
AATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCT
GCAGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATG
GCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCG
GAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAA
GTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCAT
TTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCT
CCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTT
GAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTAGAGGA
ACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTC
AAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGT
GCTTCATTTATAATCACTTTGG
TTTCAAA

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DS 

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TCACTCTCTAATAATCTATAAGA*****AAAATGATAATCCATATTTTCTTCACCCTTTC
CTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGG
TCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTT
CGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGAC
TCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCT
TGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCT
TGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTT
GAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCT
TAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCCGGGGCT
CCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGAAGCCAC
TACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTAGAGGAACTAATTA
AGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGT
CTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGTGCTTCATT
TATAATCACTTTGG
TTTC

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DS 

RD RR4BS17JQ 791 0 0
GGATAAGAAAATG
AAAATGATAATCCATATTTTCTTCACCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCA
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCTAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCT
TTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCA
AATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAG
AAGCTTAAGGGTGTGCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCT
TGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGTCTGCCATTCTGATCTTTATTTTAATGGT
TTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGTGCTTCATTTATAATCACTTTGG
CTTGAACTAAGG

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DS 

RD RR4BS17TF 783 0 0
GGATAAGAAAATG
AAAATGATAATCCATATTTTCTTCACCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCA
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCTAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCT
TTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCA
AATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAG
AAGCTTAAGGGTGTGCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCT
TGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGTCTGCCATTCTGATCTTTATTTTAATGGT
TTCTGTGTTGT*ATTGATTTCAGTGCTTCATTTATA*TCACTTTGGCTTG

QA 14 783 14 783
DS 

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G
AGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCA
CTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTC
TCCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGT
TGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTGGAGG
AACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATT
CAAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAG
TGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGAACTAAGGAATAAACATTCCATATTGCAC

QA 2 417 2 417
DS 

RD RR4AI49TF 417 0 0
G
AGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCA
CTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTC
TCCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGT
TGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTGGAGG
AACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATT
CAAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAG
TGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGAACTAAGGAATAAACATTCCATATTGCAC

QA 2 417 2 417
DS 



AS 1 7

CO CL1025Contig1 925 7 13 U
GCGAGAGCAAGAAGGTTGAAATAAAAAGAAGGCAATGGAGAAAAAGGAGCAGAAGCAGTA
TGTGCTTGTCCACGGGATCTGCCACGGCGCATGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCT
CGAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAGTAGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAAC
CAGATTGGAAGAGATTCAAACACTAGAGGATTACTGCAAACCGTTGCTTGATGTTCTGAG
CTCGCCTGATGAAGATAAGGTGGTTCTCGTTGCTCATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGC
GTTTGCAGCTGACACCTTCCCTCATAAGATCGCTGCTATGGTCTTTGTGACATCGTTCAT
GCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCAAAAATATCATGCCGAGCATGTCACC
GCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAAGCTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTC
TGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAAGAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGA
TCTTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGGTAAACCCATCAGTTACGGACAACCTGGCAGG
GACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGGTACGGATCTGTTACGCGTATCTACATCACATGCGG
AAAGGATAATGTGATACGTAATGATTACCAGCGTTGGATGATCAACAACTTTCCGGTAAA
AGAAGTAATGGAAATCAAAGCTGCGGATCATATGCCAATGAACTCCAAGCCTCGAGAACT
CTGTGCTCGTCTCTTGGAGATTGCACATAGATATGCATGAATAAAAAAACATGAGATTGA
TTGCACATATATATGCATGCTAAAGACTTTATGCACAATGTAGATATTACACTTTTTATA
ATGCTACAATAAACGATTTACTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DW39TF U 27
AF RR4FB37TF U 1
AF RR4BI05TF U 29
AF RR4B419TF U 29
AF RR4B419JQ C 102
AF RR4FB37JQ C 240
AF RR4DW39JQ C 123
BS 1 91 RR4FB37TF
BS 92 92 RR4DW39TF
BS 93 334 RR4FB37TF
BS 335 335 RR4DW39TF
BS 336 625 RR4FB37TF
BS 626 828 RR4B419TF
BS 829 829 RR4B419JQ
BS 830 863 RR4B419TF
BS 864 864 RR4B419JQ
BS 865 877 RR4B419TF
BS 878 878 RR4B419JQ
BS 879 887 RR4B419TF
BS 888 925 RR4B419JQ

RD RR4DW39TF 570 0 0
GGA
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GCTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCA
AGAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGATCTTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGG
TAAACCCATCAGTTACGGACAATCTGG

QA 4 570 4 570
DS 

RD RR4FB37TF 625 0 0
GCGAGAGCAAGAAGGTTGAAATAAAAAGAAGGCAATGGAGAAAAAGGAGCAGAAGCAGTA
TGTGCTTGTCCACGGGATCTGCCACGGCGCACGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCT
CGAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAGTAGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAAC
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CTCGCCTGATGAAGATAAGGTGGTTCTCGTTGCTCATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGC
GTTTGCAGCTGACACCTTCCCTCATAAGATCGCTTCTATGGTCTTTGTGACATCGTTCAT
GCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCAAAAATATCATGCCGAGCATGTCACC
GCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAAGCTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTC
TGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAAGAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGA
TCTTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGGTAAACCCATCAGTTACGGACAACCTGGCAGG
GACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4BI05TF 682 0 0
G
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CATGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCTCGAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAG
TAGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAACCAGATTGGAAGAGATTCAAACACTAGAGG
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TCGCTGCTATGGTCTTTGTGACATCGTTCATGCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATG
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GCTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCA
AGAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGATCTTTAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGG
TAAACCCATCAGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGGTACG
GATCTGTTACGCGTATCTACATCACATGCGGAAAGGATAATGTGATACGTAATGATTACC
AGCGTTGGATGATCAACAACT

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR4B419TF 865 0 0
G
AGGCAATGGAGAAAAAGGAGCAGAAGCAGTATGTGCTTGTCCACGGGATCTGCCACGGCG
CATGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCTCGAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAG
TAGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAACCAGATTGGAAGAGATTCAAACACTAGAGG
ATTACTGCAAACCGTTGCTTGATGTTCTGAGCTCGCCTGATGAAGATAAGGTGGTTCTCG
TTGCTCATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGCGTTTGCAGCTGACACCTTCCCTCATAAGA
TCGCTGCTATGGTCTTTGTGACATCGTTCATGCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATG
TTCTCAAAAATATCATGCCGAGCATGTCACCGCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAA
GCTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCA
AGAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGATCTTTAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGG
TAAACCCATCAGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGGTACG
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GATATGCATGAATAAAAAA*CATGAGATTGATTGCACATATATATGCATGCTAA*GACTT
TATGCACA*TGTAGATAT
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TAAAAAAACATGAGATTGATTGCACATATATATGCATGCTAAAGACTTTATGCACAATGT
AGATATTACACTTTTTATAATGCTACAATAAACGATTTACTACC

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DS 

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CGTTTGCAGCTGACACCTTCCCTCATAAGATCGCTTCTATGGTCTTTGTGACATCGTTCA
TGCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCAAAAATATCATGCCGAGCATGTCAC
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AATGCTACAATAAACGATTTACTAC
G

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DS 

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CTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCAAAAATATCATGCCGAGCATGTCACCGC
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TTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGGTAAACCCATCAGTTACGGACAATCTGGCAGGGA
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GTGCTCGTCTCTTGGAGATTGCACATAGATATGCATGAATAAAAAAACATGAGATTGATT
GCACATATATATGCATGCTAAAGACTTTATGCACAATGTAGATATTACACTTTTTATAAT
GCTACAATAAACGATTTACTAC
G

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 7

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A*GGAAGATAGATCAAAGCTTTTACGTTTTAAAAAGGGAAGATAACAAGATGAATCTTGC
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CGGTTGGGTAAACGCACACGCCACATTCTACGGCGGTGGTGATGCCTCAGGAACAATAGG
AGGTGCTTGTGGGTACGGAAACCTTTACAGCCAAGGATATGGAACCAACACGGCGGCGCT
GAGCACTGCTCTGTTCAACAACGGGTTAAGCTGTGGTGCTTGCTTCGAGATACGGTGCCA
GAACGACGGCAAATGGTGTCTCCCTGGCTCAATCGTCGTCACAGCGACTAACTTTTGCCC
TCCTAACAACGCTTTACCTAACAACGCAGGAGGTTGGTGTAACCCTCCTCAGCAGCATTT
CGATCTCTCTCAGCCCGTGTTTCAACGCATCGCTCAGTACAAAGCTGGCATTGTCCCCGT
TGCATACAGAAGAGTGCCTTGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACTATAAACGGACA
TTCTTACTTCAACCTTGTTCTGATTACGAACGTCGGAGGAGCTGGAGATGTTCACTCAGC
GTGGGTTAAAGGGTCAAGAACAGGATGGCAAGCTATGTCGAGAAACTGGGGACAAAACTG
GCAGAGTAACTCTTACCTGAACGGACAAGCTCTCTCTTTCAAAGTCACAACCAGTGATGG
TCGGACCATCGTTTCTAACAACGTTGCTT*CTGCGGGATGGTCCTTTGGCCAGACCTTCA
CCGGCGCACAGATACGCTAGAAAGGGGTGATTTCGTAAAAAAAAA*CTCATATATCATTT
GACTAAGTGAAAACAAGTGGTTCTTGTGTATTGTAGAGAGATTGGAAAGGGAGCATATTA
GTAATTTGGTCCGTTGTTACCTAAAAAGAAGTGGTGCTTCGAGTGCTTGATTTTCCACAA
AGTCTTGATGACGATGTCTTTTGGGATCTTCTTTCTATTATTATTGGTAAGGTTTGTTTG
AATTTATACTCTGATGCAGAGGTGGAGTTAAGTACCACACGCTACTAGTAAATTTCTCGT
GTAGTTTGTATGTCCCCTCTTGAAGCGAGAGGGAGAGTTTCAGCTTTCAAGAATTGGTAG
ATTGTATTATGTCGTTAAAGTCATCATCTATGTTGTAAATTTTCAATTTTTACAAGGAAT
ATTGGAGATTTGTAAGTTTCAAAAAATATGTATTGGAGATTTGTTATTCTAATTTACAGT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A182TFB U 1
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RD RR4A182TFB 679 0 0
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A*GGAAGATAGATCAAAGCTTTTACGTTTTAAAAAGGGAAGATAACAAGATGAATCTTGC
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CGGTTGGGTAAACGCACACGCCACATTCTACGGCGGTGGTGATGCCTCAGGAACAATAGG
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GAGCACTGCTCTGTTCAACAACGGGTTAAGCTGTGGTGCTTGCTTCGAGATACGGTGCCA
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TCCTAACAACGCTTTACCTAACAACGCAGGAGGTTGGTGTAACCCTCCTCAGCAGCATTT
CGATCTCTCTCAGCCCGTGTTTCAACGCATCGCTCAGTACAAAGCTGGCATTGTCCCCGT
TGCATACAGAAGAGTGCCTTGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACTATAAACGGACA
TTCTTACTTCAACCTTGTTCTGATTACGAACGTCGGAGGAGCTGGAGATGTTCACTCAGC
GTGGGTTAAAGGGTCAAGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4GX82TF 678 0 0
GGAAT
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GATAGATCAAAGCTTCTACGTTTTAAAAAGGGAAGATAACAAGATGAATCTTGCCGGCTT
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GGCTCTGTTCAACAACGGGTTAAGCTGCGGTGCTTGCTTCGAGATACGATGCCAGAACGA
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CTCTCAGCCCGTGTTTCAACGCATCGCTCAGTACAAAGCTGGCATTGTCCCCGTCGCCTA
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TAAAGGGTCAAGA

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DS 

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GGCAA
TCAAAACCAAACAACAGCTTCTCATAATCATCCCTCTTGTTTCCTCTTTAAGAAA*GGAA
GATAGATCAAAGCTTTTACGTTTTAAAAAGGGAAGATAACAAGATGAATCTTGCCGGCTT
CTTGATTATAGTTGTCCTCGGAGTCATGACGTCACGTGTGAATGGATACGGTGGCGGTTG
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CGGCAAATGGTGTCTCCCTGGCTCAATCGTCGTCACAGC*ACTAACTTTTGCCCTCCTAA
CAACGCTTTACCTAACAACGCAGGAGGTTGGTGTAACCCTCCTCAGCAGCATTTCGATCT
CTCTCAGCCCGTGTTTCAACGCATCGCTCAGTACAAAGCTGGCATTGTCCCCGTTGCATA
CAGAAGAGTGCCTTGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACTATAAACGGACATTCTTA
CTTCAACCTTGTTCTGATTACGAACGTCGGAGGAGCTGGAGATGTTCACTCAGCGTGGGT
TAAAGGGTCAAGAACAGGATGGCAAGCTATGTCGAGAAACTGGGGACAAAACTGGCAGAG
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CATCGTTTCTAACA*CGTTGCTTTCTGCGGGATGGTCCTTTGGC
A

QA 6 829 6 829
DS 

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G
CTGGCTCAATCGTCGTCATAGCGACTAACTTTTGCCCTCCTAACAACGCTTTACCTAACA
ACGCAGGAGGTTGGTGTAACCCTCCTCAGCAGCATTTCGATCTCTCTCAGCCCGTGTTTC
AACGCATCGCTCAGTACAAAGCTGGCATTGTCCCCGTTGCATACAGAAGAGTGCCTTGCG
TGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACTATAAACGGACATTCTTACTTCAACCTTGTTCTGA
TTACGAACGTCGGAGGAGCTGGAGATGTTCACTCAGCGTGGGTTAAAGGGTCAAGAACAG
GATGGCAAGCTATGTCGAGAAACTGGGGACAAAACTGGCAGAGTAACTCTTACCTGAACG
GACAAGCTCTCTCTTTCAAAGTCACAACCAGTGATGGTCGGACCATCGTTTCTAACAACG
TTGCTT*CTGCGGGATGGTCCTTTGGCCAGACCTTCACCGGCGCACAGATACGCTAGAAA
GGGGTGATTTCGTAAAAAAAAA*CTCATATATCATTTGACTAAGTGAAAACAAGTGGTTC
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AAAAGAAGTGGTGCTTCGAGTGCTTGATTTTCCACAAAGTCTTGATGACGATGTCTTTTG
GGATCTTCTTTCTATTATTATTGGTAAG*TTTGTTTGAATTTATACTCTGATGCAGAG*T
GGAGTTAAGTACCACACGCTACTAGTAAATTTCTCGTGTAGTTTGTATGTCCCCTCTTGA
AGCGAGAG

QA 2 789 2 789
DS 

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GGATGGCAAGCTATGTCGAGAAACTGGGGACAAAACTGGCAGAGTAACTCTTACCTGAAC
GGACAAGCTCTCTCTTTCAAAGTCACAACCAGTGATGGTCGGACCATCGTTTCTAACAAC
GTTGCTT*CTGCGGGATGGTCCTTTGGCCAGACCTTCACCGGCGCACAGATACGCTAGAA
AGGGGTGATTTCGTAAAAAAAAAACTCATATATCATTTGACTAAGTGAAAACAAGTGGTT
CTTGTGTATTGTAGAGAGATTGGAAAGGGAGCATATTAGTAATTTGGTCCGTTGTTACCT
AAAAAGAAGTGGTGCTTCGAGCGCTTGATTTTCCACAAAGTCTTGATGACGATGTCTTTT
GGGTTCTTCTTTCTATTATTATTGGTAAGGTTTGTTTGAATTTATACTCTGATGCAGAGG
TGGAGTTAAGTACCACCCGCTACTAGTAAATTTCTCGTGTAGTTTGTATGTCCCCTCTTG
AAGCGAGAGGGAGAGTTTCAGCTTTCAAGAATTGGTAGATTGTATTATGTCGTTAAA

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4BY72JQ 468 0 0
CGGGATGGTCCTTTGGCCAGACCTTCACCGGCGCACAGATACGCTAGAAAGGGGTGATTT
CGTAAAAAAAAA*CTCATATATCATTTGACTAAGTGAAAACAAGTGGTTCTTGTGTATTG
TAGAGAGATTGGAAAGGGAGCATATTAGTAATTTGGTCCGTTGTTACCTAAAAAGAAGTG
GTGCTTCGAGTGCTTGATTTTCCACAAAGTCTTGATGACGATGTCTTTTGGGATCTTCTT
TCTATTATTATTGGTAAGGTTTGTTTGAATTTATACTCTGATGCAGAGGTGGAGTTAAGT
ACCACACGCTACTAGTAAATTTCTCGTGTAGTTTGTATGTCCCCTCTTGAAGCGAGAGGG
AGAGTTTCAGCTTTCAAGAATTGGTAGATTGTATTATGTCGTTAAAGTCATCATCTATGT
TGTAAATTTTCAATTTTTACAAGGAATATTGGAGATTTGTAAGTTTC
T

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR4A182JQD 790 0 0
GTCCCCGTTGCATACAGAAGAGTGCCTTGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACTATA
AACGGACATTCTTACTTCAACCTTGTTCTGATTACGAACGTCGGAGGAGCTGGAGATGTT
CACTCAGCGTGGGTTAAAGGGTCAAGAACAGGATGGCAAGCTATGTCGAGAAACTGGGGA
CAAAACTGGCAGAGTAACTCTTACCTGAACGGACAAGCTCTCTCTTTCAAAGTCACAACC
AGTGATGGTCGGACCATCGTTTCTAACAACGTTGCTT*CTGCGGGATGGTCCTTTGGCCA
GACCTTCACCGGCGCACAGATACGCTAGAAAGGGGTGATTTCGTAAAAAAAAAACTCATA
TATCATTTGACTAAGTGAAAACAAGTGGTTCTTGTGTATTGTAGAGAGATTGGAAAGGGA
GCATATTAGTAATTTGGTCCGTTGTTACCTAAAAAGAAGTGGTGCTTCGAGCGCTTGATT
TTCCACAAAGTCTTGATGACGATGTCTTTTGGGATCTTCTTTCTATTATTATTGGTAAGG
TTTGTTTGAATTTATACTCTGATGCAGAGGTGGAGTTAAGTACCCCCCGCTACTAGTAAA
TTTCTCGTGTAGTTTGTATGTCCCCTCTTGAAGCGAGAGGGAGAGTTTCAGCTTTCAAGA
ATTGGTAGATTGTATTATGTCGTTAAAGTCATCATCTATGTTGTAAATTTTCAATTTTTA
CAAGGAATATTGGAGATTTGTAAGTTTCAAAAAATATGTATTGGAGATTTGTTATTCTAA
TTTACAGTGG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 7

CO CL1027Contig1 1221 7 3 U
GGGTTAAAACTGAACCTTTCTTTATTATTATTACACAATCTCTCAAATTTTGTTCGTTCA
AGTCAGGCTTGATCAAATAATACTTTACATTATACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGG
AGTTTCTGGCAATCAAAATAACCTGACACCAACACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGA
CATGCCATACCCAACCGTTCCTACGCTCCGGTGTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAGCTCC
AGCAGGACCATACTGGGACTGTGCATGCAACAGCTTAGCATCAATACCCACCTTATGCTG
TGTTTGGACGACATAAGGGTTAGGGTTCAGCTCAGCTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGC
TTCTGTACCACCGCCACGCTTCTCTTGTTGGTTCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTT
GGGAGAAACGGTCTGCTGTGGAGTAGCGCTTCTGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATA
AGTTAGAGATGATGATTCCACCACAGCACGGCCTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCT
TGGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGGAGCATTGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCG
TGGAAGCGAAGCATGCTTTCTCTCTGGAGGTGGTATGATTGGTACCCCACTTTTGCCGCT
CTTCTCTTCTAAGTAAGCAAACTGTTTCCTCAGATGACCAATAGCACTAGGGTATAAGAA
ACTTGAGCCATCAGAACCGTTCATGTAATCCTTGAGAAGCTGAGGATGGTACTCAAGTAT
CTCCCTGTATATCAGCTCTCTGATGTCATCTTTCGTCAACCTCCTTCTCTCAAACTCGAA
CTCCATCTTCGAGATTGGCTGACAAGAAGGTTCTCTTTCAACCTTAGCCAGACCCTTGAA
GTAAGGATCAGCCAGCGCCTCCGTAGCAGTGGGCCTATCCTTCGGATCAAAAGCCAACAG
TCTTTGCAATAAGCGCAGCGCTGAAGGATCTGCGTTAGGGAACTTTTGAGTAAAAGGGAC
GAGGCTTTTCTTCCTCATTTCTCCCAAGTATTTTCTAGCTTTCTCGTTTCGAACTCCTGC
AATGGTCTCTGCCTTTGGTGTACCGAGAAGATCGGTGATCAAATCTAACTGATGGACCAC
ACTTTTCCCGGGAAACAATGGCTTCCCTAATAACACCTCCGCAAAGATGCAACCAATGCT
CCAAATGTCAATCGCTGGAGC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH88JQ U 1
AF RR4EU47JQ U 2
AF RR4AG67JQ U 1
AF RR4FA88JQ U 1
AF RR4AG67TF C 23
AF RR4AH88TF C 33
AF RR4EU47TF C 603
BS 1 758 RR4AG67JQ
BS 759 778 RR4AG67TF
BS 779 1221 RR4EU47TF

RD RR4AH88JQ 604 0 0
G
GGTTAAAACTGAACCTTTCTTTATTATTATTACACAATCTCTCAAATTTTGTTCGTTCAA
GTCAGGCTTGATCAAATAATACTTTACATTATACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGGA
GTTTCTGGCAATCAAAATAACCTGACACCAACACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGAC
ATGCCATACCCAACCGTTCCTACGCTCCGGTGTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAGCTCCA
GCAGGACCATACTGGGACTGTGCATGCAACAGCTTAACATCAATACCCACCTTATGCTGT
GTTTGGACGACATAAGGGTTAGGGTTCAGCTCAACTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGCT
TCTGTACCACCGCCACGCTTCTCTTGTTGGTTCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTTG
GGAGAAACGGTCTGCTGTGGAGTAGCGCTTCTGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATAA
GTTAGAGATGATGATTCCACCACAGCACGGCCTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCTT
GGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGGAGCATTGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCGT
GGA

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR4EU47JQ 671 0 0
GGTTAAAACTGAACCTTTCTTTATTATTATTACACAATCTCTCAAATTTTGTTCGTTCAA
GTCAGGCTTGATCAAATAATACTTTACATTATACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGGA
GTTTCTGGCAATCAAAATAACCTGACACCAACACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGAC
ATGCCATACCCAACCGTTCCTACGCTCCGGTGTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAACTCCA
GCAGGACCATACTGGGACTGTGCATGCAACAGCTTAACATCAATACCCACCTTATGCTGT
GTTTGGACGACATAAGGGTTAGGGTTCAGCTCAGCTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGCT
TCTGTACCACCGCCACGCTTCTCTTGTTGGTTCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTTG
GGAGAAACGGTCTGCTGTGGAGTAGCGCTTCTGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATAA
GTTAGAGATGATGATCCCACCACAGCACGGCCTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCTT
GGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGGAGCATTGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCGT
GGAAGCGAAGCATGCTTTCTCTCTGGAGGTGGTACGATTGGTACCCCACTTTTGCCACTC
TTCTCTTCTAA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4AG67JQ 758 0 0
GGGTTAAAACTGAACCTTTCTTTATTATTATTACACAATCTCTCAAATTTTGTTCGTTCA
AGTCAGGCTTGATCAAATAATACTTTACATTATACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGG
AGTTTCTGGCAATCAAAATAACCTGACACCAACACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGA
CATGCCATACCCAACCGTTCCTACGCTCCGGTGTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAGCTCC
AGCAGGACCATACTGGGACTGTGCATGCAACAGCTTAGCATCAATACCCACCTTATGCTG
TGTTTGGACGACATAAGGGTTAGGGTTCAGCTCAGCTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGC
TTCTGTACCACCGCCACGCTTCTCTTGTTGGTTCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTT
GGGAGAAACGGTCTGCTGTGGAGTAGCGCTTCTGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATA
AGTTAGAGATGATGATTCCACCACAGCACGGCCTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCT
TGGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGGAGCATTGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCG
TGGAAGCGAAGCATGCTTTCTCTCTGGAGGTGGTATGATTGGTACCCCACTTTTGCCGCT
CTTCTCTTCTAAGTAAGCAAACTGTTTCCTCAGATGACCAATAGCACTAGGGTATAAGAA
ACTTGAGCCATCAGAACCGTTCATGTAATCCTTGAGAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4FA88JQ 734 0 0
G
GGTTAAAACTGAACCTTTCTTTATCATTATTACACAATCTCTCAAATTTTGTTCGTTCAA
GTCAGGCTTGATCAAATAATACTTTACATTATACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGGA
GTTTCTGGCAATCAAAATAACCTGACACCAACACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGAC
ATGCCATACCCAACCGTTCCTACGCTCCGGTGTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAGCTCCA
GCAGGACCATACTGGGACTGTGCATGCAACAGCTTAACATCAATACCCACCTTATGCTGT
GTTTGGACGACATAAGGGTTAGGGTTCAGCTCAGCTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGCT
TCTGTACCACCGCCACGCTTCTCTTGTTGGTTCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTTG
GGAGAAACGGTCTGCTGTGGAGTAGCGCTTCTGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATAA
GTTAGAGATGATGATTCCACCACAGCACGGCCTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCTT
GGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGGAGCATTGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCGT
GGAAGCGAAGCATGCTTTCTCTCTGGAGGTGGTATGATTGGTACCCCACTTTTGCCGCTC
TTCTCTTCTAAGTAAGCAAACTGTTTCCTCAGATGACCAATAGCACTAGGGTATAAGAAA
CTTGAGCCATCAG

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR4AG67TF 758 0 0
TATTATTATTACACAATCTCTCAAATTTTGTTCGTTCAAGTCAGGCTTGATCAAATAATA
CTTTACATTATACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGGAGTTTCTGGCAATCAAAATAAC
CTGACACCAACACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGACATGCCATACCCAACCGTTCCT
ACGCTCCGGTGTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAGCTCCAGCAGGACCATACTGGGACTGT
GCATGCAACAGCTTAGCATCAATACCCACCTTATGCTGTGTTTGGACGACATAAGGGTTA
GGGTTCAGCTCAGCTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGCTTCTGTACCACCGCCACGCTTC
TCTTGTTGGTTCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTTGGGAGAAACGGTCTGCTGTGGA
GTAGCGCTTCTGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATAAGTTAGAGATGATGATTCCACC
ACAGCACGGCCTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCTTGGAGGAGGTCCTAAAGGTTTA
GTTGGAGCATTGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCGTGGAAGCGAAGCATGCTTTCTC
TCTGGAGGTGGTATGATTGGTACCCCACTTTTGCCGCTCTTCTCTTCTAAGTAAGCAAAC
TGTTTCCTCAGATGACCAATAGCACTAGGGTATAAGAAACTTGAGCCATCAGAACCGTTC
ATGTAATCCTTGAGAAGCTGAGGATGGTACTCAAGT
CC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4AH88TF 748 0 0
ACACAATCTCTCAAATTT*GTTCGTTCAAGTCAGGCTTGATCAAATAATACTTTACATTA
TACAATGACTAACATGGGGGGGGAGAGGAGTTTCTGGCAATCAAAATAACGTGACACCAA
CACAAATTTGCTAAAAAATCATTTAAGACATGCCATACCCAACCGTTCCTACGCTCCGGT
GTGCCGCTACTGCAACCGCAGCAGCTCCAGCAGGACCATACTGGGACTGTGCATGCAACA
GCTTAGCATCAATACCCACCTTATGCTGTGTTTGGACGACATAAGGGTTAGGGTTCAGCT
CAGCTGGCTTTGCGAACTGCGGTTTTGCTTCTGTACCACCGCCACGCTTCTCTTGTTGGT
TCATGGCGTTGGGATGGAAGAAACAGTTGGGAGAAACGGTCTGCTGTGGAGTAGCGCTTC
TGTAATACGATGTCCTGCTATTCTCATAAGTTAGAGATGATGATTCCACCACAGCACGGC
CTGGTCTACTACCTGAAGAAGGTATCCTTGGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGGAGCAT
TGGAGGTTGTCATCACCACTGTGGACCGTGGAAGCGAAGCATGCTTTCTCTCTGGAGGTG
GTATGATTGGTACCCCACTTTTGCCGCTCTTCTCTTCTAAGTAAGCAAACTGTTTCCTCA
GATGACCAATAGCACTAGGGTATAAGAAACTTGAGCCATCAGAACCGTTCATGTAATCCT
TGAGAAGCTGAGGATGGTACTCAAGT
CC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4EU47TF 619 0 0
GAAGCGAAGCATGCTTTCTCTCTGGAGGTGGTACGATTGGTACCCCACTTTTGCCACTCT
TCTCTTCTAAGTAAACAAACTGTTTCCTCAGATGACCAATAGCACTAGGGTATAAGAAAC
TTGAGCCATCAGAACCGTTCATGTAATCCTTGAGAAGCTGAGGATGGTACTCAAGTATCT
CCCTGTATATCAGCTCTCTGATGTCATCTTTCGTCAACCTCCTTCTCTCAAACTCGAACT
CCATCTTCGAGATTGGCTGACAAGAAGGTTCTCTTTCAACCTTAGCCAGACCCTTGAAGT
AAGGATCAGCCAGCGCCTCCGTAGCAGTGGGCCTATCCTTCGGATCAAAAGCCAACAGTC
TTTGCAATAAGCGCAGCGCTGAAGGATCTGCGTTAGGGAACTTTTGAGTAAAAGGGACGA
GGCTTTTCTTCCTCATTTCTCCCAAGTATTTTCTAGCTTTCTCGTTTCGAACTCCTGCAA
TGGTCTCTGCCTTTGGTGTACCGAGAAGATCGGTGATCAAATCTAACTGATGGACCACAC
TTTTCCCGGGAAACAATGGCTTCCCTAATAACACCTCCGCAAAGATGCAACCAATGCTCC
AAATGTCAATCGCTGGAGC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 6

CO CL1028Contig1 787 6 11 U
GGACTCCTCTCCTACAAAACCTAAACGTTTTCTTTTCTCAAAGCAAGCAAAAAAGTCATG
GCAGAAGCGTCTACTTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGAGATCAAAGCTTCTGCT
GGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCAGGG
AACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTGTCATC
TGGAAATACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAG
CCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGTTGAAAGAGTACAAA
AGCTTTGTGATCACCATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGAGGGCCCGGTAGTGTTGTGCAT
TGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGTTTCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAG
TTCTGTGTTGAAATCTCAAAAGAGATCGATGAACATCTCTTGAACGAAGAATAAAGGACC
ACTCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT**CAGTGTGGCCTCTTTCAGTATCTGATGAA
ACCAAAATATATAATGTGCTGGTGTCCTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGT
CACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATC
GGTGTGTAATAGGAGTCAAGCTACAAGGCTACTTGAAGTTTATTTACAAAAAAAGTTTTA
TGCTAGC


BQ
20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 

AF RR4F564TF U 1
AF RR4DQ48TF U 1
AF RR4GS04TF U 1
AF RR4DQ48JQ C 216
AF RR4GS04JQ C 1
AF RR4CR67JQ C 1
BS 1 41 RR4DQ48TF
BS 42 42 RR4F564TF
BS 43 79 RR4DQ48TF
BS 80 80 RR4F564TF
BS 81 458 RR4DQ48TF
BS 459 459 RR4F564TF
BS 460 709 RR4DQ48TF
BS 710 760 RR4GS04JQ
BS 761 761 RR4CR67JQ
BS 762 784 RR4GS04JQ
BS 785 787 RR4CR67JQ

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ACCAAAATATATAATGTGCTGGTGTCCTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTG

QA 1 659 1 659
DS 

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TGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGTTTC*CACCCTGAAACTCTCCTCCAG
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CACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCT

QA 1 709 1 709
DS 

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CCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTCATAGAAGGAGATCTGTTGAAAGAGTACAAA
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TGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGTTTCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAG
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CACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTA

QA 1 702 1 702
DS 

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TAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGA
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TGGAGGGCCCGGTAGTGTTGTGCATTGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGT
TTC*CACCCTGAAACTCTCCTCCAGTTCTGTGTTGAAATCTCAAAAGAGATCGATGAACA
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GTGGCCTCTTTCAGTATTTGATGAAACCAAAATATATAATGTGCTGGTGTCCTAGTTTGG
GTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGTCACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGAT
ATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATCG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4GS04JQ 784 0 0
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GGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCAGGG
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TGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGTTTCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAG
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CACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATC
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TGCT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4CR67JQ 787 0 0
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GGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCAGGG
AACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTGTCATC
TGGAAATACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAGAGGGTCAAGGCGGTGGAG
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TGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGTTTCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAG
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CACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATC
GGTGTGTAATAGGAGTCAAGCTACAAGGCTACTTGAAGTTTATTTACAAAAAAAGTTTTA
TGCTAGC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 2 6

CO CL1029Contig1 713 2 9 U
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TGATCAAACGGCGAAGATAATCGATGGAAAGGCGATTGCTCATACCATCCGATCAGAGAT
CGCCGAGGAAGTTCGCCTTTTATCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTTGT
CATAGTTGGTGTCCGGAAAGATTCACAGACTTATGTGAATATGAAGAGGAAAGCATGTGC
TGAGGTTGGGATCAAGTCATTTGATGTTGACCTACCTGAAGATGTTCCTGAAGCTGATCT
TATTACCAAAGTTCATCAACTCAATTCAGATCCCCAAGTCCATGACATATTAGTTCAACT
CCCATTGCCGAAACATATCAATGAGGAGAACGTTCTGGGTGCTATCAGCATTGATAAAGA
CGTTGATGGATTCCATCCTTTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCT
CTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTCTGGAGCTCTTGGTGAGGAGTGGCATTAAGAT
AAAGGGGCAACGAGCAGTTGTAGTAGGTCGGAGTAACATTGTTGGTTTGCCCGTTTCGCT
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CTATCATAAAGGAGCTGGCATCGTTATTGCTGCAGCTGGACAGCCTGCATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY28TF U 9
AF RR4CD66TF U 1
BS 1 344 RR4CD66TF
BS 345 345 RR4DY28TF
BS 346 358 RR4CD66TF
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BS 360 469 RR4CD66TF
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RD RR4DY28TF 600 0 0
GG
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CGAGCAGTTGTAGTAGGTCGGAGTAACATTGTTGGTTTGCCCGTTTCGCTTCTATTGC

QA 3 600 3 600
DS 

RD RR4CD66TF 713 0 0
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TGATCAAACGGCGAAGATAATCGATGGAAAGGCGATTGCTCATACCATCCGATCAGAGAT
CGCCGAGGAAGTTCGCCTTTTATCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTTGT
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TGAGGTTGGGATCAAGTCATTTGATGTTGACCTACCTGAAGATGTTCCTGAAGCTGATCT
TATTACCAAAGTTCATCAACTCAATTCAGATCCCCAAGTCCATGGCATATTAGTTCAATT
CCCATTGCCGAAACATATCAATGAGGAGAACGTTCTGGGTGCTATCAGCATTGATAAAGA
CGTTGATGGATTCCATCCTTTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCGGAGAACCCCT
CTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTGGAGCTCTTGGTGAGGAGTGGCATTAAGAT
AAAGGGGCAACGAGCAGTTGTAGTAGGTCGGAGTAACATTGTTGGTTTGCCCGTTTCGCT
TCTATTGCTCAAGCTGATGCTACTGTTACAACCGTACATTCTCACACCAAAGATCCCGAG
CTATCATAAAGGAGCTGGCATCGTTATTGCTGCAGCTGGACAGCCTGCATGAT

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL1029Contig2 1516 4 8 U
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CTGTCTATTTTGTACAGTCTAGGAAGTAAGCCTCTTCAGATATGGGACAAAGAAGTTGAG
GATGGACATGTGAAGCGTTGCCATGATGATGACATACAGTCCAATATACTTGAAGTAGTT
GGATCAAACATACAGTCTACATACATCACATGCCCCGCTGATCTTTCCGCAACTCTTGGT
ATCAAACTACCCTTTCTGGTATTGGTTGTGAAGAACATGAAGAAGTATTTCTCATTCGAG
ATTCAGATCCTTGATGACAAGAATGTGCGTAGGCGTTTCCGAGCTTCTAACTTTCAATAT
GTGACTAGAGTAAAGCCATATATATGCACAATGCCATTGAAGATGGATGAGGGATGGAAT
CAGATCCAGCTGAACTTGACTGATCTTACTAGGAGAGCTTATGGGACTAATTACGCCGAG
ACTTTGCGAGTTCAGGTTCATGCTAACTGCCATCTCAGAAGGATATATTTTGCTGATCGT
CTCTACTCGGATGAAGAGCTTCCTCCAGAGTTCAAACTCTATCTCCCAGTGCAGAAAGCA
TGAGCGAGTTCCTGCCCCCTTGTCGTGGAAGCTACTTTTAGATAGACCTAGAGCGTCTTA
GGTGAGAGTTTCAGGATGGCTTGTAGCATTCACAGCATTTGGAATTTGCCGTACCTTGAG
CAGCTTGGCTTTGATAAATTATGTTTGTTGTGTCTTTATGAAATGGGATCATATACGCTT
AAGATTTTCAATGAGTATTGTACATGACTGAATCATATCATTCATGATTGTGTGCTAATT
TTGAGGAAACAAACATTCAAATGGAATGCAAATTCAAATTTATTTGAGAGGAGTAATGCC
ACATCAAGCCGAGAACACAATTATAGATATGGGTAAACTGCAGGATCTTTTTATAACGTA
CAGAAGGATGTTTTACTGGCCAATGACCCGCTTGGCCCCTTCTAAGGTGTTCTTGAGCAG
CATTGCCACTGTCATTGGGCCTACACCACCAGGGACCGGAGTTATGAAGCCTGCAACTTT
AGAAGCTTCGGCGAAATCAACATCTCCAACCAACCGGTACCCAGATTTCCTGCTCGGGTC
GCTGACTGCGTTAGTTCCAACGTCGATCACTGCGGCCCCTGGCTTTATCCAGTCTCCCTT
GATCATGCAGGCCTGTCCAACTGCAGCAATAACGATGTCAGCTTCCTTTATGATAGCCTC
GGGATCTTTGGTGTGAGAATGTACAGTAGTAACAGTTGCATCAGCCTTGAGCAATAGAAG
CGAAACGGGCAAACCAACAATGTTACTCCGACCTACTACAACTGCTCGTTGCCCCTTTAT
CTTAATGCCACTCCTCACCAAGAGCTCCAGACATCCCTTAGGGGTGCATGGAAGGAAGAG
GGGTTCTCTGCCTTTCATGGCTAGCTTACCAATATTCAAAGGATGGAATCCATCAACGTC
TTTATCAATGCTGATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D495TF U 1
AF RR4FX78TF U 1
AF RR4D495JQ C 336
AF RR4DY28JQ U 758
BS 1 42 RR4D495TF
BS 43 43 RR4FX78TF
BS 44 308 RR4D495TF
BS 309 309 RR4FX78TF
BS 310 636 RR4D495TF
BS 637 660 RR4FX78TF
BS 661 757 RR4D495JQ
BS 758 1516 RR4DY28JQ

RD RR4D495TF 636 0 0
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CTGTCTATTTTGTACAGTCTAGGAAGTAAGCCTCTTCAGATATGGGACAAAGAAGTTGAG
GATGGACATGTGAAGCGTTGCCATGATGATGACATACAGTCCAATATACTTGAAGTAGTT
GGATCAAACATACAGTCTACATACATCACATGCCCCGCTGATCTTTCCGCAACTCTTGGT
ATCAAACTACCCTTTCTGGTATTGGTTGTGAAGAACATGAAGAAGTATTTCTCATTCGAG
ATTCAGATTCTTGATGACAAGAATGTGCGTAGGCGTTTCCGAGCTTCTAACTTTCAATAT
GTGACTAGAGTAAAGCCATATATATGCACAATGCCATTGAAGATGGATGAGGGATGGAAT
CAGATCCAGCTGAACTTGACTGATCTTACTAGGAGAGCTTATGGGACTAATTACGCCGAG
ACTTTGCGAGTTCAGGTTCATGCTAACTGCCATCTCAGAAGGATATATTTTGCTGATCGT
CTCTACTCGGATGAAGAGCTTCCTCCAGAGTTCAAACTCTATCTCCCAGTGCAGAAAGCA
TGAGCGAGTTCCTGCCCCCTTGTCGTGGAAGCTACT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FX78TF 660 0 0
CCACGAGGAGCTTCGGAGA**AGCAGGAACATGTTCAAGAACACGTTTCAGTCTGGGTTT
CTGTCTATTTTGTACAGTCTAGGAAGTAAGCCTCTTCAGATATGGGACAAAGAAGTTGAG
GATGGACATGTGAAGCGTTGCCATGATGATGACATACAGTCCAATATACTTGAAGTAGTT
GGATCAAACATACAGTCTACATACATCACATGCCCCGCTGATCTTTCCGCAACTCTTGGT
ATCAAACTACCCTTTCTGGTATTGGTTGTGAAGAACATGAAGAAGTATTTCTCATTCGAG
ATTCAGATCCTTGATGACAAGAATGTGCGTAGGCGTTTCCGAGCTTCTAACTTTCAATCT
GTGACTAGAGTAAAGCCATATATATGCACAATGCCATTGAAGATGGATGAGGGATGGAAT
CAGATCCAGCTGAACTTGACTGATCTTACTAGGAGAGCTTATGGGACTAATTATGCCGAG
ACTTTGCGAGTTCAGGTTCATGCTAACTGCCGTCTCAGAAGGATATATTTTGCTGATCAT
CTCTACTCGGATGAAGAGCTTCCTCCAGAGTTCAAACTCTATCTCCCAGTGCAGAAAGCA
TGAGCGTGTTCCTGCCCCCTTGTCGTGGAAGCTACTTTTAGATAGACCTAGAGCGTCTTA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4D495JQ 546 0 0
TTTCCGAGCTTCTAACTTTCAATATGTGACTAGAGTAAAGCCATATATATGCACAATGCC
ATTGAAGATGGATGAGGGATGGAATCAGATCCAGCTGAACTTGACTGATCTTACTAGGAG
AGCTTATGGGACTAATTACGCCGAGACTTTGCGAGTTCAGGTTCATGCTAACTGCCATCT
CAGAAGGATATATTTTGCTGATCGTCTCTACTCGGATGAAGAGCTTCCTCCAGAGTTCAA
ACTCTATCTCCCAGTGCAGAAAGCATGAGCGAGTTCCTGCCCCCTTGTCGTGGAAGCTAC
TTTTAGATAGACCTAGAGCGTCTTAGGTGAGAGTTTCAGGATGGCTTGTAGCATTCACAG
CATTTGGAATTTGCCGTACCTTGAGCAGCTTGGCTTTGATAAATTATGTTTGTTGTGTCT
TTATGAAATGGGATCATATACGCTTAAGATTTTCAATGAGTATTGTACATGACTGAATCA
TATCATTCATGATTGTGTGCTAATTTTGAGGAAACAAACATTCAAATGGAATGCAAATTC
AAATTT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4DY28JQ 759 0 0
ATGAAATGGGATCATATACGCTTAAGATTTTCAATGAGTATTGTACATGACTGAATCATA
TCATTCATGATTGTGTGCTAATTTTGAGGAAACAAACATTCAAATGGAATGCAAATTCAA
ATTTATTTGAGAGGAGTAATGCCACATCAAGCCGAGAACACAATTATAGATATGGGTAAA
CTGCAGGATCTTTTTATAACGTACAGAAGGATGTTTTACTGGCCAATGACCCGCTTGGCC
CCTTCTAAGGTGTTCTTGAGCAGCATTGCCACTGTCATTGGGCCTACACCACCAGGGACC
GGAGTTATGAAGCCTGCAACTTTAGAAGCTTCGGCGAAATCAACATCTCCAACCAACCGG
TACCCAGATTTCCTGCTCGGGTCGCTGACTGCGTTAGTTCCAACGTCGATCACTGCGGCC
CCTGGCTTTATCCAGTCTCCCTTGATCATGCAGGCCTGTCCAACTGCAGCAATAACGATG
TCAGCTTCCTTTATGATAGCCTCGGGATCTTTGGTGTGAGAATGTACAGTAGTAACAGTT
GCATCAGCCTTGAGCAATAGAAGCGAAACGGGCAAACCAACAATGTTACTCCGACCTACT
ACAACTGCTCGTTGCCCCTTTATCTTAATGCCACTCCTCACCAAGAGCTCCAGACATCCC
TTAGGGGTGCATGGAAGGAAGAGGGGTTCTCTGCCTTTCATGGCTAGCTTACCAATATTC
AAAGGATGGAATCCATCAACGTCTTTATCAATGCTGATA

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 6

CO CL1030Contig1 899 6 10 U
GGGAGCTAAACCAAAAAAGAAAATGGCAGCTTCTTCTTCTCCATCTCTACTTCTACCATT
AGGTTCATCATCTAGAAACGGTCCAACCACTAAGACTCCAAGATGTATATCTACAAGAGT
CATCATAGCTTCAGAGACAAGAGACAGAAGCTGTAAAACCAATACTCTCTCTAGCCGTAG
AGACGCAATGCTATTGTTTCTCGGCGTTTCAGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTGAGGC
TTATGCAGCCGGTTTGCCACCAGAGGATAAACCGAGGCTTTGTGAAGCAGAATGCGAGAA
AGAGCTTGAAAATGTCCCAATGGTAACTGCAGAGTCAGGGCTTCAGTATAAAGATATCAA
AGTTGGTAAAG*GCCCTAGTCCCCCTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAGCTA
TGGTTCCTTCAGGGCAGATTTTTGACAGTTCTCTAGAGAAAGGTCTACCATATCTGTTCC
GTGTTGGGTCTGGCCAGGTGATCAAGGGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAGCTG
GTGGTAAACGCAGACTCTACATTCCAGGGCCTTTGGCGTTTCCAAAGGGTCTAGTCTCAG
CTCCAGGGAGGCCAAGAGTTGCACCGAACAGTCCAGTTGTATTTGATGTGAGCTTAGAGT
ACATACCAGGGCTCGAGTCAGATGAAGAGTGAAACTATTTCTTTTTAAAGTTCAGATTAT
AATATGAAATACAACATTACTTGCTTTTATGTGATGGTGTCTCATTTTTACTTACATCTC
GTTGTAAAAAGAAACCGTCAGCTCCTTCACCATTAGGCCCCCATAGTTTCTTTTGGTTTT
CTCTAGTTGCAGAAAGATGATGATTGATGACATAAGAATCTCATCATTTTTCATAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A237TF U 100
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AF RR4DL57TF U 1
AF RR4A237JQD C 36
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AACGAGCTACTCTCTTGAGGCTTATGCAGCCGGTTTGCCACCAGAGGATAAACCGAGGCT
TTGTGAAGCA

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TGCTATTGTTTCTCGGCGTTTCAGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTGAGGCTTATGCAG
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AAG*GCCCTAGTCCCCCTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAGCTATGGTTCCT
TCAGGGCAGATTTTTGACAGTTCTCTAGAGAAAGGTCTACCATATCTGTTCCGTGTTGGG
TCTGGCCAGGTGATCAAGGGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAGCTGGTGGTAAA
CGCAGAC

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CATCATAGCTTCAGAGACAAGAGACAGAAGCTGTAAAACCAATACTCTCTCTAGCCGTAG
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AGTTGGTAAAG*GCCCTAGTCCCCCTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAGCTA
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GTGGTAAACGCAGACTCTACATTCCAGGGCCTTTGGCGTTTCCAGAGGGTCTAGTCTCAG
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ACATA

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CTCCAAGATGTATATCTACAAGAGTCATCATAGCTTCAGAGACAAGAGACAGAAGCTGTA
AAACCAATACTCTCTCTAGCCGTAGAGACGCAATGCTATTGTTTCTCGGCGTTTCAGGAC
TCTCAACGAGCTACTCTCTTGAGGCTTATGCAGCCGGTTTGCCACCAGAGGATAAACCGA
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GTTGTATTTGATGTGAGCTTAGAGTACATACCAGGGCTCGAGTCAGATGAAGAGTGAAAC
TATTTCTTTTTAAAGTTCAGATTATAATATGAAATACAACATTACTTGCTTTTATGTGAT
GGTGTCTCATTTTTACTTACATCTCGTTGTAAAAAGAAACCGTCAGCTCCTTCACCATTA
GGCCCC

QA 1 786 1 786
DS 

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GAAGCTGTAAAACCAATACTCTCTCTAGCCGTAGAGACGCAATGCTATTGTTTCTCGGCG
TTTCAGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTGAGGCTTATGCAGCCGGTTTGCCACCAGAGG
ATAAACCGAGGCTTTGTGAAGCAGAATGCGAGAAAGAGCTTGAAAATGTCCCAATGGTAA
CTGCAGAGTCAGGGCTTCAGTATAAAGATATCAAAGTTGGTAAAGAGCCCTAGTCCCCCT
GTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAGCTATGGTTCCTTCAGGGCAGATTTTTGAC
AGTTCTCTAGAGAAAGGTCTACCATATCTGTTCCGTGTTGGGTCTGGCCAGGTGATCAAG
GGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAGCTGGTGGTAAACGCAGACTCTACATTCCA
GGGCCTTTGGCGTTTCCAAAGGGTCTAGTCTCAGCTCCAGGGAGGCCAAGAGTTGCACCG
AACAGTCCAGTTGTATTTGATGTGAGCTTAGAGTACATACCAGGGCTCGAGTCAGATGAA
GAGTGAAACTATTTCTTTTTAAAGTTCAGATTATAATATGAAATACAACATTACTTGCTT
TTATGTGATGGTGTCTCATTTTTACTTACATCTCGTTGT

QA 1 699 1 699
DS 

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TTCATCATCTAGAAACGGTCCAACCACTAAGACTCCAAGATGTATATCTACAAGAGTCAT
CATAGCTTCAGAGACAAGAGACAGAAGCTGTAAAACCAATACTCTCTCTAGCCGTAGAGA
CGCAATGCTATTGTTTCTCGGCGTTTCAGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTGAGGCTTA
TGCAGCCGGTTTGCCACCAGAGGATAAACCGAGGCTTTGTGAAGCAGAATGCGAGAAAGA
GCTTGAAA*TGTCCCAATGGTAACTACAGAGTCAGGGCTTCAGTATAAAGATATCAAAGT
TGGTAAAG*GCCCTAGTCCCCCTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAGCTATGG
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TTGGGTCTGGCCAGGTGATCAAGGGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAGCTGGTG
GTAAACGCAGACTCTACATTCCAGGGCCTTTGGCGTTTCCAGAGGGTCTAGTCTCAGCTC
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TACCAGGGCTCGAGTCAGATGAAGAGTGAAACTATTTCTTTTTAAAGTTCAGATTATAAT
ATGAAATACAACATTACTTGCTTTTATGTGATGGTGTCTCATTTTTACTTACATCTCGTT
GTAAAAAGAAACCGTCAGCTCCTTCACCATTAGGCCCCCATAGTTTCTTTTGGTTTTCTC
TAGTTGCAGAAAGATGATGATTGATGACATAAGAATCTCATCATTTTTCATAGTCT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 4

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GAACCGAAAAAATTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTC
GCATTGTTGCGCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACA
ATCTAGTTAGCTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTTGTGATTAAGTAGACAAAAAAAA
GACACTTTTAAAAATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAA
GTAATGGAGTCATCTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAATCAGCCGCT
TTCTCAAACTCCACCATTTTCTCAAGTGAGTCCAAGTCTCCAGCTTCAGCAAGCGCCTGT
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TTGTCTTTTAAGCAGAAGTCAGGAAGCTCGGAAAGATAGTAAATTTTTCCAAAAAGCGTC
TGCACGGCTAGTTTTTCTCTTGAAACCTTTCTCTGTAAACCCCTGCTTATTCATCACAAC
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CTCGTTCAAACCAGAAGCTCTTCTGAGATGAATGAGATTCGCAACAAGGTCGGGATTAAA
CGGTTTCTCATTCAACGCGTAATGAATGTACTTCCGTAATATCTCCTCCATGTTAAACTC
TGTCTTTTCTTCAAGTGCCTTGAGCTCAAAGCTACTCACAGTACCTTCTCTCTGTAACAT
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GCAATTGATGAAGCTTTTTGAGCTTCGGATACGGCGACGGAGCTTTACAGAAGCCGCGCT
TCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4F257TF C 25
AF RR4CJ25JQ U 25
AF RR4H733JQB U 1
AF RR4B876TF C 510
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BS 309 842 RR4H733JQB
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QA 1 451 1 451
DS 

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TGTATGAACGACTTGTGATTAAGTAGACAAAAAAAAGACACTTTTAAAAATCTTAGTATT
GATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCATCTTCTTCATTT
GAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAATCAGCCGCTTTCTCAAACTCCACCATTTTCTCA
AGTGAGTCCAAGTCTCCAGCTTCAGCAAGCGCCTGTATCCTCAGCTTCTCTGCCTCTTCA
TCTGTAACTCCGAATATTTCCTTGACAACCAAGGAATTGTCTTTTAAGCAGAAGTCAGGA
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ACGGGAGATCTCATTTAAAACCTCAGGCATCTGAGACTCGTTCAAACCAGAAGCTCTTCT
GAGATGAAT
GAGATT

QA 1 609 1 609
DS 

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GACACTTTTAAAAATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAA
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TGCACGGCTAGTTTTTCTCTTGAAACCTTTCTCTGTAAACCCCTGCTTATTCATCACAAC
AGGACCTTTGTCTTTAACAATACCACGGGAGATCTCATTTAAAACCTCAGGCATCTGAGA
CTCGTTCAAACCAGAAGCTCTTCTGAGATGAATGAGATTCGCAACAAGGTCGGGATTAAA
CGGTTTCTCATTCAACGCGTAATGAATGTACTTCCGTAATATCTCCTCCATGTTAAACTC
TGTCTTTTCTTCAAGTGCCTTGAGCTCAAAGCTACTCACAGTACCTTCTCTCTGTAACAT
CTCGTCGATTGATCTACACAACATCGCATTCTGATTCACTAGTTTCTTGCGTTGTGCGTT
AG

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4B876TF 815 0 0
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AGATCTCATTTAAAAC*TCAGGCATCTGAGACTCGTTCAAACCAGAAGCTCTTCTGAGAT
GAATGAGATTCGCAACAAGGTCGGGATTAAACGGTTTCTCATTCAACGCGTAATGAATGT
ACTTCCGTAATATCTCCTCCATGTTAAACTCTGTCTTTTCTTCAAGTGCCTTGAGCTCAA
AGCTACTCACAGTACCTTCTCTCTGTAACATCTCGTCGATTGATCTACACAACATCGCAT
TCTGATTCACTAGTTTCTTGCGTTGTGCGTTAGGAGAAGAGAAGTTATTAACGGTTTTGA
CGACAGCAGTGGCTAAAGTGGCGCCGGCGTAAGTTAACGGGACGGCGAGCATCCACGGCA
GCTTGGTGCTTCCGACTCGGGGACCTGGAAGCGCCTGAGCCACCGAACCAGTGAACTGGG
CTAGCTCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAATGTCCAACCATTTCTTCTCC
CTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCGTCTTTCCGTCGTCAACACT
CTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTCACGGCGGAGAAGACGACTG
AGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTTGAGCGAGGAGGAAGAAGCAGAAGAGGAAA
TAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAAGAGACGCAATTGATGAAGCTTTTTGAGCTTCGGA
TACGGCGACGGAGCTTTACAGAAGCCGCGCTTCCC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 7

CO CL1032Contig1 851 7 8 U
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ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
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CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCC
ACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCA
ATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCC
AACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTT
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AATTTATGAAGATTTTTTTCTTATTCTCTCAAATCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGA
AGATACTGGGCTTTTGTATTTAAAAAATGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGG
TGGATAGAGTA


BQ
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ85JQ U 1
AF RR4AD75JQ U 1
AF RR4AD75TF C 1
AF RR4EA85JQ U 40
AF RR4BF12JQ U 1
AF RR4CM78JQ U 1
AF RR4BE25JQ U 1
BS 1 117 RR4AD75JQ
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BS 119 343 RR4AD75JQ
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A
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CTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACAG
ATGG
C

QA 2 365 2 365
DS 

RD RR4AD75JQ 619 0 0
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AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTCCCAAACCCAGAAAACA
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AACGATCTATGAACCAGCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4AD75TF 619 0 0
C
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AATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACC
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ACGATCTATGAACCAGCC

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR4EA85JQ 644 0 0
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TAAGACTCATTTTTTATCATTCAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATA
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GGATGGCTATCATAAGTGATTCCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTA
CTTTTCCAAACCCAGAAAACAGATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTT
ATGCAAACTTCTTCCGCTTGATTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTG
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TATACATATAAAATTACAGCAATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCT
ATTCCTTGGTAATCGAAGCCCAACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACG
GACAAAGTGCCCTGCATCTTTTTTATTTCCCCCACACCTTTTTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4BF12JQ 746 0 0
A
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TCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCGAAAAACGAATCGA
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CTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATTC
CTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACAG
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QA 2 746 2 746
DS 

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G
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TCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCGA
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AATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACC
CTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATTC
CTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACAG
ATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGAT
TGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCCA
CATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCAA
TAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCCA
ACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTTT
TTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAATTTAAGTCTTTCACATTTACCATGAGTTCTA
ATTTATGAAGATTTTTTTCTTATTCTCTCAAATCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGA*
GATACTGGGCTT

QA 2 793 2 793
DS 

RD RR4BE25JQ 851 0 0
A
GTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTCAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCTA
TCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCGAAAAACGAATCGA
ATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATTC
AATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACC
CTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATTC
CTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACAG
ATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGAT
TGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCCA
CATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCAA
TAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCCA
ACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTTT
TTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAATTTAAGTCTTTCACATTTACCATGAGTTCTA
ATTTATGAAGATTTTTTTCTTATTCTCTCAAATCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGAA
GATACTGGGCTTTTGTATTTAAAAAATGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGGT
GGATAGAGTA

QA 2 851 2 851
DS 



AS 1 7

CO CL1033Contig1 640 7 5 U
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CTCCCATCAATTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGC
GGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGAG
ACAGAGGATTCTCAGATTGAGCTCTTGTTAAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAG
CTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTTGCC
ATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAG
AAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTC
GAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCT
ATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCA
AGAGATTTTACACAAACATGATCCTTATATTTGCATTTCTATTTTTTGTTTTGAAAATCT
GCCTTCATGTTGAATATGACTTCCAACGAAAATAGTTACC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A905JQ C 1
AF RR4A905TF U 1
AF RR4AG36JQ C 1
AF RR4AG36TF U 1
AF RR4EF48TF U 1
AF RR4EC89TF U 10
AF RR4EC89JQ C 147
BS 1 283 RR4A905TF
BS 284 284 RR4AG36TF
BS 285 567 RR4A905TF
BS 568 579 RR4AG36TF
BS 580 640 RR4EC89TF

RD RR4A905JQ 568 0 0
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ATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAG
AAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTC
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ATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCA
AGAGATTTTACACAAACATGATCCTTA
C

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4A905TF 568 0 0
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CTCCCATCAATTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGC
GGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGAG
ACAGAGGATTCTCAGATTGAGCTCTTGTTAAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAG
CTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGATGGTGGTGGCGTTGCC
ATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAG
AAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTC
GAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCT
ATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCA
AGAGATTTTACACAAACATGATCCTTA
C

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4AG36JQ 580 0 0
GGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCATTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGATC
CTCCCATCAATTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGC
GGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGAG
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ATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAG
AAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTC
GAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCT
ATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCA
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C

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4AG36TF 580 0 0
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CTCCCATCAATTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGC
GGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGAG
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ATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAG
AAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTC
GAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCT
ATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCA
AGAGATTTTACACAAACATGATC*TTATATTTGCATTTC
C

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4EF48TF 554 0 0
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CTCCCATCAATTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGC
GGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGAG
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CTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTTGCC
ATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAG
AAAGAAGAGAAGAAAGTG***AAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTC
GAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCT
ATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAA*TTCTCA
AGAGATTTTACACA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4EC89TF 631 0 0
GG
ATTGCCGTCTTCAGAAACCCATTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGATCCTCCCATCAAT
TTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGCGGAAAAGCTTG
CCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGAGACAGAGGATTC
TCAGATTGAGCTCTTGTTAAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCTGATTGCTGT
CGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTTGCCATGGCTTCTGC
TCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGAA
GAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCGG
TATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCTATATGTTGTTG
TTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAGAGATTTTAC
ACAAACATGATCCTTATATTTGCATTTCTATTTTTTGTTTTGAAAATCTGCCTTCATGTT
GAATATGACTTCCAACGAAAATAGTTACC

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR4EC89JQ 494 0 0
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GTTAAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTT
GGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTTGCCATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGG
TGGAGGAGGTGCTGCCCCAGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGA
AGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTG
GTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCTATATGTTGTTGTTTTTTAGTTTGTTC
TCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAGAGATTTTACACAAACATGATCCTT
ATATTTGCATTTCTATTTTTTGTTTTGAAAATCTGCCTTCATGTTGAATATGACTTCCAA
CGAAAATAGTTACC

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 5

CO CL1034Contig1 1250 5 15 U
ATAGGGAAGTAGGCAACATGAATAAAAATTGATCCAATATGTCAAAGGGAGACGATAACT
CATGTTCTATTCACTTGCATTTATGCAAAGTACATTTCCCCTTTTATCAAACATCCCAAC
ATGTGGAACTAGAAAATCCATCGCCAAACAAAATGAAACAAAGAGACACATCTACTACAA
TGATAAAGCAACAAACATACTTTCGAATTAAATAAAAATAAAAAATAGAAGTGGAAAGAG
AATCATAAAAAATAATCAGGAGTCTTGCGAGTGGTATCAGGTTCGACCTGTCTGGGTGCT
GGATCAAACTGAAGGAAGTTCTGTTCCATCTTCTCTCCAATCTCAAGTATTGCTGCCATG
TTCCCACATCTGTAACAGTAGTTTGGTGCACTAAACACCGTCACTACGTTCTTCTCCTGA
CACCAATTAAAGCCTTCCATTACAAGTTGATGCGCTCTTGATATCAAACTCAGTCCATTG
TTATGATTAAACTGAGTTGCAATGTCCTGTCCAAATGTGTAACCAGCACCACGGGGAGAT
ATTCCCCAACCACAACGATCGTCTGGATAT*GTCAAGGGTGTCAAGAGAAGGTGAAAGCC
CTCCATGTAAACAGAAAACCTGACTCTCAATAAGTGCTGTAAGAGGTAGGTAATCAAAGA
GGTCCGTGAAATGCTTCCACACGTTTGCATTTCCATATTTCCTCAAGCACTCGTCATAAA
ACCCATAAAATTGTGTAATTTGGCGACTCTCATGATTCCCACGCAGGATCGTGAGTCCGT
CTCTGTAACGCACCTTCAGTGCCACCAATAGGGAGACTGTTTCTACTGAGTAGTAGCCAC
GATCAACGTAATCACCCATGAATAGATAATTAGTATAAGGCGGGTTACCACCGATACGGA
AGAGCTCGATTAGGTCATAGAACTGGCCGTGGATATCGCCGCAGACGGTAACCGGACACT
TAACCGGCTGAACGTTCCATTCCTCAACGAGAATGGCCTTGGCTTGATCGCAGAGGATCT
TCACGTCCACTTCTGCCAACGGCTTACACTCCATCAGCTGCTCGATCTGACGGTCCAGAT
CCCCGTTTGACGGCATCTCCTCCCAATCCAAACGATTGACCAACGAATCTTCGGATTCGA
ACACGGCAGTGGAAGAGGATAAAAGTCGCCGATGGTATATTTAAGAGTTGATCATCACGC
GCCGTCTCTCTCTCTCTCTCGCCGTATGCAAATGAAGATATTTATTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CF18TF C 548
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ATGTGGAACTAGAAAATCCATCGCCAAACAAAATGAAACAAAGGGACACATCTACTACAA
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AATCATAAAAAATAATCAGGAGTCTTGCGAGTGGTATCAGGTTCGACCTGTCTGGGTGCT
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CAAACCATAGTAAAT

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DS 

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ACATCTACTACAATGATACAGCAACAAACATACTTTCGAATTAAATAAAAATAAAAAATA
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CACTCGTCATAAAACCCATAAAATTGTGTAATTTGGCGACTCTCATGATTCCCAC

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DS 

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AGGTGAAAGCCCTCCATGTAAACAGAAAAC*TGACTCTCAATAAGTGCTGTAAGAGGTAG
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TTCGGATTCGAACACGGCGGTGGAAGAGGATAAAAGTCGCCGATGGTATATTTAAGAGTT
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T

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TCTCAATAAGTGCTGTAAGAGGTAGGTAATCAAAGAGGTCCGTGAAATGCTTCCACACGT
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GATAATTAGTATCAGGCGGGTTACCACCGATACGGAAGAGCTCGATTAGGTCATAGAACT
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CAACGAGAATGGCCTTGGCTTGATCGCAGAGGATCTTCACGTCCGCTTCTGCCAACGGCT
TACACTCCATCAGCTGCTCGATCTGACGGTCCAGATCCCCGTTTGACGGCATCTCCTCCC
AATCCAAACGATTGACCAACGAATCTTCGGATTCGAACACGGCAGTGGAAGAGGATAAAA
GTCGCCGATGGTATATTTAAGAGTTGATCATCACGCGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCGCCG
TATGCAAATGAAGAT
CCCT

QA 18 692 18 692
DS 



AS 2 7

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AACAAATGATGCCAGTGACTATCTTTGGTACATGACTAGGGTTCATCTGGACAAGAAAGA
TCCAATTTGGAGCAGAAACATGTCGCTAAGAGTTCATAGCAACGCTCATGTTCTTCATGC
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ATGGGACTACAAGATTGGTTTGCATGGATTCAACCATAAACTTTTCAACATTAAATCTGC
TGGTCACCGCAATCTTAAATGGTCAAACGAAAAGTTACCAGCTGATCGTATGCTGTCATG
GTACAAGGCAAATTTCAAGGCTCCTCTTGGTAAAGATCCAGTGATTGTTGACTTGAATGG
CCTCGGAAAAGGAGAGGTTTGGATCAACGGTCGGAGCATCGGACGTTACTGGCCAAGCTT
TAACTCTAGTGATGATGGTTGCACCAACGAATGTGACTACCGTGGGGAGTATGGTAGTGA
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CTTGAATAATAAGGGACACAACACTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTC
AATGGTGAAGTTCAAGACGGTTGTTACCGGAAGAGTTTGTGCCAAGGTTCATGAGCACAA
CAAAGTGGAGTTGTCTTGCAATAACCGGCCAATTTCAGCCGTCAAATTCGCAAGTTTCGG
AAATCCGTCTGGCCTTTGTGGGTCATTCGCGGCTGGTACATGCGAAGGAGCCAATGATGC
TGTGAAGATCGTGGCTAAAGAGTGTGTTGGAAAGCTAAACTGCACTATGAATGTGTCTTC
CCCCAAGTTTGGATCTGCTTTGGACTGTGGGGATTCACCTAAAAGGTTGTTTGTGGGAGT
TGAGTGCTAGATTAGATCTGTGTCTCTAGGCTATCTAGCTAGTGATTGCAATAATTTTCT
TAAATAATTTAGATAGCTTTCTGGTTGGACTATGTTTCTTGTTTTTTTTTTTGATTTATC
ATAATCTTTTAGATGGAGGATGTAAGGTTGTGGAAATAAATTTTAAGATCTAATAAAAAA
AAATATCTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AU36TF U 1
AF RR4AX16TF U 1
AF RR4FX02TF U 244
AF RR4AX16JQ C 610
AF RR4AU36JQ C 684
BS 1 744 RR4AU36TF
BS 745 745 RR4AX16TF
BS 746 785 RR4AU36TF
BS 786 794 RR4AX16TF
BS 795 795 RR4FX02TF
BS 796 838 RR4AX16TF
BS 839 945 RR4FX02TF
BS 946 946 RR4AX16JQ
BS 947 962 RR4FX02TF
BS 963 963 RR4AX16JQ
BS 964 1002 RR4FX02TF
BS 1003 1116 RR4AX16JQ
BS 1117 1117 RR4AU36JQ
BS 1118 1165 RR4AX16JQ
BS 1166 1166 RR4AU36JQ
BS 1167 1329 RR4AX16JQ

RD RR4AU36TF 788 0 0
GACTATTCTTAAAAGCAGTGGAGACCTCATTGCCAAGGGTCTTGTAGACCAAAAAGACGT
AACAAATGATGCCAGTGACTATCTTTGGTACATGACTAGGGTTCATCTGGACAAGAAAGA
TCCAATTTGGAGCAGAAACATGTCGCTAAGAGTTCATAGCAACGCTCATGTTCTTCATGC
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CGTTGGACTTCAGAATTATGGACCATTCTTTGAAAGCGGTCCAACTGGAATCAATGGTCC
TGTGAAATTAGTTGGATACAAAGGAGAAGAAACAATCGAGAAAGATATATCGAAGCATCA
ATGGGACTACAAGATTGGTTTGCATGGATTCAACCATAAACTTTTCAACATTAAATCTGC
TGGTCACCGCAATCTTAAATGGTCAAACGAAAAGTTACCAGCTGATCGTATGCTGTCATG
GTACAAGGCAAATTTCAAGGCTCCTCTTGGTAAAGATCCAGTGATTGTTGACTTGAATGG
CCTCGGAAAAGGAGAGGTTTGGATCAACGGTCGGAGCATCGGACGTTACTGGCCAAGCTT
TAACTCTAGTGATGATGGTTGCACCAACGAATGTGACTACCGTGGGGAGTATGGTAGTGA
CAAATGTGTTTTTATGTGCGGCAA*CCAACTCAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTT
CTTGA
TAT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4AX16TF 838 0 0
GACTATTCTTAAAAGCAGTGGAGACCTCATTGCCAAGGGTCTTGTAGACCAAAAAGACGT
AACAAATGATGCCAGTGACTATCTTTGGTACATGACTAGGGTTCATCTGGACAAGAAAGA
TCCAATTTGGAGCAGAAACATGTCGCTAAGAGTTCATAGCAACGCTCATGTTCTTCATGC
TTACGTAAATGGAAAATACGTAGGTCACCAAATCGTGAGGGACAATAAATTCGATTACAG
ATTTGAGAAGAAGGTCAACCTCGTTCACGGGACTAATCACCTTGCACTTCTCAGCGTTTC
CGTTGGACTTCAGAATTATGGACCATTCTTTGAAAGCGGTCCAACTGGAATCAATGGTCC
TGTGAAATTAGTTGGATACAAAGGAGAAGAAACAATCGAGAAAGATATATCGAAGCATCA
ATGGGACTACAAGATTGGTTTGCATGGATTCAACCATAAACTTTTCAACATTAAATCTGC
TGGTCACCGCAATCTTAAATGGTCAAACGAAAAGTTACCAGCTGATCGTATGCTGTCATG
GTACAAGGCAAATTTCAAGGCTCCTCTTGGTAAAGATCCAGTGATTGTTGACTTGAATGG
CCTCGGAAAAGGAGAGGTTTGGATCAACGGTCGGAGCATCGGACGTTACTGGCCAAGCTT
TAACTCTAGTGATGATGGTTGCACCAACGAATGTGACTACCGTGGGGAGTATGGTAGTGA
CAAATGTGTTTTTATGTGCGGCAAACCAACTCAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTT
CTTGAATAATAAGG*ACACAACACTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4FX02TF 759 0 0
G
GAGAAGAAGGTCAACCTCGTTCACGGGACTAATCACCTTGCACTTCTCAGCGTTTCCGTT
GGACTTCAGAATTATGGACCATTCTTTGAGAGCGGTCCAACTGGAATCAATGGTCCTGTG
AAATTAGTTGGATACAAAGGAGAAGAAACAATCGAGAAAGATATATCGAAGCATCAATGG
GACTACAAGATTGGTTTGCATGGATTCAACCATAAACTTTTCAACATTAAATCTGCTGGT
CACCGCAATCTTAAATGGTCAAACGAAAAGTTACCAGCTGATCGTATGCTGTCATGGTAC
AAGGCAAATTTCAAGGCTCCTCTTGGTAAAGATCCAGTGATTGTTGACTTGAATGGCCTC
GGAAAAGGAGAGGTTTGGATCAACGGTCGGAGCATCGGACGTTACTGGCCAAGCTTTAAC
TCTAGTGATGATGGTTGCACCAACGAATGTGACTACCGTGGGGAGTATGGTAGTGACAAA
TGTGTTTTTATGTGCGGCAAACCGACTCAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTTCTTG
AATAATAAGGGACACAACACTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTCAATG
GTGAAGTTCAAGACGGTTGTTACCGGAAGAGTTTGTGCCAAGGTTCATGAGCACAACAAA
GTGGAGTTGTCTTGCAATAACCGGCCAATTTCAGCCGTCAA*TTCGCAAGTTTCGGAA*T
CCGTCTGGCCTTTGTGGGTCATTCGCGGCTGGTACATG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4AX16JQ 720 0 0
AGGAGAGGTTTGGATCAACGGTCGGAGCATCGGACGTTACTGGCCAAGCTTTAACTCTAG
TGATGATGGTTGCACCAACGAATGTGACTACCGTGGGGAGTATGGTAGTGACAAATGTGT
TTTTATGTGCGGCAAACCAACTCAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTTCTTGAATAA
TAAGGGACACAACACTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTCAATGGTGAA
GTTCAAGACGGTTGTTACCGGAAGAGTTTGTGCCAAGGTTCATGAGCACAACAAAGTGGA
GTTGTCTTGCAATAACCGGCCAATTTCAGCCGTCAAATTCGCAAGTTTCGGAAATCCGTC
TGGCCTTTGTGGGTCATTCGCGGCTGGTACATGCGAAGGAGCCAATGATGCTGTGAAGAT
CGTGGCTAAAGAGTGTGTTGGAAAGCTAAACTGCACTATGAATGTGTCTTCCCCCAAGTT
TGGATCTGCTTTGGACTGTGGGGATTCCCCTAAAAGGTTGTTTGTGGGAGTTGAGTGCTA
GATTAGATCTGTGTCTTTAGGCTATCTAGCTAGTGATTGCAATAATTTTCTTAAATAATT
TAGATAGCTTTCTGGTTGGACTATGTTTCTTGTTTTTTTTTTTGATTTATCATAATCTTT
TAGATGGAGGATGTAAGGTTGTGGAAATAAATTTTAAGATCTAATAAAAAAAAATATCTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AU36JQ 646 0 0
CCAACGAATGTGACTACCGTGGGGAGTATGGTAGTGACAAATGTGTTTTTATGTGCGGCA
AACCAACTCAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTTCTTGAATAATAAGGGACACAACA
CTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTCAATGGTGAAGTTCAAGACGGTTG
TTACCGGAAGAGTTTGTGCCAAGGTTCATGAGCACAACAAAGTGGAGTTGTCTTGCAATA
ACCGGCCAATTTCAGCCGTCAAATTCGCAAGTTTCGGAAATCCGTCTGGCCTTTGTGGGT
CATTCGCGGCTGGTACATGCGAAGGAGCCAATGATGCTGTGAAGATCGTGGCTAAAGAGT
GTGTTGGAAAGCTAAACTGCACTATGAATGTGTCTTCCCCCAAGTTTGGATCTGCTTTGG
ACTGTGGGGATTCACCTAAAAGGTTGTTTGTGGGAGTTGAGTGCTAGATTAGATCTGTGT
CTCTAGGCTATCTAGCTAGTGATTGCAATAATTTTCTTAAATAATTTAGATAGCTTTCTG
GTTGGACTATGTTTCTTGTTTTTTTTTTTGATTTATCATAATCTTTTAGATGGAGGATGT
AAGGTTGTGGAAATAAATTTTAAGATCTAATAAAAAAAAATATCTT

QA 1 646 1 646
DS 



CO CL1035Contig2 587 2 2 U
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CTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTCAATGGTGAAGTTCAAGACGGTTG
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ACCGGCCAATTTCAGCCGTCAAATTCGCAAGTTTCGGAAATCCGTCTGGTCTTTGTGGGT
CATTCGCGGCTGGTACATGCGAAGGAGCCAATGATGTTGTGAAGATCGTGGCTAAAGAGT
GTGTTGGAAAACTAAACTGCACTATGAATGTGTCTTCCCACAAGTTTGGATCTGCTTTGG
ACTGTGGGGATTCACCTAAAAGGTTGTTTGTGGAAGTTGAGTGCTAGATTAGATCGGTGT
CTCTAGGCTATCTAGCTAGTGATTGCAATAATTCTCTTAAATAATTTAGATAGCTTTCTG
GTTAAACTATGTTTCTTGTTCTTTCTTTGATTCATCATAATCTTTTAGATGGATCGGATG
TAAGGTTGTGGAAATAAATTTTAAGATTTAATAAAAAAAAATATCTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FB59JQ C 1
AF RR4FB59TF U 1
BS 1 1 RR4FB59JQ
BS 2 587 RR4FB59TF

RD RR4FB59JQ 587 0 0
GACCAACACAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTTCTTGAATGATAAGGGACACAACA
CTATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTCAATGGTGAAGTTCAAGACGGTTG
TTACCGGAAGAGTTTGTGCCAAGGTTCATGAGCACAACAAAGTGGAGTTGTCTTGCAATA
ACCGGCCAATTTCAGCCGTCAAATTCGCAAGTTTCGGAAATCCGTCTGGTCTTTGTGGGT
CATTCGCGGCTGGTACATGCGAAGGAGCCAATGATGTTGTGAAGATCGTGGCTAAAGAGT
GTGTTGGAAAACTAAACTGCACTATGAATGTGTCTTCCCACAAGTTTGGATTTGCTTTGG
ACTGTGGGGATTCACCTAAAAGGTTGTTTGTGGAAGTTGAGTGCTAGATTAGATCGGTGT
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GTTAAACTATGTTTCTTGTTCTTTCTTTGATTCATCATAATCTTTTAGATGGATCGGATG
TAAGGTTGTGGAAATAAATTTTAAGATTTAATAAAAAAAAATATCTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4FB59TF 587 0 0
G
ACCAACACAAAGATGGTACCATGTTCCACGAGCCTTCTTGAATGATAAGGGACACAACAC
TATCACACTATTCGAAGAGATGGGTGGTGACCCCTCAATGGTGAAGTTCAAGACGGTTGT
TACCGGAAGAGTTTGTGCCAAGGTTCATGAGCACAACAAAGTGGAGTTGTCTTGCAATAA
CCGGCCAATTTCAGCCGTCAAATTCGCAAGTTTCGGAAATCCGTCTGGTCTTTGTGGGTC
ATTCGCGGCTGGTACATGCGAAGGAGCCAATGATGTTGTGAAGATCGTGGCTAAAGAGTG
TGTTGGAAAACTAAACTGCACTATGAATGTGTCTTCCCACAAGTTTGGATCTGCTTTGGA
CTGTGGGGATTCACCTAAAAGGTTGTTTGTGGAAGTTGAGTGCTAGATTAGATCGGTGTC
TCTAGGCTATCTAGCTAGTGATTGCAATAATTCTCTTAAATAATTTAGATAGCTTTCTGG
TTAAACTATGTTTCTTGTTCTTTCTTTGATTCATCATAATCTTTTAGATGGATCGGATGT
AAGGTTGTGGAAATAAATTTTAAGATTTAATAAAAAAAAATATCTT

QA 2 587 2 587
DS 



AS 1 3

CO CL1036Contig1 919 3 6 U
GGAAGTTCGTCGATTAGAGAGACTACCGTCGCTACTTCGCCGCGGATTCTTCACCGCCGG
AATCAGTAGATCTACCTTCTCACAGCTTCGAATTCGACTATTTCTTCCTCCTGATATCTA
TCTGGGAACACAATGGTATATCACT*GAGCTTTGTGGAAGAAGAAGGGATAACAAAGGCA
TGTGGATGTCCTCTGCTTCCTCTTAAGAGCCATATCAAGGGCCCTGCACCTGTCTCAGAA
CAAGATAGAACTGATATTGTGGATGAGGCAATCACCTTCTTCCGCGCCAACGTCTTCTTC
ACCAACTTCCCTATCAAAAGCCCTGCTGATAAGCTCCTTATTTACTTGACCTTCTACATA
AACGTGGCCTTGAAGAGGCTCGAAGGGTGTAGAACGCTGGCTGTTGGAACTAAGGCGATT
ATCAACTTGGGTTTAGAGGATATCCCTGTTCCTGGGGAAGCTGGCTTTCCATTTCCAGGT
CTCTTTTCACTTCCTTCGTCTCAGGAAGAAGCAGAGCTTTTCAGGAACTATTTGAAGCAG
GTTCGGGGGAGACTAGTGGTAGGCTACTGAGTGTAGCGTATAGAGCTAATGGGACGCCGA
ACAAATGGTGGCTTGCATTCGCTAAGAGGAAATTCATCAACGTGGTTCTCCTCTGATCAA
CAGATCGTCATCAAAGCCCATTACAAATGAAGGGTTCCCGTCATGAGCATTGCACCCTTT
AGCTTCCTCTTGCCTATGTGCGCTTAACCATCGGGACCAGGAATACGAAAATTTTATATT
ATAGAAGAAAGCTTTCTCCCTGTCTCTCTATATACATAATATAAACATAAGTGTGTGTGA
CAGACTGACAGTGTAGTATTTTCATACGACTGTTTGGTGATACAAGATCATAGTTAATGA
GAATATTTCTTTTGTTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ24TF U 1
AF RR4DY36TF U 1
AF RR4DY36JQ C 117
BS 1 20 RR4DY36TF
BS 21 22 RR4GZ24TF
BS 23 91 RR4DY36TF
BS 92 92 RR4GZ24TF
BS 93 623 RR4DY36TF
BS 624 919 RR4DY36JQ

RD RR4GZ24TF 536 0 0
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TGTGGATGTCCTCTCCTTCCTCTTAAGAGCCATATCAAGGGCCCTGCACCTGTTTCTGAA
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ATCAACTTGGGTTTAGAGGATATCCCCGTTCCTGGGGAAGCTGGGTTTCCATTTCCAGGT
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QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4DY36TF 623 0 0
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AATCAGTAGATCTACCTTCTCACAGCTTCGA*TTCGACTATTTCTTCCTCCTGATATCTA
TCTGGGAACACAATGGTATATCACT*GAGCTTTGTGGAAGAAGAAGGGATAACAAAGGCA
TGTGGATGTCCTCTGCTTCCTCTTAAGAGCCATATCAAGGGCCCTGCACCTGTCTCAGAA
CAAGATAGAACTGATATTGTGGATGAGGCAATCACCTTCTTCCGCGCCAACGTCTTCTTC
ACCAACTTCCCTATCAAAAGCCCTGCTGATAAGCTCCTTATTTACTTGACCTTCTACATA
AACGTGGCCTTGAAGAGGCTCGAAGGGTGTAGAACGCTGGCTGTTGGAACTAAGGCGATT
ATCAACTTGGGTTTAGAGGATATCCCTGTTCCTGGGGAAGCTGGCTTTCCATTTCCAGGT
CTCTTTTCACTTCCTTCGTCTCAGGAAGAAGCAGAGCTTTTCAGGAACTATTTGAAGCAG
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ACAAATGGTGGCTTGCATTCGCT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4DY36JQ 803 0 0
ATCTATCT
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ATAGAACTGATATTGTGGATGAGGCAATCACCTTCTTCCGCGCCAACGTCTTCTTCACCA
ACTTCCCTATCAAAAGCCCTGCTGATAAGCTCCTTATTTACTTGACCTTCTACATAAACG
TGGCCTTGAAGAGGCTCGAAGGGTGTAGAACGCTGGCTGTTGGAACTAAGGCGATTATCA
ACTTGGGTTTAGAGGATATCCCTGTTCCTGGGGAAGCTGGCTTTCCATTTCCAGGTCTCT
TTTCACTTCCTTCGTCTCAGGAAGAAGCAGAGCTTTTCAGGAACTATTTGAAGCAGGTTC
GGGGGAGACTAGTGGTAGGCTACTGAGTGTAGCGTATAGAGCTAATGGGACGCCGAACAA
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TCGTCATCAAAGCCCATTACAAATGAAGGGTTCCCGTCATGAGCATTGCACCCTTTAGCT
TCCTCTTGCCTATGTGCGCTTAACCATCGGGACCAGGAATACGAAAATTTTATATTATAG
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CTGACAGTGTAGTATTTTCATACGACTGTTTGGTGATACAAGATCATAGTTAATGAGAAT
ATTTCTTTTGTTATC

QA 9 803 9 803
DS 



AS 1 7

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BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW82JQ U 1
AF RR4BX03JQ U 1
AF RR4GA03JQ U 96
AF RR4BW34JQ U 1
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DS 

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DS 

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CTCTCTGTTATCCTTAAAATGTCTTTACCAATGAGGAAGATTCCAAGCAGCATTGCGGGA
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QA 1 357 1 357
DS 

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CAGCA

QA 1 543 1 543
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TACCAATGAGGAAAATTCCAAGCAGCATTGCGGGAACTGGAATGAAAAATTCAAGGTAAA
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CACCCAGTCCCGGGGTTCTGGATGGATCCCTCACGAAAGCTCCATGGCCCTTGGGAGATG
AGGCAGCAAGATAAGCATGGTGAATCAAGT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 7

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CTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTGCAAGGCGGTAACGTACCAGCGAACTGCTGCAACGG
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CATCAAAAACGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTC
TCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGA
CAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTCCAAGAACTAAATAA
GAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTT*GCTACTAGCTACGTTAATTT*GTGATGT
ATCGTCACTCCTATGTTTTTT*GAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCATTTTCTAAG


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 10 10 

AF RR4E771TF U 1
AF RR4BE35JQ C -9
AF RR4DI29TF U -9
AF RR4BE35TF U -9
AF RR4AB78JQ C -3
AF RR4AB78TF U 274
AF RR4FS14TF U 223
BS 1 204 RR4E771TF
BS 205 205 RR4DI29TF
BS 206 221 RR4E771TF
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BS 223 534 RR4E771TF
BS 535 537 RR4BE35TF
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CATCAAAAACGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTC
TCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGA
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ATCGTCACTCCTATGTTTTTT*GAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCATTTT

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CCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGT
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C

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CCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGT
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QA 15 538 15 538
DS 

RD RR4BE35TF 548 0 0
GGACCAACAACAAA
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CCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGT
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C

QA 15 547 15 547
DS 

RD RR4AB78JQ 543 0 0
GGACCAAC
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CTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTGGAGATCTCTAC
CCTTGCCTCTCCTACGTTGTGCAAGGCGGAAACGTCCCAACGAACTGCTGCAACGGTATC
AGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGTTGCATC
AAGAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTCTCTG
CCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGT
ATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAATAAGAAG
TCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTT*GCTACTAGCTACGTTAATTT*GTGATGTATCG
TCACTCCTATGTTTTTT*GAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCATTTTCTAAG

QA 9 543 9 543
DS 

RD RR4AB78TF 266 0 0
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CTACTAGCTACGTTAATTTTGTGATGTATCGTCACTCCTATGTTTTTT*GAAAGTTATAA
TAAATTATCAACATGCATTTTCTA
AG

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DS 

RD RR4FS14TF 317 0 0
G
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CTCAACAATGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGC
CCTTCCACCAATTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTA
CT**AAGAACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTT*GCTACTAGCTA
CGTTAATTT*GTGATGTATCGTCACTCCTATGTTTTTT*GAAAGTTATAATAAATTATCA
ACATGCATTTTCTA
TG

QA 2 315 2 315
DS 



AS 2 6

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CTTAAAGAGTTGTTTGTAGAGAAGCAGGCGTACTAACAAATATTTATCTCTAGACAACGA
TTCAACACACATTGAAGAGTAAAATAACCTTTTAGGCACAAATTCTATGACCTGCGGTCC
AGAATCAGTCAGGCATACACTAATGAACCATCTTCCTAGTAGCAATATCCGGATGTTGTT
CAGTCTTCGTAGTAGAGCTTCTTCACAACTCCCTCAAGAACACCATCTGCACCAAAATTA
CCGCTGAAATCTTCGTTGCTGACAGGACCGGGAAGCTGGAAAGAGATGGTGAAGTGGCCT
GGAGGGCATAAGTTTTGCGATAGCATCTTGAACACCTGATTGTGTTTGCACACTGTCTTC
TCTCCCGTGGTTGTTACTCCTTTGATCAGAATCTTGCCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTG
AACTCCTTTTCATCTCTTGAAACACCAGGGAGTGAAACACGAAAATAGTAAGAGTCATCG
GATTCAGCAATATCAACCAAACCAATAGTTGGTCCGACCTTCCCCATGGCTGCACTTCCC
GTGAGGGCAACTCCGGTTTTTGATTGAGAGATTAGGCTATAAAGCTCTGGAGTTGATTCG
GAAGGTAGAAATATCATTGCTGGAGGTCCTGTTTTCTCCGCAGTCTCGTTGGCCTTGTTA
CCAGACATGGATGAATTACCATTTAATGGACCGACGTAAGGCAAACTGTTCAACGGAGCA
ACTTCAAGGACTTGTGGAAAACCGTTGCTCTCTCTCATCTCGTTTTGACCACTTGAAGAC
CGTAGACAAAAACACCAAATAATTGAAAAAATCGAAGAAGGATTTTTTGTCGAGAGGTAA
CAACAGGAAGCGGAGATGCTTTTCATAAAAAAAATAACAGACCAAACCTTGGATGCTACT
CAGAGATGGAGATAAGGTAAAGAGATGGACAAACGGCGGAGAAAAATGGAGAAGCGACGG
AGGAAAAGGAGAGAGAATCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD77JQ U 5
AF RR4FA54JQ U 1
AF RR4D733TF C 400
BS 1 756 RR4FA54JQ
BS 757 1040 RR4D733TF

RD RR4FD77JQ 570 0 0
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CAGCAATATCAACCAAACCAATAGTTGGTC

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DS 

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CTTAAAGAGTTGTTTGTAGAGAAGCAGGCGTACTAACAAATATTTATCTCTAGACAACGA
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CAGTCTTCGTAGTAGAGCTTCTTCACAACTCCCTCAAGAACACCATCTGCACCAAAATTA
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TCTCCCGTGGTTGTTACTCCTTTGATCAGAATCTTGCCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTG
AACTCCTTTTCATCTCTTGAAACACCAGGGAGTGAAACACGAAAATAGTAAGAGTCATCG
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QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4D733TF 641 0 0
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TCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTTCTTTTCATCTCTTGAAACACCAGGGAGTGAAACA
CGAAAATAGTAAGAGTCATCGGATTCAGCAATATCAACCAAACCAATAGTTGGTCCGACC
TTCCCCATGGCTGCACTTCCCGTGAGGGCAACTCCGGTTTTTGATTGAGAGATTAGGCTA
TAAAGCTCTGGAGTTGATTCGGAAGGTAGAAATATCATTGCTGGAGGTCCTGTTTTCTCC
GCAGTCTCGTTGGCCTTGTTACCAGACATGGATGAATTACCATTTAATGGACCGACGTAA
GGCAAACTGTTCAACGGAGCAACTTCAAGGACTTGTGGAAAACCGTTGCTCTCTCTCATC
TCGTTTTGACCACTTGAAGACCGTAGACAAAAACACCAAATAATTGAAAAAATCGAAGAA
GGATTTTTTGTCGAGAGGTAACAACAGGAAGCGGAGATGCTTTTCATAAAAAAAATAACA
GACCAAACCTTGGATGCTACTCAGAGATGGAGATAAGGTAAAGAGATGGACAAACGGCGG
AGAAAAATGGAGAAGCGACGGAGGAAAAGGAGAGAGAATCT

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL1039Contig2 705 3 3 U
TTTTTCTCCGCCGTTTGTCCATCTCTTTACCTTATCTCCATCTCTGAGTAGCATCCAAGG
TCTTCAAGTGGTCAAAACGAGATGAGAGAGAGCAACGGTTTTCCACAAGTCCTTGAAGTT
GCTCCGTTGAACAGTTTGCCTTACGTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCCATGTCTGGT
AACAAGGCCAAC***GAGACTGCGGAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCT
TCCGAATCAACTCCAGAGCTTTATAGCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTC
ACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAA
TCCGATGACTCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAG
TTCAGCTGCGAAATAGAACCAGACGGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGA
GAGAAGACAGTGTGCAAACACAATCAGGTGTTCAAGATGCTATCGCAAAACTTATGCCCT
CCAGGCCACTTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGC
GGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTTCTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGAC
TGAACAACATCCAGATATTTGCTATTAGGAAGATGGTTCATTAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA54TF U 1
AF RR4FD77TF U 1
AF RR4GB72TF U 1
BS 1 612 RR4FA54TF
BS 613 666 RR4FD77TF
BS 667 705 RR4GB72TF

RD RR4FA54TF 612 0 0
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TCCGAATCAACTCCAGAGCTTTATAGCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTC
ACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAA
TCCGATGACTCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAG
TTCAGCTGCGAAATAGAACCAGACGGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGA
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CCAGGCCACTTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGC
GGTAATTTTGGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4FD77TF 682 0 0
TTTTTCTCCGCCGTTTGTCCATCTCTTTACCTTATCTCCATCTCTGAGTAGCATCCAAGG
TCTTCAAGTGGTCAAAACGAGATGAGAGAGAGCAACGGTTTTCCACAAGTCCTTGAAGTT
GCTCCGTTGAACAGTTTGCCTTACGTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCCATGTCTGGT
AACAAGGCCAAC***GAGACTGCGGAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCT
TCCGAATCAACTCCAGAGCTTTATAGCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTC
ACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAA
TCCGATGACTCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAG
TTCAGCTGCGAAATAGAACCAGACGGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGA
GAGAAGACAGTGTGCAAACACAATCAGGTGTTCAAGATGCTATCGCAAAACTTATGCCCT
CCAGGCCACTTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGC
GGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTTCTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGAC
TGAACA
CATCCGGATATTGCTA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4GB72TF 705 0 0
TTTTTCTCCGCCGTTTGTCCATCTCTTTACCTTATCTCCATCTCTGAGTAGCATCCAAGG
TCTTCAAGTGGTCAAAACGAGATGAGAGAGAGCAACGGTTTTCCACAAGTCCTCGAAGTT
GCTCCGTTGAACAGTTTGCCTTACGTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCCATGTCTGGT
AACAAGGCCAACAACGATACTGCGGAGAAAACAGTACCTCCAGCAATGATATTTCTACCT
TCTGAATCAACTCCAGAGCTTTATAGCCTGATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTC
ACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAA
TCCGATGACTCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAG
TTCAGCTGCGAAATAGAACCAGACGGTAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGA
GAGAAGACAGTGTGCAA*CACAATCAGGTGTTCAAGATGCTATCGCAAAACTTATGCCCT
CCAGGCCACTTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGC
GGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTTCTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGAC
TGAACAACATCCAGATATTTGCTATTAGGAAGATGGTTCATTAGT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 6

CO CL1040Contig1 490 6 3 U
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CTCTAGGTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGAGGTATAACATACAAAGGAGTCACTGTT
CACACTCCCAAGACATGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTT
TGGATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGGCACCCGTGG
GATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCATCACTAGGTCTCGTCGAACCTTCGAAGA
TCTTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTTTCCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAA
ATAAAGATAACTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTG
CTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTC
TACAAATGAA


BQ
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR4BD29JQ C 1
AF RR4BV14JQ C 1
AF RR4BV14TF U 1
AF RR4BD29TF U 1
AF RR4AP48JQ C 0
AF RR4AP48TF U 0
BS 1 47 RR4BV14TF
BS 48 48 RR4BD29TF
BS 49 490 RR4BV14TF

RD RR4BD29JQ 490 0 0
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CACACTCCCAAGACATGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTT
TGGATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCAAGGGATGGAGGCACCCGTGG
GATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCGTCACTAGGTCTCGTCGAACCTTCGAAGA
TCTTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTT*CCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAA
ATAAAGATAACTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTG
CTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTC
TACAAATGAA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4BV14JQ 490 0 0
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CTCTAGGTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGAGGTATAACATACAAAGGAGTCACTGTT
CACACTCCCAAGACATGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTT
TGGATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGGCACCCGTGG
GATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCATCACTAGGTCTCGTCGAACCTTCGAAGA
TCTTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTTTCCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAA
ATAAAGATAACTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTG
CTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTC
TACAAATGAA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4BV14TF 490 0 0
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CACACTCCCAAGACATGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTT
TGGATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGGCACCCGTGG
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TCTTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTTTCCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAA
ATAAAGATAACTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTG
CTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTC
TACAAATGAA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4BD29TF 490 0 0
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CTCTAGGTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGAGGTATAACATACAAAGGAGTCACTGTT
CACACTCCCAAGACATGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTT
TGGATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCAAGGGATGGAGGCACCCGTGG
GATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCGTCACTAGGTCTCGTCGAACCTTCGAAGA
TCTTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTT*CCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAA
ATAAAGATAACTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTG
CTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTC
TACAAATGAA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4AP48JQ 491 0 0
GGC
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GATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGGCACCCGTGGGA
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TTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTTTCCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAAAT
AAAGATAACTGTGAAATAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTGCT
GCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTCTA
CAAATGAA

QA 4 491 4 491
DS 

RD RR4AP48TF 491 0 0
GGC
AGGTAGGATTGTGAAATCGGAGAGAGAGAGTCTGAAAATTGCAGTGCGAATCGGGAATCT
CTAGGTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGATGTATAACATACAAAGGAGTCACTGTTCA
CACTCCCAAGACATGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTTTG
GATTTTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGGCACCCGTGGGA
TGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCATCACTAGGTCTCGTCGAACCTTCGAAGATC
TTGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTTTTCCTTCTTTTCAGCTTCAGTATGTCGAAAT
AAAGATAACTGTGAAATAAGACATCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTGCT
GCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCGTTGATGTTTTTTACGTCTA
CAAATGAA

QA 4 491 4 491
DS 



AS 2 7

CO CL1041Contig1 807 3 8 U
GGATAATCATTTTTGACGTTTGAATTATTAATAGCTAGTAATTAAGTTAAGGAGAAGATT
AATACAACCGCGTTTAAAAACATTGGAAATTAGGAGATAGTAAAGCATTTCGATATAGGC
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TCACAAAGGCTGCCTTCCACGATGGTTTACACCAGGGAGGGGACCCATGATTTTTCTTGC
GTTCCTTAGAAAGAACATTACTCTTCATTGGCAACAGTCTCGACTCATCAGTTTTCAACA
TCTCATCAGGTGGTGGAACAGAGGTTTGTGATCCGTTCTCCAATATAGCAAGCACAAGTT
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AAACAGACTTGCACAGATAATCTAAAGAGGGCCTTGGAAGCTTTCCGAGGACGATACCAC
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TTAAAGCTTTGAGATCCTTGTTCAGAAGGTGACCGACCATTATAGTTTCAGTAGGAAATA
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GAGAATCGAGTCCGGTAATACTAGTCCTGTAGTTAATGACTGGCTGATTTGGTTTGACAA
GCACACCAAGAATCACCTTGAGACTGCGGTCAACAGCAGCAACTCTAACAGCAGCTTCAG
TGTTATCTTGACAGAGACCTTCTCGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F417JQ U 1
AF RR4CH62JQ U 1
AF RR4ET88JQ U 14
BS 1 122 RR4CH62JQ
BS 123 123 RR4F417JQ
BS 124 589 RR4CH62JQ
BS 590 590 RR4ET88JQ
BS 591 725 RR4CH62JQ
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BS 727 758 RR4CH62JQ
BS 759 807 RR4ET88JQ

RD RR4F417JQ 561 0 0
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TCACAAAGGCTGCCTTCCACGATGGTTTACACCAGGGAGGGGACCCATGATTTTTCTTGC
GTTCCTTAGAAAGAACATTACTCTTCATTGGCAACAGTCTCGACTCATCAGTTTTCAACA
TCTCATCAGGTGGTGGAACAGAGGTTTGTGATCCGTTCTCCAATATAGCAAGCACAAGTT
TCATTGAAGCTATAGCTTCATGAACACATCTGCCAGGAGAATTCGGTATTTCGTATCCCA
AAACAGACTTGCACAGATAATCTAAAGAGGGCCTTGGAAGCTTTCCGAGGACGATACCAC
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TTAAAGCTTTGAGATCCTTGT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4CH62JQ 758 0 0
GGATAATCATTTTTGACGTTTGAATTATTAATAGCTAGTAATTAAGTTAAGGAGAAGATT
AATACAACCGCGTTTAAAAACATTGGAAATTAGGAGATAGTAAAGCATTTCGATATAGGC
CCCCTGGCTCTTTTCACAGTTATTTTATGAGTTTATTCTTCACTTGTTGAACCCTGGCTC
TCACAAAGGCTGCCTTCCACGATGGTTTACACCAGGGAGGGGACCCATGATTTTTCTTGC
GTTCCTTAGAAAGAACATTACTCTTCATTGGCAACAGTCTCGACTCATCAGTTTTCAACA
TCTCATCAGGTGGTGGAACAGAGGTTTGTGATCCGTTCTCCAATATAGCAAGCACAAGTT
TCATTGAAGCTATAGCTTCATGAACACATCTGCCAGGAGAATTCGGTATTTCGTATCCCA
AAACAGACTTGCACAGATAATCTAAAGAGGGCCTTGGAAGCTTTCCGAGGACGATACCAC
ATCCAGAGAAATCATACTTGAACAAAAGTGAGGTATCGATAACTCTTGCATGATCCATCT
TTAAAGCTTTGAGATCCTTGTTCAGAAGGTGACCGACCATTATAGTTTCCGTAGGAAATA
ATCCCAGCATTTTTTCCTGTATATCTGACAAAGGAGTAGAATTTGATAGATGAAGAAGAC
GAGAATCGAGTCCGGTAATACTAGTCCTGTAGTTAATGACTGGCTGATTTGGTTTGACAA
GCACATCAAGAATCACCTTGAGACTGCGGTCAACAGCA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4ET88JQ 794 0 0
A
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TAAAAACATTGGAAATTAGGAGATAGTAAAGCATTTCGATATAGGCCCTCTGGCTCTTTT
CACAGTTATTTTATGAGTTTATTCTTCACTTGTTGAACCCTGGCTCTCACAAAGGCTGCC
TTCCACGATGGTTTACACCAGGGAGGGGACCCATGATTTTTCTTGCGTTCCTTAGAAAGA
ACATTACTCTTCATTGGCAACAGTCTCGACTCATCAGTTTTCAACATCTCATCAGGTGGT
GGAACAGAGGTTTGTGATCCGTTCTCCAATATAGCAAGCACAAGTTTCATTGAAGCTATA
GCTTCATGAACACATCTGCCAGGAGAATTCGGTATTTCGTATCCCAAAACAGACTTGCAC
AGATAATCTAAAGAGGGCCTTGGAAGCTTTCCGAGGACGATACCACATCCAGAGAAATCA
TACTTGAACAAAAGTGAGGTATCGATAACTCTTGCATGATCCATCTTTAAAGCTTTGAGA
TCCTTGTTCAGAAGGTGACCGACCATTATAGTTTCAGTAGGAAATAATCCCAGCATTTTT
TCCTGTATATCTGACAAAGGAGTAGAATTTGATAGATGAAGAAGACGAGAATCGAGTCCG
GTAATACTAGTCCTGTAGTTAATGACTGGCTGATTTGGTTTGACAAGCACACCAAGAATC
ACCTTGAGACTGCGGTCAACAGCAGCAACTCTAACAGCAGCTTCAGTGTTATCTTGACAG
AGACCTTCTCGCA

QA 2 794 2 794
DS 



CO CL1041Contig2 796 4 12 U
GGAACATCTTCTATTCTAGGTTTTGCGCCGCTGGGAGGAGCTTTTAGGTTATGGAGAACA
TAATAGCCACAAGGGAGAGGAAGGAGTTGGTAATGCTGACGAAAATTGTGCAACGTAACG
GTTTGTCAGGGGAGCACGGAACATGGAATGAATTTCTAAAATTTTACGACCCAAAAAGCG
CTCATATTATCTTTGATCCCGATTCACGACCAGACCATGCCTTGATCCAATTCCTTACTT
CAATCACCAAGAAAGACGATTCGAGGGAATTGGCTTTGATTATGAATCCCAGCCGTCCTC
TTGTTTCCGACTACTCATACAAATACCGGAACGAGACAGCTGAGCAGAGACTAGTTAGAA
AGACGCTTACACATGAGGAGTACCCATTCGACTATTTGATCCCGTATAACTCCAAGGACT
GGGTCCTTACCGGGATCATAGGGAGCCCACATATTGAACCTGTTTGCCGACACGCACCAA
TTATTTCCTATGATTTCCGCTCAACTATGCCTTTGGGTATTAGTCTTACCAAAACCGAGA
TGATTGCCGTTTGTTGCGAGAAGGTTCTCTGTCAAGATAACACTGAAGCTGCTGTTAGAG
TTGCTGCTGTTGACCGCAGTCTCAAGGTGATTCTTGATGTGCTTGTCAAACCAAATCAGC
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GGTCGGTCACTTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET88TF U 54
AF RR4F417TF U 68
AF RR4EV40TF U 1
AF RR4CH62TF U 346
BS 1 324 RR4EV40TF
BS 325 325 RR4ET88TF
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BS 678 688 RR4EV40TF
BS 689 796 RR4CH62TF

RD RR4ET88TF 389 0 0
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CGTAACGGTTTGTCAGGGGAGCACGGAACATGGAATGAATTTCTAAAATTTTACGACCCA
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CTTACTTCAACCACCAAGAAAGACGATTCGAGGGAATTGGCTTTGATTATGAATCCCAGC
CGTCCTCTTGTTTCCGACTACTCATACAAATACCGGAACGAGACAGCTGAGCAGAGACTA
GTTAGAAAGACGCTTACACATGAGGAGTACCCATTCGACTATTTGATCCCGTATAACTCC
AAGGACTGGGTCCTTACCGGGGTCATAGG

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4F417TF 554 0 0
G
ACAAGGGAGAGGAAGGAGTTGGTAATGCTGACGAAAATTGTGCAACGTAACGGTTTGTCA
GGGGAGCACGGAACATGGAATGAATTTCTAAAATTTTACGACCCAAAAAGCGCTCATATT
ATCTTTGATCCCGATTCACGACCAGACCATGCCTTGATCCAATTCCTTACTTCAATCACC
AAGAAAGACGATTCGAGGGAATTGGCTTTGATTATGAATCCCAGCCGTCCTCTTGTTTCC
GACTACTCATACAAATACCGGAACGAGACAGCTGAGCAGAGACTAGTTAGAAAGACGCTT
ACACATGAGGAGTACCCATTCGACTATTTGATCCCGTATAACTCCAAGGACTGGGTCCTT
ACCGGGATCATAGGGAGCCCACATATTGAACCTGTTTGCCGACACGCACCAATTATTTCC
TATGATTTCCGCTCAACTATGCCTTTGGGTATTAGTCTTACCAAAACCTAGATGATTGCC
GTTTGTTGCGAGAAGGTTCTCTGTCAAGATAACACTGAAGCTGCTGTTAGAGTTGCTGCT
GTTGACCGCAGTC

QA 2 554 2 554
DS 

RD RR4EV40TF 694 0 0
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TAATAGCCACAAGGGAGAGGAAGGAGTTGGTAATGCTGACGAAAATTGTGCAACGTAACG
GTTTGTCAGGGGAGCACGGAACATGGAATGAATTTCTAAAATTTTACGACCCAAAAAGCG
CTCATATTATCTTTGATCCCGATTCACGACCAGACCATGCCTTGATCCAATTCCTTACTT
CAATCACCAAGAAAGACGATTCGAGGGAATTGGCTTTGATTATGAATCCCAGCCGTCCTC
TTGTTTCCGACTACTCATACAAATCCCGGAACGAGACAGCTGAGCAGAGACTAGTTAGAA
AGACGCTTACACATGAGGAGTACCCATTCGACTATTTGATCCCGTATAACTCCAAGGACT
GGGTCCTTACCGGGATCATAGGGAGCCCACATATTGAACCTGTTTGCCGACACGCACCAA
TTATTTCCTATGATTTCCGCTCAACTATGCCTTTGGGTATTAGTCTTACCAAAACCGAGA
TGATTGCCGTTTGTTGCGAGAAAGTTCTCTGTCAAGATAACACTGAAGCTGCTGTTAGAG
TTGCTGCTGTTGACCGCAGTCTCAAG*TGATTCTTGATGTGCTTGTCAAACCAAATCAGC
CAGTCATTA*CTACAG*ACTAGTATTAC
GGACTC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4CH62TF 451 0 0
AGAGACTAGTTAGAAAGACGCTTACACATGAGGAGTACCCATTCGACTATTTGATCCCGT
ATAACTCCAAGGACTGGGTCCTTACCGGGATCATAGGGAGCCCACATATTGAACCTGTTT
GCCGACACGCACCAATTATTTCCTATGATTTCCGCTCAACTATGCCTTTGGGTATTAGTC
TTACCAAAACCGAGATGATTGCCGTTTGTTGCGAGAAGGTTCTCTGTCAAGATAACACTG
AAGCTGCTGTTAGAGTTGCTGCTGTTGACCGCAGTCTCAAGGTGATTCTTGATGTGCTTG
TCAAACCAAATCAGCCAGTCATTAACTACAGGACTAGTATTACCGGACTCGATTCTCGTC
TTCTTCATCTATCAAATTCTACTCCTTTGTCAGATATACAGGAAAAATGCTGGGATTATT
CCTACGAAACTATATGGTCGGTCACTTCTGA

QA 1 451 1 451
DS 



AS 2 6

CO CL1042Contig1 659 4 10 U
GGGAGAAGGTGCAAAATGACGAAGAACTTTCGGACAAGAGATCTACTCGCCACTCCTCTT
AGCCTTTGCTCAACATGATGATGGGAAGCCAATGAGTTTTGGTGCAGCATCATTCTCTGG
GATTGATTCATCCTACAGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTCTGACCCTGCAGGAACTTGA
TGATGGGAACGTGCTCCTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGATCT
TTCAGGAGTGGCAAGTGTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGAAAAAAAGATAGAGAAAGT
GACTGAGATGAGCCTATCAGCAAACCAAGAAAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTGGT
GTGGAAAGTAGAAGGCGAAGGATCTAATGAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGAGA
AATAGATCCAAGAAAGCTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTGAT
CCGCTTGGAGCGTCCACCTTCCCACTCTCACATCTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCAAG
CAAAAGCCTAAATAAATAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCATATCTCTCGTTCCT
CTTGTATTTATACTTTAGACGTTTAGTAAGTTAATAAAAAGGTGAAGTTGAGTTCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4CC83JQ C 1
AF RR4DY05JQ C 119
AF RR4DY05TF U 119
AF RR4CC83TF U 8
BS 1 7 RR4CC83JQ
BS 8 118 RR4CC83TF
BS 119 236 RR4DY05TF
BS 237 237 RR4CC83TF
BS 238 296 RR4DY05TF
BS 297 297 RR4CC83TF
BS 298 388 RR4DY05TF
BS 389 389 RR4CC83TF
BS 390 654 RR4DY05TF
BS 655 659 RR4CC83JQ

RD RR4CC83JQ 659 0 0
GGGAGAAGGTGCAAAATGACGAAGAACTTTCGGACAAGAGATCTACTCGCCACTCCTTTT
AGCCTTTGCTCAACATGATGATGGGAAGCCAATGAGTTTTGGTGCAGCATCATTTTTTGG
GATTGATTCATCCTACAGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTTTGACCCTGCAGGAACTTGA
TGATGGGAACGTGCTCCTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGATCT
TTCAGGAGTGGCAAGTGTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGGAAAAAAGATAGAGAAAGT
GACTGAGATGAGCCTATCAGCAAACCAAGAGAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTGGT
GTGGAAAGTTGAAGGCGAAGGATTTAATGAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGAGA
AATAGATCCAAGAAAGCTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTGAT
CCGCTTGGAGCGTCCACCTTCCCACTCTCACATTTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCAAG
CAAAAGCCTAAATAAATAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCATATCTCTCGTTCCT
CTTGTATTTATACTTTAGGCGTTTAGTAAGTTAATAAAAAGGTGAAGTTGAGTTCACAT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4DY05JQ 541 0 0
GGGATTGATTCATCCTACAGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTCTGACCCTGCAGGAACTT
GATGATGGGAACGTGCTCCTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGGT
CTTTCAGGAGTGGCAAGTGTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGAAAAAAAGATAGAGATA
GTGACTGAGATGAGCCTATCAGCAAACCAAGAAAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTG
GTGTGGAAAGTAGAAGGCGAAGGATCTAATTAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGA
GAAATAGATCCAAGAAAGCTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTG
ATCCGCTTGGAGCGTCCACCTTCCCACTCTCACATCTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCA
AGCAAAAGCCTAAATAAATAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCATATCTCTCGTTC
CTCTTGTATTTATACTTTAGACGTTTAGTAAGTTAATAAAAAGGTGAAGTTGAGTT
CACAT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4DY05TF 541 0 0
GGGATTGATTCATCCTACAGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTCTGACCCTGCAGGAACTT
GATGATGGGAACGTGCTCCTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGGT
CTTTCAGGAGTGGCAAGTGTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGAAAAAAAGATAGAGATA
GTGACTGAGATGAGCCTATCAGCAAACCAAGAAAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTG
GTGTGGAAAGTAGAAGGCGAAGGATCTAATTAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGA
GAAATAGATCCAAGAAAGCTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTG
ATCCGCTTGGAGCGTCCACCTTCCCACTCTCACATCTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCA
AGCAAAAGCCTAAATAAATAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCATATCTCTCGTTC
CTCTTGTATTTATACTTTAGACGTTTAGTAAGTTAATAAAAAGGTGAAGTTGAGTT
CACAT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4CC83TF 630 0 0
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GCTCAACATGATGATGGGAAGCCAATGAGTTTTGGTGCAGCATCATTCTCTGGGATTGAT
TCATCCTACAGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTCTGACCCTGCAGGAACTTGATGATGGG
AACGTGCTCCTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGATCTTTCAGGA
GTGGCAAGTGTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGGAAAAAAGATAGAGAAAGTGACTGAG
ATGAGCCTATCAGCAAACCAAGAGAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTGGTGTGGAAA
GTTGAAGGCGAAGGATCTAATGAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGAGAAATAGAT
CCAAGAAAGCTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTGATCCGCTTG
GAGCGTCCACCTTCCCACTCTCACATCTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCAAGCAAAAGC
CTAAATAAATAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCATATCTCTCGTTCCTCTTGTAT
TTATACTTTAGGCGTTTAGTAAGTTAATAA

QA 1 630 1 630
DS 



CO CL1042Contig2 768 2 8 U
GACTCCAGAGGTGTAGCGGAGAATCTAAACGAGACAGTGTGCGTTCAAAACAAGTGTACT
GGACTAACTATCCAAGGAAAATATTATTATAGAATCGATCCATCTGGAGAAGGTGCAAAA
TGGCGAAGAACTTTCGGACAAGAGATCTACTCGCCACTCCTCTTAGCCTTTGCTCAACAT
GATGATGGGAAGCCAATGAGTTTTGGTGCAGCATCATTCTCTGGGATTGATTCATCCTAC
AGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTCTGACCCTGCAGGAACTTGATGATGGGAACGTGCTC
CTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGATCTTTCAGGAGTGGCAAGT
GTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGGAAAAAAGATAGCGAAAGTGACTGAGATGAGCCTA
TCAGCAAACCAAGAAAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTGGTGTGGAAAGTAGAAGGC
GAAGGATCTAATGAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGAGAAATAGATCCAAGAAAG
CTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTGATCCGCTTGGAGCGTCCA
CCTTCCCACTCTCACATTTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCAAGTAAAGCCTAAATAAGG
AATAAGTAAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCTCATATCTCGTCCCTCCTCTTGTA
TTTCTACTTTAGACGTTTAGTAGCTTAATAAAAAGGTGAATTTGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ11TF U 1
AF RR4A075JQD C 303
BS 1 637 RR4CZ11TF
BS 638 638 RR4A075JQD
BS 639 659 RR4CZ11TF
BS 660 660 RR4A075JQD
BS 661 707 RR4CZ11TF
BS 708 708 RR4A075JQD
BS 709 729 RR4CZ11TF
BS 730 768 RR4A075JQD

RD RR4CZ11TF 743 0 0
GACTCCAGAGGTGTAGCGGAGAATCTAAACGAGACAGTGTGCGTTCAAAACAAGTGTACT
GGACTAACTATCCAAGGAAAATATTATTATAGAATCGATCCATCTGGAGAAGGTGCAAAA
TGGCGAAGAACTTTCGGACAAGAGATCTACTCGCCACTCCTCTTAGCCTTTGCTCAACAT
GATGATGGGAAGCCAATGAGTTTTGGTGCAGCATCATTCTCTGGGATTGATTCATCCTAC
AGTTTGCCAGACAATGTCGCACTTCTGACCCTGCAGGAACTTGATGATGGGAACGTGCTC
CTGCGTCTAGCTCATCTTTATGAGGTGGGAGAGGATAAAGATCTTTCAGGAGTGGCAAGT
GTGGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGGAAAAAAGATAGCGAAAGTGACTGAGATGAGCCTA
TCAGCAAACCAAGAAAGAAGCGTAATGGAGAAGAAGAGGTTGGTGTGGAAAGTAGAAGGC
GAAGGATCTAATGAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGAGGGAGAGAAATAGATCCAAGAAAG
CTAGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTGATCCGCTTGGAGCGTCCA
CCTTCCCACTCTCACATTTACAGATTCGATGCTTGAG*CTCAAGTAAAGCCTAAATAAG*
AATAAGTAAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCTCATATCTCGTTCCTCCTCTTGTA
TTTCTACTT
AGACGTTAGTACTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4A075JQD 466 0 0
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GGAACTGAAGAAGCTTTTCCCCGGAAAAAAGATAGGGAAAGTGACTGAGATGAGCCTATC
AGCAAACCAAGAAAGAAGGGTAATGGAGAAGAAGAGGTTGGTGTGGAAAGTAGAAGGGGA
AGGATTTAATGAAGAAATGAAGAATGTGAAGAGGGGGAGAGAAATAGATCCAAGAAAGCT
AGTGATGGAGCTTTACCCTATGGAGATTAGGACAGTATTGATCCGCTTGGAGCGTCCCCC
TTCCCACTCTCACATTTACAGATTCGATGCTTGAGGCTCAAGTAAAGCCTAAATAAGGAA
TAAGTAAAGTAAGTTTTCAAGAATAAAGAGTCTCTCATATCTCGTCCCTCCTCTTGTATT
TTTACTTTAGACGTTTAGTAGCTTAATAAAAAGGTGAATTTGAGTT

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 6

CO CL1043Contig1 1347 6 23 U
GGCACTTACCAAATCTAAAAATCTATTTGCAGATCAATCCAATCTCTTTCTGGCTTTTGT
GCTCCACGAACACTTTATAGAGAGAGAGGAGGGAATGGTGAAGGAGAGTGAATATTACGA
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AGCAAGGCAAGTTCATCCAGACAAGAACCCTAATGATCCTCAAGCTGCTAAAAACTTTCA
GACACTAGGTGAAGCTTACCAGGTTCTTAGCGATCCCGAGAAGCGAACTGCTTATGATAA
ATTTGGCAAAGACGGCGTTCAACAGGATGCAATGGTTGATCCTGCAGCTGTGTTTGGAAT
GCTCTTTGGCAGCGAGTTGTTTGAGGACTATATCGGCCAACTTGCTCTCGCTTCCATTGC
ATCCCTCGACGCTGAAGTAGAATCCCATGAGCCTGAGATCAGGAAAAAGTTGCTTCAAGA
CAAGATCAAAGCGATGCAAAAGGAAAGGGAAGACAAGCTTGTCACTACACTGAAGAACAA
ACTCGAACCATTCGTGGAAGGACGAACCGATGATTTTGTGAATTGGGCTACCGCTGAGGC
AAGGCGACTCTCAACTGCTGGTTTTGGGGAAGCAATGCTGCACACTGTGGGTTACATCTA
CACTAGAAAAGCTGCGAAAGAACTCGGGAAGGACAAACGTCTCATGAAAGTACCCTTCTT
AGCTGAATGGGTGCGTGACAAAGGCCACCTCATCAAATCTCAAGTCATGGCTGCTTCTGG
TGCGGTTTCGTTACTGGTGTTGCAGGACGAAGTGAGCAAGCTGAACCAGGGAGAGAACAA
AGAGGAGCATATTCAGAAGGCGATTGAAGCTAAAAAAGATGCAATGCTTCAGTCCCTTTG
GCAAATCAACGTGCTTGACATCGAATCAACCTTATCTCGTGTCTGCCAAGCGGTGCTTAA
AGATCCGAGTGTTTCAAAAGATGTTCTTCGAACTAGAGCAAGAGGGTTGAGGAAGCTCGG
AAACATTTTCCAGGGTTCTAAGAAACCATACTCTAGGGAAAATAGCTTGCGCCACGAAAA
TTCCGCCGTGAAACTTGACGCCGGAGATTCCTCGAAACCGGCGACTTAAAAGAAGAAAAC
CGAAGTTCGTATTTAATGTTAATGTGAAGTGATGGTTTCGTCTTTAAATTCCATTCCCTT
TCTTTATTGAATCTGTTTACCTTCCGTGTTGGGTTTCACAAAACTCTGGGTCGCGTGTTC
TGTAAGGTACTGTTATATATGGACATGGTTTTTTCGTGTTTTTTATAAGTTGGCCCCTCC
AATATAATAAAATTTATACTTTGGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AQ08TF U 15
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GAC

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AAAGATGCAATGCTTCAGTCCCTTTGGCAAATCAACGTGCTTGACATCGAATCA*CCTTA
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C

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GTTATATATGGACATGGTTTTTTCGTGTTTTTTATAAGTTGGCCCCTCCAATATAATAAA
ATTTATACTTTGGAAT

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DS 



AS 1 6

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TGTTTTTGTGTGACTTTCATTCTATGACTTCCTCCCTCTTTGTCTTTTTTTTCTCCTTTA
AAAACAAATATATCTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR11TF U 1
AF RR4A460TF U 28
AF RR4BZ84TF U 26
AF RR4C541JQ C 192
AF RR4BZ84JQ C 297
AF RR4A460JQ C 233
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GGGAGGGTTCGAGATGTTGATATGAAGCGTGACTTTGCCTTTGTCGATTTTAGCGATCCC
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CGAGAGATATCTTCAAGCAGAGGAGGACCTCCTCCCCCAGGAAGTGGGCGTTGCTTCAAT
TGTGGTCTTGATG*ACACTGGGCTAGAGATTGCACTGCTGGTGATTGGAAGAACAAATGT
TATCGATGTGGCGATAGAGGTCACATTGAGAGGAACTGCAAGAACAGTCCCAAGAAGCTC
AAGAGGGGCCAAAGTTACTCGAGATCACCAGTTAGGTCTCGGTCACCTCCTCCTCGTCGT
AGTAGAAGAAATCGCAGCAGAAGCAGAAGCCCAAGCTACAGTCGCTCAAGATCTCCG*TT
AGGACAGAAAAGAAGCGAACTCCTGAACCAGCTGCGAGAAGCAG*AGCCCTGAACC

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GGGA
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AAGATCGTCACGGAAGCACACGACTCTATGTTGGTCACTTGTCCTCTCGAACACGGACTC
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ATGGAAGAGACGTTGACGGAAGCCGTATTGTTGTTGAATTTGCTAAAGGGACACCACGTG
GTTCTGGTTCTGGTTCTGGTTATGGTTCTCGAGAGATATCTTCAAGCAGAGGAGGACCTC
CTCCCCCAGGAAGTGAGCGTTGCTTCAACTGTGGTCTTGATGGACACTGGGCTAGAGATT
GCACTGCTGGTGATTGGAAGAACAAATGTTATCGATGTGGCGATAGAGGTCACATTGAGA
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TTAGATCTCGGTCACCTCCTCCTCGTCGTAGTAGAAGAAATCGCAGCAGAAGCAGAAGCC
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CTGCGAGAAGC

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AAGATCGTCACGGAAGCACACGACTCTATGTTGGTCACTTGTCCTCTCGAACACGGACTC
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ACTTTGCCTTTGTCGATTTTAGCGATCCCCGAGATGCTGATGATGCAAGGTACCGCTTAG
ATGGAAGAGACGTTGACGGAAGCCGTATTGTTGTTGAATTTGCTAAAGGGACACCACGTG
GTTCTGGTTCTGGTTCTGGTTATGGTTCTCGAGAGATATCTTCAAGCAGAGGAGGACCTC
CTCCCCCAGGAAGTGAGCGTTGCTTCAACTGTGGTCTTGATGGACACTGGGCTAGAGATT
GCACTGCTGGTGATTGGAAGAACAAATGTTATCGATGTGGCGATAGAGGTCACATTGAGA
GGAACTGCAAGAACAGTCCCAAGAAGCTCAAGAGGGACCAAAGTTACTCGAGATCACCAG
TTAGGTCTCGGTCACCTCCTCCTCGTCGTAGTAGAAGAAATCGCAGCAGAAGCAGAAGCC
CAAGCTACAGTCGCTCAAGATCTCCGGTTAGGACAGAAAAGAAGCGAACTCCTGAA

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CTGGGCTAGAGATTGCACTGCTGGTGATTGGAAGAACAAATGTTATCGATGTGGCGATAG
AGGTCACATTGAGAGGAACTGCAAGAACAGTCCCAAGAAGCTCAAGAGGGACCAAAGTTA
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GGGTCAGGAAAACGGCAATGGGACCAATGGACAAGACGAACCCAGTCCTAGAGACGAACC
CAGTCCCTGAGATGTAATATTATTCACAAAGAGTAAAGAAACTCTTCAAACAATTTGATC
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CATTCTATGACTTCC

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DS 

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GCTCAAGAGGGACCAAAGTTACTCGAGATCACCAGTTAGGTTTCGGTCACCTCCTCCTCG
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GAGCCCAATGCCTGAGAAGAAGGGTCAGGAAAACGGCAATGGGACCAATGGACAAGACCA
***CGGTCCTAGAGACGAACCCAGTCCCTGAGATGTAATATTATTCACAAAGAGTGAAGA
AACTCTTCAAACAATTTGATCAAACTTGCATTTATTTCTATAAGACTTGTAATGAATTTA
TTGTTGTTTTTGTGTGACTTTCATTCTATGACTTCC
TCCC

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DS 

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GCCGTATTGTTGTTGAATTTGCTAAAGGGACACCACGTGGTTCTGGTTCTGGTTCTGGTT
ATGGTTCTCGAGAGATATCTTCAAGCAGAGGAGGACCTCCTCCCCCAGGAAGTGAGCGTT
GCTTCAACTGTGGTCTTGATGGACACTGGGCTAGAGATTGCACTGCTGGTGATTGGAAGA
ACAAATGTTATCGATGTGGCGATAGAGGTCACATTGAGAGGAACTGCAAGAACAGTCCCA
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CTCGTCGTAGTAGAAGAAATCGCAGCAGAAGCAGAAGCCCAAGCTACAGTCGCTCAAGAT
CTCCGGTTAGGACAGAAAAGAAGCGAACTCCTGAACCAGCTGCGAGAAGCAGGAGCCCTG
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AAAAGAGCCCAATGCCTGAGAAGAAGGGTCAGGAAAACGGCAATGGGACCAATGGACAAG
ACCA***CAGTCCTAGAGACGAACCCAGTCCCTGAGATGTAATATTATTCACAAAGAGTG
AAGAAACTCTTCAAACAATTTGATCAAACTTGCATTTATTTCTATAAGACTTGTAATGAA
TTTATTGTTGTTTTTGTGTGACTTTCATTCTATGACTTCCTCCCTCTTTGTCTTTTTTTT
CTCCTTTAAAAACAAATATATCTTCAG

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DS 



AS 2 7

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AACAATCACCAGTCTTTTCCCACACATTTGTAAAAAGTTTTTAACTAAACAATAAAATCC
TGAGGATGCCAATCATCATCATCATCATTATCATCGATCTGTTCGTCCACAAGTAGTTTA
TATATCAACCTGAGGGATTCTACCACCAGCTTGGACGATCTGCTGCTCAAGATTGAACAA
ATCTTGAAGCTTTGCCTTTAATGACTTGTACTCAATATCCACCTGCTGCAAACATCTCAC
ACACCCTTCAAAGTTCTGAGAGTCACAACACTCCTTGAAGGTAATACAAAGACCTTTGAA
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ACAGTCTTCAAAGAAGAGAGAAACAACCTCAGCCACAAAATCAGGGCTACATTCATCTTG
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TGTGACGATGAAGCAGAGAGAAGAAAGAGATTTGAAGTTTGATATAGGAGGAAAACAAAA
TGAGAAGTTTTCTCTGAATTTTTGGACTTGAAACGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A356JQ U 214
AF RR4BO12JQ U 1
AF RR4A356JQD U 11
AF RR4A356TFB C 14
AF RR4BO12TF C 169
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BS 360 360 RR4A356JQD
BS 361 476 RR4BO12JQ
BS 477 477 RR4A356JQD
BS 478 549 RR4BO12JQ
BS 550 550 RR4A356JQD
BS 551 685 RR4BO12JQ
BS 686 739 RR4A356JQD
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QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4BO12JQ 685 0 0
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AACAATCACCAGTCTTTTCCCACACATTTGTAAAAAGTTTTTAACTAAACAATAAAATCC
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TATATCAACCTGAGGGATTCTACCACCAGCTTGGACGATCTGCTGCTCAAGATTGAACAA
ATCTTGAAGCTTTGCCTTTAATGACTTGTACTCAATATCCACCTGCTGCAAACATCTCAC
ACACCCTTCAAAGTTCTGAGAGTCACAACACTCCTT*AAGGTAATACAAAGACCTTTGAC
CCTCTTGGCACCAACACTTGAGCTACTACCTTTGAGTTGATGAACACTAGAACCTACCAG
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CAGCTTTTT*CAATTCAGTGAACTGATCATCCAGAAACCCCTGGTGATAGAGAGAGATGG
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QA 1 685 1 685
DS 

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TTT
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CTTTTCCCACACATTTGTAAAAAGTTTTTAACTAAACAATAAAATCCTGAGGATGCCAAT
CATCATCATCATCATTATCATCGATCTGTTCGTCCACAAGTAGTTTATATATCAACCTGA
GGGATTCTACCACCAGCTTGGACGATCTGCTGCTCAAGATTGAACAAATCTTGAAGCTTT
GCCTTTAATGACTTGTACTCAATATCCACCTGCTGCAAACATCTCACACACCCTTCAAAG
TTCTGAGAGTCACAACACTCCTTGAAGGTAATACAAAGACCTTTGAACCTCTTGGCACCA
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TTTCCTGTCTGATCTAGAGCTCTAGCCATGTTACCGATAAGCTTCTCACAGTCTTCAAAG
AAGAGAGAAACAACCTCAGCCACAAAATCAGGGCTACATTCATCTTGCAGCTTTTTTCAA
TTCAGTGAACTGATCATCCAGAAACCCCTGGTGATAGAGAGAGATGGTGTAGTCACGGAA
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CAGAGAGAAGAAAGAGATTTGAAGTTTGATATAGGAGGAAAACAAAATGAGAAGTTTTCT
CTGAAT
CC

QA 4 729 4 729
DS 

RD RR4A356TFB 728 0 0
ATCAAACCAAAGCGATTGATAAAGTTACACGGTACTGATCTAACAACAACAATCACCAGT
CTTTTCCCACACATTTGTAAAAAGTTTTTAACTAAACAATAAAATCCTGAGGATGCCAAT
CATCATCATCATCATTATCATCGATCTGTTCGTCCACAAGTAGTTTATATATCAACCTGA
GGGATTCTACCACCAGCTTGGACGATCTGCTGCTCAAGATTGAACAAATCTTGAAGCTTT
GCCTTTAATGACTTGTACTCAATATCCACCTGCTGCAAACATCTCACACACCCTTCAAAG
TTCTGAGAGTCACAACACTCCTTGAAGGTAATACAAAGACCTTTGAACCTCTTGGCACCA
ACACTTGAGCTACTACCTTTGAGTTGATGAACACTAGAACCTACCAGACTGAAATCTACG
TTTCCTGTCTGATCTAGAGCTCTAGCCATGTTACCGATAAGCTTCTCACAGTCTTCAAAG
AAGAGAGAAACAACCTCAGCCACAAAATCAGGGCTACATTCATCTTGCAGCTTTTTTCAA
TTCAGTGAACTGATCATCCAGAAACCCCTGGTGATAGAGAGAGATGGTGTAGTCACGGAA
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CAGAGAGAAGAAAGAGATTTGAAGTTTGATATAGGAGGAAAACAAAATGAGAAGTTTTCT
CTGAAT
CC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4BO12TF 591 0 0
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CAAACATCTCACACACCCTTCAAAGTTCTGAGAGTCACAACACTCCTT*AAGGTAATACA
AAGACCTTTGACCCTCTTGGCACCAACACTTGAGCTACTACCTTTGAGTTGATGAACACT
AGAACCTACCAGACTGAAATCTACGTTTCCTGTCTGATCTAGAGCTCTAGCCATGTTACC
GATAAGCTCCTCACAGTCTTCAAAGAAGAGAGAAACAACCTCAGCCACAAAATCAGGGCT
ACATTCATCTTGCAGCTTTTT*CAATTCAGTGAACTGATCATCCAGAAACCCCTGGTGAT
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TGGTTGGTTACTTGTGACGATGAAGCAGAGAGAAGAAAGAGATTTGAAGTTTGATATAGG
AGGAAAACAAAATGAGAAGTTTTCTCTGAATTTTTGGACTTGAAACGCTCC

QA 1 591 1 591
DS 



CO CL1045Contig2 749 2 1 U
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CTCTATCACCAGGGGTTTCTGGATGATCAGTTCACTGAATTGAAAAAGCTGCAAGATGAA
TGTAGCCCTGATTTTGTGGCTGAAGTTGTTTCTCTCTTCTTTGAAGACTGTGAGAAGCTT
ATCGGTAACATGGCTCGAGCTCTAGATCAGACAGGAAACGTAGATTTCAATCTGGTTGGT
TCTAGTGTTCATCAACTCAAAGGTAGTAGCTCAAGTGTTGGTGCCAAGAGGGTCAAAGGT
CTTTGTATTACCTTCAAGGAGTGTTGTGACTCTCAGAACTTTGAAGGGTGTGTGAGATGT
TTGCAGCAGGTGGATATTGAGTACAAGTCATTGAAGGCAAAGCTTCAAGATTTGTTCAAT
CTTGAGCAGCAGGTCGTCCAAGCTGGTGGTAGAATCCCTCAGGTTGATATATAAACTACT
TGTGGACGAACAGATCGATGATAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATTTGCA
TCCTCAGGATTTTATTGTTTAGTTAAAACTTTTTACAAATGTGTGGGAAAAGACTGGTGA
TTGTTGTTGTTAGATCAGTACCGTGTAACTTTATCAATCGCTTTGGTTTGATGAACCTTG
ATCCTAATATATAATCTGAACCTTGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DH51JQ C 1
AF RR4DH51TF U 1
BS 1 749 RR4DH51TF

RD RR4DH51JQ 749 0 0
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ACCATCATGGACACACTCGTCGCTCAGTTGCAGAGACAGTTTCGTGATTACACCATTTCT
CTCTATCACCAGGGGTTTCTGGATGATCAGTTCACTGAATTGAAAAAGCTGCAAGATGAA
TGTAGCCCTGATTTTGTGGCTGAAGTTGTTTCTCTCTTCTTTGAAGACTGTGAGAAGCTT
ATCGGTAACATGGCTCGAGCTCTAGATCAGACAGGAAACGTAGATTTCAATCTGGTTGGT
TCTAGTGTTCATCAACTCAAAGGTAGTAGCTCAAGTGTTGGTGCCAAGAGGGTCAAAGGT
CTTTGTATTACCTTCAAGGAGTGTTGTGACTCTCAGAACTTTGAAGGGTGTGTGAGATGT
TTGCAGCAGGTGGATATTGAGTACAAGTCATTGAAGGCAAAGCTTCAAGATTTGTTCAAT
CTTGAGCAGCAGGTCGTCCAAGCTGGTGGTAGAATCCCTCAGGTTGATATATAAACTACT
TGTGGACGAACAGATCGATGATAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATTTGCA
TCCTCAGGATTTTATTGTTTAGTTAAAACTTTTTACAAATGTGTGGGAAAAGACTGGTGA
TTGTTGTTGTTAGATCAGTACCGTGTAACTTTATCAATCGCTTTGGTTTGATGAACCTTG
ATCCTAATATATAATCTGAACCTTGATCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4DH51TF 749 0 0
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ACCATCATGGACACACTCGTCGCTCAGTTGCAGAGACAGTTTCGTGATTACACCATTTCT
CTCTATCACCAGGGGTTTCTGGATGATCAGTTCACTGAATTGAAAAAGCTGCAAGATGAA
TGTAGCCCTGATTTTGTGGCTGAAGTTGTTTCTCTCTTCTTTGAAGACTGTGAGAAGCTT
ATCGGTAACATGGCTCGAGCTCTAGATCAGACAGGAAACGTAGATTTCAATCTGGTTGGT
TCTAGTGTTCATCAACTCAAAGGTAGTAGCTCAAGTGTTGGTGCCAAGAGGGTCAAAGGT
CTTTGTATTACCTTCAAGGAGTGTTGTGACTCTCAGAACTTTGAAGGGTGTGTGAGATGT
TTGCAGCAGGTGGATATTGAGTACAAGTCATTGAAGGCAAAGCTTCAAGATTTGTTCAAT
CTTGAGCAGCAGGTCGTCCAAGCTGGTGGTAGAATCCCTCAGGTTGATATATAAACTACT
TGTGGACGAACAGATCGATGATAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATTTGCA
TCCTCAGGATTTTATTGTTTAGTTAAAACTTTTTACAAATGTGTGGGAAAAGACTGGTGA
TTGTTGTTGTTAGATCAGTACCGTGTAACTTTATCAATCGCTTTGGTTTGATGAACCTTG
ATCCTAATATATAATCTGAACCTTGATCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 2 6

CO CL1046Contig1 1181 4 6 U
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ACTTAAAGATAACTAAGGCTAAAAGCAAGATCATAACTCTACTCCCACAAACATTAAAGA
TCAAAGGCTAAAGAAAAAA*GTCCGAGAGCCTAAAACAGCCGGATAACTTGAAAGACAAG
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AAAATCTGAAGAGCCGAACCACGCAAATTAGCATCACACCCAAGCCAGAATCCACACAAA
ACTGACCCCTGCACCCTAGAACCAAACGAACTGAAACACCCGGGACAAACACCTCCACGA
CCACATCTTCATCTAGTTGAAACAACACCTCGATCTCTTAATATTGCTTCAAACATCCAA
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GTGCCGACGACGGAGCGCCGGACACCGGAGATATTGAAACCACGGCAAACTCTCGACTTT
TTTTTTTTTTTCTCTCTCTGCTCTCGACTTTTTTCTTTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM67JQ U 2
AF RR4D976JQ U 3
AF RR4C315JQ U 1
AF RR4C315TF C 469
BS 1 786 RR4C315JQ
BS 787 787 RR4D976JQ
BS 788 847 RR4C315JQ
BS 848 848 RR4C315TF
BS 849 865 RR4C315JQ
BS 866 1181 RR4C315TF

RD RR4FM67JQ 689 0 0
C
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CGGAACTAGAACCCATAAAAGGGGAACTTAAGCCCAAACAAAAGGTAACTACCAACAAAC
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AGCAAGCGACAAAAAGGACATGAAAGACCGAAACTCATCTGAACCTCCATTCACGATGAA
AATCTGAAGAGCCGAACCACGCAAATTAGCATCACACCCAAGCCAGAATCCACACAAAAC
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GAGGATGCTAACCCTGTTCTACTCGCGAACACGTCAAGACGCCACCGCTAACACCGTTGC
TGGCACAAGACTAACAAGAACTATTTCT

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR4D976JQ 797 0 0
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CGGAACTAGAACCCATACAAGGGGAACTTAAGCCCAAACAAAAGGCGACTACCAACAAAC
TTAAAGATAACTAAGGCTAAAAGCAAGATCATAACTCTACTCCCACAAACATTAAAGATC
AAAGGCTAAAGAAAAAA*GTCCGAGAGCCTAAAACAGCCGGATAACTTGAAAGACAAGAG
AGCAAGCGACGAAAAGGACATGAAAGACCGAAACTCATCTGAACCTTTATTCACGATGAA
AATCTGAAGAGCCGAACCACGCAAATTAGCATCACACCCAAGCCAGAATCCACACAAAAC
TGACCCCTGCACCCTAGAACCAAACGAACTGAAACACCCGGGACAAACACCTCCACGACC
ACATCTTCATCTAGTTGAAACAACACCTCGATCTCTTAATATTGCTTCAAACATCCAAGA
CAAAGCCACTGAGAATTAAGAGAGAAGCAAGCAAACCGGGAACGGTCCTTATTGAAAGAT
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CGGAACAGAGACACG
TA

QA 1 795 1 795
DS 

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TCCGGAACTAGAACCCATACAAGGGGAACTTAAGCCCAAACAAAAGGCGACTACCAACAA
ACTTAAAGATAACTAAGGCTAAAAGCAAGATCATAACTCTACTCCCACAAACATTAAAGA
TCAAAGGCTAAAGAAAAAA*GTCCGAGAGCCTAAAACAGCCGGATAACTTGAAAGACAAG
AGAGCAAGCGACGAAAAGGACATGAAAGACCGAAACTCATCTGAACCTTTATTCACGATG
AAAATCTGAAGAGCCGAACCACGCAAATTAGCATCACACCCAAGCCAGAATCCACACAAA
ACTGACCCCTGCACCCTAGAACCAAACGAACTGAAACACCCGGGACAAACACCTCCACGA
CCACATCTTCATCTAGTTGAAACAACACCTCGATCTCTTAATATTGCTTCAAACATCCAA
GACAAAGCCACTGAGAATTAAGAGAGAAGCAAGCAAACCGGGAACGGTCCTTATTGAAAG
ATGCGACGAGGACTCCTTCCCGACAGGAATTGGAGAGGTGACTTAACCAACTTCAACACA
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GCTGGCACAAGACTAACAAGAACTATTTCTGAGCCCAACAAAGCTTAGTGGGGACATCCT
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ACCGGA*CAGAGACACGGTAGAAGAAAGAGAGAGCAGCTGGTATAAGAAGGACCACATGC
CAAACAA*GAGACAGACGAGAGCTA
CCGCAGACA

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4C315TF 713 0 0
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TGCTGGCACAAGACTAACAAGAACTATTTCTGAGCCCAACAAAGCTTAGTGGGGACATCC
TCTCAACTTCAAACAGAAGAAACAGTTATCGAGCTCCATTGAACCCTCTCGAACCTTCTT
TACCGGAACAGAGACACGGTAGAAGAAAGAGAGAGCAGCTGGTATAAGAAGGACCACATG
CCAAACAAAGAGACAGACGAGAGCTAACCGCAGACAACGACTAGATCCACCATCTTCCTA
GTAGTCGCAGGAAACAAACAGAAAGCTAACCCCACATCCAGATCTATCAACAACAAAATT
TTGAGATCTAGATCTGAAACTCCATGAATGACAAATCCAGATCGATAAACCGTTTTGAGA
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GGTGCCGACGACGGAGCGCCGGACACCGGAGATATTGAAACCACGGCAAACTCTCGACTT
TTTTTTTTTTTTCTCTCTCTGCTCTCGACTTTTTTCTTTTCC

QA 12 713 12 713
DS 



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AGATCTCAAAATTTTGTTGTTGATAGATCTGGATGTGGGGTTAGCTTTATGTGTGTTAAG
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GCATCTTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM67TF U 1
AF RR4EJ54TF U 46
BS 1 442 RR4FM67TF
BS 443 443 RR4EJ54TF
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RD RR4FM67TF 672 0 0
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AGAAAAAAAAAGTCGAGAGTTTGCCGTGGTTTCAATATCTCCGGTGTCCGGCGCTCCGTC
GTCGGCACCGTGGGAGTTTGCTTAGTTAGCTTGTGTCTTTAGTTATCTTGCATGGTCTTA
TTTGTGTCTTCTCAAAACGGTTTATCGATCTGGATTTGTCATTCATGGAGTTTCAGATCT
AGATCTCAAAATTTTGTTGTTGATAGATCTGGATGTGGGGTTAGCTTTATGTGTGTTAAG
ATGGTGGATCTAGTCGTTGTCTGCAGTTAGCTCTCGTCTGTCTCTTTGTTTGACCTGTGG
TCCTTCTTATACCATTTCTTCCTTCAGCTGCTCTCTCTTTCTTCTACCGTGTCTCTGTTC
CGGTAAAGAAGGTTCGAGAGGGTTCAATGGAGCTCGATAACTGTTTCTTCTGTTTGAAGT
TGAGAGGATGTCCCCACTAAGCTTTGTTGGGCTCAGAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGC
CAGCAACGGTGTTAGCGGTGGCGTCTTGACGTGTTCGCGAGTAGAACAGGGTTAGCATCC
TCGTTGTGTTGAAGTTGGTTAAGTCACCTCTCCAATTCCTGTCGGGAAGGAGTCCTCGTC
GCATCTTTCACT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4EJ54TF 620 0 0
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AAAAAAAAAGTCGAGAGTTTGCCGTGGTTTCAATATCTCCGGTGTCCGGCGCTCCGTCGT
CGGCACCGTGGGAGTTTGCTTAGTTAGCTTGTGTCTTTAGTTATCTTGCATGGTCTTATT
TGTGTCTTCTCAAAACGGTTTATCGATCTGGATTTGTCATTCATGGAGTTTCAGATCTAG
ATCTCAAAATTTTGTTGTTGATAGATCTGGATGTGGGGTTAGCTTTATGTGTGTTAAGAT
GGTGGATCTAGTCGTTGTCTGCAGTTAGCTCTCGTCTGTCTCTTTGTTTGACCTGTGGTC
CTTCTTATACCATTTCTTCCTTCAGCTGCTCTCTCTTTCTTCTACCGTGTCTCTGTTCCG
GTAAAGAAGGTTCGAGAGGGCTCAATGGAGCTCGATGACTGTTTCTTCTGTTTTAAGTTG
AGAGGATGTCCCCACTAAGCTTTGTTGGGCTCAGAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCA
GCAACGGTGTTAGCGGTGGCGTCTTGACGTGTTCGCGAGTAGAACAGGGTTAGCATCCTC
GTTGTGTTGAAGTTGGTTAAGTCACCTCTCCAATTCCTGTCGGGAAG*AGTCCTCGTCGC
ATC

QA 18 620 18 620
DS 



AS 2 7

CO CL1047Contig1 1137 5 8 U
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TTTTGATCTGCTTTGTCCTGATAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTGTACG
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TCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCGCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTG
GATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACTGAGGCTG
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CTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGCTTCATCTTTCAGCTTTACTCTT
CTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGAT
ATGGAGAAGAAGATGGTCAAAAGTACTGGATTGTGAAAAATTCGTGGGGAACTGCTTGGG
GTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGCTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTA
TTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGA
GCCTTTTATCTCTGTATGAAAAACTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FB60TF U 6
AF RR4BA36TF U 1
AF RR4BB70TF U 1
AF RR4E894TF U 5
AF RR4E894JQ C 355
BS 1 239 RR4BA36TF
BS 240 240 RR4FB60TF
BS 241 742 RR4BA36TF
BS 743 743 RR4BB70TF
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BS 756 776 RR4E894TF
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RD RR4FB60TF 707 0 0
GA
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CACAACCTTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATATGGAGG
AAAAGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGATAGACTA
CATCAACTCCCTCCACTTACCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATGACCAA
TGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAGGTTAAACAGGGA
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ATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGATCCAGAGAAGTCCAAAAA

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DS 

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TAGACTACATCAACTCCCTCCACTTACCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACA
TGACCAATGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAGGTTAA
ACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGA
GGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGT
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TCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCGCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTG
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ACTATCCATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGATCCAGAGAAGTCCAAAAACAAGATGG
TTACAATACAAAGATACACAAA
AGGTA

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DS 

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GGAAAAC
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CACAACCTTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATATGGAGG
AAAAGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGGTAGACTA
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TGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAGGTTAAACAGGGA
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ATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGATCCAGAGAAGTCCAAAA*CAAGATGGTTACAAT
ACAAAGATACACAAAG*TAGCACAGAAC

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DS 

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GGA
AAAACAAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATCATTTTGAT
CTGCTTTGTCCTGATAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTGTACGACCCAAT
CACAACCTTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATATGGAGG
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CATCAACTCCCTCCACTTACCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATGACCAA
TGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAGGTTAAACAGGGA
CCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGGAAAGA
AGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGC
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ACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCGCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAAT
GACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACTGAG*CTGACTATCC
ATACACAGCCACACAGG*TGCATGCGATCCAGAGAAGTCCAAAAACAAGATGGTTACAAT
ACAA*GATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCT

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DS 

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GGGCGTTCACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAG
TATCTCTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCGCTTTCAACAAAGGCTGCA
GCGGTGGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACTG
AGGCTGACTATCCATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGATCCAGAGAAGTCCAAAAACA
AGATGGTTACAATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCG
CTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGCTTCATCTTTCAGCTTT
ACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTG
TTGGATATGGAGAAGAAGATGGTCAAAAGTACTGGATTGTGAAAAATTCGTGGGGAACTG
CTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGCTATAGTGAAGAGACGGGTAAGT
GTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTT
TAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAAACTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATG
TGG

QA 1 783 1 783
DS 



CO CL1047Contig2 730 2 5 U
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AGTCACCGAGGCTGACTATCCATACACAGCCACACAGAGTGCATGCGACCAAGAGAAGTC
CAGAAATAAGGTGTTTACAATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTT
ACAAGCCGCTACCGCTCAATAACCAGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTT
TCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGT
GACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTG
GGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGAC
GGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCT
AGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAGATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAA
TTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAA
CATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAGATTGACTTGAACAGTG
CATTGATACTTTCTCCTAGAAGCATATTTGTTTGAGAAGCTGATTCTTATATATAACATT
AGGTTTGGCT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY77TF U 1
AF RR4CY77JQ C 1
BS 1 2 RR4CY77JQ
BS 3 697 RR4CY77TF
BS 698 698 RR4CY77JQ
BS 699 718 RR4CY77TF
BS 719 730 RR4CY77JQ

RD RR4CY77TF 718 0 0
GC
GCTGCAGCGGTGGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAG
TCACCGAGGCTGACTATCCATACACAGCCACACAGAGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCA
GAAATAAGGTGTTTACAATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTAC
AAGCCGCTACCGCTCAATAACCAGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTC
AGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGA
CTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGG
GAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGG
GTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAG
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QA 3 718 3 718
DS 

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ACAAGCCGCTACCGCTCAATAACCAGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTT
TCAGCTTTACTCTTTTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATTTCAACCATGGAGT
GACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTG
GGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGAC
GGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCT
AGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAGATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAA
TTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAA
CATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAGATTGACTTGAACAGTG
CATTGATACTTTCTCCTAGAAGCATATTTGTTTGAGAAGCTGATTCTTATATATAACATT
AGGTTTGGCT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 6

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CAATACAGGCGTGAAAAAGTACGCAGATGGAGTAATATATACTTGAAAGCAACAATATAT
CATTATCAAATACTACTTGAGAAAGAACACGGTGGTGGTGGTGCTAATTTAGACGAGGAT
TGATCCCAGATATCCTCTCATCCTCCAAGAGGGCATAAGGATCGATGTATGGTGGTGGTG
ACACTGGAGTTCTGCTTCCATCATGAACGAAATCTGCTCCAAAGTACAGGTAAAGGGCAG
AGAAGGCGCCAAGAGTTAAGACTATCAAGGGCCAAAAACCCAAGAAGAAAGTCCCTCCAG
TCGTTAGCAATATCTTAGCACGTGGAATCAATCCCTCAAGCCCTTCGCTGTTTAAGGCCA
ACGATCTCTCTCTCTGGTTTAACAAGCTCTGGTCAAATGGAGGAGTAGTAGTTGCAGTCT
TCTTAGAGCTTTCTTTACCAGTAGTTTTGATCTCATCTACATCAACTTCGTAGTCTTGAA
GCAACGAAGTAGGAGTCATACCTCGTCTCTTCAATTCTTTCATAAACAAAGATTCTGGGG
GTTCATCACCTTTTGACTGATTATCGCCGCCGTTACGAGGAGATGATGAAAAAACTCTAA
CACATCGACCAAGACGCCGAGAATCTGCTAATCTTAAAACCCTTTTTCTAGATTCCAGTT
TCACTGTAGATTTATGGCGGGAAATCGATGATACAGGAGAGTACCCACATAATTTAACAA
TCTCCAGAGAAGAAACAGCCATTG*TTTTGTTTTTGTTTCCTTTCTAACTCGAATTCTCT
TTGTCTTTTTTT*CTCAGTTGTCGGAAAGAATCATGATCCAGACGCCGCCGCAGGATAAA
TAGAGAAAGGAAACTCAGACGGCAAATATTATTCTATTTGTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B286JQ U 24
AF RR4B282JQ U 24
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DS 

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AGAACACGGTGGTGGTGGTGCTAATTTAGACGAGGATTGATCCCAGATATCCTCTCATCC
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TGAACGAAATCTGCTCCAAAGTACAGGTAAAGGGCAGAGAAGGCGCCAAGAGTTAAGACT
ATCAAGGGCCAAAAACCCAAGAAGAAAGTCCCTCCAGTCGTTAGCAATATCTTAGCACGT
GGAATCAATCCCTCAAGCCCTTCGCTGTTTAAGGCCAACGATCTCTCTCTCTGGTTTAAC
AAGCTCTGGTCAAATGGAGGAGTAGTAGTTGCAGTCTTCTTAGAGCTTTCTTTACCAGTA
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CGTCTCTTCAATTCTTTCATAAACAAAGATTCTGGGGGTTCATCACCTTTTGACTGATTA
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G*TTTTGTTTTTGTTTCCTTTCTAACTCGAATT

QA 1 813 1 813
DS 

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CATTATCAAATACTACTTGAGAAAGAACACGGTGGTGGTGGTGCTAATTTAGACGAGGAT
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TTGTCTTTTTTT
C

QA 1 852 1 852
DS 

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TAAGACTATCAAGGGCCAAAAACCCAAGAAGAAAGTCCCTCCAGTCGTTAGCAATATCTT
AGCACGTGGAATCAATCCCTCAAGCCCTTCGCTGTTTAAGGCCAACGATCTCTCTCTCTG
GTTTAACAAGCTCTGGTCAAATGGAGGAGTAGTAGTTGCAGTCTTCTTAGAGCTTTCTTT
ACCAGTAGTTTTGATCTCATCTACATCAACTTCGTAGTCTTGAAGCAACGAAGTAGGAGT
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CTGATTATCGCCGCCGTTACGAGGAGATGATGAAAAAACTCTAACACATCGACCAAGACG
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GCGGGAAATCGATGATACAGGAGAGTACCCACATAATTTAACAATCTCCAGAGAAGAAAC
AGCCATTG*TTTTGTTTTTGTTTCCTTTCTAACTCGAATTCTCTTTGTCTTTTTTT*CTC
AGTTGTCGGAAAGAATCATGATCCAGACGCCGCCGCAGGATAAATAGAGAAAGGAAACTC
AGACGGCAAATATTATTCTATTTGTTTGGCC

QA 1 751 1 751
DS 

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GCAATATCTTAGCTCGTGGAATCAATCCCTCGAGCCCTTCGCTGTTTAAGGCCAACGATC
TCTCTCTCTGGTTTAACAAGCTTTGGTCAAATGGAGGAGTAGTAGTTGCAGTCTTCTTAG
AGCTGTCTTTACCAGTAGTTTTGATCTCATCTACATCAACTTCGTAGTCTTGAAGCAACG
AAGTAGGAGTCATACCTCGTCTCTTCAATTCTTTCATGAACAAAGATTCTGGGGGTTCAT
CACCTTTTGACTGATTATCGCCGCCGTTACGAGGAGATGATGAATAAACTCTAACACATC
GACCAAGACGCCGAGAATCTGCTAATCTTAAAACCCTTTTTCTAGATTCCAGTTTCACTG
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AAGGAAACTCAGACGGCAAA

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DS 

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GACTATCAAGGGCCAAAAACCCAAGAAGAAAGTCCCTCCAGTCGTTAGCAATATCTTAGC
ACGTGGAATCAATCCCTCAAGCCCTTCGCTGTTTAAGGCCAACGATCTCTCTCTCTGGTT
TAACAAGCTCTGGTCAAATGGAGGAGTAGTAGTTGCAGTCTTCTTAGAGCTTTCTTTACC
AGTAGTTTTGATCTCATCTACATCAACTTCGTAGTCTTGAAGCAACGAAGTAGGAGTCAT
ACCTCGTCTCTTCAATTCTTTCATAAACAAAGATTCTGGGGGTTCATCACCTTTTGACTG
ATTATCGCCGCCGTTACGAGGAGATGATGAAAAAACTCTAACACATCGACCAAGACGCCG
AGAATCTGCTAATCTTAAAACCCTTTTTCTAGATTCCAGTTTCACTGTAGATTTATGGCG
GGAAATCGATGATACAGGAGAGTACCCACATAATTTAACAATCTCCAGAGAAGAAACAGC
CATTG*TTTTGTTTTTGTTTCCTTTCTAACTCGAATTCTCTTTGTCTTTTTTT*CTCAGT
TGTCGGAAAGAATCATGATCCAGACGCCGCCGCAGGATAAATAGAGAAAGGAAACTCAGA
CGGCAAATATTATTCTATTTGTTTGGCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 7

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TCTCACACTCTCGGCCTCACCAAACCCAACTCCACCGATCATCCCAAGATCTCGTTCTCC
GCGAAGGAGATCGATGTAACGGAGTGGAAGGGGGACTTGCTCGTCGTCGGCGTGACGGAG
CAAGACTTGACGAAAAACGGTGGCTCCTCGAAGTTCGAGAACCCGATCTTGAGCAAGCTC
GATGCTCACACGAGCGGACTCTTAGGTTTAGTCTCTTCCGAGGAAGATTTCACCGGTAAA
CCCGGTCAGTCAACGGTTCTCAGACTTCCCGGTTTAGCATCCAAACGGATCGGTTTGATC
GGTTTAGGAAAATCATCTCCCGCGGCTTTTCAGAGCCTTGGCGAAGGTGTAGCCACAGTG
TCGAAGGCTTCACAGTCTAGTACTGTTGCTGTTGTTCTTGCCTCACCTGAGAGTGAATCC
ATCTATGCTTCGGCTATAGCTTCAGGCGTAGTGCTGGGGCTATTCGAAGACGGGAGGTAT
AAGTCTGAGTCAAAGAAACCATCTTTGAAGTCTGTGGATATCATTGGGTTTGGAGCTGGA
TCTGAATTGGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTGAAGATGTTTCTTACGGTGTGATTTTCGGG
AGAGAGCTCATTAACTCGCCTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTTAGCTGAGGAAGCG
GCAAAAGTGGCTTCTACGTACAGTGATGTGTTTACAGCGAACATCTTGAACGAGGAGCAG
TGCAGAGAGTTGAAGATGGGATCTTATCTAGCCGTTGCTGCTGCTTCGGCTAATCCCCCT
TTCTTCATTCACCTTGTGTATAGACCTTCCGGTGGCGATGTTAAGACAAAGCTTGCTCTT
GTTGGAAAAGGATTGACCTTTGACAGTGGTGGCTACAACATTAAGACTGGACCTGGCTGC
TCCATTGAGCTCATGAAATTCGACATGGGTGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGCGAAA
GCCATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTACATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAG
AATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCCTCAAACGGAAAG
ACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGACGTTTAACACTTGCTGATGCTTTAGTG
TATGCTTGTAACCAAGGCGTTGACAAGATTGTTGACCTCGCTACGTTGACTGGAGCCTGC
GTTATTGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGATCTACACACCTAACGACGAGCTTGCAAAA
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AGCTACTGGGAGATGATGAAGTCTGGATGTGCTGATATGGTCAACACAGGTGGGCGTGCA
GGAGGTTCCATCACCGCAGCTCTCTTCTTGAAGCAGTTTGTGAGCGAGAAGGTGCAATGG
ATGCATATAGACATGGCTGGACCGGTGTGGAACGAGAAAAAGAAGTCTGGAACTGGGTTT
GGTGTTGCGACGCTTGTAGAATGGGTGCAGACGAACTCTTCTTCGTAAAGGATGAGATAA
AGTGTTTCGGGTGTCGAAGTGGGGTTGTTGGTTTTAATAAGGTTGTCAAAAGTTGTTGTG
TTTTGGATTGTCTTTTGCTTGTTCCGAACAGTAACATTATCAGATGCTGAATAAAAGAAG
TCTTTTGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4GQ64TF U 592
AF RR4B619TF U 1
AF RR4EF70TF U 596
AF RR4FL39TF U 1284
AF RR4B619JQ C 914
AF RR4EF70JQ C 923
AF RR4GQ64JQ C 923
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BS 838 861 RR4B619TF
BS 862 1215 RR4EF70TF
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BS 1217 1275 RR4EF70TF
BS 1276 1283 RR4B619JQ
BS 1284 1585 RR4FL39TF
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AAG

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GGTTTAGGAAAATCATCTCCCGCGGCTTTTCAGAGCCTTGGCGAAGGTGTAGCCACAGTG
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ATCTATGCTTCGGCTATAGCTTCAGGCGTAGTGCTGGGGCTATTCGAAGACGGGAGGTAT
AAGTCTGAGTCAAAGAAACCATCTTTGAAGTCTGTGGATATCATTGGGTTTGGAGCTGGA
TCTGAATTGGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTGAAGATGTTTCTTACGGTGTGATTTTCGGG
AGAGAGCTCATTAACTCGCCTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTTAGCTGAGGAAGCG
GCAAAAGTGGCTTCTACGTACAGTGATGTGTTTACAGCGAACATCTTGAACGAGGAGCAG
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TTCTTCATTCACCTTGTGTAT

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AAGCGGCAAAAGTGGCTTCTACGTACAGTGATGTGTTTACAGCGAACATCTTGAACGAGG
AGCAGTGCAGAGAGTTGAAGATGGGATCTTATCTAGCCGTTGCTGCTGCTTCGGCTAATC
CCCCTTTCTTCATTCACCTTGTGTATAGACCTTCCGGTGGCGATGTTAAGACAAAGCTTG
CTCTTGTTGGAAAAGGATTGACCTTTGACAGTGGTGGCTACAACATTAAGACTGGACCTG
GCTGCTCCATTGAGCTCATGAAATTCGACATGGGTGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTG
CGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTACATTTCATCGTTGCAGCCT
GTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCCTCAAACG
GAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGACGTTTAACACTTGCTGATGCTT
TAGTGTATGCTTGTAACCAAAGCGTTGACAAGATTGTTGACCTCGCTACGTTGACTGGAG
CCTGCGTTATTGCTCTTGGA
CATC

QA 1 680 1 680
DS 

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GAGTGGAGAGAAGCTGTGGAGGATGCCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGAAGTC
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CTTCTTGAAGCAGTTTGTGAGCGAGAAGGTGCAATGGATGCATATAGACATGGCTGGACC
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GG*GCAGACGAACTCTTCTTCGTAAAGGATGAGATAAAGTGTTTCGGGTGTCGAAGTGGG
GTTGTTGGTTTTAA

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DS 

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TTGA
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ATTCGACATGGGTGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAA
GCCTCCTGGTGTTGAGGTACATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAAC
TGGAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCCTCAAACGGAAAGATCATTGAGGTGAACAA
CACAGATGCTGAAGGACGTTTAACACTTGCTGATGCTTTAGTGTATGCTTGTAACCAAGG
CGTTGACAAAATTGTTGACCTCGCTACGTTGACTGGAGCCTGCGTTATTGCTCTTGGAAC
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AGAGAAGAGTGGAGAGAAGCTGTGGAGGATGCCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGAT
GAAGTCTGGATGTGCTGATATGGTCAACACAGGTGGGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGC
AGCTCTCTTCTTGAAGCAGTTTGTGAGCGAGAAGGTGCAATGGATGCATATAGACATGGC
TGGACCGGTGTGGAACGAGAAAAAGAAGTCTGGAACTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGT
AGAATGGGTGCAGACGAACTCTTCTTCGTAAAGGATGAGATAAAGTGTTTCGGGTGTCGA
AGTGGAGTTGTTGGTTTTAATAAGGTTGTCAAAAGTTGTTGTGTCTTGGATTGTCTTTTG
CTTGTTCCGAACAGTAACATTATCAGATGCTGAATAAAAGAAGTCTTTTGA
TC

QA 5 835 5 835
DS 

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GACAGTGGTGGCTAC
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CTGCTGTTCT*GGCGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTAC
ATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGATG
TCATCACAGCCTCAAACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGACGTT
TAACACTTGCTGATGCTTTAGTGTATGCTTGTAACCAAGGCGTTGACAAGATTGTTGACC
TCGCTACGTTGACTGGAGCCTGCGTTATTGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGATCTACA
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AAAAGAAGTCTGGAACTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGTAGAATGGGTGCAGACGAACT
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TAAGGTTGTCAAAAGTTGTTGTGTTTTGGATTGTCTTTTGCTTGTTCCGAACAGTAACAT
TATCAGATGCTGAATAAAAGAAGTCTTTTGATTT

QA 16 829 16 829
DS 

RD RR4GQ64JQ 829 0 0
GACAGTGGGGCTACA
ACATTAAGACTGGACCTGGCTGCTCCATTGAGCTCATGAAATTCGACATGGGTGGTTCAG
CTGCTGTTCTTGGCGCTGCGAAAGCTATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTAC
ATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGATG
TCATCACAGCCTCAAACTGAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGACGTT
TAACACTTGCTGATGCTTTAGTGTATGCTTGTAGCCAAGCCGTTGACAAGATTGTTGACC
TCGCTACGTTGACTGGAGCCTGCGTTATCGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGATCTACA
CACCTAACGACGAGCTTGCAAAAGAAGTGATTGCTGCGTCAGAGAAGAGTGGAGAGAAGC
TGTGGAGGATGCCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGAAGTCTGGATGTGCTGATA
TGGTCAACACAGGTGGGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGCAGCTCTCTTCTTGAAGCAGT
TTGTGAGCGAGAAGGTGCGATGGATGCATATAGACATGGCTGGACCGGTGTGGAACGAGA
AAAAGAAGTCTGGAACTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGTAGAATGGGTGCAGACGAACT
CTTCTTCGTAAAGGATGAGATAAAGTGCTTCGGGTGTCGAAGTGGGGTTGTTGGTTTTAA
TAAGGTTGTCAAAAGTTGTTGTGTTTTGGATTGTCTTTTGCTTGTTCCGAACAGTAACAT
TATCAGATGCTGAATAAAAGAAGTCTTTTGA
CCG

QA 16 826 16 826
DS 



AS 1 5

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GAGAATGGCGTCGTTCGATGAAGCACCACCAGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTT
CAGGACCAATTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGACC
AAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGC
TGCTAACAAGAACAAAGCTGTTGAGTGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAA
CCCAAAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGA
ACGCGCTGATCTCATCGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACCAA
CCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTTGACAAATAAAATCTCCAAAC
TATTTTTTGTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTCATCTCTATTTATATATGTTTTTGTTTTGA
GTACCAAATGTACTCCGAATACTTTCATTTTCTTAGGTTCACTCATATAAGTGCATCTAT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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ATACCTCCA*CACTCTGAGTTTGTCT

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR4AI50TF 840 0 0
GGACCAAAACC
CACAATCGTCAATCTCAGCAAAAGGAAAAACAAATACAGAAAAAGAGATGGCGACGACAA
CAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCCATCTCAGAATCTCC
GACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGTATATTC
TGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTGACAG
CAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAGTTTCTCAACATGC
TCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTACACTGGCTACTCTC
TCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGATGTTAACA
GAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCACAAGATCG
ATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAAATCGTTGCTGACGAGAAGAACC
ATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAACTACCATA
AGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGTTATGACAACACTTTGTGGA
ATGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTATGTTCGTTATTACAGAG
ACTTTGTTCTCGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATCTGCATGC
TTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGA

QA 12 840 12 840
DS 

RD RR4DH62TF 627 0 0
TCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTACAC
TGGCTACTCTCTCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCCGAAGATGGCAAAATTCTTGCTAT
GGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGC
TCACAAGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAAATCGTTGCTGA
CGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATAT
CAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGTTATGACAA
CACTTTGTGGAATGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTATGTTCG
TTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGA
GATCTGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGA
TACCTCCAACACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGATCAATTCTCCTCTCTCTACTACCTACC
AA*TTGGACCACTCATATGTATTTTGT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4DH62JQ 685 0 0
TCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTACAC
TGGCTACTCTCTCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCCGAAGATGGCAAAATTCTTGCTAT
GGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGC
TCACAAGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAAATCGTTGCTGA
CGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATAT
CAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGTTATGACAA
CACTTTGTGGAATGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTATGTTCG
TTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGA
GATCTGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGA
TACCTCCAACACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGATCAATTCTCCTCTCTCTACTACCTACC
AA*TTGGACCACTCATATGTATTTTGTTAAGGCATTGTCTTTTGTTTTTGCTTTTCTTCT
GAACAAAGAAATAATGTACCC
TACC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4AI50JQ 588 0 0
CCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTT
GCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCACAAGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCT
TCCCGTTCTTGATCAAATCGTTGCTGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATT
CGTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAA
AGTTGGTGGAGTGATTGGTTATGACAACACTTTGTGGAATGGTTCTGTCGTTGCTCCTCC
TGATGCACCGATGAGGAAGTATGTTCGTTATTACAGAGACTTTGTTCTCGAGCTTAACAA
GGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATCTGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCAC
TATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGATACCTCCAATACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGA
TCAGTTCTCCTCTCTCTACTACCTACCAAATTGGACCACTCATATGTACTTTGTTAAGGC
ATTGTCTTTTGTTTTTGCTTTTTTTCTGAACAAAGAAATAATGTACCC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4EA22JQ 622 0 0
GTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCAC
AAGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAAATCGTTGCTGACGAG
AAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCTTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAAC
TACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGTTATGACAACACT
TTGTGGAATGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTATGTTCGTTAT
TACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATC
TGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGATACC
TCCAATACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGATCAGTTCTCCTCTCTCTACTACCTACCAAAT
TGGACCACTCATATGTACTTTGTTAAGGCATTGTCTTTTGTTTTTGCTTCTCTTCTGAAC
AAAGAAATAATGTACCCTACCTTTCTTGTTTTGTTTGTTTTTCACTTATGATACAACATC
TAAAACAATATATCACTCATTT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4EA22TF 622 0 0
GTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCAC
AAGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAAATCGTTGCTGACGAG
AAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCTTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAAC
TACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGTTATGACAACACT
TTGTGGAATGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTATGTTCGTTAT
TACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATC
TGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGATACC
TCCAATACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGATCAGTTCTCCTCTCTCTACTACCTACCAAAT
TGGACCACTCATATGTACTTTGTTAAGGCATTGTCTTTTGTTTTTGCTTCTCTTCTGAAC
AAAGAAATAATGTACCCTACCTTTCTTGTTTTGTTTGTTTTTCACTTATGATACAACATC
TAAAACAATATATCACTCATTT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 2 4

CO CL1052Contig1 424 2 4 U
ATGAACTTAGATATCGAAGCAAACAAATCCCAGCAATGCATAAACTGATACATGACACAC
AAAATTAAGTATCCACAACATACAAAGACAGTGAAGCCTATATCAAACATATCACCAATA
TGAGGAGTATAAGTAAACAGCCATTCACTCGAATTGGTAGTGCTTATCAACTGCAACAAA
AACGTCCCAAGTGCAACTCATTCCTTTAGGGAAAACAACAAAGTCCCCTGCTTCGATCTC
CACGCCTTCATCGGACCCATCAGGGTACACTTTCACTTTCCCCTCTAGCAGGAAACAAGT
CTCCTTTGCATCGTAAGTCCATGGAAACTTGCTCGGAGGACAACCCCACTTGGGCCAATT
ACGAACACCTAGTTGGGTGAGTTTGGACTCGGGAGGATTCTTCTCGATAAAGATCCCTAA
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DP18JQ U 1
AF RR4DY62JQ U 35
BS 1 137 RR4DP18JQ
BS 138 138 RR4DY62JQ
BS 139 410 RR4DP18JQ
BS 411 424 RR4DY62JQ

RD RR4DP18JQ 410 0 0
ATGAACTTAGATATCGAAGCAAACAAATCCCAGCAATGCATAAACTGATACATGACACAC
AAAATTAAGTATCCACAACATACAAAGACAGTGAAGCCTATATCAAACATATCACCAATA
TGAGGAGTATAAGTAAATAGCCATTCACTCGAATTGGTAGTGCTTATCAACTGCAACAAA
AACGTCCCAAGTGCAACTCATTCCTTTAGGGAAAACAACAAAGTCCCCTGCTTCGATCTC
CACGCCTTCATCGGACCCATCAGGGTACACTTTCACTTTCCCCTCTAGCAGGAAACAAGT
CTCCTTTGCATCGTAAGTCCATGGAAACTTGCTCGGAGGACAACCCCACTTGGGCCAATT
ACGAACACCTAGTTGGGTGAGTTTGGACTCGGGAGGATTCTTCTCGATAA

QA 1 410 1 410
DS 

RD RR4DY62JQ 390 0 0
AATGCATAGACTGATACATGACACACAAAATTAAGTATCCACAACATACAAAGACAGTGA
AGCCTATATCAAACATATCATCAATATGAGGAGTATAAGTAAACAGCCATTCACTCGAAT
TGGTAGTGCTTATCAACTGCAACAGAGACGTCCCAAGTGCAACTCATTCCTTTAGGGAAA
ACAACAAAGTCCCCTGCTTCGATCTCCACGCCTTCATCGGACCCATCAGGGTACGCTTTC
ACTTTCCCCTCTAGCAGGAAACAAGTCTCCTTTGCATCGTAAGTCCATGGAAACTTGCTC
GGAGGACAACCCCACTTGGGCCAATTACGAACACCTAGTTGGGTGAGTTTGGACTCGGGA
GGATTCTTCTCGATAAAGATCCCTAATTTT

QA 1 390 1 390
DS 



CO CL1052Contig2 603 2 2 U
GGGAGAAATTAAACAAAACGAAAAAAAATAGAGAGGTATTACCAGTGAAGCGAGATGGGC
TGCATCGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACA
TCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGATTCGAGCTGAGTCAATG
GCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAA
CTAGGTGTTCGTAGTTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGACTTAC
GATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAAGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTAATGGATCC
GATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGAGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGC
ACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTGC
TTCTGCTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATATCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGA
TACTTAATTTTGTGTCATGTATCAGTATCACTCTATGCATTGCTAGGATTTGTTTGCTCC
GAT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR4F890JQ C 1
AF RR4F890TF U 1
BS 1 2 RR4F890JQ
BS 3 603 RR4F890TF

RD RR4F890JQ 603 0 0
GGGAGAAATTAAACAAAACGAAAAAAAATAGAGAGGTATTACCAGTGAAGCGAGATGGGC
TGCATCGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACA
TCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGATTCGAGCTGAGTCAATG
GCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAA
CTAGGTGTTCGTAGTTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGACTTAC
GATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAAGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTAATGGATCC
GATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGAGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGC
ACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTGC
TTCTGCTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATATCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGA
TACTTAATTTTGTGTCATGTATCAGTATCACTCTATGCATTGCTAGGATTTGTTTGCTCC
GAT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4F890TF 603 0 0
GG
GAGAAATTAAACAAAACGAAAAAAAATAGAGAGGTATTACCAGTGAAGCGAGATGGGCTG
CATCGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACATC
AAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGATTCGAGCTGAGTCAATGGC
TACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACT
AGGTGTTCGTAGTTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGA
TGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAAGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTAATGGATCCGA
TGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGAGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCAC
TTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTGCTT
CTGCTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATATCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGATA
CTTAATTTTGTGTCATGTATCAGTATCACTCTATGCATTGCTAGGATTTGTTTGCTCCGA
T

QA 3 603 3 603
DS 



AS 2 6

CO CL1053Contig1 704 2 1 U
TTAATTATTTGGGCACAAATAACAAATGTCAAACACAGTATACGTACATAGTAACTATAC
AAAAAAGAGAGGAGTTCATATAAGTTGAACAGCTGCAATAGAAGGAATTTTCTCTCTGAG
TTTCTGAGTTACTGCCACTCGTACGGTCATGACCCCAGCAGCAGGTCCTGTGATTCTTAT
CTTCACGATCGGTTCTTCAATCTCCACCAGTTCGAGGGATCCATCTGCTGTTCCGATCAA
GTAAGGCCTGATTTCTTCAAGCACCTTTTCAATGTTTTCGTCATTGAGTTCAAGGCCAAT
CTCTTCATCTGCAACTGATTCAACAGCCACTATTTCAGGGATCTTTTCCATGAGGCGACG
CTCAATACCCATCTTCATCGTCGTAACAGAACTTGGGCATGAACCACACGCTCCCTGCAG
TTTCACTCGAACAATATTGCCATCGATCTCATGCAATGCCACATTCCCACCATCAGACAT
AAGGTATGGTCTGATTTCGTCCAAAACGCTTTCAACGTTTTCCTCTGTCAAGGGTACTGC
CAAGACTGGGTCTGGGGTTGCCACTGCCTTCACAACTTGGGATCGTCGACTAGAGAGAGA
TTGAGATAATCCTGGAAATCGATTACGAGGCCTAGCTACGAGAGCAAAAGAGCGTTGGGA
GCTCAAACTCTGAGCAGAAGAAAGAAAACGAGAGAAGGAAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ09JQ U 1
AF RR4EI91JQ U 1
BS 1 704 RR4EI91JQ

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TTGCCACTGCCTTCACAACTTGGGATCGTCGACTAGAGAGAGAT

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DS 

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CTTCACGATCGGTTCTTCAATCTCCACCAGTTCGAGGGATCCATCTGCTGTTCCGATCAA
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CTCAATACCCATCTTCATCGTCGTAACAGAACTTGGGCATGAACCACACGCTCCCTGCAG
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CAAATAATTAATTTTGTTTTATTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EI91TF U 1
AF RR4FJ09TF U 1
AF RR4G030TF U 50
AF RR4G030JQ C 152
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QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4FJ09TF 775 0 0
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GCCACGAACCCTACCCCTAGAGCCTTCCTTCTCTCGTTTTCTTTCTTCTGCTCAGAGTTT
GAGCTCCCAACGCTCTTTTGCTCTCGTAGCTA***GGCCTCGTAATCGATTTCCAGGATT
ATCTCAATCTCTCTCTAGTCGAC***GATCCCAAGTTGTGAAGGCAGTGGCAACCCCAGA
CCCAGTCTTGGCAGTACCCTTGACAGAGGAAAACGTTGAAAGCGTTTTGGACGAAATCAG
ACCATACCTTATGTCTGATGGTGGGAATGTGGCATTGCATGAGATCGATGGCAATATTGT
TCGAGTGAAACTGCAGGGAGCGTGTGGTTCATGCCCAAGTTCTGTTACGACGATGAAGAT
GGGTATTGAGCGTCGCCTCATGGAAAAGATCCCTGAAATAGTGGCTGTTGAATCAGTTGC
AGATGAAGAGATTGGCCTTGAACTCAATGACGAAAACATTGAAAAGGTGCTTGAAGAAAT
CAGGCCTTACTTGATCGGAACAGCAGATGGATCCCTCGAACTGGTGGAGATTGAAGAACC
GATCGTGAAGATAAGAATCACAG*ACCTGCTGCTGGGGTCATGACCGTACGAGTGGCAGT
AACTCAGAAACTCAGAGAGAAAATTCCTTCTATTGCAGCTGTTCA*CTTATATGA

QA 1 775 1 775
DS 

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TTTCCAGGATTATCTCAATCACTCTCTAGTCGACGACGATCCCAAGTTGTAAAGGCAGTG
GCAACCCCAGACCCAATCTTGGAAGTACCCTTGACGGAGGAAAACGTTGAAAGCGTTTTG
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CGAGTGGCAGTAACTCAGAAACTCAGAGAGAAA*TTCCTTCTATTGCAGCTGTTCA*CTT
ATATGA
CTCGTCTCTTTCTT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4G030JQ 714 0 0
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CCTGAAATAGTAGCTGTTGAATCAGTTGCAGATGAAGAGACTGGCCTTGAACTCAATGAC
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GCTGGAGTCATGACCGTACGAGTGGCAGTAACTCAGAAACTCAGAGAGAAAATTCCTTCT
ATTGCAGCTGTTCAACTTATATGAACTCGTCTCTTTCTTTGTATAGTTACTATGTACAGA
TACTGTGTTTGACATTTGTTTTTTGTGCCCAAATAATTAATTTTGTTTTATTTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 7

CO CL1054Contig1 935 7 18 U
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TGTCTGAAAAAAAAAAAACAAATGGGAAGCGAAGGAGGATCAATAGTGAGGAAACCAAGG
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CAAGGTAAATCTGATGTCGACGGAATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAATTC
AACAAGGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATCGT
ATGATCAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGTTGTCT
GGGGGCTTACCAGGACTGCAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCAAG
TTTATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATGCTTAT
TCGCCTTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCT
TACGGAATCAAGCTGATAGAGTCGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCCAAAGGC
CACACGGTCCCCAGACTTGATGAGAAGAGCTTGGTGAAAGTCACGGCGTTCCTCGAGACC
ATAGAGAACCTGGTGATGATGGAGGATGAAGACAAGGGTGGTGAAGAAATCAATTGTACG
CCAATATAGAACTTATCTTATACTGCTATAAGATATAACGAATAATTCTTTATGAAATAA
TTCTTTAGAAAATAATCCGTAAAATGACTGTAAATGATTGTTAAAAGTCATTATTACCAC
ACACACAATAATAATATATATAGACATTTCATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 10 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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TATGAGAATTTTGAGAACTGTTTGGAGTACTTGGAAGATCGTATGATCAAGCTTGGTCCT
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A
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AATGATTGTTAAAAGTCATTATTACCACACACACAATAATAATATATATAGACATTTCAT
TCG

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CC

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DS 



AS 1 6

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4C036TF U 26
AF RR4AD22TF U 1
AF RR4DW35TF U 2
AF RR4DW35JQ C 7
AF RR4CZ64JQ C 41
AF RR4CZ64TF U 41
BS 1 199 RR4AD22TF
BS 200 202 RR4C036TF
BS 203 205 RR4DW35TF
BS 206 295 RR4AD22TF
BS 296 296 RR4DW35TF
BS 297 298 RR4AD22TF
BS 299 300 RR4DW35TF
BS 301 346 RR4AD22TF
BS 347 347 RR4DW35TF
BS 348 358 RR4AD22TF
BS 359 359 RR4DW35TF
BS 360 403 RR4AD22TF
BS 404 404 RR4DW35TF
BS 405 608 RR4AD22TF
BS 609 609 RR4DW35TF
BS 610 709 RR4AD22TF
BS 710 715 RR4DW35TF
BS 716 716 RR4CZ64TF
BS 717 748 RR4DW35TF
BS 749 775 RR4DW35JQ
BS 776 777 RR4CZ64JQ

RD RR4C036TF 196 0 0
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ATTCTCCTTCTCCGGTGGACGAACTCAGCAGAATCATCAAGTTTCTTCCGCAAATGGAAG
AGTTCGCGTTATCTCCTGCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
GGTCCGAAGCCTGAGAGCG

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR4AD22TF 712 0 0
CATAACGAGCGGAGAATCCATATCGCCGGAGATCGGAAGTTCAAACGGGAAGAGAAGAAA
TGGCTTCGCTCGGTTTCAACCTCGGATTCTCCTTCTCCGGTGGACGAACTCAGCAGAATC
ATCAAGTTTCTTCCGCAAATGGAAGAGTTCGCGTTATCTCCTGCAACTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCACA***AGCATCTCCGCAGGGGATTTCGACGCCTCCTGAGA
TAGAGCTCGAGTTCTTCGGTCCGAAGCCTGAGAGCGACGGGACGTATCCGAGGGATAAGA
CGAAAGCTGTGAGCGGAGAGAAGCTTCTGAGAAGCATTATGCAGGACAACAAGATCGATC
TTTACGCCACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGGAGGTGGAGGCAGCTGTGGAACTTGCA
TTGTTGAGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAACGATAGAACCGATACAGAAAACAAGT
ACCTGAAGAAAAAGCCTGAATCCTGGAGACTCGCATGCCAAACAATAGTAGGGAACAAAG
AAAACTCAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCCGCAATGGAAGAAGTGAATTCCCTCCA
TGTATGTGTAAGGGGTTCTCTATTCGTTTCATTTATCAGCTCGCGAGCCATATTTACATG
TCCCATACTGGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCATACAGCTCGATTCCAA
ATA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4DW35TF 747 0 0
GGAAC
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CGCTCGGTTTCAACCTCGGATTCTCCTTCTCCGGTGGACGAACTCAGCAGAATCATCAAG
TTTCTTCCGCAAATGGAAGAGTTCGCGTTATCTCCTGCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCCGCAGGGGATTTCGACGCCTCCTGAGATAGAGC
TCGAGTTCTTCGGTCCGAAGCCTGAGAGCGACGGGACGTATCCGAGGGAGAAAGCGAAAG
CTGTGAGCGGAGAGAAGCTTCTGAGAAGCATTATGCAGGATAACAAGATCGAGCTTTACG
CCACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGGAGGTGGAGGAAGCTGTGGAACTTGCATTGTTG
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AGAAAAAGCCTGAATCCTGGAGACTCGCATGCCAAACAATAGTAGGGAACAAAGAAAACT
CAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCCGCAATGGAAGAAGTGAATTCCCTCCATGTATG
TGCAAGGGGTTCTCTATTCGTTTCATTTACCAGCTCGCGAGCCATATTTACATGTCCCAT
ACTGGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCATACAGCTCGATTCCAACTAGAA*CTGTTTCAGC
TTTTCCTTGTAGATGGCAAAAA

QA 6 747 6 747
DS 

RD RR4DW35JQ 769 0 0
GAGCGGAGAATCCATATCGCCGGAGATCGGAAGTTCAAACGGGAAGAGAAGATATGGCTT
CGCTCGGTTTCAACCTCGGATTCTCCTTCTCCGGTGGACGAACTCAGCAGAATCATCAAG
TTTCTTCCGCAAATGGAAGAGTTCGCGTTATCTCCTGCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCCGCAGGGGATTTCGACGCCTCCTGAGATAGAGC
TCGAGTTCTTCGGTCCGAAGCCTGAGAGCGACGGGACGTATCCGAGGGAGAAAGCGAAAG
CTGTGAGCGGAGAGAAGCTTCTGAGAAGCATTATGCAGGATAACAAGATCGAGCTTTACG
CCACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGGAGGTGGAGGAAGCTGTGGAACTTGCATTGTTG
AGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAACGATAGAACCGATACAGAAAACAAGTACCTGA
AGAAAAAGCCTGAATCCTGGAGACTCGCATGCCAAACAATAGTAGGGAACAAAGAAAACT
CAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCCGCAATGGAAGAAGTGAATTCCCTCCATGTATG
TGCAAGGGGTTCTCTATTCGTTTCATTTACCAGCTCGCGAGCCATATTTACATGTCCCAT
ACTGGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCATACAGCTCGATTCCAACTAGAAACTGTTTCAGC
TTTTCCTTGTAGATGGCAAAAAAGTCACAAGTATCTTATATATATTACT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4CZ64JQ 737 0 0
GG
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GACGAACTCAGCAGAATCATCAAGTTTCTTCCGCAAATGGAAGAGTTCGCGTTATCTCCT
GCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCCGCAGGGGA
TTTCGACGCCTCCTGAGATAGAGCTCGAGTTCTTCGGTCC******TGAGAGCGACGGGA
CGTATCCGAGGGAGAAAGCGAAAGCTGTGAGCGGAGAGAAGCTTCTGAGAAGCATTATGC
AGGATAACAAGATCGAGCTTTACGCCACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGGAGGTGGAG
GAAGCTGTGGAACTTGCATTGTTGAGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAACGATAGAA
CCGATACAGAAAACAAGTACCTGAAGAAAAAGCCTGAATCCTGGAGACTCGCATGCCAAA
CAATAGTAGGGAACAAAGAAAACTCAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCCGCAATGGA
AGAAGTGAATTCCCTCCATGTATGTGCAAGGGGTTCTCTATTCGTTTCATTTATCAGCTC
GCGAGCCATATTTACATGTCCCATACTGGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCATACAGCTCG
ATTCCAACTAGAAACTGTTTCAGCTTTTCCTTGTAGATGGCAAAAAAGTCACAAGTATCT
TATATATATTACTAC

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR4CZ64TF 708 0 0
GG
AAACGGGAAGAGAAGAAATGGCTTCGCTCGGTTTCAACCTCGGATTCTCCTTCTCCGGTG
GACGAACTCAGCAGAATCATCAAGTTTCTTCCGCAAATGGAAGAGTTCGCGTTATCTCCT
GCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCCGCAGGGGA
TTTCGACGCCTCCTGAGATAGAGCTCGAGTTCTTCGGTCC******TGAGAGCGACGGGA
CGTATCCGAGGGAGAAAGCGAAAGCTGTGAGCGGAGAGAAGCTTCTGAGAAGCATTATGC
AGGATAACAAGATCGAGCTTTACGCCACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGGAGGTGGAG
GAAGCTGTGGAACTTGCATTGTTGAGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAACGATAGAA
CCGATACAGAAAACAAGTACCTGAAGAAAAAGCCTGAATCCTGGAGACTCGCATGCCAAA
CAATAGTAGGGAACAAAGAAAACTCAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCCGCAATGGA
AGAAGTGAATTCCCTCCATGTATGTGCAAGGGGTTCTCTATTCGTTTCATTTATCAGCTC
GCGAGCCATATTTACATGTCCCATACTGGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCATACAGCTCG
AT*CCAACTAGAAACTGTTTCAGCTTTTCCTTGTAGATGGCAAAAA

QA 3 708 3 708
DS 



AS 1 7

CO CL1056Contig1 967 7 14 U
GGGTTTAAGGTAAACAAAGTACAAGAAAAAAGGAATCATAATCACTTCAAATCTAAAATT
CTCATCAAAGCCTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTA
ATTTTTGGATCGGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTT
TCGTCCCTCAACATTACCAATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGGAAA
TACGTGCCAGGGGGTGTGTTCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACC
TTTGATCTGCGCAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAATTTATA
CCTCCTGCCGCCGTCTTCGTCATGCTCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCTAAGTGT
CACTCTTGCCTCGCCAAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCA
GCAACAATATGGTACGACCAATGCACTCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACC
AGAATCCTTTACGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACG
GAGATGTTCGATAAGAAGAAGAGCGCTTTCACCAAAAAGCTATTGTCTGAAGTCAAAAAG
TTGGGCAAAGACGGGAAGAGACCAGTGTACGCAACGGGGGAGATGATGATCGAGAGAAAG
AAGCTTTATGGAATGATGCAATGTACGGACGAGTTATCTGGGAACGGTTGCTTTGTGTGT
CTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCCATTCTGCGGCCATGAAAAACAAGGAGTTAGATAT
TTG*TGTAGAAGCTGTAATGCAAGATTTGAGCTTTACCCTTTTCTTAGAACTTAAGACTG
TTTGTGGGAGCCCTTTGTTTGATGTTTGAATAAGTGCTATATCAGGAAATAAAAAGTGTT
CTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4H580TF U 5
AF RR4FE92TF U 5
AF RR4AB13TF U 10
AF RR4AU06TF U 1
AF RR4H580JQB C 392
AF RR4AU06JQ C 169
AF RR4AB13JQ C 140
BS 1 268 RR4AU06TF
BS 269 269 RR4H580TF
BS 270 485 RR4AU06TF
BS 486 487 RR4FE92TF
BS 488 824 RR4AU06TF
BS 825 827 RR4AB13JQ
BS 828 828 RR4AU06TF
BS 829 829 RR4AB13JQ
BS 830 843 RR4AU06TF
BS 844 844 RR4H580JQB
BS 845 862 RR4AU06TF
BS 863 863 RR4AB13JQ
BS 864 873 RR4AU06TF
BS 874 967 RR4AB13JQ

RD RR4H580TF 365 0 0
GGAAGGT
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CTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTAATTTTTGGATC
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CATTACCAATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGGAAATACGTGCCAGG
GGGTGTGTTCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACCTTTGATCTGCG
CAACGGTTACGCCCTTGA*TCCA*TATGGATAGACCCTACAA*TTTATACCTCCTGCC

QA 8 365 8 365
DS 

RD RR4FE92TF 739 0 0
GGAAGGT
AAACAAAGTACAAGAAAAAAGGGATCATAATCACTTCAAATCTAAAATTCTCATCAAAGC
CTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTAATTTTTGGATC
GGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTTTCGTCCCTCAA
CATTACCAATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGGAAATACGTGCCAGG
GGGTGTGTTCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACCCTTGATCTGCG
CAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAATTTATACCTCCTGCCGC
CGTCTTCGT*ATGCTCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCTAAGTGTCACTCTTGCCT
CGCCAAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCAGCAACAATATG
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CGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACGGAGATGTTCGA
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AATGATGCAATG

QA 8 739 8 739
DS 

RD RR4AB13TF 811 0 0
GG
AAACAACGTACAAGAAAAAAGGAATCATAATCACTTCAAATCTAAAATTCTCATCAAAGC
CTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTAATTTTTGGATC
GGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTTTCGTCCCTCAA
CATTACCAATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGGAAATACGTGCCAGG
GGGTGTGTTCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACCTTTGATCTGCG
CAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAATTTATACCTCCTGCCGC
CGTCTTCGTCATGCTCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCTAAGTGTCACTCTTGCCT
CGCCAAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCAGCAACAATATG
GTACGACCAATGCACTCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACCAGAATCCTTTA
CGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACGGAGATGTTCGA
TAAGAAGAAGAGCGCTTTCACCAAAAAGCTATTGTCTGAAGTCAAAAAGTTGGGCAAAGA
CGGGAAGAGACCAGTGTACGCAACGGGGGAGATGATGATCGAGAGAAAGAAGCTTTATGG
AATGATGCAATGTACGGACGAGTTATCTGGGAACGGTTGCTTTGTGTGTCTAGATCGGCT
TATCAATGAGCGTCCATTCTGCGGCCATG

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR4AU06TF 873 0 0
GGGTTTAAGGTAAACAAAGTACAAGAAAAAAGGAATCATAATCACTTCAAATCTAAAATT
CTCATCAAAGCCTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTA
ATTTTTGGATCGGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTT
TCGTCCCTCAACATTACCAATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGGAAA
TACGTGCCAGGGGGTGTGTTCGAAAAAAGTCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACC
TTTGATCTGCGCAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAATTTATA
CCTCCTGCCGCCGTCTTCGTCATGCTCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCTAAGTGT
CACTCTTGCCTCGCCAAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCA
GCAAC**TATGGTACGACCAATGCACTCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACC
AGAATCCTTTACGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACG
GAGATGTTCGATAAGAAGAAGAGCGCTTTCACCAAAAAGCTATTGTCTGAAGTCAAAAAG
TTGGGCAAAGACGGGAAGAGACCAGTGTACGCAACGGGGGAGATGATGATCGAGAGAAAG
AAGCTTTATGGAATGATGCAATGTACGGACGAGTTATCTGGGAACGGTTGCTTTGTGTGT
CTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCCATTCTGCGGCCATGAAAA**CACGAGTTAGATAT
TTGGTGTAGAAGCTGTAATGCA*GATTTGAGCT

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR4H580JQB 574 0 0
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TTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCAGCAACAATATGGTACGACCAATGCACTCTGG
ATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACCAGAATCCTTTACGATAATTATTTATGCATGG
AGAACCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACGGAGATGTTCGATAAGAAGAAGAGCG**TTCA
CCAAAAAGCTATTGTTTGAAGTCAAAAAGTTGGGCAAAGACGGGAAGAGACCAGTGTACG
CAACGGGGGAGATGATGATCGAGAGAAAGAAGCTTTATGGAATGATGCAATGTACGGACG
AGTTATCTGGGAACGGTTGCTTTGTGTGTCTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCCATTTT
GCGGCCATGAAAAACAAGGAGTTAGATATTTG*TGTAGAAGCTGTAATGCAAGATTTGAG
CTTTACCCTTTTTTTAGAACTTAAGACTGTTTGTGGGAGCCCTTTGTTTGATGTTTGAAT
AAGTGCTATATCAGGAAATAAAAAGTGTT
TTCCT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4AU06JQ 798 0 0
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ACCCAAGGGAAATACGTGCCAGGGGGTGTGTTCGAAAAAAGTCTCAACATTGTCCTCAAA
AACATATCCACCTTTGATCTGCGCAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCC
TACAAATTTATACCTCCTGCCGCCGTCTTCGTCATGCTCCAATGTCGTGGCGACTCCTAC
GGGCCTAAGTGTCACTCTTGCCTCGCCAAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCG
AGAAACAGAGCAGCAAC**TATGGTACGACCAATGCACTCTGGATATTGCTACATACAAT
TCCGGTGACACCAGAATCCTTTACGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTG
AGCGGAGATACGGAGATGTTCGATAAGAAGAAGAGCGCTTTCACCAAAAAGCTATTGTCT
GAAGTCAAAAAGTTGGGCAAAGACGGGAAGAGACCAGTGTACGCAACGGGGGAGATGATG
ATCGAGAGAAAGAAGCTTTATGGAATGATGCAATGTACGGACGAGTTATCTGGGAACGGT
TGCTTTGTGTGTCTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCCATTCTGCGGCCATGAAAAACAA
GGAGTTAGATATTTG*TGTAGAAGCTGTAATGCAAGATTTGAGCTTTACCCTTTTCTTAG
AACTTAAGACTGTTTGTGGGAGCCCTTTGTTTGATGTTTGAATAAGTGCTATATCAGGAA
ATAAAAAGTGTT
CTCCGC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4AB13JQ 828 0 0
TCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTTTCGTCCCTCAACATTACCA
ATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGGAAATACGTGCCAGGGGGTGTGT
TCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACCTTTGATCTGCGCAACGGTT
ACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAATTTATACCTCCTGCCGCCGTCTTCG
TCATGCTCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCTAAGTGTCACTCTTGCCTCGCCAAAG
CCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCAGCAACAATATGGTACGACC
AATGCACTCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACCAGAATCCTTTACGATAATT
ATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACGGAGATGTTCGATAAGAAGA
AGAGCGCTTTCACCAAAAAGCTATTGTCTGAAGTCAAAAAGTTGGGCAAAGACGGGAAGA
GACCAGTGTACGCAACGGGGGAGATGATGATCGAGAGAAAGAAGCTTTATGGAATGATGC
AATGTACGGACGAGTTATCTGGGAACGGTTGCTTTGTGTGTCTAGATCGGCTTATCAATG
AGCGTCCATTCTGCGGCCATGAAAAACAAGGAGTTAGATATTTGC*GTAGAAGCTGTAAT
GCAAGATTTGAGCTTTACCCTTTTCTTAGAACTTAAGACTGTTTGTGGGAGCCCTTTGTT
TGATGTTTGAATAAGTGCTATATCAGGAAATAAAAAGTGTTCTCCTCC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 7

CO CL1057Contig1 923 7 10 U
GGAAACATAAAAGATTTTTTTATTCCTTGCAAATAGTGAGAGAATTAGATATATTGAAAT
GAGTTGCAAAGACTAGAGAAGGAACATGGTACATAAAAAAGGAACATGGTACATATTATA
CTAGACTGGTTGTTGTCGGACCAATCACGAAAGACTTTCGTAACTTTCTTATTAAAACAT
AAATTATTAAAAGCTCCTGCAACAACCGATGATCAAGCAATGTAGTACATTGGATTTGGG
ACTTTGAAAGAACGATCGGCCACAGAAAAACCTTGAAGGTCACTCCATTGATCACCAGTA
TTTCCATGGAGTCTGTAGCCTTTCTTTACCATTCTTGATCGCTGCTCTGATTTGTACTGT
GCAGCTGCTTTCCCTTGATCTTGGTGACCCCTCAACAGGAGATACTCCCAGCCGGAATAA
CCGGCGTCCAGGAGATTTTTCTCGGTAACACTCCTTTGAGCCTCGTCCCGGCCAGTTAGC
AGAATGAGAGTGAAACCAAGATTCTGGAGACGGGTAAACAGTTTCAAACTCGCAGAAAAA
CCTGGGGCTGTACCTTGTAGCACCCACTCGTTGAAAGCAAGCGAGTTGTAAGGCTCAGAC
CCGTAACCATGAGCCTTGTAATACTCGAGGTTTGAGAGGAGCGTCTCATCAATGTCAAAG
ACCCAAGCGTCCTTGCCGTCTCCCTTCAGCTTGATCGTTTTAGCGTAGGCGTAGGCGTAA
CCAGCGACTACACTGTAGTCCTTGTCGAACTGGCCTTTGTTGTAATAAGTTTCAAGAGAG
CTTACACATTGGGAAGGAACCGTCGTCCACTTTCCGGCATTGTCGGTCTCGACGGCCAGT
CTCCAGCTTACGCAGTAAGACTCAAGAGAGGAAGAGAGGGACTCATCGAGGGAGGCGGGG
AGCTTGATGAAGATGAGACGCGA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C474TF C 3
AF RR4C474JQ U 80
AF RR4AF96TF C 376
AF RR4D135JQ U 1
AF RR4AF96JQ U 76
AF RR4B578JQ U 1
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BS 1 99 RR4B578JQ
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BS 647 849 RR4B578JQ
BS 850 923 RR4AW93JQ

RD RR4C474TF 356 0 0
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TTTGAAAGAACGATCGGCCACAGAAAAACCTTGAAGGTCACTCCATTGATCACCAGTATT
TCCATGGAGTCTGTAGCCTTTCTTTACCATTCTTGATCGCTGCTCTGATTTGTAC
C

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR4C474JQ 279 0 0
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ACCAATCACGAAAGACTTTCGTAACTTTCTTATTAAAACATAAATTATTAAAAGCTCCTG
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CCACAAAAAAACCTTGAAGGTCACTCCATTGATCACCAGTATTTCCATGGAGTCTGTAGC
CTTTCTTTACCATTCTTGATCGCTGCTCTGATTTGTAC
C

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR4AF96TF 274 0 0
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CCAAGATTCTGGAGACGGGTAAACAGTTTCAAACTTGCAGAAAAACGTGGGGCTGTACCT
TGTAGCACCCACTCGTTGAAAGCAAGCGAGTTGTAAGGCTCAGACCCGTAACCATGAGCC
TTGTAATACTCGAGGTTTGAGAGGAGCGTCTCAT

QA 1 274 1 274
DS 

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GG
AAACATAAAAGATTTTTTTATTCCTTGCAAATAGTGAGAGAATTAGATATATTGAAATGA
GTTGCAAAGACTAGAGAAGGAACATGGTACATAAAAAAGGAACATGGTACATATTATACT
AGACTGGTTGTTGTCGGACCAATCACGAAAGACTTTCGTAACTTTCTTATTAAAACATAA
ATTATTAAAAGCTCCTGCAGCAACCGATGATCAAGCAATGTAGTACATTGGATTTGGGAC
TTTGAAAGAACGATCGGCCACAGAAAAACCTTGAAGGTCACTCCATTGATCACCAGTATT
TCCATGGAGTCTGTAGCCTTTCTTTACCATTCTTGATCGCTGCTCTGATTTGTACTGTGC
AGCTGCTTTCCCTTGATCTTGGTGACCCCTCAACAGGAGATACTCCCAGCCGGGATAACC
GGCGTCCAGGAGATTTTTCTCGGTAACACTCCTTTGAGCCTCGTCCCGGCCAGTTAGCAG
AATGAGAGTGAAACCAAGATTCTGGAGAAGGGTAAACAGTTTCAAACTCGCGGAAAAACC
TGGGGCTGTACCTTGTAGCACCCACTCGTTGAAAGCAAGCGAGTTGTAAGGCTCAGACCC
GTAACCATGAGCCTTGTAATACTCGAGGTTCGAGAGGAGCGTCTCATCAATGTCAAAGAC
CCAAGCGTCCTTGCCGTCTCCCTTCAGCTTGATCGTTTTA

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR4AF96JQ 723 0 0
GG
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GGACCAATCACGAAAGACTTTCGTAACTTTCTTATTAAAACATAAATTATTAAAAGCTCC
TGCAACAACCGATGATCAAGCAATGTAGTACATTGGATTTGGGACTTTGAAAGAACGATC
GGCCACAGAAAAACCTTGAAGGTCACTCCATTGATCACCAGTATTTCCATGGAGTCTGTA
GCCTTTCTTTACCATTCTTGATCGCTGCTCTGATTTGTACTGTGCAGCTGCTTTCCCTTG
ATCTTGGTGACCCCTCAACAGGAGATACTCCCAGCCGGAATAACCGGCGTCCAGGAGATT
TTTCTCGGTAACACTCCTTTGAGCCTCGTCCCGGCCAGTTAGCAGAATGAGAGTGAAACC
AAGATTCTGGAGACGGGTAAACAGTTTCAAACTCGCAGAAAAACCTGGGGCTGTACCTTG
TAGCACCCACTCGTTGAAAGCAAGCGAGTTGTAAGGCTCAGACCCGTAACCATGAGCCTT
GTAATACTCGAGGTTTGAGAGGAGCGTCTCATCAATGTCAAAGACCCAAGCGTCCTTGCC
GTCTCCCTTCAGCTTGATCGTTTTAGCGTAGGCGTAGGCGTAACCAGCGACTACACTGTA
GTCCTTGTCGAACTGGCCTTTGTTGTAATAAGTTTCAAGAGAGCTTACACATTGGGAAGG
A

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR4B578JQ 851 0 0
GGAAACATAAAAGATTTTTTTATTCCTTGCAAATAGTGAGAGAATTAGATATATTGAAAT
GAGTTGCAAAGACTAGAGAAGGAACATGGTACATAAAAA*GGAACACGGTACATATTATA
CTAGACTGGTTGTTGTCGGACCAATCACGAAAGACTTTCGTAACTTTCTTATTAAAACAT
AAATTATTAAAAGCTCCTGCAACAACCGATGATCAAGCAATGTAGTACATTGGATTTGGG
ACTTTGAAAGAACGATCGGCCACAGAAAAACCTTGAAGGTCACTCCATTGATCACCAGTA
TTTCCATGGAGTCTGTAGCCTTTCTTTACCATTCTTGATCGCTGCTCTGATTTGTACTGT
GCAGCTGCTTTCCCTTGATCTTGGTGACCCCTCAACAGGAGATACTCCCAGCCGGAATAA
CCGGCGTCCAGGAGATTTTTCTCGGTAACACTCCTTTGAGCCTCGTCCCGGCCAGTTAGC
AGAATGAGAGTGAAACCAAGATTCTGGAGACGGGTAAACAGTTTCAAACTCGCAGAAAAA
CCTGGGGCTGTACCTTGTAGCACCCACTCGTTGAAAGCAAGCGAGTTGTAAGGCTCAGAC
CCGTAACCATGAGCCTTGTAATACTCGAGGTTCGAGAGGAGCGTCCCATCAATGTCAAAG
ACCCAAGCGTCCTTGCCGTCTCCCTTCAGCTTGATCGTTTTAGCGTAGGCGTAGGCGTAA
CCAGCGACTACACTGTAGTCCTTGTCGAACTGGCCTTTGTTGTAATAAGTTTCAAGAGAG
CTTACACATTGGGAAGGAACCGTCGTCCACTTTCCGGCATTGTCGGTCTCGACGGCCAGT
CTCCAGCTT
GC

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR4AW93JQ 886 0 0
GAGAGAATTAGATATATTGAAATGAGTTGCAAAGACTAGAGAAGGAACATGGTACATAAA
AAAGGAACATGGTACATATTATACTAGACTGGTTGTTGTCGGACCAATCACGAAAGACTT
TCGTAACTTTCTTATTAAAACATAAATTATTAAAAGCTCCTGCAACAACCGATGATCAAG
CAATGTAGTACATTGGATTTGGGACTTTGAAAGAACGATCGGCCACAGAAAAACCTTGAA
GGTCACTCCATTGATCACCAGTATTTCCATGGAGTCTGTAGCCTTTCTTTACCATTCTTG
ATCGCTGCTCTGATTTGTACTGTGCAGCTGCTTTCCCTTGATCTTGGTGACCCCTCAACA
GGAGATACTCCCAGCCGGAATAACCGGCGTCCAGGAGATTTTTCTCGGTAACATTCCTTT
GAGCCTCGTCCCGGCCAGTTAGCAGAATGAGAGTGAAACCAAGATTCTGGAGACGGGTAA
ACAGTTTCAAACTCGCAGAAAAACCTGGGGCTGTACCTTGTAGCACCCACTTGTTGAAAG
CAAGCGAGTTGTAAGGCTCAGACCCGTAACCATGAGCCTTGTAATACTCGAGGTTTGAGA
GGAGCGTCTCATCAATGTCAAAGACCCAAGCGTCCTTGCCGTCTCCCTTCAGCTTGATCG
TTTTAGCGTAGGCGTAGGCGTAACCAGCGACTACACTGTAGTCCTTGTCGAACTGGCCTT
TGTTGTAATAAGTTTCAAGAGAGCTTACACATTGGGAAGGAACCGTCGTCCACTTTCCGG
CATTGTCGGTCTCGACGGCCAGTCTCCAGCTTACGCAGTAAGACTCAAGAGAGGAAGAGA
GGGACTCATCGAGGGAGGCGGGGAGCTTGATGAAGATGAGACGCGA

QA 1 886 1 886
DS 



AS 2 6

CO CL1058Contig1 838 2 12 U
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TCTAGTATCGATTTTCACCAACGACGCAAAGAACGCAACTCTTACACCTCGGTTTTGCAA
AAGAAAAAAAAATGGCGTATTCTAGGGCAGCGAGACGACCCCTTGGAGTCTTTCTTTACA
GTGCTAGTCGTAGGTTCAGCTGTGGAAATGAGTACTCAAGCAAATTCGAAAGTCTGTCTC
AGTACAGAAGCCATGTCGGTGGGTTTGGGAACTTGTTGAGGAGTTTTAGTTCGGAGGCTC
CTGCTGGAGTTGACCAGATGAGCCTCATCAAGCAACTGAGGCAAAGAACTAGTGCTCCTA
TTAAGGATGTTAAGGCTTCTCTTGTTGAATGCAATTGGGACATTGAGGCTGCTCAGAAGG
ATTTGAGGAAGAGAGGGAAAGTACTGGCTTCCAAAAAGTCGTCACGGACAGCTGCAGAGG
GTATGCTTGCTGTTGCCCAGAACGAGGGAAGAGTTGCTGTTATCGAACTGAACTGCGAGA
CAGACTTTGTGGCTAGGAACGACATCTTCCAGTACTTGGCTTTAGCTATGGCAAAACGTG
CTTTGCTGGTTGATAACAGTTCTCAGCAAGTTCCTGGTGTCTTCCCCTTTGGCCCTGAGC
TTTTTGAGGAGCTAAAGCTCAATCTCGACCATCCAAAAGTGAATGGTGAAACCACAGTTT
CAAACGCTGCTACAGAAGTAGCGGCAATTATGGGAGAGAATGTCAAGTTTAGGAGAGGTT
TCTTGATGTCAAATCTTCAACAGGCGTCCTCTCTGCATATCTCACACAAGTCCCCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL05TF U 1
AF RR4A747TF U 24
BS 1 693 RR4CL05TF
BS 694 694 RR4A747TF
BS 695 723 RR4CL05TF
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BS 744 745 RR4CL05TF
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BS 750 759 RR4CL05TF
BS 760 838 RR4A747TF

RD RR4CL05TF 765 0 0
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TCTAGTATCGATTTTCACCAACGACGCAAAGAACGCAACTCTTACACCTCGGTTTTGCAA
AAGAAAAAAAAATGGCGTATTCTAGGGCAGCGAGACGACCCCTTGGAGTCTTTCTTTACA
GTGCTAGTCGTAGGTTCAGCTGTGGAAATGAGTACTCAAGCAAATTCGAAAGTCTGTCTC
AGTACAGAAGCCATGTCGGTGGGTTTGGGAACTTGTTGAGGAGTTTTAGTTCGGAGGCTC
CTGCTGGAGTTGACCAGATGAGCCTCATCAAGCAACTGAGGCAAAGAACTAGTGCTCCTA
TTAAGGATGTTAAGGCTTCTCTTGTTGAATGCAATTGGGACATTGAGGCTGCTCAGAAGG
ATTTGAGGAAGAGAGGGAAAGTACTGGCTTCCAAAAAGTCGTCACGGACAGCTGCAGAGG
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CTTTGCTGGTTGATAACAGTTCTCAGCAAGTTCCTGGTGTCTTCCCCTTTGGCCCTGAGC
TTTTTGAGGAGCTAAAGCTCAATCTCGACCATC*AAAAGTGAATGGTGAAACCACAGTTT
CAA*CGCTGCTACAGAAGTAGCTGCGAT*ATGGGAGAGA
TGTCAG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4A747TF 815 0 0
GG
GGTCGCTCCCATTTCTACGATCTCCTCGATCTCTTTCTAGTATCGATTTTCACCAACGAC
GCAAAGAACGCAACTCTTACACCTCGGTTTTGCAAAAGAAAAAAAAATGGCGTATTCTAG
GGCAGCGAGACGACCCCTTGGAGTCTTTCTTTACAGTGCTAGTCGTAGGTTCAGCTGTGG
AAATGAGTACTCAAGCAAATTCGAAAGTCTGTCTCAGTACAGAAGCCATGTCGGTGGGTT
TGGGAACTTGTTGAGGAGTTTTAGTTCGGAGGCTCCTGCTGGAGTTGACCAGATGAGCCT
CATCAAGCAACTGAGGCAAAGAACTAGTGCTCCTATTAAGGATGTTAAGGCTTCTCTTGT
TGAATGCAATTGGGACATTGAGGCTGCTCAGAAGGATTTGAGGAAGAGAGGGAAAGTACT
GGCTTCCAAAAAGTCGTCACGGACAGCTGCAGAGGGTATGCTTGCTGTTGCCCAGAACGA
GGGAAGAGTTGCTGTTATCGAACTGAACTGCGAGACAGACTTTGTGGCTAGGAACGACAT
CTTCCAGTACTTGGCTTTAGCTATGGCAAAACGTGCTTTGCTGGTTGATAACAGTTCTCA
GCAAGTTCCTGGTGTCTTCCCCTTTGGCCCTGAGCTTTTTGAGGAGTTGAAGCTCAATCT
CGACCATCCAAAAGTGAATGGTGAAACCACAGTTTCAAACGCTGCTACAGAAGTAGCGGC
AATTATGGGAGAGAATGTCAAGTTTAGGAGAGGTTTCTTGATGTCAAATCTTCAACAGGC
GTCCTCTCTGCATATCTCACACAAGTCCCCAAC

QA 3 815 3 815
DS 



CO CL1058Contig2 932 4 10 U
GCATCCAAAAGTGAATGGTGAAACCACAGTTTCAAACGCTGCTACAGAAGTAGCTGCGAT
AATGGGAGAGAATGTCAAGTTTAGGAGAGGTTTCTTAATGTCAAAATCTTCAACAGGCGT
CCTCTCTGCATATCTCCACACAAGTCCCCAGCCAGGGTTGGGTCGTATCGCTGGGATTGT
ATCTCTCGAAGTAGAAGGTGGAAACACTCAACTAGAGGCTCTTCAACGTGTAGGCTCAGA
AATGGCCATGCATGTTGTAGCAGCAAAGCCTTTATTTTTAAGCAAAGACCTCGTTTCTTC
TGAAGCATTAGCAAACGAACGGGAGATTCTCAAATCTCAGGCAGAAAGTACAGCCAAGTC
TCAGATGGCTGTGGAGAAGATGGTGGAAGGCCTCCGTAAATATTTCGAAGAAGTTGCTCT
AATGGAGCAAAAGTTCATTGTGAACGATTCTATTAACATAAAGACATTGGTGGATAATTT
GTCCAAGGAGGTGGGTTCTCCTGTGAAGGTTGCCGATTTTCTGAGAGTTGAGGTTGGGGA
AGGAATAGAAAGGCTTGAAGCATCTGATGAACCAGTTGCTCAAACTGCTTGAAGATGATG
AATGTGGAGATGGTGTTAAATTTAGAGACCTCTTTCTTTGGTTAATTGGGTTTGGATACC
GATCACTCACCATATGGTTTCTATGCCGGCTTGAGACTAGAGAGTGTTAGGCTTTCCTTT
TCCCATGTTTTGTTGTTTTAGAAATGTGAGTTTGCCATACAATTTCCCAATAAGATAAAT
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GTGACAAAACCATGTCTTGATGAGTTTTCTTACTCAAGTTACCAGATATTTTGATAATTT
TTACATACATATATGAACAGTTCATAATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4DD94TF U 1
AF RR4DD34TF U 1
AF RR4DD94JQ C 193
AF RR4DD34JQ C 304
BS 1 710 RR4DD34TF
BS 711 711 RR4DD94JQ
BS 712 730 RR4DD34TF
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BS 745 763 RR4DD34TF
BS 764 932 RR4DD94JQ

RD RR4DD94TF 684 0 0
GCATC
CAAAAGTGAATGGTGAAACCACAGTTTCAAACGCTGCTACAGAAGTAGCTGCGATAATGG
GAGAGAATGTCAAGTTTAGGAGAGGTTTCTTAATGTCAAAATCTTCAACAGGCGTCCTCT
CTGCATATCTCCACACAAGTCCCCAGCCAGGGTTGGGTCGTATCGCTGGGATTGTATCTC
TCGAAGTAGAAGGTGGAAACACTCAACTAGAGGCTCTTCAACGTGTAGGCTCAGAAATGG
CCATGCATGTTGTAGCAGCAAAGCCTTTATTTTTAAGCAAAGACCTCGTTTCTTCTGAAG
CATTAGCAAACGAACGGGAGATTCTCAAATCTCAGGCAGAAAGTACAGCCAAGTCTCAGA
TGGCTGTGGAGAAGATGGTGGAAGGCCTCCGTAAATATTTCGAAGAAGTTGCTCTAATGG
AGCAAAAGTTCATTGTGAACGATTCTATTAACATAAAGACATTGGTGGATAATTTGTCCA
AGGAGGTGGGTTCTCCTGTGAAGGTTGCCGATTTTCTGAGAGTTGAGGTTGGGGAAGGAA
TAGAAAGGCTTGAAGCATCTGATGAACCAGTTGCTCAAACTGCTTGAAGATGATGAATGT
GGAGATGGTGTTAAATTTAGAGACCTCTTTCTTTGGTTAATTGGGTTTGGATACCGATCA
CTCACCATATGGTTTCTAT

QA 6 684 6 684
DS 

RD RR4DD34TF 763 0 0
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CCTCTCTGCATATCTCCACACAAGTCCCCAGCCAGGGTTGGGTCGTATCGCTGGGATTGT
ATCTCTCGAAGTAGAAGGTGGAAACACTCAACTAGAGGCTCTTCAACGTGTAGGCTCAGA
AATGGCCATGCATGTTGTAGCAGCAAAGCCTTTATTTTTAAGCAAAGACCTCGTTTCTTC
TGAAGCATTAGCAAACGAACGGGAGATTCTCAAATCTCAGGCAGAAAGTACAGCCAAGTC
TCAGATGGCTGTGGAGAAGATGGTGGAAGGCCTCCGTAAATATTTCGAAGAAGTTGCTCT
AATGGAGCAAAAGTTCATTGTGAACGATTCTATTAACATAAAGACATTGGTGGATAATTT
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AGGAATAGAAAGGCTTGAAGCATCTGATGAACCAGTTGCTCAAACTGCTTGAAGATGATG
AATGTGGAGATGGTGTTAAATTTAGAGACCTCTTTCTTTGGTTAATTGGGTTTGGATACC
GATCACTCACCATATGGTTTCTATGCCGGCTTGAGACTAGAGAGTGTTAG*CTTTCCTTT
TCCCATGTTT*GTTGTTT*AGAA*TGTGAGTTTGCCATACAAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4DD94JQ 740 0 0
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GCTTGAAGCATCTGATGAACCAGTTGCTCAAACTGCTTGAAGATGATGAATGTGGAGATG
GTGTTAAATTTAGAGACCTCTTTCTTTGGTTAATTGGGTTTGGATACCGATCACTCACCA
TATGGTTTCTATGCCGGCTTGAGACTAGAGAGTGTTAGGCTTTCCTTTTCCCATGTTTTG
TTGTTTTAGAAATGTGAGTTTGCCATACAATTTCCCAATAAGATAAATTTTGTGATTATG
CACATGGCTTCTCTCACTCTTTGGCTATATACAGCCTATGGAAGCTGTGTGACAAAACCA
TGTCTTGATGAGTTTTCTTACTCAAGTTACCAGATATTTTGATAATTTTTACATACATAT
ATGAACAGTTCATAATTCAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4DD34JQ 629 0 0
AGCATTAGCAAACGAACGGGAGATTCTCAAATCTCAGGCAGAAAGTACAGCCAAGTCTCA
GATGGCTGTGGAGAAGATGGTGGAAGGCCTCCGTAAATATTTCGAAGAAGTTGCTCTAAT
GGAGCAAAAGTTCATTGTGAACGATTCTATTAACATAAAGACATTGGTGGATAATTTGTC
CAAGGAGGTGGGTTCTCCTGTGAAGGTTGCCGATTTTCTGAGAGTTGAGGTTGGGGAAGG
AATAGAAAGGCTTGAAGCATCTGATGAACCAGTTGCTCAAACTGCTTGAAGATGATGAAT
GTGGAGATGGTGTTAAATTTAGAGACCTCTTTCTTTGGTTAATTGGGTTTGGATACCGAT
CACTCACCATATGGTTTCTATGCCGGCTTGAGACTAGAGAGTGTTAGGCTTTCCTTTTCC
CATGTTTTGTTGTTTTAGAAATGTGAGTTTGCCATACAATTTCCCAATAAGATAAATTTT
GTGATTATGCACATGGCTTCTCTCACTCTTTGGCTATATACAGCCTATGGAAGCTGTGTG
ACAAAACCATGTCTTGATGAGTTTTCTTACTCAAGTTACCAGATATTTTGATAATTTTTA
CATACATATATGAACAGTTCATAATTCAT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 7

CO CL1059Contig1 447 4 2 U
GTGCAATGAGAACTACTTTTATTGATTTTTTAAGTATTTTATTATTGATGATTCATTCGC
ACTGGAAAGACCAAGAAAGAGGACGCAGAGCAAACTGGTAGGAGTTGGAGTAGTTGAAAG
AGAGAGTCTCCATTGGACTCAACGGCAAACCGTCGTTAACCACACAGTTTCCGGCGGAAG
TGGAGAGAACACGGAGGAGCGTGGGGTCCAAGAGACTGGGGAAACCCCTGGCATTTCAGA
CGGAGGTTTATGACAGGACACATTGGACATTTGTTCATCACTTCGACTCTGAAATTATTC
TTCCCTTCTCCCAACTTCACCTGCGTCTGTCTAACCATTGGTTCACTGCTTTTGCTATCA
CATTTTTCTCCAAAACCTGTTTGAAGAAGCAAGAGAGCAAGAAATGACCAAAGAAGGAAC
TTGAGAGAGATTGACATTTGGACACCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AY72TF C 1
AF RR4F753JQ U 1
AF RR4F753TF C 1
AF RR4AY72JQ U 32
BS 1 2 RR4AY72TF
BS 3 447 RR4F753JQ

RD RR4AY72TF 447 0 0
GTGCAATGAGAACTACTTTTATTGATTTTTTAAGTATTTTATTATTGATGATTCATTCGC
ACTGGAAAGACCAAGAAAGAGGACGCAGAGCAAACTGGTAGGAGTTGGAGTAGTTGAAAG
AGAGAGTCTCCATTGGACTCAACGGCAAACCGTCGTTAACCACACAGTTTCCGGCGGAAG
TGGAGAGAACACGGAGGAGCGTGGGGTCCAAGAGACTGGGGAAACCCCTGGCATTTCAGA
CGGAGGTTTATGATAGGACACATTGGACATTTGTTCATCACTTCGACTCTGAAATTATTC
TTCCCTTCTCCCAACTTCACCTGCGTCTGTCTAACCATTGGTTCACTGCTTTTGCTATCA
CATTTTTCTCCAAAACCTGTTTGAAGAAGCAAGAGAGCAAGAAATGACCAAAGAAGGAAC
TTGAGAGAGATTGACATTTGGACACCC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4F753JQ 447 0 0
GT
GCAATGAGAACTACTTTTATTGATTTTTTAAGTATTTTATTATTGATGATTCATTCGCAC
TGGAAAGACCAAGAAAGAGGACGCAGAGCAAACTGGTAGGAGTTGGAGTAGTTGAAAGAG
AGAGTCTCCATTGGACTCAACGGCAAACCGTCGTTAACCACACAGTTTCCGGCGGAAGTG
GAGAGAACACGGAGGAGCGTGGGGTCCAAGAGACTGGGGAAACCCCTGGCATTTCAGACG
GAGGTTTATGACAGGACACATTGGACATTTGTTCATCACTTCGACTCTGAAATTATTCTT
CCCTTCTCCCAACTTCACCTGCGTCTGTCTAACCATTGGTTCACTGCTTTTGCTATCACA
TTTTTCTCCAAAACCTGTTTGAAGAAGCAAGAGAGCAAGAAATGACCAAAGAAGGAACTT
GAGAGAGATTGACATTTGGACACCC

QA 3 447 3 447
DS 

RD RR4F753TF 447 0 0
GT
GCAATGAGAACTACTTTTATTGATTTTTTAAGTATTTTATTATTGATGATTCATTCGCAC
TGGAAAGACCAAGAAAGAGGACGCAGAGCAAACTGGTAGGAGTTGGAGTAGTTGAAAGAG
AGAGTCTCCATTGGACTCAACGGCAAACCGTCGTTAACCACACAGTTTCCGGCGGAAGTG
GAGAGAACACGGAGGAGCGTGGGGTCCAAGAGACTGGGGAAACCCCTGGCATTTCAGACG
GAGGTTTATGACAGGACACATTGGACATTTGTTCATCACTTCGACTCTGAAATTATTCTT
CCCTTCTCCCAACTTCACCTGCGTCTGTCTAACCATTGGTTCACTGCTTTTGCTATCACA
TTTTTCTCCAAAACCTGTTTGAAGAAGCAAGAGAGCAAGAAATGACCAAAGAAGGAACTT
GAGAGAGATTGACATTTGGACACCC

QA 3 447 3 447
DS 

RD RR4AY72JQ 416 0 0
AAGTATTTTATTATTGATGATTCATTCGCACTGGAAAGACCAAGAAAGAGGACGCAGAGC
AAACTGGTAGGAGTTGGAGTAGTTGAAAGAGAGAGTCTCCATTGGACTCAACGGCAAACC
GTCGTTAACCACACAGTTTCCGGCGGAAGTGGAGAGAACACGGAGGAGCGTGGGGTCCAA
GAGACTGGGGAAACCCCTGGCATTTCAGACGGAGGTTTATGATAGGACACATTGGACATT
TGTTCATCACTTCGACTCTGAAATTATTCTTCCCTTCTCCCAACTTCACCTGCGTCTGTC
TAACCATTGGTTCACTGCTTTTGCTATCACATTTTTCTCCAAAACCTGTTTGAAGAAGCA
AGAGAGCAAGAAATGACCAAAGAAGGAACTTGAGAGAGATTGACATTTGGACACCC

QA 1 416 1 416
DS 



CO CL1059Contig2 471 3 7 U
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CTCTCTTGCTTCTTCAAACAGGTTTTGGAGAAAAATGTGACAGCAAAAGCAGTGAACCAA
TGGTGAGACAGACGCAGGTGAAGTTGGTGGGAGAAGGGAATAAGAAGTTCAGAGTTGAAG
TGATGAACAAATGTCCAATGTGTCCTATCATCAACCTCCGTCTGAAATGCCAAGGCTTTC
CTCAACCTCTTGTGGACCCTACGCTCCTCCGTGTTCTCTCCTCTTCCGCCGGAAACTGTG
TGGTTAACGACGGCTTGCCGTTGAGTCCAATGGAGACTCTCTCTTTCAACTACTCAAACT
CCTACCAGTTTGCTCTGCGTCCTCTTTCTTGGTCTTTCCAGTGCGAATGAATCATCAATA
ATAAAATACTTAAAAAATCAATAAAAGTAGTTCTCATTGCTCATCAAAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ03TF U 1
AF RR4CJ62TF U 1
AF RR4GA78TF U 1
BS 1 14 RR4CJ62TF
BS 15 15 RR4FQ03TF
BS 16 244 RR4CJ62TF
BS 245 245 RR4FQ03TF
BS 246 445 RR4CJ62TF
BS 446 447 RR4GA78TF
BS 448 471 RR4CJ62TF

RD RR4FQ03TF 418 0 0
GGGTGTCTACTTGTATCCAAATGTCAATCTCTCTCAAGTTCCTTCTTTGGTCATTTCTTG
CTCTCTTGCTTCTTCAAACAGGTTTTGGAGAAAAATGTGACAGCAAAAGCAGTGAACCAA
TGGTGAGACAGACGCAGGTGAAGTTGGTGGGAGAAGGGAATAAGAAGTTCAGAGTTGAAG
TGATGAACAAATGTCCAATGTGTCCTATCATCAACCTCCGTCTGAAATGCCAAGGCTTTC
CTCAACCTCTTGTGGACCCTACGCTCCTCCGTGTTCTCTCCTCTTCCGCCGGAAACTGTG
TGGTTAACGACGGCTTGCCGTTGAGTCCAATGGAGACTCTCTCTTTCAACTACTCAAACT
CCTACCAGTTTGCTCTGCGTCCTCTTTCTTGGTCTTTCCAGTGCGAATGAATCATCAA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4CJ62TF 471 0 0
GGGTGTCTACTTGTGTCCAAATGTCAATCTCTCTCAAGTTCCTTCTTTGGTCATTTCTTG
CTCTCTTGCTTCTTCAAACAGGTTTTGGAGAAAAATGTGACAGCAAAAGCAGTGAACCAA
TGGTGAGACAGACGCAGGTGAAGTTGGTGGGAGAAGGGAATAAGAAGTTCAGAGTTGAAG
TGATGAACAAATGTCCAATGTGTCCTATCATCAACCTCCGTCTGAAATGCCAAGGCTTTC
CTCAGCCTCTTGTGGACCCTACGCTCCTCCGTGTTCTCTCCTCTTCCGCCGGAAACTGTG
TGGTTAACGACGGCTTGCCGTTGAGTCCAATGGAGACTCTCTCTTTCAACTACTCAAACT
CCTACCAGTTTGCTCTGCGTCCTCTTTCTTGGTCTTTCCAGTGCGAATGAATCATCAATA
ATAAAATACTTAAAAAATCAATAAAT*TAGTTCTCATTGCTCATCAAAATC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4GA78TF 462 0 0
GGGTGTCTACTTGTATCCAAATGTCAATCTCTCTCAAGTTCCTTCTTTGGTCATTTCTTG
CTCTCTTGCTTCTTCAAACAGGTTTTGGAGAAAAATGTGACAGCAAAAGCAGTGAACCAA
TGGTGAGACAGACGCAGGTGAAGTTGGTGGGAGAAGGGAATAAGAAGTTCAGAGTTGAAG
TGATGAACAAATGTCCAATGTGTCCTATCATCAACCTCCGTCTGAAATGCCAAGGCTTTC
CTCAACCTCTTGTGGACCCTACGCTCCTCCGTGTTCTCTCCTCTTCCGCCGGAAACTGTG
TGGTTAACGACGGCTTGCCGTTGAGTCCAATGGAGACTCTCTCTTTCAACTACTCAAACT
CCTACCAGTTTGCTCTGCGTCCTCTTTCTTGGTCTTTCCAGTGCGAATGAATCATCAATA
ATAAAATACTTAAAAAATCAATAAAAGTAGTTCTCATTGC
TC

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 6

CO CL1060Contig1 1036 6 18 U
GGATCGAACAACCAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTGAGATAATCACAAAATGGCCG
TTTCATCGCGCGACGAGTACGTATACATGGCGAAGCTCTCGGAGCAGGCCGAGAGGTACG
AGGAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAACTCTCCGCCGCCGCGGACGGCACCGAGCTCACCG
TCGAGGAGCGCAACCTCCTCTCCGTCGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGCCGCGCCT
CGTGGCGGATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCG
TCAAGACGATCCGCGACTACAAGGTGAAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACG
GGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGG
TGTTCTACCTAAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTA
AGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATG
CGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGT
TCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGACCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTG
ATGCTGCTATTGCTGAGTTAGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGA
TCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTG
CAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCATCAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTTCG
TCAATTCTGTGT**CTATTCAAGAGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGT
TAACACTCTTCTATCTCCTTTTTTTTCTTTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAAATTG
ATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACAA
TTTAATTTCAAGCAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4B227TF U 1
AF RR4AV69TF U 1
AF RR4AV69JQ C 202
AF RR4H993JQB C 224
AF RR4B227JQ C 204
AF RR4AO08TF U 416
BS 1 770 RR4AV69TF
BS 771 771 RR4AO08TF
BS 772 804 RR4AV69TF
BS 805 809 RR4AO08TF
BS 810 810 RR4AV69JQ
BS 811 852 RR4AO08TF
BS 853 854 RR4AV69JQ
BS 855 857 RR4AO08TF
BS 858 858 RR4AV69JQ
BS 859 862 RR4AO08TF
BS 863 863 RR4AV69JQ
BS 864 910 RR4AO08TF
BS 911 911 RR4AV69JQ
BS 912 925 RR4AO08TF
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BS 927 930 RR4AO08TF
BS 931 931 RR4AV69JQ
BS 932 1036 RR4AO08TF

RD RR4B227TF 703 0 0
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AGGAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAACTCTCCGCCGCCGCGGACGGCACCGAGCTCACCG
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CGTGGCGGATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCG
TCAAGACGATCCGCGACTACAAGGTGAAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACG
GGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGG
TGTTCTACCTAAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTA
AGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATG
CGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGT
TCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGACCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTG
ATGCTGCTATTGCTGAGTTAGATACACTAGGGGAAGAGTCGTA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4AV69TF 810 0 0
GGATCGAACAACCAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTGAGATAATCACAAAATGGCCG
TTTCATCGCGCGACGAGTACGTATACATGGCGAAGCTCTCGGAGCAGGCCGAGAGGTACG
AGGAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAACTCTCCGCCGCCGCGGACGGCACCGAGCTCACCG
TCGAGGAGCGCAACCTCCTCTCCGTCGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGCCGCGCCT
CGTGGCGGATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCG
TCAAGACGATCCGCGACTACAAGGTGAAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACG
GGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGG
TGTTCTACCTAAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTA
AGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATG
CGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGT
TCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGACCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTG
ATGCTGCTATTGCTGAGTTAGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGA
TCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAG*ATGAAACTG
CAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAA
GCCATC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AV69JQ 834 0 0
CC
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GAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAG
GTGAAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCC
ACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCTACCTAAAGATGAAAGGT
GATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTAAGGAGAGGGATGATGCGGCTGAT
AACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCAC
CCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTCAATTCT
CCTGACCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCTATTGCTGAGTTAGAT
ACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAAC
CTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCA
AAGCCATCAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGT**CTATTCAAG
AGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTCTATCTCCTTTTT
TTTCTTTTGCCCTTTTGGATTGAGTAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATG
GAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACAATTTAATTTCAAGC
GG

QA 3 832 3 832
DS 

RD RR4H993JQB 810 0 0
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CGGCAACGACGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAGGCGAAGATCGAGACGGAGCT
CGCGGGGATCTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTTCCGCCGC
CTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCTACCTAAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGC
TGAGTTCAAGATCGGTAAGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGA
ATCTGCTCAGGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGC
GTTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGACCGTGCTTGCAACCT
CGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCTATTGCTGAGTTAGATACACTAGGGGAAGAGTCGTA
CAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGA
CATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCATCAGAAGAGCAGAA
ATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGT**CTATTCAAGAGAGATGTCACTCTCTTTTC
TTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTCTATCTCCTTTTTTTTCTTTTGCCCTTTTGGAT
TGAGCAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGAAGGTTTTTTCATGTGATT
TGCGAAATAAATAACAATTTAATTTCAAGC

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DS 

RD RR4B227JQ 832 0 0
GTCGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGCCGCGCCTCGTGGCGGATCATCTCCTCGATC
GAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAG
GTGAAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCC
ACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCTACCTAAAGATGAAAGGT
GATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTAAGGAGAGGGATGATGCGGCTGAT
AACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCAC
CCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTCAATTCT
CCTGACCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCTATTGCTGAGTTAGAT
ACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAAC
CTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCA
AAGCCATCAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGT**CTATTCAAG
AGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTCTATCTCCTTTTT
TTTCTTTTGCCCTTTTGGATTGAGTAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATG
GAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACAATTTAATTTCAAGC
GG

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4AO08TF 621 0 0
G
AAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATC
GGTAAGGAGAGGGACGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGAC
AATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCT
GTGTTCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCT
TTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTAGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACT
TTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAA
ACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCAACAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTC
TTCGTCAATTCTGTGTGTCTAATCAACAGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTG
AAGTTAACACTCTTTTATCTCCTTTTTTTCCTTT*GCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAA
ATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATA
ACAATTTAATTTCAAGCAGG

QA 2 621 2 621
DS 



AS 1 5

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GCAGAGTTTTACAAACAATACAAACAATACAAAACATAGATGATGAAGAACCCCTAAACA
ACAGTTCGTCCATCTCTAAAGCCCCCTTCCTCTGTTGTTATAGTTCTTTTTTCCCCTGAT
TGTTCTTTTTTTCCAAGACAAAAGTAAGGCCTTGGCTTTTAAGTCTAAGCAACTCTGATG
ATGCTGCTATTACTATCTCCATCACTGAAGCTTGGCAACATGGTGAAAGCCGAATGTCTT
GAGTTGGACTGTTCGTTGAGGTTATTAAAAGACAGAGAAAGGTTGAGAGACAGCGGAGCA
GGAACCTCTGCAGCATCTGTGTTTAGATTGAACGGAGGATTTGCTTGGAAGGTTACTGGG
ACAATCTGTGGTGCGTTCTCAGTTCTTGTCGGCACCACCGCAACTTGAGTAAAAACTTGC
ATAGCTTGTTGTCCAGAGCTGATATCAGTTTCAGGTAGTGATGAGATGTCCTGAGGATGA
TGCCCCTGATCTTGCTCCATGTGCATTCCTGTGACGGTCTCGGTTGTGATGTCGAAAAGG
CTAGATCTTCTCCGGCGACGGTTGAGGTTAGTCCGGCGGAGGAAGTATTTCTGAGCGTGA
CTAGCTACCTGAGTAGGCGTCCTGCTCTTGACAAAGTTTCTAGAGATCCCTTTCCAATCT
CCTTTGCCTACTTTTTTCAGACCAAGCAAGAACCTCTTGTGCTCGTCTTCAGTCCATGCT
ATTCCTCGTTTCCTCTCGCGATTTCCGGCGGAGGACGACGGAATCTGGACGGCGTCATTG
GCGGAGGCGTAACCGGCGGCGACGGCGGCTGTCACATCAGCTTCTCCATCTCCGATCTTG
GGGATCTCCTCATCGGGCGAAGACTTCTCGTAATCAGAGAGATTGTTCAAACTCACACAC
TTCCTCATCGGATCGACAACGACTCTAACTCCGAACAGCATGATCTCTCCCTTCTCCGCG
GTGCCGGTGCCACCACCACCGCCTCCTGTCTCCGACGAGCTACTCACGGCGGCCATTTGA
ATGATTTTTTCCGATTTTGCCCCTTGCGTCTGTTTTGGTTTTTTATTACAACCACTTTCA
ATCTCTTTAGAACCGTACAAATAAGGGGACGAGGTGTGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4A114JQ U 217
AF RR4A114JQD U 1
AF RR4AC89JQ U 1
AF RR4A114TFB C 333
AF RR4AC89TF C 340
BS 1 805 RR4A114JQD
BS 806 816 RR4AC89JQ
BS 817 1180 RR4A114TFB

RD RR4A114JQ 349 0 0
TTTTAAGTCTAAGCAACTCTGATGATGCTGCTATTACTATCTCCATCACTGAAGCTTGGC
AACATGGTGAAAGCCGAATGTCTTGAGTTGGACTGTTCGTTGAGGTTATTAAAAGACAGA
GAAAGGTTGAGAGACAGCGGAGCAGGAACCTCTGCAGCATCTGTGTTTAGATTGAACGGA
GGATTTGCTTGGAAGGTTACTGGGACAATCTGTGGTGCGTTCTCAGTTCTTGTCGGCACC
ACCGCAACTTGAGTAAAAACTTGCATAGCTTGTTGTCCAGAGCTGATATCAGTTTCAGGT
AGTGATGAGATGTCCTGAGGATGATGCCCCTGATCTTGCTCCATGTGCA

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR4A114JQD 805 0 0
GAGAGAGTCACACCTTCTTTTAACTTACATACCACAAAACAAACCACACATACGGAGAGA
GCAGAGTTTTACAAACAATACAAACAATACAAAACATAGATGATGAAGAACCCCTAAACA
ACAGTTCGTCCATCTCTAAAGCCCCCTTCCTCTGTTGTTATAGTTCTTTTTTCCCCTGAT
TGTTCTTTTTTTCCAAGACAAAAGTAAGGCCTTGGCTTTTAAGTCTAAGCAACTCTGATG
ATGCTGCTATTACTATCTCCATCACTGAAGCTTGGCAACATGGTGAAAGCCGAATGTCTT
GAGTTGGACTGTTCGTTGAGGTTATTAAAAGACAGAGAAAGGTTGAGAGACAGCGGAGCA
GGAACCTCTGCAGCATCTGTGTTTAGATTGAACGGAGGATTTGCTTGGAAGGTTACTGGG
ACAATCTGTGGTGCGTTCTCAGTTCTTGTCGGCACCACCGCAACTTGAGTAAAAACTTGC
ATAGCTTGTTGTCCAGAGCTGATATCAGTTTCAGGTAGTGATGAGATGTCCTGAGGATGA
TGCCCCTGATCTTGCTCCATGTGCATTCCTGTGACGGTCTCGGTTGTGATGTCGAAAAGG
CTAGATCTTCTCCGGCGACGGTTGAGGTTAGTCCGGCGGAGGAAGTATTTCTGAGCGTGA
CTAGCTACCTGAGTAGGCGTCCTGCTCTTGACAAAGTTTCTAGAGATCCCTTTCCAATCT
CCTTTGCCTACTTTTTTCAGACCAAGCAAGAACCTCTTGTGCTCGTCTTCAGTCCATGCT
ATTCCTCGTTTCCTCTCGCGATTTC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4AC89JQ 816 0 0
GAGAGAGTCACACCTTCTTTTAACTTACATACCACAAAACAAACCACACATACGGAGAGA
GCAGAGTTTTACAAACAATACAAACAATACAAAACATAGATGATGAAGAACCCCTAAACA
ACAGTTCGTCCATCTCTAAAGCCCCCTTCCTCTGTTGTTATAGTTCTTTTTTCCCCTGAT
TGTTCTTTTTTTCCAAGACAAAAGTAAGGCCTTGGCTTTTAAGTCTAAGCAACTCTGATG
ATGCTGCTATTACTATCTCCATCACTGAAGCTTGGCAACATGGTGAAAGCCGAATGTCTT
GAGTTGGACTGTTCGTTGAGGTTATTAAAAGACAGAGAAAGGTTGAGAGACAGCGGAGCA
GGAACCTCTGCAGCATCTGTGTTTAGATTGAACGGAGGATTTGCTTGGAAGGTTACTGGG
ACAATCTGTGGTGCGTTCTCAGTTCTTGTCGGCACCACCGCAACTTGAGTAAAAACTTGC
ATAGCTTGTTGTCCAGAGCTGATATCAGTTTCAGGTAGTGATGAGATGTCCTGAGGATGA
TGCCCCTGATCTTGCTCCATGTGCATTCCTGTGACGGTCTCGGTTGTGATGTCGAAAAGG
CTAGATCTTCTCCGGCGACGGTTGAGGTTAGTCCGGCGGAGGAAGTATTTCTGAGCGTGA
CTAGCTACCTGAGTAGGCGTCCTGCTCTTGACAAAGTTTCTAGAGATCCCTTTCCAATCT
CCTTTGCCTACTTTTTTCAGACCAAGCAAGAACCTCTTGTGCTCGTCTTCAGTCCATGCT
ATTCCTCGTTTCCTCTCGCGATTTCCGGCGGAGGAC

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4A114TFB 848 0 0
CAGAGAAAGGTTGAGAGACAGCGGAGCAGGAAC*TCTGCAGCATCTGTGTTTAGATTGAA
CGGAGGATTTGCTTGGAAGGTTACTGGGACAATCTGTGGTGCGTTCTCAGTTCTTGTCGG
CACCACCGCAACTTGAGTAAAAACTTGCATAGCTTGTTGTCCAGAGCTGATATCAGTTTC
AGGTAGTGATGAGATGTCCTGAGGATGATGCCCCTGATCTTGCTCCATGTGCATTCCTGT
GACGGTCTCGGTTGTGATGTCGAAAAGGCTAGATCTTCTCCGGCGACGGTTGAGGTTAGT
CCGGCGGAGGAAGTATTTCTGAGCGTGACTAGCTACCTGAGTAGGCGTCCTGCTCTTGAC
AAAGTTTCTAGAGATCCCTTTCCAATCTCCTTTGCCTACTTTTTTCAGACCAAGCAAGAA
CCTCTTGTGCTCGTCTTCAGTCCATGCTATTCCTCGTTTCCTCTCGCGATTTCCGGCGGA
GGACGACGGAATCTGGACGGCGTCATTGGCGGAGGCGTAACCGGCGGCGACGGCGGCTGT
CACATCAGCTTCTCCATCTCCGATCTTGGGGATCTCCTCATCGGGCGAAGACTTCTCGTA
ATCAGAGAGATTGTTCAAACTCACACACTTCCTCATCGGATCGACAACGACTCTAACTCC
GAACAGCATGATCTCTCCCTTCTCCGCGGTGCCGGTGCCACCACCACCGCCTCCTGTCTC
CGACGAGCTACTCACGGCGGCCATTTGAATGATTTTTTCCGATTTTGCCCCTTGCGTCTG
TTTTGGTTTTTTATTACAACCACTTTCAATCTCTTTAGAACCGTACAAATAAGGGGACGA
GGTGTGAG

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR4AC89TF 837 0 0
AGGTTGAGAGACAGCGGAGCAGGA*CCTCTGCAGCATCTGTGTTTAGATTGAACGGAGGA
TTTGCTTGGAAGGTTACTGGGACAATCTGTGGTGCGTTCTCAGTTCTTGTCGGCACCACC
GCAACTTGAGTAAAAACTTGCATAGCTTGTTGTCCAGAGCTGATATCAGTTTCAGGTAGT
GATGAGATGTCCTGAGGATGATGCCCCTGATCTTGCTCCATGTGCATTCCTGTGACGGTC
TCGGTTGTGATGTCGAAAAGGCTAGATCTTCTCCGGCGACGGTTGAGGTTAGTCCGGCGG
AGGAAGTATTTCTGAGCGTGACTAGCTACCTGAGTAGGCGTCCTGCTCTTGACAAAGTTT
CTAGAGATCCCTTTCCAATCTCCTTTGCCTACTTTTTTCAGACCAAGCAAGAACCTCTTG
TGCTCGTCTTCAGTCCATGCTATTCCTCGTTTCCTCTCGCGATTTCCGGCGGAGGACGAC
GGAATCTGGACGGCGTCATTGGCGGAGGCGTAACCGGCGGCGACGGCGGCTGTCACATCA
GCTTCTCCATCTCCGATCTTGGGGATCTCCTCATCGGGCGAAGACTTCTCGTAATCAGAG
AGATTGTTCAAACTCACACACTTCCTCATCGGATCGACAACGACTCTAACTCCGAACAGC
ATGATCTCTCCCTTCTCCGCGGTGCCGGTGCCACCACCACCGCCTCCTGTCTCCGACGAG
CTACTCACGGCGGCCATTTGAATGATTTTTTCCGATTTTGCCCCTTGCGTCTGTTTTGGT
TTTTTATTACAACCACTTTCAATCTCTTTAGAACCGTACAAATAAGGGGACGAGGTG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 7

CO CL1062Contig1 1077 7 11 U
TATACTCCTATAATTCACAATAACGTACATTTAGTTAGGTTCAACTAATGAAACCCTATA
CGATTGAAGTCATTTGAAAGAAAGAAATGTAATTCATTAGACTTTAACTAAACCAAATAT
GTTGAAGTTCAACTAAACATTTAAAATGAAAACAAAAGATTAATTGAGTAGCGAGTCTTT
AGAAATCAAACTAAAACCATTGCCTAAATTCTGTCTCTTGCTCATCATCTCCTCGTATTT
CCCGGCCAAAGAGTCAAAGAGAATCCCAGCTCCAACTCCTACCGCAAGATCGATTGTGTA
GTGTCCTCTCGTCCCGAGCAGCCTGATCGATTGCAACACGTTGAGGATATCAAAAAGCAT
CGCTAGTCTCAACCTCTGCATTCTCCTCATGTCCAAGGATGCGATCATTGAACCAGCGAC
GTGACCAGAATAGAAGAGGAAGAATGAGACATTTCCCACCGGAAAATCAACTCCTGATCC
TAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAGAGTAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAA
CATGAAGCAAGCCGAGATAGTGGCTCGTGGTCTTCCTTCCATCAACCATGTCCATACAAT
ATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGTTTAGAGCCGCTAAAAGGGTGTTAAGATC
CGGTGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGCGCGTGACCACAAACCCAATATCAAACGG
CTCAGACTTCGCCGGAACCATCTGGAGCGTGTACTCAACGCCCATAAAGAACAGAACTCC
GACCGCAGAGAAACACGGTATCCAATGGTATCTCGCCACGTAGACAACGTCACGCATAGT
CCACGTCAGAAACGACGCTTTGCTCTTCCCTCCTCCCCCGTTGCCGTTGGTGTAGCAGTC
GTCGGTTTTCTTGACAACGTTCTCCATTCCGTTTAAGGCCACTCCGTTAGTGTGATATCC
GTTAGATCTGCGACGGAGAGGGACGACGGTATTAGTTGACATGACCGTTAGAGTTAACGG
AGAGGAACATTTTTTTATGTTTAGAGAGATGAGTTATATAAGAGATACGATGCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H963JQB U 1
AF RR4FL59JQ U 93
AF RR4H963TF C 152
AF RR4BL90JQ U 93
AF RR4CH32JQ U 93
AF RR4FL59TF C 463
AF RR4CH32TF C 716
BS 1 560 RR4H963JQB
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BS 726 870 RR4BL90JQ
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BS 878 900 RR4BL90JQ
BS 901 1077 RR4FL59TF

RD RR4H963JQB 725 0 0
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CGATTGAAGTCATTTGAAAGAAAGAAATGTAATTCATTAGACTTTAACTAAACCAAATAT
GTTGAAGTTCAACTAAACATTTAAAATGAAAACAAAAGATTAATTGAGTAGCGAGTCTTT
AGAAATCAAACTAAAACCATTGCCTAAATTCTGTCTCTTGCTCATCATCTCCTCGTATTT
CCCGGCCAAAGAGTCAAAGAGAATCCCAGCTCCAACTCCTACCGCAAGATCGATTGTGTA
GTGTCCTCTCGTCCCGAGCAGCCTGATCGATTGCAACACGTTGAGGATATCAAAAAGCAT
CGCTAGTCTCAACCTCTGCATTCTCCTCATGTCCAAGGATGCGATCATTGAACCAGCGAC
GTGACCAGAATAGAAGAGGAAGAATGAGACATTTCCCACCGGAAAATCAACTCCTGATCC
TAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAGAGTAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAA
CATGAAGCAAGCCGAGATAGCGGCTCGTGGTCTTCCTTCCATCAACCATGTCCATACAAT
ATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGTTTAGAGCCGCTAAAAGGGTGTTAAGATC
CGGCGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGCGCGTGACCACAAACCCAATATCAAACGG
CTCAG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FL59JQ 661 0 0
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CAAAAGATTAATTGAGTAGCGAGTCTTTAGAAATCAAACTAAAACCATTGCCTAAATTCT
GTCTCTTGCTCATCATCTCCTCGTATTTCCCGGCCAAAGAGTCAAAGAGAATCCCAGCTC
CAACTCCTACCGCAAGATCGATTGTGTAGTGTCCTCTCGTCCCGAGCAGCCTGATCGATT
GCAACACGTTGAGGATGTCAAAAAGCATCGCTAGTCTCAACCTCTGCATTCTCCTCATGT
CCAAGGATGCGATCATTGAACCAGCGACGTGACCAGAATAGAAGAGGAAGAATGAGACAT
TTCCCACCGGAAAATCAACTCCTGATCCTAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAG
AGTAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAACATGAAGCAAGCCGAGATAGTGGCTCGTGGTC
TTCCTTCCATCAACCATGTCCATACAATATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGT
TTAGAGCCGCTAAAAGGGTGTTAAGATCCGGTGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGC
GCGTGACCACAAACCCAATATCAAACGGCTCAGACTTCGCCGGAACCATCTGGAGCGTGT
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4H963TF 677 0 0
AAC
AAAGATTAATTGAGTAGCGAGTCTT*AGAAATCAAACTAAAACCATTGC*TAAATTCTGT
CTCTTGCTCATCATCTC*TCGTATTTCCCGGCCAAAGAGTCAAAGAGAATCCCAGCTCCA
ACTCCTACCGCAAGATCGATTGTGTAGTGTCCTCTCGTCCCGAGCAGCCTGATCGATTGC
AACACGTTGAGGATATCAAAAAGCATCGCTAGTCTCAACCTCTGCATTCTCCTCATGTCC
AAGGATGCGATCATTGAACCAGCGACGTGACCAGAATAGAAGAGGAAGAATGAGACATTT
CCCACCGGAAAATCAACTCCTGATCCTAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAGAG
TAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAACATGAAGCAAGCCGAGATAGCGGCTCGTGGTCTT
CCTTCCATCAACCATGTCCATACAATATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGTTT
AGAGCCGCTAAAAGGGTGTTAAGATCCGGCGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGCGC
GTGACCACAAACCCAATATCAAACGGCTCAGACTTCGCCGGAACCATCTGGAGCGTGTAC
TCAACGCTCATAAAGAACAGAACTCCGACCGCAAAGAAACACGGTATCCAATGGTATCTC
GCCACGTAGACAAC

QA 4 677 4 677
DS 

RD RR4BL90JQ 808 0 0
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CAAAAGATTAATTGAGTAGCGAGTCTTTAGAAATCAAACTAAAACCATTGCCTAAATTCT
GTCTCTTGCTCATCATCTCCTCGTATTTCCCGGCCAAAGAGTCAAAGAGAATCCCAGCTC
CAACTCCTACCGCAAGATCGATTGTGTAGTGTCCTCTCGTCCCGAGCAGCCTGATCGATT
GCAACACGTTGAGGATGTCAAAAAGCATCGCTAGTCTCAACCTCTGCATTCTCCTCATGT
CCAAGGATGCGATCATTGAACCAGCGACGTGAC*AGAATAGAAGAGGAAGAATGAGACAT
TTCCCACCGGAAAATCAACTCCTGATCCTAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAG
AGTAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAACATGAAGCAAGCCGAGATAGTGGCTCGTGGTC
TTCCTTCCATCAACCATGTCCATACAATATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGT
TTAGAGCCGCTAAAAGGGTGTTAAGATCCGGTGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGC
GCGTGACCACAAACCCAATATCAAACGGCTCAGACTTCGCCGGAACCATCTGGAGCGTGT
ACTCAACGCCCATAAAGAACAGAACTCCGACCGCAGAGAAACACGGTATCCAATGGTATC
TCGCCACGTAGACAACGTCACGCATAGTCCACGTCAGAAACGACGCTTTGCTCTTCCC*C
CTCC*CCGTTGCCGTTGGTGTAGCAGTC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4CH32JQ 750 0 0
TTCATTAGACTTTAACTAAACCAAATATGTTGAAGTTCAACTAAACATTTAAAATGAAAA
CAAAAGATTAATTGAGTAGCGAGTCTTTAGAAATCAAACTAAAACCATTGCCTAAATTCT
GTCTCTTGCTCATCATCTCCTCGTATTTCCCGGCCAAAGAGTCAAAGAGAATCCCAGCTC
CAACTCCTACCGCAAGATCGATTGTGTAGTGTCCTCTCGTCCCGAGCAGCCTGATCGATT
GCAACACGTTGAGGATGTCAAAAAGCATCGCTAGTCTCAACCTCTGCATTCTCCTCATGT
CCAAGGATGCGATCATTGAACCAGCGACGTGAC*AGAATAGAAGAGGAAGAATGAGACAT
TTCCCACCGGAAAATCAACTCCTGATCCTAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAG
AGTAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAACATGAAGCAAGCCGAGATAGTGGCTCGTGGTC
TTCCTTCCATCAACCATGTCCATACAATATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGT
TTAGAGCCGCTAAAAGGGTGTTAAGATCCGGTGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGC
GCGTGACCACAAACCCAATATCAAACGGCTCAGACTTCGCCGGAACCATCTGGAGCGTGT
ACTCAACGCCCATAAAGAACAGAACTCCGACCGCAGAGAAACACGGTATCCAATGGTATC
TCGCCACGTAGACA*CGTCACGCATAGTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4FL59TF 615 0 0
AAAATCAACTCCTGATCCTAAAAAATCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAGTAGAGTAACCAAG
AATGCCGCGACAAGTAAACATGAAGCAAGCCGAGATAGTGGCTCGTGGTCTTCCTTCCAT
CAACCATGTCCATACAATATACGTCGTTTGCATCGCGACGAATACCGTGTTTAGAGCCGC
TAAAAGGGTGTTAAGATCCGGTGAACTCGCCAAGACACGGTTCAGAGAGCGCGTGACCAC
AAACCCAATATCAAACGGCTCAGACTTCGCCGGAACCATCTGGAGCGTGTACTCAACGCC
CATAAAGAACAGAACTCCGACCGCAAAGAAACACGGTATCCAATGGTATCTCGCCACGTA
GACAACGTCACGCATAGTCCACGTCAGAAACGACGCCTTGCTCTTCCCTCCTCCTCCGTT
GCCGTTGGTGTAGCAGTCGTCGGTTTTCTTGACAACGTTCTCCATTCCGTTTAAGGCCAC
TCCGTTAGTGTGATATCCGTTAGATCTGCGACGGAGAGGGACGACGGTATTAGTTGACAT
GACCGTTAGAGTTAACGGAGAGGAACATTTTTTTATGTTTAGAGAGATGAGTTATATAAG
AGATACGATGCGGCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4CH32TF 358 0 0
AACGGCTCAGA*TTCGCCGGA*CCATCTGGAGCGTGTACTCAACGCCCATAAAGAACAGA
ACTCCGACCGCAGAGAAACACGGTATCCAATGGTATCTCGCCACGTAGACAACGTCACGC
ATAGTCCACGTCAGAAACGACGCTTTGCTCTTCCCTCCTCCCCCGTTGCCGTTGGTGTAG
CAGTCGTCGGTTTTCTTGACAACGTTCTCCATTCCGTTTAAGGCCACTCCGTTAGTGTGA
TATCCGTTAGATCTGCGACGGAGAGGGACGACGGTATTAGTTGACATGACCGTTAGAGTT
AACGGAGAGGAACATTTTTTTATGTTTAGAGAGATGAGTTATATAAGAGATGCGAT
CC

QA 1 356 1 356
DS 



AS 2 7

CO CL1063Contig1 714 4 4 U
TTTTGATGAAAGATCTCATAATCATAACTAGATTCATAATTCATCCAAAAAGGATCTGTA
TCAACAACAACCATACTTGCCATCACTATTTTTCTTGACTATTCGAAACGTCTAAAGATA
CATACATTAAACTGAGGGTTTTCTCAATCTTCAGTTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGAG
CTCATCCTTTCTTCCTTTTGTTGGAAGACCTTTCTCCTTGAGAAGGGCACGGAGCTTCTC
CACAGTTAAAGACTGAAAGTCTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGA
TACAAGAGTAGCAGGTCTTTTAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCTTATTTGCAGTCCT
CTTTTTAGGACCATCTTCAGGAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAG
CAAGAGGGATCTGATTAGTATGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGG
AGATGTGTCATGCTCACATACGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGACGACGGT
AGAAGATAAGAAACCGCGGGACGGAAGGTCGGAAAGGAACTTGGATGCAGTTTCATCAGC
AGAAGATTCCGATGACCGAGAAGATGACGCCTCCATTGTTGCCTAACCACTACTGATAAA
CCCCAATCCAAAAGGCAACACCAAGCGAGATTAGAGAAGAGAGATCGACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4E783JQ U 20
AF RR4E783TF C 1
AF RR4B722JQ U 20
AF RR4B722TF C 20
BS 1 19 RR4E783TF
BS 20 547 RR4E783JQ
BS 548 709 RR4B722JQ
BS 710 714 RR4E783TF

RD RR4E783JQ 528 0 0
AATCATAACTAGATTCATAATTCATCCAAAAAGGATCTGTATCAACAACAACCATACTTG
CCATCACTATTTTTCTTGACTATTCGAAACGTCTAAAGATACATACATTAAACTGAGGGT
TTTCTCAATCTTCAGTTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGAGCTCATCCTTTCTTCCTTTT
GTTGGAAGACCTTTCTCCTTGAGAAGGGCACGGAGCTTCTCCACAGTTAAAGACTGAAAG
TCTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGATACAAGAGTAGCAGGTCTT
TTAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCTTATTTGCAGTCCTCTTTTTAGGACCATCTTCA
GGAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAGCAAGAGGGATCTGATTAGT
ATGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGGAGATGTGTCATGCTCACAT
ACGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGACGACGGTAGAAGAT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4E783TF 714 0 0
TTTTGATGAAAGATCTCATAATCATAACTAGATTCATAATTCATCCAAAAAGGATCTGTA
TCAACAACAACCATACTTGCCATCACTATTTTTCTTGACTATTCGAAACGTCTAAAGATA
CATACATTAAACTGAGGGTTTTCTCAATCTTCAGTTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGAG
CTCATCCTTTCTTCCTTTTGTTGGAAGACCTTTCTCCTTGAGAAGGGCACGGAGCTTCTC
CACAGTTAAAGACTGAAAGTCTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGA
TACAAGAGTAGCAGGTCTTTTAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCTTATTTGCAGTCCT
CTTTTTAGGACCATCTTCAGGAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAG
CAAGAGGGATCTGATTAGTATGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGG
AGATGTGTCATGCTCACATACGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGACGACGGT
AGAAGATAAGAAACCGCGGGACGGAAGGTCGGAAAGGAACTTGGATGCAGTTTCATCAGC
AGAAGGTTCCGATGACCGAGAAGATGACGCCTCCATTGTTGCCTAACCACTACTGATAAA
CCCCAATCCAAAAGGCAACACCAAGCGAGATTAGAGAAGAGAGATCGACAATCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4B722JQ 692 0 0
AATCATAACTAGATTCATAATTCATCCAAAAAGGATCTGTATCAACAACAACCATACTTG
CCATCACTATTTTTCTTGACTATTCGAAACGTCTAAAGATACATACATTAAACTGAGGGT
TTTCTCAATCTTCAGTTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGGGCTCATCCTTTCTTCCTTTT
GTTGGAAGACCTTTCTCCTTGAGAAGGGCACGGAGCTTCTCCACAGTTAAAGACTGAAAG
TCTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGATACAAGAGTAGCAGGTCTT
TTAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCT*ATTTGCAGTCCTCTTTTTAGGACCATCTTCA
GGAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAGCAAGAGGGATCTGATTAGT
ATGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGGAGATGTGTCATGCTCACAT
ACGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGACGACGGTAGAAGATAAGAAACCGCGG
GACGGAAGGTCGGAAAGGAACTTGGATGCAGTTTCATCAGCAGAAGATTCCGATGACCGA
GAAGATGACGCCTCCATTGTTGCCTAACCACTACTGATAAACCCCAATCCAAAAGGCAAC
ACCAAGCGAGATTAGAGAAGAGAGATCGAC
CC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4B722TF 692 0 0
AATCATAACTAGATTCATAATTCATCCAAAAAGGATCTGTATCAACAACAACCATACTTG
CCATCACTATTTTTCTTGACTATTCGAAACGTCTAAAGATACATACATTAAACTGAGGGT
TTTCTCAATCTTCAGTTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGGGCTCATCCTTTCTTCCTTTT
GTTGGAAGACCTTTCTCCTTGAGAAGGGCACGGAGCTTCTCCACAGTTAAAGACTGAAAG
TCTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGATACAAGAGTAGCAGGTCTT
TTAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCT*ATTTGCAGTCCTCTTTTTAGGACCATCTTCA
GGAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAGCAAGAGGGATCTGATTAGT
ATGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGGAGATGTGTCATGCTCACAT
ACGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGACGACGGTAGAAGATAAGAAACCGCGG
GACGGAAGGTCGGAAAGGAACTTGGATGCAGTTTCATCAGCAGAAGATTCCGATGACCGA
GAAGATGACGCCTCCATTGTTGCCTAACCACTACTGATAAACCCCAATCCAAAAGGCAAC
ACCAAGCGAGATTAGAGAAGAGAGATCGAC
CC

QA 1 690 1 690
DS 



CO CL1063Contig2 751 3 5 U
TCATTGTCGATCTCTCTTCTCTACTCTCGCTCTGTGTGCCTTTTGGATTGGGGTTTATCA
GTAGTGGGTTAGGGCAACAATGGAGGCGTCATCGTCTCGGTCATCGGAATCTTCTGCTGA
TGAAACTGCTTCCAAGTTCCTTTCCGACCTTCCGTCCCGCGGTTTCTTATCTTCTACCGT
CCTCCCCTCCAATCCGGGAAGCTTGCGGGTGTACGTATGTGAGCATGACACATCTCCCCC
TGAAGGACAGGTTATCAAGACAAACCAGCAAAACATACTAATCAGATCCCTCTTGCTAAA
GAAGCAAAAAGGAGAATCTAGTTCCAAAGGAACTCCTGAAGATGGTCCTAAAAAGAGGAC
TGCAAATAAGGCTCTGGACGACAGAAGCTCAGCTAAAAGACCTGCTACTCTTGTATCTAG
ACAAGAAGGATCAAGCAGTCGTTCAGGAGAAAAAGACTTTCAGTCTTTAACTGTGGAGAA
GCTCCGTGCCCTTCTCAAGGAGAAAGGTCTTCCAACAAAAGTAAGAAAGGATGAGCTCAT
TGCACGTCTGAAGAGTGCCAACTGAAGATTGAGAAAACGCTCAGTTTAATGTATGTATCT
TTAGACGTTTCGAATAGTCAAAAAAGTGATGGCAAGGATGGTTGTTGTTGTTGATACAGA
TCCTTTTGGATAAATTATGAATCTAGTTCTAATTTTGAGATCTTTTGAACTCGTTTTCAG
GGCTTAGATCGAGTTTTATTACACTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET32TF U 12
AF RR4FU66TF U 4
AF RR4ET32JQ C 1
BS 1 5 RR4ET32JQ
BS 6 11 RR4FU66TF
BS 12 618 RR4ET32TF
BS 619 621 RR4FU66TF
BS 622 751 RR4ET32JQ

RD RR4ET32TF 607 0 0
CTCTCTTCTCTACTCTCGCTCTGTGTGCCTTTTGGATTGGGGTTTATCAGTAGTGGGTTA
GGGCAACAATGGAGGCGTCATCGTCTCGGTCATCGGAATCTTCTGCTGATGAAACTGCTT
CCAAGTTCCTTTCCGACCTTCCGTCCCGCGGTTTCTTATCTTCTACCGTCCTCCCCTCCA
ATCCGGGAAGCTTGCGGGTGTACGTATGTGAGCATGACACATCTCCCCCTGAAGGACAGG
TTATCAAGACAAACCAGCAAAACATACTAATCAGATCCCTCTTGCTAAAGAAGCAAAAAG
GAGAATCTAGTTCCAAAGGAACTCCTGAAGATGGTCCTAAAAAGAGGACTGCAAATAAGG
CTCTGGACGACAGAAGCTCAGCTAAAAGACCTGCTACTCTTGTATCTAGACAAGAAGGAT
CAAGCAGTCGTTCAGGAGAAAAAGACTTTCAGTCTTTAACTGTGGAGAAGCTCCGTGCCC
TTCTCAAGGAGAAAGGTCTTCCAACAAAAGTAAGAAAGGATGAGCTCATTGCACGTCTGA
AGAGTGCCAACTGAAGATTGAGAAAACGCTCAGTTTAATGTATGTATCTTTAGACGTTTC
GAATAGT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FU66TF 622 0 0
GG
GTCGATCTCTCTTCTCTACTCTCGCTCTGTGTGCCTTTTGGATTGGGGTTTATCAGTAGT
GGGTTAGGGCAACAATGGAGGCGTCATCGTCTCGGTCATCGGAATCTTCTGCTGATGAAA
CTGCTTCCAAGTTCCTTTCCGACCTTCCGTCCCGCGGTTTCTTATCTTCTACCGTCCTCC
CCTCCAATCCGGGAAGCTTGCGGGTGTACGTATGTGAGCATGACACATCTCCCCCTGAAG
GACAGGTTATCAAGACAAACCAGCAAAACATACTAATCAGATCCCTCTTGCTAAAGAAGC
AAAAAGGAGAATCTAGTTCCAAAGGAACTCCTGAAGATGGTCCTAAAAAGAGGACTGCAA
ATAAGGCTCTGGACGACAGAAGCTCAGCTAAAAGACCTGCTACTCTTGTATCTAGACAAG
AAGGATCAAGCAGTCGTTCAGGAGAAAAAGACTTTCAGTCTTTAACTGTGGAGAAGCTCC
GTGCCCTTCTCAAGGAGAAAGGTCTTCCAACAAAAGGAAGAAAGGATGAGCTCATTGCAC
GTCTGAAGAGTGCCAACTGAAGATTGAGAAAACGCTCAGTTTAATGTATGTATCTTTAGA
CGTTTCGAATAGTCAA
AAAA

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR4ET32JQ 751 0 0
TCATTGTCGATCTCTCTTCTCTACTCTCGCTCTGTGTGCCTTTTGGATTGGGGTTTATCA
GTAGTGGGTTAGGGCAACAATGGAGGCGTCATCGTCTCGGTCATCGGAATCTTCTGCTGA
TGAAACTGCTTCCAAGTTCCTTTCCGACCTTCCGTCCCGCGGTTTCTTATCTTCTACCGT
CCTCCCCTCCAATCCGGGAAGCTTGCGGGTGTACGTATGTGAGCATGACACATCTCCCCC
TGAAGGACAGGTTATCAAGACAAACCAGCAAAACATACTAATCAGATCCCTCTTGCTAAA
GAAGCAAAAAGGAGAATCTAGTTCCAAAGGAACTCCTGAAGATGGTCCTAAAAAGAGGAC
TGCAAATAAGGCTCTGGACGACAGAAGCTCAGCTAAAAGACCTGCTACTCTTGTATCTAG
ACAAGAAGGATCAAGCAGTCGTTCAGGAGAAAAAGACTTTCAGTCTTTAACTGTGGAGAA
GCTCCGTGCCCTTCTCAAGGAGAAAGGTCTTCCAACAAAAGTAAGAAAGGATGAGCTCAT
TGCACGTCTGAAGAGTGCCAACTGAAGATTGAGAAAACGCTCAGTTTAATGTATGTATCT
TTAGACGTTTCGAATAGTCAAAAAAGTGATGGCAAGGATGGTTGTTGTTGTTGATACAGA
TCCTTTTGGATAAATTATGAATCTAGTTCTAATTTTGAGATCTTTTGAACTCGTTTTCAG
GGCTTAGATCGAGTTTTATTACACTGGTTCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 7

CO CL1064Contig1 1208 7 9 U
AGTTTTGTCTATTATTAATGAGTGAGGAGAAGTTGAGAAGCGCTGTTTGCGTTTGAACCA
AACAGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCTCCTCTGATAATGGCTAATGCAGTTAGATTCT
TCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTC
CTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATT
GCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTCTTTAAAAAATTGTTTGAAG
ACAATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATG
ACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTGAAAAGAACTCTACAGGATCTGCAGCTTGACTATG
TCGATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGCTAAGC
CCGAGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTATG
ACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTACCC
TCTTAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCCTGCCGTTAATCAGGTCGAATGTCATCCTTCTTGGC
AACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCTC
CATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGATGTTTTGAAGAACCCTATACTGA
ATACTGTTGCTGATAAACTTGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTCGCGCTTCGCTGGGGACTAC
AAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAAAAGCACCAATGAAGTGAGAATCAGAGAGAACTTTG
AGGTTTTTGATTGGTCCATACCCGATGACTTCTTTGCCAAGTTTTCAGAGATTGAACAGG
CTAGGTTATTGACTGCTTCCTTCTTCGTTCATGAGACATTGAGCCCTTATAAGTCTCTTC
AAGAATTATGGGATGGTGAGATATGATACTTCAAATGATTTATTTGTTTTATCAATAATA
TGGAGGCTTCTATGTCTTTCGAACTTCTCAGTTTATTCATGAATGTTACGTCACTCAAAT
CATTTACTTTCATATTTGTGTTATTTTGAATTTTAATTAAAAGCTTATAAAGCCAATTAT
GCATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ84TF U 27
AF RR4B939TF U 1
AF RR4GV92TF U 53
AF RR4DG45TF U 265
AF RR4DG45JQ C 342
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BS 1 221 RR4B939TF
BS 222 222 RR4AQ84TF
BS 223 688 RR4B939TF
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BS 690 765 RR4B939TF
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BS 829 955 RR4DG45TF
BS 956 1208 RR4DG45JQ

RD RR4AQ84TF 608 0 0
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TCTCCTCTGATAATGGCTAATGCAGTTAGATTCTTCGAGCTCAGCACTGGCGCTAAGATC
CCGTCGGTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTCCTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCC
GCAGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAA
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GCCGTTAA

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DS 

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AACAGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCTCCTCTGATAATGGCTAATGCAGTTAGATTCT
TCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTC
CTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCTGTTAAGATCTGATATCGTCATATTGATT
GCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTCTTTAAAAAATTGTTTGAAG
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TCTTAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCCTGCCGTTAATCAGGTCGAATGTCATCCTTCTTGGC
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GG
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GATTCTTCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGAACATGGCAAG
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TTGATTGCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTCTTTAAAAAATTGT
TTGAAGACAATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTGTACTG
ATCATGACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTGAAAAGAACTCTACAGGATCTGCAGCTTG
ACTATGTCGATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAG
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TCTATGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAG
CTACCCTCTTAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCCCGCCGTTAATCAGGTCGAATGTCATCCTT
CTTGGCAACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCACCTCACCGCAT
ACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAA*GCGATGTTTTGA*GAACCCTA
TACTGAATACTGTTGCTG

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DS 

RD RR4DG45TF 691 0 0
G
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GTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACT
GAAAAGAACTCTACAGGATCTGCAGCTTGACTATGTCGATCTCTATTTGATACACTGGCC
TGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGCTAAGCCCGAGAACCTTATGCCTGTAGATAT
TTCTAGCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTATGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGG
AGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTACCCTCTTAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCC
TGCCGTTAGTCAGGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTG
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GTCTCCAGCGCAAGTCGCGCTTCGCTGGGGACTACAAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAA
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TGACTTCTTTGCCAAGTTTTCAGAGATTGA

QA 2 691 2 691
DS 

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GGTTCTGTTGGAGCTAAGCCCGAGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAA
GCGATGGAAGCACTCTATGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCC
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GAATGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTT
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TTGAAGAACCCTATACTGAATACTGTTGCTGATAAACTTGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTC
GCGCTTCGCTGGGGACTACAAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAAAAGCACCAATGAAGTG
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TTTTCAGAGATTGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTTCCTTCTTCGTTCATGAGACATTG
AGCCCTTATAAGTCTCTTCAAGAATTATGGGATGGTGAGATATGATACTTCAAATGATTT
ATTTGTTTTATCAATAATATGGAGGCTTCTATGTCTTTCGAACTTCTCAGTTTATTCATG
AATGTTACGTCACTCAAATCATTTACTTTCATATTTGTGTTATTTTGAATTTTAATTAAA
AGCTTATAAAGCCAATTATGCATTCCC

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DS 

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AATGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTC
ACCTCACCGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGATGTTT
TGAAGAACCCTATACTGAATACTGTTGCTGATAAACTTGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTCG
CGCTTCGTTGGGGACTACAAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAAAAGCACCAATGAAGTGA
GAATCAGAGAGAACTTTGAGGTTTTTGATTGGTCCATACCCGATGACTTCTTTGCCAAGT
TTTCAGAGATTGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTTCCTTCTTCGTTCATGAGACATTGA
GCCCTTATAAGTCTCTTCAAGAATTATGGGATGGTGAGATATGATACTTCAAATGATTTA
TTTGTTTTATCAATAATATGGAGGCTTTTATGTCTTTCGAACTTCTCAGTTTATTCATGA
ATGTTACGTCACTCAAATCATTTACTTTCATATTTGTGTTATTTTGAATTTTAATTAAAA
GCTTATAAAGCCAATTATGC
ATTCC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4GV92JQ 798 0 0
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TCTGTTGGAGCTAAGTCCGAGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAAGCG
ATGGAAGCACTCTATGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACC
AAGAAGCTAGCTACCCTCTTAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCCCGCCGTTAATCAGGTCGAA
TGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCAC
CTCACCGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGATGTTTTG
AAGAACCCTATACTGAATACTGTTGCTGATAAACTTGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTCGCG
CTTCGCTGGGGACTACAAATGGGTAACAGTGCTCTTCCTAAAAGCACCAATGAAGCGAGA
ATCAGAGAGAACTTTGAGGTTTTTGATTGGTCCATACCCGATGACTTCTTTGCCAAGTTT
TCAGAGATTGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTTCCTTCTTCGTTCATGAGACATTGAGC
CCTTATAAGTCTCTTCAAGAATTATGGGATGGTGAGATATGATACTTCAAATGATTTATT
TGTTTTATCAATAATATGGAGGCTTCTATGTCTTTCGAACTTCTCAGTTTATTCATGAAT
GTTACGTCACTCAAATCATTTACTTTCATATTTGTGTTATTTTGAATTTTAATTAAAAGC
TTATAAAGCCAATTATGC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 7

CO CL1065Contig1 1615 7 12 U
GCTGGAGAAAGATGCTCTTGTTAGACAGATGGGTGTGAACCCAACAAGTCAGAACCCTAC
ACTGTTCAAAGATCTCCTCGGCTAACAGAACCATTCTCCCAACCAAACCAAAACATCCAT
TGACTCACATAATCATCTTCATCATCATCAACATCGCCACACATTCCCATATTTGGTAAT
GCGTTGTGGAGTTTGTTGGTAATGCTTCTGATTTCACATTCTCAAGTCTCAACATCGCCA
CATTCACGTATATTTTTGATAGGGTGCGTTGGGGGATAAGTAATGTTTCTGGTTTAAGAA
CAGCTTTTTGTTGTACCTATGTTCCTGGAGATTTTTGTTTTCAAAGGTTTCTCTTTTTTT
TTGTTTTCATATCAGTGAATGGTTGCTGTTTGATTTTGGAGCTTCTCTTGTTTGTATCTA
TAGAAACAATGTTACTATTATAGGCGTGATGGATACAAAGTTATTACAAGCTAAGCTTTG
GTAAAAATGCTATTCGTAAGCATTCACATACCAACTTCAAAACCACAAAAATCAATTGAA
AAACAACAAAGAAGGGGATTCCAACTTTATTGAAGTAAATATGGCTGTTCGAATGTATTT
TGTATTACTGTAGATGAAATTTGTTTTTCTAAATCACTTGTGTAAAACATCTAATATCAA
GTATTAAATCATCTAAGAAACTATCGGTAGTGACACTCCTTTATCGTCATCATCTGCACT
GCTACACAGCCTCACTCAACAGAAGTGAGAAACGATTGGATGCCAAAAATAATGAAAAGC
ATTCCACCAGAAAGAGCAACTATTCGTTCGGATATTTGGGAAGCTAAGCTCTTTCCTCCA
ATCACAGCAGCAGTTGTACACAATAGCCGTGCGACAATTCCGCCAAGGACCACCCCAAAC
GGATTTTCATCGGCAGCTAAACCAATAGTAGCAAGCTGACTCTTGTCACCAAATTCACCA
AAGAAATTAATCGAAAATGCCTTGAGAAAGATTGGAGAAAAGAATTGTGTGAGGAACGGC
CTTTTCTCCTTTTTGTTTTCATCTTCAATCTTACTGTTGTTATCTTTGGTAGCTTTACCA
TTAGCCTTCAAATCAGAATCCAGTTCTGCTTCGACTTCAGCCAATTCTTCTGATTCCCCT
CCATCTCCTTTGAAACCGTCAAGCAAAGACCAAAGACCGAAACCAAAGAACAACAATGTC
GTTATGTGATGAGTCCACTTGCGAGAGATCAGATTAGGAGCAGCCCATCCAACAGTAGCA
GAGAGGATAGTCATGACAATAAGAGCAGAGACACAACCAGCCAACACAAGTCTCCTTGGA
TAACGCATCGCCAGAATAGCGGCGGCGAAAAAGGTCTTGTCGCCAATCTCCGAGACAAAA
GTCATGGCCAGTGACTTGGTAAAACCCTGCAAAACCGAGCTCATGGCTATCGTCTTATAT
ATAAGCAGCTTCAAACTCCGAAAACTTCCGAACTTAACCAGAGTCAAGCGGAGTGATCGA
CTGCCAGAAGAAGCAAAGAGCCGGCAGTCTAGAGAGAGAGAGACGAAAGTTGTGTTCAAG
TGCGCAGCGAAAGATGAATGATTTTTTATTTTTTCTTTCTTTGTTAGAGGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G910TF U 1
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AF RR4AM80TF C 747
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QA 1 637 1 637
DS 

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C
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TGTACACAATAGCCGTGCGACAATTCCGCCAAGGACCACCCCAAACGGATTTTCATCGGC
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AGTAGCAAGCTGACTCTTGTCACCAAATTCACCAAAGAAATTAATCGAAAATGCCTTGAG
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CC

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AGTCTAGAGAGAGAGAGACGAAAGTTGTGTTCAAGTGCGCAGCGAAAGATGAATGATTTT
TTATTTTTTCTTTCTTTGTTAGAGGCTTTC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 5

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CCGTAGCGAGAAGTCACCGTCTATCGTGTACTCTTCTCCTGTTCCGTCGTATACTTCTAC
TTCCATCGTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACGCTGAAGATCGGTTTCTGACC
CTCTTGTCTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGCAGAGTCGGTCTCTTGCGTTT
AACGGTGAGCAGACACTTTCCGGTGGCGTCCATGAGGACAAACTCGTCGTTATCTCTTCC
GTATGAATCAACCCTAAAGATGATATCGCCGTTACAGTCGTAGGTGGTGAAACCATCGCC
GGTGTGGAACAGAGAGGTTTTGCATACGGTCAGTGGGTTTTCTTCATCGTAGAGAAGCTT
TGTCCACCACAATTCTTCTTTCTCCTATCTTGTTTTCTTCTTTTGGAGCCTTCTCTTCAA
CTAATTCCATTTTTTTTTTATTTGGTGTTCGGAAGTTAGATTTTGTGGTTTGTTTAACGA
ATGATTATGATATGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D315JQ U 1
AF RR4H669JQB U 118
AF RR4C186JQ U 68
AF RR4C186TF C 345
AF RR4C401TF C 856
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BS 116 600 RR4D315JQ
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BS 693 835 RR4C186JQ
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BS 920 960 RR4C186TF
BS 961 979 RR4C401TF

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AAAACCCAAAGATTCGATTCGATTGGTTAAAACCGGAACAAAGACTTGACGAGGTGAAAG
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TGGATCATCACCGTTGATCTGGTCAAGCACGAGGACCAAACCCATCGCGAAAGCACCGTC
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GTCCACTTTGCGTTTGATCTCAGCCACAGTTCGCTTCTCCGTGTCGTATATGACGCATTT
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TTCTTGTCTCTCCCCGACAAAACCTTCCCATCTCTGGTGCAGAGTCGGTCTCTTGCGTTT
AACGGTGAGCAGACACTTTCCGGTGGCGTCCA

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DS 

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AACTGGATCATCACCGTTGATCTGGTCAAGCACGAGGACCAAACCCATCGCGAAAGCACC
GTCAAAACCGGGTTTTATCTCGAGAGTGAACACATCTCGTCCAAGCATCACGTTCGTTGA
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TTTCCGTAGCGAGAAGTCACCGTCTATCGTGTACTCTTCTCCTGTTCCGTCGTATACTTC
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TTTAACGGTGAGCAGA

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AAAGATTCGATTCGATTGGTTAAAACCGGAACAAAGACTTGACGAGGTGAAAGTGAGAGA
TGAAGAAACTAATCCTCCACAAAAGGGTGTACTTGTTCATCACCAATCTCAACTGGATCA
TCACCGTTGATCTGGTTAAGCACGAGGACCAAACCCATCGCGAAAGCACCGTCGAAACCG
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TTGCGTTTGATCTCAGCCACAGTTCGCTTCTCCGTGTCGTATATGACGCATTTCCGTAGC
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GTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACGCTGAAGATCGGTTTCTGACCCTCTTGT
CTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGCAGAGTCGGTCTCTTGCGTTTAACGGTG
AGCAGACACTTTCCGGTGGCGTCCATGAGGACAAACTCGTCGTTATCTCTTCCGTATGAA
TCAACCCTAAAGATGATATCGCCGTTACAGTCGTAGGTGGTGAAACCATCGCCGGTGTGG
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TCACGTTCGTTGACGCGTCCACTTTGCGTTTGATCTCAGCCACAGTTCGCTTCTCCGTGT
CGTATATGACGCATTTCCGTAGCGAGAAGTCACCGTCTATCGTGTACTCTTCTCCTGTTC
CGTCGTATACTTCTACTTCCATCGTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACGCTGA
AGATCGGTTTCTGACCCTCTTGTCTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGCAGAG
TCGGTCTCTTGCGTTTAACGGTGAGCAGACACTTTCCGGTGGCGTCCATGAGGACAAACT
CGTCGTTATCTCTTCCGTATGAATCAACCCTAAAGATGATATCGCCGTTACAGTCGTAGG
TGGTGAAACCATCGCCGGTGTGGAACAGAGAGGTTTTGCATACGGTCAGTGGGTTTTCTT
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GGAGCCTTCTCTTCAACTAATTCCATTTTTTTT**ATTTGGTGTTCGGAAGTTAGATTTT
GTGGTTTGTTTAACGA
GTG

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TTTTATTTGGTGTTCGGAAGTTAGATTTTGTGGTTTGTTTAACGAATGATTATGATATGG
ACCC

QA 1 124 1 124
DS 



AS 1 7

CO CL1067Contig1 674 7 15 U
TTTTTTCTTTTCTTTCCCAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTTTCTTTTT
CTTTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTTTTTTTTT
*CTCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAG
GACGTCCCTTACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTT
TCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGC
CTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGC
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TGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAA
AGCAATGTTCTTCTTTTTT*ATGTTTTATT*GTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAAA
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CTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTT
ATTGGAAAACCAGG


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 0 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4CA61TF U 1
AF RR4CN24JQ C 49
AF RR4CN24TF U 461
AF RR4CA61JQ C 1
AF RR4F972TF U 2
AF RR4AC20TF U 7
AF RR4F972JQ C 49
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RD RR4CA61TF 626 0 0
TTTTTT
CTTTTCTTTCCCAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTTTCCTTTTCTTTCA
CTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTTTTTTTTT*CTCTC
TCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTC
CCTTACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAG
TCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTA
AATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCATAGTAAACCCCAGCCTAAAA
AATGGCTCTGCTTCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACCAAGATTGGATT
TGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAAT
GTTCTTCCTTTTT*ATGTTTTATT*GTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAAAAAAAAG
TTCCTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGACTTTCCTTCTTCTT
CTTTTGAAGTCGTTTGTTAT

QA 7 626 7 626
DS 

RD RR4CN24JQ 583 0 0
TTTTTTCTTTTTCTTTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTT
TCCTTTTTTTT**CTCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCA
TGTCGGACAAAGGACGTCCCTTACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCAT
CAGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCA
AGCCAGGATCGCCTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTA
GTAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTTTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGAC
GGACACAAAGATTGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGC
TTAGACATGTAAAGCAATGTTCTTCTTTTTT*ATGTTTTATT*GTCTTTCTTGAAAGTAT
CCACACAACAAAAAAAAGTTCCTAATATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATT
ATGACTTTCCTTCTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTA
G

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4CN24TF 171 0 0
ACAT
TTGCTTAGACATGTAAAGCAATGTTCTTCTTTTTTTATGTTTTATTTGTCTTTCTTGAAA
GTATCCACACAACAAAAAAAAGTTCCTAATATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCAC
GATTATGACTTTCCTTCTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTA
G

QA 5 170 5 170
DS 

RD RR4CA61JQ 674 0 0
TTTTTTCTTTTCTTTCCCAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTTTCCTTTT
CTTTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTTTTTTTTT
*CTCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAG
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TGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAA
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AAAAAGTTCCTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGACTTTCCTT
CTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTT
ATTGGAAAACCAGG

QA 1 674 1 674
DS 

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TTTTT
CTTTTCTCTCCCAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTT*CTTTTTCTTTCA
CTTTCCCTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTTTTTTT***CTCTC
TCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTC
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TCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTA
AATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGACCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAA
AATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACAAAGATTGGATT
TGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAAT
GTTCTTCTTTTTTTATGTTTTATT*GTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAAAAAAAAG
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CTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTTATTGGA
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QA 6 673 6 673
DS 

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CTTTTCTCTCCCAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTT*CTTTTTCTTTCA
CTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTTTTTTTTTTCTCTC
TCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTC
CCTTACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAG
TCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTA
AATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAA
AATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACCAAGATTGGATT
TGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAAT
GTTCTTCTTTTTT*ATGTTTTATT*GTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAAAAAAAAG
TTCCTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTA***TTCACGATTATGACTTTCCTTCTTCTT
CTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTTATTGGA
AAACCAGG

QA 1 668 1 668
DS 

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TTTTTTCTTTTTCTTTCACTTTCCCTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTT
TCCTTTTTTT***CTCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCA
TGTCGGACAAAGGACGTCCCTTACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCAT
CAGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCA
AGCCAGGATCGCCTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGACCCTA
GTAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTTTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGAC
GGACACAAAGATTGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGC
TTAGACATGTAAAGCAATGTTCTTCTTTTTTTATGTTTTATT*GTCTTTCTTGAAAGTAT
CCACACAACAAAAAAAAGTTCCTAATATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATT
ATGACTTTCCTTCTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGT
GTTGCCACTTTTATTGGAAAACCAGG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 6

CO CL1068Contig1 1238 6 16 U
AAAAACCATAGTAACAATAAAACTGTACATAATGCCCCAAGAGCTTTGACAACATTTAAA
AGTAGAGAAGTAACATTTAACAGATTCAGAGAACATAAACATACGAGCAAAATGATAAAA
CATGTGAAGAAAAAGCATAAGTAGGTGGAAGTTCTTACAACAAAGTTCAGGGTTTTGTCT
TAACAGTCTTACCTGAAAATCATTGCTGGGAGAAGGATCAGACTGGTGTTGGGTTGGATA
CTGGCGGCTGCTCTGGAGATAAAGCAAAGTGAAGTCCCCTGCGTTGAGGCACACCACCGT
GTATCATGAAGGCAACTTCCGCGGCAGCTAGAGCAGCAGCTTCCTGTCTTTGCCTCCGGC
GCTGGAGAATTCCAATGGCCCATGCCATGATGTAACATGGCAGGAGAAAACCAGCAGCAC
GAAGAAGAAAAAGAGAGAAGAAGGCAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGA
GGTTTAGTGCATCTCTTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAGAGCGACAGA
AGGCAGCACCGCTTGAGTTAGACTCAGAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGC
GTTCCGCTGCAGCCATTGCAAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCT
CCCAATCCTCACCAATGTGAATAATAGTTTCATCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTAT
ATCCAGATTGATAAGGCTGGTGGCATATTTCGCAGATAATGTCGCCTTTCTCATTACACC
AACGCTGAACACACTTGCGGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAAGCACAAGGAGCCT
CCAAGTTGTTAGTGATATCTTCCTCCTGGCAAATACGGCACTCAACAGACTGGAGAAGCG
GTTCCTCTTCCGCAGGGACAACAGCATAGTACTTCCTGGCATCTTCAGCTTCATCCACAG
ACACAGACGACGACGAAGAAGAAGAAGAAGCCACATCTCTGCCTTGAGGACAAGAACTTT
CTCCACAATCCTTTTCTGACTCCAAGCTCTCACCCGTTATGAGACGATCCGTGCATAAAC
TCAGATGATCCGACATCTTCTCACCAATGACAGAACCGCTATTGATCTAGAAATGATTCT
GGAGAAATAAAAAAGAAGCTCTTTTGAAATCTGGAACCTTTGAGCTCTCAAACGAAAACT
TCGTGTTTTGTTTTTCTTGTTTCTGTGTTCGGTCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B516JQ U 25
AF RR4B579JQ U 25
AF RR4B762JQ U 1
AF RR4B762TF C 375
AF RR4B516TF C 366
AF RR4A812TF C 438
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BS 109 126 RR4B762JQ
BS 127 127 RR4B516JQ
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BS 133 196 RR4B762JQ
BS 197 197 RR4B516JQ
BS 198 219 RR4B762JQ
BS 220 220 RR4B516JQ
BS 221 661 RR4B762JQ
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BS 663 877 RR4B762JQ
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BS 879 898 RR4B762JQ
BS 899 1238 RR4B516TF

RD RR4B516JQ 672 0 0
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CAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGAGGTTTAGTGCATCTCTTAACAGTA
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CAAAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGCGTTCCGCTGCAGCCATTGCAAGAA
TGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCTCCCAATCCTCACCAATGTGAATAA
TAGTTTCATCAG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4B579JQ 795 0 0
GTACATAATGCCCCAAGAGCTTTGACAACATTTAAAAGTAGAGAAGTAACATTTAACAGA
TTCAGAGAACATAAACATACGAGCAAAATGATAAAACATGTGAAGAAAAAGCATAAGTAG
GTGGAAGTTCTTACAACAAAGTTCAGGGTTTTGTCTTAACAGTCTTACCTGAAAATCATT
GCTGGGAGAAGGATCAGACTGGTGTTGGGTTGGATACTGGCGGCTGCTCTGGAGATAAAG
CAAAGTGAAGTCCCCTGCGTTGAGGCACACCACCGTGTATCATGAAGGCAACTTCCGCGG
CAGCTAGAGCAGCAGCTTCCTGTCTTTGCCTCCGGCGCTGGAGAATTCCAATGGCCCATG
CCATGATGTAACATGGCAGGAGAAAACCAGCAGCACGAAAAAAAAAAAGAGAGAAGAAGG
CAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGAGGTTTAGTGCATCTCTTAACAGTA
AAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAAAGCGACAGAAGGCAGCACCGCTTGAGTTAGACT
CAAAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGCGTTCCGCTGCAGCCATTGCAAGAA
TGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCTCCCAATCCTCACCAATGTGAATAA
TAGTTTCATCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTATATCCAGATTGATAAGGCTGGTGGC
ATATTTCGCAGATAATGTCGCCTTTCTCATTACACCAACGCTGAACACACTTGCGGTGCG
CATACTTCAAACTGC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4B762JQ 898 0 0
AAAAACCATAGTAACAATAAAACTGTACATAATGCCCCAAGAGCTTTGACAACATTTAAA
AGTAGAGAAGTAACATTTAACAGATTCAGAGAACATAAACATACGAGTAAAATGATAAAA
CATGTGGAGAAGAAGCATAAGTAGGTGGAAGTTCTTACAACAAAGTTCAGGGTTTTGTCT
TAACAGTCTTACCTGAGAATCATTGCTGGGAGAAGGATCGGACTGGTGTTGGGTTGGATA
CTGGCGGCTGCTCTGGAGATAAAGCAAAGTGAAGTCCCCTGCGTTGAGGCACACCACCGT
GTATCATGAAGGCAACTTCCGCGGCAGCTAGAGCAGCAGCTTCCTGTCTTTGCCTCCGGC
GCTGGAGAATTCCAATGGCCCATGCCATGATGTAACATGGCAGGAGAAAACCAGCAGCAC
GAAGAAGAAAAAGAGAGAAGAAGGCAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGA
GGTTTAGTGCATCTCTTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAGAGCGACAGA
AGGCAGCACCGCTTGAGTTAGACTCAGAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGC
GTTCCGCTGCAGCCATTGCAAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCT
CTCAATCCTCACCAATGTGAATAATAGTTTCATCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTAT
ATCCAGATTGATAAGGCTGGTGGCATATTTCGCAGATAATGTCGCCTTTCTCATTACACC
AACGCTGAACACACTTGCGGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAAGCACAAGGAGCCT
CCAAGTTGTTAGTGATATCTTCCTCCTGGCAAATACG*CACTCAACAGACTGGAGAAG

QA 1 898 1 898
DS 

RD RR4B762TF 820 0 0
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GAGAAGAAGGCAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGAGGTTTAGTGCATCT
CTTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAGAGCGACAGAAGGCAGCACCGCTT
GAGTTAGACTCAGAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGCGTTCCGCTGCAGCC
ATTGCAAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCTCTCAATCCTCACCA
ATGTGAATAATAGTTTCATCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTATATCCAGATTGATAA
GGCTGGTGGCATATTTCGCAGATAATGTCGCCTTTCTCATTACACCAACGCTGAACACAC
TTGCGGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAAGCACAAGGAGCCTCCAAGTTGTTAGTG
ATATCTTCCTCCTGGCAAATACGGCACTCAACAGACTGGAGAAGCGGTTCCTCTTCCGCA
GGGACAACAGCATAGTACTTCCTGGCATCTTCAGCTTTATCCACAGACACAGACGACGAC
GAAGAGGAAGAAGAAGCCACATCTCTGCCTTGAGGACAAGAACTTTCTCCACAATCCTTT
TCTGACTCCAAGCTCTCACCCGTTATGAGACGGTCCGTGCATAAACTCAGATGTTCCGAC
ATCTTCTCACCAATGACAGAACCGCTATTGATCTAGAAATGATTCTGGAGAAATAAAAAA
GAAGCTCTTTTGAAATCTGGAACCTTTGAGCTCTCAAACG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4B516TF 873 0 0
AGAATTCCAATGGCCCATGCCATGATGTAACATGGCAGGAGAAA*CCAGCAGCACGAAGA
AGAAAA*GAGAGAAGAAGGCAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGAGGTTT
AGTGCATCTCTTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAGAGCGACAGAAGGCA
GCACCGCTTGAGTTAGACTCAGAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGCGTTCC
GCTGCAGCCATTGCAAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCTCCCAA
TCCTCACCAATGTGAATAATAGTTTCATCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTATATCCA
GATTGATAAGGCTGGTGGCATATTTCGCAGATAATGTCGCCTTTCTCATTACACCAACGC
TGAACACACTTGCGGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAAGCACAAGGAGCCTCCAAG
TTGTTAGTGATATCTTCCTCCTGGCAAATACGGCACTCAACAGACTGGAGAAGCGGTTCC
TCTTCCGCAGGGACAACAGCATAGTACTTCCTGGCATCTTCAGCTTCATCCACAGACACA
GACGACGACGAAGAAGAAGAAGAAGCCACATCTCTGCCTTGAGGACAAGAACTTTCTCCA
CAATCCTTTTCTGACTCCAAGCTCTCACCCGTTATGAGACGATCCGTGCATAAACTCAGA
TGATCCGACATCTTCTCACCAATGACAGAACCGCTATTGATCTAGAAATGATTCTGGAGA
AATAAAAAAGAAGCTCTTTTGAAATCTGGAACCTTTGAGCTCTCAAACGAAAACTTCGTG
TTTTGTTTTTCTTGTTTCTGTGTTCGGTCTGAG

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR4A812TF 789 0 0
AAGAAGGCAGTGGGATCATCCTCGTCATCTGGATTAGTCGTGAGGTTTAGTGCATCTCTT
AACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAGAGCGACAGAAGGCAGCACCGCTTGAG
TTAGACTCAGAGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGCGTTCCGCTGCAGCCATT
GCAAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCTCCCAATCCTCACCAATG
TGAATAATAGTTTCATCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTATATCCAGATTGATAAGGC
TGGTGGCATATTTCGCAGATAATGTCGCCTTTCTCATTACACCAACGCTGAACACACTTG
CGGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAAGCACAAGGAGCCTCCAAGTTGTTAGTGATA
TCTTCCTCCTGGCAAATACGGCACTCAACAGACTGGAGAAGCGGTTCCTCTTCCGCAGGG
ACAACAGCATAGTACTTCCTGGCATCTTCAGCTTCATCCACAGACACAGACGACGACGAA
GAAGAAGAAGAAGCCACATCTCTGCCTTGAGGACAAGAACTTTCTCCACAATCCTTTTCT
GACTCCAAGCTCTCACCCGTTATGAGACGATCCGTGCATAAACTCAGATGATCCGACATC
TTCTCACCAATGACAGAACCGCTATTGATCTAGAAATGATTCTGGAGAAATAGAAAAGAA
GCTCTTTTGAAATCTGGAACCTTTGAGCTCTCAAACGAAAACTTCGTGTTTTGTTTTTCT
TGTTTCT
CC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 2 7

CO CL1069Contig1 683 2 2 U
GGGAACTGGAGAGAGACTCCTGGAAACGGTGGTGATGCTCATGGTCAGCCTTTTGGTGGG
AGGGTCATAACTGTGAAATTAGGCGACTATACAAGAAGAATCGGTGTTGATGGAACTGCT
GAAGCAATCAAAGAGACAATCAGGTCTGCTTTTAGATTAAGAACCCGGAGGGCGTTTTGG
TTAGAAGATGAAGATCAGGTTGTTCGTTGTCTTGACCGAGACATGCCCTTAGGGAACTAC
CTACTCCATGTCGATGATGGACTGGCCATAAGGGTTTGCCATTATGATGAATCCAACCAG
TTACCAGTCCATACGGAAGAGAAAATATTCTACACGGAAGAGGATTACCGCGACTTTCTG
GCTAGACGAGGGTGGATATGTCAAGGTGATGGCTTTAGGAACATAGGCAACATGGATGAT
CTTCAGCCTGGTGCTGTCTACCGAGGAGTGAGAGAAAGAATGTGATCTCAGAACTTCTTT
GTCCAAGTCCATCCATCAACGGCTAATCTAATCACAGAACTGTCCCTGTAAATATATATT
TCCATTCCCATTGTAAATTCCCGCTCAGTAGGACAAAAAGTTTGGATTCACCTTACAGGC
CAATAAGTCCTCAAATTGTATTTTTGTTTTGTTGCATTTTGGAATGAACAAGAGGCGTGA
GTGGTGTCAGCCACTCTTCATCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A469JQ C 1
AF RR4A469TF U 1
BS 1 1 RR4A469JQ
BS 2 683 RR4A469TF

RD RR4A469JQ 683 0 0
GGGAACTGGAGAGAGACTCCTGGAAACGGTGGTGATGCTCATGGTCAGCCTTTTGGTGGG
AGGGTCATAACTGTGAAATTAGGCGACTATACAAGAAGAATCGGTGTTGATGGAACTGCT
GAAGCAATCAAAGAGACAATCAGGTCTGCTTTTAGATTAAGAACCCGGAGGGCGTTTTGG
TTAGAAGATGAAGATCAGGTTGTTCGTTGTCTTGACCGAGACATGCCCTTAGGGAACTAC
CTACTCCATGTCGATGATGGACTGGCCATAAGGGTTTGCCATTATGATGAATCCAACCAG
TTACCAGTCCATACGGAAGAGAAAATATTCTACACGGAAGAGGATTACCGCGACTTTCTG
GCTAGACGAGGGTGGATATGTCAAGGTGATGGCTTTAGGAACATAGGCAACATGGATGAT
CTTCAGCCTGGTGCTGTCTACCGAGGAGTGAGAGAAAGAATGTGATCTCAGAACTTCTTT
GTCCAAGTCCATCCATCAACGGCTAATCTAATCACAGAACTGTCCCTGTAAATATATATT
TCCATTCCCATTGTAAATTCCCGCTCAGTAGGACAAAAAGTTTGGATTCACCTTACAGGC
CAATAAGTCCTCAAATTGTATTTTTGTTTTGTTGCATTTTGGAATGAACAAGAGGCGTGA
GTGGTGTCAGCCACTCTTCATCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4A469TF 683 0 0
G
GGAACTGGAGAGAGACTCCTGGAAACGGTGGTGATGCTCATGGTCAGCCTTTTGGTGGGA
GGGTCATAACTGTGAAATTAGGCGACTATACAAGAAGAATCGGTGTTGATGGAACTGCTG
AAGCAATCAAAGAGACAATCAGGTCTGCTTTTAGATTAAGAACCCGGAGGGCGTTTTGGT
TAGAAGATGAAGATCAGGTTGTTCGTTGTCTTGACCGAGACATGCCCTTAGGGAACTACC
TACTCCATGTCGATGATGGACTGGCCATAAGGGTTTGCCATTATGATGAATCCAACCAGT
TACCAGTCCATACGGAAGAGAAAATATTCTACACGGAAGAGGATTACCGCGACTTTCTGG
CTAGACGAGGGTGGATATGTCAAGGTGATGGCTTTAGGAACATAGGCAACATGGATGATC
TTCAGCCTGGTGCTGTCTACCGAGGAGTGAGAGAAAGAATGTGATCTCAGAACTTCTTTG
TCCAAGTCCATCCATCAACGGCTAATCTAATCACAGAACTGTCCCTGTAAATATATATTT
CCATTCCCATTGTAAATTCCCGCTCAGTAGGACAAAAAGTTTGGATTCACCTTACAGGCC
AATAAGTCCTCAAATTGTATTTTTGTTTTGTTGCATTTTGGAATGAACAAGAGGCGTGAG
TGGTGTCAGCCACTCTTCATCT

QA 2 683 2 683
DS 



CO CL1069Contig2 1007 5 2 U
GGAAAGTGAAAGATTTTGTGTTACTAAAGATCAGGAAGTTTGTTTTCTTCTGCAGGTTCA
CAAGGGACTCGACACACTTTATTCTTTACATGAATGACGTATAAGATGAAGAGTGGCTGA
CACCACTCACGCCTCTCCATCTCTTGTTTATTCCAAAATGCAACAAAACAAAAATACAAT
TTGAGGACTTATTGGCCTTGTAAGGTGAATCCAAACTTTTTGTCCTACTGAGCGGGAATT
TACAATGGGAATAATCGAAATATATATTTACAGGGACAGTTCTGTGATTAGATTAGCCGT
TGATGGATGGACTTGGACAAAGAAGATCTGAGATCACATTCTCTCTCTCACTCCTCGGTA
GACAGCACCAGGCTGAAGATCATCCATGTTGTCTATGTTCCTAAAGCCATCACCTTGTAG
ACATGTCCACCCTCGTCTAGCCAGAAAGTCGCGATAATCTTCTTCCGTGTAGAAGATTTT
CTCTTCCGTATGGACTGGTAACTGGTTGGATTCATCATAATGGCAAACCCTGATGGCCAG
TCCATCATCGACATGGAGTAGGTAGTTCCCTAAGGGCATGTCTCGGTCAAGACAACGAAC
AACCTGATCTTCATCTTCTAACCAAAACGCCCTCCGGGTTCTTAGTCTAAAAGCAGACCT
GATTGTCTCTTTGATTGCTTCAGCAGTACCATCAACACCGATTCTTCTTGTATAGTCGCC
TAATTTCACAGTTATGACCCTCCCACCAAAAGGCTGACCATGAGCATCACCACCGTTTCC
AGGAGTCTCTCTCCAGTTCCAAGGAGGAACTCCATTGGCTGGAACAGCATCAACTGCAGT
GATTGCAAGAGGATGACCATCATGATCAAGACTCCTTTCAAGGTTTAACGCCGGCCTGCC
ACTAGCTAGAACATAAATAGGAAACACTTATCAAGATTAAAAGACACATACACATCCTCT
AGAAACCAAAACTAAACCAACAAACAAATAAGCTTCAAGAGGCAATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F910JQ U 97
AF RR4AU77JQ U 1
AF RR4AY52JQ U 1
AF RR4AU77TF C 223
AF RR4AY52TF C 229
BS 1 797 RR4AU77JQ
BS 798 1007 RR4AU77TF

RD RR4F910JQ 378 0 0
G
CGTATAAGATGAAGAGTGGCTGACACCACTCACGCCTCTCCATCTCTTGTTTATTCCAAA
ATGCAACAAAACAAAAATACAATTTGAGGACCTATTGGCCTTGTAAGGTGAATCCAAACT
TTTTGTCCTACTGAGCGGGAATTTACAATGGGAATAATCGAAATATATATTTACAGGGAC
AGTTCTGTGATTAGATTAGCCGTTGATGGATGGACTTGGACAAAGAAGATCTGAGATCAC
ATTCTCTCTCTCACTCCTCGGTAGACAGCACCAGGCTGAAAATCATCCATGTTGTCTATG
TTCCTAAAGCCATCACCTTGTAAACATGTCCACCCTCGTCTAGCCAGAAAGTCGCGATAA
TCTTCTTCCGTGTAGAA

QA 2 378 2 378
DS 

RD RR4AU77JQ 797 0 0
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CAAGGGACTCGACACACTTTATTCTTTACATGAATGACGTATAAGATGAAGAGTGGCTGA
CACCACTCACGCCTCTCCATCTCTTGTTTATTCCAAAATGCAACAAAACAAAAATACAAT
TTGAGGACTTATTGGCCTTGTAAGGTGAATCCAAACTTTTTGTCCTACTGAGCGGGAATT
TACAATGGGAATAATCGAAATATATATTTACAGGGACAGTTCTGTGATTAGATTAGCCGT
TGATGGATGGACTTGGACAAAGAAGATCTGAGATCACATTCTCTCTCTCACTCCTCGGTA
GACAGCACCAGGCTGAAGATCATCCATGTTGTCTATGTTCCTAAAGCCATCACCTTGTAG
ACATGTCCACCCTCGTCTAGCCAGAAAGTCGCGATAATCTTCTTCCGTGTAGAAGATTTT
CTCTTCCGTATGGACTGGTAACTGGTTGGATTCATCATAATGGCAAACCCTGATGGCCAG
TCCATCATCGACATGGAGTAGGTAGTTCCCTAAGGGCATGTCTCGGTCAAGACAACGAAC
AACCTGATCTTCATCTTCTAACCAAAACGCCCTCCGGGTTCTTAGTCTAAAAGCAGACCT
GATTGTCTCTTTGATTGCTTCAGCAGTACCATCAACACCGATTCTTCTTGTATAGTCGCC
TAATTTCACAGTTATGACCCTCCCACCAAAAGGCTGACCATGAGCATCACCACCGTTTCC
AGGAGTCTCTCTCCAGT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4AY52JQ 790 0 0
GGAAAGTGAAAGATTTTGTGTTACTAAAGATCAGGAAGTTTGTTTTCTTCTGCAGGTTCA
CAAGGGACTCGACACACTTTATTCTTTACATGAATGACGTATAAGATGAAGAGTGGCTGA
CACCACTCACGCCTCTCCATCTCTTGTTTATTCCAAAATGCAACAAAACAAAAATACAAT
TTGAGGACTTATTGGCCTTGTAAGGTGAATCCAAACTTTTTGTCCTACTGAGCGGGAATT
TACAATGGGAATAATCGAAATATATATTTACAGGGACAGTTCTGTGATTAGATTAGCCGT
TGATGGATGGACTTGGACAAAGAAGATCTGAGATCACATTCTCTCTCTCACTCCTCGGTA
GACAGCACCAGGCTGAAGATCATCCATGTTGTCTATGTTCCTAAAGCCATCACCTTGTAG
ACATGTCCACCCTCGTCTAGCCAGAAAGTCGCGATAATCTTCTTCCGTGTAGAAGATTTT
CTCTTCCGTATGGACTGGTAACTGGTTGGATTCATCATAATGGCAAACCCTGATGGCCAG
TCCATCATCGACATGGAGTAGGTAGTTCCCTAAGGGCATGTCTCGGTCAAGACAACGAAC
AACCTGATCTTCATCTTCTAACCAAAACGCCCTCCGGGTTCTTAGTCTAAAAGCAGACCT
GATTGTCTCTTTGATTGCTTCAGCAGTACCATCAACACCGATTCTTCTTGTATAGTCGCC
TAATTTCACAGTTATGACCCTCCCACCAAAAGGCTGACCATGAGCATCACCACCGTTTCC
AGGAGTCTCT

QA 1 790 1 790
DS 

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GT
CTACTGAGCGGGAATTTACAATGGGAATAATCGAAATATATATTTACAGGGACAGTTCTG
TGATTAGATTAGCCGTTGATGGATGGACTTGGACAAAGAAGATCTGAGATCACATTCTCT
CTCTCACTCCTCGGTAGACAGCACCAGGCTGAAGATCATCCATGTTGTCTATGTTCCTAA
AGCCATCACCTTGTAGACATGTCCACCCTCGTCTAGCCAGAAAGTCGCGATAATCTTCTT
CCGTGTAGAAGATTTTCTCTTCCGTATGGACTGGTAACTGGTTGGATTCATCATAATGGC
AAACCCTGATGGCCAGTCCATCATCGACATGGAGTAGGTAGTTCCCTAAGGGCATGTCTC
GGTCAAGACAACGAACAACCTGATCTTCATCTTCTAACCAAAACGCCCTCCGGGTTCTTA
GTCTAAAAGCAGACCTGATTGTCTCTTTGATTGCTTCAGCAGTACCATCAACACCGATTC
TTCTTGTATAGTCGCCTAATTTCACAGTTATGACCCTCCCACCAAAAGGCTGACCATGAG
CATCACCACCGTTTCCAGGAGTCTCTCTCCAGTTCCAAGGAGGAACTCCATTGGCTGGAA
CAGCATCAACTGCAGTGATTGCAAGAGGATGACCATCATGATCAAGACTCCTTTCAAGGT
TTAACGCCGGCCTGCCACTAGCTAGAACATAAATAGGAAACACTTATCAAGATTAAAAGA
CACATACACATCCTCTAGAAACCAAAACTAAACCAACAAACAAATAAGCTTCAAGAGGCA
ATC

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR4AY52TF 779 0 0
TGAGCGGGAATTTACAATGGGAATAATCGAAATATATATTTACAGGGACAGTTCTGTGAT
TAGATTAGCCGTTGATGGATGGACTTGGACAAAGAAGATCTGAGATCACATTCTCTCTCT
CACTCCTCGGTAGACAGCACCAGGCTGAAGATCATCCATGTTGTCTATGTTCCTAAAGCC
ATCACCTTGTAGACATGTCCACCCTCGTCTAGCCAGAAAGTCGCGATAATCTTCTTCCGT
GTAGAAGATTTTCTCTTCCGTATGGACTGGTAACTGGTTGGATTCATCATAATGGCAAAC
CCTGATGGCCAGTCCATCATCGACATGGAGTAGGTAGTTCCCTAAGGGCATGTCTCGGTC
AAGACAACGAACAACCTGATCTTCATCTTCTAACCAAAACGCCCTCCGGGTTCTTAGTCT
AAAAGCAGACCTGATTGTCTCTTTGATTGCTTCAGCAGTACCATCAACACCGATTCTTCT
TGTATAGTCGCCTAATTTCACAGTTATGACCCTCCCACCAAAAGGCTGACCATGAGCATC
ACCACCGTTTCCAGGAGTCTCTCTCCAGTTCCAAGGAGGAACTCCATTGGCTGGAACAGC
ATCAACTGCAGTGATTGCAAGAGGATGACCATCATGATCAAGACTCCTTTCAAGGTTTAA
CGCCGGCCTGCCACTAGCTAGAACATAAATAGGAAACACTTATCAAGATTAAAAGACACA
TACACATCCTCTAGAAACCAAAACTAAACCAACAAACAAATAAGCTTCAAGAGGCAATC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 2 7

CO CL1070Contig1 813 3 9 U
TGGGTAACCAAAACAATAAACAATATATATAAAAGGTATATGTGTGTTCAGTCCAAATCC
CTCTGATTCTCGTGTACATAAACATCAGTCCCAACTAAATCATCTAGAAAAAACCCTCTT
TGAGAAAAATCATCCAAAACAATGTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTTG
ATCCATGTCTTGGCCATACAACTTCTCCTTATAAGCAGTGAATTGTATTTAAACACGACC
AATGCGTATCTCAACTACAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGG
TACGAGGAAATTTTAATATCTAACACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTAGAAGA
GCTTTCACCCTGTTCGGCTCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGATTCC
TACGGGACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGT
CCATGGTATAAGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAAT
CATTCTACTGGAATGATCGATTACGACAATATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTG
GGAGATAAGCTCGGGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTA
GCTATCAGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGG
TTCAAGGGTGATACAATTTATGGAATGGTGCAGTGTACCAAAGACATAGACAGAAGCTTG
TGAAGAGTGTTTGGTTTTAATAGGTGCATTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A769TF U 16
AF RR4CP83TF U 54
AF RR4CB73TF U 1
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RD RR4A769TF 750 0 0
GG
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AACAATGTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTTGATCCATGTCTTGGCCAT
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CAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGGTACGAGGAAATTTTAAT
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GATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAATCATTCTACTGGAATGAT
CGATTACGACAATATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGATAAGCTCGGGTT
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TTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGGTTCAAGGGTGATACAAT
TTATGGAATGGTGCAGTGTACCAAAGAC

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR4CP83TF 670 0 0
GG
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CTCTTTGAGAAAAATCATCCAAAACAATGTACTCTTCACTGTCTGTGTCAAAACGCCTCC
TTTTGATCCATGTCTTGGCCATACAACTTCTCCTTATAAGCAGTGAATTGTATTTAAACA
CGACCAATGCGTATCTCAACTACAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAA
GTAGGTACGAGGAAATTTTAATATCTAACACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTA
GAAGAGCTTTCACCCTGTTCGGCCCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAG
ATTCCTACGGGACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGA
AATGTCCATGGTATAAGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGT
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CTTTAGCTATCAGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGA
CACGGTTC

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4CB73TF 813 0 0
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CTCTGATTCTCGTGTACATAAACATCAGTCCCAACTAAATCATCTAGAAAAAACCCTCTT
TGAGAAAAATCATCCAAAACAATGTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTTG
ATCCATGTCTTGGCCATACAACTTCTCCTTATAAGCAGTGAATTGTATTTAAACACGACC
AATGCGTATCTCAACTACAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGG
TACGAGGAAATTTTAATATCTAACACCAAAAGGTTCTATGTGGGCAGTAGCCTTAGAAGA
GCTTTCACCCTGTTCGGCTCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGATTCC
TACGGGACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGT
CCATGGTATAAGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAAT
CATTCTACTGGAATGATCGATTACGACAATATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTG
GGAGATAAGCTCGGGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTA
GCTATCAGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGG
TTCAAGG*TGATACA*TTTATGGAATGGTGCAGTGTAC*AAAGACATAGACAGAAGCTTG
TGAAGAGTGTTTGGTTTTAATAGGTGCATTTCA

QA 1 813 1 813
DS 



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TGTTGTTTTATTCTTTCAAAAAGTAGCACTTGATGTTACATAAGCTTATGATTGAAAAAA
TCAAACAAAAAATATATATATTTAGGTCTTTAAATATTTTGAACCGGCTTGGTAATAAAA
GGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTTCCACCGACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCA
TTCAGGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTAAAAACCAAACACTCTTCACAAGCTTCTGGT
CCTATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCATAAATTGTATCACCCTTGAACCGTGTCTCC
CCCACAGAGTACAATGCTGTTGGCTCAGTGTAATTAACTCGACTGATAGCTAAAGTCGTA
AGATTGTCCAAGAGAGTATTCCATACACTTGCAAACCCGAGCTTATCTCCCAACTTCTTC
GCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAATCGATCATTCCAGTAGAATGATTGGACGAA
AACGTGAGAAGACATTGGTCATACCATATTATCCTCCCCTTATACCATGGACATTTCCTA
ATAAGCGCAGCGAGGGCAGTGGCAAAGCAGTCGTGGCATTTGGTCCCGTAGGAATCTCCA
CGGCACTGGAGGATAGCGGAAAATTTATCAGAGCCGAACAGGGTGAAAGCTCTTCTAAGG
CTACTGTCCACATAGAACCTTTTGGTGTTAGATATTAAAATTTCCTCGTACCTACTTCCC
CGCTTGTATTTTCCTTGACTATCCAAGCATTTGTAGTTGAGATACGCATTGGTCGTGTTT
AAATACATTCACTGCTTATAAGAGAAGTTGTATGGCCAGACATGGATCAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP83JQ U 1
AF RR4HB92JQB U 25
AF RR4A769JQ U 30
AF RR4CB73JQ U 31
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BS 693 715 RR4CP83JQ
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BS 846 893 RR4CB73JQ

RD RR4CP83JQ 715 0 0
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TGTTGTTTTATTCTTTCAAAAAGTAGCACTTGATGTTACATAAGCTTATGATTGAAAAAA
TCAAACAAAAAATATATATATTTAGGTCTTTAAATATTTTGAACCGGCTTGGTAATAAAA
GGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTTCCACCGACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCA
TTCAGGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTAAAAACCAAACACTCTTCACAAGCTTCTGGT
CCTATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCATAAATTGTATCACCCTTGAACCGTGTCTCC
CCCACAGAGTACAATGCTGTTGGCTCAGTGTAATTAACTCGACTGATAGCTAAAGTCGTA
AGATTGTCCAAGAGAGTATTCCATACACTTGCAAACCCGAGCTTATCTCCCAACTTCTTC
GCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAATCGATCATTCCAGTAGAATGATTGGACGAA
AACGTGAGAAGACATTGGTCATACCATATTATCCTCCCCTTATACCATGGACATTTCCTA
ATAAGCGCAGCGAGGGCAGTGGCAAAGCAGTCGTGGCATTTGGTCCCGTAGGAATCTCCA
CGGCACTGGAGGATAGCGGAAAATTTATCAGGGCCGAACAGGGTGAAAGCTCTTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4HB92JQB 777 0 0
TAGATA
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TAAATATTTTGAACCGGCTTGGTAATAAAAGGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTT
CCACCGACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCATTCAGGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTA
AAAACCAAACACTATTCACAAGCTTCTGGTCCTATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCA
TAAATTGTATCACACTTGAACCGTGTCTCCCCCACAGAGTACAATGCTGTTGGCTCAGTG
TAATTAACTCGACTGATAGCTAAAGTCGTAAGATTGTCCAAGAGAGTATTCCATACACTT
GCAAACCCGAGCTTATCTCCCAACTTCTTCGCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAA
TCGATCATTCCAGTAGAATGATTGGACGAAAACGTGAGAAGACATTGGTCATACCATATT
ATCCTCCCCTTATACCATGGACATTTTCTAATAAGCGCAGCGAGGGCAGTGGCAAAGCAG
TCGTGGCATTTGGTCCCGTAGGAATCTCCACGGCACTGGAGGATAGCGGAAAATTTATCA
GAGCCGAACAGGGTGAAAGCTCTTCTAAGGCTACTGTCCACATAGAACCTTTTGGTGTTA
GATATTAAAATTTCCTCGTACCTACTTCCCCGCTTGTATTTTCCTTGACT
C

QA 7 776 7 776
DS 

RD RR4A769JQ 816 0 0
A
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TGATGTTACATAAGCTTATGATTGAAAAAATCAAACAAAAAATATATATATTTAGGTCTT
TAAATATTTTGAACCGGCTTGGCAATAAAAGGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTT
CCACCGACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCATTCAGGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTA
AAAACCAAACACTCTTCACAAGCTTCTGGTCCTATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCA
TAAATTGTATCACCCTTGAACCGTGTCTCCCCCACAGAGTACAATGCTGTTGGCTCAGTG
TAATTAACTCGACTGATAGCTAAAGTCGTAAGATTGTCCAAGAGAGTATTCCATACACTT
GCAAACCCGAGCTTATCTCCCAACTTCTTCGCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAA
TCGATCATTCCAGTAGAATGATTGGACGAAAACGTGAGAAGACATTGGTCATACCATATT
ATCCTCCCCTTATACCATGGACATTTCCTAATAAGCGCAGCGAGGGCAGTGGCAAAGCAG
TCGTGGCATTTGGTCCCGTAGGAATCTCCACGGCACTGGAGGATAGCGGAAAATTTATCA
GAGCCGAACAGGGTGAAAGCTCTTCTAAGGCTAATGTCCACATAGAACCTTTTGGTGTTA
GATATTAAAATTTCCTCGTACCTACTTCCCCGCTTGTATTTTCCTTGACTATCCAAGCAT
TTGTAGTTGAGATACGCATTGGTCGTGTTTAAATA

QA 2 816 2 816
DS 

RD RR4CB73JQ 863 0 0
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TGATGTTACATAAGCTTATGATTGAAAAAATCAAACAAAAAATATATATATTTAGGTCTT
TAAATATTTTGAACCGGCTTGGTAATAAAAGGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTT
CCACCGACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCATTCAGGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTA
AAAACCAAACACTCTTCACAAGCTTCTGGTCCTATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCA
TAAATTGTATCACCCTTGAACCGTGTCTCCCCCACAGAGTACAATGCTGTTGGCTCAGTG
TAATTAACTCGACTGATAGCTAAAGTCGTAAGATTGTCCAAGAGAGTATTCCATACACTT
GCAAACCCGAGCTTATCTCCCAACTTCTTCGCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAA
TCGATCATTCCAGTAGAATGATTGGACGAAAACGTGAGAAGACATTGGTCATACCATATT
ATCCTCCCCTTATACCATGGACATTTCCTAATAAGCGCAGCGAGGGCAGTGGCAAAGCAG
TCGTGGCATTTGGTCCCGTAGGAATCTCCACGGCACTGGAGGATAGCGGAAA*TTTATCA
GAGCCGAACAGGGTGAAAGCTCTTCTAAGGCTACTGCCCACATAGAACCTTTTGGTGTTA
GATATTAAAATTTCCTCGTACCTACTTCCCCGCTTGTATTTTCCTTGACTATCCAAGCAT
TTGTAGTTGAGATACGCATTGGTCGTGTTTAA*TACATTCACTGCTTATAAGAGAAGTTG
TATGGCCAGACATGGATCAAAAG

QA 1 863 1 863
DS 



AS 2 5

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CGAGTTCATCGAAAGTTTTCAGACCGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCC
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GCGGCGGTGAGGGGAAGGATAAGGTGAAGGTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH39TF U 19
AF RR4BL06TF U 1
BS 1 336 RR4BL06TF

RD RR4CH39TF 276 0 0
GG
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AGACCGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCCGACAGATTCCGTGCGTCTCA
AGCTCCGTCACCGATGGCCGTTACTCCGGTCTCCGATTTTCCGGCAACACGAGGACGACG
ACGGTCGGGTTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAATCACGTGTAATAACGAGTTTTCCG*T
AAAGGGCACATGA*TTACTATTCTGGG
TGACGAC

QA 3 269 3 269
DS 

RD RR4BL06TF 336 0 0
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CGAGTTCATCGAAAGTTTTCAGACCGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCC
GACAGATTCCGTGCGTCTCAAGCTCCGTCACCGATGGCCGTTACTCCGGTCTCCGATTTT
CCGGCAACACGAGGACGACGACGGTCGGGTTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAATCACGT
GTAATAACGAGTTTTCCGATAAAGGGCACATGAGTTACTATTCTGGGATGACGACGAGAT
GCGGCGGTGAGGGGAAGGATAAGGTGAAGGTTATGG

QA 1 336 1 336
DS 



CO CL1071Contig2 999 3 8 U
CTCTATTGCAACATAGGTTTCTTTGTCAAGACCAAAGTACAGAAAAGAGGTTTATATTAC
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AACCTTCTCTCCTGCATTATTCACCAAAAAAACTTGTGACAATAGTTTCCACATCCTGCA
ACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGTGTTCTAACTGAATCAGTCATCCCAGCAT
CGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCTACACTTCCCCATGCACTTGCAAG
CCACAGCAGATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTGAAACTCATCCAACAACACAGCTC
CTCCTGATTTCTTGCACTTTCCTCCCATACAGACTTCTACTCTCTTCGACGGCAATCCAA
CAACCGGAACTGATTCCACCGTCTTTAATGGCAATCTAGGATTAACAACTGAGGGAAAGG
CCGTGGATGCAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCTTCAACGCTTCACCGGTGTTCTTGC
AAGAACCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCCAGATTCTGGTTGTAACGGCTCAA
GAATCGCCTTGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAACTTCCCCTTTGCCACAATCACTGT
CACTAGATTCAGACGAAGAAGATGATTCAGAGTCCATCTTCAAAGCTTTAGCTTTTGCCT
TTTCTTCTTTCCTCTGTTTCTTCAACAGCTTCTCCTCTGATTTCAACTGATCCAGCTGCT
TAACCAGAATCTCCGTTGCTTCCGAGATTGTCTTGTTTTGAATCTCAGCAACCAAACCGG
CTTCCGGATCAAGACCAAACCCTATGCTTGAAAACATATTCAAGTTCTTAGAAGAGCTTT
AAGAACCTTAGCCTTCTTCTTCATCTCCTTCTTCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D617JQ U 39
AF RR4CH39JQ U 1
AF RR4D617TF C 250
BS 1 211 RR4CH39JQ
BS 212 212 RR4D617JQ
BS 213 492 RR4CH39JQ
BS 493 493 RR4D617JQ
BS 494 538 RR4CH39JQ
BS 539 539 RR4D617JQ
BS 540 848 RR4CH39JQ
BS 849 999 RR4D617TF

RD RR4D617JQ 635 0 0
ACAGAAAAGAGGTTTATATTACCAATGTTCTACTCGAAAATGCACACGAAGACATGTATG
TACAATGAGAAAAGAACACCACACTATGCATATATCAATTCGATCATATGTTTAAACACT
TTCCATACGAGGCATGATCCAAAACCTTCTCTCCTGCATTATTCACCAAAAAAACTTGTG
ACAATAGTTTCCACATCCTGCAACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGTGTTCTA
ACTGAATCAGTCATCCCAGCATCGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCTA
CACTTCCCCATGCACTTGCAAGCCACAGCAGATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTGA
AACTCATCCAACAACACAGCTCCTCCTGATTTCTTGCACTTTCCTCCCATACAGACTTCT
ACTCTCTTCGACGGCAATCCAACAACCGGAACTGATTCCACCGTCTTTAATGGCAATCTA
GGATTAACAACTGAGGGAAAGGCCGTGGATGCAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCTTC
AACGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAACCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCCA
GATTCTGGTTGTAACGGCTCAAGAATCGCCTTG
TT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4CH39JQ 855 0 0
CTCTATTGCAACATAGGTTTCTTTGTCAAGACCAAAGTACAGAAAAGAGGTTTATATTAC
CAATGTTCTACTCGAAAATGCACACGAAGACATGTATGTACAATGAGAAAAGAACACCAC
ACTATGCATATATCAATTCGATCATATGTTTAAACACTTTCCATACGAGGCATGATCCAA
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ACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGTGTTCTAACTGAATCAGTCATCCCAGCAT
CGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCTACACTTCCCCATGCACTTGCAAG
CCACAGCAGATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTGAAACTCATCCAACAACACAGCTC
CTCCTGATTTCTTGCACTTTCCTCCCATACAGACTTCTACTCTCTTCGACGGCAATCCAA
CAACCGGAACTGCTTCCACCGTCTTTAATGGCAATCTAGGATTAACAACTGAGGGAAAAG
CCGTGGATGCAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCTTCAACGCTTCACCGGTGTTCTTGC
AAGAACCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCCAGATTCTGGTTGTAACGGCTCAA
GAATCGCCTTGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAACTTCCCCTTTGCCACAATCACTGT
CACTAGATTCAGACGAAGAAGATGATTCAGAGTCCATCTTCAAAGCTTTAGCTTTTGCCT
TTTCTTCTTTCCTCTGTTTCTTCAACAGCTTCTCCTCTGATTTCAACTGATCCAGCTGCT
TAACCAGA
TCTCCGT

QA 1 848 1 848
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TCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCTACACTTCCCCATGCACTTGCAAGCCACAGCAG
ATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTGAAACTCATCCAACAACACAGCTCCTCCTGATT
TCTTGCACTTTCCTCCCATACAGACTTCTACTCTCTTCGACGGCAATCCAACAACCGGAA
CTGATTCCACCGTCTTTAATGGCAATCTAGGATTAACAACTGAGGGAAAGGCCGTGGATG
CAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCTTCAACGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAACCTT
CTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCCAGATTCTGGTTGTAACGGCTCAAGAATCGCCT
TGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAACTTTCCCTTTGCCACAATCACTGTCACTAGATT
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TCCTCTGTTTCTTCAACAGCTTCTCCTCTGATTTCAACTGATCCAGCTGCTTAACCAGAA
TCTCCGTTGCTTCCGAGATTGTCTTGTTTTGAATCTCAGCAACCAAACCGGCTTCCGGAT
CAAGACCAAACCCTATGCTTGAAAACATATTCAAGTTCTTAGAAGAGCTTTAAGAACCTT
AGCCTTCTTCTTCATCTCCTTCTTCTCCCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 7

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ATAGAGACCAACTCCACTCTTTTTTTTTGTCCTTCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAAT
TGATGTGGAAAAGAAGAACGATGAAGCAGTAAGTTTTTTAGTTGCGATGATTGTCTCATC
AGGTTCATGGGTTTTGTCCCCATCTTCTTCTTCCGTCTTTTTTAGTTGTCGCCAGAGATT
ACCTTTGGTGAGATCAACGGTCGATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCA
AACGCCTAACAAAAAAGTAACAGAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCGAAAACTAG
GAAAGTTGCAGCAGAAGAGATTTTAGCTGCTTTTTCTGCTATCGAAAAGGCTAAGGTTGA
TCCATCACCATTCCTTGAAACACTAGGTGGATCCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCT
CATCTTCACTGCCGAGAAGAAACTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCAGTTCA
GAGATTTGATGCTGCGGGGAAGAGAATAGAGAACGGGGTGTATCTTGGTCCAATAGGAGC
GTTGACATTTGAAGGAAAGTTTTCATGGAAGAACCGTATCCTAGCCTTCATATTCGAACA
GATACGCATAAAGATTGGACCTTTGGATCCTATAGAGATCGGTTTGGGGAAGAAAGATGC
AGAGTATGAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAAT
AGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGCGGCGGTACAGCTTTCTGG*TGTCGTTGTCGCCGCATCG
CTTCCTGATGAACTGATGATGATAGACTCTCTTCTTCAATACTTTTATACTTTTCCCTGT
AAAAAATCTTTGAATGTGTGAATGATACTCATCTGCAATGTTGTAATGTAAACTAAACCC
GGATGGTTTAAGGTTGTGTTAGTAAAAAAATGGTTCATGGGGTTTCAGTTTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DR76TF U 1
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RD RR4DR76TF 654 0 0
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QA 1 654 1 654
DS 

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QA 1 780 1 780
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RD RR4AZ07TF 844 0 0
GG
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QA 3 829 3 829
DS 

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GG
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TCATGGGTTTTGTCCCCATCTTCTTCTTCCGTCTTTTTTAGTTGCCGCCAGAGATTACCT
TTGGTGAGATCAACGGTCGATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACG
CCTAACAAAAAAGTAACAGAGAGCGTGAGT*TGCTAAAAACGGCTGCGAAAACTAGGAAA
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CGCATAAAGATTGGACCTTTGGATCCTATAGAGATCGGTTTGGGGAAGAAAGATGCAGAG
TATGAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCA
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CTGATGAACTGATGATGATAGACTCTCTTCTTCAATACTTTTATACTTTTCCCTGTAAAA
A*TCTTTGAATGTGTGAATGATACTCATCTGCAATGTTGTAATGTAAACTAAACCCG

QA 3 839 3 839
DS 

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GAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGCGGCGGTACAGCTTTCTGG*TGTCGTTGTCGCCG
CATCGCTTCCTGATGAACTGATGATGATAGACTCTCTTCTTCAATACTTTTATACTTTTC
CCTGTAAAAAATCTTTGAATGTGTGAATGATACTCATCTGCAATGTTGTAATGTAAACTA
AACCCGGATGGTTTAAGGTTGTGTTAGTAAAAAAATGGTTCATGGGGTTTCAGTTTGGTT
T

QA 1 601 1 601
DS 

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TTCCCTCTAACCGCAGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAGAGAATAGAGAACGGGGTG
TATCTTGGTCCAATAGGAGCGTTGACATTTGAAGGAAAGTTTTCATGGAAGAACCGTATC
CTAGCCTTCATATTCGAACAGATACGCATAAAGATTGGACCTTTGGATCCTATAGAGATC
GGTTTGGGGAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTCTTCATTTGG
TTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGCGGCGGTACAGCTTTCTGG
*TGTCGTTGTCGCCGCATCGCTTCCTGATGAACTGATGATGATAGACTCTTTTTTTCAAT
ACTTTTATACTTTTCCCTGTAAAAAATCTTTGAATGTGTGAATGATACTCATTTGCAATG
TTGTAATGTAAACTAAACCCGGATGGTTTAAGGTTGTGTTAGTAAAAAAATGGTTCATGG
GGTTTC
G

QA 1 546 1 546
DS 

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TTGATGCTGCGGGGAAGAGAATAGAGAACGGGGTGTATCTTGGTCCAATAGGAGCGTTGA
CATTTGAAGGAAAGTTTTCATGGAAGAACCGTATCCTAGCCTTCATATTCGAACATATAC
GCATAAAGATTGGACCTTTGGATCCTATAGAGATCGGTTTGGGGAAGAAAGATGCAGAGT
ATGAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTTTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAG
TTGCTCGTGGACGAAGCGGCGGTACAGCTTTTTGG*TGTCGTTGTCGCCGCATCGCTTCC
TGATGAACTGATGATGATAGACTTTTTTTTTCAATACTTTTATACTTTTCCCTGTAAAAA
ATCTTTGAATGTGTGAATGATACTCATTTGCAATGTTGTAATGTAAACTAAACCCGGATG
GTTTAAGGTTGTGTTAGTAAAAAAATGGTTCATGGGGTTTCAGTTTGGTTT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 7

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CGCCTGTGTGTGTGTTGTCGTCGACGTCGATTGCTCTTGCGCCACCCAGTTCCAATCTCA
GTCATCGGCTTCTCCGAATTTGCGCCACTGCTGACGACGGAGTGGAAGCTCCCGAGGAGG
TTCAAACCCAATCTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGG
TGGTTAACAAGACAGCAGCAACCTTTGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAG
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TTGGAGGTGTTCTCTCTTTCAACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGT
TGATGGGTATGTGGTCCATTTGGATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCC
CTCCTAAAGAGAAAGAAGCTCTTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTG
CTATTCCCTTCTTCTGGAAATCTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCT
TTGCCATGTATGCCTGGAAGCTTGGATGGCTGGAAAGAACCGAGTAGAGCTACTCCTGTT
GGGATTAGAGTCTGGAAGATTCTATGTCTTCTCTTCCTTAGAATGAATGGTTCTCCATCC
AGCTTCTTTGTTACCAAGTACAGCATATCTAATATTCGAGGTACCTGGGTTTGAGTGAGG
CAAACAAATGTGTACATTGCTAAATATTGGCAAGCCCCCCCTTAAGTAATATTCATAGAC
TTCTGAGATGGTTTGTTTGTTTATTATCTAGGAAATGAAAATGCCACTTCATATACATTT
TCTTATCAAGAGCGCAGCTGGTAAATTTACAGAAAATAAACAAGTGTGCTCTCTTTTTTT
TTTCTGAATGAATAAACAAGTGTGCTCATTGCATTTGCATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU76TF U 1
AF RR4CB43TF U 12
AF RR4CD62TF U 30
AF RR4AR54TF U 13
AF RR4AU76JQ C 139
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BS 1 764 RR4AU76TF
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BS 780 780 RR4AR54TF
BS 781 820 RR4CB43TF
BS 821 845 RR4AU76JQ
BS 846 877 RR4CD62JQ
BS 878 878 RR4CB43JQ
BS 879 932 RR4CD62JQ
BS 933 1003 RR4CB43JQ

RD RR4AU76TF 764 0 0
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CGCCTGTGTGTGTGTTGTCGTCGACGTCGATTGCTCTTGCGCCACCCAGTTCCAATCTCA
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CTATTCCCTTCTTCTGGAAATCTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCT
TTGCCATGTATGCCTGGAAGCTTGGATGGCTGGAAAGAACCGAGTAGAGCTACTCCTGTT
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AGCTTCTTTGTTACCAAGTACAGCATATCTAATATTCGAGGTAC

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DS 

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CTTCTTCTTCTTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGGTGGTTAACAAGACAGCAGCAA
CCTTTGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGCTCTCCCTGGAACTACTCTTT
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ACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGCTGATGGGTATGTGGTCCATTT
GGATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAGAAAGAAGCTC
TTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTCTTCTGGAAAT
CTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCATGTATGCCTGGAAGC
TTGGATGGCTGGAAAGAACCGAGTA*AGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGTCTGGAAGATT
CTATGTCTTCTCTTCCTTAGAATGAATGGTTCTCCATCCAGCTTCTTTGTTAC*AAGTAC
AGCATATCTAATATTCGAGGTACCTGGGTTTGAGTGAG*CAAACAAATGTGTACATTGCT
AAATATTGGCAAGCCCCCC
TTAAGTATATTCAT

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GG
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TGACGACGGAGTGGAAGCTCCCGAGGAGGTTCAAACCCAATCTCCTTCCTCTTCTTCTTC
TTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGGTGGTTAACAAGACAGCAGCAACCTTTGCGCC
TAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGCTCTCCCTGGAACTACTCTTTACAAAGTTTT
TGAGGTTCAAGGTTATGCATCCATGTTCCTTGGAGGTGTTCTCTCTTTCAACCTCCTCTT
TCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGTTGATGGGTATGTGGTCCATTTGGATGTTCAC
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TTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTCTTCTGGAAATCTTTTCCTCT
TGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCATGTATGCCTGGAAGCTTGGATGGCT
GGAAAGAACCGAGTAGAGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGTCTGGAAGATTCTATGTCTTC
TCTTCCTTAGAATGAATGGTTCTCCATCCAGCTTCTTTGTTACCAAGTACAGCATATCTA
*TATTCGAGGTACCTGGGTTTGAGTGAG*CAAC**AATGTGTACATTGCTAA
TAT

QA 3 774 3 774
DS 

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CGACGTCGATTGCTCTTGCGCCACCCAGTTCCAATCTCAGTCATCGGCTTCTCCGAATTT
GCGCCACTGCTGACGACGGAGTGGAAGCTCCCGAGGAGGTTCAAACCCAATCTCCTTCCT
CTTCTTCTTCTTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGGTGGTTAACAAGACAGCAGCAA
TCTTTGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGTTCTCCCTGGAACTACTCTTT
ACAAAGTTTTTGAGGTTCAAGGTTATGCATCCATGTTCCTTGGAGGTGTTCTCTCTTTCA
ACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGTTGATGGGTATGTGGTCCATTT
GGAT*TTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAGAAAGAAGCTC
TTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTCTTCTGGAAAT
CTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCATGTATGCCTGGAAGC
TTGGATGGCTGGAAAGAACCGAGTAGAGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGTCTGGAAGATT
CTATGTCTTCTCTTCCTTAGAATGAATGGTTCTCCATCCAGCTTCTTTGTTACCAAGTAC
AGCATATCTAATATTCGAGGTACCTGGGTTTGAGTGAGGCAAACAAATGTGTACATTGCT
AAATATTGGCAAGCC

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DS 

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CCTCTTCTTCTTCTTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGGTGGTTAACAAGACAGCAG
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TCAACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGTTGATGGGTATGTGGTCCA
TTTGGATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAGAAAGAAG
CTTTTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTTTTCTGGA
AATCTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCATGTATGCCTGGA
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TACAGCATATCTAATATTCGAGGTACCTGGGTTTGAGTGAGGCAAACAAATGTGTACATT
GCTAAATATTGGCAAGCCCCCCCTTAAGTAATATTCATAGACTTCTG
G

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DS 

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CTTTGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGCTCTCCCTGGAACTACTCTTTA
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CCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGTTGATGGGTATGTGGTCCATTTG
GATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAGAAAGAATCTCT
TAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTCTTCTGGAAATC
TTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCATGTATGCCTGGAAGCT
TGGATGGCTGGAAAGAACCGAGTAGAGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGTCTGGAAGATTC
TATGTCTTCTCTTCCTTAGAATGAATGGTTCTCCATCCAGCTTCTTTGTTACCAAGTACA
GCATATCTAATATTCGAGGTACCTGGGTTTGAGTGAGGCAAACAAATGTGTACATTGCTA
AATATTGGCAAGCCCCCCCTTAAGTAATATTCATAGACTTCTGAGATGGTTTGTTTGTTT
ATTATCTAGGAAATGGAAATGCCACTTCATATACATTTTCTTATCAAGAGCGCAGCTGGT
AAATTTACAG

QA 1 730 1 730
DS 

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GCATCCATGTTCCTTGGAGGTGTTCTCTCTTTCAACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCT
GACTTATGGAGGCTGATGGGTATGTGGTCCATTTGGATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGA
GCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAGAAAGAAGCTCTTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCT
TTACTCAATGTTGCTATTCCCTTCTTCTGGAAATCTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGAT
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AGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGTCTGGAAGATTCTATGTCTTTTCTTCCTTAGAATGAA
TGGTTCTCCATCCAGCTTCTTTGTTACCAAGTACAGCATATCTAATATTCGAGGTACCTG
GGTTTGAGTGAGGCAAACAAATGTGTACATTGCTAAATATTGGCAAGCCCCCCCTTAAGT
AATATTCATAGACCTCTGAGATGGTTTGTTTGTTTATTATCTAGGAAATGAAAATGCCAC
TTCATATACATTTTTTTATCAAGAGCGCAGCTGGTAAATTTACAGAAAATAAACAAGTGT
GCTCTCTTTTTTTTTTCTGAATGAATAAACAAGTGTGCTCATTGCATTTGCATCTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 7

CO CL1074Contig1 1075 7 24 U
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TTTTAGCAGAGATGACGAAGAACTACCCAAATGTGAGCGAGGACTACAAGAAGGCTATTG
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TCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTTGACTCTGCCACAAAGACTGGTGGTCCCT
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TGTCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTTGAAG
GTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGAGCTCCTGAGCG
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AGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGCGACATGTGTGG
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TTTTATGTACTCTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTTGTGATTTGGAC
GTTGGTACGTTTTGATTTTGCTGGTTAGACATTCTAATAAATCAATTCCTCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES60TF U 1
AF RR4FG36TF U 50
AF RR4EY28TF U 50
AF RR4AF63TF U 312
AF RR4A053JQ C 478
AF RR4A053TFB U 478
AF RR4A053JQD C 480
BS 1 159 RR4ES60TF
BS 160 160 RR4FG36TF
BS 161 602 RR4ES60TF
BS 603 603 RR4FG36TF
BS 604 634 RR4ES60TF
BS 635 732 RR4EY28TF
BS 733 733 RR4AF63TF
BS 734 735 RR4EY28TF
BS 736 736 RR4A053TFB
BS 737 817 RR4EY28TF
BS 818 818 RR4AF63TF
BS 819 825 RR4EY28TF
BS 826 828 RR4AF63TF
BS 829 833 RR4EY28TF
BS 834 834 RR4AF63TF
BS 835 842 RR4EY28TF
BS 843 843 RR4AF63TF
BS 844 864 RR4EY28TF
BS 865 916 RR4AF63TF
BS 917 917 RR4A053TFB
BS 918 934 RR4AF63TF
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BS 936 1060 RR4AF63TF
BS 1061 1075 RR4A053JQD

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TTTTAGCAGAGATGACGAAGAACTACCCAAATGTGAGCGTGGACTACAAGAAGGCTATTG
AGAAGTGCAGGAGGAAGCTCAGAGGCTTGATCGCTGAGAAGCATTGTGCACCTATCATGG
TCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTTGACTCTGCCACAAAGACTGGTGGTCCCT
TTGGAACAATGAGGTTCACCGATGAGCAAGCTCATGAGGCCAACAGTGGTATCAAGATTG
CTCTTGGGTTGTTGGAGCCTATCAGGGTGCAGTTCCCTACCATCTCTTTTGCTGATTTCC
ATCAGCTTGCTGGTGTTGTTGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCAGTTCCACC
CTGGAAGAGAGGACAAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGATGCTACAAAGG
GTTGTAACCACTTGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATCG
TGGCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4FG36TF 568 0 0
GG
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GTTTCAGATTTTTAGCAGAGATGACGAAGAACTACCCAAATGTGAGCGAGGACTACAAGA
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CTATCATGGCCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTTGACTCTGCCACAAAGACTG
GTGGTCCCTTTGGAACAATGAGGTTCACCGATGAGCAAGCTCATGAGGCCAACAGTGGTA
TCCAGATTGCTCTTGGGTTGTTGGAGCCCATCAGGGTGCAGTTCCCTACCATCTCTTTTG
CTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTTGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTC
AGTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGATG
CTACAAAGGGTTGTAACCACTTGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACA
ATGACATCGTGTCTTTATCTGGTGCC

QA 3 568 3 568
DS 

RD RR4EY28TF 815 0 0
GG
GTGCTCACCTCGTCACAGCTACTCTCACTTTCTCAGATTTTTATCCTCTCTCGAGAAAGT
GTTTCAGATTTTTAGCAG*GATGACGAAGAACTACCCAAATGTGAGCGAGGACTACAAGA
AGGCTATTGAGAAGTGCAGGAGGAAGCTCAGAGGCTTGATCGCTGAGAAGCATTGTGCAC
CTATCATGGTC*GCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTTGACTCTGCCACAAAGACTG
GTGGTCCCTTTGGAACAATGAGGTTCACCGATGAGCAAGCTCATGAGGCCAACAGTGGTA
TCAAGATTGCTCTTGGGTTGTTGGAGCCTATCAGGGTGCAGTTCCCTACCATCTCTTTTG
CTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTTGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTC
AGTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGATG
CTACAAAGGGTTGTAACCACTTGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACA
ATGACATCGTGGCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTCTG
GCTTTGAAGGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGAGC
TCCTGAGCGGTGAGAAGGAAG*TCTTATTCAACTTGTCTCTGACAAGTCACTATTGGACG
ATCCCACATTCCGTTCTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGA*GCCTTTTC**ATG
AT*ACGCTGAG*CCCACTTGAAGCTTTCTGAGC

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DS 

RD RR4AF63TF 760 0 0
G
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TGGAGCCTATCAGGGTGCAGTTCCCTACCATCTCTTTTGCTGATTTCCATCAGCTTGCTG
GTGTTGTTGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCAGTTCCACCCTGGAAGAGAGG
ACAAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGATGCTACAAAGGGTTGTAACCACT
TGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATCGTGGCTTTATCTG
GTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTTGAAGGTCCTTGGACTT
CAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGAGCTCCTGAGCGGTGAGAAGGAAG
GTCTTATTCAACTTGTCTCTGACAAGTCACTATTGGACGATCCCACATTCCGTTCTTTGG
TTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTTTTTCAATGATTACGCTGAGGCCCACTTGA
AGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGCGACATGTGTGGATATGGTGTCTC
CAAGACTCGGAGGATTCGCATTACATTTGAACGTTTGTCATTTGATTGTTTTATGTACTC
TCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTTGTGATTTGGACGTTGGTACGTTT
TGATTTTGCTGGTTAGACATTCTAATAA
TCAATTTCTCA

QA 2 749 2 749
DS 

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GG
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GGTTGTAACCACTTGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATC
GTGTCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTTGAA
GGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGAGCTCCTGAGC
GGTGAGAAGGAAGGTCCTATTCAACTTGTCTTTGACAAGTCACTATTGGACGATCCCACA
TTCCGTTCTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTTTTTCAATGATTACGCT
GAGGCCCACTTGAAGCTTTTTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGCGACATGTGTG
GATATGGTGTCTCCAAGGCTCGGAGGATTCGCATTGCATTTGAACGTTTGTCATTTGATT
GTTTTATGTACTCTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTTGTGATTTGGA
CGTTGGTAC

QA 3 551 3 551
DS 

RD RR4A053TFB 598 0 0
GG
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GGTTGTAACCACTTGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATC
GTGTCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTTGAA
GGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGAGCTCCTGAGC
GGTGAGAAGGAAGGTCCTATTCAACTTGTCTCTGACAAGTCACTATTGGACGATCCCACA
TTCCGTTCTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTTTTTCAATGATTACGCT
GAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGCGACATGTGTG
GATATGGTGTCTCCAAGGCTCGGAGGATTCGCATTGCATTTGAACGTTTGTCATTTGATT
GTTTTATGTACTCTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTTGTGATTTGGA
CGTTGGTACGTTTTGATTTTGCTGGTTAGACATTCTAATAA
ATCAATTCCTCAGCG

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR4A053JQD 596 0 0
CCTGGAAGAGAGGACTAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGATGCTACAAAG
GGTTGTAACCACTTGAGAGAAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATC
GTGTCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTTGAA
GGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGAGCTCCTGAGC
GGTGAGAAGGAAGGTCCTATTCAACTTGTCTCTGACAAGTCACTATTGGACGATCCCACA
TTCCGTTCTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTTTTTCAATGATTACGCT
GAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGCGACATGTGTG
GATATGGTGTCTCCAAGGCTCGGAGGATTCGCATTGCATTTGAACGTTTGTCATTTGATT
GTTTTATGTACTCTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTTGTGATTTGGA
CGTTGGTACGTTTTGATTTTGCTGGTTAGACATTCTAATAAATCAATTCCTCAGCG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 4

CO CL1075Contig1 1317 4 6 U
GGATCTCTATCTCTATCTCTGCGCCGCCGCGCTATCTCCGAATCTCTCTAACCCTAACCA
ACCACGCTTCATCCCTCCCTCTCTCTCTCCGACGTAAGATATAAATGGGGCGGAAGAAGC
CTAGTGCTCGTGGCGGAGACGACGAACCAGCTGCTTCGTCTCTCGTCGTCGGTGGTGGTG
GTAAATCCAAGAAGAAAGGTGTTCAGATCGATGACGATGAGTACTCCATAGGTACGGAGC
TCTCCGAGGATCCGCCTAAAGGAGGAGGCGAGGAAGACAAGGTTGTTGTTATCACTGGGA
AGAAGAAGAAGAGTAAGAAAGGTGATAAGAAAGGTGCCGTTCATGATGATGAAGAAGGAG
ATGATGTTGTTGTTCCGGAGATTGCTTTTGAAGGGAAGAAGAAGAAGTCTAAGTCTAAGA
AAGGTAGTGGTGGATCCGTTAGCTTTGCTTTGTTAGATGATGATGATGGTGATGGTGGAG
ATGATAAGGATGGTGATGATGAAGTGGAGGAGGATGAGCCTAAGAAGGGTGGTAAGTCTT
TTGCTGCTCCAGCTTTTGATGCACTTGGTGGTGATGGTGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAG
AGGTGAAGCCAATCACTTTCTCTGGTAAGAAGAAGTCTTCCAAGAAGAGTGGGAATTCAT
TTGCGGCTGCTTTGCTTGATGATGATGAAGAGGAGAGTAATGCGGTTGAGGAGGAAGAGA
GGCCTGAGATTATGTTTACGGGGAAGAAGAAGTCGTCTAAGAAGAAGGGAAGTAGTGTTT
TGGCGTCGGTAGGTGATGATGATGACTCAGTTGCTGAGGAAGTGAGTAAGGATAAAGCTT
CTGATGCTAAGAGTGTTGTAGAGGTTGTAGAGCCTGCGAAGAGTAAGAAAAAGAAGAAGA
ATAACAAGAGTGGGAGGACAGTACAGGAAGAGGATGATTTGGACAAGCTTCTTGCTGAGC
TTGGAGAAGGCCCTGTTGCTGGAAAACCTGCTGAAGAAGAGAAAGTTCAAGCTCAGCCTC
AGCCTGTTGCAGCAGCTGTAGAGAATGATGGTGAGAAGGAAGGAGAAGAAGAGAGTGCTG
CAGCGAAGAAAAGGAAGAAGAAGAAGGAGAAAGAGAAGGAAAAGAAAGCAGCAGCTGCAG
CAACCTTTACTGTGGAGGCTAAGGAGGAAAAACAAGAAGAATCAGTACCTGAGCCACTGC
AGGGGAAGAAGAAGGATGCAAAGGGTAAAGCAGCTGACAAGAAAATTCCTAAACATGTTA
GAGAGATGCAAGAGGCTCTTGCACGGCGGCAGGAAGCCGAAGAGAGAAAGAAGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO88TF U 1
AF RR4G641TF U 229
AF RR4CT58JQ C 451
AF RR4BO88JQ C 760
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ACCACGCTTCATCCCTCCCTCTCTCTCTCCGACGTAAGATATAAATGGGGCGGAAGAAGC
CTAGTGCTCGTGGCGGAGACGACGAACCAGCTGCTTCGTCTCTCGTCGTCGGTGGTGGTG
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G
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TATCACTGGGAAGAAGAAGAAGAGTAAGAAAGGTGATAAGAAAGGTGCCGTTCATGATGA
TGAAGAAGGGGATGATGTTGTTGTTCCGGAGATTGCTTTTGAAGGGAAGAAGAAGAAGTC
TAAGTCTAAGAAAGGTAGTGGTGGATCCGTTAGCTTTGCTTTGTTAGATGATGATGATGG
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TTAAG

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TT
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GATGAGC*TAAGAAGGGTGGTAAGTCTTTTGCTGCTCCAGCTTT*GATGCACTTGGTGGT
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GAGAAGGAAAAGAAAGCAGCAGCTGCAGCAACCTTTACTGTGGAGGCTAAGGAGGAAAAA
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GCTGACAAGAAAATTCCTAAACATGTTAGAGAGATGCAAGAGGCTCTTGCACGGCGGCAG
GAAGCCGAAGAGAGAAAG
AAGAAGG

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DS 

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AAAAGAAAGCAGCAGCTGCAGCAACCTTTACTGTGGAGGCTAAGGAGGAAAAACAAGAAG
AATCAGTACCTGAGCCACTGCAGGGGAAGAAGAAGGATGCAAAGGGTAAAGCAGCTGACA
AGAAAATTCCTAAACATGTTAGAGAGATGCAAGAGGCTCTTGCACGGCGGCAGGAAGCCG
AAGAGAGAAAGAAGAAGG

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 5

CO CL1076Contig1 989 5 12 U
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TGGTAACTATCCTGAGTGGAAGCTTTTCATCCAGACGATGGATCCTGCGGATGAGGATAA
GTTTGATTTCGACCCGCTTGATGTGACCAAAATCTGGCCTGAGGATATCTTGCCTTTGCA
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GCTTGCTTTCAACCCTGGTCTTGTGGTTCCTGGGATCTACTACTCTGATGATAAGCTTCT
CCAGTGTAGGATCTTTGCTTATGGTGACACTCAGAGACATCGTCTTGGGCCTAATTATCT
GCAGCTACCGGTTAATGCTCCAAAATGTGCTCACCACAACAATCACCACGAAGGTTTTAT
GAACTTCATGCATAGAGATGAGGAGATCAACTACTACCCCTCAAAGTTTGATCCTGTCCG
TTGTGCTGAGAAAGTTCCTATCCCTAACAAGTCTTACACTGGAATCCGAACAAAGTGCAT
CATCAAGAAGGAGAACAACTTCAAGCAACCTGGAGATAGATACAGATCGTGGGCACCAGA
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TGAGATCCGTAGCATCTGGATCTCTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCTTTGGGACAGAA
GCTTGCAAGCCGTTTCAACGTTAGGCCAAGCATATAATCTTCATATTTGCTTATTGCCCG
GAAAGTACAATCGTGATCGATCTATCATCTGTTGGTCGTTACATTCCTCAAAAATATGAT
TTTCTTGGGTTATTTATTTCGTCTATGTATAATAGTAATGCTTGTAATCCTCTAAAACGA
TGTTTCCTTCATGTTTTACTGTCACTCTCTTTGTAATTTCTTAAGAATAAATCAATGTTT
CTTGAAGCAGTATATATAGCTTACTATAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF48TF U 1
AF RR4GV24TF U 1
AF RR4GV24JQ C 363
AF RR4GF48JQ C 450
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RD RR4GF48TF 561 0 0
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QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4GV24TF 739 0 0
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TGGTAACTATCCTGAGTGGAAGCTTTTCATCCAGACGATGGATCCTGCGGATGAGGATAA
GTTTGATTTCGACCCGCTTGATGTGACCAAAATCTGGCCTGAGGATATCTTGCCTTTGCA
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GCTTGCTTTCAACCCTGGTCTTGTGGTTCCTGGGATCTACTACTCTGATGATAAGCTTCT
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GCAGCTACCGGTTAATGCTCCAAAATGTGCTCACCACAACAATCACCACGAAGGTTTTAT
GAACTTCATGCATAGAGATGAGGAGATCAACTACTACCCCTCAAAGTTTGATCCTGTCCG
TTGTGCTGAGAAAGTTCCTATCCCTAACAAGTCTTACACTGGAATCCGAACAAAGTGCAT
CATCAAGAAGGAGAACAACTTCAAGCAACCTGGAGATAGATACAGATCGTGGGCACCAGA
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GCTTGCAAGCCGT
TTCACG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4GV24JQ 606 0 0
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TCAAGAAGGAGAACAACTTCAAGCAACCTGGAGATAGATACAGATCGTGGGCACCAGACA
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AGATCCGTAGCATCTGGATCTCTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCTTTGGGACAGAAGC
TTGCAAGCCGTTTCAACGTTAGGCCAAGCATATAATCTTCATATTTGCTTATTGCCCGGA
AAGTACAATCGTGATCGATCTATCATCTGTTGGTCGTTACATTCCTCAAAAATATGATTT
TCTTGGGTTATTTATTTCGTCTATGTATAATAGTAATGCTTGTAATCCTCTAAAACGATG
TTTCCTTCATGTTTTACTGTCACTCTCTTTGTAATTTCTTAAGAATAAATCAATGTTTCT
TG
AAGC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4GF48JQ 519 0 0
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AGTCTTACACTGGAATCCGAACAAAGTGCATCATCAAGAAGGAGAACAACTTCAAGCAAC
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TGGAGATTCTGTCAGAGCCACGTCTCACGCATGAGATCCGTAGCATCTGGATCTCTTACT
GGTCTCAGGCTGATCGATCTTTGGGACAGAAGCTTGCAAGCCGTTTCAACGTTAGGCCAA
GCATATAATCTTCATATTTGCTTATTGCCCGGAAAGTACAATCGTGATCGATCTATCATC
TGTTGGTCGTTACATTCCTCAAAAATATGATTTTCTTGGGTTATTTATTTCGTCTATGTA
TAATAGTAATGCTTGTAATCCTCTAAAACGATGTTTCCTTCATGTTTTACTGTCACTCTC
TTTGTAATTTCTTAAGAATAAATCAATGTTTCTTG
AAGC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4BP06TF 252 0 0
G
CGTTAGGCCAAGCATATAATCTTCATATTTTCTTATTGCCCGGAAAGTACAATCGTGATC
GATCTATCATCTGTTGGTCGTTACATTCCTCAAAAATATGATTTTCTTGGGTTATTTATT
TCTTCTATGTATAATAGTAATGCTTGTAATCCTCTAAAACGATGTTTCCTTCATGTTTTA
CTGTCACTCCCTTTGTAATTTCTTAAGAATAAATCAATGTTTCTTGAAGCAGTATATATA
GCTTACTATAT

QA 2 252 2 252
DS 



AS 1 7

CO CL1077Contig1 949 7 15 U
GGGGAGAAGATTTGATCGGCATCCACGACGGCGGCGGCGGAGTAAGTCATGGCGAACCTA
GAACCCGAAGCAGTCGATTTCTAGCCGGAGGAGGATGACCTGATGGACAGTGCAGCAGCT
GATCTCTCCCCACGCGCAGCCAATCCGCGGCTTAGGTCTACAATCGCCGGAGCAAACGAC
GATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGAGGAGAAGGATTCCGATCGC
CAGCGCCGCC*TTTCCTCCCGAGATTTCGACTCACTCGGTTCCGATGGTGGTCCTGGCCC
TCAGCGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGTTCATGAGGAGGCACAGGA
AGATGATATATCGAATGCTTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAAGAGTTTGCATCTCAATCT
CGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAAGAGCGAAGA
AGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTCTTACACAGAACGTCAGCGT
GGACTGGGCCTTCTGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAGGAGAAGGAACATGAGGTC
TGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTCTGATTGTGTTTCATTTGGTT
CGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCAGTATTTCGGATTCTCTCTCTTTATCTGTATGCCGCT
GAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTCTGGGTTGCGTAGGTTTGGTTGTTGTGTATGGTGTGTA
GTCTTATGCATTTGCATAGGATTGTTGCGTTTTTTTTAACACCATGAGAGATATGGTTAA
CATT**GGTTGAGAATGATGCTTTAGATTTTACTAGTATTATCTCCC*AAGCACAGGCAT
ATTCATTATGAAACCAAGATGAATATTAAAAAAGTAACTTTTCTTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN60TF U 1
AF RR4CX30TF U 1
AF RR4CX30JQ C 155
AF RR4BN60JQ C 172
AF RR4EL01TF U 504
AF RR4C581JQ C 445
AF RR4C581TF U 769
BS 1 514 RR4BN60TF
BS 515 515 RR4CX30TF
BS 516 522 RR4BN60TF
BS 523 588 RR4CX30TF
BS 589 604 RR4EL01TF
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BS 606 768 RR4EL01TF
BS 769 844 RR4C581TF
BS 845 846 RR4EL01TF
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BS 849 887 RR4C581TF
BS 888 888 RR4EL01TF
BS 889 933 RR4C581TF
BS 934 949 RR4C581JQ

RD RR4BN60TF 522 0 0
GGGGAGAAGATTTGATCGGCATCCACGACGGCGGCGGCGGAGTAAGTCATGGCGAACCTA
GAACCCGAAGCAGTCGATTTCTAGCCGGAGGAGGATGACCTGATGGACAGTGCAGCAGCT
GATCTCTCCCCACGCGCAGCCAATCCGCGGCTTAGGTCTACAATCGCCGGAGCAAACGAC
GATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGAGGAGAAGGATTCCGATCGC
CAGCGCCGCC*TTTCCTCCCGAGATTTCGACTCACTCGGTTCCGATGGTGGTCCTGGCCC
TCAGCGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGTTCATGAGGAGGCACAGGA
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CGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAAGAGCGAAGA
AGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCTAGCTTCT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4CX30TF 592 0 0
GGGGAGAAGATTTGATCGGCATCCACGACGGCGGCGGCGGAGTAAGTCATGGCGAACCTA
GAACCCGAAGCAGTCGATTTCTAGCCGGAGGAGGATGACCTGATGGACAGTGCAGCAGCT
GATCTCTCCCCACGCGCAGCCAATCCGCGGCTTAGGTCTACAATCGCCGGAGCAAACGAC
GATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGAGGAGAAGGATTCCGATCGC
CAGCGCCGCC*TTTCCTCCCGAGATTTCGACTCACTCGGTTCCGATGGTGGTCCTGGCCC
TCAGCGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGTTCATGAGGAGGCACAGGA
AGATGATATATCGAATGCTTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAAGAGTTTGCATCTCAATCT
CGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAAGAGCGAAGA
AGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTCTTACACAGAACGTCAGCGT
GGACTGGGCCTTCTGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAGGAGAAG
AACA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4CX30JQ 687 0 0
GGTCTACAATCGC*GGAGCAAACGACGATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCT
TTCGCGAGGAGAAGGATTCCGATCGCCAGCGCCCCCCTTTCCTCCCGAGATTTCGACTCA
CTCGGTTCCGATGGTGGTCCTGGCCCTCAGCGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTC
ACTGGAGTTCATGAGGAGGCACAGGAAGATGATATATCGAATGCTTTTGGTGATTTTGGG
GAGATTAAGAGTTTGCATCTCAATCTCGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCT
TTGATTGAATATGAGAAGAGCGAAGAAGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCC
GAGCTTCTTACACAGAACGTCAGCGTGGACTGGGCCTTCTGCAACGGACCCAATGCTGGA
TCTTACAGGAGAAGGAACATGAGGTCTGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGA
CGTTTCTGATTGTGTTTCATTTGGTTCGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCAGTATTTCGGA
TTCTCTCTCTTTATCTGTATGCCGCTGAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTCTGGGTTGCGTA
GGTTTGGTTGTTGTGTATGGTGTGTAGTCTTATGCATTTGCATAGGATTGTTGCGTTTTT
TTTAACACCATGAGAGATATGGTTA
CC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4BN60JQ 670 0 0
GCAAACGACGATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGAGGAGAAGGAT
TCCGATCGCCAGCGCCGCC*TTTCCTCCCGAGATTTCGACTCACTCGGTTCCGATGGTGG
TCCTGGCCCTCAGCGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGTTCATGAGGA
GGCACAGGAAGATGATATATCGAATGCTTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAAGAGTTTGCA
TCTCAATCTCGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAA
GAGCGAAGAAGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTCTTACACAGAA
CGTCAGCGTGGACTGGGCCTTCTGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAGGAGAAGGAA
CATGAGGTCTGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTCTGATTGTGTTT
CATTTGGTTCGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCAGTATTTCGGATTCTCTCTCTTTATCTG
TATGCCGCTGAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTCTGGGTTGCGTAGGTTTGGTTGTTGTGTA
TGGTGTGTAGTCTTATGCATTTGCATAGGATTGTTGCGTTTTTTTTAACACCATGAGAGA
TATGGTTA
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4EL01TF 395 0 0
AGGGG
GGTGCCGAGCTTCTTACACAGAACGTCAGCGTTGACTGGGCCTTCTGCAACGGACCCAAT
GCTGGATCTTACAGGAGAAGGAACATGAGGTCTGGGGGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCG
AGAAGACGTTTCTGATTGTGTTTCATTTGGTTCGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCAGTAT
TTCGGATTCTCTCTCTTTATCTGTATGCCGCTGAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTCTGGGT
TGCGTAGGTTTGGTTGTTGTGTATGGTGTGTAGTCTTATGCATTTGCATAGGATTGTTGC
GTTTTTTTTAACACCATGAGAGATATGGTTAACATT**GGTTTAGAATGATGCTTTAGAT
TTTACTAGTATTATCTCCC*AAGCACAGGC

QA 6 395 6 395
DS 

RD RR4C581JQ 505 0 0
GGGT
TATGCTTTGATTGAATATGAGAAGAGCGAAGAAGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAAT
GTTGCCGAGCTTCTTACACAGAACGTCAGCGTTGACTGGGCCTTCAGCAACGGACCCAAT
GCTGGATCTTACAGGAGAAGGAACATGAGGTCTGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCG
AGAAGACGTTTCTGATTGTGTTTCATTTGGTTCGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCAGTAT
TTCGGATTCTCTCTCTTTATCTGTATGCCGCTGAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTCTGGGT
TGCGTAGGTTTGGTTGTTGTGTATGGTGTGTAGTCTTATGCATTTGCATAGGATTGTTGC
GTTTTTTTTAACACCATGAGAGATATGGTTAACATT**GGTTGAGAATGATGCTTTAGAT
TTTACTAGTATTATCTCCC*AAGCACAGGCATATTCATTATGAAACCAAGATGAATATTA
AAAAAGTAACTTTTCTTCTCC

QA 5 505 5 505
DS 

RD RR4C581TF 165 0 0
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AGATATGGTTAACATTTGGTTTGAGAATGATGCTTTAGATTTTACTAGTATTATCTCCCC
AAGCACAGGCATATTCATTATGAAACCAAGATGAATATTAAAAAA

QA 1 165 1 165
DS 



AS 1 7

CO CL1078Contig1 837 7 3 U
AGGAATAAAGCAGTGGATTTTTCTTTCAAAAGTCAAATATTCCAATGAATTAATAAATTG
TTGATAAAGTCACAGTCTAGTTAACTCACAAACAAAACAAATGTTTGTGGAAACTTTTGA
CTTTTTTTGTTATAAAATTAATTATATCAAAAAGCTTATTTGGGACACATAGGGAAACTA
AGTTTTCCACCGAAGATAACGTTGGCGTTGGTACAAAGAGCTCCGACCAAACCTCCTGAC
GACGAGGGATGTCCTCCTTTGTTACCAATGAAGTTCAAGTTCACGTCAATGACGCTGACT
CCTGCGCACGGTACTGCTTTGCTGCACATGATCTGAACTTCATCTTTTGTAATTGTTGTT
CCTCTTACGTTCTTGAACAGCACATCGCTAATGGCAACTCTTGATTCTCCGCCTCTTGAG
CCGTAGTTTTGGTCAATGATGATTGGGTTCTTCACGCTTTCCATTATAATATCTTCAAAC
TTAATGTCCGTAGCCTTGCTTGGAGACGAACCACCCCAACTCTTGATTCTAAAACCATTG
TCGGTACCTTTCATCGTGCAGCTCTTAAAGTGAATGCCGTTAACATCCTCCTCGTTCGGG
TACTTTCCGAGACTACCGACACTTAGGCCGTGTCCTGGGCCACAAACCACGCGTTCGACA
GTTACATTGTTGGAACCACGACCGACAGAAATACAATCGTCTCCTGTCCCTATATTACTG
TCAACGATGCTAACGTTGTCTGCATTGCTCAAATGGATACCATCGGTGTTGGGACTTTCA
GCAGGGCACAATATTGATGTTGTGGATGTCGACATTCGTAGTTTCACCAGAACATGT


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF55JQ U 1
AF RR4BQ90JQ U 3
AF RR4BQ90TF C 3
AF RR4EF55TF C 1
AF RR4F211JQ U 27
AF RR4F211TF C 27
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C

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DS 

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CGAGGGATGTCC
C

QA 1 252 1 252
DS 

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AG
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CGAGGGATGTCCTCCTTTGTTACCAATGAAGTTCAAGTTCACGTC

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DS 

RD RR4F211TF 387 0 0
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AATGAAGTTCAAGTTCACGTCAATGACGCTGACTCCTGCGCACGGTACTGCTTTGCTGCA
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GCTAATGGCAACTCTTGATTCTCCGCC

QA 1 387 1 387
DS 

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AC
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TCACGTCAATGACGCTGACTCCTGCGCATGGTACTGCTTTGCTGCACATGATCTGAACTT
CATCTTTTGTAATTGTTGTTCCTATTACGTTCTTGAACAGCACATCGCTAATGGCAACTC
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GTTTCACCAGAACATGT

QA 3 799 3 799
DS 



AS 2 7

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GTCTTTAATT


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4CA57JQ C 1
AF RR4CA57TF U 1
AF RR4C208TF U 1
AF RR4GM55TF U -3
AF RR4GM55JQ C 313
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AAACAATATTTTCTTGCGTTTCACC

QA 1 505 1 505
DS 

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AG

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CTACTGTCATCCATGCTAATAAATGACAATAGCTGGTTTTGATTGTTTGTGGGTTGTTTA
AAATTTTCTTTTCATGAAAAAAAAATATTTTTAACCGGCTAATATTTTGAAGTAGCTTTT
AAAAAAAGTTTTAAATGCCAGTTTTAAAAGTTTTCACCAAATAATAAGATAAAAACAAAA
ACAATATTTTCTTGCGTTTCACCAAAAAAATGCTTGTTTTTTCTCAGACGAGATTTTTAG
TATATTATATAATTATTTAGAAATTCAAACTTATTCTAAAAACTGCAAACAATCAAAGCC
AATATGCATAAAAATACCACAAAGTGTAATAAGATAAGATCATAATGAAAATAAGATTGT
CTTTA
TTT

QA 7 671 7 671
DS 

RD RR4GM55JQ 358 0 0
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TTCATGAAAAAAAAATATTTTTAACCGGCTAATATTTTGAAGTAGCTTTTAAAAAAAGTT
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TTTGGGTTTCACCAAAAAAATGCTTGTTTTTTTTCAGACGAGATTTTTAGTATATTATAT
AATTATTTAGAAATTCAAACTTATTTTAAAAACTGCAAACAATCAAAGCCAATATGCATA
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QA 1 358 1 358
DS 



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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4FS22JQ U 56
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QA 5 235 5 235
DS 

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TTTTGTCTTTATCTTATTATTTGGCGAAAACTTTTAAAACTGGCATTTTTAACTTTTTTT
TTAAAAGCTACTTCAAAATATTAGCCGGTTAAAAGTATATTTTTTCATGAAAAGAAAAAT
TTAAACAACCCACAAACAATCAAAACCAGCTATTGTCATTTATTAGCATGGATGACAGTA
GCATTCCTTCCTTCCTGACATTTTATATGGGAAACATTTTCCAGAACATCTTTTAGGATT
TTTTTCTGCAACGCAATGCTGAGTGCATACAGCATCACCAGAATTACGACCCAGACAGAC
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AACCAACAAGAAAATCAACAAAAGATAGGTGAAATCAACGACATTTCCATGTTTCGCCAT
GTTTATTTTTCTTCTTATTTGTTATATTTTCTTTTTTTCTTATGGAATATTTCTGTTGTC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 7

CO CL1080Contig1 1529 7 13 U
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TGAACAGTATAACCAACTCTGGCTTGGTTGCCAAAGACAGTTTGCGGAGATGGAGAGATT
GCATTTGCATACAGTGCAACAGCTTCAGCATGAGCTTGCCAATGTAAAAG***GAGGTGG
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GAACATTCAAGCCGGTCAGGTGACTCCTCTGCATTCGTTTGCCATGCATCAACAAGAGCT
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TGGATCCATTGCGCGTGAAAGTCTAATCTCATCTGGTAAAACTGAGAGGAACTTTGAGAG
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TGGAAGAATCAGAATCAGCTCAACGCTTCCAAATCGTTTGGGCAAAATGCTAGCTCCTCT
GCACTGGCATGATTACAAGAAGAAGTACGGGAAGCTGGAAGATTTTGTTGCTAGCCATCT
CGAGTTATTTATGATAGAGGACGACTACATTCAAGTGAGGGAAGGTGCACAGAAAATGGT
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TATCTGGTATCTGCTCAAAATCTATTCCG


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF41TF U 1
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AF RR4EF41JQ C 840
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GATGGATGCGTTGCAGTCATCTACAAATCACTCCTTGCGGGCTGAATTGCGAGAACGTAC
TGAACAGTATAACCAACTCTGGCTTGGTTGCCAAAGACAGTTTGCGGAGATGGAGAGATT
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CTCTAAAACAAACCCCAACGGTGCCTCCCAGACTATCCAGAACAGTGGGAACCAAATCAA
GAACATTCAAGCCGGTCAGGTGACTCCTCTGCATTCGTTTGCCATGCATCAACAAGAGCT
TCTTCAACCTCGGGGACCTTCACCTCATGTTCCAGAGTCAGTGTTACTGCAGCAAAAGGC
TGTACCAGCTAGTTCAGAGATGCCTAGGCAGAATTATGTGCATCCATCTCAAGTTGTACA
TGGCTTGGTAAGTTCTGATGAGAAGAGTGAACACCACCAAGTGCCTACCAATGGACAGTC
CCTTGA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4D546TF 668 0 0
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CTTGCAGGCTGAATTGCGAGAACGTACTGAACAGTATAACCAACTCTGGCTTGGTTGCCA
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GCTTGCCAATGTAAAAG***GAGGTGGCTCTAAAACAAACCCCAACGGTGTCTCCCAGAC
TATCCAGAACAGTGGGAACCAAATCAAGAACATTCAAGCCGGTCAGGTGACTCCTCTGCA
TTCGTTTGCCATGCATCAACAAGAGCTTCTTCAACCTCGGGGACCTTCACCTCATGTTCC
AGAGTCAGTGTTACTGCAGCAAAAGGCTGTACCAGCTAGTTCAGAGATGCCTAGGCAGAA
TTATGTGCATCTATCTCAAGTTGTACATGGCTTGGTAAGTTCTGATGAGAAGAGTGAACA
CCACCAAGTGCCTACCAATGGACAGTCCCTTGATCAAGGGTATCTCGATGTTCAAACTAG
CCATGGAGCACAATTCGGATCAACTACACCATCGTCCTCTGTGAACGAACAGGTGGTGGA
ATCTGGCAATGGGTCCAATACGTCAGAGAATAACTTTCAAGACATTTCTTCACAGTTCCG
TGATGCGC

QA 1 668 1 668
DS 

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GG
CAGAATAGGATTGCTCAAGAAACTATCATGTACAAGGATGAGCAACTGAGAGAAGCGCAA
GGCTGGATTGCGCGTGCCCAAGAGATGGATGCGTTACAATCATCTACAAATCACTCCTTG
CAGGCTGAATTGCGAGAACGTACTGAACAGTATAACCAGCTCTGGCTTTGTTGCCAAAGA
CAGTTTGCGGAGATGGAGAGATTGCATTTGCATACAGTGCAACAGCTTCAGCATGAGCTT
GCCAATGTAAAAGAAGGAGGTGGCTCTAAAACAAACCCCAATGGTGCCTCCCAGATTATC
CAGAACAGTGGGAACCAAATCAAGAACATTCAAGCGGGTCAGGTGACCCCTCTGCATTCG
TTTGCCATGCACCAACAAGAGCTTCTTCAACCTCGGGGACCTTCACCTCATGTTCCAGAA
TCAGTGTTACTGCAGCAAAAGGCTGTACCAGCTAGTTCAGAGATGCCTAGGCAGAATTAT
GTGCATCCATCTCAAGTTGTACATGGCTTGGTAAGTTCTGATGAGAAGAGTGAACACCAC
CAAGTGCCTACCAATGGACAGTCCCTTGATCAAGGGTATCTCGATGTTCAAACTAGCCAT
GGAGCACAATTCGGATCAACTACACCATCGTCCTCTGTGAACGAACAGGTGGTGGAATCT
GGCAATGGGTCCAATACGTCAGAGAATAATTTTCAAGACATTTCTTCACAGTTCCGTGAT
GCGCTAAG*CTAGATTCCGTTGCCATAAATCAGAAACCTGAG*AGAT*AATGGCCAGGTT
TCTCCCGGTGAACCAAA

QA 3 799 3 799
DS 

RD RR4FU41TF 604 0 0
G
CTAGCCATGGAGCACAATTCGGATCAACTACACCATCGTCCTCTGTGAACGAACAGGTGG
TGGAATCTGGCAATGGGTCCAATACGTCAGAGAATAATTTTCAAGACATTTCTTCACAGT
TCCGTGATGCGCTAAGGCTAGATTCCGTTGCCATAAATCAGAAACCTGAGGAGATTAATG
GCCAGGTTTCTCCCGGTGAACCAAATGGTGTTGGATCCATTGCGCGTGAAAGTCTAATCT
CATCTGGTAAAACTGAGAGGAACTTTGAGAGTGCTGCTCTTCTTGATGAAAGGTCGCTGT
TGGCTTGCATCGTTCGCACTATACCAGCTGGTGGAAGAATCAGAATCAGCTCAACGCTTC
CAAATCGTTTGGGCAAAATGCTAGCTCCTCTGCACTGGCATGATTACAAGAAGAAGTACG
GGAAGCTGGAAGATTTTGTTGCTAGCCATCTCGAGTTATTTATGATAGAGGACGACTACA
TTCAAGTGAGGGAAGGTGCACAGAAAATGGTAGCAGCGTCAGCTTCAGCAGCAGCAAGCA
AAGTGGCAGTTTCATCATCTCCAAGCTCCATGTACGTGGCTATGACTCCTATGGCTCAAT
CTC

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR4EF41JQ 677 0 0
CCATAAATCAGAAAC*TGAGGAGATTAATGGTCAGGTTTCTCCCGGTGAACCAAATGGTG
TTGGATCCATTGCGCGTGAAAGTCTAATCTCATCTGGTAAAACTGAGAGGAACTTGGAGA
GTGCTGCTCTTCTTGATGAAAGGTCGCTGTTGGCTTGCATCGTTCGCACTATACCAGCTG
GTGGAAGAATCAGAATCAGCTCAACGCTTCCAAATCGTTTGGGCAAAATGCTAGCTCCTC
TGCACTGGCATGATCACAAGAAGAAGTACGGGAAGCTGGAAGATTTTGTTGCTAGCCATC
TCGAGTTATTTATGATAGAGGACGACTACATTCAAGTGAGGGAAGGTGCACAGAAAATGG
TAGCCGCGTCAGCTTCAGCAGCAGCAAGCAAAGTGGCAGTTTCATCATCTCCAAGCTCCA
TGTACGTGGCTATGACTCCTATGGCTCAATCTCAGGGGTCAAAGAAGAATGTCCAAAGAG
GAAGACTGAGCTCTGATTACATGGCGCCGCCACAACAAAGGAAGCTCTGAAGTGAATTGC
ATGT*AAGAGCCAAGGCGTGACATTCTCCTTATCTTATTTTTATCTATTTTGTTTTAATT
GGTGTATGAAGTCACCATTCCTGGATGTCTAAGTATACAATTTGATTTTGGATTTTAATA
GTATCTGGTATCTGC
CC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4FU41JQ 579 0 0
AAAACTGAGAGGAACTTTGAGAGTGCTGCTCTTCTTGATGAAAGGTCGCTGTTGGCTTGC
ATCGTTCGCACTATACCAGCTGGTGGAAGAATCAGAATCAGCTCAACGCTTCCAAATCGT
TTGGGCAAAATGCTAGCTCCTCTGCACTGGCATGATTACAAGAAGAAGTACGGGAAGCTG
GAAGATTTTGTTGCTAGCCATCTCGAGTTATTTATGATAGAGGACGACTACATTCAAGTG
AGGGAAGGTGCACAGAAAATGGTAGCAGCGTCAGCTTCAGCAGCAGCAAGCAAAGTGGCA
GTTTCATCATCTCCAAGCTCCATGTACGTGGCTATGACTCCTATGGCTCAATCTCAGGGG
TCAAAGAAGAATGTCCAAAGAGGAAGACTGAGCTCTGATTACATGGCGCCGCCACAACAA
AGGAAGCTCTGAAGTGAATTGCATGTTAAGAGCCGAGGCGTGACATTCTCCTTATCTTAT
TTTTATCTATTTTGTTTTAATTGGTGTATGAAGTCACCATTCCTGGATGTCTAAGTATAC
AATTTGATTTTGGATTTTAATAGTATC*GGTATCTGC
AC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4D546JQ 280 0 0
CCAAGCTCCATGTACGTGGCTATGACTCCTAGGGCTCAATCTCGGGGGTCAAAGAAGAAT
GTCCAAAGAGGAAGACTGAGCTCTGATTACATGGCGCCGCCACAACAAAGGAAGCTCTGA
AGTGAATTGCATGT*AAGAGCCAAGGCGTGACATTCTCCTTATCTTATTTTTATCTATTT
TGTTTTAATTGGTGTATGAAGTCACCATTCCTGGATGTCTAAGTATACAATTTGATTTTG
GATTTTAATAGTATCTGGTATCTGCTCAAAATCTATTCCG

QA 1 280 1 280
DS 



AS 1 5

CO CL1081Contig1 804 5 4 U
AAGCTCACCAATAGATAGAAACTGATATACGTAGGAAGGGGAAGAATTAAAACAAACCTT
ATGGGATAATTCATAATAGTTAGTTATACACGAAGATAGAAAAGAAACTAGAAGCCTAAT
CGATTTATTCAATTGCTGTCCCACGTTCTCTTATTAAAGAGAACAACTTAAAACCTGTAA
AAGAGGATTCGCAAGTCAGATTTTGGCACCGATTATTATAGTGTCCAGCTTCATCACTAT
CCACGTAACGCTTATGCTTCGCCATGAGTTTGACCTCAAGCTCTCCAGCGTCGCTTCGAT
TCTCCTCCATTGCAACGAAAACCAACGAGAAA*GCCGTGTCATCTCTAGAAACACGTTGG
CTAGTGATGTTCAAAA*CGGCGGCGTTTCGAGAACCAAGCCTCACGGCAGCGTCATCGAC
GTTGTAGTAGATAGAATACCTCGAGGTCGGGATTTTCACGAGAAAATCGCCTTGCCACGT
TGCGGAGGAGAGGGCGAGGGACTGGAGGGAGATTTTGGCGTGGGAGTGGGCTTTGTCGAT
GAACAAAAAGATTAAGTACACGGCGACAACGGTGAGTAAGGCACCAAAGCAGGGTGTACA
CATAGCCGCACATTCTTTGTCAGTGCGACTACGTTCATTAGATGGTGGGATAGTCATCAT
TGGACGTGACCACCACCGACGAAGAGCGACGGAGAACGGTTGCGTTTGATGAAAGTTGGT
TTGGTAAGCCATACTGATTTCTTTTTGTTGGTTTGACTTTGGAGACGAGAATAGATTGAT
ACTACGTTATCATAATTGTGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4CS32TF C 305
AF RR4CS32JQ U 14
AF RR4A405JQ U 1
AF RR4CJ07JQ U 14
AF RR4CJ07TF C 209
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BS 229 229 RR4CJ07JQ
BS 230 801 RR4A405JQ
BS 802 804 RR4CJ07TF

RD RR4CS32TF 419 0 0
TCCATTGCA
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AAAACGGCGGCGTTTCGAGAACCAAGCCTCACGGCAGCGTCATCGACGTTGTAGTAGATA
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GCGAGGGACTGGAGGGAGATTTTGGCGTGGGAGTGGGCTTTGTCGATGAACAAAAAGATT
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TCTTTGTCAGTGCGACTACGTTCATTAGATGGTGGGATAGTCATCATTGGACGTGACCAC
CACCGACGAAGAGCGACGGAGAACGGTTGCGTTTGATGAAAGTTGGTTTG

QA 10 419 10 419
DS 

RD RR4CS32JQ 731 0 0
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TAATAGTTAGTTATACACGAAGATAGAAAAGAAACTAGAAGCCTAATCGATTTATTCAAT
TGCTGTCCCACGTTCTCTTATTAAAGAGAACAACTTAAAACCTGTAAAAGAGGATTCGCA
AGTCAGATTTTGGCACCGATTATTATAGTGTCCAGCTTCATCACTATCCACGTAACGCTT
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AACGAAAACCAACGAGAAA*GCCGTGTCATCTCTAGAAACACGTTGGCTAGTGATGTTCA
AAA*CGGCGGCGTTTCGAGAACCAAGCCTCACGGCAGCGTCATCGACGTTGTAGTAAATA
GAATACCTCGAGGTCGGGATTTTCACGAGAAAATCGCCTTGCCACGTTGCGGAGGAGAGG
GCGAGGGACTGGAGGGAGATTTTGGCGTGGGAGTGGGCTTTGTCGATGAACAAAAAGATT
AAGTACACGGCGACAACGGTGAGTAAGGCACCAAAGCAGGGTGTACACATAGCCGCACAT
TCTTTGTCAGTGCGACTACGTTCATTAGATGGTGGGATAGTCATCATTGGACGTGACCAC
CACCGACGAAGAGCGACGGAGAACGGTTGCGTTTGATGAAAGTTGGTTTGGTAAGCCATA
CTGATTTCTTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4A405JQ 803 0 0
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ATGGGATAATTCATAATAGTTAGTTATACACGAAGATAGAAAAGAAACTAGAAGCCTAAT
CGATTTATTCAATTGCTGTCCCACGTTCTCTTATTAAAGAGAACAACTTAAAACCTGTAA
AAGAGGATTCGCAAGTCAGATTTTGGCACCGATTATTATAGTGTCCAGATTCATCACTAT
CCACGTAACGCTTATGCTTCGCCATGAGTTTGACCTCAAGCTCTCCAGCGTCGCTTCGAT
TCTCCTCCATTGCAACGAAAACCAACGAGAAA*GCCGTGTCATCTCTAGAAACACGTTGG
CTAGTGATGTTCAAAA*CGGCGGCGTTTCGAGAACCAAGCCTCACGGCAGCGTCATCGAC
GTTGTAGTAGATAGAATACCTCGAGGTCGGGATTTTCACGAGAAAATCGCCTTGCCACGT
TGCGGAGGAGAGGGCGAGGGACTGGAGGGAGATTTTGGCGTGGGAGTGGGCTTTGTCGAT
GAACAAAAAGATTAAGTACACGGCGACAACGGTGAGTAAGGCACCAAAGCAGGGTGTACA
CATAGCCGCACATTCTTTGTCAGTGCGACTACGTTCATTAGATGGTGGGATAGTCATCAT
TGGACGTGACCACCACCGACGAAGAGCGACGGAGAACGGTTGCGTTTGATGAAAGTTGGT
TTGGTAAGCCATACTGATTTCTTTTTGTTGGTTTGACTTTGGAGACGAGAATAGATTGAT
ACTACGTTATCATAATTGTGT
CC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4CJ07JQ 779 0 0
GATAGAAACTGATATACGTAGGAAGGGGAAGAATTAAAACAAACCTTATGGGATAATTCA
TAATAGTTAGTTATACACGAAGATAGAAAAGAAACTAGAAGCCTAATCGATTTATTCAAT
TGCTGTCCCACGTTCTCTTATTAAAGAGAACAACTTAAAACCTGTAAAAGAGGATTCGCA
AGTCAGATTTTGGCACCGATTATTATAGTGTCCAGCTTCATCACTATCCACGTAACGCTT
ATGCTTCGCCATGAGTTTGACCTCAAGCTCTCCAGCGTCGCTTCGATTCTCCTCCATTGC
AACGAAAACCAACGAGAAA*GCCGTGTCATCTCTAGAAACACGTTGGCTAGTGATGTTCA
AAA*CGGCGGCGTTTCGAGAACCAAGCCTCACGGCAGCGTCATCGACGTTGTAGTAGATA
GAATACCTCGAGGTCGGGATTTTCACGAGAAAATCGCCTTGCCACGTTGCGGAGGAGAGG
GCGAGGGACTGGAGGGAGATTTTGGCGTGGGAGTGGGCTTTGTCGATGAACAAAAAGATT
AAGTACACGGCGACAACGGTGAGTAAGGCACCAAAGCAGGGTGTACACATAGCCGCACAT
TCTTTGTCAGTGCGACTACGTTCATTAGATGGTGGGATAGTCATCATTGGACGTGACCAC
CACCGACGAAGAGCGACGGAGAACGGTTGCGTTTGATGAAAGTTGGTTTGGTAAGCCATA
CTGATTTCTTTTTGTTGGTTTGACTTTGGAGACGAGAATAGATTGATACTACGTTATCA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4CJ07TF 596 0 0
CCGATTATTATAGTGTCCAGCTTCATCACTATCCACGTAACGCTTATGCTTCGCCATGAG
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GAAA*GCCGTGTCATCTCTAGAAACACGTTGGCTAGTGATGTTCAAAA*CGGCGGCGTTT
CGAGAACCAAGCCTCACGGCAGCGTCATCGACGTTGTAGTAGATAGAATACCTCGAGGTC
GGGATTTTCACGAGAAAATCGCCTTGCCACGTTGCGGAGGAGAGGGCGAGGGACTGGAGG
GAGATTTTGGCGTGGGAGTGGGCTTTGTCGATGAACAAAAAGATTAAGTACACGGCGACA
ACGGTGAGTAAGGCACCAAAGCAGGGTGTACACATAGCCGCACATTCTTTGTCAGTGCGA
CTACGTTCATTAGATGGTGGGATAGTCATCATTGGACGTGACCACCACCGACGAAGAGCG
ACGGAGAACGGTTGCGTTTGATGAAAGTTGGTTTGGTAAGCCATACTGATTTCTTTTTGT
TGGTTTGACTTTGGAGACGAGAATAGATTGATACTACGTTATCATAATTGTGTAGC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 2 7

CO CL1082Contig1 856 5 12 U
GGCTAATAAAGAGAGTTCTTTATTGATTTCTTGTGTTCATATACAAACAACTGAGATAAT
AAACATCATGAAGTCTCTTATGTTGCCCTGACACAAAGTCCATAAACCATCCAAGACCAG
CAGTAGGGAACATATCAGTTAAATTGAAAGTCATGTTACTGTGAGCTTCAAGCATCAGTT
CTTCGATCCTTTCCTTATCGATATGCTTGTTCTCCAAGAAACTCTGTCCGAAGGCAGTTC
TGAAGATGATACTCGCAGTTAGGCAGAAAAGGGTTTTGCTCAAATCCACTGGAGATTGCT
TCAAAGCCGATTCTCTCAGTTGCTTGACCATCAAGTCACTCTCTTCCTCTCTAACATACC
TGAAAGACCGAACCTTTGTCACGCTGAAAAACTCACGAACCGCAAGCTTACGCAGCTCTC
TCCATTCCTCGCTAAAGCCGATGTCATTACCGTTACGTGATAAAACCGTTGAGGAGATAG
TGACAGGTCGTGTACAACACTCGAGGTCATGGGTTTTTAAAACTTCTTCAGCTGCTTCAC
TTGATGAGATCACAACCATTTGGAGAGAACCAAGACGGAGATGTAACATGGGTCCATGTT
TCTTGGAGAGATTATGAAGAGATCTGTGAAACAACCCTCGAAGCTGGTGTAGGTTTCCGA
TGATCGGAATCTTTGGTGGGCTTGGAGGAAGATTTTGTTTGGAGTCTTTGATTTTCTTCA
CGAATATTAACGAGAAAAGTAAAAACGAAACGAAATACAGAATAATCGACATAGTTTTCA
CTTTTTTTT**TGTGTTCTGTTTTTGATAACTATAAAAACAGAGCACTAAGACACTAAAG
CAAACAAATAGTTTCC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG96JQ U 1
AF RR4FZ64JQ U 1
AF RR4AT79JQ U 2
AF RR4AT79TF C 4
AF RR4FZ64TF C 116
BS 1 425 RR4DG96JQ
BS 426 426 RR4FZ64JQ
BS 427 583 RR4DG96JQ
BS 584 584 RR4FZ64JQ
BS 585 588 RR4DG96JQ
BS 589 589 RR4FZ64JQ
BS 590 598 RR4DG96JQ
BS 599 599 RR4FZ64JQ
BS 600 606 RR4DG96JQ
BS 607 649 RR4FZ64JQ
BS 650 814 RR4AT79JQ
BS 815 856 RR4FZ64TF

RD RR4DG96JQ 606 0 0
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AAACATCATGAAGTCTCTTATGTTGCCCTGACACAAAGTCCATAAACCATCCAAGACCAG
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CTTCGATCCTTTCCTTATCGATATGCTTGTTCTCCAAGAAACTCTGTCCGAAGGCAGTTC
TGAAGATGATACTCGCAGTTAGGCAGAAAAGGGTTTTGCTCAAATCCACTGGAGATTGCT
TCAAAGCCGATTCTCTCAGTTGCTTGACCATCAAGTCACTCTCTTCCTCTCTAACATACC
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TCCATCCCTCGCTAAAGCCGATGTCATTACCGTTACGTGATAAAACCGTTGAGGAGATAG
TGACAGGTCGTGTACAACACTCGAGGTCATGGGTTTTTAAAACTTCTTCAGCTGCTTCAC
TTGATGAGATCACAACCATTTGGAGAGAACCAAGACGGAGATGCAACACGGGTCCATGCT
TCTTGG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4FZ64JQ 649 0 0
GGC
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CATCATGAAGTCTCTTATGTTGCCCTGACACAAAGTCCATAAACCATCCAAGACCAGCAG
TAGGGAACATATCAGTTAAATTGAAAGTCATGTTACTGTGAGCTTCAAGCATCAGTTCTT
CGATCCTTTCCTTATCGATATGCTTGTTCTCCAAGAAACTCTGTCCGAAGGCAGTTCTGA
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AAGCCGATTCTCTCAGTTGCTCGACCATCAAGTCACTCTCTTCCTCTCTAACATACCTGA
AAGACCGAACCTTTGTCACGCTGAAAAACTCACGAACCGCAAGCTTACGCAGCTCTCTCC
ATTCCTCGCTAAAGCCGATGTCATTACCGTTACGTGATAAAACCGTTGAGGAGATAGTGA
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ATGAGATCACAACCATTTGGAGAGAACCAAGACGGAGATGTAACATGGGTCCATGTTTCT
TGGAGAGATTATGAAGAGATCTGTGAAACAACCCTCGAAGCTGGTG

QA 4 649 4 649
DS 

RD RR4AT79JQ 813 0 0
GC
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TAGGGAACATATCAGTTAAATTGAAAGGCATGTTACTGTGAGCTTCAAGCATCAGTTCTT
CGATCCTTTCCTTATCGATATGCTTGTTCTCCAAGAAACTCTGTCCGAAGGCAGTTCTGA
AGATGATACTCGCAGTTAGGCAGAAAAGGGTTTTGCTCAAATCCACTGGAGATTGCTTCA
AAGCCGATTCTCTCAGTTGCTTGACCATCAAGTCACTCTCTTCCTCTCTAACATACCTGA
AAGACCGAACCTTTGTCACGCTGAAAAACTCACGAACCGCAAGCTTACGCAGCTCTCTCC
ATTCCTCGCTAAAGCCGATGTCATTACCGTTACGTGATAAAACCGTTGAGGAGATAGTGA
CAGGTCGTGTACAACACTCGAGGTCATGGGTTTTTAAAACTTCTTCAGCTGCTTCACTTG
ATGAGATCACAACCATTTGGAGAGAACCAAGACGGAGATGTAACATGGGTCCATGTTTCT
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TTTTTT**TGTGTTCTGTTTTTGATAACTAT

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DS 

RD RR4AT79TF 811 0 0
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TAGGGAACATATCAGTTAAATTGAAAGGCATGTTACTGTGAGCTTCAAGCATCAGTTCTT
CGATCCTTTCCTTATCGATATGCTTGTTCTCCAAGAAACTCTGTCCGAAGGCAGTTCTGA
AGATGATACTCGCAGTTAGGCAGAAAAGGGTTTTGCTCAAATCCACTGGAGATTGCTTCA
AAGCCGATTCTCTCAGTTGCTTGACCATCAAGTCACTCTCTTCCTCTCTAACATACCTGA
AAGACCGAACCTTTGTCACGCTGAAAAACTCACGAACCGCAAGCTTACGCAGCTCTCTCC
ATTCCTCGCTAAAGCCGATGTCATTACCGTTACGTGATAAAACCGTTGAGGAGATAGTGA
CAGGTCGTGTACAACACTCGAGGTCATGGGTTTTTAAAACTTCTTCAGCTGCTTCACTTG
ATGAGATCACAACCATTTGGAGAGAACCAAGACGGAGATGTAACATGGGTCCATGTTTCT
TGGAGAGATTATGAAGAGATCTGTGAAACAACCCTCGAAGCTGGTGTAGGTTTCCGATGA
TCGGAATCTTTGGTGGGCTTGGAGGAAGATTTTGTTTGGAGTCTTTGATTTTCTTCACGA
ATATTAACGAGAAAAGTAAAAACGAAACGAAATACAGAATAATCGACATAGTTTTCACTT
TTTTTT**TGTGTTCTGTTTTTGATAACTAT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4FZ64TF 741 0 0
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AGTTCTGAAGATGATACTCGCAGTTAGGCAGAAAAGGGTTTTGCTCAAATCCACTGGAGA
TTGCTTCAAAGCCGATTCTCTCAGTTGCTCGACCATCAAGTCACTCTCTTCCTCTCTAAC
ATACCTGAAAGACCGAACCTTTGTCACGCTGAAAAACTCACGAACCGCAAGCTTACGCAG
CTCTCTCCATTCCTCGCTAAAGCCGATGTCATTACCGTTACGTGATAAAACCGTTGAGGA
GATAGTGACAGGTCGTGTACAACACCCGAGGTCATGGGTTTTTAAAACTTCTTCAGCTGC
TTCACTTGATGAGATCACAACCATTTGGAGAGAACCAAGACGGAGATGTAACATGGGTCC
ATGTTTCTTGGAGAGATTATGAAGAGATCTGTGAAACAACCCTCGAAGCTGGTGTAGGTT
TCCGATGATCGGAATCTTTGGTGGGTTTGGAGGAAGATTTTGTTTGGAGTCTTTGATTTT
CTTCACGAATATTAACGAGAAAAGTAAAAACGAAACGAAATACAGAATAATCGACATAGT
TTTCACTTTTTTTTTTTGTGTTCTGTTTTTGATAACTATAAAAACAGAGCACTAAGACAC
TAAAGCAAACAAATAGTTTCC

QA 1 741 1 741
DS 



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AGCTTCCGATCATTGGAAACCTACACCAGCTTCGAGGGTTGTTTCACAGATCTCTTCATA
ACCTCTCCAAGAAGCATGGACCCGTGTTGCATCTCCGTCTTGGTTCTCTCCAAATGGTTG
TGATCTCATCAAGTGAAGCAGCTGAAGAAGTTTTAAAAACCCATGACCTCGAGTGTTGTA
CACGACCTGTCACTATCTCCTCAACGGTTTTATCACGTAACGGTAATGACATCGGCTTTA
GCGAGGGATGGAGAGAGCTGCGTAAGCTTGCGGTTCGTGAGTTTTTCAGCGTGACAAAGG
TTCGGTCTTTCAGGTATGTTAGAGAGGAAGAGAGTGACTTGATGGTCAAGCAACTGAGAG
AATCGGCTTTGAAGCAATCTCCAGTGGATTTGAGCAAAACCCTTTTCTGCCTAACTGCCA
GTATCATCTTCAGAACTGCCTTCGGACAGAGTTTCTTGGAGAACAAGCATATCGATAAGG
AAAGGATCGAAGAACTGATGCTTGAAGCTCACAGTAACATGACTTTCAATTTAACTGATA
TGTTCCCCACTGCTGGTCTTGGATGGTTTATGGACTTTGTGTCCGGGCAACGTAAGAGGC
TTCATGATGTTTTCACTGAGGTTGATACTTTTCTTAACCATATAATAGATGATCATCAAT
CCAAGAACTTCACACAAGATCGTCCTGATTTCATAGACTACCTCTTAGAAATGATACCTA
AACAAGAACGAAGCGAATCTTTCAAGCTCACCATTGATCATCCAAAATATATATCTTGCT
GGAGTAGACACAAGTTCCATCACCATGATTTGGACGATGGCAGAGCTCGTTAGAAACCCT
AGAGTGATGAAAAAAGTACAAGATGAGATCCAAAATTGCATTGGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DG96TF U 1
AF RR4BF65JQ C 391
BS 1 478 RR4DG96TF
BS 479 479 RR4BF65JQ
BS 480 607 RR4DG96TF
BS 608 608 RR4BF65JQ
BS 609 642 RR4DG96TF
BS 643 948 RR4BF65JQ

RD RR4DG96TF 642 0 0
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AGCTTCCGATCATTGGAAACCTACACCAGCTTCGAGGGTTGTTTCACAGATCTCTTCATA
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CACGACCTGTCACTATCTCCTCAACGGTTTTATCACGTAACGGTAATGACATCGGCTTTA
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TTCGGTCTTTCAGGTATGTTAGAGAGGAAGAGAGTGACTTGATGGTCAAGCAACTGAGAG
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TGTTCCCTACTGCTGGTCTTGGATGGTTTATGGACTTTGTGT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4BF65JQ 558 0 0
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ACAGTAACATGACTTTCAATTTAACTGATATGTTCCCCACTGCTGGTCTTGGATGGTTTA
TGGACTTTTTGTCCGGGCAACGTAAGAGGCTTCATGATGTTTTCACTGAGGTTGATACTT
TTCTTAACCATATAATAGATGATCATCAATCCAAGAACTTCACACAAGATCGTCCTGATT
TCATAGACTACCTCTTAGAAATGATACCTAAACAAGAACGAAGCGAATCTTTCAAGCTCA
CCATTGATCATCCAAAATATATATCTTGCTGGAGTAGACACAAGTTCCATCACCATGATT
TGGACGATGGCAGAGCTCGTTAGAAACCCTAGAGTGATGAAAAAAGTACAAGATGAGATC
CAAAATTGCATTGGAACC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 7

CO CL1083Contig1 587 7 2 U
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GTTGCACTTGTTAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTT
GACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAG
AGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCTTTG
ATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGG
AAGCTTATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTTGACAGGTTCAAGATCATG
TTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAG
ATCACTGCTTGATCAAATTGAGTATTTATCTGCGTGTCTTTTTTTCTTTTGTATTTTGGA
TTGGCAATTAGTGTTTTTGGAAATCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTAA
TTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTC


BQ
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 20 40 40 40 40 
40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4C375TF U 1
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AF RR4EF09TF U 1
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ATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGG
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GTTA

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TTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTT
TTTAT

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TATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTTGACAGGTTCAAGATCATGTTGGC
CAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGATCAC
TGCTTGATCAAATTGAGTATTTATCTGCGTGTCTTTTTTTCTTTTGTATTTTGGATTGGC
AATTAGTGTTTTTGGAAATCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTAATTCCA
AGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTC

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DS 



AS 2 6

CO CL1084Contig1 1182 4 11 U
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GATCGTCTTACCTCTTTGGGGCCTAAGTTTTCAGAGTGTAAATGGGTATATTTCCTGGGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C050TF U 28
AF RR4DJ13TF U 1
AF RR4DJ13JQ C 349
AF RR4C050JQ C 998
BS 1 288 RR4DJ13TF
BS 289 289 RR4C050TF
BS 290 721 RR4DJ13TF
BS 722 722 RR4DJ13JQ
BS 723 764 RR4DJ13TF
BS 765 765 RR4DJ13JQ
BS 766 783 RR4DJ13TF
BS 784 1034 RR4DJ13JQ
BS 1035 1035 RR4C050JQ
BS 1036 1180 RR4DJ13JQ
BS 1181 1182 RR4C050JQ

RD RR4C050TF 595 0 0
GG
GTCCCGGTACCTATATCTCAGATACTCTTTTGATCGTCTTACCTCTTTGGGGCCTAAGTT
TTCAGAGTGTAAATGGGTATATTTCCTGGGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACACAA
CAGCCTAAAAAATCTGAAAATGTTAAATCCAAGCCAGTGATAGAGACAAAAACTCACCAT
GAGAGAGATGAGATGGAGCAATTGAAACTATGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATAT
CATGAACCTTCTCCTAGTGCGAAGGTGCGCGTAGACCATAATCTTGATGGCCTTTCCCGT
ATGGAAATGGAATTTATATTAGGATTGCCACCTCAAACAGCTTACGACGTTTTAACTAAT
GAAGACAATGAATCATACTCCAGAGATAAGAACCGCCGCCGACTTCTGACAGCCGTATCA
AGAATAGTTACACCAGAGAGGGATGAAGGTCCAGGGCATAGGCCGATCGTGAAGGTTGAG
AAAGAGTTGGCATGGAAATTCCTTTTCTTGTCAGGAACTCTCCCAATACGTCTAATTGTC
CTCGAAGATCCAAAAAAGCTCCATGTATTCTACTTGAAAGATGCAAAAG
AATA

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR4DJ13TF 783 0 0
GGAAGGTCCTGTAAGTCAATTATCTCTTTGTCCCGGTACCTATATCTCAGATACTCTTTT
GATCGTCTTACCTCTTTGGGGCCTAAGTTTTCAGAGTGTAAATGGGTATATTTCCTGGGT
TTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACACAACAGCCTAAAAAATCTGAAAATGTTAAATCCA
AGCCAGTGAGAGAGACAAAAACTCACCATGAGAGAGATGAGATGGAGCAATTGAAACTAT
GGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATCAAGAACCTTCTCCTAGTGTGAAGGTGCGCG
TAGACCATAATCTTGATGGCCTTTCCCGTATGGAAATGGAATTTATATTAGGATTGCCAC
CTCAAACAGCTTACGACGTTTTAACTAATGAAGACAATGAATCATACTCCAGAGATAAGA
ACCGCCGCCGACTTCTGACAGCCGTATCAAGAATAGTTACACCAGAGAGGGATGAAGGTC
CAGGGCATAAGCCGATCGTGAAGGTTGAGAAAGAGTTGGCATGGAAATTCCTTTTCTTGT
CAGGAACTCTCCCAATACGTCTAATTGTCCTCGAAGATCCAAAAA*GCTCCATGTATTCT
ACTTGAAAGATGCAAAAGGAATAAGGACCATGGAAACGTTCGAGGGTAGCTATACAGTGG
AGCCATTATATGTTGATGCAGAACGTTTGTGCAAGCGCACGAAGCCAAAGAGTACAGAAG
A*TACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGACGGATTGGGTCCAAG*TTAAAGTGGACCAGA
CTT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4DJ13JQ 834 0 0
TAGGATTGCCACCTCAAACAGCTTACGACGTTT*AACTAATGAAGACAATGAATCATACT
CCAGAGATAAGAACCGCCGCCGACTTCTGACAGCCGTATCAAGAATAGTTACACCAGAGA
GGGATGAAGGTCCAGGGCATAAGCCGATCGTGAAGGTTGAGAAAGAGTTGGCATGGAAAT
TCCTTTTCTTGTCAGGAACTCTCCCAATACGTCTAATTGTCCTCGAAGATCCAAAAA*GC
TCCATGTATTCTACTTGAAAGATGCAAAAGGAATAAGGACCATGGAAACGTTCGAGGGTA
GCTATACAGTGGAGCCATTATATGTTGATGCAGAACGTTTGTGCAAGCGCACGAAGCCAA
AGAGTACAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGACGGATTGGGTCCAAGGTTA
AAGTGGACCAGACTTTTAGGCCTGCTTCTCCTTGGGATCTGCCACTGCTGTCGTCGTACA
TGCGCCGGTTCACTATCGAGACCACTAAGAAAGTGGCTGAAGATCTTCAAATTCGGGCTA
CCAACATTCGAGGTATTCCGGAGTATAAAGGCGAATATTAGCGGCTTCCGGCGATCCTTC
CGACCCGGGACGGGGGAAGAACTCGGAGGATTTTGGATCAGGGTCTTCGAATATCTGCTG
TGTAAACCACAAAAAGGAAGGATATTTATATACATTTCTGGCTATCATATGTTTTTTTTT
ACTTTGTATACAAGTAAGCATGTTTACTTTGTCGTCTCTTATATATACTTTTCTGACTAT
CATATGGCTTGTTTCTAACCACAAGATGACATGTCTAAATATATGAGTCTTC
GT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4C050JQ 185 0 0
AATATCTGCTGTGTAAACCACAAAAAGGAAGGATATTCATATACATTTCTGGCTATCATA
TGTTTTTTTTTACTTTGTATACAAGTAGGCATGTTTACTTTGTCGTCTCTTATATATACT
TTTCTGACTATCATATGGCTTGTTTCTAACCACAAGATGACATGTCTAAATATATGAGTC
TTCAC

QA 1 185 1 185
DS 



CO CL1084Contig2 639 2 3 U
GATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAGAGTTCTGACAAGAAAAGGAATTTCCATGC
CAACTCTTTCTCAACTTTCACGATCGGCCTATGCCCTGGACCTTCATCCCTCTCTGGTGT
AACTATTCTTGATACGGCTGTCAGAAGTGCGCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGATAT
GTTGTCTTCATTAATTAAAACGTCGTAAGCTGTTTGAGGTGGAATTCCTAATATAAATTC
CATTTCCATACGGGAAAGGCCATCAAATTTATGGTCTACCCCCATCTTCACAGCAGGAGG
AGGTTCTTGATATTGTTTCTTCTTATTTGCATCTCTCCATAGTTTCAATTGCTCCATCTC
ATCTCTCTCATGGTGAGTTTTTGTCTCTCTCACTGGCTTGGATTTAACATTTTCAGATTT
TTTAGGCTGTTGTGTGTTCTGACTGATCCAGCCACCAAACCCAGGAAATATACCCATTCA
CACTCTGAAAATTTAGGCCTCAAAGAGATATGACGATCAAAAGAGCATCTGAGATATAGG
TACCGGGACAAAGAGATAATTGACTTACAGGGGAATAAGGTCAACGGGACAAATCATGTA
TAGTATATGCTATAGGGTTTCAGGAACTTTAGAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E137JQ U 146
AF RR4E137TF C 1
BS 1 145 RR4E137TF
BS 146 335 RR4E137JQ
BS 336 639 RR4E137TF

RD RR4E137JQ 193 0 0
AGTGCGCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGATATGTTGTCTTCATTAATTAAAACGTCG
TAAGCTGTTTGAGGTGGAATTCCTAATATAAATTCCATTTCCATACGGGAAAGGCCATCA
AATTTATGGTCTACCCCCATCTTCACAGCAGGAGGAGGTTCTTGATATTGTTTCTTCTTA
TTTGCATCTC
CCC

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4E137TF 639 0 0
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CAACTCTTTCTCAACTTTCACGATCGGCCTATGCCCTGGACCTTCATCCCTCTCTGGTGT
AACTATTCTTGATACGGCTGTCAGAAGTGCGCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGATAT
GTTGTCTTCATTAGTTAAAACGTCGTAAGCTGTTTGAGGTGGAATTCCTAATATAAATTC
CATTTCCATACGGGAAAGGCCATCAAATTTATGGTCTACGCGCATCTTCACAGCAGGAGG
AGGTTCTTGATATTGTTTCTTCTTATTTGCATCTCTCCATAGTTTCAATTGCTCCATCTC
ATCTCTCTCATGGTGAGTTTTTGTCTCTCTCACTGGCTTGGATTTAACATTTTCAGATTT
TTTAGGCTGTTGTGTGTTCTGACTGATCCAGCCACCAAACCCAGGAAATATACCCATTCA
CACTCTGAAAATTTAGGCCTCAAAGAGATATGACGATCAAAAGAGCATCTGAGATATAGG
TACCGGGACAAAGAGATAATTGACTTACAGGGGAATAAGGTCAACGGGACAAATCATGTA
TAGTATATGCTATAGGGTTTCAGGAACTTTAGAAAATCC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 7

CO CL1085Contig1 645 7 21 U
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GAAATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGAAAAAA
AATTTGATTCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTA
GCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCACCTGCGCAATACCAGGCAAAGCATTC
GAGACCAAACAATGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCA
CAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGC
AAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTC
CTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCCCATGCTTGGC
CACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTT
CAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGAGAGTTT
TTGATTGGAGATTCGTGCCTCTAAAATATCGTGCGACTTTCTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ91JQ U 46
AF RR4HB37JQB U 1
AF RR4HB37TF C 1
AF RR4FS30JQ U 51
AF RR4CK70JQ U 26
AF RR4CK70TF C 26
AF RR4FS30TF C 26
BS 1 72 RR4HB37JQB
BS 73 73 RR4GJ91JQ
BS 74 131 RR4HB37JQB
BS 132 132 RR4GJ91JQ
BS 133 147 RR4HB37JQB
BS 148 148 RR4CK70JQ
BS 149 252 RR4HB37JQB
BS 253 253 RR4CK70JQ
BS 254 330 RR4HB37JQB
BS 331 331 RR4CK70JQ
BS 332 385 RR4HB37JQB
BS 386 386 RR4FS30JQ
BS 387 408 RR4HB37JQB
BS 409 409 RR4CK70JQ
BS 410 508 RR4HB37JQB
BS 509 509 RR4CK70JQ
BS 510 581 RR4HB37JQB
BS 582 592 RR4CK70JQ
BS 593 593 RR4CK70TF
BS 594 614 RR4CK70JQ
BS 615 645 RR4FS30TF

RD RR4GJ91JQ 132 0 0
GAGTTTAGCAAAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAA
AACTTGAAGAAAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCT
CTTTCAAGGGTA

QA 1 132 1 132
DS 

RD RR4HB37JQB 583 0 0
CGTCTAGAAAATTTTGTTCTTTATTAATCTCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCAAAATG
GAAATTTTCTCAAATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGAAAAAA
AATTTGATTCAAATTACACAATCTTGTCCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTA
GCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCACCTGCGCAATACCAGGCAAAGCATTC
GAGACCAAACAACGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCA
CAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCCTTCCAAAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGC
AAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTAAACAACTCTTGGCACTTCTCCACGGTGGCAGGTTC
CTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCCCATGCTTGGC
CACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTAACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTT
CAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGT
CC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4HB37TF 583 0 0
CGTCTAGAAAATTTTGTTCTTTATTAATCTCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCAAAATG
GAAATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGAAAAAA
AATTTGATTCAGATTACACAATCTTGTCCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTA
GCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCACCTGCGCAATACCAGGCAAAGCATTC
GAGACCAAACAACGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCA
CAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGC
AAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACGGTGGCAGGTTC
CTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCCCATGCTTGGC
CACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTAACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTT
CAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGT
CC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4FS30JQ 539 0 0
TAGCAAAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTT
GAAGAAAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTC
AAGGGTAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCACCTGCGCAATACCAGG
CGAAGCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTC
TGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGG
GAATGCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAG
TGGCAGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCC
CATGCTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCG
ATGCCATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4CK70JQ 591 0 0
AATCTCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCAAAATGGAAATTTTCTCAAATCCCAAATACT
CTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGAAAAAAA*TTTGATTCAAATTACACAATCTT
GTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCG
GCGATTTCACCTGCGCAATACCAGGCAAAGCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTCCT
GCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCC
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AACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCA
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CC

QA 1 589 1 589
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GCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCC
TTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTA
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QA 1 583 1 583
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CTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGAAAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATCTT
GTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCG
GCGATTTCACCTGCGCAATACCAGGCGAAGCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTCCT
GCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCC
TTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTA
GACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCA
AGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCCCATGCTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACGCC
TTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGA
GAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGAGAGTTTTTGATTGGAGATTCGTGCCTCTAAA
ATATCGTGCGACTTTCTCCC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 4

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ACACGACTGAGTTAGTGCAGAAATGGAGGTGAGTATGTCTCTCAACGCCTTGTCTCGGCT
TCCACTGAAGAAGAATACAGGAAGACTGGAAGAGGTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTT
GAGAACACCGAAACAAAGGCGGCGGATGGTGTTCGTGGTGGAGGCGAAAGGGAAGAAAGG
AATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGG
AAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCACTTAG
TATAATAGCAGGTGGCACAACGGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGATAACCTCTTGGG
GAAGTATATCTACAAAGACACCATT*GCTAGAAACATTGCTGCTGTTATTTACAGAGATG
AGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATCGGGTCTTGCGGACTGCCACTGAGT
TT*CGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACATGAGAGCTGCACTTAGTACCTCA
GATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAACAGTGTTGGACAAAGTGAAAGAC
TTTTTCGGGGATGCAAAAGAGTCGTTCGGGAAGATATCATCGTTAAATCCTGGGCCAGAT
GAAGAAATCCCTGATGACAAAGCCAAGCAAGTATAGCCAGGGTCCAAGGCTGGACAACTG
ACACTTGATGGGCTCATTCCTATCTCAACCGTGTTGATACGGGATCCAGAAGGTCCAAAG
GGATATCATGACGAGATGCCCGCTATTTTGTGCACATTATTTTCTTTTATACACCTCTCA
GAGAGAAACAGTTTCTCTTAAAAATCTCTTGTAAACTTATAGTGTCTGTAGATTTGTTGA
AAGAAAGAGCTGTTTGGTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF84TF U 1
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TT*CGTTATGGCTACAAACTTGTTG
TAACTGCCT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4BO48TF 584 0 0
GG
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GTTTAGCGAGACACTCTCTGTTGAGAACACCGAAACAAAGGCGGCGGATGGTGTTCGTGG
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TGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAATG
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CTGCTAAAGATAACCTCTTGGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATT*GCTAGAAACATT
GCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATCGG
GTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTT*CGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACAT
GAGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAAC

QA 3 584 3 584
DS 

RD RR4BN31TF 603 0 0
GGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTGAGAACACCGAAACAAAGGCGGCGGATGGTGTTCGTG
GTGGAGGCGAAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTCCT
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TGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATCG
GGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACA
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TTAGACAG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4EK55JQ 653 0 0
TGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCAGGTGGCACAACGGCTAAGA
TCATGGTTGCTGCTAAAGATAACCTCTTGGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATT*GCT
AGAAACATCGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAA
CAGCACCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTT*CGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAA
CGGGAACATGAGAGCTGCACTTAGTACCTCTGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCA
GCTAAAAACAGTGTTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTCGGGGATGCAAAAGAGTCGTTCGG
GAAGATATCATCGTTAAATCCTGGGCCAGATGAAGAAATCCCTGATGACAAAGCCAAGCA
AGTATAGCCAGGGTCCAAGGCTGGACAACTGACACTTGATGGGCTCATTCCTATCTCAAC
CGTGTTGATACGGGATCCAGAAGGTCCAAAGGGATATCATGACGAGATGCCCGCTATTTT
GTGCACATTATTTTCTTTTATACACCTCTCAGAGAGAAACAGTTTCTCTTAAAAATCTCT
TGTAAACTTATAGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTTGGT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 7

CO CL1087Contig1 692 5 7 U
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AGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATTGTATAACAATCATATTACAGGAAAATCCC
ATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCTGCGATCTTCTTC
TTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTG
TAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGA
ACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCT
CCATATATTATTACAGTTGACTTGTTCTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTG
AAGATCTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTC
ATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAGCAGTAAAAGAG
GATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGCAAGGAACGGCTGAGAAGCGGGCGGATACGGAG
GTGACACGTGGCATCATGACTGCTACGGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATCGAA
GCACACCGATAATTTCTTCTTCAGCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE63TF C 199
AF RR4BB71JQ U 54
AF RR4GV31JQ U 67
AF RR4BB71TF C 54
AF RR4BE63JQ U 1
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BS 216 216 RR4BB71JQ
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BS 379 593 RR4BE63JQ
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TACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCA
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GACTTGTTCTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATCTCGTTGGTGTCA
ATGGATGCTGATGTATCTTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGT
AAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAGCAGTAAAAGAGGATCGGCCAAAAGAG

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR4BB71JQ 593 0 0
A
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TTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGG
TATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGC
AGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAAGGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCT
CCTCCTCCATATATTATTACAGTTGACTTGTTCTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAG
TCTGTGAAGATCTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGATGAAGAAGCTCTC
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CC

QA 2 591 2 591
DS 

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AAAGCTGGTTTATATTTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCTGCGATCTTCTTCTTCAAG
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AACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAG
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ATTATTACAGTTGACTTGTTCTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATC
TCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGATGAAAAAGCTCTCGTCTTCATCGAT
TCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAGCAGTAAAAGAGGATCGG
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CGTGGCATCATGACTGCTACGG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4BB71TF 593 0 0
A
GACCTCAGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATTGTATAACAATCATATTACAGGAA
AATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCTGCGATC
TTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGG
TATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGC
AGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAAGGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCT
CCTCCTCCATATATTATTACAGTTGACTTGTTCTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAG
TCTGTGAAGATCTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGATGAAGAAGCTCTC
GTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAGCAGTA
AAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGCAAGGAACGGCTGAGAAGCGGGCGGAT
ACGGAGGTGACACGTGGCATCATGACTGCTACGGAGGACGAAGCTGCTAC
CC

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR4BE63JQ 692 0 0
ATCTCCTAATACTAAATTGCATTCACTGACGGTGGATCTAAGAGAATAGTTTCAGACCTC
AGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATTGTATAACAATCATATTACAGGAAAATCCC
ATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCTGCGATCTTCTTC
TTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTACTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTG
TAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGA
ACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCT
CCATATATTATTACAGTGGACTTGTTCTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTG
AAGATCTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTC
ATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAGCAGTAAAAGAG
GATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGCAAGGAACGGCTGAGAAGCGGGCGGACACGGAG
GTGACACGTGGCATCATGACTGCTACGGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATCGAA
GCACACCGATAATTTCTTCTTCAGCTTCTTCC

QA 1 692 1 692
DS 



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CTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCCGATCCTCTCTCACTGTTCCGGTGAAGCTACTTT
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CATCAGCATCCATTGACACCAACGAGATCTTCAGATACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTC
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CTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCAAAGGTGATGGAATTTG
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AATATATATATATATTTTAACAATGTATCTTCTGAGGTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4ED43JQ C 1
AF RR4ED43TF U 1
BS 1 2 RR4ED43JQ
BS 3 639 RR4ED43TF

RD RR4ED43JQ 639 0 0
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TTTCAAAAAATATAAACCAGCTTTCTCTATGGGATTTTCCTGTAATATGATATGTTATAC
AATATATATATATATTTTAACAATGTATCTTCTGAGGTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4ED43TF 639 0 0
GG
AGAAGCTGAAGAAGAAATAATCGGTGTGCTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCC
TCTGTGGCAGTCATGATGCCACGTGTCCACTCCGTATCCGCCTGCTTCTCAGCGGTTCCT
TACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCCGATCCTCTCTCACTGTTCCGGTGAAGCTACTTTCA
GGGAATGGTTTACACAAGGTTGAATCGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGAAGATACA
TCAGCATCCATTGACACCAACGAGATCTTCAGATACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTT
GAAAACAAGTCAACTGTAATAATATATGGAGGAGGAGCTGTTGTTGCTGTTTGGTTATCT
TCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCAAAGGTGATGGAATTTGTT
GGTCTTGGGTACACAGGATGGTTCGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAG
GAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATTGCAGGGACTGAATAGATTCTT
TCAAAAAATATAAACCAGCTTTCTCTATGGGATTTTCCTGTAATATGATATGTTATACAA
TATATATATATATTTTAACAATGTATCTTCTGAGGTC

QA 3 639 3 639
DS 



AS 1 6

CO CL1088Contig1 839 6 18 U
GGAATCCAAAAGATAATAATAATAACACTTAAGAGTAAGATTGAGCTTCTGATTTGTTTC
TCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTTCCC
TTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAG
CCTCC*ACCTCTTCTCCGTCATGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGCTTCAG
TCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTGAA
GCTTCGGTCGCTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAA
GAAGCTTGGGAGAAAGTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTG
TTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCA
GGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAATCTGATC
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AGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCATTTTATGT
TGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATTCTCAAGTTTTCAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CD24TF U 68
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TT*CAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAG
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TTAGCTCTTTGGAGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCA
GGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAATCTGATC
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GTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGT
AGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCC

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GG
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GG
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TGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTT
GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCA
GACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTAGGGAGCAGC
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DS 



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TTCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

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CTACGAGACGTTAGCCATCACTCAGAGTGTCATCTTCGTCAACACTCGTCGCAAGGTGGA
CTGGCTAACCGACAAAATGAGGAGCCGTGACCACACGGTCTCAGCGACTCACGGAGACAT

QA 1 540 1 540
DS 

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G
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QA 2 756 2 756
DS 

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G
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ATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGATCTACGACATATTCCAGCTTCTCCCACCAAAG
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GACCAGAACACGAGAGACATCATCATGAGAGAGTTCAGGTCTGGTTCTTCCCGTGTTCTC
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QA 2 724 2 724
DS 

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CTCTGTTTCTCTCTTGCTCATCGACACCTCTTTCTCGTTTTCGAACATATATGTCTCATC
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ACT

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DS 

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TTCGAACATATATGTCTCATCTGAACATGTTTCTTCTTAATCTCATGCAATATTTATTTT
T

QA 1 781 1 781
DS 

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G
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CCCAACTCAGCCGGAGAACTACCTTCACCGTATCGGGAGAAGTGGAAGGTTTGGGAGGAA
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CTTTTTTTTTATCCTTAGTATTTTAATGTACAATATACAAACACAATACAATTCTTT

QA 2 598 2 598
DS 



AS 2 6

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TCAAAGGTAGGGATCCATGCCGACATGGTTACCGGTTACGTCGTGGTCGTCTCACGTGGT
ATTACTATAGGATTAGGACCCACTTGCTTGCGACTCCATTAATTGCTCCTCCCTTCCCTC
AACTCTCCATGATCTGAGATTTTATTCGCAGTCTCTTTTTTTTTTTGTTAAGTATTTTTA
TTCACAGTCTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTCTGGTTTTTGGGGGTT
TTAAGCATTTGCAATGATGGACCTAACGAAGCTGAAGCCTCCACAGATCACTTTCTACTG
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TATCTACGCCGTTGTCTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGGAAGTGAAATCTTCTT
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GTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTCCCTGATGGAATCAA
AGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTCCTTCCAGCCTCATGTAGTTCTTCT
GGATCATCGAACTCTTAGACTTTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCGTGGTCATCAGACC
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CTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCTGTCTCTCTGGCGCTTTATTCACTTGTTGT
ATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAATCCACTCGCAAAGTTCCTCTG
CATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGATAGCACTAGACATTCTGGTGGC
AATGGGTGTGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTAGAACAGATCCAGGAGGCTAT
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TTTTGTTCCTGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGGTTTTTTTGTTCAGGTGTTTTGGAGAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF34TF U 1
AF RR4GH25TF U 170
AF RR4GD87TF U 229
AF RR4GD87JQ C 640
BS 1 293 RR4CF34TF
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BS 828 862 RR4GD87TF
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RD RR4CF34TF 716 0 0
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ATTACTATAGGATTAGGACCCACTTGCTTGCGACTCCATTAATTGCTCCTCCCTTCCCTC
AACTCTCCATGATCTGAGATTTTATTCGCAGTCTCTTTTTTTTTTTGTTAAGTATTTTTA
TTCACAGTCTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTCTGGTTTTTGGGGGTT
TTAAGCATTTGCAATGATGGACCTAACGAAGCTGAAGCCTCCACAGATCACTT*CTACTG
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ATCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCCATACTCATCATTGTTCTTATGGCTCC
TATCTACGCCGTTGTCTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGGAAGTGAAATCTTCTT
CCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCTAAGTTCTTGGC
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GGATCATCGAACTCTGAGACTTTTGAAATACTGGACATGGCAATTTGTGGTCATCA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4GH25TF 658 0 0
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TTTTGGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTAACGAAGCTGAAGCCTCCACAGATC
ACTTTCTACTGCTCTGCGCTCTCCGTCTTCATCACAGTTCTGTTGACGTTACAGCTTGTA
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CTTATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTCTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGGAAGT
GAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCT
AAGTTCTTGGCGTTGGTGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTCCCT
GATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTCCTTCCAGCCTCAT
GTAGTTCGTCTGGATCATCGAACTCTGAGACTTTTGAAATACTGGACATGGTAATTTGTG
GTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTCTATCCT
TCTTGGTGG*GCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCTGTCTCTCTGGCGCTTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GD87TF 657 0 0
TTTTTAGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTAACGAAGCTGAAGCCTCCGCAGAT
CACTTTCTACTGCTCTGCCTTCTCCGTCTTCATCACAGTTCTGTTGACGTTACAGCTTGT
ATCTCAGCATCTCTCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCATTGT
TCTCATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTCTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGGAAG
TGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGC
TAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATTTCTATCAGCAAAAACATTGTCCC
TGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTTCCTATGACTTTCTTCCAGCCTCA
TGTAGTTCTTCTGGATCATCGAACTCTTAGACTTTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCGT
GGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTCTATCC
TTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCTGTCTCTCTGGCGCTTTA
TTCACTTGTTGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAG*AGCTTGCTCCTCACAATCCACT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4GD87JQ 647 0 0
CCAGCCTCATGTAGTTCTTCTGGATCATCGAACTCTTAGACTTTTGAAATACTGGACGTG
GCAATTCGTGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGG
GTTCTATCCTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCTGTCTTTCT
GGCGCTTTATTCACTTGTTGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAA
TCCACTCGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGAT
AGCACTAGACATTCTGGTGGCAATGGGTGTGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGT
AGAACAGATCCAGGAGGCTATTCAGAATGTGTTGGTGTGTTTAGAGATGGTTATCTTCGC
TGCGGTTCAGAAGCATGCTTATCATGTTGGTCCTTATAGCGGCGAGACCAAGAAGAAGCT
CGATAAAAAGACAGAGTGATCTTTTGTTCCTGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGGTTTTT
TTGTTCAGGTGTTTTGGAGACTTGAAACTTTTGCTTGTCACGATTGGGATAAGAGACGAT
AAAATAATGTGTTGAGATATCATCATCAGACAATAATGTTAAACGAC

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL1090Contig2 674 2 14 U
GCCAAACAAAACTTGAGAAAATAGTGTGGTCGTTTAACATTATTGTCTGATGATGATATC
TCAAAACATTATTTTATCGTCTCTTATCCCAATCGTGACAAGCAAAAGTTTCAAGTCTCC
AAAAACACCTGAACAAAAAACCAATCGATTTCCCGTTCTAACACGGGGGACAAGATCACT
CTGTCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTGGTCTCGCCGCTATAAGGACCAACATGATAAGCAT
GCTTCTGAACCGCAGAGAAGATAACCATCTCTAAACACACCAACACATTCTGAATAGCTT
CCTGGATCTGTTCCACCTCCAACCAGAAATGGTGAGACTTGATCACTCCCATTGCCACCA
GAATGTCTAGTGCTATCCCCTGCCAGAAGCAGAAGAAGACAATCCCTTTGATGCAGAGGA
ACTTCGCGAGTGGATTGTGAGGAGCAAGCTCCTTAGCAAACACGTGGTAGAATACCACAA
GTGAATAAAGCGCCAGAAAGACAGAGAGGTTGAGAACGATAGTGAACGTCCAGCCCAACC
AAGAAGGATAGAACCCGATGATTTGTAAAGCAATCATCAAGATGGAGCACACGGGTCTGA
TGACCACAAATTACCATGTCCAGTATTTCAAAAGTCTCAGAGTTCGATGATCCAGACGAA
CTACATGAGGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F568JQ U 1
AF RR4GH25JQ U 28
BS 1 255 RR4F568JQ
BS 256 256 RR4GH25JQ
BS 257 277 RR4F568JQ
BS 278 278 RR4GH25JQ
BS 279 393 RR4F568JQ
BS 394 394 RR4GH25JQ
BS 395 497 RR4F568JQ
BS 498 498 RR4GH25JQ
BS 499 534 RR4F568JQ
BS 535 535 RR4GH25JQ
BS 536 612 RR4F568JQ
BS 613 613 RR4GH25JQ
BS 614 641 RR4F568JQ
BS 642 674 RR4GH25JQ

RD RR4F568JQ 641 0 0
GCCAAACAAAACTTGAGAAAATAGTGTGGTCGTTTAACATTATTGTCTGATGATGATATC
TCAAAACATTATTTTATCGTCTCTTATCCCAATCGTGACAAGCAAAAGTTTCAAGTCTCC
AAAAACACCTGAACAAAAAACCAATCGATTTCCCGTTCTAACACGGGGGACAAGATCACT
CTGTCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTGGTCTCGCCGCTATAAGGACCAACATGATAAGCAT
GCTTCTGAACCGCAGCGAAGATAACCATCTCTAAACATACCAACACATTCTGAATAGCTT
CCTGGATCTGTTCCACCTCCAACCAGAAATGGTGAGACTTGATCACTCCCATTGCCACCA
GAATGTCTAGTGCTATCCCCTGCCAGAAGCAGAGGAAGACAATCCCTTTGATGCAGAGGA
ACTTCGCGAGTGGATTGTGAGGAGCAAGCTCCTTAGCAAACACGTGGTAGAATACCACAA
GTGAATAAAGCGCCAGAGAGACAGAGAGGTTGAGAACGATAGTGAACGTCCAGCTCAACC
AAGAAGGATAGAACCCGATGATTTGTAAAGCAATCATCAAGATGGAGCACACGGGTCTGA
TGACCACAAATTGCCATGTCCAGTATTTCAAAAGTCTCAGA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GH25JQ 647 0 0
G
GTCGTTTAACATTATTGTCTGATGATGATATCTCAAAACATTATTTTATCGTCTCTTATC
CCAATCGTGACAAGCAAAAGTTTCAAGTCTCCAAAAACACCTGAACAAAAA*CCAATCGA
TTTCCCGTTCTAACACGGGGGACAAGATCACTCTGTCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTGGT
CTCGCCGCTATAAGGACCAACATGATAAGCATGCTTCTGAACCGCAGAGAAGATAACCAT
CTCTAAACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCCTGGATCTGTTCCACCTCCAACCAGAA
ATGGTGAGACTTGATCACTCCCATTGCCACCAGAATGTCTAGTGCTATCCCCTGCCAGAA
GCAGAAGAAGACAATCCCTTTGATGCAGAGGAGCTTCGCGAGTGGATTGTGAGGAGCAAG
CTCCTTAGCAAACACGTGGTAGAATACCACAAGTGAATAAAGCGCCAGAAAGACAGAGAG
GTTGAGAACGATAGTGAACGTCCAGCCCAACCAAGAAGGATAGAACCCGATGATTTGTAA
AGCAATCATCAAGATGGAGCACACGGGTCTGATGACCACAAATTACCATGTCCAGTATTT
CAAAAGTCTCAGAGTTCGATGATCCAGACGAACTACATGAGGCTGG

QA 2 647 2 647
DS 



AS 1 7

CO CL1091Contig1 530 7 15 U
GGGACTCAGACTCGAAACAAATCTGTAGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCG
TTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTG
TTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTG
AATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACGG
GGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAA
AACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTCGAGTCTGGTTCATGTTA
TTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCC
AAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTTT
TT**TGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAATTTTTCTTTATCTTGG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4EQ62JQ C 1
AF RR4GO09JQ C 25
AF RR4GO09TF U 25
AF RR4EQ62TF U 1
AF RR4FA73JQ C 1
AF RR4E115TF U 12
AF RR4FA73TF U 1
BS 1 26 RR4EQ62TF
BS 27 57 RR4GO09TF
BS 58 58 RR4EQ62TF
BS 59 139 RR4GO09TF
BS 140 140 RR4EQ62TF
BS 141 238 RR4GO09TF
BS 239 239 RR4EQ62TF
BS 240 342 RR4GO09TF
BS 343 343 RR4EQ62TF
BS 344 479 RR4GO09TF
BS 480 482 RR4EQ62TF
BS 483 484 RR4GO09TF
BS 485 485 RR4EQ62TF
BS 486 508 RR4GO09TF
BS 509 530 RR4EQ62TF

RD RR4EQ62JQ 530 0 0
GGGACTCAGACTCGAAACAAATCTGTAGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCG
TTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTG
TTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTG
AATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACGG
GGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAA
AACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTCGAGTTTGGTTCATGTTA
TTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCC
AAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTTT
TT**TGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAATTTTTCTTTATCTTGG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4GO09JQ 484 0 0
GG
AGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTTCGTTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAG
ATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTGTTGATCCAAAGAAGTACCTTGAGGAA
TCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATC
CAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGC
ATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTT
GGACACAGTATCTTCTTGAGTCTGGTTCATGTTATTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAG
TGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTT
TCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTT******GCTACAGATCTTATGCCTAAT
AA

QA 3 484 3 484
DS 

RD RR4GO09TF 484 0 0
GG
AGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTTCGTTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAG
ATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTGTTGATCCAAAGAAGTACCTTGAGGAA
TCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATC
CAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGC
ATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTT
GGACACAGTATCTTCTTGAGTCTGGTTCATGTTATTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAG
TGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTT
TCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTT******GCTACAGATCTTATGCCTAAT
AA

QA 3 484 3 484
DS 

RD RR4EQ62TF 530 0 0
GGGACTCAGACTCGAAACAAATCTGTAGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCG
TTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTG
TTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTG
AATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACGG
GGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAA
AACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTCGAGTCTGGTTCATGTTA
TTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCC
AAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTTT
TT**TGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAATTTTTCTTTATCTTGG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4FA73JQ 530 0 0
GGGACTCAGACTCGAAACAAATCTGTAGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCG
TTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTG
TTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTG
AATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACGG
GGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAA
AACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTCGAGTCTGGTTCATGTTA
TTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCC
AAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTTT
TT**TGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAATTTTTCTTTATCTTGG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4E115TF 509 0 0
GG
GAAACAAATCTGTAGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCGTTCTAGGACAGTT
TTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTGTTGATCCAAAGAA
GTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAATATCAGGCGTG
TGTGTAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACGGGGCAGTACTTCGA
CTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAACTGAAATGAAA
ACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTCGAGTCTGGTTCATGTTATTTGTAAGAGGAT
GTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAAATGGCTCTTCT
TCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTTTTTTTTGCTACAGA
TCTTATGCCTAATAACAAGAATTTTTC

QA 3 509 3 509
DS 

RD RR4FA73TF 530 0 0
GGGACTCAGACTCGAAACAAATCTGTAGGGTTCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCG
TTCTAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTG
TTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTG
AATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACGG
GGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAA
AACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTCGAGTCTGGTTCATGTTA
TTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCC
AAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTATTTGCGGTTATTACATTTTTTTTT
TT**TGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAATTTTTCTTTATCTTGG

QA 1 530 1 530
DS 



AS 2 6

CO CL1092Contig1 802 2 2 U
CACAGAAAATATATTTGAGTTCTTTCACAACAATTAGAATATTACATGAAATTTTACAAT
GATCTATATATCAAGAGATCGGATTTTAACAAAATTTACAAAATGTATTGACAAGGACCA
TGCATGCACGCTATAAACTATTGAACTTATGAAAGCTTGTATGAGGATAGACTAGATCTG
ATCCCTTTGATTTCATAGAGAATTATGGACGGTTTGAGATTCAAAGTCCATCGTAGTAAC
CTCCAAAAGATATCTGAGCTCTCACGACAGGAACACCTTTCATTGCAAAGATTGCTTCAT
TAACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCATTCATCCTCTTATGATCATCAAAGTAAATCT
GAAACCTAAGCTTCTGGTTTTTGTTCTTACAGACTTTGATGTTGTTGTGTCCGAGGAATA
AGACACATACTGTAGCAGCAGCAGCTGCAACGCCAAAAGAGCAAACAGCTCCGATCCCAT
TAAGACCAATCTTCCAGAAGTTCAGTTTCTCACCACCATGTTCACTAGTCACATCATCAC
TTTCTTTCTTCACTTGCAAGTCATCGTTTCCTTCACAATCGGAGGGCTTCTCAGCATCTA
TCAAAGGCACAGGACTCGTGATCCTCGCTGGTGGGTCAACTTTCATGTCGGCAAATTCAG
TTCCCTTCGTTTTCTTGAAGGATACTCTTGGTGACGGAACAGAGTCCATCAAAAGGGTTT
GTTTTGGATCCGGATCAAGATCCAATACGGGCTCCCAAGCTATGGGAACTTGGAGGAGCT
TTGTGGGGACAACTCTAGAGCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTTTTGGA

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ATGAGGATAGACTAGATCTGATCCCTTTGATTTCATAGAGAATTATGGACGGTTTGAGAT
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CATTGCAAAGATTGCTTCATTAACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCATTCATCCTCTT
ATGATCATCAGAGTAAATCTGAAACCTAAGCTTCTGGTTTTTGTTCTTACAGACTTTGAT
GTTGTTGTGTCCGAGGAATAAGACACATACTGTAGCGGCAGCAGCTGCAACGCCAAAAGA
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TTCACTAGTCACATCATCACTTTCTTTCTTCACTTGCAAGTCATCGTTTCCTTCACAATC
GGAGGGCTTCTCAGCATCTATCAAAGGCACAGGACTCGTGATCCTCGCTGGTGGGTCAAC
TTTCATGTCGGCAAATTCAGTTCCCTTCGTTTTCTTGAAGGATACTCTTGGTGACGGAAC
AGAGTCCATCAAAAGGGTTTGTTTTGGATCCGGATCAAGATCCAATACGGGCTCCCAAGC
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QA 1 762 1 762
DS 



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GGGAAAAAAATTAAAGAAGAGTCTCAAATCTTAATTCATTTTCTATTGAACATATTTCTT
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GGAAACTGACTTCTCAAATAATATTATAGAGATTTACTTGTAGAGGATGAATGAAGCTGT
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GATCTCTTGATATATAGATCATTGTAAAATTTCATGTAAT


BQ
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AATTATTAATATTATTAATTATGTATCCAAACATTCTCAAACCTATTAAAGGATCTTGAA
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DS 

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CCATGATGATGGATTGCTTCCTCTCCCC*ATCTACTCAA*GATCCTCTCCACAAGATAGA
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GCCCGTATTGGATCTTGATCCGGATCCAAAACAAACCCTTTTGATGGACTCTGTTCCGTC
ACCAAGAGTATCCTTCAAGAAAACGAAGGGAACTGAATTTGCCGACATGAAAGTTGACCC
ACCAGCGAGGATCACGAGTCCTGTGCCTTTGATAGATGCTGAGAAGCCCT**CCGATTGT
GAAGGAAACGATGACTTGCAAGTGAAGAAAGAAAGTGATGATGTGACTAGTGAACATGGT
GGTGAGAAACTGAACTTCTGGAAGATTGGTCTTAATGGGATCGGAGCTGTCTGCTCTTTT
GGCGTTGCAGCTGCTGCCGCTACAGTATGTGTCTTATTCCTCGGACACAACAACATCAAA
GTCTG*TAAGAACAAAA
A

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4B720TF 378 0 0
CGAGT
TCCTGTGCCTTTGATAGATGCTGAGAAGCCCCTCCCGATTGTGAAGGAAACGATGACTTG
CAAGTGAAGAAAGAAAGTGATGATGTGACTAGTGAACATGGTGGTGAGAAACTGAACTTC
TGGAAGATCGGTCTTAATGGGATCGGAGCTGTCTGCTCTTTTGGCGTTGCAGCTGCTGCT
GCTACAGTATGTGTCTTATTCCTCGGACACAACAACATCAAAGTCTGGTATCAGCGTAAT
CAACCATCGTGAGAGTTAACGTGAGCGCGACACTAGGAAACTGACTTCTCAAATAATATT
ATAGAGATTTACTTGTAGAGGATGAATGAAGCTGTGAATCATGCAACAAAG*TTAATGAA
GCAATCTTTGCAA

QA 6 378 6 378
DS 

RD RR4B720JQ 911 0 0
TCTTGATCTTGATCACGACGAGGATGATCACCATGGAGCCATGATGATGGATTGCTTCCT
CTCCCCCATCTACTCAAAGATCCTCTCCACAAGATAGAGTCTCCTCCAAGCTCTAGAGTT
GTCCCCACAAAGCTCCTCCAAGTTCCCATAGCTTGGGAGCCCGTATTGGATCTTGATCCG
GATCCAAAACAAACCCTTTTGATGGACTCTGTTCCGTCACCAAGAGTATCCTTCAAGAAA
ACGAAGGGAACTGAATTTGCCGACATGAAAGTTGACCCACCAGCGAGGATCACGAGTCCT
GTGCCTTTGATAGATGCTGAGAAGCCCT**CCGATTGTGAAGGAAACGATGACTTGCAAG
TGAAGAAAGAAAGTGATGATGTGACTAGTGAACATGGTGGTGAGAAACTGAACTTCTGGA
AGATCGGTCTTAATGGGATCGGAGCTGTCTGCTCTTTTGGCGTTGCAGCTGCTGCTGCTA
CAGTATGTGTCTTATTCCTCGGACACAACAACATCAAAGTCTGGTATCAGCGTAATCAAC
CATCGTGAGAGTTAACGTGAGCGCGACACTAGGAAACTGACTTCTCAAATAATATTATAG
AGATTTACTTGTAGAGGATGAATGAAGCTGTGAATCATGCAACAAAGGTTAATGAAGCAA
TCTTTGCAATGAAAGGTGTTCCTGTCGTGAGAGCTCAGATATCTTTTGGAGGTTACTACG
ATGGACTTTGAATCTCAAACCGTCCATAATTCTCTATGAAATCAAAGGGATCAGATCTAG
TCTATCCTCATACCAGCTTTCATAAGTTCAATAGTTTATAGCGTGCATGCATGGTCCTTG
TCAATACATTTTGTAAATTTTGTTAAAATCCGATCTCTTGATATATAGATCATTGTAAAA
TTTCATGTAAT

QA 1 911 1 911
DS 



AS 1 6

CO CL1093Contig1 848 6 27 U
GGAGGGTCAAAAATCCTGCAAAATTCACCTGAGCTAAAATATGTTCGCGAGGCGTCTCAC
TTCTGTCTTCAAACGATCTTCGACTTCAACTAGCTCGTCGGAGAAGGCAGCAGGGAAAGA
AAATGGGACGTTGGGGTCTTTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTCTTGATTACAGTCAC
TGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCTCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGGTCGTAGCAGCAA
GGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCAATGGGAGAGCCAATTGA
GAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCTGTCTCTTG
TTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCTGTTCGCAA
TGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGATAATGGA
CGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGGACCCCAACAAACCTTGAGAATCGACATCTC
TGACTATGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCTTCCGAACCAGAAAAGCC
AGAGAAGAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTGCTAGAG
TTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTTTTGTGT
ACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTGAATACATGACTGGT
AAACTAACCAGTACGTTTGGATGTTGAATACATTGG*TTATGCAATCAAGCGTATTTTTA
TTGTGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4A362TF U 218
AF RR4CM02JQ C 167
AF RR4A362TFB U 81
AF RR4A362JQD C 1
AF RR4CM02TF U 53
AF RR4AS22TF U 1
BS 1 53 RR4AS22TF
BS 54 85 RR4CM02TF
BS 86 86 RR4A362TFB
BS 87 217 RR4CM02TF
BS 218 297 RR4A362TF
BS 298 298 RR4CM02TF
BS 299 328 RR4A362TF
BS 329 477 RR4CM02TF
BS 478 478 RR4A362TFB
BS 479 734 RR4CM02TF
BS 735 735 RR4A362TFB
BS 736 761 RR4CM02TF
BS 762 762 RR4A362TFB
BS 763 767 RR4CM02TF
BS 768 768 RR4A362TFB
BS 769 804 RR4CM02TF
BS 805 807 RR4A362TFB
BS 808 813 RR4CM02TF
BS 814 814 RR4A362TFB
BS 815 818 RR4CM02TF
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BS 820 824 RR4CM02TF
BS 825 825 RR4A362TFB
BS 826 828 RR4CM02TF
BS 829 829 RR4A362TFB
BS 830 844 RR4CM02TF
BS 845 848 RR4A362JQD

RD RR4A362TF 111 0 0
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GAAGCAATGGGAGAGCCAATCGAGAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTA

QA 1 111 1 111
DS 

RD RR4CM02JQ 681 0 0
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GGTTGTAGCAGCAAGGCCATGGGGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCAATG
GGAGAGCCAATTGAGAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGG
CACTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTC
AAAGCTGTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGAC
ATTCTGATAATTGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGGACCCCAACAAACCTTG
AGAATCGACATCTCTGACTATGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCTTCC
GAACCAGAAAAGCCAGAGAAGAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGA
TCACCTTGCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAAC
AAGATGTTTTGTGTACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTG
AATACATGACTGGTAAACTAACCAGTACGTTTGGATGTTGAATACATTGG*TTATGCAAT
CAAGCGTATTTTT
ATTGTGTT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4A362TFB 769 0 0
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TTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTCTTGATTACAGTCACTGGTGGTGTTGCTTTGAGTG
CTCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGGTCGTAGCAGCAAGGCCATGGAGAAGGTGATGA
GGAATAAGGCTATGATCGAAGCAATGGGAGAGCCAATTGAGAAAGGGCCATGGTACAATG
CCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCC
CACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCTGTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTG
GGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGATAATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTT
CAAACGATGAACCCCAACAAACCTTGAGAATCGACATCTCTGACTATGCTCCTCCTTCGG
CTGCTACAGACTACAAACCTTCTTCCGAACCAGAAA*GCCAGAGAAGAGCTAAGAAGAGA
AAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTGCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATG
TTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTTTTGTGTACTGACAAATAAAAACATAA
TTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTGAATACATGACTGGTAAACTAACCAGTACGTTTGG
ATGTTGAATACATTGGGTTATGCAATCAAGCGTATTTTT
TATTGTGTTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4A362JQD 848 0 0
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TTCTGTCTTCAAACGATCTTCGACTTCAACTAGCTCGTCGGAGAAGGCAGCAGGGAAAGA
AAATGGGACGTTGGGGTCTTTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTCTTGATTACAGTCAC
TGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCTCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGGTCGTAGCAGCAA
GGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCAATGGGAGAGCCAATTGA
GAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCTGTCTCTTG
TTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCTGTTCGCAA
TGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGATAATGGA
CGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGAACCCCAACAAACCTTGAGAATCGACATCTC
TGACTATGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCTTCCGAACCAGAAAAGCC
AGAGAAGAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTGCTAGAG
TTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTTTTGTGT
ACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTGAATACATGACTGGT
AAACTAACCAGTACGTTTGGATGTTGAATACATTGG*TTATGCAATCAAGCGTATTTTTA
TTGTGTTC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR4CM02TF 794 0 0
G
GTCTCACTTCTGTCTTCAAACGATCTTCGACTCCAACTAGCTCGTCGGAGAAGGCAGCAG
GGAAAGAAAATGGGACGTTGGGGTCTTTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTCTTGATTA
CAGTCACTGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCTCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGGTTGTA
GCAGCAAGGCCATGGGGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCAATGGGAGAGC
CAATTGAGAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCTG
TCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCTG
TTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGA
TAATTGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGGACCCCAACAAACCTTGAGAATCG
ACATCTCTGACTATGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCTTCCGAACCAG
AAAAGCCAGAGAAGAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTT
GCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGT
TTTGTGTACTGACAAATAAAA*CATAATTCTTTTTGGTACTATACAAA*GTTGA*TACAT
GACTGGTAAACTAACCAGTACGTTTGGATGTG**ATACATGGG*T*ATGCA*TCA*GCGT
ATTTTTATTGT
GT

QA 2 792 2 792
DS 

RD RR4AS22TF 844 0 0
GGAGGGTCAAAAATCCTGCAAAATTCACCTGAGCTAAAATATGTTCGCGAGGCGTCTCAC
TTCTGTCTTCGAACGATCTTCGACTTCGACTAGCTCGTCGGAGAAGGCAGCAGGGAAAGA
AAATGGGACGTTGGGGTCTTTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTCTTGATTACAGTCAC
TGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCTCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGGTTGTAGCAGCAA
GGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCAATGGGAGAGCCAATTGA
GAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCTGTCTCTTG
TTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCTGTTCGCAA
TGG*GAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGATAATGGA
CGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGGACCCCAACAAACCTTGAGAATCGACATCTC
TGACTATGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCTTCCGAACCAGAAAAGCC
AGAGAAGAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTGCTAGAG
TTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTTTTGTGT
ACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTGAATACATGACTGGT
AAACTAACCAGTACGTTTGGATGTTG*ATACATTGG*TTATGCAATCA*GCGTATTTTTA
TTGT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 7

CO CL1094Contig1 563 7 5 U
GGATTTTCTCTCTGCTTCCGTAGTCTCCTCGTTCGTGTTGCTTCTCTCTCGCTCGTCTAC
GCGATTTGACTCGAGGATTTGTGCTAGGTTGAAATGGCAGGACACAGGATTGCGCATGCT
ACACTGAAAGGCCCGAGTGTGGTGAAGGAGTTAGTTATCGGTTTGGCACTCGGTTTAGCT
GCGGGTGGTCTCTGGAAGATGCACCACTGGAACGAGCAGAGGAAAACCAGAGCTTTCTAT
GACTTGCTTGAGAGGGGTGAGATCAGCGTTGTCCACCCTGAAGAATGAGTAGTGAATTCA
ACACCTACCAATCTCTCAATCTCTACTTTTTTTTATGTTATTGTATGGTTTCTTGACAAC
TTGGATGAAGTGCCTGAGAAAAAGGGGTTGCTTACGTAATAAAACAACAAACCTGAGACC
GGATTTTTGGGGATTTGTTAAACATATTATTGTTTTCCGGAAGATGCATGTATGCTACTA
TGCTACTACTGTATTCCATTGTTTAATTTCAGACAGCTTTCTTGACTTGACTCTAGATAA
ACAGGTGCTTTCATTTTTTCCTC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E135TF U 45
AF RR4GR19JQ C 1
AF RR4GR19TF U 1
AF RR4DY41JQ C 1
AF RR4DY41TF U 1
AF RR4BI20JQ C 1
AF RR4BI20TF U 1
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BS 45 487 RR4E135TF
BS 488 489 RR4GR19TF
BS 490 531 RR4E135TF
BS 532 563 RR4BI20TF

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ATGGTTTCTTGACAACTTGGATGAAGTGCCTGAGAAAAAGGGGTTGCTTACGTAATAAAA
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TGCATGTATGCTACTATGCTACT**TGTATTCCATTGTTTAATTTCAGACAGCTTTCTTG
ACTTGAC
TCTAGAA

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DS 

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ACACCTACCAATCTCTCAATCTCTACTTTTTTTTATGTTATTGTATGGTTTCTTGACAAC
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CG

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DS 

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CG

QA 1 522 1 522
DS 

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GC

QA 1 531 1 531
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DS 

RD RR4BI20TF 563 0 0
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ACACCTACCAATCTCTCAATCTCTACTTTTTTTTATGTTATTGTATGGTTTCTTGACAAC
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ACAGGTGCTTTCATTTTTTCCTC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 5

CO CL1095Contig1 1355 5 9 U
GGGTAAACCCTAGAGCGTCTCTTTTCCACTGTAAACTCCGATCTAACTCATTTTCCCTTC
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GCATCGAGGCCTCGCGCATCCAAAACCGAATCCTTCGTAGACAACAAACGGAAAGAAGGT
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CCAGATCTCGCCTCCCAAGACTGATATCGAGCAGAGTATTGTTGTCTCTGATTATACTCA
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GGCGACTGGTTGTAATGTGTTGTTGATCCAGAAGAGTATTTTGAGAGATGCTGTGACTGA
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AGTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTGA
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TTGATGACATCGTTACGGTGAGGTAGTGGGGTAGTTTCATTCTAAACGGGTCATCAGTAC
ACTCCTCTTTCTCTATCTATCTAAGCTTTGTTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTT
TTTTTTT*GCAATGGTTGAACTTAGAACCCTAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCATC
TTTTTTTT*GTCAGCGTTTTATTGCAGCCTAGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTGCTACTTTG
TTTCTTTCTAGTGACTTTAAATATCAAGATTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H310TF U 1
AF RR4G908TF U 570
AF RR4H310JQ C 561
AF RR4G908JQ C 570
AF RR4C823TF U 713
BS 1 634 RR4H310TF
BS 635 635 RR4G908TF
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BS 1269 1269 RR4H310JQ
BS 1270 1355 RR4C823TF

RD RR4H310TF 709 0 0
GGGTAAACCCTAGAGCGTCTCTTTTCCACTGTAAACTCCGATCTAACTCATTTTCCCTTC
AGAGATCAAATCAAATCTGAGCTCTCTCCTCCGTACTCTATAATGGCGACGGTACCCATG
GCATCGAGGCCTCGCGCATCCAAAACCGAATCCTTCGTAGACAACAAACGGAAAGAAGGT
TAGCCACGCTGCAGGTGGACCTACGAGGATGGAGAATGCTAAGATCGCTGTGATTCAGTT
CCAGATCTCGCCTCCCAAGACTGATATCGAGCAGAGTATTGTTGTCTCTGATTATACTCA
GATGGATAGGATCTTGAAGGAAGAGAGGAACTACATCTTGGGGATGATTAAGAAGATCAA
GGCGACTGGTTGTAATGTGTTGTTGATCCAGAAGAGTATTTTGAGAGATGCTGTGACTGA
TTTGTCTCTTCACTATTTGGCTAAGGCTAAGATCATGGTGATTAAGGATGTGGAGAGGGA
TGAGATTGAGTTCGTGACGAAGACGTTGAACTGCTTGCCGATTTCTAACATTGAGCATTT
TAGGGCTGAGAAGCTTGGTTTTGCTGATCTCGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAA
GATTTTGAAGATCACTGGGATTAAAGACATGGGGGAGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTG
GCTCTAACCAGCTTGTTCTTGATGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGC

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DS 

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G
CGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAAGATTTTGAAGATCACTGGGATTAAAGACAT
GGGG*AGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTGGCTCTAACCAGCTTGTTCTTGATGAAGCCG
AGATGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGTCAGGTGTCTGGTGAGCAAGAGGTTTTTGA
TTGCGGGAGGTGGTGCGTCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGGGCTAAGG
TGCTCCATGGGATGGAAGGGTACTGTGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAGGTTATTC
CTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTGAATCCTATTGCAATTGTGACTGAGCTCAGGA
ACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTCAGGAAAGGGCAGATTACTA
ATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCACCAGCGCAATCACTCTCG
CAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGTTACGGTGAGGTAGTGGG
GTAGTTTCATTCTAAACGGGTCATCAGTACACTCCTCTTTCTCTATCTATCTAAGCTTTG
TTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTTTTTTTTT*GCAATGGTTGAACTTAGAACCC
TAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCA

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DS 

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T
TGCTGATCTCGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAAGATTTTGAAGATCACTGGGAT
TAAAGACATGGGG*AGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTGGCTCTAACCAGCTTGTTCTTG
ATGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGTCAGGTGTCTGGTGAGCAAGA
GGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGTGCTT
GGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAGGGTACTGTGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCTCTGG
AGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTGAATCCTATTGCAATTGTGACTG
AGCTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTCAGGAAAGGGC
AGATTGCTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCACCAGCGCAA
TCACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGTTACGGTGA
GGTAGTGGGGTAGTTTCATTCTAAACGGGTCATCAGTACACTCCTCTTTCTCTATCTATT
TAAGCTTTATTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTTTTTTTTT*GCAATGGTTGAAC
ATAGAACCCTAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCATCTTTTTTTT*GTCAGCGTTTTA
TTGCAGCCTAGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTGCTACTTTGTTTCTTTCTAGTGACTTTAAA
TA
CT

QA 2 783 2 783
DS 

RD RR4G908JQ 779 0 0
G
CGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAAGATTTTGAAGATCACTGGGATTAAAGACAT
GGGG*AGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTGGCTCTAACCAGCTTGTTCTTGATGAAGCCG
AGATGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGTCAGGTGTCTGGTGAGCAAGAGGTTTTTGA
TTGCGGGAGGTGGTGCGTCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGGGCTAAGG
TGCTCCATGGGATGGAAGGGTACTGTGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAGGTTATTC
CTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTGAATCCTATTGCAATTGTGACTGAGCTCAGGA
ACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTCAGGAAAGGGCAGATTACTA
ATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCACCAGCGCAATCACTCTCG
CAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGTTACGGTGAGGTAGTGGG
GTAGTTTCATTCTAAACGGGTCATCAGTACACTCCTCTTTCTCTATCTATCTAAGCTTTG
TTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTTTTTTTTT*GCAATGGTTGAACTTAGAACCC
TAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCATCTTTTTTTT*GTCAGCGTTTTATTGCAGCCT
AGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTGCTACCTTGTTTCTTTCTAGTGACTTTAAATA
TCAGG

QA 2 774 2 774
DS 

RD RR4C823TF 643 0 0
GTGTGTTGTCAGGTGTCTGGTGAGCAAGAGGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGA
GATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAGGGTA
CTGTGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGC
AGGTCTGAATCCTATTGCAATTGTGACTGAGCTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAAT
CAACTCTGGGATCAATGTCAGGAAAGGGCAGATTACTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGT
GCAGCCTCTGCTTGTGAGCACCAGCGCAATCACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGAT
TTTGAAGATTGATGACATCGTTACGGTGAGGTAGTGGGGTAGTTTCATTCTAAACGGGTC
ATCAGTACACTCCTCTTTCTCTATCTATCTAAGCTTTGTTTCCCTTTTGGTGTTTTGATG
TGTTTTTTTTTTTTTTGCAATGGTTGAACTTAGAACCCTAGTTGCCTTTCATCATGTTCT
ATTGCATCTTTTTTTTTGTCAGCGTTTTATTGCAGCCTAGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTG
CTACTTTGTTTCTTTCTAGTGACTTTAAATATCAAGATTTCTC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 6

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GGAGGGTTAGAGAAGAATGGAGATGATGATGATGCAGGAGCAGGAGGAGGCGGCAGCGGC
AGCAGCAAATAAAGCTGGATCGGAGGTGTCTTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAA
TCTCAACGAAAAAGTCAAGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCA
GTACGGGAAGATAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTG
GGTTGTGTTCGACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCC
CTTCTACGACAAACCCATGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAA
GGCTGACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAA
GAAAAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCGTATCCTGGTGT
CTATGGATCCGCCCCTCCTCTTTCCCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGG
TGTCAAAAGCAATCTTCCCGAAGCACCGGCACCCCCGAACAACATCCTCTTTGTCCAACA
CCTTCCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAGGAACTTTTCGGCAATTACCATGGCTT
CAAGGAGGTTAGGATGGTTGCAGCCAAGCCTGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTTCTGATGA
GATGCAGTCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAACCCCTAT
GCACATCACCTATGCTAAGAAATAAACCCACCCCCACCCATTTTGGATTTTGGTGGGGTG
CTACTATTATTATCTCCCTTGTATTCTGTCAATGCTACTTGTTCTTTCTTCTCTTGTGTT
AGAGATTCTTTATTTCTTAGCATATATTACAACTTTAATCCAGAGTAAGAACAGGTTTTA
ATGGGCTTTTATTGACCCATTCATCTTTAGCTTAGCCCCGACTCTTCTTCATCATTTCTG
TGATGCTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H341TF U 1
AF RR4D247TF U 3
AF RR4EB44TF U 7
AF RR4EB44JQ C 488
AF RR4CV65JQ C 335
AF RR4H341JQ C 305
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BS 520 525 RR4EB44TF
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BS 870 1034 RR4H341JQ

RD RR4H341TF 518 0 0
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AGCAGCAAATAAAGCTGGATCGGAGGTGTCTTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAA
TCTCAACGAAAAAGTCAAGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCA
GTACGGGAAGATAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTG
GGTTGTGTTCGACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCC
CTTCTACGACAAACCCATGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAA
GGCTGACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAA
GAAAAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCGTATCCTGGTGT
CTATGGATCCGCCCCTCCTCTTTCCCAAGTACCATACC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4D247TF 517 0 0
GGGGTT
AGAGAAGAATGGAGATGATGATGATGCAGGAGCAGGAGGAGGCGGCAGCGGCAGCAGCAA
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AAAAAGTCAAGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCAGTACGGGA
AGATAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGTTGTGT
TCGACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCCCTTCTACG
ACAAACCCATGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCTGACG
GCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGA
AAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTATGGAT
CTGCCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCATACCC

QA 7 517 7 517
DS 

RD RR4EB44TF 519 0 0
GG
AGAGAAGAATGGAGATGATGATGATGCAGGAGCAGGAGGAGGCGGCAGCGGCAGCAGCAA
ATAAAGCTGGATCGGAGGTGTCTTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAATCTCAACG
AAAAAGTCAAGCTCGATGGGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCTCAGTACGGGA
AGATAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATCGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGTTGTGT
TCGACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCCCTTCTACG
ACAAACCCATGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCTGACG
GCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGA
AAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGGCCATCCCACCGTATCCTGGTGTCTATGGAT
CCGCCCCTCCTCTTTCCCAAGTACCATACCCTGGTGG

QA 3 519 3 519
DS 

RD RR4EB44JQ 459 0 0
TCCGCCCCTCCTCTTTCCCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTG***TCAAA
AGCAATCTTCCCGAAGCACCGGCACCCCCGAACAACATCCTCTTTGTCCAACACCTTCCT
CACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAGGAACTTTTCGGCAATTACCATGGCTTCAAGGAG
GTTAGAATGGTTGCAGCCAAGCCTGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTTCTGATGAGATGCAG
TCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAACCCCTATGCACATC
ACCTATGCTAAGAAATAAACCCACCCCCACCCATTTTGGATTTTGGTGGGGTACTACTAT
TATTATCTCCCTTGTATTCTGTCAATGTTACTTGTTCTTTCTTCTCTTGTGTTAGAGATT
CTTTATTTCTTAGCATATATTACAACTTTAATCC
AGAGC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4CV65JQ 607 0 0
AAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCTGACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGA
AAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGT
ATGCCCATCCCACCGTATCCTGGTGTCTATGGATCCGCCCCTCCTCTTTCCCAAGTACCA
TACCCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTCAAAAGCAATCTTCCCGAAGCACCGGCACCC
CCGAACAACATCCTCTTTGTCCAACACCTTCCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAG
GAACTTTTCGGCAATTACCATGGCTTCAAGGAGGTTAGGATGGTTGCAGCCAAGCCTGGT
ATTGCTTTCGTTGAGTTTTCTGATGAGATGCAGTCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAA
GGTTTCACCATTCACCAAACCCCTATGCACATCACCTATGCTAAGAAATAAACCCACCCC
CACCCATTTTGGATTTTGGTGGGGTGCTACTATTATTATCTCCCTTGTATTCTGTCAATG
CTACTTGTTCTTTCTTCTCTTGTGTTAGAGATTCTTTATTTCTTAGCATATATTACAACT
TTAATCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4H341JQ 730 0 0
TACGACAAACCCATGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCT
GACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAA
AAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCGTATCCTGGTGTCTAT
GGATCCGCCCCTCCTCTTTCCCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTC
AAAAGCAATCTTCCCGAAGCACCGGCACCCCCGAACAACATCCTCTTTGTCCAACACCTT
CCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCGGGAACTCTTCGGCAATTACCATGGCTTCAAG
GAGGTTAGGATGGTTGCAGCCAAGCCTGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTTCTGATGAGATG
CAGTCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAACCCCTATGCAC
ATCACCTATGCTAAGAAATAAACCCACCCCCACCCATTTTGGATTTTGGTGGGGTGCTAC
TATTATTATCTCCCTTGTATTCTC*CAATGCTACTTGTTCTTTCTTCTCTTGTGTTAGAG
ATTCTTTATTTCTTAGCATATATTACAACTTTAATCCAGAGTAAGAACAGGTTTTAATGG
GCTTTTATTGACCCATTCATCTTTAGCTTAGCCCCGACTCTTCTTCATCATTTCTGTGAT
GCTTTGTGTT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 7

CO CL1097Contig1 559 7 5 U
GGGATCTAAAACTTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTTCTACTAG
TCTTAACTTTGGAACTCAACGAGCCGTTATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCGTCTCAC
AGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAGTCTTGGTTCAAGAACAACGAACCGGATGGT
GAAGTTTAGGCCAGTAAAAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGAG
CATCAAGGACGCCGAGGAGGCTTGTGCTGGCGACCCTGTGAGCGGAGAGTGTGTAGCTGC
GTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGA
CTCCGACCCTTTGGAGGAGTACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTCGTACTTA
CGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTATATTACATAAAAAT
CATTTGTTTCGGTCTATTTGGTGTTATGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAAGCAGGT
TATATAATTTTATTCATAT


BQ
10 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI13JQ C 1
AF RR4AH32JQ C -2
AF RR4AH32TF U -2
AF RR4BI13TF U 1
AF RR4A216TFB U 2
AF RR4G909TF U 2
AF RR4G909JQ C 117
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TAACTTTGGAACTCAACGAGCCGTTATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCGTCTCACAGG
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QA 7 534 7 534
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G
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AC

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ATATAATTTTATTCATAT

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AGGTTATATAATTTT

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DS 



AS 1 5

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AGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATGGA
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TTCTGTTTTTAATGTTTCTTTGTGGAAGTTTGTAGATCTTTTCTTTAGTGGTAGTAGTGG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4EA11TF U 1
AF RR4EM03TF U 1
AF RR4CY75TF U 355
AF RR4EM03JQ C 399
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QA 1 715 1 715
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AGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATGGA
TTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCAGCCGTTGATTCATCAGT
CTCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATTAAAAAAAA*TACACCCACCAGAT
CTCCTCCGATCGTATCTTTTAAAA*CCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAG*TCAC
GATAGATATGCTTCTCGCAGCCAGTGAGCGTTTTT
ACGGGAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4CY75TF 601 0 0
G
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15 15 15 15 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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GACACCGGAGAGATCACCTCTGGTCTTGGTTTTCGTTTCCTACCTCCTAATGGAGAATCC
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G
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A

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CC

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CGTATGGTTTTGATCAGTCCATAATGGCATGTTGTGGAACCGGAGGACCGCCACTGAACT
ACAATGATCAGGTTGG*CTGCGGTTGGACAGGGACATCTCCAAATGGTACGACAATAACA
ACCAAATCATGTAATGCTAGTTCCAAATATGTTAACTGGGATGGAATTCACTATACCGAA
GCTGCAAACCGGTTTGTTTCACAGAAAATTCTCTCCGGTAAATATTCCCAGACGGCGGCG
TCTTGAAAATCAGAACCCCTAGAGGGGTCTTTTGATTGTTTCAAGTGTGTGATAAAACAG
AGCATTCCTTTATAACTCTCCGTTCACAATATAATAAAATGCTTTGATTCAATAATATTA
TCTTCTTCAGATTTCATGTAACGTTTTTTGTACAACATTACTATCATCAGCATTTTCCAT
T

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4AF91JQ 831 0 0
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GCAATGTACGGCAAGACAGTAGATCAAGCTGCTGCTGTTATTCCTACAATCATAAATACA
TTTAAAGATGGAATAAATAGACTATATTGGGAAGGTGGCGCGAGAAACTTTTGGATACAC
AACACAGGACCAATTGGGTGTTTAGCTCAGATGGTGTCATTATTTGGGAAAGAGAAATCA
CAAGTTGATAAGTTTGGTTGTGTAATTGGCCATAACGAAGCTGCTAAGCTTTTCAATTCA
CAGCTTCAGGGTCTTGTCACAAATTTCACTCAACAATATACTGATGCTAATTTCACATAC
GTAGATATCTTCTCCATCAAATCCGACCTTATCCAGAATCATTCGACGTATGGTTTTGAT
CAGTCCATAATGGCATGTTGTGGAACCGGAGGACCGCCACTGAACTACAATGATCAGGTT
GG*CTGCGGTTGGACAGGGACATCTCCAAATGGTACGACAATAACAACCAAATCATGTAA
TGCTAGTTCCAAATATGTTAACTGGGATGGAATTCGCTATACCGAAGCTGCAAACCGGTT
TGTTTCACAGAAAATTCTCTCCGGTAAATATTCCCAGACGGCGGCGTCTTGAAAATCAGA
ACCCCTAGAGGGGTCTTTTGATTGTTTCAAGTGTGTGATAAAACAGAGCATTCCTTTATA
ACTCTCCGTTCACAATATAATAAAATGCTCTGATTCAATAATATTATCTTCTTCAGATTT
CATGTAACGTTTTTTGTACAACATTACTATCATCAGCATTTTCCATTACAT

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 5

CO CL1100Contig1 1045 5 29 U
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AAAGACAGAGGAAGCTAAAGTTGAAGAGCTGATTAAAGCTGTTGCTGAATCAGGAGCTAA
AGTTATTGTTAGCGGAGGATCAGTTGGAGAAATGGCATTGCATTTCTGCGAGCGCTACAA
GATTATGGTCTTGAAAACCAGCTCAAAGCTTGAACTAAGGCGTTTCTGCCGTACTGCTGG
GGCTGTCGCTCATTTGAAACTAAACCGGCCGAGTCCTGATGATCTGGGCTACGTTGATTC
CATAGCAGTGGAGGAAATTGGTGGTGTGACAGTCACTATTGCCAGAAATGAGCAAGGTGG
TAACTCAATCTCTACAGTGGTTTTGCGTGGGAGCACAGACAGCATTTTGGACGACCTTGA
AAGAGCCGTTGATGATGGAGTTAACACATACAAGGCCATGTGCAGAGACAGCCGTATCGT
TCCTGGCGCTGCAGCTACTGAAATAGAACTGGCTCAGAGATTGAAAGAATATGCCAACGC
AGAAACAGGGTTGGACAAATATGCCATCACCAAATACGCAGAGAGCTTCGAGTTTGTGCC
CAAAACCCTTGCAGACAACGCTGGCCTAAATGCGATGGAAATCATTGCTTCTCTGTACAC
TGGACACGGATCTGGAAACACAAAGCTAGGCATTGACTTGGAGGAAGGTGCCTGTAAAGA
TGTCTCAGAGACAAAAGTGTGGGATCTTTTTGCAACCAAGTTATTTGCTCTTAAGTACGC
TTCTGATGCTGCATGCACGGTGCTTCGCGTAGACCAGATTATAATGGCGAAACAAGCAGG
TGGACCAAGGAGAGACCTCGCAGCAGCCGCCGGTGCAGGCGCAGAGGAAGATTAAGCTTT
GAAGAACAATACCTCTTAGTAAAAGTCTTCTTCTGTAACCTTTCTTTTTTTAATTCTGGT
AAGATTTTTGTCAGGCTCAGTTTGAGATTTGTGATCTTGTTTTGTACACAGACCATCAAC
TTAAGGTTTTGTTTTTTGGTTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 35 20 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4FM06TF U 1
AF RR4FZ81TF U 207
AF RR4BH32TF U 260
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AF RR4H504TF U 509
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BS 265 273 RR4FM06TF
BS 274 274 RR4FZ81TF
BS 275 282 RR4FM06TF
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BS 284 334 RR4FM06TF
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BS 505 505 RR4FZ81TF
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BS 1044 1045 RR4H504JQB

RD RR4FM06TF 742 0 0
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GGCTGTCGCTCATTTGAAACTAAGCCGGCCGAGCCCTGATGACCTGGGCTACGTTGATTC
CATAGCAGTGGAGGAAATTGGTGGTGTGACAGTCGCTATTGCCAGAAATGAGCAAGGTGG
TAACTCAATCTCTACAGTGGTTTTGCGTGGGAGCACAGACAGCATTTTGGACGACCTTGA
AAGAGCCGTTGATGATGGAGTTAACACATACAAGGCCATGTGCAGAGACAGCCGTATCGT
TCCTGGCGCTGCAGCTACTGAAAT*GAACTTGCTCAGAGATTGAAAGAATATGCCAACGC
AGAAACAGGGTTGGACAAATATGCCATCACCAAATACGCAGAGAGCTTCGAGTTTGTACC
CAAAACCCTTGCAGACAACGCTGGCCTAAATGCGATGGAAATCATTGCTTCTCTGTACAC
TGGACACGGATCTGGAAACACAAAGCTAGGCATTGACTTGGAGGAAG*TGCCTGTAAAGA
TGTCTCAGAGACAAA
GTGTGGG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4FZ81TF 662 0 0
GGT
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GGAGCACAGACAGCATTTTGGACGACCTTGAAAGAGCCGTTGATGATGGAGTTAACACAT
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TGGCTCAGAGATTGAAAGAATATGCCAACGCAGAAACAGGGTTGGACAAATATGCCATCA
CCAAATACGCAGAGAGCTTCGAGTTTGTGCCCAAAACCCTTGCAGACAACGCTGGCCTAA
ATGCGATGGAAATCATTGCTTCTCTGTACACTGGACACGGATCTGGAAACACAAAGCTGG
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TTGCAACCAAGTTATTTGCTCTTAAGTACGCTTCTGATGCTGCATGCACGGTGCTTCGCG
TAGACCAGATTATAATGGCGAAACAAGCACGTGGACCAAGGAGAGACCTCGCAGCAGCC

QA 4 662 4 662
DS 

RD RR4BH32TF 774 0 0
GTAAG
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TGTGACAGTCACTATTGCCAGAAATGAGCAAGGTGGTAACTCAATCTCTACAGTGGTTTT
GCGTGGGAGCACAGACAGCATTTTGGACGACCTTGAAAGAGCCGTTGATGATGGAGTTAA
CACATACAAGGCCATGTGCAGAGACAGCCGTATCGTTCCTGGCGCTGCCGCTACTGAAAT
AGAACTGGCTCAGAGATTGAAAGAATATGCCAACGCAGAAACAGGGTTGGACAAATATGC
CATCACCAAATACGCAGAGAGCTTCGAGTTTGTGCCCAAAACCCTTGCAGACAACGCTGG
CCTAAATGCGATGGAAATCATTGCTTCTCTGTACACTGGACACGGATCTGGAAACACAAA
GCTAGGCATTGACTTGGAGGAAGGTGCCTGTAAAGATGTCTCAGAGACAAAAGTGTGGGA
TCTTTTTGCAACCAAGTTATTTGCTCTTAAGTACGCTTCTGATGCTGCATGCACGGTACT
TCGCGTAGACCAGATTATAATGGCGAAACAAGCAGGTGGACCAAGGAGAGACCTCTCAGC
AGCCGCCGGTGCAGGCGCAGAGGAAGATTAAGCTTTGAAGAACAATACCTCGTAGTAAAA
GTCTTCTTCTGTAACCTTTCTTTTTTTAATTCTGGTAAGATTTTTGTCACGCTCAGTTTG
AGATTTGTGATCTTGTTTTGTACACAGACCATCAACTTAAAGTTTTGTT

QA 6 774 6 774
DS 

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G
TGGCTCATAGATTGAAAGAATATGCCAACGCAGAAACAGGGTTGGACAAATATGCCATCA
CCAAATACGCAGAGAGCTTCGAGTTTGTGCCCAAAACCCTTGCAGACAACGCTGGCCTAA
ATGCGATGGAAATCATTGCTTCTCTGTACACTGGACACGGATCTGGAAACACAAAGCTAG
GCATTGACTTGGAGGAAGGTGCCTGTAAAGATGTTTCAGAGACAAAAGTGTGGGATCTTT
TTGCAACCAAGTTATTTGCTTTTAAGTACGCTTTTGATGCTGCATGCACGGTGCTTCGCG
TAGACCAGATTATAATGGCGAAACAAGCAGGTGGACCAAGGAGAGACCTCGCAGCAGCCG
CCGGTGCAGGCGCAGAGGAAGATTAAGCTTTGAAGAACAATACCTCTTAGTAAAAGTCTT
TTTCTGTAACCTTTCTTTTTTTAATTTTGGTAAGATTTTTGTCAGGCTCAGTTTGAGATT
TGTGATCTTGTTTTGTACACAGACCATCAACTTAAGGTTTTGTTTTTTGGTTTGCG

QA 2 537 2 537
DS 

RD RR4H504TF 537 0 0
G
TGGCTCATAGATTGAAAGAATATGCCAACGCAGAAACAGGGTTGGACAAATATGCCATCA
CCAAATACGCAGAGAGCTTCGAGTTTGTGCCCAAAACCCTTGCAGACAACGCTGGCCTAA
ATGCGATGGAAATCATTGCTTCTCTGTACACTGGACACGGATCTGGAAACACAAAGCTAG
GCATTGACTTGGAGGAAGGTGCCTGTAAAGATGTCTCAGAGACAAAAGTGTGGGATCTTT
TTGCAACCAAGTTATTTGCTCTTAAGTACGCTTCTGATGCTGCATGCACGGTGCTTCGCG
TAGACCAGATTATAATGGCGAAACAAGCAGGTGGACCAAGGAGAGACCTCGCAGCAGCCG
CCGGTGCAGGCGCAGAGGAAGATTAAGCTTTGAAGAACAATACCTCTTAGTAAAAGTCTT
CTTCTGTAACCTTTCTTTTTTTAATTCTGGTAAGATTTTTGTCAGGCTCAGTTTGAGATT
TGTGATCTTGTTTTGTACACAGACCATCAACTTAAGGTTTTGTTTTTTGGTTTG
CG

QA 2 535 2 535
DS 



AS 1 7

CO CL1101Contig1 1472 7 4 U
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ACTTTGTACCATCCATTCCAGTGTAGTTGAATTAAGTTCAAGAGCCCAAGGACTTGGAGC
ACATCTTTTGTTATTTCCACTGCTTAAAGTGATTGTTACGACCACGAAGAAACAACAAAT
CCCAACTACGGATATATAAGAGCCAAAACTGGAAAGGGCATTCCATCCAGCGTAAGCATC
TGGATAATCTGGAATACGACGTGGCATACCTGAAAGCCCTAAGAAATGCATAGGAAAGAA
GGTCAAATTAACCCCGAAAAAAGTGATCCAAAAATGGATTTGACCTAAAGTTTCAGGGTA
TGTCCGACCAAAGATTTTACCCACCCAATAGTAAAATCCTGCAAATAAAGCAAAAACGGC
TCCCATAGAAAGTACATAATGGAAATGTGCAACCACATAATAAGTATCATGTAGAGCAAT
GTCTAGCCCTGAATTTGCCAGGACTATTCCAGTGAGTCCTCCTATGGTGAACAAAAAGAT
AAATCCTACAGCAAATAACATGGGTGTTTTGTATTGTATCGAACCCCCCCACATGGTAGC
GATCCAACTAAAGATTTTGATTCCAGTGGGGACAGCTATGATCATGGTAGCTGCGGTGAA
GTAGGCACGGGTATCTACGTCTAAGCCCACAGTAAACATATGATGAGCCCAAACAAGAAA
TCCTAAGACACCAATACTGATCATGGCATAAACCATGCCTAGATACCCGAAGACCGGTTT
TCCCGAAAAAGTCGAAACGATATGACTTATGATACCGAATCCAGGCAGAATGAGAATATA
CACCTCTGGATGACCGAAGAACCAAAAGAGATGCTGGTATAAAATTGGGTCTCCCCCTCC
AGCGGGATCAAAAAAGGTTGTATTAAAGTTTCGATCGGTTAATAACATGGTAATTGCCCC
TGCCAGTACCGGGAGTGATAATAAAAGTAGGAATGCTGTCACTAGAACGGACCACACAAA
TAGGGGTAATCTATGCATAGTCATTCCAGGTCCACGCATGTTGAAGATAGTTGTTATAAA
ATTGATAGAACCTAAAATGGATGAAACACCAGATAGATGAAGACTAAAAATTGCTAAATC
AACTGCTCCTCCAGAATGACTGGTAATACCACTTAAGGGCGGATAGACCGTCCACCCAGT
GCCGCTACCTACTTCTACTAAGGCTGAGCTTAATAGGAGCAAGAGACTTGGTGGCAACAA
CCAGAATGAAATATTATTTAATCGTGGAAATGCCATGTCAGGTGCACCTATCAGAATCGG
AACAAACCAATTACCAAATCCACCTATCATCGCCGGCATAACCATAAAAAAGATCATTAA
AAAAGCATGAGCTGTTATTAAAACATTATAAAGTTGATGATTCCCACCAAGAATTTGATC
GCCGGGTCGTGCTAATTCCATCCGAATTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ92JQ U 6
AF RR4BQ92TF C 6
AF RR4ER43TF C 6
AF RR4ER43JQ U 168
AF RR4DG70JQ U 1
AF RR4A723JQ U 13
AF RR4A723TF C 631
BS 1 687 RR4DG70JQ
BS 688 688 RR4A723JQ
BS 689 758 RR4DG70JQ
BS 759 1472 RR4A723TF

RD RR4BQ92JQ 185 0 0
A
GCTTTTCGTCTCCTTGATAGCTGGAAGTTCTCCAAAAGTATGAAAAGCAGGAGGACTTTG
TACCATCCATTC*AGTGTAGTTGAATTAAGTTCAAGAGCCCAAGGACTTGGAGCACATCT
TTTGTTATTTCCACTGCTTAAAGTGATTGTTACGACCACGAAGAAACAACAAATCCCAAC
TAC
C

QA 2 184 2 184
DS 

RD RR4BQ92TF 185 0 0
A
GCTTTTCGTCTCCTTGATAGCTGGAAGTTCTCCAAAAGTATGAAAAGCAGGAGGACTTTG
TACCATCCATTC*AGTGTAGTTGAATTAAGTTCAAGAGCCCAAGGACTTGGAGCACATCT
TTTGTTATTTCCACTGCTTAAAGTGATTGTTACGACCACGAAGAAACAACAAATCCCAAC
TAC
C

QA 2 184 2 184
DS 

RD RR4ER43TF 263 0 0
G
GCTTTTCGTCTCCTTGATAGCTGGAAGTTCTCCAAAAGTATGAAAAGCAGGAGGACTTTG
TACCATCCATTCCAGTGTAGTTGAATTAAGTTCAAGAGCCCAAGGACTTGGAGCACATCT
TTTGTTATTTCCACTGCTTAAAGTGATTGTTACGACCACGAAGAAACAACAAATCCCAAC
TACGGATATATAAGAGCCAAAACTGGAAAGGGCATTCCATCCAGCGTAAGCATCTGGATA
ATCTGGAATACGACGTGGCAT
C

QA 2 262 2 262
DS 

RD RR4ER43JQ 101 0 0
AA
AAACAACAAATCCCAACTACGGATATATAAGAGCCAAAACTGGAAAGGGCATTCCATCCA
GCGTAAGCATCTGGATAATCTGGAATACGACGTGGCAT
C

QA 3 100 3 100
DS 

RD RR4DG70JQ 758 0 0
CACATAGCTTTTCGTCTCCTTGATAGCTGGAAGTTCTCCAAAAGTATGAAAAGCAGGAGG
ACTTTGTACCATCCATTCCAGTGTAGTTGAATTAAGTTCAAGAGCCCAAGGACTTGGAGC
ACATCTTTTGTTATTTCCACTGCTTAAAGTGATTGTTACGACCACGAAGAAACAACAAAT
CCCAACTACGGATATATAAGAGCCAAAACTGGAAAGGGCATTCCATCCAGCGTAAGCATC
TGGATAATCTGGAATACGACGTGGCATACCTGAAAGCCCTAAGAAATGCATAGGAAAGAA
GGTCAAATTAACCCCGAAAAAAGTGATCCAAAAATGGATTTGACCTAAAGTTTCAGGGTA
TGTCCGACCAAAGATTTTACCCACCCAATAGTAAAATCCTGCAAATAAAGCAAAAACGGC
TCCCATAGAAAGTACATAATGGAAATGTGCAACCACATAATAAGTATCATGTAGAGCAAT
GTCTAGCCCTGAATTTGCCAGGACTATTCCAGTGAGTCCTCCTATGGTGAACAAAAAGAT
AAATCCTACAGCAAATAACATGGGTGTTTTGTATTGTATCGAACCCCCCCACATGGTAGC
GATCCAACTAAAGATTTTGATTCCAGTGGGGACAGCTATGATCATGGTAGCTGCGGTGAA
GTAGGCACGGGTATCTACGTCTAAGCC*ACAGTAAACATATGATGAGCCCAAACAAGAAA
TCCTAAGACACCAATACTGATCATGGCATAAACCATGC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4A723JQ 752 0 0
CGTCTCCTTGATAGCTGGAAGTTCTCCAAAAGTATGAAAAGCAGGAGGACTTTGTACCAT
CCATTCCAGTGTAGTTGAATTAAGTTCAAGAGCCCAAGGACTTGGAGCACATCTTTTGTT
ATTTCCACTGCTTAAAGTGATTGTTACGACCACGAAGAAACAACAAATCCCAACTACGGA
TATATAAGAGCCAAAACTGGAAAGGGCATTCCATCCAGCGTAAGCATCTGGATAATCTGG
AATACGACGTGGCATACCTGAAAGCCCTAAGAAATGCATAGGAAAGAAGGTCAAATTAAC
CCCGAAAAAAGTGATCCAAAAATGGATTTGACCTAAAGTTTCAGGGTATGTCCGACCAAA
GATTTTACCCACCCAATAGTAAAATCCTGCAA*TAAAGCAAAAACGGCTCCCATAGAAAG
TACATAATGGAA*TGTGCAACCACATAATAAGTATCATGTAGAGCAATGTCTAGCCCTGA
ATTTGCCAGGACTATTCCAGTGAGTCCTCCTATGGTGAACAAAAAGATAAATCCTACAGC
AAATAACATGGGTGTTTTGTATTGTATCGAACCCCCCCACATGGTAGCGATCCAACTAAA
GATTTTGATTCCAGTGGGGACAGCTATGATCATGGTAGCTGCGGTGAAGTAGGCACGGGT
ATCTACGTCTAAGCCCACAGTAAACATATGATGAGCCCAAACAAGAAATCCTAAGACACC
AATACTGATCATGGCATAAACCATGC
CTAGAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4A723TF 842 0 0
GACAGCTATGATCATGGTAGCTGCGGTGAAGTAGGCACGGGTATCTACGTCTAAGCCCAC
AGTAAACATATGATGAGCCCAAACAAGAAATC*TAAGACACCAATACTGATCATGGCATA
AACCATGCCTAGATACCCGAAGACCGGTTTTCCCGAAAAAGTCGAAACGATATGACTTAT
GATACCGAATCCAGGCAGAATGAGAATATACACCTCTGGATGACCGAAGAACCAAAAGAG
ATGCTGGTATAAAATTGGGTCTCCCCCTCCAGCGGGATCAAAAAAGGTTGTATTAAAGTT
TCGATCGGTTAATAACATGGTAATTGCCCCTGCCAGTACCGGGAGTGATAATAAAAGTAG
GAATGCTGTCACTAGAACGGACCACACAAATAGGGGTAATCTATGCATAGTCATTCCAGG
TCCACGCATGTTGAAGATAGTTGTTATAAAATTGATAGAACCTAAAATGGATGAAACACC
AGATAGATGAAGACTAAAAATTGCTAAATCAACTGCTCCTCCAGAATGACTGGTAATACC
ACTTAAGGGCGGATAGACCGTCCACCCAGTGCCGCTACCTACTTCTACTAAGGCTGAGCT
TAATAGGAGCAAGAGACTTGGTGGCAACAACCAGAATGAAATATTATTTAATCGTGGAAA
TGCCATGTCAGGTGCACCTATCAGAATCGGAACAAACCAATTACCAAATCCACCTATCAT
CGCCGGCATAACCATAAAAAAGATCATTAAAAAAGCATGAGCTGTTATTAAAACATTATA
AAGTTGATGATTCCCACCAAGAATTTGATCGCCGGGTCGTGCTAATTCCATCCGAATTAA
TC

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 7

CO CL1102Contig1 812 7 19 U
GGTCAAACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGCTGTATTCGTTCTTCTCTTCAGTG
GTTTCACGGCCAATAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAG
TCATTCCAAGCGTGATGGATTCAGAAAATATCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAG
AGAATCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATA
ACGCGATGTCTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGA
GATATAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGCAGGTTTGTCTTAAACATTACCAAGATG
GCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTT
CAGATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAA*
GGCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCT
TACATGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTT
ACGGGCGGCACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTG
TGAAAGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCCCTGTCTCAA
TAATGTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTAAGTGAGTTCTATTAA
AAGAAAAGTTAAGAATAAATACAGTTAGTTCC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 25 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 25 25 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D512TF U 4
AF RR4CD55TF U 1
AF RR4BV38TF U 2
AF RR4CN95JQ C 2
AF RR4CN95TF U 2
AF RR4BV38JQ C 10
AF RR4D512JQ C 394
BS 1 94 RR4CD55TF
BS 95 95 RR4BV38TF
BS 96 666 RR4CD55TF
BS 667 667 RR4CN95TF
BS 668 680 RR4CD55TF
BS 681 681 RR4CN95TF
BS 682 704 RR4CD55TF
BS 705 705 RR4CN95TF
BS 706 719 RR4CD55TF
BS 720 720 RR4CN95TF
BS 721 726 RR4CD55TF
BS 727 727 RR4BV38TF
BS 728 729 RR4CD55TF
BS 730 730 RR4BV38TF
BS 731 739 RR4CD55TF
BS 740 740 RR4CN95JQ
BS 741 765 RR4CD55TF
BS 766 783 RR4CN95TF
BS 784 812 RR4CN95JQ

RD RR4D512TF 659 0 0
G
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TGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGG
GCGGCACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTGTG

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4CD55TF 772 0 0
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GCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTT
CAGATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAA*
GGCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCT
TACATGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTT
ACGGGCGGCACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTG
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TAATGT*CTGCGTCCGCCC*TGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTA
GTGAGTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4BV38TF 752 0 0
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TAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGCAGGTTTGTCTTAAACATTACCAAGATGGCTA
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TGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAAGGCG
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GTTCTACGTC*GCCC*TGGAGACGAGTGC

QA 4 752 4 752
DS 

RD RR4CN95JQ 811 0 0
GGA
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GTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTAAGTGAGTTCTATTAAAAGA
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QA 4 811 4 811
DS 

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TAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGCAGGTTTGTCTTAAACATTACCAAGATGGCTA
TGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTTCAGA
TGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAA*GGCG
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TGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGG
GCGGCACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTGTGAA
AGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAA*TACAATGTGCCCTGTCTCAATAAT
GTTCTACGTCCGCCC*TGGAGACGAGTGCAGTGAG*TGTTAAGTGAGTTCTATTAAAAG
A

QA 4 782 4 782
DS 

RD RR4BV38JQ 803 0 0
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AGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATAACGCGATGT
CTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATATAAGA
GTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGCAGGTTTGTCTTAAACATTACCAAGATGGCTATGAGT
GGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTTCAGATGATT
TGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAA*GGCGAAATA
AATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCTTACATGATT
AGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGGGCGGC
ACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTGTGAAAGGCT
CTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCCCTGTCTCAATAATGTTCT
ACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTAAGTGAGTTCTATTAAAAGAAAAGT
TAAGAATAAATACAGTTAGTTCC

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DS 

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CCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAA*GGCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATC
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AGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGGGCGGCACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATT
TTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTGTGAAAGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCAT
GAGAAAATACAATGTGCCCTGTCTCAATAATGTTTTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGC
AGTGAGGTGTTAAGTGAGTTTTATTAAAAG

QA 1 390 1 390
DS 



AS 2 7

CO CL1103Contig1 537 5 19 U
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CATCAAATATTTGAGTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BU12JQ C 1
AF RR4B716TF U 17
AF RR4CK96JQ C 1
AF RR4BU12TF U 1
AF RR4CK96TF U 1
BS 1 21 RR4BU12TF
BS 22 51 RR4B716TF
BS 52 52 RR4BU12TF
BS 53 69 RR4B716TF
BS 70 70 RR4BU12TF
BS 71 157 RR4B716TF
BS 158 158 RR4BU12TF
BS 159 232 RR4B716TF
BS 233 233 RR4BU12TF
BS 234 270 RR4B716TF
BS 271 271 RR4BU12TF
BS 272 312 RR4B716TF
BS 313 313 RR4BU12TF
BS 314 326 RR4B716TF
BS 327 327 RR4BU12TF
BS 328 359 RR4B716TF
BS 360 360 RR4BU12TF
BS 361 487 RR4B716TF
BS 488 537 RR4BU12TF

RD RR4BU12JQ 537 0 0
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ATTTTCGTTACCAGTGCGACATTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCA
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CATCAAATATTTGAGTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4B716TF 472 0 0
GGAAG
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CGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCTTGAAATCTGCTGAGCTCGAGCAAAGGCC
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TTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCAAACCGATGGAATGTTTTGCAC
GCTTGTGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATCAAA
C

QA 6 471 6 471
DS 

RD RR4CK96JQ 537 0 0
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4BU12TF 537 0 0
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4CK96TF 537 0 0
GGGAAGAACATCCAAGAGAAAACGATCCATCTTTCTCATCTGCTACCTCTCAATCTCAGG
AAAAGAAAAGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACATGGACACGGAGGCGATTT
CAGAGCGAAGGTTTGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACCGTAGGCCCAAACACTGGCGTCG
CAACACAGCCCTTGCTATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCATGAAATC
TGCTGAGCTCGAGCAAAGGCCACACATGCCGGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTG
CAAGAACTTTGGCACCAAGGATGATTACGAAAAAGAGCATTGATTCTAAAAGCCTTTTTG
ATTTTCGTTACCAGTGCGACATTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCA
AACCGATGGAATGTTTTGCACGCTTGTGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTT
CATCAAATATTTGAGTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTC

QA 1 537 1 537
DS 



CO CL1103Contig2 560 2 2 U
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AGAAAAGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGACACGGAGGCGATTTCAG
AGCGAAGGTTTGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAA
CACAGCCCTTGCCATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCATGAAATCTGC
TGAGCTCGAGCAAAGGCCACACATGCCTGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTGCAA
GAACTTTGGTACCAAGGATGATTACGAAAAAGCGCATTGATTCTAAAAACCTTTTTCATT
TTCGTTACTAGTGTGACATTAATCCATAATAGTATGTCTTTGCTGGAACCCTCTCAAACC
GGTGGAATGTTTTGCACGCTTTTGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATC
AAACATTTGAGTTTTGCTTTGATGTATCGCAACAACTATAAAAACAATTCTTATCAAACT
CTATCTGCATCAGATACTCC


BQ
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AGAAAAGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGACACGGAGGCGATTTCAG
AGCGAAGGTTTGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAA
CACAGCCCTTGCCATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCATGAAATCTGC
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GAACTTTGGTACCAAGGATGATTACGAAAAAGCGCATTGATTCTAAAAACCTTTTTCATT
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GGTGGAATGTTTTGCACGCTTTTGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATC
AAACATTTGAGTTTTGCTTTGATGTATCGCAACAACTATAAAAACAATTCTTATCAAACT
CTATCTGCATCAGATACTCC

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DS 

RD RR4DG19TF 560 0 0
GGGAAG
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GGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGACACGGAGGCGATTTCAGAGCGAA
GGTTTGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAACACAGC
CCTTGCCATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCATGAAATCTGCTGAGCT
CGAGCAAAGGCCACACATGCCTGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTGCAAGAACTT
TGGTACCAAGGATGATTACGAAAAAGCGCATTGATTCTAAAAACCTTTTTCATTTTCGTT
ACTAGTGTGACATTAATCCATAATAGTATGTCTTTGCTGGAACCCTCTCAAACCGGTGGA
ATGTTTTGCACGCTTTTGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATCAAACAT
TTGAGTTTTGCTTTGATGTATCGCAACAACTATAAAAACAATTCTTATCAAACTCTATCT
GCATCAGATACTCC

QA 7 560 7 560
DS 



AS 2 5

CO CL1104Contig1 1496 3 9 U
GGAATACCCTCTGCTTCTTCTGCCTCTCTCTCTAACCTCTCAGCGAAGAAAGAATGTCGA
TTCCTTGTCTGACAGAAGAGACGGCCAAATCAGTGCTACGCCAGGTGGAGTTCTACTTCA
GTGATAGTAATCTCCCGATTGATGATTTCCTCAAGAAGACTGTTGAGAGAGCGAAGATGG
ATTGGTTAGTTTGGGGTTGATATGTTCCTTCAGTAAGATGAGAGCGTATTTGAAGTTGGG
TGATTCCAAAGGAGATGAGGTTCCTGAAGATACCATCAAAGCTGTTGCTGATACTCTTCG
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GTTGAAGCTAGAAGATTTGATTGAACAGCTTAATGCTAGAACTGTAGCTGTTTCACCCTT
CTCCTATGATGTTAAGAGGGAAGACGTGGAAGCATTCTTCAGTCAGTACGGAAAGGTTAA
TAGTGTGAGGATGCCTCGTCATGTAGCTGAGACGAGAGTGTTTAGTGGTGTTGCATTGGT
TGAGTTCCCTACTGAAGAGGAGGCCCAGAATGTTATGAAGCAAAATTTGGTCTTTGCTGG
TCTCGAGTTGGAGATGAAAACAAAGAAAGAGTTTGATGATGAAAGGGAGAAAGATGAAGA
AAAGTTTGCTAACTACCGTCCTCAAAAGGCTTCTGCAAATCAGAAGAACGGCTCTGACCA
CAGGAACGGTTCTGAATCCGAGGCAAACTATCCCAAGGGTTTGATCATTTCCTTCACTCT
AAAGCGCTCAACTGAAGAAGGTGCTAAAGAAAAGAGTTCTGAGGAGGCAGCTGATAAAAA
AATGGAGGAAAGTGAATCAAAGCCGGAAGATAATCCTGCTGCGGACAAAGAAAACACTGA
CAAGTCACAGGGACAAGGAACAGAGGGGGAAGATGATGATGGTGAGAAAGAAGAAAAGGG
TGGTGCTCTAGCTACCCATAAGGATAATAAAGATGTTGTCTTGCGTGAGGATCTTAAGGC
CGTTTTTGGAAAATTCGGTGATGTCAAGTTTGTTGATTTCAAGATGGGATTTGAGACGGG
TTACCTAAGGTTTGATGAACCAGAAGCATCCCAGAAAGCCCGTGCTGCTGCAGTATTAGC
TAAAGAAGGCGGACTAGCCGTGAAGAATTTTATAGCTGTCCTAGAACCTCTTACAGGCGA
AGCTGAAAAGGAGTACTGGGGTCTTCTTCGCAGCAAAGACAGGTTTGACAAGGGTGGCCG
TGGAGGAAGGGGAGGAAAACGAGGAGGAAGATTCGGGAGAAAGAGGGGATCTGATTCCCC
CGGTGGTCGCTGGAACAAATCTCAGAAGGTTGAAGCATGATTACACACTTTGTTTCTAGT
CTCGTTTTCTCTTTTTATAGCTCGTGACTTGTTGCTTCTCAATCTATGTGTAACCTCACA
GCCGAAACCTTTTATCATCTACTTGTTACATGTTGTGATGCTATAACTATTAAGTC


BQ
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AF RR4A570TF U 1
AF RR4ER31TF U 262
AF RR4A570JQ C 681
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BS 901 1496 RR4A570JQ

RD RR4A570TF 684 0 0
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TTCCTTGTCTGACAGAAGAGACGGCCAAATCAGTGCTACGCCAGGTGGAGTTCTACTTCA
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CACCTCCAAGGCTCTCAAGGTTTCTGAAGATGGGAAAAAGGTGGGTAGGAGTACAGAACT
GTTGAAGCTAGAAGATTTGATTGAACAGCTTAATGCTAGAACTGTAGCTGTTTCACCCTT
CTCGTATGATGTTAAGAGGGAAGACGTGGAAGCATTCTTCAGTCAGTACGGAAAGGTTAA
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TCTCGAGTTGGAGATGAAAACAAAGAAAGAGTTTGATGATGAAAGGGAGAAAGATGAAGA
AAAGTTTGCTAACTACCGTCCTCA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4ER31TF 639 0 0
TCCTGAAGATACCATCAAAGCTGTTGCTGATACTCTTCGCACCTCCAAGGCTCTCAAGGT
TTCTGAAGATGGGAAAAAGGTTGGTAGGAGTACAGAACTGTTGAAGCTAGAAGATTTGAT
TGAACAGCTTAATGCTAGAACTGTAGCTGTTTCACCCTTCTCCTATGATGTTAAGAGGGA
AGACGTGGAAGCGTTCTTCAGTCAGTATGGAAAGGTTAATAGTGTGAGGATGCCTCGTCA
TGTAGCTGAGACGAGAGTGTTTAGTGGTGTTGCATTGGTTGAGTTCCCTACTGAAGAGGA
GGCCCAGAATGTTATGAAGCAAAATTTGGTCTTTGCTGGTCTCGAGTTGGAGATGAAAAC
AAAGAAAGAGTTTGATGATGAAAGGGAGAAAGATGAAGAAAAGTTTGCTAACTACCGTCC
TCAAAAGGCTTCTGCAAATCAGAAGAACGGCTCTGACCACAGGAACGGTTCTGAATCCGA
GGCAAACTATCCCAAGGGTTTGATCATTTCCTTCACTCTGAAGCGCTCAACTGAAGAAGG
TGCTAAAGAAAAGAGTTCTGAGGAGGCAGCTGATAAAAAAATGGAGGAAAGTGAATCAAA
GCCGGAAGATAATCCTGCTGCGGACAAAGAAAACACTGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4A570JQ 816 0 0
CTCAAAAGGCTTCTGCAAATCAGAAGAACGGCTCTGACCACAGGAACGGTTCTGAATCCG
AGGCAAACTATCCCAAGGGTTTGATCATTTCCTTCACTCTAAAGCGCTCGACTGAAGAAG
GTGCTCAAGAAAAGAGTTCTGAGGAGGCAGCTGATAAAAAAATGGAGGAAAGTGAATCAA
AGCCGGAAGATAATCCTGCTGCGGATAAAGAAAACACTGACAAGTCACAGGGACAAGGAA
CAGAGGGGGAAGATGATGATGGTGAGAAAGAAGAAAAGGGTGGTGCTCTAGCTACCCATA
AGGATAATAAAGATGTTGTCTTGCGTGAGGATCTTAAGGCCGTTTTTGGAAAATTCGGTG
ATGTCAAGTTTGTTGATTTCAAGATGGGATTTGAGACGGGTTACCTAAGGTTTGATGAAC
CAGAAGCATCCCAGAAAGCCCGTGCTGCTGCAGTATTAGCTAAAGAAGGCGGACTAGCCG
TGAAGAATTTTATAGCTGTCCTAGAACCTCTTACAGGCGAAGCTGAAAAGGAGTACTGGG
GTCTTCTTCGCAGCAAAGACAGGTTTGACAAGGGTGGCCGTGGAGGAAGGGGAGGAAAAC
GAGGAGGAAGATTCGGGAGAAAGAGGGGATCTGATTCCCCCGGTGGTCGCTGGAACAAAT
CTCAGAAGGTTGAAGCATGATTACACACTTTGTTTCTAGTCTCGTTTTCTCTTTTTATAG
CTCGTGACTTGTTGCTTCTCAATCTATGTGTAACCTCACAGCCGAAACCTTTTATCATCT
ACTTGTTACATGTTGTGATGCTATAACTATTAAGTC

QA 1 816 1 816
DS 



CO CL1104Contig2 571 2 3 U
GGAGAGGGTGCTCTTGCTACCCATAAAGATAATAAAGATGTTGTCTTGCGTGAAGATCTT
AAGGCTGTATTTGGAAAATTCGGTGATGTCAAGTTTGTGGATTTCAAGATGGGATTTGAG
ACGGGTTACCTAAGGTTTGATGAACCAGAAGCATCCCAGAAAGCCCGTGCTGCTGCAGTA
TTAGCTAAAGAAGGCGGACTAGCCGTGAAGAATTTTATAGCTGTTTTAGAACCTTTTACA
GGCGAAGCTGAAAAGGAGTACTGGGGTTTTCTTCGCAGCAAAGACAGGTTTGACAAGGGT
GGCCGTGGAGGAAGGGGAGGAAAACGAGGAGGAGGGAGATTCGGGAGAAAGAGGGGATCT
GATTCCCCGGGTGGTCGCTGGAACAAATCTCAGAAGGTGGAAGCATGATTACACACATTG
TTTCTACTCTCGTTTTCTCTTTTATAGCTCGTGACTTGTTGCTTCTGCTTTATCTATGTG
TAACCTCACAGCCGAAACCTTTTATCATCTACTTGTGACATGTTGTGATGCTATAACTAT
AAATCAGCAATTAAATTTTGCTTAGATCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB13TF U 384
AF RR4DK51JQ C 1
BS 1 390 RR4DK51JQ
BS 391 540 RR4EB13TF
BS 541 571 RR4DK51JQ

RD RR4EB13TF 162 0 0
GGACAGA
CAGAAGGTGGAAGCATGATTACACACATTGTTTCTACTCTCGTTTTCTCTTTTATAGCTC
GTGACTTGTTGCTTCTGCTTTATCTATGTGTAACCTCACAGCCGAAACCTTTTATCATCT
ACTTGTGACATGTTGTGATGCTATAACTAT
AAATC

QA 8 157 8 157
DS 

RD RR4DK51JQ 571 0 0
GGAGAGGGTGCTCTTGCTACCCATAAAGATAATAAAGATGTTGTCTTGCGTGAAGATCTT
AAGGCTGTATTTGGAAAATTCGGTGATGTCAAGTTTGTGGATTTCAAGATGGGATTTGAG
ACGGGTTACCTAAGGTTTGATGAACCAGAAGCATCCCAGAAAGCCCGTGCTGCTGCAGTA
TTAGCTAAAGAAGGCGGACTAGCCGTGAAGAATTTTATAGCTGTTTTAGAACCTTTTACA
GGCGAAGCTGAAAAGGAGTACTGGGGTTTTCTTCGCAGCAAAGACAGGTTTGACAAGGGT
GGCCGTGGAGGAAGGGGAGGAAAACGAGGAGGAGGGAGATTCGGGAGAAAGAGGGGATCT
GATTCCCCGGGTGGTCGCTGGAACAAATCTCAGAAGGTGGAAGCATGATTACACACATTG
TTTCTACTCTCGTTTTCTCTTTTATAGCTCGTGACTTGTTGCTTTTGCTTTATCTATGTG
TAACCTCACAGCCGAAACCTTTTATCATCTACTTGTGACATGTTGTGATGCTATAACTAT
AAATCAGCAATTAAATTTTGCTTAGATCAGG

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 7

CO CL1105Contig1 653 7 5 U
GGATTATTCTTCAAGGATAAGAAACGCGCTTTACGAATCCTTATATATAAATGTATATAT
AGTACAGCAGATTAGAAGACATAGCAACGAATCAAAATAATCAACAGAGAGAAAGGAAGG
AAGCAGGCGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTGGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCA
AATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAG
AAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCG
GGAACGATGCACCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAG
GCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGCACTTCAACCACGTT
CGCGATGTTTAAATGCGAGTAAACACATCTCAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTTGTTTAA
CCAAAGTATATTTTAAATAAGTGAATGTGAATCCAGTCCATGTGTTT*GATTTGATGGGA
TGTGTACGGAACTGGTGATTTGTGTATCTCTCTGACTTTCGTTTGTGTATTATTTCAAGT
TGTCACTTTATTATACCTATCTACCATATGATTTTACGAGACATTATGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H913TF U 76
AF RR4D682TF U 1
AF RR4D682JQ C 12
AF RR4BO81JQ C 44
AF RR4BO81TF U 44
AF RR4B108JQ C 87
AF RR4B108TF U 87
BS 1 184 RR4D682TF
BS 185 185 RR4BO81TF
BS 186 611 RR4D682TF
BS 612 612 RR4BO81TF
BS 613 653 RR4B108TF

RD RR4H913TF 274 0 0
GG
GACATAGCAATGAATCAAAATAATCAACAGAGAGAAAGGAAGGAAGCAGGCGATAATGGC
GGATCAAGGAACAGTCGTGGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCA
AGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACT
GGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCACCATCT
CACCGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATA

QA 3 274 3 274
DS 

RD RR4D682TF 611 0 0
GGATTATTCTTCAAGGATAAGAAACGCGCTTTACGAATCCTTATATATAAATGTATATAT
AGTACAGCAGATTAGAAGACATAGCAACGAATCAAAATAATCAACAGAGAGAAAGGAAGG
AAGCAGGCGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTGGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCA
AATGGAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAG
AAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCG
GGAACGATGCACCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAG
GCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGCACTTCAACCACGTT
CGCGATGTTTAAATGCGAGTAAACACATCTCAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTTGTTTAA
CCAAAGTATATTTTAAATAAGTGAATGTGAATCCAGTCCATGTGTTT*GATTTGATGGGA
TGTGTACGGAACTGGTGATTTGTGTATCTCTCTGACTTTCGTTTGTGTATTATTTCAAGT
TGTCACTTTAT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4D682JQ 601 0 0
CAAGGATAAGAAACGCGCTTTACGAATCCTTATATATAAATGTATATATAGTACAGCAGA
TTAGAAGACATAGCAACGAATCAAAATAATCAACAGAGAGAAAGGAAGGAAGCAGGCGAT
AATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTGGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGGAAATGA
TCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGT
GACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCA
CCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTTTACGAGGCCAAGGTTTT
GGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTA
AATGGGAGTAAACACATCTCAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTTGTTTAACCAAAGTATAT
TTTAAATAAGTGAATGTGAATCCAGTCCATGTGTTT*GATTTGATGGGATGTGTACGGAA
CTGGTGATTTGTGTATCTTTCTGACTTTCGTTTGTGTATTATTTCAAGTTGTCACTTTAT
C

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4BO81JQ 569 0 0
GGG
ATAAATGTATATATAGTACAGCAGATTAGAAGACATAGCAACGAATCAAAATAATCAACA
GAGAGAAAGGAAGGAAGCAGGCGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTGGGAGGAGTTC
GCGATATAGATCCAAATGCAAATGATTTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCG
GTGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAA
CACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCACCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGACCA
ATAAGGTTTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGC
ACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAAATGCGAGTAAACACATCTCAGGCTACGTGATAAG
AGTCCCTTGTTTAACCAAAGTATATTTTAAATAAGTGAATGTGAATCCAGTCCATGTGTT
T*GATTTGATGGGATGTATACGGAACTGGTGATTTGTGTATCTCTCTGACTTTCGTTTGT
GTATTATTTCAAGTTGTCACTTTATT

QA 4 569 4 569
DS 

RD RR4BO81TF 569 0 0
GGG
ATAAATGTATATATAGTACAGCAGATTAGAAGACATAGCAACGAATCAAAATAATCAACA
GAGAGAAAGGAAGGAAGCAGGCGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTGGGAGGAGTTC
GCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCG
GTGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAA
CACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCACCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGACCA
ATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGC
ACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAAATGCGAGTAAACACATCTCAGGCTACGTGATAAG
AGTCCCTTGTTTAACCAAAGTATATTTTAAATAAGTGAATGTGAATCCAGTCCATGTGTT
T*GATTTGATGGGATGTATACGGAACTGGTGATTTGTGTATCTCTCTGACTTTCGTTTGT
GTATTATTTCAAGTTGTCACTTTATT

QA 4 569 4 569
DS 

RD RR4B108JQ 567 0 0
GG
GAATCAAAATAATCAACAGAGAGAAAGGAAGGAAGCAGGCGATAATGGCGGATCAAGGAA
CAGTCGTGGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTC
TCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGA
GGCTCCTTGGTGCGAAAACGCAGGTTGTGGCGGGAACGATGCACCATCTCACCGTGGAGG
TGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGA
ATCTCAAGAAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAAATGCGAGTAAACACAT
CTCAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTTGTTTAACCAAAGTATATTTTAAATAAGTGAATGT
GAATCCAGTCCATGTGTTTCGATTTGATGGGATGTGTACGGAACTGGTGATTTGTGTATC
TCTCTGACTTTCGTTTGTGTATTATTTCAAGTTGTCACTTTATTATACCTATCTACCATA
TGATTTTACGAGACATTATGATGAC

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR4B108TF 567 0 0
GG
GAATCAAAATAATCAACAGAGAGAAAGGAAGGAAGCAGGCGATAATGGCGGATCAAGGAA
CAGTCGTGGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTC
TCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGA
GGCTCCTTGGTGCGAAAACGCAGGTTGTGGCGGGAACGATGCACCATCTCACCGTGGAGG
TGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGA
ATCTCAAGAAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAAATGCGAGTAAACACAT
CTCAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTTGTTTAACCAAAGTATATTTTAAATAAGTGAATGT
GAATCCAGTCCATGTGTTTCGATTTGATGGGATGTGTACGGAACTGGTGATTTGTGTATC
TCTCTGACTTTCGTTTGTGTATTATTTCAAGTTGTCACTTTATTATACCTATCTACCATA
TGATTTTACGAGACATTATGATGAC

QA 3 567 3 567
DS 



AS 1 6

CO CL1106Contig1 1000 6 7 U
GTGACCCAAAAAAAAACATAATCGTCAATATTAGCAAAACAAAACAATATACAGAGAGAT
GGCGACGACAACAACAGAAGCAACGAAGACATCTCCTACTAATGGAGAAGACAAGCAATC
TCAGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTA
CCAGTATATTCTGGAGACGAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAG
GGAAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGACGAAGGACAGTT
TCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACCATGGAGATCGGTGTTTACAC
TGGCTACTCTCTCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCTGATGACGGCAAAATTCTTGCTAT
GGACGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCTGGCGTTGC
TCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGA
CGAGAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTATAT
CAACTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGG*AGGAGTGATCGGCTACGACA
ACACTCTGTGGAACGGCTCCGTTGTGGCTCCTCCTGATGCGCCAATGAGGAAGTACGTTC
GTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCG
AGATCTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAATTGATTGA
TACCCATTTTTGAGTGTGGGTTGATTTCTTTCATTTCTCTATCTCTTTCATTCACCAACC
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TGTTTTGTTTGTGTTTTTCAATTTAAATATGATAAACAAG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RR4AZ59TF U 2
AF RR4C158JQ C 165
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GAA

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G
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G
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CGACGACAACAACAGAAGCAACGAAGACATCTCCTACTAATGGAGAAGACAAGCAATCTC
AGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACC
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AAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGACGAAGGACAGTTTC
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ACGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCTGGCGTTGCTC
ACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACG
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ACTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGG*AGGAGTGATCGGCTACGACAAC
ACTCTGTGGAACGGCTCCGTTGTGGCTCCTCCTGATGCGCCAATGAGGAAGTACGTTCGT
TACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGAG
ATCTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCG*ATCAATTGATTGATA
CCCA

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GCTGACCCTAGGATCGAGATCTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGT
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CTTTCATT

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AATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGC
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TCTTTCATTCACCAACCATCTTTAATGTATTTTGTTATGTAATATCTGTGAACAAAGAAA
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GTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCTGGCGTTGCTCAC
AAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAG
AAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTATATCAAC
TACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGG*AGGAGTGATCGGCTACGACAACAC
TCTGTGGAACGGCTCCGTTGTGGCTCCTCCTGATGCGCCAATGAGGAAGTACGTTCGTTA
CTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGAGAT
CTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAATTGATTGATACC
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TTAATGTATTTTGTTATGTAATATCTGTGAACAAAGAAATGATGTATCCTACCTTTTGTT
TTGTTTGTGTTTTTCAATTTAAATATGATAAACAAG

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DS 



AS 1 7

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AGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTC
ACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAA
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ATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACATGG
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TGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAA
GATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATATAG
TATACACATAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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GATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAAGGAGAAAAGAGAGATAGA
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GGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTTATTCCCAGGACTGCAGACAGTTGCGTCGGCAAAAT
CACTATGATTTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACT
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TAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATT
TCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTA
G

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CACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAA
TGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAA
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CACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAA
TGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAA
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T

QA 1 721 1 721
DS 

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A
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DS 

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ATTCCCAGGACTGCAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATTTGGGAGAAGCGCAAC
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GAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCA
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GTATACACAT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 7

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GCTAGGATACTGGAGTTTCAAGCATTTCATATCATGTCTAAGGTCATGACCAACAAGAAG
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GTAATCGGTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGAGTAGAAAAGATGACATGCTCGTCTTC
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TTCACAGTCAATTGCCACTGCCTTGAGACGTGAATTTACTACACCAAGAGTCCTAGTAGG
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CGAAAGTAAATCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E854JQ U 1
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AF RR4HB30JQB U 2
AF RR4E854TF C 608
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GA
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TACATCAAAAGAGGAGCTATTTATGAGAGGAACTTAAATTTCAACGGCGGTCAAGGCACC
AGCAGCGGTACTCTGATGTGGAGTTGTGGTACAGCTCTTCCGGCTTCATCTTCTCTAGAT
CGCTCTGTTTCCACGAGTTCAGTCCATCCCCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCCCTTTCCAT
GCTCTTGATCCCGCATTTTCTTGTACAGCCTCATCACAGATACGCAGTCCTCGTACGGCT
CGTGCTTCCCGCATTGTATCTTGTATCCGAAATATGACCTTGTGAGGTACTTGAGTGATT
GGCTTACAAGATTTGTTTTCATCAATGGCACGTATTTTGCTGTGTCTCTCAACAGATGGC
TAGGATACTGGAGTTTCAAGCATTTCATATCATGTCTAAGGTCATGACCAACAAGAA
GAA

QA 3 539 3 539
DS 

RD RR4DN52JQ 725 0 0
GCGCCTAAATCATTTTTTATTATACAAGTTCCTAAAGCAGAGGAGAGAGCTGTTGTTATC
ATCGTTTAGAATCAGTTTCCCAAAAAACACCCAGAGCTTTTTTTTTTCCTAAGAAAATGA
GTTACATCAAAAGAGGAGCTATTTATGAGAGGAACTTAGATTTCAACGGCGGTCAAGGCA
CCAGCAGCGGTACTCTGATGTGGAGTTGTGGTACAGCTCTTCCGGCTTCATCTTCTCTAG
ATCGCTCTGTTTCCACGAGTTCAGTCCATCCCCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCCCTTTCC
ATGCTCTTGATCCCGCATTTTCTTGTACAGCCTCATCACAGATACGCAGTCCTCGTACGG
CTCGTGCTTCCCGCATTGTATCTTGTATCCGAAATATGACCTTGTGAGGTACTCGAGTGA
TTGGCTTACAAGATTTGTTTTCATCAATGGCACGTATTTTGCTGTGTCTCTCAACAGATG
GCTAGGATACTGGAGTTTCAAGCATTTCATATCATGTCTAAGGTCATGACCAACAAGAAG
AAGCCTCCCAACCCCATCATTATGTCCACCGCACAAGATGGTTAAAACTTTTTCTCTTAC
ATCCTGAAGCCGCATACCATTCTTCAAATCTTCTTCGGTCAGTCCAGTTACCTTGTGTCT
GTAATCGGTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGAGTAGAAAAGATGACATGCTCGTCTTC
GTCAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4DV03JQ 767 0 0
GA
GCCTAAATCATTTTTTATTATACAAGTTCCTAAAGCAGAGGAGAGAGCTGTTGTTATCAT
CGTTTAGAATCAGTTTCCCAAAAAACACCCAGAGCTTTTTTTTTTCCTAAGAAAATGAGT
TACATCAAAAGAGGAGCTATTTATGAGAGGAACTTAGATTTCAACGGCGGTCAAGGCACC
AGCAGCGGTACTCTGATGTGGAGTTGTGGTACAGCTCTTCCGGCTTCATCTTCTCTAGAT
CGCTCTGTTTCCACGAGTTCAGTCCATCCCCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCCCTTTCCAT
GCTCTTGATCCCGCATTTTCTTGTACAGCCTCATCACAGATACGCAGTCCTCGTACGGCT
CGTGCTTCCCGCATTGTATCTTGTATCCGAGATATGACCTTGTGAGGTACTTGAGTGATT
GGCTTACAAGATTTGTTTTCATCAATGGCACGTATTTTGCTGTGTCTCTCAACAGATGGC
TAGGATACTGGAGTTTCAAGCATTTCATATCATGTCTAAGGTCATGACCAACAAGAAGAA
GCCTCCCAACCCCATCATTATGCCCACCGCACAAGATGGTTAAAACTTTTTCTCTTACAT
CCTGAAGCCGCATACCATTCTTCAAATCTTCTTCGGTCAGTCCAGTTACCTTGTGTCTGT
AATCGGTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGAGTAGAAAAGATGACATGCTCGTCTTCGT
CAACGAGGCAAATAGATGCGCAGAGATCAATAGACCCGTCATCAC

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR4HB30JQB 765 0 0
G
GCCTAAATCATTTTTTATTATACAAGTTCCTAAAGCAGAGGAGAGAGCTGTTGTTATCAT
CGTTTAGAATCAGTTTCCCAAAAAACACCCAGAGCTTTTTTTTTTCCTAAGAAAATGAGT
TACATCAAAAGAGGAGCTATTTATGAGAGGAACTTAGATTTCAACGGCGGTCAAGGCACC
AGCAGCGGTACTCTGATGTGGAGTTGTGGTACAGCTCTTCCGGCTTCATCTTCTCTAGAT
CGCTCTGTTTCCACGAGTTCAGTCCATCCCCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCCCTTTCCAT
GCTCTTGATCCCGCATTTTCTTGTACAGCCTCATCACAGATACGCAGTCCTCGTACGGCT
CGTGCTTCCCGCATTGTATCTTGTATCCGAAATATGACCTTGTGAGGTACTTGAGTGATT
GGCTTACAAGATTTGTTTTCATCAATGGCACGTATTTTGCTGTGTCTCTCAACAGATGGC
TAGGATACTGGAGTTTCAAGCATTTCATATCATGTCTAAGGTCATGACCAACAAGAAAAA
GCCTCCCAACCCCATCATTATGTCCACCGCACAAGATGGTTAAAACTTTTTCTCTTACAT
CCTGAAGCCGCATACCATTCAAAAAATCTTCTTCGGTCAGTCCAGTTACCTTGTGTCTGT
AATCGGTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGAGTAGAAAAGATGACATGCTCGTCTTCGT
CAACGAGGCAAATAGATGCGCAGAGATCAATAGACCCGTCATCA

QA 2 765 2 765
DS 

RD RR4E854TF 662 0 0
AGCCGCATACCATTCTTCAAATCTTCTTCGGTCAGTCCAGTTACCTTGTGTCTGTAATCG
GTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGAGTAGAAAAGATGACATGCTCGTCTTCGTCAACG
AGGCAAATAGATGCGCAGAGATCAATAGACCCGTCATCACCACCACCAACCATTTCACAG
TCAATTGCCACTGCCTTGAGACGTGAATTTACTACACCAAGAGTCCTAGTAGGATTGACA
AGAGGAAGAGGCGGAGGAAGAGGTGGAGAGAGGAGACACTCGTTTTGATGGTGAGCCAGA
GCAGTGGCGTCGTCAAAGATTTGAAGACAGAGCGAACAGCCTCGTTCAGAGAAAATGGAC
TTGCAGTCACCTTTGAATAGATGGTCCGGAACGTTAAGGTGTCCCCGAACAGATTCGAAG
GATTTACAATGCTTGAAGCAAACCCCACAGCGAGGCTGATGAAGGGAATGGTGAGAAATC
TTCATGTGCTCCACAAGGTGTTGGCGTCTATTGAACATCTTGTAGCAAGCAACGCATCTG
TGCCTTATCTTGGCGGTTTTGGGAGACATCAGGGGATGGACAATAGAAATCAAAGGCGAT
TCGCTGGAAGAAGATTAAACGTTAAACCGTCCTGCTGCAGCTGCTGAGTACTCCGAAAGT
CC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4DV03TF 635 0 0
TCGGTCAGTCCAGTTACTTTGTGTCTGTAATCGGTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGA
GTAGAAAAGATGACATGCTCGTCTTCGTCAACGAGGCAAATAGATGCGCAGAGATCAATA
GACCCGTCATCACCACCACCAACCATTTCACAGTCAATTGCCACTGCCTTGAGACGTGAA
TTTACTACACCAAGAGTCCTAGTAGGATTGACAAGAGGAAGAGGCGGAGGAAGAGGTGGA
GAGAGGAGACACTCGTTTTGATGGTGAGCCAGAGCAGTGGCGTCGTCAAAGATTTGAAGA
CAGAGCGAACAGCCTCGTTCAGAGAAAATGGACTTGCAGTCACCTTTGAATAGATGGTCC
GGAACGTTAAGGTGTCCCCGAACAGATTCGAAGGATTTACAATGCTTGAAGCAAACCCCA
CAGCGAGGCTGATGAAGGGAATGGTGAGAAATCTTCATGTGCTCCACAAGGTGTTGGCGT
CTATTGAACATCTTGTAGCAAGCAACGCATCTGTGCCTTATCTTGGCGGTTTTGGGAGAC
ATCAGGGGATGGACAATAGAAATCAAAGGCGATTCGCTGGAAGAAGATTAAACGTTAAAC
CGTCCTGCTGCAGCTGCTGAGTACTCCGAAAGT
CC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4DN52TF 618 0 0
TGTCTGTAATCGGTGACAGGGAGTTGGGGCTGGACGTGAGTAGAAAAGATGACATGCTCG
TCTTCGTCAACGAGGCAAATAGATGCGCAGAGATCAATAGACCCGTCATCACCACCACCA
ACCATTTCACAGTCAATTGCCACTGCCTTGAGACGTGAATTTACTACACCAAGAGTCCTA
GTAGGATTGACAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGTGGAGAGAGGAGACACTTGTTTTGA
TGGTGAGCCAGAGCAGTGGCGTCGTCAAAGATTTGAAGACAGAGCGAACAGCCTCGTTCA
GAGAAAATGGACTTGCAGTCACCTTTGAATAGATGGTCCGGAACGTTAAGGTGTTCCCGA
ACAGATTCGAGGGATTTACAATGCTTGAAGCAAACCCCACAGCGAGGCTGATGAAGGGAA
TGGTGAGAAATCTTCATGTGCTCCACAAGGTGTTGGCGTCTATTGAACATCTTGTAGCAA
GCAACGCATCTGTGCCTTATCTTGGCGGTTTTGGGAGACATCAGGGGATGGACAATAGAA
ATCAAAGGCGATTCGCTGGAAGAAGATTAAACGTTAAACCGTCCTGCTGCAGCTGCTGAG
TACTCCGAAAGTAAATCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 2 7

CO CL1109Contig1 521 5 5 U
TTTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTA
ATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAAC
TCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTAC
GGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTG
TTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAA
GAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATT
GGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCT
GCATTGTGGTATATGATAGCATTTATCACACGTGTCGTTTTTTGTGCATTCCATAGTATG
TTACATTTCAAAATGCCCATTAATGAATCTTCTACACTCCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX59JQ C 1
AF RR4FX59TF U 1
AF RR4DG46JQ C 1
AF RR4DG46TF U 1
AF RR4DS65TF U 25
BS 1 165 RR4FX59TF
BS 166 166 RR4DG46TF
BS 167 444 RR4FX59TF
BS 445 509 RR4DG46TF
BS 510 521 RR4DS65TF

RD RR4FX59JQ 444 0 0
TTTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTA
ATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAAC
TCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTTTTCGGCGAATGGGCTGTGGATTAC
GGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTG
TTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAA
GAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATT
GGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCT
GCATTGTGGTATATGATAGCATTT

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR4FX59TF 444 0 0
TTTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTA
ATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAAC
TCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAATGGGCTGTGGATTAC
GGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTG
TTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAA
GAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATT
GGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCT
GCATTGTGGTATATGATAGCATTT

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR4DG46JQ 509 0 0
TTTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTA
ATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAAC
TCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTTTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTAC
GGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTG
TTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAA
GAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATT
GGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGATCTGATTAATTGAATTTTCT
GCATTGTGGTATATGATAGCATTTATCACACGTGTCGTTTTTTGTGCATTCCATAGTATG
TTACATTTCAAAATGCCCATTAATGAATC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4DG46TF 509 0 0
TTTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTA
ATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAAC
TCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTAC
GGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTG
TTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAA
GAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATT
GGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGATCTGATTAATTGAATTTTCT
GCATTGTGGTATATGATAGCATTTATCACACGTGTCGTTTTTTGTGCATTCCATAGTATG
TTACATTTCAAAATGCCCATTAATGAATC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4DS65TF 497 0 0
GG
GCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCT
CGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGC
CGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAA
GAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATG
AGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAAGAAGGAAGTGAAACTTTCCTTGTTGT
TTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATTGGGATGATTTTAATACTTTCACCTAA
AGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCTGCATTGTGGTATATGATAGCATTTAT
CACACGTGTCGTTTTTTGTGCATTCCATAGTATGTTACATTTCAAAATGCCCATAAATGA
ATCTTCTACACTCCC

QA 3 497 3 497
DS 



CO CL1109Contig2 479 2 1 U
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GAAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGGTC
ATGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGG
GCTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAA
GACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTT
CTCAGACTAAAAGAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTT
CAATAAATCATTGGGATTATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACCGTTCTGATTA
ATTGAATTTTCTGCATTGTGGTATATGATAGCATTTATCACACGTGTCGTTTTTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FG75TF U 1
AF RR4FG75JQ C 165
BS 1 479 RR4FG75TF

RD RR4FG75TF 479 0 0
TTTTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAGAGATCAGGTGCCAGAATCAA
GAAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGGTC
ATGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGG
GCTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAA
GACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTT
CTCAGACTAAAAGAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTT
CAATAAATCATTGGGATTATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACCGTTCTGATTA
ATTGAATTTTCTGCATTGTGGTATATGATAGCATTTATCACACGTGTCGTTTTTTGTGC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4FG75JQ 315 0 0
TTTT
TTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGG
AAACGGTACGAAGACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCC
TTTACGAATCTTCTCAGACTAAAAGAAGGAAATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTC
GCTTCTCTTGTTCAATAAATCATTGGGATTATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTA
CCGTTCTGATTAATTGAATTTTCTGCATTGTGGTATATGATAGCATTTATCACACGTGTC
GTTTTTTGTGC

QA 5 315 5 315
DS 



AS 1 7

CO CL1110Contig1 951 7 18 U
TTTTTTGGGAAATTTCAAGAAGACTGGTCATGTTAATTGTTTTTGAACGTGTCTTTGCAG
ATTAATAGCAGTTTCTAGTGGTAGATCAGATCATCAAGAAAGGGTTTTGAGAATGTCGAC
AAACATATTCTGGCAAGAATCACCCATTGGGAAAACTGAGAGGCAGAAGCTGATAAACCA
GAAGGGTTGTGTGGTGTGGATCACAGGGCTCAGTGGCTCAGGAAAAAGCACGTTGGCTTG
CTCGCTAAGTAGAGAGTTGTACACCCGGGGAAAGCTATCATACATTCTTGATGGGGATAA
TCTTCGTCATGGTTTGAACAAAGATCTTGGTTTCAAGGCAGAGGATAGAGTGGAAAACAT
ACGCAGAGTCGGAGAAGTAGCAAAACTCTTTGCTGATGCTGGTTTGATCTGCATTGCTAG
CCTCATATCTCCATACAGGAAAGACCGTGATGCTTGTAGGGAAATGATGCAGGGTTCATC
TTTTATCGAGGTTTACATGAACATGTCTCTACAACTATGTGAAGCAAGAGACCCTAAAGG
CTTGTACAAGCTTGCACGTGCAGGAAAGATCAAAGGTTTCACAGGAATAGATGATCCATA
TGAATCTCCCTTGAATTGTGAGATAGAGCTGAAAGAGAAGGAAGGAGAGTGTCCTTCACC
TGTAGCAATGGCAGAGGAAGTCATCGCTTATTTAGAAGCCAAAGGCTTCCTTCAAAACCA
GTAGTAGTAACCCCTCCACCACCATGAATCCATCCAAGTCCCATTTGATTTTCCATTTCT
CTCTAAAAGTGTTTACTGCTTTCTTTATGTTTTTTCTTTCACTCTCCTGATAAAAATGCA
TATCATAAAGAAGATTGAACTATGAAAGACATGTTATAGCTTCTTCATTTGCAACTTTTT
TTTCTTGTTCTTTTTACACATAAGGAAATAATAAAAGCAAACAAGTCATTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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TG

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C

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DS 



AS 1 6

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G689TF U 1
AF RR4BO04TF U 140
AF RR4G689JQ C 433
AF RR4GR47JQ C 656
AF RR4GR47TF U 656
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CACTCCATCAGCTCCTTCGTCTTCTCTATCTCTCTCTCGAGAGAGATTCACGTAACACAA
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GGGAAACTCGGTGTCCAGTTACACACCGATTCAG*CTTCTTGACGATTCTTCA*GACGAC
GAAAA

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DS 

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ATCAACCATGGAGTTCCACTGTCTTTGATGTCTGACATGAAGAAGACCGTTATCGATCTC
TTCGAACGTCCGCACGAGGTGAAAGTGCGTAACACAGACGTGTTACTAGGGAGTGGTTAC
AGGGCTCCTAACGAAATTAATCCTTATTACGAAGCGTTAGGTCTCTACGACATGGCTTCT
CCTCGAGCAGTCAACACGTTTTGTGACCAGCTCGAGGCTTCTGTGGATCAAAGGGACATA
ATGGTAAAATATGCGAAAGCTATCGATGGACTTGCAAAGGATTTAGCAAGGAGGTTAGCA
GAGAGCTACGGCTTAGCCGAGACCAACTTCTTCGAAGGGTGGCCGAGCCAGTTCCGGATC
AACAAGTATCATTTCCAACCAGAAACGGTCGGGAAACTCGGTGTCCAGTTACACACCGAT
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CATTCTTCGGGAACGTTCTTTCCCATTAGCCCCTTGCCGAACACTTTGGCTATCAACCTC
GGCGACATGGCTACGATATGGAGCAATGG

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GTCCAGTTACACACCGATTCAGGCTTCTTGACGATTCTTCAAGACGACGAAAACGTCGGT
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T

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G
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TGGGAGGTTGTGCAACGTGAAGCATAGAGTGCAATGCAACGAAGCGA***AGAGGTTTTC
TATCGCTTCTTTTTT*GTTAGGACCGATTGATACAGATTTGGAGCCGCCTAGTGAGTTCG
TGGATGCCCAACATCCCCGTCTATACATG*CTATTAGTCACGACGGGATACGGAATATTA
GAACGACTACGAAGATTCATGATGGAGAAGCTCTCAAGCTTATAACCTATGAATGATGAA
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TCCTGTTATGTATAAGTTCCACTAAGATTGAGAAATAGAGGTTGCAGACTTGTCTTAAAT
AATTGTTACAATTGAGATCTTTCTCTTTGTGGATGCAATACTTCTCT

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DS 

RD RR4GR47TF 588 0 0
G
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CGACGAAAACGTCGGTGGGCTCGAAGCTATGGACCATTCTTCGGGAACGTTCTTTCCCAT
TAGCCCCTTGCCGAACACTTTGGCTATCAACCTCGGCGACATGGCTACGATATAGAGCAA
TGGGAGGTTGTGCAACGTGAAGCATAGAGTGCAATGCAACGAAGCGA***AGAGGTTTTC
TATCGCTTCTTTTTT*GTTAGGACCGATTGATACAGATTTGGAGCCGCCTAGTGAGTTCG
TGGATGCCCAACATCCCCGTCTATACATG*CTATTAGTCACGACGGGATACGGAATATTA
GAACGACTACGAAGATTCATGATGGAGAAGCTCTCAAGCTTATAACCTATGAATGATGAA
TGACAGATTTTAAATGACGTGAAAAGCAAGGTTTAAAATGGTTGCAGAAAATTTTAGTAT
TCCTGTTATGTATAAGTTCCACTAAGATTGAGAAATAGAGGTTGCAGACTTGTCTTAAAT
AATTGTTACAATTGAGATCTTTCTCTTTGTGGATGCAATACTTCTCT

QA 2 588 2 588
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AGAGCCGCCTAGTGAGTTCGTGGATGCCCAACATCCCCGTCTATACAAGGCTATTAGTCA
CGACGGGATACGGAATATTAGAACGACTACGAAGATTCATGATGGAGAAGCTCTCAAGCT
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GTTGCAGACTTGTCACAAATAATTGTTACAATTGAGATCTTTTTCTTTGTGGATGCAATA
CTTCTCTAAATCTTATGTAATGGACTACTACTCCAATAGACTGGTATTGTAGTGGAAGAG
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 2 7

CO CL1112Contig1 1138 5 18 U
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AGAAAACCGGATTTTTTAAGTTTCAATCAACCAAAAATCAAACCGAACATATATTTGGAG
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CGGAAAGAAAACAAGCTGGTCATACAAAACTGTTTTTTT*TCTTCTTCTTTTGGCAGAAA
GACCAGACAACAGGAACATCAGTTTATCTTTGCGTTTGTGAAGTCCATCTCTGGATGCTG
AGACATGAATTTCTTGAGAATGTCCTGCTTTTGTAGCTCGTCGCTTGTTGGAAGACCCAT
TTGCTTTTGCCTTTGATCAAACATCATCTTCTCAACGGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAAG
GTCAGCTAATTTACTGTTCTCCGGTTCAACCTTCTGTGTATCGATCTCAGGTTCACCTTT
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TTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGAACGGTAGAGCTCTCCATC
GACGATTGGATCCTGGCCTTTGAGACCAAGCTTAAGACGGTTCTTCTTAATCTCGCATAC
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CTGGACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATACCCATTACCCTTGTTAGGAGCAATGGGACT
AGCTTCTTGTTTCTTCTCCTCCACTTTAGTGGGCTCTGAGGTTGAAGCAGCCATGTTTGG
CTTCTCCTTCACCACAGGCTTCTTCTTCTCAACACTCTCTTTCTTCTCAGGCTTTCTCAG
CTTCTCCTTCGCCGCCCTAACCGCGGCGGCGATCTCTTCCTCAGCGGAGGGTTTCTTGAG
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AGAATCGAGTGTCGCCCTAAACGGTAAGATCGAGGGTCGGGTGCTGCTTTCATCTTCAAC
CTCGGAGATGATCGCCATTGTTGTGTTTTTTTTTTTTCGTTTCTAGGGTTTTGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR14JQ U 72
AF RR4E403JQ U 1
AF RR4EE34JQ U 96
AF RR4EE34TF C 455
AF RR4FR14TF C 481
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BS 283 458 RR4E403JQ
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TCTTCCACCAAGACAAAACAAAAGCAGGAACATGTTTTTAAGGATGCAACGGAAAGAAAA
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TCTTGAGAATGTCCTGCTTTTGTAGCTCGTCGCTTGTTGGAAGACCCATTTGCTTTTGCC
TTTGATCAAACATCATCTTCACAACGGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAGGGTCAGCTAATT
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TCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAGCAGAATCGAAATCATCTTTTGATCCTCGA
TATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGAACGGTAG

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DS 

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AGAAAACCGGATTTTTTAAGTTTCAATCAACCAAAAATCAAACCGAACATATATTTGGAG
ATGAAACTGTGTCTTCCACCAAGACAAAACAAAAGCAGGAACATGTTTTTAAGGATGCAA
CGGAAAGAAAACAAGCTGGTCATACAAAACTGTTTTTT**TCTTCTTCTTTTGGCAGAGA
GACCAGACAACAGGAACATCAGTTTATCTTTGCGTTTGTGAGGTCCATCTCTGGATGCTG
AGACATGAATTTCTTGAGAATGTCCTGCTTTTGTAGCTCGTCGCTTGTTGGAAGACCCAT
TTGCTTTTGCCTTTGATCAAACATCATCTTCTCAACGGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAAG
GTCAGCTAATTTACTGTTCTCCGGTTCAACCTTCTGTGCATCGATCTCAGGTTCACCTTT
CACACAGCATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAGCAGAATCGAAATCATCTT
TTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGAACGGTAGAGCTCTCCATC
GATGATTGGATCCTGGCCTTTGAGACCAAGCTTAAGACGGTTCTTCTTAATCTCGCATAC
AACAGAGCGTGCTTTAGTGCCACTAGGGACTGGAATGTTAACAGTAACCTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EE34JQ 651 0 0
AATCAAACCGAACATATATTTGGAGATGAAACTGTGTCTTCCACCAAGACAAAACAAAAG
CAGGAACATGTTTTTAAGGATGCAACGGAAAGAAAACAAGCTGGTCATACAAAACTGTTT
TTTT*TCTTCTTCTTTTGGCAGAAAGACCAGACAACAGGAACATCAGTTTATCTTTGCGT
TTGTGAAGTCCATCTCTGGATGCTGAGACATGAATTTCTTGAGAATGTCCTGCTTTTGTA
GCTCGTCGCTTGTTGGAAGACCCATTTGCTTTTGCCTTTGATCAAACATCATCTTCTCAA
CGGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAAGGTCAGCTAATTTACTGTTCTCCGGTTCAACCTTCT
GTGTATCGATCTCAGGTTCACCTTTCACACAGCATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCT
TAGTCAGCAGAATCGAAATCATCTTTTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAATCATCAGGCT
TCACAGAACGGTAGAGCTCTCCATCGACGATTGGATCCTGGCCTTTGAGACCAAGCTTAA
GACGGTTCTTCTTAATCTCGCATACAACAGAGCGTGCTTTAGTGCCACTAGGGACTGGAA
TGTTAACAGTAACCTCCTGAAGGGTCTGGACCCATGAGTAGCTCTCA
GATC

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DS 

RD RR4EE34TF 684 0 0
TGTGTATCGATCTCAGGTTCAC*TTTCACACAGCATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGC
TTAGTCAGCAGAATCGAAATCATCTTTTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAATCATCAGGC
TTCACAGAACGGTAGAGCTCTCCATCGACGATTGGATCCTGGCCTTTGAGACCAAGCTTA
AGACGGTTCTTCTTAATCTCGCATACAACAGAGCGTGCTTTAGTGCCACTAGGGACTGGA
ATGTTAACAGTAACCTCCTGAAGGGTCTGGACCCATGAGTAGCTCTCAGGATCATACCCA
TTACCCTTGTTAGGAGCAATGGGACTAGCTTCTTGTTTCTTCTCCTCCAGTTTAGTGGGC
TCTGAGGTTGAAGCGGCCATGTTTGGCTTCTCCTTCACCACAGGCTTCTTCTTCTCAACA
CTCTCTTTCTTCTCAGGCTTTCTCAGCTTCTCCTTCGCCGCCCTAACCGCGGCGGCGATC
TCTTCCTCAGCGGAGGGTTTCTTGAGAAAATCGCTCTGTTCGCCGAGAAAGTTGAAGACT
TTCTCTAGAAAAACTAATGGGTTCGAAGAATCGAGTGTCGCCCTAAACGGTAAGATCGAG
GGTCGGGTGCTGCTTTCATCTTCAACCTCGGAGATGATCGCCATTGTTGTGTTTTTTTTT
TTTCGTTTCTAGGGTTTTGCTCCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4FR14TF 624 0 0
CACACAGCATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAGCAGAATCGAAATCATCTT
TTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGAACGGTAGAGCTCTCCATC
GATGATTGGATCCTGGCCTTTGAGACCAAGCTTAAGACGGTTCTTCTTAATCTCGCATAC
AACAGAGCGTACTTTAGTGCCACTAGGGACTGGAACGTTAACAGTAACCTCCTGAAGGGT
CTGGACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATACCCATTACCCTTGTTAGGAGCAATGGGACT
AGCTTCTTGTTTCTTCTCCTCCACTTTAGTGGGCTCTGAGGTTGAAGCAGCCATGTTTGG
CTTCTCCTTCACCACAGGCTTCTTCTTCTCAACACTCTCTTTCTTCTCAGGCTTTCTCAG
CTTCTCCTTCGCCGCCCTAACCGCGGCGGCGATCTCTTCCTCAGCGGAGGGTTT**TGAG
AAAATCGCTCTGTTCGCCGAGAAAGTTGAAGACTTTCTCTAGAAAAACTAATGGGTTCGA
AGAATCGAGTGTCGCCCTAAACGGTAAGATCGAGGGTCGGGTGCTGCTTTCATCTTCAAC
CTCGGAGATGATCGCCATTGTT
CC

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL1112Contig2 909 2 18 U
GGAGCAAAACCCTAGAAACGGAAAAAAAAACCCAACAATGGCGATCATCTCCGAGGTTGA
AGATGAAAGCAGCACTCGACCCTCGATCTTACCGTTTAGGGCGACACTCGATTCTTCGAA
CCCATTAGTTTTCTTACAGAAAGTCTTCGACTTTCTCGGCGAACATAGCGATTTTCTCGA
GAAACCCTCCGCGGAGGAGGAGATCGCCGCCGCAGTCAGGGCGGCGAAGGAGAGGCTGCT
GAGAAAGCCGGAGAAGAATAAAGAGAGTGTTGAGAAGAAGAAGCCTGTGGTGAAGGAGAA
GCCAACCATGGCTGCTTCAACCTCAGAGCCAATTAAAGTGGAGGAGAAGAAACAAGAAGC
TAGTCCCATTGCTCCTAACAAGGGTAATGGTTATGATCTTGAGAGCTACTCATGGGTCCA
GACTCTCCAGGAGGTCACTGTTAACATTCCAGTTCCTACTGGTACTAAAGCACGGTCTGT
TGTATACGAGATTAAGAAGAACCGTCTCAAGCTTGGTCTTAAAGGCCAGGATCCAATCAT
TGATGGAGAGCTCTACCGATCTGTGAAGCCTGATGACTGCTACTGGAACATCGAGGATCA
AAAGATGATTTCGATTCTGTTGACTAAGCAAGATCAGATGGAGTGGTGGAAATGCTGTGT
GAAAGGTGAACCTGAGATCGATACACAGAAGGTTGAACCAGAGAACAGTAAATTAGCTGA
CCTTGACCCTGAAACTCGCTCCACTGTTGAGAAGATGATGTTTGATCAAAGCCAAAAGCA
AATGGGTCTTCCAACAAGCGACGAGCTACAAAAGCAAGACATTCTCAAGAAGTTCATGTC
TCAGCATCCAGAGATGGACTTCACAAACGCAAAGATAAACTGATGTTCCTGTTGTCTGGT
CTCTCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G739TF U 1
AF RR4G739JQ C 178
BS 1 665 RR4G739TF
BS 666 666 RR4G739JQ
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BS 753 753 RR4G739JQ
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BS 773 774 RR4G739JQ
BS 775 793 RR4G739TF
BS 794 796 RR4G739JQ
BS 797 813 RR4G739TF
BS 814 909 RR4G739JQ

RD RR4G739TF 813 0 0
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AGATGAAAGCAGCACTCGACCCTCGATCTTACCGTTTAGGGCGACACTCGATTCTTCGAA
CCCATTAGTTTTCTTACAGAAAGTCTTCGACTTTCTCGGCGAACATAGCGATTTTCTCGA
GAAACCCTCCGCGGAGGAGGAGATCGCCGCCGCAGTCAGGGCGGCGAAGGAGAGGCTGCT
GAGAAAGCCGGAGAAGAATAAAGAGAGTGTTGAGAAGAAGAAGCCTGTGGTGAAGGAGAA
GCCAACCATGGCTGCTTCAACCTCAGAGCCAATTAAAGTGGAGGAGAAGAAACAAGAAGC
TAGTCCCATTGCTCCTAACAAGGGTAATGGTTATGATCTTGAGAGCTACTCATGGGTCCA
GACTCTCCAGGAGGTCACTGTTAACATTCCAGTTCCTACTGGTACTAAAGCACGGTCTGT
TGTATACGAGATTAAGAAGAACCGTCTCAAGCTTGGTCTTAAAGGCCAGGATCCAATCAT
TGATGGAGAGCTCTACCGATCTGTGAAGCCTGATGACTGCTACTGGAACATCGAGGATCA
AAAGATGATTTCGATTCTGTTGACTAAGCAAGATCAGATGGAGTGGTGGAAATGCTGTGT
GAAAG*TGAACCTGAGATCGATACACAGAAG*TTGAACCAGAGAACAGTAA*TTAGCTGA
CCTTGACC*TGAA*CTCGCTCCACTGTTGAGA*GATGATGTTTGATCAAAGC**AAAGCA
AATGGGTCTTCCA**CAGCGACGAGCTACAAAA

QA 1 813 1 813
DS 

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CGAG
AAACCCTCCGCGGAGGAGGAGATCGCCGCCGCAGTCAGGGCGGCGAAGGAGAGGCTGCTG
AGAAAGCCGGAGAAGAATAAAGAGAGTGTTGAGAAGAAGAAGCCTGTGGTGAAGGAGAAG
CCAACCATGGCTGCTTCAACCTCAGAGCCAATTAAAGTGGAGGAGAAGAAACAAGAAGCT
AGTCCCATTGCTCCTAACAAGGGTAATGGTTATGATCTTGAGAGCTACTCATGGGTCCAG
ACTCTCCAGGAGGTCACTGTTAACATTCCAGTTCCTACTGGTACTAAAGCACGGTCTGTT
GTATACGAGATTAAGAAGAACCGTCTCAAGCTTGGTCTTAAAGGCCAGGATCCAATCATT
GATGGAGAGCTCTACCGATCTGTGAAGCCTGATGACTGCTACTGGAACATCGAGGATCAA
AAGATGATTTCGATTCTGTTGACTAAGCAAGATCAGATGGAGTGGTGGAAATGCTGTGTG
AAAGGTGAACCTGAGATCGATACACAGAAGGTTGAACCAGAGAACAGTAAATTAGCTGAC
CTTGACCCTGAAACTCGCTCCACTGTTGAGAAGATGATGTTTGATCAAAGGCAAAAGCAA
ATGGGTCTTCCAACAAGCGACGAGCTACAAAAGCAAGACATTCTCAAGAAGTTCATGTCT
CAGCATCCAGAGATGGACTTCACAAACGCAAAGATAAACTGATGTTCCTGTTGTCTGGTC
TCTCTGCC

QA 5 732 5 732
DS 



AS 2 7

CO CL1113Contig1 1062 4 23 U
GGAGCGCAGGAGAGAAAAAACGTGGCACGTTCAGTTCATTGGAGCTTTCAAATCTGCGCT
TCAATGGAACTTTAGGTCTCTTTTCTGGATTCTCGTCGATTCGAAGAGAGAACGTCGATC
AGTTATCTTTTCTGGTTTCCCGGAAAATTTTGCCGCCAATCGTCTCCTCGCGTCGTCTTT
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GTATCTTAATCCTCCTTCTCAAAATCTACGCCACCAAATCTTGCGCCGGAATCTCTCTCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
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CT

QA 3 724 3 724
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AACT

QA 1 724 1 724
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AACTGGATCTATCGCTATTTCACAGAAGATCATTTCACTAGATGGATCGCTTGTGTCTCC
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TCAGTGAACATTGTAAGTTTGTAACTCTCACGTTGAGGTTGAATCAAAACTCAAGTCTTT
TTGGGGG

QA 1 427 1 427
DS 



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CTTGGTTCTGTTCAAGCCGGAAGCTTAAGCTTGGTGTTGGTTTTCCAGCTTAAGTAGTAG
TAGTAGAAGAAATCCGCATAGAGAGCTGTTTGGACAAGGCCGGAAACACAAGCGATCCAT
CTAGTGAAATGATCTTCTGTGAAATAACGATAGATCCAGTTGATGATATATAGTCCACGA
TACGCACCAAGAAAGAGAACATATTGTCCAGTCAAATTGTCCACATTCCCACTTCTCTGT
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ACCTCTTGAAACGTGAATTTCTCATTCAGGATAAGTGCCAAAACAAAGCATGCCAACACA
ACGTACTGATGACGAAACGTGTCAAGATCCTTAT


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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX82TF U 1
AF RR4EX82JQ C 1
AF RR4FU62JQ U 651
BS 1 577 RR4EX82TF
BS 578 578 RR4EX82JQ
BS 579 592 RR4EX82TF
BS 593 593 RR4EX82JQ
BS 594 610 RR4EX82TF
BS 611 651 RR4EX82JQ
BS 652 1354 RR4FU62JQ

RD RR4EX82TF 610 0 0
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TGCTCAGCGTAGACCGGTCCTGTCCTTTGATTTCCTTAGACGGCTATTACAGCAGTCTCT
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TCTGTGGTTAGACATCCACATCATCAAGTGATAGCTTCTTGCGGGTTGGATCGATATTTA
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GAGAAGGGTGAAGAGATAGACGAGGTAAGAAGCAAAA*GACACGAGACCACA*GAAGAAA
ACCAAGAAAG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4EX82JQ 760 0 0
GGACCATCGTAAATTTGTCACTGGAACAAAGTCTCACCAGGTTCGTCTTTACGATGTTTC
TGCTCAGCGTAGACCGGTCCTGTCCTTTGATTTCCTTAGACGGCTATTACAGCAGTCTCT
GAAGATCCAGATGGTCATACTGTTTATGTCGGGAATGCTTCTGCTGACCTCGCTGCCTTT
GATATACGAACAGGAAAGCTGTTGGGAAACTTTTTAGGGAAGTGTTCTGGAAGCATAAGG
TCTGTGGTTAGACATCCACATCATCAAGTGATAGCTTCTTGCGGGTTGGATCGATATTTA
CGAGTCTATGACGTGAAGACACGCCAGCTCATCTTTGCGGTTTTCTTGAAGCAGCATCTT
ACAGGTCTTGTATTCGACTCAGGCTTTGGTGGTGAAGAGATAGCTGTAGCAAACACAGTG
GTTGAGGCTGAAACAGAGGAGAAAATGAAGATCCAGGAAGATGATGAAGATAAAACAGAG
GAGGCTCCTGTGAAGAAAAAGAAGTCAAAGAAAGAGAAACGCAGTAGAGATAAAGTTTCA
GAGAAGGGTGAAGAGATAGACGAGGTAAGAAGCAAAAAGACACGAGACCACAAGAAGAAA
ACCAAGAAAGTAAAACACACTCAAGAAGACTAGTTTTAAGTTTTTTCTATCTCCAAAAAC
ATTGTTGTTGTACTTGGCTCTTTTAATCCGAGCTACAGTTTTGAACAAAACTACAAAAGA
AAAACAGTGTTTTGGCTCTTTAGATTTTCTGTTTCCCTC
G

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4FU62JQ 704 0 0
G
TCCAAAAACATTGTTGTTGTACTTGGCTCTTCTAATCCGAGCTACAGTTTTGAACAAAAC
TACAAAAGAAAAACAGTGTTTTGGCTCTTTAGATTTTCTGTTTCCCTCAGAAAGACTTGA
GTTTTGATTTCGACCTCAACGTGAGAGTTACAAACTTACAATGTTCACTGAAAGGCTAAA
AGCACATCTTAACAACAATCCTGCATCACTCAACTCGTTGTTAGATCGTAACCATGTTTT
TTTTTTTCGTTTTTCTAGTGCCCCCATCGTTGTAAATTCCTGAACTTTTGACACTCTTGC
AAAATTTGTCTTGGTTCTGTTCAAGCCGGAAGCTTAAGCTTGGTGTTGGTTTTCCAGCTT
AAGTAGTAGTAGTAGAAGAAATCCGCATAGAGAGCTGTTTGGACAAGGCCGGAAACACAA
GCGATCCATCTAGTGAAATGATCTTCTGTGAAATAACGATAGATCCAGTTGATGATATAT
AGTCCACGATACGCACCAAGAAAGAGAACATATTGTCCAGTCAAATTGTCCACATTCCCA
CTTCTCTGTAACAGAACCAACTGGGGAAGGATAGCAACTGCCTCCAAGTATATAGAAAAG
GCCCAGAACACCTCTTGAAACGTGAATTTCTCATTCAGGATAAGTGCCAAAACAAAGCAT
GCCAACACAACGTACTGATGACGAAACGTGTCAAGATCCTTAT

QA 2 704 2 704
DS 



AS 1 7

CO CL1114Contig1 606 7 8 U
GGAACTCTTGTTAAATGAAAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCATCGCAGGGATTAA
TTACATCCGAATCCAAACTGATCATCGGATAAAAAA*TTACTAAACTCTAACTTAAAGGG
GAAAAAAAA*GCCGCGACCACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTC
TAATACAAAGCTATTCACATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTA
ATGTAAATTTCGCTGAAAGAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAA
TCAAGAAGAGAAATTGTTTGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGAC
ATCTTCATAACCACAAGCCATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATCGTCTCTGGTG
TTCTTCTCTCGTCTTGGCGTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCGTTTGCTGCGGTTGGTTAAA
GAACGTCGCCGCTTTCTTGAATGGCGTTGCGATTGTTTTCTTCCATGAAGTCATTTTCTT
TCTAAAATAAAACGATAAAATTAGGTTTAACTGGTAATTGCTTATTTGCTTTCCTTTTGG
AGATCC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 

AF RR4EZ22TF C 17
AF RR4GJ96JQ U 1
AF RR4DT77JQ U 1
AF RR4DT77TF C 1
AF RR4GJ96TF C 1
AF RR4CU43JQ U 17
AF RR4EZ22JQ U 17
BS 1 46 RR4DT77JQ
BS 47 47 RR4GJ96JQ
BS 48 189 RR4DT77JQ
BS 190 190 RR4GJ96JQ
BS 191 540 RR4DT77JQ
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GG
AAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCATCGCAGGGATTAATTACATCCGAATCCAAAC
TGATCATCGGATAAAAAAATTACTAAACTCTAACTTAAAGGGGAAAAAAAA*GCCGCGAC
CACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTCTAATACAAAGCTATTCAC
ATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTAATGTAAATTTCGCTGAAA
GAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAATCAAGAAGAGAAATTGTT
TGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGACATCTTCATAACCACAAGC
CATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATCGTCTCTGGTG

QA 3 404 3 404
DS 

RD RR4GJ96JQ 483 0 0
GA
AACTCTTGTTAAATGAAAAATCGCACCGTGACTTGGATTAAATCATCGCAGGGATTAATT
ACATCCGAATCCAAACTGATCATCGGATAAAAAA*TTACTAAACTCTAACTTAAAGGGGA
AAAAAAA*GCCGCGACCACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTCTA
ATACAAAGCTATTCACATTGAAAAAAAAGAAAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTAAT
GTAAATTTCGCTGAAAGAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAATC
AAGAAGAAAAATTGTTTGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGACAT
CTTCATAACCACAAGCCATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATTGTCTCTGGTGTT
CTTCTCTCGTCTTGGCGTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCGTTTGCTGCGGTTGGTTAAAGA
A

QA 3 483 3 483
DS 

RD RR4DT77JQ 597 0 0
GGAACTCTTGTTAAATGAAAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCGTCGCAGGGATTAA
TTACATCCGAATCCAAACTGATCATCGGATAAAAAA*TTACTAAACTCTAACTTAAAGGG
GAAAAAAAA*GCCGCGACCACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTC
TAATACAAAACTATTCACATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTA
ATGTAAATTTCGCTGAAAGAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAA
TCAAGAAGAGAAATTGTTTGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGAC
ATCTTCATAACCACAAGCCATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATCGTCTCTGGTG
TTCTTCTCTCGTCTTGGCGTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCGTTTGCTGCGGTTGGTTAAA
GAACGTCGCCGCTTTCTTGAATGGCGTTGCGATTGTTTTCTTCCATGAAGTCATTTTCTT
CCTAAAATAAAACGATAAAATTAGGTTTAACTGGTAATTGCTTATTTGCTTTCCT
CC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4DT77TF 597 0 0
GG
AACTCTTGTTAAATGAAAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCGTCGCAGGGATTAATT
ACATCCGAATCCAAACTGATCATCGGATAAAAAA*TTACTAAACTCTAACTTAAAGGGGA
AAAAAAA*GCCGCGACCACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTCTA
ATACAAAACTATTCACATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTAAT
GTAAATTTCGCTGAAAGAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAATC
AAGAAGAGAAATTGTTTGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGACAT
CTTCATAACCACAAGCCATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATCGTCTCTGGTGTT
CTTCTCTCGTCTTGGCGTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCGTTTGCTGCGGTTGGTTAAAGA
ACGTCGCCGCTTTCTTGAATGGCGTTGCGATTGTTTTCTTCCATGAAGTCATTTTCTTCC
TAAAATAAAACGATAAAATTAGGTTTAACTGGTAATTGCTTATTTGCTTTCCT
CC

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR4GJ96TF 606 0 0
GA
AACTCTTGTTAAATGAAAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCATCGCAGGGATTAATT
ACATCCGAATCCAAACTGATCATCGGATAAAAAA*TTACTAAACTCTAACTTAAAGGGGA
AAAAAAA*GCCGCGACCACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTCTA
ATACAAAGCTATTCACATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTAAT
GTAAATTTCGCTGAAAGAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAATC
AAGAAGAGAAATTGTTTGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGACAT
CTTCATAACCACAAGCCATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATTGTCTCTGGTGTT
CTTCTCTCGTCTTGGCGTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCGTTTGCTGCGGTTGGTTAAAGA
ACGTCGCCGCTTTCTTGAATGGCGTTGCGATTGTTTTCTTCCATGAAGTCATTTTCTTTC
TAAAATAAAACGATAAAATTAGGTTTAACTGGTAATTGCTTATTTGCTTTCCTTTTGGAG
ATCC

QA 3 606 3 606
DS 

RD RR4CU43JQ 590 0 0
GAAAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCATCGCAGGGATTAATTACATCCGAATCCAA
ACTGATCATCGGATAAAAAA*TTACTAAACTCTAACTTAAAGGGGAAAAAAAAAGCCGCG
ACCACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTCTAATACAAAGCTATTC
ACATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTAATGTAAATTTCGCTGA
AAGAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAATCAAGAAGAGAAATTG
TTTGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGACATCTTCATAACCACAA
GCCATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATCGTCTCTGGTGTTCTTCTCTCGTCTTG
GCGTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCGTTTGCTGCGGTTGGTTAAAGAACGTCGCCGCTTTC
TTGAATGGCGTTGCGATTGTTTTCTTCCATGAAGTCATTTTCTTTCTAAAATAAAACGAT
AAAATTAGGTTTAACTGGTAATTGCTTATTTGCTTTCCTTTTGGAGATCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4EZ22JQ 590 0 0
GG
AAAATCGCACCGTGACTTGGATTAGATCATCGCAGGGATTAATTACATCCGAATCCAAAC
TGATCATCGGATAAAAAAATTACTAAACTCTAACTTAAAGGGGAAAAAAAA*GCCGCGAC
CACATAAAAGATAAGGAGAAAGAAGAGACACATGGCGGGCTCTAATACAAAGCTATTCAC
ATTGAAGAAGAAGAGAAATTCGAATTCCATTTGTTCAACGTAATGTAAATTTCGCTGAAA
GAGGAAGGAGAGTTTCTCATTTTTCGTTGTGAGAAATCCAAATCAAGAAGAGAAATTGTT
TGAAGAGTTTGACTTGTCAAGAATTGACCACATGACGAGGACATCTTCATAACCACAAGC
CATGACGTCTCCTTGAAGCTCCTTCACCGATCGTCTCTGGTGTTCTTCTCTCGTCTTGGC
GTTTGCGTGGCGGTTGTGTGTCCTTTGCTGCGGTTGGTTAAAGAACGTCGCCGCTTTCTT
GAATGGCGTTGCGATTGTTTTCTTCCATGAAGTCATTTTCTTTCTAAAATAAAACGATAA
AATTAGGTTTAACTGGTAATTGCTTATTTGCTTTCCTTTTGGAGATCC

QA 3 590 3 590
DS 



AS 1 6

CO CL1115Contig1 782 6 4 U
ACGCAAGGGATTAGGAAAGATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCACTCATAGCCAT
GGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATCGC
ATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGACGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGC
AGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACC
ACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGT
CAACGACACCACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTT
TTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAG
AGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCC
AAGCAAGTACAATGTTAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAA
AGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTT
GCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCACCCCCCCC
TCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTA
TCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTATG
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 

AF RR4AD31TF U 1
AF RR4FR03TF U 47
AF RR4FT38TF U 47
AF RR4DB94TF U 18
AF RR4AD31JQ C 107
AF RR4DB94JQ C 178
BS 1 40 RR4AD31TF
BS 41 41 RR4DB94TF
BS 42 640 RR4AD31TF
BS 641 782 RR4AD31JQ

RD RR4AD31TF 641 0 0
ACGCAAGGGATTAGGAAAGATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCTATCTCTCACTCATAGCCAT
GGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATCGC
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AGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACC
ACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGT
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TTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAG
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AGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTT
GCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTT
G

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DS 

RD RR4FR03TF 594 0 0
GG
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GTCAAGAATCGCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGACGAATCTTCGCCGTCTC
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TGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTT

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR4FT38TF 594 0 0
GG
ACTCATAGCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGA
GTCAAGAATCGCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGACGAATCTTCGCCGTCTC
GCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAA
GGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACAT
AGTTACAATAGTCAACGACACCACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGT
ATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAA
CGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTC
TCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTTAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAA
TGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCAT
TGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTT

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR4DB94TF 619 0 0
G
GATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCACTCATAGCCATGGCTGCCTTCACTTGTAC
CTCTCGTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATCGCATCCTCACCATCCGCTTC
ACTCTCCGCTCGACGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCT
TTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGCCGT
CTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGACACCACATGGGA
CTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGG
ACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGT
CAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTTAG
AAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGC
AGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGT
GAGTCTGTGAGATCTGTG

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR4AD31JQ 676 0 0
GAGTCAAGAATCGCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGACGAATCTTCGCCGTC
TCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCG
AAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGAC
ATAGTTACAATAGTCAACGACACCACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCT
GTATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTG
AACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTTTACAAACTGAACACGGACGAC
TCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTTAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTC
AATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGC
ATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCC
CCCCCACCCCCCCCTCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTG
CTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGAT
GTCATGTTTTTATGTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4DB94JQ 605 0 0
AGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCG
ACCACGAAGAAGAGGTGCCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAAT
AGTCAACGACACCACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGA
CTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGC
AAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAAC
CCCAAGCAAGTACAATGTTAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAA
GAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTT
CTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCACCCCC
CCCTCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATT
GTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTT
ATGT
T

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 7

CO CL1116Contig1 515 7 7 U
GGAAAAGAACGTTGGCGATCTGCAAAACTTCATTTTCAATAGACTGCGTATCCACCTTCT
CCTTCTCCCTCTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCTTCTTCGAGTCAGCCATGGA
GGATGAGATTGAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGAC
AAGGCATTGCTTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGGTGAGGA
CTCCAGTGACTGCGAGAGATTCGCCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGT
TGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCCGAGCA
AGAAGCTCTCTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATTTCA
ATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAATCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAACTGCAA
GGCATTCTTATGATCCGACTTATAAAAAGCTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 

AF RR4G891TF U 1
AF RR4DS48JQ C 55
AF RR4AX06JQ C 82
AF RR4AX06TF U 82
AF RR4E990JQ C 55
AF RR4DS48TF U 55
AF RR4E990TF U 55
BS 1 100 RR4G891TF
BS 101 101 RR4DS48TF
BS 102 108 RR4G891TF
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BS 110 492 RR4G891TF
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BS 515 515 RR4DS48TF

RD RR4G891TF 492 0 0
GGAAAAGAACGTTGGCGATCTGCAAAACTTCATTTTCAATAGACTGCGTATCCACCTTCT
CCTTCTCCCTCTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCGTCTTCGAATCAGCCATGGA
GGATGAGATTGAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGAC
AAGGCATTGCTTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGGTGAGGA
CTCCAGTGACTGCGAGAGATTCGCCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGT
TGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCCGAGCA
AGAAGCTCTCTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATTTCA
ATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAATCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAACTGCAA
GGCATTCTTATG

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4DS48JQ 461 0 0
CCTTCTCCTTCTCCCTCTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCTTCTTCGAGTCAGC
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TGAGGACTCCAGTGACTGCGAGAGATTCGCCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGA
ATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATC
CGAGCAAGAAGCTCTCTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATC
ATTTCAATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAATCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAA
CTGCAAGGCATTCTTATGATCCGACTTATAAAAAGCTCACG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4AX06JQ 441 0 0
GG
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CTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCATTGCTTCACCCGTTACA
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CCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGG
AGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCCGAGCAAGAAGCTCTCTTTTATCATGTTT
TGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATTTCAATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAA
TCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAACTGCAAGGCATTCTTATGATCCGACTTAT
AAAAAGCTCAC
ATACATGG

QA 3 433 3 433
DS 

RD RR4AX06TF 441 0 0
GG
AAACCTTCTCATCGTTCGTCTTCGAATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAACTGAAAACTG
CTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCATTGCTTCACCCGTTACA
TTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGGTGAGGACTCCAGTTACTGCGAGAGATTCG
CCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGG
AGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCCGAGCAAGAAGCTCTCTTTTATCATGTTT
TGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATTTCAATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAA
TCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAACTGCAAGGCATTCTTATGATCCGACTTAT
AAAAAGCTCAC
ATACATGG

QA 3 433 3 433
DS 

RD RR4E990JQ 461 0 0
CCTTCTCCTTCTCCCTTTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCTTCTTCGAGTCAGC
CATGGAGGATGAGATTGAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAA
CCAGACAAGGCATTGCTTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGG
TGAGGACTCCAGTGACTGCGAGAGATTCGCCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGA
ATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATC
CGAGCAAGAAGCTCTCTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATC
ATTTCAATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAATCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAA
CTGCAAGGCATTCTTATGATCCGACTTATAAAAAGCTCACG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4DS48TF 461 0 0
CCTTCTCCTTCTCCCTCTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCTTCTTCGAGTCAGC
CATGGAGGATGAGATTGAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAA
CCAGACAAGGCATTGCTTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGG
TGAGGACTCCAGTGACTGCGAGAGATTCGCCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGA
ATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATC
CGAGCAAGAAGCTCTCTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATC
ATTTCAATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAATCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAA
CTGCAAGGCATTCTTATGATCCGACTTATAAAAAGCTCACG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4E990TF 461 0 0
CCTTCTCCTTCTCCCTCTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCTTCTTCGAGTCAGC
CATGGAGGATGAGATTGAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAA
CCAGACAAGGCATTGCTTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGG
TGAGGACTCCAGTGACTGCGAGAGATTCGCCAAATACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGA
ATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACTGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATC
CGAGCAAGAAGCTCTCTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATC
ATTTCAATCCAACTCTTTCTTTTTGTTAATCTTTTTCTTTGTTTGATCAAATAAAATAAA
CTGCAAGGCATTCTTATGATCCGACTTATAAAAAGCTCACG

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 4

CO CL1117Contig1 1279 4 8 U
TATTTTCTCTCCAGATCTCTCTCTCCCGTGTCAAATCTTTGAGATCTGAATATCTCCTCC
TGAATCCTGAAGGGGGAAGGATGTACGGATTCGAGGCGCTCACCTTCAACATCCATGGCG
GATACCTGGAGGCGATCGTGAGGGGCCACCGTGCTGGTCTCCTCACCACCGCGGATTACA
ACAATCTGTGCCAATGTGAAAACCTGGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACCAAAT
ACGGCTCTTACCTCCAGAACGAACCGTCACCTCTGCATACGACGACAATCGTGGAGAAGT
GTACGCTCAAGCTTGTGGATGACTACAAGCATATGCTTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGT
CCACCTTCTTAGAGTACATCAGATACGGCCACATGATTGACAATGTGGTGCTGATTGTTA
CTGGAACTTTGCACGAGAGAGATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCA
TGTTTGACAGCATTGCCACACTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGG
TGCTTGTTGATACTCCTCTCGCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGG
ATGACATGAACATAGAGATCATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTTGAGGATTTTT
ACAAGTTCTGTCAGAAACTCGGAGGGGCAACAGCAGAGATAATGTCTGACCTTCTGGCCT
TCGAAGCTGACAGAAGAGCTGTGAACATCACCATCAATAGCATTGGCACTGAGCTAACAA
GAGAAGACAGAAAGAAACTGTACTCCAACTTTGGTCTCCTCTATCCATATGGTCACGAGG
AGCTTGCTATTTGCGAAGACATAGATCAGGTTCGTGGTGTTATGGAGAAGTACCCTCCTT
ACCAAGCAATATTCTCAAAGATGTCTTATGGAGAGAGCCAGATGCTTGACAAAGCATTTT
ATGAAGAAGAAGTCAGAAGGCTTTGCTTAGCCTTTGAGCAGCAGTTCCATTACGGGGTGT
TCTTTGCCTACATGAGATTGAGGGAGCAGGAGATCAGGAACCTGATGTGGATATCCGAGT
GTGTTGCACAGAACCAGAAGTCGAGGATCCACGACAGTGTGGTCTACATGTTCTGAGTCC
GGTAAGGAGTGAGAGAAAAAGCACATTAAAATGTGTAAATGTGTTTTTTAACATTGGAGA
ACAAGAAGAAAGAACCTATTTGATTGCTGTTGGTTTTCTTCATTGCTCCGATTTGCCAGA
GAAATTTGCGGTTTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ55TF U 117
AF RR4GT51TF U 151
AF RR4A934TF U 1
AF RR4A934JQ C 423
BS 1 205 RR4A934TF
BS 206 206 RR4EZ55TF
BS 207 369 RR4A934TF
BS 370 370 RR4GT51TF
BS 371 388 RR4A934TF
BS 389 389 RR4GT51TF
BS 390 811 RR4A934TF
BS 812 1279 RR4A934JQ

RD RR4EZ55TF 178 0 0
GGCGGATACCTGGAGGCGATCGTGAGGGGCCACCGTGCTGGTCTCCTCACCACCGCGGAT
TACAACAATCTGTGCCAATGTGAAAACCTGGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACC
AAATACGGCTCTTACCTCCAGAACGAACCGTCACCTCTGCATACGACGACAATCGTGG

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR4GT51TF 628 0 0
GTGCTGGTCTCCTCACCACCGCGGATTACAACAATCTGTGCCAATGTGAAAACCTGGACG
ACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACCAAATACGGCTCTTACCTCCAGAACGAACCGTCAC
CTCTGCATACGACGACAATCGTGGAGAAGTGTACGCTCAAGCTTGTGGATGACTACAAGC
ATATGCTTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGTCCACCTTCTTAGAGTACATCAGATACGGCC
ACATGATTGACAATGTGGTGCTGATTGTTACTGGAACTTTGCACGAGAGAGATGTTCAAG
AGTTGATTGAGAAATGTCACCCTCTAGGCATGTTTGACAGCATTGCCACACTGGCTGTTG
CTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGGTGCTTGTTGATACTCCTCTCGCTCCATATT
TTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGGATGACATGAACATAGAGATTATGAGGAACA
CCCTCTACAAAGCATACCTTGAGGATTTTTACAAGTTCTGTCAGAAACTTGGAGGGGCAA
CAGCAGAGATAATGTCTGACCTTCTGGCCTTCGAAGCTGATAGAAGAGCTGTGAACATCA
C*ATCA*TAGCATTGGCACTGAGCTA
CA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4A934TF 811 0 0
TATTTTCTCTCCAGATCTCTCTCTCCCGTGTCAAATCTTTGAGATCTGAATATCTCCTCC
TGAATCCTGAAGGGGGAAGGATGTACGGATTCGAGGCGCTCACCTTCAACATCCATGGCG
GATACCTGGAGGCGATCGTGAGGGGCCACCGTGCTGGTCTCCTCACCACCGCGGATTACA
ACAATCTGTGCCAATGTGAAAACCTAGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACCAAAT
ACGGCTCTTACCTCCAGAACGAACCGTCACCTCTGCATACGACGACAATCGTGGAGAAGT
GTACGCTCAAGCTTGTGGATGACTACAAGCATATGCTTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGT
CCACCTTCT*AGAGTACATCAGATACGGGCACATGATTGACAATGTGGTGCTGATTGTTA
CTGGAACTTTGCACGAGAGAGATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCA
TGTTTGACAGCATTGCCACACTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGG
TGCTTGTTGATACTCCTCTCGCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGG
ATGACATGAACATAGAGATCATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTTGAGGATTTTT
ACAAGTTCTGTCAGAAACTCGGAGGGGCAACAGCAGAGATAATGTCTGACCTTCTGGCCT
TCGAAGCTGACAGAAGAGCTGTGAACATCACCATCAATAGCATTGGCACTGAGCTAACAA
GAGAAGACAGAAAGAAACTGTACTCCAACTT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4A934JQ 857 0 0
GGAACTTTGCACGAGAGAGATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCATG
TTTGACAGCATTGCCACACTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGGTG
CTTGTTGATACTCCTCTCGCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGGAT
GACATGAACATAGAGATCATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTTGAGGATTTTTAC
AAGTTCTGTCAGAAACTCGGAGGGGCAACAGCAGAGATAATGTCTGACCTTCTGGCCTTC
GAAGCTGACAGAAGAGCTGTGAACATCACCATCAATAGCATTGGCACTGAGCTAACAAGA
GAAGACAGAAAGAAACTGTACTCCAACTTTGGTCTCCTCTATCCATATGGTCACGAGGAG
CTTGCTATTTGCGAAGACATAGATCAGGTTCGTGGTGTTATGGAGAAGTACCCTCCTTAC
CAAGCAATATTCTCAAAGATGTCTTATGGAGAGAGCCAGATGCTTGACAAAGCATTTTAT
GAAGAAGAAGTCAGAAGGCTTTGCTTAGCCTTTGAGCAGCAGTTCCATTACGGGGTGTTC
TTTGCCTACATGAGATTGAGGGAGCAGGAGATCAGGAACCTGATGTGGATATCCGAGTGT
GTTGCACAGAACCAGAAGTCGAGGATCCACGACAGTGTGGTCTACATGTTCTGAGTCCGG
TAAGGAGTGAGAGAAAAAGCACATTAAAATGTGTAAATGTGTTTTTTAACATTGGAGAAC
AAGAAGAAAGAACCTATTTGATTGCTGTTGGTTTTCTTCATTGCTCCGATTTGCCAGAGA
AATTTGCGGTTTTTACG

QA 1 857 1 857
DS 



AS 2 6

CO CL1118Contig1 717 4 16 U
GATGGAAACGAAACAGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGCAAGACACCGTCT
ATCTTAGCTCTGTCTAGACAAAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGCACATCCATCGAAGGAGTT
GAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCATCAGGAAACAAACCCGATGTGATCTTG
GTTGGAACTGGATCTGAGCTAGAGATTGCTGCACAGGCTGCGGAGGTGCTTAGGAAAGAA
GGCAAAACCGTGAGAGTTGTGTCTTTCGTCTGCTGGGAGCTGTTTGATGAGCAATCAGAT
GAGTACAAGGAGAGTGTCTTGCCGTCTGGTGTATCTGCTAGAGTTAGTATCGAAGCAGCT
TCGACTTTCGGATGGGGGAAGATTGTTGGAGGCAAAGGGAAGTCCATTGGTATTAATTCG
TTTGGGGCTAGTGCACCAGCTCCTTTGCTCTACAAGGAGTTTGGCATCACTGTTGAAGCT
GTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTCTTCTAAGTGACTTTTACCATTATTCTCTATAAGGAC
ATTGTCTCATTACCTCAAAATAAAAGTGCAACAAGACGCAAAGAGACTCTTCTTTCTTTT
TTGTTTCTTGTAATGCGGGTCAACATAGGTTTTGGGTTTGGGCAGAGAAGATATTAGAAG
ACAATGTAAAACTCTTTTATGATCAGTTGTGTATTGTATGTCATATGCTTGAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BT30TF U 384
AF RR4E302JQ C 1
AF RR4CE80TF U 163
AF RR4DH76TF U 75
BS 1 75 RR4E302JQ
BS 76 84 RR4DH76TF
BS 85 85 RR4E302JQ
BS 86 163 RR4DH76TF
BS 164 167 RR4CE80TF
BS 168 168 RR4DH76TF
BS 169 200 RR4CE80TF
BS 201 201 RR4DH76TF
BS 202 232 RR4CE80TF
BS 233 233 RR4DH76TF
BS 234 294 RR4CE80TF
BS 295 295 RR4DH76TF
BS 296 642 RR4CE80TF
BS 643 643 RR4DH76TF
BS 644 713 RR4CE80TF
BS 714 717 RR4E302JQ

RD RR4BT30TF 207 0 0
TGTTGGAGGCAAAGGGAAGTCCATTGGTATTAATTCGTTTGGGGCTAGTGCACCAGCTCC
TTTGCTCTACAAGGAGTTTGGCATCACTGTTGAAGCTGTTGTTGATGCGGCTAAGTCATT
CTTCTAAGTGACTTTTACCATTATTCTCTATAAGGACATTGTCTCATTACCTCAAAATAA
AAGTGCAACAAGACGCAAAGAGACTCT

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4E302JQ 717 0 0
GATGGAAACGAAACAGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGCAAGACACCGTCT
ATCTTAGCTCTGTCTAGACAAAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGCACATCCATCGAAGGAGTT
GAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCATCGGGAAACAAACCCGATGTGATCTTG
GTTGGAACTGGATCTGAGCTAGGGATTGCTGCACAGGTTGCGGAGGTGCTTAGGAAAGAA
GGCAAAACCGTGAGAGTTGTGTCTTTCGTCTGCTGGGAGCTGTTTGATGAGCAATCAGAT
GAGTACAAGGAGAGTGTCTTGCCGTCTGGTGTATCTGCTAGAGTTAGTATCGAAGCAGCT
TCGACTTTCGGATGGGGGAAGATTGTTGGAGGCAAAGGGAAGTCCATTGGTATTAATTCG
TTTGGGGCTAGTGCCCCAGCTCCTTTGCTCTACAAGGAGTTTGGCATCACTGTTGAAGCT
GTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTCTTCTAAGTGACTTTTACCATTATTCTCTATAAGGAC
ATTGTCTCATTATCTCAAAATAAAAGTGCAACAAGACGCAAAGAGACTCTTCTTTCTTTT
TTGTTTCTTGTAATGCGGGTCAACATAGGTTTTGGGTTTGGGCAGAGAAGATATTAGAAG
ACAATGTAAAACTCTTTTATGATCAGTTGTGTATTGTATGTCATATGCTTGAATTCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4CE80TF 552 0 0
G
AACCTGATGTGATCTTGGTTGGAACTGGATCTGAGCTGGAGATTGCTGCACAGGCTGCGG
AGGTGCTTAAGAAAGAAGGCAAAACCGTGAGAGTTGTGTCTTTCGTCTGCTGGGAGCTGT
TTGATGAGCAAACAGATGAGTACAAGGAGAGTGTCTTGCCGTCTGGTGTATCTGCTAGAG
TTAGTATCGAAGCAGCTTCGACTTTCGGATGGGGGAAGATTGTTGGAGGCAAAGGGAAGT
CCATTGGTATTAATTCGTTTGGGGCTAGTGCACCAGCTCCTTTGCTCTACAAGGAGTTTG
GCATCACTGTTGAAGCTGTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTCTTCTAAGTGACTTTTACCA
TTATTCTCTATAAGGACATTGTCTCATTACCTCAAAATAAAAGTGCAACAAGACGCAAAG
AGACTCTTCTTTCTTTTTTGTTTCTTGTAATGCGGGTCAACATAGGTTTTGGGTTTGGGA
AGAGAAGATATTAGAAGACAATGTAAAACTCTTTTATGATCAGTTGTGTATTGTATGTCA
TATGCTTGAA
A

QA 2 551 2 551
DS 

RD RR4DH76TF 626 0 0
G
AGACAAAAGTTTCCTCAGCTTCCAGGCACATCCATCGAAGGAGTTGAGAAGGGTGGATAC
ACGATCTCTGACAACTCATCAGGAAACAAACCCGATGTGATCTTGGTTGGAACTGGATCT
GAGCTAGAGATTGCTGCACAGGCTGCGGAGGTGCTTAGGAAAGAAGGCAAAACCGTGAGA
GTTGTGTCTTTCGTCTGCTGGGAGCTGTTTGATGAGCAATCAGATGAGTACAAGGAGAGT
GTCTTGCCGTCTGGTGTATCTGCTAGAGTTAGTATCGAAGCAGCTTCGACTTTCGGATGG
GGGAAGATTGTTGGAGGCAAAGGGAAGTCCATTGGTATTAATTCGTTTGGGGCTAGTGCA
CCAGCTCCTTTGCTCTACAAGGAGTTTGGCATCACTGTTGAAGCTGTTGTTGATGCGGCT
AAGTCATTCTTCTAAGTGACTTTTACCATTATTCTCTATAAGGACATTGTCTCATTACCT
CAAAATAAAAGTGCAACAAGACGCAAAGAGACTCTTCTTTCTTTTTTGTTTCTTGTAATG
CGGGTCAACATAGGGTT*GGGTTTGGGCAGAGAAGATATTAGAAGACAATGTAAAACTCT
TTTATGATCAGTTGTGTATTGTATG

QA 2 626 2 626
DS 



CO CL1118Contig2 859 2 10 U
GCATTGGTTATGGATCTCCAAACAAGGCCAACTCATACAGTGTCCATGGAGCTGCACTTG
CAGAGAAGGAAGTTGAGGCTACCAGAAACAACCTCGGATGGCCATATGAGCCATTCAAGG
TACCTGAGGAAGTTAAAAGCCACTGGAGCCGTCACACGCCTGATGGCAAAGCTCTTGAGT
CTGACTGGAATGCATCGTTTGCAGCGTATGAAAAGAAGTACCCAGAGGAAGCTGCAGAGT
TGAAATCTATCATCACCGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAACATACA
CACCAGAGTCTCCTGGTGATGCCACAAGAAACTTGTCACAGCAATGTCTCAACGCCCTCG
CTAAAGTTGTTCCCGGTTTCCTCGGAGGAAGTGCTGACCTTGCTTCTTCCAACATGACAC
TCCTGAAAGCCTTTGGTGACTTCCAAAAGGCAACACCCGAAGAGAGGAACCTTAGGTTCG
GTGTCAGAGAGCATGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCACTCCACAGCCCTGGTC
TTATCCCTTACTGCGCAACTTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAA
TCTCGGCTTTGTCTGAAGCTGGTGTCATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTGGTCTTG
GAGAAGATGGGCCAACCCATCAGCCCATTGAGCACTTGGCTAGTTTCCGTGCTATGCCCA
ACACTCTTATGTTCCGTCCTGCTGATGGAAACGAAACAGCCGGTGCGTACAAGATCGCTG
TCACCAAGCGCAAGACACCGTCTATCTTAGCTCTGTCTAGACAAAGCTTCCTCAGCTTCC
AGGACATCCATCGAAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E302TF U 1
AF RR4EW27TF U 89
BS 1 126 RR4E302TF
BS 127 127 RR4EW27TF
BS 128 523 RR4E302TF
BS 524 524 RR4EW27TF
BS 525 526 RR4E302TF
BS 527 527 RR4EW27TF
BS 528 626 RR4E302TF
BS 627 627 RR4EW27TF
BS 628 755 RR4E302TF
BS 756 859 RR4EW27TF

RD RR4E302TF 755 0 0
GCATTGGTTATGGATCTCCAAACAAGGCCAACTCATACAGTGTCCATGGAGCTGCACTTG
CAGAGAAGGAAGTTGAGGCTACCAGAAACAACCTCGGATGGCCATATGAGCCATTCAAGG
TACCTGGGGAAGTTAAAAGCCACTGGAGCCGTCACACGCCTGATGGCAAAGCTCTTGAGT
CTGACTGGAATGCATCGTTTGCAGCGTATGAAAAGAAGTACCCAGAGGAAGCTGCAGAGT
TGAAATCTATCATCACCGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAACATACA
CACCAGAGTCTCCTGGTGATGCCACAAGAAACTTGTCACAGCAATGTCTCAACGCCCTCG
CTAAAGTTGTTCCCGGTTTCCTCGGAGGAAGTGCTGACCTTGCTTCTTCCAACATGACAC
TCCTGAAAGCCTTTGGTGACTTCCAAAAGGCAACACCCGAAGAGAGGAACCTTAGGTTCG
GTGTCAGAGAGCATGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCCCTTCACAGCCCTGGTC
TTATCCCTTACTGCGCAACTTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAA
TCTCGGCTTTGTCTGAAGCTGGTGTCGTCTATGTGATGACTCATGACTCCATTGGTCTTG
GAGAAGATGGGCCAACCCATCAGCCCATTGAGCACTTGGCTAGTTTCCGTGCTATGCCCA
ACACTCTTATGTTCCGTCCTGCTGATGGAAACGAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4EW27TF 771 0 0
G
AACCTCGGATGGCCATATGAGCCATTCAAGGTACCTGAGGAAGTTAAAAGCCACTGGAGC
CGTCACACGCCTGATGGCAAAGCTCTTGAGTCTGACTGGAATGCATCGTTTGCAGCGTAT
GAAAAGAAGTACCCAGAGGAAGCTGCAGAGTTGAAATCTATCATCGCTGGTGAACTACCT
GCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAGCATACACACCAGAGTCTCCTGGTGATGCCACAAGA
AACTTGTCACAGCAATGTCTCAACGCCCTCGCTAAAGTTGTTCCCGGTTTCCTTGGTGGA
AGTGCTGACCTTGCTTCTTCCAACATGACACTCCTGAAAGCCTTTGGTGACTTCCAAAAG
GCAACACCCGAAGAGAGGAACCTTAGGTTCGGTGTCAGAGAGCATGGAATGGGAGCCATC
TGCAACGGCATTGCACTCCACAGCCCTGGTCTTATCCCTTACTGTGCAACTTTCTTTGT*
TTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAATCTCGGCTTTGTCTGAAGCTGGTGTCATC
TATGTGATGACTCATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGATGGGCCAACCCATCAGCCCATT
GAGCACTTGGCTAGTTTCCGTGCTATGCCCAACACTCTTATGTTCCGTCCTGCTGATGGA
AACGAAACAGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGCAAGACACCGTCTATCTTA
GCTCTGTCTAGACAAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGACATCCATCGAAGAGT

QA 2 771 2 771
DS 



AS 2 7

CO CL1119Contig1 1381 5 10 U
GGGTCCCACAGACACACAAAAAAAACCCTAAAACCACTTCTCCTCGCAGCTGCCCCCAAT
GTCGAAGAAGCGTAACCCTCTCGAAGATCCACCCGCCGCATCCTCAAGCGACGACGAAGA
AGTCGAGTCTTCCGCCGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAGGACGACGACTCCTCATCCGAAGA
AGACGCTCCCGTCAAACCTCCTTCCTCCTCCGCCGCCGCCGTCACAATCGCCGTCCCAGG
CAAACCCACCGCCTCCCTCCCCGCCGCCACACAAGCCTCCGATTCAGAGTCCGGATCCGA
GACCGAGACCGACTCCGAATCTGAGCCCGAACAGCCAACAAAAAACAAGGGATCTGGCAA
AGCCATCCTCACCGCGAAGCCAGCTCCTCCTCCTCCTCCGGTTGCCCTAGCTCTACCGGC
GAAGAAATCAGGAGCGAAGCGGCCTAGCGAAGTCTCCTCTTCCAAGGAGACAACGAACTC
AAAGCGAGTCAAGAAGGATGGTGAGGATAAGAAGATCGGAGAGGACTCGAAGAAGCCCGG
CGCGTTTCAGAGGCTATGGACGGAGGAAGACGAGATTGCCGTGTTACAAGGTATGATCGA
TTTCAAGAAGGAGACGGGGAAGTCTCCTTACGAGGACACTAATGTTTACTATGATTATAT
AAAGAAGTCTATTAGCTTTGAGGTTAGCAAGAACCAGTTTATGGATAAGATTAGGAGCTT
AAGGAAGAAGTACATTGGTAAAGAGAAACCGTCATTCACCAAACCGCATGATCAGAAGTC
TTATAGGTTGTGTCAGTATATCTGGGGACCTGATGGGATGGATCTTGAGTCCGCGGTTAA
GTCGAACGGCGCGTCGAAAAAGAGCCAGAAGAAGACTAAGAAGCTCGACTCCGTGAAGCA
GGAGCTTTCTTTCGGCGGCGCCTCGCCTAATGGTAAAGCGGTTGTTGGTGATGATGATGA
GAAAGATGTGGAGTCGTCTGTTGCTGCTAAGAAGCATGATTGGTTCGAGAACTCCTTTCT
TGTTAAGGGGATTGCGGGGTTTGGTGTTGATGAGTATTGTGTGAAACAGAGGTGGAGTTT
GGTTCCGGTGGAGACCAAGAAGAAGGTTGAAGAGAAGCTTAAGCTGTTGCAGGCCAAGGA
AATCGAGTATGTGTTGCAGAAGACTGAGGTTTTGCATGAAGTGACCTCTATGATCGCTGA
AGCTTCTAAGAACAAGCTGTTAGATATATAAGATCGAGTGCAAATGCCTCTCTTTTGTTT
TTGTTTTTATTCCCTGTTATGATCTATCTATGTAGTTTTCTGGTTTATTTTGATGGTTTT
CTCTCATATGAAACTTCTCTGTTTTTGTTTTGTTGGTTATATATAAAAGCACCATTGAAG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
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10 

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AF RR4AP54TF U 525
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BS 488 677 RR4D484TF
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AGACGCTCCCGTCAAACCTCCTTCCTCCTCCGCCGCCGCCGTCACAATCGCCGTCCCAGG
CAAACCCACCGCCTCCCTCCCCGCCGCCACACAAGCCTCCGATTCAGAGTCCGGATCCGA
GACCGAGACCGACTCCGAATCTGAGCCCGAACAGCCAACAAAAAACAAGGGATCTGGCAA
AGCCATCCTCACCGCGAAGCCAGCTCCTCCTCCTCCTCCGGTTGCCCTAGCTCTACCGGC
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AAAGCGGGTCAAGAAGGATGGTGAGGATAAGAAGATCGGAGAGGACTCGAAGAAGCCCGG
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AAAGAAGTCTATTAGCTATGAG*TTAGCAAGAACCAGTTTATGGATAAGATTAGGAGCT

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G
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CTATGGACGGAGGAAGACGAGATTGCCGTGTTACAAGGTATGATCGATTTCAAGAAGGAG
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AGCTTTGAGGTTAGCAAGAACCAGTTTATGGATAAGATTAGGAGCTTAAGGAAGAAGTAC
ATTGGTAAAGAGAAACCGTCATTCACCAAACCGCATGATCAGAAGTCTTATAGGTTGTGT
CAGTATATCTGGGGACCTGATGGGATGGATCTTGAGTCCGCGGTTAAGTCGAACGGCGCG
TCGAAAAAGAGCCAGAAGAAGACTAAGAAGCTCGACTCCGTGAAGCAGGAGCTTTCTTTC
GGCGGCGCCTCGCCTAATGGTAAAGCGGTTGT

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G
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TTACTATGATTATATA**GAAGTCTATTAGCTTTGAGGTTAGCAAGAACCAGTTTATGGA
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CGACTCCGTGAAGCAGGAGCTTTCTTTCGGCGGCGCCTCGCCTAATGGTAAAGCGGTTGT
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CGAGAACTCCTTTCTTGTTAAGGGGATTGCGGGGTTTGGTGTTGATGAGTATTGTGTGAA
ACAGAGGTGGAGTTTGGTTCCGGTGGAGACCAAGAAGAAGGTTGAAGAGAAGCTTAAGCT
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TGGATCTTGAGTCCGCGGTTAAGTCGAACGGCGCGTCGAAAAAGAGCCAGAAGAAGACTA
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CGGTTGTTGGTGATGATGATGAGAAAGATGTGGAGTCGTCTGTTGCTGCTAAGAAGCATG
ATTGGTTCGAGAACTCCTTTCTTGTTAAGGGGATTGCGGGGTTTGGTGTTGATGAGCATT
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AAGTGACCTCTATGATCGCTGAAGCTTCTAAGAACAAGCTGTTAGATATATAAGATCGAG
TGCAAATGCCTCTCTTTTGTTTTTGTTTTTATTCCCTGTTATGATCTATCTATGTAGTTT
TCTGGTTTATTTTGATGGTTTTCTCTCATATGAAACTTCTCTGTTTTTGTTTTGTTGGTT
ATATATAAAAGCACCATTG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4AP54JQ 841 0 0
CGCGTTTCAGAGGCTATGGACGGAGGAAGACGAGATTGCCGTGTTACAAGGTATGATCGA
TTTCAAGAAGGAGACGGGGAAGTCTCCTTACGAGGACACTAATGTTTACTATGATTATAT
A**GAAGTCTATTAGCTTTGAGGTTAGCAAGAACCAGTTTATGGATAAGATTAGGAGCTT
AAGGAAGAAGTACATTGGTAAAGAGAAACCGTCATTCACCAAACCGCATGATCAGAAGTC
TTATAGGTTGTGTCAGTATATCTGGGGACCTGATGGGATGGGTCTTGAGTCCGCGGTTAA
GTCGAACGGCGCGTCGAAAAAGAGCCAGAAGAAGACTAAGAAGCTCGACTCCGTGAAGCA
GGAGCTTTCTTTCGGCGGCGCCTCGCCTAATGGTAAAGCGGTTGTTGGTGATGATGATGA
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TGTTAAGGGGATTGCGGGGTTTGGTGTTGATGAGTATTGTGTGAAACAGAGGTGGAGTTT
GGTTCCGGTGGAGACCAAGAAGAAGGTTGAAGAGAAGCTTAAGCTGTTGCAGGCCAAGGA
AATCGAGTATGTGTTGCAGAAGACTGAGGTTTTGCATGAAGTGACCTCTATGATCGCTGA
AGCTTCTAAGAACAAGCTGTTAGATATATAAGATCGAGTGCAAATGCCTCTCTTTTGTTT
TTGTTTTTATTCCCTGTTATGATCTATCTATGTAGTTTTCTGGTTTATTTTGATGGTTTT
CTCTCATATGAAACTTCTCTGTTTTTGTTTTGTTGGTTATATATAAAAGCACCATTGAAG
G

QA 1 841 1 841
DS 



CO CL1119Contig2 996 2 2 U
GGGTCCCACAGACACACAAAAAAACCCTAAAACCACTTCTCTTCAAAGCTGCCCCCAATG
TCGAAGAAGCGTAACCCTCTCGAAGATCCACCCGCCGCATCCTCAAGCGACGACGAAGAA
GTCGAGTCTTCCGCCGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAGGACGACGACTCCTCATCCGAGGAA
GACGAAATTGCCGTGTTACAAGGTATGATCGATTTCAAGAAGGAGACGGGGAAGTCTCCT
TACGAGGAACTAATGTGTACTATGATTATATTAAGAAGTCTATTAGCTTTGAGGTTAGCA
AGAACCAGTTTATGGATAAGATTAGGAGCTTAAGGAAGAAGTACATTGGTAAAGAGAAAC
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CTGATGGGATGGGTCTTGAGTCTGCGGTTAAGTCGAACGGTGCGTCGAAAAAGAGCCAGA
AGAAGACTAAGAAGCTCGACTCCGTGAAGCAAGAGCTTTCTTTCGGCGGCGCCTCGCCTA
ATGGTAAAGCTGTTGTTGGTGATGATGATGAGAAAGATGTGGAGTCGTCTGTTGCTGCTA
AGAAACATGACTGGTTCGAGAACTCGTTTCTTGTTAAGGGGATTGCGGGGTTTGGTGTTG
ATGAGCATTGTGTGAAACAGAGGTGGAGTTTGGTTCCGGTGGAGACCAAGAAGAAGGTTG
AAGAGAAGCTTAAGCTGTTGCAGGCCAAGGAAATTGAGTATGTGTTGCAGAAGACTGAGG
TTTTACATGAAGTGACCTCTATGATCGCTGAAGCATCTAAGAACAAGCTGTTAGATATAT
AAGATTGAGTGCAAATGCCTCTCTTTTGTTTTTGTTTTTATTCCCTGTTATGATCTATCT
ATCTATGTAGTTTTCTGGTTTATTTTGATGGTTTTCTCTCATATGAAACTTCTCTGTTTT
GGTTTTGTTGCTTATATATAAAAGCACCATTGAAGT


BQ
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AF RR4H240TF U 1
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BS 1 419 RR4H240TF
BS 420 996 RR4H240JQ

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GGGTCCCACAGACACACAAAAAAACCCTAAAACCACTTCTCTTCAAAGCTGCCCCCAATG
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GTCGAGTCTTCCGCCGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAGGACGACGACTCCTCATCCGAGGAA
GACGAAATTGCCGTGTTACAAGGTATGATCGATTTCAAGAAGGAGACGGGGAAGTCTCCT
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AGAACCAGTTTATGGATAAGATTAGGAGCTTAAGGAAGAAGTACATTGGTAAAGAGAAAC
CGTCATTCACCAAGCTTCATGATCAGAAGTCTTATAGGTTGTGTCAGTACATCTGGGGA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR4H240JQ 800 0 0
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GTACTATGATTATATTAAGAAGTCTATTAGCTTTGAGGTTAGCAAGAACCAGTTTATGGA
TAAGATTAGGAGCTTAAGGAAGAAGTACATTGGTAAAGAGAAACCGTCATTCACCAAGCT
TCATGATCAGAAGTCTTATAGGTTGTGTCAGTACATCTGGGGACCTGATGGGATGGGTCT
TGAGTCTGCGGTTAAGTCGAACGGTGCGTCGAAAAAGAGCCAGAAGAAGACTAAGAAGCT
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TGGTGATGATGATGAGAAAGATGTGGAGTCGTCTGTTGCTGCTAAGAAACATGACTGGTT
CGAGAACTCGTTTCTTGTTAAGGGGATTGCGGGGTTTGGTGTTGATGAGCATTGTGTGAA
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GTTGCAGGCCAAGGAAATTGAGTATGTGTTGCAGAAGACTGAGGTTTTACATGAAGTGAC
CTCTATGATCGCTGAAGCATCTAAGAACAAGCTGTTAGATATATAAGATTGAGTGCAAAT
GCCTCTCTTTTGTTTTTGTTTTTATTCCCTGTTATGATCTATCTATCTATGTAGTTTTCT
GGTTTATTTTGATGGTTTTCTCTCATATGAAACTTCTCTGTTTTGGTTTTGTTGCTTATA
TATAAAAGCACCATTGAAGT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 6

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TTTTTTCCTATGAATCGAATTGTTCCATTATTACTAACAGAATAGAACAAATATTAATCC
TTTCTCCGAAATAATTACCTAAAAAGGGGGGGTCCATAACATAGTTTTTTTCCAATGCAA
TAAAGTTACACAGTGTCTATTTTTCATTGATAAAGGGGTATTTCCATGGGTTTGCCTTGG
TATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTTTCGGTTCATATAATG
CATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCCGGTTCCATGGCTCTATATGAATTAGCTGTTTTT
GATCCCTCCGACCCTGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATGTTCGTTATACCTTTC
ATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCATGGGGCGGTTGGAATATTACAGGAGGGACTATA
ACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACATATCGTGTTTTCTGGC
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GGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCGTATTGCAGCA
GGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGTGTTCGTCCGCCTCAACGTCTA
TACAAAGGATTACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTC
TTTTTTGCAGCTTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATC
GAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTTCAACAAGAAATATAT
CGAAGAGTTAGTGCTGGACTAGCTGAAAATCAAAGTGTATCAGAAGCTTGGTCTAAAATT
CCTGAAAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCAAAAGGGGGATTATTC
CGAGCGGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGGTTAGGACACCCTGTC
TTTAGAAATAAAGAAGGGCGCGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCTACTTTTTTTGAAACA
TTTCCGGTTGTTTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCGGACGTCCCGTTTAGAAGG
GCAGAATCTAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTACGGTGGTGAA
CTCAATGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATATGCTAGACGGGCTCAA
TTGGGTGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCTACTTTGAAATCTGATGGTGTTTTTCGTAGC
AGTCCAAGAGGTTTGTTTACTTTTGGGCATGCTTCGTTTGCTCTACTTTTCTTCTTTGGA
CACATTTGGCACGGTTCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGAT
TTGGATGCTCAGGTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGATCCAACTACAAAAAGA
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TTCATTTTATTTAAATTTTATTTAATTGGGTAGAGTACAATAAAACTAGAGGGAATTTAG
AGCTTTGGAGAAACTTTTGCTCGACTTTTCTTCATGGTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GG03TF U 1
AF RR4GG03JQ C 263
AF RR4GB57JQ C 424
AF RR4AX89TF U 671
AF RR4AX89JQ C 671
AF RR4FX38TF U 1272
BS 1 643 RR4GG03TF
BS 644 644 RR4GG03JQ
BS 645 692 RR4GG03TF
BS 693 1344 RR4AX89TF
BS 1345 1841 RR4FX38TF

RD RR4GG03TF 692 0 0
TTTTTTCCTATGAATCGAATTGTTCCATTATTACTAACAGAATAGAACAAATATTAATCC
TTTCTCCGAAATAATTACCTAAAAAGGGGGGGTCCATAACATAGTTTTTTTCCAATGCAA
TAAAGTTACACAGTGTCTATTTTTCATTGATAAAGGGGTATTTCCATGGGTTTGCCTTGG
TATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTTTCGGTTCATATAATG
CATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCCGGTTCCATGGCTCTATATGAATTAGCTGTTTTT
GATCCCTCCGACCCTGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATGTTCGTTATACCTTTC
ATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCATGGGGCGGTTGGAATATTACAGGAGGGACTATA
ACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACATATCGTGTTTTCTGGC
TTGTGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTAGAAATTTTTTGTGAT
GAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGAATTCATTTATTTCTT
TCAGGAGTGGCTTGCTTTGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAG*ATTATATGGTCCTGGA
ATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GG03JQ 744 0 0
GGGCCGGTTCCATGGCTCTATATGAATTAGCTGTTTTTGATCCCTCCGACCCTGTTCTTG
ATCCAATGTGGAGACAAGGTATGTTCGTTATACCTTTCATGACTCGTTTAGGAATAACCA
ATTCATGGGGCGGTTGGAATATTACAGGAGGGACTATAACGAATCCGGGTCTTTGGAGTT
ACGAAGGGGTAGCCGGAGCACATATCGTGTTTTCTGGCTTGTGCTTCTTGGCAGCTATTT
GGCATTGGGTATATTGGGATCTAGAAATTTTTTGTGATGAACGTACAGGAAAACCTTTTT
TGGATTTGCCCAAGATTTTTGGAATTCATTTATTTCTTTCAGGAGTGGCTTGCTTTGGTT
TTGGCGCATTTCATGTAACAGGATTATATGGTCCTGGAATATGGGTATCCGACCCTTATG
GACTAACCGGAGAGGTCCAACCCGTAAATCCGGCGTGGGGCGTGGAGGGTTTTGACCCTT
TTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCATATTGCAGCAGGGACGTTGGGTATATTAGCGG
GCTTATTCCATCTTAGTGTTCGTCCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATTACGTATGGGAA
ATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGCTTTTATTGTTG
CTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATCGAATTATTTGGTCCTACTCGTT
ATCAATGGGATCAGGGATACTTTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4GB57JQ 583 0 0
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TGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTAGAAATTTTTTGTGATGAA
CGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGAATTCATTTATTTCTTTCA
GGAGTGGCTTGCTTTGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAGGATTATATGGTCCTGGAATA
TGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAGAGGTCCAACCCGTAAATCCGGCGTGGGGC
GTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCATATTGCAGCAGGG
ACGTTGGGTATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGTGTTCGTCCGCCTCAACGTCTATAC
AAAGGATTACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTCTTT
TTTGCAGCTTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATCGAA
TTATTTGGTCCTACTGGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTTC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4AX89TF 674 0 0
G
CGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAACCCGTAAATCCGGCGTGGGGCGTGGAGGG
TTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCGTATTGCAGCAGGGACGTTGGG
TATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGTGTTCGTCCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATT
ACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGC
TTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATCGAATTATTTGG
TCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTTCAACAAGAAATATATCGAAGAGTTAG
TGCTGGACTAGCTGAAAATCAAAGTGTATCAGAAGCTTGGTCTAAAATTCCTGAAAAATT
AGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCAAAAGGGGGATTATTCCGAGCGGGTTC
AATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGGTTAGGACACCCTGTCTTTAGAAATAA
AGAAGGGCGCGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCTACTTTTTTTGAAACATTTCCGGTTGT
TTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCGGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCTAA
ATATAGTGTCGAA

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR4AX89JQ 746 0 0
G
CGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAACCCGTAAATCCGGCGTGGGGCGTGGAGGG
TTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCGTATTGCAGCAGGGACGTTGGG
TATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGTGTTCGTCCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATT
ACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGC
TTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATCGAATTATTTGG
TCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTTCAACAAGAAATATATCGAAGAGTTAG
TGCTGGACTAGCTGAAAATCAAAGTGTATCAGAAGCTTGGTTTAAAATTCCTGAAAAATT
AGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCAAAAGGGGGATTATTCCGAGCGGGTTC
AATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGGTTAGGACACCCTGTCTTTAGAAATAA
AGAAGGGCGCGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCTACTTTTTTTGAAACATTTCCGGTTGT
TTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCGGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCTAA
ATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTACGGTGGTGAACTCAATGGAGT
GAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTG

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR4FX38TF 570 0 0
G
TTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCGGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCTAAA
TATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTACGGTGGTGAACTCAATGGAGTG
AGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATATGCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGATT
TTTGAATTAGATCGTGCTACTTTGAAATCTGATGGTGTTTTTCGTAGCAGTCCAAGAGGT
TTGTTTACTTTTGGGCATGCTTCGTTTGCTCTACTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCAC
GGTTCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCAG
GTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGATCCAACTACAAAAAGACAAGCAGTCTGA
TGCAACATTGCTTTTTTTCTTTTAGTTTCTGTTTGCGATTTTTTTGATTTCATTTTATTT
AAATTTTATTTAATTGGGTAGAGTACAATAAAACTAGAGGGAATTTAGAGCTTTGGAGAA
ACTTTTGCTCGACTTTTCTTCATGGTTTC

QA 2 570 2 570
DS 



AS 1 5

CO CL1121Contig1 1420 5 37 U
GGGTTCTTGTCCACTAGAGAGGTTTTGGAGAGATGGCGAGAAGAGAGAGAAATGAGATGG
TGAAGATGTCAATACTTATGATGATGATGTCATCAACGTTGATGACGATGGTCTACTCTT
CTAGAACAGTCCAAAGAGCTCGTGACGACTCTGAGATCTTAAGAAGACATTTGCTCGCTA
ATGGCCTCGGTGTCACTCCTCCCATGGGGTGGAACAGCTGGAACCATTTCAACTGTAAAA
TTAACGAGAAAGTCATCAAAGAAACTGCTGATGCTTTGGTTACCACTGGCCTCTCTAAGC
TCGGTTACAACTATGTTAACATCGATGATTGCTGGGCTGAACGTGCTCGGGACAAAAAGG
GGAAACTGGTGCCCAAGAAGTCAACGTTCCCTTCTGGTATTAAAGCCCTTGCGGATTATG
TACACAGCAAGGGCCTTAAGCTCGGGATTTACTCTGATGCAGGGTATTTGACATGCAGCA
AAACCATGCCTGGCTCTCTAGGCTATGAGGAGAAAGATGCCAAGACATTTGCAGAATGGG
GAATAGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACCACGACGGCTCGAGACCAACGGTCAGGT
ACCCAGTTATGACACGCGCTCTGATGAAATCTGGCCGCGCCATCTTTCACTCCTTGTGTG
AATGGGGGGACATGCATCCAGCTCTATGGGGAACTCCAATAGGCAACAGTTGGAGAACTA
CTAATGACATCAGTGATAACTGGTCTAGTATGATATCAATTGCAGACATGAACGAAATCT
ATGCTGAGCATGCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCCGGATATGCTTGAAGTTGGAAATG
GAGGGATGACCAAAGATGAGTACATAGTCCATTTCAGCATATGGGCGATCTCTAAGGCTC
CTCTTCTACTTGGCTGTGACATAAGAAACATGACCAAAGAGACTATGGAGATTGTGGCAA
ACAAGGAGGTCATTGCTATTAATCAAGATCCACATGGTGTTCAGGCCAAGAAAGCTAGAA
TGGAAGGTGATATTCAGGTCTGGGCAGGACCATTGTCAGGTTACAGAGTAGCTTTGCTTC
TGTTGAACCGTGGACCAAAAAAATCTGACATTACTGCTTTTTGGGATGATATTGAGATTC
CTGCAAATAGCATTGTTGAAGCCAGAGATCTGTGGAAGCACAAGACATTGAAGCAAAAGT
TTGTAGGGAACTTGACGGCAACAGTTGATTCTCATGCTTGCAAGTTGTATATTCTCAAAC
CTGTTGCCTGATGTAATATCCAATTGTTCTGTAAAAAACAATAACTGTTCGCATCAATAA
AGTGTTCCATGTTATGCTTAAATTTTGAAACGAAACATGTATCTGTATAATGATGAACCC
TTTGCTTCTTTTGTTTGGCGTAAGACACAAGTCAAATAAT


BQ
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5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU86TF U 1
AF RR4H955TF U 71
AF RR4AH62TF U 27
AF RR4EU86JQ C 891
AF RR4AH62JQ C 638
BS 1 38 RR4EU86TF
BS 39 39 RR4AH62TF
BS 40 118 RR4EU86TF
BS 119 119 RR4AH62TF
BS 120 238 RR4EU86TF
BS 239 239 RR4AH62TF
BS 240 241 RR4EU86TF
BS 242 242 RR4AH62TF
BS 243 247 RR4EU86TF
BS 248 248 RR4AH62TF
BS 249 268 RR4EU86TF
BS 269 269 RR4AH62TF
BS 270 342 RR4EU86TF
BS 343 343 RR4AH62TF
BS 344 349 RR4EU86TF
BS 350 350 RR4AH62TF
BS 351 373 RR4EU86TF
BS 374 374 RR4AH62TF
BS 375 406 RR4EU86TF
BS 407 407 RR4AH62TF
BS 408 484 RR4EU86TF
BS 485 485 RR4AH62TF
BS 486 498 RR4EU86TF
BS 499 500 RR4AH62TF
BS 501 523 RR4EU86TF
BS 524 524 RR4AH62TF
BS 525 574 RR4EU86TF
BS 575 575 RR4AH62TF
BS 576 577 RR4EU86TF
BS 578 578 RR4AH62TF
BS 579 585 RR4EU86TF
BS 586 586 RR4AH62TF
BS 587 600 RR4EU86TF
BS 601 700 RR4AH62TF
BS 701 928 RR4AH62JQ
BS 929 929 RR4EU86JQ
BS 930 1420 RR4AH62JQ

RD RR4EU86TF 600 0 0
GGGTTCTTGTCCACTAGAGAGGTTTTGGAGAGATGGCGGGAAGAGAGAGAAATGAGATGG
TGAAGATGTCAATACTTATGATGATGATGTCATCAACGTTGATGACGATGGTCTACTCCT
CTAGAACAGTCCAAAGAGCTCGTGACGACTCTGAGATCTTAAGAAGACATTTGCTCGCTA
ATGGCCTCGGTGTCACTCCTCCCATGGGGTGGAACAGCTGGAACCATTTCAACTGTAACA
TAAACGAAAAAGTCATCAAAGAAACTGCGGATGCTTTGGTTACCACTGGCCTCTCTAAGC
TCGGTTACAACTATGTTAACATCGATGATTGCTGGGCTGAACTTGCTCGTGACAAAAAGG
GGAAACTGGTGCCGAAGAAGTCAACGTTCCCTTCTGGTATTAAAGCGCTTGCGGATTATG
TACACAGCAAGGGCCTTAAGCTCGGGATTTACTCTGATGCAGGGTATTTGACATGCAGCA
AAACGATGCCTGGCTCTCAGGGCTATGAGGAGAAAGATGCCAATACATTTGCAGAATGGG
GAATAGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACCATGATGGCTCGAAACCAACGGTCAGGT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4H955TF 524 0 0
AATACTTATGATGATGATGTCATCAACGTTGATGACGATGGTCTACTCTTCTAGAACAGT
CCAAAGAGCTCGTGACGACTCTGAGATCTTAAGAAGACATTTGCTCGCTAATGGCCTCGG
TGTCACTCCTCCCATGGGGTGGAACAGCTGGAACCATTTCAACTGTAAAATTAACGAGAA
AGTCATCAAAGAAACTGCTGATGCTTTGGTTACCACTGGCCTCTCTAAGCTCGGTTACAA
CTATGTTAACATCGATGATTGCTGGGCTGAACGTGCTCGGGACAAAAAGGAAAAACTGGT
GCCCAAGAAGTCAACGTTCCCTTCTGGTATTAAAGCCCTTGCGGATTATGTACACAGCAA
GGGCCTTAAGCTCGGGATTTACTCTGATGCAGGGTATTTGACATGCAGCAAAACCATGCC
TGGCTCTCTAGGCTATGAGGAGAAAGATGCCAAGACATTTGCAGAATGGGGAATAGATTA
CTTGAAGTATGACTACTGCAACCACGACGGCTCGAGACCAACGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4AH62TF 674 0 0
GGAGAGATGGCGAGAAGAGAGAGAAATGAGATGGTGAAGATGTCAATACTTATGATGATG
ATGTCATCAACGTTGATGACGATGGTCTACTCTTCTAGAACAGTCCAAAGAGCTCGTGAC
GACTCTGAGATCTTAAGAAGACATTTGCTCGCTAATGGCCTCGGTGTCACTCCTCCCATG
GGGTGGAACAGCTGGAACCATTTCAACTGTAAAATTAACGAGAAAGTCATCAAAGAAACT
GCTGATGCTTTGGTTACCACTGGCCTCTCTAAGCTCGGTTACAACTATGTTAACATCGAT
GATTGCTGGGCTGAACGTGCTCGGGACAAAAAGGGGAAACTGGTGCCCAAGAAGTCAACG
TTCCCTTCTGGTATTAAAGCCCTTGCGGATTATGTACACAGCAAGGGCCTTAAGCTCGGG
ATTTACTCTGATGCAGGGTATTTGACATGCAGCAAAACCATGCCTGGCTCTCTAGGCTAT
GAGGAGAAAGATGCCAAGACATTTGCAGAATGGGGAATAGATTACTTGAAGTATGACAAC
TGCAACCACGACGGCTCGAGACCAACGGTCAGGTACCCAGTTATGACACGCGCTCTGATG
AAATCTGGCCGCGCCATCTTTCACTCCTTGTGTGAATGGGGGGACATGCATCCAGCTCTA
TGGGGAACTCCAAT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4EU86JQ 320 0 0
TCTAAGGCTCCTCTTCTACTTGGGTGTGACATAAGAAACATGACCAAAGAGACTATGGAG
ATTGTGGCAAACAAGGAGGTCATTGCTATTAATCAAGATCCACATGGTGTTCAGGCCAAG
AAAGCTAGAATGGAAGGTGATATTCAGGTCTGGGCAGGACCATTGTCAGGTTACAGAGTA
GCTTTGCTTCTGTTGAACCGTGGACCAAAAAAATCTGACATTACTGCTTTTTGGGATGAT
ATTGAGATTCCTGCATATAGCATTGTTGAAGCCAGAGATCTGTGGAAGCACAGGACATTG
AAGCAAAAGTTTGTAGGGA
A

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4AH62JQ 783 0 0
CG
CCATCTTTCACTCCTTGTGTGAATGGGGGGACATGCATCCAGCTCTATGGGGAACTCCAA
TAGGCAACAGTTGGAGAACTACTAATGACATCAGTGATAACTGGTCTAGTATGATATCAA
TTGCAGACATGAACGAAATCTATGCTGAGCATGCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCCGG
ATATGCTTGAAGTTGGAAATGGAGGGATGACCAAAGATGAGTACATAGTCCATTTCAGCA
TATGGGCGATCTCTAAGGCTCCTCTTCTACTTGGCTGTGACATAAGAAATATGACCAAAG
AGACTATGGAGATTGTGGCAAACAAGGAGGTCATTGCTATTAATCAAGATCCACATGGTG
TTCAGGCCAAGAAAGCTAGAATGGAAGGTGATATTCAGGTCTGGGCAGGACCATTGTCAG
GTTACAGAGTAGCTTTGCTTCTGTTGAACCGTGGACCAAAAAAATCTGACATTACTGCTT
TTTGGGATGATATTGAGATTCCTGCAAATAGCATTGTTGAAGCCAGAGATCTGTGGAAGC
ACAAGACATTGAAGCAAAAGTTTGTAGGGAACTTGACGGCAACAGTTGATTCTCATGCTT
GCAAGTTGTATATTCTCAAACCTGTTGCCTGATGTAATATCCAATTGTTCTGTAAAAAAC
AATAACTGTTCGCATCAATAAAGTGTTCCATGTTATGCTTAAATTTTGAAACGAAACATG
TATCTGTATAATGATGAACCCTTTGCTTCTTTTGTTTGGCGTAAGACACAAGTCAAATAA
T

QA 3 783 3 783
DS 



AS 1 7

CO CL1122Contig1 516 7 10 U
GGGCCGGGGGACAAATTATTAAATCTAAATCAAAAACAGAAAAGATCAATCAGAAAAGAA
AACATATAAAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTTATTTTGGTGATCA
TATTGATTTCTACAGAAATACAAAATGGACATGCTCACCCGTTGAATATATATTGTAAGA
AAGTACGAAGCAAGACGGCTCCACCTGACACTTGTAATAAAAAAAATGCTGATGCATTGT
GCAAAAACACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGTCTAATACTTCCAA
AGACTACAAATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCAAAATGCCCAGGAA
GCTAATTCTGTAGACTATGATATTGTATAATTTAAAATTCTCAATCTAACTACTACTTAA
TATCAATAATAATAAGTAACAAGATCTTGATGTGCATCCGCACGAGATATCTATCAATTA
ATCATTAGTTGTATTTATATTTAAATTCATATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F677TF U 1
AF RR4BF32JQ C 9
AF RR4BS03JQ C 327
AF RR4AF82JQ C 46
AF RR4AF82TF U 46
AF RR4BS03TF U 9
AF RR4BF32TF U 9
BS 1 209 RR4F677TF
BS 210 210 RR4AF82TF
BS 211 227 RR4F677TF
BS 228 228 RR4AF82TF
BS 229 363 RR4F677TF
BS 364 365 RR4AF82TF
BS 366 418 RR4F677TF
BS 419 497 RR4AF82TF
BS 498 508 RR4BS03TF
BS 509 516 RR4BF32TF

RD RR4F677TF 418 0 0
GGGCCGGGGGACAAATTATTAAATCTAAATCAAAAACAGAAAAGATCAATCAGAAAAGAA
AACATATAAAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTTATTTTGGTGATCA
TATTGATTTCTACAGAAATACAAAATGGACATGCTCACCCGTTGAATATATATTGTAAGA
AAGTACGAAGCAAGACGGCTCCACCTGACTCTTGTAATAAAAAAAATTCTGATGCATTGT
GCAAAAACACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGTCTAATACTTCCAA
AGACTACAAATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCAAAATGCCCAGGAA
GCT**TTCTGTAGACTATGATATTGTATAATTTAAAATTCTCAATCTAACTACTACTT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4BF32JQ 508 0 0
GGACAAATTATTAAATCTAAATCAAAAACAGAAAAGATCAATCAGAAAAGAAAACATATA
AAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTTATTTTGGTGATCATATTGATT
TCTACAGAAATACAAAATTGACATGCTCACCCGTTGAATATATATTGTAAGAAAGTACGA
AGCAAGACGGCTCCACCTGACACTTGTAATAAAAAAAATGCTGATGCATTGTGCAAAAAC
ACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGTCTAATACTTCCAAAGACTACA
AATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCAAAATGCCCAGGAAGCTAATTC
TGTAGACTATGATATCGTATAATTTAAAATTCTCAATCTAACTACTACTTAATATCAATA
ATAATAAGTAACAAGATCTTGATGTGCATCCGCACGAGATATCTATCAATTAACCTTTAG
TTGTATTTATATTTAAATTCATATTTTT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4BS03JQ 182 0 0
TACCATTTCGACGATGGATCAAAATGCCCAGGAAGCTAATTCTGTAGACTATGATATTGT
ATAATTTAAAATTCTCAATCTAACTACTAATTAATATCAATAATAATAAGTAACAAGATC
TTGATGTGCATCCGCACGAGATATCTATCAATTAATCATTAGTTGTATTTATATTTAAAT
TC

QA 1 182 1 182
DS 

RD RR4AF82JQ 453 0 0
GG
AATCAGAAAAGAAAACATATAAAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTT
ATTTTGGTGATCATATTGATTTCTACAGAAATACAAAATGGACATGCTCACCCGTTGAAT
ATATATTGTAAGAAAGTACGAAGCAAGACGGCTCCACCTGACACTTGTAATAAAAAAAAT
GCTGATGCATTGTGCAAAAACACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGT
CTAATACTTCCAAAGACTACAAATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCA
AAATGCCCAGGAAGCTAATTCTGTAGACTATGATATTGTATAATTCAAAATTCTCAATCT
AACTACTACTTAATATCAATAATAATAAGTAACAAGATCTTGATGTGCATCCGCACGAGA
TATCTATCAATTAATCATTAGTTGTATTTA
G

QA 3 452 3 452
DS 

RD RR4AF82TF 453 0 0
GG
AATCAGAAAAGAAAACATATAAAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTT
ATTTTGGTGATCATATTGATTTCTACAGAAATACAAAATGGACATGCTCACCCGTTGAAT
ATATATTGTAAGAAAGTACGAAGCAAGACGGCTCCACCTGACACTTGTAATAAAAAAAAT
GCTGATGCATTGTGCAAAAACACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGT
CTAATACTTCCAAAGACTACAAATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCA
AAATGCCCAGGAAGCTAATTCTGTAGACTATGATATTGTATAATTCAAAATTCTCAATCT
AACTACTACTTAATATCAATAATAATAAGTAACAAGATCTTGATGTGCATCCGCACGAGA
TATCTATCAATTAATCATTAGTTGTATTTA
G

QA 3 452 3 452
DS 

RD RR4BS03TF 500 0 0
GGACAAATTATTAAATCTAAATCAAAAACAGAAAAGATCAATCAGAAAAGAAAACATATA
AAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTTATTTTGGTGATCATATTGATT
TCTACAGAAATACAAAATGGACATGCTCACCCGTTGAATATATATTGTAAGAAAGTACGA
AGCAAGACGGCTCCACCTGACACTTGTAATTAAAAAAATGCTGATGCATTGTGCAAAAAC
ACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGTCTAATACTTCCAAAGACTACA
AATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCAAAATGCCCAGGAAGCTAATTC
TGTAGACTATGATATTGTATAATTTAAAATTCTCAATCTAACTACTAATTAATATCAATA
ATAATAAGTAACAAGATCTTGATGTGCATCCGCACGAGATATCTATCAATTAATCATTAG
TTGTATTTATATTTAAATTC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4BF32TF 508 0 0
GGACAAATTATTAAATCTAAATCAAAAACAGAAAAGATCAATCAGAAAAGAAAACATATA
AAAATGGACAGCAGCGTAAAAAGTTTTTTGTTCATTGTTATTTTGGTGATCATATTGATT
TCTACAGAAATACAAAATTGACATGCTCACCCGTTGAATATATATTGTAAGAAAGTACGA
AGCAAGACGGCTCCACCTGACACTTGTAATAAAAAAAATGCTGATGCATTGTGCAAAAAC
ACTTGTTGGACAAGAGAAACTTATATCGAAGGAAAATGTCTAATACTTCCAAAGACTACA
AATAAAGCTTGCTACTGCTACCATTTCGACGATGGATCAAAATGCCCAGGAAGCTAATTC
TGTAGACTATGATATCGTATAATTTAAAATTCTCAATCTAACTACTACTTAATATCAATA
ATAATAAGTAACAAGATCTTGATGTGCATCCGCACGAGATATCTATCAATTAACCTTTAG
TTGTATTTATATTTAAATTCATATTTTT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 7

CO CL1123Contig1 1179 7 7 U
ACGCTTATAACAAAAATCTGATATGCCATATGGATTTAACTGTACTACAAATATGTCTGG
TAGAGGTTTTGTTGACAAGTTTTAGCAACAAAATGTTTCACCTTATTTAGTAAGTATGTT
TCTTTTTTGGGCGCAAAATACATATATGAATACATAATTACATAAGTCACCCTGTATTAC
TCAGTACTTATTTATGCTTCAACACTCCATCATGCTTATGTTTTAACTCGCTCTCTAATC
GTCCGTTAGATTCAGAGGTTCTATCCACCAGCCACTTTATGACATCAGTAAATACGATTT
CTGAATTTTCAGGAGTTTCTCCATACAATAAAGCATGCCACATGTTAGGGTAAAGCTTGA
CTGTTTTGTCCGAGCTTGAAGCCACTTCATATAGCATTTTGCTGACGCTTTTGTCCGTCA
CTTTATCATCTTCTCCGTGAAGAACAATGAAGGGAATCGATACCTCGTGAAGATTCTTCT
CGAGATCCAAGCTAACCAGCAAAAGTTGGTAGGCAGTTTTGAGGCGAGGCCGGCCTTTGT
AGCAATATTCGTTCTCCCTCACCTGAGTTCTGATGTGAGGTTCTTTAATCGCAATGTCAA
GAATATCACTGCCTGGAACTATTTTCCACGTTGGAATAAACGAGCAAAGCTTTATGAGAA
TTGAGATCACTACTGGATGTGGCTTTACCTCTTCAGCTAACTTACACATAGGTGCGACCA
AAACGGCACCGTCCCAAAATTCAGGATTCTTTCTAGCTAAGAGCAACACAACTGCTCCTC
CCATGGATTCTCCAAGTAGAAACCTCATCTTCCCTTTATTCTCTTCTTTCTCACAAATTG
TAGAGTAATGAATAGAGACATCATCAACTAGATCATCAAAGTTACTGATGTAACCACTTA
ATCCCTCGGATTTTCCGTGTCCTTCATAGTCCATTCCATAGACTGCAAACCCAGCCTTGG
CTAGCCTCGTCGCTGTACTGTTCATGGTGATACTGGACTCCGCAGCGTAACCGTGGCATA
AGAAGAGCAACGCCTTTGGTTCTTGCTTGACCGGTTTCCATACACAAGTGAACAACTTCA
TGCCTCGTGAGTTCAACACAAAATTCTCTTCATACATAACCATGATGCTCTGTTTGTATA
CGAAGATTATGATATTTTGTTTGTTTTAAGGGCGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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ATTCAGAGGTTCTATCCACCAGCCACTTTATGACATCAGTAAATACGATTTCTGAATTTT
CAGG

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DS 

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TCTTTTTTGGGCGCAAAATACATATATGAATACATAATTACATAAGTCACCCTGTATTAC
TCAGTACTTATTTATGCTTCAACACTCCATCATGCTTATGTTTTAACTCGCTCTCTAATC
GTCCGTTAGATTCAGAGGTTCTATCCACCAGCCACTTTATGACATCAGTAAATACGATTT
CTGAATTTTCAGGAGTTTCTCCATACAATAAAGCATGCCACATGTTAGGGTAAAGCTTGA
CTGTTTTGTCCGAGCTTGAAGCCACTTCATATAGCATTTTGCTGACGCTTTTGTCCGTCA
CTTTATCATCTTCTCCGTGAAGAACAATGAAGGGAATCGATACCTCGTGAAGATTCTTCT
CGAGATCCAAGCTAACCAGCAAAAGTTGGTAGGCAGTTTTGAGGCGAGGCCGGCCTTTGT
AGCAATATTCGTTCTCCCTCACCTGAGTTCTGATGTGAGGTTCTTTAATCGCAATGTCAA
GAATATCACTGCCTGGAACTATTTTCCACGTTGGAATAAACGAGCAAAGCTTTATGAGAA
TTGAGATCACTACTGGATGTGGCTTTACCTCTTCAGCTAACTTGCACATAGGTGCGACCA
AAACGGCACCGTCCCAAAATTCAGGATTCTTTCTAGCTAAGAGCAACACAACTGCTCCTC
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TAGAGTAATGAATAGAGACATCATCAACTA

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G
GGCGCAAAATACATATATGAATACATAATTACATAAGTCACCCTGTATTACTCAGTACTT
ATTTATGCTTCAACACTCCATCATGCTTATGTTTTAACTCGCTCTCTAATCGTCCGTTAG
ATTCAGAGGTTCTATCCACCAGCCACTTTATGACATCAGTAAATACGATTTCTGAATTTT
CAGGAGTTTCTCCATACAATAAAGCATGCCACATGTTAGGGTAAAGCTTGACTGTTTTGT
CCGAGCTTGAAGCCACTTCATATAGCATTTTGCTGACGCTTTTGTCCGTCACTTTATCAT
CTTCTCCGTGAAGAACAATGAAAGGAATCGATACCTCGTGAAGATTCTTCTCGAGATCCA
AGCTAACCAGCAAAAGTTGGTAGGCAGTTTTGAGGCGAGGCCGGCCTTTGTAGCAATATT
CGTTCTCCCTCACCTGAGTTCTGATGTGAGGTTCTTTAATCGCAATGTCAAGAATATCAC
TGCCTGGAACTATTTTCCACGTTGGAATAAACGAGCAAAGCTTTATGAGAATTGAGATCA
CTACTGGATGTGGCTTTACCTCTTCAGCTAACTTACACATAGGTGCGACCAAAACGGCAC
CGTCCCAAAATTCAGGATTCTTTCTAGCTAAGAGCAACACAACTGCTCCTCCCATGGATT
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GAATAGAGACATCATCAACTAGATCATCAAAGTTACTGATGTAACCACTTAATCCCTCGG
ATTTTCCGTGTCCTTCATAGTCCATTCCATAGACTGCAAACCCAGCCTTGGCTAGC

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TAATTACATAAGTCACCCTGTATTACTCAGTACTTATTTATGCTTCAACACTCCATCATG
CTTATGTTTTAACTCGCTCTCTAATCGTCCGTTAGATTCAGAGGTTCTATCCACCAGCCA
CTTTATGACATCAGTAAATACGATTTCTGAATTTTCAGGAGTTTCTCCATACAATAAAGC
ATGCCACATGTTAGGGTAAAGCTTGACTGTTTTGTCCGAGCTTGAAGCCACTTCATATAG
CATTTTGCTGACGCTCTTGTCCGTCACTTTATCATCTTCTCCGTGAAGAACAATGAAAGG
AATCGATACCTCGTGAAGATTCTTCTCGAGATCCAAGCTAACCAGCAAAAGTTGGTAGGC
AGTTTTGAGGCGAGGCCGGCCTTTGTAGCAATATTCGTTCTCCCTCACCTGAGTTCTGAT
GTGAGGTTCTTTAATCGCAATGTCAAGAATATCACTGCCTGGAACTATTTTCCACGTTGG
AATAAACGAGCAAAGCTTTATGAGAATTGAGATCACTACTGGATGTGGCTTTACCTCTTC
AACTAACTTACACATAGGTGCGACCAAAACGGCACCGTCCCAAAATTCAGAATTCTTTCT
AGCTAAGAGCAACACAACTGCTCCTCCCATGGATTCTCCAAGTAGAAACCTCATCTTCCC
TTTATTCTCTTCTTTCTCACAAATTGTAGAGTAATGAATAGAGACATCATCAACTAGATC
ATCAAAGTTACTGATGTAACCACTTAATCCCTCGGATTTTCCGTGTCCTTCATAGTCCAT
TCCATAGACTGCAAACCCAGCCTTGGCTAGCCTCGTCGCTGTACTGTTCATGGTGATACT
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GAGCACGCCTTTG

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ATGTCAAGAATATCACTGCCTGGAACTATTTTCCACGTTGGAATAAACGAGCAAAGCTTT
ATGAGAATTGAGATCACTACTGGATGTGGCTTTACCTCTTCAGCTAACTTGCACATAGGT
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GCTCCTCCCATGGATTCTCCAAGTAGAAACCTCATCTTCCCTTTATTCTCTTCTTTCTCA
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CCACTTAATCCCTCGGATTTTCCGTGTCCTTCATAGTCCATTCCATAGACTGCAAACCCA
GCCTTGGCTAGCCTCGTCGCTGTACTGTTCATGGTGATACTGGACTCCGCAGCGTAACCG
TGGCATAAGAAGAGCAACGCCTTTGGTTCTTGCTTGACCGGTTTCCATACACAAGTGAAC
AACTTCATGCCTCGTGAGTTCAACACAAAATTCTCTTCATACATAACCATGATGCTCTGT
TTGTATACGAAGATTATGATATTTTGTTTGTTTTAAGGGCGTATCC

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TACCTCTTCAGCTAACTTACACATAGGTGCGACCAAAACGGCACCGTCCCAAAATTCAGG
ATTCTTTCTAGCTAAGAGCAACACAACTGCTCCTCCCATGGATTCTCCAAGTAGAAACCT
CATCTTCCCTTTATTCTCTTCTTTCTCACAAATTGTAGAGTAATGAATAGAGACATCATC
AACTAGATCATCAAAGTTACTGATGTAACCACTTAATCCCTCGGATTTTCCGTGTCCTTC
ATAGTCCATTCCATAGACTGCAAACCCAGCCTTGGCTAGCCTCGTCGCTGTACTGTTCAT
GGTGATACTGGACTCCGCAGCGTAACCGTGGCATAAGAAGAGCAACGCCTTTGGTTCTTG
CTTGACCGGTTTCCATACACAAGTGAACAACTTCATGCCTCGTGAGTTCAACACAAAATT
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T

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ATATCACTGCCTGGAACTATTTTCCACGTTGGAATAAACGAGCAAAGCTTTATGAGAATT
GAGATCACTACTGGATGTGGCTTTACCTCTTCAACTAACTTACACATAGGTGCGACCAAA
ACGGCACCGTCCCAAAATTCAGAATTCTTTCTAGCTAAGAGCAACACAACTGCTCCTCCC
ATGGATTCTCCAAGTAGAAACCTCATCTTCCCTTTATTCTCTTCTTTCTCACAAATTGTA
GAGTAATGAATAGAGACATCATCAACTAGATCATCAAAGTTACTGATGTAACCACTTAAT
CCCTCGGATTTTCCGTGTCCTTCATAGTCCATTCCATAGACTGCAAACCCAGCCTTGGCT
AGCCTCGTCGCTGTACTGTTCATGGTGATACTGGACTCCGCAGCGTAACCGTGGCATAAG
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CCTCGTGAGTTCAACACAAAATTCTCTTCATACATAACCATGATGCTCTGTTTGTATACG
AAGATTATGATATTTTGTTTGTTTTAAGGGCGTATC
C

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 7

CO CL1124Contig1 1304 7 5 U
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TTGAGGAAACAATAAGGGATGCCGTGGAAGATTCAATCACATGGCCTGTTCGGAAGGTCA
TCCCGATTTTGCCTGGTGATTATAGTGATCTGGAGCTAAAGCCTGTTGGAGTGTTGGAGG
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TTGCCAAAATGTTCATACGCCCTTTACGAGAAAAAACTCAAAGAAGCAAGACAATTAACA
ATGACCTGAATCCCATCTGGAATGAGCATTTTGAATTTGTCGTGGAGGACGCGTCAACCC
AACATCTAGTGGTTAGAGTATATGACGACGAGGGTGTGCAGGCATCTGAGCTTCTTGGTT
GTGCCCAAATCCGGCTTTGTGAACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGC
TGGTCAAAGATTTAGAGATCCAAAGAGATAATAAGAACCGTGGAGAGGTTCACCTTGAGC
TACTATATGCCCCTTTCGGTGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGATGA
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TACCGATACAAGATCTGATGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAAT
CTGGTGCTAAGAGCAAAACTCGGGTGGTCAATGACAGCTTAAACCCTGTCTGGAACCAGA
CTTTTGATTTTGTAGTTGAAGACGGGTTACACGACATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACC
ATGACACCTTTGGAAAGGACTACATTGGGAGATGCATCTTGACGTTGACAAGGGTTATAA
TGGAAGAGGAATACACAGACTGGTTCCAGTTAGACGAATCCAAAGCGGGCAAGCTTCAGC
TGCATCTCAAGTGGATGGCTCAGTCAATTTATCGCGATTCCTAAGTTCGTTTTCTTGGGT
TCTCTCAACTTGGAATGTACATTATGTCTAGTAAGCCTCAAAACGGATTATTTTTTTCTG
TCAAACAGAGACGAGTCTGCATGTGTAGCTGAGAAAGCTAGAGACTTGGAAATGAGTTCC
CTCTAGTTCTGTGAAAACCCTAGGCAATACTTATGTTACTTGCACTATAAGGGAACGTGA
AACAGCCACACAGAGCACGAATATCATAAGGTTTATTATGCTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ87TF U 1
AF RR4AV15TF U 1
AF RR4F459TF U 250
AF RR4AH37TF U 438
AF RR4AZ87JQ C 371
AF RR4AV15JQ C 440
AF RR4AH37JQ C 485
BS 1 852 RR4AV15TF
BS 853 947 RR4F459TF
BS 948 1197 RR4AH37TF
BS 1198 1245 RR4AZ87JQ
BS 1246 1304 RR4AH37JQ

RD RR4AZ87TF 797 0 0
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TTGAGGAAACAATAAGGGATGCCGTGGAAGATTCAATCACATGGCCTGTTCGGAAGGTCA
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TAAAGCTTGTGCAAGCGAAGAACTTGACCAACAAAGATCTAGTGGGAAAATCAGACCCCT
TTGCCAAAATGTTCATACGCCCTTTACGAGAAAAAACTCAAAGAAGCAAGACAATTAACA
ATGACCTGAATCCCATCTGGAATGAGCATTTTGAATTTGTCGTGGAGGACGCGTCAACCC
AACATCTAGTGGTTAGAGTATATGACGACGAGGGTGTGCAGGCATCTGAGCTTCTTGGTT
GTGCCCAAATCCGGCTTTGTGAACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGC
TGGTCAAAGATTTAGAGATCCAAAGAGATAATAAGAACCGTGGAGAGGTTCACCTTGAGC
TACTATATGCCCCTTTCGGTGCGGGAAACGCCGTATATCCCTTTACCGCTTCATCGATGA
CTTCATTAGAAAAGGTGCTGAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTA
AAAGAAAAGATGTCATCGTAAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGA
TACCGATACAAGATCTGATGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAAT
CTGGTGCTAAGAGCAAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4AV15TF 852 0 0
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TTGAGGAAACAATAAGGGATGCCGTGGAAGATTCAATCACATGGCCTGTTCGGAAGGTCA
TCCCGATTTTGCCTGGTGATTATAGTGATCTGGAGCTAAAGCCTGTTGGAGTGTTGGAGG
TAAAGCTTGTGCAAGCGAAGAACTTGACCAACAAAGATCTAGTGGGAAAATCAGACCCCT
TTGCCAAAATGTTCATACGCCCTTTACGAGAAAAAACTCAAAGAAGCAAGACAATTAACA
ATGACCTGAATCCCATCTGGAATGAGCATTTTGAATTTGTCGTGGAGGACGCGTCAACCC
AACATCTAGTGGTTAGAGTATATGACGACGAGGGTGTGCAGGCATCTGAGCTTCTTGGTT
GTGCCCAAATCCGGCTTTGTGAACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGC
TGGTCAAAGATTTAGAGATCCAAAGAGATAATAAGAACCGTGGAGAGGTTCACCTTGAGC
TACTATATGCCCCTTTCGGTGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGATGA
CTTCATTAGAAAAGGTGCTGAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTA
AAAGAAAAGATGTCATCGTAAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGA
TACCGATACAAGATCTGATGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAAT
CTGGTGCTAAGAGCAAAACTCGGGTGGTCAATGACAGCTTAAACCCTGTCTGGAACCAGA
CTTTTGATTTTG

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4F459TF 698 0 0
G
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TCCCATCTGGAATGAGCATTTTGAATTTGTCGTGGAAGACGCGTCAACCCAACATCTAGT
GGTTAGAGTATATGACGACGAGGGTGTGCAGGCATCTGAGCTTCTTGGTTGTGCCCAAAT
CCGGCTTTGTGAACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGCTGGTCAAAGA
TTTAGAGATCCAAAGAGATAATAAGAACTGTGGAGAGGTTCACCTTGAGCTACTATATGT
CCCTTTCGGTGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGATGACTTCATTAGA
AAAGGTGCTGAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTAAAAGAAAAGA
TGTCATCGTAAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACA
AGATCTGATGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCTGGTGCTAA
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TGTAGTTGAAGACGGGTTACACGACATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGACACCTT
TGGAAAGGACTACATTGGGAGATGCATCTTGACGTTG

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DS 

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G
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TCCAAAGAGATAATAAGAACCGTGTAGAGGTCCACCTTGAGCTACTATATGTCCCTTTCG
GTGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGACGACTTCATTAGAAAAGGTGC
TGAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTAAAAGAAAAGATGTCATCG
TAAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACAAGATCTGA
TGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCTGGTGCTAAGAGCAAAA
CTCAGGTGGTCAATGACAGCTTAAACCCTGTCTGGAACCAGACTTTTGATTTTGTAGTTG
AAGACGGGTTACACGACATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGACACCTTTGGAAAGG
ACTACATTGGGAGATGCATCTTGACGTTGACAAGGGTTATAATGGAAGAGGAATACACAG
ACTGGTTCCAGTTAGACGAATCCAAAGCGGGCAAGCTTCAGCTGCATCTCAAGTGGATGG
CTCAGTCAATTTATCGCGATTCCTAAGTTCGTTTTCTTGGGTTCTCTCAACTTGGAATGT
ACATTATGTCTAGTAAGCCTCAAAACGGATTATTTTTTTCTGTCAAACAGAGACGAGTCT
GCATGTGTAGCTGAGAAAGCTAGAGACTTGGAAATGAGT

QA 2 760 2 760
DS 

RD RR4AZ87JQ 876 0 0
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CCGGCTTTGTGAACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGCTGGTCAAAGA
TTTAGAGATCCAAAGAGATAATAAGAACCGTGGAGAGGTTCACCTTGAGCTACTATATGC
CCCTTTCGGTGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGATGACTTCATTAGA
AAAGGTGCTGAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTAAAAGAAAAGA
TGTCATCGTAAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACA
AGATCTGATGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCTGGTGCTAA
GAGCAAAACTCGGGTGGTCAATGACAGCTTAAACCCTGTCTGGAACCAGACTTTTGATTT
TGTAGTTGAAGACGGGTTACACGACATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGACACCTT
TGGAAAGGACTACATTGGGAGATGCATCTTGACGTTGACAAGGGTTATAATGGAAGAGGA
ATACACAGACTGGTTCCAGTTAGACGAATCCAAAGCGGGCAAGCTTCAGCTGCATCTCAA
GTGGATGGCTCAGTCAATTTATCGCGATTCCTAAGTTCGTTTTCTTGGGTTCTCTCAACT
TGGAATGTACATTATGTCTAGTAAGCCTCAAAACGGATTATTTTTTTCTGTCAAACAGAG
ACGAGTCTGCATGTGTAGCTGAGAAAGCTAGAGACTTGGAAATGAGTTCCCTCTAGTTCT
GTGAAAACCCTAGGCAATACTTATGTTACTTGCAC
G

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DS 

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TGAACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGCTGGTCAAAGATTTAGAGAT
CCAAAGAGATAATAAGAACCGTGGAGAGGTTCACCTTGAGCTACTATATGCCCCTTTCGG
TGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGATGACTTCATTAGAAAAGGTGCT
GAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTAAAAGAAAAGATGTCATCGT
AAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACAAGATCTGAT
GGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCTGGTGCTAAGAGCAAAAC
TCGGGTGGTCAATGACAGCTTAAACCCTGTCTGGAACCAGACTTTTGATTTTGTAGTTGA
AGACGGGTTACACGACATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGACACCTTTGGAAAGGA
CTACATTGGGAGATGCATCTTGACGTTGACAAGGGTTATAATGGAAGAGGAATACACAGA
CTGGTTCCAGTTAGACGAATCCAAAGCGGGCAAGCTTCAGCTGCATCTCAAGTGGATGGC
TCAGTCAATTTATCGCGATTCCTAAGTTCGTTTTCTTGGGTTCTCTCAACTTGGAATGTA
CATTATGTCTAGTAAGCCTCAAAACGGATTATTTTTTTCTGTCAAACAGAGACGAGTCTG
CATGTGTAGCTGAGAAAGCTAGAGACTTGGAAATGAGTTCCCTCTAGTTCTGTGAAAACC
CTAGGCAATACTTATGTTACTTGCAC
G

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DS 

RD RR4AH37JQ 820 0 0
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ATATGTCCCTTTCGGTGCGGGAAACGCCGTAAATCCCTTTACCGCTTCATCGACGACTTC
ATTAGAAAAGGTGCTGAAGAATGATGCAACAGACGAAGTGAATGCATCATCGCGTAAAAG
AAAAGATGTCATCGTAAGAGGAGTGCTCTCTGTGACAGTGATATCTGCAGAAGAGATACC
GATACAAGATCTGATGGGGAAAGCTGATCCATTTGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCTGG
TGCTAAGAGCAAAACTCAGGTGGTCAATGACAGCTTAAACCCTGTCTGGAACCAGACTTT
TGATTTTGTAGTTGAAGACGGGTTACACGACATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGA
CACCTTTGGAAAGGACTACATTGGGAGATGCATCTTGACGTTGACAAGGGTTATAATGGA
AGAGGAATACACAGACTGGTTCCAGTTAGACGAATCCAAAGCGGGCAAGCTTCAGCTGCA
TCTCAAGTGGATGGCTCAGTCAATTTATCGCGATTCCTAAGTTCGTTTTCTTGGGTTCTC
TCAACTTGGAATGTACATTATGTCTAGTAAGCCTCAAAACGGATTATTTTTTTCTGTCAA
ACAGAGACGAGTCTGCATGTGTAGCTGAGAAAGCTAGAGACTTGGAAATGAGTTCCCTCT
AGTTCTGTGAAAACCCTAGGCAATACTTATGTTACTTGCACTATAAGGGAACGTGAAACA
GCCACACAGAGCACGAATATCATAAGGTTTATTATGCTTT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 7

CO CL1125Contig1 1423 7 10 U
GGACGTAGTCTAAAATCGAGGATGAGGCCAAAGAGGAGGAGATGTCAGCCTCAAATTTGA
TCAGGAGGAGGAGCGTGTACGACGTCGCAATGAAGGTGGCCGTCATCGGAAGCGGAATAT
CAGGAGCAGTGTGCGCATCGACTCTGGCGAGGAATGGAGTCTCCGTCACTATCTTCGACT
CCGCTCGTGGTCCCGGTGGCCGCATGTCTCAAAGAAGGGAGGTTGGGGAAGATGGGAAGG
AGTTGACGTTCGACCATGGAGCTCCGTGTTTCTCAGTGACCAACCCTGATGCTATCTCCC
TTGTTCACGAGTGGGAGTCTATAGGTCTTGTTTCTCAATGGAAACAAGTTTTCGGCTCTT
TCGACTCTGCCTCCAACATGTTTCTTGGCTTCCAACAGGAAGGGGATCATACCAACAACA
TCAAGTATGTGGGTGTTCCAGGCATGAACTCTATATCAAAGGCCTTGTGCAACCACTCCG
GTGTTGAATCTATGTTTGGAACTGGTATTGCCAAGCTGGAGTGGTTAGAGGAAGAGATAC
CATGGCTGTTAAAAGATTCTAAAGGACAAAACTTGGGTCGTTTTCATGGAGTGGTTGCAT
CTGATAAAAACATTGTTTCTCCAAGGTTTACTCAACTAACTGGACTCCCACCTCCTCTTG
ACTTGAATCTTGTCCCGGAGTTGGCCACTACTAAGCTCCAAGATATTCCTGTTTTGCCAC
GCTTTTCTCTTATGCTTGCTTTTAAAGAACCATTGTCTTTGATGCCAGCAAAAGGCTTAT
CTTTCAAGAATTCTGAGATTTTGAGCTGGGCTCACTGTGATAGCACTAAGCCAGGGCGGT
CTACTGATAGTGAAAGATGGATACTGCATTCTACTCCAGGCTATGCCAGCAGTGTTATTG
CCAAAACCGGCCTCCAAAAGCTATCGAGCGAAACACTCAACAAAATAGCTGAAGAGATGT
TCAAAGAGTTTCAGTGCTCAGGGCTTGTTAATTCTTTACCCTTTTTCATGAAAGCCCACA
GATGGGGAAGTGCGTTCCCAGCCAAAAGCATTGCCGTAGAGGAGAGGTGTTTCTGGGATA
GAAACAGGAATCTGGCAATCTGTGGAGATTTCTGTGTCAGTCCAAACGTCGAAGGTGCCA
TACTCAGTGGCTTAGCTGCAGCCTCAAAGCTTTTGCAGGCTTCCAGCTGCCGCTTATAGG
TAAGGTACCCCTACTCAGTGTACCTCACAACAGAGTTAATATATTCTTATTATAAGTATT
TTACTAGAATCATGTAATAGTGTACTGTAACAGTCTTCCTCGTAAACTCTATCCGCCGAT
GAAGCAGACATATCATGTGATCTTCCTAAATTTTATACTTTGTTTCTTGATGAAATGACA
GCGAGCGCACTTATATATATATGGAAATGCCATTTGAAGTACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H588TF U 2
AF RR4EH90TF U 3
AF RR4GN21TF U 1
AF RR4B539TF U 57
AF RR4B539JQ C 744
AF RR4H588JQB C 740
AF RR4EH90JQ C 829
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BS 902 995 RR4H588JQB
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BS 1358 1416 RR4H588JQB
BS 1417 1423 RR4EH90JQ

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GAC
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DS 

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GG
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GAGGAGGAGCGTGTACGACGTCGCAATGAAGGTGGCCGTCATCGGAAGCGGAATATCAGG
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GACGTTCGACCATGGAGCTCCGTGTTTCTCAGTGACCAACCCTGATGCTATCTCCCTTGT
TCACGAGTGGGGGTCCATAGGTCTTGTTTCTCAATGGAAACAAGTTTTCGGCTCTTTCGA
CTCTGCCTCCAACATGTTTCTTGGCTTCCAACAGGAAGGGGATCATACCAACAACATCAA
GTATGTGGGTGTTCCAGGCATGAACTCTATATCAAAGGCCTTGTGCAACCACTCCGGTGT
TGAATCTATGTTTGGAACTGGTATTACCAAGCTGGAGTGGTTAGAGGAAGAGATACCATG
GCTGTTAAAAGATTC

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DS 

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TCAGGAGGAGGAGCGTGTACGACGTCGCAATGAAGGTGGCCGTCATCGGAAGCGGAATAT
CAGGAGCAGTGTGCGCATCGACTCTGGCGAGGAATGGAGTCTCCGTCACTATCTTCGACT
CCGCTCGTGGTCCCGGTGGCCGCATGTCTCAAAGAAGGGAGGTTGGGGAAGATGGGAAGG
AGTTGACGTTCGACCATGGAGCTCCGTGTTTCTCAGTGACCAACCCTGATGCTATCTCCC
TTGTTCACGAGTGGGAGTCTATAGGTCTTGTTTCTCAATGGAAACAAGTTTTCGGCTCTT
TCGACTCTGCCTCCAACATGTTTCTTGGCTTCCAACAGGAAGGGGATCATACCAACAACA
TCAAGTATGTGGGTGTTCCAGGCATGAACTCTATATCAAAGGCCTTGTGCAACCACTCCG
GTGTTGAATCTATGTTTGGAACTGGTATTGCCAAGCTGGAGTGGTTAGAGGAAGAGATAC
CATGGCTGTTAAAAGATTCTAAAGGACAAAACTTGGGTCGTTTTCATGGAGTGGTTGCAT
CTGATAAAAACATTGTTTCTCCAAGGTTTACTCAACTAACTGGACTCCCACCTCCTCTTG
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GG
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GGAGTTGACGTTCGACCATGGAGCTCCGTGTTTCTCAGTGACCAACCCTGATGCTATCTC
CCTTGTTCACGAGTGGGAGTCTATAGGTCTTGTTTCTCAATGGAAACAAGTTTTCGGCTC
TTTCGACTCTGCCTCCAACATGTTTCTTGGCTTCCAACAGGAAGGGGATCATACCAACAA
CATCAAGTATGTGGGTGTTCCAGGCATGAACTCTATATCAAAGGCCTTGTGCAACCACTC
CGGTGTTGAATCTATGTTTGGAACTGGTATTGCCAAGCTGGAGTGGTTAGAGGAAGAGAT
ACCATGGCTGTTAAAAGATTCTAAAGGACAAAACTTGGGTCGTTTTCATGGAGTGGTTGC
ATCTGATAAAAACATTGTTTCTCCAAGGTTTACTCAACTAACTGGACTCCCACCTCCTCT
TGACTTGAATCTTGTCCCGGAGTTGGCCACTACTAAGCTCCAAGATATTCCTGTTTTGCC
ATGCTTTTCTCTTATGCTTGCTTTTAAAGAACCATTGTCTTTGATGCCAGCAAAAGGCTT
ATCTTTCAAGAATTCTGAGATTTTGAGCTGGGCTCACTGTGATAGCACTAAGCCAGGGCG
GTCTACTGATAGTGAAAGATGGATACTGCATTCTACTCCAGGCTATGCCAGCAGTGTTAT
TGC

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DS 

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CTGCATTTTACTCCAGGCTATGCCAGCAGTGTTATTGCCAAAACCGGCCTCCAAAAGCTA
TCGAGCGAAACACTCAACAAAATAGCTGAAGAGATGTTCAAAGAGTTTCAGTGCTCAGGG
CTTGTTAATTCTTTACCCTTTTTCATGAAAGCCCACAGATGGGGAAGTGCGTTCCCAGCC
AAAAGCATTGCCGTAGAGGAGAGGT

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DS 

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TTTT
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TCGAGCGAAACACTCAACAAAATAGCTGAAGAGATGTTCAAAGAGTTTCAGTGCTCAGGG
CTTGTTAATTCTCTACCCTTTTTCATGAAAGCCCACAGATGGGGAAGTGCGTTCCCAGCC
AAAAGCATTGCCGTAGAGGAGAGGTGTTTTTGGGATAGAAACAGGAATCTGGCAATCTGT
GGAGATTTCTGTGTCAGTCCAAACGTCGAAGGTGCCATACTCAGTGGCTTAGCTGCAGCC
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GAAATGCCATTTG

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DS 

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GCAGTGTTATTGCCAAAACCGGCCTCCAAAAGCTATCGAGCGAAACACTCAACAAAATAG
CTGAAGAGATGTTCAAAGAGTTTCAGTGCTCAGGGCTTGTTAATTCTTTACCCTTTTTCA
TGAAAGCCCACAGATGGGGAAGTGCGTTCCCAGCCAAAAGCATTGCCGTAGAGGAGAGGT
GTTTCTGGGATAGAAACAGGAATCTGGCAATCTGTGGAGATTTCTGTGTCAGTCCAAACG
TCGAAGGTGCCATACTCAGTGGCTTAGCTGCAGCCTCAAAGCTTTTGCAGGCTTCCAGCT
GCCGCTTATAGGTAAGGTACCCCTACTCAGTGTACCTCACAACAGAGTTAATATATTCTT
ATTATAAGTATTTTACTAGAATCATGTAATAGTGTACTGTAACAGTCTTCCTCGTAAACT
CTATCCGCCGATGAAGCAGACATATCATGTGATCTTCCTAAATTTTATACTTTGTTTCTT
GATGAAATGACAGCGAGCGCACTTATGTATATATGGAAATGCCATTTGAAGTACC

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DS 



AS 1 6

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CGCTGGCTACATCGGAAGCCACACGGTGCTTCAACTTCTCAACGGCGGCTACTCCGTCGT
AGTTGTCGACAATCACGACAATTCGTCCGCTGCGTCTCTCCACCGAGTCAAAAAACTCGC
CGGCGATAACGGAAACCGCCTCTCCTTCCACGAGGTGGATCTCAGAGACAGGCCTGCGCT
TGAGAAGATTTTCTCTGAAACTAAGTTTGATGCAGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGC
AGTAGGTGAGAGTGTCGAGAAGCCTTTGCTCTATTATAATAATAACCTTTTTGGCACTGT
CATCCTTTTGGAGGTTATGTCTCAGTACGGCTGCAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGC
TACTGTCTATGGCTGGCCTAAAGAGGTTCCTTGCACCGAGGAGTCCCCAATCTCTGCAAC
CAACCCTTATGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAAGAGATTTGCCGGGATGTGCATCGTTC
TGACCCGGAATGGAAGATCATATTGCTTCGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAG
TGGTTACATTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTCCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCA
AGTTGCTGTTGGCCGCAGACCTCACCTCACCGTCTTTGGAACCGACTACAAGACAAAGGA
TGGTACAGGGGTGAGAGATTACATTCATGTGATTGATTTAGCAGATGGACATATAGCAGC
TCTGCGCAAGCTAGATGATCCCAAAATCAGTTGTGAGGTATACAATCTTGGAACTGGTAA
TGGAACATCAGTTCTAGAGATGGTAGCTGCCTTTGAGAAGGCATCCGGAAAGAAAATCCC
TTTGGTGTTGGCCGGACGACGTACTGGAGACGCTGAGATTGTTTTCGCCTCAACAGAGAA
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ATGGAACTGGGCCAGCAATAATCCTTACGGCTACGCCTCCTCAAATGGCTCCTCTTAATT
CTTGTTCTTTTCTCTTTGCAGTAGTT*ATTCATTTTTATAAAACACATAAGAAAATGCTG
ATCAGAACCCACAGTTTACAAGGGATTACTCCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTT
AAATCGTCATTTCTACTCTTAGTATATAGTTTTTACTTGTTTTTGTTATATTTCTTAAAA
TTGATAGATGTAATCATTCAGATATTTTTTGTTTACTATTTTTTTTCAGTCCCTGTAATT
CGATTTCCCAACCATTGCAAGTTGTAATACAACAATGTCCTCATTCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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AGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGCAGTAGGTGAGAGTGTCGAGAAGCCTTTGCTCTA
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CAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGCTACTGTCTATGGCTGGCCTAAAGAGGTTCCTTG
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C

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AC

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AGAACCCACAGTTTACAAGGGATTACTCCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTTAAA
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TCATTTTTATAAAACACATAAGAAAATGCTGATCAGAACCCCCAGTTTACAAGGGATTAC
TCCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTTAAATCGTCATTTTTACTCTTAGTATATAG
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TGTTTACTATTTTTTTTCAGTCCCTGTAATTCGATTTCCCAACCATTGCAAGTTGTAATA
CAACAATGTCCTCATTCAAACT

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DS 



AS 1 7

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TCTATGATTCCACTGTGTTAAGAATCAGAATTACATTAGAAACCAAATCTCAAGCGACCA
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TTCCATTCTTCCTCTCTGTCCTTCTCTTCCCCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 15 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4ET08JQ U 2
AF RR4ET08TF C 2
AF RR4BL93JQ U 1
AF RR4CT11JQ U 26
AF RR4CT11TF C 39
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AF RR4C908TF C 57
BS 1 685 RR4BL93JQ
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BS 689 767 RR4BL93JQ
BS 768 797 RR4CT11JQ
BS 798 834 RR4C908JQ
BS 835 835 RR4CT11TF
BS 836 872 RR4C908JQ
BS 873 873 RR4C908TF

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CG
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ATGATTCCACTGTGTTAAGAATCAGAATTACATTAGAAACCAAATCTCAAGCGACCAAAA
AGCCAATGTTGCCGCCACACACACGCACACAAAGAGACTGAAGAAGAGAATGTGAATCTG
CCAAAGCTTTGAACTCTACTCGGTCTTCTTTCATAACCGGCGTCCAAAACATAGGCAGAC
ACATTTGTTCTGGTTCAAATCACCTTTAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTT***TT***CTTT
TTCAGTAAGCTGAGGTTGAATGAGGACATGCATAGTGGTGACAGCATCTGAGAGATTGGA
GACAGGACTCCTGCAGTCTCCAACCGTCTTGTTGTTCTCCAATATTCTACCCGCGCTTAT
CAGTTTCACATCTTTCACTGTCTTTGGCCCATTCTCCTTCTCTCGAGGCCATTGAGCAAC
*ACAGTTTCTTTCAATGCAGCAACGGTTGTAGCATC
C

QA 3 518 3 518
DS 

RD RR4ET08TF 519 0 0
CG
TAAAACCACTGTAAAATTTCTTAAAGATTCACTCTAGTCTGCAAATTTGAAATGTTATCT
ATGATTCCACTGTGTTAAGAATCAGAATTACATTAGAAACCAAATCTCAAGCGACCAAAA
AGCCAATGTTGCCGCCACACACACGCACACAAAGAGACTGAAGAAGAGAATGTGAATCTG
CCAAAGCTTTGAACTCTACTCGGTCTTCTTTCATAACCGGCGTCCAAAACATAGGCAGAC
ACATTTGTTCTGGTTCAGATCACCTTTAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTT***TT***CTTT
TTCAGTAAGCTGAGGTTGAATGAGGACATGCATAGTGGTGACAGCATCTGAGAGATTGGA
GACAGGACTCCTGCAGTCTCCAACCGTCTTGTTGTTCTCCAATATTCTACCCGCGCTTAT
CAGTTTCACATCTTTCACTGTCTTTGGCCCATTCTCCTTCTCTCGAGGCCATTGAGCAAC
*ACAGTTTCTTTCAATGCAGCAACGGTTGTAGCATC
C

QA 3 518 3 518
DS 

RD RR4BL93JQ 767 0 0
CCATAAAACCACTGTAAAATTTCTTAAAGATTCACTCTAGTCTGCAAATTTGAAATGTTA
TCTATGATTCCACTGTGTTAAGAATCAGAATTACATTAGAAACCAAATCTCAAGCGACCA
AAAAGCCAATGTTGCCGCCACACACACGCACACAAAGAGACTGAAGAAGAGAATGTGAAT
CTGCCAAAGCTTTGAACTCTACTCGGTCTTCTTTCATAACCGGCGTCCAAAACATAAGCA
GACACATTTGTTCTGGTTCAGATCACCTTTAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTT***C
TTTTTCAGTAAGCTGAGGTTGAATGAGGACATGCATAGTGGTGACAGCATCTGAGAGATT
GGAGACAGGACTCCTGCAGTCTCCAACCGTCTTGTTGTTCTCCAATATTCTACCCGCGCT
TATCAGTTTCACATCTTTCACTGTCTTTGGCCCATTCTCCTTCTCTCGAGGCCATTGAGC
AACCACAGTTTCTTTCAATGCAGCAACGGTTGTAGCATCTGGAAACGATTTAGGACCGAT
ATCTGAACCATCGTTTAGACGGAACTTAATCTCTAAGTGATCCTTCTTCACCTCTGCCAT
GTATATATATCTCCAAAGAGCCAATCTCTCCTCTCACCAAATGACTTAACAAGGGCAAGA
AAAAGTCTATATACCTCCTTTTGCTC**TTGCTTTTTGGTGGGATCGCAGCTGATCTAAG
TTTGATGATACGAAGACCTCACAACATCACAGACTCGAACAGAGAGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4CT11JQ 772 0 0
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CAGAATTACATTAGAAACCAAATCTCAAGCGACCAAAAAGCCAATGTTGCCGCCACACAC
ACGCACACAAAGAGACTGAAGAAGAGAATGTGAATCTGCCAAAGCTTTGAACTCTACTCG
GTCTTCTTTCATAACCGGCGTCCAGAACATAAGCAGACACATTTGTTCTGGTTCAGATCA
CCTTTAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTGCTTTTTCAGTAAGCTGAGGTTGAATG
AGGACATGCATAGTGGTGACAACATCTGAGAGATTGGAGACAGGACTCCTGCAGTCTCCA
ACCGTCTTGTTGTTCTCCAATATTCTACCCGCGCTTATCAGTTTCACATCTTTCACTGTC
TTTGGCCCATTCTCCTTCTCTCGAGGCCATTGAGCAACCACAGTTTCTTTCAATGCAGCA
ACGGTTGTAGCATCTGGAAACGATTTAGGACCGATATCTGAACCATCGTTTAGACGGAAC
TTAATCTCTAAGTGATCCTTCTTCACCTCTGCCATGTATATACATCTCCAAAGAGCCAAT
CTCTCCTCTCACCAAATGACTTAACAAGGGCAAGAAAAAGTCTATATACCTCCTTTTGCT
TCTTTGCTTTTTGGTGGGATCGCAGCTGATCTAAGTTTGATGATACGAAGACCTCACAAC
ATCACAGACTCGAACAGAGAGAAGAAGAAGAGAGAGAGGGGTACGAGATCTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CT11TF 812 0 0
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GACTGAAGAAGAGAATGTGAATCTGCCAAAGCTTTGAACTCTACTCGGTCTTCTTTCATA
ACCGGCGTCCAGAACATAAGCAGACACATTTGTTCTGGTTCAGATCACCTTTAGGCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTTTCTGCTTTTTCAGTAAGCTGAGGTTGAATGAGGACATGCATAG
TGGTGACAACATCTGAGAGATTGGAGACAGGACTCCTGCAGTCTCCAACCGTCTTGTTGT
TCTCCAATATTCTACCCGCGCTTATCAGTTTCACATCTTTCACTGTCTTTGGCCCATTCT
CCTTCTCTCGAGGCCATTGAGCAACCACAGTTTCTTTCAATGCAGCAACGGTTGTAGCAT
CTGGAAACGATTTAGGACCGATATCTGAACCATCGTTTAGACGGAACTTAATCTCTAAGT
GATCCTTCTTCACCTCTGCCATGTATATACATCTCCAAAGAGCCAATCTCTCCTCTCACC
AAATGACTTAACAAGGGCAAGAAAAAGTCTATATACCTCCTTTTGCTTCTTTGCTTTTTG
GTGGGATCGCAGCTGATCTAAGTTTGATGATACGAAGACCTCACAACATCACAGACTCGA
ACAGAGAGAAGAAGAAGAGAGAGAGGGGTACGAGATCTTAGAAGAAGAGTTGATTGATAA
ATCAATCAATAGAAGCCAAATGTTCCATTC
CC

QA 1 810 1 810
DS 

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G
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ATCTCAAGCGACCAAAAAGCCAATGTTGCCGCCACACACACGCACACAAAGAGACTGAAG
AAGAGAATGTGAATCTGCCAAAGCTTTGAACTCTACTCGGTCTTCTTTCATAACCGGCGT
CCAAAACATAAGCAGACACATTTGTTCTGGTTCAGATCACCTTTAGGCTTCTTCTTCTTC
TTCTTCTTTT***CTTTTTCAGTAAGCTGAGGTTGAATGAGGACATGCATAGTGGTGACA
GCATCTGAGAGATTGGAGACAGGACTCCTGCAGTCTCCAACCGTCTTGTTGTTCTCCAAT
ATTCTACCCGCGCTTATCAGTTTCACATCTTTCACTGTCTTTGGCCCATTCTCCTTCTCT
CGAGGCCATTGAGCAACCACAGTTTCTTTCAATGCAGCAACGGTTGTAGCATCTGGAAAC
GATTTAGGACCGATATCTGAACCATCGTTTAGACGGAACTTAATCTCTAAGTGATCCTTC
TTCACCTCTGCCATGTATATATATCTCCAAAGAGCCAATCTCTCCTCTCACCAAATGACT
TAA***GGGCAAGAAAA*GTCTATATACCTCCTTTTGCTTCTTTGCTTTTTGGTGGGATC
GCAGCTGATCTAAGTTTGATGATACGAAGACCTCACAACATCACAGACTCGAACAGAGAG
AAGAAGAAGAGAGAGAGGGGTACGAGATCTTAGAAGAAGAGTTGATTGATAAATCAATCA
ATAGAAGC*AAATGTTCCATTCTTCCTCTCTGTCCTTCTCTTCCCC

QA 2 827 2 827
DS 

RD RR4C908TF 817 0 0
GTTATCTATGAT*CCACTGTGT*AAGAATCAGAATTACATTAGAAACCAAATCTCAAGCG
ACCAAAAAGCCAATGT*GCCGCCACACACACGCACACAAAGAGACTGAAGAAGAGAATGT
GAATCTGCCAAAGCTTTGAACTCTACTCGGTCTTCTTTCATAACCGGCGTCCAAAACATA
AGCAGACACATTTGTTCTGGTTCAGATCACCTTTAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTT
***CTTTTTCAGTAAGCTGAGGTTGAATGAGGACATGCATAGTGGTGACAGCATCTGAGA
GATTGGAGACAGGACTCCTGCAGTCTCCAACCGTCTTGTTGTTCTCCAATATTCTACCCG
CGCTTATCAGTTTCACATCTTTCACTGTCTTTGGCCCATTCTCCTTCTCTCGAGGCCATT
GAGCAACCACAGTTTCTTTCAATGCAGCAACGGTTGTAGCATCTGGAAACGATTTAGGAC
CGATATCTGAACCATCGTTTAGACGGAACTTAATCTCTAAGTGATCCTTCTTCACCTCTG
CCATGTATATATATCTCCAAAGAGCCAATCTCTCCTCTCACCAAATGACTTAA***GGGC
AAGAAAA*GTCTATATACCTCCTTTTGCTTCTTTGCTTTTTGGTGGGATCGCAGCTGATC
TAAGTTTGATGATACGAAGACCTCACAACATCACAGACTCGAACAGAGAGAAGAAGAAGA
GAGAGAGGGGTACGAGATCTTAGAAGAAGAGTTGATTGATAAATCAATCAATAGAAGCCA
AATGTTCCATTCTTCCTCTCTGTCCTTCTCTTCCCCC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 5

CO CL1128Contig1 1250 5 26 U
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CGTAAGAATCCGGCCGTGAAGAGGATCCTGCAGGAGGTTAAGGAGATGCAAGCTAATCCG
TCCGATGATTTCATGTCTCTCCCCCTTGAGGAGAACATATTTGAGTGGCAATTCGCCATC
AGAGGCCCTGCGGATACTGAATTCGAAGGTGGGATCTATCATGGGAGGATCCAGCTGCCT
GCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTTCCTTCATGTTATTGACTCCTAACGGCCGTTTTGAA
ACCAATACAAAGATTTGCTTGAGCATTTCGAATTACCATCCCGAACACTGGCAACCGTCA
TGGAGTGTTCGCACTGCTTTGGTGGCTCTAATTGCCTTCATGCCTACAAGCCCCAACGGA
GCACTGGGCTCAGTAGAGTATCCGAAAGAAGAGAGGCGTACACTAGCCGTTAAATCACGT
GAGGCTCCACCCAAGTATGGCTCTCCTGAACGTCAGAAGGTTATTGATGAGATTCATCAT
TACATCCTTAGCAAAGCGACAGTGGTTTCAAAACCTCTTCCTCTGGAATGTAACCAAACT
GCTTCCACTGAATCAGTAACTCATTCCCAAACTGAGCCACAGGAAGCCATAACAGTAGTG
GAAGAACCATCCGTCGTCACAGCAGACACCATAGCTGATGATCGAATAATCGAAGAAGCA
GCTGAAGCAGTCAATAGAGAAGCTTATGCGAGTCCTACAGCAGGAGCGTTAGCAACGGTT
GAGGTTGCGGCAAAAGCTTCTGGAAGTGGTGAGCAAACAATGGTAAGAAGAGCGGCTCAG
AAGCCAGTCGATGACAGACTGTTCACGTTGGCAGCGGTTGGGCTCACAATCGCAATCATG
GTTCTTCTCCTAAAGAAGTTCATAAGGTCAAGTGGTTATGGCACTGGCTTTATGGACGAG
TCTTGAACATCGTCGATGCAAACCAAACGGTAAAGAAAAGGTGAAAGCTGATCGATGAAT
AAATTGTGTGAAAAGTCGATGCTGCTGATGGCGTTTGTTGGTCGTTTGGTATATGAATAT
GATTAAAGTGCATATAAAATAGGGTAAATAATTATGTGTGACATTGTCTTGCAGACGTAT
TTGGTAAAATTCGATTATAGCTTGTGACCAAGTTAGCAACAATATTGTATTTTGGATTTG
AATATTGTACACACTTTTATTATTTTCTTACTAGAATTTAAATTCTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EG68TF U 1
AF RR4G849TF U 16
AF RR4GP32JQ C 408
AF RR4BT24TF U 894
AF RR4BT24JQ C 902
BS 1 191 RR4EG68TF
BS 192 192 RR4G849TF
BS 193 290 RR4EG68TF
BS 291 291 RR4G849TF
BS 292 308 RR4EG68TF
BS 309 309 RR4G849TF
BS 310 344 RR4EG68TF
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BS 346 356 RR4EG68TF
BS 357 357 RR4G849TF
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BS 390 390 RR4G849TF
BS 391 431 RR4EG68TF
BS 432 432 RR4G849TF
BS 433 518 RR4EG68TF
BS 519 519 RR4G849TF
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BS 574 599 RR4EG68TF
BS 600 618 RR4G849TF
BS 619 619 RR4GP32JQ
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BS 895 1250 RR4BT24TF

RD RR4EG68TF 599 0 0
GGCTCCGACGGCGGATTACATTTCCGGTGAGATCTAGAGATGGCGGATGAGAAGTATAAC
CGTAAGAATCCGGCCGTGAAGAGGATCCTGCAGGAGGTTAAGGAGATGCAAGCTAATCCG
TCCGATGATTTCATGTCTCTCCCCCTTGAGGAGAACATATTTGAGTGGCAATTCGCCATC
AGAGGCCCTGCTGATACTGAATTCGAAGGTGGGATCTATCATGGGAGGATCCAGCTGCCT
GCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTTCCTTCATGTTATTGACTCCTAACGGTCGTTTTGAA
ACCAATACCAAGATTTGCTTGAGCATTTCGAATTACCATCCCGAGCACTGGCAACCTTCA
TGGAGTGTTCGCACTGCTTTGGTGGCTCTCATTGCCTTCATGCCTACAAGCCCCAACGGA
GCACTGGGCTCTGTAGAGTATCCGAAAGAAGAGAGGCGTACACTAGCCGTTAAATCACGT
GAGGCTCCACCCAAGTATGGCTCTCCTGAACGTCAGAAAGTTATTGATGAGATTCATCAT
TACATCCTTAGCAAAGCGACAGTGGTTTCAAA*CCTCTTCCTCTGGAATGTAACCAAAC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4G849TF 782 0 0
GG
ACATTTCCGGTGAGATCTAGAGATGGCGGATGAGAAGTATAACCGTAAGAATCCGGCTGT
GAAGAGGATTCTGCAGGAGGTTAAGGAGATGCAAGCTAATCCGTCCGATGATTTCATGTC
TCTCCCCCTTGAGGAGAACATATTTGAGTGGCAATTCGCCATCAGAGGCCCTGCGGATAC
TGAGTTCGAAGGTGGGATCTATCATGGGAGGATTCAGCTGCCTGCAGATTACCCTTTCAA
ACCTCCTTCCTTCATGTTGTTGACTCCTAATGGCCGTTTTGAAACCAATACAAAGATTTG
CTTGAGCATTTCGAATTACCATCCCGAACATTGGCAACCGTCGTGGAGTGTTCGCACTGC
TTTGGTGGCTCTAATTGCCTTCATGCCTACAAGCCCCAACGGAGCACTGGGCTCAGTAGA
GTATCCGAAAGAAGAGAGGCGTACACTAGCCGTTAAATCACGTGAGGCTCCACCCAAGTA
TGGCTCTCCTGAACGTCAGAAGGTTATTGATGAGATTCATCATTACATCCTTAGCAAAGC
GACAGTGGTTTCAAAACCTCTTCCTCTGGAATGTAACCAAACTGCTTCCACTGAATCAGT
AGCTCATTCCCAAACTGAGCCACAGGAAGCCATAACAGTAGTGGAAGAACCATCCGTCGT
CACAGCAGACACCATAGCTGATGATCGAATAATCGAAGAAGCAGCTGAAGCAGTCAATAG
AGAAGCTTATGCGAGTCCTACAGCAG*AGCGTTAGCAACGGTTGAGGT
GCGGCAAAGCTT

QA 3 770 3 770
DS 

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CGTTAAATCACGTGAGGCTCCACCCAAGTATGGCTCTCCTGAACGTCAGAAGGTTATTGA
TGAGATTCATCATTACATCCTTAGCAAAGCGACAGTGTTTTCAAAACCTCTTCCTCTGGA
ATGTAACCAAACTGCTTCCACTGAATCAGTAACTCATTCCCAAACTGAGCCACAGGAAGC
CATAACAGTAGTGGAAGAACCATCCGTCGTCACAGCAGACACCATAGCTGATGATCGAAT
AATCGAAGAAGCAGCTGAAGCAGTCAATAGAGAAGCTTATGCGAGTCCTACAGCAGGAGC
GTTAGCAACGGTTGAGGTTGCGGCAAAAGCTTCTGGAAGTGGTGAGCAAACAATGGTAAG
AAGAGCGGCTCAGAAGCCAGTCGATGACAGACTGTTCACGTTGGCAGCGGTTGGGCTCAC
AATCGCAATCATGGTTCTTCTCCTAAAGAAGTTCATA*GGTCAAGTGGTTATGGCACTGG
CTTTATGGACGAGTCTTGAACATCGTCGATGCAAACCAAACGGTAAAGAAAAGGTGAAAG
CTGATCGATGAATAAATTGTGTGAAAAGTCGATGCTGCTGATGGCGTTTGTTGGTCGTTT
GGTATATGAATATGATTAAAGTGCATATAAAATAGGGTAAATAATTATGTGTGACATTGT
CTTGCAGACGTATTTGGTAAAATTCGATTATAGCTTGTGACC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BT24TF 357 0 0
G
ATCATGGTTCTTCTCCTAAAGAAGTTCATAAGGTCAAGTGGTTATGGCACTGGCTTTATG
GACGAGTCTTGAACATCGTCGATGCAAACCAAACGGTAAAGAAAAGGTGAAAGCTGATCG
ATGAATAAATTGTGTGAAAAGTCGATGCTGCTGATGGCGTTTGTTGGTCGTTTGGTATAT
GAATATGATTAAAGTGCATATAAAATAGGGTAAATAATTATGTGTGACATTGTCTTGCAG
ACGTATTTGGTAAAATTCGATTATAGCTTGTGACCAAGTTAGCAACAATATTGTATTTTG
GATTTGAATATTGTACACACTTTTATTATTTTCTTACTAGAATTTAAATTCTGATC

QA 2 357 2 357
DS 

RD RR4BT24JQ 349 0 0
TTT
TTCTCCTAAAGAAGTTCATAAGGTCAAGTGGTTATGGCACTGGCTTTATGGACGAGTCTT
GAACATCGTCGATGCAAACCAAACGGTAAAGAAAAGGTGAAAGCTGATCGATGAATAAAT
TGTGTGAAAAGTCGATGCTGCTGATGGCGTTTGTTGGTCGTTTGGTATATGAATATGATT
AAAGTGCATATAAAATAGGGTAAATAATTATGTGTGACATTGTCTTGCAGACGTATTTGG
TAAAATTCGATTATAGCTTGTGACCAAGTTAGCAACAATATTGTATTTTGGATTTGAATA
TTGTACACACTTTTATTATTTTCTTACTAGAATTTAAATTCTGATC

QA 4 349 4 349
DS 



AS 1 6

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GGGCTTTATCCAGACTCTCTCTCTCTCATCATCCACAAAGAAGAAACCCTAGAAAGGCGG
TCGAAGAAGGAAGAAAAAAAGAAGAAGCCATGGCAGGAGTAGGACCGATGACTCAGGATT
GGGAGCCCGTGGTGATCCGTAAGAAAACCCCCAACGCCGCCGCTAAGCGCGACGAGAAGA
CTGTCAACGCTGCTCGGAGAAGCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTG
GAACGAACAAGGCGGCTTCAAGCGGCACCTCCTTGAACACCAAGAGGCTTGATGATGACA
CTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATCATGCATGCCC
GAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAACTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAAG
TGATCCAAGAATATGAGTCTGGGAAAGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGG
AGAGGGCACTCGGAGCTAAACTCCGTGGAAAGAAGTAATAACAAAACCTCCTCAAAAGGT
TAAAGAAAAAAAAGCTAGTCGCCGTTTCACTACAGTCCTTTTACTGTAGTAACTGTGTGC
CTGGTTTATTGGTTTAGTAGAGAGCTCTGTGTGGAATCTTTTATGGTTTGTAAGAAAACA
AAGAAACTAAAGCTGTTTGGAACCCTTTTGTCTTTATAAATAAACCGCTCGTTCTCTTTG
CGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
10 10 10 10 

AF RR4GK43JQ C 1
AF RR4GK43TF U 1
AF RR4E592JQ C 4
AF RR4E592TF U 4
AF RR4G049JQ C 295
AF RR4G049TF U 4
BS 1 14 RR4GK43JQ
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RD RR4GK43JQ 721 0 0
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AAGAAACTAAAGCTGTTTGGAACCCTTTTGTCTTTATAAATAAACCGCTCGTTCTCTTT
AC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4GK43TF 719 0 0
GGGCTTTATCCAGA
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DS 

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CGGAGAAGCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACGAACAAGGCG
GCTTCAAGCGGCACCTCCTTGAACACCAAGAGGCTTGATGATGACACTGAGAACTTAGCT
CATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATCATGCATGCCCGAGGGGAGAAGAAG
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GAGTCTGGGAAAGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGGAGAGGGCACTCGGA
GCTAAACTCCGTGGAAAGAAGTAATAACAAAACCTCCTCAAAAGGTTAAAGAAAAAAA*G
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GCC

QA 12 716 12 716
DS 

RD RR4E592TF 716 0 0
GGATCCAGACT
CTCTCTCTCTCTCATCATCCACAAAGAAGAAACCCTAGAAAGGCGGTCGAAGAAGGAAGA
AAAAAAGAAGAAGCCATGGCAGGAGTAGGACCGTTGACTCAGGATTGGGAGCCCGTGGTG
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GCTTCAAGCGGCACCTCCTTGAACACCAAGAGGCTTGATGATGACACTGAGAACTTAGCT
CATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATCATGCATGCCCGAGGGGAGAAGAAG
CTCACCCAGTCCCAACTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATAT
GAGTCTGGGAAAGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGGAGAGGGCACTCGGA
GCTAAACTTCGTGGAAAGAAGTAATAACAAAACCTCCTCAAAAGGTTAAAGAAAAAAA*G
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GTTTGGAACCCTTTTGTCTTTATAA*TAAACCGCTCGTTCTCTTT

QA 12 716 12 716
DS 

RD RR4G049JQ 428 0 0
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AGCTGGAGAGGGCACTCGGAGCTAAACTCCGTGGAAAGAAGTAATAACAAAACCTCCTCA
AAAGGTTAAAGAAAAAAAAGCTAGTCGCCGTTTCACTACAGTCCTTTTACTGTAGTAACT
GTGTGCCTGGTTTATTGGTTTAGTAGAGAGCTCTGTGTGGAATCTTTTATGGTTTGTAAG
AAAACAAAGAAACTAAAGCTGTTTGGAACCCTTTTGTCTTTATAAATAAACCGCTCGTTC
TCTTT
GCG

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4G049TF 721 0 0
GGATCCAGACT
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AAAAAAGAAGAAGCCATGGCAGGAGTAGGACCGATGACTCAGGATTGGGAGCCCGTGGTG
ATCCGTAAGAAAACCCCCAACGCCGCCGCTAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCTGCT
CGGAGAAGCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACGAACAAGGCG
GCTTCAAGCGGCACCTCCTTGAACACCAAGAGGCTTGATGATGACACTGAGAACTTAGCT
CATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATCATGCATGCCCGAGGGGAGAAGAAG
CTCACCCAGTCCCAACTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATAT
GAGTCTGGGAAAGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGGAGAGGGCACTCGGA
GCTAAACTCCGTGGAAAGAAGTAATAACAAAACCTCCTCAAAAGGTTAAAGAAAAAAAAG
CTAGTCGCCGTTTCACTACAGTCCTTTTACTGTAGTAACTGTGTGCCTGGTTTATTGGTT
TAGTAGAGAGCTCTGTGTGGAATCTTTTATGGTTTGTAAGAAAACAAAGAAACTAAAGCT
GTTTGGAACCCTTTTGTCTTTATAAATAAACCGCTCGTTCTCTTTGCGAA

QA 12 721 12 721
DS 



AS 1 5

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GGAGACAAATTCCTTCCGCCGCTGGATCTCTTCACCGACAATGTCGAATTGGAGTAACGA
TGTGACTAGGTTAATGGATCGAGATGTGGGTATTTATTCTGGAGAAGGAACCTCTGGGAC
GGCAAAGAGGTCCGAGAGCTTTGCAAAAGAAGTCCAGCATATGGAATCTGTGATGAATTT
TAAGAGAAGTGGCGAGGGAGTTGTTGCTGTAGCTTCTACCACTTATTCCTTGAATGAATT
GGTCGAGTTCTTGGAATCCCCGACGGTGAACATTCCTGTTGGAGCTCTAGACATAGGAAC
GATCACCCCTGTGGAGATCTGGAAGGCCTTTCAAATGAGTGATCGTAAACGGCACTTCTC
CACTGTCTTGGCCTTTGATGTAGACGTTACTCCTGAGGCAAGTCAACTCGCGGAACAGTT
GCAAGTCAAAGTCATCTGTGGCTGTATGCTTGAAAGGCTGCACTACCAGTTCAAAGAGCA
TATCGAAGAGCTGGGAGAGGACCCAAAAATGGAGGATGAAGCAATCTTCCCTGGCATCCT
CAGCATCTTAACCAACGCTGTCTTCAGCAAGGAAGACCCTATTGTCCTCGGAGTCTTAGT
TGTTGAGGGTTTCATCAAGGTAGGAGTTCCCATAGCCTATGTGCGAACTGCTGGTTGTCT
GGATTTAGGACGTATTGCATGGATTGAGAAATACCAACAACCCGTCGATGTTGCTAGTTT
AGGCGAGACCGCTGTTATCAAGATTGTTGCATCAAACCCGGAAGAACAGAGACAAGCACG
TAGCTTTGGAAGCCATTATGACATTAATGACAATATTCTTGTCACTCGTCTTTTTAGGGC
ATCTATCATTGCCTTCCGAGATAGTGACTTGGAAAAACTATCCTGCAGCGAGTTTAAAGC
GATGTCTGATATCAAACGCGTTCTCAAATTCAAGTAATATGTGTATGTCTAATGTTGTTT
TCGTTTGTCAACAACAACTACTTTCCATTTAAAATCTGAACAAGCTGGCCACTCCTAGTT
ATTTCATCTTTTTATATAGTTATGTATTTTATG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI68TF U 1
AF RR4DS28TF U 2
AF RR4F822TF U 1
AF RR4EI68JQ C 396
AF RR4F822JQ C 540
BS 1 567 RR4EI68TF
BS 568 668 RR4F822TF
BS 669 669 RR4EI68JQ
BS 670 690 RR4F822TF
BS 691 691 RR4EI68JQ
BS 692 718 RR4F822TF
BS 719 719 RR4EI68JQ
BS 720 722 RR4F822TF
BS 723 723 RR4EI68JQ
BS 724 787 RR4F822TF
BS 788 826 RR4EI68JQ
BS 827 1053 RR4F822JQ

RD RR4EI68TF 567 0 0
GGAGACAAATTCCTTCCGCCGCTGGATCTCTTCACCGACAATGTCGAATTGGAGTAACGA
TGTGACTAGGTTAATGGATCGAGATGTGGGTATTTATTCTGGAGAAGGAACCTCTGGGAC
GGCAAAGAGGTCCGAGAGCTTTGCAAAAGAAGTCCAGCATATGGAATCTGTGATGAATTT
TAAGAGAAGTGGCGAGGGAGTTGTTGCTGTAGCTTCTACCACTTATTCCTTGAATGAATT
GGTCGAGTTCTTGGAATCCCCGACGGTGAACATTCCTGTTGGAGCTCTAGACATAGGAAC
GATCACCCCTGTGGAGATCTGGAAGGCCTTTCAAATGAGTGATCGTAAACGGCACTTCTC
CACTGTCTTGGCCTTTGATGTAGACGTTACTCCTGAGGCAAGTCAACTCGCGGAACAGTT
GCAAGTCAAAGTCATCTGTGGCTGTATGCTTGAAAGGCTGCACTACCAGTTCAAAGAGCA
TATCGAAGAGCTGGGAGAGGACCCAAAAATGGAGGATGAAGCAATCTTCCCTGGCATCCT
CAGCATCTTAACCAACGCTGTCTTCAG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4DS28TF 614 0 0
GAGACAAATTCCTTCCGCCGCTGGATCTCTTCACCGACAATGTCGAATTGGAGTAACGAT
GTGACTAGGTTAATGGATCAAGATGTTGGTATTTATTCTGGAGAAGGAACCTCTGGGACG
GCAAAGAGGTCCGAGAGCTTTGCAAAAGAAGTCAAGCATATGGAATCTGTGATGAATTTT
AAGAGAAGTGGCGAGGGAGTTGTTGCTGTAGCTTCTACCACTTATTCGTTGAATGAATTG
GTCGAGTTCTTGGAATCCCCGACGGTGAACATTCCTGTTGGAGCTCTAGACGTAGGAACG
ATCACCCCTGTGGAGATCTGGAAGGCCTTTCAAATGAGTGATCGTAAACGACACTTCTCC
ACTGTCTTGGCCTTTGATGTAGACGTTACTCCTGAGGCAAGTCAACTCGCGGAACAGTTG
CAAGTCAAAGTCATCTGTGGCTGTATGCTTGAAAGGCTGCACTACCAGTTCAAAGAGCAT
ATCGAAGAGCTGGGAGAGGACCCAAAAATGGAGGATGAAGTAATCTTCCCTGGCATCCTC
AGCATCTTAACTAACGCTGTCTTCAGCAAGGAAGACCCTATTGTCCTCGGAGTCTTAGTT
GTTGAGGGTTTCAT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4F822TF 787 0 0
G
GAGACAAATTCCTTCCGCCGCTGGATCTCTTCACCGACAATGTCGAATTGGAGTAACGAT
GTGACTAGGTTAATGGATCGAGATGTGGGTATTTATTCTGGAGAAGGAACCTCTGGGACG
GCAAAGAGGTCCGAGAGCTTTGCAAAAGAAGTCCAGCATATGGAATCTGTGATGAATTTT
AAGAGAAGTGGCGAGGGAGTTGTTGCTGTAGCTTCTACCACTTATTCCTTGAATGAATTG
GTCGAGTTCTTGGAATCCCCGACGGTGAACATTCCTGTTGGAGCTCTAGACATAGGAACG
ATCACCCCTGTGGAGATCTGGAAGGCCTTTCAAATGAGTGATCGTAAACGGCACTTCTCC
ACTGTCTTGGCCTTTGATGTAGACGTTACTCCTGAGGCAAGTCAACTCGCGGAACAGTTG
CAAGTCAAAGTCATCTGTGGCTGTATGCTTGAAAGGCTGCACTACCAGTTCAAAGAGCAT
ATCGAAGAGCTGGGAGAGGACCCAAAAATGGAGGATGAAGCAATCTTCCCTGGCATCCTC
AGCATCTTAACCAACGCTGTCTTCAGCAAGGAAGACCCTATTGTCCTCGGAGTCTTAGTT
GTTGAGGGTTTCATCAAGGTAGGAGTTCCCATAGCCTATGTGCGAACTGCTGGTTGTCTG
GATTTAG*ACGTATTGCATGGATTGAGAA*TACCAACAACCCGTCGATGTTGCTAGTCTA
G*CGAGACCGCTGTTATCAAGATTGTTGCATCAAACCCGGAAGAACAGAGACAAGCACGT
AGCTTT

QA 2 787 2 787
DS 

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AGGCAAGTCAACTCGCGGAACAGTTGCAAGTCAAAGTCATCTGTGGCTGTATGCTTGAAA
GGCTGCACTACCAGTTCAAAGAGCATATCGAAGAGCTGGGAGAGGACCCAAAAATGGAGG
ATGAAGCAATCTTCCCTGGCATCTTCAGCATCTTAACCAACGCTGTCTTCAGCAAGGAAG
ACCCTATTGTCCTCGGAGTTTTAGTTGTTGAGGGTTTCATCAAGGTAGGAGTTCCCATAG
CCTATGTGCGAACTGCTGGTTGTCTGGATTTAGGACGTATTGCATGGATTGAGAAATACC
AACAACCCGTCGATGTTGCTAGTTTAGGCGAGACCGCTGTTATCAAGATTGTTGCATCAA
ACCCGGAAGAACAGAGACAAGCACGTAGCTTTGGAAGCCATTATGACATTAATGACAATA
TTCTTGTCACT
CGTCTT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4F822JQ 514 0 0
TCAGCATTTTAACCAACGCTGTCTTCAGCAAGGAAGACCCTATTGTCCTCGGAGTTTTAG
TTGTTGAGGGTTTCATCAAGGTAGGAGTTCCCATAGCCTATGTGCGAACTGCTGGTTGTC
TGGATTTAGGACGTATTGCATGGATTGAGAAATACCAACAACCCGTCGATGTTGTTAGTT
TAGGCGAGACCGCTGTTATCAAGATTGTTGCATCAAACCCGGAAGAACAGAGACAAGCAC
GTAGCTTTGGAAGCCATTATGACATTAATGACAATATTCTTGTCACTCGTCTTTTTAGGG
CATCTATCATTGCCTTCCGAGATAGTGACTTGGAAAAACTATCCTGCAGCGAGTTTAAAG
CGATGTCTGATATCAAACGCGTTCTCAAATTCAAGTAATATGTGTATGTCTAATGTTGTT
TTCGTTTGTCAACAACAACTACTTTCCATTTAAAATCTGAACAAGCTGGCCACTCCTAGT
TATTTCATCTTTTTATATAGTTATGTATTTTATG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 6

CO CL1131Contig1 1385 6 11 U
GGGATAGGGTAGACTCGTGGGTTCATGACTTTTGGATGGAGGGTGTTATCACGGAGAAGA
ACAAAAAAGATGAAAATACAGTGACTGTACATTTTCCAGCACAAGGAGAGACTCTGACTA
TCAAAGCTTGGAATCTGCGTCCTTCTCTTGTTTGGAAAGATGGAAGGTGGATTGAATGTT
CTACTACTTCAGGAGAAAACATCAACTCATCACATGAGGGTGATACTCCAAAAGAGAAGC
GTCCTAGACTAGAAGCTCCAGCTCCTGTGGCTGAAGGAAAAGACACGAAAATGGAAACTG
TCGTTGATCCGGATTTGGGTAAACCGCCTCAGAGTGGTGTTCTTGACCTCGGTGTTTCAG
AAACTACATTTAACATCGGGACGACGATTACCAAAGGGGAGGGCAATCCTGGTCCACTCC
GAATGAAGAGAACAGGTTTGCAAACGCAGGGAGCAAAAGTGGTTTATGGTGTCCCTAAAC
CTGGAAAGACAAGGAAGTTCATGGACGTGAGCAAACACTACGTTTCAGAGGCGAGCAACA
AAACTCGGAAACAGAAGGAACCGGCTATGCCTGTGAAACCAATTGTGCCCCAGAATCCAG
GACCAGGGAGCTGGAGATT*CCTTCTAAAACCATTT*CCAGAGAGAAACAGACAACGACA
ACATCAAAGCCCAAGAGTTCCAAACCTGGACCCAAGACCAAAGAGAAACCGGTTGCTGCA
GATAGGATAATTCCCCGCAAGGACTCGCGTAACACAACAGCCTCAAATATGAAATCTGAT
GATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAAAGGTCCTACATCTGGAACCGTTTCTAGTGTT
GCATCCAAGGGAACAGAGGAAGAGCAAAATAGTTCCTCGGGCACTACTGGTAAAGGGAAA
GTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAAGATTGAAGAGGATAAGGCGATGGCTGATAAT
TCTTCAAAAGCATCTGATGGAATGGAACCACGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACT
TCTAGACTGCTTGAAGGTCTGCAATCATCAATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATTTCA
CAGAGCAGAAGTCATCAAAGTCGAAGCAAAAAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGG
AAGGAGCATAGGCTAAGTGCATATAAAAACCCAAGAAGAAGAAAGAGGCAGTCTTTGCTG
CTGTTTGGTTGAAGCTCCGTTGTTGGTTGGGGGGAGAGATGATATGTTATTGTAGGTGTG
TTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGTTCTCTCTCTCTCTCACTCGAAGTATATTCGTGACA
TTGTTGTAGGAACAAAACAACAGAGTTTTATTATTGCCAAGTATCATCATCATCTTCCCT
GACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4F157TF U 1
AF RR4EP78TF U 1
AF RR4BH91TF U 510
AF RR4EP78JQ C 626
AF RR4F157JQ C 631
AF RR4BH91JQ C 521
BS 1 619 RR4EP78TF
BS 620 620 RR4BH91TF
BS 621 698 RR4EP78TF
BS 699 699 RR4BH91TF
BS 700 721 RR4EP78TF
BS 722 1212 RR4BH91TF
BS 1213 1213 RR4BH91JQ
BS 1214 1234 RR4BH91TF
BS 1235 1297 RR4BH91JQ
BS 1298 1299 RR4EP78JQ
BS 1300 1385 RR4BH91JQ

RD RR4F157TF 691 0 0
GGGATAGGGTAGACTCGTGGGTTCATGACTTTTGGATGGAGGGTGTTATCACGGAGAAGA
ACAAAAAAGATGAAAATACAGTGACTGTACATTTTCCAGCACAAGGAGAGACTCTGACTA
TCAAAGCTTGGAATCTGCGTCCTTCTCTTGTTTGGAAAGATGGAAGGTGGATTGAATGTT
CTACTACTTCAGGAGAAAACATCAACTCATCACATGAGGGTGATACTCCAAAAGAGAAGC
GTCCTAGACTAGAAGCTCCAGCTCCTGTGGCTGAAGGAAAAGACACGAAAATGGAAACTG
TCGTTGATCCGGATTTGGGTAAACCGCCTCAGAGTGGTGTTCTTGACCTCGGTGTTTCAG
AAACTACATTTAACATCGGGACGACGATTACCAAAGGGGAGGGCAATCCTGGTCCACTCC
GAATGAAGAGAACAGGTTTGCAAACGCAGGGAGCAAAAGTGGTTTATGGTGTCCCTAAAC
CTGGAAAGACAAGGAAGTTCATGGACGTGAGCAAACACTACGTTTCAGAGGCGAGCAACA
AAACTCGGAAACAGAAGGAACCGGCTATGCCTGTGAAACCAATTGTGCCCCAGAATCCAG
GACCAGGGAGCTGGAGATTGCCTTCTAAAACCATTTTCCAGAGAGAAACAGACAACGACA
*CATCAAAGCCCAAGAGTTCCAAACCTGGAC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4EP78TF 721 0 0
GGGATAGGGTAGACTCGTGGGTTCATGACTTTTGGATGGAGGGTGTTATCACGGAGAAGA
ACAAAAAAGATGAAAATACAGTGACTGTACATTTTCCAGCACAAGGAGAGACTCTGACTA
TCAAAGCTTGGAATCTGCGTCCTTCTCTTGTTTGGAAAGATGGAAGGTGGATTGAATGTT
CTACTACTTCAGGAGAAAACATCAACTCATCACATGAGGGTGATACTCCAAAAGAGAAGC
GTCCTAGACTAGAAGCTCCAGCTCCTGTGGCTGAAGGAAAAGACACGAAAATGGAAACTG
TCGTTGATCCGGATTTGGGTAAACCGCCTCAGAGTGGTGTTCTTGACCTCGGTGTTTCAG
AAACTACATTTAACATCGGGACGACGATTACCAAAGGGGAGGGCAATCCTGGTCCACTCC
GAATGAAGAGAACAGGTTTGCAAACGCAGGGAGCAAAAGTGGTTTATGGTGTCCCTAAAC
CTGGAAAGACAAGGAAGTTCATGGACGTGAGCAAACACTACGTTTCAGAGGCGAGCAACA
AAACTCGGAAACAGAAGGAACCGGCTATGCCTGTGAAACCAATTGTGCCCCAGAATCCAG
GACCAGGGAGCTGGAGATTGCCTTCTAAAACCATTT*CCAGAGAGAAACAGACAACGACA
ACATCAAAGCCCAAGAGTTCCAAACCTGGACCCAAGAC*AAAGAGAAACCGGTTGCTGCA
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4BH91TF 734 0 0
G
GCAAACACTACGTTTCAGAGGCGAGCAACAAAACTCGGAAACAGAAGGAACCGGCTATGC
CTGTGAAACCAATTGTGCCCCAGAATCCAGGACCAGGGAGCTGGAGATT*CCTTCTAAAA
CCATTT*CCAGAGAGAAACAGACAACGACAACATCAAAGCCCAAGAGTTTCAAACCTGGA
CCCAAGACCAAAGAGAAACCGGTTGCTGCAGATAGGATAATTCCCCGCAAGGACTCGCGT
AACACAACAGCCTCAAATATGAAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAAA
GGTCCTACATCTGGAACCGTTTCTAGTGTTGCATCCAAGGGAACAGAGGAAGAGCAAAAT
AGTTCCTCGGGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAAG
ATTGAAGAGGATAAGGCGATGGCTGATAATTCTTCAAAAGCATCTGATGGAATGGAACCA
CGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTGCAATCATCA
ATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATTTCACAGAGCAGAAGTCATCAAAGTCGAAGCAAA
AAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAGGCTAAGTGCATATAAAAAC
CCAAGAAGAAGAAAGAGGCAGTCTTTGCTGCTGTTTGGTTGA*GCTCCGTTGTTGGTTGG
GGGG
GAGAGATGA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4EP78JQ 749 0 0
TAAAACCATTT*CCAGAGAGAAACAGACAACGACAACATCAAAGCCCAAGAGTTCCAAAC
CTGGACCCAAGACCAAAGAGAAACCGGTTGCTGCAGATAGGATAATTCCCCGCAAGGACT
CGCGTAACACAACAGCCTCAAATATGAAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGA
ACAAAGGTCCTACATCTGGAACCGTTTCTAGTGTTGCATCCAAGGGAACAGAGGAAGAGC
AAAATAGTTCCTCGGGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAG
CCAAGATTGAAGAGGATAAGGCGATGGCTGATAATTCTTCAAAAGCACCTGATGGAATGG
AACCACGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTGCAAT
CATCAATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATTTCACAGAGCAGAAGTCATCAAAGTCGAA
GCAAAAAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAGGCTAAGTGCATATA
AAAACCCAAGAAGAAGAAAGAGGCAGTCTTTGCTGCTGTTTGGTTGAAGCTCCGTTGTTG
GTTGGGGGGAGAGATGATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGT
TCTCTCTCTCTCTCACTCGAAGTATATTCGTGACATTGTTGTAGGAACAAAACAACAGAG
TTTTATTATTGCCAAGTATCATCATCATC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4F157JQ 744 0 0
CCATTT*CCAGAGAGAAACAGACAACGACAACATCAAAGCCCAAGAGTTCCAAACCTGGA
CCCAAGACCAAAGAGAAACCGGTTGCTGCAGATAGGATAATTCCCCGCAAGGACTCGCGT
AACACAACAGCCTCAAATATGAAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAAA
GGTCCTACATCTGGAACCGTTTCTAGTGTTGCATCCAAGGGAACAGAGGAAGAGCAAAAT
AGTTCCTCGGGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAAG
ATTGAAGAGGATAAGGCGATGGCTGATAATTCTTCAAAAGCACCTGATGGAATGGAACCA
CGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTGCAATCATCA
ATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATTTCACAGAGCAGAAGTCATCAAAGTCGAAGCAAA
AAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAGGCTAAGTGCATATAAAAAC
CCAAGAAGAAGAAAGAGGCAGTCTTTGCTGCTGTTTGGTTGAAGCTCCGTTGTTGGTTGG
GGGGAGAGATGATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGTTCTCT
CTCTCTCTCACTCGAAGTATATTCGTGACATTGTTGTAGGAACAAAACAACAGAGTTTTA
TTATTGCCAAGTATCATCATCATC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4BH91JQ 865 0 0
CGTTTCAGAGGCGAGCAACAAAACTCGGAAACAGAAGGAACCGGCTATGCCTGTGAAACC
AATTGTGCCCCAGAATCCAGGACCAGGGAGCTGGAGATT*CCTTCTAAAACCATTT*CCA
GAGAGAAACAGACAACGACAACATCAAAGCCCAAGAGTTTCAAACCTGGACCCAAGACCA
AAGAGAAACCGGTTGCTGCAGATAGGATAATTCCCCGCAAGGACTCGCGTAACACAACAG
CCTCAAATATGAAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAAAGGTCCTACAT
CTGGAACCGTTTCTAGTGTTGCATCCAAGGGAACAGAGGAAGAGCAAAATAGTTCCTCGG
GCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAAGATTGAAGAGG
ATAAGGCGATGGCTGATAATTCTTCAAAAGCATCTGATGGAATGGAACCACGTAGATCTG
TCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTGCAATCATCAATGATGACCT
CGAAGATTCCTTCCATTTCACAGAGCAGAAGTCATCAAAGTCGAAGCAAAAAGTAACCGT
AGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAGGCTAAGTGCATATAAAAACCCAAGAAGAA
GAAAGAGGCAGTCTTTGCTGCTGTTTGGTTGAAGCTCCGTTGTTGGTTGGGGGGAGAGAT
GATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGTTCTCTCTCTCTC**A
CTCGAAGTATATTCGTGACATTGTTGTAGGAACAAAACAACAGAGTTTTATTATTGCCAA
GTATCATCATCATCTTCCCTGACCC

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 6

CO CL1132Contig1 1026 6 18 U
GAAAGGGGAATGCAATCATAAGCCTATTCTCCAATTGACACAAATGAATAGACCATCATT
ACACATAGCACGTAAGTTTGGTGTCGCTGATATTACAAAGAAACAGAGTGTGAAGATCAA
TTTTACATACAGCAACAGTTGCCAAATGAGCTTCCTTTTTCTCCCAGCTGAGCTTCAGCC
CTTCTTTTCCTGTGGGGTGTTGATGGTGAGAAGAAGCCTCTCAACGTATTTGCCCATAAT
ATCAACCTCCAAGTTGACTTTCTGCCCAACTTTCTTGGTTGGAATCACCACATTCTGCTG
GGTATAAGCAACGAGCATGAAGCTAAAGCAGCTCTCCTCGTCAGACACATCCACCACCGT
CAGGCTCGTCCCGTCCACCGCCACAAAGCCCTTGGGGACAATGTATTTGAGCAAAGCCTT
GTCCGCTTTCACCTTCACCCACAGCGAATCTCCCTCAGCCTCCATCGAAACGATCACTCC
CGTACCGTCCACGTGTCCCTGCACAACGTGTCCCCCCATTCGGCTCACCGGCTGCAGCGC
ACGCTCCAGATTCACCAGGGATCCTCTCTCCAGCTCCTCCAGCGACGTTTTCCGCAGCGT
CTCCGGCGCTAACCCGACGGTGAACTCCTCGGCGTCGAAATGGGTGACAGTTAGGCAAGT
ACCGTTGACGGCGATGCTGTCGCCAAGCTTCACGTCCTCCACCACCACTCTCGCCCCGAT
TTTAAGGTCGAATCCGCCGTGATCAGCTAATCCAAGATCCTTAACTTGCCCCATTTCTTC
CACGATTCCCGTGAACACCGATCGGATGCTCAGATTTTGCCTCCGATGTCTTCCACATGT
CGTCGTCAGCTTTGATGAGTCAAATCTTAGGATATTTGGTCTGAGTGAAGCGATGTTTGG
CGGCAACTGCGGAGAGGGAAACAGACTGAAAGATTGAGTGGCCATCATCGTTTTTTTGCG
GTGAGCCTCCTATTTTTCCACCCACGGCGGCGCTAAGTCGTCGTCTCTCTGTATTGTTGT
AGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC68JQ U 1
AF RR4CC90JQ U 113
AF RR4FE96JQ U 12
AF RR4FE96TF C 217
AF RR4EC68TF C 421
AF RR4CC90TF C 395
BS 1 53 RR4EC68JQ
BS 54 54 RR4FE96JQ
BS 55 139 RR4EC68JQ
BS 140 140 RR4FE96JQ
BS 141 300 RR4EC68JQ
BS 301 301 RR4FE96JQ
BS 302 322 RR4EC68JQ
BS 323 323 RR4FE96JQ
BS 324 333 RR4EC68JQ
BS 334 334 RR4FE96JQ
BS 335 361 RR4EC68JQ
BS 362 409 RR4FE96JQ
BS 410 410 RR4CC90JQ
BS 411 666 RR4FE96JQ
BS 667 941 RR4FE96TF
BS 942 942 RR4CC90TF
BS 943 949 RR4FE96TF
BS 950 1026 RR4CC90TF

RD RR4EC68JQ 361 0 0
GAAAGGGGAATGCAATCATAAGCCTATTCTCCAATTGACACAAATGAATAGACTATCATT
ACACATAGCACGTAAGTTTGGTGTCGCTGATATTACAAAGAAACAGAGTGTGAAGATCAA
TTTTACATACAGCAACAGT*GCCAAATGAGCTTCCTTTTTCTCCCAGCTGAGCTTCAGCC
CTTCTTTTCCTGTGGGGTGTTGATGGTGAGAAGAAGCCTCTCAACGTATTTGCCCATAAT
ATCAACCTCCAAGTTGACTTTCTGCCCAACTTTCTTGGTTGGAATCACCACATTCTGCTG
CGTATAAGCAACGAGCATGAAGTTAAAGCAGCTGTCCTCGTCAGACACATCCACCACCGT
C

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4CC90JQ 447 0 0
AAGAACAATTTTACATACAGCAACAGTTGCCAAATGAGCTTCCTTTTTCTCCCAGCTGAG
CTTCAGCCCTTCTTTTCCTGGGGGGTGTTGATGGTGAGAAGAAGCCTCTCAACGTATTTG
CCCATAATATCAACCTCCAAGTTGACTTTCTGCCCAACTTTCTTGGTTGGAATCACCACA
TTCTGCTGGGTATAAGCAACGAGCATGAAGCTAAAGCAGCTCTCCTCGTCAGACACATCC
ACCACCGTCAGGCTCGTCCCGTCCACCGCCACAAAGCCCTTGGGGACAATGTATTTGAGC
AAAGCCTTGTCCGCTTTCACCTTCACCCACAGCGAATCTCCCTCAGCCTCCATCGAAACG
ATCACTCCCGTACCGTCCACGTGTCCCTGCACAACGTGTCCCCCCATTCGGCTCACCGGC
TGCAGCGCACGCTCCAGATTCACCAGG

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4FE96JQ 655 0 0
GCAATCATAAGCCTATTCTCCAATTGACACAAATGAATAGACCATCATTACACATAGCAC
GTAAGTTTGGTGTCGCTGATATTACAAAGAAACAGAGTGTGAAGATCAATTTTACATACA
GCAACAGTTGCCAAATGAGCTTCCTTTTTCTCCCAGCTGAGCTTCAGCCCTTCTTTTCCT
GTGGGGTGTTGATGGTGAGAAGAAGCCTCTCAACGTATTTGCCCATAATATCAACCTCCA
AGTTGACTTTCTGCCCAACTTTCTTGGTTGGAATCACCACATTCTGCTGGGTATAAGCAA
CGAGCATGAAGCTAAAGCAGCTCTCCTCGTCAGACACATCCACCACCGTCAGGCTCGTCC
CGTCCACCGCCACAAAGCCCTTGGGGACAATGTATTTGGGCAAAGCCTTGTCCGCTTTCA
CCTTCACCCACAGCGAATCTCCCTCAGCCTCCATCGAAACGATCACTCCCGTACCGTCCA
CGTGTCCCTGCACAACGTGTCCCCCCATTCGGCTCACCGGCTGCAGCGCACGCTCCAGAT
TCACCAGGGATCCTCTCTCCAGCTCCTCCAGCGACGTTTTCCGCAGCGTCTCCGGCGCTA
ACCCGACGGTGAACTCCTCGGCGTCGAAATGGGTGACAGTTAGGCAAGTACCGTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4FE96TF 735 0 0
CCTCTCAACGTATTTGCCCATAATATCA*CCTCCAAGTTGACTTTCTGCCCAACTTTCTT
GGTTGGAATCACCACATTCTGCTGGGTATAAGCAACGAGCATGAAGCTAAAGCAGCTCTC
CTCGTCAGACACATCCACCACCGTCAGGCTCGTCCCGTCCACCGCCACAAAGCCCTTGGG
GACAATGTATTTGGGCAAAGCCTTGTCCGCTTTCACCTTCACCCACAGCGAATCTCCCTC
AGCCTCCATCGAAACGATCACTCCCGTACCGTCCACGTGTCCCTGCACAACGTGTCCCCC
CATTCGGCTCACCGGCTGCAGCGCACGCTCCAGATTCACCAGGGATCCTCTCTCCAGCTC
CTCCAGCGACGTTTTCCGCAGCGTCTCCGGCGCTAACCCGACGGTGAACTCCTCGGCGTC
GAAATGGGTGACAGTTAGGCAAGTACCGTTGACGGCGATGCTGTCGCCAAGCTTCACGTC
CTCCACCACCACTCTCGCCCCGATTTTAAGGTCGAATCCGCCGTGATCAGCTAATCCAAG
ATCCTTAACTTGCCCCATTTCTTCCACGATTCCCGTGAACACCGATCGGATGCTCAGATT
TTGCCTCCGATGTCTTCCACATGTCGTCGTCAGCTTTGATGAGTCAAATCTTAGGATATT
TGGTCTGAGTGAAGCGATGTTTGGCGGCAACTGCGGAGAGGGAAACAGACTGAAAGATTG
AGTGGTCATCATC
CC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4EC68TF 602 0 0
GTCCGCTTTCACCTTCACCCACAGCGAATCTCCCTCAGCCTCCATCGAAACGATCACTCC
CGTACCGTCCACGTGTCCCTGCACAACGTGTCCCCCCATTCGGCTCACCGGCTGCAGCGC
ACGCTCCAGATTCACCAGGGATCCTCTCTCCAGCTCCTCCAGCGACGTTTTCCGCAGCGT
CTCCGGCGCCAACCCGACGGTGAACTCCTCGGCGTCGAAATGGGTGACAGTTAGGCAAGT
ACCGTTGACGGCGATGCTGTCGCCTAGCTTCACGTCCTCCACCACCACTCTCGCCCCGAT
TTTAAGGTCGAATCCGCCGTGATCAGCTAATCCAAGATCCTTAACTTGCCCCATTTCTTC
CACGATTCCCGTGAACACCGATCGGATGCTCAGATTTTGCCTCCGATGTCTTCCACATGT
CGTCGTCAGCTTTGATGAGTCAAATCTTAGGATATTTGGTCTGAGTGAAGCGAAGTTTGG
CGGCAACTGCGGAGAGGGAAGCAGACTGAAAGATTGAGTGGCCATCATCGTTTTTTTGCG
GTGAGCCTCCTATTTTTCCACCCACGGCGGCGCTAAGTCGTCGTCTCTCTGTATTGTTGT
CC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4CC90TF 632 0 0
GGGACAATGTATTTGAGCAAAGC*TTGTCCGCTTTCACCTTCACCCACAGCGAATCTCCC
TCAGCCTCCATCGAAACGATCACTCCCGTACCGTCCACGTGTCCCTGCACAACGTGTCCC
CCCATTCGGCTCACCGGCTGCAGCGCACGCTCCAGATTCACCAGGGATCCTCTCTCCAGC
TCCTCCAGCGACGTTTTCCGCAGCGTCTCCGGCGCTAACCCGACGGTGAACTCCTCGGCG
TCGAAATGGGTGACAGTTAGGCAAGTACCGTTGACGGCGATGCTGTCGCCAAGCTTAACG
TCCTCCACCACCACTCTAGCCCCGATTTTAAGGTCGAATCCGCCGTGATCAGCTAATCCA
AGATCCTTAACTTGCCCCATTTCTTCCACGATTCCCGTGAACACCGATCGGATGCTCAGA
TTTTGCCTCCGATGTCTTCCACATGTCGTCGTCAGCTTTGATGAGTCAAATCTTAGGATA
TTTGGTCTGAGTGAAGCGATGTTTGGCGGCAACTGCGGAGAGGGAAACAGACTGAAAGAT
TGAGTGGCCATCATCGTTTTTTTGCGGTGAGCCTCCTATTTTTCCACCCACGGCGGCGCT
AAGTCGTCGTCTCTCTGTATTGTTGTAGGTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 7

CO CL1133Contig1 803 7 2 U
GGAAAAGAACACATCTTTGATTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATTCCTCTTGTCCGT
GTCTCAAACCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCATGGATCCGGCTGAGATGAGGT
ACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGGTTTCG
CCGCTGGGACGATCTACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGA
GGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGGGCTCA
CTTTCGCTGCCATCG*AGGAGTGTACATCGGCGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAG
GAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGTCCTTG
GCTATAGAGCAAGGAGCATACCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACAT
CTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATC
CTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTC
TGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGGCCTCGTGAAGAATGTCTGTCTCTCTTTGTTGTCAT
CTCTTTTTTTTT*CTTTTTTAATCTACTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTG
TTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCATCTTTTGTCTGAATGTTGATTCCTACAA
TAAAGATATCAACTTTGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4F631TF U 1
AF RR4GM68JQ C 425
AF RR4GM68TF U 425
AF RR4A777JQ C 333
AF RR4A777TF U 38
AF RR4H928TF U 371
AF RR4F631JQ C 200
BS 1 502 RR4F631TF
BS 503 803 RR4A777TF

RD RR4F631TF 502 0 0
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GTCTCAAACCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCATGGATCCGGCTGAGATGAGGT
ACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGGTTTCG
CCGCTGGGACGATCTACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGA
GGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGGGCTCA
CTTTCGCTGCCATCG*AGGAGTGTACATCGGCGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAG
GAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGTCCTTG
GCTATAGAGCAAGGAGCATACCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACAT
CTGCTTTGATTGACTCTGGAGG

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4GM68JQ 330 0 0
G
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TTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTAC
ACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAG
TCAATAAAGCTTATCCCAGGCCTCGTGAAGAATGTCTGTCTCTCTTTGTTGTCATCTCTT
TTTTTT**CTTTTTTAATCTACTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTAC
TCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCA
CC

QA 2 328 2 328
DS 

RD RR4GM68TF 330 0 0
G
AGAGCAAGGAGCATACCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCT
TTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTAC
ACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAG
TCAATAAAGCTTATCCCAGGCCTCGTGAAGAATGTCTGTCTCTCTTTGTTGTCATCTCTT
TTTTTT**CTTTTTTAATCTACTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTAC
TCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCA
CC

QA 2 328 2 328
DS 

RD RR4A777JQ 425 0 0
GTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGG
GGGTTTGTGGCCGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATACCAACAGCGATA
GCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATTTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACA
AGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCT
GATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGGCCTCGTG
AAGAATGTCTGTCTCTCTTTGTTGTCATCTCTTTTTTTTT*CTTTTTTAATCTACTGTAT
CTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCA
T
TTTT

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4A777TF 766 0 0
GG
TCGCTCATTCCTCTTGTCCGTGTCTCAAACCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCA
TGGATCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCA
AAGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACGATCTACGGAACTATTCTGGCCACGTGGA
AAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGA
TGATGGGAACTCACGGGCTCACTTTCGCTGCCATCGGAGGAGTGTACATCGGCGTTGAGC
AGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTG
TGGCCGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATACCAACAGCGATAGCTGCAG
GTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAG
ACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCT
GATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGGCCTCGTGAAGAATG
TCTGTCTCTCTTTGTTGTCATCTCTTTTTTTTT*CTTTTTTAATCTACTGTATCTGGAGA
TATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCATCTTTTG
TCTGAATGTTGATTCCTACAATAAAGATATCAACTTTGTCTTCC

QA 3 766 3 766
DS 

RD RR4H928TF 431 0 0
TTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGC
AAGGAGCATACCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGAT
TGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCC
CGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAAT
AAAGCTTATCCCAGGCCTCGTGAAGAATGTCTGTCTCTCTTTGTTGTCATCTCTTTTTTT
TT*CTTTTTTAATCTACTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTG
TGTTTATGGAGATTGACTTTCATCCTTTGTCTGAATGTTGATTCCTACAATAAAGATATC
AACTTTGTCTT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4F631JQ 604 0 0
AACC
ATTCTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTC
ATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGGGCTCACTTTCGCTGCCATCG*AGGAGTG
TACATCGGCGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGT
GCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATACCA
ACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGT
CAGGCCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACA
GCTAAAGCAGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGACGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCA
GGCCTCGTGAAGAATGTCTGTCTCTCTTTGTTGTCATCTCTTTTTTTTTTCTTTTTTAAT
CTACTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTATGAAGAT
TGACTTTCATCTTTTGTCTGAATGTTGATTCCTACAATAAAGATATCAACTTTGTCTT
CC

QA 5 602 5 602
DS 



AS 2 7

CO CL1134Contig1 649 2 2 U
GTCTTGAGATTGGTCCTGGAGCTCCACAGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCACAAAGG
GAAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTC
TCTACTCCTCAGTTGTTTACCCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAG
ACAATGACCCTATTGATGTTTTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTC
TGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAATGCCCATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGA
TTATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAGGAGCTTC
CTCCTCACCGTCTCTCTGAGATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACA
AGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTCTCCCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTACT
CAATGGACCTTTATGCTGAGTACATTCTCCATACCCTGAGACGTTGAAGCTTTCCCCTCT
CAACATTTCTGCAACGTCTTGTTTCTGTTTCTTTCTATGTTCTCTGAATTTTCTTGTTAA
ACTTTTGGACTTGTCCTTGTGAACTCAATAATATTTTCTTCTAAATCAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4B773TF U 1
AF RR4B991TF U 1
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DS 

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G
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TCCTCACCGTCTCTCTGAGATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAA
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AACATTTCTGCAACGTCTTGTTTCTGTTTCTTTCTATGTTCTCTGAATTTTCTTGTTAAA
CTTT*GGACTTGTCCTTGTGAACTCAATAATATTTTCTTCTAAATCAT

QA 2 649 2 649
DS 



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TATAAGTGAAGCGCGTTGGTGTGTGCTAAAATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU81JQ U 1
AF RR4EV95JQ U 2
AF RR4AT72JQ U 5
AF RR4AT72TF C 64
AF RR4EV95TF C 270
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C

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DS 

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DS 

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DS 

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ATAAAGTGCGAGGAACAAAACCATAGTTGTGAGGGTAAACAACTGATGAGTACAGAATAC
GATCAACCTTAATGAGTCCAGTCTTTTTGTCAAGTTCATATTTGACCTTGCTCCCCTTTG
TGATCTCAACGACCACATTGAAAATCTGTGGAGCTCCAGGTCCAATCTCAAGATCATGCC
ATGGATGAGCAGCAACGGATCGTCGGGACAAGGAAGAGAGGATCCTCTCGTTAAGACGAG
GAGCAGGTCTCTGGTTGTTCTCTTTCGTTTCTTCTTCACTCATCTTTTGGAATCGAAAAG
GGAGAAACTTTGGGAGAGAAAATAAAAGTTTTATAAGTGAAGCGCGTTGGTGTGT
CC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 7

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AAGAGAAACAAACAAACATACAGAATAATTATCAAACATGGTAAAATAGAAAAGCATCCA
AAACACACAGCAACCACATACGAGGATTTGACATACGGAAAATACTCTCCGTGTCATTAT
TCTTGTCACAAACTTGAGTAATATATAGATTTATATATGATCATGATTTGGCTATCAACA
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TCTTCTTTAATTACTTTAGATTTGGAGAGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 

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AF RR4H376TF C 65
AF RR4GO21JQ U 6
AF RR4G752JQ U 6
AF RR4H376JQ U 73
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TCTTCTTTAATTACTTTAGATTTGGAGAGGGATCC

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ATAAAA
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AG
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TTTATATATGATCATGATTTGGCTATCAACAGTTGTAATAGCAGTAGCAATCACGGAACG
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CAGACCTCACAAAAGTGTTGGCCATCCTTCTTCTTCTTTAATTACTTTAGATTTGGAGAG
GAATCC

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DS 

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ATCAAACATGGTAAAATAGAAAAGCATCCAAAACACACAGCAACCACATACGAGGATTTG
ACATACGGAAAATACTCTCCGTGTCATTATTCTTGTCACAAACTTGAGTAATATATAGAT
TTATATATGATCATGATTTGGCTATCAACAGTTGTAATAGCAGTAGCAATCACGGAACGG
CCACATAGTACACTGTCCCCACCAGTTGCTGTTATTTTGTTTGCACTTTTTGTTGCAATC
GTTGCAGTCATAAACGAATTGGTAGTACGAACATGTACCGTATAGTGGTCCTCCTGTTAG
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ATACAATCTGTTTCCAGTAGCTGCAACGACGATAGCAAACAGAATAGCAAGAATATAACC
AGACCTCACAAAAGTGTTGGCCATCCTTCTTCTTCTTTAATTACTTTAGATTTGGAGAGG
AATCC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 2 7

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ATCTTTTGATATTTCAGTTTTAATGTCAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B905TF U 1
AF RR4B905JQ C 109
BS 1 743 RR4B905TF
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ATCTTTTGATATT
TC

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ATTTTGAAAACAATCTTTTGATATTTCAGTTTTAATGTCAGATTC

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DS 



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TCTTCATATTCAATTTACAAAGACTAGTTTACTGTGCTGTTCAATTTTGAAAACCATCTT
TTGATATTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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G

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AJ74JQ C 1
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TCATGTGCAGCATTGTCCAGAAAATGGGCTATGGCGAGGGGTTCAAATGGCTCTCTCAGT
ACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTTTCTGTCTTTTTCTTATAAACCAAACCCA
TGAACATGTCCGTACAATTTGAATTTTTTTTGAGCTAAAAGCATTTTATGAATTGAAGAT
GTCACACTTCCTTTGGTGGCTTGATGTTCATTGTTTGGGTAAATCTAATATAATGGGACA
T

QA 10 790 10 790
DS 



CO CL1137Contig2 811 5 13 U
GGGTCTATCGAATCTTAAGACGAAGATCTGACTTTTTTTTGTTTTATCAGTTTCTTCTGT
GAGGAAGAAAAAAAGGGAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGATTGGTTCTACGGAAT
CTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCTAAGATCTTGTTTCTCGGACTCGACAA
TGCTGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAGCC
GACACAACACCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGA
TTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGTGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGATGC
AGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGGTTCTCGGAGTCGAAGAAAGAGCT
AGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTGCGACCGTACCGTTTCTGATTCTCGGAAACAA
GATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAA
CTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGAGGAGATTCCGGTGTTCGCCCGCT
CGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGAGGGGTTCAAATGGCT
CTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCATGTCTCTCTGTCTGTCTTTTTTTT
T*ACATATCAAAACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGAAATTTTTTGAGCTAAA
AGCATTTTATGAATTGAAGATGTCACACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL29TF U 44
AF RR4DO09TF U 46
AF RR4E851TF U 1
AF RR4CL29JQ C 127
AF RR4E851JQ C 171
BS 1 92 RR4E851TF
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RD RR4CL29TF 670 0 0
GG
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TTGGTTCTACGGAATCTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCTAAGATCTTGTT
TCTCGGACTCGACAATGCTGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATT
GGTTCAGCACCAGCCGACACAACACCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAA
GTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGTGTTTGGAAAGATTACTA
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GTCGAAGAAAGAGCTAGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTGCGACCGTACCGTTTCT
GATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCA
CTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGAGGAGATTC
CGGTGTTCGCCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGA
GGGGTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCATGTCTCTCT
GTCTGTCT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4DO09TF 688 0 0
ATCAGTTTCTTCTGTGAGGAAGAAAAAAAGGGAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGA
TTGGTTCTACGGAATCTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTT
TCTCGGACTCGACAATGCTGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATT
GGTTCAGCACCAGCCGACACAACACCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAA
GTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGTGTTTGGAAAGATTACTA
CGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGGTTCTCGGA
GTCGAAGAAAGAGCTAGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTGCGACCGTACCGTTTCT
GATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCA
CTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGAGGAGATTC
CGGTGTTCGCCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGA
GGGGTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCATGTCTCTCT
GTCTGTCTTTTTTTT
TTTACATATCAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4E851TF 774 0 0
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GAGGAAGAAAAAAAGGGAGGAGAATAGAATCACGTTCTTGTTCGATTGGTTCTACGGAAT
CTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTTTCTCGGACTCGACAA
TGCTGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAGCC
GACACAACACCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGA
TTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGTGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGATGC
AGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGGTTCTCGGAGTCGAAGAAAGAGCT
AGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTGCGACCGTACCGTTTCTGATTCTCGGAAACAA
GATTGATATCCCTTACGCAGCCCCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAA
CTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGAGGAGATTCCGGTGTTCGCCCGCT
CGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGGGGGGTTCAAATGGCT
CTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCATGTCTCTCTGTCTGTCTTTTTTTT
**ACATATCAAAACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGAAATTTTT
GAG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4CL29JQ 665 0 0
GTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCTAAGATCTTGTTTCTCGGACTCGACAATGCTGG
AAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAGCCGACACA
ACACCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGG
TGGCCATCAGATTGCTCGTCGTGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGATGCAGTTGT
TTACCTCGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGGTTCTCGGAGTCGAAGAAAGAGCTAGACGC
TCTTTTGTCGGATGAATCCCTTGCGACCGTACCGTTTTTGATTCTCGGAAACAAGATTGA
TATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCAC
CACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGAGGAGATTCCGGTGTTCGCCCGCTCGAGGT
CTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGAGGGGTTCAAATGGCTCTCTCA
GTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCATGTCTCTCTGTCTGTCTTTTTTTTTTACAT
ATCAAAACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGAAATTTTTTGAGCTAAAAGCATT
TTATG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4E851JQ 641 0 0
GACTCGACAATGCTGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTC
AGCACCAGCCGACACAACACCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCA
AGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGTGTTTGGAAAGATTACTACGCCA
AGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGGTTCTCGGAGTCGA
AGAAAGAGCTAGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTGCGACCGTACCGTTTCTGATTT
TCGGAAACAAGATTGATATCCCTTACGCAGCCCCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGG
GTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGAGGAGATTCCGGTG
TTCGCCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGGGGGGT
TCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCATGTCTCTCTGTCTG
TCTTTTTTTTT*ACATATCAAAACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGAAATTTT
TTGAGCTAAAAGCATTTTATGAATTGAAGATGTCACACTTC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 7

CO CL1138Contig1 1055 7 23 U
GGACGTAACATGGAACCGACACAAAGAAAATTATGTCTGCGTCTCCGAACCAATTGTCTT
CTTCCTCTTCATTCGATCTGACCCGGTTTTACTTCTCTCGTAATCGAATCAATCAATTGG
ATCGCATCTTCCAGCGGCAGGAACTCGAAGGTTGGGTTACGAGGAAGAGGAGGAAGAATA
AACCTTGATTTGTGTCTCCATGGACGTTCCTAGCTCTTGGGATGAGTTACGGAAACAGGC
TAGGAAGATTGAAGCTCAGCTTGACGAGCAGATGCATTCATATCGCAGACTTGTTTCCAC
AAAGTCAGATGGTGCAGAGAGTGATCTCGAAGCTGGGATTGCCTTGCTATTAAGGCAACT
TCAACAAGTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGGGTTTCTTCTGGTGGCTCTGACATGGTCTC
CCATACTTTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGATCTCACACAGGAGTTTTATCGACA
CCGATCCAATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATA
TGATCGAACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGG*ATGATGGCTCGACAGAGCAAGCGC
TGCTCAAAGAACATGTGGGGATCAACCGCAATACAGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCAC
ATGCTCAAGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACGTTCAAATTTTGGCGGAATCAACT
CGAAGCTTAGCAATGTCACTAGCCGTCTACCCACGGTGAACACTATTCTGTCAGCTATAA
AGAGGAAAAAGTCCATGGATACAATCATTCTTTCACTTGTTGCAGCTGTATGCACTTTTC
TCATTTTCATCTACTGGTTAACCAAGTAAAAAAAGTCTGCTTTCATCTCTCTGTGTTGGG
CCACGTCTGGTTTTCCCGTGTTGCTATTTTGTTATCATTGATCTTCTCTAGTAAAGCATG
TACAGATCGAAAACATAAATATTTTCTCTACACCAAGCAAACTTTGTCCCTATATTTGTA
GTTTAGACGAGCTTATACAACCATCTGTTTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH47TF U 1
AF RR4DO67TF U 5
AF RR4HB86TF U 5
AF RR4G435TF U 217
AF RR4G435JQ C 248
AF RR4HB86JQB C 215
AF RR4EH47JQ C 421
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BS 430 707 RR4EH47TF
BS 708 713 RR4DO67TF
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BS 734 755 RR4DO67TF
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BS 1043 1055 RR4EH47JQ

RD RR4EH47TF 707 0 0
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CTTCCTCTTCATTCGATCTGACCCGGTTTTACTTCTCTCGTAATCGAATCAATCAATTGG
ATCGCATCTTCCAGCGGCAGGAACTCGAAGGTTGGGTTACGAGGAAGAGGAGGAAGAATA
AACCTTGATTTGTGTCTCCATGGACGTTCCTAGCTCTTGGGATGAGTTACGGAAACAGGC
TAGGAAGATTGAAGCTCAGCTTGACGAGCAGATGCATTCATATCGCAGACTTGTTTCCAC
AAAGTCAGATGGTGCAGAGAGTGATCTCGAAGCTGGGATTGCCTTGCTATTAAGGCAACT
T*AACAAGTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGAGTTTCTTCTGGTTGCTCTGACATGGTCTC
CCATACTT*AGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGATCTCACACAGGAGTTTTATCGACA
CCGATCCAATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATA
TGATCGAACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGG*ATGATGGCTCGACAGAGCAAGCGC
TGCTCAAAGAACATGTGGGGATCAACCGCAATACAGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCAC
ATGCTCAAGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACGTTCAAATTTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DO67TF 777 0 0
GG
AACATAGAACCGACACAAAGAAAATTATGTCTGCGTCTCCGAACCAATTGTCTTCTTCCT
CTTCATTCGATCTGACCCGGTTTTACTTCTCTCGTAATCGAATCAATCAATTGGATCGCA
TCTTCCAGCGGCAGGAACTCGAAGGTTGGGTTACGAGGAAGAGGAGGAAGAATAAACCTT
GATTTGTGTCTCCATGGACGTTCCTAGCTCTTGGGATGAGTTACGGAAACAGGCTAGGAA
GATTGAAGCTCAGCTTGACGAGCAGATGCATTCATATCGCAGACTTGTTTCCACAAAGTC
AGATGGTGCAGAGAGTGATCTCGAAGCTGGGACTGCCTTGCTATTAAGGCAACTTCAACA
AGTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGGGTTTCTTCTGGTGGCTCTGACATGGTCTCCCATAC
TTTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGATCTCACACAGGAGTTTTATCGACACCGATC
CAATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATATGATCG
AACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGGGATGATGGCTCGACAGAGCAAGCGCTGCTCA
AAGAACATGTGGGGATCAACCGCAATACAGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCACATGCTC
AAGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACGTTCAAATTTTGGCGGA*TCAACTCGA*GC
TTAGCA*TGTCACTAGCCGTCTACCCACG*TGA*CACTATTCTGTCAGCTATAA
G

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DS 

RD RR4HB86TF 742 0 0
GG
AACATGGAACCGACACAAGGAAAATTATGTCTGCGTCTCCGAACCAGTTGTCTTCTTCCT
CTTCATTCGATCTGACCCGGTTTTACTTCTCTCGTAATCGAATCAATCAATTGGATCGCA
TCTTCCAGCGGCAGGAACTCGAAGGTTGGGTTACGAGGAAGAGGAGGAAGAATAAACCTT
GATTTGTGTCTCCATGGACGTTCCTAGCTCTTGGGATGAGTTACGGAAACAGGCTAGGAA
GATTGAAGCTCAGCTTGACGAGCAGATGCATTCATATCGCAGACTTGTTTCCACAAAGTC
AGATGGTGCAGAGAGTGATCTCGAAGCTGGGATTGCCTTGCTATTAAGGCAACTTCAACA
AGTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGGGTTTCTTCTGGTGGCTCTGACATGGTCTCCCATAC
TTTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGATCTCACACAGGAGTTTTATCGACACCGATC
CAATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATATGATCG
AACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGG*ATGATGGCTCGACAGAGCAAGCGCTGCTCA
AAGAACATGTGGGGATCAACCGCAATACAGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCACATGCTC
AAGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACGTTCAAATTTTGGCGGAATCAACTCGAAGC
TTAGCAATGTCACTAGCCGT

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR4G435TF 574 0 0
G
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TCATATCGCAGACTTGTTTCCACAAAGTCAGATGGTGCAGAGAGTGATCTCGAAGCTGGG
ATTGCCGTGCTATTAAGGCAACTTCAACAAGTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGGGTTTCT
TCTGGTGGCTCTGACATGGTCTCCCATACTTTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGAT
CTCACACAGGAGTTTTATCGACACCGATCCAATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCA
CTTCTTGAAGACTTTAAAGAATATGATCGAACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGG*A
TGATGGCTCGACAGATCAAGCGCTGCTCAAAGAACATGTGGGGACCAACCGCAATACAGC
GCAGATGGATGGTGTCATTTCACATGCTCAAGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACG
TTCAAATTTTGGCGGAATCAACTCGAAGCTTAGCAATGTCACTAGCCGTCTACCCACGGT
GAACACTATTCTGTCAGCTATAAAGAGGAAAAA

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DS 

RD RR4G435JQ 766 0 0
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GTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGGGTTTCTTCTGGTGGCTCTGACATGGTCTCCCATACT
TTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGATCTCACACAGGAGTTTTATCGACACCGATCC
AATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATATGATCGA
ACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGG*ATGATGGCTCGACAGATCAAGCGCTGCTCAA
AGAACATGTGGGGACCAACCGCAATACAGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCACATGCTCA
AGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACGTTCAAATTTTGGCGGAATCAACTCGAAGCT
TAGCAATGTCACTAGCCGTCTACCCACGGTGAACACTATTCTGTCAGCTATAAAGAGGAA
AAAGTCCATGGATACAATCATTCTTTCACTTGTTGCAGCTGTATGCACTTTTCTCATTTT
CATCTACTGGTTAACCAAGTAAAAAAAGTCTGCTTTCATCTCTCTGTGTTGGGCCACGTT
TGGTTTTCCCGTGTTGCTATTTTGTTATCATCGATCTTCTCTAGTAAAGCATGTACAGAT
CGAAAACATAAATATTTTCTCTACACCAAGCAAACTTTGTCCCTAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4HB86JQB 828 0 0
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CATTCATATCGCAGACTTGTTTCCACAAAGTCAGATGGTGCAGAGAGTGATCTCGAAGCT
GGGATTGCCTTGCTATTAAGGCAACTTCAACAAGTTAATGCTCAGATGCAAGCGTGGGTT
TCTTCTGGTGGCTCTGACATGGTCTCCCATACTTTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAA
GATCTCACACAGGAGTTTTATCGACACCGATCCAATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCT
TCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATATGATCGAACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGG
G*ATGATGGCTCGACAGAGCAAGCGCTGCTCAAAGAACATGTGGGGATCAACCGCAATAC
AGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCACATGCTCAAGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCA
ACGTTCAAATTTTGGCGGAATCAACTCGAAGCTTAGCAATGTCACTAGCCGTCTACCCAC
GGTGAACACTATTCTGTCAGCTATAAAGAGGAAAAAGTCCATGGATACAATCATTCTTTC
ACTTGTTGCAGCTGTATGCACTTTTCTCATTTTCATCTACTGGTTAACCAAGTAAAAAAA
GTCTGCTTTCATCTCTCTGTGTTGGGCCACGTCTGGTTTTCCCGTGTTGCTATTTTGTTA
TCATTGATCTTCTCTAGTAAAGCATGTACAGATCGAAAACATAAATATTTTCTCTACACC
AAGCAAACTTTGTCCCTATATTTGTAGTTTAGACGAGCTTATACAACC

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DS 

RD RR4EH47JQ 635 0 0
CCCATAC
TTAGCTCGACATCAGGAGATCTTTCAAGATCTCACACAGGAGTTTTATCGACACCGATCC
AATCTTAGAACAAAGCAAGAGCATGCTTCACTTCTTGAAGACTTTAAAGAATATGATCGA
ACTAGATTAGACTTAGAAGCTGGGGGGG*ATGATGGCTCGACAGAGCAAGCGCTGCTCAA
AGAACATGTGGGGATCAACCGCAATACAGCGCAGATGGATGGTGTCATTTCACATGCTCA
AGCAACGCTCGATACACTTGTGTTTCAACGTTCAAATTTTGGCGGAATCAACTCGAAGCT
TAGCAATGTCACTAGCCGTCTACCCACGGTGAACACTATTCTGTCAGCTATAAAGAGGAA
AAAGTCCATGGATACAATCATTCTTTCACTTGTTGCAGCTGTATGCACTTTTCTCATTTT
CATCTACTGGTTAACCAAGTAAAAAAAGTCTGCTTTCATCTCTCTGTGTTGGGCCACGTC
TGGTTTTCCCGTGTTGCTATTTTGTTATCATTGATCTTCTCTAGTAAAGCATGTACAGAT
CGAAAACATAAATATTTTCTCTACACCAAGCAAACTTTGTCCCTATATTTGTAGTTTAGA
CGAGCTTATACAACCATCTGTTTCTCAC

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DS 



AS 1 7

CO CL1139Contig1 1414 7 25 U
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CATGCGTGTGATTGCTCGTGATCCTTACGCACCAGCAGACCTTGCGCACGCCATTGGTGT
TGAGCTAGTGAGCTTCGACGAAGCCTTGGCTACTGCGGATTTCATTTCGCTCCACATGCC
TCTTACCCCTGCGACGAACAAGATACTCAACGACGAAACGTTCGCCAAGATGAAGAAGGG
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ATTGGATGCTGGGATTGTTGCTCAGGCTGCGCTTGATGTGTTCACTAAAGAGCCGCCGGC
TAAAGACAGTCCTCTGGTGCAGCACGAGAGGGTTACAGTGACACCTCATCTCGGAGCCAG
CACAATGGAGGCTCAGGAAGGAGTTGCTATTGAAATTGCTGAAGCTGTTGTTGGTGCTTT
GAATGGAGAGCTTGCTGCTACTGCTGTCAATGCTCCTATGGTTTCTGCTGAGGTTCTGAC
TGAGCTGAAACCATACGTGATACTAGCCGAGAAGCTAGGGAGACTAGCGGTGCAGCTAGT
GGCTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATACACGTCAGCAAGAGCCACTGA
TGATCTCGACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATCACCAAGGGAATCATCGAGCCGATCTC
CGATGTATACGTCAACTTGGTCAACGCTGACTTCACAGCCAAGCAGAGAGGTCTCAGACT
CTCAGAGGAGCGTGTGCTCTTGGACGGGTCGCCAGAGAACCCGTTGGAGACCATAACAGT
TCAGCTGGGGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGTTCCTTGTCTGAGTCAGGAGAGGTGAA
AGTGGAAGGAAGGGTTAAAGATGGAATCCCGCATTTGACTAAGGTTGGGTCTTTTGAAGT
GGATGTGACTCTTGAAGGTAGTATCATACTGTGCAGGCAGGTTGATCAGCCGGGTATGAT
TGGGACGGTGGGGAGCATTCTTGGAGAGTCTAACGTGAATGTTAACTTCATGAGCGTTGG
AAGGATCGCACCGAGGAAGCAAGCGATCATGGCTATCGGTGTAGATGATCAGCCAAGCAA
GGAGACGCTTAAGAAGATTGGAGAGATCCCAGCGGTGGAGGAGTTTGTTTTCCTCAAGCT
CTAAGTTTGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATTTTTGAACCTTGAATCTTGAATG
TGAGGGAGGGAGGATTTGATGAAGTGTTTTACCTTTACTGGGTTTTAGGCAATAAAGTTT
CTTTTGGCATTACTCGAGTGCTTCTTTATTCTCTAGATCATGTTCTCCTCTTGCAAACAC
TATCTGAAACTTGAAGTTAGCCCTTGTTGTAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F550TF U 45
AF RR4ER63TF U 1
AF RR4G365TF U 369
AF RR4ER63JQ C 575
AF RR4F550JQ C 603
AF RR4G365JQ C 580
AF RR4DW09TF U 817
BS 1 703 RR4ER63TF
BS 704 704 RR4G365TF
BS 705 734 RR4ER63TF
BS 735 735 RR4G365TF
BS 736 743 RR4ER63TF
BS 744 744 RR4G365TF
BS 745 752 RR4ER63TF
BS 753 753 RR4F550TF
BS 754 770 RR4ER63TF
BS 771 771 RR4G365TF
BS 772 777 RR4ER63TF
BS 778 778 RR4G365TF
BS 779 787 RR4ER63TF
BS 788 788 RR4G365TF
BS 789 807 RR4ER63TF
BS 808 1024 RR4G365TF
BS 1025 1025 RR4DW09TF
BS 1026 1083 RR4G365TF
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BS 1085 1141 RR4G365TF
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RD RR4F550TF 728 0 0
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CGCACGCCATTGGTGTTGAGCTAGTGAGCTTCGACGAAGCCTTGGCTACTGCGGATTTCA
TTTCGCTCCACATGCCTCTTACCCCTGCGACGAACAAGATACTCAACGACGAAACGTTCG
CCAAGATGAAGAAGGGAGTTCGTATTGTTAATGTTGCTCGTGGAGGTGTGATTGACGAAG
ACGCGTTGGTGAGGGCATTGGATGCTGGGATTGTTGCTCAGGCTGCGCTTGATGTGTTCA
CTAAAGAGCCGCCGGCTAAAGACAGTCCTCTGGTGCAGCACGAGAGGGTTACAGTGACAC
CTCATCTCGGAGCCAGCACAATGGAGGCTCAGGAAGGAGTTGCTATTGAAATTGCTGAAG
CTGTTGTTGGTGCTTTGAATGGAGAGCTTGCTGCTACTGCTGTCAATGCTCCTATGGTTT
CTGCTGAGGTTCTGACTGAGCTGAAACCATACGTGATACTAGCCGAGAAGCTAGGGAGAC
TAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATACACGT
CAGCAAGAGCCACTGATGATCTCGACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATCACCAAGGGA*
TCATCGAGCCGATCTCCGATGTATACGTCA*CTTGGTCA*CGCTGACTTCACAGCCAAGC
AGAGAG
TC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4ER63TF 807 0 0
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CATGCGTGTGATTGCTCGTGATCCTTACGCACCAGCAGACCTTGCGCACGCCATTGGTGT
TGAGCTAGTGAGCTTCGACGAAGCCTTGGCTACTGCGGATTTCATTTCGCTCCACATGCC
TCTTACCCCTGCGACGAACAAGATACTCAACGACGAAACGTTCGCCAAGATGAAGAAGGG
AGTTCGTATTGTTAATGTTGCTCGTGGAGGTGTGATTGACGAAGACGCGTTGGTGAGGGC
ATTGGATGCTGGGATTGTTGCTCAGGCTGCGCTTGATGTGTTCACTAAAGAGCCGCCGGC
TAAAGACAGTCCTCTGGTGCAGCACGAGAGGGTTACAGTGACACCTCATCTCGGAGCCAG
CACAATGGAGGCTCAGGAAGGAGTTGCTATTGAAATTGCTGAAGCTGTTGTTGGTGCTTT
GAATGGAGAGCTTGCTGCTACTGCTGTCAATGCTCCTATGGTTTCTGCTGAGGTTCTGAC
TGAGCTGAAACCATACGTGATACTAGCCGAGAAGCTAGGGAGACTAGCGGTGCAGCTAGT
GGCTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATACACGTCAGCAAGAGCCACTGA
TGATCTCGACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATCACCAAGGGA*TCATCGAGCCGATCTC
CGATGTATACGTCA*CTTGGTCA*CGCTGACT*CACAGCCAAGCAGAGAG*TCTCAG*CT
CTCAGAG*AGCGTGTGCTCTTGGACGG

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DS 

RD RR4G365TF 794 0 0
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AGGCTCAGGAAGGAGTTGCTATTGAAATTGCTGAAGCTGTTGTTGGTGCTTTGAATGGAG
AGCTTGCTGCTACTGCTGTCAATGCTCCTATGGTTTCTGCTGAGGTTCTGACTGAGCTGA
AACCATACGTGATACTAGCCGAGAAGCTAGGGAGACTAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAG
GAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATACACGTCAGCAAGAGCCACTGATGATCTCG
ACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATCACCAAGGGAATCATCGAGCCGATCTCCGATGTAT
ACGTCAACTTGGTCAACGCTGACTTCACAGCCAAGCAGAGAGGTCTCAGACTCTCAGGGG
AGCGTGTGCTCTTGGACGGGTCGCCAGAGAACCCGTTGGAGACCATAACAGTTCAGCTGG
GGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGTTCCTTGTCTGAGTCAGGAGAGGTGAAAGTGGAAG
GAAGGGTTAAAGATGGAATCCCGCATTTGACTAAGGTTGGGTCTTTTGAAGTGGATGTGA
CTCTTGAAGGTAGTATCATACTGTGCAGGCAGGTTGATCAGCCGGGTATGATTGGGGCGG
TGGGGAGCATTCTTGGAGAGTCTAACGTGAATGTTAACTTCATGAGCGTTGGAAG*ATCG
CACCGAGGAAGCAAGCGATCATGGCTATCGGTGTAGATGATCAGCCAAGCAAG*AGACGC
TTA
GAAGATGGAGA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4ER63JQ 733 0 0
CTAGGGAGACTAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTC
TCATACACGTCAGCAAGAGCCACTGATGATCTCGACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATC
ACCAAGGGAATCATCGAGCCGATCTCCGATGTATACGTCAACTTGGTCAACGCTGACTTC
ACAGCCAAGCAGAGAGGTCTCAGGCTCTCAGAGGAGCGTGTGCTCTTGGACGGGTCGCCA
GAGAACCCGTTGGAGACCATAACAGTTCAGCTGGGGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGT
TCCTTGTCTGAGTCAGGAGAGGTGAAAGTGGAAGGAAGGGTTAAAGATGGAATCCCGCAT
TTGACTAAGGTTGGGTCTTTTGAAGTGGATGTGACTCTTGAAGGTAGTATCATACTGTGC
AGGCAGGTTGATCAGCCGGGTATGATTGGGACGGTGGGGAGCATTCTTGGAGAGTCTAAC
GTGAATGTTAACTTCATGAGCGTTGGAAGGATCGCACCGAGGAAGCAAGCGATCATGACT
ATCGGTGTAGATGATCAGCCAAGCAAGGAGACGCTTAAGAAGATTGGAGAGATCCCAGCG
GTGGAGGAGTTTGTTTTCCTCAAGCTCTAAGTTTGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GATTTTTGAACCTTGAATCTTGAATGTGAGGGAGGGAGGATTTGATGAAGTGTTTTACCT
TTACTGGGTTTTA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4F550JQ 705 0 0
CTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATACACGTCAGCAAGAGCCACTGATG
ATCTCGACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATCACCAAGGGAATCATCGAGCCGATCTCCG
ATGTATACGTCAACTTGGTCAACGCTGACTTCACAGCCAAGCAGAGAGGTCTCAGGCTCT
CAGAGGAGCGTGTGCTCTTGGACGGGTCGCCAGAGAACCCGTTGGAGACCATAACAGTTC
AGCTGGGGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGTTCCTTGTCTGAGTCAGGAGAGGTGAAAG
TGGAAGGAAGGGTTAAAGATGGAATCCCGCATTTGACTAAGGTTGGGTCTTTTGAAGTGG
ATGTGACTCTTGAAGGTAGTATCATACTGTGCAGGCAGGTTGATCAGCCGGGTATGATTG
GGACGGTGGGGAGCATTCTTGGAGAGTCTAACGTGAATGTTAACTTCATGAGCGTTGGAA
GGATCGCACCGAGGAAGCAAGCGATCATGACTATCGGTGTAGATGATCAGCCAAGCAAGG
AGACGCTTAAGAAGATTGGAGAGATCCCAGCGGTGGAGGAGTTTGTTTTCCTCAAGCTCT
AAGTTTGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATTTTTGAACCTTGAATCTTGAATGTG
AGGGAGGGAGGATTTGATGAAGTGTTTTACCTTTACTGGGTTTTA

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DS 

RD RR4G365JQ 731 0 0
GAGACTAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATA
CACGTCAGCAAGAGCCACTGATGATCTCGACACGAGACTGCTCCGAGCCATGATCACCAA
GGGAATCATCGAGCCGATCTCCGATGTATACGTCAACTTGGTCAACGCTGACTTCACAGC
CAAGCAGAGAGGTCTCAGACTCTCAGGGGAGCGTGTGCTCTTGGACGGGTCGCCAGAGAA
CCCGTTGGAGACCATAACAGTTCAGCTGGGGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGTTCCTT
GTCTGAGTCAGGAGAGGTGAAAGTGGAAGGAAGGGTTAAAGATGGAATCCCGCATTTGAC
TAAGGTTGGGTCTTTTGAAGTGGATGTGACTCTTGAAGGTAGTATCATACTGTGCAGGCA
GGTTGATCAGCCGGGTATGATTGGGGCGGTGGGGAGCATTCTTGGAGAGTCTAACGTGAA
TGTTAACTTCATGAGCGTTGGAAGGATCGCACCGAGGAAGCAAGCGATCATGGCTATCGG
TGTAGATGATCAGCCAAGCAAGGAGACGCTTAAGAAGATTGGAGAGATCCCAGCGGTGGA
GGAGTTTGTTTTCCTCAAGCTCTAAGTTTGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATTT
TTGAACCTTGAATCTTGAATGTGAGGGAGGGAGGATTTGATGAAGTGTTTTACCTTTACT
GGGTTTTA
GGC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4DW09TF 598 0 0
GAACCCGTTGGAGACCATAACAGTTCAGCTGGGGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGTTC
CTTGTCTGAGTCAGGAGAGGTGAAAGTGGAAGGAAGGGTTAAAGATGGAATCCCGCATTT
GACTAAGGTTGGGTCTTTTGAAGTGGATGTGACTCTTGAAGGTAGTATCATACTGTGCAG
GCAGGTTGATCAGCCGGGTATGATTGGGACGGTGGGGAGCATTCTTGGAGAGTCTAACGT
GAATGTTAACTTCATGAGCGTTGGAAGGATCGCACCGAGGAAGCAAGCGATCATGGCTAT
CGGTGTAGATGATCAGCCAAGCAAGGAGACGCTTAAGAAGATTGGAGAGATCCCAGCGGT
GGAGGAGTTTGTTTTCCTCAAGCTCTAAGTTTGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGA
TTTTTGAACCTTGAATCTTGAATGTGAGGGAGGGAGGATTTGATGGAGTGTTTTACCTTT
ACTGGGTTTTAGGCAATAAAGTTTCTTTTGGCATTACTCGAGTGCTTCTTTATTCTCTAG
ATCATGTTCTCCTCTTGCAAACACTATCTGAAACTTGAAGTTAGCCCTTGTTGTAATA

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 7

CO CL1140Contig1 802 7 16 U
GGATAACAACATAGCTCC*TTGATATCAATCCAAAAGAACAACAAATGAGTTCCTCAAAG
AAGATCACTCTCGTTATCCTTCTTGTTTCATTTTATATGTTTTCATGTGTTTCAAGCACT
GAGTTTGAAGTTGGAGGAGTAGATGGTTGGATTGTACCAGAATCTAAGACTCAGGGAGAT
ATGTTTAACCATTGGGCTTCACACAACCGGTTTAAAGTTGGCGACACTGTTCGTTTCAAC
TACACAAAAGACTCGGTGTTAGTGGTGTCTGAAGAAGAGTACAAGAAATGCAAGGCGACT
AAACCACAACTCTATTCGAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGGTTTG
TTTTACTTCATTAGTGGTATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCATTAAA
GTCATGGAGACCGAGTCTTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTTCTTCTTCCTCG
TCTTCATCTCCATCTCTACCGGCTTCAACTCACAAGAAGAGCAGTGCGTTGAAAACCGCA
GTCCAGTTCAGCAGTTCTGTCTTTGTTGTCTTTGCGGTTCTTGTTGTTTCGGTTTTCGGT
TTGGCTTAGTCACGGTTGAGCATTTT*GTTCTCCTTAAAGATTTCATTCATCATTAGGGC
TGCATCGTTCTTACTTCTTGAGTAGTGACTTTCCAAATAAGTACACTGACCGG*TCAAGG
TTTCAATCAGCATGTTTCACTTTTCTTGTAGCCTTAACTATTTTGTTCTTTACATTTTCT
TATAATTCAACTTCTTAGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C866JQ C 236
AF RR4DC30TF U 317
AF RR4DL14TF U 1
AF RR4BE45JQ C 4
AF RR4BE45TF U 4
AF RR4C866TF U 236
AF RR4DC30JQ C 317
BS 1 18 RR4DL14TF
BS 19 19 RR4BE45TF
BS 20 152 RR4DL14TF
BS 153 153 RR4BE45TF
BS 154 200 RR4DL14TF
BS 201 201 RR4BE45TF
BS 202 458 RR4DL14TF
BS 459 459 RR4BE45TF
BS 460 643 RR4DL14TF
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BS 645 653 RR4DL14TF
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BS 760 768 RR4C866TF
BS 769 802 RR4DC30JQ

RD RR4C866JQ 240 0 0
G
CAACTACACAAAAGACTCGGTGTTAGTGGTGTCTGAAGAAGAGTACAAGAAATGCAGGGC
GACTAAACCACAACTCTATTCGAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGG
TTTGTTTTACTTCATTAGTGGTATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCAT
TAAAGTCATGGAGACCGAGTTTTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTT
TTTTTT

QA 2 234 2 234
DS 

RD RR4DC30TF 199 0 0
G
GAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGAACGTCCTGGTTTGTTTTACTTCATTAGTGG
TATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCATTAAAGTCATGGAGACCGAGTC
TTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTTCTTCTTCCTCGTCTTCATCTCCATCTCT
ACCGGCTTCAACTCACAA

QA 2 199 2 199
DS 

RD RR4DL14TF 653 0 0
GGATAACAACATAGCTCCCTTGATATCAATCCAAAAGAACAACAAATGAGTTCCTCAAAG
AAGATCACTCTCGTTATCCTTCTTGTTTCATTTTATATGTTTTCATGTGTTTCAAGCACT
GAGTTTGAAGTTGGAGGAGTAGATGGTTGGATGGTACCAGAATCTAAGACTCAGGGAGAT
ATGTTTAACCATTGGGCTTCGCACAACCGGTTTAAAGTTGGCGACACTGTTCGTTTCAAC
TACACAAAAGACTCGGTGTTAGTGGTGTCTGAAGAAGAGTACAAGAAATGCAAGGCGACT
AAACCACAACTCTATTCGAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGGTTTG
TTTTACTTCATTAGTGGTATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCATTAAA
GTCATGGAGACCGAGTCTTCGCCAGATTCTCCTCCTCCCTCATCACCTTCTTCTTCCTCG
TCTTCATCTCCATCTCTACCGGCTTCAACTCACAAGAAGAGCAGTGCGTTGAAAACCGCA
GTCCAGTTCAGCAGTTCTGTCTTTGTTGTCTTTGCGGTTCTTGTTGTTTCGGTTTTCGGT
TTGGCTTAGTCACGGTTGAGCATTTT*GTTCTCCTTAAAGATT*CATTCATCA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4BE45JQ 756 0 0
GG
ACAACATAGCTCC*TTGATATCAATCCAAAAGAACAACAAATGAGTTCCTCAAAGAAGAT
CACTCTCGTTATCCTTCTTGTTTCATTTTATATGTTTTCATGTGTTTCAAGCACTGAGTT
TGAAGTTGGAGGAGTAGATGGTTGGATTGTACCAGAATCTAAGACTCAGGGAGATATGTT
TAACCATTGGGCTTCACACAACCGGTTTAAAGTTGGCGACACTGTTCGTTTCAACTACAC
AAAAGACTCGGTGTTAGTGGTGTCTGAAGAAGAGTACAAGAAATGCAAGGCGACTAAACC
ACAACTCTATTCGAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGGTTTGTTTTA
CTTCATTAGTAGTATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCATTAAAGTCAT
GGAGACCGAGTCTTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTTCTTCTTCCTCGTCTTC
ATCTCCATCTCTACCGGCTTCAACTCACAAGAAGAGCAGTGCGTTGAAAACCGCAGTCCA
GTTCAGCAGTTCTGTCTTTGTTGTCTTTGCGGTTCTTGTTGTTTCGGTTTTCGGTTTGGC
TTAGTCACGGTTGAGCATTTT*GTTCTCCTTAAAGATTTCATTCATCATTAGGGCTGCAT
CGTTCTTACTTCTTGAGTAGTGACTTTCCAAATAAGTACACTGACCGG*TCAAGGTTTCA
ATCAGCATGTTTCACTTTTCTTGTAGCCTTAACT

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR4BE45TF 756 0 0
GG
ACAACATAGCTCC*TTGATATCAATCCAAAAGAACAACAAATGAGTTCCTCAAAGAAGAT
CACTCTCGTTATCCTTCTTGTTTCATTTTATATGTTTTCATGTGTTTCAAGCACTGAGTT
TGAAGTTGGAGGAGTAGATGGTTGGATTGTACCAGAATCTAAGACTCAGGGAGATATGTT
TAACCATTGGGCTTCACACAACCGGTTTAAAGTTGGCGACACTGTTCGTTTCAACTACAC
AAAAGACTCGGTGTTAGTGGTGTCTGAAGAAGAGTACAAGAAATGCAAGGCGACTAAACC
ACAACTCTATTCGAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGGTTTGTTTTA
CTTCATTAGTAGTATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCATTAAAGTCAT
GGAGACCGAGTCTTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTTCTTCTTCCTCGTCTTC
ATCTCCATCTCTACCGGCTTCAACTCACAAGAAGAGCAGTGCGTTGAAAACCGCAGTCCA
GTTCAGCAGTTCTGTCTTTGTTGTCTTTGCGGTTCTTGTTGTTTCGGTTTTCGGTTTGGC
TTAGTCACGGTTGAGCATTTTTGTTCTCCTTAAAGATTTCATTCATCATTAGGGCTGCAT
CGTTCTTACTTCTTGAGTAGTGACTTTCCAAATAAGTACACTGACCGGGTCAAGGTTTCA
ATCAGCATGTTTCACTTTTCTTGTAGCCTTAACT

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR4C866TF 534 0 0
G
CAACTACACAAAAGACTCGGTGTTAGTGGTGTCTGAAGAAGAGTACAAGAAATGCAAGGC
GACTAAACCACAACTCTATTCGAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGG
TTTGTTTTACTTCATTAGTGGTATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCAT
TAAAGTCATGGAGACCGAGTCTTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTTCTTCTTC
CTCGTCTTCATCTCCATCTCTACCGGCTTCAACTCACAAGAAGAGCAGTGCGTTGAAAAC
CGCAGTCCAGTTCAGCAGTTCTGTCTTTGTTGTCTTTGCGGTTCTTGTTGTTTCGGTTTT
CGGTTTGGCTTAGTCACGGTTGAGCATTTT*GTTCTCCTTAAAGATTTCATTCATCATTA
GGGCTGCATCGTTCTTACTTCTTGAGTAGTGACTTTCCAAATAAGTACACTGACCGG*TC
AAGGTTTCAATCAGCATGTTTCACTTTTCTTGTAGCCTTAACTATTTTGTTC
C

QA 2 533 2 533
DS 

RD RR4DC30JQ 486 0 0
G
GAACAACGAAGACACGGTTTTCAAACTAGACCGTCCTGGTTTGTTTTACTTCATTAGTGG
TATCTCTGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAAGATGATCATTAAAGTCATGGAGACCGAGTC
TTCGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCATCACCTTCTTCTTCCTCGTCTTCATCTCCATCTCT
ACCGGCTTCAACTCACAAGAAGAGCAGTGCGTTGAAAACCGCAGTCCAGTTCAGCAGTTC
TGTCTTTGTTGTCTTTGCGGTTCTTGTTGTTTCGGTTTTCGGTTTGGCTTAGTCACGGTT
GAGCATTTT*GTTCTCCTTAAAGATTTCATTCATCATTAGGGCTGCATCGTTCTTACTTC
TTGAGTAGTGACTTTCCAAATAAGTACACTGACCGG*TCAAGGTTTCAATCAGCATGTTT
CACTTTTCTAGTAGCCTTAACTATTTTGTTCTTTACATTTTCTTATAATTCAACTTCTTA
GTTAG

QA 2 486 2 486
DS 



AS 2 7

CO CL1141Contig1 491 2 2 U
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TGTAAAACCAAACCAAAGCTTCTCACTTGACATGGTTGATGAACCAAACAAGCATGTCCT
TGTGAGCTTCCTCAGCAGCTTCAACTTCTGATGGATCATTTGGGTCGTACCTAACAGTCC
AACCATGTTTAACTCTTGGGAATATCTTCACAAAACCATTCACCTCAGGTTTTGTAACTA
AAACGTCTTGGAACTGCTTGACGAGTTCTGGAGGAGTCACTTGATCGTATTCAGCTCCTA
AAACAAAAATTGGAACCTTGACACCCTTAATGTCATCCACCGTGACACGAAAAGGATGTA
ACAAAACAACAGCTTTAACAAGCTCTTGCTTCCCCAGTTCCACTGCAACTTTTGCACCCC
AACAAAACCCTACTGCTCCAACTGTAGCTATGCCTGTGTTCTTCAAGGCATCAACTACTG
GCTTCGACTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE53JQ U 1
AF RR4EF13JQ U 1
BS 1 131 RR4EE53JQ
BS 132 491 RR4EF13JQ

RD RR4EE53JQ 131 0 0
CATTTATTTAAAACATTTTTCTTAAGGCTTCTCAAGTCTCTCATTACTTTATTCTGGCTG
TGTAAAACCAAACCAAAGCTTCTCACTTGACATGGTTGATGAACCAAACAAGCATGTCCT
TGTGAGCTTCC

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR4EF13JQ 491 0 0
CATTTATTTAAAACATTTTTCTTAAGGCTTCTCAAGTCTCTCATTACTTTATTCTGGCTG
TGTAAAACCAAACCAAAGCTTCTCACTTGACATGGTTGATGAGCCAAACAAGCATGTCCT
TGTGAGCTTCCTCAGCAGCTTCAACTTCTGATGGATCATTTGGGTCGTACCTAACAGTCC
AACCATGTTTAACTCTTGGGAATATCTTCACAAAACCATTCACCTCAGGTTTTGTAACTA
AAACGTCTTGGAACTGCTTGACGAGTTCTGGAGGAGTCACTTGATCGTATTCAGCTCCTA
AAACAAAAATTGGAACCTTGACACCCTTAATGTCATCCACCGTGACACGAAAAGGATGTA
ACAAAACAACAGCTTTAACAAGCTCTTGCTTCCCCAGTTCCACTGCAACTTTTGCACCCC
AACAAAACCCTACTGCTCCAACTGTAGCTATGCCTGTGTTCTTCAAGGCATCAACTACTG
GCTTCGACTCC

QA 1 491 1 491
DS 



CO CL1141Contig2 931 5 12 U
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GTGTACGGAGAACCCTCCTAAGCTGGATCCAAACAGCGGGTCGGGTCATGTCGAGAAAGT
AGGCGGCCTCGACAGTTACGTCACTGGCTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTCTTGT
CTCTCATGTTTTCGGATATGAAACTCC*ACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTGCAG
AAGCTGGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTACAATCCTGCGA
ATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTGAGG
AGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAGGCATGGCTACAGTTGGAGCAGTAG
GGTTTTGTTGGGGAGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGGCGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCGG
TTGTTTTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATGACATCAAGGGTGTCAAGGTTCCAA
TTTCTGTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTCCTCCAGAACTCGTCAAGCAGTTCC
AAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTTTTGTGAAGATATTCCCAAGAGTTA
AACATGGTTGGACTGTTAGGTACGACCCGAATGATCCATCAGAAGTTGAAGCTGCTGAGG
AAGCTCACAAGGACATGCTTGTTTGGCTCATCGACCATGTGAAGTGAGAAGCTTCGGTTT
ACACAGAATAATAAAGTAATGAGGGACTTGAGAAGCTGTAAGAAAAATGTTTTAAATAAA
TGATGTAATATATTCAAGCTTCCTTGAGTGTATTCTTATAAACAAGTGTACTTGCAAAGA
AATAATTGAATCATCAAATGTTTGCAACAGG


BQ
15 15 15 15 15 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE53TF U 6
AF RR4GR09TF U 1
AF RR4EF13TF U 6
AF RR4H510TF U 1
AF RR4GR09JQ C 157
BS 1 26 RR4GR09TF
BS 27 27 RR4EE53TF
BS 28 40 RR4GR09TF
BS 41 44 RR4EE53TF
BS 45 679 RR4GR09TF
BS 680 680 RR4EF13TF
BS 681 719 RR4GR09TF
BS 720 720 RR4GR09JQ
BS 721 731 RR4H510TF
BS 732 732 RR4GR09JQ
BS 733 760 RR4H510TF
BS 761 931 RR4GR09JQ

RD RR4EE53TF 575 0 0
GGGAACCTTTGTTTCTGTGTCCGGAAGAAAGAAAGAAAGAAATGTCGGGTCATCAGTGTA
CGGAGAACCCTCCTAAGCTGGATCCAAACAGCGGGTCGGGTCATGTCGAGAAAGTAGGCG
GCCTCGACAGTTACGTCACTGGCTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTCTTGTCTCTC
ATGTTTTCGGATATGAAACTCC*ACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTGCAGAAGCT
GGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTATAATCCTGCGAATGAG
GATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTGAGGAGTCG
AAGCCAGTAGTTGATGCCTTGAAGAACACAGGCATAGCTACAGTTGGAGCAGTAGGGTTT
TGTTGGGGTGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGGCGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCTGTTGTT
TTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATGACATTAAGGGTGTCAAGGTTCCAATTTCT
GTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTCCTCC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4GR09TF 726 0 0
GGGAAGCGAACCTTTGTTTCTGGGTCGGGAAGAAAGAAAG****AAATGTCGGGTCATCA
GTGTACGGAGAACCCTCCTAAGCTGGATCCAAACAGCGGGTCGGGTCATGTCGAGAAAGT
AGGCGGCCTCGACAGTTACGTCACTGGCTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTCTTGT
CTCTCATGTTTTCGGATATGAAACTCC*ACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTGCAG
AAGCTGGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTACAATCCTGCGA
ATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTGAGG
AGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAGGCATGGCTACAGTTGGAGCAGTAG
GGTTTTGTTGGGGAGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGGCGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCGG
TTGTTTTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATGACATCAAGGGTGTCAAGGTTCCAA
TTTCTGTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTCCTCCAGAACTCGTCAAGCAGTTCC
AAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTTTTGTGAAGATATTCCCAAGAGTTA
AACATGGTTGGACTGTTAG*TACGACCCGAATGATCCATCAGAAGTTGAAGCTGCTGAG
AAGCTCA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4EF13TF 695 0 0
GGGAACCTTTGTTTCTGTGTCCGGAAGAAAGAAAGAAAGAAATGTCGGGTCATCAGTGTA
CGGAGAACCCTCCTAAGCTGGATCCAAACAGCGGGTCGGGTCATGTCGAGAAAGTAGGCG
GCCTCGACAGTTACGTCACTGGCTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTCTTGTCTCTC
ATGTTTTCGGATATGAAACTCC*ACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTGCAGAAGCT
GGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTATAATCCTGCGAATGAG
GATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTGAGGAGTCG
AAGCCAGTAGTTGATGCCTTGAAGAACACAGGCATAGCTACAGTTGGAGCAGTAGGGTTT
TGTTGGGGTGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGGCGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCTGTTGTT
TTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATGACATTAAGGGTGTCAAGGTTCCAATTTCT
GTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTCCTCCAGAACTCGTCAAGCAGTTCCAAGAC
GTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAATGGTTTTGTGAAGATATTCCCAAGAGTTAAACAT
GGTTGGACTGTTAGGTACGACCCAAATGATCCATC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4H510TF 762 0 0
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AGGCGGCCTCGACAGTTACGTCACTGACTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTCTTGT
CTCTCATGTTTTCGGATATGAAACTCC*ACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTGCAG
AAGCTGGATTCTATGCGGCGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTACAATCCTGCGA
ATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTGAGG
AGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAGGCATGGCTACAGTTGGAGCAGTAG
GGTTTTGTTGGGGAGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGGCGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCGG
TTGTTTTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATGACATCAAGGGTGTCAAGGTTCCAA
TTTCTGTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTCCTCCAGAACTCGTCAAGCAGTTCC
AAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTTTTGTGAAGATATTCCCAAGAGTTA
AACATGGTTGGACTGTTAG*TACGACCCGAATGATCCATCAGAAGTTGAAGCTGCTGAG*
AAGCTCACAAG*ACATGCTTGTTTGGCTCATCGACCATGT
GA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GR09JQ 775 0 0
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GGAAACTTGCTGACAAAGTTGCAGAAGCTGGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCC
ATGGAGATCCCTACAATCCTGCGAATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATC
ACACACAAGATAAGGCTTTTGAGGAGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAG
GCATGGCTACAGTTGGAGCAGTAGGGTTTTGTTGGGGAGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGG
CGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCGGTTGTTTTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATG
ACATCAAGGGTGTCAAGGTTCCAATTTCTGTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTC
CTCCAGAACTCGTCAAGCAGTTCCAAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTT
TTGTGAAGATATTCCCAAGAGTTAAACATGGTTGGACTGTTAGGTACGACCCGAATGATC
CATCAGAAGTTGAAGCTGCTGAGGAAGCTCACAAGGACATGCTTGTTTGGCTCATCGACC
ATGTGAAGTGAGAAGCTTCGGTTTACACAGAATAATAAAGTAATGAGGGACTTGAGAAGC
TGTAAGAAAAATGTTTTAAATAAATGATGTAATATATTCAAGCTTCCTTGAGTGTATTCT
TATAAACAAGTGTACTTGCAAAGAAATAATTGAATCATCAAATGTTTGCAACAGG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 7

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ACAAACAAAATCTTATTAATCTATTATTATTAAACACTTTATTCATCCACAATTACACAA
AATTACATAAGCTTTAATTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCGTTCACTTCACAC
AATACAAACCAAAACGGTTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTTT
GTAGCCACCATATAACAGTTTTGCAGTAGAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCCT
TCTCTTATTTTGTTTGACGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAGT
CCCACTTGAATGCTCCACTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCG
AGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAAT
CTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAA
AGACCGTATCGGACAACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGT
TATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCAT
AGGTCTCTAATGCGTTCTCACCAGCAACTTCGATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAATA
CCATTTGAACAAGTTCTTGTGGAGCACTCATTGCTTCGGCAGTATTGTCGGTATCTTTCA
TCTCAAGGCAAGTGAAGTTGAGAGTGCCGTAGTGTTTTGAGAGCATCCTAGCGATCGGGC
GATAACCATCTCTCTCGTAGAGGTTATAATATCCGGCAGTAAGCTCCGCAGCGTGGCTGT
GGTGGTTGTACAACCAGTGAATTCCAGAAACCTTGGCAGCCAAGTTAACTTTAAGTCCAG
CGAAGATCTTGTTGGCTTCTCCTATGATCTGATCTCCATGAAAGATAAGTTTGGTCGAGT
ACCATGTCAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H274JQ U 18
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AF RR4EQ81JQ U 18
AF RR4HA55JQB U 18
AF RR4G183TF C 305
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AF RR4H274TF C 266
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TTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCGTTCACTTCACACAATACAAACCAAAACGG
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GTTTTGCAGTAGAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCCTTCTCTTATTTTGTTTGA
CGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAGTCCCACTTGAATGCTCCA
CTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTCAAC
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TTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCGGACAAC
CGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCA

QA 1 508 1 508
DS 

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AATTACATAAGCTTTAATTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCGTTCACTTCACAC
AATACAAACCAAAACGGTTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTTT
GTAGCCACCATATAACAGTTTTGCAGTAGAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCCT
TCTCTTATTTTGTTGGACGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAGT
CCCACTTGAATGCTCCACTTGGCTGAGCCGGGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCG
AGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCACATCTCCACAGTAAT
CTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAA
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TATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCAT
AGGTCTCTAATGCGTTCTCAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4EQ81JQ 675 0 0
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TTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCGTTCACTTCACACAATACAAACCAAAACGG
TTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTTTGTAGCCACCATATAACA
GTTTTGCAGTAGAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCCTTCTCTTATTTTGTTTGA
CGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAGTCCCACTTGAATGCTCCA
CTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTCAAC
GGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGCATT
TTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCGGACAAC
CGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACCCCGTTA
GGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCATAGGTCTCTAATGCGTTC
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TGTGGAGCACTCATT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4HA55JQB 779 0 0
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TTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCGTTCACTTCACACAATACAAACCAAAACGG
TTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTTTGTAGCCACCATATAACA
GTTTTGCAGTAGAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCCTTCTCTTATTTTGTTTGA
CGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAGTCCCACTTGAATGCTCCA
CTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTCAAC
GGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGCATT
TTCCTCACAAACCTCTTGAAAAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGCATCGGACAAC
CGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACCCCGTTA
GGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCATAGGTCTCTAATGCGTTC
TCACCAGCAACTTCGATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAATACCATTTGAACAAGTTCT
TGTGGAGCACTCATTGCTTCGGCAGTATTGTCGGTATCTTTCATCTCAAGGCAAGTGAAG
TTGAGAGTGCCGTAGTGTTTTGAGAGCATCCTAGCGATCGGGCGATA*CCATCTCTCTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4G183TF 626 0 0
CTTGAATGCTCCACTTGGCTGAGCCGGGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTT
CGGTGTCTTCAACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCACATCTCCACAGTAATCTTG
GTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAAAGAC
CGTATCGGACAACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATG
GTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCATAGGT
CTCTAATGCGTTCTCACCAGCAACTTCGATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAATACCAT
TTGAACAAGTTCTTGTGGAGCACTCATTGCTTCGGCAGTATTGTCGGTATCTTTCATCTC
AAGGCAAGTGAAGTTGAGAGTGCCGTAGTGTTTTGAGAGCATCCTAGCGATCGGGCGATA
ACCATCTCTCTCGTAGAGGTTATAATATCCGGCAGTAAGCTCCGCAGCGTGGCTGTGGTG
GTTGTACAACCAGTGAATTCCAGAAACCTTGGCAGCCAAGTTAACTTTAAGTCCAGCGAA
GATCTTGTTGGCTTCTCCT
ATGATCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4EQ81TF 641 0 0
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CTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTC
CGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTG
AAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCGGACAACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCT
CAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATT
GTAACCTTTGGTTCCATAGGTCTCTAATGCGTTCTCACCAGCAACTTCGATGCCTTCTTT
CCATGATTTGCTCAATACCATTTGAACAAGTTCTTGTGGAGCACTCATTGCTTCGGCAGT
ATTGTCGGTATCTTTCATCTCAAGGCAAGTGAAGTTGAGAGTGCCGTAGTGTTTTGAGAG
CATCCGAGCGATCGGGCGATAACCATCTCTCTCGTAGAGGTTATAATATCCGGCAGTAAG
CTCCGCAGCGTGGCTGTGGTGGTTGTACAACCAGTGAATTCCAGAAACCTTGGCAGCCAA
GTTAACTTTAAGTCCAGCGAAGATCTTGTTGGCTTCTCCT
C

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4H274TF 711 0 0
TGGTCAACCATCAAC*TTCATGTCGGTTTCAGAGTCCCACTTGAATGCTCCACTTGGCTG
AGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAAT
CTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCAC
AAACCTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCGGACAACCGAAGGTA
AGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGC
ATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCATAGGTCTCTAATGCGTTCTCACCAGC
AACTTCGATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAATACCATTTGAACAAGTTCTTGTGGAGC
ACTCATTGCTTCGGCAGTATTGTCGGTATCTTTCATCTCAAGGCAAG**AAGTTGAGAGT
GCCGTAGTGTTTTGAGAGCATCCGAGCGATCGGGCGATAACCATCTCTCTCGTAGAGGTT
ATAATATCCGGCAGTAAGCTCCGCAGCGTGGCTGTGGTGGTTGTACAACCAGTGAATTCC
AGAAACCTTGGCAGCCAAGTTAACTTTAAGTCCAGCGAAGATCTTGTTGGCTTCTCCTAT
GATCTGATCTCCATGAAAGATAAGTTTGGTCGAGTACCATGTCAAGAAAAA

QA 1 711 1 711
DS 



AS 2 6

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TGATGATGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCGCTGGTTCTTGGAGATGG
TCCATCACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGGGCTATCGGGGTCACGCAGAAGATAACT
GGAAATTAAGTGAAGAAGCATCTTTTTCGAAAGGTGGAGACTGAAGAAACTGGTGGAGAG
TGAAGAAGTCTTGCTATGGTTCTACCCTTGTTATGTCTGAGACATCTATTATGGAGTTTT
TTTTCTTTTGGGTTGTTGTTTTTCTTATTTGGTGCTATAATTAATACTCTACGAGAGGAA
ACGCTTAGTGATTTGGGTTTTTGGTATTTTCTCGATTGCATTGCATGGATGTTTTGTGAC
TTAATCTATCTACGCCTTTGTTTTGATTGG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B938JQ C 1
AF RR4B938TF U 1
BS 1 1 RR4B938JQ
BS 2 448 RR4B938TF
BS 449 450 RR4B938JQ

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TGATGATGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCGCTGGTTCTTGGAGATGG
TCCATCACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGGGCTATCGGGGTCACGCAGAAGATAACT
GGAAATTAAGTGAAGAAGCATCTTTTTCGAAAGGTGGAGACTGAAGAAACTGGTGGAGAG
TGAAGAAGTCTTGCTATGGTTCTACCCTTGTTATGTCTGAGACATCTATTATGGAGTTTT
TTTTCTTTTGGGTTGTTGTTTTTCTTATTTGGTGCTATAATTAATACTCTACGAGAGGAA
ACGCTTAGTGATTTGGGTTTTTGGTATTTTCTCGATTGCATTGCATGGATGTTTTGTGAC
TTAATCTATCTACGCCTTTGTTTTGATTGG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4B938TF 450 0 0
G
GGGATACTTCGTTACCAGCTCGACATGACTGCTTTTGATGAGGATTTGGATGTGTATGAT
GATGATGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCGCTGGTTCTTGGAGATGGT
CCATCACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGGGCTATCGGGGTCACGCAGAAGATAACTG
GAAATTAAGTGAAGAAGCATCTTTTTCGAAAGGTGGAGACTGAAGAAACTGGTGGAGAGT
GAAGAAGTCTTGCTATGGTTCTACCCTTGTTATGTCTGAGACATCTATTATGGAGTTTTT
TTTCTTTTGGGTTGTTGTTTTTCTTATTTGGTGCTATAATTAATACTCTACGAGAGGAAA
CGCTTAGTGATTTGGGTTTTTGGTATTTTCTCGATTGCATTGCATGGATGTTTTGTGACT
TAATCTATCTACGCCTTTGTTTTGATT
GG

QA 2 448 2 448
DS 



CO CL1143Contig2 1273 4 4 U
GACCGAAGCTCTGAATGAGTTACTGGAGTCTGACGACAAGTTTGGTTTCATTGTGATGGA
CGGGAACGGGACTCTCTTTGGAACCCTGAGCGGTAACACACGTGAGGTGCTTCACAAGTT
CTCTGCTGATCTTCCGAAGAAGCACGGGAGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGGTTTGCACG
TCTGCGTATGGAGAAGCGTCACAATTACGTGAGGAAAACTGCTGAGCTCGCCACGCAGTA
CTACATCAACCCTGCGACGAGTCAGCCTAATGTGTCTGGTCTGATACTCGCCGGTTCTGC
TGATTTCAAGACTGAGCTGAGCCAGTCTGACATGTTTGATCCCCGGCTTGCTGCAAAGAT
ACTTAACGTGGTGGACGTATCATACGGAGGAGAAAACGGTTTCAACCAGGCTATTGAGCT
TTCGTCTGAGATCCTCGCGAACGTGAAGTTCATCCAGGAGAAGCGTTTGATAGGGAAGTA
CTTTGAGGAGATTAGTCAGGACACGGGGAAGTATGTGTTTGGCGTGGAGGACACTCTGAA
CGCTTTGGACTCAGGTGCTGTCGAGACGCTGATCGTATGGGAGAACCTTGACATCAACAG
ATACGTGTTGAAGAACAGTGCCACTGGTGAAACTGTGATAAAGCACCTGAACAAGGAACA
GGAAGCCAACACTGAGAACTTCAAAGCAGGCAATAGCGACTTGGACGTGGAGGATAAGAT
GTCGCTGCTGGAGTGGCTGGCTAACGAGTACAAGCGTTTCGGGTGTGCGCTGGAGTTTGT
GACCAACAAGTCGCAGGAAGGGTCTCAGTTTTGCAGAGGGTTTGGAGGAATAGGAGGGAT
ACTTCGTTACCAGCTCGACATGACTGCTTTTGATGAGGATTTGGATGTGTATGATGATGA
TGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCGCTGGTTCTTGGAGATGGTCCATC
ACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGCTATCGGGGTCACGCAGAAGATAACTGGAAATTA
AGTGAAGCATCTTTTTCGAAAGGTGGGGACTGAAGAAACTGGTGGAGAGTGAAGAAGTCT
TGCTATGGTTTTACCTTTGTTATGTCTGAGACATCCATTATGGAGTTTTTTTTCTTTTGG
GTTGTTGTTTTTCTTATTCGGTGCTATAATACTCTACGAGAGGAAACGCTTAGTGATTTG
GGTTTTTGGTATTTTCTCGATTGCATTGCATGGATGTTTTGTGACTTAATCTATCTACGC
CTTTGTTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GQ62TF U 1
AF RR4EV60TF U 352
AF RR4GQ62JQ C 471
AF RR4EV60JQ C 578
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BS 638 1001 RR4EV60TF
BS 1002 1271 RR4GQ62JQ
BS 1272 1273 RR4EV60JQ

RD RR4GQ62TF 637 0 0
GACCGAAGCTCTGAATGAGTTACTGGAGTCTGACGACAAGTTTGGTTTCATTGTGATGGA
CGGGAACGGGACTCTCTTTGGAACCCTGAGCGGTAACACACGTGAGGTGCTTCACAAGTT
CTCTGCTGATCTTCCGAAGAAGCACGGGAGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGGTTTGCACG
TCTGCGTATGGAGAAGCGTCACAATTACGTGAGGAAAACTGCTGAGCTCGCCACGCAGTA
CTACATCAACCCTGCGACGAGTCAGCCTAATGTGTCTGGTCTGATACTCGCCGGTTCTGC
TGATTTCAAGACTGAGCTGAGCCAGTCTGACATGTTTGATCCCCGGCTTGCTGCAAAGAT
ACTTAACGTGGTGGACGTATCATACGGAGGAGAAAACGGTTTCAACCAGGCTATTGAGCT
TTCGTCTGAGATCCTCGCGAACGTGAAGTTCATCCAGGAGAAGCGTTTGATAGGGAAGTA
CTTTGAGGAGATTAGTCAGGACACGGGGAAGTATGTGTTTGGCGTGGAGGACACTCTGAA
CGCTTTGGACTCAGGTGCTGTCGAGACGCTGATCGTATGGGAGAACCTTGACATCAACAG
ATACGTGTTGAAGAACAGTGCCACTGGTGAAACTGTG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4EV60TF 650 0 0
G
GCAAAGATACTTAACGTGGTGGACGTATCATACGGAGGA**AAACGGTTTCAACCAGGCT
ATTGAGCTTTCGTCTGAGATCCTCGCGAACGTGAAGTTCATCCAGGAGAAGCGTTTGATA
GGGAAGTACTTTGAGGAGATTAGTCAGGACACGGGGAAGTATGTGTTTGGCGTGGAGGAC
ACTCTGAACGCTTTGGACTCAGGTGCTGTCGAGACGCTGATCGTATGGGAGAACCTTGAC
ATCAACAGATACGTGTTGAAGAACAGTGCCACTGGTGAAACTGTGATAAAGCACCTGAAC
AAGGAACAGGAAGCCAACACTGAGAACTTCAAAGCAGGCAATAGCGACTTGGACGTGGAG
GATAAGATGTCGCTGCTGGAGTGGCTGGCTAACGAGTACAAGCGTTTCGGGTGTGCGCTG
GAGTTTGTGACCAACAAGTCGCAGGAAGGGTCTCAGTTTTGCAGAGGGTTTGGAGGAATA
GGAGGGATACTTCGTTACCAGCTCGACATGACTGCTTTTGATGAGGATTTGGATGTGTAT
GATGATGATGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCGCTGGTTCTTGGAGAT
GGTCCATCACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGCTATCGGGGTCACGC

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4GQ62JQ 802 0 0
TAGGGAAGTACTTTGAGGAGATTAGTCAGGACACGGGGAAGTATGTGTTTGGCGTGGAGG
ACACTCTGAACGCTTTGGACTCAGGTGCTGTCGAGACGCTGATCGTATGGGAGAACCTTG
ACATCAACAGATACGTGTTGAAGAACAGTGCCACTGGTGAAACTGTGATAAAGCACC**A
ACAAGGAACAGGAAGCCAACACTGAGAACTTCAAAGCAGACAATAGCGACTTGGACGTGG
AGGATAAGATGTCGCTGCTGGAGTGGCTGGCTAACGAGTACAAGCGTTTCGGGTGTGCGC
TGGAGTTTGTGACCAACAAGTCGCAGGAAGGGTCTCAGTTTTGCAGAGGGTTTGGAGGAA
TAGGAGGGATACTTCGTTACCAGCTCGACATGACTGCTTTTGATGAGGATTTGGATGTGT
ATGATGATGATGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCGCTGGTTCTTGGAG
ATGGTCCATCACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGCTATCGGGGCCACGCAGAAGATAA
CTGGAAATTAAGTGAAGCATCTTTTTCGAAAGGTGGGGACTGAAGAAACTGGTGGAGAGT
GAAGAAGTCTTGCTATGGTTTTACCTTTGTTATGTCTGAGACATCCATTATGGAGTTTTT
TTTCTTTTGGGTTGTTGTTTTTCTTATTCGGTGCTATAATACTCTACGAGAGGAAACGCT
TAGTGATTTGGGTTTTTGGTATTTTCTCGATTGCATTGCATGGATGTTTTGTGACTTAAT
CTATCTACGCCTTTGTTTTGA
G

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4EV60JQ 696 0 0
TGGGAGAACCTTGACATCAACAGATACGTGTTGAAGAACAGTGCCACTGGTGAAACTGTG
ATAAAGCACCTGAACAAGGAACAGGAAGCCAACACTGAGAACTTCAAAGCAGGCAATAGC
GACTTGGACGTGGAGGATAAGATGTCGCTGCTGGAGTGGCTGGCTAACGAGTACAAGCGT
TTCGGGTGTGCGCTGGAGTTTGTGACCAACAAGTCGCAGGAAGGGTCTCAGTTTTGCAGA
GGGTTTGGAGGAATAGGAGGGATACTTCGTTACCAGCTCGACATGACTGCTTTTGATGAG
GATTTGGATGTGTATGATGATGATGAATCAGAATAGCAATCAATCCAATCACTAGCATCG
CTGGTTCTTGGAGATGGTCCATCACCAAGCTCGAACCAGCCTGTGTGGGCTATCGGGGTC
ACGCAGAAGATAACTGGAAATTAAGTGAAGCATCTTTTTCGAAAGGTGGGGACTGAAGAA
ACTGGTGGAGAGTGAAGAAGTCTTGCTATGGTTTTACCTTTGTTATGTTTGAGACATCCA
TTATGGAGTTTTTTTTCTTTTGGGTTGTT**TTTTCTTATTCGGTGCTATAATACTCTAC
GAGAGGAAACGCTTAGTGATTTGGGTTTTTGGTATTTTCTCGATTGCATTGCATGGATGT
TTTGTGACTTAATCTATCTACGCCTTTGTTTTGATT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 5

CO CL1144Contig1 1083 5 12 U
GGGACTCACCCAATCTGTAATTTTCCCCTTTGTTAATAAAGAAAAGCCAGTTTTGGGCTC
GCTCTCTAACAGTCGCATGGCGGTCTCGTTTAACACAACCCTTCACCAGTCTTCTCTGAG
CCCGTGCTGTAGCATCAAGCTTTACTCTGGGTTGAAGCCTCAATCTTCAAGCTTTTTGAG
AAATGGGTATCAGAATTTGAACAAGGAGTTCTATGGCAGGATTCACAAGAGTTTGCAATC
CGGGACGGGGAAAGCGAGTAGGTCAAGGGTGAAGATGATGCCTATTGGTACACCTAGAGT
TCCCTACCGAAACCGAGAGGAAGGCACTTGGCAATGGGTTGATATTTGGAACGCCCTTTA
TCGAGAGCGTGTGATCTTCATTGGACAAAACATTGACGAAGAGTTTAGCAACCAGATATT
AGCAACTATGCTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCCAGGAGGATTTATATGTACCTTAA
TGGACCTGGCGGTGATCTAACTCCGAGTCTAGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAA
AAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCCTATAA*CCTTGCTGGTTTTCTTCTTG
CTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATCGCCCTCCAGTCAC
CAGCTGGTGCTGCTCGTGGTCAGGCTGATGATATCCAAAATGAAGCGAAAGAGCTTTCAA
GGATAAGAGATTACCTCTTCAACGAACTAGCCAAGAATACAGGACAGCCTGCGGAAACGA
TCTTCAAAGACTTGAGCAGAATGAAGAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATTGAGTACGGAC
TTATCGATAAGATTGTTAGACCACCGCGCATCAAAGCCGACGCTCCTCGCCAAGATGAAA
CCTCTGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTTTTTTCACATTTGGTAATGTTGTCATAGTTTAAC
AAGCTTAAAGTTGATTGTTCCTGGTGTGAGATTGTTACCCGAATTAAAATCACTTTGCTT
GTTATTACTCCCCACTGGGTTCTACAAACATTTTTAAAGCTGAGATGAACATTTTCTAAG
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 

AF RR4DF12TF U 1
AF RR4AG14TF U 3
AF RR4E644TF U 359
AF RR4E644JQ C 360
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BS 811 813 RR4E644JQ
BS 814 830 RR4E644TF
BS 831 1083 RR4E644JQ

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GCTCTCTAACAGTCGCATGGCGGTCTCGTTTAACACAACCCTTCACCAGTCTTCTCTGAG
CCCGTGCTGTAGCATCAAGCTTTACTCTGGGTTGAAGCCTCAATCTTCAAGCTTTTTGAG
AAATGGGTATCAGAATTTGAACAAGGAGTTCTATGGCAGGATTCACAAGAGTTTGCAATC
CGGGACGGGGAAAGCGAGTAGGTCAAGGGTGAAGATGATGCCTATTGGTACACCTAGAGT
TCCCTACCGAAACCGAGAGGAAGGCACTTGGCAATGGGTTGATATTTGGAACGCCCTTTA
TCGAGAGCGTGTGATCTTCATTGGACAAAACATTGACGAAGAGTTTAGCAACCAGATATT
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TGGACCTGGCGGTGATCTAACTCCGAGTCTAGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAA
AAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCCTA

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DS 

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GGAC
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TAACAGTCGCATGGCGGTCTCGTTTAACACAACCCTTCACCAGTCTTCTCTGAGCCCGTG
CTGTAGCATCAAGCTTTACTCTGGGTTGAAGCCTCAATCTTCAAGCTTTTTGAGAAATGG
GTATCAGAATTTGAACAAGGAGTTCTATGGCAGGATTCACAAGAGTTTGCAATCCGGGAC
GGGGAAAGCGAGTAGGTCAAGGGTGAAGATGATGCCTATTGGTACACCTAGAGTTCCCTA
CCGAAACCGAGAGGAAGGCACTTGGCAATGGGTTGATATTTGGAACGCCCTTTATCGAGA
GCGTGTGATCTTCATTGGACAAAACATTGACGAAGAGTTTAGCAACCAGATATTAGCAAC
TATGCTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCCAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACC
TGGCGGTGATCTAACTCCGAGTCTAGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAAAGTCC
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GTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATCGCCCTCCAGTCACCAGCTG
GTGCTGCTCGTGG

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DS 

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TTAGCAACTATGCTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCCAGGAGGATTTATATGTACCTT
AATGGACCTGGCGGTGATCTAACTCCGAGTCTAGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTG
AAAAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCCTATAAACCTTGCTGGTTTTCTTCT
TGCTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATCGCCCTCCAGTC
ACCAGCTGGTGCTGCTCGTGGTCAG*CTGATGATATCCAAAATGAAGCGAAAGAGCTTTC
AAG*ATAAGAGATTACCTCTTCAACGAACTAGCCAAGAATACAG*ACAGCCTGCGGAAAC
GATCTTCAAAGACTTGAGCAGAATGAAGAGGTC**ACGCAGAAGAAGCTATT

QA 1 472 1 472
DS 

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TAGCAACTATGCTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCCAGGAGGATTTATATGTACCTTA
ATGGACCTGGCGGTGATCTAACTCCGAGTCTAGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGA
AAAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCCTATAA*CCTTGCTGGTTTTTTTCTT
GCTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATCGCCCTCCAGTCA
CCAGCTGGTGCTGCTCGTGGTCAGGCTGATGATATCCAAAATGAAGCGAAAGAGCTTTCA
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ATCTTCAAAGACTTGAGCAGAATGAAGAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATTGAGTACGGA
CTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCGCGCATCAAAGCCGACGCTCCTCGCCAAGATGAA
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CAAGCTTAAAGTTGATTGTTCCTGGTGTGAGATTGTTACCCGAATTAAAATCACTTTGCT
TGTTATTACTCCCCACTGGGTTCTACAAACATTTTTAAAGCTGAGATGAACATTTTCTAA
GCCC

QA 1 724 1 724
DS 

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CTCCAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCTGGCGGTGATCTAACTCCGAGTCTAGC
TATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAAAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGC
CTATAA*CCTTGCTGGTTTTCTTCTTGCTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGC
CATTGTCAAGAATCGCCCTCCAGTCACCAGCTGGTGCTGCTCGTGGTCAGGCTGATGATA
TCCAAAATGAAGCGAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTTTTCAACGAACTAGCCA
AGAATACAGGACAGCCTGCGGAAACGATCTTCAAAGACTTGAGCAGAATGAAGAGGTTCA
ACGCAGAAGAAGCTATTGAGTACGGACTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCGCGCATCA
AAGCCGACGCTCCTCGCCAAGA**AAACCTCTGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTTTTTTCA
CATTTGGTAATGTTGTCATAGTTTAACAAGCTTAAAGTTGATTGTTCCTGGTGTGAGATT
GTTACCCGAATTAAAATCACTTTGCTTGTTATTACTCCCCACTGGGTTCTACAAACATTT
TTAAAGCTGAGATGAACATTTTTTAAGCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL1145Contig1 787 3 8 U
AGGGAAGTCTTTATAAATCAGCCGCCATCTCTTACCCCCAGGTTCTACTACTCCGACCAG
CAAGCTTAGGGTTCGAATCTGTGAAGCTTTGCTGATAAGAAGAACACTCAAATGGGTCGT
TTCAAGAGCAATAAGAAAGGTAGGGTCAACGTGAAGCCTATCGTGACGAAGAACCAAGCG
GATGTTGATCATGTCACTGGTGATAAGATCCCTAAAAGTTTTGTCTTTTCAAGAACGAAA
CTTCCTGGCTCCGTCAAACAACTTCAGATGGATTTGAGAAAGCTCATGCTTCCCTACACT
GCTCTCAGTCTCAAGGAGAAAAAGAGGAACACTTTAAGGGACTTTTTGAACGTGTCAGGG
CCAATGGGTGTTACTCATTTCCTCATGCTAAAGAAGACAGCCTCTGCGTTGTCTCTAAGA
GTAGCAAGAACCCCGCAGGGCCCCACTCTCACTTTCAAAATCCATCAGTATTCGTTAGCA
TCTGATATTGCTCAGTCTCAGACACGCCCTAGGTGTCCTCCAGATCTTTTCAAGAGTCCC
CCTTTGATTGTTCTTTCTGGGTTCGGTACTCAGGAGCTGCATCTGAAGCTAGCAACCATC
ATGTTTCAGAACATATTCCCAGCTATTGATATCAACACTGTCAAGCTCTCGACATGCCAG
AGATTAGTACTCTTGAACTACAACAAGGACACGAAACTCATTGATTCCCGCATTATTCGA
TAAGCTGCAGCCTGTAGAGTGTCTCGTAAGCTCAGAAATTTTGTGGAGACTCACAACGCA
CCTGATC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H491TF U 1
AF RR4EX24TF U 3
AF RR4CX86TF U 343
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CTTCCTGGCTCCGTCAAACAACTTCAGATGGATTTGAGAAAGCTCATGCTTCCCTACACT
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CCAATGGGTGTTACTCATTTCCTCATGCTAAAGAAGACAGCCTCTGCGTTGTCTCTAAGA
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DS 

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AGCTTATGGTTCGAATCTGTGAAGCTTTGCTGATAAGAAGAACACTCAAATGGGTCGTTT
CAAGAGCAATAAGAAAGGTAGGGTCAACGTGAAGCCTATCGTGACGAAGAACCAAGCGGA
TGTTGATCATGTCACTGGTGATAAGATCCCTAAAAGTTTTGTCTTTTCAAGAACGAAACT
TCCTGGCTCCGTCAAACAACTTCAGATGGATTTGAGAAAGCTCATGCTTCCCTACACTGC
TCTCAGTCTCAAGGAGAAAAAGAGGAACACTTTAAGGGACTTTTTGAACGTGTCAGGGCC
AATGGGTGTTACTCATTTCCTCATGCTAAAGAAGACAGCCTCTGCGTTGTCTCTAAGAGT
AGCAAGAACCCCGCAGGGCCCCACTCTCACTTTCAAAATCCATCAGTATTCGTTAGCATC
TGATATTGCTCAGTCTCAGACACGCCCTAGGTGTCCTCCAGATCTTTTCAAGAGTCCCCC
TTTGATTGTTCTTTCTGGGTTCGGTACTCAGGAGCTGCATCTGAAGCTAGCAACCATCAT
GTTTCAGAACATATTCCCAGCTATTGATATCAACACTGTCAAGCTCTCGACATGCCAGAG
ATTAGTACTCTTGAACTACA
CA

QA 1 680 1 680
DS 

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TCTGCGTTGTCTCTAAGAGTAGCAAGAACCCCGCAGGGCCCCACTCTCACTTTCAAAATC
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AAGCTATCGACATGCCAGAGATTAGTACTCTTGAACTACAACAAGGACACGAAACTCATT
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GTGGAGACTCACAACGCACCTGATC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 7

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ATGTCTTCATTTATATCATCTGTTTTACTGGAAAACACACTAATATTACGAATTGTATTA
CTATATAGCTTTATGTGTCTCGGATTCTAAGGGCCGCACTAAGGCCATGTTAGAGAACTA
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BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G333JQ C 123
AF RR4G333TF U 1
AF RR4BY91TF U 1
AF RR4BY91JQ C 121
AF RR4H524TF U 1
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GG

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C

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CTAT

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GTGTATATGTACTTGA

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RD RR4H524JQB 717 0 0
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DS 



AS 2 7

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TTGAACTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTAT
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ATTGCTAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAG
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TGCTATTGCTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTTTATATCATCCTTCTTCTCATCGCAAAGAAC
CAAACCGAAAGTCCCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCAGATTTCACCACTTTCT
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TGATCTTCCTCCTTTTTTTTTTCTGAACTTGCAACTCTATTTATCTTTTTTTTTTCCTGT
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TAATTTCTGTTTGTAAATATAATCTGATTACAAGTTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI73TF U 1
AF RR4H951TF U 4
AF RR4BV77TF U 69
AF RR4BV77JQ C 151
AF RR4H951JQB C 296
BS 1 164 RR4FI73TF
BS 165 165 RR4H951TF
BS 166 175 RR4FI73TF
BS 176 176 RR4H951TF
BS 177 189 RR4FI73TF
BS 190 190 RR4H951TF
BS 191 296 RR4FI73TF
BS 297 297 RR4H951TF
BS 298 344 RR4FI73TF
BS 345 345 RR4H951TF
BS 346 371 RR4FI73TF
BS 372 372 RR4H951TF
BS 373 392 RR4FI73TF
BS 393 393 RR4H951TF
BS 394 455 RR4FI73TF
BS 456 456 RR4H951TF
BS 457 491 RR4FI73TF
BS 492 492 RR4H951TF
BS 493 536 RR4FI73TF
BS 537 624 RR4H951TF
BS 625 625 RR4BV77TF
BS 626 655 RR4H951TF
BS 656 656 RR4BV77TF
BS 657 718 RR4H951TF
BS 719 747 RR4BV77TF
BS 748 748 RR4BV77JQ
BS 749 762 RR4BV77TF
BS 763 763 RR4BV77JQ
BS 764 769 RR4BV77TF
BS 770 770 RR4BV77JQ
BS 771 786 RR4BV77TF
BS 787 787 RR4BV77JQ
BS 788 823 RR4BV77TF
BS 824 850 RR4BV77JQ
BS 851 851 RR4H951JQB
BS 852 957 RR4BV77JQ
BS 958 1001 RR4H951JQB

RD RR4FI73TF 536 0 0
GATTTGCATTGAAGAACATGCGAGCCTCTGTTTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATACA
GATCTCTTCCTCTCTCACTTCAAGATCGCCACAACTCTAACCCCGTTTCCAAGTGGGGAT
CGTTAGAGAGATTTGTGTAACATCAGAGTCAAAAAAATGGGGAATAAGGAGAGACCTAGA
CCAGAGAAGCTGTCTGTTTACCTTTATATACCTAACATTGTTGGGTACATGAGAGTTCTC
TTGAACTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTTTAT
TTCTTCAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGTGCTCGAAGATTCAACCAAGTT
TCAACGTTTGGAGCTGTTCTCGACATGGTCACGGATAGAGTTAGCACGGCATGTCTACTC
GTGATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTGTTCCTTTCATTGCTGGCTTTAGAT
ATTGCTAGTCACTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4H951TF 715 0 0
GG
GCATTGAAGAATATGCGAGCCTCTGTTTAACTCTCTCTCTCTCTCTCT**ATACAGATCT
CTTCCTCTCACACTTCAAGATCGCCACAACTCTAACCCCGTTTCCAAGTGGGGATCGTTA
GAGAGATTTGTGTAACATCAGAGTCAAAAAAATGGGGAAGAAGGAGAGACATAGACCAGA
GAAGTT**CTGTTTACCTTTATATACCTAACATTGTTGGGTACATGAGAGTTCTCTTGAA
CTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCCAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTATTTCTT
CAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGTGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAAC
GTTTGGGGCTGTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAGCACGGCATGTCTACTCGTGAT
TCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCATTGCTGGCTTTAGATATTGC
TAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATAT
GAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCTTCATGTGCTA
TTGCTGTGTTTCCTGCGAG*TTCTTTATATCATCCTTCTTCTCATCGCAA*GAACCAAAC
CGAAAGTCCCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCAGATTTCACCACTTT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR4BV77TF 758 0 0
CCTCTCTCACTTCAAGATCGCCACAACTCTAACCCCGTTTCCAAGTGGGGATCGTTAGAG
AGATTTGTGTAACATCAGAGTCAAAAAAATGGGGAAGAAGGAGAGACATAGACCAGAGAA
GTTGTCTGTTTACCTTTATATACCTAACATTGTTGGGTACATGAGAGTTCTCTTGAACTG
TGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTATTTCTTCAG
CTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGTGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACGTT
TGGGGCTGTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAGCACGGCATGTCTACTCGTGATTCT
CTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCATTGCTGGCTTTAGATATTGCTAG
TCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTGAA
AGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCTTCATGTGCTATTG
CTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTTTATATCATCCTTCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGA
AAGTCTCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCAGATTTCACCACTTTCTCTTCTCCT
AGCTTTGACAATATTCGGT*GGTCGATGAAACAA*CAGTCA*TATCATTCAGATGAAA*C
AGCTGCAGATGTCTGTGTACTGTATGATATAGAGA
GCA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4BV77JQ 809 0 0
C
AAAAAATGGGGAAGAAGGAGAGACATAGACCAGAGAAGTTGTCTGTTTACCTTTATATAC
CTAACATTGTTGGGTACATGAGAGTTCTCTTGAACTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCT
CTAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTATTTCTTCAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATG
GCTGGTGTGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACGTTTGGGGCTGTTCTCGACATGGTCA
CAGATAGAGTTAGCACGGCATGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCT
TGGTCTTCCTTTCATTGCTGGCTTTAGATATTGCTAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTA
CGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTGAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCA
GACTCTACTATGGAAACCGGATCTTCATGTGCTATTGCTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTTT
ATATCATCCTTCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTCCTGAATGTCGTAGTTT
CCACATTAACTCAGATTTCACCACTTTCTCTTCTCCTAGCTTTGACAATATTCGGTTGGT
CGATGAAACAAACAGTCAATATCATTCAGATGAAAACAGCTGCAGATGTCTGTGTACTGT
ATGATATAGAGAAGCAGCAGAAGAATACTTGATCTTCCTTCTTTTTTTTTTCTGAACTTG
CAACTCTATTTATCTTTTTTTTTTCCTGTGTAGAAACATGTTCCTATGTCATAAACAAGA
TGAAAGAATATTGATTTACCTTTTTG
GC

QA 2 807 2 807
DS 

RD RR4H951JQB 706 0 0
TCTATTTCTTCAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGTGCTCGTAGATTCAACC
AAGTTTCAACGTTTGGGGCTGTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAGCACGGCATGTC
TACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCATTGCTGGCTT
TAGATATTGCTAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCC
ATAAGGATATGAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCT
TCATGTGCTATTGCTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTTTATATCATCCTTCTTCTCATCGCAA
AGAACCAAACCGAAAGTCCCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCAGATTTCACCAC
TTTCTCTTCTCCTAGCTTTGACAATATTCGGTTGGTCGATGAAACAAACAGTCAATATCA
TTCAGATGAAAACAGCTGCAGATGTCTGTGTACTGTATGATATAGAGAAGCAGCAGAAGA
ATACTTGATCTTCCTCCTTTTTTTTT*CTGAACTTGCAACTCTATTTATCTTTTTTTTT*
CTTGTGTAGAAACATGTTCCTATGTTATAAACAAGATGAAAGAATATTGATTTACCTTTT
TGACATAATTTCTGTTTGTAAATATAATCTGATTACAAGTTTTACG

QA 1 706 1 706
DS 



CO CL1147Contig2 651 2 5 U
GTCAAAAAGGTAAATCAATATTCTTTCATCTTGTTTATAACATAGGAACATGTTTCTACA
CAATTAAAAAAAAAGATAAATAGAGTTGCAAGTTCAGAAAAAAAAGGAAGGAAGATTAAG
GATTTTTCTGCTGCTTCTCTATATCATACAGTACACAGACATCTGCAGCTGTTTTCATCT
GAATGATATTGACTGTTTGTTTCATGGACCAACCGAATATTGTCAAAGCTAGAAGAAGAA
AAAGTGGTGAAATCTGAGTTAATGTGGAAACTACGACATTCAGGAGACTTTCGGTTTGGT
TCTTTGCAATGAGAAGAAGGATGATATAAAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAGCACA
TGAAGATCCGGTTTCCATAGTAGAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCTGTCTTTCACATCCT
TATGGCTGCTCTTCCCTGCTAGAAACGTACTGTACATCTGCAGCCAGTGACTAGCAATAT
CTAAAGCCAGCAATGAAAGGAACACCAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGA
GTAGACATGCCGTGCTGACTCTATCTGTGACCATGTCGAGAACAGCTCCAAACGTTGAAA
CTTGGTTGAATCTTCGAGCACACCAGCCATCCACAGCATCGCAACAAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI73JQ U 9
AF RR4FP57JQ U 1
BS 1 73 RR4FP57JQ
BS 74 74 RR4FI73JQ
BS 75 239 RR4FP57JQ
BS 240 240 RR4FI73JQ
BS 241 651 RR4FP57JQ

RD RR4FI73JQ 534 0 0
GGTAAATCAATATTCTTTCATCTTGTTTATAACATAGGAACATGTTTCTACACAATTAAA
AAAAAAGATAAATAGAGTTGCAAGTTCAGAAAAAAAAGGAAGGAAGATTAAGGATTTTTC
TGCTGCTTCTCTATATCATACAGTACACAGACATCTGCAGCTGTTTTCATCTGAATGATA
TTGACTGTTTGTTTCATGGACCAACCGAATATTGTCAAAGCTAGAAGAAGAAAAAGTGGT
GAAATCTGAGTTAATGTGGAAACTACGACATTCAGGAGACTTTCGGTTTGGTTCTTTGCA
ATGAGAAGAAGGATGATATAAAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAGCACATGAAGATC
CGGTTTCCATAGTAGAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCTGTCTTTCACATCCTTATGGCTG
CTCTTCCCTGCTAGAAACGTACTGTACATCTGCAGCCAGTGACTAGCAATATCTAAAGCC
AGCAATGAAAGGAACACCAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGAGT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4FP57JQ 651 0 0
GTCAAAAAGGTAAATCAATATTCTTTCATCTTGTTTATAACATAGGAACATGTTTCTACA
CAATTAAAAAAAA*GATAAATAGAGTTGCAAGTTCAGAAAAAAAAGGAAGGAAGATTAAG
GATTTTTCTGCTGCTTCTCTATATCATACAGTACACAGACATCTGCAGCTGTTTTCATCT
GAATGATATTGACTGTTTGTTTCATGGACCAACCGAATATTGTCAAAGCTAGAAGAAGAG
AAAGTGGTGAAATCTGAGTTAATGTGGAAACTACGACATTCAGGAGACTTTCGGTTTGGT
TCTTTGCAATGAGAAGAAGGATGATATAAAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAGCACA
TGAAGATCCGGTTTCCATAGTAGAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCTGTCTTTCACATCCT
TATGGCTGCTCTTCCCTGCTAGAAACGTACTGTACATCTGCAGCCAGTGACTAGCAATAT
CTAAAGCCAGCAATGAAAGGAACACCAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGA
GTAGACATGCCGTGCTGACTCTATCTGTGACCATGTCGAGAACAGCTCCAAACGTTGAAA
CTTGGTTGAATCTTCGAGCACACCAGCCATCCACAGCATCGCAACAAAAGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 7

CO CL1148Contig1 883 7 15 U
GGGACGACGAACGTGATCTCGGGTCTGTCTCAGCTATCGATTTCCAGACATCGAAAAAAT
GGCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACAGAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCT
CCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGTGGCCTGTCGCCCGGAACTGACGACCATTC
CTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAA
AGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAA
GTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGC
TGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCTTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAA
AGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGAT
GAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCC
AGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGAT
CACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAA
GCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGG
ATTTGTTGGAGTAAGAAAAAACAAAAACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAATT
CATTTGAGCTTAGAAGTGTTGTTTTTATTTTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCAA
TTTTTATAATGATACGAAGTATGGGACATTAGATCATTTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC54TF U 12
AF RR4GL52TF U 1
AF RR4EY08TF U 1
AF RR4EX38TF U 12
AF RR4EX38JQ C 146
AF RR4EY08JQ C 185
AF RR4EC54JQ C 483
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BS 41 156 RR4EY08TF
BS 157 157 RR4EX38TF
BS 158 162 RR4EY08TF
BS 163 163 RR4EX38TF
BS 164 298 RR4EY08TF
BS 299 299 RR4EX38TF
BS 300 666 RR4EY08TF
BS 667 667 RR4EX38TF
BS 668 692 RR4EY08TF
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BS 694 726 RR4EY08TF
BS 727 865 RR4EX38JQ
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TGGTGGCCTGTCGCCCGGAACTGACGACCATTCCTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAA
TGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGG
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ATCTTTGGTCGAAGGTA**GAAGATGAGAAGAAAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGT
ATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAG
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CTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTT
TGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATG
TTTT

QA 17 680 17 680
DS 

RD RR4GL52TF 680 0 0
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GGCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACAGAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCT
CCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGTGGCCTATCGCCAGGAACTGACGACCATTC
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TGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCTTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAA
AGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGAT
GAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCC
AGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGAT
CACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACA*GAAAAGTGACCAA
GCATCCTAGAGCAA
GTAAGT

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GGCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACAGAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCT
CCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGTGGCCTATCGCCAGGAACTGACGACCATTC
CTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAA
AGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCGA
GTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGC
TGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCTTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAA
AGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGAT
GAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCC
AGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGAT
CACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAA
GCATCCCAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTTTT*GAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGG
ATTTGT

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ACAGAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCTCCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCAT
TGGTGGCCTGTCGCCCGGAACTGACGACCATTCCTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAA
TGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGG
ATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAAGTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACA
GGAGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGCTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTT
ATCTTTGGTCGAAGGTA**GAAGATGAGAAGAAAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGT
ATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAG
GAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGAT
CTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTT
TGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATG
TTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGGATT
GT

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AATGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTAT
GGATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAAGTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGA
CAGGAGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGCTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCG
TTATCTTTGGTCGAAGGTA**GAAGATGAGAAGAAAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCT
GTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAAC
AGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGG
ATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAG
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TGTTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGGATTTGTTGGAGTAAGAAAAAACAAA
AACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAATTCATTTGAGCTTAGAAGTGTTGTTTT
TATTTTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCAATTTTTATAATGATACGAAGTATGGG
GC

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AATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAG
AAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCAGAG
TATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACA
GAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAAGCAT
CCCAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGGATTT
GTTGGAGTAAGAAAAAACAAAAACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAATTCATT
TGAGCTTAGAATTGTTGTTTTTATTTTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCAATTTT
TATAATGATACGAAGTATGGGACATTAGATCATTTTTCT

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TTGTTGGAGTAAGAAAAAACAAAAACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAATTCA
TTTGAGCTTAGAAGTGTTGTTTTTATTTTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCAATT
TTTATAATGATACGAAGTATGGG
GC

QA 1 383 1 383
DS 



AS 2 6

CO CL1149Contig1 1026 4 14 U
GAAGAGTAAATTACTATAAAAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGTT
CAGCTGTTTTTCTTTTTCTTATGGGGTTTCGCAAGAAAGAAACATGTAATAGAAAGAAAA
AAACAAACTCAAAACTGAAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATCTAA
GCAGCTTGCTGAGCAGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATACCT
TTACCCTTCGGAAGAGACACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCCAGAGTGAACACATTACCC
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TTATGCTTCTCACGGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTCCTACCACCAGTCACC
ATCACAACGTTGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGGTCG
AGCTTGATGGTGTCGTTGGGTTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGGATGGTGCGACCGTCG
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TTGAACTTTGCTTCCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCGTAA
AGAAGACGGAAGCTCTCATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAGCCAGCAGGG
TATGTTTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGAATATGCCTCTGCATGAGGATGGAG
ATGACTTCACGGTATGTCAAAGCGTACTTCAACCTGTTCCTGATGATGAGGACAAGAGGA
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GCCATGTTTGCAGCTGTTGTTTCGGAGCAGACGACGACTCTCCTTCTTCTTCCTCAGTGG
CGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 

AF RR4EQ40JQ U 1
AF RR4C341JQ U 1
AF RR4A577TF C 252
AF RR4FO58TF C 378
BS 1 359 RR4C341JQ
BS 360 360 RR4EQ40JQ
BS 361 404 RR4C341JQ
BS 405 405 RR4A577TF
BS 406 410 RR4C341JQ
BS 411 411 RR4A577TF
BS 412 674 RR4C341JQ
BS 675 675 RR4A577TF
BS 676 683 RR4C341JQ
BS 684 684 RR4A577TF
BS 685 714 RR4C341JQ
BS 715 879 RR4A577TF
BS 880 880 RR4FO58TF
BS 881 1026 RR4A577TF

RD RR4EQ40JQ 643 0 0
GAAGAGTAAA
TTACTATAAAAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGTTCAGCTGTTTT
TCTTTTTCTTATGGGGTTTTGCAAGAAAGAAACATGTAATAGAAAGAAAAAAACAAACTC
AAAACTGAAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATCTAAGCAGCTTGCT
GAGCAGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATACCTTTACCCTTCG
GAAGAGACACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCCAGAGTGAACACATTACCCAACCTCGTGG
CGAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGGATGTGAATAGTCTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCT
CACGGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTTCTACCGCCAGTCACCATCACAACGT
TGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCGTTAAGGTCGAGCTTGATGG
TGTCGTTGGGTTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGGATGGTGCGACCGTCGTAAGTGTTGA
GGTAAGGGATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAAAGCTTGAACTTTG
CTTCCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAAC

QA 11 643 11 643
DS 

RD RR4C341JQ 714 0 0
GAAGAGTAAATTACTATAAAAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGTT
CAGCTGTTTTTCTTTTTCTTATGGGGTTTCGCAAGAAAGAAACATGTAATAGAAAGAAAA
AAACAAACTCAAAACTGAAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATCTAA
GCAGCTTGCTGAGCAGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATACCT
TTACCCTTCGGAAGAGACACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCCAGAGTGAACACATTACCC
AACCTCGTGGCGAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGGATGTGAATCGTCTCAAAGCTTCC*
TTATGCTTCTCACGGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTTCTACCGCCAGTCACC
ATCACAACGTTGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGGTCG
AGCTTGATGGTGTCGTTGGGTTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGGATGGTGCGACCGTCG
TAAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAAAGC
TTGAACTTTGCTTCCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCGTAA
AGAAGACGGAAGCTGTCATTGGTTTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAGCCA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4A577TF 775 0 0
AA
GAGACACCCACGGCTTAGTCCCTTTCCCCAGAGTGAACACATTACCCAACCTCGTGGCGA
ACTCATGCCCAGTCGAGTCTTGGATGTGAATCGTCTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCAC
GGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTCCTTCCACCAGTCACCATCACAACGTTGC
CGACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGGTCGAGCTTGATGGTGT
CGTTGGGTTTGATGAGCGGGTCGGGGTAGCGGATGGTGCGACCGTCGTAAGTGTTGAGGT
AAGGGATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAAAGCTTGAACTTTGCTT
CCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCGTAAAGAAGACGGAAGC
TCTCATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAGCCAGCAGGGTATGTTTTGTCAG
TCCTGACTTTACCATCGACTTGAATATGCCTCTGCATGAGGATGGAGATGACTTCACGGT
ATGTCAAAGCGTACTTCAACCTGTTCCTGATGATGAGGACAAGAGGAAGACACTCCCTAG
ACTTGTGAGGTCCAGAAGACGGATTGGGAGCGAAGGCACCACCAAGTTTGTCAAGACCCC
AATGATGGGGGGCATTGAGCCTCTTCAGATGCTTCTTCAATCCCCTTGCCATGTTTGCAG
CTGTTGTTTCGGAGCAGACGACGACTCTCCTTCTTCTTCCTCAGTGGCGGCCC

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4FO58TF 649 0 0
CTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTCCTTCCACCAGTCACCATCACAACGTTGCCGAC
GTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGGTCGAGCTTGATGGTGTCGTT
GGGTTTGATGAGCGGGTCGGGGTAGCGGATGGTGCGACCGTCGTAAGTGTTGAGGTAAGG
GATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAAAGCTTGAACTTTGCTTCCTC
ATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCGTAAAGAAGACGGAAGCTCTC
ATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAGCCAGCAGGGTATGTTTTGTCAGTCCT
GACTTTACCATCGACTTGAATATGCCTCTGCATGAGGATGGAGATGACTTCACGGTATGT
CAAAGCGTACTTCAACCTGTTCCTGATGATGAGGACAAGAGGAAGACACTCCCTAGACTT
GTGAGGTCCAGAAGACGGCTTGAGAGCGAAGGCACCACCAAGTTTG**AAGACCCCAATG
ATGGGGGGCATTGAGCCTCTTCAGATGCTTCTTCAATCCCCTTGCCATGTTTGCAGCTGT
TGTTTCGGAGCAGACGACGACTCTCCTTCTTCTTCCTCAGTGGCGGCC
C

QA 1 648 1 648
DS 



CO CL1149Contig2 718 2 8 U
GGGCCGCCACTGAGGAAGAAGAAGGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAAACAACAGCTGCAAA
CATGGCAAGGGGATTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTGGGGTCT
TGACAAACTTGGTGGTGCCTTCGCTCCCAAGCCGTCTTCTGGACCTCACAAGTCTAGGGA
GTGTCTTCCTCTTGTCCTCATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTTTGACATACCGTGA
AGTCATCTCCATCCTCATGCAGAGGCATATTCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACAA
AACATACCCTGCTGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAAACCAATGACAGCTTCCG
TCTTCTTTACGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTGCATCAGAGATGAGGAAGCAAA
GTTCAAGCTTTGCAAGGTGAGGGCTATCCTGCTCGGACGAAAGGGAATCCCTTACCTCAA
CACTTACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCAT
CAAGCTCGACCTCAACGAGAACAAGATTGTCGAGTTCATCAAGTTCGACGTTGGCAACGT
TGTGATGGTGACTGGCGGTAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTCATTAAGAACCGTGAGAA
GCATAAGGGAAGCTTTGAGACTATTCACATCCAAGACTCGACGGGCATGAGTTCGCCA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C341TF U 1
AF RR4EQ40TF U 2
BS 1 75 RR4C341TF
BS 76 76 RR4EQ40TF
BS 77 553 RR4C341TF
BS 554 554 RR4EQ40TF
BS 555 555 RR4C341TF
BS 556 556 RR4EQ40TF
BS 557 648 RR4C341TF
BS 649 718 RR4EQ40TF

RD RR4C341TF 648 0 0
GGGCCGCCACTGAGGAAGAAGAAGGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAAACAACAGCTGCAAA
CATGGCAAGGGGATTTAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTGGGGTCT
TGACAAACTTGGTGGTGCCTTCGCTCCCAAGCCGTCTTCTGGACCTCACAAGTCTAGGGA
GTGTCTTCCTCTTGTCCTCATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTTTGACATACCGTGA
AGTCATCTCCATCCTCATGCAGAGGCATATTCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACAA
AACATACCCTGCTGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAAACCAATGACAGCTTCCG
TCTTCTTTACGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTGCATCAGAGATGAGGAAGCAAA
GTTCAAGCTTTGCAAGGTGAGGGCTATCCTGCTCGGACGAAAGGGAATCCCTTACCTCAA
CACTTACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCAT
CAAGCTCGACCTCGAGGAGAACAAGATTGTCGAGTTCATCAAGTTCGACGTTGGCAACGT
TGTGATGGTGACTGGCGGTAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTCATTAA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EQ40TF 717 0 0
GGCCGCCACTGAGGAAGAAGAAGGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAAACAACAGCTGCAAAC
ATGGCAAGGGGATTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTGGGGTCTT
GACAAACTTGGTGGTGCCTTCGCTCCCAAGCCGTCTTCTGGACCTCACAAGTCTAGGGAG
TGTCTTCCTCTTGTCCTCATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTTTGACATACCGTGAA
GTCATCTCCTTCCTCATGCAGAGGCATATTCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACAAA
ACATACCCTGCTGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAAACCAATGAGAGCTTCCGT
CTTCTTTACGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTGCATCAGAGATGAGGAAGCAAAG
TTCAAGCTTTGCAAGGTGAGGGCTATCCTGCTCGGACGAAAGGGAATCCCTTACCTCAAC
ACTTACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCATC
AAGCTCGACCTTAACGAGAACAAGATTGTCGAGTTCATCAAGTTCGACGTTGGCAACGTT
GTGATGGTGACTGGCGGTAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTCATTAAGAACCGTGAGAAG
CATAAGGGAAGCTTTGAGACTATTCACATCCAAGACTCGACGGGCATGAGTTCGCCA

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 6

CO CL1150Contig1 980 6 20 U
GGGATCTCTCCCCAATCTTCCTGCGCCACATAAATCTCAGTATTTTCTCCAAATCTCCCG
ATCGTTAACGGCGACCAAACTTAAAGATGAATGACTTAGATGTGTCGAAGCAGATCCAGC
AGATGGTGAGATTCATTCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCG
CTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAGAAGAAGATCA
GGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCGA
TGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCA
TGAAAGACCAAGCAGCTAAAGATCTTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAAC
AGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGC
TGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGG
AGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCC
TTCCCCCTCCTCCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGC
TAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACTCTCGATGCTCGTCTTGATGTGG
CATTCCGTATGAAACTCCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAAT
GAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGAGATTTATCTTTGTTGT
GATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGAAGTCCAAAAGAACCCATCGAACTCGTCGT
TTACTCGTGTATTTTTTTTCCTCCTTCCCGAATGTTATCACTGGCCATAAAAATAAATAA
AGGGATGAAAGACTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A010TFB U 24
AF RR4EE64TF U 1
AF RR4A010TF U 24
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G
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AAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCATGAAAGACCAAGCAGCTAAAGATC
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TGTGCGAGAACACTCTCGATGCTCGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTCCCAGTGA
TCC

QA 2 724 2 724
DS 

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ATCGTTAACGGCGACCAAACTTAAAGATGAATGACTTAGATGTGTCGAAGCAGATCCAGC
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GGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCGA
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AGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGC
TGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGG
AGTATGCTGGCAAGGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCC
TTCCCCCTCCTCCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTTTGGAGGTGTTGTGC
TAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCTCGTCTTGATGTGG
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GA*TGAAAGAGATGT

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DS 

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G
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AGATGAATGACTTAGATGTGTCGAAGCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATTCGCCAAG
AGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGA
AACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGA
AGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCA
AAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCATGAAAGACCAAGCAGCTAAAGATC
TTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTC
AGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGCTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGG
GTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTC
ATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCCAGTG
ATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCG
TGTGCGAGAACACTCTCGATGCTCGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTCCCAGTGA
TCCGTAG*TCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGAAAGAGATGTGATTCATAC
TGGTTTGTGTGTTTGTTTGAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTT
ACTTTGA

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DS 

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TGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGCTGAA
TGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCATGAAAGACCA
AGCAGCTAAAGATCTTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTCAA
GAATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGCTGCGTTGTCG
TGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGG
CAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCC
TCCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCG
TGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACTCTCGATGCTCGTCTTGATGTGGCATTCCGTAT
GAAACTCCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGAAAGA
GATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGT
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ATTTTTTTTCCTCCTTCCCGAATGTTATCACTGGCCA

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DS 

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TGAAAGAGCCTTCTGTGTTGCTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTA
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CCGTGGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTC
ACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCC
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TTTGAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGAAGTCCAAA
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ACTGGCCA
TAAAAA

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DS 

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TTCATTCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAA
TTCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTAT
GAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGCTGAAT
GCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCATGAAAGACCAA
GCAGCTAAAGATCTTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTCAAG
GATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGCTGCGTTGTCGT
GAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGC
AAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCCT
CCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCGT
GATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACTCTCGATGCTCGTCTTGATGTGGCATTCCGTATG
AAACTCCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGAAAGAG
ATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTT
TCTGCAGAATTTTACTTTGAAGTCCAAAAGAACCCATCGAACTCGTCGTTTACTCGTGTA
TTTTTTTTCCTCCTTCCCGAATGTTATCACTGGCCATAAAAATAAATAAAGGGATGAAAG
ACTTTTGTC

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DS 



AS 1 4

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AAGGTATTTGTTTCAAATCTGCAGCGCATCAGCAATGGATCCTGCGAGGCTCAAGACTTC
AAAAGGTGCCTTGTTTCCTATGGACTTAACCGTCTGTGGACAAGAATCCGTGATCCAGAA
GTATGCAAACGCTTCCTCTGATCCATTGTTCTTGTGAGTGAAACGCTCCCAGGAGCTCTT
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GCAACCAGCGGGGTTCCCTTCCTTCAGCCTGACTATCCTCTTATCACCTTCACGAACCTT
TGTGCACACCACCGTGGGATACTGGTCCAACAGCTTGTGGAAACGCTTCCAGGCTCCATC
ATCTGGAAATGCAACTATGATTTTCTCAGTTTCAGGAAGCTGTTGAAGACGTTTGGTCAA
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AGAGACAATCCTAGCCATGGTGAAAGCAGTAGCTACATCTCCTTCCTCTTCCATCCTCTC
AAAGGAGCCAGTGGGGAAGAAAGGCAACACCAAGGTGAAGGACGCAACAAACAAGCGAGG
GAGCAAGTAAATGACAGAGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GD10JQ U 42
AF RR4E384JQ U 1
AF RR4C265JQ U 1
AF RR4E384TF C 472
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BS 209 209 RR4E384JQ
BS 210 212 RR4C265JQ
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BS 214 336 RR4C265JQ
BS 337 337 RR4E384JQ
BS 338 349 RR4C265JQ
BS 350 350 RR4E384JQ
BS 351 516 RR4C265JQ
BS 517 517 RR4E384JQ
BS 518 540 RR4C265JQ
BS 541 541 RR4E384JQ
BS 542 575 RR4C265JQ
BS 576 576 RR4E384JQ
BS 577 719 RR4C265JQ
BS 720 923 RR4E384TF

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ATATGATTATTTCATAAATTGATAATCTAGGTAACATCTCTTAAGAGTACAACACCAAGG
CGAAACCACCAAGACCAGCAAGGTATTTGTTTCAAATCTGCAGCGCATCAGCAATGGATC
CTGCGAGGCTCAAGACTTCAAAAGGTGCCTTGTTTCCTATGGACTTAACCGTCTGTGGAC
AAGAATCCGTGATCCAGAAGTATGCAAACGCTTCCTCTGATCCATTGTTCTTGTGAGTGA
AACGCTCCCATGAGCTCTTTGGGAAGACACCGTGAGTTACATAAGCACTCACCTTCGCAG
CTCCATGAGCTGCCAATACTTTCTGGCATTCAATGAGTGTACCCCCAGATTGCA

QA 1 414 1 414
DS 

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TGATAATCTAGGTAACATCTCTTAAGAGTACAACACCAAGGCGAAACCACCAAGACCAGC
AAGGTATTTGTTTCAAATCTGCAGCGCATCAGCAATGGATCCTGCGAGGCTCAAGACTTC
AAAAGGTGCCTTGTTTCCTATGGACTTAACCGTCTGTGGACAAGAATCCGTGATCCAAAA
GTATGCAAACGCTTCCTCTGATCCATTGTTCTTGTGAGTGAAACGCTCCCAGGAGCTCTT
TGGGAAGACACCGTGAGTTACATAAGCACTCACCTTCGCAGCTCCATTAGCTGCCAATAC
TTTCTGGCATTCAATGAGTGTACCACCAGATTGCACAAGATCATCAACGATGACAACGTG
GCAACCAGCGGGGTTCCCTTCCTTCAGCCTGACTATCCTCTTATCACCTTCACGAACCTT
TGTGCACACCACCGTGGGATACTGGTCCAACAGCTTGTGGAAACGCTTCCAGGCTCCATC
ATCTGGAAATGCAACTATGATTTTCTCAGTTTCAGGAAGCTGTTGAAGACGTTTG

QA 1 655 1 655
DS 

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CAGCATACGAGGTTTCAACAATCTGTCTCTCTGCAAAAGTGATATGATTATTTCATAAAT
TGATAATCTAGGTAACATCTCTTAAGAGTACAACACCAAGGCGAAACCACCAAGACCAGC
AAGGTATTTGTTTCAAATCTGCAGCGCACCAGTAATGGATCCTGCGAGGCTCAAGACTTC
AAAAGGTGCCTTGTTTCCTATGGACTTAACCGTCTGTGGACAAGAATCCGTGATCCAGAA
GTATGCAAACGCTTCCTCTGATCCATTGTTCTTGTGGGTGAAACGCTCCTAGGAGCTCTT
TGGGAAGACACCGTGAGTTACATAAGCACTCACCTTCGCAGCTCCATTAGCTGCCAATAC
TTTCTGGCATTCAATGAGTGTACCACCAGATTGCACAAGATCATCAACGATGACAACGTG
GCAACCAGCGGGGTTCCCTTCCTTCAGCCTGACTATTCTCTTATCACCTTCACGAACCTT
*GTGCACACCACCGTGGGATACTGGTCCAACAGCTGGTGGAAACGCTTCCAGGCTCCATC
ATCTGGAAATGCAACTATGATTTTCTCAGTTTCAGGAAGCTGTTGAAGACGTTTGGTCAA
CAAGGGGATACCAGTCTCAAACAAAGGAAGAACCTGATCAGCAAAGTAGAACCTTTCCT

QA 1 719 1 719
DS 

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ACGAACCTTTGTGCACACCACCGTGGGATACTGGTCCAACAGCTTGTGGAAACGCTTCCA
GGCTCCATCATCTGGAAATGCAACTATGATTTTCTCAGTTTCAGGAAGCTGTTGAAGACG
TTTGGTCAACAAGGGGATACCAGTCTCAAACAAAGGAAGAACCTGATCAGCAAAGTAGAA
CCTTTCCTGTAGGGCGTGGATGTCATAGATGACAACACTAGTGGGACCACCGCGCGAAAT
GGGGATGTTAGAGACAATCCTAGCCATGGTGAAAGCAGTAGCTACATCTCCTTCCTCTTC
CATCCTCTCAAAGGAGCCAGTGGGGAAGAAAGGCAACACCAAGGTGAAGGACGCAACAAA
CAAGCGAGGGAGCAAGTAAATGACAGAGATCC

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 5

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GGGTTCCAAACTTTCTGATAATTTTACATTATTTTCTGCTTATATAGCATTATTCAGTTA
CAAACACTAGATCATAAACGCTCACACTCAATTCATTGAGTCGACAGTTTAGGATCAAAT
ACAGATATAGGGAAACAGAGTTGAAAACGTTGATATTTTCAAACGTGAAATAAAGCCTTG
TGTTCAGTCCAAAGATGAGCTGCTGAGTTCAGATATTTCCCATCCTTTTTTTTTTAATTG
TAAGCAACTCCATAAAGATGAGGGCTTAAGTGGTAAAAGGCAGAAAGAGAGACCTTGTTG
ATATCTACACCACCTTTGAACCCAGCTTCTAAAAGGTAGTCTTCTGTGTTCCTAGTTAAA
TGACATCCGTCGGCTACAACTTGTTGTAATGGATCCAAAACATTCTGCACCATCCTTAGA
AATGTTCCATCTTCTGCTGCAACATGTTCCACGAAGAGGTATAGCCCTCCAGGTTTTAGG
ATCCGTTTTATCTCTTTGAGTGTTTGAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAAGACTT
CCCACAACTGCATCCACTGATGCATCTTCTAATGGCATAGATTCTGCGACCGCGTGAATA
AACTTGAAATTTTCCGATTTCACTCCTGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGACTTTCC
ATCTTAGGGTTTGGATCAACACCAAGAACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGTACTTG
ATGTTCGGACCAGCTCCAATTCCAATCTCCAAAACAGTTTCTGCTTTTCCCACCAAATTT
GCAAAGAGTTTCCTCTTGTAAACGGTAATCTCTTTCTCATATCTTTCCATGCCTGCACTC
CTGAAATAACCATAGAGCTCAAAATACCAGTCAGGCTTAGGAGGACGCAACTGGTTCAAT
ACTTCCGTTGAGTTAGTAGCAGTGGATGGAGCTGTGGATGGAGCAGCGTAGGAAGGAGAG
ATTGGAAGAAACGGAGTCGTAGCTTCTCCTAGGAAATGCTTTCTTCCGCACGTACATAAG
CTGAAACCATGTGAGGCTGGAGGATCCGTAGTAATGAGACTCTTCTGCATTTTGATGACA
GAACCTCTAACTCTTGTTCTTCGAGCTGAATCTATGGTCACCGGGAACGTTAAGGAAGGT
GTGAAATTCAGGATCGCCATTGCTATTTCTCAAACTACCCGTTTCAATTTGATTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ27JQ U 1
AF RR4GU28JQ U 236
AF RR4AC09JQ U 15
AF RR4FZ27TF C 494
AF RR4AC09TF C 507
BS 1 224 RR4FZ27JQ
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BS 975 975 RR4AC09TF
BS 976 1199 RR4FZ27TF

RD RR4FZ27JQ 786 0 0
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ACAGATATAGGGAAACAGAGTTGAAAACGTTGATATTTTCAAACGTGAAATAAAGCCTTG
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ATATCTACACCACCTTTGAACCCAGCTTCTAAAAGGTAGTCTTCTGTGTTCCTAGTTAAA
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AATGTTCCATCTTCTGCTGCAACATGTTCCACGAAGAGGTATAGCCCTCCAGGTTTTAGG
ATCCGTTTTATCTCTTTGAGTGTTTGAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAAGACTT
CCCACAACTGCATCCACTGATGCATCTTCTAATGGCATAGATTCTGCGATCGCGTGAATA
AACTTGAAATTTTCCGATTTCACTCCTGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGACTTTCC
ATCTTAGGGTTTGGATCAACACCAAGAACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGTACTTG
ATGTTCGGACCAGCTCCAATTCCAATCTCCAAAACAGTTTCTGCTTTTCCCACCAA
TTTGCAAGAG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4GU28JQ 537 0 0
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TGTTGATATCTACACCACCTTTGAACCCAGCTTCTAAAAGGTAGTCTTCTGTGTTCCTAG
TTAAATGACATCCGTCGGCTACAACTTGTTGTAATGGATCCAAAACATTCTGCACCATCC
TTAGAAATGTTCCATCTTCTGCTGCAACATGTTCCACGAAGAGGTATAGCCCTCCAGGTT
TTAGGATCCGTTTTATCTCTTTGAGTGTTTGAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAA
GACTTCCCACAACTGCATCCACTGATGCATCTTCTAATGGCATAAATTCTGCGACCGCGT
GAATAAACTTGAAATTTTCCGATTTCACTCCTGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGAC
TTTCCATCTTAGGGTTTGGATCAACACCAAGAACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGT
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4AC09JQ 837 0 0
CTGATAATTTTACATTATTTTCTGCTTATATAGCATTATTCAGTTACAAACACTAGATCA
TAAACGCTCACACTCAATTCATTGAGTCGACAGTTTAGGATCAAATACAGATATAGGGAA
ACAGAGTTGAAAACGTTGATATTTTCAAACGTGAAATAAAGCCTTGTGTTCAGTCCAAAG
ATGAGCTGCTGAGTTCAGATATTTCCCATCCTTTTTTTT**AATTGTAAGCAACTCCATA
AAGATGAGGGCTTAAGTGGTAAAAGGCAGAAAGAGAGACCTTGTTGATATCTACACCACC
TTTGAACCCAGCTTCTAAAAGGTAGTCTTCTGTGTTCCTAGTTAAATGACATCCGTCGGC
TACAACTTGTTGTAATGGATCCAAAACATTCTGCACCATCCTTAGAAATGTTCCATCTTC
TGCTGCAACATGTTCCACGAAGAGGTATAGCCCTCCAGGTTTTAGGATCCGTTTTATCTC
TTTGAGTGTTTGAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAAGACTTCCCACAACTGCATC
CACTGATGCATCTTCTAATGGCATAGATTCTGCGACCGCGTGAATAAACTTGAAATTTTC
CGATTTCACTCCTGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGACTTTCCATCTTAGGGTTTGG
ATCAACACCAAGAACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGTACTTGATGTTCGGACCAGC
TCCAATTCCAATCTCCAAAACAGTTTCTGCTTTTCCCACCAAATTTGCAAAGAGTTTCCT
CTTGTAAACGGTAATCTCTTTCTCATATCTTTCCATGCCTGCACTCCTGAAATAACC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4FZ27TF 706 0 0
CTCTTGAGTG
TTGAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAAGACTTCCCACAACTGCATCCACTGATGC
ATCTTCTAATGGCATAGATTCTGCGATCGCGTGAATAAACTTGAAATTTTCCGATTTCAC
TCCTGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGACTTTCCATCTTAGGGTTTGGATCAACACC
AAGAACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGTACTTGATGTTCGGACCAGCTCCAATTCC
AATCTCCAAAACAGTTTCTGCTTTTCCCACCAAATTTGCAAAGAGTTTCTTCTTGTAAAC
GGCAATCTCTTTCTCATATCTTTCCATGCCTGCACTCCTGAAATAACCATAGAGCTCAAA
ATACCAGTCAGGCTTAGGAGGACGCAACTGGTTCAATACTTCCGTTGAGTTAGTAGCAGT
GGATGGAGCTGTGGATGGAGCAGCGTAGGAAGGAGAGATTGGAAGAAACGGCGTCGTAGC
TTCTCCTAGGAAATGCTTTCTTCCGCACGTACATAAGCTGAAACCATGTGAGGCTGGAGG
ATCCGTAGTAATGAGACTCTTCTGCATTTTGATGACAGAACCTCTAACTCTTGTTCTTCG
AGCTGAATCTATGGTCACCGGGAACGTTAAGGAAGGTGTGAAATTCAGGATCGCCATTGC
TATTTCTCAAACTACCCGTTTCAATTTGATTCTCCC

QA 11 706 11 706
DS 

RD RR4AC09TF 680 0 0
AGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAAGACTTCCCACAACTGCATCCACTGATGCATC
TTCTAATGGCATAGATTCTGCGACCGCGTGAATAAACTTGAAATTTTCCGATTTCACTCC
TGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGACTTTCCATCTTAGGGTTTGGATCAACACCAAG
AACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGTACTTGATGTTCGGACCAGCTCCAATTCCAAT
CTCCAAAACAGTTTCTGCTTTTCCCACCAAATTTGCAAAGAGTTTCCTCTTGTAAACGGT
AATCTCTTTCTCATATCTTTCCATGCCTGCACTCCTGAAATAACCATAGAGCTCAAAATA
CCAGTCAGGCTTAGGAGGACGCAACTGGTTCAATACTTCCGTTGAGTTAGTAGCAGTGGA
TGGAGCTGTGGATGGAGCAGCGTAGGAAGGAGAGATTGGAAGAAACGGAGTCGTAGCTTC
TCCTAGGAAATGCTTTCTTCCGCACGTACATAAGCTGAAACCATGTGAGGCTGGAGGATC
CGTAGTAATGAGACTCTTCTGCATTTTGATGACAGAACCTCTAACTCTTGTTCTTCGAGC
TGAATCTATGGTCACCGGGAACGTTAAGGAAGGTGTGAAATTCAGGATCGCCATTGCTAT
TTCTCAAACTACCCGTTTCA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 2 7

CO CL1153Contig1 917 5 32 U
ATATTAGACTGAAGAAATAATTAACTAGTAAAATAGCATAACATTAGCTCGGGCTACAGA
AAACAATTCCGACAGGATTACATATTTATATTTATGTTAAATATCTCTTCATTCCTCATT
TCATTACTAACTTATTTTCCCTAATCTCTCTCAAACCACTCAGACAAAAAAAAAGAGAGA
GTTGAGAACCAAAACTCAACCACAAGAAAGAGTCATGAGAAGTACAGCTGCTCGTTCCTC
TTCACCGAGTTTCCTCCACAGCCTCTTCTTCTCCAACACCGATCTCTTCATCGCCGGTAC
TTTAAACCCTATATCCAAAAATCGACTTGCCCTTTCCAAACTCTTCTTGTTAACTTTACT
ACTGCTGCAACTATCATCAGCAGCATCCACTGTCTTGATCCTTTTCTTGACATTTCCTGC
ATCTCCTTTTCCGTTCTTGACAGTCTGATGATCAGTAGCGAGATTGTTGTTGCTTTTGTT
CTTGATCTTGATCTTGTTGTCATCTTGTCTGATCCCAAGAGCTGCTTGCCTCTTCTTCCT
GCTCTTGATCCCACACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAAAG
AGGAGTCTTGTTAGTCCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTCGTGTCGCCTCCACTTCCGCT
ACTGCTACAGTTACCACCACTTTCCACATCGGAGGAATCTCCCGCCGCCGATTCGAGCTT
ACTCGTCTTTGTTTCTTCCGTCATTGACATATTGATTCACTTCGAGGATCGAGATAGAAA
GTAAGCTATTTGGCTTTTAGCTGAAGAATCAGAGAAACGATAGAAATGAGAAATCTCCGC
TTGTGAAGTGGAGAGAGTGTGATGCCTTGTGATGAAGATAAGGAAGAGAGAGAGAGAGAG
ATGCCGCGGAGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G212JQ U 24
AF RR4EC53JQ U 1
AF RR4CN93JQ U 23
AF RR4CN93TF C 176
AF RR4GR53TF C 240
BS 1 173 RR4EC53JQ
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BS 175 225 RR4EC53JQ
BS 226 226 RR4CN93JQ
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BS 232 232 RR4CN93JQ
BS 233 284 RR4EC53JQ
BS 285 285 RR4CN93JQ
BS 286 323 RR4EC53JQ
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BS 325 327 RR4EC53JQ
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BS 559 559 RR4CN93JQ
BS 560 566 RR4EC53JQ
BS 567 567 RR4CN93JQ
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BS 694 694 RR4CN93JQ
BS 695 739 RR4EC53JQ
BS 740 807 RR4CN93JQ
BS 808 812 RR4CN93TF
BS 813 813 RR4GR53TF
BS 814 907 RR4CN93TF
BS 908 917 RR4GR53TF

RD RR4G212JQ 458 0 0
G
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TTTATATTTATGTTAAATATCTCTTCATTCCTCATTTCATTACTAACTTATTTTCCCTAA
TCTCTCTCAAACCACTCAGACAAAAAAAAAGAGAGAGTTGAGAACCAAAACTCAACCACA
AGAAAGAGTCATGAGAAGTACTGCTGCACGTTCCTCTTCACCGAGTTTCCTCCACAGCCT
CTTCTTCTCCAACACCGATCGCTTCATCGCCGGTACTTTAAACCCTATATCCAAAAATCT
ACTAGCCCTTTCCAAACTCTTCTTGTTAACT***CTACTGCTGCAACTATCATCAGCAGC
ATCCATTGTCTTGATCCTTTTCTTGACATTTCCTGCATCTCCTTTTCCGTTCTTGACAGT
CTGATGATCAGTAGCGAGATTGTTGTTGCTTTTGT
CC

QA 2 456 2 456
DS 

RD RR4EC53JQ 739 0 0
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AAACAATTCCGACAGGATTACATATTTATATTTATGTTAAATATCTCTTCATTCCTCATT
TCATTACTAACTTATTTTCCCTAATCTCTCTCAAACCACTCAGACAAAAAAAA*GAGAGA
GTTGAGAACCAAAACTCAACCACAAGAAAGAGTCATGAGAAGTACTGCTGCACGTTCCTC
TTCACCGAGTTTCCTCCACAGCCTCTTCTTCTCCAACACCGATCGCTTCATCGCCGGTAC
TTTAAACCCTATATCCAAAAATCTACTAGCCCTTTCCAAACTCTTCTTGTTAACT***CT
ACTGCTGCAACTATCATCAGCAGCATCCATTGTCTTGATCCTTTTCTTGACATTTCCTGC
ATCTCCTTTTCCGTTCTTGACAGTCTGATGATCAGTAGCGAGATTGTTGTTGCTTTTGTT
CTTGATCTTGATCTTGTTGTCATCTTGTCTGATCCCAAGAGCTGCTTGCCTCTTCTTCCT
GCTCTTGATCCCACACGCGTTGCACAGTGATTTAGGACCAGCGGGGCCACCACGCCAAAG
AGGAGTCTTGTCAGTCCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTCGTGTCGCCTCCACTTCCGCT
ACTGCTACAGTTACCACCACTTTCCACATCGGATGAATCTCCCGCCGCCGATTCGAGCTT
ACTCGTCTTTGTTTCTTCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4CN93JQ 785 0 0
CA
CTAGTAAAATAGCATAACATTAGCTCGGGCTACAGAAAACAATTCCGACAGGATTACATA
TTTATATTTATGTTAAATATCTCTTCATTCCTCATTTCATTACTAACTTATTTTCCCTAA
TCTCTCTCAAACCACTCAGACAAAAAAAAAGAGAGAGTTGAGAACCAAAACTCAACCACA
AGAAAGAGTCATGAGAAGTACAGCTGCTCGTTCCTCTTCACCGAGTTTCCTCCACAGCCT
CTTCTTCTCCAACACCGATCTCTTCATCGCCGGTACTTTAAACCCTATATCCAAAAATCG
ACTTGCCCTTTCCAAACTCTTCTTGTTAACTTTACTACTGCTGCAACTATCATCAGCAGC
ATCCACTGTCTTGATCCTTTTCTTGACATTTCCTGCATCTCCTTTTCCGTTCTTGACAGT
CTGATGATCAGTAGCGAGATTGTTGTTGCTTTTGTTCTTGATCTTGATCTTGTTGTCATC
TTGTCTGATCCCAAGAGCTGCTTGCCTCTTCTTCCTGCTCTTGATCCCACACGCATTGCA
CAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAAAGAGGAGTCTTGTTAGTCCCGCAATC
AACGCAAGTCTTCTTCGTGTCGCCTCCACTTCCGCTACTGCTACAGTTACCACCACTTTC
CACATCGGAGGAATCTCCCGCCGCCGATTCGAGCTTACTCGTCTTTGTTTCTTCCGTCAT
TGACATATTGATTCACTTCGAGGATCGAGATAGAAAGTAAGCTATTTGGCTTTTAGCTGA
AGA

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR4CN93TF 735 0 0
AGAGAGAGTGAGAACC
AAACTCAACCACAAGAAAGAGTCATGAGAAGTACAGCTGCTCGTTCCTCTTCACCGAGTT
TCCTCCACAGCCTCTTCTTCTCCAACACCGATCTCTTCATCGCCGGTACTTTAAACCCTA
TATCCAAAAATCGACTTGCCCTTTCCAAACTCTTCTTGTTAACTTTACTACTGCTGCAAC
TATCATCAGCAGCATCCACTGTCTTGATCCTTTTCTTGACATTTCCTGCATCTCCTTTTC
CGTTCTTGACAGTCTGATGATCAGTAGCGAGATTGTTGTTGCTTTTGTTCTTGATCTTGA
TCTTGTTGTCATCTTGTCTGATCCCAAGAGCTGCTTGCCTCTTCTTCCTGCTCTTGATCC
CACACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAAAGAGGAGTCTTGT
TAGTCCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTCGTGTCGCCTCCACTTCCGCTACTGCTACAGT
TACCACCACTTTCCACATCGGAGGAATCTCCCGCCGCCGATTCGAGCTTACTCGTCTTTG
TTTCTTCCGTCATTGACATATTGATTCACTTCGAGGATCGAGATAGAAAGTAAGCTATTT
GGCTTTTAGCTGAAGAATCAGGGAAACGATAGAAATGAGAAATCTCCGCTTGTGAAGTGG
AGAGAGTGTGATGCCTTGTGATGAAGATAAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGATGCCGC
CCC

QA 17 732 17 732
DS 

RD RR4GR53TF 678 0 0
CTTCACCGAGTTTCCTCCACAGCCTCTTCTTCTCCAACACCGATCTCTTCATCGCCGGTA
CTTTAAACCCTATATCCAAAAATCGACTTGCCCTTTCCAAACTCTTCTTGTTAACTTTAC
TACTGCTGCAACTATCATCAGCAGCATCCACTGTCTTGATCCTTTTCTTGACATTTCCTG
CATCTCCTTTTCCGTTCTTGACAGTCTGATGATCAGTAGCGAGATTGTTGTTGCTTTTGT
TCTTGATCTTGATCTTGTTGTCATCTTGTCTGATCCCAAGAGCTGCTTGCCTCTTCTTCC
TGCTCTTGATCCCACACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAAA
GAGGAGTCTTGTTAGTCCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTCGTGTCGCCTCCACTTCCGC
TACTGCTACAGTTACCACCACTTTCCACATCGGAGGAATCTCCCGCCGCCGATTCGAGCT
TACTCGTCTTTGTTTCTTCCGTCATTGACATATTGATTCACTTCGAGGATAGAGATAGAA
AGTAAGCTATTTGGCTTTTAGCTGAAGAATCAGAGAAACGATAGAAATGAGAAATCTCCG
CTTGTGAAGTGGAGAGAGTGTGATGCCTTGTGATGAAGATAAGGAAGAGAGAGAGAGAGA
GATGCCGCGGAGGAATCC

QA 1 678 1 678
DS 



CO CL1153Contig2 725 2 11 U
GGATCTCTCTGGCGGCATCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTTATCTTCATCACAAGGCACCAC
ACTCTCACTACTTCACAAGCGGAGATTTCTCATTTCTATCGTTTCTCTGATTCTTCAGCT
AAAAGCCAAATAGCTTACTTTCTATCTCGATCCTCAAAGTGAATCAATATGTCAATGACG
GAAGAAACAAAGACGAGTAAGCTCGAATCGGCGGCGGGAGATTCATCCGATGTGGAAAGT
GGTGGTAACTGTAGCAGTAGCGGAAGTGGAGGCGACACGAAGAAGACTTGCGTCGATTGC
GGGACTAACAAGACTCCTCTTTGACGTGGTGGCCCCGCTGGTCCTAAATCACTGTGCAAC
GCGTGTGGGATCAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGCAGCTCTTGGGATCAGACAAGATGAC
AACAAGATCAAGATCAAGAACAAAAGCAACAACAATCTCGCTACTGATCATCAGACTGTC
AAGAACGGAAAAGGAGATGCAGGAAATGTCAAGAAAAGGATCAAGACAATGGATGCTGCT
GATGATAGTTGCAGCAGTAGAGTTAACAAGAAGAGTTTGGAAAGGGCTAGTAGATTTTTG
GATATAGGGTTTAAAGTACCGGCGATGAAGCGATCGGTGTTGGAGAAGAAGAGGCTGTGG
AGGAAACTCGGTGAAGAGGAACGTGCAGCAGTACTTCTCATGACTCTTTCTTGTGGTTGA
GTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4EC53TF U 9
AF RR4G212TF U 1
BS 1 307 RR4G212TF
BS 308 308 RR4EC53TF
BS 309 359 RR4G212TF
BS 360 360 RR4EC53TF
BS 361 378 RR4G212TF
BS 379 379 RR4EC53TF
BS 380 387 RR4G212TF
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BS 389 438 RR4G212TF
BS 439 439 RR4EC53TF
BS 440 725 RR4G212TF

RD RR4EC53TF 636 0 0
GGG
GCGGCATCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTTATCTTCATCACAAGGCACCACACTCTCACTAC
TTCACAAGCGGAGATTTCTCATTTCTATCGTTTCTCTGATTCTTCAGCTAAAAGCCAAAT
AGCTTACTTTCTATCTCGATCCTCAAAGTGAATCAATATGTCAATGACGGAAGAAACAAA
GACGAGTAAGCTCGAATCGGCGGCGGGAGATTCATCCGATGTGGAAAGTGGTGGTAACTG
TAGCAGTAGCGGAAGTGGAGGCGACACGAAGAAGACTTGCGTTGATTGCGGGACTGACAA
GACTCCTCTTTGGCGTGGTGGCCCCGCTGGTCCTAAATCACTGTGCAACGCGTGTGGGAT
CAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGCAGCTCTTGGGATCAGACAAGATGACAACAAGATCAA
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TAAAGTACCGGCGATGAAGCGATCGGTGTTGGA

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DS 

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AGGAAACTCGGTGAAGAGGAACGTGCAGCAGTACTTCTCATGACTCTTTCTTGTGGTTGA
GTTTT

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DS 



AS 1 5

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AGGTCAGTGCCATGATCTTGATTAAGATGAAGGAGACTGCTGAAGCTTACCTTGGAAAGA
AAATCAAGGACGCTGTTGTCACTGTTCCAGCTTACTTCAACGATGCCCAGAGGCAGGCTA
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AAGTCCGTGTTGAGATCGAGTCTCTCTTTGATGGTCTTGATTTCTCAGAGCCTCTCACCA
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ATTCTGAGCGGAGAAGGTGGTGACGAGACCAAAGACATCCTTCTTCTTGACGCTGCACCC
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TTCGACCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTTACCTTT
GAAGTGGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAAGGCAGAGGACAAGGCAAGTGGTAAATCA
GAGAAGATCACAATCACAAACGAGAAGGGTCGTCTGAGCCAGGAAGAGATTGACCGGATG
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TTGAGGGATAAAGATGAAGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AT
CTGAG

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G
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TACTTTATCAAGTTGATCAAGAAGAAGCACCAAAAGGACATCAGCAAGGACAACAAGGCT
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AGTACTAGAATCCCCAAAGTTCAGCAGCTGTTGAAGGACTTCTTCGAAGGGAAAGAGCCA
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ATCCGACC

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DS 

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G
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CCAAGTCCGTGTTGAGATCGAGTCTCTCTTTGATGGCCTTGATTTCTCAGAGCCTCTCAC
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GAAGGCCATGGATGATGCTGGTCTACAGAAGAGTCAGATCGATGAGATTGTTCTTGTTGG
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GTATTCTGAGCGGAGAAGGTGGTGACGAGACCAAAGACATCCTTCTTCTTGACGTTGCAC
CCCTCACTTTGGGTATTGAGACCGTGGGAGGAGTGATGACCAAACTTATCCCGAGAAACA
CAGTTATTCCGACCAAGAAGTCTCAGGTGTTCACGACATACCAAGACCAACAGACCACTG
TCTCCATTCAGGTCTTTGAAGGTGAGCGAAGTCTCACCAAGGACTGCAGGCTGCTCGGGA
ACTTCGACCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGT*ACCT
TTGAAGTGGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAA
GCAG

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR4BB38JQ 663 0 0
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CCACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTTACCTTTGAAGTGGACGCCAACGGT
ATCCTGAACGTGAAGGCAGAGGACAAGGCAAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACA
AACGAGAAGGGTCGTCTGAGCCAGGAAGAGATTGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAG
TTTGCAGAGGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACT
TACGTGTACAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAG
GGTGACGAGAAGGAGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCCTTGGAGTGGCTTGACGAG
AACCAAAACTCAGAGAAGGAAGAGTACGACGAGAAGTTGAAGGAAGTAGAGGCAGTTTGT
AACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGGTGGA
GAAGGAGCGGCCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATGTTGT
TTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGATGAA
GAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FD51JQ 621 0 0
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GAAGTGGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAAGGCAGAGGACAAGGCAAGTGGTAAATCA
GAGAAGATCACAATCACAAACGAGAAGGGTCGTCTGAGTCAGGAAGAGATTGACCGGATG
GTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGAGGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCA
AGGAACAGCCTCGAGACTTACGCGTACAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAAT
CTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCC
TTTGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAACTCAGAGAAGGAAGAGTACGACGAGAAGTTGAAG
GAAGTAGAGGCAGTTTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGCG
CCAGGTGGTGCTGGTGGAGAAGGAGCGGCCGAAGAGC*GGATGAGTCTCACGATGAGCTT
TAAGTTGTTTAATGTTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAGTT
TTGAGGGATAAAGATGAAGAG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 7

CO CL1155Contig1 878 7 16 U
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TTTTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTAGCTGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCC
AAATGATTTTCTAAGAAAAAAAAACAAATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCAT
CATAAAATTGGTCAGATCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATATT
TCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTC
TCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCA
CGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCTTTGTCATCGAAT
ACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAG
TAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACA
AGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATTCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATC
CCTGGATGTAGTAAACCCTCAAACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCACC
TGTAAGTAGCGTGAGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATCCTCCACGCCTCGT
GTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCTACGT
CCATGGGAAGAAGATGAGAGATGCTTATCCAAAAATGGAGCAGATCTGACGAAAGACGCA
ACAAAACGCGAAATGAAGCAAATGGATTTTGATCCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT16JQ U 60
AF RR4EC18JQ U 25
AF RR4GL04JQ U 26
AF RR4CT39JQ U 1
AF RR4CT39TF C 87
AF RR4EC18TF C 134
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BS 1 134 RR4CT39JQ
BS 135 135 RR4EC18JQ
BS 136 349 RR4CT39JQ
BS 350 350 RR4EC18JQ
BS 351 376 RR4CT39JQ
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BS 501 501 RR4EC18JQ
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BS 746 878 RR4GL04TF

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AAGAACCCGATGAGGAGAT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4EC18JQ 601 0 0
AA
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AATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCATCATAAAATTGGTCAGATCAGTCCGCA
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TACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATC
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QA 3 601 3 601
DS 

RD RR4GL04JQ 600 0 0
G
GCTAAAACAAATTTTAATTCCATCTTTTGTTTGTTTTTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTA
GCTGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCCAAATGATTTTCTAA*AAAAAAAAACA
AATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCATCATAAAATTGGTCAGATCAGTCCGCA
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CGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCC
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TAGATTCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAAACA

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR4CT39JQ 745 0 0
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TCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTC
TCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAAAACACAGGCA
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ACCAAAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAAAGCCTCTAG
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AGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATTCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATC
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QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4CT39TF 671 0 0
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GCTGGCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTT
GATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAG
CAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAAT
GCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGG
CTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGC
CTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATTCCGAG
ACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAAACAGTAGGCGAGGGC
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CTGGTAGATCCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACT

QA 12 671 12 671
DS 

RD RR4EC18TF 682 0 0
AAG
AAAAAAAACAAATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCATCATAAAATTGGTCAGA
TCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGAGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCT
GAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAA
GAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAA
GAACGTCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTC
AGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCC
ATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAG
ATTCAAGAGGTAGATTCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAAC
CCTCAAACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGG
CGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATCCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAAC
CGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCTACGTCCATGGGAAGAAGATG
AGAGATGCTTATCCAAAAA

QA 4 682 4 682
DS 

RD RR4GL04TF 794 0 0
TAGCTGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCCAAATGATTT*CTAAGAAAAAAAA*
CAAATGTTT*GTTGTTT*GCAATGGCCAACATTCATCATAAAATTGGTCAGATCAGTCCG
CATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGA
TGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGCGAGAACAAAGAGAACGA
TCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCA
TCGCAAACGCAACGCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGAC
GGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATC
CCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGA
GGTAGATTCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAAAC
AGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTGGTCT
TGTCGAGGTAATGCTGGTAGATCCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCG
CCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCTACGTCCATGGGAAGAAGATGAGAGATGC
TTATCCAAAAATGGAGCAGATCTGACGAAAGACGCAACAAAACGCGAAATGAAGCAAATG
GATTTTGATCCGCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 2 7

CO CL1156Contig1 852 2 12 U
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TGACTCAAAATTTGAAGGGAAGGGAAGGGGGAAATAAGAATCAATCATGGGTTGGATCGG
AGAAACAATGGATTCCATCAAATCAATCAAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCAC
CCTCGGTATGATAGTGACGTCGGCATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGG
CACTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGCGAGG
GGATATATTGTTCTTGGCCATGACCAAAGATCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTT
CAAAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCATCGTGCAATCGAAGTTCATGAGAGGAA
AACTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACAAAAGGTGACAACAACGAGGTGGATGACATCGG
CCTCTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCATAAATGGGCAGAGCTGTTGCG
TTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTAT
ATACTCATTGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATACA
TAAAGACGGGTCTATGGTGTGGGGAAGTGGCTCCTCTGCAAGTGCAACCCTCATCATCTT
TTCAAGTCATTCCTTAAACCAAAGAAACAAAACCAATTTTATAATTGAATTTTAGAATCT
TATAATCCAAATTTAATAAATGTATAAGTTTTGGTAAATTAGCAATGCTTTTTATAACAA
TTCTTTTTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM52TF U 1
AF RR4DM52JQ C 93
BS 1 706 RR4DM52TF
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RD RR4DM52TF 793 0 0
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ATACTCATTGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATACA
TAAAGACGGGTCTATGGTGTGGGGAAGTGGCTCCTCTGCAAGTGCA*CCCTCATCATCTT
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TATAATCCAA
TTA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4DM52JQ 760 0 0
AAT
AAGAATCAATCATGGGTTGGATCGGAGAAACAATGGATTCCATCAAATCAATCAAGATCC
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GCATGGAACCTGGCTTTCAGCGAGGGGATATATTGTTCTTGGCCATGACCAAAGATCCCA
TTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTTCAAAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCATC
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AAATTAGCAATGCTTTTTATAACAATTCTTTTTAACG

QA 4 760 4 760
DS 



CO CL1156Contig2 860 5 12 U
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TTTTTATAACAATTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE58TF U 1
AF RR4D478TF U 50
AF RR4CM66TF U 10
AF RR4CM66JQ C 7
AF RR4D478JQ C 376
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QA 1 675 1 675
DS 

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AAAGACTGAGACAC**ATACATAAAGACGG*TCTAT

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G*ATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATACTCATTGGTGCG
TTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATACATAAAGACGG
TCTATGG

QA 17 670 17 670
DS 

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CCTTCTCAACTGAA*CTTCTTCAGCGGATCTGAATCATTTCGACTCAAAATTACAAGGAA
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CAAATCAATCAAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCACCCTCGGTATGATAGTGAC
GTCGGCATTAATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGGCACTGAATCTCCAGTTGC
CGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGCGAGGGGATATATTGTTCTTGAC
CATGACCAAAGAGCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTTCAAAATTGATGGTCGTGA
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G*ATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATACTCATTGGTGCG
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TTAAACCAAAGAAACTAAACCAATTTTATAATGGAATTTTAGAATCTTATAATCCAAATT
TAATAAATGTATAAGTTTTG
AC

QA 20 819 20 819
DS 

RD RR4D478JQ 485 0 0
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CCTTATGTTGG*ATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATACT
CATTGGTGCGTTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATACATAAAG
ACGGGTCTATGGTGGTGGTGGGGAAGTGGCTCCTGCAAGTGCAACCCTCATCATCTTTTG
AACTCATTCCTTAAACCAAAGAAACTAAACCAATTTTATAATGGAATTTTAGAATCTTAT
AATCCAAATTTAATAAATGTATAAGTTTTGGTAAATTAGCAATGCTTTTTATAACAATTC
TTTTT

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 6

CO CL1157Contig1 2107 6 4 U
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GGTGCCAAGTACATATAATAAAGTGAATGAGGTTGAAGAAGGCAATGCCATATCTTCCTT
CTCCAACATTCAGATCGATCCTAATAGCACAAGAAGCGTAAACACCACCACACAAGAGAC
TCAGCTTCTTACTAAACCCCAAGAAGAAGACGCCAAATCAGTATCTAAAGATGAATCCAA
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GGTTTATGATTGCTGCAATGTTGATGGACCTTGTCACATGAGATTATTTACATACAAAGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4D196TF U 1
AF RR4D196JQ C 14
AF RR4D303JQ C 362
AF RR4AF33TF U 35
AF RR4A969JQ U 783
AF RR4A969TF C 1269
BS 1 630 RR4D196TF
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GGTGCCAAGTACATATAATAAAGTGAATGAGGTTGAAGAAGGCAATGCCATATCTTCCTT
CTCCAACATTCAGATCGATCCTAATAGCACAAGAAGCGTAAACACCACCACACAAGAGAC
TCAGCTTCTTACTAAACCCCAAGAAGAAGACGCCAAATCAGTATCTAAAGATGAATCCAA
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TGCAAAGCGAAACCACAGACAAAACCTACA

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DS 

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GACGAATTGAGTTAT
GAGAGAGAGAAGAAGATGGAGGAGGATCAGGAATCGAAGCGAAACACATCAAGAAGAAGA
AGATCTGTCATCATCAGCCTCAAAGACATTCCTCCTCTCGATCCTTCTTCTATCCC*ACA
AGAAACTCCTCTCTGAAGCCAAGGACAATGATGGTGCCAAGTACATATAATAAAGTGAAT
GAGGTTGAAGAAGGCAATGCCATATCTTCCTTCTCCAACATTCAGATCGATCCTAATAGC
ACAAGAAGCGTAAACACCACCACACAAGAGACTCAGCTTCTTACTAAACCCCAAGAAGAA
GACGCCAAATCAGTATCTAAAGATGAATCCAAGAAAGGTTCAGCGAAAATGGTGTTACAG
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ATACATTTCTTTTTTCTTAATCTAGGGAAGTCTAAAAATATATCTGTCCTCATATCTAAA
ATCATTGTACTGTTTTATAAAAAAGTTTGTAAAGGG

QA 16 771 16 771
DS 

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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DS 

RD RR4AD91JQ 766 0 0
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GAGCTGCAACGATTGCCGCGGCAACATCAACCACATATACGGGCTGGAATTTGTTGGTAC
CACCACCTATGAGCGGGAGGAAACCATATTTTTTAACGAACATTGCCCAGGGGTTCAAGA
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DS 

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CATGACTGTCGCCTCAGGCAGCGCGCTGAAGACAGCTTCCTCAGCAGCAGCTTTTGCCCT
CTGCATTCTTGAAGGAGATGACGCAGACGCTCCCAGACAAGAAACCTGAATAAATCTCAT
TATCCCACCATGTTCCTTAGCCACCAATGCAAGTTTCTCGGCCATGTGATGATTCACCTC
TTCGAAACTGAAATTCCTGGTCTCGTACTCTCTTCCAATGAGATTGATAACGACATTAGC
CTTTGCCATGACAGCCTTAATCGAGTCTTCATCCCTTGGATCAAATTTCATTGGTACTAC
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AGTTGCTCCAAATACCGTAGCTACAATGCCACTGACGGAAGATCTGCCACCAGTACCCTT
GCGAGCGAGGTGTCCAGCGCCCTTTGTAGCAAGGGAAGACGAGTAGCGACGATTATCACT
TCCATTCAGGTGATTAGAGACTCCAAAGAGCGATCTTAGAGAAGACGACGAATAATAGAT
CGAAGTTTCTCCGGCGAGAGGCCGTTGGACTAATCTCCTGGAAACTGCTTGCATCATCGT
CCTCACTCTTCAGTTACACGATCGATCGAGAGGCAC

QA 1 756 1 756
DS 

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AAGTTTCTCGGCCATGTGATGATTCACCTCTTCGAAACTGAAATTCCTGGTCTCGTACTC
TCTTCCAATGAGATTGATAACGACATTAGCCTTTGCCATGACAGCCTTAATCGAGTCTTC
*TCTCTTGGATCAAATTTCATTGGTACTACCTGTCCTAAATCTCCCATTAACTTGAGATG
TCGAGGGTTGTCCTCAGAGCCTCGGAAAGGAACTAGCACTTGTGATCCCATTTTAGCTAG
CTGCTGCACAAGATAACGACCAAGAAACCCAGTGGCTCCAAATACCGTAGCTACAATGCC
ACTGACGGAAGATCTGCCACCAGTACCCTTGCGAGCGAGGTGTCCAACGCCCTTTGCAGC
AAGGGAAGACGAGTAGCGACGATTATCACTTCCATTCAGGTGATTAGAGACTCCAAAGAG
CGATCTTAGAGAAGACGAAGAATAATAGATCGAAGTTTCTCCGGCGAGAGGCCGTTGGAC
TAATCTCCTGGAAACTGCTTGCATCATCGTCCTCACTCTTCAGTTACACGATCGATCGAG
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 6

CO CL1159Contig1 817 6 6 U
GGTCAACTGTGCTTATCATTAAGCTTAAAAGGCTTTAAGCCCTATTACAAACGGATTCAA
CCCCACCTTACAAGATTTCAGCCCAGTCTTTACTTCAAAAAATTACACGTGTTATCTAAA
GAATAACTAAAATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCTAGACCTTTCTGGAATC
GGAGGAAGCATCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAAACCGTGAATCACTTTC
TCCGTTTAGTTGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCGCCGTTGATCTTTTCAG
ATTCATCATCCATCACCAGTGTTAAACGCAGTGAGAAGCTTTAAAGAGATGAAACGCAGA
GTCTTGCCAGAACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGAAACCGCTTTCCGTCTC
CTTCGCTTAATCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACTCCGCTCGTTATTGGAG
GCGAAGATTGATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTTTTGAATAGATTAAAAT
CTCCCAAGATCAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGAGAAAAACGGATTTAAA
ACACAAACAAAATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAAGAAACTAAAATCGATC
AACAGATCGAAAGTTTTATTTAATTTACAAAGCAAAAAGGGAATCAGTAACCGGCGGCGA
AGCCACCGGCTACCGGAGACGGAATCTTATTTTTGAAGTTGTCTAGAGAGAAGTTGGAGA
AAACGGGAGAGAGAGGTTTTTTATGTTCCCTAGCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4D190JQ U 1
AF RR4AI88JQ U 2
AF RR4AG37JQ U 2
AF RR4AI88TF C 45
AF RR4CG69TF C 48
AF RR4AG37TF C 71
BS 1 481 RR4D190JQ
BS 482 482 RR4AG37JQ
BS 483 698 RR4D190JQ
BS 699 791 RR4AG37JQ
BS 792 815 RR4AI88TF
BS 816 817 RR4AG37TF

RD RR4D190JQ 698 0 0
GGTCAACTGTGCTTATCATTAAGCTTAAAAGGCTTTAAGCCCTATTACAAACGGATTCAA
CCCCACCTTACAAGATTTCAGCCCAGTCTTTACTTCAAAAAATTACACGTGTTATCTAAA
GAATAACTAAAATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCTAGACCTTTCTGGAATC
GGAGGAAGCATCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAAACCGTGAATCACTTTC
TCCGTTTAGTTGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCGCCGTTGATCTTTTCAG
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GTCTTGCCAGAACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGAAACCGCTTTCCGTCTC
CTTCGCTTAATCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACTCCGCTCGTTATTGGAG
GGGAAGATTGATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTTTTGAATAGATTAAAAT
CTCCCAAGATCAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGAGAAAAACGGATTTAAA
ACACAAACAAAATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAAGAAACTAAAATCGATC
AACAGATCGAAAGTTTTATTTAATTTACAAAGCAAAAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AI88JQ 692 0 0
GTCAACTGTGCTTATCATTAAGCTTAAAAGGCTTTAAGCCCTATTACAAACGGATTCAAC
CCCACCTTACAAGATTTCAGCCCAGTCTTTACTTCAAAAAATTACACGTGTTATCTAAAG
AATAACTAAAATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCTAGACCTTTCTGGAATCG
GAGGAAGCATCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAAACCGTGAATCACTTTCT
CCGTTTAGTTGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCGCCGTTGATCTTTTCAGA
TTCATCATCCATCACCAGTGTTAAACGCAGTGAGAAGCTTTAAAGAGATGAAACGCAGAG
TCTTGCCAGAACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGAAACCGCTTTCCGTCTCC
TTCGCTTAATCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACTCCGCTCGTTATTGGAGG
CGAAGATTGATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTTTTGAATAGATTAAAATC
TCCCAAGATCAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGAGAAAAACGGATTTAAAA
CACAAACAAAATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAAGAAACTAAAATCGATCA
ACAGATCGAAAGTTTTATTTAATTTACAAAGC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4AG37JQ 790 0 0
GTCAACTGTGCTTATCATTAAGCTTAAAAGGCTTTAAGCCCTATTACAAACGGATTCAAC
CCCACCTTACAAGATTTCAGCCCAGTCTTTACTTCAAAAAATTACACGTGTTATCTAAAG
AATAACTAAAATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCTAGACCTTTCTGGAATCG
GAGGAAGCATCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAAACCGTGAATCACTTTCT
CCGTTTAGTTGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCGCCGTTGATCTTTTCAGA
TTCATCATCCATCACCAGTGTTAAACGCAGTGAGAAGCTTTAAAGAGATGAAACGCAGAG
TCTTGCCAGAACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGAAACCGCTTTCCGTCTCC
TTCGCTTAATCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACTCCGCTCGTTATTGGAGG
CGAAGATTGATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTTTTGAATAGATTAAAATC
TCCCAAGATCAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGAGAAAAACGGATTTAAAA
CACAAACAAAATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAAGAAACTAAAATCGATCA
ACAGATCGAAAGTTTTATTTAATTTACAAAGCAAAAAGGGAATCAGTAACCGGCGGCGAA
GCCACCGGCTACCGGAGACGGAATCTTATTTTTGAAGTTGTCTAGAGAGAAGTTGGAGAA
AACGGGAGAG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4AI88TF 773 0 0
TTACAAACGGATTCAACCCCACCTTACAAGATTTCAGCCCAGTCTTTACTTCAAAAAATT
ACACGTGTTATCTAAAGAATAACTAAAATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCT
AGACCTTTCTGGAATCGGAGGAAGCATCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAA
ACCGTGAATCACTTTCTCCGTTTAGTTGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCG
CCGTTGATCTTTTCAGATTCATCATCCATCACCAGTGTTAAACGCAGTGAGAAGCTTTAA
AGAGATGAAACGCAGAGTCTTGCCAGAACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGA
AACCGCTTTCCGTCTCCTTCGCTTAATCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACT
CCGCTCGTTATTGGAGGCGAAGATTGATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTT
TTGAATAGATTAAAATCTCCCAAGATCAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGA
GAAAAACGGATTTAAAACACAAACAAAATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAA
GAAACTAAAATCGATCAACAGATCGAAAGTTTTATTTAATTTACAAAGCAAAAAGGGAAT
CAGTAACCGGCGGCGAAGCCACCGGCTACCGGAGACGGAATCTTATTTTTGAAGTTGTCT
AGAGAGAAGTTGGAGAAAACGGGAGAGAGAGGTTTTTTATGTTCCCTAGCT
CC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4CG69TF 746 0 0
CAAACGGAT*CAACCCCAC*TTACA*GATT*CAGCC*AGTCTT*ACTTCAAAAA*TTACA
CGTGT*ATCTAAAGAATAACTAAAATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCTAGA
CCTTTCTGGAATCGGAGGAAGCATCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAAACC
GTGAATCACTTTCTCCGTTTAGTTGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCGCCG
TTGATCTTTTCAGATTCATCATCCATCACCAGTGTTAAACGCAGTGAGAAGCTTTAAAGA
GATGAAACGCAGAGTCTTGCCAGAACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGAAAC
CGCTTTCCGTCTCCTTCGCTTAATCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACTCCG
CTCGTTATTGGAGGCGAAGATTGATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTTTTG
AATAGATTAAAATCTCCCAAGATCAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGAGAA
AAACGGATTTAAAACACAAACAAAATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAAGAA
ACTAAAATCGATCAACAGATCGAAAGTTTTATTTAATTTACAAAGCAAAAAGGGAATCAG
TAACCGGCGGCGAAGCCACCGGCTACCGGAGACGGAATCTTATTTTTGAAGTTGTCTAGA
GAGAAGTTGGAGAAAACGGGAGAG
CC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4AG37TF 747 0 0
CAAGATTTCAGCCCAGTCTTTACTTCAAAAAATTACACGTGTTATCTAAAGAATAACTAA
AATGCATGCTCGACACATGCTCTTTGATGTGGCTAGACCTTTCTGGAATCGGAGGAAGCA
TCGGCGGTGACGCCGGATCTCTGCCGGATCGAAAACCGTGAATCACTTTCTCCGTTTAGT
TGAAGCCGCTTGACCGCTCCACCTTTCCGATTCGCCGTTGATCTTTTCAGATTCATCATC
CATCACCAGTGTTAAACGCAGTGAGAAGCTTTAAAGAGATGAAACGCAGAGTCTTGCCAG
AACGTTTTCAAAAAGAAAACTCCAGCCAATCTGAAACCGCTTTCCGTCTCCTTCGCTTAA
TCAAACAATTTGACTTTTATCAGCTTTGGATACTCCGCTCGTTATTGGAGGCGAAGATTG
ATTCCTCTACTGAATAACAAATCAAGCATAACTTTTGAATAGATTAAAATCTCCCAAGAT
CAAACAGGATATATATATAAAGATTAGGAAAAGAGAAAAACGGATTTAAAACACAAACAA
AATCTCCAAGGGAAAAAGAGATCCGCTACCGGAAGAAACTAAAATCGATCAACAGATCGA
AAGTTTTATTTAATTTACAAAGCAAAAAGGGAATCAGTAACCGGCGGCGAAGCCACCGGC
TACCGGAGACGGAATCTTATTTTTGAAGTTGTCTAGAGAGAAGTTGGAGAAAACGGGAGA
GAGAGGTTTTTTATGTTCCCTAGCTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 7

CO CL1160Contig1 766 7 12 U
TAGCTCCCTATTTATCGAGAGACGACGAAGTCCCGTCAGAGTTGCATTGCACATACACAC
GTATAGAGATTAAAGAACGAAAACAGAAAAGGAAGAACAAGAAAGAGATCTAGATAATGT
CGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGTGACGGCCAAGGTCACC
ACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCTAATT
TTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGATTTCGATGAGCCTGGTC
ACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATGGTTATCCAAGGCGAGC
CTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAATCAAAAAGACAGGAC
AGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCAGGACAATGTAACATGGTCG
TCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATCTCTGAAACCTTATAGAATGCTATA
TT*GATGTTGTTCCAATCCTTTGAACCATTGTTTCACTTTTACTTTTGGCTGGGTGCATG
GGTTTT*ATGTTTTCCTAATTTAATTTTTGGCGTTTCTACTTTAGCAAAGTTTAAAAGAA
TGTGAAACCTTCCTCTTTTGCATGGTTCCCTGATTAATTTTGTGTGTTTTGGTTTAATTT
TATCTTAACATGTATTTATTGCGTATATGCTCATGTGGTTCTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC36JQ C 202
AF RR4FA85JQ C 238
AF RR4BC36TF U 1
AF RR4FA85TF U 42
AF RR4EI15TF U 42
AF RR4GR41TF U 44
AF RR4GR41JQ C 44
BS 1 137 RR4BC36TF
BS 138 138 RR4EI15TF
BS 139 249 RR4BC36TF
BS 250 250 RR4EI15TF
BS 251 542 RR4BC36TF
BS 543 543 RR4EI15TF
BS 544 648 RR4BC36TF
BS 649 673 RR4EI15TF
BS 674 694 RR4GR41TF
BS 695 695 RR4GR41JQ
BS 696 716 RR4GR41TF
BS 717 766 RR4GR41JQ

RD RR4BC36JQ 206 0 0
TCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGTTAATTTTCCTCAGTCCAAACCTCAAG
AGATGACAGATATCATGAAAGATTTTGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGT
TCCTCGCAGGACTTAAGTATATGGTTATCCAAGGCGAGCCTGGTCCAGTCATTCGTGGCA
AAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAATC

QA 1 206 1 206
DS 

RD RR4FA85JQ 132 0 0
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GTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATGGTTATCCAAGGCG
AGCCTGGTGCAG

QA 1 132 1 132
DS 

RD RR4BC36TF 652 0 0
TAGCTCCCTATTTATCGAGAGACGACGAAGTCCCGTCAGAGTTGCATTGCACATACACAC
GTATAGAGATTAAAGAACGAAAACAGAAAAGGAAGAACAAGAAAGAGATCTAGATAATGT
CGTGGCAAACTTACGTTAATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGTGACGGCCAAGGTCACC
ACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCTAATT
TTCCTCAGTCCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGATTTCGATGAGCCTGGTC
ACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATGGTTATCCAAGGCGAGC
CTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAATCAAAAAGACAGGAC
AGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCAGGACAATGTAACATGGTCG
TCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATCTCTGAAACCTTATAGAATGCTATA
TTTGATGTTGTTCCAATCCTTTGAACCATTGTTTCACTTTTACTTTTGGCTGGGTGCATG
GGTTTT*ATGTTTTCCTAATTTAATTTTTGGCGTTTCTACTTTAGCAA
GTTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4FA85TF 609 0 0
GGGC
ATTGCACATACACACGTATAGAGATTAAAGAACGAAAACAGAAAAGGAAGAACAAGAAAG
AGATCTAGATAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGTG
ACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGG
CTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGATT
TCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATGG
TTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAA
TCAAAAAGACAGGACAGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCAGGAC
AATGTAACATGGTCGTCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATCTCTGAAACC
TTATAGAATGCTATATT*GATGTTGTTCCAATCCTTTGAACCATTGTTTCACTTTTACTT
TTGGCTGGGTGCATGGGTTTT*ATGTTTTCCTAATTTAATTTTTGGCGTTTCTACTTTAG
CAAAG

QA 5 609 5 609
DS 

RD RR4EI15TF 632 0 0
GGGC
ATTGCACATACACACGTATAGAGATTAAAGAACGAAAACAGAAAAGGAAGAACAAGAAAG
AGATCTAGATAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGTG
ACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGG
CTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGATT
TCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATGG
TTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAA
TCAAAAAGACAGGACAGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCATGAC
AATGTAACATGGTCGTCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATCTCTGAAACC
TTATAGAATGCTATATT*GATGTTGTTCCAATCCTTTGAACCATTGTTTCACTTTTACTT
TTGGCTGGGTGCATGGGTTTTTATGTTTTCCTAATTTAATTTTTGGCGTTTCTACTTTAG
CAAAGTTTAAAAGAATGTGAAACCTTCC

QA 5 632 5 632
DS 

RD RR4GR41TF 673 0 0
GG
ATTGCACATACACACGTATAGAGATTAAAGAACGAAAACAGAAAAGGAAGAACAAGAAAG
AGATCTAGATAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGTG
ACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGG
CTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGATT
TCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCGGGACTTAAGTATATGG
TTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAA
TCAAAAAGACAGGACAGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCAGGAC
AATTTAACATGGTCGTCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATCTCTGAAACC
TTATAGAATGCTATATT*GATGTTGTTCCAATCCTTTGGACCATTGTTTCACTTTTACTT
TTGGCTGGGTGCATGGGTTTT*ATGTTTTCCTAATTTAATTTTTGGCGTTTCTACTTTAG
CAAAGTTTAAAAGAATGTGAAACCTTCCTCTTTTGCATGGTTCCCTGAT*AATTTTGTGT
GTTTTGGTTTA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4GR41JQ 723 0 0
GG
ATTGCACATACACACGTATAGAGATTAAAGAACGAAAACAGAAAAGGAAGAACAAGAAAG
AGATCTAGATAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGTG
ACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGGG
CTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGATT
TCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCGGGACTTAAGTATATGG
TTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACAA
TCAAAAAGACAGGACAGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCAGGAC
AATTTAACATGGTCGTCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATTTCTGAAACC
TTATAGAATGCTATATT*GATGTTGTTCCAATCCTTTGGACCATTGTTTCACTTTTACTT
TTGGCTGGGTGCATGGGTTTT*ATGTTTTCCTAATTTAATTTTTGGCGTTTCTACTTTAG
CAAAGTTTAAAAGAATGTGAAACCTTCCTCTTTTGCATGGTTCCCTGATTAATTTTGTGT
GTTTTGGTTTAATTTTATCTTAACATGTATTTATTGCGTATATGCTCATGTGGTTCTGAC
C

QA 3 723 3 723
DS 



AS 1 3

CO CL1161Contig1 952 3 8 U
GGAAATCCGGTCCGACAATGGCGATTTCCGTAACTCATTGTTTCTCCTTCCCCTCTTCAT
CGCTCTATCTGTCTCCACCTACATCAAGAAAATCGAGAATCATACCCATCTATTTCCATG
GAAGACCACCTTCATCTCCATTATTTTCGAAACTAAACCGAGGGGTTCAATTCATGTATC
TATCTCGGAAAAATGTCGTATCATGTCACTCTGCCCACCAAGCTTCACCAACTAATGGTG
AAGAAACGAATTCAAAGCACCCGCCAGATGTAAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAG
CTCTCTTCAATGGACACGAACTCACCGTTACAGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATCG
AGAAGGAAAAGAATAGATTCGACCACAAGGTTTTATCATTATCAATGAAGATAGCTTCAG
AGAAGGACACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGATTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACA
AGGATCGGCTTAGCACAGAGTCAAACGCAAAAGTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCAC
TCGTTGATAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAGCAGACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAGA
AGATCGGTACGAGTTATCAGGGAATTTACAGGCAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTTC
GTGTTAAAGCCATTCCAACTCTGGGCAAGCCTTTTGATCCTTTGTTGCACGAGGCTATTT
CGCGAGAAGAATCTGAGGCGGTTAAGGTAGGGATGATAACCGAGGAGCTTACCCGGGGTT
TTCTTCTAGGAGATCGGGTTCTGCGACCAGCAAAGGTTAAAGTCTCTCTAGGACCCATCA
AGAAGAAGACTGCTTCACCTTCTGCTTGAGTTGATGTTTGGTAAATGGTTCTATGTGTCT
TTGTGTTTAACTCAACTTCTTTCTTTTTCAATGGTAAACACACAAACATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ88TF U 6
AF RR4G182TF U 1
AF RR4G182JQ C 272
BS 1 50 RR4G182TF
BS 51 51 RR4GQ88TF
BS 52 164 RR4G182TF
BS 165 165 RR4GQ88TF
BS 166 713 RR4G182TF
BS 714 714 RR4G182JQ
BS 715 733 RR4G182TF
BS 734 952 RR4G182JQ

RD RR4GQ88TF 704 0 0
GG
CGGTCCGACAATGGCGATTTCCGTAACTCATTGTTTCTCCTTCCCCTCTTCATCGCTCTA
TCTGTCTCCATCTACATCAAGAAAATCGAGAATCATACCCATCTATT*CCATGGAAGACC
ACCTTCATCTCCATTATTTTCGAGACTAAACCGAGGGGTTCAATTCATGTATCTATCTCG
GAAAAATGTCGTATCATGTCACTCTGCCCACCAAGCTTCACCAACTAATGGTGAAGAAAC
GAATTCAAAGCACCCGCCAGATGTAAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAGCTCTCTT
CAATGGACACGAACTCACCGTTACAGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATTGAGAAGGA
AAAGAATAGATTCGACCACAAGGTTTTATCATTATCAATGAAGATAGCTTCAGAGAAGGA
CACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGATTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACAAGGATCG
GCTTAGCACAGAGTCAAACGCAAAAGTGCAATTCATGAAGAGTCTCTTGCCACTCGTTGA
TAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAACAGACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAGAAGATCGA
TACGAGTTATCAGGGAATTTACAGGCAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTTCGTGTTAA
AGCCATTCCAACTCTGGGCAAGCCTTTTGATCCTTTGTT
TCA

QA 3 701 3 701
DS 

RD RR4G182TF 733 0 0
GGAAATCCGGTCCGACAATGGCGATTTCCGTAACTCATTGTTTCTCCTTCTCCTCTTCAT
CGCTCTATCTGTCTCCACCTACATCAAGAAAATCGAGAATCATACCCATCTATTTCCATG
GAAGACCACCTTCATCTCCATTATTTTCGAAACTAAACCGAGGGTTTCAATTCATGTATC
TATCTCGGAAAAATGTCGTATCATGTCACTCTGCCCACCAAGCTTCACCAACTAATGGTG
AAGAAACGAATTCAAAGCACCCGCCAGATGTAAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAG
CTCTCTTCAATGGACACGAACTCACCGTTACAGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATCG
AGAAGGAAAAGAATAGATTCGACCACAAGGTTTTATCATTATCAATGAAGATAGCTTCAG
AGAAGGACACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGATTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACA
AGGATCGGCTTAGCACAGAGTCAAACGCAAAAGTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCAC
TCGTTGATAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAGCAGACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAGA
AGATCGGTACGAGTTATCAGGGAATTTACAGGCAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTTC
GTGTTAAAGCCATTCCAACTCTGGGCAAGCCTTTTGATCCTTTGTTGCACGAG*CTATTT
CGCGAGAAGAATC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4G182JQ 681 0 0
AAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAGCTCTCTTCAATGGACACGAACTCACCGTTAC
AGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATCGAGAAGGAAAAGAATAGATTCGACCACAAGGT
TTTATCATTATCAATGAAGATAGCTTCAGAGAAGGACACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGA
TTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACAAGGATCGGCTTAGCACAGAGTCAAACGCAAA
AGTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCACTCGTTGATAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAGCA
GACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAGAAGATCGGTACGAGTTATCAGGGAATTTACAG
GCAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTTCGTGTTAAAGCCATTCCAACTCTGGGCAAGCC
TTTTGATCCTTTGTTGCACGAGGCTATTTCGCGAGAAGAATCTGAGGCGGTTAAGGTAGG
GATGATAACCGAGGAGCTTACCCGGGGTTTTCTTCTAGGAGATCGGGTTCTGCGACCAGC
AAAGGTTAAAGTCTCTCTAGGACCCATCAAGAAGAAGACTGCTTCACCTTCTGCTTGAGT
TGATGTTTGGTAAATGGTTCTATGTGTCTTTGTGTTTAACTCAACTTCTTTCTTTTTCAA
TGGTAAACACACAAACATAGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 7

CO CL1162Contig1 959 7 7 U
GGACACACCACATCACTCTCTACACAAAAGAAGTAGCCAACACTCTCTCTCTTGTGTTCT
CTCCACTTTCTCTTCTTCTTGCTCTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTTCACACTGTGA
CATTTTCTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGCTTCTCTCACTTCTCCTTCTAGTTCTAG
CCATGGCTGACCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTGATGATGTGT
TACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAACCCCATTCACCCAA
AAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGTCAACAGCT
TCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCTA
CTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCTGGAG
GCAGCACAACAGTGACACCTGGGACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAAGCACCACCACAC
TTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAACCAATGGAGTTTTTGGGAACAATA
GCACAGGAGCCAACGGGACGGGAGTTAACCCGGACTACACGACAGAAAGCAGCGCGTTTG
GTCTCAAGAACTCAAGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGAGTGGATTCT
GTTCTTTCTTGATGCTCTAAGGATGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTAGCAACTTATT
GTATTAAAGACATTGGTCTAGCTTAGTTGGTAATCTATATGTCTGTGTTCTGAGTCTCTA
TCTATGTTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCAGCTCTTGCTTGTACTCTTACCACGTGA
TGGTTTCTGGTAGATTTGATCGTAGTTTAAAAAACTTATATATAAATGTATCTTGTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL57TF U 84
AF RR4FV48TF U 1
AF RR4GL67TF U 22
AF RR4A706TF U 1
AF RR4A706JQ C 172
AF RR4FV48JQ C 364
AF RR4GL67JQ C 255
BS 1 354 RR4A706TF
BS 355 355 RR4FV48TF
BS 356 740 RR4A706TF
BS 741 741 RR4A706JQ
BS 742 841 RR4A706TF
BS 842 945 RR4A706JQ
BS 946 959 RR4GL67JQ

RD RR4BL57TF 313 0 0
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GCTGCTCTGCTTCTCTCACTTCTCCTTCTAGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCTAGTGCC
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TGTGGAAATGGAGCAGACTGTAACCCCATTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGAC
AATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGTCAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCT
TCAGGCACTTGTG

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DS 

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TCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCTA
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TTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAG*AACCTCAACCAATGGA

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DS 

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GG
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CTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTTCACACTGTGACATTTTCTCTGAACGCATCTATG
GCTGCTCTGCTTCTCTCACTTCTCCTTCTAGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCTAGTGCC
TCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTGATGATGTGTTACAGAAGACCATAGACTATGCT
TGTGGAAATGGAGCAGACTGTAACCCCATTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGAC
AATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGTCAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCT
TCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCTACTAACTCCGATCCAAGTTATTCA
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ACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAAGCACCACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTAT
TCAGGAACCTCAACCAATGGAGTTTTTGGGAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACGGGA
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CTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGAGTGGATTCTGTTCTTTCTTGATACTCTAA*GA
TGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTG

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CTCCACTTTCTCTTCTTCTTGCTCTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTTCACACTGTGA
CATTTTCTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGCTTCTCTCACTTCTCCTTCTAGTTCTAG
CCATGGCTGACCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTGATGATGTGT
TACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAACCCCATTCACCCAA
AAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGTCAGCAGCT
TCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCTA
CTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCTGGAG
GCAGCACAACAGTGACACCTGGGACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAAGCACCACCACAC
TTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAACCAATGGAGTTTTTGGGAACAATA
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GTCTCAAGAACTCAAGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGAGTGGATTCT
GTTCTTTCTTGATGCTCTAAAGATGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTAGCAACTTATT
GTATTAAAGACATTGGTCTAGCTTAGTTGGTAATCTATATGTCTGTGTTCTGAGTCTCTA
T
CT

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DS 

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TTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAG
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ACCACGTGATGGTTTCTGGTAGATTTGATCGTAGTTTAAAAAACTTATATATAA
G

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DS 

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TTTTTTTGATGCTTTAAGGACGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTAGCAACTTATTGTA
TTAAAGACATTGGTCTAGCTTAGTTGGTAATTTATATGTCTGTGTTTTGAGTCTCTATTT
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TTTTTGGTAGATTTGATCGTAGT

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ACACCTGGGACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAAGCACCACCACACTTCCTGGTGGCAAC
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GGGACGGGAGTTAACCCGGACTACACGACAGAAAGCAGCGCGTTTGGTCTCAAGAACTCA
AGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGAGTGGATTCTGTTCTTTCTTGATA
CTCTAAGGATGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTAGCAACTTATTGTATTAAAGACATT
GGTCTAGCTTAGTTGGTAATCTATATGTCTGTGTTCTGAGTCTCTATCTATGTTATGTTC
TTGTTGTAAGAAGATTTCAGCTCTTGCTTGTACTCTTACCACGTGATGGTTTCTGGTAGA
TTTGATCGTAGTTTAAAAAACTTATATATAAATGTATCTTGTCCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 2 6

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AAGCTTTCACA**ACAGCAGCCATGGCGGAACTGACTGAGAAGGCTTTTCTAAAGCAACC
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CCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGGAGCCATTCAAGGAAC
TTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCTATTAGAGGCCGTATCTTAGC
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GAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAACGGGGGTTTTCAGCTTAGTTTATGTTTTTGGATGC
TTTTATCCCTTTTATCTATGGAAGAATTCTACATTTGAGTGTTCAGATATTAATGTTTTA
AT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4C028TF U 1
AF RR4A415TF U 1
AF RR4A415JQ C 1
BS 1 71 RR4C028TF
BS 72 73 RR4A415TF
BS 74 92 RR4C028TF
BS 93 93 RR4A415TF
BS 94 153 RR4C028TF
BS 154 154 RR4A415TF
BS 155 162 RR4C028TF
BS 163 163 RR4A415TF
BS 164 189 RR4C028TF
BS 190 190 RR4A415TF
BS 191 224 RR4C028TF
BS 225 225 RR4A415TF
BS 226 279 RR4C028TF
BS 280 280 RR4A415TF
BS 281 282 RR4C028TF
BS 283 283 RR4A415TF
BS 284 315 RR4C028TF
BS 316 316 RR4A415TF
BS 317 339 RR4C028TF
BS 340 340 RR4A415TF
BS 341 399 RR4C028TF
BS 400 400 RR4A415TF
BS 401 617 RR4C028TF
BS 618 618 RR4A415TF
BS 619 658 RR4C028TF
BS 659 662 RR4A415JQ

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CCGTTTCTCTAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCATTCAAGGAAC
TTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCCATCAGAGGCCGTATCTTAGC
CGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTGAGAAGGAACTATCTCCA
CTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCCAACATCCCTGCTCATGTCTC
ACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCATTGTC
CAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCGAA
GAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAACGGGGGTTTTCAGCTTAGTTTATGTTTTTGGATGC
TTTTATCCCTTTTATCTGTGGAAGAATTCTACATTTGAGTGTTCAGATATTAATGTTT
ATGCAT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4A415TF 619 0 0
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AAGCTTTCACA**ACAGCAGCCATGGCGGAACTGACTGAGAAGGCTTTTCTAAAGCAACC
TAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAAGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAA
CCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGGAGCCATTCAAGGAAC
TTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCTATTAGAGGCCGTATCTTAGC
CGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTATCTCCA
CTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCATGTCTC
ACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCATTGTC
CAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCGAA
GAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAACGGGGGTTTTCAGCTTAGTTTATGTTTTTGGATGC
TTTTATCCCTTTTATCTAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4A415JQ 662 0 0
GGCTCGAAGCTTTAGCCGTCTCTGCCTCTCCTATCATATCGTCTCCTACATTCTTGCCTC
AAGCTTTCACA**ACAGCAGCCATGGCGGAACTGACTGAGAAGGCTTTTCTAAAGCAACC
TAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAAGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAA
CCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGGAGCCATTCAAGGAAC
TTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCTATTAGAGGCCGTATCTTAGC
CGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTATCTCCA
CTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCATGTCTC
ACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCATTGTC
CAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCGAA
GAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAACGGGGGTTTTCAGCTTAGTTTATGTTTTTGGATGC
TTTTATCCCTTTTATCTATGGAAGAATTCTACATTTGAGTGTTCAGATATTAATGTTTTA
AT

QA 1 662 1 662
DS 



CO CL1163Contig2 687 3 12 U
GGCTCGAAGCTTTAGCCGTCTCTGCCTCTCCTATCATATCATATCGTCTCCTACATTCTT
GCCCCAAGCTTTCACAAAACAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCTTTTCTAAAG
CAGCCTAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGT
GGAAACCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCATTCAA
GGAACTTACATTGACAGAAAATGTCCCTTTACCGGAACTGTCTCCATTAGAGGCCGTATC
TTAGCCGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTAT
CTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCAT
GTCTCACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCA
TTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTC
GCGAAGAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTATGTTTTTG
GATGCTTTTATCCCTTTTATCTATGGAT*AATTCTACATTCGAGTGTTCGGATATTAATG
TTTTAATCATCGATTTTGTTTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E801TF U 1
AF RR4CP55JQ C 5
AF RR4CP55TF U 5
BS 1 84 RR4E801TF
BS 85 85 RR4CP55TF
BS 86 179 RR4E801TF
BS 180 180 RR4CP55TF
BS 181 385 RR4E801TF
BS 386 386 RR4CP55TF
BS 387 492 RR4E801TF
BS 493 493 RR4CP55TF
BS 494 627 RR4E801TF
BS 628 629 RR4CP55TF
BS 630 667 RR4E801TF
BS 668 687 RR4CP55TF

RD RR4E801TF 674 0 0
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CAGCCTAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGC
GGAAACCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCATTCAA
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TTAGCCGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTAT
CTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAGATGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCAT
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TTGTCCAAGACT*TGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTC
GCGAAGAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTATGTTTTTG
GATGCTTTTATCCCTTTTATCTATGGAAGAATTCTACATTCGAGTGTTCGGATATTAATG
TTTTAAT
GCATCGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CP55JQ 663 0 0
G
GAAGCTTTAGCCGTCTCTGCCTCTCCTATCATATCATATCGTCTCCTACATTCTTGCCCC
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TAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAA
CCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCATTCAAGGAAC
TTACATTGACAGAAAATGTCCCTTTACCGGAACTGTCTCCATTAGAGGCCGTATCTTAGC
CGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTATCTCCA
CTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCATGTCTC
ACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCATTGTC
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GAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTATGTTTTTGGATGC
TTTTATCCCTTTTATCTATGGAT*AATTCTACATTCGAGTGTTCGGATATTAATGTTTTA
AT

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4CP55TF 683 0 0
G
GAAGCTTTAGCCGTCTCTGCCTCTCCTATCATATCATATCGTCTCCTACATTCTTGCCCC
AAGCTTTCACAAAACAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCTTTTCTAAAGCAGCC
TAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAA
CCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCATTCAAGGAAC
TTACATTGACAGAAAATGTCCCTTTACCGGAACTGTCTCCATTAGAGGCCGTATCTTAGC
CGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTATCTCCA
CTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCATGTCTC
ACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCATTGTC
CAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCGAA
GAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTATGTTTTTGGATGC
TTTTATCCCTTTTATCTATGGAT*AATTCTACATTCGAGTGTTCGGATATTAATGTTTTA
TGCATCGATTTTGTTTAAAAAA

QA 2 683 2 683
DS 



AS 1 7

CO CL1164Contig1 1373 7 13 U
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CGCATAGAGATGAGGCCCAAAGCTGCTTCAGGAAAAGCCATAATAGTGCTGTGCCTCGCT
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GAAGAGGATCAACATCTCGTAAAGCATTTGTCTAAACGTTTAGAAGTTCAAAAGGACTGC
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AGACGAGATTCGGTGGGGCAGACATGGATGCCAACAGGAGAAAAGCTGAAGAAAATCGAG
AAAGAGAAAGGGATTGTTGTAAGGTTTGTGATAGGACACAGTGCAACACCAGGAGGAGTA
TTAGACAAAGCCATAGATGAAGAAGACTCAGAGTATAAAGATTTCTTGAGACTAAAACAC
ATTAAAGGATATCACCAGCTCTCTACAAAGACAAGACTCTACTTCTCAACAGCAGCAGCA
ATGTGGGACGCAGAGTTCTACGTGAA*GGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTAGGAAT
GCTCGTTACCACACTAGCGAGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTACATTGGATGCATGAA
GTCTGGTCCGGTTCTTTCACTAAAGGGAGTGAAGTACCACGAGCCAGAGTTCTGGAAGTT
TGGAGAAGAAGGGAACAAGTACTTCAGACATGCGACTGGACAGATCTACGCAATCTCTAA
AGACTTAGCTGCGTACATCTCTACTAACCAGGGAATACTGCACAGGTACGCGAACGAGGA
CGTGTCGTTAGGAGCGTGGATGCTAGGGTTAGAGGTGGAGCATGTGGACGAGAGGTCAAT
GTGTTGCGGGACGCCACCGGATTGTCAGTGGAAAGCGCAGGCCGGGAACGTGTGTGCTGC
GTCGTTCGATTGGTCATGCAGTGGGATTTGTAAGTCGGTTGATCGGATGGCACGTGTGCA
CCGCGCTTGCGCGGAAGGAGACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTCTTCTTCTGAGTTGG
TTGCCTTTGTGGAATGAATAAAGGAGACGTTGCAAAACGTAATAAAAATGATATTTT*GT
TGGTGTCAAACAATTGCCCAATTGGTTATGAGCATTGACTTTATAGGTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES18TF U 8
AF RR4AQ86TF U 1
AF RR4G642TF U 586
AF RR4AQ86JQ C 475
AF RR4D577JQ C 671
AF RR4ES18JQ C 730
AF RR4D577TF U 583
BS 1 366 RR4AQ86TF
BS 367 367 RR4ES18TF
BS 368 746 RR4AQ86TF
BS 747 747 RR4D577TF
BS 748 775 RR4AQ86TF
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BS 777 861 RR4AQ86TF
BS 862 1295 RR4D577TF
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BS 1309 1327 RR4D577TF
BS 1328 1373 RR4AQ86JQ

RD RR4ES18TF 628 0 0
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ATTCGGTGAGGCAGACATGGATGCCAACAGGAGAAAAGCTGAAGAAAATCGAGAAAGAGA
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AAGCCATAGATGAAGAAGACTCAGA
TAT

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DS 

RD RR4AQ86TF 861 0 0
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CGCATAGAGATGAGGCCCAAAGCTGCTTCAGGAAAAGCCATAATAGTGCTGTGCCTCGCT
AGCTTTCTTGCAGGCTCACTGTTCATGAGTCGATCTTTGAGTCGCTCTTACGTGTCTGAA
GAAGAGGATCAACATCTCGTAAAGCATTTGTCTAAACGTTTAGAAGTTCAAAAGGACTGC
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AAAACCCACCAAGCAGTAAAAGCATTGGAGAGAACTATGTCAACGTTGGAGCTGGAGTTA
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CAGAGTCTACAAAAAGCGTTTGCAGTGATAGGCATCAACACAGCATTCAGCAGCAAGAAG
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AAAGAGAAAGGGATTGTTGTAAGGTTTGTGATAGGACACAGTGCAACACCAGGAGGAGTA
TTAGACAAAGCCATAGATGAAGAAGACTCAGAGTATAAAGATTTCTTGAGACTAAAACAC
ATTAAAGGATATCACCAGCTCTCTACAAAGACAAGACTCTACTTCTCAACAGCAGCAGCA
ATGTGGGACGCAGAGTTCTACGTGAAAGGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTATGAAT
GCTCGTTACCACACTAGCGAGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTACATTGGATGCATGAA
GTCTGGTCCGGTTCTTTCACT

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DS 

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G
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GTCAACTTAGGAATGCTCGTTACCACACTAGCGAGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTAC
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TACGCAATCTCTAAAGACTTAGCTGCGTACATCTCTACTAACCAGGGAATACTGCACAGG
TACGCGAACGAGGACGTGTCGTTAGGAGCGTGGATGCTAGGGTTAGAGGTGGAGCATGTG
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DS 

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ATCGAGAAAGAGAAAGGGATTGTTGTAAGGTTTGTGATAGGACACAGTGCAACACCAGGA
GGAGTATTAGACAAAGCCATAGATGAAGAAGACTCAGAGTATAAAGATTTCTTGAGACTA
AAACACATTAAAGGATATCACCAGCTCTCTACAAAGACAAGACTCTACTTCTCAACAGCA
GCAGCAATGTGGGACGCAGAGTTCTACGTGAA*GGTAGACGACGACGTACATGTCAACTT
AGGAATGCTCGTTACCACACTAGCGAGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTACATTGGATG
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CTCTAAAGACTTAGCTGCGTACATCTCTACTAACCAGGGAATACTGCACAGGTACGCGAA
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TGTGCACCGCGCTTGCGCGGAAGGAGACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTCTTCTTCTG
AGTTGGTTGCCTTTGTGGAATGAATAAAGGAGACGTTGCAAGACGTAATAAAAATGATAT
TTTTGTTGGTGTCAAACAATTGCCCAATTGGTTATGAGCATTGACTTTATAGGTCTTTT

QA 1 899 1 899
DS 

RD RR4D577JQ 658 0 0
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CAGAGTTCTACGTGAA*GGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTAGGAATGCTCGTTACC
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GTTCTTTCACTAAAGGGAGTGAAGTACCACGAGCCAGAGTTCTGGAAGTTTGGAGAAGAA
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GCGTACATCTCTACTAACCAGGGAATACTGCACAGGTACGCGAACGAGGACGTGTCGTTA
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ACGCCACCGGATTGTCAGTGGAAAGCGCAGGCCGGGAACGTGTGTGCTGCGTCGTTCGAT
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GCGGAAGGAGACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTCTTCTTCTGAGTTGGTTGCCTTTGT
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G

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DS 

RD RR4ES18JQ 599 0 0
GCAGAGTTCTACGTGAG*GGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTAGGAATGCTCGTTAC
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GGTTCTTTCACTAAAGGGAGTGAAGTACCACGAGCCAGAGTTCTGGAAGTTTGGAGAAGA
AGGGAACAAGTACTTCAGACATGCGACTGGACAGATCTACGCAATCTCTAAAGACTTAGC
TGCGTACATCTCTACTAACCAGGGAATACTGCACAGGTACGCGAACGAGGACGTGTCGTT
AGGAGCGTGGATGCTAGGGTTAGAGGTGGAGCATGTGGACGAGAGGTCAATGTGTTGCGG
GACGCCACCGGATTGTCAGTGGAAAGCGCAGGCCGGGAACGTGTGTGCTGCGCCGTTCGA
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TGGAATGAATAAAGGAGACGTTGCAAAACGGAATAAAAATGATATTTTTGTTGGTGTC
G

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DS 

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GCAA
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TGAGACTAAAACACATTGAAGGATATCACCAGCTCTCTACAAAGACAAGACTCTACTTCT
CAACAGCAGCAGCAATGTGGGACGCAGAGTTCTACGTGAA*GGTAGACGACGACGTACAT
GTCAACTTAGGAATGCTCGTTACCACACTAGCGAGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTAC
ATTGGATGCATGAAGTCTGGTCCGGTTCTTTCACTAAAGGGAGTGAAGTACCACGAGCCA
GAGTTCTGGAAGTTTGGAGAAGAAGGGAACAAGTACTTCAGACATGCGACTGGACAGATC
TACGCAATCTCTAAAGACTTAGCTGCGTACATCTCTACTAACCAGGGAATACTGCACAGG
TACGCGAACGAGGACGTGTCGTTAGGAGCGTGGATGCTAGGGTTAGAGGTGGAGCATGTG
GACGAGAGGTCAATGTGTTGCGGGACGCCACCGGATTGTCAGTGGAAAGCGCAGGCCGGG
AACGTGTGTGCTGCGTCGTTCGATTGGTCATGCAGTGGGATTTGTAAGTCGGTTGATCGG
ATGGCACGTGTGCACCGCGCTTGCGCGGAAGGAGACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTC
TTCTTCTGAGTTGGTTGCCTTTGTGGAATGAATAAAGGAGACGTTGCAA*ACGTAATAAA
A*TGATATTTT*GTTGGTGTC
G

QA 5 745 5 745
DS 



AS 1 7

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN49JQ U 38
AF RR4GQ57JQ U 1
AF RR4EN49TF C 38
AF RR4AM23JQ U 17
AF RR4AM23TF C 17
AF RR4CS82JQ U 26
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RD RR4EN49JQ 179 0 0
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QA 1 179 1 179
DS 

RD RR4GQ57JQ 713 0 0
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TGAACAACGTAAAACATCATTACAATACAAACGAACTATTAGCCCATTGTTAATAGTAGC
TTCATATCATGCACATTTTTGGTCTTTTTGATTGCATTTGGATATTGTTGAATAAAGAAA
TGAAGTTAGTAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAATTCGAGCAACTTCTTAGAAAAAA*G
CCATGGTTGAATAACTGTAACTGAGTCAAACATCCTGCTCGTTCCATCGGGTTGAGTCAC
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TCTGAATTTCAACGGACTCAACACGTTAGCGTCTGTTCTCGCAATGGATGCAGCGTTTGT
TTGCTCGCTCATTTCTTGTAGATTGAATTGTTTCACGCAGTACCTTCCAAGTTCTTGAAT
CTCCATGTTGATTCCAACGTTCCCAACATCTGACTTCCCTCCGAGAAGGGCGGACTTCGC
CGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAGGAACACTAACAATGACAATCTGATAAGATAAAC
TTTTGACATATTGCTTATAACTTTTGTCTTCTTCTTTGGCTTAAGTTTGATTTTTTGGGT
TATTTATTTGCCTCTTGATGTTTCTTCAAAGCTTTGATTTTGTTTT
CCTTTCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EN49TF 673 0 0
ATAGCATCTTTGGCCTTTATTTATGAACAACGTAAAACATCATTACAATACAAACGAACT
ATTAGCCCATTGTTAATAGTAGCTTCATATCATGCACATTTTTGGTCTTTTTGATTGCAT
TTGGATATTGTTGAATAAAGAAATGAAGTTAGTAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAATT
CGAGCAACTTCTTAGAAAAAA*GCCATGGTTGAATAACTATAACTGAGTCAAACATCCTG
CTCGTTCCATCGGGTTGAGTCACTTCAATCCTTAGATAGTATTTGGTACCAGCCACGATC
TGTTTCTGAGCCGACACAACTCGTCTGAATTTCAACGGACTCAACACGTTAGCGTCTGTT
CTCGCAATGGATGCAGCGTTTGTTTGCTCGCTCATTTCTTGTAGATTGAATTGCTTCACG
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AATGACAATCTGATAAGATAAACTTTTGACATATTGCTTATAACTTTTGTCTTCTTCTTT
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TCTTGTTTT
TCCC

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DS 

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CT
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ATTACAATACAAACGAACTATTAGCCCATTGTTAATAGTAGCTTCATATCATGCACATTT
TTGGTCTTTTTGATTGCATTTGGATATTGTTGAATAAAGAAATGAAGTTAGTAGATAGGA
GTAGCAACAGGAGTGAATTCGAGCAACTTCTTAAAAAAAA*GCCATGGTTGAATAACTAT
AACTGAGTCAAACATCCTGCTCGTTCCATCGGGTTGAGTCACTTCAATCCTTAGATAGTA
TTTGGTACCAGCCACGATCTGTTTCTGAGCCGACACAACTCGTCTGAATTTCAACGGACT
CAACACGTTAGCGTCTGTTCTCGCAATGGATGCAGCGTTTGTTTGCTCGCTCATTTCTTG
TAAATTGAATTGTTTCACGCAGTACCTTCCAAGTTCTTGAATCTCCATGTTGATTCCAAC
GTTCCCAACATCTGACTTCCCTCCGAGAAGGGCGGACTTCGCCGATGGAGTCACGACGGC
CATCACCAGGAACACTAACAATGACAATCTGATAAGATAAACTTTTGACATATTGCTTAT
AACTTTTGTCTTCTTCTTTGGCTTAAGTTTGATTTTTTGGGTTATTTATTTGCCTCTTGA
TGTTTC
CC

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR4AM23TF 670 0 0
CT
GTAATTTCATCACATCTTTATAGCATCTTTGGCCTTTATTTATGAACAACGTAAAACATC
ATTACAATACAAACGAACTATTAGCCCATTGTTAATAGTAGCTTCATATCATGCACATTT
TTGGTCTTTTTGATTGCATTTGGATATTGTTGAATAAAGAAATGAAGTTAGTAGATAGGA
GTAGCAACAGGAGTGAATTCGAGCAACTTCTTAGAAAAAA*GCCATGGTTGAATAACTAT
AACTGAGTCAAACATCCTGCTCGTTCCATCGGGTTGAGTCACTTCAATCCTTAGATAGTA
TTTGGTACCAGCCACGATCTGTTTCTGAGCCGACACAACTCGTCTGAATTTCAACGGACT
CAACACGTTAGCGTCTGTTCTCGCAATGGATGCAGCGTTTGTTTGCTCGCTCATTTCTTG
TAGATTGAATTGTTTCACGCAGTACCTTCCAAGTTCTTGAATCTCCATGTTGATTCCAAC
GTTCCCAACATCTGACTTCCCTCCGAGAAGGGCGGACTTCGCCGATGGAGTCACGACGGC
CATCACCAGGAACACTAACAATGACAATCTGATAAGATAAACTTTTGACATATTGCTTAT
AACTTTTGTCTTCTTCTTTGGCTTAAGTTTGATTTTTTGGGTTATTTATTTGCCTCTTGA
TGTTTC
CC

QA 3 668 3 668
DS 

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TACAAACGAACTATTAGCCCATTGTTAATAGTAGCTTCGTATCATGCACATTTTTGGTCT
TTTTGATTGCATTTGGATATTGTTGAATAAAGAAATGAAGTTAGTAGATAGGAGTAGCAA
CAGGAGTGAATTCGAGCAACTTCTTAAAAAAAAAGCCATGGTTGAATAACTATAACTGAG
TCAAACATCCTGAT*GTTCCATCGGGTTGAGTCACTTCAATCCTTAGATAGTATTTGGTA
CCAGCCACGATCTGTTTCTGAGCCGACACAACTCGTCTGAATTTCAACGGACTCAACACG
TTAGCGTCTGTTCTCGCAATGGATGCAGCGTTTGTTTGCTCGCCCATTTCTTGTAAATTG
AATTGTTTCACGCAGTACCTTCCAAGTTCTTGAATCTCCATGTTGATTCCAACGTTCCCA
ACATCTGACTTCCCTCCGAGAAGGGCGGACTTCGCCGATGGAGTCACGACAGCCATCACC
AGGAACACTAACAATGACAATCTGATAAGATAAACTTTTGACATATTGCTTATAACTTTT
GTCTTCTTCTTTGGCTTAAGTTTGATTTTTTGGGTTATTTATTTGCCTCTTGATGTTTCT
TCAAAGCTTTGATTTTGTTTTCCTTTCC

QA 1 688 1 688
DS 

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G
CTTTATTTATGAACAACGTAAAACATCATTACAATACAAACGAACTATTAGCCCATTGTT
AATAGTAGCTTCATATCATGCACATTTTTGGTCTTTTTGATTGCATTTGGATATTGTTGA
ATAAAGAAATGAAGTTAGTAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAATTCGAGCAGCTTCTTA
GAAAAAA*GCCATGGTTGAATAACTATAACTGAGTCAAACATCCTGCTCGTTCCATCGGG
TTGAGTCACTTCAATCCTTAGATAGTATTTGGTACCAGCCACGATCTGTTTCTGAGCCGA
CACAACTCGTCTGAATTTCAACGGACTCAACACGTTAGCGTCTGTTCTCGCAATGGATGC
AGCGTTTGTTTACTCGCTCATTTCTTGTAGATTGAATTGTTTCACGCAGTACCTTCCAAG
TTCTTGAATCTCCATGTTGATTCCAACGTTCCCAACATCTGACTTCCCTCCGAGAAGGGC
GGACTTCGCCGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAGGAACACTAACAATGACAATCTGAT
AAGATAAACTTTTGACATATTGCTTATAACTTTTGTCTTTTTCTTTGGCTTAAGTTTGAT
TTTTTGGGTTATTTATTTGCCTCTTGATGTTTCTTCAAAGCTTTGATTTTGTTTT
CCTTTCC

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DS 



AS 1 7

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ACCAAAGGTGACTTGCACGAATCATCATCACTCTACGATAGAACGATTTGACTTTCAGAA
GAGCAAGAGTCTGAGAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAA
TCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATTAGTGTGGTACAAGAAAAAGAGGTTGACAATCA
AACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCATGTTGGTCTGCTCTGCGAAAACTTAGAACG
GTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGA
TAAGCTTCCGTACAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGA
GCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGC
TTGTATCGCAATCCGTGATGTTTCAAATCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGA
GTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGC
TCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTTTTTTATAGATATAAAGTTGCA
GATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCACCCTTCAAATTTGTGTGTCGGTTTGGATCAGTTT
CATTAAGCATCCCACTTTATTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV53TF U 27
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AF RR4A720TF U 1
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GG
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ATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGATTTGCGCGAATCATCAT
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AATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATT
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GG
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AGAAAAAGAGGTTGACAATCAAACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCATGTTGGTCT
GCTCTGCGAAAACTTAGAACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGCCTTGAGGT
AAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTACAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTC
GGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCA
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TTTGGACAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCAC
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TTT*ATAGATATAAAGTTGCAGATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCACCCTTCAAATTTG
TGTGTCGGTT

QA 3 732 3 732
DS 

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CGAAGCTTCTCTTTACGTGATGGTGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACG
ACCAAAGGTGACTTGCACGAATCATCATCACTCTACGATAGAACGATTTGACTTTCAGAA
GAGCAAGAGTCTGAGAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAA
TCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATTAGTGTGGTACAAGAAAAAGAGGTTGACAATCA
AACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCATGTTGGTCTGCTCTGCGAAAACTTAGAACG
GTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGA
TAAGCTTCCGTACAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGA
GCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGC
TTGTATCGCAATCCGTGATGTTTCAAATCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGA
GTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGC
TCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTTTTTTATAGATATAAAGTTGCA
GATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCACCCTTCAAATTTGTGTGTCGGTTTGGATCAGTTT
CATTAAGCATCCC
AC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4DV53JQ 461 0 0
TGCGAAAACTTAGAACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTTTAGGCCTTGAGATAAAC
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ATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGA
GGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTTTCAAATTTTAAACAGATTTTG
GACAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGGGGCCAGGGATATTCACTCGT
GATCCAGACGCAAACGCTTTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCCCTCTTTTTTT
ATAGATAAAAAGTTGCAGATACTTAAATACTGTTCAAGTTTCCCCCTTCAAATTTGTGTG
TCGGTTTGGATCAGTTTCATTAAGCATCCCACTTTATTTTT

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DS 

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GATATAAAGTTGCAGATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCCCCCTTCAAATTTGTGTGTCG
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DS 

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ATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGC
CGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTTTCAAATTTTAAACAGATTTTGGAC
AAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGGGATATTCACTCGTGAT
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GATATAAAGTTGCAGATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCCCCCTTCAAATTTGTGTGTCG
GTTTGGATCAGTTTCATTAAGCATCCC
CCTTTATTT

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DS 



AS 1 6

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TAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACGCTCTTGGCCTTGATCA
AGACTGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGACAGTTTCA
TGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCAGAG
GCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTCAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGC
AGGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATAATGGGAAAAGCAGATC
ATCTTCCTTTTCTGGCATCTGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCGCTTAGTCTCA
GTTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATG
CTGAAAAGCTAAATTAGTTACAAGTATGTATGAATAGTGGAAATGGAAGACTTGTAATAG
CTATGCATGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTGACAAAAAA*TAATA
CGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAACACTTGATCAATAACTCTTCCATTGATATTTGAC
AGCATAAAAGAATATGAATTAGTCAAGAAAGAGCACTTGATCGATAGCTCTTTCCCTAAT
ATTTGTATGTGTGTGGTTGTATATCAACGACGAAAACTGTTGATTGG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E531JQ C 1
AF RR4E531TF U 1
AF RR4B458JQ C 2
AF RR4D644TF U 2
AF RR4D644JQ C 8
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G
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CGTGACCCACTTGAACAACGTCGTCGAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCA
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TCTTCCTTTTCTGGCATCTGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCGCTTAGTCTCAG
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TGAAAAGCTAAATTAGTTACAAGTATGTATGAATAGTGGAAATGGAAGACTTGTAATAGC
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GAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAACACTTGATC

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CATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCAGAGGCGTGAC
CCACTTGAACAACGTCGTCGAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGGGAG
TGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCTTCC
TTTTCTGGCATCTGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCGCTTAGTCTCAGTTTCCC
TATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGAAAA
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TGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTGACAAAAAA*TAATACGAATTA
GTCAAGAAAGAGCGGATAACACTTGATC

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DS 

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QA 11 609 11 609
DS 



AS 1 6

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TCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCC
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TCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCATAGGCTTTGTGAGTGGTGAGCTTCCCACGACG
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BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G706JQ U 132
AF RR4H162JQ U 1
AF RR4H162TF C 1
AF RR4EZ54TF C 84
AF RR4EZ54JQ U 1
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TGGGGTACGTCAGCTTTCCCAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTTCCCAATTCCTCCG
ACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCCACCACCTGAAACAACAATCCAATG

QA 1 233 1 233
DS 

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TAT
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AAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAACCC
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ATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTGTCC
CGCGACTAAC

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DS 

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TAT
AAAAACATGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTGTTTTAGCATGTATACATAA
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ATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCCATG
AAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAACCC
CATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCCAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTTCCCAA
TTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCCACCACCTGAAGCAACAATCCAAT
GCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAATGGC
TCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTCCAA
ATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTGTCC
CGCGACTAAC

QA 4 553 4 553
DS 

RD RR4EZ54TF 620 0 0
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CGTCCAAAATATCATCCACCACCTGAAACAACAATCCAATGCACCTGGCAAACTTTCTTA
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CCAACAAAACAGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTCCAAATGCTCTAAACCGACGTCGT
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CAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGCCG
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CGCCATAGGCTTTGTGAGTG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4EZ54JQ 773 0 0
TATAAAAACATGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTGTTTTAGCATGTATACA
TAAACCCGACACAACAAAACGAACAATCAAAGTTCTAAAAGACATAACATTTCATTTATT
TCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCC
ATGAAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAA
CCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCCAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTTCC
CAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCCACCACCTGAAACAACAATCC
AATGCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAAT
GGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTC
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TCCCACGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCAT
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TCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCATAG*CTTTGTGAGTGGTGGGCTTCCCACGACG
CAGATCGTCATTGTCCATACAGGCAAGTCGTCTTTGATAAGAGACATGGTATC

QA 1 773 1 773
DS 

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AAAAACATGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTGTTTTAGCATGTATACATAA
ACCCGACACAACAAAACGAACAATCAAAGTTCTAAAAGACATAACATTTCATTTATTTCT
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AAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAACCC
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GCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAATGGC
TCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTCCAA
ATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTGTCC
CGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCAAAACCATTCT
ATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAAGAGACAAGAGAGCTCCTCC
GGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCATAGGCTTTGTGAGTGGTGAGCTTCCCACGACGCAG
ACCGTCATTGTCCA

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 7

CO CL1169Contig1 1610 7 5 U
GCTTCAAAATTTTAATAATGTTATTATATATATTAAAGCACTCTTGCATATTGAGAATCA
TACAAAATTTACTACTCAGTAATGTGTCACTCTCTCTGGAGATATCCACATCATTTATAT
GTCAAAAAAGTATAATAAATACAAGAGTGATATATCAGAACTTTTCCATCGCAGTCTAAT
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ATGTTAGCACAGGCCCCTACAGCTGGTCCTTCTGCACCTTTGTGGACCAAGTTGATGTCA
GCAAGAGCAACATTAGTGCAAGGCGTGCCTGAGCTGCAGATTAATTTCACAGCAATCTTT
GTCGCTGATGTGCCCTTAATGTTCTTGAAGGTCACGTCCGACAATTTCACCTTAGAAGGT
ACCCCAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTTGGTCGATGAGAACGGGAGTGCTA
ACATTGTCCATTGTGATATCCTCAAAAATAATGTTGGAGGCAATACCAGGAGGAGATCCA
GGCCATGTCTTGATGCGAACACCATTCATGGTGTTCTTGATGAGGCATTTCCTCACTGTG
ACTCCTTTGACTGGTTGCTCATTAGGGTACCTTCCTAGACTCCCTACGGCAATGCCGTGT
CCCGGTCCACATTCCACATTCTCAACAATGAGATTCTCAGTACCATCTCCTATGGAAACA
CAGTAATCTCCTGTTTTAATCTTTGCCCCTAGTAAGTTCACGCCGATGGACCTTCCAATG
TGGATACCATCAGTGTTGAGACTCTCCGGTGGTGCATCAATACCAATTTTCTCAAGAGTT
ACGTTCTTGCAGTTGAGAACGTTCATGTGGAAAAGTTTGCTGTTCGTTGATGTTATGCCA
ATAATTTTGGAGTTTGTGAGACCCGTGAATCGTATGTTGATGGGGAGAGAGTTGCATTTT
CCAGTTTTTGCGCAGTCATTGGCCTTCCAAGCGAGGGAGCCTTGACCGTCAAAAATGGCT
CCGTTTCCATTCAAAGTGAAATCAGCAAGATTTGTAAAATCTATCCATCCGCTGTTAGGC
TTAGTGGCACCGACCGTAGCCGGAGCCTTCATATTGCCGTGCATTTCCAAAGTGACAGGA
CCCTTGCACGGACCTAAGAACTCTATGTTGTTCACCAAATAATCACCCTTTGGCATTGTA
ATCGTGCTCGGTCCTGCTGCTTCACACGCTGTTTTCCATACAGCCAAAAATGCCGCAGTG
TCATCTGTTGTTCCGTCTCCTTTGGCTCCTGCTGCTTTAACGTCAAGTGCTCCACCACTT
CCTGCGGGTCCTGTTGGTGCAGCTGCGCCGCTTCCTTTGCGTCCTGGATCAAGGGGTGCC
CCGTTTGCTATTGTGTTCAAAATAGCCACTACTAGTACAAGAAGTACCGTCTTTGCTCTG
CGCAAACCCACCATTTTTATTCTCTTTTATTTTGTCTTATCTAATACTAGATGCTTATTT
ATTTTTTCTTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK01JQ U 53
AF RR4EK06JQ U 5
AF RR4EY95JQ U 1
AF RR4EV13JQ U 1
AF RR4EY95TF C 458
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AF RR4EK01TF C 1001
BS 1 288 RR4EV13JQ
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GT
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TGATATGTCAAAAAGATATTATAAATACAAGAGTGATATATCAGAACTTTTCCATCGCAG
TCTAATTAATCAAAGTGTCTTAACTAGATGGATGCTTGGTGGACAAGCGACAATAAAATT
CAAGGACCCGATTTAGCGATCTCAGTGCAAGCAGGTGGAATCATCTGTCCGGTGAGAACA
GGCTTCATGTTAGCACAGGCCCCTACAGC*GGTCCTTTTGCACCTTTGTGGACCAAGTTG
ATGTCAGCAAGAGCAACATTAGTGCAAGGCGTGCCTGAGCTGCAGATTAATTTCACGGCA
ATCTTTGTCGCTGATGTGCCCTTAATGTTCTTGAAGGTCACGTCCGACAATTTCACCTTA
GATGGTACCCCAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTTGGTCGATGAGAACGGGA
GTGCTAACATTGTCCATTGTGATATCCTCAAAAA

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR4EK06JQ 564 0 0
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AAATTTACTACTCAGTAATGTGTCACTCTCTCTGGAGATATCCACATCATTTATATGTCA
AAAAAGTATAATAAATACAAGAGTGATATATCAAAACTTTTCCATCGCAGTCTAATTAAT
CAAAGTGTCTTAATTAAATGGATGCTTGGTGGACAAGCGACTATAAAATTCAAGGACCCG
ATTTAGCGATCTCAGTGCAAGCAGGTGGAATCATCTGTCCGGTGAGAACAGGCTTCATGT
TAGCACAGGCCCCTACAGCTGGTCCTTCTGCACCTTTGTGGACCAAGTTGATGTCAGCAA
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CAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTTGGTCGATGAAAACGGGAGTGCTAACAT
TGTCCATTGTGATATCCTCAAAAA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4EY95JQ 679 0 0
GCTT
CAAAATTTTAATAATGTTATTATATATATTAAAGCACTCTTGCATATTGAGAATCATACA
AAATTTACTACTCAGTAATGTGTCACTCTCTCTGGAGATATCCACATCATTTATATGTCA
AAAAAGTATAATAAATACAAGAGTGATATATCAGAACTTTTCCATCGCAGTCTAATTAAT
CAAAGTGTCTTAATTAGATGGATGCTTGGTGGACAAGCGACTATAAAATTCAAGGACCCG
ATTTAGCGATCTCAGTGCAAGCAGGTGGAATCATCTGTCCGGGG**AACAGGCTTCATGT
TAGCACAGGCCCCTACAGCTGGTCCTTCTGCACCTTTGTGGACCAAGTTGATGTCAGCAA
GAGCAACATTAGTGCAAGGCGTGCCTGAGCTGCAGATTAATTTCACAGCAATCTTTGTCG
CTGATGTGCCCTTAATGTTCTTGAAGGTCACGTCCGACAATTTCACCTTAGAAGGTACCC
CAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTTGGTCGATGAGAACGGGAGTGCTAACAT
TGTCCATTGTGATATCCTCAAAAATAATGTTGGAGGCAATACCAGGAGGAGATCCAGGCC
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CTTTGACTGGTTGCT

QA 5 679 5 679
DS 

RD RR4EV13JQ 792 0 0
GCTTCAAAATTTTAATAATGTTATTATATATATTAAAGCACTCTTGCATATTGAGAATCA
TACAAAATTTACTACTCAGTAATGTGTCACTCTCTCTGGAGATATCCACATCATTTATAT
GTCAAAAAAGTATAATAAATACAAGAGTGATATATCAGAACTTTTCCATCGCAGTCTAAT
TAATCAAAGTGTCTTAATTAGATGGATGCTTGGTGGACAAGCGACTATAAAATTCAAGGA
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ATGTTAGCACAGGCCCCTACAGCTGGTCCTTCTGCACCTTTGTGGACCAAGTTGATGTCA
GCAAGAGCAACATTAGTGCAAGGCGTGCCTGAGCTGCAGATTAATTTCACAGCAATCTTT
GTCGCTGATGTGCCCTTAATGTTCTTGAAGGTCACGTCCGACAATTTCACCTTAGAAGGT
ACCCCAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTTGGTCGATGAGAACGGGAGTGCTA
ACATTGTCCATTGTGATATCCTCAAAAATAATGTTGGAGGCAATACCAGGAGGAGATCCA
GGCCATGTCTTGATGCGAACACCATTCATGGTGTTCTTGATGAGGCATTTCCTCACTGTG
ACTCCTTTGACTGGTTGCTCATTAGGGTACCTTCCTAGACTCCCTACGGCAATGCCGTGT
CCCGGTCCACATTCCACATTCTCAACAATGAGATTCTCAGTACCATCTCCTATGGAAACA
CAGTAATCTCCT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4EY95TF 614 0 0
CCGACAATTTCACCTTAGAAGGTACCCCAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTT
GGTCGATGAGAACGGGAGTGCTAACATTGTCCATTGTGATATCCTCAAAAATAATGTTGG
AGGCAATACCAGGAGGAGATCCAGGCCATGTCTTGATGCGAACACCATTCATGGTGTTCT
TGATGAGGCATTTCCTCACTGTGACTCCTTTGACTGGTTGCTCATTAGGGTACCTTCCTA
GACTCCCTACGGCAATGCCGTGTCCCGGTCCACATTCCACATTCTCAACAATGAGATTCT
CAGTACCATCTCCTATGGAAACACAGTAATCTCCTGTTTTAATCTTTGCCCCTAGTAAGT
TCACGCCGATGGACCTTCCAATGTGGATACCATCAGTGTTGAGACTCTCCGGTGGTGCAT
CAATACCAATTTTCTCAAGAGTTACGTTCTTGCAGTTGAGAACGTTCATGTGGAAAAGTT
TGCTGTTCGTTGATGTTATGCCAATAATTTTGGAGTTTGTGAGACCCGTGAATCGTATGT
TGATGGGGAGAGAGTTGCATTTTCCAGTTTTTGCGCAGTCATTGGCCTTCCAAGCGAGGG
AGCCTTGACCGTC
C

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4EV13TF 618 0 0
CACGT
CGACAATTTCAC*TTAGAAGGTACCCCAACTTTGCAGTCGGCATAAGGACAGTACTCTTG
GTCGATGAGAACGGGAGTGCTAACATTGTCCATTGTGATATCCTCAAAAATAATGTTGGA
GGCAATACCAGGAGGAGATCCAGGCCATGTCTTGATGCGAACACCATTCATGGTGTTCTT
GATGAGGCATTTCCTCACTGTGACTCCTTTGACTGGTTGCTCATTAGGGTACCTTCCTAG
ACTCCCTACGGCAATGCCGTGTCCCGGTCCACATTCCACATTCTCAACAATGAGATTCTC
AGTACCATCTCCTATGGAAACACAGTAATCTCCTGTTTTAATCTTTGCCCCTAGTAAGTT
CACGCCGATGGACCTTCCAATGTGGATACCATCAGTGTTGAGACTCTCCGGTGGTGCATC
AATACCAATTTTCTCAAGAGTTACGTTCTTGCAGTTGAGAACGTTCATGTGGAAAAGTTT
GCTGTTCGTTGATGTTATGCCAATAATTTTGGAGTTTGTGAGACCCGTGAATCGTATGTT
GATGGGGAGAGAGTTGCATTTTCCAGTTTTTGCGCAGTCATTGGCCTTCCAAGCGAGGGA
GCCTTGACCGTC
C

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DS 

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CTTGACCGTCAAAAATGGCTCCGTTTCCATTCAAAGTGAAATCAGCAAGATTTGTAAAAT
CTATCCATCCGCTGTTAGGCTTAGTGGCACCGACCGTAGCCGGAGCCTTCATATTGCCGT
GCATTTCCAAAGTGACAGGACCCTTGCACGGACCTAAGAACTCTATGTTGTTCACCAAAT
AATCACCCTTTGGCATTGTAATCGTGCTCGGTCCTGCTGCTTCACACGCTGTTTTCCATA
CAGCCAAAAATGCCGCAGTGTCATCTGTTGTTCCGTCTCCTTTGGCTCCTGCTGCTTTAA
CGTCAAGTGCTCCACCACTTCCTGCGGGTCCTGTTGGTGCAGCTGCGCCGCTTCCTTTGC
GTCCTGGATCAAGGGGTGCCCCGTTTGCTATTGTGTTCAAAATAGCCACTACTAGTACAA
GAAGTACCGTCTTTGCTCTGCGCAAACCCACCATTTTTATTCTCTTTTATTTTGTCTTAT
CTAATACTAGATGCTTATTTATTTTTTCTTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGT
TTTTGTTTCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

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ATAAGTCATAACTCACCGACTCCAAAAATCTGTTCTTTTTTTTTGAACTCAAAACCAAAA
CCAAATGGCTAGTAACAACAACCCACATGGTAACCTTTCAGACCAAACACCTTCTGATGA
CTTCTTCGACCAAATCCTCGGTCTTCCCAACTTCTCAGCTTCTTCATCCGACGGTGGGTT
AGGCGGAGGAGGAGGAGCACCGCCGATGATGCTGCAGCTGGGTTCAGGAGAGGAAGGAAG
TCACATGGGTGGTGGTGGGTTAGGAGTAGGGAGGAAGTGGACCAACTGGGTTTCACAATC
AGATGTTTCCTCTAGAGTTGAGTCTTGACCAAGGCAAAGGACATGGCTTCCTTAGACCTG
AAGGTGGTCATGGAAGTGTGAATCGTTCTTCTTCTTCTTCTATGAAAGGACCTGTTTTTC
ATGGGCAGCCGATGCAACAGCCAGCTCCAGCAGCGCCACATCAGCCTACATCGATCCGTC
CTAGGGTTCGAGCTAGGCGTGGTCAAGCTACTGATCCACATAGCATCGCTGAAAGGCTAC
GCAGGGAAAGAATAGCTGAACGGATCACGGCGCTTCAAGAACTTGTTCCCACTGTTAACA
AGACAGATAGAGCTGCTATGATCGATGAGATTGTGGACTATGTTAAGTTTCTCAGGCTCC
AAGTTAAGGTTTTGAGCATGAGTCGACTTGGTGGGGCTGGTGCGGTTGCTCCACTTGTTA
CTGATATGCCTTTGTCATCATCAGTTGAGGATGAAACGAGTGATGGTGGAAGGACGCCAC
AACCTGCGTGGGAGAAATGGTCAAACGATGGGACTGAACGCCAAGTGGCTAAGTTGATGG
AAGAAAACGTTGGAGCAGCTATGCAGCTACTTCAATCAAAGGCTCTTTGTATGATGCCTA
TCTCACTGGCTATGGCGATTTACCATTCTCAGCCTCCAGATACATCATCAGTGGTTAAAC
CAGAGACCAATCCTCCTCCACCACAGTAGGGTTTTGTGCAAGTAAGGGTTGTACAGCAAC
TCAAACGGTCCAACGTGGCTTTACTTTCTACTACTACACTCATGATGACTCTGGTTTCTT
GCTGCTTCATCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4EJ62TF U 26
AF RR4H079TF U 1
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GC

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RD RR4EJ62TF 580 0 0
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AAATCTGTTCTTTTTTTT*GAACTCAAAACCAGAACCAAATGGCTAGTAACAACAACCCA
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CCCAACTTCTCAGCTTCTTCATCCGACGGTGGGTTAGGCGGAGGAGGAGGAGCACCGCCG
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CAGG

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DS 

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CCAAATGGCTAGTAACAACAACCCACATGGTAACCTTTCAGACCAAACACCTTCTGATGA
CTTCTTCGACCAAATCCTCGGTCTTCCCAACTTCTCAGCTTCTTCATCCGACGGTGGGTT
AGGCGGAGGAGGAGGAGCACCGCCGATGATGCTGCAGCTGGGTTCAGGAGAGGAAGGAAG
TCACATGGGTGGTGGTGGGTTAGGAGTAGGGAGGAAGTGGACCAACTGGGTTTCACAATC
AGATGTTTCCTCTAGAGTTGAGTCTTGACCAAGGCAAAGGACATGGCTTCCTTAGACCTG
AAGGTGGTCATGGAAGTGTGAATCTTTCTTCTTCTTCTTCTATGAAAGGACCTGTTTTTC
ATGGGCAGCCGATGCAACAGCCAGCTCCAGCAGCGCCACATCAGCCTACATCGATCCGTC
CTAGGGTTCGAGCTAGGCGTGGTCAAGCTACTGATCCACATAGCATCGCTGAAAGGCTAC
GCAGGGAAAGAATAGCTGAACGGATCACGGCGCTTCAAGAACTTGTTCCCACTGTTAACA
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QA 1 696 1 696
DS 

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G
AGGACATGGCTTCCTTAGACCTGAAGGTGGTCATGGAAGTGTGAATCGTTCTTCTTCTTC
TTCTATGAAAGGACCTGTTTTTCATGGGCAGCCGATGCAACAGCCAGCTCCAGCAGCGCC
ACATCAGCCTACATCAATCCGTCCTAGGGTTCGAGCTAGGCGTGGTCAAGCTACTGATCC
ACATAGCATCGCTGAAAGGCTACGTAGGGAAAGAATAGCTGAACGGATCAGGGCGCTTCA
AGAACTTGTTCCCACTGTTAACAAGACAGATAGAGCTGCTATGATCGATGAGATTGTGGA
CTATGTTAAGTTTCTCAGGCTCCAAGTTAAGGTTTTGAGCATGAGTCGACTTGGTGGGGC
TGGTGCGGTTGCTCCACTTGTTACTGATATGCCTTTGTCATCATCAGTTGAGGATGAAAC
GAGTGATGGTGGAAGGACGCCACAACCTGCGTGGGAGAAATGGTCAAACGATGGGACTGA
ACGCCAAGTGGCTAAGTTGATGGAAGAAAACGTTGGAGCAGCTATGCAGCTACTTCAATC
AAAGGCTCTTTGTATGATGCCTATCTCACTGGCTATGGCGATTTACCATTCTCAGCCTCC
AGATACATCATCAGTGGTTAAACCAGAGACCAATCCTCCTCCACCACAGTAGGGTTTTGT
GCAAGTAAGGGTTGTACAGCAACTCAAACGGTCCAACGTGGCTTTACTTTCTACTACTAC
ACTCATGATGACTCTGGTTTCTTGCTGCTTCATCTCCTC

QA 2 760 2 760
DS 



AS 2 7

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GGGATTGTGTGACATTACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACAAGAATCGGCGAGCTTTGA
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TGAGTTTCTTAAAAGAGAGGTCAGAAGCAGGAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGG
AAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGGAGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGC
AACCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGT
GTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAAC
CCGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATTTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGT
ATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATT
TGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGAAAACCAGTTCTCAACATCA
ACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGA
ACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGA
GGGCCATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAA
AGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTGCAAAAAGAGAAGAACCAAAACCCTTTTTATCTGCTAT
TCTATTTCTCAAAGAACCTTGTTTTTGTAAGACTACGTTGTGAGTAAGAAAACCCTTTCC
CCCCTTAGCTCATTATCTTTCTGAACTTTTAGTTCGTGAGAGTTGGACAAAGGAACTGAG
AACTCTAAAAATGTGGATTGTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ68TF U 1
AF RR4AO83TF U 1
AF RR4FZ68JQ C 264
BS 1 242 RR4AO83TF
BS 243 243 RR4FZ68TF
BS 244 390 RR4AO83TF
BS 391 391 RR4FZ68TF
BS 392 449 RR4AO83TF
BS 450 450 RR4FZ68TF
BS 451 520 RR4AO83TF
BS 521 521 RR4FZ68TF
BS 522 744 RR4AO83TF
BS 745 923 RR4FZ68JQ

RD RR4FZ68TF 658 0 0
GGGATTGTGTGACATTACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACAAGACTCGGCGAGCTTTGA
TTCAGTCGTTAATCTGTTCCGATCTCGTGTTCCGTAACGAAATTACAATCTTCTGTCGTG
TGAGTTTCTTAAAAGAGAGGTCAGAAGCAGGAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGG
AAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGGAGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGC
AACCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGT
GTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAAC
CCGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATTTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGT
ATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATT
TGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGAAAACCAGTTCTCAACATCA
ACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGA
ACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4AO83TF 744 0 0
GGGATTGTGTGACATTACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACAAGAATCGGCGAGCTTTGA
TTCAGTCGTTAATCTGTTCCGATCTCGTGTTCCGTAACGAAATTACAATCTTCTGTCGTG
TGAGTTTCTTAAAAGAGAGGTCAGAAGCAGGAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGG
AAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGGAGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGC
AATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGT
GTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAAC
CCGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATGTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGT
ATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCGAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATT
TGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCAGTTCTCAACATCA
ACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGA
ACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGA
GGGCCATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAA
AGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FZ68JQ 660 0 0
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AAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCATAAT
GGTACATTTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTT
AAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAACGTTTGCCTCAAC
ATCTTGCGTGAAGACTGAAAACCAGTTCTCAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTC
CATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTTA
AGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGTT
GGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTG
CAAAAAGAGAAGAACCAAAACCCTTTTTATCTGCTATTCTATTTCTCAAAGAACCTTGTT
TTTGTAAGACTACGTTGTGAGTAAGAAAACCCTTTCCCCCCTTAGCTCATTATCTTTCTG
AACTTTTAGTTCGTGAGAGTTGGACAAAGGAACTGAGAACTCTAAAAATGTGGATTGTGT

QA 1 660 1 660
DS 



CO CL1171Contig2 834 4 7 U
GGGTGTTTTAGCTTCCCAGAACGAGAATCCGGTGGGAGAGATCAGAGGGAGAATCATCGC
CGATCTTGAGCTCTCTAAAAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAGAAG
CAAAGAGAACAAGCTCAGAATGCTAGCAGAGGCGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCT
GCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCCAAGCTCGTGTACG
ATATCATTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGAT
GATGGTTACTACCACAATGGTAGGTTTGTTTTCACGTTCCAAGTGTCTCCTGTGTATCCT
CATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAA
GGAAACGTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATTAACACT
GTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCAT
GACGCAGCTCAAGTTTTAAGGGACAACCCAAAGCTGTTTGAGACCAATGTCCGTAGAGCC
ATGACTGGTGGATATGTTGGTCAGACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAGCAAAAA
GATAAGAACTGGAACCCCCACCCTTTATCCGCCATTGTATCTCTGATTCTCAAAGGACAC
ACTTGCTTGTTTGTTTGCTTCTGTAATATCACATTCTGCTTAAGTTCGCGAGAGTTCGAC
AAAGGAATTGTATAACATTCTGTTCTATTTGATTAGATCTCGGTATCAATGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FU56TF U 1
AF RR4FZ55TF U 1
AF RR4FU56JQ C 2
AF RR4FZ55JQ C 85
BS 1 659 RR4FU56TF
BS 660 660 RR4FU56JQ
BS 661 673 RR4FU56TF
BS 674 678 RR4FZ55TF
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BS 680 715 RR4FZ55TF
BS 716 834 RR4FU56JQ

RD RR4FU56TF 673 0 0
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CGATCTTGAGCTCTCTAAAAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAGAAG
CAAAGAGAACAAGCTCAGAATGCTAGCAGAGGCGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCT
GCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCCAAGCTCGTGTACG
ATATCATTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGAT
GATGGTTACTACCACAATGGTAGGTTTGTTTTCACGTTCCAAGTGTCTCCTGTGTATCCT
CATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAA
GGAAACGTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATTAACACT
GTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCAT
GACGCAGCTCAAGTTTTAAGGGACAACCCAAAGCTGTTTGAGACCAATGTCCGTAGAGCC
ATGACTGGTGGATATGTTGGTCAGACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAGCAAAA*
GATAAGAACTGGA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FZ55TF 722 0 0
GGGTGT
TTTAGCTTCCCAGAACGAGAATCCGGTGGGAGAGATCAGAGGGAGAATCATCGCCGATCT
TGAGCTCTCTAAAAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGA
GAACAAGCTCAGAATGCTAGCAGAGGCGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTGGT
GAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCCAAGCTCGTGTACGATATCA
TTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGT
TACTACCACAATGGTAGGTTTGTTTTCACGTTCCAAGTGTCTCCTGTGTATCCTCATGAA
GCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAAC
GTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATTAACACTGTTATC
TATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGACGCA
GCTCAAGTTTTAAGGGACAACCCAAAGCTGTTTGAGACCAATGTCCGTAGAGCCATGACT
GGTGGATATGTTGGTCAGACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAGCAAAA*GATAAG
AACTGGAACCCC*ACCCTTTATCCGCCATTGTATCTCTGATTCTCAAAG
ACACACT

QA 7 715 7 715
DS 

RD RR4FU56JQ 833 0 0
GGGTG
TTTAGCTTCCCAGAACGAGAATCCGGTGGGAGAGATCAGAGGGAGA*TCATCGCCGATCT
TGAGCTCTCTAAAAA*CAGAAGCAATGATTGGGTTGTT*AAAGTAAAGGAGAAGCAAAGA
GAACAAGCTCAGAATGCTAGCAGAGGCGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTGGT
GAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCCAAGCTCGTGTACGATATCA
TTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGT
TACTACCACAATGGTAGGTTTGTTTTCACGTTCCAAGTGTCTCCTGTGTATCCTCATGAA
GCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAAC
GTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATTAACACTGTTATC
TATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGACGCA
GCTCAAGTTTTAAGGGACAACCCAAAGCTGTTTGAGACCAATGTCCGTAGAGCCATGACT
GGTGGATATGTTGGTCAGACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAGCAAAAAGATAAG
AACTGGAACCCCCACCCTTTATCCGCCATTGTATCTCTGATTCTCAAAGGACACACTTGC
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ATTGTATAACATTCTGTTCTATTTGATTAGATCTCGGTATCAATGTCT

QA 6 833 6 833
DS 

RD RR4FZ55JQ 750 0 0
GAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAATGCT
AGCAGAGGCGGTGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAA
GATATATCAGAGTTGAATCTTCCAAGCTCGTGTACGATATCATTTCCTAATGGCAAAGAT
GATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCACAATGGTAGG
TTTGTTTTCACGTTCCAAGTGTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGC
AAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACATCTTG
CGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATTAACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTT
TTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGACGCAGCTCAAGTTTTAAGGGAC
AACCCAAAGCTGTTTGAGACCAATGTCCGTAGAGCCATGACTGGTGGATATGTTGGTCAG
ACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAGCAAAAAGATAAGAACTGGAACCCCCACCCT
TTATCCGCCATTGTATCTCTGATTCTCAAAGGACACACTTGCTTGTTTGTTTGCTTCTGT
AATATCACATTCTGCTTAAGTTCGCGAGAGTTCGACAAAGGAATTGTATAACATTCTGTT
CTATTTGATTAGATCTCGGTATCAATGTCT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 6

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GGGTGCAAGAAAAGCAAGAAAGCTTTACAAACAGAGAAAGAATTCGAGAATGGGGAAAAT
GGAGGTAGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCGAGAGACCCATCTGGGTTACTCTCTCC
TTACACTTACACTCTCAGAGAGACAGGACCAGAGGATGTGCACATCAGAATCATATGCTG
TGGAATCTGCCACACCGATCTTCATCAAACCAAAAACGATCTTGGCATGTCAAACTACCC
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GTTCACCGCAGGGGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGCTGTGGAGGTTGTAG
CCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGT
TTACATCAATGGTCAACCTACACAAGGCGGTTTCGCTAGAGCCACCGTCGTTCACCAAAA
GTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCTGTTGAGCAGGCGGCACCACTACTGTGTGC
CGGTGTGACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTTCGGGCTGAAGCGACCAGGCCTAAGAGG
AGGCATACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGTGTGAAAATAGCCAAAGCAATGGG
TCACCATGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAAGAAGAGAGAAGAGGCTTTGAAAGATCT
TGGAGCCGATGATTACGTGATCGGATCCGACCAAACGAAGATGAACGAATTGGCGGATTC
AATGGATTATATAATCGATACGGTCCCTGTCCATCATGCACTTGAGCCTTACTTGTTTCT
GCTTAGGCTTGATGGGAAACTCATACTCATGGGAGTTATCAGCAATCCGTTGCAGTTTCT
CACTCCTATGGTTATGCTTGGGAGGAAAGTGATAACGGGGAGTTTCATTGGGAACATGAA
GGAAACAGAGGAGATGCTTGAGTTCTGTAAGGAGAAGGGTTTGAGTTCAATCATCGAAGT
TGTGAAGATGGATTATGTGAACACTGCGTTTGAGAGACTCGAGAAGAACGATGTGCGTTA
TAGGTTCGTGGTTGATGTCGAAGGAAGCAAACTTGAGGCTTGAGTTACTTGAAACTAAAA
CATCTTTTGTCCTTCTTTACAAAACCTGATGATAATATTTTATGTTTGTTTGTGAGCATA
AAACTGATTTGTCGCTGCTTTTCGTGTGAAAGCATATACTTATATGAAAACGTCTTTGCA
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 

AF RR4DX85TF U 1
AF RR4DX79TF U 1
AF RR4EA27TF U 1
AF RR4DV44TF U 5
AF RR4DX85JQ C 514
AF RR4DX79JQ C 525
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BS 156 156 RR4EA27TF
BS 157 369 RR4DX79TF
BS 370 370 RR4EA27TF
BS 371 396 RR4DX79TF
BS 397 397 RR4EA27TF
BS 398 685 RR4DX79TF
BS 686 706 RR4EA27TF
BS 707 707 RR4DX85JQ
BS 708 714 RR4EA27TF
BS 715 715 RR4DX85JQ
BS 716 733 RR4EA27TF
BS 734 1258 RR4DX85JQ
BS 1259 1262 RR4DX79JQ

RD RR4DX85TF 605 0 0
GGGTGC
AAGAAAAGCAAGAAAGCTTTACAAACAGAGAAAGAATTCGAGAATGGGGAAAATGGAGGT
AGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCGAGAGACCCATCTGGGTTACTCTCTCCTTACAC
TTACACTCTCAGAGAGACAGGACCAGAGGGTGTGCACATCAGAATCATATGCTGTGGAAT
CTGCCACACCGATCTTCATCAAACCAAAAACGATCTTGGCATGTCAAACTACCCCATGGT
TCCTGGGCACGAGGTTGTTGGGGAAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCAC
CGCAGGGGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGCTGTGGAGGTTGTAGCCCCTG
CGATAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAATAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACAT
CAATGGTCAACCTACACAAGGCGGTTTCGCTAGAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGT
GGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCTGTTGAGCAGGCGGCACCACTACTGTGTGCCGGTGT
GACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTTCGGGCTGAAGCGACCAGGCCTAAGAGGAGGCA

QA 7 605 7 605
DS 

RD RR4DX79TF 685 0 0
GGGTGCAAGAAAAGCAAGAAAGCTTTACAAACAGAGAAAGAATTCGAGAATGGGGAAAAT
GGAGGTAGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCGAGAGACCCATCTGGGTTACTCTCTCC
TTACACTTACACTCTCAGAGAGACAGGACCAGAGGGTGTGCACATCAGAATCATATGCTG
TGGAATCTGCCACACCGATCTTCATCAAACCAAAAACGATCTTGGCATGTCAAACTACCC
CATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTTGGGGAAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAA
GTTCACCGCAGGGGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGCTGTGGAGGTTGTAG
CCCCTGCGATAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAATAAGATCTGGAGCTACAACGATGT
TTACATCAATGGTCAACCTACACAAGGCGGTTTCGCTAGAGCCACCGTCGTTCACCAAAA
GTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCTGTTGAGCAGGCGGCACCACTACTGTGTGC
CGGTGTGACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTTCGGGCTGAAGCGACCAGGCCTAAGAGG
AGGCATACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGTGTGAAAATAGCCAAAGCAATGGG
TCACCATGTGACTGTCATAAGCTCA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4EA27TF 741 0 0
GGGTGC
AAGAAAAGCAAGAAAGCTTTACAAACAGAGAAAGAATTCGAGAATGGGGAAAATGGAGGT
AGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCGAGAGACCCATCTGGGTTACTCTCTCCTTACAC
TTACACTCTCAGAGAGACAGGACCAGAGGATGTGCACATCAGAATCATATGCTGTGGAAT
CTGCCACACCGATCTTCATCAAACCAAAAACGATCTTGGCATGTCAAACTACCCCATGGT
TCCTGGGCACGAGGTTGTTGGGGAAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCAC
CGCAGGG*ATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGCTGTGGAGGTTGTAGCCCCTG
CGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACAT
CAATGGTCAACCTACACAAGGCGGTTTCGCTAGAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGT
GGCGAAGATTCCAGAAGGAATGGCTGTTGAGCAGGCGGCACCACTACTGTGTGCCGGTGT
GACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTTCGGGCTGAAGCGACCAGGCCTAAGAGGAGGCAT
ACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGTGTGAAAATAGCCAAAGCAATGGGTCACCA
TGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAAGAAGAGAGAAGAG*CTTTGAA*GATCTTGGAGC
CGATGAT
ACGTGATC

QA 7 733 7 733
DS 

RD RR4DV44TF 718 0 0
GG
AAGAAAAGCAAGAAAGCTTTACAAACAGAGAAAGAATTCGAGAATGGGGAAAATGGAGGT
AGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCGAGAGACCCATCTGGGTTACTCTCTCCTTGCAC
TTACACTCTCAGAGAGACAGGACCAGAGGATGTGCACATCAGAATCATATGCTGTGGAAT
CTGCCACACCGATCTTCATCAAACCAAAAACGATCTTGGCATGTCAAACTACCCCATGGT
TCCTGGGCACGAGGTTGTTGGGGAAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCAC
CGCAGCGGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGCTGTGGAGGTTGTAGCCCCTG
CGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACAT
CAATGGTCAACCTACACAAGGCGGTTTCGCTAGAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGT
GGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCTGTTGAGCAGGCGGCACCACTACTGTGTGCCGGTGT
GACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTTCGGGCTGAAGCGACCAGGCCTAAGAGGAGGCAT
ACTAGG*TTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGTGTGAAGATAGCCAAAGCAATGGGCCACCA
TGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAAGAAGAGAGATAGG*CTTTGAACGATCTTG

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4DX85JQ 749 0 0
TGAGCAGGCGGCACCACTACTGTGTGCCGGTGTGACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTT
CGGGCTGAAGCGACCAGGCCTAAGAGGAGGCATACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACAT
GGGTGTGAAAATAGCCAAAGCAATGGGTCACCATGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAA
GAAGAGAGAAGAGGCTTTGAAAGATCTTGGAGCCGATGATTACGTGATCGGATCCGACCA
AACGAAGATGAACGAATTGGCGGATTCAATGGATTATATAATCGATACGGTCCCTGTCCA
TCATGCACTTGAGCCTTACTTGTTTCTGCTTAGGCTTGATGGGAAACTCATACTCATGGG
AGTTATCAGCAATCCGTTGCAGTTTCTCACTCCTATGGTTATGCTTGGGAGGAAAGTGAT
AACGGGGAGTTTCATTGGGAACATGAAGGAAACAGAGGAGATGCTTGAGTTCTGTAAGGA
GAAGGGTTTGAGTTCAATCATCGAAGTTGTGAAGATGGATTATGTGAACACTGCGTTTGA
GAGACTCGAGAAGAACGATGTGCGTTATAGGTTCGTGGTTGATGTCGAAGGAAGCAAACT
TGAGGCTTGAGTTACTTGAAACTAAAACATCTTTTGTCCTTCTTTACAAAACCTGATGAT
AATATTTTATGTTTGTTTGTGAGCATAAAACTGATTTGTCGCTGCTTTTCGTGTGAAAGC
ATATACTTATATGAAAACGTCTTTG
CATG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4DX79JQ 738 0 0
CACCACTACTGTGTGCCGGTGTGACTGTGTACAGTCCACTGGCTCACTTCGGGCTGAAGC
GACCAGGCCTAAGAGGAGGCATACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGTGTGAAAA
TAGCCAAAGCAATGGGTCACCATGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAAGAAGAGAGAAG
AGGCTTTGAAAGATCTTGGAGCCGATGATTACGTGATCGGATCCGACCAAACGAAGATGA
ACGAATTGGCGGATTCAATGGATTATATAATCGATACGGTCCCTGTCCATCATGCACTTG
AGCCTTACTTGTTTCTGCTTAGGCTTGATGGGAAACTCATACTCATGGGAGTTATCAGCA
ATCCGTTGCAGTTTCTCACTCCTATGGTTATGCTTGGGAGGAAAGTGATAACGGGGAGTT
TCATTGGGAACATGAAGGAAACAGAGGAGATGCTTGAGTTCTGTAAGGAGAAGGGTTTGA
GTTCAATCATCGAAGTTGTGAAGATGGATTATGTGAACACTGCGTTTGAGAGACTCGAGA
AGAACGATGTGCGTTATAGGTTCGTGGTTGATGTCGAAGGAAGCAAACTTGAGGCTTGAG
TTACTTGAAACTAAAACATCTTTTGTCCTTCTTTACAAAACCTGATGATAATATTTTATG
TTTGTTTGTGAGCATAAAACTGATTTGTCGCTGCTTTTCGTGTGAAAGCATATACTTATA
TGAAAACGTCTTTGCATG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 7

CO CL1173Contig1 839 7 2 U
GGAAATACAGAATCCCCCAAAAAGCCACCTTTAGGGTTTTCGTCTCCAAACCAATTCTTG
ATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCA**AATCCAATCCCCTGATTTCCTTTTTCTTCTTCTC
CAGTTTTCGATCTCAATCTCTTTCTCGAGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAA
GGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATACTTGCTGGCACTTC
CGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATACGAAGAAGATGTCGAAGA
GGAGTCTGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAGG
ACATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACTTTAAAAGC
TAGGGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGA
GAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAATC
AAGAAAGGATTTGGATCGTCTGGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAA
GCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCTCGCAAATGAGAGAA
GTTTTCTCCTTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTTACTTTGTTCCTTTT
TCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACCGTGGGGATTCCATC
TTAATACATTTGAAGTTAATAATCTCGGTCCTGCTTTGTTATTAAAGTCCTTTAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT78TF U 204
AF RR4AL49TF U 1
AF RR4DN32TF U 52
AF RR4AL49JQ C 43
AF RR4DN32JQ C 107
AF RR4GT78JQ C 107
AF RR4EC95TF U 657
BS 1 797 RR4AL49TF
BS 798 839 RR4EC95TF

RD RR4GT78TF 516 0 0
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AGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCTCTGATTGAAGTTG
ATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACTTTAAAAGCTAGGGACCTTGATGCTAGTAAAA
CCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGAT
ACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAATCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTGG
CTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTACCAAGAAGCGAGGAGAGGAAAAAGCAGCAA
GAGACGCCAAGAAAGTAGATGCTCGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCTTAAAAA*TAACGA
AAGAAGA*TACTCATCGAGTTTTACTTTGTCCCTTT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4AL49TF 799 0 0
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ATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCA**AATCCAATCCCCTGATTTCCTTTTTCTTCTTCTC
CAGTTTTCGATCTCAATCTCTTTCTCGAGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAA
GGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATACTTGCTGGCACTTC
CGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATACGAAGAAGATGTCGAAGA
GGAGTCTGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAGG
ACATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACTTTAAAAGC
TAGGGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGA
GAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAATC
AAGAAAGGATTTGGATCGTCTGGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAA
GCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCTCGCAAATGAGAGAA
GTTTTCTCCTTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTTACTTTGTTCCTTTT
TCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACCGTGGGGATTCCATC
TTAATACATTTGAAGTT
AA

QA 1 797 1 797
DS 

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G
AATTCTTGATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCACGAATCCAATCCCCTGATTTCCTTTTTC
TTCTTCTCCAGTTTTCGATCTCAATCTCTTTCTCGAGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGC
AAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATACTTGCT
GGCACTTCCGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATACGAAGAAGAT
GTCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAG
AAGAAAGGACATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACT
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GAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACC
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GCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCTCGCAAA
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TTCCTTTTTCGATTGGTAA*CAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACCGTGGGG
AT*CCATCTTAATACATTTGAAGTT

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR4AL49JQ 758 0 0
TCTCCAAACCAATTCTTGATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCA**AATCCAATCCCCTGAT
TTCCTTTTTCTTCTTCTCCAGTTTTCGATCTCAATCTCTTTCTCGAGAGAAACAAACGAT
GGGAAGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGA
TATACTTGCTGGCACTTCCGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATA
CGAAGAAGATGTCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATT
TGATGTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCTTTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAA
ACCAAAGACTTTAAAAGCTAGGGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCG
TGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCA
AGGCAAAACCGAACAATCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTGGCTCTGATTCGCCAACAGAG
AGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCCAAGAAAGTAGA
TGCTCGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCTTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAG
TTTTACTTTGTTCCTTTTTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAG
TACCGTGGGGATTCCATCTTAATACATTTGAAGTT
AAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4DN32JQ 691 0 0
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AGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATA
CTTGCTGGCACTTCCGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATACGAA
GAAGATGTCGAAGAGGAGTTTGAAGAGGAGTTTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATTTGAT
GTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCTTTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCA
AAGACTTTAAAAGCTAGGGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAA
AGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGC
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GAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCT
CGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCTTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTT
ACTTTGTTCCTTTTTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACC
GTGGGGATTCCATCTTAATACATTTGAAGTT

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DS 

RD RR4GT78JQ 691 0 0
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AGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATA
CTTGCTGGCACTTCCGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATACGAA
GAAGATGTCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGATTTTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCTGAT
GTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCTTTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCA
AAGACTTTAAAAGCTAGGGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAA
AGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGC
AAAACCGAACAATCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTGGCTTTGATTCGCCAACAGAGAGAA
GAAGCTACCAAGAAGCGAGGAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCT
CGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCTTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTT
ACTTTGTTCCTTTTTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACC
GTGGGGATTCCATCTTAATACATTTGAAGTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4EC95TF 183 0 0
G
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TTTTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACCGTGGGGATTCC
ATCTTAATACATTTGAAGTTAATAATCTCGGTCCTGCTTTGTTATTAAAGTCCTTTAGTT
TG

QA 2 183 2 183
DS 



AS 1 7

CO CL1174Contig1 1396 7 15 U
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TTAGTTAGCTGCTAGCATAATAACAATGTGACAAATAACTAATAACATACAGTTATGTTA
CAACAAAAAACAAATACAGATTTGAATTTTAGACGACGGCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTA
CAGCTTGTTTTGTAGGAAGTGCAGGTATTGCACCTCTCTCCTTTACGGTCAAGGCACCAC
ACGCATTCGCAAACATTAGAGCCTCTCTCAGTCTTTCTTCGTCCTGAAGCAAAGAGAGAT
CACATGCTAGTTGAGATAGTATTCCGGCAACAAACGCATCCCCAGCACCTGTTGTGTCCA
CTACTTCCACCTTCAATCCATGTACTCTCCCGCTAAAATCCTTTGTGTAGTAGCGACAGC
CTTCAGGGCCTTCGGTGACAAGGAGCAGTTTCAGCTTAGGATGGAACAGCTTCCTGACGA
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TTATGATATCAGCAGTATCCCAAACGCTGAGGATCTCATCCCTAGCGCTGTCTGCAGAAG
GCCACAGGGGGAGCCTAAGGTTAGGATCGTACGAAAGAATCACGCCAGCGTCCTTAGCTG
CCTTCGACGCAGCTATGTGAGCTGACTTGCACGGTTCCGTTATCAGACTTATCGAACCGT
AATGGAATATCTTCGCCTTTTTAATCAAATCCAGATCAAGCTCAGACTCTTCTAACAGCA
TGTCGGCGCTTGGGTTTCGATAGAACATGAACTCGCGTTCGCCTTCGCTAGTGAGAGTGA
CGAAAGCTAAAGCAGTTCTGGCTCCAGGGTCAAAACGCATGCCTTCGTTGTTCACGTTGT
TATCCTTGAGAATGTTTGCAAGCATATAACCAAACTCATCTTCACCAACCTTGCCAATGA
AAGCTGAAGAGCCACCGAGACGAGCGATACCAACGGCGACATTGGCAGGGGCACCACCTG
GAGCCTTTTTGAAAGCTGGTGCTTGGGCCAATGAAAGCCCACTAGTGGTTGGTACGAAGT
CGATCAGCATTTCTCCGAAACAGACCACTGAGGGAGACTCTTGCGTTGATGAGCCATCAC
TTGAAAAGGCTCTTCCTTTGAGATTAGATCGTGAAAGAGAGAGGAGGGGAGGAGGAGGAG
AAGAGAGTCCCGAAGAAGAAGATTTGATGGAGAGACGACGCTTCGAAGTGAATGCGTGAG
GAGGAGGAGTTGATCGGAAAGTAGGAGCGGAGAAGGAGAACGTAGTAGTGGTGGCTTGGA
GAGCCATTGGTCGGAGGAGATTCGAAAGATTGCGTTTTTGAGACGCGTTCGCGTTTAAAG
AGGAAAGGAAGACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EI58JQ U 37
AF RR4F945JQ U 37
AF RR4F562JQ U 1
AF RR4EL48JQ U 37
AF RR4F562TF C 619
AF RR4EL48TF C 667
AF RR4F945TF C 743
BS 1 80 RR4F562JQ
BS 81 81 RR4EI58JQ
BS 82 192 RR4F562JQ
BS 193 193 RR4EI58JQ
BS 194 240 RR4F562JQ
BS 241 241 RR4EI58JQ
BS 242 520 RR4F562JQ
BS 521 521 RR4EI58JQ
BS 522 763 RR4F562JQ
BS 764 1297 RR4F562TF
BS 1298 1298 RR4EL48TF
BS 1299 1323 RR4F562TF
BS 1324 1324 RR4EL48TF
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BS 1352 1396 RR4EL48TF

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GG
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GCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTACAGCTTGTTTTGTAGGAGGTGCAGGTATTGCACCTCTC
TCCTTTACGGTCAAGGCACCACACGCATTCGCAAACATTAGAGCCTCTCTCAGTCTTTCT
TCGTCCTGAAGCAAAGAGAGATCACATGCTAGTTGAGATAGTATTCCGGCAACAAACGCA
TCCCCAGCACCTGTTGTGTCCACTACTTCCACCTTCAATCCATGTACTCTCCCGCTAAAA
TCCTTTGTGTAGTAGCGACAGCCTTCAGGGCCTTCGGTGACAAGGAGCAGTTTCAGCTTA
GGATGGAACAGCTTCCTGACGACAGAATCATCATAAGGATCTTCTCCTTTCGTCAGAAAC
TCGACCTCCTCTTCGCTAATCTTTATGATATCAGCAGTATCCCAAACGCTGAGGATCTCA
TCCCTAGCGCTGTCTGCAGAAGGCCACAGGGGGAGCCTAAGGTTAGGATCGTACGAAAGA
ATCACGCCAGCGTCCTTAGCTGCCTTCGCCGCAGCTATGTGAGCTGACTTGCACGGTT

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4F945JQ 679 0 0
GG
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CTAATAACATACAGTTATGTTACAACAAAAAACAAATACAGATTTGAATTTTAGACGACG
GCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTACAGCTTGTTTTGTAGGAAGTGCAGGTATTGCACCTCTC
TCCTTTACGGTCAAGGCACCACACGCATTCGCAAACATTAAAGCCTCTCTCAGTCTTTCT
TCGTCCTGAAGCAAAGAGAGATCACATGCTAGTTGAGATAGTATTCCGGCAACAAACGCA
TCCCCAGCACCTGTTGTGTCCACTACTTCCACCTTCAATCCATGTACTCTCCCGCTAAAA
TCCTTTGTGTAGTAGCGACAGCCTTCAGGGCCTTCGGTGACAAGGAGCAGTTTCAGCTTA
GGATGGAACAGCTTCCTGACGACAGAATCATCATAAGGATCTTCTCCTTTCGTCAGAAAC
TCGATCTCCTCTTCGCTAATCTTTATGATATCAGCAGTATCCCAAACGCTGAGGATCTCA
TCCCTAGCGCTGTCTGCAGAAGGCCACAGGGGGAGCCTAAGGTTAGGATCGTACGAAAGA
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GTTATCAGACTTATCGA

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DS 

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TTAGTTAGCTGCTAGCATAACAACAATGTGACAAATAACTAATAACATACAGTTATGTTA
CAACAAAAAACAAATACAGATTTGAATTTTAGACGACGGCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTA
CAGCTTGTTTTGCAGGAAGTGCAGGTATTGCACCTCTCTCCTTTACGGTCAAGGCACCAC
GCGCATTCGCAAACATTAGAGCCTCTCTCAGTCTTTCTTCGTCCTGAAGCAAAGAGAGAT
CACATGCTAGTTGAGATAGTATTCCGGCAACAAACGCATCCCCAGCACCTGTTGTGTCCA
CTACTTCCACCTTCAATCCATGTACTCTCCCGCTAAAATCCTTTGTGTAGTAGCGACAGC
CTTCAGGGCCTTCGGTGACAAGGAGCAGTTTCAGCTTAGGATGGAACAGCTTCCTGACGA
CAGAATCATCATAAGGATCTTCTCCTTTCGTCAGAAACTCAATCTCCTCTTCGCTAATCT
TTATGATATCAGCAGTATCCCAAACGCTGAGGATCTCATCCCTAGCGCTGTCTGCAGAAG
GCCACAGGGGGAGCCTAAGGTTAGGATCGTACGAAAGAATCACGCCAGCGTCCTTAGCTG
CCTTCGACGCAGCTATGTGAGCTGACTTGCACGGTTCCGTTATCAGACTTATCGAACCGT
AATGGAATATCTTCGCCTTTTTAATCAAATCCAGATCAAGCTC

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DS 

RD RR4EL48JQ 702 0 0
GG
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CTAATAACATACAGTTATGTTACAACAAAAAACAAATACAGATTTGAATTTTAGACGACG
GCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTACAGCTTGTTTTGTAGGAAGTGCAGGTATTGCACCTCTC
TCCTTTACGGTCAAGGCACCACACGCATTCGCAAACATTAGAGCCTCTCTCAGTCTTTCT
TCGTCCTGAAGCAAAGAGAGATCACATGCTAGTTGAGATAGTATTCCGGCAACAAACGCA
TCCCCAGCACCTGTTGTGTCCACTACTTCCACCTTCAATCCATGTACTCTCCCGCTAAAA
TCCTTTGTGTAGTAGCGACAGCCTTCAGGGCCTTCGGTGACAAGGAGCAGTTTCAGCTTA
GGATGGAACAGCTTCCTGACGACAGAATCATCATAAGGATCTTCTCCTTTCGTCAGAAAC
TCGATCTCCTCTTCGCTAATCTTTATGATATCAGCAGTATCCCAAACGCTGAGGATCTCA
TCCCTAGCGCTGTCTGCAGAAGGCCACAGGGGGAGCCTAAGGTTAGGATCGTACGAAAGA
ATCACGCCAGCGTCCTTAGCTGCCTTCGCCGCAGCTATGTGAGCTGACTTGCACGGTTCC
GTTATCAGACTTATCGAACCGTAATGGAATATCTTCGCCT

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DS 

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TTTTAATCAAATCCAGATCAAGCTCAGACTCTTCTAACAGCATGTCGGCGCTTGGGTTTC
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GTGCTTGGGCCAATGAAAGCCCACTAGTGGTTGGTACGAAGTCGATCAGCATTTCTCCGA
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TGAGATTAGATCGTGAAAGAGAGAGGAGGGGAGGAGGAGGAGAAGAGAGTCCCGAAGAAG
AAGATTTGATGGAGAGACGACGCTTCGAAGTGAATGCGTGAGGAGGAGGAGTTGATCGGA
AAGTAGGAGCGGAGAAGGA*AACGTAGTAGTGGTGGCTTGGAGAGACATTGGTCGGAGGA
GATTCGAAAGATT
CC

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DS 

RD RR4EL48TF 730 0 0
C
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GCTTGGGTTTCGATAGAACATGAACTCGCGTTCGCCTTCGCTAGTGAGAGTGACGAAAGC
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GAGAATGTTTGCAAGCATATAACCAAACTCATCTTCACCAACCTTGCCAATGAAAGCTGA
AGAGCCACCGAGACGAGCGATACCAACGGCGACATTGGCAGGGGCACCACCTGGAGCCTT
TTTGAAAGCTGGTGCTTGGGCCAATGAAAGCCCACTAGTGGTTGGTACGAAGTCGATCAG
CATTTCTCCGAAACAGACCACTGAGGGAGACTCTTGCGTTGATGAGCCATCACTTGAAAA
GGCTCTTCCTTTGAGATTAGATCGTGAAAGAGAGAGGAGGGGAGGAGGAGGAGAAGAGAG
TCCCGAAGAAGAAGATTTGATGGAGAGACGACGCTTCGAAGTGAATGCGTGAGGAGGAGG
AGTTGATCGGAAAGTAGGAGCGGAGAAGGAGAACGTAGTAGTGGTGGCTTGGAGAGCCAT
TGGTCGGAGGAGATTCGAAAGATTGCGTTTTTGAGACGCGTTCGCGTTTAAAGAGGAAAG
GAAGACTCC

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DS 

RD RR4F945TF 654 0 0
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GAACATGAACTCGCGTTCGCCTTCGCTAGTGAGAGTGACGAAAGCTAAAGCAGTTCTGGC
TCCAGGGTCAAAACGCATGCCTTCGTTGTTCACGTTGTTATCCTTGAGAATGTTTGCAAG
CATATAACCAAACTCATCTTCACCAACCTTGCCAATGAAAGCTGAAGAGCCACCGAGACG
AGCGATACCAACGGCGACATTGGCAGGGGCACCACCTGGAGCCTTTTTGAAAGCTGGTGC
TTGGGCCAATGAAAGCCCACTAGTGGTTGGTACGAAGTCGATCAGCATTTCTCCGAAACA
GACCACTGAGGGAGACTCTTGCGTTGATGAGCCATCACTTGAAAAGGCTCTTCCTTTGAG
ATTAGATCGTGAAAGAGAGAGGAGGGGAGGAGGAGGAGAAGAGAGTCCCGAAGAAGAAGA
TTTGATGGAGAGACGACGCTTCGAAGTGAATGCGTGAGGAGGAGGAGTTGATCGGAAAGT
AGGAGCGGAGAAGGAGAACGTAGTAGTGGTGGCTTGGAGAGCCATTGGTCGGAGGAGATT
CGAAAGATTGCGTTTTTGAGACGCGTTCGCGTTTAAAGAGGAAAGGAAGACTCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 7

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GGCTTGTAACTTGAAATCATTATCAGATCCAAAAGCGTTCTGTTACAGATATTACCGTAG
GAATCAAAGAGACCCTCACACTGCACTCCAGTTCCCAGTAATATCTTTTGATAATAGACT
TTTTTACAAGTTGTTTGTTCTTGAAGAATTGGTCTAGATCTATTATGGAACCAGGAAACT
CAAAGATCAACTAATGTAGGTAAATAACCAAGGCTTACACTGAAGATACATCCGAATCAC
CACCACTCTGGTCTCAGAGAAGCCAATTCTCTCCCATCAAATTTAAGATTTCTCCATCGT
CACATGCATTACAAAATAGCTAGAAAGAGAAGCAACCAGAGCACACATGCAAATCTTTTG
ATAAGACATTCGATTACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTGCTCGTGTAAAAGC
TTTGCTGAAGATTTGGCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTATATCAGCCTTGCAG
ATGTTGTCACGTCCATTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAACAGCTGAACAGTG
TGTCTTAGAGATGTTCTTTGCCCAGTGTCCCCAAGTAGGAACAAGCATTCTTCATCCACC
GTTAGCTCTTCTACTTGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATTTCAGAGGGATTATAG
ATTTGAGTCCTGATAATGACCAACCGATCCAACAAGTCAATAGGGACTCCATGTGGACTA
GGCATATCAGTCCCTCTAACGTTGCAGACTCCTCTATTTGTTGCAAATATCACTATTGGA
GATAAAGAGCTCTCCAGCGCACGGTTTAAGTAAGAAAAGCACTCCATATCAAGCATATGA
ACCTCATCGATAAATAGAACTCCGGGAACGAGCTCTGCAACACCTTCATCTATATAACGG
TTAACAACCTTGTTAATTCCTTGGCGCAGCTTATCAGTGATCTCAGTCTTCCGGGGTTTC
ATCATTTGGCCCATCAAAGAAAGTATATCCTGCCCACCTTGAGGCCGAGCATTTGCTGCA
TCCAGATCTTGAAGCGTCACATCCTGCACTATCTCTTTCTTTTTGTGAACCTCTCCCTTG
GGAAGTGGAACATATTCTTCTGCTTCTAGATCGAATTCAGTGGCAAAAGCATCGCTTCTA
CCCACCCGCTTGACAGCTCCACTGTTTGCTTCAATGTATATAACATCCCCCACAGCTACT
TTTTCCTTAATCAAGGCATCGTAGATAGTGGGATCCAACTTAAGTTGTTTGGTTCCTTTG
ACTGTCTTGAGTCCAATGATAACATGACTGATGCTTTTGCCATAACCTCCGGTAAGACTT
TCAGTTTCTTCTGGTGACAGCTCCGTAACCTCTCCTTCGTAGACGTCTTTGGTTTCCTTG
ATACGTAGGCCAATGGCACGTCTAAAATTCTCCATGGGAACCTCAGTTTTCTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU74JQ U 1
AF RR4F619JQ U 1
AF RR4GI96JQ U 168
AF RR4F619TF C 168
AF RR4EU74TF C 256
AF RR4EZ58JQ U 250
AF RR4GI96TF C 992
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BS 654 716 RR4GI96JQ
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TTTTTACAAGTTGTTTGTTCTTGAAGAATTGGTCTAGATCTATTATGGAACCAGGAAACT
CAAAGATCAACTAATGTAGGTAAATAACCAAGGCTTACACTGAAGATACATCCGAATCAC
CACCACTCTGGTCTCAGAGAAGCCAATTCTCTCCCATCAAATTTAAGATTTCTCCATCGT
CACATGCATTACAAAATAGCTAGAAAGAGAAGCAACCAGAGCACACATGCAAATCTTTTG
ATAAGACATTCGATTACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTGCTCGTGTAAAAGC
TTTGCTGAAGATTTGGCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTATATCAGCCTTGCAG
ATGTTGTCACGTCCATTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAACAGCTGAACAGTG
TGTCTTAGAGATGTTCTTTGCCCAGTGTCCCCAAGTAGGAACAAGCATTCTTCATCCACC
GTTAGCTCTTCTACTTGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATTTCAGAGGG

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DS 

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GAATCAAAGAGACCCTCACACTGCACTCCAGTTCCCAGTAATATCTTTTGATAATAGACT
TTTTTACAAGTTGTTTGTTCTTGAAGAATTGGTCTAGATCTATTATGGAACCAGGAAACT
CAAAGATCAACTAATGTAGGTAAATAACCAAGGCTTACACTGAAGATACATCCGAATCAC
CACCACTCTGGTCTCAGAAAAGCCAATTCTCTCCCATCAAATTTAAGATTTCTCCATCGT
CACATGCATTACAAAATAGCTAGAAAGAGAAGCAACCAGAGCACACATGCAAATCTTTTG
ATAAGACATTCGATTACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTGCTCGTGTAAAAGC
TTTGCTGAAGATTTGGCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTATATCAGCCTTGCAG
ATGTTGTCACGTCCATTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAACAGCTGAACAGTG
TGTCTTAGAGATGTTCTTTGCCCAGTGTCCCCAAGTAGGAACAAGCATTCTTCATCCACC
GTTAGCTCTTCTACTTGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATT

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DS 

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ATTTCTCCATCGTCACATGCATTACAAAATAGCTAGAAAGAGAAGCAACCAAAGCACACA
TGCAAATCTTTTGATAAGACATTCGATTACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTG
CTCGTGTAAAAGCTTTGCTGAAGATTTGGCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTAT
ATCAGCCTTGCAGATGTTGTCACGTCCATTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAA
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TTCTTCATCCACAGTTAGCTCTTCTACTTGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATTTC
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TCCATGTGG

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DS 

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ATTTCTCCATCGTCACATGCATTACAAAATAGCTAGAAAGAGAAGCAACCAGAGCACACA
TGCAAATCTTTTGATAAGACATTCGATTACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTG
CTCGTGTAAAAGCTTTGCTGAAGATTTGGCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTAT
ATCAGCCTTGCAGATGTTGTCACGTCCATTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAA
CAGCTGAACAGTGTGTCTTAGAGATGTTCTTTGCCCAGTGTCCCCAAGTAGGAACAAGCA
TTCTTCATCCACCGTTAGCTCTTCTACTTGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATTTC
AGAGGGATTATAGATTTGAGTCCTGATAATGACCAACCGATCCAACAAGTCAATAGGGAC
TCCATGTGGACTAGGCATATCAGTCCCTCTAACGTTGCAGACTCCTCTATTTGTTGCAAA
TATCACTATTGGAGATAAAGAGCTCTCCAGCGCACGGTTTAAGTAAGAAAAGCACTCCAT
ATCAAGCATATGAACCTCATCGATAAATAGAACTCCGGGAACGAGCTCTGCAACACCTTC
ATCT
C

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4EU74TF 637 0 0
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ATAGCTAGAAAGAGAAGCAACCAGAGCACACATGCAAATCTTTTGATAAGACATTCGATT
ACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTGCTCGTGTAAAAGCTTTGCTGAAGATTTG
GCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTATATCAGCCTTGCAGATGTTGTCACGTCCA
TTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAACAGCTGAACAGTGTGTCTTAGAGATGTT
CTTTGCCCAGTGTCCCCAAGTAGGAACAAGCATTCTTCATCCACCGTTAGCTCTTCTACT
TGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATTTCAGAGGGATTATAGATTTGAGTCCTGATA
ATGACCAACCGATCCAACAAGTCAATAGGGACTCCATGTGGACTAGGCATATCAGTCCCT
CTAACGTTGCAGACTCCTCTATTTGTTGCAAATATCACTATTGGAGATAAAGAGCTCTCC
AGCGCACGGTTTAAGTAAGAAAAGCACTCCATATCAAGCATATGAACCTCATCGATAAAT
AGAACTCCGGGAACGAGCTCTGCAACACCTTCATCT
C

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4EZ58JQ 809 0 0
GGTCTCAGAGAAGCCAATTCTCTCCCATCAAATTTAAGATTTCTCCATCGTCACATGCAT
TACAAAATAGCTGGAAAGAGAAGCAACCAGAGCACACATGCAAATCTTTTGATAAGACAT
TCGATTACGGTTTCTCATGAGATGTATTTTTCTTGTTGCTCGTGTAAAAGCTTTACTGAA
GATTTGGCGTCAAGGTAGAGTGATGTTACTTCCTCTATATCAGCCTTGCAGATGTTGTCA
CGTCCATTCATTTTCGCCACGATGCTGGCAGGAGACAACAGCTGAACAGCGTGTCTTAAA
GATGTTCTTTGCCCAATGTCCCCAAGTAGGACCAAGCATTCTTCATCCACCGTTAGCTCT
TCTACTTGCGCACGAATGGCTATAATCTGTATCATTTCAGAGGGATTATAGATTTGAGTC
CTGATAATGACCAACCGATCCAACAAGTCAATAGGGACTCCATGTGGACTAAGCATATCA
GTCCCTCTAACGTTGCAGACTCCTCTATTTGTTGCAAATATCACTATTGGAGATAAAGAG
CTCTCCAGCGCACGGTTTAAGTAAGAAAAGCACTCCATATCAAGCATATGAACCTCATCG
ATAAATAGAACTCCGGGAACGAGCTCTGCAACACCTTCATCTATATAACGGTTAACAACC
TTGTTAATTCCTTGGCGCAGCTTATCAGTGATCTCAGTCTTCCGGGGTTTCATCATTTGG
CCCATCAAAGAAAGTATATCCTGCCCACCTTGAGGCCGAGCATTTGCTGCATCCAGATCT
TGAAGCGTCACATCCTGCACTATCT
TTTC

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DS 

RD RR4GI96TF 444 0 0
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TCTCTTTCTTTTTGTGAACCTCTCCCTTGGGAAGTGGAACATATTCTTCTGCTTCTAGAT
CGAATTCAGTGGCAAAAGCATCGCTTCTACCCACCCGCTTGACAGCTCCACTGTTTGCTT
CAATGTATATAACATCCCCCACAGCTACTTTTTCCTTAATCAAGGCATCGTAGATAGTGG
GATCCAACTTAAGTTGTTTGGTTCCTTTGACTGTCTTGAGTCCAATGATAACATGACTGA
TGCTTTTGCCATAACCTCCGGTAAGACTTTCAGTTTCTTCTGGTGACAGCTCCGTAACCT
CTCCTTCGTAGACGTCTTTGGTTTCCTTGATACGTAGGCCAATGGCACGTCTAAAATTCT
CCATGGGAACCTCAGTTTTCTTAC

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DS 



AS 1 5

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GCACCACCAATTGGTTTAGCATTATTGACAATATCATCTGTATATCTCAACATTATTGTA
TCTTTTTCCCATATCAAAAGTTTCAAGTCTCCCAAACACTATATGCTGAAGAATGATAAC
AAAACACACACAAAGGATTTGCTACACTGCGCTCTAAACCGGACCAAAGATCATTCGGTC
TTTTTATCGAGCTTCTTCTTTGTCTCCCCGCTGTAAGGACCAACATGGTAAGCATGCTTC
TGAACCGCAGCAAAGATAACCATCTCAAAACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCCTGG
ATTTGTTCCACCTCCAACCAGAAATGGTGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGTATG
TCTAGTGCTATTCCATGCCAGAAGCAAAAGAAGACGATCCCTTTGATGCAGAGGAACTTT
GCGAGTGGGTTATGAGGAGCAAGCTCCTTGGCAAACACATGGTAGAAGATCACAAGAGAA
TACAAGGCCAGGGAAACCGAGATATTGAGAACGATAGTGAATGTCCAGCTCAGCCAAGAC
GGATAAAACCCGATGATTTGTAAAGCAATCATCAAGATAGAGCACACTGGTATGATCACC
ACAAACTGCCATGTCCAGTACTTCAAGAGCCTCAGAGTGCGATGATCCAAACGGACAACA
TGAGGCTGGAAAAGAGTCATTGGAAAAGAATGGTGAATCTCCCTTCCTTTGATTCCATCA
GGGACAATGTTTTTGCTGATTGATATGTTCAAGTAACTATACATCAACGCCAAGAACTTA
GCAATGACGAGTGCTTCGTAGCATTCTTTGATGGACTCTAGAAACAAGAAGAAGGTTTCA
CTTCCTTTGACATCTAACAAACCAACAAAGGAAACAACGGCGTAGATAGGAGCCATGAGA
ACAATGACGAGTATAGCCTTCTGTTCCTTGGGGTCCTTCCAGTGAAAGAGATGCTGAGAC
ACAAGCTGTATCGTCAGATGAAGTGTGATCAAGACAGAAAACGCAGAGCAGTAAAAAGTG
ATCTGCGGTGGCTTCATCTTCGTTAGGTCCATCATTGCTACAAAAAAAAAACCAAACCGG
AGAAGAAGAGGGATGAGAGTGTGGGAGACGCGAGTAGAATCAGATCTCTCTGTCTTCTTC
TTCTTTAGATCATGAAGAATTGAAGACCGTCACCATTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D539JQ U 1
AF RR4FH79JQ U 58
AF RR4FH79TF C 74
AF RR4D719JQ U 735
AF RR4D719TF C 735
BS 1 140 RR4D539JQ
BS 141 141 RR4FH79JQ
BS 142 251 RR4D539JQ
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BS 253 266 RR4D539JQ
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BS 269 269 RR4FH79JQ
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BS 284 284 RR4FH79JQ
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TCTTTTTCCCATATCAAAAGTTTCAAGTCTCCCAAACACTATATGCTGAAGAATGATAAC
AAAACACACACAAAGGATTTACTACACTGCGCTCTAAACCGGACCAAAGATCATTCGGTC
TTTTTATCGAGCTTCTTCTTTGTCTCCCCGCTGTAAGGACCAACATGGTAAGCATGCTTC
TGAACCGCAGCGAAGATAACCATCTCCACACACACCAACACATCCTGAATAGCTTCCTGG
ATTTGTTCCACCTCCAACCAGAAATGATGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGTATG
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QA 1 469 1 469
DS 

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AACAAAACACACACAAAGGATTTGCTACACTGCGCTCTAAACCGGACCAAAGATCATTCG
GTCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTTGTCTCCCCGCTGTAAGGACCAACATGGTAAGCATGC
TTCTGAACCGCAGCAAAGATAACCATCTCAAAACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCC
TGGATTTGTTCCACCTCCAACCAGAAATGGTGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGT
ATGTCTAGTGCTATTCCATGCCAGAAGCAAAAGAAGACGATCCCTTTGATGCAGAGGAAC
TTTGCGAGTGGGTTATGAGGAGCAAGCTCCTTGGCAAACACATGGTAGAAGATCACAAGA
GAATACAAGGCCAGGGAAACCGAGATATTGAGAACGATAGTGAATGTCCAGCTCAGCCAA
GACGGATAAAACCCGATGATTTGTAAAGCAATCATCAAGATAGAGCACACTGGTATGATC
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ACATGAGGCTGGAAAAGAGTCATTGGAAAAGAATGGTGAATCTCCCTTCCTTTGAT

QA 1 656 1 656
DS 

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TCAAAAGT
TTCAAGTCTCCCAAACACTATATGCTGAAGAATGATAACAAAACACACACAAAGGATTTG
CTACACTGCGCTCTAAAC*GGACCAAAGATCATTCGGTCTTTT*ATCGAGCTTCTTCTTT
GTCTCCCCGCTGTAAGGACCAACATGGTAAGCATGCTTCTGAACCGCAGCAAAGATAACC
ATCTCAAAACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCCTGGATTTGTTCCACCTCCAACCAG
AAATGGTGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGTATGTCTAGTGCTATTCCATGCCAG
AAGCAAAAGAAGACGATCCCTTTGATGCAGAGGAACTTTGCGAGTGGGTTATGAGGAGCA
AGCTCCTTGGCAAACACATGGTAGAAGATCACAAGAGAATACAAGGCCAGGGAAACCGAG
ATATTGAGAACGATAGTGAATGTCCAGCTCAGCCAAGACGGATAAAACCCGATGATTTGT
AAAGCAATCATCAAGATAGAGCACACTGGTATGATCACCACAAACTGCCATGTCCAGTAC
TTCAAGAGCCTCAGAGTGCGATGATCCAAACGGACAACATGAGGCTGGAAAAGAGTCATT
GGAAAAGAATGGTGAATCTCCCTTCCTTTGATTCCATCAGGGACAATGTTTTTGCTGATT
GATATGTTCAAGTAACTATACATCAACGCCAAGAACTTAGCAATGACGAGTGCTTCGTAG
CATTCTTTGATGGACTCTAGAAACAAGAAGAAGGTTTCACTTCCTTTG
C

QA 9 776 9 776
DS 

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CATCTTCGTTAGGTCCATCATTGCTACAAAAAAAAAACCAAACCGGAGAAGAAGAGGGAT
GAGAGTGTGGGAGACGCGAGTAGAATCAGATCTCTCTGTCTTCTTCTTCTTTAGATCATG
AAGAATTGAAGACCGTCACCATTGATCC

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DS 

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GCTGATTGATATGTTCAAGTAACTATACATCAACGCCAAGAACTTAGCAATGACGAGTGC
TTCGTAGCATTCTTTGATGGACTCTAGAAACAAGAAGAAGGTTTCACTTCCTTTGACATC
TAACAAACCAACAAAGGAAACAACGGCGTAGATAGGAGCCATGAGAACAATGACGAGTAT
AGCCTTCTGTTCCTTGGGGTCCTTCCAGTGAAAGAGATGCTGAGACACAAGCTGTATCGT
CAGATGAAGTGTGATCAAGACAGAAAACGCAGAGCAGTAAAAAGTGATCTGCGGTGGCTT
CATCTTCGTTAGGTCCATCATTGCTACAAAAAAAAAACCAAACCGGAGAAGAAGAGGGAT
GAGAGTGTGGGAGACGCGAGTAGAATCAGATCTCTCTGTCTTCTTCTTCTTTAGATCATG
AAGAATTGAAGACCGTCACCATTGATCC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 2 7

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GGAATTGATTATAAAAAGAACAAAACTTCATAACACTCTTCTGAGTCCTAATATCCTCCT
TCAACACTTAAACGTACTTATTTGTTTTCATACATTCTTTTGTGTCAA*CTCTCAAATTC
TTACACACACGCCAAATACAAAACCCTTTGTCTCTTTATCTGCAACCCAAGACGAGTCTT
CCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCCTACATATCTTCTGAAGGTCTATGTAACCAATGATG
GTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCAGGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAGGACC
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GGTTAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 10 25 10 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A831JQ U 20
AF RR4BC51JQ U 1
AF RR4BC51TF C 40
BS 1 789 RR4BC51JQ

RD RR4A831JQ 687 0 0
GG
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TTGTTTTCATACATTCTTTTGTATCAAACTCTCAAATTCTTACACACACGCCAAATACAA
AACCCTTTGTCTCTTTATCTGCAACCCAAGACGAGTCTTCCTTCTTCGTTTATTGTCACG
TTCCTACATATCTTCTGAAAGTCTATGTAACCAATGATGGTGTCCTCAAAGACCACATCC
TCCAGGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAAGACCGTGTTCTTGAACACAGCTCCT
TTTAGATCCGACTTCCCGAAGTTCACCCGATCGATAACGGCATTCGAGAAATTCACCCCC
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CCTATCGTGTTACCAACAAAAGCCTGTTCACACCGGGTGGGATCTGTTGAAAGCGGAGGA
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DS 

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GGAATTGATTATAAAAAGAACAAAACTTCATAACACTCTTCTGAGTCCTAATATCCTCCT
TCAACACTTAAACGTACTTATTTGTTTTCATACATTCTTTTGTGTCAA*CTCTCAAATTC
TTACACACACGCCAAATACAAAACCCTTTGTCTCTTTATCTGCAACCCAAGACGAGTCTT
CCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCCTACATATCTTCTGAAGGTCTATGTAACCAATGATG
GTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCAGGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAGGACC
GTGTTCTTGAACACAGCTCCTTTTAGATCCGACTTCCCGAAGTTCACCCGATCGATAACG
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GGATCTGTTGAAAGCGGAGGAAGCCTCTGGTTCCACATCCGCCATGCTTAGATCTCGGTG
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GGTTAACCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4BC51TF 750 0 0
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TTGTGTCAA*CTCTCAAATTCTTACACACACGCCAAATACAAAACCCTTTGTCTCTTTAT
CTGCAACCCAAGACGAGTCTTCCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCCTACATATCTTCTGA
AGGTCTATGTAACCAATGATGGTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCAGGTTTGCCTCCTCG
AATGTGGAACCTGACAGGACCGTGTTCTTGAACACAGCTCCTTTTAGATCCGACTTCCCG
AAGTTCACCCGATCGATAACGGCATTCGAGAAATTCACCCCCTTGAAGCTAGCTCCAACG
GCGTAAGCTTTAGACATAACGACTTCAGACATGTCAGCACCATCAAACTTGGCACCTGAC
ATCAAGGCTGCCGAGAGAGTCTTGCCTTTGAGATTAGACTGATCGTTGGTGTAGTCGCAG
AACCTGAGATCGAGTGGCTTGTCATAGACCCCGTTTGCTTGACCTATCGTGTTACCAACA
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CGCCATGCTTAGATCTCGGTGAAAGTATAAAACCCTACGCAGCTACAGACTTTACTTGAG
AGACTGGTTGTCTTTGCGTGAGGTTAACCC

QA 1 750 1 750
DS 



CO CL1177Contig2 753 4 12 U
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ATCATCTCTCTTCCCCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGCCGTTCCACCGAGACCAGATCTT
TTGTAGCTCTTGTACATTGCTCCGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGT
TTCCTGTGAAAGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAA
TGGCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCCACCC
GGTGTGAACAGGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGC
CTCTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTC
TCTCGGCAGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTA
TGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTA
TCGATCGGGCGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTCT
TGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCA
TTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGTAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAAGAAGAC
TCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGACAAAGGGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B947JQ C 312
AF RR4DH45TF U 1
AF RR4A831TF U 15
AF RR4B947TF U 2
BS 1 29 RR4DH45TF
BS 30 30 RR4B947TF
BS 31 361 RR4DH45TF
BS 362 362 RR4B947TF
BS 363 549 RR4DH45TF
BS 550 550 RR4B947TF
BS 551 567 RR4DH45TF
BS 568 568 RR4B947TF
BS 569 580 RR4DH45TF
BS 581 581 RR4B947TF
BS 582 603 RR4DH45TF
BS 604 753 RR4B947TF

RD RR4B947JQ 253 0 0
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AGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCGGCAGCC
TTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCT
TACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGCG
AACTTCGGGAAGT

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR4DH45TF 603 0 0
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ATCATCTCTCTTCCCCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGCCGTTCCACCGAGACCAGATCTT
TTGTAGCTCTTGTACATTGCTCCGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGT
TTCCTGTGAAAGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAA
TGGCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCCACCC
GGTGTGAACAGGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGC
CACTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTC
TCTCGGCAGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTA
TGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTA
TCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGG*TCTAAAAGGAGCAGTGTTCAAGAACACGGTCT
TGT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4A831TF 697 0 0
ATCAAATATCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATCTCTCTTCC
CCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGCCGTTCCACCGAGACCAGATCTTTTGTAGCTCTTGTA
CATTGCTCCGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGAAAGAG
CTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCCTGTC
ATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCCACCCGGTGTGAACAGGCT
TTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGATCTCAGG
TTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCGGCAGCCTTG
ATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTAC
GCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAAC
TTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTCTTGTCAGGTTCCACA
TTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACATAGAC
TTTCAGAAGATATGTAGGAACGTGACAATAAACGAAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4B947TF 752 0 0
GGAGAGAGAGAAAATCAAATATCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAA
TCATCTCTCTTCCCCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGCCGTTCCACCGAGACCAGATCTTT
*GTAGCTCTTGTACATTGCTCCGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTT
TCCTGTGAAAGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAAT
GGCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCCACCCG
GTGTGAACAGGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCC
TCTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCT
CTCGGCAGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTAT
GTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTAT
CGATCGGGCGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTCTT
GTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCAT
TGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGTAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAAGAAGACT
CGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGACAAAGGGT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 6

CO CL1178Contig1 791 6 6 U
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CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGATTGAGACAACTATTGAGATCAAAGCTCCCGCCC
AGAAGTACTACCACATGCTCACTGGAAAACCAAACGATCTTCCGAAAGCCAGTCCTAAAA
ACCTCCAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGAATTCTCTTCT
GGAACTACGTCACCGATGGACAGCCAAAGGTGATGAAGGAGAGGATCGATGCACTGGAGC
CAGAGAAGAGTCTCATGGTGGCTAGGGTTATTGGGGGAGATCTAATGAATGAGTTCAAGA
ACTTCTTCCTCACTATTCAGGCGACCCCGAAACAAAGAGGACCTGGAAGTTTGGTTAAGT
GTCACCTGAAGTATGAGAAGATTGACAAGAAGGTAGCTGACCCAGAGGACATACTCGTGT
TGTTTGTCAATGCCTCCAGGGCCATGGACAGAATGCTTTCTTCTGAATTCTAGAGGATTC
TTCAGATATCTATTCATCATCTATCAGTCTGTCATCTATCCGTACAACTATGTATCTATC
TATATATTGTGTCTGGGTGTTAAGCTTATATTTATCAATAATGTGCTCTCTATATGATTG
AAGAGATCTAATATTATGCAAGTATGTCATAATATCATATACATGATTTCTAGTGTGTTA
CGTATCTTTGAAGTTATAAGTTGTAAACTGTAACTTGTGTGTTGCAATGATATTTCTTCT
TGACTGGTGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E349TF U 1
AF RR4DU89TF U 1
AF RR4EN13TF U 254
AF RR4G792TF U 21
AF RR4E349JQ C 1
AF RR4DU89JQ C 85
BS 1 718 RR4DU89TF
BS 719 722 RR4EN13TF
BS 723 723 RR4G792TF
BS 724 724 RR4E349JQ
BS 725 768 RR4EN13TF
BS 769 791 RR4E349JQ

RD RR4E349TF 494 0 0
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CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGATTGAGACAACTATTGAGATCAAAGCTCCCGCCC
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ACCTCCAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGAATTCTCTTCT
GGAACTACGTCACCGATGGACAGCCAAAGGTGATGAAGGAGAGGATCGATGCACTGGAGC
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GTCACCTGAAGTATGAGAAGATTGACAAGAAGGTAGCTGACCCAAAGGACATACTCGTGT
TGTTTGTCAATGCC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4DU89TF 718 0 0
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CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGATTGAGACAACTATTGAGATCAAAGCTCCCGCCC
AGAAGTACTACCACATGCTCACTGGAAAACCAAACGATCTTCCGAAAGCCAGTCCTAAAA
ACCTCCAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGAATTCTCTTCT
GGAACTACGTCACCGATGGACAGCCAAAGGTGATGAAGGAGAGGATCGATGCACTGGAGC
CAGAGAAGAGTCTCATGGTGGCTAGGGTTATTGGGGGAGATCTAATGAATGAGTTCAAGA
ACTTCTTCCTCACTATTCAGGCGACCCCGAAACAAAGAGGACCTGGAAGTTTGGTTAAGT
GTCACCTGAAGTATGAGAAGATTGACAAGAAGGTAGCTGACCCAGAGGACATACTCGTGT
TGTTTGTCAATGCCTCCAGGGCCATGGACAGAATGCTTTCTTCTGAATTCTAGAGGATTC
TTCAGATATCTATTCATCATCTATCAGTCTGTCATCTATCCGTACAACTATGTATCTATC
TATATATTGTGTCTGGGTGTTAAGCTTATATTTATCAATAATGTGCTCTCTATATGATTG
AAGAGATCTAATATTATGCAAGTATGTCATAATATCATATACATGATTTCTAGTGTGT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EN13TF 515 0 0
G
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ATGGTGGCTAGGGTTATTGGGGGAGATCTAATGAATGAGTTCAAGAACTTCTTCCTCACT
ATTCAGGCGACCCCGAAACAAGGAGGACCTGGAAGTTTGGTTAAGTGTCACCTGAAGTAT
GAGAAGATTGATAAGAAGGTGGCTGACCCAGAGGACATACTCGTGTTGTTTGTCAATGCC
TCCAGGGGCATGGACAAAATGCTTTCTGCTGAATTCTAGAGGATTCTTCAGATATCTATT
CATCATCTATCAGTCTATCATCTATCCGTACAACTATGTATCTATCTATATATTGTGTCT
GGGTGTTAAGCTTATATTTATCAATAATGTGCTCTCTATATGATTGAAGAGATCTAATAT
TATGCAAGTATGTCATAATCATATATACATGATTTCTAGTGTGTTACGCCTCTTTGAAGT
TATAAGTTGTAAACTGTAACTTGTGTGTTGCAAT

QA 2 515 2 515
DS 

RD RR4G792TF 748 0 0
GGAG
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AGATTGAGACAACTATTGAGATCAAAGCTCCCGCCCAGAAGTACTACCACATGCTCACCG
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GGGTTATTGGGGGAGATCTAATGAATGAGTTCAAGAACTTCTTCCTCACTATTCAGGCGA
CCCCGAAACAAAGAGGACCTGGAAGTTTGGTTAAGTGTCACCTGAAGTATGAGAAGATTG
ATAAGAAGGTGGCTGACCCAGAGGACATACTCGTGTTGTTTGTCAATGCCTCCAGGGGCA
TGGACAAAATGCTTTCTGCTGAATTCTAGAGGATTCTTCAGATATCTATTCATCATCTAT
CAGTCTATCATCTATCCGTACAACTATGTATCTATCTATATATTGTGTCTGGGTGTTAAG
CTTATATTTATCAATAATGTGCTCTCTATATGATTGAAGAGATCTAATATTATGCAAGTA
TGTCATAATCATATATACATGATTTCTAGTGTGTTACGTCTCTTTGAAGTTATAAGTTGT
AAACTGTAACTTGTGTGTTGCAAT

QA 5 748 5 748
DS 

RD RR4E349JQ 791 0 0
GGATACACTCACATTAACACCCAGAGACACTAAACAC*GTCTGAAAAATGGTACGGACTA
CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGATTGAGACAACTATTGAGATCAAAGCTCCCGCCC
AGAAGTACTACCACATGCTCACTGGAAAACCAAACGATCTTCCGAAAGCCAGTCCTAAAA
ACCTCCAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGAATTCTCTTCT
GGAACTACGTCACCGATGGACAGCCAAAGGTGATGAAGGAGAGGATCGATGCACTGGAGC
CAGAGAAGAGTCTCATGGTGGCTAGGGTTATTGGGGGAGATCTAATGAATGAGTTCAAGA
ACTTCTTCCTCACTATTCAGGCGACCCCGAAACAAAGAGGACCTGGAAGTTTGGTTAAGT
GTCACCTGAAGTATGAGAAGATTGACAAGAAGGTAGCTGACCCAGAGGACATACTCGTGT
TGTTTGTCAATGCCTCCAGGGCCATGGACAGAATGCTTTCTTTTGAATTCTAGAGGATTC
TTCAGATATCTATTCATCATCTATCAGTCTGTCATCTATCCGTACAACTATGTATCTATC
TATATATTGTGTCTGGGTGTTAAGCTTATATTTATCAATAATGTGCTCTCTATATGATTG
AAGAGATCTAATATTATGCAAGTATGTCATAATATCATATACATGATTTCTAGTGTGTTA
CGTATCTTTGAAGTTATAAGTTGTAAACTGTAACTTGTGTGTTGCAATGATATTTCTTCT
TGACTGGTGAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4DU89JQ 707 0 0
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GAAAACCAAACGATCTTCCGAAAGCCAGTCCTAAAAACCTCCAGAGATGTGATGTGCTCG
AGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGAATTCTCTTCTGGAACTACGTCACCGATGGACAGC
CAAAGGTGATGAAGGAGAGGATCGATGCACTGGAGCCAGAGAAGAGTCTCATGGTGGCTA
GGGTTATTGGGGGAGATCTAATGAATGAGTTCAAGAACTTCTTCCTCACTATTCAGGCGA
CCCCGAAACAAAGAGGACCTGGAAGTTTGGTTAAGTGTCACCTGAAGTATGAGAAGATTG
ACAAGAAGGTAGCTGACCCAGAGGACATACTCGTGTTGTTTGTCAATGCCTCCAGGGCCA
TGGACAGAATGCTTTCTTCTGAATTCTAGAGGATTCTTCAGATATCTATTCATCATCTAT
CAGTCTGTCATCTATCCGTACAACTATGTATCTATCTATATATTGTGTCTGGGTGTTAAG
CTTATATTTATCAATAATGTGCTCTCTATATGATTGAAGAGATCTAATATTATGCAAGTA
TGTCATAATATCATATACATGATTTCTAGTGTGTTACGTATCTTTGAAGTTATAAGTTGT
AAACTGTAACTTGTGTGTTGCAATGATATTTCTTCTTGACTGGTGAG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 7

CO CL1179Contig1 687 7 20 U
TTTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTTTTCTCG
GTTGAGCACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCT
CCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATC
ATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCT
CCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTATCACCCAAAC
ATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTC
ACCATATCCAAGG*TTTTGTTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCTAACCCTGACGA
TCCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCTAC
CGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGACTTGAGTGGTCGA
GAGAAGCCGAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAATTTTAAGAAAAAAT
GCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGC
TCTGCTTAAGCATTATTATTATCCAGC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BL18TF U 1
AF RR4CT87TF U 1
AF RR4FN84TF U 1
AF RR4FN84JQ C 50
AF RR4CT87JQ C 2
AF RR4DE06TF U 482
AF RR4DE06JQ C 452
BS 1 198 RR4BL18TF
BS 199 199 RR4CT87TF
BS 200 373 RR4BL18TF
BS 374 374 RR4CT87TF
BS 375 477 RR4BL18TF
BS 478 478 RR4CT87TF
BS 479 526 RR4BL18TF
BS 527 527 RR4CT87TF
BS 528 548 RR4BL18TF
BS 549 549 RR4CT87TF
BS 550 586 RR4BL18TF
BS 587 587 RR4CT87TF
BS 588 595 RR4BL18TF
BS 596 596 RR4FN84TF
BS 597 610 RR4BL18TF
BS 611 611 RR4CT87TF
BS 612 661 RR4BL18TF
BS 662 662 RR4CT87TF
BS 663 671 RR4BL18TF
BS 672 687 RR4CT87TF

RD RR4BL18TF 671 0 0
TTTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTTTTCTCG
GTTGAGCACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCT
CCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATC
ATGGGACCTCCTGACAGTGCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCT
CCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTATCACCCAAAC
ATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTC
ACCATATCCAAGGGTTTTGTTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCTAACCCTGACGA
TCCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCAAC
CGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGTCTTGAGTGGTCGA
GAGAAGCCAAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAACTTTAAGAAGAAAT
GCATGTGTTGAGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGC
TATGCTTAAGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CT87TF 687 0 0
T
TTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTTTTCTCGG
TTGAGCACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTACCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTATCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGG*TTTTGTTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCTAACCCTGACGAT
CCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCTACC
GCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGACTTGAGTGGTCGAG
AGAAGCCGAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAATTTTAAGAA*AAATG
CATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCT
CTGCTTAAGCATTATTATTATCCAGC

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR4FN84TF 673 0 0
T
TTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTTTTCTCGG
TTGAGCACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTATCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGG*TTTTGTTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCTAACCCTGACGAT
CCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCTACC
GCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGACTTGAGTGGTCGAG
AGAAGCCGA*GTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAATTTTAAGAAAAAATG
CATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCT
CTGCTTAAGC
TA

QA 2 671 2 671
DS 

RD RR4FN84JQ 623 0 0
TTTTTTTCTCGGTTGAGCACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGC
AGAAGGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGC
AAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCA
TTCACTTCCCTCCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTT
ATCACCCAAACATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGA
GTCCTGCTCTCACCATATCCAAGG*TTTTGTTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCT
AACCCTGACGATCCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAG
TACGAGTCTACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGACT
TGAGTGGTCGAGAGAAGCCGA*GTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAATTT
TAAGAAAAAATGCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGC
AACTTAGATGCTCTGCTTAAGC
T

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4CT87JQ 686 0 0
TTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTTTTCTCGG
TTGAGCACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTACCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTATCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGG*TTTTGTTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCTAACCCTGACGAT
CCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCTACC
GCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGACTTGAGTGGTCGAG
AGAAGCCGAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAATTTTAAGAAAAAATG
CATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCT
CTGCTTAAGCATTATTATTATCCAGC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DE06TF 196 0 0
GCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATAAGAAGAGACTTGAGTGGTCGAG
AGAAGCCGAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAATTTTAAGAAAAAATG
CATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCT
CTGCTTAAGCATTATT

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR4DE06JQ 226 0 0
GG
GACGGATAAATCCAAGTACGAGTTTACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGG
ATGATAAGAAGAGACTTGAGTGGTCGAGAGAAGCCGAAGTGTTAATGTTATTTTGCATCC
AAATATTTTAAAATTTTAAGAAAAAATGCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTAT
GTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCTCTGCTTAAGCATTATT

QA 3 226 3 226
DS 



AS 1 7

CO CL1180Contig1 394 7 7 U
GGACGCCAGAGCAATCAAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGAAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGAGTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCTATGTTTTAATCCAAAATCTTGGCTTTACAAT
TTGACCATCCTATAGAGATTTTGAGTTTCTCTTT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY15JQ C 1
AF RR4GY15TF U 1
AF RR4H803JQB C 1
AF RR4GP28TF U 185
AF RR4DI47TF U 1
AF RR4G436JQ C 1
AF RR4G436TF U 1
BS 1 16 RR4DI47TF
BS 17 17 RR4GY15TF
BS 18 24 RR4DI47TF
BS 25 25 RR4GY15TF
BS 26 97 RR4DI47TF
BS 98 98 RR4GY15TF
BS 99 394 RR4DI47TF

RD RR4GY15JQ 300 0 0
GGACGCCAGAGCAATCAAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGAAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4GY15TF 300 0 0
GGACGCCAGAGCAATCAAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGAAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4H803JQB 300 0 0
GGACGCCAGAGCAATCAAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGAAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4GP28TF 120 0 0
G
GTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTTTTGAA
ACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGT*CTATGATTTCTATAAGACAATT

QA 2 120 2 120
DS 

RD RR4DI47TF 394 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCTTGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGAGTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCTATGTTTTAATCCAAAATCTTGGCTTTACAAT
TTGACCATCCTATAGAGATTTTGAGTTTCTCTTT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4G436JQ 389 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAGTCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGAGTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCTATGTTTTAATCCAAAATCTTGGCTTTACAAT
TTGACCATCCTATAGAGATTTTGAGTT
CC

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4G436TF 389 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAGTCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAACTGTGTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGAGTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCTATGTTTTAATCCAAAATCTTGGCTTTACAAT
TTGACCATCCTATAGAGATTTTGAGTT
CC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 6

CO CL1181Contig1 1042 6 16 U
TTTTTTTTCTGTCATTCTTTGTTCCTTACAGTGTGTGAGAAAATGGAGAGTGGGCTAAGC
GAGATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATACAACAAAAGATACAAACACAACAGTGAG
ACACTCGGCTGTTCCATGACTTTCTCCATCTACTTCCCTCCTTCTTCCCACAAATCCCCT
GTGCTATACTGGCTCTCTGGGCTCACATGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGT
GCTCAACGTGCTGCTTCTACTCACGGCATTGCTCTTGTTGTTCCCGATACTTCTCCAAGA
GGACTCAATATTGAAGGTGAAGCAGACAGTTACGACTTTGGTGTAGGAGCTGGATTCTAC
CTCAATGCTACTCAGGAGAAGTGGAAGAACTGGCGTATGTATGACTATGTTGTCAAAGAG
TTGCCAAAGCTCCTGAGTGACAACTTCTCTCAGCTTGACACAGCAAGAGCATCTATCTCT
GGACATTCCATGGGTGGACATGGTGCTCTTACTATTTACCTCAAGAACCTCGATAAGTAT
AAGTCTGTGTCTGCCTTTGCACCAATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATGGGGACAGAAA
GCATTCACCAATTATCTTGGTGACAACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGT
CTCATTTCAAAGTTCAACAATCTTTCTGCCACAATTCTAATTGATCAGGGAGAAAACGAC
CAGTTCTACCCTGATCAGTTATTGCCCAACAAGTTTGAAGAGGCGTGCAGGAAAGTGAAT
GCGCCGCTCTTAGTGCGTCTGCAGCCAGGATACGACCACTCCTACTACTTCATTGCAACT
TTCATCGAAGACCACATCAGTCACCATGCTCAAGCCCTTGAGTTGTAGCTCACTCATGTT
GCTCCGCATCATCCAGCTTTGCCTTTGTCCAAATACTAGTTATATCAATAAAGCAAGTGG
ACTTGTAATGTTTTTGTGTTCAGTGACTGCTCTGTGTAGTGTGTTATGTCTACAATAATA
AAATAAATCGAAACTTCCAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4H751TF U 12
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AF RR4B753TF U 12
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AF RR4CL95JQ C 331
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BS 593 593 RR4B753TF
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BS 700 770 RR4B753TF
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CCTTTGCACCAATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATGGGGACAGAAAGCATTCACCAATT
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AAGTCTGTGTCTGCCTTTGCACCAATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATGGG*ACAGAAA
GCATTCACCAATTATCTTGGTGACAACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGT
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CGAAGATGTTCGATGGATACAACAAAAGATACAAACACAACAGTGAGACACTCGGCTGTT
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TCTCTGGGCTCACATGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGTGCTCAACGTGCTG
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AAGGTGAAGCAGACAGTTACGACTTTGGTGTAGGAGCTGGATTCTACCTCAATGCTACTC
AGGAGAAGTGGAAGAACTGGCGTATGTATGACTATGTTGTCAAAGAGTTGCCAAAGCTCC
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ATCTTGGTGACAACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGTCTCATTTCAAAGT
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CCCATTAATTGTCCATGGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTTGGTGACAACAAGACT
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ATTCTAATTGATCAGGGAGAAAACGACCAGTTCTACCCTGATCAGTTATTGCCCAACAAG
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TAAGTCTGTGTCTGCCTTTGCACCAATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATGGGGACAGAA
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TCTCATTTCAAAGTTCAACAATCTTTTTGCCACAATTCTAATTGATCAGGGAGAAAACGA
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GACTTGTAATGTTTTTGTGTTCAGTGACTGCTCTGTGTAGTGTGTTATGTCTACAATAAT
AAAATAAATCGAAACTTCC
AATG

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DS 



AS 2 7

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CATTGATAGACTTGGACAAGGATCATATCATCTTGACCCTTTAGTTGACGCCATTGGCGT
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ATGCGTCCTCAACTGTTGGCGTCTCCATGTCGATAGAATGCCTCAACCAGTTCGGCTGTC
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CGAGCCAGCCAGTTCGCCATCCTGGTACATTCCATCCCTTAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU06JQ U 1
AF RR4GG23JQ U 1
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QA 1 692 1 692
DS 

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ATTACAACTACGAAAGTGTTCATGATTTATCTCACATTACCAAAAACACCCATTTATTAT
CATTGATAGACTTGGACAAGGATCATATCATCTTGACCCTTTAGTTGACGCCATTGGCGT
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ATGCGTCCTCAACTGTTGGCGTCTCCATGTCGATAGAATGCCTCAACCAGTTCGGCTGTC
TAAATGCAATCCCTGGCAAAACGACGAGATTTTCTTCCATAGCAAGCTTGCTGCAGAACT
CTTGATCGTCTCCAATGTCAGCAAAGCACGATATATCCAGCTTGGTCCATAAAAAGGTGC
ACGCTTCGGGTTTCATGTAACAAGTGAGGCCAGGTATGTGCTTGAGCTTAGCGTATCCAA
TATCAACTTTATGTTTCAGAAAACTTCCCCTCTCAAGGAAGAAATGTTTTGGAGTTCTCT
CCAAAATGTCAGGCATAGCCGCCTGAATAACAGTCGGAGGTTTGGCATTTATCTGGAGAA
ATTCGTTGGAAGCTTCTAATATCTTAGTGTTTCTGAAGACACCGTCTAGATCGTGCAGCG
CGAGCCAGCCAGTTCGCCATCCTGGTACATTCCATCCCTTAG

QA 1 702 1 702
DS 



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CTCGAGGTCCGTTACTATGATTTTATCCCTGAACAAAACTTTGAGATCGACTTCGAAAGC
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TCTATCGACATGGAGACGCCAACCGTCGAGGACGCATTTGAAAGATTGAAGAGCTTCTGT
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GTGAGATAAATCATGAACACTTTCGTAGTTGTAACAAATAAAAATGGTGTACTTATCATT
AATCATAGAATGTTTTCTCATGATGTATCATCTACCTTCGAATAATAAAATTATTATGTA
CC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR4DV85TF U 1
AF RR4GG23TF U 1
AF RR4FH83TF U 549
AF RR4FH83JQ C 779
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RD RR4DV85TF 700 0 0
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TGCACTGAGTGGCAGTTCAGCGGTAGCGAGGCAGCCAAAGAAGCTGCTGCGGCCGCCCTA
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CCAAACAAAAAGGCCATAGAGACCAGCAATTCAGCCGAAAAAGCTGTCGTTAAAGTTGTT
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GTAGCAGAGTATCTAAACCGAGATCTTCCGAAGAAGCTAACAGCAGATGACGTGTTTATG
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QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4GG23TF 766 0 0
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CCAAACAAAAAGGCCATAGAGACCAGCAATTCAGCCGAAAAAGCTGTCGTTAAAGTTGTT
CTCTCCGGCACTGGAAACGCCTATGCTCCTAGCATTGGCCTTCCCGTCGCAAAAAGTGCC
GTAGCAGAGTATCTAAACCGAGATCTTCCGAGGAAGCTAACAGCAGATGACGTGTTTATG
ACTGTTGGATGCAAACGAGCGATTGACCTTGCGGTCGATATTCTTGCTAAACCAAAAGCC
AACGTTCTGCTTCCGAGGCCAGGCTTCCCATGGGATGTAGTACGCTCCATCTACAAGAAG
CTCGAGGTCCGTTACTATGATTTTATCCCTGAACAAAACTTTGAGATCGACTTCGAAAGC
GTCAAAAAGGTGACAGACAAGAACACGTTTGCTATATTTATCATCAACCCTCACAATCCC
AATGGAAACACCTACTCGGAGGCTCATCTCAAACAGCTCGCTGAATTGGCTAA*GAACTC
TCCATTATGGTGGTTTCTGATGAAGTTTTTAGATGGACCGTCTTCGG*AATAACCCTTTT
GT*CCGATGGGAAAGTTTTCTTCCATCGTAC*AGTGGTTACACTCG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4FH83TF 714 0 0
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CACCTACTCGGAGGCTCATCTCAAACAGCTCGCTGAATTGGCTAAGGAACTCTCCATTAT
GGTGGTTTCTGATGAAGTTTTTAGATGGACCGTCTTCGGGAATAACCCTTTTGTTCCGAT
GGGAAAGTTTTCTTCCATCGTACCAGTGGTTACACTCGGATCCTTATCTAAGGGATGGAA
TGTACCAGGATGGCGAACTGGCTGGCTCGCGCTGCACGATCTAGACGGTGTCTTCAGAAA
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TATTCAGGCGGCTATGCCTGACATTTTGGAGAGAACTCCAAAACATTTCTTCCTTGAGAG
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CCTCACTTGTTACATGAAACCCGAAGCGTGCACCTTTTTATGGACCAAGCTGGATATATC
GTGCTTTGCTTACATTGAAGACGATCAAGAGTTCTGCAGCAAGCTTGCTATGGAAGAAAA
TCTCGTCGTTTTACCAGGGATTGCATTTAGACAGCAGAACTGGTTGAGGCATTCTATCGA
CATGGAGACGCCAACCGTCGAGGACGCATTTGAAAGATTGAAGAGCTTCTGTGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FH83JQ 724 0 0
AGGGATG
GAATGTACCAGGATGGCGAACTGGCTGGCTCGCGCTGCACGATCTAGACGGTGTCTTCAG
AAACACTAAGATATTAGAAGCTGCCAACGAATTTCTCCAGATAAATGCCAAACCTCCGAC
TGTTATTCAGGCGGCTATGCCTGACATTTTGGAGAGAACTCCAAAACATTTCTTCCTTGA
GAGGGGAAGTTTTCTGAAACATAAAGTTGATATTGGATACGCTAAGCTCAAGCACATACC
TGGCCTCACTTGTTACATGAAACCCGAAGCGTGCACCTTTTTATGGACCAAGCTGGATAT
ATCGTGCTTTGCTTACATTGAAGACGATCAAGAGTTCTGCAGCAAGCTTGCTATGGAAGA
AAATCTCGTCGTTTTACCAGGGATTGCATTTAGACAGCAGAACTGGTTGAGGCATTCTAT
CGACATGGAGACGCCAACCGTCGAGGACGCATTTGAAAGATTGAAGAGCTTCTGTGAACG
CCATTCCACAAAAGGTGGAGCTTCACTCAAAAACGTCAATGGCGTCAACTAAAGGGTCAA
GATGATGATCATTGTCTAAGTCTATCTATGATAATAAATGGGTGTGTTTGGTAATGTGAG
ATAAATCATGAACACTTTCGTAGTTGTAACAAATAAAAATGGTGTACTTATCATTAATCA
TAGAATGTTTTCTCATGATGTATCATCTACCTT*GAATAATAAAATTATTATGTACC

QA 8 724 8 724
DS 

RD RR4DV85JQ 645 0 0
ATTAGAAGCTGCCAACGAATTTCTCCAGATAAATGCCAAACCTCCGACTGTTATTCAGGC
GGCTATGCCTTACATTTTGGAGAGAACTCCAAAACATTTCTTCCTTGAGAGGTGAAGTTT
TCTGAAACATAAAGTTGATATTGGATACGCTAAGCTCAAGCACATACCTGGCCTCACTTG
TTACATGAAACCCGAAGCGTGCACCTTTTTATGGACCAAGCTGGATATATCGTGCTTTGC
TGACATTGAAGACGGTCAAGAGTTCTGCAGCAAGCTTGCTATGGAAGAAAATCTCGTCGT
TTTGCCAGGGATTGCATTTAGACAGCAGAACTGGTTGAGGCATTCTATCGACATGGAGAC
GCCAACCGTCGAGAACGCATTTGAAAGATTGAAGAGCTTCTGTGAACGCCATTCCACAAA
AGGTGGAGCTTCACTCAAAAACGTCAATGGCGTCAACTAAAGGGTCAAGATGATGATCAT
TGTCTAAGTCTATCTATGATAATAAATGGGTGTTTTTGGTAATGTGAGATAAATCATGAA
CACTTTCGTAGTTGTAACAAATAAAAATGGTGTACTTATCATTAATCGTAGAATGTTTTC
TCATGATGTATCATCTACTTTCGAATAATAAAATTATTATGTACC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 7

CO CL1183Contig1 1080 7 10 U
GAAATCGAGAAACAAACTTTTTCTTCTTTTATTTTTTTCCGTCTAATATATTTTTATTAA
GGGTCAAGACCTAAAAAAAAACTCATCCCAAACCGAAAAAAACAAAAGGCCATTCAAGTC
CGATTACAAAACGATATAAGTCTAACATGAAGGGCTATCGAAACGGGCCGCAAGCTCAAA
CCAGTAACTACCCATCCTTCCACGCATCCTGATCTCTTCCCTTGATCGTCCACGCGTTAA
ATTCCACCGTTCGCACGAACCACAGCCACGCGTCAGCCAACCATAACGTCGTCATCTAAA
AGTCGAAATTTTCGCCGGAGAAAAACAAAGCGACTGATATTTTGCCGGAATACGCCGTCG
ACAAATCACCGCACCCACCCTAACACCGG*AAAGCTTTCACCAGAGATCTTCCATCGTCA
AAACGAGATCTCATCCGGGAAACATTAAACCACGCACCACGCCTTCGCTAAACGATCTCA
ACCCGTCGGAGAGCTTCCAATCGATGTCGTCAAGATCTCTCCCC*AAACCGTCGGAGTTT
TAACAAATTGTCGGTCTCGTGACTACCTATTCTTGAGAGAACCAGAAACGCCGGAGATAC
GAAGCTAGGTAAGCCTTCACTCCCGGAAACAGAAGTCGGCTACCACCGTCAAAGGAGACG
GCATGGTCCCAAAAACAAAGCCGGTCGTCCACCAGACGGTGCGATACCGGAACAGTAAAA
TCAAAAACAAACATGCAAACTATCTAAAGAAAAGCCGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAACGG
GAAAAGCTTAAAACCGGACCGGCGGTGACTGTGGAAGCCCACCCGTCGACTGGAGTCTAG
TTTTACGGCTGAGATTTGGTTTAAGGAGAGATAAGAGGAAATTAGAGAGAGAAAGAAAAA
CTCTCTAACTAGTATAGTGTTAAAGAATAATTCAACTTTTTCTTCCTTAGCAAAATAAAA
CATTTTGGTGTTCGAAAAAAAAAGAAGAAGCAAAATAAAACATTTTGTGCAGAAACAAGT
CTGGAGAAAAAAAAA***GAGAGAGAGAATAAATGGTCTAATCTCTTGCTCTCGTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FW61JQ U 3
AF RR4BZ66JQ U 8
AF RR4C617JQ U 6
AF RR4AH92JQ U 1
AF RR4AH92TF C 285
AF RR4FW61TF C 392
AF RR4BZ66TF C 348
BS 1 191 RR4AH92JQ
BS 192 192 RR4FW61JQ
BS 193 837 RR4AH92JQ
BS 838 919 RR4AH92TF
BS 920 920 RR4FW61TF
BS 921 942 RR4AH92TF
BS 943 943 RR4FW61TF
BS 944 1035 RR4AH92TF
BS 1036 1038 RR4FW61TF
BS 1039 1080 RR4AH92TF

RD RR4FW61JQ 402 0 0
AATCGAG
AAACAAACTTTTTCTTCTTTTATTTTTTTCCGTCTAATATATTTTTATTAAGGGTCAAGA
CCTAAAAAAAA*CTCATCCCAAACCGAAAAAAACAAAAGGCCATTCAAGTCCGATTACAA
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ACCCATCCTTACCCGCATCCTGATCTCTTCCCTTGATCGTCCACGCGTTAAATTCCACCG
TTCGCACGAACCACAGCCACGCGTCAGCCAACCATAACGTCGTCATCTAGAAGTCGAAAT
TTTCCCCGGAGAAAAACAAAGCGACTGATATTTTGCCGGAATACCCCGTCGACAAATCAC
CGCCCCCCCCCTAACACCGG*AAAGCTTTCACCA
G

QA 8 401 8 401
DS 

RD RR4BZ66JQ 395 0 0
GT
AAACAAACTTTTTCTTCTTTTATTTTTTTCCGTCTAATATATTTTTATTAAGGGTCAAGA
CCTAAAAAAAAACTCATCCCAAACCGAAAAAAACAAAAGGCCATTCAAGTCCGATTACAA
AACGATATAAGTCTAACATGAAGGGCTATCGAAACGGGCCGCAAGCTCAAACCAGTAACT
ACCCATCCTTCCACGCATCCTGATCTCTTCCCTTGATCGTCCACGCGTTAAATTCCACCG
TTCGCACGAACCACAGCCACGCGTCAGCCAACCATAACGTCGTCATCTAAAAGTCGAAAT
TTTCGCCGGAAAAAAACAAAGCGACTGATATTTTGCCGGAATACGCCGTCGACAAATCAC
CGCACCCACCCTAACACCGG*AAAGCTTTCACC

QA 3 395 3 395
DS 

RD RR4C617JQ 589 0 0
CGAG
AAACAAACTTTTTCTTCTTTTATTTTTTTCCGTCTAATATATTTTTATTAAGGGTCAAGA
CCTAAAAAAAAACTCATCCCAAACCGAAAAAAACAAAAGGCCATTCAAGTCTGATTACAA
AACGATATAAGTCTAACATGAAGGGCTATCGAAACGGGCCGCAAGCTCAAACCAATAACT
ACGCATCCTTCCACGCATCCTGATCTCTTCCCTTGATCGTCCACGCGTTAAATTCCACCG
TTCGCACGAACCACAGCCACGCGTCAGCCAACCATAACGTCGTCATCTAAAAGTCGAAAT
TTTCGCCGGAAAAAAACAAAGCGACTGATATTTTGCCGGAATACGCCGTCGACAAATCAC
CGCACCCACCCTAACACCGG*AAAGCTTTCACCAAAGATCTTCCATCGTCAAAACGAGAT
CTCATCCGGGAAACATTAAACCACGCACCACGCCTTCGCTAAACGATCTCAACCCGTCGG
AAAGCTTCCAATCGATGTCGTCAAGATCTCTCCCC*AAACCGTCGGAGTTTTAACAAATT
GTCGGTCTCGTGACTACCTATTCTTGAGAGAACCAGAAACGCCGG

QA 5 589 5 589
DS 

RD RR4AH92JQ 843 0 0
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GGGTCAAGACCTAAAAAAAAACTCATCCCAAACCGAAAAAAACAAAAGGCCATTCAAGTC
CGATTACAAAACGATATAAGTCTAACATGAAGGGCTATCGAAACGGGCCGCAAGCTCAAA
CCAGTAACTACGCATCCTTCCACGCATCCTGATCTCTTCCCTTGATCGTCCACGCGTTAA
ATTCCACCGTTCGCACGAACCACAGCCACGCGTCAGCCAACCATAACGTCGTCATCTAAA
AGTCGAAATTTTCGCCGGAGAAAAACAAAGCGACTGATATTTTGCCGGAATACGCCGTCG
ACAAATCACCGCACCCACCCTAACACCGG*AAAGCTTTCACCAGAGATCTTCCATCGTCA
AAACGAGATCTCATCCGGGAAACATTAAACCACGCACCACGCCTTCGCTAAACGATCTCA
ACCCGTCGGAGAGCTTCCAATCGATGTCGTCAAGATCTCTCCCC*AAACCGTCGGAGTTT
TAACAAATTGTCGGTCTCGTGACTACCTATTCTTGAGAGAACCAGAAACGCCGGAGATAC
GAAGCTAGGTAAGCCTTCACTCCCGGAAACAGAAGTCGGCTACCACCGTCAAAGGAGACG
GCATGGTCCCAAAAACAAAGCCGGTCGTCCACCAGACGGTGCGATACCGGAACAGTAAAA
TCAAAAACAAACATGCAAACTATCTAAAGAAAAGCCGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAACGG
GAAAAGCTTAAAACCGGACCGGCGGTGACTGTGGAAGCCCACCCGTCGACTGGAGTC
TAGTTT

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4AH92TF 796 0 0
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CCGGAATACGC*GTCGACAAATCACCGCACCCACCCTAACACCGGGAAAGCTTTCACCAG
AGATCTTCCATCGTCAAAACGAGATCTCATCCGGGAAACATTAAACCACGCACCACGCCT
TCGCTAAACGATCTCAACCCGTCGGAGAGCTTCCAATCGATGTCGTCAAGATCTCTCCCC
*AAACCGTCGGAGTTTTAACAAATTGTCGGTCTCGTGACTACCTATTCTTGAGAGAACCA
GAAACGCCGGAGATACGAAGCTAGGTAAGCCTTCACTCCCGGAAACAGAAGTCGGCTACC
ACCGTCAAAGGAGACGGCATGGTCCCAAAAACAAAGCCGGTCGTCCACCAGACGGTGCGA
TACCGGAACAGTAAAATCAAAAACAAACATGCAAACTATCTAAAGAAAAGCCGAAAAGAA
AAGAAAAGGAAAACGGGAAAAGCTTAAAACCGGACCGGCGGTGACTGTGGAAGCCCACCC
GTCGACTGGAGTCTAGTTTTACGGCTGAGATTTGGTTTAAGGAGAGATAAGAGGAAATTA
GAGAGAGAAAGAAAAACTCTCTAACTAGTATAGTGCTAAAGAATAATTCAACTTTTTCCT
CCTTAGCAAAATAAAACATTTTGGTGTTCGAAAAAAAAAGAAGAAGCAAAATAAAACATT
TTGTGCAGAAACAAGTCTGGAGAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAATAAATGGTCTAATCT
CTTGCTCTCGTCTCCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4FW61TF 667 0 0
AAGCTTTCACCAGAGATCTTCCATCGTCAAAACGAGATCTCATCCGGGAAGCATTAAACC
ACGCACCACGCCTTCGCTAAACGATCTCAACCCGTCGGAGAGCTTCCAATCGATGTCGTC
GAGATCTCTCCCC*AAACCGTCGGAGTTTTAACAAATTGTCGGTCTCGTGACTACCTATT
CTTGAGAGAACCAGAAACGCCGGAGATACGAAGCTAGGTAAGCCTCCACTCCCGGAAACA
GAAGTCGGCTACCACCGTCAAAGGAGACGGCATGGTCCCAAAAACAAAGCCGGTCGTCCA
CCAGACGGTGCGATACCGGAACAGTAAAATCAAAAACAAACATGCAAACTATCTAAAGAA
AAGCCGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAACGGGAAAAGCTTAAAACCGGACCGGCGGTGACTG
TGGAAGCCCACCCGTCGACTGGAGTCTAGTTTTACGGCTGAGATTTGGTTTAAGGAGAGA
TAAGAGGAAATTAGAGAGAGAAAGAAAAACTCTCTAACTAGTATAGTGTTAAAGAATAAT
TCAACTTTTTCTTCCTTAGCAAAATAAAACATTTTGGTGTTCGAAAAAAAAAGAAGAAGC
AAAATAAAACATTTTGTGCAGAAACAAGTCTGGAGAAAAAAAAA***GAGAGAGAGAATA
AATGGTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BZ66TF 733 0 0
GGAATACG
CGTCGACAAATCACCGCACCCACC*TAACACGG**AAAGCTTTCACCAGAGATCTTCCAT
CGTCAAAACGAGATCTCATCCGGGAAACATTAAACCACGCACCACGC*TTCGCTAAACGA
TCTCAACCCGTCGGAGAGCTTCCAATCGATGTCGTCAAGATCTCTCCCCCAAACCGTCGG
AGTTTTAACAAATTGTCGGTCTCGTGACTACCTATTCTTGAGAGAACCAGAAACGCCGGA
GATACGAAGCTAGGTAAGCCTTCACTCCCGGAAACAGAAGTCGGCTACCACCGTCAAAGG
AGACGGCATGGTCCCAAAAACAAAGCCGGTCGTCCACCAGACGGTGCGATACCGGAACAG
TAAAATCAAAAACAAACATGCAAACTATCTAAAGAAAAGCCGAAAAGAAAAGAAAAGGAA
AACGGGAAAAGCTTAAAACCGGACCGGCGGTGACTGTGGAAGCCCACCCGTCGACTGGAG
TC*AGTTTTACGGCTGAGATTTGGTTTAAGGAGAGATAAGAGGAAATTAGAGAGAGAAAG
AAAAACTCTCTAACTAGTATAGCGTTAAAGAATAGTTCAACTTTTTCTTCCTTAGCAAAA
TAAAACATTTTGGTGTTCGAAAAAAAAAGAAGAAGCAAAATAAAACATTTTGTGCAGAAA
CAAGTCTGGAGAAAAAAAA****GAGAGAGAGAATAAATGGTCTAATCTCTTGCTCTCGT
CTCCC

QA 9 733 9 733
DS 



AS 1 5

CO CL1184Contig1 1340 5 7 U
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AACCAGATATTTCCGCCGTTAAGACCCTCTCTTTAGAGGAATCAAGCGATGCTGTTGGTG
TCACTGTCATCACTGGTTATCTCGGCGCCGGAAAGTCCACCCTGGTGAATTATATTCTGA
ACGGGAAACACGGGAAGAAAATAGCGGTGATTTTGAACGAGTTTGGGGAAGAGATTGGAG
TAGAGAGGGCTATGATCAACGAAGGTGAAGGAGGTGCTCTTGTCGAAGAATGGGTCGAGC
TTGCTAATGGCTGTATTTGCTGCACTGTCAAGCACAGTCTTGTTCAAGCTCTCGAGCAGC
TTGTTCTGAGGAAAGACAGGCTTGATCATATATTACTGGAGACAACAGGTTTAGCAAATC
CGGCTCCTCTTGCTTCTATTCTTTGGTTGGATGACCAGTTAGAATCAGAAGTCAAGCTTG
ACTGCATTGTTACTGTTGTGGATGCAAAGAACCTTCGTTTTCAGCTCAATGAGCGCCGTG
ACTCGTCTTCCTTTCCCGAGGCTTTTAATCAAATAGCATTTGCAGACACAGTGATAATGA
ACAAGGTTGACTTGATTTCTCAAGAGGAATCTGATGAACTGGAGAAGGAGATTCACTCCA
TCAACTCCCTCGCCAATGTCATCCGTTCTGTCAGGTGTCGAGTTGATTTATCCAACATAT
TAGAATGCCAAGCATATGATTCAACCCACGTTAGTCGTCTCGAATCCCTGCTAGAGGCAA
ATAGATCATTAACGACAACGGATCTTCATGATAGTGGAGTGAGAACTCTATGCATCAGTG
AACCTCAGCCTATTAACCTCGACAAGGTTCGTTTATGGCTTGAGGAAGTTCTGTGGGATA
AAAAACTTGACATGGATGTATATCGTTGCAAGGCTGTGTTGAGCATTCAAAACTCGGACC
AGCTGCATATTTTGTAGGCCGTTAAAGGGATATATGAGATAGTTCCATCGCGAAAGTGGA
GTGAAGAAGAGAATAGAATGAACAAAATAGTGTTTATAGGACACAAACTGGACGAAGAAG
CTCTTAGAACCGGGTTAAGAGAGTGCACAACCTGAAGAAAACCTTAGAAGTTGCAGTGAA
ACCACATTTGTCTAAACAGTTTTTACCGTTCTTGTACGAAACTCTCTAGTCGATTGCTGA
GTTGGGGTATTAAAGCTTGCAATTTTACCATCTTAAGTGTAATTTTACACTAGAATCTTA
TAGTTGATGTTCTATATTTTGTAATGTAATGACATTAGCATATGTACCACATTCATTTTC
CGTCAAATTTTGAACAACCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G372JQ C 649
AF RR4BY51TF U 676
AF RR4BY51JQ C 765
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TAGAATGCCAAGCATATGATT

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GG
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AAACACGGGAAGAAAATAGCGGTGATTTTGAACGAGTTTGGGGAAGAGATTGGAGTAGAG
AGGGCTATGATCAACGAAGGTTAAGGAGGTGCTCTTGTCGAAGAATGGGTCGAGCTTGCT
AATGGCTGTATTTGCTGCACTGTCAAGCACAGTCTTGTTCAAGCTCTCGAGCAGCTTGTT
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ATTGTTGCTGTTGTGGATGCAAAGAACCTTCGTTTTCAGCTCAATGAGCGCCGTGACTCG
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CGATCCCTGCT

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CGCGAAAGTGGAGTGAAGAAGAGAATAGAATGAACAAAATAGTGTTTATAGGACACAAAC
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G
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TGATTCAACCCACGTTAGTCGTCTCGAATCCCTGCTAGAGGCAAATAGATCATTAACGAC
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CCTCGACAAGGTTCGTTTATGGCTTGAGGAAGTTCTGTGGGATAAAAAACTTGACATGGA
TGTATATCGTTGCAAGGCTGTGTTGAGCATTCAAAACTCGGACCAGCTGCATATTTTGTA
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TTTTGTAATGTAATGACATTAGCATATGTACCACATTCATTTTCCGTCAAATTTTGAACA
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ATTCAAAACTCGGACCAGCTGCATATTTTGTAGGCCGTTAAAGGGATATATGAGATAGTT
CCATCGCGAAAGTGGAGTGAAGAAGAGAATAGAATGAACAAAATAGTGTTTATAGGACAC
AAACTGGACGAAGAAGCTCTTAGAACCGGGTTAAGAGAGTGCACAACCTGAAGAAAACCT
TAGAAGTTGCAGTGAAACCACATTTGTCTAAACAGTTTTTACCGTTCTTGTACGAAACTC
TCTAGTCGATTGCTGAGTTGGGGTATTAAAGCTTGCAATTTTACCATCTTAAGTGTAATT
TTACACTAGAATCTTATAGTTGATGTTCTATATTTTGTAATGTAATGACATTAGCATATG
TACCACATTCATTTTCCGTCAAATTTTGAACAACCC

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DS 



AS 2 7

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AAACTGAACCAAATTACGATAAATGCGAAAGCCGAGTAAAATGAAACACACTTAAAATCA
AAAGGAGTCAAAATAAAATACCACTTAACCGGACAAAAGCACAAACCGGACTAAACATGG
GAAAATAAGTGATTAACAACCAAATCTCATCTCCTAATACCATCTTCTCTTACCGGAACC
AACCCTAATTTTTACCACTCTCAGAGATCGAGTAGATCCGGCTGACCTTGACCACCCTCT
GGCGTCGTTGTTTTCTCCTCTCCGGCTGTTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAGACGGT
GGCATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCAACG
GCTTGTTCTTCGACACAGAGCATAGCAACGTAGAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATAGGA
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D171JQ U 1
AF RR4D822JQ U 1
AF RR4D822TF C 61
BS 1 144 RR4D171JQ
BS 145 145 RR4D822JQ
BS 146 354 RR4D171JQ
BS 355 355 RR4D822JQ
BS 356 565 RR4D171JQ
BS 566 566 RR4D822JQ
BS 567 624 RR4D171JQ
BS 625 744 RR4D822JQ
BS 745 775 RR4D822TF

RD RR4D171JQ 624 0 0
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GGCGTCGTTGTTTTCTCCTCTCCGGCTGTTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAAACGGT
GGCATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCAACG
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GTGACTAGCTCTAAAAGAACCACA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4D822JQ 744 0 0
CG
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ACTGAACCAAATTACGATAAATGCGAAAGCCGAGTAAAATGAAACACACTTAAAATCAAA
AGGAGTCAAAATAAAATACCACTTAACCGGACAAAAGCACAAACCGGACTAAACATGGGA
AAATAAGTGATTAACAACCAAATCTCATCTCCTAATACCATCTTCTCTTACCGGAACCAA
CCCTAATTTTTACCACTCTCAGAGATCGAGTAGATCCGGCTGACCTTGACCACCCTCTGG
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CATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCAACGGC
TTGTTCTTCGACACAGAGCATAGCAACGTAGAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATAGGAAT
CGAAGAAAGCCTCGGATCCAACACTTTGAGAACAGAGTCCTTGTTCGAATCAGTCATTTT
ACGAACCCACTGCACGATATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTTTCTCCCGGT
GACTAGCTCTAAAAGAACCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATCTACCTTCAA
CGTATACGCATATTCTGGTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGACATGCATTC
AGAAGTACCGGAGTCTTGTAAG

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR4D822TF 715 0 0
AAACTGAACCAAATTACGATAAATGCGAAAGCCGAGTAAAATGAAACACACTTAAAATCA
AAAGGAGTCAAAATAAAATACCACTTAACCGGACAAAAGCACAAACCGGACTAAACATGG
GAAAATAAGTGATTAACAACCAAATCTCATCTCCTAATACCATCTTCTCTTACCGGAACC
AACCCTAATTTTTACCACTCTCAGAGATCGAGTAGATCCGGCTGACCTTGACCACCCTCT
GGCGTCGTTGTTTTCTCCTCTCCGGCTGTTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAGACGGT
GGCATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCAACG
GCTTGTTCTTCGACACAGAGCATAGCAACGTAGAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATAGGA
ATCGAAGAAAGCCTCGGATCCAACACTTTGAGAACAGAGTCCTTGTTCGAATCAGTCATT
TTACGAACCCACTGCACGATATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTTTCTCCCG
GTGACTAGCTCTAAAAGAACCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATCTACCTTC
AACGTATACGCATATTCTGGTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGACATGCAT
TCAGAAGTACCGGAGTCTTGTAAGAACTTGGCGAGACCAAAGTCAGCGACATGCC

QA 1 715 1 715
DS 



CO CL1185Contig2 1078 4 5 U
CAAGACAAAACTTTTAAATTAAACCCAACTGTACACCTTGATTCATACAAACTACTCCAA
ACTAAACTGAACCAAATTACGATAAATGCGAAAGCCGAGTAAAATGATAAACACACTTAA
AAACAAAAGGAGTCAAAATAAAATACCACTTAACCGGACAAAAGCACAAACCGGACTAAA
CATGCGAAAACAAGTGATCAACAACCAAATCTCATCGCTAATACCCATCTTCTCTCACCG
GAACCAACCCCTAATTTTTACCACTCTCAGAGATCGAGTAGATCCGGCTGACCTTGACCA
CCCTCTGGCGTCGTTGTTTTCTCCTCTCCGGCTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAGAC
GGTGGCATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCA
ACGGCTTGTTCTTCGACACAGAGCATAGCAACGTAGAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATA
GGAATCGAAGAAAGCCTCGGATCCAACACTTTGAGAACAGAGTCCTTGTTCGAATCAGTC
ATTTTACGAACCCACTGCACGATATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTTTCTC
CCGGTGACTAGTTCTAAAAGAACCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATCTACC
TTCAACGTATACGCATATTCTGGTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGACATG
CATTCAGAAGTACCGGAGTCTTGTAAGAACTTGGCGAGACCAAAGTCAGCGACATGAGCT
TCGAAGCTGGAATCGAGGAGGATGTTGTTCGACTTAACATCTCGATGAACAATCAGCGGA
GAACAATCGTGATGGAGATAACAGAGTCCTTTCGCAGCTTCGAGAGCAATCTTGTAACGC
GTGTCCCAATGCAAGTGTCCACCTTTCTTACCGTGCAACACCTCACCGAGACTCCCGTTA
GGCATGTACTCATACACGAGCAGATTCGTCTCGTGGTTAGAGCAAAAACCTAGCAGCCTC
ACGATGTGCCTGTGCCTTATCCTCCCCAAGGTCTGAATCTCCGCGTTGAACCCGTGAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP86JQ U 1
AF RR4EN47JQ U 2
AF RR4EP86TF C 143
AF RR4EN47TF C 537
BS 1 46 RR4EP86JQ
BS 47 47 RR4EN47JQ
BS 48 791 RR4EP86JQ
BS 792 826 RR4EP86TF
BS 827 1078 RR4EN47TF

RD RR4EP86JQ 791 0 0
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CCCTCTGGCGTCGTTGTTTTCTCCTCTCCGGCTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAGAC
GGTGGCATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCA
ACGGCTTGTTCTTCGACACAGAGCATAGCAACGTAGAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATA
GGAATCGAAGAAAGCCTCGGATCCAACACTTTGAGAACAGAGTCCTTGTTCGAATCAGTC
ATTTTACGAACCCACTGCACGATATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTTTCTC
CCGGTGACTAGTTCTAAAAGAACCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATCTACC
TTCAACGTATACGCATATTCTGGTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGACATG
CATTCAGAAGTACCGGAGTCTTGTAAGAACTTGGCGAGACCAAAGTCAGCGACATGAGCT
TCGAAGCTGGA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4EN47JQ 780 0 0
A
AGACAAAACTTTTAAATTAAACCCAACTGTACACCTTGATTCATACAAACTACTCCAAAC
TAAACTGAACCAAATTACGATAAATGCGAAAGCCGAGTAAAATGATAAACACACTTAAAA
ACAAAAGGAGTCAAAATAAAATACCACTTAACCGGACAAAAGCACAAACCGGACTAAACA
TGCGAAAACAAGTGATCAACAACCAAATCTCATCGCTAATACCCATCTTCTCTCACCGGA
ACCAACCCCTAATTTTTACCACTCTCAGAGATCGAGTAGATCCGGCTGACCTTGACCACC
CTCTGGCGTCGTTGTTTTCTCCTCTCCGGCTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAAACGG
TGGCATCTTCGGCACCTCAGTGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCAAC
GGCTTGTTCTTCGACACAGAGTATAGCAACGTAAAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATAGG
AATCGAAGAAAGCCTCGGATCCAACACTTTGAGAACAGAGTCCTTGTTCGAACCAGTCAT
TTTACGAACCCACTGCACGATATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTTTCTCCC
GGTGACTAGTTCTAAAAGAACCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATCTACCTT
CAACGTATACGCATATTCTGGTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGACATGCA
TTCAGAAGTACCGGAGTCTTGTAAGAACTTGGCGAGACCAAAGTCAGCGACATGAGCTT

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4EP86TF 685 0 0
ATACCACTTA*CCGGACAAAAGCACAAACCGGACTAAACATGCGAAAACAAGTGATCAAC
AACCAAATCTCATCGCTAATACCCATCTTCTCTCACCGGAACCAACCCCTAATTTTTACC
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CCTCTCCGGCTGATTCCGTCGCAGGCTGATCCTTAGACGGTGGCATCTTCGGCACCTCAG
TGAGAATCTGAACGACTTCTCTCATCGTAGGTCTCTCAACGGCTTGTTCTTCGACACAGA
GCATAGCAACGTAGAAAACGTGCGTCACTTCGTGAATAGGAATCGAAGAAAGCCTCGGAT
CCAACACTTTGAGAACAGAGTCCTTGTTCGAATCAGTCATTTTACGAACCCACTGCACGA
TATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTTTCTCCCGGTGACTAGTTCTAAAAGAA
CCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATCTACCTTCAACGTATACGCATATTCTG
GTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGACATGCATTCAGAAGTACCGGAGTCTT
GTAAGAACTTGGCGAGACCAAAGTCAGCGACATGAGCTTCGAAGCTGGAATCGAGGAGGA
TGTTGTTCGACTTAACATCTCGAT
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EN47TF 542 0 0
AGTCATTTTACGAACCCACTGCACGATATCGACACCGTCACCGAACTCACCGACGGGTTT
TCTCCCGGTGACTAGTTCTAAAAGAACCACACCGAAACTGTACACATCGCTCTTCTCATC
TACCTTCAACGTATACGCATATTCTGGTGCTATGTAGCCGTAAGATCCAGCGATGGCAGA
CATGCATTCAGAAGTACCGGAGTCTTGTAAGAACTTGGCGAGACCAAAGTCAGCGACATG
AGCTTCGAAGCTGGAATCGAGGAGGATGTTGTTCGACTTAACATCTCGATGAACAATCAG
CGGAGAACAATCGTGATGGAGATAACAGAGTCCTTTCGCAGCTTCGAGAGCAATCTTGTA
ACGCGTGTCCCAATGCAAGTGTCCACCTTTCTTACCGTGCAACACCTCACCGAGACTCCC
GTTAGGCATGTACTCATACACGAGCAGATTCGTCTCGTGGTTAGAGCAAAAACCTAGCAG
CCTCACGATGTGCCTGTGCCTTATCCTCCCCAAGGTCTGAATCTCCGCGTTGAACCCGTG
AC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 2 6

CO CL1186Contig1 761 2 1 U
GAACGTGTGGTGATTCAAAACATCGAAACTCAAAACAATTTGAGCTTCCCCAAGAGTCCA
AGACCGCGTGGTAGAAATAAGAATAAATAAATGTTCCAATACATTTAACTAAGAAATGAA
GAGTCCTCCTACGTTTGTTGTGTAAAATGTAGAGCATCTCACTGTTACATTGTCACAACT
CAAGTAGGCTAAAACCCAAACCTTGGCCCCACCCTAAAAATGAATATGAATAATCATTTT
TTGTGCTAACTTCTTTTTTTTTGTGTGTGGTGAGTGTGTTCTACTTAGCTTTTATCAATG
GAGTTTCGATCTTCATTTGGATATGGGACGTGCTTCAAGGCAGCAAACCCTCCTCTACTT
ATTTGTACAAGACCTAATTACACTTATATCAGGTTGAGAAGTAGAAGTCAGAGATTCCCA
TTCAGAGTCTCTGCTATTTCAAATATGGAATTTTCTGAGTCTGCTCTGGAAGAATCCAGG
AAGAGGGTTGTTCTTGAACCTTCACCTCTCCAGGTAGTGTAGTACAGTGAATGGAGGATT
ATCTCTCTTTCATTGCTTTTTGCCTGTTTGTGGAAATACTATGAACAATGGTGTGGGTAT
ATGGGCCCAATCTCATCTTCCAGCCCAATGCCATAACCCGGGCCTAAGTTCGATCTCTGT
TGTGGTCTTTTAAACATCGCCTAAGAAGACAGGAGCGCCACAGGTGACGTCATTGTTGTA
ACCTCGCCACAGAAGAAATAATGAGTTAAAGTACTCCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 



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AAGAGGACTCTTCATTTCTTAGTTAAATGTATTGGAACATTTATTTATTCTTATTTCTAC
CG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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GG
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GCTTCTCCACCTTGAGCTAAGATTTCTTTGCCTCGCCTCTCCTTCCCCACAGGTAACGTT
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ATTATTTCTTCTGTGGCGAGGTTACAACAATGACGTCACCTGTGGCGCTCCTGTCTTCTT
AGGCGATGTTTAAAAGATCACAACAGAGATCGAAC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR4DW13TF 757 0 0
GGGAACACACACACGGTGACTTGAGTTCTTCAACTTCTTCCAATGCGATTTGATGATCCG
ATCCGGTGAAAGCTTCGCCAAGTTTCTTCTCCGGTGTACCTCTCTATCGCCAAGAGTCTC
CTCAAGCTTCTTGTCTTTGCTATGTCTCCCTAGAACCTCGATGTGGTGATGAAGTCTATC
GGCGAGTCCC*TCTCGCCGTAGTTCCGAAGTAGCTCGTACGCCGCCACCTCTTCCTCACC
TTGCTTTGATTCTCAAGATCAACTTACTTCCAAATCCTCAGCTCTCTCCCTTTAATCAAA
TCAACTACTCACCAACTCCTCTTCCATGGTGATGAATGATTTGCTCGATCTAGCCGGATT
ACTGCAGCGCTCCGCCGAGATACTCGTCTCCCTTCAGCCTCCATCGCTGTTTAAGACGTT
TTCTCCCTGCTTCTCCACCTTGAGCTAAGATTTCTTTGCCTCGCCTCTCCTTCCCCACAG
GTAACGTTTCCTTTGAACTCTAAAGTTCCTTCATTGTTGTTTAAGAAATAACCGGAGTAC
TTTAACTCATTATTTCTTCTGTGGCGGGGTTACAACAATGACGTCACCTGTGGCGCTCCT
GTCTTCTTAG*CGATGTTTAAAAGATCACAACGGAGATCGAACTTAG*CCCGGGTTCAGA
CATAAAGCGGCTTATGAGTCCAACTGCAAAACCTAAATCAG*TCTCGATCCGACCATTGC
GTACATAAGACTTCCTACCGCGCTTGCATACG
TTATG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4CQ40TF 678 0 0
AGCTTCGCCAAGTTTCTTCTCCGGTGTACCTCTCTATCGCCAAGAGTCTCCTCAAGCTTC
TCGTCTTTGCCATGTCTCCCTAGAACCTCGATGTGGTGATGAAGTCTATCGGCGAGTCCC
CTTTCGCCGTAGTTCCGAAGTAGCTCGTACGCCGCCACCTCTTCCTCACCTTGCTTTGAT
TCTCAAGATCAACTTACTTCCAAATCCTCAGCTCTCTCCCTTTAATCAAATCAACTACTC
ACCAACTCCTCTTCCATGGTGATGAATGATTTGCTCGATCTAGCCGGATTACTGCAGCGC
TCCGCCGAGATACTCGTCTCCCTTCAGCCTCCATCGCTGTTTAAGACGTTTTCTCCCTGC
TTCTCCACCTTGAGCTAAGATTTCTTTGCCTCGCCTCTCCTTCCCCACAGGTAACGTTTC
CTTTGAACTCTAAAGTTCCTTCATTGTTGTTTAAGAAATAACCGGAGTACTTTAACTCAT
TATTTCTTCTGTGGCGAGGTTACAACAATGACGTCACCTGTGGCGCTCCTGTCTTCTTAG
GCGATGTTTAAAAGATCACAACAGAGATCGAACTTAGGCCCGGGTTCAGACATAAAGCGG
CTTATGAGTCCAACTGCAAA*CCTAAATCAG*TCTCGATCCGACCATTGCGTACATAAGA
CTTCCTACCGCGCTTGCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4CQ40JQ 763 0 0
TGTGGCGAGGTTACAACAATGACGTCAC*TGTGGCGCTCCTGTCTTCTTAGGCGATGTTT
AAAAGATCACAACAGAGATCGAACTTAGGCCCGGGTTCAGACATAAAGCGGCTTATGAGT
CCAACTGCAAAACCTAAATCAGGTCTCGATCCGACCATTGCGTACATAAGACTTCCTACC
GCGCTTGCATACGGTTATGGCATTGGGCTGGAAGATGAGATTGGGCCCATATACCCACAC
CATTGTTCATAGTATTTCCACAAACAGGCAAAAAGCAATGAAAGAGAGATAATCCTCCAT
TCACTGTACTACACTACCTGGAGAGGTGAAGGTTCAAGAACAACCCTCTTCCTGGATTCT
TCCAGAGCAGACTCAGAAAATTCCATATTTGAAATAGCAGAGACTCTGAATGGGAATCTC
TGACTTCTACTTCTCAACCTGATATAAGTGTAATTAGGTCTTGTACAAATAAGTAGAGGA
GGGTTTGCTGCCTTGAAGCACGTCCCATATCCAAATGAAGATCGAAACTCCATTGATAAA
AGCTAAGTAGAACACACTCACCACACACAAAAAAAAAAGAAGTTAGCACAAAAAATGATT
ATTCATATTCATTTTTAGGGTGGGGCCAAGTTTTGGGTTTTAGCCTACTTGAGTTGTGAC
AATGTAACAGTGAGATGCTCTACATTTTACACAACAAACGTAAGAGGACTCTTCATTTCT
TAGTTAAATGTATTGGAACATTTATTTATTCTTATTTCTACCG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 6

CO CL1187Contig1 922 6 26 U
GGAGAGCTCACGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAAGATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTAC
ATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACATGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTT
ACGTTTCACTCTCCAAACCCGTCCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACG
ATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCTGCAGTTG
GTTCCAAAGTGTCTCCCGCTGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGC
CAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAG
CTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACA
ACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCA
CTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGCAAACAAG
CTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAA
ACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGC
TGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCACAGCCACTGTGA
ATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAG
CCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAAC
TCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGG
ATAATGAAACTAAGCTTTTGAG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E732TF U 18
AF RR4BH13TF U 1
AF RR4E732JQ C 656
AF RR4FR45TF U 331
AF RR4BH13JQ C 3
AF RR4FR45JQ C 331
BS 1 340 RR4BH13TF
BS 341 341 RR4FR45TF
BS 342 532 RR4BH13TF
BS 533 533 RR4FR45TF
BS 534 586 RR4BH13TF
BS 587 587 RR4FR45TF
BS 588 659 RR4BH13TF
BS 660 660 RR4FR45TF
BS 661 682 RR4BH13TF
BS 683 683 RR4FR45TF
BS 684 688 RR4BH13TF
BS 689 689 RR4FR45TF
BS 690 703 RR4BH13TF
BS 704 704 RR4FR45TF
BS 705 715 RR4BH13TF
BS 716 716 RR4FR45TF
BS 717 766 RR4BH13TF
BS 767 767 RR4FR45TF
BS 768 793 RR4BH13TF
BS 794 794 RR4FR45TF
BS 795 847 RR4BH13TF
BS 848 848 RR4FR45TF
BS 849 852 RR4BH13TF
BS 853 853 RR4FR45TF
BS 854 874 RR4BH13TF
BS 875 922 RR4BH13JQ

RD RR4E732TF 666 0 0
CAGATAC
AGAGAGAGAAAATGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCG
CCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTTACGTTTCACTCTCCAAACCCGTCC
AGGTAATGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGCC
TCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCCGCCGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGATG
CTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGG
CATACAGTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGG
TAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCA
ATGTCATGGTCACCCCTGCCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGTCTCTCCTGAAGAGT
TCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTG
AGGGAGGCTTTGACAACAATTCAGTGGCAACAGCAAACACTCTGGAGACTAATGTTCAGG
ACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACG*CCGATGGAGA
T

QA 8 665 8 665
DS 

RD RR4BH13TF 874 0 0
GGAGAGCTCACGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAAGATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTAC
ATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACATGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTT
ACGTTTCACTCTCCAAACCCGTCCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACG
ATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCTGCAGTTG
GTTCCAAAGTGTCTCCCGCTGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGC
CAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATGGATTCCAAGTGCAGGTGCCAG
CTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACA
ACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCA
CTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGGAAACAAG
CTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCGGTGGCAACAGCAA
ACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGT
TGACAAGAACGGCCGATGGAGACGAAGGAGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCCACCGTGA
ATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAG*TGGTTCAAGGGAG
CCAACAAATTTGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAAC
TCAAACATAACAGAACAATGCTTTGCTTTCTTTC

QA 1 874 1 874
DS 

RD RR4E732JQ 243 0 0
CGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCACAGCCAC
TGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCGCAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAA
GGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAA
GCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTT*TTCATTTGTCTCTTTGTAAAA
AAA

QA 1 243 1 243
DS 

RD RR4FR45TF 552 0 0
GTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGT
ATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCA
TGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCT
CTCAGGTCAATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGTCTCTGAGGGAG
GCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTG
GTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCG
GTAAGCATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCAC
AAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTT
CTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTC
TTT
CTTGATTTG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4BH13JQ 920 0 0
AGAGCTCACGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAAGATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTACAT
CAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACATGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTTAC
GTTTCACTCTCCAAACCCGTCCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGAT
AACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCTGCAGTTGGT
TCCAAAGTGTCTCCCGCTGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCA
AAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATGGATTCCAAGTGCAGGTGCCAGCT
AAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAAC
TTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACT
GATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGGAAACAAGCT
TACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCGGTGGCAACAGCAAAC
ATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGTTG
ACAAGAACGGCCGATGGAGACGAAGGAGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCCACCGTGAAT
GGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCC
AACAAATTTGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTC
AAACATAACAGAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGAT
AATGAAACTAAGCTTTTGAG

QA 1 920 1 920
DS 

RD RR4FR45JQ 592 0 0
GTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGT
ATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCA
TGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCT
CTCAGGTCAATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGTCTCTGAGGGAG
GCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTG
GTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCG
GTAAGCATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCAC
AAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTT
CTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTC
TTTCTTGATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGATAATGAAACTAAGCTTTTGAG

QA 1 592 1 592
DS 



AS 2 6

CO CL1188Contig1 846 2 6 U
AGATCAAATAGAAAAAGATGCGGTTGGAGTGTGAGTGAGAAAATCTGATATTATCACAAG
TCAAGTCTGATGTGAGGGAGTCCATACCAGAAACATATGTCCTTCACACTATACCCGTTA
GGGGGAAACAGAGAATTGTAAAAAGAATACGTAAAAAACACCATCGCATTTAGAAGATTT
TCTTTCTCAGAAGCCAGATTCTCTCCTTCGATGGTGGTGTGAGGGACCAGTTTTCTACTA
ACCACAACATGCTGATTTCTGAGTAGCTTGAGATGTCCCTGCACCCTGATCGGTTTGGTT
GATTTTGATTGTTTGTGGCTCAGCCTTTGCATCGGTATCTGCAAGTCTTTGCTTAATGTC
TTTACCAATTGAAAAGAAAACTTCCTCAACGTTTAGGTTAGTCTTGGCACTAGTCTCGAA
AAACTTCATTCCGTATTCATCTGCAAGAGCTTGACCCTTCGCTTTTGGCACAGCTCGTTT
GCTTTCATCCATATCAGCCTTGTTCCCCACAAGAATCTTGTTGACATTATCAGACGCGTG
CTGCTCAATGTTACGGATCCAATTCCTGATATTGTTGAAAGATGATTCATCAGTGACATC
ATACACAAGCAAGATGCCCATGGCTCCACGGTAGTATGCAGTTGTGATAGTCCTGAACCG
CTCCTGTCCAGCAGTATCCCAGATTTGCAGCTTGATTCTCTTCCCATCCAGCTCAATAGT
CCGTATCTTGAAATCAATACCAATAGTCGTAATGAAACTGGTGGTGAATGAGCCATAGAG
AAACGTAGAAGAGCAACTTTTACCCACACCGCTGTCTCCGATCAAGAGAAGTTTGATGAG
GTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP51JQ U 1
AF RR4EW42JQ U 31
BS 1 153 RR4DP51JQ
BS 154 154 RR4EW42JQ
BS 155 282 RR4DP51JQ
BS 283 284 RR4EW42JQ
BS 285 645 RR4DP51JQ
BS 646 846 RR4EW42JQ

RD RR4DP51JQ 645 0 0
AGATCAAATAGAAAAAGATGCGGTTGGAGTGTGAGTGAGAAAATCTGATATTATCACAAG
TCAAGTCTGATGTGAGGGAGTCCATACCAGAAACATATGTCCTTCACACTATACCCGTTA
GGGGGAAACAGAGAATTGTAAAAAGAATACGTAGAAAACACCATCGCATTTAGAAGATTT
TCTTTCTCAGAAGCCAGATTCTCTCCTTCGATGGTGGTGTGAGGGACCAGTTTTCTACTA
ACCACAACATGCTGATTTCTGAGTAGCTTGAGATGTCCCTGC**CCTGATCGGTTTGGTT
GATTTTGATTGTTTGTGGCTCAGCCTTTGCATCGGTATCTGCAAGTCTTTGCTTAATGTC
TTTACCAATTGAAAAGAAAACTTCCTCAACGTTTAGGTTAGTCTTGGCACTAGTCTCGAA
AAACTTCATTCCGTATTCATCTGCAAGAGCTTGACCCTTCGCTTTTGGCACAGCTCGTTT
GCTTTCATCCATATCAGCCTTGTTCCCCACAAGAATCTTGTTGACATTATCAGACGCGTG
CTGCTCAATGTTACGGATCCAATTCCTGATATTGTTGAAAGATGATTCATCAGTGACATC
ATACACAAGCAAGATGCCCATGGCTCCACGGTAGTATGCAGTTGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4EW42JQ 816 0 0
GA
GAGTGAGAAAATCTGATATTATCACAAGTCAAGTCTGATGTGAGGGAGTCCATACCAGAA
ACATATGTCCTTCACACTATACCCGTTAGGGGGAAACAGAGAATTGTAAAAAGAATACGT
AAAAAACACCATCGCATTTAGAAGATTTTCTTTCTCAGAAGCCAGATTCTCTCCTTCGAT
GGTGGTGTGAGGGACCAGTTTTCTACTAACCACAACATGCTGATTTCTGAGTAGCTTGAG
ATGTCCCTGCACCCTGATCGGTTTGGTTGATTTTGATTGTTTGTGGCTCAGCCTTTGCAT
CGGTATCTGCAAGTCTTTGCTTAATGTCTTTACCAATTGAAAAGAAAACTTCCTCAACGT
TTAGGTTAGTCTTGGCACTAGTCTCGAAAAACTTCATTCCGTATTCATCTGCAAGAGCTT
GACCCTTCGCTTTTGGCACAGCTCGTTTGCTTTCATCCATATCAGCCTTGTTCCCCACAA
GAATCTTGTTGACATTATCAGACGCGTGCTGCTCAATGTTACGGATCCAATTCCTGATAT
TGTTGAAAGATGATTCATCAGTGACATCATACACAAGCAAGATGCCCATGGCTCCACGGT
AGTATGCAGTTGTGATAGTCCTGAACCGCTCCTGTCCAGCAGTATCCCAGATTTGCAGCT
TGATTCTCTTCCCATCCAGCTCAATAGTCCGTATCTTGAAATCAATACCAATAGTCGTAA
TGAAACTGGTGGTGAATGAGCCATAGAGAAACGTAGAAGAGCAACTTTTACCCACACCGC
TGTCTCCGATCAAGAGAAGTTTGATGAGGTATCG

QA 3 816 3 816
DS 



CO CL1188Contig2 844 4 6 U
GGGATCGGGAGGAAACAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAG
CAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCTCGCGATGGCTGCTCCTCCTG
CTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTG
TGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTA
CGACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTGGATGGGAAGAGAATCAAGC
TGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACC
GTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATA
TCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTG
TGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGTCAAG
CTCTTGCAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACG
TTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATG
CAAAGGCTGAGCCACAAACAATCAAAATCAACCAAACCGATCAGGGTGCAGGGACATCTC
AAGCTACTCAGAAATCAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTCACACCACCATC
GAAGAGAGATCTGGCTTCTGAGAAGAAATCTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTC
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DP51TF U 1
AF RR4EW42TF U 67
AF RR4E465TF U 112
AF RR4D162TF U 67
BS 1 531 RR4DP51TF
BS 532 535 RR4D162TF
BS 536 536 RR4E465TF
BS 537 697 RR4D162TF
BS 698 698 RR4E465TF
BS 699 844 RR4D162TF

RD RR4DP51TF 531 0 0
GGGATCGGGAGGAAACAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAG
CAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCTCGCGATGGCTGCTCCTCCTG
CTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTG
TGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTA
CGACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTGGATGGGAAGAGAATCAAGC
TGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACC
GTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATA
TCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTG
TGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4EW42TF 620 0 0
TGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCTCGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAG
CCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTA
AAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCT*ATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTACGACTA
TTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTGGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAA
TCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAG
CCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGA
ATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTGTGGGGA
ACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGTCAAGCTCTTG
CAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGG
AAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGG
CTGAGCCACAAACAATCAAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4E465TF 666 0 0
CTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAG
ACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCA
GTTTCATTACGACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTGGATGGGAAGA
GAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTG
CATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTT
TCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACA
AGATTCTTGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGA
AGGGTCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTA
ACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAG
ATACCGATGCAAAG*CTGAGCCACAA*CAATCAAAATCAACCAAACCGATCAGG***CAG
G*ACATCTCA*GCTACTCAGAA*TCAGCATGTTGTGGT*AGTAGAAA*CTGGTCC*TCAC
ACCACC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4D162TF 778 0 0
TGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCACGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAG
CCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTA
AAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTACGACTA
TTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAA
TCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAG
CCATGGGCATCTTGCTCGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGA
ATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTGGTGGGGA
ACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTG
CAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGG
AAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGG
CTGAGCCACAAACAATCAAAATCAACCAAACGGATCAGGGTGCAGGGACATCTCAAGCTA
CTCAGAAATCAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTCACACCACCATCGAAGAG
AGATCTGGCTTCTGAGAAGAAATCTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 5

CO CL1189Contig1 858 5 12 U
GGGCAGAAGCAAAGATCGGTCTTTCAACAGTCAGAGAGTGAGTGGTGAAATCGAAAGTGA
AAGAGAAAACAAGAGAGGTTCAACAATGGTGACGACTCAACATCCTTTCACTCTGCTTCT
CCTTATTCTTCCGCTAGCTGTCATCGGGATCTTCTCCTCCTCTTCTCAGGTTAGCGCAAC
CAATGTCAGAATCGAACAATTCTCCTCGCCTTTCTCTACCGATCTCGCAACCCTGCAATC
TCAAATCGGCTACAACTTCACAAACATCAACCTCCTTCGCCGTGCAATGACCCACGCTTC
CTTCTCTCAAGAGAACAACAAGGCCCTCAGTATCTTCGGATCCCATCTCATCGAAACCGC
TGTCTCTCTTCAGCTTCTCTCCAAAGACATCGACACCTCCTCCAAGGCTCTGACCCGTTT
GATAGCGGAGGTTTCGAGTGTGGAGTCCTCGTGTGCTCTTGATGGGAACCGGTTGGGTTT
GGAGAGGGTTATCAGGGTTTCTCCCAAGACTGATGCCTCGAACTCGGCGATTGTTTGCGG
TGGGTTCAGAGCCATCTTTGGAGCTGTTGCTGTTGATTCTGGATTGGTTGATGAGGCTAT
GAAGGTTTTCTGGAAAGTACATGGAGGTCCAGGTGGGAGACTAGTAGTGTCTATGCTGTA
ATATTAGTGTTTTGCTTCGGATGGTAAAAGTTCTAAGAGGTTCGTCTTTAAGGCTTATAT
GGTACTAGTACTACTAATCGCTTTCTTTCTCTTTGTTTTTTTTTCTTTT*GTGTTGTGTG
ATGAGCAAAACAATAATAATATTGGTTGATGTTGTGAGGATGTGTAAGGGACCACTGCAA
TGAAATGTTTCAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4EK36TF U 1
AF RR4BA78TF U 16
AF RR4H915TF U 16
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CCTTATTCTTCCGCTAGCTGTCATCGGGATCTTCTCCTCCTCTTCTCAGGTTAGCGCAAC
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TCAAATCGGCTACAACTTCACAAACATCAACCTCCTTCGCCGTGCAATGACCCACGCTTC
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GATAGCGGAGGTTCCGAGTGTGGAGTCCTCGTGTGCTCTTGATGGGAACCGGTTGGGTTT
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TGGGTTCAGAGCCATCTTTGGAGCTGTTGCTGTTGATTCTGGATTGGTTGATGAGGCTAT
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ATATTAGTGTTTTGCTTCGGATGGTAAAAGTT

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DS 

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GGGGTCTT
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CAATGGTGACGACTCAACATCCTTTCACTCTGCTTCTCCTTATTCTTCCGCTAGCTGTCA
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CCTCGCCTTTCTCTACCGATCTCGCAACCCTGCAATCTCAAATCGGCTACAACTTCACAA
ACATCAACCTCCTTCGCCGTGCAATGACCCACGCTTCCTTCTCTCAAGAGAACAACAAGG
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AAGACATCGACACCTCCTCCAAGGCTCTGACCCGTTTGATAGCGGAGGTTTCGAGTGTGG
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DS 

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TCAACAGTCAGAGAGTGAGTGGTGAAATCGAAAGTGAAAGAGAAAACAAGAGAGGTTCAA
CAATGGTGACGACTCAACATCCTTTCACTCTGCTTCTCCTTATTCTTCCGCTAGCTGTCA
TCGGGATCTTCTCCTCCTCTTCTCAGGTTAGCGCAACCAATGTCAGAATCGAACAATTCT
CCTCGCCTTTCTCTACCGATCTCGCAGCCCTGCAATCTCAAATCGGCTACAACTTCACAA
ACATCAACCTCCTTCGCCGTGCAATGACCCACGCTTCCTTCTCTCAAGAGAACAACAAGG
CCCTCAGTATCTTCGGATCCCATCTCATCGAAACCGCTGTCTCTCTTCAGCTTCTCTCCA
AAGACATCGACACCTCCTCCAAGGCTCTGACCCGTTTGATAGCGGAGGTTTCGAGTGTGG
AGTCCTCGCGTGCTCTTGATGGGAACCGGTTGGGTTTGGAGAGGGTTATCAGGGTTTCTC
CCAAGACTGATGCCTCGAACTCGGCGATTGTTT*CGGTGGGTTCAGAGCCATCTTTGGAG
CTGTTGTTGTTGATTCTGGATTGGTTGATGAGGCTATGAAGGTTTTCTGGAAAGTACATG
GAGGTCCAGGTGGGAGACTAGTAGTGTCTATGCTGTAATATTAGTGTTTTGCTTCGGATG
GTAAAAGTTCTAAGAGGTTCGTCTTTAAG*CTTATATGGTACTAGTACTACTAATCGCTT
TCTTTCTCTTTGTTTTTTTTTCTTT**GTGT*GTGTGATGAGCAAA
CATAATATATTGGTTG

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TTTTCCCAAGACTGATGCCTCGAACTTGGCGATTGTTT*CGGTGGGTTCAGAGCCATCTT
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GGATGGTAAAAGTTTTAAGAGGTTTGTCTTTAAGGGTTATATGGTACTAGTACTACTAAT
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ATATTGGTTGATGTTGTG
AGG

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DS 

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AAGAGAACAACAAGGCCCTCAGTATCTTCGGATCCCATCTCATCGAAACCGCTGTCTCTC
TTCAGCTTCTCTCCAAAGACATCGACACCTCCTCCAAGGCTCTGACCCGTTTGATAGCGG
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TTATCAGGGTTTCTCCCAAGACTGATGCCTCGAACTCGGCGATTGTTTGCGGTGGGTTCA
GAGCCATCTTTGGAGCTGTTGCTGTTGATTCTGGATTGGTTGATGAGGCTATGAAGGTTT
TCTGGAAAGTACATGGAGGTCCAGGTGGGAGACTAGTAGTGTCTATGCTGTAATATTAGT
GTTTTGCTTCGGATGGTAAAAGTTCTAAGAGGTTCGTCTTTAAGGCTTATATGGTACTAG
TACTACTAATCGCTTTCTTTCTCTTTGTTTTTTTTTCTTTT*GTGTTGTGTGATGAGCAA
AACAATAATAATATTGGTTGATGTTGTGAGGATGTGTAAGGGACCACTGCAATGAAATGT
TTCAATTTCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 6

CO CL1190Contig1 962 6 4 U
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GTGCCTCCGCCTAACTCCGACGTCACGCCCTCATCTCCACCCACCTCAATCGTCTTGTTT
CCCTT*CTGTAATCAAATCCAGTAGCCTATCATTCTCTTCAGCCGCATCAGGTTTTGCGT
CACCACTCGCTGTAGAGAAGGAGCTACGCTCGTCGTTGGTGACGGAAGCTGTTCGACATG
TCACCGGGTCGCTTATGAGAGGGGAAGGTCTTCGATTCGCCATCGTTGTTGCTCGTTCCA
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GAGGAGATACCACCCATTATGATGCTTTTGCAAACTCTGCTGCATCTGGTGTACTTTCTG
CTAGCATCAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGATC
AGGCACTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGGTAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGG
CTCTCGAGATGG*CGTCGTTGTTTGAGCACCATCTGAAATAGCTGTTCCTTTCCATGGAT
AAACACAATGATCATATATGAGAACTTGTTACTCTGTCGCACTTGGTTACAATCCAATCT
CCAAAACTGTACCTCAAAGATTACCAAAATCTTTTCTTTCTTTTTTTTTCACCTTGTTGA
ACAAATATTTAGACGCTTTTGGTCTGGTTATGAATCGTGTGTTGTAACCTAATAATAAGT
TTCTCTGAATTTTGGGGACAAGTGGGTTATTCTTTACCAAACAAAAAAATATGGCTCTCA
TC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC02TF U 19
AF RR4A206TFB U 1
AF RR4A206TF U 407
AF RR4DC02JQ C 157
AF RR4A206JQ C 151
AF RR4A206JQD C 109
BS 1 85 RR4A206TFB
BS 86 86 RR4DC02TF
BS 87 823 RR4A206TFB
BS 824 962 RR4A206JQD

RD RR4DC02TF 720 0 0
GGA
AACCGCATCAGCTCAAATGAAGTCGTTAGCATCGCCGCCGTGCCTCCGCCTAACTCCGAC
GTCACGCCCTCGTCTCCACCCACCTCAATCGTCTTGTTTCCCTT*CTGTAATCAAATCCA
GTAGCCTATCATTCTCTTCAGCCGCATCAGGTTTCGCGTCACCACTCGCTGTAGAGAAGG
AGCTACGCTCGTCGTTGGTGACGGAAGCTGTTCGACATGTCACCGGGTCGCTTATGAGAG
GGGAAGGTCTTCGATTCGCCATCGTTGTTGCTCGTTTCAACGAGGTTGTGACGAAGTTGC
TTCTGGAAGGATCCATCGAAACTTTCAAGAAGTATTCTGTCAGAGAAGAAGACATCCAAG
TTATATGGGTTCCTGGCAGCTTTGAGATTGGTGTTGTTGCACAAAACCTTGGGAAATCAG
GAAACTTTGATGCTGTTTTATGTATTGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACCACCCATTATG
ATGCTGTTGCAAACTCTGCTGCATCTGGTGTACTTTCTGCTAGCATCAATTCAGGTGTTC
CATGCATATTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATG*ATCAGGCACTGAATCGATCTGGTG
GCAAAGCCGGTAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGGCTCTCGAGATGG*CGTCGTTG
TTTGAGCACCATCTGAAATAGCTGTTCCTTTCCATGGATAAACACAATGATCATATA

QA 4 720 4 720
DS 

RD RR4A206TFB 823 0 0
GAGCCTCACTCACTCACTACAAACCGCATCAGCTCAAATGAAGTCGTTAGCATCGCCGCC
GTGCCTCCGCCTAACTCCGACGTCATGCCCTCATCTCCACCCACCTCAATCGTCTTGTTT
CCCTT*CTGTAATCAAATCCAGTAGCCTATCATTCTCTTCAGCCGCATCAGGTTTTGCGT
CACCACTCGCTGTAGAGAAGGAGCTACGCTCGTCGTTGGTGACGGAAGCTGTTCGACATG
TCACCGGGTCGCTTATGAGAGGGGAAGGTCTTCGATTCGCCATCGTTGTTGCTCGTTCCA
ACGAAGTTGTGACGAAGTTGCTTCTGGAAGGAGCCATCGAAACTTTCAAGAAGTATTCTG
TCAGAGAAGAAGACATCCAAGTTATATGGGTTCCTGGCAGCTTTGAGATTGGTGTTGTTG
CACAAAACCTTGGGAAATCAGGAAACTTTGATGCTGTTTTATGTATTGGTGCTGTGATAA
GAGGAGATACCACCCATTATGATGCTTTTGCAAACTCTGCTGCATCTGGTGTACTTTCTG
CTAGCATCAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGATC
AGGCACTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGGTAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGG
CTCTCGAGATGG*CGTCGTTGTTTGAGCACCATCTGAAATAGCTGTTCCTTTCCATGGAT
AAACACAATGATCATATATGAGAACTTGTTACTCTGTCGCACTTGGTTACAATCCAATCT
CCAAAACTGTACCTCAAAGATTACCAAAATCTTTTCTTTCTTT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4A206TF 402 0 0
GATTGGTGTTGTTGCACAAAACCTTGGGAAATCAGGAAACTTTGATGCTGTTTTATGTAT
TGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACCACCCATTATGATGCTTTTGCAAACTCTGCTGCATC
TGGTGTACTTTCTGCTAGCATCAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTACTGACATG
CGAGGACATGGATCAGGCACTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGGTAACAAGGGAGCTGA
AACTGCTTTGACGGCTCTCGAGATGGGCGTCGTTGTTTGAGCACCATCTGAAATAGCTGT
TCCTTTCCATGGATAAACACAATGATCATATATGAGAACTTGTTACTCTGTCGCACTTGG
TTACAATCCA*TCTCCAAAACTGTACCTCAA*GATTACCAAA

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4DC02JQ 763 0 0
CTTCAGCCGCATCAGGTTTCGCGTCACCACTCGCTGTAGAGAAGGAGCTACGCTCGTCGT
TGGTGACGGAAGCTGTTCGACATGTCACCGGGTCGCTTATGAGAGGGGAAGGTCTTCGAT
TCGCCATCGTTGTTGCTCGTTTCAACGAGGTTGTGACGAAGTTGCTTCTGGAAGGATCCA
TCGAAACTTTCAAGAAGTATTCTGTCAGAGAAGAAGACATCCAAGTTATATGGGTTCCTG
GCAGCTTTGAGATTGGTGTTGTTGCACAAAACCTTGGGAAATCAGGAAACTTTGATGCTG
TTTTATGTATTGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACCACCCATTATGATGCTGTTGCAAACT
CTGCTGCATCTGGTGTACTTTCTGCTAGCATCAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTG
TACTGACATGCGAGGACATG*ATCAGGCACTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGGTAACA
AGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGGCTCTCGAGATGG*CGTCGTTGTTTGAGCACCATCTG
AAATAGCTGTTCCTTTCCATGGATAAACACAATGATCATATATGAGAACTTGTTACTCTG
TCGCACTTGGTTACAATCCAATCTCCAAAACTGTACCTCAAAGATTACCAAAATCTTTTC
TTTCTTTTTTTT*CACCTTGTTGAACAAATATTTAGACGCTTTTGGTCTGGTTATGAATC
GTGTGTTGTAACCTAATAATAAGTTTCTCTGAATTTTGGG
GAC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4A206JQ 766 0 0
CATTCTCTTCAGCCGCATCAGGTTTTGCGTCACCACTCGCTGTAGAGAAGGAGCTACGCT
CGTCGTTGGTGACGGAAGCTGTTCGACATGTCACCGGGTCGCTTATGAGAGGGGAAGGTC
TTCGATTCGCCATCGTTGTTGCTCGTTCCAACGAAGTTGTGACGAAGTTGCTTCTGGAAG
GAGCCATCGAAACTTTCAAGAAGTATTCTGTCAGAGAAGAAGACATCCAAGTTATATGGG
TTCCTGGCAGCTTTGAGATTGGTGTTGTTGCACAAAACCTTGGGAAATCAGGAAACTTTG
ATGCTGTTTTATGTATTGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACCACCCATTATGATGCTTTTG
CAAACTCTGCTGCATCTGGTGTACTTTCTGCTAGCATCAATTCAGGTGTTCCATGCATAT
TTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGATCAGGCACTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCG
GTAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGGCTCTCGAGATGG*CGTCGTTGTTTGAGCAC
CATCTGAAATAGCTGTTCCTTTCCATGGATAAACACAATGATCATATATGAGAACTTGTT
ACTCTGTCGCACTTGGTTACAATCCAATCTCCAAAACTGTACCTCAAAGATTACCAAAAT
CTTTTCTTTCTTTTTTTTTCACCTTGTTGAACAAATATTTAGACGCTTTTGGTCTGGTTA
TGAATCGTGTGTTGTAACCTAATAATAAGTTTCTCTGAATTTTGGG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4A206JQD 854 0 0
ATCGTCTTGTTTCCCTTTCTGTAATCAAATCCAGTAGCCTATCATTCTCTTCAGCCGCAT
CAGGTTTTGCGTCACCACTCGCTGTAGAGAAGGAGCTACGCTCGTCGTTGGTGACGGAAG
CTGTTCGACATGTCACCGGGTCGCTTATGAGAGGGGAAGGTCTTCGATTCGCCATCGTTG
TTGCTCGTTCCAACGAAGTTGTGACGAAGTTGCTTCTGGAAGGAGCCATCGAAACTTTCA
AGAAGTATTCTGTCAGAGAAGAAGACATCCAAGTTATATGGGTTCCTGGCAGCTTTGAGA
TTGGTGTTGTTGCACAAAACCTTGGGAAATCAGGAAACTTTGATGCTGTTTTATGTATTG
GTGCTGTGATAAGAGGAGATACCACCCATTATGATGCTTTTGCAAACTCTGCTGCATCTG
GTGTACTTTCTGCTAGCATCAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTACTGACATGCG
AGGACATGGATCAGGCACTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGGTAACAAGGGAGCTGAAA
CTGCTTTGACGGCTCTCGAGATGG*CGTCGTTGTTTGAGCACCATCTGAAATAGCTGTTC
CTTTCCATGGATAAACACAATGATCATATATGAGAACTTGTTACTCTGTCGCACTTGGTT
ACAATCCAATCTCCAAAACTGTACCTCAAAGATTACCAAAATCTTTTCTTTCTTTTTTTT
TCACCTTGTTGAACAAATATTTAGACGCTTTTGGTCTGGTTATGAATCGTGTGTTGTAAC
CTAATAATAAGTTTCTCTGAATTTTGGGGACAAGTGGGTTATTCTTTACCAAACAAAAAA
ATATGGCTCTCATC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 3 7

CO CL1191Contig1 539 2 1 U
GGTATTCTTCACCTGTGAACTTCTTACACAATTTCCGGCGAGGAAGATGCCACTGTAAGG
GAGCCACTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTAGACGAGAGAATCTATGTCAAGCTCCGCTCA
GACCGCGAACTCCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTGGGT
GATGTTGAAGAAGTTATCACTACTGTGGAAATTGATGACGAGACATACGAAGAGATTGTC
CGGACGACAAAGCGCAATATTCAGTATCTATTTGTGAGAGGAGATGGAGTAATATTGGTG
TCTCCACCACTGAGGACAACTTGAGCTAAAAATCAAATCCGAAGCCTAAGTTAATCAACT
CTTTAAACAAATGTCTTCGTGACTATGTGTCGTCCAAAACTCGAAATGCTTTAAGAAGAT
GTGTTTTCTTTGGAATGTTTCTCCCTCTCAACTTCTTTGGTTTTACTTTTCATCGTGGGA
CCATTCTTGATTACAACCCAAACCATCTGAGTTTTATAAGTAAAGACAAGTTCTTAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B557JQ C 1
AF RR4B557TF U 1
BS 1 539 RR4B557TF

RD RR4B557JQ 539 0 0
GGTATTCTTCACCTGTGAACTTCTTACACAATTTCCGGCGAGGAAGATGCCACTGTAAGG
GAGCCACTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTAGACGAGAGAATCTATGTCAAGCTCCGCTCA
GACCGCGAACTCCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTGGGT
GATGTTGAAGAAGTTATCACTACTGTGGAAATTGATGACGAGACATACGAAGAGATTGTC
CGGACGACAAAGCGCAATATTCAGTATCTATTTGTGAGAGGAGATGGAGTAATATTGGTG
TCTCCACCACTGAGGACAACTTGAGCTAAAAATCAAATCCGAAGCCTAAGTTAATCAACT
CTTTAAACAAATGTCTTCGTGACTATGTGTCGTCCAAAACTCGAAATGCTTTAAGAAGAT
GTGTTTTCTTTGGAATGTTTCTCCCTCTCAACTTCTTTGGTTTTACTTTTCATCGTGGGA
CCATTCTTGATTACAACCCAAACCATCTGAGTTTTATAAGTAAAGACAAGTTCTTAAGC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4B557TF 539 0 0
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GAGCCACTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTAGACGAGAGAATCTATGTCAAGCTCCGCTCA
GACCGCGAACTCCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTGGGT
GATGTTGAAGAAGTTATCACTACTGTGGAAATTGATGACGAGACATACGAAGAGATTGTC
CGGACGACAAAGCGCAATATTCAGTATCTATTTGTGAGAGGAGATGGAGTAATATTGGTG
TCTCCACCACTGAGGACAACTTGAGCTAAAAATCAAATCCGAAGCCTAAGTTAATCAACT
CTTTAAACAAATGTCTTCGTGACTATGTGTCGTCCAAAACTCGAAATGCTTTAAGAAGAT
GTGTTTTCTTTGGAATGTTTCTCCCTCTCAACTTCTTTGGTTTTACTTTTCATCGTGGGA
CCATTCTTGATTACAACCCAAACCATCTGAGTTTTATAAGTAAAGACAAGTTCTTAAGC

QA 1 539 1 539
DS 



CO CL1191Contig2 655 3 2 U
TGGACTCTGGTATTCAGTGGGGATCAGCACCCTCAAGTGAAAGGCATACGAGATGCGGCT
GTTGAGCTCTTGCACACTCTTGTAGCTGTCCATGCAGAGGTCTTTTGCGGGTGCAAAACC
ACTACTGGACAAGATACTTGGCGTCCTGATCGAAGGTCTAGTCGACACTTTTCTCAGTCT
TGTAGAAGAAAACAGAACAGATGATCTGAGTTCAATTGATGCAAATGGTTTCTGCCAACT
CATGTTTGAGCTTGAATACTTTGAGACAGTACTTAATCTATATTTCACAAGCGATGCAAC
CGCGTCTCTGAAAACGCTACAAGGAACCGTGTTGGAGATTCGCCATAGAGAGCATCAGTG
AAGCAGTAGAGACTCCGGGGCATAACCGCAGACCAACTCGTGGCAGCGAAGACACAGTTT
CAGATGACCTCGCTCTAACGAAACAGTACTCGAGCGAATTGCTGCAGTCAGAAATGGAGA
GAACTCGTCTGAACACCGCATGCTTTGCAGAGTCAGTCCCGGTAGAGCCAACGCCTACAT
TACCCAAAACTGCGTACAGAGTGTCGATGGATTCTCCAAGTAGAAACTACAGAGCTCACA
ATCATCAGGTCTCCGGTCATAGCCGACCCAGACGAAGATAAAAGACAACTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC73TF U 1
AF RR4CK71JQ C 10
AF RR4CK71TF U 153
BS 1 295 RR4FC73TF
BS 296 655 RR4CK71TF

RD RR4FC73TF 295 0 0
TGGACTCTGGTATTCAGTGGGGATCAGCACCCTCAAGTGAAAGGCATACGAGATGCGGCT
GTTGAGCTCTTGCACACTCTTGTAGCTGTCCATGCAGAGGTCTTTTGCGGGTGCAAAACC
ACTACTGGACAAGATACTTGGCGTCCTGATCGAAGGTCTAGTCGACACTTTTCTCAGTCT
TGTAGAAGAAAACAGAACAGATGATCTGAGTTCAATTGATGCAAATGGTTTCTGCCAACT
CATGTTTGAGCTTGAATACTTTGAGACAGTACTTAATCTATATTTCACAAGCGAT

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR4CK71JQ 476 0 0
GTATTCAGTGGGGATCAGCACC*TCAAGTGAAAGGCATACGAGATGCGGCTGTTGAGCTC
TTGCACACTCTTGTAGCTGTCCATGCAGAGGTCTTT*GCGGGTGCAAAACCACTACTGGA
CAAGATACTTGGCGTCCTGATCGAAGGTCTAGTCGACACTTTTCTCAGTCTTGTAGAAGA
AAACAGAACAGATGATCTGAGTTCAATTGATGCAAATGGTTTCTGCCAACTCATGTTTGA
GCTTGAATACTTTGAGACAGTACTTAATCTATATTTCACAAGCGATGCAACCGCGTTTCT
GAAAACGCTACAAGGAACCGTGTTGGAGATT*GCCATAGAGAGCATCAGTGAAGCAGTAG
AGACTCCGGGGCATAACCGCAGACCAACTCGTGGCAGGGAAGACACAGTTTCAGATGACC
TCGCTCTAACGAAACAGTACTCGAGCGAATTGCTGCAGTCAGAAATGGAGAGAACT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4CK71TF 503 0 0
AAGGTCTAGTCGACACTTTTCTCAGTCTTGTAGAAGAAAACAGAACAGATGATCTGAGTT
CAATTGATGCAAATGGTTTCTGCCAACTCATGTTTGAGCTTGAATACTTTGAGACAGTAC
TTAATCTATATTTCACAAGCGATGCAACCGCGTCTCTGAAAACGCTACAAGGAACCGTGT
TGGAGATTCGCCATAGAGAGCATCAGTGAAGCAGTAGAGACTCCGGGGCATAACCGCAGA
CCAACTCGTGGCAGCGAAGACACAGTTTCAGATGACCTCGCTCTAACGAAACAGTACTCG
AGCGAATTGCTGCAGTCAGAAATGGAGAGAACTCGTCTGAACACCGCATGCTTTGCAGAG
TCAGTCCCGGTAGAGCCAACGCCTACATTACCCAAAACTGCGTACAGAGTGTCGATGGAT
TCTCCAAGTAGAAACTACAGAGCTCACAATCATCAGGTCTCCGGTCATAGCCGACCCAGA
CGAAGATAAAAGACAACTCTTTG

QA 1 503 1 503
DS 



CO CL1191Contig3 715 2 11 U
CTCGATTACAACCCAAACCATCTGAGTTTTATAAGTAAAGACAAGTTCTTAAGAAGCACA
AACATAACAAACACTCACAAAGAATTGTTAATCGTTAACGTGCAAAAAGGTGTTACTTAA
AAAGAAAAAAAACAAAGAGTTGTCTTTTTATCTTCGTCTGGGTAGGCTATGAACCGGAGA
ACCTGATGATTGTGAGCCTCTGTAGTTTCTACTTGGAGAATCCATCGACACTCTGTACGC
AGTTTTGGGTAATGTAGGCGTTGGCTCTACCGGGACTGACTCTGCAAAGCATGCAGTGTT
CAGACGAGTTCTCTCCATTTCTGACTGCAGCAATTCGCTCGAGTACTGTTTCGTTAGAGC
GAGGAGGTCATCTGCTGAAACAGATGATCCTTGTCTGTCATCTGAAACTGTGTCTTCGCT
GCCACGAGTTGGTCTGCGGTTATGCCCCGGAGTCTCTACTGCTTCACTGATGCTCTCTAT
GGCAATCTCCAACACGGTTCCTTGTAGCGTTTTCAGAGACGCGGTTGCATCGCTTGGGAA
ATATAGATTAAGTACTGTCTCAAAGTATTCAAGCTCAAACATGAGTTGGCAGAAACCATT
TGCATCAATTGAACTCAGATCATCTGTTCTGTTTTCTTCTACAAGACTGAGAAAAGTGTC
GACTAGACCTTCGATCAGGACGCCAAGTATCTTGTCCAGTAGTGGTTTTGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC73JQ U 29
AF RR4FS01TF C 1
BS 1 29 RR4FS01TF
BS 30 66 RR4FC73JQ
BS 67 67 RR4FS01TF
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RD RR4FC73JQ 550 0 0
C
TATAAGTAAAGACAAGTTCTTAAGAAGCACAAACATACCAAACACTCACAAAGAATTGTT
AATCGTTAACGTGCAAAAAGGTGTTACTTAAAAAGAAAAAAAACAAAGAGTTGTCTTTTT
ATCTTCGTCTGGGTCGGCTATGAACCGGAGAACCTGATGATTGTGAGCCTCTGTAGTTTC
TACTTGGAGAATCCATCGACACTCTGTACGCAGTTTTGGGTAATGTAGGCGTTGGCTCTA
CCGGGACTGACTCTGCAAAGCATGCGGTGTTCAGACGAGTTCTCTCCATTTCTGACTGCA
GCAATTCGCTCGAGTACTGTTTCGTTAGAGCGAGGAGGTCATCTGCTGAAACAGATGATC
CTTGTCTGTCATCTGAAACTGTGTCTTCGCTGCCACGAGTTGGTCTGCGGTTATGCCCCG
GAGTCTCTACTGCTTCACTGATGCTCTCTATGGCAATCTCCAACACGGTTCCTTGTAGCG
TTTTCAGAGACGCGGTTGCATCGCTTGTGAAATATAGATTAAGTACTGTCTCAAAGTATT
CAAGCTCAA

QA 2 550 2 550
DS 

RD RR4FS01TF 715 0 0
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AACATAACAAACACTCACAAAGAATTGTTAATCGTTAACGTGCAAAAAGGTGTTACTTAA
AAAGAAAAAAAACAAAGAGTTGTCTTTTTATCTTCGTCTGGGTAGGCTATGAACCGGAGA
ACCTGATGATTGTGAGCCTCTGTAGTTTCTACTTGGAGAATCCATCGACACTCTGTACGC
AGTTTTGGGTAATGTAGGCGTTGGCTCTACCGGGACTGACTCTGCAAAGCATGCAGTGTT
CAGACGAGTTCTCTCCATTTCTGACTGCAGCAATTCGCTCGAGTACTGTTTCGTTAGAGC
GAGGAGGTCATCTGCTGAAACAGATGATCCTTGTCTGTCATCTGAAACTGTGTCTTCGCT
GCCACGAGTTGGTCTGCGGTTATGCCCCGGAGTCTCTACTGCTTCACTGATGCTCTCTAT
GGCAATCTCCAACACGGTTCCTTGTAGCGTTTTCAGAGACGCGGTTGCATCGCTTGGGAA
ATATAGATTAAGTACTGTCTCAAAGTATTCAAGCTCAAACATGAGTTGGCAGAAACCATT
TGCATCAATTGAACTCAGATCATCTGTTCTGTTTTCTTCTACAAGACTGAGAAAAGTGTC
GACTAGACCTTCGATCAGGACGCCAAGTATCTTGTCCAGTAGTGGTTTTGCACCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 2 6

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GGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAAT
CTCCAAACCCTCCGCCATCGTCAAAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTC
ATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGG
AAACGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCC
CAACGAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCC
ACACAATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTC
CATGGACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGAGCGA
GCCTGGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGT
CACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGAACCAAAGTAGAG
GCTTTCCTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACCGTGATTTGTTATAGTA
TGAATGGTTCCATAAGTGCTTTTTTCCTGGTTTATAAATTGTATGTAAATTTATGTCTCT
CCCTATAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO74JQ C 176
AF RR4BO74TF U 47
AF RR4DX48TF U 6
AF RR4D456TF U 1
BS 1 151 RR4D456TF
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BS 282 282 RR4BO74TF
BS 283 732 RR4D456TF

RD RR4BO74JQ 406 0 0
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GCTGGAAACGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTC
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AGCGAGCCTGGGACTTACAGCTTTTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGT
AAAGTCACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTG

QA 1 406 1 406
DS 

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GG
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CAAATCCACAATCTCCAAACCCTCCGCCATCGTCAAAATCCCCACAACATCACGGAAGCT
CACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAAT
CGCTTTGGCTGGAAACGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTT
AGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAA
CGCTGGATTCCCACACAATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGC
GAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGT
TGCTTTGAGCGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTAT
GGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGA
ACCAAAGTAGAGGCTTTCCTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACCGTGA
TTTGTTATAGTATGAATGGTTCCATAAGTGCTTTTTTCCTGGTTTATAAATTGTATGTAA
ATTTATGTCTC

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4DX48TF 682 0 0
G
GACACAAAGATATAAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATATTCTTCATCATGGCCTC
AGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTCCAA
ACCCTCCGCCATCGTCAAAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCTCT
AAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAACGC
CATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAACGA
GTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACACAA
TGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGA
CGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGAGCGAGCCTGG
GACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACCGT
TAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGAACCAAAGTAGAGGCTTTC
CTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACCGTGATTTGTTATAGTATGAATG
GTTCCATAAGTGCTTTTTTCC

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR4D456TF 732 0 0
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GGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAAT
CTCCAAACCCTCCGCCATCGTCAAAATCCCCTCAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTC
ATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGG
AAACGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATG*AGCGTTAGCTTTCGTTCC
CAACGAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCC
ACACAATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTC
CATGGACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGAGCGA
GCCTGGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGT
CACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGAACCAAAGTAGAG
GCTTTCCTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACCGTGATTTGTTATAGTA
TGAATGGTTCCATAAGTGCTTTTTTCCTGGTTTATAAATTGTATGTAAATTTATGTCTCT
CCCTATAATTTT

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL1192Contig2 657 2 2 U
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GACTTCGGAGTCGCTGCCGTAGCGGCTGCAGCTTCCATCGCTTTGGCAGGAAACGCCATG
GCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTC
ACCATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCGCACAACGTT
GTGTTCGACGAGGACGAGATCCCGAGCGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAG
CAGGACCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACT
TACAGCTTCTACTGTGCCCCGCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGCAAAGTCACCGTTAAC
TAATAAACTGTGTGTGTAAATGCGAAAGGGTGTCTCTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTT
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ATTGATTTGTTAATGAGAGTGCTGGTTCCATCCATGAATGGTTTTTCTTGGTTTATAAAT
TATTTGTAGATTTATGTCTGGCTCTAAAAGCTTTTTAAGATTATGATAAATTAAGTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI38TF U 1
AF RR4EI38JQ C 1
BS 1 203 RR4EI38TF
BS 204 657 RR4EI38JQ

RD RR4EI38TF 206 0 0
GGTCTCCAAACCCTCCGCCGTCGTCAGGCTCCCCACCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAG
GACTTCGGAGTCGCTGCCGTAGCGGCTGCAGCTTCCATCGCTTTGGCAGGAAACGCCATG
GCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTC
ACCATAGCGAAAGGAGAGAAGAT
CGT

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR4EI38JQ 657 0 0
GGTCTCCAAACCCTCCGCCGTCGTCAGGCTCCCCACCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAG
GACTTCGGAGTCGCTGCCGTAGCGGCTGCAGCTTCCATCGCTTTGGCAGGAAACGCCATG
GCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTC
ACCATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCGCACAACGTT
GTGTTCGACGAGGACGAGATCCCGAGCGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAG
CAGGACCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACT
TACAGCTTCTACTGTGCCCCGCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGCAAAGTCACCGTTAAC
TAATAAACTGTGTGTGTAAATGCGAAAGGGTGTCTCTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTT
CAGTTTTTACTTACATAGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGAC
ATTGATTTGTTAATGAGAGTGCTGGTTCCATCCATGAATGGTTTTTCTTGGTTTATAAAT
TATTTGTAGATTTATGTCTGGCTCTAAAAGCTTTTTAAGATTATGATAAATTAAGTT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 7

CO CL1193Contig1 821 7 8 U
GGGAGTCAGTTCTCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTC
CTTTTAGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCT
GAAACCCCTGCGGGTTACCCTTGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTC
TTTTCCGGTTTAGGCACTACTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCC
GGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGAC
CTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTT
GTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTTTGCGAACTCTGTCTACGTTCAG
ACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAAT
GCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAG
ATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACT
TTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGTCTAAAAG
ATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGT
AGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCTAAATTAAGATCCT
GAGTTGGTCATACCGTTTATAGCATTTGCTAAAACTTAAGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT30TF U 159
AF RR4B125JQ C 1
AF RR4B281TF U 1
AF RR4B125TF U 1
AF RR4B281JQ C 1
AF RR4EF93TF U 13
AF RR4EF93JQ C 278
BS 1 764 RR4B281TF
BS 765 767 RR4B125TF
BS 768 769 RR4EF93TF
BS 770 770 RR4EF93JQ
BS 771 771 RR4EF93TF
BS 772 773 RR4EF93JQ
BS 774 799 RR4EF93TF
BS 800 821 RR4EF93JQ

RD RR4GT30TF 299 0 0
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CATCAGCGCTGCGGTCACGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGG
CCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCC
TGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTC
TGCGAACTCTGTCTACGTTCAGACGCTAAAACCAGGACAGG
GTCATGGGTTTTCCCACA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4B125JQ 767 0 0
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CTTTTAGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCT
GAAACCCCTGCGGGTTACCCTTGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTC
TTTTCCGGTTTAGGCACTACTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCC
GGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGAC
CTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTT
GTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTTTGCGAACTCTGTCTACGTTCAG
ACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAAT
GCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAG
ATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACT
TTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGTCTAAAAG
ATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGT
AGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4B281TF 764 0 0
GGGAGTCAGTTCTCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTC
CTTTTAGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCT
GAAACCCCTGCGGGTTACCCTTGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTC
TTTTCCGGTTTAGGCACTACTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCC
GGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGAC
CTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTT
GTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTTTGCGAACTCTGTCTACGTTCAG
ACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAAT
GCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAG
ATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACT
TTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGTCTAAAAG
ATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGT
AGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4B125TF 767 0 0
GGGAGTCAGTTCTCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTC
CTTTTAGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCT
GAAACCCCTGCGGGTTACCCTTGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTC
TTTTCCGGTTTAGGCACTACTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCC
GGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGAC
CTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTT
GTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTTTGCGAACTCTGTCTACGTTCAG
ACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAAT
GCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAG
ATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACT
TTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGTCTAAAAG
ATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGT
AGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4B281JQ 767 0 0
GGGAGTCAGTTCTCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTC
CTTTTAGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCT
GAAACCCCTGCGGGTTACCCTTGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTC
TTTTCCGGTTTAGGCACTACTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCC
GGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGAC
CTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTT
GTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTTTGCGAACTCTGTCTACGTTCAG
ACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAAT
GCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAG
ATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACT
TTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGTCTAAAAG
ATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGT
AGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4EF93TF 787 0 0
TCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTTT*AGCTCTA
TCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCTGAAACCCCTGCG
GGTTACCCTTGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTTA
GGCACTACTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCCGGTTTCGCCGCT
CAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAA
GGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGC
TACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACTCTGTCTACGTTCAGACGCTAAAACCA
GGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCA
GCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAGATTCTAGATTTC
GCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCCT
GCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGGCTAAAAGATACTTGGTGCT
TTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAAT
ACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCTAATT**AGATCCTGAGTTGGTCATA
CCGTTTA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4EF93JQ 544 0 0
GCCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACC
CTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCT
CTGCGAACTCTGTCTACGTTCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAG
GCCTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCA
GCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTA
CTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTG
TTCTCGGAGGAACTGGCTAAAAGATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATG
GGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATTACATTGTAT
GTGAGTTTCTAAATTAAGATCCTGAGTTGGTCATACCGTTTATAGCATTTGCTAAAACTT
AAGC

QA 1 544 1 544
DS 



AS 2 7

CO CL1194Contig1 1107 5 10 U
GGCCTCTTCCCCTGTCTGATTCTTCGCCGTGCAAAAAAAAAAAGTGAAGACAATAGAAGC
TCAGCTAGCTATGGCGTTTCTTCTCCCGAATCTCTCTCCTTCATTCCTTCTTCAAACAGG
AAAATCCATCAAAGAGAAACCCATTTCCACCCATTCTCTATCCATCTCATCATCATCTTC
TTCTTCTTCCAGTAGCTACAATTTCGAAGAAGATAGCCTCTCTCTGCTAACTCTCCCCGT
ACAAGCTCCTCCTGCTCCAGGTGCGCAGGTTAAGACCATGCCGAGTGGACAGGATAAGCA
CCTGCAGCATGGCAAAGATGAGTTCTACATCAATCTCGGTCTAGCGATACGTACCCTTCG
TGAAGATTTGCCTTTGCTCTTCACCAAAGATCTCAATTACGACATTTACAGGGATGATAT
AACATTGGTGGATCCAGTGAACACTTTCTCTGGGATTGAGAACTACAAACTCATCTTCTG
GGCACTCAGGTTTCATGGCAAGATTCTCTTCAGAGATATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGT
TTGGCAACCATCAGAGAACATGATCCTCATCAGGTGGAATCTCAAAGGGGTGCCTAGAGT
TCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACTTCTCGCTATAAACTAGACCGCAATGG
CAAAATCTATGAGCATAAAGTTGATAACTTGGCTTTCAACTTCCCTCACCAGCTCAAACC
TGCCACTTCTGTGTTGGATTTGGTCACTGCTTGCCCCGCCAGTCCCAATCCGACTTTCAT
GTTTGGCTCTTCATACTCGTCTTCTTGGATTGAGTTCTATCAAGCTGTGAGAAGAACACT
AGACAAGCAGCAAGAGCAAATTCTTGTGCAAGACCGTTTTGTTATATGTTCATAGAACCA
TTGAATGGGTCACACTCAGCTGTGTATATACTGTTGCATCGAAGATAATATATACATATA
ATGTGCAGGCATATGTAGATGTGGTTGACTTATGGAAGCAAACCTGTTTAACCCATGAGC
TTGTACATTTTGCCTATCGAATGTAAACAGACTTCATTATAGTTTATTATATGTCTGACA
CTCTTAAACAGAGAAATTTTGAATAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A581TF U 1
AF RR4A581JQ C 534
AF RR4E181JQ C 481
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GGGCCGTGC
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TGGAATCTCAAAGGGGTGCCTAGAGTTCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACT
CCTCGCTATAAACTAGACCGCAATGGCAAAATCTATGAGCATAAAGTTGATAACTTGGCT
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CCCGC
AGTCCCATCC

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TTCTTCTTCCAGTAGCTACAATTTCGAAGAAGATAGCCTCTCTCTGCTAACTCTCCCCGT
ACAAGCTCCTCCTGCTCCAGGTGCGCAGGTTAAGACCATGCCGAGTGGACAGGATAAGCA
CCTGCAGCATGGCAAAGATGAGTTCTACATCAATCTCGGTCTAGCGATACGTACCCTTCG
TGAAGATTTGCCTTTGCTCTTCACCAAAGATCTCAATTACGACATTTACAGGGATGATAT
AACATTGGTGGATCCAGTGAACACTTTCTCTGGGATTGAGAACTACAAACTCATCTTCTG
GGCACTCAGGTTTCATGGCAAGATTCTCTTCAGAGATATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGT
TTGGCAACCATCAGAGAACATGATCCTCATCAGGTGGAATCTCAAAGGGGTGCCTAGAGT
TCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACTTCTCGCTATAAACTAGACCGCAATGG
CAAAATCTATGAGCATAAAGTTGATAACTTGGCTTTCAACTTCCCTCACCAGCTCAAACC
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GTTTGGCTCTTCATACTCGTCTTCTTGGATTGAGTTCTATCAAGCTGTGAGA

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DS 

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CTAGAGTTCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACTTCTCGCTATAAACTAGACC
GCAATGGCAAAATTTATGAGCATAAAGTTGATAACTTGGCTTTCAACTTCCCTCACCAGC
TCAAACCTGCCACTTTTGTGTTGGATTTGGTCACTGCTTGCCCCCCCAGTCCCAATCCGA
CTTTCATGTTTGGCTCTTCATACTCGT
TTT

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TCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACTCCTCGCTATAAACTAGACCGCAATGG
CAAAATCTATGAGCATAAAGTTGATAACTTGGCTTTCAACTTCCCTCACCAGCTCAAACC
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GTTTGGCTCTTCATACTTGTCTTCTTGGATTGAGTTCTATCAAGCTGTGAGAAGAACACT
AGACAAGCAGCAAGAGCAAATTCTTGTGCAAGACCGTTTTGTTATATGTTCATAGAACCA
TTGAATGGGTCACATTCAGCTGTGTATATACTGTTGCATCGAAGATGATATATACATATA
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ATCATATGTTTGAACACT

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DS 

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G
AATCTCGGTCTAGCGATAC***CCCTTCGTGAAGATTTGCCTTTGCTCTTCACCAAAGAT
CTCAATTACGACATTTACAGGGATGATATAACATTGGTGGATCCAGTGAACACTTTCTCT
GGGATTGAGAACTACAAACTCATCTTCTGGGCACTCAGGTTTCATGGCAAGATTCTCTTC
AGAGATATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGTTTGGCAACCATCAGAGAACATGATCCTCATC
AGGTGGAATCTCAAAGGGGTGCCTAGAGTTCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGC
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GCTTTCAACTTCCCTCACCAGCTCAAACCTGCCACTTCTGTGTTGGATTTGGTCACTGCT
TGCCCCGCCAGTCCCAATCCGACTTTCATGTTTGGCTCTTCATACTCGTCTTCTTGGATT
GAGTTCTATCAAGCTGTGAGAAGAACACTAGACAAGCAGCAAGAGCAAATTCTTGTGCAA
GAC*GTTTTGTTATATGTTCATAGAACCATTGAATGGGTCACTCTCAGCTGTGTATATAC
TGTTGCATCGAAGATAATGTA**CATATAATGTGCAGGCATATGTAGATGTGGTTGACTT
ATGGAAGCAAACCTGTTTAACCCATGAGCTTGTACATTTTGCCTATCGAATGTAAACAGA
CTTCATTATAGTTTATTATATGTCTGACACTCTTAAACAGAGAAATTTTGAATAGA

QA 2 777 2 777
DS 



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CAGGAAAATCCATCAAAGAGAAACCCATTTCCACCCATTCTCTATCCATCTCATCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCCAGTAGCTACAATTTCGAAGAAGATAGCCTCTCTCTGCTAACTCTTC
CCGTCCAGGCTCCTCCTGCTCCAGGTGCGCAGGTTAAGACCATGCCGAGTGGACAGGATA
AGCACCAGCAGCATGGCAAAGATGAGTTCTACATCAATCTCGGTCTAGCGATACGTACCC
TTCGTGAAGATTTGCCTTTGCTCTTCACCAAAGATCTCAATTATGACATTTACAGGGATG
ATATAACATTGGTGGATCCAGTGAACACTTTCTCTGGGATTGAGAACTACAAACTCATCT
TCTGGGCGCTCAGGTTTCATGGCAAGATTCTCTTCAGAGATATCTCGCTTGAGATCTTCA
GGGTTTGGCAACCATCAGAGAACATGATCCTCATCAGGTGTAATCTCAAAGGTGTGCCTA
GAGTCCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACTTCTCGTTATAAACTAGACCGCA
ATGGGAAGATCTACGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCTTTCTTTCCCTCACCAGCTCAAA
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ATGTTTGGCTCTTCATACTCGTCTTCTTGGATTGAGTTCTATCAAGCTGTGAGAAATACA
CTAGACAAGCAACAAGAACAAATCCTTGTGCAAGACCGTTTTGTTATATGTTCATAAATC
CATTGATTGGGTGGGTCACATTCAGCTATATATATACTGTTGCATCGAAGATGATATATA
CATATAATGTGCAGGCATATGTAGATGTGGTTGACTTATGGAAGCAAACCTGTTTAACCC
ATGAGCTTGTACATTTTGCCTATCGAATGTAAACAGACTTCATTATAGTTATTATATGTT
TGAACACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU84TF U 1
AF RR4EU84JQ C 322
BS 1 707 RR4EU84TF
BS 708 708 RR4EU84JQ
BS 709 740 RR4EU84TF
BS 741 1028 RR4EU84JQ

RD RR4EU84TF 740 0 0
AAGCTCAGCTAGCTATGGCGTTTCTTCTCCCGAATCTCTCTCCTTCATTCCTTCTTCAAA
CAGGAAAATCCATCAAAGAGAAACCCATTTCCACCCATTCTCTATCCATCTCATCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCCAGTAGCTACAATTTCGAAGAAGATAGCCTCTCTCTGCTAACTCTTC
CCGTCCAGGCTCCTCCTGCTCCAGGTGCGCAGGTTAAGACCATGCCGAGTGGACAGGATA
AGCACCAGCAGCATGGCAAAGATGAGTTCTACATCAATCTCGGTCTAGCGATACGTACCC
TTCGTGAAGATTTGCCTTTGCTCTTCACCAAAGATCTCAATTATGACATTTACAGGGATG
ATATAACATTGGTGGATCCAGTGAACACTTTCTCTGGGATTGAGAACTACAAACTCATCT
TCTGGGCGCTCAGGTTTCATGGCAAGATTCTCTTCAGAGATATCTCGCTTGAGATCTTCA
GGGTTTGGCAACCATCAGAGAACATGATCCTCATCAGGTGTAATCTCAAAGGTGTGCCTA
GAGTCCCATGGGAGGCCAAAGGAGAGTTTCAGGGCACTTCTCGTTATAAACTAGACCGCA
ATGGGAAGATCTACGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCTTTCTTTCCCTCACCAGCTCAAA
CCTGCCACTTCTGTGTTGGATTTGGTCACTGCTTGCCCTGCCAGTCC*AATCCAACATTC
ATGTTTGGCTCTTCATACTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4EU84JQ 707 0 0
TCTTCACCAAAGATCTCAATTATGACATTTACAGGGATGATATAACATTGGTGGATCCAG
TGAACACTTTCTCTGGGATTGAGAACTACAAACTCATCTTCTGGGCGCTCAGGTTTCATG
GCAAGATTCTCTTCAGAGATATCTCGCTTGAGATCTTCAGGGTTTGGCAACCATCAGAGA
ACATGATCCTCATCAGGTGTAATCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTCCCATGGGAGGCCAAAG
GAGAGTTTCAGGGCACTTCTCGTTATAAACTAGACCGCAATGGGAAGATCTACGAGCATA
AAGTCGATAACTTGGCTTTCTTTCCCTCACCAGCTCAAACCTGCCACTTCTGTGTTGGAT
TTGGTCACTGCTTGCCCTGCCAGTCCCAATCCAACATTCATGTTTGGCTCTTCATACTCG
TCTTCTTGGATTGAGTTCTATCAAGCTGTGAGAAATACACTAGACAAGCAACAAGAACAA
ATCCTTGTGCAAGACCGTTTTGTTATATGTTCATAAATCCATTGATTGGGTGGGTCACAT
TCAGCTATATATATACTGTTGCATCGAAGATGATATATACATATAATGTGCAGGCATATG
TAGATGTGGTTGACTTATGGAAGCAAACCTGTTTAACCCATGAGCTTGTACATTTTGCCT
ATCGAATGTAAACAGACTTCATTATAGTTATTATATGTTTGAACACG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 7

CO CL1195Contig1 1142 7 26 U
GGGTAGAAGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAAACACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCA
ACCGCCGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAG
ATGCTAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGC
GTTACTCCGGCGTTTAGAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTT
GTTGAACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAA
TCCGCGGGAAAATTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGG
CTTCGCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACG
GATTTGGCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACGATCATAAG
TTGGAGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTT
TCGACTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAA*TGCGACCA
A*GTCAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAAC
GGGAGTGCAGGGGATGCTGGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCG
GACCAGACAATGAGGCTGAAGAAGCAGCGTGTGGGGGAGAGGTTTTGTGTCTTGGATGTT
GCCAAGCGCTTCCAAAGTGCAGGTTCTGCAACAAACCCTACCGCACAAGTCACAGCAGCC
TGCGACAAGAGAACACAGCGACGGATTCGGCTATGTTTGCATGCCAAGCTTGTCACTACA
TGACAGGAACAAGCGCAAGTGAACCCCTCGAGTATCAATTCTAAAAACACTTGTCGTTGA
AAAGCCAAGCTTGTTACTAAGCCAATAAGAAGATGTGAACTTTCGTATCTAAAAACATTT
GTTGTTCTCTGCTTTTTGTCTTTATGTTCTTTACATGAAAACCTTGGATTGTGTAAAATC
CAAAGATATTCGTTGTGTAATAAAAAAACAAGTGTTCAACATATAAAACAATTACAAACC
GC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F070TF U 3
AF RR4B647TF U 1
AF RR4AX91TF U 3
AF RR4AX91JQ C 572
AF RR4F837TF U 3
AF RR4AJ19TF U 4
AF RR4B647JQ C 283
BS 1 27 RR4B647TF
BS 28 28 RR4F070TF
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BS 37 37 RR4F070TF
BS 38 100 RR4B647TF
BS 101 101 RR4F070TF
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BS 313 342 RR4B647TF
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BS 691 720 RR4B647TF
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BS 722 754 RR4B647TF
BS 755 1142 RR4B647JQ

RD RR4F070TF 663 0 0
AG
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TAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCCATCCATGTCCGGCGTTA
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AACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCG
CGGGAAAATTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGCTTC
GCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGGCGGGATGCACGGATT
TGGCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACGATCATAAGTTGG
AGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGGCCATCTCTCAGCACTTTCGA
CTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAA*TGCGACCAA*GT
CACGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGA
G

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR4B647TF 755 0 0
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ACCGCCGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCAACCAGAATTGGTGCACAAG
ATGCTAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGC
GTTACTCCGGCGTTTAGAAACGCAATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTT
GTTGAACAACCCTTGAATTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAA
TCCGCGGGAAAGTTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTAGAGTCACCAACAAAGGG
CTTCGCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACG
GATTTGGCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACGATCATAAG
TTAGAGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTT
TCGACTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAAGTGTGTCCCCAA*TGCGACCA
A*GTCAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAAC
GGGAGTGCAGGGGATGCTGGTATTGCGTCCCTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCG
TACCAGACAATGAGGCTGAAGAAGCAGCGTGTGG
G

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AX91TF 752 0 0
GG
AGAAGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAA*CACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCG
CCGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGC
TAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGCGTTA
CTCCGGCGTTTAGAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTTGTTG
AACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGTGAGTTCACTTCAAAATCCG
CGGGAAAATTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGCTTC
GCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGGATT
TGGCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACGATCATAAGTTGG
AGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTTTCGA
CTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAA*TGCGACCAA*GT
CAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGA
GTGCAGGGGATGCTGGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGACC
AGACAATGAGGCTGAAGAAGCAGCGTGTGG

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR4AX91JQ 180 0 0
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ATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTGCAGGGGATGCTGGTATTGCGTCAC
TAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGACCAGACAATGAGGCTGAAGAAGCAGCGTG

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR4F837TF 732 0 0
AG
AGAAGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAAACACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCG
CCGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGC
TAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCCATCCATGTCCGGCGTTA
CTCCGGCGTTTAGAAACGCCATTAGTGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTTGTTG
AACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCG
CGGGAAAATTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGCTTC
GCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGGCGGGATGCACGGATT
TGGCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACGATCATAAGTTGG
AGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGGCCATCTCTCAGCACTTTCGA
CTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAA*TGCGACCAA*GT
CAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGA
GTGCAGGG*ATGCTGGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGAC
AGACATGAGCT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR4AJ19TF 754 0 0
GGGG
AGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAAACACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCGCCG
ATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGCTAA
TGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGCGTTACTC
CGGCGTTTAGAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTTGTTGAAC
AACCCTTGAGTTCTCGTCTA*CCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCGCGG
GAAAATTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGCTTCGCC
GTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGGATTTGG
CTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACAAAGAACGATCATAAGTTGGAGA
CACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTTTCGACTT
ACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCTAGGTGTGTCCCCAA*TGCGACCAA*GTCAG
GATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAATGGGAGTG
CAGGGGATGCTGGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGACCAGA
CAATGAG*CTGA*GAAGCAGCGTGTGG
GGG

QA 5 751 5 751
DS 

RD RR4B647JQ 860 0 0
TGGGAGTTCACTTCAAAATCCGCGGGAAAGTTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGT
AGAGTCACCAACAAAGGGCTTCGCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTG
ATTGTGACGGGATGCACGGATTTGGCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTG
ACGAAGAACGATCATAAGTTAGAGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAAT
GACCATCTCTCAGCACTTTCGACTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAAGTG
TGTCCCCAA*TGCGACCAA*GTCAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAAC
GTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTGCAGGGGATGCTGGTATTGCGTCCCTAGATGCATGG
AGTGTGCAGTGTGTCTCGTACCAGACAATGAGGCTGAAGAAGCAGCGTGTGGGGGAGAGG
TTTTGTGTCTTGGATGTTGCCAAGCGCTTCCAAAGTGCAGGTTCTGCAACAAACCCTACC
GCACAAGTCACAGCAGCCTGCGACAAGAGAACACAGCGACGGATTCGGCTATGTTTGCAT
GCCAAGCTTGTCACTACATGACAGGAACAAGCGCAAGTGAACCCCTCGAGTATCAATTCT
AAAAACACTTGTCGTTGAAAAGCCAAGCTTGTTACTAAGCCAATAAGAAGATGTGAACTT
TCGTATCTAAAAACATTTGTTGTTCTCTGCTTTTTGTCTTTATGTTCTTTACATGAAAAC
CTTGGATTGTGTAAAATCCAAAGATATTCGTTGTGTAATAAAAAAACAAGTGTTCAACAT
ATAAAACAATTACAAACCGC

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 5

CO CL1196Contig1 1126 5 29 U
GCACTGAAAATCTTTGTTTAATATCCGTTCGACCACAAGAAAACAAACAAAACTGCGTCT
ACCGATGGTCCGGTTCAGACGTGCCAAACGACAAGAAGCTTTACTACTAGAGAGGGCATA
GTCTTACATTAATATCCCAAATGTAACAACATCCAAATCCGAAAGTAAAAAAATCCGAAA
GATCCAAATCCAATTCAAAGAAAAATCTCAGGAGTTTTTTTTTCATCAGATTGAAAAGCC
TTTTCAGCCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGAGCACAGATCCTCCGTCTCCTG
TGGGATTGTGTAGTGACCAAGTCCACTGTAAGCTTTGAAGGTCGTCTTCTTAAACCCATG
TGCTATCAAGGCCTGCGATGATTTCTCCCCAAACTTGAACGGTACAACATCATCACCTTT
TCCATGACAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGATCTGCTCCTCTTCTAG
TTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTTAAGCCAATGACTGCGCTTAA
ATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCAAAACAGGTCGCAAAATA
TAGAGACGTCCCGGCACCCATGCTGAACCCTCCAACACCTAACTTAATGTCAGCAGGCTC
ATTTGACAAGAGTTTTGCAACATGTTCGGCAGTCACATCCAGTCCTTCTACATCGTCAGG
TCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACATCAAACCAAGCTGTGGAAGGGAAACCACCAAACAA
ACTTATTGGCTGAGAAGGAGCAGTCGGGCATATCCATTTGATATTTGGAAGGGGAAGCGT
CTCCAACATCTGGGACCAGCTGGAGCCATTGTCGCCAAGGCCATGTAGCCAGACAATAGT
AGCTTGATGCTTCCCTTTGGGCCTAACAACACGAGTTTTACCAAACTCCACCGCTCTTCT
CAAATTTCTGCTTGAACCAACTGCAGCAGCACCAGAGAGACTCATTCTGAGATGACAAGC
GATGCTGAGAAGAAACTGCTCTCGACAAAGGTGTAGCGACGGAGAAGTCTACGGAAGCCA
CCAAAAGATTAGAAGAGCTCCAGCGGCAGCAATCCGTATAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C535JQ U 1
AF RR4HA20JQB U 103
AF RR4DB68JQ U 223
AF RR4C282TF C 386
AF RR4DB68TF C 476
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BS 512 512 RR4HA20JQB
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BS 533 579 RR4C535JQ
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RD RR4C535JQ 594 0 0
GCACTGAAAATCTTTGTTTAATATCCGTTCGACCACAAGAAAACAAACAAAACTGCGTCT
ACCGATGGTCCGGTTCAGACGTGCCAAACGACAAGAAGCTTTACTACTAGAGAGGGCATA
GTCTTACATTAATATCCCAAATGTAACAACATCCAAATCCGAAAGTAAAAAAATCCGAAA
GATCCAAATCCAATTCAAAGAAAAATCTCAGGAGTTTTTTTTTCATCAGATTGAAAAGCC
TTTTCAGCCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGAGCACAGATCCTCCGTCTCCTG
TGGGATTGTGTAGTGACCAAGTCCACTGTAAGCTTTGAAGGTCGTCTTCTTAAACCCATG
TGCTATCAAGGCCTGCGATGATTTCTCCCCAAACTTGAACGGTACAACATCATCACCTTT
TCCATGGCAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGATCTGCTCCTCTTCTAG
TTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCTACCCGCTTAAGCCAATGACCGCGCTTAA
ATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGCGCAAAACAGGTCGC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4HA20JQB 783 0 0
AC
TACTAGAGAGGGCATAGTCTTACATTAATATCCCAAATGTAACAACATCCAAATCCGAAA
GTAAAAAAATCCGAAAGATCCAAATCCAATTCAAAGAAAAATCTCAGGAGTTTTTTTTTC
ATCAAATTGAAAAGCCTTTTCAGCCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGAGCACA
GATCCTCCGTCTCCTGTGGGATTGTGTAGTGACCAAGTCCACTGTAAGCTTTGAAGGTCG
TCTTCTTAAACCCATGTGCTATCAAGGCCTGCGATGATTTCTCCCCAAACTTGAACGGTA
CAACATCATCACCTTTTCCATGACAAACTAAAATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGA
TCTGCTCCTCTTCTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTTAAGC
CAATGACCGCGCTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGCGCAA
AACAGGTCGCAAAATATAGAGACGTCCCCGCACCCATGCTGAACCCTCCAATACCTAACT
TAATGTCAGCAGGCTCGTTTGACAAAAGTTTTGCAACATGTTCGGCAGTCACATCCAGTC
CTTCTACATCGTCAGGTCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACATCAAACCAAGCTGTGGAAG
GGAAACCATCAAACAAACTTATTGGCTGAGAAGGAGCAGTAGGGCATATCCATTTGATAT
TTGGAAGGGGAAGCGTCTCCAACATCTGGGACCAGCTGGAGCCATTGTCGCCAAGGCCAT
G

QA 3 783 3 783
DS 

RD RR4DB68JQ 690 0 0
C
CATCAGATTGAAAAGCCTTTTCAACCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGTGCAC
AAATCCTCCGTCTCCTGTGGGATTGTGTAATGACCAAGCCCACTGTAAGCTTTGAAGGTC
GTCTTCTTAAACCCAAGTGCTATCAAGGCCTGTGATGATTTCTCCCCAAACTTGAACGGT
ACAACATCATCACCTTTTCCATGACAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTG
ATCTGCTCCTCTTCTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTTAAG
CCAATGACTGCGCTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCA
AAACAGGTCGCAAAATATAGAGACGTCCCGGCACCCATGCTGAACCCTCCAACACCTAAC
TTAATGTCAGCAGGCTCATTTGACAAGAGTTTTGCAACATGTTCGGCAGTCACATCCAGT
CCTTCTACATCGTCAGGTCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACATCAAACCAAGCTGTGGAA
GGGAAACCACCAAACAAACTTATTGGCTGAGAAGGAGCAGTCGGGCATATCCATTTGATA
TTTGGAAGGGGAAGCGTCTCCAACATCTGGGACCAGCTGGAGCCATTGTCGCCAAGGCCA
TGTAGCCAGACAATAGTAGCTTGATGCTT

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR4C282TF 718 0 0
TCCCCAAACT*GAACGGTACA*CATCATCAC*TTTTCCATGACAAGCTAAGATGGGTAAC
GATGCAGCTCGGTTCT*GATCTGCTCCTCT*CTAGTTTACCAGTTAGTGTCT*GGCACAA
GGAAGCCACCCGCTTAAGCCAATGACTGCGCTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTT
CCATATTTACCGAGTGCAAAACAGGTCGCAGAATATAGAGACGTCCCGGCACCCATGCTG
AACCCTC*AACACCTAACTTAATGTCAGCAGGCTCATTTGACAAGAGTTTTGCAACATGT
TCGGCAGTCACATCCAGTCCTTCTACATCGTCAGGTCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACA
TCAAACCAAGCTGTGGAAGGGAAACCACCAAACAAACTTATTGGCTGAGAAGGAGCAGTC
GGGCATATCCATTTGATATTTGGAAGGGGAAGCGTCTCCAACATCTGGGACCAGCTGGAG
CCATTGTCGCCAAGGCCATGTAGCCAGACAATAGTAGCTTGATGCTTCCCTTTGGGCCTA
ACAACATGAGTTTTACCAAACTCCACCGCTCTTCTCAAATTTCTGCTTGAACCAACTGCA
GCAGCACCAGAGAGACTCATTCTGAGATGACAAGCGATGCTGAGAAGAAACTGCTCTCGG
CAAAGGTGTAGCGACGGAGAAGTCTACGGAAGCCACCAAAAGATTAGAAGAGCTCC
CC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DB68TF 651 0 0
TCTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTTAAGCCAATGACTGCG
CTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCAAAACAGGTCGCA
GAATATAGAGACGTCCCGGCACCCATGCTGAACCCTCCAACACCTAACTTAATGTCAGCA
GGCTCATTTGACAAGAGTTTTGCAACATGTTCGGCAGTCACATCCAGTCCTTCTACATCG
TCAGGTCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACATCAAACCAAGCTGTGGAAGGGAAACCACCA
AACAAACTTATTGGCTGAGAAGGAGCAGTCGGGCATATCCATTTGATATTTGGAAGGGGA
AGCGTCTCCAACATCTGGGACCAGCTGGAGCCATTGTCGCCAAGGCCATGTAGCCAGACA
ATAGTAGCTTGATGCTTCCCTTTGGGCCTAACAACACGAGTTTTACCAAACTCCACCGCT
CTTCTCAAATTTTTGCTTGAACCAACTGCAGCAGCACCAGAGAGACTCATTCTGAGATGA
CAAGCGATGCTGAGAAGAAACTGCTCTCGACAAAGGTGTAGCGACGGAGAAGTCTACGGA
AGCCACCAAAAGATTAGAAGAGCTCCAGCGGCAGCAATCCGTATAAAACCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 7

CO CL1197Contig1 1412 7 13 U
GGACCCACAGAGAAAAGAATGGAGGAAGAAAAGCAAATTGAAGTTGGTAAAACTTCCGCA
TCATCTAGAAAAGTTATAACACTGGAGCCAAAGCTGATTATAAAGAAAGGAATATCGACT
CTTGGATTTGTTTTTCGGCTATTTGCTGTTTTTGGAACTATAGGAAGCGCACTCGCCATG
GGAACAACACAAGAATCAGTTGTCTCTTTGACTCAGCTTGTACTCCTTAAAGCTAAATAC
AGCGACTTACCAACGCTCATGTTCTTCGTGGTTGCAAACGCGGTTGCTGGTGGATATTTG
GTTCTTTCACTACCTGTTAGTATCTTTCATATCATCAGTACTAAAGCTAAAACCTCAAGA
ATCATCTTGCTGGCCATCGATACGGTGATGTTGGCTTTGGTGAGCTGTGGTGCATCTGCA
GCAACAGCAACCGTGTATTTAGCTCACGAGGGGAATACAACTGCTAATTGGCCGCCGATC
TGCCAGCAGTTTGATGGATTCTGCGAACGCATCTCAGGATCTCTCATTGGTTCTTTCGGC
GCAGTGGTCTT*GCTCATGCTT*ACTGTT*ATTAGTTCAGCTATATCTCTCTCTCGCCAC
TAAGATATATCTCTTATTTAACATCAAAATCGTGGCGAAATGTGTATCTAATCTACAATA
TGGACTTT*GAAGTTTTTATATCATGTAACTTGTAATGCAATGTAACATAATGTAATGAA
TACAGGTAAATTATATTTAGTACTAATACAACTACCCAAGAAGCTCCACCACGTCGTCTA
TCGATTTCAATGTCTTCTCGTAGTAGAGATACGACTCATACACCTTTGGCGTCCGTACGT
AGAAATCCAACTCACTCATGTTATTGACTAGCTGATTTGCCGCTTGAACGTAATCATTCC
GGCGACTCTCCGGCAGGATGTTCATGGCGTTGGTCAAATCCTGAGACAGATAAGCCTGTT
TTAGTCTTATGTAGAAGATTACGTACCTCCACGACATATGGTCCAACTTCTCCCTCATGT
CTCTTAATCCTTCCGCCGTCTGTTTTATACGAGCCGCCGCGTCCTCCGGCGATAACCCTG
GCTGGAAATATTTCTCCTTTATGAAAGACCTAGTTCCCCATTTCTCCTGTGCTAATGCTG
CTGACGTGGCGATGGCACCGGCGCCGAGGGCCGTGAGGGTTATAAGCGATGTCAGGGTTC
TCCGGCGAGTGAAGCTGTCTTGATGGGATTCTCCGACGCAGGAAATGACGGAGACTGTTG
GCCGATGGTAACTTGACAGGCGGAGATAGGGTGGTGGAGTTTTGGTGGTGAAGGAGTTCA
TCGGATTTTCGTTTTCTAAAATTTGTTTTTTTTTTGAGGATATGAAATGGGAGGAGCTGA
AAATACTGTCTAGGGGAACTTCATTTTTGTCA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAAA

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TCCGGATTAAAAACGGACCCGTGCGCTTGTCTCTCTGCTTCCATGTCGTATATAGTGCTT
GCAATCATACCAGAGAAGACCAGGGACCCAGCCGGATTGGCTAGAGTCAAAAAGTTGTAT
AAAGCTCCAAAGTTTTTCAGACCAAAGAGCTCAAAGGCAGTAGCTGGGACAATAGCCCAG
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GG
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C

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AC
C

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GACGATGTTGTGGCTGACAACGACGAGATCTTCAATAAGCATAACGGCCATGAGATAGGC
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CTGCCTGTGACCACCAACGGGTCTGATGAAAA

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DS 



AS 2 7

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GTGAGAAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H111JQ U 12
AF RR4H147JQ U 1
AF RR4HA13JQB U 12
BS 1 69 RR4H147JQ
BS 70 70 RR4H111JQ
BS 71 75 RR4H147JQ
BS 76 76 RR4H111JQ
BS 77 416 RR4H147JQ
BS 417 418 RR4H111JQ
BS 419 472 RR4H147JQ
BS 473 473 RR4H111JQ
BS 474 499 RR4H147JQ
BS 500 500 RR4H111JQ
BS 501 578 RR4H147JQ
BS 579 579 RR4HA13JQB
BS 580 591 RR4H147JQ
BS 592 592 RR4HA13JQB
BS 593 648 RR4H147JQ
BS 649 851 RR4HA13JQB

RD RR4H111JQ 527 0 0
GG
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CCAAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTCAAGCTACAAGCAG
CTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCTCTGCTTTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAAT
ACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAG
CCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGTAGTACAATCCTTTCATTACTTGTTTGAACGCTG
CTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGCTCCTTGGACTCACCAGGAACAACCCTTCTTCCA
AAGGTCCACCAAAGAAGAGACTCTTGTCTGAAAACGTTCCCGC**TGTCTAGGACCGTTG
ATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTCGAGGATGACTCCTATAGGAC
CTGAGGATCCAACTGAGAGGAGTAGGATCACCGTCTTTTCGAAGA

QA 3 527 3 527
DS 

RD RR4H147JQ 648 0 0
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CCAACAACC*CATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTC
AAGCTACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCTCTGCTTTCAACTGCTCTTTC
TCCCAACCACAATACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCCACCAGCTTCCTCTTC
ACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGTAGTACAATCCTTTCATTACT
TGTTTGAACGCTGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGCTCCTTGGACTCACCAGGAAC
AACCCTTCTTCCAAAGGTCCACCAAAGAAGAGACTCTTGTCTGAAAACGTTCCCGCCATG
TCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGATG
ACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACTGAGAGGAGTAGGATCACCGTCTTTTCGAAGATG
TGGACTTCTTCTAGCTTCTCTGTTGCTAGTAGGAGACATCCTGTCTCTGGCTCTAGTATC
TTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGATAGTGAA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4HA13JQB 840 0 0
GG
TCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGCCAGTTTGAGGTCCAATAAGACCAACAACCTCAT
CCAAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTCAAGCTACAAGCAG
CTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCTCTGCTTTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAAT
ACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAG
CCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGTAGTACAATCCTTTCATTACTTGTTTGAACGCTG
CTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGCTCCTTGGACTCACCAGGAACAACCCTTCTTCCA
AAGGTCCACCAAAGAAGAAACTCTTGTCTGAAAACGTTCCCGC**TGTCTAGGACCGTTG
ATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTCGAGGATGACTCCTATAGGAC
CTGAGGATCCAACTGAGAGGAGTAGGATCACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACTTCTTCTA
GCTTCTCTGTTGCTAGTAGGAGACACCCTGTCTCTGGCACTAGTATCTTGTGTGCCCATT
TGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGATAGTGAAGATGAGGACGAGTCCTTCTCGGGGG
TTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAGCATCTG
ATGTAGAACTGTTGTTAACACTGTCCTTGAAGAGATCAGCATCATCATCCAGTGGCTTCC
ATGAATCCGAAGAGACAATTCACAGAGATGGAGAAGCAACCTTCCTGGTGAGAAACTG

QA 3 840 3 840
DS 



CO CL1199Contig2 764 4 12 U
GGCTCTTCAGAGGAACTAAACTGAACTGAGTCAGAGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGA
GAGAGAGACATGGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTT
GTCCCCCCACTCATCAAAACCAGAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAG
TTTCTCACCAGGAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGAATTGTTCTCTTTCGGATTCATGG
AAGCCACTGGAGGATGATGCTGATCTCTTCAAGGACAGTGTTAACAACAGTTCTACATCA
GATGCTGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTTGTAGCTGGAGAGCAAGCTGCAACC
CCCGAGAAGGACTCGTCCTCATCTTCACTATCATCATCACTGATCACAACTGGGAACAAA
TGGGCACACAAGATACTAGAGCCAGAGACAGGATGTCTCCTACTAGCAACAGAGAAGCTA
GAAGAAGTCCACATCTTCGAAAAGACGGTGATCCTACTCCTCTCAGTTGGACCCTCAGGT
CCTATAGGAGTCATCCTCAACCGTCCCTCGCTCATGTCAATCAAAGAGACCACCAAATCA
ACGGTCCTAGACATGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGTCTCTTCTTTGGTGGACCTTTG
GAAGAAGG*TTGTTCCTGGTGAGTCCAAGAGCGGCAACGAGGTTGAGAAGAGCGGAGCAG
CGTTCAAACAAGTAATGAAAGGATGTACTACGGGACGAGAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA13TF U 7
AF RR4H147TF U 1
AF RR4FV87TF U 7
AF RR4H111TF U 7
BS 1 129 RR4H147TF
BS 130 130 RR4H111TF
BS 131 354 RR4H147TF
BS 355 355 RR4FV87TF
BS 356 655 RR4H147TF
BS 656 656 RR4FV87TF
BS 657 685 RR4H147TF
BS 686 708 RR4FV87TF
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BS 710 734 RR4FV87TF
BS 735 735 RR4H111TF
BS 736 764 RR4FV87TF

RD RR4HA13TF 181 0 0
GG
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CATGGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCCCC
ACTCATCAAAACCAGAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAGTTTCTCA

QA 3 181 3 181
DS 

RD RR4H147TF 685 0 0
GGCTCTTCAGAGGAACTAAACTGAACTGAGTCAGAGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGA
GAGAGAGACATGGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTT
GTCCCCCCATTCATCAAAACCAGAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAG
TTTCTCACCAGGAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGAATTGTTCTCTTTCGGATTCATGG
AAGCCACTGGAGGATGATGCTGATCTCTTCAAGGACAGTGTTAACAACAGTTCTACATCA
GATGCTGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTTGTAGCTGGAGAGCAAGCTACAACC
CCCGAGAAGGACTCGTCCTCATCTTCACTATCATCATCACTGATCACAACTGGGAACAAA
TGGGCACACAAGATACTAGAGCCAGAGACAGGATGTCTCCTACTAGCAACAGAGAAGCTA
GAAGAAGTCCACATCTTCGAAAAGACGGTGATCCTACTCCTCTCAGTTGGACCCTCAGGT
CCTATAGGAGTCATCCTCAACCGTCCCTCGCTCATGTCAATCAAAGAGACCACCAAATCA
ACGGTCCTAGACATGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGTCTCTTCTTTGGTGGAC*TTTG
GAAGAAGG*TTGTTCCTGGTGAGTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FV87TF 758 0 0
GG
AGAGGAACTAAACTGAACTGAGTCAGGGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGAGAGAGAGA
CATGTATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCCCC
ATTCATCAAAACCAGAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAGTTTCTCAC
CAGGAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGGATTGTTCTCTTTCGGATTCATGGAAGCCACT
GGAGGATGATGCTGATCTCTTCAAGGACAGTGTTAA**ACAGTTCTACATCAGATGCTGC
TGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTTGTAGCTGGAGAGCAAGCTGCAACCCCCGAAAA
GG**TCGTCCTCATCTTCACTATCATCATCACTGATCACAACTGGGAACAAATGGGCACA
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CCACATCTTCGAAAAGACGGTGATCCTACTCCTCTCAGTTGGACCCTCAGGTCCTATAGG
AGTCATCCTCAACCGTCCCTCGCTCATGTCAATCAAAGAGACCACCAAATCAACGGTCCT
GGACATGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGTCTCTTCTTTGGTGGACCTTTGGAAGAAGG
*TCGTTCCTGGTGAGTCCAAGAGCGGCAACGAGGTTGAGA*GAGCGGAGCAGCGTTCAAA
CAAGTA*TGAAAGGATGTACTACGGGACGAGAGAGA

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4H111TF 732 0 0
GG
AGAGGAACTAAACTGAACTGAGTCAGAGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGAGAGAGAGA
CATGGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCCCC
ACTCATCAAAACCAGAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAGTTTCTCAC
CAGGAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGAATTGTTCTCTTTCGGATTCATGGAAGCCACT
GGATGATGATGCTGATCTCTTCAAGGACAGTGTTAACAACAGTTCTACATCAGATGCTGC
TGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTTGTAGCTGGAGAGCAAGCTGCAACCCCCGAGAA
GGACTCGTCCTCATCTTCACTATCATCATCACTGATCACAACTGGGAACAAATGGGCACA
CAAGATACTAGTGCCAGAGACAGGGTGTCTCCTACTAGCAACAGAGAAGCTAGAAGAAGT
CCACATCTTCGAAAAGACGGTGATCCTACTCCTCTCAGTTGGATCCTCAGGTCCTATAGG
AGTCATCCTCGACCGTCCCTCGCTCATGTCAATCAAAGAGACCACCAAATCAACGGTCCT
AGACA**GCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGTCTCTTCTTTGGTGGACCTTTGGAAGAAGG
GTTGTTCCTGGTGAGTCCAAGAGCGGCAACGAGGTTGAGAAGAGCGGAGCAGCGTTCAA*
CAAGTAATGA

QA 3 732 3 732
DS 



AS 1 6

CO CL1200Contig1 965 6 2 U
ACTCTCAATTTCCAGTGCTGGATTTTATTAGATATCATTTTCTTACTTCTCAATCTACAT
ATATAAAATTACTTCATTCCACCAAGCCTGATACAAACTTAATATCCCAAATACACTTAG
CAACACAGCAAAATAAAATTAAAACATAAATAAATAAGTACTATCACTCTCATTTTATTC
TTGCAAGAACTCAACCCACAAATCCACAAGGACCACAACCATCAGCTTAGGCCGCGGGCT
TGGCAAAGATCTTCTTAGCAAATTCAGCCAGCGTTGCAGTGTCGGGCATGACAGGTTTCA
CAGCAGGATCGTTACAGAATTGCTCAGCCCATTTGGATAGAGAAGGAGTCTTGGCCTCAT
CAAGAACTTTATGACCAGCTGCCAACTCGGTGACTCTCAACCAACCCAGGAAGCACCCGA
ATGCAATGTCGAGGTAACCGATGTGTTCACCGTTGAAGAATGGTTTTCCTTTGCTGCAAT
CGATGAAGGCCTTCTCGAGAAGCGCAGTCCCTTCTTCCACTTGAGCTAGCACAGCTTTCT
TCGCTTCTTCTCCCTCAGCTTGTAGGATACTTTTTAGAGAGGGAAACCACTTTTCGTCAA
TATAGGCAGCCCAGAACCGAGCGATGGCTCGGTCATAAGGATTAGAAGGTAACATGGACG
GTCCAGATGTGCTCCAAGTCTCATCAACATACTCAACGATGATGTTAGATTCACAAACCG
GTTTGTCAGCATGAATCAGAACGGGAATCTTCTTGTGAACCGGGTTTGATTTAAGAAGCA
ACTCGCTCTTAGAACCAAATGTCTCCTGGAGGAACTCGTAGGAAACAGACTTGAGGTTCA
GAGCAATCCTCGGCCTCATCACAAAAGGACTCGCCCATGCGCCGATCACCTTCACTTCGT
CGCTAGCCATTTTCACCTCAAGATCAAGAACAGAGAAGGAATTGGTTTAACAAGTTGAAG
CTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

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AF RR4C719JQ U 61
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DS 



AS 2 7

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RR4FE32JQ U 2
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GG
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GC

QA 3 344 3 344
DS 

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GG
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CAAAGTATCAATAAGAATTCACAACAAAAATCGTTTATTGGAAGAAAAAAATTCAGAAAA
GCCAATTAATACTGATGTTACCAAGCCATATCAAAAGAGGGAACTGGACCAAGGCCAAAA
ACAGCAGGAGGTAATGATGTCTGCTCGAATCATAACTCCTTACCTCAGCAAACAGAACAC
GTTTCATAGTCTTCACCAAGAAAACCCCAGTGCATAAACACGTCCATGGCATCAAAGCAT
AATACGAGTATCCCCACATGATCTTAGCAAAACCCGCAAGGCACAGACCAGCAAAAGCAT
AGCCTCCATAAGCCACAATGTCTAGCAAAGGCGCCTCAGCGCTACCAAGTGACAAGAGCG
TTACTTTCAGGAGCATCACTTGCAAAAACCAACCAACCAATCCTTTCACAAACAGCCAAT
TCAAAGCTTCCGGTGAAAACTTTCCGTTAAGTCCCAAAGAAAGACCAGCAAGAACAACGT
ATGTACCAAATGCCATAAAGGGAATATACAAGTCAGGCGCATTGATATCATAGATGGGAG
GCTTGTATGAGAGCCTACCCCCAACTGGTTCAGAGATTCTAGCCCAGTGTC

QA 3 653 3 653
DS 

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GG
CGTTCAAGCATAACAATTTATTCACCACGTACAATTTCAAGAATGTTCAAACTTCTGCTA
CAAAGTACCAATAAGAATTCACAACAAAAATCGTTTATTGGAAGAAAAAAATTCAGAAGA
GCCAATTAATACTGATGTTACCAAGCCATATCAAAAGAGGGAACTGGACCAAGGCCAAAA
ACAGCAGGAGGTAATGATGTCTGCTCGAATCATAACTTCTTACCTCAGCAAACAGAACAC
GTTTCATCGTCTTCACCAAGAAAACCCCAGTGCACAAGCACGTCCATGGCATCAAAGCGT
AGTACGAGTATCCCCACATGATCTTGGCAAAACCGGCAAGACACAGACCAGCAAAAGCAT
AGCCTCCATAAGCCAAAATGTCTAGCAAAGGCGCCTCTGCGCTACCAAGTGATAGAAGCG
TTACTTTCAGGAGCATCACTTGCAAAAACCAACCAACCAATCCTTTCACAAACAGCCAAT
TCAAAGCTTCCGGTGAAAACTTTCCGTTAAGTCCCAAAGAAAGACCAGCAAGAACAAGGT
ATGTACCAAATGCCATAAAGGGAATGTACAAGTCAGGCGCATTGATATCATAGATGGGAG
GCTTGTATGAGA

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR4AC14JQ 805 0 0
GGACGTTCAAGCATAACAATTTATTCACCACGTACAATTTCAAGAATGTTCAAACTTCTG
CTACAAAGTACCAATAAGAATTCACAACAAAAATCGTTTATTGGAAGAAAAAAATTCAGA
AAAGCCAATTAATACTGATGTTACCAAGCCATATAAAAAGAGGGAACTGGACCAAGGCCA
AAAACAGCAGGAGGTAATGATGTCTGCTCGAATCATAACTTCTTACCTCAGCAAACAGAA
CACGTTTCATCGTCTTCACCAAGAAAACCCCAGTGCACAAGCACGTCCATGGTATCAAAG
CGTAGTACGAGTATCCCCACATGATCTTGGCAAAACCGGCAAGACACAGACCAGCAAAAG
CATAGCCTCCATAAGCCACAATGTCTAGCAAAGGCGCCTCTGCGCTACCAAGTGATAGAA
GCGTTACTTTCAGGAGCATCACTTGCAAAAACCAACCAACCAATCCTTTCACAAACAGCC
AATTCAAAGCTTCCGGTGAAAACTTTCCGTTAAGTCCCAAAGAAAGACCAGCAAGAACAA
GGTATGTACCAAATGCCATAAAGGGAATGTACAAGTCAGGCGCATTGATATCATAGATGG
GAGGCTTGTATGAGAGCCTACCCCCAACTGGTTCAGAGATTCTGGCCCAGTGTCCCCGGT
GAAGGAACGGAAAGAGAACAACCTTGAGTTTGTTCCTAACATATTGATCATTCACTTGGA
AGTAGTATTGGGGATCAGAGAAGTAACGAGTTATATTGCTCTGCACATACTCAGAGCTTG
ATCCTAGAATCCTCTCCCCGTAAGC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4AC14TF 756 0 0
TCAAACTTCTGCTACAAAGTACCAATAAGAATTCACAACAAAAATCGTTTATTGGAAGAA
AAAAATTCAGAAAAGCCAATTAATACTGATGTTACCAAGCCATATAAAAAGAGGGAACTG
GACCAAGGCCAAAAACAGCAGGAGGTAATGATGTCTGCTCGAATCATAACTTCTTACCTC
AGCAAACAGAACACGTTTCATCGTCTTCACCAAGAAAACCCCAGTGCACAAGCACGTCCA
TGGTATCAAAGCGTAGTACGAGTATCCCCACATGATCTTGGCAAAACCGGCAAGACACAG
ACCAGCAAAAGCATAGCCTCCATAAGCCACAATGTCTAGCAAAGGCGCCTCTGCGCTACC
AAGTGATAGAAGCGTTACTTTCAGGAGCATCACTTGCAAAAACCAACCAACCAATCCTTT
CACAAACAGCCAATTCAAAGCTTCCGGTGAAAACTTTCCGTTAAGTCCCAAAGAAAGACC
AGCAAGAACAAGGTATGTACCAAATGCCATAAAGGGAATGTACAAGTCAGGCGCATTGAT
ATCATAGATGGGAGGCTTGTATGAGAGCCTACCCCCAACTGGTTCAGAGATTCTGGCCCA
GTGTCCCCGGTGAAGGAACGGAAAGAGAACAACCTTGAGTTTGTTCCTAACATATTGATC
ATTCACTTGGAAGTAGTATTGGGGATCAGAGAAGTAACGAGTTATATTGCTCTGCACATA
CTCAGAGCTTGATCCTAGAATCCTCTCCCCGTAAGC

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL1201Contig2 754 2 11 U
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ATGTACAATAATAACAACATGGGACCTCAACCAGGGATGCCGAGACCTCCTGGAAACCCT
CAGCCCGGTCCGTTTGGGAATCCCTTCACTGGACCTGCCTCGGGCTTTATCCGTGGCGGG
TTGGGTGCTTACGGGGAAAGGATCCTAGGATCAAGCTCTGAGTATGTTCAGAGCAATATT
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AAACTCAAGGTTGTGCTCTTTCCTTTCCTTCACCGGGGACACTGGGCTAGAATCTCTGAA
CCAGTTGGGGGTAGGCTCTCATACAAGCCTCCCATCTATGATATCAATGCGCCTGACTTG
TATATTCCCTTTATGGCATTTGGTACATACGTTGTTCTTGCTGGTCTTTCTTTGGGACTT
AACGGAAAGTTTTCACCGGAAGCTTTGAATTGGCTGTTTGTGAAAGGATTGGTTGGTTGG
TTTTTGCAAGTGATGCTCCTGAAAGTAACGCTCTTTGTCACTTGGTAGCGCTGAGGCGCC
TTTGCTAGACATTGTGGCTTATGGAGGCTATGCTTTTGCTGGTCTGCGCCTTGCGGGTTT
TGCTAAGATCATGTGGGGATACTCGTATTATGCTTTGATGCCATGGACGTGTTTATGCAC
TGGGGTTTTCTTGGTGAAGACTATGAACGTGTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF47TF U 1
AF RR4FE32TF U 1
BS 1 203 RR4FE32TF
BS 204 204 RR4FF47TF
BS 205 250 RR4FE32TF
BS 251 251 RR4FF47TF
BS 252 575 RR4FE32TF
BS 576 576 RR4FF47TF
BS 577 595 RR4FE32TF
BS 596 596 RR4FF47TF
BS 597 646 RR4FE32TF
BS 647 647 RR4FF47TF
BS 648 754 RR4FE32TF

RD RR4FF47TF 720 0 0
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TTTGCTAGACATTGTGGCTTATGGAGTCTATGCTTTTGCTGGTCTGCGTCTTGCGGGTTT
TGCTAAGATCATGTGGGGATACTCGTATTATGCTTTGATGCCATGGACGTGTTTATGCAC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4FE32TF 754 0 0
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ATGTACAATAATAACAACATGGGACCTCAACCAGGGATGCCGAGACCTCCTGGAAACCCT
CAGCCCGGTCCGTTTGGGAATCCCTTCACTGGACCTGCCTCGGGCTTTATCCGTGGCGGG
TTGGGTGCTTACGGGGAAAGGATTCTAGGATCAAGCTCTGAGTATGTTCAGAGCAATATT
ACTCGTTACTTCTCTGATCCCCAATACTACTTCCAAGTGAATGATCAATATGTTAGGAAC
AAACTCAAGGTTGTGCTCTTTCCTTTCCTTCACCGGGGACACTGGGCTAGAATCTCTGAA
CCAGTTGGGGGTAGGCTCTCATACAAGCCTCCCATCTATGATATCAATGCGCCTGACTTG
TATATTCCCTTTATGGCATTTGGTACATACGTTGTTCTTGCTGGTCTTTCTTTGGGACTT
AACGGAAAGTTTTCACCGGAAGCTTTGAATTGGCTGTTTGTGAAAGGATTGGTTGGTTGG
TTTTTGCAAGTGATGCTCCTGAAAGTAACGCTCTT*GTCACTTGGTAGCGCTGAG*CGCC
TTTGCTAGACATTGTGGCTTATGGAGGCTATGCTTTTGCTGGTCTGTGCCTTGCGGGTTT
TGCTAAGATCATGTGGGGATACTCGTATTATGCTTTGATGCCATGGACGTGTTTATGCAC
TGGGGTTTTCTTGGTGAAGACTATGAACGTGTCT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 5

CO CL1202Contig1 1126 5 2 U
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CAGTGGCTCTCTTGTCAAGCGAGTAAGGCAAGTAAGTACCGAGAATCCTATCCCACATGA
CAAAGAAGGGCTGCGAGAAATTGTATTTGGTTACGTAGAGCTGATGATGAACATCATGGT
AAGCAGAGTTATTAGTGAAGAAGATGTGAAAGGGGTTTCCGGGGAGCCAGAGTCCACAGT
GATCGTCAACCGTCTTGATGGTGGCGAAGGAAAAGAAAAAGATGGCGGTTCTCGGGGACA
TACCGGAGAAGAGGAAAGACAGAGCACCACCGACGGTGTCCAAGAGAAGGCCTTCTAGTG
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TGTGCTTGTATAAGAACTTGTTGATGTGCATGTAGCGATGGATGAAGTATTGCCAAGTGT
CGATAACGAGCATGGCGATGATAAACTGCCTAGCGAGAGTAGAAGGGAGAATTGCTGCGT
CGTAGACGCATCTGCATCATCACTTCCTGTTATCTTGAAGAGGATAACGGAGATGATGGC
CTGGAGAGCCTGCTGAAGGAGGACGCCCTTGACGACGGCGGATTTAGTGACGAGATTCTT
CTCGTCCTCGTCCACCTTGGAATGCAATCGATACCTCTCCAAAGATCCTAAGCAAATGTA
CATCCCTGAATACACCCAATACACCAAAATCGGCACGAACGTTCCCAGAAACTCATCGGA
GATCTCGAAACCCATCATCATCATCATTTCTAGAGTCTATTTATATAATATGGTTTTACA
CTAAACAAATCGATAAGCGAATCAAACACCGCCTGGTGAAGAAAATCGCATCACTCTTCG
CTAATTCCCCTTTTTTGTCAAAAGAGCTAAACCTAACACGAAGAGATTAGAGAATCTTCT
TCGTCGTCGTCGCACGGTGTTTTCTCTCTTTTTCGTTCTGCGTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A127JQ U 25
AF RR4A676JQ U 1
AF RR4A127JQD U 1
AF RR4A127TFB C 272
AF RR4A676TF C 266
BS 1 801 RR4A127JQD
BS 802 1126 RR4A676TF

RD RR4A127JQ 607 0 0
TGTACACAGATACAAGTACACAGAGAGGTTACAAGGGTTCTCTAGCGAGTAAATGATGAA
GTAACGTAAAAGCAGTGATAAAGAAACACCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGTTACTCAT
CTTTGGACGCTTTGATTGGCCGTGTCTCAAACCCTCCAGTGGCTCTCTTGTCAAGCGAGT
AAGGCAAGTAAGTACCGAGAATCCTATCCCACATGACAAAGAAGGGCTGCGAGAAATTGT
ATTTGGTTACGTAAAGCTGATGATGAACATCATGGTAAGCAAAGTTATTAGTGAAGAAAA
TGTGAAAGGGGTTTCCGGGGAGCCAGAGTCCACAGTGATCGTCAACCGTCTTGATGGTGG
CGAAGGAAAAGAAAAAGATGGCGGTTCTCGGGGACATACCGGAAAAAAGGAAAGACAGAG
CACCACCGACGGTGTCCAAGAGAAGGCCTTCTAGTGGATGGTTGTATAAAGCTCCGTATG
AGTAGGGAACGATGAGGCGGTGGTGCTGAAAGTGGATGTGCTTGTATAAAAACTTGTTGA
TGTGCATGTAGCGATGGATGAAGTATTGCCAAGTGTCGATAACGAGCATGGCGATGATAA
ACTGCCT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4A676JQ 753 0 0
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GTTCTCTAGCGAGTAAATGATGAAGTAACGTAAAAGCAGTGATAAAGAAACACCAAAAAA
AAAAGAAGAAGAAAAGTTACTCATCTTTGGACGCTTTGATTGGCCGTGTCTCAAACCCTC
CAGTGGCTCTCTTGTCAAGCGAGTAAGGCAAGTAAGTACCGAGAATCCTATCCCACATGA
CAAAGAAGGGCTGCGAGAAATTGTATTTGGTTACGTAGAGCTGATGATGAACATCATGGT
AAGCAGAGTTATTAGTGAAGAAGATGTGAAAGGGGTTTCCGGGGAGCCAGAGTCCACAGT
GATCGTCAACCGTCTTGATGGTGGCGAAGGAAAAGAAAAAGATGGCGGTTCTCGGGGACA
TACCGGAGAAGAGGAAAGACAGAGCACCACCGACGGTGTCCAAGAGAAGGCCTTCTAGTG
GATGGTTGTATAAAGCTCCGTATGAGTAGGGAACGATGAGGCGGTGGTGCTGAGAGTGGA
TGTGCTTGTATAAGAACTTGTTGATGTGCATGTAGCGATGGATGAAGTATTGCCAAGTGT
CGATAACGAGCATGGCGATGATAAACTGCCTAGCGAGAGTAGAAGGGAGAATTGCTGCGT
CGTAGACGCATCTGCATCATCACTTCCTGTTATCTTGAAGAGGATAACGGAGATGATGGC
CTGGAGAGCCTGCTGAAGGAGGACGCCCTTGAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4A127JQD 801 0 0
CGAAAAGGAGAGATTGGGATTGTATGTACACAGATACAAGTACACAGAGAGGTTACAATG
GTTCTCTAGCGAGTAAATGATGAAGTAACGTAAAAGCAGTGATAAAGAAACACCAAAAAA
AAAAGAAGAAGAAAAGTTACTCATCTTTGGACGCTTTGATTGGCCGTGTCTCAAACCCTC
CAGTGGCTCTCTTGTCAAGCGAGTAAGGCAAGTAAGTACCGAGAATCCTATCCCACATGA
CAAAGAAGGGCTGCGAGAAATTGTATTTGGTTACGTAGAGCTGATGATGAACATCATGGT
AAGCAGAGTTATTAGTGAAGAAGATGTGAAAGGGGTTTCCGGGGAGCCAGAGTCCACAGT
GATCGTCAACCGTCTTGATGGTGGCGAAGGAAAAGAAAAAGATGGCGGTTCTCGGGGACA
TACCGGAGAAGAGGAAAGACAGAGCACCACCGACGGTGTCCAAGAGAAGGCCTTCTAGTG
GATGGTTGTATAAAGCTCCGTATGAGTAGGGAACGATGAGGCGGTGGTGCTGAGAGTGGA
TGTGCTTGTATAAGAACTTGTTGATGTGCATGTAGCGATGGATGAAGTATTGCCAAGTGT
CGATAACGAGCATGGCGATGATAAACTGCCTAGCGAGAGTAGAAGGGAGAATTGCTGCGT
CGTAGACGCATCTGCATCATCACTTCCTGTTATCTTGAAGAGGATAACGGAGATGATGGC
CTGGAGAGCCTGCTGAAGGAGGACGCCCTTGACGACGGCGGATTTAGTGACGAGATTCTT
CTCGTCCTCGTCCACCTTGGA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4A127TFB 628 0 0
TACGTAGAGCTGATGATGA*CATCATG*TAAGCAGAGTA**TAGTGA*GAAGATGTGAAA
GGGGTT*CCGGGGAGCCAGAGTCCACAGTGATCGTCAACCGTCTTGATGGTGGCGAAGGA
AAAGAAAAAGATGGCGGTTCTCGGGGACATACCGGAGAAGAGGAAAGACAGAGCACCACC
GACGGTGTCCAAGAGAAGGCCTTCTAGTGGATGGTTGTATAAAGCTCCGTATGAGTAGGG
AACGATGAGGCGGTGGTGCTGAGAGTGGATGTGCTTGTATAAGAACTTGTTGATGTGCAT
GTAGCGATGGATGAAGTATTGCCAAGTGTCGATAACGAGCATGGCGATGATAAACTGCCT
AGCGAGAGTAGAAGGGAGAATTGCTGCGTCGTAGACGCATCTGCATCATCACTTCCTGTT
ATCTTGAAGAGGATAACGGAGATGATGGCCTGGAGAGCCTGCTGAAGGAGGACGCCCTTG
ACGACGGCGGATTTAGTGACGAGATTCTTCTCGTCCTCGTCCACCTTGGAATGCAATCGA
TACCTCTCCAAAGATCCTAAGCAAATGTACATCCCTGAATACACCCAATACACCAAAATC
GGCACGAACGTTCCCAGAAACTCATCGG

QA 1 628 1 628
DS 

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ATTT
GTTACGTAGAGCTGATGATGA*CATCATG*TAAGCAGAGTTATTAGTGAAGAAGATGTGA
AAGGGGTTTCCGGGGAGCCAGAGTCCACAGTGATCGTCAACCGTCTTGATGGTGGCGAAG
GAAAAGAAAAAGATGGCGGTTCTCGGGGACATACCGGAGAAGAGGAAAGACAGAGCACCA
CCGACGGTGTCCAAGAGAAGGCCTTCTAGTGGATGGTTGTATAAAGCTCCGTATGAGTAG
GGAACGATGAGGCGGTGGTGCTGAGAGTGGATGTGCTTGTATAAGAACTTGTTGATGTGC
ATGTAGCGATGGATGAAGTATTGCCAAGTGTCGATAACGAGCATGGCGATGATAAACTGC
CTAGCGAGAGTAGAAGGGAGAATTGCTGCGTCGTAGACGCATCTGCATCATCACTTCCTG
TTATCTTGAAGAGGATAACGGAGATGATGGCCTGGAGAGCCTGCTGAAGGAGGACGCCCT
TGACGACGGCGGATTTAGTGACGAGATTCTTCTCGTCCTCGTCCACCTTGGAATGCAATC
GATACCTCTCCAAAGATCCTAAGCAAATGTACATCCCTGAATACACCCAATACACCAAAA
TCGGCACGAACGTTCCCAGAAACTCATCGGAGATCTCGAAACCCATCATCATCATCATTT
CTAGAGTCTATTTATATAATATGGTTTTACACTAAACAAATCGATAAGCGAATCAAACAC
CGCCTGGTGAAGAAAATCGCATCACTCTTCGCTAATTCCCCTTTTTTGTCAAAAGAGCTA
AACCTAACACGAAGAGATTAGAGAATCTTCTTCGTCGTCGTCGCACGGTGTTTTCTCTCT
TTTTCGTTCTGCGTCCC

QA 5 861 5 861
DS 



AS 1 3

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GGGTGGAGAAGAAAGTTTGATGAGTGAGGCTGTATGGTTTTACAATGAATATATATGTCT
CTCTGTTCATCTATACACACACCAACGTTGAGATACAAACAACCGAATATCATTTTTATC
GGTGGGGTTTAGGGTTTAAACTAAACCAACTGTTTCTGCAGAAGGCTTCCACAGAATGCC
AAATCAAACCTCTCTTCAGGAGGGTCTCCAATGCAGTCGAAAACCGCGTCTGCGTTCACA
AAATCTTCATCCGCCGTGTATCCACTCTTTGTAACTATACAAGTCATTCCCGCAGCTTTT
GCAGCTGCTAGCCCGATAGCGCTGTCTTCAACCACAACACATCTTGAGGGATCAACTCCA
AGGGTTTCAGCTGCTAGGTTGTAGATGGCCGGGTCAGGCTTCTTTTTGGGGACTACATCT
CCTGCAAATATCTTGATCTTCTCTGCTTTTTCTGGTCCAAGCAAGCATGAGACTATAGCA
GACACCGCCTTTTCATTTGAAGTGCTGCACACGGCGACTTTTACTCCATTCGTTAGAGCT
TGATCAACCAGTTTGGCAACACCGGGTCGAAGAGGAAGCAGCTTCTTCTCGATGAGAACC
ATGAAAAGCTCAGTCTTCTGCTTGTGAAGGCCAGCTATGAACC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DM55JQ U 1
AF RR4AS53JQ U 5
AF RR4AS53TF C 5
BS 1 167 RR4DM55JQ
BS 168 168 RR4AS53JQ
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BS 495 625 RR4DM55JQ
BS 626 643 RR4AS53JQ

RD RR4DM55JQ 625 0 0
GGGTGGAGAAGAAAGTTTGATGAGTGAGGCTGTATGGTTTTACAATGAATATATATGTCT
CTCTGTTCATCTATACACACACCAACGTTGAGATACAAACAACCGAATATCATTTTTATC
GGTGGGGTTTAGGGTTTAAACTAAACCAACTGTTTCTGCAGAAGGCTACCACAGAATGCC
AAATCAAACCTCTCTTCAGGAGGGTCTCCAATGCAGTCGAAAACCGCGTCTGCGTTCACA
AAATCTTCATCCGCCGTGTATCCACTCTTTGTAACTATACAAGTCATTCCCGCAGCTTTT
GCAGCTGCTAGCCCGATAGCGCTGTCTTCAACCACAACACATCTTGAGGGATCAACTCCA
AGGGTTTCAGCTGCTAGGTTGTAGATGGCCGGGTCAGGCTTCTTTTTGGGGACTACATCT
CCTGCAAATATCTTGATCTTCTCTGCTTTTTCTGGTCCAAGCAAGCATGAGACTATAGCA
GACACCGCCTTTTAATTTGAAGTGCTGCACACGGCGACTTTTACTCCATTCGTTAGAGCT
TGATCAACCAGTTTGGCAACACCGGGTCGAAGAGGAAGCAGCTTCTTCTCGATGAGAACC
ATGAAAAGCTCAGTCTTCTGCTTGT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4AS53JQ 639 0 0
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GTTCATCTATACACACACCAACGTTGAGATACAAACAACCGAATATCATTTTTATCGGTG
GGGTTTAGGGTTTAAACTAAACCAACTGTTTCTGCAGAAGGCTTCCACAGAATGCCAAAT
CAAACCTCTCTTCAGGAGGGTCTCCAATGCAGTCGAAAACCGCGTCTGCGTTCACAAAAT
CTTCATCCGCCGTGTATCCACTCTTTGTAACTATACAAGTCATTCCCGCAGCTTTTGCAG
CTGCTAGCCCGATAGCGCTGTCTTCAACCACAACACATCTTGAGGGATCAACTCCAAGGG
TTTCAGCTGCTAGGTTGTAGATGGCCGGGTCAGGCTTCTTTTTGGGGACTACATCTCCTG
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AAAGCTCAGTCTTCTGCTTGTGAAGGCCAGCTATGAACC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AS53TF 639 0 0
GGAGAAGAAAGTTTGATGAGTGAGGCTGTATGGTTTTACAATGAATATATATGTCTCTCT
GTTCATCTATACACACACCAACGTTGAGATACAAACAACCGAATATCATTTTTATCGGTG
GGGTTTAGGGTTTAAACTAAACCAACTGTTTCTGCAGAAGGCTTCCACAGAATGCCAAAT
CAAACCTCTCTTCAGGAGGGTCTCCAATGCAGTCGAAAACCGCGTCTGCGTTCACAAAAT
CTTCATCCGCCGTGTATCCACTCTTTGTAACTATACAAGTCATTCCCGCAGCTTTTGCAG
CTGCTAGCCCGATAGCGCTGTCTTCAACCACAACACATCTTGAGGGATCAACTCCAAGGG
TTTCAGCTGCTAGGTTGTAGATGGCCGGGTCAGGCTTCTTTTTGGGGACTACATCTCCTG
CAAATATCTTGATCTTCTCTGCTTTTTCTGGTCCAAGCAAGCATGAGACTATAGCAGACA
CCGCCTTTTCATTTGAAGTGCTGCACACGGCGACTTTTACTCCATTCGTTAGAGCTTGAT
CAACCAGTTTGGCAACACCGGGTCGAAGAGGAAGCAGCTTCTTCTCGATGAGAACCATGA
AAAGCTCAGTCTTCTGCTTGTGAAGGCCAGCTATGAAC
C

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 4

CO CL1204Contig1 926 4 6 U
GGAACTGAGAGAGAGACGACGACCGAAAAGATTCGCTTCTCAGGGGGAAGGAAGGAAGAA
CTTTCACTTCACTCATCTTCTCGGAAATGGCGATATCTGGGAATCTGAGGATCTCCGCAA
GCTTAGTATCTCCTTATCATCACCATCCTAAATGCCTCTCTTTACCTTCTTCCAAGGTTG
ATTTCATAAGCAATGTCGCAAACAGTTTTGAAAAGCAGAAAGTGTCAATCAGCCTCGGAA
ACAGACGTGGTGAAGCGAAGGTTTTAGCAAGGAACAACACCACGGCGGGAGACTATGAGC
TATCACCAAGCCCGGTTCAGCAAGAGGTGGAGAGATTTCTCTTGAACGCCATCAACATGA
GCTTCTTTGACCGGTTAAACCTAGCGTGGAAGATAGTCTTCCCTTCCCACGCGTCGAGGA
GAAGCTCCAACGCGAGAATCGCGAAGCAGAGGCTCAAGATGATTTTATTCTCGGACAGGT
GTGATGTTAGCGACGAGGCTAAAAGGAAGATCGTGAACAACATTGTTCACGCGCTGTCGG
ATTTCGTGGAGATTGAGTCGGAGGAGAAAGTTCAGCTTAACGTCTCCACGGACGGTGACA
TCGGGACTATTTACT*GGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACG
TGGATGAGGCGGGATCGATAACCAACGTGGAGTACAAAGATACGCTTGATGGGTCCGTGG
ATGTCAGGTTCGATTTTTATGTTCCAGAGTGATAACAAGGCATTGTGTCTTATTAGGGTT
GTTTTCTTTGTTTGTCTGTTTTCGTGTTGCTGTTGTTGAAGTTTTAGTCTGTGAGGGAAC
AAAGACTGTTTCTTGACACTCTCATTTGTATATATGCGACTTCTCTCTTCAAAGTTCTAT
CAAAACCTAGGGTCCTTTTCTTACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4CI85TF U 1
AF RR4A545TF U 1
AF RR4A545JQ C 123
AF RR4CI85JQ C 181
BS 1 428 RR4A545TF
BS 429 429 RR4CI85TF
BS 430 725 RR4A545TF
BS 726 878 RR4A545JQ
BS 879 879 RR4CI85JQ
BS 880 926 RR4A545JQ

RD RR4CI85TF 614 0 0
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CTTTCACTTCACTCATCTTCTCGGAAATGGCGATATCTGGGAATCTGAGGATCTCCGCAA
GCTTAGTATCTCCTTATCATCACCATCCTAAATGCCTCTCTTTACCTTCTTCCAAGGTTG
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ATTTCGTGGAGATTGAGTCGGTGGAGAAAGTTCAGCTTAACGTCTCCACGGACGGTGACA
TCGGGACTATTTAC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4A545TF 725 0 0
GGAACTGAGAGAGAGACGACGACCGAAAAGATTCGCTTCTCAGGGGGAAGGAAGGAAGAA
CTTTCACTTCACTCATCTTCTCGGAAATGGCGATATCTGGGAATCTGAGGATCTCCGCAA
GCTTAGTATCTCCTTATCATCACCATCCTAAATGCCTCTCTTTACCTTCTTCCAAGGTTG
ATTTCATAAGCAATGTCGCAAACAGTTTTGAAAAGCAGAAAGTGTCAATCAGCCTCGGAA
ACAGACGTGGTGAAGCGAAGGTTTTAGCAAGGAACAACACCACGGCGGGAGACTATGAGC
TATCACCAAGCCCGGTTCAGCAAGAGGTGGAGAGATTTCTCTTGAACGCCATCAACATGA
GCTTCTTTGACCGGTTAAACCTAGCGTGGAAGATAGTCTTCCCTTCCCACGCGTCGAGGA
GAAGCTCCGACGCGAGAATCGCGAAGCAGAGGCTCAAGATGATTTTATTCTCGGACAGGT
GTGATGTTAGCGACGAGGCTAAAAGGAAGATCGTGAACAACATTGTTCACGCGCTGTCGG
ATTTCGTGGAGATTGAGTCGGAGGAGAAAGTTCAGCTTAACGTCTCCACGGACGGTGACA
TCGGGACTATTTACT*GGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACG
TGGATGAGGCGGGATCGATAACCAACGTGGAGTACAAAGATACGCTTGATGGGTCCGTGG
ATGTC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4A545JQ 804 0 0
TTAGTATCTCCTTATCATCACCATCCTAAATGCCTCTCTTTACCTTCTTCCAAGGTTGAT
TTCATAAGCAATGTCGCAAACAGTTTTGAAAAGCAGAAAGTGTCAATCAGCCTCGGAAAC
AGACGTGGTGAAGCGAAGGTTTTAGCAAGGAACAACACCACGGCGGGAGACTATGAGCTA
TCACCAAGCCCGGTTCAGCAAGAGGTGGAGAGATTTCTCTTGAACGCCATCAACATGAGC
TTCTTTGACCGGTTAAACCTAGCGTGGAAGATAGTCTTCCCTTCCCACGCGTCGAGGAGA
AGCTCCGACGCGAGAATCGCGAAGCAGAGGCTCAAGATGATTTTATTTTCGGACAGGTGT
GATGTTAGCGACGAGGCTAAAAGGAAGATCGTGAACAACATTGTTCACGCGCTGTCGGAT
TTCGTGGAGATTGAGTCGGAGGAGAAAGTTCAGCTTAACGTCTCCACGGACGGTGACATC
GGGACTATTTACT*GGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACGTG
GATGAGGCGGGATCGATAACCAACGTGGAGTACAAAGATACGCTTGATGGGTCCGTGGAT
GTCAGGTTCGATTTTTATGTTCCAGAGTGATAACAAGGCATTGTGTCTTATTAGGGTTGT
TTTCTTTGTTTGTCTGTTTTCGTGTTGCTGTTGTTGAAGTTTTAGTCTGTGAGGGAACAA
AGACTGTTTCTTGACACTCTCATTTGTATATATGCGGCTTCTCTCTTCAAAGTTCTATCA
AAACCTAGGGTCCTTTTCTTACCG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4CI85JQ 742 0 0
ATTTCATAAGCAATGTCGCAAACAGTTTTGAAAAGCAGAAAGTGTCAATCAGCCTCGGAA
ACAGACGTGGTGAAGCGAAGGTTTTAGCAAGGAACAACACCACGGCGGGAGACTATGAGC
TATCACCAAGCCCGGTTCAGCAAGAGGTGGAGAGATTTCTCTTGAACGCCATCAACATGA
GCTTCTTTGACCGGTTAAACCTAGCGTGGAAGATAGTCTTCCCTTCCCACGCGTCGAGGA
GAAGCTCCAACGCGAGAATCGCGAAGCAGAGGCTCAAGATGATTTTATTCTCGGACAGGT
GTGATGTTAGCGACGAGGCTAAAAGGAAGATCGTGAACAACATTGTTCACGCGCTGTCGG
ATTTCGTGGAGATTGAGTCGGTGGAGAAAGTTCAGCTTAACGTCTCCACGGACGGTGACA
TCGGGACTATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACG
TGGATGAGGCGGGATCGATAACCAACGTGGAGTACAAAGATACGCTTGATGGGTCCGTGG
ATGTCAGGTTCGATTTTTATGTTCCAGAGTGATAACAAGGCATTGTGTCTTATTAGGGTT
GTTTTCTTTGTTTGTCTGTTTTCGTGTTGCTGTTGTTGAAGTTTTAGTCTGTGAGGGAAC
AAAGACTGTTTCTTGACACTCTCATTTGTATATATGCGACTTCTCTCTTCAAGGTTCTAT
CAAAACCTAGGGTCCTTTTCTT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 7

CO CL1205Contig1 426 7 7 U
GAAAACACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGC
TTCATTTTGGTCACAATCTTACTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCA
AGCACAGAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAG
CAATGTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATA
GGCAAAGGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCT
ACATTGAAGCTCAAATCTATTCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATA
TTTATAATATAGATCTTCACTAAAAGGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGG
CATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4E246JQ C 1
AF RR4E665TF U 223
AF RR4E246TF U 1
AF RR4E665JQ C 1
AF RR4FY28TF U 5
AF RR4BD33TF U 19
AF RR4BD39TF U 19
BS 1 6 RR4E246JQ
BS 7 222 RR4E246TF
BS 223 381 RR4E665TF
BS 382 390 RR4FY28TF
BS 391 391 RR4BD33TF
BS 392 400 RR4FY28TF
BS 401 426 RR4BD33TF

RD RR4E246JQ 381 0 0
GAAAACACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGC
TTCATTTTGGTCACAATCTTACTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCA
AGCACAGAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAG
CAATGTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATA
GGCAAAGGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCT
ACATTGAAGCTCAAATCTATTCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATA
TTTATAATATAGATCTTCACT

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR4E665TF 159 0 0
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CGCTGATATTTTTAACCTACATTGAAGCTCAAATCTATTCCACTTTTAATAAGTCACAAT
TTCTTTTCATGTGTGATATTTATAATATAGATCTTCACT

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR4E246TF 381 0 0
GAAAAC
ACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCATT
TTGGTCACAATCTTACTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCACA
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GAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCAAA
GGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATTG
AAGCTCAAATCTATTCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATATTTATA
ATATAGATCTTCACT

QA 7 381 7 381
DS 

RD RR4E665JQ 381 0 0
GAAAAC
ACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCATT
TTGGTCACAATCTTACTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCACA
GAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGT
GAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCAAA
GGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATTG
AAGCTCAAATCTATTCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATATTTATA
ATATAGATCTTCACT

QA 7 381 7 381
DS 

RD RR4FY28TF 396 0 0
GG
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TTGGTCACAATCTTACTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCACA
GAAGGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGT
GAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCAAA
GGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATTG
AAGCTCAAATCTATTCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATATTTATA
ATATAGATCTTCATTAAAAGGTCAGGTTTCATTT

QA 3 396 3 396
DS 

RD RR4BD33TF 408 0 0
GG
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TGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGTGAAGCCGAATGTAC
CAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGTTATGTGCCTACCCATAGGCAAAGGAGATTTTCAATG
CAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATTGAAGCTCAAATCTAT
TCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATATTTATAATATAGATCTTCAT
TAAAAGGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCATCAT

QA 3 408 3 408
DS 

RD RR4BD39TF 408 0 0
GG
ATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCATTTTGGTCACAATCTT
ACTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCACAGAAAGAACTTGTAC
TGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGTGAAGCCGAATGTAC
CAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGTTATGTGCCTACCCATAGGCAAAGGAGATTTTCAATG
CAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATTGAAGCTCAAATCTAT
TCCACTTTTAATAAGTCACAATTTCTTTTCATGTGTGATATTTATAATATAGATCTTCAT
TAAAAGGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCATCAT

QA 3 408 3 408
DS 



AS 1 7

CO CL1206Contig1 2179 7 6 U
GACTATTATATTTATAAACCAACACGCTAGTACTTAGCTCAGCTGATTCATATAAAGACG
ACTACGATATTCCAACACACAATCAACAAACAGCCTTAGTAATTTCTTTCCTACAATAGA
AAGTAGTTCCTTGCATGTGTAAACAAGCAAAGATAGCGTTAAAATAGATTTAGCTTTACA
GTATATGTTTTTTTTTTGAAAAAAAGGGCAGCTTTACAGTATATGTTGAAAGTATGGATT
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CACTTAACCTTCTTTCTCAAGTCTTTTGTATCATAAAGTTACTACTCAAATGTTGAAACA
CATTGTTTCAAGCCATGCGAGAGGAATAATTTTATGTTCTTTTTTTTGTCAAACGAGCCA
TAGATTACGGCCAGATCCATGAAAATTACGGGTTTCTTGTAAGATTTGGAATGAAAAGTC
AAAAACAGTTGGACTACTTTTGAACTTAGCACTAATCAGTAATCAATGCCCCAACTGCAT
GCTAATACTAATCAGTCATCACCTCTTTAACAATTATGACTGCTAAAAGCGTGCAATAAT
GTCGATTACGGAAATAGATAAAAGGTCTCAAACTAGAATGACCTTACTATTTTCTGCTCC
CGTGTTCCCCAAGTAACAGGGGTCTGCCTGATCCCTAATTATCCGATCTGAATTTATTCA
AGTTAACCAAACTTCGGTTAGAGATTTAAGATTTGGAAGGAATCACTTAGCAGTGGTCGT
TCACAAGTATCATTAGTTAAAACGCTGTGGTGGTTCGCTTTGATCTGATTAAATCTTGAA
CTACTGTAGCTTATTTAGACCTAGTTGAAAGACAATTTAAGGTAATAACAATTGAGCTGC
ATCCCGTTGGACAATTGACTTCATCTCAAGTCATTTCATACTGATATATCATCATCATCA
TTTGTAGTAGTTAGACGTGATGAGGATAACAAAGTAAATGAGCTTGATGGCGAAGAAGAG
GTTCTCCCGGAGTTTAGTGCATGGAGTTTGATGAGACTTCATCTACCACTACTCATGAAG
TCGATTACACCATCTCGGATTCAAATAGCCAACAGAGATCCAGGAGGCTTGTGTTTTCGT
TGCAGCATTTCAGGGAAAAGTTTGATGACCATACGACTTTAATATAAAGCTTGATTCAGT
CTTACACCACCATACTATTTTTCCTCGGCTATAACATTATGACAACAGAAATTGAAATAA
TTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGCACATTCAAGAGTAGAGCGCCAACA
AACACCAAATTAAAAAAAAAAACTGTTAATAACCCCTACTGATTTAATTTAAAGGATCTA
ATTTACAAAAAAAAACAGGTACAAGCTATCACAACTTTACAACCCAAAATAAACTCTGTA
AACCAACTTTTAACTGACAGCAACTGTTTTCCTTTTTCTTCTTACCTTTGCATCTGATGA
TCTGAACTTGAGTTATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTCAGTC
CCTGCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCATCTTCTAAAAGCTTCAAATGGC
TCAATCACTTTAACTGAACCGTCAAACAGTCCGACGGCTAACTGATTCGGTTCTTGTGGA
TGTGTTGTGATCACTTGTGGAATGATCGGTGCACTGTTGGGTGTTGGCTGAGGCATGTAC
GCAAATGGAGCAATGCGACACCTGAGTCTCAAGGAATCAGCATCAAAGACAGCAATGTTT
CCATCAGAGAATGATGCGTAAACCAGCTGGCTGTTGCATGAGTAAGATGCAGAGGTTATG
GGAGAAGAGAGAGCTTCTTGTGGCACCCACTTATGTATACATTCCATCTTTGTAGTATCG
TAAATGGCGAGCTGGTCTCGTGTGAAACCAACAGATGGATTTGATCGTTGTGGAACTGGA
CACGTGAGTCACCCACCGGTGCTTTTCCAGGTGGTAGTGAGATCGCTGAAGATTTCTTCT
TTTCCCATGTGTCAGCGGTCCAAAAGAAGAGCTGAGCATCAGCGCCAGAAGAGACGAGGG
TATTGAGTGCGGTAGAGAATGCTAGACCGGTGATATGCTTCTGGTGACCTTTCAACTTTG
TTTTCACCTCATCTACCCC


BQ
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AF RR4FD34JQ C 585
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AGGCTTGTGTTTTCGTTGCAGCATTTCAGGGAAAAGTTTGATGACCATACGACTTTAATA
TAAAGCTTGATTCAGTCTTACACCACCATACTATTTTTCCTCGGCTATAACATTATGACA
ACAGAAATTGAAATAATTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGTACATTCAA
GAGTAGAGCGCCAACAAACACC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4FA65JQ 546 0 0
AATTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGCACATTCAAGAGTAGAGCGCCAA
CAAACACCAAATTAAAAAAAAAAACTGTTAATAACCCCTACTGATTTAATTTAAAGGATC
TAATTTACAAAAAAAAACAGGTACAAGCTATCACAACTTTACAACCCAAAATAAACTCTG
TAAACCAACTTTTAACTGACAGCAACTGTTTTCCTTTTTCTTCTTACCTTTGCATCTGAT
GATCTGAACTTGAGTTATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTCAG
TCCCTGCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCATCTTCTAAAAGCTTCAAATG
GCTCAATCACTTTAACTGAACCGTCAAACAGTCCGACGGCTAACTGATTCGGTTCTTGTG
GATGTGTTGTGATCACTTGTGGAATGATCGGTGCACTGTTGGGTGTTGGCTGAGGCATGT
ACGCAAATGGAGCAATGCGACACCTGAGTCTCAAGGAATCAGCATCAAAGACAGCAATGT
TTCCAT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4FK53JQ 586 0 0
AATTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGCACATTCAAGAGTAGAGCGCCAA
CAAACACCAAATTAAAAAAAAAAACTGTTAATAACCCCTACTGATTTAATTTAAAGGATC
TAATTTACAAAAAAAAACAGGTACAAGCTATCACAACTTTACAACCCAAAATAAACTCTG
TAAACCAACTTTTAACTGACAGCAACTGTTTTCCTTTTTCTTCTTACCTTTGCATCTGAT
GATCTGAACTTGAGTTATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTCAG
TCCCTGCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCATCTTCTAAAAGCTTCAAATG
GCTCAATCACTTTAACTGAACCGTCAAACAGTCCGACGGCTAACTGATTCGGTTCTTGTG
GATGTGTTGTGATCACTTGTGGAATGATCGGTGCACTGTTGGGTGTTGGCTGAGGCATGT
ACGCAAATGGAGCAATGCGACACCTGAGTCTCAAGGAATCAGCATCAAAGACAGCAATGT
TTCCATCAGAGAATGATGCGTAAACCAGCTGGCTGTTGCATGAGTA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4D405TF 687 0 0
ATCTGATGACC
GAACTTGAGTTATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTCAGTCCCT
GCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCATCTTCTAGAAGCTTCAGACGGCTCA
ATCACTTTAACTGAATCGTCAGACAGTTCGACGGCTAACTGATTCGGTTCTTGTGGATGT
GTTGTGATCACTTGTGGAATGATCGGTGCACTGTTGGGTGTTGGCTGAGGCATGTACGCA
GATGGAGCAATGCGACACCTGAGTCTCAAGGAATCAGCATCAAAGACAGCAATGTTTCCA
TCAGAGAATGATGCGTAAACCAGCTGGCTGTTGCATGAGTAAGATGCAGAGGTTATGGGA
GAAGAGAGAGCTTCTTGTGGCACCCACTTATGTATACATTCCATCTTTGTAGTATCGTAA
ATGGCGAGCTGGTCTCGTGTGAAACCAACAGATGGATTTGATCGTTGTGGAACTGGACAC
GTGAGTCACCCACCGGTGCTTTTCCAGGTGGTAGTGAGATCGCTGAAGATTTCTTCTTTT
CCCATGTGTCAGCGGTCCAAAAGAAGAGCTGAGCATCAGCGCCAGAAGAGACGAGGGTAT
TGAGTGCGGTAGAGAATGCTAGACCGGTGATATGCTTCTGGTGACCTTTCAACTTTGTTT
TCACCTCATCTACCCC

QA 12 687 12 687
DS 



AS 1 7

CO CL1207Contig1 456 7 2 U
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTG
GTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4FW62JQ C 1
AF RR4GN75JQ C 1
AF RR4FW62TF U 1
AF RR4GN75TF U 1
AF RR4FW17JQ C 1
AF RR4FW17TF U 1
AF RR4AS26TF U 48
BS 1 405 RR4FW62TF
BS 406 456 RR4FW17TF

RD RR4FW62JQ 405 0 0
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCAC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4GN75JQ 405 0 0
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCAC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4FW62TF 405 0 0
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCAC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4GN75TF 405 0 0
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCAC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4FW17JQ 456 0 0
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGTATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTGGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTG
GTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4FW17TF 456 0 0
GGACAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGTATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTT
TACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACC
TCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTGGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTG
GTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4AS26TF 409 0 0
CTATCGTCGCCCTTCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAG
TGGTGGAAGCAAAGTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACA
ATAACGCATGCAAGAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACT
ATGTGTTCCCTGCTCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTG
GTGCTTGTATGTTTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTC
ACTATGAGTGACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGA
ATATTCTATGTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 7

CO CL1208Contig1 1111 7 7 U
GGGATACCATAATCGTTCAATCCATAATTGAGACTGAAACCACAAATTACGAACCGTCGA
TTTTTTTCTTGAATAATAAGTTTATCAACTTCTCATTTACCAAAATTTGTTTCCTATTCC
ATTAATATGCAATCAAATTTTGTGTAGAGATGATAATTGAAACTTCGACCATAAAATCAT
ATATTTCCTTTCTGTTTGAGAAAAATAAGCGAATTCTTTATAAGCTAAACAAAAAGTATT
TTTCTTCATGTACCGAATAAGGAAAGGAAGGCAGAAAAGGCAAAATATAAAATAAAATGG
GGAAACATTAAATATGAAATCACGGATGGCTACCCCCCTACCACACCATTTGTCACAAGA
GATTCCTCACTCGGAGCGTCTTGTTTTTGCACATTTCTACATATGTTGATAATATTTATA
TTTCTTCTCATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTC
CAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGCAAGGATGTGAGTTTGAGCC
AATTCAAAGGCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATG
CGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATAT
TGGCGTTCCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGC
AAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACG
GGAAGAACACGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAATGGAGGTTTGCTTATTG
ATGCAATCAAATG*AACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGA
GATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGAC
AGGCTTCTTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTT
TTTTT*CCTTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTT
TTGAATAAACATGTTGTCTTCTCGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ82TF U 1
AF RR4D628TF U 338
AF RR4DI89TF U 338
AF RR4GY83TF U 428
AF RR4GY83JQ C 428
AF RR4D628JQ C 421
AF RR4DI89JQ C 341
BS 1 350 RR4BZ82TF
BS 351 351 RR4D628TF
BS 352 390 RR4BZ82TF
BS 391 391 RR4D628TF
BS 392 637 RR4BZ82TF
BS 638 958 RR4D628TF
BS 959 1111 RR4DI89TF

RD RR4BZ82TF 637 0 0
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TTTTTTTCTTGAATAATAAGTTTATCAACTTCTCATTTACCAAAATTTGTTTCCTATTCC
ATTAATATGCAATCAAATTTTGTGTAGAGATGATAATTGAAACTTCGACCATAAAATCAT
ATATTTCCTTTCTGTTTGAGAAAAATAAGCGAATTCTTTATAAGCTAAACAAAAAGTATT
TTTCTTCATGTACCGAATAAGGAAAGGAAGGCAGAAAAGGCAAAATATAAAATAAAATGG
GGAAACATTAAATATGAAATCACGGATGGCTACCCCCCTACCACACCATTCGTCACAAGA
GATTCCTCACTCGGAGCGTCTTGTTTTTGCTCATTTCTACATATGTTGATAATATTTATA
TTTCTTCTCATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTC
CAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGCAAGGATGTGAGTTTGAGCC
AATTCAAAGGCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATG
CGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4D628TF 621 0 0
GGA
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ATATGTTGATAATATTTATATTTCTTCTCATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACC
AAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGG
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CAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAA
GGAACAAGGGTTGGAGATATTGGCGTTCCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGG
AAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTT
TGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGA
GAATGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCAAATG*AACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCC
TGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGA
CATTCAAACTCTGTTGGG

QA 4 621 4 621
DS 

RD RR4DI89TF 774 0 0
GGA
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ATATGTTGATAATATTTATATTTCTTCTCATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACC
AAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGG
CAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTC
CAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAA
GGAACAAGGGTTGGAGATATTGGCGTTCCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGG
AAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTT
TGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGA
GAATGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCAAATG*AACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCC
TGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGA
CATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACC
GTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTT*CCTTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTA
TTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGAATAAACATGTTGTCTTCTCGAAAAAAA

QA 4 774 4 774
DS 

RD RR4GY83TF 682 0 0
GG
ATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCTA
TCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTAAAGGCAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAG
GCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACA
AGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTGGCGTTCC
CATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCT
GCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACA
CGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCA
AATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTC
CCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGTCATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTT
CTTGGATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTT*CCT
TAAGAATCCCACGATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGAATAAA
CATGTTGTCTTCT
AAAACAA

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR4GY83JQ 675 0 0
GG
ATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCTA
TCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTAAAGGCAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAG
GCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACA
AGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTGGCGTTCC
CATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCT
GCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACA
CGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCA
AATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTC
CCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGTCATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTT
CTTGGATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTT*CCT
TAAGAATCCCACGATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGAATAAA
CATGTTGTCTTCT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR4D628JQ 684 0 0
TTTCTTCTCATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTC
CAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGCAAGGATGTGAGTTTGAGCC
AATTCAAAGGCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATG
CGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATAT
TGGCGTTCCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGC
AAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACG
GGAAGAACACGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAATGGAGGTTTGCTTATTG
ATGCAATCAAATG*AACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGA
GATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGAC
AGGCTTTTTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATTTGAATATTTGTT
TTTTTTCCTTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTTTGAATTTGCGTT
TTGAATAAACATGTTGTCTTCT
CG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4DI89JQ 764 0 0
CCACACCATTTGTCACAAGAGATTCCTCACTCGGAGCGTCTTGTTTTTGCACATTTCTAC
ATATGTTGATAATATTTATATTTCTTCTCATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACC
AAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGG
CAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTGTGATTGTAAATGTTGCCTC
CAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGTACGATAAATACAA
GGAACAAGGGTTGGAGATATTGGCGTTCCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGG
AAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTT
TGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACGGCGCCTTTATACAAATACTTGAAAGCAGA
GAATGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCAAATG*AACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCC
TGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGA
CATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTTTTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACC
GTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTTTCCTTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTA
TTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGAATAAACATGTTGTCTTCT
CG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 2 5

CO CL1209Contig1 782 3 2 U
GAGAAGAAAGCTCACATGATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCCCAGAAGGTC
GACTCTGCCTACAGCTTCTTCGAGAAACAGATTCCCATCGATGCTGTCTTCCAGAAGGAT
GAGATGATTGATGTGATTGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGT
TGGGGTGTGACCAGGCTTCCACGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATC
GGTGCCTGGCATCCAGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTAC
CATCACCGTACTGAATTGAACAAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACT
CACACTGCCATGACTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACACCAATGGGTGGATTC
GCACACTATGGTGTGGTGAAGGATGACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCA
AAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGACAGTCGTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATG
GAGCAGATCAACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAG
ACTACCCAGGAGAAGAACAAGTTTTACGGTCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTG
TTCCTTTTTCAGTTTGTATTCGCTCTTTCTTCAAAGTCTTGATAATACTCTTTTGAACTA
TTCGCTGCAATTTTGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTTATACATCATATGCTTCTTCCC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4FE67TF U 1
AF RR4H643TF U 27
AF RR4FE67JQ C 73
BS 1 628 RR4FE67TF
BS 629 782 RR4FE67JQ

RD RR4FE67TF 646 0 0
GAGAAGAAAGCTCACATGATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCCCAGAAGGTC
GACTCTGCCTACAGCTTCTTCGAGAAACAGATTCCCATCGATGCTGTCTTCCAGAAGGAT
GAGATGATTGATGTGATTGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGT
TGGGGTGTGACCAGGCTTCCACGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATC
GGTGCCTGGCATCCAGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTAC
CATCACCGTACTGAATTGAACAAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACT
CACACTGCCATGACTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACACCAATGGGTGGATTC
GCACACTATGGTGTGGTGAAGGATGACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCA
AAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGACAGTCGTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATG
GAGCAGATCAACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAG
ACTACCCAGGAGAAGAACAAGTTTTACG
TCGTGCCCCTGCCAAGCT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4H643TF 598 0 0
G
CAGATCAACGGTGGTACCATTGCCCAGAAGGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTTGAGAAA
CAGATCCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGATTGATGTGATTGGTGTGACC
AAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTGACGAGGCTTCCACGTAAG
ACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATCCAGCTAGAGTCTCC
TACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACTGAATTGAACAAGAAG
ATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACCCACACTGCCATGACTGAATACGACAGG
ACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTCGCACACTACGGTGTGGTGAAGGATGAT
TACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGACAG
TCGCTGCTCACTCAGACATCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACCTCAAGTTTATCGAC
ACTTCCTCTAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAGGAGAAGAACAAGTTT

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR4FE67JQ 710 0 0
AGCTTCTTC
GAGAAACAGATTCCCATCGATGCTGTCTTCCAGAAGGATGAGATGATTGATGTGATTGGT
GTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTGACCAGGCTTCCA
CGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATCCAGCTAGA
GTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACTGAATTGAAC
AAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACTCACACTGCCATGACTGAATAC
GACAGGACCGAGAAGGATGTGACACCAATGGGTGGATTCGCACACTATGGTGTGGTGAAG
GATGACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACTCTT
AGACAGTCGTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACCTCAAGTTT
ATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAGGAGAAGAACAAG
TTTTACGGTCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCCTTTTTCAGTTTGTATTC
GCTCTTTCTTCAAAGTCTTGATAATACTCTTTTGAACTATTCGCTGCAATTTTGTGTTTT
AGTTATTTGGAGAGTTTTATACATCATATGCTTCTTCCCCT

QA 10 710 10 710
DS 



CO CL1209Contig2 709 2 17 U
TTTGAGAAACAGATCCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGATTGATGTGATT
GGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTGACGAGGCTG
CCACGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATCCAGCT
AGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACTGAATTG
AACAAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACCCACACTGCCATGACTGAA
TACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTCGCACACTACGGTGTGGTG
AAGGATGACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACT
CTTAGACAGTCGCTGCTCACTCAGACATCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACCTCAAG
TTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAGGAGAAGAAC
AAGTTTTACGGCCGTGCCTCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCTTTTTTTCTCAGTTT
GTATTCGCTTTTTCTTCAGAAAAGTCTTTGATAATACTCTTTTGAACTATTCGCTGCAAT
TTTGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTCAAACATCATATGCTTCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4H643JQB C 1
AF RR4AA09TF U 71
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RD RR4H643JQB 709 0 0
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AAGGATGATTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACT
TTTAGACAGTCGCTGCTCACTCAGACATCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACCTCAAG
TTTATCGACACTTCCTTTAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAGGAGAAGAAC
AAGTTTTACGGTCGTGCCTCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCTTTTTTTCTCAGTTT
GTATTCGCTTTTTCTTCAGAAAAGTCTT*GATAATACTCTTTTGAACTATTCGCTGCAAT
TTTGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTCAAACATCATATGTTTCTTCTC

QA 1 709 1 709
DS 

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G
GGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTGACGAGGCTGCCACGTAAGAC
TCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATCCAGCTAGAGTCTCCTA
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TTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACCCACACTGCCATGACTGAATACGACAGGAC
CGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTCGCACACTATGGTGTGGTGAAGGATGACTA
CTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGACAGTC
GTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATTAACCTCAAGTTTATCGACAC
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TTCTTCAGAAAAGTCTTTGATAATACTCTTTTGAACTATTCGCTGCAATTTTGTGTTTTA
GTTATTTGGAGAGTTTTAAACATCATATGCTTCTTC
C

QA 2 637 2 637
DS 



AS 1 7

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AGCAATCTCACAACTTAGATGCTAAAACTCTTTGTAGACATATAAGGTAGAGAGATCTGT
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AAGGAAGAAAAGACTATTATTCATCCTTCTCCTTGTCAACTTTCTTCCCAATCCAATTAG
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CGTCCTTTGAGGTCAATATCTTCCACAGAACAACTTCGAGTCCGTATTTCTTGGTAACTT
CCTCCGGAGACGACGGCGAAGTGTTCTTCTCCTCGGCTTTCTCTCGGACTGCTCTGCATC
TGAATCTCTTCGTATTAGACTCCGACGGAGCTTGAATTGAAGAGAAGAAGAATCGGGTTT
TAGGGTTTCTGGTGTGGCATAAGGAAGAGGGAGTGGAAGAAGGAGAGACTTGCAGAATCA
TCGCCATTATTTTCAGCCACCAAAAATGCGAAGTTAATCATTTTACCTCTTCTTATTCGT
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GAGTACAGAAGAACAAAGACGAGGAGGCAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY03JQ U 5
AF RR4F518JQ U 5
AF RR4H031JQ U 119
AF RR4GB13JQ U 107
AF RR4F518TF C 1
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GACGACGGCGA

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DS 

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CTGCGTAAGCCAAAGCAAAGGCTCCCACTTTCTCTCCCGTCTCATTCGTCGAGATCCCAA
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CGTCCTTTGAGGTCAATATCTTCCACAGAACAACTTCGAGTCCGTATTTCTTGGTAACTT
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TAGGGTTTCTGGTGTGGCATAAGGAAGAGGGAGTGGAAGAAGGAGAGACTTGCAGAATCA
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GTAG
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GCTTCATCTGTTTTTGACTTCT******TCTTCTTCTCTCCATCAGTTTCTTCGTCCTTT
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GACGACGGCGAAGTGTTCTTCTCCTCGGCTTTCTCTCGGACGGCTCTGCATCTGAATCTC
TTCGTATTAGACTCCGACGGAGCTTGAATTGAAGAGAAGAAGAATCGGGTTTTAGGGTTT
CTGGTGTGGCATAAGGAAGAGGGAGTGGAAGAAGGAGAGACTTGCAGAATCATCGCCATT
ATTTTCAGCCACCAAAAA

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DS 

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TCTCTCGGACTGCTCTGCATCTGAATCTCTTCGTATTAGACTCCGACGGAGCTTGAATTG
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ATTTTACCTCTTCTTATTCGTGTTCTGTACACACAAATATTACCGTAGTTAATTCTAATT
ATTTAAACAAAGTTGCCTTTTTATTAAATATGAGTTTATTAAATTTCGTGTTAATCATTT
GGAATTTAGAAGATGCTTTAGGAGTACAGAAGAACAAAGACGAGGAGGCAAACCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 6

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CCATTTTGTTTGGAACTATGGATAAGGTTAAACTCGTAAAGAATGGTGTTATGAGATTGC
CACCTGGATTCAGATTTCATCCCACTGATGAAGAGCTTGTGGTTCAGTATCTCAAGAGAA
AAGTCTTGTGTTCTCCATTACCAGCTTCCATCATTCCTGACTTTGATGTTTGCAGAGCTG
ATCCTTGGGACTTGCCTGGCAATTTGGAGAAGGAGAGGTACTTCTTCAGCACAAGGGAAG
CTAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCTAATAGAGCAACGGGTTCGGGTTATTGGAAAGCTA
CCGGTATTGATAAACGGGTAGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAA
CACTCGTTTTCTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATT*GGATCATGCAC
GAATATCGTCTATCTTCTTCCCCACCGAGTTCAATGGGTCC*TACTCAGAACTGGGTTCT
TTGTCGTATCTTCCTTAAAAAGAGAGCTGGTAACAAGAGCGACGACGACGACGGAGATAA
CCGGAGTATTAGATATGATAATGACCAAATTGAAATAATTACAACGAACCAAACCGAAGA
TAAAACTAAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACCACAGACTTGAACCT
TTTACCTAGCTCTCCTTCTTCCGACCACGCTTCAAGTGGACTCACGACGGAGCTCTTCTC
TTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTCAGAAGAAATCTTTAATTTAATATTAA
TGTTGACTATCTTTAATAAATGTTATAATAATTTTATATTAATACGATTCTGCTTCTTTT
TTTCC


BQ
10 10 10 10 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 

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AF RR4AS42TF U 34
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CCGGAGTATTAGATATGATAATGACCAAATTGAAATAATTACAACGAACCAAACCGAAGA
TAAAACTAAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACCACAGACTTGAACCT
TTTACCTAGCTCTCCTTCTTCCGA

QA 1 744 1 744
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CTCT
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DS 

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GACTATCTTTA
TAAATGTTA

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DS 

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GGTTCTTTGTCGTATCTTCCTTAAAAAGAGAGCTGGTAACAAGAGCGACGACGACGACGG
AGATAACCGGAGTATTAGATATGATAATGACCAAATTGAAATAATTACAACGAACCAAAC
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CTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTCAGAAGAAATCTTTAATTTAA
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DS 

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TCATTCCTGACTTTGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTGCCTGGCAATTTGGAGA
AGGAGAGGTACTTCTTCAGCACAAGGGAAGCTAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCTAATA
GAGCAACGGGTTCGGGTTATTGGAAAGCTACCGGTATTGATAAACGGGTAGTGACCTCTA
GAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTCGTTTTCTACAAAGGCAAACCACCTC
ATGGCTCAAGAACCGATT*GGATCATGCACGAATATCGTCTATCTTCTTCCCCACCGAGT
TCAATGGGTCC*TACTCAGAACTGGGTTCTTTGTCGTATCTTCCTTAAAAAGAGAGCTGG
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TGAAATAATTACAACGAACCAAACCGAAGATAAAACTAAACCAATCTTCTTCGACTTCAT
GAGAAAAGAAAGGACCGCAGACTTGAACCTTTTACCTAGCTCTCCTTCTTCCAACCACGC
TTCAAGTGGACTCACGACGGAGCTCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAG
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ATTTTATATTAATACGATTCTGCTTCTTTTTTTCC

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DS 

RD RR4AS42JQ 674 0 0
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ATTGGAAAGCTACCGGTATTGATAAACGGGTAGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTG
GTTTGAAGAAAACACTCGTTTTCTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATT
*GGATCATGCACGAATATCGTCTATCTTCTTCCCCACCGAGTTCAATGGGTCC*TACTCA
GAACTGGGTTCTTTGTCGTATCTTCCTTAAAAAGAGAGCTGGTAACAAGAGCGACGACGA
CGACGGAGATAACCGGAGTATTAGATATGATAATGACCAAATTGAAATAATTACAACGAA
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AGACTTGAACCTTTTACCTAGCTCTCCTTCTTCCGACCACGCTTCAAGTGGACTCACGAC
GGAGCTCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTCAGAAGAAATCTTTA
ATTTAATATTAATGTTGACTATCTTTAATAACTGTTATAATAATTTTATATTAATACGAT
TCTGCTTCTTTTT
C

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 7

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AAATAATACATTTCATTGCAACTGATTGCTACGCAACGTGCAAGTTGCAAATGGTCCTGG
TCCATAGCTAAAAAAAAATAACAACTTTTAATCATACAACATCCAAAGTAAATATCATTT
TGTCCCTCTCCCTCAGTCTCCTTCTACCCCTCCTCTACCGGAGACTTTGGTCTGAGACAC
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AAAACCGTGACAAACCGAAAGCCAGATAATGAGAACAAGTAGTAGCAAGATCCCGAGAAC
CACAAGTTTTATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCACTTGTGTCCCTTGTTT
CTTGTACTCTTGCGCCTGAAAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E529JQ U 1
AF RR4FE91JQ U 52
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CTTGTACTCTTGCGCCTGAAAGCGT

QA 1 445 1 445
DS 

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GG
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GAGACACCATTCCTCGCCAAAGTTTCTCTAACATCACATTCAGAAGTAGTCTTCAATCAG
TGCAATTAAAGCCGTGACAAACCGAAAGCCAGATAATGAGAACAAGTAGTAGCAAGATCC
CGAGAACCACAAGTTTTATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCACTTGTGTCC
CTTGTTTCTTGTACTCTTGCGCCTGAAAGCGT

QA 3 394 3 394
DS 



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TATTGACAAGGCAATCGACAGAGGAGAAAATCTGACGGTTCTTACTGACAAGACCGAGAA
TCTACGCTCTCAGGCGCAAGAGTACAAGAAACAAGGGACACAAGTGAGGAGGAAACTGTG
GTACCAGAACATGAAGATAAAACTTGTGGTTCTCGGGATCTTGCTACTACTTGTTCTCAT
TATCTGGCTTTCGGTTTGTCACGGTTTTAATTGCACTGATTGAAGACAACTTCAGAATGT
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CC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 

AF RR4FE91TF U 1
AF RR4AH82TF U 2
AF RR4AH34TF U 2
AF RR4AH34JQ C 263
AF RR4AH82JQ C 263
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BS 327 335 RR4FE91TF
BS 336 336 RR4AH34TF
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BS 372 474 RR4FE91TF
BS 475 475 RR4AH34TF
BS 476 492 RR4FE91TF
BS 493 493 RR4AH34TF
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TCTACGCTC

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DS 

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AACTGCGATCACCACACCTTCAACTTCCTCGTCGAAGATGGCTTCGCATATTGTGTGGTG
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DS 

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DS 

RD RR4AH82JQ 760 0 0
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CTTTACTTTCATCCTTCAAGAACAACTTATATTTAGCGC
C

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 6

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CAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 5 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 15 15 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR4C831TF U 1
AF RR4CD08TF U 34
AF RR4D465TF U 6
AF RR4C831JQ C 47
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AF RR4C463JQ C 53
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CGGGTTG

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DS 

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TCTGGTTCTTGGCTTACCTCTACTCCTGCCTCCTCAAGCCTTGCATCGTCTCCCTAAGCC
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ATAAAAGCATCACGGAAATTGCCATGTCAGCTTCAGAACCCGTGGCTGCGGTGGAGCCGC
CTAGGGATGGTGAGAAGCACGTGCAGTTCGGGAATGTGGTGGTTCTTGGCGATGAAGGAC
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TGTCTT

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DS 

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GG
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GCTCTTCGTTGGCATCCCTTGGTTCTTCTGGTTCTTGGCTTACCT**ACTCCTGCCTCCT
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GGGGAACAAATGATCATGGAACTGATTGTCTTTTTT

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DS 

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CG
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ATTCGATCCGGAGAAAGGAGGGGAGCAGGAGGAGGAGGAGAAGAACAATAAAAGCATCAC
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TATGAGAATGGGAGACGAAGATAATCAAGAACATAGTGGCGTTGATAAGGATTGCGATAG
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CGGGTTGTAAAACAGAGAGGAAAGGCTTTGGAAAAAAAA**GCTAGCCCTAATAGACCTG
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ATTGAGAAAATAATCAGT

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DS 

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GGATCAAAGAACAGGTGATCCAAGAATATACATCGTCACTCTTCTCTTTCTTTCATGTAT
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TCTGGAAGCGGGTATGCTCTTCGTTGGCATCCCTTGGTTCTTCTGGTTCTTGGCTTACCT
CTACTCCTGCCTCCTCAAGCCTTGCATCGTCTCCCTAAGCCAAAGAGTTTCTAGATTCGA
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AATGGGAGACGAAGATAATCAAGAACATAGTGGCGTTGATAAGGATTGCGATAGAACTCC
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AAGGAACAACGTTTCGTTGAGTATGAACAAAAATGAAAGTCCGTCCATAGAAGATTTTGT
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DS 



AS 1 6

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AGGCATATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGT
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TTTTCTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTTGTTTTTTTACTTTTCC


BQ
10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D545JQ U 6
AF RR4D545TF C 6
AF RR4F665TF C 1
AF RR4DW37TF C 2
AF RR4F665JQ U 3
AF RR4DW37JQ U 38
BS 1 4 RR4F665TF
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C
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C

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C
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TGATTTAAGATAATTAAATAAAAAGAGAGAGACTTGAGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGC
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GAAAGTCCTGGACAATCCAGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTG
CTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGT
CAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACGACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAG
TTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACC
GGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCAT
ATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTG
C

QA 2 506 2 506
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AACAGGGAAAGTCCTGGACAATCCAGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGT
TGGCTGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAAC
ACCGGTCAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACGACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGA
GACAAGTTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACAC
AACACCGGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATT
AGGCATATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGT
GTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCATCTCTCTGTTTTTTTG
TTTTCTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTT
C

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TTT
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CATGATTTAAGATAATTAAATAAAAAGAGAGAGACTTGAGTAAGTAAACATCTCTAATTT
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GGGAAAGTCCTGGACAATCCAGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGC
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CTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTTGTTTTTTT
ACTTTTCC

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GG
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CATGATTTAAGATAATTAAATAAAAAGAGGGAGACTTGAGTAAGTAAGCATCTCTAATTT
GCAATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACA
GGGAAAGTCCTGGACAATCCAGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGC
TGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCG
GTCAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACGACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACA
AGTTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACA
CCGGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGC
ATATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTAT
TTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCATCTCTCTGTTTTTTTGTTTT
CTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTT
C

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DS 

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GCAGTGACCTCAGTGCCGCAAGAGACAAGTTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATG
CTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATG
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TCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACC
AAACCCATCTCTCTGTTTTTTTGTTTTCTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTTGTTT
TTTTACTTTTCC

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DS 



AS 1 5

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CGACACATTTGACAGAACAAACTAGTTTTCTTATAAGAATAATAATACCCAAACAGTTGC
TACACTCTCTTAACTTCTTGGAATCCCTTCTGGCAATCTAAAGAGAGAGTTTTTGTATGC
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TAAGAACCAGAGTCTCTGGGGGAGATATGGAGATGATGATCATGATCACTGTCTTCCTTT
CTTTGCACAGCAAGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCTGCTTTGGCGGGAGTGAT
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ATCCTCATCCTCGTAGCTCTCTTCCATCAGTCTTGGTGTCGGACTCTTTGTCTGCCCTTC
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GAATAGCCGCTTCCTCTCGTTGCGGTTAAGGCGAGCACCAAAGTAGAAAGAAACAGAGAG
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TCTAGCGAAATTGATACCAAGAGCAGGCTCAGGAAGCTCAGGAGGAACTTCCTCCGCTGG
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ATCGCATTGAGAGTAGAAATCATCAACATCTTTAGTAAGAGCACGGAGAAGAGCGCAGCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G153JQ U 1
AF RR4EB80JQ U 71
AF RR4E559JQ U 71
AF RR4EB80TF C 494
AF RR4E559TF C 541
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RD RR4G153JQ 544 0 0
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TATT

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CAAGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTCACGCAT
TTCCCGTGGTACCAACGTTCACAAACATCACAGCAAATCCAGAACTCATCTTGTGTATAG
TTGCCTCCACAGATACCACAGAGAGTGTCTCCGTGCTCGTCTTCTTCTTCATCCTCATCC
TCGTAGCTCTCTTCCATCAGTCTTGGTGTCGGACTCTTTGTCTGCCCTTCTATTGATCTC
TTAGTGCCGTTTCTGGATTTGCTTCCGGAATCCGAGCTTGGCTTGTTGTCTTTGATGGGT
TTCCTGCCAGTCACTACATCAAAGAGAGTTGGGAGATCGTTGATCAGACTGAATAGCCGC
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CAGAGTATGTATGTGTATGTACGGTTTTGTGTAAGGGTGTAGATCAGTAGCTAGTGGAGA
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AAA

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DS 

RD RR4E559TF 616 0 0
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CAACCAACAATCACTATGGACAGCAACAAGCGAGAGCCAATCTTTCCTCTGCATACCATC
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TAGATTCACTTCCCATGACTCATTCGGATGTCCATACAAACACAAATTCTCCTTCTCCGG
ATCGCATTGAGAGTAGAAATCATCAACATCTTTAGTAAGAGCACGGAGAAGAGCGCAGCG
ACGAGCGGTGTAATCCTTGGAGATCTCTTCGACGGTGCGAGGGTTAGAGGAAACGGCGGC
CATAAGATTTTTACAGAGTATGTATGTGTATGTACGGTTTTGTGTAAGGGTGTAGATCAG
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AGTGGAGAGAGAAAAA

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DS 



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TATAGAAAAAACGAGAGAAAAAATATCCGCCCTTTTAAGGACGGGTTAGAATCTAGTTAC
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CGCCAACCACCATTGTAGTATTTATGTGTATAATAGATATTATGATGTATATGAAGATTA
TCTTCAAAACATGTTCAAGGACATTTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAA
CAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCATAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGTTACACTTCTCA
CAACATATATTGCAATACTTGAGACACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCA
TTGCATTTTCCGTCGCATGGTGAGGCTTTTGAAAGCATGAACAAAGAAGATGAGAGGAGT
AGGGAGATGATGACGAACGTTACAACAGCGAGTTTCATTTTCATTCTTAGCGAGGTTGAA
GTTATTCTAATCTGATTCGATGAGGTTTGTTACTTTGGTAAGATGAAGACAAAAGCTCAA
GAGTTTCCGCACAATGCAAAAGAAGTGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4F013JQ U 36
AF RR4CU30JQ U 68
AF RR4G416JQ U 1
AF RR4G416TF C 1
AF RR4F013TF C 50
AF RR4G517JQ U 85
AF RR4G517TF C 85
BS 1 539 RR4G416JQ
BS 540 540 RR4CU30JQ
BS 541 631 RR4G416JQ

RD RR4F013JQ 455 0 0
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TAAGGACGGGTTAGAATCTAGTTACGTTTATAATCAAAGATCTTTCACATTTTCATACAA
ACATATTCAAACTCATTATTTCATGCGCCAACCACCATTGTAGTATTTATGTGTATAATA
AATATTATGATGTATATGAAGATTATCTTCAAAACATGTTCAAGGACATTTGGGATGGCC
TTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAACAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCATAAGTGCCGGA
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TCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCATTGCATTTTCCGTCCCATGGGGAGGCTTTTGAAAG
CATGAACAAAGAAAATGAAAGGAGTAGGGAGATGA

QA 1 455 1 455
DS 

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ATCAAAGATCTTTCACATTTTCATACAAACATATTCAAACTCATTATTTCATGCGCCAAC
CACCATTGTAGTATTTATGTGTATAATAGATATTATGATGTATATGAAGATTATCTTCAA
AACATGTTCAAGGACATTTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAACAGGGGC
ATTCATCTTTGTTTCCATAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGTTACACTTCTCACAACATA
TATTGCAATACTTGAGACACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCATTGCATT
TTCCGTCGCATGGTGAGGCTTTTGAAAGCATGAACAAAGAAGATGAGAGGAGTAGGGAGA
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TAATCT
CC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4G416JQ 631 0 0
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TATAGAAAAAACGAGAGAAAAAATATCCGCCCTTTTAAGGACGGGTTAGAATCTAGTTAC
GTTTATAATCAAAGATCTTTCACATTTTCATACAAACATATTCAAACTCATTATTTCATG
CGCCAACCACCATTGTAGTATTTATGTGTATAATAGATATTATGATGTATATGAAGATTA
TCTTCAAAACATGTTCAAGGACATTTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAA
CAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCATAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGTTACACTTCTCA
CAACATATATTGCAATACTTGAGACACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCA
TTGCATTTTCCGTCGCATGGTGAGGCTTTTGAAAGCATGAACAAAGAAGATGAGAGGAGT
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GTTATTCTAATCTGATTCGATGAGGTTTGTTACTTTGGTAAGATGAAGACAAAAGCTCAA
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QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4G416TF 631 0 0
AATTGAAACTTGATTATGTCACAGTTTATATAATTAAAACGAAGAATTATCAATCTTTTA
TATAGAAAAAACGAGAGAAAAAATATCCGCCCTTTTAAGGACGGGTTAGAATCTAGTTAC
GTTTATAATCAAAGATCTTTCACATTTTCATACAAACATATTCAAACTCATTATTTCATG
CGCCAACCACCATTGTAGTATTTATGTGTATAATAGATATTATGATGTATATGAAGATTA
TCTTCAAAACATGTTCAAGGACATTTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAA
CAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCATAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGTTACACTTCTCA
CAACATATATTGCAATACTTGAGACACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCA
TTGCATTTTCCGTCGCATGGTGAGGCTTTTGAAAGCATGAACAAAGAAGATGAGAGGAGT
AGGGAGATGATGACGAACGTTACAACAGCGAGTTTCATTTTCATTCTTAGCGAGGTTGAG
GTTATTCTAATCTGATTCGATGAGGTTTGTTACTTTGGTAAGATGAAGACAAAAGCTCAA
GAGTTTCCGCACAATGCAAAAGAAGTGATCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4F013TF 582 0 0
TCAATCTTTTATATAGAAAAAACGAGAGAAAAAATATCCGCCCTTTTAAGGACGGGTTAG
AATCTAGTTACGTTTATAATCAAAGATCTTTCACATTTTCATACAAACATATTCAAACTC
ATTATTTCATGCGCCAACCACCATTGTAGTATTTATGTGTATAATAGATATTATGATGTA
TATGAAGATTATCTTCAAAACATGTTCAAGGACATTTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCA
TATCCCTGTAACAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCATAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGT
TACACTTCTCACAACATATATTGCAATACTTGAGACACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTG
AACATCTCGCATTGCATTTTCCGTCGCATGGTGAGGCTTTTGAAAGCATGAACAAAGAAG
ATGAGAGGAGTAGGGAGATGATGACGAACGTTACAACAGCGAGTTTCATTTTCATTCTTA
GCGAGGTTGAAGTTATTCTAATCTGATTCGATGAGGTTTGTTACTTTGGTAAGATGAAGA
CAAAAGCTCAAGAGTTTCCGCACAATGCAAAAGAAGTGATCC

QA 1 582 1 582
DS 

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TTTTCATACAAACATATTCAAACTCATTATTTCATGCGCCAACCACCATTGTAGTATTTA
TGTGTATAATAGATATTATGATGTATATGAAGATTATCTTCAAAACATGTTCAAGGACAT
TTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAACAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCA
TAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGTTACACTTCTCACAACATATATTGCAATACTTGAGA
CACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCATTGCATTTTCCGTCGCATGGTGAG
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GTGATCC

QA 1 547 1 547
DS 

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TTTTCATACAAACATATTCAAACTCATTATTTCATGCGCCAACCACCATTGTAGTATTTA
TGTGTATAATAGATATTATGATGTATATGAAGATTATCTTCAAAACATGTTCAAGGACAT
TTGGGATGGCCTTTGGAGTTTTTCATATCCCTGTAACAGGGGCATTCATCTTTGTTTCCA
TAAGTGCCGGAGGGAACACAGAAGTTACACTTCTCACAACATATATTGCAATACTTGAGA
CACCGATCTTGTCTTCCTGCCTTTGAACATCTCGCATTGCATTTTCCGTCGCATGGTGAG
GCTTTTGAAAGCATGAACAAAGAAGATGAGAGGAGTAGGGAGATGATGACGAACGTTACA
ACAGCGAGTTTCATTTTCATTCTTAGCGAGGTTGAAGTTATTCTAATCTGATTCGATGAG
GTTTGTTACTTTGGTAAGATGAAGACAAAAGCTCAAGAGTTTCCGCACAATGCAAAAGAA
GTGATCC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 3

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CAAAAGGTTCCTTGACAAAATGTCTAGCTGATCATAGTTTTAAGATGACTTATTCATTTA
GCCTTCTCTTTCAAATAAGATGAAGAAAGAAGCTAAAAGGGTATAAATAGCTCTTATTGT
AATCTTCGTGAGACCAAAACTTAGCTTACGTTATGGTATGAGTCGATGATGGCATCAGCA
AGGTACTCGCATTTAGCCATAGACAACCCGGCCAACGATATCCTCCCATCTTTAGTCATG
TACACATGCCACTTGTCCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTGTTGAGTCCAGTGAACGAA
AACATGCCAATCTGCTTCAAAATAAACGACCAGTCCTTACCACTCTTGTCTTTCGAAACG
AGGCTGTCGTACAGCTTCTGTCTCACCGTCTTGATCCTTCCCGCCATCATTTCCATCTCT
GCTTTCCACTCATTGAACATAGCCACATCACCCACGACATTAGCCACGATCCTCGCACCG
TGAACCGGTGGGTTCGAGTACATAGGCCGAGCTATCCTCTTCAACTGGCTCTTCACCCTT
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CCCAAGTTTTTACTATATGACTGAGCGACGAAAAACTCCATTCCACGCTCAGCAAATAAT
CTCACAGAAGATGCATCTTCATCAGGCTTCCACTAGCAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT52JQ U 43
AF RR4A426JQ U 118
AF RR4GQ89JQ U 1
BS 1 107 RR4GQ89JQ
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BS 360 360 RR4A426JQ
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BS 399 399 RR4A426JQ
BS 400 763 RR4GQ89JQ

RD RR4FT52JQ 300 0 0
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AGATGACTTATTCATTTAGCCTTCTCTTTCAAATAAGATGAAGAAAGAAGCTAAAAGGGT
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CTCCCATCTTTAGTCATGTACACATGCCACTTGTCCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTG

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4A426JQ 369 0 0
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GCAAGGGACTCCCATTTAGCCATAAACAACCCGGCCAACGATATCCTCCCATCTTTAGTC
ATGTACACATGCCACTTGTCCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTGTTGAGTCCAGTGAAC
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TCTGCTTTC

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4GQ89JQ 763 0 0
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GCCTTCTCTTTCAAATAAGATGAAGAAAGAAGCTAAAAGGGTATAAATAGCTCTTATTGT
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AGGTACTCGCATTTAGCCATAGACAACCCGGCCAACGATATCCTCCCATCTTTAGTCATG
TACACATGCCACTTGTCCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTGTTGAGTCCAGTGAACGAG
AACATGCCAATCTGCTTCAGAATAAACGACCAGTCCTTGCCACTCTTGTCTTTCGAAACG
AGGCTGTCGTACAGCTTCTGTCTCACCGTCTTGATCCTTCCCGCCATCATTTCCATCTCT
GCTTTCCACTCATTGAACATAGCCACATCACCCACGACATTAGCCACGATCCTCGCACCG
TGAACCGGTGGGTTCGAGTACATAGGCCGAGCTATCCTCTTCAACTGGCTCTTCACCCTT
GTAGCAGCATCGGCTGATGAGCGGACGACGTTGATCGCACCAATTCTTTCAGCGTAAAGG
CCCAAGTTTTTACTATATGACTGAGCGACGAAAAACTCCATTCCACGCTCAGCAAATAAT
CTCACAGAAGATGCATCTTCATCAGGCTTCCACTAGCAAAGCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 7

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GGACACATCCGAAAGATAGCATCCAACGCGCTACTCTTTCACAATGAACACTCTGATGAA
GACAGGTGGCGCGTGGCTTGTTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAGGAGGATGAGTGTAGC
TGGTTTCGCCACGTCATCATCATCTTCTTCCTTACCCAATTGGGAAGGTGGAGTTTCCAT
GGTCCAAGGAGCTTCCAGAGGCGTCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCAGTTGCTAGAGAATAG
TAAGAAAGGACATGTTGTTGCCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGCAACAGACCTCGTTAA
TCTCAAGAACAGCTTTTCTGAGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGATGTTACAGATGAAAC
TACCATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACTTGCTTAT
AAATGCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTATTGCAGCCAGAAACAACATTGAACAA
GGTTGAGAAATCATCATTGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAATTCTAGT
AATGAAGCATATGTGGCCACTGCTTAAGGCTGGTGGAGGAAATGGAACCGAGAGGGAAGT
TGCTGTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAACTTGGTGG
TTGGCACTCTTACAGGGCTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGACGAAGAATGTATCGGT
TGAGTTGGGTAGGAGGAAGGATCCTGTGGTATGCATTCTACTGCATCCAGGCACGGTAGA
CACTGATCTCTCTCGACCGTTCCAAAGGAATGTTCCTGAAGGTAAGCTTTTCACAAAAGA
GTACCCTGTTCAGAAACTATTGCACATCATCACCAATGCAAAGAAACAAGACAACGGCAA
GTTCTTCGCATGGGATGGCCAGGAGATACCTTGGTGATTCTTTTGACTTCTTGTTATGTC
CATCTATATGGTCACTTCTTTCAAATTCTATTGAATCCTTGGTCTTTCTTGGTTTGAGAG
CAATTCCTTTGAGTAATACTAAATAACCTGGAGTGAGTGTCCAGAAGTTGAGAGCTTTCA
GAGTATTCAATATCATCCAAATTTCTTGAAACGATTTAATAATTAATGTGATGGTACAAT
CTTTAATCTATATTGTGTTTACCTTTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC73TF U 1
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AF RR4AX80JQ C 154
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GCACTCTTAC

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GG
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ACG

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TA
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AATGCAAAGAAACAAGACAACGGCAAGTTCTTCGCATGGGATGGCCAGGAGATACCTTGG
TGATTCTTTTGACTTCTTGTTATGTCCATCTATATGGTCACTTCTTTCAAATTCTATTGA
ATCCTTGGTCTTTCTTGGTTTGAGAGCAATTCCTTTGAGTAATACTAAATAACCTGGAGT
GAGTGTCCAGAAGTTGAGAGCTTTCAGAGTATTCAATATCATCCAAATTTCTTGAAACGA
TTTAATAATTAATGTGATGGTACAATCTTTAATCTATATTGTGTTTACCTTTAAAAAAA

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DS 



AS 1 6

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CCTCTCCGAGAAGGTGAGGATCTCAGTCAAGTTTCTCCGCAGTGCTATACCATATCGTCA
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4G610TF U 1
AF RR4GQ74TF U 1
AF RR4F284TF U 288
AF RR4GQ74JQ C 490
AF RR4D919TF U 598
AF RR4F284JQ C 619
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BS 59 133 RR4G610TF
BS 134 637 RR4GQ74TF
BS 638 727 RR4F284TF
BS 728 728 RR4D919TF
BS 729 819 RR4F284TF
BS 820 820 RR4D919TF
BS 821 892 RR4F284TF
BS 893 1245 RR4D919TF
BS 1246 1247 RR4F284JQ

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CCAGTTATCGAGACAGCACCGTCACTTCGTCTCCTTGACGCCGGTGGTGCCTCTGGCCGC
CGGCGTCGAGCCA

QA 1 133 1 133
DS 

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GGAGATAAGAAACTAAACAAATATATGTCCATGGCGAGTTCGCCCTAAACTCTCTCAGGT
CCAGTTATCGAGACAGCGCCGTCACTTCGTCTCCTTGACGCCGGTGGTGCCTCTGGCCGC
CGGCGTCGAGCCATCTCCGCCACTGTTCAACCTCGCCCTCGATTCTGTTGCATCATTCCA
GTCTCGACGAGATCTCTCGTCTACTTTCTTATGTGCGCTTCTCAAGACGACGGATCTGTT
CAGAGAAGGTTTGCCGCCGTGATTAGGAGAGCTCCGTCTTTGCGTTACAGGTGGGACTCC
ACCGGTTTCAAATCTTACTGGGGGATTCCCCATTATTGTTGCTTCTTGGCCTTACTCACC
AGTTTCACTCACAGTGTTGTGTCTGATCTTTCAATTTGCTCCACCGACCTTCTAATCGGT
GCATCTCTACTCCTTTATGAAGAAGAAACCGTGAGCGTTTCCAGATCTAGGTCTCACCCG
CCGGATCCGACACCATCCCCGCTGTCCATCATGTTCGGTTCAGCTCTGAAGATTTTGCTT
CCTCTCCGAGAAGGTGAGGATCTCAGTCAAGTTTCTCCGCAGTGCTATACCATATCGTCA
ACAGATCGGAGAGCCGAACCGTCTATCAATTTGTCAC

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DS 

RD RR4F284TF 605 0 0
G
AGGTGGGACTCCACCGGTTTCAAATCTTACTGGGGGATTCCCCATTATTGTTGCTTCTTG
GCCTTACTCACCAGTTTCACTCACAGTGTTGTGTCTGATCTTTCAATTTGCTCCACCGAC
CTTCTAATCGGTGCATCTCTACTCCTTTATGAAGAAGAAACC*TGAGCGTTTCCAGATCT
AGGTCTCACCCG***GATCTGACACCATCCCCGCTGTCCATCATGTTCGGTTCAGCTCTG
AAGATTTTGCTTCCTCTCCGAGAAGGTGAGGATCTCAGTCAAGTTTCTCCGCAGTGCTAT
ACCATATCGTCAACAGATCGGAGAGCCGAACCGTCCATCAATTTGTCACGAAAAAGCCAC
CAGCCGTTCACATGTCACTGCTCCGTTTGCGCCGAGTTGGGATTCCACCGGCAAAGACAA
TTTGATACATCAATTGGGCTGGGTTTACAAAGTTTGGGTGTGGGCCTAACAAGTCCAAAA
TCTATCACTGATAGTTTGCTTTCAACGCCTTATTTATCTTTTGTGAAGAGCTTTGTCGCT
CAATTACTGGTGGATTCATCAGGATTTCTGAAGAAGCGAACCTTATCAACCCCTGCCTCA
GTCA

QA 2 605 2 605
DS 

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GAAGGTGAGGATCTCAGTCAAGTTTCTCCGCAGTGCTATACCATATCGTCAACAGATCGG
AGAGCCGAACCGTCTATCAATTTGTCACGAAAAAGCCACCAGCCGTTCACATGTCACTGC
TCTGTTTGCGCCGAGTTGGGATTCCACCGGCAAAGACAATTTGATACATCAATTGGGCGG
GGTTTACAAAGTTTGGGTGTGGGCCTAACAAGTCCAAAATCTATCACTGATAGTTTGCTT
TCAACGCCTTATTTCTCTTTTGTGAAGAGTCTTGTCGCTCAATTACTGGTGGATTCATCA
GGATTTCTGAAGAAGCGAACCTTATCAACCCCTGCCTCAGTCAAGAGGAATGTTTCCCCT
CCAAACGTTAAATGGAGGTGTATGCTCATATCTATAACTGTTTTTTTATCTTGTGTACTG
GTCCGTTAGGGGCCTGGAGATGCAACGGATTTCGTTACGACGATATTTGGAGGTGCGGAT
TGGGTATTAACGTCACGTCTCAAAGTGACTAAATTTCAAGTGTCCGGCAGTGCCGCGAAC
CTTGCTTTGACGCATTCGAGCCCGACTCTGAATTCGCTGTCATCATATTTCAGTGTCTTA
ACTATGTTTTATGTTGTAATGTTTTCTGATTGTAGAGTTTTAAGTTCTCTTTCCTGTTGT
AGTTCTGAAGTTTAAATTATGAAATGAAAGTTGTGT
TC

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DS 

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G
CAACAGATCGGAGAGCCGAACCGTCTATCAATTTGTCACGAAAAAGCCACCAGCCGTTCA
CATGTCACTGCTCTGTTTGCGCCGAGTTGGGATTCCACCGGCAAAGACAATTTGATACAT
CAATTGGGCGGGGTTTACAAAGTTTGGGTGTGGGCCTAACAAGTCCAAAATCTATCACTG
ATAGTTTGCTTTCAACGCCTTATCTCTCTTTTGTGAAGAGTCTTGTCGCTCAATTACTGG
TGGATTCATCAGGATTTCTGAAGAAGCGAACCTTATCAACCCCTGCCTCAGTCAAGAGGA
ATGTTTCCCCTCCAAACGTTAAATGGAGGTGTATGCTCATATCTATAACTGTTTTGTTAT
CTTGTGTACCGGTCCGTTAGGGGCCTGGAGATGCAACGGATTTCGTTACGACGATATTTG
GAGGTGCGGATTGGGTATTAACGTCACGTCTCAAAGTGACTAAATTTCAAGTGTCCGGCA
GTGCCGCGAACCTTGCTTTGACGCATTCGAGCCCGACTCTGAATTCGCTGTCATCATATT
TCAGTGTCTTAACTATGTTTTATGTTGTAATGTTTTCTGATTGTAGAGTTTTAAGTTCTC
TTTCCTGTTGTAGTTCTGAAGTTTAAATTATGAAATGAAAGTTGTGT

QA 2 648 2 648
DS 

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CCGTCCATCAATTTGTCACGAAAAAGCCACCAGCCGTTCACATGTCACTGCTCCGTTTGC
GCCGAGTTGGGATTCCACCGGCAAAGACAATTTGATACATCAATTGGGCTGGGTTTACAA
AGTTTGGGTGTGGGCCTAACAAGTCCAAAATCTATCACTGATAGTTTGCTTTCAACGCCT
TATTTATCTTTTGTGAAGAGCTTTGTCGCTCAATTACTGGTGGATTCATCAGGATTTCTG
AAGAAGCGAACCTTATCAACCCCTGCCTCAGTCAAGAGGAATGTTTCCCCTCCAAACGTT
AAATGGAGGTGCATGCTCATATCTATAACTGTTTTGTTATCTTGTGTACCGGTCCGTTTG
GGACCTGAAGATGCAACGGATTTCGTTACGACGATATTTGGAAGTGCGGATTGGGTATTA
ACGTCATGTCTCAAAGTGACTAAATTTCAAGTGTCCGGCAGTGCCGCGAACCTTGCTTTG
ACGCATTCGAGCCCGACTCTGAATTCGCTGTCATCATATTTCAGTGTCTTAGCTATGTTT
TATGTTGTAATGTTTTCTGATTGTAGAGTTTTAAGTTCTCTTTCCTGTTGTAGTCCTGAA
GTTTAAGTTATGAAATGAAAGTTGTGTAC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 6

CO CL1220Contig1 783 6 9 U
GGGAAACGGGGCGAAGACGAACGTCGAAATCGAATATCCAGGCGAATCCGAGTGAGAGAG
GTGAAGAGGAAAAAAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGACGATTAG
AGAGAAAGGTCTCGGCGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCT
ACCAGATGGGAACCTCTTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGTGT
CGACAAGTTCGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAG
ATGGGTAGAGTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCA
CGGATGGCTTCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAA
AAGGTATGGGATTGAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCA
TTCCAAAGGACATACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGT
ACCCACCAAGACCAAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCT
*GAGTTATTGGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAA
AGTTGAACAATTGGGTTTATGGAATTGTGTAATTGATAATGTTTCATCTCATTTTGGTTA
CTTGAGCTTTCCTTCACCTCGAGAGAGAGGAGTGTGGAGGACTATAAATAACAATATTAT
CTT


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BH94TF U 10
AF RR4BH94JQ C 10
AF RR4H670TF U 1
AF RR4BI52JQ C 9
AF RR4BI52TF U 9
AF RR4H670JQB C 119
BS 1 9 RR4H670TF
BS 10 10 RR4BH94TF
BS 11 208 RR4H670TF
BS 209 209 RR4BH94TF
BS 210 461 RR4H670TF
BS 462 462 RR4BH94TF
BS 463 745 RR4H670TF
BS 746 764 RR4BI52TF
BS 765 783 RR4H670JQB

RD RR4BH94TF 663 0 0
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AAAAAAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGACGATTAGAGAGAAAGG
TCTCGGCGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCTACCAGATGG
GAACCTCTTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGTGCCGACAAGTT
CGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGA
GTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCT
TCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGG
GATTGAGCATAAGGAGAACTTCTTTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGG
ACATACCTTGAACTCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAA
GACCAAGTAAGAATGTGAAAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCT*GAGTTATT
GGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAACA
A
AA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4BH94JQ 659 0 0
GGCGAAGACGAACGTCGAAATCGAATATCCAGGCGAATCCGAGTGAGAGAGGTGAAGAGG
AAAAAAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGACGATTAGAGAGAAAGG
TCTCGGCGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCTACCAGATGG
GAACCTCTTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGTGCCGACAAGTT
CGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGA
GTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCT
TCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGG
GATTGAGCATAAGGAGAACTTCTTTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGG
ACATACCTTGAACTCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAA
GACCAAGTAAGAATGTGAAAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCT*GAGTTATT
GGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAAC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4H670TF 745 0 0
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GTGAAGAGGAAAAAAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGACGATTAG
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ACCAGATGGGAACCTCTTGCAAACTAAAGTACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGTGT
CGACAAGTTCGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAG
ATGGGTAGAGTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCA
CGGATGGCTTCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAA
AAGGTATGGGATTGAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGTTGATGCATACATTTACCA
TTCCAAAGGACATACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGT
ACCCACCAAGACCAAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCT
*GAGTTATTGGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAA
AGTTGAACAATTGGGTTTATGGAATTGTGTAATTGATAATGTTTCATCTCATTTTGGTTA
CTTGAGCTTTCCTTCACCTCGAGAG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4BI52JQ 757 0 0
G
GGCGAAGACGAACGTCGAAATCGAATATCCAGGCGAATCCGAGTGAGATAGGTGAAGAGG
AAAAAAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGACGATTAGAGAGAAAGG
TCTCGGCGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTTAGATGCCTACCAGATGG
GAACCTCTTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTCGTTGGCGTGGACAAGTT
CGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGA
GTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCT
TCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGG
GATTGAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGG
ACATACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAA
GACCAAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCTTGAGTTATT
TGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAACA
ATTGGGTTTATGGAATTGTGTAATTGATAATGTTTCATCTCATTTTGGTTACTTGAGCTT
TCCTTCACCTCTAGAGAGAGGAGTGTGGAGGACTA
C

QA 2 756 2 756
DS 

RD RR4BI52TF 757 0 0
G
GGCGAAGACGAACGTCGAAATCGAATATCCAGGCGAATCCGAGTGAGATAGGTGAAGAGG
AAAAAAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGACGATTAGAGAGAAAGG
TCTCGGCGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTTAGATGCCTACCAGATGG
GAACCTCTTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTCGTTGGCGTGGACAAGTT
CGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGA
GTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCT
TCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGG
GATTGAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGG
ACATACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAA
GACCAAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCTTGAGTTATT
TGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAACA
ATTGGGTTTATGGAATTGTGTAATTGATAATGTTTCATCTCATTTTGGTTACTTGAGCTT
TCCTTCACCTCTAGAGAGAGGAGTGTGGAGGACTA
C

QA 2 756 2 756
DS 

RD RR4H670JQB 665 0 0
AGAGAGAAAGGTCTCGGCGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGC
CTACCAGATGGGAACCTCTTGCAAACTAAAGTACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGT
GTCGACAAGTTCGGTAACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACAC
AGATGGGTAGAGTACGCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGG
CACGGATGGCTTCATTTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCA
AAAAGGTATGGGATTGAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGTTGATGCATACATTTAC
CATTCCAAAGGACATACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGG
GTACCCACCAAGACCAAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCT
CT*GAGTTATTGGTTGTTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCT
AAAGTTGAACAATTGGGTTTATGGAATTGTGTAATTGATAATGTTTCATCTCATTTTGGT
TACTTGAGCTTTCCTTCACCTCGAGAGAGAGGAGTGTGGAGGACTATAAATAACAATATT
ATCTT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 2 7

CO CL1221Contig1 853 5 9 U
CGAAGAACTTGACATAGCCTAGCATTTTATTGGTCCAAAAAACAACCTACATTGCGAAAC
GCAGAGAAGCAAACGATAACAACAAACACTATACAAACAAATGAAGATGTGATCTAAAAC
ATTCTCAAAAACCAAACGATGAACAACACTCTCCCCTCTCCTCCTCATCCTCTTTATTAC
CAAAGACATAATGAAGAAACATCACATAACACACAAGCACTTGTTTCTTCACATGAAGAA
GCTCTGAAAACATTTACACCTCAGGTTTATTTGCCAATGCCTTATCCAGCTTCAGGCTTT
TGGTCATGGAACTCGCTCTTGTCAGTGTCTGTGCTGTTCCTTGGAGGGTCTGAATCTCTT
GTTGATCCGTTCTCACTCTTTCGTCTTCTTCTATCCTCCCTAGGAATTGGGTATTCTTCG
GATTCAAGCATACGTGCAACTTGGCTCATCCTTGGTCGTTTCTCAGACATTGGATCAACA
CATCTCAAAGCAGTCAGGAGTGTTCTTTTCAATGCACTTGTAGATGGTTTTGTGTTGAGG
TTTGGATCAATCACTTCTTCTGATCGTCTCTGTTGGACCATCATCTTCAGCCATTCCACC
AAATGTACCTCAGGTGGTGGACGAGCATAGTCTACAGGATATCTACCAGTTATAGCTTCC
AAGAGTACAACACCAAAGCTATAGACATCACTCTTCTCATTCAGAAGACCAGAATTCGCA
TACTCTGGAGCTACATAACCAAAGGTACCCATAACTCTAGTAGTTATAAAACTTTTATCA
CCACCAAGCAGCTTGGCAAGTCCAAAGTCAGAAATTTTAGAGTTGAATTTGTCATCAATC
AGAATGTTGCTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FD58JQ U 65
AF RR4F592JQ U 1
AF RR4FD70JQ U 1
AF RR4F592TF C 169
AF RR4FD70TF C 285
BS 1 465 RR4F592JQ
BS 466 466 RR4FD70JQ
BS 467 740 RR4F592JQ
BS 741 802 RR4FD70JQ
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RD RR4FD58JQ 107 0 0
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TCAAAAACCAAACGATGAACAACACTCTCCCCTCTCCTCCTCATCCT

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR4F592JQ 740 0 0
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GTTGATCCGTTCTCACTCTTTCGTCTTCTTCTATCCTCCCTAGGAATTGGGTATTCTTCG
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AAATGTACCTCAGGTGGTGGACGAGCATAGTCTACAGGATATCTACCAGTTATAGCTTCC
AAGAGTACAACACCAAAGCTATAGACATCACTCTTCTCATTCAGAAGACCAGAATTCGCA
TACTCTGGAGCTACATAACC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4FD70JQ 835 0 0
CGAAGAACTTGACATAGCCTAGCATTTTATTGGTCCAAAAAACAACCTACATTGCGAAAC
GCAGAGAAGCAAACGATAACAACAAACACTATACAAACAAATGAAGATGTGATCTAAAAC
ATTCTCAAAAACCAAACGATGAACAACACTCTCCCCTCTCCTCCTCATCCTCTTTATTAC
CAAAGACATAATGAAGAAACATCACATAACACACAAGCACTTGTTTCTTCACATGAAGAA
GCTCTGAAAACATTTACACCTCAGGTTTATTTGCCAATGCCTTATCCAGCTTCAGGCTTT
TGGTCATGGAACTCGCTCTTGTCAGTGTCTGTGCTGTTCCTTGGAGGGTCTGAATCTCTT
GTTGATCCGTTCTCACTCTTTCGTCTTCTTCTATCCTCCCTAGGAATTGGGTATTCTTCG
GATTCAAGCATACGTGCAACTTGGCTCATCCTTGGTCGTTTCTCAGACATTGGATCAACA
CATCTCAAAGCAGTCAGGAGTGTTCTTTTCAATGCACTTGTAGATGGTTTTGTGTTGAGG
TTTGGATCAATCACTTCTTCTGATCGTCTCTGTTGGACCATCATCTTCAGCCATTCCACC
AAATGTACCTCAGGTGGTGGACGAGCATAGTCTACAGGATATCTACCAGTTATAGCTTCC
AAGAGTACAACACCAAAGCTATAGACATCACTCTTCTCATTCAGAAGACCAGAATTCGCA
TACTCTGGAGCTACATAACCAAAGGTACCCATAACTCTAGTAGTTATAAAACTTTTATCA
CCACCAAGCAGCTTGGCAAGTC*AAAGTCAGAAATTT*AGAGTTGAATTTGTCAT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4F592TF 685 0 0
CCTCTTTATTACCAAAGACATAATGAAGAAACATCACATAACACACAAGCACTTGTTTCT
TCACATGAAGAAGCTCTGAAAACATTTACACCTCAGGTTTATTTGCCAATGCCTTATCCA
GCTTCAGGCTTTTGGTCATGGAACTCGCTCTTGTCAGTGTCTGTGCTGTTCCTTGGAGGG
TCTGAATCTCTTGTTGATCCGTTCTCACTCTTTCGTCTTCTTCTATCCTCCCTAGGAATT
GGGTATTCTTCGGATTCAAGCATACGTGCAACTTGGCTCATCCTTGGTCGTTTCTCAGAC
ATTGGATCAACACATCTCAAAGCAGTCAGGAGTGTTCTTTTCAATGCACTTGTAGATGGT
TTTGTGTTGAGGTTTGGATCAATCACTTCTTCTGATCGTCTCTGTTGGACCATCATCTTC
AGCCATTCCACCAAATGTACCTCAGGTGGTGGACGAGCATAGTCTACAGGATATCTACCA
GTTATAGCTTCCAAGAGTACAACACCAAAGCTATAGACATCACTCTTCTCATTCAGAAGA
CCAGAATTCGCATACTCTGGAGCTACATAACCAAAGGTACCCATAACTCTAGTAGTTATA
AAACTTTTATCACCACCAAGCAGCTTGGCAAGTCCAAAGTCAGAAATTTTAGAGTTGAAT
TTGTCATCAATCAGAATGTTGCTTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FD70TF 569 0 0
TCCAGCTTCAGGCTTTTGGTCATGGAACTCGCTCTTGTCAGTGTCTGTGCTGTTCCTTGG
AGGGTCTGAATCTCTTGTTGATCCGTTCTCACTCTTTCGTCTTCTTCTATCCTCCCTAGG
AATTGGGTATTCTTCGGATTCAAGCATACGTGCAACTTGGCTCATCCTTGGTCGTTTCTC
AGACATTGGATCAACACATCTCAAAGCAGTCAGGAGTGTTCTTTTCAATGCACTTGTAGA
TGGTTTTGTGTTGAGGTTTGGATCAATCACTTCTTCTGATCGTCTCTGTTGGACCATCAT
CTTCAGCCATTCCACCAAATGTACCTCAGGTGGTGGACGAGCATAGTCTACAGGATATCT
ACCAGTTATAGCTTCCAAGAGTACAACACCAAAGCTATAGACATCACTCTTCTCATTCAG
AAGACCAGAATTCGCATACTCTGGAGCTACATAACCAAAGGTACCCATAACTCTAGTAGT
TATAAAACTTTTATCACCACCAAGCAGCTTGGCAAGTCCAAAGTCAGAAATTTTAGAGTT
GAATTTGTCATCAATCAGAATGTTGCTT
C

QA 1 568 1 568
DS 



CO CL1221Contig2 1038 2 4 U
GGAACAGCCAAAGCGCTTGCGTACCTTCACGAGGCGATTGAGCCAAAAGTAGTGCATAGA
GACATAAAGTCAAGCAACATTCTGATTGATGACAAATTCAACTCTAAAATCTCTGACTTT
GGACTTGCCAAGCTGCTTGGTGGTGATAAAAGTTTTATAACTACTAGAGTTATGGGTACC
TTTGGTTATGTAGCTCCAGAGTATGCGAATTCTGGTCTTCTGAATGAGAAAAGTGATGTC
TACAGCTTTGGTGTTGTACTCTTGGAAGCTATAACTGGTAGATATCCTGTAGACTATGCT
CTTCCACCACCTGAGGTACATTTGGTGGAATGGCTGAAGATGATGGTCCAACAGAGACGA
TCAGAAGAAGTGATTGACCCAAACCTCAACACAAAACCATCTACAAGTGCCTTAAAAAGA
ACACTCTTGACTGCTCTGAGATGTGTTGATCCCATGTCTGAGAAACGTCCAAGGATGATC
CAAGTTGCACGTATGCTTGAATCCTAGGAGTACCCAATTCCTAGAGAGGATAGAAGAAGA
CGAAAGAGTGAGAACGGATCAGCAAGAGGTTCAGACCCTCCAAGGAACAGCACAGACACT
GACAAGAGCGAGTTCCATGACCAAAAGCCTGAAGCTGGATAAAGCATTGGCAAATAAACC
TGAGGTGTAAATGTTTTCAGAGCTTCTTCATGTGAGGAAGCAAGTCCTTGTTCGTCTCCA
GAATCTTCTGTGTTATGTGATGTTTCTTCATTTTGTCTTTGGTAATAAAGAGAAAGAGGA
GGAGAGGGGAGGAGAGTGTGTTGTTGTTCTTCGTTTGGTTTTGAGTATGTTTTAGATCAC
ATCATATCATTTGTTTGTATAGTGTTTGTTGTATCGTTTGCTTCTCTACGTTTCGCAATG
TAGGTTGTTTTTGGACCAAGAAAATGCTAGGCTATGTCAAGTTCTTCGTAGAAACGATGT
GTAGTTTGTAGTTTGCTTGTGTAATATGTTGTTTATCTGAGACTGTCTGTTAAATGTCTA
TTGCAAATCCTGTTAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE24TF U 1
AF RR4GE24JQ C 315
BS 1 670 RR4GE24TF
BS 671 671 RR4GE24JQ
BS 672 693 RR4GE24TF
BS 694 1038 RR4GE24JQ

RD RR4GE24TF 693 0 0
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GACATAAAGTCAAGCAACATTCTGATTGATGACAAATTCAACTCTAAAATCTCTGACTTT
GGACTTGCCAAGCTGCTTGGTGGTGATAAAAGTTTTATAACTACTAGAGTTATGGGTACC
TTTGGTTATGTAGCTCCAGAGTATGCGAATTCTGGTCTTCTGAATGAGAAAAGTGATGTC
TACAGCTTTGGTGTTGTACTCTTGGAAGCTATAACTGGTAGATATCCTGTAGACTATGCT
CTTCCACCACCTGAGGTACATTTGGTGGAATGGCTGAAGATGATGGTCCAACAGAGACGA
TCAGAAGAAGTGATTGACCCAAACCTCAACACAAAACCATCTACAAGTGCCTTAAAAAGA
ACACTCTTGACTGCTCTGAGATGTGTTGATCCCATGTCTGAGAAACGTCCAAGGATGATC
CAAGTTGCACGTATGCTTGAATCCTAGGAGTACCCAATTCCTAGAGAGGATAGAAGAAGA
CGAAAGAGTGAGAACGGATCAGCAAGAGGTTCAGACCCTCCAAGGAACAGCACAGACACT
GACAAGAGCGAGTTCCATGACCAAAAGCCTGAAGCTGGATAAAGCATTGGCAAATAAACC
TGAGGTGTAA*TGTTTTCAGAGCTTCTTCATGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4GE24JQ 724 0 0
GGTACATTTGGTGGAATGGCTGAAGATGATGGTCCAACAGAGACGATCAGAAGAAGTGAT
TGACCCAAACCTCAACACAAAACCATCTACAAGTGCCTTAAAAAGAACACTCTTGACTGC
TCTGAGATGTGTTGATCCCATGTCTGAGAAACGTCCAAGGATGATCCAAGTTGCACGTAT
GCTTGAATCCTAGGAGTACCCAATTCCTAGAGAGGATAGAAGAAGACGAAAGAGTGAGAA
CGGATCAGCAAGAGGTTCAGACCCTCCAAGGAACAGCACAGACACTGACAAGAGCGAGTT
CCATGACCAAAAGCCTGAAGCTGGATAAGGCATTGGCAAATAAACCTGAGGTGTAAATGT
TTTCAGAGCTTCTTCATGTGAGGAAGCAAGTCCTTGTTCGTCTCCAGAATCTTCTGTGTT
ATGTGATGTTTCTTCATTTTGTCTTTGGTAATAAAGAGAAAGAGGAGGAGAGGGGAGGAG
AGTGTGTTGTTGTTCTTCGTTTGGTTTTGAGTATGTTTTAGATCACATCATATCATTTGT
TTGTATAGTGTTTGTTGTATCGTTTGCTTCTCTACGTTTCGCAATGTAGGTTGTTTTTGG
ACCAAGAAAATGCTAGGCTATGTCAAGTTCTTCGTAGAAACGATGTGTAGTTTGTAGTTT
GCTTGTGTAATATGTTGTTTATCTGAGACTGTCTGTTAAATGTCTATTGCAAATCCTGTT
AGTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 7

CO CL1222Contig1 1262 7 20 U
GCAGATCACAGCAAAAATGGATAGTCACAAAAGGAGTTTAGGTTTCATATCTCTCGCTTT
TCTCTTCCTCACTTGCTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACAGAAGGCAGAGG
AACAGAGAACAACAGTACTTATAATGTCGAGGCGCATCTTGGAGAGACAAGAGCGTTTAG
AGAGGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAAGGGAG
ATTCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTT
GTACGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGAAT
CGAAGGCGCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGT
CCACAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAA
TGCTGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATAC
TAACAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATTGTTAA
ACCTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCAC
TTGGAAGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCTGCCGATTTTCT
CGTTGGAGACCGATACTGGAGATTAGGCTTTAACCCGAAAGGGGATGGAGATGGACGACC
ACATGCACTTCCACTCTTCCTATTTGCTCAAGGCTTTAAGGAAAACGCAGTTGCTACAAA
CACTTGGGGAGCAGTTAACTTGCGGTTGAAGAATCAGCGAAACTCCAACCACAGACAATT
ATATTCTGCAGCTTGGTACCCGATTCGAAGTGATTATGGTGTGGGAGTGAACAATATCAT
ATTGTTAGCAGATTTAAAGGATCCATCGAAAGGGTATTTGGTGAATGATGCCATTATCTT
TGAAGCTGAAATGGTTAAGGTCTCTGTGACCAATATCGTCTCAGCTTAGTAATCTCTACA
TCTTTTTCATATATATGGGTCAAACAACCTTATAAATAAAGAGACGCTTAATGAGATTGT
AATAAGATGAAATTATCGATGCTTGTGTGATGTAGTCGTCATTTCTGTCCTTGGAGTGTG
TTTTATTTTCTGCTTTGTTATCAATGAAACTAGACCTTGACCCGCCCAGCCGGGCAGATA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 

AF RR4BK85TF U 1
AF RR4G230TF U 6
AF RR4FT29TF U 183
AF RR4DH06JQ C 695
AF RR4DH06TF U 621
AF RR4FT29JQ C 407
AF RR4G230JQ C 520
BS 1 39 RR4BK85TF
BS 40 40 RR4G230TF
BS 41 75 RR4BK85TF
BS 76 76 RR4G230TF
BS 77 230 RR4BK85TF
BS 231 231 RR4G230TF
BS 232 663 RR4BK85TF
BS 664 665 RR4G230TF
BS 666 666 RR4FT29TF
BS 667 683 RR4G230TF
BS 684 719 RR4FT29TF
BS 720 720 RR4DH06TF
BS 721 887 RR4FT29TF
BS 888 888 RR4DH06TF
BS 889 902 RR4FT29TF
BS 903 903 RR4DH06TF
BS 904 914 RR4FT29TF
BS 915 1147 RR4DH06TF
BS 1148 1257 RR4FT29JQ
BS 1258 1262 RR4G230JQ

RD RR4BK85TF 663 0 0
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TCTCTTCCTCACTTGTTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACAGAAGGCAGAGG
AACAGAGAACAACAGTACTTATAATGTCGAGGCGCATCTTGGAGAGACAAGAGCGTTTAG
AGAGGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGACTAAAGGGAG
ATTCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTT
GTACGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGAAT
CGAAGGCGCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGT
CCACAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAA
TGCTGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATAC
TAACAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATTGTTAA
ACCTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCAC
TTG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4G230TF 678 0 0
GG
ACAGCAAAAATGGATAGTCACAAAAGGAGTTTAGGTTTCATATCTCTCGCTTTTCTCTTC
TTCACTTGCTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACAGAAGGCAGAGGAACAGAG
AACAACAGTACTTATAATGTCGAGGCGCATCTTGGAGAGACAAGAGCGTTTAGAGAGGAG
CGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAAGGGAGATTCGAA
CCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGTACGTG
ATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGAATCGAAGGC
GCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAAT
CCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAATGCTGCA
AAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATACTAACAAT
GGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATTGTTAAACCTGCC
GAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAA*CCCTCCAAACAATATTTTCACTTGGA*G
ATACTTCGTTTCTCCA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR4FT29TF 732 0 0
G
GGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAAGGGAGATT
CGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGTA
CGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGAATCGA
AGGCGCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCA
CAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAATGC
TGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATACTAA
CAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATTGTTAAACC
TGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCACTTG
GAAGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCTGCCGATTTTCCCGT
TGGAGACCGATACTGGAGATTAGGCTTTAACCCGAAAGGGGATGGAGATGGACGACCACA
TGCACTTCCACTCTTCCTATTTGCTCAAGGCTTTAAGGAAAACGCAGTTGCTACAAACAC
TTGGGGAGCAGTTAACTTGCGGTTGAAGAATCAGCGAAACTCCA*CCACAGACAATTATG
TTCTGCAGCTT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR4DH06JQ 336 0 0
AAATTTTACTATTCAGCCGATTTTCTCGTTGGAGACCGATACTGGAGATTAGGCTTTAAC
CCGAAAGGGGATGGAGATGGACGACCACATGCACTTCCACTTTTCCTATTTGCTCAAGGC
TTTAAGGAAAACGCAGTTGCTACAAACACTTGGGGAGCAGTTAACTTGCGGTTGAAGAAT
CAGGGAAACTCCAACCCCAGACAATTATATTTTGCAGCTTGGTACCCGATTTGAAGTGAT
TATGGTGTGGGAGTGAACAATATCATATTGTTAGCAGATTTAAAGGATCCATTGAAAGGG
TATTTGGTGAATGATGCCATTATTTTTGAAGGTGAA

QA 1 336 1 336
DS 

RD RR4DH06TF 527 0 0
G
AGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCACTTGGAAGATACTTCGTTTCTC
CAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCAGCCGATTTTCTCGTTGGAGACCGATACTGGAG
ATTAGGCTTTAACCCGAAAGGGGATGGAGATGGACGACCACATGCACTTCCACTCTTCCT
ATTTGCTCAAGGCTTTAAGGAAAACGCAGTTGCTACAAACACTTGGGGAGCAGTTAACTT
GCGGTTGAAGAATCAGCGAAACTCCAACCACAGACAATTATATTCTGCAGCTTGGTACCC
GATTCGAAGTGATTATGGTGTGGGAGTGAACAATATCATATTGTTAGCAGATTTAAAGGA
TCCATCGAAAGGGTATTTGGTGAATGATGCCATTATCTTTGAAGCTGAAATGGTTAAGGT
CTCTGTGACCAATATCGTCTCAGCTTAGTAATCTCTACATCTTTTTCATATATATGGGTC
AAACAACCTTATAAATAAAGAGACGCTTAATGAGATTGTAATAAGA

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR4FT29JQ 851 0 0
GATCTCAACTCTTGTCCAC
ATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGA*CCGTGAAGCGATACAATGCTG
CAAAAA*GGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATACTAACA
ATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATTGTTAAACCTG
CCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCACTTGGA
AGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCTGCCGATTTTCCCGTTG
GAGACCGATACTGGAGATTAGGCTTTAACCCGAAAGGGGATGGAGATGGACGACCACATG
CACTTCCACTCTTCCTATTTGCTCAAGGCTTTAAGGAAAACGCAGTTGCTACAAACACTT
GGGGAGCAGTTAACTTGCGGTTGAAGAATCAGCGAAACTCCAACCACAGACAATTATGTT
CTGCAGCTTGGTACCCGATTCGAAGTGATTATGGTGTGGGAGTGAACAATATCATATTGT
TAGCAGATTTAAAGGATCCATCGAAAGGGTATTTGGTGAATGATGCCATTATCTTTGAAG
CTGAAATGGTTAAGGTCTCTGTGACCAATATCGTCTCAGCTTAGTAATCTCTACATCTTT
TTCATATATATGGGTCAAACAACCTTATAAATAAAGAGACGCTTAATGAGATTGTAATAA
GATGAAATTATCGATGCTTGTGTGATGTAGTCGTCATTTCTGTCCTTGGAGTGTGTTTTA
TTTTCTGCTTTGTTATCAATGAAACTAGACCTTGACCCGCCCAGCCGGGCAG

QA 20 851 20 851
DS 

RD RR4G230JQ 743 0 0
TCTTTCAACATTCGAGAATACTAACAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGG
TGCTGAGATCCTCATTGTTAAACCTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAA
CCCTCCAAACAATATTTTCACTTGGAAGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATT
TTACTATTCTGCCGATTTTCTCGTTGGAGACCGATACTGGAGATTAGGCTTTAACCCGAA
AGGGGATGTAGATGGACGACCACATGCACTTCCACTCTTCCTATTTGCTCAAGGCTTTAA
GGAAAACGCAGTTGCTACAAACACTTGGGGAGCAGTTAACTTGCGGTTGAAGAATCAGCG
AAACTCCAACCACAGACAATTATATTCTGCAGCTTGGTACCCGATTCGAAGTGATTATGG
TGTGGGAGTGAACAATATCATATTGTTAGCAGATTTAAAGGATCCATCGAAAGGGTATTT
GGTGAATGATGCCATTATCTTTGAAGCTGAAATGGTTAAGGCCTCTGTGACCAATATCGT
CTCAGCTTAGTAATCTCTACATCTTTTTCATATATATGGGTCAAACAACCTTATAAATAA
AGAGACGCTTAATGAGATTGTAATAAGATGAAATTATCGATGCTTGTGTGATGTAGTCGT
CATTTCTGTCCTTGGAGTGTGTTTTATTTTCTGCTTTGTTATCAATGAAACTAGACTTTG
ACCCGCCCAGCCGGGCAGATATC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL1223Contig1 1114 4 10 U
GGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATCAACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATTG
CTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGATTACAATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGGAGT
TCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAGGGTCCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCTTG
AGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTTCTCTACAAGGAGCTTGGTAGAAGGC
TCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGGCTGAGATCTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAA
GACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGCT
TCTTGACAAAGGCAAGGAAATACACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTT
ACTTGTCCGAGAAAATCGGGTACTGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAAGCAAA
ACCCTGAGTTCCAATGTTACCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGA
ACCGTCATGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACT
GGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGTACCTCA
ACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGTTTGACA
TGCACGTCATCATTGAGACAAACCGGACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTTGGATG
TTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGGAAGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAAGCTGA
TGGCTGTAGGACAAACTGATGATCCTTCCTTTGTCAAGAACCTCAAGAGGATTCCTCTCA
TTGCTGGTCTAGTCTCTGAGATCTTGGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGTCTGGAT
CTGTTGATTTCGCTGAGTTTGAGCCTAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCAAGTCT
TGTGAGTTTATGGACGGTTCTTGATTTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGAAACCTC
TTTTTATTTGTAATAAACCAAATACTTTTACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC76TF U 1
AF RR4FH78TF U 93
AF RR4B315JQ C 416
AF RR4EC76JQ C 579
BS 1 358 RR4EC76TF
BS 359 359 RR4FH78TF
BS 360 636 RR4EC76TF
BS 637 638 RR4FH78TF
BS 639 711 RR4EC76TF
BS 712 712 RR4FH78TF
BS 713 748 RR4EC76TF
BS 749 753 RR4FH78TF
BS 754 1105 RR4B315JQ
BS 1106 1114 RR4EC76JQ

RD RR4EC76TF 754 0 0
GGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATCAACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATTG
CTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGATTACAATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGGAGT
TCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAGGGTCCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCTTG
AGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTTCTCTACAAGGAGCTTGGTAGAAGGC
TCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGGCTGAGATCTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAA
GACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGTT
TCTTGACAAAGGCAAGGAAATACACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTT
ACTTGTCCGAGAAAATCGGGTACTGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAAGCAAA
ACCCTGAGTTCCAATGTTACCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGA
ACCGTCATGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACT
GGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTCT**GTTTATGTGACCATGTACCTCA
ACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGGGTTTGACA
TGCACGTCATCATTGAGACAAACCGGAC
ACGGCA

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DS 

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G
AGACACATTTCGTGAGGAACAAGGAGTTCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAGGGTCCTC
TAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCC
TTCTCTACAAGGAGCTTGGTAGAAGGCTCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGTCTGAGATCT
TCTCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTG
ATTTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGCTTCTTGACAAAGGCAAGGAAATACACTTTCTTCA
AACCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTTACTTGTCCGAGAAAATCGGGTACTGGAGATACA
TCACAATCTACAGACACCTCAAGCAAAACCCTGAGTTCCAATGTTACCCTATCTTCAAGT
ACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGAACCGTCATGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGA
AAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCC
TCTCGGTTTATGTGACCATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTA
TTGGGTTAAACACCAAGGAGTTTGACATGCACGTCATCATTGAGACAAACCGGACCACGG

QA 2 661 2 661
DS 

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CACTTACTTGTCCGAGAAAATCGGGTACTGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAA
GCAAAACCCTGAGTTCCAATGTTACCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGA
CGAGAACCGTCATGGAGATTTTTTTTTTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAA
TGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTTTTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGTA
CCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTTTACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGTT
TGACATGCACGTCATCATTGAGACAAACCGGACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTT
GGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGGAAGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAA
GCTGATGGCTGTAGGACAAACTGATGATCCTTCCTTTGTCAAGAACCTCAAGAGGATTCC
TCTCATTGCTGGTCTAGTCTCTGAGATCTTGGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGTC
TGGATCTGTTGATTTCGCTGAGTTTGAGCCTAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCA
AGTCTTGTGAGTTTATGGACGGTTCTTGATTTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGAA
ACCTCTTTTTATTTGTAATAAACCAAATAC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4EC76JQ 536 0 0
CAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTCT**
GTTTATGTGACCATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTATTGGG
TTAAACACCAAGGGGTTTGACATGCACGTCATCATTGAGACAAACCGGACCACGGCAAGG
ATATTCCCAGCTGTGTTGGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGGAAGCTAGATAGAATG
GTTGTGATCAATGAGAAGCTGATGGCTGTAGGACAAACTGATGATCCTTCCTTTGTCAAG
AACCTCAAGAGGATTCCTCTCATTGCTGGTCTAGTCTCTGAGATCTTGGCTGCTTATCTC
ATGCCTCCTGTTGAGTCTGGATCTGTTGATTTCGCTGAGTTTGAGCCTAATCTTGTCTAT
TAGTAGCTGCATTGTCAAGTCTTGTGAGTTTATGGACGGTTCTTGATTTCTTGTAGTTGA
ATGATCAAAACTGAGAAACCTCTTTTTATTTGTAATAAACCAAATACTTTTACAGT

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 6

CO CL1224Contig1 818 6 12 U
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AAATGGCGTCGGAGAAGGAGCTGTCGAACTCCATGAGGGACATTAAGGTCCAAAAACTTG
TTCTTAACATCTCCGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACTCGTGCCTCCAAGGTTTTGG
AACAGCTCAGTGGACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTG
GTATCAGGCGTAACGAAAAGATCGCGTGCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAAGGCAATGC
AGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTCAGGAGGAACTTTAGTG
ACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGATC
CTTCTACGGGTATCTACGGAATGGACTTCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTG
TGGCTCGTCGCCGTAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATG
ATGCAATGAAATGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACA
TCACTGGCTAAACTAAAACTTGAATCTTCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGCTTTTGTTT
TTTTTTAAGTTGTCATCTTTACGATTTCTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTCTAGTAAAA
CCTCTTTTTGTAGTCAGTGGGGTAGAAATTATATTTCCAGAACCTTCTTTTATGTTTACC
ATCTATGTCATTTAAATTTCCAAGAACCTTCTTAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM50TF U 1
AF RR4C461JQ C 26
AF RR4GJ69JQ C 27
AF RR4E226TF U 172
AF RR4EA58TF U 172
AF RR4FM50JQ C 61
BS 1 55 RR4FM50TF
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BS 57 217 RR4FM50TF
BS 218 218 RR4E226TF
BS 219 322 RR4FM50TF
BS 323 323 RR4E226TF
BS 324 493 RR4FM50TF
BS 494 494 RR4E226TF
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BS 798 808 RR4GJ69JQ
BS 809 818 RR4FM50JQ

RD RR4FM50TF 661 0 0
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GTATCAGGCGTAACGAAAAGATCGCGTGCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAAGGCAATGC
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ATGCAATGAAATGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACA
TCACTGGCTAAACTAAAACTTGAATCTTCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGCTTTTGTTT
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4C461JQ 691 0 0
GG
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TCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCTCGTCGCCGTAGGTGCAAGGCTC
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TCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGCTTTTGTTTGTTTTTAAGTTGTCATCTTTACGATTT
CTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTCTAG
C

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR4GJ69JQ 782 0 0
C
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ACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAAAAACTTGTTCTTA***TCTCCGTTGGTGAGAGTG
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TCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGATCGCGT
GCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTA
AGGAGTATGAGCTTCTCAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCC
AAGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGATCCTTCTACGGGTATCTACGGAATGGACT
TCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCTCGTCGCCGTAGGTGCAAGGCTC
GTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATGATGCAGTGAAATGGTTCCAAGTTAAGT
ATGAAGGAGTTATCCCCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGCTAAACTAAAACTTGAATCT
TCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGCTTTTGTTTTTTTTTAAGTTGTCATCTTTACGATTT
CTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTCTAGTAAAACCTCTTTTTGTAGTCAGTGGGGTAGAA
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C

QA 2 782 2 782
DS 

RD RR4E226TF 628 0 0
G
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CTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTTGGTATCAA
GTATGATCCTTCTACGGGTATCTACGGAATGGACTTCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGG
ATACCGTGTGGCTCGTCGCCGTAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGAC
TAAGGATGATGCAATGAAATGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTC
TCAGAACATCACTGGCTAAACTAAAACTTGAATCTTCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGC
TTTTGTTTTTTTTTAAGTTGTCATCTTTACGATTTCTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTC
TAGTAAAACCTCTTTTTGTAGTCAGTGGGGTAGAAATTATATTTCCAGAACCTTCTTTTA
TGTTTACCATCTATGTCATTTAAAT
TT

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR4EA58TF 626 0 0
G
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GTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGATCGCGTGCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAA
GGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTC**AGGAGGAA
CTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTTGGTATCAA
GTATGATCCTTCTACGGGTATCTACGGAATGGACTTCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGG
ATACCGTGTGGCTCGTCGCCGTAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGAC
TAAGGATGATGCAATGAAATGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTC
TCAGAACATCACTGGCTAAACTAAAACTTGAATCTTCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGC
TTTTGTTTTTTTTTAAGTTGTCATCTTTACGATTTCTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTC
TAGTAAAACCTCTTTTTGTAGTCAGTGGGGTAGAAATTATATTTCCAGAACCTTCTTTTA
TGTTTACCATCTATGTCATTTAAAT

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR4FM50JQ 758 0 0
AAATGGCGTCGGAGAAGGAGCTGTCGAACTCCATGAGGGACATTAAGGTCCAAAAACTTG
TTCTTAACATCTCCGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACTCGTGCCTCCAAGGTTTTGG
AACAGCTCAGTGGACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCAAGGTACACTGTGAGGTCTTTTG
GTATCAGGCGTAACGAAAAGATCGCGTGCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAAGGCAATGC
AGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAGGTTAAGGAGTATGAGCTTCTCAGGAGGAACTTTAGTG
ACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGATC
CTTTTACGGGTATTTACGGAATGGACTTCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTG
TGGCTCGTCGCCGCAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATG
ATGCAATGAAATGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACA
TCACTGGCTAAACTAAAACTTGAATCTTCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGCTTTTGTTT
TTTTTTAAGTTGTCATCTTTACGATTTCTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTCTAGTAAAA
CCTCTTTTTGTAGTCAGTGGGGTAGAAATTATATTTCCAGAACCTTCTTTTATGTTTACC
ATCTATGTCATTTAAATTTCCAAGAACCTTCTTAATCG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 7

CO CL1225Contig1 778 7 11 U
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TGAAAGCCGCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAACGGGTCC
TTCTCACCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTTATTAACCTCTCCGACA
AACCTCAGTGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTCAAGATGGACG
ACAAGTGGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACC
CATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTTT*GCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACCTTC
GTGAGTTTCATCAAGAGCAAAGACTCCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAG
CTACAAGCTCTGGAAGATCATCTCAAGTCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGA
GTCACGGCGGCGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGC
CATTTCAAAACCTGGTCTGTGCCCGGGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCT
TTGTTCTCTCTTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCTGGA
TGGGCACCCAAGGTCAACCCCTAAAAGAACTGAAGCTCCGAAGTCTCTTCAATAAGAAAA
TAAAAATATAATAATGTTCTTGGAGCTGGTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN52TF U 103
AF RR4FN35TF U 5
AF RR4BY90TF U 3
AF RR4BJ05TF U 1
AF RR4BN52JQ C 57
AF RR4BY90JQ C 19
AF RR4FN35JQ C 86
BS 1 184 RR4BJ05TF
BS 185 185 RR4BY90TF
BS 186 246 RR4BJ05TF
BS 247 247 RR4BY90TF
BS 248 417 RR4BJ05TF
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BS 447 665 RR4BJ05TF
BS 666 742 RR4BY90JQ
BS 743 778 RR4FN35JQ

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ACGACAAGTATCCTGACCCATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTTTTGCCTCTGTT

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DS 

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GG
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CCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTTATTAACCTCTCCGACAAACCTC
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GCGG

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DS 

RD RR4BY90TF 642 0 0
GGCC
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CCGCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAACGGGTCCTTCTCA
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AGTGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTCAAGATGGACGACAAGT
GGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTC
TCAAGACCCCACCTCAGTTT*GCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACCTTCGTGAGT
TTCATCAAGAGCAAAGACTCCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAGCTACAA
GCTCTGGAAGATCATCTCAAGTCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGG*AAGAGTCACG
GCGGCGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGCCATTTC
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AGAGT

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DS 

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CATTTCAAAACCTGGTCTGTGCCCGGGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCT
TTGTTCTCTCTTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCTGGA
TGGGC
ACC

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DS 

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GTCCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCC
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GACGACAAGTGGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTGGACGACAAGTATCCT
GACCCATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTTT*GCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCAC
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AAGAGTGACGGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCT
TGGCCATTTCAAAACCTGGTCTGTCCCTGGGACCTTACCACATGTTCGTACCTACATGAA
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TGGATGGGCCCCCAAGGTCAACCCCTAAAAGAACTGTAGCTCCGAAGTCTCTTCA
G

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DS 

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AAG
AAAAAGAAAAAAGGTTAAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAAAGCCGCTGTTGGTGCCC
CTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAACGGGTCCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGA
ATCAGCCCTACAAAATACATCTTATTAACCTCTCCGACAAACCTCAGTGGTTCTTAGACA
TTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTCAAGATGGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCTG
ACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCTCAAGACCCCACCTC
AGTTT*GCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACCTTCGTGAGTTTCATCAAGAGCAAA
GACTCCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAGCTACAAGCTCTGGAAGATCAT
CTCAAGTCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGG*AAGAGTCACGGCGGCGGATCTTAGC
TTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGCCATTTCAAAACCTGGTCTGTG
CCCGGGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCTTTGTTCTCTCTTGACTCCTTT
GAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCTGGATGGGCACCCAAGGTCAACCCC
TAAAAGAACTGAAGCTCCGAAGTCTCTTCAATAAGAAAATAAAAATATAATAATGTTCTT
G

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DS 

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GCCCTACAAAATACATCTTATTAACCTCTCCGACAAACCTCAGTGGTTCTTAGACATTAA
TCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTCAAGATGGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCTGACAT
CATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTT
T*GCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACCTTCGTGAGTTTCATCAAGAGCAAAGACT
CCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAGCTACAAGCTCTGGAAGATCATCTCA
AGTCTTATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTCACGGCGGCGGATTTTAGCTTAG
CACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTTTTGGCCATTTCAAAACCTGGTC*GTGCCCG
GGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCTTTGTTCTCTCTTGACTCCTTTGAGA
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CTGGTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTCT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 7

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AAAGTTGCAACCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCCCTTTTCAAAAAATAAATAATA
ATATTATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATCTATTA
CATATGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCTCCTTTTTCTTTTCGGCACTTTGAT
GATGTATGTACGCATATATACCGTAGTACCATCAGGGATACTGGACACAACATACTGCTT
TGCATTTAATATGATCAATACAAAGGCC


BQ
30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4DS49JQ C 1
AF RR4E386JQ C 1
AF RR4DS49TF U 1
AF RR4E386TF U 1
AF RR4E960TF U 5
AF RR4GX87TF U 0
AF RR4GX87JQ C 87
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BS 563 685 RR4GX87TF
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RD RR4DS49JQ 562 0 0
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DS 

RD RR4E386JQ 562 0 0
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CATATGGCAATAACGACAAAGG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4DS49TF 562 0 0
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QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4E386TF 562 0 0
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ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCG
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ATATTATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATCTATTA
CATATGGCAATAACGACAAAGG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4E960TF 585 0 0
G
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TGACCACACTCCCTACAACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAGCACCA
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TGCAAGCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCCCTTTTCAAAAAATAAATAATAATATT
ATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATCCATTACATAT
GGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCTCCTTTTTCTTTTC

QA 2 585 2 585
DS 

RD RR4GX87TF 688 0 0
GGA
AAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAAAATGGTGTTCCCTTCAAAGATCATCACAT
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CAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCCAT
CAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCGCC
GACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGACC
TTGTGACCACACTCCCTACAACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAGCA
CCAATTGTGACA*TATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGAACGACTAATCAA
AGTTGCAAGCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCCCTTTTCAAAAAATAAATAATAAT
ATTATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATCCATTACA
TATGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCTCCTTTTTCTTTTCGGCACTTTGATGA
TGTATGTACGCATATATACCGTAGTACCATCAGGGATACTGGACACAACATACTGCTTTG
CATTTAATATGATCAATACAAAG
CC

QA 4 686 4 686
DS 

RD RR4GX87JQ 602 0 0
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GTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCCATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAAT
CATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCGCCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAAT
CTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGACCTTGTGACCACACTCCCTACAACTT
GTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAGCACCAATTGTGACA*TATATCGGCTA
CCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGAACGACTAATCAAAGTTGCAAGCTTTTAACCTAAATA
ATAATATTATGCCCTTTTCAAAAAATAAATAATAATATTATGCTGTTATTTCCCATTTTA
TGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATCCATTACATATGGCAATAACGACAAAGGAACT
CTTTCTCGCTCCTTTTTCTTTTCGGCACTTTGATGATGTATGTACGCATATATACCGTAG
TACCATCAGGGATACTGGACACAACATACTGCTTTGCATTTAATATGATCAATACAAAGG
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 7

CO CL1227Contig1 963 7 2 U
GTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTCTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAG
AATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTTCGATACAAAAAAGTAAAGTATGTAGGTCTAAAATT
TTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGTTTGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTC
CGGAATATGAGTGTGTGACTTGTTAGAATTGACCCTATGGATAGTACAGAGAAGGGGGTC
TGTCATCTTTATCAAGATGGTTTTACTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACG
AAATAGATCAAATAGATCACAAAGTTTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCT
CGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGC
TTTTAAACTCTTATTTAGATCAAAGGACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTTAATCA
TTATAGCTCTTTTTTTGATTGAATAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTTT
GGACTTTGAAGGTTTCATTGAATTATCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAA
TAAGTAGGGTCTTAACAAGAAAATTCCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAATACGT
ATTCCCATTCCATACAAATACCAAATAAAAAAGACAATAACGATAGGTAATCTAGAAGAT
TCAAGAGGCCTGTAACGATCAACACAACATAAAGACGTATGAGCTGACTTGAGTTTTTGG
CATTTAACCACAAAGAAGAGCTTTCGCATTTTGACTCTTTCATATCTTTAAATAATATTG
AATGAGAGAGAAGTTTAAAACTTTATATTACATATCCGTTTCAATTAATAAGTAGGGTCT
TAACAAGAAAATTCCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAATACGTATTCCCATTCCA
TAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4DB51TF U 1
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TGTCATCTTTATCAAGATGGTTTTACTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACG
AAATAGATCAAATAGATCACAAAGTTTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCT
CGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGC
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TTATAGCTCTTTTTTTGATTGAATAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTTT
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DS 

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AATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTTAAACTCTTATTTAGATCAAAGGACAAAC
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TCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAATAAGTAGGGTCTTAACAAGAAAATTCCTATCA
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QA 1 650 1 650
DS 

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G
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TGAATAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTTTGGACTTTGAAGGTTTCATT
GAATTATCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAATAAGTAGGGTCTCAACAAG
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ACC

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CCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAATACGTATTCCCATTCCATACAAATACC

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DS 

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TACGTATTCCCATTCCATACAAATACC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR4FS79TF 327 0 0
GACCTCGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTT
TCTGCTTTTAAACTCTTATTTAGATCAAAGGACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTT
AATCATTATAGCTCTTTTTTTGATTGAATAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGA
ACTTTGGACTTTGAAGGTTTCATTGAATTCTCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCA
ATTAATAAGTAGGGTCTTAACAAGAAAATTCCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAA
TACGTATTCCCATTCCATACAAATACC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR4AA91TF 660 0 0
G
AGATCAAATAGATCACAAAGTTTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCTCGTA
GCCGGACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTT
AAACTCTTATTTAGATCAAAGGACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTTAATCATTAT
AGCTCTTTTTTTGATTGAATAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTTTGGAC
TTTGAAGGTTTCATTGAATTATCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAATAAG
TAGGGTCTTAACAAGAAAATTCCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAATACGTATTC
CCATTCCATACAAATACCAAATAAAAAAGACAATAACGATAGGTAATCTAGAAGATTCAA
GAGGCCTGTAACGATCAACACAACATAAAGACGTATGAGCTGACTTGAGTTTTTGGCATT
TAACCACAAAGAAGAGCTTTCGCATTTTGACTCTTTCATATCTTTAAATAATATTGAATG
AGAGAGAAGTTTAAAACTTTATATTACATATCCGTTTCAATTAATAAGTAGGGTCTTAAC
AAGAAAATTCCTATCAATAATAAAGAAAACAAGAAGAAATACGTATTCCCATTCCATAC

QA 2 660 2 660
DS 



AS 2 7

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AATGTTTATTGAAAGCACTACAAATTAAAAAAACTAACCCCATAAGGAAACAAAACCTCA
ACTTCTGTTCTTCCTTTTTTTTGCTGGTTTGGCTTTGTTTTAGGCTTTTGATGAAGTGGT
TTCTTGGGGTGTTAGATCTTTCTACTTACAGAGTAGTCTTTCGTAACTGAAAAGGCTGTA
TGATGGCATATCTTCAATACCTCTTATGTCTTCCACCATTATCTCTCTCTCCAGTTGCCG
CCTTGTCGATTTCATTACCGTGTTAAATTCCATGTATGAAGCACGCATGGAGAGCCATTG
CTGATCCATTAGCTTGAAGGCAATGCAATAAAGAAGGTCAAACGCATATTCATTCACCGA
AAGGAATCTCAAAAATGTTTCGCCAACAATACTCCGTGGTTTCACTGCCTCAAGGACAAG
CATCTGGATAAGCATGAAGGTAATATTGATACCAGCAACGGCAAACGGGTATTCCCATAT
AGAACGAACCCCAACCTGCTTCCGCAGAAGGTCCTGGAAGCATTTCGGGAACCTCTTGGC
GAAGTACAACAAGTTTTCAAGAGATACGAAACCACCACCCCTAAAATCAGTAGATGGATC
TTTGCCCTGCCAACCCATTTCCTTCCACTGCTCAGATACAATCCCGTGTAGCTCTTCTTC
AGGGAAGGACAGTTTCCAAAGATCCTTCAGAGCTTCCTGATGCTGAAGAATTGAGCTGTC
AAATGCTACATCAATGCGGCTCTGCAACCTCTGCAAGCATTCCTCCTGAGCAGGTGTTAG
ATCAAAAGAAGGACGAGCGTCGCCATGACTTCCCTGAACACAAACACAGGAAAGGCCACG
TCCTAACCATGCCGCCGATCCCCCCACAGCCTCAGCAGAAGAAGAATGGTACACGTTTCC
TTTTTTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EP35JQ U 1
AF RR4G167JQ U 31
AF RR4G166JQ U 31
AF RR4EP35TF C 197
AF RR4EP36TF C 489
BS 1 49 RR4EP35JQ
BS 50 50 RR4G166JQ
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BS 188 679 RR4EP35JQ
BS 680 766 RR4G166JQ
BS 767 972 RR4EP35TF

RD RR4EP35JQ 679 0 0
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AATGTTTATTGAAAGCACTACAAATTAAAAAAACTAACCCCATAAGGAAACAAAACCTCA
ACTTCTGTTCTTCCTTTTTTTTGCTGGTTTGGCTTTGTTTTAGGCTTTTGATGAAGTGGT
TTCTTGAGGTGTTAGATCTTTCTACTTACAGAGTAGTCTTTCGTAACTGAAAAGGCTGTA
TGATGGCATATCTTCAATACCTCTTATGTCTTCCACCATTATCTCTCTCTCCAGTTGCCG
CCTTGTCGATTTCATTACCGTGTTAAATTCCATGTATGAAGCACGCATGGAGAGCCATTG
CTGATCCATTAGCTTGAAGGCAATGCAATAAAGAAGGTCAAACGCATATTCATTCACCGA
AAGGAATCTCAAAAATGTTTCGCCAACAATACTCCGTGGTTTCACTGCCTCAAGGACAAG
CATCTGGATAAGCATGAAGGTAATATTGATACCAGCAACGGCAAACGGGTATTCCCATAT
AGAACGAACCCCAACCTGCTTCCGCAGAAGGTCCTGGAAGCATTTCGGGAACCTCTTGGC
GAAGTACAACAAGTTTTCAAGAGATACGAAACCACCACCCCTAAAATCAGTAGATGGATC
TTTGCCCTGCCAACCCATT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4G167JQ 657 0 0
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GGCTTTGTTTTAGGCTTTTGATGAAGTGGTTTCTTGGGGTGTTAGATCTTTCTACTTACA
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TTCCACCATTATCTCTCTCTCCAGTTGCCGCCTTGTCGATTTCATTACCGTGTTAAATTC
CATGTATGAAGCACGCATGGAGAGCCATTGCTGATCCATTAGCTTGAAGGCAATGCAATA
AAGAAGGTCAAACGCATATTCATTCACCGAAAGGAATCTCAAAAATGTTTCGCCAACAAT
ACTCCGTGGTTTCACTGCCTCAAGGCCAAGCATCTGGATAAGCATGAAGGTAATATTGAT
ACCAGCAACAGCAAACGGGTATTCCCATACAGAACGAACCCCAACCTGCTTCCGCAGAAG
GTCCTGGAAGCATTTCGGGAACCTCTTGGCGAAGTACAACAAGTTTTCAAGAGATACGAA
ACCACCACCCCTAAAATCAATAGATGGATCTTTGCCCTGCCAACCCATTTCCTTCCA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4G166JQ 736 0 0
CTTATTAGCCCAAAAACGAACTAACCAAACAATGTTTATTGAAAGCACTACAAATTAAAA
AAACTAACCCCATAAGGAAACAAAACCTCAACTTCTGTTCTTCCTTTTTTTTGCTGGTTT
GGCTTTGTTTTAGGCTTTTGATGAAGTGGTTTCTTGGGGTGTTAGATCTTTCTACTTACA
GAGTAGTCTTTCGTAACTGAAAAGGCTGTATGATGGCATATCTTCAATACCTCTTATGTC
TTCCACCATTATCTCTCTCTCCAGTTGCCGCCTTGTCGATTTCATTACCGTGTTAAATTC
CATGTATGAAGCACGCATGGAGAGCCATTGCTGATCCATTAGCTTGAAGGCAATGCAATA
AAGAAGGTCAAACGCATATTCATTCACCGAAAGGAATCTCAAAAATGTTTCGCCAACAAT
ACTCCGTGGTTTCACTGCCTCAAGGCCAAGCATCTGGATAAGCATGAAGGTAATATTGAT
ACCAGCAACAGCAAACGGGTATTCCCATACAGAACGAACCCCAACCTGCTTCCGCAGAAG
GTCCTGGAAGCATTTCGGGAACCTCTTGGCGAAGTACAACAAGTTTTCAAGAGATACGAA
ACCACCACCCCTAAAATCAATAGATGGATCTTTGCCCTGCCAACCCATTTCCTTCCACTG
CTCAGATACAATCCCGTGTAGCTCTTCTTCAGGGAAGGACAGTTTCCAAAGATCCTTCAG
AGCTTCCTGATGCTGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4EP35TF 776 0 0
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ATACCTCTTATGTCT*CCACCATTATCTCTCTCTCCAGTTGCCGCCTTGTCGATTTCATT
ACCGTGTTAAATTCCATGTATGAAGCACGCATGGAGAGCCATTGCTGATCCATTAGCTTG
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GTTTCGCCAACAATACTCCGTGGTTTCACTGCCTCAAGGACAAGCATCTGGATAAGCATG
AAGGTAATATTGATACCAGCAACGGCAAACGGGTATTCCCATATAGAACGAACCCCAACC
TGCTTCCGCAGAAGGTCCTGGAAGCATTTCGGGAACCTCTTGGCGAAGTACAACAAGTTT
TCAAGAGATACGAAACCACCACCCCTAAAATCAGTAGATGGATCTTTGCCCTGCCAACCC
ATTTCCTTCCACTGCTCAGATACAATCCCGTGTAGCTCTTCTTCAGGGAAGGACAGTTTC
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CGGCTCTGCAACCTCTGCAAGCATTCCTCCTGAGCAGGTGTTAGATCAAAAGAAGGACGA
GCGTCGCCATGACTTCCCTGAACACAAACACAGGAAAGGCCACGTCCTAACCATGCCGCC
GATCCCCCCACAGCCTCAGCAGAAGAAGAATGGTACACGTTTCCTTTTTTTTCTCC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4EP36TF 484 0 0
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CCCCAACCTGCTTCCGCAGAAGGTCCTGGAAGCATTTCGGGAACCTCTTGGCGAAGTACA
ACAAGTTTTCAAGAGATACGAAACCACCACCCCTAAAATCAGTAGATGGATCTTTGCCCT
GCCAACCCATTTCCTTCCACTGCTCAGATACAATCCCGTGTAGCTCTTCTTCAGGGAAGG
ACAGTTTCCAAAGATCCTTCAGAGCTTCCTGATGCTGAAGAATTGAGCTGTCAAATGCTA
CATCAATGCGGCTCTGCAACCTCTGCAAGCATTCCTCCTGAGCAGGTGTTAGATCAAAAG
AAGGACGAGCGTCGCCATGACTTCCCTGAACACAAACACAGGAAAGGCCACGTCCTAACC
ATGCCGCCGATCCCCCCACAGCCTCAGCAGAAGAAGAATGGTACACGTTTCCTTTTTTTT
CTCC

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DS 



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CGTCGTCGTCGGATAAACTCAGTCGCCGCCTAAACGCCGGCGACACTTGGAAGAGAGGGA
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AGGAAACGTGTACCATTCTTCTTCTTCTGCTGAGGTTGTGGGGGGATCGGCGGCATGGTT
AGGACGTGGCCTTTCCTGTGTTTGTGTTCAGGGAAGTCATGGCGACGCTCGTCCTTCTTT
TGATCTAACACCTGCTCAGGAGGAATGCTTGCAGAGGTTGCAGAGCCGCATTGATGTAGC
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CCCTGAAGAAGAGCTACACGGGATTGTATCTGAGCAGTGGAAGGAAATGGGTTGGCAGGG
CAAAGATCCATCTATTGATTTTAGGGGTGGTGGTTTCGTATCTCTTGAAAACTTGTTGTA
CTTCGCCAAGAGGTTCCCGAAATGCTTCCAGGACCTTCTGCGGAAGCAGGTTGGGGTTCG
TTCTGTATGGGAATACCCGTTTGCTGTTGCTGGTATCAATATTACCTTCATGCTTATCCA
GATGCTTGGCCTTGAGGCAGTGAAACCACGGAGTATTGTTGGCGAACATTTTTGAGATTC
CTTTCGTGATGAATATGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G167TF U 1
AF RR4G166TF U 1
BS 1 676 RR4G166TF
BS 677 677 RR4G167TF
BS 678 739 RR4G166TF

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CGTCGTCGTCGGATAAACTCAGTCGCCGCCTAAACGCCGGCGACACTTGGAAGAGAGGGA
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AGGACGTGGCCTTTCCTGTGTTTGTGTTCAGGGAAGTCATGGCGACGCTCGTCCTTCTTT
TGATCTAACACCTGCTCAGGAGGAATGCTTGCAGAGGTTGCAGAGCCGCATTGATGTAGC
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GATGCTTGGCCTTGAGGCAGTGAAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4G166TF 739 0 0
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CGTCGTCGTCGGATAAACTCAGTCGCCGCCTAAACGCCGGCGACACTTGGAAGAGAGGGA
GATGGATGATAGAGGAGGCTCGTTCGTGGCGGTGAGGCGGATATCACAAGGTCTAGAACG
AGGAAACGTGTACCATTCTTCTTCTTCTGCTGAGGTTGTGGGGGGATCGGCGGCATGGTT
AGGACGTGGCCTTTCCTGTGTTTGTGTTCAGGGAAGTCATGGCGACGCTCGTCCTTCTTT
TGATCTAACACCTGCTCAGGAGGAATGCTTGCAGAGGTTGCAGAGCCGCATTGATGTAGC
ATTTGACAGCTCAATTCTTCAGCATCAGGAAGCTCTGAAGGATCTTTGGAAACTGTCCTT
CCCTGAAGAAGAGCTACACGGGATTGTATCTGAGCAGTGGAAGGAAATGGGTTGGCAGGG
CAAAGATCCATCTATTGATTTTAGGGGTGGTGGTTTCGTATCTCTTGAAAACTTGTTGTA
CTTCGCCAAGAGGTTCCCGAAATGCTTCCAGGACCTTCTGCGGAAGCAGGTTGGGGTTCG
TTCTGTATGGGAATACCCGTTTGCTGTTGCTGGTATCAATATTACCTTCATGCTTATCCA
GATGCTTGGCCTTGAG*CAGTGAAACCACGGAGTATTGTTGGCGAACATTTTTGAGATTC
CTTTCGTGATGAATATGCG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 6

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ATATTCTTTCTTTGAGTTGCCCAAATATATGTTCTCTGTTTACCATTAGAGGTCTTAATG
AGTAAAAATGAAAAA*GGTGTGTGTTTAACGTAGACAGAGCATAACAGAAAGGAGCTAAA
CGGAAGTCGGAAGACTCCTACTGCTCTCGTTTTCATTCTTGAATATCATATAATCTCATC
AGTCAAGCTTCTCCAGTTCTGACATCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGCTTGTTTCTTGAA
GCTCTCCAGCAAGAATGAATTCATCCAGTATTAAGTACACCTTGTGGAAGTTGAAAACCA
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ATTCAAGGTAAGCCAACTCATTGTCTGTTATGTCAACGCACAATGAGAAAAACAACCCAG
CATATCGCCTGTATATAACCTTATGCGTTCTAAACTCAACGAAATTGGTGAACTTTGAGT
CGCGATTGACCACCAATCTATGAACCTCGTATTCAACCTTGTGTTTCTCGGACTCTTCGA
GAGGAACATAGTACTTTGCAAGACGAGTCTTGCCCTGTCTGTTCTGCAATAATATGAACC
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TTCAAGTCATTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H180JQ U 1
AF RR4G995JQ U 1
AF RR4DD36JQ U 13
AF RR4F817JQ U 24
AF RR4F817TF C 169
AF RR4G995TF C 68
BS 1 52 RR4G995JQ
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BS 742 794 RR4G995TF

RD RR4H180JQ 629 0 0
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AGTAAAAATGAAAAA*GGTGTGTGTTTAACGTAGACAGAGCATAACAGAAAGGAGCTAAA
CGGAAGTCGGAAGACTCCTACTGCTCTCGTTTTCATTCTTGAATATCATATAATCTCATC
AGTCAAGCTTCTCCAGTTCTGACATCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGCTTGTTTCTTGAA
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CGCGATTGACCACCAATCTATGAACCTCGTATTCAACCTTGTGTTTCTCGGACTCTTCGA
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QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4G995JQ 689 0 0
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ATATTCTTTCTTTGAGTTGCCCAAATATATGTTCTCTGTTTACCATTAGAGGTCTTAATG
AGTAAAAATGAAAAA*GGTGTGTGTTTAACGTAGATAGAGCATAACAGAAAGGAGCTAAA
CGGAAGTCGGAAGACTCCTACTGCTCTCGTTTTCATTCTTGAATATCATATAATCTCATC
AGTCAAGCTTCTCCAGTTCTGACATCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGCTTGTTTCTTGAA
GCTCTCCAGCAAGAATGAATTCATCCAGTATTAAGTACACCTTGTGGAAGTTGAAAACCA
AATCAAGCTCACAGACATTGCTGAAGAAATGGTCCAAAATCTCAACGAACAAGTGGATGC
ATTCAAGGTAAGCCAACTCATTGTCTGTTATGTCAACGCACAATGAGAAAAACAACCCAG
CATATCGCCTGTATATAACCTTATGCGTTCTAAACTCAACGAAATTGGTGAACTTTGAGT
CGCGATTGACCACCAATCTATGAACCTCGTATTCAACCTTGTGTTTCTCGGACTCTTCGA
GAGGAACATAGTACTTTGCAAGACGAGTCTTGCCCTGTCTGTTCTGCAATAATATGAACC
TGATCATTTTTCCCGGAATCACAACAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

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CT
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AAGGTGTGTGTTTAAGGTTGACAGAGCATAACAGAAAGGAGCTAAACGGAAGTCGGAAGA
CTCCTACTGCTCTCGTTTTCATTCTCGAATATCATATAATCTCATCAGTCAAGCTTCTCC
AGTTCTGGCATCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGCTTGTTTCTTGAAGCTCTCCAGCAAGA
ATGAATTCATCCAGTATTAAGTACACCTTGTGGAAGTTGAAAACCAAATCAAGCTCACAG
ACATTGCTGAAGAAATGGTCCAAAATCTCAACGAACAAGTGGATGCATTCAAGGTAAGCC
AACTCATTGTCTGTTATGTCAACGCACAATGAGAAAAACAACCCAGCGTATCGCCTGTAT
ATAACCTTATGCGTTCTAAACTCGACGAAATTGGTGAACTTCGAGTCACGATTGACCACC
AATCTATGAACCTCGTATTCAACCTTGTGTTTCTCGGACTCCTCGAGAGGAACATAGTAC
TTTGCAAGACGAGTCTTGCCCTGTCTGTTCTGCAATAATATGAACCTGATCATTTTTCCC
GGAAT

QA 3 667 3 667
DS 

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C
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ATATATGTTCTCTGTTTACCATTAAAGGTCTTAATGAGTAAAAATGAAAAA*GGTGTGTG
TTTAACGTAAACAGAGCATAACAGAAAGGAGCTAAACGGAAGTCGGAAGACTCCTACTGC
TCTCGTTTTCATTCTTGAATATCATATAATCTCATCAGTCAAGCTTCTCCAGTTCTGACA
TCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGCTTGTTTCTTGAAGCTCTCCAGCAAGAATGAATTCAT
CCAGTATTAAGTACACCTTGTGGAAGTTGAAAACCAAATCAAGCTCACAGACATTGCTGA
AAAAATGGTCCAAAATCTCAACGAACAAGTGGATGCATTCAAGGTAAGCCAACTCATTGT
CTGTTATGTCAACGCACAATGAGAAAAACAACCCAGCATATCGCCTGTATATAACCTTAT
GCGTTCTAAACTCAACGAAATTGGTGAACTTTGAGTCGCGATTGACCACCAATCTATGAA
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GAGTCTTGCCCTGTCTGTTCTGCAATAATATGAACCTGATCATTTTTCCCGGAATCACAA
CAAAAGAAAACGCATCCGAGGTTCCGTGAGATCTTCGGCAGCTTTGCGGGTTCGCCC
CC

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DS 

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TATAATCTCATCAGTCAAGCTTCTCCAGTTCTGACATCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGC
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AGTTGAAAACCAAATCAAGCTCACAGACATTGCTGAAGAAATGGTCCAAAATCTCAACGA
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AAAACAACCCAGCATATCGCCTGTATATAACCTTATGCGTTCTAAACTCAACGAAATTGG
TGAACTTTGAGTCGCGATTGACCACCAATCTATGAACCTCGTATTCAACCTTGTGTTTCT
CGGACTCTTCGAGAGGAACATAGTACCTTGCAAGACGAGTCTTGCCCTGTCTGTTCTGCA
ATAATATGAACCTGATCATTTTTCCCGGAATCACAACAAAAGAAAACGCATCCGAGGTTC
CGTGAGATCTTCGGCAGCTTTGCGGGTTCGCCC
CC

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DS 

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ATGAAAAA*GGTGTGTGTTTAACGTAGATAGAGCATAACAGAAAGGAGCTAAACGGAAGT
CGGAAGACTCCTACTGCTCTCGTTTTCATTCTTGAATATCATATAATCTCATCAGTCAAG
CTTCTCCAGTTCTGACATCCTCTCAATGATCGCCCGCTTGCTTGTTTCTTGAAGCTCTCC
AGCAAGAATGAATTCATCCAGTATTAAGTACACCTTGTGGAAGTTGAAAACCAAATCAAG
CTCACAGACATTGCTGAAGAAATGGTCCAAAATCTCAACGAACAAGTGGATGCATTCAAG
GTAAGCCAACTCATTGTCTGTTATGTCAACGCACAATGAGAAAAACAACCCAGCATATCG
CCTGTATATAACCTTATGCGTTCTAAACTCAACGAAATTGGTGAACTTTGAGTCGCGATT
GACCACCAATCTATGAACCTCGTATTCAACCTTGTGTTTCTCGGACTCTTCGAGAGGAAC
ATAGTACTTTGCAAGACGAGTCTTGCCCTGTCTGTTCTGCAATAATATGAACCTGATCAT
TTTTCCCGGAATCACAACAAAAGAAAACGCGTCCGAGGTTCCGTGAGATCTTCGGCAGCT
TTGCGGGTTCGCCCAATTAACACTTTTGGGAATCCTCAATTTAATTAAATATTTTCAAGT
CATTTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 7

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GCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCC
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GAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTC
GTCAAAAACTTCCAGAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCCATTTCCACAAC
GATCTCGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTC
AAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCTGTTGAT
TTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATGCC
ATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTTGGCTCTACT
TTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAA
CTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCTGAGACTCGTTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 10 10 

AF RR4CH01TF U 48
AF RR4BK03JQ C 1
AF RR4BK03TF U 1
AF RR4A741JQ C 34
AF RR4A741TF U 34
AF RR4CH01JQ C 59
AF RR4C410TF U 107
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TCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGACGTCACAGATCG
CGTTATCTCCGTCGTCAAAAA

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR4BK03JQ 652 0 0
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ATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTTGGCTCTACT
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GC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4BK03TF 652 0 0
GGGATTCTAATTCTAGGGTTGTCTTTTATTTCATTTCTTCTGCAACACATAGCGATGGCG
GCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCC
ACAACAATCGGCGCTAGATAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCCTTCTTCGTCGTTTCTCG
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GATCTCGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTC
AAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCTGTTGAT
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ATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTTGGCTCTACT
TTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAA
CTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCTGAGACTCGTT
GC

QA 1 650 1 650
DS 

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AC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4A741TF 619 0 0
TTTCTTCTGCAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTC
AACGTCAATCCATCACTACTAAACCCCACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCT
TTCGCCGTCCTTCTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCT
GATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAGATAGTCGATCCCTCAAAG
GTAACACCGAAAGCCCATTTCCACAACGATCTCGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAA
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TGCATCTGAGACTCGTT
AC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4CH01JQ 595 0 0
CGGCGAGAAATGCTCTCCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACC
CCACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCCTTTTTCGTCGTTTCT
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TCGTCAAAAACTTCCAAAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCCATTTCCACA
ACGATCTCGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAAT
TCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCTGTTG
ATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATG
CCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTT*GGCTCTA
CTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGA
AACTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATTTGAGACTCGTTGCG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4C410TF 543 0 0
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TTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGACGTCACATATC
GCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAAAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAG
CTCATTTCCACAACGATCTCGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGATGGCAT
TGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCG
ATCAAGCTGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTC
TTCAGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTT
TTTT*GGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGA
GGTCTTTCCTGAAATTTTGTGGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCTGAGACT
CGT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 2 6

CO CL1231Contig1 1405 2 6 U
GGAGAATACAATACACAGAAACAAAGAAAGAGTTTTGATTGGTTAGCTAAGAAAAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAAGAAAAAAAGCAGCTTTGGAAAATGGATTTGACACGTCCCTCTTCTG
GTCATGATCAAGCAGAGGATCCACTCGAGATTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCATG
AGAGCCGAGCATCTAAAATGTTCGGGAAAGTAAAGGCAAAAGCTAAGAAGTTGAAGAACA
GACTTACTAACCATGGTGATGATGAGCAAGAAGCTCAGGATCTAGTGGACGAAGAAGAAG
ATGAATCTGACGAGGCAGAGCCAGAGCCAGAGAAGCATGTCTCACCAGTTACCAATGTGA
GAAGCTATAGAACGAGTCAACCTGAGTCTTTGACTCATCCGACGACAGAGGAGATCATTC
CTTCAGGGACGAAGGGTTCTTCAACTGATTACACTGGAATCGTCGAACCTGAACCATTAC
GAGATGCTAGTACTTACGAACATGAGGCACCGTCTTATCCTGTAAGAACATCAGACGTGT
CGGAGGACAGGGAAGAGAGCAGAGGAGAGACTCATCACGTGCCACTGAAGACTCCCGTGT
CTCTGCTCTCCGCAACAGAGGATGAGACAAGTCCTGGTGAAGATGGGTTAATCGGTGGTC
AACGGGAAGTCAACACTGATATGCCCAAAAGATTCGAGGACGATCTGAGTGGTGGTGAAT
CTACTTATTATCACACCCAACAAGGGAGTGGGGAAGCTGGAGAAGAGGATCAGAAGAAGT
CAGGACTAGGAACTGAGCTGGCGTCCGAATCTGGAACAAAAAAGGATTGGCCAGAAACAG
AGCTCTTCGGTAAAGATCTTCCGACAAGAAGCTTCGAATCTGAAATCAGCAACGATCCGC
CACCGACAGTTTTTGGCGGGAAACCAGAAACTGTGCCGGGGGATGATTTTCCAGCGAGAA
GCCATGACTATGATCAGAAGATCGAATTTGGGAACGATGGTGGAAAGCTAGGAACTGATG
AGCTGAGTGAAGATTTTCCGGCGAAGAGCCTTGAATTTGAACAGACGGTGGGATCTGAGA
TCGGCGAGGATAACGGCGCGGGAAAAGCAGGAACTGAGCGGAGGGAAGATTTTTTGGGGA
AAAGCTATGAGTTCGATCAGGAGATTGAATCTGCATTCGGCAATGATTCTCCCACGAGAC
TTCCCCGAAGACGAAAATCTTCCGACAAGAAGTGATGATGATACGAAAGTCGAGATTGGG
TTGGGAAGAGACTTGTCGACAGAAACAATAACTGATGATCACTTCTCACCAGAATTTTCT
GGTCCGAAAGAGAGAGATGATGAGACAGACAAGAGTGAAGCCCACCCCTACTCAGAGATG
ATGGGTCAGCGACCGAACTGCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC93TF U 1
AF RR4BT14TF U 707
BS 1 742 RR4BC93TF
BS 743 743 RR4BT14TF
BS 744 763 RR4BC93TF
BS 764 764 RR4BT14TF
BS 765 771 RR4BC93TF
BS 772 1405 RR4BT14TF

RD RR4BC93TF 771 0 0
GGAGAATACAATACACAGAAACAAAGAAAGAGTTTTGATTGGTTAGCTAAGAAAAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAAGAAAAAAAGCAGCTTTGGAAAATGGATTTGACACGTCCCTCTTCTG
GTCATGATCAAGCAGAGGATCCACTCGAGATTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCATG
AGAGCCGAGCATCTAAAATGTTCGGGAAAGTAAAGGCAAAAGCTAAGAAGTTGAAGAACA
GACTTACTAACCATGGTGATGATGAGCAAGAAGCTCAGGATCTAGTGGACGAAGAAGAAG
ATGAATCTGACGAGGCAGAGCCAGAGCCAGAGAAGCATGTCTCACCAGTTACCAATGTGA
GAAGCTATAGAACGAGTCAACCTGAGTCTTTGACTCATCCGACGACAGAGGAGATCATTC
CTTCAGGGACGAAGGGTTCTTCAACTGATTACACTGGAATCGTCGAACCTGAACCATTAC
GAGATGCTAGTACTTACGAACATGAGGCACCGTCTTATCCTGTAAGAACATCAGACGTGT
CGGAGGACAGGGAAGAGAGCAGAGGAGAGACTCATCACGTGCCACTGAAGACTCCCGTGT
CTCTGCTCTCCGCAACAGAGGATGAGACAAGTCCTGGTGAAGATGGGTTAATCGGTGGTC
AACGGGAAGTCAACACTGATATGCCCAAAAGATTCGAGGACGATCTGAGTGGTGGTGAAT
CTACTTATTATCACACCCAACAGGGGAGTGGGGAAGCTGGAGACGAGGATC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4BT14TF 699 0 0
GAGTGGTGGTGAATCTACTTATTATCACACCCAACAAGGGAGTGGGGAAGCTGGAGAAGA
GGATCAGAAGAAGTCAGGACTAGGAACTGAGCTGGCGTCCGAATCTGGAACAAAAAAGGA
TTGGCCAGAAACAGAGCTCTTCGGTAAAGATCTTCCGACAAGAAGCTTCGAATCTGAAAT
CAGCAACGATCCGCCACCGACAGTTTTTGGCGGGAAACCAGAAACTGTGCCGGGGGATGA
TTTTCCAGCGAGAAGCCATGACTATGATCAGAAGATCGAATTTGGGAACGATGGTGGAAA
GCTAGGAACTGATGAGCTGAGTGAAGATTTTCCGGCGAAGAGCCTTGAATTTGAACAGAC
GGTGGGATCTGAGATCGGCGAGGATAACGGCGCGGGAAAAGCAGGAACTGAGCGGAGGGA
AGATTTTTTGGGGAAAAGCTATGAGTTCGATCAGGAGATTGAATCTGCATTCGGCAATGA
TTCTCCCACGAGACTTCCCCGAAGACGAAAATCTTCCGACAAGAAGTGATGATGATACGA
AAGTCGAGATTGGGTTGGGAAGAGACTTGTCGACAGAAACAATAACTGATGATCACTTCT
CACCAGAATTTTCTGGTCCGAAAGAGAGAGATGATGAGACAGACAAGAGTGAAGCCCACC
CCTACTCAGAGATGATGGGTCAGCGACCGAACTGCTGAT

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL1231Contig2 941 4 10 U
GGTCGAACTAATTATTAGATCTACCTAATCCAACTATATAACCAATTCATGATCGGATAC
GGTCCAACCATCGGATCAGTCCAGTTTTAAAAACAAAGGTTTTAAACACACAAATAAGGA
TTACATCACATCAAAATACATTCAAGTGACAACACAAAGACACCAACAACACAAATATGA
TTTAGTAGCAAAACCCAAATCTCAGTTCCCAAATTCTCAAAGTTGCTTCTGAACTGCCAC
ATCTCCGGTAGTACTGCCTGTCCCGCTCTCACCAGAATCCGAAAATCCTTTAGTCCCAAC
GGTGGAGCTAATTGGTTGTGATGATGACTCTTCAACTGAATTTGGAGATTTAGGCTTCTC
ACTCCTCCGTACCACCGAGCCAATAATTGTACACCCCTTTAATCGTCCCCACTATTCCTC
CTCCTTCTCCTCCTTTCCCTTCCTCTTCAACCGTCTCCTCCGGTAACTTGTCGGAAGGAA
TCTTCTCCACGACTACTTCCTCCTTTATTGTTGTCTGCTTCTCTCCTCCAAGATTAAGTT
TCTCGGCGACCATATCAGAAAAGGCTTTGTCTTCTTCTTCTTCAAGTGTCAGCTTCTCCT
CCAGATGATCTCTAGTCGGCACAAATATGTCTTCCTCTTGTTTTGTCTCATCCGCTTCAC
GTCTTCCATCGCCAGAGAAAGACAATTTCGTCGTCACAGGTGATGCAGTTTCTTTGACAT
TTTCGTCGTCAGTAGTAGCCAACTTATCAGCAGTTTCGGTCGCTGAACCAATCATCTCTG
AGTAGGTGGTGGGTTTCACCTCTTGTCTTGTCTCATCATCTCTCTCTTTCGGACCAGAAA
ATTCTGGTGAGAAGTGATCATCAGTTATTGTTTCTGTCGACAAGTCTCTTCCCAACCCAA
TCTCGACTTTCGCATCATCATCACTTCTTGTCGGAAGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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C

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C

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BQ
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10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AA

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TGACGTAAACAACATCTTATTAATACGATGACTACTACAGAACCTCAAGCCTGGCTAACA
TGAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAATACACACAAAACAGATAGT
AATCCTCAATAACAAGACCCTTGCAATACGTTAACTTATTCTTCAGAGGATTCAGGATTT
GGATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTGGAAATCCCGGCTTAAG
AAAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATC
GATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAA
AGACCACACGTAGTATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACT
CAAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTGTTCCAACTGCGACGTC
ATTGTGTAAGTCTCCA
C

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4FI31JQ 658 0 0
GACGTAAACAACATCTTATTAATACGATGACTACTACAGAACCTCAAGCCTGGCTAACAT
GAATGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAATACACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAATAACAAGACCCTTGCAATACGTTAACTTATTCTTCAGAGGATTCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCACACGTAGTATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACTC
AAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTGTTCCAACTGCGACGTCA
TTGTGTAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGGTCT
CCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAAAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCCACCGGCAGGCTTGCTACCAATCTTGTATCCATCCACAGTCTTACTTTCCCACT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4C256JQ 771 0 0
TCGTT
GACGTAAACAACATCTTATTAATACGATGACTACTACAGAACCTCAAGCCTGGCTAACAT
GAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAATACACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAATAACAAGACCCTTGCAATACGTTAACTTATTCTTCAAAGGATCCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCACACGTAGTATCCAGTAACTTTAAC**TGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACTC
AAAAAATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTGTTCCAACTGCGACGTCA
TTGTGTAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGGTCT
CCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAAAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCCACCGGCAGGCTTGCTACCAATCTTGTATCCATCCACAGTCTTACTTTCCCACTGA
ACAAGGGAGTCGGTCGTCCAACTCGGGTTCTTGGAATCACCTGTCTTCATATTAGCACCA
AACAATGATGTATAATAATTCATTCCGACAAAATCTGCAGAGTTCT

QA 6 771 6 771
DS 

RD RR4AJ43JQ 874 0 0
GCT
GACGTAAACAACATCTTATTAATACGATGACTACTACAGAACCTCAAGCCTGGCTAACAT
GAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAATACACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAATAACAAGACCCTTGCAATACGTTAACTTATTCTTCAGAGGATTCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCACATGTAGTATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACTC
AAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTGTTCCAACTGCGACGTCA
TTGTGTAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGGTCT
CCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAAAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCCACCGGCAGGCTTGCTACCAATCTTGTATCCATCCACAGTCTTACTTTCCCACTGA
ACAAGGGAGTCGGTCGTCCAACTCGGGTTCTTGGAATCACCTGTCTTCATATTAGCACCA
AACAATGATGTATAATAATTCATTCCGACAAAATCTGCAGAGTTCTTTAGGATTCTCTTT
TCAGCTTCAGTGAACTTTGGCAATCTATGACCAATGCGATCCTTCATCGACTGTGGATAG
TCTCCGTAAGTTGTTGGATGCAAATGCCATC

QA 4 874 4 874
DS 

RD RR4FI31TF 682 0 0
AGAGGATTCAGGATTTGGATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTG
GAAATCCCGGCTTAAGAAAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCA
AATTGTTTTGGAAATCGATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACT
CAAAGTTGTCCATCAAAGACCACACGTAGTATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATA
TGGCTTCATGCAAACTCAAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTG
TTCCAACTGCGACGTCATTGTGTAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAA
TCATAATTTCTGGGTCTCCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAAAGCTTCCTCATTCCTC
TTGAATACACATCCAGTTTCCCACCGGCAGGCTTGCTACCAATCTTGTATCCATCCACAG
TCTTACTTTCCCACTGAACAAGGGAGTCGGTCGTCCAACTCGGGTTCTTGGAATCACCTG
TCTTCATATTAGCACCAAACAATGATGTATAATAATTCATTCCGACAAAATCTGCAGAGT
TCTTTAGGATTCTCTTTTCAGCTTCAGTGAACTTTGGCAATATATGACCAATGCGATCCT
TCATCGACTGTGGATAGTCTCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4C256TF 676 0 0
AAAGACCACACGTAGTATCCAGTA*CTTTAAC**TGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAA
CTCAAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTGTTCCAACTGCGACG
TCATTGTGTAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGG
TCTCCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAAAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCC
AGTTTCCCACCGGCAGGCTTGCTACCAATCTTGTATCCATCCACAGTCTTACTTTCCCAC
TGAACAAGGGAGTCGGTCGTCCAACTCGGGTTCTTGGAATCACCTGTCTTCATATTAGCA
CCAAACAATGATGTATAATAATTCATTCCGACAAAATCTGCAGAGTTCTTTAGGATTCTC
TTTTCAGCTTCAGTGAACTTTGGCAATCTATGACCAATGCGATCCTTCATCGACTGTGGA
TAGTCTCCGTAAGTTGTTGGATGCAAATGCCATCCCAGGATGAAAGTGAAAGTGTCCCAC
ATGCTTGGACCTCTGCAGCCTTCATCAACAGCTCCTTCAACCTGAAACGCTGCGGTTGCG
GTTCCCCAAAGGAAACCTTCAGGAAAGCTAGCTCTGCTAAACTTCTCTTTCACTCTAAAC
ACTGGTTGAGTTAATT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 7

CO CL1233Contig1 581 7 6 U
GGATTTTACAAAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATT
TGCAACCCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAA
AGCCTTCTCTTCATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAA
CGGAGCATCAGGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAA
CGTGGTGGGGTTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGG
GAAGAGCTTGACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAAC
TCCTCCAGCACTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTT
CATCTGTCTCACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAG
ATAAACCATTTCTCGTTGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTG
TAATATTAATTATTACTCAAAACTAAGCTTTATTCCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4GU40JQ C 1
AF RR4CY09TF U 9
AF RR4DD64JQ C 13
AF RR4GU40TF U 25
AF RR4DZ36JQ C 9
AF RR4DD64TF U 13
AF RR4DZ36TF U 9
BS 1 10 RR4GU40JQ
BS 11 153 RR4CY09TF
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BS 371 581 RR4CY09TF

RD RR4GU40JQ 569 0 0
GGATTTTACAAAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATT
TGCAACCCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAA
AGCCTTCTCTTCATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAA
CGGAGCATCAGGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAA
CGTGGTGGGGTTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGG
GAAGAGCCTGACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAAC
TCCTCCAGCACTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTT
CATCTGTCTCACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAG
ATAAACCATTTCTCGTTGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTG
TAATATTAATTATTACTCAAAACTAAGCT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4CY09TF 573 0 0
GG
AAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACCCCA
TCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCT
TCATCCTTTCTAAAACCAACATTGAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGCATCA
GGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGG
TTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTG
ACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCAGCG
CTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTC
ACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAACCATT
TCTCGTTGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTAAT
TATTACTCAAAACTAAGCTTTATTCCTTTGC

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR4DD64JQ 545 0 0
GGAT
GGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGTAACAGCATTTGCAACCCCATCGACG
GTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTTTTTTCATCC
TTTTTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTTTGAGAGTCAACGGAGCATCAGGAGGA
AGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTTAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGGTTTGGA
CTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTGACGGGT
CTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCGGCACTCACT
TCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTCACCTTC
GGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAACCATTTCTCGT
TGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTAATTATTAC
G

QA 5 544 5 544
DS 

RD RR4GU40TF 557 0 0
AGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACCCCATCGACGGTGATAGG
TCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCTTCATCCTTTCTAAA
ACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGCATCAGGAGGAAGATTCAC
TTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGGTTTGGACTGATCGG
ATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCCTGACGGGTCTCTTTTT
CGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCAGCACTCACTTCACAGTT
CTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTCACCTTCGGACAAAT
CGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAACCATTTCTCGTTGTCCCAT
TTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTAATTATTACTCAAAACT
AAGCTTTATTCC
TTTGC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4DZ36JQ 568 0 0
GA
AAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACCCCA
TCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCT
TCATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGCATCA
GGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGG
TTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTG
ACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCAGCA
CTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTC
ACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAACCATT
TCTCGTTGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTAAT
TATTACTCAAAACTAAGCTTTATTCC

QA 3 568 3 568
DS 

RD RR4DD64TF 545 0 0
GGAT
GGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGTAACAGCATTTGCAACCCCATCGACG
GTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCTTCATCC
TTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGCATCAGGAGGA
AGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTTAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGGTTTGGA
CTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTGACGGGT
CTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCGGCACTCACT
TCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTCACCTTC
GGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAACCATTTCTCGT
TGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTAATTATTAC
G

QA 5 544 5 544
DS 

RD RR4DZ36TF 568 0 0
GA
AAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACCCCA
TCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCT
TCATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGCATCA
GGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGG
TTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTG
ACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCAGCA
CTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTC
ACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAACCATT
TCTCGTTGTCCCATTTGTAATACATCTTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTAAT
TATTACTCAAAACTAAGCTTTATTCC

QA 3 568 3 568
DS 



AS 1 7

CO CL1234Contig1 943 7 6 U
GTTTAAACTATAGTACTTTTAACAATCAAAGTGCCTTGTCACATTCTTATTGCCAGATAA
TATATACATCAGCTTAATCCATACAAGTCACATTATTGGCTTTTCTATGCACATACCAAG
CCCACAAAACACAATTAAGTGCAAAAAAAAAA**CTCCTGGCGTTCAGAAGAAAAAAGTT
CAACAAAAACGTTCAATTTAAAAGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATAT
TCAGTAATTCACACCTAATGGTGAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAAC
GAATCTCCCTTTCATTCGAGGTCGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTAT
CTTCTTCGAGAACAATCTCGTCCTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCT
TCCTCCATCCCCAAACCCAGTTGATGGTAAACATCCACCAACGTAATGCTTATGATGACT
TTCTCCTCCATTTATTTCCATGGAAACAACTGGCTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTC
TGGTGGCTCTCCCGATGTCCACGGTGGACCTTGGCCTCCCCAAGTGGATATCACCGAGTC
ATAGTTTAAGCTCAGCATTAGAACATTCTTTTGCTCTTCCTCCTTCACTTTAATACATTT
AACATTCTTTATTGCCTCTTCTTCGTATGTGTTGTGTGACTCGTGATCAAACCTCAGCTC
AAACGCCACAGTTCCATCCCCATCGTCCCGATCCTCACCGCAGCCTATTCCCATCTTCAT
AGCTTTTGTTTCTTCTCCTTCATCTTCTTCTATCTCGTCTTTTTCGATTTTGAACATCTC
TGTATTAGACAACCCTAGCCCCTCCATCGCATAAGACTCTGTGACGTCTAACCCGTGGCC
GAGTAGAGTCTCCACGTCAGCAGCAACTCTCAGCTCCATGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE26TF C 1
AF RR4BE26JQ U 1
AF RR4CT95JQ U 22
AF RR4CT95TF C 154
AF RR4A227JQD U 22
AF RR4A227JQ U 22
AF RR4A227TFB C 69
BS 1 79 RR4BE26JQ
BS 80 80 RR4A227JQ
BS 81 170 RR4BE26JQ
BS 171 171 RR4A227JQ
BS 172 542 RR4BE26JQ
BS 543 943 RR4A227JQ

RD RR4BE26TF 458 0 0
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TATATACATCAGCTTAATCAATACAAGTCACATTATTGGCTTTTCTATGCACATACCAAG
CCCACAAAACACAATTAAGTGCAAAAAAAAAA**CTCCTGGCGTTCAGAAGAAAAAAGTT
CAACAAAAACGTTCAATTTAAAAGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATAT
TCAGTAATTCACACCTAATGGTGAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAAC
GAATCTCCCTTTCATTCGAGGTCGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTAT
CTTCTTCGAGAACAATCTCGTCCTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCT
TCCTCCATCCCCAAACCCAGTTGATGGTAAACATCCAC

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DS 

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TATATACATCAGCTTAATCAATACAAGTCACATTATTGGCTTTTCTATGCACATACCAAG
CCCACAAAACACAATTAAGTGCAAAAAAAAAA**CTCCTGGCGTTCAGAAAAAAAAAGTT
CAACAAAAACGTTCAATTTAAAAGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATAT
TCAGTAATTCACACCTAATGGTGAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAAC
GAATCTCCCTTTCATTCGAGGTCGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTAT
CTTCTTCGAGAACAATCTCGTCCTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCT
TCCTCCATCCCCAAACCCAGTTGATGGTAAACATCCACCAACGTAATGCTTATGATGACT
TTCTCCTCCATTTATTTCCATGGAAACAACTGGCTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTC
TG
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4CT95JQ 783 0 0
G
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AAAAAAAAAAAACTCCTGGCGTTCAGAAGAAAAAAGTTCAACAAAAACGTTCAATTTAAA
AGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATATTCAGTAATTCACACCTAATGGT
GAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAACGAATCTCCCTTTCATTCGAGGT
CGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCTTCGAGAACAATCTCGTC
CTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCTTCCTCCATCCCCAAACCCAGTT
GATGGTAAACATCCACCAACGTAATGCTTATGATGACTTTCTCCTCCGTTTATTTCCATG
GAAACAACTGGCTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTCTGGTGGCTCTCCCGATGTCCAC
GGTGGACCTTGGCCTCCCCAAGTGGATATCACCGAGTCATAGTT*AAGCTCAGCATTAGA
ACATTCTTTTGCTCTTCCTCCTTCACTTTAATACATTCAACATTCTTTATTGCCTCTTCT
TCGTATGTGTTGTGTGACTCGTGATCAAACCTCAGCTCAAACGCCACAGTTCCATCCCCA
TCGTCCCGATCCTCACCGCAGCCTATTCCCATCTTCATAGCTTTTGTTTCTTCTCCTTCA
TC

QA 2 783 2 783
DS 

RD RR4CT95TF 678 0 0
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AGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAACGAATCTCCCTTTCATTCGAGGTCGTTTCTCTGC
ATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCTTCGAGAACAATCTCGTCCTCCTCTTCTC
TCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCTTCCTCCATCCCCAAACCCAGTTGATGGTAAACA
TCCACCAACGTAATGCTTATGATGACTTTCTCCTCCGTTTATTTCCATGGAAACAACTGG
CTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTCTGGTGGCTCTCCCGATGTCCACGGTGGACCTTG
GCCTCCCCAAGTGGATATCACCGAGTCATAGTT*AAGCTCAGCATTAGAACATTCTTTTG
CTCTTCCTCCTTCACTTTAATACATTCAACATTCTTTATTGCCTCTTCTTCGTATGTGTT
GTGTGACTCGTGATCAAACCTCAGCTCAAACGCCACAGTTCCATCCCCATCGTCCCGATC
CTCACCGCAGCCTATTCCCATCTTCATAGCTTTTGTTTCTTCTCCTTCATCTTCTTCTAT
CTCGTCTTTTTCGATTTT

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DS 

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CAAAAAAAAA***CTCCTGGCGTTCAGAAGAAAAAAGTTCAACAAAAACGTTCAATTTAA
AAGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATATTCAGTAATTCACACCTAATGG
TGAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAACGAATCTCCCTTTCATTCGAGG
TCGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCTTCGAGAACAATCTCGT
CCTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCTTCCTCCATCCCCAAACCCAGT
TGATGGTAAACATCCACCAACGTAATGCTTATGATGACTTTCTCCTCCATTTATTTCCAT
GGAAACAACTGGCTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTCTGGTGGCTCTCCCGATGTCCA
CGGTGGACCTTGGCCTCCCCAAGTGGATATCACCGAGTCATAGTTTAAGCTCAGCATTAG
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TTCGTATGTGTTGTGTGACTCGTGATCAAACCTCAGCTCAAACGCCACAGTTCCATCCCC
ATCGTCCCGATCCTCACCGCAGCCTATTCCCATCTTCATAGCTTTTGTTTCTTCTCCTTC
ATCTTCTTCTATCTCGTCTTTTTCGATTTTGAACATCTCTGTATTAGACAACCCTAGCCC
CTCCATCGCATAAGACTCTGTGACGTC

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DS 

RD RR4A227JQ 922 0 0
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TACAAGTCACATTATTGGCTTTTCTATGCACATACCAAGCCCACAAAACACAATTAAGTG
CAAAAAAAAA***CTCCTGGCGTTCAGAAGAAAAAAGTTCAACAAAAACGTTCAATTTAA
AAGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATATTCAGTAATTCACACCTAATGG
TGAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAACGAATCTCCCTTTCATTCGAGG
TCGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCTTCGAGAACAATCTCGT
CCTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCTTCCTCCATCCCCAAACCCAGT
TGATGGTAAACATCCACCAACGTAATGCTTATGATGACTTTCTCCTCCATTTATTTCCAT
GGAAACAACTGGCTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTCTGGTGGCTCTCCCGATGTCCA
CGGTGGACCTTGGCCTCCCCAAGTGGATATCACCGAGTCATAGTTTAAGCTCAGCATTAG
AACATTCTTTTGCTCTTCCTCCTTCACTTTAATACATTTAACATTCTTTATTGCCTCTTC
TTCGTATGTGTTGTGTGACTCGTGATCAAACCTCAGCTCAAACGCCACAGTTCCATCCCC
ATCGTCCCGATCCTCACCGCAGCCTATTCCCATCTTCATAGCTTTTGTTTCTTCTCCTTC
ATCTTCTTCTATCTCGTCTTTTTCGATTTTGAACATCTCTGTATTAGACAACCCTAGCCC
CTCCATCGCATAAGACTCTGTGACGTCTAACCCGTGGCCGAGTAGAGTCTCCACGTCAGC
AGCAACTCTCAGCTCCATGTCG

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DS 

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ACACAATTAAGTGCAAAAAAAAA***CTCCTGGCGT*CAGAAGAAAAAAGTTCAACAAAA
ACGTTCAATTTAAAAGGTAAAGTGAGATATAGCCGGCAGATAGCTAGGATATTCAGTAAT
TCACACCTAATGGTGAATTTGCAGCAGATAGAGCAAGTGAAGCTCTCTTAACGAATCTCC
CTTTCATTCGAGGTCGTTTCTCTGCATTCAGTTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCTTCG
AGAACAATCTCGTCCTCCTCTTCTCTCTGTACCTGGAAACCCTAGCCTCTCTTCCTCCAT
CCCCAAACCCAGTTGATGGTAAACATCCACCAACGTAATGCTTATGATGACTTTCTCCTC
CATTTATTTCCATGGAAACAACTGGCTTGTCACTGATGTCTATGTCTCGTTCTGGTGGCT
CTCCCGATGTCCACGGTGGACCTTGGCCTCCCCAAGTGGATATCACCGAGTCATAGTTTA
AGCTCAGCATTAGAACATTCTTTTGCTCTTCCTCCTTCACTTTAATACATTTAACATTCT
TTATTGCCTCTTCTTCGTATGTGTTGTGTGACTCGTGATCAAACCTCAGCTCAAACGCCA
CAGTTCCATCCCCATCGTCCCGATCCTCACCGCAGCCTATTCCCATCTTCATAGCTTTTG
TTTCTTCTCCTTCATCTTCTTCTATCTCGTCTTTTTCGATTTTGAACATCTCTGTATTAG
ACAACCCTAGCCCCTCCATCGCATAAGACTCTGTGACGTCTAACCCGTGGCCGAGTAGAG
TCTCCACGTCAGCAGCAA
ACTCCTCAAGCTC

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DS 



AS 1 6

CO CL1235Contig1 1180 6 10 U
CAATAGTTGTGTTATTATATTAAGAAGAGAAAGAAAAAAACTAATTGACAGACTAGACAG
AATATTCTCAGAAACATAAGACAGATTAGTCATAGAATTTAAACATTAACAGCAAAATAA
AATAAAATAAAAAA*GCACAAAGACATAACTAACTGCAAAGCTGTCTAAATCCCATTAAG
ACTACACAATCAAAAGCCTTTTTGGTTCTTCTTCTCCCTTCTCCTCACAACTGTGAAAAC
TTTATCCTCTTTCACAGTCCCTACTGTTATTACCACTTTCATTCAAGCTCTCATCTTCTT
GCTGGTACTGCAAGTCGGACACTTGTAGTGTTTGATGTGCTCAGCCTTGGCGGGTGTGAT
CTTCACGCATTTTCCATGGAACCATTTCTCACAAGCATCACAACATATCCAGAAGTCATC
ATAGTTCTCTCCACACGCACCACAAACCGCACCTTGTTCATCATCTTCCTCATCTTCTCC
GCTCTCATCATCTTCTCTTGGTGGTGGAGGCATCTTTGAAGCCTTGGTGTGAGACTCAGA
TTGACGAGGCTTGACACCACTAGGTTTGCTTCTGCTACTGTTGTTGTGGTTAGCAGATTG
GTCTTTCGATTGCTTTGCATTGCCAGTTATAACCTCGAAAAGGGTTGGGAGATCATTTAT
CATCTGGAAAAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGGGCACCGAAGTAAAA
GGCAACAGAGATGAGCCAAGAGTCACTGTGGACAGCAACCAAAGTAATCCAGTCTTTTTC
AGGCATTCCGTTCCTTGCAAAGTTGATGCCTAAAGCTGGTTCAGGAAGCTCGGGAGGGAC
CTCATCGACAGGAAGGTTAACCTCCCATGTCTCGTTAGGAAGTCCATAAAGACACAAGTT
TTCCTTGTCAGGGTCACACTGGAGGTAAAACTGCTGCCCATCTGATGTGAGAGCCTTGAG
GAGACCAGCTCTACGACCCTTAAAGTCGCTAAACACCTCTTCGACAGTGCGGTGGATAGG
ATTCTGTATTCCCTCCATATCAATACGAATCAGCTTCGTTCGGAAAATCACGCCGGCGGT
GAGAGACTGCGTCTGAGAAGAGAAAAGCCAAGATCGGCTTTTTTTTTTCTTTTCCCTTTG
GAGAGCAAATTTGTTTACTTTGTTTTTCGGACAGAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ46JQ U 69
AF RR4G196JQ U 34
AF RR4G493JQ U 1
AF RR4DQ50JQ U 36
AF RR4G493TF C 429
AF RR4G196TF C 527
BS 1 133 RR4G493JQ
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RD RR4EZ46JQ 195 0 0
CG
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AAAAAGCACAAAGACATAACTAACTGCAAAGCTGTCTAAATCCCATTAAGACTACACAAT
CAAA*GCCTTTTTGGTTCTTCTTCTCCCTTCTCCTCACAACTGTGAAAACTTTATCCTCT
TTCACAGTCCCTA

QA 3 195 3 195
DS 

RD RR4G196JQ 544 0 0
AA
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CCCTTCTCCTCACAACTGTGAAAACTTTATCCTCTTTCACAGTCCCTACTGTTATTACCA
CTTTCATTCAAGCTCTCATCTTCTTGCTGGTACTGCAAGTCGGACACTTGTAGTGTTTGA
TGTGCTCAGCCTTGGCGGGTGTGGTCTTCACGCATTTTCCATGGAATCATTTCTCACAAG
CATCACAACATATCCAGAAGTCATCATAGTTCTCTCCACACGCACCACAAACCGCACCTT
GTTCATCATCTTCCTCATCTTCTCCGCTCTCATCATCTTCTCTTGGTGGTGGA**CATCT
TTGAAGCCTTGGTGTGAGACTCAGATTGACGAGGCTTGACACCACTAGGTTTGCTTCTGC
TA

QA 3 544 3 544
DS 

RD RR4G493JQ 762 0 0
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AATAAAATAAAAAG*GCACAAAGACATAACTAACTGCAAAGCTGTCTAAATCCCATTAAG
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TTTATCCTCTTTCACAGTCCCTACTGTTATTACCACTTTCATTCAAGCTCACATCTTCTT
GCTGGTACTGCAAGTCGGACACTTGTAGTGTTTGATGTGCTCAGCCTTGGCGGGTGTGAT
CTTCACGCATTTTCCATGGAACCATTTCTCACAAGCATCACAACATATCCAGAAGTCATC
ATAGTTCTCTCCACACGCACCACAAACCGCACCTTGTTCATCATCTTCCTCATCTTCTCC
GCTCTCATCATCTTCTCTTGGTGGTGGAGGCATCTTTGAAGCCTTGGTGTGAGACTCAGA
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GTCTTTCGATTGCTTTGCATTGCCAGTTATAACCTCGAAAAGGGTTGGGAGATCATTTAT
CATCTGGAAAAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGGGCACCGAAGTAAAA
GGCAACAGAGATGAGCCAAGAGTCACTGTGGACAGCAACCAA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4DQ50JQ 698 0 0
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GCAAAGCTGTCTAAATCCCATTAAGACTACACAATCAAAAGCCTTTTTGGTTCTTCTTCT
CCCTTCTCCTCACAACTGTGAAAACTTTATCCTCTTTCACAGTCCCTACTGTTATTACCA
CTTTCATTCAAGCTCTCATCTTCTTGCTGGTACTGCAAGTCGGACACTTGTAGTGTTTGA
TGTGCTCAGCCTTGGCGGGTGTGATCTTCACGCATTTTCCATGGAACCATTTCTCACAAG
CATCACAACATATCCAGAAGTCATCATAGTTCTCTCCACACGCACCACAAACCGCACCTT
GTTCATCATCTTCCTCATCTTCTCCGCTCTCATCATCTTCTCTTGGTGGTGGAGACATCT
TTGAAGCCTTGGTGTGAGACTCAGATTGACGAGGCTTGACACCACTAGGTTTGCTTCTGC
TACTGTTGTTGTGGTTAGCAGATTGGTCTTTCGATTGCTTTGC*****CAGTTATAACCT
CGAAAAGGGTTGGGAGATCATTTATCATCTGGAAAAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAA
ACCCGAAACGGGCACCGAAGTAAAAGGCAACAGAGATG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4G493TF 752 0 0
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CATCTTCTCTTGGTGGTGGAGGCATCTTTGAAGC*TTGGTGTGAGACTCAGATTGACGAG
GCTTGACACCACTAGGTTTGCTTCTGCTACTGTTGTTGTGGTTAGTAGATTGGTCTTTCG
ATTGCTTTGCATTGCCAGTTATAACCTCGAAAAGGGTTGGGAGATCATTTATCATCTGGA
AAAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGGGCACCGAAGTAAAAGGCAACAG
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CAGGGTCACACTGGAGGTAAAACTGCTGCCCATCTGATGTGAGAGCCTTGAGGAGACCAG
CTCTACGACCCTTAAAGTCGCTAAACACCTCTTCGACAGTGCGGTGGATAGGATTCTGTA
TTCCCTCCATATCAATACGAATCAGCTTCGTTCGGAAAATCACGCCGGCGGTGAGAGACT
GCGTCTGAGAAGAGAAAAGCCAAGATCGGCTTTTTTTTT*CTTTTCCCTTTGGAGAGCAA
ATTTGTTTACTTTGTTTTTCGGACAGAGACCC

QA 1 752 1 752
DS 

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TGGTTAGCAGATTGGTCTTTCGATTGCTTTGCATTGCCAGTTATAACCTCGAAAAGGGTT
GGGAGATCATTTATCATCTGGAAAAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGG
GCACCGAAGTAAAAGGCAACAGAGATGAGCCAAGAGTCACTGTGGACAGCAACCAAAGTA
ATCCAGTCTTTTTCAGGCATTCCGTTCCTTGCAAAGTTGATGCCTAAAGCTGGTTCAGGA
AGCTCGGGAGGGACCTCATCGACAGGAAGGTTAACCTCCCATGTCTCGTTAGGAAGTCCA
TAAAGACACAAGTTTTCCTTGTCAGGGTCACACTGGAGGTAAAACTGCTGCCCATCTGAT
GTGAGAGCCTTGAGGAGACCAGCTCTACGACCCTTAAAGTCGCTAAACACCTCTTCGACA
GTGCGGTGGATAGGATTCTGTATTCCCTCCATATCAATACGAATCAGCTTCGTTCGGAAA
ATCACGCCGGCGGTGAGAGACTGCGTCTGAGAAGAGAAAAGCCAAGATCGGCTTTTTTTT
TTCTTTTCCCTTTGGAGAGCAAATTTGTTTACTTTGTTTTTCGGAC
AC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 2 7

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A230JQD U 1
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AF RR4AL35JQ U 1
AF RR4A230TFB C 1
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DS 

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TATGTTTCCCGGTATCACATTCTCTCCTCCGAACTTCTTGACACCGAGATTCTTGGGCTT
AGAGTCACGTCCATTCTTGGTGGAACCGGCGGTTTTCTTAGTAGCCCAACGCTTTAACAC
CAAACTCAACCCACTTGAAGAACAATCGGAGATGCCACTGCCACCGTAAGCAGGAACCTC
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CATTTTTGTGCAGAAATCAGAAATTTTCGACTCCAGTACACTGCGACCGGTGATCC

QA 1 656 1 656
DS 

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TATGTTTCCCGGTATCACATTCTCTCCTCCGAACTTCTTGACACCGAGATTCTTGGGCTT
AGAGTCACGTCCATTCTTGGTGGAACCGGCGGTTTTCTTAGTAGCCCAACGCTTTAACAC
CAAACTCAACCCACTTGAAGAACAATCGGAGATGCCACTGCCACCGTAAGCAGGAACCTC
GGTGATAAGTTCCCTCAAACTAACTCTTCTGCATAAGGATGCTGCTGAGTTTAAGAAATT
CATTTTTGTGCAGAAATCAGAAATTTTCGACTCCAGTACACTGCGACCGGTGATCC

QA 1 656 1 656
DS 



CO CL1236Contig2 736 2 4 U
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TTTGTCAGATAACATCTTCTGTTGACTAGAAGATTGTGATACTTGTACCTTAGAACAGCA
AACAATCAATTCAATAACATCTGCTGTTTTGTCTCTCTCTTTAGTAGTACAACAATGTAT
CCAGTACTCTCCTCGC


BQ
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AACAATCAATTCAATAACATCTGCTGTTTTGTCTCTCTCTTTAGTAGTACAACAATGTAT
CCAGTACTCTCCTCGC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 7

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BQ
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AF RR4EO13TF C 661
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BS 683 706 RR4EO13JQ
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BS 870 1353 RR4E231TF
BS 1354 1359 RR4EO13TF

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GGAAACTTACTCGAGCAAGATGAAAAAAGAAGTTGAAAACGAAAACATCACAAATTCAAT
TTCTTAGATGTAATTTATAGGGACTCAATAGAACTCGTAACCGCGACTTGCTGACGAGCT
AGAGTCGCTGGCTTGGATGGTGGCTGACGTTGTAGGTAACCAAACTTCCCTCATAGGTTC
ATCGACTGGGTAAACAACGAGCTAGCGTACATTCATTGGTTGGATCACATTTGGATCGAC
TCCGAAAAGAAGATGACCAAAACTCTCTTGTGCCTTCTCGGTATTGTGACGCCCATCGAA
AAATAAGTAAGATCGTTGGTACTCACATAGCTTGGAGTGCACGTTAGGTAAACCGCAACC
GTAAGCATTGTGTGTCCCAACACCGCAGCACGATGCATTTGTCACGAAAAACCTGTAGTT
GAAGCCTCTCTGCGTCCTACGAAGAATGACACTGTAGAAATCGAAGACGGTAAATTGGAA
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AGCCAAATTGTTGAGAACTTCGTGGCATTGATCCATTCCTGTTTTGTAATCTTGTCTGAC
TATAGGTAAGCAACCTAATGGT
C

QA 1 682 1 682
DS 

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G
ACTCTCTAATCAGTCCAATACGTGGTAAGAGTTACAATGATCGATCTTTTATTATAGAGG
GAAACTTACTCGAGCAAGATGAAAAAAGAAGTTGAAAACGAAAACATCACAAATTCAATT
TCTTAGATGTAATCTATAGGGACTCAATAGAACTCGTAACCGCGACTTGCTGACGAGCTA
GAGTCGCTGGCTTGGATGGTGGCTGACGTTGTAGGTAACCAAACTTCCCTCATAGGTTCA
TCGACTGGGTAAACAACGAGCTCGCGTACATTCATTGGTTGGATCACATTTGGATCGGCT
CCGAAAAGAAGATGACCAAAACTCTCTTGTGCCTTCTCGGTATTGTGACGCCCATCGAAG
AATAAGTAAGATCGTTGGTACTCACATAGCTTGGAGTGCACGTTAGGTAAACCGCAACCG
TAAGCATTGTGTGTCCCAACACCGCAGCACGATGCATTTGTCACGAAAAACCTGTAGTTG
AAGCCTCTCTGCGTCCTACGAAGAATGACACTGTAGAAATCGAAGACGGTAAATTGGAAA
CCAGGAGTTGTTCGGGCCATTTCGTTCAACATCGGTCCGATTTTTTCGTTGTGTTGTTTA
GCCAAATTGTTGAGAACTTCGTGGCATTGATCCATTCCTGTTTTGTAATCATGTCTGACT
ATAGGTAAGCAACCTAATGGTGCTAGGGTTTGGATCACAAATTTA

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DS 

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C
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GTAGGTAACCAAACTTCCCTCATAGGTTCATCGACTGGGTAAACAACGAGCTCGCGTACA
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GCCTTCTCGATATTGTGACGCCCATCGAAAAATAAGTAAGATCGTTGGTACTCACATAGC
TTGGAGTGCACGTTAGGTAAACCGCAACCGTAAGCATTGTGTGTCCCAACACCGCAGCAC
GATGCATTTGTCACGAAAAACCTGTAGTTGAAGCCTCTCTGCGTCCTACGAAGAATGACA
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ATCGGTCCGATTTTTTCGTTGTGTTGTTTAGCCAAATTGTTGAGAACTTCGTGGCATTGA
TCCATTCCTGTTTTGTAATCTTGTCTGACTATAGGTAAGCAACCTAATGGTGCTAGGGTT
TGGATCACAAATTTACTAGCTCCTGATGAATACAACAAGCTGATATCATTCTTTAACTTG
TTGGTCACCGAAGTGACGAAAGCTTGTTGAGC

QA 2 753 2 753
DS 

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C
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GTTGAAAACGAAAACATCACAAATTCAATTTCTTAGATGTAATTTATAGGGACTCAATAG
AACTCGTAACCGCGACTTGCTGACGAGCTAGAGTCGCTGGCTTGGATGGTGGCTGACGTT
GTAGGTAACCAAACTTCCCTCATAGGTTCATCGACTGGGTAAACAACGAGCTCGCGTACA
TTCATTGGTTGGATCACATTTGGATCGGCTCCGAAAAGAAGATGACCAAAACTCTCTTGT
GCCTTCTCGATATTGTGACGCCCATCGAAGAATAAGTAAGATCGTTGGTACTCACATAGC
TTGGAGTGCACGTTAGGTAAACCGCAACCGTAAGCATTGTGTGTCCCAACACCGCAGCAC
GATGCATTTGTCACGAAAAACCTGTAGTTGAAGCCTCTCTGCGTCCTACGAAGAATGACA
CTGTAGAAATCGAAGACGGTAAATTGGAAACCAGGAGTTGTTCGGGCCATTTCGTTCAAC
ATCGGTCCGATTTTTTCGTTGTGTTGTTTAGCCAAATTGTTGAGAACTTCGTGGCATTGA
TCCATTCCTGTTTTGTAATCTTGTCTGACTATAGGTAAGCAACCTAATGGTGCTAGGGTT
TGGATCACAAATTTACTAGCTCCTGATGAATACAACAAGCTGATATCATTCTTTAACTTG
TTGGTCACCGAAGTGACGAAAGCTTGTTGAGCAGAAGCATCGGCGTTAGGGTTGTTCTTG
GTGAAATTCAAGTAGTCGTTAGCACCAACGTATATCATAAACACTGACTTCTTGATAA
GTCATC

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DS 

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C*TGATGAATACAACAAGCTGATATCATTCTTTAACTTGTTGGTCAC*GAAGTGACGAAA
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TTCATTTGATTAAATTTCCGCACTTGTTGACTTAGAGTCAAAGATTCAACCGGAGCTCCG
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TGGGCAACGTTTGCTGTGGTGAGAGTCTGTTTGTTTCCGGCGTCGAAGTCGGAGTCACCG
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TAGTGAGTGAGAGAGGAGGAAAGTAAGAGAGAATATTGCTT
CC

QA 12 712 12 712
DS 

RD RR4DT42TF 707 0 0
TATC
TGTCTGACTATAGGTAAGCAAC*TAATGGTGCTAGGGTTTGGATCACAAATTTACTAGCT
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GCTTGTTGAGCAGAAGCATCGGCGTTAGGGTTGTTCTTGGTGAAATTCAAGTAGTCGTTA
GCACCAACGTATATCATAAACACTGACTTCTTGATAAAGTCATCATTCCAGTTTGCTGCT
TTCATTTGATTAAATTTCCGCACTTGTTGACTTAGAGTCAAAGATTCAACCGGAGCTCCG
AGAAGCGTAGCATCAGCAACGGCGAGACTAGCTCCACGTGAGACATTGACGTTCGGTTTA
AGGGCCGCCGGGATTGGGATTGGTATCCCCATGAATTTTGCGACGAAGTCAGGAGCGATG
AAACCGTCGGAGAATTTCCCGTTAGGATCATCTCTGGATTTACCGTACGGCCAGAAACCT
TGGGCAACGTTTGCTGTGGTGAGAGTCTGTTTGTTTCCGGCGTCGAAGTCGGAGTCACCG
AACGTGAACAAAGCCACCGCCGGGATATTTTGACCGGAGACGGTGAGCGGGTTGTGTAGC
AGCGTCAATACCAAAACTACCCCTAGAACACTCGCTAAAATGCACTTGCCTGCCATTGTA
TAGTGAGTGAGAGAGGAGGAAAGTAAGAGAGAATATTGCTT
CC

QA 5 705 5 705
DS 

RD RR4EO13TF 699 0 0
TATAGGTAAGCAAC*TAATGGTGCTAGGGTTTGGATCACAAATTTACTAGCTC*TGATGA
ATACAACAAGCTGATATCATTCTTTAACTTGTTGGTCACCGAAGTGACGAAAGCTTGTTG
AGCAGAAGCATCGGCGTTAGGGTCGTTCTTGGTGAAATTCAAGTAGTCGTTAGCACCAAC
GTATATCATAAACACTGACTTCTTGATAAAGTCATCATTCCAGTTTGCTGCTTTCATTTG
ATTAAATTTCCGCACTTGTTGACTTAGAGTCAAAGATTCAACCGGAGCTCCGAGAAGCGT
AGCATCAGCAACGGCGAAACTAGCTCCACGTGAGACATTGACGTTCGGTTTAAGGGCCGC
CGGGATTGGGATTGGTATCCCCATGAATTTTGCGACGAAGTCAGGAGCGATGAAACCGTC
GGAGAATTTCCCGTTAGGATCATCTCTGGATTTACCGTACGGCCAGAAACCTTGGGCAAC
GTTTGCTGTGGTGGGAGTCTGTTTGTTTCCGGCGTCGAAGTCGGAGTCACCGAACGTGAA
CAAAGCCACCGCCGGGATATTTTGACCGGAGACGGTGAGCGGGTTGTGTAGCAGCGTCAA
TACCAAAACTACCCCTAGAACACTCGCTAAAATGCACTTGCCTGCCATTGTATAGTGAGT
GAGAGAGGAGGAAAGTAAGAGAGAATATTGCTTGTGTCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 6

CO CL1238Contig1 1075 6 7 U
GGAGGATTAAAGTCCACGTCGGCATCGTACACTTCTGCCTTTACGAATGCACTTCCCGCA
GTCACCTTCATTCTCGCCCTCATTTTCAGGCTTGAGACAGTGAACTTTAGAAAGATACAT
AGTGTTGCAAAAGTGGTAGGAACGGTAATAACGTTGGCAGGAGCAATGGTGATGACTTTG
TACAAAGGTCCAGCCATCGAGATCGTGAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTCC
AACACGGCCACCGGCCAGCACTGGGTCACCGGAACTTTAGCCATCATGGGAAGTATCTCC
ACTTGGGCTGCTTTCTTTATTTTACAGTCGTTCACATTAAAAATTTATCCGGCTGAGTTA
TCCCTCGTGACGTTGATATGTGGGATTGGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGATA
TTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAAAATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGTT
TACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAA
CGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTC
GGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATC
GTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGAT
GAGAAAATTGTTGTAGCTCAAGAGCTTCCGATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGGT
CATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAATGGCGTGGCTACAAGTATCTAATCAGTCCCGAAG
AAAAAGAAAGATACAGAGACAAAGATGCATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTT
CTTGTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTTGTGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCTACTC
TTAAATCTTAGCATCTTTACTTATCTGTGTTTTTTCTGTTTCTACTTTCGTATATTTTGA
AATTCCAAGGCAAATGATGAATGGGTCATTTGATAAATATTTGAGCCTAGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL57TF U 1
AF RR4CK43TF U 464
AF RR4FQ51JQ C 484
AF RR4E369TF U 387
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AF RR4EL57JQ C 511
BS 1 693 RR4EL57TF
BS 694 694 RR4E369TF
BS 695 745 RR4EL57TF
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RD RR4EL57TF 745 0 0
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GTCACCTTCATTCTCGCCCTCATTTTCAGGCTTGAGACAGTGAACTTTAGAAAGATACAT
AGTGTTGCAAAAGTGGTAGGAACGGTAATAACGTTGGCAGGAGCAATGGTGATGACTTTG
TACAAAGGTCCAGCCATCGAGATCGTGAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTCC
AACACGGCCACCGGCCAGCACTGGGTCACCGGAACTTTAGCCATCATGGGAAGTATCTCC
ACTTGGGCTGCTTTCTTTATTTTACAGTCGTTCACATTAAAAATTTATCCGGCTGAGTTA
TCCCTCGTGACGTTGATATGTGGGATTGGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGATA
TTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAAAATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGTT
TACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAA
CGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTC
GGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATC
GTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGAAAA*GTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGAT
GAGAAAATTGTTGTAGCTCAAGAGC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4CK43TF 440 0 0
GCACACTGGCCGCAGTTTGCTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAA
GCATTGTGATTAAACAACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGG
TCATTACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAA
TCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGAAAAAGTAAAGACG
TGGTGAATCCATTGGATGAGAACATTGTTGTAGCTCAAGAGCTTCCGATCACTAACTCAG
TCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAATGGCGTGGCTACAAGTA
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GAAATTTTGATATCTTTCTT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4FQ51JQ 478 0 0
TCTGGAGTGGTTTGTTCGGTCATTGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAACGT
GGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTCGGT
GCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATCGTC
ATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGATGAG
AAAATTGTTGTAGCTCAAGAGCTTCCGATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGGTCAT
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AAGAAAGATACAGAGACAAAGATGCATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTTCTT
GTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTTGTGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCTACT
CC

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4E369TF 668 0 0
G
GGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGATATTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAAA
ATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGTTTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATT
GCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTT
AGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATC
CACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGG
GGAAAAAGTAAAGACGCGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATCGTTGTAGCTCAAGAGCTT
CCGATCACTAACCCAGTCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAAT
GGCGTGGCTACAAGTATCTAATCAGTCCCGAAGAAAAAGAAAGATACAGAGACAAAGATG
CATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTTCTTGTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTTG
TGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCTACTCTTAAATCTTAGCATCTTTACTTATCTG
TGTTTTTTCTGTTTCTACTTTCGTATATTTTGAAATTCCAAGGCAAATGATGAATGGGTC
ATTTGAT

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR4E369JQ 654 0 0
ACTTCGGCGTTTCGATGATATTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAAAATCGGCATGGACT
CTGGCACACTGGCCGCAGTTTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATAC
AAAGCATTGTGATTAAGCAACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTA
TGGTCATTACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTA
TAATCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGAAAAAGTAAAG
ACGCGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATCGTTGTAGCTCAAGAGCTTCCGATCACTAACC
CAGTCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAATGGCGTGGCTACAA
GTATCTAATCAGTCCCGAAGAAAAAGAAAGATACAGAGACAAAGATGCATCTCCTTTGGG
GTTGAAATTTTGATATCTTTCTTGTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTTGTGTCTTTTTACGT
TCTCTAATATTGCCCTACTCTTAAATCTTAGCATCTTTACTTATCTGTGTTTTTTCTGTT
TCTACTTTCGTATATTTTGAAATTCCAAGGCAAATGATGAATGGGTCATTTGAT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4EL57JQ 565 0 0
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CCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCAC
CTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGA
AAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATTGTTGTAGCTCAAGAGCTTCCG
ATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAATGGC
GTGGCTACAAGTATTTAATCAGTCCCGAAGAAAAAGAAAGATACAGAGACAAAGATGCAT
TTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTTCTTGTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTTGTGT
CTTTTTACGTTCTTTAATATTGCCCTACTTTTAAATTTTAGCATCTTTACTTATCTGTGT
TTTTTCTGTTTCTACTTTCGTATATTTTGAAATTCCAAGGCAAATGATGAATGGGTCATT
TGATAAATATTTGAGCCTAGTTTAC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 2 6

CO CL1239Contig1 964 4 10 U
AGGGTATGACTATGCCCGCATCCGAAAGGTGTGTAACAAGCAAAAAGCTGTGATGCTAGC
AGATATGGCACACATCAGTGGTTTGGTTGCTGCTGGTGTAATCCCTTCACCTTTCGACTA
TGCAGATGTTGTAACCACTACAACTCACAAGTCACTTCGTGGACCCCGTGGAGCCATGAT
TTTCTACAGAAAGGGTGTTAAGGAAGTTAACAAACAAGGGAAAGAGGTTTTGTATGATTT
TGAAGACAAGATCAACCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTCCACACAACCACAC
TATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGTACAAAGCATATCA
AGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGAGAAAGGGTATGA
GCTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAATCTGAAGCCCAAGGGAAT
TGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTCACATTGCATCAAACAAAAACAC
TGTTCCTGGAGATGTTTCTGCCATGGTTCCTGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCACT
CACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGACTTTGCTAAAGTTGCTGAATACTTTGACAAAGC
TGTGAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACCAAGCTGAAAGACTTTGT
GTCAGCAATGGAAGCTTCTTCAACCATTCAATCAGAGATTACCAAGCTGCGCCATGAAGT
AGAGGAATTTGCTAAACAGTTCCCAACAATTGGGTTCGAGAAAGAAACCATGAAGTACAA
GAACTAATAAATGTCTTCTCATACAAGTCTTTTACTATGCTTTGAACTTCCATGGAATGT
ATAGATGATATGATACATGTGCTCTATCTTATGCTATGAGAAAAAAATAATGAACGTTCT
ATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RR4EW77TF U 27
AF RR4DF95TF U 1
AF RR4EW77JQ C 113
AF RR4DF95JQ C 279
BS 1 226 RR4DF95TF
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BS 386 688 RR4DF95TF
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BS 897 897 RR4DF95JQ
BS 898 964 RR4EW77JQ

RD RR4EW77TF 593 0 0
G
GGTGTGTAACAAGCAAAAAGCTGTGATGCTAGCAGATATGGCACACATCAGTGGTTTGGT
TGCTGCTGGTGTAATCCCTTCACCTTTCGACTATGCAGATGTTGTAACCACTACAACTCA
CAAGTCACTTCGTGGACCCCGTGGAGCCATGATTTTCTACAGAAAGGGTGTTAAGGAAGT
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CCCTGGTCTTCAAGGTGGTCCACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAA
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TCTGGTTCTAGTGAATCTGAAGCCCAAGGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTT
GGAAGCTGTTCACATTGCATCAAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCTATGGT
TCCTGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCACTCACTTCCAGAGGCTTTGTT

QA 2 593 2 593
DS 

RD RR4DF95TF 688 0 0
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TGCAGATGTTGTAACCACTACAACTCACAAGTCACTTCGTGGACCCCGTGGAGCCATGAT
TTTCTACAGAAAGGGTGTTAAGGAAGTTAACAAACAAGGGAAAGAGATTTTGTATGATTT
TGAAGACAAGATCAACCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTCCACACAACCACAC
TATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGTACAAAGCATATCA
AGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCGAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGAGAAAGGGTATGA
GCTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAATCTGAAGCCCAAGGGAAT
TGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTCACATTGCATCAAACAAAAACAC
TGTTCCTGGAGATGTTTCTGCCATGGTTCCTGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCACT
CACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGACTTTGCTAAAGTTGCTGAATACTTTGACAAAGC
TGTGAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4EW77JQ 852 0 0
TTCGACTATGCAGATGTTGTAACCACTACAACTCACAAGTCACTTCGTGGACCCCGTGGA
GCCATGATTTTCTACAGAAAGGGTGTTAAGGAAGTTAACAAACAAGGGAAAGAGGTTTTG
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AACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAACCAGGCAACTACTTCAGAGTACAAA
GCATATCAAGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGAGAAA
GGGTATGAGCTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAATCTGAAGCCC
AAGGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTCACATTGCATCAAAC
AAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCTATGGTTCCTGGTGGAATCAGAATGGGTACA
CCTGCACTCACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGACTTTGCTAAAGTTGCTGAATACTTT
GACAAAGCTGTAAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACCAAGCTGAAA
GACTTTGTGTCAGCAATGGAAGCTTCTTCAACCATTCAATCAGAGATTACCAAGCTGCGC
CATGAAGTTGAGGAATTTGCTAAACAGTTCCCAACAATTGGGTTCGAGAAAGAAACCATG
AAGTACAAGAACTAATAAATGTCTTCTCATACAAGTCTTTTACTATGCTTTGAACTTCCA
TGGACTGTATAGATGATATGATACATGTGCTCTATCTTATGCTATGAGAAAAAAATAATG
AACGTTCTATGC

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4DF95JQ 686 0 0
AAGGTGGTCCACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTA
CTTCAGAGTACAAAGCATATCAAGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCGAAGTTTGCTCAGA
CTCTGATGGAGAAAGGGTATGAGCTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAG
TGAATCTGAAGCCCAAGGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTC
ACATTGCATCAAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCCATGGTTCCTGGTGGAA
TCAGAATGGGTACACCTGCACTCACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGACTTTGCTAAAG
TTGCTGAATACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGTTCAAG
GAACCAAGCTGAAAGACTTTGTGTCAGCAATGGAAGCTTCTTCAACCATTCAATCAGAGA
TTACCAAGCTGCGCCATGAAGTAGAGGAATTTGCTAAACAGTTCCCAACAATTGGGTTCG
AGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTAATAAATGTCTTCTCATGCAAGTCTTTTACTAT
GCTTTGAACTTCCATGGAATGTATAGATGATATGATACATGTGCTCTATCTTATGCTATG
AGAAAAAAATAATGAACGTTCTATGC

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL1239Contig2 825 2 2 U
AAAAGGTGAGTATGTTTCCCATATATCATAAGATGGAGTACATGTAGCATTATCTATACA
TTACATGGAAGTTGAAAGCATGTGATGATAATAATAAAGAGAAGACTTGTTTGTAGGATA
ATAAAGACAGACATATTCAGTTCTTGTACTTCATGGTTTCTTTCTCAAACCCAATAGTTG
GGAACTGCTTAGCGAACTCCTCCACGTCGTGGCGCAGCTTGGCTATCTCTGATTGGATGC
CTGAAGACGATTCCATTGCTGACACAAAATCTTTCAGCTTCGTTCCTTCAGCTTCAGATT
TGACTTTGAGAGCCAACTTCACAGCTTTGTCAAAGTATTCAGCTACTTTGGCAAAGTCTT
CCTCGACAAAACCTCTGGAAGTGAGAGCAGGTGTACCCATTCTGATTCCACCGGGAACCA
TGGCAGAAACATCTCCAGGGACAGTGTTTTTGTTGGATGCAATGTGAACAGCTTCCAACA
CTTTCTCAACTCTAGATCCATCAATTCCCTTGGGCTTCAAGTTCACTAGAACCAGATGGT
TGTCAGTTCCACCAGAAACAAGTTCATAACCTCTCTCCATCAGAGTCTGAGCAAACTTTG
CAGAGTTACTCAGGACTTGCTCTTGGTATGCTTTGTACTCTGAAGTAGTTGCCTGTTTTA
AAGCAACAGCTAGTCCTGTAATAGTGTGGTTGTGTGGACCACCTTGAAGACCAGGGAAGA
CAGCTTGATTGATCTTGTCTTCATAATCATACAAAACCTCTTTCCCTTGTTTGTTAATTT
CCTTAACACCCTTTCTGTAGAAAATCATGGCTCCACGAGGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW12JQ U 1
AF RR4EE68TF C 148
BS 1 468 RR4FW12JQ
BS 469 825 RR4EE68TF

RD RR4FW12JQ 468 0 0
AAAAGGTGAGTATGTTTCCCATATATCATAAGATGGAGTACATGTAGCATTATCTATACA
TTACATGGAAGTTGAAAGCATGTGATGATAATAATAAAGAGAAGACTTGTTTGTAGGATA
ATAAAGACAGACATATTCAGTTCTTGTACTTCATGGTTTCTTTCTCAAACCCAATAGTTG
GGAACTGCTTAGCGAACTCCTCCACGTCGTGGCGCAGCTTGGCTATCTCTGATTGGATGC
CTGAAGACGATTCCATTGCTGACACAAAATCTTTCAGCTTCGTTCCTTCAGCTTCAGATT
TGACTTTGAGAGCCAACTTCACAGCTTTGTCAAAGTATTCAGCTACTTTGGCAAAGTCTT
CCTCGACAAAACCTCTGGAAGTGAGAGCAGGTGTACCCATTCTGATTCCACCGGGAACCA
TGGCAGAAACATCTCCAGGGACAGTGTTTTTGTTGGATGCAATGTGAA

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4EE68TF 678 0 0
ACTTCATGGTT*CTTTCTCAAACCCAATAGTTGGGAACTGCTTAGCGAACTCCTCCACGT
CGTGGCGCAGCTTGGCTATCTCTGATTGGATGCCTGAAGACGATTCCATTGCTGACACAA
AATCTTTCAGCTTCGTTCCTTGAGCTTCAGATTTGACTTTGAGAGCCAACTTCACAGCTT
TGTCAAAGTATTCAGCTACTTTGGCAAAGTCTTCCTCGACAAAACCTCTGGAAGTGAGAG
CAGGTGTACCCATTCTGATTCCACCGGGAACCATGGCAGAAACATCTCCAGGGACAGTGT
TTTTGTTGGATGCAATGTGAACAGCTTCCAACACTTTCTCAACTCTAGATCCATCAATTC
CCTTGGGCTTCAAGTTCACTAGAACCAGATGGTTGTCAGTTCCACCAGAAACAAGTTCAT
AACCTCTCTCCATCAGAGTCTGAGCAAACTTTGCAGAGTTACTCAGGACTTGCTCTTGGT
ATGCTTTGTACTCTGAAGTAGTTGCCTGTTTTAAAGCAACAGCTAGTCCTGTAATAGTGT
GGTTGTGTGGACCACCTTGAAGACCAGGGAAGACAGCTTGATTGATCTTGTCTTCATAAT
CATACAAAACCTCTTTCCCTTGTTTGTTAATTTCCTTAACACCCTTTCTGTAGAAAATCA
TGGCTCCACGAGGTCCCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 7

CO CL1240Contig1 922 7 12 U
GGAGTTCATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAA
GACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTACAT
GGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTC
TCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGA
AACCGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTTCTG
TGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGA
ACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGT
GAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTT
GCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCG
TCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGC
AAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGC
TCTCTCTCTCTCCCTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAG
AGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCT
GCTCGTCTTTATTGACCATCTTTGCCGTATCCGTTTTACGAAAAATTGTATCGAGTCAGT
TCGATCATATATCTTCATGCGTACGTTTCTTTGTGAGCAACTAAGGAAACATAATAAGAG
TTGTTTATTGCTGCGTGGATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 20 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4FV40TF U 1
AF RR4FV40JQ C 378
AF RR4GL55TF U 56
AF RR4CB14TF U 11
AF RR4C810TF U 51
AF RR4CT45JQ C 169
AF RR4GL55JQ C 550
BS 1 678 RR4FV40TF
BS 679 789 RR4CB14TF
BS 790 792 RR4C810TF
BS 793 796 RR4CB14TF
BS 797 797 RR4C810TF
BS 798 816 RR4CB14TF
BS 817 817 RR4C810TF
BS 818 824 RR4CB14TF
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BS 826 843 RR4CB14TF
BS 844 918 RR4CT45JQ
BS 919 922 RR4GL55JQ

RD RR4FV40TF 678 0 0
GGAGTTCATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAA
GACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTACAT
GGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTC
TCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGA
AACCGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTTCTG
TGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGA
ACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGT
GAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTT
GCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCG
TCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGC
AAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGC
TCTCTCTCTCTCCCTTCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FV40JQ 395 0 0
AAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAG
CTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATC
ATCGCTTCCCCGTGGATTTTGACAACTATATCAAGGCAATGGGTCTTTTTGTGGGTGAAC
CGGTGTGGACCCCATACAATTGTCCACACGACCATTTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTG
ATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTTTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTCTCCCTTT
TAAAGAAACATGATTTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAGAGTATGCATGTGGAGAA
TGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAAT

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4GL55TF 731 0 0
GG
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CATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCAT
CTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTA
CGAAACCGATGAGGAGTTGAATA***TCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTT
CTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGA
GGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGA
TGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGT
CTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAAT
GCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCC
TGCAAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAG
AGCTCTCTCTCTCTCCCTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAA
GAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACAC
TCTGCTCGT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR4CB14TF 833 0 0
GG
ATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACGACGATGGG
TGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTACATGGATGATAGCCA
AGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAAACT
TGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCCGATCACTACGAAACCGATGAGGA
GTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCCC
TGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAGGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTTCACAC
TGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCAA
CGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGAAT
TTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGG
TGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGAATA
TGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTCTC
CCTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAGAGTATGCATGTG
GAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGCTCGTCTT**A
TGAC*ATCTTTGCCGTATCCGTTT*ACGAAAA*TTGTATCGAGTCAGTTCG

QA 3 833 3 833
DS 

RD RR4C810TF 800 0 0
GGATAAC
GAAGACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTA
CATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCAT
CTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTA
CGAAACCGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTT
CTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGA
GGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGA
TGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAAT***AGT
CTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAAT
GCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCC
TGCAAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAG
AGCTCTCTCTCTCTCCCTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAA
GAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACAC
TCTGCTCGTCTTTATTGACCATCTTTGCCGTATCCGTTTTACGAAAA*TTGTATCGAGTC
AGTTCG
ATCATAT

QA 8 793 8 793
DS 

RD RR4CT45JQ 751 0 0
AGAGTTCATCTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGC
TGATCACTACGAAACCGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTA
CATGGACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAG
TTTTTTCGAGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGG
CTACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAGCCTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGG
AATGATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATAT
CAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGA
CCATCTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACTCCTC
TGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTC**CCTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCC
TGCAATGAAGAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACT
TAATCACACTCTGCTCGTCTTTATTGACCATCTTTGCCGTATCCGTTTTACGAAAAATTG
TATCGAGTCAGTTCGATCATATATCTTCATGCGTACGTTTCTTTGTGAGCAACTAAGGAA
ACATAATAAGAGTTGTTTATTGCTGCGTGG
C

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4GL55JQ 373 0 0
GGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATTTTCCTGCAAGGAAAGA
ATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCT
CTCCCTTTTAAAGAAACATGATTTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAGAGTATGCAT
GTGGAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGCTCGTCTT
TATTGACCATTTTTGCCGTATCCGTTTTACGAAAAATTGTATCGAGTCAGTTCGATCATA
TATTTTCATGCGTACGTTTTTTTGTGAGCAACTAAGGAAACATAATAAGAGTTGTTTATT
GCTGCGTGGATAA

QA 1 373 1 373
DS 



AS 1 5

CO CL1241Contig1 667 5 7 U
TTTTTTTGTAGAAGGAAACTAAGATGTAGGAGGTGATGAGTTAAAACATACAATGGACAT
TGAGCATTACAAATTAAACCAAATAGCTGTAACATCAATTGAATCCAATATAGAAAAGGG
TTTAGAAACCAAATTATCATTAACCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAA
TCTTTTAAGAAGACATAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAA*CA
TAACAGCTCGATCAAAATCAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGA
ATCACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCC
CAAATCGACATTGTTGCCATTGTAATGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTA
TTCAATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGACCAGAATCAACTTACCTTT
GGAGCTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCAT
GACCAAAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCCGCAAC
CATTTTCTCAAGAGTCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTCGGAGGGGT
GACGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 

AF RR4B160JQ U 196
AF RR4FH08JQ U 8
AF RR4FH08TF C 1
AF RR4FA36JQ U 76
AF RR4FA36TF C 76
BS 1 7 RR4FH08TF
BS 8 237 RR4FH08JQ
BS 238 238 RR4FA36JQ
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BS 378 378 RR4FA36JQ
BS 379 652 RR4FH08JQ
BS 653 667 RR4FA36JQ

RD RR4B160JQ 259 0 0
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QA 1 259 1 259
DS 

RD RR4FH08JQ 645 0 0
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GGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATCG
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TCAAGAGTCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTC

QA 1 645 1 645
DS 

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TGAGCATTACAAATTAAACCAAATAGCTGTAACATCAATTGAATCCAATATAGAAAAGGG
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TCTTTTAAGAAGACATAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAAACA
TAACAGCTCGATCAAAATCAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGA
ATCACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCC
CAAATCGACATTGTTGCAATTGTAATGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTA
TTCAATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGACCAGAATCAACTTACCTTT
GGAGCTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCAT
GACCAAAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCCGCAAC
CATTTTCTCAAGAGTCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTCGGAGGAGT
GACGCCC

QA 1 667 1 667
DS 

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TAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAA*CATAACAGCTCGATCAA
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AATGTTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATCGACATTGTT
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CCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATCAGAATCAACTTACCTTTGGAGCTGCGAAGGGA
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QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4FA36TF 592 0 0
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AATCAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCACCTGGATCAAC
AATGTTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATCGACATTGTT
GCCATTGTAATGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTATTCAATCTCTGATCT
CCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATCAGAATCAACTTACCTTTGGAGCTGCGAAGGGA
CTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAAAGCTAATCT
GCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCCGCAACCATTTTCTCAAGAGT
CGCTGATCGCCGAGTTAACACGAAGAGAGGCCTTTTCGGAGGGGTGACGCCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 5

CO CL1242Contig1 890 5 11 U
AGAAGAACCCTCCTTTATTTAGATAGCCAATAGACAAGACAAACGTACATTAAGATATAA
GACAAACCAAAAACAACAACAATAGACCATGCAACTCCATAAGTTCACATGATAATCTTA
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ATCTTGTAAAGAAACTCACCAGCTTGTCCATAGAACCCAACGACCTTGTGGTCTTTCTTC
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ATCACACCTGTGAGATATTCACCATCTTCAAGCACAAACTCTTCAGCATCAAGCAATGAC
TTCTTCCCATGAACACTTCCAAGGACAGGCTTTGAAGCATTTACATACTCAGCCTCGAAA
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GGTGTTGACGTAGGAGCAATATAAACTCCAAGAGAGTGGATCACGTCGCTTGCACTTCCA
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GGCTGAGAAACTTTTCCCTTGAATGTCTTGAAGATAAGAGCGGTGATGATCTCTGTTGGT
GTTCCAAAGAGTTTCTCGTAGTAAACTTTTACAGATGTTATGTAATCATCTGAATCAAGC
TCAAACTCCTCTGGGTCAAGTAACGTCTTTTTACCATGTTCGAGTGATAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM18TF C 1
AF RR4ED23JQ U 2
AF RR4AL03JQ U 1
AF RR4GM17JQ U 1
AF RR4GM17TF C 372
BS 1 36 RR4AL03JQ
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BS 774 803 RR4GM17JQ
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A
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C

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TGAATTTAAGACAGATGATCGCCGGTGCATCGACACCATAAATCTTGTCATAGTAGCCTA
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TCTTCCCATGAACACTTCCAAGGACAGGCTTTGAAGCATTTACATACTCAGCCTCGAAAT
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QA 1 656 1 656
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TCCAGCACGAATTCAGTTCCTGAGTCCATTCCATACGGGTCAGAAATTCTCTTGTTTGTC
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ATCACACCTGTGAGATATTCACCATCTTCAAGCACAAACTCTTCAGCATCAAGCAATGAC
TTCTTCCCATGAACACTTCCAAGGACAGGCTTTGAAGCATTTACATACTCAGCCTCGAAA
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TCGTCCCACTTAACTCCAGCGTCTCCACCTTGTGCTGGAATAGTATCGACGGGAGTCACT
GGTGTTGACGTAGGAGCAATATAAACTCCAAGAGAGTGGATCACGTCGCTTGCACTTCCA
TGGAATCCAACGATTTTGCCACCTCCTAGCTCTGCTTCTTGTCCAGAGGCCATTCCAAAC
GGCTGAGAAACTTTTCCCTTGAATGTCTTGAAGATAAGAGCGGTGATGATCTC
TGTTGGTGT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4GM17JQ 806 0 0
C
GAAGAACCCTCCTTTATTTAGATAGCCAATAGACAAGACAAACGTACATTAAGATATAAG
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TCATACACAATATAAGATTGGTTCTGCATCAGTTGGCTATGGGCGCCACTCTAACTCCGA
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CCAGCACGAATTCAGTTCCTGAGTCCATTCCATACGGGTCAGAAATTCTCTTGTTTGTCT
TGAATTTAAGACAGATGATCGCCGGTGCATCGACACCATAAATCTTGTCATAGTAGCCTA
TCACACCTGTGAGATATTCACCATCTTCAAGCACAAACTCTTCAGCATCAAGCAATGACT
TCTTCCCATGAACACTTCCAAGGACAGGCTTTGAAGCATTTACATACTCAGCCTCGAAAT
AAGTCACACAAGAGTCACCTTGTCCTACATATATCTTCTTCACACCGTCGTGAACACCAT
CGTCCCACTTAACTCCAGCATCTCCACCTTGTGCTGGAATAGTATCGACGGGAGTCACTG
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GCTGAGAAACTTTTCCCTTGAATGTCTTGAAGATAAGAGCGGTGATGATCTCTGTTGGTG
TTCCAAAGAGTTTCTCGTAGTA
AAC

QA 2 803 2 803
DS 

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AGAGTCACCTTGTCCTACATATATCTTCTTCACACCGTCGTGAACACCATCGTCCCACTT
AACTCCAGCATCTCCACCTTGTGCTGGAATAGTATCGACGGGAGTCACTGGTGTTGACGT
AGGAGCAATATAAACTCCAAGAGAGTGGATCACGTCGCTTGCACTTCCATGGAATCCAAC
GATTTTGCCACCTCCTAGCTCTGCTTCTTGTCCAGAGGCCATTCCAAACGGCTGAGAAAC
TTTTCCCTTGAATGTCTTGAAGATAAGAGCGGTGATGATCTCTGTTGGTGTTCCAAAGAG
TTTCTCGTAGTAAACTTTTACAGATGTTATGTAATCATCTGAATCAAGCTCAAACTCCTC
TGGGTCAAGTAACGTCTTTTTACCATGTTCGAGTGATAC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 2 7

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ATGGTTTCTATTTAG


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 

AF RR4B704TF U 1
AF RR4FG13TF U 1
AF RR4BA39TF U 1
AF RR4FX76JQ C 1
AF RR4FX76TF U 1
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ATGGTTTCTATTT

QA 1 433 1 433
DS 

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ATGGTTTCTATT

QA 1 432 1 432
DS 

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ATGGTTTCTATTT

QA 1 433 1 433
DS 

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ATGGTTTCTATTTAG

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR4FX76TF 435 0 0
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ATGGTTTCTATTT
AG

QA 1 433 1 433
DS 



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AAAGATGGTTTCTGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4GL86JQ C 1
AF RR4GL86TF U 1
BS 1 433 RR4GL86TF
BS 434 437 RR4GL86JQ

RD RR4GL86JQ 437 0 0
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AGTGACTCTTATCCCATAACATGTGTTTGCTTTCGCCACATTTTCATTTCAAAAGAAAAG
AAAGATGGTTTCTGTTC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4GL86TF 437 0 0
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GGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGATCTTTTGGAGGCTC
TGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATGATCCCGCTTTGTATCCATGAAGCGTGTCTTTGA
CAGAGTGCTTATTTATCAAACTTAAAATGTTTGTGTAACTTCCTACCATGTCTGTAGGGG
AGTGACTCTTATCCCATAACATGTGTTTGCTTTCGCCACATTTTCATTTCAAAAGAAAAG
AAAGATGGTTTCT
GTTC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 7

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AATGCATGAACAAAAAAGAGGTAACGTAACCCTAAAACTTCCTCAAAGACAAACTTAAAA
CTCTTTAAAAACGCCAAAAGCTGAAGTCTATATAAGCTGTAAAGGAGCCAAAAAGGCTCT
CTTTTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTC
GAGCCACTCGTCCAGTGATGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTT
TTTGGTTTTCTTAGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCATAGACCGAGGAGGAGGAG
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AACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTA
GATAACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGAC
GTAGGAGAATGTTGCTTGAACAGAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGT
AAGATTCTGAACCAACAACTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCAT
CACACCAACTCTAGATTTCCCATCATTCCTGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCC
AGCTATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGC
TGAGGTCAAGTTGAGATCCAAGTCCTGGTCATCTTCCTCAGCACCAGAATCACTGTGTTC
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CTTCTTCTTCGCCTCTCTTTTTTTTTTTCTTGTTTCCCTCAGGTCAACGGAGATTTTTTT
CACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 

AF RR4DW33JQ U 64
AF RR4BA03JQ U 1
AF RR4E686JQ U 1
AF RR4E686TF C 300
AF RR4AR17JQ U 30
AF RR4BA03TF C 303
AF RR4AR17TF C 305
BS 1 401 RR4BA03JQ
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BS 403 780 RR4BA03JQ
BS 781 852 RR4AR17JQ
BS 853 1021 RR4BA03TF
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TTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTCGAG
CCACTCGTCCAGTGATACGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTTTTT
GGTTTTCTTAGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCATAGACCGAGGAGGAGGAGGAG
AGCAATCCCAAGTGTTATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAAAAGACCTCCAGATTCAAC
CACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCAGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAGAT
AACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTA
GGGGAATGTTGCTTGAACAAAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGTAA

QA 1 539 1 539
DS 

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AATGCATGAACAAAAAAGAGGTAACGTAACCCTAAAACTTCCTCAAAGACAAACTTAAAA
CTCTTTAAAAACGCCAAAAGCTGAAGTCTATATAAGCTGTAAAGGAGCCAAAAAGGCTCT
CTTTTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTC
GAGCCACTCGTCCAGTGATGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTT
TTTGGTTTTCTTAGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCATAGACCGAGGAGGAGGAG
GAGAGCAATCCCAAGTGTTATAAGGAAGACAGACTCACCGCCGAGAAGACCTCCAGATTC
AACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTA
GATAACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGAC
GTAGGAGAATGTTGCTTGAACAGAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGT
AAGATTCTGAACCAACAACTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCAT
CACACCAACTCTAGATTTCCCATCATTCCTGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCC
AGCTATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGC

QA 1 780 1 780
DS 

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AATGCATGAACAAAAAAGAGGTAACGTAACCCTAAAACTTCCTCAAAGACAAACTTAAAA
CTCTTTAAAAACGCCAAAAGCTGAAGTCTATATAAGCTGTAAAGGAGCCAAAAAGGCTCT
CTTTTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTC
GAGCCACTCGTCCAGTGATGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTT
TTTGGTTTTCTTAGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCACAGACCGAGGAGGAGGAG
GAGAGCAATCCTAAGTGTTATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAGAAGACCTCCAGATTC
AACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTA
GATAACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGAC
GTAGGAGAATGTTGCTTGAACAGAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGT
AAGATTCTGAACCAACAACTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCAT
CACACCAACTCTAGATTTCCCATCATTCCTGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCC
AGCTATAACCAATCTGCCACTGTTT*GGGGGAAAACAGAGACAGTCTCA
CTC

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DS 

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TTTTTGG
TTTCTTAGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCACAGACCGAGGAGGAGGAGGAGAGC
AATC*TAAGTGTTATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAGAAGACCTCCAGATTCAACCAC
CTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAGATAAC
ATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAGGA
GAATGTTGCTTGAACAGAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGTAAGATT
CTGAACCAACAACTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCATCACACC
AACTCTAGATTTCCCATCATTCCTGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCCAGCTAT
AACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGCTGAGGT
CAAGTTG

QA 8 494 8 494
DS 

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CCCTAAAACTTCCTCAAAGACAAACTTAAAACTCTTTAAAAACGCCAAAAGCTGAAGTCT
ATATAAGCTGTAAAGGAGCCAAAAAGGCTCTCTTTTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCC
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ACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTTTTTGGTTTTCTTAGTGAGACGCTGAACTT
GGCTGTATGCCCATAGACCGAGGAGGAGGAGGAGAGCAATCCCAAGTGTTATAAGGAAGA
CAGACTCACCGCTGAGAAGACCTCCAGATTCAACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGA
CATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAGATAACATAACCCACCAGATCAAATGCTC
CAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAGGAGAATGTTGCTTGAACAGAATATG
GGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGTAAGATTCTGAACCAACAACTTATGATCAT
AAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCATCACACCAACTCTAGATTTCCCATCATTCC
TGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCCAGCTATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGG
GGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGCTGAGGTCAAGTTGAGATCCAAGTCCTGGT
CATCTTCCTCAGCACCAGAATCACTGTGTTCTCCCACAACATC

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DS 

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GAGCAATCCCAAGTGTTATAAGGAAGACAGACTCACCGCCGAGAAGACCTCCAGATTCAA
CCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAGA
TAACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGACGT
AGGAGAATGTTGCTTGAACAGAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGTAA
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CACCAACTCTAGATTTCCCATCATTCCTGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCCAG
CTATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGCTG
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CCACAACATCGTCAACAATGCTGGAATGATCATCTTCCACTTGACATCTAGCAACTTGGA
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TCTTCTTCGCCTCTCTTTTTTTTTTTCTTGTTTCCCTCAGGTCAACGGAGATTTTTTTC
CC

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DS 

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GCAATCCCAAGTGTTATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAGAAGACCTCCAGATTCAACC
ACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAGATA
ACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGTAAGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAG
GAGAATGTTGCTTGAACAGAATATGGGATGGATGCATTGTTGATTCTCAGGACGGTAAGA
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CCAACTCTAGATTTCCCATCATTCCTGAGAGCAACAATGAGTTCAGTATCTTCTCCAGCT
ATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGCTGAG
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AGAGGAGATGCGAGGAGAAGGAGAGCCAGAAACAAAACCCTAACGTTCATCTTCATCTTC
TTCTTCGCCTCTCTTTTTTTTT**CTTGTTTCCCTCAGGTCAACGGAGATTTTTTTCACC

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DS 



AS 1 6

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CTTTGAAGTAGGAAGCAAAGCAAAAATGGTGAAAGGTCCAGGTCTCTACACTGACATCGG
CAAAAAAGTCAGAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCACAAATTGAGTATCAC
CACTATCTCTCCAGCCAGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACTAAGAAAGGTGACCTCCT
TTTGGGAGATGTCGCTTTTCTTTTGAAGCAAAAGAACATCACTACTGATTTTAGAGTTTC
CACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACCGTTGATGAGGCTGCACCTGGACTCAAGTC
TATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAATTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCA
TGACTACGCTGGTATCAGCACCAGCTTGGGCTTGACTCAGAACCCCACTGTCAACTTCTC
TGGTGTTATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATC
CGGCAATTTTACCAAGATCAATGCTGGTTTAAATTTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTC
CCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATTCTGTCAACGCTTCGTACTACCACATTGTTAATCC
GCTGTTCAACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTGAGCCACAAGTTCTCTAGCAAGGCCAACAC
CATAACAGTGGGAACGCAGCATTCACTCGACCCCTTGACCATGGTCAAGGCACGTGTGAA
CAGTGCCGGAATAGCCAATGCTCTCATTCAACACCAGTGGACACCTGGGTCCTTCTTCAC
TATTTCTGGAGAAGTTGACACCAAAGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCTCT
CTCTCTCAAGCCTTGAAACTGATGAGCCAAACAAATCAAAGCATTTAAAATAGTTTTTTT
CTTTAGACTTGGGTTCTATTTCCTCTGCTTGGTTTGTTGGGTTTTAATGGCTACTGCTTA
AAACTTTCTCCCCTTTTTCTTGTCGGATTTGTAGAGAATAAAAAGGTTGAAAAAGATCCG
TCTGTCTTGTTGACATGATGAAACACCAAAGATCCTTTTGAGTTCTGTTTCTATTTATTT
GCTGTGCACTTTACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4EN27TF U 1
AF RR4GD35TF U 21
AF RR4CI83TF U 127
AF RR4GW39JQ C 520
AF RR4CI83JQ C 388
AF RR4EN27JQ C 447
BS 1 189 RR4EN27TF
BS 190 190 RR4GD35TF
BS 191 445 RR4EN27TF
BS 446 446 RR4CI83TF
BS 447 555 RR4EN27TF
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BS 557 705 RR4EN27TF
BS 706 710 RR4GD35TF
BS 711 785 RR4CI83TF
BS 786 960 RR4CI83JQ
BS 961 961 RR4GW39JQ
BS 962 1157 RR4CI83JQ
BS 1158 1158 RR4EN27JQ

RD RR4EN27TF 705 0 0
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CTTTGAAGTAGGAAGCAAAGCAAAAATGGTGAAAGGTCCAGGTCTCTACACTGACATCGG
CAAAAAAGTCAGAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCACAAATTGAGTATCAC
CACTATCTCCCCAGCCAGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACTAAGAAAGGTGACCTCCT
TTTGGGAGATGTCGCTTTTCTTTTGAAGCAAAAGAACATCACTACTGATTTTAGAGTTTC
CACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACCGTTGATGAGGCTGCACCTGGACTCAAGTC
TATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAATTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCA
TGACTACGCTGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGACTCAGAACCCCACTGTCAACTTCTC
TGGTGTTATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATC
CGGCAATTTTACCAAAATCAATGCTGGTTTAAATTTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTC
CCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATTCTGTCAACGCTTCGTACTACCACATTGTTAATCC
GCTGTTCAACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTGAGCCACAAGTTCTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GD35TF 690 0 0
GGGCGTTTCTCTCA
CTCTCTCTCTCGGGGTATCTTTTGTTCTTTGAAGTAGGAAGCAAAGCAAAAATGGTGAAA
GGTCCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAGTCAGAGATCTGCTGTACAAGGACCAC
AACAGCGAC*ACAAATTGAGTATCACCACTATCTCTCCAGCCAGTGTTGCCATCACTTCA
ACTGGAACTAAGAAAGGTGACCTCCTTTTGGGAGATGTCGCTTTTCTTTTGAAGCAAAAG
AACATCACTACTGATTTTAGAGTTTCCACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACCGTT
GATGAGGCTGCACCTGGACTCAAGTCTATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAATTCC
GGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGACTACGCTGGTATCAGCGCCAGCATGGGCTTG
ACTCAGAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCTGGT
ACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCAATTTTACCAAGATCAATGCTGGTTTAAAT
TTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATTCTGTCAAC
GCTTCGTACTACCACATTGTTAATCCGCTGTTCA*CACTGCTGTTGGAGCCGA*GTGAGC
*ACAAGTTCTCTAGCA

QA 15 690 15 690
DS 

RD RR4CI83TF 659 0 0
G
GTCAGAGATCTGCTGTACAAGGGCCACAACAGCGACCACAAATTGAGTATCACCACTATC
TCTCCAGCCAGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACTAAGAAAGGTGACCTCCTTTTGGGA
GATGTCGCTTTTCTTTTGAAGCAAAAGAACATCACTACTGATTTTAGAGTTTCCACTGAC
AATACCGTTTTGATCACTGCTACCGTTGATGAGGCTGCACCTGGACTCAAGTCTATCTTC
AGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAATTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGACTAC
GCTGGTATCAGCACCAGCTTGGGCTTGACTCAGAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTT
ATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCAAT
TTTACCAAGATCAATGCTGGTTTAAATTTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACC
CTGAATGACAAAGGAGATTCTGTCAACGCTTCGTACTACCACATTGTTAATCCGCTGTTC
AACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTGAGCCACAAGTTCTCTAGCAAGGCCAACACCATAACA
GTGGGAACGCAGCATTCACTCGACCCCTTGACCATGGTCAAGGCACGTGTGAACAGTG

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4GW39JQ 588 0 0
TGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCAATTTTACCAAGATCAATGCTGGTTTAAATTTCAC
TAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATTCTGTCAACGCTTC
GTACTACCACATTGTTAATCCGCTGTTCAACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTGAGCCACAA
GTTCTCTAGTAAGGCCAACACCATAACAGTGGGAACGCAGCATTCACTCGACCCCTTGAC
CATGGTCAAGGCACGTGTGAACAGTGCCGGAATAGCCAATGCTCTCATTCAACACCAGTG
GACACCTGGGTCCTTCTTCACTATTTCTGGAGAAGTTGACACCAAAGCTATTGACAAGAA
TGCTAAGGTTGGTTTGGCTCTCTCTCTCAAGCCTTGAAACTGATGAGCCAAACAAATCAA
AGCATTTAAAATAGTTTTTTTCTTTAGACTTGGGTTCTATTTCCTCTGCTTGGTTTGTTG
GGTTTTAATGGCTACTGCTTAAAACTTTCTCCCCTTTTTCTTGTCGGATTTGTAGAGAAT
AAAAAGGTTGAAAAAGATCCGTCTGTCTTGTTGACATGATGAAACACC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4CI83JQ 770 0 0
AAAA
TCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGACTACGCTGGTATCAGCACCAGCTTGGGC
TTGACTCAGAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCT
GGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCAATTTTACCAAGATCAATGCTGGTTTA
AATTTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATTCTGTC
AACGCTTCGTACTACCACATTGTTAATCCGCTGTTCAACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTG
AGCCACAAGTTCTCTAGCAAGGCCAACACCATAACAGTGGGAACGCAGCATTCACTCGAC
CCCTTGACCATGGTCAAGGCACGTGTGAACAGTGCCGGAATAGCCAATGCTCTCATTCAA
CACCAGTGGACACCTGGGTCCTTCTTCACTATTTCTGGAGAAGTTGACACCAAAGCTATT
GACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCTCTCTCTCTCAAGCCTTGAAACTGATGAGCCAAA
CAAATCAAAGCATTTAAAATAGTTTTTTT*TTTAGACTTGGGTTCTATTTCCTCTGCTTG
GTTTGTTGGGTTTTAATGGCTACTGCTTAAAACTTTCTCCCCTTTTTCTTGTCGGATTTG
TAGAGAATAAAAAGGTTGAAAAAGATCCGTCTGTCTTGTTGACATGATGAAACACCAAAG
ATCCTTTTGAGTTCTGTTTCTATTTATTTGCTGTGCACTTTACTCC

QA 5 770 5 770
DS 

RD RR4EN27JQ 712 0 0
TGGGCTTGACTCAGAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATTGGAACCAATCTCTTAG
CTGCTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCAATTTTACCAAAATCAATGCTG
GTTTAAATTTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATT
CTGTCAACGCTTCGTACTACCACATTGTTAATCCGCTGTTCAACACTGCTGTTGGAGCCG
AAGTGAGCCACAAGTTCTCCAGCAAGGCCAACACCATAACAGTGGGAACGCAGCATTCAC
TCGACCCCTTGACCATGGTCAAGGCACGTGTGAACAGTGCCGGAATAGCCAATGCTCTCA
TTCAACACCAGTGGACACCTGGGTCCTTCTTCACTATCTCTGGAGAAGTTGACACCAAAG
CTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCTCTCTCTCTCAAGCCTTGAAACTGATGAG
CCAAACAAATCAAAGCATTTAGAATAGTTTTTTTCTTTAGACTTGGGTTCTATTTCCTCT
GCTTGGTTTGTTGGGTTTTAATGGCTACTGCTTAAAACTTTCTCCCCTTTTTCTTGTCGG
ATTTGTAGAGAATAAAAAGGTTGAAAAAGATCCGTCTGTCTTGTTGACATGATGAAACAC
CAAAGATCCTTTTGAGTTCTGTTTCTATTTATTTGCTGTGCACTTTACTCCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 6

CO CL1246Contig1 741 6 3 U
TAAAGATCTACAGACACCTACTCAATTACTCAAAAAATGTATTTAATCTTCGGAGTTTCC
CAAATCTAGCTGGGATGAAGTATAGACAGATAAGACTTGGGTTCCAGGAGGTAGTGGTTT
GTGGTATTTTACGAGATGGAAAAGTAAATTTCCACCCAAACGATGACGAAAAGCTCATGG
AAACAGACAAAGTATTGTTTATTGCGCCTCTTAGTTGGAGAAAGAAGCAACTTTTATCTA
AAGAGATTGAAACTGAGAACATTTCAGTAGACGATGAACTCGAAACTCGTAAGCAATCAA
GGCTAGAGATGATTATAAAACGTTTTAAGATGTTCTTATCAAAGGGATCGTCAGATTCCG
TCCAAGGACCCAGAGAAACTATACTTCTACTTGGTTGGCGTGAGGATGTTGTAGATATGA
TTGAAGAGTTTGATAACTATCTTGGTCCAGGAAGTTCATTGGAAATATTATCTGATGTAC
CAATAGAGGACAGAGGAAGAGTGAGTGATGGTATAGGTTCAGGAAAAATCAAGAACATAC
AAGTTTCCCATCGGGTTGGGAATCCGATGAACTATGATACATTAAAGGAAACTATAATGC
ATATGCAAACTAAATACCAAAAAGAAGAAGATGTAGAGATAATGTGTATAAGGGTCTTTT
AGTCTTTGTATTATACCTAGTATATCTCATGTCTTCTGTATAAATACCGTATTATTACAT
CTAATGAAAATAAGTTCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FO29JQ C 1
AF RR4CL19TF U 360
AF RR4DK33JQ C 365
AF RR4DM46JQ C 551
AF RR4DK33TF U 365
AF RR4DM46TF U 365
BS 1 365 RR4FO29JQ
BS 366 623 RR4CL19TF
BS 624 741 RR4DK33TF

RD RR4FO29JQ 618 0 0
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CAAATCTAGCTGGGATGAAGTATAGACAGATAAGACTTGGGTTCCAGGAGGTAGTGGTTT
GTGGTATTTTACGAGATGGAAAAGTAAATTTCCACCCAAACGATGACGAAAAGCTCATGG
AAACAGACAAAGTATTGTTTATTGCGCCTCTTAGTTGGAGAAAGAAGCAACTTTTATCTA
AAGAGATTGAAACTGAGAACATTTCAGTAGACGATGAACTCGAAACTCGTAAGCAATCAA
GGCTAGAGATGATTATAAAACGTTTTAAGATGTTCTTATCAAAGGGATCGTCAGATTCCG
TCCAAGGACCCAGAGAAACTATACTCCTACTTGGTTGGCGTGAAGATGTTGTAGATATGA
TTGAAGATTTTGATAACTATCTTGGTCCAGGAAGTTCATTGGAAATATTATCTGATGTAC
CAATAGAGGACAGAGGAAGAGTGACTGATGGTATAGGTTCAGGGAAAATCAAGAACATAC
AAGTTTCCCATCGGGTTGGGAATCCGATGAACTATGATACATTAAAGGAAACTATAATGC
ATATGCAAACTAAATACC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4CL19TF 264 0 0
GTCCAA
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CAAACTAAATACCAAAAA

QA 7 264 7 264
DS 

RD RR4DK33JQ 377 0 0
G
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GAGTTTGATAACTATCTTGGTCCAGGAAGTTCATTGGAAATATTATCTGATGTACCAATA
GAGGACAGAGGAAGAGTGAGTGATGGTATAGGTTCAGGAAAAATCAAGAACATACAAGTT
TCCCATCGGGTTGGGAATCCGATGAACTATGATACATTAAAGGAAACTATAATGCATATG
CAAACTAAATACCAAAAAGAAGAAGATGTAGAGATAATGTGTATAAGGGTCTTTTAGTCT
TTGTATTATACCTAGTATATCTCATGTCTTCTGTATAAATACCGTATTATTACATCTAAT
GAAAATAAGTTCAGCC

QA 2 377 2 377
DS 

RD RR4DM46JQ 191 0 0
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TAAATACCAAAAAGAAGAAGATGTAGAGATAATGTGTATAAGGGTCTTTTAGTCTTTGTA
TTATACCTAGTATATCTCATGTCTTCTGTATAAATACCGTATTATTACATCTAATGAAAA
TAAGTTCAGCC

QA 1 191 1 191
DS 

RD RR4DK33TF 377 0 0
G
GGACCCAGAGAAACTATACTTCTACTTGGTTGGCGTGAGGATGTTGTAGATATGATTGAA
GAGTTTGATAACTATCTTGGTCCAGGAAGTTCATTGGAAATATTATCTGATGTACCAATA
GAGGACAGAGGAAGAGTGAGTGATGGTATAGGTTCAGGAAAAATCAAGAACATACAAGTT
TCCCATCGGGTTGGGAATCCGATGAACTATGATACATTAAAGGAAACTATAATGCATATG
CAAACTAAATACCAAAAAGAAGAAGATGTAGAGATAATGTGTATAAGGGTCTTTTAGTCT
TTGTATTATACCTAGTATATCTCATGTCTTCTGTATAAATACCGTATTATTACATCTAAT
GAAAATAAGTTCAGCC

QA 2 377 2 377
DS 

RD RR4DM46TF 377 0 0
G
GGACCCAGAGAAACTATACTTCTACTTGGTTGGCGTGAGGATGTTGTAGATATGATTGAA
GAGTTTGATAACTATCTTGGTCCAGGAAGTTCATTGGAAATATTATCTGATGTACCAATA
GAGGACAGAGGAAGAGTGAGTGATGGTATAGGTTCAGGAAAAATCAAGAACATACAAGTT
TCCCATCGGGTTGGGAATCCGATGAACTATGATACATTAAAGGAAACTATAATGCATATG
CAAACTAAATACCAAAAAGAAGAAGATGTAGAGATAATGTGTATAAGGGTCTTTTAGTCT
TTGTATTATACCTAGTATATCTCATGTCTTCTGTATAAATACCGTATTATTACATCTAAT
GAAAATAAGTTCAGCC

QA 2 377 2 377
DS 



AS 1 6

CO CL1247Contig1 939 6 8 U
GGAGAGAGAGACTTTACTCAGAGAAGCTTACACAACAATTTTATTTTGGGAGAAAGAGTG
ATCATCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTGGCTGACGAGATTTTTAACAGCGGTAGCG
TTTTTAGCCGCCGGAGTTATATTCCCACCGGAGACATTCGGATCGTTATCAAAGGGCGAG
AATTCGGCGAAGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCT
TGGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCG
AGGCATCAATTTGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGT
TCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTCCATCCATGGAAGTCTTCTTCT
GCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAAT
TTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTTGAGAGA
GAGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAATAGAGAGAAGGCAAAGACTATC
CCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAAAAGTTTGGTATGATTCACGGCTTGTCATCTCTCGCT
AACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGAT
CTCTAAGTTTCTTGTCACAAAGGTCTGAGCTTTTATGCCCTCCTTCATCAATAAAATCTC
TTGCTTTGTAAAGATTATTATACCACAAGGCGAAACAGTTTGTTATAATGATATCATTTT
TTTTTCTTTTAAACACTAGATGTTTTCTTTTTCTCTGAAATAGTTGATGTGTGAATGCTA
TTACAGAAGAGTAATGCCCAAGTTTTACTTAAAGAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4BI12TF U 1
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BS 146 148 RR4BI12TF
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BS 150 767 RR4BI12TF
BS 768 859 RR4AQ67JQ
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TTTTTAGCCGCCGGAGTTATATTCTCACTGGAGACATTCGGATCGTTATCAAAGGGCGAG
AATTCGGCGAAGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCT
TGGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCG
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GCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAAT
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GAGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAATAGAGAGAAGGCAAAGACTATC
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AACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGAT
CTCTAAGTTTCTTGTCACAAAGGTCTGAGCTTTTATGCCCTCCTTCA

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GT
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GCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGTGCTATTTCACTCTCTG
CCTCTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCATCTTCTGCTGTGGAGAAGTATCAGCTACGGT
TCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCA
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AGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCTCTCGCTAACATCTTCTCTTTTGGAAGCCTTG
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DS 

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GG
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TATTCCCACCGGAGACATTCGGATCGTTATCAAAGGGCGAGAATTCGGCGAAGGTTTTGA
TATTGGCGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTTGGGGAGCTGCTCTCTGGG
CTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCGAGGCATCAATTTGGTAACC
TTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCAC
TCTCTGCCTTTGGGTATCTCCATCCATGGAAGTCTTCTTCTGCTGTGGAGAAGTATCAGC
TAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCA
TGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTTGAGAGAGAGAACAACATTGGAGATG
AAGTTGGTTGGTCCAAGAATAGAGAGAAGGCAAATACTATCCCTCAGCCAGCTGCCATGA
ACAAAAAGTTTGGTATGATTCACGGCTTGTCATCTCTCGCTAACATCTTTTCTTTTGGAA
GCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGATCTCTAAGTTTCTTGTCAC

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DS 

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TCGCTACAGCTTGGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCA
AGAACTTACCGAGGCATCAATTTGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCA
CTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTCCATCCATGGA
AGTCTTCTTCTGCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCA
ATCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACA
AAGTTGAGAGAGAGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAATAGAGAGAAGG
CAAATACTATCCCTCAGCCAGCTGCCATGAACAAAAAGTTTGGTATGATTCACGGCTTGT
CATCTCTCGCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTG
GGAAGATGGATCTCTAAGTTTCTTGTCACAAAGGTCTGAGCTTTTATGCCCTCCTTCATC
AATAAAATCTCTTGCTTTGTAAAGATTATTATACCACAAGGCGAAACAGTTTGTTATAAT
GATATCATTTTTTTTTCTTTTAAACACTAGGTGTTTTCTTTTTCTCTGAAATAGTTGATG
TGTGAATGCTATTACAGAAGAGTAATGCCCAAGTTTTACTTAAAGAAACT

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DS 

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TCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCGAGGCATCAATTTGGTAACCTTCAGA
GCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTG
CCTTTGGGTATCTCCATCCATGGAAGTCTTCTTCTGCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGT
TCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCA
TCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTTGAGAGAGAGAACAACATTGGAGATGAAGTTG
GTTGGTCCAAGAATAGAGAGAAGGCAAAGACTATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAAA
AGTTTGGTATGATTCACGGCTTGTCATCTCTCGCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTG
CCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGATCTCTAAGTTTCTTGTCACAAAGGTC
TGAGCTTTTATGCCCTCCTTCATCAATAAAATCTCTTGCTTTGTAAAGATTATTATACCA
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TCTTTTTCTCTGAAATAGTTGATGTGTGAATGCTATTACAGAAGAGTAATGCCTAAGTTT
TACTTAAAGAAAC

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DS 

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AACTTACCGAGGCATCAATTTGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACT
CTTGTTGGTTCTTGCTTCGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTCCATCCATGGAAG
TCTTCTTCTTCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAAT
CTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAA
GTTGAGAGAGAGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAATAGAGAGAAGGCA
AAGACTATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAAAAGTTTGGTATGATTCACGGCTTGTCA
TCTCTCGCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGG
AAGATGGATCTCTAAGTTTCTTGTCACAAAGGTCTGAGCTTTTATGCCCTCCTTCATCAA
TAAAATCTCTTGCTTTGTAAAGATTATTATACCACAAGGCGAAACAGTTTGTTATAATGA
TATCATTTTTTTTTCTTTTAAACACTAGATGTTTTCTTTTTTTCTGAAATAGTTGATGTG
TGAATGCTATTACAG
C

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 7

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CTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCC
AGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCG
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GCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCA
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GCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGT
CGGCATATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGGCTGACT
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TTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTTATATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCG
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TTCAATAAAAAATGTGTTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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AF RR4E445TF U 1
AF RR4EA43JQ C 265
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AF RR4EA43TF U 145
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GG
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CCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCGATCGGAGTTTTATCAAGGGCTTTCTCA
AAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCT
CGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCGACATCTTC
AAGGGGAAGAAAGTCGTCATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAG
CA***TGTGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCC
GTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGG
GCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGG
CTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCATAT
GTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAG
TG

QA 3 599 3 599
DS 

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GAAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCGATCGGAGTTTTATCAAGGG
CTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCC
AGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCG
ACATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGTCATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCT
GCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCA
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AGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAA
GCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGT
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TCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCAACAAGTTG
TTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTC

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DS 

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TCATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCT
ACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTG
TCAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTG
AGTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTTT
CTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCATATGTAGAAGACGGCAAGG
TGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGGCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAGGTCA
TTTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCAACAAGTTGTTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTCT
TTTATATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATAACCAAAGGATCACACCAA
GTTTACAACTCCA

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DS 

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G
GGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGG
CGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGTCGACATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGT
CATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTA
CAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGT
CAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGA
GTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTC
TGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCATATGTAGAAGACGGCAAGGT
GAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGGCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAGGTCAT
TTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCAACAAGTTGTTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTCTT
TTATATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATAACCAAAGGATCACACCAAG
TTTACAACTCCACTTTTTCTTGGTTC

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DS 

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AATGTTTCCCCGATCGGAGTTTTATCAAGGGCTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGAC
ATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTC
TCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCGACATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGTCATC
TTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTACAAG
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GATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGAGTTT
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GCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCATATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAG
GCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTA
GGACAGATCTAACAAGTGTTTCAACAAGTTGTTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTTAT
ATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATAACCAAAGGATCACACCAAGTTTA
CAACTCCACTTTTTCTTGGTTCTTGTTTTCTTTCAATAAAAAATGTGTTACTT

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DS 

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G
GGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGG
CGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGTCGACATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGT
CATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTA
CAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGT
CAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGA
GTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTC
TGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCATATGTAGAAGACGGCAAGGT
GAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGGCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAGGTCAT
TTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCAACAAGTTGTTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTCTT
TTATATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATAACCAAAGGATCACACCAAG
TTTACAACTCCACTTTTTCTTGGTTCTTGTTTTCTTTCAATAAAAAATGTGTTACTTC

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DS 

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G
GGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGG
CGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGTCGACATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGT
CATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTA
CAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGT
CAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGA
GTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTC
TGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCATATGTAGAAGACGGCAAGGT
GAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGGCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAGGTCAT
TTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCAACAAGTTGTTCTCTGTCTCTGTTGTTTCCTCTT
TTATATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATAACCAAAGGATCACACCAAG
TTTACAACTCCACTTTTTCTTGGTTCTTGTTTTCTTTCAATAAAAAA

QA 2 648 2 648
DS 



AS 1 6

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ACAAGTTTCACACAACTCTTTATTATTCAAAACAAACCAAAAGGGAAACATAATCAGTAT
TATTCAGACATCTCCATGTCCGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAGT
GTCTTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGAT
GCGTTCCATGTCAACTTCAGTTCTCGTAGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGT
TCCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAA
ACACGTGATCGCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTT
CTTGTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAGC
TTTGCTTCTCGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGAC
CTTCTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTCCTTC
GTACCGGAAAGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGAAGTGTGCTG
AGCAACATCTTCCTCGAGTGATTTCTTGTAACGGGCTTGGTAAGCTTGCTTTATCTTGAA
AAGCTCGACGGCAGACCTAGTGCAAGCGATCTCGACGAGAACCCAGTTGTTCTTGGTGAA
CATTTTGGTGGATTCTTTGGCCAAGTAAGCGTCTCTCTCCGCTGGATCGAGCGTCCACAA
CATCACAGCTCTCTCAAAGTCACTAGAGAGCTCTTTGTCTAAGGCCTTGAGGAGATCCTC
ATTGTAAGTAGCGGCGTAAACGCTGCGGATCATGCTGCGTTGTGCTGCGTTCCTGTGTGC
TAGAATTGATATGATCAGCTTCTCGTTTGTACCCCATCCGGAGAAAGCCTTGTGGAGTTG
CTCGGCATCATCTTCGGGGAGAGGGACATTGCTCGGGACTTTGAGAGACGCCATTGTTGT
TTCTTTGGGATCAGACTTCTAACTTTGAGATCTCTCTCTGTGTTGC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D329JQ U 1
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AF RR4GS23TF C 1
AF RR4EW35JQ U 1
AF RR4DJ63JQ U 55
AF RR4DJ63TF C 416
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GTCTTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGAT
GCGTTCCATGTCAACTTCAGTTCTCGTAGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGT
TCCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAA
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QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GS23JQ 660 0 0
A
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TACCGGAAAGTGCTGGCCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGAAGTGTGCT
C

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4GS23TF 641 0 0
A
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ATTCAGACATCTCCATGTCCGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAGTG
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CGTTCCATGTCAACTTCAGTTCTCGTAGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGTT
CCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAAA
CACGTGATCGCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTTC
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QA 2 641 2 641
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A
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ATTCAGACATCTCCATGTCCGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAGTG
TCTTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGATG
CGTTCCATGTCAACTTCAGTTCTCGTAGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGTT
CCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAAA
CACGTGATCGCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTTC
TTGTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAGCT
TTGCTTCTCGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGACC
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TACCGGAAAGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGAAGTGTGCTGA
GCGACGTCTTCCTCGAGTGATTTCTTGTAACGGGCTTGGTAAGCTTGCTTTACCTTGAAA
AGCTCGACGGCAGACCTCGTGCAAGCGATCTCGACGA

QA 2 758 2 758
DS 

RD RR4DJ63JQ 684 0 0
GG
GGGAACAAGTTTCACACAACTCTTTATTATTCAAAACAAACCAAAAGGGAAACATAATCA
GTATTATTCAGACATCTCCATGTCCGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAG
AAGTGTCTTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTT
TGATGCGTTCCATGTCAACTTCGGTTCTCGTTGTCACAACTCTGGTTAGTCCCCACTCGT
CGGTTCCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATG
TCAAACACGTGATCGCAGCTCTCAGTAGTTTCATGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCA
AGTTCTTGTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCT
GAGCTTTGCTTCTCGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGG
AGACTTTCTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTC
CTTCGTACCTGAAAGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGAAGTGT
GCTGAGCAACATCTTCCTCGAGTGATTTCTTGTAACGGGCTTGGTAAGCTTGCTTTATCT
TGAAAAGCTCGACGG
GGGACCT

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR4DJ63TF 711 0 0
TCAAGTC
TGTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAGCTT
TGCTTCTCGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGACTT
TCTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTCCTTCGT
ACCTGAAAGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGAAGTGTGCTGAG
CAACATCTTCCTCGAGTGATTTCTTGTAACGGGCTTGGTAAGCTTGCTTTATCTTGAAAA
GCTCGACGGCGGACCTAGTGCAAGCGATCTCGACGAGAACCCAGTTGTTCTTGGTGAACA
TTTTGGTGGATTCTTTGGCCAAGTAAGCGTCTCTCTCCGCTGGATCGAGCGTCCACAACA
TCACAGCTCTCTCAAAGTCACTAGAGAGCTCTTTGTCTAAGGCCTTGAGGAGATCCTCAT
TGTAAGTAGCGGCGTAAACGCTGCGGATCATGCTGCGTTGTGCTGCGTTCCTGTGTGCTA
GAATTGATATGATCAGCTTCTCGTTTGTACCCCATCCGGAGAAAGCCTTGTGGAGTTGCT
CGGCATCATCTTCGGGGAGAGGGACATTGCTCGGGACTTTGAGAGACGCCATTGTTGTTT
CTTTGGGATCAGACTTCTAACTTTGAGATCTCTCTCTGTGTTGC

QA 8 711 8 711
DS 



AS 1 7

CO CL1250Contig1 974 7 4 U
CATACATAACAAATTTTCATTGATCGGATTATTTATTACATACATACCCTCAAATCATAA
AACTCGAATTCAAACTTAAAACATTAGTACACCAACTCTCAGTTTTGGTTTTATTCAATA
CCAACATCAAAATAGGTGTCTAAAGTAATAATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATG
CACACACTCGTTCCATACAGATATGTCATGATGTGAAATATATATA****TAAAGTTTCA
GTGGTGGTGCATTTGGAAATTTATATTCCCATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTC
AACACCTTTGAGGAAGAGCCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAA
AGTGATTTCTCCGGCGGAATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCA
TTGATACCTTGGTATTTCCCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTT
AGGTAACACTAGTTTAATGTTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTT
CACCTTAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCC
CGTGATGTCGAGCCAACACACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGG
TGACTCCTTGTTGAGAAACCAAGTCCAATAGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAG
GTTCCTTGGATAGAGCATGAAGTTGCTGTTTTTCTCGTCCACCCTAGACTCGATGTGTCC
ATTTTTAAGATTCTTGGGCTTCAGGACATCAGAACGTAGCTGTGCAGTGGAGGGAGAAAT
TGGAACCTTGGCGTCTTTGGGACTGGCCTCATAGTTTCTTGGAGTATCTGATAACTTCGG
TTCAGCCCTTTTTACCCAATCCCGATTGGTAAGCATCTTGATTATAGACATCTCCCGATT
GAATTTTGTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM62JQ U 1
AF RR4DN08JQ U 1
AF RR4GH50JQ U 1
AF RR4DN08TF C 19
AF RR4DM62TF C 66
AF RR4BU93JQ U 90
AF RR4BU93TF C 198
BS 1 680 RR4DM62JQ
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BS 757 872 RR4BU93JQ
BS 873 974 RR4BU93TF

RD RR4DM62JQ 680 0 0
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CCAACATCAAAATAGGTGTCTAAAGTAATAATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATG
CACACACTCGTTCCATACAGATATGTCATGATGTGAAATATATATA****TAAAGTTTCA
GTGGTGGTGCATTTGGAAATTTATATTCCCATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTC
AACACCTTTGAGGAAGAGCCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAA
AGTGATTTCTCCGGCGGAATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCA
TTGATACCTTGGTATTTCCCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTT
AGGTAACACTAGTTTAATGTTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTT
CACCTTAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCC
CGTGATGTCGAGCCAACACACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGG
TGACTCCTTGTTGAGAAACC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4DN08JQ 756 0 0
CATACATAACAAATTTTCATTGATCGGATTATTTATTACATACATACCCTCAAATCATAA
AACTCGAATTCAAACTTAAAACATTAGTACACCAACTCTCAGTTTTGGTTTTATTCAATA
CCAACATCAAAATAGGTGTCTAAAGTAATAATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATG
CACACACTCGTTCCATACAGATATGTCATGATGTGAAATATATATA****TAAAGTTTCA
GTGGTGGTGCATTTGGAAATTTATATTCCCATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTC
AACACCTTTGAGGAAGAGCCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAA
AGTGATTTCTCCGGCGGAATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCA
TTGATACCTTGGTATTTCCCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTT
AGGTAACACTAGTTTAATGTTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTT
CACCTTAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCC
CGTGATGTCGAGCCAACACACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGG
TGACTCCTTGTTGAGAAACCAAGTCCAATAGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAG
GTTCCTTGGATAGAGCATGAAGTTGCTGTTTTTCTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4GH50JQ 723 0 0
CATACATAACAAATTTTCATTGATCGGATTATTTATTACATACATACACTTAAATCATAA
AACTCGAATTCAAACTTAAAACATTAGTACACCAACTCTCGGTTTTGGTTTTATTCAATA
CCAACATCAAAATAGGTGTCTAAAGTAATAATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATG
CACACACTCGTTCCATACAGATATGTCATGATGTAATATATATATATATATAAAGTTTCA
GTGGTGGTGCATT*GGAAATTTATATTCCCATATTAATTTATATATTTGGGACAAATGTC
AACACCTTTGAGGAAGAGCCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAA
AGTGATTTCTCCGGCGGAATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCA
TTGATACCTTGGTATTTCCCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTT
AGGCAACACTAGTTTAATGTTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTT
CACCTTAAAGACTACCTCGTACGTAATCCCTGGAGTGAGGTTCTTCGTGTCGAATTTTCC
CGTGATGTCGAGCCAACACACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCATTTGG
TGACTCCTTGTTGAGAAACCAAGTCCAATAGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAG
GTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4DN08TF 738 0 0
ATTGATCGGATTATTTATTACATACATACCCTCAAATCATAAAACTCGAATTCAAACTTA
AAACATTAGTACACCAACTCTCAGTTTTGGTTTTATTCAATACCAACATCAAAATAGGTG
TCTAAAGTAATAATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATGCACACACTCGTTCCATAC
AGATATGTCATGATGTGAAATATATATA****TAAAGTTTCAGTGGTGGTGCATTTGGAA
ATTTATATTCCCATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTCAACACCTTTGAGGAAGAG
CCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAAAGTGATTTCTCCGGCGGA
ATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCATTGATACCTTGGTATTTC
CCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTTAGGTAACACTAGTTTAAT
GTTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTTCACCTTAAAGACCACCTC
GTACGTAATCCCTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCCCGTGATGTCGAGCCAACA
CACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGGTGACTCCTTGTTGAGAAA
CCAAGTCCAATAGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAGGTTCCTTGGATAGAGCAT
GAAGTTGCTGTTTTTCTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4DM62TF 691 0 0
GAATTCAAACTTAAAACATTAGTACACCAACTCTCAGTTTTGGTTTTATTCAATACCAAC
ATCAAAATAGGTGTCTAAAGTAATAATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATGCACAC
ACTCGTTCCATACAGATATGTCATGATGTGAAATATATATA****TAAAGTTTCAGTGGT
GGTGCATTTGGAAATTTATATTCCCATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTCAACAC
CTTTGAGGAAGAGCCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAAAGTGA
TTTCTCCGGCGGAATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCATTGAT
ACCTTGGTATTTCCCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTTAGGTA
ACACTAGTTTAATGTTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTTCACCT
TAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCCCGTGA
TGTCGAGCCAACACACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGGTGACT
CCTTGTTGAGAAACCAAGTCCAATAGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAGGTTCC
TTGGATAGAGCATGAAGTTGCTGTTTTTCTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4BU93JQ 783 0 0
CACCAACTCTCGGTTTTGGTTTTATTCAATACCAACATCAAAATAGGTGTATAAAGTAAT
AATACCATAGATCAACCTTATCGTATATATGAACACACTCGTTCCATACAGATATGTCAT
GATGTGAAATATATATA****TAAAGTTTCAGTGGTGGTGCATTTGGAAATTTATATTCC
CATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTCAACACCTTTGAGGAAGAGCCCTTTCTTCC
AAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAAAGTGATTTCTCCAGCGGAATTTTTCTCCG
GCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCATTGATACCTTGGTATTTCCCTTAAACTCA
CCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTTAGGTAACACTAGTTTAATGCTCACCGGCG
TGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTTCACCTTAAAGACCACCTCGTACGTAATCC
CTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCCCGTGATGTCGAGCCAACACACGTTTTTCA
ACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGGTGACTCCTTGTTGAGAAACCAAGTCCAAT
AGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAGGTTCCTTGGATAGAGCATGAAGTTGCTGT
TTTTCTCGTCCACCCTAGACTCGATGTGTCCATTTTTAAGATTCTTGGGCTTCAGGACAT
CAGAACGTAGCTGTGCAGTGGAGGGAGAAATTGGAACCTTGGCGTCTTTGGGACTGGCCT
CAT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4BU93TF 777 0 0
CAGATATGTCATGATGTGA*ATATATATA*****TAAGTTTCAGTGGTGGTGCATT*GGA
AATTTATATTCCCATATTAATTTGTATATTTGGGACAAATTTCAACACCTTTGAGGAAGA
GCCCTTTCTTCCAAAGGCCACTCTCATGCTCATACATTGAGAAAGTGATTTCTCCAGCGG
AATTTTTCTCCGGCTTGAATTCTCCGACTATAATATCGACCCATTGATACCTTGGTATTT
CCCTTAAACTCACCTTTTGCTCCTGCAGTTTGTGGTTACCGTTAGGTAACACTAGTTTAA
TGCTCACCGGCGTGTCCCATCCATAGGCCGGATCCTCTAGTTTCACCTTAAAGACCACCT
CGTACGTAATCCCTGGAGTGAGATTCTTCGTGTCGAATTTTCCCGTGATGTCGAGCCAAC
ACACGTTTTTCAACGCCACAGCTTCTACACCTGCCTCGTTTGGTGACTCCTTGTTGAGAA
ACCAAGTCCAATAGTTGGGGTCATCCGACCAAGTGATCGAGAGGTTCCTTGGATAGAGCA
TGAAGTTGCTGTTTTTCTCGTCCACCCTAGACTCGATGTGTCCATTTTTAAGATTCTTGG
GCTTCAGGACATCAGAACGTAGCTGTGCAGTGGAGGGAGAAATTGGAACCTTGGCGTCTT
TGGGACTGGCCTCATAGTTTCTTGGAGTATCTGATAACTTCGGTTCAGCCCTTTTTACCC
AATCCCGATTGGTAAGCATCTTGATTATAGACATCTCCCGATTGAATTTTGTTTTCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 2 5

CO CL1251Contig1 765 2 1 U
GGATTACCCACTCACATAGAAAGAAAAAAAAATACTCTTAAGAGAGAGAAATGGAAGGCA
AGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCCATCGGAACAT
CGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGGCG
AGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTG
TCACGTTTGGTCTATTCTTGGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAG
TGATGCAGTGCTTGGGAGCCATTTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGC
AATACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACTGTGGCTCCTGGTTACACCAAAGGAAGTG
GTCTTGGAGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTG
ACGCCAAAAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCAATTGGAT
TCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAG
CTAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGT
TCTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGTCA
TCAGAGCCATCCCATTTAAGTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H755TF U 335
AF RR4AP59TF U 1
BS 1 765 RR4AP59TF

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G
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GATAACGCTTGGGACGACCATTGG
GCTTTTG

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DS 

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GTCTTGGAGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTG
ACGCCAAAAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCAATTGGAT
TCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAG
CTAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGT
TCTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGTCA
TCAGAGCCATCCCATTTAAGTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTT

QA 1 765 1 765
DS 



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AGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCCATCGGAACAT
CGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGGCG
AGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCTGAGTTCAGGAAGCTTTCGCTTA
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TGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACTGTAGCTC
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ACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTC
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CTGGAGCTGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAGGATA
ACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCTCTTGCTG
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AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4C372TF U 1
AF RR4C372JQ C 161
AF RR4GC85TF U 778
BS 1 596 RR4C372TF
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RD RR4C372TF 725 0 0
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AGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCTGAGTTCAGGAAGCTTTCGCTTA
CCCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGCCATCTGTGGAGCTGGTGTGG
TGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACTGTAGCTC
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ACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTC
TTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACTATCCCCATCA
CTGGAGCTGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAG*ATA
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CTCTGTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCC*ATTTAAGTCCAGAAGCTGATCCAGTC
ACTCT

QA 1 725 1 725
DS 

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TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTTTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCA
CTTAGCAACTATCCCCATCACTGGAGCTGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAGCTGC
CATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATT
CATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCATTTAA
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TCTTTTTGTGAATTGTGTGAAGCATCGTGTGTGTATTTGCTTGTTCCTCTTCTTTGCCTA
ATGCAAGACTATTTGT

QA 1 676 1 676
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G
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AGAC

QA 2 125 2 125
DS 



AS 1 6

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ACCTGCTCGTCCTTTTAAACAAGACGAAGCTATAGTTCCTTGTGATTTCAATCTCATCAC
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CTCAGATTCTTGCCACAGTGGTGGCCTCATTGACAAGGAGAAAGAACAAATCGGACCCTT
CTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTTACC
CTACAAGGAAGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGTACCGGAATCTCAACTTCAGACATTGG
TACACACCTACTCGAGCTCTTTGGTGGCGACGCTGGTCTAAAGTTCC*GGCTACCGGCTA
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TGAAGAACAAGGAACTAGTGATAATGGCAAGAGAAGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTCAGC
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GTGT*TTGATGTGTATTTTCACTCTTTCGTGGTGTGTGTGTTCCATAATTAAAAGGAAGA
ATAAATTGCTACGAATTTAAAACAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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G
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GGACCCTTCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAACAACATCACGT
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AC*GGCTATGGATTTGATGGATCTTT
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TGTCAAGAGAAGACTAGCCGTTCTCGTCGGCTGCAACTACCCTAACACAAAGAACGAGCT
TCACGGCTGCGTCAACGATGTTTTAGCCATGAAAGAAACTCTTTTAACCCGTTTCGGATT
CAAACAAAACGACATGGAGGTACTAACGGACGAGCCTGACTCAAAGCTAAAGCCTACTGG
AGCCAACATCAAGGCTGCTTTACGTAGGATGGTGGATAAAGCTCAAACCGGATCTGAAAA
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TCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTTAC
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AAGGCGTATGGAGCGTTTAGCAACGCGATTCAGACGGTTTTGAAGGAAATCGGAGGTGCC
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AATAAATTGCTACGGATTTAAAACAG

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GGTTTTGAAGGAAATCGGAGGTGCCTTGAAGGACAAGGAACTAGTGATAATGGCAAGAGA
AGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTCAGCAACACCCTTGTCTTTACTGCAGCGACCAGAACGC
GGGCGCAACGTTCCTGTCTCAACCTTGATGCGATTATACTTAATGAATAAAAGCGTTGTC
GTTGTGTTTCTTTTATTTGTGTTGTCGTGT*TTGATGTGTATTTTCACTCTTTCGTGGTG
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TCCGGCCATGGAGACAACGACGACAACAACATCACGTGCCTTACCCTACAAGGAAGTTCT
CGACCACTTGAGTTCTCGTACCGGAATCTCAACTTCAGACATTGGTACACACCTACTCGA
GCTCTTTGGTGGCGACGCTGGTCTAAAGTTCC*GGCTACCGGCTATGGATTTGATGGATC
TTTTGGAGAGCATGAAGGCGCGTGAAAGACACGTTGACTCAGGGATACTGTTGAGTGGGT
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TTAGCAACGCGATTCAGACGGTTTTGAAGGAAAACGGAGGTGCCTTGAAGAACAAGGAAC
TGGTGATAATGGCAAGAGAAGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTCAGCAACACCCTAGTCTTT
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AATGAATAAAAGCGTTGTCGTTGTGTTTCTTTTATTTGTGTTGTCGTGTGTTGATGTGTA
TTTTCACTCTTTCATGGTGTGTGTGTTCCATAATTAAAAGGAAGAATAAATTGCTACGAA
TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 6

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GGAGGAACATCAGTTAGTGAGTTCTGGCACGATCCAAAGAGAATGGCGACTGCGCTGCAG
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AGGTGGACAAAAGAAGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGTGCTTTGACAAACGGTGTG
CTTGGGATTCAACGAGGAACCGAGCCTGGACGGATGATCTACATGCTCCCGTTGGGTAAA
GGTGTTTCTAAAGCCGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATGCCTTCTGGTGT
TGCTATGGCACTGGAATTGAATCTTTCTCAAAACTGGGAGATTCTATATATTTTCAAGAA
GATGGAGGAGACTCTCCAGCTCTTTATGTCACACAATATATATCAAGCACACTTGATTGG
AAGTCTTCTGGTGTGTCTCTATCTCAGACGGTTAAACCGGTTGTGTCATGGGATCCGTAC
ATGCGTGTGACATTCACTTTCTCTTCTTCCAAAGGGGGGATAGGGAAGGATTCCACTTTG
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GATCAAGTAACCATGGAGCTACCCTTGAGTATCAGAATAGAAGCTATAAAAGATGATCGG
CCGGAGTACGCATCTCTTCAGGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCTGGACTCACG
AGCAGGGACTGGAGCATCACAACAACTCAAGCTAAAGGTGGGATATGGGTAAGCTCTATC
CCTGAAACACACAACACTCACCTCGTCACACTCTCACAACAGTCTGGAAACACATCTTAC
GTTTTGTCAAATAACAACCAAACCATCACCATGGAAGTATCTCCCGCGCCAGGGACGCAA
GCCGCTGTTGCATCAACTTTCAGGCTCGTGACTGTTGATTCTAAAGTAAGGATATCATCA
TCAGGTCCAAAGGAGCTAATTGGAAGCCTAGTCATAATCGAACCGTTTGATTTCCCTGGA
ATGCTTGTGACGCAAGCAACTGATGGCTCCCTTGCTGTTCAAGGTTCTTCTTCTACTGAC
AAAGAAGCCTCGAGGTTTCGTTTAGTAGATGGAGTTGATGGGAAGGAGGGGAGTGTTTCT
TTAATGCTAGAGAGCAAGAAGGGTTGTTATGTGTGCAGCGATCAAACACTAAAGCCGGGG
ATGAAACTGAAGCTCACATGTGATTCTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTTAGC
TTAAGGAAAGGAATGAGTGAATACAATCCGATGAGCTTCGTGACGAACGGAGCACAGAGG
AACTTTGTGTTGTCGCCATTGTTCAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGT
TTACAAACTTGAAGGAAGATAATACTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4CZ91TF U 1
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AF RR4B786TF U 573
AF RR4BG19TF U 573
AF RR4CZ91JQ C 753
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AAGTCTTCTGGTGTGTCTCTATCTCAGACGGTTAAACCGGTTGTGTCATGGGATCCGTAC
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TT

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DS 

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G
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TGCTGTTCAAGGTTCTTCTTCTACTGACAAAGAAGCCTCGAGGTTTCGTTTAGTAGATGG
AGTTGATGGGAAGGAGGGGAGTGTTTCTTTAATGCTAGAGAGCAAGAAGGGTTGTTATGT
GTGCAGCGATCAA*CACTAAAGCCGGGGATGAAACTGAAGCTCACATGTGATTCTGATGA
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GAGCTTCGTGACGAACGGAGCACAGAGGAACTTTGTGTTGTCGCCATTGTTCAGCTTAAG
AGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTTTACAAACTTGAAGGAAGATAATACTTTTTTT

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DS 



AS 1 5

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AGTTGATATCATCTAAGCTCCATAGCTCCATTGGGTTTCCCTCTTCCTGAGTCACACCAG
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AGTGGCTGCCCTGATCAGAACTGAAATACTGTCCAACATCGAAGAACTGATTGTTGTACA
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TTCCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4DA13JQ U 3
AF RR4DU91JQ U 1
AF RR4DU91TF C 285
AF RR4G993JQ U 3
AF RR4G993TF C 209
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DS 

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GCCCAGTGAGACAACAACAAACACAAAAACCAAACTGAAGACTTAAATAAACCGCTGTTT
GTCTTCACAATGGGCTTTTGAAACTCACCAACACACACACAAAAAAACAGCTTTATTTAC
AAACTAGGTAACCAACCCATCATTCAATCACACTTCAGAAGACTCCTCCATCCAGCATGG
AGTTGATATCATCTAAGCTCCATAGATCCATTGGGTTTCCCTCTTCCTGAGTCACACCAG
CAGCATCTACTCCGAGCATATCTTCCACTTCTAAAGGAGACTCCCACAAGGCATTGTCAA
GGTATGCCATCAGATCATCATTGTTGCTCGTCTCGTCCTCGGAGTTGAGTTTGACCTTCT
TGGCTGCATTGGTTTCTTCAGCAAAGGTGGTAGCTTGGTTGTTATTGACTAGCATTGAGG
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AGTGGCTGCCCTGATCAGAACTGAAATACTGTCCAACATCGAAGAACTGATTGTTGTACA
TCTGAGGCTTCTCTTCAATGAAACCAACATCACCAAAGGAGTTGTTGCAGTACTGACTCA
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DS 

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TT
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GAGTTTGACCTTCTTGGCTGCATTGGTTTCTTCAGCAAAGGTGGTAGCTTGGTTGTTATT
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GCAGTACTGACTCAGATGTGGTGTTGGCTGCTGAACCAAAGCTACGG

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DS 

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CTTCACAATGGGCTTTTGAAACTCACCAACACACACACAAAAAAACAGCTTTATTTACAA
ACTAGGTAACCAACCCATCATTCAATCACACTTCAGAAGACTCCTCCATCCAGCATGGAG
TTGATATCATCTAAGCTCCATAGCTCCATTGGGTTTCCCTCTTCCTGAGTCACACCAGCA
GCATCTACTCCGAGCATATCTTCCACTTCTAAAGGAGACTCCCACAAGGCATTGTCAAGG
TATGCCATCAGATCATCATTGTTGCTCGTCTCGTCCTCGGAGTTGAGTTTGACCTTCTTG
GCTGCATTGGTTTCTTCAGCAAAGGTGGTAGCTTGGTTGTTATTGACTAGCATTGAGGAG
ATCTCTGGTGGTGTCTTGGGGCCGTGATCACTCCACCCAAACTCAGAGCAGTCGAATGAG
TGGCTGCCCTGATCAGAACTGAAATACTGTCCAACATCGAAGAACTGATTGTTGTACATC
TGAGGCTTCTCTTCAATGAAACCAACATCACCAAAGGAGTTGTTGCAGTACTGACTCAGA
TGTGGTGTTGGCTGCTGAACCAAAGCTACGGTTTGGTTTGGTTTAGCCACTGGTTTCTTA
AGATTACTGGTCTTAGCAGTAGGAACCATCTCCTCT

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DS 

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CATTGGGTTTCCCTCTTC*TGAGTCACACCAGCAGCATCTACTCCGAGCATATCTTCCAC
TTCTAAAGGAGACTCCCACAAGGCATTGTCAAGGTATGCCATCAGATCATCATTGTTGCT
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GGTAGCTTGGTTGTTATTGACTAGCATTGAGGAGATCTCTGGTGGTGTCTTGGGGCCGTG
ATCACTCCACCCAAACTCAGAGCAGTCGAATGAGTGGCTGCCCTGATCAGAACTGAAATA
CTGTCCAACATCGAAGAACTGATTGTTGTACATCTGAGGCTTCTCTTCAATGAAACCAAC
ATCACCAAAGGAGTTGTTGCAGTACTGACTCAGATGTGGTGTTGGCTGCTGAACCAAAGC
TACGGTTTGGTTTGGTTTAGCCACTGGTTTCTTAAGATTACTGGTCTTAGCAGTAGGAAC
CATCTCCTCTTCAGGGAAATTCACTTTAGCTTTATCGCCACGGATCCTGCGTGCAGCTGC
ATCATAAGCTCTTGCTGCTTCCTCAGCGGTGTCGAACGTTCCAAGCCATTCTCGAGAGCC
TTTCTTAGGATCACGGATCTCAGCAGCCCATTTTCCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 6

CO CL1255Contig1 1091 6 4 U
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ATGTCTCCTCAATTTTCCGATACTAATCAAGATCGCCGATTCGTTTCTATCTCTGTATTT
CATGGTTCTCTGCGATCTCCGACCCGTAACGGTCGATCTAGACGACGGAGAAACCACCGT
CCATTTCTGGATCTCCGGCCACCGAAGAATCTCACGTCCGAATCTCGTCATGCTCCACGG
ATACGGAGGAAACTCCAAATGGCAGTTCGTTCACCAAGTCTCCGATCTCTCCAAGTCATT
TAATCTGTTCATCCCCGATTTGGTGTTCTTCGGGAAATCATACACCAAGAATGCGGATCG
GAGCGTTGAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTTGAAGAAACTAGGCTGCGACGT
AAGGATCTCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGTGGCGTATAAAATGGCGGAGAT
GTGGCCGGAGATGATGGAGAAGCTGGTGATCGTGAGCAGCGGAGTGGGGTTTACTCAGCA
GCAGAAGACGGCGGAGATGAGAAAACACGGTGGTGATTGTTCGAAGATGCTTGTTCCGAA
AACTCCGATGGATCTAAGGATGTTGGTTAAGATCTCTACTAACACCGGTTTAACGTTTGT
GGATTGGGTACCAGGTTTTATCCTCTCCCAATTCATAGCTGTAATGTATGAGAAAAATAG
ACAGGAGCTTCTCGAACTAGCTAAGAACTTGCTGGAAAGAGAAGAAGCAGAGTTGCCTGT
AATATCACAGAAAACGTTAATCGTTTGGGGAGACAAGGACAAAGTATTTCCATTGGAGCA
TGGTTATCGGCTGCAAAGGCATCTGCAAAATTCAAGATTAGAGATTATCAAGGAAATTGG
GCATGCTGTTAACGTTGAAGCACCAACTACTCTTAATAATTTGATTACATCGTTTGTCTT
AAACGTTTGATTTTTAATTTTGTAATACACTTCTAACTCTACCAACTATCTATATGTCAG
CTGGTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4BX13TF U 1
AF RR4H167TF U 6
AF RR4F237TF U 6
AF RR4H167JQ C 300
AF RR4BX13JQ C 340
AF RR4F237JQ C 405
BS 1 614 RR4BX13TF
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BS 731 1090 RR4H167JQ
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RD RR4BX13TF 614 0 0
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ATGTCTCCTCAATTTTCCGATACTAATCAAGATCGCCGATTCGTTTCTATCTCTGTATTT
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CCATTTCTGGATCTCCGGCCACCGAAGAATCTCACGTCCGAATCTCGTCATGCTCCACGG
ATACGGAGGAAACTCCAAATGGCAGTTCGTTCACCAAGTCTCCGATCTCTCCAAGTCATT
TAATCTGTTCATCCCCGATTTGGTGTTCTTCGGGAAATCATACACCAAGAATGCGGATCG
GAGCGTTGAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTTGAAGAAACTAGGCTGCGACGT
AAGGATCTCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGTGGCGTATAAAATGGCGGAGAT
GTGGCCGGAGATGATGGAGAAGCTGGTGATCGTGAGCAGCGGAGTGGGGTTTACTCAGCA
GCAGAAGACGGCGG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4H167TF 667 0 0
GG
GCACCAGACCCACACCACTTCCTCTGCACTAAAAAGATGGCGTCCATGAAACACGTCCAT
CTCTTTCGTCGTTACCTCACCATCGCTCTCACTCTCTTTCAAAGCCTAATCTCATGTCTC
CTCAATTTTCCGATACTAATCAAGATCGCCGATTCGTTTCTATCTCTGTATTTCATGGTT
CTCTGCGATCTCCGACCCGTAACGGTCGATCTAGACGACGGAGAAACCACCGTCCATTTC
TGGATCTCCGGCCACCGAAGAATCTCACGTCCGAATCTCGTCATGCTCCACGGATACGGA
GGAAACTCCAAATGGCAGTTCGTTCACCAAGTCTCCGATCTCTCCAAGTCATTTAATCTG
TTCATCCCCGATTTGGTGTTCTTCGGGAAATCATACACCAAGAATGCGGATCGGAGCGTT
GAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTTGAAGAAACTAGGCTGCGACGTAAGGATC
TCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGTGGCGTATAAAATGGCGGAGATGTGGCCG
GAGATGATGGAGAAGCTGGTGATCGTGAGCAGCGGAGTGGGGTTTACTCAGCAGCAGAAG
ACGGCGGAGATGAGAAAACACGGTGGTGATTGTTCGAAGATGCTTGTTCCGAAA*CTCCG
ATGGA

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR4F237TF 725 0 0
GG
GCACCAGACCCACACCACTTCCTCTGCACTAAAAAGATGGCGTCCATGAAACACGTCCAT
CTCTTTCGTCGTTACCTCACCATCGCTCTCACTCTCTTCCAAAGCCTAATCTCATGTCTC
CTCAATTTTCCGGTACTAATCAAGATCGCCGATTCGTTTCTATCTCTGTATTTCATGGTT
CTCTGCGATCTCCGACCCGTAACGGTCGATCTAGACGACGGAGAAACCACCGTCCATTTC
TGGATCTCCGGCCACCGAAGAATCTCACGTCCGAATCTCGTCATGCTCCACGGATACGGA
GGAAACTCCAAATGGCAGTTCGTTCACCAAGTCTCCGATCTCTCCAAGTCATTTAATCTG
TTCATCCCCGATTTGGTGTTCTTCGGGAAATCATACACCAAGAATGCGGATCGGAGCGTT
GAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTTGAAGAAACTAGGCTGCGACGTAAGGATC
TCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGTGGCGTATAAAATGGCGGAGATGTGGCCG
GAGATGATGGAGAAGCTGGTGATTGTGAGCAGCGGAGTGGGGTTTACTCAGCAGCAGAAG
ACGGCGGAGATGAGAAAACACGGTGGTGATTGTTCGAAGATGCTTGTTCCGAAAACTCCG
ATGGATCTAAGGATGTTGGTTAAGATCTCTACTAACACCGGTTTAACGTTTGTGGATTGG
GTA

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR4H167JQ 792 0 0
GATACGGAGGAAACTCCAAATGGCAGTTCGTTCACCAAGTCTCCGATCTCTCCAAGTCAT
TTAATCTGTTCATCCCCGATTTGGTGTTCTTCGGGAAATCATACACCAAGAATGCGGATC
GGAGCGTTGAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTTGAAGAAACTAGGCTGCGACG
TAAGGATCTCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGTGGCGTATAAAATGGCGGAGA
TGTGGCCGGAGATGATGGAGAAGCTGGTGATCGTGAGCAGCGGAGTGGGGTTTACTCAGC
AGCAGAAGACGGCGGAGATGAGAAAACACGGTGGTGATTGTTCGAAGATGCTTGTTCCGA
AAACTCCGATGGATCTAAGGATGTTGGTTAAGATCTCTACTAACACCGGTTTAACGTTTG
TGGATTGGGTACCAGGTTTTATCCTCTCCCAATTCATAGCTGTAATGTATGAGAAAAATA
GACAGGAGCTTCTCGAACTAGCTAAGAACTTGCTGGAAAGAGAAGAAGCAGAGTTGCCTG
TAATATCACAGAAAACGTTAATCGTTTGGGGAGACAAGGACAAAGTATTTCCATTGGAGC
ATGGTTATCGGCTGCAAAGGCATCTGCAAAATTCAAGATTAGAGATTATCAAGGAAATTG
GGCATGCTGTTAACGTTGAAGCACCAACTACTCTTAATAATTTGATTACATCGTTTGTCT
TAAACGTTTGATTTTTAATTTTGTAATACACTTCTAACTCTACCAACTATCTATATGTCA
GCTGGTTTATA
C

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4BX13JQ 752 0 0
CTCCGATCTCTCCAAGTCATTTAATCTGTTCATCCCCGATTTGGTGTTCTTCGGGAAATC
ATACACCAAGAATGCGGATCGGAGCGTTGAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTT
GAAGAAACTAGGCTGCGACGTAAGGATCTCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGT
GGCGTATAAAATGGCGGAGATGTGGCCGGAGATGATGGAGAAGCTGGTGATCGTGAGCAG
CGGAGTGGGGTTTACTCAGCAGCAGAAGACGGCGGAGATGAGAAAACACGGTGGTGATTG
TCCGAAGATGCTTGTTCCGAAAACTCCGATGGATCTAAGGATGTTGGTTAAGATCTCTAC
TAACACCGGTTTAACGTTTGTGGATTGGGTACCAGGTTTTATCCTCTCCCAATTCATAGC
TGTAATGTATGAGAAAAATAGACAGGAGCTTCTCGAACTAGCTAAGAACTTGCTGGAAAG
AGAAGAAGCAGAGTTGCCTGTAATATCACAGAAAACGTTAATCGTTTGGGGAGACAAGGA
CAAAGTATTTCCATTGGAGCATGGTTATCGGCTGCAAAGGCATCTGCAAAATTCAAGATT
AGAGATTATCAAGGAAATTGGGCATGCTGTCAACGTTGAAGCACCAACTACTCTTAATAA
TTTGATTACATCGTTTGTCTTAAACGTTTGATTTTTAATTTTGTAATACACTTCTAACTC
TACCAACTATCTATATGTCAGCTGGTTTATAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4F237JQ 687 0 0
CCAAGAATGCGGATCGGAGCGTTGAGATTCAGGCGAGGAGCATCGTCGGAGGGTTGAAGA
AACTAGGCTGCGACGTAAGGATCTCGGTGTATTCGATAAGCTACGGTGGGTTCGTGGCGT
ATAAAATGGCGGAGATGTGGCCGGAGATGATGGAGAAGCTGGTGATTGTGAGCAGCGGAG
TGGGGTTTACTCAGCAGCAGAAGACGGCGGAGATGAGAAAACACGGTGGTGATTGTTCGA
AGATGCTTGTTCCGAAAACTCCGATGGATCTAAGGATGTTGGTTAAGATCTCTACTAACA
CCGGTTTAACGTTTGTGGATTGGGTACCAGGTTTTATCCTCTCCCAATTCATAGCTGTAA
TGTATGAGAAAAATAGACAGGAGCTTCTCGAACTAGCTAAGAACTTGCTGGAAAGAGAAG
AAGCAGAGTTGCCTGTAATATCACAGAAAACGTTAATCGTTTGGGGAGACAAGGACAAAG
TATTTCCATTGGAGCATGGTTATCGGCTGCAAAGGCATCTGCAAAATTCAAGATTAGAGA
TTATCAAGGAAATTGGGCATGCTGTTAACGTTGAAGCACCAACTACTCTTAATAATTTGA
TTACATCGTTTGTCTTAGACGTTTGATTTTTAATTTTGTAATACACTTCTAACTCTACCA
ACTATCTATATGTCAGCTGGTTTATA
T

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

CO CL1256Contig1 1059 6 4 U
ACCCGATAAATTACAATGAATAACCAAATCAGACCAAACCAAACTGATACAGTATGAGAT
CAGAGGCGTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTCATGATACAAAACAAGCTACTTGGTTTCACAA
AGAAGATACAACAAGTAAAGATCGAGAAAACAAACAGGGAAAATTTTCAATTGAGCAACT
CAAGACACTGTTAAAGAGTTAAAACTAGGACAGTGTCGAATGTTCTCAAAGCAAGTCACT
CACTCTAGGATAAGATTACGAGTCAAAAACAGAAGATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCA
ACAGTACTCTCCCCTCAGGCAACCAATTCAAATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAAC
GTTTTGTAATCCAAGCTCCTTGCGGTTTCAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTC
CCTACCAAGACACCATGTCCTAAGTTGAGTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACC
ACTCTTTGGATTTCTTCGGTTAAAGCAGGAAGCGGAGAGAATAGGTAAGCTGGATCAACG
TTCCCCTGCACGCTAACATCGCTCCCCAGTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTC
CAGTCAAGTCCAATAACATCAGCTCCTGTTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTT
CCATTTATGTAGAAAACTATCGGCGTGTCTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATC
TCCTCGATGTAAGGTTTGGACCAACGCTCCCACATCTCAGGAGTCAGCTGCCCACCCCAC
GAATCAAATATCTGAATGCAGTGAGCTCCGTGCTCGACTTGGTACACAACGTACTCCGTA
ATAGCTTTGGTCAAATGAGACAAGAGAGCTCTCAGCACATTCGGTGCAGTATGACACATA
CTCTTGATCACCGTATACGTCCGAGTCGTTCCTCCTTCAACTATATAAGTCGCTATCGTC
CAAGGCGCTCCAACGAAACCCAAAACAGCAGCATTCCCTCCGACCTCTCCTCTCAGAATC
TTTAACGAGTCACCAACGAACCGAAGCTTGTCGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B996JQ U 1
AF RR4AY78JQ U 84
AF RR4BH96TF C 1
AF RR4B996TF C 7
AF RR4BH96JQ U 1
AF RR4AY78TF C 209
BS 1 124 RR4B996JQ
BS 125 125 RR4AY78JQ
BS 126 749 RR4B996JQ
BS 750 1059 RR4AY78TF

RD RR4B996JQ 749 0 0
ACCCGATAAATTACAATGAATAACCAAATCAGACCAAACCAAACTGATACAGTATGAGAT
CAGAGGCGTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTCATGATACAAAACAAGCTACTTGGTTTCACAA
AGAAAATACAACAAGTAAAGATCGAGAAAACAAACAGGGAAAATTTTCAATTGAGCAACT
CAAGACACTGTTAAAGAGTTAAAACTAGGACAGTGTCGAATGTTCTCAAAGCAAGTCACT
CACTCTAGGATAAGATTACGAGTCAAAAACAGAAGATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCA
ACAGTACTCTCCCCTCAGGCAACCAATTCAAATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAAC
GTTTTGTAATCCAAGCTCCTTGCGGTTTCAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTC
CCTACCAAGACACCATGTCCTAAGTTGAGTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACC
ACTCTTTGGATTTCTTCGGTTAAAGCAGGAAGCGGAGAGAATAGGTAAGCTGGATCAACG
TTCCCCTGCACGCTAACATCGCTCCCCAGTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTC
CAGTCAAGTCCAATAACATCAGCTCCTGTTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTT
CCATTTATGTAGAAAACTATCGGCGTGTCTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATC
TCCTCGATGTAAGGTTTGGACCAACGCTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AY78JQ 653 0 0
CAGTTCATGATACAAAACAAGCTACTTGGTTTCACAAAGAAGATACAACAAATAAAGATC
GAGAAAACAAACAGGGAAAATTTTCAATTGAGCAACTCAAGACACTGTTAAAGAGTTAAA
ACTAGGACAGTGTCGAATGTTCTCAAAGCAAGTCACTCACCCTAGGATAAGATTACGAGT
CAAAAACAGAAGATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCAACAGTACTCTCCCCTCAAGCAAC
CAATTCAAATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAACGTTTTGTAATCCAAGCTCCTTGC
GGTTTCAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTCCCTACCAAGACACCATGTCCTAA
GTTGAGTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACCACTCTTTGGATTTCTTCGGTTAA
AGCAGGAAGCGGAGAGAATAGGTAAGCTGGATCAACGTTCCCCTGCACGCTAACATCGCT
CCCCAGTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTCCAGTCAAGTCCAATAACATCAGC
TCCTGTTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTTCCATTTATGTAGAAAACTATCGG
CGTGTCTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATCTCCTCGATGTAAGG
GT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4BH96TF 749 0 0
ACCCGA
TAAATTACAATGAATAACCAAATCAGACCAAACCAAACTGATACAGTATGAGATCAGAGG
CGTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTCATGATACAAAACAAGCTACTTGGTTTCACAAAGAAGA
TACAACAAGTAAAGATCGAGAAAACAAACAGGGAAAATTTTCAATTGAGCAACTCAAGAC
ACTGTTAAAGAGTTAAAACTAGGACAGTGTCGAATGTTCTCAAAGCAAGTCACTCACTCT
AGGATAAGATTACGAGTCAGAAACAGAAGATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCAACAGTA
CTCTCCCCTCAGGCAACCAATTCAGATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAACGTTTTG
TAATCCAAGCTCCTTGCGGTTTCAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTCCCTACC
AAGACACCATGTCCTAAGTTGAGTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACCACTCTT
TGGATTTCTTCGGTTAAAGCAGGAAGCGGAGAGAATAGGTAAGCTGGATCAACGTTCCCC
TGCACGCTAACATCGCTCCCCAGTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTCCAGTCA
AGTCCAATAACATCAGCTCCTGTTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTTCCATTT
ATGTAGAAAACTATCGGCGTGTCTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATCTCCTCG
ATGTAAGGTTTGGACCAACGCTC

QA 7 749 7 749
DS 

RD RR4B996TF 743 0 0
TAAATTACAATGAATAACCAAATCAGACCAAACCAAACTGATACAGTATGAGATCAGAGG
CGTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTCATGATACAAAACAAGCTACTTGGTTTCACAAAGAAGA
TACAACAAGTAAAGATCGAGAAAACAAACAGGGAAAATTTTCAATTGAGCAACTCAAGAC
ACTGTTAAAGAGTTAAAACTAGGACAGTGTCGAATGTTCTCAAAGCAAGTCACTCACTCT
AGGATAAGATTACGAGTCAGAAACAGAAGATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCAACAGTA
CTCTCCCCTCAGGCAACCAATTCAGATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAACGTTTTG
TAATCCAAGCTCCTTGCGGTTTCAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTCCCTACC
AAGACACCATGTCCTAAGTTGAGTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACCACTCTT
TGGATTTCTTCGGTTAAAGCAGGAAGCGGAGAGAATAGGTAAGCTGGATCAACGTTCCCC
TGCACGCTAACATCGCTCCCCAGTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTCCAGTCA
AGTCCAATAACATCAGCTCCTGTTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTTCCATTT
ATGTAGAAAACTATCGGCGTGTCTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATCTCCTCG
ATGTAAGGTTTGGACCAACGCTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4BH96JQ 749 0 0
ACCCGA
TAAATTACAATGAATAACCAAATCAGACCAAACCAAACTGATACAGTATGAGATCAGAGG
CGTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTCATGATACAAAACAAGCTACTTGGTTTCACAAAGAAAA
TACAACAAGTAAAGATCGAGAAAACAAACAGGGAAAATTTTCAATTGAGCAACTCAAGAC
ACTGTTAAAGAGTTAAAACTAGGACAGTGTCGAATGTTCTCAAAGCAAGTCACTCACTCT
AGGATAAGATTACGAGTCAAAAACAGAAAATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCAACAGTA
CTCTCCCCTCAGGCAACCAATTCAAATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAACGTTTTG
TAATCCAAGCTCCTTGCGGTTTCAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTCCCTACC
AAGACACCATGTCCTAAGTTGAGTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACCACTCTT
TGGATTTCTTCGGTTAAAGCAGGAAGCGGAAAGAATAGGTAAGCTGGATCAACGTTCCCC
TGCACGCTAACATCGCTCCCCAGTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTCCAGTCA
AGTCCAATAACATCAGCTCCTGTTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTTCCATTT
ATGTAGAAAACTATCGGCGTGTCTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATCTCCTCG
ATGTAAGGTTTGGACCAACGCTC

QA 7 749 7 749
DS 

RD RR4AY78TF 851 0 0
GACAGTGTCGAATGT*CTCAAAGCAAGTCACTCAC*CTAGGATAAGATTACGAGTCAGAA
ACAGAAGATTTTCTCTGATTCCTGTCTATTCAACAGTACTCTCCCCTCAAGCAACCAATT
CAGATTCTGCAGGAACATGGTTTTGGAAAAACGTTTTGTAATCCAAGCTCCTTGCGGTTT
CAAAGAAATGAGCCACGGCTTCCTCTGGCGTCCCTACCAAGACACCATGTCCTAAGTTGA
GTATATGCCCTTTTGGTCCAGCACTCTTCACCACTCTTTGGATTTCTTCGGTTAAAGCAG
GAAGCGGAGAGAATAGGTAAGCTGGATCAACGTTCCCCTGCACGCTAACATCGCTCCCCA
GTCTCCTCCTTCCATCAGCCATATCTACAGTCCAGTCAAGTCCAATAACATCAGCTCCTG
TTCCTTTCATCCGCTCAAGAAGTCCACCGTTTCCATTTATGTAGAAAACTATCGGCGTGT
CTGGACATCTTCTCTTTACCTCATGAATAATCTCCTCGATGTAAGGTTTGGACCAACGCT
CCCACATCTCAGGAGTCAGCTGCCCACCCCACGAATCAAATATCTGAATGCAGTGAGCTC
CGTGCTCGACTTGGTACACAACGTACTCCGTAATAGCTTTGGTCAAATGAGACAAGAGAG
CTCTCAGCACATTCGGTGCAGTATGACACATACTCTTGATCACCGTATACGTCCGAGTCG
TTCCTCCTTCAACTATATAAGTCGCTATCGTCCAAGGCGCTCCAACGAAACCCAAAACAG
CAGCATTCCCTCCGACCTCTCCTCTCAGAATCTTTAACGAGTCACCAACGAACCGAAGCT
TGTCGAGATCC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 4

CO CL1257Contig1 744 4 16 U
GTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGTCACAAGGACTGCAAATCAA
ACCTGTCTGAGTTTGATGATGTCCAAGGACACCCTGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGGT
TCAAGCGATTGATCAAGGATCAGAATGACCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT
TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATGACGAGAGGAAGAAGGTTGGAG
CAAGCGATGTGGCTATTCGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGACCTCATTC
AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGA
ACATGGGAGCATTCAGCTACATAACTCCAAGGCTATGGACAGCGATGAGAAGCTTAGGCA
GAGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCTTCTGCTGCTACTGCCACTG
GTTTCTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTCCAGAAAGCCATTGGAAAGG
AACCCATCAGTTAAAAACCAAACTTCATTTTTTTGAATGAATTCTTTAAATAAGAAACTT
TGGGTGAATCAAAGTGATAAACAACACTGACAAAATCATCATGTATTTGCTTTATTTGGC
CCCTTTGATTTTTTTTT*GAGCCTGTCTTGTGTTGCAGGTTAATACGGATCATACTCATT
TTCATAAAAGCTTTGTTTTTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D480TF U 194
AF RR4FQ77JQ C 1
AF RR4FQ77TF U 1
AF RR4BR93JQ C 11
BS 1 415 RR4FQ77TF
BS 416 416 RR4D480TF
BS 417 541 RR4FQ77TF
BS 542 542 RR4D480TF
BS 543 556 RR4FQ77TF
BS 557 557 RR4D480TF
BS 558 637 RR4FQ77TF
BS 638 640 RR4D480TF
BS 641 674 RR4FQ77TF
BS 675 677 RR4D480TF
BS 678 698 RR4FQ77TF
BS 699 699 RR4FQ77JQ
BS 700 707 RR4FQ77TF
BS 708 708 RR4FQ77JQ
BS 709 728 RR4FQ77TF
BS 729 744 RR4BR93JQ

RD RR4D480TF 523 0 0
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TATTTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAA
GAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATT
CAGCTACATAACTCCAAGGCTATGGACAGCGATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGA
AGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCTTCTGCTGCTACTGCCACTGGTTTCTACACTTT
CCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTTCAGAAATCCATTGGAGAGGAACCCATCAGTTA
AAAACCAAACTTCATTTTTT*GAATGAATTCTTTAAATAAGAA*CTTTGGGTGAATCAAA
GTGATAAACAACACTGACAAAATCATCATGTATTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTT
TTTTTGAGCCTGTCTTGTGTTGCAG*TTAATACG
GATCATACT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4FQ77JQ 745 0 0
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ACCTGTCTGAGTTTGATGATGTCCAAGGACACCCTGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGGT
TCAAGCGATTGATCAAGGATCAGAATGACCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT
TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATGACGAGAGGAAGAAGGTTGGAG
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AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGA
ACATGGGAGCATTCAGCTACATAACTCCAAGGCTATGGACAGCGATGAGAAGCTT*GGCA
GAGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCTTTTGCTGCTACTGCCACTG
GTTTTTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTCCAGAAAGCCATTGGAAAGG
AGCCCATCAGTTAAAA*CCAAACTTCATTTTTTTGAATGAATTCTTTAAATAAGAAACTT
TGGGTGAATCAAAGTGATAAACAACACTGACAAAATC***ATGTATTTGCTTTATTTGGC
CCCTTTGATTTTTT**T*GAGCCTGTCTTGTGTTGCAGGTTAATACGGATCATACTCATT
TTCATAAA
AGCTTTTGTTTTTTTTC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4FQ77TF 742 0 0
GTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGTCACAAGGACTGCAAATCAA
ACCTGTCTGAGTTTGATGATGTCCAAGGACACCCTGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGGT
TCAAGCGATTGATCAAGGATCAGAATGACCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT
TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATGACGAGAGGAAGAAGGTTGGAG
CAAGCGATGTGGCTATTCGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGACCTCATTC
AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGA
ACATGGGAGCATTCAGCTACATAACTCCAAGGCTATGGACAGCGATGAGAAGCTT*GGCA
GAGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCTTCTGCTGCTACTGCCACTG
GTTTCTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTCCAGAAAGCCATTGGAAAGG
AGCCCATCAGTTAAAA*CCAAACTTCATTTTTTTGAATGAATTCTTTAAATAAGAAACTT
TGGGTGAATCAAAGTGATAAACAACACTGACAAAATC***ATGTATTTGCTTTATTTGGC
CCCTTTGATTTTTT****GAGCCTGTCTTGTGTTGCAG*TTAATACG*ATCATACTCATT
TTCATAAA
GCTTTGTTTTTTTC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4BR93JQ 734 0 0
GATA
GTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGTCACAAGGACTGCAAATCAAACCTCTCTGAGTTT
GATGATGTCCAAGGACACCCTGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGATTCAAGCGATTAATC
AAGGATCAGAATGACCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGATTGGTACTTTGCTCC
GGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATGATGAGAGGAAGAAGGTTGGAGCAAGCGATGTGGCT
ATTTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAG
AGATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGATCATTC
AGCTACATAACTCCAAGGCTATGGACAGCGATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGAA
GACATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCTTCTGCTGCTACTGCCACTGGTTTCTACACTTTC
CATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTTCAGAAAGCCATTGGAAAGGAACCCATCAGTTAA
AAACCAAACTTCATTTTTT*GAATGAATTCTTTAAATAAGAA*CTTTGGGTGAATCAAAG
TGATAAACAACACTGACAAAATCATCATGTATTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTTT
TTT*GAGCCTGTCTTGTGTTGCAGGTTAATACGGATCATACTCATTTTCATAAAAGCTTT
GTTTTTTTTC

QA 5 734 5 734
DS 



AS 1 6

CO CL1258Contig1 755 6 13 U
GGAAACTGAATCCAAAGAAACTAAGATAAAACATAGAAATAAAACACATTTCATCTCTTT
CATATTCAAATGGCTATGGCTCAAAAGGATAGGAATACAAGGATGGCTCAAAGGGCCTTT
GAAATGGTCGATAAGGTGTACGGTAGGTCCCAGAAAACAGGCCTTCCAGTACTATATGTT
CCTAGAGACGAGCCTGCTCCTCGTTTTAGCCAAAATTCTTACGAATATGGTGGTCCAAAA
GTCTATACCGTAAAAGAGGGAACTAATACTACTAGTTGCCGCCGAGTCATTTATCAGTAT
TCAAAAGAGTCAACCACAAAGGAACCGGTTGTTTCTCTCCCCACAGAACATATTCAATAC
TTCGGTGGTGTCCGTTCTCACATGGGCCATGCAAACAGGTTTGGAACTCCGAAAGGAGGG
GCTATTAGCTGCGACGAGGCCGTCCAACTCTATGGAGGGGTTCTTATAAAGGAATATCGT
AAATAACCGAGGGAAACTAAATTAATGTTGAAGATGGA**TGGTGAGTTTGTATAAAAGT
GTTTATAGTTGTTATTTCTGATAACGGAAAAGTGCAGACCAACACAGATACTAAAGCTTG
TTGTAATGGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCACTACAAGTGTTTGTGTCTGTTAAG
TATCTACCAGTACTTCAAGTTGAAGCTTTATGTATTATAAAATCCCAGGGTGTTACTTCT
GATGAAGATAGATAATATGCTTTATATAAAAAAAA


BQ
35 35 35 35 35 35 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C204TF U 1
AF RR4H765TF U 1
AF RR4C204JQ C 1
AF RR4GF28TF U 1
AF RR4C667JQ C 6
AF RR4H765JQB C 1
BS 1 6 RR4C204TF
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BS 226 656 RR4C204TF
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BS 669 677 RR4C204TF
BS 678 701 RR4GF28TF
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BS 703 723 RR4GF28TF
BS 724 755 RR4C204JQ

RD RR4C204TF 696 0 0
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TTGTAATGGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCACTACAAGTGTTTGTGTCTGT*AAG
TATCTAC*AGTACTTCA
GTGAAGCTTTATGTATATA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4H765TF 704 0 0
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TCAAAAGAGTCAACCACAAAGGAACCGGTTGTTTCTCTCCCCACAGAACATATTCAATAC
TTCGGTGGTGTCCGTTCTCACATGGGCCATGCAAACAGGTTTGGAACTCCGAAAGGAGGG
GCTATTAGCTGCGACGAGGCCGTCCAACTCTATGGAGGGGTTCTTATAAAGGAATATCGT
AAATAACCGAGGGAAACTAAATTAATGTTGAAGATGGA**TGGTGAGTTTGTATAAAAGT
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TTGTAATGGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCACTACAAGTGTTTGTGTCTGTTAAG
TATCTATCAGTACTTCAAGTTGAAGCTTTATGTATTATAAAATC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4C204JQ 755 0 0
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CCTAGAGACGAGCCTGCTCCTCGTTTTAGCCAAAATTCTTACGAGTATGGTGGTCCAAAA
GTCTATACCGTAAAAGAGGGAACTAATACTACTAGTTGCCGCCGAGTCATTTATCAGTAT
TCAAAAGAGTCAACCACAAAGGAACCGGTTGTTTCTCTCCCCACAGAACATATTCAATAC
TTCGGTGGTGTCCGTTCTCACATGGGCCATGCAAACAGGTTTGGAACTCCGAAAGGAGGG
GCTATTAGCTGCGACGAGGCCGTCCAACTCTATGGAGGGGTTCTTATAAAGGAATATCGT
AAATAACCGAGGGAAACTAAATTAATGTTGAAGATGGA**TGGTGAGTTTGTATAAAAGT
GTTTATAGTTGTTATTTCTGATAACGGAAAAGTGCAGACCAACACAGATACTAAAGCTTG
TTGTAATGGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCACTACAAGTGTTTGTGTCTGTTAAG
TATCTACCAGTACTTCAAGTTGAAGCTTTATGTATTATAAAATCCCAGGGTGTTACTTCT
GATGAAGATAGATAATATGCTTTATATAAAAAAAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4GF28TF 723 0 0
GGAAACTGAATCCAAAGAAACTAAGATAAAACATAGAAACAAAACACATTTCATCTCTTT
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CCTAGAGACGAGCCTGCTCCTCGTTTTAGCCAAAATTCTTACGAATATGGTGGTCCAAAA
GTCTATACCGTAAAAGAGGGAACTAATACTACTAGTTGCCGCCGAGTCATTTATCAGTAT
TCAAAAGAGTCAGCCACAAAGGAACCGGTTGTTTCTCTCCCCACAGAACATATTCAATAC
TTCGGTGGTGCCCGTCCTCACATGGGCCATGCAAACAGGTTTGGAACTCCGAAAGGAGGG
GCTATTAGCTGCGACGAGGCCGTTCAACTCTATGGAGGGGTTCTTATAAAGGAATATCGT
AAATAACCGAGGGAAACTAAATTAATGTTGAAGATGGATTTGGTGAGTTTGTATAAAAGT
GTTTATAGTTGTTATTTCTGATAACGGAAAAGTGCAGACCAACACATATACTAAAGCTTG
TTGTAATGGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCAGTACAAGTGTTTGTGTCTGTTAAG
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GAT

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DS 

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GG
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AAATGGCTATGGCTCAAAAGGATAGGAATACAAGGATGGCTCAAAGGGCCTTTGAAATGG
TCGATAAGGTGTACGGTAGGTCCCAGAAAACAGGCCTTCCAGTACTATATGTTCCTAGAG
ACGAGCCTGCTCCTCGTTTTAGCCAAAATTCTTACGAATATGGTGGTCCAAAAGTCTATA
CCGTAAAAGAGGGAACTAATACTACTAGTTGCCGCCGAGTCATTTATCAGTATTCAAAAG
AGTCAACCACAAAGGAACCGGTTGTTTCTCTCCCCACAGAGCATATTCAATACTTCGGTG
GTGCCCGTCCTCACATGGGCCATGCAAACAGGTTTGGAACTCCGAAAGGAGGGGCTATTA
GCTGCGACGAGGCCGTTCAACTCTATGGAGGGGTTCTTATAAAGGAATATCGTAAATAAC
CGAGGGAAACTAAATTAATGTTGAAGATGGATTTGGTGAGTTTGTATAAAAGTGTTTATA
GTTGTTATTTCTGATAACGGAAAAGTGCAGACCAACACATATACTAAAGCTTGTTGTAAT
GGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCAGTACAAGTGTTTGTGTCTGTTAAGTATCTAC
AAGTACTTCAAGTTGAAGCTTTATGTATTATAAAATCCCAGGGTGTTACTTCTGAT
GAAGAT

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4H765JQB 724 0 0
GGAAACTGAATCCAAAGAAACTAAGATAAAACATAGAAATAAAAC*CATTTCATCTCTTT
CATATTCAAATGGCTATGGCTCAAAAGGATAGGAATACAAGGATGGCTCAAAGGGCCTTT
GAAATGGTCGATAAGGTGTACGGTAGGTCCCAGAAAACAGGCCTTCCAGTACTATATGTT
CCTAGAGACGAGCCTGCTCCTCGTTTTAGCCAAAATTCTTACGAATATGGTGGTCCAAAA
GTCTATACCGTAAAAGAGGGAACTAATACTACTAGTTGCCGCCGAGTCATTTATCAGTAT
TCAAAAGAGTCAACCACAAAGGAACCGGTTGTTTCTCTCCCCACAGAACATATTCAATAC
TTCGGTGGTGTCCGTTCTCACATGGGCCATGCAAACAGGTTTGGAACTCCGAAAGGAGGG
GCTATTAGCTGCGACGAGGCCGTCCAACTCTATGGAGGGGTTCTTATAAAGGAATATCGT
AAATAACCGAGGGAAACTAAATTAATGTTGAAGATGGA**TGGTGAGTTTGTATAAAAGT
GTTTATAGTTGTTATTTCTGATAACGGAAAAGTGCAGACCAACACAGATACTAAAGCTTG
TTGTAATGGTTTTCACTTGGAATAAGCTTTAGATCACTACAAGTGTTTGTGTCTGTTAAG
TATCTATCAGTACTTCAAGTTGAAGCTTTATGTATTATAAAATCCCAGGGTGTTACTTCT
GAT
C

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL1259Contig1 935 4 12 U
TTTTTGAGGGAGTCGGCAGCCAAACTCTACGATTCGTTTCGTCTAATACAAGTTTTCGAA
CTCTACAGCGATGGATATCAATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACCATCATCGG
CGTCACTTACAATGGTGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGGATGTA
CGTGGCGAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGCCG
TTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCGGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCA
GCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGCCACTGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGAT
GCTCGCATATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGTTGGGGGCTGGGATAA
GTATGAAGGCGGCAAGATCTACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTT
CGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCGTGGAAAGA
AAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGC
CCGTGATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGAC
AAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAA
CTCCTTGTTGGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCCATGTGATGCAAAAC
AACCGATCATTCTCTTTACTCTGTTAAACAAACGTTTTAGATGTTGCGTTACATTCATCA
GTATCTTACTACTCTAAACTATGTTTTTATTTTGGATTGACCCGATCTGTCATTAAAAGG
ATATCGTGTTTGTTTATGGTTTAAAATTTTAATTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E368TF U 1
AF RR4EX63TF U 1
AF RR4A459TF U 6
AF RR4A459JQ C 189
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BS 758 776 RR4EX63TF
BS 777 818 RR4A459TF
BS 819 935 RR4A459JQ

RD RR4E368TF 578 0 0
TTTTTGAGGGAGTCGGCAGCCAAACTCTACGATTCGTTTCGTCTAATACAAGTTTTCGAA
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CGTCACTTACAATGGTGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGGATGTA
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CGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCGTGGAAAGA
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QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4EX63TF 776 0 0
TTTTT
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TGTTGGACGTCCTGAACGCTGCTGGTC*TGA*CCAATGGCCATGTGATGCA

QA 6 776 6 776
DS 

RD RR4A459TF 813 0 0
GAGGGAGTCGGCAGCCAAACTCTACGATTCGTTTCGTCTAATACAAGTTTTCGAACTCTA
CAGCGATGGATATCAATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACCATCATCGGCGTCA
CTTACAATGGTGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGGATGTACGTGG
CGAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTG
GTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCGGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAGCATA
CAATCCAGCTCGGACAGCCTGCCACTGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCTCG
CATATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGTTGGGGGCTGGGATAAGTATG
AAGGCGGCAAGATCTACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTA
TTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCGTGGAAAGAAAACA
TGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTG
ATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAA
ACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAACTCCT
TGTTGGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCCATGTGATGCAAAACAACCG
ATCATTCTCTTTACTCTGTTAAACAAACGTTTT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4A459JQ 747 0 0
ATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTCACAGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTGGTT
CGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCGGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAGCATACAA
TCCAGCTCGGACAGCCTGCCACTGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCTCGCAT
ATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGTTGGGGGCTGGGATAAGTATGAAG
GCGGCAAGATCTACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTATTG
GAGGCTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCGTGGAAAGAAAACATGA
CCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATG
GAGCCAGTGGAGGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAAACT
TCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAACTCCTTGT
TGGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCCATGTGATGCAAAACAACCGATC
ATTCTCTTTACTCTGTTAAACAAACGTTTTAGATGTTGCGTTACATTCATCAGTATCTTA
CTACTCTAAACTATGTTTTTATTTTGGATTGACCCGATCTGTCATTAAAAGGATATCGTG
TTTGTTTATGGTTTAAAATTTTAATTC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 6

CO CL1260Contig1 1105 6 9 U
GGGCCAATCATCATTCCCCATTGCTAGAGAGATTAGATTCGAGAGAGAAGAAGAAGAAGA
TGAGTTTCCAAGATCTCGAGGCTGGCTCTCGATTCCAATCGCCGAATCGTTTCACCGGCG
GGAGGAGGCAGCAGCAGAAACCTCTGTCTCGTGGAGATCCGTCTCAGGAGGTAGCCGCCG
GGATTTTCAGGATCAGCACGGCCGTCAATTCCTTCTTCCGCCTCGTTAATTCGATCGGAA
CGCCTAAGGATACTCTCGATTTGCGAGATAAGCTGCAAAAGACAAGGTTACAGATATCAG
AACTGGTGAAAAATACGTCAGCTAAGCTTAAAGAGGCTAGCGAAGCCGACCTCCATGGAG
CTTCTACTCCAATTAAGAAGATTGCGGATGCTAAACTGGCGAAAGATTTCCAATCAGTTC
TCAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAGAGACTTGCAGCTGAGAGAGAATTAACATATACTCCTG
TCGTCACTAAAGATATGCCTACCAGTTATAATGCACAGGAACTGTATATTGAATCTTTAA
GGACCTCCCAGGAGCAAACTCTTCTTCTACAATCAAAAAGGCAAGAAGTGGTGTTTCTAG
ATAACGAGATAACATTCAATGAAGCAATTATTGAGGAAAGAGAGCAAGGAATCAGAGAAA
TTCAAGAACAGATTGGTGAAGTGAATGAAATCTTCAAAGATCTAGCTGTTTTAGTGAACG
ATCAAGGAGTTATGATCGATGACATCAGCTCCAACATTGATAATTCACATGCTGCAACTG
CACAAGCCACTTCCCAACTCAGAAAAGCATCTAAAACTCAAAGAGCAAACTCATCCTTGA
CATGCCTTCTTATTCTCATATTTGGGATTGTTATACTCATTGTCATCATCGTTGTCCTGG
TTTGAGCACCAAGCTCCAAGCATCAACCGAAGAAGAGTGGATCAAACTATACAAGTTACC
ACATTAAAGATATATATATATTTATTGTACAGATTCTTTGTACTGCATCGTCCTTCTTCC
CTTGCAATCGAATTGAATCTTAACGTTTATGTATTAATCCATCTTACTGATCTTTATAGC
AAAAGATACGAAAATGTTATGGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AX14TF U 1
AF RR4DN03TF U 17
AF RR4AZ26TF U 1
AF RR4AZ26JQ C 352
AF RR4DN03JQ C 355
AF RR4AX14JQ C 567
BS 1 723 RR4AX14TF
BS 724 725 RR4AZ26TF
BS 726 726 RR4DN03TF
BS 727 815 RR4AZ26TF
BS 816 816 RR4AZ26JQ
BS 817 821 RR4AZ26TF
BS 822 822 RR4AZ26JQ
BS 823 850 RR4AZ26TF
BS 851 1105 RR4AZ26JQ

RD RR4AX14TF 723 0 0
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TGAGTTTCCAAGATCTCGAGGCTGGCTCTCGATTCCAATCGCCGAATCGTTTCACCGGCG
GGAGGAGGCAGCAGCAGAAACCTCTGTCTCGTGGAGATCCGTCTCAGGAGGTAGCCGCCG
GGATTTTCAGGATCAGCACGGCCGTCAATTCCTTCTTCCGCCTCGTTAATTCGATCGGAA
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TCAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAGAGACTTGCAGCTGAGAGAGAATTAACATATACTCCTG
TCGTCACTAAAGATATGCCTACCAGTTATAATGCACAGGAACTGTATATTGAATCTTTAA
GGACCTCCCAGGAGCAAACTCTTCTTCTACAATCAAAAAGGCAAGAAGTGGTGTTTCTAG
ATAACGAGATAACATTCAATGAAGCAATTATTGAGGAAAGAGAGCAAGGAATCAGAGAAA
TTCAAGAACAGATTGGTGAAGTGAATGAAATCTTCAAAGATCTAGCTGTTTTAGTGAACG
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

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GGG
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GGCTGGCTCTCGATTCCAATCGCCGAATCGTTTCACCGGCGGGAGGAGGCAGCAGCAGAA
ACCTCTGTCTCGTGGAGATCCGTCTCAGGAGGTAGCCGCCGGGATTTTCAGGATCAGCAC
GGCCGTCAATTCCTTCTTCCGCCTCGTTAATTCGATCGGAACGCCTAAGGATACTCTCGA
TTTGCGAGATAAGCTGCAAGAGACAAGGTTACAGATATCAGAACTGGTGAAAAATACGTC
AGCTAAGCTTAAAGAGGCTAGCGAAGCCGACCTCCATGGAGCTTCTACTCCAATTAAGAA
GATTGCGGATGCTAAACTGGCGAAAGATTTCCAATCAGTTCTCAAAGAGTTTCAGAAAGC
TCACAGACTTGCAGCTGAGAGAGAATTAACATATACTCCTGTCGTCACTAAAGATATGCC
TACCAGTTATAATGCACAGGAACTGGATATTGAATCTTTAAGGACCTCCCAGGAGCAAAC
TCTTCTTCTACAATCAAAAAGGCAAGAAGTGGTGTTTCTAGATAACGAGATAACATTCAA
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T

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TGAGTTTCCAAGATCTCGAGGCTGGCTCTCGATTCCAATCGCCGAATCGTTTCACCGGCG
GGAGGAGGCAGCAGCAGAAACCTCTGTCTCGTGGAGATCCGTCTCAGGAGGTAGCCGCCG
GGATTTTCAGGATCAGCACGGCCGTCAATTCCTTCTTCCGCCTCGTTAATTCGATCGGAA
CGCCTAAGGATACTCTCGATTTGCGAGATAAGCTGCAAAAGACAAGGTTACAGATATCAG
AACTGGTGAAAAATACGTCAGCTAAGCTTAAAGAGGCTAGCGAAGCCGACCTCCATGGAG
CTTCTACTCCAATTAAGAAGATTGCGGATGCTAAACTGGCGAAAGATTTCCAATCAGTTC
TCAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAGAGACTTGCAGCTGAGAGAGAATTAACATATACTCCTG
TCGTCACTAAAGATATGCCTACCAGTTATAATGCACAGGAACTGTATATTGAATCTTTAA
GGACCTCCCAGGAGCAAACTCTTCTTCTACAATCAAAAAGGCAAGAAGTGGTGTTTCTAG
ATAACGAGATAACATTCAATGAAGCAATTATTGAGGAAAGAGAGCAAGGAATCAGAGAAA
TTCAAGAACAGATTGGTGAAGTGAATGAAATCTTCAAAGATCTAGCTGTTTTAGTGAACG
ATCAAAGAGTTATGATCGATGACATCAGCTCCAACATTGATAATTCACATGCTGCAACTG
CACAAGCCACTTCCCAACTCAGAAAAGCATCTAAA*CTCAA*GAGCAAACTCATCCTTGA
CATGCCTTCT
ATCTCATATTTGGGATG

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DS 

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AATCAGTTCTCAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAGAGACTTGCAGCTGAGAGAGAATTAACAT
ATACTCCTGTCGTCACTAAAGATATGCCTACCAGTTATAATGCACAGGAACTGTATATTG
AATCTTTAAGGACCTCCCAGGAGCAAACTCTTCTTCTACAATCAAAAAGGCAAGAAGTGG
TGTTTCTAGATAACGAGATAACATTCAATGAAGCAATTATTGAGGAAAGAGAGCAAGGAA
TCAGAGAAATTCAAGAACAGATTGGTGAAGTGAATGAAATCTTCAAAGATCTAGCTGTTT
TAGTGAACGATCAAGGAGTTATGATCGATGACATCAGCTCCAACATTGATAATTCACATG
CTGCAACTGCACAAGCCACTTCCCAACTCAGAAAAGCATCTAAAACTCAAAGAGCAAACT
CATCCTTGACATGCCTTCTTATTCTCATATTTGGGATTGTTATACTCATTGTCATCATCG
TTGTCCTGGTTTGAGCACCAAGCTCCAAGCATCAACCGAAGAAGAGTGGATCAAACTATA
CAAGTTACCACATTAAAGATATATATATATTTATTGTACAGATTCTTTGTACTGCATCGT
CCTTCTTCCCTTGCAATCGAATTGAATCTTAACGTTTATGTATTAATCCATCTTACTGAT
CTTTATAGCAAAAGATACGAAAATGTTATGGCCC

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DS 

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ATGGAGCTTCTACTCCAATTAAGAAGATTGCGGATGCTAAACTGGCGAAAGATTTCCAAT
CAGTTCTCAAAGAGTTTCAGAAAGCTCACAGACTTGCAGCTGAGAGAGAATTAACATATA
CTCCTGTCGTCACTAAAGATATGCCTACCAGTTATAATGCACAGGAACTGGATATTGAAT
CTTTAAGGACCTCCCAGGAGCAAACTCTTCTTCTACAATCAAAAAGGCAAGAAGTGGTGT
TTCTAGATAACGAGATAACATTCAATGAAGCAATTATTGAGGAAAGAGAGCAAGGAATCA
GAGAAATTCAAGAACAGATTGGTGAAGTGAATGAAATCTTCAAAGATCTAGCTATTTTAG
TGAACGATCAAGGAGTTATGATCGATGACATCAGCTCCAACATTGATAATTCACATGCTG
CAACTGCACAAGCCACTTCCCAACTCAGAAAAGCATCTAAAACTCAAAGAGCAAACTCAT
CCTTGACATGCCTTCTTATTCTCATATTTGGGATTGTTACACTCATTGTCATCATCGTTG
TCCTGGTTTGAGCACCAAGCTCCAAGCATCAACCGAAGAAGAGTGGATCAAACTATACAA
GTTACCACATTAAAGATATATATATATTTATTGTACAGATTCTTTGTACTGCATCGTCCT
TCTTCCCTTGCAATCGAATTGAATCTTAACGTTTATGTATTAATCCATCTTACTGATCTT
TATAGCAAAAGATACG

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DS 

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ATTATTGAGGAAAGAGAGCAAGGAATCAGAGAAATTCAAGAACAGATTGGTGAAGTGAAT
GAAATCTTCAAAGATCTAGCTGTTTTAGTGAACGATCAAGGAGTTATGATCGATGACATC
AGCTCCAACATTGATAATTCACATGCTGCAACTGCACAAGCCACTTCCCAACTCAGAAAA
GCATCTAAAACTCAAAGAGCAAACTCATCCTTGACATGCCTTCTTATTCTCATATTTGGG
ATTGTTATACTCATTGTCATCATCGTTGTCCTGGTTTGAGCACCAAGCTCCAAGCATCAA
CCGAAGAAGAGTGGATCAAACTATACAAGTTACCACATTAAAGATATATATATATTTATT
GTACAGATTCTTTGTACTGCATCGTCCTTCTTCCCTTGCAATCGAATTGAATCTTAACGT
TTATGTATTAATCCATCTTACTGATCTTTATAGCAAAAGATACGAAAATGTTATGGCCC

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DS 



AS 1 4

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CTGTAGCTGCGAAGATCTATAACGGTCTTAGAGCTCAAGGTAACTACAATCTCCCCAAGC
ACTGGTGACATAGCTGGATCATCCTCTCGAGCCACTCCTTACTCCTCTTCTTATAACCAA
AGCCCTTTCGAGAGTCCCATCCTTTCTTACCAAGTCAGTCCATCGTCTTCTTCATTCCCT
AGCCCTTCTCGTGGTGGCGGCGGTGACACGCACAAACAACATCTCCACCATCTTCCCTTT
CCTCAGGAACGGTGGGATACCATCATCGCTTCCTCCGCTCAGGATCTCAAATAGTGCTCC
GGTGACTCCACCAGTCTCGTCCCCAACTTCTAAGCACCCCAAGCCGTTACCTACTTGGGA
GTCTTTCACCAAACAGTCCATGGCCATTGCTGCTAAACAGTCAATGTCGTCTTTCAACTA
CCCGTTCTACGCGGTGTCTGCACCGGCGAGTCCCACTCACCATCGCCAGTTCAATGCCCC
GGCTACTATACCCGAGTGCGACGAGTCTGACGCTTCAACTGTTGATTCTGGTCATTGGAT
AAGCTTTCAGAAGTTCTCACAGCAGCCTTTCCATGGCGTACTCTCTGCAGTGCCGGCTTC
TCCTACTTTCAATCTAGCTAAACCACCCGTGCCTCAGCGGTTGTCTCCAAACACTGGAGC
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GGAAGGAGAGAAGATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCTCACACTTGGAAACGC
TAAAGGTCGTTAGTTGATTGATATATGAAGAACAAAAGGAATAACCCGTTGTGGCATGTC
GGAAGCAAAAAAGGTTGGAGTGTTAGTGTGTTTTTGGTTCAGTTCATGGTTCTGGTTCTT
GTACTAGAATTAATATTCATAGTACCAATGAGTTTGTTTCACATTTGGCATTATTTTGTA
GATAGACTGTGTAAGATGTATGTTTCTTCTATTATGTATCATTCCTTTTAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AS59TF U 1
AF RR4AU66TF U 1
AF RR4AU66JQ C 237
AF RR4AS59JQ C 267
BS 1 275 RR4AS59TF
BS 276 276 RR4AU66JQ
BS 277 746 RR4AS59TF
BS 747 791 RR4AU66TF
BS 792 792 RR4AU66JQ
BS 793 839 RR4AU66TF
BS 840 1069 RR4AU66JQ
BS 1070 1071 RR4AS59JQ

RD RR4AS59TF 746 0 0
GGGTAACATTCCAGCGAAGAGAGAGGGAGAACAACCGGAGGAGGGAGAGGAGGAGAAGAG
CTGTAGCTGCGAAGATCTATAACGGTCTTAGAGCTCAAGGTAACTACAATCTCCCCAAGC
ACTGGTGACATAGCTGGATCATCCTCTCGAGCCACTCCTTACTCCTCTTCTTATAACCAA
AGCCCTTTCGAGAGTCCCATCCTTTCTTACCAAGTCAGTCCATCGTCTTCTTCATTCCCT
AGCCCTTCTCGTGGTGGCGGCGGTGACACGCACAA*CAACATCTCCACCATCTTCCCTTT
CCTCAGGAACGGTGGGATACCATCATCGCTTCCTCCGCTCAGGATCTCAAATAGTGCTCC
GGTGACTCCACCAGTCTCGTCCCCAACTTCTAAGCACCCCAAGCCGTTACCTACTTGGGA
GTCTTTCACCAAACAGTCCATGGCCATTGCTGCTAAACAGTCAATGTCGTCTTTCAACTA
CCCGTTCTACGCGGTGTCTGCACCGGCGAGTCCCACTCACCATCGCCAGTTCAATGCCCC
GGCTACTATACCCGAGTGCGACGAGTCTGACGCTTCAACTGTTGATTCTGGTCATTGGAT
AAGCTTTCAGAAGTTCTCACAGCAGCCTTTCCATGGCGTACTCTCTGCAGTGCCGGCTTC
TCCTACTTTCAATCTAGCTAAACCACCCGTGCCTCAGCGGTTGTCTCCAAACACTGGAGC
GATCCAAGAGATTGGTCAAAGCTCGG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AU66TF 839 0 0
GGGTAACATTCCAGCGAAGAGAGAGGGAGAACAACCGGAGGAGGGAGAGGAGGAGAAGAG
CTGTAGCTGCGAAGATCTATAACGGTCTTAGAGCTCAAGGTAACTACAATCTCCCCAAGC
ACTGGTGACATAGCTGGATCATCCTCTCGAGCCACTCCTTACTCCTCTTCTTATAACCAA
AGCCCTTTCGAGAGTCCCATCCTTTCTTACCAAGTCAGTCCATCGTCTTCTTCATTCCCT
AGCCCTTCTCGTGGTGGCGGCGGTGACACGCACAA*CAACATCTCCACCATCTTCCCTTT
CCTCAGGAACGGTGGGATACCATCATCGCTTCCTCCGCTCAGGATCTCAAATAGTGCTCC
GGTGACTCCACCAGTCTCGTCCCCAACTTCTAAGCACCCCAAGCCGTTACCTACTTGGGA
GTCTTTCACCAAACAGTCCATGGCCATTGCTGCTAAACAGTCAATGTCGTCTTTCAACTA
CCCGTTCTACGCGGTGTCTGCACCGGCGAGTCCCACTCACCATCGCCAGTTCAATGCCCC
GGCTACTATACCCGAGTGCGACGAGTCTGACGCTTCAACTGTTGATTCTGGTCATTGGAT
AAGCTTTCAGAAGTTCTCACAGCAGCCTTTCCATGGCGTACTCTCTGCAGTGCCGGCTTC
TCCTACTTTCAATCTAGCTAAACCACCCGTGCCTCAGCGGTTGTCTCCAAACACTGGAGC
GATCCAAGAGATTGGTCAAAGCTCGGAGTTTAAATTTGAGAACAGGCAAGTTACGCCGTG
GGAAGGAGAGA*GATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCTCACACTTGGAAACG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4AU66JQ 833 0 0
CCCTAGCCCTTCTCGTGGTGGCGGCGGTGACACGCACAAACAACATCTCCACCATCTTCC
CTTTCCTCAGGAACGGTGGGATACCATCATCGCTTCCTCCGCTCAGGATCTCAAATAGTG
CTCCGGTGACTCCACCAGTCTCGTCCCCAACTTCTAAGCACCCCAAGCCGTTACCTACTT
GGGAGTCTTTCACCAAACAGTCCATGGCCATTGCTGCTAAACAGTCAATGTCGTCTTTCA
ACTACCCGTTTTACGCGGTGTCTGCACCGGCGAGTCCCACTCACCATCGCCAGTTCAATG
CCCCGGCTACTATACCCGAGTGCGACGAGTCTGACGCTTCAACTGTTGATTCTGGTCATT
GGATAAGCTTTCAGAAGTTCTCACAGCAGCCTTTCCATGGCGTACTCTCTGCAGTGCCGG
CTTCTCCTACTTTCAATCTAGCTAAACCACCCGTGCCTCAGCGGTTGTCTCCAAACACTG
GAGCGATCCAAGAGATTGGTCAAAGCTCGGAGTTTAAATTTGAGAACAGGCAAGTTACGC
CGTGGGAAGGAGAGAAGATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCTCACACTTGGAA
ACGCTAAAGGTCGTTAGTTGATTGATATATGAAGAACAAAAGGAATAACCCGTTGTGGCA
TGTCGGAAGCAAAAAAGGTTGGAGTGTTAGTGTGTTTTTGGTTCAGTTCATGGTTCTGGT
TCTTGTACTAGAATTAATATTCATAGTACCAATGAGTTTGTTTCACATTTGGCATTATTT
TGTAGATAGACTGTGTAAGATGTATGTTTCTTCTATTATGTATCATTCCTTTT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4AS59JQ 805 0 0
ACACGCAC
AACAACATCTCCACCATCTTCCCTTTCCTCAGGAACGGTGGGATACCATCATCGCTTCCT
CCGCTCAGGATCTCAAATAGTGCTCCGGTGACTCCACCAGTCTCGTCCCCAACTTCTAAG
CACCCCAAGCCGTTACCTACTTGGGAGTCTTTCACCAAACAGTCCATGGCCATTGCTGCT
AAACAGTCAATGTCGTCTTTCAACTACCCGTTCTACGCGGTGTCTGCACCGGCGAGTCCC
ACTCACCATCGCCAGTTCAATGCCCCGGCTACTATACCCGAGTGCGACGAGTCTGACGCT
TCAACTGTTGATTCTGGTCATTGGATAAGCTTTCAGAAGTTCTCACAGCAGCCTTTCCAT
GGCGTACTCTCTGCAGTGCCGGCTTCTCCTACTTTCAATCTAGCTAAACCACCCGTGCCT
CAGCGGTTGTCTCCAAACACTGGAGCGATCCAAGAGATTGGTCAAAGCTCGGAGTTTAAA
TTTGAGAACAGGCAAGTTACGCCGTGGGAAGGAGAGAAGATCCATGATGTGGCTATGGAG
GATCTTGAGCTCACACTTGGAAACGCTAAAGGTCGTTAGTTGATTGATATATGAAGAACA
AAAGGAATAACCCGTTGTGGCATGTCGGAAGCAAAAAAGGTTGGAGTGTTAGTGTGTTTT
TGGTTCAGTTCATGGTTCTGGTTCTTGTACTAGAATTAATATTCATAGTACCAATGAGTT
TGTTTCACATTTGGCATTATTTTGTAGATAGACTGTGTAAGATGTATGTTTCTTCTATTA
TGTATCATTCCTTTTAG

QA 9 805 9 805
DS 



AS 1 6

CO CL1262Contig1 711 6 18 U
ATTTAAAACAAACAAGAACCAATTAATTTATTGAATACAGTGAAGAAATACATTAACGCC
ATTGACGTTAGGGATGAAGAGTGCACAAGTTACAAAGTTATCCAAGAAAAAAAAATGTTA
CATAACATATAAAACAGAAGAGAGACGTCTTGTTTTCTCTCATTAGTGTTTATCGCTAGA
AGCGTGTTTAGCCTTAGGTTTCTTGACGATCATGACGGAACAATGAGCATGATGAGCTAA
ATAATCACTCACGCTCCCCAAAAACACCCTCTTGACAGCTCCATAACCATGGCTCCCAAG
AACAAGAACAGATGCATGGTGTCTCTCCGCTGCTTCCACCATTATGTTCCTAGGATCTCC
TTCTATAGCCTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAGCACACTTCGGTACACTT
CTTCTTAACCAACTCCGCGGTCTTGTCTAAATCTTGTTCCACCAGCGGTATTATATCGAC
CGTTCCTGGTCCGGCAAAGCCGATGACGGAAGTTGCGGTGAGTCTTGCGTGGATGACGAC
GAGTTTGAATTGTGGGTTTGATTTGAAAGGTGTGAAGAAGAGATCGAGAGCTGTCTCCAG
TGCGTGGTAGCTATGAGATGAATCATCGACTCCTACCACCACCACACGCTCACTTCCACT
AGCCATTTCGATCTTTTGGTAAACTTTCTCTTTTTGATGATCATGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV56TF C 3
AF RR4H590JQB U 10
AF RR4BV56JQ U 121
AF RR4F888TF C 1
AF RR4F888JQ U 5
AF RR4H590TF C 290
BS 1 9 RR4F888TF
BS 10 120 RR4F888JQ
BS 121 139 RR4BV56JQ
BS 140 140 RR4F888JQ
BS 141 141 RR4BV56JQ
BS 142 142 RR4F888JQ
BS 143 167 RR4BV56JQ
BS 168 168 RR4F888JQ
BS 169 258 RR4BV56JQ
BS 259 259 RR4F888JQ
BS 260 267 RR4BV56JQ
BS 268 268 RR4F888JQ
BS 269 334 RR4BV56JQ
BS 335 335 RR4F888JQ
BS 336 540 RR4BV56JQ
BS 541 541 RR4F888JQ
BS 542 576 RR4BV56JQ
BS 577 711 RR4F888JQ

RD RR4BV56TF 413 0 0
TTTAAAC
AAACAAGAACCAATTAATTTAT*GAATACAGTGAAGAAATACATTAACGCCATTGACGTT
AGGGATGAAGAGTGCACAAGTTACAAAGTTATCCAAGAAAAAAAA*TGTTACATAACATA
TAAAACAGAAGAGAGACGTCTTGTTTTCTCTCATTAGTGTTTATCGCTAGAAGCGTGTTT
AGCCTTAGGTTTCTTGACGATCATGACGGAACAATGAGCATGATGAGCTAAATAATCACT
CACGCTCCC*AAAAACACTCTCTTGACAGCTCCATAACCATGGCTCCCAAGAACAAGAAC
AGATGCATGGTGTCTCTCCGCTGCTCCCACCATTATGTTCCTAGGATCTCCTTCTATAGC
CTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAGCACACTTCGGTA

QA 8 413 8 413
DS 

RD RR4H590JQB 527 0 0
AAACAAGAACCAATTAATTTATTGAATACAGTGAAAAAATACATTAACGCCATTGACGTT
AGGGATGAAAAGTGCACAAGTTACAAAGTTATCCAAAAAAAAAAAATGTTACATAACATA
TAAAACAAAAAAAAGACGTCTTGTTTTCTCTCATTAGTGTTTATCGCTAGAAGCGTGTTT
AGCCTTAGGTTTCTTGACGATCATGACGGAACAATGGGCATGATGAGCTAAATAATCACT
CACGCTCCCCAAAAACACCCTCTTGACAGCTCCATAACCATGGCTCCCAAAAACAAAAAC
AGATGCATGGTGTCTCTCACCTGCTTCCACCATTATGTTCCTAGGATCTCCTTCTATAGC
CTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAACACACTTCGGTACACTTCTTCTTAAC
CAACTCAGCAGTCTTGTCTAAATCTTGTTCCGCCAGCGGTATTATATCGACCGTTCCTGG
TCCGGCAAAGCCGATGACGGAAGTTGCGGTGAGTCTTGCGTGGATGA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4BV56JQ 459 0 0
CATAACATATAAAACAGAAAAAAGACGTCTTGTTTTCTCTCATTAGTTTTTATCGCTAGA
AGCGTGTTTAGCCTTAGGTTTCTTGACGATCATGACGGAACAATGAGCATGATGAGCTAA
ATAATCACTCACGCTCCC*AAAAACACTCTCTTGACAGCTCCATAACCATGGCTCCCAAG
AACAAGAACAGATGCATGGTGTCTCTCCGCTGCTCCCACCATTATGTTCCTAGGATCTCC
TTCTATAGCCTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAGCACACTTCGGTACACTT
CTTCTTAACCAACTCCGCGGTCTTGTCTAAATCTTGTTCCACCAGCGGTATTATATCGAC
CGTTCCTGGTCCGGCAAAGCCGATGACGGAAGTTGCGGTGAGTCTTGCGTGGATGACGAC
AAGTTTGAATTGTGGGTTTGATTTGAAAGGTGTGAA
AAA

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4F888TF 711 0 0
ATTTAAAACAAACAAGAACCAATTAATTTATTGAATACAGTGAAGAAATACATTAACGCC
ATTGACGTTAGGGATGAAGAGTGCACAAGTTACAAAGTTATCCAAGAAAAAAAAATGTTA
CATAACATATAAAACAGAAGAGAGACGTCTTGTTTTCTCTCATTAGTGTTTATCGCTAGA
AGCGTGTTTAGCCTTAGGTTTCTTGACGATCATGACGGAACAATGAGCATGATGAGCTAA
ATAATCACTCACGCTCCCCAAAAACACCCTCTTGACAGCTCCATAACCATGGCTCCCAAG
AACAAGAACAGATGCATGGTGTCTCTCCGCTGCTTCCACCATTATGTTCCTAGGATCTCC
TTCTATAGCCTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAGCACACTTCGGTACACTT
CTTCTTAACCAACTCCGCGGTCTTGTCTAAATCTTGTTCCACCAGCGGTATTATATCGAC
CGTTCCTGGTCCGGCAAAGCCGATGACGGAAGTTGCGGTGAGTCTTGCGTGGATGACGAC
GAGTTTGAATTGTGGGTTTGATTTGAAAGGTGTGAAGAAGAGATCGAGAGCTGTCTCCAG
TGCGTGGTAGCTATGAGATGAATCATCGACTCCTACCACCACCACACGCTCACTTCCACT
AGCCATTTCGATCTTTTGGTAAACTTTCTCTTTTTGATGATC
ATGAATCCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4F888JQ 707 0 0
AAAAC
AAACAAGAACCAATTAATTTATTGAATACAGTGAAGAAATACATTAACGCCATTGACGTT
AGGGATGAAGAGTGCACAAGTTACAAAGTTATCCAAGAAAAAAAAATGTTACATAACATA
TAAAACAGAAGAGAGACGTCTTGTTTTCTCTCATTAGTGTTTATCGCTAGAAGCGTGTTT
AGCCTTAGGTTTCTTGACGATCATGACGGAACAATGAGCATGATGAGCTAAATAATCACT
CACGCTCCCCAAAAACACCCTCTTGACAGCTCCATAACCATGGCTCCCAAGAACAAGAAC
AGATGCATGGTGTCTCTCCGCTGCTTCCACCATTATGTTCCTAGGATCTCCTTCTATAGC
CTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAGCACACTTCGGTACACTTCTTCTTAAC
CAACTCCGCGGTCTTGTCTAAATCTTGTTCCACCAGCGGTATTATATCGACCGTTCCTGG
TCCGGCAAAGCCGATGACGGAAGTTGCGGTGAGTCTTGCGTGGATGACGACGAGTTTGAA
TTGTGGGTTTGATTTGAAAGGTGTGAAGAAGAGATCGAGAGCTGTCTCCAGTGCGTGGTA
GCTATGAGATGAATCATCGACTCCTACCACCACCACACGCTCACTTCCACTAGCCATTTC
GATCTTTTGGTAAACTTTCTCTTTTTGATGATCATGAATCCC

QA 6 707 6 707
DS 

RD RR4H590TF 417 0 0
TGGCTCCCAAGAACAAGAACAGATGCATGGTGTCTCTCAGCTGCTTCCACCATTATGTTC
CTAGGATCTCCTTCTATAGCCTCCAACGAAGTGATCTCAACGGATTTGGCCGAGCACACT
TCGGTACACTTCTTCTTAACCAACTCAGCAGTCTTGTCTAAATCTTGTTCCGCCAGCGGT
ATTATATCGACCGTTCCTGGTCCGGCAAAGCCGATGACGGAAGTTGCGGTGAGTCTTGCG
TGGATGACGACGAGTTTGAATTGTGGGTTTGATTTGAAAGGTGTGAAGAAGAGATCGGGA
GCT*TCTCCAGTGCGTGGTAGCTATGAGATGAATCATCGACGCCTAACACCACCACACGC
TCACTTCCACTAGCCATTTCGATCTTTTGGTAAACTTTCTCCTTTTGATGATC
CCCT

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 6

CO CL1263Contig1 879 6 26 U
GGGATTTGATTGCCTGCCTCTTCACCGCCCTTCTTACTCCGGAGACGACGATATCAGAAA
TGGAGAGCGAGCCAACTCGAGTGATGGTGGCGGTGAACGAGTCGACGATCAAAGGCTACC
CGCACGCGTCGATAGGCAGCAAAAAAGCGTTCGAGTGGACACTGAGGAAGATAGTCAGGG
ACAATACCTCTGGCTTCAAGCTTCTCTTGCTTCACGCTCAAGTCCAGGACGAAGACGGTT
TTGATGACGTGGACAGCATATATGCTTCCCCTGATGATTTCCGACATATGAGGGAGCGTA
ACAAGGCTAAAGGACTTCACCTTCTTGAGTTTTTCGTTAATAAATGCCATGAGATTGGGG
TTGGGTGTGAGGCTTGGATCAGGAAAGGTGATCCCACGGAAGTGATATGCCATGAAGTGA
GGCGTGTTAGGCCAGATTTCCTGGTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGG
TGTTTGTTGGAACGGTGAGTGAGTTTTGTGTGAAGCATGCAGAATGCCCAGTCATCGTTA
TCAAACGCAATGCTGACGAAAGTCCACAAGATCCAGCTGATGACTAAATTCCAAAAGCTA
CACAAACCATGCGGTGTTCTTTCGTCTGAGAGAGACATACATGTGAAGAGAAAAAAAGAG
AAACAGAACTCTTTCGAATGATCTAGTGTGTGCGTCTCTAGTTGTTGTAGTAGATACTCA
GATTCACATGATATATAATTGTGTGAGCAATGCCTTTAGTCTTTGATTCTCTATAACGTC
AAAACAGAAGTTCCATTACTCGGTGTGTAATCTTTCCACTGTCCTGTCTTAAATATGTGG
TTTTATCAAAAAAAGAGGCAACATCTCTACTGCTTACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL60TF U 11
AF RR4BW88TF U 1
AF RR4GN82JQ C 82
AF RR4GN82TF U 82
AF RR4GI88JQ C 197
AF RR4GI88TF U 197
BS 1 134 RR4BW88TF
BS 135 135 RR4GN82TF
BS 136 439 RR4BW88TF
BS 440 440 RR4EL60TF
BS 441 495 RR4BW88TF
BS 496 496 RR4EL60TF
BS 497 538 RR4BW88TF
BS 539 539 RR4EL60TF
BS 540 643 RR4BW88TF
BS 644 644 RR4GN82TF
BS 645 656 RR4BW88TF
BS 657 657 RR4GN82TF
BS 658 677 RR4BW88TF
BS 678 678 RR4GN82TF
BS 679 706 RR4BW88TF
BS 707 707 RR4GN82TF
BS 708 721 RR4BW88TF
BS 722 722 RR4GN82TF
BS 723 749 RR4BW88TF
BS 750 783 RR4GN82TF
BS 784 784 RR4GI88TF
BS 785 791 RR4GN82TF
BS 792 792 RR4GI88TF
BS 793 823 RR4GN82TF
BS 824 850 RR4GI88TF
BS 851 879 RR4GI88JQ

RD RR4EL60TF 585 0 0
G
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CCAACTCGAGTGATGGTGGTGGTGAACGAGTCGACGATCAAAGGCTACCCGCACGCGTCG
ATAAGCAGCAAAAAAGCGTTCGAGTGGACACTGAGGAAGATAGTCAGGGACAATACCTCT
GGCTTCAAGCTTCTCTTGCTTCACGCTCAAGTCCAGGACGAAGACGGTTTTGATGACGTG
GACAGCATATATGCTCCCCCTGATGATTTCCGACATATGAGGGAGCGTAACAAGGCTAAA
GGACTTCACCTTCTTGAGTTTTTCGTTAATAAATGCCATGAGATTGGGGTTGGGTGTGAG
GCTTGGATCAGGAAAGGTGATCCCACGGAAGTGATATGCCATGAAGTGAGGCGTGTTAGG
CCAGATTTCCTGGTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGGTGTTTGTTGGA
ACGGTGAGTGAGTTTTGTGTGAAGCATGCAGAATGCCCAGTCATCGTTATCAAACGCAAT
GCTGACGAAAGTCCACAAGATCCAGCTGATGACTAAATTCCAAA

QA 2 585 2 585
DS 

RD RR4BW88TF 749 0 0
GGGATTTGATTGCCTGCCTCTTCACCGCCCTTCTTACTCCGGAGACGACGATATCAGAAA
TGGAGAGCGAGCCAACTCGAGTGATGGTGGCGGTGAACGAGTCGACGATCAAAGGCTACC
CGCACGCGTCGATAAGCAGCAAAAAAGCGTTCGAGTGGACACTGAGGAAGATAGTCAGGG
ACAATACCTCTGGCTTCAAGCTTCTCTTGCTTCACGCTCAAGTCCAGGACGAAGACGGTT
TTGATGACGTGGACAGCATATATGCTTCCCCTGATGATTTCCGACATATGAGGGAGCGTA
ACAAGGCTAAAGGACTTCACCTTCTTGAGTTTTTCGTTAATAAATGCCATGAGATTGGGG
TTGGGTGTGAGGCTTGGATCAGGAAAGGTGATCCCACGGAAGTGATATGCCATGAAGTGA
GGCGTGTTAGGCCAGATTTTCTGGTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGG
TGTTTGTTGGAACGGGGAGTGAGTTTTGTGTGAAGCATGCAGAATGCCCAGTCATCGTAA
TCAAACGCAATGCTGACGAAAGTCCACAAGATCCAGCTGATGACTAAATTCCAAAAGCTA
CACAAACCATGCGGTGTTCTTTCGTCTGAGAGAGACATACATGAGAAGAGAAAAAA*GAG
AAACAGAACTCTTTCGA*TGATCTAGTGTGTGCGTCTCTAGTTGTTATAGTAGATACTCA
GTTTCACATGATATATAATTGTGTGAGCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GN82JQ 749 0 0
GT
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AAAGCGTTCGAGTGGACACTGAGGAAGATAGTCAGGGACAATACCTCTGGCTTCAAGCTT
CTCTTGCTTCACGCTCAAGTCCAGGACGAAGACGGTTTTGATGACGTGGACAGCATATAT
GCTTCCCCTGATGATTTCCGACATATGAGGGAGCGTAACAAGGCTAAAGGACTTCACTTT
CTTGAGTTTTTCGTTAATAAATGCCATGAGATTGGGGTTGGGTGTGAGGCTTGGATCAGG
AAAGGTGATCCCACGGAAGTGATATGCCATGAAGTGAGGCGTGTTAGGCCAGATTTCCTG
GTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGGTGTTTGTTGGAACGGTGAGTGAG
TTTTGTGTGAAGCATGCAGAATGCCCAGTCATCGTTATCAAACGCAATGCTGACGAAAGT
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GTCTGAGAGAGACATACATGTGAAGAGAAAAAAAGAGAAACAGAACTCTTTCGAATGATC
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TGAGCAATGCCTTTAGTCTTTGATTCTCTATAACGTCAAAACAGAAGTTCCATTACTCGG
TGTGTAATCTTTCCACTGTC
CTGTCGT

QA 3 742 3 742
DS 

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GT
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AAAGCGTTCGAGTGGACACTGAGGAAGATAGTCAGGGACAATACCTCTGGCTTCAAGCTT
CTCTTGCTTCACGCTCAAGTCCAGGACGAAGACGGTTTTGATGACGTGGACAGCATATAT
GCTTCCCCTGATGATTTCCGACATATGAGGGAGCGTAACAAGGCTAAAGGACTTCACTTT
CTTGAGTTTTTCGTTAATAAATGCCATGAGATTGGGGTTGGGTGTGAGGCTTGGATCAGG
AAAGGTGATCCCACGGAAGTGATATGCCATGAAGTGAGGCGTGTTAGGCCAGATTTCCTG
GTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGGTGTTTGTTGGAACGGTGAGTGAG
TTTTGTGTGAAGCATGCAGAATGCCCAGTCATCGTTATCAAACGCAATGCTGACGAAAGT
CCACAAGATCCAGCTGATGACTAAATTCCAAAAGCTACACAAACCATGCGGTGTTCTTTC
GTCTGAGAGAGACATACATGTGAAGAGAAAAAAAGAGAAACAGAACTCTTTCGAATGATC
TAGTGTGTGCGTCTCTAGTTGTTGTAGTAGATACTCAGATTCACATGATATATAATTGTG
TGAGCAATGCCTTTAGTCTTTGATTCTCTATAACGTCAAA*CAGAAGT*CCATTACTCGG
TGTGTAATCTTTCCACTGTC
TGTCGTAAA

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR4GI88JQ 683 0 0
GG
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TCCTGGTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGGTGTTTGTTGGAACGGTGA
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CTTTCGTCTGAGAGAGACATACATGTGAAGAGAAAAAAAGAGAAACAGAACTCTTTCGAA
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TTCGGTGTGTAATCTTTCCACTGTCCTGTCTTAAATATGTGGTTTTATCAAAAAAAGAGG
CAACATCTCTACTGCTTACTG

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR4GI88TF 654 0 0
GG
AGCTTCTCTTGCTTCACGCTCAAGTCCAGGACGAAGACGGTTTTGATGACGTGGACAGCA
TATATGCTTCCCCTGATGATTTCCGACATATGAGGGAGCGTAACAAGGCTAAAGGACTTC
ACCTTCTTGAGTTTTTCGTTAATAAATGCCATGAGATTGGGGTTGGGTGTGAGGCTTGGA
TCAGGAAAGGTGATCCCACGGAAGTGATATGCCATGAAGTGAGGCGTGTTAGGCCAGATT
TCCTGGTTGTGGGAAGTCGTGGTCTCGGTCCTTTTCAGAAGGTGTTTGTTGGAACGGTGA
GTGAGTTTTGTGTGAAGCATGCAGAATGCCCAGTCATCGTTATCAAACGCAATGCTGACG
AAAGTCCACAAGATCCAGCTGATGACTAAATTCCAAAAGCTACACAAACCATGCGGTGTT
CTTTCGTCTGAGAGAGACATACATGTGAAGAGAAAAAAAGAGAAACAGAACTCTTTCGAA
TGATCTAGTGTGTGCGTCTCTAGTTGTTGTAGTAGATACTCAGATTCACATGATATATAA
TTGTGCGAGCAATGCCTTTAGTCTTTGATTCTCTATAACGTCAAAACAGAAGTTCCATTA
TTCGGTGTGTAATCTTTCCACTGTCCTGTCTTAAATATGTGGTTTTATCAAA

QA 3 654 3 654
DS 



AS 1 6

CO CL1264Contig1 794 6 22 U
GGATCACCACCTTCGCAGCAGCAGCGGGAGTTGCAGAGTCTGAAAAAGAAAACAAAATGG
CGACCATGACTTCTCTTCAGAGCTCGTTTACATCTCTTTCGATATCCTCATCCCCTTCCT
CCTTCCTCGGCCAGCGTCTCATTTCCCCGATTTCCCTCTCCGCCGCTTCTCCGGTCAATC
CCGCCCAGAACCACCCATGTCTTGTTTTTGCAAAGCTTAAGCGTTGGGAACGGAAGAAAT
GCAAACCAAACAATCTTCCAATTCTGCACAAAATGCATGTCAAGTTTGGAGATACTGTCA
AAGTTATCTCTGGACGAGACAAGGGTAAGATTGGTGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACA
ACAGCACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGGGAAG
AGGGGGAGCCTG*TCAAATTGTCAAGATTGAAGCACCGATACACAGCTCAAATGTGATGC
TGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGAC
AGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCGTTGAGAAGTGGAAGC
AACTTAAGGAGGCAAAGGATAAAGAAACATCTGCAGTTACAGTTGCCTCCACATCTTAGC
ATGTCACATGTTTCTTCTTCATTGCACTTTTGTTTGTAGGCTAATGGACCTATGTATTTG
ATGGATAAATTGAATCCCTTTCAAGAGGTGAAGTGTAAAATTTATACCAGATAAAGAACA
CCTTCTGCACGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ77TF U 31
AF RR4FZ77JQ C 126
AF RR4GB68JQ C 31
AF RR4GB68TF U 31
AF RR4GM20TF U 1
AF RR4GM20JQ C 162
BS 1 252 RR4GM20TF
BS 253 253 RR4FZ77TF
BS 254 307 RR4GM20TF
BS 308 308 RR4FZ77TF
BS 309 320 RR4GM20TF
BS 321 321 RR4FZ77TF
BS 322 432 RR4GM20TF
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BS 748 748 RR4FZ77JQ
BS 749 767 RR4GM20TF
BS 768 768 RR4GM20JQ
BS 769 777 RR4GM20TF
BS 778 778 RR4GM20JQ
BS 779 787 RR4GM20TF
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GG
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TCTCTTTCGATATCCTCATCCCCTTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCATTTCCCCGATT
TCCCTCTCCGCCGCTTCTCCGGTCAATCCCGCCCAGAACCACCCATGTCTTGTTTTTGCA
AAGCTTAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAATCTTCCAATTCTGCACAAA
ATGCATGTCAAGTTTGGAGATACTGTCAAAGTTATCTCTGGACGAGACAAGGGTAAGATT
GGTGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTC
AAGACCAAACACATGAAGAGCCGGGAAGAGGGGGAGCCTG*TCAAATTGTCAAGATTGAA
GCACCGATACACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGG
GTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAA
CTTATCGACACCGTTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCAAAGGATAAAGAAACATCT
GCAGTTACAGTTGCCTCCACATCTTAGCATGTCACATGTTTCTTCTTCATTGCACTTTTG
TTTGT

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DS 

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CAGAACCACCCATGTCTTGTTTTTGCAAAGCTTAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAA
CCAAACAATCTTCCAATTCTGCACAAAATGCATGTCAAGTTTGGAGATACTGTCAAAGTT
ATCTCTGGACGAGACAAGGGTAAGATTGGTGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGC
ACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGGGAAGAGGGG
GAGCCTG*TCAAATTGTCAAGATTGAAGCACCGATACACAGCTCAAATGTGATGCTGTAT
TCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAG
GTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCGTTGAGAAGTGGAAGCAACTT
AAGGAGGCAAAGGATAAAGAAACATCTGCAGTTACAGTTGCCTCCACATCTTAGCATGTC
ACATGTTTCTTCTTCATTGCACTTTTGTTTGTAGGCTAATGGACCTATGTATTTGATGGA
TAAATTGAATCCCTTTCAAGAGGTGAAGTGTAAAATTTATAC
CAGAC

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DS 

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GG
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TCTCTTTCGATATCCTCATCCCCTTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCATTTCCCCGATT
TCCCTCTCCGCCGCTTCTCCGGTCAATCCCGCCCAGAACCACCCATGTCTTGTTTTTGCA
AAGCTTAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAATCTTCCAATTCTGCACAAA
ATGCATGTCAAGTTTGGAGATACTGTCAAAGTTATCTCTGGACGAGACAAGGGTAAGATT
GGTGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTC
AAGACCAAACACATGAAGAGCCGGGAAGAGGGGGAGCCTG*TCAAATTGTCAAGATTGAA
GCACCGATACACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGG
GTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAA
CTTATCGACACCGTTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCAAAGGATAAAGAAACATCT
GCAGTTACAGTTGCCTCCACATCTTAGCATGTCACATGTTTCTTCTTCATTGCACTTTTG
TTTGTAGGCTAATGGACCTATGTATTTGATGGATAAATTGAATCCCTTTCAAGAGGTGAA
GTGTAAAATTTATAC
CAGAC

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DS 

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GG
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TCTCTTTCGATATCCTCATCCCCTTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCATTTCCCCGATT
TCCCTCTCCGCCGCTTCTCCGGTCAATCCCGCCCAGAACCACCCATGTCTTGTTTTTGCA
AAGCTTAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAATCTTCCAATTCTGCACAAA
ATGCATGTCAAGTTTGGAGATACTGTCAAAGTTATCTCTGGACGAGACAAGGGTAAGATT
GGTGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTC
AAGACCAAACACATGAAGAGCCGGGAAGAGGGGGAGCCTG*TCAAATTGTCAAGATTGAA
GCACCGATACACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTTGTAAGCCGG
GTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAA
CTTATCGACACCGTTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCAAAGGATAAAGAAACATCT
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CCTTCCTCGGCCAGCGTCTCATTTCCCCGATTTCCCTCTCCGCCGCTTCTCCGGTCAATC
CCGCCCAGAACCACCCATGTCTTGTTTTTGCAAAGCTTAAGCGTTGGGAACGGAAGAAAT
GCAAACCAAACAGTCTTCCAATTCTGCACAAAATGCATGTCAAGTTTGGAGATACTGTCA
AAGTTATTTCTGGACGAGACGAGGGTAAGATTGGTGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACA
ACAGCACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGGGAAG
AGGGGGAGCCTGGTCAAATTGTCAAGATTGAAGCACCGATACACAGCTCAAATGTGATGC
TGTATTCGAAAGGAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGAC
AGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCGTTGAGAAGTGGAAGC
AACTTAAGTAGGCAAAGGATAAAGAAACATCTGCAGTTACAGTTGCCTCCACATCTTAGC
ATGTCACATGTTTCTTCTTCATTGCACTTTTGTTTGTAG*CTAATGGACCTATGTATTTG
ATGGATAAATTGAATCCCTTTCAAGAG*TGAAGTGTAAAATTTATAC*AGATAAAGA*CA
CCTTCTG

QA 1 787 1 787
DS 

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AAGTTTGGAGATACTGTCAAAGTTATTTCTGGACGAGACGAGGGTAAGATTGGTGAAGTC
ACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCATTGTCATCAACGATGTCAACCTCAAGACCAAA
CACATGAAGAGCCGGGAAGAGGGGGAGCCTGGTCAAATTGTCAAGATTGAAGCACCGATA
CACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGGAAAGGAGGTTGTAAGCCGGGTGGGTCAC
AAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAGGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGAC
ACCGTTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGTAGGCAAAGGATAAAGAAACATCTGCAGTTACA
GTTGCCTCCACATCTTAGCATGTCACATGTTTCTTCTTCATTGCACTTTTGTTTGTAGGC
TAATGGACCTATGTATTTGATGGATAAATTGAATCCCTTTCAAGAGGTGAAGTGTAAAAT
TTATACCAGATAAAGAACACCTTCTGCACGGAC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 6

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TTGGTACTAAACATTCTAAAATATATACACAAATGAGGCTTTTGCAATGTTCTCATCATC
ATCATCGTCATCATCACTGTATCCATGAGAAGGCTTTGTCTTATGTTTCCATTGAACTTC
TTCTTCTTACACCTTTTTCTTGCTAATTAGGGTTGGAGTCACAGAGAGCACACCAATGAG
AAACAGAGTCGCCATAGAGCTGAAGTCATAGAGATCTCCCAATGATTTCAGCTCTCCAAG
AGCGATCCCAGCCCGGACAGTGACATAAGCAGTAGGAATCAGACCGATGAATGTAGCGAG
GAAAGAGATATGGTAAGGAACATCAACAATAGGAGAAGCAACATTAATGAACGTGTTAGG
CAACGTCGGAGTTAGTCTCAAGAAGAGCATATAGTTCAGCAACCCGTCTTTCCTCCTGGC
GACCTGATCTTGGAAGAAGACGAGCTTGTCGGGCCAAAGGGAGAAGATCAAAGGTCTGCC
GATGAGCTTAGAGAGGAAGAAGCAAGAGGAAGCACCAGCTGTCGCGGTGGAGACAACGAG
AGCCATCCCTTTGATAACTCCAAAGAGAGCACCGGCAAGCAATGACATGAACACAGTTCC
GGGAATCATGAACGTCTGCATAAAAACATACACCAGACAATATCCGACAAGAACTTGAAC
CGTGTAATCACTTGTGTAAATCTCCAGATTGTCTCTGAGGATCTGAAGGTCTTGGAGATT
ACGAGGGAGCTTGAGGAAGCTGTAATCAGATTGAGGCATTGT*AGATAAACGCAGAGAAG
GCCAACGAGAAAGCCCAAAACGACGCCGGAAACTGTCGTGACCTCCCAAAAGCTCACAGA
ATATCTTCTAGGAGTCGCCGGAGCAACGCCGGCGATTGTTGTTTCTCCTTCTCTCTCCAT
CTCTCTCTTATGTGTACAATCTGATCGAAAGGAGAGAGATAGAGATAGAAGAACGGAAAG
TTTTGTGCTTGCTTACACGATTCCTTTCTCCTCTCTGTCTCTGTCTTCTCCAAATCTGAA
CTGACGGAGGAAAGATTGGAGAAGGAGAAGGAAGAAGAAAAAATAAATAAAACGAATATT
CGAATTTTGATTTTGAAGATTTGTTGGATTTTTTTGTTTGTTTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FR72JQ U 35
AF RR4G130JQ U 1
AF RR4FY62JQ U 15
AF RR4FR72TF C 487
AF RR4G130TF C 531
AF RR4FY62TF C 612
BS 1 747 RR4G130JQ
BS 748 752 RR4FY62JQ
BS 753 822 RR4FR72TF
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BS 971 1038 RR4FR72TF
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BS 1040 1080 RR4FR72TF
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RD RR4FR72JQ 390 0 0
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TTTGTCTTATGTTTCCATTGAACTTCTTCTTCTTACACCTTTTTCTTGCTAATTAGGGTT
GGAGCCACAGAGAGCACACCAATGAGAAACAGAGTCCCCATAGAGCTGAAGTCATAGAGA
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GGAATCAGACCGATGAATGTAGCGAGGAAGAAGATATGGTAAGGAACATCAACAATAGGA
GAAGCAACATTAATGAACGTGTTAGGCAAC

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4G130JQ 747 0 0
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TTGGTACTAAACATTCTAAAATATATACACAAATGAGGCTTTTGCAATGTTCTCATCATC
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CAACGTCGGAGTTAGTCTCAAGAAGAGCATATAGTTCAGCAACCCGTCTTTCCTCCTGGC
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GATGAGCTTAGAGAGGAAGAAGCAAGAGGAAGCACCAGCTGTCGCGGTGGAGACAACGAG
AGCCATCCCTTTGATAACTCCAAAGAGAGCACCGGCAAGCAATGACATGAACACAGTTCC
GGGAATCATGAACGTCTGCATAAAAACATACACCAGACAATATCCGACAAGAACTTGAAC
CGTGTAATCACTTGTGTAAATCTCCAG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4FY62JQ 741 0 0
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TCTAAAATATATACACAAATGAGGCTTTTGCAATGTTCTCATCATCATCATCGTCATCAT
CACTGTATCCATGAGAAGGCTTTGTCTTATGTTTCCATTGAACTTCTTCTTCTTACACCT
TTTTCTTGCTAATTAGGGTTGGAGTCACAGAGAGCACACCAATGAGAAACAGAGTCGCCA
TAGAGCTGAAGTCATAGAGATCTCCCAATGATTTCAGCTCTCCAAGAGCGATCCCAGCCC
GGACAGTGACATAAGCAGTAGGAATCAGACCGATGAATGTAGCGAGGAAAGAGATATGGT
AAGGAACATCAACAATAGGAGAAGCAACATTAATGAACGTGTTAGGCAACGTCGGAGTTA
GTCTCAAGAAGAGCATATAGTTCAGCAACCCGTCTTTCCTCCTGGCGACCTGATCTTGGA
AGAAGACGAGCTTGTCGGGCCAAAGGGAGAAGATCAAAGGTCTGCCGATGAGCTTAGAGA
GGAAGAAGCAAGAGGAAGCACCAGCTGTCGCGGTGGAGACAACGAGAGCCATCCCTTTGA
TAACTCCAAAGAGAGCACCGGCAAGCAATGACATGAACACAGTTCCGGGAATCATGAACG
TCTGCATAAAAACATACACCAGACAATATCCGACAAGAACTTGAACCGTGTAATCACTTG
TGTAAATCTCCAGATTGT
CTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FR72TF 601 0 0
ATCTTGGAAGAAGACGAGCTTGTCGGGCCAAGGGGAGAAGATCAAAGGTCTGCCGATGAG
CTTAGAGAGGAAGAAGCAAGAGGAAGCACCAGCTGTCGCGGTGGAGACAACGAGAGCCAT
CCCTTTGATAACTCCAAAGAGAGCACCGGCAAGCAATGACATGAACACAGTTCCGGGAAT
CATGAACGTCTGCATAAAAACATACACCAGACAATATCCGACAAGAACTTGAACTGTGTA
ATCACTTGTGTAAATCTCCAGATTGTCTCTGAGGATCTGAAGGTCTTGGAGATTACGAGG
GAGCTTGAGGAAGCTGTAATCAGATTGAGGCATTGTGAGATAAACGCAGAGAAGGCCAAC
GAGAAAGCCCAAAACGACACCGGAAGCTGTCGTGACCTCCCAAAAGCTCACAGAATATCT
TCTAGGAGTCGCCGGAGCAACGCCGGCGATTGTTGTTTCTCCTTCTCTCTCCATCTCTCT
CTTCTGTGTACAATCTGATCGAAAGGAGAGAGATAGAGATAGAAGAACGGAAAGTTTTGT
GCTTGCTTACACAATTCCTTTCTCCTCTCTGTCTCTGTCTTCTCCAAATCTGAAATGAC
CC

QA 1 599 1 599
DS 

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AGACAACGAGAGCCATCCCTTTGATAACTCCAAAGAGAGCACCGGCAAGCAATGACATGA
ACACAGTTCCGGGAATCATGAACGTCTGCATAAAAACATACACCAGACAATATCCGACAA
GAACTTGAACCGTGTAATCACTTGTGTAAATCTCCAGATTGTTTCTGAGGATCTGAAGGT
CTTGGAGATTACGAGGGAGCTTGAGGAAGCTGTAATCAGATTGAGGCATTGT*AGATAAA
CGCAGAGAAGGCCAACGAGAAAGCCCAAAACGACGCCGGAAACTGTCGTGACCTCCCAAA
AGCTCACAGAATATCTTCTAGGAGTCGCCGGAGCAACGCCGGCGATTGTTGTTTCTCCTT
CTCTCTCCATCTCTCTCTTATGTGTACAATCTGATCGAAAGGAGAGAGATAGAGATAGAA
GAACGGAAAGTTTTGTGCTTGCTTACACGATTCCTTTCTCCTCTCTGTCTCTGTCTTCTC
CAAATCTGAACTGACGGAGGAAAGATTGGAGAAGGAGAAGGAAGAAGAAAAAATAAATAA
AACGAATATTCGAATTTTGATTTTGAAGATTTGTTGGATTTTTTTGTTTGTTTGTA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4FY62TF 575 0 0
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ACGTCTGCATAAAAACATACACCAGACAATATCCGACAAGAACTTGAACCGTGTAATCAC
TTGTGTAAATCTCCAGATTGTCTCTGAGGATCTGAAGGTCTTGGAGATTACGAGGGAGCT
TGAGGAAGCTGTAATCAGATTGAGGCATTGT*AGATAAACGCAGAGAAGGCCAACGAGAA
AGCCCAAAACGACGCCGGAAACTGTCGTGACCTCCCAAAAGCTCACAGAATATCTTCTAG
GAGTCGCCGGAGCAACGCCGGCGATTGTTGTTTCTCCTTCTCTCTCCATCTCTCTCTTAT
GTGTACAATCTGATCGAAAGGAGAGAGATAGAGATAGAAGAACGGAAAGTTTTGTGCTTG
CTTACACGATTCCTTTCTCCTCTCTGTCTCTGTCTTCTCCAAATCTGAACTGACGGAGGA
AAGATTGGAGAAGGAGAAGGAAGAAGAAAAAATAAATAAAACGAATATTCGAATTTTGAT
TTTGAAGATTTGTTGGATTTTTTTGTTTGTTTGTA

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 5

CO CL1266Contig1 1410 5 22 U
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AAACAGACAAGACTGATAAAAACAGAAGCACACAGACAGCATTTGGTTTTCCGTTTTCAT
GACAACGTATACATCCATTACTTAGCAAGGGGGTTTGTACCATCCCCACGGGTCGTTTGA
TGTGTAGAGAGTCACTTGCTTCACATTCAAGTAGTTATCAAGTCCCCATTCTCCTAATTC
GCGTCCAAACCCACTGCGTTTGACTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCAAGGCTGTGA
GCAGTTAATCCACACAATCCCAGCTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGGTCACATCTTTCAGC
GTCATTAGATATCACTGCAGCTCCTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGC
CTCATCCTCACTGGAGAATGTTTTCACGCAAAGAACAGGCCCGAAAACTTCTTCCCTCCA
AATTTGCATTGAAGTGGTTACATCAGTTATGATGGTTAGTTCAATGAAGAAGCCCTTTTT
CAGATGCTCAGGTCGGGAACCACCATGTAAAATCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGA
GATAAACTTCAATATTTTCTCGTACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCC
TTCTTCCAAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCCATGAA
TTCAGATGCGATGTTTTCATGAACAAGAAGGCGGGAAGTTGCACTGCAGATCTGACCATT
TGTCCAGAAGCAACCGAAGAGAGCCCATTCAGCAGCTTTATCAAGATCAACGTCATCAAA
CACAATGAGAGGGCTCTTCCCGCCCAGCTCCATCGAAACAGGCTTCACCAACTGAGCAGC
AGCTGTCATGACCTTGCTTCCCGTGGCAAAACTTCCGGTAAAAGCAATCTTGTCGACATT
GGGATGTGAAGCCAAAGGAGCACCAGCTTCCGAACCATATCCAGTAAGAACGTTGAGGAC
ACCAGGAGGAAGACCAACCTCACGACAGATATCAGCAAGCTCCAAACAAGTGACTGAAGC
GAGCTCTGATGGCTTGAGAACCGCAGTACATCCAGCAGCAAGCGAAGGAGCCACCTTCCA
AACAGCCATCAGAAGTGGGTAATTCCAAGGCGTGATGAGTCCCACAACTCCAAGAGGTTG
CTTGAGAACATAACTCTTAAAACTCTCCATGGGAAGAGAAACAGGCGCCTTCTGCTTAGC
ATCTAAGCCTTCAGCAAGGTCAGCATAAAACTCAAAACACCCAGCAACATCCTCCATATC
CCAAAGAGTTTCATCCAAAGGTTTACCAGAGTCAAGCGACTCAAGCGTTGCCAGATGCGA
CTTCCTTTCAGTCACCTTAGCAGCAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A522JQ U 1
AF RR4A522TF C 1
AF RR4GC45JQ U 5
AF RR4AZ78JQ U 1
AF RR4AZ78TF C 670
BS 1 34 RR4AZ78JQ
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BS 36 52 RR4AZ78JQ
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BS 692 877 RR4AZ78JQ
BS 878 1410 RR4AZ78TF

RD RR4A522JQ 710 0 0
GGTCACT
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AAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAG
GC

QA 8 708 8 708
DS 

RD RR4A522TF 710 0 0
GGTCACT
AAAGCTGACTTTATTCATATCGTCTTT*ACTTTTTTTACTCAAAACGTTCCACAAACAGA
CAAGACTGATAAAAACAGAAGCACACAGACAGCATTTGGTTTTCCGTTTTCATGACAACG
TATACATCCATTACTTAGCAAGGGGGTTTGTACCATCCCCACGGGTCGTTTGATGTGTAG
AGAGTCACTTGCTTCACATTCAAGTAGTTATCAAGTCCCCATTCTCCTAATTCGCGTCCA
AACCCACTGCGTTTGACTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCAAGGCTGTGAGCAGTTA
ATCCACACAATCCCAGCTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGGTCACATCTTTCAGCGTCATTA
GATATCACTGCAGCTCCTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGCCTCATCC
TCACTGGAGAATGTTTTCACGCAAAGAACAGGCCCGAAAACTTCTTCCCTCCAAATTTGC
ATTGAAGTGGTTACATCAGTTATGATGGTTAGTTCAATGAAGAAGCCCTTTTTCAGATGC
TCAGGTCGGGAACCACCATGTAAAATCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGAGATAAAC
TTCAATATTTTCTCGTACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCCTTCTTCC
AAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAG
GC

QA 8 708 8 708
DS 

RD RR4GC45JQ 805 0 0
GCC
AAAGTTGACTTTATTCATATCGTCTTT*ACTTTTTT*ACTCAAAACGTTCCACAAACAGA
CAAGACTGATAAAAACAGAAGCACACAGACAGCATTTGGTTTTCCGTTTTCATGACAACG
TATACATCCATTACTTAGCAAGGGGGTTTGTACCATCCCCACGGGTCGTTTGATGTGTAG
AGAGTCACTTGCTTCACACTCAAGTAGTTATCAAGTCCCCATTCTCCTAATTCGCGTCCA
AACCCACTGCGTTTGACTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCATGGCTGTGAGCAGTTA
ATCCACACAATCCCAGCTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGATCACATCTTTCAGCGTCATTA
GATATCACTGCAGCTCCTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGCCTCATCC
TCACTGGAGAATGTCTTCACGCAAAGAACAGGCCCGAAAACTTCTTCTCTCCAAATTTGC
ATTGAAGTGGTTACATCAGTTATGATGGTTGGTTCAATGAAGAAGCCCTTTTTCAGATGC
TCAGGTCGGGAACCACCCTGTAAA*TCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGAGATAAAC
TTCAAGATTTTCTCGTACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCCTTCTTAC
AAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCTATGAATTCAGAT
GCGATTTTTTCATGAACAAGAAG*CGGGAAGTTGCACTGCAGATCTGACCATTTGTCCAG
AAGCAACCGAAGAGAGCCCATT

QA 4 805 4 805
DS 

RD RR4AZ78JQ 877 0 0
GATCACCAAAGCTGACTTTATTCATATCGTCTTTGACTTTTTTTACTCAAAAGGTTCCAC
AAACAGACAAGACTGATAAAAACAGAAGCACACAGACAGCATTTGGTTTTCCGTTTTCAT
GACAACGTATACATCCATTACTTAGCAAGGGGGTTTGTACCATCCCCACGGGTCGTTTGA
TGTGTAGAGAGTCACTTGCTTCACACTCAAGTAGTTATCAAGTCCCCATTCTCCTAATTC
GCGTCCAAACCCACTGCGTTTGACTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCATGGCTGTGA
GCAGTTAATCCACACAATCCCAGCTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGGTCGCATCTTTCAGC
GTCATTAGATATCACTGCAGCTCCTAGTCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGC
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AATTTGCATTGAAGTGGTTACATCAGTTATGATGGTTGGTTCAATGAAGAAGCCCTTTTT
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GATAAACTTCAATATTTTCTCGTACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCC
TTCTTCAAAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTTTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCCATGAA
TTCAGATGCGATGTTTTCATGAACAAGAAGGCGGGAAGTTGCACTGCAGATCTGACCATT
TGTCCAGAAGCAACCGAAGAGAGCCCATTCAGCAGCTTTATCAAGATCAACGTCATCAAA
CACAATGAGAGGGCTCTTCCCGCCCAGCTCCATCGAA

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR4AZ78TF 741 0 0
GGGGTCAGAAACTTTAATGTTTTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCCATGAATTCAGATGC
GATGTTTTCATGAACAAGAAGGCGGGAAGTTGCACTGCAGATCTGACCATTTGTCCAGAA
GCAACCGAAGAGAGCCCATTCAGCAGCTTTATCAAGATCAACGTCATCAAACACAATGAG
AGGGCTCTTCCCGCCCAGCTCCATCGAAACAGGCTTCACCAACTGAGCAGCAGCTGTCAT
GACCTTGCTTCCCGTGGCAAAACTTCCGGTAAAAGCAATCTTGTCGACATTGGGATGTGA
AGCCAAAGGAGCACCAGCTTCCGAACCATATCCAGTAAGAACGTTGAGGACACCAGGAGG
AAGACCAACCTCACGACAGATATCAGCAAGCTCCAAACAAGTGACTGAAGCGAGCTCTGA
TGGCTTGAGAACCGCAGTACATCCAGCAGCAAGCGAAGGAGCCACCTTCCAAACAGCCAT
CAGAAGTGGGTAATTCCAAGGCGTGATGAGTCCCACAACTCCAAGAGGTTGCTTGAGAAC
ATAACTCTTAAAACTCTCCATGGGAAGAGAAACAGGCGCCTTCTGCTTAGCATCTAAGCC
TTCAGCAAGGTCAGCATAAAACTCAAAACACCCAGCAACATCCTCCATATCCCAAAGAGT
TTCATCCAAAGGTTTACCAGAGTCAAGCGACTCAAGCGTTGCCAGATGCGACTTCCTTTC
AGTCACCTTAGCAGCAATACC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 6

CO CL1267Contig1 1135 6 12 U
GCCAGTCATATTATTCAGATGTTTTATTACAATCCAAAACCAAAAAGCTTTGAATTCTAC
ACAGCCAATTAATTCGTTAACTGCAGTAGAAAATTTATAGACCATATGGTATTCCTTTGC
AAGGTGATTTCAAATGACTGGTTGGAGAAAACATCCGTCACAGCCAGCCAAACCACGTAG
AAGCTTTCACGGATATCCAGAAGCAATTCGGAAGGCAGTTCTCGACGGAAGGATTTTAGC
CAAAAAAAAAAAAAGATGATACTCCATGAAAGGAAGACAAGAGAAATAAGAAACCCCAGA
AAATCAAAATATCTAAACTATGCTAAATTAAATGGTAGAAAAAAACTTTTATAAAAAGTT
GACCCGATGGTGGTTGCTTTTGTTTTTTTTTCTTAAAAGCCTATGAGAAGAGCTTGTAGC
TTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTCTCATTCCTCCAATGGGCGCGAAGATTGCTATCAAGA
CCCCAATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAACCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCT
TCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGAAGTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCAC
CGAAGAACCCTAAAAGACCTCCGAAG*AAGGGTATACAAATTGCAATAAGACATACAA*T
TGCAA*CGTATGTGCTACGTGCAGCTAGACGCAGCATTGCTGAAGGA*GTGAGCTTCAGT
GTTTGCACCAGATATGACTCGATCGTGTCAAACACCGACATCGCAAAAACCTGGTAACTT
CCAATGACATGGATAAAGACCATGAAATTAGCTGCAGCAATAAGCCAAACAGGTCTCTCA
AGGGAAATAAGGACATCATCCTCAACATGAGCACCAAAAGCCCAGTAACCAGAGATAGCC
ACACAGAGGTAACAAACGATGACGATGAAGTAAGCAACGACGACTCCTTTCCACATTGGT
TTCTTAGAAGGGACTTCAGGTGTTGAAGGAATAGTAGCTTGGATCTCAAGAACCACACTG
TGTCCTGCGAACGCAAACGCTATGGTTCCAATGCCATTAAACGCGTCAAAGATCATTGAG
GCCGTGGTGTGTCCTCTGACTCCGTACTCAGCTGGATGATGCTCCGTTCCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4CM30JQ U 1
AF RR4F551TF C 170
AF RR4A022TF C 511
AF RR4A022JQ U 392
AF RR4A022JQD U 392
AF RR4A022TFB C 426
BS 1 253 RR4CM30JQ
BS 254 254 RR4F551TF
BS 255 363 RR4CM30JQ
BS 364 364 RR4F551TF
BS 365 406 RR4CM30JQ
BS 407 407 RR4A022JQ
BS 408 768 RR4CM30JQ
BS 769 769 RR4A022JQ
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BS 820 966 RR4A022JQ
BS 967 967 RR4A022JQD
BS 968 1135 RR4A022JQ

RD RR4CM30JQ 822 0 0
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AAGCTTTCACGGATATCCAGAAGCAATTCGGAAGGCAGTTCTCGACGGAAGGATTTTAGC
CAAAAAAAAAAAA*GATGATACTCCATGAAAGGAAGACAAGAGAAATAAGAAACCCCAGA
AAATCAAAATATCTAAACTATGCTAAATTAAATGGTAGAAAAAAACTTTTATAAAAAGTT
GACGCGATGGTGGTTGCTTTTGTTTTTTTTTCTTAAAAGCCTATGAAAAGAGCTTGTAGC
TTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTCTCATTCCTCCAATGGGCGCGAAGATTGCTATCAAGA
CCCCAATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAACCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCT
TCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGAAGTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCAC
CGAAGAACCCTAAAAGACCTCCGAAG*AAGGGTATACAAATTGCAATAAGACATACAA*T
TGCAA*CGTATGTGCTACGTGCAGCTAGACGCAGCATTGCTGAAGGA*GTGAGCTTCAGT
GTTTGCACCAGATATGACTCGATCGTGTCAAACACCGACATCGCAAAA*CCTGGTAACTT
CCAATGACATGGATAAAGACCATGAAATTAGCTGCAGCA
TAA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4F551TF 687 0 0
AAACCACGTAGAAGCTTTCACGGATATCCAGAAGCAATTCGGAAGGCAGTTCTCGACGGA
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GAAACCCCAGAGAATCAAAATATCTAAACTATGCTAAATTAAATGGTAGAAATAAACTTT
TATAAGAAGTTGACCCGATGGTGGTTGCTTTTGTTTTTTTTTCTTAAAAGCCTATGAGAA
GAGCTTGTAGCTTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTCTCATTCCTCCAATGGGCGCGAAGAT
TGCTATCAAGACCCCAATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAACCAATGGAAGCTAAATAG
TTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGAAGTATGAGGTTGATGCGAA
GACTAGGCCACCGAAGAACCCTAAAAGACCTCCGAAG*AAGGGTATACAAATTGCAATAA
GACATACAA*TTGCAA*CGTATGTGCTACGTGCAGCTAGACGCAGCATTGCTGAAGGA*G
TGAGCTTCAGTGTTTGCACCAGATATGACTCGATCGCGTCAAACACCGACATCGCAAAAA
CCTGGTAACTTCCAATGACATGGATAAAGACCATGAAATTAGCTGCAGCAATAAGCCAAA
CAGGTCTCTCAAGGGAAATAAGGACA
C

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4A022TF 331 0 0
ACCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGA
AGTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCACCGAAGAACCCTAAAAGACCTCCGAAGGAAG
GGTATACAAATTGCAATAAGACATACAAATTGCAAACGTATGTGCTACGTGCAGCTAGAC
GCAGCATTGCTGAAGGAAGTGAGCTTCAGTGTTTGCACCAGATATGACTCGATCGTGTCA
AACACCGACATCGCAAAAACCTGGTAACTTCCAATGACATGGATAAAGACCATGAAATTA
GCTGCAGCAATAAGCCAAACAGGTCTCTCAA

QA 1 331 1 331
DS 

RD RR4A022JQ 744 0 0
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TCCAATGGGCGCGAAGATTGCTATCAAGACCCCAATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAA
CCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGAA
GTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCACCGAAAAACCCTAAAAGACCTCCGAAG*AAGG
GTATACAAATTGCAATAAGACATACAA*TTGCAA*CGTATGTGCTACGTGCAGCTAGACG
CAGCATTGCTGAAGGA*GTGAGCTTCAGTGTTTGCACCAGATATGACTCGATCGTGTCAA
ACACCGACATCGCAAAAACCTGGTAACTTCCAATGACATGGATAAAGACCATGAAATTAG
CTGCAGCAATAAGCCAAACAGGTCTCTCAAGGGAAATAAGGACATCATCCTCAACATGAG
CACCAAAAGCCCAGTAACCAGAGATAGCCACACAGAGGTAACAAACGATGACGATGAAGT
AAGCAACGACGACTCCTTTCCACATTGGTTTCTTAAAAGGGACTTCAGGTGTTGAAGGAA
TAGTAGCTTGGATCTCAAGAACCACACTGTGTCCTGCGAACGCAAACGCTATGGTTCCAA
TGCCATTAAACGCGTCAAAGATCATTGAGGCCGTGGTGTGTCCTCTGACTCCGTACTCAG
CTGGATGATGCTCCGTTCCTTTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4A022JQD 744 0 0
CTTAAAAGCCTATGAGAAGAGCTTGTAGCTTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTCTCATTCC
TCCAATGGGCGCGAAGATTGCTATCAAGACCCCAATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAA
CCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGAA
GTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCACCGAAAAACCCTAAAAGACCTCCGAAG*AAGG
GTATACAAATTGCAATAAGACATACAA*TTGCAA*CGTATGTGCTACGTGCAGCTAGACG
CAGCATTGCTGAAGGA*GTGAGCTTCAGTGTTTGCACCAGATATGACTCGATCGTGTCAA
ACACCGACATCGCAAAAACCTGGTAACTTCCAATGACATGGATAAAGACCATGAAATTAG
CTGCAGCAATAAGCCAAACAGGTCTCTCAAGGGAAATAAGGACATCATCCTCAACATGAG
CACCAAAAGCCCAGTAACCAGAGATAGCCACACAGAGGTAACAAACGATGACGATGAAGT
AAGCAACGACGACTCCTTTCCACATTGGTTTCTTAGAAGGGACTTCAGGTGTTGAAGGAA
TAGTAGCTTGGATCTCAAGAACCACACTGTGTCCTGCGAACGCAAACGCTATGGTTCCAA
TGCCATTAAACGCGTCAAAGATCATTGAGGCCGTGGTGTGTCCTCTGACTCCGTACTCAG
CTGGATGATGCTCCGTTCCTTTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4A022TFB 710 0 0
GCTGAAAGGATAATGTGTCTCATTCCTCCAATGGGCGCGAAGATTGCTATCAAGACCCCA
ATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAACCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCTTCATG
ACCAACCATATAATGCAAGGTATGAAGTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCACCGAAG
AACCCTAAAAGACCTCCGAAG*AAGGGTATACAAATTGCAATAAGACATACAA*TTGCAA
*CGTATGTGCTACGTGCAGCTAGACGCAGCATTGCTGAAGGA*GTGAGCTTCAGTGTTTG
CACCAGATATGACTCGATCGTGTCAAACACCGACATCGCAAAAACCTGGTAACTTCCAAT
GACATGGATAAAGACCATGAAATTAGCTGCAGCAATAAGCCAAACAGGTCTCTCAAGGGA
AATAAGGACATCATCCTCAACATGAGCACCAAAAGCCCAGTAACCAGAGATAGCCACACA
GAGGTAACAAACGATGACGATGAAGTAAGCAACGACGACTCCTTTCCACATTGGTTTCTT
AGAAGGGACTTCAGGTGTTGAAGGAATAGTAGCTTGGATCTCAAGAACCACACTGTGTCC
TGCGAACGCAAACGCTATGGTTCCAATGCCATTAAACGCGTCAAAGATCATTGAGGCCGT
GGTGTGTCCTCTGACTCCGTACTCAGCTGGATGATGCTCCGTTCCTTTCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 5

CO CL1268Contig1 1292 5 5 U
AGCCGTAAAAGTTATGAGAGTTTTATTTATAATATTTCATACCAACTTTTTTAAATACAC
CACAGCATGCATGACATAATATTCCATGATATGATAAACACAAAAGATAGAGAGACATCT
TCTGATGTTTCTTAATTATAACATGTCACGTTACAGCTTCAAAGTTTCACACTGGTGGCA
TCGATCAATCTCCACCGTCCACCCATTCTTATCCTCAGCCCGACCCAACTGGATATCCGT
TAACGTCGCAAAGAGCTTCGCAGCCAATGTCTTATCACCTGTTTTGAATCCGGTCTTTTT
GTCCTTGAAGGTGACGGACGCAATAGTTGTCACAATTGCAGCAGTGCCAGAGCAGAAAAC
TTCTTCCGCATCGAGAAGATCCTCAACGGGAACAACACGTTCCTCAACCTTGTATCCGAA
ATCACGAGTTAATTCGATGATACATTTTCGTGTGATTCCAGGCAATACGGTTCCTGAAAT
TTCTGGAGTCGACACAACATTTCCCTTGACTATGAAAACGTTAGAAGCGTAAAGCTCTTC
AACGTTTTTGCCAGTTGCAGCATCCAAAAACAAAACATCGGAGAAACCTTGTGCTTTCGC
CTCTGCTACTGTTATCCAAACAGGAGAATAGTTTGTGATACTCTTCACACCACCAGTTCC
ACCTGGAAAAGCACGACGAAACTTATCTTCAATTTTCAGGTTCAACCCTGCGTTATCGCT
GTGATAACGACCAACGGGACATGCAAACATTGTGAAGGTGTACTCGGAAACAGGAAATGA
GCCAAGTATAGGACCGCTCCCAAACAAGACAGATCTGAGATACAGTGTTCCTCTCCCCGG
AGGAGGAATCCATTTCTTGTTGGCAAGAACAACTTGTTTGACAGCGGAGACGAATTGATC
GACCGAGGGACAAGGCATACAAAGTCTGTGGGCTCCGGACTGAAGGCGGAGAGCGTTTTG
GTCTGGTCGGAATAGCATAATTCGACCATCTTCTGTCCTGTAAGCCTTCAGCCCTTCATA
TAAACCCTGGCCATAGTTAAGAACTGCAGAGCAAGGGCTGACTTGGAGATCAGCATAAGG
AACGATCTTTCCCTCTTGGAAACTCTCTCCATGCTTGCACTTCGCAACATACATACTGTC
CGTACGATAAAACCCGAATCCCAATTCTTCCCATTTCACATTCGCGTATTTCTCATCAGA
AACACTTGTAGGAAGAGATTGCGCAGAAGGAGCCATATGGATTTGCTGTTTGAGTCGAGT
TGCTTTTGTGTAAGAAACTCGAGTTGTCTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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GTCCTTGAAGGTGACGGACGCAATAGTTGTCACAATTGCAGCAGTGCCAGAGCAGAAAAC
TTCTTCCGCATCGAGAAGATCCTCAACGGGAACAACACGTTCCTCAACCTTGTATCCGAA
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AGGAGGAATCCATTTCTTGTTGGCAAGAACAACTTGTTTGACAGCGGAGACGAATTGATC
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AACACTTGTAGGAAGAGATTGCGCAGAAGGAGCCATATGGATTTGCTGTTTGAGTCGAGT
TGCTTTTGTGTAAGAAACTCGAGTTGTCTCCC

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DS 



AS 1 6

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ACACTCTCAGGGTGAGAAGGAAGTGTTGCTAATGTGTGTAATAATCCTACTCTGTCTTCC
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TGGCCAAGTGTCTCAAGTCGGTCGTCGTAACTTCTAGTCGTGATGACGTTAGGGTAGTAC
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GCTTGTTGCTTCTCAATCATGCCCAATGTGCAGCAAACCTCCATCCCC*ATGCCTCTTAT
CTCTTTGATGTAATCAAGTATCTGGTTGAAATTGGTTGTCCGTCCTATTGTATCTCTCCA
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GACGGCGTCCTTGGACATGAGTTTTTGGGCCTTGACTCCAGTGCTATATCTGGAGGACTG
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GTGCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4GR12JQ U 5
AF RR4FT57JQ U 1
AF RR4FS59JQ U 1
AF RR4FT57TF C 216
AF RR4FS59TF C 250
AF RR4EK48TF C 655
BS 1 284 RR4FS59JQ
BS 285 285 RR4FT57JQ
BS 286 820 RR4FS59JQ
BS 821 821 RR4FT57TF
BS 822 836 RR4FS59JQ
BS 837 997 RR4FT57TF
BS 998 1325 RR4EK48TF

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CAAGATTG
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TGATACTGTAATGCTACATAGTAAAAAGGTGGCTACTTCAAAGAGTGTCCAGACATTAGT
GAGAAGCAGAAGCAACTTTCTCGCAATTTTCTGATTCAGAATCATCTTCAGAGAAGCTTG
GGGGTTTAGGAGTGAGTCCTAAAGTCTTGAACATGAGCTGGTCAGCGTCAAAGTCATTGT
TTGGTGTTGTTAACAGTTTCTCTCC*AGTGAATATAGAGTTTGCACCAGCAAGGAGACAC
AAGGCTTGCTCTGGCATGGTGAAACGGACTCTGCCAGCAGATAGCCTCACCATTGCTTTT
GGCACCACTATTCTTGCTGTTCCAATCATCCTGATCATCTCCCATATCTCAACCGGCTTC
TGGTCTTCAAGAGGAGTGCCTTTCACTGCAAGCAGAGCATTGATAGGAACACTCTCTGGG
TGAGAAGGAAGTGTTGCCAGTGTGTGTAATAATCCTACTCTGTCTTCCTCTGCCTCTCCA
AGCCCTATGATTCCTCCTGAACAGACATTGATTCCAGCTTCACGAACATGGTCAAGAGTC
TCAAGTCGGTCGTCATAACTTCTA

QA 9 632 9 632
DS 

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GTGACAAGTTTA
TACTGGTCATTATTATATCATAATCAACTTAAGATTCTGTAGAGCTAGCATCGCTGAAAC
TGATACTGTAATGCTACATAGTAAAAAGGTGGCTACTTCAAAGAGTGTCCAGACTTTAGT
GAGAAGCAGAAGCAACTTTCTCGCAATTTTCTGATCCAGAATCATCTTCGGAGAAGTTTG
GGGGTTTAGGAGTGAGTCCTAAAGTCTTGAACATGAGCTGGTCAGCGTCAAAGTCATTGT
TTGGTGTTGTTAACAGCTTCTCTCC*AGTGAAGATAGAGTTTGCACCAGCAAGGAAACAC
AAGGCTTGCTCTGGCATGGTGAAACGGACTCTGCCAGCAGATAGCCTCACCATTGCTTTT
GGCATCACTATTCTTGCTGTTCCAATCATCCTGATCATCTCCCATATCTCAACCGGCTTC
TGGTCTTCAAGAGGAGTGCCTTTCACTGCAAGCAGAGCATTGATAGGAACACTCTCAGGG
TGAGAAGGAAGTGTTGCTAATGTGTGTAATAATCCTACTCTGTCTTCCTCTGCCTCTCCA
AGCCCTATGATTCCTCCTGAACAGACAT*GATTCCAGCTTCACGAACATGGCCAAGTGTC
TCAAGTCGGTCGTCGTAACTTCTAGTCGTGATGACGTTAGGGTAGTACTCTCTTGAAGTA
TCAAGATTGTGGTTATAAGCAGTGA

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DS 

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CATCGCTGAGACTGATACTGTAATGCTACATAGTAAAAAGGTGGCTACTTCAAAGAGTGT
CCAGACTTTAGTGAGAAGCAGAAGCAACTTTCTCGCAATTTTCTGATCCAGAATCATCTT
CGGAGAAGTTTGGGGGTTTAGGAGTGAGTCCTAAAGTCTTGAACATGAGCTGGTCAGCGT
CAAAGTCATTGTTTGGTGTTGTTAACAGCTTCTCTCC*AGTGAAAATAGAGTTTGCACCA
GCAAGGAAACACAAGGCTTGCTCTGGCATGGTGAAACGGACTCTGCCAGCAGATAGCCTC
ACCATTGCTTTTGGCATCACTATTCTTGCTGTTCCAATCATCCTGATCATCTCCCATATC
TCAACCGGCTTCTGGTCTTCAAGAGGAGTGCCTTTCACTGCAAGCAGAGCATTGATAGGA
ACACTCTCAGGGTGAGAAGGAAGTGTTGCTAATGTGTGTAATAATCCTACTCTGTCTTCC
TCTGCCTCTCCAAGCCCTATGATTCCTCCTGAACAGACAT*GATTCCAGCTTCACGAACA
TGGCCAAGTGTCTCAAGTCGGTCGTCGTAACTTCTAGTCGTGATGACGTTAGGGTAGTAC
TCTCTTGAAGTATCAAGATTGTGGTTATAAGCAGTGAGGCCGGCCTTCTTTAGCTCTAAC
GCTTGTTGCTTCTCAATCATGCCCAATGTGCAGCAAACCTCCATCCCC*ATGCCTCTTAT
CTCTTTGATGTAATCAAGTATCTGGTTGAAATTGGTTGTC*GTCCTATTGTATCTC

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DS 

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AGTC
TGAACATGAGCTG*TCAGCGTCAAAGTCATTGTTTGGTGTTGTTAACAGCTTCTCTCC*A
GTGAAGATAGAGTT*GCACCAGCAAGGAAACACAAGGCTTGCTCTGGCATGGTGAAACGG
ACTCTGCCAGCAGATAGCCTCACCATTGCTTTTGGCATCACTATTCTTGCTGTTCCAATC
ATCCTGATCATCTCCCATATCTCAACCGGCTTCTGGTCTTCAAGAGGAGTGCCTTTCACT
GCAAGCAGAGCATTGATAGGAACACTCTCAGGGTGAGAAGGAAGTGTTGCTAATGTGTGT
AATAATCCTACTCTGTCTTCCTCTGCCTCTCCAAGCCCTATGATTCCTCCTGAACAGACA
T*GATTCCAGCTTCACGAACATGGCCAAGTGTCTCAAGTCGGTCGTCGTAACTTCTAGTC
GTGATGACGTTAGGGTAGTACTCTCTTGAAGTATCAAGATTGTGGTTATAAGCAGTGAGG
CCGGCCTTCTTTAGCTCTAACGCTTGTTGCTTCTCAATCATGCCCAATGTGCAGCAAACC
TCCATCCCC*ATGCCTCTTATCTCTTTGATGTAATCAAGTATCTGGTTGAAATTGGTTGT
CCGTCCTATTGTATCTCTCCAAGCAGCACCCATGCAAAAACGTGTGCTACCAGCTTCTTT
TGCCTTCTTTACTGCTTCAATGACGGCGTCCTTGGACATGAGTTTTTGGGCCTTGACTCC
AGTGCTATATCTGGAGGACTGAGGACAATAGGAACAGTCCTCGCTGCACCCACCAGTC
C

QA 5 782 5 782
DS 

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CACAAGGCTTGCTCTGGCATGGTGAAACGGACTCTGCCAGCAGATAGCCTCACCATTGCT
TTTGGCATCACTATTCTTGCTGTTCCAATCATCCTGATCATCTCCCATATCTCAACCGGC
TTCTGGTCTTCAAGAGGAGTGCCTTTCACTGCAAGCAGAGCATTGATAGGAACACTCTCA
GGGTGAGAAGGAAGTGTTGCTAATGTGTGTAATAATCCTACTCTGTCTTCCTCTGCCTCT
CCAAGCCCTATGATTCCTCCTGAACAGACAT*GATTCCAGCTTCACGAACATGGCCAAGT
GTCTCAAGTCGGTCGTCGTAACTTCTAGTCGTGATGACGTTAGGGTAGTACTCTCTTGAA
GTATCAAGATTGTGGTTATAAGCAGTGAGGCCGGCCTTCTTTAGCTCTAACGCTTGTTGC
TTCTCAATCATGCCCAATGTGCAGCAAACCTCCATCCCC*ATGCCTCTTATCTCTTTGAT
GTAATCAAGTATCTGGTTGAAATTGGTTGTCCGTCCTATTGTATCTCTCCAAGCAGCACC
CATGCAAAAACGTGTGCTACCAGCTTCTTTTGCCTTCTTTACTGCTTCAATGACGGCGTC
CTTGGACATGAGTTTTTGGGCCTTGACTCCAGTGCTATATCTGGAGGACTGAGGACAATA
GGAACAGTCCTCGCTGCACCCACCAGTC
C

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DS 

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TCTAACGCTTGTTGCTTCTCAATCATGCCCAATGTGCAGCAAACCTCCATCCCCCATGCC
TCTTATCTCTTTGATGTAATCAAGTATCTGGTTGAAATTGGTTTTCCGTCCTATTGTATC
TCTCCAAGCAGCACCCATGCAAAAACGTGTGCTACCAGCTTCTTTTGCCTTCTTTGCTGC
TTCAATGACGGCGTCCTTGGACATGAGTTTTTGGGCCTTGACTCTAGTGCTATATCTGGA
GGACTGAGGACAATAGGAACAGTCCTCGCTGCACCCACCAGTCTTTATGGAGAGAAGAGT
ACACTGCTGCACTTCCCTGAAGTTATGAACATGTCTGTGAACCTGTGCGCCATGGAAGAG
GAGGTCAAGAAGAGGAGAATCATAAACAGCCTTGATTTCATCTCTACTCCAGTCATTCCT
CGGACCTTCCCGAATCGTCCTTTCATCTTCAGCTGAAGCTGCTGATGATGATGAAGACGA
GTAAGAAGCAGACTGACGAACCGAGAGAGAAGCTCTCAGTTGAGATCGAAATACAAATCG
AGCAAGCATCATTTTATCTCGATCTACTGATCTGCGCTAATCTTCCACTTCAGTCATCCA
TTATGAGTGCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 6

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CTCCATTAAGGTTCAGTTCAATAAGCTGCAAAATAGGAGTACACAGCCCTCAGGTACTTG
AGAGCAATTCATAAATCATTGATTGCGCAACGCATTGGTTATTGTTCCACCATGCCGCAT
CATCACCACTACTGCAGCAATCATGTATGTGTGTGTGTGTATATAGATAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAGTTGAAGCAACGGAGATGATGAGGCTCA
GCAAGAAACAACCAAGCGGCACAACTCAAAGACATTTTATTCATCATCACAGGGCTAAAG
TATATATCAACCAGATCTAGCCCGTATAATGCAAGAGAAACCAAACAAAAAACCAATAAA
ACTTAAATCAAAACTACATTTTTTAGAACCCTCAGAATTTCAGATAAATCTGTCATTAGT
GGCGCATCAAAATCCGGTTTTCAAAACGTCACATAGCTATCACTGCAGCAAACCAGTAGT
AGTAGTAGTAGTAGAAGCAGTAACACAAGCAGACAGCGAAGGAGAGGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGTTGGAGATGATGATGATGATGATGATGATAAAGAGTCGCAATGATAACTACGTGA
TCAAGACATCGAAAAACCAGGGCACCACTCAGAAAGTATCAAGCTTTAACATCAACGGGC
TTAATATACCAATAAAAATCGAAACTTTAAAAAATAAATAAAAAAAGCCCTCAGATCTCA
TAGCTATAATCTGATCATTCACGGCCTGCATATTGCAAGTAAATGGATAAAACTCCAGCA
AAACCCTAAAAGCCCCCAAACAACGCTAATTCGCAACCGACGCACGTGTGTGAATGAATG
GTAGGTGATGGTGAGATGTGCGCGTGTGAATGCAATCGGACACGAAATAGCGAAGCTCAG
AGACTTTAAAAGGAATACACAACACGCCGGAGCGTTATCCAAATACAACCGCTCTATATA
AAAATTTATCCATCATTAGGCATTCAACAAAACAAACAATAAATCAAAAAGGACGAGTAA
AACGAAAAATCCCTAATCGAAGTAGAGAGTGAAATCAGATCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4A111JQD U 257
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TTTTCAAAACGTCACATAGCTATCACTGCAGCAAACCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGAAG
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AG
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AAAAA

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AGAGTGAAATCAGATCC

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DS 



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GCGCATTGTCCGTCTTCCACAGACAGGCTCTACCCGAACCAAGACCCAACAATGAACAAG
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TCATCTTAGCTTTGATTTGAATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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CTATGCTGTACCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCATTCGCGAGCCAGAACACGACGTT
AAACAACTTACCACCACCTTTC

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR4H275TF 698 0 0
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ATGGGTGAGGGTTTATCCAAACGTGTCCTCACTTTTCTGATATTGATCTCGTTAGTGGCG
GTGGCAATGAACCTTCTGTCCACGGTAGAGGCACAGGATAAGAAGAAGCCGAGGAGAGAT
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AGCATCATCAGGAAAGAGCTCAAGAAAATCTTCAAGAGAGATATTGGTTTAGCCGCAGCC
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GATGGATCAGCGAGTGGACCAGGAGAGCAATCATCGATCCCGAATCTGACACTCCGTCAA
GCCGCCTTTGTCGTCATCAATAACCTTCGTGCCCTTGTCCACAAGCAATGTGGTCAAGTC
GTCTCTTGTTCTGACATCCTCGCTCTAGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGG
CCAGACTATGCTGTACCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCATTCGCGAGCCAGAACACG
ACGTTAAACAACTTACCACCACCTTTCGCCAAAGCGGACCAGCTCATCGCCGACTTCGCC
AATAGAAACCTCAACATCACCGACTTAGTAGCACTTTC

QA 1 698 1 698
DS 

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G
CAGGAGAGCAATCATCGATCCCGAATCTGACACTCCGTCAAGCCGCCTTTGTCGTCATCA
ATAACCTTCGTGCCCTTGTCCACAAGCAATGTGGTCAAGTCGTCTCTTGTTCTGACATCC
TCGCTCTAGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGGCCAGACTATGCTGTACCAC
TTGGCCGACGTGACTCACTAGCATTCGCGAGCCAGTACACGACGTTAAACAACTTACCAC
CACCTTTCGCCAAGGCGGACCAGCTCATCGCCGACTTCGCCAATAGAAACCTCAACATCA
CCGACTTAGTAGCACTTTCTGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCATTGTCCGTCTTCCA
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TGACGGGGTCACAATGAGAGATTCGTGCAA*CTGTTCCGCCAGAA*CACTGAAAGTTTCA
TGTCTGTTTTGGA
GA

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DS 

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ACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGGCCAGACTATGCTGTACCACTTGGCCGACGTGACTCAC
TAGCATTCGCGAGCCAGAACACGACGTTAAACAACTTACCACCACCTTTCGCCAAGGCGG
ACCAGCTCATCGCCGACTTCGCCAATAGAAACCTCAACATCACCGACTTAGTAGCACTTT
CTGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCATTGTCCGTCTTTCACAGACAGGCTCTACCCGA
ACCAAGACCCAACAATGAACAAGTCTTTCGCCAACAACCTCAAACGCACTTGCCCCACTG
CTAACTCGAGCAACACGCAAGTGAATGACATAAGGAGCCCTGGCGTGTTTGACAACAAGT
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ACAAGAGGACACGTGGTATCGTGGAGAGCTTTGCGATCGACCAGAAGCTGTTTTTTGATC
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GCATACTCGAGGAGGCTCTTTCCATGATCTAGATGAAACTCATATAACTATCGTCTCTTA
TTTTCCTTTGACTTTGTTTTCTTAGTTAACGCACTTGTGGTTTGTGGAATGCTTAAGACT
ATTTGATAAATAAGAGTGTTGCTTCATCTTAGCTTTG

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DS 

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TGGCCGACGTGACTCACTAGCATTCGCGAGCCAGAACACGACGTTAAACAACTTACCACC
ACCTTTCGCCAAGGCGGACCAGCTCATCGCCGACTTCGCCAATAGAAACCTCAACATCAC
CGACTTAGTAGCACTTTCTGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCATTGTCCGTCTTTCAC
AGACAGGCTCTACCCGAACCAAGACCCAACAATGAACAAGTCTTTCGCCAACAACCTCAA
ACGCACTTGCCCCACTGCTAACTCGAGCAACACGCAAGTGAATGACATAAGGAGCCCTGG
CGTGTTTGACAACAAGTACTACGTTGATCTCATGAACCGACAAGGGCTATTCACATCCGA
CCAGGACCTGTTCACGGACAAGAGGACACGTGGTATCGTGGAGAGCTTTGCGATCGACCA
GAAGCTGTTTTTTGATCATTTTGTGGTGGGGATGATCAAGATGGGTCAGATGAGTGTTTT
GACGGGGTCACAAGGAGAGATTCGTGCAAACTGTTCCGCCAGAAACACTGAAAGTTTCAT
GTCTGTTTTGGAAGATGGCATACTCGAGGAGGCTCTTTCCATGATCTAGATGAAACCCAT
ATAACTATCGTCTCTTATTTTCCTTTGACTTTGTTTTCTTAGTTAACGCACTTGTGGTTT
GTGGAATGCTTAAGACTATCTGATAAATAAGAGTGTTGCTTCATCTTAGCTTTGATTTGA
ATTTCG

QA 1 726 1 726
DS 

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GCCAAGGCGGACCAGCTCATCGCCGACTTCGCCAATAGAAACCTCAACATCACCGACTTA
GTAGCACTTTCTGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCATTGTCCGTCTTCCACAGACAGG
CTCTACCCGAACCAAGACCCAACAATGAACAAGTCTTTCGCCAACAACCTCAAACGCACT
TGCCCCACTGCTAACTCGAGCAACACGCAAGTGAATGACATAAGGAGCCCTGGCGTGTTT
GACAACAAGTACTACGTTGATTTCATGAACCGACAAGGGCTATTCACATCCGACCAGGAC
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TCGTCTCTTATTTTCCTTTGACTTTGTTTTCTTAGTTAACGCACTTGTGGTTTGTGGAAT
GCTTAAGACTATTTGATAAATAAGAGTGTTGCTTCATCTTAGCTTTG
G

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 6

CO CL1272Contig1 1200 6 20 U
GGAAATGAAGTCAGCAGTTACATCGTCACTCTTCTCCCATTCGAAGAATCTTTTAAAACC
TAATCCCTTTTCTCGTCTCGAATCCGTTTTTCTCCCTAAACCATCACTTAGATCGATCGT
CAAACTCCTCCCATCATCGTCAACAACCTCAGGTCTAAGATCCATCTCCTCAATGGCTTC
CTCTTTCAAACCCGAACAAGCCAGAGTTCCCTCTGCTCTTCCCCTCCCAGCTCCTCCGTT
GACCAAATTCAACATCGGATTGTGTCAGCTATCTGTGACTGCCGACAAATCAAGAAACAT
CTCTCACGCCAAGAAAGCCATCGAAGAAGCTGCTTCCAAGGGAGCTAAGCTTGTTCTCTT
GCCCGAGATTTGGAACAGTCCGTATTCGAATGATAGTTTCCCGGTTTACGCGGAAGAGAT
CGATGCAGGTGGTGAGGCTTCTCCTTCGACCGCTATGCTTTCCGAAGTTTGTAAACGTCT
CGGGATCACTATCATTGGTGGCTCCATACCCGAAAGAGTCGGGGATCGTTTGTATAACAC
TTGCTGTGTCTTTGGCTCTGATGGTGAGCTCAAAGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATT
TGATATAGACATTCCCGGGAAGATTACTTTCATGGAATCAAAAACTCTTACTGCCGGTGA
GACACCAACAATCGTCGACACAGATGTGGGGCGTATTGGAATAGGCATCTGCTATGACAT
CCGGTTCCAGGAGTTGGCTATGATATATGCTGCAAGAGGGGCTCATTTGCTGTGCTATCC
AGGAGCATTTAACATGACAACTGGACCTCTGCATTGGGAATTACTACAAAGGGCAAGGGC
TACGGATAATCAGTTATATGTAGCCACATGCTCACCTGCTAGAGATTCAGGAGCTGGCTA
CACTGCTTGGGGACATTCTACACTCATCGGGCCATTTGGAGAAATTCTAGCGACGACTGA
GCATGAGGAAGCAATCATCATAGCAGAGATTGATTACTCTATCCTTGAACAACGAAGGAC
AAGTCTTCCATTGAATAAACAGCGTCGGGGAGATCTCTACCAGCTTGTAGACGTGCAGCG
CCTGAACTCTAAATGAGTGCAACAGAGAGAGAGAGTGAGAGTGAGATGTTGTCTTTAGCT
TTTGTTGAGTCTGAGAACAGTTTGGTTACTTGCAACTTCTTGACATGTCAGAGATGCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D790TF U 1
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AF RR4CE86TF U 145
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TAATCCCTTTTCTCGTCTCGAATCCGTTTTTCTCCCTAAACCATCACTTAGATCGATCGT
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GCCCGAGATTTGGAACAGTCCGTATTCGAATGATAGTTTCCCGGTTTACGCGGAAGAGAT
CGATGCAGGTGGTGAGGCTTCTCCTTCGACCGCTATGCTTTCCGAAGTTTGTAAACGTCT
CGGGATCACTATCATTGGTGGCTCCATACCCGAAAGAGTCGGGGATCGTTTGTATAACAC
TTGCTGTGTCTTTGGCTCTGATGGTGAGCTCAAAGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATT
TGATATAGACATTCCCGGGAAGATTACTTTCATGGAATCAAAAACTCTTACTGCCGGTGA
GACACCAACAATCGTCGACACAGATGTGGGGCGTAT*GGAATAG*CATCTGCTATGACAT
CCGGTTCCAGGAGT*GGCTATGATATATGCTGCA*GAGGG*CTCATT*GCTGTGCTATC*
AGGAGCATT*AACATGACAACTGGAC
TCT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4A018TFB 804 0 0
G
TCTTCTCCCATTCGAAGAATCTTTTAAAACCTAATCCCTTTTCTCGTCTCGAATCCGTTT
TTCTCCCTAAACCATCACTTAGATCGATCGTCAAACTCCTCCCATCATCGTCAACAACCT
CAGGTCTAAGATCCATCTCCTCAATGGCTTCCTCTTTCAAACCCGAACAAGCCAGAGTTC
CCTCTGCTCTTCCCCTCCCAGCTCCTCCGTTGACCAAATTCAACATCGGATTGTGTCAGC
TATCTGCGACTGCCGACAAATCAAGAAACATCTCTCACGCCAAGAAAGCCATCGAAGAAG
CTGCTTCCAAGGGAGCTAAGCTTGTTCTCTTGCCCGAGATTTGGAACAGTCCGTATTCGA
ATGATAGTTTCCCGGTTTACGCGGAAGAGATCGATGCAGGTGGTGAGGCTTCTCCTTCGA
CCGCTATGCTTTCCGAAGTTTGTAAACGTCTCGGGATCACTATCATTGGTGGCTCCATAC
CCGAAAGAGTCGGGGATCGTTTGTATAACACTTGCTGTGTCTTTGGCTCTGATGGTGAGC
TCAAAGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATTTGATATAGACATTCCCGGGAAGATTACTT
TCATGGAATCAAAAACTCTTACTGCCGGTGAGACACCAACAATCGTCGACACAGATGTGG
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TGCATTGGGAATTACTACAAAGG

QA 2 804 2 804
DS 

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G
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GTTCCCTCTGCTCTTCCCCTCCCAGCTCCTCCGTTGACCAAATTCAACATCGGATTGTGT
CAGCTATCTGTGACTGCCGACAAATCAAGAAACGTCTCTCACGCCAAGAAAGCCATCGAA
GAAGCTGCTTCCAAGGGAGCTAAGCTTGTTCTCTTGCCCGAGATTTGGAACAGTCCGTAC
TCCAATGATAGTTTCCCGGTTTACGCGGAAGAGATCGATGCAGGTGGTGAGGCTTCTCCT
TCGACCGCAATGCTTTCCGAAGTTTCTAAACGTCTCGGGATCACTATCATTGGTGGCTCC
ATACCCGAAAGAGTCGGGGATCGTTTGTATAACACTTGCTGTGTCTTTGGCTCTGATGGT
GAGCTCAAAGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATTTGATATAGACATTTCCGGGAAGATT
ACTTTCATGGAATCAAAAACTCTTACTGCCGGTGAGACACCAACAATCGTCGACACAGAT
GTGGGGCGTATTGGAATAGGCATCTGCTATGACATCCGGTTCCAGGAGTTGGCTATGATA
TATGCTGCAAGAGGGGCTCATTTGCTGTGCTATCCAGGAGCATTTAACATGACAACTGGA
CCTCTGCATTGGGAATTACTACAAAGG
GCA

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR4A018JQD 709 0 0
CTATCATTGGTGGCTCCATACCCGAAAGAGTCGGGGATCGTTTGTATAACACTTGCTGTG
TCTTTGGCTCTGATGGTGAGCTCAAAGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATTTGATATAG
ACATTCCCGGGAAGATTACTTTCATGGAATCAAAAACTCTTACTGCCGGTGAGACACCAA
CAATCGTCGACACAGATGTGGGGCGTATTGGAATAGGCATCTGCTATGACATCCGGTTCC
AGGAGTTGGCTATGATATATGCTGCAAGAGGGGCTCATTTGCTGTGCTATCCAGGAGCAT
TTAACATGACAACTGGACCTCTGCATTGGGAATTACTACAAAGGGCAAGGGCTACGGATA
ATCAGTTATATGTAGCCACATGCTCACCTGCTAGAGATTCAGGAGCTGGCTACACTGCTT
GGGGACATTCTACACTCATCGGGCCATTTGGAGAAATTCTAGCGACGACTGAGCATGAGG
AAGCAATCATCATAGCAGAGATTGATTACTCTATCCTTGAACAACGAAGGACAAGTCTTC
CATTGAATAAACAGCGTCGGGGAGATCTCTACCAGCTTGTAGACGTGCAGCGCCTGAACT
CTAAATGAGTGCAACAGAGAGAGAGAGTGAGAGTGAGATGTTGTCTTTAGCTTTTGTTGA
GTCTGAGAACAGTTTGGTTACTTGCAACTTCTTGACATGTCAGAG
ATGC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4A018JQ 487 0 0
ATGACATCCGGTTCCAGGAGTTGGCTATGATATATGCTGCAAGAGGGGCTCATTTGCTGT
GCTATCCAGGAGCATTTAACATGACAACTGGACCTTTGCATTGGGAATTACTACAAAGGG
CAAGGGCTACGGATAATCAGTTATATGTAGCCACATGCTCACCTGCTAGAGATTCAGGAG
CTGGCTACACTGCTTGGGGACATTCTACACTCATCGGGCCATTTGGAGAAATTCTAGCGA
CGACTGAGCATGAGGAAGCAATCATCATAGCAGAGATTGATTACTCTATCCTTGAACAAC
GAAGGACAAGTCTTCCATTGAATAAACAGCGTCGGGGAGATCTCTACCAGCTTGTAGACG
TGCAGCGCCTGAACTCTAAATGAGTGCAACAGAGAGAGAGAGTGAGAGTGAGATGTTGTC
TTTAGCTTTTGTTGAGTCTGAGAACAGTTTGGTTACTTGCAACTTCTTGACATGTCAGAG
ATGCAAT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR4D790JQ 386 0 0
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TCACCTGCTAGAGATTCAGGAGCTGGCTACACTGCTTGGGGACATTCTACACTCATCGGG
CCATTTGGAGAAATTCTAGCGACGACTGAGCATGAGGAAGCAATCATCATAGCAGAGATT
GATTACTCTATCCTTGAACAACGAAGGACAAGTCTTCCATTGAATAAACAGCGTCGGGGA
GATCTCTACCAGCTTGTAGACGTGCAGCGCCTGAACTTTAAATGAGTGCAACAGAGAGAG
AGAGTGAGAGTGAGATGTTGTCTTTAGCTTTTGTTGAGTTTGAGAACAGTTTGGTTACTT
GCAACTTCTTGACATGTCAGAG
GTGC

QA 1 382 1 382
DS 



AS 1 3

CO CL1273Contig1 1075 3 7 U
GTGTCTTGAGAATTATTTTTAAAGATTATATAGAAAAAGGACTCTTGAATTCACAAGTAA
ATAGTGTAATCACTTTATAAGTTACAAGAAAGATCTTAAACCAAAGACCCTTTTTCTCGC
CGAAAACTAAACTTCCTTCAAACCAAAACTCATGAATCAATTTTTGTTTTTTTCATTATT
AGTTCAAGAACAACTAAAAACACAACAACAACAAGCTCGCCAACCCCCGCTCTTTTATTT
CATCATCTCATTCGTTCCATGGAGACGTGCGGAAAGTCGTCAATCAAGCAGCAACTTTCT
TTGACGTGACTGAGTTCACAATGGTCGCAAACTCAGGTCCCTTCAAGGAGGCACCACCGA
CAAGAAAACCATCAATGTCTTCTTCTTTGGCAAGCTCAGCACAGTTGCCTCCATTGACAG
AACCTCCGTATATGATCCTCGTTTTGGAAGCAACTTCTTCAAAGACGTTTTTCTTGAGCC
AATCACGGACAGCAACATGGACTTCCTGTACTTGCTGAGGAGATGCAACTTTGCCAGTTC
CAATCGCCCATACTGGCTCGTATGCAACCACTACCTTGTCCCAGCTAGGCACCGCATCAG
CAAAGGCCTTTAATTGGTCGAAGCAAACATCAAAAGTCTTGCCAGCTTCCCTCTCTTCAA
GCTTCTCCCCGATACAAGCTATGACTCCAAGACCCTCACTCAACGCGTAAGCAGCTTTCT
TCCCAATAAACTCATCCTTTTCTCCGATGACATGCCTCCTTTCGGAATGGCCAAGAATGA
CCCACTTGCAGCCAATGTCTTTGAGCTGTTCCACGCTGATTTCGCCGGTGAAGGCACCAC
CTTTACCAACCCAAGAGTTCTGACCAGATATCTCAATACGGTCTGTCAAGGATGATTTGA
CTTGGTCGATGTACACAAACGGAGGCGACACAACAACATCAACATCTGGTTCCAAGGTGG
CGGTGTTGAGGTCAGAGACAAGCTTGGTGATGGAGTCCTTAGTCCCGTTACACTTCCAGT
TTCCTCCAACGAAAAACTTTCCGGATCCGGCCATGGCGACAACGCCTCTAGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE19JQ U 1
AF RR4F938JQ U 52
AF RR4DE19TF C 481
BS 1 145 RR4DE19JQ
BS 146 146 RR4F938JQ
BS 147 197 RR4DE19JQ
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BS 199 361 RR4DE19JQ
BS 362 766 RR4F938JQ
BS 767 1075 RR4DE19TF

RD RR4DE19JQ 365 0 0
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ATAGTGTAATCACTTTATAAGTTACAAGAAAGATCTTAAACCAAAGACCCTTTTTCTCGC
CGAAAACTAAACTTCCTTCAAACCAGAACTCATGAATCAATTTTTGTTTTTTTCATTATT
AGTTCAAGAACAACTAAGAACACAACAACAACAAGCTCGCCAACCCCCGCTCTTTTATTT
CATCATCTCATTCGTTCCATGGAGACGTGCGGAAAGTCGTCAATCAAGCAGCAACTTTCT
TTGACGTGACTGAGTTCACAATGGTCGCAAACTCAGGTCCCTTCAAGGAGGCACCACCGA
C
AAGA

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4F938JQ 715 0 0
CACAAGTAAATAGTGTAATCACTTTATAAGTTACAAGAAAGATCTTAAACCAAAGACCCT
TTTTCTCGCCGAAAACTAAACTTCCTTCAAACCAAAACTCATGAATCAATTTTTGTTTTT
TTCATTATTAGTTCAAGAACAACTAAAAACACAACAACAACAAGCTCGCCAACCCCCGCT
CTTTTATTTCATCATCTCATTCGTTCCATGGAGACGTGCGGAAAGTCGTCAATCAAGCAG
CAACTTTCTTTGACGTGACTGAGTTCACAATGGTCGCAAACTCAGGTCCCTTCAAGGAGG
CACCACCGACAAGAAAACCATCAATGTCTTCTTCTTTGGCAAGCTCAGCACAGTTGCCTC
CATTGACAGAACCTCCGTATATGATCCTCGTTTTGGAAGCAACTTCTTCAAAGACGTTTT
TCTTGAGCCAATCACGGACAGCAACATGGACTTCCTGTACTTGCTGAGGAGATGCAACTT
TGCCAGTTCCAATCGCCCATACTGGCTCGTATGCAACCACTACCTTGTCCCAGCTAGGCA
CCGCATCAGCAAAGGCCTTTAATTGGTCGAAGCAAACATCAAAAGTCTTGCCAGCTTCCC
TCTCTTCAAGCTTCTCCCCGATACAAGCTATGACTCCAAGACCCTCACTCAACGCGTAAG
CAGCTTTCTTCCCAATAAACTCATCCTTTTCTCCGATGACATGCCTCCTTTCGGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DE19TF 595 0 0
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CAATCGCCCATACTGGCTCGTATGCAACCACTACCTTGTCCCAGCTAGGCACCGCATCAG
CAAAGGCCTTTAATTGGTCGAAGCAAACATCAAAAGTCTTGCCAGCTTCCCTCTCTTCAA
GCTTCTCCCCGATACAAGCTATGACTCCAAGACCCTCACTCAACGCGTAAGCAGCTTTCT
TCCCAATAAACTCATCCTTTTCTCCGATGACATGCCTCCTTTCGGAATGGCCAAGAATGA
CCCACTTGCAGCCAATGTCTTTGAGCTGTTCCACGCTGATTTCGCCGGTGAAGGCACCAC
CTTTACCAACCCAAGAGTTCTGACCAGATATCTCAATACGGTCTGTCAAGGATGATTTGA
CTTGGTCGATGTACACAAACGGAGGCGACACAACAACATCAACATCTGGTTCCAAGGTGG
CGGTGTTGAGGTCAGAGACAAGCTTGGTGATGGAGTCCTTAGTCCCGTTACACTTCCAGT
TTCCTCCAACGAAAAACTTTCCGGATCCGGCCATGGCGACAACGCCTCTAGGAGC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 5

CO CL1274Contig1 1113 5 11 U
TACGCCTTGATCTCTCTTCTTTGAAGATGTGATTACATGTACATGATCAAGTTGAACATA
TCATTTAAAATGGAAGAAAGACTATACTACACCAATACTAACTCTCTCGACCAATCAATT
GAAACATACGTTAAATTAAACTCAACAGAATTCGTATTTAGAGGAACTAAGAGAGCAATC
AACAATGAACACTGAAAAGAAGAAAACAAAAAAAAAAAGTAAAACGCAAACACTTTTTTA
AAGACCCTGTCATCGAGCTTCTTACAAAATGGAGCAAGCTTTTTGTGCTTTGTTCTTCTT
TTTCTTCTGCTTTGGAGGTTGAAGGACCACTTTGATAGCTGCATCAAAGACTCCCTTCAC
GTTCTCTTGTGATTTAGAACTGCACTCGATGTAAGCAGGCGCTTCAATTAGCTTCTTGAG
CTCCTCTCCCTGAGCACTGGTAATAGGGACGGCACCAGGATGGTCGATGACAAACTGTTT
GTCATCCCGAAAATCAAGTTTGGTTCCAACAAGGACGATAGGGACACCAGGAGCATAGTG
CTTCAGCTCTGGGGTCCACTTCTTGGAAACATTCTCGTAACTAGCCTTACTAATAAGAGA
GAAGGCAAGAATGAAAACATCAGCACCACGGTAACTCAAAGGTCTTAATCTGTTATAGTC
TTCCTGCCCTGCAGTATCCCACAATCCAAGATTGACCGTTGCTCCGTTAACAACCACATT
GGCGCTAAAGTTATCGAAAACAGTGGGGACATAGTCCGTGGGAAAGGTGTTGCTTGTGTA
AGAAATGAGCAAACATGTTTTACCGACAGCTCCGTCACCAACCGTAACGCACTTAATGAA
CCTTGACGCGCTCATTGCCCAAGCCCAAACTTGATGAAGACACAATACAGAAAACGAAAG
AGAATAATAAAAATGCAACCTCAGATCTATGTCTGAGGAACAACCCCACAATATGAATCT
AATTCCTCCGAGTCCTCTACCATTTACATTCGATTAAACATCTCTCCGTCACAAACAAAA
AACTAAACGATGTAAGTGAATGAGGAAACGCTAGAATGAAAAAAAATGTAAAGAGGAAAA
CACAAAGGACGTGATCAAAGATGGTGGTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV07JQ U 33
AF RR4E293JQ U 1
AF RR4CK41JQ U 117
AF RR4E293TF C 344
AF RR4EV07TF C 570
BS 1 67 RR4E293JQ
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BS 69 77 RR4E293JQ
BS 78 78 RR4EV07JQ
BS 79 217 RR4E293JQ
BS 218 218 RR4EV07JQ
BS 219 611 RR4E293JQ
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BS 613 762 RR4E293JQ
BS 763 815 RR4CK41JQ
BS 816 1113 RR4E293TF

RD RR4EV07JQ 343 0 0
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CAATACTAACTCTCTCGACCAATCAATTGAAACATACGTTAAATTAAACTCAACAGAATT
CGTATTTAAAGGAACTAAAAGAGCAATCAACAATGAACACTGAAAAGAAGAAAACAAAAA
AAAAAAGTAAAACGCAAACCCTTTTTTAAAGACCCTGTCATCGAGCTTCTTACAAAATGG
AGCAAGCTTTTTGTGCTTTGTTCTTCTTTTTCTTCTGCTTTGGAGGTTGAAGGACCACTT
TGATAGCTGCATCAAAGACTCCCTTCACGTTCTCTTGTGATTT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4E293JQ 762 0 0
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TCATTTAGAATGGAAGAGAGACTATACTACACCAATACTAACTCTCTCGACCAATCAATT
GAAACATACGTTAAATTAAACTCAACAGAATTCGTATTTAGAGGAACTAAGAGAGCAATC
AACAATGAACACTGAAAAGAAGAAAACAAAAAAAAAA*GTAAAACGCAAACACTTTTTTA
AAGACCCTGTCATCGAGCTTCTTACAAAATGGAGCAAGCTTTTTGTGCTTTGTTCTTCTT
TTTCTTCTGCTTTGGAGGTTGAAGGACCACTTTGATAGCTGCATCAAAGACTCCCTTCAC
GTTCTCTTGTGATTTAGAACTGCACTCGATGTAAGCAGGCGCTTCAATTAGCTTCTTGAG
CTCCTCTCCCTGAGCACTGGTAATAGGGACGGCACCAGGATGGTCGATGACAAACTGTTT
GTCATCCCGAAAATCAAGTTTGGTTCCAACAAGGACGATAGGGACACCAGGAGCATAGTG
CTTCAGCTCTGGGGTCCACTTCTTGGAAACATTCTCGTAACTAGCCTTACTAATAAGAGA
GAAGGCAAGAA*GAAAACATCAGCACCACGGTAACTCAAAGGTCTTAATCTGTTATAGTC
TTCCTGCCCTGCAGTATCCCACAATCCAAGATTGACCGTTGCTCCGTTAACAACCACATT
GGCGCTAAAGTTATCGAAAACAGTGGGGACATAGTCCGTGGG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4CK41JQ 699 0 0
AATTGAAACATACGTTAAATTAAACTCAACAGAATTCGTATTTAGAGGAACTAAGAGAGC
AATCAACAATGAACACTGAAAAGAAGAAAACAAAAAAAAAAAGTAAAACGCAAACACTTT
TTTAAAGACCCTGTCATCGAGCTTCTTACAAAATGGAGCAAGCTTTTTGTGCTTTGTTCT
TCTTTTTCTTCTGCTTTGGAGGTTGAAGGACCACTTTGATAGCTGCATCAAAGACTCCCT
TCACGTTCTCTTGTGATTTAGAACTGCACTCGATGTAAGCAGGCGCTTCAATTAGCTTCT
TGAGCTCCTCTCCCTGAGCACTGGTAATAGGGACGGCACCAGGATGGTCGATGACAAACT
GTTTGTCATCCCGAAAATCAAGTTTGGTTCCAACAAGGACGATAGGGACACCAGGAGCAT
AGTGCTTCAGCTCTGGGATCCACTTCTTGGAAACATTCTCGTAACTAGCCTTACTAATAA
GAGAGAAGGCAAGAATGAAAACATCAGCACCACGGTAACTCAAAGGTCTTAATCTGTTAT
AGTCTTCCTGCCCTGCAGTATCCCACAATCCAAGATTGACCGTTGCTCCGTTAACAACCA
CATTGGCGCTAAAGTTATCGAAAACAGTGGGGACATAGTCCGTGGGAAAGGTGTTGCTTG
TGTAAGAAATGAGCAAACATGTTTTACCGACAGCTCCGT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4E293TF 770 0 0
TCAAAGACTCC*TTCACGTT*TCTTGTGATTTAGAACTGCACTCGATGTAAGCAGGCGCT
TCAATTAGCTTCTTGAGCTCCTCTCC*TGAGCACTGGTAATAGGGACGGCACCAGGATGG
TCGATGACAAACTGTTTGTCATCCCGAAGATCAAGTTTGGTTCCAACAAGGACGATAGGG
ACACCAGGAGCATAGTGCTTCAGCTCTGGGGTCCACTTCTTGGAAACATTCTCGTAACTA
GCCTTACTAATAAGAGAGAAGGCAAGAA*GAAAACATCAGCACCACGGTAACTCAAAGGT
CTTAATCTGTTATAGTCTTCCTGCCCTGCAGTATCCCACAATCCAAGATTGACCGTTGCT
CCGTTAACAACCACATTGGCGCTAAAGTTATCGAAAACAGTGGGGACATAGTCCGTGGGA
AAGGTGTTGCTTGTGTAAGAAATGAGCAAACATGTTTTACAGACAGCTCCGTCACCAACC
GTAACGCACTTAATGAACCTTGACGCGCTCATTGCCCAAGCCCAAACTTGATGAAGACAC
AATACAGAAAACGAAAGAGAATAATAAAAATGCAACCTCAGATCTATGTCTGAGGAACAA
CCCCACAATATGAATCTAATTCCTCCGAGTCCTCTACCATTTACATTCGATTAAACATCT
CTCCGTCACAAACAAAAAACTAAACGATGTAAGTGAATGAGGAAACGCTAGAATGAAAAA
AAATGTAAAGAGGAAAACACAAAGGACGTGATCAAAGATGGTGGTGAATC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4EV07TF 529 0 0
CATTCTCGTAACTAGCCTTACTAATAAGAGAGAAGGCAAGAATGGAAACATCAGCACCAC
GGTAACTCAAAGGTCTTAATCTGTTATAGTCTTCCTGCCCTGCAGTATCCCACAATCCAA
GATTGACCGTTGCTCCGTTAACAACCACATTGGCGCTAAAGTTATCGAAAACAGTGGGGA
CATAGTCCGTGGGAAAGGTGTTGCTTGTGTAAGAAATGAGCAAACATGTTTTACCGACAG
CTCCGTCACCAACCGTAACGCGCTTAATGAACCTTGACGCGCTCATTGCCCAAGCCCAAA
CTTGATGAAGACACAATACAGAAAACGAAAGAGAATAATAAAAATGCAACCTCAGATCTA
TGTCTGAGGAACAACCCCACAATATGAATCTAATTCCTCCGAGTCCTCTACCATTTACAT
TCGATTAAACATCTCTCCGTCACAAACAAAAAACTAAACGATGTAAGTGAATGAGGAAAC
GCTAGAATGAAAAAAAATGTAAAGAGGAAAACACAAAGGACGTGATC
CC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 5

CO CL1275Contig1 977 5 10 U
GGAAAATACCCCAATCTGTAAACACACACTCGACGACGACCATGGCGGTCTCGTTTAATA
CGACCCTTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGG*TTGA
AGCCTCAATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATG
GCAGGATCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGA
TGATGCCAATAGGCACACCTAGGGTGCCTTACAGAAACCGAGAGGAAGGAACTTGGCAAT
GGGTCGACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATAGGACAAAACATCG
ATGAAGAGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACT
CCAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTA
TCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTT
ATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCAT
TGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCTCGTGGTCAGGCTGATGATATAC
AAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTTCAACGAGCTAGCCAAGA
ATACAGAGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACG
CAGAAGAAGCTATGGAGTATGGGCTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCAAAG
CGGACGCTCCTCGCCAAGACGAAACTGCAGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTCTTTTCTTTT
GTAATGTAATAAGGTCTGAAGTTCATACAATCTTGAAGTCATTGGTTCTTGTTATGAAAT
CTCACAGTTTTCATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GX44TF U 5
AF RR4AK63TF U 1
AF RR4GY74TF U 5
AF RR4GY74JQ C 144
AF RR4GX44JQ C 204
BS 1 115 RR4AK63TF
BS 116 116 RR4GX44TF
BS 117 478 RR4AK63TF
BS 479 479 RR4GX44TF
BS 480 534 RR4AK63TF
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BS 536 726 RR4AK63TF
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BS 728 765 RR4AK63TF
BS 766 977 RR4GY74JQ

RD RR4GX44TF 639 0 0
GGG
ACCCCAATCTGTAAACACACACTCGACGACGACCATGGCGGTCTCGTTTAATACGACCCT
TCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGG*TTGAAGCCTCA
ATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATGGCAGGAT
CCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCC
AATAGGCACACCTAGGGTGCCTTACAGAAACCGAGAGGAAGGAACTTGGCAATGGGTCGA
CATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATAGGACAAAACATCGATGAAGA
GTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCCAGGAG
GATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGA
TACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCT
TGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAG
AATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCTCGTGG

QA 4 639 4 639
DS 

RD RR4AK63TF 765 0 0
GGAAAATACCCCAATCTGTAAACACACACTCGACGACGACCATGGCGGTCTCGTTTAATA
CGACCCTTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGGGTTGA
AGCCTCAATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATG
GCAGGATCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGA
TGATGCCAATAGGCACACCTAGGGTGCCTTACAGAAACCGAGAGGAAGGAACTTGGCAAT
GGGTCGACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATAGGACAAAACATCG
ATGAAGAGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACT
CCAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCCA
TCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCATGCTT
ATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCAT
TGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCTCGTGGTCAGGCTGATGATATAC
AAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTTCAACGAGCTAGCCAAGA
ATACAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAGAG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4GY74TF 734 0 0
GGG
ACCCCAATCTGTAAACACACACTCGACGACGACCATGGCGGTCTCGTTTAATACGACCCT
TCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGG*TTGAAGCCTCA
ATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATGGCAGGAT
CCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCC
AATAGGCACACCTAGGGTGCCTTACAGAAACCGAGAGGAAGGAACTTGGCAATGGGTCGA
CATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATAGGACAAAACATCGATGAAGA
GTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCCAGGAG
GATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGA
TACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCT
TGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAG
AATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCTCGTGGTCAG*CTGATGATATACAAAACGA
AGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTTCAACGAGCTAGCCAAGAATACAGA
GCAGCCTGCGG

QA 4 734 4 734
DS 

RD RR4GY74JQ 834 0 0
ACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATGGCAGGATCCACAAGAGTTTGGA*
TCCGGGACTGG*AAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCCAATAGGCACACCTAGG
GTGCCTTACAGAAACCGAGAGGAAGGAACTTGGCAATGGGTCGACATTTGGAATGCCCTT
TATCGAGAGCGTGTAATCTTCATAGGACAAAACATCGATGAAGAGTTTAGCAACCAGATA
TTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCCAGGAGGATTTATATGTACCTT
AATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTG
AAGAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTT
GCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCA
CCAGCTGGTGCAGCTCGTGGTCAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCA
AGGATAAGAGATTACCTCTTCAACGAGCTAGCCAAGAATACAGAGCAGCCTGCGGAAAGG
ATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATGGAGTATGGG
CTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGCCAAGACGAA
ACTGCAGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTCTTTTCTTTTGTAATGTAATAAGGTCTGAAGTT
CATACAATCTTGAAGTCATTGGTTCTTGTTATGAAATCTCACAGTTTTCATGTT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4GX44JQ 774 0 0
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GTGCCTTACAGAAACCGAGAGGAAGGAACTTGGCAATGGGTCGACATTTGGAATGCCCTT
TATCGAGAGCGTGTAATCTTCATAGGACAAAACATCGATGAAGAGTTTAGCAACCAGATA
TTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCCAGGAGGATTTATATGTACCTT
AATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTG
AAGAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTT
GCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCA
CCAGCTGGTGCAGCTCGTGGTCAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCA
AGGATAAGAGATTACCTCTTCAACGAGCTAGCCAAGAATACAGAGCAGCCTGCGGAAAGG
ATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATGGAGTATGGG
CTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGCCAAGACGAA
ACTGCAGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTCTTTTCTTTTGTAATGTAATAAGGTCTGAAGTT
CATACAATCTTGAAGTCATTGGTTCTTGTTATGAAATCTCACAGTTTTCATGTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 6

CO CL1276Contig1 1099 6 22 U
TCTTGCCTCCTCGTCACTCATATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCC
AAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAG
ACTGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCC
AAGTACCGTTTTGTTGTTCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCCCAAATCGTGTCCGCG
AGCATAGCTGGCGACATTGTCAAGGCTTCTGCCTATGCACATGAGCTGCCTCAATATGGG
CTCACTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGC
CGTGTTTTGAAGATGTTGGAAATGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGA
GAAGACTTTTCCGTGGAACCCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTC
GGTCTTATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGG*A
CGGAGGTCTTGATATTCCTCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAGAACAA
ACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGAACTATAT
GAAGATGTTGAATGAAGATGAGCCGGAAAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAA
GAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCGGCCATTCG
TGCTGACCCTAACCCTAAGAAGACTGAGAAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAA
TTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGAAAGGAAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATT
GAATGGAGCAGCTGGGGGTGATGACGATGATGAGGAGGATGAAGAGTAAATCAGTGCAAC
TCTTGTTGTCTCACGATGTTTCTTGTAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAATGCCTCTTTT
ATTCTATTTTCAAGACTAAAACTACTCAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCT
GAGGATTTACTTCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4G440TF U 1
AF RR4FC93TF U 15
AF RR4DN81TF U 19
AF RR4FJ50TF U 14
AF RR4G440JQ C 335
AF RR4DN81JQ C 505
BS 1 93 RR4G440TF
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BS 95 209 RR4G440TF
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BS 238 500 RR4G440TF
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BS 502 538 RR4G440TF
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BS 655 717 RR4G440TF
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BS 731 761 RR4FJ50TF
BS 762 763 RR4G440JQ
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BS 775 775 RR4G440JQ
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BS 789 1096 RR4G440JQ
BS 1097 1099 RR4DN81JQ

RD RR4G440TF 717 0 0
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AAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCGAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAG
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AAGTACCGTTTTGTTGTTCGTTTCACCAATAAAGACATCGTCGCCCAAATCGTGTCTGCG
AGCATAGCTGGCGACATTGTCAAGGCTTCTGCCTATGCACATGAGCTGCCTCAATATGGG
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GGTCTTATCAGGACCACAACGGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGGA
CGGAGGTCTTGATATTCCTCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAGAACAA
ACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGA*CTATAT
GAAGATGTTGAATGAAGATGAGCCGGAAAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4FC93TF 744 0 0
GACTC
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ACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGGTTTGAAGATGTTGG
AAGTGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAAC
CCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTTATCAGGACCACAA
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AGCATGGAGGAGTTGTACA

QA 6 744 6 744
DS 

RD RR4DN81TF 722 0 0
G
ATATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTACTTCA
AGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTGATTACAGAGCAAGAA
TCCGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAGTACCGTTTTGTTGTTC
GTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCCCAAATCGTGTCCGCGAGCATAGCTGGCGACATTG
TCAAGGCTTCTGCCTATGCACATGAGCTGCCTCAATATGGGCTCACTGTTGGGCTCTCCA
ACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGTTTTGAAGATGTTGG
AAATGGATG*TGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAAC
CCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTTATCAGGACCACAA
CAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGGACGGAGGTCTTGATATTCCT
CACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAGAACAAACAGCTTGATGCTGAGATC
CACGGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAATGAAGAT
GAGCCGGAAAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAG
A

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR4FJ50TF 793 0 0
GGACTC
ATATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTACTTCA
AGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTGATTACATAGCAAGAA
TCCGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAGTACCGTTTTGTTGTCC
GTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCCCAAATCGTGTCCGCGAGCATAGCTGGCGACATTG
TCAAGGCTTCTGCCTATGCACATGAGCTGCCTCAATATGGGCTCACTGTTGGGCTCTCCA
ACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCCTCTCTTGGCTCGCCGTGTTTTGAAGATGTTGG
AAATGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAAC
CCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTTATCAGGACCACAA
CAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGG*ACGGAGGTCTTGATATTCCT
CACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAGAACAAACAGCTTGATGCTGAGATC
CACAGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAATGAAGAT
GAGCCGGAAA*GTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAAGGAGT*GATGCCGAG
AGCATGGAGGAGTTGTACAAGA**GTTCATGCGGC*ATTCGTGCTGACC
TACCCTAGAGACTGAGAA

QA 7 775 7 775
DS 

RD RR4G440JQ 762 0 0
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ATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAACCCACCGAGTCAAGGA
GACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTTATCAGGACCACAACGGGAAACCGTGTTT
TCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGG*ACGGAGGTCTTGATATTCCTCACAGTGACAAGAGA
TTTGCCGGTTTCAACAAAGAGAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATA
TATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAATGAAGATGAGCCGGAAAAGTTT
CAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGAGTTG
TACAAGAAGGTTCATGCGGCCATTCGTGCTGACCCTAACCCTAAGAAGACTGAGAAACCT
GCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGAAAGGAAGAAC
AAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGCTGGGGGTGATGACGATGATGAG
GAGGATGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTGTTGTCTCACGATGTTTCTTGTAGCTTTTT
ACTGTTTTGAGCTTAATGCCTCTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAACTACTCAGTTTTT
GTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTACTTCTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4DN81JQ 595 0 0
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TGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAGAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACGG
GAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAATGAAGATGAGCC
GGAAAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCAT
GGAGGAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCGGCCATTCGTGCTGACCCTAACCCTAAGAAGAC
TGAGAAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGA
AAGGAAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGCTGGGGGTGATGA
CGATGATGAGGAGGATGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTGTTGTCTCATGATGTTTCTT
GTAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAATGCCTCTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAAC*A
CTCAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTACTTCTTTTCT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 6

CO CL1277Contig1 943 6 29 U
GGAACTCATTTGATAACACTTTGGTTAAGCACTATTCAATGTGATTAGAAAAAGAAAAAA
AAACAAATTCAAAGAGATCCGACCTTAAGGATTCAGATGTCGGGCGGAGGAGCACCGTCG
AGGTACGTCAAGTTGACAAAGGAACAAGCTCCGGTCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTC
AATCAACCGATTCAGGTTCCTCAACTAGATGTTTACAAATGCCACGAGTGTGGCCAAACT
CTGCCTGAAAATTTTGAAGCTCCTGCAGATGAGCCATGGATTACCGGAATATTCGGGTGC
ACTGAGGACATGGATAGCTTTTGGCAAGGATTCTTTTGCCCAAGTGTTCTGTTCGGACGT
TTCTACGAAACTCTGAGTGAGGAGGAAACCTCATGGAAGAGAGCATGTGTTTGCCACTCG
ATTGTAGTAGAAGGTGGTCTTACGGCCGCATCCTTGCTTGTTTGTATTCCCGGTATAGAT
CCACATACCACGTTTCTTTTATGGGAAGGCTTGTTCTTTGTTTGGTGGATGTGTGGGATT
TACACTGGAAACGTCAGGCAAACTCTCCAGCGCAAATATCACCTCCAGGACACTCCTTGC
GACCCATGTATGGTGCATTGTTTCCTCCATTTCTGTGCTGTTTGTCAAGCACACCGGGAG
ATGAAGAACCGTCTTTCGGATAACTTTGTGATGCCAATGACTGTGGTTAACCCGCCACCG
GTTCAAGAGATGAGTTCCTCTAACGACGGACACCACCAAGACCCTGTCCCGGTATCACAC
CACAGCTCTGACCTCGTGATGCGGCCTTTGTAGTGCGAAAAGATTCAAGGTCTTGTTTTG
TATGAACCTGAAGATGCATGATTTATTTTAATAAGGATAATATATAGACCCACGTGGTTT
GTTAATTTAAAACTCATCAATAATAGAGAGAGATCCTTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

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GG
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CCTTGCGACCCATGTATGGTGCATTGTTTCCTCCATTTCTGTGCTGTTTGTCAAGCACAC
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GTTTTGTATGAACCTGAAGATGCATGATTTATTTTAATAAGGATAATATATAGACCCACG
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TC

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TGAACCTGAAGATGCATGATTTATTTTAATAAGGATAATATATAGACCCACGTGGTTTGT
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CC

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TTGTTTGTATTCCCGGTATAGATCCACATACCACGTTTCTTTTATGGGAAGGCTTGTTCT
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QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 6

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TCCCTTCCTCTCGCTGAAACGGCCGAGCTTTAACATCATATATAATCCATTCAATTCCAT
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TAAATATCCGTTGCTCCTCCGTCGTCGAGGCAAGACTGCTCCGGTCTCCGGTTCTGGGAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE75TF U 19
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AF RR4F787TF U 1
AF RR4F787JQ C 428
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BS 334 347 RR4F787TF
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BS 800 801 RR4F787JQ
BS 802 815 RR4F787TF
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GGTGATC
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AGCTTTAACATCATATATAATCCATTCAATTCCATCTCCCACTACGTTGTGAATCAATGT
GTCGTTCATGGCTCCTAGGCGGTGTCGCATCTATATAAATATCCGTTGCTCCTCCGTCGT
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GGTTGACATGCTCTTCCTGGACGTCAACGCAATTGAAGAACAAAGATGAGGATAGAGTAG
TTAAGAACAATGAAGGTCTGCCTCAGCCATTTTTGGGAAGCTGCAATGATCGTGCAAGGC
AGCTCCAGGCTTCTTCTTCAGGTCTTTTCCCATGTTTAAAGGTTTTATCTCTCTCACACT
TCACTTTTTATCATTCAGATTATTTATTTTTCACAAACAATTCAGACTGTCGGCTGTGTT
ATGTTGTCTTCGTTTAATATTTCTTTTTCATTGATCTATTTCGTCATCTACGGTTCTTTG
CGAGACGAATCCACCACTTGGAAAAAGTTGAACAAAGCAGCAGAGAAATAATAGCATTAG
CTTATAG*TTGCTAAGTCAGCTACTTTGAGAACTAAATTGCCTCACAGTTTTCTTTGTTG
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TCTGCCGT

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DS 

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TTCTTCTCTGCGGCAGAAGCTCCTGTCCTTTGCGCTCCCTTCCTCTCGCTGAAACGGCCG
AGCTTTAACATCATATATAATCCATTCAATTCCATCTCCCACTACGTTGTGAATCAATGT
GTCGTTCATGGCTCCTAGGCGGTGTCGCATCTATATAAATATCCGTTGCTCCTCCGTCGT
CGAGGCAAGACTGCTCCGGTCTCCGGTTCTGGGAGGCGAGAAATATCGCGAGCTCATGTG
GGTTGACATGCTCTTCCTGGACGTCAACGCAATTGAAGAACAAAGATGAGGATAGAGTAG
TTAAGAACAATGAAGGTCTGCCTCAGCCATTTTTGGGAAGCTGCAATGATCGTGCAAGGC
AGCTCCAGGCTTCTTCTTCAGGTCTTTTCCCATGTTTAAAGGTTTTATCTCTCTCACACT
TCACTTTTTATCATTCAGATTATTTATTTTTCACAAACAATTCAGACTGTCGGCTGTGTT
ATGTTGTCTTCGTTTAATATTTCTTTTTCATTGATCTATTTCGTCATCTACGGTTCTTTG
CGAGACGAATCCACCACTTGGAAAAAGTTGAACAAGGCAGCAGAGAAATAATAGCATTAG
CTTATAGGTTGCTAAGTCAGCTACTTTGAGAACTAAATTGCCTCACAGTTTTCTTTGTTG
ACTCGGTCAAGTTACTTGGTTTGA*GCTACA*TCAGTTCGCAAGTGATTGACATAAATAT
TCT

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DS 

RD RR4F787TF 819 0 0
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TCCCTTCCTCTCGCTGAAACGGCCGAGCTTTAACATCATATATAATCCATTCAATTCCAT
CTCCCACTACGTTGTGAATCAATGTGTCGTTCATGGCTCCTAGGCGGTGTCGCATCTATA
TAAATATCCGTTGCTCCTCCGTCGTCGAGGCAAGACTGCTCCGGTCTCCGGTTCTGGGAG
GCGAGAAATATCGCGAGCTCATGTGGGTTGACATGCTCTTCCTGGACGTCAACGCAATTG
AAGAACAAAGATGAGGATAGAGTAGTTAAGAATAATGAAGGTCTGCCCCAGCCATTTTTG
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TTAAAGGTTTTATCTCTCTCACACTTCACTTTTTATCATTCAGATTATTTATTTTTCACA
AACAATTCAGACTGTCGGCTGTGTTATGTTGTCTTCGTTTAATATTTCTTTTTCATTGAT
CTATTTCGTCATCTACGGTTCTTTGCGAGACGAATCCACCACTTGGAAAAAGTTGAACAA
GGCAGCAGAGAAATAATAGCATTAGCTTATAGGTTGCTAAGTCAGCTACTTTGAGAACTA
AATTGCCTCACAGTTTTCTTT**TGACTCGGTCAAGTTACTTGGTTTGAAGCTACAATCA
GTTCGCAAGTGATTGACATAAATATTCTGCCGTTCAG*CGTTCAT**CCCTGGAG*TAGC
AAAGAGTCAGACTCTGTGA**GTTGCTAGAGGAGT
AAAG

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DS 

RD RR4F787JQ 785 0 0
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CAGACTGTCGGCTGTGTTATGTTGTCTTCGTTTAATATTTCTTTTTCATTGATCTATTTC
GTCATCTACGGTTCTTTGCGAGACGAATCCACCACTTGGAAAAAGTTGAACAAGGCAGCA
GAGAAATAATAGCATTAGCTTATAGGTTGCTAAGTCAGCTACTTTGAGAACTAAATTGCC
TCACAGTTTTCTTT**TGACTCGGTCAAGTTACTTGGTTTGAAGCTACAATCAGTTCGCA
AGTGATTGACATAAATATTCTGCCGTTCAGGCGTTCAATCCCCTGGAGGTAGCAAAGAGT
CAGACTCTGTGAAGGTTGCTAGAGGAGTTAAAGCTGTTTCCAGGAGGACACAGTCACTGG
TTGAGAGGTTTGAGAGAAGAGACACACTTACACTTCCGGAAGAAAGATAAAGCAGCAATA
GTTCAGAGCACTAATGCTGTGGAGAAAGTGGCCAAATCATCATCGATACGAGCAGTTAGC
ATAACGCCTACCCAGGTCATGGAAGTTGAACTTGATGAGGCAACTAACTTGACCACAGTT
GAAACTCCTGTGATATTTATTGCAAGAGCTAATTGTAATATCCAGCTGTTTTTAATCAAC
AATGCAGTTCTCTGCAACTTTCTTACATGTTTGTTTCTTATTTAATTTCTGGTTGGCTAT
TACATATGTTGCCAACACTATACACAATTTTATTGTGGTATCAATGAGGTGACGTCTACA
AGTT
C

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DS 

RD RR4CE75JQ 768 0 0
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TGTCTTCGTTTAATATTTCTTTTTCATTGATCTATTTCGTCATCTACGGTTCTTTGCGAG
ACGAATCCACCACTTGGAAAAAGTTGAACAAGGCAGCAGAGAAATAATAGCATTAGCTTA
TAGGTTGCTAAGTCAGCTACTTTGAGAACTAAATTGCCTCACAGTTTTCTTTGTTGACTC
GGTCAAGTTACTTGGTTTGAGGCTACAATCAGTTCGCAAGTGATTGACATAAATATTCTG
CCGTTCAGGCGTTCAATCCCCTGGAGGTAGCAAAGAGTCAGACTCTGTGAAGGTTGCTAG
AGGAGTTAAGGCTGTTTCCAGGAGGACACAGTCACTGGTTGAGAGGTTTGAGAGAAGAGA
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AGAAAGTGGCCAAATCATCATCGATACGAGCAGTTAGCATAACGCCTACCCAGGTCATGG
AAGTTGAACTTGATGAGGCAACTAACTTGACCACAGTTGAAACTCCTGTGATATTTATTG
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TTACGTGTTTGTTTCTTATTTAATTTCTGGTTGGCTATTACATATGTTGCCAACACTATA
CACAATTTTATTGTGGTATCAATGAGATGACGTCTACAAGTT
TAACTC

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DS 

RD RR4BS27JQ 755 0 0
GATTATTTATTTT*CACAAACAATTCAGACTGTCGGCTGTGTTATGTTGTCTTCGTTTAA
TATTTCTTTTTCATTGATCTATTTCGTCATCTACGGTTCTTTGCGAGACGAATCCACCAC
TTGGAAAAAGTTGAACAAGGCAGCAGAGAAATAATAGCATTAGCTTATAGGTTGCTAAGT
CAGCTACTTTGAGAACTAAATTGCCTCACAGTTTTCTTTGTTGACTCGGTCAAGTTACTT
GGTTTGAGGCTACAATCAGTTCGCAAGTGATTGACATAAATATTCTGCCGTTCAGGCGTT
CAATCCCCTGGAGGTAGCAAAGAGTCAGACTCTGTGAAGGTTGCTAGAGGAGTTAAGGCT
GTTTCCAGGAGGACACAGTCACTGGTTGAGAGGTTTGAGAGAAGAGACACACTTACACTT
CCGGAAGAAAGATAAAGCAGCAATAGTTCAGAGCACCAATGCTGTGGAGAAAGTGGCCAA
ATCATCATCGATACGAGCAGTTAGCATAACGCCTACCCAGGTCATGGAAGTTGAACTTGA
TGAGGCAACTAACTTGACCACAGTTGAAACTCCTGTGATATTTATTGCAAGAGCTAATTG
TAATATCCAGCTGTTTTTAATCAACAATGCAGTTTTCTGCAACTTTCTTACGTGTTTGTT
TCTTATTTAATTTCTGGTTGGCTATTACATATGTTGCCAACACTATACACAATTTTATTG
TGGTATCAATGAGATGACGTCTACAAGTTTAACTC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 5

CO CL1279Contig1 765 5 13 U
GGAAATAAGAATCTAGTACATAAAATTATGCAATTAACGTACATTACATCTAGACCTCTT
CACACGGATTAGATTAGAAAAGGTAAAAGAAACTGTGTTAAACAAGAGCTCTGAAATTTT
T*GGCAGGAGAAAAATAACTCATCAGACCTAAACTCTACTCATTGGTTTCAGGAGATTCA
GCACCAGGGTTCGGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGCTGGATTTGTATGA
TAAGGAGGAGGAGGAGGAAGTCCACTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGT
ATTGGAGCCAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGGTGGTGGTAGAGGA
CCGCCAGGTGGTGCCATCATCTGTGGTACTCCTGGAGGAGGCATGTAACCTTGACCAGGG
ATAATGGGTCTAGGCAAAATAGGAGGCCGCATCCCCATAGGCATAGGCATAGGCATCATA
GGAAGGCGAGGTCTAGCGAGCATATGCTGATTAAACACAGCACCAACCTGATTGTACGCC
GCAGTTTGGCCAAGATGCTCTTTAATTCTCTGATCAATCAGACTTTGGGTTTGCTGTTCC
TCAAATTGCTGATAGTATGTTCTTACATTCGCCTTGTGTTTGTAACCAGAATTGTGCTGC
TTCCTCACGGATGGGGAGTCGTGGGTGAGATAAGTGTCACAATAATCACAGTAATACCTC
GGCATCGTAAGAGACGGTAGCAGCGAGAGGAAGACGACAGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG57JQ U 230
AF RR4F936JQ U 255
AF RR4G863JQ U 1
AF RR4G863TF C 9
AF RR4EG57TF C 80
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BS 122 122 RR4G863TF
BS 123 248 RR4G863JQ
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RD RR4EG57JQ 131 0 0
GATTTGTATGATAAGGAGGAAGAGGAGGAAGTCCACTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCAC
CTTGACCTGGTATTGGAACCAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGGTG
ATGGTA
AAAGA

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR4F936JQ 160 0 0
AGGAAGTCCACTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGTATTGGAGCCAATCC
TGGTGGCCTAAAAATACCATTTTGTGGAAGTGGTGGTGGTAGAGGACCGCCGGGTGGTGC
CATCATCTGTGGTACTCCTGGAGGAAGCATGTAACCTTGA

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR4G863JQ 493 0 0
GGAAATAAGAATCTAGTACATAAAATTATGCAATTAACGTACATTACATCTAGACCTCTT
CACACGGATTAGATTAGAAAAGGTAAAAGAAACTGTGTTAAACAAGAGCTCTGAAATTTT
TTGGCAGGAGAAAAATAACTCATCAGACCTAAACTCTACTCATTGGTTTCAGGAGATTCA
GCACCAGGGTTCGGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGCTGGATTTGTATGA
TAAGGAGGTGGAGGAGGAAGTCCAGTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGT
ATTGGAGCCAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGGTGGTGGTAGAGGA
CCGCCAGGTGGTGCCATCATCTGTGGTACTCCTGGAGGAGGCATGTAACCTTGACCAGGG
ATAATGGGTCTAGGCAAAATAGGAGGCCGCATCCCCATAGGCATAGGCATAGGCATCATA
AGAAGGCGAGGTC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4G863TF 755 0 0
GAATCTAGTACATAAA*TTATGCAATTAACGTACATTACATCTAGAC*TCTTCACACGGA
TTAGATTAGAAAAGGTAAAAGAAACTGTGTTAAACAAGAGCTCTGAAATTTTT*GGCAGG
AGAAAAATAACTCATCAGACCTAAACTCTACTCATTGGTTTCAGGAGATTCAGCACCAGG
GTTCGGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGCTGGATTTGTATGATAAGGAGG
TGGAGGAGGAAGTCCAGTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGTATTGGAGC
CAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGGTGGTGGTAGAGGACCGCCAGG
TGGTGCCATCATCTGTGGTACTCCTGGAGGAGGCATGTAACCTTGACCAGGGATAATGGG
TCTAGGCAAAATAGGAGGCCGCATCCCCATAGGCATAGGCATAGGCATCATAGGAAGGCG
AGGTCTAGCGAGCATATGCTGATTAAACACCGCACCAACCTGATTGTACGCCGCAGTTTG
GCCAAGATGCTCTTTAATTCTCTGATCAATCAGACTTTGGGTTTGCTGTTCCTCAAATTG
CTGATAGTATGTTCTTACATTCGCCTTGTGTTTGTAACCAGAATTGTGCTGCTTCCTCAC
GGATGGGGAGTCGTGGGTGAGATAAGTGTCACAATAATCACAGTAATACCTCGGCATCGT
AAGAGACGGTAGCAGCGAGAGGAAGACGACA
ATCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4EG57TF 686 0 0
AAGGTAAAAGAAACTGTGTTAAACAAGAGCTCTGAAATTTTT*GGCAGGAGAAAAATAAC
TCATCAGACCTAAACTCTACTCGTTGGTTTCAGGAGATTCAGCACCAGGGTTCTGATTGT
TGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGCTTGATTTGTATGATAAGGAGGAGGAGGAGGAA
GTCCACTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGTATTGGAGCCAATCCTGGTG
GCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGGTGATGGTAGAGGACCGCCGGGTGGTGCCATCA
TCTGTGGTACTCCTGGAGGAGGCATGTAACCTTGACCAGGGATCATGGGTCTAGGCAGAA
TAGGAGGTCGCATCCCCATAGGCATAGGCATGGGCATCATAGGAAGGCGAGGTCTAGCGA
GCATATGCTGATTAAACACAGCACCAACCTGATTGTACGCTGCAGTTTGGCCAAGATGCT
CTTTAATTCTCTGATCAATCAGACTTTGGGTTTGCTGTTCCTCAAATTGCTGATAGTATG
TTCTTACATTCGC*TTGTGTTTGTAACCAGAATTGTGCTGCTTCCTCACGGATGGGGAGT
CGTGGGTGAGATAAGTGTCACAATAATCACAGTAATACCTCGGCATCGTGGGAGACGGTT
GCAGCGAGAGGAAGACGACAGTCCCT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

CO CL1280Contig1 851 6 3 U
CATCAAACGGCTAACTCATATATTGAACGCGTAAACATAAAAGTTTTTAGAAGATCTTTT
ATTTATCATTCCACTTATAACATAAGCTTAAATCCATCTTAGTTTAAGTCTTCTGCTTGG
TAATTGAAATCTTCATCGGCATAGGAGACTTGAAGCTTCATCACTTTGCTCTCAGGTGAC
TTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAGATTTTTGGGAGAGAAGCCTTTCCTTTGTACGCTTTG
CACACCCGGGCTACTAAATCATTAAGCTTGTATAGTGGTTTGCTGTTTACTGTGACCCAT
GGTACGTACTTATGTTTCGGCTTCAAACTTAAAGTCTGGTTTGCATAACCAAATATGAGA
ATTTTAGAGAGATCACTGGAATAACAATCTTTGATGGCCTTCTCACCTCCATATTGCGCG
AAACATGATGATTCCCAGTTTTTTGTGTCGTTTTCGATGCACCTTATGAACCAGTAATGT
GCATTCGGATCGGGCCAAGTTCTTATGGCGCAAGCTTCAATGGCGTTTAGTTTGCATTCC
TCTTCACCATGCTGGCAAGTGACAGTCAGATTATCGGAGACATGAGCGTTACCGAATGGA
ACGAGCTTTAGATCAGTGATTGTGTGGAGATCGGAGTCAAATATCTTGACTAGACCATCG
GCTATGAAACTCTGACAATAGGGACAAAGTGATTCGTAGTAAAGATTGAGCTTCACTTTG
TCGGATTCACCAGCCACAGAGTTGTAAGAAAAGGTGAACAGAAGGCAAGCTAAGCAGAAG
AACACAAGCCTGTATGACGAAGAAGAATCCATTGTAAAAATCATTCTTAGTATAATGTTT
ATACTAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GI63JQ U 1
AF RR4G284JQ U 1
AF RR4FR55JQ U 49
AF RR4FR55TF C 86
AF RR4G284TF C 118
AF RR4GI63TF C 138
BS 1 550 RR4G284JQ
BS 551 677 RR4FR55JQ
BS 678 851 RR4FR55TF

RD RR4GI63JQ 509 0 0
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TAATTGAAATCTTCATCGGCATAGGAGACTTGAAGCTTCATCACTTTGCTCTCAGGTGAC
TTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAGATTTTTGGGAGAGAAGCCTTTCCTTTGTACGCTTTG
CACACCCGGGCTACTAAATCATTAAGCTTGTATAGTGGTTTGCTGTTTACTGTGACCCAT
GGTACGTACTTATGTTTCGGCTTCAAACTTAAAGTCTGGTTTGCATAACCAAATATGAGA
ATTTTAGAGAGATCACTGGAATAACAATCTTTGATGGCCTTCTCACCTCCATATTGCGCG
AAACATGATGATTCCCAGTTTTTTGTGTCGTTTTCGATGCACCTTATGAACCAGTAATGT
GCATTCGGATCGGGCCAAGTTCTTATGGC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4G284JQ 550 0 0
CATCAAACGGCTAACTCATATATTGAACGCGTAAACATAAAAGTTTTTAGAAGATCTTTT
ATTTATCATTCCACTTATAACATAAGCTTAAATCCATCTTAGTTTAAGTCTTCTGCTTGG
TAATTGAAATCTTCATCGGCATAGGAGACTTGAAGCTTCATCACTTTGCTCTCAGGTGAC
TTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAGATTTTTGGGAGAGAAGCCTTTCCTTTGTACGCTTTG
CACACCCGGGCTACTAAATCATTAAGCTTGTATAGTGGTTTGCTGTTTACTGTGACCCAT
GGTACGTACTTATGTTTCGGCTTCAAACTTAAAGTCTGGTTTGCATAACCAAATATGAGA
ATTTTAGAGAGATCACTGGAATAACAATCTTTGATGGCCTTCTCACCTCCATATTGCGCG
AAACATGATGATTCCCAGTTTTTTGTGTCGTTTTCGATGCACCTTATGAACCAGTAATGT
GCATTCGGATCGGGCCAAGTTCTTATGGCGCAAGCTTCAATGGCGTTTAGTTTGCATTCC
TCTTCACCAT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4FR55JQ 629 0 0
G
GAAGATCTTTTATTTATCATTCCACTTATAACATAAGCTTAAATCCATCTTAGTTTAAGT
CTTCTGCTTGGTAATTGAAATCTTCATCGGCATAGGAGACTTGAAGCTTCATCACTTTGC
TCTCAGGTGACTTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAGATTTTTGGGAGAGAAGCCTTTCCTT
TGTACGCTTTGCACACCCGGGCTACTAAATCATTAAGCTTGTATAGTGGTTTGCTGTTTA
CTGTGACCCATGGTACGTACTTATGTTTCGGCTTCAAACTTAAAGTCTGGTTTGCATAAC
CAAATATGAGAATTTTAGAGAGATCACTGGAATAACAATCTTTGATGGCCTTCTCACCTC
CATATTGCGCGAAACATGATGATTCCCAGTTTTTTGTGTCGTTTTCGATGCACCTTATGA
ACCAGTAATGTACATTCGGATCGGGCCAAGTTCTTATGGCGCAAGCTTCAATGGCGTTTA
GTTTGCATTCCTCTTCACCATGCTGGCAAGTGACAGTCAGATTATCGGAGACATGAGCGT
TACCGAATGGAACGAGCTTTAGATCAGTGATTGTGTGGAGATCGGAGTCAAATATCTTGA
CTAGACCATCGGCTATGAAACTCTGACA

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR4FR55TF 766 0 0
TAAGCTAAATCCATCTAG
TTAAGTCTTCTGCTTGGTAATG**AATCT*CATCGGCATAGGAGACTTGAAGCTTCATCA
CTTTGCTCTCAGGTGACTTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAGATTTT*GGGAGAGAAGCCT
TTCCTTTGTACGCTTTGCACACCCGGGCTACTAAATCATTAAGCTTGTATAGTGGTTTGC
TGTTTACTGTGACCCATGGTACGTACTTATGTTTCGGCTTCAAACTTAAAGTCTGGTTTG
CATAACCAAATATGAGAATTTTAGAGAGATCACTGGAATAACAATCTTTGATGGCCTTCT
CACCTCCATATTGCGCGAAACATGATGATTCCCAGTTTTTTGTGTCGTTTTCGATGCACC
TTATGAACCAGTAATGTACATTCGGATCGGGCCAAGTTCTTATGGCGCAAGCTTCAATGG
CGTTTAGTTTGCATTCCTCTTCACCATGCTGGCAAGTGACAGTCAGATTATCGGAGACAT
GAGCGTTACCGAATGGAACGAGCTTTAGATCAGTGATTGTGTGGAGATCGGAGTCAAATA
TCTTGACTAGACCATCGGCTATGAAACTCTGACAATAGGGACAAAGTGATTCGTAGTAAA
GATTGAGCTTCACTTTGTCGGATTCACCAGCCACAGAGTTGTAAGAAAAGGTGAACAGAA
GGCAAGCTAAGCAGAAGAACACAAGCCTGTATGACGAAGAAGAATCCATTGTAAAAATCA
TTCTTAGTATAATGTTTATACTAAAAAA

QA 19 766 19 766
DS 

RD RR4G284TF 734 0 0
TGGTAATTGAAATCTTCATCGGCATAGGAGACTTGAAGCTTCATCACTTTGCTCTCAGGT
GACTTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAGATTTTTGGGAGAGAAGCCTTTCCTTTGTACGCT
TTGCACACCCGGGCTACTAAATCATTAAGCTTGTATAGTGGTTTGCTGTTTACTGTGACC
CATGGTACGTACTTATGTTTCGGCTTCAAACTTAAAGTCTGGTTTGCATAACCAAATATG
AGAATTTTAGAGAGATCACTGGAATAACAATCTTTGATGGCCTTCTCACCTCCATATTGC
GCGAAACATGATGATTCCCAGTTTTTTGTGTCGTTTTCGATGCACCTTATGAACCAGTAA
TGTGCATTCGGATCGGGCCAAGTTCTTATGGCGCAAGCTTCAATGGCGTTTAGTTTGCAT
TCCTCTTCACCATGCTGGCAAGTGACAGTCAGATTATCGGAGACATGAGCGTTACCGAAT
GGAACGAGCTTTAGATCAGTGATTGTGTGGAGATCGGAGTCAAATATCTTGACTAGACCA
TCGGCTATGAAACTCTGACAATAGGGACAAAGTGATTCGTAGTAAAGATTGAGCTTCACT
TTGTCGGATTCACCAGCCACAGAGTTGTAAGAAAAGGTGAACAGAAGGCAAGCTAAGCAG
AAGAACACAAGCCTGTATGACGAAGAAGAATCCATTGTAAAAATCATTCTTAGTATAATG
TTTATACTAAAAAA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GI63TF 714 0 0
CGGCATA
GAGACTTGAAGCTTCATCACTT*GCTCTCAGGTGACTTAGACAGAGCAGAGGAATGGCAG
ATTTT*GGGAGAGAAGCCTCTCCTTTGTACGCTTTGCACACCCGGGCTACTAAATCATTA
AGCTTGTATAGTGGTTTGCTGTTTACTGTGACCCATGGTACGTACTTATGTTTCGGCTTC
AAACTTAAAGTCTGGTTTGCATAACCAAATATGAGAATTTTAGAGAGATCACTGGAATAA
CAATCTTTGATGGCCTTCTCACCTCCATATTGCGCGAAACATGATGATTCCCAGTTTTTT
GTGTCGTTTTCGATGCACCTTATGAACCAGTAATGTGCATTCGGATCGGGCCAAGTTCTT
ATGGCGCAAGCTTCAATGGCGTTTAGTTTGCATTCCTCTTCACCATGCTGGCAAGTGACA
GTCAGATTATCGGAGACATGAGCGTTACCGAATGGAACGAGCTTTAGATCAGTGATTGTG
TGGAGATCGGAGTCAAATATCTTGACTAGACCATCGGCTATGAAACTCTGACAATAGGGA
CAAAGTGATTCGTAGTAAAGATTGAGCTTCACTTTGTCGGATTCACCAGCCACAGAGTTG
TAAGAAAAGGTGAACAGAAGGCAAGCTAAGCAGAAGAACACAAGCCTGTATGACGAAGAA
GAATCCATTGTAAAAATCATTCTTAGTATAATGTTTATACTAAAAAA

QA 8 714 8 714
DS 



AS 1 6

CO CL1281Contig1 1074 6 2 U
GGATTCTCCTCAATTCCCAATCCCTGCGTCGTCTCGCAGATTCTTCGTTACTCGGAGGAG
GATCTCGATGATGATGATCCCTCTCGCTCTCTTCTCCGCCGCCCTTTTCCTCTTCTTTAT
GCCCTTCAACGGCTCGGGGAGATCGTCCGATTCGTTTGATCTTTCGCATACGATCCATGA
AATCGAAGTGGTCGCTGAGTTTCCTCACGATCCAAAGGCGTTTACTCAGGGACTTCTTTA
TGCGGGAGACGATACACTCTTCGAGTCTACTGGTCTATACGGAGAGTCCTCAGTCAGGAA
AGTGTCTCTTCGGACAGGAAAGGTTGAAGTTATCGAAAAAATGGGCGATAAGTTCTTTGG
AGAGGGTTTGACACTCCTTGGAGATAGCCTCTTTCAAGTTGCTTGGCTGACGACCACGGG
TTTCACATATGATCTTCGCAACTTAACCAAAGTAAAGCCATTTAAACATCATATGAAAGA
TGGATGGGGATTGGCTACCGATGGACAAGTATTGTTTGGAAGTGATGGCACTTCTACACT
ATACCAGATGGACCCTCTAACAATGAAAGTTACTGATAAGCATGTAATCAAATATAATGG
CCGTGAGGTACGATACCTTAATGAACTCGAGTACATAAACAATGAAGTTTGGGCAAACGT
GTGGCAGTCTGATTGCATTGCTAGAATTTCTCCCAAGGACGGCTCGCTACTTGGATGGAT
ACTTCTTCCTGAATTAAGAGAAGGATTGCTGCGATCTGGACACGGGGGTATTGATGTCTT
GAATGGTATAGCATGGGACAGCGACAAGAAGCGCCTCTTTGTAACGGGAAAACTGTGGCC
GAAGCTGTACCAAATCAATCTAAAACCAGTAGCAGCAAAGAGCGAGAGACAAATCGCGCG
ACAATGCTTGATATGAAAAAAGGAAAAAAGATGTGGGTAATTGTTAGAATGTACACTGTT
GTAGCTTAAACTTTAAAAGAGGCAAATGTGCACCAGACATTCTTAACATTAGCAAAAAAG
TGTATCCGGAAGGGGTCCATGACCCAAGTTGCATTTTACTAGTTTTGTATCCTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F876TF U 1
AF RR4F874TF U 1
AF RR4AO89TF U 1
AF RR4AQ69TF U 1
AF RR4F876JQ C 283
AF RR4F874JQ C 338
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TTTCACATATGATCTTCGCAACTTAACCAAAGTAAAGCCATTTAAACATCATATGAAAGA
TGGATGGGGATTGGCTACCGATGGACAAGTATTGTTTGGAAGTGATGGCACTTCTACACT
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A

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TGGATGGGGATTGGCTACCGATGGACAAGTATTGTTTGGAAGTGATGGCACTTCTACACT
ATACCAGATGGACCCTCTAACAATGAAAGTTACTGATAAGCATGTAATCAAATATAATGG
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ACTTCTTCCTGAATTA

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ATCCTT

QA 7 792 7 792
DS 

RD RR4F874JQ 737 0 0
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AACAATGAAGTTTGGGCAAACGTGTGGCAGTCTGATTGCATTGCTAGAATTTCTCCCAAG
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CATTCTTAACATTAGCAAAAAAGTGTATCCGGAAGGGGTCCATGACCCAAGTTGCATTTT
ACTAGTTTTGTATCCTT

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DS 



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TAG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU25TF U 1
AF RR4H962TF U 335
AF RR4H509TF U 396
AF RR4H267TF U 396
AF RR4FU25JQ C 466
BS 1 597 RR4FU25TF
BS 598 631 RR4H962TF
BS 632 632 RR4H267TF
BS 633 657 RR4H962TF
BS 658 940 RR4H267TF
BS 941 941 RR4H509TF
BS 942 953 RR4H267TF
BS 954 956 RR4H509TF
BS 957 1076 RR4H267TF
BS 1077 1077 RR4FU25JQ
BS 1078 1111 RR4H267TF
BS 1112 1112 RR4FU25JQ
BS 1113 1149 RR4H267TF
BS 1150 1263 RR4FU25JQ

RD RR4FU25TF 597 0 0
GGAGTATCATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATTCTCTTATTATTTATCCATAATG
GGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGTAAAAGACGAATCTGGAGTTCTC
TCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGATGGGAGAGAAGGATGTGAGGTTCAAAGTGTTG
TTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTGAGCATGGCAAAAAACGAGTGGGGGTTTACTACT
TATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGTGACTGAATTCGGAGCCAAAGTG
ACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTATATGGTCAGCTCGTGCCGGTCA
TGTGAAACCTGCTCCAATGACCAAGAGAACTACTGTCCAAAAATGATCCTAACATCCGGA
GGCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTACTCCGACCACATGGTTTGTGAA
GAGGACTACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTCCGTTAGACGCTACCGCGCCGCTACTC
TGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTATCACGGGCTCCTCGGGCCGGGT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4H962TF 331 0 0
GTTATATGGTCAGCTCGTGCCGGTCATGTGAAACCTGCTCCAATGACCAAGAGAACTACT
GTCCAAAAATGATCCTAACATCCGGAGGCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTG
GTTACTCCGACCACATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTC
CGTTAGACGCTACCGCGCCGCTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGT
ATCACGGGCTCCTCGGGCCGGGTATGCACATCGGTGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAG*TC
ATGTAGCTGTGAAATTTGCTAAG
CTATGGGT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4H509TF 598 0 0
G
CCAAAAATGATCCTAACATCCGGAGGCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGT
TACTCCGACCACATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTCCG
TTAGACGCTACCGCGCCGCTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTAT
CACGGGCTCCTCGGGCCGGGTATGCACATCGGTGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAGGTCAT
GTAGCTGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTACTAAGGTTACGGTTATTAGTACTTCGGAT
AAGAAGAGAGACGAGGCCATTAGTCGGCTTGGTGCGGATCTGTTCTTGGTGAGCCGTGAC
CCGGAGCAGATGAAGGATGTAATGGGGACTATGGATGGTATTATTGATACCGTATCTGCG
ACTCATTCACTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTTAAATATAACGGTAAACTAATTATGGTC
GGTGCACCTGAGAAACCACTTGAGCTTCCGGTTCTGCCTCTCATCGTGGGGAAGAGGATG
GTGG*TGGGAAGTATGGT**AGGAGGGATAAAAGAGACTCAAGAGATGATGGATCTG

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR4H267TF 754 0 0
G
CCAAAAATGATCCTAACATCCGGAGGCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGT
TACTCCGACCACATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTCCG
TTAGACGCTACCGCGCCGCTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTAT
CACGGGCTCCTCGGGCCGGGTATGCACATCGGTGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAGGTCAT
GTAGCTGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTACTAAGGTTACGGTTATTAGTACTTCGGAT
AAGAAGAGAGACGAGGCCATTAGTCGGCTTGGTGCGGATCTGTTCTTGGTGAGCCGTGAC
CCGGAGCAGATGAAGGATGTAATGGGGACTATGGATGGTATTATTGATACCGTATCTGCG
ACTCATTCACTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTTAAATATAACGGTAAACTAATTATGGTC
GGTGCACCTGAGAAACCACTTGAGCTTCCGGTTCTGCCTCTCATCGTGGGGAAGAGGATG
GTGGGTGGGAAGTATGGGTAAGGAGGGATAAAAGAGACTCAAGAGATGATGGATCTGGCC
GGAAAACACAACATCACGGCAGACATTGAGCTTATCTCTGCAGATTATGTCAACACTGCC
ATGGAACGGCTCGAGAAAGCTGACGTTAGATACCGTTTTGTGATTGATGTTGCCA*CACG
TTGAAGCCTACTCCTTAATTATAAAGCTTAAGA

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR4FU25JQ 798 0 0
CACATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTCCGTTAGACGCT
ACCGCGCCGCTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTATCACGGGCTC
CTCGGGCCGGGTATGCACATCGGTGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAGGTCATGTAGCTGTG
AAATTTGCTAAGGCTATGGGTACTAAGGTTACGGTTATTAGTACTTCGGATAAGAAGAGA
GACGAGGCCATTAGTCGGCTTGGTGCGGATCTGTTCTTGGTGAGCCGTGACCCGGAGCAG
ATGAAGGATGTAATGGGGACTATGGATGGTATTATTGATACCGTATCTGCGACTCATTCA
CTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTTAAATATAACGGTAAACTAATTATGGTCGGTGCACCT
GAGAAACCACTTGAGCTTCCGGTTCTGCCTCTCATCGTGGGGAAGAAGATGGTGG*TGGG
AAGTATGGT**AGGAGGGATAAAAGAGACTCAAGAGATGATGGATCTGGCCGGAAAACAC
AACATCACGGCAGACATTGAGCTTATCTCTGCAGATTATGTCAACACTGCCATGGAACGG
CTCGAGAAGGCCGACGTTAGATACCGTTTTGTGATTGATGTTGCCAACACGTTGAAGCCT
ACTCCTTAATTATAAAGCTTAAGAATTAAATTTCCCCAGAAGCCTTTCTTTTCTTGTTTG
GTTTGTTGTAATATGTTACGTGTTGTTTGTCTGTAGCACTAATATTGTGCCCTATAAATT
GAATCAACTTGAGTGTAG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 2 4

CO CL1283Contig1 851 2 1 U
GTATCCAATATCCATATATGATAATGGACTTAAGTTGATAAAAAGTTTAACATGCTTTCT
TATTTATATATCAACCGACGAGTACGACCTATTTACAACGTCTTAGTTTATTATCTGTAC
ACTATCTTACACGACCACAAATAATCAAAGAACCCTTCTTCGTCCTCCACCTCTGAGTCT
CCCAAACTCTCCCTTCCAAGCAAGCATTCTTGCTCAACACTCTCATCAACCAGCTCCTAA
ATACTGGAGACTCCGGTTGTGGTTGTGGATATAGTTTTCGTTTTAGTTACCTCCGGGGAA
GGATCTATCCGGGACAGGAATATGTTACCCTTGGAATCTCTTCTGCTGTAACTCTCCAAC
TCGTGGCCCATCACTATGCTGCATTGTCTCCAAGTTTCGCACATCAACTCCACCCCAAAG
TACGTTAAGTGGTCGGATATGCTACCTCCCATCACCGATCTGCAGCAAGTAGGATCTTCA
CCGGTGTTGTCACAAACTTTCTCAATACCAAAACGAACAATTTTCAAAACACTGAGATCT
CTCACCCACACCTCTGTAGGGAAGTGGTGGTATGTTTTCTGAGGGAAAAGATAAAAGAAA
GGAGGCAGATGAGGAACAATATCTCGGTCATGCGTGATTCTGAAGGTATTAGGTACAAGC
AAACTGTAATAAGATGCAAACGCCGCATTCCCAATACGAGGTTGCCCAAATGTCATGACC
TGTACGTTTTCGTATACTTCATTTACAACTAGGTCTAGTCCACAAAAGCAGCCATGGCTC
CTCCCATTGAATGACCAGTCACCATGATCTTGATGTCCTCCCATAGAACTTCTTCGCTCG
TTTACTGCATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ65JQ U 1
AF RR4EG02JQ U 1
BS 1 851 RR4EG02JQ

RD RR4EJ65JQ 746 0 0
GTATCCAATATCCATATATGATAATGGACTTAAGTTGATAAAAAGTTTAACATGCTTTCT
TATTTATATATCAACCGACGAGTACGACCTATTTACAACGTCTTAGTTTATTATCTGTAC
ACTATCTTACACGACCACAAATAATCAAAGAACCCTTCTTCGTCCTCCACCTCTGAGTCT
CCCAAACTCTCCCTTCCAAGCAAGCATTCTTGCTCAACACTCTCATCAACCAGCTCCTAA
ATACTGGAGACTCCGGTTGTGGTTGTGGATATAGTTTTCGTTTTAGTTACCTCCGGGGAA
GGATCTATCCGGGACAGGAATATGTTACCCTTGGAATCTCTTCTGCTGTAACTCTCCAAC
TCGTGGCCCATCACTATGCTGCATTGTCTCCAAGTTTCGCACATCAACTCCACCCCAAAG
TACGTTAAGTGGTCGGATATGCTACCTCCCATCACCGATCTGCAGCAAGTAGGATCTTCA
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CTCACCCACACCTCTGTAGGGAAGTGGTGGTATGTTTTCTGAGGGAAAAGATAAAAGAAA
GGAGGCAGATGAGGAACAATATCTCGGTCATGCGTGATTCTGAAGGTATTAGGTACAAGC
AAACTGTAATAAGATGCAAACGCCGCATTCCCAATACGAGGTTGCCCAAATGTCATGACC
TGTACGTTTTCGTATACTTCATT
TAC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4EG02JQ 851 0 0
GTATCCAATATCCATATATGATAATGGACTTAAGTTGATAAAAAGTTTAACATGCTTTCT
TATTTATATATCAACCGACGAGTACGACCTATTTACAACGTCTTAGTTTATTATCTGTAC
ACTATCTTACACGACCACAAATAATCAAAGAACCCTTCTTCGTCCTCCACCTCTGAGTCT
CCCAAACTCTCCCTTCCAAGCAAGCATTCTTGCTCAACACTCTCATCAACCAGCTCCTAA
ATACTGGAGACTCCGGTTGTGGTTGTGGATATAGTTTTCGTTTTAGTTACCTCCGGGGAA
GGATCTATCCGGGACAGGAATATGTTACCCTTGGAATCTCTTCTGCTGTAACTCTCCAAC
TCGTGGCCCATCACTATGCTGCATTGTCTCCAAGTTTCGCACATCAACTCCACCCCAAAG
TACGTTAAGTGGTCGGATATGCTACCTCCCATCACCGATCTGCAGCAAGTAGGATCTTCA
CCGGTGTTGTCACAAACTTTCTCAATACCAAAACGAACAATTTTCAAAACACTGAGATCT
CTCACCCACACCTCTGTAGGGAAGTGGTGGTATGTTTTCTGAGGGAAAAGATAAAAGAAA
GGAGGCAGATGAGGAACAATATCTCGGTCATGCGTGATTCTGAAGGTATTAGGTACAAGC
AAACTGTAATAAGATGCAAACGCCGCATTCCCAATACGAGGTTGCCCAAATGTCATGACC
TGTACGTTTTCGTATACTTCATTTACAACTAGGTCTAGTCCACAAAAGCAGCCATGGCTC
CTCCCATTGAATGACCAGTCACCATGATCTTGATGTCCTCCCATAGAACTTCTTCGCTCG
TTTACTGCATC

QA 1 851 1 851
DS 



CO CL1283Contig2 816 2 2 U
GGAGCCGAGGAGGATTTTAATCTCCGATCACTACTGTCCGTATTTATATCCCCCCATTCG
TGCTTCTTCTGCTTCAAACCTCAGTTTCTCTCTGGTCGAAGATGGAACAGAAGAGATGGG
TGTTCTTGCTGGCAATATTTGCTTGTCTTCTTTTCTTTTCTCGTGGAAGAGTGGCAGTTC
TCAAGTGGGAGACTGATGATGATTCACCTGTTTACAACCATACACTTGCCTTAACACTTG
TCGAGTATACTTCTGCGGTCTATATGTCTGATTTGACCGAACTCTTCACTTGGACATGTG
AAAGATGCAATGGTTTGACTAAGGGTTTCCAAGTGATAGAGATAATAGTTGACATTGAGC
ACTGCTTACAGGGATATGTTGGGGTAGCAAAGGATTTGAATGCGATTGTCATTGCATTCC
GGGGAACTCAAGAACACAGCATACAAAACTGGGTCTCAGATTTGTTCTGGAAACAGCTCG
ATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATGGTTCACCATGGCTTCTACAGTGCTTATC
ACAATACAACGGTACGTCCTGCAGTTTTGGATGCAGTAAAACGAGCGAAGAAGTTCTATG
GGGAGGACATCAAGATCATGGTGACTGGTCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTGCCTTTT
GTGGACTAGACCTAGTTGTAAATGAAGTATACGAAAACGTACAGGTCATGACATTTGGGC
AACCTCGTATTGGGAATGCGGCGTTTGCATCTTATACAGTTTGCTTGTACTAATACCTTC
AGATCACGCATGACCGAGATATGTTCCTCATCTGCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EG02TF U 1
AF RR4EJ65TF U 1
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BS 716 816 RR4EJ65TF

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TGTTCTTGCTGGCAATATTTGCTTGTCTTCTTTTCTTTTCTCGTGGAAGAGTGGCAGTTC
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GGGAGGACATCAAGATCATGGTGACTGGTCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTGCCTTTT
GTGGACTAGACCTAGTTGTAAATGAAGTATACGAAAACGTACAGGTCATGACATT
GGGC

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DS 

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GG
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CTTCTTCTGCTTCAAACCTCAGTTTCTCTCTGGTCGAAGATGGAACAGAAGAGATGGGTG
TTCTTGCTGGCAATATTTGCTTGTCTTCTTTTCTTTTCTCGTGGAAGAGTGGCAGTTCTC
AAGTGGGAGACTGATGATGATTCACCTGTTTACAACCATACACTTGCCTTAACACTTGTC
GAGTATACTTCTGCGGTCTATATGTCTGATTTGACCGAACTCTTCACTTGGACATGTGAA
AGATGCAATGGTTTGACTAAGGGTTTCCAAGTGATAGAGATAATAGTTGACATTGAGCAC
TGCTTACAGGGATATGTTGGGGTAGCAAAGGATTTGAATGCGATTGTCATTGCATTCCGG
GGAACTCAAGAACACAGCATACAAAACTGGGTCTCAGATTTGTTCTGGAAACAGCTCGAT
CTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATGGTTCACCATGGCTTCTACAGTGCTTATCAC
AATACAACGGTACGTCCTGCAGTTTTGGATGCAGTAAAACGAGCGAAGAAGTTCTATGGG
GAGGACATCAAGATCATGGTGACTGGTCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTGCCTTTTGT
GGACTAGACCTAGTTGTAA*TGAAGTATACGAAAACGTACAGGTCATGACATTTGGGCAA
CCTCGTATTGGGAATGCGGCGTTTGCATCTTATACAGTTTGCTTGTACTAATACCTTCAG
ATCACGCATGACCGAGATATGTTCCTCATCTGCC

QA 3 816 3 816
DS 



AS 1 5

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GGACTCACATTCACTGTGGACCTGTGCATTGAAACAATACTAACTTACCTACAGATCTTT
TTATCGACGGACCTGGGACTGAGTGAGTGAGCAATTCTTCCTCTCTCTGATACATTCTCT
AAGAGATGAATTGCCTTCAGAATCTTACTAGATCTTCAGTCTCACCTTTGTTGGGGAGCT
TTGGAGGCAATCACAGAGATCCTTCTTGGTCTTCCCTGAAGATGATGCTACCAATCAAAG
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GTGTTTCAAAAAAGGAGGAAGAGAAATCTGATGAATATAGCCAAGACATGACTCAAGCTA
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GTATGGGAAAGGGCTCC*TGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAAGCTATAA
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TATCAGAAATGCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAA*GAAGTATGTTACTCTGA
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AGAGGATACCTCTGACACTGGACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAGAGAATTGC
CTGAGGGACAGTTTGAATATAAATATATCATAGATGGGGAATGGAGACACAATGAGCTCG
AGCCGTTTACAGGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAATTACGCAAAAGTGGTGTATG
ATCCAACGAGCGTTGATGGTGCAACTCGGGAGAGATTAACAAAGGAGGACCCTGAGCTTT
TGGAGGATGAACGCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGCAGAAGTTT
GAGAGTTGAGAGCATCTTTGTAACTCTGTGAATGTACGTACCCCTTACTAGTAACAATAA
AATGCTTTATGTAGCTCATACATAAAGTTATGTTTATAGGCAAAAAGAAACAAAAAGCTA
GTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAATATATTACATAAGACTTTAAGCAG


BQ
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AF RR4B018TF U 1
AF RR4FV32TF U 73
AF RR4A974TF U 481
AF RR4FV32JQ C 742
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BS 534 534 RR4A974TF
BS 535 851 RR4B018TF
BS 852 872 RR4A974TF
BS 873 873 RR4A974JQ
BS 874 882 RR4A974TF
BS 883 883 RR4A974JQ
BS 884 907 RR4A974TF
BS 908 1245 RR4A974JQ
BS 1246 1246 RR4FV32JQ
BS 1247 1431 RR4A974JQ

RD RR4B018TF 851 0 0
GGACTCACATTCACTGTGGACCTGTGCATTGAAACAATACTAACTTACCTACAGATCTTT
TTATCGACGGACCTGGGACTGAGTGAGTGAGCAATTCTTCCTCTCTCTGATACATTCTCT
AAGAGATGAATTGCCTTCAGAATCTTACTAGATCTTCAGTCTCACCTTTGTTGGGGAGCT
TTGGAGGCAATCACAGAGATCCTTCTTGGTCTTCCCTGAAGATGATGCTACCAATCAAAG
CCAATGATCCTAAATGTCGACTTGTTTTACAGGCTGTATCAGACAGCGCAGAGATGAGTG
GTGTTTCAAAGAAGGAGGAAGAGAAATCTGATGAATATAGCCAAGACATGACTCAAGCTA
TGGGTGCTGTATTAACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAACTACAATTTCCTTCGTCCAG
ATTTAATCGTTGGATCTTGCTTACAGACTCCTGAAGATGTTGACAAGCTCCGTAAGATTG
GTGTTAAAACCATATT*CTGCTT*GCAACAAGATCCTGACTT*GGAATATTTT*GGAGTA
GATATAAAGAGCATT*CAAGCATATGCTAAGACATTT*ACTGATATTGAGCATATT*CGC
TGTGAAATAAGAGACTTTGATGCATTTGATTT*GAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAG
TACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGG*AGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTG
GTATGGGAAAGGGCTCC*TGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAAGCTATAA
ACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGC
TATCAGAAATG

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4FV32TF 775 0 0
GG
GGGACTGAGTGAGTGAGCAATTCTTCCTCTCTCTGATACATTCTCTAAGAGATGAATTGC
CTTCAGAATCTTACTAGATCTTCAGTCTCACCTTTGTTGGGGAGCTTTGGAGGCAATCAC
AGAGATCCTTCTTGGTCTTCCTTGAAGATGATGCTACCAATCAAAGCCAATGATCCTAAA
TGTCGACTTGTTTTACAGGCTGCATCAGACAGCGCAGAGATGAGTGGTGTTTCAAAAAAG
GAGGAAGTGAAATCTGATGAATATAGCCAAGACATGACTCAAGCTATGGGTGCTGTATTA
ACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAACTACAACTTCCTTCGTCCAGATTTAATCGTTGGA
TCTTGCTTACAGACTCCTGAAGATGTTGACAAGCTCCGTAAGATTGGTGTTAAAACCATA
TT*CTGCTT*GCAACAAGATCCTGACTT*GGAATATTTT*GGAGTAGATATAAAGAGCAT
T*CAAGCATATGCTAAGACATTT*ACTGATATTGAGCATATT*CGCTGTGAAATAAGAGA
CTTTGATGCATTTGATTT*GAGGATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTGTACAAAG
CTGTTAAGCGAAATGG*AGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTGGTATGGGAAAGG*C
TCC*TGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAA*GCTATAAACTTATGGATGCTC
ATAAA*TACTTATGAGCAA*CGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGA

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4A974TF 427 0 0
GTGTTAAAACCATATTTCTGCTTTGCAACAAGATCCTGACTTTGGAATATTTTTGGAGTA
GATATAAAGAGCATTTCAAGCATATGCTAAGACATTTTACTGATATTGAGCATATTTCGC
TGTGAAATAAGAGACTTTGATGCATTTGATTTTGAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAG
TACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGGAGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTG
GTATGGGGAAGGGCTCCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAAGCTATAA
ACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGC
TATCAGAAATGCAACAATTGATATTCTTACAG*ACTCAAGAAAGAAGTATGTTACTCTGA
CACTGAA

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4FV32JQ 635 0 0
TGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTTATGGATGCTCATAAAAT
ACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGAAATGCAACAATTGA
TATTCTTACAGGACTCAAGAA*GAAGTATGTTACTCTGACACTGAAAGACAAGGGTTTCT
CCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATCGGATGGGGACAGAGGATACCTCTGACACTGG
ACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAGAGAATTGCCTGAGGGACAGTTTGAATATA
AATATATCATAGATGGGGAATGGAGACACAATGAGCTCGAGCCGTTTACAGGACCTAACA
AAGATGGTCATACCAATAATTACGCAAAAGTGGTGTATGATCCAACGAGCGTTGATGGTG
CAACTCGGGAGAGATTAACAAAGGAGGACCCTGAGCTTTTGGAGGATGAACGCTCGAAGC
TAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGCAGAAGTTTGAGAGTTGAGAGCATCTTTGT
AACTCTGTGAATGTACGTACCCCTTACTAGTAACAATAAAATGCTTTATGTAGCTCATAC
ATAAAGTTATGTTTATAGGCAAAAAGAA
ACAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4A974JQ 910 0 0
CTTGGAATA
TTTTGGAGTAGATATAAAGAGCATT*CAAGCATATGCTAAGACATTT*ACTGATATTGAG
CATATT*CGCTGTGAAATAAGAGACTTTGATGCATTTGATTT*GAGAATGCGTCTTCCTG
CTGTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGG*AGGAGTTACATACGTCCAC
TGCACTGCTGGTATGGG*AAGGGCTCC*TGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGC
AAGGCTATAAACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGA
AGCTGGATGCTATCAGAAATGCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAA*GAAGTAT
GTTACTCTGACACTGAAAGACAAGGGTTTCTCCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATC
GGATGGGGACAGAGGATACCTCTGACACTGGACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAG
AGAGAATTGCCTGAGGGACAGTTTGAATATAAATATATCATAGATGGGGAATGGAGACAC
AATGAGCTCGAGCCGTTTACAGGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAATTACGCAAAA
GTGGTGTATGATCCAACGAGCGTTGATGGTGCAACTCGGGAGAGATTAACAAAGGAGGAC
CCTGAGCTTTTGGAGGATGAACGCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTTTGAG
GCAGAAGTTTGAGAGTTGAGAGCATCTTTGTAACTCTGTGAATGTACGTACCCCTTACTA
GTAACAATAAAATGCTTTATGTAGCTCATACATAAAGTTATGTTTATAGGCAAAAAGAAA
CAAAAAGCTAGTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAATATATTACATAAGACTTTAAGCA
G

QA 10 910 10 910
DS 



AS 1 6

CO CL1285Contig1 863 6 16 U
GGAATAGAAAAGAGAGGAAAGATGGTGCTAAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCT*CACCC
AAGCGTGCTTTGGTAACGCTTATCGAGAAGGGCGTTCCCTTCGAGACCATCCCCGTCGAT
CTCATGAAAGGAGAGCACAAGCAGCCTGCTTATCTCGCCTTACAGCCTTTCGGTACCGTT
CCAGCTGTTGTCGACGGTGACTACAAGATCTTCGAGTCACGTGCCGTGATGAGGTACGTA
GCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCCGACCTTTTGGGCAAAACCGTTGAAGACAGAGGT
CAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCACTTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTC
ACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGATTCCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAG
GAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATGTCTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGC
AAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGATTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGAT
TACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCG
TGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAGGAGACTATTGAGAAGTACTCATTC
CCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTTCTTGTTCTTGTTTTTGAGTT*****
*TGTAAGCAATGTTTG*TGTTTTTAATAAAGAGTGGAACTGTATGCCTCCTCTTATCTTA
TGTATGTCACCTCTGTCTCTTCTGTTTCATATTGTAACTTGTGTGATTGAGTTGAGGTTT
GAATCTAGAGGAACTTAATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 0 35 5 5 35 
35 5 5 35 5 35 35 5 35 35 5 5 35 35 35 20 35 35 35 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE08TF U 1
AF RR4AD06JQ C 216
AF RR4AD06TF U 216
AF RR4A133TF U 39
AF RR4A133TFB U 39
AF RR4CE08JQ C 215
BS 1 54 RR4CE08TF
BS 55 55 RR4A133TF
BS 56 636 RR4CE08TF
BS 637 637 RR4A133TF
BS 638 669 RR4CE08TF
BS 670 722 RR4A133TF
BS 723 723 RR4AD06TF
BS 724 743 RR4A133TF
BS 744 744 RR4A133TFB
BS 745 749 RR4A133TF
BS 750 750 RR4A133TFB
BS 751 790 RR4A133TF
BS 791 791 RR4A133TFB
BS 792 801 RR4A133TF
BS 802 845 RR4A133TFB
BS 846 863 RR4CE08JQ

RD RR4CE08TF 677 0 0
GGAATAGAAAAGAGAGGAAAGATGGTGCTAAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCTTCACCC
AAGCGTGCTTTGGTAACGCTTATCGAGAAGGGCGTTCCCTTCGAGACCATCCCCGTCGAT
CTCATGAAAGGAGAGCACAAGCAGCCTGCTTATCTCGCCTTACAGCCTTTCGGTACCGTT
CCAGCTGTTGTCGACGGTGACTACAAGATCTTCGAGTCACGTGCCGTGATGAGGTACGTA
GCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCCGACCTTTTGGGCAAAACCGTTGAAGACAGAGGT
CAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCACTTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTC
ACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGATTCCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAG
GAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATGTCTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGC
AAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGATTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGAT
TACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCG
TGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAG*AGACTATTGAGAAGTACTCATTC
CCTGCTTAA
GATGATTA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4AD06JQ 533 0 0
GTCACGTGCCGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCTGACCTTTT
GGGCAAAACCGTTGAAGACAGAGGCCAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCAC
TTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGATT
CCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATGT
CTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGA
TTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGAT
CAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAA
GGAGACTATTGAGAAGTACTCATTCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTT
CTTGTTCTTGTTTTTGAGTCCAAATGTGTTTGCTTTTTTGGCTCCTTTTAATC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4AD06TF 533 0 0
GTCACGTGCCGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCTGACCTTTT
GGGCAAAACCGTTGAAGACAGAGGCCAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCAC
TTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGATT
CCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATGT
CTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGA
TTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGAT
CAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAA
GGAGACTATTGAGAAGTACTCATTCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTT
CTTGTTCTTGTTTTTGAGTCCAAATGTGTTTGCTTTTTTGGCTCCTTTTAATC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4A133TF 763 0 0
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CTTCGAGACCATCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAGCACAAGCAGCCTGCTTATCTCGC
CTTACAGCCTTTCGGTACCGTTCCAGCTGTTGTCGACGGTGACTACAAGATCTTCGAGTC
ACGTGCCGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCCGACCTTTTGGG
CAAAACCGTTGAAGACAGAGGTCAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCACTTT
CCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGATTCCC
ATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATGTCTA
CGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGATTT
GGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAA
AGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAGGA
GACTATTGAGAAGTACTCATCCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTTCTT
GTTCTTGTTTTTGAGTT******TCTAAGCAATGTTTG*TGTTTT*AATAA*GAGTGGAA
CTGTATGCCTCCTCTTATCTTATGTATGTCAC*TCTGTCTCTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4A133TFB 807 0 0
CGGACCTCACTTTGCT*CACCCAAGCGTGCTTTGGTAACGCTTATCGAGAAGGGCGTTCC
CTTCGAGACCATCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAGCACAAGCAGCCTGCTTATCTCGC
CTTACAGCCTTTCGGTACCGTTCCAGCTGTTGTCGACGGTGACTACAAGATCTTCGAGTC
ACGTGCCGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCCGACCTTTTGGG
CAAAACCGTTGAAGACAGAGGTCAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCACTTT
CCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGATTCCC
ATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATGTCTA
CGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGATTT
GGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAA
AGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAGGA
GACTATTGAGAAGTACTCATCCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTTCTT
GTTCTTGTTTTTGAGTT******TCTAAGCAATGTTTG*TGTTTTTAATAAAGAGTGGAA
CTGTATGCCTCCTCTTATCTTATGTATGTCACCTCTGTCTCTTCTGTTTCATATTGTAAC
TTGTGTGATTGAGTTGAGGTTTGAATC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4CE08JQ 649 0 0
AGTCACGTGCCGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCCCAAGGACCCGACCTTT
TGGGCAAAACCGTTGAAGACAGAGGTCAAGTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCA
CTTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTCGCATCAGTCATGGGAT
TCCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTCGCTGCTGTGCTCGATG
TCTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTG
ATTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGA
TCAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGA
AGGAGACTATTGAGAAGTACTCATTCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGT
TCTTGTTCTTGTTTTTGAGTT******TTTAAGCAATGTTTG*TGTTTTTAATAAAGAGT
GGAACTGTATGCTTCCTCTTATCTTATGTATGTCACCTCTGTCTCTTCTGTTTCATATTG
TAACTTGTGTGATTGAGTTGAGGTTTGAATCTAGAGGAACTTAATAATC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 6

CO CL1286Contig1 1333 6 20 U
GGGATCGGAGTTGAAGAAGCGATCGCATCGATGGCGGAAGGCGGCGGCGATGATCCCCAG
CGAGTGAAGAAGATAGCGGCGGCAGCATACGACTACGATAACGACGCTCGGTGGACGGAT
TACTGGTCGAATATCCTGATCCCTCCTCACATGGCTTCTCGCCCCGAGGTCGTCGACCAC
TACAAGCGCAAATTCTACCAACGCTACATGGATCCTGATCTTGTTGTGGAGCCTATGTCC
TCGAATTCATCTGCAAGACCATCTGCTACTCCTGCAACTGCTACTAATTCAAATGAACAA
CAAGCTCGTTCACGGAACTCTGGATCGGTTCCTCGTAGTACTGCGCCGTCTGCTACGACT
GGTGCAAGCCCAAGTTCAGTGCGCTGGGATCAGCAGACTATTCACTTCTCTGTCAATGCT
TGGGTTTTCGTTATTGCTGTGCTGGCAGTGTTACCTCTAGTTCCAAAGAACCTCTCTAGT
AGGGCTTATCGTCTATCTTTCATGGGAACTGCGTGCTCCTCTCTATATTCCTTGTACTCT
CTTTACGGGAGGCCAAGGGCATGGAATATGCAAGGGATGCAAGTTTATTTTCAGTCAATT
GTGGGAGCAAAGGATTTCATCTATTTCATCTACTGCCTTACATTTGTCACTTCACATCTC
TGTCTCAAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCACTTGAACAAGTAGCCAAGTTC
TTGAGACGTAATTTCACTCGCTCCACCATATACAGGAAGTACTTGGAAGACCCTTGTGTT
TGGGTGGAGTCAAACACAACTACCCTCAACATCCTCTCATCGCAAGCTGAGATAGCCATT
GGCTTCCTTCTGATTATCTCTCTGCTCTCATGGCAACGCAACTTTATACAGACATTCATG
TACTGGCAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACCGGTGACAGCAGGATACCACCAGAGC
AATTGGAGCAAAATAGGGAGGACGGTGAATCCAATGATCCAACGTTACGCTCCCTTCTTG
AATACTCCGGTGACTGCCGTTCAGAGATGGTGGTTCAGGTGAAGAACAAACAAATTGCAG
AGTTGACTTTTGAAACCCTTAAAAGAAACTAAAGTTTTAGCTTTCATGTTCAACAGTCCT
CTTTACCTGTTTCAGCTTTCAGCGTAAAGTAGATTCTTCTTCTCTTTGTACCTCTCTATG
GGTTATGAAATATTACTGTGTTGCTACGAAAGATTTTGGCTTTCAATTTGGTTACCATTT
CACGTGTAGACATTTGATCCTTTCCCTTTTGCGGTGCATAAATGTAACAATAAAGAAGAG
ACTCGAAGAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GATGCAAGTTTATTTTCAGTCAATTGTGGGAGCAAAGGATTTCATCTATTTCATCTACTG
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AGCACTTGAACAAGTAGCCAAGTTCTTGAGACGT

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TGGGTTTTCGTTATTGCTGTGCTGGCAGTGTTACCTCTAGTTCCAAAGAACCTCTCTAGT
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TGGGTGGAGTCAAA

QA 1 794 1 794
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G
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AGTAGGGCTTATCGTCTATCTTTCATGGGAACTGCGTGCTCCTCTCTATATTCCTTGTAC
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AGTTCTTGAGACGTAACTTCACTCGCTCCACCATATACAGGAAGTACTTGGAAGACCCTT
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GTCCTCTTTACCTGTTTCAGCTTTCAGCGTAAAGTAGATTCTTCTTCTCTTTGTACCTCT
CTATGGGTTATGAAATATTACTGTGTTGCTACGAAAGATTTTGGCTTTCAATTTGGTTAC
C

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GCTACGAAAGATTTTGGCTTTCAATTTGGTTACC

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CATCTCTGTCTCAAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCACTTGAACAAGTAGCC
AAGTTCTTGAGACGTAATTTCACTCGCTCCACCATATACAGGAAGTACTTGGAAGACCCT
TGTGTTTGGGTGGAGTCAAACACAACTACCCTCAACATCCTCTCATCGCAAGCTGAGATA
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TTCTTGAATACTCCGGTGACTGCTGTTCAGAGATGGTGGTTCAGGTGAAGAACAAACAAA
TTGCAGAGTTGACTTTTGAAACCCTTAAAAGAAACTAAAGTTTTAGCTTTCATGTTCAAC
AGTCCTCTTTACCTGTTTCAGCTTTCAGCGTAAAGTAGATTCTTCTTCTCTTTGTACCTC
TCTATGGGTTATGA**TATTACTGTGTTGCTACGAAAGATTTTGGCTTTCAATTTGGTTA
CCATTTCACGTGTAGACATTTGATCCTTTCCCTTTTGCGGTGCATAAATGTAACAATAAA
GAAGAGACTCGAAGAGGAG

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DS 



AS 1 6

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TTTTGGTTCACCTGATGGGCTTTATCTCTTAAAAAAAAGCCCATAGATAAAAAACATGCT
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GGTCTATTGGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGG
ATATGGTGAAAGCCTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGAGATGTCTGTTTTTTAAAACTT
GAATTTAGTATGCGTGCCAAGTGTTTGCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGACTTTCTTCT
TTGTATGTGTTGGACCAAACTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AS16TF U 1
AF RR4AV64TF U 1
AF RR4CA74TF U 160
AF RR4AS16JQ C 324
AF RR4AV64JQ C 440
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BS 963 963 RR4AS16JQ
BS 964 977 RR4CA74TF
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CGGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCGGAGACGATGGCTCTGATGGATAAGAGAG
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GTCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGGGGAGATATTGACATTCCGG
CGGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAACACAGCGAGATAACGG
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CAATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTAT
CTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGG
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GATGGGTTACAGCTCGGAGAT

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DS 

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TTTTGGTTCACCTGATGGGCTTTATCTCTTAAAAAAAAGCCCATAGATAAAAAACATGCT
CCGTCTCCCAAAGTAAAGAAGCTAAAGAAAGTTTTGGATTCGGTGGAAGATCAGATCAAT
CGGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCGGAGACGATGGCTCTGATGGATAAGAGAG
CTGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATCGTTGAACGTCTATGTAATCCCGGTGGTCCTG
GTCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGGGGAGATATTGACATTCCGG
CGGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAACACAGCGAGATAACGG
ACAAGATCGATGTGAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACGTCAAGAGCTT
CAATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTAT
CTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGG
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GATGGGTTACAGCTCGGAGA

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DS 

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GG
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GCTCTGATGGATAAGAGAGCTGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATCGTTGAACGTCTA
TGCAATCCCGGTGGTCCTGGTCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGG
GGAGATATTGACATTCCGGCGGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAAT
GAACACAGCGAGATAACGGACAAGATCGATGTGAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGG
CCTACTACGTCAAGAGCTTCAATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCA
GGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGT
GCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTT*GATGAGATAACCGA
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ACAAGCAGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAATTGGATTTATCTGTCACCCC
GAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTATTGGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGA
T*ATCATTTGGAGGC*TGGATATGGTGAA*GCCTGCAGAGTTTT*GGTTGAG**ATGAGA
TGTCTGTTTTT**AAACTTGA*TTTAGTATGCGTGC
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DS 

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CTTGCTGAGTTACGGAATGAACACAGCGAGATAACGGACAAGATCGATGTGAACATTCAG
ATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACGTCAAGAGCTTCAATTTCCAAAGATTCAGGTCCA
GAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGGC
ATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATG
GTT*GATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCAGAGGATGGGTTACAGCTCGGAGATCA
GGTTGTGAAATTCGGCAGCGTGGAAGGTGGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTGCCGCTGA
AGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCAGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAATT
GGATTTATCCGTCACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTATTGGGGTGCCATTTCCG
TTTGTTATGAGCCATGGATTACCATTTGGAGGCCTGGATATGGTGAAAGCTTGCAGAGTT
TTTGGTTGAAGAATGAGATGTCTGTTTTTTAAAACTTGAATTTAGTATGCGTGCCAAGTG
TTTGCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGACTTTCTTCTTTGTATGTGTTGGACCAAACTCA
GAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTGGC

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DS 

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TCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATC
TGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGC
CATGGTT*GATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCAGAGGATGGGTTACAGCTCGGAG
ATCAGGTTGTGAAATTCGGCAGCGTGGAAGGTGGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTGCCG
CTGAAGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCAGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGA
AATTGGATTTATCCGTCACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTATTGGGGTGCCATT
TCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTACCATTTGGAGGCCTGGATATGGTGAAAGCTTGCAG
AGTTTTTGGTTGAAGAATGAGATGTCTGTTTTTTAAAACTTGAATTTAGTATGCGTGCCA
AGTGTTTGCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGACTTTCTTCTTTGTATGTGTTGGACCAAA
CTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTGGC

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DS 

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GATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACGTCAAGAGCTTCAATTTCCAAAGATTCAGGTCC
AGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGG
CATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCAT
GGTT*GATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCAGAGGATGGGTTACAGCTCGGAGATC
AGGTTGTGAAATTCGGCAGCGTGGAAGGTGGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTGCCGCTG
AAGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCAGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAAT
TGGATTTATCTGTCACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTATTGGGGTGCCATTTCC
GTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGGATATGGTGAAAGCCTGCAGAGT
TTTTGGTTGAAGAATGAGATGTCTGTTTTTTAAAACTTGAATTTAGTATGCGTGCCAAGT
GTTTGCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGACTTTCTTCTTTGTGTGTGTTGGACCAAACTC
AGAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 2 4

CO CL1288Contig1 845 2 10 U
GCTAAGCTTCATATTGTATTTCAGTTAAAAATACTAGAATAGGTGAAGTCATAAAGATAA
TTTGATATACTACAGACATTAAAGCAACAAAACTTTGACATAAAAGCATCCAAGTGCAAA
CCAGAGAACCAAATAGAACAAAGCAGAACGCAGGTGAATAATACGATATTCAGAAACTTT
AAAAGAGTTGATCATCAAAATCTTGGCTTTTTCAAGAGGTTTCAACGTCAGAGAGATCCA
AGCCTTCTCTGTAAAGCTCAAAGTCACTAGGGCTCCATCTGCAGACTAAGTTGAGTTTGA
AAGTAGCCAACTTGATTCCCAACAGACGCAAAATGCGAGAAGATTCTGGGGAAAGAGGTA
TCCCTTCTTCACAAACTACAAAGTCGGAGAGTAACCCCACCGTACCTTTGTTAAGACGAA
CAGGCATACCCTGCTTCCTAAGAAACGGTTCCATCTCATGTGTGAACTATTCTAGAGGTC
CTTCCTTCAGCTCAACCGTTTCTACAGCAGTGCTTCCGGTTCTTGAAAAGTCTGAATCCT
CATAAGCGTTAAATAAGCTTTCGACCTCTTCCTTTGGCATATCCGTAACAAGAAGTCCAG
CATCACCATGAAGCATCTTGGAGGCTTTGAAGATACCAGGACGCATTTCATCAGAAGCAG
AACGACCTAGAGAAACCTGCATCACCTTGTTCGAACCGAGGAAGAACTTTCCGTTCTGCC
TAAACTGCTGTCTGAACTCCTTGAACTTGATGTTTCTCATGTTCTCAAAAGAGAAAACAT
AGACTGATGAATACTTGTCGACAGCCTCTCTGATTCCATTTACGATAACCTCCTTGTGCG
CTCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4D083JQ U 1
AF RR4BU88JQ U 45
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BS 772 845 RR4BU88JQ

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CATAAGCGTTAAATAAGCTTTCGACCTCTTCCTTTGGCATATCCGTAACAAGAAGTCCAG
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TAAACTGCTGTCTGAACTCCTTGAACTTGATGTTTCTCATGTTCTCAAAAG

QA 1 771 1 771
DS 

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ACGTCTGAGAGATCCAAGCCTTCTCTGTAAAGCTCAAAGTCATTAGGGCTCCATCTGCAG
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TCTGGTGAAAGAGGTTTGCCTTCTTCACAAACTACAAAGTCGGAGAGTGACCCCACCGTA
CCTTTGTTAAGACGAACAGGCATACCCTGCTTCCTAAGAAACGGTTCCATCTCATGTGTG
AACTGTTCTAGAGGTCCTTCCTTCAGCTCAACCGTTTCTACAGCAGTGCTTCCGGTTCTT
GAAAAGTCTGAATCCTCATAAGCGTTAAATAAGCTTTCGACCTCTTCCTTTGGCATATCC
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AACTTTCCGTTCTGCCTAAACTGCTGTCTGAACTCCTTGAACTTGATGTTTCTCATGTTC
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ATAACCTCCTTGTGCGCTCTT

QA 1 801 1 801
DS 



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BQ
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AF RR4H074TF U 1
AF RR4D083TF U 1
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QA 1 761 1 761
DS 

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GACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAGGTGATGCAGGTTT
CTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGATGAAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGC
TTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACGGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTAT
TTAACGCTTATGAAGATTCAGACTTTTCAAGAACCGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTG
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ACTCTTTTAAGTTTCTGAATATCGTATTAT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 2 5

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX63TF C 2
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TC

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DS 

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ATTAGACTACATAGCAAAGAGTACAACACACTGTTAACTCAAAACGAAAGAGCAAAAGAC
ACAACA******ACACAGCTTGTTTTAAGCAAAACTATACAAAAAGCTACTCGAAATGTT
CTCCCTTCTCAATGATATCGGAATTGTTACTTAATAAAATGGGGACGAATCAAATAGTTG
AAATCATCATTCTTCTCCTTCTTCTTTTAAGTTGGTTACCTAGTAGTCTTTAGAGATTTT
TT*AAAAAAAATCACAAGAAGGCGCAACGGTTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCCTCTGCTTT
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TTTGTAGTAATGGGTACTGCACCAGGATGATCTATGAAGAATTGCTTGTCATCTCGAAGG
TCAAGTTTTGTTCCAACGAGGATAATGGGAACACCAGGGGCATAATGCCTGAGCTCAGGA
ATCCACTTTTTGGCGATATTCTCATGGCTAGCCTTGCTGATGAGGGAGAAGGCAAGAATG
AAAACATCAGCGCCACGGTAACTCAGAGGTCGTAACCCGTTGTAGTCTTCTTGACCGGCT
GTG
TCC

QA 1 723 1 723
DS 

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C
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TTTAAGCAAAACTATACAAAAAGCTACTCGAAATGTTCTCCCTTCTCAATGATATCGGAA
TTGTTACTTAATAAAATGGGGACGAATCAAATAGTTGAAATCATCATTCTTCTCCTTCTT
CTTTTAAGTTGGTTACCTAGTAGTCTTTAGAGATTTTTT*AAAAAAAATCACAAGAAGGC
GCAACGGTTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCCTCTGCTTTGGTGGCTGAAGCACCACTTTGAT
GGCTGCATCAAACACTGCCTTCACATTCTGCTGTGTCTTTGAACTACATTCAATGTAGAC
CGCAGAGCCGATCAGTTTCTTTAGCTCCTCTCCCTGGTTTGTAGTAATGGGTACTGCACC
AGGATGATCTATGAAGAATTGCTTGTCATCTCGAAGGTCAAGTTTTGTTCCAACGAGGAT
AATGGGAACACCAGGGACATAATGCCTGAGCTCAGGAATCCACTTTTTGGCGATATTCTC
ATAGCTAGCCTTGCTGATGAGGGAGAAGGCAAGAATGAAAACATCAGCGCCACGGTAACT
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QA 2 824 2 824
DS 



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CTAGCAGAAAAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTTACCGTCGGTGATGGTGCT
GTCGGAAAAACCTGCATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTG
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GGCTTGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4F805TF U 1
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CTAGCAGAAAAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTTACCGTCGGTGATGGTGCT
GTCGGAAAAACCTGCATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTG
CCAACAGTTTTTGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGGAACACCGTCAATCTT
GGCTTGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGT
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GCCAAAAAGTGGATTCCTGAGCTCAGGCATTATGCCCCTGGTGTTCCCATTATCCTCGTT
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GTGCTTCAGTCGCC

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DS 



AS 1 4

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CGGCGCTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP08JQ U 16
AF RR4EJ09JQ U 1
AF RR4D240JQ U 2
AF RR4GP08TF C 274
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RD RR4GP08JQ 654 0 0
GG
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ACTTCCAACAAAAAAAAAGAGAATCCTTTTTTGAACAACAAATTGAAGAGACAATCTAAA
CACTCAAAAAGATCCTTATTAGTTATTCCTCTGGGCAGCCTCCTTTGCAAGTACTCTTTC
CTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGAGATTTGGATCCCATTATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCT
GTACTCTTCGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTTGATAGCTTCGAGGATTTTGCTGAACTC
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AACAGCTCCAAGACGAGATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGGACTTCCATCTTCCTGCA
GAGAGCAGGCAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCGACATCATGAGCAATGACAACAAG
CTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAGGTCACATGGTTAAGGCCGTATTTGACAACAAT
AGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCCGCTTCAGCTTGAGCCTTCTTGACAAGACG
CTCTTTCTTGGCGGCTTTATCCTCCGGCCTATACTTGAGAAGTATCTTGAAG

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR4EJ09JQ 742 0 0
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CATACACGATAGTTCCAACTTCCAACAAAAAAAA*GAGAATCCTTTTTTGAACAACAAAT
TGAAGAGACAATCTAAACACTCAAAAAGATCCTTATTAGTTATTCCTCTGGGCAGCCTAC
TTTGCAAGTACTCTTTCCTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGTGATTTGGATCCCATTATGCCT
CCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCTTCGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCG
AGGATTTTGCTGAACTCAAGCTTGTCCTCATTCTTGACAGTGGTCAAACACAAGCAAGCA
GCAGTCTTTTGGTGAACCACAGCTCCAAGACGAGATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGG
ACTTCCATCTTCCTGCAGAGAGCAGGTAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCGACATCA
TGAGCAATGACAACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAGGTCACATGGTTAAGG
CCGTATTTGACAACAATAGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCAGCTTCAGCTTGA
GCCTTCTTGACAAGACGCTCTTTCTTGGCGGCTTTGTCCTCTGGCCTATACTTGAGAAGT
ATCTTGAAGAGGCTGGTCGCAAGATTCTTGTCGAGGGTCTTGGTGAACTGATTAAGGGCA
GGTGGGACCTTCAACCTCTGCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4D240JQ 741 0 0
CCTGAAACCAAAATGATCATAAAGCTTGAAAACTGTCTGAAGAGGGTGCAAAACACATCC
ATACACGATAGTTCCAACTTCCAACAAAAAAAAAGAGAATCCTTTTTTGAACAACAAATT
GAAGAGACAATCTAAACACTCAAAAAGATCCTTATTAGTTATTCCTCTGGGCAGCCTCCT
TTGCAAGTACTCTTTCCTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGAGATTTGGATCCCATTATGCCTC
CTCCCCATTTCTTCCT**ACTCTTCGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTTGATAGCTTCGA
GGATTTTGCTGAACTCAAGCTTGTCCTCATTCTTGACAGTGGTCAAACACAAGCAAGCAG
CAGTCTTTTGGTGAACAACAGCTCCAAGACGAGATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGGA
CTTCCATCTTCCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCGACATCAT
GAGCAATGACAACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAGGTCACATGGTTAAGGC
CGTATTTGACAACAATAGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCCGCTTCAGCTTGAG
CCTTCTTGACAAGACGCTCTTTCTTGGCGGCTTTATCCTCCGGCCTATACTTGAGAAGTA
TCTTGAAGAGGCTGGTCGCAAGATTCTTGTCGAGGGTCTTGGTGAACTGATTAAGGGCAG
GTGGGACTTTCAACCTCTGCT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GP08TF 696 0 0
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TTGACAGTGGTCAAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTTTGGTGAACAACAGCTCCAAGACGA
GATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGGACTTCCATCTTCCTGCAGAGAGCAGGCAACCAG
ACGACCAACTCGATGGGGTCGACATCATGAGCAATGACAACAAGCTGTGCCTTGTTCTGC
TCGATGAGGTAGGTCACATGGTTAAGGCCGTATTTGACAACAATAGGCTTCTTGGATTCA
GAAGGCTTTCCCTCCGCTTCAGCTTGAGCCTTCTTGACAAGACGCTCTTTCTTGGCGGCT
TTATCCTCCGGCCTATACTTGAGAAGTATCTTGAAGAGGCTGGTCGCAAGATTCTTGTCG
AGGGGCTTGGTGAACTGATTAAGGGCAGGTGGGACTTTCAACCTCTGCTTAAGGATCCTC
TTCTGCCTTTGAAGACGGATAGACTTAGGCCATTTGATGTAGCGGGTAAGATCCTTCTTG
GGAGGAAGAGCTCCACCAATACCAAATTGCTTAGGCCTCCTCTCGAATAGAGGGTTCGTT
ACTTTCTCCGTCTTCTTCTTGGCAGCAACCTTGACTCCTTTCTTCGGGGCCATGGTTCGT
CCAAATGGGTGGTTTCTGCAAAACGGACGGCGCTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 6

CO CL1291Contig1 1242 6 27 U
GAGCCTTGGAGCTCGACCTGCTCGAGATCATATCCAAGAATGTCGCTCTCCCTGGCGGTC
AACTGTCTCCCTCGGAGGTAGCTTCTTATCTTTCGACCAAAAACCCTGATGCTCCAGTCA
TGGTTGACCGGATCCTTAGGTTGCTTGCGGCTTACTCCGTCTTAACCTGCTCTGTCCGTA
AGCTTCCCGATGGCGGCGTGGAACGTCTGTACGGACTTGGACCGGTATGCAAGTACCTTA
TTAAGAACGAAGACGGAGTTGCACTCGATGCACTCTGTCATTTGAACAGAGACAGGGTCT
TCATGGAGAGCTGGTATCATTTGAAAGATGCAGTTCTTGAAGGTGGGATTCCATTCAACA
GGGCATTTGGTATGGGCGCTTTCGAGTACCAAGGGTCTGATCCGAGGTTCAACAAGGTGT
TCAACAGTGGAATGTCCAACCACACGACGATAGTCATGACCAAGATTCTAGAGACATACA
AAGGCTTTGAGGGATTATCTTCGTTGGTTGATGTTGGTGGTGGCATTGGAGTTACTCTCC
GTATGATTGTCTCCAAGCACCCATACATCAAGGGGATCCTCTATGGTCTCCCTCATGTCA
TCGAGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTGAACACATTGGCGGAGATATGTTTGTGAATG
TCCCTAAAGCAGATGCCATCTTCACGAAGTGGATATGTCATGATTGGAGTGACCAACACT
GTTTGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCACTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTAG
CGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGACTCAAGCCTCATGACGAAAGAAGTTGTCCACA
TGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTG
AGGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAGGCTTTCAAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTA
CTCACATCTTCGAGTTCCTCAAGAAGATATGAGCCTAATAAGTACAAATATCCATGGAAC
ATTTTCTTCTCGATTTTTTGCGTCCAGATATTTTTTCTACATTTCCAGTGTTATCCTGTT
CTGCATATATGTTGTTTCTCTGGCTTGTGAGGCCACTATCGTCGTTGTTTACTTGTTTAA
GCTGTTTTTGATGTTGTTGGAAAATGCATTTCTTTGTAATTGTATTTCCGATTTTAATGC
ATATGAATAAAACCAAGGCCAAATAATATGTTAAATCAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL17TF U 1
AF RR4DX41TF U 392
AF RR4E774TF U 392
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AF RR4E774JQ C 697
AF RR4EL17JQ C 544
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BS 686 727 RR4EL17TF
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BS 779 779 RR4DX41TF
BS 780 793 RR4EL17TF
BS 794 794 RR4DX41TF
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BS 798 800 RR4DX41TF
BS 801 812 RR4EL17TF
BS 813 994 RR4DX41TF
BS 995 1055 RR4E774TF
BS 1056 1056 RR4DX41JQ
BS 1057 1079 RR4E774TF
BS 1080 1080 RR4DX41JQ
BS 1081 1111 RR4E774TF
BS 1112 1113 RR4DX41JQ
BS 1114 1147 RR4E774TF
BS 1148 1230 RR4DX41JQ
BS 1231 1242 RR4EL17JQ

RD RR4EL17TF 820 0 0
GAGCCTTGGAGCTCGACCTGCTCGAGATCATATCCAAGAATGTCGCTCTCCCTGGCGGTC
AACTGTCTCCCTCGGAGGTAGCTTCTTATCTTTCGACCAAAAACCCTGATGCTCCAGTCA
TGGTTGACCGGATCCTTAGGTTGCTTGCGGCTTACTCCGTCTTAACCTGCTCTGTCCGTA
AGCTTCCCGATGGCGGCGTGGAACGTCTGTACGGACTTGGACCGGTATGCAAGTACCTTA
TTAAGAACGAAGACGGAGTTGCACTCGATGCACTCTGTCATTTGAACAGAGACAGGGTCT
TCATGGAGAGCTGGTATCATTTGAAAGATGCAGTTCTTGAAGGTGGGATTCCATTCAACA
GGGCATTTGGTATGGGCGCTTTCGAGTACCAAGGGTCTGATCCGAGGTTCAACAAGGTGT
TCAACAGTGGAATGTCCAACCACACGACGATAGTCATGACCAAGATTCTAGAGATATACA
AAGGCTTTGAGGGATTATCTTCGTTGGTTGATGTTGGTGGTGGCATTGGAGTTACTCTCC
GTATGATTGTCTCCAAGCACCCATACATCAAGGGGATCCTCTATGATCTCCCTCATGTCA
TCTAGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTGAACACATTGGCGGAGATATGTTTGTGAATG
TCCCTAAAGCAGATGCCATCTTCATGAAGTGGATATGTCATGATTGGAGTGACCAACACT
GTTTGAA*TTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCACTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTGG
CGGAATCAATGCTCCCGT**TTGCCAGACTCA
GCCTCATG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4DX41TF 603 0 0
G
GGGTCTGATCCGAGGTTCAACAAGGTGTTCAACAGTGGAATGTCCAACCACACGACGATA
GTCATGACCAAGATTCTAGAGACATACAAAGGCTTTGAGGGATTATCTTCGTTGGTTGAT
GTTGGTGGTGGCATTGGAGTTACTCTCCGTATGATTGTCTCCAAGCACCCATACATCAAG
GGGATCCTCTATGGTCTCCCTCATGTCATCGAGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTGAA
CACATTGGCGGAGATATGTTTGTGAATGTCCCTAAAGCAGATGCCATCTTCACGAAGTGG
ATATGTCATGATTGGAGTGACCAACACTGTTTGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCA
CTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTAGCGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGACTCA
AGCCTCATGACGAAAGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGA
GGCAAAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTGAGGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAGGC
TTTCAAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTACTCACATCTTCGAGTTCCTCAAGAAGATATGA
GC

QA 2 603 2 603
DS 

RD RR4E774TF 756 0 0
G
GGGTCTGATCCGAGGTTCAACAAGGTGTTCAACAGTGGAATGTCCAACCACACGACGATA
GTCATGACCAAGATTCTAGAGACATACAAAGGCTTTGAGGGATTATCTTCGTTGGTTGAT
GTTGGTGGTGGCATTGGAGTTACTCTCCGTATGATTGTCTCCAAGCACCCATACATCAAG
GGGATCCTCTATGGTCTCCCTCATGTCATCGAGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTGAA
CACATTGGCGGAGATATGTTTGTGAATGTCCCTAAAGCAGATGCCATCTTCACGAAGTGG
ATATGTCATGATTGGAGTGACCAACACTGTTTGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCA
CTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTAGCGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGACTCA
AGCCTCATGACGAAAGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGA
GGCAAAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTGAGGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAGGC
TTTCAAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTACTCACATCTTCGAGTTCCTCAAGAAGATATGA
GCCTAATAAGTACAAATATCCATGGAACATTTTCTTCTCGATTTTTTGCGTCCAGATATT
TTT*CTACATTTCCAGTGTTATCCTGT*CTGCATATATGTTGTTTCTCTGGCTTGTGAG*
*CACTATCGTCGTTGTTTACTTGTTTAAGCTGTTT

QA 2 756 2 756
DS 

RD RR4DX41JQ 734 0 0
CTTCGTTGGTTGATGTTGGTGGTGGCATTGGAGTTACTCTCCGTATGATTGTCTCCAAGC
ACCCATACATCAAGGGGATCCTCTATGGTCTCCCTCATGTCATCGAGGAAGCTATTTCCT
ATCCTGGTATTGAACACATTGGCGGAGATATGTTTGTGAATGTCCCTAAAGCAGATGCCA
TCTTCACGAAGTGGATATGTCATGATTGGAGTGACCAACACTGTTTGAAATTTCTCAAGA
ATTGTTATGAAGCACTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTAGCGGAATCAATGCTTCCGG
TGTTGCCAGACTCAAGCCTCATGACGAAAGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGG
CTCACAACCCCGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTGAGGCATTAGCCAGAGGTT
CTGGCTTCCAAGGCTTTCAAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTACTCACATCTTCGAGTTCC
TCAAGAAGATATGAGCCTAATAAGTACAAATATCCATGGAACATTTTTTTCTCGATTTTT
TGCGTCCAGATATTTTTTCTACATTTCCAGTGTTATCCTGTTCTGCATATATGTTGTTTC
TCTGGCTTGTGAGGCCACTATCGTCGTTGTTTACTTGTTTAAGCTGTTTTTGATGTTGTT
GGAAAATGCATTTCTTTGTAATTGTATTTCCGATTTTAATGCATATGAATAAAACCAAGG
CCAAATAATATG
CC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4E774JQ 536 0 0
GTCATGATTGGAGTGACCAACACTGTTTGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCACTCC
CAGACAACGGGAAAGTGATAGTAGCGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGACTCAAGCC
TCATGACGAAAGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGAGGCA
AAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTGAGGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAGGCTTTC
AAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTACTCACATCTTCGAGTTCCTCAAGAAGATATGAGCCT
AATAAGTACAAATATCCATGGAACATTTTCTTCTCGATTTTTTGCGTCCAGATATTTTTT
CTACATTTCCAGTGTTATCCTGTTCTGCATATATGTTGTTTCTCTGGCTTGTGAGGCCAC
TATCGTCGTTGTTTACTTGTTTAAGCTGTTTTTGATGTTGTTGGAAAATGCATTTCTTTG
TAATTGTATTTCCGATTTTAATGCATATGAATAAAACCAAGGCCAAATAATATG
CC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4EL17JQ 699 0 0
TGATTGTCTCCAAGCACCCATACATCAAGGGGATCCTCTATGATCTCCCTCATGTCATCT
AGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTGAACACATTGGCGGAGATATGTTTGTGAATGTCC
CTAAAGCAGATGCCATCTTCATGAAGTGGATATGTCATGATTGGAGTGACCAACACTGTT
TGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCACTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTGGCGG
AATCAATGCTTCCGGTTTTGCCAGACTCAAGCCTCATGACGAAAGAAGTTGTCCACATGG
ACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTGAAG
CATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAGGCTTTCAAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTACTC
ACATCTTCGAGTTCCTCAAGAAGATATGAGCCTAATAAGTACAAATATCCATGGAACATT
TTCTTCTCGATTTTTTGCGTCCAGATATTTTTTCTACATTTCCAGTGTTATCCTGTTCTG
CATATATGTTGTTTCTCTGGCTTGTGAGGCCACTATCGTCGTTGTTTACTTGTTTAAGCT
GTTTTTGATGTT*TTGGAAAATGCATTTCTTTGTAATTGTATTTCCGATTTTAATGCATA
TGAATAAAACCAAGACCAAATAATATGTTAAATCAAAGC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 6

CO CL1292Contig1 753 6 15 U
TTTCATCATAATCATAATAGACAATTATTGGGCTTTAAAGCATTGCAAGCTCTCAAAATG
TCTCAATATAAAGCTTCATGTACAGTACGCCAACCAACACACTGGCTTGAGATGTATAAA
ACTAATAAAGCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTTT*CTCAATCTTATTCTTAAG
ACAATGCGCAATGTATTGGTGGTGCAGATTATTATTGCCAATCATCATCATCCCATTGCA
TACTTCTGGGTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTGTCTTGTAGGTG
TGAGCTATTTCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCAGTGAGCATATC
GACAGAAGAACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCAGAATGTCAAGA
CAGATGCTGCCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGAAAGAAACCTTG
GGTGGCTTGAAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAGACAAGAAAAACACCTCCAGAG
AATGGGCTATCAGTTGGACCCATTATAGTCGCTTGCCAGTGGAACATATCATCACCCACA
GGACCAGCACTGCATGAGACAGGAGGATCCCTTTGGAGGTCCCTAAGCTCCTTGTTGATT
CTTTTCGAAGAAGCCATCTTGAACTGCGCACTCGCT****TTCTTAGGGTTTTTGATTGG
TGATCTTCGGAAATCTCAAGGGGTTGTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EJ39JQ U 45
AF RR4FV80JQ U 4
AF RR4FV80TF C 1
AF RR4EJ39TF C 110
AF RR4B011TF C 6
AF RR4B011JQ U 10
BS 1 9 RR4FV80TF
BS 10 49 RR4FV80JQ
BS 50 409 RR4EJ39JQ
BS 410 410 RR4FV80JQ
BS 411 418 RR4EJ39JQ
BS 419 419 RR4FV80JQ
BS 420 482 RR4EJ39JQ
BS 483 483 RR4FV80JQ
BS 484 518 RR4EJ39JQ
BS 519 519 RR4FV80JQ
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BS 530 696 RR4FV80JQ
BS 697 735 RR4B011JQ
BS 736 752 RR4FV80TF
BS 753 753 RR4B011TF

RD RR4EJ39JQ 485 0 0
GTAAA
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AGATGTATAAAACTAATAAAGCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTTT*CTCAATC
TTATTCTTAAGACAATGCGCAATGTATTGGTGGTGCAGATTATTATTGCCAATCATCATC
ATCCCATTGCATACTTCTGGGTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTG
TCTTGTAGGTGTGAGCTATTTCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCA
GTGAGCATATCGACAGAAGAACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCA
AAATGTCAAAACAGATGCTGCCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGA
AAGAAACCTTGGGCGGCTTGAAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAAACAAGAAAAA

QA 6 485 6 485
DS 

RD RR4FV80JQ 696 0 0
CATCAT
AATCATAATAGACAATTATTGGGCTTTAAAGCATTGCAAGCTCTCAAAATGTCTCAATAT
AAAGCTTCATGTACAGTACGCCAACCAACACACTGGCTTGAGATGTATAAAACTAATAAA
GCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTTTTCTCAATCTTATTCTTAAAACAATGCGC
AATGTATTGGTGGTGCAAATTATTATTGCCAATCATCATCATCCCATTGCATACTTCTGG
GTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTGTCTTGTAGGTGTGAGCTATT
TCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCAGTGAGCATATCGACAGAAGA
ACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCAGAATGTCAAGACAGATGCTG
CCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGAAAGAAACCTTGGGTGGCTTG
AAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAGACAAGAAAAACACCTCCAGAGAATGGGCTA
TCAGTTGGACCCATTATAGTCGCTTGCCAGTGGAACATATCATCACCCACAGGACCAGCA
CTGCATGAGACAGGAGGATCCCTTTGGAGGTCCCTAAGCTCCTTGTTGATTCTTTTCGAA
GAAGCCATCTTGAACTGCGCACTCGCTTTC

QA 7 696 7 696
DS 

RD RR4FV80TF 753 0 0
TTTCATCATAATCATAATAGACAATTATTGGGCTTTAAAGCATTGCAAGCTCTCAAAATG
TCTCAATATAAAGCTTCATGTACAGTACGCCAACCAACACACTGGCTTGAGATGTATAAA
ACTAATAAAGCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTTT*CTCAATCTTATTCTTAAG
ACAATGCGCAATGTATTGGTGGTGCAGATTATTATTGCCAATCATCATCATCCCATTGCA
TACTTCTGGGTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTGTCTTGTAGGTG
TGAGCTATTTCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCAGTGAGCATATC
GACAGAAGAACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCAGAATGTCAAGA
CAGATGCTGCCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGAAAGAAACCTTG
GGTGGCTTGAAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAGACAAGAAAAACACCTCCAGAG
AATGGGCTATCAGTTGGACCCATTATAGTCGCTTGCCAGTGGAACATATCATCACCCACA
GGACCAGCACTGCATGAGACAGGAGGATCCCTTTGGAGGTCCCTAAGCTCCTTGTTGATT
CTTTTCGAAGAAGCCATCTTGAACTGCGCACTCGCT****TTCTTAGGGTTTTTGATTGG
TGATCTTCGGAAATCTCAAGGGGTTGTTGATC
C

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4EJ39TF 643 0 0
AGATGTATAAAACTAATAAAGCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTT**CTCAATC
TTATTCTTAAGACAATGCGCAATGTATTGGTGGTGCAGATTATTATTGCCAATCATCATC
ATCCCATTGCATACTTCTGGGTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTG
TCTTGTAGGTGTGAGCTATTTCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCA
GTGAGCATATCGACAGAAGAACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCA
GAATGTCAAGACAGATGCTGCCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGA
AAGAAACCTTGGGCGGCTTGAAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAGACAAGAAAAA
CACCTCCAGAGAATGGGCTATCAGTTGGACCCATTATAGTCGCTTGCCAGTGGAACATAT
CATCACTCACAGGACCAGCACTGCATGAGACAGGAGGATCCCTTTGGAGGTCCCTAAGCT
CCTTGTTGATTCTTTTCGAAGAAGCCATCTTGAACTGCGCACTCGCTACCTTTCTTAGGG
TTTTTGATTGGTGATCTTCGGAAATCTCAAGGGGTTGTTGATC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4B011TF 748 0 0
TTTT
AATCATAATAGACAATTATTGGGCTTTAAAGCATTGCAAGCTCTCAAAATGTCCCAATAT
AAAGCTTCATGTACAGTACGCCAACCAACACACTGGCTTGAGATGTATAAAACTAATAAA
GCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTTT*CTCAATCTTATTCTTAAGACAATGCGC
AATGTATTGGTGGTGCAGATTATTATTGCCAATCATCATCATCCCATTGCATACTTCTGG
GTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTGTCTTGTAGGTGTGAGCTATT
TCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCAGTGAGCATATCGACAGAAGA
ACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCAGAATGACAAGACAGATGCTG
CCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGAAAGAAACCTTGGGTGGCTTG
AAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAGACAAGAAAAACACCTCCAGAGAATGGGCTA
TCAGTTGGACCCATTATAGTCGCTTGCCAGTGGAACATATCATCACCCACAGGACCAGCA
CTGCATGAGACAGGAGGATCCCTTTGGAGGTCCCTAAGCTCCTTGTTGATTCTTTTCGAA
GAAGCCATCTTGAACTGCGCACTCGCT****TTCTTAGGGTTTTTGATTGGTGATCTTCG
GAAATCTCAAGGGGTTGTTGATCC

QA 5 748 5 748
DS 

RD RR4B011JQ 726 0 0
AATCATAATAGACAATTATTGGGCTTTAAAGCATTGCAAGCTCTCAAAATGTCCCAATAT
AAAGCTTCATGTACAGTACGCCAACCAACACACTGGCTTGAGATGTATAAAACTAATAAA
GCAACCAAGCAAACACCACACTCTGTTTTTTT*CTCAATCTTATTCTTAAAACAATGCGC
AATGTATTGGTGGTGCAAATTATTATTGCCAATCATCATCATCCCATTGCATACTTCTGG
GTCCAGGATCGGGCAGTGCTCTCGTACTTGACTCGGTCTGTCTTGTAGGTGTGAGCTATT
TCTGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTAAGCAGTGAGCATATCGACAGAAAA
ACCTTGGATATGGTAAGTGCAGGGCTCCACTGCTCTTTCAAAATGACAAGACAGATGCTG
CCGTTACTGTTGATATTCGGGTGGTAAACCTTGGTGCGGAAAGAAACCTTGGGTGGCTTG
AAGGGGTAATCTGGTGGGAAGTGAATGGAGACAAGAAAAACACCTCCAGAGAATGGGCTA
TCAGTTGGACCCATTATAGTCGCTTGCCAGTGGAACATATCATCACCCACAGGACCAGCA
CTGCATGAGACAGGAGGATCCCTTTGGAGGTCCCTAAGCTCCTTGTTGATTCTTTTCGAA
GAAGCCATCTTGAACTGCGCACTCGCT****TTCTTAGGGTTTTTGATTGGTGATCTTCG
GAAATC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 6

CO CL1293Contig1 769 6 7 U
TTTTTTTTCTTTAAAGTTAAAATTATGGATATTATATTGAAAGGTGAGAAATGTAATGAC
AAG*TTTCATATTTGCTACAGCGTCTGTTATTAAGCTCGAGAAGCAAAGATAAAAAGCCG
ATGGGGTTTCGGTTTATGTTCACAAGAGATGAAGTCTGGACATGACATTCATCAACAGTT
ATACAGATGGAGCTTGAGTTGCTATTTTGTTTTCTTAAGATGTAACACCATACGGAAGTA
ATGCAGCAGCAACGACCCTTCCTTCTTCATTCAGAATGTTGTAAGTTGATGCAGCATTTC
TAGAATCAACGGTTTCTAGCTTCATCCCGATAGACTTGACAAACTGACGGAGCTCGGGAG
TTACCGGGTGAATGTTTCTTCCACAACCAACAATTAAGAGCTCTGGAATTGGTCGAATTG
TCCGGAAGATAGACAAGCTATCAGGAGTGATGTCGGAGAATTGACGAGGGGTCCATGACA
TAAGCAAGTTCCCAACACAGAGCAAGCTACCTTCGTATTTGACTCCATTCACCGTGAAAC
TCGTCTCATTAAACTCTTGGAAGCGGAGCTGGTCTTCGGGGACATTGTCAATGAGATTGA
TCTGGTCGTAGAGGGAGAACGCTCGTCTCAGAGACGGCAAAACTGGATTGCAATGCTTTG
GAGCTTCTTTCCTCATGCTTTGTATCAGTTTTGGTAAACTCCCCATCGCTTTCACCCTCG
TCGCCATCGTTATTTTTCTCCAGCCTCTGCCTTCTGTGTTCTGTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF09JQ U 13
AF RR4C311JQ U 39
AF RR4D203JQ U 13
AF RR4DF09TF C 1
AF RR4D203TF C 13
AF RR4C311TF C 39
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CTCCCCATCG

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DS 

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CGACCCTTCCTTCTTCATTCAGAATGTTGTAAGTTGATGCAGCATTTCTAGAATCAACGG
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ACAAGCTATCAGGAGTGATGTCGGAGAATTGACGAGGGGTCCATGACATAAGCAAGTTCC
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CC

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CGACCCTTCCTTCTTCATTCAGAATGTTGTAAGTTGATGCAGCATTTCTAGAATCAACGG
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ACAAGCTATCAGGAGTGATGTCGGAGAATTGACGAGGGGTCCATGACATAAGCAAGTTCC
CAACACAGAGCAAGCTACCTTCGTATTTGACTCCATTCACCGTGAAACTCGTCTCATTAA
ACTCTTGGAAGCGGAGCTGGTCTTCGGGGACATTGTCAATGAGATTGATCTGGTCGTAGA
GGGAGAACGCTCGTCTCAGAGACGGCAAAACTGGATTGCAATGCTTTGGAGCTTCTTTCC
TCATGCTTTGTATCAGTTTTGGTAAACTCCCCATCGCTTTCACCCTCGTCGCCATCGTT
CC

QA 1 719 1 719
DS 

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GACATGACATTCATCAACAGTTATACAGATGGAGCTTGAGTTGCTATTTTGTTTTCTTAA
GATGTAACACCATACGGAAGTAATGCAGCAGCAACGACCCTTCCTTCTTCATTCAGAATG
TTGTAAGTTGATGCGGCATTTCTAGAATCAACGGTTTCTAGCTTCATCCCGATAGACTTG
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AATTGACGAGGGGTCCATGACATAAGCAAGTTCCCAACACAGAGCAAGCTACCTTCGTAT
TTGACTCCATTCACCGTGAAACTCGTCTCATTAAACTCTTGGAAGCGGAGCTGGTCTTCG
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TTCTGTCCTCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 5

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CTTCTTCAGTAACAAGGGATCAGTTGTCAAAAGTGATTCCGAATGGTGATGTTGATGTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT76TF U 1
AF RR4BT76JQ C 32
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BS 581 637 RR4BT76JQ

RD RR4BT76TF 580 0 0
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GCATCTTCACAAAACTTCTTAAAAGCCATTCTTCTCGATT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4BT76JQ 606 0 0
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TTCTCGATTTAAGGTTACAAGTAACTGTTGCGGCTGAAGATTAGTCTGTTGCATATTGTA
TAGTTT

QA 1 606 1 606
DS 



CO CL1294Contig2 962 3 13 U
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TGGTCTCATCGATGGACACTTGCATCTATACCGTTACGGAGTCTTGCAGAGCTGTTCGGT
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ATAAACAGAAACTTTTGAATTGCAGATTGATCTCATAATTAACTGATGGGTTCCAAAATC
GTCTTTCGATCCCTCACCGAGTTATTCCCACAGATTGATGCAAGGATTCTAAAAGCTGTA
GCCATTGAGCACCCTAAAGATGCTGATGTTGCTGCAGCTATTGTTATCTCTGAGATTGTT
CCCAAGTTTTACCCTGATTTGGCTGATGATCCTTCTTCCCAACCTGACAACAAGACACCA
GTGAAGGTCCCAGACAACAAAGTAGGACATGATATGGCAATTAGTGCGTCCTCTTCTTCA
GTAACAA*GGGATCAGTTGTCAAAAGTGATTCCGAATGGTGATGTTGATGTTCAGAGCAA
AGCTCCGCGTGATTACAGAAGAATCAGTAGAAGTTGATGATACCAAGAGTTACGTTAGAG
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CACAAAACTTCTTAAAAGCCATTCTTCTCGATTTAAGGTTACAAGTAACTGTTGCGGCTG
AAGATTAGTCTGTTGCATATTGTATAGTTTCTGCTCTGAGTCATTCTTCTCGAAGATTAG
TCTGTTGCATATTGTATAGTTTTTGCTCTGAGTCATTCTTCTCGCAAGTTTTTGCTCTTA
GACTTATGTGCATACAATATAACAAAGTTTAAATTCCTAAGGACTCTATCTTGAGTTACA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RR4H677TF U 1
AF RR4AO52TF U 66
AF RR4FG39JQ C 413
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TGTAGTTGTTGGCTTTACATTTTATTCTTTGTCATAGGTTTATGGATGGTTGTTAACCCT
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GG
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GTCGGCTT*ACATTTTATTCTTTGTCATAGGTTTATGGATGGTTGTTAACCCTATAAACA
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GATCCCTCACCGAGTTATTCCCACAGATTGATGCAAGGATTCTAAAAGCTGTAGCTATTG
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ACA

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CTTCTTCAGTAACAA*GGGATCAGTTGTCAAAAGTGATTCCGAATGGTGATGTTGATGTT
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TGCATCTTCACAAAACTTCTTAAAAGCCATTCTTCTCGATTTAAGGTTACAAGTAACTGT
TGCGGCTGAAGATTAGTCTGTTGCATATTGTATAGTTTCTGCTCTGAGTCATTCTTCTCG
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TGCTCTTAGACTTGTGTGCATACAATATAACAAAGTTTAAATTCCTAAGGACTCTATCTT
GAGTTACACC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 5

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AGTAAATGCACTGAATCCTTAAAAGTAAACCAAAATCATCAAAGATAAAGCAAAAACACA
CACAGAAAGCCAGCTAAGCAAAGTGACTCTAGGTCCACCATGTAAATCAACGGCGGCGGC
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AATGCCTTAGCCTCCCATTTTGCTCCCTCATGTATCCCTTACACAAGAAAGTCGCCGAGA
ACTCATCTTCCACCGG*ACGGTTAACGTCGTGAACAAAAACGTCAGTTTCTCCATCTTCA
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TCCTCAATAAACAAGGTACGTCCACCGTGGTTGAGAGATGCCCACATCAAGCTGTCATGA
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GAGACTTCGTCGAATGTCTGTTGTGGAGTGACGTTACTGGTGACGTAGTGAACCAATGCG
TCGGATAAAGATATTGGCATCTTTGTGCATTGTTTTGTTGATGGACAATACGTCTGATTT
TCTTCTTCTTCTTGAGAGAGATGTGTTTTGGAAAGGGGCCTTGAGGAGGAAGAAGAGATG
TTTGATCTTGCAAAGAAGATAATGAGAAAGATCAAGATTGAGCAGCATGTGAATATGACC
TTCAGATTAACAGAAGACTGAGATTTGGTCCTCATTTTTCAATCTTTGTTTTGATCGACG
AATGCAACAATGAAAGGATCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F650JQ U 1
AF RR4GS43JQ U 13
AF RR4AF67JQ U 28
AF RR4AF67TF C 272
AF RR4GS43TF C 409
BS 1 64 RR4F650JQ
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BS 66 366 RR4F650JQ
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BS 368 631 RR4F650JQ
BS 632 733 RR4GS43JQ
BS 734 870 RR4AF67JQ
BS 871 1101 RR4AF67TF

RD RR4F650JQ 631 0 0
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AGTAGATGCACTGAATCCTTAAAAGTAAACCAAAATCATCAAAGATAAAGCAAAAACACA
CACAGAAAGCCAGCTAAGCAAAGTGACTCTAGGTCCACCATGTAAATCAACGGCGGCGGC
GATCAACATCCACAGGACAAAACGGTCTTCCAGCTCGAGCCCTGTGACTAGGGATGGTGA
AATGCCTTAGCCTCCCATTTTGCTCCCTCATGTATCCCTTACACAAGAAAGTCGCCGAGA
ACTCATCTTCCACCGG*ACGGTTAACGTCGTGAACAAAAACGTCAGTTTCTCCATCTTCA
CGGTTGAGAGCCAAAAGCCCCGCCGTGTAGATAGCGCTCATCCTCCCTGGAGCTTCCTCG
TGGTAACCAGTTGGAGCATCTACCATGATCAGATCCCATTTCGTCTCGTAAAAATCTGCC
GGAAAATCTTTCAACGCTAGATCACATTTCGAGTTTCTTGGGTCGGAGACGGATTTGCAC
TCCTCTGATCTTCCTAGCTCCATCAGCTTGTCTGAATTTTTCACTTTGGTGTCGTAAACG
ACGTGGTAAGCTTCCAAGTTTGGGAACTTCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4GS43JQ 721 0 0
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GAATCCTTAAAAGTAAACCAAAATCATCAAAGATAAAGCAAAAACACACACAGAAAGCCA
GCTAAGCAAAGTGACTCTAGGTCCACCATGTAAATCAACGGCGGCGGCGATCAACATCCA
CAGGACAAAACGGTCTTCCAGCTCGAGCCCTGTGACTAGGGATGGTGAAATGCCTTAGCC
TCCCATTTTGCTCCCTCATGTATCCCTTACACAAGAAAGTCGCCGAGAACTCATCTTCCA
CCGG*ACGGTTAACGTCGTGAACAAAAACGTCAGTTTCTCCATCTTCACGGTTGCGAGCC
AAAAGCCCCGCCGTGTAGATAGCGCTCATCCTCCCTGGAGCTTCCTCGTGGTAACCAGTT
GGAGCATCTACCATGATCAGATCCCATTTCGTCTCGTAAAAATCTGCCGGAAAATCTTTC
AACGCTAGATCACATTTCGAGTTTCTTGGGTCGGAAACGGATTTGCACTCCTCTGATCTT
CCTAGCTCCATCAGCTTGTCTGAATTTTTCACTTTGGTGTCGTAAACGACGTGGTAAGCT
TCCAAGTTTGGGAACTTCTTAGTCACAGTCTCGATCCAAGCCTTATCTTCCTCAATAAAC
AAGGTACGTCCACCGTGGTTGAGAGATGCCCACATCAAGCTGTCATGACCTAAACCAAAG
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AF67JQ 843 0 0
GG
AGAAAAGAAAACTACATTAATACATCGTTTCAGTAAATGCACTGAATCCTTAAAAGTAAA
CCAAAATCATCAAAGATAAAGCAAAAACACACACAGAAAGCCAGCTAAGCAAAGTGACTC
TAGGTCCACCACGTAAATCAACGGCGGCGGCGATCAACATCCACAGGACAAAACGGTCTT
CCAGCTCGAGCCCTGTGACTAGGGATGGTGAAATGCCTTAGCCTCCCATTTTGCTCCCTC
ATGTATCCCTTACACAAGAAAGTCGCCGAGAACTCATCTTCCACCGG*ACGGTTAACGTC
GTGAACAAAAACGTCAGTTTCTCCATCTTCACGGTTGCGAGCCAAAAGCCCCGCCGTGTA
GATAGCGCTCATCCTCCCTGGAGCTTCCTCGTGGTAACCAGTTGGAGCATCTACCATGAT
CAGATCCCATTTCGTCTCGTAAAAATCTGCCGGAAAATCTTTCAACGCTAGATCACATTT
CGAGTTTCTTGGGTCGGAGACGGATTTGCACTCCTCTGATCTTCCTAGCTCCATCAGCTT
GTCTGAATTTTTCACTTTGGTGTCGTAAACGACGTGGTAAGCTTCCAAGTTTGGGAACTT
CTTAGTCACAGTCTCGATCCAAGCCTTATCTTCCTCAATAAACAAGGTACGTCCACCGTG
GTTGAGAGATGCCCACATCAAGCTGTCATGACCTAAACCAAAGACGAGGAAGTTACATGG
AGACTTCTTGTCCAACACTCTCTTTGAGACAGAGACTTCGTCGAATGTCTGTTGTGGAGT
GACGTTACTGGTGACGTAGTGAACCAATGCGTCGGATAAAGATATTGGCATCTTTGTGCA
T

QA 3 843 3 843
DS 

RD RR4AF67TF 830 0 0
TGTAT
CCTTACACAAGAAAGTCGCCGAGAACTCATCTTCCACCGGGACGGTTAACGTCGTGAACA
AAAACGTCAGTTTCTCCATCTTCACGGTTGCGAGCCAAAAGCCCCGCCGTGTAGATAGCG
CTCATCCTCCCTGGAGCTTCCTCGTGGTAACCAGTTGGAGCATCTACCATGATCAGATCC
CATTTCGTCTCGTAAAAATCTGCCGGAAAATCTTTCAACGCTAGATCACATTTCGAGTTT
CTTGGGTCGGAGACGGATTTGCACTCCTCTGATCTTCCTAGCTCCATCAGCTTGTCTGAA
TTTTTCACTTTGGTGTCGTAAACGACGTGGTAAGCTTCCAAGTTTGGGAACTTCTTAGTC
ACAGTCTCGATCCAAGCCTTATCTTCCTCAATAAACAAGGTACGTCCACCGTGGTTGAGA
GATGCCCACATCAAGCTGTCATGACCTAAACCAAAGACGAGGAAGTTACATGGAGACTTC
TTGTCCAACACTCTCTTTGAGACAGAGACTTCGTCGAATGTCTGTTGTGGAGTGACGTTA
CTGGTGACGTAGTGAACCAATGCGTCGGATAAAGATATTGGCATCTTTGTGCATTGTTTT
GTTGATGGACAATACGTCTGATTTTCTTCTTCTTCTTGAGAGAGATGTGTTTTGGAAAGG
GGCCTTGAGGAGGAAGAAGAGATGTTTGATCTTGCAAAGAAGATAATGAGAAAGATCAAG
ATTGAGCAGCATGTGAATATGACCTTCAGATTAACAGAAGACTGAGATTTGGTCCTCATT
TTTCAATCTTTGTTTTGATCGACGAATGCAACAATGAAAGGATCC

QA 6 830 6 830
DS 

RD RR4GS43TF 679 0 0
GGAGCTTCCTCGTGGTAACCAGTTGGAGCATCTACCATGATCAGATCCCATTTCGTCTCG
TAAAAATCTGCCGGAAAATCTTTCAACGCTAGATCACATTTCGAGTTTCTTGGGTCGGAG
ACGGATTTGCACTCCTCTGATCTTCCTAGCTCCATCAGCTTGTCTGAATTTTTCACTTTG
GTGTCGTAAACGACGTGGTAAGCTTCCAAGTTTGGGAACTTCTTAGTCACAGTCTCGATC
CAAGCCTTATCTTCCTCAATAAACAAGGTACGTCCACCGTGGTTGAGAGATGCCCACATC
AAGCTGTCATGACCTAAACCAAAGACGAGGAAGTTACATGGAGACTTCTTGTCCAACACT
CTCTTTGAGACAGAGACTTCGTCGAATGTCTGTTGTGGAGTGACGTTACTGGTGACGTAG
TGAACCAATGCGTCGGATAAAGATATTGGCATCTTTGTGCATTGTTTTGTTGATGGACAA
TGCGTCTGATTTTCTTCTTCTTCTTGAGAGAGATGTGTTTTGGAAAGGGGCCTTGAGGAG
GAAGAAGAGATGTTTGATCTTGCAAAGAAGATAATGAGAAAGATCAAGATTGAGCAGCAT
GTGAATATGACCTTCAGATTAACAGAAGACTGAGATTTGGTCCTCATTTTTCAATCTTTG
TTTTGATCGACGAATGCAA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 6

CO CL1296Contig1 1123 6 7 U
GGAAGCAAAAATAAGCAGGGACATTATAGAAGAAGAAGAAAAAGAATAAGGGAGAGATGA
CGGTCATAAATATTATCTTCAGAGTCGATGAGATATGCAAGAAGTACGACAAGTACGACG
TCGACAAGCAGCGTGAGCTCGGCGCTTCCGGAGACGATGCCTTCTCCCGTCTCTTTAACT
CCATTGATACCGATATTGAATCCGTTGTACATAAAGCGGAGTTGGCATCAACAGAGAGCA
ACAGAGCTGCAGCTGTGGCCTTGAATGCTGAGGTTCGAAGGACAAAAGCTCGTTTAGCTG
AAGATGTTGTTAAACTGCAGAAACTCGCCGTTAAAAAGGTCAAAGGGCTCACAAAAGAGG
AACGAGAGTCCCGATGTGATCTAGTTATCGCGCTAGCCGATAGGATTCAAGTGATACCTG
ACGGACATGAAAGACAATCTAATAATGAATGGGGAGGTGCCCCCAACAAGAACATCAAGT
TTGATATATCTGAGGAAGATATGGATGATGGGTTTTTCCAGCAAACTGAAGAATCCAGCC
AGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAGAAGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATAT
CAGAAGGTTTGGACGCACTGAAGAACTTAGCACGTGACATGAACGAGGAACTTGACAAGC
AAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAACAAAGGTTGATGGAGCAACTTCGGATTTGAAGA
ACACCAATGTTCGGCTCAAGCAACAGCTTGTAAAGATGAGATCGAGCCGCAACTTCTGCA
TCGACATTATTCTTCTCTGTGTGGTCCTTGGAATCATCTCTTACATCTATAATGCCCTGA
GCTAAAGTTGGGGAGGGCAGATACCGGATATTCTCATTGCCATTGTCAAGCCTATGGTAA
CTTCTTACCAAAGTAATAATAGTCATTTCCTGGAGAGCAAGCAAACAAGTTATTTTCACA
AGCTTTTACCATTTGTATACAGTTTTAAGGAATTATTCTTGGCAAGAAATAATACATATG
CACAAGGTTCGCTGTTGTAGTTGTGTTTGTTTTGTTGGGCGATTTATTTTGTTGAATCAG
AATGTTTTAGCGTTTCCAAGTATCATAAATTTGTAAGAAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI77TF U 1
AF RR4DQ05TF U 16
AF RR4AH30TF U 518
AF RR4DQ05JQ C 264
AF RR4GI77JQ C 345
AF RR4FP16TF U 513
BS 1 604 RR4GI77TF
BS 605 691 RR4DQ05TF
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BS 862 1123 RR4FP16TF

RD RR4GI77TF 604 0 0
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CGGTCATAAATATTATCTTCAGAGTCGATGAGATATGCAAGAAGTACGACAAGTACGACG
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CCATTGATACCGATATTGAATCCGTTGTACATAAAGCGGAGTTGGCATCAACAGAGAGCA
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AAGATGTTGTTAAACTGCAGAAACTCGCCGTTAAAAAGGTCAAAGGGCTCACAAAAGAGG
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ACGGACATGAAAGACAATCTAATAATGAATGGGGAGGTGCCCCCAACAAGAACATCAAGT
TTGATATATCTGAGGAAGATATGGATGATGGGTTTTTCCAGCAAACTGAAGAATCCAGCC
AGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAGAAGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATAT
CAGA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4DQ05TF 676 0 0
GG
GGGACATTATAGAAGAAGAAGAAAAAGAATAAGGGAGAGATGACGGTCATAAATATTATC
TTCAGAGTCGATGAGATATGCAAGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAGCAGCGTGAG
CTCGGCGCTTCCGGAGACGATGCCTTCTCCCGTCTCTTTAACTCCATTGATACCGATATT
GAATCCGTTGTACTTAAAGCGGAGTTGGCATCAACAGAGAGCAACAGAGCTGCAGCTGTG
GCCTTGAATGCTGAGGTTCGAAGGACAAAAGCTCGTTTAGCTGAAGATGTTGTTAAACTG
CAGAAACTCGCCGTTAAAAAGGTCAAAGGGCTCACAAAAGAGGAACGAGAGTCCCGATGT
GATCTAGTTATCGCGCTAGCCGATAGGATTCAAGTGATACCTGACGGACATGAAAGACAA
TCTAATAATGAATGGGGAGGTGCCCCCAACAAGAACATCAAGTTTGATATATCTGAGGAA
GATATGGATGATGGGTTTTTCCAGCAAACTGAAGAATCCAGCCAGTTTCGACAAGAATAT
GAAATGAGAAAAAAGAAGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATATCAGAAGGTTTGGACGCA
CTGAAGAACTTAGCACGTGACATGAACGAGGAACTTGACAAGCAAGTCCCATTGATGGAT
GAAATGGAAACAAA

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR4AH30TF 174 0 0
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GGACGAGGGCCTTGATGTTATATCAGAAG*TTTGGACGCACTGAAGAACTTAGCACGTGA
CATGAACGAGGAACTTGACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAACAAA

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR4DQ05JQ 851 0 0
AATGCTGAGGTTCGAAGGACAAAAGCTCGTTTAGCTGAAGATGTG**TAAACTGCAGAAA
CTCGCCGTTAAAA*GGTCAAAGGGCTCACAAA*GAGGAACGAGAGTCCCGATGTGATCTA
GTTATCGCGCTAGCCGATAGGATTCAAGTGATACCTGACGGACATGAAAGACAATCTAAT
AATGAATGGGGAGGTGCCCCCAACAAGAACATCAAGTTTGATATATCTGAGGAAGATATG
GATGATGGGTTTTTCCAGCAAACTGAAGAATCCAGCCAGTTTCGACAAGAATATGAAATG
AGAAAAAAGAAGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATATCAGAAGGTTTGGACGCACTGAAG
AACTTAGCACGTGACATGAACGAGGAACTTGACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATG
GAAACAAAGGTTGATGGAGCAACTTCGGATTTGAAGAACACCAATGTTCGGCTCAAGCAA
CAGCTTGTAAAGATGAGATCGAGCCGCAACTTCTGCATCGACATTATTCTTCTCTGTGTG
GTCCTTGGAATCATCTCTTACATCTATAATGCCCTGAGCTAAAGTTGGGGAGGGCAGATA
CCGGATATTCTCATTGCCATTGTCAAGCCTATGGTAACTTCTTACCAAAGTAATAATAGT
CATTTCCTGGAGAGCAAGCAAACAAGTTATTTTCACAAGCTTTTACCATTTGTATACAGT
TTTAAGGAATTATTCTTGGCAAGAAATAATACATATGCACAAGGTTCGCTGTTGTAGTTG
TGTTTGTTTTGTTGGGCGATTTATTTTGTTGAATCAGAATGTTTTAGCGTTTCCAAGTAT
CATAAATTTGT

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4GI77JQ 757 0 0
GGGCTCACA
AAAGAGGAACGAGAGTCCCGATGTGATCTAGTTATCGCGCTAGCCGATAGGATTCAAGTG
ATACCTGACGGACATGAAAGACAATCTAATAATGAATGGGGAGGTGCCCCCAACAAGAAC
ATCAAGTTTGATATATCTGAGGAAGATATGGATGATGGGTTTTTCCAGCAAACTGAAGAA
TCCAGCCAGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAGAAGCAGGACGAGGGCCTTGAT
GTTATATCAGAAGGTTTGGACGCACTGAAGAACTTAGCACGTGACATGAACGAGGAACTT
GACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAACAAAGGTTGATGGAGCAACTTCGGAT
TTGAAGAACACCAATGTTCGGCTCAAGCAACAGCTTGTAAAGATGAGATCGAGCCGCAAC
TTTTGCATCGACATTATTTTTCTCTGTGTGGTCCTTGGAATCATTTCTTACATCTATAAT
GCCCTGAGCTAAAGTTGGGGAGGGCAGATACCGGATATTCTCATTGCCATTGTCAAGCCT
ATGGTAACTTCTTACCAAAGTAATAATAGTCATTTCCTGGAGAGCAAGCAAACAAGTTAT
TTTCACAAGCTTTTACCATTTGTATACAGTTTTAAGGAATTATTCTTGGCAAGAAATAAT
ACATATGCACAAGGTTCGCTGTTGTAGTTGTGTTTGTTTTGTTGGGCGATTTATTTTGTT
GAATCAGAATGTTTTAGCGTTTCCAAGT

QA 10 757 10 757
DS 

RD RR4FP16TF 611 0 0
TTTTTCCAGCAAT*TGAAGAATCCAGCCAGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAG
AAGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATATCAGAAGGTTTGGATGCACTGAAGAACTTAGCA
CGTGACATGAACGAGGAACTTGACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAACAAAG
GTTGATGGAGCAACTTCGGATTTGAAGAACACCAATGTTCGGCTCAAGCAACAGCTTGTA
AAGATGAGATCGAGCCGCAACTTCTGCATCGACATTATTCTTCTCTGTGTGGTCCTTGGA
ATCATCTCTTACATCTATAATGCCCTGAGCTAAAGTTGGAGAGGGCAGCTACCGGATATT
CTCATTGCCATTGTCAAGCCTATGGTAACTTCTTACCAAAGTAATAATAGTCATTTCCTG
GAGAGCAAGCAAACAAGTTATTTTCACAAGCTTTTACCATTTGTATACAGTTTTAAGGAA
TTATTCTTGGCAAGAAATAATACATATGCACAAGGTTCGCTGTTGTAGTTGTGTTTGTTT
TGTTGGGCGATTTATTTTGTTGAATCAGAATGTTTTAGCGTTTCCAAGTATCATAAATTT
GTAAGAAATGG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 6

CO CL1297Contig1 1323 6 15 U
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GGACACGCCATCGACGAGCTCGGCAACACGGTGATAAAAGGCACGGCTGAGATCATCGCT
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AATAGAAATAGTAATCGTCGTGATAGCTTTAGCTCGAAGCCGTATAGTCGTTTCGATGCT
CAGGTTCGCGCCGTTCAAGGAGATGTCGGTACTTATAGTGAAGAGCCTGACGAGGATTCG
GATGAATATAGGAAGTGGGAAGCTGAGTTTTCAATTGGAGATAGGAGCGAGGAGATGGAG
ATGTTGTTGGAAGGGAATGGAGAGATGAGAGGAGTGTATAAGAGGGTTGTTCCTAGTGTG
GTTGATCATGAGACGTTTTGGTTTAGGTATTTTTATAAGGTTTATAAGCTCAAGCAAGCT
GAAGACTTGAGGGCTAATCTTGTGAAACGAGCAGCTTTGGATGATGAGGAAGAGTTGAGC
TGGGATATTGATGATGAAGAGGAGACTGCTAGCGAGAAAGTTGATGAAGTTGCCAAAGAT
GTTTCGAGATTGAAACTTGAGGGGAATGATAGTGGAGACGTTAGCGAAACTGTGAAGGAT
TCAGTGACTGAAAAGAGCGTTAAAGATGATGTGACAAGTGCAGATTCAGTGTCTGAAGTG
AGCAATGCTGGTTTGAACACAGAAACAGATTCTGAGGTGAAGAAGGAAACTGGTAGTGAG
AAAGCTCCAGAATCAATAGTAGTTGCTGATGCTGCTGCTCCTCCTGCATCTGATGAGTCT
CCAGCTCAAGATCCGGGCAAAAAACAGGAAGCTGTTCAAGAATCTGTTGAGAGTGCTCCG
TCCCAAGAAGACTCAGACAAACCAGATGGCGCTGCCTCTTCGTTAGCTCAAGGCTCAGGT
AAGCCAGATGGTGCTGCTTCTTCAACAGCTCAAGAAGAGGATTTGGGATGGGATGAGATA
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AGAGCTGAGCTGCGTAAACGCCTGAGTGCTGCAGAGGAAGATGAGGACTTAAGCTGGGAC
ATTGAAGATGACGACGAAGAATCATCACCATCATCAAAAACTTAATCTAGTATCATAGTG
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CGTTCTGTTAAAATTTGATATATGCAAACATTTGATTTGAATCCGAAATTCCACATTCAA
TGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

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DS 

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G
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G
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GATGAATATAGGAAGTGGGAAGCTGAGTTTTCAATTGGAGATAGGAGCGAGGAGATGGAG
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GAAGACTTGAGGGCTAATCTTGTGAAACGAGCAGCTTTGGATGATGAGGAAGAGTTGAGC
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GTTTCGAGATTGAAACTTGAGGGGAATGATAGTGGAGACGTTAGCGAAACTGTGAAGGAT
TCAGTGACTGAAAAGAGCGTTAAAGATGATGTGACAAGTGCAGATTCAGTGTCTGAAGTG
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CCAGCTCAAGATCCGGGCAA

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TGATCATGAGACGTTT*GGTTTAG*TATTTT*ATAAGGTTTATAAGCTCAAGCAAGCTGA
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TGAAGATGACGACGAATAATCATCACCATCATCAAAAACTTAATCTAGTATCATAGTGGT
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TTCTGTTAAAATTTGATATATGCAAACATTTGATTT
C

QA 8 883 8 883
DS 

RD RR4CE68JQ 753 0 0
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ATGTGACAAGTGCAGATTCAGTGTCTGAATTGATCAATGCTGGTTTGAACACAGAAACAG
ATTCTGAGGTGAAGAAGGAAACTGGTAGTGAGAAAGCTCCAGAATCAATAGTAGTTGCTG
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DS 

RD RR4E271JQ 763 0 0
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AGAAACAGATTCTGAGGTGAAGAAGGAAACTGGTAGTGAGAAAGCTCCAGAATCAATAGT
AGTTGCTGATGCTGCTGCTCCTCCTGCATCTGATGAGTCTCCAGCTCAAGATCCGGGCAA
AAAACAGGAAGCTGTTCAAGAATCTGTTGAGAGTGCTCCGTCCCAAGAAGACTCAGACAA
ACCAGATGGCGCTGCCTCTTCGCTAGCTCAAGGCTCAGGTAAGCCAGATGGTGCTGCTTC
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CCTGAGTGCTGCAGAGGAAGATGAGGACTTAAGCTGGGACATTGAAGATGACGACGAAGA
ATCATCACCATCATCAAAAACTTAATCTAGTATCATAGTGGTGTTGTTTTTTGTAAGTTT
CTGGTAATTTTCTTTCATTCTTCTGTTGTTATCTCTTTAACGTTCTGTTAAAATTTGATA
TATGCAAACATTTGATTTGAATCCGAAATTCCACATTCAATGG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 2 5

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AAGTCAGCGTGTCGCTAGATGGAGTCAGAGACAAAAACATGATGCAGCTTAAGAAACTCA
ACACTGTGCTCTTCCCGGTTCGCTACAACGACAAGTACTACGCTGATGCGATTGCATCCG
GCGAGTTCACTAAGCTTGCTTATTACAGTGATATATGTGTTGGAGCTATTGCTTGTCGGC
TGGAGAAGAAAGAAGGCGGGGCCATGAGAGTGTATATAATGACACTTGGTGTTCTTGCAC
CATACCGCGGCATTGGCATTGGTTCAAAGCTACTGAATCATGTTCTTGAGATGTGCTCCA
AGCAGAACATGTCGGAAATATACTTGCATGTTCAGACAAACAACGAAGATGCGATCAAGT
TCTACAAGAAATTTGGTTTTGAGATCACAGATACCATACAAGACTATTACGTCAACATCG
AGCCTAGAGATTGCTATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAACCGAAGCCAGCAAATGATG
ACAATACGTTACTTCGGGAAGCCATTCTTTCCCGCCAGTTTGTTTGTTTCACTGAAGATT
CCATTCTTGAAGTTCTGATGTTTTGGTTTCGTGAGTTTTACTTGTTTTGATTACCCCAAA
GTTATAGATACATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGGTTTTGGACCTCTTAGTTGGGGAGGTG
TTAACTTTGCAGCTCTCAATCATTATTACAACAC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS84TF U 1
AF RR4BS84JQ C 4
BS 1 702 RR4BS84TF
BS 703 754 RR4BS84JQ

RD RR4BS84TF 707 0 0
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TCTACAAGAAATTTGGTTTTGAGATCACAGATACCATACAAGACTATTACGTCAACATCG
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CCATTCTTGAAGTTCTGATGTTTTGGTTTCGTGAGTTTTACTTGTTTTGATTACCCCAAA
GTTATAGATACATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGGTTTTGGAC
CTCTT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BS84JQ 751 0 0
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CTGTGCTCTTCCCGGTTCGCTACAACGACAAGTACTACGCTGATGCGATTGCATCCGGCG
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ACCGCGGCATTGGCATTGGTTCAAAGCTACTGAATCATGTTCTTGAGATGTGCTCCAAGC
AGAACATGTCGGAAATATACTTGCATGTTCAGACAAACAACGAAGATGCGATCAAGTTCT
ACAAGAAATTTGGTTTTGAGATCACAGATACCATACAAGACTATTACGTCAACATCGAGC
CTAGAGATTGCTATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAACCGAAGCCAGCAAATGATGACA
ATACGTTACTTCGGGAAGCCATTCTTTCCCGCCAGTTTGTTTGTTTCACTGAAGATTCCA
TTCTTGAAGTTCTGATGTTTTGGTTTCGTGAGTTTTACTTGTTTTGATTACCCCAAAGTT
ATAGATACATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGGTTTTGGACCTCTTAGTTGGGGAGGTGTTA
ACTTTGCAGCTCTCAATCATTATTACAACAC

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL1298Contig2 805 3 15 U
GGGATCTTTCTTTCTCTAGTCGAAGACGACGAATCTATATTTCTCTCGCAAATCTAGATT
GTTCGTGTAGAGAGAGAGAGGAAGACGGCGATGGGAAGTGGGCGAGAAGTCAGCGTGTCG
CTAGATGGAGTCAGAGACAAAAACATGATGCAGCTTAAGAAACTCAACACTGTGCTCTTC
CCGGTTCGCTACAACGACAAGTACTACGCTGATGCCATCGCATCCGGCGAGTTCACTAAG
CTTGCTTATTACAGTGATATATGTGTTGGAGCTATTGCTTGTCGGCTGGAGAAGAAAGAA
GGCGGGGCCATGAGAGTGTATATAATGACACTTGGTGTTCTTGCTCCATACCGCGGCATT
GGCATTGGTTCAAAGCTACTGAATCATGTTCTTGAGATGTGCTCCAAGCAGAACATGTCG
GAAATATACTTGCATGTTCAGACAAACAACGCAGATGCGATCAAGTTCTACAAGGAATTT
GGGTTTGAGATCACAGATACCACACAAGACTATTACGTCAACATCGAGCCTAGAGATTGC
TATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAATCTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACT
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CATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGGTTTTGGACTTCTGGGTTGGGGAGGTGTTAACTTTGC
AGCTCTCAATCATTATTACTACTCG


BQ
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK09TF U 1
AF RR4CK09JQ C 1
AF RR4CU10TF U 109
BS 1 108 RR4CK09TF
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BS 785 805 RR4CK09JQ

RD RR4CK09TF 748 0 0
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G

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4CK09JQ 805 0 0
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CTAGATGGAGTCAGAGACAAAAACATGATGCAGCTTAAGAAACTCAACACTGTGCTCTTC
CCGGTTCGCTACAACGACAAGTACTACGCTGATGCCATCGCATCCGGCGAGTTCACTAAG
CTTGCTTATTACAGTGATATATGTGTTGGAGCTATTGCTTGTCGGCTGGAGAAGAAAGAA
GGCGGGGCCATGAGAGTGTATATAATGACACTTGGTGTTCTTGCTCCATACCGCGGCATT
GGCATTGGTTCAAAGCTACTGAATCATGTTCTTGAGATGTGCTCCAAGCAGAACATGTCG
GAAATATACTTGCATGTTCAGACAAACAACGCAGATGCGATCAAGTTTTACAAGGAATTT
GGGTTTGAGATCACAGATACCACACAAGACTATTACGTCAACATCGAGCCTAGAGATTGC
TATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAATCTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACT
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QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4CU10TF 678 0 0
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TGTTA*CTTTGCAGCT
CT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 6

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CTTCTTGAAGCCGATCGTGGAGATAGGCTTCATTAAAACCATCTTGGAGTCTTACCTCCC
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CTTCTCGGTCTTGAACGTCTTCATCGGTGTAACCCTCGCAGGGTCTTTGTTCCAGAATTT
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GCTGTCTAGGATCATACCTTTGATAATATTCCACCTGAAAAAGAAGTATCTATGCAAAAC
CGAAGCAGAGGTCAAAGAAGCTTGGTATCCAGGAGACTTGAGCTACGCGACTAGGGTTCC
CAGTGACATGCTCATCCTCACTATCACCTTCTGCTACTCCGTAATCGCTCCTCTTATCCT
CGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGCTGGCTCATCCTTAGAAACCAGGCTTTGAA
AGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCAT
TCTAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAACTGGTTATGTTTGGTTACTTGGGAGTCAAGCTAAT
CGTTTGGGCGACTCTCTTGGTTCCTCTCATCTTCATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTGTG
CCGCCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGAACACACGGCTCTGGAGGTGGCTTGCCGTGAGCT
GAAGACGAGACCGGACCTCGAGGAGGTTTTCAGGGCGTACATCCCGCATAGCTTGAACAC
TCACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGCCATGTCTCGTTATCAAGACTATGCTGC
GATATCAGCCGCTTAAACATTTGAATCCTTATTATTATCTCACAGATTTGTTTTTTTTCT
TTTAGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGATTTTAGGGTTTGTTTAGGGTTTTTTCGTTT
GTATGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTGTAACCCATGCAAGCTACGCTTTAATTATCA
ACTTCGTCAGTCTTCGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4DS35TF U 28
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AF RR4DS35JQ C 366
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G
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GTAACCCTCGCAGGGTCTTTGTTCCAGAATTTGAAGGCTCTTGAGAAGAAACCGAACTCT
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TTCTGCTACTCCGTAATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGT

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CTTCTCGGTCTTGAACGTCTTCATCGGTGTAACCCTCGCAGGGTCTTTGTTCCAGAATTT
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GAACGCTACTTTCTTCTTGACCTACGTTGCTCTCAAGTTCTTTGTTGGTTATGGCCTGGA
GCTGTCTAGGATCATACCTTTGATAATATTCCACCTGAAAAAGAAGTATCTATGCAAAAC
CGAAGCAGAGGTCAAAGAAGCTTGGTATCCAGGAGACTTGAGCTACGCGACTAGGGTTCC
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CGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAG*CTGGCTCATCCTTAGAAACCAGGCTTTGAA
AGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCAT
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CGTTTGGGCGACT

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DS 

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G
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CAAGTTCTTTGTTGGTTATGGCCTGGAGCTGTCTAGGATCATACCTTTGATAATATTCCA
CCTGAAAAAGAAGTATCTATGCAAAACCGAAGCAGAGGTCAAAGAAGCTTGGTATCCAGG
AGACTTGAGCTACGCGACTAGGGTTCCCAGTGACATGCTCATCCTCACTATCACCTTCTG
CTACTCCGTAATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGCTG
GCTCATCCTTAGAAACCAGGCTTTGAAAGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAG
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CATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTGTGCCGCCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGAACACAC
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G*CGTACATCCCGCATAGCTTGAACACTCACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGC
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*ATATCTCACAGATTTGTTTTTTT
CT

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ACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCATTCTAG
CGGCATTGTTTCTGTTCCAACTGGTTATGTTTGGTTACTTGGGAGTCAAGCTATTCGTTT
GGGCGACTCTCTTGGTTCCTCTCATCTTCATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTGTGCCGCC
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CGAGACCGGACCTCGAGGAGGTTTTCAGGGCGTACATCCCGCATAGCTTGAGCACTCACA
AAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGCCATGTCTCGTTATCAAGACTATGCTGCGATAT
CAGCCGCTTAAACATTTGAATCCTTATTATTATCTCACAGATTTGTTTTTTTTCTTTTAG
AAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGATTTTAGGGTTTGTTTAGGGTTTTTTCGTTTGTATG
TGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTGTAACCCATGCAAGCTACGCTTTAATTATC

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TTGAGCTACGCGACTAGGGTTCCCAGTGACATGCTCATCCTCACTATCACCTTCTGCTAC
TCCGTAATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGCTGGCTC
ATCCTTAGAAACCAGGCTTTGAAAGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAGGATG
TGGCCGCATATTCACACCCGCATTCTAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAACTGGTTATGTTT
GGTTACTTGGGAGTCAAGCTATTCGTTTGGGCGACTCTCTTGGTTCCTCTCATCTTCATC
TCTCTCGTATTCGGTTACGTGTGCCGCCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGAACACACGGCT
CTGGAGGTGGCTTGCCGTGAGCTGAAGACGAGACCGGACCTCGAGGAGGTTTTCAGGGCG
TACATCCCGCATAGCTTGAGCACTCACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGCCATG
TCTTGTTATCAAGACTATGCTGCGATATCAGCCGCTTAAACATTTGAATCCTTATTATTA
TCTCACAGATTTGTTTTTTTTCTTTTAGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGATTTTAGG
GTTTGTTTAGGGTTTTTTCGTTTGTATGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTGTAACCCA
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DS 

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TGACATGCTCATCCTCACTATCACCTTCTGCTACTCCGTAATCGCTCCTCTTATCCTCGT
ATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGCTGGCTCATCCTTAGAAACCAGGCTTTGAAAGT
GTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCATTCT
AGCGGCATTGTTTCTGTTCCAACTGGTTATGTTTGGTTACTTGGGAGTCAAGCTAATCGT
TTGGGCGACTCTCTTGGTTCCTCTCATCTTCATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTGTGCCG
CCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGAACACACGGCTCTGGAGGTGGCTTGCCGTGAGCTGAA
GACGAGACCGGACCTCGAGGAGGTTTTCAGGGCGTACATCCCGCATAGCTTGAACACTCA
CAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGCCATGTCTCGTTATCAAGACTATGCTGCGAT
ATCAGCCGCTTAAACATTTGAATCCTTATTATTATCTCACAGATTTGTTTTTTTTCTTTT
AGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGATTTTAGGGTTTGTTTAGGGTTTTTTCGTTTGTA
TGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTGTAACCCATGCAAGCTACGCTTTAATTATCAACT
TCGTCAGTCTTCGT
CCT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 6

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GTGACCTTCGCGGCTGCGACTAACATCAGATTCCGATCGTTTCATTGCAATCTCCGGGAG
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GGTCCTGAGGAAACCCACGGATTTAAGGCTCTAAAGTGTTTAGGCAATGATGAAAACGGT
AGCAGAGGAATCGACGGCGGAGAAGACAGAGTAACGAAACCGTCGGTTATTAGAGATTCA
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GAGTTCGGTTCCGACAAGACTCCTTATGTTTCTTCAAGGCCATCAACTGAATCGCCTATT
GATCCTACATACAGCAGCTTTCAAATAGACTCTTTTAAGCTAATGGAGCTTCTTGGACCT
GAGAGAGTAGATCCTGCAGATGTCAAGTTAATAAAGGACAACATATTTGGGTATTCAACA
TTCTGGGCGACGAAAGAAGAACCCTTTGGGGATCTCGGAGAGGGCATCCTCTTTCTTGGG
AATTTAAGAGGAAAAAGGGAAGATGTTTTTGCAAAGCTTCAAAGAAAACTGGCAGAGCTT
GCTGGCGATAAGTATAATTTGTTCATGATCGAGGAGCCTAACTCTGAAGGACCAGATCCA
CGTGGCGGTGCACGTGTTAGCTTTGGTTTGCTTCGTAAATAAGTCTCGGAGCCAGGACCA
ACCACGCTCTGGCAGTATGTGATTGCGTTCATATTGTTTCTTCTGACTATTGGTTCCTCT
GTAGAATTGGGAATTGCTTCTCAGATTAACCGTTTACCTCCTGAGGTGGTAAGGTATTTC
ACCGATCCAAATGCTGTTGAACCACCTGATATGGAGCTTTTGTATCCATTTGTAGATTCT
GCATTGCCTTTGGCATATGGTGTCTTGGGAATTCTTTTGTTTCATGAATTGGGGCACTTT
CTTGCTGCAGTTCCAAAGAAAGTAAAGCTTAGCATTCCTTACTTCATTCCAAACATTACA
CTCGGCAGTTTTGGTGCAATCACACAGTTCAAGTCGATTCTTCCCGACCGGAGTACAAAA
GTTGACATTTCGCTAGCTGGTCCATTTGCTGGAGCTGCACTCTCAGTTTCCATGTTTGCT
GTTGGTCTGTTTCTATCTACTAACCCAGATGCAGCTAGCGATCTGGTGCAGGTCCCCAGC
ATGTCATTCCAAGGTTCATTACTTCTTGGACTCATCAGCCGAGCAACCCTGGGATACGCA
GCTATGCATGCTACAACAGTTTCGATCCACCCGCTTGTTATTGCTGGATGGTGTGGTTTA
ACAACAACGGCTTTTAATATGCTTCCTGTTGGGTGTTTGGATGGAGGAAGAGCTGTACAG
GGCGCATTTGGGAAAAATGTACTGTTTACATTTGGTTTGTCAACCTATGTAATGCTTGGA
CTCAGAGTGCTCGGTGGCCCTTTGGCACTTCCTTGGGGTCTCTACGTGCTAATCTGCCAG
AGAACACCCGAAAAAGCATGCCTGAACGATGTGACCGAGGTTGGAACATGGAGGAAGGCA
CTTGTCGGGACTGCAATTATTCTGGTGGTTTTGATACTCCTGCCTGTATGGGACGAACTC
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GTTGCAAAATTTTGTTTCGTTGTGTATAAGATTGCCAGATATAACGAGTCATATTTGTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DS23TF U 1
AF RR4CD33TF U 1110
AF RR4G573TF U 529
AF RR4G573JQ C 1070
AF RR4CD33JQ C 1109
AF RR4DS23JQ C 1402
BS 1 547 RR4DS23TF
BS 548 548 RR4G573TF
BS 549 663 RR4DS23TF
BS 664 664 RR4G573TF
BS 665 693 RR4DS23TF
BS 694 694 RR4G573TF
BS 695 705 RR4DS23TF
BS 706 1232 RR4G573TF
BS 1233 1233 RR4CD33TF
BS 1234 1251 RR4G573TF
BS 1252 1252 RR4G573JQ
BS 1253 1277 RR4G573TF
BS 1278 1813 RR4G573JQ
BS 1814 1823 RR4CD33JQ
BS 1824 1854 RR4DS23JQ

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GTGACCTTCGCGGCTGCGACTAACATCAGATTCCGATCGTTTCATTGCAATCTCCGGGAG
AGGATTAGGACACCAATGCCTAAGGTTACTACGCCATTGAGAGAAAGATACTGTTTCTCT
GGTCCTGAGGAAACCCACGGATTTAAGGCTCTAAAGTGTTTAGGCAATGATGAAAACGGT
AGCAGAGGAATCGACGGCGGAGAAGACAGAGTAACGAAACCGTCGGTTATTAGAGATTCA
ACTGTAGAAACCACTTCGCGTGAAGAAGATGCAGACAAGAAAAGTAAAAGTAGCAGCAAC
GAGTTCGGTTCCGACAAGACTCCTTATGTTTCTTCAAGGCCATCAACTGAATCGCCTATT
GATCCTACATACAGCAGCTTTCAAATAGACTCTTTTAAGCTAATGGAGCTTCTTGGACCT
GAGAGAGTAGATCCTGCAGATGTCAAGTTAATAAAGGACAACATATTTGGGTATTCAACA
TTCTGGGTGACGAAAGAAGAACCCTTTGGGGATCTCGGAGAGGGCATCCTCTTTCTTGGG
AATTTAAGAGGAAAAAGGGAAGATGTTTTTGCAAAGCTTCAAAGAAAACTGGCAGAGCTT
GCTTGCGATAAGTATAATTTGTTCATGATCGAG*AGCCTAACTCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4CD33TF 145 0 0
GGAAGTC
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GCACTCTCAGTTTCCATGTTTGCTGTTGGTCTGTTTCTATCTACTAACCCAGATGCAGCT
AGCGATCTGGTGCAG
GTC

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DS 

RD RR4G573TF 749 0 0
GGGTATTCAACATTCTGGGCGACGAAAGAAGAACCCTTTGGGGATCTCGGAGAGGGCATC
CTCTTTCTTGGGAATTTAAGAGGAAAAAGGGAAGATGTTTTTGCAAAGCTTCAAAGAAAA
CTGGCAGAGCTTGCTGGCGATAAGTATAATTTGTTCATGATCGAGGAGCCTAACTCTGAA
GGACCAGATCCACGTGGCGGTGCACGTGTTAGCTTTGGTTTGCTTCGTAAATAAGTCTCG
GAGCCAGGACCAACCACGCTCTGGCAGTATGTGATTGCGTTCATATTGTTTCTTCTGACT
ATTGGTTCCTCTGTAGAATTGGGAATTGCTTCTCAGATTAACCGTTTACCTCCTGAGGTG
GTAAGGTATTTCACCGATCCAAATGCTGTTGAACCACCTGATATGGAGCTTTTGTATCCA
TTTGTAGATTCTGCATTGCCTTTGGCATATGGTGTCTTGGGAATTCTTTTGTTTCATGAA
TTGGGGCACTTTCTTGCTGCAGTTCCAAAGAAAGTAAAGCTTAGCATTCCTTACTTCATT
CCAAACATTACACTCGGCAGTTTTGGTGCAATCACACAGTTCAAGTCGATTCTTCCCGAC
CGGAGTACAAAAGTTGACATTTCGCTAGCTGGTCCATTTGCTGGAGCTGCACTCTCAGTT
TCCATGTTTGCTGTTGGTCTGTTTCTATCTACTAACCCAGATGCGGCTAGCGATCTGGTG
CAG*TCCCCAGCATGTCATTCCAAGGTTC

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DS 

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CAAACATTACACTCGGCAGTTTTGGTGCAATCACACAGTTCAAGTCGATTCTTCCCGACC
GGAGTACAAAAGTTGACATTTCGCTAGCTGGTCCATTTGCTGGAGCTGCACTCTCAGTTT
CCATGTTTGCTGTTGGTCTGTTTCTATCTACTAACCCAGATGCGGCTAGCGATCTGGTGC
AGGTCCCCAGCATGTCATTCCAAGGTTCATTACTTCTTGGACTCATCAGCCGAGCAACCC
TGGGATACGCAGCTATGCATGCTACAACAGTTTCGATCCACCCGCTTGTTATTGCTGGAT
GGTGTGGTTTAACAACAACGGCTTTTAATATGCTTCCTGTTGGGTGTTTGGATGGAGGAA
GAGCTGTACAGGGCGCATTTGGGAAAAATGTACTGTTTACATTTGGTTTGTCAACCTATG
TAATGCTTGGACTCAGAGTGCTCGGTGGCCCTTTGGCACTTCCTTGGGGTCTCTACGTGC
TAATCTGCCAGAGAACACCCGAAAAAGCATGCCTGAACGATGTGACCGAGGTTGGAACAT
GGAGGAAGGCACTTGTCGGGACTGCAATTATTCTGGTGGTTTTGATACTCCTGCCTGTAT
GGGACGAACTCGCCGAAGAGGTAGGAATAGGGCTGGTAAACACATTTTGATGTTGTAGTT
AGGGCCAACAAGTTGCAAAATTTTGTTTCGTTGTGTATAAGATTGCCAGATATAACGAGT
CATATTTGTACGATGTAAGCTGAT

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DS 

RD RR4CD33JQ 715 0 0
GGAAGTCG
ATTCTTCCCGACCGGAGTACAAAAGTTGACATTTCGCTAGCTGGTCCATTTGCTGGAGCT
GCACTCTCAGTTTCCATGTTTGCTGTTGGTCTGTTTCTATCTACTAACCCAGATGCAGCT
AGCGATCTGGTGCAGGTCCCCAGCATGTTATTCCAAGGTTCATTACTTCTTGGACTCATC
AGCCGAGCAACCCTGGGATACGCAGCTATGCATGCTACAACAGTTTCGATCCACCCGCTT
GTTATTGCTGGATGGTGTGGTTTAACAACAACGGCTTTTAATATGCTTCCTGTTGGGTGT
TTGGATGGAGGAAGAGCTGTACAGGGCGCATTTGGGAAAAATGTACTGTTTACATTTGGT
TTGTCAACCTATGTAATGCTTGGACTCAGAGTGCTCGGTGGCCCTTTGGCACTTCCTTGG
GGTCTTTACGTGCTAATCTGCCAGAGAACACCCGAAAAAGCATGCCTGAACGATGTGACC
GAGGTTGGAACATGGAGGAAGGCACTTGTCGGGACTGCAATTATTCTGGTGGTTTTGATA
CTCCTGCCTGTATGGGACGAACTCGCCGAAGAGGTAGGAATAGGGCTGGTAAACACATTT
TGATGTTGTAGTTAGGGCCAACAAGTTGCAAAATTTTGTTTCGTTGTGTATAAGATTGCC
AGATATAACGAGTCATATTTGTACGATGTAAGCTGATGAAGAATAAT

QA 9 715 9 715
DS 

RD RR4DS23JQ 453 0 0
CTTCCTGTTGGGTGTTTGGATGGAGGAAGAGCTGTACAGGGCGCATTTGGGAAAAATGTA
CTGTTTACATTTGGTTTGTCAACCTATGTAATGCTTGGACTCAGAGTGCTCGGTGGCCCT
TTGGCACTTCCTTGGGGTCTCCACGTGCTAATCCGCCAGAGAACACCCGAAAAAGCATGC
CTGAACGATGTGACCGAGGTTGGAACATGGAGGAAGGCACTTGTCGGGACTGCAATTATT
CTGGTGGTTTTGATACTCCTGCCTGTATGGGACGAACTCGCCGAAGAGGTAGGAATAGGG
CTGGTAAACACATTTTGATGTTGTAGTTAGGGCCAACAAGTTGCAAAATTTTGTTTTGTT
GTGTATAAGATTGCCAGATATAACGAGTCATATTTGTACGATGTAAGCTGATGAAGAATA
ATTTATACTTCTGATATGTGCTTTTGCTCCACA

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 6

CO CL1301Contig1 858 6 13 U
GGTGATGATGATTCAGAGGAGAAGAAGAGGATGAGGGTGAAACGAGAGCTCGAAAAGGTA
GCTCAGGAGCAAGCAGAGAGGAGAGCAACTGCAGAATTGATGTTTGAGTTGGGACAAAAG
GCTTATGGTAAAGGCATGTATGGACGAGCGATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTACTATT
ATCCCAAGGCCAACGCTCTTTGGTGGTGAGATTCAAATTTGGTTAGCTATGGCATATGAG
GCCAATAATCGCCACGCTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAACTAGAGAAGAGACACCCT
AGTCCTGGTATCCGTCGTCAAGCCTCTGAGCTTAGGTATATTTTGCAAGCTCCTAAGC**
AAGATCTCTCAGGAGGAGATGGTTACCATACCCATGATCGGTTCAAGCTACGACAGCTAT
GCAGTGACATGGAGTGACAAGGAGAGGGACAGGGACAGTAGGATGAATGAATT*GACTAC
GAATCAGCTCAACTCGAGTGAAGACTTTCTAGGAAAGCTCTTGGTTTGGAGGCCACCTGT
TGGGATGGAGAAGAACAAAGTCTTTTGGCTTTCTTTGACACTGTGGTTTGG*TTTAGTTG
GAGCAGCACTTTTGCTACAAAGATAATGAAAGAGGAGGAAAAGACTCTTTCGTCCCAGGT
CTGGTACTGTTTCATCTCTCTCACACACTTGTCTTGTAATTATATTTGAATATGGATGTA
TAAACTTGCAAGTAGATGTAATCATATCTCATTGTAGATAAAAAAAGTGTTGGATGTCTG
GAACTATATCACTTTGTTCTGTATTACTATTGTACTGTAATTGTTTATTCAGAAAAAAAA
ATTGTTTATTCAGTGATT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AT

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DS 

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GCTTATGGTAAAGGCATGTATGGACGAGCGATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTACTATT
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GCCAATAATCGCCACGCTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAACTAGAGAAGAGACACCCT
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AAGGTCTCTCAGGAGGAGATGGTTACCATACCCATGATCGGTTCAAGCTACGACAGCTAT
GCAGTGACATGGAGTGACAAGGAGAGGGACAGGGACAGGAGGATGAATGAATT*GACTAC
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TGGGATGGAGAAGAACAAAGTCTTTTGGCTTTCTTTTACACTGTGGTTTGG*TTTAGTTG
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C

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DS 

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G

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DS 

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TGTTTATTCAGTGATT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 6

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4C438JQ C 97
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AF RR4BB41TF U 23
AF RR4CT84TF U 26
AF RR4E243TF U 54
AF RR4CT84JQ C 27
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BS 33 33 RR4CT84TF
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BS 252 735 RR4A334TFB
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BS 743 785 RR4CT84TF
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RD RR4C438JQ 595 0 0
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GATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTATGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGG
CGGATAACGAGCTAGAGGTGCTGGAGATCATTCATCACTATGTCGAGATTCTTGACCGTT
ACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTCGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTATATAT
TGGATGAGCTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGA
TAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGCTAGTTCCATAAGTA
ACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTT*CTGATTTGTTGTTAAAAAAGCATTCGT
TAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGATAAATTCTATTCTAAATCACACTTTT

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DS 

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TACATTTTGTGCTTCTAGTTAGTCGACAAGGAAAAGTAAGGCTAACCAAGTGGTATTCGC
CTTACACACAGAAGGAAAGGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTTAACA
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ATGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGCTAGAGGTGCTGG
AGATCATTCATCACTATGTCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTCG
ATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGCTGTTGATCGCCGGTG
AGCTTCAAGAGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGG
TGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGT
AGTTTCTT*CTGATTTGTTGTTAAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTT
TCTGATAAATTCTATTCTAAATCACACTTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTC
TGTTTGATA*AGAAG

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DS 

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GGATT
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AATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTATGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCA
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TTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTCGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGT
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AGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGATAAATTCTATTCTAAATCACAC
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GG
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TCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTCATCG
AATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTACGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCA
TTGATGAGACGGATAACGAGTTAGAGGTACTGGAGATCATTCATCACTACGTCGAAATTC
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AGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCGTATTTTCTGATAAATTCTATTCTAAATCACAC
TTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATAGAGAAGAA*****CATTT
ATTGATCGGTGTGGGTTT*ATGAGTAGTGATTCCTTTG

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DS 

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GG
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CATGATACATTTTGTGCTTCTAGTTAGTCGACAAGGAAAAGTAAGGCTAACCAAGTGGTA
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TAACAGAGGTCCCAAGCTCTGTAATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAA
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DS 

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G
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ATCGAGGATCTGTTGAGTTACGGATAATCATGATACATTTTGTGCTTCTAGTTAGTCGAC
AAGGAAAAGTAAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACACAGAAGGAAAGGTCTAAGG
TCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTCATCG
AATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTACGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCA
TTGATGAGACGGATAACGAGTTAGAGGTACTGGAGATCATTCATCACTACGTCGAAATTC
TTGACTGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGT
ATTATATATTGGATGAGCTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGCAAGAAAACAG
TGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGCTAGTT
CCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTT*CTGATTTGTTGTTAAAAA
AGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCGTATTTTCTGATAAATTCTATTCTAAATCACAC
TTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATA*AGAAGAAAGAAACATTT
ATTGATCGGTGTGGGTTT*ATGAGTAGTGATTCCTTTGTAAAGACAACATACAGCACATT
CTTTGCCATCTACCATGATTGATAAGAGTACTACCGCCGC

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DS 



AS 1 6

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CGCTGCTCCATCTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCTCAGATTTCAGAT
CCAAATCCAAAAAAAAAAATTCAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTT
CTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGG
AACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCAT
GAAGTCCATCGTCCCCGTTGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGC
TGTTATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATA
CGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCTGGAATGGCCAT
TGGTATTGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGG
GATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAAT
CATCCTCTCCTCCAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTT
GCTATCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCGTTTTTGTTC
TTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTT
GTTCCGGAAACAAACCCACCTATTCGTCGTCCCCTTTTCTCTTACGGTGGTTTGGTTTGC
TTTCGGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCTTAGGAGC
TTGGTATGTTTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATACATTTATTTGTTTT
GATTTTAAAAATATACATTTATCTGTAAAGAAGTCTGCTTTCTCAATCCATCTCGTAGAA
AACGTTACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO86TF U 1
AF RR4FX70TF U 67
AF RR4F491TF U 83
AF RR4FX70JQ C 224
AF RR4F491JQ C 243
AF RR4EO86JQ C 364
BS 1 581 RR4EO86TF
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RD RR4EO86TF 733 0 0
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CCAAATCCAAAAAAAAAAATTCAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTT
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CGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCTGGAATGGCCAT
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GATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTGCGGGCTTATTGTAGGAAT
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GCTATCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCGTTTT*GTTC
TTTCCTTCTTTAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4FX70TF 717 0 0
GGG
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AAAAAAAAA*TTCAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTT
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GAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCAT
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CTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCCCTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGT
CGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCT
TATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTC
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CTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCGTTTTTGTTCTTTCCTTCT
TTAGTATTTATCATCGGTAA*CCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGTT

QA 4 717 4 717
DS 

RD RR4F491TF 738 0 0
GG
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CATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGC
CGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGT
GGCTTCCATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATCGTCCCCGTTGTTAT
GGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTATTAA
CCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGC
TTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTCGGTGATGCCGGTGT
CAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTACGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGC
AGAAGCGCTTGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCCAGAGCTGGCCA
GTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTTGCTATCGTTCTGAGAATGAGAGAA
TGTTACTTCCTTT*CGTTCTGTGTGCGTTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATC
GGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGTTCCGGAAACAAACCCACCTATT
CGTCGTCCC
TTTCTCT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR4FX70JQ 726 0 0
ATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATG
AGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATCGTCCCCGTTGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATT
TACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTAC
TACCTCTTTGATGGATACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCCC
TCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAG
CCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTAC
GGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCCAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAA
TGTGACCCACAAGATTTGCTATCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTC
TGTGTGCGTTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTAC
TGGATTCTTGGAACTTTGTTCCGGAAACAAACCCCCCTATTCGTCGTCCCCTTTTCTCTT
ACGGTGGTTTGGTTTGCTTTCGGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTTCGGTTCTGTAAT
AAAGAGCTCTTAGGAGCTTGGTATGTTTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAA
ATACAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4F491JQ 744 0 0
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AGTCCATCGTCCCCGTTGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTG
TTATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACG
CTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCTGGAATGGCCATTG
GTATTGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTACGCTCTTTGTTGGGA
TGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCA
TCCTCTCCTCCAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTTGC
TATCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTT*CGTTCTGTGTGCGTTTTTGTTCTT
TCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGT
TCCGGAAACAAACCCACCTATTCGTCGTCCCCTTTTCTCTTACGGTGGTTTGGTTTGCTT
TCGGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCTTAGGAGCTT
GGTATGTTTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATACATTTATTTGTTTTGA
TTTTAAAAATATACATTTATCTGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4EO86JQ 668 0 0
TATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGC
TCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCTGGAATGGCCATTGG
TATTGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGAT
GATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTGCGGGCTTATTGTAGGAATCAT
CCTCTCCTCCAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCCCAAGATTTGCT
ATCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCGTTTTTGTTCTTT
CCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGTT
CCGGAAACAAACCCCCCTATTCGTCGTCCCCTTTTCTCTTACGGTGGTTTGGTTTGCTTT
CGGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCTTAGGAGCTTG
GTATGTTTTTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATACATTTATTTGTTTTGAT
TTTAAAAATATACATTTATCTGTAAAGAAGTCTGCTTTCTCAATCCATCTCGTAGAAAAC
GTTACGTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 6

CO CL1304Contig1 988 6 12 U
GGAATAATAGATTTCTTGTCAAAAAAATCAAGATTTCATAAAGGTGGTCACGTTTGGAGA
TTCTGAATAGTTGTTTCGCTGGAGGCGTTGAAATAGCCTTCTTTAACAGCTCACTTCGTT
TCACATTCCAAAGTTATTGAACTCCTCTCGGTCTTCTTCTTACATATTATATAAATCTCT
GTTTATCTCTGACAATAATACGACAGCATCGGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAA
AAGGCAACTTCGACTCTTAATGAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTT
GGTGCTTCTCTAACTGATGCTCAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACC
TCTCTAGCCGATGCTCAGGCAACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCC
GAAGCCGCGCCAGGGAAAGTGTCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAAT
GTTATGTCAAGAGGTATAGAAGGAGCCAAATCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAG
ACCGAAATTTCCTCCAAGCTTGTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGC
AGCACCAACGTGGCAAACCGAGACCTTCCCATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACT
GGTGAGCGCGGGGTTGATGCGACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTT
CTCAAGACATCTACTACAAAATAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGA
ACAATATGTAAAAGCCTTTTGATTTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGA
TTGTGTCTTTTTTT*CTTTTGAAACAAAGTTTGTGATTGTGTCTATGTCTTTGTTTTTAT
TTGTATTTT*GATATGTTGATTGTTCCCATGAACTTGCGTAAGAAGTAAGAACCAATAAA
TCCAAAACAAGTAATTTTTTTTGTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4H448TF U 1
AF RR4FL08TF U 201
AF RR4A590TF U 198
AF RR4A590JQ C 198
AF RR4H448JQB C 321
AF RR4FL08JQ C 577
BS 1 210 RR4H448TF
BS 211 211 RR4A590TF
BS 212 292 RR4H448TF
BS 293 293 RR4A590TF
BS 294 672 RR4H448TF
BS 673 854 RR4A590TF
BS 855 855 RR4A590JQ
BS 856 909 RR4A590TF
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BS 951 986 RR4A590JQ
BS 987 988 RR4FL08JQ

RD RR4H448TF 672 0 0
GGAATAATAGATTTCTTGTCAAAAAAATCAAGATTTCATAAAGGTGGTCACGTTTGGAGA
TTCTGAATAGTTGTTTCGCTGGAGGCGTTGAAATAGCCTTCTTTAACAGCTCACTTCGTT
TCACATTCCAAAGTTATTGAACTCCTCTCGGTCTTCTTCTTACATATTATATAAATCTCT
GTTTATCTCTGACAATAATACGACAGCATCAGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAA
AAGGCAACTTCGACTCTTAATGAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGGATCCGTT
GGTGCTTCTCTAACTGATGCTCAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACC
TCTCTAGCCGATGCTCAGGCAACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCC
GAAGCCGCGCCAGGGAAAGTGTCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAAT
GTTATGTCAAGAGGTATAGAAGGAGCCAAATCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAG
ACCGAAATTTCCTCCAAGCTTGTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGC
AGCACCAACGTGGCAAACCGAGACCTTCCCATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACT
GGTGAGCGCGGG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4FL08TF 634 0 0
G
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GAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGCT
CAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGCA
ACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCGAAGCCGCGCCAGGGAAAGTG
TCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGAA
GGAGCCAAATCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTT
GTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCAACGTGGCAAACCGA
GACCTTCCCATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATGCG
ACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAAA
TAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTG
ATTTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGT

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR4A590TF 753 0 0
GGAC
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GAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGCT
CAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGCA
ACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCGAAGCCGCGCCAGGGAAAGTG
TCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGAA
GGAGCCAAATCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTT
GTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCAACGTGGCAAACCGA
GACCTTCCCATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATGCG
ACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAAA
TAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTG
ATTTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTTTTTCTTTTG
AAACAAAGTTTGTGATTGTGTCTATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTTGATATGTTGAT
TGTTCCCATGAACTTGCGTAAGAAGTAAG

QA 5 753 5 753
DS 

RD RR4A590JQ 790 0 0
GGAC
GACAGCATCGGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAAAAGGCAACTTCGACTCTTAAT
GAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGCT
CAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGCA
ACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCGAAGCCGCGCCAGGGAAAGTG
TTTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGAA
GGAGCCAAATCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTT
GTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCAACGTGGCAAACCGA
GACCTTCCCATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATGCG
ACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAAA
TAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTG
ATTTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTTTT*CTTTTG
AAACAAAGTTTGTGATTGTGTCTATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTT*GATATGTTGAT
TGTTCCCATGAACTTGCGTAAGAAGTAAGAACCAATAAATCCAAAACAAGTAATTTTTTT
TGTGA
G

QA 5 789 5 789
DS 

RD RR4H448JQB 643 0 0
TCAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGC
AACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCGAAGCCGCGCCAGGGAAAGT
GTCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGA
AGGAGCCAAATCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCT
TGTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCAACGTGGCAAACCG
AGACCTTCCCATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATGG
GACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATTTACTACAAA
ATAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTT
GATTTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTTTT*CTTTT
GAAACAAAGTTTGTGATTGTGTCTATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTT*GATATGTTGA
TTGTTCCCATGAACTTGCGTAAGAAGTAAGAACCAATAAATCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4FL08JQ 412 0 0
AATGTTGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCAACGTGGCAAACCGAGACCTTCCCATATCC
ACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGGGGGGGGTTGATGGGACGCCATGGTGGAAA
AACTGTTGTGGAGTTTTTGATTTTTTCAAGACATTTACTACAAAATAAAAGGTCAAGGTG
ATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTGATTTTTTATTTCCTT
CCTTTTTTTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTTTTTTTTT*TTTTTGAAACAAAGTTTGTGA
TTGGGTTTATGTTTTTGTTTTTATTTGTATTTT*GATATGTTGATTGTTCCCATGAACTT
GGGTAAGAAGTAAGAACCAATAAATCCAAAACAAGTAATTTTTTTTGTGATG

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 6

CO CL1305Contig1 877 6 6 U
AAAGTAATAAACAAAGGAAAAATGTTTTCTTCCAGACATGATGATGATTGATGATCAAAG
AAAACAGCCAACATAGATAGAGTTTTATTAAGCTGACAAAAAAAA*GGATAAGAGAGTTT
TATCATTAGTCATAAGTTATAACTCTTATCCTCTTCATTTTGTAGCCTTTAATTTTTCTT
AGATAATGGACATAGTCTTGGATAAAGTCTCTGCTGTCCTAGTAGCTTTCTCGAACACAA
CGTTGAATGGCGTAGTAGGGCCTAAAACGAAACGCCCAACGCCAGCTAGGTCCTCCATTA
CACCGACATCGACGCAATCGTTATGCTCTCCACAAAACACAAACTTGTAAGCGTCAAGTT
TTCCCACAGTCTTCTTGACGATCTGGAAGAAACTACTCGACGAATCTTCTTCTCCAGCTT
CTGGCTTAGGACCAGCTATTATGAACGACGTTACATCACTGGCGGGCGGACTACTGAGCC
ACCAATAAACTGACTCTGGGCGGCAGATCTTTGGTGTGGTATCCATCTCGATGTTGAGGT
TCTCTGACTCCGGAACGTGCTTAACTCTAGACCTCCAGTTTGAGAATCTTACGGGAATGC
CCCTGTTCAGGTCTGAACGTTCCTGTCCGAGAAAGAGGGGACATTGGTTGCCAAAAACGG
GGGCGAGAGTTAGACCGCCACCCCCAGCGCCCCAGAAGATGGGGAGAACGTAGTAACTAG
TGCCGCCGAATATGACATCACCATCAGTGTCGAAAATTGGTCCGGCGGCGTTTGTTTTCG
CGGCAAAAACGGCGGTTAAGGCAAGAAGGAAGTAAAACATAGGATTCATCCTTTTTGAGT
TTATTTAGCTGATGAGATTTGAATGTTTACTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AY54JQ U 178
AF RR4C325JQ U 9
AF RR4B307JQ U 1
AF RR4B307TF C 38
AF RR4AY54TF C 264
AF RR4C325TF C 266
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GTTTTCCCACAGTCTTCTTGA

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DS 

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GGCGTAGTAGGGCCTAAAACGAAACGCCCAACGCCAGCTAGGTCCTCCATTACACCGACA
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GTCTTCTTGACGATCTGGAAAAAACTACTCGACGAATCTTCTTCTCCAGCTTCTGGCTTA
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AAAACAGCCAACATAGATAGAGTTTTATTAAGCTGACAAAAAAAA*GGATAAGAGAGTTT
TATCATTAGTCATAAGTTATAACTCTTATCCTCTTCATTTTGTAGCCTTTAATTTTTCTT
AAATAATGGACATAGTCTTGGATAAAGTCTCTGCTGTCCTAGTAGCTTTCTCGAACACAA
CGTTGAATGGCGTAGTAGGGCCTAAAACGAAACGCCCAACGCCAGCTAGGTCCTCCATTA
CACCGACATCGACGCAATCGTTATGCTCTCCACAAAACACAAACTTGTAAGCGTCAAGTT
TTCCCACAGTCTTCTTGACGATCTGGAAGAAACTACTCGACGAATCTTCTTCTCCAGCTT
CTGGCTTAGGACCAGCTATTATGAACGACGTTACATCACTGGCGGGCGGACTACTGAGCC
GCCAATAAACTGACTCTGGGCGGCAGATCTTTGGTGTGGTATCCATCTCGATGTTGAGGT
TCTCTGACTCCGGAACGTGCTTAACTCTAGACCTCCAGTTTGAGAATCTTACGGGAATGC
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GGGCGAGAGTTAGACCGCCACCCCCAGCGCCCCAGAAGATGGGGAGAACGTAGTAACTAG
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C

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DS 

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AAAAAAAA*GGATAAGAGAGTTTTATCATTAGTCATAAGTTATAACTCTTATCCTCTTCA
TTTTGTAGCCTTTAATTTTTCTTAGATAATGGACATAGTCTTGGATAAAGTCTCTGCTGT
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ACTGGCGGGCGGACTACTGAGCCGCCAATAAACTGACTCTGGGCGGCAGATCTTTGGTGT
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GTTTGAGAATCTTACGGGAATGCCCCTGTTCAGGTCTGAACGTTCCTGTCCGAGAAAGAG
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TGGAAGAAACTACTCGACGAATCTTCTTCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAGCTATTATG
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CAGATCTTTGGTGTGGTATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGACTCCGGAACGTGCTTA
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TGTCCGAGAAAGAGGGGACATTGGTTGCCAAAAACGGGGGCGAGAGTTAGACCGCCACCC
CCAGCGCCCCAGAAGATGGGGAGAACGTAGTAACTAGTGCCGCCGAATATGACATCACCA
TCAGTGTCGAAAATTGGTCCGGCGGCGTTTGTTTTCGCGGCAAAAACGGCGGTTAAGGCA
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TGTTTACTGGATCC

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GAAGAAACTACTCGACGAATCTTCTTCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAGCTATTATGAA
CGACGTTACATCACTGGCGGGCGGACTACTGAGCCACCAATAAACTGACTCTGGGCGGCA
GATCTTTGGTGTGGTATCCATCTCGATGTTGAGGTTCTCTGACTCCGGAACGTGCTTAAC
TCTAGACCTCCAGTTTGAGAATCTTACGGGCATGCCCCTGTTCAGGTCTGAACGTTCCTG
TCCGAGAAAGAGGGGACATTGGTTGCCAAAAACGGGGGCGAGAGTTAGACCGCCACCCCC
AGCGCCCCAGAAGATGGGGAGAACGTAGTAACTAGTGCCGCCGAATATGACATCACCATC
AGTGTCGAAAATTGGTCCGGCGGCGTTTGTTTTCGCGGCAAAAACGGCGGTTAAGGCAAG
AAGGAAGTAAAACATAGGATTCATCCTTTTTGAGTTTATTTAGCTGATGAGATTTGAATG
TTTACTGGATCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 6

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TCATCAAGACGCAGAGTTCGAGTGGTTCGAATCATGTGACGAGACCAATATATTTGTGTA
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GTTTCTATCATTGTTTAATGGTATCAAACACAAAGAATTTTAC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BQ37TF U 1
AF RR4BQ37JQ C 8
AF RR4GO15TF U 138
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AF RR4BJ73JQ C 25
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RD RR4BQ37TF 602 0 0
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TCATCAAGACGCAGAGTTCGAGTGGTTCGAATCATGTGACGAGACCAATATATCTGTGTA
GT

QA 1 602 1 602
DS 

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CAGAAGCAGAGCAAGAAGAAGAGTTCAGTGAATGGGTAGTGATACAAACCTCACCCACAA
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ATGAT***GAAGATTCTGTTGTTCCCGTCGTAGAAGAGGAAGATGATGAACCCTCCTCCA
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CAAGATTTTTCGAGAGGGCGTCCTGTAATTACGTGAGTAGTACAAGGGTGTTCTGGTCAT
TGACCCTCGTTTGTGGTTTCTCCCTTGTCTCGAGCCTTATTTATGTTAAGGTCGTGAGAT
GGTGGAGACGATTACAAGAAGAGAAGCTGAGGTTTTTGCTTCTTCAGCTTAGAGAGAAAG
ATCAGAAAATAAAGGAGCTTATACTTGAAATCGGGAGACTGAACGAGTCATTATCATCAA
GACGCAGAGTTCGAGTGGTTCGAATCATGTGACGAGACCAATATATCTGTGTAGTAGAAC
ATTGGCTATTTGTTGTGTGAAGTATACAGATTATGGACATATATT***GTCCATGTATAT
GTAAGAATA
CAT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4GO15TF 542 0 0
G
GACGCATCTAGCCCTCTAAACTCACCGATATCACAAGCAAGCCAAGGCCATGATGATGAA
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AAGGAGCTTATACTTGAAATCGGGAGACTGAACGAGTCATTATCATCAAGACGCAGAGTT
CGAGTGGTTCGAATCATGTGACGAGACCAATATATTTGTGTAGTAGAACATTGGCTATTT
GTTGTGTGAAGTATACAGATTATGGACATATATT***GTCCATGTATATGTAAGAATA
TAT

QA 2 539 2 539
DS 

RD RR4CJ76TF 671 0 0
GGA
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GAGTTCAGTGAATGGGTAGTGATACAAACCTCACCCACAAGCTCATCAATCGACGCATCT
AGCCCTCTAAACTCACCGATACCACAAGCAAGCCAAGGCCATGATGATGAAGATTCTGTT
GCTCCCGTGGTAGAAGAGGAAGATGATGAATCCTCCTCCACGGTGAATCAGTCGTTTCCG
TGTTGGGTGATTGAGACTGCCAAGAAGCGCTTGAAGGACTCAAGATTTTTCGAGAGGGCG
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AGTATACAGATTATGGACATATATTAATGTCCATGTGTATGTAAGAGTATAAAA
TCAAAGAAAATAGA

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DS 

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GCTCCCGTGGTAGAAGAGGAAGATGATGAATCCTCCTCCACGGTGAATCAGTCGTTTCCG
TGTTGGGTGATTGAGACTGCCAAGAAGCGTTTGAAGGACTCAAGATTTTTCGAGAGGGCG
TCTTGTAATTACGTGAGTAGTACAAGGGTGTTCTGGTCATTGACCCTCGTTTGTGGTTTC
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ATACTTGAAATCGGGAGACTGAACGAGTCGTTATCATCAAGACGCAGAGTTCGAGTGGTT
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ACACAAAGAATTTTAC

QA 4 739 4 739
DS 

RD RR4BJ73TF 739 0 0
GGA
AAAAGCAGAACATTATCCCAAAAACATATGAACAACAACGCAGAAGCAGAGCAAGAAGAA
GAGTTCAGTGAATGGGTAGTGATACAAACCTCACCCACAAGCTCATCAATCGACGCATCT
AGCCCTCTAAACTCACCGATATCACAAGCAAGCCAAGGCCATGATGACGAAGATTCTGTT
GCTCCCGTGGTAGAAGAGGAAGATGATGAATCCTCCTCCACGGTGAATCAGTCGTTTCCG
TGTTGGGTGATTGAGACTGCCAAGAAGCGTTTGAAGGACTCAAGATTTTTCGAGAGGGCG
TCTTGTAATTACGTGAGTAGTACAAGGGTGTTCTGGTCATTGACCCTCGTTTGTGGTTTC
TCCCTTGTCTCGAGCCTTGTTTATGTTAAGGTCGTGAGATGGTGGAGACGATTACAAGAA
GAGAAGCTGAGGTTTCTGCTTCTTCAGCTTAGAGAGAAAGATCAGAAAATAAAGGAGCTT
ATACTTGAAATCGGGAGACTGAACGAGTCGTTATCATCAAGACGCAGAGTTCGAGTGGTT
CGAATCGTGTGATGAGACCAATATATTTGTGTAGTAGAACATTGGCTATTTGTTGTGTGA
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GGAAAATAGAGTGGAATACAGTTTAAGTATAGTGTTTCTATCATTGTTTAATGGTATCAA
ACACAAAGAATTTTAC

QA 4 739 4 739
DS 



AS 1 6

CO CL1307Contig1 931 6 11 U
GCACTAAAAAAAAAAGAAGATTACTAAAAATGATCCTGAGAAGCGCGTCGTCTCTGGACC
TTAACATACGCGCCGCCCAAAAACCCTCAGCTCCACGTTGCACTAACGGAGCTCGCGTGG
CCACGACGGCTCGTCCCGTCTCCGCTTCTCTCCGAGGCTGTAAGTCGATGCCAAGAGCTT
CTTCAGATGGAAACCTCCACGAGATGAGAGCGATACATGGCAGAACCAAAACGTCCAGCG
TCTACCGCGACGACGCGGCGTCTTCTAGGGTCTTGGAGAGATCAAGGCTCCACCAGGGAG
GAGGTTCTAACGGTGGATTTGGCGGTAGAGGTGGAGACGGTGGTGCCGGAGGTGACGGTA
CCGGAGGTGGGAGCGTTGATGGTTACTACGAGGAGATGATACAACGTTATCCTGGAGACG
CTCTTCTCCTCGCTAACTACGCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAGAGAAAAG
CGGAGGAGTACTGTGAGAGAGCGATGTTGTCTGAGGATGGGAGAGATGGTGAGATGTTGT
CTATGTATGGAGATTTGATATGGAAGAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAGTCTTACT
TTGATCAAGCTGTTCAATCTTCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGGT
TTCTGTGGGATACGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGCAAGAAAGTAAATATGAGAATG
GTTTCTCTACTTATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGCTGATCTT
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AGATACATTATTGTGATATCCCAAAGAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV35TF U 1
AF RR4AW69TF U 2
AF RR4GV35JQ C 90
AF RR4CR32JQ C 173
AF RR4CR32TF U 173
AF RR4AW69JQ C 141
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RD RR4GV35TF 766 0 0
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CTTCAGATGGAAACCTCCACGAGATGAGAGCGATACATGGCAGAACCAAAACGTCCAGCG
TCTACCGCGACGACGCGGCGTCTTCTAGGGTCTTGGAGAGATCAAGGCTCCACCAGGGAG
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CTATGTATGGAGATTTGATATGGAAGAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAGTCTTACT
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TTCTGTGGGATACGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGCAAGAAAGTAA*TATGAGAATG
GTTTCTCTACTTATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACC
TTG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4AW69TF 823 0 0
GGACT
AAAAAAAAAGAAGATTACTAAAAATGATCCTGAGAAGCGCGTCGTCTCTGGACCTTAACA
TACGCGCCGCCCAAAAACCCTCAGCTCCACGTTGCACTAACGGAGCTCGCGTGGCCACGA
CGGCTCGTCCCGTCTCCGCTTCTCTCCGAGGCTGTAAGTCGATGCCAAGAGCTTCTTCAG
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CTACTTATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGCTGATCTTAAACCG
GTGTAATATAATAACAATTTCAAGTCCCGGTTTAATCA

QA 6 823 6 823
DS 

RD RR4GV35JQ 751 0 0
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CTCCGAGGCTGTAAGTCGATGCCAAGAGCTTCTTCAGATGGAAACCTCCACGAGATGAGA
GCGATACATGGCAGAACCAAAACGTCCAGCGTCTACCGCGACGACGCGGCGTCTTCTAGG
GTCTTGGAGAGATCAAGGCTCCACCAGGGAGGAGGTTCTAACGGTGGATTTGGCGGTAGA
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TCTGAGGATGGGAGAGATGGTGAGATGTTGTCTATGTATGGAGATTTGATATGGAAGAAT
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GACTGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGGTTTCTGTGGGATACGGAAGAAGAAGAGGAA
GAGGAGGAGCAAGAAAGTAAATATGAGAATGGTTTCTCTACTTATAACTCATCTGTGTCA
GTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGCTGATCTTAAACCGGTGTAATATAATAACAATTTCAA
GTCC*GGTTTAATCATAAAAATATCTTTTG
T

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4CR32JQ 668 0 0
G
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TCCAGCGTCTACCGCGACGACGCGGCGTCTTCTAGGGTCTTGGAGAGATCAAGGCTCCAC
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GACGGTACCGGAGGTGGGAGCGTTGATGGTTACTACGAGGAGATGATACAACGTTATCCT
GGAGACGCTCTTCTCCTCGCTAACTACGCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAG
AGAAAAGCGGAGGAGTACTGTGAGAGAGCGATGTTGTCTGAGGATGGGAGAGATGGTGAG
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TCTTACTTTGATCAAGCTGTTCAATCTTCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATAT
GCTCGGTTTCTGTGGGATACGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGCAAGAAAGTAAATAT
GAGAATGGTTTCTCTACTTATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGC
TGATCTTAAACCGGTGTAATATAATAACAATTTCAAGTCC*GGTTTAATCATAAAAATAT
CTTTTG
C

QA 2 667 2 667
DS 

RD RR4CR32TF 653 0 0
G
AGAGCTTCTTCAGATGGAAACCTCCACGAGATGAGAGCGATACATGGCAGAACCAAAACG
TCCAGCGTCTACCGCGACGACGCGGCGTCTTCTAGGGTCTTGGAGAGATCAAGGCTCCAC
CAGGGAGGAGGTTCTAACGGTGGATTTGGCGGTAGAGGTGGAGACGGTGGTGCCGGAGGT
GACGGTACCGGAGGTGGGAGCGTTGATGGTTACTACGAGGAGATGATACAACGTTATCCT
GGAGACGCTCTTCTCCTCGCTAACTACGCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAG
AGAAAAGCGGAGGAGTACTGTGAGAGAGCGATGTTGTCTGAGGATGGGAGAGATGGTGAG
ATGTTGTCTATGTATGGAGATTTGATATGGAAGAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAG
TCTTACTTTGATCAAGCTGTTCAATCTTCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATAT
GCTCGGTTTCTGTGGGATACGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGCAAGAAAGTAAATAT
GAGAATGGTTTCTCTACTTATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGC
TGATCTTAAACCGGTGTAATATAATAACAATTTCAAGTCC*CGTTTAATCAT

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR4AW69JQ 791 0 0
TCCGCTTCTCTCCGAGGCTGTAAGTCGATGCCAAGAGCTTCTTCAGATGGAAACCTCCAC
GAGATGAGAGCAATACATGGCAGAACCAAAACGTCCAGCGTCTACCGCGACGACGCGGCG
TCTTCTAGGGTCTTGGAGAGATCAAGGCTCCACCAGGGAGGAGGTTCTAACGGTGGATTT
GGCGGTAGAGGTGGAGACGGTGGTGCCGGAGGTGACGGTACCGGAGGTGGGAGCGTTGAT
GGTTACTACGAGGAGATGATACAACGTTATCCTGGAGACGCTCTTCTCCTCGCTAACTAC
GCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAGAGAAAAGCGGAGGAGTACTGTGAGAGA
GCGATGTTGTCTGAGGATGGGAGAGATGGTGAGATGTTGTCTATGTATGGAGATTTGATA
TGGAAGAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAGTCTTACTTTGATCAAGCTGTTCAATCT
TCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGGTTTCTGTGGGATACGGAAGAA
GAAGAGGAAGAGGAGGAGCAAGAAAGTAAATATGAGAATGGTTTCTCTACTTATAACTCA
TCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGCTGATCTTAAACCGGTGTAATATAATAA
CAATTTCAAGTCC*GGTTTAATCATAAAAATATCTTTTGCACATTGAGGTAGATTGATGC
TTATGTGTTGGAAGAGACGAACCAAGTATCAAAACTCCAAAGATACATTATTGTGATATC
CCAAAGAAGAT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 6

CO CL1308Contig1 909 6 22 U
GAAAGAAGAAACCACTCTCTTTGCAGAAACAAGACCAACTTACTCTTGAATTCTCCTCTC
CATCAGCTAACTAACAAGAAGCAGAAGGGTA**********AATGGCGAAGATCAAGCCG
CAAGCTCTATTGCAGCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGC
ATCGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAGA
CGTTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCA
GCAAAGACCACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACC
ATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAATTCATCAACTTATGTCAA
GATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTGAAACATTCTGTCATTCAAGCT
GGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCACTGATTGGGCTCTCCAAAAGACTAATCTTCAT
ACCAGTTT*AAAACAAGAAGAATTCATGGTGGGAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGG
AGGATTTCAGTTTTTCATTGTATCTTCTCAGATCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGT
TTCTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAGGAGATCGAGGAGGTTGAGACAGA
TGAACATCATCAACCAAAAGCACCAATAGAGATCATGTCCGTCACTTTGCTTCAAGACAT
GTGAAAGCATTATTACTTATATTAAAAAATACTCCAAATGATTCTTGATGTATTAATGCT
TTGTAACTTGAATTCTTTTTTTC*ATCACCTCATTTGCAACTTTGTGGTAACATAAGTTT
TAATTTTCG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 5 30 30 5 5 5 30 10 5 30 5 5 5 5 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE76TF U 3
AF RR4G684TF U 1
AF RR4BY81TF U 29
AF RR4BY81JQ C 215
AF RR4G684JQ C 216
AF RR4DE76JQ C 288
BS 1 330 RR4G684TF
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BS 332 497 RR4G684TF
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BS 550 567 RR4G684TF
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BS 745 774 RR4BY81TF
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BS 776 808 RR4BY81TF
BS 809 809 RR4BY81JQ
BS 810 845 RR4BY81TF
BS 846 863 RR4BY81JQ
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BS 865 882 RR4BY81JQ
BS 883 909 RR4DE76JQ

RD RR4DE76TF 436 0 0
GG
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AGCTAACTAACAAGAAGCAGAAGGGTA**********AATGGCGAAGATCAAGCCGCAAG
CTCTATTGCAGCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGCATCG
TGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAGACGTT
GGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGCAA
AGACCACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTG
AACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGATG
GGTATTTCAAAGGT

QA 3 436 3 436
DS 

RD RR4G684TF 567 0 0
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CATCAGCTAACTAACAAGAAGCAGAAGGGTA**********AATGGCGAAGATCAAGCCG
CAAGCTCTATTGCAGCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGC
ATCGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAGA
CGTTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCA
GCAAAGACCACTAATGTCCCATGGTTTGCTGCCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACC
ATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAATTCATCAACTTATGTCAA
GATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTGAAACATTCTGTCATTCAAGCT
GGTCACTCTGCTGAGTCTGATGCTGTCACTGATTGGGCTCTCCAAAAGACTAATCTTCAT
ACCAGTTTTAAAACAAGAAGAATTCAT

QA 1 567 1 567
DS 

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GG
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AAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGCATCGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTG
GTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAAACGTTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACC
CACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGCAAAGACCACTAATGTCCCATGGTTTGCT
ACCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAAC
GTTGTTGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGC
AGAGTTGTGAAACATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCACT
GATTGGGCTCTCCAAAAGACTAATCTTCATACCAGTTT*AAAACAAGAAGAATTCATGGT
GGGAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGATTTCAGTTTTTCATTGTATCTTCTCA
GATCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTCTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGT
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GATCATGTCCGTCACTTTGCTTCA*GACATGTGAAAGCATTATTACTTATATTAAAAA*T
ACTCCAAATGATTCTTGATGTATTAATGCTTTGTA
CTTGAAT

QA 3 817 3 817
DS 

RD RR4BY81JQ 675 0 0
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ATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGCAAAGACCACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCT
TAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTG
TTGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAG
TTGTGAAACATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCACTGATT
GGGCTCTCCAAAAGACTAATCTTCATACCAGTTT*AAAACAAGAAGAATTCATGGTGGGA
ACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGATTTCAGTTTTTCATTGTATCTTCTCAGATC
ACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTCTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTT
CAGGAGATCGAGGAGGTTGAGACAGATGAACATCATCAACCAAAAGCACCAATAGAGATC
ATGTCCGTCACTTTGCTTCAAGACATGTGAAAGCATTATTACTTATATTAAAAAATACTC
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TTGCAACT
TTGTGGC

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DS 

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TGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGCAAAGACCACTAATGTCCCATGGTTTGCTGCCTT
AGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGT
TGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGT
TGTGAAACATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCTGATGCTGTCACTGATTG
GGCTCTCCAAAAGACTAATCTTCATACCAGTTTTAAAACAAGAAGAATTCATGGTGGGAA
CTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGATTTCAGTTTTTCATTGTATCTTCTCAGATCA
CAGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTC
AGGAGATCGAGGAGGTTGAGACAGATGAACATCATCAACCAAAAGCACCGATAGAGATCA
TGTCCGTCACTTTGCTTCAAGACATGTGAAAGCTTTATTACTTCTTGTATTGAAAA****
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TGCAACT
C

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DS 

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AGGTTCAGTGACCATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAATTCAT
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TGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCACTGATTGGGCTCTCCAAAA
GGCTAATCTTCATACCAGTTT*AAAACAAGAAGAATTCATGGTGGGAACTCCTAAAGCTA
AAAACCAGGAAGGAGGATTTCAGTTTTTCATTGTATCTTCTCAGATCACAGATCTGAACG
AGAAATTGACAGTTTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAGGAGATCGAGG
AGGTTGAGACAGATGAACATCATCAACCAAAAGCACCGATAGAGATCATGTCCGTCACTT
TGCTTCAAGACATGTGAAAGCTTTATTACTTCTTGTATTGAAAA****AAATC**TCTTG
ATGTATTAATGCTTTGTAACTTGAATTCTTTTTTTC*ATCACCTCATTTGCAACTTTGTG
GTAACATAAGTTTTAATTTTCG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 6

CO CL1309Contig1 649 6 13 U
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ATCAAGACAGAAGAAAGACCCATGAAACCATAACATAAGAAGGGCTATGTTCAGCTCTGG
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TCTGACTTCCCAAGCGTGATTTCGATCTTAGGTTTCTGCACAGGACGTCCCCTTGAGCCA
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TCATTGTGCTCTTGCATATACCTCTTGGCGAGGTTGACGTAAAAGAACAATGGTTTCTTG
GTGTTGGAAACCTGAATCCGGTTCTTCTTCTGGGAATCATTGGCCAAGTTCATGTTGTTC
ACTCTCTCTGTAATCTCTTCCATGGATGCTGATTCCTAATTCGTTAACCCTAATTTTTGT
TTCGAGGGAAAGAGGGGGCGAGTAAATAAGACGAGAGACAGAGAGACCC


BQ
10 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EZ48JQ U 2
AF RR4EZ48TF C 2
AF RR4CT42JQ U 1
AF RR4DR15JQ U 2
AF RR4DR15TF C 2
AF RR4A327TFB C 5
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BS 133 133 RR4EZ48JQ
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BS 320 408 RR4CT42JQ
BS 409 409 RR4EZ48JQ
BS 410 464 RR4CT42JQ
BS 465 465 RR4EZ48JQ
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RD RR4EZ48JQ 592 0 0
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CC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4EZ48TF 592 0 0
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AAACATAACAAACTCAAATTCAGCCAAAAATCAATGAAATTAAACAAATAATATAAAGCA
TCAAGACAGAAGAAAGACCCATGAAACCATAACATAAGAAGGGCTATGTTCAGCTCTGGA
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CTGACTTCCCAAGCGTGATTTCGATCTTAGGTTTCTGCACAGGACGTCCCCTTGAGCCAT
CCTTAATATCCACAGTAGAAGTCATGATCTTCTTCTCAACAGCAAAACCATTGTTCTTGA
GTATCTCAGCAATGGTAACAACGGTTGCAATGGCCATCCCAAGGGCAGACAATTCGACAT
CATTGTGCTCTTGCATATACCTCTTGGCGAGGTTGACGTAGAAGAACAATGGTTTCTTGG
TGTTGGAAACCTGAATCCGGTTCTTCTTCTGGGAATCATTGGCCAAGTTCATGTTGTTCA
CTCTCTCTGTAATCTCTTCCATGGATGCTGATTCCTAATTCGTTAACCCT
CC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4CT42JQ 649 0 0
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DS 

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CATTGTGCTCTTGCATATACCTCTTGGCGAGGTTGACGTAAAAAAACAATGGTTTCTTGG
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CC

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DS 

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TCAAGACAGAAGAAAGACCCATGAAACCATAACATAAGAAGGGCTATGTTCAGCTCTGGA
CTTGAGCATCTGCAGCTTCTTTTTCTTCATTGGCTGCAGCCATTAGTTCATCAAACTTCT
CTGACTTCCCAAGCGTGATTTCGATCTTAGGTTTCTGCACAGGACGTCCCCTTGAGCCAT
CCTTAATATCCACAGTAGAAGTCATGATCTTCTTCTCAACAGCAAAACCATTGTTCTTGA
GTATCTCAGCAATGGTAACAACGGTTGCAATGGCCATCCCAAGGGCAGACAATTCGACAT
CATTGTGCTCTTGCATATACCTCTTGGCGAGGTTGACGTAGAAGAACAATGGTTTCTTGG
TGTTGGAAACCTGAATCCGGTTCTTCTTCTGGGAATCATTGGCCAAGTTCATGTTGTTCA
CTCTCTCTGTAATCTCTTCCATGGATGCTGATTCCTAATTCGTTAACCCTAATTTTTGTT
TCGAGGGAAAGAGGGGGC
CC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4A327TFB 645 0 0
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CATAACAAACTCAAATTCAGCCAAAAATCAATGAAATTAAACAAATAATATAAAGCATCA
AGACAGAAGAAAGACCCATGAAACCATAACATAAGAAGGGCTATGTTCAGCTCTGGACTT
GAGCATCTGCAGCTTCTTTTTCTTCATTGGCTGCAGCCATTAGTTCATCAAACTTCTCTG
ACTTCCCAAGCGTGATTTCGATCTTAGGTTTCTGCACAGGACGTCCCCTTGAGCCATCCT
TAATATCCACAGTAGAAGTCATGATCTTCTTCTCAACAGCAAAACCATTGTTCTTGAGTA
TCTCAGCAATGGTAACAACGGTTGCAATGGCCATCCCAAGGGCAGACAATTCGACATCAT
TGTGCTCTTGCATATACCTCTTGGCGAGGTTGACGTAGAAGAACAATGGTTTCTTGGTGT
TGGAAACCTGAATCCGGTTCTTCTTCTGGGAATCATTGGCCAAGTTCATGTTGTTCACTC
TCTCTGTAATCTCTTCCATGGATGCTGATTCCTAATTCGTTAACCCTAATTTTTGTTTCG
AGGGAAAGAGGGGGCGAGTAAATAAGACGAGAGACAGAGAGACCC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

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CATCCATACAAATTGCATTTGTTCTATGTAAATTATGTCCGAATAATACGAAAAAACTGG
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TATTAGTTCCGGGAACTGCTGGCGTTGAGGTTCTGGAAGAGCTCAGGAAGATGAGCGTTG
GTGAGTTTGGTCCTCTTGCTGATCTCTTGTTTCTTCTTCTTCTGCTTTGGTTTATTCGAT
ACCCCTTGGATCTGTGCAGCGGCTCTCCTCTGCGCAGTGTTCATCACAGGCTTCAAACCA
ATCTTCTGCAGCTCCTTCTCCACATCAAGAAGGTCGCTGGGAATGTCTATGTCTCGGAAC
AGAGATTTGAACTCGTCATCAACCTCAATCTGGCCCTTGAAGTCGTTTGGGTACGCAATG
TCCTCTTGTGAATCAGCGTTTGACAGGAACCATATGTGTTTTGAAGCTTTCAGAGCCTGT
AAATCATCCATGACATTAGGGTAAGCGTCTTTGAGATCAACAGCTGCAATCCCAGCAGGA
TACTTCTTGATCAGGGAGAGAAGCTGGTTCTTGTCTTTAACATCATGCTTAGCCTTGTAA
GAGAACCTCCTTCCGTCATAATAAACTTTGGGATTGTTCCTGAGACTATCAAAGACAGCT
TTATTCGAAAGCATATCAACATAACACCTTTCGTTAATCTGCTCCGGTGTGAAGGCTTGT
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ATGCTGTTGATAAACTGAAGACGCTCAGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH63JQ U 1
AF RR4G682JQ U 8
AF RR4EY31JQ U 84
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RD RR4EH63JQ 657 0 0
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CTTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4G682JQ 755 0 0
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TTTGTTCTATGTAAATTATGTCCGAATAATACGAAAAAACTGGGGGCTCAATCTCCCAGT
AACAGTCTTCGAACCGACATAATCATATTCCATTTATGAAGTTTATTAGTTCCGGGAACT
GCTGGCGTTGAGGTTCTGGAAGAGCTCAGGAAGATGAGCGTTGGTGAGTTTGGTCCTCTT
GCTGATCTCTTGTTTCTTCTTCTTCTGCTTTGGTTTATTCGATACCCCTTGGATCTGTGC
AGCGGCTCTCCT**GCGCAGTGTTCATCACAGGCTTCAAACCAATCTTCTGCAGCTCCTT
CTCCACATCAAGAAGGTCGCTGGGAATGTCTATGTCTCGGAACAGAGATTTGAACTCGTC
ATCAACCTCAATCTGGCCCTTGAAGTCGTTTGGGTACGCAATGTCCTCTTGTGAATCAGC
GTTTGACAGGAACCATATGTGTTTTGAAGCTTTCAGAGCCTGTAAATCATCCATGACATT
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ATAATAAACTTTGGGATTGTTCCTGAGACTATCAAAGACAGCTTTATTCGAAAGCATATC
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QA 11 755 11 755
DS 

RD RR4EY31JQ 789 0 0
CTG
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CGAACCGACATAATCATATTCCATTTATGAAGTTTATTAGTTCCAGGAACTGCTGGCGTT
GAGGTTCTGGAAGAGCTCAGGAAGATGAGCGTTGGTGAGTTTGGTTCTCTTGCTGATCTC
TTGTTTCTTCTTCTTCTGCTTGGGTTTATTCGATACCCCTTGGATCTGTGCAGCAGCTCT
CCTCTGCGCAGTGTTCATCACAGGCTTCAAACCAATCTTCTGCAGCTCCTTCTCCACATC
AAGAAGGTCGCTGGGAATGTCTATGTCACGGAACAGAGATTTAAACTCGTCGTCAACCTC
AATCTGCCCCTTGAAGTCGTTAGGGTAAGCAATGTCCTCTTGTGAATCAGCGTTTGACAG
GAACCATATGTGTTTTGAAGCTTTCAGAGCCTGTAAATCATCCATGACATTAGGGTAAGC
GTCTTTGAGATCAACAGCTGCAATCCCAGCAGGATACTTTTTGATCAGGGAGAGAAGCTG
GTTCTTGTCTTTAACATCATGCTTAGCTTTGTAAGAGAACCTCCTTCCGTCATAATAAAC
TTTGGGGTTGTTCCTGAGACTATCAAAGACAGCTTTGTTCGAAAGCATATCAACATAACA
CCTTTCGTTAATCTGCTCCGGTGTGAAGGCTTGTCTTGCCTCAAGGAGAAGCTCAATGAC
ACGCTTGATTTGAGCACCGACAGGACCTTTCCTGATGCTGTTGATAAACTGAAGACGCTC
AGTGTC

QA 4 789 4 789
DS 



AS 1 5

CO CL1311Contig1 940 5 38 U
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TGGCAGAAGACTTTTCGGTGGTAGTCTTAGCTTCTGATCTAGGCGTCGACGCTCGACCGT
TCTTAACTAGAAGCGATGAGATCGATGAGCAAGAGAACTGGCACGACTGTCCTCAATACC
TCGGCGACGACGAAGACTTCTCCGATCTCGATCTCCTCCACTTCTTCACCCTCCAAGGCT
CCGATAAGTCCGGTAACCGGATCTTCCGCGTCGTCGGAAAGTACTTTCCTGCTCGTGTGG
TGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGAAGATTAGCAACGAGTGTCCCGAGG
GACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTCAAAAGGACGAGAACTCACCGGGGA
TTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTTCCGAGATCAAAGACAGGCTCCAAG
TTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCGAGACTTGTCATTGCCACTCTCGGTCGCC
TTCTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGTATGTGAGCAGGTTGCAGTATCTGT
GGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTTCCTGACTCTGTGAACAACCATGATAACG
TGCTTGAGCATAGACCGTTAACTGACTATGGAATCGAACCGGATCCTTTTCATTTAACCG
AGGTTCAGTCTTCTTCGTTCTCACTCAACAGAGAACTCAACCAGTACGAGAATAGATGGG
TCTCATAGTGTACTTTTCTCCTCTTCTGTAATGCCAGAACCTCTGTGTTTTATGTTTCTT
GTATAGAGTATAATTGAGTGTCTAAAAACTCTTCAGTGTCAATGTGGTTTTGATTGATTT
TGGACAGAACCAGTAACTAATTATTGTCGTTGGTAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC52TF U 35
AF RR4C844TF U 1
AF RR4DM80TF U 32
AF RR4DM80JQ C 183
AF RR4EC52JQ C 344
BS 1 94 RR4C844TF
BS 95 95 RR4DM80TF
BS 96 127 RR4C844TF
BS 128 128 RR4DM80TF
BS 129 136 RR4C844TF
BS 137 137 RR4DM80TF
BS 138 229 RR4C844TF
BS 230 230 RR4DM80TF
BS 231 254 RR4C844TF
BS 255 255 RR4DM80TF
BS 256 289 RR4C844TF
BS 290 290 RR4DM80TF
BS 291 355 RR4C844TF
BS 356 356 RR4DM80TF
BS 357 472 RR4C844TF
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BS 474 556 RR4C844TF
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BS 680 680 RR4DM80TF
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BS 684 718 RR4C844TF
BS 719 722 RR4DM80TF
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BS 793 911 RR4DM80JQ
BS 912 940 RR4EC52JQ

RD RR4EC52TF 594 0 0
GG
AAAGATCCGTGAGAGTTCCGGCGATGGCAGAAGACTTTTCGGTGGTAGTCTTAGCTTCTG
ATCTAGGCGTCGACGCTCGACCGTTCTTAACTAGAAGCGATGAGATCGATGAGCAAGAGG
ACTGGCACGACTGTCCTCAATACCTCGGCGACGACGAAGACTTCTCCGATCTCGATCTCC
TCCACTTCTTCACCCTCCAAGGCTCCGATAAGTCCGGTAACCGGATCTTCCGCGTCGTCG
GAAAGTACTTTCCTGCTCGTGTGGTGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGA
AGATTAGCAACGAGTGTCCCGAGGGACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTC
AAAAGGACGAGAACTCACCGGGGATTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTT
CCGAGATCAAAGACAGGCTCCAAGTTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCGAGAC
TTGTCATTGCCACTCTCGGTCGCCTTCTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGC
ATGTGAGCAGGTTGCAGTATCTGTGGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGA

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR4C844TF 718 0 0
GGGATCCTTAACCAAAACACACACTCAAAAGGTAGAAAAGATCCGTGAGAGTTCCGGCGA
TGGCAGAAGACTTTTCGGTGGTAGTCTTAGCTTCCGATCTAGGCGTCGACGCTCGACCGT
TCTTAACGAGAAGCGACGAGATCGATGAGCAAGAGAACTGGCACGACTGTCCTCAATACC
TCGGCGACGACGAAGACTTCTCCGATCTCGATCTCCTCCACTTCTTCACTCTCCAAGGCT
CCGATAAGTCCGGTTACCGGATCTTCCGCGTCGTCGGAAAGTACTTTCCGGCTCGTGTGG
TGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGAAGATTAGCAACGAGTGTCCAGAGG
GACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTCAAAAGGACGAGAACTCACCGGGGA
TTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTTCCGAGATCAAAGACAGACTCCAAG
TTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCGAGACTTGTCATTGCCACTCTCGGTCGCC
TTCTTCTAACTGGAGGACTGTACTGGAAGATTAAGTATGTGAGCAGGTTGCAGTATCTTT
GGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTCCCTGACTTTGTGAACAACCATGACAATG
TGCTTGAGCATAGACCGTTGACGGACTATGGAATCGAACCGGATCCTTTTCATTTAAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4DM80TF 764 0 0
GGGGA
AAAGATCCGTGAGAGTTCCGGCGATGGCAGAAGACTTTTCGGTGTTAGTCTTAGCTTCTG
ATCTAGGCGTCGACGCTCGACCGTTCTTAACTAGAAGCGATGAGATCGATGAGCAAGAGA
ACTGGCACGACTGTCCTCAATACCTCGGCGACGACGAAGACTTCTCCGATCTCGATCTCC
TCCACTTCTTCACCCTCCAAGGCTCCGATAAGTCCGGTAACCGGATCTTCCGCGTCGTCG
GAAAGTACTTTCCTGCTCGTGTGGTGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGA
AGATTAGCAACGAGTGTCCCGAGGGACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTC
AAAAGGACGAGAACTCACCGGGGATTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTT
CCGAGATCAAAGACAGGCTCCAAGTTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCGAGAC
TTGTCATTGCCACTCTCGGTCGCCTTCTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGT
ATGTGAGCAGGTCGCAGTATCTGTGGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTTCCTG
ACTCTGTGAACAACCATGATAACGTGCTTGAGCATAGACCGTTAACTGACTATGGAATCG
AACCGGATCCTTTTCATTTAACCGAG*TTCAGTCTTCTTCGTTCTCACTCAACAGAGAAC
TCAACCAGTACGAGAATAGATGGGTCTCATAGTGTA
CTT

QA 6 761 6 761
DS 

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GATAAGTCCGGTAACCGGATCTTCCGCGTCGTCGGAAAGTACTTTCCTGCTCGTGTGGTG
AGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGAAGATTAGCAACGAGTGTCCCGAGGGA
CCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTCAAAAGGACGAGAACTCACCGGGGATT
ACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTTCCGAGATCAAAGACAGGCTCCAAGTT
GTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCGAGACTTGTCATTGCCACTCTCGGTCGCCTT
CTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGTATGTGAGCAGGTCGCAGTATCTGTGG
GAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTTCCTGACTCTGTGAACAACCATGATAACGTG
CTTGAGCATAGACCGTTAACTGACTATGGAATCGAACCGGATCCTTTTCATTTAACCGAG
GTTCAGTCTTCTTCGTTCTCACTCAACAGAGAACTCAACCAGTACGAGAATAGATGGGTC
TCATAGTGTACTTTTCTCCTCTTCTGTAATGCCAGAACCTCTGTGTTTTATGTTTCTTGT
ATAGAGTATAATTGAGTGTCTAAAAACTCTTCAGTGTCAATGTGGTTTTGATTGATTTTG
GACAGAACC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4EC52JQ 597 0 0
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CGAGAACTCACCGGGGATTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTTCCGAGAT
CAAAGACAGGCTCCAAGTTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCGAGACTTGTCAT
TGCCACTCTCGGTCGCCTTCTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGCATGTGAG
CAGGTTGCAGTATCTGTGGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTTCCTGACTTTGT
GAACA*CCATGATAACGTGCTTGAGCATAGACCGTTAACTGACTATGGAATCGAACCGGA
TCCTTTTCATTTAACCGAGGTTCAGTCTTCTTCGTTCTCACTCAACAGAGAACTCAACCA
GTACGAGAATAGATGGGTCTCATAGTGTACTTTTCTCCTCTTCTGTAATGCCAGAACCTC
TGTGTTTTATGTTTCTTGTATAGAGTATAATTGAGTGTCTAAAAACTCTTCAGTGTCAAT
GTGGTTTTGATTGATTTTGGACAGAACCAGTAACTAATTATTGTCGTTGGTAAGTTC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 3 6

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GTTATTGATGTTCTTCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTTAAGGAGAAG
CTAGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCGATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACC
CATTTTGGAGGTGGTAAATCTTCAGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTAGAGAGCGCT
AAGAAGTTCGAACCCAAGTACAGGCTTATCAGGAATGGTCTTGATACCAAGATTGAGAAA
TCAAGGAAACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATACGTGGTGTTAAGAAG
ACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGATCTCAAGAGACAGTATCAGCCATTTTCG
GTTCTTGTTCACTGCGTAATCACCTGTTATGTCATTTTAAGTTTTATTTGTCTGCTTTTA
GATTTTTTTCTTTTCCACCGACTAGACATGTATACTAAATCTCGAGCCTTTTGCTTGTTT
CAATCGAATTTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4DP16JQ C 1
AF RR4DP16TF U 1
BS 1 8 RR4DP16JQ
BS 9 613 RR4DP16TF
BS 614 617 RR4DP16JQ

RD RR4DP16JQ 617 0 0
GGACTCTCGCCGGCGACGAACTCAAATCTTTGCAAAGAGATCGTAGCGATGTCGGAAAAG
GCAGTCACGATCAGAACCCGAAAGTTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAGTTC
GTTATTGATGTTCTTCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTTAAGGAGAAG
CTAGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCGATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACC
CATTTTGGAGGTGGTAAATCTTCAGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTAGAGAGCGCT
AAGAAGTTCGAACCCAAGTACAGGCTTATCAGGAATGGTCTTGATACCAAGATTGAGAAA
TCAAGGAAACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATACGTGGTGTTAAGAAG
ACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGATCTCAAGAGACAGTATCAGCCATTTTCG
GTTCTTGTTCACTGCGTAATCACCTGTTATGTCATTTTAAGTTTTATTTGTCTGCTTTTA
GATTTTTTTCTTTTCCACCGACTAGACATGTATACTAAATCTCGAGCCTTTTGCTTGTTT
CAATCGAATTTTTGTTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4DP16TF 617 0 0
GGACTCTC
GCCGGCGACGAACTCAAATCTTTGCAAAGAGATCGTAGCGATGTCGGAAAAGGCAGTCAC
GATCAGAACCCGAAAGTTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAGTTCGTTATTGA
TGTTCTTCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTTAAGGAGAAGCTAGCGAG
GATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCGATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCATTTTGG
AGGTGGTAAATCTTCAGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTAGAGAGCGCTAAGAAGTT
CGAACCCAAGTACAGGCTTATCAGGAATGGTCTTGATACCAAGATTGAGAAATCAAGGAA
ACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATACGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGC
TGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGATCTCAAGAGACAGTATCAGCCATTTTCGGTTCTTGT
TCACTGCGTAATCACCTGTTATGTCATTTTAAGTTTTATTTGTCTGCTTTTAGATTTTTT
TCTTTTCCACCGACTAGACATGTATACTAAATCTCGAGCCTTTTGCTTGTTTCAATCGAA
TTTTT
GTTT

QA 9 613 9 613
DS 



CO CL1312Contig2 518 2 2 U
CAAACAAAAAATTCAATTGAAACAAGCAAAAAGCTCGAGATTTAGTATACATGTCTAGTT
GGAAAGCAAAAAAAAATCTAAAAGCAAACAAATAAAACTTAAAATGACATAACAGGGGAT
TACCCAAAACAAAAACCGAAAATGGCTGATACTGTCTCTTGAAATCTCACTTCTTCTTGG
GGTCACCAGCCTTGGTCTTCTTAACACCACGTATCTTCTTGGCACGGTTCTTCCTTTCCT
TAATTTGTTTCCTTGATTTCCCAATCTTGGTATCAAGACCATTCCTGATAAGTCTGTACT
TGGGTTCAAACTTCTTAGCGCTCTCGACATTGTCATAAATCAAACCAAACCCTGAAAATT
TGCCACCTCCAAAATGGGTTCTGAATTTGAAAACAAATATTGCATTTGGGTCCTTGACCT
CGTACGTCCTCGCTAGCTTCTCCTTAAGCTCAGCCTTTGAAACATTGGCTCTTCCAGGGT
GAAAAACATCAATAACGAATTGCTTCCTTGAGAGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ75JQ U 1
AF RR4DU76JQ U 43
BS 1 428 RR4DQ75JQ
BS 429 518 RR4DU76JQ

RD RR4DQ75JQ 428 0 0
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GGAAAGCAAAAAAAAATCTAAAAGCAAACAAATAAAACTTAAAATGACATAACAGGGGAT
TACCCAAAACAAAAACCGAAAATGGCTGATACTGTCTCTTGAAATCTCACTTCTTCTTGG
GGTCACCAGCCTTGGTCTTCTTAACACCACGTATCTTCTTGGCACGGTTCTTCCTTTCCT
TAATTTGTTTCCTTGATTTCCCAATCTTGGTATCAAGACCATTCCTGATAAGTCTGTACT
TGGGTTCAAACTTCTTAGCGCTCTCGACATTGTCATAAATCAAACCAAACCCTGAAAATT
TGCCACCTCCAAAATGGGTTCTGAATTTGAAAACAAATATTGCATTTGGGTCCTTGACCT
CGTACGTC

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4DU76JQ 476 0 0
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AATGACATAACAGGGGATTACCCAAAACAAAAACCGAAAATGGCTGATACTGTCTCTTGA
AATCTCACTTCTTCTTGGGGTCACCAGCCTTGGTCTTCTTAACACCACGTATCTTCTTGG
CACGGTTCTTCCTTTCCTTAATTTGTTTCCTTGATTTCTCAATCTTGGTATCAAGACCAT
TCCTGATAAGTCTGTACTTGGGTTCGAACTTCTTAGCGCTCTCGACATTGTCATAAATCA
AACCAAACCCTGAAAATTTGCCACCTCCAAAATGGGTTCTGAATTTGAAAACAAATATTG
CATTTGGGTCCTTGACCTCGTACGTCCTCGCTAGCTTCTCCTTAAGCTCAGCCTTTGAAA
CATTGGCTCTTCCAGGGTGAAAAACATCAATAACGAATTGCTTCCTTGAGAGAAGT

QA 1 476 1 476
DS 



CO CL1312Contig3 619 2 2 U
GGGCCGGCGACGAACTCAAATCTTTTGCAGAGAGATCGTAACAATGGCGGAAAAGGCAGT
CACCATCAGAACCCGAAAGTTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAATTCGTTAT
TGATGTTCTTCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTTAAGGAGAAGCTAGC
GAGGACGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATATTTGTTTTCAAATTCAGAACCCATTT
TGGAGGTGGCAAATCTTCAGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAA
GTTCGAACCCAAGTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGATACCAAGATTGAGAAATCAAG
GAAACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATACGTGGTGTTAAGAAGACCAA
GGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGATCTCAAGAGACAGTATCAGCCATTTTCGGTTCT
TGTTCTGCGTAATCACCTGTTATGTCATTTTAAGTTTTATTTGTCTGCTTTTAGATTTTT
TTTTGCTCTCCAACTAGACATGTATACTAAATCTCGAGCTTTTTGCTTGTTTCAATCGAA
TTTTTTGTTTGAAAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ75TF U 1
AF RR4DU76TF U 1
BS 1 605 RR4DQ75TF
BS 606 619 RR4DU76TF

RD RR4DQ75TF 611 0 0
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CACCATCAGAACCCGAAAGTTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAATTCGTTAT
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TGGAGGTGGCAAATCTTCAGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAA
GTTCGAACCCAAGTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGATACCAAGATTGAGAAATCAAG
GAAACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATACGTGGTGTTAAGAAGACCAA
GGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGATCTCAAGAGACAGTATCAGCCATTTTCGGTTCT
TGTTCTGCGTAATCACCTGTTATGTCATTTTAAGTTTTATTTGTCTGCTTTTAGATTTTT
TTTTGCTCTCCAACTAGACATGTATACTAAATCTCGAGCTTTTTGCTTGTTTCAATCGAA
TTTTT
TGTTTG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4DU76TF 619 0 0
GG
GCCGGCGACGAACTCAAATCTTTTGCAGAGAGATCGTAACAATGGCGGAAAAGGCAGTCA
CCATCAGAACCCGAAAGTTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAATTCGTTATTG
ATGTTCTTCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTTAAGGAGAAGCTAGCGA
GGACGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATATTTGTTTTCAAATTCAGAACCCATTTTG
GAGGTGGCAAATCTTCAGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAAGT
TCGAACCCAAGTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGATACCAAGATTGAGAAATCAAGGA
AACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATACGTGGTGTTAAGAAGACCAAGG
CTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGATCTCAAGAGACAGTATCAGCCATTTTCGGTTCTTG
TTCTGCGTAATCACCTGTTATGTCATTTTAAGTTTTATTTGTCTGCTTTTAGATTTTTTT
TTGCTCTCCAACTAGACATGTATACTAAATCTCGAGCTTTTTGCTTGTTTCAATCGAATT
TTTTGTTTGAAAAAAAA

QA 3 619 3 619
DS 



AS 1 6

CO CL1313Contig1 890 6 14 U
GCCCAATGATCAGCTAGATAAAATCTCCTTTTATGGATATATAGCATTGCATTTAGTATT
CT*TTTTTTTTTAAAAGTAGTTCACTCTTATCATCAGACAAGAACAGAAACGCAACACAT
AAAGTTATAATAAACCCAATTAATATCATATCTAGCGCCAAAAGAGGCCTCTGCTTTGAT
AGATT*CTAACCAGAGCAGAGCTTTTCAAGCGCCAGATTCTCATCTCCACCACTTGATTC
AATTGCACTCCTGACCTGAGCATCTCCAAAACCCATCTCCACAAGTCTCTTCACTTTGTC
CTCAAGAGAAGAGTTCTTGGCGAATGTTTGGGTCCAGTAACGGGCTGTTGATACGAACAC
TTGATAGTTCTTCATGTACTGCTCAGCAACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGG
TGCAGAGAGTAATGCCTGGACAGAAACAAGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCA
CTGGTCTTTCAAGACATCCAAGCATATTGCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCA
AACTTTGGTTGAAAATTGCATCTTTGGAGGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATGGTGAT
ATCGATCTGAAAGGTTCCGCCTTCGTAAGGAGTACCGATTGGACCGGGGATGGTTCCGGT
GAGTCGGGTAAGGTTGTCGGATTTCGGGCAGACCCGGATGCCCGAGGAGTCTCTGTCTTT
CTCGCAATCTTGGAGCTCTTTCTGGACTCGGCTGATATCTATCATCCTCGCGATCCGAAT
TGAACAATAATCCCCACAGAAGAGAGAGAATTGGAAGAAAAAAAAAGATAAGATGTGTTG
AGTTAAAAGAAGCTTCTTTTCTTGCAGAGGTTATCGAACCGGCACTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D307JQ U 16
AF RR4DA49JQ U 20
AF RR4DA49TF C 260
AF RR4DS40JQ U 1
AF RR4DS40TF C 252
AF RR4D307TF C 260
BS 1 32 RR4DS40JQ
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RD RR4D307JQ 638 0 0
AGATAAAATCTCC
TTTTATGGATATATAGCATTGCATTTAGTATTCT*TTTTTTTTTTAAAGTAGTTCACTCT
TATCATCAGACAAGAACAGAAACGCAACACATAAAGTTATAATAAACCCAATTAATATCA
TATCTAGCGCCAAAAGAGGTCTCTGCTTTGATAGATT*CTAACCAGAGCAGAGCTTTTCA
AGCGCCAGATTCTCATCTCCACCACTTGATTCAATTGCACTCCTGACCTGAGCATCTCCA
AAACCCATCTCCACAAGTCTCTTCACTTTGTCCTCAAGAAAAAAGTTCTTGGCGAATGTT
TGGGTCCAGTAACGGGCTGTTGATACGAACACTTGATAGTTCTTCATGTACTGCTCAGCA
ACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGGTGCAGAAAGTAATGCCTGGACAGAAACA
AGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCACTGGTCTTTCAAGACATCCAAGCATATT
GCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCAAACTTTGGTTGAAAATTGCATCTTTGGA
GGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATG*TGATATCGATCTGAAAGGTTCCGCCTTCGTAA
GGAGTACCGATTGGACCGGGGATGG

QA 14 638 14 638
DS 

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GGAAACTCG
TTTTATGGATATATAGCATTGCATTTAGTATTCTCTTTTTTTTTAAAAGTAGTTCACTCT
TATCATCAGACAAGAACAGAAACGCAACACATAAAGTTATAATAAACCCAATTAATATCA
TATCTAGCGCCAAAAGAGGCCTCTGCTTAAATAGATTTCCAACCAGAGCAGAGCTTTTCA
AGCGCCAGATTCTCATCTCCACCACTTGATTCAATTGCACTCCTGACCTGAGCATCTCCA
AAACCCATCTCCACAAGTCTCTTCACTTTGTCCTCAAGAAAAGAGTTCTTGGCGAATGTT
TGTGCCCAGTAACGAGATGTTGATACGAACACTTGATAGTTCTTCATGTACTGCTCAGCA
ACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGGTGCAGAAAGTAATGCCTGGACAGAAACA
AGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCACTGGTCTTTCAAGACATCCAAGCATATT
GCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCAAACTTTGGTTGAAAATTGCATCTTTGGA
GGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATGGTGATATCGATCTGAAAGGTTCCGCCTTCGTAA
GGAGTACCGATTGGACCGGGGATGGTTCCGGTGAGTCGGGTAAGGTTATCGGATTTCGGG
CAGACCCGGATGCCC

QA 10 684 10 684
DS 

RD RR4DA49TF 555 0 0
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GCGAATGTTTGTGCCCAGTAACGAGATGTTGATACGAACACTTGATAGTTCTTCATGTAC
TGCTCAGCAACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGGTGCAGAGAGTAATGCCTGG
ACAGAAACAAGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCACTGGTCTTTCAAGACATCC
AAGCATATTGCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCAAACTTTGGTTGAAAATTGC
ATCTTTGGAGGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATGGTGATATCGATCTGAAAGGTTCCG
CCTTCGTAAGGAGTACCGATTGGACCGGGGATGGTTCCGGTGAGTCGGGTAAGGTTATCG
GATTTCGGGCAGACCCGGATGCCCGAGGAGTCTCTGTCTTTCTCGCAATCCTGGAGCTCT
TTCTGGACTCGGCTGATATCTATCATCCTCGCGATCCCAATTGAACAATAATCCCCACAA
AAGAGAGAGAATTGG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4DS40JQ 850 0 0
GCCCAATGATCAGCTAGATAAAATCTCCTTTTGTGGATATATAGCATTGCATTTAGTATT
CT*TTTTTTTT**AAAGTAGTTCACTCTTATCATCAGACAAGAACAGAAACGCAACACAT
AAAGTTATAATAAACCCAATTAATATCATATCTAGCGCCAAAAGAGGCCTCTGCTTTGAT
AGATT*CTAACCAGAGCAGAGCTTTTCAAGCGCCAGATTCTCATCTCCACCACTTGATTC
AATTGCACTCCTGACCTGAGCATCTCCAAAACCCATCTCCACAAGTCTCTTCACTTTGTC
CTCAAGAGAAGAGTCCTTGGCGAATGTTTGGGTCCAGTAACGGGCTGTTGATACGAACAC
TTGATAGTTCTTCATGTACTGCTCAGCAACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGG
TGCAGAGAGTAATGCCTGGACAGAAACAAGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCA
CTGGTCTTTCAAGACATCCAAGCATATTGCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCA
AACTTTGGTTGAAAATTGCATCTTTGGAGGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATGGTGAT
ATCGATCTGAAAGGTTCCGCCTTCGTAAGGAGTACCGATTGGACCGGGGATGGTTCCGGT
GAGTCGGGTAAGGTTGTCGGATTTCGGGCAGACCCGGATGCCCGAGGAGTCTCTGTCTTT
CTCGCAATCTTGGAGCTCTTTCTGGACTCGGCTGATATCTATCATCCTCGCGATCCGAAT
TGAACAATAATCCCCACAGAAGAGAGAGAATTGGAAGAAAAAAAA*GA*AAGATGTGTTG
AGTTAAAA
AA

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR4DS40TF 622 0 0
TGACGTGAGCATCTCCAAAACCCATCTCCACAAGTCTCTTCACTTTGTCCTCAAGAGAAG
AGTCCTTGGCGAATGTTTGGGTCCAGTAACGGGCTGTTGATACGAACACTTGATAGTTCT
TCATGTACTGCTCAGCAACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGGTGCAGAGAGTA
ATGCCTGGACAGAAACAAGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCACTGGTCTTTCA
AGACATCCAAGCATATTGCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCAAACTTTGGTTG
AAAATTGCATCTTTGGAGGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATGGTGATATCGATCTGAA
AGGTTCCGCCTTCGTAAGGAGTACCGATTGGACCGGGGATGGTTCCGGTGAGTCGGGTAA
GGTTGTCGGATTTCGGGCAGACCCGGATGCCCGAGGAGTCTCTGTCTTTCTCGCAATCTT
GGAGCTCTTTCTGGACTCGGCTGATATCTATCATCCTCGCGATCCGAATTGAACAATAAT
CCCCACAGAAGAGAGAGAATTGGAAGAAAAAAAAAGATAAGATGTGTTGAGTTAAAAGAA
GCTTCTTTTCTTGCAGAGGTT
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4D307TF 631 0 0
GCATCTCCAAAACCCATCTCCACAAGTCTCTTCACTTTGTCCTCAAGAGAAGAGTTCTTG
GCGAATGTTTGGGTCCAGTAACGGGCTGTTGATACGAACACTTGATAGTTCTTCATGTAC
TGCTCAGCAACAACAGCATCTTGAGGGTCTTTAGGCTCTGGTGCAGAGAGTAATGCCTGG
ACAGAAACAAGAGCTGTCTTCAAAGTAAGAGCTGGACTCCACTGGTCTTTCAAGACATCC
AAGCATATTGCCCCGCTTTGGCTACTGATATTCGGGTGCCAAACTTTGGTTGAAAATTGC
ATCTTTGGAGGCTCAAAGGGATACCCTTCTGGAATG*TGATATCGATCTGAAAGGTTCCG
CCTTCGTAAGGAGTACCGATTGGACCGGGGATGGTTCCGGTGAGTCGGGTAAGGTTGTCG
GATTTCGGGCAGACCCGGATGCCCGAGGAGTCTCTGTCTTTCTCGCAATCTTGGAGCTCT
TTCTGGACTCGGCTGATATCTATCATCCTCGCGATCCGAATTGAACAATAATCCCCACAG
AAGAGAGAGAATTGGAAGAAAAAAAAAGATAAGATGTGTTGAGTTAAAAGAAGCTTCTTT
TCTTGCAGAGGTTATCGAACCGGCACTTCCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 6

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GAGAGAATTCTCTCTTTCTTTCCCTGTTCACAGACTCTTATCTTTCACAGGGAGAAAGAG
ATTAGTCTTATGTTTTGATTTGTTTTTGTTCGCTTAGGCGATTTTGTTTTCCGGGTTAGC
GGATTAGTCTTTTCCCTTGGGGATTTTGTAGTGTTTCAATCTAAAGTTGAAGCTGTTGGT
TTCATTCCGATCTTATCTCTTTGACTTTGGGTTGAATAATAAATAAGTAATCCCGATCGT
TAGATCGGCCTCCTCTTCTGCAAAAAATTACTAGATTCCATTTGTTTGGGTTGGATTCTC
TGTCTAATCAATGATAAGCACTTATTCCTTATCAATAAGAGTCAATCTTTACTCTAAAGT
AAAGTCGATAGGCGTTTGGTAAAGTATCTTTGCGACAAGGATGCGGTGGAGTTGGATTGA
CATCGGTTAACTTAACGGAGGTTTAGAAGAGCCGGCGTTTTCTTTATGAAGACGGTCCAG
CAAAAGATCTCTTGTTTGGTCAAATCGATATATCCCAGAGTTATAATCGGAGATAGATGG
AGATCCATCAGCACAAGCAAAGGTTGGAGCAGAGGTGGAGTAAGAAGGTTTTGACGTTCT
TACAGCGAGGTTATCACGGATTTTCCGGGGGTGAGAAGCGAAAGACGGAGGTTGTACAGA
GACTCCCGACGGTGAAGAATTGAGGCGACAGAGACGATGTCTTGCATGAGGGACACGTAT
TACTAACAGTTGTCCTCAGATCTTCACCAAGCTGATACGTGGAAGGACAGACATCAATTG
CAAGCCAACCTCTATCTTGAGCCTATAATAGGGCTTCTCTTGTTTTATGTTAATGGACCA
CGTTTTGTAATAATGTCAAACCTTTGTAAAACAGCCCATTGGGCTAGTTTCAATGAAAAT
ATTGTCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4GB14TF U 35
AF RR4FR46TF U 19
AF RR4FZ60TF U 1
AF RR4FR46JQ C 210
AF RR4GB14JQ C 220
AF RR4FZ60JQ C 390
BS 1 622 RR4FZ60TF
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RD RR4GB14TF 510 0 0
GGG
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TTATCTTTCACGGGGAGAAAGAGATTAGTCTTATGTTTTGATTTGTTTTTGTTCGCTTAG
GCGATTTTGTTTTCCGGGTTAGCGGATTAGTCTTTTCCCTTGGGGATTTTGTAGTGTTTC
AATCTAAAGTTGAAGCTGTTGGTTTCATTCCGATCTTATCTCTTTGACTTTGGGTTGAAT
AATAAATAAGTAATCCCGATCGTTAGATCGGCCTCCTCTTCTGCAAAAA*TTACTAGATT
CCATTTGTTTGGGTTGGATTCTCTGTCTAATCAATGATAAGCACTTATTCCTTATCAATA
AGAGTCAATCTTTACTCTAAAGTAAAGTCGATAGGCGTTTGGTAAAGTATCTTTGCGACA
AGGATGCGGTGGAGTTGGATTGACATCGGTTAACTTAACGGAGGTTTAGAAGAGCCGGCG
TTTTCTTTATGAAGACGGTCCAGCAAA

QA 4 510 4 510
DS 

RD RR4FR46TF 623 0 0
GG
AAATTCGTGGTAAAAATACTCTCTCTCTTCTCTTTAGAGAGAGAGAATTCTCTCTTTCTT
TCCCTGTTCACAGACTCTTATCTTTCACAGGGAGAAGGAGATTAGTCTTATGTTTTGATT
TGTTTTTGTTCGCTTAGGCGATTTTGTTTTCCGGGTTAGCGGATTAGTCTTTTCCCTTGG
GGATTTTGTAGTGTTTCAATCTAAAGTTGAAGCTGTTGGTTTCATTCCGATCTTATCTCT
TTGACTTTGGGTTGAATAATAAATAAGTAATCCCGATCGTTAGATCGGCCTCCTCTTCTG
CAAAAAATTACTAGATTCCATTTGTTTGGGTTGGATTCTCTGTCTAATCAATGATAAGCA
CTTATTCCTTATCAATAAGAGTCAATCTTTACTCTAAAGTAAAGTCGATAGGCGTTTGGT
AAAGTATCTTTGCGACAAGGATGCGGTGGAGTTGGATTGACATCGGTTAACTTAACGGAG
GTTTAGAAGAGCCGGCGTTTTCTTTATGAAGACGGTCCAGCAAAAGATCTCTTGTTTGGT
CAAATCGATATATCCCAGAGTTATAATCGGAGATAGATGGAGATCCATCAGCACAAGCAA
AG*TTGGAGCAGAG
TGGAGTA

QA 3 616 3 616
DS 

RD RR4FZ60TF 699 0 0
GGAAGATACAGAACGGCAGCAAATTCGTGGTAAAAAGACTCTCTCTCTTCTCTTTAGAGA
GAGAGAATTCTCTCTTTCTTTCCCTGTTCACAGACTCTTATCTTTCACAGGGAGAAAGAG
ATTAGTCTTATGTTTTGATTTGTTTTTGTTCGCTTAGGCGATTTTGTTTTCCGGGTTAGC
GGATTAGTCTTTTCCCTTGGGGATTTTGTAGTGTTTCAATCTAAAGTTGAAGCTGTTGGT
TTCATTCCGATCTTATCTCTTTGACTTTGGGTTGAATAATAAATAAGTAATCCCGATCGT
TAGATCGGCCTCCTCTTCTGCAAAAAATTACTAGATTCCATTTGTTTGGGTTGGATTCTC
TGTCTAATCAATGATAAGCACTTATTCCTTATCAATAAGAGTCAATCTTTACTCTAAAGT
AAAGTCGATAGGCGTTTGGTAAAGTATCTTTGCGACAAGGATGCGGTGGAGTTGGATTGA
CATCGGTTAACTTAACGGAGGTTTAGAAGAGCCGGCGTTTTCTTTATGAAGACGGTCCAG
CAAAAGATCTCTTGTTTGGTCAAATCGATATATCCCAGAGTTATAATCGGAGATAGATGG
AGATCCATCAGCACAAGCAAAG*TTGGAGCAGAGGTGGAGTAAGAAG*TTTTGACGTTCT
TACAGCGAGGTTATCACGGATTTTCCGGGG
TGAGAGCGA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4FR46JQ 758 0 0
AGTGTTTCAATCTAAAGTTGAAGCTGTTGGTTTCATTCCGATCTTATCTCTTTGACTTTG
GGTTGAATAATAAATAAGTAATCCCGATCGTTAGATCGGCCTCCTCTTCTGCAAAAAATT
ACTAGATTCCATTTGTTTGGGTTGGATTCTCTGTCTAATCAATGATAAGCACTTATTCCT
TATCAATAAGAGTCAATCTTTACTCTAAAGTAAAGTCGATAGGCGTTTGGTAAAGTATCT
TTGCGACAAGGATGCGGTGGAGTTGGATTGACATCGGTTAACTTAACGGAGGTTTAGAAG
AGCCGGCGTTTTCTTTATGAAGACGGTCCAGCAAAAGATCTCTTGTTTGGTCAAATCGAT
ATATCCCAGAGTTATAATCGGAGATAGATGGAGATCCATCAGCACAAGCAAAGGTTGGAG
CAGAGGTGGAGTAAGAAGGTTTTGACGTTCTTACAGCGAGGTTATCACGGATTTTCCGGG
GGTGATAAGCGAAAGACGGAGGTTGTACAGAGACTCCCGACGGTGAAGAATTGAGGCGAC
AGAGACGATGTCTTGCATGAGGGACACGTATTACTAACAGTTGTCCTCAGATCTTCACCA
AGCTGATACGTGGAAGGACAGACATCAATTGCAAGCCAACCTCTATCTTGAGCCTATAAT
AGGGCTTCTCTTGTTTTATGTTAATGGACCACGTTTTGTAATAATGTCAAACCTTTGTAA
AACAGCCCATTGGGCTAGTTTCAATGAAAATATTGTCG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4GB14JQ 748 0 0
TCTAAAGTTGAAGCTGTTGGTTTCATTCCGATCTTATCTCTTTGACTTTGGGTTGAATAA
TAAATAAGTAATCCCGATCGTTAGATCGGCCTCCTCTTCTGCAAAAA*TTACTAGATTCC
ATTTGTTTGGGTTGGATTCTCTGTCTAATCAATGATAAGCACTTATTCCTTATCAATAAG
AGTCAATCTTTACTCTAAAGTAAAGTCGATAGGCGTTTGGTAAAGTATCTTTGCGACAAG
GATGCGGTGGAGTTGGATTGACATCGGTTAACTTAACGGAGGTTTAGAAGAGCCGGCGTT
TTCTTTATGAAGACGGTCCAGCAAAAGATCTCTTGTTTGGTCAAATCGATATATCCCAGA
GTTATAATCGGAGATAGATGGAGATCCATCAGCACAAGCAAAGGTTGGAGCAGAGGTGGA
GTAAGAAGGTTTTGACGTTCTTACAGCGAGGTTATCACGGATTTTCCGGGGGTGAGAAGC
GAAAGACGGAGGTTGTACAGAGACTCCCGACGGTGAAGAATTGAGGCGACAGAGACGATG
TCTTGCATGTGGGACACGTATTACTAACAGTTGTCCTCAGATCTTCACCAAGCTGATACG
TGGAGGGACAGACATCAATTGCAAGCCAACCTCTATCTTGAGCCTATAATAGGGCTTCTC
TTGTTTTATGTTAATGGACCACGTTTTGTAATAATGTCAAACCTTTGTAAAACAGCCCAT
TGGGCTAGTTTCAATGAAAATATTGTCG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4FZ60JQ 580 0 0
TATCAATAAGAGTCAATCTTTACTCTAAAGTAAAGTCGATAGGCGTTTGGTAAAGTATCT
TTGCGACAAGGATGCGGTGGAGTTGGATTGACATCGGTTAACTTAACGGAGGTTTAGAAG
AGCCGGCGTTTTCTTTATGAAGACGGTCCAGCAAAAGATCTCTTGTTTGGTCAAATCGAT
ATATCCCAGAGTTATAATCGGAGATAGATGGAGATCCATCAGCACAAGCAAAGGTTGGAG
CAGAGGTGGAGTAAGAAGGTTTTGACGTTCTTACAGCGAGGTTATCACGGATTTTCCGGG
GGTGAGAAGCGAAAGACGGAGGTTGTACAGAGACTCCCGACGGTGAAGAATTGAGGCGAC
AGAGACGATGTCTTGCATGAGGGACACGTATTACTAACAGTTGTCCTCAGATCTTCACCA
AGCTGATACGTGGAAGGACAGACATCAATTGCAAGCCAACCTCTATCTTGAGCCTATAAT
AGGGCTTCTCTTGTTTTATGTTAATGGACCACGTTTTGTAATAATGTCAAACCTTTGTAA
AACAGCCCATTGGGCTAGTTTCAATGAAAATATTGTCGAC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 6

CO CL1315Contig1 1196 6 21 U
AATATAACTCTCAATGCTTTTTCAATTGAAATAAAAAGATTCTCATATCTAAGGAGGGAT
ATAGAACTAAGCTTACATTATACACCTTTTTTGTAAACACACAAATAACAAATGGGAGGA
ATGTTACAACAACGCTGAAGAGACGAACACTCATCATCAAACATTCAAAAACCACAATCC
TCAGATCAGATCCCAAACAAAACTAGAAAGTGTCTTCTTCTTCTTCTTCT******GCAT
GAGTTTCTCTATACGCTTGTAGCTCTGTCGATGGAGGCTGCTGGTTTATCTAGTGTAGAT
AGAATTTGCGGCATTGACATTCCACCCGAAACAACAATCTCTATGCCTTCCCGGACCGAG
AGGTTTGGCCTGATAACGTCAATACTGTTGACAAGTAGTATATCTCCGATGTAAAGGTGG
TTCGTTGGAACATAAACACAGCAAAGTTCCTCCTCTGTTGGGTAATTCTGAAGAACAACA
GTTGATGTAATAAACCCAAATGCGTATTCGCCTACACGTGGATGCCTGATGATTGCAACT
TCCTTGAAAGCTTGTGTATTTTGATCAGGAGAAATGGCAGTGCTGATTTGCTTGGAGGCG
TTGTAGATGTGACGAACAAATGGCATCCGCTTGATAAACCACTCGCCCAAGTTCAGAACC
GAAGCCCCCAACCATGAAGACATGAACACTCCGACCAAGAAGATGAATGCGATTGAAGTC
AAGAAACCGAAACCAAAAATGTTGATTCCAAGTTGAGCATAAATGGGAGAGAAGAAGCCA
TCAACAAAGTGGATAAACCACCATGTTATATAGAATGTAATGGCAATGGGAAGGAGGATA
ACACAGCCAGTCATGAACTTCTTAGAGGCCCAACCCCTAATGAACAAGCTTAAAGTCTCG
TGGCTAGCTTGATGATGCGAAGAGGAGGAAGAAGAAGACGGCTTCGAAGTAGAGCCTTCA
TCTTTATCTCTGGAATCAGCGACGGGCATCAGAAGCTCCAGATCTCTTTCTCGATTGGCC
ATCACAACCGTCGGCTTCTCGTCTCCCATCGCTAGTACGATAAGGAATCTTAGAGAGAGA
AATGGCGGTGGACTTCAGGACAGAGATTCGAGTGGCGGTGAGAT*****GAGACTTTTCG
CCGACGACGACTCTTCTTCTGTTGAGCTACTTACTACCTTCCCCAACTTGAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4F528JQ U 7
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ATAGAACTAAGCTTACATTATACACCTTTTTTGTAAACACACAAATAACAAATGGGAGGA
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TCAGATCAGATCCCAAACAAAACTAGAAAGTGTCTTCTTCTTCTTCTTCT******GCAT
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AGGTTTGGCCTGATAACGTCAATACTGTTGACAAGTAGTATATCTCCGATGTAAAGGTGG
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A
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CAACAACGCTGAAGAGACGAACACTCATCATCAAACATTCAAAAACCACAATCCTCAGAT
CAGATCCCAAACAAAACTAGAAAGTGTCTTCTTCTTCTTCT*********GCATGAGTTT
CTCTATACGCTTGTAGCTCTGTCGATGGAGGCTGCTGGTTTATCTAGTGTAGATAGAATT
TGCGGCATTGACATTCCACCCGAAACAACAATCTCTATGCCTTCCCGGACCGAGAGGTTT
GGCCTGATAACGTCAATACTGTTGACAAGTAGTATATCTCCGATGTAAAGGTGGTTCGTT
GGAACATAAACACAGCAAAGTTCCTCCTCTGTTGGGTAATTCTGAAGAACAACAGTTGAT
GTAATAAACCCAAATGCGTATTCGCCTACACGTGGATGCCTGATGATTGCAACTTCCTTG
AAAGCTTGTGTATTTTGATCAGGAAAAATGGCAGTGCTGATTTGCTTGGAGGCGTTGTAG
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TCTCGATTGGCCATCACAACCGTCGGCTTCTCGTCTCCCATCGCTAGTACGATAAGGAAT
CTTAGAGAGAGAAATGGCGGTGGACTTCAGGACAGAGATTCGAGTGGCGGTGAGATTAGA
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CC

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GCTTGGAGGCGTTGTAGATGTGACGAACAAATGGCATCCGCTTGATAAACCACTCGCCCA
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AGAAGAAGCCATCAACAAAGTGGATAAACCACCATGTTATATAGAATGTAATGGCAATGG
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TTAAAGTCTCATGGCTAGCTTGATGATGCGAAGAGGAGGAAGAAGAAGACGGCTTCGAAG
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GAAGCCC

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ACCATGTTATATAGAATGTAATGGCAATGGGAAGGAGGATAACACAGCCAGTCATGAACT
TCTTAGAGGCCCAACCCCTAATGAATAAGCTTAAAGTCTCGTGGCTAGCTTGATGATGCG
AAGAGGAGGAAGAAGAAGACGGCTTCGAAGTAGAGCCTTCATCTTTATCTCTGGAATCAG
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CGTCTCCCATCGCTAGTACGATAAGGAATCTTAGAGAGAGAAATGGCGGTGGACTTCAGG
ACAGAGATTCGAGTGGCGGTGAGAT*****GAGACTTTTCGCCGACGACGACTCTTCTTC
TGTTGAGCTACTTACTACCTTCCCCAACTTGAA

QA 11 643 11 643
DS 



AS 2 6

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GGTTCTGAAATTTCGCTTTCCTCTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGTCATCAGATCTCTCAT
TACGTTCCGTCTGTGAGAAAGTAAAAGCTTGAGGATGGCCTCTGAGACTGGAGAAATCAC
CATCGTATGCAACCACTGTGACAGAGACATTCCAGCTCCAAATATTGATCTGCATCGTGT
ACATTGCGCCCGGAATCTAGAAAAATGTAAGATTTGTGGTGATATGGTTCCTAAAAAGCA
TGCCCAGGAACACTTCTCCAACACCCATGCTCCGGTACCATGCTCGATGTGCAAAGAAAC
CATAGACCGTGAGGTTTTTAATAGTCATACAGAAGAAATCTGCCCCAAGAGGATGGTAAC
TTGTGAGTTCTGTGAGTTTCCACTGCCTGCAGTTGATCTTCCTGAGCATCAGGAAGTATG
TGGCAACCGCACCGAACTCTGTTATCAATGCAACAGCTATGTTAGATTGCGTGAAACGTT
TAACCATGAAACCAAGTGCCCTGGTTCTGTGCTCAACAC***TGTTGAATCTTCCAGAAG
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GTGCGTAGTTCTGTAAAGTTTGCTCAAACTCCCTTCCAGACAGATTCGAAGGAAGGGGTT
TTATACATTTTAAAATACTTACTGAGACAGAGATGTTCTTTCTTCGCTAAGGATTTGTTT
AAGCTGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP15TF U 1
AF RR4AQ15TF U 1
AF RR4F246TF U 1
AF RR4F246JQ C 235
BS 1 243 RR4AQ15TF
BS 244 244 RR4F246TF
BS 245 258 RR4AQ15TF
BS 259 259 RR4F246TF
BS 260 303 RR4AQ15TF
BS 304 304 RR4F246TF
BS 305 324 RR4AQ15TF
BS 325 325 RR4F246TF
BS 326 420 RR4AQ15TF
BS 421 421 RR4F246TF
BS 422 432 RR4AQ15TF
BS 433 433 RR4F246TF
BS 434 492 RR4AQ15TF
BS 493 493 RR4F246TF
BS 494 578 RR4AQ15TF
BS 579 582 RR4F246TF
BS 583 591 RR4AQ15TF
BS 592 592 RR4F246TF
BS 593 610 RR4AQ15TF
BS 611 611 RR4F246TF
BS 612 633 RR4AQ15TF
BS 634 634 RR4F246TF
BS 635 668 RR4AQ15TF
BS 669 721 RR4F246TF
BS 722 909 RR4F246JQ

RD RR4DP15TF 597 0 0
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GGTTCTGAAATTTCGCTTTCCTCTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGTCATCAGATCTCTCAT
TACGTTCCGTCTGTGAGAAAGTAAAAGCTTGAGGATGGCCTCTGAGACTGGAGAAATCAC
CATCGTATGCAACCACTGTGACAGAGACATTCCAGCTCCAAATATTGATCTGCATCGTGT
ACACTGCGCCCGGAATCTTGAAAAATGTAAGATTTGTGGTGATATGGTTCCTAAAAAGCA
TGCTCAGGAACACTTCTCCAACACACATGCTCCGGTACCATGCTCGATGTGCAAAGAAGC
CATAGACCGTGAGGTTTTTAATAGTCATACAGAAGAAATCTGCCCCAAGAGGATGGTAGC
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TAACCATGAAACCAAGTGCCCTGGTTCTGTGCTCAACAACAATGTTGAATCATCCAG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4AQ15TF 668 0 0
GGAAATAAAATCGGAGGTTCGGTTAAGAAAAGATCGGTGCTTGAATCATCATCATCGGGT
GGTTCTGAAATTTCGCTTTCCTCTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGTCATCAGATCTCTCAT
TACGTTCCGTCTGTGAGAAAGTAAAAGCTTGAGGATGGCCTCTGAGACTGGAGAAATCAC
CATCGTATGCAACCACTGTGACAGAGACATTCCAGCTCCAAATATTGATCTGCATCGTGT
ACACTGCGCCCGGAATCTTGAAAAATGTAAGATTTGTGGTGATATGGTTCCTAAAAAGCA
TGCTCAGGAACACTTCTCCAACACACATGCTCCGGTACCATGCTCGATGTGCAAAGAAAC
CATAGACCGTGAGGTTTTTAATAGTCATACAGAAGAAATCTGCCCCAAGAGGATGGTAAC
GTGTGAGTTCTGCGAGTTTCCACTGCCTGCAGTTGATCTTCCTGAGCATCAGGAAGTATG
TGGCAACCGCACGGAACTCTGTTATCAATGCAACAGCTATGTTAGATTGCGTGAAACGTT
TAACCATGAAACCAAGTGCCCTGGTTCTGTGCTCAACAACAATGTTGAATCATCCAGAAG
GGTTCCAAGAGCAGCAGAAGGAGATGGAAACGGGAGGAGGAGAAGAGGTGGCAACGGTGT
ATCTAACA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4F246TF 721 0 0
GGAAATAAAATCGGAGGTTCGGTTAAGAAAAGATCGGTGCTTGAATCATCATCATCGGGT
GGTTCTGAAATTTCGCTTTCCTCTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGTCATCAGATCTCTCAT
TACGTTCCGTCTGTGAGAAAGTAAAAGCTTGAGGATGGCCTCTGAGACTGGAGAAGTCAC
CATCGTATGCAACCACTGTGACAGAGACATTCCAGCTCCAAATATTGATCTGCATCGTGT
ACATTGCGCCCGGAATCTAGAAAAATGTAAGATTTGTGGTGATATGGTTCCTAAAAAGCA
TGCCCAGGAACACTTCTCCAACACCCATGCTCCGGTACCATGCTCGATGTGCAAAGAAAC
CATAGACCGTGAGGTTTTTAATAGTCATACAGAAGAAATCTGCCCCAAGAGGATGGTAAC
TTGTGAGTTCTGTGAGTTTCCACTGCCTGCAGTTGATCTTCCTGAGCATCAGGAAGTATG
TGGCAACCGCACCGAACTCTGTTATCAATGCAACAGCTATGTTAGATTGCGTGAAACGTT
TAACCATGAAACCAAGTGCCCTGGTTCTGTGCTCAACAC***TGTTGAATCTTCCAGAAG
GGTTCCAAGACCAGCAGAAGGAGATGGAAACGGCAGGAGGAGAAGAGGTGGCAACGGTGT
ATCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACGATAGCTATAACGGGAATAGCTGTGTTATTAGGATC
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4F246JQ 675 0 0
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AAAGCATGCCCAGGAACACTTCTCCAACACCCATGCTCCGGTACCATGCTCGATGTGCAA
AGAAACCATAGACCGTGAGGTTTTTAATAGTCATACAGAAGAAATCTGCCCCAAGAGGAT
GGTAACTTGTGAGTTCTGTGAGTTTCCACTGCCTGCAGTTGATCTTCCTGAGCATCAGGA
AGTATGTGGCAACCGCACCGAACTCTGTTATCAATGCAACAGCTATGTTAGATTGCGTGA
AACGTTTAACCATGAAACCAAGTGCCCTGGTTCTGTGCTCAACAC***TGTTGAATCTTC
CAGAAGGGTTCCAAGACCAGCAGAAGGAGATGGAAACGGCAGGAGGAGAAGAGGTGGCAA
CGGTGTATCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACGATAGCTATAACGGGAATAGCTGTGTTATT
AGGATCGCTCTTCTTCCAGAGGAAGCCTGAGGGTGGGAGCTAAGCAGAGAGAGACATATA
TAGCTCGTGCGTAGTTCTGTAAAGTTTGCTCAAACTCCCTTCCAGACAGATTCGAAGGAA
GGGGTTTTATACATTTTAAAATACTTACTGAGACAGAGATGTTCTTTCTTCGCTAAGGAT
TTGTTTAAGCTGATC

QA 1 675 1 675
DS 



CO CL1316Contig2 718 2 13 U
GCCTGAAAACTCTTTTATTGAAAACCAAATGTAAAAGAAAGTCTCATGGTGATCAGCTTT
AAACAATCCTTAGGGAAGAACGAACATCTCTGTCTCAGTAAGCATTTAAAATGTATAAAA
CCCCTTCCTTCGAATCTGTCTCGAAGGGAGTTTGAGCAACTTTACAGAACTACACACGAG
CTATATATGTCTCTGTGCTTAGCTCCCACCCCCAGGCTTCCTCTGGAAAAACAGCGATCC
TAATAACACAGCTATTCCCGTTATAGCTATAGTGAAAAAAAGCCTTTTGTTAAATACACC
GTTGCCACCTCTTCTCCTCCTCCCGTTTCCATCTCCTTCTGCTGCTCTTGGAACCCTTCT
GGATGATTCAACATTGTTGTTGAGCACAAAACCAGGGCACTTGGTTTCATGGTTAAACGT
TTCACGCAATCTAACATAGCTGTTGCATTGATAACAGAATTCCGTGCGGTTGCCACATAC
TTCCTGATACTCAGGAAGATCAACTGCAGGCAGTGGAAACTCGCAGAACTCACACGCTAC
CATCCTCTTGGGGCAGATTTCTTCTGTATGACTATTAAAAACCTCACGGTCTATGGCTTC
TTTGCACATCGAGCATGGTACCGGAGCATGTGTGTTGGAGAAGTGTTCCTGAGCATGCTT
TTTAGGAACCATATCACCACAAATCTTACATTTTTCAAGATTCCGGGCGCAGTGTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ15JQ U 206
AF RR4DP15JQ U 1
BS 1 211 RR4DP15JQ
BS 212 212 RR4AQ15JQ
BS 213 228 RR4DP15JQ
BS 229 229 RR4AQ15JQ
BS 230 276 RR4DP15JQ
BS 277 277 RR4AQ15JQ
BS 278 292 RR4DP15JQ
BS 293 293 RR4AQ15JQ
BS 294 388 RR4DP15JQ
BS 389 389 RR4AQ15JQ
BS 390 458 RR4DP15JQ
BS 459 459 RR4AQ15JQ
BS 460 718 RR4DP15JQ

RD RR4AQ15JQ 267 0 0
CCACCCCCAGGCTTCCTCTGGAAAAACAGCGATCCTAATAACACAGCTATTCCCGTTATA
GCTATAGTGAAAAAAAGCCTTTTGTTAAATACACCGTTGCCACCTCTTCTCCTCCTCCCG
TTTCCATCTCCTTCTGCTGCTCTTGGAACCCTTCTGGATGATTCAACATTGTTGTTGAGC
ACAAAACCCGGGGACTTGGTTTCATGGTTAAACGTTTCACGCAATCTAACATAGCTGTTG
CATTGATAACAGAATTCCGTGCGGTTG

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR4DP15JQ 718 0 0
GCCTGAAAACTCTTTTATTGAAAACCAAATGTAAAAGAAAGTCTCATGGTGATCAGCTTT
AAACAATCCTTAGGGAAGAACGAACATCTCTGTCTCAGTAAGCATTTAAAATGTATAAAA
CCCCTTCCTTCGAATCTGTCTCGAAGGGAGTTTGAGCAACTTTACAGAACTACACACGAG
CTATATATGTCTCTGTGCTTAGCTCCCACCCTCAGGCTTCCTCTGGAAGAACAGCGATCC
TAATAACACAGCTATTCCCGTTATAGCTATAGTGAAGAAAAGCCTTTTGTTAGATACACC
GTTGCCACCTCTTCTCCTCCTCCCGTTTCCATCTCCTTCTGCTGCTCTTGGAACCCTTCT
GGATGATTCAACATTGTTGTTGAGCACAGAACCAGGGCACTTGGTTTCATGGTTAAACGT
TTCACGCAATCTAACATAGCTGTTGCATTGATAACAGAGTTCCGTGCGGTTGCCACATAC
TTCCTGATACTCAGGAAGATCAACTGCAGGCAGTGGAAACTCGCAGAACTCACACGCTAC
CATCCTCTTGGGGCAGATTTCTTCTGTATGACTATTAAAAACCTCACGGTCTATGGCTTC
TTTGCACATCGAGCATGGTACCGGAGCATGTGTGTTGGAGAAGTGTTCCTGAGCATGCTT
TTTAGGAACCATATCACCACAAATCTTACATTTTTCAAGATTCCGGGCGCAGTGTACA

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 6

CO CL1317Contig1 1114 6 10 U
GGTTATTCAAAGTTGGTTTCTTTGATTTAATAACAATGTTGTGATACAATTGTGAAGCAA
CCAAATAGAGAGTCTCCTTGAAGAAGAAAGCTTCTTTTAATCAGAGAGAGCACAAATACA
AAGATAAATGAGGAGGAGGTGCACACACCATTCGAAGCAGCTTTATGGTGCAAGTCAAGA
AAAAGCCATGGCGGGCTTGGTGGTCCCGTTAATAGCTGGGGCAACACCGCCGCCTCTCGT
GGCCTTCACGTATGAAAGGTATTCGCTATAATGCATGCTGAATAATGTACTCTGGTAACG
TGTTAGATGGATTCTCCTACGCACTGATTCAGTTATATCACCGTTGTATCCTGCTTTGCG
CACCAGTGAATCTATTGCCTCTATTTTTGTCCAGCCTTCATGAGCTGGCACCTCAGGCAA
ATATGTGGCGTTTCGCCTTGTATTTGTCACAGGTTCAGTGAACTCAATAATTATACCATG
CTTCCCCACCTCCCAATCAAGATAATCCTCTGCAGTTTCATAATCGGTCAGGACAGATAC
TGTACATTGCAGAAACGGCAGTTCTTTGGACTGAATTGGTGGGAACCTACGATCCCTCAG
GGCACTGGTCAAGGCATAATCCTTGAAGCCACTGATCAAGCGGCGTGCTTCTAGTGTACC
AATGCATCCACGCAATCGAGGCTCCCCACCATTCACTATTTTCTTCCACGTCACAAACAA
TGGATGATTGGCGTCTTCAAAGGCAGGTGGAGGAGTGTCATCGTTGTTGTAGTGAGAGAC
CAATGTGTCGAAACAGTACACAGCCATCTCTCTCTTTGCCATACTTTTTGCTTTGAGGAC
AGAACCGCAGTCCGCAGACCAAAAAAAAAAAACCGAACTTTTGTAAATATTTTCTGTTTT
CTAACAATAAAAATCGAAAGCAACTCTAAAATCTAATTAAAAAGCATAGCATTCTCAGAT
CGAAAAAAAAAA*GTACAAAAAATTTAGATCGGACAAGGAAACTGAGCAAAAAGCTAGAA
AAGCATAGAGATTTATGATAAGAATTGAAATTAAACAGACAGTTAATCAATTGAGTCTTG
AGAGCATTATGATAATAAACACGAAATAAAGCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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CATCCACGCAATCGAGGCTCCCCACCATTCACTATTTTCTTCCACGTCACAAACAATGGA
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DS 



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BQ
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10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF23JQ U 30
AF RR4FC30JQ U 30
AF RR4EP06JQ U 1
AF RR4EP06TF C 58
AF RR4EF23TF C 461
BS 1 516 RR4EP06JQ
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BS 518 819 RR4EP06JQ
BS 820 853 RR4EP06TF
BS 854 1089 RR4EF23TF

RD RR4EF23JQ 618 0 0
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CGAACCAAATAATGAAAAGGAGAAGAGAAGTTCTATATCATTTGTAAGCCAAAAAGAGCA
TAATTGAAAAGTTAAAGTGCTTCAACTTTTGATCTGCAAGTTGCTCATCTGACCTTCAAT
ATGATCTTCATTGTTCTGTGCCCTGAGAGTCAGCCAAGGATGCTGCAGGCATTGTTGAGC
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TGCTTCTGCTTCTTGAAGCTTGTACTTATCTGTCAGTAAACGGTCCAGTGGCCAATATTT
CAACCTCCGGATCCTCTTTAGGTCACCATGTCTGTCAAAGTAATCCTTTGATTTCGCACC
TCCAATGACAATCTTCCGAGGTATTTTTCCTAAGAGTTCCATCATAAGAGCAAGGTGGTC
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CTCGAAAGCGGTACAAGC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4FC30JQ 667 0 0
CATTACGTTCCAATGTTTTATACATAAACCAATGGTTAGTCACTAATCATGTCTCTCCAA
AATTTAGTAAAAAAAAATGAAGAACAAACAAATAAAGAATCAAAATTATTCAAACAGAAA
CGAACCAAATAATGAAAAGGAGAAGAGAAGTTCTATATCATTTGTAAGCCAAAAAGAGCA
TAATTGAAAAGTTAAAGTGCTTCAACTTTTGATCTGCAAGTTGCTCATCTGACCTTCAAT
ATGATCTTCATTGTTCTGTGCCCTGAGAGTCAGCCAAGGATGCTGCAGGCATTGTTGAGC
ACTAGGTCGTTTCTCTGGCTCAAAAGAAAGAATCGGACAAAGAAAATCTGCAAATCCTTG
TGCTTCTGCTTCTTGAAGCTTGTACTTATCTGTCAGTAAACGGTCCAGTGGCCAATATTT
CAACCTCCGGATCCTCTTTAGGTCACCATGTCTGTCAAAGTAATCCTTTGATTTCGCACC
TCCAATGACAATCTTCCGAGGTATTTTTCCTAAGAGTTCCATCATAAGAGCAAGGTGGTC
CTCGTCTTCTCCATAACCATTTCCATCTTTTGGAGCAAAAAGCATGTCTCCTGTGGCAAG
CTCGAAAGCGGTACAAGCGAAAGACCACATATCAACAGAGAAAGAGTAGCCTGACTGAAG
TATTACT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EP06JQ 819 0 0
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ATGGTTAGTCACTAATCATGTCTCTCCAAAATTTAGTAAAAAAA**TGAAGAACAAACAA
ATAAAGAATCAAAATTATTCAAACAGAAACGAACCAAATAATGAAAAGGAGAAGAGAAGT
TATATATCATTTGTAAGCCAAAAAGGTCATAATTGAAAAGTTAAAATTCTTCAACCTTTG
ATCTGCAAGTTACTCATCTGACCTTCAATATGATCTTCATTGTTCTGTGCCCTGAGATTC
AGCCAAGGATGATGCAGGCATTGTTGAGCACTAGGTCGTTTCTCTGGCTCAAAAGAAAGA
ATCGGACAAAGAAAATCTGCAAATTCTTGTGCTTCTGCTTCTTGAAGCTTGTACTTATCT
GTCAGTAAACGGTCCAGTGGCCAATATTTCAACCTCCGGATCCTCTTTAGGTCACCATGT
CTGTCAAAGTAATCCTTTGATTTCGCACCTCCAATGGCAATCTTCCGAGGTATTTTTCCT
AAGAGTTCCATCATAAGAGCAAGGTGGTCCTCGTCTTCTCCATAACCATTTCCATCTTTT
GGAGCAAAAAGCATGTCTCCTGTGGCAAGCTCGAAAGCGGTACAAGCGAAAGACCACATA
TCAACAGAGAAAGAGTAGCCTGACTGAAGTATTACTTCAGGAGCTCTGTACTGTCTTGTC
TGTATTTCTTCCGCAAACTTGTTATCAGCCCAACACGCGTTCCCAAAGTCCACAACTTTG
CATTTCATATCAATCCCATCTAAACTTCTCACGGTCTTT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4EP06TF 797 0 0
ACCAATGG
TAGTCACTAATCATGTCTCTCCAAA*TTTAGTAAAAAA***TGAAGAACAAACAAATAAA
GAATCAAAATTAT*CAAACAGAAACGAACCAAATAATGAAAAGGAGAAGAGAAGTTATAT
ATCATTTGTAAGCCAAAAAGGTCATAATTGAAAAGTTAAAATTCTTCAACCTTTGATCTG
CAAGTTACTCATCTGACCTTCAATATGATCTTCATTGTTCTGTGCCCTGAGATTCAGCCA
AGGATGATGCAGGCATTGTTGAGCACTAGGTCGTTTCTCTGGCTCAAAAGAAAGAATCGG
ACAAAGAAAATCTGCAAATTCTTGTGCTTCTGCTTCTTGAAGCTTGTACTTATCTGTCAG
TAAACGGTCCAGTGGCCAATATTTCAACCTCCGGATCCTCTTTAGGTCACCATGTCTGTC
AAAGTAATCCTTTGATTTCGCACCTCCAATGGCAATCTTCCGAGGTATTTTTCCTAAGAG
TTCCATCATAAGAGCAAGGTGGTCCTCGTCTTCTCCATAACCATTTCCATCTTTTGGAGC
AAAAAGCATGTCTCCTGTGGCAAGCTCGAAAGCGGTACAAGCGAAAGACCACATATCAAC
AGAGAAAGAGTAGCCTGACTGAAGTATTACTTCAGGAGCTCTGTACTGTCTTGTCTGTAT
TTCTTCCGCAAACTTGTTATCAGCCCAACACGCGTTCCCAAAGTCCACAACTTTGCATTT
CATATCAATCCCATCTAAACTTCTCACGGTCTTTGTCGGCGTTTCACTTAAACCCACTAT
GGAAACTC
C

QA 9 796 9 796
DS 

RD RR4EF23TF 629 0 0
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TCTTCCGAGGTATTTTTCCTAAGAGTTCCATCATAAGAGCAAGGTGGTCCTCGTCTTCTC
CATAACCATTTCCATCTTTTGGAGCAAAAAGCATGTCTCCTGTGGCAAGCTCGAAAGCGG
TACAAGCGAAAGACCACATATCAACAGAGAAAGAGTAGCCTGACTGAAGTATTACTTCAG
GAGCTCTGTACTGTCTTGTCTGCATCTCTTCCGCAAACTTGTTATCAGCCCAACAAGCGT
TCCCAAAGTCCACAACTTTGCATTTCATATCAATCCCATCTAAACTTCTCACGGTCTTTG
TCGGCGTTTCACTTAAACCCACTATGGAAACTCTTCTTCCTGATATTTTAGCAACCGCTC
TTCTTGCCCTCCTCTTCAACTTCTTCTCAATCAGATTCATGGTTGTTGCACCGTTTTGGT
TTCCCTCTGGTTTTTCTAGTATCGGTGTTAGTCCGGATCTGATGGGATCCCTGGCAGCGT
CAATGGTGGAACAGAGAAGAATGTTTTCGGGCTTTAAGTCGGAGTGGATCATACCGAGTT
CACGATGCAGATAGTCTAGACCGGTCAGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 4

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AGAAATAAAAGGTCCTAAATAATTGTGTAAACCCTGCCTAGCAAAAAATAAAAACAAAAA
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CACAAACCCATAGTCATAATCTTGGACCAAACTCCATTTAGGAGTCAGCGAGCTAAACGG
AGACAAGTGACTTCCTGCACCACCAACAACTACGTGAATGGTTCCTCGGAAGGTCCCTGA
GTAGTGATCCTTTTCACCGTCCACACATTGGCTCTGGTAAATGGGGCAAGTTCGTTCATA
GTTGTGGACATGTCCGTAGAATGCAATGTCTACTTTGTACTTCTGCCACAGTTTCTGCAG
GCTCTCTCTTCCCATAGGCTCTTCAAAGGTTCCTTCTTTGCCATACCAGTCATTGGAGGA
ATAACCGAGGACACGATGAGCGATAAAGATGAGCCACGGCTGAGTCTTTCTGTCAACAGT
GGCGAGGCAATGCTCTATGAATTTGTATTGCTCTGTGCCTTCTCTCCAGTCATGTTCACT
GTCTGCTACACAGAATCGGACACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E991JQ U 1
AF RR4BV27JQ U 3
BS 1 406 RR4E991JQ
BS 407 407 RR4BV27JQ
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RD RR4E991JQ 615 0 0
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AGAAATAAAAGGTCCTAAATAATTGTGTAAACCCTGCCTAGCAAAAAATAAAAACAAAAA
CCGAAACGATACTAAGTAAAATAAAAATCATGAAGCTGATGTGGTGGGCTCGCAGCTATC
GTGAGTGCAAGCAAGAACATCTCTGTAGTCTCTAGAGATCTTGAAGGAGTCATGCACTTG
GCCATTGCTGCTCTTCTTGTACTCAAAGAGAAGGTTTGAGTGATCCGAAGCAGTCAACTT
CACAAACCCATAGTCATAATCTTGGACCAAACTCCATTTAGGAGTCAGCGAGCTAAACGG
AGACAAGTGACTTCCTGCACCACCAACAACTACGTGAATGGTTCCTTGGAAGGTCCCTGA
GTAGTGATCCTTTTCACCGTTCACACATTGGCTCTGGTAAATGGGGCAAGTTCGTTCATA
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GCTCTCTCTTCCCATAGGCTCTTCAAAGGTTCCTTCTTTGCCATACCAGTCATTGGAGGA
ATAACCGAGGACACG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4BV27JQ 742 0 0
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AAATAAAAGGTCCTAGATAATTGTGTAAACCCTGCCTAGCAAAAAATAAAAACAAAAGCC
GAAACGATACTAAGTAAAATAAAAATCATGAAGCTGATGTGGTGG*CTCGCAGCTATCGT
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CATTGCTGCTCTTCTTGTACTCAAAGAGAAGGTTTGAGTGATCCGAAGCAGTCAACTTCA
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AGTGATCCTTTTCACCGTCCACACATTGGCTCTGGTAAATGGGGCAAGTTCGTTCATAGT
TGTGGACATGTCCGTAGAATGCAATGTCTACTTTGTACTTCTGCCACAGTTTCTGCAGGC
TCTCTCTTCCCATAGGCTCTTCAAAGGTTCCTTCTTTGCCATACCAGTCATTGGAGGAAT
AACCGAGGACACGATGAGCGATAAAGATGAGCCACGGCTGAGTCTTTCTGTCAACAGTGG
CGAGGCAATGCTCTATGAATTTGTATTGCTCTGTGCCTTCTCTCCAGTCATGTTCACTGT
CTGCTACACAGAATCGGACACT

QA 1 742 1 742
DS 



CO CL1319Contig2 1307 2 8 U
GGATTCACAACAGATCAACGATGCCTAAAGTTCTATTTCTGCTTCTCTGTTTCATCGGAG
TGCTGAGTTCGAGATGTTCGGGTCACGACAGCAATGGACGAGGAGATCAGCCTTTAGCTC
AGATTAATATCTATAAAACAAGTCTTGCTTTGGACACTTCTGTCAACATTCATGCTTCTC
CTCAAGTCCTTGGTTTAAAGGGTGAAGATACTGAGTGGGTGGACGTTGCTATCTCCAACC
ACAAGTTCACTTCAAACGATTGGATTGGAGTTTTCTCTCCAGCAAAATTCGACTCATCTA
CCTGTTGGCCACCTAAATATCCAAATAAGGATAGATCTCCTTTCCTTTGCTCATCTCCCA
TCAAGTACACGTATATGAGGAATTATCCGGAGTATACAAAGTCTGGGAACGTGATTCTGA
AGTTGCAGATTATCAACCAGAGGGCTGATGTCTCCTTTGCACTGTTTTCTGGAAGTCTTG
ACCAGCCAGTACTTCTCGGTGTTTCGAATCCTGTAGCTTTTGTTAATCCTAAAGCACCTG
TCTACCCACGTCTTGCTTTAGGGAAGAGTTGGGATGAAATGACTGTAACATGGACGAGTG
GGTACAACATAAACGAGGCTGTTCCGTTCATTGAATGGAGTTCTATGGGACTTCCAGCTA
GAAGATCACCAGCTGGAACCATTACCTTCAACAGAAACAGCATGTGTGGTGATCCTGCTC
GTAGTATGGGTTGGCGTGATCCTGGTTTCTTCCATACATCTTTCTTGAAAGAACTTTGGC
CAAACCGCGAATACACATACAGGCTAGGCCATGACTTGGCCAATGGTTCGACTATTTGGA
GCAAGAATTACACTTTTGTTTCCTCTCCTTTTCCTGGACAAGACTCGTTACAACGTGTCA
TTATATTTGGTGACATGGGAAAGGGAGAGCGAGATGGCTCGAATGAATATAATGATTACC
AGCCTGGTTCCCTCAACACAACTGACCAGCTCATCAAGGACTTGAAGAACATTGACATTA
TTTTCCATATCGGAGATATCACTTACTCAAATGGTTATATCTCCCAGTGGGATCAGTTCA
CAGCACAAGTTGAGCCTGTGGCTTCTAAGGTTCCATACATGATTGCAAGTGGCAACCACG
AGCGTGATTGGCCAGACACGGGATCTTTCTACGCAGGTCAAGACTCTGGAGGAGAGTGTG
GTGTTCCTGCAGAGACCATGTTCTACTTTCCTGCTGAGACCGAGCTAAGTTCTGGTACAA
AGCAGACTATGGAATGTTCCGATTCTGTGTAGCAGACAGTGAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GM87TF U 1
AF RR4E991TF U 591
BS 1 613 RR4GM87TF
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GTAGTATGGGTTGGCGTGATCCTGGTTTCTTCCATACATCTTTCT

QA 1 765 1 765
DS 

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G
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AACTTTGGCCAAACCGCGAATACACATACAGGCTAGGCCATGACTTGGCCAATGGTTCGA
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AACGTGTCATTATATTTGGTGACATGGGAAAGGGAGAGCGAGATGGCTCGAATGAATATA
ATGATTACCAGCCTGGTTCCCTCAACACAACTGACCAGCTCATCAAGGACTTGAAGAACA
TTGACATTATTTTCCATATCGGAGATATCACTTACTCAAATGGTTATATCTCCCAGTGGG
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QA 2 717 2 717
DS 



AS 2 4

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CTGTTTCTTCTCTCCTCCAACTCCCTCAAGACTAAACCAATCCTCCAACGACGACGCCAA
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TGTGTTCCCCTTTCATTTCATAATTCATTTGTGCAGAGTGTGTAAAAGCGCCTGTTATTT
TATTTTTTTACTATAAAAGAATTTTAATTATTCAACGA


BQ
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AF RR4B832TF U 1
AF RR4ED93TF U 144
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TGTGTTCCCCTTTCATTTCATAATTCATTTGTGCAGAG
TGTGTAAAAGCGCCTGTT

QA 1 758 1 758
DS 

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TACTCCAAGAAACAAAAACTGTTTCTTCTCTCCTCCAACTCCCTCAAGACTAAACCAATC
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CATCGGTGGTGGTGGTTCATCAGTCAGAGATGACGAGAGTCTGGCTGGCTCACAGTCTCT
ACCGAGCTATATGGTTCCAACTAAATCAGCTAGAGCCAGGCTGAAGCCGCAGCAGAGTCC
GTTAAGTGGTAGTACCACACAGGAGAACGATGGGCTTGTTGCAGACAAGGCATCTGCTAA
GAAACGCCTCTCTTATACGAGTTCATCTGCATTGCCCAAACCACGGAGGTTCTCAGCTCC
GCCTAAAGTGGAGAGTGGCGACGTTGCCGTCACCAATGGAGGAGTAAGCTGAGGTTTGGT
TTGTCTTTTAAACAAAAAGATATATGTGATTTTCCACTTTGATGGATATGTCCGAGATGG
TTTGTTGTATGTTTGCTATGTGTTCCCCTTTCATTTCATAATTCATTTGTGCAGAGTGTG
TAAAAGCGCCTGTTATTTTATTTTTTTACTATAAAAGAATTTTAATTATTCAACGA

QA 20 675 20 675
DS 



CO CL1320Contig2 849 2 8 U
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GTCGTTGAATAATTAAAATTCTTTTATAGTAAAAAAATTAAATAACAGGCGCTTACAACT
CTCTGCACAAATGAATTATGAAATGAAAGGGGAACACATAACAAACATACAACAAACCAT
CTCGGACATATCCATCAAAGTGGAAAATCACATATATCTTTTTGTTTAAAAAACAAACCA
AACCTCAGCTTACTCCTCCATTGGTGACGGCAACGTCCCCACTCTCCACTTTAGGCGGAG
CTGAAAACCTCCGTGGTTTAGGCAATGTAGTTGAATTCGTATAAAAAAGGCGTTTCTTAG
CAAATGCCTTGTCTGCAAGCACATCGTTCTCCTGTGTGGTACTACCACTTAACGGACTCT
GCTGCGGCTTCAGCCTGGCTCTAGCTGATTTAGTTGGAACCATATAGCTCGGTAGAGCCT
GTGAGCCAGCCAGACTCTCGTCATCTCTGACTGATGAACCACCACCGATGCTGTGTCCAC
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GTCTTGAGGGAGTTGGAGGAGAGAAGAAACTGTTTTTGTTTCTTGGAGTACCACCACCTC
TTGCGGATGATGGTGTGTTTGGTTGTGTTGAGTTTTTATTGCGGAGGTTTATAGAATTGT
TCTTCCAGTTTTGCTGATGAGAGTAAGCATAAGCCAATGCCCTTTCTCTTCTCATCGTTG
CCTCGTACTTGCTCAGCAACTTCGCTTCAACTTTTTCCTTTGATTGAATGCTATCATCCC
AGTTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD32JQ U 1
AF RR4F510JQ U 115
BS 1 266 RR4BD32JQ
BS 267 267 RR4F510JQ
BS 268 483 RR4BD32JQ
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BS 539 625 RR4BD32JQ
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RD RR4BD32JQ 625 0 0
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QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4F510JQ 735 0 0
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TCTTCCAGTTTTGCTGATGAGAGTAAGCATAAGCCAATGCCCTTTCTCTTCTCATCGTTG
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AGTTATCAC

QA 7 735 7 735
DS 



AS 1 6

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ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATTGTATATTCGTTTTC
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TATCTTCGGAGAACTCTCTTTCTCAATGGATTTGAAAAATATATCTTCGGTTAATTTGAG
ACTCTGTTTACATTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G360JQ C 141
AF RR4G360TF U 12
AF RR4G070JQ C 12
AF RR4G070TF U 12
AF RR4FB87JQ C 1
AF RR4FB87TF U 1
BS 1 13 RR4FB87TF
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BS 25 70 RR4G360TF
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BS 280 280 RR4G070TF
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BS 363 363 RR4G070TF
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BS 593 617 RR4FB87TF

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G

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DS 

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G

QA 3 581 3 581
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QA 3 581 3 581
DS 

RD RR4G070TF 581 0 0
GG
ACCGAACCCTAGTTTCTCGATATCATCGATTCGCTTCTTCTTCTTTAGATACTGATCTAA
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TTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAATGTCTTTTACTTTGTGGTTTTATCTTCGGAGAA
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QA 3 581 3 581
DS 

RD RR4FB87JQ 617 0 0
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GATACTGATCTAATCGACATGGCCAAAAACTCCTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGGCG
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GATCTAACCGCTGGACAATTTGTGTACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCCGAG
AAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGCTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCA
ATTTATGAAGAACACAAAGATGAAGATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAAC
ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATTGTATATTCGTTTTC
CCCTTTAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAATGTCTTTTACTTTGTGGTTT
TATCTTCGGAGAACTCTCTTTCTCAATGGATTTGAAAAATATATCTTCGGTTAATTTGAG
ACTCTGTTTACATTTCG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4FB87TF 617 0 0
GGAGTCTTTGATCACCGAACCCTAGTTTCTCGATATCATCGATTCGCTTCTTCTTCTTTA
GATACTGATCTAATCGACATGGCCAAAAACTCCTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGGCG
AGAATGGCTGAATCTACTCGTATCAGAGACAAGTACCAAGACAGAGTTCCTGTGATTGTG
GAGAAAGCTGCACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTGCCAGCT
GATCTAACCGCTGGACAATTTGTGTACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCCGAG
AAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGCTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCA
ATTTATGAAGAACACAAAGATGAAGATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAAC
ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATTGTATATTCGTTTTC
CCCTTTAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAATGTCTTTTACTTTGTGGTTT
TATCTTCGGAGAACTCTCTTTCTCAATGGATTTGAAAAATATATCTTCGGTTAATTTGAG
ACTCTGTTTACATTTCG

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 5

CO CL1322Contig1 1011 5 6 U
GGAAAAACTTGGAAGTTTTATTATTATAAATCACGGGAAATGAGTGAGACTGCAAATGAT
GTTGGAATGCATTTTTAAGGAATCACGGTTGGTTTATAAAAAGGAGCACAGGTACAGAGT
TAGAGGTCTGAAAGGGGTTTCCCATGGATGAAGTTGATCACTTTAGTGGCAGTTTCCTCT
AGCGCAGAGGTCACCATTGCCAAGTTCTGTAAGAATTCCTCTGCAGCCGGTTTGTCTCCG
TCTATCAGATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAGCAACG
TGGGCCACCGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAACGTAGCATCATTGGAAATGATCAGAGAT
TCATCTTGTGTGGACATATCCAAGGAGTCACCAGTAGACAACCTGCCAATCTTCAAATTG
AGTTCCTTGAGGAGATTGGGGGTTGAGAAGGCCTGACGAAGACCAACACCATACAGATCA
AACATCGGGATAGGTATTCTTCTATCATGGAAGACAACATCAGATACAAGGAAGACATCG
CCTATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAAGGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAATGTCA
GGCTGTAGGGCTTGGATAGAAGCAAAGGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGTTCCAACACTA
TCAATCCCTAGAGCAGCATCTTTTCCGGGGCGGACAACATAGATTCGAAGATCTTTGTGC
AGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAATCCTTTCCCAAGCGGAGAATCAGAAGTTTCGGAG
AGTCCGAACTTGTTGACCAATGGTTGAGCCTCCGCTTGCATAGCGATGACGAAGACGACT
GTGGAGATGGGTCGATGACTCTCCGATTCAACTTTCTCCATGTCACCATCTCCATGAGTA
CCCATACTTCTCCCGATTCCTCTTTCGCTCTTCACTCCAGGAAAGCGAATAAAGACCGGA
CCCGACCCCCTCTCATGGTTGGAAACAATTACTTATTTACTGTGTGCTCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY60JQ U 2
AF RR4H721JQB U 2
AF RR4AL12JQ U 1
AF RR4H721TF C 321
AF RR4AL12TF C 236
BS 1 29 RR4AL12JQ
BS 30 30 RR4EY60JQ
BS 31 479 RR4AL12JQ
BS 480 480 RR4H721JQB
BS 481 776 RR4AL12JQ
BS 777 1011 RR4AL12TF

RD RR4EY60JQ 356 0 0
GG
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GGAATGCATTTTTAAGGAATCACGGTTGGTTTATAAAAAGGAGCACAGGTACAGAGTTAG
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GCAGAGGTCACCATTGCCAAGTTCTGTAAGAATTCCTCTGCAGCCGGTTTGTCTCCGTCT
ATCAAATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAGCAACGTAG
GCCACCGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAACGTAGCATCATTGGAAATGATCAGA

QA 3 356 3 356
DS 

RD RR4H721JQB 682 0 0
GA
AAAACTTGGAAGTTTTATTATTATAAATCACGGGAAATGAGTGAGACTGCAAATGATGTT
GGAATGCATTTTTAAGGAATCACGGTTGGTTTATAAAAAGGAGCACAGGTACAGAGTTAG
AGGTCTGAAAGGGGTTTCCCATGGATGAAGTTGATCACTTTAGTGGCAGTTTCCTCTAGC
GCAGAGGTCACCATTGCCAAGTTCTGTAAGAATTCCCCTGCAGCCGGTTTGTCTCCGTCT
ATCAGATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAGCAACGTAG
GCCACCGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAACATAGCATCATTGGAAATGATCAGAGATTCA
TCTTGTGTGGACATATCCAAGGAGTCACCAGTAGACAACCTGCCAATCTTCAAATTGAGT
TCCTTGAGGAGATTGGGGGTTGAGAAGGCCTGACGAAGACCAACACCATACAGATCAAAC
ATCGGGATAGGTATTCTTCTATCATGGAAGACAACATCAGATACAAGGAAGACATCGCCT
ATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAAGGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAATGTCAGGC
TGTAGGGCTTGGATAGAAGCAAAGGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGTTCCAACACTATCA
ATCCCTAGAGCAGCATCTTT

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4AL12JQ 776 0 0
GGAAAAACTTGGAAGTTTTATTATTATAA*TCACGGGAAATGAGTGAGACTGCAAATGAT
GTTGGAATGCATTTTTAAGGAATCACGGTTGGTTTATAAAAAGGAGCACAGGTACAGAGT
TAGAGGTCTGAAAGGGGTTTCCCATGGATGAAGTTGATCACTTTAGTGGCAGTTTCCTCT
AGCGCAGAGGTCACCATTGCCAAGTTCTGTAAGAATTCCTCTGCAGCCGGTTTGTCTCCG
TCTATCAGATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAGCAACG
TGGGCCACCGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAACGTAGCATCATTGGAAATGATCAGAGAT
TCATCTTGTGTGGACATATCCAAGGAGTCACCAGTAGACAACCTGCCAATCTTCAAATTG
AGTTCCTTGAGGAGATTGGGGGTTGAGAAGGCCTGACGAAGACCAACACCATACAGATCG
AACATCGGGATAGGTATTCTTCTATCATGGAAGACAACATCAGATACAAGGAAGACATCG
CCTATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAAGGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAATGTCA
GGCTGTAGGGCTTGGATAGAAGCAAAGGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGTTCCAACACTA
TCAATCCCTAGAGCAGCATCTTTTCCGGGGCGGACAACATAGATTCGAAGATCTTTGTGC
AGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAATCCTTTCCCAAGCGGAGAATCAGAAGTTTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4H721TF 633 0 0
CCATGT
CTTTAACATAGCATCATTGGAAATGATCAGAGATTCATCTTGTGTGGACATATCCAAGGA
GTCACCAGTAGACAAC*TGCCAATCTTCAAATTGAGTTCCTTGAGGAGATTGGGGGTTGA
GAAGGCCTGACGAAGACCAACACCATACAGATCAAACATCGGGATAGGTATTCTTCTATC
ATGGAAGACAACATCAGATACAAGGAAGACATCGCCTATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAA
GGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAATGTCAGGCTGTAGGGCTTGGATAGAAGCAAA
GGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGTTCCAACACTATCAATCCCTAGAGCAGCATCTTTTCC
GGGGCAGACAACATAGATTCGAAGATCTTTGTGCAGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAA
TCCTTTCCCAAGCGGAGAATCAGAAGTTTCGGAGAGTCTGAACTTGTTGACCAATGGTTG
AGCCTCCGCTTGCATAGCGATGACGAAGACGACTGTGGAGATGGGTCGATGACTCTCCGA
TTCAACTTTCTCCATGTCACCATCTCCATGAGTACCCATACTTCTCCCGATTCCTCTTTC
GCTCTTCACTCC
TTCGATTTCCAGACC

QA 7 618 7 618
DS 

RD RR4AL12TF 776 0 0
CTCCGTCTATCAGATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAG
CAACGTGGGCCACCGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAACGTAGCATCATTGGAAATGATCA
GAGATTCATCTTGTGTGGACATATCCAAGGAGTCACCAGTAGACAACCTGCCAATCTTCA
AATTGAGTTCCTTGAGGAGATTGGGGGTTGAGAAGGCCTGACGAAGACCAACACCATACA
GATCGAACATCGGGATAGGTATTCTTCTATCATGGAAGACAACATCAGATACAAGGAAGA
CATCGCCTATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAAGGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAA
TGTCAGGCTGTAGGGCTTGGATAGAAGCAAAGGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGTTCCAA
CACTATCAATCCCTAGAGCAGCATCTTTTCCGGGGCGGACAACATAGATTCGAAGATCTT
TGTGCAGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAATCCTTTCCCAAGCGGAGAATCAGAAGTTT
CGGAGAGTCCGAACTTGTTGACCAATGGTTGAGCCTCCGCTTGCATAGCGATGACGAAGA
CGACTGTGGAGATGGGTCGATGACTCTCCGATTCAACTTTCTCCATGTCACCATCTCCAT
GAGTACCCATACTTCTCCCGATTCCTCTTTCGCTCTTCACTCCAGGAAAGCGAATAAAGA
CCGGACCCGACCCCCTCTCATGGTTGGAAACAATTACTTATTTACTGTGTGCTCCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 2 6

CO CL1323Contig1 990 4 4 U
GTATGATTTTCAATGTTTTTAAATTTGAATCACAAAAGATCATCATATGATTACAAAAGA
TTTTTTTTTTAGAGTTTGCTTTCCTTGTTCTGTTTCTCTTAGCCATTGCTGACTTTGGTG
GCTCAACAAAACATGAAAAGCCTGAAACTTTTATTTTCACGAGAAACAGAGTGAAAAGTT
TTTAAGACTCTTTTGCTTTCTTCTCTCACTTAAAATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCG
ATTTGCTTCACTATAAACTCCCTAAACCCGACACGGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATA
CACGAACCACCACCACCACCACTTCCTCCGCTGGAACCACCACCAGCAACGTTCCCTCGC
TGTAAATCCGCCATGTAACTCCTCACCTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACCGTCATG
AACTCACCACCGAATCCTGATATCCCATTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCGAACCGGG
AACAGCTCCGCCGTGTAACCAACGTCAATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCG
TTGACTCTAACCGTCTCCGTCTCGCAACGGTTATTCCAAGGGAGAGACAAACTTAGATAA
GTAGGCGGATCTTCACCGGACGTTGACGCCGTCACCTCCGTTACAGCACCAGATCTAGCC
GTCGGTTTGAACACGTGTGGAGCACCACTGGATTGCTCGCTGACGTCAGATCCAGATGGA
CTTCCGGGGCTCATATATAACCCGGTAGACACACCACCACCACTCGCCGTACGTTTCAAC
GGTTGCTCCTCTCCTAAGTTACCGTCATACCCTCCGTTACCACCGAAGTCACAGCTCTGT
CCATCAGATGTAAAAGCGCTGCATTTACGCTTGAGCGTCGAGTTCCAATGGTTCTTGATA
GCGTTGTCGGTTCTTCCATTGAGGAGACGAGAGATGGTCGCCCACTTGTTACCGAACCGA
GCGTGTGCCCGAATAATCGTCTCGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D394JQ U 135
AF RR4DY21JQ U 1
AF RR4DY21TF C 87
AF RR4D394TF C 295
BS 1 446 RR4DY21JQ
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BS 448 772 RR4DY21JQ
BS 773 990 RR4D394TF

RD RR4D394JQ 486 0 0
GAAAAGCCTGAAACTTTTATTTTCACGAAAAACAAAGTGAAAAGTTTTTAAAACTCTTTT
GCTTTCTTCTCTCACTTAAAATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCGATTTGCTTCACTAT
AAACTCCCTAAACCCGACACGGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATACACGAACCACCACC
ACCACCACTTCCTCCGCTGGAACCACCACCAGCAACGTTCCCTCGCTGTAAATCCGCCAT
GTAACTCCTCACCTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACCGTCATGAACTCACCACCGAA
TCCTGATATCCCATTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCGAACCGGGAACAGCTCCGCCGT
GTAACCAACGTCAATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCGTTGACTCTAACCGT
CTCCGTCTCGCAACGGTTATTCCAAGGGAGAGACAAACTTAAATAAGTAGGCGGATCTTC
ACCGGA

QA 1 486 1 486
DS 

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TTTTTTTTTTAGAGTTTGCTTTCCTTGTTCTGTTTCTCTTAGCCATTGCTGACTTTGGTG
GCTCAACAAAACATGAAAAGCCTGAAACTTTTATTTTCACGAGAAACAGAGTGAAAAGTT
TTTAAGACTCTTTTGCTTTCTTCTCTCACTTAAAATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCG
ATTTGCTTCACTATAAACTCCCTAAACCCGACACGGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATA
CACGAACCACCACCACCACCACTTCCTCCGCTGGAACCACCACCAGCAACGTTCCCTCGC
TGTAAATCCGCCATGTAACTCCTCACCTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACCGTCATG
AACTCACCACCGAATCCTGATATCCCTTTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCGAACCGGG
AACAGCTCCGCCGTGTAACCAACGTCAATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCG
TTGACTCTAACCGTCTCCGTCTCGCAACGGTTATTCCAAGGGAGAGACAAACTTAGATAA
GTAGGCGGATCTTCACCGGACGTTGACGCCGTCACCTCCGTTACAGCACCAGATCTAGCC
GTCGGTTTGAACACGTGTGGAGCACCACTGGATTGCTCGCTGACGTCAGATCCAGATGGA
CTTCCGGGGCTCATATATAACCCGGTAGACACACCACCACCACTCGCCGTAC
C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4DY21TF 687 0 0
GTTCTGTTTCTCTTAGCCATTGCTGACTTTGGTGGCTCAACAAAACATGAAAAGCCTGAA
ACTTTTATTTTCACGAGAAACAGAGTGAAAAGTTTTTAAGACTCTTTTGCTTTCTTCTCT
CACTTAAAATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCGATTTGCTTCACTATAAACTCCCTAAA
CCCGACACGGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATACACGAACCACCACCACCACCACTTCC
TCCGCTGGAACCACCACCAGCAACGTTCCCTCGCTGTAAATCCGCCATGTAACTCCTCAC
CTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACCGTCATGAACTCACCACCGAATCCTGATATCCC
TTTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCGAACCGGGAACAGCTCCGCCGTGTAACCAACGTC
AATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCGTTGACTCTAACCGTCTCCGTCTCGCA
ACGGTTATTCCAAGGGAGAGACAAACTTAGATAAGTAGGCGGATCTTCACCGGACGTTGA
CGCCGTCACCTCCGTTACAGCACCAGATCTAGCCGTCGGTTTGAACACGTGTGGAGCACC
ACTGGATTGCTCGCTGACGTCAGATCCAGATGGACTTCCGGGGCTCATATATAACCCGGT
AGACACACCACCACCACTCGCCGTAC
C

QA 1 686 1 686
DS 

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GGCATACACGAACCACCACCACCACCACTTC*TCCGCTGGAACCACCACCAGCAACGTTC
CCTCGCTGTAAATCCGCCATGTAACTCCTCACCTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACC
GTCATGAACTCACCACCGAATCCTGATATCCCATTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCGA
ACCGGGAACAGCTCCGCCGTGTAACCAACGTCAATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTT
GGCTCGTTGACTCTAACCGTCTCCGTCTCGCAACGGTTATTCCAAGGGAGAGACAAACTT
AGATAAGTAGGCGGATCTTCACCGGACGTTGACGCCGTCACCTCCGTTACAGCACCAGAT
CTAGCCGTCGGTTTGAACACGTGTGGAGCACCACTGGATTGCTCGCTGACGTCAGATCCA
GATGGACTTCCGGGGCTCATATATAACCCGGTAGACACACCACCACCACTCGCCGTACGT
TTCAACGGTTGCTCCTCTCCTAAGTTACCGTCATACCCTCCGTTACCACCGAAGTCACAG
CTCTGTCCATCAGATGTAAAAGCGCTGCATTTACGCTTGAGCGTCGAGTTCCAATGGTTC
TTGATAGCGTTGTCGGTTCTTCCATTGAGGAGACGAGAGATGGTCGCCCACTTGTTACCG
AACCGAGCGTGTGCCCGAATAATCGTCTCGTCTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



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TTTTTTGTAAAGTTTTTTTTACTTTTCGTCAATTCTTTTGTATGATTTTCAATGTTTTTA
AATTTGAATCACGAAAGATCATCATATGATTACAAAAGATTTTTTTTTAGAGTTTGCTTC
CCTTGTTCTGTTTCTCTTAGCCATTGCTGACTTTGGTGGCTCAACAAAACATGAAAAGCC
TGAAACTTTTATTTTCACGAGAAACAGAGTGAAAAGTTTTTAAGACTCTTTTGCTTTCTT
CTCTCACTTAAAATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCGATTTGCTTCACTATAAACTCCC
TAAACCCGACACGGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATACACGAACCACCACCACCACCAC
TTCCTCCGCTGGAACCACCCCCAGCAACGTTCCCTCGCTGTAAATCCGCCATGTAACTCC
TCACCTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACCGTCATGAACTCCCCACCGAATCCTGATA
TCCCTTTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCTAACCGGGAACAGCTCCGCCGTGTAAACAC
CGTCCATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCGTTGACTCTAACCGTCTCCGTCT
CGCAACGGTTATTCCAAGGGAGCGACAAACTTAGATAAGTCGGCGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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AF RR4F680TF C 1
AF RR4F680JQ U 6
BS 1 12 RR4F680TF
BS 13 632 RR4F680JQ
BS 633 649 RR4F680TF

RD RR4F680TF 649 0 0
TTTTTTGTAAAGTTTTTTTTACTTTTCGTCAATTCTTTTGTATGATTTTCAATGTTTT*A
AATTTGAATCACGAAAGATCATCATATGATTACAAAAGATTTTTTTT*AGAGTTTGCTTC
CCTTGTTCTGTTTCTCTTAGCCATTGCTGACTTTGGTGGCTCAACAAAACATGAAAAGCC
TGAAACTTTTATTTTCACGAGAAACAGAGTGAAAAGTTTTTAAGACTCTTTTGCTTTCTT
CTCTCACTTAAAATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCGATTTGCTTCACTATAAACTCCC
TAAACCCGACACGGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATACACGAACCACCACCACCACCAC
TTCCTCCGCTGGAACCACCCCCAGCAACGTTCCCTCGCTGTAAATCCGCCATGTAACTCC
TCACCTCCGTCCTAATCATCTCCTGCACCACCGTCATGAACTCCCCACCGAATCCTGATA
TCCCTTTCTCTTCTTCCACCTCTTCCTTTCTAACCGGGAACAGCTCCGCCGTGTAAACAC
CGTCCATAACCGTGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCGTTGACTCTAACCGTCTCCGTCT
CGCAACGGTTATTCCAAGGGAGCGACAAACTTAGATAAGTCGGCGGATC

QA 1 649 1 649
DS 

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GTAAAGT
TTTTTTTTACTTTTCGTCAATTCTTTTGTATGATTTTCAATGTTTTTAAATTTGAATCAC
GAAAGATCATCATATGATTACAAAAGATTTTTTTTTAGAGTTTGCTTCCCTTGTTCTGTT
TCTCTTAGCCATTGCTGACTTTGGTGGCTCAACAAAACATGAAAAGCCTGAAACTTTTAT
TTTCACGAGAAACAGAGTGAAAAGTTTTTAAGACTCTTTTGCTTTCTTCTCTCACTTAAA
ATCACTACTCGCTCTTCCCAATACCGATTTGCTTCACTATAAACTCCCTAAACCCGACAC
GGCGGCTGTTTACACTTTGCGGCATACACGAACCACCACCACCACCACTTCCTCCGCTGG
AACCACCCCCAGCAACGTTCCCTCGCTGTAAATCCGCCATGTAACTCCTCACCTCCGTCC
TAATCATCTCCTGCACCACCGTCATGAACTCCCCACCGAATCCTGATATCCCTTTCTCTT
CTTCCACCTCTTCCTTTCTAACCGGGAACAGCTCCGCCGTGTAAACACCGTCCATAACCG
TGTTCTCGTTTACTTGAGTTGGCTCGTTGACTCTAACCGTCTCCGTCTCGCAACGGTTAT
TCCAAGGGAGCGACAAACTT

QA 8 627 8 627
DS 



AS 1 4

CO CL1324Contig1 1571 4 7 U
GGGCCCTATCACCACCACCGTCATTGTTTATCATCCCTGAATCTCAGTCAGATCTTCGAG
GTGATCCTTCTTAGTTAGTGACCGACCACCTTCTAGTATTTGATAGGTAGTATGCTGGCT
TCAACGCAAAACCCATTCTCCTGCTTCGCCGAACCATTGTATCCGAGAAGCCGCTCCGTA
CTATTTCACCCGCTTCCAACAAGGTTCTCCATCACTGCCCATTCGAAAAGATGTAAACTT
AGTTTAAATTTTTTTTTTTTTGGACTCGTTGAATGCCTTTTGTTTTGCTCCATAGGTAGG
TTAATGGAGGCTTCTCAGCTTCTGCTAAAAGATATCATTTTGGGAAAGAGTTGCTGAGTT
TTGCTTCAGATAATTTCTTGCCTCTAGCTCTTGTTACTGATTTGCAAACCCAACTCTTGG
ATGTCTTGCCGACAAATACTCTCTTTCAACGTTCAGCACAGGTGGAATATTTATAACATC
AGGAAGGATTGGCTTTACATACTGAAGCTATTGGTGCTGCTGTGAAAGGGTGGCCTCTTG
GTATCTTCGGGCTAGTATGATCTTGCTTCCTGTTTAGACCTACTATTTTGTTGCTCACTC
CATCCTTATCAAGGCTAGTTATGCTAGTCCAACTCCAACCTCAACAACTTGTTACAGGGC
TAAGTATATTTTGCTGTATGCCAACCACCTTATCAAGCGGTGCTGGGCCTCACTCACGTA
CTCAACCACCTTACCAATGCATCCAATTTGTCAGGCATTTTAAGTAGGGTATCAAGATAC
ATAGCCGGAGGAGTACGTAGGGGTTTCGTTTCCTACTGACCAACTATTCAGAAGTCTTAT
AGTTTACTCTGTCACTTAATCCCTTTAATCATTTGCAAGGTTATTCGGGAATCATTCCAA
TTCCAAGCAGAGCCTCATTTGTGATCTCTTCCCTTTCTGGTGAAACTATATAAACTCTGT
GGTATTGCAAACTTCGTTGACAATAACCGTAAAAAGTGAATGAACGCAATCTGCCTCAGT
TTGGTGCCATGGATCCAAGTTAGCAGGTCAAGATCACTGCTACTATCCGTTGAGCCTAAG
GCTTTTCTTGCAGCCATTGGCATTGGAATATTGCTGCTGCATCTCATCTCTCTTTACTAG
CATTCAATGCTCTATCAATCCGCATCCTCTCAGGTGATTATGATAGTAAGAACTCCAAGG
GAATTGGCACAGCAGTCTTACTCGTTGCAAGCCAGGTACTACTAGTACTAATAAAGTTAT
TGCCTTTAACCACCGAGCTCTGGTGTTTTTGCTTTCGTGCCTATAGAAAACATTACCTGT
AAATGGTCCCTGTCCCTTATGATAACCTCTATGTTCATTTACTCTTATTGTTAGAATACG
TATTTGCAATGTGTATTGATTAAATACACTAGTCAACGAATGGATCAGGAAGAGTAATGC
GTCTTCCACTGAATGTAAAGACAGCTTAAGAAAGAGAGGAGATAGAAACCAGTGTTGTGG
AGTAAGGTTTGGTCATATTATTCTGCAGATTCATTTGTTTAAATTTTCTGAAAAAATGTT
GTAAAAAAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CT

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CA

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AC

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CGTGTGG
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TATAAACTCTGTGGTATTGCAAACTTCGTTGACAATAACCGTAAAAAGTGAATGAACGCA
ATCTGCCTCAGTTTGGTGCCATGGATCCAAGTTAGCAGGTCAAGATCACTGCTACTATCC
GTTGAGCCTAAGGCTTTTCTTGCAGCCATTGGCATTGGAATATTGCTGCTGCATCTCATC
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TAATAAAGTTATTGCCTTTAACCACCGAGCTCTGGTGTTTTTGCTTTCGTGCCTATAGAA
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TGAAAAAATGTTGTAAAAAAATA

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DS 



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ATAAACCACATTCTCCCCCGATCTCAAAAGGAAAAGCAAAAATGGGATATGAATGTGTTT
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CCTCGATCAGTGATGTTAAAATTCTTCCTTGTGAAGAAAGAGAGAATCTCTCCAGCAACT
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F989JQ U 1
AF RR4AG83JQ U 80
AF RR4F851JQ U 89
AF RR4F989TF C 359
AF RR4AG83TF C 358
BS 1 637 RR4F989JQ
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BS 639 708 RR4F989JQ
BS 709 712 RR4AG83JQ
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BS 729 729 RR4AG83TF
BS 730 765 RR4F851JQ
BS 766 771 RR4AG83TF
BS 772 781 RR4F851JQ
BS 782 783 RR4AG83TF
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BS 792 792 RR4AG83TF
BS 793 795 RR4F851JQ
BS 796 1050 RR4AG83TF

RD RR4F989JQ 708 0 0
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ATATGGACACTATGAAATTGAGTCAAATGGTCATTTTAGTCTCATACTAGAAACAGATGT
ATAAACCACATTCTCCCCCGATCTCAAAAGGAAAAGCAAAAATGGGATATGAATGTGTTT
TGTGTTCATGATCTCTCAAAGAGACCTTTAACATAAACCATGTCTTTCTCACTAAGCTGA
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TCAGGCAATGTAATGGTTAAGACAAGACCCACACTTGCTAAACTTATACATGTACAGAAC
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CCTCGATCAGTGATGTTAAAATTCTTCCTTGTGAAGAAAGAGAGAATCTCTCCAGCAACT
TGCTTTGGCTCCTTCTTGACGATTCCTTCTCCTTCGCCAACAACGAACGTCTTCCTCACT
ATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTGATGAGAGACCAAAGACCTGGAACT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4AG83JQ 633 0 0
GGGTA
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CAAAAGGAAAAGCAAAAATGGGATATGAATGTGTTTTGTGTTCATGATCTCTCAAAGAGA
CCTTTAACATAAACCATGTCTTTCTCACTAAGCTGAAGGTCCTTCCTCATTTCTTCAACC
TGTACATCATCTCCCTGAACCACAACCTCGCTCAGTATCCCATTTTCTCCCACCATCATC
TTCACCTTTATCTCCTCTTTCCTCGACGCCTTCTTCCAGTAATACGCTCCTGCGAGTGGA
CTAAGAATGGTAATGAAGAACCAATTGTTTCCAAAATCAGGCAATGTAATGGTTAAGACA
AGACCCACACTTGCTAAACTTATACATGTACAGAACGTCAGCAGAGCAGCTTGTCCTCTA
CTCGGAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATGGTTTCTCCTCGATCAGTGATGTTAAAATTC
TTCCTTGTGAAGAAAGAGAGAATCTCTCCAGCAACTTGCTTTGGCTCCTTCTTGACGATT
CCTTCTCCTTCGCTAACAACGAACGTCTTCCTCACTATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTG
ATGAGAGACCAAAGACCTGGAACTGAAA

QA 6 633 6 633
DS 

RD RR4F851JQ 707 0 0
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AGGAAAAGCAAAAATGGGATATGAATGTGTTTTGTGTTCACGATCTCTCAAAGAGACCTT
TAACATAAACCATGTCTTTCTCACTAAGCTGAAGGTCCTTCCTCATTTCTTCAACCTGTA
CATCATCTCCTTGAACCACAACCTCACTCAGTGTCCCATTTTCTCCCACCATCATCTTCA
CCTTTATCTCCTCTTTCCTCGACGCCTTCTTCCAGTAATACGCTCCTGCGAGTGGACTAA
GAATGGTAATGAAGAACCAATTGTTTCCAAAATCAGGCAATGTAATGGTTAAAACAAGAC
CCACACTTGCTAAACTTATACACGTACAGAACGTGAGCAGAGCAGCTTGTCCTCTACTCG
GAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATGGTTTCTCCTCGATCAGTGATGTTAAAATTATTCC
TTGTGAAGAAAGAGAGAATCTCTCCAGCAACTTGCTTTGGCTCCTTCTTGACGATTCCTT
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ACGTCAGCAGAGCAGCTTGTCCTCTACTCGGAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATGGTTT
CTCCTCGATCAGTGATGTTAAAATTCTTCCTTGTGAAGAAAGAGAGAATCTCTCCAGCAA
CTTGCTTTGGCTCCTTCTTGACGATTCCTTCTCCTTCGCCAACAACGAACGTCTTCCTCA
CTATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTGATGAGAGACCAAAGACCTGGAACTGAAATAACGA
ACAAACCCAACGACGTGTAGTAGCTAGCCAACGAGTAACCACCACCA******GTCTCCG
CCAACAACAGTAACGAACTAGGGTTCTGTTCCCACCATTGATGAATCTGAACCGCCGATG
AAGAAACAGCACTGAGAGGCTCCACAACCATGGCGGTAACAGGAGAGACTCTGTTTCGTT
TCGTCACACAGTCCCGGAGTCTCCTCCGCCCTTTGATTATTACTACATCTCTTGAAGTCT
TCATCCATGGACACGACAGCGACGGAGAAAACAGCTTCGTTGTCGCCATTGTCGAGAG
CC

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AAATCAGGCAATGTAATGGTTAAGACAAGACCCACACTTGCTAAACTTATACATGTACAG
AACGTCAGCAGAGCAGCTTGTCCTCTACTCGGAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATGGTT
TCTCCTCGATCAGTGATGTTAAAATTCTTCCTTGTGAAGAAAGAGAGAATCTCTCCAGCA
ACTTGCTTTGGCTCCTTCTTGACGATTCCTTCTCCTTCGCTAACAACGAACGTCTTCCTC
ACTATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTGATGAGAGACCAAAGACCTGGAACTGAAATAACG
AACAAACCCAACGACGTGTAGTAGCTAGCCAACGAGTAACCACCACCA******GTCTCC
GCCAACAACAGTAACGAACTAGGGTTCTGTTCCCACCATTGATGAATCTGAACCGCCGAT
GAAGAAACAGCACTGAGAGGCTCCACAACCATGGCGGTAACAGGAGAGACTCTGTTTCGT
TTCGTCACACAGTCCCGGAGTCTCCTCCGCCCTTAGATTATTACTACATCTCTTGAAGTC
TTCATCCATGGACACGACAGCGACGGAGAAAACAGCTTCGTTGTCGCCATTGTCGAGAGA
GTCGTCTATATGGCTTCAAAGGCTTTACATCCC

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DS 



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TTATTGTTATATTCTGAATTCTAAAGATATCTTAGAATATCTTGTATTTTTATTATTTCT
C


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 

AF RR4GX43JQ U 6
AF RR4GX43TF C 6
AF RR4A392JQD U 1
AF RR4A392TFB C 1
AF RR4A392JQ U 10
BS 1 601 RR4A392JQD

RD RR4GX43JQ 546 0 0
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GTTAT
C

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4GX43TF 546 0 0
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ATATAATTGTTTATATCTAAAATAATAACATCTCCTTCCTTTATATGATCCCCTATAACT
ATATACATACAAATAAATACATTGATAACTATATACATACAATTAAATACATTGACTTGA
ATTTCATACAGCGGTCCAATGATGATCCATTTTTTCAAAAGAGCGCAAATTGAGTTACCC
CATATAATACGTTTACACATGCATAAAAGCTTTTTTTAGTTATGTTTGTAGGAATCTATG
TGTTATACAATATTCTACCAAATGGGTCTTATCAAATCGAAGTTTTTAAAATAAAAAAGG
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GTTAT
C

QA 1 545 1 545
DS 

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AATTTATATAATTGTTTATATCTAAAATAATAACATCTCCTTCCTTTATATGATCCCCTA
TAACTATATACATACAAATAAATACATTGATAACTATATACATACAATTAAATACATTGA
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TACCCCATATAATACGTTTACACATGCATAAAAGCTTTTTTTAGTTATGTTTGTAGGAAT
CTATGTGTTATACAATATTCTACCAAATGGGTCTTATCAAATCGAAGTTTTTAAAATAAA
AAAGGGATTTATACGATTCGGTCTCATCAGATCTAAAAAATCTTATTTTTTTGAATATGA
AGAAATAAAGAAGCCATTGCAAGTGCCGGAAAGACTAGGCCTACTAAAGGCACAAAAATA
GAGGGTAAGTTGTTGAAAGTTGTCATAAAATGGGGTACCTCAATTTAATATTTGTACCTG
TTATTGTTATATTCTGAATTCTAAAGATATCTTAGAATATCTTGTATTTTTATTATTTCT
C

QA 1 601 1 601
DS 

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GTTTT
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ATATAATTGTTTATATCTAAAATAATAACATCTCCTTCCTTTATATGATCCCCTATAACT
ATATACATACAAATAAATACATTGATAACTATATACATACAATTAAATACATTGACTTGA
ATTTCATACAGCGGTCCAATGATGATCCATTTTTTCAAAAGAGCGCAAATTGAGTTACCC
CATATAATACGTTTACACATGCATAAAAGCTTTTTTTAGTTATGTTTGTAGGAATCTATG
TGTTATACAATATTCTACCAAATGGGTCTTATCAAATCGAAGTTTTTAAAATAAAAAAGG
GATTTATACGATTCGGTCTCATCAGATCTAAAAAATCTTATTTTTTTGAATATGAAGAAA
TAAAGAAGCCATTGCAAGTGCCGGAAAGACTAGGCCTACTAAAGGCACAAAAATAGAGGG
TAAGTTGTTGAAAGTTGTCATAAAATGGGGTACCTCAATTTAATATTTGTACCTGTTATT
GTTATATTCTGAATTCTAAAGATATCTTAGAATATCTTGTATTTTTATTATTTCTC

QA 6 601 6 601
DS 

RD RR4A392JQ 592 0 0
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ACATACAAATAAATACATTGATAACTATATACATACAATTAAATACATTGACTTGAATTT
CATACAGCGGTCCAATGATGATCCATTTTTTCAAAAGAGCGCAAATTGAGTTACCCCATA
TAATACGTTTACACATGCATAAAAGCTTTTTTTAGTTATGTTTGTAGGAATCTATGTGTT
ATACAATATTCTACCAAATGGGTCTTATCAAATCGAAGTTTTTAAAATAAAAAAGGGATT
TATACGATTCGGTCTCATCAGATCTAAAAAATCTTATTTTTTTGAATATGAAGAAATAAA
GAAGCCATTGCAAGTGCCGGAAAGACTAGGCCTACTAAAGGCACAAAAATAGAGGGTAAG
TTGTTGAAAGTTGTCATAAAATGGGGTACCTCAATTTAATATTTGTACCTGTTATTGTTA
TATTCTGAATTCTAAAGATATCTTAGAATATCTTGTATTTTTATTATTTCTC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 6

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ATAAGTTTAGTCAACAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTTGTCACCAAGGAGCTTC
AAATCGATGACAGGCTCGTCACACTCCAAATTTGGGACACTGCTGGGCAAGAGAGGTTCC
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ACTACCTCAAGTCATTTGATTCTCTGGACAATTGGCACGAGGAGTTTCTTAAGCAGGCTA
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ACATATGCTATTACGAGACATCTGCTAAAGAAGATTACAACGTAGATGAATCGTTCTTGT
GCATCACAAAACTTGCCCTTGCCAATGAGCGCGACCAAGATATATATTTTCAGGGGATTC
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TCTTAGCTATGTTTGATTTGTGCCATTAGTCATGTTTGTTCTCTCGTTTTCAGCTTTGGC
ACGAGCCTGGTCGTTGTCGTGCAGCTATTCCGTCTTTCTTCTGATCTAAAACCTAAAAAG
AACGTTAGTCTAAGACGATAGATTAATATAGATACTAAAATGTAGCTTATCAAATATCAA
CATACTTCTTATAATTCTTGTTACATTTTTTAAATCTTTTGGGTGGAGGAGGAAACAAAG
AACAAAACAAGTTTAAGTTAGTAAACTCCATGGGTCATGGCAAGGCTGGAGATACGTATG
AGCACATTCATTCTGTGTTTTTCTTTTTCTTTTCATTCTGCGGTTTTGCCTATATGGAGC
TTTGTGATTTCATTTTTACACACAAAAACATATATTTATCCATTACAAGTTTGGATGTTG
CATGTAATATTTGGATATTAATAGCAAATCCTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AC

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AA
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CC

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TTTATCCATTACAAGTTTGGATGTTGCATGTAATATTTGGATATTAATAGCAAATCCTTT
CCC

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DS 



AS 1 6

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GAGGAATCTACTCTCCACCCAAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCTGTTGATT
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC65TF U 37
AF RR4FN62TF U 1
AF RR4FN62JQ C 114
AF RR4EC65JQ C 348
AF RR4FS84TF U 371
AF RR4GN11TF U 371
BS 1 688 RR4FN62TF
BS 689 869 RR4FS84TF
BS 870 918 RR4GN11TF

RD RR4EC65TF 613 0 0
GACCG
CCGCACGAAAACGAATCACCGTCGCACGATATCTGCTCAGCCCGCATAATCGAGTGAGCT
CTCTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGTCGAGTGGTGGGTGTAAAATGGGAGATGGAGAG
AAGAATGATGGGAAGAGACTAGTGTTTGTGACGGTGGGAACAACGAGTTTCGACGCCCTC
GTGAAAGCAGTGGTCAGTCAAAACGTTAAAGACGAGTTGCGCAAGAGAGGATATACTCAT
CTTCTCATTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCACCCAAGTGTGATGGAGCGGATGGA
TCATCACTAGCTGTTGATTACTTCACATTCTCCTCGAGTATCGCAGATTATATTCGATCT
GCTTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATATTCGAGACGCTAAAGCTAGGG
AAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGGACAATCATCAGTGTGAATTAGCC
GAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGTCCTCATGCGCTTCATCAGACC
TTGACCAAGATGGAGTTGGGATCTCTGGTTCGGTACGATCCAGGGGATGGGACACCTGTT
GCCCGT
GT

QA 6 611 6 611
DS 

RD RR4FN62TF 688 0 0
GGGCCGCTATGAATTTTCGAAGTTGATTGGGAAGGGAACCACCGCACGAAAACGAATCAC
CGTCGCACGATATCTGCTCAGCCCGCATAATCGAGTGAGCTCTCTTTGACCAATCAGTGA
TCGATCAGTCGAGTGGTGGGTGTAAAATGGGAGATGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGAC
TAGTGTTTGTGACGGTGGGAACAACGAGTTTCGACGCCCTCGTGAAAGCAGTGGTCAGTC
AAAACGTTAAAGACGAGTTGCGCAAGAGAGGATATACTCATCTTCTCATTCAGATGGGTC
GAGGAATCTACTCTCCACCCAAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCTGTTGATT
ACTTCACATTCTCCTCGAGTATCGCAGATTATATTCGATCTGCTTCTCTTGTTATTAGTC
ACGCTGGATCTGGAAGCATATTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAG
TGAACGAGGATCTGATGGACAATCATCAGTGTGAATTAGCCGAAGAGCTTGAAGAGAGGA
AGCATTTGTACTGCGCTCGTCCTCATACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGG
GATCTCTGGTTCGGTACGATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGT
TCCTGGGTTTCCCTGATGATTAAAACAG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FN62JQ 688 0 0
TCAGTGATCGATCAGTCGAGTGGTGGGTGTAAAATGGGAGATGGAGAGAAGAATGATGGG
AAGAGACTAGTGTTTGTGACGGTGGGAACAACGAGTTTCGACGCCCTCGTGAAAGCAGTG
GTCAGTCAAAACGTTAAAGACGAGTTGCGCAAGAGAGGATATACTCATCTTCTCATTCAG
ATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCACCCAAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCT
GTTGATTACTTCACATTCTCCTCGAGTATCGCAGATTATATTCGATCTGCTTCTCTTGTT
ATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATATTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATT
GTTGTAGTGAACGAGGATTTGATGGACAATCATCAGTGTGAATTAGCCGAAGAGCTTGAA
GAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGTCCTCATACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATG
GAGTTGGGATCTCTGGTTCGGTACGATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATC
GATAGGTTCCTGGGTTTCCCTGATGATTAAAACAGATGCGTTTAAAAAACAAGTTTTTTG
AGAACAGTTTTAACTAGTTATGTACTAAAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTT
GTAGTAGATTTCATATCTTTGTAA
CAGC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EC65JQ 527 0 0
CTAGCTGTTGATTACTTCACATTCTCCTCGAGTATCGCAGATTATATTCGATCTGCTTCT
CTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATATTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCG
TTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGGACAATCATCAGTGTGAATTAGCCGAAGAG
CTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGTCCTCATGCGCTTCATCAGACCTTGACC
AAGATGGAGTTGGGATCTCTGGTTCGGTACGATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGT
GTTATCGATAGGTTCCTGGGTTTCCCTGATGATTAAAACAGATGCGTTTAAAAAACAAGT
TTTCTGAGAACAGTTTTAACTAGTTATGTACTAAAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTT
GTTTTTGTAGTAGATTTCATATCTTTGTAATAGCTAAAGCTTTTTCTGATGTTTGAGAGG
ATTATGGATAGCTTCGTATTCAACAGTACTCACCTTTTGCAG
ACGAT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4FS84TF 510 0 0
G
TCCTCGAGTATCGCAGATTATATTCGTTCTGCGTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCT
GGAAGCATATTTGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGAT
CTGATGGACAATCATCAGTGTGAATTAGCCGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTAC
TGCGCTCGTCCTCACACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGATCTCTGGTT
CGGTACGATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTC
CCTGATGATTAAAACAGATGCGTTTAAAAAACAAGTTTTCTGAGAACAGTTTCAACTAGT
TATGTACTAAAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTTGTAGTAGATTTCATATCT
TTGTAATAGCTAAAGCTTTTTCTGATGTTTGAGAGGATTATGGGTAGCTTCGTATTCAAC
AGTACTCACCTTTTGCAG
GCTGTAAAAAA

QA 2 499 2 499
DS 

RD RR4GN11TF 548 0 0
G
TCCTCGAGTATCGCAGATTATATTCGTTCTGCGTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCT
GGAAGCATATTTGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGAT
CTGATGGACAATCATCAGTGTGAATTAGCCGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTAC
TGCGCTCGTCCTCACACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGATCTCTGGTT
CGGTACGATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTC
CCTGATGATTAAAACAGATGCGTTTAAAAAACAAGTTTTCTGAGAACAGTTTCAACTAGT
TATGTACTAAAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTTGTAGTAGATTTCATATCT
TTGTAATAGCTAAAGCTTTTTCTGATGTTTGAGAGGATTATGGGTAGCTTCGTATTCAAC
AGTACTCACCTTTTGCAGGCTGTAAAAAATGATCATATTGGTCTGGTTATCTGTAACCGA
ACCTGAG

QA 2 548 2 548
DS 



AS 1 6

CO CL1329Contig1 677 6 3 U
GGGCTTTTGAAGCTGCTCCTGTTGTTGGTGTTGGATTTTGAGGCGCAGTAGTATCGACTT
TTGGCATCCAGAGAAAAAAACGAAGAGGTGCATCTATGGCTGATCCTGAGCTAGAAACTA
TTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTTATGGCTCAACATGGCACTGGGAAGCAGGGCAGTC
AGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTA
GGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCCGAGAGAGAATTGCTCGAATTG
CACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATGTTATTCTGAGGGCTGCTCAAA
TGGGACAGATTGTTGAAAAGGTTTCTGAGGAACGGCTTATAACGCTGCTGGAACAAATTA
ACAGCCAGACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGTTCGACG
ATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCTGACTGTTAAGTTTG***GTGT
TCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTTTATTGTGGTGAATCTTAATGA
TCTTCCT*GATGCTTTGGTTGAGATAAAATCTGAAACTGAAACTCCGTATTTTACATTTG
GCATTTCCTCTATCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BA84JQ C 1
AF RR4BA84TF U 1
AF RR4F712JQ C 37
AF RR4F712TF U 37
AF RR4AF92JQ C 40
AF RR4AF92TF U 40
BS 1 625 RR4BA84TF
BS 626 629 RR4F712TF
BS 630 677 RR4AF92TF

RD RR4BA84JQ 626 0 0
GGGCTTTTGAAGCTGCTCCTGTTGTTGGTGTTGGATTTTGAGGCGCAGTAGTATCGACTT
TTGGCATCCAGAGAAAAAAACGAAGAGGTGCATCTATGGCTGATCCTGAGCTAGAAACTA
TTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTTATGGCTCAACATGGCACTGGGAAGCAGGGCAGTC
AGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTA
GGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCCGAGAGAGAATTGCTCGAATTG
CACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAA
TGGGACAGATTGTTGAAAAGGTTTTTGAGGAACGGCTTATAACGCTGCTGGAACAAATTA
ACAGCCAGACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGTTCGACG
ATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCTGACTGTTAAGTTTG***GTGT
TCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTTTATTGTGGTGAATCTTAATGA
TCTTCCT*GATGCTTTGGTTGAGAT
G

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4BA84TF 626 0 0
GGGCTTTTGAAGCTGCTCCTGTTGTTGGTGTTGGATTTTGAGGCGCAGTAGTATCGACTT
TTGGCATCCAGAGAAAAAAACGAAGAGGTGCATCTATGGCTGATCCTGAGCTAGAAACTA
TTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTTATGGCTCAACATGGCACTGGGAAGCAGGGCAGTC
AGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTA
GGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCCGAGAGAGAATTGCTCGAATTG
CACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATGTTATTCTGAGGGCTGCTCAAA
TGGGACAGATTGTTGAAAAGGTTTCTGAGGAACGGCTTATAACGCTGCTGGAACAAATTA
ACAGCCAGACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGTTCGACG
ATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCTGACTGTTAAGTTTG***GTGT
TCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTTTATTGTGGTGAATCTTAATGA
TCTTCCT*GATGCTTTGGTTGAGAT
G

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4F712JQ 609 0 0
GGG
GAGGCGCAGTAGTATCGACTTTTGGCATCCAGAGAAAAAAACGAAGAGGTGCATCTATGG
CTGATCCTGAGCTAGAAACTATTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTTATGGCTCAACATG
GCACTGGGAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTA
AAAGGGAAGCTGATGAACGTAGGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCC
GAGAGAGAATTGCTCGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATG
TTATTCTGAGGGCTGCTCAATTGGGACAGATTGTTGAAAAGGTTTTTGAGGAACGGCTTA
TAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAGACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGA
GGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCT
GACTGTTAAGTTTG***GTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTT
TATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCT*GATGCTTTGGTTGAGATAAAA
GAGTAATCTGAAACTG

QA 4 593 4 593
DS 

RD RR4F712TF 609 0 0
GGG
GAGGCGCAGTAGTATCGACTTTTGGCATCCAGAGAAAAAAACGAAGAGGTGCATCTATGG
CTGATCCTGAGCTAGAAACTATTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTTATGGCTCAACATG
GCACTGGGAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTA
AAAGGGAAGCTGATGAACGTAGGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCC
GAGAGAGAATTGCTCGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATG
TTATTCTGAGGGCTGCTCAATTGGGACAGATTGTTGAAAAGGTTTCTGAGGAACGGCTTA
TAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAGACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGA
GGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCT
GACTGTTAAGTTTG***GTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTT
TATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCT*GATGCTTTGGTTGAGATAAAA
GAGTAATCTGAAACTG

QA 4 593 4 593
DS 

RD RR4AF92JQ 638 0 0
GAGGCGCAGTAGTATCGGATTTTGGCATCCAGAGAAAAA**CGGAGAGGTGCATCTATGG
CTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTCATGGCTCAACATG
GCACTGGGAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTA
AAAGGGAAGCTGATGAACGTAGGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCC
GAGAGAGAATTGCACGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATG
TTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGGTTTTTGAGGAACGGCTTA
TAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAAACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGA
GGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCT
GACTGTTAAGTTTGTGTGTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTT
TATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCTTGATGCTTTGGTTGAGATAAAATCTGAAACTG
AAACTCCGTATTTTACATTTGGCATTTCCTCTATCTCG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4AF92TF 638 0 0
GAGGCGCAGTAGTATCGGATTTTGGCATCCAGAGAAAAA**CGGAGAGGTGCATCTATGG
CTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGGATGCAAGAGCTCATGGCTCAACATG
GCACTGGGAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCACAAGAAGATGCTA
AAAGGGAAGCTGATGAACGTAGGCAAATGATGCTTAGTCAGATATTGTCTTCCCAAGCCC
GAGAGAGAATTGCACGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAGCTAGAGGCGTAGAGGATG
TTATTCTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGGTTTCTGAGGAACGGCTTA
TAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAAACTAGCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGA
GGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTATGATGTGCTTTGTACATCT
GACTGTTAAGTTTGTGTGTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGACGTTACTGTGAAATATGTT
TATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCTTGATGCTTTGGTTGAGATAAAATCTGAAACTG
AAACTCCGTATTTTACATTTGGCATTTCCTCTATCTCG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 6

CO CL1330Contig1 1255 6 14 U
GTAGTATTACTTTTTGCAAACTCATGTAAACTATTTCTTTCAAGAGTGAGACAAACCCAC
AGTTCTACTCGGTTACTAAATAGCAAAACATCGTTATTACCAATTTACCAAAGTGAAATT
AAACAGGAGGTGGTGGCAAATCAATAAGAAGCCAAAAGCCAACACAGTCATCAGAATCCA
AGTCATCTTGAATTGCAAGAAAATGCAAACCTCCACTTGCTTTCTTTGCAGATTCCCAAG
CTTCAGCTTCATCAGTAGTAACAGGTGTTTTCTTGTACGTTGCGTAGACATACCTTGTCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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G
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AAGAATCGGCCTCGAGCAGAAATCTAACTCCCACTCTTTTATGCTCTCTGCATCTGTTTC
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QA 15 751 15 751
DS 



AS 1 6

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TGATATAAGATTGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP71TF U 1
AF RR4EO55TF U 1
AF RR4E342TF U 5
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AF RR4FP71JQ C 585
AF RR4E342JQ C 354
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DS 

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CCCTCGAGTC

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DS 

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GG
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TCTCCAGAGCCTTGCCTTCCTCATCAAGCAAAATTTCTCCCTCCTTCATTCCCTTCCGAT
CTCCTTCCCTCAAAATCACCAGTTCCGCTTCCTTCCTCCCGTCATCTATCTCCCTCTCTT
CACGTCGCGCATCCTTCATCATCCCACGTGCCACTGCCTCTTCCTCCGAGGGATCCGACT
CGCTAGCCAAAACCACCTTCCACGGTCTATGCTTCGTCTTGAAAGACAACATAGACACCG
ACCAGATCATCCCAGCAGACAAAGCATGCATCTTCCCTTCCAACCAGCAAGAGCGTGACG
AGATCGGCTCTAACGCCCTCTCCGGTCTACCAGACTCCCACAAACCCCGCTTCGTTGAGC
CAGGAGAGATCAAATCTAAATACTCCATCATAGTCGCCGGTGAGAACTTTGGTTGCGGGT
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C

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TTTTTT
G

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CGCTTCGTTGAGCCAGGAGAGATCAAATCTAAATACTCCATCATAGTCGCCGGTGAGAAC
TTTGGTTGCGGGTCGTCACGTGAACATGCTCCTGTCTGTCTAGGAGCAGCAGGAGCTAAA
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GTGTTTCCCCTCGAGTCAGAGGTTAGAGTCTGCGACGAGTGTACGACAGGAGACACGGTG
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GCGAGGAAGGTGGGAATGGTTCCTTCTCCATCAGTAGCTTAACTATCTTCATAATTTAAT
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AAGCACATGATATAAGATTGTTACC

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DS 



AS 1 2

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CATTGCAGTATGCTAATGACATGCATTGCACTCGCTAGTCTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH72TF U 1
AF RR4C959TF U 15
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TCTCGATTTAAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAATGGACCCATCGTCGATGAGTGTGG
TCAAGAGCTTGGGGAGACGTTACTGAATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACATC
AACCTCTCGTACTTTAGTGAAGAAACTTCCCCAACTGGAAACTTCACTAACAGATGGTGC
CAAATCAGCCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGACA
GTACGGTCAAGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTCTT
ATCTGCAAATACATCACCTGCCTCAGTCGGTAATGAATCCAAGTCAATA*CGAGGATGTT
TAAGTTTGGGGA
GCT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4C959TF 808 0 0
GG
AAGATGGATTCTGTTGGTCTCCTTCAGCCTTTCCACAATGTCTCTTCCACCATCTTCTTT
TCACAGCAGCGAAGTCCTTGTTTGATGATTCATTCCACATCCTTCCTGAAACCTCAACCT
TGGAAAAGACTAAATCTTTCGAGACCCTCTACTCTCACATTTGCTCTTGCCGAATCAGAT
TCTCCTCAGCCTTTGGAAACAAGCTCGAAATCTCTTCTCTTACAACTCTCTAAGTGTTTC
GATCTTCCATCAGATTACTTCCAGCAGCTACCAAGTGATCTTCGTCTCGATTTAAATGAT
GCTGCCTTTGATCTCTCCAATGGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGCTTGGGGAG
ACGTTACTGAATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACATCAACCTCTCGTACTTTA
GTGAAGAAACTTCCCCAACTGGAAACTTCATTAACGGCTGGTGCCAAATCATCCTTTGGG
AGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTACGGTCAAGGTGAA
TTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAGCTGGAGAGGTCTTATCTGCAAATACAACA
CCTGCCCCAGTCGGTAATGAATCTAAGTCGACAACCAGGATGTTTAAGTTTGGGGAACTT
CAGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCTGGAGCTGCATTGCATTCGTCTTTGGGAT
ACTGTCATGGCAAATCAGTCAGGAATCCAAAGCATACAGAGACTCATTGCAGTATGCTAA
TGACATGCATTGCACTCGCTAGTCTC

QA 3 808 3 808
DS 



AS 2 6

CO CL1333Contig1 604 4 4 U
GCATTTAGCGTAGATACTCTGTTCTCCAAAAAAAAAAGAAGCAAAATACATAAATGTGAT
TTTCGAAAGTTTTTATTCAATGCCAGCCTTCTTCTTCAACATTTCGATGAATTTTTCTTT
CTCTTCATCTGTCATTCCATTGGCTGAACAGTCTCCTACTCCCCACTCTGCTCCTCTCAG
ACAATACTTATCTTGAATCGCTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTTAGTTTGGAGTTCTCGAG
TAGTTTCTTGAGAATTGGAGAATCTTTGAATCTGGAATCGTTTTCAGCGTAAAATTTCTG
GTTTCTAGCATTGAAACGTTCAAGGAACTCGAGCTTTGGTAATTCAGGACCAGGAACTGA
TTCTATACCGGGACTTCCCGACATTAAGCCTGCTTCAGCGGTGCAGGGAGAGGAGAAGGG
TGAGTGAGGCAGCGAGAGGGAAGGTGGACTTGCAGAGAAGGTTCTTAAACGGTGGTGGTG
ATGGTAAAGGTAAAGCCATGGAGGAGATACGAGGTGCTCTTGTTTCATGGAGAGTGAAGC
TCGGCCGAGAGAGAGAAGAGATTTTGGTTTGCATCTTTGCTTCTAGATATTTTTTTTTGT
CCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 

AF RR4DQ31TF C 1
AF RR4DS18TF C 8
AF RR4DQ31JQ U 20
AF RR4DS18JQ U 20
BS 1 19 RR4DQ31TF
BS 20 179 RR4DQ31JQ
BS 180 180 RR4DS18JQ
BS 181 604 RR4DQ31JQ

RD RR4DQ31TF 604 0 0
GCATTTAGCGTAGATACTCTGTTCTCCAAAAAAAAAAGAAGCAAAATACATAAATGTGAT
TTTCGAAAGTTTTTATTCAATGCCAGCCTTCTTCTTCAACATTTCGATGAATTTTTCTTT
CTCTTCATCTGTCATTCCATTGGCTGAACAGTCTCCTACTCCCCACTCTGCTCCTCTCAG
ACAATACTTATCTTGAATCGCTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTTAGTTTGGAGTTCTCGAG
TAGTTTCTTGAGAATTGGAGAATCTTTGAATCTGGAATCGTTTTCAGCGTAGAATTTCTG
GTTTCTAGCATTGAAACGTTCAAGGAACTCGAGCTTTGGTAATTCAGGACCAGGAACTGA
TTCTATACCGGGACTTCCCGACATTAAGCCTGCTTCAGCGGTGCAGGGAGAGGAGAAGGG
TGAGTGAGGCAGCGAGAGGGAAGGTGGACTTGCAGAGAAGGTTCTTAAACGGTGGTGGTG
ATGGTAAAGGTAAAGCCATGGAGGAGATACGAGGTGCTCTTGTTTCATGGAGAGTGAAGC
TCGGCCGAGAGAGAGAAGAGATTTTGGTTTGCATCTTTGCTTCTAGATATTTTTTTTTGT
CCCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4DS18TF 597 0 0
GCGTAGATACTCTGTTCTCCAAAAAAAAAAGAAGCAAAATACATAAATGTGATTTTCGAA
AGTTTTTATTCAATGCCAGCCTTCTTCTTCAACATTTCGATGAATTTTTCTTTCTCTTCA
TCTGTCATTCCATTGGCTGAACAGTCTCCTACTCCCCACTCTGCTCCTCTCAGACAATAC
TTATCTTGAATCGCTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTTAGTTTGGAGTTCTCGAGTAGTTTC
TTGAGAATTGGAGAATCTTTGAATCTGGAATCGTTTTCAGCGTAGAATTTCTGGTTTCTA
GCATTGAAACGTTCAAGGAACTCGAGCTTTGGTAATTCAGGACCAGGAACTGATTCTATA
CCGGGACTTCCCGACATTAAGCCTGCTTCAGCGGTGCAGGGAGAGGAGAAGGGTGAGTGA
GGCAGCGAGAGGGAAGGTGGACTTGCAGAGAAGGTTCTTAAACGGTGGTGGTGATGGTAA
AGGTAAAGCCATGGAGGAGATACGAGGTGCTCTTGTTTCATGGAGAGTGAAGCTCGGCCG
AGAGAGAGAAGAGATTTTGGTTTGCATCTTTGCTTCTAGATATTTTTTTTTGTCCCT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4DQ31JQ 585 0 0
TGTTCTCCAAAAAAAAAAGAAGCAAAATACATAAATGTGATTTTCGAAAGTTTTTATTCA
ATGCCAGCCTTCTTCTTCAACATTTCGATGAATTTTTCTTTCTCTTCATCTGTCATTCCA
TTGGCTGAACAGTCTCCTACTCCCCACTCTGCTCCTCTCAAACAATACTTATCTTGAATC
GCTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTTAGTTTGGAGTTCTCGAGTAGTTTCTTGAGAATTGGA
GAATCTTTGAATCTGGAATCGTTTTCAGCGTAAAATTTCTGGTTTCTAGCATTGAAACGT
TCAAGGAACTCGAGCTTTGGTAATTCAGGACCAGGAACTGATTCTATACCGGGACTTCCC
GACATTAAGCCTGCTTCAGCGGTGCAGGGAGAGGAGAAGGGTGAGTGAGGCAGCGAGAGG
GAAGGTGGACTTGCAGAGAAGGTTCTTAAACGGTGGTGGTGATGGTAAAGGTAAAGCCAT
GGAGGAGATACGAGGTGCTCTTGTTTCATGGAGAGTGAAGCTCGGCCGAGAGAGAGAAGA
GATTTTGGTTTGCATCTTTGCTTCTAGATATTTTTTTTTGTCCCT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4DS18JQ 585 0 0
TGTTCTCCAAAAAAAAAAGAAGCAAAATACATAAATGTGATTTTCGAAAGTTTTTATTCA
ATGCCAGCCTTCTTCTTCAACATTTCGATGAATTTTTCTTTCTCTTCATCTGTCATTCCA
TTGGCTGAACAGTCTCCTACTCCCCACTCTGCTCCTCTCAGACAATACTTATCTTGAATC
GCTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTTAGTTTGGAGTTCTCGAGTAGTTTCTTGAGAATTGGA
GAATCTTTGAATCTGGAATCGTTTTCAGCGTAAAATTTCTGGTTTCTAGCATTGAAACGT
TCAAGGAACTCGAGCTTTGGTAATTCAGGACCAGGAACTGATTCTATACCGGGACTTCCC
GACATTAAGCCTGCTTCAGCGGTGCAGGGAGAGGAGAAGGGTGAGTGAGGCAGCGAGAGG
GAAGGTGGACTTGCAGAGAAGGTTCTTAAACGGTGGTGGTGATGGTAAAGGTAAAGCCAT
GGAGGAGATACGAGGTGCTCTTGTTTCATGGAGAGTGAAGCTCGGCCGAGAGAGAGAAGA
GATTTTGGTTTGCATCTTTGCTTCTAGATATTTTTTTTTGTCCCT

QA 1 585 1 585
DS 



CO CL1333Contig2 634 2 4 U
AGAAGCAATGATGCAAACCAAAATCTCTTCTCTCTCTAGGCCAAGCTTCACTCTCCATGA
AACAAGAGCACCTCATCAACCTCGTATCTCCATGGCTTTACCTTTACCATCACCATCACC
GTTTAAGCACCTTTTCTGCAAGTCCACGTTCCCTCTCGCTGCCTCACTCACCCTTCTCCT
CTCTCCCTGCACCGCTGAAGCAGGCCTAATGTCGGGAAGTCCCGGCATAGAATCAGTTCC
TGGTCCTGAATTACCAAAGCTCGAGTTCCTTGAACGTTTCAATGCTAGAAACCAGAAATT
CTACGCTGAAAACGGTTCCAGATTCAAAGAATCTCCAATTCTCAAGAAACTACTCGAGAA
CTCAAACTAAACAAAGAAAAGAATGAAAGAGCGATTCAAGATAAGTATTGTCTGAGAGGA
GCAGAGTGGGGAGTAGGAGACTGTTCAACCAATGGAATGACAGATGAAGAGAAAGAAAAA
TTCATCGAAATGTTGAAGAAGAAGACTGGCATTGAATAAAAACTTTCGAAAATCACATTT
ATGTATTTTGCTTTTTTTTTTTTTGGAGAACAGAGTATTTACGCTAAATGCAAAAATACA
AAACATGACAAAAACAAACGTTCGATATAACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD15TF U 1
AF RR4GD15JQ C 56
BS 1 423 RR4GD15TF
BS 424 424 RR4GD15JQ
BS 425 522 RR4GD15TF
BS 523 634 RR4GD15JQ

RD RR4GD15TF 522 0 0
AGAAGCAATGATGCAAACCAAAATCTCTTCTCTCTCTAGGCCAAGCTTCACTCTCCATGA
AACAAGAGCACCTCATCAACCTCGTATCTCCATGGCTTTACCTTTACCATCACCATCACC
GTTTAAGCACCTTTTCTGCAAGTCCACGTTCCCTCTCGCTGCCTCACTCACCCTTCTCCT
CTCTCCCTGCACCGCTGAAGCAGGCCTAATGTCGGGAAGTCCCGGCATAGAATCAGTTCC
TGGTCCTGAATTACCAAAGCTCGAGTTCCTTGAACGTTTCAATGCTAGAAACCAGAAATT
CTACGCTGAAAACGGTTCCAGATTCAAAGAATCTCCAATTCTCAAGAAACTACTCGAGAA
CTCAAACTAAACAAAGAAAAGAATGAAAGAGCGATTCAAGATAAGTATTGTCTGAGAGGA
GCATAGTGGGGAGTAGGAGACTGTTCAACCAATGGAATGACAGATGAAGAGAAAGAAAAA
TTCATCGAAATGTTGAAGAAGAAGACTGGCATTGAATAAAAA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4GD15JQ 579 0 0
CATGAAACAAGAGCACCTCATCAACCTCGTATCTCCATGGCTTTACCTTTACCATCACCA
TCACCGTTTAAGCACCTTTTCTGCAAGTCCACGTTCCCTCTCGCTGCCTCACTCACCCTT
TTCCTTTCTCCCTGCACCGCTGAAGCAGGCCTAATGTCGGGAAGTCCCGGCATAGAATCA
GTTCCTGGTCCTGAATTACCAAAGCTCGAGTTCCTTGAACGTTTCAATGCTAGAAACCAG
AAATTTTACGCTGAAAACGGTTCCAGATTCAAAGAATCTCCAATTCTCAAGAAACTACTC
GAGAACTCAAACTAAACAAAGAAAAGAATGAAAGAGCGATTCAAGATAAGTATTGTTTGA
GAGGAGCAGAGTGGGGAGTAGGAGACTGTTCAACCAATGGAATGACAGATGAAGAGAAAG
AAAAATTCATCGAAATGTTGAAGAAGAAGACTGGCATTGAATAAAAACTTTCGAAAATCA
CATTTATGTATTTTGCTTTTTTTTTTTTTGGAGAACAGAGTATTTACGCTAAATGCAAAA
ATACAAAACATGACAAAAACAAACGTTCGATATAACATC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

CO CL1334Contig1 632 4 4 U
AAACTTAACAGATAACTCTTATTATGTGTGAAACAAGAACGTGTAAAATAACTGATGAGT
AGGAACTATGAACAATATAACATGCCTCCTGGTTTTTATTTTTCCTCATCCGAAAGGTTA
GAGAAAACCAGCAGATATACAGAAACGTTCTTACATTTGAGCCTAAGAACTATTGTAGAG
CTTGCACTTGTTTGTTCCAGCACAAACGAGACATTCGTCTGCATCACCTTCAACATGACT
CAGACAATGTTGGATTCTGTCGTTCACAACATAAATGAGGAGATGATGGAGGCCGAGAGG
TGCAGTAATGAGGTATGAGATGTCAGAAAACTCCTTTGCAGCATCAGCCGTCAAAGCAGG
AATGTCCTGATGCCAATGTCTTCCAGGAAAGAGAAAAAATGGGCTAACAACTACACGTTT
GGCTCCTTGTTGTACACACAAA*CTGAAGGCACTTTTTATAGATGGCTCAGCCAA*TTCC
ATATGAGCAGGCTCGACAA*TAGAGTAGCCAGTGTTGTCTTCGAACATCTTTACAAACTC
CTCAAGCATAAGATTAGATTCACGGCGACGAGAACCGTGATCGACGATTATAATCCCATC
AGCATCACCAATCCCACTTCTGAGCAGCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4A280TFB C 101
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C

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AAACT
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CTATGAACAATATAACATGCCTCCTGGTTTTTATTTTTCCTCATCCGAAAGGTTAGAGAA
AACCAGCAGATATACAGAAACGTTCTTACATTTGAGCCTAAGAACTATTGTAGAGCTTGC
ACTTGTTTGTTCCAGCACAAACGAGACATTCGTCTGCATCACCTTCAACATGACTCAGAC
AATGTTGGATTCTGTCGTTCACAACATCAATGAGGAGATGATGGAGGCCGAGAGGTGCAG
TAATGAGGTATGAGATGTCAGAGAACTCCTTTGCAGCATCAGCCGTCAAAGCAGGAATGT
CCTGATGCCAATGTCTTCCAGGAAAGAGAAAAAATGGGCTAACAACTACACGTTTGGCTC
CTTGTTGTACACACAAA*CTGAAGGCACTTTTTATAGATGGCTCAGCCAA*TTCCATATG
AGCAGGCTCGACAA*TAG
C

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DS 

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TTTT
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CACTTTCAACATGACTCAGACAATGTTGGATTCTGTCGTTCACAACATAAATGAGGAGAT
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ACATCTTTACAAACTCCT

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DS 

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GATGGAGGCCGAGAGGTGCAGTAATGAGGTATGAGATGTCAGAAAACTCCTTTGCAGCAT
CAGCCGTCAAAGCAGGAATGTCCTGATGCCAATGTCTTCCAGGAAAGAGAAAAAATGGGC
TAACAACTACACGTTTGGCTCCTTGTTGTACACACAAA*CTGAAGGCACTTTTTATAGAT
GGCTCAGCCAA*TTCCATATGAGCAGGCTCGACAA*TAGAGTAGCCAGTGTTGTCTTCGA
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CGATTATAATCCCATCAGCATCACCAATCCCACTTCTGAGCAGCTCAC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 6

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ATCTATGATCTAGCTC*TGTCACCATAGCTCTCTGGCAATAGAAGCTGTACAGTTAAGCT
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CTTCGCCGATACCGACTCCGCTGGGCCAACCTCCCTCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTG
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GGTTTGATTGCCTCGATAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTACCTTGGCTTAGAAAC
CACAAACCTCAAAGAACTAACCACACATACTCCGTTGAATTTATAACTTCACAAACACCA
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TTATGAAGATGAGGAAACAAATTTGTAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H248JQ C 1
AF RR4H248TF U 1
AF RR4CC57TF U 1
AF RR4AB63TF U 388
AF RR4AW32TF U 163
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DS 

RD RR4H248TF 219 0 0
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TCTTCCCAAACTTCTCTTCTCTTCTCAGTTAAATTTTTTTCAGTTCTCCTTTTAAATTAA
ATCTATGATCTAGCTC*TGTCACCATAGCTCTCTGGCAATAGAAGCTGTACAGTTAAGCT
TAAGGTAAAAACAAATTTTCATTTATTTTTTCTGGATCG

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR4CC57TF 708 0 0
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TCTTCCCAAACTTCTCTTTTCTTCTCAGTTAAATTTTTTTCAGTTCTCCTTTTAAATTAA
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TAAGGTAAAAACAAATTTTCATTTATTTTTTCTGGATCGAAAAAAAAA*GAAAAGAAAAC
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CGTGTCAGTGGTGGAAAGAGACCAGGCTGTTGTCGTTTGTCCAAAACCACGTCGTATTGG
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QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4AB63TF 278 0 0
TCGAAC
TCTGCGATGTTACAACCACCAAGTTTGAATCCAAGGGCAGAGGCTGATATCTTAGATATC
ATTCCTGACAAAGGATGGTTATGGTACGGAACAAGTTCACCAAACGCAGGTATTAGACTC
GCCGTCCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGG
ATGCTCGATTCAGAGATGAAATCTTTTCTTCGCCGATACCGACTCCGCTGGGCCAACCTC
CCTCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTGGGAGG

QA 7 278 7 278
DS 

RD RR4AW32TF 781 0 0
G
AGCTGTACAGTTAAGCTTAAGGTAAAAACAAATTTTCATTTATTTTTTCTGGATCGAAAA
AAAAAAGAGAAGAAGACGATGAATCACTGGGCGGTTCAACCAAACGCTTTCGCTGCGGGT
GGAGATCTGAGGAACTCCGTGTCAGTGGTGGAAAGAGACCAGGCTGTTGTCGTTTGTCCA
AAACCACGTCTTATTGGTCTCCGTAACCCTCTCCACCATCCTTCTCGATCTCTGCGATGT
TACAACCACCAAGTT*GAATCCAAGG*CAGAGGCTGATATCTTAGATATCATTC*TGACA
AAGGATGGTTATGGTACGGAACAAGTTCACCAAACGCAGGTATTAGACTCGCCGTCCCC*
GTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCGATT
CAGAGATGAAATCTTTTCTTCGCCGATACCGACTCCGCTGGGCCAACCTCCCTCGTCTCC
TTCTTCTTCTTCCTCTGGGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCTATTTTGGTAACAGCCC
AGCGGTTAGGATCGAAGGGTTTGATTGCCTCGATAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCC
TACCTTGGCTTAGAAACCACAAACCTCAAAGAACTAACCACACATACTCCGTTGAATTTA
TAACTTCACAAACACCAGTTAGTGCGTCGTACATAAATGTTGTTAAATGATATGGAGATG
TGTGGAATGAGTCTTTGAGTGAAGTTGAGAAAGTACAAGAGATCGATCATTTGGAGTTTT

QA 2 781 2 781
DS 

RD RR4AW32JQ 775 0 0
TCTGCGATGTTACAACCACCAAGTT*GAATCCAAGG*CAGAGGCTGATATCTTAGATATC
ATTC*TGACAAAGGATGGTTATGGTACGGAACAAGTTCACCAAACGCAGGTATTAGACTC
GCCGTCCCC*GTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGG
ATGCTCGATTCAGAGATGAAATCTTTTCTTCGCCGATACCGACTCCGCTGGGCCAACCTC
CCTCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTGGGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCTATTTTG
GTAACAGCCCAGCGGTTAGGATCGAAGGGTTTGATTGCCTCGATAGGGACAGTAGAAACT
GCAGCATCCCTACCTTGGCTTAGAAACCACAAACCTCAAAGAACTAACCACACATACTCC
GTTGAATTTATAACTTCACAAACACCAGTTAGTGCGTCGTACATAAATGTTGTTAAATGA
TATGGAGATGTGTGGAATGAGTCTTTGAGTGAAGTTGAGAAAGTACAAGAGATCGATCAT
TTGGAGTTTTTTTTTCTTCTAAGAGTGTAAATAGGTGACGAAGTACGCAGTTTTCTTGGG
TTAAGTAAGTAGTATTTGTCGTCATTTTGTAAAGTATTAATATTCGGAAGGTCAGGTTCT
CTTCTATGGTTATGTAAAGAGATGGAGATAGAAGAGGAGGGTTTTGGGTATTTTCGTTTG
TAGTTTTCTTTTCTGTTGGAGTGTCGGTTATGAAGATGAGGAAACAAATTTGTAC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL1336Contig1 630 2 2 U
GCTTGTCATTGTCAAGAAAGGTGAGAAGGATCTTCCCGGGCTTACTGATACCGAGAAGCC
AAGGATGAGGGGACCCAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACTGTTTAACCTCACCAAGGA
TGATGATGTCAGGAAGTACGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGCAA
GGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCGTTGACCCTTCAGAGGAA
GAGAGCTAGAATCGCTGACAAGAAGAAGAGGATTGCTAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGA
GTACCAGAAGCTTCTTGCCTCGAGGTTGAAGGAACAACGTGAAAAGAGGAGTGAGAGTTT
GGCAAAGAAGAGGTCTAGACTCTCTTCCGCTGCCGCCAAGCCTTCCGCTACTGCTTAAAA
ATCCTGAGAATCTCATTTCTAGTTTTGTTTTTCCTTTTTTTTTGCTTCATCCGCATTAAA
ATACGTTAGTTCGAGTTTATATTTCTGTTGTTCCATCCGTTACATCGACTTTGTACTCGT
GTTGCTTGTTTTATTCTCTTTTACTTGAAAGACCACCTTAATACTCGATTTTTGTTTCTC
ATTTTCTAATTATGATCATGGTATTACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4EW87TF U 1
AF RR4EW87JQ C 26
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BS 628 630 RR4EW87JQ

RD RR4EW87TF 627 0 0
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AAGGATGAGGGGACCCAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACTGTTTAACCTCACCAAGGA
TGATGATGTCAGGAAGTACGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGCAA
GGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCGTTGACCCTTCAGAGGAA
GAGAGCTAGAATCGCTGACAAGAAGAAGAGGATTGCTAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGA
GTACCAGAAGCTTCTTGCCTCGAGGTTGAAGGAACAACGTGAAAAGAGGAGTGAGAGTTT
GGCAAAGAAGAGGTCTAGACTCTCTTCCGCTGCCGCCAAGCCTTCCGCTACTGCTTAAAA
ATCCTGAGAATCTCATTTCTAGTTTTGTTTTTCCTTTTTTTTTGCTTCATCCGCATTAAA
ATACGTTAGTTCGAGTTTATATTTCTGTTGTTCCATCCGTTACATCGACTTTGTACTCGT
GTTGCTTGTTTTATTCTCTTTTACTTGAAAGACCACCTTAATACTCGATTTTTGTTTCTC
ATTTTCTAATTATGATCATGGTATTAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4EW87JQ 605 0 0
AAGGATCTTCCCGGGCTTACTGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCCAAGAGAGCT
TTTAAGATCCGTAAACTGTTTAACCTCACCAAGGATGATGATGTCAGGAAGTACGTCAAC
ACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGCAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAGATC
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AAGAGGATTGCTAAGGCTAACTTTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTTGCCTCGAGG
TTGAAGGAACAACGTGAAAAGAGGAGTGAGAGTTTGGCAAAGAAGAGGTTTAGACTTTTT
TCCGCTGCCGCCAAGCCTTCCGGTACTGCTTAAAAATCCTGAGAATTTCATTTTTAGTTT
TGTTTTTCCTTTTTTTTTGCTTCATCCGCATTAAAATACGTTAGTTCGAGTTTATATTTT
TGTTGTTCCATCCGTTACATTGACTTTGTACTCGTGTTGCTTGTTTTATTTTTTTTTACT
TGAAAGACCACCTTAATACTCGATTTTTGTTTTTCATTTTTTAATTATGATCATGGTATT
ACTCG

QA 1 605 1 605
DS 



AS 2 6

CO CL1337Contig1 492 2 3 U
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TTGTCAATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAAAACTTGAAATGTTTGG
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TTGTTGTTCTGCAAACGAAGACTGCAAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATT
GCATACCTTCTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAACAAGAATCTGAAACAGTAGCA
GCCATAATCAGGACATGGAAGGAGAAAGAGAGATTTTGCTCCATGGAAGCCACACAGAAG
CAAATACAGAGTCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCTCAAACCATATCATTTATCTTCTT
TGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTCGCAGGTTGACCA
GACGAAGCATTG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4CW27JQ C 1
AF RR4CW27TF U 1
BS 1 1 RR4CW27JQ
BS 2 491 RR4CW27TF
BS 492 492 RR4CW27JQ

RD RR4CW27JQ 492 0 0
GGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGA
TTGTCAATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAAAACTTGAAATGTTTGG
CTGAGATGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGA
TTGTTGTTCTGCAAACGAAGACTGCAAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATT
GCATACCTTTTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAACAAGAATCTGAAACAGTAGCA
GCCATAATCAGGACATGGAAGGAGAAAGAGAGATTTTGCTCCATGGAAGCCACACAGAAG
CAAATACAGAGTCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCTCAAACCATATCATTTATCTTCTT
TGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTCGCAGGTTGACCA
GACGAAGCATTG

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4CW27TF 492 0 0
G
GCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGAT
TGTCAATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAAAACTTGAAATGTTTGGC
TGAGATGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGAT
TGTTGTTCTGCAAACGAAGACTGCAAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATTG
CATACCTTCTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAACAAGAATCTGAAACAGTAGCAG
CCATAATCAGGACATGGAAGGAGAAAGAGAGATTTTGCTCCATGGAAGCCACACAGAAGC
AAATACAGAGTCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCTCAAACCATATCATTTATCTTCTTT
GATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTCGCAGGTTGACCAG
ACGAAGCATT
G

QA 2 491 2 491
DS 



CO CL1337Contig2 782 4 14 U
GGATTCTGCGTAACAAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAAAACTTGCAATCCACAAGAAGC
TAATCCCTGGTCACATTGGTGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCTTTGTGT
TTACAACTGCCTCTGCTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAATTTGATG
CGCCTGTCAAGCTTTTGGATAAACATCTTCATGCAATGGCTCAATCCGTGGACGAGCAGC
TTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGATTGTCA
ATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAAAACTTGAAATGTTTGGCTGAGA
TGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGATTGTAG
TTCTGCAAACGAAGACTGCGAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATTGCATAC
CTTCTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAACAAAAATCTGAAACAGTAGCAGCCATA
AACAGAACATGGAAGGAGAAAGAGAGAGATTTTTGCTCCATGGAAGCCACACAGAAGCAA
ATACAGAGCCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCTCAGACCATAATACCATATCATTTATC
CTCTTTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTCGCAGGTT
GACAGACGAAGCATTCAAAAAAAAAAAAGTTTTTAAGAACCGTTGTGTTGTGGTTTGCTA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4FV91TF U 77
AF RR4EL28TF U 1
AF RR4FV91JQ C 395
AF RR4EL28JQ C 159
BS 1 129 RR4EL28TF
BS 130 130 RR4FV91TF
BS 131 135 RR4EL28TF
BS 136 136 RR4FV91TF
BS 137 608 RR4EL28TF
BS 609 609 RR4FV91TF
BS 610 660 RR4EL28TF
BS 661 661 RR4FV91TF
BS 662 703 RR4EL28TF
BS 704 704 RR4FV91TF
BS 705 717 RR4EL28TF
BS 718 718 RR4EL28JQ
BS 719 735 RR4EL28TF
BS 736 782 RR4EL28JQ

RD RR4FV91TF 637 0 0
G
GGTGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCTTTGTGTTTACAACTGCCTCTGCT
CCTTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTG
GATAAACATCTTCATGCAATGGCTCAATCCGTGGACGAGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAA
GTTCTCGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGATTGTCAATACCCAGGTTCTTGCT
TTCAATGGTAAACCTGTGAAAAACTTGAAATGTTTGGCTGAGATGGTGGAGAATTGTGAT
GATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGATTGTAGTTCTGCAAACGAAGACT
GCGAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATTGCATACCTTCTGCTATGTCTGAT
GATCTCAAGAATTGAACAAAAATCTGAAACAGTAGCAGCCATAAACAGAACATGGAAGGA
GAAAGAGAGAGATTTTTGCTCCATGGAAGCCACACAGAAGCAAATACAGAGCCATGGAAG
ACAGAGCTTTGAAAGCTCAGACCATAATACCATATCATTTATCCTCTTTGATTCTTACTC
TGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTC

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR4EL28TF 741 0 0
GGATTCTGCGTAACAAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAAAACTTGCAATCCACAAGAAGC
TAATCCCTGGTCACATTGGTGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCTTTGTGT
TTACAACTGTCTCTGTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAATTTGATG
CGCCTGTCAAGCTTTTGGATAAACATCTTCATGCAATGGCTCAATCCGTGGACGAGCAGC
TTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGATTGTCA
ATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAAAACTTGAAATGTTTGGCTGAGA
TGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGATTGTAG
TTCTGCAAACGAAGACTGCGAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATTGCATAC
CTTCTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAACAAAAATCTGAAACAGTAGCAGCCATA
AACAGAACATGGAAGGAGAAAGAGAGAGATTTTTGCTCCATGGAAGCCACACAGAAGCAA
ATACAGAGTCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCTCAGACCATAATACCATATCATTTATC
TTCTTTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAA*TATGCACTCGCAG*TT
GACAGACGAAGCATT
CAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4FV91JQ 342 0 0
CAGTTTTGATTATGATCAGATTGTAGTTCTGCAAACGAAGACTGCGAAAGAGGCAACTTT
AGATATTTTGACCACACATTGCATACCTTTTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAAC
AAAAATTTGAAACAGTAGCAGCCATAAACAGAACATGGAAGGAGAAAGAGAGAGATTTTT
GCTCCATGGAAGCCACACAGAAGCAAATACAGAGCCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCT
CAGACCATAATACCATATCATTTATCCTCTTTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACT
TTTGGCAAAATATGCACTCGCAGGTTGAC
AGAGGAAGCATTC

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR4EL28JQ 624 0 0
GGAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTGGATAAACATCTTCATGCAATG
GCTCAATCCGTGGACGAGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAAC
ATTGGTTATGAGGAGATTGTCAATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAA
AACTTGAAATGTTTGGCTGAGATGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGT
CTTGATTATGATCAGATTGTAGTTCTGCAAACGAAGACTGCGAAAGAGGCAACTTTAGAT
ATTCTGACCACACATTGCATACCTTTTGCTATGTCTGATGATCTCAAGAATTGAACAAAA
ATCTGAAACAGTAGCAGCCATAAACAGAACATGGAAGGAGAAAGAGAGAGATTTTTGCTC
CATGGAAGCCACACAGAAGCAAATACAGAGTCATGGAAGACAGAGCTTTGAAAGCTCAGA
CCATAATACCATATCATTTATTTTCTTTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTG
GCAAAATATGCACTCGCAGGTTGACAGACGAAGCATTCAAAAAAAAAAAAGTTTTTAAGA
ACCGTTGTGTTGTGGTTTGCTACC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 6

CO CL1338Contig1 709 6 18 U
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCATCTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCAGCCAAAAGAACGGGAATGAAAACCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGACACCACATA
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGA
TTTCTGTGAACATTTTTATTAATCATAGTTAGAAAAAATGTATGAATTAACACTATCCCG
CAAGAGAAAAACGTCAAGAGGTATAATATTGCAGCTCTCTGCTTCAGAT


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DE41TF U 1
AF RR4FN36JQ C 23
AF RR4FN36TF U 1
AF RR4AU21TF U -1
AF RR4E647JQ C 1
AF RR4E647TF U 1
BS 1 96 RR4DE41TF
BS 97 97 RR4E647TF
BS 98 117 RR4DE41TF
BS 118 118 RR4E647TF
BS 119 131 RR4DE41TF
BS 132 133 RR4E647TF
BS 134 244 RR4DE41TF
BS 245 245 RR4E647TF
BS 246 340 RR4DE41TF
BS 341 341 RR4E647TF
BS 342 529 RR4DE41TF
BS 530 530 RR4E647TF
BS 531 550 RR4DE41TF
BS 551 590 RR4E647TF
BS 591 591 RR4FN36TF
BS 592 670 RR4E647TF
BS 671 671 RR4E647JQ
BS 672 709 RR4E647TF

RD RR4DE41TF 550 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCACCTCCCCTTCCATCGAAACCTGCA
AGGAAACCGACT*GAATCAGCCAAAAGAACGGGAATGAAAACCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCATGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACTAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTATACACCACATA
TTTACCATGA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4FN36JQ 589 0 0
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CCAATGACTCTCCATCTCCCCTTCCATCGAAACCTACAAGGAAACCGACAAGAATCAGCC
AAAAGAACGGGAATGAAAACCAGCAACTATCACGGAAGCAACGGCGTGAGAAGAAGCCAT
CAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCATATCGTGATTCTGAAGGGGAAA
TGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGTCATGCTAACAAATTCGAAGGAA
AGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTTGTAGACCGAACAGAGTTTAAGC
TTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTTCAATGGATACTTCCTATATGGA
TTGTGTTTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTTCCCTTTAGCCTCCCATTACTTG
ATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGACACCACATATTTACCATGATCACAATCACTT
TTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGATTTCTGTGA
CC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4FN36TF 611 0 0
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TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCATCTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCAGCCAAAAGAACGGGAATGAAAACCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGACACCACATA
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGA
TTTCTGTGA
CC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4AU21TF 612 0 0
GGAC
AAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCTTC
AACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCATCTCCCCTTCCATCGAAACCTACAAG
GAAACCGACAAGAATCAGCCAAAAGAACGGGAATGAAAACCAGCAACTATCACGGAAGCA
ACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCATA
TCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGTCA
TGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTTGT
AGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTTCA
ATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTTCC
CTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGACACCACATATT
TACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGATT
TCTGTGA
G

QA 5 611 5 611
DS 

RD RR4E647JQ 709 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCATCTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCAGCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTTTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTCGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATA
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAGAGAAAGCGA
TTTCTGTGAACATTTTTATTAATCATAGTTAGAAAAAATGTATGAATTAACACTATCCCG
CAAGAGAAAAACGTCAAGAGGTATAATATTGCAGCTCTCTGCTTCAGAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4E647TF 709 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCATCTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCAGCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTCGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATA
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAGAGAAAGCGA
TTTCTGTGAACATTTTTATTAATCATAGTTAGAAAAAATGTATGAATTAACACTATCCCG
CAAGAGAAAA*CGTCAAGAGGTATAATATTGCAGCTCTCTGCTTCAGAT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 5

CO CL1339Contig1 563 5 8 U
ATCGAATTGGATATTCGTTAAAAGTAACTAATTTTTAACACAAGAACTCTTCTCACTCAT
CGCTTAATTATTAATTAGTAAATTAATTTTATTTGTAAGACTAAAAATAATGTATTGTCG
GCCAGGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAAATATCGGCCAGGAAGTTTCTGTAGCCA
TAACAGCCTTGTTCTCTTTATTCTTCACCACAAGGTTCCTTAATAAAACAAAAGCAGTCA
CGCTGGTGCTTCTTTTCATAAAAGATATCTGCACAGTTGCACCTCAAATATTTGATCTTC
TTATCAACCTGGCACGTCTTGTTTTTATCAGGGCCACATTTTCCAGGAGTCCTTACTAAC
CGGTCACAAGCGCCATTCACTTCTTGCACAATGTTCGAAACGTAAAACATGAGAACGCAT
AAAACGAGAACTGAAATAAAACACTTCATGATTTAAGAAATTGAAAAAAAAAATTATGTT
TTTTTT*ATCTGAACTTCTTTTTTTGTTTCTGTTATATGTAGAAACCTTTTTGTTTTCTC
TTATCAATCTAAAAGAATGTGCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4D835JQ U 269
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AF RR4B915TF C 1
AF RR4BJ76JQ U 1
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TCTGTTATATGT

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TTATCAACCTGGCACGTCTTGTTTTTATCAGGGCCACATTTTCCAGGAGTCCTTACTAAC
CGGTCACAAGCGCCATTCACTTCTTGCACAATGTTCAAAACGTAAAACATGAGAACGCAT
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TTATCAATCTAAAA

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CGCTTAATTATTAATTAGTAAATTAATTTTATTTGTAAGACTAAAAATAATGTATTGTCG
GCCAGGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTT*GCAAATATCGGCCAGGAAGTTTCTGTAGCCA
TAACAGCCTTGTTCTCTTTATTCTTCACCACAAGGTTCCTTAATAAGACAAAAGCAGTCA
CGCTGGTGCTTCTTTTCATAAAAGATATCTGCACAGTTGCACCTCAGATATTTGATCTTC
TTATCAACCTGGCACGTCTTGTTTTTATCAGGGCCACATTTTCCAGGAGTCCTTACTAAC
CGGTCACAAGCGCCATTCACTTCTTGCACAATGTTCAAAACGTAAAACATGAGAACGCAT
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AAAACGAGAACTGAAATAAAACACTTCATGATTTAAGAAATTGA*AAAAAAAATTATGTT
TTTTTT*ATCTGAACTTCTTTTTTTGTTTCTGTTATATGTAAAAACCTTTTTGTTTTCTC
TTATCAATCT

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CGCTTAATTATTAATTAGTAAATTAATTTTATTTGTAAGACTAAAAATAATGTATTGTCG
GCCAGGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAAATATCGGCCAGGAAGTTTCTGTAGCCA
TAACAGCCTTGTTCTCTTTATTCTTCACCACAAGGTTCCTTAATAAGACAAAAGCAGTCA
CGCTGGTGCTTCTTTTCATAAAAGATATCTGCACAGTTGCACCTCAGATATTTGATCTTC
TTATCAACCTGGCACGTCTTGTTTTTATCAGGGCCACATTTTCCAGGAGTCCTTACTAAC
CGGTCACAAGCGCCATTCACTTCTTGCACAATGTTCGAAACGTAAAACATGAGAACGCAT
AAAACGAGAACTGAAATAAAACACTTCATGATTTAAGAAATTGA*AAAAAAAATTATGTT
TTTTTT*ATCTGAACTTCTTTTTTTGTTTCTGTTATATGTAGAAACCTTTTTGTTTTCTC
TTATCAATCTAAAAGAATGT
CC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 3

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TTTTAATATATACACAATACCCAAAAGCTGCATTTTATGTATCTTATGTCATAACAACAT
CATACAACCATTTGACAAATCTCTACAGAGATCTCTTTGCTCATATGAGTCAGAATCCTC
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ACCAGAATGGTGTTGCGGGCTTGCGCTTAATGGCCTTGATACTAAAAGGACTGTTCTTGC
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TGCCATAATCAAAGAGACAACAACAGGTGTTGCTCTCAGGACATGTGTAGTAACTGTCAC
ATTGGGTCGGAGGCGTGACGGGAGATGGAGGTGAAGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTTTGGC
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CAATCCAATAGTCTTTGCCGCTCTCTGTTCCGTACCCGACCGCCAAAACTCCGTGGTCTA
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CACCCTCAATGGCCACGCTGATTGGTTGGTGAGAAAGTGCTTTCTTCAAGGACTCTTCGC
TGTTAGCCGGCACATCCTCATATGAATCGATTGTAACAACTTTAGCGTTTTTTCTGGTCT
GATCACAACGTCCGTCAACACCCTTGTAAGGGTAATCTTCCTCTGTATCGATTCCACCGT
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AAGTGTCACAGTCGACCAATTCTTGTTCAGACAATGATATTAAGTCTCCGGTCACGACCT
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GATCTTTAACCTCAGCGACAGCACCTTCCTTCCTCCAGTCAACGCTCTCCGGGATAGCGT
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CGAACCGTCGATCTTTCTCTGTAAGAGAATTCTGAGCCTTCCCGTGTTTCACTAAACACT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ39JQ U 1
AF RR4AP46JQ U 585
AF RR4FJ39TF C 944
BS 1 733 RR4FJ39JQ
BS 734 734 RR4AP46JQ
BS 735 823 RR4FJ39JQ
BS 824 973 RR4AP46JQ
BS 974 974 RR4FJ39TF
BS 975 1037 RR4AP46JQ
BS 1038 1038 RR4FJ39TF
BS 1039 1051 RR4AP46JQ
BS 1052 1052 RR4FJ39TF
BS 1053 1435 RR4AP46JQ
BS 1436 1436 RR4FJ39TF
BS 1437 1443 RR4AP46JQ
BS 1444 1444 RR4FJ39TF
BS 1445 1447 RR4AP46JQ
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BS 1449 1453 RR4AP46JQ
BS 1454 1644 RR4FJ39TF

RD RR4FJ39JQ 825 0 0
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TTTTAATATATACACAATACCCAAAAGCTGCATTTTATGTATCTTATGTCATAACAACAT
CATACAACCATTTGACAAATCTCTACAGAGATCTCTTTGCTCATATGAGTCAGAATCCTC
TCTGAAGAAACAAATGTGCAGTGTCACCATCTTCTTACGCAATGTTCTTCCTGCTCTGCG
ACCAGAATGGTGTTGCGGGCTTGCGCTTAATGGCCTTGATACTAAAAGGACTGTTCTTGC
TCATTAAACAAGTTCCCTGATCAAGGTCACAAACGGGGTACTCGTGAGGGCAGCAACTAT
AGTTGTCATCACAACATGTGGCTGCTTCTAGTGGGCAACATCCCCAAGCAAGGCAATACT
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CACCCTCAATGGCCACGCTGATTGGTTGGTGAGAAAGTGCTTT
TT

QA 1 823 1 823
DS 

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TGTTTCACTAACCACTCCTTGTATAGTCT

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR4FJ39TF 701 0 0
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ATTGTCTTTAAAGATCTCGAACCGTCGATCTTTCTCTGTAAGAGAATTCTGAGCCTTCCC
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GGTGCGGTGGTTTTTGTCATAGGAAATGATTGACATATCCATCGCTGATGATACCACGAT
CATCGTTAAGAAGAGGATCACGGTAGCTGAGTTAAGGAGCTTCATTTTCTTTTCACTGTT
TTTCTTTGGAGGAGAAGGAAAGATGATGAAAGATACGATCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 6

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GCTCTCGTGTCTCGTATCCGTGCAGCTTTACAACGAGACGAACACGGGCGATTTGGTTTT
CAACGACTCCTCTCGGAAGTCCGTCACCGCCAGAAATAAAGAATTCCTTTAAGACCTCTA
CATCTTCTTCAAGTAGCTTTGACTCGCTTGGATGAAATACACGTGACGAGCCTCCGTCTA
ATAGTACGTGAAGTAATCCGTCAAGTGATGCTTGAAGCAAGCTTGTGACTATCCGATCCC
CCGGTGATTCCATTATGACACTGCATAGCTGCCCAAGTTCCGTGTCAAGGGCTTCGATTA
ATGCTTCCAATCTTGATTGAGAAACACTTGGCTTGTACAGATTCTCAATAAATGGCCCCC
TTAGATCGTAGAAGATGATCTTCGTTCCAGTAAACTCGCAAATACGA


BQ
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F236JQ U 1
AF RR4D471JQ U 2
AF RR4D747JQ U 2
AF RR4D471TF C 2
AF RR4D747TF C 2
AF RR4F258JQ U 1
BS 1 488 RR4F236JQ
BS 489 489 RR4D471JQ
BS 490 540 RR4F236JQ
BS 541 541 RR4D471JQ
BS 542 542 RR4F236JQ
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RD RR4F236JQ 592 0 0
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GTTTGCCTCTTCCTCCTTGCTGCATATCTAGACTGCTTCTAGACCTTAAGTCATCGATAA
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TCAGTGATTCCATTATGACACTGCATAGCTGCCCAAGTTCCGTGTCAAGGGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4D471JQ 542 0 0
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CG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4D747JQ 542 0 0
GAGTGAAACTGTAATTTCTCTACAGCCTGTGCTTGTGAAAATCATCGTTTATACAGAAGT
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CG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4D471TF 542 0 0
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CG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4D747TF 542 0 0
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CG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4F258JQ 707 0 0
C
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CTCTCGTGTCTCGTATCCGTGCAGCTTTACAACGAGACGAACACGGGCGATTTGGTTTTC
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ATCTTCTTCAAGTAGCTTTGACTCGCTTGGATGAAATACACGTGACGAGCCTCCGTCTAA
TAGTACGCGAAGTAATCCGTCAAGTGATGCTTGAAGCAAGCTTGTGACTATCCGATCCCT
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TGCTTCCAATCTTGATTGAGAAACACTTGGCTTGTACAGATTCTCAATAAATGGCCCCCT
TAGATCGTAGAAGATGATCTTCGTTCCAGTAAACTCGCAAATACGA

QA 2 707 2 707
DS 



AS 2 4

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CGTCTGCTATCATCGTTGCAAATTTCTCCTGAGGGGGAAACCGACAAACACTCTCAACCA
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TCAAGGCCTCTGCATCTCCTTCGACCCATACCAGTGACTTGTTATCGCTTAGCCCTCTCT
CGGCAGCACGTTGTTTCCCAACGTTTAACATGTTGGGATTAATATCACATACGTATATCT
GAGTTTCTTCAAGTGATTCCTCATCAACTTTCCGCAATGCTCTTCGCTTGACACTGTTAA
CAGCATCAAAGATCCTAAACGCAACATCACCCGTTCCACCGGCAACATCAAGATGCTTCA
TCCCTGCAAATGGACTCAGCTTCCCAACGAGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FQ29JQ U 142
AF RR4CA81JQ U 1
BS 1 225 RR4CA81JQ
BS 226 226 RR4FQ29JQ
BS 227 251 RR4CA81JQ
BS 252 252 RR4FQ29JQ
BS 253 275 RR4CA81JQ
BS 276 276 RR4FQ29JQ
BS 277 328 RR4CA81JQ
BS 329 329 RR4FQ29JQ
BS 330 755 RR4CA81JQ

RD RR4FQ29JQ 259 0 0
CC
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TTCTCCTGAGGGGGAAACCGACAAACACTCTCAACCAGGTACTGGTAAAAGTCCCGGTCA
CCGGCAATTAGTACCCCTAAGTTTGGAATGACCTTGAATGAATACAAATCGTATACATCT
TTGAAAATCGGAATGTCAACATGGCTGAGCTCAAGGCACAGGAATCTTCCTCCCCGTTTT
AGTACCCTATAAG
CCTC

QA 3 255 3 255
DS 

RD RR4CA81JQ 755 0 0
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TTGGGAAACAGATAAAATGCAGAAGGAAAAAAGAAAGAGAGAGAGATCAGAGCTTAATGG
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CGTCTGCTATCATCGTTGCAAATTTCTCCTGAGGGGGAAACCGACGAACACTCTCAACCA
GGTACTGGTAAGAGTCCCGGTCACCGGCAATTAGTTCCCCTAAGTTTGGAATGACCTTGA
ATGAATACAAATCGTATACATCTTTGAAGATCGGAATGTCAACATGGCTGAGCTCAAGGC
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GTGTGACATTCCTTATTCCAAATGCAATAGTGTATCCATCCATTGAATTGTCATCGAAAC
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GAGTTTCTTCAAGTGATTCCTCATCAACTTTCCGCAATGCTCTTCGCTTGACACTGTTAA
CAGCATCAAAGATCCTAAACGCAACATCACCCGTTCCACCGGCAACATCAAGATGCTTCA
TCCCTGCAAATGGACTCAGCTTCCCAACGAGTCTT

QA 1 755 1 755
DS 



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CGCCGCAGTATAACCTCCGTCGCAATAACAGATTTTGAAGTAGAGGACTATGGCACTTCG
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CCTTCTTCATTCTCACGCCACAAGTTTCGGGTTTCAAGAGGTAAAGGAAGAAGAGAAAAG
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TGATGCTGTTAACAGTGTCAAACGAAGAGCACTGAGGAAAGTTGATGAGGAATCACTTGA
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GGCCTTGAGTTTCGATGACAATTCAATGGATGGATACACTATCGCATTTGGAATAAGGAA
TGTCACACACATCGAGAAAGCTCTCGCGGAGACTTATAGGGTACTAAAACGGG


BQ
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AF RR4CA81TF U 1
AF RR4EG84TF U 94
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BS 638 650 RR4CA81TF
BS 651 651 RR4EG84TF
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BS 703 703 RR4EG84TF
BS 704 711 RR4CA81TF
BS 712 773 RR4EG84TF

RD RR4CA81TF 711 0 0
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ATTATTATATAGAAAAGGTGAATGCATTTAACCTATAGTCGCCCCTTTCACCTGTCTCCT
CGCCGCAGTATAACCTCCGTCGCAGTAACAGATTTTGAAGTAGAGGACTATGGCACTTCG
ATCACTAAGCAGAAGGTTTGGGAGCAGAATCTTGTGTTACCGTTCCTCTTCTGCTGCTTC
CCTTCTTCATTCTCACGCCACAAGTTTCGGGTTTCAAGAGGTAAAGGAAGAAGAGAAAAG
CAAGTTGGTTGGTAACGTTTTCACCAATGTTGCTTCCAGTTATGATATCATGAACGATGT
CATGAGCGGTGGCTTGCATAGGCTTTGGAAGGAAAGACTCGTTGGGAAGCTGAGTCCATT
TGCAGGGATGAAGCATCTTGATGTTGCCGGTGGAACGGGTGATGTTGCGTTTAGGATCTT
TGATGCTGTTAACAGTGTCAAGCGAAGAGCATTGCGGAAAGTTGATGAGGAATCACTTGA
AGAAACTCAGATATACGTATGTGATATTAATCCCAACATGTTAAACGTTGGGAAACAACG
TGCTGCCGAGAGAGGGCTAAGCGATAACAAGTCACTGGTATGGGTCGAAG*AGATGCAGA
GGCCTTGAGTTTCGATGACAATTCAATGGATGGATACACTATTGCATTTGG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4EG84TF 680 0 0
GGAGT
TCGCCCCTTTCACTTGTCTCCTCGCCGCAGTATAACCTCCGTCGCAATAACAGATTTTGA
AGTAGAGGACTATGGCACTTCGATCACTAAGCAGAAGGTTTGGGAGCAGAATCTTGTGTT
ACCGTTCCTCTTCTGTTGCTTCCCTTC***ATTCTCACGCCACAAGTTTCGGGTTTCAAG
AGGTAAAGGAAGAAGAGAAAAGCAAGTTGGTTGGTAATGTTTTCACCAATGTTGCTTCCA
GTTATGATATCATGAACGATGTCATGAGCGGTGGCTTGCATAGGCTTTGGAAGGAAAGAC
TCGTTGGGAAGCTGAGTCCATTTT*AGGGATGAAGCATCTTGATGTTGCCGGTGGAACCG
GTGATGTTGCGTTTAGGATCTTTGATGCTGTTAACAGTGTCAAACGAAGAGCACTGAGGA
AAGTTGATGAGGAATCACTTGAAGAAACTCAGATATACGTATGTGATATTAATCCCAACA
TGTTAAACGTTGGCAAACAACGTGCTGCCGAGAGAGGGCTAAGCGATAACAAGTCACTCG
TATGGGTGGAAGGAGATGCAGAGGCCTTGAGTTTCGATGACAATTCAATGGATGGATACA
CTATCGCATTTGGAATAAGGAATGTCACACACATCGAGAAAGCTCTCGCGGAGACTTATA
GGGTACTAAAACGGG

QA 6 680 6 680
DS 



AS 1 6

CO CL1343Contig1 542 6 6 U
GAAACACTGTGAAAAACCTTTCTTAAAGCTTTAGAATTTTCGAATCAACCAAAACCCTAG
CCTCCTTTTGCTCTCTACCACACAAATGGCGATCTCAAAGGCTTCCGTTGTCGCTCTCGT
AGCTGTGATCGTCTCCGTCGTAGCTACCGTCGCTTCTGCTCAGGTCGAGGCTCCAGCTCC
AAGCCCTACGTCTGGATCTGCCGCGTTCTCGCCTTCGATCGTGTCAGCTGGAGTTGCGGC
CGTCGCGGCTCTTGTCTTCGGCTCTGCTCTTCGGATCTAAGTCCTTTGCGATGGAGATTC
GTACAGAGAAGAATGTTTTTTTGAAAAAAAAATTGATCGGGTATTAGCATTTATTCATGA
TATTCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCTTTCTATATTTTACTATAACTACCCTTCA
TATCTGTATGAGGGTACTACTATATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGAGT
TCTAGACTATGGTTTTTGATATGACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTCTC
AG


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
10 10 

AF RR4GZ23JQ C 1
AF RR4G636JQ C 321
AF RR4G636TF U 321
AF RR4CJ84TF U 2
AF RR4GZ23TF U 1
AF RR4CJ84JQ C 2
BS 1 3 RR4GZ23JQ
BS 4 185 RR4CJ84TF
BS 186 186 RR4GZ23TF
BS 187 323 RR4CJ84TF
BS 324 540 RR4G636TF
BS 541 542 RR4CJ84JQ

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AAGCCCTACGTCTGGATCTGCCGCGTTCTCGCCTTCGATCGTGTCAGCTGGAGTTGCGGC
CGTCGCGGCTCTTGTCTTCGGCTCTGCTCTTCGGATCTAAGTCCTTTGCGATGGAGATTC
GTACAGAGAAGAATGTTTTTTTGAAAAAAAAATTGATCGGGTATTAGCATTTATTCATGA
TATTCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCTTTCTATATTTTACTATAACTACCCTTCA
TATCTGTATGAGGGTACTACTATATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGAGT
TCTAGACTATGGTTTTTGATATGACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTCTC
AG

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DS 

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ATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGAGTTCTAGACTATGGTTTTTGATATG
ACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTCTC
G

QA 4 220 4 220
DS 

RD RR4G636TF 221 0 0
GGA
AAAAAAAAATTGATCGGGTATTAGCATTTATTCATGATATTCGTGTGTATTCCGGAGCTA
TAGATCTCTTTCTATATTTTACTATAACTACCCTTCATATCTGTATGAGGGTACTACTAT
ATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGAGTTCTAGACTATGGTTTTTGATATG
ACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTCTC
G

QA 4 220 4 220
DS 

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GG
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CCTTTTGCTCTCTACCACACAAATGGCGATCTCAAAGGCTTCCGTTGTCGCTCTCGTAGC
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CGCGGCTCTTGTCTTCGGCTCTGCTCTTCGGATCTAAGTCCTTTGCGATGGAGATTCGTA
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TCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCTTTCTATATTTTACTATAACTACCCTTCATAT
CTGTATGAGGGTACTACTATATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGGGTTCT
AGACTATGGTTTTTGATATGACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTC

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DS 

RD RR4GZ23TF 542 0 0
GAA
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CCTTTTGCTCTCTACCACACAAATGGCGATCTCAAAGGCTTCCGTTGTCGCTCTCGTAGC
TGTGATCGTCTCCGTCGTAGCTACCGTCGCTTCTGCTCAGGTCGAGGCTCCAGCTCCAAG
CCCTACGTCTGGATCTGCCGCGTTCTCGCCTTCGATCGTGTCAGCTGGAGTTGCGGCCGT
CGCGGCTCTTGTCTTCGGCTCTGCTCTTCGGATCTAAGTCCTTTGCGATGGAGATTCGTA
CAGAGAAGAATGTTTTTTTGAAAAAAAAATTGATCGGGTATTAGCATTTATTCATGATAT
TCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCTTTCTATATTTTACTATAACTACCCTTCATAT
CTGTATGAGGGTACTACTATATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGAGTTCT
AGACTATGGTTTTTGATATGACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTCTC
AG

QA 4 540 4 540
DS 

RD RR4CJ84JQ 541 0 0
GG
ACACTGTGAAAAACCTTTCTTAAAGCTTTAGAATTTTCGAATCAACCAAAACCCTAGCCT
CCTTTTGCTCTCTACCACACAAATGGCGATCTCAAAGGCTTCCGTTGTCGCTTTCGTAGC
TGTGATCGTTTCCGTCGTAGCTACCGTCGCTTCTGCTCAGGTCGAGGCTCCAGCTCCAAG
CC*TACGTCTGGATTTGCCGCGTTCTCGCCTTCGATCGTGTCAGCTGGAGTTGCGGCCGT
CGCGGCTCTTGTTTTCGGCTTTGCTCTTCGGATCTAAGTCCTTTGCGATGGAGATTCGTA
CAGAGAAGAATGTTTTTTTGAAAAAAAAATTGATCGGGTATTAGCATTTATTCATGATAT
TCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCTTTCTATATTTTACTATAACTACCCTTCATAT
CTGTATGAGGGTACTACTATATCTCTAGAGTATTGTGGTTTGTGTGTGTGTGTGGGTTCT
AGACTATGGTTTTTGATATGACTCGTATTCTATTTATTTATGGATCTGTTGTTTCTCAG

QA 3 541 3 541
DS 



AS 1 6

CO CL1344Contig1 932 6 8 U
GGAATAAAACAAATTTCTCCCTTCTCTCTCATCTCCTTGTGCTCCCTTCTCACTAAAACC
AGAGTTCAGATCTGTTCTTGGCTAAGGTGGCTCCGGTGGCTTCTTGAGCACCGGAGCCGT
GTCTCCTTTTGTTTTATGTATTTCTTCTTCTCGGGGTATTATGTTTCGATTTAGGGTTTG
TTTTGGGTCAATCGACGGGATTTATCGTTTTTGGGTTTGTAACTCTTCGATGTGTTCCGG
ATTGATGCTTGCAAGCTCAATCGTCGGATACTGATTCGATGCTGGTGGGTGTGGGATGTG
GTCTCGTCTTTCTCCTTTCTCCTCTCCCTAGAAGTTCCAGGTTTCTATTATTTCTTCACC
GGGTGAGGTGTGGATCCGTCTATCCTGTGGTGGTCTAGAGGTTTGTTACCTCAATCGGAG
GTTCTTCTCGGTTCTTCTAATACAGATCCTCAACCATCGTCTTCTGATCTGTTGTAACCG
GTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGTTTGATTGTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATC
TGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAGCTTATCGCCGTTTCCGTTCATAGTTGGTCTATGATG
TCTATGGCCTATTTGGTAAAACGGATGTTGACTGTACCGAAGGGAACTCATGGCTTCGAC
AACGTAATGACATGTTGGTGTAAGGGTTAAGTGAGAAGTTCGGTCTCAGTCTTTATTCAC
TGTCTTTTGTGGTTCTGGTCAAGTTTATGGTTTGATGGGTCTTGTAAGTTTAGCCTTCTT
GTTTAGAATCTTAGTTGTTTGTTTGATGTTGTTTCAGTTTCTTTTCCCACTTGTGGGCTT
AGTTTCCAGGGACATCCATATCGTCCGCTGGCTTAGCATGCTCGACTATGTAATGGTTGA
TGTTGCAAGCTCTAATAAAATCTGTTCAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4ES90TF U 1
AF RR4D432TF U 102
AF RR4ES90JQ C 147
AF RR4CY33JQ C 440
AF RR4D432JQ C 468
AF RR4CY33TF U 440
BS 1 130 RR4ES90TF
BS 131 131 RR4D432TF
BS 132 641 RR4ES90TF
BS 642 642 RR4D432TF
BS 643 680 RR4ES90TF
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BS 931 932 RR4CY33JQ

RD RR4ES90TF 684 0 0
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AGAGTTCAGATCTGTTCTTGGCTAAGGTGGCTCCGGTGGCTTCTTGAGCACCGGAGCCGT
GTCTCCTTTT*TTTTATGTATTTCTTCTTCTCGGGGTATTATGTTTCGATTTAGGGTTTG
TTTTGGGTCAATCGACGGGATTTATCGTTTTTGGGTTTGTAACTCTTCGATGTGTTCCGG
ATTGATGCTTGCAAGCTCAATCGTCGGATACTGATTCGATGCTGGTGGGTGTGGGATGTG
GTCTCGTCTTTCTCCTTTCTCCTCTCCCTAGAAGTTCCAGGTTTCTATTATTTCTTCACC
GGGTGAGGTGTGGATCCGTCTATCCTGTGGTGGTCTAGAGGTTTGTTACCTCAATCGGAG
GTTCTTCTCGGTTCTTCTAATACAGATCCTCAACCATCGTCTTCTGATCTGTTGTAACCG
GTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGTTTGATTGTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATC
TGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAGCTTATCGCCGTTTCCGTTCATAGTTGGTCTATGATG
TCTATGGCCTATTTGGTAAAACGGATGTTGACTGTACCGAAAGGAACTCATGGCTTCGAC
AACGTAATGACATGTTGGTG
AAAG

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DS 

RD RR4D432TF 674 0 0
G
CTTGAGCACCGGAGCCGTGTCTCCTTTTGTTTTATGTATTTCTTCTTTTCGGGGTATTAT
GTTTCGATTTAGGGTTTGTTTTGGGTCAATCGACGGGATTTATCGTTTTTGGGTTTGTAA
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TGGTGGGTGTGGGATGTGGTCTCGTCTTTCTCCTTTCTCCTCTCCCTAGAAGTTCCAGGT
TTCTATTATTTCTTCACCGGGTGAGGTGTGGATCCGTCTATCCTGTGGCGGTCTAGAGGT
TTGTTACCTCAATCGGAGGTTCTTCTCGGTTCTTCTAATACAGATCCTCAACCATCGTCT
TCTGATCTGTTGTAACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGTTTGATTGTGACTTCTTGA
CCATTGAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAGCTTATCGCCGTTTCCGTT
CATAGTTGGTCTATGATGTCTATGGCCTATTTGGTAAAACGGATGTTGACTGTACCGAAG
GGAACTCATGGCTTCGACAACGTAATGACATGTTGGTGTAAGGGTTAAGTGAGAAGTTCG
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TGTAAGTTTAGCC

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DS 

RD RR4ES90JQ 767 0 0
CTTC
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CTGATTCGATGCTGGTGGGTGTGGGATGTGGTCTCGTCTTTCTCCTTTCTCCTCTCCCTA
GAAGTTCCAGGTTTCTATTATTTCTTCACCGGGTGAGGTGTGGATCCGTCTATCCTGTGG
TGGTCTAGAGGTTTGTTACCTCAATCGGAGGTTCTTCTCGGTTCTTCTAATACAGATCCT
CAACCATCGTCTTCTGATCTGTTGTAACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGTTTGATT
GTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAGCTTATC
GCCGTTTCCGTTCATAGTTGGTCTATGATGTCTATGGCCTATTTGGTAAAACGGATGTTG
ACTGTACCGAAGGGAACTCATGGCTTCGACAACGTAATGACATGTTGGTGTAAGGGTTAA
GTGAGAAGTTCGGTCTCAGTCTTTATTCACTGTCTTTTGTGGTTCTGGTCAAGTTTATGG
TTTGATGGGTCTTGTAAGTTTAGCCTTCTTGTTTAGAATCTTAGTTGTTTGTTTGATGTT
GTTTCAGTTTCTTTTCCCACTTGTGGGCTTAGTTTCCAGGGACATCCATATCGTCCGCTG
GCTTAGTATGCTCGACTATGTAATGGTTGATGTTGCAAGCTCT

QA 5 767 5 767
DS 

RD RR4CY33JQ 493 0 0
G
TACAGATCCTCAACCATCGCCTTTTGATCTGTTGTAACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTG
GGGTTTGATTGTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTA
GGAGCTTATCGCCGTTTCCGTTCATAGTTGGTCTATGATGTCTATGGCCTATTTGGTAAA
ACGGATGTTGACTGTACCGAAGGTAACTCATGGCTTCGACAACGTAATGACATGTTGGTG
TAAGGGTTAAGTGAGAAGTTCGGTCTCAGTCTTTATTCACTGTCTTTTGTGGTTCTGGTC
AAGTTTATGGTTTGATGGGTCTTGTAAGTTTAGCCTTCTTGTTTAGAATCTTAGTTGTTT
GTTTGATGTTGTTTCAGTTTCTTTTCCCACTTGTGGGCTTAGTTTCCAGGGACATCCATA
TCGTCCGCTGGCTTAGCATGCTCGACTATGTAATGGTTGATGTTGCAAGCTCTAATAAAA
TCTGTTCAGACG

QA 2 493 2 493
DS 

RD RR4D432JQ 465 0 0
TCTGTTGTAACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGTTTGATTGTGACTTCTTGACCATT
GAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAGCTTATCGCCGTTTCCGTTCATAG
TTGGTCTATGATGTCTATGGCCTATTTGGTAAAACGGATGTTGACTGTACCGAAGGGAAC
TCATGGCTTCGACAACGTAATGACATGTTGGTGTAAGGGTTAAGTGAGAAGTTCGGTCTC
AGTCTTTATTCACTGTCTTTTGTGGTTCTGGTCAAGTTTATGGTTTGATGGGTCTTGTAA
GTTTAGCCTTCTTGTTTAGAATCTTAGTTGTTTGTTTGATGTTGTTTCAGTTTCTTTTCC
CACTTGTGGGCTTAGTTTCCAGGGACATATATATCGTCCGCTGGCTTAGTATGCTCGACT
ATGTAATGGTTGATGTTGCAAGCTCTAATAAAATCTGTTCAGA
GG

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4CY33TF 493 0 0
G
TACAGATCCTCAACCATCGCCTTCTGATCTGTTGTAACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTG
GGGTTTGATTGTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTA
GGAGCTTATCGCCGTTTCCGTTCATAGTTGGTCTATGATGTCTATGGCCTATTTGGTAAA
ACGGATGTTGACTGTACCGAAGGTAACTCATGGCTTCGACAACGTAATGACATGTTGGTG
TAAGGGTTAAGTGAGAAGTTCGGTCTCAGTCTTTATTCACTGTCTTTTGTGGTTCTGGTC
AAGTTTATGGTTTGATGGGTCTTGTAAGTTTAGCCTTCTTGTTTAGAATCTTAGTTGTTT
GTTTGATGTTGTTTCAGTTTCTTTTCCCACTTGTGGGCTTAGTTTCCAGGGACATCCATA
TCGTCCGCTGGCTTAGCATGCTCGACTATGTAATGGTTGATGTTGCAAGCTCTAATAAAA
TCTGTTCAGA
CG

QA 2 491 2 491
DS 



AS 1 4

CO CL1345Contig1 755 4 16 U
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AACAAAAGAGTTACGATCTTCCTGGTTATGCTGATATAAACACATCAAAAGGTCTCATAA
CTGTTGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAAGCTGTTGACAGGTTTCTAGATCTATGTC
AAAAAGATCACTTCAAGGGAATGCCGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAG
CTGGTCACTCCCAGAGCTCGATACCTGTTGAAGAATGGACATCTAAAGGAAAGCTCCGTG
GTCGCCTTAACACAAGCCCAAAACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAACAAAAG
GGAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTCATCACAACGGCGCCAATCCCTGATCTTAATG
ATCAGCTTATAGTGTTTGGAAGAGTCCTTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGG
AAGTGGATACAGATGAGCATTACCAGCCGAAATCACAAATAGGGATCATTAGCGTTATAC
TGAAACGAGAATTATGAAAAAAATGAAAATCTCTCTTCCTCTGTATATGAGGTCCATCTT
CATACTCGCTGTTTTTCAAAATCCTCTTTTGAGGTTTTTTTT*AAAACTGATTATTTCCT
TTCGTTTTGTAATTTTATTTGATCTTCTTGAGGAAATAGAATCTTTGTTTAAGTCCATCG
TCTGGTTTTTGTTTTAGAATCAATAGTCTTCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 0 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ87TF U 5
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AF RR4DO21TF U 5
AF RR4EL59JQ C 165
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CCTCTTTTGAGG

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DS 

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AAAAAGATCACTTCAAGGGAATGCCGTTTCATCGGGTCA*AAAAAACTACTTGGTGCAAG
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GTCGCCTTAACACAAGCCCAAAACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAACAAAAG
GGAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTCATCACAACGGCGCCAATCCCTGATCTTAATG
ATCAGCTTATAGTGTTTGGAGGAGTCCTTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGG
AAGTGGATACAGATGAGCATTACCAGCCGAAATCACAAATAGGGATCATTAGCGTTATAC
TGAAACGAGAATTAAAAAAAAAATGAAAATCTCTCTTCCTCTGTATATGAGGTCCATCTT
CATACTCGCTGTTTTTCAAAATCCTCTTTTGAGGTTTTTTTT*AAAACTGATTATTTCCT
TTTGTTT*GTA*TTTTATTTGATCTTCTTGAGGAA
TAGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4DO21TF 660 0 0
GAGAAACACACTTGAAAC
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TGGTTATGCTGATATAAACACATCAAAAGGTCTCATAACTGTTGAACTCTTTAAAGATGC
TTCCCCTGAAGCTGTTGACAGGTTTCTAGATCTATGTCAAAAAGATCACTTCAAGGGAAT
GCCGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAGCTGGTCACTCCCAGAGCTCGAT
ACCTGTTGAAGAATGGACATCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCCTTAACACAAGCCCAAA
ACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAACAAAAGGGAACAACAACAAGGACTTCGA
GCTTCTCATCACAACGGCGCCAATCCCTGATCTTAATGATCAGCTTATAGTGTTTGGAAG
AGTCCTTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAGCATTA
CCAGCCGAAATCACAAATAGGGATCATTAGCGTTATACTGAAACGAGAATTATGAAAAAA
ATGAAAATCTCTCTTCCTCTGTATATGAGGTCCATCTTCATACTCGCTGTTTTTCAAAAT
CCTCTTTTGAGGTTTTTTTT*AAAACTGATTATTTCCTTT
TG

QA 19 658 19 658
DS 

RD RR4EL59JQ 591 0 0
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ACACCAAAAACAAAAGGGAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTCATCACAACGGCGCCA
ATCCCTGATCTTAATGATCAGCTTATAGTGTTTGGAAGAGTCCTTAAGGGAGAGGATGT*
GTACAGGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAGCATTACCAACCGAAATCACAAGTAGGG
ATCATTAGCGTTATACTGAAACGAGAATTATGAAAAAAATGAAAATCTCTCTTCCTCTGT
ATATGAGGTCCATCTTCATACTCGCTGTTTTTCAAAATCCTCTTTTGAGGTTTTTTTTTA
AAACTGATTATTTCCTTTCGTTTTGTAATTTTATTTGATCTTCTTGAGGAAATAGAATCT
TTGTTTAAGTCCATCGTCTGGTTTTTGTTTTAGAATCAATAGTCTTCATAT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 6

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ATGGCCGTCAAAATGCGGTGGTTTGCAGCCTCCGTAGCGTGAATTCCGTCCCAACTCACG
TAGTTTTGTGGATCACGGCAAGCCTTGGCCGTCACTGAAGAATTTCCGATTACTTTTGTG
GTGCCGCAAAATAACTTCTGATCGAAGTTGTACGGACGTCCACCGTACCCACAACAAGCT
TTAATACCGTGTTTCATTCCATAGGATTTGGGGTGTTGAAAAAGGTCGAGCAGTGTTTTG
TGAGTGTCTAAATATATAATGGTAGCGTTTTTCAATTCGGTTCTTGTCTCAAATAATGTC
TTTTTCAATAATGAATTGTAGTACTCGACAGCTTTGTTTACTGGAATGAGACATCCGAAT
TTGTCTAAATCCGAATTGGAATGAGTGTAACCGGTTAGTATCGCCGGGTAACATCCAACT
*GGTGCTAAATTTAGTACCAAAAATGTCCGACCACCTATTCCATATATCTCCTTAATGGT
TCCAGAAATTTGGCCAATGACTTGTGGAAGATACTGTTTTACACCATCC*ACTCCAATGG
AAGCTAAATTGGATGTGAAATCGTTTTGGCCGATATAAAACGTATAAAGCGATTTTCCGA
AAATATTGCTAGGCGGTAAGATATGCAACCCTGGTAGGTCCGAGGAATGGAACTCGTCGA
CTCTAAC*CTTAAATTGTTTCATCTGATTTAGCTGAATAGCGAGTGAGAAAGGACTGATC
CCGGAGACGAACAAGGACGTGTTTGGCAAAAGAACCGTCGACGCTAAGGTCGCAAAGTTT
GCACCGTGTCGAAAATCCGATCCGATTGATTGCAAATATGGGCTTAGGAAAGGCATCCCA
AGAGATTCCGCCAAAAAATCAATGATGAGACGGCCGTCTGAAGCACGACCGACCGGTTTC
TTGAAATAAGTCATTCCCCATGGACCGGATTGAGCCGGAAAAGCAGCCCAAAATCCTCCA
GTGTCAGAGTTCGAATCTCCGAAATTAAAAATTGCCTTGAATTCACATTTTGAATCAGCT
TTACACGAAGAGAACATCACAATGATCACTGTTAGAAGAGAGAAAGATACTCTTCTATTT
AGAACATAACCCATTTCTCTCACTTTGAGCCAAATGTTTGTGAGTGTGTCCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM04JQ U 1
AF RR4BA58JQ U 590
AF RR4GY24JQ U 434
AF RR4BA58TF C 556
AF RR4GY24TF C 742
AF RR4BM04TF C 592
BS 1 735 RR4BM04JQ
BS 736 1145 RR4GY24JQ
BS 1146 1312 RR4BA58TF

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GTGCCGCAAAATAACTTCTGATCGAAGTTGTACGGACGTCCACCGTACCCACAACAAGCT
TTAATACCGTGTTTCATTCCATAGGATTTGGGGTGTTGAAAAAGGTCGAGCAGTGTTTTG
TGAGTGTCTAAATATATAATGGTAGCGTTTTTCAATTCGGTTCTTGTCTCAAATAATGTC
TTTTTCAATAATGAATTGTAGTACTCGACAGCTTTGTTTACTGGAATGAGACATCCGAAT
TTGTCTAAATCCGAATTGGAATGAGTGTAACCGGTTAGTATCGCCGGGTAACATCCAACT
*GGTGCTAAATTTAGTACCAAAAATGTCCGACCACCTATTCCATATATCTCCTTAATGGT
TCCAGAAATTTGGCCAATGACTTGTGGAAGATACTGTTTTACACCATCC*ACTCCAATGG
AAGCTAAATTGGATG

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DS 

RD RR4BA58JQ 224 0 0
ACATC
CCAACC*GGTGCTAAATTTAGTACCAAAAATGTCCGACCACCTATTCCATATATCTCCTT
AATGGTTCCAGAAATTTGGCCAATGACTTGCGGAAGATACTGTTTTACACCATCC*ACTC
CAATGGAAGCTAAATTGGATGTGAAATCGTTTTGGCCGATATAAAACGTATAAAGCGATT
TTCCGAAAATATTGCTAGGCGGTAAGATATGCAACCCTG

QA 6 224 6 224
DS 

RD RR4GY24JQ 712 0 0
ATATAATGGTAGCGTTTTTCAATTCGGTTCTTGTCTCAAATAATGTCTTTTTCAATAATG
AATTGTAGTACTCGACAGCTTTGTTTACTGGAATGAGACATCCGAATTTGTCTAAATCCG
AATTGGAATGAGTGTAACCGGTTAGTATCGCCGGGTAACATCCAACT*GGTGCTAAATTT
AGTACCAAAAATGTCCGACCACCTATTCCATATATCTCCTTAATGGTTCCAGAAATTTGG
CCAATGACTTGTGGAAGATACTGTTTTACACCATCC*ACTCCAATGGAAGCTAAATTGGA
TGTGAAATCGTTTTGGCCGATATAAAACGTATAAAGCGATTTTCCGAAAATATTGCTAGG
CGGTAAGATATGCAACCCTGGTAGGTCCGAGGAATGGAACTCGTCGACTCTAAC*CTTAA
ATTGTTTCATCTGATTTAGCTGAATAGCGAGTGAGAAAGGACTGATCCCGGAGACGAACA
AGGACGTGTTTGGCAAAAGAACCGTCGACGCTAAGGTCGCAAAGTTTGCACCGTGTCGAA
AATCCGATCCGATTGATTGCAAATATGGGCTTAGGAAAGGCATCCCAAGAGATTCCGCCA
AAAAATCAATGATGAGACGGCCGTCTGAAGCACGACCGACCGGTTTCTTGAAATAAGTCA
TTCCCCATGGACCGGATTGAGCCGGAAAAGCAGCCCAAAATCCTCCAGTGTC

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DS 

RD RR4BA58TF 757 0 0
TTGGAATGAGTGTAACCGGTTAGTATCGCCGGGTAACATCCAACCCGGTGCTAAATTTAG
TACCAAAAATGTCCGACCACCTATTCCATATATCTCCTTAATGGTTCCAGAAATTTGGCC
AATGACTTGCGGAAGATACTGTTTTACACCATCCCACTCCAATGGAAGCTAAATTGGATG
TGAAATCGTTTTGGCCGATATAAAACGTATAAAGCGATTTTCCGAAAATATTGCTAGGCG
GTAAGATATGCAACCCTGGTAGGTCCGAGGAATGGAACTCGTCGACTCTAACTCTTAAAT
TGTTTCATCTGATTTAGCTGAATAGCGAGTGAGAAAGGACTGATCCCGGAGACGAACAAG
GACGTGTTTGGCAAAAGAACCGTCGACGCTAAGGTCGCAAAGTTTGCACCGTGTCGAAAA
TCCGATCCGATTGATTGCAAATATGGGCTTAGGAAAGGCATCCCAAGAGATTCCGCCAAA
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CCCCATGGACCGGATTGAGCCGGAAGAGCAGCCCAAAATCCTCCAGTGTCAGAGTTCGAA
TCTCCGAAATTAAAAATTGCCTTGAATTCACATTTTGAATCAGCTTTACACGAAGAGAAC
ATCACAATGATCACTGTTAGAAGAGAGAAAGATACTCTTCTATTTAGAACATAACCCATT
TCTCTCACTTTGAGCCAAATGTTTGTGAGTGTGTCCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GY24TF 567 0 0
CGTTTTGGCCGATATAAAACGTATAAAGCGATTTTCCGAAAATATTGCTAGGCGGTAAGA
TATGCAACCCTGGTAGGTCCGAGGAATGGAACTCGTCGACTCTAAC*CTTAAATTGTTTC
ATCTGATTTAGCTGAATAGCGAGTGAGAAAGGACTGATCCCGGAGACGAACAAGGACGTG
TTTGGCAAAAGAACCGTCGACGCTAAGGTCGCAAAGTTTGCACCGTGTCGAAAATCCGAT
CCGATTGATTGCAAATATGGGCTTAGGAAAGGCATCCCAAGAGATTCCGCCAAAAAATCA
ATGATGAGACGGCCGTCTGAAGCACGACCGACCGGTTTCTTGAAATAAGTCATTCCCCAT
GGACCGGATTGAGCCGGAAAAGCAGCCCAAAATCCTCCAGTGTCAGAGTTCGAATCTCCG
AAATTAAAAATTGCCTTGAATTCACATTTTGAATCAGCTTTACACGAAGAGAACATCACA
ATGATCACTGTTAGAAGAGAGAAAGATACTCTTCTATTTAGAACATAACCCATTTCTCTC
ACTTTGAGCCAAATGTTTGTGAGT
CCC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4BM04TF 679 0 0
CAT
CCAACT*GGTGCTAAATTTAGTACCAAAAATGTCCGACCAC*TATTCCATATATCTC*TT
AATGGTTCCAGAAATTTGGCCAATGACTTGTGGAAGATACTGTTTTACACCATCC*ACTC
CAATGGAAGCTAAATTGGATGTGAAATCGTTTTGGCCGATATAAAACGTATAAAGCGATT
TTCCGAAAATATTGCTAGGCGGTAAGATATGCAACCCTGGTAGGTCCGAGGAATGGAACT
CGTCGACTCTAAC*CTTAAATTGTTTCATCTGATTTAGCTGAATAGCGAGTGAGAAAGGA
CTGATCCCGGAGACGAACAAGGACGTGTTTGGCAAAAGAACCGTCGACGCTAAGGTCGCA
AAGTTTGCACCGTGTCGAAAATCCGATCCGATTGATTGCAAATATGGGCTTAGGAAAGGC
ATCCCAAGAGATTCCGCCAAAAAATCAATGATGAGACGGCCGTCTGAAGCACGACCGACC
GGTTTCTTGAAATAAGTCATTCCCCATGGACCGGATTGAGCCGGAAAAGCAGCCCAAAAT
CCTCCAGTGTCAGAGTTCGAATCTCCGAAATTAAAAATTGCCTTGAATTCACATTTTGAA
TCAGCTTTACACGAAGAGAACATCACAATGATCACTGTTAGAAGAGAGAAAGATACTCTT
CTATTTAGAACATAAC

QA 4 679 4 679
DS 



AS 1 4

CO CL1347Contig1 1104 4 9 U
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AAGAAAAATCAAAAACCCAATCTCCAGATGACAATCCTTGTCTTAACAATTTAGATCGGA
AAGAAGAACAATTTTTAAAAAACTTTTTTTTTTGAAACACTCTGTTATAATGGCAGACAA
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AGCAGCTTTTGCCAAGTGATGATTACATCAGCAGACTCAGAAGTGGAGATTTTGATTTGA
ATGTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTAAAGGCTTGTGAGGAACACCAGTTTG
GCCCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAATTACTTGGATCGGTTCTTATCAGTTCATGATG
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ATGGAGATTGAGAGCGATAACTCCCTGCTCATACTAAGATATTTCCTGAGGAAGATGAGT
AAATGTGATCAAGAACCATCCAGCACATTGATATCCAGATCATTACAAGTGATAGCCAGC
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CTTTCTGTTTCTGGAGAACTGTACACAGTACACTTTGACAACTCTTCCCTCTCTCCTCTT
TTCTCACTACTTCAAAAGGAGAGAGTGAAGAAGATTGGGGAAATGATAGAGAGTGATGGG
TCAGGCTTATGTTCACAAACACCCAATGGGGTTTTAGAAGTATCAGCTTGTTGTTTCAGC
TCTAAGACTCGTGATTCTTCTTCTTCCCATACACATCTTTCCTAAATCTCTCTGTTTCTT
CTTCAAATAAATTATCATTATTATTATATGTGAGGAGAGGTTGAGAAACGAAATAATCAT
AGCAAATTTTTAAAATAAAAGAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A355TF U 1
AF RR4A355TFB U 1
AF RR4A355JQ C 174
AF RR4A355JQD C 496
BS 1 209 RR4A355TF
BS 210 210 RR4A355TFB
BS 211 465 RR4A355TF
BS 466 466 RR4A355TFB
BS 467 476 RR4A355TF
BS 477 477 RR4A355TFB
BS 478 508 RR4A355TF
BS 509 812 RR4A355TFB
BS 813 1104 RR4A355JQ

RD RR4A355TF 508 0 0
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AAGAAAAATCAAAAACCCAATCTCCAGATGACAATCCTTGTCTTAACAATTTAGATCGGA
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QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4A355TFB 812 0 0
GGAACCAAAGCAAAAAGAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAATCCTTACACGAAGACATT
AAGAAAAATCAAAAACCCAATCTCCAGATGACAATCCTTGTCTTAACAATTTAGATCGGA
AAGAAGAACAATTTTTAAAAAACTTTTTTTTTTGAAACACTCTGTTATAATGGCAGACAA
TCTAGAACTGAGTCTTTTATGTACAGAGATCACCAACTTTGATGGAGAAGGAGAAGGAGA
AGCAGCTTTTGCCAAGTGATGATTACATCAGCAGACTCAGAAGTGGAGATTTTGATTTGA
ATGTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTAAAGGCTTGTGAGGAACACCAGTTTG
GCCCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAATTACTTGGATCGGTTCTTATCAGTTCATGATG
TCCCTAGTGGCAACGCTTGGGCAGTGCAGTTGTTGGCTGTGGCTT*GTTTATCATT*GGC
AGCCAAAATTGAAGAAACTGAAGTCCCATTGCTAATAGATCTTCAGGCTGGACATCCTCA
GTTTGTGTTTGAGGCCAAATCAGTTCAAAGAATGGAGCTTTTGGTGTTGAACAGACTGGA
ATGGAGATTGAGAGCGATAACTCCCTGCTCATACTAAGATATTTCCTGAGGAAGATGAGT
AAATGTGATCAAGAACCATCCAGCACATTGATATCCAGATCATTACAAGTGATAGCCAGC
AGAACCAAAGGTATTGACTTTTTGGAGTTTAGACCTTCTGAAGTTGCTGCTGCAGTTGCA
CTTTCTGTTTCTGGAGAACTGTACACAGTACA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4A355JQ 931 0 0
CAGACAATCTAGAACTGAGTCTTTTATGTACAGAGATCACCAACTTTGATGGAGAAGGAG
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GATTTGAATGTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTAAAGGCTTGTGAGGAACAC
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DS 



AS 1 6

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BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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TTTCACATGGTTCTTCACTTCATTTGGCTACGTAGGCTTACCACGAGGTCCTACTTCCTA
GGGGTAAATGATTATAGGTCATACAGAAAACACATATTGTTAGTTTTTTTAAAAACTCAT
ACCACATAATTAAGTGTAGTAGTACCTTAACGTCTGGATATAATGAATGGCATTTATTTG
GTGTTATTACTAAACGTCTGGTGAATTATTGCAACATTTCTAATCAACAGAGCAACAATA
TATATAATCTAAACCTTTATACCACACTATATTACAAACTATTAATCATAAAAAGAGAAG
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TAGAATCTTACCGAGCGAGAAACGTTGGTTGCGGTGCGTGCAGACAAGGCTGGTTGTTCA
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TTT

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TGCGCTTCACATGGTTCTTCACTTCATTTGGCTACGTAGGCTTACCACGAGGTCCTACTT
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AATATATATAATCTAAACCTTTATACCACACTATATTACAAACTATTAATCATAAAAAGA
GAAGAAAAACTATCAATCATTTGGTTGGGACGAAGTTGTGTGAAAGGCGTTCCATCTGCG
ACCGTAGAATCTTACCGAGCGAGAAACGTTGGTTGCGGTGCGTGCAGACAAGGCTGGTTG
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TCTCTTTCTTCACTGACTCCACATTAAGTGTGTGTATCATCGATTTAAAGATTTTCTAGT
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DS 

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GG
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GACCTCGAGGTGGATCGGTCTCATCTCTTTCTTCACTGACTCCACATTAAGTGTGTGTAT
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DS 

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TA
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GCATTTCTGCTTTGTGTTTTGGTGGTCAGAAGTTGTTCACTAATACTGTGTACATTTAAA
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TCAATTGTAAGAGGTCAAAGCAGGAGTAGGATTCAGTACATAAAAAGACGTTGTTATGTA
ATTAGGTTCAATAACCATGTGTCCGGTCTTGCAAACAAAATAATTCGCAAGTCTTTAACT
CTTTACTAAACTGTGTTGTTGATAAATAATATTATCTGTAAGGTTTTTTGGTC

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DS 

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AAG
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TTATTTAATCATTGATCAGTCCAAAAGCTTACTTTAGTCAGGAGATATCATAGCTTTTGC
AATGGAGACTATATATTACAAGCTGTATCATTTCTTACGATAAATTTCCCACCCGAGCCC
ATTAGACTCTCCGTTCTCAAACTAGATGGCTCTTCCTTCATTAAAAATGCACCATCGTCT
TAAAATCTTTAAATCTTCGTTTTGGTCATTACTTTATCACTATTCCTTTGGTTATCTTCG
ATTTTATTGTATTACTATGTCAAGATCTTTACGTAAAGAGCTCAGCAACCGTTGGAGATC
TCAAGCTTGCCACAGAGATTACCTTCAGCCACGTCCTCAAGATCTCATGGTCACACGTGT
GGGGGCATTTCTGCTTTGTGTTTTGGTGGTCAGAAGTTGTTCACTAATACTGTGTACATT
TAAAGTTATGGGATGAAGGAGGGTGGTGAGGTTTTATAGCCAATCTTCCATCTCGTTTTC
ATGATCAATTGTAAGAGGTCAAAGCAGGAGTAGGATTCAGTACATAAAAAGACGTTGTTA
TGTAATTAGGTTCAAGAACCATGTGACCGGTCTTGCAAACAAAATAATTCGCAAGTCTTT
AACTCTTTACTAAACTGTGTTGTTGATAAATAATATTATCTGTAAGGTTTTTTGGTCGCA
GCACACATTTCAGGTTTTGTATCACAACAAAATGATCTAAGGAACATGTTTTATTACAAA
GG

QA 4 785 4 785
DS 



AS 1 6

CO CL1349Contig1 636 6 3 U
GGATGGACACTCCACCGTAGTGAAGGGGGGTATTAAAATGTGTGTTTTAACCCCATATAC
ATATTCTAGAGTCTATAAATACCAATCACTTTCCAAGTCTTGTAAGATAAAAATAAGAGA
GAGAAATGGCTAACATTTTGCCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCTCTCAT
TCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACATTTTCTCCAGATGGGAAGTTCTTTC
GCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAGATGCT
TCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATCGAAGT
TCTAATTTCGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTGGTGCC
TTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAGATCTA
TGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTGTGCGA
TTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGTGTCAA
TTATCATAATGATATTTCTGTTTACTGTTTACATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CS11JQ C 1
AF RR4C761JQ C 115
AF RR4G670JQ C 119
AF RR4CI21TF U 115
AF RR4G670TF U 119
AF RR4CS11TF U 1
BS 1 115 RR4CS11TF
BS 116 623 RR4CI21TF
BS 624 636 RR4CS11TF

RD RR4CS11JQ 636 0 0
GGATGGACACTCCACCGTAGTGAAGGGGGGTATTAAAATGTGTGTTTTAACCCCATATAC
ATATTCTAGAGTCTATAAATACCAATCACTTTCCAAGTCTTGTAAGATAAAAATAAGAGA
GAGAAATGGCTAACATTTTACCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCTCTCAT
TCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACATTTTCTCCAGATGGGAAGTTCTTTC
GCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAGATGCT
TCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATCGAAGT
TCTAATTTCGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTGGTGCC
TTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAGATCTA
TGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTGTGCGA
TTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGTGTCAA
TTATCATAATGATATTTCTGTTTACTGTTTACATCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4C761JQ 508 0 0
G
AGAGAGAGAAATGGCTAACATTTTGCCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCT
CTCATTCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACTTTTTCTCCAGATGGGAAGTT
CTTTCGCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAG
ATGCTTCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATC
GAAGTTCTAATTTTGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTG
GTGCGTTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAG
ATCTATGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTG
TGCGATTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGT
GTCAATTATCATAATGATATTTCTGT
C

QA 2 507 2 507
DS 

RD RR4G670JQ 505 0 0
GG
GAGAAATGGCTAACATTTTGCCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCTCTCAT
TCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACATTTTCTCCAGATGGGAAGTTCTTTC
GCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAGATGCT
TCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATCGAAGT
TCTAATTTCGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTGGTGCC
TTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAGATCTA
TGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTGTGCGA
TTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGTGTCAA
TTATCATAATGATATTTCTGTTT

QA 3 505 3 505
DS 

RD RR4CI21TF 514 0 0
G
AGAGAGAGAAATGGCTAACATTTTGCCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCT
CTCATTCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACATTTTCTCCAGATGGGAAGTT
CTTTCGCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAG
ATGCTTCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATC
GAAGTTCTAATTTCGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTG
GTGCCTTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAG
ATCTATGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTG
TGCGATTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGT
GTCAATTATCATAATGATATTTCTGTTT
ACTGT

QA 2 509 2 509
DS 

RD RR4G670TF 505 0 0
GG
GAGAAATGGCTAACATTTTGCCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCTCTCAT
TCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACATTTTCTCCAGATGGGAAGTTCTTTC
GCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAGATGCT
TCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATCGAAGT
TCTAATTTCGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTGGTGCC
TTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAGATCTA
TGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTGTGCGA
TTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGTGTCAA
TTATCATAATGATATTTCTGTTT

QA 3 505 3 505
DS 

RD RR4CS11TF 636 0 0
GGATGGACACTCCACCGTAGTGAAGGGGGGTATTAAAATGTGTGTTTTAACCCCATATAC
ATATTCTAGAGTCTATAAATACCAATCACTTTCCAAGTCTTGTAAGATAAAAATAAGAGA
GAGAAATGGCTAACATTTTACCAAGTTTATCGAAGCTCTATGTGGTTATGCTTCTCTCAT
TCTTGGCTCTTTTCATAATCGCCCATGCTCAAACATTTTCTCCAGATGGGAAGTTCTTTC
GCGATCCACCGGCCCAAGCCTACGACGGTCCTTCGTACGCTCCTGTTCCTCCGAGATGCT
TCAATCCCCCTGGCTGCGGTCCGGTGAATAAAAGGAAAAAGAAGATTTCGCCATCGAAGT
TCTAATTTCGCCACATGAATCTTGAGAATTAAAAGTTTGCTCGCTGATGGTTGTGGTGCC
TTCTCATTTGGTTTAGGTTATCTATGTATAAATACATATATGAAATGTTTTTGAGATCTA
TGTTATAATATGGTGCGGTTGTACCCTGGAGTTGAGGGGAATGTGATTCTAATTGTGCGA
TTTCAATTACTGGTAAGTTGGTGACCACTATAGTCTGTTATGTAAAATGTATAGTGTCAA
TTATCATAATGATATTTCTGTTTACTGTTTACATCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 6

CO CL1350Contig1 889 6 18 U
GCACAACGGTCACGCACTTCTTATGACTGATACTCGGAGGAGACTTCTTGAGATGGGATA
CAAGAACCCTATCCTATTGCTTCATCCATTGGGAGGGTACACGAAGGCTGATGATGTTCC
TCTGAGTTGGAGGATGAAGCAGCACGAGAAGGTGCTAGAGGACGGTGTTCTTGATCCAGA
GACAACAGTGGTATCCATATTCCCGTCGCCTATGCATTACGCTGGTCCAACCGAAGTGCA
GTGGCACGCGAAGGCTAGAATCAATGCAGGTGCTAACTTCTACATTGTGGGCCGTGATCC
AGCCGGGATGGGTCACCCAGTTGAAAAGCGTGATCTTTACGATGCTGATCATGGAAAGAA
AGTACTAAGCATGGCTCCTGGACTTGAAAGACTCAATATCCTTCCTTTCAGGGTTGCTGC
ATATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGCCTCAAGATTTCTT
GTTCATCTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAACCCTCCGGATGG
ATTCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGCTTGTCTCCGGC
AGGTAAACTACCGGAAGTGGTTCCAGCCTAAGACAACGACAAAGAAACTGTCTCTGCGTC
GTTTAAAA*CTGTCTCTGATTTGTGTTGTGGACCTTTGAGGCAACTGTCGTTGTTGTATA
GGAGAAGCCTACATATAAATCTGGCCGGACCTTTTTTTTCAAAATAAAATACATAAAAGA
CTGTTTCCTTTACGAAAGTTGTAATATTTGATCCAATCACCTTCTGGTGAAAACTTGTAC
CATATGAAACGATTGTGTTTATATGAAAATAACAAGAAGCAGTTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4G133TF U 1
AF RR4G337TF U 242
AF RR4G660TF U 178
AF RR4G660JQ C 230
AF RR4AJ67JQ C 422
AF RR4AJ67TF U 422
BS 1 249 RR4G133TF
BS 250 250 RR4G660TF
BS 251 320 RR4G133TF
BS 321 321 RR4G660TF
BS 322 327 RR4G133TF
BS 328 328 RR4G660TF
BS 329 362 RR4G133TF
BS 363 363 RR4G660TF
BS 364 396 RR4G133TF
BS 397 397 RR4G660TF
BS 398 700 RR4G133TF
BS 701 701 RR4G660TF
BS 702 721 RR4G133TF
BS 722 820 RR4G660TF
BS 821 821 RR4AJ67TF
BS 822 862 RR4G660TF
BS 863 888 RR4AJ67TF
BS 889 889 RR4AJ67JQ

RD RR4G133TF 724 0 0
GCACAACGGTCACGCACTTCTTATGACTGATACTCGGAGGAGACTTCTTGAGATGGGATA
CAAGAACCCTATCCTATTGCTTCATCCATTGGGAGGGTACACGAAGGCTGATGATGTTCC
TCTGAGTTGGAGGATGAAGCAGCACGAGAAGGTGCTAGAGGACGGTGTTCTTGATCCAGA
GACAACAGTGGTATCCATATTCCCGTCGCCTATGCATTACGCTGGTCCAACCGAAGTGCA
GTGGCACGCAAAGGCTAGAATCAATGCAGGTGCTAACTTCTACATTGTGGGCCGTGATCC
AGCCGGGATGGGTCACCCAGGTGAAAAACGTGATCTTTACGATGCTGATCATGGAAAGAA
AGCACTAAGCATGGCTCCTGGACTTGAAAGACTCAACATCCTTCCTTTCAGGGTTGCTGC
ATATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGCCTCAAGATTTCTT
GTTCATCTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAACCCTCCGGATGG
ATTCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGCTTGTCTCCGGC
AGGTAAACTACCGGAAGTGGTTCCAGCCTAAGACAACGACAAAGAAACTGTCTCTGCGTC
GTTTAAAA*CTGTCTCTGATTTGTGTTGTGGACCTTTGAG*CAACTGTCGTTGTTGTATA
G
AGA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4G337TF 546 0 0
G
GGCACGCGAAGGCTAGAATCAATGCAGGTGCTAACTTCTACATTGTGGGCCGTGATCCAG
CCGGGATGGGTCACCCAGTTGAAAAGCGTGATCTTTACGATGCTGATCATGGAAAGAAAG
TACTAAGCATGGCTCCTGGACTTGAAAGACTCAATATCCTTCCTTTCAGGGTTGCTGCAT
ATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGC*TCAAGACTTCTTGT
TCATCTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAGCCCTCCTGATGGAT
TCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGCTTGTCTCCGGCAG
GTAAACTACCGGAAGCGGTTCCAGCCTAAGACAAGGACAAAGAAACTGTCTCTGCGTCGT
TTAAAA*CTGTCTCTTATTTGTGTTGTGGACCTTTGAGGCAACTGTCGTTGTTGTATAGG
AGAAGCCTACATATAAATCTGGCCGGACCTTTTTTTTCAAAATAAAATACATAAAAGACT
GTTTC

QA 2 546 2 546
DS 

RD RR4G660TF 685 0 0
G
GAGACTACAGTGGTTTCCATATTCCCGTCTCCTATGCATTACGCTGGTCCAACCGAAGTG
CAGTGGCACGCGAAGGCTAGAATCAATGCAGGTGCTAACTTCTACATTGTGGGCCGTGAT
CCAGCCGGGATGGGTCACCCAGTTGAAAAGCGTGATCTTTACGATGCTGATCATGGAAAG
AAAGTACTAAGCATGGCTCCTGGACTTGAAAGACTCAATATCCTTCCTTTCAGGGTTGCT
GCATATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGCCTCAAGATTTC
TTGTTCATCTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAGCCCTCCTGAT
GGATTCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGCTTGTCTCCG
GCAGGTAAACTACCGGAAGTGGTTCCAGCCTAAGACAAGGACAAAGAAACTGTCTCTGCG
TCGTTTAAAA*CTGTCTCTTATTTGTGTTGTGGACCTTTGAGGCAACTGTCGTTGTTGTA
TAGGAGAAGCCTACATATAAATCTGGCCGGACCTTTTTTTTCAAAATAAAATACATAAAA
GACTGTTTCCTTTACGAAAGTTGTAATATTTGATCCAATCACTTTCTGGTGAAAACTTGT
ACCATATGAAACGATTGTGTTTAT

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4G660JQ 659 0 0
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GGCCGTGATCCAGCCGGGATGGGTCACCCAGTTGAAAAGCGTGATCTTTACGATGCTGAT
CATGGAAAGAAAGTACTAAGCATGGCTCCTGGACTTGAAAGACTCAATATCCTTCCTTTC
AGGGTTGCTGCATATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGCCT
CAAGATTTCTTGTTCATCTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAGC
CCTCCTGATGGATTCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGC
TTGTCTCCGGCAGGTAAACTACCGGAAGTGGTTCCAGCCTAAGACAAGGACAAAGAAACT
GTCTCTGCGTCGTTTAAAA*CTGTCTCTTATTTGTGTTGTGGACCTTTGAGGCAACTGTC
GTTGTTGTATAGGAGAAGCCTACATATAAATCTGGCCGGACCTTTTTTTTCAAAATAAAA
TACATAAAAGACTGTTTCCTTTACGAAAGTTGTAATATTTGATCCAATCACTTTCTGGTG
AAAACTTGTACCATATGAAACGATTGTGTTTATATGAAAACAACAAGAAGCAGTTTTGC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4AJ67JQ 468 0 0
G
ATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGCCTCAAGATTTCTTGT
TCATTTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAACCCTCCGGATGGAT
TCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGCTTGTTTCCGGCAG
GTAAACTACCGGAAGTGGTTCCAGCCTAAGACAACGACAAAGAAACTGTCTCTGCGTCGT
TTAAAAACTGTTTCTGATTTGTGTTGTGGACCTTTGAGGCAACTGTCGTTGTTGTATAGG
AGAAGCCTATATATAAATCTGGCCGGACCTTTTTT**CAAAATAAAATACATAAAAGACT
GTTTCCTTTACTAAAGTTGTAATATTTGATCCAATCACCTTCTGGTGAAAACTTGTACCA
TATGAAACGATTGTGTTTATATGAAAATAACAAGAAGCAGTTTTGCC

QA 2 468 2 468
DS 

RD RR4AJ67TF 468 0 0
G
ATGACAAGACACAAGGCAAAATGGCTTTCTTTGATCCCTCGAGGCCTCAAGATTTCTTGT
TCATCTCCGGCACTAAGATGCGCACATTGGCCAAGAACAAAGAAAACCCTCCGGATGGAT
TCATGTGCCCAGGTGGATGGCAAGTTCTTGTTGATTACTATGACAGCTTGTCTCCGGCAG
GTAAACTACCGGAAGTGGTTCCAGCCTAAGACAACGACAAAGAAACTGTCTCTGCGTCGT
TTAAAAACTGTCTCTGATTTGTGTTGTGGACCTTTGAGGCAACTGTCGTTGTTGTATAGG
AGAAGCCTATATATAAATCTGGCCGGACCTTTTTT**CAAAATAAAATACATAAAAGACT
GTTTCCTTTACTAAAGTTGTAATATTTGATCCAATCACCTTCTGGTGAAAACTTGTACCA
TATGAAACGATTGTGTTTATATGAAAATAACAAGAAGCAGTTTTGC
C

QA 2 467 2 467
DS 



AS 1 6

CO CL1351Contig1 720 6 10 U
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CTTGCAAGGCAAGGGGAGCAGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACTAGGGAAACAGCGC
ATGCCATACGGAAGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCCC
ACAAGCAAGCTATTCCCTT*CACACGTTTCTGTCGTGGTGTTGGACGAACTGCTCAAGCA
AAGAACAGACATTCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATCTGCTCAGTTCGTTCTT
GATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTT
TTCATTTCTCACATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATATCGTGCC
CATGGAAGAATCAATCCATACATGTCAAACCCATGTCACATTGAGTTGATTTTGTCAGAG
AAGGAAGAGTCTGTGAAGAAAGAGCCTGAGACTCAGCTGGCTGCCAAGTCAAAGAAAGGT
GCCTCGTCTTGAGTCTAGATACAGTAGCTATCTTGTGGTCACGTTGGGTGATACATTTTG
TTCACTTTCATTTGTTTGTGGATCCTTTTTAAAAAAAA*CACACAAATGATCTTTTGTTT
GTCA*CACCAGAAGCGTTGAATTTATTTACAAATCAAACAAAATCGTGAATTTGGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR36TF U 1
AF RR4D296TF U 2
AF RR4GT57JQ C 7
AF RR4GT57TF U 10
AF RR4C278TF U 11
AF RR4C278JQ C 54
BS 1 84 RR4FR36TF
BS 85 85 RR4D296TF
BS 86 199 RR4FR36TF
BS 200 200 RR4D296TF
BS 201 503 RR4FR36TF
BS 504 510 RR4D296TF
BS 511 511 RR4GT57TF
BS 512 632 RR4D296TF
BS 633 702 RR4GT57TF
BS 703 720 RR4C278JQ

RD RR4FR36TF 503 0 0
GGTCTTCTCGTTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCAAGAACCGGACAATTCGACCAAAT
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ATGCCATACGGAAGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCCC
ACAAGCAAGCTATTCCCTTTCACACGTTTCTGTCGTGGTGTTGGACGAACTGCTCAAGCA
AAGAACAGACATTCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATCTGCTCAGTTCGTTCTT
GATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTT
TTCATTTCTCACATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATATCGTGCC
CATGGAAGAATCAATCCATACATGTCAAACCCATGTCACATTGAGTTGATTTTGTCAGAG
AAGGAAGAGTCTGTGAAGAAAGA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4D296TF 631 0 0
GGCTTCTCG
TTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCAAGAACCGGACAATTCGACCAAATCTTGCAAGGC
AAGGGGAGCAGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACTAGGGAAACAGCGCATGCCATACG
GAAGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCCCACAAGCAAGC
TATTCCCTT*CACACGTTTCTGTCGTGGTGTTGGACGAACTGCTCAAGCAAAGAACAGAC
ATTCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATCTGCTCAGTTCGTTCTTGATCTCCTCA
AGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTTTTCATTTCTC
ACATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATATCGTGCCCATGGAAGAA
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CTGTGAAGAAAGAGCCTGAGGCTCAGCTGGCTGCCAAGTCAAAGAAAGGTGCCTCGTCTT
GAGTCTAGATACAGTAGCTATCTTGTGGTCACGTTGGGTGATACATTTTGTTCACTTTCA
TTTGTTTGTGGATCCTTTTTAA

QA 10 631 10 631
DS 

RD RR4GT57JQ 633 0 0
GGGT
TTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCAAGAACCGGACAATTCGACCAAATCTTGCAAGGC
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GAAGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCCCACAAGCAAGC
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ATTCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATCTGCTCAGTTCGTTCTTGATCTCCTCA
AGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTTTTCATTTCTC
ACATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATATCGTGCCCATGGAAGAA
TCAATCCATACATGTCAAACCCATGTCACATTGAGTTGATTTTGTCAGAGAAGGAAGAGT
CTGTGAAGAAAGAGCCTGAGACTCAGCTGGCTGCCAAGTCAAAGAAAGGTGCCTCGTCTT
GAGTCTAGATACAGTAGCTATCTTGTGGTCACGTTGGGTGATACATTTTGTTCACTTTCA
TTTGTTTGTGGATCCTTTTTAAAAAAAA
A

QA 5 632 5 632
DS 

RD RR4GT57TF 709 0 0
T
TTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCAAGAACCGGACAATTCGACCAAATCTTGCAAGGC
AAGGGGAGCAGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACTAGGGAAACAGCGCATGCCATACG
GAAGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCCCACAAGCAAGC
TATACCCTT*CACACGTTTCTGCCGTGGTGTTGGACGAACTGCTCAAGCGAAGAACAGAC
ATTCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATCTGCTCAGTTCGTTCTTGATCTCCTCA
AGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTTTTCATTTCTC
ACATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATATCGTGCCCATGGAAGAA
TCAATCCATACATGTCAAACCCATGTCACATTGAGTTGATTTTGTCAGAGAAGGAAGAGT
CTGTGAAGAAAGAGCCTGAGACTCAGCTGGCTGCCAAGTCAAAGAAAGGTGCCTCGTCTT
GAGTCTAGATACAGTAGCTATCTTGTGGTCACGTTGGGTGATACATTTTGTTCACTTTCA
TTTGTTTGTGGATCCTTTTTAAAAAAAA*CACACAAATGATCTTTTGTTTGTCA*CACCA
GAAGCGTTGAATTTATTTACAAATCAAACAAA
TCGTGATTTGGTTTTG

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR4C278TF 667 0 0
GG
TGGCCGCCATGGTGAAATACTCCCAAGAACCGGACAATTCGACCAAATCTTGCA**GCAA
GGGGAGCAGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACTAGGGAAACAGCGCATGCCATACGGA
AGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCCCACAAGCAAGCTA
TTCCCTT*CACACGTTTCTGTCGTGGTGTTGGACGAACTGCTCAAGCAAAGAACAGACAT
TCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATCTGCTCAGTTCGTTCTTGATCTCCTCAAG
AATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTTTTCATTTCTCAC
ATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATATCGTGCCCATGGAAGAATC
AATCCATACATGTCAAACCCATGTCACATTGAGTTGATTTTGTCAGAGAAGGAAGAGTCT
GTGAAGAAAGAGCCTGAGACTCAGCTGGCTGCCAAGTCAAAGAAAGGTGCCTCGTCTTGA
GTCTAGATACAGTAGCTATCTTGTGGTCACGTTGGGT*ATACATTTTGTTCACTTTCATT
TGTTTGTGGATCCTTTTTAAAAAAAA*CACACAAATGATCTTTTGTTTGTCA*CACCAGA
AGCGT

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR4C278JQ 667 0 0
ACCAAATCTTGCA**GCAAGGGGAGCAGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACTAGGGAA
ACAGCGCATGCCATACGGAAGCTGCCACTGATCAAGGCGAAAAGGTACTTGGAAGATGTG
ATAGCCCACAAGCAAGCTATTCCCTT*CACACGTTTCTGTCGTGGTGTTGGACGAACTGC
TCAAGCAAAGAACAGACATTCAAACGGTCAAGGTCGTTGGCCTGCCAAATTTGCTCAGTT
CGTTCTTGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTCAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCCCTTTTCATTTTTCACATTCAAGTTAACCAAGCAGCAAAACAGAGGCGGAGGACATA
TCGTGCCCATGGAAGAATCAATCCATACATGTCAAACCCATGTCACATTGAGTTGATTTT
GTCAGAGAAGGAAGAGTCTGTGAAGAAAGAGCCTGAGACTCAGCTGGCTGCCAAGTCAAA
GAAAGGTGCCTCGTCTTGAGTCTAGATACAGTAGCTATTTTGTGGTCACGTTGGGT*ATA
CATTTTGTTCACTTTCATTTGTTTGTGGATCCTTTTTAAAAAAAAACACACAAATGATCT
TTTGTTTGTCAACACCAGAAGCGTTGAATTTATTTACAAATCAAACAAAATCGTGAATTT
GGTTTTG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 5

CO CL1352Contig1 1174 5 16 U
GACCTTGAAAGAATCGTTCCACAGCTTGAAGATCATTCATGTACCCCGCACACAAAATTT
GAAGGCCGATGGCTTAGCACGCAGTGCTAGAAAACAAACGACCTTTGTTGTGCACATGGA
TGCAGAACTACCGTTTTAGTTTACAGAGTCTGTTTGAATCTGTAAAAGTCGATGACAAAA
AAAAAAAATCATCAATCTGGCACATTTACAATTAGAGACATATTATAAACTCTAACGAAA
ATCCAAAGACTGGATGGCCAGTTTGGCTGCAATTGAAGAAATGTTCTCCTTGATGAGTCC
CATTGAAAGTTTTAACCTCTCCATTGTATCTTTTATATCCATTGCCTTTAATTTCTCTTG
TTGTAACCTTGACAGTTCCGACTGTGTGACTCCGGAAACCGGTTGAAACGCAGCGAATGA
TAAACGTTCTTGAAGGGAAGGAAAAAAGGATTTTTCACATTCTCCCGGTGGCTCATCTTC
AGCCCATTTCAAAGAGTTAAAGAGACGAGTTTGAAGCAGCGAGTCATCTGGAGCCTTAAG
TTTGATCTCCAAGCTGTTGAGATTCTTGATAGATTCCTTTAGGTTGGATATTTTTGAGGT
TATTTCATCGCTGCTCTCATAATTAAAACGATCTTGTATTGGTCTGACCTCTCCAGACAA
ATAAGGATCTGCCCCTAGAATTCTCGAAATCTTCACACGACCAGCTCCTCTAATCGAGAC
AAGTGCTCCAATGTCTAATCTCTCGACATTTTCAATAAGTACTAAACAGCCATATCGAGC
AGCAAAGGATGCTTCTGTTGCTTCCTCACTAATCGAAATAGGATCGAGAATGAAATGAAC
AAACATATTCTTCTTTCTTTTCATCGACTCTTCAAGTAGTGCCAAGTATCTTGCTTCGTA
CAAATGCAATGTTTTACTCTCCGTTGGTACAAGAACCTCGCTCATGCTGAAGGGAAGAAG
AGGAAGATCGAGTGACTTGGCGACAATTTTCAAACGACGTCGTTTCGCCACGCGGACATT
GCTAACTCCGGAAATTGAAGTCGCCGGAATTCGAAACCAGCTGCGATATTCGGTAGGGAA
GATAGAGGAAGAGAGAACAGAGGAGATTAAGGTGGACGTCATCGGGAAAACGTAAATCGC
AGTATGGAGACTTCCGCGCTCCTTCCGCTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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C

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DS 



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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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TG

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CT

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DS 

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CTAGGCTTAGTTCCGGGCTTCAAAATCAGCAAATCCGCTGGCAACATTGTCATTTTTTGG
AGCGTGCTCGTCGGTGACAAGTTGCAGGTTTGGTGTGCTGAGATTTCACTTGAGAGGCGG
CTGCGCCAGGATGATGGCCAGATTTGGGGGATCATCCAGTGCATTGATCATGTCTTCACT
ATGGACCCTGACCTCTATATTTTGTCTTCTATTAATGTTAGTCTTTGAACATACTTTTCT
CTTTTATTAGCACACTTTTTTTTTTTTTTATTAGCACACTTAATTGGTAGATACTCTTTG
TTTCTGTTAACTCTGTCAAGTGTGTTTCTTCTTGTTCTTCTATATTTCACATAATCTTCA
TTAATGTGACATT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 6

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CATCGACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCGGTG
TCTTCATCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGTAACAAGC
CTCGCTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCTTCCGCTTCCTTTCCACTCTACTTCTTCTTCTT
CTTCACTCGTAGCGAAATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAG
ATGAGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAAAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTG
GAATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGG
AGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCCGGTTTGAAGTTGACTA
TTAAGGAGAAGAAAGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTC
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ACAATCTTAACTCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB61TF U 5
AF RR4B829TF U 1
AF RR4CB61JQ C 292
AF RR4B829JQ C 353
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BS 552 703 RR4B829TF
BS 704 704 RR4CB61TF
BS 705 829 RR4B829TF
BS 830 830 RR4B829JQ
BS 831 901 RR4CB61JQ
BS 902 902 RR4B829JQ
BS 903 947 RR4CB61JQ
BS 948 948 RR4B829JQ
BS 949 1034 RR4CB61JQ
BS 1035 1095 RR4B829JQ

RD RR4CB61TF 708 0 0
GG
AAACTAGGAATTAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGTCTTCTTCATCGA
CACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCGGTGTCTTCA
TCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGTAACAAGCCTCGCT
TTCAATCAATCTCTTCAAAGCTTCCGCTTCCTTTCCACTCTACTTCTTCTTCTTCTTCAC
TCGTAGCGAAATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAGATGAGA
GCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAAAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTGGAATGG
TATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGGAGGAGG
ATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCCGGTTTGAAGTTGACTATTAAGG
AGAAGAAAGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCG
TCGGAAAATCTGGCGTTACTGATTCGGTGGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTCGAGAAGA
ACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTA
G*CATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAAATCGG

QA 3 708 3 708
DS 

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GGAAATAAACTAGGAATTAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGTCTTCTT
CATCGACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCGGTG
TCTTCATCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGTAACAAGC
CTCGCTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCTTCCGCTTCCTTTCCACTCTACTTCTTCTTCTT
CTTCACTCGTAGCGAAATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAG
ATGAGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAAAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTG
GAATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGG
AGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCCGGTTTGAAGTTGACTA
TTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTC
AACTCGTCGGCAAATCTGGCGTTACTGATTCGGTGGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTCG
AGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACG
CTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGTCAAATCGGGAGGACGG
TTATATTGTACCGGCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAAGAAAGAAGTTG
AGAGATTGTTGATTAGAAGGAGATAGAAGTTCTCAAACTCCCGACCCAC
CAG

QA 1 829 1 829
DS 

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GAGAAGAAGATGAGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAAAAGACGAAGAAGAAGAGC
TGGACAGTGGAATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAG
ACAAGGAGGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCCGGTTTGA
AGTTGACTATTAAGGAGAAGAAAGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAAT
TGAAATGTCAACTCGTCGGAAAATCTGGCGTTACTGATTCGGTGGTTTTCTCATTCCTCG
AGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGA
TGGAGGACGCTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAAATCG
GGAGGACGGTTATATTGTACCGGCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAAGA
AAGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTCTCAAATTCCCGACCCACTA
GACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTA
GAGTTGCAACGCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCTGTTTTTTTTTTTT*ATT
ATCACCTAAGAAGACCAGTTCTTTGCTTTTGTATGCATTCTTCAAAAAAATACAATCTCG
ATCTGTAAACCCTCCATTGCTGG
C

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4B829JQ 743 0 0
GGACAGTGGAATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGA
CAAGGAGGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCCGGTTTGAA
GTTGACTATTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATT
GAAATGTCAACTCGTCGGCAAATCTGGCGTTACTGATTCGGTGGTTTTCTCATTCCTCGA
GACTCTCGAGAAGAACGAGCTTTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGAT
GGAGGACGCTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGTCAAATCGG
GAGGACGGTTATATTGTACCGGCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAAGAA
AGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGATAGAAGTTCTCAAACTCCCGACCCCCCAG
ACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTAG
AGTTGCAACCCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCTGTTTTTTTTTTTTTATTA
TCACCTAAGAAGACCAGTTCTTTGCTTTTGTATGCATTCTTCAAAAAAATACAATCTCGA
TCTGTAAACCCTCCATTGCTGGGAAGCTGTAACCATTTGTGGCCATGAAATGACGTGAAG
AGTTAAAGACAATCTTAACTCTT

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL1354Contig2 583 2 3 U
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GACTATGGGCGTATGAAGCAAGTTCCTTCTTCTCCTTTATCGTCAACTTCAAACCCGAGC
CCCGAGCCTTCTTCTTCATCTTCTCTATCTTATCCTCCTCCTCGTCTCCTAAACCTTCCT
CGTCGTCCTCACTTCCTCTCGCGGATACCATTCCACTCTCCACCTCTTCTTCTTCGTTGT
AATGGTCTTCCTCGCTCTCGTCTTCTTCTCCGAGTTCCGGCTCATCGACGGCAGAGAAGG
ACTTCGCTACGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGTAGAGTGGAAAGGAAGCGGAAGCTTTGAAG
AGATTGATTGAAACCGAGGCTTGTTACAGCGGCTAGATTGACATGTTACAGCGGAGAAGC
GAAAGGGTCTGAGGAAGAGACCGAAGGAAGACGGTGGTTCGGGATGTCGGAGAAGGTTGT
GGATAAGATGTGTCGATGAAGAAGACGGTGGTTGTATTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS55JQ U 178
AF RR4GS55TF C 1
BS 1 191 RR4GS55TF
BS 192 346 RR4GS55JQ
BS 347 583 RR4GS55TF

RD RR4GS55JQ 169 0 0
CCCCGAGCCCTTCT
TTCTTCATCTTCTCTATCTTATCCTCCTCCTCGTCTCCTAAACCTTCCTCGTCGTCCTCA
CTTCCTCTCGCGGATACCATTCCACTCTCCACCTCTTCTTCTTCGTTGTAATGGTCTTCC
TCGCTCTCGTCTTCTTCTCCGAGTTCCGGCTCATC

QA 15 169 15 169
DS 

RD RR4GS55TF 583 0 0
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GACTATGGGCGTATGAAGCAAGTTCCTTCTTCTCCTTTATCGTCAACTTCAAACCCGAGC
CCCGAGCCTTCTTCTTCATCTTCTCTATCTTATCCTCCTCCTCGTCTCCTAAACCTTCCT
CGTCGTCCTCACTTCCTCTCGCGGATACCATTCCACTCTCCACCTCTTCTTCTTCGTTGT
AATGGTCTTCCTCGCTCTCGTCTTCTTCTCCGAGTTCCGGCTCATCGACGGCAGAGAAGG
ACTTCGCTACGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGTAGAGTGGAAAGGAAGCGGAAGCTTTGAAG
AGATTGATTGAAACCGAGGCTTGTTACAGCGGCTAGATTGACATGTTACAGCGGAGAAGC
GAAAGGGTCTGAGGAAGAGACCGAAGGAAGACGGTGGTTCGGGATGTCGGAGAAGGTTGT
GGATAAGATGTGTCGATGAAGAAGACGGTGGTTGTATTCTTAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 5

CO CL1355Contig1 1040 5 18 U
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TCCGGATATTCTCAGAGCATGTTTAGAATTATCAGATGTTTAAACTCGATTGAGTATAAT
GCGGAATATTAAGATAATGCCATTTTTCAATATGATGTAAGGAAGTCAAACGAAAAAAAT
ACAAATATTATGATAAGTCCATTTCCCGTGTGATTAAATATCTATTAAGATTTATCAATA
AGGAATAGGTATCGGAGAAGGGACGTGGACCGGCCGTAAAACAAGATCGGAATCAGAAAG
ATTAAGCGGCGGAAGCGAGTAAACACCGTAAGTAGAACTCCCTCTTCTCATCTCTCTCAT
CGTCATCAACGCCGCAACCGTATTCCTAAATATCCCTTCTCCCGCTGCAGCCGAACTCAC
CGCCGCAGATCTCTCGTATCCCTCCACCTCCCTAGTCAGCGCCGGAAACATCGCGTCCAT
TGTCGTCTCCCACTCTCTTACAAGCCTCGACACCAGATCAGTCTTGAAAAACGGTTGACG
AAGAACTTTTTGGATAAACGGCGATCGCAATGCTCCTCCTGTTCTCTTGTCGTACTTCTT
CAGGATCTTTGCTAACCCAGTGTAGTTTATGTTGCTGTAATTAACGAGAAGTACCATCTC
CCCATGGAAGTTAACAATATCCTTTCTGATCTCACCAATCTCTTCTCTGAACATTACATC
ATCATTGTCTCCACATTTTT*CTACCAATCTCTGAATCCGATATTGCAATTCCTTATGGT
GGATGATGAAATCTTCTTCTTGCTCGACGAAGAAAGCATTAAACTTCTCAATCTCGGCGT
TCAGCAAACAGACGAAGATAGATTCAGCTGGAGCAGGAGAAGAGATCAGATTCTTGAGTT
CTTTGTAACGCAAAAACTTGTCACGCCACTCCGGCAACGACTCTTGTATCTGCTCCTTAA
TCCTCTTACCGAACTTCATTAAAACAGGTGTATATGTTTAAATGAAGAAAGGGTAAGAAA
TGTATTATAATGAGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK45JQ U 70
AF RR4EF74JQ U 1
AF RR4ED46JQ U 162
AF RR4FK45TF C 323
AF RR4EF74TF C 390
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BS 862 872 RR4ED46JQ
BS 873 995 RR4FK45TF
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A
CTCAGAGCATGTTTAGAATTATCAGATGTTTAAACTCGATTGAGTATAATGCGGAATATT
AAGATAATGCCATTTTTCAATATGATGTAAGGAAGTCAAACGAAAAAAATACAAATATTA
TGATAAGTCCATTTCCCGTGTGATTAAATATCTATTAAGATTTATCAATAAGGAATAGGT
ATCGGAGAAGGGACGTGGACCGGCCGTAAAACAAGATCGGAATCAGAAAGATTAAGCGGC
GGAAGCGAGTAAACACCGTAAGTAGAACTCCCTCTTCTCATCTCTCTCATCGTCATCAAC
GCCGCAACCGTATTCCTAAATATCCCTTCTCCCGCTGCAGCCGAACTCACCGCCGCAGAT
CTCTCGTATCCCTCCACCTCCCTAGTCAGCGCCGGAAACATCGCGTCCATTGTCGTCTCC
CACTCTCTTACAAGCCTCGACACAAGATCAGTCTTGAAAAACGGTTGACGAAGAACTTTT
TGGATAAACGGCGATCGCAATGCTCCTCCTGTTCTCTTGTCGTACTTCTTCAGGATCTTT
GCTAACCCAGTGTAGTTTATGTTGATGTAATTAACGAGAAGTACCATCTCCCCATGGAAG
TTAACAATATCCTTTCTGGTCTCACCAATCTCTTCTCTGAACATTACATCATCATTGTCT
CCACATTTTT*CTACCAATCTCTAAATCCGATATTGCAATTCCTTATGGTGGATGATGAA
ATCTTCTTCTTGCTCGACGAAG

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GCGGAATATTAAGATAATGCCATTTTTCAATATGATGTAAGGAAGTCAAACGAAAAAAAT
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AGGAATAGGTATCGGAGAAGGGACGTGGACCGGCCGTAAAACAAGATCGGAATCAGAAAG
ATTAAGCGGCGGAAGCGAGTAAACACCGTAAGTAGAACTCCCTCTTCTCATCTCTCTCAT
CGTCATCAACGCCGCAACCGTATTCCTAAATATCCCTTCTCCCGCTGCAGCCGAACTCAC
CGCCGCAGATCTCTCGTATCCCTCCACCTCCCTAGTCAGCGCCGGAAACATCGCGTCCAT
TGTCGTCTCCCACTCTCTTACAAGCCTCGACACCAGATCAGTCTTGGAAAACGTTTGACG
AAGAACTTTTTGGATAAACGGCGATCGCAATGCTCCTCCTGTTCTCTTGTCGTACTTCTT
CAGGATCTTTGCTAACCCAGTGTAGTTTATGTTGCTGTAATTAACGAGAAGTACCATCTC
CCCATGGAAGTTAACAATATCCTTTCTGATCTCACCAATCTCTTCTCTGAACATTACATC
ATCATAGTCTCCACATTTTTTCTACCAATCTCTGAATCCGATATTGCAATTCCTTATGGT
GGATGATGAAATCTTCTTCTTGCTCGACGAAAAA*GCATTAAACTTCTCAATCTCGGCGT
TCAGCAA*CAGACGAAGATAG

QA 1 861 1 861
DS 

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CTATTAAGATTTATCAATAAGGAATAGGTATCGGAGAAGGGACGTGGACCGGCCGTAAAA
CAAGATCGGAATCAGAAAGATTAAGCGGCGGAAGCGAGTAAACACCGTAAGTAGAACTCC
CTCTTCTCATCTCTCTCATCGTCATCAACGCCGCAACCGTATTCCTAAATATCCCTTCTC
CCGCTGCAGCCGAACTCACCGCCGCAGATCTCTCGTATCCCTCCACCTCCCTAGTCAGCG
CCGGAAACATCGCGTCCATTGTCGTCTCCCACTCTCTTACAAGCCTCGACACCAGATCAG
TCTTGAAAAACGGTTGACGAAGAACTTTTTGGATAAACGGCGATCGCAATGCTCCTCCTG
TTCTCTTGTCGTACTTCTTCAGGATCTTTGCTAACCCAGTGTAGTTTATGTTGCTGTAAT
TAACGAGAAGTACCATCTCCCCATGGAA*TTAACAATATCCTTTCTGATCTCACCAATCT
CTTCTCTGAACATTACATCATCATTGTCTCCACATTTTT*CTACCAATCTCTGAATCCGA
TATTGCAATTCCTTATGGTGGATGATGAAATCTTCTTCTTGCTCGACGAAGAAAGCATTA
AACTTCTCAATCTCGGCGTTCAGCAAACAGACGAAGATAGATTCAGCTGGA

QA 1 711 1 711
DS 

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ACACCGTAAGTAGAACTCCCTCTTCTCATCTCTCTCATCGTCATCAACGCCGCAACTGTA
TTCCTAAATATCCCTTCTCCCGCTGCAGCCGAACTCACCGCCGCAGATCTCTCGTATCCC
TCCACCTCCCTAGTCAGCGCCGGAAACATCGCGTCCATTGTCGTCTCCCACTCTCTTACA
AGCCTCGACACAAGATCAGTCTTGAAAAACGGTTGACGAAGAACTTTTTGGATAAACGGC
GATCGCAATGCTCCTCCTGTTCTCTTGTCGTACTTCTTCAGGATCTTTGCTAACCCAGTG
TAGTTTATGTTGATGTAATTAACGAGAAGTACCATCTCCCCATGGAAGTTAACAATATCC
TTTCTGGTCTCACCAATCTCTTCTCTGAACATTACATCATCATTGTCTCCACATTTTT*C
TACCAATCTCTAAATCCGATATTGCAATTCCTTATGGTGGATGATGAAATCTTCTTCTTG
CTCGACGAAGAAAGCATTAAACTTCTCAATCTCGGCGTTCAGCAAACAGACGAAGATAGA
TTCAGCTGGAGCAGGAGAAGAGATCAGATTCTTGAGTTCTTTGTAACGCAAAAACTTGTC
ACGCCACTCCGGCAACGACTCTTGTATCTGCTCCTTAATCCTCTTACCGAACTTCATTAA
AACAGGTGTATAT
CC

QA 1 673 1 673
DS 

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CCCTAGTCAGCGCCGGAAACATCGCGTCCATTGTCGTCTCCCACTCTCTTACAAGCCTCG
ACACCAGATCAGTCTTGGAAAACGTTTGACGAAGAACTTTTTGGATAAACGGCGATCGCA
ATGCTCCTCCTGTTCTCTTGTCGTACTTCTTCAGGATCTTTGCTAACCCAGTGTAGTTTA
TGTTGCTGTAATTAACGAGAAGTACCATCTCCCCATGGAAGTTAACAATATCCTTTCTGA
TCTCACCAATCTCTTCTCTGAACATTACATCATCATAGTCTCCACATTTTT*CTACCAAT
CTCTGAATCCGATATTGCAATTCCTTATGGTGGATGATGAAATCTTCTTCTTGCTCGACG
AAGAAAGCATTAAACTTCTCAATCTCGGCGTTCAGCAAACAGACGAAGATAGATTCAGCT
GGAGCAGGAGAAGAGATCAGATTCTTGAGTTCTTTGTAACGCAAAAACTTGTCACGCCAC
TCCGGCAACGACTCTTGTATCTGCTCCTTAATCCTCTTACCGAACTTCATTAAAACAGGT
GTATATGTTTAAATGAAGAAAGGGTAAGAAATGTATTATAATGAGATCTCC

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DS 



AS 2 6

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GAAGGAAGAGGAAAAAGAAGATGAAGATGTTGTAAATGACCAAGAAAACGAAGGACGCGA
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GCTTAGTTTGTTCCCGGAGGAAGAGGAGGAGGATGAGTAGTACGACGGAGGCGGCGTTAA
CGGTGGAAGATGAAATGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE14JQ U 71
AF RR4AS67JQ U 1
AF RR4AV75JQ U 1
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BS 464 464 RR4AV75JQ
BS 465 619 RR4AS67JQ

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QA 9 450 9 450
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QA 1 619 1 619
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GCTTAAAATAAAACACAAAACTCTTTTCACACTAAATCCTCTTTTATAACACAACGTTGA
CGTCGGCGAGTACGAACCAATCTCTTCCTCGTCTTCTTCCTTAACGTACGATCTGGAGCA
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GAAGGAAGAGGAAAAAGAAGATGAAGATGTTGTAAATGACCAAGAAAACGAAGGACGCGA
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GCTTAGTTTGTTCCCGGAGGAAGAGGAGGAGGATGAGTAGTACGACGGAGGCGGCGTTAA
CGGTGGA

QA 1 607 1 607
DS 



CO CL1356Contig2 1097 3 2 U
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AATGTCAGAAAGGTCCTCGAAGGTGGTCGTAAAAGATAACTCGCAGGTCAACACATCGTC
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ACCAAAACACCCTCTCTTCTCTGAATCATTTCATCTTCCACCGTTAACGCCGCCTCCGTC
GTACTACTCATCCTCCTCCTCTTCCTCCGGGAACAAACTAAGCAAAGTTAGAACAAAACA
AACTCGGTTCGTGAAGACCTTGTTCAACGGAAAGCATCACGTATCGCGTCCTTCGTTTTC
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TAGGTCTAAAACAGTGCATCGTGCCAACAAGTGTTACCTTTCTTGCTCCAGATCGTACGT
TAAGGAAGAAGACGAGGAAGAGATTGGTTCGTACTCGCCGACGTCAACGTTGTGTTATAA
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TCTTGATTTTAAAGATCCGTTTGTTATGTTTCTTTTTTTGTGCGATGTCAAATTTTAGTT
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GTTCACATGTTTTTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4AS67TF U 1
AF RR4CE14TF U 305
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CTTTAATTCTTCCGCAAACTTCTCTTACACTAACAAAGCATCGTTGTTCCAAAAATAGAT
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T

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DS 



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BQ
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AF RR4H021TF U 21
AF RR4EL95TF U 1
AF RR4G696TF U 235
AF RR4B159TF U 298
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ATAGATTGTGATACCGGCAGTTACAACAAAGGGTGTAGCGGTGGATTAATGGAAACAGCC
TATGAATACCTCATAGCTAATGGTGGACTCGTCGCCTTGG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4EL95TF 718 0 0
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ACCCACACAACACCCTGATGAAGAAGCAGTTCGGAGAATGGCTTCAATACCACGGAAAAT
CATATGTAGAAAAGGATGAGTGGA*GTATAGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGT
GGATTGACTATGTCAACTCCCATCACTTGTCCTTTAACTTAGCGGAAAACAGATTTGCTG
ACATGACCAACTCTGAGTTTAAGGCCAATTTTCTCGGGTTGAACACGTCTTCCTTGAGGT
TAAACAGCGACTATGTGCGGGCTTGTGAACCATCAGGCAATGTGCCGGCCGCTGTGGACT
GGAGGAAAGAAGGTGCTGTGACTCCTATTAGAGATCAAGGAAAATGCGGAGGCTGCTGGG
CTTTCGCCACAGTTTCAGCTATTGAAGGAATCAATAAGATAAACACAGGGAATTTAGTAA
CTCTCTCAGAACAACAACTCATAGATTGTGATACCGGCAGTTACAACAAAGGGTGTAGCG
GTGGATTAATGGAAACAGCCTATGAATACCTCATAGCTAATGGTGGACTCGTCGCCTTGG
ACGACTACCCATACACAGCCACAGATGGTACGGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAAAAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4G696TF 683 0 0
G
CCAGTGGATTGACTATGTCAACTCCCTCCACTTGTCCTTTAACTTAGCGGAAAACAGATT
TGCTGACATGACCAACTCTGAGTTTAAGGCCAATTTTCTCGGGTTGAATACATCTTCCTT
GAGGTTAAACAGCGACTATGTGCGGGCTTGCGAACCATCAGGCAATGTGCCGGCCGCTGT
GGACTGGAGGAAAGAAGGTGCTGTGACTCCTATTAGAGATCAAGGAAAATGCGGAGGCTG
CTGGGCTTTCGCCACAGTTTCAGCTATTGAAGGAATCAATAAGATAAACACAGGGAATTT
AGTAACTCTCTCAGAACAACAACTCATAGATTGTGATACCGGCAGTTACAACAAAGGGTG
TAGCGGTGGATTAATGGAAACAGCCTATGAATACCTCATAGCTAATGGTGGACTCGTCGC
CTTGGACGACTACCCGTACACAGCCACAGATGGTACCGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAA
AAATAATATCGTTACAATTACAGGATACCAAAAGGTAGCACCGAACGAGGAGAGCTTACA
AGTCGCTGCTGCTCAACAACCAGTGTCAGTTGGAATCGACGCTGATGGGTTTATCTTTCA
GTTCTACTCTTCTGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCAAGTCTCAACCATGCTGTGAC
TGTTGTTGGATATGGAGAAGAA

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR4B159TF 719 0 0
G
TGACATGACCAACTCTGAGTTTAAGGCCAATTTTCTCGGGTTGAACACATCTTCCTTGAG
GTTAAACAGCAACTATGTGCGGGCTTGCGAACCATCAGGCAATGTGCCGGCCGCTGTGGA
CTGGAGGAAAGAAGGTGCTGTGACTCCTATTAGAGATCAAGGAAAATGCGGAGGCTGCTG
GGCTTTCGCCACAGTTTCAGCTATTGAAGGAATCAATAAGATAAACACAGGGAATTTAGT
AACTCTCTCAGAACAACAACTCATAGATTGTGATACCGGCAGTTACAACAAAGGGTGTAG
CGGTGGATTAATGGAAACAGCCTATGAATACCTCATAGCTAATGGTGGACTCGTCGCCTT
GGACGACTACCCGTACACAGCCACAGATGGTACCGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAAAAA
TAAGATCGTTACAATTACAGGATACCAAAAGGTAGCACCGAACGAGGAGAGCTTACAAGT
CGCTGCTGCTCAACAACCAGTGTCAGTTGGAATCGACGCTGATGGTTTTATCTTTCAGTT
CTACTCTTCTGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCAAGTCTCAACCATGCTGTGACTGT
TGTTGGATATGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGGAAC
TGGTTGGGGTGAAGAAAGCTACATACGGATGGAACGTGGTTATCGTAAAGACAGGGGT

QA 2 719 2 719
DS 

RD RR4B159JQ 597 0 0
CTTGGACGACTACCCGTACACAGCCACAGATGGTACCGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAA
AAATAAGATCGTTACAATTACAGGATACCAAAAGGTAGCACCGAACGAGGAGAGCTTACA
AGTCGCTGCTGCTCAACAACCAGTGTCAGTTGGAATCGACGCTGATGGTTTTATCTTTCA
GTTTTACTTTTTTGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCAAGTTTCAACCATGCTGTGAC
TGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGG
AACTGGTTGGGGTGAAGAAGGCTACATACGGATGGAACGTGGTTATTGTAAAGACAGGGG
TAAATGTGGTATTACTATGCTGGCGAGCTATCCCTTGCAGTGAGTCCACGAACTCCAGAA
GATTAAGAGAGCCTTTTTTTTTTCGTTAACAGAGAATTAACATGAAAATTGTCTCTATAT
GACAATTTGCAATAGGGTAGCTAAAATAATTACCAATGTGAAATAAAGTACTAGAGATAA
TTGAGAACCAGGGTGCTGTTTACAGGATTCCAAAGATAAGATGTGTTTAGTCTGGAT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 6

CO CL1358Contig1 657 6 11 U
TTGTGGAGTCTCTCTCACGAGACATCGACGGAACCGAAGGTAGAGCCATCTCCGCCCGAG
AGCCGTCGTCGTCCCTATCCCACTCCGACAAGATCTCCTCTGTCACAGTCTTCGTCGATT
TCGACACCTCCTCGCCAAGTCGCCATTGTCCCTATCGTGTTACCCTAGGTCCTATTTGTT
TTCCTTTTTAAATCGACGAAATTGAAACT****TTCGTATCTAAGGGAGTTCTGAGGAGT
GGAACTATGCATGTTGACATATATTGAAAGATCAGTTTTGCAGAGGTGTGAGCTGTCACT
GTCCCATGCAACGAATAAATACTTTGTGTATGCATCGCTTGATGTTTCATCTTCAAGGTC
TCATGGAGAAAAGCTCTTCTACAGTTTACATCTTCAAATGGGAACAAAAATAATCACAAA
CTGACGTGCGAGGAGCTAAGCCAGAGAATGTTACACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCG
TTTAGATGATAATCTGTTCTTGTTTCTTTTAGTTATGTCCTCCGTTTCTCAACATCTAAA
ATTCATGTAGTCGAGTTGTTTTGTTTATTTTTCTTTTCGAAGTCAATAATCGATTATCAC
ATTTACATGCTACTGAATATTGACTGATTACTATGAAATTCAATTTACAGCAGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 10 10 10 

AF RR4FI17TF U 1
AF RR4A058JQD C 15
AF RR4FI17JQ C 116
AF RR4A058TFB U 96
AF RR4A649TF U 15
AF RR4A649JQ C 15
BS 1 54 RR4FI17TF
BS 55 55 RR4A649TF
BS 56 209 RR4FI17TF
BS 210 213 RR4A058TFB
BS 214 238 RR4FI17TF
BS 239 239 RR4A058TFB
BS 240 288 RR4FI17TF
BS 289 289 RR4A058TFB
BS 290 485 RR4FI17TF
BS 486 653 RR4A058TFB
BS 654 657 RR4A058JQD

RD RR4FI17TF 485 0 0
TTGTGGAGTCTCTCTCACGAGACATCGACGGAACCGAAGGTAGAGCCATCTCCGACCGAG
AGCCGTCGTCGTCCCTATCCCACTCCGACAAGATCTCCTCTGTCACAGTCTTCGTCGATT
TCGACACCTCCTCGCCAAGTCGCCATTGTCCCTATCGTGTTACCCTAGGTCCTATTTGTT
TTCCTTTTTAAATCGACGAAATTGAAACTACAGTTCGTATCTAAGGGAGTTCTGAGGATT
GGAACTATGCATGTTGACATATATTGAAAGATCAGTTTTGCAGAGGTGCGAGCTGTCACT
GTCCCATGCAACGAATAAATACTTTGTGTATGCATCGCTTGATGTTTCATCTTCAAGGTC
TCATGGAGAAAAGCTCTTCTACAGTTTACATCTTCAAATGGGAACAAAAATAATCACAAA
CTGACGTGCGAGGAGCTAAGCCAGAGAATGTTACACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCG
TTTAG

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4A058JQD 643 0 0
GG
ACGAGACATCGACGGAACCGAAGGTAGAGCCATCTCCGCCCGAGAGCCGTCGTCGTCCCT
ATCCCACTCCGACAAGATCTCCTCTGTCACAGTCTTCGTCGATTTCGACACCTCCTCGCC
AAGTCGCCATTGTCCCTATCGTGTTACCCTAGGTCCTATTTGTTTTCCTTTTTAAATCGA
CGAAATTGAAACT****TTCGTATCTAAGGGAGTTCTGAGGAGTGGAACTATGCATGTTG
ACATATATTGAAAGATCAGTTTTGCAGAGGTGTGAGCTGTCACTGTCCCATGCAACGAAT
AAATACTTTGTGTATGCATCGCTTGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAAGCTC
TTCTACAGTTTACATCTTCAAATGGGAACAAAAATAATCACAAACTGACGTGCGAGGAGC
TAAGCCAGAGAATGTTACACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTG
TTCTTGTTTCTTTTAGTTATGTCCTCCGTTTCTCAACATCTAAAATTCATGTAGTCGAGT
TGTTTTGTTTATTTTTCTTTTCGAAGTCAATAATCGATTATCACATTTACATGCTACTGA
ATATTGACTGATTACTATGAAATTCAATTTACAGCAGAAGC

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4FI17JQ 539 0 0
CGATTTCGACACCTCCTCGCCAAGTCGCCATTGTCCCTATCGTGTTACCCTAGGTCCTAT
TTGTTTTCCTTTTTAAATCGACGAAATTGAAACTACAGTTCGTATCTAAGGGAGTTCTGA
GGATTGGAACTATGCATGTTGACATATATTGAAAGATCAGTTTTGCAGAGGTGCGAGCTG
TCACTGTCCCATGCAACGAATAAATACTTTGTGTATGCATCGCTTGATGTTTCATCTTCA
AGGTCTCATGGAGAAAAGCTTTTCTACAGTTTACATCTTCAAATGGGAACAAAAATAATC
ACAAACTGACGTGCGAGGAGCTAAGCCAGAGAATGTTACACTTGTATGAGGAATGTGGAA
ACTCGTTTAGATGATAATCTGTTCTTGTTTCTTTTAGTTATGTCCTCCGTTTCTCAACAT
CTAAAATTCATGTAGTCGAGTTGTTTTGTTTATTTTTCTTTTCGAAGTAAATAATCGATT
ATCACATTTACATGCTACTGAATATTGACTGATTACTATGAAATTCAATTTACAGCAG
G

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4A058TFB 562 0 0
TCCTCTGTCACAGTCTTCGTCGATTTCGACACCTCCTCGCCAAGTCGCCATTGTCCCTAT
CGTGTTACCCTAGGTCCTATTTGTTTTCCTTTTTAAATCGACGAAATTGAAACT****TT
CGTATCTAAGGGAGTTCTGAGGAGTGGAACTATGCATGTTGACATATATTGAAAGATCAG
TTTTGCAGAGGTGTGAGCTGTCACTGTCCCATGCAACGAATAAATACTTTGTGTATGCAT
CGCTTGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAAGCTCTTCTACAGTTTACATCTTC
AAATGGGAACAAAAATAATCACAAACTGACGTGCGAGGAGCTAAGCCAGAGAATGTTACA
CTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTGTTCTTGTTTCTTTTAGTTA
TGTCCTCCGTTTCTCAACATCTAAAATTCATGTAGTCGAGTTGTTTTGTTTATTTTTCTT
TTCGAAGTCAATAATCGATTATCACATTTACATGCTACTGAATATTGACTGATTACTATG
AAATTCAATTTACAGCAG
AAGC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4A649TF 637 0 0
GG
ACGAGACATCGACGGAACCGAAGGTAGAGCCATCTCCGCCCGAGAGCCGTCGTCGTCCCT
ATCCCACTCCGACAAGATCTCCTCTGTCACAGTCTTCGTCGATTTCGACACCTCCTCGCC
AAGTCGCCATTGTCCCTATCGTGTTACCCTAGGTCCTATTTGTTTTCCTTTTTAAATCGA
CGAAATTGAAACT****TTCGTATCTAAGGGAGTTCTGAGGAGTGGAACTATGCATGTTG
ACATATATTGAAAGATCAGTTTTGCAGAGGTGTGAGCTGTCACTGTCCCATGCAACGAAT
AAATACTTTGTGTATGCATCGCTTGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAAGCTC
TTCTACAGTTTACATCTTCAAATGGGAACAAAAATAATCACAAACTGACGTGCGAGGAGC
TAAGCCAGAGAATGTTACACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTG
TTCTTGTTTCTTTTAGTTATGTCCTCCGTTTCTCAACATCTAAAATTCATGTAGTCGAGT
TGTTTTGTTTATTTTTCTTTTCGAAGTCAATAATCGATTATCACATTTACATGCTACTGA
ATATTGACTGATTACTATGAAATTCAATTTACAGC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR4A649JQ 643 0 0
GG
ACGAGACATCGACGGAACCGAAGGTAGAGCCATCTCCGCCCGAGAGCCGTCGTCGTCCCT
ATCCCACTCCGACAAGATCTCCTCTGTCACAGTCTTCGTCGATTTCGACACCTCCTCGCC
AAGTCGCCATTGTCCCTATCGTGTTACCCTAGGTCCTATTTGTTTTCCTTTTTAAATCGA
CGAAATTGAAACT****TTCGTATCTAAGGGAGTTCTGAGGAGTGGAACTATGCATGTTG
ACATATATTGAAAGATCAGTTTTGCAGAGGTGTGAGCTGTCACTGTCCCATGCAACGAAT
AAATACTTTGTGTATGCATCGCTTGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAAGCTC
TTCTACAGTTTACATCTTCAAATGGGAACAAAAATAATCACAAACTGACGTGCGAGGAGC
TAAGCCAGAGAATGTTACACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTG
TTCTTGTTTCTTTTAGTTATGTCCTCCGTTTCTCAACATCTAAAATTCATGTAGTCGAGT
TGTTTTGTTTATTTTTCTTTTCGAAGTCAATAATCGATTATCACATTTACATGCTACTGA
ATATTGACTGATTACTATGAAATTCAATTTACAGCAG
AAGC

QA 3 639 3 639
DS 



AS 2 6

CO CL1359Contig1 1011 3 11 U
GGAAGAGAGTCAGAGAGATCGAAAATGGTGACAAATACTGAAGTGGTATCTCCCGCGAGC
AACGGCGTTGACGGAGGATGTTGCAAGTCAGGTCCTGGTTACGCGACGCCACTCGCCGCC
ATGTCTGGTCCATCGGAAAAGCTCATCTACGTCACCGCCGTCTACAGTGGAACGGGACGA
GAGAAGCCTGATTACTTGGCAACAGTAGATGTTGATCCAAACTCACCAACATATTCAACC
GTCATCCACAGATTACCAATGCCTTTTCTGGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAAC
TCTTGCAGCTCTTGCCATGGTGATGCTTCCGCCGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCC
CTTATATCTGGTCGCATCTATGCGATTGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCTTTG
TACAAGTACGTGGATCCTAAAGAGATCGCTGATAAGACTGGACTGGCTTATCCACACACT
GCTCATTGTCTCGCCTCTGGTGAAATCTTGGTGTCCTGTCTTGGAGACGAAGAGGGAAAC
GCCAAGGGGAATGGGTTTCTTCTTCTCGACTCTGATTTCAACATCAAGAGCAGGTGGGAG
AAAGAAGGACATAGTCCCTTGTTCGGTTATGATTTCTGGTATCAACCCCGGCACAAGACG
ATGATAAGCACTTCTTGGGGAGCACCTAAAGCCTTCACCAAAGGTTTCGATCTCCAACAC
GTTGCTGATGGCTTATACGGAAGTCATCTCCATGTTTACAGTTGGCCTGGAGGTGAAATG
AAACAATTAATTGACCTTGGACCAACTGGCATGTTACCTCTAGAGATAAGATTCTTGCAT
GATCCGTCTAAAGATACAGGGTATGTTGGGGGTGCTCTGTCGAGTAATATGATAAGATTT
TTCAAAACAGTGATGAAACATGGGGCCATGAGTGGTTATCCAAGTTAAACCACTGAAAGT
AGAGAACTGGATCTACAAAATGCCGGGCTTATCACCGACTTCTTGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY31TF U 1
AF RR4GD77TF U 15
AF RR4CN83TF U 256
BS 1 152 RR4BY31TF
BS 153 155 RR4GD77TF
BS 156 251 RR4BY31TF
BS 252 252 RR4GD77TF
BS 253 682 RR4BY31TF
BS 683 692 RR4GD77TF
BS 693 693 RR4CN83TF
BS 694 703 RR4GD77TF
BS 704 704 RR4CN83TF
BS 705 729 RR4GD77TF
BS 730 1011 RR4CN83TF

RD RR4BY31TF 682 0 0
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AACGGCGTTGACGGAGGATGTTGCAAGTCAGGTCCTGGTTACGCGACGCCACTCGCCGCC
ATGTCTGGTCCATCGGAAAAGCTCATCTACGT***CGCCGTCTACAGTGGAACGGGACGA
GAGAAGCCTGATTACTTGGCAACAGTAGATGTTGATCCAAACTCACCAACATATTCAACC
GTCATCCACAGGTTACCAATGCCTTTTCTGGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAAC
TCTTGCAGCTCTTGCCATGGTGATGCTTCCGCCGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCC
CTTATATCTGGTCGCATCTATGCGATTGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCTTTG
TACAAGTACGTGGATCCTAAAGAGATCGCTGATAAGACTGGACTGGCTTATCCACACACT
GCTCATTGTCTCGCCTCTGGTGAAATCTTGGTGTCCTGTCTTGGAGACGAAGAGGGAAAC
GCCAAGGGGAATGGGTTTCTTCTTCTCGACTCTGATTTCAACATCAAGAGCAGGTGGGAG
AAAGAAGGACATAGTCCCTTGTTCGGTTATGATTTCTGGTATCAACCCCGGCACAAGACG
ATGATAAGCACTTCTTGGGGAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4GD77TF 715 0 0
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AGGATGTTGCAAGTCATGTCCTGGTTACGCGACGCCACTCGCCGCCATGTCTGGTCCATC
GGAAAAGCTCATCTACGTCACCGCCGTCTACAGTGGAACGGGACGAGAGAAGCCTGATTA
CTTGGCAACAGTAGATGTTGATCCAAACTCACCAACATATTCAACCGTCATCCACAGATT
ACCAATGCCTTTTCTGGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAACTCTTGCAGCTCTTG
CCATGGTGATGCTTCCGCCGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCCCTTATATCTGGTCG
CATCTATGCGATTGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCTTTGTACAAGTACGTGGA
TCCTAAAGAGATCGCTGATAAGACTGGACTGGCCTATCCACACACTGCTCATTGTCTCGC
CTCTGGTGAAATCTTGGTGTCCTGTCTTGGAGACGAAGAGGGAAACGCCAAGGGGAATGG
GTTTCTTCTTCTCGACTCTGATTTCAACATCAAGAGCAGGTGGGAGAAAGAAGGACATAG
TCCCTTGTTCGGTTATGATTTCTGGTATCAACCCCGGCACAAGACGATGATAAGCACTTC
TTGGGGAGCACCTAAAGC*TTCACCAAAG*TTTCGATCTCCAACACGTTGCTGAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CN83TF 756 0 0
CCAATGCCTTTTCTGGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAACTCTTGCAGCTCTTGC
CATGGTGATGCTTCCGCCGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCCCTTATATCTGGTCGC
ATCTATGCGATTGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCTTTGTACAAGTACGTGGAT
CCTAAAGAGATCGCTGATAAGACTGGACTGGCTTATCCACACACTGCTCATTGTCTCGCC
TCTGGTGAAATCTTGGTGTCCTGTCTTGGAGACGAAGAGGGAAACGCCAAGGGGAATGGG
TTTCTTCTTCTCGACTCTGATTTCAACATCAAGAGCAGGTGGGAGAAAGAAGGACATAGT
CCCTTGTTCGGTTATGATTTCTGGTATCAACCCCGGCACAAGACGATGATAAGCACTTCT
TGGGGAGCACCTAAAGCCTTCACCAAAGGTTTCGATCTCCAACACGTTGCTGATGGCTTA
TACGGAAGTCATCTCCATGTTTACAGTTGGCCTGGAGGTGAAATGAAACAATTAATTGAC
CTTGGACCAACTGGCATGTTACCTCTAGAGATAAGATTCTTGCATGATCCGTCTAAAGAT
ACAGGGTATGTTGGGGGTGCTCTGTCGAGTAATATGATAAGATTTTTCAAAACAGTGATG
AAACATGGGGCCATGAGTGGTTATCCAAGTTAAACCACTGAAAGTAGAGAACTGGATCTA
CAAAATGCCGGGCTTATCACCGACTTCTTGATCTCC

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL1359Contig2 802 3 15 U
GCACCGAATAGTGTGTTACTCGAAATGTAGAAAGTTTTATTACAAAGCATTATTAGCCAC
AAGGAGGCCAACTTTACGAACAAAGTATAAATTGTCTACACACCATCAACACACGAAATA
TAGGGGACCTCTTATTACTTACGCTTTTTATTCAACAAACTAATAAAAACTCAGTTTAAG
CGTAGCACAACAACTCACCATATAAACAGGCCAGACTCAAATCCAAATATCGGAAGTGCA
GTCTCCACCTGGATACCTCATCTCATGGGCAAGCGCAGGACCCTCTGGTTCATCACCAAA
GTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGGAGAGACCACCTTTCTCTGTATCAACATCAAGCTG
TATTATGTGTGATCCTTTATCCATGAGTTCCGGGTAAAATTGACGATCCCGTGCACTATA
GAGCGAGTTTGTTGCATACAATCGTTTCCCATCGAGGCTCAGATGGATCATTTGAGGTCC
TCCTCTTAGAGATTTCCCCTTGATCTGAGGAACATCATATTGGAAAGTGTTACCGTCTTC
TCCAACCGCCTTAACAGGACTGCCCTTTTGTAGTAATCCTCCCACCCATATTTGTCCGGT
TAAGACAGGGTTTTCAGGGTCTTCAATGTTGTACTGACGAATGTCTCCATGAAGCCAGTT
CACAAAGTAGAGGAACCGGTCATCGAGGGAGATCAAGAAGTCGGTGATAAGCCCCGGCAT
TTCTGGTAGAATCCAGTTCTCTACTTTCAGTGGTTTAACTTGGATAACCACCTCATGGCC
CCATGTTTCATCACTGTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CN83JQ U 1
AF RR4BY31JQ U 27
AF RR4C656JQ U 31
BS 1 96 RR4CN83JQ
BS 97 97 RR4BY31JQ
BS 98 112 RR4CN83JQ
BS 113 113 RR4BY31JQ
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BS 411 411 RR4BY31JQ
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BS 772 792 RR4BY31JQ
BS 793 802 RR4C656JQ

RD RR4CN83JQ 773 0 0
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GTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGGAGAGACCACCTTTCTCTGTATCAACATCAAGCTG
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TCCAACCGCCTTAACAGGACTGCCCTTTTGTAGTAATCCTCCCACCCATATTTGTCCGGT
TAAGACAGGGTTTTCAGGGTCTTCAATGTTGTACTGACGAATGTCTCCATGAAGCCAGTT
CACAAAGTAGAGGAACCGGTCATCGAGGGAGATCAAGAAGTCGGTGATAAGCCCCGGCAT
TTCTGGTAGAATCCAGTTCTCTACTTTCAGTGGTTTAACTTGGATAACCAC
CT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4BY31JQ 766 0 0
GTAG
AAAGTTTTATTACAAAGCATTATTAGCCACAAGGAGGCCAACTTTACGAACAAAGTATAA
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TTCAACAAACTAATAAAAACTCAGTTTAAGCGTAGCACAACAACTCACCATATAAACAGG
CCAGACTCAAATCCAAATATCGGAAGTGCAGTCTCCACCTGGATACCTCATCTCATGGGC
AAGCGCAGGACCCTCTGGTTCATCACCAAAGTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGGAGAG
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TGGTTTAACTTGGATAACCACCTCATGGCCCCATGTTTCATC

QA 5 766 5 766
DS 

RD RR4C656JQ 772 0 0
AAAGTTTTATTACAAAGCATTATTAGCCACAAGGAGGCCAACTTTACGAACAAAGTATAA
ATTGTCTACACACCATCAACACACGAAATATAGGGGACCTCTTATTACTTACGCTTTTTA
TTCAACAAACTAATAAAAACTCAGTTTAAGCGTAGCACAACAACTCACCATATAAACAGG
CCAGACTCAAATCCAAATATCGGAAGTGCAGTCTCCACCTGGATACCTCATCTCATGGGC
AAGCGCAGGACCCTCTGGTTCATCACCAAAGTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGGAGAG
ACCACCTTTCTCTGTATCAACATCAAGCTGTATTATGTGTGATCCTTTATCCATGAGTTC
CGGGTAAAATTGACGATCCCGTGCACTATAGAGCGAGTTTGTTGCATACAATCGTTTCCC
ATCGAGGCTCAGATGGATCATTTGAGGTCCTCCTCTTAGAGATTTCCCCTTGATCTGAGG
AACATCATATTGGAAAGTGTTACCGTCTTCTCCAACCGCCTTAACAGGACTGCCCTTTTG
TAGTAATCCTCCCACCCATATTTGTCCGGTTAAGACAGGGTTTTCAGGGTCTTCAATGTT
GTACTGACGAATGTCTCCATGAAGCCAGTTCACAAAGTAGAGGAACCGGTCATCGAGGGA
GATCAAGAAGTCGGTGATAAGCCCCGGCATTTCTGGTAGAATCCAGTTCTCTACTTTCAG
TGGTTTAACTTGGATAACCACCTCATGGCCCCATGTTTCATCACTGTTTTTG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 6

CO CL1360Contig1 1068 6 2 U
GCTTGGTGCAGCTAAAGGTCTTGCCTTTCTTCATGAGGAAGCTGAGAAGCCTGTCATTTA
CCGCGATTTCAAAACATCCAACATCTTACTAGACGCTGAATTAACTCAAAGCTCTCTGAT
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GATGTATACAGCTTTGGAGTAGTTCTACTTGATATACTAACTGGACGAAGAGCCGTGGAT
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AAAAAGAAGTTTTACAGACTGTTAGATCCTCGCTTAGAGGGTCATTTCTCGATCAAGGGA
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GCTTCTACGTCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGACACAGGGA
GGAGGAGGAGGGTTCGTGTCGAGAAATGGACAGCAGCCTTTGAGGAGTTTGTCTAGTTTA
AACCTGCCTCAAGCTTCTCCTTAT*CGGAATGCGAGGCAATCACCAAAGCCTAATAAAGG
GAAAGAGCAATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGATTGAAGCTGGATGT
TCCAGGCTTCCAGGCTTCATGTTGCATCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAGAT
GGTCTGTGGATGGATCCAGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAAAA**
TATCTTTGGTCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTATGTGTAGAAGAAAT
GTAAAGGTTGAGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAAA
CATATGTTTACCCCTGTAATATATGTGTCCTGCTATGTATTGAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4BR13TF U 1
AF RR4BR13JQ C 413
AF RR4A161TF U 428
AF RR4A161TFB U 428
AF RR4A161JQD C 543
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BS 1 639 RR4BR13TF
BS 640 1068 RR4A161TF

RD RR4BR13TF 639 0 0
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CCGCGATTTCAAAACATCCAACATCTTACTAGACGCTGAATTAACTCAAAGCTCTCTGAT
TTTGGGCTAGCTAAAGATGCACCAGACGAGAAGAAATCGCATGTATCAACCAGAGTCATG
GGAACATATGGTTATGCAGCTCCTGAATATGTAATGACTGGACATTTGACAACGAAGAGT
GATGTATACAGCTTTGGAGTAGTTCTACTTGATATACTAACTGGACGAAGAGCCGTGGAT
AAAAGCCGTCCCAACGGTGAACAGAACTTGGTGGAATGGGTGAAACCTCATCTTCTAGAC
AAAAAGAAGTTTTACAGACTGTTAGATCCTCGCTTAGAGGGTCATTTCTCGATCAAGGGA
GCTCAGAAAGCCACGCAAGTAGCCGCACAGTGTCTTAACAGAGACTCCAAAGCTAGACCG
AAGATGAGCGAAGTTGTGGAAGCGTTAAAGCCGTTGCCAAGTCTTAAAGACTTTGCTAGC
GCTTCTACGTCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGACACAGGGA
GGAGGAGGAGGGTTCGTGTCGAGAAATGGACAGCAGCCT

QA 1 639 1 639
DS 

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CTAGACCGAAGATGAGCGAAGTTGTGGAAGCGTTAAAGCCGTTGCCAAGTCTTAAAGACT
TTGCTAGCGCTTCTACGTCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGA
CACAGGGAGGAGGAGGAGGGTTCGTGTCGAGAAATGGACAGCAGCCTTTGAGGAGTTTGT
CTAGTTTAAACCTGCCTCAAGCTTCTCCTTATTCGTAATGCGAGGCAATCACCAAAGCCT
AATAAAGGGAAAGAGCAATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGATTGAAG
CTGGATGTTCCAGGCTTCCAGGCTTCATGTTGCATCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAA
AAAGAGATGGTCTGTGGATGGATCCTGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAA
AAAAAAAATATCTTTGGTCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTATGGGTA
GAAGAAATGTAAAGGTTGAGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATATATAAAACCTGTTTGTC
TGTAAAAACATATGTTTACCCCTGTAATATATGTGTCCTGC

QA 1 641 1 641
DS 

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GG
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GAAGTTGTGGAAGCGTTAAAGCCGTTGCCAAGTCTTAAAGACTTTGCTAGCTCTTCTACG
TCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGACACAGGGAGGAGGAGGA
GGGTTCGTGTCGAGAAATGGACAGCAGCCTTTGAGGAGTTTGTCTAGTTTAAACCTGCCT
CAAGCTTCTCCTTAT*CGGAATGCGAGGCAATCACCAAAGCCTAATAAAGGGAAAGAGCA
ATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGATTGAAGCTGGATGTTCCAGGCTT
CCAGGCTTCATGTTGCATCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAGATGGTCTGTGG
ATGGATCCAGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAAAA**TATCTTTGG
TCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTATGTGTAGAAGAAATGTAAAGGTT
GAGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAAACATATGTTT
ACCCCTGTAATATATGTGTCCTGCTATGTATTGAATTCC

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR4A161TFB 641 0 0
GG
GCCACGCAAGTAGCCGCACAGTGTCTTAACAGAGACTCCAAAGCTAGACCGAAGATGAGC
GAAGTTGTGGAAGCGTTAAAGCCGTTGCCAAGTCTTAAAGACTTTGCTAGCTCTTCTACG
TCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGACACAGGGAGGAGGAGGA
GGGTTCGTGTCGAGAAATGGACAGCAGCCTTTGAGGAGTTTGTCTAGTTTAAACCTGCCT
CAAGCTTCTCCTTAT*CGGAATGCGAGGCAATCACCAAAGCCTAATAAAGGGAAAGAGCA
ATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGATTGAAGCTGGATGTTCCAGGCTT
CCAGGCTTCATGTTGCATCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAGATGGTCTGTGG
ATGGATCCAGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAAAA**TATCTTTGG
TCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTATGTGTAGAAGAAATGTAAAGGTT
GAGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAAACATATGTTT
ACCCCTGTAATATATGTGTCCTGCTATGTATTGAATTCC

QA 3 641 3 641
DS 

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TTT
TACGTCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGACACAGGGAGGAGG
AGGAGGGTTCGTGTCGAGAAATGGACAGCAGCCTTTGAGGAGTTTGTCTAGTTTAAACCT
GCCTCAAGCTTCTCCTTAT*CGGAATGCGAGGCAATCACCAAAGCCTAATAAAGGGAAAG
AGCAATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGATTGAAGCTGGATGTTCCAG
GCTTCCAGGCTTCATGTTGCATCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAGATGGTCT
GTGGATGGATCCAGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAAAA**TATCT
TTGGTCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTATGTGTAGAAGAAATGTAAA
GGTTGAGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAAACATAT
GTTTACCCCTGTAATATATGTGTCCTGCTATGTATTGAATTCC

QA 4 526 4 526
DS 

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ATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTTAGGACACAGGGAGGAGGAGGAGGGTTCGTGTCG
AGAAATGGACAGCAGCCTTTGAGGAGTTTGTCTAGTTTAAACCTGCCTCAAGCTTCTCCT
TAT*CGGAATGCGAGGCAATCACCAAAGCCTAATAAAGGGAAAGAGCAATGACTCAAGTA
TAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGATTGAAGCTGGATGTTCCAGGCTTCCAGGCTTCATG
TTGCATCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAGATGGTCTGTGGATGGATCCAGGT
TTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAAAA**TATCTTTGGTCCTGAAGGTCT
AAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTATGTGTAGAAGAAATGTAAAGGTTGAGAGTGTAAAG
TTCTTGCAAGGATATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAAACATATGTTTACCCCTGTAATA
TATGTGTCCTGCTATGTATTGAATTCC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 5

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GGGTATGTTCAAAGAAGATAGATAGATAGAGAACAAGACTGAGAGAGAAAACAAAAAAAA
TAAAAAGACAGTGTTAAATCTACACTCTTCCTTGGTGGAGTTTGAATCTATCCATTTATA
TATCTTGTGAGAGAGAGAAGAAAAATATCAAAACTTTAATTTTATTTCTCTCTGTTTTAC
CTAAAAGTTTCTGTCTTTGGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGTGATTATTGTATTGTGG
AAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTTCTTAAAGTATTGTGTGATGG
AAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTGCAATGGG
GGGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTCAACTG
ATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGAGGCTCTC
CTTCTCGTCATCTTAACCGCCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAATGTGAGGAGAT
CGTTTGTGGCGTCGCCAGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAACGAGGGGTTCAATGGGTA
CAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAAGAACCTGTGAAGGAGACCAAGAAGCATGTGTGGC
CAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAGGAAGAAGATTTCTTGGCTATGAAGG
GGTGTAAGCTTCCTCAAATACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGAAGACATTGCTTC
TGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTTTGCAAAGAGAGGTATGAAGTAAGGGAGA
AAAAGACTTCAAAGAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAAAGCGATT
CAGAGTGAAGAAGAGTTGAACTAAAGAAACATTCAAGATTTTGGTGTGAAGGCACAAGAA
TCTGTTTTGTATCTTTCATTGCATTTTGAGATGCTCTCTCTCTCTCTTCATCACATGTCA
ACAACTATGAGGCATTTGTATTTTTTTCCTGAATGTTTTACTTTTTGAAGCTAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G104TF U 1
AF RR4G343TF U 1
AF RR4D148TF U 49
AF RR4G104JQ C 464
AF RR4G343JQ C 518
BS 1 555 RR4G104TF
BS 556 695 RR4G343TF
BS 696 1049 RR4G104JQ
BS 1050 1074 RR4G343JQ

RD RR4G104TF 555 0 0
GGGTATGTTCAAAGAAGATAGATAGATAGAGAACAAGACTGAGAGAGAAAACAAAAAAAA
TAAAAAGACAGTGTTAAATCTACACTCTTCCTTGGTGGAGTTTGAATCTATCCATTTATA
TATCTTGTGAGAGAGAGAAGAAAAATATCAAAACTTTAATTTTATTTCTCTCTGTTTTAC
CTAAAAGTTTCTGTCTTTGGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGTGATTATTGTATTGTGG
AAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTTCTTAAAGTATTGTGTGATGG
AAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTGCAATGGG
GGGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTCAACTG
ATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGAGGCTCTC
CTTCTCGTCATCTTAACCGCCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAATGTGAGGAGAT
CGTTTGTGGCGTCGC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4G343TF 695 0 0
GGGTATGTTCAAAGAAGATAGATAGATAGAGAACAAGACTGAGAGAGAAAACAAAAAAAA
TAAAAAGACAGTGTTAAATCTACACTCTTCCTTGGTGGAGTTTGAATCTATCCATTTATA
TATCTTGTGAGAGAGAGAAGAAAAATATCAAAACTTTAATTTTATTTCTCTCTGTTTTAC
CTAAAAGTTTCTGTCTTTGGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGTGATTATTGTATTGTGG
AAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTTCTTAAAGTATTGTGTGATGG
AAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTGCAATGGG
GGGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTCAACTG
ATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGAGGCTCTC
CTTCTCGTCATCTTAACCGCCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAATGTGAGGAGAT
CGTTTGTGGCGTCGCCAGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAACGAGGGGTTCAATGGGTA
CAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAAGAACCTGTGAAGGAGACCAAGAAGCATGTGTGGC
CAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4D148TF 644 0 0
GGGAC
AAAAAAATAAAAAGACAGTGTTAAATCTACACTCTTCCTTGGTGGAGTTTGAATCTATCC
ATTTATATATCTTGTGAGAGAGAGAAGAAAAATATCAAAACTTTAATTTTATTTCTCTCT
GTTTTACCTAAAAGTTTCTGTCTTTGGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGTGATTATTGT
ATTGTGGAAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTTCTTAAAGTATTGT
GTGATGGAAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTG
CAATGGGGGGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAG
TCAACTGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGA
GGCTCTCCTTCTCGTCATCTTAACCGCCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAATGTG
AGGAGATCGTTTGTGGCGTCGCCAGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAACGAGGGGTTCA
ATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAAGAACCTGTGAAGGAGACCAAGAAGCAT
GTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAG

QA 6 644 6 644
DS 

RD RR4G104JQ 586 0 0
TTCTGAGAGAGGCTCTCCTTCTCGTCATCTTAACCGCCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCC
TGGTAATGTGAGGAGATCGTTTGTGGCGTCGCCAGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAAC
GAGGGGTTCAATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAAGAACCTGTGAAGGAGAC
CAAGAAGCATGTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAGGAAGAAGA
TTTCTTGGCTATGAAGGGGTGTAAGCTTCCTCAAATACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGT
TCAGAAGACATTGCTTCTGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTTTGCAAAGAGAG
GTATGAAGTAAGGGAGAAAAAGACTTCAAAGAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGG
GAGCATGGAAAGCGATTCAGAGTGAAGAAGAGTTGAACTAAAGAAACATTCAAGATTTTG
GTGTGAAGGCACAAGAATCTGTTTTGTATCTTTCATTGCATTTTGAGATGCTCTCTCTCT
CTCTTCATCACATGTCAACAACTATGAGGCATTTGTATTTTTTTCC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4G343JQ 557 0 0
TTCTCCTGGTAATGTGAGGAGATCGTTTGTGGCGTCGCCAGAGAAGGAAGATAGGTACTA
CACAACGAGGGGTTCAATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAAGAACCTGTGAA
GGAGACCAAGAAGCATGTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAGGA
AGAAGATTTCTTGGCTATGAAGGGGTGTAAGCTTCCTCAAATACCCAAGAAACGAGCCAA
ATTGGTTCAGAAGACATTGCTTCTGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTTTGCAA
AGAGAGGTATGAAGTAAGGGAGAAAAAGACTTCAAAGAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGC
AATGGGGAGCATGGAAAGCGATTCAGAGTGAAGAAGAGTTGAACTAAAGAAACATTCAAG
ATTTTGGTGTGAAGGCACAAGAATCTGTTTTGTATCTTTCATTGCATTTTGAGATGCTCT
CTCTCTCTCTTCATCACATGTCAACAACTATGAGGCATTTGTATTTTTTTCCTGAATGTT
TTACTTTTTGAAGCTAA

QA 1 557 1 557
DS 



AS 2 6

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GGGACAAACCATGAAAATCTTATTAAATGACGAAATTACATTTCTCAAAGGCTCGTAATT
TCGATTATAACCATATAGATAGCCTTTGATAAGAAGTATATATGTACATCATACATCATA
CATCATACATGAGAATGAAATCTTTAACTTCACAGTTCCTCTAGATTCAGATATGAAAAC
CAAGAGGATAATCTTGAGGTCGTTTCTCTACTAATTCCTTTAAACCAAGTTCTTGCTCCT
CGAGATTTTTTGTCTTAACATCATACACATCGTTAAACAACTCTGTCAATGGCTGCTTCT
CCCACTTCTCCGCCGCCTGAATCGCTTGTAGAAGCTGTTTTCTTGTGCTAGATCTTAGCT
TGGACTCATCTTCCTCGCTCCACCATCCATTATCCTCCACCCATTTCTTGAACCTATTCA
CAGGGTTTCTCGACATTTTCCAGTACTGGATTTCATCGGCTTCCCTGTACTTAGTTGAAT
CATCTGATGTGGAATGATGTCCTACTCTATATGTCATCGCCTCGATGAGGACAGGCCTTT
GTTCTGTAACAGCCATCTCTCTAGCTGAGCGTACCGCGCTGTAAACCGCAAGAGCATCGT
TACCATCCACTCGGATGCTTCGGATCCCGTAAGCATGACCTTTCACAACAATTCCATCAA
TTCTGAATTGTTCTGAGATATGAGTGCTGATAGCCCAACCGTTGTTCCGACATATAAACA
CCACCGGAGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C133JQ U 2
AF RR4DE30JQ U 1
BS 1 634 RR4DE30JQ
BS 635 635 RR4C133JQ
BS 636 659 RR4DE30JQ
BS 660 660 RR4C133JQ
BS 661 730 RR4DE30JQ

RD RR4C133JQ 712 0 0
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CGATTATAACCATATAGATAGCCTTTGATAAGAAGTATATATGTACATCATACATCATAC
ATCATACATGAGAATGAAATCTTTAACTTCACAGTTCCTCTAGATTCAGATATGAAAACC
AAGAGGATAATCTTGAGGTCGTTTCTCTACTAATTCCTTTAAACCAAGTTCTTGCTCCTC
GAGATTTTTTGTCTTAACATCATACACATCGTTAAACAACTCTGTCAATGGTTGTTTCTC
CCACTTCTCCGCCGCCTGAATCGCTTGTAGAAGCTGTTTTCTTGTGCTAGATCTTAGCTT
GGACTCATCTTCCTCGCTCCACCATCCATTATCCTCCACCCATTTCTTGAACCTATTCAC
AGGGTTTCTCGACATTTTCCAGTACTGGATTTCATCGGCTTCCCTGTACTTAGTTGAATC
ATCTGATGTGGAATGATGTCCTACTCTATATGTCATCGCCTCGATGAGGACAGGCCTTTG
TTCTGTAACAGCCATCTCTCTAGCTGAGCGTACCGCGCTGTAAACCGCAAGAGCATCGTT
ACCATCCACTCGGATGCTTCGGATCCCGTAAGCATGACCTTTCACAACAATTCCATCAAT
TCTGAATTGTTCTGAGATATGAGTGCTGATAGCCCAACCGTTGTTCCGACA
C

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DE30JQ 730 0 0
GGGACAAACCATGAAAATCTTATTAAATGACGAAATTACATTTCTCAAAGGCTCGTAATT
TCGATTATAACCATATAGATAGCCTTTGATAAGAAGTATATATGTACATCATACATCATA
CATCATACATGAGAATGAAATCTTTAACTTCACAGTTCCTCTAGATTCAGATATGAAAAC
CAAGAGGATAATCTTGAGGTCGTTTCTCTACTAATTCCTTTAAACCAAGTTCTTGCTCCT
CGAGATTTTTTGTCTTAACATCATACACATCGTTAAACAACTCTGTCAATGGCTGCTTCT
CCCACTTCTCCGCCGCCTGAATCGCTTGTAGAAGCTGTTTTCTTGTGCTAGATCTTAGCT
TGGACTCATCTTCCTCGCTCCACCATCCATTATCCTCCACCCATTTCTTGAACCTATTCA
CAGGGTTTCTCGACATTTTCCAGTACTGGATTTCATCGGCTTCCCTGTACTTAGTTGAAT
CATCTGATGTGGAATGATGTCCTACTCTATATGTCATCGCCTCGATGAGGACAGGCCTTT
GTTCTGTAACAGCCATCTCTCTAGCTGAGCGTACCGCGCTGTAAACCGCAAGAGCATCGT
TACCATCCACTCGGATGCTTCGGATCCCGTAAGCTTGACCTTTCACAACAATTCCATCAC
TTCTGAATTGTTCTGAGATATGAGTGCTGATAGCCCAACCGTTGTTCCGACATATAAACA
CCACCGGAGC

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL1362Contig2 955 4 17 U
GGATCTAACCAACACAACTACTTCACTGTCTCATCTCCAATCGCCACACAGCTTCCTCAA
GCTGCCGTAGTTGGTTATGCTCTGAAGATGGAGAAGAAGAACGCTTGTGCAGTAACATTC
ATTGGAGACGGTGGCACAAGCGAGGGAGATTTTCACGCCGGGTTGAATTTCGCGGCGGTG
ATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATATGTCGGAACAACGGTTGGGCTATCAGCACTCATATC
TCAGAACAATTCAGAAGTGATGGAATTGTTGTGAAAGGTCAAGCTTACGGAATCCGAAGC
ATCCGAGTGGATGGTAACGATGCTCTTGCGGTTTACAGCGCGGTACGCTCAGCTAGAGAG
ATGGCTGTTACAGAACAAAGACCTGTCCTCATCGAGGCGATGACATATAGAGTAGGACAT
CATTCCACATCAGATGATTCAACTAAGTACAGGGAAGCCGATGAAATCCAGTACTGGAAA
ATGTCGAGAAACCCTGTTAATAGGTTCAAGAAATGGGTGGAGGATAATGGATGGTGGAGC
GAAGAAGATGAATCCAAGCTAAGATCTAGCACAAGAAAACAGCTTCTACAAGCGATTCAG
GTGGCGGAGAAGTGGGAGAAACAACCATTGACAGAGTTGTTCAACGATGTGTATGATGTT
AAGACAAAAAATCTTGAGGAGCAAGAACTTGGTCTAAAGGGATTAGTAGAGAAACAACCT
CAAGATTATCCTCCTGGTTTTCATATCTGAATCTAGAGGAACTGTGAAGCTGAAGATCTC
ATTCTCATGTATGATGTATCATGTACATATATACTTCTCATCAAAGGCTATTTATATCGT
TATAATCAAAATTACCGACCTTTGAGAAATGTATTTTCGTCATTTAATAGATTTCATGGT
TTGTCCTATGGTCATATTTGACTTTTGACTCTTATCTAAATTTCAGAATCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C133TF U 102
AF RR4DE30TF U 1
AF RR4G785JQ C 102
AF RR4CU85JQ C 107
BS 1 179 RR4DE30TF
BS 180 180 RR4G785JQ
BS 181 290 RR4DE30TF
BS 291 291 RR4G785JQ
BS 292 380 RR4DE30TF
BS 381 381 RR4G785JQ
BS 382 497 RR4DE30TF
BS 498 498 RR4G785JQ
BS 499 542 RR4DE30TF
BS 543 543 RR4G785JQ
BS 544 551 RR4DE30TF
BS 552 552 RR4G785JQ
BS 553 584 RR4DE30TF
BS 585 810 RR4G785JQ
BS 811 811 RR4CU85JQ
BS 812 850 RR4G785JQ
BS 851 955 RR4CU85JQ

RD RR4C133TF 286 0 0
GGCTT
GTGCAGTAACATTCATTGGAGACGGTGGCACAAGCGAGGGAGATTTTCACGCCGGGTTGA
ATTTCGCGGCGGTTATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATGTGTCGGAACAACGGTTGGGCTA
TCAGCACTCATATCTCAGAACAATTCAGAATTGATGGAATTGTTGTGAAAGGTCATGCTT
ACGGGATCCGAAGCATCCGAGTGGATGGTAACGATGCTCTTGCGGTTTACAGCGCGGTAC
GCTCAGCTAGAGAGATGGCTGTTACAGAACAAAGGCGTGTC

QA 6 286 6 286
DS 

RD RR4DE30TF 584 0 0
GGATCTAACCAACACAACTACTTCACTGTCTCATCTCCAATCGCCACACAGCTTCCTCAA
GCTGCCGTAGTTGGTTATGCTCTGAAGATGGAGAAGAAGAACGCTTGTGCAGTAACATTC
ATTGGAGACGGTGGCACAAGCGAGGGAGATTTTCACGCCGGGTTGAATTTCGCGGCGGTT
ATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATATGTCGGAACAACGGTTGGGCTATCAGCACTCATATC
TCAGAACAATTCAGAAGTGATGGAATTGTTGTGAAAGGTCAAGCTTACGGGATCCGAAGC
ATCCGAGTGGATGGTAACGATGCTCTTGCGGTTTACAGCGCGGTACGCTCAGCTAGAGAG
ATGGCTGTTACAGAACAAAGGCCTGTCCTCATCGAGGCGATGACATATAGAGTAGGACAT
CATTCCACATCAGATGATTCAACTAAGTACAGGGAAGCCGATGAAATCCAGTACTGGAAA
ATGTCGAGAAACCCTGTGAATAGGTTCAAGAAATGGGTGGAGGATAATGGATGGTGGAGC
GAGGAAGATGAGTCCAAGCTAAGATCTAGCACAAGAAAACAGCT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4G785JQ 749 0 0
CGCTT
GTGCAGTAACATTCATTGGAGACGGTGGCACAAGCGAGGGAGATTTTCACGCCGGTTTGA
ATTTTGCGGCGGTGATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATATGTCGGAACAACGGTTGGGCTA
TCAGCACTCATATCTCAGAACAATTCAGAAGTGATGGAATTGTTGTGAAAGGTCAAGCTT
ACGGAATCCGAAGCATCCGAGTGGATGGTAACGATGCTCTTGCGGTTTACAGCGCGGTAC
GCTCAGCTAGAGAGATGGCTGTTACAGAACAAAGACCTGTCCTCATCGAGGCGATGACAT
ATAGAGTAGGACATCATTCCACATCAGATGATTCAACTAAGTACAGGGAAGCCGATGAAA
TCCAGTACTGGAAAATGTCGAGAAACCCTGTTAATAGGTTCAAGAAATGGGTGGAGGATA
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ATGTGTATGATGTTAAGACAAAAAATCTTGAGGAGCAAGAACTTGGTCTAAAGGGATTAG
TAGAGAAACAACCTCAAGATTATCCTCCTGGTTTTCATATCTGAATCTAGAGGAACTGTG
AAGCTGAAGATCTCATTCTCATGTATGATGTATCATGTACATATGTACTTCTCATCAAAG
GCTATTTATATCGTTATAATCAAA

QA 6 749 6 749
DS 

RD RR4CU85JQ 849 0 0
GTGCAGTAACAT*CATTGGAGACGGTGGCACAAGCGAGGGAGATTT*CACGCCGGTTTGA
ATTT*GCGGCGGTGATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATATGTCGGAACAACGGTTGGGCTA
TCAGCACTCATATCTCAGAACAATTCAGAAGTGATGGAATTGTTGTGAAAGGTCAAGCTT
ACGGAATCCGAAGCATCCGAGTGGATGGTAACGATGCTCTTGCGGTTTACAGCGCGGTAC
GCTCAGCTAGAGAGATGGCTGTTACAGAACAAAGACCTGTCCTCATCGAGGCGATGACAT
ATAGAGTAGGACATCATTCCACATCAGATGATTCAACTAAGTACAGGGAAGCCGATGAAA
TCCAGTACTGGAAAATGTCGAGAAACCCTGTTAATAGGTTCAAGAAATGGGTGGAGGATA
ATGGATGGTGGAGCGAAGAAGATGAATCCAAGCTAAGATCTAGCACAAGAAAACAGCTTC
TACAAGCGATTCAGGTGGCGGAGAAGTGGGAGAAACAACCATTGACAGAGTTGTTCAACG
ATGTGTATGATGTTAAGACAAAAAATCTTGAGGAGCAAGAACTTGGTCTAAAGGGATTAG
TAGAGAAACAACCTCAAGATTATCCTCCTGGTTTTCATATCTGAATCTAGAGGAACTGTG
AAGCTGAAGATCTCATTCTCATGTATGATGTATCATGTACATATATACTTCTCATCAAAG
GCTATTTATATCGTTATAATCAAAATTACCGACCTTTGAGAAATGTATTTTCGTCATTTA
ATAGATTTCATGGTTTGTCCTATGGTCATATTTGACTTTTGACTCTTATCTAAATTTCAG
AATCTTCTC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 2 4

CO CL1363Contig1 901 2 4 U
GGTCACGAGGCTTTTGTTGAAGCTGTCAACAGTCTTGGTGGCAGTGACAGAGCAACTCCT
AAGGGTGTGCTGAAGATTATGAAAGTTGAAGGATTGACTATATATCATGTCAAAAGCCAT
TTGCAGAAATATAGGACGGCTAGATATAGGCCAGAACCATCAGAAAGTGGCTCGCCGGAG
AAGAAGTTGACACCGCTTGAACATATAACAGCTCTTGACTTGAAAGGTGGGATAGGTATT
ACAGAGGCTCTGCGGCTTCAGATGGAAGTACAGAAGCAACTCCATGAGCAGCTCGAGATT
CAAAGAAACTTGCAACTCCGGATAGAAGAACAAGGCAAGTACCTGCAAATGATGTTCGAG
AAACAAAACTCTGGTCTTGGCAAAGGGACAGCCTCAACATCAGATTCACCTCCCAAATCT
GAACATGAAGACAAGAAAACCGCTGCTGATTCAGAGGAGCTCGCACCAGAGGAGGAGACA
AGGAAATGCCAAGAAGAGCCAGAATCTCCACAGCCAAAGCGCGTCAAAACCGACAAATGA
AAGAATCTATTATCTACTAGGAACTGGTGTTTTGCTGGATCGTTTCGTAGTTCCCGAGTG
TTTAACAGTTAGAGAGATAAAGATAGAAAGAGAGCTCTCTCTTATCTTGAGGGTCTTCAG
GACTTCTGTCTCTCTACTGTTTCAACTATTTTTTCTGATGGAAGACTCTCTCAACTCTGC
TGTGTAGACAAAAACTACAGATCCCCAAAGAAGAAACCAAAAAACAAAAATAAGAGTTTA
GTTTGGGAAGAATCTTCATCATTTGAATGTAATCTAAATGCTGTAACACATCGTTAGTTT
ACGGATACAGATACTATGTTTTAATATTTTCTAGAATATTGAAACCCTCTCAGTTTGTTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4CZ85TF U 1
AF RR4CZ85JQ C 180
BS 1 528 RR4CZ85TF
BS 529 529 RR4CZ85JQ
BS 530 640 RR4CZ85TF
BS 641 901 RR4CZ85JQ

RD RR4CZ85TF 657 0 0
GGTCACGAGGCTTTTGTTGAAGCTGTCAACAGTCTTGGTGGCAGTGACAGAGCAACTCCT
AAGGGTGTGCTGAAGATTATGAAAGTTGAAGGATTGACTATATATCATGTCAAAAGCCAT
TTGCAGAAATATAGGACGGCTAGATATAGGCCAGAACCATCAGAAAGTGGCTCGCCGGAG
AAGAAGTTGACACCGCTTGAACATATAACAGCTCTTGACTTGAAAGGTGGGATAGGTATT
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GAACATGAAGACAAGAAAACCGCTGCTGATTCAGAGGAGCTCGCACCAGAGGAGGAGACA
AGGAAATGCCAAGAAGAGCCAGAATCTCCACAGCCAAAGCGCGTCAAA*CCGACAAATGA
AAGAATCTATTATCTACTAGGAACTGGTGTTTTGCTGGATCGTTTCGTAGTTCCCGAGTG
TTTAACAGTTAGAGAGATAAAGATAGAAAGAGAGCTCTCT
CTTATCTTGAGGGTCTT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4CZ85JQ 722 0 0
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TACAGAGGCTCTGCGGCTTCAGATGGAAGTACAGAAGCAACTCCATGAGCAGCTCGAGAT
TCAAAGAAACTTGCAACTCCGGATAGAAGAACAAGGCAAGTACCTGCAAATGATGTTCGA
GAAACAAAACTCTGGTCTTGGCAAAGGGACAGCCTCAACATCAGATTCACCTCCCAAATC
TGAACATGAAGACAAGAAAACCGCTGCTGATTCAGAGGAGCTCGCACCAGAGGAGGAGAC
AAGGAAATGCCAAGAAGAGCCAGAATCTCCACAGCCAAAGCGCGTCAAAACCGACAAATG
AAAGAATCTATTATCTACTAGGAACTGGTGTTTTGCTGGATCGTTTCGTAGTTCCCGAGT
GTTTAACAGTTAGAGAGATAAAGATAGAAAGAGAGCTCTCTCTTATCTTGAGGGTCTTCA
GGACTTCTGTCTCTCTACTGTTTCAACTATTTTTTCTGATGGAAGACTCTCTCAACTCTG
CTGTGTAGACAAAAACTACAGATCCCCAAAGAAGAAACCAAAAAACAAAAATAAGAGTTT
AGTTTGGGAAGAATCTTCATCATTTGAATGTAATCTAAATGCTGTAACACATCGTTAGTT
TACGGATACAGATACTATGTTTTAATATTTTCTAGAATATTGAAACCCTCTCAGTTTGTT
TT

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL1363Contig2 761 2 9 U
ATATTGTAAGACAGGTTAACATTGATAATAGAGAACTTTAAGAGAAAACAAACTGAGGGT
TTCATATTCTAGAAAATATTAAAACATAGTTTCTGTATCCGTAAACTAACGATGTGTTAC
AGCATTTTAGATTACATTCAAATGATGAAGATTCTCCCAAACTTAAACTCTCTTATTTTT
TGTTTTTGGTTTCTTCTTTGGGGATCTGTAGTTTTGTCTACACAGCAGAATTGAAAGTCT
TCCATCAGAAAAAATAGTTGAAACAGTAGAGAAAGTAAGTCCTGAAGACCCTCAAGACAA
GAGAGCTCTCTTTCTTTCTTTATCTCTCTAACTGTTAAACACTCGGGAAACTACGAAACG
ATCCAGCAAAAACACCAGTTCCTAGTAAATAGTGGTTCTTTCATTTGTCGGTTTTGACGC
GCTTTGGCTGTGGAGGTTCTGGCTCTTGTTGGCATTTCCTTGTCTCCTCCTCTGGTGCGA
GCTCCTCTGAAACAGCAGCGGTTTTCTTGTCTTCTTTGGGTGGTGAATCTGATGTTGAGG
CTGTCCCTTTGCCAAGACCCGAGTTTTGTTTCTCGAACATCATTTGAAGGTACTTGCCTT
GTTCTTCTATCCGGAGTTGCAGGTTTCTTTGAATCTCGAGCTGCTCATGGAGTTGCTTCT
GTACTTCCATCTGAAGTCGCAGAGCCTCTGTAATACCTATCCCACCTTTCAAGCCAAGAG
CTGTTATATGTTCAAGCGGTGTCAACTTCTTCTCTGGCGAG


BQ
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AF RR4BY77JQ U 43
AF RR4D081JQ U 1
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AAGTCTTCCATCAGAAAAAATAGTTGAAACAGTAGAGAGAGTAAGTCCTGAAGACCCTCA
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GCTTCTGTACTTCCATCTGAAG
TCGC

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AGCATTTTAGATTACATTCAAATGATGAAGATTCTCCCAAACTTAAACTCTCTTATTTTT
TGTTTTTGGTTTCTTCTTTGGGGATCTGTAGTTTTGTCTACACAGCAGAGTTGAGAGTCT
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CTGTTATATGTTCAAGCGGTGTCAACTTCTTCTCTGGCGAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 6

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4FH25TF U 260
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AF RR4CI04TF U 458
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AF RR4BR87JQ C 458
AF RR4FH25JQ C 587
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QA 1 224 1 224
DS 

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TACGGTTTTGAAAAGAACTGTGTGGTTGTGCAGTGGTCAGGAGACAATCCTAATAGTTTG
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GTGGATCCCGAGGGTTACATGGTAATGTTGGTATACAAGAATGCTTCTCTCACCCGTGAA
GAAATTCGTGACCGTTGCGCTGAGGGATCTTGGGATGTTTTTAACAAGTATTTGGAACAA
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CCACTTCCCGTTGGCTCTCATCGCTACATTCTTGATAACTTCTCTGGTGAGTCTCTTGAG
GGTGTAAAGGAACGTGAGGTCAAAGAGTTCGACCCTCCCTC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4CI04TF 401 0 0
TTTTTAACAAGTATTTGGAACAAACACAGCCACTCAATGATGGGAAACTGGGCTTTTACT
ACACTGAAAATGAAATCCTTCCCCCACTTCCCGTTGGCTCTCATCGCTACATTCTTGATA
ACTTCTCTGGTGAGTCTCTTGAGAGTGTAAAGGAACGTTAGGTCAAAGAGTTCGACCCTC
CCTCAGAGGTTAGAGCATTGATTGAAGGTCAGTTTCTTTCAAAGCGAGCTCATGCTGAGA
GATTTGGCATGCCTTCCCCTCCAATCCGAATTATAGCCACGGGTGGTGCTTCTGCTAACG
AGAATATTCTGAGTATGATCTCTGCAATCTTCGGATGCGATGTTTATACTGTCCAAAGGC
*TGATTCAGCATCACTTGGAGCTGCACTGAGAGCTGCTCAT

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR4CI04JQ 761 0 0
TCCCGTGGATCCCGAGAGTTACATGGTAATGTTGGTCTACAAGAATGCTTCTCTCACCCG
TGAAGAAATTCGTGACCGTTGCGCTGAGGGATCTTGGGATGTTTTTAACAAGTATTTGGA
ACAAACACAGCCACTCAATGATGGGAAACTGGGCTTTTACTACACTGAAAATGAAATCCT
TCCCCCACTTCCCGTTGGCTCTCATCGCTACATTCTTGATAACTTCTCTGGTGAGTCTCT
TGAGAGTGTAAAGGAACGTTAGGTCAAAGAGTTCGACCCTCCCTCAGAGGTTAGAGCATT
GATTGAAGGTCAGTTTCTTTCAAAGCGAGCTCATGCTGAGAGATTTGGCATGCCTTCCCC
TCCAATCCGAATTATAGCCACGGGTGGTGCTTCTGCTAACGAGAATATTCTGAGTATGAT
CTCTGCAATCTTCGGATGCGATGTTTATACTGTCCAAAGGCCTGATTCAGCATCACTTGG
AGCTGCACTGAGAGCTGCTCATGGCTGGCTCTGCAACAAAAAAGGAACCTTTGTGCCCAT
CTCCTGTCTCTACGAGGGGAAATTGGAGAAGACCTCTCTAAACTGCAAGCTCAAGGTAAA
AGCAGGAGACGATAATGTGGCTTGCTCCTACGGTTTGTTGATGAAGAAGGGGATGGAAAT
AGAAAAGAAGCTTGTGGAGAAGTTAGGACACTTCTGAATTTAAAATAAAAAATTATCTTA
GTCTTTAAGAGTTTAATAGCTTTATAATTGTTGAACAAATT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4BR87JQ 720 0 0
TTTTTAACAAGTATTTGGAACAAACACAGCCACTCAATGATGGGAAACTGGGCTTTTACT
ACACTGAAAATGAAATCCTTCCCCCACTTCCCGTTGGCTCTCATCGCTACATTCTTGATA
ACTTCTCTGGTGAGTCTCTTGAGGGTGTAAAGGAACGTGAGGTCAAAGAGTTCGACCCTC
CCTCAGAGGTTAGGGCATTGATTGAAGGACAGTTTCTTTCAAAGCGAGCTCATGCCGAGA
GATTTGGCATGCCTTCCCCTCCAATCCGAATTATAGCCACAGGTGGTGCTTCTGCTAACG
AGAATATTCTGAGTATGATCTCTGCAATCTTCGGATGTGATGTTTATACTGTCCAAAGGC
CTGATTCAGCATCACTTGGAGCTGCACTGAGAGCTGCTCATGGCTGGCTCTGCAACAAAA
AAGGAACCTTTGTGCCCATCTCCTGTCTCTACGAGGGGAAATTGGAGAAGACCTCTCTAA
ACTGCAAGCTCAAGGTAAAAGCAGGAGGCGATAATGTGGCTTGCTCCTACGGTTTGTTGA
TGAAGAAGAGGATGGAAATAGAAAAGAAGCTTGTGGAGAAGTTAGGACACTTCTGAATTT
AAAATAAAAAATTATCTTAGTCTTTAAGAGTTTAATAGCTTTATAATTGTTGAACAAATT
AATAAGATCTACTAAAAATATGCTTTGCTTGTCTCTCGAAATAAAAGAAAACTATATCAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4FH25JQ 569 0 0
GTGAGTCTCTTGAGGGTGTAAAGGAACGTGTGGTCAAAGAGTTCGACCCTCCCTCAGAGG
TTAGGGCATTGATTGAAGGACAGTTTCTTTCAAAGCGAGCTCATGCCGAGAGATTTGGCA
TGCCTTCCCCTCCAATCCGAATTATAGCCACAGGTGGTGCTTCTGCTAACGAGAATATTC
TGAGTATGATCTCTGCAATCTTCGGATGTGATGTTTATACTGTCCAAAGGCCTGATTCAG
CATCACTTGGAGCTGCACTGAGAGCTGCTCATGGCTGGCTCTGCAACAAAAAAGGAACCT
TTGTGCCCATCTCCTGTCTTTACGAGGGGAAATTGGAGAAGACCTCTCTAAACTGCAAGC
TCAAGGTAAAAGCAGGAGACGATAATGTGGCTTGCTCCTACGGTTTGTTGATGAAGAAGA
GGATGGGAATAGAAAAGAAGCTTGTGGAGAAGTTAGGACACTTCTGAATTTAAAATAAAA
AATTATCTTAGTCTTTAAGAGTTTAATAGCTTTATAATTGTTGAACAAATTAATAAGATC
TACTAAAAATATGCTTTGCTTGTCTCTCG

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 5

CO CL1365Contig1 1292 5 6 U
ACTAGAGATTCATTTTTTTCTTTAAATATACTGAATAGTCATATGATACATTATGTAATA
ATGTCCCCACAATATATAGAAAAGAGAAAGTGACAAATATTCATATGATGATATAGCATG
CAATGTCCCACAATAGAAGGAGAAAATGACAAGAATTAGATAGGAAAAGAAACATGACAC
CACCAAATACTATTCCTAGCTCTATCTCCCCTTTGGAGATGGCTACAGTGGCTCCTACAC
ACTCACCGACACACACAAGACACAACACACGCAAATCCACAATACAAGGGGTAAGAGGAG
AGATCGCAGGACCCGTTGGATTCGGATGGACTCAATTACAGTTGCCATCCTACGGTCAGC
CACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAAACATGACACATATAATAGTAGGAATAGGT
ATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGTTAAGGCGGGAAGTATAAGTTGCTTTAGGA
GCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTGACAGTGTTTTACCGGCTGACAAAGTGGTG
AGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTGGTCCTCCAACAATGCACCAGTTGGCTCCCCAT
ACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTCCTGCTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATG
TCGCCTTCTCCATCTTCGAACTCAACGAGCAGAGACAACCAAAAATCAGTTGATCCTTCG
TTCACATGGAACGCTATGTTCTTCCCTCTATACTTGCATGCTGTCCGGCGGTAAATCACG
GGAATGAGACCACGGTTGCGGAGGGGACCAGATTCTCCTGAGATAGCCAATCGACCAAAA
GCCGCGCCACTGAGATCAAAGTGAGTGTTGGTCTTCGAACAGCCGGGACACTCGTCGGTG
ATGATGACGGTGACGGCTCTTCGGGAACATATACTCCTGTCCAAGCAACGAACCTTGTAA
CAAGCTCCGCAGCCTTCACCGTTCTTGAAGAGGATAGGGTTCACCGCTCCAACCCTCGCA
TGTAACGGTTTCACGTCAACCAACGTACCGTAACCACACGCTCCTCCATCGCTTCCGTCA
CCGTCGGCGTTCCGTACCAGGTGGCCACTGCAGGAAGCCAATGCGAGTTTGACCCGTGGC
TATTGGTCGTCACTGGAGCGGAGGAGGTAAGCTGCGGGACAATGCAGAGCGTGGCTAAAA
TGATGACCGGAGAGAACTGCATTTTACCCCCAAAGAAGTATGTTTTGCCGACAGTGAGAG
AGAAAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD20JQ U 89
AF RR4H192JQ U 89
AF RR4H616JQB U 1
AF RR4CE24TF C 92
AF RR4H616TF C 668
BS 1 167 RR4H616JQB
BS 168 169 RR4DD20JQ
BS 170 405 RR4H616JQB
BS 406 406 RR4DD20JQ
BS 407 761 RR4H616JQB
BS 762 1292 RR4H616TF

RD RR4DD20JQ 611 0 0
GGT
GACAAATATTCATATGATGATATAGCATGCAATGTCCCACAATAGAAGGAGAAAATGACA
AGAATTAGATAGGAAAAGAAACATGACACCACCAAATACTATTCCTAGCTCTATCTCCCC
TTTGGAGATGGCTACAGTGGCTCCTACACACTCACCGACACACACAAGACACAACACACG
CAAATCCACAATACAAGGGGTAAGAGGAGAGATCGCAGGACCCGTTGGATTCGGATGGAC
TCAATTACAGTTGCCATCCTACGGTCAGCCACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAA
ACATGACACATATAATAGTAGGAATAGGTATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGT
TAAGGCGGGAAGTATAAGTTGCTTTAGGAGCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTG
ACAGTGTTTTACCGGCTGGCAAAGTGGTGAGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTGGTC
CTCCAACAATGCACCAGTTGGCTCCCCATACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTC
CTGCTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATGTCGCCTTCTCCATCTTCGAACTCAACGAGCA
GAGACAAC

QA 4 611 4 611
DS 

RD RR4H192JQ 617 0 0
GGT
GACAAATATTCATATGATGATATAGCATGCAATGTCCCACAATAGAAGGAGAAAATGACA
AGAATTAGATAGGAAAAGAAACATGACACCACCAAATACTATTCCTAGCTCTATCTCCCC
TTTGGAGATGGCTACAGTGGCTCCTACACACTCACCGACACACACAAGACACAACACACG
CAAATCCACAATACAAGGGGTAAGAGGAGAGATCGCAGGACCCGTTGGATTCGGATGGAC
TCAATTACAGTTGCCATCCTACGGTCAGCCACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAA
ACATGACACATATAGTAGTAGGAATAGGTATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGT
TAAGGCGGGAAGTATAAGTTGCTTTAGGAGCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTG
ACAGTGTTTTACCGGCTGACAAAGTGGTGAGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTGGTC
CTCCAACAATGCACCAGTTGGCTCCCCATACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTC
CTGCTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATGTCGCCTTCTCCATCTTCGAACTCAACGAGCA
GAGACAACCAAAAA

QA 4 617 4 617
DS 

RD RR4H616JQB 763 0 0
ACTAGAGATTCATTTTTTTCTTTAAATATACTGAATAGTCATATGATACATTATGTAATA
ATGTCCCCACAATATATAGAAAAGAGAAAGTGACAAATATTCATATGATGATATAGCATG
CAATGTCCCACAATAGAAGGAGAAAATGACAAGAATTAGATAGGAAA**AAACATGACAC
CACCAAATACTATTCCTAGCTCTATCTCCCCTTTGGAGATGGCTACAGTGGCTCCTACAC
ACTCACCGACACACACAAGACACAACACACGCAAATCCACAATACAAGGGGTAAGAGGAG
AGATCGCAGGACCCGTTGGATTCGGATGGACTCAATTACAGTTGCCATCCTACGGTCAGC
CACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAAACATGACACATATAGTAGTAGGAATAGGT
ATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGTTAAGGCGGGAAGTATAAGTTGCTTTAGGA
GCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTGACAGTGTTTTACCGGCTGACAAAGTGGTG
AGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTGGTCCTCCAACAATGCACCAGTTGGCTCCCCAT
ACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTCCTGCTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATG
TCGCCTTCTCCATCTTCGAACTCAACGAGCAGAGACAACCAAAAATCAGTTGATCCTTCG
TTCACATGGAACGCTATGTTCTTCCCTCTATACTTGCATGC
TG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CE24TF 661 0 0
GACAAATATTCATATGATGATATAGCATGCAATGTCCCACAATAGAAGGAGAAAATGACA
AGAATTAGATAGGAAAAGAAACATGACACCACCAAATACTATTCCCAGCTCTATCTCCC*
TTTGGAGATGGCTACAGTGGCTCCTACACACTCACCGACACACACAAGACACAACACACG
CAAATCCACAATACAAGGGGTAAGAGGAGAGATCGCAGGACCCGTTGGATTCGGATGGAC
TCAATTACAGTTGCCATCCTACGGTCAGCCACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAA
ACATGACACATATAATAGTAGGAATAGGTATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGT
TAAGGCGGGAAGTATAAGTTGCTTTAGGAGCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTG
ACAGTGTTTTACCGGCTGACAAAGTGGTGAGCTTGATGGAGAATGGTCCGT*GAGTGGTC
CTCCAACAATGCACCAGTTGGCTCCCCATACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTA
CTGCTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATGTCGCCTTCTCCATCTTCGAACTCAACGAGCA
GAGACAACCAAAAATCAGTTGATCCTTCGTTCACATGGAACGCTATGTTCTTCCCTCTAT
C

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4H616TF 625 0 0
CTCCATCTTCGAACTCAACGAGCAGAGACAACCAAAAATCAGTTGATCTTTCGTTCACAT
GGAACGCTATGTTCTTCCCTCTATACTTGCATGCTGTCCGGCGGTAAATCACGGGAATGA
GACCACGGTTGCGGAGGGGACCAGATTCTCCTGAGATAGCCAATCGACCAAAAGCCGCGC
CACTGAGATCAAAGTGAGTGTTGGTCTTCGAACAGCCGGGACACTCGTCGGTGATGATGA
CGGTGACGGCTCTTCGGGAACATATACTCCTGTCCAAGCAACGAACCTTGTAACAAGCTC
CGCAGCCTTCACCGTTCTTGAAGAGGATAGGGTTCACCGCTCCAACCCTCGCATGTAACG
GTTTCACGTCAACCAACGTACCGTAACCACACGCTCCTCCATCGCTTCCGTCACCGTCGG
CGTTCCGTACCAGGTGGCCACTGCAGGAAGCCAATGCGAGTTTGACCCGTGGCTATTGGT
CGTCACTGGAGCGGAGGAGGTAAGCTGCGGGACAATGCAGAGCGTGGCTAAAATGATGAC
CGGAGAGAACTGCATTTTACCCCCAAAGAAGTATGTTTTGCCGACAGTGAGAGAGAAAGT
GAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTGTCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 6

CO CL1366Contig1 659 6 5 U
GGAAATACAAGCTTAGTGTTTTCTCTACATTTAGTGATCAAACAAGTAATATCAATCAAA
AGATGGAAGGCAAAACTGTGATATTAAGTGTTCTCATAATAGGTCTTGTCATGGCGCAAA
TTCAAGTAGAAGCAGAAAAGATCTGTTGCCGTAACACTAGAGCTAGAAATACGTTTAATT
CTTGCACTGCTCAAGGTATCCCCGTGAGCTTCTGTGTACGAATCGTTGATTGCATAATAC
TT*CCTTATAATACATGCCCACCAGAATTTCCCGCGGATCGTCTGGAAAACTCAGCTGAT
GTTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGATGTACGTCCTCTGTGTGCGGTCCTTTGACCACT
CTCCAAAATTCGGGTGCAAGTGAAATTGGAGATGGAGCCGTTGAAGATTGTGCCAAAGTA
TGTTCTACTTTTTGCACTAATGGCTCTACTAAGCTTGCAATTGAAACTGCCTAAACAATC
GTACCCTCGAAGATATACCACGTCTAAGTTTGAGAGTGTTGGTCTTGGTCTTTAGAAAGC
GGTCTGCTTGCATTTTAATAAGTTGTTTTTTGTTGAGAAAAATGTTTTAATAAGTTTGTT
TCTCGTTTGCGTGTGTATCGTAGAAGGTTTTAATAATATCATGGAACTAAAGATTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4A214TF U 41
AF RR4A214TFB U 1
AF RR4D287TF U 1
AF RR4BT84JQ C 7
AF RR4D287JQ C 30
AF RR4BT84TF U 7
BS 1 622 RR4A214TFB
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BS 627 657 RR4D287TF
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RD RR4A214TF 340 0 0
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AGCTAGAAATACGTTTAATTCTTGCACTGCTCAAGGTATCCCCGTGAGCTTCTGTGTACG
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GTCTGGAAAACTCAGCTGATGTTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGATGTACGTCCTCTG
TGTGCGGTCCTTTGACCACTCTCCAAAATTCGGGTGCAAG

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DS 

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AGATGGAAGGCAAAACTGTGATATTAAGTGTTCTCATAATAGGTCTTGTCATGGCGCAAA
TTCAAGTAGAAGCAGAAAAGATCTGTTGCCGTAACACTAGAGCTAGAAATACGTTTAATT
CTTGCACTGCTCAAGGTATCCCCGTGAGCTTCTGTGTACGAATCGTTGATTGCATAATAC
TT*CCTTATAATACATGCCCACCAGAATTTCCCGCGGATCGTCTGGAAAACTCAGCTGAT
GTTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGATGTACGTCCTCTGTGTGCGGTCCTTTGACCACT
CTCCAAAATTCGGGTGCAAGTGAAATTGGAGATGGAGCCGTTGAAGATTGTGCCAAAGTA
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TCTCGTTTGCGTGTGTATCGTA

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DS 

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TGAATACTGCAAGTTGGGATGTACGTCCTCTGTGTGCGGTCCTTTGACCACTCTCCAAAA
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TT

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DS 

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GG
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TGAATACTGCAAGTTGGGATGTACGTCCTCTGTGTGCGGTCCTTTGACCACTCTCCAAAA
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TTTTTGCACTAATGGCTCTACTAAGCTTGCAATTGAAACTGCCTAAACAATCGTACCCTC
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TTCTGTGTACGAATCGTTGATTGCATAATACTT*CCTTATAATACATGCCCACCAGAATT
TCCCGCGGATCGTCTGGAAAACTCAGCTGATGTTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGATG
TACGTCCTCTGTGTGCGGTCCTTTGACCACTCTCCAAAATTCGGGTGCAAGTGAAATTGG
AGGTGGAGCCGTTGAAGATTGTGCCAAAGTATGTTCTACTTTTTGCACTAATGGCTCTAC
TAAGCTTGCAATTGAAACTGCCTAAACAATCGTACCCTCGAAGATATACCACGTCTAAGT
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TTGTTGAGAAAAATGTTTTAATAAGTTTGTTTCTCGTTTGCGTGTGTATCGTAGAAGGTT
TTAATAATATCATGGAACTAAAGATTGG
TT

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DS 

RD RR4BT84TF 653 0 0
GG
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GGCAAAACTGTGATATTAAGTGTTCTCATAAT**GTCTTGTCATGGCGCAAATTCAAGTA
GAAGCAGAAAAGATCTGTTGCCGTAACACTAGAGCTAGAAATACGTTTAATTCTTGCACT
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TAATACATGCCCACCAGAATTTCCCGCGGATCGTCTGGAAAACTCAGCTGATGTTGTCAA
TGAATACTGCAAGTTGGGATGTACGTCCTCTGTGTGCGGTCCTTTGACCACTCTCCAAAA
TTCGGGTGCAAGTGAAATTGGAGATGGAGCCGTTGAAGATTGTGCCAAAGTATGTTCTAC
TTTTTGCACTAATGGCTCTACTAAGCTTGCAATTGAAACTGCCTAAACAATCGTACCCTC
GAAGATATACCACGTCTAAGTTTGAGAGTGTTGGTCTTGGTCTTTAGAAAGCGGTCTGCT
TGCATTTTAATAAGTTGTTTTTTGTTGAGAAAAATGTTTTAATAAGTTTGTTTCTCGTTT
GCGTGTGTATCGTAGAA*GTTTTAATAATATCATGGAACTAAAGATTGG
CC

QA 3 651 3 651
DS 



AS 1 6

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ATTTAATCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 30 30 30 30 30 

AF RR4GY05JQ C 1
AF RR4D363JQ C 43
AF RR4D363TF U 43
AF RR4GY17JQ C 1
AF RR4GY05TF U 1
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RD RR4GY05JQ 429 0 0
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TCCGGTTCGGGTACTTCTCCGGTTTGATCGTGCTTGTGTATTTGTTTTATGGTGTTCATG
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TATGTAATTAAACTCTCTATTTTTCAAAAGGAGGGGGTTTTGAAAATATTAATGAAAGTT
ATTTAATCT

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TGTTTTATGGTGTTCATGCCAGCTCTGACGCTGAAGCGAATGGGTCTTTTGATGTGAAAG
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DS 

RD RR4D363TF 382 0 0
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CCTTCATGCCGTTGACCCCGTGCGTGTCGATTTTCTTGAACATATTCTTGCTTGGTTCGT
TGGACGCACCGTCGTACGTCCGGTTCGGGTACTTCTCCGGTTTGATCGTGCTTGTGTATT
TGTTTTATGGTGTTCATGCCAGCTCTGACGCTGAAGCGAATGGGTCTTTTGATGTGAAAG
AAGATGGACAAGCCTTGAAAGAACTAACCGAAGTGTGAATAAGTGAACGTTATTTAGTTT
GTTTCCTAAAAATTAGCTTATGTAATTAAACTCTCTATTTTTCAAAAGGAGGGGGTTTTG
AAAATATTAATGAAAGTTATTT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4GY17JQ 429 0 0
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CCAGCTCTGACGCTGAAGCGAATGGGTCTTTTGATGTGAAGGAAGATGGACAAGCCTTGA
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TATGTAATTAAACTCTCTATTTTTCAAAAGGAGGGGGTTTTGAAAATATTAATGAAAGTT
ATTTAATCT

QA 1 429 1 429
DS 

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TCCGGTTCGGGTACTTCTCCGGTTTGATCGTGCTTGTGTATTTGTTTTATGGTGTTCATG
CCAGCTCTGACGCTGAAGCGAATGGGTCTTTTGATGTGAAGGAAGATGGACAAGCCTTGA
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TATGTAATTAAACTCTCTATTTTTCAAAAGGAGGGGGTTTTGAAAATATTAATGAAAGTT
ATTTAATCT

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR4GY17TF 429 0 0
GGGCTTTCATGCTTGGTGCCAGTGCGGTAGTGGCTATGGCAATCGTGTTGATTTTCCATT
TCGTGGTCCCTCAAGCAAACAAACCCGAGTTATGGGGTGTCCCCTTCATGCCGTTGACCC
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TATGTAATTAAACTCTCTATTTTTCAAAAGGAGGGGGTTTTGAAAATATTAATGAAAGTT
ATTTAATCT

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 6

CO CL1368Contig1 705 6 4 U
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AGACAACAATACTTCAATGAAAACGCTATTTATGCATTTTCATTTATTTGATTTCTATAT
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TATGCTTCACCACTTTCTCTCTCTCCTCAATTTCCAAAACGTCGAGATCGTGGCTGACGT
GGAATCCGAACTTGCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCCTTTGAGAGAGACGGAAC
CGGTTAACATAGAACCTAACGCCAAGAGAAGAACCGCTACTAAAACCCACAGCTTGTAAC
CAGCGCGTTTGCGGTCGGAACCGCCGTTTAAAGGTTTTCTCACCGGTAAGAGCGTTTGCG
ATCCTTCAAATTTCATCTCTGATCTCTGATTTCGAAAATCTGCTTATGATGATGGCCCCT
TGATAAAGGAACTAGGATCAGTGTGAAACGAGAGACTTTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH06JQ U 1
AF RR4AJ59JQ U -4
AF RR4GH06TF C -1
AF RR4AJ59TF C 164
AF RR4AS54TF C 5
AF RR4AS54JQ U 7
BS 1 490 RR4GH06JQ
BS 491 491 RR4AJ59JQ
BS 492 633 RR4GH06JQ
BS 634 705 RR4AS54JQ

RD RR4GH06JQ 635 0 0
CGGATTGCTTGTAAATTTGTAATACATAGACAACAATTTGGTTGCTACATAATAGTTTTC
AGACAACAATACTTCAATGAAAACGCTATTTATGCATTTTCATTTATTTGATTTCTATAT
ACAAGAGAATCTTAATGCTATTCTCGTGGGCTTTCGTCTTCACAACTCAACGACTATTGG
GCTGGGCCGTAGTAGAGTCGGGCTTAAGGGAGCGAGTAAGAGACAGTTTAGCTATATCGG
AAATAGCCCCGTTTCGAACGGCGGCGGAATCACTGACCAGGAACTCATACGCCGCCTCGA
AAGCCTCCCGCCAGAACTGAGGCACCCTAACTCCGCCGGATCGTCCGTACACATCCCACA
TATGCTTCACCACTTTCTCTCTCTCCTCAATTTCCAAAACGTCGAGATCGTGGCTGACGT
GGAATCCGAACTTGCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCCTTTGAGAGAGACGGAAC
CGGTTAACATGGAACCTAACGCCAAGAGAAGAACCGCTACTAAAACCCACAGCTTGTAAC
CAGCGCGTTTGCGGTCGGAACCGCCGTTTAAAGGTTTTCTCACCGGTAAGAGCGTTTGCG
ATCCTTCAAATTTCATCTCTGATCTCTGATTTC
CC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4AJ59JQ 626 0 0
GGAAATAGATTGCTTGTA
AATTTGTAATACATAGACAACAATTTGGTTGCTACATAATAGTTTTCAGACAACAATACT
TCAATGAAAACGCTATTTATGCATTTTCATTTATTTGATTTCTATATACAAGAGAATCTT
AATGCTATTCTCGTGGGCTTTCGTCTTCACAACTCAACGACTATTGGGCTGGGCCGTAGT
AGAGTCGGGCTTAAGGGAGCGAGTAAGAGACAGTTTAGCTATATCGGAAATAGCCCCGTT
TCGAACGGCGGCGGAATCACTGACCAGGAACTCATACGCCGCCTCGAAAGCCTCCCGACA
GAACTGAGGCACCCTAACTCCGCCGGATCGTCCGTACACATCCCACATATGCTTCACCAC
TTTCTCTCTC**CTCAATTTCCAAAACGTCGAGATCGTGGCTGACGTGGAATCCGAACTT
GCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCCTTTGAGAGAGACGGAACCGGTTAACATAGA
ACCTAACGCCAAGAGAAGAACCGCTACTAAAACCCACAGCTTGTAACCAGCGCGTTTGCG
GTCGGAACCGCCGTTTAAAGGTTTTCTCACCGGTAAGAGCGTTTGCGATCCTTCAAATTT
CATCTCTG

QA 19 626 19 626
DS 

RD RR4GH06TF 637 0 0
TTTTTCGGATGCTGT
AATTTGTAATACATAGACAACAATTTGGTTGCTACATAATAGTTTTCAGACAACAATACT
TCAATGAAAACGCTATTTATGCATTTTCATTTATTTGATTTCTATATACAAGAGAATCTT
AATGCTATTCTCGTGGGCTTTCGTCTTCACAACTCAACGACTATTGGGCTGGGCCGTAGT
AGAGTCGGGCTTAAGGGAGCGAGTAAGAGACAGTTTAGCTATATCGGAAATAGCCCCGTT
TCGAACGGCGGCGGAATCACTGACCAGGAACTCATACGCCGCCTCGAAAGCCTCCCGCCA
GAACTGAGGCACCCTAACTCCGCCGGATCGTCCGTACACATCCCACATATGCTTCACCAC
TTTCTCTCTCTCCTCAATTTCCAAAACGTCGAGATCGTGGCTGACGTGGAATCCGAACTT
GCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCCTTTGAGAGAGACGGAACCGGTTAACATGGA
ACCTAACGCCAAGAGAAGAACCGCTACTAAAACCCACAGCTTGTAACCAGCGCGTTTGCG
GTCGGAACCGCCGTTTAAAGGTTTTCTCACCGGTAAGAGCGTTTGCGATCCTTCAAATTT
CATCTCTGATCTCTGATTTC
CC

QA 16 635 16 635
DS 

RD RR4AJ59TF 472 0 0
AACTCAACGACTATTGGGCTGGGCCGTAGTAGAGTCGGGCTTAAGGGAGCGAGTAAGAGA
CAGTTTAGCTATATCGGAAATAGCCCCGTTTCGAACGGCGGCGGAATCACTGACCAGGAA
CTCATACGCCGCCTCGAAAGCCTCCCGACAGAACTGAGGCACCCTAACTCCGCCGGATCG
TCCGTACACATCCCACATATGCTTCACCACTTTCTCTCTC**CTCAATTTCCAAAACGTC
GAGATCGTGGCTGACGTGGAATCCGAACTTGCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCC
TTTGAGAGAGACGGAACCGGTTAACATAGAACCTAACGCCAAGAGAAGAACCGCTACTAA
AACCCACAGCTTGTAACCAGCGCGTTTGCGGTCGGAACCGCCGTTTAAAGGTTTTCTCAC
CGGTAAGAGCGTTTGCGATCCTTCAAATTTCATCTCTGATCTCTGATTTC
CC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4AS54TF 670 0 0
TT
GCTTGTAAATTTGTAATACATAGACAACAATTTGGTTGCTACATAATAGTTTTCAGACAA
CAATACTTCAATGAAAACGCTATTTATGCATTTTCATTTATTTGATTTCTATATACAAGA
GAATCTTAATGCTATTCTCGTGGGCTTTCGTCTTCACAACTCAACGACTATTGGGCTGGG
CCGTAGTAGAGTCGGGCTTAAGGGAGCGAGTAAGAGACAGTTTAGCTATATCGGAAATAG
CCCCGTTTCGAACAGCGGCGGAATCACTGACCAGGAACTCATACGCCGCCTCGAAAGCCT
CCCGCCAGAACTGAGGCACCCTAACTCCGCCGGATCGTCCGTACACATCCCACATATGCT
TCACCACTTTCTCTCTCTCCTCAATTTCCAAAACGTCGAGATCGTGGCTGACGTGGAATC
CGAACTTGCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCCTTTGAGAGAGACGGAACCGGTTA
ACATAGAACCTAACGCGAAGAGAAGAACCGCTACTAAAACCCACAGCTTGTAACCAGCGC
GTTTGCGGTCGGAACCACCGTTTAAAGGTTTTCTCACCGGTAAGAGCGTTTGCGATCCTT
CAAATTTCATCTCTGATCTCTGATTTCGAAAATCTGCTTATGATGATGGCCCCTTGATAA
AGGAACTA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4AS54JQ 699 0 0
GCTTGTAAATTTGTAATACATAGACAACAATTTGGTTGCTACATAATAGTTTTCAGACAA
CAATACTTCAATGAAAACGCTATTTATGCATTTTCATTTATTTGATTTCTATATACAAGA
GAATCTTAATGCTATTCTCGTGGGCTTTCGTCTTCACAACTCAACGACTATTGGGCTGGG
CCGTAGTAGAGTCGGGCTTAAGGGAGCGAGTAAGAGACAGTTTAGCTATATCGGAAATAG
CCCCGTTTCGAACAGCGGCGGAATCACTGACCAGGAACTCATACGCCGCCTCGAAAGCCT
CCCGCCAGAACTGAGGCACCCTAACTCCGCCGGATCGTCCGTACACATCCCACATATGCT
TCACCACTTTCTCTCTCTCCTCAATTTCCAAAACGTCGAGATCGTGGCTGACGTGGAATC
CGAACTTGCCGTCAACGGAATGAAACAGACCGAGTCCTTTGAGAGAGACGGAACCGGTTA
ACATAGAACCTAACGCGAAGAGAAGAACCGCTACTAAAACCCACAGCTTGTAACCAGCGC
GTTTGCGGTCGGAACCACCGTTTAAAGGTTTTCTCACCGGTAAGAGCGTTTGCGATCCTT
CAAATTTCATCTCTGATCTCTGATTTCGAAAATCTGCTTATGATGATGGCCCCTTGATAA
AGGAACTAGGATCAGTGTGAAACGAGAGACTTTCGTTCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 6

CO CL1369Contig1 696 2 5 U
AATCAGTAACTAACAGAGTGTTATTATTATATTTGTATACATTTTGGTATACAAAACATT
ACATACATGCCGAGATTTCATTTATAACAATATTCAACTTGTGTTCTAATCAAGCAATGA
GACGATATGCTTATTTTCACCATCCGTAAATGGATGGTTCTCTTCTTCTACTACTAAATC
TTGACCCTCCTTTTTATCACAACCCAAAAGTGGGTTTATCTCTGTGTTTTCCTCATCTTC
AGGATCCATATTTTCTTTCATACTCTTCCCGGATTCCTCGTTCCCCTCAATCACCAACGG
CTGAGGGAAGTGGCCGGTGACATTAGGAAAAACCATTGTGTTGTTGATCTCTTGGTCATC
TTCAATGTACTTGGTATAGGTTGAAAATTCTTGTAGGACTTCATTCTTTGAAGGCTTGCG
GTTGAAGCTACCAAAACCTTGAATCCCTCGAGACAGCTCGCGAGCTCGCTTCCTCTCTTC
CTTGAGAAAATCTCCTTTCTCAAGTAGCTTCAAAACCTTCTCTGATTTCCTCCTAACAGA
TAGTCCCCAATTGAACCCTTTCTCGTCGATCTGTTGGAAGGTTTGCATTTGCGAGATAAC
ATGTTTATCGCCTTGAAACTCAACTGAGACGCTCTCTGGTCCATGAGTGAGCAAATGTTC
AACAACTATGAGTGGGTTATAAGCCATTCTCCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI71JQ U 8
AF RR4BA32TF C 1
BS 1 7 RR4BA32TF
BS 8 622 RR4EI71JQ
BS 623 623 RR4BA32TF
BS 624 624 RR4EI71JQ
BS 625 696 RR4BA32TF

RD RR4EI71JQ 617 0 0
AACTAACAGAGTGTTATTATTATATTTGTATACATTTTGGTATACAAAACATTACATACA
TGCCGAGATTTCATTTATAACAATATTCAACTTGTGTTCTAATCAAGCAATGAGACGATA
TGCTTATTTTCACCATCCGTAAATGGATGGTTCTCTTCTTCTACTACTAAATCTTGACCC
TCCTTTTTATCACAACCCAAAAGTGGGTTTATCTCTGTGTTTTCCTCATCTTCAGGATCC
ATATTTTCTTTCATACTCTTCCCGGATTCCTCGTTCCCCTCAATCACCAACGGCTGAGGG
AAGTGGCCGGTGACATTAGGAAAAACCATTGTGTTGTTGATCTCTTGGTCATCTTCAATG
TACTTGGTATAGGTTGAAAATTCTTGTAGGACTTCATTCTTTGAAGGCTTGCGGTTGAAG
CTACCAAAACCTTGAATCCCTCGAGACAGCTCGCGAGCTCGCTTCCTCTCTTCCTTGAGA
AAATCTCCTTTCTCAAGTAGCTTCAAAACCTTCTCTGATTTCCTCCTAACAGATAGTCCC
CAATTGAACCCTTTCTCGTCGATCTGTTGGAAGGTTTGCATTTGCGAGATAACATGTTTA
TCGCCTTGAAACTCATC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4BA32TF 696 0 0
AATCAGTAACTAACAGAGTGTTATTATTATATTTGTATACATTTTGGTATACAAAACATT
ACATACATGCCGAGATTTCATTTATAACAATATTCAACTTGTGTTCTAATCAAGCAATGA
GACGATATGCTTATTTTCACCATCCGTAAATGGATGGTTCTCTTCTTCTTCTACTAGATC
TTGACCCTCCTTTTTATCACAACCCAAAAGTGGGTTTATCTCTGTGTTTTCCTCATCTTC
AGGATCCATATTTTCTTTCATACTCTTCCCGGATTCCTCGTTCCCCTCAATCACCAACGG
CTGAGGGAAGTGGCCGGTGACATTAGGAGAAACCATTGTGTTGTTGATCTCTTGGTCATC
TTCAATGTACTTGGTATAGGTTGAAGATTCTTGTAGGACTTCATTCTTTGAAGGCTTGCG
GTTGAAGCTACCAAAACCTTGAATCCCTCGAGACAGCTCGCGAGCTCGCTTCCTCTCTTC
CTTGAGCAAATCTCCTTTCTCAAGTAGCTTCAAAACCTTCTCTGATTTCCTCCTAACAGA
TAGTCCCCAATTGAACCCTTTCTCGTCGATCTGTTGGAAGGTTTGCATTTGCGAGATAAC
ATGTTTATCGCCTTGAAACTCAACTGAGACGCTCTCTGGTCCATGAGTGAGCAAATGTTC
AACAACTATGAGTGGGTTATAAGCCATTCTCCAGTC

QA 1 696 1 696
DS 



CO CL1369Contig2 1101 4 18 U
TTTTTCTATCACAGATCTGGACTTTTCTTGATTTTTTTTTTTAGTTTGTCTCTTTATTCA
ATGACCAATCTAGAAATCATAGACAAAAGCTGAAACCCACTCTCTCCCTCAGCCTCATAT
GCAAACTGAGAATTAATTTGAAGAGAGATGTCGATGATGAGCAAAAATCGAAGCAGCATC
GGCATGGGAACACCTTCATTTCTTGATTTGAAGAAGCAAGCTTCCTTTTTCTTCAAAGAA
AAGCTCAAAACTGCGCGTTTAGCTCTCACCGACGTTACTCCTCTTCAACTATTGACTGAG
GAAGCTACGGATGGAGAGTCATGTGGACCAAACACACAAACCTTAGGATCCATTTCGAAG
GCAGCTTCTGAGTTTGAAGATTACTTGCAGATTGTCAATGTCTTGCACAAAAGATTGGCA
AAGTTTGATCAGAGGAACTGGAGAATGGCTTATAACTCACTCATAGTTGTTGAACATTTG
CTCACTCATGGACCAGAGAGCGTCTCAGATGAGTTTCAAGGCGATAAACATGTTATC**G
CAAATGCAAACCTTCCAAC***TCGACGAGAAAGGGTTCAATTGGGGACTATCTGTTAGG
AGGAAATCAGAGAAGGTTTTGAAGCTACTTGAGAAAGGAGATTTGCTCAAGGAAGAGAGG
AAGCGAGCTCGCGAGCTGTCTCGAGGGATTCAAGGTTTTGGTAGCTTCAACCGCAAGCCT
TCAAAGAATGAAGTCCTACAAGAATCTTCAACCTATACCAAGTACATTGAAGATGACCAA
GAGATCAACAACACAATGGTTTCTCCTAATGTCACCGGCCACTTCCCTCAGCCGTTGGTG
ATTGAGGGGAACGAGGAATCCGGGAAGAGTATGAAAGAAAATATGGATCCTGAAGATGAG
GAAAACACAGAGGTAAACCCACTTTTGGGTTGTGATAAAAAGGAGGGTCAAGATCTAGTA
GAAGAAGAAGAGAACCATCCATTTACGGATGGTGAAAATAAGCATATCGTCTCATTGCTT
GATTAGAACACAAGTTGAATATTGTTATAAATGAAATCTCGGCATGTATGTAATGTTTTG
TATACCAAAATGTATACAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 
5 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG54TF U 1
AF RR4A490TF U 43
AF RR4EI71TF U 171
AF RR4A490JQ C 347
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BS 236 367 RR4DG54TF
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BS 369 537 RR4DG54TF
BS 538 539 RR4A490TF
BS 540 559 RR4DG54TF
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BS 600 601 RR4A490TF
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BS 604 605 RR4DG54TF
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BS 850 853 RR4EI71TF
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RD RR4DG54TF 611 0 0
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GCAGCTTTTGAGTTTGAAGATTACTTGCAGATTGTCAATGTCTTGCACAAAAGATTGGCA
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GGAAA*TCAGA

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AAAAATCGAAGCAGCATCGGCATGGGAACACCTTCATTTCTTGATTTGAAGAAGCAAGCT
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CTTCAACTATTGACTGAGGAAGCTACTGATGGAGAGTCATGTGGACCAAACACACAAACC
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TTGCACAAAAGATTGGCAAAGTTTGATCAGAGGAACTGGAGAATGGCTTATAACTCACTC
ATAGTTGTTGAACATTTGCTCACTCATGGACCAGAGAGCGTCTCAGATGAGTTTCAAGGC
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TGGGGACTATCTGTTAGGAGGAA*TCAGAGAAGGTTTTGAAGCTACTTGAGAAAGGAGAT
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AGCTTCAACCGCAAGCCTTCAAAGAATGAAGTCCTACAAGAATCTTCAACCTATACCAAG
TACATTGAAGATGACCAAGAGATCAACAACACAATGGTTTCTCCTAATGTCACCGGCCAC
TTCCCTCAGCCGTTGGTGATTGAGGGG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4EI71TF 683 0 0
G
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TTCAAAGAAAAGCTCAAAACTGCGCGTTTAGCTCTCACCGACGTTACTCCTCTTCAACTA
TTGACTGAGGAAGCTACGGATGGAGAGTCATGTGGACCAAACACACAAACCTTAGGATCC
ATTTCGAAGGCAGCTTTTGAGTTTGAAGATTACTTGCAGATTGTCAATGTCTTGCACAAA
AGATTGGCAAAGTTTGAT*AGAGGAACT**AGAATGGCTTATAACTCACTCATAGTTGTT
GAACATTTGCTCACTCATGGACCAGAGAGCGTCTCAGATGAGTTTCAAGGCGATAAACAT
GTTATCTCGCAAATGCAAACCTTCCAACAGATCGACGAGAAAGGGTTCAATTGGGGACTA
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GATGACCAAGAGATCAACAACACAATGGTTTCTCCTAATGTCACCGGCCACTTCCCTCAG
CCGTTGGTGATTGAGGGGAACG

QA 2 683 2 683
DS 

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TTGTTGAACATTTGCTCACTCATGGACCAGAGAGCGTCTCAGATGAGTTTCAAGGCGATA
AACATGTTATC**GCAAATGCAAACCTTCCAAC***TCGACGAGAAAGGGTTCAATTGGG
GACTATCTGTTAGGAGGAAATCAGAGAAGGTTTTGAAGCTACTTGAGAAAGGAGATTTGC
TCAAGGAAGAGAGGAAGCGAGCTCGCGAGCTGTCTCGAGGGATTCAAGGTTTTGGTAGCT
TCAACCGCAAGCCTTCAAAGAATGAAGTCCTACAAGAATCTTCAACCTATACCAAGTACA
TTGAAGATGACCAAGAGATCAACAACACAATGGTTTCTCCTAATGTCACCGGCCACTTCC
CTCAGCCGTTGGTGATTGAGGGGAACGAGGAATCCGGGAAGAGTATGAAAGAAAATATGG
ATCCTGAAGATGAGGAAAACACAGAGGTAAACCCACTTTTGGGTTGTGATAAAAAGGAGG
GTCAAGATCTAGTAGAAGAAGAAGAGAACCATCCATTTACGGATGGTGAAAATAAGCATA
TCGTCTCATTGCTTGATTAGAACACAAGTTGAATATTGTTATAAATGAAATCTCGGCATG
TATGTAATGTTTTGTATACCAAAATGTATACAAAC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 6

CO CL1370Contig1 705 6 4 U
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TATTACTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCCACAT
CCGAAGAGCAGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTAACCATGACCAAT
ATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAG
GGGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACA
ATGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGATACAACGGTGGAGGCCGAGGTGGAGGATACAACG
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GCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGT
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GAGCTGTTATCTTTCGTGGCCGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTT


BQ
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
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35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL59JQ C 96
AF RR4DA92TF U 5
AF RR4GL59TF U 5
AF RR4F348TF U 1
AF RR4F348JQ C 110
AF RR4D234TF U 373
BS 1 356 RR4F348TF
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RD RR4GL59JQ 549 0 0
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GGAGGACACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGACACAACGGA
GGAGGCCGAGGTGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCACGGC
TGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTT
CAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAACGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTA
TGTGTCTCTATGAGTACGAAACGTCGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGA
TGTAAGCGACTTTTAGTGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGT
TTGATTATG

QA 1 549 1 549
DS 

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GG
ATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCTAAACAAGTTGAAAATGGCTTCCAAGGTATTAC
TTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCCACATCCGAAG
AGCAGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTAACCATGACCAATATGGTG
GTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGGGGAG
GATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACAATGGAG
GAGGACACAACGGAGGAGGATGCAACGGTGGAGGCCGAGGTGGAGGATACAACGGAGGAG
GCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAA
GGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAA
CGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAACGTCGAAAAC
CATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGAAG*CCAGGATTG
A

QA 3 603 3 603
DS 

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GG
ATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCTAAACAAGTTGAAAATGGCTTCCAAGGCATTAC
TTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGAAG
AGCAGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTAACCATGACCAATATGGTG
GTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGGGGAG
GATACAATGGAGGCGGTGGATACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACAACGGAG
GAGGACACAATGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGCCGAGGTGGAGGATACAACGGAGGAG
GCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAA
GGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAA
CGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTCTATGAGTACGAAACGTCGAAAAC
CATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGAAGGCCAGGATTG
ATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATG

QA 3 640 3 640
DS 

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TATTACTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCCACAT
CCGAAGAGCAGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTAACCATGACCAAT
ATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAG
GGGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACA
ATGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGATACAACGGTGGAGGCCGAGGTGGAGGATACCACG
GAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCT
GCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGT
CGATAACGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAACGTC
GAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGAAGGCCA
GGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTTGCGTTT
GAGCTGTTATCTTTCGT

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DS 

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CCATGACCAATATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGG
TTACAACGGAGGGGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAACGG
AGGAGGACACAATGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGATACAACGGTGGAGGCCGAGGTGG
AGGATACCACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGG
TTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGG
CCACTAAAAGTCGATAACGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAG
TACGAAACGTCGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTT
AGTGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATG
TCTTTGCGTTTGAGCTGTTATCTTTCGTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTT

QA 1 596 1 596
DS 

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GAGGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTT
GCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAACGTATT
AACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAACGTCGAAAACCATCGT
GGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGAAGGCCAGGATTGATTAAG
AGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTTGCGTTTGAGCTGTTATCT
TTCGTGGCCGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTT

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 6

CO CL1371Contig1 1105 6 5 U
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AAAACCCTTTTGGCCAAAGCTATAGCCAACGAGTGCCAAGCGAACTTCATCAGTGTCAAA
GGTCCTGAGCTTCTCACCATGTGGTTTGGAGAGAGCGAAGCCAACGTCCGTGAAATCTTT
GACAAGGCACGCCAGTCTGCTCCGTGTGTTCTCTTCTTCGATGAGCTCGACTCCATTGCC
ACTCAGAGAGGAGGTGGAGGCGGAGGTGATGCCGGCGGTGCAGCGGATAGAGTCCTGAAC
CAGCTTTTGACTGAGATGGATGGGATGAACGCCAAGAAGACTGTCTTCATCATCGGAGCG
ACCAACAGGCCAGACATTATTGATTCTGCTCTCCTCCGTCCAGGGAGGCTCGACCAGCTC
ATTTACATTCCACTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAACATCTTCAAGGCCGCCTTGAGG
AAGTCTCCTATTGCTAAAGATGTTGACATCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTC
AGTGGTGCTGATATCACTGAGATTTGCCAGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAAC
ATCGAGAAGGACATTGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAA
GATGGAGTGGATGAAGTGTCAGAGATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTAT
GCGCGCAGGAGTGTGAGTGATGCAGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTG
CAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTCTGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGCTGGTTCAGGT
GCAACCACTGGAGTCGCTGATCCTTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGAT
GATCTCTACAACTAAAAGATCCATCCTTTTTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGA
CTGGGAAAGTGATACTCTCATCTTTTCATAGTGTTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTT
TGACATTTCAATCAATGCTCTTTGTTAATGTTTGGGCGGCAGTTAAAAGTAGTACATGCC
CCAATAAAAGCTCAAATTTACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EE13TF U 1
AF RR4EE13JQ C 562
AF RR4G921JQ C 443
AF RR4G921TF U 443
AF RR4C473JQ C 528
AF RR4C473TF U 623
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AAAACCCTTTTGGCCAAAGCTATAGCCAACGAGTGCCAAGCGAACTTCATCAGTGTCAAA
GGTCCTGAGCTTCTCACCATGTGGTTTGGAGAGAGCGAAGCCAACGTCCGTGAAATCTTT
GACAAGGCACGCCAGTCTGCTCCGTGTGTTCTCTTCTTCGATGAGCTCGACTCCATTGCC
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CAGCTTTTGACTGAGATGGATGGGATGAACGCCAAGAAGACTGTCTTCATCATCGGAGCG
ACCAACAGGCCAGACATTATTGATTCTGCTCTCCTCCGTCCAGGGAGGCTCGACCAGCTC
ATTTACATTCCACTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAACATCTTCAAGGCCGCCTTGAGG
AAGTCTCCTATTGCTAAAGATGTTGACATCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTC
AGTGGTGCTGATATCACTGAGATTTGCCAGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAAC
ATCGAGAAGGACATTGA

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DS 

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GAGAAGAGGAGGAGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTGTCA
GAGATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGAGTGTGAGTGAT
GCAGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTTGTTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGT
TCTGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGTTGGTTCAGGTGCAACCACTGGAGTCGCTGAT
CCTTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGAT
TTTTACA

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DS 

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G
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TGACATCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTCAGTGGTGCTGATATCACTGAGAT
TTGCCAGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAGAAGGA
GAAGAGGAGGGGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTGTCAGA
GATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGAGTGTGAGTGATGC
AGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTC
TGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGCTGGTTCAGGTGCAACCACTGGAGTCGCTGATCC
TTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTACAACTAAAAGATCCA
TCCTTTTTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGACTGGGAAAGTGATACTCTCATCT
TTTCATAGTGTTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTTTGACATTTCAATCAATGCTCTTT
GTTAATGTTTGGGCGGCAGTT

QA 2 622 2 622
DS 

RD RR4G921TF 622 0 0
G
GGATTCACGTCTCAACATCTTCAAGGCCGCCTTGAGGAAGTCTCCTATTGCTAAAGATGT
TGACATCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTCAGTGGTGCTGATATCACTGAGAT
TTGCCAGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAGAAGGA
GAAGAGGAGGGGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTGTCAGA
GATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGAGTGTGAGTGATGC
AGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTC
TGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGCTGGTTCAGGTGCAACCACTGGAGTCGCTGATCC
TTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTACAACTAAAAGATCCA
TCCTTTTTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGACTGGGAAAGTGATACTCTCATCT
TTTCATAGTGTTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTTTGACATTTCAATCAATGCTCTTT
GTTAATGTTTGGGCGGCAGTT

QA 2 622 2 622
DS 

RD RR4C473JQ 578 0 0
G
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ATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAATCCAGAG
GCCATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTGTCAGAGATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAG
TCGATGAAGTATGCGCGCAGGAGTGTGAGTGATGCAGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTT
GCTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTTTGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCT
GCTGGTTCAGGTGCAACCACTGGAGTCGCTGATCCTTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCT
GCGGACGATGATGATCTCTACAACTAAAAGATCTATCCTTTTTAATATTTTAAGTTGTCA
ATCGAATTCAGACTGGGAAAGTGATACTCTCATCTTTTCATAGTGTTTTTTAAGTTTATC
AGAAACTTTGTTTGACATTTCAATCAATGCTCTTTGTTAATGTTTGGGCGGCAGTTAAAA
GTAGTACATGCCCCAATAAAAGCTCAAATTTACATCG

QA 2 578 2 578
DS 

RD RR4C473TF 483 0 0
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AGATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGAGTGTGAGTGATG
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CTGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGCTGGTTCAGGTGCAACCACTGGAGTCGCTGATC
CTTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTACAACTAAAAGATCT
ATCCTTTTTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGACTGGGAAAGTGATACTCTCATC
TTTTCATAGTGTTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTTTGACATTTCAATCAATGCTCTT
TGTTAATGTTTGGGCGGCAGTTAAAAGTAGTACATGCCCCAATAAAAGCTCAAATTTACA
TCG

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 5

CO CL1372Contig1 917 5 11 U
GGGAATCACATTCCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCGAAAAAAAA*GTCCCTCTT
CCTAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACGAA
TCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCCTCCTCCTTCT
CTCTGCATCCTCTGCTTTCTCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCAT
CGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCC
ATCTACCGTTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTC
TACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTC
GGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATC
GACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCTGATTTC
AATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGTTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCG
ATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTT
GTGGCCAAGGAAGGAGCGAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTC
AGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAAAGCTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTCACACAATG
ACAAGATCAGTTTTTATGTTTATTGCATTTATGATTTGATTCCAATTGTCAAAAAAGCTT
CCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTT
TCGAATTTCTTTTCGTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AP10TF U 2
AF RR4F327TF U 2
AF RR4B234TF U 1
AF RR4B234JQ C 177
AF RR4F327JQ C 376
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GGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCCA
TCTACCGTTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCT
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TTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAA

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CGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCC
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ATCCATCTACCGTTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTT
GCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGT
TCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGT
TATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCTGA
TTTCAATGACTTTCTTCTCTACTTTCCCATGTTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAA
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AGTTTCGAATTTCTTTTCGT

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ATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAG
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GCGAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCC
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ATGTTTATTGCATTTATGATTTGATTCCAATTGTCAAAAAAGCTTCCATTGGCATTGATG
AAGCCTTGTTTCTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTTCGAATTTCTTTTCG
TT

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 6

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G032JQ C 1
AF RR4CK91TF U 20
AF RR4G032TF U 1
AF RR4CK91JQ C 3
AF RR4AR32TF U 22
AF RR4DQ67JQ C 56
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QA 1 632 1 632
DS 

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AACTATCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACTGTTAAAATGACTCT
CAAGGGCAAGAACCCTGTGACGATGGACCATCTGAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTA
CTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACTTTGCTTGTTGAAGACACTCCTCGACT
TAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGAAGAGGTCGTGGGACGTGGTG*TC
GTGGGGCGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAAGTCGTTAAAGGCAGCGACAAGTTTAAGGG
TGTGTGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAAAACCCTTTGGTGGTGTCTCAGTTATGTA
TTTAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCTATGGATTTAAAGGATTA
AGCTTTTCATGT
CAAAA

QA 1 612 1 612
DS 

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GG
GAAGCCGGATCCGTGCCCGCCGCTAAAGAGCTAACCACTTCGAGGTACAGTCTCCACTGC
CAAAGAAGGGTTCTAGGGTTTCGCAGCTCCTTCTTCCTCTTCTTCGCAATCCCAAAGATG
AAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAAC
GGGACTGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAG
ACTGTTAAAATGACTCTCAAGGGCAAGAACCCTGTGACGATGGACCATCTGAGCTTGAGG
GGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACTTTGCTTGTT
GAAGACACTCCTCGACTTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGAAGAGGT
CGTGG*ACGTGGTGGTCGTGGG*CGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAAAGC
AGCGACAAGTTTAAGG*TGTGTGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTGGT
GGTGTCTCAGTTATGTATTTAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCT
ATGGATTTAAAGGATTAAGCTTTTCATGTT

QA 3 632 3 632
DS 

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GAAGCCGGATCCGTGCCCGCCGCTAAAGAGCTAACCACTTCGAGGTACAGTCTCCACTGC
CAAAGATGG*TTCTAGGGTTTCGCAGCTCCTTCTTCCTCTTCTTCGCA*TCCCAAAGATG
AAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAAC
GGGACTGTGGTCCATGGAACTATCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAG
ACTGTTAAAATGACTCTCAAGGGCAAGAACCCTGTGACGATGGACCATCTGAGCTTGAGG
GGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACTTTGCTTGTT
GAAGACACTCCTCGACTTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGAAGAGGT
CGTGG*ACGTGGTG*TCGTGGG*CGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAAGGC
AGCGACAAGTTTAAGG*TGTGTGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTGGT
GGTGTCTCAGTTATGTATTTAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCT
ATGGATTTAAAGGATTAAGCTTTTCATGT
C

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4AR32TF 630 0 0
GG
GCTAAAGAGCTAACCACTTCGAGGTACAGTCTCCACTGCCAAAGAAGGGTTCTAGGGTTT
CGCAGCTCCTTCTTCCTCTTCTTCGCAATCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATG
AAGTTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACTGTGGTCCATGGAACC
ATCACTGGTGTTGACGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACTGTTAAAATGACTCTCAAG
GGCAAGAACCCTGTGACGATGGACCATCTGAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTAC
ATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACTTTGCTTGTTGAAGACACTCCTCGACTTAAA
CCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGAAGAGGTCGTGG*ACGTGGTGGTCGTGG
G*CGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAAAGCAGCGACAAGTTTAAGG*TGTG
TGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTGGTGGTGTCTCAGTTATGTATTTA
GAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCTATGGATTTAAAGGATTAAGCT
TTTCATGTTATAAGGATTAAGCCTTTAA

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR4DQ67JQ 579 0 0
GGACC
GCCAAAGAAGGGTTCTAGGGTTTCGCAGCTCCTTCTTCCTCTTCTTCGCAATCCCAAAGA
TGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGA
ACGGGACTGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGA
AGACTGTTAAAATGACTCTCAAGGGCAAGAACCCTGTGACGATGGACCATCTGAGCTTGA
GGGGTAACGACATCCGCTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACTTTGCTTG
TTGAAGACACTCCTCGACTTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGAAGAG
GTCGTGG*ACGTG*TGGTCGTGGG*CGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAAA
GCAGCGACAAGTTTAAGG*TGTGTGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTG
GTGGTGTCTCAGTTATGTATTTAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACT
CTATGGATTTAAAGGATTAAGCTTTTCATGTT
AT

QA 6 577 6 577
DS 



AS 1 5

CO CL1374Contig1 747 5 10 U
GGACACTTTTGTGGTTTCGAAGCTTTGTTTCTCCGTCGCGAACGAACATGAAGATATCTC
TCTTCCTTATCTCTTTCCTCATCCTCTTACCTCTCTCCCTACAAGATCCCAGTCCAGAAG
TCAAAGCAGAAGTCAAAGCACCGACTCGTGCTCACGCGGAGCTCACCAATCATGGTTTCC
CGATTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAAGACTACTACATCAACAAAACCTCCGGCGACT
TCTCCCTCTTCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCGCCA
CTTACTCGAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCA
TCCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATA
ACCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGA
GTCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCC
AGGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAA
AGCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTACTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACT
AAGGGCTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATGTGAGACTTTAAA
AACAAGCAAGAACCATTTTATTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G845TF U 36
AF RR4DN20TF U 1
AF RR4DN20JQ C 90
AF RR4CD85JQ C 193
AF RR4CD85TF U 193
BS 1 296 RR4DN20TF
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RD RR4G845TF 624 0 0
GG
GCGAACGAACATGAAGATATCTCTCTTCCTTATCTCTTTCCTCATCCTCTTACCTCTCTC
CCTACAAGATCCCAGTCCAGAAGTCAAAGCAGAAGTCAAAGCACCGACTCGTGCTCACGC
GGAGCTCACCAATCATGGTTTCCCGATTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAAGACTACTA
CATCAACAAAACCTCCGGCGACTTCTCCCTCTTCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCT
TCCTCCCGACAACTACCTCGCCACTTACTCGAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGG
TCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCATCCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCAC
CGGGATTCGATCCTCCGGTGATAACCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATA
CCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAGTCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATT
CAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCAGGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATAT
ATTTATCTCCATCCGAAAAATAAAGCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTACTC
TATTCTTGTATTCTCTGCAAAC

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR4DN20TF 725 0 0
GGACACTTTTGTGGTTTCGAAGCTTTGTTTCTCCGTCGCGAACGAACATGAAGATATCTC
TCTTCCTTATCTCTTTCCTCATCCTCTTACCTCTCTCCCTACAAGATCCCAGTCCAGAAG
TCAAAGCAGAAGTCAAAGCACCGACTCGTGCTCACGCGGAGCTCACCAATCATGGTTTCC
CGATTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAAGACTACTACATCAACAAAACCTCCGGCGACT
TCTCCCTCTTCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCTCCA
CTTACTCCAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCA
TCCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATA
ACCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGA
GTCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCC
AGGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTGTTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAA
AGCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTACTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACT
AAGG*CTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATG
ACTTAATGTGAGACTTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4DN20JQ 636 0 0
CCTCTCTCCCTACAAGATCCCAGTCCAGAAGTCAAAGCAGAAGTCAAAGCACCGACTCGT
GCTCACGCGGAGCTCACCAATCATGGTTTCCCGATTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAA
GACTACTACATCAACAAAACCTCCGGCGACTTCTCCCTCTTCCTCCACGGCACGTGCAAA
ATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCTCCACTTACTCCAACAAGGTAACGGGTCGGATC
ACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCATCCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGG
TCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATAACCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACC
GCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAGTCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCT
TCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCAGGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTGTTT
TGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAAAGCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAAC
CACTACTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACTAAGGGCTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTG
AACTAAGTATGGGTTAATG
ACTTAATGTGAGACTTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4CD85JQ 555 0 0
G
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CCACGGCACGTGTAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCGCCACTTACTCGAACAA
GGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCATCCGGGTCAGAGC
GTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATAACCTTGTCTTCGA
GGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAGTCTTGATTGTGA
AGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCAGGACAGGAGCAA
CAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAAAGCTTGTAATGTA
AAAACCGAATCTAAACCACTACTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACTAAGGGCTCAATGG
AGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATGTGAGACTTTAAAAACAAGCAAGAAC
CATTTTATTTCTCC

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DS 

RD RR4CD85TF 555 0 0
G
CCCTCTATCCATCAAAGACTACTACATCAACAAAACCTCCGGCGACTTCTCCCTCTTCCT
CCACGGCACGTGTAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCGCCACTTACTCGAACAA
GGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCATCCGGGTCAGAGC
GTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATAACCTTGTCTTCGA
GGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAGTCTTGATTGTGA
AGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCAGGACAGGAGCAA
CAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAAAGCTTGTAATGTA
AAAACCGAATCTAAACCACTACTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACTAAGGGCTCAATGG
AGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATGTGAGACTTTAAAAACAAGCAAGAAC
CATTTTATTTCTCC

QA 2 555 2 555
DS 



AS 2 6

CO CL1375Contig1 630 2 2 U
GCATGTTCTAGATCCGCCACTTCCTCAAGGATACTACGGTAACGCGTACATAGACGTGTA
CGTCGAGTTAACCGTCAGAGAACTCGAGGAATCATCCATCTCCGACATCGCAAAGCGCGT
CAAGAAAGCCAAGAAAACGGCCTATGACAAAGGGTATATAGAGGAGGAGCTGAGCAACGG
AGAGAGACTGATGAGAGACGATGCAAAATTCGAAGGTGTGAGTGACGGTGTGTTCTTCTT
GACGGACTGGAGGAATATTGGTTGGTTTGGATCGATGGATTTTGGTTGGAACGAGCCTGT
GAATCTGAGGCCGTTGACTCAGAGGGAGAGTGCGATGCATATAGGAATGATCTTGAGACC
TTCTAAGTTAGATCCATCGATGGAAGGTGGAGTTAAGTGGTCATGACATTGCCAAGAGAT
GCAATGGTTAAGTTCAAGTTAAATATGGATGCTATGAACAAACTTTAGTTCCATTGCATA
TGAACTTTCTTTACGTTAAAAGAATAAAAGTGATATGCAAAATATGTAATAACGTTAACT
TACATCTATCATTTTCACTGCGGAACCTGAAATATTTATCATTACAGGTTCTGACATTGT
TATACAATATATGAGATTATACTTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C613JQ C 1
AF RR4C613TF U 1
BS 1 4 RR4C613JQ
BS 5 630 RR4C613TF

RD RR4C613JQ 630 0 0
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CGTCGAGTTAACCGTCAGAGAACTCGAGGAATCATCCATCTCCGACATCGCAAAGCGCGT
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AGAGAGACTGATGAGAGACGATGCAAAATTCGAAGGTGTGAGTGACGGTGTGTTTTTCTT
GACGGACTGGAGGAATATTGGTTGGTTTGGATCGATGGATTTTGGTTGGAACGAGCCTGT
GAATTTGAGGCCGTTGACTCAGAGGGAGAGTGCGATGCATATAGGAATGATCTTGAGACC
TTTTAAGTTAGATCCATCGATGGAAGGTGGAGTTAAGTGGTCATGACATTGCCAAGAGAT
GCAATGGTTAAGTTCAAGTTAAATATGGATGCTATGAACAAACTTTAGTTCCATTGCATA
TGAACTTTCTTTACGTTAAAAGAATAAAAGTGATATGCAAAATATGTAATAACGTTAACT
TACATCTATCATTTTCACTGCGGAACCTGAAATATTTATCATTACAGGTTCTGACATTGT
TATACAATATATGAGATTATACTTTGTTTG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4C613TF 630 0 0
GCAC
GTTCTAGATCCGCCACTTCCTCAAGGATACTACGGTAACGCGTACATAGACGTGTACGTC
GAGTTAACCGTCAGAGAACTCGAGGAATCATCCATCTCCGACATCGCAAAGCGCGTCAAG
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AGACTGATGAGAGACGATGCAAAATTCGAAGGTGTGAGTGACGGTGTGTTCTTCTTGACG
GACTGGAGGAATATTGGTTGGTTTGGATCGATGGATTTTGGTTGGAACGAGCCTGTGAAT
CTGAGGCCGTTGACTCAGAGGGAGAGTGCGATGCATATAGGAATGATCTTGAGACCTTCT
AAGTTAGATCCATCGATGGAAGGTGGAGTTAAGTGGTCATGACATTGCCAAGAGATGCAA
TGGTTAAGTTCAAGTTAAATATGGATGCTATGAACAAACTTTAGTTCCATTGCATATGAA
CTTTCTTTACGTTAAAAGAATAAAAGTGATATGCAAAATATGTAATAACGTTAACTTACA
TCTATCATTTTCACTGCGGAACCTGAAATATTTATCATTACAGGTTCTGACATTGTTATA
CAATATATGAGATTATACTTTGTTTG

QA 5 630 5 630
DS 



CO CL1375Contig2 1526 4 4 U
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GAAATGAAACAAACTGAACTCGTCACACCCTCAAAGCACACTCCTCGTGAAGTCCTATCC
CTTTCTACTCTAGACAGCGATGTTCTCAATGAAGATATGTACGCTACGATTTATGTTTAC
AAAGCCAATGAACATAATAAAAACGATCCTGTCACTCTGCTTAGGAAAGCTTTGTCCGAG
CTTCTTGTGTATTATTATCCACTTTCAGGCAAGCTTGTGAGAGGAGAGAGTGGCCGAAAG
CCTCAGCTAGTTTGCCAGGGTGAGGGAGTCCCATTTGCTGTCGCTACGGCATCACTAGAC
CTCACTTCTCTAGACTATTTGGAAAAGCTTGATGATGAAGTTGCTTTGCGTCTGGTGCCT
GAGATTGAAATTGACTATGATACTGACTTTTGTTATCATCCTCTAGCTTTGCAAGTGACC
AAGTTTGCTTGTGGAGGGTTTACCATTGGCACTGCATTGACGCACGTTGTGTGTGATGGA
TTTGGTGTGGCTCAGATCATCCATGCTTTAACCGAGTTCGCTGCAGGAAAGAGTGAACCA
TCGGTGGTTCCGGTGTGGCAGAGGGAGCGGCTTGTTGGGAAAATTGATAGTGAACCGGCC
AAAGTACCCGGTGGCCACATTGCTAGTCTTTTGGCCACCTCACCGTACATGCCAACTACT
GATCTGGTCACAGAGATAATAAACATTCAGGCTGTGAATATAAAGAGGCTAAAAGACACT
CTGATGAGAGAATGCGAGTTCCCTGAAGAGTGTTTCACCACATACGAAGTACTTAGTTCT
TGCATATGGAAAGCAAGGTCTCGAGCCCTTAAACTAAACCCTGACGGGATCACTGTCCTT
GCCGTAGCTGTTGGGATCCGACATGTTCTAGATCCACCACTTCCTCAAGGATACTACGGT
AACGCGTACATAGACGTGTATGTCGAGTTAACAGTCAGAGAACTCGAACAATCATCGATC
TCCAATATCGCAAAGCGCGTCAAGAAAGCCAAGAAAACAGCCTACGACAAGGGGTATATA
GAGGAGGAGCTTAGTAACGGAGAGAGACTGATGAGGGATGATGCCAAATTCGAAGGTGTG
AGTGACGGTGTGTTTTTCTTGACGGATTGGAGGAATATTGGTTGGTTCGGATCGATGGAT
TTTGGTTGGAACGAGCCTGTGAATCTGAGGCCGTTGACTCAGAGGGAGAGCGCGATGCAT
ATAGGAACGATCTTGAGACCTTTTAAGTTAGATCCATCGATGGAAGGTGGAGTTAAAGTG
GTCATGACATTGCCAAGAGATGCAATGGTTAAGTTCAAGTTAAATATGGATGCTATGAAC
AAACTTTAGTTCCATTGCATATGAACTTTCTTTACGTTAAAAGAATAAAAGTGATATGCA
AAATATGTAATAATGTTAACTTACATCTACCATTTTCACTGCGGAACCTGAAATATTTAT
CATTACAGGTTCTGACATTGTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D923TF U 1
AF RR4BS34TF U 392
AF RR4BS34JQ C 836
AF RR4D923JQ C 838
BS 1 568 RR4D923TF
BS 569 1007 RR4BS34TF
BS 1008 1488 RR4BS34JQ
BS 1489 1526 RR4D923JQ

RD RR4D923TF 568 0 0
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GAAATGAAACAAACTGAACTCGTCACACCCTCAAAGCACACTCCTCGTGAAGTCCTATCC
CTTTCTACTCTAGACAGCGATGTTCTCAATGAAGATATGTACGCTACGATTTATGTTTAC
AAAGCCAATGAACATAATAAAAACGATCCTGTCACTCTGCTTAGGAAAGCTTTGTCCGAG
CTTCTTGTGTATTATTATCCACTTTCAGGCAAGCTTGTGAGAGGAGAGAGTGGCCGAAAG
CCTCAGCTAGTTTGCCAGGGTGAGGGAGTCCCATTTGCTGTCGCTACGGCATCACTAGAC
CTCACTTCTCTAGACTATTTGGAAAAGCTTGATGATGAAGTTGCTTTGCGTCTGGTGCCT
GAGATTGAAATTGACTATGATACTGACTTTTGTTATCATCCTCTAGCTTTGCAAGTGACC
AAGTTTGCTTGTGGAGGGTTTACCATTGGCACTGCATTGACGCACGTTGTGTGTGATGGA
TTTGGTGTGGCTCAGATCATCCATGCTT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4BS34TF 622 0 0
ATGATGAAGTTGCTTTGCGTCTGGTGCCTGAGATTGAAATTGACTATGATACTGACTTTT
GTTATCATCCTCTAGCTTTGCAAGTGACCAAGTTTGCTTGTGGAGGGTTTACCATTGGCA
CTGCATTGACGCATGTTGTGTGTGATGGATTTGGTGTGGCTCAGATCATCCATGCTTTAA
CCGAGTTCGCTGCAGGAAAGAGTGAACCATCGGTGGTTCCGGTGTGGCAGAGGGAGCGGC
TTGTTGGGAAAATTGATAGTGAACCGGCCAAAGTACCCGGTGGCCACATTGCTAGTCTTT
TGGCCACCTCACCGTACATGCCAACTACTGATCTGGTCACAGAGATAATAAACATTCAGG
CTGTGAATATAAAGAGGCTAAAAGACACTCTGATGAGAGAATGCGAGTTCCCTGAAGAGT
GTTTCACCACATACGAAGTACTTAGTTCTTGCATATGGAAAGCAAGGTCTCGAGCCCTTA
AACTAAACCCTGACGGGATCACTGTCCTTGCCGTAGCTGTTGGGATCCGACATGTTCTAG
ATCCACCACTTCCTCAAGGATACTACGGTAACGCGTACATAGACGTGTATGTCGAGTTAA
CAGTCAGAGAACTCGA
ACAATC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4BS34JQ 653 0 0
GT
TCTTGCATATGGAAAGCAAGGTCTCGAGCCCTTAAACTAAACCCTGACGGGATCACTGTC
CTTGCCGTAGCTGTTGGGATCCGACATGTTCTAGATCCACCACTTCCTCAAGGATACTAC
GGTAACGCGTACATAGACGTGTATGTCGAGTTAACAGTCAGAGAACTCGAACAATCATCG
ATCTCCAATATCGCAAAGCGCGTCAAGAAAGCCAAGAAAACAGCCTACGACAAGGGGTAT
ATAGAGGAGGAGCTTAGTAACGGAGAGAGACTGATGAGGGATGATGCCAAATTCGAAGGT
GTGAGTGACGGTGTGTTTTTCTTGACGGATTGGAGGAATATTGGTTGGTTCGGATCGATG
GATTTTGGTTGGAACGAGCCTGTGAATCTGAGGCCGTTGACTCAGAGGGAGAGCGCGATG
CATATAGGAACGATCTTGAGACCTTTTAAGTTAGATCCATCGATGGAAGGTGGAGTTAAA
GTGGTCATGACATTGCCAAGAGATGCAATGGTTAAGTTCAAGTTAAATATGGATGCTATG
AACAAACTTTAGTTCCATTGCATATGAACTTTCTTTACGTTAAAAGAATAAAAGTGATAT
GCAAAATATGTAATAATGTTAACTTACATCTACCATTTTCACTGCGGAACC

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR4D923JQ 689 0 0
TCTTGCATATGGAAAGCAAGGTCTCGAGCCCTTAAACTAAACCCTGACGGGATCACTGTC
CTTGCCGTAGCTGTTGGGATCCGACATGTTCTAGATCCACCACTTCCTCAAGGATACTAC
GGTAACGCGTACATAGACGTGTATGTCGAGTTAACAGTCAGAGAACTCGAACAATCATCG
ATCTCCGATATCGCAAAGCGCGTCAAGAAAGCCAAGAAAACAGCCTACGACAAGGGGTAT
ATAGAGGAGGAGCTTAGTAACGGAGAGAGACTGATGAGGGATGATGCCAAATTCGAAGGT
GTGAGTGACGGTGTGTTTTTCTTGACGGATTGGAGGAATATTGGTTGGTTCGGATCGATG
GATTTTGGTTGGAACGAGCCTGTGAATTTGAGGCCTTTGACTCAGAGGGAGAGCGCGATG
CATATAGGAATGATCTTGAGACCTTTTAAGTTAGATCCATCGATGGAAGGTGGAGTTAAA
GTGGTCATGACATTGCCAAGAGATGCAATGGTTAAGTTCAAGTTAAATATGGATGCTATG
AACAAACTTTAGTTCCATTGCATATGAACTTTCTTTACGTTAAAAGAATAAAAGTGATAT
GCAAAATATGTAATAATGTTAACTTACATCTATCATTTTCACTGCGGAACCTGAAATATT
TATCATTACAGGTTCTGACATTGTTATAC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL1376Contig1 1405 4 7 U
GTCGGGGTTGAAATTCACCCTTTTCCCTATAAAAAACACCAAACGTAAATGATGAATACA
TACGATGGCGGGTGAAGATTCGCCTTTATAATGTCAAGAGAAACAATAGCAAAGAAAATG
AAGCTAAGAAAGGTTCCATAAACATATAGTAGAAAGTACATTGCAGAAGTAAACATCAAA
AGAACAATGAAATCTTCTACAACATTCTGATAACCATGTCGTAAGAAGACAAACATTAGA
CTTGCTCATTTCTCATCTTCATCACTGGATAACCCGAGTTCTATTTTCACCTGCTTATCT
TCTTTACCAGTCTTGTTGGAGGATCCTGGTGATTCTGGATGTT***CATCCTTTTGTTTC
ACAAGATGTTCTTCTGTTGGTTTCGGACCACCAGCATCTTTGCTTCCTGATGATTCTTGC
TCCATCACGGACAACGCCTTCTTCTCAGTTTCATCGTAAATAGATAGAACGCGTTGGAGC
TCATCGTTGAGATGCAGAGCCTCAAAAAGAACACTCTCATCGTCTGTTGTGCTCTCTATG
ATCATTTGAATCAACGGTTGTGACTGCTTGCATTTCTCCATCAGGCTTACTGTTAGCTCG
TCCTCTGTGTGATTCGGCTTTCCATCAGTGTTTAACATGCTAGAGAGCAACTCGAGGCTG
TTCCGTGTAATCTCAATCTGTTCTTTCTTATCCTTGATCGATAAGTTCCCAAAGTTATAG
TCAAGAAGAC********CACCATCACGGTCTCCACGAGCATGTTCTTGATTAGGAGGAA
CAGGATAGCTACCAGGTGGAGGAACTGGAACAGGGCGTTGCATGAGAGACTCCAGAGAAC
TCTGTCCCGCCACTGGATTCTCCTCGTTACGTGCGTTCAAACCATTCTCTCCCTCCAAGC
TCATATAAGTCTGCTTGAAAACAGGAAGATAAGCAAGATCTTTAGACCGTCCCCAAGCTC
TAATAAGCTGAAAAGCTCTGCTCCTGTTCTCAGTTCATAGCACAAGCCTCGAGAAGCTCA
AGGCTCAGCCTCTGGCTCACGGGGCTTTTGTTATTACCAGAGATCTTCCTCTTGATGGCT
CTGACGATCTCGACGGCGTTGAACTCCTGGCTGTTGATCTGAGCGCATATCCTCATGTTC
ATACCCCAGTTAGGCTCCTCGAGAGTCTCGAGAGTTGCTTCGTCGACCATTTTGGATTCC
AGGGTCGGAGCTTGGAGGATGTCTTTGAACTTCTCGCTCACCATCCTGCTCATCTGAGCT
CCTCCTGTCTTCAGCTTCTCTCCCCACTCAGCTATCTTCAATTTGTCCATCTTTCTTGTG
ATTCACCTGAGATGTAGTTTCGTTTGGGACGATCAAATCTTGTCGAAAAATCTTGTCTTG
TTTGGTGTCAAAGCTTTGAACCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
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20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 10 10 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G123JQ U 1
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AF RR4AX22JQ U 120
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AGAACAATGAAATCTTCTACAACATTCTGATAACCATGTCGTAAGAAGACAAACATTAGA
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TCTTTACCAGTCTTGTTGGAGGATCCTGGTCATTCTGGATGTTGTTCATCCTTTTGTTTC
ACAAG
CTGTGATTCTGCTGGTTT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4BN66JQ 624 0 0
A
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GAAATCTTCTACAACATTCTGATAACCATGTCGTAATAAGACAAACATTAAACTTGCTCA
TTTCTCATCTTCATCACTGGATAACCCGAGTTCTATTTTCACCTGCTTATCTTCTTTACC
AGTCTTGTTGGAGGATCCTGGTGATTCTGGATGTT***CATCCTTTTGTTTCACAAGATG
TTCTTCTGTTGGTTTCGGACCACCAGCATCTTTGCTTCCTGATGATTCTTGCTCCATCAC
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TCTTGTGATTCACCAAAACTTTC

QA 2 624 2 624
DS 

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GG
AGCTAAGAAAGGTTCCATAAACATATAGTAGAAAGTACATTGCAGAAGTAAACATCAAAA
GAACAATGAAATCTTCTACAACATTCTGATAACCATGTCGTAAGAAGACAAACATTAGAC
TTGCTCATTTCTCATCTTCATCACTGGATAACCCGAGTTCTATTTTCACCTGCTTATCTT
CTTTACCAGTCTTGTTGGAGGATCCTGGTGATTCTGGATGTT***CATCCTTTTGTTTCA
CAAGATGTTCTTCTGTTGGTTTCGGACCACCAGCATCTTTGCTTCCTGATGATTCTTGCT
CCATCACGGACAACGCCTTCTTCTCAGTTTCATCGTAAATAGATAGAACGCGTTGGAGCT
CATCGTTGAGATGCAGAGCCTCAAAAAGAACACTCTCATCGTCTGTTGTGCTCTCTATGA
TCATTTGAATCAACGGTTGTGACTGCTTGCATTTCTCCATCAGGCTTACTGTTAGCTCGT
CCTCTGTGTGATTCGGCTTTCCATCAGTGTTTAACATGCTAGAGAGCAACTCGAGGCTGT
TCCGTGTAATCTCAATCTGTTCTTTCTTATCCTTGATCGATAAGTTCCCAAAGTTATAGT
CAAGAAGAC********CACCATCACGGTCTCCACGAGCATGTTCTTGATTAGGAGGAAC
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CTGTCCCGCCACTGGATTCTCCTCGTTACGTGCGTTCAAACCATTCTCTCCCTCCAAGCT
CATATAAGTCTGCTTGAAAACAGGAAGATAAGCAAGATCTTTAGACCGTCC

QA 3 833 3 833
DS 

RD RR4AX22TF 890 0 0
CTCATCGTCTGT*GTGCTCTCTATGATCATT*GAATCAACGGTTGTGACTGCTTGCATTT
CTCCATCAGGCTTACTGTTAGCTCGTCCTCTGTGTGATTCGGCTTTCCATCAGTGTTTAA
CATGCTAGAGAGCAACTCGAGGCTGTTCCGTGTAATCTCAATCTGTTCTTTCTTATCCTT
GATCGATAAGTTCCCAAAGTTATAGTCAAGAAGAC********CACCATCACGGTCTCCA
CGAGCATGTTCTTGATTAGGAGGAACAGGATAGCTACCAGGTGGAGGAACTGGAACAGGG
CGTTGCATGAGAGACTCCAGAGAACTCTGTCCCGCCACTGGATTCTCCTCGTTACGTGCG
TTCAAACCATTCTCTCCCTCCAAGCTCATATAAGTCTGCTTGAAAACAGGAAGATAAGCA
AGATCTTTAGACCGTCCCCAAGCTCTAATAAGCTGAAAAGCTCTGCTCCTGTTCTCAGTT
CATAGCACAAGCCTCGAGAAGCTCAAGGCTCAGCCTCTGGCTCACGGGGCTTTTGTTATT
ACCAGAGATCTTCCTCTTGATGGCTCTGACGATCTCGACGGCGTTGAACTCCTGGCTGTT
GATCTGAGCGCATATCCTCATGTTCATACCCCAGTTAGGCTCCTCGAGAGTCTCGAGAGT
TGCTTCGTCGACCATTTTGGATTCCAGGGTCGGAGCTTGGAGGATGTCTTTGAACTTCTC
GCTCACCATCCTGCTCATCTGAGCTCCTCCTGTCTTCAGCTTCTCTCCCCACTCAGCTAT
CTTCAATTTGTCCATCTTTCTTGTGATTCACCTGAGATGTAGTTTCGTTTGGGACGATCA
AATCTTGTCGAAAAATCTTGTCTTGTTTGGTGTCAAAGCTTTGAACCTCC

QA 1 890 1 890
DS 



AS 2 5

CO CL1377Contig1 762 2 2 U
AATACTTAATCTTTAGCTAAAAGACAGAACAATAAAAGTGTTGTAAGCGCATTCGACAAG
AAAACAAACACAAAAGTTGTGTGACAAGAAAAACAATTACAAAACCATGACAAGACGAGT
CATCCTTTTGTCCTTTTTTAATATCGAAACCCAACAAGTCATTCAATGAAGATGTTTCAT
TGTACAATAGACAGGTTTTGACCAAGTATACAGTGCATATATAGTCAAATGACAGAGCAC
TTTTTATTTTTACATCATATGGGTGTGAAAACAGGTAAAAACCACCTGAGATGATCAGAT
GAATGCAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTACCTTTCTACCTTGTGTGGTTGAACCAG
AGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGGAGAATCATCATCTGCCAACTT
GAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATAAACACCTCTTGAAGCGCTATACTTGAA
TGAAACTCTGGTAGCACGCTCCGACTTGGTGTCGTTGAATCCAGATTTGAGAAGATGATG
ATACGAGTTTCCCAACGTGGCTGTTCCAAGATTGACAATTCTTCCCACAACTTGAGGTCT
TGTCAGGAGTCGTGTTTTCGCACCGTAGAACATTGCCTGATGCTTAAAGAACCCTTCAAG
CAAACCGAAGGTAGCGTTGGCGTTGAAAGTATTCACAATGTGTAAAGCACGAGAGGTTAC
ATACGCATTGTCATGGTACGGTAACGGAAGGAGGTGGAGGAG


BQ
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AF RR4F185JQ U 1
AF RR4FJ60JQ U 114
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CATCCTTTTGTCCTTTTTTAATATCGAAACCCAACAAGTCATTCAATGAAGATGTTTCAT
TGTACAATAGACAGGTTTTGACCAAGTATACAGTGCATATATAGTCAAATGACAGAGCAC
TTTTTATTTTTACATCATATGGGTGTGAAAACAGGTAAAAACCACCTGAGATGATCAGAT
GAATGCAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTACCTTTCTACCTTGTGTGGTTGAACCAG
AGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGGAGAATCATCATCTGCCAACTT
GAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATAAACACCTCTTGAAGCGCTATACTTGAA
TGAAACTCTGGTAGCACGCTCCGACTTGGTGTCGTTGAATCCAGATTTGAGAAGATGATG
ATACGAGTTTCCCAACGTGGCTGTTCCAAGATTGACAATTCTTCCCACAACTTGAGGTCT
TGTCAGGAGTCGTGTT

QA 1 616 1 616
DS 

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GTTTCATTGTACAATAGACAGGTTTTGACCAAGTATACAGTGCATATATAGTCAAATGAC
AGAGCACTTTTTATTTTTACATCATATGGGTGTGAAAACAGGTAAAAACCACCTGAGATG
ATCAGATGAATGCAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTACCTTTCTACCTTGTGTGGTT
GAACCAGAGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGGAGAATCATCATCTG
CCAACTTGAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATAAACACCTCTTGAAGCGCTAT
ACTTGAATGAAACTCTGGTAGCACGCTCCGACTTGGTGTCGTTGAATCCAGATTTGAGAA
GATGATGATACGAGTTTCCCAACGTGGCTGTTCCAAGATTGACAATTCTTCCCACAACTT
GAGGTCTTGTCAGGAGTTGTGTTTTCGCACCGTAGAACATTGCCTGATGCTTAAAGAACC
CTTCAAGCAAACCGAAGGTAGCGTTGGCGTTGAAAGTATTCACAATGTGTAAAGCACGAG
AGGTTACATACGCATTGTCATGGTACGGTAACGGAAGGAGGTGGAGGAG

QA 1 649 1 649
DS 



CO CL1377Contig2 876 3 5 U
GGGAAAGAGCTAGAAAATGATCAGAACCATTTTACTCTTCTTCCTTGTCTTCTTCATCGG
AACGCAAGTCAACACGCAGCTAATTCCGCCGGCGAGGCCCGATGGTTTCGTTTACCAACC
GGGTCGTCATCGTGTTGACCCGGATACTATACTAATCGAGGCGTTTTATGACCCGGTTTG
CCCGTACAGTAGAGACTCTTGGCCGCCGCTGAAGCAAGCGCTTAAACACTATGGATCTCG
CGTTTCCCTTCTCCTCCACCTCCTTCCGTTACCGTACCATGACAATGCGTATGTAACCTC
TCGTGCTTTACACATTGTGAATACTTTCAACGCCAACGCTACCTTCGGTTTGCTTGAAGG
GTTCTTTAAGCATCAGGCAATGTTCTACGGTGCGAAAACACAACTCCTGACAAGACCTCA
AGTTGTGGGAAGAATTGTCAATCTTGGAACAGCCACGTTGGGAAACTCGTATCATCATCT
TCTCAAATCTGGATTCAACGACACCAAGTCGGAGCGTGCTACCAGAGTTTCATTCAAGTA
TAGCGCTTCAAGAGGTGTTTATGGAACACCAACCTTCTACGTGAACGGGTTCAAGTTGGC
AGATGATGATTCTCCTTCGGATTTTAGAGGATGGAAAAAGATTATTGATTCTCTGATTCA
ACCACACAAGGTAGAAAGGTAGCCAGAGATTCAAGATGATCTTATTTCATTTCATCTGAT
CATCCCAAGTGCTTTTTACCTGTTTTCACATTCAAATCATGTAAAAATAAAAAGTGCTAT
GTCATCTGACTATATTATGCACTGTATATATGTACTTGGTCAAAACCTGTCTATTGTACA
ATGAAACATCATCATTGAATGACTTGTTGGGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FJ60TF U 1
AF RR4F185TF U 7
AF RR4BE83JQ C 127
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RD RR4FJ60TF 639 0 0
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GTTCTTTAAGCATCAGGCAATGTTCTACGGTGCGAAAACACAACTCCTGACAAGACCTCA
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TCTCAAATCTGGATTCAACGACACCAAGTCGGAGCGTGCTACCAGAGTTTCATTCAAGTA
TAGCGCTTCAAGAGGTGTTTATGGAACACCAACCTTCTACGTGAACGGGTTCAAGTTGGC
AGATGATGATTCTCCTTCGGATTTTAGAGGATGGAAAAA

QA 1 639 1 639
DS 

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GG
GCTAGAAAATGATCAGAACCATTTTACTCTTCTTCCTTGTCTTCTTCATCGGAACGCAAG
TCAACACGCAGCTAATTCCGCCGGCGAGGCCCGATGGTTTCGTTTACCAACCGGGTCGTC
ATCGTGTTGACCCGGATACTATACTAATCGAGGCGTTTTATGACCCGGTTTGCCCGTACA
GTAGAGACTCTTGGCCGCCGCTGAAGCAAGCGCTTAAACACTATGGATCTCGCGTTTCCC
TTCTCCTCCACCTCCTTCCGTTACCGTACCATGACAATGCGTATGTAACCTCTCGTGCTT
TACACATTGTGAATACTTTCAACGCCAACGCTACCTTCGGTTTGCTTGAAGGGTTCTTTA
AGCATCAGGCAATGTTCTACGGTGCGAAAACACGACTCCTGACAAGACCTCAAGTTGTGG
GAAGAATTGTCAATCTTGGAACAGCCACGTTGGGAAACTCGTATCATCATCTTCTCAAAT
CTGGATTCAACGACACCAAGTCGGAGCGTGCTACCAGAGTTTCATTCAAGTATAGCGCTT
CAAGAGGTGTTTATGGAACACCAACCTTCTACGTGAACGGGTTCAAGTTGGCAGATGATG
ATTCTCCTTCGGATTTTAGAGGATGGAAAAAGATTATTGATTCTCTGGTTCAACCACACA
AG
TAG

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4BE83JQ 750 0 0
TCATCGTGTTGGCCCCGATACTATACTAATCGAGGCGTTTTATGACCCGGTTTGCCCGTA
CAGCAGAGACTCTTGGCCGCCGCTGAAGCAAGCGCTTAAACACTATGGATCTCGCGTTTC
CCTTCTCCTCCACCTCCTTCCGTTACCGTACCATGACAATGCGTATGTAACCTCTCGTGC
TTTACACATTGTGAATACTTTCAACGCCAACGCTACCTTCGGTTTGCTTGAAGGGTTCTT
TAAGCATCAGGCAATGTTTTACGGTGCGAAAACACAACTCCTGACAAGAACTCAAGTTGT
GGGAAGAATTGTCAATCTTGGAAC*GCCACGTTGGGAAACTCGTATCATCATCTTCTCAA
ATCTGGATTCAACGACACCAAGTCGGAACGTGCAACCAGAGTTTCATTCAAGTATAGCGC
TTCAAGAGGTGTTTATGGAACACCAACCTTTTACGTGAACGGGTTCAAGTTGGCAGATGA
TGATTCTCCTTCGGATTTTAGAGGATGGAAAAAGATTATTGATTTTTTGATTCAACCACA
CAAGGTAGAAAGGTAGCCAGAGATTCAAGATGATCTTATTTCATTTCATCTGATCATCCC
AAGTGCTTTTTACCTGTTTTCACATTCAAATCATGTAAAAATAAAAAGTGCTATGTCATC
TGACTATATTATGCACTGTATATATGTACTTGGTCAAAACCTGTCTATTGTACAATGAAA
CATCATCATTGAATGACTTGTTGGGTTTCG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 5

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ACAATCACCACCCAACGTTGAAAGAAACAATACAACAAGACAATATCATGAAACTATATA
TTACATGCAATAAAAACCATCAAGAACATAGAAACACCAAACAAATCATATCTATTTATG
GAACTCGATAACAGAATAGGAATACGAAGGGCAAATAACTTCACATCGGAGAAAACCTGA
AGCAACTGCTAGTTTTTCAAACTGCGATAGAGATCTTTCTTTACCATTTGAGCATTGTGT
TAACATCAACAAGTCCATAGCAAACACGATGTTAGAGTGAAAATCGCTAGGCTTTGGTTC
TACTGGTGTAATCATCTCTACAAGGATCACTTTTCCTTTTTCTGGAAGACTCTTCCAACA
ATTTTTTAGAAGCTTTATACAATGTTCGTCCGTCCAATCATGTAGTATCCATTTCATAAA
GACGGCATCTCCCCT*GGAACTTCTATAAACATGTCTCCGGAGACATGCTCAACTCCTGG
ATAAGATGGAGCATTGGTTAAAACCTGAGCTAAGTCAAAATTAATACCCTTGATATGAGG
ATGCTTGGAAGTGATTAAGCCTAATATAGTGCCAGTTGCTCCTCCTACATCCACCAAAGT
GTTAACATCTTCAAATCCTCTGTAAACCTCTAGAACTTTCTTCATGACCATTGTGGCAGA
ATCTGACATGGCCCGGTGAAACACCTCAGAGAATTGTTGGTCCGTACTAATGTATTCGAA
AAGTGGCATGCCTTGTGCAGAGATGAATGCATCTTTTCCATCTAATATTACATCTTTGAG
ATTGTCCCAAGTATTAAAATGGACTTGGGTATGGAACAACAAGAACAAAGACACGAGAGA
ACCAGATCCGTCAGTATCCTTCAAGAAATATTTGCAAACCGATTCGGCTGCATATACCCT
CTCAGTGTTTCCGGTTCGATCCTTCTCTACGGTTTCAATTACCCGGCATTTTAAGATGGA
GTGGCTAACCAGTAACCGCAGCATCCGGTCCAGCAAAATCGGTGCCTCCTGGTTCTTGGG
TTTGATTGGGAGACTAGCCGTTATCTCAGACGGTGAGAGCCATGCACCGTCGCCTGCAGC
AGCGATGGTATCGATGACGCCAAGCTCCAGGGCAGCCTTGAGGACCATGGGGAAAGCTAT
GGTGTTGACGATACTCTCAGCTTGCAAGCTAACCATTTTCTCGTCGACTTCTTGGTCTTT
TTTGGTTGAAATCGGTTCAGGGCAAGTGGTTAAGGGCAAATGAAGATGGTTTGACATTAT
TTGTTGAAGGATTGAGAAGTAAAGACTACAAAGGTAGTGTTAGTTGGCGAAGTGTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN33JQ U 34
AF RR4DE66JQ U 1
AF RR4DE66TF C 1
AF RR4DC38JQ U 153
AF RR4DC38TF C 702
BS 1 627 RR4DE66JQ
BS 628 776 RR4DC38JQ
BS 777 1377 RR4DC38TF

RD RR4BN33JQ 103 0 0
TTGGCACAACTACAGTTCATTAATACTACAATCCCCACCCAACGTTGAAAAAAACAATAC
AACAAGACAATATCATGAAACTATATATTACATGCAATAAAAA

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR4DE66JQ 628 0 0
AAGCAGGTTACAATAGTTTTAGCATAAGCACACTTGGCACAACTACAGTTCATTAATACT
ACAATCACCACCCAACGTTGAAAGAAACAATACAACAAGACAATATCATGAAACTATATA
TTACATGCAATAAAAACCATCAAGAACATAGAAACACCAAACAAATCATATCTATTTATG
GAACTCGATAACAGAATAGGAATACGAAGGGCAAATAACTTCACATCGGAGAAAACCTGA
AGCAACTGCTAGTTTTTCAAACTGCGATAGAGATCTTTCTTTACCATTTGAGCATTGTGT
TAACATCAACAAGTCCATAGCAAACACGATGTTAGAGTGAAAATCGCTAGGCTTTGGTTC
TACTGGTGTAATCATCTCTACAAGGATCACTTTTCCTTTTTCTGGAAGACTCTTCCAACA
ATTTTTTAGAAGCTTTATACAATGTTCGTCCGTCCAATCATGTAGTATCCATTTCATAAA
GACGGCATCTCCCCT*GGAACTTCTATAAACATGTCTCCGGAGACATGCTCAACTCCTGG
ATAAGATGGAGCATTGGTTAAAACCTGAGCTAAGTCAAAATTAATACCCTTGATATGAGG
ATGCTTGGAAGTGATTAAGCCTAATAT
C

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4DE66TF 628 0 0
AAGCAGGTTACAATAGTTTTAGCATAAGCACACTTGGCACAACTACAGTTCATTAATACT
ACAATCACCACCCAACGTTGAAAGAAACAATACAACAAGACAATATCATGAAACTATATA
TTACATGCAATAAAAACCATCAAGAACATAGAAACACCAAACAAATCATATCTATTTATG
GAACTCGATAACAGAATAGGAATACGAAGGGCAAATAACTTCACATCGGAGAAAACCTGA
AGCAACTGCTAGTTTTTCAAACTGCGATAGAGATCTTTCTTTACCATTTGAGCATTGTGT
TAACATCAACAAGTCCATAGCAAACACGATGTTAGAGTGAAAATCGCTAGGCTTTGGTTC
TACTGGTGTAATCATCTCTACAAGGATCACTTTTCCTTTTTCTGGAAGACTCTTCCAACA
ATTTTTTAGAAGCTTTATACAATGTTCGTCCGTCCAATCATGTAGTATCCATTTCATAAA
GACGGCATCTCCCCT*GGAACTTCTATAAACATGTCTCCGGAGACATGCTCAACTCCTGG
ATAAGATGGAGCATTGGTTAAAACCTGAGCTAAGTCAAAATTAATACCCTTGATATGAGG
ATGCTTGGAAGTGATTAAGCCTAATAT
C

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4DC38JQ 624 0 0
AACACCAAACAAATCATATCTATTTATGGAACTCGATAACAGAATGGGAATACGAATGGC
AAATAACTTCACATCGGAGAAAACCTGAAGCAACTGCTAGTTTTTCAAACTGCGATGGAG
ATCTTTCTTTACCATTTGAGCATTGTGTTAACATCAACAAGTCCATAGCAAACACGATGT
TAGAGTGAAAATCGCTAGGCTTTGGTTCTACTGGTGTAATCATCTCTACAAGGATCACTT
TTCCTTTTTCTGGAAGACTCTTCCAACAATTTTTTAGAAGCTTTATACAATGTTCGTCCG
TCCAATCATGTAGTATCCATTTCATAAAGACGGCATCTCCCTTTGGAACTTCTATAAACA
TGTCTCCGGAGACATGCTCAACTCCTGGATAAGATGGAGCATTGGTTAAAACCTGAGCTA
AGTCAAAATTAATACCCTTGATATGAGGATGCTTGGAAGTGATTAAGCCTAATATAGTGC
CAGTTGCTCCTCCTACATCCACCAAAGTGTTAACATCTTCAAATCCTCTGTAAACCTCTA
GAACTTTCTTCATGACCATTGTGGCAGAATCTGACATGGCCCGGTGAAACACCTCAGAGA
ATTGTTGGTCCGTACTAATGTATT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4DC38TF 676 0 0
TCATGACCATTGTGGCAGAATCTGACATGGCCCGGTGAAACACCTCAGAGAATTGTTGGT
CCGTACTAATGTATTCGAAAAGTGGCATGCCTTGTGCAGAGATGAATGCATCTTTTCCAT
CTAATATTACATCTTTGAGATTGTCCCAAGTATTAAAATGGACTTGGGTATGGAACAACA
AGAACAAAGACACGAGAGAACCAGATCCGTCAGTATCCTTCAAGAAATATTTGCAAACCG
ATTCGGCTGCATATACCCTCTCAGTGTTTCCGGTTCGATCCTTCTCTACGGTTTCAATTA
CCCGGCATTTTAAGATGGAGTGGCTAACCAGTAACCGCAGCATCCGGTCCAGCAAAATCG
GTGCCTCCTGGTTCTTGGGTTTGATTGGGAGACTAGCCGTTATCTCAGACGGTGAGAGCC
ATGCACCGTCGCCTGCAGCAGCGATGGTATCGATGACGCCAAGCTCCAGGGCAGCCTTGA
GGACCATGGGGAAAGCTATGGTGTTGACGATACTCTCAGCTTGCAAGCTAACCATTTTCT
CGTCGACTTCTTGGTCTTTTTTGGTTGAAATCGGTTCAGGGCAAGTGGTTAAGGGCAAAT
GAAGATGGTTTGACATTATTTGTTGAAGGATTGAGAAGTAAAGACTACAAAGGTAGTGTT
AGTTGGCGAAGTGTCC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 2 6

CO CL1379Contig1 577 4 1 U
TTTTTTGCTAGAATCAGAATGGGAGAAGTGGCTGCTCAGATTCCGACGAGTTTCGGCCAC
GAGCTCAGAGCTTGTCTTCGATGCCGCCTCGTCAAGACCTACGATCAGTTTAGGGATTCT
GGGTGCGAGAATTGCCCTTTCTTCAAAATAGACGAGGACCCTGAGCGTATCGTTGATGTT
ACCACCCCTAATTTCAACGGTACAATCTCTATGATGGATCCACGCAGAAGTTGGGCTGCG
AGATGGTTAAGAATTGGTAAATTCGCTCCTGGTTGCTACGCTCTTGCTGTCTCAGAGACA
CTCTCAGAGGATATGCAGTCACTATGCCAAGAAGTGCGAGTGCAGTACATTCCGCCGAAA
*CGCATTTGAAGCCCTTTTTGCATCATGTCTGACATCTCTCC*TGCAAGTCGTCATCATC
ATCTTCTAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATGGAGGCTGCTAATGCTATTAATCTATG
TTTACTAGTAACTATATATTTTTATGATTTTTAAAACTAATCTTAAGATTCAGAGTTTT*
GTTTTGCCAACAAAGAACATCTCTTGCAACTCATATG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4C139JQ C 1
AF RR4C139TF U 1
AF RR4CL58TF U 35
AF RR4CL58JQ C 1
BS 1 577 RR4C139TF

RD RR4C139JQ 577 0 0
TTTTTTGCTAGAATCAGAATGGGAGAAGTGGCTGCTCAGATTCCGACGAGTTTCGGCCAC
GAGCTCAGAGCTTGTCTTCGATGCGGCCTCGTCAAGACCTACGATCAGTTTAGGGATTCT
GGGTGCGAGAATTGCCCTTTCTTCAAAATAGACGAGGACCCTGAGCGTATCGTTGATGTT
ACCACCCCTAATTTCAACGGTACAATCTCTATGATGGATCCACGCAGAAGTTGGGCTGCG
AGATGGTTAAGAATTGGTAAATTCGCTCCTGGTTGCTACGCTCTTGCTGTCTCAGAGACA
CTCTCAGAGGATATGCAGTCACTATGCCAAGAAGTGCGAGTGCAGTACATTCCGCCGAAA
*CGCATTTGAAGCCCTTTTTGCATCATGTCTGACATCTCTCC*TGCAAGTCGTCATCATC
ATCTTCTAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATGGAGGCTGCTAATGCTATTAATCTATG
TTTACTAGTAACTATATATTTTTATGATTTTTAAAACTAATCTTAAGATTCAGAGTTTT*
GTTTTGCCAACAAAGAACATCTCTTGCAACTCATATG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4C139TF 577 0 0
TTTTTTGCTAGAATCAGAATGGGAGAAGTGGCTGCTCAGATTCCGACGAGTTTCGGCCAC
GAGCTCAGAGCTTGTCTTCGATGCCGCCTCGTCAAGACCTACGATCAGTTTAGGGATTCT
GGGTGCGAGAATTGCCCTTTCTTCAAAATAGACGAGGACCCTGAGCGTATCGTTGATGTT
ACCACCCCTAATTTCAACGGTACAATCTCTATGATGGATCCACGCAGAAGTTGGGCTGCG
AGATGGTTAAGAATTGGTAAATTCGCTCCTGGTTGCTACGCTCTTGCTGTCTCAGAGACA
CTCTCAGAGGATATGCAGTCACTATGCCAAGAAGTGCGAGTGCAGTACATTCCGCCGAAA
*CGCATTTGAAGCCCTTTTTGCATCATGTCTGACATCTCTCC*TGCAAGTCGTCATCATC
ATCTTCTAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATGGAGGCTGCTAATGCTATTAATCTATG
TTTACTAGTAACTATATATTTTTATGATTTTTAAAACTAATCTTAAGATTCAGAGTTTT*
GTTTTGCCAACAAAGAACATCTCTTGCAACTCATATG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4CL58TF 543 0 0
CTCAGATTCCGACGAGTTTCGGCCACGAGCTCAGAGCTTGTCTTCGATGCCGCCTCGTCA
AGACCTACGATCAGTTTAGGGATTCTGGGTGCGAGAATTGCCCTTTCTTCAAAATAGACG
AGGACCCTGAGCGTATCGTTGATGTTACCACCCCTAATTTCAACGGTACAATCTCTATGA
TGGATCCACGCAGAAGTTGGGCTGCGAGATGGTTAAGAATTGGTAAATTCGCTCCTGGTT
GCTACGCTCTTGCTGTCTCAGAGACACTCTCAGAGGATATGCAGTCACTATGCCAAGAAG
TGCGAGTGCAGTACATTCCGCCGAAAACGCATTTGAAGCCCTTTTTGCATCATGTCTGAC
ATCTCTCCCTGCAAGTCGTCATCATCATCTTCTAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATG
GAGGCTGCTAATGCTATTAATCTATGTTTACTAGTAACTATATATTTTTATGATTTTTAA
AACTAATCTTAAGATTCAGAGTTTTTGTTTTGCCAACAAAGAACATCTCTTGCAACTCAT
ATG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4CL58JQ 577 0 0
TTTTTTGCTAGAATCAGAATGGGAGAAGTGGCTGCTCAGATTCCGACGAGTTTCGGCCAC
GAGCTCAGAGCTTGTCTTCGATGCCGCCTCGTCAAGACCTACGATCAGTTTAGGGATTCT
GGGTGCGAGAATTGCCCTTTCTTCAAAATAGACGAGGACCCTGAGCGTATCGTTGATGTT
ACCACCCCTAATTTCAACGGTACAATCTCTATGATGGATCCACGCAGAAGTTGGGCTGCG
AGATGGTTAAGAATTGGTAAATTCGCTCCTGGTTGCTACGCTCTTGCTGTCTCAGAGACA
CTCTCAGAGGATATGCAGTCACTATGCCAAGAAGTGCGAGTGCAGTACATTCCGCCGAAA
*CGCATTTGAAGCCCTTTTTGCATCATGTCTGACATCTCTCC*TGCAAGTCGTCATCATC
ATCTTCTAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATGGAGGCTGCTAATGCTATTAATCTATG
TTTACTAGTAACTATATATTTTTATGATTTTTAAAACTAATCTTAAGATTCAGAGTTTT*
GTTTTGCCAACAAAGAACATCTCTTGCAACTCATATG

QA 1 577 1 577
DS 



CO CL1379Contig2 835 2 4 U
TTTTTTGCTAGAATCAGAATGGGAGAAGTGGCTGCTCAGATTCCGACGAGTTTCGGCCAC
GAGCTCAGAGCTTGTCTTCGACGCCGCCTCGTCAAGACCTACGATCAGTTTAGGGATTCT
GGGTGCGAGAATTGCCCTTTCTTCAAAATAGACGAGGACCCTGAGCGTATCGTTGATGTT
ACCACCCCTAATTTCAACGGTACAATCTTTATGATGGATCCACGCAGAAGTTGGGCTGCG
AGATGGTTAAGAATTGGTAAATTCGCTCCTGGTTGCTACGCTCTTGCTGTCTCAGAGACA
CTCTCAGAGGATATGCAGTCACTATGCCAAGAAGTGCGAGTGCAGTACATTCCGCCGAAA
CGCATTTGAAGCCCTTTTTGCATCATGTCTGACATCTCTCCTGCAAGTCGTCATCATCAT
CTTCAAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATGGAGGCTGCTATTAATCGAAGATGTTTAC
TAGTAACTATATATTTTATGATTTTTGAAACTAATCTTAAGATTCGAGTTTTGTTTTGCC
AACAAAATAACATTTCTTGCAACTCATATGAATAAAAAAAACTACAAAAAAAAAGAAGCA
GCAGCAAAATGGATATAAAAGAATATTCTTTTTTATTATAATTATAAAATTCGAGTTCAC
GTGGCTGTCGCTACCAACTTCGTTTCACAAAAGCTAATTTAATAAAAACTAGATTTTGAC
CCACCCTTGGAAGGGCGGGTATATTTTATGTTAAATATTTTTGTAAAAGTTTAATTTTTA
TTTTTCAGTAGCTATATTTGTATTTTTTTTTGTAATAATATTTTTTTTTTAAATC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EE06TF U 1
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CTTCAAGAAGCCAGAGTGTGAGAAAATCCATGGAGGCTGCTATTAATCGAAGATGTTTAC
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AACAAAATAACATTTCTTGCAACTCATATGAATAAAAAAAACTACAAAAAAAAAGAAGCA
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DS 

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GAAGCAGCAGCAAAATGGATATAAAAGAATATTCTTTTTTATTATAATTATAAAATTCGA
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TTTGACCCACCCTTGGAAGGGCGGGTATATTTTATGTTAAATATTTTTGTAAAAGTTTAA
TTTTTATTTTTCAGTAGCTATATTTGTATTTTTTTTTGTAATAATATTTTTTTTTTAAAT
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 2 6

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TAACCAATCTAGGGTTTCGCTCTGTCTTTTGGTCTGTGAGAGAATGTCTCGTTGTTACCC
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CGGCTCTGAAGCCAGCATACGGATCTTGTTACATGGCAAAGAGCATGAACATCAAGATCC
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AAATAAGGCGAAACAGTCTTCTAGTCATAGTCATCAAGAAACTGTTAAAGCTTCAAAGCT
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CACTGTCCCGTTCTGATCTCTTCAGAGAGGGTTGACATGACCAACAAATTGTTTTCCTAT
ATGTATTTTTAGGTAGCATTAAAACTTGAATATATCTGGATTCTTTGTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CI81TF U 1
AF RR4BL20TF U 12
AF RR4BL20JQ C 313
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CCCACCGAAGCAAGAAGCACCGTCATCATAAGAGACGGCGGAAAGATGACGGTGTTAATG
CTAGTAAGAAGGTTGATGGCCGCGGAGTAGTAACAGGCGACGAGCTTGAGTGCTTGGAGA
AGAGCTGTCTTACAGTGGAACTTGAGCATCAAACGTCGTCTCAGAATTCTTGTGATAGCA
GCAGACCCTATCATATTAAGAGTCCGCTGCTACTCGATGGTAGGCAGTACGGCTCTGAAG
CCAGCATACGGATCTTGTTACATGGCAAAGAGCATGAACATCAAGATCCTGAGGTTATGA
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QA 1 714 1 714
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AGTGGAACTTGAGCATCAAACGTCGTCTCAGAATTCTTGTGATAGCAGCAGACCCTATCA
TATTAAGAGTCCGCTGCTACTCGATGGTAGGCAGTACGGCTCTGAAGCCAGCATACGGAT
CTTGTTACATGGCAAAGAGCATGAACATCAAGATCCTGAGGTTATGATTACCAACGAGGA
TCTTAGCGAGTCCCTTGCTCATGCTTCTGCAAATGAAGCTCCACTAGACCCTTTAATGGT
CTGCCAAGAGAAGAGAAGGGGAGAATTCTCAACAAAACTCAGTAGAGAGAAGAAGACAGT
TCTTCCGGAATCGGACAGACAAATCAGAACGCCACTAAATAAGGCGAAACAGTCTTCTAG
TCATAGTCATCAAGAAACTGTTAAAGCTTCAAAGCTATGCAGCAAATGCTCTTCTTCCAC
GGCTGTGCGGTTCTTGAATCTCATCGAGAACTGGTCTCCTGATCTGGTCAAGAGCAAGCT
CACTGACTCTGAAGATCAAGAATTGTGGTTCATGAATGTTGGTGCCAAAAGCCATCATCA
TCAAGTTAGCAATCAGATAAACATCAACGGAAGGAGTTCGATGGTGTGGCCAACTGCTAG
GTTTCTTCCAGAAGCTGAACTACACGCATTGCCATTCACTGTCCCGTTCTGATCTCTTCA
GAGAGGGTTGACATGACCAACAAATTGTTTTCCTATATGTATTTTTAGGTAGCATTAAAA
CTTGAATATATCTGGATTCTTTGTAGA

QA 13 819 13 819
DS 

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AGTAGTAACAGGCGACGAGCTTGAGTGCTTGGAGAAGAGCTGTCT*ACAGTGGAACTTGA
GCATCAAACGTCGTCTCAGAATTCTTGTGATAGCAGCAGACCCTATCATATTAAGAGTCC
GCTGCTACTCGATGGTAGGCAGTACGGCTCTGAAGCCAGCATACGGATCTTGTTACATGG
CAAAGAGCATGAACATCAAGATCCTGAGGTTATGATTACCAACGAGGATCTTAGCGAGTC
CCTTGCTCATGCTTCTGCAAATGAAGCTCCACTAGACCCTTTAATGGTCTGCCAAGAGAA
GAGAAGGGGAGAATTCTCAACAAAACTCAGTAGAGAGAAGAAGACAGTTCTTCCGGAATC
GGACAGACAAATCAGAACGCCACTAAATAAGGCGAAACAGTTTTCTAGTCATAGTCATCA
AGAAACTGTTAAAGCTTCAAAGCTATGCAGCAAATGCTCTTCTTCCACGGCTGTGCGGTT
CTTGAATCTCATCGAGAACTGGTCTCCTGATCTGGTCAAGAGCAAGCTCACTGACTCTGA
AGATCAAGAATTGTGGTTCATGAATGTTGGTGCCAAAAGCCATCATCATCAAGTTAGCAA
TCAGATAAACATCAACGGAAGGAGTTCGATGGTGTGGCCAACTGCTAGGTTTCTTCCAGA
AGCTGAACTACACGCATTGCCATTCACTGTCCCGTTCTGATCTCTTCAGAGAGGGTTGAC
ATGACCAACAAATTGTTTTCCTATATGTATTTTTAGGTAGCATTAAAACTTGAATATATC
TGGATTCTTTGTAGA

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL1380Contig2 953 2 2 U
GAAGGACAAAAAGAGGAAGGAGAGGGATAATGAGTCTGCCCACCGAAGCAAGAAGCACCG
TCATCATAAGAGACGTCGGAAAGATGCTAGTAAGAAGGTTGATGATGGCCGCGGGTTAGT
AACAGGCGACGAGCTTGAGTGCTTGGAGAAGAGCTGTCTTACAGTGGAATTTGAGCATCA
AACGTCGTCTCAGAATTCTTGTGAAAGCAGCAGACCGAATCATATTCAGAGTCCGCTCCT
CCTCGATGGTAGGCAGTACGGCTCTGAAGCCAGCATACGGATCTTGTTACATGGCAAAGA
GCATGAACATCAAGATCCTGAGGTTATGATTACCAACGAGGATCTTAGCGAGTCCCTTGC
TCATGCTTCTGCAAATGAAGCTCCACTAGACCCTTTAATGGTCTGCCAAGAGAAGAGAAG
GAGAGAAATCACAACAAAACTCAGTAAAGAGAAGAAAACTGTTCCTCTAGAATCAGACAG
TCGAATCAATAAGCCACTGGGTAAAGAGACTCATCAAGAAACTGTTGGAACTTCAAAGCT
ATGCAGCAAATGCCCTCCTTCCACGGCTGTGCGGTTCTTGAATCTCATCGAGAACTGGGC
CCCTGATCGGGTTCAGAGCAAGCTCACCGACTCTGAAGATCAAGAATTGTGGTTGTTCAT
GAAGGTTGGTGCTAAAAGACATCATCATCAAGTTAGCATTCAGACAACCAGCAATGGAAG
TAGTTCGATGGTGTGGCGGCCAACTGCTAACTTTCTTCCAGAAGCAGAAGTACACGCATT
GCCATTCACTGTCCCGTTCTGATCTCTTCAGAGAGGGTTGACATGACCAACAATTTGTTT
TCCTATATGCATTTTTAGGTAGCATTAAACTTGGAGATTTATGTGTGATTCTTTGTAGTC
TTGTAGATGCACAGTTATATATATAAATAGTATACTAAAATTAGTTTTACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DC27TF U 1
AF RR4DC27JQ C 322
BS 1 545 RR4DC27TF
BS 546 953 RR4DC27JQ

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AACGTCGTCTCAGAATTCTTGTGAAAGCAGCAGACCGAATCATATTCAGAGTCCGCTCCT
CCTCGATGGTAGGCAGTACGGCTCTGAAGCCAGCATACGGATCTTGTTACATGGCAAAGA
GCATGAACATCAAGATCCTGAGGTTATGATTACCAACGAGGATCTTAGCGAGTCCCTTGC
TCATGCTTCTGCAAATGAAGCTCCACTAGACCCTTTAATGGTCTGCCAAGAGAAGAGAAG
GAGAGAAATCACAACAAAACTCAGTAAAGAGAAGAAAACTGTTCCTCTAGAATCAGACAG
TCGAATCAATAAGCCACTGGGTAAAGAGACTCATCAAGAAACTGTTGGAACTTCAAAGCT
ATGCA

QA 1 545 1 545
DS 

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TAAAGAGACTCATCAAGAAACTGTTGGAACTTCAAAGCTATGCAGCAAATGCCCTCCTTC
CACGGCTGTGCGGTTCTTGAATCTCATCGAGAACTGGGCCCCTGATCGGGTTCAGAGCAA
GCTCACCGACTCTGAAGATCAAGAATTGTGGTTGTTCATGAAGGTTGGTGCTAAAAGACA
TCATCATCAAGTTAGCATTCAGACAACCAGCAATGGAAGTAGTTCGATGGTGTGGCGGCC
AACTGCTAACTTTCTTCCAGAAGCAGAAGTACACGCATTGCCATTCACTGTCCCGTTCTG
ATCTCTTCAGAGAGGGTTGACATGACCAACAATTTGTTTTCCTATATGCATTTTTAGGTA
GCATTAAACTTGGAGATTTATGTGTGATTCTTTGTAGTCTTGTAGATGCACAGTTATATA
TATAAATAGTATACTAAAATTAGTTTTACATC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 6

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GGGCTAGACCAAAACTAATTCTCAATATCAAGAAAAATACATAAAGAGAGATAAACGACG
GTGGTTGCTTCGCCGGAAATCTCGCCGGAGCTCGAACTCTCGATTTCTTCTCCCATTTTC
GTCCCGGCGAGGTCCGAGAGGGGAGGTAACAATCATGCAGAAACGGAGAGCGGTGAGGGA
ATCTTCCAAGACAACAACGTCAAAAAATGAAAAGGCTTTGGATTCCGACGAGAAGAAGAG
ATCTGAGAAGAGATTGATGAAGTTCGAGGAGTTGCCAAGGTATCTCAAAGACAACGAGTA
CATACACAATCATTACCGATGTGAATGGTCTCTCAAGGAGACTTTCCTCAGCGCTTTCTC
ATGGCACAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTAGGTGGGTTTCTGATATTCGGATG
GATGATGGTGGTGAGCTCCATGGAAACCACGGAGCTCGGCCTCGCCGGATTTGTCAGCGC
CTTCTCCGGAGTAACAATTCGCTGGCCGTGGTCGTCAATGGCTAAAGCCGTTTACTTCTT
CTCCAGCGATCATCACGACTCGAACGTGACACACACTAGCTCGTTCTTGAACACACAAGG
AGAAGTTAACTACGAGACAATTCCCAAATGGCCATGGCTAGTCTTCTTAACCGGAGCAAT
GACCTGTTTGATATGCAGCTCCATGTCACACCTCTTCGCCTGCCACTCCAGACGTTTCAA
CCTCTTCTTCTGGCGCCTAGACTACGCAGGGATCTCCCTCATGATCGTCTGCTCCTTCTT
CGCACCAATCTACTACGCCTTCTCTTGCCACACTAACTGGCGTCTCTTCTACCTCTCCTC
GATCTCAATCCTCGGTCTCCTCGCCATCTTTGCTCTCCTCTCTCCAGCGCTCTCAGCTCC
CCGTTTCAGATCTTTCAGAGCAGCTCTTTTCCTAACGATGGGATTCTCAGGCGTCATACC
CGCTTCGCACGTGCTTTACCTTCACTGGGATCATCCCAACGTCGTTATCGCTCTTGGTTA
CGAGCTAGCGATGGCTGTGTTGTATGCAACGGGGGCAGGGTTTTACGTTAGCCGTATACC
GGAGAGATGGAAGCCTGGTGCTTTCGATATTGCGGGACATAGCCATCAGATATTCCATGT
GTTTGTAGTGTTAGGAGCCCTTGCTCATAGTGTTGCCTCTCTTCTTATCATGGATTTTCG
ACGTGCTTCGCCTTCTTGTGCCTTTTGAAGCAAGTAACAGAACTGTAAAACGTTTAGTGA
TATTTCATTCAACGTATCATAATGTATGTGTTACATGGAAGATACGCATTGGCAATGTAC
TACACAACCCAAAATTACTAAAAAATAATGTTCCTAAAGGGGTTTAGCAGACGCTTAACG
CTTATTCTGGTGGCAAATTGGTCACAGCTTAAATAGTTTTTTAGAATCTGGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD37TF U 1
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G
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G

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G

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GAGAGATGGAAGCCTGGTGCTTTCGATATTGCGGGACATAGCCATCAGATATTCCATGTG
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ATTTCACTCAACGTATCATAATGTATGTGTTACATGGAAGATACGCATTGGCAATGTACT
ACACAACCCAAAATTACTAAAAAATAATGTTCTTAAAGGGGTTTAGCAGACGCTTAACGC
TTATTCTGGTGGCAAATTGGTCACAGCTTAAATAGTTTTTTAGAATCTGGTTTACC

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DS 



AS 1 6

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TAAGAAGAAACTCAACCCCTTAGAAGACCCACCAAAGTCATCTTCAAGCGACGACGATGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F045TF U 1
AF RR4GS20TF U 93
AF RR4F788TF U 1
AF RR4GS20JQ C 381
AF RR4F788JQ C 643
AF RR4F045JQ C 713
BS 1 254 RR4F045TF
BS 255 687 RR4F788TF
BS 688 815 RR4GS20JQ
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BS 817 914 RR4GS20JQ
BS 915 915 RR4F788JQ
BS 916 1048 RR4GS20JQ
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BS 1050 1109 RR4GS20JQ
BS 1110 1123 RR4F788JQ
BS 1124 1124 RR4F045JQ
BS 1125 1214 RR4F788JQ

RD RR4F045TF 254 0 0
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TAAGAAGAAACTCAACCCCTTAGAAGACCCACCAAAGTCATCTTCAAGCGACGACGATGA
AATGGAAACTCAATCCGGAGAGGAGGAAGAAGCTGAAGAACAGATATCCGATGATTCCGA
TTCCTCTTCATCTGAGGAAGAAAAAGACGGTCTCTGGAATCCCGTCATCGTTCCGCCTCT
AAAGAAACCAAAAA

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR4GS20TF 281 0 0
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CTGAAGAACAGATATCCGATGATTCCGATTCCTCTTCATCTGAGGAAGAAAAAGACGGTC
TCTGGAATCCCGTCATCATTCCGCCTCTAAAGAAACCAAAAACTTCCGTCGCGAGTCCTT
CGAAACAGAGATCTAAGCGTTCGAGTGAAGAGATGGAGGCGCCGCATGCAAAAAAGCGGT
CCAAGAAGAAGAAACCTCTGTTTCAGAGACTGTGGAGCGAA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4F788TF 687 0 0
GGGGTGTCCGCTAAAAACCTAAAGCTTCAATTCCCAATCCAGCGCTACTCCAGAGATGGG
TAAGAAGAAACTCAACCCCTTAGAAGACCCACCAAAGTCATCTTCAAGCGACGACGATGA
AATGGAAACTCAATCCGGAGAGGAGGAAGAAGCTGAAGAACAGATATCCGATGATTCCGA
TTCCTCTTCATCTGAGGAAGAAAAAGACGGTCTCTGGAATCCCGTCATCGTTCCGCCTCT
AAAGAAACCAAAAACTTCCGTCGCGAGTCCTTCGAAACAGAGATCTAAGCGTTCGAGTGA
AGAGATGGAGGCGCCGCATGCAAAAAAGCGGTCCAAGAAGAAGAAACCTCTGTTTCAGAG
ACTGTGGAGCGAAGAAGATGAGATCTCTCTGCTACAAGGTATGATCGATTTCAAATATGG
GACGGGGAAGAGTCCGTACGAAGATATGGATGGTTTTTATGAACTCATCAAGAAATCCAT
TAGCTTTGAGGCTAGCAAGTACCAAACTGCTGAGAAGATTAGGTCTTTGAAGAAGAAGTA
TGTGAAGAAATTTAAGAGAGGTGTAGAATCTATCTCCAAATCTCATGATATGGGATGTTT
TAACTTGTCCAAGTATATTTGGGGATCTAATGGAATGGCTCTCAAGTCTAATGTGAAGAA
GAGTGACTCTGTCAAACCTCATGGTCA

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DS 

RD RR4GS20JQ 731 0 0
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AAGATATGGATGGTTTTTATGAACTCATCAAGAAATCCATTAGCTTTGAGGCTAGCAAGT
ACCAAACTGCTGAGAAGATTAGGTCTTTGAAGAAGAAGTATGTGAAGAAATTTAAGGGAG
GTGTAGAATCTATCTCCAAATCTCATGATATGGGATGTTTTAACTTGTCCAAGTATATTT
GGGGATCTAATGGAATGGCTCTCAAGTCTAATGTGAAGAAGAGTGACTCTGTCAAACCTC
ATGGTCAAGAGGTAGAGAAAGAAGTTGAATCTGATGCTAATTTGGAAGTTAATGGTGAAA
ATGGTGACAAGGAAGAAGAAGATGGAGAGGTGTTGGTTAATGGAGATTCGAAGGCTCCTG
GTGTGACGAGTGCATCTGACTGGTTTGAAGACTCGTTTCTTGTTGGATCCATTGGGAGTT
TGGGTGTGGGTGAACGGTTTGTGAAACAGAGATGGAGCATGGTGGCTGTGGAGATTAAGA
AGAAAATGGAAGAGAAGTGGAAGCTGTTGCAGGCCAAAGAAATGGAACTTGTGTTGGAGA
AGACTGACTTTATGCGTGAGGTTGGCTCTGTGATTGCTGAAGCATCTTAGGAAGGCACAA
TTTTATGT*GGTTTAAGTTGGAGATCCAATGTGTATTTTGTTATCTAATTATATGAAGTT
TCGTTATCT
CC

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DS 

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AGTTGAATCTGATGCTAATTTGGAAGTTAATGGTGAAAATGGTGACAAGGAAGAAGAAGA
TGGAGAGGTGTTGGTTAATGGAGATTCGAAGGCTCCTGGTGTGACGAGTGCATTTGACTG
GTTTGAAGACTCGTTTCTTGTTGGATCCATTGGGAGTTTGGGTGTGGGTGAACGGTTTGT
GAAACAGAGATGGAGCATGGTGGCTGTGGAGACTAAGAAGAAAATGGAAGAGAAGTGGAA
GCTGTTGCAGGCCAAAGAAATGGAACTTGTGTTGGAGAAGACTGACTTTATGCGTGAGGT
TGGCTCTGTGATTGCTGAAGCATCTTAGGAAGGCACAATTTTATGTAGGTTTAAGTTGGA
GATCCAATGTGTATTTTGTTATCTAATTATATGAAGTTTCGTTATCTTCCTACCTAACTT
TTTGGTTTTTTGTTTCATCTTGTGAACTCCATTGAAGTAATTAAAACTTCTGCCGAGTTA
GGCGGTTAGATATAATATTGTCTTTGCAGTTT

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DS 

RD RR4F045JQ 502 0 0
GATGCTAATTTGGAAGTTAATGGTGAAAATGGTGACAAGGAAGAAGAAGATGGAGAGGTG
TTGGTTAATGGAGATTCGAAGGCTCCTGGTGTGACGAGTGCATTTGACTGGTTTGAAGAC
TCGTTTCTTGTTGGATCCATTGGGAGTTTGGGTGTGGGTGAACGGTTTGTGAAACAGAGA
TGGAGCATGGTGGCTGTGGAGACTAAGAAGAAAATGGAAGAGAAGTGGAAGCTGTTGCAG
GCCAAAGAAATGGAACTTGTGTTGGAGAAGACTGACTTTATGCGTGAGGTTGGCTCTGTG
ATTGCTGAAGCATTTTAGGAAGGCACAATTTTATGTAGGTTTAAGTTGGAGATCCAATGT
GTATTTTGTTATCTAATTATATGAAGTTTCGTTATCTTCCTACCTAACTTTCTGGTTTTT
TGTTTCATCTTGTGAACTCCATTGAAGTAATTAAAACTTCTGCCGAGTTAGGCGGTTAGA
TATAATATTGTCTTTGCAGTTT

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 3

CO CL1383Contig1 1030 3 8 U
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CGGAGGAGCACAAACACGAAGAAGAACCCTTGACCGCGTCGGAGCCAGCGGTGGAGATTT
CTGGGAGGGGATCGTTGATGGACAGGATATCGGAGAAGATCCACCACGGCGGCGATTCGT
CGTCGTCTTCTTCATCCTCAGACGACGAGGACGATAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTCGA
TGGAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTTCACAAAGTCCTCGGCG
GTGGAAAACCTGCTGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCTCG
GTGGTGCGACAGCTGGGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCATCTTCTCACTTTGA
TGTGTCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGGTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGT
TTATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCCGTTCTTC
AGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATAAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTG
CATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTCATCTCCGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTCTTTCAA
TCTTGGGAGGATGGTTCAATTTCTTTGACACTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTTC
ACGGTGCCCTCTTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTGGATCCATTAGGTGAGAAAG
CAATGATAGAGATCAAGAAGCAGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCC
CGTTGGGTCCGTTGAAGAACAAGAAGAGAGATTAGAAGGTTCTCTACGGAATGGTAATAC
GTTGTTAGTTAAAAAAGGCTGTTGTTGAAATGGTGTCACAATCTGTGTGTTACTACATCT
TTTTAGTATGTTTATTTGATTCAGGTGAATTGTTGTAAGAAGTTTTAGACTTAAAACAGT
ATCTTACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB75TF U 1
AF RR4C622TF U 658
AF RR4CB75JQ C 180
BS 1 575 RR4CB75TF
BS 576 657 RR4CB75JQ
BS 658 689 RR4C622TF
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BS 831 984 RR4C622TF
BS 985 1030 RR4CB75JQ

RD RR4CB75TF 575 0 0
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CGGAGGAGCACAAACACGAAGAAGAACCCTTGACCGCGTCGGAGCCAGCGGTGGAGATTT
CTGGGAGGGGATCGTTGATGGACAGGATATCGGAGAAGATCCACCACGGCGGCGATTCGT
CGTCGTCTTCTTCATCCTCAGACGACGAGGACGATAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTCGA
TGGAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTTCACAAAGTCCTCGGCG
GTGGAAAACCTGCTGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCTCG
GTGGTGCGACAGCTGGGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCATCTTCTCACTTTGA
TGTGTCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGGTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGT
TTATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCCGTTCTTC
AGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATAAACCGT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4C622TF 339 0 0
CAATCTTGGGAGGATGGTTCAATTTCTTTGACGCTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTC
TTCACGGTGCCCTCTTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTGGATCCATTAGGTGAGA
AAGCAATGATAGAGATCAAGAAGCAGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGTTTAGCAAGA
TCCCGTTGGGTCCGTTGAAGAACAAGAAGAGAGATTAGAAGGTTCTCTACGGAATGGTAA
TACGTTGTTAGTTAAAAAAGGCTGTTGTTGAAATGGTGTCACAATCTGTGTGTTACTACA
TCTTTTTAGTATGTTTATTTGATTCAG
TGAATTGTTGTA

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR4CB75JQ 851 0 0
TCGTCGTCGTCTCTCAT
CTCAGACGACGAGGACGATAAGAAGAAGAAGAAAC*GTCTTCGATGGAATCGAAAGTCTA
CCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTTCACAAAGTCCTCGGCGGTGGAAAACCTGCTGA
TATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCTCGGTGGTGCGACAGCTGG
GTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCATCTTCTCACTTTGATGTGTCATGTGATGAT
TGTTGTTCTTGCGGTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGTTTATTCACAAGTCACC
ACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCCGTTCTTCAGCTTGCGTCTGGGCT
CAGGATAGAGATAAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCATCTGGAAGGGATCT
CAAGAAGTTCATCTCCGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTCTTTCAATCTTGGGAGGATGGTT
CAATTTCTT*GACACTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTTCACGGTGCC*TCTT*GT
CTACGACAAGTACGAAGACAAAGTGGATCCATTAGGTGAGAAAGCAATGATAGAGATCAA
GAAGCGGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCGTTGGGTCCGTTGAA
GAACAAGAAGAGAGATTAGTAGGTTCTCTACGGAATGGTAATACGTTGTTAGTTAAAAAA
GGCTGTTGTTGAAATGGTGTCACAATCTGTGTGTTACTACATCTTTTTAGTATGTTTATT
TGATTCAGGTGAATTGTTGTAAGAAGTTTTAGACTTAAAACAGTATCTTACTAC

QA 18 851 18 851
DS 



AS 1 6

CO CL1384Contig1 630 6 10 U
GGGCAACCAACAAAAAAAAAAAATTGTAAATAGAGAGAGAGAGAGAGGAAAACAAGGCGG
GGAAAAGGATCACGATCCACTAAATTAGTGGTGAATCCGACGTCTTGATCATCGGAGCGG
CTTAGAGAGAAAATGGCAACACCTCAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTTTGAACAAG
GGTCACGTCGTCACCAGACGCGAATTGGCACCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACG
AGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTAC
GAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTCGCT
AAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTT
CTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAATAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTAT
GTTATTGGAAACTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTTGCTATTGCAAATCTGCTTTA
TGCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCACTCTTTTT
CTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H815TF U 127
AF RR4EN31JQ C 1
AF RR4EN31TF U 1
AF RR4E177JQ C 127
AF RR4H815JQB C 127
AF RR4E177TF U 127
BS 1 160 RR4EN31TF
BS 161 161 RR4H815TF
BS 162 172 RR4EN31TF
BS 173 173 RR4H815TF
BS 174 212 RR4EN31TF
BS 213 213 RR4H815TF
BS 214 589 RR4EN31TF
BS 590 590 RR4E177TF
BS 591 623 RR4EN31TF
BS 624 630 RR4E177JQ

RD RR4H815TF 378 0 0
GAGAAAATGGCAACACCTCAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTTTGAACAAGGGTCAC
GTCGTCATCAGACGCGAATTGGCACCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAG
AGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTACGAGAAG
AGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAGGAGGGCTCCTAAGGTCGCTAAGAGG
AAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTTCTCCGT
AAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAATAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTATGTTATT
GGAAACTTTGTTATTTTT

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4EN31JQ 624 0 0
GGGCAACCAACAAAAAAAAAAAATTGTAAATAGAGAGAGAGAGAGAGGAAAACAAGGCGG
GGAAAAGGATCACGATCCACTAAATTAGTGGTGAATCCGACGTCTTGATCATCGGAGCGG
CTTAGAGAGAAAATGGCAACACCTCAAGTGAAGACTGGTTCGTTCGTTGGTTCGAACAAG
GGTCACGTCGTCACCAGACGCGAATTGGCACCCCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACG
AGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTAC
GAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTCGCT
AAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTT
CTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAATAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTAT
GTTATTGGAAACTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTTGCTATTGCAAATCTGCTTTA
TGCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTCCACTCTTTTT
CTATTAAGCTTTTTAAAACTTGC
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4EN31TF 624 0 0
GGGCAACCAACAAAAAAAAAAAATTGTAAATAGAGAGAGAGAGAGAGGAAAACAAGGCGG
GGAAAAGGATCACGATCCACTAAATTAGTGGTGAATCCGACGTCTTGATCATCGGAGCGG
CTTAGAGAGAAAATGGCAACACCTCAAGTGAAGACTGGTTCGTTCGTTGGTTCGAACAAG
GGTCACGTCGTCACCAGACGCGAATTGGCACCCCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACG
AGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTAC
GAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTCGCT
AAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTT
CTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAATAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTAT
GTTATTGGAAACTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTTGCTATTGCAAATCTGCTTTA
TGCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTCCACTCTTTTT
CTATTAAGCTTTTTAAAACTTGC
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4E177JQ 504 0 0
GAGAAAATGGCAACAC*TCAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTTTGAACAAGGGTCAC
GTCGTCACCAGACGCGAATTGGCACCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAG
AGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGTAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTACGAGAAG
AGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTCGCTAAGAGG
AAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTTCTCCGT
AAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTATGTTATT
GGAAACTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTTGCTATCGCAAATCTGCTTTATGCTCA
AAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCACTCTTTTTCTATTA
AGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4H815JQB 498 0 0
GAGAAAATGGCAACACCTCAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTTTGAACAAGGGTCAC
GTCGTCATCAGACGCGAATTGGCACCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAG
AGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTACGAGAAG
AGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAGGAGGGCTCCTAAGGTCGCTAAGAGG
AAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTTCTCCGT
AAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTATGTTATT
GGAAACTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTTGCTATTGCAAATCTGCTTTATGCTCA
AAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCACTCTTTTTCTATTA
AGCTTTTTAAAACTTGC
C

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4E177TF 504 0 0
GAGAAAATGGCAACAC*TCAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTTTGAACAAGGGTCAC
GTCGTCACCAGACGCGAATTGGCACCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAG
AGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGTAGGTTGCTGGTTTTGCACCTTACGAGAAG
AGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTCGCTAAGAGG
AAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGCGTTCTCCGT
AAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAACATCTCTTAAGTCTTCTTCTATGTTATT
GGAAACTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTTGCTATCGCAAATCTGCTTTATGCTCA
AAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCACTCTTTTTCTATTA
AGCTTTTTAAAACTTGC
TACGTTT

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 6

CO CL1385Contig1 940 6 8 U
GAAAATGTATATTTGAATATATATTTAAACGTGAAAGTAGGATTAATAATGACAACCAAA
AACGAAACATATGATATTCTGTTGGCCTCTCAAGTTCATTTAGCTCTTCTCTAACAAATA
GGCCAAAAAATCAACAATAGATTGAAACTTCGACATAGATCCCACCACATCTTTATAAAG
TGTGTAAATGAATAGTTATATGGAAGTTTGATATAAGAAAGAAGAAAATAAAATGATCAA
TGCAGGAGATGAAGCTTCTTAGGGAACATAGTAGTTTGGTGTTACTTCAAAAACTTCCAA
AATCACGGATTTTGCCTTGAATGATCTATGGTTTCAGGCGAGAGGAGACCCATTTGTTGA
GTCAGATTATCCATCTGTTTCTTCTCTGTCTCACTGTCCTTGGTTCTAACATCCACTGGC
GTTACATCCATATCCTCTGGAACCGGGCTTGACATGAGAATGTCTTGAAAGAGTGAAGCG
TAATCATCAACCGAAGGTTCTAAATCGGGATCTCTCAGAATGTCGCCAAAGTCAAAGGGT
AAATCATCACTATTGAACAGATCTGAATCTAGGATCGTACTCATATCTTCCATGTTTGTT
TCCAAGAAATTCTCTGGAGGCACCTCGGCCATATTCTCCGGCAGAATATCAGCAAATTCG
GGTAGAGATGGGTCATCAGGTGAAGGAATTGCTTCATCAGGTGTTGGAAACTCAGCTACT
GTAACATTTTCAGGAGTTGCTCCACTTGGTGATGATGATGATTGTATCTCAGAAGCTGTT
GGCATCTCCTGAAGAGTTATACCCGCTACGTTGTTTGATGAAATCTCCATCTCTGTTCCT
TCTGTAGTAGAAGTACCGTTACCTAGAAGGAAACCATCATCGCCGGTTTTGTAAGGTTCC
ATATTCATAAGCTGGCTAAACATTGCCTTTGCTTGCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AX52JQ U 403
AF RR4AZ75JQ U 120
AF RR4DA68JQ U 1
AF RR4AX51TF C 597
AF RR4AZ75TF C 174
AF RR4AX52TF C 512
BS 1 180 RR4DA68JQ
BS 181 181 RR4AZ75JQ
BS 182 244 RR4DA68JQ
BS 245 245 RR4AZ75JQ
BS 246 525 RR4DA68JQ
BS 526 526 RR4AZ75JQ
BS 527 675 RR4DA68JQ
BS 676 940 RR4AZ75TF

RD RR4AX52JQ 114 0 0
GTTCTAACATCCACTGGCGTTACATCCATATCCTCTGGAACCGGGCTTGACATGAGAATG
TCTTGAAAGAGTGAAGCGTAATCATCAACCGAAGGTTCTAAATCGGGATCTCTC

QA 1 114 1 114
DS 

RD RR4AZ75JQ 453 0 0
AGGCCAAAAAATCAACAATAGATTGAAACTTCGACATAGATCCCACCACATCTTTATAAA
GTGTGTAAATGAATAGTTATATGGAAGTTTGATATAAGAAAGAAGAAAATAAAATGATCA
ATGCAGGAGATGAAGCTTCTTAGGGAACATAGTAGTTTGGTGTTACTTCAAAAACTTCCA
AAATCACGGATTTTGCCTTGAATGATCTATGGTTTCAGGCGAGAGGAGACCCATTTGTTG
AGTCAGATTATCCATCTGTTTCTTCTCTGTCTCACTGTCCTTGGTTCTAACATCCACTGG
CGTTACATCCATATCCTCTGGAACCGGGCTTGACATGAGAATGTCTTGAAAGAGTGAAGC
GTAATCATCAACCGAAGGTTCTAAATCGGGATCTCTCAAAATGTCGCCAAAGTCAAAGGG
TAAATCATCACTATTGAACAGATCTGAATCTAG

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4DA68JQ 675 0 0
GAAAATGTATATTTGAATATATATTTAAACGTGAAAGTAGGATTAATAATGACAACCAAA
AACGAAACATATGATATTCTGTTGGCCTCTCAAGTTCATTTAGCTCTTCTCTAACAAATA
GGCCAAAAAATCAACAATAGATTGAAACTTCGACATAGATCCCACCACATCTTTATAAAG
CGTGTAAATGAATAGTTATATGGAAGTTTGATATAAGAAAGAAGAAAATAAAATGATCAA
TGCATGAGATGAAGCTTCTTAGGGAACATAGTAGTTTGGTGTTACTTCAAAAACTTCCAA
AATCACGGATTTTGCCTTGAATGATCTATGGTTTCAGGCGAGAGGAGACCCATTTGTTGA
GTCAGATTATCCATCTGTTTCTTCTCTGTCTCACTGTCCTTGGTTCTAACATCCACTGGC
GTTACATCCATATCCTCTGGAACCGGGCTTGACATGAGAATGTCTTGAAAGAGTGAAGCG
TAATCATCAACCGAAGGTTCTAAATCGGGATCTCTCAGAATGTCGTCAAAGTCAAAGGGT
AAATCATCACTATTGAACAGATCTGAATCTAGGATCGTACTCATATCTTCCATGTTTGTT
TCCAAGAAATTCTCTGGAGGCACCTCGGCCATATTCTCCGGCAGAATATCAGCAAATTCG
GGTAGAGATGGGTCA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4AX51TF 117 0 0
TGTTTCCAAGAAATTCTCTGGAGGCACCTCGGCCATATTTTCCGGCAGAATATCAGCAAA
TTCGGGTAGAGATGGGTCATCAGGTGAAGGAATTGCTTCATCAGGTGTTGGAAACTC

QA 1 117 1 117
DS 

RD RR4AZ75TF 767 0 0
TATAAAGTGTGTAAATGAATAGTTATATGGAAGTTTGATATAAGAAAGAAGAAAATAAAA
TGATCAATGCAGGAGATGAAGCTTCTTAGGGAACATAGTAGTTTGGTGTTACTTCAAAAA
CTTCCAAAATCACGGATTTTGCCTTGAATGATCTATGGTTTCAGGCGAGAGGAGACCCAT
TTGTTGAGTCAGATTATCCATCTGTTTCTTCTCTGTCTCACTGTCCTTGGTTCTAACATC
CACTGGCGTTACATCCATATCCTCTGGAACCGGGCTTGACATGAGAATGTCTTGAAAGAG
TGAAGCGTAATCATCAACCGAAGGTTCTAAATCGGGATCTCTCAGAATGTCGCCAAAGTC
AAAGGGTAAATCATCACTATTGAACAGATCTGAATCTAGGATCGTACTCATATCTTCCAT
GTTTGTTTCCAAGAAATTCTCTGGAGGCACCTCGGCCATATTCTCCGGCAGAATATCAGC
AAATTCGGGTAGAGATGGGTCATCAGGTGAAGGAATTGCTTCATCAGGTGTTGGAAACTC
AGCTACTGTAACATTTTCAGGAGTTGCTCCACTTGGTGATGATGATGATTGTATCTCAGA
AGCTGTTGGCATCTCCTGAAGAGTTATACCCGCTACGTTGTTTGATGAAATCTCCATCTC
TGTTCCTTCTGTAGTAGAAGTACCGTTACCTAGAAGGAAACCATCATCGCCGGTTTTGTA
AGGTTCCATATTCATAAGCTGGCTAAACATTGCCTTTGCTTGCTCGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4AX52TF 429 0 0
CTCTCAGAATGTCGCCAAAGTCAAAGGGTAAATCATCACTATTGAACAGATCTGAATCTA
GGATCGTACTCATATCTTCCATGTTTGTTTCCAAGAAATTCTCTGGAGGCACCTCGGCCA
TATTCTCCGGCAGAATATCAGCAAATTCGGGTAGAGATGGGTCATCAGGTGAAGGAATTG
CTTCATCAGGTGTTGGAAACTCAGCTACTGTAACATTTTCAGGAGTTGCTCCACTTGGTG
ATGATGATGATTGTATCTCAGAAGCTGTTGGCATCTCCTGAAGAGTTATACCCGCTACGT
TGTTTGATGAAATCTCCATCTCTGTTCCTTCTGTAGTAGAAGTACCGTTACCTAGAAGGA
AACCATCATCGCCGGTTTTGTAAGGTTCCATATTCATAAGCTGGCTAAACATTGCCTTTG
CTTGCTCGC

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 6

CO CL1386Contig1 822 6 15 U
GGATCTGCAAACATTTACCCGAGACTCCAAATCGCCGCCATGTTGAGACAAGCTTCCCGC
CTCCTCTCCCGATCCGTCACCGCCGCGTTCTCCAAATCGACTGCGGCTCGTGCCTTTTCA
ACGGAGCTTCCGTCGACGATCGATTCGACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCG
AACATGGACCCGCCTCAGACTCCTTCTTCCTTCATGAAGCCTCGTCCGTCGACTGCCTCT
TCGATCCCGACGAAGCTCACAGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGAG
AAAGAGGTCGACATGGTCATCATCCCCGCGACAACAGGACAAATGGGTGTGTTGCCTGGA
CACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACCGAC
ATAAAGAAATACTTCGTGAGCAGTGGTTTCGCGTTTCTCCACGCAAACTCCGTCGCTGAC
ATCATAGCGGTCGAGGCCGTGCCGCTTGAGAACATTGACGCCGGTCAAGTCCAAAAGGGT
TTAGCTGAGTTCACACAGAAACTTGCTTCTGCCACAACGGACCTTGAGAAAGCAGAAGCA
CAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCAGGCTAATAGAAGTTT
CTCTTTCTCTCTCTCTTTAAAACAAAATCATTTGGGTTTACAAATGATTAATGAAAATTC
CCTCTCTCTTTTTTACTACAACAAAGGATGATTTTTCCTTGTTTTAACTGTGTTGGAGTT
TGTTTGAATAATAAAAGAATTTGTGGAAGGCACAAACCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RR4ET24TF U 1
AF RR4ET24JQ C 199
AF RR4AT33TF U 385
AF RR4AY12TF U 385
AF RR4ED72JQ C 338
AF RR4ED72TF U 338
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BS 361 532 RR4ET24TF
BS 533 546 RR4AT33TF
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BS 698 818 RR4AT33TF
BS 819 822 RR4ET24JQ

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ATCATAGCGGTCGAGGCCGTGCCGCTTGAGAACATTGACGCCGGTCAAGTCC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4ET24JQ 624 0 0
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ACAGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGAGAAAGAGGTCGACATGGTC
ATCATCCCCGCGACAACAGGACAAATGGGTGTGTTGCCTGGGCACGTTCCAACAATCGCT
GAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACCGACATAAAGAAATACTTCGTG
AGCAGTGGTTTCGCGTTTCTCCACGCAAACTCCGTCGCTGACATCATAGCGGTCGAGGCC
GTGCCGCTTGAGAACATTGACGCCGGTCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACACAG
AAACTTGCTTCTGCCACAACGGACCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTT
CACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCAGGCTAATAGAAGTTTCTCTTTCTCTCTCTCTTT
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ATTTGTGGAAGGCACAAACCAACG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4AT33TF 434 0 0
G
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GTTTCGCGTTTCTCCACGCAAACTCCGTCGCTGACATCATAGCGGTCGAGGCCGTGCCGC
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AATCATTTGGGCTTACAAATGATTAATGAAAATTCCCTCTCTCTTTTTTACTACAACAAA
GGATGATTTTTCCTTGTTTTAACTGTGTTGGAGTTTGTTTGAATAATAAAAGAATTTGTG
GAAGGCACAAACC

QA 2 434 2 434
DS 

RD RR4AY12TF 434 0 0
G
AACCCGGTATCATTTCCGTTCACGAAGGCACCGACATAAAGAAATACTTCGTGAGCAGGG
GTTTCGCGTTTCTCCACGCAAACTCCGTCGCTGACATCATAGCGGTCGAGGCCGTGCCGC
TTGAGAACATTGACGCCGGTCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTAAGTTCACACAGAAACTTG
CTTCTGCCACAACGGACCTTGAGAAAGCATAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTG
CTATGAACGCAGCTCCCTCAGGCTAATAGAAGTCTCTCTTTCTCTCTCTCTTTAAAACAA
AATCATTTGGGCTTACAAATGATTAATGAAAATTCCCTCTCTCTTTTTTACTACAACAAA
GGATGATTTTTCCTTGTTTTAACTGTGTTGGAGTTTGTTTGAATAATAAAAGAATTTGTG
GAAGGCACAAACC

QA 2 434 2 434
DS 

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TGTCCGTTCACGAAGGCACCGACATAAAGAAATACTTCGCGAGCAGTGGTTTCGCGTTTC
TCCACGCAAACTCCGTCGCTGACATCATAGCGGTCGAGGCCGTGCCGCTTGAGAACATTG
ACGCCGGTCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACACAGAAACTTGCTTCTGCCACAA
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C
AGT

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR4ED72TF 484 0 0
GACAAATGGGTGTGTTGCCTGGACACGTTCCGACAATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCA
TGTCCGTTCACGAAGGCACCGACATAAAGAAATACTTCGCGAGCAGTGGTTTCGCGTTTC
TCCACGCAAACTCCGTCGCTGACATCATAGCGGTCGAGGCCGTGCCGCTTGAGAACATTG
ACGCCGGTCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACACAGAAACTTGCTTCTGCCACAA
CGGACCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAG
CTCTCTCAGGCTAATAGAAGTTTCTCTTTCTCTCTCTCTTTAAAACAAAATCATTTGGGT
TTACAAATGATTAATGAAAATTCCCTCTCTCTTTTTTACTACAACAAAGGATGATTTTTC
CTTGTTTTAACTGTGTTGGAGTTTGTTTGAATAATAAAAGAATTTGTGGAAGGCACAAAC
C
AGT

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 6

CO CL1387Contig1 893 6 5 U
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AGAGTTATCATTATTACAGCATAGGAGCAACGTAGACTCCTAAGATTACATGAAATCAAC
ATGAAACAATTATTCTGAAGGTCTAGAGAAGAAGAAGCTTCTTCTTGCTTCAAGATGTCT
TTAACTTGGGACGAACTGGAAGCAACTGATAACAAGAGATAAGTGAGGTGATAAGCCCCA
AAAAGCCAGTGACACGATGACCAATTATCCATGGAGCTAAACGAAGCAGACCAATGGCTA
CAACAATGTCCATGCTTGATTTAATCAAAGCTACTATTCTGTCTTTTGTTTTCTGAAGCT
TAGCACGATGCAACTCATCATGATTCTTCTTTTCATCATCTTTGAGTTCCTTGTCCATCT
TCTTCATAGATGAAGAGAGCCTTATAAGCTCACAAATCTCAATTATTACAATACAGATAG
ATGATCCAAGCCAGCAGAAAATTGAGAAACCGCTAATCAACTCCGTTAATATTTTGTTCT
TATATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACGAATTGATCAAGAAAGAAGTAGGTACACAAAA
GTGCATTCTTGCACTTTCCGAGCAAGACAAGAGGAAGAGGAGTCCTTCTATGCACAGGGC
TAATAAGCAATTGAAAATCATTGAGAAACTTGAAAAGACGGAACACTTTTCTAGCCAAAC
TGGTGTTTCTGTAGACATTTTGAGCAGTACCAGGTTTTCCACCGCTCAAGAATTTGGAAC
CGTACTGAATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTAAGCTTTGTTCAAGTATAGGATTA
TAAGGGCTAGCTCGTCTCTGGTTAAATATAATGTTTTCATCTTCTATCTGCAT


BQ
10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C074JQ U 2
AF RR4C026JQ U 2
AF RR4A401JQ U 1
AF RR4A401TF C 1
AF RR4D848JQ U 1
AF RR4C026TF C 223
BS 1 368 RR4A401JQ
BS 369 598 RR4D848JQ
BS 599 599 RR4C026TF
BS 600 716 RR4D848JQ
BS 717 893 RR4C026TF

RD RR4C074JQ 178 0 0
G
GAGACTAAAGGTATTGAACTTGAACATAGAATCCTGTTCAGAGTATAAGTATCGTATAAG
AGTTATCCTTATTACAGCATAGGAGCAACGTAGACTCCTAAGATTACATGAAATCAACAT
GAAACAATTATTCTGAAGGTCTAGAGAAGAAGAAGCTTCTTCTTGCTTCAAGATGTC

QA 2 178 2 178
DS 

RD RR4C026JQ 191 0 0
G
GAGACTAAAGGTATTGAACTTGAACATAGAATCCTGTTCAGAGTATAAGTATCGTATAAG
AGTTATCCTTATTACAGCATAGGAGCAACGTAGACTCCTAAGATTACATGAAATCAACAT
GAAACAATTATTCTGAAGGTCTAGAGAAGAAGAAGCTTCTTCTTGCTTCAAGATGTCTTT
AACTTGGGA
A

QA 2 190 2 190
DS 

RD RR4A401JQ 369 0 0
CAGAGACTAAAGGTATTGAACTTGAACATAGAATCCTGTTCAGAGTATAAGTATCGTATA
AGAGTTATCATTATTACAGCATAGGAGCAACGTAGACTCCTAAGATTACATGAAATCAAC
ATGAAACAATTATTCTGAAGGTCTAGAGAAGAAGAAGCTTCTTCTTGCTTCAAGATGTCT
TTAACTTGGGACGAACTGGAAGCAACTGATAACAAGAGATAAGTGAGGTGATAAGCCCCA
AAAAGCCAGTGACACGATGACCAATTATCCATGGAGCTAAACGAAGCAGACCAATGGCTA
CAACAATGTCCATGCTTGATTTAATCAAAGCTACTATTCTGTCTTTTGTTTTCTGAAGCT
TAGCACGA
C

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4A401TF 369 0 0
CA
GAGACTAAAGGTATTGAACTTGAACATAGAATCCTGTTCAGAGTATAAGTATCGTATAAG
AGTTATCATTATTACAGCATAGGAGCAACGTAGACTCCTAAGATTACATGAAATCAACAT
GAAACAATTATTCTGAAGGTCTAGAGAAGAAGAAGCTTCTTCTTGCTTCAAGATGTCTTT
AACTTGGGACGAACTGGAAGCAACTGATAACAAGAGATAAGTGAGGTGATAAGCCCCAAA
AAGCCAGTGACACGATGACCAATTATCCATGGAGCTAAACGAAGCAGACCAATGGCTACA
ACAATGTCCATGCTTGATTTAATCAAAGCTACTATTCTGTCTTTTGTTTTCTGAAGCTTA
GCACGA
C

QA 3 368 3 368
DS 

RD RR4D848JQ 716 0 0
AA
GAGACTAAAGGTATTGAACTTGAACATAGAATCCTGTTCAGAGTATAAGTATCGTATAAG
AGTTATCATTATTACAGCATAGGAGCAACGTAGACTCCTAAGATTACATGAAATCAACAT
GAAACAATTATTCTGAAGGTCTAGAGAAGAAGAAGCTTCTTCTTGCTTCAAGATGTCCTT
AACTTGGGACGCACTGGAAGCAACTGATAACAAGAGATAAGTGAGGTGATAAGCCCCAAA
AAGCCAGTGACACGATGACCAATTATCCATGGAGCTAAACGAAGCAGACCAATGGCTACA
ACAATGTCCATGCTTGATTTAATCAAAGCTACTATTCTGTCTTTTGTTTTCTGAAGCTTA
GCACGATGCAACTCATCATGATTCTTCTTTTCATCATCTTTGAGTTCCTTGTCCATCTTC
TTCATAGATGAAGAGAGCCTTATAAGCTCACAAATCTCAATTATTACAATACAGATAGAT
GATCCAAGCCAGCAGAAAATTGAGAAACCGCTAATCAACTCCGTTAATATTTTGTTCTTA
TATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACGAATTGATCAAGAAAGAAGTAGGTACACAAGAGT
GCATTCTTGCACTTTCCGAGCAAGACAAGAGGAAGAGGAGTCCTTCTATGCACAGGGCTA
ATAAGCAATTGAAAATCATTGAGAAACTTGAAAAGACGGAACACTTTTCTAGCC

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR4C026TF 671 0 0
AGTGA
GTGATAAGCCCCAAAAAGCCAGTGACACGATGACCAAT*ATCCATGGAGCTAAACGAAGC
AGACCAATGGCTACAACAATGTCCATGCTTGATTTAATCAAAGCTACTATTCTGTCTTTT
GTTTTCTGAAGCTTAGCACGATGCAACTCATCATGATTCTTCTTTTCATCATCTTTGAGT
TCCTTGTCCATCTTCTTCATAGATGAAGAGAGCCTTATAAGCTCACAAATCTCAATTATT
ACAATACAGATAGATGATCCAAGCCAGCAGAAAATTGAGAAACCGCTAATCAACTCCGTT
AATATTTTGTTCTTATATATGCCGGATCTACCAAGCCAGACGAATTGATCAAGAAAGAAG
TATGTACACAAAAGTGCATTCTTGCACTTTCCGAGCAAGACAAGAGGAAGAGGAGTCCTT
CTATGCACAGGGCTAATAAGCAATTGAAAATCATTGAGAAACTTGAAAAGACGGAACACT
TTTCTAGCCAAACTGGTGTTTCTGTAGACATTTTGAGCAGTACCAGGTTTTCCACCGCTC
AAGAATTTGGAACCGTACTGAATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTAAGCTTTGTTC
AAGTATAGGATTATAAGGGCTAGCTCGTCTCTGGTTAAATATAATGTTTTCATCTTCTAT
CTGCAT

QA 6 671 6 671
DS 



AS 1 6

CO CL1388Contig1 581 6 5 U
GGGCCTCTCGCTTATTGCTGCCGTCGCTACTCTCATTTGCCCTTATCTTTGAGATTCTTG
CGAAGATGGTTCTTCAAAACGACATCGATCTCCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGAAGA
GGAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCATTCTTCATGGATGTGAAGT
GCCAAGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTGGTATGTG
GAAACTGCCAGACAGTGCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGAT
GCTCTTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGGAAGCAATCATCAAATCAA
TCAAGGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAA
AAAGCAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCT
ATTTACTATTTTAAAAGGTTCTTTGCTTGGAGATTGCCACTTTGATCACAATAAAATAAT
TTACGAATAGGGTTTATGAGAAAATCCTGATGTCTTATGTA


BQ
10 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C184TF U 1
AF RR4DG65JQ C 3
AF RR4DG65TF U 3
AF RR4BF58JQ C 2
AF RR4BF58TF U 2
AF RR4BX40TF U 1
BS 1 135 RR4BX40TF
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BS 137 235 RR4BX40TF
BS 236 236 RR4C184TF
BS 237 581 RR4BX40TF

RD RR4C184TF 513 0 0
G
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GAAGATGGTTCTTCAAAATGACATCGATCTGCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGA*GAG
GAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCATTCTTCATGGATGTGAAGTG
CCAAGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACTGTTGTGGTATGTGG
AAACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGATG
CTCTTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGGAAGCAATCATCAAATCAAT
CAAGGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAAA
AAGCAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCTA
TTTACTATTTTAAAAGGTTCTTTGCTTGGAGA

QA 2 513 2 513
DS 

RD RR4DG65JQ 490 0 0
GG
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GATGGTTCTTCAAAATGACATCGATCTGCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGAAGAGGAA
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AGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACTGTTGTGGTATGTGGAAA
CTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGATGCTC
TTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGGAAGCAATCATCAAATCAATCAA
GGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAAAAAG
CAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCTATTT
ACTATT
CT

QA 3 488 3 488
DS 

RD RR4DG65TF 490 0 0
GG
CTCTCGCTTATTGTTGCCGTCGCTACTCTCATTTGCCGTTGTCTT*GAGATTCTTGCGAG
GATGGTTCTTCAAAATGACATCGATCTGCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGAAGAGGAA
GCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCATTCTTCATGGATGTGAAGTGCCA
AGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACTGTTGTGGTATGTGGAAA
CTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGATGCTC
TTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGGAAGCAATCATCAAATCAATCAA
GGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAAAAAG
CAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCTATTT
ACTATT
CT

QA 3 488 3 488
DS 

RD RR4BF58JQ 500 0 0
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GAAGATGGTTCTTCAAAACGACATCGATCTCCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGAAGAG
GAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCATTCTTCATGGATGTGAAGTG
CCAAGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTGGTGTGTGG
AAACTGCCAGACAGTGCTGTGCCCGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGATG
CTCTTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGTAAGCAATCATCAAATCAAT
CAAGGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAAA
AAGCAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCTA
TTTACTATTTTAAAAGGTTC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4BF58TF 500 0 0
GGCCTCTCGCTTATTGCTGCCGTCGCTACTCTCATTTGCCCTTATCTTTGAGATTCTTGC
GAAGATGGTTCTTCAAAACGACATCGATCTCCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGAAGAG
GAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCATTCTTCATGGATGTGAAGTG
CCAAGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTGGTGTGTGG
AAACTGCCAGACAGTGCTGTGCCCGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGATG
CTCTTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGTAAGCAATCATCAAATCAAT
CAAGGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAAA
AAGCAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCTA
TTTACTATTTTAAAAGGTTC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4BX40TF 581 0 0
GGGCCTCTCGCTTATTGCTGCCGTCGCTACTCTCATTTGCCCTTATCTTTGAGATTCTTG
CGAAGATGGTTCTTCAAAACGACATCGATCTCCTTAACCCACCAGCAGAGCTTGAGAAGA
GGAAGCACAAGCTCAGGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCATTCTTCATGGATGTGAAGT
GCCAAGGATGCTTCAACATCACGACTGTTTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTGGTGTGTG
GAAACTGCCAGACAGTGCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGAAGGAT
GCTCTTTCAGGAAAAAGTGATGAGATTGATTTTGAAGCTTGGAAGCAATCATCAAATCAA
TCAAGGCCGGTTTCTTTTTTGTTCTATGATGTTATGAATCTCTTTTTTTATCTGTTTTAA
AAAGCAACTCAGTTGGAGTTTAGAGGAAGAAACCTTTGTTGATGTTTGGATTTTAAGGCT
ATTTACTATTTTAAAAGGTTCTTTGCTTGGAGATTGCCACTTTGATCACAATAAAATAAT
TTACGAATAGGGTTTATGAGAAAATCCTGATGTCTTATGTA

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 6

CO CL1389Contig1 485 6 1 U
GCAACACTCTCTGCTTTTAATGGCCACAGATCAAGAAAATCTACTCTCTGATGATTACGA
GAAAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCG
AAGAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAG
CTGGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTCTGAGAAAATTGCGGGACCAAA
GTGGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTT
CACGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACC
GGAGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTC
CTATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGT
TAACC


BQ
30 30 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 30 

AF RR4DT27JQ C 1
AF RR4F833JQ C 1
AF RR4DT27TF U 1
AF RR4F833TF U 1
AF RR4DZ13TF U 1
AF RR4DZ13JQ C 1
BS 1 485 RR4DT27TF

RD RR4DT27JQ 485 0 0
GCAACACTTTCTGCTTTTAATGGCCACAGATCAAGAAAATCTACTCTCTGATGATTACGA
GAAAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCG
AAGAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAG
CTGGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTCTGAGAAAATTGCGGGACCAAA
GTGGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTT
CACGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACC
GGAGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTC
CTATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGT
TAACC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4F833JQ 485 0 0
GG
AACACTCTCTGCTTTTAATGGCCACAGATCAAGAAAATCTACTCTCTGATGATTACGAGA
AAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCGAA
GAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAGCT
GGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTTTGAGAAAATTGCGGGACCAAAGT
GGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTTCA
CGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACCGG
AGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTCCT
ATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGTTA
AC
T

QA 3 484 3 484
DS 

RD RR4DT27TF 485 0 0
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GAAAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCG
AAGAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAG
CTGGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTCTGAGAAAATTGCGGGACCAAA
GTGGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTT
CACGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACC
GGAGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTC
CTATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGT
TAACC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4F833TF 485 0 0
GG
AACACTCTCTGCTTTTAATGGCCACAGATCAAGAAAATCTACTCTCTGATGATTACGAGA
AAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCGAA
GAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAGCT
GGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTCTGAGAAAATTGCGGGACCAAAGT
GGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTTCA
CGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACCGG
AGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTCCT
ATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGTTA
AC
T

QA 3 484 3 484
DS 

RD RR4DZ13TF 485 0 0
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GAAAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCG
AAGAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAG
CTGGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTCTGAGAAAATTGCGGGACCAAA
GTGGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTT
CACGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACC
GGAGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTC
CTATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGT
TAACC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4DZ13JQ 485 0 0
GCAACACTTTCTGCTTTTAATGGCCACAGATCAAGAAAATCTACTCTCTGATGATTACGA
GAAAACGGCGCCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCCGTAGGTTCCAGGTGTTCCGGTGGCG
AAGAGTAGGAGGAGGAGACGGTGGCTGGAGCGGTGACTTGCAGGAAGAAAGAAGCGAAAG
CTGGTGGAGCAGGAAACTTAAGGTGCTAAAGGAGATTTCTGAGAAAATTGCGGGACCAAA
GTGGAAAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAAGAAGAAGAAGGTGAAGAGGGATGTGGATTT
CACGTACGATCTTGAAAACTACAGTCTTAATTTTGATGAGGGAGGTGATAATCATTCACC
GGAGAGGTATGTAGCTCCGGTTGTTATTAAAGTTTGATACTTTTTTGGTATTTATCTCTC
CTATTGTAACTATTTTTATTGATTGTGTTGTTATATGTTAATACAAATATACATAAGGGT
TAACC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 5

CO CL1390Contig1 1120 5 36 U
GGAGGAGCCGTATGCGTAGATCTGATCCGATAAAAAGATGGCAAGATTCTCAATTTCTGG
AGGCGATGACGGAGAAGGATCAAGCAACCATCAATCCCGCAAACGACAACGACTTCCTTC
CATCGATGAAGATGAAGAAACCGCCGGAAGTTCCGGTGAAGAAGACGAAGAAGAAGATGA
CCGTCTGATTGAATCCACGAGCGATGACAGCGATCGTGAAGTGGTGATAGAAGAGGCAAC
AACCAGACAGATCTCTTCGAGCAGAGATTCTTCTCTTTCCGTAACGCTTTTGGATCCAGA
TGTTCTCGATTGCCCCATTTGCTGCGAGTCCCTCAAGCTTCCCATCTTTCAGTGTGATAA
TGGTCATCTAGCTTGTTCTGTGTGCTGCACCAAAGTCAGGAACATATGTCCCTCCTGCAC
GTTACCCGTTGGTTACATTCGCTGCAGGGCCATGGAGAAGGTCATAGAAACATCTAGAGT
CTCTTGTCCTTACGCCAAGTACGGGTGTAAGGAGAAAATGTTATATGGTAATAAATTTAG
CCACGAGAAGCTTTGTGTTTTCGCCCCGTGTTCCTGCCCCGTACTTAACTGCGACTACAC
TGGCTATTACAAGGATCTCAACACCCACGTACGTGCTAAGCACAAAGACGAGGTGGTTCC
TTTTGTGTGGGACGTTTCTATAACCATTAGATTGGATAAGACCACAATCCTTCAGGAAGA
AAACGATGGGGAAGTGATGGTAGTTCAAGTTTTCAGGGGTTTGCACGTTGTGTATGTCGT
TGTGAGCTGTATTGCACCTTCGGCACGGGAAGTGGGAAACTTCTCATACTATCTGGTAAC
TGTACCTTTAGCCGTTGATGGCTCACTAGTGCAGCGATCCACGATGAAGAACATTCAGAA
ATTGAAGAATGAACAACCAGAAGATGGTTTCATGGTGATTCCTTCCTATATGCTGTCTGG
TAGTTCGCGGATTTTACTTGGCCGTGGCCGGGCTTATGGTCATGCCTGAGGTTGCGGAAA
GAATTGAATTTGTTATTTCGTTCTCTCACATTTTAGGTGTATATATGATTTGGTCTGTGA
ACTTAACCTTTGAGGCAGCATAATGGTTTTCTGTGATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU71TF U 22
AF RR4GW53TF U 1
AF RR4AC53TF U 23
AF RR4GW53JQ C 284
AF RR4AC53JQ C 397
BS 1 42 RR4GW53TF
BS 43 43 RR4EU71TF
BS 44 54 RR4GW53TF
BS 55 55 RR4EU71TF
BS 56 94 RR4GW53TF
BS 95 95 RR4EU71TF
BS 96 102 RR4GW53TF
BS 103 103 RR4EU71TF
BS 104 173 RR4GW53TF
BS 174 176 RR4EU71TF
BS 177 204 RR4GW53TF
BS 205 205 RR4EU71TF
BS 206 235 RR4GW53TF
BS 236 236 RR4EU71TF
BS 237 532 RR4GW53TF
BS 533 534 RR4AC53TF
BS 535 608 RR4GW53TF
BS 609 711 RR4AC53TF
BS 712 723 RR4GW53JQ
BS 724 724 RR4AC53JQ
BS 725 825 RR4GW53JQ
BS 826 826 RR4AC53JQ
BS 827 864 RR4GW53JQ
BS 865 865 RR4AC53JQ
BS 866 867 RR4GW53JQ
BS 868 868 RR4AC53JQ
BS 869 881 RR4GW53JQ
BS 882 882 RR4AC53JQ
BS 883 952 RR4GW53JQ
BS 953 953 RR4AC53JQ
BS 954 1010 RR4GW53JQ
BS 1011 1011 RR4AC53JQ
BS 1012 1020 RR4GW53JQ
BS 1021 1021 RR4AC53JQ
BS 1022 1042 RR4GW53JQ
BS 1043 1120 RR4AC53JQ

RD RR4EU71TF 508 0 0
GG
GATCCGATAAAAAGATGGCAAGATTCTCAATTTCTGGAGGCGATGACGGAGAAGGATCAA
GCAACCATCAATCCCGCAAACGACAACGACTTCCTTCCATCGATGAAGATGAAGAAACCG
CCGGAAGTTCCGGTGAAGAAGACGAAGAAGAAGATGACCGTCTGATTGAATCCACGAGCG
ATGACAGCGATCGTGAAGTGGTGTTAGAAGAGGCAACAACCAGACAGATCTCTTCGAGCA
GAGATTCTTCTCTTTCCGTAACGCTTTTGGATCCAGATGTTTTCGATTGCCCCATTTGCT
GCGAGCCCCTCAAGCTTCCCATCTTTCAGTGTGATAATGGTCATCTAGCTTGTTCTGTGT
GCTGCACCAAAGTCAGGAACATATGTCCCTCCTGCACGTTACCCGTTGGTTACATTCGCT
GCAGAGCCATGGAGAAGGTCATAGAAACATCTAGAGTCTCATGTCCTTACGCCAAGTACG
GGTGTAAGGAGAAAATGTTATATGGT

QA 3 508 3 508
DS 

RD RR4GW53TF 608 0 0
GGAGGAGCCGTATGCGTAGATCTGATCCGATAAAAAGATGGCGAGATTCTCAATATCTGG
AGGCGATGACGGAGAAGGATCAAGCAACCATCAACCCCGCAAGCGACAACGACTTCCTTC
CATCGATGAAGATGAAGAAACCGCCGGAAGTTCCGGTGAAGAAGACGAAGAAG***ATGA
CCGTCTGATTGAATCCACGAGCGACGACAGCGATCGTGAAGTGGTGATAGAAGAGACAAC
AACCAGACAGATCTCTTCGAGCAGAGATTCTTCTCTTTCCGTAACGCTTTTGGATCCAGA
TGTTCTCGATTGCCCCATTTGCTGCGAGTCCCTCAAGCTTCCCATCTTTCAGTGTGATAA
TGGTCATCTAGCTTGTTCTGTGTGCTGCACCAAAGTCAGGAACATATGTCCCTCCTGCAC
GTTACCCGTTGGTTACATTCGCTGCAGGGCCATGGAGAAGGTCATAGAAACATCTAGAGT
CTCTTGTCCTTACGCCAAGTACGGGTGTAAGGAGAAAATGTTATATGGTAATCGATTTAG
CCACGAGAAGCTTTGTGTTTTCGCCCCGTGTTCCTGCCCCGTACTTAACTGCGACTACAC
TGGCTATT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4AC53TF 689 0 0
G
GATCCGATAAAAAGATGGCAAGATTCTCAATTTCTGGAGGCGATGACGGAGAAGGATCAA
GCAACCATCAATCCCGCAAACGACAACGACTTCCTTCCATCGATGAAGATGAAGAAACCG
CCGGAAGTTCCGGTGAAGAAGACGAAGAAGAAGATGACCGTCTGATTGAATCCACGAGCG
ATGACAGCGATCGTGAAGTGGTGATAGAAGAGGCAACAACCAGACAGATCTCTTCGAGCA
GAGATTCTTCTCTTTCCGTAACGCTTTTGGATCCAGATGTTCTCGATTGCCCCATTTGCT
GCGAGCCCCTCAAGCTTCCCATCTTTCAGTGTGATAATGGTCATCTAGCTTGTTCTGTGT
GCTGCACCAAAGTCAGGAACATATGTCCCTCCTGCACGTTACCCGTTGGTTACATTCGCT
GCAGGGCCATGGAGAAGGTCATAGAAACATCTAGAGTCTCTTGTCCTTACGCCAAGTACG
GGTGTAAGGAGAAAATGTTATATGGTAATAAATTTAGCCACGAGAAGCTTTGTGTTTTCG
CCCCGTGTTCCTGCCCCGTACTTGACTGCGACTACACTGGCTATTACAAGGATCTCAACA
CCCACGTACGTGCTAAGCACAAAGACGAGGTGGTTCCTTTTGTGTGGGACGTTTCTATAA
CCATTAGATTGGATAAGACCACAATCCT

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR4GW53JQ 763 0 0
ACGCTTTTGGATCCAGATGTTCTCGATTGCCCCATTTGCTGCGAGTCCCTCAAGCTTCCC
ATCTTTCAGTGTGATAATGGTCATCTAGCTTGTTCTGTGTGCTGCACCAAAGTCAGGAAC
ATATGTCCCTCCTGCACGTTACCCGTTGGTTACATTCGCTGCAGGGCCATGGAGAAGGTC
ATAGAAACATCTAGAGTCTCTTGTCCTTACGCCAAGTACGGGTGTAAGGAGAAAATGTTA
TATGGTAATCGATTTAGCCACGAGAAGCTTTGTGTTTTCGCCCCGTGTTCCTGCCCCGTA
CTTAACTGCGACTACACTGGCTATTACAAGGATCTCAACAACCACGTACGTGCCAAACAC
AAAGACGAGGTGGTTCCTTTTGTGTGGGACGTTTCTATAACCATTAGATTGGATAAGACC
ACAATCCTTCAGGAAGAAAATGATGGGGAAGTGATGGTAGTTCAAGTTTTCAGGGGTTTG
CACGTTGTGTATGTCGTTGTGAGCTGTATTGCACCTTCGGCACGGGAAGTGGGAAACTTC
TCTTACTATCTGGTAACTGTACCTTTAGCCGTTGATGGCTCGCTTGTGCAGCGATCCATG
ATGAAGAACATTCAGAAATTGAAGAATGAACAACCAGAAGATGGTTTCATGGTGATTCCT
TCCTATATGTTGTCTGGTAGTTCGCGGATTTTACTTGGCCGTGGCCGGGCTTATGGTCAT
GCCTGAG*TTGCGGAAATAATTGAATTTGTTATTTCGTT
CTCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4AC53JQ 724 0 0
CAGGAACATATGTCCCTCCTGCACGTTACCCGTTGGTTACATTCGCTGCAGGGCCATGGA
GAAGGTCATAGAAACATCTAGAGTCTCTTGTCCTTACGCCAAGTACGGGTGTAAGGAGAA
AATGTTATATGGTAATAAATTTAGCCACGAGAAGCTTTGTGTTTTCGCCCCGTGTTCCTG
CCCCGTACTTGACTGCGACTACACTGGCTATTACAAGGATCTCAACACCCACGTACGTGC
TAAGCACAAAGACGAGGTGGTTCCTTTTGTGTGGGACGTTTCTATAACCATTAGATTGGA
TAAGACCACAATCCTTCAGGAAGAAAACGATGGGGAAGTGATGGTAGTTCAAGTTTTCAG
GGGTTTGCACGTTGTGTATGTCGTTGTGAGCTGTATTTCACCTTCGGCACGGGAAGTGGG
TAACTTCTCATACTATCTGGTAACTGTACCTTTAGCCGTTGATGGCTCACTAGTGCAGCG
ATCCACGATGAAGAACATTCAGGAATTGAGGAATGAACAACCAGAAGATGGTTTCATGGT
GATTCCTTCCTATATGCTGTCTGGTAGTTCGCGGATTTTACTTGGCCGTGGCCGGGCTTA
TGGTCATGCCTGAGGTTGCGGAAAGAATTGAATTTTTTATTTCGTTCTCTCACATTTTAG
GTGTATATATGATTTGGTCTGTGAACTTAACCTTTGAGGCAGCATAATGGTTTTCTGTGA
TTTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 6

CO CL1391Contig1 565 2 2 U
GGATCTTATCATTTCGATCTTTCCAGAAAAATTCGATTCCGAGAGCGAGAAAAAAATGGA
GTTCACGGCAGAGCAGCTTAGCCAATACAACGGGACGGACTCATCGAAGCCGATCTACGT
GGCGATCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCTACGGTCCCGGAGG
CGATTACGCTTTATTCGCGGGAAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAA
CGAAGAAGACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAA
TGATTGGGAGACGAAGTTTGAAGCCAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGG
TCAATCAGAATCGTTACGATCTCTCTTGGTTTGTAACTATGTGGTGTGTGAGGATCTGTG
TGCCTGTGTTTGATCTGATCGTTTGATGACGATTCGGAATATAATAATGTAATAAATTTG
TGTTTCTTACTCTTTAACCTAATGTAATAAATGAAATCATCCTGGAGTCTAAAGTTTTAG
TGTGGCATAGAAATTGATTGTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A606JQ C 1
AF RR4A606TF U 1
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BS 8 565 RR4A606TF

RD RR4A606JQ 565 0 0
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CGATTACGCTTTATTCGCGGGAAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAA
CGAAGAAGACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAA
TGATTGGGAGACGAAGTTTGAAGCCAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGG
TCAATCAGAATCGTTACGATCTCTCTTGGTTTGTAACTATGTGGTGTGTGAGGATCTGTG
TGCCTGTGTTTGATCTGATCGTTTGATGACGATTCGGAATATAATAATGTAATAAATTTG
TGTTTCTTACTCTTTAACCTAATGTAATAAATGAAATCATCCTGGAGTCTAAAGTTTTAG
TGTGGCATAGAAATTGATTGTGTGT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4A606TF 565 0 0
GGATCTT
ATCATTTCGATCTTTCCAGAAAAATTCGATTCCGAGAGCGAGAAAAAAATGGAGTTCACG
GCAGAGCAGCTTAGCCAATACAACGGGACGGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGATC
AAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCTACGGTCCCGGAGGCGATTAC
GCTTTATTCGCGGGAAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAA
GACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATTGG
GAGACGAAGTTTGAAGCCAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGGTCAATCA
GAATCGTTACGATCTCTCTTGGTTTGTAACTATGTGGTGTGTGAGGATCTGTGTGCCTGT
GTTTGATCTGATCGTTTGATGACGATTCGGAATATAATAATGTAATAAATTTGTGTTTCT
TACTCTTTAACCTAATGTAATAAATGAAATCATCCTGGAGTCTAAAGTTTTAGTGTGGCA
TAGAAATTGATTGTGTGT

QA 8 565 8 565
DS 



CO CL1391Contig2 524 4 10 U
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CGGCAGAGCAGCTTAGCCAATACAACGGGACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGA
TCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCCACGGTCCCGGAGGCGATT
ACGCTTTATTCGCGGGAAAAGACACGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAG
AAGACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATT
GGGAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGGTCAAT
CAGATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAACTAATGGTGTGTGAGGATCTATGTGTTTGTG
TGTTTCGTGTTTGATCTGATCGTTTGATGACGATTCGAAATATAATAATGTAATAAATCG
GTGTTTGTATTACTCACTCATGTCAGATTTGAGATTGCTCGCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GI34JQ C 1
AF RR4DQ28JQ C 30
AF RR4DQ28TF U 30
AF RR4GI34TF U 1
BS 1 2 RR4GI34JQ
BS 3 29 RR4GI34TF
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BS 490 524 RR4GI34TF

RD RR4GI34JQ 524 0 0
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CGGCAGAGCAGCTTAGCCAATACAACGGGACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGA
TCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCCACGGTCCCGGAGGCGATT
ACGCTTTATTCGCGGGAAAAGACACGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAG
AAGACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATT
GGGAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGGTCAAT
CAGATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAACTAATGGTGTGTGTGGATCTATGTGTTTGTG
TGTTTCGTGTTTGATCTGATCGTTTGATGACGATTCGAAATATAATAATGTAATAAATTG
GTGTTTGTATTACTCACTCATGTCAGATTTGAGATTGCTCGCCC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4DQ28JQ 466 0 0
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GGCAAATCCTTTTACGGTCCCGGAGGCGATTACGCTTTATTCGCGGGAAAAGACGCGAGC
AGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAAGACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTC
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GTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGGTCAATCAGATCGTTACGATCTTTCTGGTTTGTAA
CTAATGGTGTGTGAGGATCTGTGTGTTTGTGTGTTTCGTGTTTGATCTGATCGTTTGATG
ACGATTCGAAATATAATAATGTAATAAATCGGTGTTTGTA
CCAAAA

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4DQ28TF 462 0 0
GATTCCGCGAGAGAGAAAAAAATGGAGTTCACGGCAGAGCAGCTTAGCCAATACAACGGG
ACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACC
GGCAAATCCTTCTACGGTCCCGGAGGCGATTACGCTTTATTCGCGGGAAAAGACGCGAGC
AGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAAGACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTC
ACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCC
GTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGGTCAATCAGATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAA
CTAATGGTGTGTGAGGATCTGTGTGTTTGTGTGTTTCGTGTTTGATCTGATCGTTTGATG
ACGATTCGAAATATAATAATGTAATAAATCGGTGTTTGTA
CC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4GI34TF 524 0 0
GG
ATCATTTCGATCTTTCCAGAAAAATTCGATTCCGCGAGAGAGAAAAAAATGGAGTTCACG
GCAGAGCAGCTTAGCCAATACAACGGGACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGATC
AAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCCACGGTCCCGGAGGCGATTAC
GCTTTATTCGCGGGAAAAGACACGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAA
GACGTATCTCCTTCTCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATTGG
GAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGGTCAATCA
GATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAACTAATGGTGTGTGTGGATCTATGTGTTTGTGTG
TTTCGTGTTTGATCTGATCGTTTGATGACGATTCGAAATATAATAATGTAATAAATTGGT
GTTTGTATTACTCACTCATGTCAGATTTGAGATTGCTCGCCC

QA 3 524 3 524
DS 



AS 1 6

CO CL1392Contig1 1293 6 13 U
GGAGAGAAACCAACATCTACATCGCTGCCTTCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGTTCT
TCTCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAAGA
***CCGAAGTAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATGCT
GCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTTTA
ATGGCTACATACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGACC
ACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCTTCTCATCTTCCCTTC
ACAGAGCTTCTTAAGTTCATTCTATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTAGT
CTCATGTGGAACTCTGTTGGGTTTTATCAGATTACAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAGCT
TGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGCATA
GGACTTGTCCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCAAA
GGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCAT
TATCTTCAGCGAAAGTATTCACTTACCTCATTCAACCTACTGGGTCATACTGCTCCAGCT
CAAGCTGCAACGTTGTTGACAGTCGGTCCATTTCTCGACTTTTGGCTGACAGAAAAACGA
GTAGACATGTATGACTACAACGTTGTCTCTCTGATGTTTATAACCCTCTCATGCACAATA
GCTATCGGGACAAACCTCAGCCAGTTCATCTGCATCGGGAGATTCACAGCCGTGTCGTTC
CAAGTCCTGGGCCATATGAAGACGATCTTGGTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGAC
CGGGACGGTCTAAACCTGCACGTGGTTATCGGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATGATC
TGGTACGGTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGTGGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCCA
ACGACCCGTCAACAGAAACATGGAGATGATTCGGATTCTGATGAAAACCCAAGGTTGAAA
GCTTAGCTAGCGTTAAGCGAGTTAACGATGAGTCTCTTACTACAGAAATGGCACCATTTT
TATACATCATATCGCTTATTCTTTCTTAGCAGAATATTGTAAAATCCTCCTAGTATTTTA
ATTTATATTTTTCAATACGAGCAACTTGCCTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D430TF U 1
AF RR4DD59TF U 1
AF RR4DT18TF U 19
AF RR4DT18JQ C 554
AF RR4DD59JQ C 608
AF RR4D430JQ C 871
BS 1 537 RR4D430TF
BS 538 597 RR4DD59TF
BS 598 601 RR4DT18TF
BS 602 602 RR4DT18JQ
BS 603 722 RR4DT18TF
BS 723 739 RR4DT18JQ
BS 740 740 RR4DD59JQ
BS 741 808 RR4DT18JQ
BS 809 809 RR4DD59JQ
BS 810 894 RR4DT18JQ
BS 895 895 RR4DD59JQ
BS 896 1252 RR4DT18JQ
BS 1253 1293 RR4DD59JQ

RD RR4D430TF 537 0 0
GGAGAGAAACCAACATCTACATCGCTGCCTTCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGTTCT
TCTCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAAGA
***CCGAAGTAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATGCT
GCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTTTA
ATGGCTACATACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGACC
ACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCTTCTCATCTTCCCTTC
ACAGAGCTTCTTAAGTTCATTCTATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTAGT
CTCATGTGGAACTCTGTTGGGTTTTATCAGATTACAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAGCT
TGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4DD59TF 597 0 0
GGAGAGAAACCAACATCTACATCGCTGCCTTCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGTTCT
TCTCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAAGA
***CCGAAGTAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATGCT
GCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTTTA
ATGGCTACATACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGACC
ACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCTTCTCATCTTCCCTTC
ACAGAGCTTCTTAAGTTCATTCTATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTAGT
CTCATGTGGAACTCTGTTGGGTTTTATCAGATTACAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAGCT
TGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGCATA
GGACTTGTCCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4DT18TF 707 0 0
GG
ATCGCTGCCTGCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGTTCTTCTCCAGGATTTTGTCTGGA
GAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAAGAAGACCAAAGTAACAAATGGC
TCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCGACGGTAGATGCTGCTGCTTGGATGTTCAATGT
CGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTTTAATGGCTACATACGGCTTTAG
CTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGACCACACTGATGACACTTGTTCT
AGGATGTCTAGGCTACATTCAGCCCTCTCATCTTCCCTTCACAGAGCTTCTCAAGTTCAT
TATATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTAGTCTTATGTGGAACTCCGTTGG
GTTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAGCTTGCTTGTTGGAAGTAGTGTT
CGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGCATAGGACTTGTCCTTGTGGGTGT
TGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCAAAG*TTTCGTTGCTGCTTTTGT
TGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCATTATCTTCAGCGAAAGTATTC
ACTTACCTCATTCAACCTACTGGGTCATACTGCTCCAGCTCA
GCT

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR4DT18JQ 699 0 0
TGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCAAAGGTTTCGTTGCTG
CTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCATTATCTTCAGCGAA
AGTATTCACTTACCTCATTCAACCTACTGGGTCATACTGCTCCAGCTCAAGCTGCAACGT
TGTTGATAGTCGGTCCATTTCTCGACTTTTGGCTGACAGAAAAACGAGTAGACATGTATG
ACTACAACGTTGTCTTTCTGATGTTTATAACCCTCTCATGCACAATAGCTATCGGGACAA
ACCTCAGCCAGTTCATCTGCATCGGGAGATTCACAGCCGTGCCGTTCCAAGTCCTGGGCC
ATATGAAGACGATCTTGGTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGACCGGGACGGTCTAA
ACCTGCACGTGGTTATCGGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATGATCTGGTACGGTAATG
CCTCGTCCAAGCCAGGTGGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCCAACGACCCGTCAAC
AGAAACATGGAGATGATTCGGATTCTGATGAAAACCCAAGGTTGAAAGCTTAGCTAGCGT
TAAGCGAGTTAACGATGAGTCTCTTACTACAGAAATGGCACCATTTTTATACATCATATC
GCTTATTCTTTCTTAGCAGAATATTGTAAAATCCTCCTA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4DD59JQ 686 0 0
TTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGCACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCATTATCTTC
AGCGAAAGTATTCACTTACCTCATTCAACCTACTGGGTCATACTGCTCCAGCTCAAGCTG
CAACGTTGTTGACAGTCGGTCCATTTCTCGACTTTTGGCTGACAGAAAAACGAGTAGACA
TGTATGACTACAACGTTGTCTCTCTGATGTTTATAACCCTCTCATGCACAATAGCTATCG
GGACAAACCTCAGCCAGTTCATCTGCATCGGGAGATTCACAGCCGTGTCGTTCCAAGTCC
TGGGCCATATGAAGACGATCTTGGTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGACCGGGACG
GTCTAAACCTGCACGTGGTTATCGGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATGATTTGGTACG
GTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGTGGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCCAACGACCC
GTCAACAGAAACATGGAGATGATTCGGATTTTGATGAAAACCCAAGGTTGAAAGCTTAGC
TAGCGTTAAGCGAGTTAACGATGAGTCTCTTACTACAGAAATGGCACCATTTTTATACAT
CATATCGCTTATTCTTTCTTAGCAGAATATTGTAAAATCCTCCTAGTATTTTAATTTATA
TTTTTCAATACGAGCAACTTGCCTTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4D430JQ 423 0 0
TGCATCGGGAGATTCACAGCCGTGTCGTTCCAAGTCCTGGGCCATATGAAGACGATCTTG
GTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGACCGGGACGGTCTAAACCTGCACGTGGTTATC
GGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATGATCTGGTACGGTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGT
GGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCCAACGACCCGTCAACAGAAACATGGAGATGAT
TCGGATTCTGATGAAAACCCAAGGTTGAAAGCTTAGCTAGCGTTAAGCGAGTTAACGATG
AGTCTCTTACTACAGAAATGGCACCATTTTTATACATCATATCGCTTATTCTTTCTTAGC
AGAATATTGTAAAATCCTCCTAGTATTTTAATTTATATTTTTCAATACGAGCAACTTGCC
TTT

QA 1 423 1 423
DS 



AS 2 6

CO CL1393Contig1 540 4 14 U
GCTTCTCAAACCAGAACTGAGTTTATTTGGAAATCCCATGATCAGGAAAGAACTGAGTTT
ATAACCAAAAAAAAACAAATCAAAAGAGATAGCACAATGTGTGTTTAGCTAGACATAGGA
TGATTGAAAACGTATTCAATGGCAAGAGAGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCCTTGTCA
GGGATCTCAAGCTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACAATCTCCACCGTGTCCAAACTA
TCTAAACCCAAATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTAGCGGGATCGACTTTA
GGGAAGCTTTTGACAACGTCGAGGACTCTGTCGACGACATCTTGCTTGCTGAGATGATCA
TCGTGCGAAGAGAAAGCACGGATCGAAGTCGAACCGATCGGAGACTGGTTCGATCCCCTC
ACTGTCAGGTTTTGCACCGGAACCCTAAGGTGGCGAAGAAGTGCATTTCTTAGTGCCATT
TCCGTCGAGCTCGAGTTTTTTTTTT*AGGGATTTGATGTTGAGATGCAACACGAAAACCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DR81JQ U 46
AF RR4DR81TF C 1
AF RR4D029JQ U 4
AF RR4D029TF C 4
BS 1 4 RR4DR81TF
BS 5 45 RR4D029JQ
BS 46 332 RR4DR81JQ
BS 333 333 RR4D029JQ
BS 334 335 RR4DR81JQ
BS 336 336 RR4D029JQ
BS 337 369 RR4DR81JQ
BS 370 370 RR4D029JQ
BS 371 387 RR4DR81JQ
BS 388 388 RR4D029JQ
BS 389 427 RR4DR81JQ
BS 428 428 RR4D029JQ
BS 429 448 RR4DR81JQ
BS 449 540 RR4D029JQ

RD RR4DR81JQ 403 0 0
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TAGCTAGACATAGGATGATTGAAAACGTATTCAATGGCAAGAGAGCAAGAGTCGATCTTG
TCAGCTTCCTTGTCAGGGATCTCAAGCTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACAATCTCC
ACCGTGTCCAAACTATCTAAACCCAAATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTA
GCGGGATCGACTTTAGGGAAGCTTTTGACAACGTCGAGGACTCTGTCCACAACATCTTGC
TTGCTGAGATGATCATCGTGCGAAAAGAAAGCACGGATCGAAATCGAACCGATCGGAGAC
TGGTTCGATCCCCTCACTGTCAAGTTTTGCACCGGAACCCTAA

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4DR81TF 522 0 0
GCTTCTCAAACCAGAACTGAGTTTATTTGGAAATCCCATGATCAGGAAAGAACTGAGTTT
ATAACCAAAAAAAAACAAATCAAAAGAGATAGCACAATGTGTGTTTAGCTAGACATAGGA
TGATTGAAAACGTATTCAATGGCAAGAGAGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCCTTGTCA
GGGATCTCAAGCTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACAATCTCCACCGTGTCCAAACTA
TCTAAACCCAAATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTAGCGGGATCGACTTTA
GGGAAGCTTTTGACAACGTCGAGGACTCTGTCGACGACATCTTGCTTGCTGAGATGATCA
TCGTGCGAAGAGAAAGCACGGATCGAAGTCGAACCGATCGGAGACTGGTTCGATCCCCTC
ACTGTCAGGTTTTGCACCGGAACCCTAAGGTGGCGAAGAAGTGCATTTCTTAGTGCCATT
TCCGTCGAGCTCGAGTTTTTTTTTTTAGGGATTTGATGTT
CC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4D029JQ 537 0 0
A
CTCAAACCAGAACTGAGTTTATTTGGAAATCCCATGATCAGGAAAGAACTGAGTTTATAA
CCAAAAAAAAACAAATCAAAAGAGATAGCACAATGTGTGTTTAGCTAGACATAGGATGAT
TGAAAACGTATTCAATGGCAAGAGAGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCCTTGTCAGGGA
TCTCAAGCTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACAATC**CACCGTGTCCAAACTATCTA
AACCCAAATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTAGCGGGATCGACTTTAGGGA
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TCGAGCTCGAGTTTTTTTTTT*AGGGATTTGATGTTGAGATGCAACACGAAAACCC

QA 2 537 2 537
DS 

RD RR4D029TF 537 0 0
A
CTCAAACCAGAACTGAGTTTATTTGGAAATCCCATGATCAGGAAAGAACTGAGTTTATAA
CCAAAAAAAAACAAATCAAAAGAGATAGCACAATGTGTGTTTAGCTAGACATAGGATGAT
TGAAAACGTATTCAATGGCAAGAGAGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCCTTGTCAGGGA
TCTCAAGCTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACAATC**CACCGTGTCCAAACTATCTA
AACCCAAATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTAGCGGGATCGACTTTAGGGA
AGCTTTTGACAACGTCGAGGACTCTGTCGACGACATCTTGCTTGCTGAGATGATCATCGT
GCGAAGAGAAAGCACGGATCGAAGTCGAACCGATCGGAGACTGGTTCGATCCCCTCACTG
TCAGGTTTTGCACCGGAACCCTAAGGTGGCGAAGAAGTGCATTTCTTAGTGCCATTTCCG
TCGAGCTCGAGTTTTTTTTTT*AGGGATTTGATGTTGAGATGCAACACGAAAACCC

QA 2 537 2 537
DS 



CO CL1393Contig2 576 2 3 U
GGACGGAAATGGCACTGAGAAATGCACTTCTTCGCCACCTTAGGGTTCCGGTGCAGAACC
TGACAGTGGAGGATCGAACCAGTCTCCGATCGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCGCACGA
TGATCATCTCAGCAAGCAAGATGTCGTCGACAGAGTCCTCGATGTTGTCAAAAGCTTCCC
TAAAGTCGATCCCGCTAAGGTGACACCTGATGCTCATTTCCAAAAGGATTTGGGTTTAGA
TAGTTTGGACACTGTGGAGATTGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTTGAGATCCC
TGACAAGGAAGCTGACAAGATCGACTCTTGCTCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAATCA
TCCTATGTCTAGCTAAACACACTCTGCTTTCTCTTTTGTTTTTTTGGTTATAAACAGTTC
TTTCCTGATCATGTGACTTCCAAATAAATTCAGTTCTGGTTTGAGAGGCATGCTTGACTC
TTTGAACAGTTTCAATCACCTTGAGAAACCTTCTGTCTTGATTGTTTTGTAATTCGACAC
TTATTTGGTGTAATTACAATCTACCTTATTCAACCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H653TF U 1
AF RR4H653JQB C 1
BS 1 1 RR4H653JQB
BS 2 348 RR4H653TF
BS 349 576 RR4H653JQB

RD RR4H653TF 348 0 0
G
GACGGAAATGGCACTGAGAAATGCACTTCTTCGCCACCTTAGGGTTCCGGTGCAGAACCT
GACAGTGGAGGATCGAACCAGTCTCCGATCGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCGCACGAT
GATCATCTCAGCAAGCAAGATGTCGTCGACAGAGTCCTCGATGTTGTCAAAAGCTTCCCT
AAAGTCGATCCCGCTAAGGTGACACCTGATGCTCATTTCCAAAAGGATTTGGGTTTAGAT
AGTTTGGACACTGTGGAGATTGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTTGAGATCCCT
GACAAGGAAGCTGACAAGATCGACTCTTGCTCTCTTGCCATTGAATA

QA 2 348 2 348
DS 

RD RR4H653JQB 576 0 0
GGACGGAAATGGCACTGAGAAATGCACTTCTTCGCCACCTTAGGGTTCCGGTGCAGAACC
TGACAGTGGAGGATCGAACCAGTCTCCGATCGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCGCACGA
TGATCATCTCAGCAAGCAAGATGTCGTCGACAGAGTCCTCGATGTTGTCAAAAGCTTCCC
TAAAGTCGATCCCGCTAAGGTGACACCTGATGCTCATTTCCAAAAGGATTTGGGTTTAGA
TAGTTTGGACACTGTGGAGATTGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTTGAGATCCC
TGACAAGGAAGCTGACAAGATCGACTCTTGCTCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAATCA
TCCTATGTCTAGCTAAACACACTCTGCTTTCTCTTTTGTTTTTTTGGTTATAAACAGTTC
TTTCCTGATCATGTGACTTCCAAATAAATTCAGTTCTGGTTTGAGAGGCATGCTTGACTC
TTTGAACAGTTTCAATCACCTTGAGAAACCTTCTGTCTTGATTGTTTTGTAATTCGACAC
TTATTTGGTGTAATTACAATCTACCTTATTCAACCG

QA 1 576 1 576
DS 



AS 3 6

CO CL1394Contig1 1050 2 2 U
GGATCCTGGATTCCCGTCAGGACCAGGATCAGGATCACCTTTTCCTTTTCCATTTCCTCC
CCAAACAAGTCCTACTCCCTCGCCGTTCCAATCTCAATCCCAGTCTTCAAGTGCTACTGT
TGATGTGACAGCGACAAAAGTAGATACACCTCCTTCGACTAATCCGCAGCCTGCCCCTGT
AAAGAATATAGAAGTGGATAAGCCAAGTGTTGTCTTAGAGGAAAACAAATCCAAGAAGGA
AGAAAAGAACTACGCCTTTGAGGAAAGTCCATTTAGTAACTATGCAGAAGTCTCTGAAAC
CAGTGCTCCCAAAGAAGCTCGCTTATTTGAGGATGTTTTGCAAAATGGATCTTCTACTCC
GGCTAATGGTGCTACTGCTTCAGAGGTTTTTCAATTTGGGCGCTGGGAAAGGAGGGCCTG
GTTTGTCTGTAGAAGCTTTAGAGGAAATGATGGAAGATCCAACAGTTCAGAAGATGGTTT
ACCCACATTTGCCTGAGGAGATGAGGAACCCAGAAACTTTCAAATGGATGCTTCAAAATC
CTCAATACCGTCAACAGCTACAGGACATGTTGAATAATATGAGTGGGAGTGGTGAATGGG
ACAAGAGAATGACGGAGACCTTAAAGAACTTCGACCTGAATAGTCCTGAAGTGAAGCAAC
AATTCGATCAAATAGGACTGACACCAGAAGAAGCCATCTCTAAGATAATGCAGAACCCTG
ATGTTGCAATGGCATTCCAGAATCCTAGAGTCCAAGCAGCGTTAATGGAATGTTCAGAGA
ACCCAATGAACATCATGAAGTACCAAAACGACAAAGAGGTAATGGATGTGTTCAACAAGA
TTTCACAGCTCTTCCCAGGAATGACGGGTTGAGACAAAGCGCTCACGACTCGTATGGTTT
TGATCTCCATTGGATCAAAATCTCATGTCTTTCTTTAGCTCTAGGCACCAAAAAAAAAGA
AAACAAGAACATGATTTTTTTGGTTATCACAGACAAAGATGCTTAAGTTTTGCTCAGGAC
ATAGAGAGAGACGCTTGTACCTTTTTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC36TF U 1
AF RR4AC36JQ C 341
BS 1 781 RR4AC36TF
BS 782 1050 RR4AC36JQ

RD RR4AC36TF 783 0 0
GGATCCTGGATTCCCGTCAGGACCAGGATCAGGATCACCTTTTCCTTTTCCATTTCCTCC
CCAAACAAGTCCTACTCCCTCGCCGTTCCAATCTCAATCCCAGTCTTCAAGTGCTACTGT
TGATGTGACAGCGACAAAAGTAGATACACCTCCTTCGACTAATCCGCAGCCTGCCCCTGT
AAAGAATATAGAAGTGGATAAGCCAAGTGTTGTCTTAGAGGAAAACAAATCCAAGAAGGA
AGAAAAGAACTACGCCTTTGAGGAAAGTCCATTTAGTAACTATGCAGAAGTCTCTGAAAC
CAGTGCTCCCAAAGAAGCTCGCTTATTTGAGGATGTTTTGCAAAATGGATCTTCTACTCC
GGCTAATGGTGCTACTGCTTCAGAGGTTTTTCAATTTGGGCGCTGGGAAAGGAGGGCCTG
GTTTGTCTGTAGAAGCTTTAGAGGAAATGATGGAAGATCCAACAGTTCAGAAGATGGTTT
ACCCACATTTGCCTGAGGAGATGAGGAACCCAGAAACTTTCAAATGGATGCTTCAAAATC
CTCAATACCGTCAACAGCTACAGGACATGTTGAATAATATGAGTGGGAGTGGTGAATGGG
ACAAGAGAATGACGGAGACCTTAAAGAACTTCGACCTGAATAGTCCTGAAGTGAAGCAAC
AATTCGATCAAATAGGACTGACACCAGAAGAAGCCATCTCTAAGATAATGCAGAACCCTG
ATGTTGCAATGGCATTCCAGAATCCTAGAGTCCAAGCAGCGTTAATGGAATGTTCAGAGA
A
CC

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AC36JQ 710 0 0
CAAAATGGATCTTCTA
CTCCGGCTAATGGTGCTACTGCTTCAGAGGTTTTTCAATTTGGGCGCTGGGAAAGGAGGG
CCTGGTTTGTCTGTAGAAGCTTTAGAGGAAATGATGGAAGATCCAACAGTTCAGAAGATG
GTTTACCCACATTTGCCTGAGGAGATGAGGAACCCAGAAACTTTCAAATGGATGCTTCAA
AATCCTCAATACCGTCAACAGCTACAGGACATGTTGAATAATATGAGTGGGAGTGGTGAA
TGGGACAAGAGAATGACGGAGACCTTAAAGAACTTCGACCTGAATAGTCCTGAAGTGAAG
CAACAATTCGATCAAATAGGACTGACACCAGAAGAAGCCATCTTTAAGATAATGCAGAAC
CCTGATGTTGCAATGGCATTCCAGAATCCTAGAGTCCAAGCAGCGTTAATGGAATGTTCA
GAGAACCCAATGAACATCATGAAGTACCAAAACGACAAAGAGGTAATGGATGTGTTCAAC
AAGATTTCACAGCTCTTCCCAGGAATGACGGGTTGAGACAAAGCGCTCACGACTCGTATG
GTTTTGATCTCCATTGGATCAAAATCTCATGTCTTTCTTTAGCTCTAGGCACCAAAAAAA
AAGAAAACAAGAACATGATTTTTTTGGTTATCACAGACAAAGATGCTTAAGTTTTGCTCA
GGACATAGAGAGAGACGCTTGTACCTTTTTGTAA

QA 17 710 17 710
DS 



CO CL1394Contig2 690 2 20 U
GCACAAACCGTTATTTCGATACATAGAAATACAGATGGATAAATACGGTTATACAACAAT
AGATCTTCTCTTATTTGAGCAAAACCGAAGCATCTTTGCTAACAAAACAAAACATGTTTT
ATCTTTCACTCCTACAAAAGCTAAAGAAAGACATGAATCCGATCCAATAAGATGGAAACC
AAAAGACGTGAGCGAGCCTTTTTCAACCCGTCATTCCTGGGAAGAGCTGGGATATCTTGT
TGAACACATCCATTACCTCTTTGTCATTTTGGTACTTCATGATGTTCATTGGATTATCTG
AACATTCCATTAGCGCTGCTTGGACTCTAGGATTCTGGAATGCCATTGCAACATCAGGGT
TCTCCATAATCTTAGAGATGACTTCTTCTGGAGTCAGTCCTATTTGATCGAACTGTTGCT
TCACTTCAGGACTATTCAGGTCGAAGTTCTTTAAGGTCTCCGTCATTCTCTTGTCCCATT
CACCACTCCCAATCATATTATTCAACATGTCCTGTAGCTGTTGACGGTATTGAGGATTCT
TAAGCATCCACTTGAAAGTTTCTGGGTTCCTCATCTCCTCAGGCAAATGTGGGTAAACCA
TCTTCTGAACTGTAGGATCTTCCATCATTTTCTCCAAAGCTTCTACTGACAAACCAGGCC
CTCCTTTCCCAGCGCCCAAAGATTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BA01JQ U 1
AF RR4EV49JQ U 8
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BS 620 690 RR4EV49JQ

RD RR4BA01JQ 619 0 0
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ATCTTTCACTCCTACAAAAGCTAAAGAAAGACGTGAATCCGATCCAATAAGATGGAAACC
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AACATTCCATTAGCGCTGCTTGGACTCTAGGATTCTGGAATGCCATTGCAACATCAGGGT
TCTCCATTATCTTAGAGATGACTTCTTCTGGAGTCAGTCCTATTTGATCGAACTGTTGCT
TCACTTCAGGACTATTCAGGTCGAAGTTCTTTAAGGTCTCCGTCATTCTCTTGTCCCATT
CACCACTCCCACTCATATTATTCAACATGTCCTGTAGCTGTTGACGGTATTGAGGATTCT
TAAGCATCCACTTGAAAGTTTCTGGGTTCCTCATCTCCTCAGGCAAATGTGGGTAAACCA
TTTTCTGAACTGTTGGATC

QA 1 619 1 619
DS 

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CTCTTATTTGAGCAAAACCGAAGCATCTTTGCTAACAAAACAAAACATGTTTTATCTTTC
ACTCCTACAAAAGCTAAAGAAAGACATGAATCCGATCCAATAAGATGGAAACCAAAAGAC
GTGAGCGAGCCTTTTTCAACCCGTCATTCCTGGGAAGAGCTGGGATATCTTGTTGAACAC
ATCCATTACCTCTTTGTCATTTTGGTACTTCATGATGTTCGTTGGATTATCTGAACATTC
CATTAGCGCTGCTTGGACTCTAGGATTCTGGAATGCCATTGCAACATCAGGGTTCTCCAT
AATCTTAGAGATGACTTCTTCTGGAGTCAGTCCTATTTGATCGAACTGTTGCTTCACTTC
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CCCAATCATATTATTCAACATGTCCTGTAGCTGTTGACGGTATTGAGGATTCTTAAGCAT
CCATTTGAAAGTTTCTGGGTTCCTCATCTCCTCAGGCAAATGTGGGTAAACCATCTTCTG
AACTGTAGGGTCTTCCATCATTTTCTCCAAAGCTTCTACTGACAAACCAGGCCCTCCTTT
CCCAGCGCCCAAAGATTGAAAAA

QA 1 683 1 683
DS 



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CTGCTCCGGCGAATGGTGCTACTGCTTCGGAGGTTTTTCAATCTTTGGGCGCTGGGAAAG
GAGGGCCTGGTTTGTCTGTAGAAGCGTTAGAGAAAATGATGGAAGATCCAACAGTTCAGA
AGATGGTTTACCCACATTTGCCTGAGGAGATGAGGAACCCAGAAACTTTCAAATGGATGC
TCCAAAATCCTCAATACCGTCAACAGCTACAGGACATGCTGAATAATATTAGTGGGAGTG
GTGAATGGGACAAGAGAATGACGGAGACCTTAAAGAATTTTGATCTGAATAGTCCTGAAG
TGAAGCAACAGTTCGATCAAATAGGATTGACTCCAGAAGAAGCCATCTTTAAGATAATGC
AGAACCCTGATGTTGCTATGGCATTCCAGAATCCTAGAGTCCAAGCAGCCTTAATGGAAT
GTTCAGAGAACCCAATGAACATCATGAAGTACCAAAACGACAAAGAGGTAATGGATGTTT
TCAACAAGATTTCACAGCTCTTCCCAGGAATGACGGGTTTAGACAAAGCGCTCACGACTT
ATGGTTTTGATCTCCATTGGATCAAAATCTCATGTCTTTCTTTAGCTTTTTAGGAACCAA
AAAAAAAAAGAGAAAACAAGAACATGTTTTTTTTTTGGTTATCACAGACAAAGATGCTCA
AGTTTTGCTCAGGCCATAGAGAGAGACGCTTGTACCTTGTAAACTCAGTCGTGAATTCGA
TACGTGTAAGAATATTGTTGGTGCG


BQ
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AF RR4E174TF U 1
AF RR4E174JQ C 539
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RD RR4E174TF 759 0 0
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CAGGACCAGGATCAGGATCACCTTTTCCTTTTCCATTTCCTCCCCAAACAAGTCCTACTC
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AAGTAGATACACCTCCTTCTACTAAGCCGCAACCTGCCCCTGTAAAGAATATAGAAGTGG
ATAAGCCAAGTGTTGTCTTAGAGGAAAACAAAGCCAAGAAAGAAGAAAAGAACTACGCCT
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TGTCTGAAACCAGTGCTCCCAAAGAAGCTCGCTTATTTGAGGATGTTTTGCAAAATGGAT
CTGCTCCGGCGAATGGTGCTACTGCTTCGGAGGTTTTTCAATCTTTGGGCGCTGGGAAAG
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TGAAGCAACAGTTCGATCAAATAGGATTGACTCCAGAAG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4E174JQ 627 0 0
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TTATGGTTTTGATCTCCATTGGATCAAAATCTCATGTCTTTCTTTAGCTTTTTAGGAACC
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GATACGTGTAAGAATATTGTTGGTGCG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 2 6

CO CL1395Contig1 521 3 14 U
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ATACAAATCATTGCCGGAAAGACAAAAGGGAAAAACAAAGACAACAAGGGATTGAAACAA
CAAAGCAAGAGGAACATAAAACCGCTCCTAAATCCAAATGATATTAAGAATCAAAAGAGT
TTTTTGTTATTCATCAAACACTGGAACCCTTATCTTCAAGCTCTTTTAATGGTTCCCACA
TCTTTTCTCTCTTCCTTCATTACTCTTGAGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGAT
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CATGCTTCCAGAATCCATACACACACGTCAATGTCAGGAGCCTCTGTGAGTAAATCTGCC
ATGTGTATTTCTCCTCAATCCTCTGAAGCCCTCCCTTTGAGATCTGGTCCCAGTGAGATG
GATCTTCCTTACACTTGGTGAAGAAATCAGCAAGAGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EI86JQ U 1
AF RR4EN96JQ U 11
AF RR4EN96TF C 11
BS 1 14 RR4EI86JQ
BS 15 15 RR4EN96JQ
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BS 195 384 RR4EI86JQ
BS 385 386 RR4EN96JQ
BS 387 491 RR4EI86JQ
BS 492 492 RR4EN96JQ
BS 493 502 RR4EI86JQ
BS 503 521 RR4EN96JQ

RD RR4EI86JQ 506 0 0
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AAAA

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DS 

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G
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DS 

RD RR4EN96TF 511 0 0
G
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TGCCGGAAAGACAAAAGGGAAAAACAAAGACAACAAGGGATTGAAACAACAAAGCAAGAG
GAACATAAAACCGCTCCTAAATCCAAATGATATTAAGAATCAAAAGAGTTTTTTGTTATT
CATCAAACACTGGAACCCTTATCTTCAAGCTCTTTTAATGGTTCCCACATCTTTTCTCTC
TTCCTTCATTACTCTTGAGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGATACTTCAAGGCA
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CACTTGGTGAAGAAATCAGCAAGAGTATC
C

QA 2 510 2 510
DS 



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AATGTTGAAAACGAAGAGCACTTATGTGTGCTCAAGGACAAGAAGAAGCCAATCCTCTTC
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AAGCTCAACGGCCAGTTCAGGTGGATCTCATCCCAGATGAACAGAGTTAGGAACGGTGAG
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CACTGGGACCAGATCTCAAAGGTAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACATGGCAG
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CTTTTGATTCTTAGTATCATTTGGATTTAGGAGCGGTTTTATGTTCCTCTTGCTTTGTTG
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GATTGTTGAGGGATCTCCCCTGATCATTGGCAATGAAATTTCTACT


BQ
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20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EI86TF U 1
AF RR4BD59TF U 416
AF RR4BE41TF U 416
BS 1 485 RR4EI86TF
BS 486 486 RR4BD59TF
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RD RR4EI86TF 768 0 0
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AAGCTCAACGGCCAGTTCAGGTGGATCTCATCCCAGATGAACAGAGTTAGGAACGGTGAG
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GGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGATTTCTTCACCAAGTTTAAGGAAGATCCATCT
CACTGGGACCAGATCTCAAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACATGGCAG
ATTTACTCACAGAGGCTCCTGACATTGACCGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTCTCG
AACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4BD59TF 651 0 0
G
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QA 2 651 2 651
DS 

RD RR4BE41TF 650 0 0
G
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CAAAGGTGGTCCAGCTGAGATCATTGTGCACGGCAAATCGGGTTTCCACATTGACCCTTA
CCACGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGATTTCTTCACCAAATGTAAGGAAGATCC
ATCTCACTGGGACCAGATCTCAAAGGTAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACATG
GCAGATTTACTCACAGAGGCTCCTGACATTGACCGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGT
CTCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCCTTGAAGTA
TCGCCCACTGGCTAAGGCCGTTCCTCTCGCTGAAGAGTAATGAAGAAGAGGGAAAAGATG
TGGGAACCATTAAAAGAGCTTGAAGATAAAGGTTCCAGTGTTTGATGAATAATAACAAAA
AACTCTTTTGATTCTTAGTATCATTTGGATTTAGGAGCGGTTTTATGTTCCTCTTGCTTT
GTTGTTTCAATCCCTTGTTGTCTTTGTTTTTCCCCTTTGTCTTTCCGGCAATGATTTGTA
TTCTGATTGTTGAGGGATCTCCCCTGATCATTGGCAATGAAATTTCTAC

QA 2 650 2 650
DS 



AS 1 2

CO CL1396Contig1 785 2 3 U
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ATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAATTCTGGCACAGAAATCTTGGAATTAAGTGCCGT
CTACATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATCTCTGTTTCTGGAGCTTCAAAACTTCTGGCA
AACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGTCTTTCTGTCGGCACTATGATCGCTGGATGG
GACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTCGACAACGAAGGAGGAAGGCTTAAGGGAGAC
AGGTTTTCAGTCGGTTCTGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACAGCGGGTACAAA
TTTGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACA
TTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGG
AAGAAACTGTCAGGAGATGACGTTGGGGAGCTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCA
GAAAGTGCTGAACAAGTCATGGAGGAAGCAGCCGCTGAGTAAGGAGATCCGTTTTTACTT
CCAAATGATTCGCTCTCTTTTATGTGTGTTTTGCTTCTAGTAAGTATGCTGAGTTTTTAT
CTAGCTCTTAAGTACAAGGTTCTCCCTTTTTTTATCTGCAAATACGTGTTCCCATTACTT
TGTTCAAGCAGCTCTTTTTTACTCTCACACTGTGTTTTAACATGAAATAATATGTGATTG
TTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4BU54TF U 418
AF RR4H002JQ C 1
BS 1 418 RR4H002JQ
BS 419 523 RR4BU54TF
BS 524 785 RR4H002JQ

RD RR4BU54TF 106 0 0
G
CATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGAT
GGAAGAAACTGTCAGGAGATGACGTTGGGGAGCTACACTATCACT

QA 2 106 2 106
DS 

RD RR4H002JQ 785 0 0
TATATCTCCTCACAATCTGTGAAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATATGCTTGGTACA
ATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAATTCTGGCACAGAAATCTTGGAATTAAGTGCCGT
CTACATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATCTCTGTTTCTGGAGCTTCAAAACTTCTGGCA
AACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGTCTTTCTGTCGGCACTATGATCGCTGGATGG
GACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTCGACAACGAAGGAGGAAGGCTTAAGGGAGAC
AGGTTTTCAGTCGGTTCTGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACAGCGGGTACAAA
TTTGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACA
TTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGG
AAGAAACTGTCAGGAGATGACGTTGGGGAGCTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCA
GAAAGTGCTGAACAAGTCATGGAGGAAGCAGCCGCTGAGTAAGGAGATCCGTTTTTACTT
CCAAATGATTCGCTCTCTTTTATGTGTGTTTTGCTTCTAGTAAGTATGCTGAGTTTTTAT
CTAGCTCTTAAGTACAAGGTTCTCCCTTTTTTTATCTGCAAATACGTGTTCCCATTACTT
TGTTCAAGCAGCTCTTTTTTACTCTCACACTGTGTTTTAACATGAAATAATATGTGATTG
TTTTG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 6

CO CL1397Contig1 850 6 6 U
GAAAACACGAAATCATACGTTCTCGGATCCGTTCGCACTGCTCTGATCTCTCTCTGCGAT
GAGATGCTAAGTCCTCAATAGGACACTGTAAAAGCGAAAGACGAAACAAATGAACTTTCG
AAGGGAGAATCGTGCATCGAGAACATCTCTCTTCGACGGGCTCGATGGACTCGAGGAAGG
TCGCTTGAGAGCTTCCTCTTCCTACTCTCATGATACCACCGAACGCGACAATGACGAAGC
CCTCGAGAGTCTTCAGGACAGAGTTTCGTTTCTGAAGAGAGTGACTGGAGGCATACATGA
GGAAGTTGAGAGTCATAACCGTATGCTTGACAAAGTGGGTAACAAAATGGACTCGGCCAG
GGGAATAATGTCAGGAACTATCAACCGTTTCAAGTTGGTCTTTGAGAAGAAGTCGAATCG
AAAAAATTGCAAACTCATAGCGTATTTTGTGCTCCTGTTCTTGGTCATGTATTACCTTAT
TAGACTATTAAACTACATCAGAGGGTGAACTTGGATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTAC
ATCAATACTTGTTTCGTTTCATTTTTGTGTTTCTTCTGATAAATGATTCAGGCAACATTG
AACTAGTCGAGGGACCCATGTTAAAAACAAGGTCAAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACT
AGTGAAGAACCGAAGGAGAAGGGTAGATAGATGCACGGTTTTTTTGCTCCAAGTACAATT
GTCTCATTGTCGTTTTGTATGATCTTCTTTATGAATTGCCAACTATTTGGATGCCCAACA
AACAAGGCCTTCTTGGATCGTGTCAGCAACTTTGGCTACGGAAAGCTTAATTGTTAAGTT
TAACAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4F883TF U 1
AF RR4F883JQ C 253
AF RR4BU51JQ C 334
AF RR4BU51TF U 335
AF RR4CM05JQ C 335
AF RR4CM05TF U 335
BS 1 414 RR4F883TF
BS 415 415 RR4BU51TF
BS 416 675 RR4F883TF
BS 676 676 RR4BU51TF
BS 677 700 RR4F883TF
BS 701 850 RR4BU51TF

RD RR4F883TF 700 0 0
GAAAACACGAAATCATACGTTCTCGGATCCGTTCGCACTGCTCTGATCTCTCTCTGCGAT
GAGATGCTAAGTCCTCAATAGGACACTGTAAAAGCGAAAGACGAAACAAATGAACTTTCG
AAGGGAGAATCGTGCATCGAGAACATCTCTCTTCGACGGGCTCGATGGACTCGAGGAAGG
TCGCTTGAGAGCTTCCTCTTCCTACTCTCATGATACCACCGAACGCGACAATGACGAAGC
CCTCGAGAGTCTTCAGGACAGAGTTTCGTTTCTGAAGAGAGTGACTGGAGGCATACATGA
GGAAGTTGAGAGTCATAACCGTATGCTTGACAAAGTGGGTAACAAAATGGACTCGGCCAG
GGGAATAATGTCAGGAACTATCAACCGTTTCAAGTTGGTCTTTGAGAAGAAGTCTAATCG
AAAAAATTGCAAACTCATAGCGTATTTTGTGCTCCTGTTCTTGGTCATGTATTACCTTAT
TAGACTATTAAACTACATCAGAGGGTGAACTTGGATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTAC
ATCAATACTTGTTTCGTTTCATTTTTGTGTTTCTTCTGATAAATGATTCAGGCAACATTG
AACTAGTCGAGGGACCCATGTTAAAAACAAGGTCAAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACT
AGTGAAGAACCGAAG*AGAAGGGTAGATAGATGCACGGTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4F883JQ 524 0 0
TCAGGACAGAGTTTCGTTTCTGAAGAGAGTGACTGGAGGCATACATGAGGAAGTTGAGAG
TCATAACCGTATGCTTGACAAAGTGGGTAACAAAATGGATTCGGCCAGGGGAATAATGTC
AGGAACTATCAACCGTTTCAAGTTGGTTTTTGAGAAGAAGTTTAATCGAAAAAATTGCAA
ACTCATAGCGTATTTTGTGCTCCTGTTTTTGGTCATGTATTACCTTATTAGACTATTAAA
CTACATCAGAGGGTGAACTTGGATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTACATCAATACTTGT
TTCGTTTCATTTTTGTGTTTTTTTTGATAAATGATTCAGGCAACATTGAACTAGTCGAGG
GACCCATGTTAAAAACAAGGTCAAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACTAGTGAAGAACCG
AAGGAGAAGGGTAGATAGATGCACGGTTTTTTTGCTCCAAGTACAATTGTTTCATTGTCG
TTTTGTATGATTTTCTTTATGAATTGCCAACTATTTGGATGCCC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4BU51JQ 406 0 0
G
GTGGGTAACAAAATGGACTCGGCCAGGGGAATAATGTCAGGAACTATCAACCGTTTCAAG
TTGGTCTTTGAGAAGAAGTCGAATCGAAAAAATTGCAAACTCATAGCGTATTTTGTGCTC
CTGTTCTTGGTCATGTATTACCTTATTAGACTATTAAACTACATCAGAGGGTGAACTTGG
ATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTACATCAATACTTGTTTCGTTTCATTTTTGTGTTTCT
TCTGATAAATGATTCAGGCAACATTGAACTAGTCGAGGGACCCATGTTAAAAACAAGGTC
AAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACTAGTGAAGAACCGAAGGAGAAGGGTAGATAGATGC
ACGGTTTTTTTGCTCCAAGTACAATTGTCTCATTGTCGTTTTGTA

QA 2 406 2 406
DS 

RD RR4BU51TF 516 0 0
GTGGGTAACAAAATGGACTCGGCCAGGGGAATAATGTCAGGAACTATCAACCGTTTCAAG
TTGGTCTTTGAGAAGAAGTCGAATCGAAAAAATTGCAAACTCATAGCGTATTTTGTGCTC
CTGTTCTTGGTCATGTATTACCTTATTAGACTATTAAACTACATCAGAGGGTGAACTTGG
ATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTACATCAATACTTGTTTCGTTTCATTTTTGTGTTTCT
TCTGATAAATGATTCAGGCAACATTGAACTAGTCGAGGGACCCATGTTAAAAACAAGGTC
AAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACTAGTGAAGAACCGAAGGAGAAGGGTAGATAGATGC
ACGGTTTTTTTGCTCCAAGTACAATTGTCTCATTGTCGTTTTGTATGATCTTCTTTATGA
ATTGCCAACTATTTGGATGCCCAACAAACAAGGCCTTCTTGGATCGTGTCAGCAACTTTG
GCTACGGAAAGCTTAATTGTTAAGTTTAACAGGTCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4CM05JQ 516 0 0
GTGGGTAACAAAATGGACTCGGCCAGGGGAATAATGTCAGGAACTATCAACCGTTTCAAG
TTGGTCTTTGAGAAGAAGTCGAATCGAAAAAATTGCAAACTCATAGCGTATTTTGTGCTC
CTGTTCTTGGTCATGTATTACCTTATTAGACTATTAAACTACATCAGAGGGTGAACTTGG
ATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTACATCAATACTTGTTTCGTTTCATTTTTGTGTTTCT
TCTGATAAATGATTCAGGCAACATTGAACTAGTCGAGGGACCCATGTTAAAAACAAGGTC
AAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACTAGTGAAGAACCGAAGGAGAAGGGTAGATAGATGC
ACGGTTTTTTTGCTCCAAGTACAATTGTCTCATTGTCGTTTTGTATGATCTTCTTTATGA
ATTGCCAACTATTTGGATGCCCAACAAACAAGGCCTTCTTGGATCGTGTCAGCAACTTTG
GCTACGGAAAGCTTAATTGTTAAGTTTAACAGGTCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4CM05TF 516 0 0
GTGGGTAACAAAATGGACTCGGCCAGGGGAATAATGTCAGGAACTATCAACCGTTTCAAG
TTGGTCTTTGAGAAGAAGTCGAATCGAAAAAATTGCAAACTCATAGCGTATTTTGTGCTC
CTGTTCTTGGTCATGTATTACCTTATTAGACTATTAAACTACATCAGAGGGTGAACTTGG
ATACAAGAAGAAAGTATATTGTTTACATCAATACTTGTTTCGTTTCATTTTTGTGTTTCT
TCTGATAAATGATTCAGGCAACATTGAACTAGTCGAGGGACCCATGTTAAAAACAAGGTC
AAGAATGAGATTGTTGTCAAGCGACTAGTGAAGAACCGAAGGAGAAGGGTAGATAGATGC
ACGGTTTTTTTGCTCCAAGTACAATTGTCTCATTGTCGTTTTGTATGATCTTCTTTATGA
ATTGCCAACTATTTGGATGCCCAACAAACAAGGCCTTCTTGGATCGTGTCAGCAACTTTG
GCTACGGAAAGCTTAATTGTTAAGTTTAACAGGTCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 5

CO CL1398Contig1 988 5 3 U
GCCCTTTAATTAAAGCTTATAAGTCGAAAACCTTATAGAAAAGGCCCACGTGGAGCGAGA
TTAAAGGACATCTATAAAATCGACGGCATCAAGTAAACGTGCAATTAAAAACACCGTCAA
AAGGTAAAAAAGAAGAAGTTAACGGAGATAGGATATTACACGGACCCCACAGAATAAAAG
GTCACTAATCTAACCCGGGACTTCTCATCTTCTGCCGTCGAACCGGCGATTCCTCCGGCG
ACGATGTCAGCACATCGTCATCTTCATTGTCTATCGGAGATGAGAGCGGCGAGGGAAAGA
TCTCAACGGGAGATAACGGCGAGGGAGAAGAGTCCGAAGAATCAGGCGAGAGAGTCGACG
GAGGCGGAGAAGAGTCCGACGATTCAGGAGACAGAGTCGACGGAGGCGAGTCTTCTGGAA
GCTTCCGTTTGTTTACGTTGGAAAGTTTAACGTCTCTGGTCAGATAGTTTCTGAGGCGTT
TCACGTCGGCGAGTTTCACCGGTTTGAGTAAGAAATCCTCCGCACCTTCCTCAAGGCACC
CGTCGATTCTTGTTATTACATTCTCCGACGACATTATTACAACCGGGACTTGTCGGAAAC
TGGACGATTCCTTGATCTTCTTGAGGAGCTCGTAGCCAGTCATTCCAGGCATGCAGTAAT
CCGTGATGATCAGATCAACTTTCAATCTATCGAGTTCTGCAGAGGCTTTCTCGTTGTCTA
GCCCTAGAAACTCTAGAGCACGCCATCCGCTATCTACCGCCGTGACTTTGCAGGAGGTAA
TACGAAGCAATCTCTCGATGACAATCCGATCAACGAGGCTGTCGTCGACGGCCAGGACAT
GAACTTCATCTACATCCAAAAGAGGATGTTCCATTCCTCCGATTCCGACGTTCATCATCT
CTGGCCTCCGTAGACAAGAAACGCCACCGTCGCTAGCCATTGACGAGTAGTGGTAGTAAC
TGAGAGGAGAGGATATTAAATGTTTTAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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C

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AS 2 4

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BQ
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AF RR4E706JQ U 1
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QA 1 719 1 719
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CACCTCGAGCTGGTTGTTCAGCTTTGCCACATCAATGGGTGTCTTCTCGTCTAGGTTTTG
CAGAGTCACAGCAGCACCATTCTCTAGGAGAAGGGTTACACACTCTTTCCTCCCGTAACC
AGCAGCGTAATGCAGAGGCGTGTTCTTGTTTTTGTCAACAGCGTTAACACTTGCTCCAGC
ATCAATAAGAACTTGAGCACATTTCAACTCGCCGTATCCACAAGCAAAATGCAATGCTGT
CCTTCCCTCAGAATCTTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCCAAAGCATTTTTCAAACC
CTCAACATCACCAAGACTGGCAGTTTGATGAACAATAGACTCTTCTTCTTCTTCACCGTC
TTCCGCTACCTCGGCAGGTTCAGCTGAAGCAGCCTGGTCTGGCATGCCAGCAATAGGCAT
ACCCATTGCTTCACCCAGCTTTTTCAGCACATCTTTATCATTCCAGTACTTCATCATGGC
AGAAAGACCACCAGCATCAATCTCATCAAGTATAGGTTT

QA 1 759 1 759
DS 



CO CL1399Contig2 1165 2 2 U
GGGCCACCACAACGTTGTCTTCTCGGGGTTTAAGTTTGATCTAATGGCTTCGAATCCAGA
GAAAAATCCGCTGATTCCTTCAGATGAGAAAACCGAATCGAAGGAGGAGAGCAAGAGTCC
TAAACCGGAATCAGCAGCAGCAGCAGCATCTGGGAGTTCACTTTCATCACCTAATCCTCC
AGCATCTGGGAGTTCAGCTAATCCTCCTGGCTTGAATTTCAATGCTTTTGATTTCTCAAA
CATGGCTAGTATCCTCAACGATCCAAGCATCAGAGAATTGGCGGAGCAGATTGCTAAAGA
TCCTGCCTTTAACCAGTTGGCTGAGCAGCTTCAGAGATCTATCCCAAACGCAGCTGAGGG
AGGAGCAGGAGGAGGGGGTTTCCCTAACATTGATCCGCAACAGTATGTCAGCACAATGCA
ACAAGTTATGCATAACCCCGAGTTTCAGACCATGGCTGAACGACTTGGTAACGCCTTAGT
CAAGGATCCACAAATGTCTCCTTTCTTGGATGCTTTCTCGAACCCTGAAACAGCTGAGAA
CTTTACTGAGCGTATGGCACGGTTGAAAGAAGATCCAGAGTTGAAACCTATACTTGATGA
GATTGATGCTGGTGGTCCTTCTGCCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTGCTGAA
AAAGCTTGGTGAAGCAATGGGTATGCCTGTTGCTGGCTTGCCTGACCAGACTCCTTCAGC
TGAACCCGAGGTGGCTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTCTATTGTTCATCAAACGGCCAG
TCTTGGTGATGTTGAGGGTTTGAAAACCGCTTTGGAATCTGGTGGTAACAAAGATGAAGA
AGATTCTGAAGGAAGGACAGCACTGCATTTTGCGTGTGGATACGGCGAGTTGAAATGTGC
TCAAGTTCTTATCGATGCTGGAGCAAGTGTTAACGCTGTTGACAAAAACAAGAACACACC
TCTGCATTACGCTGCTGGTTACGGGAGGAAAGAGTGTGTTAGCCTTCTCCTTGAGAATGG
TGCAGCAGTGACTCTGCAAAACCTAGACGAGAAGACACCCATTGATGTGGCTAAGCTCAA
CAACCAGCTCGAGGTGGTGAAGCTGCTCGAAAAAGATGCTTTCCTTTGAGCGTGTGTCAA
AAGAAGCTCTAAGATCATAATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK11TF U 1
AF RR4G760TF U 560
BS 1 684 RR4EK11TF
BS 685 1165 RR4G760TF

RD RR4EK11TF 684 0 0
GGGCCACCACAACGTTGTCTTCTCGGGGTTTAAGTTTGATCTAATGGCTTCGAATCCAGA
GAAAAATCCGCTGATTCCTTCAGATGAGAAAACCGAATCGAAGGAGGAGAGCAAGAGTCC
TAAACCGGAATCAGCAGCAGCAGCAGCATCTGGGAGTTCACTTTCATCACCTAATCCTCC
AGCATCTGGGAGTTCAGCTAATCCTCCTGGCTTGAATTTCAATGCTTTTGATTTCTCAAA
CATGGCTAGTATCCTCAACGATCCAAGCATCAGAGAATTGGCGGAGCAGATTGCTAAAGA
TCCTGCCTTTAACCAGTTGGCTGAGCAGCTTCAGAGATCTATCCCAAACGCAGCTGAGGG
AGGAGCAGGAGGAGGGGGTTTCCCTAACATTGATCCGCAACAGTATGTCAGCACAATGCA
ACAAGTTATGCATAACCCCGAGTTTCAGACCATGGCTGAACGACTTGGTAACGCCTTAGT
CAAGGATCCACAAATGTCTCCTTTCTTGGATGCTTTCTCGAACCCTGAAACAGCTGAGAA
CTTTACTGAGCGTATGGCACGGTTGAAAGAAGATCCAGAGTTGAAACCTATACTTGATGA
GATTGATGCTGGTGGTCCTTCTGCCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTGCTGAA
AAAGCTTGGTGAAGCAATGGGTAT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4G760TF 606 0 0
GGGT
TGAAAGAAGATCCAGAGTTGAAACCTATACTTGATGAGATTGATGCTGGTGGTCCTTCTG
CCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTGCTGAAAAAGCTTGGTGAAGCAATGGGTA
TGCCTGTTGCTGGCTTGCCTGACCAGACTCCTTCAGCTGAACCCGAGGTGGCTGAAGAAG
AAGAAGAAGAAGAGTCTATTGTTCATCAAACGGCCAGTCTTGGTGATGTTGAGGGTTTGA
AAACCGCTTTGGAATCTGGTGGTAACAAAGATGAAGAAGATTCTGAAGGAAGGACAGCAC
TGCATTTTGCGTGTGGATACGGCGAGTTGAAATGTGCTCAAGTTCTTATCGATGCTGGAG
CAAGTGTTAACGCTGTTGACAAAAACAAGAACACACCTCTGCATTACGCTGCTGGTTACG
GGAGGAAAGAGTGTGTTAGCCTTCTCCTTGAGAATGGTGCAGCAGTGACTCTGCAAAACC
TAGACGAGAAGACACCCATTGATGTGGCTAAGCTCAACAACCAGCTCGAGGTGGTGAAGC
TGCTCGAAAAAGATGCTTTCCTTTGAGCGTGTGTCAAAAGAAGCTCTAAGATCATAATTG
TC

QA 5 606 5 606
DS 



AS 1 6

CO CL1400Contig1 449 6 4 U
GGGAACGTGAGCTGGGATTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCC
GCGTCGCGATAGTAATTCAACCTAGTACGAGGGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCAT
CGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGC
CTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCT
CAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCG
CCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGAC
GACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACT
GAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4DK90JQ C 89
AF RR4FS53JQ C 275
AF RR4FS53TF U 1
AF RR4DK90TF U 89
AF RR4DL21JQ C 89
AF RR4DL21TF U 89
BS 1 91 RR4FS53TF
BS 92 92 RR4DK90TF
BS 93 448 RR4FS53TF
BS 449 449 RR4DK90TF

RD RR4DK90JQ 221 0 0
GAGGGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCG
AAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTTTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCG
ACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCAC
GTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGA

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR4FS53JQ 142 0 0
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AGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGGGACGGGGTATTGTAAGTGGCA
GAGTGCCCTTGCTGCCACGATC

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR4FS53TF 449 0 0
GGGAACGTGAGCTGGGATTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCC
GCGTCGCGATAGTAATTCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCAT
CGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGC
CTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCT
CAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCG
CCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGAC
GACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACT
GAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTC
C

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4DK90TF 361 0 0
GAGGGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCG
AAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCG
ACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCAC
GTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTA
CCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAA
GTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTC
G

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4DL21JQ 361 0 0
GAGGGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCG
AAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTTTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCG
ACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCAC
GTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTA
CCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAA
GTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTC
G

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR4DL21TF 361 0 0
GAGGGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCG
AAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCG
ACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCAC
GTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTA
CCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAA
GTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTC
G

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 6

CO CL1401Contig1 740 6 7 U
GGATCGTCTCCGTCTTCCATCACGCTCCTCTCGAATTACCCCAAATTAGCTAAAGCATAA
TGGTTTCTGGGTTAATCAACGAGAACCCAACTGTCTACGAGAGAAAAGAGCGTCGTGTCC
GCACCGATTCCACCAATACCGATGAGTTTTCAGTTGAACCTATCGACCAGCTCGAGATTT
TTGATCATATAAGAGATATAAGAGATCCAGAGCATCCTTACTCTTTGGAACAACTCAAAG
TTCTTACTGAAGACTCTGTTGAAGTTGATGATGGCAAGAGTTATGTCAGGGTTACATTCA
CACCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAACCATTATCGGTCTTTCTGTCCGCGTTAAAC
TTATGCGAAGCCTTCCTCCTCGCTACAAGATTGATATAAGGGTAGCACCAGGTTCTCATG
CAACAGAGGCTGCACTCAATAAACAACTAAACGACAAGGAGCGTGTGGCGGCTGCGCTAG
AGAATCCAAACCTCGTGGAGATGGTTGATGAATGTTTGTCTCCATCATTTGAGTGATGCT
TGATGTTCTCATGGTACACTATCATAATATGTCTCTGCTTTAGTCTGAAAAGATTTTGAT
CCACTAGGACTTGCTTTCTGTTCAGTTTCTTGTTAGTTTTCATCTTGTTAAAGACTGAGA
AGTTATCCAGATAACGAGGTATTTATTGGATCCTCTCTCATTGTTCCATTTGTTTCATCT
TAAATCGCACTTCTGTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE76JQ C 201
AF RR4EE76TF U 201
AF RR4E032TF U 1
AF RR4CL87JQ C 377
AF RR4CL87TF U 377
AF RR4E032JQ C 588
BS 1 464 RR4E032TF
BS 465 465 RR4EE76TF
BS 466 606 RR4E032TF
BS 607 607 RR4CL87TF
BS 608 667 RR4E032TF
BS 668 714 RR4CL87TF
BS 715 740 RR4E032JQ

RD RR4EE76JQ 405 0 0
G
GAGATCCAGAGCATCCTTACTCTTTGGAACAACTCAAAGTTCTTACTGAAGACTCTGTTG
AAGTTGATGATGGCAAGAGTTATGTCAGGGTTACATTCACACCAACGGTGGAACATTGTA
GCATGGCAACCATTATCGGTCTTTCTGTCCGCGTTAAACTTATGCGAAGCCTTCCTCCTC
GCTACAAGATTGATATAAGGGTAGCACCAGGTTCTCATGCAACAGAGGCTGCACTCAATA
AACAACTAAACGACAAGGAGCGTGTGGCGGCTGCGCTAGAGAATCCAAACCTCGTGGAGA
TGGTTGATGAATGTTTGTCTCCATCATTTGAGTGATGCTTGATGTTCTCATGGTACACTA
TCATAATATGTCTCTGCTTTAGTCTGAAAAGATTTTGATCCACT

QA 2 405 2 405
DS 

RD RR4EE76TF 405 0 0
G
GAGATCCAGAGCATCCTTACTCTTTGGAACAACTCAAAGTTCTTACTGAAGACTCTGTTG
AAGTTGATGATGGCAAGAGTTATGTCAGGGTTACATTCACACCAACGGTGGAACATTGTA
GCATGGCAACCATTATCGGTCTTTCTGTCCGCGTTAAACTTATGCGAAGCCTTCCTCCTC
GCTACAAGATTGATATAAGGGTAGCACCAGGTTCTCATGCAACAGAGGCTGCACTCAATA
AACAACTAAACGACAAGGAGCGTGTGGCGGCTGCGCTAGAGAATCCAAACCTCGTGGAGA
TGGTTGATGAATGTTTGTCTCCATCATTTGAGTGATGCTTGATGTTCTCATGGTACACTA
TCATAATATGTCTCTGCTTTAGTCTGAAAAGATTTTGATCCACT

QA 2 405 2 405
DS 

RD RR4E032TF 672 0 0
GGATCGTCTCCGTCTTCCATCACGCTCCTCTCGAATTACCCCAAATTAGCTAAAGCATAA
TGGTTTCTGGGTTAATCAACGAGAACCCAACTGTCTACGAGAGAAAAGAGCGTCGTGTCC
GCACCGATTCCACCAATACCGATGAGTTTTCAGTTGAACCTATCGACCAGCTCGAGATTT
TTGATCATATAAGAGATATAAGAGATCCAGAGCATCCTTACTCTTTGGAACAACTCAAAG
TTCTTACTGAAGACTCTGTTGAAGTTGATGATGGCAAGAGTTATGTCAGGGTTACATTCA
CACCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAACCATTATCGGTCTTTCTGTCCGCGTTAAAC
TTATGCGAAGCCTTCCTCCTCGCTACAAGATTGATATAAGGGTAGCACCAGGTTCTCATG
CAACAGAGGCTGCACTCAATAAACAACTAAACGACAAGGAGCGTTTGGCGGCTGCGCTAG
AGAATCCAAACCTCGTGGAGATGGTTGATGAATGTTTGTCTCCATCATTTGAGTGATGCT
TGATGTTCTCATGGTACACTATCATAATATGTCTCTGCTTTAGTCTGAAAAGATTTTGAT
CCACTACGACTTGCTTTCTGTTCAGTTTCTTGTTAGTTTTCATCTTGTTAAAGACTGAGA
AGTTATC
AGATA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CL87JQ 340 0 0
G
CCTCGCTACAAGATTGATATAAGGGTAGCACCAGGTTTTCATGCAACAGAGGCTGCACTC
AATAAACAACTAAACGACAAGGAGCGTGTGGCGGCTGCGCTAGAGAATCCAAACCTCGTG
GAGATGGTTGATGAATGTTTGTCTCCATCATTTGAGTGATGCTTGATGTTCTCATGGTAC
ACTATCATAATATGTTTCTGCTTTAGTCTGAAAAGATTTTGATCCACTAGGACTTGCTTT
CTGTTCAGTTTCTTGTTAGTTTTCATCTTGTTAAAGACTGAGAAGTTATCCAGATAACGA
GGTATTTATTGGATCCTCTCTCATTGTTCCATTTGTT
CC

QA 2 338 2 338
DS 

RD RR4CL87TF 340 0 0
G
CCTCGCTACAAGATTGATATAAGGGTAGCACCAGGTTCTCATGCAACAGAGGCTGCACTC
AATAAACAACTAAACGACAAGGAGCGTGTGGCGGCTGCGCTAGAGAATCCAAACCTCGTG
GAGATGGTTGATGAATGTTTGTCTCCATCATTTGAGTGATGCTTGATGTTCTCATGGTAC
ACTATCATAATATGTCTCTGCTTTAGTCTGAAAAGATTTTGATCCACTAGGACTTGCTTT
CTGTTCAGTTTCTTGTTAGTTTTCATCTTGTTAAAGACTGAGAAGTTATCCAGATAACGA
GGTATTTATTGGATCCTCTCTCATTGTTCCATTTGTT
CC

QA 2 338 2 338
DS 

RD RR4E032JQ 153 0 0
AAAAGATTTTGATCCACTAGGACTTGCTTTCTGTTCAGTTTCTTGTTAGTTTTCATCTTG
TTAAAGACTGAGAAGTTATCCAGATAACGAGGTATTTATTGGATCCTCTCTCATTGTTCC
ATTTGTTTCATCTTAAATCGCACTTCTGTTCAC

QA 1 153 1 153
DS 



AS 2 6

CO CL1402Contig1 1015 2 4 U
GAGATCTGAAAACAGCTTTGGGGGAAGCTCGAATGATTGGAGAGGAACTTGGCGATATAT
ATGACTATGTGGCTCCTTGTTTTCCTCCGAGATACGAGATATTTCAGCTTATGGTGAACC
TGTATACCGAGAGATTCATTCACATGCTCAGATCGCTCAGTGGCAGGGCAACCGATCTGA
CAAATATAGAGATATTAAAGGTTACTGGTTGGGTAGTAGAGTACCAAGAAAACTTGATTG
CGCTTGGTGTTGATGATTCACTAGCTCAAGTGTGTTCAGAGAGTGGTTCAATGGATCCTC
TAATGAATGCATATGTCGAACGAATGCAAGCTACGACGAAGAAATGGTACATGAATATCC
TTGAGGCGGATAAGGTGCAACCACCTAAGAAAACAGAGGAAGGAAAATTATACACACCCG
CTGCTGTAGATTTATTCAGAATACTTGGAGAGCAAGTGCAAATTGTCAGAGATAATAGCA
CCGACGTGATGCTATACAGGATTGCGTTAGCTATCATTCAGGTTATGATCGACTTCCAAG
CAGCTGAAAAGCAGAGAGTTGGAGAACCTGCTTCTGACATTGGTTTGGAACCTCTTTGCG
CTATGATAAACAACAACCTCCGCTGCTATGATCTGGCCATGGAATTGAGTAATAGCACTT
TAGAAGCTCTTCCACAGAACTATGCGGAGCAGGTCAATTTTGAAGACACTTGCAAAGGTT
TCTTGGAAGTGGCTAAGGAAGCAGCGCATCAAACGGTTCGCGTTATCTTTGAGGATCCAG
GAGTTCAGGAGTTACTTGTTAAGCTTTACCAGAAAGATTGGGCGGAGGGACAGGTTACCG
AGTTTCTCGTAGCAACTTTTAGTGATTATTTCACAGATGTGAAAATGTATGTCGAAGAAA
GATCGTTCAGAAGATTTGTGGAAGCTTGTCTGGAAGAAACAGTCGTTGTTTATGTTGATC
ATCTCCTACACAGAAAACTACATCAAAGAGGAACTATTGAGCGGATGAGACTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU72TF U 1
AF RR4CR37TF U 265
BS 1 316 RR4BU72TF
BS 317 317 RR4CR37TF
BS 318 688 RR4BU72TF
BS 689 1015 RR4CR37TF

RD RR4BU72TF 688 0 0
GAGATCTGAAAACAGCTTTGGGGGAAGCTCGAATGATTGGAGAGGAACTTGGCGATATAT
ATGACTATGTGGCTCCTTGTTTTCCTCCGAGATACGAGATATTTCAGCTTATGGTGAACC
TGTATACCGAGAGATTCATTCACATGCTCAGATCGCTCAGTGGCAGGGCAACCGATCTGA
CAAATATAGAGATATTAAAGGTTACTGGTTGGGTAGTAGAGTACCAAGAAAACTTGATTG
CGCTTGGTGTTGATGATTCACTAGCTCAAGTGTGTTCAGAGAGTGGTTCAATGGATCCTC
TAATGAATGCATATGTTGAACGAATGCAAGCTACGACGAAGAAATGGTACATGAATATCC
TTGAGGCGGATAAGGTGCAACCACCTAAGAAAACAGAGGAAGGAAAATTATACACACCCG
CTGCTGTAGATTTATTCAGAATACTTGGAGAGCAAGTGCAAATTGTCAGAGATAATAGCA
CCGACGTGATGCTATACAGGATTGCGTTAGCTATCATTCAGGTTATGATCGACTTCCAAG
CAGCTGAAAAGCAGAGAGTTGGAGAACCTGCTTCTGACATTGGTTTGGAACCTCTTTGCG
CTATGATAAACAACAACCTCCGCTGCTATGATCTGGCCATGGAATTGAGTAATAGCACTT
TAGAAGCTCTTCCACAGAACTATGCGGA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4CR37TF 751 0 0
CTCAAGTGTGTTCAGAGAGTGGTTCAATGGATCCTCTAATGAATGCATATGTCGAACGAA
TGCAAGCTACGACGAAGAAATGGTACATGAATATCCTTGAGGCGGATAAGGTGCAACCAC
CTAAGAAAACAGAGGAAGGAAAATTATACACACCCGCTGCTGTAGATTTATTCAGAATAC
TTGGAGAGCAAGTGCAAATTGTCAGAGATAATAGCACCGACGTGATGCTATACAGGATTG
CGTTAGCTATCATTCAGGTTATGATCGACTTCCAAGCAGCTGAAAAGCAGAGAGTTGGAG
AACCTGCTTCTGACATTGGTTTGGAACCTCTTTGCGCTATGATAAACAACAACCTCCGCT
GCTATGATCTGGCCATGGAATTGAGTAATAGCACTTTAGAAGCTCTTCCACAGAACTATG
CGGAGCAGGTCAATTTTGAAGACACTTGCAAAGGTTTCTTGGAAGTGGCTAAGGAAGCAG
CGCATCAAACGGTTCGCGTTATCTTTGAGGATCCAGGAGTTCAGGAGTTACTTGTTAAGC
TTTACCAGAAAGATTGGGCGGAGGGACAGGTTACCGAGTTTCTCGTAGCAACTTTTAGTG
ATTATTTCACAGATGTGAAAATGTATGTCGAAGAAAGATCGTTCAGAAGATTTGTGGAAG
CTTGTCTGGAAGAAACAGTCGTTGTTTATGTTGATCATCTCCTACACAGAAAACTACATC
AAAGAGGAACTATTGAGCGGATGAGACTGGA

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL1402Contig2 782 4 5 U
GAAACATTTTCAAGATAATGCTTGCAATTTATTAATTGTGAAACATTTATAAAATTATTC
ACGATGGTAATGATCAAGGTTCCGGGCCACATGAAGAGGTAAACAAAAGTTGAGGGAGAA
TCAAAGAAAATTAGAATAAGTAACTAATAGGAAAAAATATCATGCAAAGAAAAAGTAAAA
AGAGAGAGACAGGAGATGGAAGCAAACGCCAAATGCTGAAAACGCAAACGCTGAACGTTG
TTCTAAATGCGTTTTCGCCAGAGAGATCCTTTGGACGCGGCTAAACACTTGACTCTTGGG
AATACAAAGCCCGTCTTTGGAGGGTTACCATCTACCAAAGTGTTCTCATATATTTCTTTG
CATTCTTGTACCACCTCTTTGGTGTCTTTCTTTGGTATGCCTTCACGAAGTCCAACAAGC
TTCTCCACAACCTCGGCCGGGCAGTCAGGCTGGTGCTCAAGGATGTTCGAGTACACGAGT
GTAAATGCATCTAGACTCTCCGCAGATGCAAGTTCTCTCAGATCACTCATTATTCTGATT
CTGCTCTCCACTTTAGATGCACTTATATACTCCCTAAAGAAATCCATGAGAACCTCCTCG
TCCAGTCTCATCCGCTCAATAGTTTCCTCTTTGATGTAGTTTTTCTGTGTTAGGAGATGA
TCAACATAAACAACGACTGTTTCTTCCAGACAAGCTTCCACAAATCTTCTGAACGATCTT
TCTTCGACATACATTTTCACATCTGTGAAATAATCACTAAAAGTTGCTACGAGAAACTCG
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4A351JQ U 237
AF RR4A351JQD U 238
AF RR4BU72JQ U 37
AF RR4CR37JQ U 1
BS 1 156 RR4CR37JQ
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BS 158 311 RR4CR37JQ
BS 312 312 RR4A351JQ
BS 313 782 RR4CR37JQ

RD RR4A351JQ 108 0 0
G
TTGTTCTAAATGCGTTTTCGCCAGAAAGATCCTTTGGACGCGGCTAAACACTTGACTCTT
GGGAATACAAAGCCCGTCTTTGGAGGGTTACCATCTACCAAAGTGTT

QA 2 108 2 108
DS 

RD RR4A351JQD 171 0 0
TTGTTCTAAATGCGTTTTCGCCAGAGAGATCCTTTGGACGCGGCTAAACACTTGACTCTT
GGGAATACAAAGCCCGTCTTTGGAGGGTTACCATCTACCAAAGTGTTCTCATTTATTTCT
TTGCATTCTTGTACCACCTCCTTGGTGTCTTTCTTTGGTATGCCTTCACGA

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR4BU72JQ 701 0 0
G
GTGAAACATTTATAAAATTATTCACGATGGTAATGATCAAGGTTCCGGGCCACATGAAGA
GGTAAACAAAAGTTGAGGGAGAATCAAAGAAAATTAGAATAAGTAACTAATAGGAAAAAA
TATCATGCAAAGAAAAAGTAAAAAGAGAGAGACAGGAGATGGAAGCAAACGCCAAATGCT
GAAAACGCAAACGCTGAACGTTGTTCTAAATGCGTTTTCGCCAGAGAGATCCTTTGGACG
CGGCTAAGCACTTGACTCTTGGGAATACAAAGCCTGTCTTTGGAGGGTTACCATCTACCA
AAGTGTTCTCATATATTTCTTTGCATTCTTGTACCACCTCTTTGGTGTCTTTCTTTGGTA
TGCCTTCACGAAGTCCAACAAGCTTCTCCACAACCTCGGCCGGGCAGTCAGGCTGGTGCT
CAAGGATGTTCGAGTACACGAGTGTAAATGCATCTAGACTCTCCGCAGATGCAAGTTCTC
TCAGATCACTCATTATTCTGATTCTGCTCTCCACTTTAGATGCACTTATATACTCCCTAA
AGAAATCCATGAGAACCTCCTCGTCCAGTCTCATCCGCTCAATAGTTTCCTCTTTGATGT
AGTTTTTCTGTGTTAGGAGATGATCAACATAAACAACGACTGTTTCTTCCAGACAAGCTT
CCACAAATCTTCTGAACGATCTTTCTTCGACATACATTTT

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR4CR37JQ 782 0 0
GAAACATTTTCAAGATAATGCTTGCAATTTATTAATTGTGAAACATTTATAAAATTATTC
ACGATGGTAATGATCAAGGTTCCGGGCCACATGAAGAGGTAAACAAAAGTTGAGGGAGAA
TCAAAGAAAATTAGAATAAGTAACTAATAGGAAAAA*TATCATGCAAAGAAAAAGTAAAA
AGAGAGAGACAGGAGATGGAAGCAAACGCCAAATGCTGAAAACGCAAACGCTGAACGTTG
TTCTAAATGCGTTTTCGCCAGAGAGATCCTTTGGACGCGGCTAAACACTTGACTCTTGGG
AATACAAAGCCTGTCTTTGGAGGGTTACCATCTACCAAAGTGTTCTCATATATTTCTTTG
CATTCTTGTACCACCTCTTTGGTGTCTTTCTTTGGTATGCCTTCACGAAGTCCAACAAGC
TTCTCCACAACCTCGGCCGGGCAGTCAGGCTGGTGCTCAAGGATGTTCGAGTACACGAGT
GTAAATGCATCTAGACTCTCCGCAGATGCAAGTTCTCTCAGATCACTCATTATTCTGATT
CTGCTCTCCACTTTAGATGCACTTATATACTCCCTAAAGAAATCCATGAGAACCTCCTCG
TCCAGTCTCATCCGCTCAATAGTTTCCTCTTTGATGTAGTTTTTCTGTGTTAGGAGATGA
TCAACATAAACAACGACTGTTTCTTCCAGACAAGCTTCCACAAATCTTCTGAACGATCTT
TCTTCGACATACATTTTCACATCTGTGAAATAATCACTAAAAGTTGCTACGAGAAACTCG
GT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 3 6

CO CL1403Contig1 1005 2 2 U
TTCTTTTCAATTTATCTCTTTGTGTTCATTAGATCTCTCTCCTATGTCATCGTCTTTCCG
ATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCGATCCACGGATAGGACTCGTATCGGCATGGATCT
AGTGGCTTCGGTTTGATTCATGCTAGAAGACGTATCGTAGCTGCTGAGAGATCTCTCAGG
ATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGTGGTTCCTCGTTGGATCTGTGATTTG
CGTCTCGGAGATGATGAATCCGATTGGCAAGGAGGAGCGACTGGAGAAGAAGAGAGAAGA
TGAGGAAGATATGTAAATGATATGAGATGATTGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGA
CGATACAGCCTTTCTGATGAGAGAGGGCTTGAGTTCTGAATTAGCATCTTTGTCATCCGA
CCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACAAAAAGTTCCTTAATAAAAAAAA
TAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTTCGCACGGGGAAACATATTTTTTTAAGCCCGGGT
TCTCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATCTCGCTCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTT
TGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGAATGAATCCAGATCTTA
CTATTGAGCAGATCTGGAGTCAAACGCACGGCCTAATCCAACATACTCCATGGAGACACA
GAGTGTTGCAAATGGCTTTGAAGACCTTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCTAAAACCTGC
CCCCAAGGGAAATTAATTTTCATGTTGTTTAAGCAGAAGGTATATAAAAGAAGTTACTTT
GTTCTTTTTGTACAAATTTGTCAAAGTTCGAGCCCACAGATCTTGTTTCTAAATCTGAGT
ATTTCATTCTTTATCTCACTTAATAATGAATTTTATACTGTAATGTCTCGATTATACTTG
TATTACGTCGATTTGCTCTTTGAATTAGCAATTACAGTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX75TF U 1
AF RR4BX75JQ C 140
BS 1 480 RR4BX75TF
BS 481 1005 RR4BX75JQ

RD RR4BX75TF 480 0 0
TTCTTTTCAATTTATCTCTTTGTGTTCATTAGATCTCTCTCCTATGTCATCGTCTTTCCG
ATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCGATCCACGGATAGGACTCGTATCGGCATGGATCT
AGTGGCTTCGGTTTGATTCATGCTAGAAGACGTATCGTAGCTGCTGAGAGATCTCTCAGG
ATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGTGGTTCCTCGTTGGATCTGTGATTTG
CGTCTCGGAGATGATGAATCCGATTGGCAAGGAGGAGCGACTGGAGAAGAAGAGAGAAGA
TGAGGAAGATATGTAAATGATATGAGATGATTGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGA
CGATACAGCCTTTCTGATGAGAGAGGGCTTGAGTTCTGAATTAGCATCTTTGTCATCCGA
CCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACAAAAAGTTCCTTAATAAAAAAAA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4BX75JQ 866 0 0
ATGCTAGAAGACGTATCGTAGCTGCTGAGAGATCTCTCAGGATCGGT*GAATAGCTGATC
TGATCTCCGATCGCGTGGTTCCTCGTTGGATCTGTGATTTGCGTCTCGGAGATGATGAAT
CCGATTGGCAAGGAGGAGCGACTGGAGAAGAAGAGAGAAGATGAGGAAGATATGTAAATG
ATATGAGATGATTGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATG
AGAGAGGGCTTGAGTTCTGAATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGC
GCTTGCATGGCAGGTCACAAAAAGTTCCTTAATAAAAAAAATAGTTTCGTGTTGTTGTGA
GGGGAGTTCGCACGGGGAAACATATTTTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCCTCACCTTTGTGT
CTTTGCATCTCGCTCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTGATCTCAAATTCACCAAA
ATATCTCGATACAGACATATTTTGAATGAATCCAGATCTTACTATTGAGCAGATCTGGAG
TCAAACGCACGGCCTAATCCAACATACTCCATGGAGACACAGAGTGTTGCAAATGGCTTT
GAAGACCTTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCTAAAACCTGCCCCCAAGGGAAATTAATTT
TCATGTTGTTTAAGCAGAAGGTATATAAAAGAAGTTACTTTGTTCTTTTTGTACAAATTT
GTCAAAGTTCGAGCCCACAGATCTTGTTTCTAAATCTGAGTATTTCATTCTTTATCTCAC
TTAATAATGAATTTTATACTGTAATGTCTCGATTATACTTGTATTACGTCGATTTGCTCT
TTGAATTAGCAATTACAGTTTTTATT

QA 1 866 1 866
DS 



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GAGATCTCTCAGGATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGAGGCTCCTCGTTG
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AGGAGATAGAAGATGAGGAAAGAGGAGGAAGATATGTGAAATGATATGAGTATTGAAGGA
TGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGAGAGAGGGGCTTGAGTTCT
AAATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCAC
AAAAAACTTCCTTAATAAAAAAAAATAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGGAGTTCGCACGG
GGAACATATTTTTTTTAGCCCGGGTTCTCCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATCTCGCTC
TCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGATACAG
ACATATTTTGAATGAATCCAGATCTTACTATTGAGCAGATCGGGAGTCAAACGCACGGCC
TAATCCAACATACTCCATGGAGACCAGAGTGTTGCAAATGGCTTTGAAGACCTTTAAAGA
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CACAGATCTTGTTTCTAAATCTGAATATTTCATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FI11TF U 1
AF RR4FI11JQ C 272
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BS 545 935 RR4FI11JQ

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AAAAAACTTCCTTAATAAAAAAAAATAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGGAGTTCGCACGG
GGAA
CATAT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4FI11JQ 664 0 0
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CTCAAATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGAATGAATCCAGATCTTACTAT
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TTGCAAATGGCTTTGAAGACCTTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCTAAAACCTGCCCCCA
AGGGAAGTTAATTTTCATGCTGTTTAAGCAGAAGGTATATAAAAGAAGTTACTTTGTTCT
TTTTGTACAAATTTGTCAAAGTTCGAGCCCACAGATCTTGTTTCTAAATCTGAATATTTC
ATAC

QA 1 664 1 664
DS 



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ACCTTTGTGTCTTTACATCTCGCTCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTTGATCTCA
AATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGAATGAATCCAGATCTTACTATTGAG
CAGATCTGGAGTCAAACGCACGGCCTAATCCAACATACTCCATGGAGACCAGAGGTACTT
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CGCATTTTTATAGTGTATTGCATCTTGTTACAAAGTCTACCAATCTGTAAGCATAATGTA
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TGTTTCTAAATCTGAATATTTCATTCTTTATCTCACTTAGTAATGAATTTTATACTGTAA
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TTGATGCATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI19TF U 1
AF RR4EV90JQ C 418
BS 1 677 RR4FI19TF
BS 678 678 RR4EV90JQ
BS 679 691 RR4FI19TF
BS 692 692 RR4EV90JQ
BS 693 754 RR4FI19TF
BS 755 1090 RR4EV90JQ

RD RR4FI19TF 754 0 0
GTGAAATGATATGAGTATTGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTT
CTGATGAGAGAGGGGCTTGAGTTCTAAATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGA
CAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACAAAAAACTTCCTTAATAAAAAAAAATAGTTTCGTG
TTGTTGTGAGGGGGAGTTCGCACGGGGAACATATTTTTTTTAGCCCGGGTTCTCCCCCTC
ACCTTTGTGTCTTTACATCTCGCTCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTTGATCTCA
AATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGAATGAATCCAGATCTTACTATTGAG
CAGATCTGGAGTCAAACGCACGGCCTAATCCAACATACTCCATGGAGACCAGAGGTACTT
TTAATTTTAGTTTCAATTCTCCCATTCAGCTGTTTAATCTTACAAACATAACATATCTAA
CCAACCGTCTTTAATTTGCTCATGGACAAAAAAGATTATTACTATTCAGAATTGAATTAT
TATTAATTAGTCTTTTGTAACAAAGAAATCATATATTGCATCTATATTTATATCACTTTA
CCATTACCTCGGCTCATTATTGATTTGAATTTGAAATTACTTATTACTTTCGTCTATAAT
AACATGTGATTTACAAG*TGTATATACCTAG*TAAAATTTGTTTGGGACAACAATTTGTA
CGCATTTTTATAGTGTATTGCATCTTGTTACAAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4EV90JQ 673 0 0
T
TTTTAATTTTAGTTTCAATTCTCCCATTCAGCTGTTTAATCTTACAAACATAACATATCT
AACCAACCGTCTTTAATTTGCTCATGGACAAAAAAGATTATTACTATTCAGAATTGAATT
ATTATTAATTAGTCTTTTGTAACAAAGAAATCATATATTGCATCTATATTTATATCACTT
TACCATTACCTCGGCTCATTATTGATTTGAATTTGAAATTACTTATTACTTTCGTCTATA
ATAACATGTGATTTACAAGGTGTATATACCTAGGTAAAATTTGTTTGGGACAACAATTTG
TACGCATTTTTATAGTGTATTGCATCTTGTTACAAAGTCTACCAATCTGTAAGCATAATG
TAGTGTATCATGTATGTTTTAGTGTTGCAAATGGCTTTGAAGACCTTTAAAGATTTTCCC
CAGCCATGCTAAAACCTGCCCCCAAGGGAAGTTAATTTTCATGTTGTTTAAGCAGAAGGT
ATATAAAAGAAGTTACTTTGTTCTTTTTGTACAAATTTGTCAAAGTTCGAGCCCACAGAT
CTTGTTTCTAAATCTGAATATTTCATTCTTTATCTCACTTAGTAATGAATTTTATACTGT
AATGTCTCGATTATACTTGTATTACGTCGATTTGCTCTTTGAATTAGCAATTACAGTTTT
TATTGATGCATT

QA 2 673 2 673
DS 



AS 1 4

CO CL1404Contig1 807 4 3 U
AGCTAAAAACGTTACGATTAATATACCAAAATAAAAGTTAACATCCAAATCAAATAACAA
AGATAGGTTCACAAAGATAATAAACATGAAACAGTCTTAACAAAATACATAATAAAAGAT
ACTAGAAACAAGGGGTGAACGTGAGTTTCATGGAAAGTGGAAATTTCTGGTGGTGGATCC
AAGTCTAGACCCTGAGATTTGTGATAGACTGAACAAGAGCCTCCATATTCTCAAGTCTTT
TCTGAAACTGCAGATTCTCTTCACGGCTCTGTTTTAGTTCTGCTTCCACCTCTTGCAATC
TTTGTGTTATCTTTTCAACTTCTTCAGAAGCTTCGGGTGCATTCGGTGAAACATCACAAG
CTGGTAAAATCTTACTGTGTAATGCTCCAAGTCCAAAGACACGTCCCTGCTTAGACATTC
CAGCAGCCTTGACATAAATTTCATTTTTTTCACTCTGGTCAAGATTTTCAAGTGTTACAT
TATCTTGACCAGAAGATTCGAGCTGTCCCAAACGTTCTTCCACATGTTTCTCATAAGTTT
CTGCAACCAAGCGAGCACGCTCATCAACGTATGTTCCGTCAGGTCTTTGATGAGTTTTCT
TCATCACAGCAATAAAAGAGGAGTCTTCATTGTTTGCTTCCAGCACATCTTGAACTTTGG
CATAGGAACATGAACCCGCTCTATGTCGATGCGGACCTAAGCCATTGCGATCAGACAATC
GAGAAGCATGTGCACTAGCACTCGTTTTTTGGCTTTCGCTGTTGCCCAATAAGCTTGCAT
AGTGGTCCAATAATCAGACAAATCCAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F110JQ U 5
AF RR4FQ79JQ U 316
AF RR4FQ79TF C 316
AF RR4E491JQ U 1
BS 1 360 RR4E491JQ
BS 361 361 RR4FQ79JQ
BS 362 807 RR4E491JQ

RD RR4F110JQ 489 0 0
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AGGTTCACAAAGATAATAAACATGAAACAGTCTTAACAAAATACATAATAAAAGATACTA
GAAACAAGGGGTGAACGTGAGTTTCATGGAAAGTGGAAATTTCTGGTGGTGGATCCAAGT
CTAGACCCTGAGATTTGTGATAGACTGAACAAGAGCCTCCATATTCTCAAGTCTTTTCTG
AAACTGCAGATTCTCTTCACGGCTCTGTTTTAGTTCTGCTTCCACCTCTTGCAATCTTTG
TGTTATCTTTTCAACTTCTTCAGAAGCTTCGGGTGCATTCAGTGAAACATCACAAGCTGG
TAAAATCTTACTGTGTAATGCTCCAAGTCCAAAGACACGTCCCTGCTTAGACATTCCAGC
AGCCTTGACATAAATTTCATTTTTTTCACTCTGGTCAAGATTTTCAAGTGTTACATTATC
TTGACCAGA

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4FQ79JQ 233 0 0
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TGTGTAATGCTCCAAGTCCAAAGACACGTCCCTGCTTAGACATTCCAGCAGCCTTGACAT
AAATTTCATTTTTTTCACTCTGGTCAAGATTTTCAAGTGTTACATTATCTTGACCAGAAG
ATTCGAGCTGTCCCAAACGTTCTTCCACATGTTTCTCATAAGTTTCTGCAACC

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR4FQ79TF 233 0 0
CAACTTCTTCAGAAGCTTCGGGTGCATTCGGTGAAACATCACAAGCTGGTAAAATCTTAC
TGTGTAATGCTCCAAGTCCAAAGACACGTCCCTGCTTAGACATTCCAGCAGCCTTGACAT
AAATTTCATTTTTTTCACTCTGGTCAAGATTTTCAAGTGTTACATTATCTTGACCAGAAG
ATTCGAGCTGTCCCAAACGTTCTTCCACATGTTTCTCATAAGTTTCTGCAACC

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR4E491JQ 807 0 0
AGCTAAAAACGTTACGATTAATATACCAAAATAAAAGTTAACATCCAAATCAAATAACAA
AGATAGGTTCACAAAGATAATAAACATGAAACAGTCTTAACAAAATACATAATAAAAGAT
ACTAGAAACAAGGGGTGAACGTGAGTTTCATGGAAAGTGGAAATTTCTGGTGGTGGATCC
AAGTCTAGACCCTGAGATTTGTGATAGACTGAACAAGAGCCTCCATATTCTCAAGTCTTT
TCTGAAACTGCAGATTCTCTTCACGGCTCTGTTTTAGTTCTGCTTCCACCTCTTGCAATC
TTTGTGTTATCTTTTCAACTTCTTCAGAAGCTTCGGGTGCATTCGGTGAAACATCACAAG
GTGGTAAAATCTTACTGTGTAATGCTCCAAGTCCAAAGACACGTCCCTGCTTAGACATTC
CAGCAGCCTTGACATAAATTTCATTTTTTTCACTCTGGTCAAGATTTTCAAGTGTTACAT
TATCTTGACCAGAAGATTCGAGCTGTCCCAAACGTTCTTCCACATGTTTCTCATAAGTTT
CTGCAACCAAGCGAGCACGCTCATCAACGTATGTTCCGTCAGGTCTTTGATGAGTTTTCT
TCATCACAGCAATAAAAGAGGAGTCTTCATTGTTTGCTTCCAGCACATCTTGAACTTTGG
CATAGGAACATGAACCCGCTCTATGTCGATGCGGACCTAAGCCATTGCGATCAGACAATC
GAGAAGCATGTGCACTAGCACTCGTTTTTTGGCTTTCGCTGTTGCCCAATAAGCTTGCAT
AGTGGTCCAATAATCAGACAAATCCAG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 2 5

CO CL1405Contig1 728 2 16 U
GATTCAACATATATTTTTACTTGTTACTTACGCCACCAAAACATTACACGGACACTGTCA
GACGTACTTAAGACAACTTCTCCACAAGTATATATCAAACAACAAAAAGGCATAACCTAA
ACCGTTCCGCAACTCTAGGCTCTGAGAACCTGAAATGAAGAGGACAAGATCCTGAAGAGG
CCATCCGGGTTATCCGTGTGAACCCAGTGACCGGCATCTTCCAGGACATGCATTTCTACG
CCGCCGCCTTCTTCAGAGGCGATCTCTTCAGCGGAGTGGATCCGTTGAAGGTCTTCGAGT
GCCCAACGGTGCAAGCTTCTTTCCGCTTTAAGAAAATTCACATGTACCCCTCTTGGCAGG
TTCTCAACAAAGTTCCATAGATTTGTGTCTTCGTAGGACTGATAAAGTTGGGAGATCCCG
TCTAAGTCAAATGTCCACGAGAAGATAGAGCACGATGGTCCAGTAGGTCTCAGATTAGTA
ACAACCCACTGTGCGACATCATTCGAAAAGCCTTCTTTGATAAGAGCGTTTAAAACTTCT
CGCTTTGATGAGACCACTTTAGGCAATGTACGTAGAAATGATATGAGCTCTCGTGGATGA
TCCTCTCCATCTCCTCCTGCACGAACCTTTCCAGGAGTAGCATCCAACACCCAAGCTCGG
ACTGGCCGAGGAAGAGGCTTAGCTGCTTGCTCCACCATGCTTAAAACAACTTTCCCTCCA
AAGCTGTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF69JQ U 1
AF RR4FX21JQ U 1
BS 1 32 RR4FF69JQ
BS 33 33 RR4FX21JQ
BS 34 126 RR4FF69JQ
BS 127 127 RR4FX21JQ
BS 128 253 RR4FF69JQ
BS 254 254 RR4FX21JQ
BS 255 269 RR4FF69JQ
BS 270 270 RR4FX21JQ
BS 271 296 RR4FF69JQ
BS 297 297 RR4FX21JQ
BS 298 538 RR4FF69JQ
BS 539 539 RR4FX21JQ
BS 540 665 RR4FF69JQ
BS 666 666 RR4FX21JQ
BS 667 672 RR4FF69JQ
BS 673 728 RR4FX21JQ

RD RR4FF69JQ 672 0 0
GATTCAACATATATTTTTACTTGTTACTTACGTCACCAAAACATTACACGGACACTGTCA
GACGTACTTAAGACAACTTCTCCACAAGTATATATCAAACAACAAAAAGGCATAACCTAA
ACCGTTTCGCAACTCTAGGCTCTGAGAACCTGAAATGAAGAGGACAAGATCCTGAAGAGG
CCATCCGGGTTATCCGTGTGAACCCAGTGACCGGCATCTTCCAGGACATGCATTTCTACG
CCGCCGCCTTCTT*AGAGGCGATCTCTTCGGCGGAGTGGATCCGTTGAAGGTCTTCTAGT
GCCCAACGGTGCAAGCTTCTTTCCGCTTTAAGAAAATTCACATGTACCCCTCTTGGCAGG
TTCTCAACAAAGTTCCATAGATTTGTGTCTTCGTAGGACTGATAAAGTTGGGAGATCCCG
TCTAAGTCAAATGTCCACGAGAAGATAGAGCACGATGGTCCAGTAGGTCTCAGATTAGTA
ACAACCCACTGTGCGACATCATTCGAAAAGCCTTCTTTGATAAGAGCGTTTAAAACTTGT
CGCTTTGATGAGACCACTTTAGGCAATGTACGTAGAAATGATATGAGCTCTCGTGGATGA
TCCTCTCCATCTCCTCCTGCACGAACCTTTCCAGGAGTAGCATCCAACACCCAAGCTCGG
ACTGGTCGAGGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4FX21JQ 728 0 0
GG
TTCAACATATATTTTTACTTGTTACTTACGCCACCAAAACATTACACGGACACTGTCAGA
CGTACTTAAGACAACTTCTCCACAAGTATATATCAAACAACAAAAAGGCATAACCTAAAC
CGTTCCGCACCTCTAGGCTCTGAGAACCTGAAATGAAGAGGACAAGATCCTGAAGAGGCC
ATCCGGGTTATCCGTGTGAACCCAGTGACCGGCATCTTCCAGGACATGCATTTCTACGCC
GCCGCCTTCTTCAGAGGCGATCTCTTCAGCGGAGTGGATCCGTTGAAGGTCTTCGAGTGC
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GCTGTG

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DS 



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TCAGCATCTCTCAAAAAGAGAGGTCCACACTCTGTTGCTACAACTGCTTCTGATGTTCTA
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TTAAGTACGTCTGACAGTGTCCGTGTAATGTTTTGGTGACGTAAGTAACAAGTAAAAATA
TATGTTGAATCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4G504JQ C 587
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GG
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TGGCGTACGATCTTGTTCAAGGGGCACTTGTGAAGTGGAGATGGAAGGAGGACAAGTCTG
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GCACTTTTGCTCGAAGATTGGCTCATGAGTTCCCAACTTGGCAGTTTCTCTTGGTAGACT
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DS 

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GGGTTCACACGGATAACCCGGATGGCCTCTTCAGGATCTTGTCCTCTTCATTTCAGGTTC
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AACAAGTAAAAATATATGTTGAATCG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

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CTCGTCGGCGGCATGGACTCCTACTTCCTTCATATCGCCGAGGTTCTTGAGTCCCATTGG
AACTCCTATGAAACGTGTTCTTGTTAACATGAAAGGATATCTAGAGGAAGTGGGTCATCT
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TCACTATGCCGCGTTTCATTACCTAAACGCTGGTGTTGGGTTTCAAGCCCTCGTTCTTCC
CGTTGCGTTTACGTTTCTTGGCTGGAGTTGGGGAATTCTGTCACTGACAATAGCCTATAT
TTGGCAACTGTACACACTGTGGATTCTAGTTCAGTTACACGAAGCTGTCCCAGGCAAACG
TTACAACCGATATGTCGAGCTTGCACAAGCTGCCTTTGGAGAAAGATTGGGAGTTTGGCT
TGCCTTGTTTCCTACGGTTTACTTATCAGCAGGAACTGCGACAGCTCTTATTCTGATCGG
TGGAGAGACAATGAAACTCTTCTTCCAAATAGTTTGTGGTCCATTATGCACCTCGAACCC
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TCCAAACCTCAATTCCATTGCCGGACTCTCCTTAATAGGAGCAGTGACTGCGATAACTTA
CTCTACAATGGTTTGGGTTCTCTCTGTTAGTCAACCAAGACCAGCCACTATTTCCTACGA
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AACGTTTAAGCATCCGCTCATGTACCAATGTGGAGAGGAGCCAAAGTTTCTTACTTCTTC
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GTGGCACTCCCTTTCCTGTCCAGTCTCGCGGGTTTGCTCGGTGGACTCACCCTTCCGGTC
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ATAGGTGGGATATGGAGCATGGTTACTCAAGGACTTAAGCTTAAGTTCTTCAGTCCTAAC
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TAAAGAGTTTTTACAGTCTATGTTTTTGTGTAAGAGTGCTTTTGTGTTGAATTGGACCGT
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GTTTATTGGTATCACACCGTTTATTAACG


BQ
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AF RR4CT25TF U 1
AF RR4CR50TF U 442
AF RR4CT25JQ C 1098
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TCACTATGCCGCGTTTCATTACCTAAACGCTGGTGTTGGGTTTCAAGCCCTCGTTCTTCC
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TTGGCAACTGTACACACTGTGGATTCTAGTTCAGTTACACGAAGCTGTCCCAGGCAAACG
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TGCCTTGTTTCC

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CTGGAGTTGGGGAATTCTGTCACTGACAATAGCCTATATTTGGCAACTGTACACACTGTG
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TGCACAAGCTGCCTTTGGAGAAAGATTGGGAGTTTGGCTTGCCTTGTTTCCTACGGTTTA
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CTTCCAAATAGTTTGTGGTCCATTATGCACCTCGAACCCCTTAACAACAGTGGAGTGGTA
TCTGGTGTTTACTTCTCTATGCATCGTTCTGTCTCAACTTCCAAACCTCAATTCCATTGC
CGGACTCTCCTTAATAGGAGCAGTGACTGCGATAACTTACTCTACAATGGTTTGGGTTCT
CTCTGTTAGTCAACCAAGACCAGCCACTATTTCCTACGAGCCACTCTCTATGCCTTCGCT
TTCTGGTTCGCTTTTTTCTGTGTTGAATGCTCTTGGTATTGTAGCTTTTGCCTTCAGAGG
TCACAACTTGGTTCTTGAAATTCAGTCGACGATGCCATCAACGTTTAAGCATCCGCTCAT
GTACCAATGTGGAGAGGAGCCAAAGTTTCTTACTTCTTCATTGCTCTGTGTATCTTTCCA
TCTCCATCGGAGTTTT

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TCCAATCTCCATCGGAGGTTTTTGGGCTTATGGGAACCTTATGCCTTCAGGAGGTATGCT
CGCTGCTCTTTATGCATTCCACATTCACGACATTCCTCGAGGTTTATTAGCGACGGCATT
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QA 1 742 1 742
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TTCATTGCTCTGTGTATCTTTCCAATCTCCATCGGAGGTTTTTGGGCTTATGGGAACCTT
ATGCCTTCAGGAGGTATGCTCGCTGCTCTT*ATGCATTCCACATTCACGACATTCCTCGA
GGTTTATTAGCGACGGCATTTCTCCTAGTAGTCTTCAGTTGCTTGAGCAGCTTTCAGATA
TACTCTATGCCCGCCTTTGACAGCTTTGAGGCTGGCTACACAAGCCGAACCAACAAGCCG
TGTTCAATTTGGGTCAGATCAGGTTTTAGAGTCTTTTTCGGTTTTGTCTCCTTTTTCATC
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GTCACGTTTGCTTATCCTTGCTTCATGTGGGTTTTGATCAAGAAACCGGCCAAGTACAGT
TTCAATTGGTATTTCCATTGGGGATTGGGTTGGTTAGGAGTTGCATTCAGCCTGGCGTTC
TCCATAGGTGGGATATGGAGCATGGTTACTCAAGGACTTAAGCTTAAGTTCTTCAGTCCT
AACTGAGTAATAGCTTTTGTCAAGAAGTCAGTGGGTTTTGTTTGGTTGATAAGTTTGAAG
TTTTAAAGAGTTTTTACAGTCTATGTTTTTGTGTAAGAGTGCTTTTGTGTTGAATTGGAC
CGTTGTCATCTGTAACATATTCCGTAAGCTTTTTTCAGTATGAAGAATTTCGACGTTTGA
AGAGTTTATTGGTATCACACCGTTTATTAACG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 6

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CAACCATTGGATTGATAGTTCTAAGTCATCAGACACACAGCCAAGTTGTGGGCGCAACTC
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CGAAGACAAGGAAACCAGGCACAAGCAGTGGCCTTAAAAA


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX59JQ U 1
AF RR4H477JQB U 1
AF RR4GX59TF C 1
AF RR4H477TF C 1
AF RR4D045JQ U 1
AF RR4F159JQ U 1
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QA 1 318 1 318
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CCAAGGAGACGGACCTCCCACATGTCTATGTCGCCAAGAAGAAAAAGCGGATTCGAGATG
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QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4GX59TF 318 0 0
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QA 1 318 1 318
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AACTCAACCTACGATAAAAATAACACAAGAGGTATCCGGAGGAAGTCGTCACTTCCACAA
CGAAG

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DS 



AS 1 6

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TTATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTTCC


BQ
10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR4CN77TF C 1
AF RR4BG91JQ U 3
AF RR4CN77JQ U 3
AF RR4BH23JQ U 3
AF RR4BG91TF C 3
AF RR4BH23TF C 3
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TGTTGATGGGAATAAAAATGAGCTTCACGAAGAATCCCACGAATCCCATTACTACAAACC
CGATCGCTGTACGGACCGCCACTTTCGGGAATTCTTTGCGATCTGGTTTGTGACAACGCT
TAACGAGACGAATGCTGTCCTTTGCAAAGTCTCTGAGGGGATCAACGACGGAATCGATGG
CGTCCATGGCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGATGACTTTTTAT
TTATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTT
GGCC

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RD RR4BG91JQ 448 0 0
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ATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTTCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4CN77JQ 450 0 0
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TTTCTGAGTATCTGAACAAAAAAAAACTGTGAAATTGTTTTCTTGAAACAAGAAAGCTGT
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ATCGCTGTACGGACCGCCACTTTCGGGAATTCTTTGCGATCTGGTTTGTGACAACGCTTA
ACGAGACGAATGCTGTCCTTTGCAAAGTCTCTGAGGGGATCAACGACGGAATCGATGGCG
TCCATGGCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGATGACTTTTTATTT
ATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTT
GGCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4BH23JQ 448 0 0
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TTTCTGAGTATCTGAACAAAAAAAAACTGTGAAATTGTTTTCTTGAAACAAGAAAGCTGT
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TTGATGGGAATAAAAATGAGCTTCACGAAGAATCCCACGAATCCCATTACTACAAACCCG
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ACGAGACGAATGCTGTCCTTTGCAAAGTCTCTGAGAGGATCAACGACGGAATCGATGGCG
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ATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTTCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4BG91TF 448 0 0
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ACGAGACGAATGCTGTCCTTTGCAAAGTCTCTGAGAGGATCAACGACGGAATCGATGGCG
TCCATGGCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGATGACTTTTTATTT
ATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTTCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4BH23TF 448 0 0
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TTTCTGAGTATCTGAACAAAAAAAAACTGTGAAATTGTTTTCTTGAAACAAGAAAGCTGT
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TTGATGGGAATAAAAATGAGCTTCACGAAGAATCCCACGAATCCCATTACTACAAACCCG
ATCGCTGTACGGACCGCCACTTTCGTGAATTCTTTGCGATCTGGTTTGTGACAACGCTTA
ACGAGACGAATGCTGTCCTTTGCAAAGTCTCTGAGAGGATCAACGACGGAATCGATGGCG
TCCATGGCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGATGACTTTTTATTT
ATTTATTTGTCTTCCTTTTTTGGTTTCC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 2 6

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TGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 

AF RR4E833TF U 1
AF RR4G045JQ C 31
AF RR4G045TF U 31
AF RR4E833JQ C 207
BS 1 120 RR4E833TF
BS 121 121 RR4G045TF
BS 122 474 RR4E833TF
BS 475 475 RR4G045TF
BS 476 479 RR4E833TF

RD RR4E833TF 479 0 0
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AACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
GAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGAT
GAGGTATCTTCGCAATGTGCCACGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAGCTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4G045JQ 449 0 0
GG
AACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGGAACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGA
GTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGCCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCT
CCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCC
GTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATTTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCA
AGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAG
CTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTC
AGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGA
CTTGAATGAGATTTCTGTTAAGCTTGC

QA 3 449 3 449
DS 

RD RR4G045TF 449 0 0
GG
AACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGGAACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGA
GTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGCCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCT
CCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCC
GTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCA
AGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAG
CTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTC
AGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGA
CTTGAATGAGATTTCTGTTAAGCTTGC

QA 3 449 3 449
DS 

RD RR4E833JQ 273 0 0
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GGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTT
CATCAGCTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTA
TTATTCAGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACT
TTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 1 273 1 273
DS 



CO CL1409Contig2 473 2 3 U
GGAGAGACCTCTAAAGTTATCTCGTAACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGGAACGGGG
AGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGT
TTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACC
TACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGATGAGGTAT
CTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCA
AGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCTGCTTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTT
GCAAGATTACTCTGTTTTATTATTCAGCATCCGATTACAATTTGTCTTTTTGGTGTGTTA
TCTACTCTTTATATGAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAACTCTTAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV48JQ C 1
AF RR4EV48TF U 1
BS 1 2 RR4EV48JQ
BS 3 466 RR4EV48TF
BS 467 473 RR4EV48JQ

RD RR4EV48JQ 473 0 0
GGAGAGACCTCTAAAGTTATCTCGTAACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGGAACGGGG
AGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGT
TTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACC
TACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGATGAGGTAT
CTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCA
AGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCTGCTTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTT
GCAAGATTACTCTGTTTTATTATTCAGCATCCGATTACAATTTGTCTTTTTGGTGTGTTA
TCTACTCTTTATATGAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAACTCTTAC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR4EV48TF 473 0 0
GG
AGAGACCTCTAAAGTTATCTCGTAACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGGAACGGGGAG
TTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTT
CCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTA
CAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCT
TCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAG
GAACAAGTCAGCAGCTTCATCTGCTTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGC
AAGATTACTCTGTTTTATTATTCAGCATCCGATTACAATTTGTCTTTTTGGTGTGTTATC
TACTCTTTATATGAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAA
CTCTTAC

QA 3 466 3 466
DS 



AS 0 0

AS 2 6

CO CL1411Contig1 986 4 15 U
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AAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCCCCCAAGCATTGGATGCTTGACAAACTCGGTGGTGCT
TTCGCTCCCAAGCCGTCTTCTGGACCTCACAAGTCTAGAGAGTGTCTTCCTCTTGTTTTG
ATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTTTGACGTATCGTGAAGTCATCTCCATCCTGATG
CAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTGAGGACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTC
ATGGATGTTGTATCAATCCCCAAGACCAATGAGAACTTCCGTCTTCTGTATGACACCAAG
GGACGTTTCCGCCTCCATTCCATCAGGGATGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTT
AGGACTATCCAGTT*GGGGCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGATGGTCGCAC
CATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAACCAAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGA
GAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTCGACGTGGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGG
TAGAAACAGAGGGCGTGTGGG*TGTGATCAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTTG
AGACGATCCACATCCAGGACTCGACAGGGCACGAGTTTGCAACAAGGTTGGGCAATGTGT
TCACCCTCGGCAAAGGTACAAAGCCATGGGTGTCTCTTCCAAAGGGCAAAGGTATTAAGC
TGACCATCATTGAGGAAGCCAGGAAGAGGCTTTCTGCCCAACAAGCTGCTTAAAAGATGA
ATCATCAAAAGTCCGTTTTGTTTCTCTTTCCTACAAACTCTAGTTTCTTACCTCAGTTTT
GAGCTTTTGTGCCTTCATGTTGCTTTTCGCAAAACCACCTTGAAATTCATGTAATGTTTA
TGTTGACAATTTTAGTAATTTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ80TF U 173
AF RR4ET04TF U 1
AF RR4CQ80JQ C 258
AF RR4ET04JQ C 344
BS 1 208 RR4ET04TF
BS 209 209 RR4CQ80TF
BS 210 263 RR4ET04TF
BS 264 264 RR4CQ80TF
BS 265 492 RR4ET04TF
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BS 494 592 RR4ET04TF
BS 593 593 RR4CQ80TF
BS 594 683 RR4ET04TF
BS 684 760 RR4CQ80JQ
BS 761 761 RR4ET04JQ
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BS 937 980 RR4CQ80JQ
BS 981 986 RR4ET04JQ

RD RR4CQ80TF 485 0 0
TTGTTT
TGATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTTTGACGTATCGTGAAGTCATCTCCATCCTGA
TGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTGAGGACTGACAAGACATACCCTGCTGGTT
TCATGGATGTTGTATCAATCCCCAAGACCAATGAGAACTTCCGTCTTCTGTATGACACCA
AGGGACGTTTCCGCCTCCATTCCATCAGGGATGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTTTGCAAGG
TTAGGACTATCCAGTTTGGGGCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGATGGTCGC
ACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAACCAAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAG
GAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTCGACGTGGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGG
GGTAGAAACAGAGGGCGTGTGGGGTGTGATCAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGA
GCTT

QA 7 481 7 481
DS 

RD RR4ET04TF 683 0 0
GGAGAAGTAGTCGTCGTCGTCAGCTCCGAAACCTCTGCAAACATGGCGAGGGGATTGAAG
AAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCCCCCAAGCATTGGATGCTTGACAAACTCGGTGGTGCT
TTCGCTCCCAAGCCGTCTTCTGGACCTCACAAGTCTAGAGAGTGTCTTCCTCTTGTTTTG
ATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTT*GACGTATCGTGAAGTCATCTCCATCCTGATG
CAAAGGCATATCCAAGTTGATGGAAAAGTGAGGACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTC
ATGGATGTTGTATCAATCCCCAAGACCAATGAGAACTTCCGTCTTCTGTATGACACCAAG
GGACGTTTCCGCCTCCATTCCATCAGGGATGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTT
AGGACTATCCAGTT*GGGGCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGATGGTCGCAC
CATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAACCAAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGA
GAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTCGACGTGGGCAACGTTGTGATGGTGGCTGGGGG
TAGAAACAGAGGGCGTGTGGG*TGTGATCAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTTG
AGACGATCCACATCCAGGACTCG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4CQ80JQ 723 0 0
T
GATGGGAAAGTGAGGACTGACAAGACATACC*TGCTGGTTTCATGGATGTTGTATCAATC
CCCAAGACCAATGAGAACTTCCGTCTTCTGTATGACACCAAGGGACGTTTCCGCCTCCAT
TCCATCAGGGATGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTTAGGACTATCCAGTT*GGG
GCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCC
GCTCATCAAACCAAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTT
CATCAAGTTCGACGTGGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGGTAGAAACAGAGGGCGTGT
GGG*TGTGATCAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTTGAGACGATCCACATCCAGG
ACTCGACAGGGCACGAGTTTGCAACAAGGTTGGGCAATGTGTTCACCCTCGGCAAAGGTA
CAAAGCCATGGGTGTCTCTTCCGAAGGGCAAAGGTATTAAGCTGACCATCATTGAGGAAG
CCAGGAAGAGGCTTTCTGCCCAACAAGCTGCTTAAAAGATGAATCATCAAAAGTCCGTTT
TGTTTCTCTTTCCTACAAACTCTAGTTTCTTACCTCAGTTTTGAGCTTTTGTGCCTTCAT
GTTGCTTTTCGCAAAAC*ACCTTGAAATTCATGTAATGTTTATGTTGACAATTTTAGTAA
TT

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR4ET04JQ 643 0 0
TTCTGTATGACACCAAGGGACGTTTCCGCCTCCATTCCATCAGGGATGAGGAAGCAAAGT
TCAAGCTTTGCAAGGTTAGGACTATCCAGTT*GGGGCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAAC
ACTTACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAACCAAACGACACCATC
AAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTCGACGTGGGCAACGTT
GTGATGGTGGCTGGGGGTAGAAACAGAGGGCGTGTGGG*TGTGATCAAGAACCGTGAGAA
GCATAAGGGAAGCTTTGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACAGGGCACGAGTTTGCAAC
AAGGTTGGGCAATGTGTTCACCCTCGGCAAAGGTACAAAGCCATGGGTGTTTCTTCCAAA
GGGCAAAGGTATTAAGCTGACCATCATTGAGGAAGCCAGGAAGAGGCTTTCTGCCCAACA
AGCTGCTTAAAAGATGAATCATCAAAAGTCCGTTTTGTTTCTCTTTCCTACAAACTCTAG
TTTCTTACCTCAGTTTTGAGCTTTTGTGCCTTCATGTTGCTTTTCGCAAAACCACCTTGA
AATTCATGTAATGTTTATGTTGACAATTTTAGTAATTTACTCC

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL1411Contig2 891 2 2 U
CAACAGATTTAAAGAGTAAAATTACTAAAAATTTCCATACAAAAACGCTCTACTGGAGTC
TTAAAACTGTCTTGTAATAGGTTTTGCAAACAAGCAACATAAAAAGAGGAAAAAACCTCC
AAACCGAGACAAGTAGCGAGTCTACAACACAAGAGTAAAACGAAACATATCCTTCAACGA
TAATTATATTTTTAAGCAGCTTGTTGACCAGAAAGCCTCTTTCTAGCTTCCTCAATGATG
GTAAGCTTGATACCTTTACCCTTGGGAAGGGACACCCACGGCTTCGTCCCTTTCCCGAGA
GTAAACACATTCCCCAACCTCGTTGCAAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGAATGTGAATC
GTCTCAAGGCTTCCCTTGTGCTTCTCACGGTTCTTGATCACACCCACACGCCCTCTGTTT
CTACCCCCAGTCACCATCACAACGTTGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCCACAACCTTG
TTCTCCTCGAGGTCTAGCTTGATGGTGTCGTTTGGCTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGG
ATGGTGCGGCCATCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATCCCCTTCTGCCCCAAACTGATAGTC
CTAACCTTGCAAAGCTTGAACTTAGCTTCCTCGTCCCTGATGGAGTGGAGACGGAAACGT
CCCTTGGTGTCATACAGAAGACGGAAGTTCTCATTCGTCTTGGGAATGGAAACAACATCC
ATGAAGCCAGCAGGGTATGTCTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTT
TGCATGAGGATGGAGATGACTTCACGGTATGTCAAAGCGTACTTCAACCTGTTCCTGATG
ATCAGGACAAGGGGAAGACACTCCCTCGACTTGTGAGGTCCAGAAGACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H869JQB U 1
AF RR4GT68TF C 577
BS 1 781 RR4H869JQB
BS 782 891 RR4GT68TF

RD RR4H869JQB 781 0 0
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TTAAAACTGTCTTGTAATAGGTTTTGCAAACAAGCAACATAAAAAGAGGAAAAAACCTCC
AAACCGAGACAAGTAGCGAGTCTACAACACAAGAGTAAAACGAAACATATCCTTCAACGA
TAATTATATTTTTAAGCAGCTTGTTGACCAGAAAGCCTCTTTCTAGCTTCCTCAATGATG
GTAAGCTTGATACCTTTACCCTTGGGAAGGGACACCCACGGCTTCGTCCCTTTCCCGAGA
GTAAACACATTCCCCAACCTCGTTGCAAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGAATGTGAATC
GTCTCAAGGCTTCCCTTGTGCTTCTCACGGTTCTTGATCACACCCACACGCCCTCTGTTT
CTACCCCCAGTCACCATCACAACGTTGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCCACAACCTTG
TTCTCCTCGAGGTCTAGCTTGATGGTGTCGTTTGGCTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGG
ATGGTGCGGCCATCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATCCCCTTCTGCCCCAAACTGATAGTC
CTAACCTTGCAAAGCTTGAACTTAGCTTCCTCGTCCCTGATGGAGTGGAGACGGAAACGT
CCCTTGGTGTCATACAGAAGACGGAAGTTCTCATTCGTCTTGGGAATGGAAACAACATCC
ATGAAGCCAGCAGGGTATGTCTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTT
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4GT68TF 315 0 0
CCTTCTGCCCCAAAACT
GATAGTCCTAACCTTGCAAAGCTTGAACTTAGCTTCCTCGTCCCTGATGGAGTGGAGACG
GAAACGTCCCTTGGTGTCATACAGAAGACGGAAGTTCTCATTCGTCTTGGGGATGGAAAC
AACATCCATGAAGCCAGCAGGGTATGTCTTGTCAGTCCTGACTTTACCAT*GACTTGGAT
ATGCCTTTGCATGAGGATGGAGATGACTTCACGGTATGTCAAAGCGTACTTCAACCTGTT
CCTGATGATCAGGACAAGGGGAAGACACTCCCTCGACTTGTGAGGTCCAGAAGACGGC

QA 18 315 18 315
DS 



AS 1 2

CO CL1412Contig1 581 2 3 U
GGAGAAAATCACCGAAGAAAGAAAAAAGAATGAGCGAGGGGAGGATAAAGAAGAGTGTGA
ACGGAGGAGCACCGGCGCAAACGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTTGAACCTTCTC
AAGCAGCGGCGGCGGGGAAGCGAGCTGTAGTAAAGAGTGCTGATATGAAAGAGGATATGC
AGAAGGAGGCTATCGATATCGCTATCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATA
TAGCTGAGAATATAAAAAAGGAGTTTGACAAGAAACATGGTGCGACTTGGCATTGCATTG
TTGGTCGCAACTTTGGTTCTTACGTAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACC
TCGACCAAAAAGCTGTGCTGCTCTTCAAGTCGGGTTAAAGAATTCCGAAACCAAGAGAGC
TTCCTTCACCTCTTTGGAGTCTGAAGTTGTTAAATCGCATTATTGTCATCACGTTGTAGT
TAGTTCCTTCATTGTGTTCTACGCGTATGTATGTGTTGGCTTTCACCAACAAAACTGGAT
TATAAACACTGTATGTAATAATATTCGATTTTAAAAACTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BO53TF U 1
AF RR4BO53JQ C 1
BS 1 4 RR4BO53JQ
BS 5 409 RR4BO53TF
BS 410 581 RR4BO53JQ

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GGAG
AAAATCACCGAAGAAAGAAAAAAGAATGAGCGAGGGGAGGATAAAGAAGAGTGTGAACGG
AGGAGCACCGGCGCAAACGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTTGAACCTTCTCAAGC
AGCGGCGGCGGGGAAGCGAGCTGTAGTAAAGAGTGCTGATATGAAAGAGGATATGCAGAA
GGAGGCTATCGATATCGCTATCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATATAGC
TGAGAATATAAAAAAGGAGTTTGACAAGAAACATGGTGCGACTTGGCATTGCATTGTTGG
TCGCAACTTTGGTTCTTACGTAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACCTCGA
CCAAAAAGCTGTGCTGCTCTTCAAGTCGGGTTAAAGAATTCCGAA

QA 5 409 5 409
DS 

RD RR4BO53JQ 581 0 0
GGAGAAAATCACCGAAGAAAGAAAAAAGAATGAGCGAGGGGAGGATAAAGAAGAGTGTGA
ACGGAGGAGCACCGGCGCAAACGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTTGAACCTTCTC
AAGCAGCGGCGGCGGGGAAGCGAGCTGTAGTAAAGAGTGCTGATATGAAAGAGGATATGC
AGAAGGAGGCTATCGATATCGCTATCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATA
TAGCTGAGAATATAAAAAAGGAGTTTGACAAGAAACATGGTGCGACTTGGCATTGCATTG
TTGGTCGCAACTTTGGTTCTTACGTAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACC
TCGACCAAAAAGCTGTGCTGCTCTTCAAGTCGGGTTAAAGAATTCCGAAACCAAGAGAGC
TTCCTTCACCTCTTTGGAGTCTGAAGTTGTTAAATCGCATTATTGTCATCACGTTGTAGT
TAGTTCCTTCATTGTGTTCTACGCGTATGTATGTGTTGGCTTTCACCAACAAAACTGGAT
TATAAACACTGTATGTAATAATATTCGATTTTAAAAACTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 6

CO CL1413Contig1 469 6 14 U
AGATAAAATGAATCCATAAACAATGAAAAATGATGATGATACATACAAAGCACACATAGA
AACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGC
ACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGT
TGTTTTTGGCTCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTG
GTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCG
CCACTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCA
CCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAAGAAAG
ATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGATAATCCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR21TF C 20
AF RR4GY41JQ U 1
AF RR4GY41TF C 1
AF RR4CR21JQ U 20
AF RR4GP68JQ U 25
AF RR4GP68TF C 25
BS 1 27 RR4GY41JQ
BS 28 28 RR4CR21JQ
BS 29 37 RR4GY41JQ
BS 38 38 RR4CR21JQ
BS 39 119 RR4GY41JQ
BS 120 120 RR4CR21JQ
BS 121 189 RR4GY41JQ
BS 190 190 RR4CR21JQ
BS 191 319 RR4GY41JQ
BS 320 320 RR4CR21JQ
BS 321 414 RR4GY41JQ
BS 415 415 RR4CR21JQ
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AATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGCACAAATCATTAACAAAAAC
AACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGTTGTTTTTGGCTCAAAAGAG
AAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTGGTACGAACATAGTAGCATC
CGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACCGTGGCAGCCGCCACTTGTCCTACGGCTGA
GAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAA

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DS 

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AACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGA
ACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGT
TGTTTTTGGATCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTG
GTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCG
CCACTTGTCCTACGGCTGAAAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCA
CCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAGGAAAG
ATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGAT
CC

QA 1 463 1 463
DS 

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AACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGA
ACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGT
TGTTTTTGGATCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTG
GTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCG
CCACTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCA
CCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAGGAAAG
ATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGAT
CC

QA 1 463 1 463
DS 

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AATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGCACAAATCATTAACAAAAAC
AACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGTTGTTTTTGGCTCAAAAGAG
AAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTGGTACGAACATAGTAGCATC
CGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACCGTGGCAGCCGCCACTTGTCCTACGGCTGA
GAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCACCTCCATTGCTTCTCTTTG
ATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAAGAAAGATTATGTTCTTCTTTAGTG
TGTATGTGTTTGTGCTATGATGATAATCCC

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DS 

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TACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGCACAAATCATTAACAAAAACAACAA
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TTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCGCCACTTGTCCTACGGCTGAAAAAG
CCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCACCTCCATTGCTTCTCT**GATTGT
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GTGTTTGTGCTATGATGAT
AATC

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DS 

RD RR4GP68TF 443 0 0
GAAAAATGATGGTGATACATACGAAGCACACATAGAAACGGATGGTAAAATTAAGAATAC
TACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGCACAAATCATTAACAAAAACAACAA
AAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGTTGTTTTTGGCTCAAAAGAGAAGAC
CAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTGGTACGAACATAGTAGCATCCGAAG
TTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCGCCACTTGTCCTACGGCTGAGAAAG
CCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCACCTCCATTGCTTCTCT**GATTGT
ACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAAGAAAGATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTAT
GTGTTTGTGCTATGATGAT
AATC

QA 1 439 1 439
DS 



AS 1 6

CO CL1414Contig1 1167 6 17 U
GTGCTCTTCCCGTAAACGACCGGTCACCATCAAACACAGCAACCATTTCCTACGACGACA
AACGAAGAACAGAGCTTTTCCTCAAAGACAGAATCCCATCATGGATCGCTGTAACCGGCT
ACGTAGTCATGGCCATAATCTCAATCATCACAGTTCCACACATCTTCCCTCAGCTCAGAT
GGTACCACATCTTGACCATGTACATAATCGCTCCTGTCCTAGCCTTTTGTAACGCCTACG
GCTGCGGACTCACCGACTGGTCCTTAGCTTCTACCTACGGAAAACTCGCCATTTTCACCA
TCGGAGCTTGGGCTGGTGCAGCCAACGGAGGTGTCTTGGCAGGACTCGCGGCTTGTGGTG
TCATGATGAACATTGTCTCCACCGCTTCTGATCTCATGCAAGATTTCAAAACCGGTTACA
TGACATTAGCTTCGCCGAGATCAATGTTCTTGAGCCAAGCGATTGGTACAGCGATGGGCT
GCGTCATCTCTCCTTGCGTCTTCTGGCTATTCTACAAGGCCTTTCCCGACTTCGGTCAAA
CCGGAACCGCGTATCCCGCACCTTACGCCTTAGTCTACAGAAACATGTCGATACTCGGGG
TAGAAGGATTCTCTGCTCTGCCCCACAATTGCCTCATACTCTGTTACATATTCTTCGCGG
CAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGGGACGCCGTGGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCC
CTCTCCCGATGGCTATGGCAATACCGTTTTACATCGGTGGTTACTTCACGATCGATATGT
GCGTGGGAAGTCTGATCCTGTTCTTATGGAGGAAGCTGAATAGACCAAAAGCAGATGCTT
ACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATATGTGGTGAAGGGATATGGACGTTACCAAGCT
CTGTACTTGCTTTGGCTAGTGTTAAGCCTCCTATCTGCATGAAGTTCTTGTCTGGCGCTA
CCAACGTTAAGGTTGATTCTTTCTTAAACCCTTCTTAACTGTGTTTTGGTTTTT*CTTTT
CATTTGTTATTTCTAGTGTTTACGGTTTTCTATGTTTCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCA
ACTTCAGTTCTACTCAATTATGTATAAAAAGATGATTGAATTATTGGTTTTCTAGTTGCT
ATTTTATTCTCGTTCTCTTGATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA51TF U 74
AF RR4FE33TF U 1
AF RR4DA51JQ C 387
AF RR4C894JQ C 690
AF RR4C894TF U 690
AF RR4FE33JQ C 649
BS 1 137 RR4FE33TF
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BS 139 427 RR4FE33TF
BS 428 428 RR4DA51JQ
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BS 527 527 RR4DA51JQ
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BS 570 649 RR4FE33TF
BS 650 650 RR4DA51JQ
BS 651 739 RR4FE33TF
BS 740 740 RR4C894TF
BS 741 756 RR4FE33TF
BS 757 757 RR4C894TF
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BS 775 1139 RR4C894TF
BS 1140 1167 RR4FE33JQ

RD RR4DA51TF 224 0 0
GCTTTTCCTCAAAGACAGAATTCCATCATGGATCGCTGTAACCGGTTACGTAGTCATGGC
CATAATCTCAATCATCACAGTTCCACACATCTTCCCTCAGCTCAGATGGTACCACATCTT
GACTATGTACATAATCGCTCCTGTCCTAGCCTTTTGTAACGCCTACGGCTGCGGACTCAC
CGACTGGTCCTTAGCTTCTACCTACGGAAAACTCGCCATTTTCA

QA 1 224 1 224
DS 

RD RR4FE33TF 774 0 0
GTGCTCTTCCCGTAAACGACCGGTCACCATCAAACACAGCAACCATTTCCTACGACGACA
AACGAAGAACAGAGCTTTTCCTCAAAGACAGAATCCCATCATGGATCGCTGTAACCGGCT
ACGTAGTCATGGCCATAGTCTCAATCATCACAGTTCCACACATCTTCCCTCAGCTCAGAT
GGTACCACATCTTGACCATGTACATAATCGCTCCTGTCCTAGCCTTTTGTAACGCCTACG
GCTGCGGACTCACCGACTGGTCCTTAGCTTCTACCTACGGAAAACTCGCCATTTTCACCA
TCGGAGCTTGGGCTGGTGCAGCCAACGGAGGTGTCTTGGCAGGACTCGCGGCTTGTGGTG
TCATGATGAACATTGTCTCCACCGCTTCTGATCTCATGCAAGATTTCAAAACCGGTTACA
TGACATTGGCTTCGCCGAGATCAATGTTCTTGAGCCAAGCGATTGGTACAGCGATGGGCT
GCGTCATCTCTCCTTGCGTCTTCTGGCTATTCTACAAGGCCTTTCCTGACTTCGGTCAAA
CCGGAACCGCGTATCCCGCACCTTACGCTTTAGTCTACAGAAACATGTCGATACTCGGGG
TAGAAGGATTCTCTGCTCTGCCCCACAATTGCCTCATACTCTGTTACATCTTCTTCGCGG
CAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGGGACGCCGTGGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCC
CTCTCCCGATGGCTATGGCTATACCGTTTTACATCG*TGGTTACTTCACGATCG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4DA51JQ 736 0 0
TCTGATCTCATGCAAGATTTCAAAACCGGTTACATGACATTAGCTTCGCCGAGATCAATG
TTCTTGAGCCAAGCGATTGGTGCAGCGATGGGCTGCGTCATCTCTCCTTGCGTCTTCTGG
CTATTCTACAAGGCCTTTCCCGACTTCGGTCAAACCGGAACCGCGTATCCCGCACCTTAC
GCCTTAGTCTACAGAAACATGTCGATACTCGGGGTAGAAGGATTCTCTGCTCTGCCCCAC
AATTGCCTCATGCTCTGTTACATATTCTTCGCAGCAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGG
GACGCCGTGGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCAATACCG
TTTTACATCGGTGGTTACTTCACGATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATTCTGTTCTTA
TGGAGGAAGCTGAATAGACCAAAAGCAGATGCTTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTG
ATATGTGGTGAAGGGATATGGACGTTACCAAGCTCTGTACTTGCTTTGGCTAGTGTTAAG
CCTCCTATCTGCATGAAGTTCTTGTCTGGCGCTACCAACGTTAAGGTTGATTCTTTCTTA
AACCCTTCTTAACTGTGTTTTGGTTTTT*CTTTTCATTTGTTATTTCTAGTGTTTACGGT
TTTCTATGTTTCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGTATA
AAAAGATGATTGAATT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4C894JQ 450 0 0
GCCGTGGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCAATACCGTTT
TACATCGGTGGTTACTTCACGATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATCCTGTTCTTATGG
AGGAAGCTGAATAGACCAAAAGCAGATGCTTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATA
TGTGGTGAAGGGATATGGACGTTACCAAGCTCTGTACTTGCTTTGGCTAGTGTTAAGCCT
CCTATCTGCATGAAGTTCTTGTCTGGCGCTACCAACGTTAAGGTTGATTCTTTCTTAAAC
CCTTCTTAACTGTGTTTTGGTTTTT*CTTTTCATTTGTTATTTCTAGTGTTTACGGTTTT
CTATGTTTCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGTATAAAA
AGATGATTGAATTATTGGTTTTCTAGTTGC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4C894TF 450 0 0
GCCGTGGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCAATACCGTTT
TACATCGGTGGTTACTTCACGATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATCCTGTTCTTATGG
AGGAAGCTGAATAGACCAAAAGCAGATGCTTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATA
TGTGGTGAAGGGATATGGACGTTACCAAGCTCTGTACTTGCTTTGGCTAGTGTTAAGCCT
CCTATCTGCATGAAGTTCTTGTCTGGCGCTACCAACGTTAAGGTTGATTCTTTCTTAAAC
CCTTCTTAACTGTGTTTTGGTTTTT*CTTTTCATTTGTTATTTCTAGTGTTTACGGTTTT
CTATGTTTCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGTATAAAA
AGATGATTGAATTATTGGTTTTCTAGTTGC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4FE33JQ 519 0 0
TC
TTCTTCGCGGCAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGGGACGCCGTGGGGCCTAACTGGTCT
CGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCTATACCGTTTTACATCGGTGGTTACTTCACG
ATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATTCTGTTCTTATGGAGGAAGCTGAATAGACCAAAA
GCAGATGCTTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATATGTGGTGAAGGGATATGGACG
TTACCAAGCTCTGTACTTGCTTTGGCTAGTGTTAAGCCTCCTATCTGCATGAAGTTCTTG
TCTGCCGCTACCAACGTGAAGGTTGATTCTTTCTTAAACCCTTCTTAACTGTGTTTTGGT
TTTTTCTTTTCATTTGTTATTTCTAGAATT*ACGGTTTTCTTTGTTTCTTGTCTATCTCT
CTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGTATAAAAAGATGATTGAATTATTGGTTT
TCTAGTTGCTATTTTATTCTCGTTCTCTTGATAATCC

QA 3 519 3 519
DS 



AS 2 6

CO CL1415Contig1 571 2 16 U
GGAAACGAAGGATGATATGATTAGCAAAATTCCAATGTAAACATTACACAGCTAGATAGA
AAGTGTATGATAAATAAAAACACTGTGGACATAAACATGGAAGAACAGAAAGAGAAGAAA
AATGAGAGAAAGGGGGAGACACATAACATAAAGACATGAATGTAAATCAAGCTGATACTG
CAGCTGCGACTTGTTCTTCTTCTGGGAGGAGAGTGCACACCAGCTTCCTGTCTCCATACA
CATTGTCCACCCCCCCTGTGGTTGGCCAAAACTTGGCAAATCGGAGCCATGCGGTAGGGA
AAGCAGCGTACTCTCGGGAATACGGCTTCTTCCATGTGTCTGACATTAGCATAGCTGGAA
AATGTGGAGCTCCCTTGAAAACGTCGTTCTGGACATCTGCATTTCCTTTTTCAATCTGTG
CAATTTCTTCCCTGATCGAAATGAAAGTATCGCAAAACCTGTCTAACTCCCCCTTGCTTT
CACTCTCGGTTGGCTCAATCATGAACGTTCCAAAAACAGGGAAAAACATTGTGGGTGCAT
GGAATCCATAGTCCATTAGCCGTTTCCCCAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CACTCTCGGTTGGCTCAATCATGAACGTTC

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DS 

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AGTCCATTAGCCGTTTCCCCAC

QA 1 442 1 442
DS 



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ATGCCAGTCTCATGGCCAAGTTTCACTGACATCCACCCATTTGCTCCAATTGATCAAGCA
CAAGGTTATCAGGAAATGTTCAGCGACTTGGGTGATCTATTGTGTACAATCACTGGGTTT
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TTCTGGCCAACCACAGGGCGGGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAAGCTGGTGTGCACT
CTCCTCCCAGATGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTATTAGCTTGATTTACATTCATGTCT
TTATGTTATGTGTCTCCCCCTTTCTCTCATTTCTCTTCTCTCTCTGCTCTTCCATGTTTA
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AATGTTGCTAATCATATCATCC


BQ
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AF RR4DJ04TF U 1
AF RR4CC12TF U 407
AF RR4EK94TF U 482
AF RR4DM82JQ C 952
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BS 948 1097 RR4EK94TF
BS 1098 1522 RR4DM82JQ

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GGCCACAGCATGATTCCATTGGGATCTTGTACAATGAAGTTAAACGCAACAACTGAAATG
ATGCCAGTCTCATGGCCAAGTTTCACTGACATCCACCCATTTGCTCCAATTGATCAAGCA
CAAGGTTATCAGGAAATGTTCAGCGACTTGGGTGATCTATTGTGTACAATCACTGGGTTT
GACTCTCTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTTCTGGTGAATACACCGGGCTCATGGTT
ATCCGCGAATATCACAGGTCAAGAGGGGATCACCACAGAAATGTGTGTATCATACCCGTC
TCTGCACACGGGACAAACCCTGCAAGCGCTGCTATGTGCGGGATGAAAATTATTACGGTT
GGAACTGATGCTAAGGGAAATATCAACATGGAGGAGGTGAGAAAAGCTGCTGAAGACAAC
AAAGACAGCTTAGCTGCCCTCATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAGTCTATGAAGAG
ACTATTGATGAGATTTGCAAAATAATTCACGACAATGGAGGTCAAGTGTACATGGATGGT
GCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCTGGTTTCATTGGAGCGGATGTGTGC
CATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGGCCTGGAATGGGT
CCCATTGGTGTGAAGAAACATTTAGCACCATTTCTTCCTTCTCACC*TGTGATACCCACC
GGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTGGGTCC*ATTGCCGCTGCACCGTGG
GGATCTGCGCT

QA 1 791 1 791
DS 

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G
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AGTCTATGAAGAGACTATTGATGAGATTTGCAAAATAATTCACGACAATGGAGGTCAAGT
GTACATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCTGGTTTCATTGG
AGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTAT**CTCATGGAGGTGGTGG
GCCTGGAATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAAACATTTAGCACCATTTCTTCCTTCTCACCC
TGTGATACCCACCGGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTGGGTCCCATTGC
CGCTGCACCGTGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTACATTGCCATGAT
GGGATCTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATGAC
GAAGCGCCTAGAGAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCACA

QA 2 541 2 541
DS 

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G
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CAACATGAATGCACAGGTTGGTATGACCAGCCCTGGTTTCATTGGAGCGGATGTGTGCCA
TCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGGCCTGGAATGGGTCC
CATTGGTGTGAAGAAACATTTAGCACCATTTCTTCCTTCTCACCCTGTGATACCCACCGG
TGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGA*AGAACCGCTGGGTCCCATTGCCGCTGCACCGTGGGG
ATCTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTACATTGCCATGATGGGATCTGGTGGACT
CACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATGG*GAAGCGCCTAGAGAA
GCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCACACGAATTCATCATAGA
TTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAAGCAGAGGATGTGGCGAAACGGCTAAT
GGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTCTCTGGAACGCTCATGATTGA
GCCAACCGAGAGTGA

QA 2 616 2 616
DS 

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G
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AACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTCTCTGGAACGC
TCATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGACAGGTTCTGCGATACTC
TCATTTCGATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCCAGAACA
ACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTAATGTCAGACGCATGGCTCCGAT
CTGCCAAGTTCTGGCCAACCACAGGGCGGGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAAGCTGG
TGTGCACTCTCCTCCCAGATGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTATTAGCTTGATTTACAT
TCATGTCTTTATGTTATGTGTCTCCCCCTTTCTCTCATTTCTCTTCTCTCTCTGCTCTTC
CATGTTTATGTCCACAGTGTTCTTATTTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGTAATGTT
TACATTGGAATGTTGCTAATCATATCATCC

QA 2 571 2 571
DS 



AS 2 6

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TTCCGTTGTCTCCGTAGTTTTGTTAGGCTTGGCCGGGGTAACACTCGCAGGTTCGGCCGT
GGTATTAGCCGTATCCACACCTCTTTTCATCATATTCAGTCCCATTCTCGTACCCGCCAC
TATAGCCACGACTCTTCTAGCAACTGGGCTTGGCGCTGGTGCCGCCCTCGGAGTGACCGC
CGTGGGTCTCATCGTTTGGCTCCTTAAGCATAGGATCGGAGTAAAGCCGAAGGATAATCC
ACCTCCTGCAGGAGCTCCCCCGGCAGCACCGGCAGCTCCTGCAGCTCCTGCAGCTCCGGA
AGCACCACCAGCAGCACCAGCAGCTCCGGCAGCACCAGCAGCTCCGGCAGCTCCGACAGC
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TAAGAGCAAGCTGCTAGATGTGTTAATTAATATACCAGGATTTGGAAAGAAATCCAAAGA
GCATGGCAAATCTAAAAGTGACGAAAATCCCAAAGGTAGAAAAGGTAAGTCTAAACGTGG
AAGAGATAAACATGTAGGTGAAAGTAAATCCAAGCATAAAAAAGGCAAATCTGGAGGTAA
AGATAAAGATAAATCCAAGGGTAAAGGTATATTCGGTAGAAAGGGTTCATCTAATGATGA
AAGTTCATAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C965TF U 1
AF RR4C965JQ C 15
BS 1 644 RR4C965TF
BS 645 645 RR4C965JQ
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BS 679 699 RR4C965TF
BS 700 794 RR4C965JQ

RD RR4C965TF 699 0 0
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TAAGAGCAAGCTGCTAGATGTGTTAATTAATATACCAGGATTTGGAAAGAAATCCAAAGA
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AAGAGATAAACATGTAG*TGAAAGTAAATCCAAGCATAA

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DS 

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A
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CACACCTCTTTTCATCATATTCAGTCCCATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCACGACTCT
TCTAGCAACTGGGCTTGGCGCTGGTGCCGCCCTCGGAGTGACCGCCGTGGGTCTCATCGT
TTGGCTCCTTAAGCATAGGATCGGAGTAAAGCCGAAGGATAATCCACCTCCTGCAGGAGC
TCCCCCGGCAGCACCGGCAGCTCCTGCAGCTCCTGCAGCTCCGGAAGCACCACCAGCAGC
ACCAGCAGCTCCGGCAGCACCAGCAGCTCCGGCAGCTCCGACAGCTCCGGCAGCTCCGGC
AGCACCGCCATCCTTCCTATCCCTTATTGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGCAAGCTGCT
AGATGTGTTAATTAATATACCAGGATTTGGAAAGAAATCCAAAGAGCATGGCAAATCTAA
AAGTGACGAAAATCCCAAAGGTAGAAAAGGTAAGTCTAAACGTGGAAGAGATAAACATGT
AGGTGAAGGTAAATCCAAGCATAAAAAAGGCAAATCTGGAGGTAAAGATAAAGATAAATC
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QA 2 780 2 780
DS 



CO CL1416Contig2 556 4 8 U
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TTTACCCTTGGATTTATCTTTATCTTTACCTCCAGATTTGCCTTTTTTATGCTTGGATTT
ACCTTCACCTCCATGTTTATCTCTTCCACGTTTAGACTTACCTTTTCTACCTTCGGAATT
TTCGTCACTTTTAGATTTGCCATGCTCTTTGGATTTCTTTCCAAATCCTGGTATATTAAT
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AATGTTTTTCTCTCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 0 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F162JQ U 1
AF RR4F162TF C 1
AF RR4EN77JQ U 192
AF RR4EN77TF C 192
BS 1 272 RR4F162JQ
BS 273 273 RR4EN77JQ
BS 274 318 RR4F162JQ
BS 319 319 RR4EN77JQ
BS 320 357 RR4F162JQ
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BS 359 437 RR4F162JQ
BS 438 556 RR4EN77JQ

RD RR4F162JQ 438 0 0
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TGTCATAAAATTCATGAATATAATACACAACGTATCTAAACATTGGAATAGATGAACCAG
TGTCTTTTACTCTTCCATGAATTTATCTTTATACCCATGTGTTTACCACAATTCCTATAC
GAACTTGTTTCGATCTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTTCTACCGAATATACC
TTTACCCTTGGATTTATCTTTATCTTTACCTCTAGATTTGCCTTTTTTATGCTTGGATTT
ACCTTCACCTCCATGTTTGTCTCTTCCACGTTTAGACTTACCTTTTCTACCTTCGGATTT
TTCGTCACTTTTAGATTTGCCATGCTCTTTGGATTTCTTTCCAAATCCTGGTATATTAAT
TAACACATCTAGCAGCT
C

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4F162TF 438 0 0
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TGTCATAAAATTCATGAATATAATACACAACGTATCTAAACATTGGAATAGATGAACCAG
TGTCTTTTACTCTTCCATGAATTTATCTTTATACCCATGTGTTTACCACAATTCCTATAC
GAACTTGTTTCGATCTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTTCTACCGAATATACC
TTTACCCTTGGATTTATCTTTATCTTTACCTCTAGATTTGCCTTTTTTATGCTTGGATTT
ACCTTCACCTCCATGTTTGTCTCTTCCACGTTTAGACTTACCTTTTCTACCTTCGGATTT
TTCGTCACTTTTAGATTTGCCATGCTCTTTGGATTTCTTTCCAAATCCTGGTATATTAAT
TAACACATCTAGCAGCT
C

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4EN77JQ 365 0 0
GGA
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TATCTTTATCTTTACCTCCAGATTTGCCTTTTTTATGCTTGGATTTACCTTCACCTCCAT
GTTTATCTCTTCCACGTTTAGACTTACCTTTTCTACCTTTGGGATTTTCGTCACTTTTAG
ATTTGCCATGCTCTTTGGATTTCTTTCCAAATCCTGGTATATTAATTAACACATCTAGCA
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CC

QA 4 365 4 365
DS 

RD RR4EN77TF 365 0 0
GGA
CTTATGAACTTTCATCATTAGATGAACCCTTTCTACCGAATATACCTTTACCCTTGGATT
TATCTTTATCTTTACCTCCAGATTTGCCTTTTTTATGCTTGGATTTACCTTCACCTCCAT
GTTTATCTCTTCCACGTTTAGACTTACCTTTTCTACCTTTGGGATTTTCGTCACTTTTAG
ATTTGCCATGCTCTTTGGATTTCTTTCCAAATCCTGGTATATTAATTAACACATCTAGCA
GCTTGCTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCAATAAGGGATAGGAAGGATGGCGGTGCTGCCG
GAGCTGCCGGAGCTGCCGGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTCGCTAATGTTTTTCTCTC
CC

QA 4 365 4 365
DS 



AS 2 6

CO CL1417Contig1 1002 3 2 U
GGAAACAGAAAGGTATACGAAATTATCATAAAATAACGAGAATAGGAAAAGTCGAGAGCT
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BQ
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AF RR4A686TF U 1
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GG
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AAAAAGGTCATAATTGTTCC

QA 1 680 1 680
DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ62JQ U 1
AF RR4DX13JQ U 1
AF RR4DX13TF C 515
BS 1 802 RR4DX13JQ
BS 803 803 RR4DX13TF
BS 804 818 RR4DX13JQ
BS 819 819 RR4DX13TF
BS 820 833 RR4DX13JQ
BS 834 1067 RR4DX13TF

RD RR4DZ62JQ 718 0 0
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CGGAAACAACTTAACATCCCTGGAAACATAGCCCACAAAAGAGAATCACAAACCCAAACA
ACAGGTACCATACATCAACTACTAAGATCACTAGAATAATCTTCACTCTTACATCCAAAT
CCATGAACAATCCTTGGTAATGAGAATAGTGCTGATATCTCTTGGTTTTAACCAGCCGGA
ACTCTTCCGAGAGCCAGACAAGAGATAGTAACGATGCAATAGCCTTCACAACAACAAGGC
TAAACTTACCCGAACCTTCAGTTCCAGGTACCAAGCCAGAACCACAATGACCAACACCAA
AACCAACTTGAGAAGCAAACAAGCAAGCGCCTGTGACTAAAGCTCTCTTCTCAACTGAAC
CTTCATCGGACAATCTAAAAGCCTCAACCTCTTTATAATGCTTCCATCAACAGAAGGCAC
CGAGGAACGAGAGACGCAAACAACAACCCGGAAAACACACTTATTAAAAGGCCAGGAGAT
GAACTCATAACAGAGAGATGGAGGCGACAAGAAACCTGAATCTTCTCTTCTCAAAGGTGT
TTGTCCTGTTCTGCTTACCACACACCACTACACCATCAACACCACCGCACCATCAACACA
CCACAGCTTAGACCGTTCCTGAAATAAAACCCATAGAACAAACACTAAAACCCAACAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4DX13JQ 847 0 0
CCCAACTGATATTTGATTGATGAAACTTAAAAACATACAAGGGTGAAATCCAAATGCCGA
CGGAAACAACTTAACATCCCTGGAAACATAGCCCACAAAAGAGAATCACAAACCCAAACA
ACAGGTACCATACATCAACTACTAAGATCACTAGAATAATCTTCACTCTTACATCCAAAT
CCATGAACAATCCTTGGTAATGAGAATAGTGCTGATATCTCTTGGTTTTAACCAGCCGGA
ACTCTTCCGAGAGCCAGACAAGAGATAGTAACGATGCAATAGCCTTCACAACAACAAGGC
TAAACTTACCCGAACCTTCAGTTCCAGGTACCAAGCCAGAACCACAATGACCAACACCAA
AACCAACTTGAGAAGCAAACAAGCAAGCGCCTGTGACTAAAGCTCTCTTCTCAACTGAAC
CTTCATCGGACAATCTAAAAGCCTCAACCTCTTTATAATGCTTCCATCAACAGAAGGCAC
CGAGGAACGAGAGACGCAAACAACAACCCGGAAAACACACTTATTAAAAGGCCAGGAGAT
GAACTCATAACAGAGAGATGGAGGCGACAAGAAACCTGAATCTTCTCTTCTCAAAGGTGT
TTGTCCTGTTCTGCTTACCACACACCACTACACCATCAACACCACCGCACCATCAACACA
CCACAGCTTAGACCGTTCCTGAAATAAAACCCATAGAACAAACACTAAAACCCAACAAGA
AAGTCTCAGATTTTCAACCTCTCTGTCAAGGAACAGACAACAAATGGAATAAAAAGATGA
AGCACAAGCCAAGCCAAAGCAA*CCAGACTGACCCAAA*CAGCACCATCTGAA
CAGAATCTAAAAGG

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4DX13TF 553 0 0
ACACACTTATTAAAAGGCCAGGAGATGAACTCATAACAGAGAGATGGAGGCGACAAGAAA
CCTGAATCTTCTCTTCTCAAAGGTGTTTGTCCTGTTCTGCTTACCACACACCACTACACC
ATCAACACCACCGCACCATCAACACACCACAGCTTAGACCGTTCCTGAAATAAAACCCAT
AGAACAAACACTAAAACCCAACAAGAAAGTCTCAGATTTTCAACCTCTCTGTCAAGGAAC
AGACAACAAATGGAATAAAAAGATGAAGCACAAGCCAAGCCAAAGCAAACCAGACTGACC
CAAAACAGCACCATCTGAAACAGAAATCTAAAAGGGAAACAATTCAAGATCTGTAGATCT
AAAAAGTTCCAACCCCAAAATTTCTAGATCTGTTGAAAAACAAAGAGGAGATGAAAAAGA
GGAGAAGAAGAAACAAAATACAAGAGGACAAATCACTCCGGTGGCGGCGAGAAGCGCCCA
CCACCGGAGAACGTAACGCACACTGACGGCTGTTCTTGAGCTCTCGACTTTTCCTATTCT
CGTTATTTTATCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 6

CO CL1418Contig1 743 6 10 U
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AACCGCAAGCTGAATGACCTTCTTGACGCATTGGACTTCAATCAAGTTGTCATATTTGTG
AAGAGCGTCAGCAGAGCTGGGGAGCTGAACAAGCTGCTTAGCGAATGTAACTTCCCCTCA
ATATGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGACTCACTACAAAAGTTTCAAG
GAAGGGCACAAGATAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAGGGAGAGGCATTGACATTGAG
CGTGTCAACATTGTCATCAACTATGACATGCCAGATTCTGCTGATACATACCTTCACAGG
GTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAATCACATTTGTGGCATCAGCT
TCAGACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCGAGGTTGATATCAAGCAACTT
CCTGAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAAGCAGCATCGTCTCTCAGGAA
GAACCTCTCCAGATTACAATTATCATCCTCCCCTCTATATTTTAGCTTTTTTTCTCTGTG
GACAAGCTTCCGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTATAGAGATCGAGTGATTCTCCA
ATCACATTTTGTTAAAGTTTGTTCTGTTTTGTAAAAGATATTTTTATGTTTATCTCAGGA
ATTAATCTTGGTTTTTAGTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 

AF RR4FA29TF U 1
AF RR4FA29JQ C 17
AF RR4DM14JQ C 161
AF RR4DN67JQ C 161
AF RR4DM14TF U 161
AF RR4DN67TF U 161
BS 1 160 RR4FA29TF
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BS 162 253 RR4FA29TF
BS 254 254 RR4DM14TF
BS 255 559 RR4FA29TF
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BS 561 653 RR4FA29TF
BS 654 654 RR4DM14TF
BS 655 685 RR4FA29TF
BS 686 743 RR4DM14TF

RD RR4FA29TF 685 0 0
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AACCGCAAGCTGAATGACCTTCTTGACGCATTGGACTTCAATCAAGTTGTCATATTTGTG
AAGAGCGTCAGCAGAGCTGGGGAGCTGAACAAGCTGCTTATCGAATGTAACTTCCCCTCA
ATATGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGACTCACTACAAAAGTTTCAAG
GAAGGGCACAAGAGAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAGGGAGAGGCATTGACATTGAG
CGTGTCAACATTGTCATCAACTATGACATGCCAGATTCTGCTGATACATACCTTCACAGG
GTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAATCACATTTGTGGCATCAGCT
TCAGACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCGAGGTTGATATCAAGCAACTT
CCTGAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAAGCAGCATCGTCTCTCAGGAA
GAACCTCTCCAGATTACAACTATCATCCTCCCCTCTATATTTTAGCTTTTTTTCTCTGTG
GACAAGCTTCCGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTATAGAGATCGAGTGACTCTCCA
ATCACATTTTGTTAAAGTTTGTTCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FA29JQ 727 0 0
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CTGGGGAGCTGAACAAGCTGCTTATCGAATGTAACTTCCCCTCAATATGCATTCACTCTG
GCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGACTCACTACAAAAGTTTCAAGGAAGGGCACAAGAGAA
TTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAGGGAGAGGCATTGACATTGAGCGTGTCAACATTGTCA
TCAACTATGACATGCCAGATTTTGCTGATACATACCTTCACAGGGTTGGAAGAGCTGGTA
GGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAATCACATTTGTGGCATCAGCTTCAGACTCGGAAGTTT
TTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCGAGGTTGATATCAAGCAACTTCCTGAGAATATTGATA
CTTCTACATACATGCCGTCTTAAAGCAGCATCGTCTTTCAGGAAGAACCTCTCCAGATTA
CAACTATCATCCTCCCCTCTATATTTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGACAAGCTTCCGTTTA
GACCGTTTGTAACTCTTCAGTTATAGAGATCGAGTGACTCTCCAATCACATTTTGTTAAA
GTTTGTTCTGTTTTGTAAAAGATATTTTTATGTTTATCTCAGGAATTAATCTTGGTTTTT
AGTGGC
G

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4DM14JQ 583 0 0
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TCACATTTGTGGCATCAGCTTCAGACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCG
AGGTTGATATCAAGCAACTTCCTGAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAA
GCAGCATCGTCTCTCAGGAAGAACCTCTCCAGATTACAATTATCATCCTCCCCTCTATAT
TTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGACAAGCTTCCGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTAT
AGAGATCGAGTGATTCTCCAATCACATTTTGTTAAAGTTTGTTCTGTTTTGTAAAAGATA
TTTTTATGTTTATCTCAGGAATTAATCTTGGTTTTTAGTGGCC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4DN67JQ 583 0 0
GCGAATGTAACTTCCCCTCAATATGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGA
CTCACTACAAAAGTTTCAAGGAAGGGCACAAGATAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAG
GGAGAGGCATTGACATTGAGCGTGTCAACATTGTCATCAACTATGACATGCCAGATTCTG
CTGATACATACCTTCACAGGGTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAA
TCACATTTGTGGCATCAGCTTCAGACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCG
AGGTTGATATCAAGCAACTTCCTGAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAA
GCAGCATCGTCTCTCAGGAAGAACCTCTCCAGATTACAATTATCATCCTCCCCTCTATAT
TTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGACAAGCTTCCGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTAT
AGAGATCGAGTGATTCTCCAATCACATTTTGTTAAAGTTTGTTCTGTTTTGTAAAAGATA
TTTTTATGTTTATCTCAGGAATTAATCTTGGTTTTTAGTGGCC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4DM14TF 583 0 0
GCGAATGTAACTTCCCCTCAATATGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGA
CTCACTACAAAAGTTTCAAGGAAGGGCACAAGATAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAG
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CTGATACATACCTTCACAGGGTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAA
TCACATTTGTGGCATCAGCTTCAGACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCG
AGGTTGATATCAAGCAACTTCCTGAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAA
GCAGCATCGTCTCTCAGGAAGAACCTCTCCAGATTACAATTATCATCCTCCCCTCTATAT
TTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGACAAGCTTCCGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTAT
AGAGATCGAGTGATTCTCCAATCACATTTTGTTAAAGTTTGTTCTGTTTTGTAAAAGATA
TTTTTATGTTTATCTCAGGAATTAATCTTGGTTTTTAGTGGCC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4DN67TF 583 0 0
GCGAATGTAACTTCCCCTCAATATGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGA
CTCACTACAAAAGTTTCAAGGAAGGGCACAAGATAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAG
GGAGAGGCATTGACATTGAGCGTGTCAACATTGTCATCAACTATGACATGCCAGATTCTG
CTGATACATACCTTCACAGGGTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAA
TCACATTTGTGGCATCAGCTTCAGACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCG
AGGTTGATATCAAGCAACTTCCTGAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAA
GCAGCATCGTCTCTCAGGAAGAACCTCTCCAGATTACAATTATCATCCTCCCCTCTATAT
TTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGACAAGCTTCCGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTAT
AGAGATCGAGTGATTCTCCAATCACATTTTGTTAAAGTTTGTTCTGTTTTGTAAAAGATA
TTTTTATGTTTATCTCAGGAATTAATCTTGGTTTTTAGTGGCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 5

CO CL1419Contig1 1032 5 25 U
GCGGCAACCTCTGTTTTATTACATTAACATTAAGATTACATAAAAGCCGATATTTTTTTA
TTACATTAACATTAAGATTACATAAAAGCCGAGAAACATGATCCTTTTTAGACACCACAG
AAAACATAGTGCTTCTATTACACACACACTGAAGCAGATATATTTTTTTCACAAAGAGTT
ACCATTTAGCAGCCTCTGCAAGCAAAGCAAAAAACTTAAACCTCTTGATATTGAGTTTGA
CTTCCTCAGCACATAACTCTTTCCACTCATCGCTCAACTCTTTTCTTTTACCAGATCCAA
GGTTCATCAGCTTCTCAAGCTGCAACTTCTTTTGATAATCACTTAAACCTTTAGACACCA
TGGTCTCGAATGCATCCCGCACAGCCCATGTCTCGTCATTTCCTTCAAAGTCAGCTTTTG
GTAATGATTCATTACCCATTTCATCACCACTCTTGCTGCTGTGATTAACAGACTGACCAG
GTTCATTTTGGGGGCCCCATATCCTTTTGGAAAGTAGGAAGGCTTCAGATTTGCTGGTGT
TGCCTTTCCGCATGCTAACAATGAACTTACCTTTCAGCTTGCGGATCTTAGTCAAAACCT
GATCCTTTGAGTATATCGCAGTGATGGAATCACCGAGGAAACGGTAAAAGTCAGCCCAGT
TACTGTTGGGTTCGTTCCCTGTCTTGGCTCGATAATCCACTAACCCTTTTAACACAGTGA
GCTCATCTTCCTCGTTCCAGATTCTGCTGCTGCTGCTGCTCGCCAGTGTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGTCACTTGTTCTGCTGCTGCTGGTGGTTGTGGAGGAGAAG
GCTCTGAAGCTTGTTTCCGTGGGGATTTTCTGAGAATATGTGAAGGTGGAGAGGCTGCGT
CAGAGAAATCAAGATTCACCATGGGCATGGTCGCAATCCTCACATGCAGAGAAGCCCTGA
TCCAGGAAATCAAAATTCATCAGTACATCTTCCGACAAAAACAAACTCACACTCTAGAGA
GAGAAAAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CG59JQ U 21
AF RR4H158TF C 249
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TTACATTAACATTAAGATTACATAAAAGCCGAAAAACATGATCCTTTTTAGACACCACAG
AAAACATAGTGCTTCTATTACACACACACTGAAGCAGATATATTTTTTTCACAAAGAGTT
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DS 

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A
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ACATTAACATTAAGATTACATAAAAGCCGAGAAACATGATCCTTTTTAGACACCACAGAA
AACATAGTGCTTCTATTACACACACACTGAAGCAGATATATTTTTT*CACAAAGAGTTAC
CATTTAGCAGCCTCTGCAAGCAAAGCAAAAAACTTAAACCTCTTGATATTGAGTTTGACT
TCCTCAGCACATAACTCTTTCCACTCATCACTCAACTCTTTTCTTTTACCAAATCCAAGG
TTCATCAGCTTCTCAAGCTGCAACTTCTTTTGATAATCACTTAAACCTTTAGACACCATG
GTCTCGAACGCATCCCGCACAGCCCATGTCTCGTCATTTCCTTCAAAGTCAGCTTTTGGT
AATGATTCATTACCCATTTCATCACCACTCTTGCTGCTGTGATTATCAAACTGATCAGGT
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AGCAAAGCAGAAAACTTAAACCTCTTGATATTGAGTTTGACTTCCTCAGCACATAACTCT
TTCCACTCATCGCTCAACTCTTTTCTTTTACCAGATCCAAGGTTCATCAGCTTCTCAAGC
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ACAGCCCATGTCTCGTCATTTCCTTCAAAGTCAGCTTTTGGTAATGATTCATTACCCATT
TCATCACCACTCTTGCTGCTGTGATTAACAGACTGACCAGGTTCATTTTGGGGGCCCCAT
ATCCTTTTGGAAAGTAGGAAGGCTTCAGATTTGCTGGTGTTGCCTTTCCGCATGCTAACA
ATGAACTTACCTTTCAGCTTGCGGATCTTAGTCAAAACCTGATCCTTTGAGTATATCGCA
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GTCTTGGCTCGATAATCCACTAACCCTTTTAACACAGTGAGCTCATCTTCCTCGTTCCAG
ATTCTGCTGCTGCTGCT
GCTCGCCAGTGTCTTCT

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AGCTTCTCAAGCTGCAACTTCTTTTGATAATCACTTAAACCTTTAGACACCATGGTCTCG
AATGCATCCCGCACAGCCCATGTCTCGTCATTTCCTTCAAAGTCAGCTTTTGGTAATGAT
TCATTACCCATTTCATCACCACTCTTGCTGCTGTGATTAACAGACTGATCAGGTTCATTT
TGGGGGCCCCATATCCTTTTGGAAAGTAGGAAGGCTTCAGATTTGCTGGTGTTGCCTTTC
TGCATGCTAACAATGAACTTACCTTTCAGCTTGCGGATCTTAGTCAAAACCTGATCCTTT
GAGTATATCGCAGTGATGGAATCACCGAGGAAACGGTAAAAGTCAGCCCAGTTACTGTTG
GGTTCGTTCCCTGTCTTGGCTCGATAATCCACTAACCCTTTTAACACAGTGAGCTCATCT
TCCTCGTTCCAGATTCTGCTGCTGCTGCTGCTCGCCAGTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCTTCTTCTTTGTCACTTGTTCTGCTGCTGCTGGTGGTTGTGGAGGAGAAGGCTCTGAA
GCTTGTTTCCGTGGGGATTTTCTGAGAATATGTGAAGGTGGAGAGGCTGCGTCAGAGAAA
TCAAGATTCACCATGGGCATGGTCGCAATCCTCACATGCAGAGAAGCCCTGAT
CCAGGAAATC

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DS 

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TTTGATATCACTAAA
CTTTAGACACCATGGTCTCGAATGCATCCCGCACAGCC*ATGTCTCGTCATTTC*TTCAA
AGTCAGCTTTTGGTAATGATTCATTACCCATTTCATCACCACTCTTGCTGCTGTGATTAA
CAGACTGACCAGGTTCATTTTGGGGGCCCCATATCCTTTTGGAAAGTAGGAAGGCTTCAG
ATTTGCTGGTGTTGCCTTTCCGCATGCTAACAATGAACTTACCTTTCAGCTTGCGGATCT
TAGTCAAAACCTGATCCTTTGAGTATATCGCAGTGATGGAATCACCGAGGAAACGGTAAA
AGTCAGCCCAGTTACTGTTGGGTTCGTTCCCTGTCTTGGCTCGATAATCCACTAACCCTT
TTAACACAGTGAGCTCATCTTCCTCGTTCCAGATTCTGCTGCTGCTGCTGCTCGCCAGTG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT******TGTCACTTGTTCTGCTGCTGCTGGTGGTT
GTGGAGGAGAAGGCTCTGAAGCTTGTTTCCGTGGGGATTTTCTGAGAATATGTGAAGGTG
GAGAGGCTGCGTCAGAGAAATCAAGATTCACCATGGGCATGGTCGCAATCCTCACATGCA
GAGAAGCCCTGATCCAGGAAATCAAAATTCATCAGTACATCTTCCGACAAAAACAAACTC
ACACTCTAGAGAGAGAAAAAAAAA

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DS 



AS 1 6

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TCTTCTTACATCGATCGTGTTCAGAAATCATATTCATTACACAACTCTTTCTCTCTCTCT
GAGTTGGATTCTTTTATAACATGTGGTTATCCCTACAGAGACGAGTAGAAGCAAAGAATA
TTAATAGAAATGATGAAAATGAATATAGGAACGACGCCCTCCGTTGACGGCAGCGTCGGC
GGAGTTAGCGGCAATGAATGGGAGTCCCGACCTGGAGGAATGGTTGTGCAAAGACGAACG
GATCAGAGCTCCGATTCGCCACGTGTCATCCGCGTCCGGGTCAAATACTTGTCGGTTTAC
CACGAGATCAACATCAACTCCCAATCTAGCTTCGGAGAGTTGAAGAAGGTGTTATCTGGT
CAGACCGGACTTCACCACGAAGACATGAAGATTCTGTACAAAGACAAGGAGAGAGATTCG
AAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGCTCAAAGCTTGTTCTTAAAGAAGAT
CCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGAGAAGAGGAAAAACGCCGTCACTGAAAAAGCT
ATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTCGCCGGACAGGTGTCGACG
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GAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGGAGATGTGAAG
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AAAGTCAAAAACTCGACCAAAAAAGTCGACATTAACAAGTCGGTGCGCCACAAACCGCAA
ACGCAGACGCAATATCAGCAACGCGATTTGTTATCGTTTGTTGATAAAGGGGTGGAGGAG
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AATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGCTAAGGCACCGGTTGAACCGGTTAAA
CCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGATTAAGCTATAATACACTATCATACG
TACACGATAAATATGTATTTTTCTCCGATTTCATGTGATTTGTGATTGATCTTGGCAATT
TTTTTTTGGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTGAAGTCAATTCACAAATA
ACAAGGGGAGTTTCAACAAATATAGTTTCCTCATCATATCATCATAATCCCATCATTGTA
ATACCTAAAGATTTGAATTTTCTTTACTAATACAATAAAAGTTACGG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4GC79TF U 1
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TAGACCGGACTTCACCACGAAGACATGAAGATTCTGTACAAAGACAAGGAGAGAGATTCG
AAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGGTCAAAGCTTGTTCTTAAAGAAGAT
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TTCGAGACGATGATTAATAAAGGAGGAAAAGTTGAAGAGAAGAGTCTCGTGAATCTGATT
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GG
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ATACTTGTCGGTTTACCACGAGATCAACATCAACTCCCAATCTAGCTTCGGAGAGTTGAA
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TGTTCTTAAAGAAGATCCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGAGAAGAGGAAAAACGC
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G
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GTTTGTTGATAAAGGGGTGGAGGAGGAGCCTAGGAGGGACTCAGGCGCGTCGTCCTCTTC
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AA

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G
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GTACGTTGAAACACTTGATGTCTTGAAAGTCAAAAACTCGACCAAAAAAGTCGACATTAA
CAAGTCGGTGCGCCACAAACCGCAAACGCAGACGCAATATCAGCAACGCGATTTGTTATC
GTTTGTTGATAAAGGGGTGGAGGAGGAGCCTAGGAGGGACTCAGGCGCGTCGTCCTCTTC
GGGTACTCCAGCGATTGGAACGAATAATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGC
TAAGGCACCGGTTGAACCGGTTAAACCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGA
TTAAGCTATAATACACTATCATACGTACACGATAAATATGTATTTTTCTCCGATTTCATG
TGATTTGTGATTGATCTTGGCAATTTTTTTTTGGTTTGTTTAG

QA 2 584 2 584
DS 

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GA
AAAGCTATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTCGCCGGACAGGTG
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CTGATTGAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGGAGAT
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GTTAAACCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGATTAAGCTATAATACACTAT
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GCAATTTTTTTTTGGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTGAAGTCAATTCA
CAAATAACAAGGGGAGTTTCAACAAATATAGTTTCTTCTTCATATCATCATAATCCCATC
ATTGTAATACCTAAAGATTTGGATTTTCTTTACTAATACAATAAAAGTT

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DS 

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CAGCGATTGGAACTAATAATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGCTAAGGCAC
CGGTT*********AAACCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGATTAAGCTA
TAATACACTATCATACGTACACGATAAATATGTATTTTTCTCCGATTTCATGTGATTTGT
GATTGATCTTGGCAATTTTTTTT*GGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTG
AAGTCAATTCCCAAATAACAAGGGGAGTTTCAACAAATATAGTTTCCTCATCAT**CATC
ATAATCCCGTCATTGTAATACCTAAAGATTTGAATTTTCTTTACTAATACAATAAAAGTT
ACGG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 3

CO CL1421Contig1 977 3 11 U
GGGTAAAAGGACTATCGTGCAATACGTAGTAAAGTAAAATTCTTAAATTAATTAAAAAAA
AATAAATACAAAGGGAACCCCTAAATTGTTTCTTCTCCCCGCCGCCGCTGTGCCGAATCG
ACGTTGCGACTTGTACCGCCACAATCGGTCGTAGATGGCTTACAGAGGAGGACGAGGAAG
AGGAAGAGGTGGGTTTGGTGGGTTTGGCGTTGAGTACGCAAAGGCAGAACCTTTCGTTAT
CTTCCCTGACATTACGTTACCTGACCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATTACTTAA
GAACTTCAATTATTTTGAGAGGTTCTGGAAAAGTTCGCCTTACCACTTAGGCGATGGTGT
TTCAAAGAAAGAGAGTGAGAGTTTAGACATTGAGAGGTTCTCAGACACGTTAAAGCCGAA
GAAGACCAAGTCTAGTGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTTCTTGTTCTTAGACCTGATAA
CTTCCCTAAAGAACTTCTTGGAGATAGTCGAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGCTAGATG
GACTCAAGACGCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGTCTTGGAGAAACTTGAAGCGAAGCTTAA
GGCTGATGGCAAGGAAGAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGAATCTGA
GGGAGAAGATTCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAAGACTTTGACGATGATGATGA
CGATTACAACGAGCCGGAGGATAACGATAATGAAGAAGTGTATATTTAAGGCTTCTTTTT
CTTTATGTCTTCCCAAAAAAAGGATCAAGTTTTGAGTGCAAGAGATGGTGGAAACTCAAT
TTTAATTACCTTCAAACCCTCTTAGAATAATACAAGCGCAATTTTTGGCATTTGTTGCTT
TCATTCTTTTTTTTGCTTTAATCTATGGGGAATTAGCTGTAATACACATTAAAAAGTCAA
AAATAAAGTTTCTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD46TF U 1
AF RR4BA79TF U 115
AF RR4DD46JQ C 401
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BS 131 596 RR4DD46TF
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BS 872 977 RR4DD46JQ

RD RR4DD46TF 596 0 0
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CTTCCCTGACATTACGTTACCTGACCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATTACTTAA
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GACTCAAGACGCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGTCTTGGAGAAACTTGAAGCGAAGC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4BA79TF 760 0 0
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AGGAAGAGGAAGAGGTGGGTTTGGTGGGTTTGGCGTTGAGTACGCAAAGGCAGAACCTTT
CTTTATCTTCCCTGACATTACGTTACCTGACCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATT
ACTTAAGAACTTCAATTATTTTGAGAGGTTCTGGAAAAGTTCGCCTTACCACTTAGGCGA
TGGTGTTTCAAAGAAAGAGAGTGAGAGTTTAGACATTGAGAGGTTCTCAGACACGTTAAA
GCCGAAGAAGACGAAGTCTAATGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTTCTTGTTCTTAGACC
TGATAACTTCCCTAAAGAACTTCTCGGAGATAGTCGAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGC
TAGATGGACTCAAGACGCAGATTTGCAGAAGCTGGAGGTCTTGGAGAAACTTGAAGCGAA
GCTTAAGGCTGATGGCAAGGA*GAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGA
ATCTGAGGGAGAAGATTCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAAGACTTTGACGATGA
TGATGACGATTATAACGAGCCGGAGGATAACGATAATGAAGAAGTGTATATTTAAGGCTT
CTTTTTCTTTATGTCTTCCCAAAAAA*GGATCAAGTTTTGAGTGCAAGAGATGGTGGAAA
CTCAATTTTAATTACCTTCAAACCCTCTTAGAATAAT
GCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4DD46JQ 577 0 0
TCAGACACGTTAAAGCCGAAGAAGACCAAGTCTAGTGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTT
CTTGTTCTTAGACCTGATAACTTCCCTAAAGAACTTCTTGGAGATAGTCGAAGAGAACGG
CCTGTGAAGAGAGCTAGATGGACTCAAGACGCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGTCTTGGAG
AAACTTGAAGCGAAGCTTAAGGCTGATGGCAAGGAAGAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGAT
GATGAAGTTGAGGAATCTGAGGGAGAAGATTCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAA
GACTTTGACGATGATGATGACGATTACAACGAGCCGGAGGATAACGATAATGAAGAAGTG
TATATTTAAGGCTTCTTTTTCTTTATGTCTTCCCAAAAAAAGGATCAAGTTTTGAGTGCA
AGAGATGGTGGAAACTCAATTTTAATTACCTTCAAACCCTCTTAGAATAATACAAGCGCA
ATTTTTGGCATTTGTTGCTTTCATTCTTTTTTTTGCTTTAATCTATGGGGAATTAGCTGT
AATACACATTAAAAAGTCAAAAATAAAGTTTCTAACC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 5

CO CL1422Contig1 893 5 3 U
GTGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGTGGTGATGTCTCTTGGCATATCCATGATGAGAGATCT
CTTCTCGCCCTTCAGGGTCCTTTGGCTGCTCCGGTGCTTCAACACTTGACCAAAGAAGAC
TTAAGCAAGCTTTACTTTGGACAGTTCCAGATCCTGGACATTAATGGTTCCACTTGCTTA
CCAGGACCGGGTATACTGGGGAAGATGGGTTTGAGATCTCGGTTCCATCGGAGCATGCAG
TTGATTTAGCCAAAGCAATCTTGGAGAAATCCGAGGGAAAAGTAAGGCTCACAGGTCTAG
GAGCAAGAGACAGTCTGAGGCTAGAAGCAGGGCTTTGTCTCTACGGCAATGACATGGAGC
AACACATTTCTCCTGTCGAAGCTGGACTCACATGGGCCATAGGTAAGCGTATAAGAGCCG
AAGGAGGGTTTCTCGGAGCTGATGTGATCCTCAAACAGCTTCAAGATGGACCAACGATCA
GAAGGGTTGGATTCTTCTCTTCGGGACCACCAGCAAGGTCGCATAACGAGGTGCATGATG
AGAGTGGTAACAAGATTGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGTCCCAACTTGAAGAAGA
ACATAGCTATGGGGTATGTTAAGTCGGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTCAAGATCT
TGGTCCGTGGGAAACCTTATGAAGGCAACATCACTAAGATGCCGTTCGTGGCTACCAAAT
ACTACAAGCCGTCATGATAAGTGTGGGCGTCTTCTTTGTCTATGACATGTGTTTCTTGCT
TTTGTTAAATGACTTCTGTGTTTCTTTTATTCTGATTTGGCATGAAAGTGTACGTTCTTT
TTGCCAAGAGGGCGATTGCTTATTTCACTGTTATTGAAATAAAATTTTAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV11TF U 1
AF RR4DZ70JQ C 442
AF RR4BV11JQ C 124
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AF RR4DZ70TF U 192
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AGAGTGGTAACAAGATTGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGTCCCAACTTGAAGAAGA
ACATAGCTATGGGGTATGTTAAGTCGGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTCAAGATCT
TGGTCCGTGGGAAACCTTAT

QA 1 680 1 680
DS 

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AAGGCAACATCACTAAGATGCCGTTCGTGGCTACCAAATACTACAAGCCGTCATGATA
TGTGG

QA 1 298 1 298
DS 

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CCAAGAGGGCGATTGCTTATTTCACTGTTATTGAAATAAAATTTTAACGC

QA 1 770 1 770
DS 

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T

QA 1 241 1 241
DS 

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GG
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TCTGAGGCTAGAAGCAGGGCTTTGTCTCTACGGCAACGACATGGAGCAACACATTTCTCC
TGTCGAAGCTGGACTCACATGGGCCATAGGTAAACGTAGAAGAGCCGAAGGAGGGTTTCT
CGGAGCTGATGTGATCCTCAAACAGCTTCAAGATGGACCAACGATCAGAAGGGTTG*ATT
CTTCTCTTCGGGACCACCAGCAAGGTCGCATAGCGAGGTGCATGATGAGAGTGGTAACAA
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GTATGTTAAGTCGGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTCAAGATCTTGGTCCGTGGGAA
ACCTTATGAAGGCAACATCACTAAGATGCCGTTCGTGGCTACCAAATACTACAAGCCGTC
ATGATA**TGTGGGCGTCTTCTTTGTCTCTATGACATGTTTCTTGCTTTTGCTAAATGAC
TTCTGTGTTTCTTTTGTTCTGATTTGGCATAAAAGTGTACGTTCTTTTTGCC
GTGAGGGCATTTGC

QA 3 654 3 654
DS 



AS 1 6

CO CL1423Contig1 1876 6 27 U
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ATCCCCCATTCTCGATTAAAGAGAACAAAGGCCAAGTCTCTCTGTATCCCAATTCTTCAC
GGAAATTTCGTTTCCATGGCACCGGTGAGAGGGATTCTTGGTTTGCAGAGGGCAGCATCA
GTTTGGAAGGAGAGTAACAGATTGGCTCCAGCTCTGAGATCATTCAGCACCACAGCTGCA
TCCACTTCCACCACTCCACAGCCACCCCCACCTCCTCCGCCTCCGGAGAAGACTCATTTC
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CTCAAGGGGGCGATGAAGAGAGGTGATTGGCATAGGACCAAAGATTTGGTGCTCAAGGGT
ACTGATTGGATTGTCAATGAGATGAAAAAGTCCGGTCTTCGTGGACGTGGTGGTGCTGGT
TTCCCTTCTGGTCTTAAGTGGTCCTTTATGCCTAAAGTCTCTGATGGTCGTCCTTCTTAT
TTGGTTGTCAACGCTGATGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAGGGAGATCATGCGT
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GCTGCTTATATTTACATCAGGGGTGAGTATGTGAATGAACGTTTGAATCTAGAGAAGGCG
AGGAGAGAGGCATATGCAGCTGGTCTCTTGGGGAAGAATGCATGTGGTTCTGGGTATGAT
TTCGATGTTTATATCCATTTTGGAGCTGGTGCCTACATTTGTGGTGAAGAGACTGCGCTT
CTTGAAAGCCTTGAAAGGGAAGCAAGGAAAACCTAGGTTGAAGCCTCCGTTCCCTGCTAA
TGCTGGTTTGTATGGCTGTCCCACTACCGTTACCAATGTGGAGACGGTGGCTGTTTCTCC
TACCATTTTAAGGCGTGGACCAGAGTGGTTTTCGAGTTTTGGTAGGAAGAATAACTCTGG
GACAAAGCTGTTTTGTATATCCGGCCATGTGAACAAGCCATGTACCGTTGAAGAGGAGAT
GAGTATCCCTCTCAAGGAACTGATTGAGAGGCATTGTGGAGGTGTTAGGGGTGGATGGGA
CAACCTGCTTGCTATCATTCCTGGAGGTTCATCTGTCCCTTTGATTCCTAAGAACATATG
CGAGGATGTGCTGATGGATTTCGATGCGCTCAAGGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAACTGC
AGCGGTCATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTTGTGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTA
CTTCTACAAGCACGAAAGCTGTGGGCAGTGCACTCCTTGCAGAGAGGGAACAGGTTGGCT
CTGGATGATCATGGAGAGAATGAAAGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCT
TCACGAGGTAACCAAGCAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCATTGGGTGATGCAGCTGC
ATGGCCAGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGA
ACGCGCTGAAAAGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTAACGACAGGGTAT
TTGCTATCATTATCGATGGAAATAAAATCTGAAGCACATTATTAGGGTTTTGGGGATGCA
AAACTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTAATGTATTTGTTGAAATGGTTCATGTTGAACTTT
AATCAAACTGTATCAGAAAGAGACTGTTTGCTCTTTTGCGTATTCTACTTTCTTTCAATG
CGTGTTTGTTTTTCTCATGACTATGCTGAGATCACATTTTGGGAACAACCAACCAAAGAA
AACCTTTTCATATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C953TF U 1
AF RR4AE31TF U 137
AF RR4AG42TF U 773
AF RR4EL93JQ C 1278
AF RR4EL93TF U 1278
AF RR4AE31JQ C 1037
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BS 769 876 RR4AE31TF
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BS 1677 1854 RR4EL93TF
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ATCCCCCATTCTCGATTAAAGAGAACAAAGGCCAAGTCTCTCTGTATCCCAATTCTTCAC
GGAAATTTCGTTTCCATGGCACCGGTGAGAGGGATTCTTGGTTTGCAGAGGGCAGTATCA
GTTTGGAAGGAGAGTAACAGATTGGCTCCAGCTCTGAGATCATTCAGCACCACAGCTGCA
TCCACTTCCACCACTCCACAGCCACCCCCACCTCCTCCGCCTCCGGAGAAGACTCATTTC
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CTCAAGGGGGCGATGAAGAGAGGTGATTGGCATAGGACCAAAGATTTGGTGCTCAAGGGT
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TTCCCTTCTGGTCTTAAGTGGTCCTTTATGCCTAAAGTCTCTGATGGTCGTCCTTCTTAT
TTGGTTGTCAACGCTGATGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAGGGAGATCATGCGT
CATGACCCTCACAAGCTGTTGGAAGGGTGTTTGATTGCTGGTGTTGGGATGAGATCTAGT
GCTGCTTATATTTACATCAGGGGTGAGTATGTGAATGAACGTTTGA*TCTAGAGAAG*CG
AGGAGAGAG*CATATGCAGCTGGTCTCTTGGGGAAGA*TGCATGTGGT
CTGGTATGATTTCG

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DS 

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G
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ACAGCCGCCTCCACCTCCTCCGCCTCCGGAGAAGACTCATTTCGGTGGTCTCAAGGATGA
AGATCGGATTTTCACCAACCTCTACGGTCTGCACGACCCGTTTCTCAAGGGGGCGATGAA
GAGAGGTGATTGGCATAGGACCAAAGATTTGGTGCTCAAGGGTACTGATTGGATTGTCAA
TGATATGAAAAAGTCTGGTCTTCGTGGACGTGGTGGTGCTGGTTTCCCTTCTGGTCTTAA
GTGGTCTTTTATGCCTAAAGTCTCTGATGGTCGTCCTTCTTATTTGGTTGTCAACGCTGA
TGAGAGTGAGCCTGGGACTTGTAAAGATAGGGAGATCATGCGTCATGACCCTCACAAGCT
GTTGGAAGGGTGTTTGATTGCTGGTGTTGGTATGAGAGCTAGTGCTGCTTATATTTACAT
CAGGGGTGAGTATGTGAATGAACGTTTGAATCTAGAGAAGGCGAGGAGAGAGGCGTATGC
AGCTGGTCTCTTGGGGAAGAATGCATGTGGTTCTGGGTATGATTTCGATGTTTATATCCA
TTTTGGAGCTGGTGCCTACATTTGTGGTGAAGAGACTGCGCTTCTTGAAAGCCTTGAAAG
GGAAGCAAGGAAAACCTAG*TTGAAGCCTCCGTTCCCTGCTAATGCTGGTTTGTATGGCT
GTCCCACTACCGTTACCAATGTGGAGACGGTGGCTGTTTCTCCTACCATTTTAAG
CGTGAC

QA 2 836 2 836
DS 

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CTGCGCTTCTTGAAAGCCTTGAA*GGGAAGCAAGGAAAACCTAGGTTGAAGCCTCCGTTC
CCTGCTAATGCTGGTTTGTATGGCTGTCCCACTACCGTTACCAATTTGGAGACGGTGGCT
GTTTCTCCTACCATTTTAAGGCGTGGACCAGAGTGGTTTTCGAGTTTTGGTAGGAAGAAT
AACTCTGGGACAAAGCTGTTTTGTATATCCGGCCATGTGAACAAGCCATGTACCGTTGAA
GAGGAGATGAGTATCCCTCTCAAGGAACTGATTGAGAGGCATTGTGGAGGTGTTAGGGGT
GGATGGGACAACCTGCTTGCTATCATTCCTGGAGGTTCATCTGTCCCTTTGATTCCTAAG
AACATATGCGAGGATGTGCTGATGGATTTCGATGCGCTCAAGGCTGTCCAATCAGGGCTA
GGAACTGCAGCGGTCATTGTGATG*ATAAATCAACCGATGTTGTGGATGCAATCGCGAGG
CTCTCTTACTTCTACAAGCACGAAAGCTGTGGGCAGTGCACTCCTTGCAGAGAGGGAACA
GGTTGGCTCTGGATGATCATGGAGAGAATGAAAGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATT
GATATGCTTCACGAGGTAACCAAGCAGATCGAAAGACACACAATCTGTGCATTGGGTGAT
GCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGG
ATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTAACGA
CAGG*TATTTGCTATCATTATCGATGGAAATAAAATCTGAAGCACATTATTAGGGTTTTG
GGGA

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DS 

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G
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AATGAAAGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCACGAGGTAACCAAGCA
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GCTACAGGCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTAACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGATG
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DS 

RD RR4EL93TF 577 0 0
G
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CTGTGGGCAGTGCACTCCTTGCAGAGAGGGAACAGGTTGGCTCTGGATGATCATGGAGAG
AATGAAAGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCACGAGGTAACCAAGCA
TATCGAAGGACACACAATCTGTGCATTGGGTGATGCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGTCT
GATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAGTT
GCTACAGGCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTAACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGATG
GAAATAAAATCTGAAGCACATTATTAGGGTTTTGGGGATGCAAAACTACTTCAGAAGGAG
AAGAAGGTAATGTATTTGTTGAAATGGTTCATGTTGAACTTTAATCAAACTGTATCAGAA
AGAGACTGTTTGCTCTTTTGCGTATTCTACTTTCTTTCAATGCGTGTTTGTTTTTCTCAT
GACTATGCTGAGATCACATTTTGGGAACAACCAACC

QA 2 577 2 577
DS 

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GAACTGATTGAGAGGCATTGTGGAGGTGTTAGGGGTGGATGGGACAACCTGCTTGCTATC
ATTCCTGGAGGTTCATCTGTCCCTTTGATTCCTAAGAACATATGCGAGGATGTGCTGATG
GATTTCGATGCGCTCAAGGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAACTGCAGCGGTCATTGTGATG
GATAAATCAACCGATGTTGTGGATGCGATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTACAAGCACGAA
AGCTGTGGGCAGTGCACTCCTTGCAGAGAGGGAACAGGTTGGCTCTGGATGATCATGGAG
AGAATGAAAGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTC**GAGGTAACCAAG
CAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCATTGGGTGATGCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGC
CTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAG
TTGCTACAGGCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTAACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGA
TGGAAATAAAATTTGAAGCACATTATTAGGGTTTTGGGGATGCAAAACTACTTCAGAAGG
AGAAGAAGGTAATGTATTTGTTGAAATGGTTCATGTTGAACTTTAATCAAACTGTATCAG
AAAGAGACTGTTTGCTCTTTTGCGTATTCTACTTTCTTTCAATGCGTGTTTGTTTTTCTC
ATGACTATGCTGAGATCACATTTTGGGAACAACCAACCAAAGAAAACCTTTTCATATTTG

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 6

CO CL1424Contig1 413 6 5 U
GGAGGGTTTTCGAGTGTTTTCACGCCGTTCATCTTCGTCTTCTAGCTTCTCGCACTTGAG
CACTCGAAAACCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCCAAGAAGTACGGGCCT
GGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACACGGGCTAATCAGGAAGTATGGACTT
AACTGCTGTAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCATCAAGTACCGT
TAAAGAGCCGGTGTTGCTTATGCAGTCAGTTGCTGTCGTTTGGATTTTTTTTCTTAAAGC
TTTTGAATGTTGTACTGGATCTTATAAATGCTTTATGATTTCCTCGTTGAACAATTGAGC
TTTCCTTGTTTTATCAACAATTTTTGGTTCTACTACAATATTATTATCGTTCC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF86JQ C 1
AF RR4G326JQ C 202
AF RR4G326TF U 202
AF RR4FZ83JQ C 40
AF RR4DF86TF U 24
AF RR4FZ83TF U 1
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CACTCGAAAACCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCCAAGAAGTACGGGCCT
GGTTCCCGCCCCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACACGGGCTAATCAGGAAGTATGGACTT
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TTTTGAATGTTGTACTGGATCTTATAAATGCTTTATGATTTCCTCGTTGAACAATTGAGC
TTTCCTTGTTTTATCAACAATTTTTGGTTCTACTACAATATTATTATCGTTCC

QA 1 413 1 413
DS 

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G
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TATAAATGCTTTATGATTTCCTCGTTGAACAATTGAGCTTTCCTTGTTTTATCAACAATT
TTTGGTTCTACTAC

QA 2 195 2 195
DS 

RD RR4G326TF 195 0 0
G
GCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGAGCCGGTGTTGCTTATG
CAGTCAGTTGCTGTCGTTTGGATTTTTTTTCTTAAAGCTTTTGAATGTTGTACTGGATCT
TATAAATGCTTTATGATTTCCTCGTTGAACAATTGAGCTTTCCTTGTTTTATCAACAATT
TTTGGTTCTACTAC

QA 2 195 2 195
DS 

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TTCTAGCTTTTCGCACTTGAGCACTCGAAAACCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCT
CATCCCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCCCCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACACGGG
CTAATCAGGAAGTATGGACTTAACTGCTGTAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAA
ATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGAGCCGGTGTTGCTTATGCAGTCAGTTGCTGTCGT
TTGGATTTTTTTTTTTAAAGCTTTTGAATGTTGTACTGGATTTTATAAATGCTTTATGAT
TTCCTCGTTGAACAATTGAGCTTTCCTTGTTTTATCAACAATTTTTGGTTTTACTACA

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4DF86TF 383 0 0
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TGCGATCTGGAACTCTCATCCCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTG
CGGAAACTCACACGGGCTAATCAGGAAGTATGGACTTAACTGCTGTAGACAGTGCTTCCG
CAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGAGCCGGTGTTGCTTATGC
AGTCAGTTGCTGTCGTTTGGATTTTTTTTCTTAAAGCTTTTGAATGTTGTACTGGATCTT
ATAAATGCTTTATGATTTCCTCGTTGAACAATTGAGCTTTCCTTGTTTTATCAACAATTT
TTGGTTCTACTACAATATTATTA

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR4FZ83TF 397 0 0
GGAGGGTTTTCGAGTGTTTTCACGCCGTTCATCTTCGTCTTCTAGCTTCTCGCACTTGAG
CACTCGAAAACCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCCAAGAAGTACGGGCCT
GGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACACGGGCTAATCAGGAAGTATGGACTT
AACTGCTGTAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCATCAAGTACCGT
TAAAGAGCCGGTGTTGCTTATGCAGTCAGTTGCTGTCGTTTGGATTTTTTTTCTTAAAGC
TTTTGAATGTTGTACTGGATCTTATAAATGCTTTATGATTTCCTCGTTGAACAATTGAGC
TTTCCTTGTTTTATCAACAATTTTTGGTTCTACTACA

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 5

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GTGCAGTAAACCGGGTCCAACAGTCAAATTGAGTTTGATTTCTGAATTGTCCAAACCAAA
ATAAGCAGAAAAAGTTATCACTGTGTTGTTAATCGTTCTTTGCTATAAGAGCTTTGGGTT
CAATGGTAAATCTATTTTAACAGATAAATAGAAGTAAAAAACAATAACTTACTACGTACT
TTCATCATCCTGAAGTCGCAGCGTCTAAAACAAATTCGCCAGAAGCATTATTGCCAAGTT
AGAAGCTCCCTTGTTGATCTTCACCATCCCTTTTGGATTCATTAAGCATTATCAATCATT
TCAGTGTCTGAATCTTCTTTCTCCCGGTGATTGGACTCTGTAGTAGCAGACACAGATGAA
GTAGTAATGTCCGAACAAGGAGGATCAACAGCCGTTGGATCTTCTTTACCATTTGCTGCT
GCTGCTTCTTCTTGATGATCATGTTCCATGTCAATACAAGGGTTTGATTCAGAATCTACT
GTATCAATTCTTTCGTTTTCGGTGACAGTTACGGATGATGATTCTTTTTTGCATTCATGG
TCTTCTGAATGTGAGATGATGCCGTTGCACAGAGAGGACGACACACCGGTGCCACTTGTT
CCGACCCCGGAACTCTCAACAGATCCATCTTGGCAATTAGATTCTGTGTTCAACGTATCT
GTTTTCTTCTCCTCTTCAACTTCTTCTTCGGGTCTAAGACTTGATGGTCTGGTCTGAACC
CTGCTGTAGAGGAGCATGTATGCACGTTGAGAAAGGACGTCTTCTAGTTCAACCTTTTCC
ACGTCAGAATCGTCTAATCTATACCAGTCACCTCGGAAGTCCTTAACGTAGTATGTAGTG
GCCGAAGAACGAGGCATTCAACATATCTAAATGGACAATCACAGCGTAGAGTTTGTATAC
ATCTGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4EM57JQ U 1
AF RR4F118JQ U 1
AF RR4BZ28JQ U 97
AF RR4EM57TF C 365
AF RR4F118TF C 675
BS 1 578 RR4EM57JQ
BS 579 651 RR4F118JQ
BS 652 780 RR4BZ28JQ
BS 781 869 RR4EM57TF
BS 870 870 RR4F118TF
BS 871 964 RR4EM57TF
BS 965 969 RR4F118TF

RD RR4EM57JQ 578 0 0
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TTCATCATCCTGAAGTCGCAGCGTCTAAAACAAATTCGCCAGAAGCATTATTGCCAAGTT
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GCTGCTTCTTCTTGATGATCATGTTCCATGTCAATACAAGGGTTTGATTCAGAATCTACT
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QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4F118JQ 651 0 0
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GTGCAGTAAACCGGGTCCAACAGTCAAATTGAGTTTGATTTCTGAATTGTCCAAACCAAA
ATAAGCAGAAAAAGTTATCACTGTGTTGTTAATCGTTCTTTGCTATAAGAGCTTTGGGTT
CAATGGTAAATCTATTTTAACAGATAAATAGAAGTAAAAAACAATAACTTACTACGTACT
TTCATCATCCTGAAGTCGCAGCGTCTAAAACAAATTCGCCAGAAGCATTATTGCCAAGTT
AGAAGCTCCCTTGTTGATCTTCACCATCCCTTTTGGATTCATTAAGCATTATCAATCATT
TCAGTGTCTGAATCTTCTTTCTCCCGGTGATTGGACTCTGTAGTAGCAGACACAGATGAA
GTAGTAATGTCCGAACAAGGAGGATCAACAGCCGTTGGATCTTCTTTACCATTTGCTGCT
GCTGCTTCTTCTTGATGATCATGTTCCATGTCAATACAAGGGTTTGATTCAGAATCTACT
GTATCAATTCTTTCGTTTTCGGTGACAGTTACGGATGATGATTCTTTTTTGCATTCATGG
TCTTCTGAATGTGAGATGATGCCGTTGCACAGAGAGGACGACACACCGGTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4BZ28JQ 690 0 0
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TCTTCGCTATAAGAGCTTTGGGTTCAATGGTAAATCTATTTTAACAGATAAATAGAAGTA
AAAAACAATAACTTACTACGTACTTTCATCATCCTGAAGTCGCAGCGTCTAAAACAAATT
CGCCAGAAGCATTATTGCCAAGTTAGAAGCTCCCTTGTTAATCTTCACCATCCCTTTTGG
ATTCATTAAGCATTATCAATCATTTCAGTGTCTGAATCTTCTTTCTCCCGGTGATTGGAC
TCTGTAGTAGCAGACACAGATGAAGTAGTAATGTCCGAACAAGGAGAATCAACAGCCGTT
GGATCTTCTTTACCATTTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTGATGATCATGTTCCATGTCAATA
CAAGGGTTTGATTCAGAATCTACTGTATCAATTCTTTCGTTTTCGGTGACAGTTACGGAT
GATGATTCTTTTTTGCATTCATGGTCTTCTGAATGTGAGATGATGCCGTTGCACAGAGAG
GACGACACACCGGTGCCACTTGTTCCGACCCCGGAACTCTCAACAGATCCATCTTGGCAA
TTAGATTCTGTGTTCAACGTATCTGTTTTCTTCTCCTCTTCAACTTCTTCTTCGGGTCTA
AGACTTGATGGTCTGGTCTGAACC
CTGCTG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EM57TF 600 0 0
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TAATGTCCGAACAAGGAGGATCAACAGCCGTTGGATCTTCTTTACCATTTGCTGCTGCTG
CTTCTTCTTGATGATCATGTTCCATGTCAATACAAGGGTTTGATTCAGAATCTACTGTAT
CAATTCTTTCGTTTTCGGTGACAGTTACGGATGATGATTCTTTTTTGCATTCATGGTCTT
CTGAATGTGAGATGATGCCGTTGCACAGAGAGGACGACACACCGGTGCCACTTGTTCCGA
CCCCGGAACTCTCAACAGATCCATCTTGGCAATTAGATTCTGTGTTCAACGTATCTGTTT
TCTTCTCCTCTTCAACTTCTTCTTCGGGTCTAAGACTTGATGGTCTGGTCTGAACCCTGC
TGTAGAGGAGCATGTATGCACGTTGAGAAAGGACGTCTTCTAGTTCAACCTTTTCCACGT
CAGAATCGTCTAATCTATACCAGTCTCCTCGGAAGTCCTTAACGTAGTATGTAGTGGCCG
AAGAACGAGGCATTCAACATATCTAAATGGACAATCACAGCGTAGAGTTTGTATACATCT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4F118TF 295 0 0
TCTC
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ACTTCTTCTTCGGGTCTAAGACTTGATGGTCTGGTCTGAACC*TGCTGTAGAGGAGCATG
TATGCACGTTGAGAAAGGACGTCTTCTAGTTCAACCTTT*CCACGTCAGAATCGTCTAAT
CTATACCAGTCACCTCGGAAGTCCTTAACGTAGTATGTAGTGGCCGAAGAACGAGGCATT
CAACATATCTAAATGGACAATCACAGCGTAGAGTTTGTATACATCTGATCC

QA 5 295 5 295
DS 



AS 1 5

CO CL1426Contig1 1123 5 9 U
GAAACCCCCTTTTCTCACCATCTTCCCCTCTCTTCTCCGCGACATTAGCAAAGTTTCGAG
AGAAAAAAAAAAGATGAATCTCAACAACGTGAAAGTGCCGAAGGTGCCAGGAGGTGGTCC
AGTATCAGCGTTGCTTAAGATTGGGATTATCGGTGGGCTTGGTCTCTACGGTGCCACACA
CAGTCTCTACAATGTCGACGGAGGTCATCGAGCCATCATGTTCAACCGTTTAGTCGGTGT
TAAAGATAAGGTTTACCCTGAGGGTACACACCTTATGGTCCCTTGGTTCGAAAGGCCTGT
CATCTATGACGTTCGTGCACGACCTTACCTTGTTGAGAGTACTTCCGGAAGCCGTGATCT
CCAGATGGTGAAAATTGGGCTGAGGGTTCTCACGCGTCCCATGGCAGACCAGTTACCTGA
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GACTTTGAAAGCTGTTGTTGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTTATCACTCAGAGAGAGGC
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TCAGGCAATCGCAAACAACCAAGCCTTCATAACGCTCAGGAAGATCGAGGCGGCAAGAGA
GATTGCTCAGACCATAGCTCACTCGGCCAACAAGGTGTACCTGAGCTCTGACGATCTTTT
GCTTAACCTACAGAAGATGAATTTGGATGTGGATCCAAAGTAGAGAGAGCCTTCTTTAAG
TAAACACATATGTGGTGGTTTGTGTCAAGTCTTTTCAATTCCCTTGCAACAAAAAGCTGA
GATCTTTGGATTGTTAAATACGTTTTAAGTTGTTCTTTTGATCTCATGTTATAAGCCTTC
TTCCATCAAAAAAGAAAAGGAAGAAGAAACTGTCTTTGCTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EA57TF U 1
AF RR4BF44TF U 426
AF RR4BF44JQ C 421
AF RR4EA57JQ C 569
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GG
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G

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DS 



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TATTGTTGTATTTCCCTTTTATACATTTTAAATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY30TF U 1
AF RR4EY12TF U 9
AF RR4EE37TF U 59
AF RR4EE37JQ C 302
BS 1 251 RR4BY30TF
BS 252 252 RR4EY12TF
BS 253 253 RR4BY30TF
BS 254 255 RR4EY12TF
BS 256 257 RR4BY30TF
BS 258 258 RR4EY12TF
BS 259 266 RR4BY30TF
BS 267 267 RR4EY12TF
BS 268 280 RR4BY30TF
BS 281 281 RR4EY12TF
BS 282 294 RR4BY30TF
BS 295 295 RR4EY12TF
BS 296 298 RR4BY30TF
BS 299 299 RR4EY12TF
BS 300 319 RR4BY30TF
BS 320 321 RR4EY12TF
BS 322 325 RR4BY30TF
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BS 327 453 RR4BY30TF
BS 454 454 RR4EE37TF
BS 455 464 RR4BY30TF
BS 465 465 RR4EY12TF
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BS 496 552 RR4BY30TF
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BS 554 582 RR4BY30TF
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BS 641 651 RR4BY30TF
BS 652 652 RR4EE37TF
BS 653 657 RR4BY30TF
BS 658 658 RR4EY12TF
BS 659 663 RR4BY30TF
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BS 674 676 RR4BY30TF
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BS 678 692 RR4BY30TF
BS 693 700 RR4EE37TF
BS 701 701 RR4EE37JQ
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BS 726 726 RR4EE37JQ
BS 727 751 RR4EE37TF
BS 752 874 RR4EE37JQ

RD RR4BY30TF 692 0 0
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ATTGGCCATGAAGAATCTCTCATTTCTTGCAGTTCTATCTCTCTTAGCTTTAACGCTTCC
ATTCGCCATTGCTTCTGACCCAAGCCCCCTTCAAGACTTCTGCGTCGCCGTCAACACCCC
AGCAAATGGTGTGTTTGTGAATGGAAAGTTCTGCAAAGACCCAAAGCTTGTCACCGTGGA
TGACTTCTTTACGTCAGGCCTTCAAAACGCAAGACCCATAGCTAATGTAGTCGGATCGAC
TGTCACTCCCGTTAACGTCACCAACATTCCAGGGTTAAACACCCTTGGCATCTCACTTGT
CCGTATAGATTATGGAGTAAATGGACAAAACCCACCTCACACCCACCCACGTGCTACCGA
GATCCTGTATGTTGGACATGGAACACTTCTTGTAGGATTTGTCATATCGAACGGAGATGG
GAACCGTCTGTTCAAAAAGACACTCAACGAGGGTGATGTATTTGTGTTTCCAGAAGGACT
AATTCATTTCCAATTCAATGTGGGACGTTTTCCTGCGGTTGC*TTCGCTGCTCTGAGCAG
CCAAAACCCAGGTGTTGTCACTATTGCCAACTCTGTGTTCGGGTCTAACCCCGCGAT*GA
CCCGAATGTTCTTGCA*GAGCATTTCAGTTGG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4EY12TF 658 0 0
GGA
TATAAATCTAATTTAAGAAAAACTATAATTGTATTAAGTTAATATATATATTGGCCATGA
AGAATCTCTCATTTCTTGCAGTTCTATCTCTCTTAGCTTTAACGCTTCCATTCGCCATTG
CTTCTGACCCAAGCCCCCTTCAAGACTTCTGCGTCGCCGTCAACACCCCAGCAAATGGTG
TGTTTGTGAATGGAAAGTTCTGCAAAGACCCAAAGCTTGTCACCGTGGATGACTTCTTTA
TGAAAGACCTTCAAATCGCGAGACCCATAACTAATGTAGTCGGGTCGGCTGTCACTCCCG
TTAACGTCGACAACCTTCCAGGGTTAAACACCCTTGGCATCTCACTTGTCCGTATAGATT
ATGGAGTAAATGGACAAAACCCACCTCACACCCACCCACGTGCTACCGAGATCCTGTATG
TTGGACATGGAACACTTCTTGTAGGATTTGTCACATCCAACGGAGATGGGAACCGTCTGT
TCACAAAGACACTCAACGAGGGTGATGTATTTGTGTTTCCAGAAGGACTAATTCATTTCC
AGTTCAATGTGGGACGTTTTCCTGCGGTTGCATTCGCTGCTCTGAGCAGCCAAAACCCAG
GGGTTGTCGGTATTGCCAAATCTGTGTTTGGGTCTAACCCCGCGATTGACCCAAA

QA 4 658 4 658
DS 

RD RR4EE37TF 693 0 0
GG
ATTGGCCATGAAGAATCTCTCATTTCTTGCAGTTCTATCTCTCTTAGCTTTAACGCTTCC
ATTCGCCATTGCTTCTGACCCAAGCCCCCTTCAAGACTTCTGCGTCGCCGTCAACACCCC
AGCAAATGGTGTGTTTGTGAATGGAAAGTTCTGCAAAGACCCAAAGCTTGTCACCGTGGA
TGACTTCTTTATGAAAGACCTTCAAATCGCAAGACCCATAACTAATGTAGTCGGGTCGGC
TGTCACTCCCGTTAACGTCGACAACCTTCCAGGGTTAAACACCCTTGGCATCTCACTTGT
CCGTATAGATTATGGAGTAAATGGACAAAACCCACCTCACACCCACCCACGTGCTACCGA
GATCCTGTATGTTGGACATGGAACACTTCTTGTGGGATTTGTCACATCCAACGGAGATGG
GAACCGTCTGTTCACAAAGACACTCAACGAGGGTGATGTATTTGTGTTTCCAGAAGGACT
AATTCATTTCCAGTTCAATGTGGGACGTTTTCCTGCGGTTGCATTCGCTGCTCTGAGCAG
CCAAAACCCAGGGGTTGTCGGTATTGCCAAATCTGTGTTTGGGTCTAACCC*GCGATTGA
CCCAAATGTTCTCGCAAGAGCATTTCAGTTGGATCCAAAG*TGATCATGGATCTACAGGC
CAAGC*TAAGTTCTGATCATGAAATAAAAAA

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR4EE37JQ 573 0 0
GTCACTCCCGTTAACGTCGACAACCTTCCAGGGTTAAACACCCTTGGCATCTCACTTGTC
CGTATAGATTATGGAGTAAATGGACAAAACCCACCTCACACCCACCCACGTGCTACCGAG
ATCCTGTATGTTGGACATGGAACACTTCTTGTGGGATTTGTCACATCCAACGGAGATGGG
AACCGTCTGTTCACAAAGACACTCAACGAGGGTGATGTATTTGTGTTTCCAGAAGGACTA
ATTCATTTCCAGTTCAATGTGGGACGTTTTCCTGCGGTTGCATTCGCTGCTTTGAGCAGC
CAAAACCCAGGGGTTGTCGGTATTGCCAAATCTGTGTTTGGGTCTAACCC*GCGATTGAC
CCAAATGTTCTCGCAAGAGCATTTCAGTTGGATCCAAAGGTGATCATGGATTTACAGGCC
AAGGGTAAGTTCTGATCATGAAATAAAAAAATATTGTGGGAGCACTTTTATTTTTTTCTA
TCTTTTGTTTGAATAAGGATCATGTATTATCCGTTCATCAGTAATGTGACATGATGTTAT
ATTGTTGTATTTCCCTTTTATACATTTTAAATG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 2 6

CO CL1428Contig1 680 2 2 U
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TCCTTTTTGCTGAGATCTAAACCATGGCGGATGTTGAACCAGAGGTTGCTGCTGCCGGAG
TCCCTAAGAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGTGTCGATCTCGATGCTCTTC
TTGACATGTCTACTGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGCAGAAGGTTCT
CAAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTCATTAAGAAGCTGCGTAAGGCCAAAAGGG
AGGCACCACAAGGTGAGAAGCCAGAGCCAGTGAGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTG
TCCCAGAGATGATCGGAAGCATCATTGGGGTGTACAATGGAAAGACCTTTAACCAGGTCG
AGATCAAGCCTGAGATGATTGGTCACTACTTGGCTGAGTTCTCCATCTCGTACAAGCCGG
TTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGGTTCATTCCTCTCAAGT
GAAGAAGAGCTTATATTGCTGCTTGTGGAATGTGTTCCTTCATCGTTATATGGTCTTTGC
TTTGAGTTGTCTCTTATGTATTCGGATCCTTTTTATTTTTTTGCATTTGTTTTTGCTTTA
TGATGAAACTACTTTTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DO80TF U 1
AF RR4DO80JQ C 199
BS 1 679 RR4DO80TF
BS 680 680 RR4DO80JQ

RD RR4DO80TF 680 0 0
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TCCTTTTTGCTGAGATCTAAACCATGGCGGATGTTGAACCAGAGGTTGCTGCTGCCGGAG
TCCCTAAGAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGTGTCGATCTCGATGCTCTTC
TTGACATGTCTACTGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGCAGAAGGTTCT
CAAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTCATTAAGAAGCTGCGTAAGGCCAAAAGGG
AGGCACCACAAGGTGAGAAGCCAGAGCCAGTGAGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTG
TCCCAGAGATGATCGGAAGCATCATTGGGGTGTACAATGGAAAGACCTTTAACCAGGTCG
AGATCAAGCCTGAGATGATTGGTCACTACTTGGCTGAGTTCTCCATCTCGTACAAGCCGG
TTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGGTTCATTCCTCTCAAGT
GAAGAAGAGCTTATATTGCTGCTTGTGGAATGTGTTCCTTCATCGTTATATGGTCTTTGC
TTTGAGTTGTCTCTTATGTATTCGGATCCTTTTTATTTTTTTGCATTTGTTTTTGCTTTA
TGATGAAACTACTTTTAGA
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DO80JQ 482 0 0
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AGCCAATGGCTCTCATTAAGAAGCTGCGTAAGGCCAAAAGGGAGGCACCACAAGGTGAGA
AGCCAGAGCCAGTGAGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTGTCCCAGAGATGATCGGAA
GCATCATTGGGGTGTACAATGGAAAGACCTTTAACCAGGTCGAGATCAAGCCTGAGATGA
TTGGTCACTACTTGGCTGAGTTCTCCATTTCGTACAAGCCGGTTAAGCACGGTAGGCCTG
GTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGGTTCATTCCTCTCAAGTGAAGAAGAGCTTATATTG
CTGCTTGTGGAATGTGTTCCTTCATCGTTATATGGTCTTTGCTTTGAGTTGTCTCTTATG
TATTCGGATCCTTTTTATTTTTTTGCATTTGTTTTTGCTTTATGATGAAACTACTTTTAG
AC

QA 1 482 1 482
DS 



CO CL1428Contig2 712 4 6 U
GGACTCTTCGCAAAGACCTAATAAAACTTCCTCAAGCTTTTTAGCCGTTTTAGGGTTTTA
TCCTTTCTCTGAGATCTAAACCATGGCGGATGTTGAACCAGAGGTTGCTGCTGCCGGAGT
CCCAAAGAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGTGTCGATCTCGATGCTCTTCT
TGACATGTCTACCGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGCATTCGCAGAAGGTTCTC
AAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTCATTAAGAAGCTCCGTAAGGCGAAAAGGGA
GGCACCACAAGGTGAGAAGCCAGAGCCAGTGAGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTGT
CCCAGAGATGATTGGAAGCATCATCGGAGTGTACAATGGAAAGACCTTTAACCAAGTCGA
GATCAAGCCTGAGATGATT*GGTCACTACTTAGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCGG
TTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGGTTCATTCCTCTCAAGT
GAAGAGCTTATATTGCTGCTTGGGG*AATGTGCTCCTTCATCGTTATATGGTCTTTGCTT
T*GAGTTGTCTTCTATGTATTCGGATCCTTTTTTTTTCTGCATTTGTTTTTGCTTTATGA
TGAAACTACTTTTAGATACTTTGTTAAATTTATTATGCTCATGCATTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4AT54TF U 169
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T
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TCGC

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DS 



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TCAACTCTTGAGTTGACCTCATTCGCAATTGGTTGTACGAATCTTCAAGAATGTAGGCTC
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ACGACTTCTCAAGCAGAGCAGGATTTTGTCGGATGAATGC


BQ
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AF RR4EB05JQ U 1
AF RR4A580JQ U 1
AF RR4DT63JQ U 1
AF RR4EB05TF C 386
AF RR4A580TF C 545
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QA 1 697 1 697
DS 

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GTATTAGCTTTTCCTCATCAGCATCAACGCTAAAAGTGAGATCTAGGACATCGCTAATAT
CATTCTCCAGCA

QA 1 792 1 792
DS 

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ATTCCTTGAAGGGCACTAAATCCTTCCAGAGGAACCTTGGAGGTTCCAGTCACAAACTGC
AATAGACGGGCTTTGTCTTCTTTGCTCAATCCCTGAACAACCTCCC*AGAACCACTGGAT
AACAGGGGATCCAGGACTGTACCCAGAATATTCAGTATTCGCCCTCAGGTTATCCAAGTC
GATATCAGGAAGACCACTTATTAATAACTCCAGTTCCTTGTCGTTAAAAATTGATATTAA
GTCTTTAAGTATAAGTTCACTAAACC*CTTCCAGGAATGCATTTATCTGAGGACGAATGG
CTGTGGTTAATCGATGCTCGGCGATTAGGTCTACATATTCATGCTTATTCTCCTCTGTAA
CTTTGATGTTCCGGCCTCCAGGGATCAGTTCATGGTCAGTCACCTCCGTTTTCTCATACA
GTATTAGCTTTTCCTCATCAGCATCAACGCTAAAAGTGAGATCTAG*ACATCGCTAATAT
CATTCTCCAGCATCCATT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4EB05TF 612 0 0
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AACTCCAGTTCCTTGTCGTTAAAAATTGATATTAAGTCTTTAAGTATAAGTTCACTAAAC
CTCTTCCAGGAATGCATTTATCTGAGGACGAATGGCTGTGGTTAATCGATGCTCGGCGAT
TAGGTCTACATATTCATGCTTATTCTCCTCTGTAACTTTGATGTTCCGGCCTCCAGGGAT
CAGTTCATGGTCAGTCACCTCCGTTTTCTCATACAGTATTAGCTTTTCCTCATCAGCATC
AACGCTAAAAGTGAGATCTAGGACATCGCTAATATCATTCTCCAGCATCCATTTCAGGGC
TTTATAGTAATCGGGATCTATAGCTTCAATATCATGGTACGTGACCTTAACTCCCAAGAT
ATGCTTGTAAAATGAACGAGTGAAATGGACGTCAAGTAGTTGACCATCAAACAGAGCTTT
TCCAACCACACGGCCAACAAATTTGAAGTAAGAGAGGTGCTCTGTCTGGTAAACAGAGTT
TGGATTCGGTT
C

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4A580TF 816 0 0
TTAAGTATAAGTTCACTAAACC**TTCCAGGAATGCATTTATCTGAGGACGAATGGCTGT
GGTTAATCGATGCTCGGCGATTAGGTCTACATATTCATGCTTATTCTCCTCTGTAACTTT
GATGTTCCGGCCTCCAGGGATCAGTTCATGGTCAGTCACCTCCGTTTTCTCATACAGTAT
TAGCTTTTCCTCATCAGCATCAACGCTAAAAGTGAGATCTAGGACATCGCTAATATCATT
CTCCAGCATCCATTTCAGGGCTTTATAGTAATCGGGATCTATAGCTTCAATATCATGGTA
CGTGACCTTAACTCCCAAGATATGCTTGTAAAAAGAACGAGTGAAATGGACGTCAAGTAG
TTGACCATCAAACAGAGCTTTTCCAACCACACGGCCAACGAATTTGAAGTAAGAGAGGTG
CTCTGTCTGGTAAACAGAGTTTGGATTCGGTTGGAAAGTCGAGTCATTGCCAACGGTTGT
GAACAGAAGAGCTCCTTTGTCAAAAATAACCCTTGACAATAGATGATACCATTCCCTGGT
AAGCCCACCAGCATCAATGCCTTCTTCTCCTTGGAAGTGAACAGTCAATCTACCTTTCAA
CTCTTGAGTTGACCTCATTCGCAATTGGTTGTACGAATCTTCAAGAATGTAGGCTCTTCT
CACTGAGATTCTCAAAGGGCTGTGGTGATGGTCATGCTGGTGTTTTATCTTTGATCTGAA
GTATGCACGTTTGTTATCAAATTCAATAAAACGTGGAACCTTGAGCATTAGTGAAAACGA
CTTCTCAAGCAGAGCAGGATTTTGTCGGATGAATGC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 4

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GGAAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTAT
CGTATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTAT
GGGTCATCTAAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAA
ACATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTAAGCTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCT
CGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAG
TCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTT
CAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGAT
TTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAACGAGGATGGTTC
CCTACTTGAGGCAATCTACCAGGCCCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGAT
ATATGTGTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGGTC
TTTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCTGCTG
CACAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGGATGA
AGAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTAAGCTCCGCAGTCT
GTAGAAATTCTGTATATCATCCATGTTAGATGTTATGCTCTCTAGTTTCTAGGCTTGTGA
ATCCAAGTCCAAGGTTAAGCTCTTCGCTTTCCTTTATCTGTGTAGTTAACGTATACTCTG
TACCTTCCAATAAGCTTATCAGAGACTTTGTTGTAATCTGATGTCCCTAAATAATGAGAC
AAAAAATGTTGTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD18TF U 1
AF RR4GU13TF U 318
AF RR4EB59TF U 1
AF RR4FD18JQ C 315
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BS 787 976 RR4FD18JQ

RD RR4FD18TF 640 0 0
GGAACA
AAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTATCGTATC
TTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTTTTTATGGGTCA
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TGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCTCGGGAA
ATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAGTCGAAA
GGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTTCAGCGC
TGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTTTTAA
CAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAACGAGGATGGTTCCCTACT
TGAGGCAATCTACCAGGCCCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATATATGT
GTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGGTCTTTCTG
TTTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTT

QA 7 640 7 640
DS 

RD RR4GU13TF 441 0 0
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ATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTTTTAACAACTATATGT
TTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAACGAGGATGGTTCCCTACTTGAGGCAATCT
ACCAGGCCCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATATATGTGTACAACCCCA
ATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGGTCTTTCTGTTTCTTATTCT
ACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGG*TTTCGTTTCTGCTGCACAAGTAACCTGGCAA
GTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGGATGA*GAGATCTTTGACGACA
TGGATATGTGATCTCTCTAT
C

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4EB59TF 786 0 0
GGAAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTAT
CGTATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTAT
GGGTCATCTAAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAA
ACATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTAAGCTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCT
CGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCTGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAG
TCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTT
CAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGAT
TTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTC
CCTACTTGAGGCAATCTACGAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGAT
ATATGTGTACAACCCGAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCGATATGGTC
TTTCTGTTTCTTGTTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCTGCTG
CATAAGCAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGGATGA
AGAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTGAGCTGCGCAGTCT
GTAGAA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4FD18JQ 662 0 0
TCT
ACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTTCAGCGCTGTGAAAGCAC
ATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTTTTAACAACTATATGT
TTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAACGAGGATGGTTCCCTACTTGAGGCAATCT
ACCAGGCCCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATATATGTGTACAACCCCA
ATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGGTCTTTCTGTTTCTTATTCT
ACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCTGCTGCACAAGTAACCTGGCAA
GTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGGACGAGGAGATCTTTGACGACA
TGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTAAGCTCCGCAGTCTGTAGAAATTCTGTATAT
CATCCATGTTAGATGTTATGCTCTCTAGTTTCTAGGCTTGTGAATCCAAGTCCAAGGTTA
AGCTCTTCGCTTTCCTTTATCTGTGTAGTTAACGTATACTCTGTACCTTCCAATAAGCTT
ATCAGAGACTTTGTTGTAATCTGATGTCCCTAAATAATGAGACAAAAAATGTTGTGACC

QA 4 662 4 662
DS 



AS 1 6

CO CL1431Contig1 1243 6 11 U
GAGTCTGTCAATAACCCTTTCGTCACGGAATTACTCCAAGCCGCGTAGTGATCGACTCCA
AAATCATCCTCTCTTTATGGCTCTCCGATTTTGAGTTTTCAGGGTCTTGAAATCTTGGAG
AAGTGTTTGCGGAATCAATTTCTCATGGCGAGTTTCTGTTGCTTCGGTTCTTCAGACTAC
GATCTCGTGACTGGGAGGGCGTCATCTAGTTCTGGGAAAGGAAAAAACAGCGATGGTGAG
ATTAAATTTGGTTACAGCTTGGTGAAAGGGAAAGCTAATCATCCAATGGAAGATTACTAT
GTCTCCAAATTCACGAAAGTTGATGGGAAGGAGCTCGGTTTGTTTGCTATCTACGATGGT
CATTTGGGCGAACGTGTTCCTGCTTATCTTCAGAAGCATTTGTTCTCCAACATTCTCAAA
GAGGAGCATTTTTGGTATGATACTCAGAGAGCACTAATTGCTGCCTATGAGAAGACAGAC
CAAACCATTCTGTCACATTCTGACCTAGGCCGTGGTGGCTCAACCGCTGTAACCGCTATT
CTGCTGGATGGACGACGTTTGTGGGTGGCAAATGTGGGTGATTCCCGGGCTGTTTTGTCA
CGAGGTGGTCAGGCAATACAGATGACTGTTGATCACGAGCCCCACACTGAAAGGTTAAGC
ATTGAGGATAAAGGAGGCTTCGTATCAAACATGCCAGGAGATGTGCCTCGTGTTAACGGG
CAGCTAGCAGTTTCCCGTGCTTTTGGGGACAAAAGCCTCAAAACACATCTGCGGTCAGAT
CCAGACGTTAAAGATTCATCGATAGATGCTCACACAGATGTTCTAGTTCTTGCTAGTGAC
GGTCTATGGAAGGTGATGGCTAGCCAAGAGGCGATTGATATCGCCAGAAGAATCAAAGAT
CCAGTGAAAGCAGCAAAATAACTAACGACCGAAGCACTAAGAAGAGACAGCAAAGATGAT
ATATCTTGCATCGTCGTCAGATTGAGGTGATGGAATTTTATTCTACAAAACCACCAGAAA
ACAAAAGGATGAAACTTATTAGAAATGGAATAAACCAAATAAATAAAGTTTGATTATCAA
GAATAGAAGACGATGTAAAATGTATTTTTAATATATTTTTGTTTCCTCCGGTGTAAAATG
GTTGATCGGTTTTCCGGATGTTTGGTAATTTGATTGGTTTGATTTGTGTAAGTGAGTGAG
AATCATATTATTTGGTGTATAAACACAACTTTTTTTTTGCTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ63TF U 1
AF RR4DT81TF U 1
AF RR4F810TF U 144
AF RR4F810JQ C 563
AF RR4DT81JQ C 679
AF RR4DZ63JQ C 679
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BS 609 852 RR4F810TF
BS 853 853 RR4F810JQ
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AAGTGTTTGCGGAATCAATTTCTCATGGCGAGTTTCTGTTGCTTCGGTTCTTCAGACTAC
GATCTCGTGACTGGGAGGGCGTCATCTAGTTCTGGGAAAGGAAAAAACAGCGATGGTGAG
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CATTTGGGCGAACGTGTTCCTGCTTATCTTCAGAAGCATTTGTTCTCCAACATTCTCAAA
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CGAGGTGG

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AC

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CTTC

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TTAGAAATGGAATAAACCAAATAAATAAAGTTTGATTATCAAGAATAGAAGACGATGTAA
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ATAAACACAACTTTT
TTTTTG

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DS 



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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CE46JQ C 2
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4CE46TF 586 0 0
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AACTTCACTCTTTCAACAATGGCTTACTCTAAGATTGCTCTTCTCCTTGTTTTGAATGTC
ATCTTCTTCACTTTGGTCAGTTCTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCAC
GACAAGAAACCCTCACCGTCGTCTCCTTACACCAAACCCAGTTGCAAAGATGCTCTTAAA
CTCAAGGTATGTGCCAACGTGTTGAATTTGGTTAAGGTTTCTCTACCAGAAAAGGCCGAA
TGTTGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTCGATGCTGGGGTCTGTCTCTGCACCGCT
TTGAAGGCTAATGTCCTTGGCATTAATCTTCATGTTCCTATTTCACTGAGTGTTCTCCTT
AACCAGTGTGGTACGAAGGTTCCATCTGGTTTCCAATGTGCTTAGAGATAGCACGTTATT
AAATCGATGTTCTAAATTATCACTTGAATACGATTGTTGTTTTAAAATTTCGTGTAATTT
CAAATTTTCTTGTTTTATTCTACTATTATCTATTGTTTGTAATCCG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4BR03JQ 628 0 0
GGGATCACACAACATCACAAGCTTGATAAAGAGAAATAACTTTCTAAGAGAAAAATCTTA
AAACTTCACTCTTTCAACAATGGCTTACTCTAAGATTGCTCTTCTCCTTGCTTTGAATGT
CATCTTCTTCACTTTGGTCAGTTCTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCA
CGACAAGAAACCCTCACCGTCGTCTCCTTACACCAAACCCAGTTGCAAAGATGCTCTTAA
ACTCAAGGTATGTGCCAACGTGTTGAATTTGGTTAAGGTTTCTCTACCAGAAAAGGCCGA
ATGTTGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTCGATGCTGGGGTCTGTCTCTGCACCGC
TTTGAAGGCTAATGTCCTTGGCATTAATCTTCATGTTCCTATTTCACTGAGTGTTCTCCT
TAACCAGTGTGGTACGAAGGTTCCATCCGGTTTCCAATGTGCTTAGAGATAGCACGTTAT
TAAATCGATGTTCTAAATTATCACTTGAATACGATTGTTGTTTTAAAATTTCGTGTAATT
TCAAATTTTCTTGTTTTATTCTACTATTATCTATTGTTTGTAATCCGCTACATGTTTTAT
TGATGAAATAATTAAGGTGTTTTCATTT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4BR03TF 628 0 0
G
GGATCACACAACATCACAAGCTTGATAAAGAGAAATAACTTTCTAAGAGAAAAATCTTAA
AACTTCACTCTTTCAACAATGGCTTACTCTAAGATTGCTCTTCTCCTTGCTTTGAATGTC
ATCTTCTTCACTTTGGTCAGTTCTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCAC
GACAAGAAACCCTCACCGTCGTCTCCTTACACCAAACCCAGTTGCAAAGATGCTCTTAAA
CTCAAGGTATGTGCCAACGTGTTGAATTTGGTTAAGGTTTCTCTACCAGAAAAGGCCGAA
TGTTGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTCGATGCTGGGGTCTGTCTCTGCACCGCT
TTGAAGGCTAATGTCCTTGGCATTAATCTTCATGTTCCTATTTCACTGAGTGTTCTCCTT
AACCAGTGTGGTACGAAGGTTCCATCCGGTTTCCAATGTGCTTAGAGATAGCACGTTATT
AAATCGATGTTCTAAATTATCACTTGAATACGATTGTTGTTTTAAAATTTCGTGTAATTT
CAAATTTTCTTGTTTTATTCTACTATTATCTATTGTTTGTAATCCGCTACATGTTTTATT
GATGAAATAATTAAGGTGTTTTCATTT

QA 2 628 2 628
DS 



AS 1 6

CO CL1433Contig1 665 6 9 U
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ATATCCATGGCATACAGATACTACTTAAACCAACAGAGTCGCATGACACATTAAAAAAAA
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TCTTAATACTAAAATTACTTATTGGCTTCCACGAGCTCTTCAATGAGCTCAGCAGCTTGC
TCCACAGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCAGCCATTTCGATGCCAAACTCTTCCTCC
AAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGATCAGCAAATTTGGTT
TCTGCAACGACCTTTTGATCGTCTTTGAGTGAGAGTTGCTTCTTGACGATCTTAGACACT
TTCTCTACTGTCTCTGGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGAGAAGCGAGTGGGGATCGAACGG
CGCAGGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTGACACCAAAGCAGCTGGCTTCTGGAATGTTGCC
AGAGAAGTAGCTTGCATGGAGGAGACAGAAGAGCTGAAAGTGGTCGACATTGTCGATATT
CACGAGAGAGATCTGCTCGAGAGGGAGATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCGGAG
TGTCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BU77JQ U 65
AF RR4CF23TF C 1
AF RR4CF23JQ U 27
AF RR4A755JQ U 3
AF RR4BU77TF C 65
AF RR4A755TF C 3
BS 1 4 RR4CF23TF
BS 5 122 RR4A755JQ
BS 123 125 RR4CF23JQ
BS 126 276 RR4A755JQ
BS 277 277 RR4CF23JQ
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BS 348 348 RR4CF23JQ
BS 349 567 RR4A755JQ
BS 568 665 RR4A755TF

RD RR4BU77JQ 339 0 0
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QA 1 339 1 339
DS 

RD RR4CF23TF 442 0 0
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ATATCCATGGCATACAGATACTACTTAAACCAACAGAGTCGCATGACACATTAAAAAAAA
AA***GAAAAATGAGAGAAACATTATGAAAACAACAAACCCAACAAAGCCTTTGGTTCTC
TCTTAATACTAAAATTACTTATTGGCTTCCACGAGCTCTTCAATGAGCTCAGCAGCTTGC
TCCACAGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCAGCCATTTCGATGCCAAACTCTTCCTCC
AAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGATCAGCAAATTTGGTT
TCTGCAACGACCTTTTGATCGTCTTTGAGTGAGAGTTGCTTCTTGACGATCTTAGACACT
TTCTCTACTGTATCTGGTTT
CC

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4CF23JQ 416 0 0
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GAAAACAACAAACCCAACAAAGCCTTTGGTTCTCTCTTAATACTAAAATTACTTATTGGC
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GAGTGAGAGTTGCTTCTTGACGATCTTAAACACTTTCTCTACTGTATCTGGTTT
CC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4A755JQ 565 0 0
GG
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AAGTAGCTTGCATGGAGGAGACA

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4BU77TF 597 0 0
CCATGGCATACAGATACTACTTAAACCAACAGAGTCGCATGACACATTAAAAAAAAAA**
*GAAAAATGAGAGAAACATTATGAAAACAACAAACCCAACAAAGCCTTTGGTTCTCTCTT
AATACTAAAATTACTTATTGGCTTCCACGAGCTCTTCAATGAGCTCAGCAGCTTGCTCCA
CAGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCAGCCATTTCGATGCCAAACTCTTCCTCCAA*C
CCATCACTATC*CAACAGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGATCAGCAAATTTGGTTTCTG
CAACGACCTTTTGATCGTCTTTGAGTGAGAGTTGCTTCTTGACGATCTTAGACACTTTCT
CTACTGTCTCTGGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGAGAAGCGAGTGGGGATCGAACGGCGCA
GGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTGACACCAAAGCAGCTGGCTTCTGGAATGTTGCCAGAG
AAGTAGCTTGCATGGAGGAGACAGAAGAGCTGAAAGTGGTCGACATTGTCGATATTCACG
AGAGAGATCTGCTCGAGAGGGAGATTGAGAGAGAGAGAGAGAGA
TGGCGGAGTGTCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4A755TF 663 0 0
GG
AACAAGCTTTCCTTCATCATGTGTAACCAAAAGTTTTCAGTCGACAAATAGAGATGATAT
CCATGGCATACAGATACTACTTAAACCAACAGAGTCGCATGACACATTAAAAAAAAAAAA
AGAAAAATGAGAGAAACATTATGAAAACAACAAACCCAACAAAGCCTTTGGTTCTCTCTT
AATACTAAAATTACTTATTGGCTTCCACGAGCTCTTCAATGAGCTCAGCAGCTTGCTCCA
CAGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCAGCCGTTTCGATGCCAAACTCTTCCTCCAAAC
CCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGATCGGCAAATTTGGTTTCTG
CAACGACCTTTTGATCGTCTTTGAGTGAGAGTTGCTTCTTGACGATCTTAGACACTTTCT
CTACTGTCTCTGGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGAGAAGCGAGTGGGGATCGAACGGCGCA
GGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTGACACCAAAGCAGCTGGCTTCTGGAATGTTGCCAGAG
AAGTAGCTTGCATGGAGGAGACAGAAGAGCTGAAAGTGGTCGACATTGTCGATATTCACG
AGAGAGATCTGCTCGAGAGGGAGATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCGGAGTGTC
C

QA 3 663 3 663
DS 



AS 1 6

CO CL1434Contig1 594 6 5 U
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GTTTGGCTCCAACAACCCTATCAATCTCTTCTCCTCTCTTCACAAAAACAAAAGCTGGAA
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BQ
10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR4ES23JQ U 1
AF RR4ES23TF C 1
AF RR4A749JQ U 5
AF RR4AC06JQ U 5
AF RR4A749TF C 5
AF RR4AC06TF C 5
BS 1 175 RR4ES23JQ
BS 176 176 RR4A749JQ
BS 177 443 RR4ES23JQ
BS 444 444 RR4A749JQ
BS 445 594 RR4ES23JQ

RD RR4ES23JQ 594 0 0
GTATCCAAACAATTTTGACATTTTTATTCATAACTTTTGAGAAAACAGCAAACCAAAAAC
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AATTAAAAATAAACAAAACTTAAACCCTATGCGTTTCAATCTTGTACACAAGTTCTTCAG
GTTTGGCTCCAACAACCCTATCAATCTCTTCTCCTCTCTTCACAAAAACAAAAGCTGGAA
GTGTATTTGCTCTGTATGTTCCAGCCACATCCATGAATCTATCCACATCAACCCTCGCAA
AAACAGCTTCTGGGTACCTAGAAACGATCTCCTTAACTTTAGGTTCCATTGCTTTACAAG
GTCCACACCATGCAGCCGTGAAATCAATCACTAGCAATTTATTTGAGCCTTTCATGGAAT
CAAAGAGAGATCTCCACTGTCTTATTGATTCCATTTCCACAACCAAACCATTCTTGGTTT
CAGTTGATGAAGGAACATCATGCACAGATGAAACGTTGGAACCCATTATCTTCTGAATGT
GTGTATAGAGATATGATTTGCACTTAATTGCTTGTAGCTAATAGCCTAATATCC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4ES23TF 594 0 0
GTAT
CCAAACAATTTTGACATTTTTATTCATAACTTTTGAGAAAACAGCAAACCAAAAACACAA
TTTCAATCAGTGAAACACACACACAAACACTCAAATGTATAATCTTTCGTTCTTCAAATT
AAAAATAAACAAAACTTAAACCCTATGCGTTTCAATCTTGTACACAAGTTCTTCAGGTTT
GGCTCCAACAACCCTATCAATCTCTTCTCCTCTCTTCACAAAAACAAAAGCTGGAAGTGT
ATTTGCTCTGTATGTTCCAGCCACATCCATGAATCTATCCACATCAACCCTCGCAAAAAC
AGCTTCTGGGTACCTAGAAACGATCTCCTTAACTTTAGGTTCCATTGCTTTACAAGGTCC
ACACCATGCAGCCGTGAAATCAATCACTAGCAATTTATTTGAGCCTTTCATGGAATCAAA
GAGAGATCTCCACTGTCTTATTGATTCCATTTCCACAACCAAACCATTCTTGGTTTCAGT
TGATGAAGGAACATCATGCACAGATGAAACGTTGGAACCCATTATCTTCTGAATGTGTGT
ATAGAGATATGATTTGCACTTAATTGCTTGTAGCTAATAGCCTAATATCC

QA 5 594 5 594
DS 

RD RR4A749JQ 590 0 0
CCAAACAATTTTGACATTTTTATTCATAACTTTTGAGAAAACAGCAAACCAAAAACACAA
TTTCAATCAGTGAAACACACACACAAACACTCAAATGTATAATCTTTCGTTCTTCAAATT
AAAAATAAACAAAACTTAAACCCTATGCGTTTCAATCTTGTACACAAGTTCATCAGGTTT
GGCTCCAACAACCCTATCAATCTCTTCTCCTCTCTTCACAAAAACAAAAGCTGGAAGTGT
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ATAGAGATATGATTTGCACTTAATTGCTTGTAGCTAATAGCCTAATATCC

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DS 



AS 1 6

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CCTCTGGGAGGTCAGAAGTCCACAAAGTGAGATTGTCTCTAAGTAGCTGCATGATAAGAG
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CTTGTTTAGCCAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTCAAGATCTCATAGTAGAAAACTG
AAAAGTTCAGCGCCAGGCCAAGTCTAACTGGATGCGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAG
CAGCAACAGCAGCCTTATATGCCTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCATCAC
CAGAACTAAACTCTGCCAGATACCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGG
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CGGTTTGCTCGGAGAGCTTCGCTAAGTATATTTGTTTTTCTCTGTCGTTCTCCATGGCTG
CTGCTTTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCAGACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO01JQ U 1
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AF RR4C770TF C 260
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RD RR4GO01JQ 574 0 0
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QA 1 574 1 574
DS 

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ATAATAATCTCCT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4ET47TF 560 0 0
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TGGCTCGTCTCCTTCCTCTGGGAGGTCAGAAGTCCACAAAGTGAGATTGTCTCTAAGTAG
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TCCATCGTCAAATGCTTGTTTAGCCAATTGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTCAAGATCTC
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GATCCTCTTGACGTTCTCC
C

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4C770JQ 785 0 0
AGTG
TTATGTTGTAGAACGTCAATGATCTGAAAACATCATCAGGAAAAACATTAAGATTAAAAA
AAAA*TTACACCTTTTCAGTGTTTAGAGCTAAAGACGCTTGCTGTCTTCGGTTTATGATT
TAGGATGCACCAAGAGCCGTTTCTCTTTTCACAGACAGATTCAGGATTTCATTTCTCTTC
TTGAGGCTCATCACCTTTGGATGGCTCGTCTCCTTCCTCTGGGAGGTCAGAAGTCCACAA
AGTGAGATTGTCTCTAAGTAGCTGCATGATAGGAGTGCTGTCCTTGTATGATTCCTCGTT
TAGACTATCAAGCTCAGCGATTCCATCGTCAAATGCTTGTTTAGCCAATTGGCATGCGCT
TTCAGGAGAGTTCAAGATCTCATAGTAGAAAACTGAAAAGTTCAGCGCCAGGCCAAGTCT
AACTGGATGCGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTATATGCCTC
AAGAAACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGCTCATCACCAGAACTAAACTCTGCCAGATACCG
ATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTAGATTCGACAGCTTTAGACGAAGG
GATGAGATGCTTATCGATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTAGCAAGCTCATCTTC
AACGCTCTTGCGATAGTACTTGATCCTCTTGACGTTCTCCTCGTTCCCCTTG*ACTCTTC
CTTCTGCTCTATGGAAGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCTTCGCGCCGATCACGTTCTT
G

QA 5 785 5 785
DS 

RD RR4C770TF 748 0 0
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TGAGGCTCATCAC*TTTGGATGGCTCGTCTC**TCCTCTGGGAGGTCAGAAGTCCACAAA
GTGAGAT*GTCTCTAAGTAGCTGCATGATAGGAGTGCTGTC*TTGTATGATTCCTCGTTT
AGACTATCAAGCTCAGCGATTCCATCGTCAAATGCTTGTTTAGCCAATTGGCATGCGCTT
TCAGGAGAGTTCAAGATCTCATAGTAGAAAACTGAAAAGTTCAGCGCCAGGCCAAGTCTA
ACTGGATGCGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTATATGCCTCA
AGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGCTCATCACCAGAACTAAACTCTGCCAGATACCGA
TAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACGGTAGATTCGACAGCTTTAGACGAAGGG
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ACGCTCTTGCGATAGTACTTGATCCTCTTGACGTTCTCCTCGTTCCCCTTG*ACTCTTCC
TTCTGCTCTATGGAAGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCTTCGCGCCGATCACGTTCTTG
TACCCAACAGACACGAGATTCCTCTCCTCCACCGTGAGCTCCACGTCAAGCTGAGCAACT
TTCTTCATCGCTTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGGTTTGCTCGGAGAGCTTCGCTAAG
TATATTTGTTTTTCTCTGTCG

QA 8 748 8 748
DS 

RD RR4DI03TF 689 0 0
AC
GATTCCTCGTTTAGACTATCAAGCTCAGCGATTCCATCGTCAAATGCTTGTTTAGCCAAT
TGGCATGCGCTTTCAGGAGAGTTTAAGATCTCATAGTAGAAAACTGAAAAGTTCAGCGCC
AGGCCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAGCAGCAACAGCAGCC
TTATATGCCTCAAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCATCACCAGAACTAAACTCT
ACCAGATACCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACTGTAGATTCGACAGCT
TTAGACGAAGGGATGAGATGCTTATCGATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTAGCA
AGCTCATCCTCAACACTCTTGCGATAGTTCTTGATCCTCTTGACATTCTCCTCGTTCCCC
TTGGACTCTTCCTTCTGCTCGATGGAAGATAGTATCCTCCACGAAGCTCTCTTTGCGCCG
ATCACGTTCTTGTACCCAACGGAGACGAGATTCCTCTCCTCCACCGTGAGCTCCACGTCA
AGCTGAGCAACTTTCTTCATCGCCTCAACCATCTCATCGTATCGTTCGGTTTGCTCGGAG
AGCTTCGCTAAGTATATTTGTTTTTCTCTGTCGTTCTCCATGGCTGCTGCTTTTGTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTTTTCAGACAATCC

QA 3 689 3 689
DS 



AS 1 5

CO CL1436Contig1 585 5 2 U
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CAGCAACAACAAGAGATGATGAAGAACACGCAAACGATTTTCGGCAAGTACTGGCGTAGA
GGTTTTTCATCCATCGCTTCTTCCCCTCTGACCTCGAGGGTCAAGCAGGAGTTGGCGGAG
CAGAATGGCTTGGGTCTCTTTGGAGCATTTATTGGTGGATGGTGTATCAAAGCTTCCATA
AATGTT*ACAAGAAAAGAGAGCATTGGTACAGAGTGGACAGATTGTCTAAAGAGAACGAT
GAGCGTTTTGTTGATCTGTTGACTAGATCTTCCCAGCTCACAATGGCAAGGACTGAAGCC
AGTCGCAAACGTTTGATGGATATGAAAGACACAGTCGATTCTGACTAGTCTCTTCCCCGA
TGTAATAATAATTATTGTGCCTTGTATCTGCACACTCTGGAACATGCTTTTGGAGTTTAT
TGGAGATAGTTTATCTTGTGCTTTGTTGTTGGTATTTGTAACTAATCTGTGTCAAATGAT
CTTAGAACAACAACTAGTTCTGACAATAGCATCTATTATTAAGTC


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC86JQ C 1
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AF RR4AJ15TF U 1
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B137JQ C 1
AF RR4G538TF U 1
AF RR4G538JQ C 1
AF RR4B137TF U 1
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BS 374 459 RR4G538TF
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G

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QA 1 564 1 564
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4CP66JQ C 1
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RD RR4CP66JQ 558 0 0
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ATTATCTTTTCTGCTTTTGATATATAAAGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTC
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TATTATAACTAGGTGATTTTCCC*GTGCTCATGCACGGATATAAATATTTATAAAGTAAA
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TATTGTATTATTTTAACC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4CP66TF 450 0 0
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TGAATGCCGGAAGATTTGCGAAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATT
CCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACAT
TTTATTCCCTATGCCAAATAAATATTACTAGATACTTTCGGTGATATCGCGGAATAAAGT
TCATTTCAATATTATTATAACTAGGTGATTTTCCCCGTGCTCATGCACGGATATAAATAT
TTATAAAGTAAACATAATATAATAATTGATTCGCTATTTACTTCTAATTTTTAAATTAAC
TTATATTAATAATATTGTATTATTTTAA
CC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 2 5

CO CL1438Contig1 1094 2 16 U
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TTTTCTTTAATGTTTGTTAAATGCTATCAGATTATATGTTTCAGACACATTAAAAGACAC
TGCTAACCGAAATGTAGAAATTTTTGTTGCACCAATTCTTGAGGGATGTTCAAGTTTCCA
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TGGATTTGTGAATTGGACCATGATTGTTGTCGTAATGCATGTAATTAAACCTAGAGCCCC
AGTGACAAAAGTCAGAGGAGACTGAGAAAAAGTTCTTGGGATCATCCACGTATTTAGATA
GCAACTCACCGTACATGGCTTCGTTTTCTGGACTTACTGCTCCAACCAAGATGGGTACAA
CTTTCACATCGTGCCCTTGAAACACTTTAGCCAAATAAGGCAAGTGCATTTCCATGCTAT
GCTCAGCTTCATCGACACGGAGATCCATCATTCCAAATTTCCCCATAGCTCTTATCTCCT
TAATCATATCCACATCAACAGGTAGATCTCCTATGGGAGTTTTGTAAACTTTTGCAGTTG
AAAGTGCACATTTTGGAGTATAGTAGTGGTGAGATGGACCAAGAATAAATATCCTGGAAA
TGTTGGTGGGATCAATGTTTGCAAAGGCATAAGCAGCTGCACGAGCGGAGTAGGAGTAAC
CTGCGTGTGGGGCAATGACGCCTCGGACATGAGGTGATTTGGTTAAACCAGTTGATCTTA
GCCATTCATCAAGATCGGACGACAACTTTGTAGGATTATCGGTATACCAAGAGCCTGCGT
GCGATGCTTGCCTCACTTTCTCCATTTTAGCAAAAAGTAATTGAAGGATTGTGATCGCTG
TCAGAAACACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS55JQ U 1
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GAAAAATACTAATGGGGTGGCGTCCACAAATGGTGTTGTCAAACTCCAAAAGATACTTGT
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DS 

RD RR4AN70TF 929 0 0
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AACCAGTTGATCTTAGCCATTCATCAAGATCGGACGACAACTTTGTAGGATTATCGGTAT
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QA 1 929 1 929
DS 



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ATGGAGAAAGTGAGGCAAGCATCGCACGCAGGCTCTTGGTATACCGATAATCCTACAAAG
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AATCATGGTCCAATACACAAATCCATTGAGGCATTAGACAAGATGGGTATGGATATAATA
GAGACCGGAGATCCAGATGCTTTCGACAAGTATCTTTTGGAGTTTGACAACACCATTTGT
GGACGCCACCCCATTAGTATTTTTCTCCATATGGTAAAACATAGCTCAAGCAAGATGAAG
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AGCTATGCATCTGCTGCTGCTAAGTTGGAAACTTGAACATCCCTGAAGAACTGGTGCACA
AAAATTTCTTCATTTCGGTTCCAAGTTCTTTTAATGTGTCTAAAACATATAATCTGGTAG
CATTTAACAAATGCAAACAACCTTAATGAAAAATAAACCAAAAGGTTTGGTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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QA 3 766 3 766
DS 

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AATTTCCTCAAGTACGAGCAGTCAAGCCAGTGCAAGACGATGCGAGACAGCAGTGTCAGC
TATGCATCTGCTGCTGCTAAGTTGGAAACTTGAACATCCCTGAAGAACTGGTGCACAAAA
ATTTCTTCATTTCGGTTCCAAGTTCTTTTAATGTGTCTAAAACATATAATCTGGTAGCAT
TTAACAAATGCAAACAACCTTAATGAAAAATAAACCAAAAGGTTTGGTGTTTTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 4

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AAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCTATATC
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TATACGACATGTTACAAGGAAATGATAACCAGTGTACAAATTTTTTCTGTAAATTTATTA
AAATGATGTGGTTATCATT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4FE66TF U 1
AF RR4DL78TF U 159
AF RR4DF22JQ C 577
AF RR4DD47JQ C 629
BS 1 590 RR4FE66TF
BS 591 824 RR4DL78TF
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BS 826 848 RR4DL78TF
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BS 871 909 RR4DF22JQ
BS 910 910 RR4DD47JQ
BS 911 1004 RR4DF22JQ
BS 1005 1005 RR4DD47JQ
BS 1006 1104 RR4DF22JQ
BS 1105 1105 RR4DD47JQ
BS 1106 1126 RR4DF22JQ
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BS 1128 1156 RR4DF22JQ
BS 1157 1159 RR4DD47JQ

RD RR4FE66TF 590 0 0
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AAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCTATATC
CAAAAGAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTGT
CATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTCGTGGG
ATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCAGTTCTCGTACCAGCAACTAT
AGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCCGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGG
TGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACC
TCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACC
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AACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAG

QA 1 590 1 590
DS 

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CGGTTCTCGTACCAGCAACTATAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTG
CCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAG
TACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGCTGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAG
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ATGGAGAAGCAACAGATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAG
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ATAAACCAAAAGATAAACCCGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGGAAATAAACCAGCTG
GAGGAC*AGCAGATAAACCTGCTGGAGGAC*AACAGATAAACCAGCAGATAA
C

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DS 

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AGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAAATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGAACCAGC
TCATAAACCAAAAGATAAACCCGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGGAAATAAACCAGC
TGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGCAGATAAACCGAC
CGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGGGGGGCGGCAAATAAACCGGCTGAAAAACCAAA
AAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAACCAGCTGGAGAGAATAAACCTCCCGCAT
GGTATAGCTGAATGGAGTAGTTTGGGTTCCATAAATTATTCCTAATTTATCCTAAACTAC
ATGTTTCATAATCATTTTTATGAATATACGACATGTTACAAGGAAATGGTAACCAGTGTA
CAAATTTTTTTTGTAAATTTATTAAAATGATGTGGTTATC

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DS 

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AAACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGCAGAT
AAACCGACCGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGGGGGGCAGCAAATAAACCGGGTGAA
AAACCAAAAAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAACCAGCTGGAGAGAATAAACC
TCCCGCATGGTATAGCCGAATGGAGTAGTTTGGGTTCCATAAATTATTCCTAATTTATCC
TAAACTACATGTTTCATAATCATTTTTATGAATATACGACATGTTACAAGGAAATGATAA
CCAGTGTACAAATTTTTTCTGTAAATTTATTAAAATGATGTGGTTATCATT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 4

CO CL1440Contig1 1024 4 15 U
ATAGTGAATTCACAAAAAAACAACGTCTATAATGCTTAGTTGTAGTCTATTGCCATAAAT
TGTTAATTCTACAGAAAGTTTAGTCTTTCGAGCGCGCATATTAGCAACCACAGAAAGTTT
GATCTTTCGGGCGCGCATATTAGCGACCACAGAAACGTGCATATTCATCCAAAAGCGCAT
GTTAGCATCATATCCCAAAAACTAGTTAACCGCCTTGGTCTTCTTCCTCTGTCCTCAACA
CGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCTCGTGATGGGATTGCTCGATCTGGAGAAGCACT
TCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATCCACATCATCTTCG
TATGGCCGATCGTCTTCACCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACCCCAATTTTCCATC
TTTCTCAATCGCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGTTAAACGTCGGCTTTATCCTTACAG
CTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTGTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTTGTAGCGGCTCTCA
TGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGATTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGCTTAGGGCCTTCTCTAG
CCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGGCATG
GACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAAGCTTTTCTCATGG
CTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTATGAACCATATCCAG
GTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAATGGAGAGCAAAGA
AGCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACCTGAACAACTTAA
ACCCATTGATTGTAATGTTTCCACACTAAAAACCTATATAATAAAAATATAAGACCACCA
CCATGGATTGATGGATTTGTGTTTGTGTATATGTGTGTAACTATGTTTCTAACGAAAGTT
ACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 0 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4G173JQ U 1
AF RR4GV40TF U 292
AF RR4GV40JQ C 475
AF RR4EE75JQ C 444
BS 1 404 RR4G173JQ
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ATAGTGAATTCACAAAAAAACAACGTCTATAATGCTTAGTTGTAGTCTATTGCCATAAAT
TGTTAATTCTACAGAAAGTTTAGTCTTTCGAGCGCGCATATTAGCAACCACAGAAAGTTT
GATCTTTCGGGCGCGCATATTAGCGACCACAGAAACGTGCATATTCATCCAAAAGCGCAT
GTTAGCATCATATCCCAAAAACTAGTTAACCGCCTTGGTCTTCTTCCTCTGTCCTCAACA
CGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCTCGTGATGGGATTGCTCGATCTGGAGAAGCACT
TCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATCCACATCATCTTCG
TATGGCCGATCGTCTTCACCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCG

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4GV40TF 633 0 0
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TCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCACCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACCCCAA
TTTTCCATCTTTCTCAATCGCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGTTAAACGTCGGGTTTG
TCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTGTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTTGTAG
CGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGATTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGCTTAGGGC
CTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTC
TTGGGCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAAGCTT
TTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTATGAAC
CATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAATGGA
GAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGA*TAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACCTGA
ACA*CTTAAACCCATTGATTGTA
TGTTTCACAC

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DS 

RD RR4GV40JQ 473 0 0
TTACGGT
TGTTTATGCTCTCTTCTACATCTGTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTTGTAGCGGCTCTCAT
GTGTTTCTCTTGCTGGCTCGATTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGCTTAGGGCCTTCTCTAGC
CCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGGCATGG
ACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAAGCTTTTCTCATGGC
TCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTATGAACCATATCCAGG
TTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAATGGAGAGCAAAGAA
GCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACCTGAACAACTTAAA
CCCATTGATTGTAATGTTTCCCCACTAAAAACCTATATAATAAAAA

QA 8 473 8 473
DS 

RD RR4EE75JQ 581 0 0
GGCGTTCTTCGGTTAAACGTCGGCTTTATCCTTACATCTGTTTATGCTCTCTTCTACATC
TGTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTTGTAGCGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGT
TCCAGCTTTCTCGCTGCTCGGTTAGGCCCTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCT
CAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCC
GCGCTATTAGACAATCTGCTCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAG
GTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTATGAACCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCC
AAGGTAGAAAGTGACATTATGGAATGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAGCTC
ACATAAGCTTTGGATTAATATAACCTGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTCCA
CACTAAAAACCTATATAATAAAAATATAAGACCACCACCATGGATTGATGGATTTGTGTT
TGTGTATATGTGTGTAACTATGTTTCTAACGAAAGTTACTT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 2 6

CO CL1441Contig1 668 2 2 U
GGATTGAAAGTTGTTTGCTTTAGTCGTGTTTGGTGTTCATACTCATCTGGGCTTTTTCTT
GCTAGTTTGAGATTGTATAATGGAAGGAATCATTGTGAGGAGAGTTATACCATCTGACAA
CAGTTGTCTCTTCAACGCAATCGGTTATGTCATGGACAAGGACAAGAAGAAAGCTCCTGA
GCTAAGACAGGTGATAGCTGCTGCAGTTGCAAGCGACAAGGAGAAGTATAACGAAGCATT
TCTTGGGAAGCAAAATGAAGAATATTGTGCTTGGATTCTCAATCCGGAGAAGTGGGGAGG
TGCGATTGAGCTTTCGATATTAGCAGACTATTATGGTCGAGAGATTGCAGCTTATGATAT
TCAAACCAGTCGATGCGACTTGTATGGACAGACCAAAAACTATAGCGAAAGAGTTATGCT
GATCTATGACGGTCTTCACTATGATGCTCTCGCTTTGTCTCCATTTGAAGATGCTGAGGA
AGACTTTGATATGACTATATTTCCAGTTGGTAAAGATAGATCCATTGGTGCTATAGAAGG
GCTTGTTCTAAATCTAGTAAAGGACCAACAAAGGAAAAGGAGTTACACAGATACTGCAAA
CTTCACTCTGCGTCGTGGTGTTTGCCAAATTGGTGTTATTGGACAAAAGGAAGCTGTGGA
GCATGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AU39TF U 1
AF RR4AZ55TF U 1
BS 1 666 RR4AU39TF
BS 667 668 RR4AZ55TF

RD RR4AU39TF 666 0 0
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GCATGC

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DS 

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CAGTTGTCTCTTCAACGCAATCGGTTATGTCATGGACAAGGACAAGAAGAAAGCTCCTGA
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TCTTGGGAAGCAAAATGAAGAATATTGTGCTTGGATTCTCAATCCGGAGAAGTGGGGAGG
TGCGATTGAGCTTTCGATATTAGCAGACTATTATGGTCGAGAGATTGCAGCTTATGATAT
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GCATGCTC

QA 1 668 1 668
DS 



CO CL1441Contig2 865 4 5 U
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CTAGTTTGAGATTATTATCATGGAAGGAATCATTGTGAGGAGAGTTATACCATCTGACAA
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TCTTGGGAAGCAAAATGAAGAATATTGTGCTTGGATTCTCAATCCGGAGAAGTGGGGAGG
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TATAATTTATGTTGTCAACAAATTCAAATTCAAATTCAGTCTGTTGTACAATTCATATTG
TGTTGTTTTCTTTCTTTAGATGTATCCTATCTTCAAGAGGAGCATCATTGTTGTCTCACC
AATAATGTCATGAAAATTTGGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4B702TF U 1
AF RR4B702JQ C 7
AF RR4GT15JQ C 307
AF RR4GT15TF U 307
BS 1 345 RR4B702TF
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BS 347 666 RR4B702TF
BS 667 863 RR4GT15TF
BS 864 865 RR4B702JQ

RD RR4B702TF 666 0 0
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CTAGTTTGAGATTATTATCATGGAAGGAATCATTGTGAGGAGAGTTATACCATCTGACAA
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TCTTGGGAAGCAAAATGAAGAATATTGTGCTTGGATTCTCAATCCGGAGAAGTGGGGAGG
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GCATGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4B702JQ 859 0 0
G
TTTCCAGAATCAGATCTCTTTCTCTGACCCCAACGCCAACGGTTTTTTTCTTGCTAGTTT
GAGATTATTATCATGGAAGGAATCATTGTGAGGAGAGTTATACCATCTGACAACAGTTGT
CTCTTCAACGCAATCGGTTATGTCATGGACAAGGACAAGAAGAAAGCTCCTGAGCTAAGA
CAGGTGATAGCTGCTGCAGTTGCAAGCGACAAGGAGAAGTATAACGAATCATTTCTTGGG
AAGCAAAATGAAGAATATTGTGCTTGGATTCTCAATCCGGAGAAGTGGGGAGGTGCGATT
GAGCTTTCGATATTAGCAGACTATTATGGTCGAGAGAT*GCAGCTTATGATATTCAAACC
AGTCGATGCGACTTGTATGGACAGACCAAAAACTATAGCGAAAGAGTTATGCTGATCTAT
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GATATGACTATATTTCCAGTTGGTAAAGATAGATCCATTGGTGCTATAGAAGGGCTTGTT
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TATGTTGTCAACAAATTCAAATTCAAATTCAGTCTGTTGTACAATTCATATTGTGTTGTT
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TCATGAAAATTTGGACAT

QA 2 859 2 859
DS 

RD RR4GT15JQ 557 0 0
G
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AGTCGATGCGACTTGTATGGACAGACCAAAAACTATAGCGAAAGAGTTATGCTGATCTAT
GACGGTCTTCACTATGATGCTCTCGCTTTGTCTCCATTTGAAGATGCTGAGGAAGACTTT
GATATGACTATATTTCCAGTTGGTAAAGATAGATCCATTGGTGCTATAGAAGGGCTTGTT
CTAAATCTAGTAAAGGACCAACAAAGGAAAAGGAGTTACACAGATACTGCAAACTTCACT
CTGCGTTGTGGTGTTTGCCAAATTGGTGTTATTGGACAAAAGGAAGCTGTGGAGCATGCT
CAGGCAACTGGTCATGTCAACTTCCAAGAATACCATTAAGGGAATGATTTGATTATAATT
TATGTTGTCAACAAATTCAAATTCAAATTCAGTCTGTTGTACAATTCATATTGTGTTGTT
TTCTTTCTTTAGATGTATCCTATCTTCAAGAGGAGCATCATTGTTGTCTCACCAATAATG
TCATGAAAATTTGGAC

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR4GT15TF 557 0 0
G
GAGCTTTCGATATTAGCAGACTATTATGGTCGAGAGATTGCAGCTTATGATATTCAAACC
AGTCGATGCGACTTGTATGGACAGACCAAAAACTATAGCGAAAGAGTTATGCTGATCTAT
GACGGTCTTCACTATGATGCTCTCGCTTTGTCTCCATTTGAAGATGCTGAGGAAGACTTT
GATATGACTATATTTCCAGTTGGTAAAGATAGATCCATTGGTGCTATAGAAGGGCTTGTT
CTAAATCTAGTAAAGGACCAACAAAGGAAAAGGAGTTACACAGATACTGCAAACTTCACT
CTGCGTTGTGGTGTTTGCCAAATTGGTGTTATTGGACAAAAGGAAGCTGTGGAGCATGCT
CAGGCAACTGGTCATGTCAACTTCCAAGAATACCATTAAGGGAATGATTTGATTATAATT
TATGTTGTCAACAAATTCAAATTCAAATTCAGTCTGTTGTACAATTCATATTGTGTTGTT
TTCTTTCTTTAGATGTATCCTATCTTCAAGAGGAGCATCATTGTTGTCTCACCAATAATG
TCATGAAAATTTGGAC

QA 2 557 2 557
DS 



AS 1 6

CO CL1442Contig1 679 6 17 U
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GGCCAAGAGAAGAGGCAGTGCATCATGGTCGGCTCGAGCCGTAGTGGCTTTGGTATTCGT
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TGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTTCACAACGTGGTGGCGGTAGATAGTGCAGG
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TATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTACTA
TGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATTAAGTATTCTAATAAAGTTTACATTG
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TGTTGTTTTCCTGTTACTAGTTTTTCTTTATAAATTAAGTCAACACCAAAAAGGGTAATA
AATATTAACATATTTACCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR74JQ C 1
AF RR4AS02TF U 117
AF RR4B241TF U 117
AF RR4CR74TF U 1
AF RR4EF63TF U 1
AF RR4EF63JQ C 72
BS 1 118 RR4CR74TF
BS 119 124 RR4AS02TF
BS 125 125 RR4CR74TF
BS 126 270 RR4AS02TF
BS 271 271 RR4CR74TF
BS 272 293 RR4AS02TF
BS 294 294 RR4CR74TF
BS 295 366 RR4AS02TF
BS 367 367 RR4CR74TF
BS 368 415 RR4AS02TF
BS 416 416 RR4CR74TF
BS 417 514 RR4AS02TF
BS 515 515 RR4CR74TF
BS 516 545 RR4AS02TF
BS 546 549 RR4CR74TF
BS 550 622 RR4EF63TF
BS 623 679 RR4EF63JQ

RD RR4CR74JQ 550 0 0
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GGCCAAGAGAAGAGGCAGTGCATCATGGTCGGCTCGAGCCGTAGTGGCTTTGGTATTCGT
CTCCCTGTTGGTGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAATC
CAACGTCTGGGCCTTTAACGCTGTGGGTTGGCCGAAGGGCAAACATTTTAAAGCCAATGA
TGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTTCACAACGTGGTGGCGGTAGATAGTGCAGG
ATACAACAATTGCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGTAT
AACTTTATCTAAAGGACAAAATTTCTTCATCTGCAACTTTCCCGGCCATTGTGAAGCCGC
TATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTACTA
TGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATTAAGTATTCTAATAAAGTTTACATTG
TTGTTGTGT
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4AS02TF 432 0 0
GG
GTCTCCGTGTTGGTGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAA
TCCAACGTCTGGGCCTTTAACGCTGTGGGTTGGCCGAAAGGCAAACATTTTAAAGCCAAT
GATGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTCCACAACGTGGTGGCGGTAGATAATGCA
GGGTACAACAATTGCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGT
ATAACTTTGTCTAAAGGACAAAATTTCTTCATCTGCAACTTTCCCGGCCATTGTGAATCC
GCTATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTAC
TATGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATCAAGTATTCTAATAAAGTTTACAT
TGTTGTT
CCC

QA 3 429 3 429
DS 

RD RR4B241TF 432 0 0
GG
GTCTCCGTGTTGGTGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAA
TCCAACGTCTGGGCCTTTAACGCTGTGGGTTGGCCGAAAGGCAAACATTTTAAAGCCAAT
GATGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTCCACAACGTGGTGGCGGTAGATAATGCA
GGGTACAACAATTGCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGT
ATAACTTTGTCTAAAGGACAAAATTTCTTCATCTGCAACTTTCCCGGCCATTGTGAATCC
GCTATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTAC
TATGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATCAAGTATTCTAATAAAGTTTACAT
TGTTGTT
CCC

QA 3 429 3 429
DS 

RD RR4CR74TF 550 0 0
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GGCCAAGAGAAGAGGCAGTGCATCATGGTCGGCTCGAGCCGTAGTGGCTTTGGTATTCGT
CTCCCTGTTGGTGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAATC
CAACGTCTGGGCCTTTAACGCTGTGGGTTGGCCGAAGGGCAAACATTTTAAAGCCAATGA
TGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTTCACAACGTGGTGGCGGTAGATAGTGCAGG
ATACAACAATTGCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGTAT
AACTTTATCTAAAGGACAAAATTTCTTCATCTGCAACTTTCCCGGCCATTGTGAAGCCGC
TATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTACTA
TGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATTAAGTATTCTAATAAAGTTTACATTG
TTGTTGTGT
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4EF63TF 622 0 0
GGACCCTCATTCGTCATCTACAATCTCTCTCTCTTTCATTCTCTCTAAAGATTAAAAGAT
GGCCAAGAGAAGAGGCAGTGCATCATGGTCGGCTCGAGCCGTAGTGGCTTTGGTATTCGT
CTCCCTGTTGGTGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAATC
CAACGTCTGGGCCTTTAACGCTATGGGCTGGCCGAAAGGCAAACATTTTAAAGCCAATGA
TGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTTCACAACGTGGTGGCGGTAGATAGTGCAGG
GTACAACAATTGCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGTAT
AACTTTATCTAAAGGACAAAATTTCTTCATCTGCAACTTTCCCGGCCATTGTGAAGCCGC
TATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTACTA
TGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATTAAGTATTCTAATAAAGTTTACATTG
TTGTTGTGTTCCCCTTTTTCTTTTTTTGGTGATGTGTGTTGTGTGTTTCCTTTTTCATTT
TGTTGTTTTCCTGTTACTAGTT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4EF63JQ 608 0 0
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TGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAATCCAACGTCTGGG
CCTTTAACGCTATGGGCTGGCCGAAAGGCAAACATTTTAAAGCCAATGATGTTCTAGTGT
TTAACTATAATCCGAGATTTCACAACGTGGTGGCGGTAGATAGTGCAGGGTACAACAATT
GCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGTATAACTTTATCTA
AAGGACAAAATTTCTTCATCTGCAACTTTCCCGGCCATTGTGAAGCCGCTATGAAAATAG
CAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTACTATGATCGTCACT
TCGTTATGTTCTAAAAAAAATATTAAGTATTCTAATAAAGTTTACATTGTTGTTGTGTTC
CCCTTTTTCTTTTTTTGGTGATGTGTGTTGTGTGTTTCCTTTTTCATTTTGTTGTTTTCC
TGTTACTAGTTTTTCTTTATAAATTAAGTCAACACCAAAAAGGGTAATAAATATTAACAT
ATTTACCC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 2 6

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AAGCTCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAGATGATGAGG
ATACTGGTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATATG
ATGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGGTTTCTATAA
GAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGATTTTTCTGAAAGTTTTTTTAGATTGTTCACTTTCT
TTTTTTCTTTTTAATTTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGGACTTTCTATGTAGGTCTT
GAGATAAGGGAAGTTTGAACTATGCTTCAACAGTTTTTTTTATACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU31TF U 1
AF RR4DU31JQ C 1
BS 1 266 RR4DU31TF
BS 267 406 RR4DU31JQ

RD RR4DU31TF 266 0 0
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ATACTGGTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATATG
ATGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGGTTTCTATAA
GAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGAT

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR4DU31JQ 406 0 0
GGAGGTTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGTACCAGGAGG
AAGCTCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAGATGATGAGG
ATACTGGTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATATG
ATGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGGTTTCTATAA
GAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGATTTTTCTGAAAGTTTTTTTAGATTGTTCACTTTCT
TTTTTTCTTTTTAATTTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGGACTTTCTATGTAGGTCTT
GAGATAAGGGAAGTTTGAACTATGCTTCAACAGTTTTTTTTATACG

QA 1 406 1 406
DS 



CO CL1443Contig2 1105 4 6 U
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AGGACAAGAAGTCTCAAACGGAAGTACAACAGTAGAGACCAGGCAAAAGGAGACCTTAAA
GGTTGCTGTCACAGAAGTGCTTGGAGGTGGTCGGTTCTATGTTCAATCTGTTGGAGATCA
GAGAATAGCCTCTATTCAGAACCAGCTTGCATCTCTTAGTGTTAAAGATGCTCCAATCAT
TGGATCCTTCAACCCCAAGAGAGGTGACATTGTTCTTGCGCAGTTTAGCCTTGACAACTC
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GCTTGAAGTGTTCTACATCGACTATGGAAACCAAGAGTTAGTGCCTTACAGCGCAATCCG
ACCAATAGATCCTTCTGTGTCTTCAGCACCAGGGCTTGCTCAGCTATGCAGGCTTGCCTA
CATAAAGGTTCCAGGGTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTGAAGCTGGAGAGTATCTGCATAC
CGTGACGCTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCGGTGATAGAAGAAAGAGACACATCTGG
AGGTAAAGCCAAAGGCCAAGGAACTGGAACCGAACTTGCTGTCACTCTCATTGCTGTTGA
TGAAGAGATCTCTGTCAACGCTGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGAATGGAGAAACG
TAGGAGGTTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGTACCAGGA
G*AAGCTCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAGATGATGA
GGATACTGGTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATA
TGATGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGGTTTCTAT
AAGAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGATTTTTCTGAAACTTTTTTTAGATTGTTCACTTT
TTTTTTTTCTTTTTAATTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGAACTTTCTATGTAGGGCT
TGAAATAAGGGAAGTTTGAACTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4H668TF U 1
AF RR4FP31TF U 375
AF RR4H668JQB C 474
AF RR4FP31JQ C 534
BS 1 411 RR4H668TF
BS 412 412 RR4FP31TF
BS 413 610 RR4H668TF
BS 611 1026 RR4FP31TF
BS 1027 1101 RR4H668JQB
BS 1102 1105 RR4FP31JQ

RD RR4H668TF 610 0 0
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GAGAATAGCCTCTATTCAGAACCAGCTTGCATCTCTTAGTGTTAAAGATGCTCCAATCAT
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CGTGACGCTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCGGTGATAGAAGAAAGAGACACATCTGG
AGGTAAAGCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4FP31TF 654 0 0
GCATT
GACTATGGAAACCAAGAGTTAGTGCCTTACAGCGCAATCCGACCAATAGATCCTTCTGTG
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GCTGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGAATGGAGAAACGTAGGAGGTTTGAGCACAAG
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ACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAGATGATGAGGATACTGGTCCGGCCAGG
AAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATATGATGGTTTCAAAGGTACC
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TCATCAGATTTTTCTGAAACTTTTTTTAGATTGTTCACTTTTTTTTT
CT

QA 6 652 6 652
DS 

RD RR4H668JQB 629 0 0
TTGCCTACATAAAGGTTCCAGGGTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTGAAGCTGGAGAGTATC
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CATCTGGAGGTAAAGCCAAAGGCCAAGGAACTGGAACCGAACTTGCTGTCACTCTCATTG
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AGAAACGTAGGAGGTTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGT
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TCACTTTTTTTTTTTCTTTTTAATTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGAACTTTCTATG
TAGGGCTTGAAATAAGGGAAGTTTGAAC
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4FP31JQ 572 0 0
TGCATACCGTGACGCTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCGGTGATAGAAGAAAGAGACA
CATCTGGAGGTAAAGCCAAAGGCCAAGGAACTGGAACCGAACTTGCTGTCACTCTCATTG
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AGAAACGTAGGAGGTTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGT
ACCAGGAG*AAGCTCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAG
ATGATGAGGATACTGGTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAA
ATTAATATGATGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGG
TTTCTATAAGAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGATTTTTTTGAAACTTTTTTTAGATTGT
TCACTTTTTTTTTT*CTTTTTAATTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGAACTTTCTATG
TAGGGCTTGAAATAAGGGAAGTTTGAACTATG

QA 1 572 1 572
DS 



AS 2 6

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AAAGAGAGTACAAGCCAAGTACTAAGTAATCATACCCAGTAAAATAGTTGTGCAACACAC
TTCATTGCACAATATTCCCAATATTCTTCTCAACAAAATAATTGAAACAAATAAGAGCAA
ATCAAATGCTCATCTGGAATTTTATAGTTGATATGCACATATTCATCACAACGAGTATAA
AATGGGGAAGTCTACGGACCTTTTTTTTCTC****TTCCTTATCACCATATTTTCACTTC
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GAGAAGCACAAGGAGATGAGATCTCAAGGCAATCCCACATAGCTCAGAAGCTTCGGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GC24JQ U 1
AF RR4BL83JQ U 1
AF RR4BP80JQ U 1
BS 1 602 RR4BL83JQ
BS 603 603 RR4BP80JQ
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RD RR4GC24JQ 664 0 0
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AATGGGGAAGTCTACGGACCTTTTTTTTCTCTTAATTCCTTATCACCATATTTTCACTTC
AGAGGATCAATGTGAGGGTAGAGCCCCAGGACATGTTCTGGCATGAAATCATGCCTTGTA
AGTATCCCAACAATAGGCGGTCTCCCTGGTGTTTTGGGCACCACACACAAGTGGCGAAGA
CCAAGTTGCCTGAAAAGAATAGCTGCTTTAGCTAGAGACAAAGTCTCAAGCACAGTGTAA
GGAGATGTGTTAGTGATGGG*ATGGAGATCAACATACATCTCCATCTCCTCATCACTTAT
AACCAAATCCTCAATCTTGAGCCCTTTCCCTAACCCTGCTTTGGCATAGTCACGAGCCTT
GCAGCTTCTAAGAATCTGAGAACCAAACGTCGTTTTCTGCTTGGAGAATCTCTTTC
CTTGGAGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4BL83JQ 718 0 0
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AAAGAGAGTACAAGCCAAGTACTAAGTAATCATACCCAGTAAAATAGTTGTGCAACACAC
TTCATTGCACAATATTCCCAATATTCTTCTCAACAAAATAATTGAAACAAATAAGAGCAA
ATCAAATGCTCATCTGGAATTTTATAGTTGATATGCACATATTCATCACAACGAGTATAA
AATGGGGAAGTCTACGGACCTTTTTTTTCTC****TTCCTTATCACCATATTTTCACTTC
AGAGGATCAATGTGAGGGTAGAGCCCCAGGACATGTTCCGGCATGAAATCATGCCTTGTA
AGTATCCCAACAATAGGCGGTCTCCCTGCTGTTTTGGGCACCACACACAAGTGGCGAAGT
CCAAGTTGCCTGAAAAGAATAGCTGCTTTAGCTAGAGACAAAGTCTCAAGCACAGTGTAA
GGAGATGTGTTAGTGATGGGGATGGAGATCAACAAACATCTCCATCTCCTCATCACTTAT
AACCAAATCCTCAATCTTGAGCCCTTTCCCTAACCCTGCTTTGGCATAGTCACGAGACTT
GCTGCTTCTAAGAATCTGAGAACCAAACGTCGTTTTCTGCTTGGAGAATCTCTTTCCTTG
GAGAAGCACAAGGAGATGAGATCTCAAGGCAATCCCACATAGCTCAGAAGCTTCGGTG

QA 1 718 1 718
DS 

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ATCAAATGCTCATCTGGAATTTTATAGTTGATATGCACATATTCATCACAACGAGTATAA
AATGGGGAAGTCTACGGACCTTTTTTTTCTC****TTCCTTATCACCATATTTTCACTTC
AGAGGATCAATGTGAGGGTAGAGCCCCAGGACATGTTCCGGCATGAAATCATGCCTTGTA
AGTATCCCAACAATAGGCGGTCTCCCTGCTGTTTTGGGCACCACACACAAGTGGCGAAGT
CCAAGTTGCCTGAAAAGAATAGCTGCTTTAGCTAGAGACAAAGTCTCAAGCACAGTGTAA
GGAGATGTGTTAGTGATGGGGATGGAGATCAACAAACATCTCCATCTCCTCATCACTTAT
AACCAAATCCTCAATCTTGAGCCCTTTCCCTAACCCTGCTTTGGCATAGTCACGAGACTT
GCAGCTTCTAAGAATCTGAGAACCAAACGTCGTTTTCTGCTTGGAGAATCTCTTTCCTTG
GAGAAGCACAAGGAGATGAGATCTCAAGGCAATCCCACATAGCTCAGAAGCTTCGGTG

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL1444Contig2 1211 3 19 U
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TCCGGGATTTAAAGTGATGCTTGTTATGGCAGTTTCCATTTTAAGCTCGTGCTGTGCGTT
TGGTCTTCCGTGGCTTTCACAGTGTACACCTTGTCCTATTGGATCAGAGGGAAAGTGCCC
AAGCGTAGGCCACTCTGGGATCTACGAGAGTTTCCAGTGTCCTCCAAACCATTACAATGA
CCTTTCCTCCCTACTTCTCAACACCAACGACGACGCTATCCGCAGTCTTTTCACATCAAG
GTCTGAGAATGAGTTCCAAATCTCCACCCTCGCCATGTTCTTTGTCTTCGTATTCTGCCT
TGGCATCATAACGTATGGCATAGCTATACCCTCTGGTCTTTTCATTCCCGTTATTCTCGC
TGGAGCTTCGTACGGACGACTTGTCGGTAGACTTTTGGGACCGGTGTCTCAGCTTGATGT
AGGTCTGTTTTCTCTCCTTGGAGCTGCTTCATTCCTTGGGGGCACAATGAGGATGACTGT
CTCTCTATGTGTCATTCTCCTCGAGCTTACAAACAATCTTCTAATGCTGCCTCTGGTGAT
GCTTGTGCTCTTGATCTCGAAAACCGTTGCTGATTGTTTCAACAAAGGTGTCTATGACCA
GATTGTGACGATGAAAGGACTGCCTTACATGGAAGGCCACGCAGAGCCATACATGCGCAA
TTTGGTTGCAAAGGACGTTGTTGCTGGACCTTTGTTGTCCTTTTCACGAGTTGAGAAGGT
TGGGGTTATATGGCAGGCTTTAAGGATGACAGCTCATAATGGCTTCCCTGTTATTGACGA
GCCACCTTTCACCGAAGCTTCTGAGCTATGTGGGATTGCCTTGAGATCTCATCTCCTTGT
GCTTCTCCAAGAAAGAGATTCTCCAAGCAGAAAACGACGTTTGGTTCTCAGATTCTTAGA
AGCTGCAAGTCTCGTGACTATGCCAAAGCAGGTTAGGGAAAGGCTCAGATTGAGATTTGG
TTATAGTGATGAGGAGATGGAGATGTTTGTTGATCTCATCCATCACTAACACATCTCCTA
CACTGTGCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BP80TF U 388
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TC

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G
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G
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DS 



AS 2 6

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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM40JQ U 1
AF RR4AW45JQ U 502
AF RR4BV23JQ U 351
AF RR4AW45TF C 451
BS 1 417 RR4AM40JQ
BS 418 531 RR4BV23JQ
BS 532 534 RR4AW45JQ
BS 535 548 RR4BV23JQ
BS 549 549 RR4AW45JQ
BS 550 692 RR4BV23JQ
BS 693 693 RR4AW45JQ
BS 694 709 RR4BV23JQ
BS 710 710 RR4AW45JQ
BS 711 743 RR4BV23JQ
BS 744 744 RR4AW45JQ
BS 745 818 RR4BV23JQ
BS 819 819 RR4AW45JQ
BS 820 845 RR4BV23JQ
BS 846 846 RR4AW45JQ
BS 847 944 RR4BV23JQ
BS 945 945 RR4AW45TF
BS 946 1030 RR4BV23JQ
BS 1031 1031 RR4AW45TF
BS 1032 1081 RR4BV23JQ
BS 1082 1215 RR4AW45TF

RD RR4AM40JQ 417 0 0
AAAATAAAATAGTTTTCTATAAAATAGAAGTACATGAACATAATAAAACGAGTTTTGCTT
GCGTTCGCATAAGACATACAAACAGCAGGAGAAGAAAATAATCTCAAAGTGATTGGAAAA
AAAAGACTTATTCTCGAAAGCCCTACAATGGCTATAAATCCTCTTTTCCAATATCTCACA
CTATAAAAAAAAAAACAAGAAAACAAAAGAAACATATAACCTCTAGTACAATCTGCCTCA
AAACACCAAACCTTAAGACATAACCCCCAAGAAGAATAACCATTACATGACAATAAAGAA
AACTAAGGAAGAAGGATCATTCTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTGAACTCTTCT
TATGTATTACTGCCTCGCCGGAAACTTGACACAGTTTCTACCGTCCCTCGTTGAAAG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4AW45JQ 356 0 0
TTTTCTGGTTAGCTCTAAGCTGAAGATGAT***ATGATCAAAGTTTT*GTCCTCATGGGC
TTTGCTTTGTATGAAGATAAATCTAAGAAATTCCAGAACGTTCACCTTGATGGCTCGCCT
CTGTTTGGTTGTCTCTTGTTCACACTGTAACTGCCAACATAACCTGGAGATGAACTTCTA
CCTGAAACATCCGAGGAAGGACCTCCTCCTCCTCCTCCAATCCCATAGCTAAAAGAAGCA
GGTCCTTCCGTCTCAGGCGTCGGTGATCTCCACGTGGGATCACTATACACCGCACCATTT
CCATAAAACTCTGCAAGCCCTGCTCCATCGTAACCAATGTTGTTGTTGGCAGCCGA

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR4BV23JQ 731 0 0
GAACTCTTCTTATGTATTACTGCCTCGCCGGAGACTTGACACAGTTTCTACCGTCCCTCG
TTGAAAGAAAAAAAAATAAAGCAGAAAAGAAAAAGCCTATGAAGAGGGAGGAGGACCAAT
GAATTTAGAAAACCAAACCATGAGGGATTTTTTTTCTGGTTAGCTCTAAGCTGATGATGA
TGATATGATCAAAGTTTTTGTCCTCATGGGCTTTGCTTTGTATGAAGATAAATCTAAGAG
ATTCCAGATCGTTCACCTTGATGGCTCGCCTCTGTTTGGTTGTCTCTTGTTCACACTGTA
ACTGCCAACATAACCTGGAGATGAACTTCTACCTGAAACATCAGAGGAAGGACCTCCTC*
TCCTCCTCCAATCCCATAGCTAAAAGAAGCAGGCCCTTCCGTCTCAGGCGTCGGTGATCT
CCACGTGGGATCACTATACACCGCACCATTCCCATAAAACTCTGCAAGTCCTGCTCCATC
GTAACCAATGTTGTTATTGGCAGCCGAGGCAGAAGAGAATGAAGAAGACGACGGCGCTGC
CGCCGCCTTGCTAGGAGGCCCTATGTTCCTCGCTGCATATCCACCTGCTCCCAACCCAAA
GCCAGACTCACCGTTTCCTCCGTAACCAAACTTCACATTCTCGTTACTACCAACAACAGC
ATTGTTTCCACCTCCTCCAGGAGCACCCCAGTTTCCAAATGGACCGCTAAGAGTGTTGTT
CCCACTTGTTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4AW45TF 765 0 0
GAAGAGGGAGGAGGACCAATGAATTTAGAAAACCAAACCATGAGGGATTTTTTT*CTGGT
TAGCTCTAAGCTGATGATGAT***ATGATCAAAGTTTT*GTCCTCATGGGCTTTGCTTTG
TATGAAGATAAATCTAAGAGATTCCAGATCGTTCACCTTGATGGCTCGCCTCTGTTTGGT
TGTCTCTTGTTCACACTGTAACTGCCAACATAACCTGGAGATGAACTTCTACCTGAAACA
TCCGAGGAAGGACCTCCTCCTCCTCCTCCAATCCCATAGCTAAAAGAAGCAGGTCCTTCC
GTCTCAGGCGTCGGTGATCTCCACGTGGGATCACTATACACCGCACCATTCCCATAAAAC
TCTGCAAGCCCTGCTCCATCGTAACCAATGTTGTTGTTGGCAGCCGAGGCAGAAGAGAAT
GAAGAAGACGACGGCGCTGCCGCCGCCTTGCTAGGAGGCCCTATGTTCCTCGCTGCATAT
CCACCTGCTCCCAAACCAAAGCCAGACTCACCGTTTCCTCCGTAACCAAACTTCACATTC
TCGTTACTACCAACAACAGCATTGTTTCCACCTCCTCCAGAAGCACCCCAGTTTCCAAAT
GGACCGCTAAGAGTGTTGTTCCCATTTGTTGATCCTCCTCCTCCTCCCATGTATGTATTG
GAGTTTGAGTTTAAGTTTGTAGCGCTGTTGTTGTTGTTGTTATAGTTAAGACCACCGTTG
TTTCCCCATAGGTTCCTTGTAACCGAACTGAAGAAGGACGAGTTT

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL1445Contig2 653 2 3 U
GTTATGAAGGAGGCAATGGAGTAGGAGGAGGAGGAGGAAACTCGTCCTTCTTCAGTTCGG
TTACAAGTAACCTATGGGGAAACAACGGTGGTCTTAACTATAACAACAACAACAACAACA
ACAACAACGCTACAAACTCAAACTTAAACTCCAATACATACATGGTAGGAGGAGGAGGAT
CAACAAGTGGGAACAACACTCTTAGCGGTCCATTTGGAAACTGGGGTGCTCCTGGAGGAG
GTGGAAACAATGCTGTTGTTGGTAGTAACGAGAATGTGAAGTTTGGTTACGGAGGAAACG
GTGAGTCTGGCTTTGGGTTGGGAGCAGGTGGATATGCAGCGAGGAACATAGGGCCTCCTA
GCAAGGCGGCGGCAGCGCCGTCGTCTTCTTCATTCTCTTCTGCCTCGGCTGCCAACAACA
ACATTGGTTACGATGGAGCAGGACTTGCAGAGTTTTATGGGAATGGTGCGGTGTATAGTG
ATCCCACGTGGAGATCACCGACGCCTGAGACGGAAGGGCCTGCTTCTTTTAGCTATGGGA
TTGGAGGAGGAGGGAGGAGGTCCTTCCTCTGATGTTTCAGGGTAGAAGTTCATCTCCAGG
TTATGTTGGCAGTTACAGTGTGGACAAGAGACAACCAAACAGAGGCGAGCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV23TF U 168
AF RR4AM40TF U 1
BS 1 203 RR4AM40TF
BS 204 204 RR4BV23TF
BS 205 653 RR4AM40TF

RD RR4BV23TF 222 0 0
GGAGGAGGAGGATCAACAAGTGGGAACAACACTCTTAGCGGTCCATTTGGAAACTGGGGT
GCTCCTGGAGGAGGTGGAAACAATGCTGTTGTTGGTAGTAACGAGAATGTGAAGTTTGGT
TACGGAGGAAACGGTGAGTCTGGCTTTGGGTTGGGAGCAGGTGGATATGCAGCGAGGAAC
ATAGGGCCTCCTAGCAAGGCGGCGGCAGCGCCGTCGTCTTCT

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4AM40TF 653 0 0
GTTATGAAGGAGGCAATGGAGTAGGAGGAGGAGGAGGAAACTCGTCCTTCTTCAGTTCGG
TTACAAGTAACCTATGGGGAAACAACGGTGGTCTTAACTATAACAACAACAACAACAACA
ACAACAACGCTACAAACTCAAACTTAAACTCCAATACATACATGGTAGGAGGAGGAGGAT
CAACAAGTGGGAACAACACTCTTGGCGGTCCATTTGGAAACTGGGGTGCTCCTGGAGGAG
GTGGAAACAATGCTGTTGTTGGTAGTAACGAGAATGTGAAGTTTGGTTACGGAGGAAACG
GTGAGTCTGGCTTTGGGTTGGGAGCAGGTGGATATGCAGCGAGGAACATAGGGCCTCCTA
GCAAGGCGGCGGCAGCGCCGTCGTCTTCTTCATTCTCTTCTGCCTCGGCTGCCAACAACA
ACATTGGTTACGATGGAGCAGGACTTGCAGAGTTTTATGGGAATGGTGCGGTGTATAGTG
ATCCCACGTGGAGATCACCGACGCCTGAGACGGAAGGGCCTGCTTCTTTTAGCTATGGGA
TTGGAGGAGGAGGGAGGAGGTCCTTCCTCTGATGTTTCAGGGTAGAAGTTCATCTCCAGG
TTATGTTGGCAGTTACAGTGTGGACAAGAGACAACCAAACAGAGGCGAGCCAT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 6

CO CL1446Contig1 1166 6 20 U
GATGTGTAACAAGGTTATATTAAAAAAATACGGGGAGACAACAACGTTTAAGGGTTTCTA
TAAAGTACACAACTGGGTTTATTTTGTATTGTTGCTGTTCATTAAATAAAGGTTTTGACA
ATTAGTACTCCAACGCTCGTATCTAGATAAAGCGATCCGTTATAATGTTTAGTGTTTGCG
TTTATTTATTTTCTTGCAACATGATATAACGTGCCAAGACCGGAAGTGAAGAGTCTCAAA
CACTTCGGAAAACGGCGCCTCGAATCTGAAGATCTTCCACTAACCTTTTAGTGCTTTTGA
TGATGACCCGACGGATGTACCAAGAAAACGGCGGCTTATCAAGAGGTTCCATGGGCCTAT
AAACCAGGTCCAACTTCAATTTCGACGCAATTAGTCCTTTTCCGCCTGAACATTTTCGGT
ATTCTTTTGGATTTTTTTGGTACCCTAGCCGTGCAATATTTATCACTATCTATGTACCAT
GGCTTTATTTGCAACTGACCCATAAACAATTCCATGTTCATTACATCCTCTCTCGGAATC
CTAAATAATGTGATGAGATCTTTTCGGTTCTCATTGAATACTAGATCTAATGGCATTTTC
CCATTCCACCGAAGAAACTTCCATGGCGCAGATTTTTTTACTACCACGACTTTCTCATCC
CTTCCATTATCCCTAAGAACCTTGCTTGATTTGACTGACAGGATTTTGCGCCTTTTCATT
TGTTTGAAGTAAGAATATGTTTGGTTGTCGTGACTAGTTATAATATCGAAGACTGTCTCA
GGAGGCAATCCTATTGAAAAGTCCATCTTCAAATGGGTTTCACCTGCACTCGATTTGGAC
ACCTTCACGGTAGGAGCATAATCTCGCAGCCATGGCCATTTCTTCTCTTCAGCTCTCCAC
ATCTTTAATTGCCTCTTCGTTTCTTCGCTCTCCGCATTGGTATTTATCTCTGACCCTGGC
TTTGATTTTACATTCTTAGATTTCCTGGACTCGGCCTTCGGAGGTTGTTGGCTGTTCAGG
TTGATCCAGGCACCAAACCCCGGAAATATACCCATTTATCGGTAATTTTGGTCCGCAAAT
GATACACTTATTTGATCAGAGCAAGAGCAAATGAAGGTCCGAATATTTTATATCTTGTGG
TTTGAGGTATCTTAAAGCTAGACCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL11JQ U 1
AF RR4A567JQ U 4
AF RR4EI46JQ U 86
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BS 251 641 RR4GL11JQ
BS 642 699 RR4EI46JQ
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TTTATTTATTTTCTTGCAACATGATATAACGTGCCAAGACCGGAAGTGAAGAGTCTCAAA
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TGATGACCCGACGGATGTACCAAGAAAACGGCGGCTTATCAAGAGGTTCCATGGGCCTAT
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CCATTCCACCGAAGAAACTTCCATGGCGCAGATTTTTTTAC

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DS 

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GC
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TACACAACTGGGTTTATTTTGTATTGTTGCTGTTCATTAAATAAAGGTTTTGACAATTAG
TACTCCAACGCTCGTATCTAGATAAAGCGATCCGTTATAATGTTTAGTGTTTGCGTTTAT
TTATTTTCTTGCAACATGATATAACGTGCCAAGACCGGAAGTGAAGAGTCTCAAACACTT
CGGAAAACGGCGCCTCGAATCTGAAGATCTTCCACTAACCTTTTAGTGCTTTTGATGATG
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AGGTCCAACTTCAATTTCGACGCAATTAGTCCTTTTCCGCCTGAACATTTTCGGTATTCT
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TATTTGCAACTGACCCATAAACAATTCCATGTTCATTACATCCTCTCTCGGAATCCTAAA
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CCACC

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AAACGGCGGCTTATCAAGAGGTTCCATGGGCCTATAAACCAGGTCCAACTTCAATTTCGA
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TTGATTTGACTGAC
TTCATAAGAAAAA

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TA
CCC

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DS 

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TCTTTTCGGTTCTCATTGAATAATAGATCTAATGGCATTTTCCCATTCCACCGAAGAAAC
TTCCATGGCGCAGATTTTTTTACTACCACGACTTTCTCATCCCTTCCATTATCCCTAAGA
ACCTTGCTTGATTTGACTGACAGGATTTTGCGCCTTTTCATTTGTTTGAAGTAAGAATAT
GTTTGGTTGTCGTGACTAGTTATAATATCGAAGAATGTCTCAGGAGGCAATCCTATTGAA
AAGTCCATCTTCAAATGGGTTTCACCTGCACTCGATTTGGACACCTTCACGGTAGGAGCA
TAATCTCGCAGCCATGGCCATTTCTTCTCTTCAGCTCTCCACATCTTTAATTGCCTCTTC
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GATTTCCTGGACTCGGCCTTCGGAGGTTGTTGGCTGTTCAGGTTGATCCAGGCACCAAAC
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GAGCAAGAGCAAATGAAGGTCCGAATATTTTATATCTTGTGGTTTGAGGTATCTTAAAGC
TAGACCCC

QA 1 728 1 728
DS 

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ATTTATCGGTAATTTTGGTCCGCAAATGATACACTTATTTGATCAGAGCAAGAGCAAATG
AAGGTCCGAATATTTTATATCTTGTGGTTTGAGGTATCTTAAAGCTA
GATCC

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DS 



AS 1 5

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TATTAAGAATTATAAAGTAACAATAGTGATCTTATAACTGGAAACTAGAAGTGAATCGTA
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CCATTTCCGAAATTGACCCCCAGTGAAACTTCCTGTAATGTATTTGTTCATTTTTGGTCG
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TCCATGGCCTCATCATCCACCTCAACTGTAATCAGAGGGAGAAGTTCAGAGCCATTGTCA
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CCTGAATCAGCCATTTTGCCTCCATAATCCTTAACAACAGATCTAACAGCTGCAACTGAT
CGATTAATTTTGTCTGTTAAGACCTCGACTACCATACTAACTCCACCATACCCATATACC
TCATAGATCTTCTCGATAAAATCTTCTTGCCCCTTCTCAGAAGCCCTTTTAATATTACGC
CCCACAATGTCCTTGGGTACATCTAGGTCTTTTGCTTTCTCAAGAATGGTAGCTAGAACT
GTATTGGACACTGGGTTTGGTCCCCCTTTCCTGACAGCAGATACAACCTCCTTGCAAATC
CTACAGTAAAGCTTCGCCTTCTTTGAATCTTGAGCCCCCTGTATTCACCAGAAACTTCAA
TTTTCTAAAACAAAATCTCTCTGATCTAGATCAATCTTTTTTTTTGTACAACACCTATGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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G

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DS 

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CCATTTCCGAAATTGACCCCCAGTGAAACTTCCTGTAATGTATTTGTTCATTTTTGATCG
ATATAAACAGCATCAACATCATCAAGTTCAAGTAGTTTCTGCATAAGCTCTTTGTTCAGT
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T

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DS 

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TCCATGGCCTCATCATCCACCTCAACTGTAATCAGAGGGAGAAGTTCAGAGCCATTGTCA
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GGGGGATCAATAACATCCTCAGCTCCAGCATCTAGAGCAATAATAAAGAGCTGGTCTTTG
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TCATAGATCTT

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DS 

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DS 

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TTCCTGACAGCAGATACAACCTCCTTGCAAATCCTACAGTAAAGCTTCGCCTTCTTTGAA
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AACAAGTGGTGGGAATCAACAATTACAAGCTCTAGAAACAACTTATAAATTGATTATTCC
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TATGTTTGTACACCACCTATGACGAAACCTACTCAAAAGACATTTCATCAAACAAGTGGT
GGGCAACAACAATTACAAGCTCTAATTTGATTATTCCTGAGAGCATTTACAATCATTAGT
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 6

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TATCCCTTTGCTTGACGAGCCGACGAATCATTTAGATTTGGAAGCTTGTGTCTGGTTAGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F227TF U 1
AF RR4EQ25TF U 210
AF RR4GH90TF U 260
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AF RR4GH90JQ C 678
AF RR4EQ25JQ C 867
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BS 381 381 RR4EQ25TF
BS 382 670 RR4F227TF
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BS 762 762 RR4GH90TF
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BS 983 1449 RR4GH90JQ
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AGAGAGCCTGAAGAACTTTGAACGGATCCTTGTTGTGGTATCCCACTCGCAGGATTTTTT
GAACGGAGTGTGTACCAACATCATCCACATGCAAAGCAAGCAGCTCAAGTACTACACTGG
AAACTTCGACCAGTACTGCCAGACACGTTCCGAGCTAGAAGAGAATCAGATGAAACAATA
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TTCAGCCAAACTCGCTCGTCGAGCGCAGAGTAAGGAGAAGACTTTGGCGAAGATGGAGAG
AGGTGGGCTCACAGAGAAGGTGGCAAGAGACAGTGTTCTCGTTTTCCGATTTGCTGATGT
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CTATCTTATATACAAGAACATCGACTTTGGTGTTGACTTGGACTCAAGAGTGGCTCTTGT
TGGACCTAACGGAGCTGGGAAGAGTACTTTATTGAAGTTAATGACCGGTGAGCTGCACCC
GACTGAAGGA*TGGTGCGGCGTCACAACCACTTGAAGATTGCTCAGTACCATCAGCATCT
GGCTGAGAA

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DS 

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G
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CAGTGTTCTCGTTTTCCGATTTGCTGATGTCGGGAAGCTTCCACCTCCGGTGCTTCAGTT
TGTGGAAGTGTCTTTTGGCTACACACCGGACTATCTTATATACAAGAACATCGACTTTGG
TGTTGACTTGGACTCAAGAGTGGCTCTTGTTGGACCTAACGGAGCTGGGAAGAGTACTTT
ATTGAAGTTAATGACCGGTGAGCTGCACCCGACTGAAGGAATGGTGCGGCGTCACAACCA
CTTGAAGATTGCTCAGTACCATCAGCATCTGGCTGAGAAGCTTGACCTGGAAGTGCCTGC
GCTTATCTACATGATGAATGAGTTTCCGGGTAACGAAGAGGAGAAGATGAGAGCTGCCAT
TGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAAGGCTCAAGTGATGCCGAT

QA 2 643 2 643
DS 

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G
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TCTCCCACATGAAGGAGTACATTGCTCGGTTCGGTCACGGTTCAGCCAAACTCGCTCGTC
AAGCGCAGAGTAAGGAGAAGAATTTGGCGAAGATGGAGAGAGGTGGGCTCACAGAGAAGG
TGGCAAGAGACAGTGTTCTCGTTTTCCGATTTGCTGATGTCGGGAAGCTTCCACCTCCGG
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TCGACTTTGGTGTTGACTTGGACTCAAGAGTGGCTCTTGTTGGACCTAACGGAGCTGGGA
AGAGTACTTTATTGAAGTTAATGACCGGTGAGCTGCACCCGACTGAAGGAATGGTGCGGC
GTCACAACCACTTGAAGATTGCTCAGTACCATCAGCATCTGGCTGAGAAGCTTGACCTGG
ATGTGCCTGCGCTTATCTACACGATGAATGAGTTTCCGGGTAACGAAGAGGAGAAGATGA
GAGCTGCCATTGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAAGGCTCAAGTGATGCCGATGAAGAATC
TCTCTGATGGACAGAGGAGCCGTGTGATATTCGCGTGGTTGGCTTATAAGCAGCCTAACA
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AG
CGTTGACGAGT

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G
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TGAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGTTCTGGTGAGTCATGACTTCAGGTTGATTAACCAAG
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TGGACTTCAAGAAGCATCTCAAGGCTAAAGCTGGACTTGATGATTGAATATAAGAGTCAA
GTCGGAAGACTCTATTTGGGTCTTTGGCTAGAGAGTGAGAGGGATGGTTTTGGGAATGGT
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GAACGTTTTTTTGAAAGGCGAAACGGAGATGG

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DS 

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TGGATGTGCCTGCGCTTATCTACACGATGAATGAGTTTCCGGGTAACGAAGAGGAGAAGA
TGAGAGCTGCCATTGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAAGGCTCAAGTGATGCCGATGAAGA
ATCTCTCTGATGGACAGAGGAGCCGTGTGATATTCGCGTGGTTGGCTTATAAGCAGCCTA
ACATGCTTCTGTTGGATGAGCCTACTAACCATTTGGATATTGAGACGATTGACTCTCTGG
CCGAGGCGTTGAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGTTCTGGTGAGTCATGACTTCAGGTTGA
TTAACCAAGTGGCTCATGAGATATGGGTGTGTGAGAAGCAGTGCATCACTAAGTGGAATG
GTGACATTATGGACTTCAAGAAGCATCTCAAGGCTAAAGCTGGACTTGATGATTGAATAT
AAGAGTCAAGTCGGAAGACTCTATTTGGGTCTTTGGCTAGAGAGTGAGAGGGATGGTTTT
GGGAATGGTTATTAACGAGTTCTGAAGCCAACACGTTAAAGAGACTCGTAATCTCTTCAA
CTTCTTACTCGTTAAGAGGTCAGTGGTTCTATATCATTATTATCAATGCGCACTTTTATT
ATTGTTACTGAACGTTTTTTTGAAAGGCGAAACGGAGATGGAAAAAGTAATACTTTTGGT
TGTATTGTAGGATTATTTGTTTCATTTTATAAAAAGACTGAGATGTTGACGT
C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4EQ25JQ 616 0 0
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TGTTGGATGAGCCTACTAACCATTTGGATATTGAGACGATTGACTCTCTGGCCGAGGCGT
TTAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGTTTTGGTGAGTCATGACTTCAGGTTGATTAACCAAG
TGGCTCATGAGATATGGGTGTGTGAGAAGCAGTGCATCACTAAGTGGAATGGTGACATTA
TGGACTTCAAGAAGCATTTCAAGGCTAAAGCTGGACTTGATGATTGAATATAAGAGTCAA
GTCGGAAGACTCTATTTGGGTCTTTGGCTAGAGAGTGAGAGGGATGGTTTTGGGAATGGT
TATTAACGAGTTTTGAAGCCAACACGTTAAAGAGACTCGTAATTTTTTCAACTTTTTACT
CGTTAAGAGGTCAGTGGTTTTATATCATTATTATCAATGCGCACTTTTATTATTGTTACT
GAACGTTTTTTTGAAAGGCGAAACGGAGATGGAAAAAGTAATACTTTTGGTTGTATTGTA
GGATTATTTGTTTCATTTTATAAAAAGACTGAGATGTTGACGTTTATGGTATTTATTTAA
TAGTATTATAAAGTTG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 2 6

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CATCAACGAATTAAAATTATTATTTGTAATCTATTATTTTAGTAAATTTCCAAGTTAGCA
AACATCATATCATATGCATGTAACACACCGAGCAAAAAGCAAAAGCAAAAGCTAAATAAG
AAAAAGAAAAGACATAAAAAGGAGTTTTGATTTAAAAGCAAACACATCACACGATAAAAC
CAGATGCAAACGCATTCGTGGTAATCTTCTTGCTGCACAGGGTTCTTGTCCGAACATCTA
GTCTTGGTATCAGCAAAA*GCAGTGCTATATATAT**GGATTACAAA*GGGAGACCGGTT
ACCACTAAAACAGACTGTGTTTCAACTAACGATGAGGGTTCAATTTACGTCATGTCTGCT
GGAGTTTTTCTGAGTGGAACCACCTGATCAGTACTAGACGATCCGTTCATCACTGTATTT
ATTTTCTTCGAGCTTCCACTATTTTCCCCTTTTGTTACTTCGTTGGCAAAGTTCTGGTCA
GATACCTCTCCTATGGTCCTATAGTGCTTGATCCACGGGCTCTTAAGAAACTCATGGTTA
GAACCACCACCGTGTCTTCTTCCTTTGACACGATACTCATGAGGCTGTCTTACATTACTC
TTCTGTTCTTCAGATGGGTTTCCTCCTACGTTCTCCTTGCTCATCAAACTCGAACTGAGG
GAGCTATAAAGCTGGTCTACGAATGAAGCTTCCATTGATTTAAGATACAGACTATGCTTC
TCATCGGTCCATTCTGTAGGCATACACTCTTTTCCCGAGGAATACATAGAAGAAGTTATG
TCTTCGTCTACAGAAGAAGAATCGTCGGAGCTACGGATATAGTTCCTTATTTAATCACCA
ACCATTGGCTGTCTATCTTTGTTGAGAGAGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D036JQ U 1
AF RR4AL29JQ U 35
AF RR4AL29TF C 42
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RD RR4D036JQ 521 0 0
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AACATCATATCATATGCATGTAACACACCGAGCAAAAAGCAAAAGCAAAAGCTAAATAAG
AAAAAGAAAAGACATAAAAAGGAGTTTTGATTTAAAAGCAAACACATCACACGATAAAAC
CAGATGCAAACGCATTCGTGGTAATCTTCTTGCTGCACAGGGTTCTTGTCCGAACATCTA
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ACCACTAAAACAGACTGTGTTTCAACTAACGATGAGGGTTCAATTTACGTCATGTCTGCT
GGAGTTTTTCTGAGTGGAACCACCTGATCAGTACTAGACGATCCGTTCATCACTGTATTT
ATTTTCTTCGAGCTTCCACTATTTTCCCCTTTTGTTACTTCGTTGGCAAAGTTCTGGTCA
GATACCTCTCCTATGGTCCTATAGTGCTTGATCCACGGGCT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4AL29JQ 725 0 0
TATTTTA
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ACACATCACACGATAAAACCAGATGCAAACGCATTCGTGGTAATCTTCTTGCTGCACAGG
GTTCTTGTCCGAACATCTAGTCTTGGTATCAGCAAAA*GCAGTGCTATATATAT**GGAT
TACAAA*GGGAGACCGGTTACCACTAAAACAGACTGTGTTTCAACTAACGATGAGGGTTC
AATTTACGTCATGTCTGCTGGAGTTTTTCTGAGTGGAACCACCTGATCAGTACTAGACGA
TCCGTTCATCACTGTATTTATTTTCTTCGAGCTTCCACTATTTTCCCCTTTTGTTACTTC
GTTGGCAAAGTTCTGGTCAGATACCTCTCCTATGGTCCTATAGTGCTTGATCCACGGGCT
CTTAAGAAACTCATGGTTAGAACCACCACCGTGTCTTCTTCCTTTGACACGATACTCATG
AGGCTGTCTTACATTACTCTTCTGTTCTTCAGATGGGTTTCCTCCTACGTTCTCCTTGCT
CATCAAACTCGAACTGAGGGAGCTATAAAGCTGGTCTACGAATGAAGCTTCCATTGATTT
AAGATACAGACTATGCTTCTCATCGGTCCATTCTGTAGGCATACACTCTTTTCCCGAG

QA 8 725 8 725
DS 

RD RR4AL29TF 833 0 0
GTAA
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AAAGGGAGACCGGTTACCACTAAAACAGACTGTGTTTCAACTAACGATGAGGGTTCAATT
TACGTCATGTCTGCTGGAGTTTTTCTGAGTGGAACCACCTGATCAGTACTAGACGATCCG
TTCATCACTGTATTTATTTTCTTCGAGCTTCCACTATTTTCCCCTTTTGTTACTTCGTTG
GCAAAGTTCTGGTCAGATACCTCTCCTATGGTCCTATAGTGCTTGATCCACGGGCTCTTA
AGAAACTCATGGTTAGAACCACCACCGTGTCTTCTTCCTTTGACACGATACTCATGAGGC
TGTCTTACATTACTCTTCTGTTCTTCAGATGGGTTTCCTCCTACGTTCTCCTTGCTCATC
AAACTCGAACTGAGGGAGCTATAAAGCTGGTCTACGAATGAAGCTTCCATTGATTTAAGA
TACAGACTATGCTTCTCATCGGTCCATTCTGTAGGCATACACTCTTTTCCCGAGGAATAC
ATAGAAGAAGTTATGTCTTCGTCTACAGAAGAAGAATCGTCGGAGCTACGGATATAGTTC
CTTATTTAATCACCAACCATTGGCTGTCTATCTTTGTTGAGAGAGGAAG

QA 5 833 5 833
DS 



CO CL1449Contig2 919 3 33 U
TTTTTCTTCCTCTCTCAACAAAGATAGACAGCCAATGGTTGGTGATTAAATAAGGAACTA
TATCCGTAGCTCCGACGATTCTTCTTCTGTAGACGAAGACACAACTTCTTCTATGTATTC
CTCGGGAAAAGAGCGTATGCCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAA
ATCAATGGAAGCTTCATTCGTAGACCAGCTTTATAGCTCCCTCAGTTCGAGTTTGATGAG
CAAGGAGAACGTAGGAGGAAACCCATCTGAAGAACAGTTCAAGGTTTTTCGTGATGGTTT
CTGGCAGAAGATGAATGTAAGACAGCCTCATGAGTATCGTGTCAAAGGAAGAAGACACGG
TGGTGGTTCTAACCATTAGTTTCTTAAGAGTCCGTGGATCAAGCACTATAGGACCATAGG
AGAGGTATCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGTGAAAATAGTGGAGGCTC
GAAGAAGATAAAGACAGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTGGTTCCACTCAG
AAAAACTCCTGCAGACATGACGTAAGTTGAAACCCTCATCGTTAGTTGAAACACAGTCTG
TTTTAGTGGTAGCCGGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATAG*GCACTGCTTTTGCTGAT
ACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCAGCAAGAAGATTACCACGAATGCGTT
TGCATCTGGTTTTATCGTGTGATGTGTTTAATTTAAATCAAAAGTACTCCTTTTTCTGCC
TTTTCTTTTTATCTTATTTTGCTTTTGCTTTTTGTTTGGTGTGTTACATGCATATGATAT
GATGTTTGCTAACTTGGAAATGTACTAGTAAAATAATAGATTACAAATAATAATTTTAAT
TCGTTGATGATATTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D036TF U 1
AF RR4EZ10TF U 87
AF RR4EZ10JQ C 285
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BS 848 919 RR4EZ10JQ

RD RR4D036TF 739 0 0
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TATCCGTAGCTCCGACGATTCTTCTTCTGTAGACGAAGACATAACTTCTTCTATGTATTC
CTCGGGAAAAGAGCGTATGCCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAA
ATCAATGGAAGCTTCATTCGTAGACCAGCTTTATAGCTCCCTCAGTTCGAGTTTGATGAG
CAAGGAGAACGTAGGAGGAAACCCATCTGAAGAATAGTTCAAGGTTTTTCGTGATGGTTT
CTGGCAGAAGAGTAATGTAAGACAGCCTCATGAGTATCGTGTCAAAGGAAGAAGACACGG
TGGTGGTTCTAACCATGAGTTTCTTAAGAGCCCGTGGATCAAGCACTATAGGACCATAGG
AGAGGTATCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGGGAAAATAGTGGAAGCTC
GAAGAAAATAAATACAGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTGGTTCCACTCAG
AAAAACTCCAGCAGACATGACGTAAATTGAA*CCCTCATCGTTAGTTGAAACACAGTCTG
TTTTAGTGGTAACCGGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATATAGCACTGCTTTTGCTGAT
ACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCAGCAAGAAGATTACCACGAATGCGTT
TGCATCTGGTTTTATCGTG

QA 1 739 1 739
DS 

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GG
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TGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCATTCGTAGACCAG
CTTTATAGCTCCCTCGGTTGGAGTTTGATGAGCAAGGAGAACGTAGGAGGAAACCCATCT
GAAGAACAGTTCAAGGTTTTTCGTGATGGTTTCTGGCAGAAGATGAATGTAAGACAGCCT
CATGAGTATCGTGTCAAAGGAAGAAGACACGGTGGTGGTTCTAACCATTAGTTTCTTAAG
AGTCCGTGGATCAAGCACTATAGGACCATAGGAGAGGTATCTGACCAGAACTTTGCCAAC
GAAGTAACAAAAGGTGAAAATAGTGGAGGCTCGAAGAAGATAAAGACAGTGATGAACGGA
TCGTCTAGTACTGATCAGGTGGTTCCACTCAGAAAAACTCCTGCAGACATGACGTAAGTT
GAAACCCTCATCGTTAGTTGAAACACAGTCTGTTTTAGTGGTAGCCGGTCTCCCTTTGTA
ATCCATATATATAG*GCACTGCTTTTGCTGATACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACC
CTGTGCAGCAAGAAGATTACCACGAATGCGTTTGCATCTGGTTTTATCGTGTGATGTGTT
TAATTTAAATCAAAAGTACTCCTTTTTCTGCCTTTTCTTTT*ATCTTATTTTGCTTTTGC
TTTTTGTTTGGTGTGTTACATGCATATGATATGATGTTT

QA 3 761 3 761
DS 

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ACTATAGGACCATAGGAGAGGTATCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGTG
AAAATAGTGGAGGCTCGAAGAAGATAAAGACAGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATC
AGGTGGTTCCACTCAGAAAAACTCCTGCAGACATGACGTAAGTTGAAACCCTCATCGTTA
GTTGAAACACAGTCTGTTTTAGTGGTAGCCGGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATAG*G
CACTGCTTTTGCTGATACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCAGCAAGAAGA
TTACCACGAATGCGTTTGCATCTGGTTTTATCGTGTGATGTGTTTAATTTAAATCAAAAG
TACTCCTTTTTCTGCCTTTTCTTTTTATCTTATTTTGCTTTTGCTTTTTGTTTGGTGTGT
TACATGCATATGATATGATGTTTGCTAACTTGGAAATGTACTAGTAAAATAATAGATTAC
AAATAATAATTTTAATTCGTTGATGATATTTATGC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 6

CO CL1450Contig1 601 6 7 U
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AAGGCGTCATCCAAAAAAACCGGATTTTATAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTT
CACTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGC
AAGAACGGAAAATAAACATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTTTGGT
TTTTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAG
CGGGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAA
AAATAATATTCGTAGAAAGTATTTCACCTCTATGGATTTGCAATAATACAGAATTCCCAT
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 

AF RR4GU49JQ C 1
AF RR4GU49TF U 1
AF RR4FO24TF U 23
AF RR4C161JQ C 384
AF RR4C161TF U 384
AF RR4FO24JQ C 234
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TTTTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAG
CGGGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAA
AAATAATATTCGTAGAAAGTATTTCACC
CT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4GU49TF 570 0 0
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AGAGAAAAAGTAGTTTCCTCCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGGTAATTTTGACAGAA
AGAATAAATGCTTATAAACCAAAAGATTTCGAGCGCGACTGTCGTGGAAGTCCACTCAAA
AATGCACCGCCGGATATGTGTACTAAACTAAATGCTCGTGCTGAATGTGAGCGTCTTTGC
AAGGCGTCATCCAAAAAAACCGGATTTTATAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTT
CACTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGC
AAGAACGGAAAATAAACATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTCTGTT
TTTTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAG
CGGGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAA
AAATAATATTCGTAGAAAGTATTTCACC
CT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4FO24TF 575 0 0
AAAAAATCGTAAACAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTAGTTTCCTCCT
CTATTATTCTTCTGATACCTTTGGTAATTTTGACAGAAAGAATAAATGCTTATAAACCAA
AAGATTTCGAGCGCGACTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAATCCACCTCCGGATATGTGTA
CTAAACTAAATGCTCGTGCTGAATGTGAGCGTCTTTGCAAGGCGTCATCCAAAAAAACCG
GATTTTATAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTTCACTATTGCCACTGCTACATGT
TTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAAACATATA
TACATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTTTGGTTTTTTTAAACAAGAAATAATAA
CTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAAT
TTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGTAT
TTCACCTCTATGGATTTGCAATAATACAGAATTC
A

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4C161JQ 186 0 0
GG
ATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTTTG*TTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTA
TATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAATTTG
TTGTAAGACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGTATTTC
ACCT

QA 3 186 3 186
DS 

RD RR4C161TF 186 0 0
GG
ATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTTTG*TTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTA
TATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAATTTG
TTGTAAGACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGTATTTC
ACCT

QA 3 186 3 186
DS 

RD RR4FO24JQ 368 0 0
TT
TTTGCAAGGGGTCATCCAAAAAAACCGGATTTTATAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCA
ATGTTCACTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCCCCACCCATGTTTC
CTGGCAAGAACGGAAAATAAACATATATACATTTATATTTGTTTATTCCAATAAAATTTT
TTGGTTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATTTCCATTTATTTATAG
ATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTTTATAGATCA
GCAAAAAATAATATTTGTAGAAAGTATTTCACCTTTATGGATTTGCAATAATACAGAATT
CCCATT

QA 3 368 3 368
DS 



AS 1 6

CO CL1451Contig1 657 6 9 U
GGGTCAGAAAATAAAAGAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGG
CAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCTTCTGTTTCTCCCA
TCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTC
TGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGA
GAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGG
CGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTC
ACTTCCCAACCCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACT
TAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATT
ACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTC
TTTGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTTCTTTCCTTCGGTTTTCTATATT
TGATGTTTCATACAATGTTTTTATTTTTTAAAACCAGATCGGACAGGTGATTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR52JQ C 219
AF RR4E986TF U 16
AF RR4FR52TF U 17
AF RR4GI23JQ C 17
AF RR4GI23TF U 17
AF RR4A418TF U 1
BS 1 16 RR4A418TF
BS 17 17 RR4E986TF
BS 18 172 RR4A418TF
BS 173 173 RR4E986TF
BS 174 370 RR4A418TF
BS 371 371 RR4FR52TF
BS 372 583 RR4A418TF
BS 584 584 RR4FR52TF
BS 585 657 RR4A418TF

RD RR4FR52JQ 366 0 0
TTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGG
CTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAG
AGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACCCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGG
TTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCCCCTTCGGACAAATCGGA
TTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTA
CTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTT
CTTTCC

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR4E986TF 539 0 0
G
GAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGC
TCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCTTCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCT
CTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGC
ATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGT
GGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAG
CCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCC
TGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTG
CCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAATATTACTTCAAGAAATAAAT
CATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCG

QA 2 539 2 539
DS 

RD RR4FR52TF 568 0 0
GAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGC
TCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCTTCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCT
CTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGC
ATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGT
GGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAG
CCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACCCCTCC
TGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTG
CCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAAT
CATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCGTG
TAATATTATGAATCAAAACTTTCTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4GI23JQ 568 0 0
GAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGC
TCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCTTCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCT
CTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGC
ATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGT
GGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAG
CCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACCCCTCC
TGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTG
CCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAAT
CATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCGTG
TAATATTATGAATCAAAACTTTCTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4GI23TF 568 0 0
GAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGC
TCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCTTCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCT
CTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGC
ATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGT
GGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAG
CCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACCCCTCC
TGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTG
CCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAAT
CATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCGTG
TAATATTATGAATCAAAACTTTCTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4A418TF 657 0 0
GGGTCAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGG
CAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCTTCTGTTTCTCCCA
TCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAATAACCCTC
TGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGA
GAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGG
CGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTC
ACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACT
TAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATT
ACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTC
TTTGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTTCTTTCTTTCGGTTTTCTATATT
TGATGTTTCATACAATGTTTTTATTTTTTAAAACCAGATCGGACAGGTGATTGAACC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 2 5

CO CL1452Contig1 1384 2 2 U
GGGTTCTCTCTCTCTCTCTGCCCGCACCACACACTTTACTCTCCTCCAACAGTAGATCTC
ATCTCCCATTCCAAACCCTAGAAAAACCAATCAAATTCAATTAGCCACAGCTTGCTCCAC
CAATGGCGAGCTTCAGTCTCCCCAAGTCACTCCTCCTTCTACTCCTCTCGCCTTTACTCC
CACTCTTCTCCACGATCACGATATCTGAAGCTAAACCATCATTTGCCTTCGGTAAAAATG
GAAACTTTGAGCCCGAAGACATCGCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTCCTCCACGGCGGAT
CTTCGATTTCGATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCATAACAGCGGGCGAGTCGTCTACA
ATAAGCCCATTGAGTTCGTCGAGACTAGGTCCGAGTATCCCGCCGGATTCTCTACTCTCA
TCTCTTTCTCCGTCAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTTCCTGTTAACGGGA
CGTTTGATCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCTTTTGAAAGGAATGTGACTGTGA
GTGTAGATGGCTCTACGGTTCCTGAGGAGACTCGCAGTTTCACGGTAGCTAACTTGGAGG
AAGAGGATAAGGAGGTGAAGGTGTTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAACTACATTGCTGGTG
GGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGA
TGTTCACTAGGATCGACTTGTCGGGAATGTTGAAAAGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTG
TGAAGGCGTACGGTGGGAACGTTGGTCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGGAGCGTCC
CTAAGGGTGTGCACTCTTATGGGGCGATTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGG
CGGAGAAGAGGAGGAGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGA
TGACCTTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTCTTCGCCATGATGCATATTTGGGCAGCATTCA
AAAGGAACAATCTTGTGATGACAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAG
CTGTGATGAGTAAAGCTGATAGCGCAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGA
TATCTCTATGTGTGTTTGTTTAGGATACGATCTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCATT
GGCTAAATATAGCCCCCTTGTTTTTCATTTCATGTGTGAACTTGCAAACACTGTTTCTCT
TATGGCATGTTCAGTTTGTTTCAGTATGCAAAACTTGACAAGATGGGATACCGGTTTGTG
GTAGAAGAGAAAAAAACATATTTAATCTCCAACATTATATATGTAATAACGAATGTTATA
AGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4AX44TF U 1
AF RR4AX44JQ C 443
BS 1 713 RR4AX44TF
BS 714 1384 RR4AX44JQ

RD RR4AX44TF 713 0 0
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ATCTCCCATTCCAAACCCTAGAAAAACCAATCAAATTCAATTAGCCACAGCTTGCTCCAC
CAATGGCGAGCTTCAGTCTCCCCAAGTCACTCCTCCTTCTACTCCTCTCGCCTTTACTCC
CACTCTTCTCCACGATCACGATATCTGAAGCTAAACCATCATTTGCCTTCGGTAAAAATG
GAAACTTTGAGCCCGAAGACATCGCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTCCTCCACGGCGGAT
CTTCGATTTCGATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCATAACAGCGGGCGAGTCGTCTACA
ATAAGCCCATTGAGTTCGTCGAGACTAGGTCCGAGTATCCCGCCGGATTCTCTACTCTCA
TCTCTTTCTCCGTCAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTTCCTGTTAACGGGA
CGTTTGATCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCTTTTGAAAGGAATGTGACTGTGA
GTGTAGATGGCTCTACGGTTCCTGAGGAGACTCGCAGTTTCACGGTAGCTAACTTGGAGG
AAGAGGATAAGGAGGTGAAGGTGTTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAACTACATTGCTGGTG
GGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGAT

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DS 

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AGTAAAGTTCGGTGCTTTTGAAAGGAATGTGACTGTGAGTGTAGATGGCTCTACGGTTCC
TGAGGAGACTCGCAGTTTCACGGTAGCTAACTTGGAGGAAGAGGATAAGGAGGTGAAGGT
GTTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAACTACATTGCTGGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTT
AAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTCACTAGGATCGACTTGTC
GGGAATGTTGAAAAGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTACGGTGGGAACGT
TGGTCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGGAGCGTCCCTAAGGGTGTGCACTCTTATGG
GGCGATTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAGGAGGAGGATGAG
AAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGGCT
TGTGTTCTTCGCCATGATGCATATTTGGGCAGCATTCAAAAGGAACAATCTTGTGATGAC
AAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGAGTAAAGCTGATAG
CGCAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATCTCTATGTGTGTTTGTTTA
GGATACGATCTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCATTGGCTAAATATAGCCCCCTTGTT
TTTCATTTCATGTGTGAACTTGCAAACACTGTTTCTCTTATGGCATGTTCAGTTTGTTTC
AGTATGCAAAACTTGACAAGATGGGATACCGGTTTGTGGTAGAAGAGAAAAAAACATATT
TAATCTCCAACATTATATATGTAATAACGAATGTTATAAGCT

QA 1 942 1 942
DS 



CO CL1452Contig2 1236 3 8 U
CTTCTCTGTTCTTTCTCTCTCTCTGCCCGCACCACACACTTTACTCTCCTCCAACAGTAG
ATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAAAACCAATCAAATTCAATTTAGCCACAGCTTG
CTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCTCCCCAGGTCCCTCTTCCTTCTACTCCTCTCGCCTT
TACTATCACTCTTCTCCGCAATCACGATATCTGAAGCTAAACCATCCTTCACCTTCCGTA
AAAATGGAAGCTTTGCGTCCGAAGACATCGCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTCCTCCACG
GCGGATCTTCGATTTCGATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCATAACAGTGGGCGAGTCG
TCTACAAGAAGCCCATCGACTTCGTCGAGACCAAGTCCGAGTATCCCGCCGGATTCTCTA
CTCTCATCTCTTTCTCCGTTAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTTCCTATTA
ACGGAACGTTTGATCAATCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTACTTTTTTTGAAAGGAATG
TAACTGTGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCCGAGGAGATTCGCAGTTTCACGGTTGCTA
ACTTGGAGGAAGAGGATAAGGAGAAGAAGGTAGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACA
TTGCAAGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCCAACACGTTG
ATCCTTTGATGTTCACTAGGATCGACTTGTCGGGAATGTTGAAAGGTGACAGTGAGTTCA
TGGTTGGTGTGAAGTCGTACGGTGGGAACGTGAATCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGA
GGAGTGTCCCTAAGGGTGTGCACTCTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGG
AAGAGGAGGAGGCGAAGAGGAGGAGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTT
GCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTCTTCGCTATGATGCATATATGGG
CAGCTTTCAAAAGGAACAATCTTGTGATGACAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGA
AAATGGAAGCTGTGATGAGTAAAACTGATAGCGCAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAA
GTGTTGTGACATCTCTATGTGTGTTTGTTTAGGATATGATCTTTTATGTAATCAAGTAGA
TTCTTCACTGGCTAAACATAGCCCACTTGTTTTTCC


BQ
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AF RR4ER19TF U 24
AF RR4CO20TF U 1
AF RR4CO20JQ C 530
BS 1 98 RR4CO20TF
BS 99 99 RR4ER19TF
BS 100 184 RR4CO20TF
BS 185 185 RR4ER19TF
BS 186 236 RR4CO20TF
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BS 238 623 RR4CO20TF
BS 624 1236 RR4CO20JQ

RD RR4ER19TF 292 0 0
G
GCCCGCACCACACACTTTACTCTCCTCCAACAGTAGATCTCATCTCCCATTTCAAACCCT
AGAAAAACCAATCAAATTCAATTTAGCCACAGCTTGCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTC
TCCCCAGGTCCCTCTTCCTTCTACTCCTCTCGCCTTTACTATCACTCTTCTCCGCAATCA
CGATATCTGAAGCTAAACCATCTTTCACCTTCCGTAAAAATGGAAGCTTTGCGTCCGAAG
ACATCGCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTCCTCCACGGCGGATCTTCGATTT

QA 2 292 2 292
DS 

RD RR4CO20TF 627 0 0
CTTCTCTGTTCTTTCTCTCTCTCTGCCCGCACCACACACTTTACTCTCCTCCAACAGTAG
ATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAAAACCAATCAGATTCAATTTAGCCACAGCTTG
CTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCTCCCCAGGTCCCTCTTCCTTCTACTCCTCTCGCCTT
TACTCTCACTCTTCTCCGCAATCACGATATCTGAAGCTAAACCATCCTTCACCTTCGGTA
AAAATGGAAGCTTTGCGTCCGAAGACATCGCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTCCTCCACG
GCGGATCTTCGATTTCGATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCATAACAGTGGGCGAGTCG
TCTACAAGAAGCCCATCGACTTCGTCGAGACCAAGTCCGAGTATCCCGCCGGATTCTCTA
CTCTCATCTCTTTCTCCGTTAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTTCCTATTA
ACGGAACGTTTGATCAATCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTACTTTTTTTGAAAGGAATG
TAACTGTGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCCGAGGAGATTCGCAGTTTCACGGTTGCTA
ACTTGGAGGAAGAGGATAAGGAG
AAGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4CO20JQ 707 0 0
TGAAAGGAATGTAACTGTGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCCGAGGAGATTCGCAGTTT
CACGGTTGCTAACTTGGAGGAAGAGGATAAGGAGAAGAAGGTAGTGTTGTTGTACGCTTG
GGTTAATTACATTGCAAGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTT
CCAACACGTTGATCCTTTGATGTTCACTAGGATCGACTTGTCGGGAATGTTGAAAGGTGA
CAGTGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGTCGTACGGTGGGAACGTGAATCTCCACTCTTGGAG
CTTAGAAGCGAGGAGTGTCCCTAAGGGTGTGCACTCTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAA
GCTTATAGAGGAAGAGGAGGAGGCGAAGAGGAGGAGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGA
GATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTCTTCGCTATGAT
GCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAATCTTGTGATGACAAAGGAGTTTGAGTATGA
GAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGAGTAAAACTGATAGCGCAAAATGAAAACAAGT
GAAGTAATCAAGTGTTGTGACATCTCTATGTGTGTTTGTTTAGGATATGATCTTTTATGT
AATCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAAACATAGCCCACTTGTTTTTCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 6

CO CL1453Contig1 1040 4 13 U
AGAATATAAATTGTTGTTGCACAATATAATAATCAACTTCCTCTCAAACATGTATCTGCG
TATCTGGTCAGATAGTCCATTATTTATTCCATGCGAGACATCATGATGGTTTACAAGAAG
ATCTCACCTCACAAGGGCATATGCATGCACACTACAATTAAAAAAGTCACTGATTCTGAC
TCGAGTCTCTTCTTTTTTTTTTTGTAAAAGTGTCGCTTTATTGACCACCGAATTGCTTAT
GGATATCGGTGAAGGATACGGTGGCTGAACCTCTGCGTTTGGCCTGAGGATGAGACGCGT
GTTCTCTCCATCCCGTCATGTAAATCACCTGAAAAGTAGCAGGTATAGTGCCGTCTTCAG
TGGCGAACATGGAGTCATATATGGCGGCCGTGGCAAGAGCAGTTTCACGATTCAATATCT
TGTTTCTCTGGAGAAGAGCGTTGGTTTCACCCATTGCACGAAGATGCTCTATAAGATCCA
GCGCACTCTTGTATTTAACAACATATTCGTCAACGTCAACACCAGGAAGACTAAAACCCG
CCCTGGTCAACAGATTCCCTGCGTCCCTAACCTGTGCCAAAGGAGATAGGCGGGGACTAA
TCCCTCCTTCGCGCTCCATGTGAGCCAAAGTGCACGCTATTCTCAGCTCCTTTAAGGTTT
CTCCCACCAAGAATGGCTGCTAAAAACAAGCCATCAGGCTTCAGAGCCAGTTTGCACTGT
ATCATGGAACCTGGGAAGATCGTTTGTCCAATGAAGCCCCCAAGGGAACTTATGATCAAA
ATCAACCGAACTCTCTTTGATAGGGGAGAAAACTCTTTCGTCACCAACCAAGTAAGATGT
CTCGATGGGAGTTATCAAAGTGGGAGCATCTCTGCATGATTTAATCATGTCATGTGAGGG
TATCCATCATAAATTAGCTTTTCAAATCCCACCGCGACCAAAGTAGGGAGTCGCTGAACA
GAACCAAGAGATCCTCCCAAAACACAATGCAGATGGAAAAACTCTTCTTACAATCCTCTA
AGCGGTCAAGAAGATTCTCA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D819JQ U 1
AF RR4B764JQ U 66
AF RR4DN40JQ U 1
AF RR4B764TF C 576
BS 1 201 RR4D819JQ
BS 202 203 RR4DN40JQ
BS 204 232 RR4D819JQ
BS 233 233 RR4DN40JQ
BS 234 368 RR4D819JQ
BS 369 369 RR4DN40JQ
BS 370 595 RR4D819JQ
BS 596 634 RR4DN40JQ
BS 635 635 RR4B764TF
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BS 665 665 RR4B764TF
BS 666 686 RR4DN40JQ
BS 687 1040 RR4B764TF

RD RR4D819JQ 595 0 0
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TATCTGGTCAGATAGTCCATTATTTATTCCATGCGAGACATCATGATGGTTTACAAGAAG
ATCTCACCTCACAAGGGCATATGCATGCACACTACAATTAAAAAAGTCACTGATTCTGAC
TCGAGTCTCTTCTTTTTTTTT**GTAAAAGTGTCGCTTTATTGACCACCGAAATGCTTAT
GGATATCGGTGAAGGATACGGTGGCTGAACCTCTGCGTTTGGCCTGAGGATGAGACGCGT
GTTCTCTCCATCCCGTCATGTAAATCACCTGAAAAGTAGCAGGTATAGTGCCGTCTTCAG
TGGCGAACGTGGAGTCATATATGGCGGCCGTGGCAAGAGCAGTTTCACGATTCAATATCT
TGTTTCTCTGGAGAAGAGCGTTGGTTTCACCCATTGCACGAAGATGCTCTATAAGATCCA
GCGCACTCTTGTATTTAACAACATATTCGTCAACGTCAACACCAGGAAGACTAAAACCCG
CCCTGGTCAACAGATTCCCTGCGTCCCTAACCTGTGCCAAAGGAGATAGGCGGGG

QA 1 595 1 595
DS 

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ACCTCACAAGGGCATATGCATGCACACTACAATTAAAAAAGTCACTGATTCTGACTCGAG
TCTCTTCTTTTTTTTTTTGTAAAAGTGTCGCTTTATTGACCACAGAATTGCTTATGGATA
TCGGTGAAGGATACGGTGGCTGAACCTCTGCGTTTGGCCTGAGGATGAGACGCGTGTTCT
CTCCATCCCGTCATGTAAATCACCTGAAAAGTAGCAGGTATAGTGCCGTCTTCAGTGGCG
AACATGGAGTCATATATGGCGGCCGTGGCAAGAGCAGTTTCACGATTCAATATCTTGTTT
*TCTGGAGAAGAGCGTTGGTTTCACCCATTGCACGAAGATGCTCTATAAGATCCAGCGCA
CTCTTGTATTTAACAACATATTCGTCAACGTCAACACCAGGAAGACTAAAACCCGCCCTG
GTCAACAGATTCCCTGCGTCCCTAACCTGTGCCAAAGG

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4DN40JQ 686 0 0
G
GAATATAAATTGTTGTTGCACAATATAATAATCAACTTCCTCTCAAACATGTATCTGCGT
ATCTGGTCAGATAGTCCATTATTTATTCCATGCGAGACATCATGATGGTTTACAAGAAGA
TCTCACCTCACAAGAGCATATGCATGCACACTACAATTAAAAAAGTCACTGATTCTGACT
CGAGTCTCTTCTTTTTTTTTTTGTAAAAGTGTCGCTTTATTGACCACCGAATTGCTTATG
GATATCGGTGAAGGATACGGTGGCTGAACCTCTGCGTTTGGCCTGAGGATGAGACGCGTG
TTCTCTCCATCCCGTCATGTAAATCACCTGAAAAGTAGCAGGTATAGTGCCGTCTTCAGT
GGCGAACATGGAGTCATATATGGCGGCCGTGGCAAGAGCAGTTTCACGATTCAATATCTT
GTTTCTCTGGAGAAGAGCGTTGGTTTCACCCATTGCACGAAGATGCTCTATAAGATCCAG
CGCACTCTTGTATTTAACAACATATTCGTCAACGTCAACACCAGGAAGACTAAAACCCGC
CCTGGTCAACAGATTCCCTGCGTCCCTAACCTGTGCCAAAGGAGATAGGCGGGGACTAAT
CCCTCCTTCGCGCTCCATGTGAGCCAAAGTGCATGCTATTCTCAGCTCCTTTAAGGTTTC
TCC*ACCAAGAATGGCTGCTAAAAA

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR4B764TF 465 0 0
GCCAAAGGAGATAGGCGGGGACTAATCCCTCTTTCGCGCTCCATGTGAGCCAAAGTGCAC
GCTATTCTCAGCTCCTTTAAGGTTTCTCCCACCAAGAATGGCTGCTAAAAACAAGCCATC
AGGCTTCAGAGCCAGTTTGCACTGTATCATGGAACCTGGGAAGATCGTTTGTCCAATGAA
GCCCCCAAGGGAACTTATGATCAAAATCAACCGAACTCTCTTTGATAGGGGAGAAAACTC
TTTCGTCACCAACCAAGTAAGATGTCTCGATGGGAGTTATCAAAGTGGGAGCATCTCTGC
ATGATTTAATCATGTCATGTGAGGGTATCCATCATAAATTAGCTTTTCAAATCCCACCGC
GACCAAAGTAGGGAGTCGCTGAACAGAACCAAGAGATCCTCCCAAAACACAATGCAGATG
GAAAAACTCTTCTTACAATCCTCTAAGCGGTCAAGAAGATTCTCA

QA 1 465 1 465
DS 



CO CL1453Contig2 726 2 4 U
GGGACTGTCCGACGTTTTCCCGGTGAAGCTCAAGAGAATTCAATGTACGGACGAATCGGG
AATATCAAGAGAGTACTCGAAAAACCAAGGAAGCAATCTCACACATTTATGGCCTCTCTC
TCCTTCTCTACAGAGGACGGTAGTGGTTATGGCGGTGGCGGCGGTGAGTCTCAGCAGCAG
AATAGCTCGTCAAGGGTGAAGATCTTCGATCGAGATCTCAAGCGCGTACATCGTGACAGA
GCGGCGTGGCTGTCTCGCAATAAAAACGACACCTTTGTCGACGCTGTTGCTGAGAATCTT
CTTGACCGCTTAGAGGATTGTAAGAAGAGTTTTCCATCTGCATTGTGTTTGGGAGGATCT
CTTGGTTCTGTTCAGCGACTCCTACGTGGTCGCGGTGGGATTGAAAAGCTAATTATGATG
GATACCTCACATGACATGATTAAATCATGCAGAGATGCTCCACTTGATAACTCCATCGAG
ACATCTTACTTGGTTGGCGACGAAGAGTTTCTCCCTATCAAAGAGAGTTCGGTTGATTTG
ATCATAAGTTCCTTGGGGCTTCATTGGACAAACGATCTTCCAGGTTCCATGATACAGTGC
AAACTGGCTCTGAAGCCTGATGGCTTGTTTTTAGCAGCCATTCTTGGTGGAGAAACCTTA
AAGGAGCTGAGAATAGCATGCACTTTGGCTCACATGGAGCGCGAAAGAGGGATAGTCCCG
CCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4D819TF U 1
AF RR4DN40TF U 21
BS 1 478 RR4D819TF
BS 479 479 RR4DN40TF
BS 480 626 RR4D819TF
BS 627 726 RR4DN40TF

RD RR4D819TF 626 0 0
GGGACTGTCCGACGTTTTCCCGGTGAAGCTCAAGAGAATTCAATGTACGGACGAATCGGG
AATATCAAGAGAGTACTCGAAAAACCAAGGAAGCAATCTCACACATTTATGGCCTCTCTC
TCCTTCTCTACAGAGGACGGTAGTGGTTATGGCGGTGGCGGCGGTGAGTCTCAGCAGCAG
AATAGCTCGTCAAGGGTGAAGATCTTCGATCGAGATCTCAAGCGCGTACATCGTGACAGA
GCGGCGTGGCTGTCTCGCAATAAAAACGACACCTTTGTCGACGCTGTTGCTGAGAATCTT
CTTGACCGCTTAGAGGATTGTAAGAAGAGTTTTCCATCTGCATTGTGTTTGGGAGGATCT
CTTGGTTCTGTTCAGCGACTCCTACGTGGTCGCGGTGGGATTGAAAAGCTAATTATGATG
GATACCTCACATGACATGATTAAATCATGCAGAGATGCTCCACTTGATAACTCCATCGGG
ACATCTTACTTGGTTGGCGACGAAGAGTTTCTCCCTATCAAAGAGAGTTCGGTTGATTTG
ATCATAAGTTCCTTGGGGCTTCATTGGACAAACGATCTTCCAGGTTCCATGATACAGTGC
AAACTGGCTCTGAAGCCTGATGGCTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4DN40TF 706 0 0
G
GGTGAAGCTCAAGAGAATTCAATGTACGGACGAATCGGGAATATCAAGAGAGTACTCGAA
AAACCAAGGAAGCAATCTCACACATTTATGGCCTCTCTCTCCTTCTCTACAGAGGACGGT
AGTGGTTATGGCGGTGGCGGCGGTGAGTCTCAGCAGCAGAATAGCTCGTCAAGGGTGAAG
ATCTTCGATCGAGATCTCAAGCGCGTACATCGTGACAGAGTGGCGTGGCTGTCTCGCAAT
AAAAACGACACCTTTGTCGACGCTGTTGCTGAGAATCTTCTTGACCGCTTAGAGGATTGT
AAGAAGAGTTTTCCATCTGCATTGTGTTTGGGAGGATCTCTTGGTTCTGTTCAGCGACTC
CTACGTGGTCGCGGTGGGATTGAAAAGCTAATTATGATGGATACCTCACATGACATGATT
AAATCATGCAGAGATGCTCCACTTGATAACTCCATCGAGACATCTTACTTGGTTGGTGAC
GAAGAGTTTCTCCCTATCAAAGAGAGTTCGGTTGATTTGATCATAAGTTCCTTGGGGCTT
CATTGGACAAACGATCTTCCAGGTTCCATGATACAGTGCAAACTGGCTCTGAAGCCTGAT
GGCTTGTTTTTAGCAGCCATTCTTGGTGGAGAAACCTTAAAGGAGCTGAGAATAGCATGC
ACTTTGGCTCACATGGAGCGCGAAAGAGGGATAGTCCCGCCTATC

QA 2 706 2 706
DS 



AS 2 6

CO CL1454Contig1 622 2 2 U
TTTTTTTTACAAACAAACAATATTTATAAAGTTATATTACAAAGGTTGCATACTTGCATC
GGCTATAGATTGTGTTTTAGGTTGTTTCTTATTGAATTATATGTTTAGATTAAAAAGTTA
GAACACATTTTTTAACATAGATTGGCTTGAAATGGCTTAACTAGCGGAACAAGCGAGCCG
CTAAGGTGCATCGACATGACTTCATTGGTCGAACCAACGAGCTTCCCATCAACAAAGATG
GCTGGAACCGGTGTGGAACACCCGAGCCTCATTAGGGCTTTCTCTATCTCACGACAATCA
GGGTCCTTGTCTATCTCATGGACGGTCGGGTGAACCCCAAGGTCTTGGAAGAGGACCTGG
ACCGCATAGGACATGCAACACGAGCTCTTGCTGAATATAACAACTCCTTTCTCCGAAGAC
ATTCTCACAACTTTGTCCATGGTTTCTTAAAGGAAGTCTCAATCAATCTGTAGTTTGTTT
CTTGGAGAAGAAGACACAAAATTCTTCTCTCTTGTAGTTTGAAAGATATCTAAAACCAAA
AGCCCATGAAATAAACCTAGCTTTTGGGTGAAGAAAAGAGTTTTTGTTGTTGTATATCCT
ACAGTATTAAGCTCAGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ78TF C 1
AF RR4BQ78JQ U 9
BS 1 8 RR4BQ78TF
BS 9 622 RR4BQ78JQ

RD RR4BQ78TF 622 0 0
TTTTTTTTACAAACAAACAATATTTATAAAGTTATATTACAAAGGTTGCATACTTGCATC
GGCTATAGATTGTGTTTTAGGTTGTTTCTTATTGAATTATATGTTTAGATTAAAAAGTTA
GAACACATTTTTTAACATAGATTGGCTTGAAATGGCTTAACTAGCGGAACAAGCGAGCCG
CTAAGGTGCATCGACATGACTTCATTGGTCGAACCAACGAGCTTCCCATCAACAAAGATG
GCTGGAACCGGTGTGGAACACCCGAGCCTCATTAGGGCTTTCTCTATCTCACGACAATCA
GGGTCCTTGTCTATCTCATGGACGGTCGGGTGAACCCCAAGGTCTTGGAAGAGGACCTGG
ACCGCATAGGACATGCAACACGAGCTCTTGCTGAATATAACAACTCCTTTCTCCGAAGAC
ATTCTCACAACTTTGTCCATGGTTTCTTAAAGGAAGTCTCAATCAATCTGTAGTTTGTTT
CTTGGAGAAGAAGACACAAAATTCTTCTCTCTTGTAGTTTGAAAGATATCTAAAACCAAA
AGCCCATGAAATAAACCTAGCTTTTGGGTGAAGAAAAGAGTTTTTGTTGTTGTATATCCT
ACAGTATTAAGCTCAG
TGTTCC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4BQ78JQ 614 0 0
ACAAACAAACAATATTTATAAAGTTATATTACAAAGGTTGCATACTTGCATCGGCTATAG
ATTGTGTTTTAGGTTGTTTCTTATTGAATTATATGTTTAGATTAAAAAGTTAGAACACAT
TTTTTAACATAGATTGGCTTGAAATGGCTTAACTAGCGGAACAAGCGAGCCGCTAAGGTG
CATCGACATGACTTCATTGGTCGAACCAACGAGCTTCCCATCAACAAAGATGGCTGGAAC
CGGTGTGGAACACCCGAGCCTCATTAGGGCTTTCTCTATCTCACGACAATCAGGGTCCTT
GTCTATCTCATGGACGGTCGGGTGAACCCCAAGGTCTTGGAAGAGGACCTGGACCGCATA
GGACATGCAACACGAGCTCTTGCTGAATATAACAACTCCTTTCTCCGAAGACATTCTCAC
AACTTTGTCCATGGTTTCTTAAAGGAAGTCTCAATCAATCTGTAGTTTGTTTCTTGGAGA
AGAAGACACAAAATTCTTCTCTCTTGTAGTTTGAAAGATATCTAAAACCAAAAGCCCATG
AAATAAACCTAGCTTTTGGGTGAAGAAAAGAGTTTTTGTTGTTGTATATCCTACAGTATT
AAGCTCAGTGTTCC

QA 1 614 1 614
DS 



CO CL1454Contig2 663 4 3 U
GGAGGCAACACTGAGTTTAATACTGTAGGATATACAACAACAAAAACTCTTTTCTTCACC
CAAAAGCTAGGTTTATTTCATGGGTTTTTGGTTTTAAATATCTTTCAAACTACAAGAGAG
AAATAATTTTGTTTCTTCTTCTCCAAGAAACGAACCACAGATTGATTGAGACTTCCTTTA
AGACACCATGGACAAAGTTGTGAGAATGTCTTCGGAGAAAGGAGTTGTTATATTCAGCAA
GAGCTCGTGTTGCATGTCCTATGCGGTCCAGGTCCTCTTCCAAGACCTCGGGGTTCACCC
GACCGTCCATGAGATAGACAAGGACCCTGATTGTCGTGAGATAGAGAAATCCCTAATGAG
GCTCGGGTGTTCCACACCAGTCCCAGCCATCTTTGTGGATGGGAAGCTCGTTGGTTCGAC
CAATGAAGTCATGTCGATGCACCTTAGCGGCTCGCTTGTTCCGCTCGTTAAGCCATTTCA
AGCCAATCTATGTTAAAAAAAGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAG
AAACAATCTAAAACACAATCTTATAGCCGATGCAAGTATGCAACCTTTGTAATATAACTT
TATAAATATTGTTTGTTTGTAATTTTATTGAAGTGATCCCTATAATAATTGACTAGTTTA
AGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4EU51TF U 1
AF RR4GC29JQ C 1
AF RR4GC29TF U 1
AF RR4EU51JQ C 16
BS 1 610 RR4EU51TF
BS 611 611 RR4GC29TF
BS 612 663 RR4EU51JQ

RD RR4EU51TF 610 0 0
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CAAAAGCTAGGTTTATTTCATGGGTTTTTGGTTTTAAATATCTTTCAAACTACAAGAGAG
AAATAATTTTGTTTCTTCTTCTCCAAGAAACGAACCACAGATTGATTGAGACTTCCTTTA
AGACACCATGGACAAAGTTGTGAGAATGTCTTCGGAGAAAGGAGTTGTTATATTCAGCAA
GAGCTCGTGTTGCATGTCCTATGCGGTCCAGGTCCTCTTCCAAGACCTCGGGGTTCACCC
GACCGTCCATGAGATAGACAAGGACCCTGATTGTCGTGAGATAGAGAAATCCCTAATGAG
GCTCGGGTGTTCCACACCAGTCCCAGCCATCTTTGTGGATGGGAAGCTCGTTGGTTCGAC
CAATGAAGTCATGTCGATGCACCTTAGCGGCTCGCTTGTTCCGCTCGTTAAGCCATTTCA
AGCCAATCTATGTTAAAAAAAGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAG
AAACAATCTAAAACACAATCTTATAGCCGATGCAAGTATGCAACCTTTGTAATATAACTT
TATAAATATT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4GC29JQ 611 0 0
GGAGGCAACG
CTGAGTTTAATACTGTAGGATATACAACAACAAAAACTCTTTTCTTCACCCAAAAGCTAG
GTTTATTTCATGGGTTTTTGGTTTTAAATATCTTTCAAACTACAAGAGAGAAATAATTTT
GTTTTTTTTTCTCCAAGAAACGAACCACAGATTGATTGAGACTTCCTTTAAGACACCATG
GACAAAGTTGTGAGAATGTCTTCGGAGAAAGGAGTTGTTATATTCAGCAAGAGCTCGTGT
TGCATGTCCTATGCGGTCCAGGTCCTCTTCCAAGACCTCGGGGTTCACCCGACCGTCCAT
GAGATAGACAAGGACCCTGATTGTCGTGAGATAGAGAAATCCCTAATGAGGCTCGGGTGT
TCCACACCAGTCCCAGCCATCTTTGTGGATGGGAAGCTCGTTGGTTCGACCAATGAAGTC
ATGTCGATGCACCTTAGCGGCTCGCTTGTTCCGCTCGTTAAGCCATTTCAGGCCAATCTA
TGTTAAAAAATGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAGAAACAATCTA
AAACACAATCTTATAGCCGATGCAAGTATGCAACCTTTGTAATATAACTTTATAAATATT
G

QA 11 611 11 611
DS 

RD RR4GC29TF 611 0 0
GGAGGCAACG
CTGAGTTTAATACTGTAGGATATACAACAACAAAAACTCTTTTCTTCACCCAAAAGCTAG
GTTTATTTCATGGGTTTTTGGTTTTAAATATCTTTCAAACTACAAGAGAGAAATAATTTT
GTTTCTTCTTCTCCAAGAAACGAACCACAGATTGATTGAGACTTCCTTTAAGACACCATG
GACAAAGTTGTGAGAATGTCTTCGGAGAAAGGAGTTGTTATATTCAGCAAGAGCTCGTGT
TGCATGTCCTATGCGGTCCAGGTCCTCTTCCAAGACCTCGGGGTTCACCCGACCGTCCAT
GAGATAGACAAGGACCCTGATTGTCGTGAGATAGAGAAATCCCTAATGAGGCTCGGGTGT
TCCACACCAGTCCCAGCCATCTTTGTGGATGGGAAGCTCGTTGGTTCGACCAATGAAGTC
ATGTCGATGCACCTTAGCGGCTCGCTTGTTCCGCTCGTTAAGCCATTTCAGGCCAATCTA
TGTTAAAAAATGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAGAAACAATCTA
AAACACAATCTTATAGCCGATGCAAGTATGCAACCTTTGTAATATAACTTTATAAATATT
G

QA 11 611 11 611
DS 

RD RR4EU51JQ 648 0 0
TTTAATACTGTAGGATATACAACAACAAAAACTCTTTTCTTCACCCAAAAGCTAGGTTTA
TTTCATGGGTTTTTGGTTTTAAATATCTTTCAAACTACAAGAGAGAAATAATTTTGTTTC
TTCTTCTCCAAGAAACGAACCACAGATTGATTGAGACTTCCTTTAAGACACCATGGACAA
AGTTGTGAGAATGTCTTCGGAGAAAGGAGTTGTTATATTCAGCAAGAGCTCGTGTTGCAT
GTCCTATGCGGTCCAGGTCCTCTTCCAAGACCTCGGGGTTCACCCGACCGTCCATGAGAT
AGACAAGGACCCTGATTGTCGTGAGATAGAGAAATCCCTAATGAGGCTCGGGTGTTCCAC
ACCAGTCCCAGCCATCTTTGTGGATGGGAAGCTCGTTGGTTCGACCAATGAAGTCATGTC
GATGCACCTTAGCGGCTCGCTTGTTCCGCTCGTTAAGCCATTTCAAGCCAATCTATGTTA
AAAAAAGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAGAAACAATCTAAAACA
CAATCTTATAGCCGATGCAAGTATGCAACCTTTGTAATATAACTTTATAAATATTGTTTG
TTTGTAATTTTATTGAAGTGATCCCTATAATAATTGACTAGTTTAAGC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 4

CO CL1455Contig1 1370 4 9 U
GATTGATCTCCCTTTCGTATTCATTCGACCTGAGGCGTTCCTCTCAGTCATACAAAAAA*
GAAAGGTTATTTCATGCAATGCATAACGGGTGGGCCTCCTATGGATTCCTCTAACTCAAT
GAATGAAGGGAGGAGTATGAGGAAGGCCGGCTTTCTAGATGAAAATGAAAACAAAAAGGA
AAAGGGTCAAACCATATCTTACTTAATAATCTGACTGAATGACGAAGAGCTCTTTATGTG
GTCTCACTTTACCACCATCTGAAATGCGCGAAACTTCGATTGGTGGAAGCCAGTCCATGA
AGATTCTCCCTTTTCCTACGTGCACTTCCCCTCTTTTGGTAAGCATCCAATATCTCAGCA
AATAAACATTTCTCTAAGCTTATCCTGTAGCTTATACGTCGTTTGAAAGCTGCTTCAAGG
ATCCAACGAATAGCTAAGGTTTGTTGACGATCCCTGGCTACAATCCCAGGGACATCATAA
ATAGTACCCGCTACTCCTACTTTTGCTACTTCGCATATGGGCTTTATATTCTCTACGGCG
TCAACCATAAGTTTGATTACATCGCGTTCAGTTCGAGCTGGGCGATGAAAAGTTTGATAA
ACAATAGCACGAACTCTCGTTCTTTTACCTTCTTTCATGCGAAAATTGACCAACTTCTTG
ATCAATAGTTTTTGCTCACCATCCAAGCCCCCTATATAGCTGAAAATTTCCGAGCAATTG
GAAGCCGCTTTCGATGACGAGGCCGAACAATTTATATTACGCAATCGTTACTGTCCATCT
TTATCAGCAAACTCCCCCAGTTTCCATCTTTCCTTTTAGAGTTTACCACTCTTCATAGCT
TCTTGAACTTTCTTTAGGGTCTTGCTCCCTGAGTTCCAGAGTCTACACTCTCGCGTCATA
TGGCTCCGCCCCGGAATCATGCTTACGCCCTCCCCCTTTAGAAATACTCTCGTTCCTCTC
TAGACAAGTGCTCGAGTAAGAAATACCTCTCCTTTTCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTGG
GATGAGCGTCCTCTGATCTAAATAAGAGCTCCTGTTTGCTTTCTGGCAATGAGCTAGCTT
AACCCTGATTGCGACAGGCTTAATACAGTCATGTTGGATCTCCTATTCGTTCTGCTACCA
GGAAGAGAAAGACTGATTGCGACAGCTCAACCGGATGAGACATCTCTTATTTACAGAACT
GTGCCAACCGAGGAACGCCTACCAACTCCGCCAACCCCATTGATTTAGCCGCACCTGAAC
CCGCAACCGAGGAACGCCTCTCCTTTCAGTCGAATTCCGTTGGACCTCTACTCCGCCTAC
TTCTTGTGCCGACTTCGACTGCCTTATTTCGGGTGAAGAGTAAGGGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 6 829 6 829
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QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 6

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AGATCGTTAAAAGAAGGAAACCAAATCCCCTCTCTCCCCCAATTCAATTCAAGCTTTTCG
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CAGGAGAGGTACAGAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTT
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B305TF U 1
AF RR4A728TF U 10
AF RR4EG36TF U 99
AF RR4FH94JQ C 262
AF RR4A728JQ C 316
AF RR4B305JQ C 488
BS 1 206 RR4B305TF
BS 207 207 RR4A728TF
BS 208 215 RR4B305TF
BS 216 216 RR4A728TF
BS 217 709 RR4B305TF
BS 710 710 RR4A728TF
BS 711 721 RR4B305TF
BS 722 722 RR4A728TF
BS 723 729 RR4B305TF
BS 730 730 RR4A728TF
BS 731 788 RR4B305TF
BS 789 791 RR4A728TF
BS 792 798 RR4EG36TF
BS 799 815 RR4FH94JQ
BS 816 816 RR4A728JQ
BS 817 1045 RR4FH94JQ
BS 1046 1051 RR4A728JQ
BS 1052 1120 RR4B305JQ

RD RR4B305TF 788 0 0
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AGATCGTTAAAAGAAGGAAACCAAATCCCCTCTCTCCCCCAATTCAATTCAAGCTTTTCG
TCCTTCGTCAGATCTGATCCCCCC****TCGATTCATCCGCCATTCTTCGAAAGGGGTGT
TGATTGGTGCTGCTAAATCGGGAAAGGAAAATGGCAAGTAGGATGGATCAGGAATACGAT
TATTTGTTTAAGATCGTGTTGATCGGAGACTCGGGTGTGGGGAAATCGAACATCTTGTCC
AGATTCACGAGGAATGAGTTTTGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCC
ACCAGAACTACTCAGGTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGC
CAGGAGAGGTACAGAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTT
GTCTACGACATCACCAAGAGACAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTGCGCGAACTC
AGAGACCATGCTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATCTCAAC
CACTTGAGATCCGTTGCTGAGGAAGATGGTCAGAATCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCT
TTCCTGGAGACGTCTGCTCTCGAAGCTACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCGGACCATCTTA
G*AGAGATCCACCACATCATAAGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCT
AACTCCGC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4A728TF 782 0 0
G
ACAGTTTGGGTCAAAACTTTCCATTTTATTACACAGAAACAAAATTTCGTAGATCGTTAA
AAGAAGGAAACCAAATCCCCTCTCTCCCCCAATTCAATTCAAGCTTTTCGTCCTTCGTCA
GATCTGATCCCCCCCCCCTCGATTCATCCGCCATTCTTCGAAAGGGGTGTTGATTGGTGC
TGCTAAATCGGGAAAGAAAAATGGCGAGTAGGATGGATCAGGAATACGATTATTTGTTTA
AGATCGTGTTGATCGGAGACTCGGGTGTGGGGAAATCGAACATCTTGTCCAGATTCACCA
GGAATGAGTTTTGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCCACCAGAACTA
CTCAGGTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGTCAGGAGAGGT
ACATAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCTACGACA
TCACTAAGAGGCAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTCCGCGAACTCAGAGACCATG
CTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATCTCAACCACCTGAGAT
CCGTTGCTGAGGAGGATGGTCAGAACCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCTTTCCTCGAGA
CGTCTGCCCTCGAAGCCACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCAGACCATCTTGGGAGAGATCT
ACCACATCATAAGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACTCCGCGA
T

QA 2 782 2 782
DS 

RD RR4EG36TF 700 0 0
GG
AATTCAATTCAAGCTTTTCGTCCTTCGTCAGATCTGATCCCCCC****TCGATTCATCCG
CCATTCTTCGAAAGGGGTGTTGATTGGTGCCGCTAAATCGGGAAAGAAAAATGGCGAGTA
GGATGGATCAGGAATACGATTATTTGTTTAAGATCGTGTTGATCGGAGACTCGGGTGTGG
GGAAATCGAACATCTTGTCCAGATTCACGAGGAATGAGTTTTGCTTGGAATCCAAATCCA
CCATCGGTGTCGAATTCGCCACCAGAACTACTCAGGTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTC
AGATCTGGGACACTGCAGGCCAGGAGAGGTACAGAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAG
GCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCTACGACATCACCAAGAGACAGACATTTGACAACGCCC
TGAGGTGGCTGCGCGAACTCAGAGACCATGCTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTG
GGAACAAATCCGATCTCAACCACTTGAGATCCGTTGCTGAGGAAGATGGTCAGAATCTGG
CCGAGAAGGAAGGTCTCTCTTTCCTGGAGACGTCTGCTCTCGAAGCTACAAACGTGGAGA
AAGCGTTTCAGACCATCTTAGGAGAGATCTACCACATCATAAGCAAGAAAGCACTGGCTG
CACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACTCCGCGATTCCGGGG

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR4FH94JQ 786 0 0
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TGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCCACCAGAACTACTCAGGTGGAA
GGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGCCAGGAGAGGTACAGAGCCATC
ACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCTACGACATCACCAAGAGA
CAGACATTTGACAACGCCCTGAGGTGGCTGCGCGAACTCAGAGACCATGCTGATTCCAAC
ATCGTCATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATCTCAACCACTTGAGATCCGTTGCTGAG
GAAGATGGTCAGAATCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCATTCCTGGAGACGCCTGCTCTC
GAAGCTACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCAGACCATCTTAGGAGAGATCTACTACATCATA
AGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACTCCGCGATTCCGGGGCAG
GGAACTACGATTAATGTCGATGACACGTCTGGAGGCGTGAAACGAGGTTGCTGCTCTACC
TAAAACGGAAAAGGTAATAATATATGTTTTCTGGCTTATTATCCCAAGATTCAAAACTTT
TGTTTTCTGGCTTATTCCTTATCCCAAGATTCGAACTTTTGTTTTCATTGGCTCCTCCTC
TTTCATTTCAACTTTTAGCTCATGCAAGACCATGTAGAATACTTGTCAACTTACTCTGTT
TTTT
TT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4A728JQ 744 0 0
GAGTTTTGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCCACCAGAACTACTCAG
GTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGTCAGGAGAGGTACATA
GCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCTACGACATCACT
AAGAGGCAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTCCGCGAACTCAGAGACCATGCTGAT
TCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATCTCAACCACCTGAGATCCGTT
GCTGAGGAGGATGGTCAGAACCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCTTTCCTCGAGACGTCT
GCCCTCGAAGCCACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCAGACCATCTTGGGAGAGATCTACCAC
ATCATAAGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACTCCGCGATTCCG
GGGCAGGGAACTACGATTAACGTCAATGACACGTCTGGAGGCGTGAAACGAGGTTGCTGC
TCTACCTAAAACG*AAACGGTAATAATATATGTTTTCTGGCTTATTATCCCAAGATTCAA
AACTTTTGTTTTCTGGCTTATTCCTTATCCCAAGATTCGAACTTTTGTTTTCATTGACTC
ATC***TTTCATTTCAACTTTTGGCTCATGCAAGACCATGTAGAATACTTGTCAACTTAC
TCTGTTTTTTATTTTT
TTATGTGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4B305JQ 633 0 0
ACATCACCAAGAGACAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTGCGCGAACTCAGAGACC
ATGCTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATTTCAACCACTTGA
GATCCGTTGCTGAGGAAGATGGTCAGAATCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCTTTCCTGG
AGACGTCTGCTCTCGAAGCTACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCGGACCATCTTAGGAGAGA
TCCACCACATCATAAGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACTCCG
CTATTCCGGGGCAGGGAACTACGATTAACGTCGATGACACGTCTGGAGGTGTGAAACGAG
GTTGCTGCTCTACCTAAAACGGAAAAGGTAATAATATATGTTTTCTGGCTTATTATCCCA
AGATTCAAAACTTTTGTTTTCTGGCTTATTCCTTATCCCAAGATTCGAACTTTTGTTTTC
ATTGGCTCCTCCTCTTTCATTTCAACTTTTAGCTCATGCAAGACCATGTAGAATACTTGT
CAACTTACTCTGTTTTTTTTTTTTAATGCTCTTCGGCTGTGTTCATTTTAAAAGCTTGTG
AGATTCTGTATTCAGTAAAGCTTTGTTGGTAGC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 5

CO CL1457Contig1 781 5 9 U
GGGACTCTTCTTTGCTCACCTCCCTCAATTTTGAATCCCTTAATCGCAAAGATGGCGTCA
GAGAAGAAGCTGTCGAACCCTATGAGGGACATCAAGGTTCAGAAGCTCGTTCTCAACATC
TCCTTTGGTGAGAGCGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGT
GGTCAAACCCCTGTCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTCGGAATCAGGCGT
AACGAGAAGATTGCTTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCGATGCAGCTTCTCGAG
AGCGGCTTGAAAGTCAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGC
TTTGGGTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGAATCAAGTACGATCCTTCCACCGGT
ATCTATGGAATGGACTTCTACGTTGTTCTTGAACGTCCTGGGTACCGTGTCGCACGTCGC
CGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACGAAGGATGATGCCATGAAG
TGGTTCCAAGTTAAGTACGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGA
AGAAGTTTGTTTCTATTTTGTTTTGTTTTGTGGTGTTAGCCTCTCTCTCTCTCAGACCAT
CGCTGTTGGGATCTCTTGTTTTTTTTTTGTACTTCAGTTGGTTTAGAATCTACGTATCCA
GCATGAACCAATTTTTGGAGGTTATCGTTATCAATTTCAAACAATCTCTCTGCTTTAAAC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4CZ21TF U 12
AF RR4CZ21JQ C 12
AF RR4A055TFB U 1
AF RR4EF44TF U 12
AF RR4EF44JQ C 194
BS 1 122 RR4A055TFB
BS 123 124 RR4CZ21TF
BS 125 312 RR4A055TFB
BS 313 313 RR4CZ21TF
BS 314 553 RR4A055TFB
BS 554 554 RR4CZ21TF
BS 555 736 RR4A055TFB
BS 737 760 RR4EF44TF
BS 761 781 RR4EF44JQ

RD RR4CZ21TF 592 0 0
GG
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CGAACCCTATGAGGGACATCAAGGTTCAGAAGCTCGTTCTCAACATCTCCTTTGGTGAGA
GCGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACCCCTG
TCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTCGGAATCAGGCGTAACGAGAAGATTG
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CTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACGAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTA
AGTACGAACGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGA

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR4CZ21JQ 708 0 0
GG
GCTCACCTCCCTCAATTTTGAATCCCTTAATCGCAAAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTGT
CGAACCCTATGAGGGACATCAAGGTTCAGAAGCTCGTTCTCAACATCTCCTTTGGTGAGA
GCGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACCCCTG
TCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTCGGAATCAGGCGTAACGAGAAGATTG
CTTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCGATGCAGCTTCTCGAGAGCGGCTTGAAAG
TCAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGCTTTGGGTTCGGTA
TCCAGGAGCACATTGATCTTGGAATCAAGTACGATCCTTCCACCGGTATCTATGGAATGG
ACTTTTACGTTGTTCTTGAACGTCCTGGGTACCGTGTCGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGA
CTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACGAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTA
AGTACGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGAAGTTTGTTTC
TATTTTGTTTTGTTTTGTGGTGTTAGCCTCTCTCTCTCTCAGACCATCGCTGTTGGGATC
TCTTGTTTTTTTTT*GTACTTCAGTTGGTTTAGAATCTACGTATCC

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR4A055TFB 736 0 0
GGGACTCTTCTTTGCTCACCTCCCTCAATTTTGAATCCCTTAATCGCAAAGATGGCGTCA
GAGAAGAAGCTGTCGAACCCTATGAGGGACATCAAGGTTCAGAAGCTCGTTCTCAACATC
TCTGTTGGTGAGAGCGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGT
GGTCAAACCCCTGTCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTCGGAATCAGGCGT
AACGAGAAGATTGCTTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCGATGCAGCTTCTCGAG
AGCGGCTTGAAATTCAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGC
TTTGGGTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGAATCAAGTACGATCCTTCCACCGGT
ATCTATGGAATGGACTTCTACGTTGTTCTTGAACGTCCTGGGTACCGTGTCGCACGTCGC
CGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACGAAGGATGATGCCATGAAG
TGGTTCCAAGTTA*GTACGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGA
AGAAGTTTGTTTCTATTTTGTTTTGTTTTGTGGTGTTAGCCTCTCTCTCTCTCAGACCAT
CGCTGTTGGGATCTCTTGTTTTTTTTTTGTACTTCAGTTGGTTTAGAATCTACGTATCCA
GCATGAACCAATTTTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4EF44TF 749 0 0
GG
GCTCACCTCCCTCAATTTTGAATCCCTTAATCGCAAAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTGT
CGAACCCTATGAGGGACATCAAGGTTCAGAAGCTCGTTCTCAACATCTCTGTTGGTGAGA
GCGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACCCCTG
TCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTCGGAATCAGGCGTAACGAGAAGATTG
CTTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCGATGCAGCTTCTCGAGAGCGGCTTGAAAG
TCAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGCTTTGGGTTCGGTA
TCCAGGAGCACATTGATCTTGGAATCAAGTACGATCCTTCCACCGGTATCTATGGAATGG
ACTTCTACGTTGTTCTTGAACGTCCTGGGTACCGTGTCGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGA
CTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTA
AGTACGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGCTGAAGAAGTTTGTTTC
TATTTTGTTTTGTTTTGTGGTGTTAGCCTCTCTCTCTC**AGACCATCGCTGTTGGGATC
TCTTGTTTTTTTTT*GTACTTCAGTTGGTTTAGAATCTACGTATCCAGCATGAACCAATT
TTTGGAGGTTATCGTTATCAATTTCAA

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR4EF44JQ 588 0 0
TCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTCGGAATCAGGCGTAACGAGAAGATTG
CTTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCGATGCAGCTTCTCGAGAGCGGCTTGAAAG
TCAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGCTTTGGGTTCGGTA
TCCAGGAGCACATTGATCTTGGAATCAAGTACGATCCTTCCACCGGTATCTATGGAATGG
ACTTTTACGTTGTTCTTGAACGTCCTGGGTACCGTGTCGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGA
CTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTA
AGTACGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGCTGAAGAAGTTTGTTTC
TATTTTGTTTTGTTTTGTGGTGTTAGCCTCTCTCTCTC**AGACCATCGCTGTTGGGATC
TCTTGTTTTTTTTTTGTACTTCAGTTGGTTTAGAATCTACGTATCCAGCATGAACCAATT
TTTGGAGGTTATCGTTATCAATTTCAAACAATCTCTCTGCTTTAAACT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 6

CO CL1458Contig1 1063 6 12 U
AAGATCTATTACCATAACAGAGGACGCGAAGATATAAGCTCAAATTTAATATGGTTGTAT
AAAATTTGGTTAAACCCCCGAATAAAACCCACAAAGCAGATATTTGAAAGACTACAAGGG
TTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACAAGTAAAAAAAAACAATGCTTCGAGATTTATAT
ATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGATGATGATGATGATGAGAGAAACGTAGACACTCTC
TAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGATTTTGCTCATGACCTTACTCAAAACCTTC
TCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCATCGCCTTTTCAGCAAAGTCATCT
ACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGAAGAGAAGAACAGTTGCGATA
TAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGACAAAACCC*ACAAACCCGC
AACAACCATAAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAATGTTCCTAAGAAGAGTAAA
ACCACGATTGATTTCAATCCTTAGCCCAGAAGCAAGCTGGAGAACAACTTCCTCGGGGAT
GTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATGAAGGTAGTAGCACTAGACCACAA
GAACAAAACAGCGAGAGCGAGAATCGAGATGTGGCCGAAGAGAGTGAGGAGGTTGTACTG
AAGCAACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGTTGCAGCACCCAACACTCCTCCTGATACCTT
CTTGTTCCTCCATAGGAATATGTCGGCAGGTTTGCCGCCACCGAAGACCTTGTGAACAGG
CTTTTCTCTTCCGAAGAGGCGGTAGATCTTCGTCTTGATAGAGGATTCTTTCTTCTCGTC
ATCTGAATCTGAAGAAGAAGAGGAATCGTGACCATGGATCTTCTCAGCTATCTTCTCCAT
GATTGATTCCTCGTGTTTGTGCTCTTCCGCCATCGTTACTTTACTTCCTTGAAACCTCCG
CAAAAAAAAAAACCCTAAAACTCTCTGTTTCAGACGTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H546JQB U 243
AF RR4GP20JQ U 1
AF RR4G021JQ U 37
AF RR4GP20TF C 297
AF RR4G021TF C 338
AF RR4H546TF C 338
BS 1 107 RR4GP20JQ
BS 108 108 RR4G021JQ
BS 109 430 RR4GP20JQ
BS 431 431 RR4G021JQ
BS 432 530 RR4GP20JQ
BS 531 571 RR4G021JQ
BS 572 906 RR4GP20TF
BS 907 907 RR4G021TF
BS 908 949 RR4GP20TF
BS 950 1029 RR4G021TF
BS 1030 1031 RR4H546TF
BS 1032 1063 RR4G021TF

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ATCCTTCTTCTTGAAGGGTCCTTTGGGGATTTTGCTCATGACCTTACTCAAAACCTTCTC
ATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCATCGCCTTTTCAGCAAAGTCATCTAC
TTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGA

QA 1 158 1 158
DS 

RD RR4GP20JQ 533 0 0
AAGATCTATTACCATAACAGAGGACGCGAAGATATAAGCTCAAATTTAATATGGTTGTAT
AAAATTTGGTTAAACCCCCGAATAAAACCCACAAAGCAGATATTTGAGAGACTACAAGGG
TTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACAAGTAAAAAAAAACAATGCTTCGAGATTTATAT
ATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGATGATGATGATGATGAGAGAAACGTAGACACTCTC
TAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGATTTTGCTCATGACCTTACTCAAAACCTTC
TCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCATCGCCTTTTCAGCAAAGTCATCT
ACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGAAGAGAAGAACAGTTGCGATA
TAGATCAAGGGCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGACAAAACCC*ACAAACCCGC
AACAACCATAAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAATGTTCCTAA
AAA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4G021JQ 535 0 0
G
GCTCAAATTTAATATGGTTGTATAAAATTTGGTTAAACCCCCGAATAAAACCCACAAAGC
AGATATTTGAAAGACTACAAGGGTTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACAAGTAAGAAA
AAACAATGCTTCGAGATTTATATATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGGTGATGATGATG
ATGAGAGAAACGTAGACACTCTCTAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGATTTTGC
TCATGACCTTACTCAAAACCTTCTCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCA
TCGCCTTTTCAGCAAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGG
TGAAGAGAAGAACGGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTT
TGGACAAAACCC*ACAAACCCGCAACAACCATAAGGAAATTCTTGAGATCTCTCCCTAAT
GCAATGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGCCCAGAA

QA 2 535 2 535
DS 

RD RR4GP20TF 654 0 0
CTTCTCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCATCGCCTTTTCAGCAAAGTC
ATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGAAGAGAAGAACAGTTGC
GATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGACAAAACCC*ACAAAC
CCGCAACAACCATAAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAATGTTCCTAAGAAGAG
TAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGCCCAGAAGCAAGCTGGAGAACAACTTCCTCGG
GGATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATGAAGGTAGTAGCACTAGACC
ACAAGAACAAAACAGCGAGAGCGAGAATCGAGATGTGGCCGAAGAGAGTGAGGAGGTTGT
ACTGAAGCAACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGTTGCAGCACCCAACACTCCTCCTGATA
CCTTCTTGTTCCTCCATAGGAATATGTCGGCAGGTTTGCCGCCACCGAAGACCTTGTGAA
CAGGCTTTTCTCTTCCGAAGAGGCGGTAGATCTTCGTCTTGATAGAGGATTCTTTCTTCT
CGTCATCTGA*TCTGAAGAAGAAGAGGAATCGTGACCATGGATCTTCTCAGCT
C

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4G021TF 726 0 0
ATCG
CTTTTCAGCAAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTT*CGTAAAGCACGGGAACGGTGAA
GAGAAGAACGGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGA
CAAAACCC*ACAAACCCGCAACAACCATAAGGAAATTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAA
TGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGCCCAGAAGCAAGCTGGA
GAACAACTTCCTCGGGGATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATGAAGG
TAGTAGCACTAGACCACAAGAACAAAACAGCGAGAGCGAGAATCGAGATGTGGCCGAAGA
GAGTGAGGAGGTTATACTGAAGCAACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGTTGCAGCACCCA
ACACTCCTCCTGATACCTTCTTGTTCCTCCATAGGAATATGTCGGCAGGTTTGCCGCCAC
CGAAGACCTTGTGAACAGGCTTTTCTCTTCCGAAGAGGCGGTAGATCTTCGTCTTGATAG
AGGATTCTTTCTTCTCGTCATCTGAATCTGAAGAAGAAGAGGAATCGTGACCATGGATCT
TCTCAGCTATCTTCTCCATGATTGATTCCTCGTGTTTGTGCTCTTCCGCCATCGTTACTT
TACTTCCTTGAAACCTCCGCAAAAAAAA**ACCCTAAAACTCTCTGTTTCAGACGTGAAT
CC

QA 5 726 5 726
DS 

RD RR4H546TF 726 0 0
ATCG
CTTTTCAGCAAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGAA
GAGAAGAACAGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGA
CAAAACCCCACAAACCCGCAACAACCATAAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAA
TGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGCCCAGAAGCAAGCTGGA
GAACAACTTCCTCGGGGATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATGAAGG
TAGTAGCACTAGACCACAAGAACAAAACAGCGAGAGAGAGAATCGAGATGTGGCCGAAGA
GAGTGAGGAGGTTGTACTGAAGCAACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGTTGCAGCACCCA
ACACTCCTCCTGATACCTTCTTGTTCCTCCATAGGAATATGTCGGCAGGTTTGCCGCCAC
CGAAGACCTTGTGAACAGGCTTTTCTCTTCCGAAGAGGCGGTAGATCTTCGTCTTGATAG
AGGATTCTTTCTTCTCGTCATCTGAATCTGAAAAAGAAGAGGAATCGTGACCATGGATCT
TCTCAGCTATCTTCTCCATGATTGATTCCTCGTGTTTGTGCTCTTCCGCCATCGTTACTT
TACTTCCTTGAAACCTCCGCAAAAAAAAAAACCCTAAAACTCTCTGTTTCAGACGTGAAT
CC

QA 5 726 5 726
DS 



AS 1 5

CO CL1459Contig1 576 5 7 U
TTTGGATTTTCAAAACATCAATAGGAAGCAAGATCAATGTTGCTGACACAAGTGAAGAAC
AAAAACAAGTTTCCATCAAACAACAAAGCTGAAACAGAGTTTCTAGTAGAAAGATTTTTT
TTAAAGGGACAGGTAACTTAAACTTTGATGGCGTACTTCCTGATTGGGAAATACATTTCC
TTCTTCTTCTCACGTTCAGTCTTCAACGAGAGCTGATGCTTGGTGAGGCGCCTGCGGATA
GCACGGGTCTTCTTGGGACGTAGATCAAGAGGGATGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCT
CTGAGTGCAGACTTCTGCTTCTGAGATGTCACTGTCAAGACCTGAGCAATGGATTTGCGG
ACAACCTTGATTTTGGAGAGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGG
AGAGCGAGCTCAGCCTTAAGATCCTGAAGCTGATTCTGAAGATCGCTCTTCGACTCGTCC
CTCAGTTCGTGAACCTTAATCCTCGCCATCGTGAGCTTCACTCGTGTTCACCCTGCTGCG
CCGCTACTACTCTCTTTTAAAAGTTGGCTGGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D166JQ U 19
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AF RR4CH93JQ U 11
AF RR4CH93TF C 11
AF RR4ES07JQ U 4
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CC

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DS 

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GGATTTT
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TCTCTTTTAAAAGTTGGCTGGGAGCC

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DS 



AS 1 6

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TCCAATCAACGACGGTGTGATCTACTGCCCTTTTGAGATCACTATGCCAAGCTCATCAGA
CTCAACTTTTGGGATGGATATTTTAAAGAGGATGCTCCACAGTGGTGGCTATCCATCGAT
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ACTATTATACAGTTGCCTCTTCCTTTTCTTGGAGTCGATGATAGATAATGTTTGGAAGTG
ACATATAAACAGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G649TF U 9
AF RR4FH16TF U 1
AF RR4FH17TF U 1
AF RR4G649JQ C 203
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GG
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QA 3 737 3 737
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TCACCGTGCACTTGGTCTAATCCGCCCTAAAGATATTGATTTGGAGCTCTTTGACATCAC
TTATGTACAATGTGGTGAAATAGAGGTAGAAAAGAAGATTGATGAGACGATTGAGCACTT
CATAAGCTGGATTGAGAAACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATGTTTATCCTTTTATGA
AGTCAAAAGCAAACAACCGTCTTGGTTCAATAATAAACAACGTTCGTATTGGGAACAACG
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TATGGACACTGGAGAGGCGTCTGAGGAGAGAAGTTCTCGTAGGACAATGCTTGAGCAATC
CCTTCAAGAAGTCTTATTCCAAATCATAAAATTCGTGAATGAGAAAAAAGACCACGTTCC
TCCAATCAACGACG*TGTGATCTACTGCCCTTTTGAGATCACTATGCCAAGCTCATCAGA
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TGTACTTGGTC
AGTCCAAAAA

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DS 

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TACTGCCCTTTTGAGATCACTATGCCAAGCTCATCAGACTCAACTTTTGGGATGGATATT
TTAAAGAGGATGCTCCACAGTGGTGGCCATCCATCGATGCTCAGTTGATACACATTAGCC
ACTCAAAAACTTAACTAGTACATATATCAACACTTCTATGTACTTGGTCCAGTCCAAATA
ACACTTACCCACTTGCATTTCCTGTGTAAATAAACATTACTATTATACAGTTGCCTCTTC
CT

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DS 

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TTCGTGAATGAGAAAAAAGACCACGTTCCTCCAATCAACGACGGTGTGATCTACTGCCCT
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ATGCTCCACAGTGGTGGCTATCCATCGATGCTCAGTTGATACACATTAGCCACTCAAAAA
CTTAACTAGTACATATATCAACACTTCTATGTACTTGGTCCAGTCCAAATAACACTTACC
CACTTGCATTTCCTGTGTAAATAAACATTACTATTATACAGTTGCCTCTTCCTTTTCTTG
GAGTCGATGATAGATAATGTTTGGAAGTGACATATAAACAGGC

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DS 

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CTTTGACATCACTTATGTACAATGTGGTGAAATAGAGGTAGAAAAGAAGATTGATGAGAC
GATTGAGCACTTCATAAGCTGGATTGAGAAACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATGTTT
ATCCTTTTATGAAGTCAAAAGCAAACAACCGTCTTGGTTCAATAATAAACAACGTTCGTA
TTGGGAACAACGGTACGTCAATCTCAATGTGCTTCACCAGACTAAATCTCCTTCCCACCA
CTCTAAACTAGTTATGGACACTGGAGAGGCGTCTGAGGAGAGAAGTTTTCGTAGGACAAT
GCTTGAGCAATCCCTTCAAGAAGTCTTATTCCAAATCATAAAATTCGTGAATGAGAAAAA
AGACCACGTTCCTCCAATCAACGACGGTGTGATCTACTGCCCTTTTGAGATCACTATGCC
AAGCTCATCAGACTCAACTTTTGGGATGGATATTTTAAAGAGGATGCTCCACAGTGGTGG
CTATCCATCGATGCTCAGTTGATACACATTAGCCACTCAAAAACTTAACTAGTACATATA
TCAACACTTCTATGTACTTGGTCCAGTCCAAATAACACTTACCCACTTGCATTTCCTGTG
TAAATAAACATTACTATTATACAGTTGCCTCTTCCTTTTCTTGGAGTCGATGATAGATAA
TGTTTGGAAGTGACATATAAACAGGC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

CO CL1461Contig1 653 6 18 U
GGGTACCACTTAACTCTCTCTCAACTTCCAACCTCACCGGCGGCGAAAATGGTTTTCAAG
AGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAAGACCATGGAAAGCTC
GTCGTTATCGTTGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGATGCCCCTGATATGGAA
AGGATCCAGATGAATTTCAAGAGGTTGTCTCTTACGGACATCGTGATTGAGATCAACCGA
GTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGG
GAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTGATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGAT
TTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAA
CTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACCGCTTGAGTACTATCTGCGAATCTTGTTATTGTG
TTTTGGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTCTGTTGAATGGATGTTAG
TTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGAACCTTTACGA
CTTCTATGTCTATACGACAACAGTTTTCTCGTATGATCTAATATTGTTCTAAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GC96JQ C 270
AF RR4H010JQ C 1
AF RR4GC96TF U -1
AF RR4H010TF U 1
AF RR4A943JQ C 1
AF RR4A943TF U 1
BS 1 15 RR4H010TF
BS 16 113 RR4GC96TF
BS 114 114 RR4H010TF
BS 115 284 RR4GC96TF
BS 285 285 RR4H010TF
BS 286 326 RR4GC96TF
BS 327 327 RR4H010TF
BS 328 359 RR4GC96TF
BS 360 360 RR4H010TF
BS 361 448 RR4GC96TF
BS 449 449 RR4H010TF
BS 450 479 RR4GC96TF
BS 480 480 RR4H010TF
BS 481 486 RR4GC96TF
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BS 488 561 RR4GC96TF
BS 562 598 RR4H010TF
BS 599 653 RR4A943TF

RD RR4GC96JQ 188 0 0
TATGGAGAAAGCTGAGGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTAT
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AATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACCGT
TTGAGTAC

QA 1 188 1 188
DS 

RD RR4H010JQ 599 0 0
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TTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAA
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C

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4GC96TF 563 0 0
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CTTTAC

QA 18 563 18 563
DS 

RD RR4H010TF 599 0 0
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GTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGG
GAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTGATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGAT
TTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAA
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TTTTGGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTCTGTTGAATGGATGTTAG
TTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGAACCTTTAC
C

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4A943JQ 653 0 0
GGGTACCACTTAACTCTCTCTCAACTTCCAACCTCACCGGCGGCGAAAATGGTTTTCAAG
AGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAAGACCATGGAAAGCTC
GTCGTTATCGTTGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGATGCCCCTGATATGGAA
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GAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTGATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGAT
TTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAA
CTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACCGCTTGAGTACTATCTGCGAATCTTGTTATTGTG
TTTTGGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTCTGTTGAATGGATGTTAG
TTTCAGTTT*GAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGAACCTTTACGA
CTTCTATGTCTATACGACAACAGTTTTCTCGTATGATCTAATATTGTTCTAAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4A943TF 653 0 0
GGGTACCACTTAACTCTCTCTCAACTTCCAACCTCACCGGCGGCGAAAATGGTTTTCAAG
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GTCGTTATCGTTGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGATGCCCCTGATATGGAA
AGGATCCAGATGAATTTCAAGAGGTTGTCTCTTACGGACATCGTGATTGGGATCAACCGA
GTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGG
GAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTGATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGAT
TTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAA
CTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACCGCTTGAGTACTATCTGCGAATCTTGTTATTGTG
TTTTGGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTCTGTTGAATGGATGTTAG
TTTCAGTTT*GAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGAACCTTTACGA
CTTCTATGTCTATACGACAACAGTTTTCTCGTATGATCTAATATTGTTCTAAT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 5

CO CL1462Contig1 982 5 19 U
ATAGAAAAACCATCCCAAAAGAAAAACAAATTTAACTATTTGTGACCCAATGTGATGTAT
CAAATTGCAACAAGATTTTGAGTTTTCTTATACAGATTGTTGATTCTGCAAATAAAATCA
GAGACTAATAAAACTTAAAATGGAAGAAGTAGCATATGCTAATCAATAAGAATGGTTTTT
T*GATTTTGTTTTCTTTATTGCTGCTTGCTCTGTTGTCCAGGGTAAGCTCCAAGTTCTTC
AACATTCCAGCTTTCGTGGGATGCAACATGCTTATGCGAAGGAGTGTACTCCTCCATCTT
TTCCATAAGCTCTTTGGCTGTTGGTGCAGAAACCACAATATTACGTGCCCCTGGTTTGAT
AAAACCTTCTTGGACGCCAGTGTCAAACAAAGCAAGCAAATTGTTATAGTATCCATCAAC
ATTCAGTAGACCAACCGTCTTCTTATGGATACCAAGTTGTGACCATGTTATCATCTCCAG
CAGCTCCTCCATTGTTCCATAACCTCCAGGGAGAGCAATGAAGGCCTCAGCTTCTTGTGC
CATTGCAGCTTTTCGTTCGTGCATGTCAGCAACAACCCTTACTTCTCCTACAGTCTCACC
AGATATCTCAATTGGCATCAAAGCTTTGGGAATGATCCCGAGTACATGGAAACCACCTTC
ATAGACTCTCCTGGATATAAGACCCATCAACCCAACACTTCCTCCTCCATAAACCAAGTC
TATCTTCCTCTTCACGAGTTCATTGGCGAGTTCGATAGCAGCATCACTGAAAAGTTCTCT
ATTACCAGAGTTGCTTCCGCAAAAGACACAAACTTTACTGAACCTGCTTCTCTTGTTCTC
CTCCGTCAACATCAACGGATAAAATCACTTTTGTGTGACTGAGATTATTATTATATACGA
AGGGGAGGGACGGGATGCAAACAAGATTGAAAATATCGAATGAGAAAAATACAAAACAAA
ACTCTAATCCAATCCAGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G521JQ U 42
AF RR4BJ56JQ U 1
AF RR4FR93JQ U 34
AF RR4FR93TF C 34
AF RR4BJ56TF C 185
BS 1 94 RR4BJ56JQ
BS 95 95 RR4FR93JQ
BS 96 120 RR4BJ56JQ
BS 121 121 RR4FR93JQ
BS 122 122 RR4BJ56JQ
BS 123 123 RR4FR93JQ
BS 124 136 RR4BJ56JQ
BS 137 137 RR4FR93JQ
BS 138 169 RR4BJ56JQ
BS 170 170 RR4FR93JQ
BS 171 181 RR4BJ56JQ
BS 182 182 RR4FR93JQ
BS 183 348 RR4BJ56JQ
BS 349 349 RR4FR93JQ
BS 350 428 RR4BJ56JQ
BS 429 429 RR4FR93JQ
BS 430 703 RR4BJ56JQ
BS 704 720 RR4FR93JQ
BS 721 982 RR4BJ56TF

RD RR4G521JQ 618 0 0
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GATTCTGCAAATAAAATCAGAGACTAATAAAACTTGAAATGGAAGAAGTAGCATATGCTA
ATCAATAAGAATGGTTTTTT**GTTTTTTTTTCTTTATTGCTGCTTGCTCTGTTGTCCAG
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GAGTATACTCCTCCATCTTCTCCATAAGCTCTTTGGCTGTTGGTGCAGAAACCACAATAT
TACGTGCCCCTGGTTTGATAAAACCTTCTTGGACGCCAGTGTCAAACAAAGCAAGCAAAT
TGTTATAGTACCCATCAACATTCAATAGACCAACCGTCTTCTTATGGATACCAAGTTGTG
ACCATGTTATCATCTCCAGCAACTCCTCCATTGTTCCATAACCTCCAGGGAGGGCAATGA
AGGCCTCAGCTTCTTGTGCCATTGCAGCTTTTCGTTCGTGCATGTCAGCAACAACTCTTA
CTTCTCCAACAGTCTCACCAGATATCTCAATTGGCATCGAAGCTTTGGGAATGATCCCTA
GTACATGGAAACCACCTT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4BJ56JQ 703 0 0
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CAAATTGCAACAAGATTTTGAGTTTTCTTATACACATTGTTGATTCTGCAAATAAAATCA
AAAACTAATAAAACTTGAAATGGAAGAAGTAGCATATGCTAATCAATAAAAATGGTTTTT
TTGATTTTGTTTTCTTTATTGCTGCTTGCTCTGTTGTCCAGGGTAAGCTCCAAGTTCTTC
AACATTCCAGCTTTCGTGGGATGCAACATGCTTATGCGAAGGAGTGTACTCCTCCATCTT
TTCCATAAGCTCTTTGGCTGTTGGTGCAGAAACCACAATATTACGTGCACCTGGTTTGAT
AAAACCTTCTTGGACGCCAGTGTCAAACAAAGCAAGCAAATTGTTATAGTATCCATCAAC
ATTCAGTAAACCAACCGTCTTCTTATGGATACCAAGTTGTGACCATGTTATCATCTCCAG
CAGCTCCTCCATTGTTCCATAACCTCCAGGGAGAGCAATGAAGGCCTCAGCTTCTTGTGC
CATTGCAGCTTTTCGTTCGTGCATGTCAGCAACAACCCTTACTTCTCCTACAGTCTCACC
AGATATCTCAATTGGCATCAAAGCTTTGGGAATGATCCCGAGTACATGGAAACCACCTTC
ATAGACTCTCCTGGATATAAGACCCATCAACCCAACACTTCCT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FR93JQ 688 0 0
G
ACTATTTGTGACCCAATGTGATGTATCAAATTGCAACAAGATTTTGAGTTTTCTTATACA
GATTGTTGATTCTGCAAATAAAATCAGAGACTAATAAAACTTAAAATGGAAGAAGTAGCA
TATGCTAATCAATAAGAATGGTTTTTT*GATTTTGTTTTCTTTATTGCTGCTTGCTCTGT
TGTCCAGGGTAAGCTCCAAGTTCTTCAACATTCCAGCTTTCGTGGGATGCAACATGCTTA
TGCGAAGGAGTGTACTCCTCCATCTTTTCCATAAGCTCTTTGGCTGTTGGTGCAGAAACC
ACAATATTACGTGCCCCTGGTTTGATAAAACCTTCTTGGACGCCAGTGTCAAACAAAGCA
AGCAAATTGTTATAGTATCCATCAACATTCAGTAGACCAACCGTCTTCTTATGGATACCA
AGTTGTGACCATGTTATCATCTCCAGCAGCTCCTCCATTGTTCCATAACCTCCAGGGAGA
GCAATGAAGGCCTCAGCTTCTTGTGCCATTGCAGCTTTTCGTTCGTGCATGTCAGCAACA
ACCCTTACTTCTCCTACAGTCTCACCAGATATCTCAATTGGCATCAAAGCTTTGGGAATG
ATCCCGAGTACATGGAAACCACCTTCATAGACTCTCCTGGATATAAGACCCATCAACCCA
ACACTTCCTCCTCCATAAACCAAGTC
C

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR4FR93TF 688 0 0
G
ACTATTTGTGACCCAATGTGATGTATCAAATTGCAACAAGATTTTGAGTTTTCTTATACA
GATTGTTGATTCTGCAAATAAAATCAGAGACTAATAAAACTTAAAATGGAAGAAGTAGCA
TATGCTAATCAATAAGAATGGTTTTTT*GATTTTGTTTTCTTTATTGCTGCTTGCTCTGT
TGTCCAGGGTAAGCTCCAAGTTCTTCAACATTCCAGCTTTCGTGGGATGCAACATGCTTA
TGCGAAGGAGTGTACTCCTCCATCTTTTCCATAAGCTCTTTGGCTGTTGGTGCAGAAACC
ACAATATTACGTGCCCCTGGTTTGATAAAACCTTCTTGGACGCCAGTGTCAAACAAAGCA
AGCAAATTGTTATAGTATCCATCAACATTCAGTAGACCAACCGTCTTCTTATGGATACCA
AGTTGTGACCATGTTATCATCTCCAGCAGCTCCTCCATTGTTCCATAACCTCCAGGGAGA
GCAATGAAGGCCTCAGCTTCTTGTGCCATTGCAGCTTTTCGTTCGTGCATGTCAGCAACA
ACCCTTACTTCTCCTACAGTCTCACCAGATATCTCAATTGGCATCAAAGCTTTGGGAATG
ATCCCGAGTACATGGAAACCACCTTCATAGACTCTCCTGGATATAAGACCCATCAACCCA
ACACTTCCTCCTCCATAAACCAAGTC
C

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR4BJ56TF 798 0 0
GATTTG
TTTCTTTATTGCTGCTTGCTCTGTTGTCCAGGGTAAGCTCCAAGTTCTTCAACATTCCAG
CTTTCGTGGGATGCAACATGCTTATGCGAAGGAGTGTACTCCTCCATCTTTTCCATAAGC
TCTTTGGCTGTTGGTGCAGAAACCACAATATTACGTGCACCTGGTTTGATAAAACCTTCT
TGGACGCCAGTGTCAAACAAAGCAAGCAAATTGTTATAGTATCCATCAACATTCAGTAGA
CCAACCGTCTTCTTATGGATACCAAGTTGTGACCATGTTATCATCTCCAGCAGCTCCTCC
ATTGTTCCATAACCTCCAGGGAGAGCAATGAAGGCCTCAGCTTCTTGTGCCATTGCAGCT
TTTCGTTCGTGCATGTCAGCAACAACCCTTACTTCTCCTACAGTCTCACCAGATATCTCA
ATTGGCATCAAAGCTTTGGGAATGATCCCGAGTACATGGAAACCACCTTCATAGACTCTC
CTGGATATAAGACCCATCAACCCAACACTTCCTCCTCCATAAACCAAGTCTATCTTCCTC
TTCACGAGTTCATTGGCGAGTTCGATAGCAGCATCACTGAAAAGTTCTCTATTACCAGAG
TTGCTTCCGCAAAAGACACAAACTTTACTGAACCTGCTTCTCTTGTTCTCCTCCGTCAAC
ATCAACGGATAAAATCACTTTTGTGTGACTGAGATTATTATTATATACGAAGGGGAGGGA
CGGGATGCAAACAAGATTGAAAATATCGAATGAGAAAAATACAAAACAAAACTCTAATCC
AATCCAGAGTCC

QA 7 798 7 798
DS 



AS 1 2

CO CL1463Contig1 803 2 4 U
AGGATGAAAACAACATTAATTAACTTCTTAAGATAGTAAAGCAACACAACAGTAACTAAA
AAAAACTAATACTATCGTTGCGTGTGGATCTGAAGCCTAATCTCCAAATCACAATCGATT
TTGGATGTATTGTTACATAAAAGATGTGAACAGATATGCTTTATTAGATATGACTAGATG
CAGAGATCATCATTTAGGCTTCCATAATTTGCTATCACATCCACTTATAGACAATGTTAT
ACAGTGTTCTGACAGGTTTGTGTGGCTGGTGAATAAAGAATCGTCGTTTCGTGATAGTTT
CGAAAAATAGTTCGGTGTGGACTTGTTATTAATCACTCTGGAATCACAAAGCTTTATTAG
CGGCGGGAGGGATCAGAAGCGGCAAGCTCCTTGTACATGTTTGTTATTGCTTCTGCGAAA
TATTCCTTTGCTTGTGATCTCTTAATCTTTAATGTCGGTGTCAACAAGCCATTTTCTAGC
GTGAAAGGCTCAAGCACCAACGTCACAGCTTTTGCAAACTCAAAGCCTCTCAACTTAGCT
TCTCTTCCAACAGCGTCCAAGTCAGATAGTACTGCTGCTTTCACTTTCGGGTTATTGCAC
AATTCTTTCAGATCTCCCTGCTTAATGCGTTGTGAAGCAGCCCAGCTTTTAAGCACATCT
GGATCGACCGATACTACAGCAACCAATGATGAATTAAAGCTATCACCATATATGAAGCAT
TGCCCCACAAATTTGCATTTGGCATAGACGTTTTCGATTTTCTCTGGAGCTATGTACGCT
CCTTGCGCAAATTTGAAGATGTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF80JQ U 1
AF RR4AR65JQ U 3
BS 1 106 RR4EF80JQ
BS 107 107 RR4AR65JQ
BS 108 712 RR4EF80JQ
BS 713 803 RR4AR65JQ

RD RR4EF80JQ 712 0 0
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AAAAACTAATACTATCGTTGCGTGTGGATCTGAAGCCTAATCTCCAGATCACAATCGATT
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CAGAGATCATCATTTAGGCTTCCATAATTTGCTATCACATCCACTTATAGACAATGTTAT
ACAGTGTTCTGACAGGTTTGTGTGGCTGGTGAATAAAGAATCGTCGTTTCGTGATAGTTT
CGAAAAATAGTTCGGTGTGGACTTGTTATTAATCACTCTGGAATCACAAAGCTTTATTAG
CGGCGGGAGGGATCAGAAGCGGCAAGCTCCTTGTACATGTTTGTTATTGCTTCTGCGAAA
TATTCCTTTGCTTGTGATCTCTTAATCTTTAATGTCGGTGTCAACAAGCCATTTTCTAGC
GTGAAAGGCTCAAGCACCAACGTCACAGCTTTTGCAAACTCAAAGCCTCTCAACTTAGCT
TCTCTTCCAACAGCGTCCAAGTCAGATAGTACTGCTGCTTTCACTTTCGGGTTATTGCAC
AATTCTTTCAGATCTCCCTGCTTAATGCGTTGTGAAGCAGCCCAGCTTTTAAGCACATCT
GGATCGACCGATACTACAGCAACCAATGATGAATTAAAGCTATCACCATATA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4AR65JQ 801 0 0
GG
TGAAAACAACATTAATTAACTTCTTAAGATAGTAAAGCAACACAACAGTAACTAAAAAAA
ACTAATACTATCGTTGCGTGTGGATCTGAAGCCTAATCTCCAAATCACAATCGATTTTGG
ATGTATTGTTACATAAAAGATGTGAACAGATATGCTTTATTAGATATGACTAGATGCAGA
GATCATCATTTAGGCTTCCATAATTTGCTATCACATCCACTTATAGACAATGTTATACAG
TGTTCTGACGGGTTTGTGTGGCTGGTGAATAAAGAATCGTCGTTTCGTGATAGTTTCGAA
GAATAGTTCGGTGTGGACTTGTTATTAATCACTCTGGAATCACAAAGCTTTATTAGCGGC
GGGAGGGATCAGAAGCGGCAAGCTCCTTGTACATGTTTGTTATTGCTTCTGCGAAATATT
CCTTTGCTTGTGATCTCTTAATCTTTAATGTCGGTGTCAACAAGCCATTTTCTAGCGTGA
AAGGCTCAAGCACCAACGTCACAGCTTTTGCAAACTCAA*GCCTCTCAACTTAGCTTCTC
TTCCAACAGCGTCCAAGTCAGATAGTACTGCTGCTTTCACTTTCGGGTTATTGCACAATT
CTTTCAGATCTCCCTGCTTAATGCGTTGTGAAGCAGCCCAGCTTTTAAGTACATCTGGAT
CGACCGATACTACAGCAACCAATGATGAATTAAAGCTATCACCATATATGAAGCATTGCC
CCACAAATTTGCATTTGGCATAGACGTTTTCGATTTTCTCTGGAGCTATGTACGCTCCTT
GCGCAAATTTGAAGATGTT

QA 3 801 3 801
DS 



AS 1 4

CO CL1464Contig1 963 4 27 U
GGGAGTGGAGGAGAAGGAGAATGGGAGATCTCTACGCTCTAGACTTCGACGGAGTTCTCT
GCGATAGTTGTGGTGAAAGCTCTCTCTCTGCTGTTAAGGCTGCGAGAGCGAGGTGGCCTG
GTCTGTTCCAAGGAGTTGACTCAGCTTTAGAGGAATGGATCGTTGATCAGATGCATATTG
TGAGACCTGTGGTGGAAACTGGCTATGAAAATCTTCTGCTTGTTCGTCTACTGTTGGAGA
CTAAGATGCCCTCTATTCGAAAATCTTCAGTTGCAGAGGGATTGACTGTTGATGGGATAT
TGGAGAGCTGGGGAAAGATTAAGCCGGTTATCATGGAAGCTTGGGGTGAAGAAGATAAAG
ATGCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAAGTTAGAGATGATTGGATTAACAATGACTTGACTA
CTTGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCAGGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCT
CAAAGATTTACATTGTTACCACGAAACAGGGCCGGTTTGCAGAAGCGTTACTACGTGAAA
TAGCAGGTGTGATCATACCACCAGAAAGGATCTATGGTCTGGGTACAGGCCCAAAGGTGG
AAGTGCTAAAGCTACTTCAGAACAAACCAGAGCACCAGGGCTTGAAGCTGCATTTCGTGG
AAGACAGACTCGCAACGCTGAAGAATGTCATCAAAGAGCCTGAACTAGACAAATGGAATC
TATACCTAAGTAACTGGGGCTACAACACAGAGAAAGAAAGAGCAGAGGCAGAGAGCATTC
CAAGAATTCAGGTCATCGAGCTTTCCACGTTTGGCAATAAGCTTAAATGAGTGGCATACC
CATCAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAACAAGCTTCCCTTTTCATTGTATTCTACAAGCCAA
ACACTGTAGCTAAGAATCAGCTAAAAGAGATAAAACTTTTCAATCTCATAACTCATCCTT
GCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FW08TF U 1
AF RR4FZ66TF U 2
AF RR4EB16TF U 28
AF RR4FW08JQ C 267
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BS 192 259 RR4FW08TF
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BS 746 754 RR4FZ66TF
BS 755 963 RR4FW08JQ

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ATGCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAAGTTAGAGATGATTGGATTAACAATGACTTGACTA
CTTGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCAGGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCT
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TAGCAGGTGTGATCATACCACCAGAAAGGATCTATGGTCTGGGTACAGG
GC

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DS 

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CGATAGTTGTGGTGAAAGCTCTCTCTCTGCTGTTAAGGCTGCGAGAGCGAGGTGGCCTGG
TCTGTTCCAAGGAGTTGACTCAGCTTTAGAGGAATGGATCGTTGATCAGATGCATATTGT
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TAAGATGCCCTCTATTCGAAAATCTTCAGTTGCAGAGGGATTGACTGCTGATGGGATATT
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TTGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCAGGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCTC
AAAGATTTACATTGTTACCACGAAACAGGGCCGGTTTGCAGAAGCGTTACTACGTGAAAT
AGCAGGTGTGATCATACCACCAGAAAGGATCTATGGTCTGGGTACAGGCCCAAAGGTGGA
AGTGCTAAAGCTACTTCAGAACAAACCAGAGCACCAGGGCTTGAAGCTGCATTTCGTGGA
AGACAGACTCTCA*CGCTGAAGA*TGTCATCAAAGAGCCTGAACTAGACAA*TGGA*TCT
ATACCTAAGTAACTGGGGCTACA*CACAGAGAA
GAAGAGC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EB16TF 707 0 0
GG
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GCTGTTAAGGCTGCGAGAGCGAGGTGGCCTGGTCTGTTCCAAGGAGTTGACTCAGCTTTA
GAGGAATGGATCGTTGATCAGATGCATATTGTGAGACCTGTGGTGGAAACTGGCTATGAA
AATCTTCTGCTTGTTCGTCTACTGTTGGAGACTAAGATGCCCTCTATTCGAAAATCTTCA
GTTGCAGAGGGATTGACTGTTGATGGGATATTGGAGAGCTGGGGAAAGATTAAGCCGGTT
ATCATGGAAGCTTGGGGTGAAGAAGATAAAGAAGCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAAGTT
AGAGATGATTGGATTAACAATGACTTGACTACTTGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCA
GGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCTCAAAGATTTACATTGTTACCACGAAACAG
GGCCGGTTTGCAGAAGCGTTACTACGTGAAATAGCAGGTGTGATCATACCACCAGAAAGG
ATCTATGGTCTGGGTACAGGCCCAAAGGTGGAAGTGCTAAAGCTACTTCAGAACAA*CCA
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ATCAAAGAGCCTGAACTAGACAAATGGAATCTATACCTAAGTAAC

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DS 

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GTTATCATGGAAGCTTGGGGTGAAGAAGATAAAGATGCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAA
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CCAGGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCTCAAAGATTTACATTGTTACCACGAAA
CAGGGCCGGTTTGCAGAAGCGTTACTACGTGAAATAGCAGGTGTGATCATACCACCAGAA
AGGATCTATGGTCTGGGTACAGGGCCAAAGGTGGAAGTGCTAAAGCTACTTCAGAACAAA
CCAGAACACCAGGGCTTGAAGCTGCATTTCGTGGAAGACAGACTCGCAACGCTGAAGAAT
GTCATCAAAGAGCCTGAACTAGACAAATGGAATCTATACCTAAGTAACTGGGGCTACAAC
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ACGTTTGGCAATAAGCTTAAATGAGTGGCATACCCATCAGAAAGAAAAAGAAAAAAAAAA
CAAGCTTCCCTTTTCATTGTATTCTACAAGCCAAACACTGTAGCTAAGAATCAGCTAAAA
GAGATAAAACTTTTCAATCTCATAACTCATCCTTGCG

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DS 



AS 1 4

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AATGCAGAGTTGTTCACATTGACGTACGGTGCAATCGTGCGTCAATTGCTTACAGACCTC
GAAGATGTCGATGAAGTCAACAAACAGCTTGATCAAATGGGATACAACATTGGAATCAGA
CTTATCGATGAGTTTCTAGCCAAATCTGGCGTTTCCAGATGCGTTGATTTCAAGGAAACT
GCTGAAATGATTGCCAAGGTGGGTTTCAAGATGTTTTTGGGGGTCACTGCATCAGTCTCA
AGCTGGGACGCGGACGGGACTTGCTGCAGTATCATCTTGGAAGACAATCCACTCGTTGAT
TTCGTGGAGCTTCCCGATACTTGCCAAGGGCTTTACTACTGCAACGTCTTAAGTGGAGTC
ATCAGAGGCGCTTTGGAAATGGTGTCAATGAAGACAGAAGTGACGTGGACGCGTGATGCT
CTCAGAGGGGATGATGCTTATGAGTTGCAGGTGAAGCTACTGAAGCAAGTCGCGGAGGAG
TATCCGTACAAGGATGATGAATAAATTGTCACTCCCATGTGTAGCGTCTTGGCTCTTCTT
TTCTTCTTCCAGAAACACAAACTCTGAGCTTTGAAACTGAATACTGTTTTATGTTTGGCA
CAAACCTATTAATCCATTTCTTAGCTGTTTTATAACTCAATGTGAGAAGAGTTGAGCGTA
TC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4CY82TF U 1
AF RR4CY82JQ C 334
AF RR4C381JQ C 5
AF RR4B965TF U 392
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CTTATCGATGAGTTTCTAGCCAAATCTGGCGTTTCCAGATGCGTTGATTTTAAGGAAACT
GCTGAAATGATTGCCAAGGTGGGTTTCAAGATGTTTTTGGGGGTCACTGCATCAGTCTCA
AGCTGGGACGCGGACGGGACTTGCTGCAGTATCATCTTGTAAGACAATCCACTCGTTGAT
TTCGTGGAGCTTCCCGATACTTGCCAAGGGCTTTACTACTGCAACGTCTTAAGTGGAGTC
ATCAGAGGCGCTTTGGAAATGGTGTCAATGAAGACAGAAGTGACTTGGACGCGTGATGCT
CTCAGAGGGGATGATGCTTATGAGTTGCAGGTGAAGCTACTGAAGCAAGTCGCTGAGGAG
TATCCGTACAAG*ATGATGAATAAATTGTCACTCCCATGTGTAGCGTCTTGGTTCTTCTT
TTCTTCTTCCAGAAACACAAACTCTGAGCTTTGAAACTGA*TACTGTTTTATGTTTGGCA
CAAACCTATTA
TCCAAAAAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4CY82JQ 402 0 0
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ATCTTGTAAGACAATCCACTCGTTGATTTCGTGGAGCTTCCCGATACTTGCCAAGGGCTT
TACTACTGCAACGTCTTAAGTGGAGTCATCAGAGGCGCTTTGGAAATGGTGTCAATGAAG
ACAGAAGTGACTTGGACGCGTGATGCTTTCAGAGGGGATGATGCTTATGAGTTGCAGGTG
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CCCATGTGTAGCGTCTTGGTTCTTCTTTTCTTCTTCCAGAAACACAAACTTTGAGCTTTG
AAACTGAATACTGTTTTATGTTTGGCACAAACCTATTA
ATCC

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DS 

RD RR4C381JQ 731 0 0
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CAGAGTTGTTCACATTGACGTACGGTGCAATCGTGCGTCAATTGCTTACAGACCTCGAAG
ATGTCGATGAAGTCAACAAACAGCTTGATCAAATGGGATACAACATTGGAATCAGACTTA
TCGATGAGTTTCTTGCCAAATCTGGCGTTTCCAGATGCGTTGATTTCAAGGAAACTGCTG
AAATGATTGCCAAGGTGGGTTTCAAGATGTTTTTGGGGGTCACTGCATCAGTCTCAAGCT
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TGGAGCTTCCCGATACTTGCCAAGGGCTTTACTACTGCAACGTCTTAAGTGGAGTCATTA
GAGGCGCTTTGGAAATGGTGTCAATGAAGACAGAAGTGACGTGGACGCGTGATGCTCTTA
GAGGGGATGATGCTTATGAGTTGCAGGTGAAGCTACTGAAGCAAGTCGCGGAGGAGTATC
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TCTTCCAGAAACACAAACTCTGAGCTTTGAAACTGCATACTGTTTTATGTTTGGCACAAA
CCTATTA
ATCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4B965TF 391 0 0
G
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TTACTACTGCAACGTCTTAAGTGGAGTCATTAGAGGCGCTTTGGAAATGGTGTCAATGAA
GACAGAAGTGACGTGGACGCGTGATGCTCTTAGAGGGGATGATGCTTATGAGTTGCAGGT
GAAGCTACTGAAGCAAGTCGCGGAGGAGTATCCGTACAAGGATGATGAATAAATTGTCAC
TCCCATGTGTAGCGTCTTGGCTCTTCTTTTCTTCTTCCAGAAACACAAACTCTGAGCTTT
GAAACTGCATACTGTTTTATGTTTGGCACAAACCTATTAATCCATTTCTTAGCTGTTTTA
TAACTCAATGTGAGAAGAGTTGAGCGTATC

QA 2 391 2 391
DS 



AS 1 5

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GGAACCAAACATTCTCTCTAAGCTCAGAATCTTCGCCATGAAAACGTAAAGAAACACAAA
GACCCAGCTCTCAAACAAAAAAAAAAAAACAGCAGCCATGTCTTTTCTTCTCTCTAATCT
ATCTCCTTCGATACTTCTCCAAACCGGAAAATCCACAAACCTTAGTAGACCCATCTTCAC
TCCATCTCTATCGCCATCGTCTTCAAAAGGCTACGTGTTTGATGGGGATAATAATCTCTC
TACACTCTCTCTTTCTTCCGTCCAGTCTCCTCCTCTTCAAGACGCCCAGGTTAAGACAAA
ACCCACTCCGCAAGACAAACATAACAACAACGACAGAGATGAGTTCTACATCAACCTCGG
TCTCGCTGTCCGTACGCTTCGTGAAGATATGCCTTTGATCTTCGCTAGAGATCTAAACTA
CGACATCTACAGGGATGATGTAACGTTTATGGATCCGATGAACACATTCAGTGGGATTGA
GAACTACAAGTTGATCTTCTGGGCACTCAGGTTTCACGGGAAGATATTGTTCAGAGACAT
CTCTCTTGAGATCTTCAGGGTATGGCAACCATCAGAGAACATGATTCTCATCAGGTGGAC
TCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTTCCATGGGAAGCTAAAGGAGAGTTTCAAGGCACTTCTCG
GTATAAACTCGACCGTAATGGCAAAATCTATGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCCTTCAA
TTTCCCTCATCAGCTCAAACCCGCAGCTTCGGTTTTGGATTTGGTGACTGCTGCTTCCCC
TGCGAGTAGTCCGAATCCGACCTTCTTTTCCAGTCCTGTCGACTCTTGTTCATCTTCATG
GATCGAGTTTTATCAAGCGGTGAGGCGGACAGTGGACAAGACAGAGGATATGCTTGTGAC
AGACAGTTTAATCACATGCTCATAGTGGAAGTAGAGTTGTTGCTATACACATACTCAGGG
ACACACCCTTCTCAGGTGTATATAGGTGTTACATTTAAAGGTTATAATATATGTGTGAGT
AGATCTGGTTGGCTTTAAGCTTTCGAGGAAACATAAAAGTGTAATGTGGTTCCAAAAGCT
TTTATACAACTTTGTCAATACATTGGAGTTTTGTCTTTGTGATCATTTGAAATATTAGAA
GCACAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 5 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX84TF U 1
AF RR4CR41TF U 27
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AF RR4GM92JQ C 360
AF RR4CR41JQ C 372
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RD RR4BX84TF 748 0 0
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TTCTCTTGAGATCTTCAGGGTATGGCAACCATCAGAGAACATGATTCTGATCAGGTGGAC
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GTATAAACTCGACCGTAATGGCAAAATCTATGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCCTTCAA
TTTCCCTCATCAGCTCAAACCCGCAG
TG

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DS 

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GG
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*CAGCAGCCATGTCTTTTCTTCTCTCTAATCTATCTCCTTCGATACTTCTCCAAACCGGA
AAATCCACAAACCTTAGTAGACCCATCTTCACTCCATCTCTATCGCCATCGTCTTCAAAA
GGCTACGTGTTTGATGGGGATAATAATCTCTCTACACTCTCTCTTTCTTCCGTCCAGTCT
CCTCCTCTTCAAGACGCCCAGGTTAAGACAAAACCCACTCCGCAAGACAAACATAACAAC
AACGACAGAGATGAGTTCTACATCAACCTCGGTCTCGCTGTCCGTACGCTTCGTGAAGAT
ATGCCTTTGATCTTCGCTAGAGATCTAAACTACGACATCTACAGGGATGATGTAACGTTT
ATGGATCCGATGAACACATTCAGTGGGATTGAGAACTACAAGTTGATCTTCTGGGCACTC
AGGTTTCACGGGAAGATATTGTTCAGAGACATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGTATGGCAA
CCATCAGAGAACATGATTCTCATCAGGTGGACTCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTTCCATGG
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TATGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCCTTCAATTTCCCTCATCAGCTCAA
CCCGCAG

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DS 

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AAAAAAAAAACAGCAGCCATGTCCTTCCTTCTCTCTAATCTATCTCCTTCGATACTTCTC
CAAACCGGAAAATCCACAAACCTTAGTAGACCCATCTTCACTCCATCTCTATCGCCATCG
TCTTCAAAAGGCTACGTGTTTGATGGGGATAATAATCTCTCTACACTCTCTCTTTCTTCC
GTCCAGTCTCCTCCTCTTCAAGACGCCCAGGTTAAGACAAAACCCACTCCGCAAGACAAA
CATAACAACAACGACAGAGATGAGTTCTACATCAACCTCGGTCTCGCTGTCCGTACGCTT
CGTGAAGATATGCCTTTGATCTTCGCTAGAGATCTAAACTACGACATCTACAGGGATGAT
GTAACGTTTATGGATCCGATGAACACATTCAGTGGGATTGAGAACTACAAGTTGATCTTC
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GTTCCATGGGAGGCTAAAGGAGAGTTTCAAGGCACTTCTCGGTATAAACTCGACCGTAAT
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ACCTTCTTTTC
AGTCTGTCGACTC

QA 9 739 9 739
DS 

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ACGACATCTACAGGGATGATGTAACGTTTATGGATCCGATGAACACATTCAGTGGGATTG
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CTCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTTCCATGGGAGGCTAAAGGAGAGTTTCAAGGCACTTCTC
GGTATAAACTCGACCGTAATGGCAAAATCTATGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCCTTCA
ATTTCCCTCATCAGCTCAAACCCGCAGCTTCGGTTTTGGATTTGGTGACTGCTGCTTCCC
CTGCGAGTAGTCCGAATCCGACCTTCTTTTCCAGTCCTGTCGACTCTTGTTCATCTTCAT
GGATCGAGTTTTATCAAGCGGTGAGGCGGACAGTGGACAAGACAGAGGATATGCTTGTGA
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GACACACCCTTCTCAGGTGTATATAGGTGTTACATTTAAAGGTTATAATATATGTGTGAG
TAGATCTGGTTGGCTTTAAGCTTTCGAGGAAACATAAAAGTGTAATGTGGTTCCAAAAGC
TTTTATACAACTTTGTCAATACATTGGAGTTTTGTCTTTGTGATCATTTGAAA
TATT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4CR41JQ 778 0 0
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GGGATGATGTAACGTTTATGGATCCGATGAACACATTCAGTGGGATTGAGAACTACAAGT
TGATCTTCTGGGCACTCAGGTTTCACGGGAAGATATTGTTCAGAGACATCTCTCTTGAGA
TCTTCAGGGTATGGCAACCATCAGAGAACATGATTCTCATCAGGTGGACTCTCAAAGGTG
TGCCTAGAGTTCCATGGGAAGCTAAAGGAGAGTTTCAAGGCACTTCTCGGTATAAACTCG
ACCGTAATGGCAAAATCTATGAGCATAAAGTCGATAACTTGGCCTTCAATTTCCCTCATC
AGCTCAAACCCGCAGCTTCGGTTTTGGATTTGGTGACTGCTGCTTCCCCTGCGAGTAGTC
CGAATCCGACCTTCTTTTCCAGTCCTGTCGACTCTTGTTCATCTTCATGGATCGAGTTTT
ATCAAGCGGTGAGGCGGACAGTGGACAAGACAGAGGATATGCTTGTGACAGACAGTTTAA
TCACATGCTCATAGTGGAAGTAGAGTTGTTGCTATACACATACTCAGGGACACACCCTTC
TCAGGTGTATATAGGTGTTACATTTAAAGGTTATAATATATGTGTGAGTAGATCTGGTTG
GCTTTAAGCTTTTGAGGAAACATAAAAGTGTAATGTGGTTCCAAAAGCTTTTATACAACT
TTGTCAATACATTGGAGTTTTGTCTTTGTGATCATTTGAAATATTAGAAGCACAATGC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 6

CO CL1467Contig1 1007 6 37 U
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ATTACATACAAAGTCATGTAGCATTTAACAGTTCGGATAATATGTCGAAATGTCCTTTTC
TAGTAACATATAACAAAAGAGCAAAAGGCAAAGCAAAAACAAGCAGCAATGCAAAAATCT
GTGAGGCAAAGCTGGTTGATCAGTCAGAGTCAGAGTCCAGATTCTCTGAAGACCTAACCG
AACGCCTTATGCTCTCTTGGTATTCAGCATCTTCATCATCTTCCTCTTTCTTCTTCTTGC
TGAGCATTCCTTTTTTAATCAGAACGTTCTCCAATTTGGTAGTGGTGAAATCATCCTTTG
TGCCAAGATCCTGGAACCCAACAAGCCTATCTATCGCAATTCCCTTGCTGAAAAGCAAAA
CGCAAGGCAAGGTCTTTATTGCTAGCTTCGTGACAAAGAAAGGAGCATTCTCTGCGTCAA
CTCTAATGAACTTAGTGTCCACATGTCTAGGGGCAAGAGTCTTCAGATGCTTGTCCATAA
TCTTGCAGCGGTAAAACTCCTTGTGGTAGAAATGACAAATAACTTTGGGACTCGTGGTGA
CTTCCCCAAAGAAATCACCCTCGGTTACCTCTCGATATTCACCATGACCTTGTCTTTTGA
ACGCTTCTCTCTTCTCAACTTCTCTCTTGAGTGCAGCAATCCTGTCAGCGTGCAACTTTT
CTAGCTCTGGATCATCCATGAGATCATCAAGATCAACCTCCTCATTCACATGATTCGATG
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CGTTTCCGAAGGCCAGATTCGAGAGGGTCGACTTTACTGCATCCGGATCCATCTTTAGTG
CCCCCTCAAAAAGATATCTACGCTCCTCCGAGATTTTTCTTACCGGTGATAAATTATAAA
CAGAGTGAGCAATCCAAAATTGGAGTGTTTCTTATTGCCTTCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AY02JQ U 15
AF RR4CW78JQ U 1
AF RR4AV16JQ U 162
AF RR4AV16TF C 250
AF RR4CW78TF C 438
AF RR4AY02TF C 250
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BS 823 1007 RR4AV16TF

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TCTTGGTATTCAGCATCTTCATCATCTTCCTCTTTCTTCTTCTTGCTGAGCATTCCTTTT
TTAATCAGAACGTTCTCCAATTTGGTAGTGGTGAAATCATCCTTTGTGCCAAGATCCTGG
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TTTATTGCTAGCTTCGTGACAAAAAAAGGAGCATTCTCTGCGTCAACTCTAATGAACTTA
GTGTCCACATGTCTAGGGGCAAGAGTCTTCAGATGCTTGTCCATAATCTTGCAGCGGTAA
AACTCCTTGTGGTAGAAATGACAAATAACTTTGGGACTCGTGGTGACTTCCCCAAAGAAA
TCACCCTCGGTTACCTCTCGATATTCACCATGACCTTGTCTTTTGAACGCTTCTCTCTTC
TCAACTTCTCTCTTGAGTGCAGCAATCCTGTCAGCGTGCAACTTTTCTAGCTCTGGATCA
TCCATGAGATCATCAAGATCAA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4CW78JQ 799 0 0
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ATTACATACAAAGTCATGTAGCATTTAACAGTTCGGATAATATGTCGAAATGTCCTTTTC
TAGTAACATATAACAAAAGAGCAAAAGGCAAAGCAGAGACAAGCAGCAATGCAAAAATCT
GTGAGGTAAGGCTGGTTGATCAGTCAGAGTCAGAGTCCAGATTCTCTGAAGACCTAACCG
AACGCCTTATGCTCTCTTGGTATTCAGCATCTTCATCATCTTCCTCTTTCTTCTTCTTGC
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TGCCAAGATCCTGGAACCCAACAAGCCTATCTATCGCTATTCCCTTGCTGAAAAGCAAAA
CGCAAGGCAAGGCCTTTATTGCTAGTTTCGTGACAAAGAAAGGAGCATTCTCGGCGTCAA
CTCTAATGAATTTAGTGTCCACATGTCTAGGGGCAAGAGTCTTCAGATGCTTGTCCATAA
TCTTGCAGCGGTAAAACTCCTTGTGGTAGAAATGACAAATAACTTTGGGACTCGTGGTGA
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ATTGCGTCTTCTCATTTGC

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DS 

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TCCTCTTTCTTCTTCTTGCTGAGCATTCCTTTTTTAATCAAAACGTTCTCCAATTTGGTA
GTGGTGAAATCATCCTTTGTGCCAAGATCCTGGAACCCAACAAGCCTATCTATCGCAATT
CCCTTGCTGAAAAGCAAAACGCAAGGCAAGGTCTTTATTGCTAGCTTCGTGACAAAAAAA
GGAGCATTCTCTGCGTCAACTCTAATGAACTTAGTGTCCACATGTCTAGGGGCAAGAGTC
TTCAGATGCTTGTCCATAATCTTGCAGCGGTAAAACTCCTTGTGGTAAAAATGACAAATA
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CCATGACCTTGTCTTTTGAACGCTTCTCTCTTCTCAACTTCTCTCTTGAGTGCAGCAATC
CTGTCAGCGTGCAACTTTTCTAGCTCTGGATCATCCATGAGATCATCAAGATCAACCTCC
TCATTCACATGATTCGATGATTGCGCCTTCTCATTTGCAAGAACTTCCTTTTTGTAATCT
C

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DS 

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AGAAATCACCCTCGGTTACCTCTCGATATTCACCATGACCTTGTCTTTTGAACGCTTCTC
TCTTCTCAACTTCTCTCTTGAGTGCAGCAATCCTGTCAGCGTGCAACTTTTCTAGCTCTG
GATCATCCATGAGATCATCAAGATCAACCTCCTCATTCACATGATTCGATGATTGCGCCT
TCTCATTTGCAAGAACTTCCTTTTTGTAATCTCTGGCAGCTGCAGCCAATACGTTTCCGA
AGGCCAGATTCGAGAGGGTCGACTTTACTGCATCCGGATCCATCTTTAGTGCCCCCTCAA
AAAGATATCTACGCTCCTCCGAGATTTTTCTTACCGGTGATAAATTATAAACAGAGTGAG
CAATCCAAAATTGGAGTGTTTCTTATTGCCTTCAATTT

QA 1 758 1 758
DS 

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TCCACATGTCTAGGGGCAAGAGTCTTCAGATGCTTGTCCATAATCTTGCAGCGGTAAAAC
TCCTTGTGGTAGAAATGACAAATAACTTTGGGACTCGTGGTGACTTCCCCCAAGAAATCA
CCCTCGGTTACCTCTCGATATTCACCATGTCCTTGTCTTTTGAACGCTTCTCTCTTCTCA
ACTTCTCTCTTGAGTGCGGCAATCCTATCAGCGTGCAATTTTTCTAGCTCTGGATCATCC
ATGAGATCATCAAGATCAACCTCCTCATTCACATGATTCGATGATTGCGTCTTCTCATTT
GCAAGAACTTCCTTTTTGTAATCTCTGGCAGCTGCAGCCAATACGTTTCCGAAGGCCAGA
TTCGAGAGGGTCGACTTTACTGCATCCGGATCCATCTTTAGTGCCCCCTCAAAAAGATAT
CTACGCTCCTCCGAGATTTTTCTTACCGGTGATAAATTATAAACAGAGTGAGCAATCCAA
AATTGGAGTGTTTCTTATTGCCTTCAATTT

QA 1 570 1 570
DS 

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CTTTTTTAATCAGAACGTTCTCCAATTTGGTAGTGGTGAAATCATCCTTTGTGCCAAGAT
CCTGGAACCCAACAAGCCTATCTATCGCAATTCCCTTGCTGAAAAGCAAAACGCAAGGCA
AGGTCTTTATTGCTAGCTTCGTGACAAAGAAAGGAGCATTCTCTGCGTCAACTCTAATGA
ACTTAGTGTCCACATGTCTAGGGGCAAGAGTCTTCAGATGCTTGTCCATAATCTTGCAGC
GGTAAAACTCCTTGTGGTAGAAATGACAAATAACTTTGGGACTCGTGGTGACTTCCCCAA
AGAAATCACCCTCGGTTACCTCTCGATATTCACCATGACCTTGTCTTTTGAACGCTTCTC
TCTTCTCAACTTCTCTCTTGAGTGCAGCAATCCTGTCAGCGTGCAACTTTTCTAGCTCTG
GATCATCCATGAGATCATCAAGATCAACCTCCTCATTCACATGATTCGATGATTGCGCCT
TCTCATTTGCAAGAACTTCCTTTTTGTAATCTCTGGCAGCTGCAGCCAATACGTTTCCGA
AGGCCAGATTCGAGAGGGTCGACTTTACTGCATCCGGATCCATCTTTAGTGCCCCCTCAA
AAAGATATCTACGCTCCTCCGAGATTTTTCTTACCGGTGATAAATTATAAACAGAGTGAG
CAATCCAAAATTGGAGTGTTTCTTATTGCCTTCAATTT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 5

CO CL1468Contig1 1107 5 14 U
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CACGCCTCTTGATTTTACAAGAATCTCATTTCAACATTGGAAAAACAAAGAGGGTGAAAT
GTCACAAAAGGGAAGATGAGTGAGTTTCATTCACTTCCAGAGCTCTTCCATGGGGATTCC
ACGCTCGAGAGCAACATCCTTAAACTGTCTCATCTGTTGAACTGCTGCAAGTGTGGCTCT
CGCGTTGTTTAGAGCATTGTTGCCTCCCAGCTGTTTCCCCAAAGCGTTCTCAACTCCCGC
CATCTCTAGCACGATCCTAACCGCTCCTCCAGCAATCACACCCGCTCCTGGTGAAGCTGG
TCTAAGCATCACCTTCGCTGCTCCGTAGTCTCCCTCTGATCTGTGAGGGAACGTAAGGTA
CTTAGTCATAGGCACTTGAACAAGGTTCCTCCTAGCATCAATCGCACTCTTCTGAACAGC
AGCAACAACCTCCTTAGCCTTAGCGCACCCAACTCCGACATTCCCCTGCTTATCACCGAC
AACAACAATCGCCCTAAACTTCAACTGCTTCCCACCTTTCACAACCTTAGTCACCCTTCT
CACCTGCACAACCCTCTCCTCGAACCCATCCCTAATCTTCTCCTTATTCGGCTTCTGCCC
ACCGATCCCACCTCCCCCGCCTTTCTTCAGCTTCGAGTCCATCACGTTCACGTCCTTCCC
CAGCATGCTCTCCCCGCTGTACGCTGGCCCGTAAGCTCCTCGTAAGCCGTGGCGATCTCG
GCTTCTGCTTCATCGGCGCCTTCGTCGAAATACGGCGCGGGAACGAAACCTTCGGGAGGG
GAAGGTGGGTCGAAGACGGCGTTGGCGGTTATCTCCGGGTTCTGGTCTTCGAAGAAGATG
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GAGAGAGAAGAGAGAGAGGAGAGAGCTGAGGTTGTCGCCATTGAAATGAGGATGAGGGGA
AGCAGAGAGGCTTATCCTTAGCAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D519JQ U 25
AF RR4D213JQ U 25
AF RR4B577JQ U 1
AF RR4D519TF C 355
AF RR4D213TF C 388
BS 1 263 RR4B577JQ
BS 264 264 RR4D213JQ
BS 265 344 RR4B577JQ
BS 345 345 RR4D213JQ
BS 346 351 RR4B577JQ
BS 352 352 RR4D213JQ
BS 353 537 RR4B577JQ
BS 538 538 RR4D213JQ
BS 539 645 RR4B577JQ
BS 646 646 RR4D519TF
BS 647 669 RR4B577JQ
BS 670 670 RR4D519TF
BS 671 690 RR4B577JQ
BS 691 1107 RR4D519TF

RD RR4D519JQ 369 0 0
TATTTCAAAATAAACAGATTATCTCAGGAATTACAGCACGCCTCTTGATTTTACAAGAAT
CTCATTTCAACATTGGAAAAACAAAGAGGGTGAAATGTCACAAAAGGGAAGATGAGTGAG
TTTCATTCACTTCCAGAGCTCTTCCATGGGGATTCCACGCTCGAGAGCAACATCCTTAAA
CTGTCTCATCTGTTGAACTGCTGCAAGTGTGGCTCTCGCGTTGTTTAGAGCATTGTTGCC
TCCCAGCTGTTTCCCCAAAGCGTTCTCAACTCCCGCCATCTCTAGCACGATCCTAACCGC
TCCTCCAGCAATCACACCCGCTCCTGGTGAAGCTGGTCTAAGCATCACCTTCGCTGCTCC
GTAGTCTCC

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4D213JQ 523 0 0
TATTTCAAAATAAACAGATTATCTCAGGAATTACAGCACGCCTCTTGATTTTACAAGAAT
CTCATTTCAACATTGGAAAAACAAAGAGGGTGAAATGTCACAAAAGGGAAGATGAGTGAG
TTTCATTCACTTCCAGAGCTCTTCCATGGGGATTCCACGCTCGAGAGCAACATCCTTAAA
CTGTCTCATCTGTTGAACTGCTGCAAGTGTGGCTCTCGCGTTGTTTAGAGCATTGTTGCC
TCCCAGCTGTTTCCCCAAAGCGTTCTCAACTCCCGCCATCTCTAGCACGATCCTAACCGC
TCCTCCAGCAATCACACCCGCTCCTGGTGAAGCTGGTCTAAGCATCACCTTCGCTGCTCC
GTAGTCTCCCTCTGATCTGTGAGGGAACGTAAGGTACTTAGTCATAGGCACTTGAACAAG
GTTCCTCCTAGCATCAATCGCACTCTTCTGAACAGCAGCAACAACCTCCTTAGCCTTAGC
GCACCCAACTCCGACATTCCCCTGCTTATCACCGACAACAACA

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4B577JQ 691 0 0
GACTTTTAACGAAGAAATGATTGATATTTCAAAATAAACAGATTATCTCAGGAATTACAG
CACGCCTCTTGATTTTACAAGAATCTCATTTCAACATTGGAAAAACAAAGAGGGTGAAAT
GTCACAAAAGGGAAGATGAGTGAGTTTCATTCACTTCCAGAGCTCTTCCATGGGGATTCC
ACGCTCGAGAGCAACATCCTTAAACTGTCTCATCTGTTGAACTGCTGCAAGTGTGGCTCT
CGCGTTGTTTAGAGCATTGTTGCTTCCCAGCTGTTTCCCCAAAGCGTTCTCAACTCCCGC
CATCTCTAGCACGATCCTAACCGCTCCTCCAGCAATCACACCCGTTCCTGGCGAAGCTGG
TCTAAGCATCACCTTCGCTGCTCCGTAGTCTCCCTCTGATCTGTGAGGGAACGTAAGGTA
CTTAGTCATAGGCACTTGAACAAGGTTCCTCCTAGCATCAATCGCACTCTTCTGAACAGC
AGCAACAACCTCCTTAGCCTTAGCGCACCCAACTCCGACATTCCCCTGCTTATCACCAAC
AACAACAATCGCCCTAAACTTCAACTGCTTCCCACCTTTCACAACCTTAGTCACCCTTCT
CACCTGCACAACCCTCTCCTCGAACCCATCCCTAATCTTCTCCTTCTTCGGCTTCTGCCC
ACCGATCCCTCCTCCCCCGCCTTTCTTCAG
A

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4D519TF 753 0 0
AGCTGGTCTAAGCATCAC*TTCGCTGCTCCGTAGTCTCCCTCTGATCTGTGAGGGAACGT
AAGGTACTTAGTCATAGGCACTTGAACAAGGTTCCTCCTAGCATCAATCGCACTCTTCTG
AACAGCAGCAACAACCTCCTTAGCCTTAGCGCACCCAACTCCGACATTCCCCTGCTTATC
ACCGACAACAACAATCGCCCTAAACTTCAACTGCTTCCCACCTTTCACAACCTTAGTCAC
CCTTCTCACCTGCACAACCCTCTCCTCGAACCCATCCCTAATCTTCTCCTTATTCGGCTT
CTGCCCACCGATCCCACCTCCCCCGCCTTTCTTCAGCTTCGAGTCCATCACGTTCACGTC
CTTCCCCAGCATGCTCTCCCCGCTGTACGCTGGCCCGTAAGCTCCTCGTAAGCCGTGGCG
ATCTCGGCTTCTGCTTCATCGGCGCCTTCGTCGAAATACGGCGCGGGAACGAAACCTTCG
GGAGGGGAAGGTGGGTCGAAGACGGCGTTGGCGGTTATCTCCGGGTTCTGGTCTTCGAAG
AAGATGGTCTCGGATTGGTCAGAGGAGGAGGCTTTGAGTGGGGTGAGGGACGAGGGTCGT
TTGAGGAAGGAGAAGGAGATGATAGGTCTCGAGGAGGTGGTGATGCGAGAGGTTGTGTTG
TGGAGGGAGAGAGAAGAGAGAGAGGAGAGAGCTGAGGTTGTCGCCATTGAAATGAGGATG
AGGGGAAGCAGAGAGGCTTATCCTTAGCAGTCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4D213TF 720 0 0
GTCTCCCTCTGATCTGTGAGGGAACGTAAGGTACTTAGTCATAGGCACTTGAACAAGGTT
CCTCCTAGCATCAATCGCACTCTTCTGAACAGCAGCAACAACCTCCTTAGCCTTAGCGCA
CCCAACTCCGACATTCCCCTGCTTATCACCGACAACAACAATCGCCCTAAACTTCAACTG
CTTCCCACCTTTCACAACCTTAGTCACCCTTCTCACCTGCACAACCCTCTCCTCGAACCC
ATCCCTAATCTTCTCCTTATTCGGCTTCTGCCCACCGATCCCACCTCCCCCGCCTTTCTT
CAGCTTCGAGTCCATCACGTTCACGTCCTTCCCCAGCATGCTCTCCCCGCTGTACGCTGG
CCCGTAAGCTCCTCGTAAGCCGTGGCGATCTCGGCTTCTGCTTCATCGGCGCCTTCGTCG
AAATACGGCGCGGGAACGAAACCTTCGGGAGGGGAAGGTGGGTCGAAGACGGCGTTGGCG
GTTATCTCCGGGTTCTGGTCTTCGAAGAAGATGGTCTCGGATTGGTCAGAGGAGGAGGCT
TTGAGTGGGGTGAGGGACGAGGGTCGTTTGAGGAAGGAGAAGGAGATGATAGGTCTCGAG
GAGGTGGTGATGCGAGAGGTTGTGTTGTGGAGGGAGAGAGAAGAGAGAGAGGAGAGAGCT
GAGGTTGTCGCCATTGAAATGAGGATGAGGGGAAGCAGAGAGGCTTATCCTTAGCAGTCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 5

CO CL1469Contig1 948 5 18 U
GGGAAACACTCTGATCCACAGATCACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGATGAA
GCTGAAAGTGTATGCGGATCGTATGTCACAGCCATCTCGTGCTGTAATCATATTCTGCAA
GGTTAACGGAATCCAATTCGATGAGGTTTTGATTAACTTGGCGAAGCGTCAGCAATTATC
CCCTGAATTCAAAGAGATTAACCCATTGGGGAAGGTTCCAGCTATTGTTGACGGCAGATT
TAAGCTCTTCGAGAGTCACGCCATCTTGATTTATCTTGCCTCAGCATTCCCAAGTGCAGC
TGATCATTGGTACCCAAATGATCTTTCCAAGAGAGCCAAGATTCACTCTGTCTTGGATTG
GCATCACACCAACTTACGCCCTGGTGCAGCTGGATATGTAATGAATAGTGTTCTAGCTCC
ATTTCTTGGCCGGTCTCTGGATTCGAAAGCAGCTGCTGAAGCTGAGAAGCTACTAACCAA
GTCTCTGTCCACTCTGGAGACTTTTTGGCTTAAGGGCAATGCTAAATTCTTGCTGGGAAG
CAACCAACCATCCATAGCTGATCTCAACCTTGTATGCGAGCTTATGCAGCTCCAGGTTTT
GGATGAGAAAGATCGTCTCAGGTTGTTTAGTCCTTACAAGAAAGTTGAAGAATGGATTGA
GAATACGAGGAAGGGGACACAGCCTCACTTTGATGTGGTTCACAAAATCCTTTACGGAGC
CAAAGACAAATTTGACAAGCAGCTGAAGATGTTTAAACCGGGTTTTCAATTTAAGATGTA
AGAAGAAGAAGAAAAAAACTTGAATTGGGGACGGTTTGTGCAAAACCGGTTTAAGGGATA
ACTGTAATAACTCGGTTCAACATTCACATTGTTGTAACCGAAACCAAAGTATGTAATCAT
ACTCCCTTTATCAGGGCTTTTAATAAATGAGACATCAATCAATACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD63TF U 1
AF RR4FJ42TF U 16
AF RR4DR87JQ C 502
AF RR4GN09TF U 620
AF RR4FD63JQ C 620
BS 1 296 RR4FD63TF
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BS 298 620 RR4FD63TF
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BS 666 673 RR4FJ42TF
BS 674 674 RR4GN09TF
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BS 832 940 RR4GN09TF
BS 941 948 RR4FD63JQ

RD RR4FD63TF 665 0 0
GGGAAACACTCTGATCCACAGATCACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGATGAA
GCTGAAAGTGTATGCGGATCGTATGTCACAGCCATCTCGTGCTGTAATCATATTCTGCAA
GGTTAACGGAATCCAATTCGATGAGGTTTTGATTAACTTGGCGAAGCGTCAGCAATTATC
CCCTGAATTCAAAGAGATTAACCCATTGGGGAAGGTTCCAGCTATTGTTGACGGCAGATT
TAAGCTCTTCGAGAGTCACGCCATCTTGATTTATCTTGCCTCAGCATTCCCAAGTGTAGC
TGATCATTGGTACCCAAATGATCTTTCCAAGAGAGCCAAGATTCACTCTGTCTTGGATTG
GCATCACACCAACTTACGCCCTGGTGCAGCTGGATATGTAATGAATAGTGTTCTAGCTCC
ATTTCTTGGCCGGTCTCTGGATTCGAAAGCAGCTGCTGAAGCTGAGAAGCTACTAACCAA
GTCTCTGTCCACTCTGGAGACTTTTTGGCTTAAGGGCAATGCTAAATTCTTGCTGGGAAG
CAACCAACCATCCATAGCTGATCTCAACCTTGTATGCGAGCTTATGCAGCTCCAGGTTTT
GGATGAGAAAGATCGTCTCACGTTGTTTAGTCCTTACAAGAAAGTTGAAGAATGGATTGA
GAATA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4FJ42TF 698 0 0
GG
ACAGATCACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGATGAAGCTGAAAGTGTATGCGG
ATCGTATGTCACAGCCATCTCGTGCTGTAATCATATTCTGCAAGGTTAACGGAATCCAAT
TCGATGAGGTTTTGATTAACTTGGCGAAGCGTCAGCAATTATCCCCTGAATTCAAAGAGA
TTAACCCATTGGGGAAGGTTCCAGCTATTGTTGACGGCAGATTTAAGCTCT*CGAGAGTC
ACGCCATCTTGATTTATCTTGCCTCAGCATTCCCAAGTGCAGCTGATCATTGGTACCCAA
ATGATCTTTCCAAGAGAGCCAAGATTCACTCTGTCTTGGGTTGGCATCACACCAACTTAC
GCCCTGGTGCAGCTGGATATGTAATGAATAGTTTTCTAGCTCCATTTCTTGGCCGGTCTC
TGGATTCGAAAGCAGCTGCTGAAGCTGAGAAGCTACTAACCAAGTCTCT*TCCACTCTGG
AGACTTTTTGGCTTAAGGGCAATGCTAAATTCTTGCTGGGAAGTAACCAACCATCCATAG
CTGATCTCAACCTTGTATGCGAGCTTATGCAGCTCCAGGTTTTGGATGAGAAAGATCGTC
TCAGGTTGTTTAGTCCTTACAAGAAAGTTGAAGAATGGATTGAGAATACGAGGAAGCG*A
CACAGCCTCACTTTGATGTGGTTCACAAAATCCTTT

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR4DR87JQ 439 0 0
TTTTTGGCTTAAGGGCAATGCTAAATTCTTGCTGGGAAGCAACCAACCATCCATAGCTGA
TTTCAACCTTGTATGTGAGCTTATGCAGCTCCAGGTTTTGGATGAGAAAGATCGTTTCAG
GTTGTTTAGTCCTTACAAGAAAGTTGAAGAATGGATTGAGAATACGAGGAAGGGGACACA
GCCTCACTTTGATGTGGTTCACAAAATCCTTTACGGAGCCAAAGACAAATTTGACAAGCA
GCTGAAGATGTTTAAACCGGGTTTTCAATTTAAGATGTAAGAAGAAGAAGAAAAAAACTT
GAATTGGGGACGGTTTGTGCAAAACCGGTTTAAGGGATAACTGTAATAACTCGGTTCAAC
ATTCACATTGTTGTAACCGAAACCAAAGTATGTAATCATACTCCCTTTATCAGGGCTTTT
AATAAATGAGACATCAATC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4GN09TF 321 0 0
G
GGTTGTTTAGTCCTTACAAGAAAGTTGAAGAATGGATTGAGAATACGAGGAAGGCGACAC
AGCCTCACTTTGATGTGGTTCACAAAATCCTTTACGGAGCCAAAGACAAATTTGACAAGC
AGCTGAAGATGTCTAAACCGGGTTTTCAATCTAAGATGTAAGAAGAAGAAGAAAAAAACT
TGAATTGGGGACGGTTTGTGCAAAACCGGTCTAAGGGATAACTGTAATAACTCGGTTCAA
CATTCACATTGTTGTAACCGAAACCAAAGTATGTAATCATACTCCCTTTATCAGGGCTTT
TAATAAATGAGACATCAATC

QA 2 321 2 321
DS 

RD RR4FD63JQ 329 0 0
AGGTTGTTTAGTCCTTACAAGAAAGTTGAAGAATGGATTGAGAATACGAGGAAGGGGACA
CAGCCTCACTTTGATGTGGTTCACAAAATCCTTTACGGAGCCAAAGACAAATTTGACAAG
CAGCTGAAGATGTTTAAACCGGGTTTTCAATTTAAGATGTAAGAAGAAGAAGAAAAAAAC
TTGAATTGGGGACGGTTTGTGCAAAACCGGTTTAAGGGATAACTGTAATAACTCGGTTCA
ACATTCACATTGTTGTAACCGAAACCAAAGTATGTAATCATACTCCCTTTATCAGGGCTT
TTAATAAATGAGACATCAATCAATACCCC

QA 1 329 1 329
DS 



AS 1 6

CO CL1470Contig1 715 6 5 U
GGAATCACACAACAGTCTAAGAGAGAGAAAAATAATCTCCTACTTCTCTCTTTTCTCTTA
CTAAAAACATTTGTTTGCTTATCATTAAAAAA*TCTTTCATAAAAAAGAAAACGATAGCC
ATGATGAGTAAAAGTTGCCGTCGCCTCTTAAGTCTAGTGTTCGTCTCCACTCTTCTGAGC
TTCCCGTTCATAACCATATCGGAGACGCCGTGTCCTTACCCTTGTTACCCACCTCCAACT
GGCGGGGGCTCAACTCAACCGGCGGGTTATTACCCTCCTCCAACCGGTTTTTATCCTCCT
CCAACCGGTTATTACCCTCCTCCAACTGGAAATGTACCGAATTACCCTTCTCCACCGTAC
GTCGGAGGTGATTCCGGCGGAGGATATTACGGTCCTCCACCGCCTGACCCTATAATGCCT
TACTTCCCGTACTACTACAGAAAGCCTCCTCATCAGACGGATCAGTCATCATCTTCATCT
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BQ
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40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 15 15 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G

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G

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T

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DS 

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AGTCATCATCTTCATCTGTTTCACTGGGATCAGTGGTCAAGATTGTAACGGTGGCAAGTG
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QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 6

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CCTTGAAGCATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTCGGGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H371JQ U 1
AF RR4GB24JQ U 5
AF RR4EM06JQ U 2
AF RR4GB24TF C 580
AF RR4EM06TF C 612
AF RR4H371TF C 612
BS 1 99 RR4H371JQ
BS 100 100 RR4EM06JQ
BS 101 101 RR4H371JQ
BS 102 103 RR4EM06JQ
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BS 154 154 RR4EM06JQ
BS 155 459 RR4H371JQ
BS 460 460 RR4EM06JQ
BS 461 766 RR4H371JQ
BS 767 784 RR4EM06JQ
BS 785 785 RR4GB24TF
BS 786 812 RR4EM06JQ
BS 813 813 RR4GB24TF
BS 814 819 RR4EM06JQ
BS 820 820 RR4GB24TF
BS 821 837 RR4EM06JQ
BS 838 838 RR4GB24TF
BS 839 850 RR4EM06JQ
BS 851 979 RR4GB24TF
BS 980 980 RR4EM06TF
BS 981 1104 RR4GB24TF
BS 1105 1105 RR4EM06TF
BS 1106 1283 RR4GB24TF
BS 1284 1296 RR4EM06TF

RD RR4H371JQ 766 0 0
CCACAGACTCAGAATCTTTTATTATATATGAAAAGTTGGAAATTAATAAACAACATAATG
ATAATTTGAGTAGTAATCAAATAGATATGTTTAAATTACTC**GCACATTGGACATCGTG
TGTCAAGTATATATACTGAAAAATATTACTTCCTTTGATTATATTCTGGAATCTAACGCC
ATGATCGTGCTAAGGTTCATGGGGTTCATGTACTCAACCGAACCAGTCATGATCTGTTGG
ACGATGAGTCGGGTAGCTTTCTCAGTCGGGTGGAAAGGGTCCCAAAATGCATAGGCGTTA
CGGTCTGGACATAAGCTTGACAACGGGGTGCAAACACCTTGCCCGTTGTATGCCCCTTGT
CCGCAGCACGCTACCTTGGATGTCACGAAACCAAATCTCTGGGGGTTGTTTATGAAATCT
GCATTCATATTGAACGCATTAGCCCCAATGAAAACATCAAAACCGATTTCGCGGTTAAGT
CCTTGAAGCATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTCGGGA
GCACATTCTCCGTTTGCGCTTCTAGATGAAGCAAGCTCTGCCGGTACGCAACCCAACGGT
CCTGTTCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTC
CTGTATTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCA
GAGAATGGCAAGAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4GB24JQ 755 0 0
C
GACTCAGAATCTTTTATTATATATGAAAAGTTGGAAATTAATAAACAACATAATGATAAT
TTGAGTAGTAATCAAATAGATATGTTTAAATTACACTTGCACATTGGACATCGTGTGTCA
AGTATATATACTGAAAAATATTACTTCCCTTGATTATATTCTGGAATCTAACGCCATGAT
CGTGCTAAGGTTCATGGGGTTCATGTACTCAACCGAACCAGTCATGATCTGTTGGACGAT
GAGTCGGGTAGCTTTCTCAGTCGGGTGGAAAGGGTCCCAAAATGCATAGGCGTTACGGTC
TGGACATAAGCTTGACAACGGGGTGCAAACACCTTGCCCGTTGTATGCCCCTTGTCCGCA
GCACGCTACCTTGGATGTCACGAAACCAAATCTCTGGGGGTTGTTTATGAAATCTGCATT
CATATTGAACGCATTAGCCCCAATGAAAACATCAGAACCGATTTCGCGGTTAAGTCCTTG
AAGCATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTCGGGAGCACA
TTCTCCGTTTGCGCTTCTAGATGAAGCAAGCTCTGCCGGTACGCAACCCAACGGTCCTGT
TCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTA
TTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAA
TGGCAAGAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCA

QA 2 755 2 755
DS 

RD RR4EM06JQ 857 0 0
CACA
GACTCAGAATCTTTTATTATATATGAAAAGTTGGAAATTAATAAACAACATAATGATAAT
TTGAGTAGTAATCAAATAGATATGTTTAAATTACACTTGCACATTGGACATCGTGTGTCA
AGTATATATACTGAAAAATATTACTTCCCTTGATTATATTCTGGAATCTAACGCCATGAT
CGTGCTAAGGTTCATGGGGTTCATGTACTCAACCGAACCAGTCATGATCTGTTGGACGAT
GAGTCGGGTAGCTTTCTCAGTCGGGTGGAAAGGGTCCCAAAATGCATAGGCGTTACGGTC
TGGACATAAGCTTGACAACGGGGTGCAAACACCTTGCCCGTTGTATGCCCCTTGTCCGCA
GCACGCTACCTTGGATGTCACGAAACCAAATCTCTGGGGGTCGTTTATGAAATCTGCATT
CATATTGAACGCATTAGCCCCAATGAAAACATCAGAACCGATTTCGCGGTTAAGTCCTTG
AAGCATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTCGGGAGCACA
TTCTCCGTTTGCGCTTCTAGATGAAGCAAGCTCTGCCGGTACGCAACCCAACGGTCCTGT
TCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTA
TTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAA
TGGCAAGAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAGTCATGAGGACTAAAGCTC*
ATTTACAAGCTGTTGTGTTTTGTCTGA*CCTATA*TCTCACTCACTCTCTCT*GATACTC
TTGGA
CAGCTCGA

QA 5 849 5 849
DS 

RD RR4GB24TF 706 0 0
GCCGGTACGCAACCCAACGGTCCTGTTCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCA
TACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTATTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGA
GATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAATGGCAAGAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCA
CCAAGAGTCATGAGGACTAAAGCTCCATTTACAAGCTGTTGTGTTTTGTCTGAACCTATA
ATCTCACTCACTCTCTCTTGATACTCTTGGAACAGCTCGAATTGCCTACCGATCCTTAGT
ATGTTCAAAAACTGAACACCGGTGTCGTTGAGAATTCCGATGCCGGCAGAGGCAAAATTA
GCTCCGATCAATAACTTCTCTCCAGTGAGCTCAGGGCTAAAGATTGGTAGCGTTGGCTCG
GATCCAATTTGCTCACTGATGATGTCAGGGAGGTTCAAGCCGTTGGAGAAACGCCCCGTT
GGACGACCAGTCGGATAATCGATTCCGTACGGCGGAGAGTCGGCAAGAGCGGTGGTGACT
AAGTAATTGTTATTACCACTGTCCACGAGTGAGTCGCCAAAGACGTAGAACGCTCGAGCC
GCGTTTGTTTTTT*GCGGCATAAGAAATAGCATTCCCCATAACGCGGTGGACAGAAATAT
GGATGTTAGAAGAGTGGACATTATGTGAAGTGATACTTCGTAAT
CC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4EM06TF 685 0 0
AACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTATTCGGA
GATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAATGGCAA
GAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAGTCATGAGGACTAAAGCTCCATTTAC
AAGCTGTTGTGTTTTGTCTGAACCTATAATCTCACTCACTCTCTCTTGATACTCTTGGAA
CAGCTCGAATTGCCTACCGATCCTTAGTATGTTCAAAAACTGAACACCGGTGTCGTTGAG
AATTCCGATGCCGGCAGAGGCAAAATTAGCTCCGATCAATAACTTCTCTCCAGTGAGCTC
AGGGCTAAGGATTGGTAGCGTTGGCTCGGATCCAATTTGCTCACTGATGATGTCAGGGAG
GTTCAAGCCGTTGGAGAAACGCCCCGTTGGACGACCAGTCGGATAATCGATTCCGTACGG
CGGAGAGTCGGCACGAGCGGTGGTGACTAAGTAATTGTTATTACCACTGTCCACGAGTGA
GTCGCCAAAGACGTAGAACGCTCGAGCCGCGTTTGTTTTTT*GCGGCATAAGAAATAGCA
TTCCCCATAACGCGGTGGACAGAAATATGGATGTTAGAAGAGTGGACATTATGTGAAGTG
ATACTTCGTAATATATGAAAAGTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4H371TF 685 0 0
AACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTATTCGGA
GATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAATGGCAA
GAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAGTCATGAGGACTAAAGCTCCATTTAC
AAGCTGTTGTGTTTTGTCTGAACCTATAATCTCACCCACTCTCTCTTGATACTCTTGGAA
CAGCTCGAATTGCCTACCGATCCTTAGTATGTTCAAAAACTGAACACCGGTGTCGTTGAG
AATTCCGATGCCGGCAGAGGCAAAATTAGCTCCGATCAATAACTTCTCTCCAGTGAGCTC
AGGGCTAAGGATTGGTAGCGTTGGCTCGGATCCAATTTGCTCACTGATGATGTCAGGGAG
GTTCAAGTCGTTGGAGAAACGCCCCGTTGGACGACCAGTCGGATAATCGATTCCGTACGG
CGGAGAGTCGGCACGAGCGGTGGTGACTAAGTAATTGTTATTACCACTGTCCACGAGTGA
GTCGCCAAAGACGTAGAACGCTCGAGCCGCGTTTGTTTTTTTGCGGCATGAGAAATAGCA
TTCCCCATAACGCGGTGGACAGAAATATGGATGTTAGAAGAGTGGACATTATGTGAAGTG
ATACTTCGTAATATATGAAAAGTCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 4

CO CL1472Contig1 938 4 8 U
GGAGGAAGTTGTCCTCGTGTCAACGAACGAACGAACGAACGAACCCTAAATCATCTACTT
AGCCCTTGCCTCCATCGTCGAATCTGATTAAAAAGTAGAGAAACATTTGGTGGCGCCAAG
ATCATCATCATCATCATCATGCTCTTCCATAGGCTCTCAAGATTAGGTTTTCGCATTGCC
AAAGAGCTTCCAAAAGAGAGGCATTTCTCAGTATGTGGGAGGAGGATTCTACAGAGGTCT
TATGGCCAATATCTGCAATCTCCGGCTGTAACACAGAGGCAATCTAGGACTTTCCATCAA
GCGTTTTTCTCAAATAACCTTAATCCGTACACCTCCTTCAGCACTTCATCTGAAAAAGGC
GGCGAAGAAACTGAAAAGATAAACGTCATCTTTGTTGATAAAGATGGAGAAGAGATTCAT
ATTAAGGTCCCAGTCGGAATGAACATCCTTGAAGCTGCCCATGAAAACGATATTGAACTC
GAAGGGGCGTGTGAATGTTCTCTAGCGTGTTCGACTTGCCATGTGATTGTTATGGACACG
GAATACTACAACAAACTCGAAGAACCAACAGATGAAGAGAACGATATGCTTGATCTTGCC
TTCGCGTTAACAGAAACGTCGAGGTTGGGATGTCAAGTGATAGCAAAGCCAGAGATAGAT
GGAATACGCTTAGCCATTCCTTCAGCCACCAGGAACTTCGCAGTTGATGGGTTCGTTCCA
AAACCTCACTAAGTCATTTCAAAATCTCTCACAGCAGACGATATTCTCAGTTTGAGTTGA
TAGCGTTTCTTCGAGTTTACACTCTGTTTATTATCTGAAATTACCATTTTACATAAAACC
CTGAGGGAGTTTATTGATTTTGTAATCAGAAGGTGAGAGATGTCACAGTTTTCAAGCATT
ATAACTACAATAAGCTTCATAAACTTAGTTTTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4A157TF U 70
AF RR4FQ35TF U 1
AF RR4FQ35JQ C 128
AF RR4FJ67JQ C 329
BS 1 131 RR4FQ35TF
BS 132 140 RR4A157TF
BS 141 397 RR4FQ35TF
BS 398 398 RR4A157TF
BS 399 717 RR4FQ35TF
BS 718 758 RR4FQ35JQ
BS 759 759 RR4FJ67JQ
BS 760 938 RR4FQ35JQ

RD RR4A157TF 384 0 0
CTCCATCGTCGAATCTGATTAAAAAGTAGAGAAACATTTGGTGGCGCCAAGATCATCATC
ATCATCATCATGCTCTTCCATAGGCTCTCAAGATTAGGTTTTCGCATTGCCAAAGAGCTT
CCAAAAGAGAGGCATTTCTCAGTATGTGGGAGGAGGATTCTACAGAGGTCTTATGGCCAA
TATCTGCAATCTCCGGCTGTAACACAGAGGCAATCTAGGACTTTCCATCAAGCGTTTTTC
TCAAATAACCTTAATCCGTACACCTCCTTCAGCACTTCATCTGAAAAAGGCGGCGAAGAA
ACTGAAAAGATAAACGTCATCTTTGTTGATAAAGATGGAGAAGAGATTCATATTAAGGTC
CCAGTCGGAATGAACATCCTTGAA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4FQ35TF 717 0 0
GGAGGAAGTTGTCCTCGTGTCAACGAACGAACGAACGAACGAACCCTAAATCATCTACTT
AGCCCTTGCCTCCATCGTCGAATCTGATTAAAAAGTAGAGAAACATTTGGTGGCGCCAAG
ATCATCATCAT*********GCTCTTCCATAGGCTCTCAAGATTAGGTTTTCGCATTGCC
AAAGAGCTTCCAAAAGAGAGGCATTTCTCAGTATGTGGGAGGAGGATTCTACAGAGGTCT
TATGGCCAATATCTGCAATCTCCGGCTGTAACACAGAGGCAATCTAGGACTTTCCATCAA
GCGTTTTTCTCAAATAACCTTAATCCGTACACCTCCTTCAGCACTTCATCTGAAAAAGGC
GGCGAAGAAACTGAAAAGATAAACGTCATCTTTGTTGGTAAAGATGGAGAAGAGATTCAT
ATTAAGGTCCCAGTCGGAATGAACATCCTTGAAGCTGCCCATGAAAACGATATTGAACTC
GAAGGGGCGTGTGAATGTTCTCTAGCGTGTTCGACTTGCCATGTGATTGTTATGGACACG
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TTCGCGTTAACAGAAACGTCGAGGTTGGGATGTCAAGTGATAGCAAAGCCAGAGATAGAT
GGAATACGCTTAGCCATTCCTTCAGCCACCAGGAACTTCGCAGTTGATGGGTTCGTT

QA 1 717 1 717
DS 

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AG
ATCATCATCATGCTCT*CCATAGGCTCTCAAGATTAGGTTT*CGCATTGCCAAAGAGCTT
CCAAAAGAGAGGCATTTCTCAGTATGTGGGAGGAGGATTCTACAGAGGTCTTATGGCCAA
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TCAAATAACCTTAATCCGTACACCTCCTTCAGCACTTCATCTGAAAAAGGCGGCGAAGAA
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TTCGAGTTTACACTCTGTTTATTATCTGAAATTACCATTTTACATAAAACCCTGAGGGAG
TTTATTGATTTTGTAATCAGAAGGTGAGAGATGTCACAGTTTTCAAGCATTATAACTACA
ATAAGCTTCATAAACTTAGTTTTTTCTTC

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DS 

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TTGAAGCTGCCCATGAAAACGATATTGAACTCGAAGGGGCGTGTGAATGTTCTCTAGCGT
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TCACAGCAGACGATATTCTCAGTTTGAGTTGATAGCGTTTCTTCGAGTTTACACTCTGTT
TATTATCTGAAATTACCATTTTACATAAAACCCTGAGGGAGTTTATTGATTTTGTAATCA
GAAGGTGAGAGATGTCACAGTTTTCAAGCATTATAACTACAATAAGCTTCATAAACTTAG
TTTTTTCT
G

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 6

CO CL1473Contig1 1290 6 15 U
GGAGGAAAATGTTGAACAGAGACGAATGAGAAGCTAAAAACAGAGAGGCCCATCTTCGTT
GCATAGTTGATCAAACATGGCTGCTGCAATAGGTGCTGCAGTCTCTTATCCTTCATCCAA
GTCCTCTTCTCTTCCCTCCAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAA
CAAGAGCAGAGTGTGCTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGT
GTCAACAGAGACGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAGGAAGAAGGGATTGT
TGTGAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACCGGTCGATGCCTCCTGAACACCAGGAT
CACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGTGAGGT
TCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAA
GCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTC
CAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGT
TAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCAC
TGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGCT
TGGAACAGGAACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGA
GCATGAGGACTACAAGTTCAACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACAAGCAG
CTCATTGCTCTACAAGGAGGAGTTTGAGAAGATGAAGGAGAAGAACCCGGAAAATTTCAG
GTTGGACTTTGCGGTGAGCAGAGAGCAGACAAACGAGAAGGGAGAGAAAATGTACATACA
GACAAGAATGGCAGAGTATGCAGAAGAGCTGTGGGAGTTGCTGAAGAAAGACAACACCTT
TGTTTACATGTGTGGTCTCAAGGGTATGGAGAAGGGTATCGATGAGATCATGGTCTCACT
TGCTGCTAAAGATGGGATTGATTGGTTGGAGTACAAGAAGCAATTGAAGAAGAGTGAGCA
GTGGAATGTGGAAGTCTACTAAGCAAGATTGTGAGAGGGTTTATTAATATTATTATGTAG
ATAAAGGAGCTGATGCCATTGTCAATTCTTCATCTTTCTTCTGCATGTGATGATTTTCCA
TCAACAATCTAAAGAGACAATCATTACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CG06TF U 1
AF RR4BW90TF U 43
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AF RR4FU27TF U 427
AF RR4BB91JQ C 414
AF RR4BW90JQ C 592
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BS 1147 1290 RR4BB91JQ

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GTCCTCTTCTCTTCCCTCCAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAA
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TCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAA
GCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGTCAGCAGTACCATTGGTGACTTTGGTGATTC
CAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGT
TAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCAC
TGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAT*ATCCTAATGCCACCATCATCATGCT
TGGAACAGAA*CTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAA
TGTTCTT

QA 1 766 1 766
DS 

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AAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGACGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAA
ACAGGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACCGGTCGATG
CCTCCTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTT
CAGCACCGAAGGTGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGG
AATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCAT
TGGTGGCTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAA
CGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGG
TGATGAGGCAAAGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAA
TGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGGA*CTGGAATAGC

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DS 

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GGG
AAAACAGAGAGGCCCATCTTCGTTGCATAGTTGATCAAACATGGCTGCTGCAATAGGTGC
TGCAGTCTCTTATCCTTCATCCAAGTCCTCTTCTCTTCCCTCCAAAACTTCCTTCGTCTC
CCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTGCTACAGAGAGGCGTGTATTTA
TAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGACGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTC
AAAGAAACAGGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACCGG
TCGATGCCTCCTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACAT
CGTCTTCAGCACCGAAGGTGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCC
AGAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAG
TGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTA
CACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAA
GCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGA
TCCTAATGCCACCATCATCATGCTTGGA

QA 4 691 4 691
DS 

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G
AGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCAC
AAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACC
GTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGA
GTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGGACCA
GTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACA
GGAACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGAGCATGAG
GACTACAAGTTCAACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACAAGCAGCTCATTG
CTCTACAAGGAGGAGTTTGAGAAGATGAAGGAGAAGAACCCGGAAAATTTCAGGTTGGAC
TTTGCGGTGAGCAGAGAGCAGACAAACGAGAAGGGAGAGAAAATGTACATACAGACAAGA
ATGGCAGAGTATGCAGAAGAGCTGTGGGAGTTGCTGAAGAAAGACAACACCTTTGTTTAC
ATGTGTGGTCTCAAGG
TATGG

QA 2 617 2 617
DS 

RD RR4BB91JQ 877 0 0
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ACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTG
GTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAG
AGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAA
AGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCA
TCATGCTTGGAACAGGAACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCT
TTGAGGAGCATGAGGACTACAAGTTCAATGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCA
CAAGCAGCTCATTGCTCTACAAGTAGGAGTTTGAGAAGATGAAGGAGAAGAACCCGGAAA
ATTTCAGGTTGGACTTTGCGGTGAGCAGAGAGCAGACAAACGAGAAGGGAGAGAAAATGT
ACATACAGACAAGAATGGCAGAGTATGCAGAAGAGCTGTGGGAGTTGCTGAAGAAAGACA
ACACCTTTGTTTACATGTGTGGTCTCAAGGGTATGGAGAAGGGTATCGATGAGATCATGG
TCTCACTTGCTGCTAAAGATGGGATTGATTGGTTGGAGTACAAGAAGCAATTGAAGAAGA
GTGAGCAGTGGACTGTGGAAGTCTACTAAGCAAGATTGTGAGAGGGTTTATTAATATTAT
TATGTAGATAAAGGAGCTGATGCCATTGTCAATTCTTCATCTTTCTTCTGCATGTGATGA
TTTTCCATCAACAATCTAAAGAGACAATCATTACCCC

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR4BW90JQ 699 0 0
AGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGC
AAAGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCAT
CATCATGCTTGGAACAGGAACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTT
CTTTGAGGAGCATGAGGACTACAAGTTCAACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACC
CACAAGCAGCTCATTGCTCTACAAGGAGGAGTTTGAGAAGATGAAGGAGAAGAACCCGGA
AAATTTCAGGTTGGACTTTGCGGTGAGCAGAGAGCAGACAAACGAGAAGGGAGAGAAAAT
GTACATACAGACAAGAATGGCAGAGTATGCAGAAGAGCTGTGGGAGTTGCTGAAGAAAGA
CAACACCTTTGTTTACATGTGTGGTCTCAAGGGTATGGAGAAGGGTATCGATGAGATCAT
GGTCTCACTTGCTGCTAAAGATGGGATTGATTGGTTGGAGTACAAGAAGCAATTGAAGAA
GAGTGAGCAGTGGAATGTGGAAGTCTACTAAGCAAGATTGTGAGAGGGTTTATTAATATT
ATTATGTAGATAAAGGAGCTGATGCCATTGTCAATTCTTCATCTTTCTTCTGCATGTGAT
GATTTTCCATCAACAATCTAAAGAGACAATCATTACCCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 6

CO CL1474Contig1 891 6 27 U
GGACTATAAAGAAAAAAAGGAAGTAGAGAGAGAGCTGCGAGGATCTTATTCGTTTCTCTC
TTTCCCACGCCACTATATAAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCAGATCCACTTCTTC
TTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTTCTCATCGCTTGTTTGGGTCTTTGTGTCTGAG*ACAT
GGCTTCGAAGAGAATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCAAATTG
CAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCC
TGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACTTCCCTCCGGACTATCC
TTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAACATCAACAGCAA
CGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTTACCGTATCCAA
GGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGATCCTCTTGTGCC
AGAGATAGCCCACATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGTCAACTGCACGAAGCTG
GACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATGAAGACCCGAAAGTGGTGGTCCAAGACGGATCAA
AATCATTAAAATAAAAACTGCATTTGTTGGGGTTTATTTAGTAAAACGCTTTTGTGTGAT
CATATCATAATCGAGCAACTTATATGCTTTGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATATCA
TTATCAGCATTCACCTATTTTACGGTTTTCTCTCGATATTATTACCTCTGCTCATTTGAT
TGTTGTTTGAGACTGCAATTGCGACAACCGTGTAAATAAGCTAAAATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY67TF U 1
AF RR4CK14TF U 52
AF RR4AV91TF U 52
AF RR4AV91JQ C 176
AF RR4GY67JQ C 376
AF RR4CK14JQ C 90
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BS 371 541 RR4GY67TF
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TTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTCCTGATCGCTTGTTTGGGTTTTCGTGTCTGAGCACAT
GGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCAAACTG
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TTTCAAGCCGCCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAACATCAACAGCAA
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ACAGATAGCCCACATGTACAAGACAGATAAGACCAAGTACGAGTCAACT

QA 1 589 1 589
DS 

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QA 1 600 1 600
DS 

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CACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTTCTCATCGCTTGTTTGGGTCTTTGTGTC
TGAG*ACATGGCTTCGAAGAGAATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCC
TTCAAATTGCAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATCGGCAAGCAACTATCAT
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GGACTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAACAT
CAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTTAC
CGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGATCC
TCTTGTGCCAGAGATAGCCCACATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGTCAACTGC
ACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATGAAGACCCGAAAGTGGTGGTCCAAG
ACGGATCAAAATCATTAAAATAAAAACTGCATTTGTTGGGGTTTATTTAGTAAAACGCTT
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CTGATATCATTATCAGCATTCACC
TATTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4AV91JQ 642 0 0
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CCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACTTCCCTCCGGAC
TATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAACATCAAC
AGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTTACCGTA
TCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGATCCTCTT
GTGCCAGAGATAGCCCACATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGTCAACTGCACGA
AGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATGAAGACCCGAAAGTGGTGGTCCAAGACGG
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GTGATCATATCATAATCGAGCAACTTATATGCTTTGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGA
TATCATTATCAGCATTCACCTATTTTACGGTTTTCTCTCGA
G

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DS 

RD RR4GY67JQ 421 0 0
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TTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGATCCTCTTGTGCCAGAGATAGCCCACAT
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CATGGGGTGATGAAGACCCGAAAGTGGTGGTCCAAGACGGATCAAAATCATTAAAATAAA
AACTGCATTTGTTGGGGTTTATTTAGTAAAACGCTTTTGTGTGATCATATCATAATCGAG
CAACTTATATGCTTTGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATATCATTATCAGCATTCACC
C

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4CK14JQ 802 0 0
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AGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCAAATTGCAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGT
TCCATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTT
TGGTCTCCATTCACTTCCCTCCGGACTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAGGA
CGAGGGTGTACCATCCCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAG
AACAGTGGAGTCCTG*TCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGA
CAGACCCGAACCCAGATGATCCTCTTGTGCCAGAGATAGCCCACATGTACAAGACGGATA
AGACCAAGTACGAGTCAACTGCACGAAGCTGGACACAGAATTACGCCATGGGGAGATGAA
GACCCGAAAGTGGTGGTCCAAGACGGATCAAAATCATTAAAATAAAAACTGCATTTGTTG
GGGTTTATTTAGTAAAACGCTTTTGTGTGATCATATCATAATCGAGCAACTTATATGCTT
TGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATATCATTATCAGCATTCACCTATTTTACGGTTTT
CTCTCGATATTATTACCTCTGCTCATTTGATTGTTGTTTGAGACTGCAATTGCGACAACC
GTGTAAATAAGCTAAAATTTGG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 6

CO CL1475Contig1 1386 6 9 U
GGAAAGCCCACACTTTTGATTCTTCTGTGTCAATTTCTCCAAATCGGCACCGAATTGGTG
CATCTTCGATCCCATTCTTCAAAGATCTCAAACCCCCCAAGAATCATGCTTTCTTTATCC
TCTTCTTCTTTGCTTCGTCCAAGTTTACACTTCCATGCTTCTTCCCACCAATCCATCGCT
ATGTCCAGAAGAAGAAGTATTAGTCGGAAAGTCTTTTGCTTTTCCATCGCCACCAAATTC
AATAGTCTATCAAAGTCAGGAGGAGGTTTGCGTGAGCCTGGGGATGATTCTGATGTTCTA
ATAGAATGTCGTGATGTCTACAAATCATTTGGGGATAAACATATCTTGAAAGGTGTTTCC
TTTAAGATTAGACATGGCGAAGCTGTTGGGGTGATTGGTCCTTCTGGGACTGGAAAATCA
ACCATTTTAAAGATCATGGCTGGTCTTCTTGCTCCCGACAAGGGAGAGGTTTATATACGA
GGAAAGAAACGAGCTGGTTTGATAAGTGATGAGGAGATATCAGGGCTTCGTATTGGCCTT
GTTTTTCAGAGTGCAGCTCTCTTTGATTCTCTTACAGTTCGTGAAAATGTTGGTTTTCTA
CTCTATGAAAATTCAAAAATGTCTGAGAATCAAATATCTGAGCTTGTGACACAGACCTTG
GCAGCTGTTGGTTTGAAGGGTGTTGAGAATCGACTACCTTCTGAGCTATCTGGTGGGGTG
AAGAAAAGGGTTGCTTTAGCTCGTTCACTTGTTTTCGATACAACAAAGGAGGTCATAGAG
CCAGAGGTGCTCTTGTACGATGAGCCAACAGCTGGACTTGATCCCATTGCATCAACTGTA
GTTGAAGATCTTATACGATCTGTTCACTTGACGGGGGAGGAGGATTCACTTGGGAAACCT
GGGAAGATCGCCTCTTATTTGGTTGTTACCCATCAACATAGCACCATTCAAAGAGCTGTA
GACAGGTTATTGTTTCTGTATAAAGGAAAAATCGTCTGGCAAGGCATGACTCATGAATTT
ACAACCTCAACTAATCCAATAGTTCAACAGTTTGCTACAGGTAGCCTTGACGGACCAATT
AGATACTAAGGGACACAAACCAAGAAGTGGCGGCGGTACATTGTTTAGTTCATGGCAACA
CATATACCTTGAGTTGAGTTGTTTGAGACTCTTGCTCCTATTAAGATTCTAAAGAAACTA
GATTTGAGTTGTGTGACCTCTTGCTCCTCTAAAGATTTCATCTAGATTCTTTATTACTTC
CAAGACAAAGCTTAAGCCTACATGTAAACACTCTTTTGTCTTAGTAGCATAGATCAGGAA
AAGATTGTAAGTCGAGATTTCTTGTTTCAAGTAACAGTATAATGCGCAGATGAGAATTGG
GTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4CM55TF U 131
AF RR4CJ33TF U 1
AF RR4C595TF U 131
AF RR4CJ33JQ C 703
AF RR4CM55JQ C 538
AF RR4C595JQ C 701
BS 1 226 RR4CJ33TF
BS 227 227 RR4C595TF
BS 228 337 RR4CJ33TF
BS 338 338 RR4C595TF
BS 339 688 RR4CJ33TF
BS 689 721 RR4C595TF
BS 722 1124 RR4CM55JQ
BS 1125 1125 RR4C595JQ
BS 1126 1386 RR4CM55JQ

RD RR4CM55TF 489 0 0
TGCTTCGTCCAAGTTTACACTTCCATGCTTCTTCCCACCAATCCATCGCTATGTCCAGAA
GAAGAAGTATTAGTCGGAAAGTCTTTTGCTTTTCCATCGCCACCAAATTCAATAGTCTAT
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GTGATGTCTACAAATCATTTGGGGATAAACATATCTTGAAAGGTGTTTCCTTTAAGATTA
GACATGGCGAAGCTGTTGGGGTGATTGGTCCTTCTGGGACTGGAAAATCAACCATTTTAA
AGATCATGGCTGGTCTTCTTGCTCCCGACAAGGGAGAGGTTTATATACGAGGAAAGAAAC
GAGCTGGTTTGATAAGTGATGAGGAGATATCAGGGCTTCGTATTGGCCTTGTTTTTCAGT
GTGCAGCTCTCTTTGATTCTCTTACAGTTCGTGAAAATGTTGGTTTTCTACTCTATGAAA
AT
TCAAAAA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4CJ33TF 688 0 0
GGAAAGCCCACACTTTTGATTCTTCTGTGTCAATTTCTCCAAATCGGCACCGAATTGGTG
CATCTTCGATCCCATTCTTCAAAGATCTCAAACCCCCCAAGAATCATGCTTTCTTTATCC
TCTTCTTCTTTGCTTCGTCCAAGTTTACACTTCCATGCTTCTTCCCACCAATCCATCGCT
ATGTCCAGAAGAAGAAGTATTAGTCGGAAAGTCTTTTGCTTTTCCACCGCCACCAAATTC
AATAGTCTATCAAAGTCAGGAGGAGGTTTGCGTGAGCCTGGGGATGATTCTGATGTTCTA
ATAGAATGTCGTGATGTCTACAAATCATTTGGGGATAGACATATCTTGAAAGGTGTTTCC
TTTAAGATTAGACATGGCGAAGCTGTTGGGGTGATTGGTCCTTCTGGGACTGGAAAATCA
ACCATTTTAAAGATCATGGCTGGTCTTCTTGCTCCCGACAAGGGAGAGGTTTATATACGA
GGAAAGAAACGAGCTGGTTTGATAAGTGATGAGGAGATATCAGGGCTTCGTATTGGCCTT
GTTTTTCAGAGTGCAGCTCTCTTTGATTCTCTTACAGTTCGTGAAAATGTTGGTTTTCTA
CTCTATGAAAATTCAAAAATGTCTGAGAATCAAATATCTGAGCTTGTGACACAGACCTTG
GCAGCTGTTGGTTTGAAGGGTGTTGAGA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4C595TF 591 0 0
TGCTTCGTCCAAGTTTACACTTCCATGCTTCTTCCCACCAATCCATCGCTATGTCCAGAA
GAAGAAGTATTAGTCGGAAAGTCTTTTGCTTTTCCATCGCCACCAAATTCAATAGTCTAT
CAAAGTCAGGAGGAGGTTTGCGTGAGCCTGGGGATGATTCTGATGTTCTAATAGAATGTC
GTGATGTCTACAAATCATTTGGGGATAAACATATCTTGAAAGGTGTTTCCTTTAAGATTA
GACATGGCGAAGCTGTTGGGGTGATTGGTCCTTCTGGGACTGGAAAATCAACCATTTTAA
AGATCATGGCTGGTCTTCTTGCTCCCGACAAGGGAGAGGTTTATATACGAGGAAAGAAAC
GAGCTGGTTTGATAAGTGATGAGGAGATATCAGGGCTTCGTATTGGCCTTGTTTTTCAGA
GTGCAGCTCTCTTTGATTCTCTTACAGTTCGTGAAAATGTTGGTTTTCTACTCTATGAAA
ATTCAAAAATGTCTGAGAATCAAATATCTGAGCTTGTGACACAGACCTTGGCAGCTGTTG
GTTTGAAGGGTGTTGAGAATCGACTACCTTCTGAGCTATCTGGTGGGGTGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4CJ33JQ 667 0 0
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ACAAAGGAGGTCATAGAGCCAGAGGTGCTCTTGTACGATGAGCCAACAGCTGGACTTGAT
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GATTCACTTGGGAAACCTGGGAAGATCGCCTTTTATTTGGTTGTTACCCATCAACATAGC
ACCATTCAAAGAGCTGTAGACAGGTTATTGTTTTTGTATGAAGGAAAAATCGTTTGGCAA
GGCATGACTCATGAATTTACAACCTCAACTAATCCAATAGTTCAACAGTTTGCTACAGGT
AGCCTTGACGGACCAATTAGATACTAAGGGACACAAACCAAGAAGTGGCGGCGGTACATT
GTTTAGTTCATGGCAACACATATACCTTGAGTTGAGTTGTTTGAGACTCTTGCTCCTATT
AAGATTCTAAAGAAACTAGATTTGAGTTGTGTGACCTCTTGCTCCTCTAAAGATTTCATC
TAGATTCTTTATTACTTCCAAGACAAAGCTTAAGCCTACATGTAAACACTCTTTTGTTTT
AGTAGCATAGATCAGGAAAAGATTGTAAGTTGAGATTTCTTGTTTCAAGTAACAGTATAA
TGCGCAG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CM55JQ 849 0 0
GCGTG
TTTTCAGAGTGCAGCTCTCTTTGAT*CTCT*ACAGTTCGTGAAAATGTTGGTTTTCTACT
CTATGAAAAT*CAAAAATGTCTGAGAATCAAATATCTGAGCTTGTGACACAGACCTTGGC
AGCTGTTGGTTTGAAGGGTGTTGAGAATCGACTACCTTCTGAGCTATCTGGTGGGGTGAA
GAAAAGGGTTGCTTTAGCTCGTTCACTTGTTTTCGATACAACAAAGGAGGTCATAGAGCC
AGAGGTGCTCTTGTACGATGAGCCAACAGCTGGACTTGATCCCATTGCATCAACTGTAGT
TGAAGATCTTATACGATCTGTTCACTTGACGGGGGAGGAGGATTCACTTGGGAAACCTGG
GAAGATCGCCTCTTATTTGGTTGTTACCCATCAACATAGCACCATTCAAAGAGCTGTAGA
CAGGTTATTGTTTCTGTATAAAGGAAAAATCGTCTGGCAAGGCATGACTCATGAATTTAC
AACCTCAACTAATCCAATAGTTCAACAGTTTGCTACAGGTAGCCTTGACGGACCAATTAG
ATACTAAGGGACACAAACCAAGAAGTGGCGGCGGTACATTGTCTAGTTCATGGCAACACA
TATACCTTGAGTTGAGTTGTTTGAGACTCTTGCTCCTATTAAGATTCTAAAGAAACTAGA
TTTGAGTTGTGTGACCTCTTGCTCCTCTAAAGATTTCATCTAGATTCTTTATTACTTCCA
AGACAAAGCTTAAGCCTACATGTAAACACTCTTTTGTCTTAGTAGCATAGATCAGGAAAA
GATTGTAAGTCGAGATTTCTTGTTTCAAGTAACAGTATAATGCGCAGATGAGAATTGGGT
TTTT

QA 6 849 6 849
DS 

RD RR4C595JQ 686 0 0
CT
GAGCTATCTGGTGGGGTGAAGAAAAGGGTTGCTTTAGCTCGTTCACTTGTTTTCGATACA
ACAAAGGAGGTCATAGAGCCAGAGGTGCTCTTGTACGATGAGCCAACAGCTGGACTTGAT
CCCATTGCATCAACTGTAGTTGAAGATCTTATACGATCTGTTCACTTGACGGGGGAGGAG
GATTCACTTGGGAAACCTGGGAAGATCGCCTCTTATTTGGTTGTTACCCATCAACATAGC
ACCATTCAAAGAGCTGTAGACAGGTTATTGTTTCTGTATAAAGGAAAAATCGTCTGGCAA
GGCATGACTCATGAATTTACAACCTCAACTAATCCAATAGTTCAACAGTTTGCTACAGGT
AGCCTTGACGGACCAATTAGATACTAAGGGACACAAACCAAGAAGTGGCGGCGGTACATT
GTTTAGTTCATGGCAACACATATACCTTGAGTTGAGTTGTTTGAGACTCTTGCTCCTATT
AAGATTCTAAAGAAACTAGATTTGAGTTGTGTGACCTCTTGCTCCTCTAAAGATTTCATC
TAGATTCTTTATTACTTCCAAGACAAAGCTTAAGCCTACATGTAAACACTCTTTTGTCTT
AGTAGCATAGATCAGGAAAAGATTGTAAGTCGAGATTTCTTGTTTCAAGTAACAGTATAA
TGCGCAGATGAGAATTGGGTTTTT

QA 3 686 3 686
DS 



AS 2 6

CO CL1476Contig1 595 2 2 U
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TCAGGAACAGGACCCCCACAATGAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGG
ACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAA
AATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCA
CTTGCTCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCT
CTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTTTTTTTTTGGGTTTGGGGTATGTTTG
TTGTTGTTGTGTACAGCTGCTACTGCTTTTACTATGAAATTAGGCTGCGTCACGGTTGAT
TCTTCATCAGATTCAGACCGGAGATGGGGTATTCTGTTGTACATTTTCTGTAAGCTGTTT
TATGTATACCCATGTGTAATGGAAGCTCTTGTTTGAACTTAGTCTTGTTGAATCTACCTG
TGTGTGTGTGTGTATTAACAAGTATCAACAGCTTAGGCTTGCAAAAAGTTGTATG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AQ64JQ C 1
AF RR4AQ64TF U 1
BS 1 2 RR4AQ64JQ
BS 3 595 RR4AQ64TF

RD RR4AQ64JQ 595 0 0
GGCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAAGAAT
TCAGGAACAGGACCCCCACAATGAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGG
ACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAA
AATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCA
CTTGCTCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCT
CTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTTTTTTTTTGGGTTTGGGGTATGTTTG
TTGTTGTTGTGTACAGCTGCTACTGCTTTTACTATGAAATTAGGCTGCGTCACGGTTGAT
TCTTCATCAGATTCAGACCGGAGATGGGGTATTCTGTTGTACATTTTCTGTAAGCTGTTT
TATGTATACCCATGTGTAATGGAAGCTCTTGTTTGAACTTAGTCTTGTTGAATCTACCTG
TGTGTGTGTGTGTATTAACAAGTATCAACAGCTTAGGCTTGCAAAAAGTTGTATG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4AQ64TF 595 0 0
GG
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AGGAACAGGACCCCCACAATGAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGAC
AACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAA
TGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCACT
TGCTCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCT
AATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTTTTTTTTTGGGTTTGGGGTATGTTTGTT
GTTGTTGTGTACAGCTGCTACTGCTTTTACTATGAAATTAGGCTGCGTCACGGTTGATTC
TTCATCAGATTCAGACCGGAGATGGGGTATTCTGTTGTACATTTTCTGTAAGCTGTTTTA
TGTATACCCATGTGTAATGGAAGCTCTTGTTTGAACTTAGTCTTGTTGAATCTACCTGTG
TGTGTGTGTGTATTAACAAGTATCAACAGCTTAGGCTTGCAAAAAGTTGTATG

QA 3 595 3 595
DS 



CO CL1476Contig2 971 4 8 U
GTATTTAAAAACAACAATTGGAAGAAGCTCTCCTCTTTCATCAAGGAAAACCCATCTCTC
ACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCAGAAACACAAAACCTTATAATAAAGATTCA
ATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCATAGCCTCCCATACTTGTCACCAGATCACATCTCTCT
GAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATCCCCCTGCGGGCTTGCATATTGTTTGAAACATCC
AAAAGAGAATTGAAAGATGGGTCTATCAAGCCTTCCTGGTCCATCAGAAGGAATGCTATG
CGTGTTATTAGTCAACACAGCCTTATCAATCTCCATCTTCAAAGGCATCCTCAGATCAGT
GCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTCAGTAGCGCCAGCCGCATCTTCAGA
GAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAAGA
ATTCAGGAACAGGACCCCCACGATGAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGC
GGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCT
AAAATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACAT
CACTTGCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTC
CTCTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTTTTATTTTTGGTTTGGGTTTGGGG
TATGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTGCTACTGCTTTTACTATGAAATTAGGCTGCGTCA
CGGTTGATTCTTCATCAGATTCAGACCGGAGATGGGGTATTCTGTTGTACATATTCTACA
TATTCTGTAAGCTGTTTTATGTATACCCATGTGTAATGGAAGCTCTGTTTTAACTTAGTC
TTGTTGAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO03TF U 1
AF RR4H438TF U 38
AF RR4H438JQB C 153
AF RR4EO03JQ C 277
BS 1 151 RR4EO03TF
BS 152 152 RR4H438TF
BS 153 463 RR4EO03TF
BS 464 464 RR4H438TF
BS 465 532 RR4EO03TF
BS 533 676 RR4H438TF
BS 677 943 RR4H438JQB
BS 944 971 RR4EO03JQ

RD RR4EO03TF 532 0 0
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ACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCAGAAACACAAAACCTTATAATAAAGATTCA
ATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCATAGCCTCTCATACTTGTCACCAGATCACATCTCTCT
GAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATCCCCCTGCGGGCTTGCATATTGTTTGAAACATCC
AAAAGAGAATTGAAAGATGGGTCTATCAAGCCTTCCTGGTCCATCAGAAGGAATGCTATG
CGTGTTATTAGTCAACACAGCCTTATCAATCTCCATCTTCAAAGGCATCCTCAGATCAGT
GCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTCAGTAGCGCCAGCCGCATCTTCAGA
GAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCAGCCTTAGAGTTTCCTTGAAGA
ATTCAGGAACAGGACCCCCACGATGAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4H438TF 639 0 0
GG
ATCAAGGAAAACCCATCTCTCACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCA*AAACACA
AAACCTTATAATAAAGATTCAATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCATAGCCTCCCATACTT
GTCACCAGATCACATCTCTCTGAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATCCCCCTGCGGGCT
TGCATATTGTTTGAAACATCCAAAAGAGAATTGAAAGATGGGTCTATCAAGCCTTCCTGG
TCCATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTCAACACAGCCTTATCAATCTCCATCTT
CAAAGGCATCCTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTCAGT
AGCGCCAGCCGCATCTTCAGAGAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCA
GCCTGAGAGTTTCCTTGAAGAATTCAGGAACAGGACCCCCACGATGAAGTTTGAGAGCTT
GTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGA
GGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAA
ATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGT

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4H438JQB 791 0 0
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GCGGGCTTGCATATTGTTTGAAACATCCAAAAGAGAATTGAAAGATGGGTCTATCAAGCC
TTCCTGGTCCATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTCAACACAGCCTTATCAATCT
CCATCTTCAAAGGCATCCTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTT
CTTCAGTAGCGCCAGCCGCATCTTCAGAGAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGG
TCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAAGAATTCAGGAACAGGACCCCCACGATGAAGTTTG
AGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAAT
TCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCT
TGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTG
TTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAG
TTCTTTTATTTTTGGTTTGGGTTTGGGGTATGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTGCTACT
GCTTTTACTATGAAATTAGGCTGCGTCACGGTTGATTCTTCATCAGATTCAGACCGGAGA
TGGGGTATTCTGTTGTACATATTCTACATATTCTGTAAGCTGTTTTATGTATACCCATGT
GTAATGGAAGC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4EO03JQ 695 0 0
TGGTCCATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTCAACACAGCCTTATCAATCTCCAT
CTTCAAAGGCATCCTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTC
AGTAGCGCCAGCCGCATCTTCAGAGAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTG
CCAGCCTTAGAGTTTCCTTGAAGAATTCAGGAACAGGACCCCCACGATGAAGTTTGAGAG
CTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGA
AGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGA
GAAATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCCGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGT
CGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCT
TTTATTTTTGGTTTGGGTTTGGGGTATGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTGCTACTGCTT
TTACTATGAAATTAGGCTGCGTCACGGTTGATTCTTCATCAGATTCAGACCGGAGATGGG
GTATTCTGTTGTACATATTCTACATATTCTGTAAGCTGTTTTATGTATACCCATGTGTAA
TGGAAGCTCTGTTTTAACTTAGTCTTGTTGAATCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 6

CO CL1477Contig1 682 6 6 U
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAGGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCGGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
TGTCACCTGGAACTATTTTCTTGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGACGATCGAGGC
ACTGGACCCGAAGAAGAATCTGATAAAGTTCAAAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAGTTTCCTATTCACGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACCTGGAGGTGT
GGTGAGATGGAACATGTCATACGTGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTAT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAACGGTGAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTTGTCAATTATCTGTTTATGTATCTATATTTACGTCTTTGTGTATTTTCTATCTT
TATGTATTT*GGGTGTTTTAAATTAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGAG
TGATATAAAAGTGTGTTATCGC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 10 

AF RR4AK47TF U 1
AF RR4B504JQ C 1
AF RR4BA30TF U 1
AF RR4BA30JQ C 1
AF RR4B504TF U 1
AF RR4AK47JQ C 173
BS 1 87 RR4AK47TF
BS 88 88 RR4BA30TF
BS 89 642 RR4AK47TF
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BS 644 681 RR4AK47TF
BS 682 682 RR4AK47JQ

RD RR4AK47TF 682 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCGGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
TGTCACCTGGAACTATTTTCTTGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGACGATCGAGGC
ACTGGACCCGAAGAAGAATCTGATAAAGTTCAAAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAGTTTCCTATTCACGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACCTGGAGGTGT
GGTGAGATGGAACATGTCATACGTGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTAT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAACGGTGAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTTGTCAATTATCTGTTTATGTATCTATATTTACGTCTTTGTGTATTTTCTATCTT
TATGTATTT*GGGTGTTTTAAATTAATAATGTGCTCTCTCTAAATCTAAAGAGATGTGAG
TGATATAAAAGTGTGTTATCG
C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4B504JQ 682 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAGGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCGGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
TGTCACCTGGAACTATTTTCTTGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGACGATCGAGGC
ACTGGACCCGAAGAAGAATCTGATAAAGTTCAAAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAGTTTCCTATTCACGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACCTGGAGGTGT
GGTGAGATGGAACATGTCATACGTGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTAT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAACGGTGAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTTGTCAATTATCTGTTTATGTATCTATATTTACGTCTTTGTGTATTTTCTATCTT
TATGTATTT*GGGTGTTTTAAATTAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGAG
TGATATAAAAGTGTGTTATCG
G

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BA30TF 682 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAGGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
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TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
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GCTCAAACTGTGTGTCAAAACGGTGAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
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G

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TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
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TATGTATTT*GGGTGTTTTAAATTAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGAG
TGATATAAAAGTGTGTTAT

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ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAGGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCGGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
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ACTGGACCCGAAGAAGAATCTGATAAAGTTCAAAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAGTTTCCTATTCACGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACCTGGAGGTGT
GGTGAGATGGAACATGTCATACGTGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTAT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAACGGTGAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTTGTCAATTATCTGTTTATGTATCTATATTTACGTCTTTGTGTATTTTCTATCTT
TATGTATTT*GGGTGTTTTAAATTAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGAG
TGATATAAAAGTGTGTTATCG
G

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GGCACTCTTGTCACCTGGAACTATTTTCTTGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGACG
ATCGAGGCACTGGACCCGAAGAAGAATTTGATAAAGTTCAAAGTGATAGAGGGAGATTTG
ATGGAAGAGTTCAAGAGTTTCCTATTCACGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACCT
GGAGGTGTGGTGAGATGGAACATGTCATACGTGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCA
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TCTATCTTTATGTATTT*GGGTGTTTTAAATTAATAATGTGCTCTCTCTAAATCTAAAGA
GATGTGAGTGATATAAAAGTGTGTTATCGC

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DS 



AS 2 5

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GCCCTAGATCTTTAACCTCTTTTATTTTAGACATCAGAAAGAAAATCAGCGCTGTCTTGT
TGCTTCTTCCTCCTACGAGCATCATCAAGCTTACTTGAGTAGGTTCCAAGCGCTTCCGTG
ATGGCCTTTGGCAACCAGAAGCCAGGCCGCTCAAGAAACGGTGCTCTGTCGATAACCAAC
GGTTCTCTCAAGGTCACATCGATCCCCTGATAAGTCCACAGCGCTAACGTTGCTTCACCT
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CAGCTACTTCCTGTCACCTGAATCTCCTTCTCTTCCCAGTTTCCCAGCTCAAACGCTCCC
TCCTCTCCTATCGGTGGCTGCAAGCGTAAACCGGAATGGGACTTGAGTATTTCTTCTGCG
TTCTCTGTTTTTCCCAGATGCAATGAAACACTGTGTGATGCCCATACTGTTATGTATATT
GTTTCAACTGTAGCACGAACAAGGTCTAGCCTCAACAGGCCACCAATGTGAACAGACTGT
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TCCTCTGAGTTCAACCTAAGAGACATAATGTAAGGATGCAAAAGACCAGGAGTGTCATAC
ATCTTCGCCTTTGCAGACAATACTCCACGAATTCTCAATATCCCAAGAGTTGTTCCAGGA
ACCGGAGCCTCCGTGAGCCTTGTGACCTTTGCACCGTCTTTCTTCGAGAAGGCATTGATC
AAAGTAGACTTCCCTGCATTCTGAGCACCAATAACCCACACGTTTCCTCTAGGACCAGCC
AGTCCCTTGATGTAAGCTAACAGGTTCTTGATACCAAGATCTTTCCTAGCACTAACCATA
TACACACCACTCAGCTTAGGCGCTCCTCCAGCCTTGGCACGATGCCGCACCCATCTGTCC
AACCGAGCTGGTGAAATCTGTGTGGGAAGCAAGTCTACTTTCGTCGCAACGAGCACAAGT
TTGGGAAGGTTCTTGCCTACCTTAGGATCGTTCTCAGCCTTCTGAAGCGCCTTGAACAAA
GAATTAGCTGCTCGTTTGGGGAAAGAGCCATCAAAGTCCACACAATCAACAACCATGACC
CCAACCGTAGTGCTTGAGTTCCTACTCATTGGTTTTATAAGTCTAGTCGAGATCATCCTA
TCGAAATCGAAATCGGGCAAGAGATTCTCAGCGGCTTGGTTCTTCACTTGGCCGTAGTTT
CTCAGAGAATGGCAACGAGCACACACCGTCACACCATCATCAGCAGCATCCTTGTCTTTC
TTGGCCTCCTCTCTAGCTAACTTCTTCCTCTCTGATTTCGAAACTCGTTTCTTCTCCACC
GTCTCTTCTGTTACATTACCGTATCCAACACCAGCTGGAGCAAAACCATCTAGTTCAACA
TCGTTTCCTTCCTCCTTCTCTTCCCATTCATCTGACTCCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE18JQ U 1
AF RR4DL38JQ U 6
AF RR4BE73JQ U 658
BS 1 95 RR4DE18JQ
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RD RR4DE18JQ 725 0 0
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GCCCTAGATCTTTAACCTCTTTTATTTTAGACATCGGAAAGAAAATCAGCGCTGTCTTGT
TGCTTCTTCCTCCTACGAGCATCATCAAGCTTACTTGAGTAGGTTCCAAGCGCTTCCGTG
ATGGCCTTTGGCAACCAGAAGCCAGGCCGCTCAAGAAACGGTGCTCTGTCGATAACCAAC
GGTTCTCTCAAGGTCACATCGATCCCCTGATGAGTCCACAGCGCTAACGTTGCTTCACCT
TTGAGACCAAGCGAAAACCAGCCGAGACCAGCCACTGCTACGTCGATGCTTTTCACCTCC
CAGCTACTTCCTGTCACCTGAATCTCCTTCTCTTCCCAGTTTCCCAGCTCAAACGCTCCC
TCCTCTCCTATCGGTGGCTGCAAGCGTAAACCGGAATGGGACTTGAGTATTTCTTCTGCG
TTCTCTGTTTTTCCCAGATGCAATGAAACACTGTGTGATGCCCATACTGTTATGTATATT
GTTTCAACTGTAGCACGAACAAGGTCTAGCCTCACCAGGCCACCAATGTGAACAGACTGT
CCTGCCTTGACTCTGTAAGACCGAGGTTGAAGCTCCTTCCTAATCTCCACCATTTTCCGC
TCCTCTGAGTTCAACCTAAGAGACATAATGTAAGGATGCAAAAGACCAGGAGTGTCATAC
ATCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4DL38JQ 768 0 0
GCGC
TAACTTTGATTTCAAACGAACTGAAAAAAAGAAATATTTTCGTTTGTATCAGCCCTAGAT
CTTTAACCTCTTTTATTTTAGACATCAGAGAGAAAATCAGTGCTGTCTTGTTGCTTCTTC
CTCCTACGAGCATCATCAAGCTTACTTGAGTAGGTTCCAAGCGCTTCCGTGATGGCCTTT
GGCAACCAGAAGCCAGGCCGTTCAAGAAACGGTGCTCTGTCGATAACCAACGGTTCTCTC
AAGGTCACATCGATCCCCTGATAAGTCCACAGCGCTAACGTTGCTTCACCTTTGAGACCA
AGCGAAAACCAGCCGAGACCAGCCACTGCTACGTCGATGCTTTTCACCTCCCAGCTACTT
CCTGTCACCTGAATCTCCTTCTCTTCCCAGTTTCCCAGCTCAGACGCTCTCTCCTCTCCT
ATCGGTGGCTGCAAGCGTAAACCGGAATGGGACTTGAGTATTTCTTCTGCGTTCTCTGTT
TTTCCCAGATGCAATGAAACACTGTGTGATGCCCATACTGTTATGTATATTGTTTCAACT
GTAGCACGAACAAGGTCTAGCCTCAACAGGCCACCAATGTGAACAGACTGTCCTGCCTTG
ACTCTGTAAGACCGAGGTTGAAGCTCCTTCCTAATCTCCACCATTTTCCGCTCCTCTGAG
TTCAACCTAAGAGACATAATGTAAGGATGCAAAAGACCAGGAGTGTCATGCATCTTCGCC
TTTGCAGACAATACTCCACGAATTCTCA*TATCCCAAGAGTTGT

QA 5 768 5 768
DS 

RD RR4BE73JQ 885 0 0
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TACATCTTCGCCTTTGCAGACAATACTCCACGAATTCTCAATATCCCAAGAGTTGTTCCA
GGAACCGGAGCCTCCGTGAGCCTTGTGACCTTTGCACCGTCTTTCTTCGAGAAGGCATTG
ATCAAAGTAGACTTCCCTGCATTCTGAGCACCAATAACCCACACGTTTCCTCTAGGACCA
GCCAGTCCCTTGATGTAAGCTAACAGGTTCTTGATACCAAGATCTTTCCTAGCACTAACC
ATATACACACCACTCAGCTTAGGCGCTCCTCCAGCCTTGGCACGATGCCGCACCCATCTG
TCCAACCGAGCTGGTGAAATCTGTGTGGGAAGCAAGTCTACTTTCGTCGCAACGAGCACA
AGTTTGGGAAGGTTCTTGCCTACCTTAGGATCGTTCTCAGCCTTCTGAAGCGCCTTGAAC
AAAGAATTAGCTGCTCGTTTGGGGAAAGAGCCATCAAAGTCCACACAATCAACAACCATG
ACCCCAACCGTAGTGCTTGAGTTCCTACTCATTGGTTTTATAAGTCTAGTCGAGATCATC
CTATCGAAATCGAAATCGGGCAAGAGATTCTCAGCGGCTTGGTTCTTCACTTGGCCGTAG
TTTCTCAGAGAATGGCAACGAGCACACACCGTCACACCATCATCAGCAGCATCCTTGTCT
TTCTTGGCCTCCTCTCTAGCTAACTTCTTCCTCTCTGATTTCGAAACTCGTTTCTTCTCC
ACCGTCTCTTCTGTTACATTACCGTATCCAACACCAGCTGGAGCAAAACCATCTAGTTCA
ACATCGTTTCCTTCCTCCTTCTCTTCCCATTCATCTGACTCCCAG

QA 1 885 1 885
DS 



CO CL1478Contig2 1027 2 8 U
GGGATACCACTGAAACAAAAAAAATGGTGGTTTTGATTTCAAGTACAGTGAATATTTGCA
GAGTAAAGCTTAAAGTCGCAAGCTTTCGTGTCAACCGGTTAATACCCAGACCCGAAGTTC
AATTTTTCTCAGGGTTCAATGAGACGAAGAAGAAGAAGATACGTGCAGTTTCTGTTAAGT
GCTTAGCTATGAAGAAAGAACAAGTTATTGAAAGCGTGGAGAGAGTTAAAGGGACAATCT
TTCCGAAGAAAGCGATGATGAGCGAAGGTAGAGATGAAGATGAGGAGTATGGAAAGCTTG
TCTGTCCAGGTTGTGGGATTTCCATGCAGGATGATGATTCTGATTTGCCCGGGTATTATC
AGAAGAGAAAGGTCACTCCAAAGAGCTTGGAAGAGGTGACTGAAGATGAGCTTGATGGGT
TTGAAATGGTTGATGAAGATGACGTGGAGGAGGATGATGATGATAATGATGATATCACGA
ATGTATTAGAGGATAGTGACTCTGAGAGTGAGGATGAGTTTGACTGGGAGTCAGATGAAT
GGGAAGAGAAAGAGGAAGGAAACGATGTTGAACTAGATGGTTTTGCTCCAGCTGGTGTTG
GATACGGTAATGTAACAGAAGAGACGGTGGAGAAGAAACGAGTTTCGAAATCAGAGAGGA
AGAAGTTAGCTAGAGAGGAGGCCAAGAAAGACAAGGATGCTGCTGATGATGGTGTGACGG
TGTGTGCTCGTTGCCATTCTCTGAGAAACTACGGCCAAGTGAAGAACCAAGCCGCTGAGA
ATCTCTTGCCCGATTTCGATTTCGATAGGATGATCTCGACTAGACTTATAAAACCAATGA
GTAGGAACTCAAGCACTACGGTTGGGGTCATGGTTGTTGATTGTGTGGACTTTGATGGCT
CTTTCCCCAAACGAGCAGCTAATTCTTTGTTCAAGCGCTTCAGACGCTGAGACGATCCTA
AGTAGCAGACCTTCCCAACTTGTGCTCGTTGCGACGAAAGTAGACTTGCTTCCCACACAG
ATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE18TF U 1
AF RR4BE73TF U 139
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BS 608 616 RR4DE18TF
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RD RR4DE18TF 616 0 0
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GAGTAAAGCTTAAAGTCGCAAGCTTTCGTGTCAACCGGTTAATACCCAGACCCGAAGTTC
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GCTTAGCTATGAAGAAAGAACAAGTTATTGAAAGCGTGGAGAGAGTTAAAGGGACAATCT
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GATACG*TAATGTAAC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4BE73TF 889 0 0
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GAAGATACGTGCAGTTTCTGTTAAGTGCTTAGCTATGAAGAAAGAACAAGTTATTGAAAG
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TGATTCTGATTTGCCCGGGTATTATCAGAAGAGAAAGGTCACTCCAAAGAGCTTGGAAGA
GGTGACTGAAGATGAGCTTGATGGGTTTGAAATGGTTGATGAAGATGACGTGGAGGAGGA
TGATGATGATAATGATGATATCACGAATGTATTAGAGGATAGTGACTCTGAGAGTGAGGA
TGAGTTTGACTGGGAGTCAGATGAATGGGAAGAGAAGGAGGAAGGAAACGATGTTGAACT
AGATGGTTTTGCTCCAGCTGGTGTTGGATACGGTAATGTAACAGAAGAGACGGTGGAGAA
GAAACGAGTTTCGAAATCAGAGAGGAAGAAGTTAGCTAGAGAGGAGGCCAAGAAAGACAA
GGATGCTGCTGATGATGGTGTGACGGTGTGTGCTCGTTGCCATTCTCTGAGAAACTACGG
CCAAGTGAAGAACCAAGCCGCTGAGAATCTCTTGCCCGATTTCGATTTCGATAGGATGAT
CTCGACTAGACTTATAAAACCAATGAGTAGGAACTCAAGCACTACGGTTGGGGTCATGGT
TGTTGATTGTGTGGACTTTGATGGCTCTTTCCCCAAACGAGCAGCTAATTCTTTGTTCAA
GCGCTTCAGACGCTGAGACGATCCTAAGTAGCAGACCTTCCCAACTTGTGCTCGTTGCGA
CGAAAGTAGACTTGCTTCCCACACAGATTTCAC

QA 17 889 17 889
DS 



AS 1 6

CO CL1479Contig1 930 6 2 U
GGGCTGCTAAATATTGACTTCTATATATACAAACCACAGACAATATATTATTGATTCGAT
GTATCCATTCACAACCGAAAACGGAGACAATGTCTATCCATTTGAAAAAAAAAGTGATGA
CACAGTTATAATATATAGAGAAAAAACAATAGATCGATCGTCACAACAGCGAAACGCGAT
TTTGCCGTCCAAGAAACACGTCCGAAACGACTTTTCTTTTATACGACTCAGAATTCAAAC
CGTGCAGAACCGTCGCTAGCACTGCGTTTTACCAACGCGGCCACGTTTCTGAGACGAGGT
AGAGAATAACACCAAGCGGATGTACAGAGAATCGCAAAGAGTCGACCCCAAACTAACATG
ATCACCAGCGTCAATATAATGATCGAAATTCCAATAACCGGATCAAACTTTCCGACCCGT
GACCCGGTTTTCTCCTGCGACGGTTTCATGTTGGGTACACCTTCGGAACACGTGTCTTCC
CTAGAGGAAGCCAACAGTTCAATGGGATTTGATCGGTCGGTGGTTACGTCTCGTAAGTCA
TTCGGTTTTGTCTCTTTTTGGTCCTGCTTCACGGCCTTATCATCAGTGGTCATACGACTT
ATCGGCGAAACGAGTTTCTTCTTATCGGCTTCTACGCTCAGAGTTGGTTTCTCCATTTCC
TCGATGGGCGCCGGTTTGATCTCTCTGTTCTTTAAGCGAAACTTGGAGCATAAAAGCCAC
CGACTTGGCTTCTTTTTCTTCTTCACCTTCATCTCGCAACCCTCCTCCGCCGCAACCATC
GCCTTGTCCGAGTATATTTTCCGGGAGAGTCCAAAACATCCTAGAAAGTAGGAAGATGAC
ACGGTTCTCTCCCTGCATCTCTTCTCGGTTTTCGCCATTGAAGTCCTAACCGAAGGAAGG
GGTCATTGTGCATTAGTATCAAGACTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DL30JQ U 50
AF RR4E714JQ U 27
AF RR4DM01JQ U 1
AF RR4E714TF C 207
AF RR4DM01TF C 191
AF RR4DL30TF C 255
BS 1 653 RR4DM01JQ
BS 654 930 RR4DM01TF

RD RR4DL30JQ 175 0 0
ATTGATTCGATGTATCCATTCACAACCGAAAACGGAGACAATGTCTATCCATTTGAAAAA
AAAAGTGATGACACAGTTATAATATATAGAGAAAAAACAATAGATCGATCGTCACAACAG
CGAAACGCGATTTTGCCGTCCAAGAAACACGTCCGAAACGACTTTTCTTTTATAC

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR4E714JQ 487 0 0
G
TACAAACCACAGACAATATATTATTGATTCGATGTATCCATTCACAACCGAAAACGGAGA
CAATGTCTATCCATTTGAAAAAAAA*GTGATGACACAGTTATAATATATAGAGAAAAAAC
AATAGATCGATCGTCACAACAGCGAAACGCGATTTTGCCGTCCAAGAAACACGTCCGAAA
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ATGTTGGGTACACCTTCGGAACACGTGTCTTCCCTAGAGGAAGCCAACAGTTCAATGGGA
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QA 2 487 2 487
DS 

RD RR4DM01JQ 653 0 0
GGGCTGCTAAATATTGACTTCTATATATACAAACCACAGACAATATATTATTGATTCGAT
GTATCCATTCACAACCGAAAACGGAGACAATGTCTATCCATTTGAAAAAAAAAGTGATGA
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TTCGGTTTTGTCTCTTTTTGGTCCTGCTTCACGGCCTTATCATCAGTGGTCATACGACTT
ATCGGCGAAACGAGTTTCTTCTTATCGGCTTCTACGCTCAGAGTTGGTTTCTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4E714TF 697 0 0
ACGACTTTTCTTT*ATACGACTCAGAATTCAAACCGTGCAGAACCGTCGCTAGCACTGCG
TTTTACCAACGCGGCCACGTTTCTGAGACGAGGTAGAGAATAACACCAAGCGGATGTACA
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GGTTTTCGCCATTGAAGTCCTAACCGAAGGAA
AAGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4DM01TF 740 0 0
AAGAAACACGTCCGAAACGACTTTTCTTTTATACGACTCAGAATTCAAACCGTGCAGAAC
CGTCGCTAGCACTGCGTTTTACCAACGCGGCCACGTTTCTGAGACGAGGTAGAGAATAAC
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TCTCCTGCGACGGTTTCATGTTGGGTACACCTTCGGAACACGTGTCTTCCCTAGAGGAAG
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CGAGTTTCTTCTTATCGGCTTCTACGCTCAGAGTTGGTTTCTCCATTTCCTCGATGGGCG
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TCTTTTTCTTCTTCACCTTCATCTCGCAACCCTCCTCCGCCGCAACCATCGCCTTGTCCG
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CCCTGCATCTCTTCTCGGTTTTCGCCATTGAAGTCCTAACCGAAGGAAGGGGTCATTGTG
CATTAGTATCAAGACTTTCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4DL30TF 676 0 0
GCTAGCACTGCGTTTTACCAACGCGGCCACGTTTCTGAGACGAGGTAGAGAATAACACCA
AGCGGATGTACAGAGAATCGCAAAGAGTCGACCCCAAACTAACATGATCACCAGCGTCAA
TATAATGATCGAAATTCCAATAACCGGATCAAACTTTCCGACCCGTGACCCGGTTTTCTC
CTGCGACGGTTTCATGTTGGGTACACCTTCGGAACACGTGTCTTCCCTAGAGGAAGCCAA
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TTTTTGGTCCTGCTTCACGGCCTTATCATCAGTGGTCATACGACTTATCGGCGAAACGAG
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TTTGATCTCTCTGTTCTTTAAGCGAAACTTGGAGCATAAAAGCCACCGACTTGGCTTCTT
TTTCTTCTTCACCTTCATCTCGCAACCCTCCTCCGCCGCAACCATCGCCTTGTCCGAGTA
TATTTTCCGGGAGAGTCCAAAACATCCTAGAAAGTAGGAAGATGACACGGTTCTCTCCCT
GCATCTCTTCTCGGTTTTCGCCATTGAAGTCCTAACCGAAGGAAGGGGTCATTGTGCATT
AGTATCAAGACTTTCC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 5

CO CL1480Contig1 1040 5 29 U
ATGAAATTGTTCATCCAAGACATGTGACATAACGCAACAGTACATGTTCTGTTCGGCTTT
ATTGAGCAAGAATATGATAAATCCCATGTTTACTCGGGAGGAAAAAGGCAAAACCAAAAG
ATAATATCTCTCTCGACTTTCCAGAAAATCAATCTTTGTCTTAAAAACAAAGCTGAGCCG
CGTGAATCAGTAATGAGTAGTAGGAACCCTGGTGGTTGTTTTCTCCGGTAAGACATTGTC
GGGGAGAATCAACTCGGCTGGAGTTTCACGGACGATCCCAAGCATTGAATCGTAATCCTC
ATCCTTGCGTGTATACTTCTTCCTAAGGGCTCTCTCAACCTCGATCTCTTCAAATGACTT
TGAATTCTCCGCGGCGTGAATATGTGCGAGGTTGATGTAGTTCTCAGCCGACTTTGAGAT
ATATGCCATCTCCTCATCTGTTAACTTTCTCATGAACTTTGCTGGGTTTCCTCCCCATAC
CTCTCCGGAAGGGATTCGAGTGTTCTCTCTCACAAGGGAACCAGCAGCAACCATGGCATG
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GACAGTACACCCATGTATGACAGCACTATGACCTATAGTGACGTTGTCCCCAATAGTAGT
AGGTAATTCCTTGCCAGCTAGGTTGGTTTTTGCAACATGTACAAGAGAATTGTCTTGGAT
ATTCGTACCCGATCCAACACTGATGTTATTCACATCACCTCGAAGAACACAGCCATACCA
AATAGAAGAGCCTTTCCCGATCTGAACATCACCAATAACAGAGGCACTCGGAGCCACGAA
CGCATCCTTATCCACCAATGGAGATTTATCAAACACACTCATCAACGTCCGATGCCTCGA
TAGGTGTTCTTCCAAGCGGTGGCTCCCTTGGAGAAGAGAGCCGACGCGATCAAGAGCTTG
GCCAGTCCCGCGGATCCAGTTACCCACTGTGTAGATTACTCTTCCCAAGGTTCCCATTTT
TTCTCGATTTGGACGATCCT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B828JQ U 31
AF RR4BM37JQ U 1
AF RR4CO05JQ U 1
AF RR4B828TF C 161
AF RR4BM37TF C 437
BS 1 145 RR4BM37JQ
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BS 147 216 RR4BM37JQ
BS 217 217 RR4CO05JQ
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BS 221 311 RR4BM37JQ
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BS 1023 1040 RR4BM37TF

RD RR4B828JQ 686 0 0
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TACTCGGGAGGAAAAAGGCAAAACCAAAAGATAATATCTCTCTCGACTTTCCAGAAAATC
AATCTTTGTCTTAAAAACAAAGCTGAGCCGCGTGAATCAGTAATGAGTAGTAGGAACCCT
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TCTCTCAACCTCGATCTCTTCAAATGACTTTGAATTCTCCGCGGCGTGAATATGTGCGAG
GTTGATGTAGTTCTCAGCCGACTTTGAAATATATGCCATCTCCTCATCTGTTAACTTTCT
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CACAAGGGAACCAGCAGCAACCATGGCATGCTTCTCAACAAGCACACCATCGAGTAGTGT
AGCTCCCATGCCAACAAAAGCCTCATCCTCGACAGTACACCCATGTATGACAGCACTATG
ACCTATAGTGACGTTGTCCCCAATAGTAGTAGGTAATTCCTTGCCAGCTAGGTTGGTTTT
TGCAACATGTACAAGAGAATTGTCTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4BM37JQ 765 0 0
ATGAAATTGTTCATCCAAGACATGTGACATAACGCAACAGTACATGTTCTGTTCGGCTTT
ATTGAGCAAGAATATGATAAATCCCATGTTTACTCGGGAGGAAAAAGGCAAAACCAAAAG
ATAATATCTCTCTCGACTTTCCAGAGAATCAATCTTTGTCTTAAAAACAAAGCTGAGCCG
CGTGAATCAGTAATGAGTAGTAGGAACCCTGGTGGTAGTCTTCTCCGGTAAGACATTGTC
GGGGAGAATCAACTCGGCTGGAGTTTCACGGACGATCCCAAGCATTGAATCGTAATCCTC
ATCCTTGCGTGCATACTTCTTCCTAAGGGCTCTCTCAACCTCGATCTCTTCAAATGACTT
TGAATTCTCCGCGGCGTGAATACGTGCGAGGTTGATGTAGTTCTCAGCCGACTTTGAGAT
ATATGCCATCTCTTCATCTGTTAACTTCCTCATGAACTTTGCTGGGTTTCCTCCCCATAC
CTCTCCAGAAGGGATTCGAGTGTTCTCTCTCACAAGGGAACCAGCAGCAACCATGGCATG
CTTCTCAACAACCACACCATCGAGTAGTGTAGCTCCCATACCAACAAAAGCCTCATCCTC
AACAGTACACCCATGTATGACAGCACTATGACCTATAGTAACATTGTCCCCAATAGTAGT
AGGTAATTCCTTGCCAGCTAGGTTGGTTTTTGCAACATGTACAAGAGAATTGTCTTGGAT
ATTCGTACCCGATCCAACACTGATGTTATTCACATCACCTCGAAG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4CO05JQ 742 0 0
G
TGAAATTGTTCATCCAAGACATGTGACATAACGCAAAAGTACATGTTCTGTTCGGCTTTA
TTGAGCAAGAATATGATAAATCCCATGTTTACTCGGGAGGAAAAAGGCAAAACCAAAAGA
TAATATCTCTCTCGACTTTCCAGAAAATCAATCTTTGTCTTAAAAACAAAGCTGAACCGC
GTGAATCAGTAATGAGTAGTAGGAACCCTGGTGGTTGTTTTCTCCGGTAAGACATTGTCG
GGGAGAATCAACTCGGCTGGAGTTTCACGGACGATCCCAAGCATTGAATCGTAATCCTCA
TCCTTGCGTGCATACTTCTTCCTAAGGGCTCTCTCAACCTCGATCTCTTCAAATGACTTT
GAATT*TCCGCGGCGTGAATATGTGCGAGGTTGATGTAGTTCTCAGCCGACTTTGAGATA
TATGCCATCTCCTCATCTGTTAACTTTCTCATGAACTTTGCTGGGTTTCCTCCCCATAAC
TCTCCGGAAGGGATTCGAGTGTTCTCTCTCACAAGGGAACCAGCAGCAACCATGGCATGC
TTCTCAACAACCACACCATCGAGTAGTGTAGCTCCCATGCCAACAAAAGCCTCATCCTCG
ACAGTACACCCATGTATGACAGCACTATGACCTATAGTGACGTTGTCCCCAATAGTAGTA
GGTAATTCCTTGCCAGCTAGGTTGGTTTTTGCAACATGTACAAGAGAATTGTCTTGGATA
TTCGTACCCGATCCAACACTG

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR4B828TF 866 0 0
TCT
AAAACAAAGCTGAGC*GCGTGAATCAGTAATGAGTAGTAGGAACCCTGGTGGT*GT*TTC
TCCGGTAAGACATTGTCGGGGAGAATCAACTCGGCTGGAGTTTCACGGACGATCCCAAGC
AT*GAATCGTAATCCTCATCCTTGCGTGTATACTTCTTC*TAAGGGCTCTCTCAACCTCG
ATCTCTTCAAATGACTTTGAATTCTCCGCGGCGTGAATATGTGCGAGGTTGATGTAGTTC
TCAGCCGACTTTGAGATATATGCCATCTCCTCATCTGTTAACTTTCTCATGAACTTTGCT
GGGTTTCCTCCCCATACCTCTCCGGAAGGGATTCGAGTGTTCCCTCTCACAAGGGAACCA
GCAGCAACCATGGCATGCTTCTCAACAAGCACACCATCGAGTAGTGTAGCTCCCATGCCA
ACAAAAGCCTCATCCTCGACAGTACACCCATGTATGACAGCACTATGACCTATAGTGACG
TTGTCCCCAATAGTAGTAGGTAATTCCTTGCCAGCTAGGTTGGTTTTTGCAACATGTACA
AGAGAATTGTCTTGGATATTCGTACCCGATCCAACACTGATATTATTCACATCACCTCGA
AGAACAGTGCCATACCAAATAGAAGAGCCTTTCCCGATCTGAACATCACCAATAACAGAG
GCACTCGGAGCCACGAACGCATCCTTATCCACCAATGGAGATTTATCAAACACACTCATC
AACGTCCGATGCCTCGATAGGTGTTCTTCCAAGCGGTGGCTCCCTTGGAGAAGAGAGCCG
ACGCGATCAAGAGCTTGGCCAGTCCCGCGGATCCAGTTACCCACTGTGTAGATTACTCTT
CCCAAGGTTCCCATTTTTT
TTCC

QA 4 862 4 862
DS 

RD RR4BM37TF 604 0 0
TCTGTTAACTTCCTCATGAACTTTGCTGGGTTTCCTCCCCATACCTCTCCAGAAGGGATT
CGAGTGTTCTCTCTCACAAGGGAACCAGCAGCAACCATGGCATGCTTCTCAACAACCACA
CCATCGAGTAGTGTAGCTCCCATACCAACAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACACCCATGT
ATGACAGCACTATGACCTATAGTAACATTGTCCCCAATAGTAGTAGGTAATTCCTTGCCA
GCTAGGTTGGTTTTTGCAACATGTACAAGAGAATTGTCTTGGATATTCGTACCCGATCCA
ACACTGATGTTATTCACATCACCTCGAAGAACACAGCCATACCAAATAGAAGAGCCTTTC
CCGATCTGAACATCACCAATAACAGAGGCACTCGGAGCCACGAACGCATCCTTATCCACC
AATGGAGATTTATCAAACGCACTCATCAACGTCCGATGCCTCGATAGGTGTTCTTCCAAG
CGGTGGCTCCCTTGGAGAAGAGAGCCGACGCGATCAAGAGCTTGGCCAGTCCCGCGGATC
CAGTTACCCACTGTGTAGATTGCTCTTCCCAAGGTTCCCATTTTTTCTCGATTTGGACGA
TCCT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 6

CO CL1481Contig1 777 6 6 U
GGAATCCACTTATAAAAAAAAAAAAAAAACTAGGGATCTCATCATCTCATCGCTTCTCTC
AAATCTTCTCTTTGCGTTTTCCCCACACAATCATGTCGACGAAGAAGATCGTGTTGAAGA
GCTCCGATGGCGAGTCTTTCGAGGTCGACGAGGCGGTTGCCCTCGAGTCTCAGACCATAG
CCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGGGTCCCTCTTCCCAACGTCACGAGCA
AGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGA
CCGAGGCCGTCGACGGTGGCGGTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCCTGGGATGCGGAGT
TCATGAAGATCGATCAAGCCACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTAATTATTTGAACA
TCAAGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGACTGTGGCGGATATGATCAAGGGAAAGACTC
CGGAAGAGATTCGCACGACCTTCAACATCAAGAACGATTTTACACCCGAGGAAGAGGAGG
AGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTGAATGATGTGTGAGAGAGAGGTCGTTGAGGC
AAACCAACCAGTTTCTTGCTTTTTATGTTGTTGTTTTTTTTTTCTGTGGATGATCAGTGT
GGATGATGATGACTTTGCTACTTTCCTTTTGTAATTCATGACCTATGTTCGTCTTGAAGA
ACCAATGCTGGATGTTTGCTTTTAATGTCTTAAAAGAGTGATGTTGGTTTGCCTTGC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AU10TF U 1
AF RR4DG22TF U 3
AF RR4FV67TF U 142
AF RR4DG22JQ C 31
AF RR4FV67JQ C 142
AF RR4AU10JQ C 151
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CCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGGGTCCCTCTTCCCAACGTCACGAGCA
AGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGA
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AGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTGAATGATGTGTGAGAGAGAGGTCGTTGAGGC
AAACCAACCAGTTTCTTGCTTTTTATGTTGTTGTTTTTTTTTTCTGTGGATGATCAGTGT

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G
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TCTTCTCTTTGCGTTTTCCCCACACAATCATGTCGACGAAGAAGATCGTGTTGAAGAGCT
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AGGCCGTCGACGGTGGCGGTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCCTGGGATGCGGAGTTCA
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AGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGACTGTGGCGGATATGATCAAGGGAAAGACTCCGG
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G
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CGTC

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DS 

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GC

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DS 

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G
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ATGCCAGACTGTGGCGGATATGATCAAGGGAAAGACTCCGGAAGAGATTCGCACGACCTT
CAACATCAAGAACGATTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATG
GGCTTTTGAATGATGTGTGAGAGAGAGGTCGTTGAGGCAAACCAACCAGTTTCTTGCTTT
TTATGTTGTTGTTTTTTTTTTCTGTGGATGATCAGTGTGGATGATGATGACTTTGCTACT
TTCCTTTTGTAATTCATGACCTATGTTCGTCTTGAAGAACCAATGCTGGATGTTTGCTTT
TAATGTCTTAAAAGAGTGATGTTGGTTTGCCTT
AC

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DS 

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AGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGACCGAGGCCGTCGACGGTGGCGGTTCCTCCG
ACGATGACCTCAAGGCCTGGGATGCGGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCCACCCTTTTCG
AACTCATCCTGGCTGCTAATTATTTGAACATCAAGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGA
CTGTGGCGGATATGATCAAGGGAAAGACTCCGGAAGAGATTCGCACGACCTTCAACATCA
AGAACGATTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTG
AATGATGTGTGAGAGAGAGGTCGTTGAGGCAAACCAACCAGTTTCTTGCTTTTTATGTTG
TTGTTTTTTTTTTCTGTGGATGATCAGTGTGGATGATGATGACTTTGCTACTTTCCTTTT
GTAATTCATGACCTATGTTCGTCTTGAAGAACCAATGCTGGATGTTTGCTTTTAATGTCT
TAAAAGAGTGATGTTGGTTTGCCTTGC

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DS 



AS 1 6

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TCATTAAAAGATACGGACATCTTCTGAAACACATCCAAAGCTCTAATGAGAAACAGTAAA
ATAAGGTCTTTGAGATGTAGTGCAAACTCAAGGCATAGGACGATCTTCCTTAACGGTTGG
CCTTTGCAACTCTCTCAATCTCATCCTTCTTCTTGATAGCATAGCTGTTGGAAGATCCCT
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AGATATCAACAGCCTGCCTCCTAACCACACCAGCAGATCCAATCCTGGTGGCATCTTCAC
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GATGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACAGCCATCAGCTTCTTACCGTTGT
TCCTCCCGTGCATCATGAGAGAGTTTGTGAGCCTCTCGACGATTGGGCATTGAGCCTTCC
TGAACCTCTTCACAGAGTACCTTCCAGCAGTGTGGGGGACAAAGGTCGCGTGCTTAGCTG
GCTGAACACCAATGTAGTCAACAAGACTAATGTCTGTGACCGAAACGTCGTCAAAGCTCC
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CGGCGGCGGCCATGGCTCGTAGTAAGTGTCGTCGTGAGGAGAAGAGAACAATTAGGTTAA
CGCAGCTTGCTGCTTGGAGAAGGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 15 40 40 40 40 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F127JQ U 1
AF RR4EC46JQ U 15
AF RR4F127TF C 1
AF RR4CU75JQ U 16
AF RR4CU75TF C 93
AF RR4EC46TF C 49
BS 1 133 RR4F127JQ
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BS 580 773 RR4CU75JQ
BS 774 866 RR4EC46TF

RD RR4F127JQ 359 0 0
GGTGAAAATATTCTTAAACATGAAACGGTTTTGATCAAGATCCCAAAGTGTCAAAAAACT
TCATTAAAAGATACGGACATCTTCTGAAACACATCCAAAGCTCTAATGAGAAACAGTAAA
ATAAGGTCTTTGAAATGTAGTGCAAACTCAAGGCATAGGACGATCTTCCTTAACGGTTGG
CCTTTGCAACTCTCTCAATCTCATCCTTCTTCTTGATAGCATAGCTGTTGGAAGATCCCT
TGGCAGCATTGATGAGCTCATCAGCAAGGCACTCAGCGATGGTCGTGATGTTTCTAAACG
CAGCTTCACGTGCACCGGTGGTGAGCAAGAAGATGGCTTGGTTCACACGTCTTAAAGGA

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4EC46JQ 565 0 0
T
AAACATGAAACGGTTTTGATCAAGATGCCAAAGTGTCAAAAAACTTCATTAAAAGATACG
GACATCTTCTGAAACACGTCCAAAGCTCTAATGAGAAACAGTAAAATAAGGTCTTTGAGA
TGTAGTGCAAACTCAAGGCATAGGACGATCTTCCTTAACGGTTGGCCTTTGCAATTCTCT
CAATCTCATCCTTCTTCTTGATAGCATAGCTGTTGGAAGATCCCTTGGCAGCATTGATTA
GCTCATCAGCAAGGCACTCAGCGATCGTCTTGATGTTTCTAAACGCAGCTTCACGTGCGC
CAGTAGTGAGTAAGAAGATGGCTTGGTTCACACGTCTCAGAGGAGAGATATCAACAGCCT
GCCTCCTAACCACACCAGCAGATCCAATCCTGGTGGCATCTTCACGTGGACCACTGTTGA
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TGGCGTGCTTGATGATCCTCACAGCCATCAGCTTCTTACCGTTGTTCCTCCCGTGCATCA
TGAGAGAGTTTGTGAGCCTCTCGA

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DS 

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ATAAGGTCTTTGAGATGTAGTGCAAACTCAAGGCATAGGACGATCTTCCTTAACGGTTGG
CCTTTGCAACTCTCTCAATCTCATCCTTCTTCTTGATAGCATAGCTGTTGGAAGATCCCT
TGGCAGCATTGATGAGCTCATCAGCAAGGCACTCAGCGATGGTCGTGATGTTTCTAAACG
CAGCTTCACGTGCACCGGTGGTGAGCAAGAAGATGGCTTGGTTCACACGTCTTAGAGGAG
AGATATCAACAGCCTGCCTCCTAACCACACCAGCAGATCCAATCCTGGTGGCATCTTCAC
GTGGACCACTGTTGACAATGGCATCGATGATGACCTGAATTGGGTTCAAGTCAGTCAAGA
GATGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACAGCCATCAGCTTCTTACCGTTGT
TCCTCCCGTGCATCATGAGAGAGTTTGTGAGCCTCTCGACGATTGGGCATTGAGCCTTCC
TGAACCTCTTCACAGAGTACCTTCCAGCAGTGTGGGGGACAAAGGTCGCGTGCTTAGCTG
GCTGAACACCAATGTAGTCAACAAGACTAATGTCT
GTGC

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DS 

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GACATCTTCTGAAACACATCCAAAGCTCTAATGAGAAACAGTAAAATAAGGTCTTTGAGA
TGTAGTGCAAACTCAAGGCATAGGAAGATCTTCCTTAACGGTTGGCCTTTGCAACTCTCT
CAATCTCATCCTTCTTCTTGATAGCATAGCTGTTGGAAGATCCCTTGGCAGCATTGATGA
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CGGTGGTGAGCAAGAAGATGGCTTGGTTCACACGTCTTAAAGGAGAGACATCAACAGCCT
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CAATGGCATCGATGATGACCTGAATTGGGTTCAAGTCAGTCAAGAGATGGATGATCTCCA
TGGCGTGCTTGATGATCCTCACAGCCATCAGCTTCTTACCGTTGTTCCTCCCGTGCATCA
TGAGAGAGTTTGTGAGCCTCTCGACGATTGGGCATTGAGCCTTCCTGAACCTCTTCACAG
AGTACCTTCCAGCAGTGTGGGGGACAAAGGTCGCGTGCTTAGCTGGCTGAACACCAATGT
AGTCAACAAGACTAATGTCTGTGACCGAAACGTCGTCAAAGCTCCAACGGTTGAAGAGCT
TGACCTCGTTGGTAAGCTGTTGCTGAATCTCAGCGTCA
TCTC

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DS 

RD RR4CU75TF 672 0 0
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GCATAGGAAGATCTTCTTTAACGGTTGGCCTTTGCAACTCTCTCAATCTCATC*TTCTTC
TTGATAGCATAGCTGTTGGAAGATCCCTTGGCAGCATTGATGAGCTCATCAGCAAGGCAC
TCAGCGATGGTCTTGATGTTTCTAAACGCAGCTTCACGTGCACCGGTGGTGAGCAAGAAG
ATGGCTTGGTTCACACGTCTTAGAGGAGAGACATCAACAGCCTGCCTCCTAACCACACCA
GCAGATCCAATCCTGGTGGCATCTTCACGTGGACCACTGTTGACAATGGCATCGATGATG
ACCTGAATTGGGTTCAAGTCAGTCAAGAGATGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATC
CTCACAGCCATCAGCTTCTTACCGTTGTTCCTCCCGTGCATCATGAGAGAGTTTGTGAGC
CTCTCGACGATTGGGCATTGAGCCTTCCTGAACCTCTTCACAGAGTACCTTCCAGCAGTG
TGGGGGACAAAGGTCGCGTGCTTAGCTGGCTGAACACCAATGTAGTCAACAAGACTAATG
TCTGTGACCGAAACGTCGTCAAAGCTCCAACGGTTGAAGAGCTTGACCTCGTTGGTAAGC
TGTTGCTGAATC

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DS 

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GTGTC
AAAAACTTCATTAAAAGATACGGACATCTTCTGAAACACGTCCAAAGCTCTA*TGAGAAA
CAGTAAA*TAAGGTCTTTGAGATGTAGTGCAAACTCAAGGCATAGGACGATCTTC*TTAA
CGGTTGGCCTTTGCAATTCTCTCAATCTCATCCTTCTTCTTGATAGCATAGCTGTTGGAA
GATCCCTTGGCAGCATTGATTAGCTCATCAGCAAGGCACTCAGCGATCGTCTTGATGTTT
CTAAACGCAGCTTCACGTGCGCCAGTAGTGAGTAAGAAGATGGCTTGGTTCACACGTCTC
AGAGGAGAGATATCAACAGCCTGCCTCCTAACCACACCAGCAGATCCAATCCTGGTGGCA
TCTTCACGTGGACCACTGTTGACAATGGCATCGATGATGACCTGAATTGGGTTCAAGTCA
GTCAAGAGATGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACAGCCATCAGCTTCTTA
CCGTTGTTCCTCCCGTGCATCATGAGAGAGTTTGTGAGCCTCTCGACGATTGGGCATTGA
GCCTTCCTGAACCTCTTCACAGAGTACCTTCCAGCAGTGTGGGGGACAAAGGTCGCGTGC
TTAGCTGGCTGAACACCAATGTAGTCAACAAGACTAATGTCTATGACCGAAACGTCGTCA
AAGCTCCAACGGTTGAAGAGCTTGACCTCGTTGGTAAGCTGTTGCTGAATCTCAGCGTCA
ATCTCAGCGGCGGCGGCCATGGCTCGTAGTAAGTGTCGTCGTGAGGAGAAGAGAACAATT
AGGTTAACGCAGCTTGCTGCTTGGAGAAGGTCC

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DS 



AS 1 6

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AAAGAAAAACTGATTGTTTCTTTAACATATGGGAAGAAAACCAACACATCTTTCGATTGT
GTCTGTAAAAGGAGTCAAGTAAAAAAGATTCTCTGGTACATTTTAAACTTATGAGGCAGA
ATAAGTTCTTAAGAGCTAAAGACAAAAAGCTTTTAGACACGAGACATGCCGAGTTTGCGT
TCAAACAAGCGACGCAGGAGATAGACTTGGAGGACACTTGCACCAATCAATGCAAACGAC
TCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCTCTTTTGCTCATGTTCTCATTCACAATGGCTTGACGA
TCGGTCTGAGCCTCTAACCAATGCTGTTCAAACTGGATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAAC
TTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGGTCGTAGTAG
GCAAAGTGGCCAAGCTGGACATCGAAGTCAATGGTTTCGTGATAAGGAGACTTGTTTGTG
AAACAGAAACGGTAAACCCCTTTCTTCTGGACAACGAAGTCGTGCTTGGCACTGATCTGT
TCCCTAAAGTCATGAATTTGTTCTCCTGTTGGGCCATGTATCACAAGATCTACACCATCC
TCGTTAAAATGCCATTGAGAATCAGACTTGATGACGACGAAAGAGACGTGGAGCGTGTCG
CCTTCGTATTCAGCCTTGTGGGAGAAGCATTCTTCTCTGTCTATCACGAATCTGATACCT
AACGCTGCCTGGAAGCTCCACACGAGCCCTAGTAATAGGATCGTAGCCTTAAAGCTCATC
TTCCGAGTCTGAGAATTGAGGAGTGATATGCTCGATGAGTGTCAAGAAAAAAAA*TGTGA
GATTGATCGGAGAAGAAGAGCGAGTTCGTCCAGAATCGGACAAGATGGATCTTGTTTTGA
CTGAGATGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F809JQ U 59
AF RR4DK79JQ U 1
AF RR4BT12JQ U 12
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AF RR4F809TF C 181
AF RR4BT12TF C 314
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CGCCTTCGTATT

QA 1 612 1 612
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RD RR4DK79JQ 754 0 0
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DS 

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GG
TTGTTTCTTTAACATATGGGAAGAAAACCAACACATCTTTCGATTGTGTCTGTAAAAGGA
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QA 3 815 3 815
DS 

RD RR4DK79TF 759 0 0
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GTACTGCTCTTTTGCTCATGTTCTCATTCACAATGGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTA
ACCAATGCTGTTCAAACTGGATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAACTTTGATATTTGCTCCA
TCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGGTCGTAGTAGGCAAAGTGGCCAAGCT
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GAGAATCAGACTTGATGACGACGAAAGAGACGTGGGGCGTGTCGCCTTCGTATTCAGCCT
TGTGGGAGAAGCATTCTTCTCTGTCTATCACGAATCTGATACCTAACGCTGCCTGGAGGC
TCCACACGAGCCCTAGTAATAGGATCGTAGCCTTAAAGCTCATCTTCCGAGTCTGAGAAT
TGAGGAGTGATATGCTCGATGAGTGTCAAGAAAAAAAA*TGCGAGATTGATCGGAGAAGA
AGAGCGAGTTCGTCCAGAATCGGACAAGATGGATCTT
CC

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DS 

RD RR4F809TF 724 0 0
TCAAACAAGCGACGCAGGAGATAGACTTGGAGGACACTTGCACCAATCAATGCAAACGAC
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TCGGTCTGAGCCTCTAACCAATGCTGTTCAAACTGGATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAAC
TTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGGTCGTAGTAG
GCAAAGTGGCCAAGCTGGACATCGAAGTCAATGGTTTCGTGATAAGGAGACTTGTTTGTG
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TCCCTAAAGTCATGAATTTGTTCTCCTGTTGGGCCATGTATCACAAGATCTACACCATCC
TCGTTAAAATGCCATTGAGAATCAGACTTGATGACGACGAGAGAGACGTGGAGCGTGTCG
CCTTCGTATTCAGCCTTGTGGGAGAAGCATTCTTCTCTGTC*ATCACGAATCTGATACCT
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TTCCGAGTCTGAGAATTGAGGAGTGATATGCTCGATGAGTGTCAAGAAAAAAAAATGTGA
GATTGATCGGAGAAGAAGAGCGAGTTCGTCCAGAATCGGACAAGATGGATCTTGTTTTGA
CT
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4BT12TF 599 0 0
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CCATCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGGTCGTAGTAGGCATAGTGGCCAA
GCTGGACATCGAAGTCAATGGTTTCGTGATAAGGAGACTTGTTTGTGAAACAGAAACGGT
AAACCCCTTTCTTCTGGACAACGAAGTCGTGCTTGGCACTGATCTGTTCCCTAAAGTCAT
GAATTTGTTCTCCTGTTGGGCCATGTATCACAAGATCTACACCATCCTCGTTAAAATGCC
ATTGAGAATCAGACTTGATGACGACGAAAGAGACGTGGAGCGTGTCGCCTTCGTATTCAG
CCTTGTGGGAGAAGCATTCTTCTCTGTCTATCACGAATCTGATACCTAACGCTGCCTGGA
AGCTCCACACGAGCCCTAGTAATAGGATCGTAGCCTTAAAGCTCATCTTCCGAGTCTGAG
AATTGAGGAGTGATATGCTCGATGAGTGTCAAGAAAAAAAA*TGTGAGATTGATCGGAGA
AGAAGAGCGAGTTCGTCCAGAATCGGACAAGATGGATCTTGTTTTGACTGAGATGCCCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 6

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TCTCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATAC
TCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTG
AACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGA
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GTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCTAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCGTCTCTT
GAGAAGCTTGGTGTCTTCTCCAAAGCCGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACT
TTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCCGCTGCATTACCGGCTCTGACAGCTGCT
ATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTT
TTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGAT
GGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGT
TGTACAATTGTTTTTTT*GTAATAAAGTTTCTATAGAAGAAGATTCTTTTTTGATCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI88TF U 1
AF RR4BL01TF U 1
AF RR4E701TF U 1
AF RR4E701JQ C 16
BS 1 53 RR4BL01TF
BS 54 54 RR4E701TF
BS 55 112 RR4BL01TF
BS 113 113 RR4E701TF
BS 114 307 RR4BL01TF
BS 308 308 RR4E701TF
BS 309 355 RR4BL01TF
BS 356 356 RR4E701TF
BS 357 605 RR4BL01TF
BS 606 606 RR4E701TF
BS 607 623 RR4BL01TF
BS 624 624 RR4E701TF
BS 625 639 RR4BL01TF
BS 640 640 RR4E701TF
BS 641 659 RR4BL01TF
BS 660 660 RR4E701TF
BS 661 697 RR4BL01TF
BS 698 717 RR4E701TF

RD RR4EI88TF 575 0 0
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GTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCTAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCGTCTCTT
GAGAAGCTTGGTGTCTTCTCCAAAGCCGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACT
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T*GGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4BL01TF 697 0 0
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TCTCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGCCTGTCATAC
TCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTG
AACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGA
AGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAAC
GTTGAGAGATCCGGCTTGCTCTCTAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCGT*TCTT
GAGAAGCTTGGTGTCTTCTCCAAAGCCGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACT
TTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCCGCTGCATTACCGGCTCTGACAGCTGCT
ATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTT
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GGACTTCAAGAAGCTGATTGAGT*TTTCCTCTGTAAACAGAACACAACTAAAAACATTGC
TGTACAATTGTTTTTTT*GTAATAAAGTTTCTATAGA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4E701TF 717 0 0
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TCTCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATAC
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AACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGA
AGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAAC
GTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCTAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCGTCTCTT
GAGAAGCTTGGTGTCTTCTCCAAAGCCGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACT
TTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCCGCTGCATTACCGGCTCTGACAGCTGCT
ATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTT
TTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGAT
GGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGT
TGTACAATTGTTTTTTT*GTAATAAAGTTTCTATAGAAGAAGATTCTTTTTTGATCA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4E701JQ 703 0 0
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CCAGCAGCCTTTTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCC
AAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAAC
GTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCCGGC
TTGCTCTCTAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCGTCTCTTGAGAAGCTTGGTGTC
TTCTCCAAAGCCGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCT
CCCGCGGTCTTGGCCTCCGCTGCATTACCGGCTCTGACAGCTGCTATTGTAGCCGTGGTG
CTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTT
GCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTCCAAGAAGCT
GATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGTTGTACAATTGTTTTT
TTTGTAATAAAGTTTCTATAGAAG
AAGGATTCTTTTTTTGATC

QA 1 684 1 684
DS 



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TAAAGTTTCTATAGAAGGACTATAGCTTATTAAAGCCTTATTGACAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF48TF U 1
AF RR4DF48JQ C 1
BS 1 1 RR4DF48JQ
BS 2 136 RR4DF48TF
BS 137 407 RR4DF48JQ

RD RR4DF48TF 136 0 0
G
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TCTTGGCCTCCGCTG

QA 2 136 2 136
DS 

RD RR4DF48JQ 407 0 0
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AAAGCCGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTTAGACTTTAGCCGGTACATCTCCCGCG
GTCTTGGCCTCCGCTGCATTACCGGCTCTGACGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTC
CTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTG
GAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGATTGAG
TTTTCCTCTGTAAACAGAACACAACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTTTTTTTTTGTAA
TAAAGTTTCTATAGAAGGACTATAGCTTATTAAAGCCTTATTGACAC

QA 1 407 1 407
DS 



AS 2 6

CO CL1485Contig1 457 3 5 U
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CGGGAAGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTT
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GTACTGTCTATATTCGGCGGCACCATGACCGCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4AW94JQ U 1
AF RR4AW94TF C 1
AF RR4FZ12JQ U 6
BS 1 102 RR4AW94JQ
BS 103 103 RR4FZ12JQ
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BS 331 331 RR4FZ12JQ
BS 332 457 RR4AW94JQ

RD RR4AW94JQ 457 0 0
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GCACATAAAATAGATATTATTTTAGTGAAATAAAAAAGCTGAAAAAAGAGAACAAATAGT
TTTGTTATACATTGAAAGGGGTGAAGAGAAAGATGGAGAAATAGGGATATGAATTAGATC
CGGGAAGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTT
CCCAATACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACATCCA
AGAAGTTGCAACTCATTAAGATGTCCAAGGGGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACT
TTGTTGAGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTACCTCTTCCACGCTCTTTTCA*AATCTCA
GTACTGTCTATATTCGGCGGCACCATGACCGCTGTCC

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4AW94TF 457 0 0
GTTTT
AATGGTATTGACATAAATAAAAATAAATCTGACATAAGTTTTTTTTGGAATAATTGCACA
TAAAATAGATATTATTTTAGTGAAATAAAAAAGCTGAGAAAAGAGAACAAATAGTTTTGT
TATACATTGAAAGGGGTGAAGAGAAAGATGGAGAAATAGGGATATGAATTAGATCCGGGA
AGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTTCCCAA
TACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACATCCAAGAAG
TTGCAACTCATTAAGATGTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACTTTGTT
GAGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTACCTCTTCCACGCTCTTTTCA*AATCTCAGTACT
GTCTATATTCGGCGGCACCATGACCGCTGTC
C

QA 6 456 6 456
DS 

RD RR4FZ12JQ 421 0 0
AATGGTATTGACATAAATAAAAATAAATCTGACATAAGTTTTTTTTGGAATAATTGCACA
TAAAATAGATATTATTTTAGTGAAATAAAAAAGCTGAGAAAAGAGAACAAATAGTTTTGT
TATACATTGAAAGGGGTGAAGAGAAAGATGGAGAAATAGGGATATGAATTAGATCCGGGA
AGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTTCCCAA
TACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACATCCAAGAAG
TTGCAACTCATTAAGATGTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACTTTGTT
GAGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTACCTCTTCCACGCTCTTTTCACAATCTCAGTACT
G

QA 1 421 1 421
DS 



CO CL1485Contig2 810 3 23 U
GACGGTGTCTCGTCCATATGTGCGCTTGATTTCCGAATGGATGAGTGGGGAGTGGATGTG
GCCTTGACCGGATCTCAGAAAGCTTTATCCCTTCCAACAGGCCTTGGTATTGTGTGCGCC
AGTCCAAAAGCTTTGGAAGCTACCAAAACTTCAAAATCCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGG
AATGACTACCTCAAGTTTTACAAGCTCGGGACATATTGGCCATACACACCTTCCATTCAA
CTCCTCTACGGTCTTAGAGCTGCTCTTGATCTTATCTTTGAAGAAGGACTTGAAAATGTC
ATCGCCCGTCACGCCCGTTTGGGAAAGGCCACAAGGCTCGCGGTGGAAGCGTGGGGGCTG
AAAAACTGTACACAAAAGGAGGAGTGGATCAGTAACACAGTGACAGCGGTCGTGGTGCCG
CCGAATATAGACAGTACTGAGATTGTGAAAAGGGCGTGGAGGAGGTACAACCTTAGTCTT
GGTCTTGGTCTCAACAAAGTGGCTGGCAAGGTTTTCAGAATTGGGCACCTTGGAAATCTT
AATGAGTTGCAACTT*CTTGGGTGTTTGGCTGGAGTGGAGATGATACTCAAGGATGTTGG
CTACCCAATTGTATTGGGAAGTGGAGTTGCAGCTGTTTCTACTTATCTTCAGCACCAGAT
CCCTCTCATTCCTTCCCGGATCTAATTCATATCCCTATTTCTCCATCTTTCTCTCCACCC
CTCTTTCAATGTATAACAAAACTATTTGGTCTCTTTTCTCTGCTTTTTTTAATTCACTAA
AATACTATCTATTTTATGTGCAATTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ32TF U 1
AF RR4CX68TF U 37
AF RR4CQ32JQ C 68
BS 1 555 RR4CQ32TF
BS 556 556 RR4CX68TF
BS 557 655 RR4CQ32TF
BS 656 656 RR4CX68TF
BS 657 669 RR4CQ32TF
BS 670 670 RR4CX68TF
BS 671 672 RR4CQ32TF
BS 673 673 RR4CX68TF
BS 674 690 RR4CQ32TF
BS 691 703 RR4CX68TF
BS 704 704 RR4CQ32JQ
BS 705 715 RR4CX68TF
BS 716 716 RR4CQ32JQ
BS 717 728 RR4CX68TF
BS 729 729 RR4CQ32JQ
BS 730 735 RR4CX68TF
BS 736 738 RR4CQ32JQ
BS 739 746 RR4CX68TF
BS 747 748 RR4CQ32JQ
BS 749 769 RR4CX68TF
BS 770 771 RR4CQ32JQ
BS 772 802 RR4CX68TF
BS 803 810 RR4CQ32JQ

RD RR4CQ32TF 690 0 0
GACGGTGTCTCGTCCATATGTGCGCTTGATTTCCGAATGGATGAGTGGGGAGTGGATGTG
GCCTTGACCGGATCTCAGAAAGCTTTATCCCTTCCAACAGGCCTTGGTATTGTGTGCGCC
AGTCCAAAAGCTTTGGAAGCTACCAAAACTTCAAAATCCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGG
AATGACTACCTCAAGTTTTACAAGCTCGGGACATATTGGCCATACACACCTTCCATTCAA
CTCCTCTACGGTCTTAGAGCTGCTCTTGATCTTATCTTTGAAGAAGGACTTGAAAATGTC
ATCGCCCGTCACGCCCGTTTGGGAAAGGCCACAAGGCTCGCGGTGGAAGCGTGGGGGCTG
AAAAACTGTACACAAAAGGAGGAGTGGATCAGTAACACAGTGACAGCGGTCGTGGTGCCG
CCGAATATAGACAGTACTGAGATTGTGAAAAGGGCGTGGAGGAGGTACAACCTTAGTCTT
GGTCTTGGTCTCAACAAAGTGGCTGGCAAGGTTTTCAGAATTGGGCACCTTGGAAATCTT
AATGAGTTGCAACTTTCTTGGGTGTTTGGCTGGAGTGGAGATGATACTCAAGGATGTTGG
CTACCCAATTGTATTGGGAAGTGGAGTTGCAGCTGTTTCTACTTATCTTCAGCAC*AGAT
CCCTCTCAT*CCCTCCCGGATCTAATTCAT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4CX68TF 778 0 0
G
TGGATGAGTGGGGAGTGGATGTGGCCTTGACCGGATCTCAGAAAGCTTTATCCCTTCCAA
CAGGCCTTGGTATTGTGTGCGCCAGTCCAAAAGCTTTGGAAGCTACCAAAACTTCAAAAT
CCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGGAATGACTACCTCAAGTTTTACAAGCTCGGGACATATT
GGCCATACACACCTTCCATTCAACTCCTCTACGGTCTTAGAGCTGCTCTTGATCTTATCT
TTGAAGAAGGACTTGAAAATGTCATCGCCCGTCACGCCCGTTTGGGAAAGGCCACAAGGC
TCGCGGTGGAAGCGTGGGGGCTGAAAAACTGTACACAAAAGGAGGAGTGGATCAGTAACA
CAGTGACAGCGGTCGTGGTGCCGCCGAATATAGACAGTACTGAGATTGTGAAAAGGGCGT
GGAGGAGGTACAACCTTAGTCTTGGTCTTGGTCTCAACAAAGTGGCTGGCAAGGTTTTCA
GAATTGGGCACCTTGGAAATCTTAATGAGTTGCAACTT*CTTGGGTGTTTGGCTGGAGTG
GAGATGATACTCAAAGATGTTGGCTACCCAATTGTATTGGGAAGTGGAGTTGCAGCTGCT
TCTACTTATCTTCAGCACCAGATCCCTCTCATTCCTTCCCGGATCTAATTCATATCCCTA
TTTCTC*ATCTTTCTCTC*ACCCCTCTTTCA*TGTATA**CAAACTATT**GTCTCTTTT
CTCTGCTTTTTT**ATTCACTAAAATACTATCTATTTTATGTGCA
TATCAAAACTAT

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR4CQ32JQ 743 0 0
CCGGATCTCAGAAAGCTTTATCCCTTCCAACAGGCCTTGGTATTGTGTGCGCCAGTCCAA
AAGCTTTGGAAGCTACCAAAACTTCAAAATCCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGGAATGACT
ACCTCAAGTTTTACAAGCTCGGGACATATTGGCCATACACACCTTCCATTCAACTCCTCT
ACGGTCTTAGAGCTGCTCTTGATCTTATCTTTGAAGAAGGACTTGAAAATGTCATCGCCC
GTCACGCCCGTTTGGGAAAGGCCACAAGGCTCGCGGTGGAAGCGTGGGGGCTGAAAAACT
GTACACAAAAGGAGGAGTGGATCAGTAACACAGTGACAGCGGTCGTGGTGCCGCCGAATA
TAGACAGTACTGAGATTGTGAAAAGGGCGTGGAGGAGGTACAACCTTAGTCTTGGTCTTG
GTCTCAACAAAGTGGCTGGCAAGGTTTTCAGAATTGGGCACCTTGGAAATCTTAATGAGT
TGCAACTT*CTTGGGTGTTTGGCTGGAGTGGAGATGATACTCAAGGATGTTGGCTACCCA
ATTGTATTGGGAAGTGGAGTTGCAGCTGTTTCTACTTATCTTCAGCACCAGATCCCTCTC
ATTCCTTCCCGGATCTAATTCATATCCCTATTTCTCCATCTTTCTCTCCACCCCTCTTTC
AATGTATAACAAAACTATTTGTTCTCTTTTCTCTGCTTTTTTTATTTCACTAAAATACTA
TCTATTTTATGTGCAATTATTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 6

CO CL1486Contig1 685 6 12 U
GGGAACATAAACATATCATAACTCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCG
TGGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCAC
CTAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTC
CCTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCAC
TTAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCGAGCCT
GGCGCTGTGATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAG
TCGTGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTC
GAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATCCTCAAAACCT
ATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGT
GAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTTCCTCTTTTTTGTTT
TCTTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTTATT
TTCTCTCCTGTTTTTTTCTTAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BV80JQ C 1
AF RR4BV80TF U 1
AF RR4G159TF U 1
AF RR4BB11JQ C 2
AF RR4G159JQ C 419
AF RR4BB11TF U 2
BS 1 9 RR4BV80JQ
BS 10 22 RR4BV80TF
BS 23 23 RR4G159TF
BS 24 299 RR4BV80TF
BS 300 300 RR4G159TF
BS 301 469 RR4BV80TF
BS 470 470 RR4G159TF
BS 471 581 RR4BV80TF
BS 582 582 RR4G159TF
BS 583 656 RR4BV80TF
BS 657 668 RR4G159TF
BS 669 685 RR4BB11TF

RD RR4BV80JQ 656 0 0
GGGAACATAAACATATCATAACGCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCG
TGGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCAC
CTAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTC
CCTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCAC
TTAGCACCCACAGGGTTATTTTTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCGAGCCC
GGCGCTGTGATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAG
TCGTGTGTGTTTGGGCTTTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTC
GAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAAAACCT
ATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGT
GAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTTTTTTCCTCTTTTTTGTTT
TCTTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4BV80TF 657 0 0
GGGAACATA
AACATATCATAACGCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAAACT
TACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCA
GCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTC
AAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCC
ACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCGAGCCCGGCGCTGTG
ATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCGTGTGTG
TTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTG
GGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAAAACCTATTAGAATG
TTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGA
TTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTTTTTTCCTCTTTTTTGTTTTCTTTGGTT
TGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGT
G

QA 10 656 10 656
DS 

RD RR4G159TF 668 0 0
GGGGAACAT
AACATATCATAACTCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAAACT
TACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCA
GCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTC
AAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCC
ACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTG
ATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCGTGTGTG
TTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTG
GGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATCCTCAAAACCTATTAGAATG
TTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGA
TTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTT*GTGTGTTTTCCTCTTTTTTGTTTTCTTTGGTT
TGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTTATTTTCTCTCC

QA 10 668 10 668
DS 

RD RR4BB11JQ 684 0 0
GGGAACAT
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TACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCA
GCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTC
AAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCC
ACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTG
ATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCGTGTGTG
TTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTG
GGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATCCTCAAAACCTATTAGAATG
TTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGA
TTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTTCCTCTTTTTTGTTTTCTTTGGTT
TGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTTATTTTCTCTCCT
GTTTTTTTCTTAAAAG

QA 9 684 9 684
DS 

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CTATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTT
GTGAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTT*GTGTGTTTTCCTCTTTTTTGT
TTTCTTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTTA
TTTTCTCTCC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR4BB11TF 684 0 0
GGGAACAT
AACATATCATAACTCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAAACT
TACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCA
GCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTC
AAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCC
ACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTG
ATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCGTGTGTG
TTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTG
GGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATCCTCAAAACCTATTAGAATG
TTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGA
TTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTTCCTCTTTTTTGTTTTCTTTGGTT
TGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTTATTTTCTCTCCT
GTTTTTTTCTTAAAAG

QA 9 684 9 684
DS 



AS 1 6

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TCATTAGCTTCACCGATTCAGTGCATCAGAATTATAAATCCATCATCTTCATCATCTTCT
TTGACAACTTCGTCGTCTTTGAGATTCTCAACGAGTAAGCCATGCGTCTTCATCATCAGA
TGTTCTCAGACCGATGGTCCTTTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAACCT
ACACCTCCCCAAAAACCTGCTCCTCCTACGCCGTCTACTTCTCCTCCACCACCACCACCG
CAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAA
GCTAAAGAGCTTCAAGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCC
TTTTTT*GGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTT
TGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAAT
CCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAAGAGTGTTGTTGG
TGTTCTATAGATATGATCTCTCTCTGATTCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTAT
TCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTAAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGT
TCAACCGCTTTTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AC74JQ C 270
AF RR4AC74TF U 136
AF RR4GL35TF U 1
AF RR4GL35JQ C 29
AF RR4EF81JQ C 244
AF RR4EF81TF U 244
BS 1 294 RR4GL35TF
BS 295 297 RR4AC74TF
BS 298 426 RR4GL35TF
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BS 709 721 RR4GL35TF
BS 722 759 RR4EF81TF

RD RR4AC74JQ 378 0 0
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TCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAA
CAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACT
TGGAATAATAATGAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTGTATAGATATGATCTCTCTTTGATT
CCTTATGTTCAATCTTCA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4AC74TF 569 0 0
TCTTTGAGATTCTCAACGAGTAATCCATGCGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCCGAT
GGTCCTTTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAACCTACACCTCCCCAAAAA
CCTGCTCCTCCTACGCCGTCTACTTCTCCTCCACCACCACCACCGCACAAAGCTGTGGCT
GTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTAAAGAGCTTCAA
GATTACTTTAAGCACAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTT*GGTTTCCA
ACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCT
GACAGATTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTT
CGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTCTATAGATATG
ATCTCTCTCTGATTCCGTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTCTTCCTCCTGTATA
TGCTGCATCTCTAAAGATCTTTTAAAT
GC

QA 1 567 1 567
DS 

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TTGACAACTTCGTCGTCTTTGAGATTCTCAACGAGTAAGCCATGCGTCTTCATCATCAGA
TGTTCTCAGACCGATGGTCCTTTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAACCT
ACACCTCCCCAAAAACCTGCTCCTCCTACGCCGTCTACTTCTCCTCCACCACCA***CCG
CAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAA
GCTAAAGAGCTTCAAGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCC
TTTTTTTGGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTT
TGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAAT
CCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAAGAGTGTTGTTGG
TGTTCTATAGATATGATCTCTCTCTGATTCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTAT
TCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTAAAGATCTTTTAAATACAGG*CCCTTTTGTTGT
T
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4GL35JQ 694 0 0
TTA
AAAAAAAAAAAAGCCATTAACGGAAGATGTCATTAGCTTCACCGATTCAGTGCATCAGAA
TTATAAATCCATCATCTTCATCATCTTCTTTGACAACTTCGTCGTCTTTGAGATTCTCAA
CGAGTAAGCCATGCGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGACCGATGGTCCTTTGAGAAGGC
CCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAACCTACACCTCCCCAAAAACCTGCTCCTCCTACGC
CGTCTACTTCTCCTCCACCACCA***CCGCAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTG
TAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTAAAGAGCTTCAAGATTACTTTAAGCAGA
AGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTTGGTTTCCAACCCAAAAACGAGATC
TCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACA
GGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTG
GAATAATAATGAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTCTATAGATATGATCTCTCTCTGATTCC
TTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTAAAG
ATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTT
G

QA 4 693 4 693
DS 

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G
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AAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTA
AAGAGCTTCAAGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTT
TT*GGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCG
GTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTT
CTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAGTGAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTT
CTATAGATATGATCTCTCTCTGATTCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTCTT
CCTCCTGTATATGCTGCATCTCTAAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAA
CCGCTTTTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCG

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DS 

RD RR4EF81TF 516 0 0
G
CTCCCCAAAAACCTGCTCCTCCTACGCCGTCTACTTCTCCTCCACCACCACCACCGCAGA
AAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTA
AAGAGCTTCAAGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTT
TT*GGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCG
GTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTT
CTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAGTGAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTT
CTATAGATATGATCTCTCTCTGATTCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTCTT
CCTCCTGTATATGCTGCATCTCTAAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAA
CCGCTTTTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCG

QA 2 516 2 516
DS 



AS 1 6

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TGGATACGATCTGCCGGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGGTTTTCCAGATCGAGTA
CGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGAT
TGTTATGGGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAG
AATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGCAG
GCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGC
TGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTA
TTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCC
TCAATTGTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCACACAGATATTTTGGTGCTGCCATTGG
TAAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATG
CAAAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGA
CAAGGCATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAA
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GGATGCTGACTAAACTGAGGAAAAATGGGTCAAATTAGTTTTTTTTTGTTTAATGCAACG
TTTGGTCGTGTTCTGTTGTAAGACCTTGAATTGTGTCTCTAGGGGCAATTTGTTGCAGTT
TCTCATGAAACCTTTGGACTCTTTCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP35TF U 1
AF RR4GS63TF U 73
AF RR4GP35JQ C 388
AF RR4AB19TF U 6
AF RR4GS63JQ C 247
AF RR4AB19JQ C 138
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BS 35 36 RR4GP35TF
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BS 545 605 RR4GP35TF
BS 606 720 RR4AB19TF
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BS 828 846 RR4AB19TF
BS 847 953 RR4AB19JQ

RD RR4GP35TF 605 0 0
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CGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGAT
TGTTATGGGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAG
AATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGCAG
GCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGC
TGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTA
TTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCC
TCAATTGTACATGATCGAGCCGTCGGGCATATCACACAGATATTTTGGTGCTGCCATTGG
TAAGGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATG
CAAAG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4GS63TF 698 0 0
GT
CGGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTG
TCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATGGGTGTGG
AGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAGAATCCATTCTGTTC
ATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGCAGGCAAATTGTTGCAA
GGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGG
AACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGC
CTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAATTGTACATGA
TCGAGCCATCGGGCATATCACACAGATATTTTGGTGCTGCCATTGGTAAAGGCAAACAAG
CTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTA
TTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAG*CATTTGAAT
TGGAGATGAGCTGGATATGTGAG*AGTCTAAACGAGAGCATCAGA**GTCCCTGATGATC
TTCTGGA*GAAGCAA*GACG*CAGCTAAA
CTGCACT

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4GP35JQ 342 0 0
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AATTGAGAAACTGAAATTATTTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCGAA
AATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAGGCATTTGAATTGGAGATGAGCTG
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DS 

RD RR4AB19TF 841 0 0
GG
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GATCTGTCGGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCC
AAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATG
GGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAGAATCCAT
TCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGCAGGCAAATT
GTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCA
GTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGGTGG
CTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAATTG
TACATGATCGAGCCATCGGGCATATCACACAGATATTTTGGTGCTGCCATTGGTAAAGGC
AAACTAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAA
GGCGTTATTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAGGCA
TTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAAGTCCCT
GATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACG*CAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATGGATGCT
GACTAAACTGAGGAAAA*TGGGTCAA*TTAGTTTTTTTT*GTTTAATGCAACGTTTGGT

QA 3 841 3 841
DS 

RD RR4GS63JQ 614 0 0
TTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGCAGGCAAAT
TGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACC
AGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGGTG
GCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAATT
GTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCACACAGATATTTTGGTGCTGCCATTGGTAAAGG
CAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATTTGAGATGACATGCAAAGA
AGGCGTTATTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAGGC
ATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAGGTCCC
TGATGATTTTTTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATGGATGC
TGACTAAACTGAGAAAAAATGGGTCAAATTAGTTTTTTTTTGTTTAATGCAACGTTTGGT
CGTGTTCTGTTGTA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4AB19JQ 816 0 0
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AACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAGAATCCATTCTGTTCATC
GTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGCAGGCAAATTGTTGCAAGGG
CCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGGAAC
TTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGCCTT
TTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAATTGTACATGATCG
AGCCATCGGGCATATCACACAGATATTTTGGTGCTGCCATTGGTAAAGGCAAACTAGCTG
CTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATTTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTG
AAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAGGCATTTGAATTGG
AGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAGGTCCCTGATGATCTTC
TGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTG
AGGAAAAATGGGTCAAATTAGTTTTTTTTTGTTTAATGCAACGTTTGGTCGTGTTCTGTT
GTAAGACCTTGAATTGTGTCTCTAGGGGCAATTTGTTGCAGTTTCTCATGAAACCTTTGG
ACTCTTTCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCTTCG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 6

CO CL1489Contig1 1124 6 14 U
GGGCGTTTAGTTGGCGAAGGATTCACATGGCTTCTCTTCACATCAACCAAATATCATAAT
ACGTGATAACTGATAAAGAACCCTTTTTCTGTTTTTTTCATATCATCTTTTTCTTTCGAG
AAGACAGAAGAAGAAAAAATCATCCAGACCGATCTCGTAGACTTTTCTTTTCTTGTCTTC
TGTCAAAAACCGGAAAGAAACTTTTCAAGCAGAAGAAACAAAAGAAGAATCTCATAGATT
CGTGAGCTTCACGACGATGGAGTCTTTAAAGAACAGAACATTGCTGAAGGTCATCGTCCT
CGGAGATAGCGGGGTTGGCAAAACTTCATTGATGAATCAATACGTGTACAAGAAGTTTAA
CCGACAATACAAGGCCACGATAGGAGCAGATTTTGTAACCAAGGAGCTCCATATCGAAGA
CAAAGCTGTCACTTTACAAATATGGGATACAGCTGGACAAGAGAGATTTCACAGTCTAGG
AGCTGCCTTCTATAGAGGTGCTGACTGTTGCGTTCTTGTCTACGACGTTAACAATCTCAA
ATCTTTTGAAACACTCAATTCTTCGCACATGGAATTCCTCAAACAGGCAAATCCAGTGGA
ACCTGAGAAATTTCCATTTGTTTTGATTGGTAACAAAACCGATGTAGATGGTGGAAACAC
TCGAGTTGTTTCGGAGAAGAGAGCCGTCGAATGGTGTGGTACGAAGGGAAACATGCCGTA
CTATGAAACCTCTGCAAAG**AAATATCAATGTGGATGAAGCTTTTTTGGGTGTTGCACA
CGAAGCTCTCTCCAATGAACATAAACAAGACTACATATATTCCAGAGACATATCTGCATC
TGTTGCAGACATTCTTGAGGAGCCGTCAAGACCAGGCTGCTCTTGCCGATTCATAATTAA
CATATCTGATCAATAATATCGATTCCAAGCTCTTCTGTTTCAATCTTTGTCTTTTTATTT
TATTATTATATGTTGGTTAATATCAATTATTGCGGTTTAGTAACAAAAAAACTGGTACAT
GCAACGACCTGAGTGTTTTGGTTCATGTGTAGCATTCTATTTAATTTTGTTCATGTTATT
GTTGATACATTCAAACGATCAAAATCATTTGGAACATTCGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 

AF RR4DK62TF U 38
AF RR4CG18TF U 1
AF RR4DN94TF U 38
AF RR4DK62JQ C 366
AF RR4DN94JQ C 860
AF RR4CG18JQ C 1018
BS 1 53 RR4CG18TF
BS 54 54 RR4DK62TF
BS 55 59 RR4CG18TF
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BS 708 708 RR4DN94TF
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BS 751 759 RR4CG18TF
BS 760 1124 RR4DK62JQ

RD RR4DK62TF 666 0 0
GG
ACATCAACCAAATATCATAATACGTGATAACTGATAAAGAACCCTTTTTCTGTTTTTTTC
ATATCATCTTTTTCTTTCGAGAAGACAGAAGAAGAAAAAATCATCCAGACCGATCTCGTA
GACTTTTCTTTTCTTGTCTTCTGTCAAAAACCGGAAAGAAACTTTTCAAGCAGAAGAAAC
AAAAGAAGAATCTCATAGATTCGTGAGCTTCACGACGATGGAGTCTTTAAAGAACAGAAC
ATTGCTGAAGGTCATCGTCCTCGGAGATAGCGGGGTTGGCAAAACTTCATTGATGAATCA
ATACGTGTACAAGAAGTTTAACCGACAATACAAGGCCACGATAGGAGCAGATTTTGTAAC
CAAGGAGCTCCATATCGAAGACAAAGCTGTCACTTTACAAATATGGGATACAGCTGGACA
AGAGAGATTTCACAGTCTAGGAGCTGCCTTCTATAGAGGTGCTGACTGTTGCGTTCTTGT
CTACGACGTTAACAATCTCAAATCTTTTGAAACACTCAATTCTTCGCACATGGAATTCCT
CAAACAGGCAAATCCAGTGGAACCTGAGAAATTTCCATTTGTTTTGATTGGTAACAAAAC
CGATGTAGATGGTGGAAACACTCGAGTTGTTTCGGAGAAGAGAGCCGTCGAATGGTGTGG
TACG

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4CG18TF 762 0 0
GGGCGTTTAGTTGGCGAAGGATTCACATGGCTTCTCTTCACATCAACCAAATACCATAAC
ACGTGATAACTGATAAAGAACCCTTTTTCTGTTTTTTTCATATCATCTTTTTCTTTCAAG
AAGACAGAAGAAGAAAAAATCATCCAGACCGATCTCGTAGACTTTTCTTTTCTTGTCTTC
TGTCAAAAACCGGAAAGAAACTTTTCAAGCAGAAGAAACAAAAGAAGAATCTCATAGATT
CGTGAGCTTCACGACGATGGAGTCTTTAAAGAACAGAACATTGCTGAAGGTCATCGTCCT
CGGAGATAGCGGGGTTGGCAAAACTTCATTGATGAATCAATACGTGTACAAGAAGTTTAA
CCGACAATACAAGGCCACGATAGGAGCAGATTTTGTAACCAAGGAGCTCCATATCGAAGA
CAAAGCTGTCACTTTACAAATATGGGATACAGCTGGACAAGAGAGATTTCACAGTCTAGG
AGCTGCCTTCTATAGAGGTGCTGACTGTTGCGTTCTTGTCTACGACGTTAACAATCTCAA
ATCTTTTGAAACACTCAATTCTTCGCACATGGAATTCCTCAAACAGGCAAATCCAGTGGA
ACCTGAGAAATTTCCATTTGTTTTGATTGGTAACAAAACCGATGTAGATGGTGGAAACAC
TCGAGTTGTTTCGGAGAAGAGAGCCGTCGAATGGTGTGGTACGAAGG*AAACATGCCGTA
CTATGAA*CCTCTGCAAAG**AAATATCA*TGTGGATGA
GCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4DN94TF 724 0 0
GG
ACATCAACCAAATATCATAATACGTGATAACTGATAAAGAACCCTTTTTCTGTTTTTTTC
ATATCATCTTTTTCTTTCGAGAAGACAGAAGAAGAAAAAATCATCCAGACCGATCTCGTA
GACTTTTCTTTTCTTGTCTTCTGTCAAAAACCGGAAAGAAACTTTTCAAGCAGAAGAAAC
AAAAGAAGAATCTCATAGATTCGTGAGCTTCACGACGATGGAGTCTTTAAAGAACAGAAC
ATTGCTGAAGGTCATCGTCCTCGGAGATAGCGGGGTTGGCAAAACTTCATTGATGAATCA
ATACGTGTACAAGAAGTTTAACCGACAATACAAGGCCACGATAGGAGCAGATTTTGTAAC
CAAGGAGCTCCATATCGAAGACAAAGCTGTCACTTTACAAATATGGGATACAGCTGGACA
AGAGAGATTTCACAGTCTAGGAGCTGCCTTCTATAGAGGTGCTGACTGTTGCGTTCTTGT
CTACGACGTTAACAATCTCAAATCTTTTGAAACACTCAATTCTTCGCACATGGAATTCCT
CAAACAGGCAAATCCAGTGGAACCTGAGAAATTTCCATTTGTTTTGATTGGTAACAAAAC
CGATGTAGATGGTGGAAACACTCGAGTTGTTTCGGAGAAGAGAGCCGTCGAATGGTGTGG
TACGAAGGGAAACATGCCGTACTATGAAACCTCTGCAAGA**AAATATCAATGTGGATGA
AG

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4DK62JQ 759 0 0
AATACAAGGCCACGATAGGAGCAGATTTTGTAACCAAGGAGCTCCATATCGAAGACAAAG
CTGTCACTTTACAAATATGGGATACAGCTGGACAAGAGAGATTTCACAGTCTAGGAGCTG
CCTTCTATAGAGGTGCTGACTGTTGCGTTCTTGTCTACGACGTTAACAATCTCAAATCTT
TTGAAACACTCAATTCTTCGCACATGGAATTCCTCAAACAGGCAAATCCAGTGGAACCTG
AGAAATTTCCATTTGTTTTGATTGGTAACAAAACCGATGTAGATGGTGGAAACACTCGAG
TTGTTTCGGAGAAGAGAGCCGTCGAATGGTGTGGTACGAAGGGAAACATGCCGTACTATG
AAACCTCTGCAAAGGAAAATATCAATGTGGATGAAGCTTTTTTGGGTGTTGCACACGAAG
CTCTCTCCAATGAACATAAACAAGACTACATATATTCCAGAGACATATCTGCATCTGTTG
CAGACATTCTTGAGGAGCCGTCAAGACCAGGCTGCTCTTGCCGATTCATAATTAACATAT
CTGATCAATAATATCGATTCCAAGCTCTTCTGTTTCAATCTTTGTCTTTTTATTTTATTA
TTATATGTTGGTTAATATCAATTATTGCGGTTTAGTAACAAAAAAACTGGTACATGCAAC
GACCTGAGTGTTTTGGTTCATGTGTAGCATTCTATTTAATTTTGTTCATGTTATTGTTGA
TACATTCAAACGATCAAAATCATTTGGAACATTCGATTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4DN94JQ 265 0 0
GAGCCGTCAAGACCAGGCTGCTCTTGCCGATTCATAATTAACATATCTGATCAATAATAT
CGATTCCAAGCTCTTCTGTTTCAATCTTTGTCTTTTTATTTTATTATTATATGTTGGTTA
ATATCAATTATTGCGGTTTAGTAACAAAAAAACTGGTACATGCAACGACCTGAGTGTTTT
GGTTCATGTGTAGCATTCTATTTAATTTTGTTCATGTTATTGTTGATACATTCAAACGAT
CAAAATCATTTGGAACATTCGATTT

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR4CG18JQ 107 0 0
CATGCAACGCCCTGAGTGTTTTGGTTCATGTGTAGCATTTTATTTAATTTTGTTCATGTT
ATTGTTGATACATTCAAACAATCAAAATCATTTGGAACATTGGATTT

QA 1 107 1 107
DS 



AS 1 6

CO CL1490Contig1 1024 6 5 U
CAAATTAAAAAGTGGTCAATGTTGATTCACAAGCTGTAAAGTCAAGTTATTCTGGTTAAA
CAGATTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTCTTAAAATATTGAATTAGCCTTATTTCTGGAG
TGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAGCTCAACCGTTCGTATACTCTTA
GCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGGTTTTGATGGTGTTCCCACGGATG
TACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTAAATGGAGGATATAGCTCAAAGTATTGGTTTACTGTC
AATTTTGACGCAATCTTTCCTTGGTCACCACTACATTTTTTGTATTCTTCTAGACTTTTT
GGTAACCTCTTTTTGCAAAATCGTTCTTGATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTA
CCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGATCTTTT
TCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGAAGTCA
TGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTT
CGTTCTACGTTTTTCATAAGGTCGCGCCACTTCTTCTCATCAAAAAACGAACTGCCCCAT
GCATCAGTCAACCATAAGAAGGTTTGTTGAGGCGCGGCTCCTATGGTCACTTCTAAGTTC
ATATGGTAAACACCCTTCTTTGTTGTCACCTTGACCTTGGGAGGGGGACTATGCCAAGGA
TGCTTCTTCTCTTCGTCATACCAAAGTATATGTTCTATCATCTCCTGTTTTTCATCATAA
ACATATTCTTTCTTCTTCTTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCTTCCTCTGACACC
GACTTAGATTCGTCATTTTCAGATCTCTTGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAGTGTTC
TTACTGATCCAGCTACCAAATCCAGGGAATATACCCATTTTCTATTACCTGAGAGCAAGA
GTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4BT33JQ U 5
AF RR4FZ51JQ U 1
AF RR4G507JQ U 376
AF RR4G507TF C 376
AF RR4FZ51TF C 356
AF RR4BT33TF C 254
BS 1 706 RR4FZ51JQ
BS 707 906 RR4G507JQ
BS 907 907 RR4BT33TF
BS 908 1012 RR4G507JQ
BS 1013 1024 RR4BT33TF

RD RR4BT33JQ 643 0 0
TTAAAAAGTGGTCAATGTTGATTCACAAGCTGTAAAGTCAAGTTATTCTGGTTAAACAGA
TTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTCTTAAAATATTGAATTAGCCTTATTTCTGGAGTGCA
TCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAGCTCAACCGTTCGTATACTCTTAGCCG
TGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGGTTTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACC
AAGAAAGCGGAGGTAGATTAAATGGAGGATATAGCTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATT
TTGACGCAATCTTTCCTTGGTCACCACTACATTTTTTGTATTCTTCTAGACTTTTTGGTA
ACCTCTTTTTGCAAAATCGTTCTTGATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTACCTT
GGAACACTTTCATGAATATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGT
TTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAA
CCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTT
CTACGTTTTTCATAAGGTCGCGCCACTTCTTCTCATCAAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4FZ51JQ 708 0 0
CAAATTAAAAAGTGGTCAATGTTGATTCACAAGCTGTAAAGTCAAGTTATTCTGGTTAAA
CAGATTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTCTTAAAATATTGAATTAGCCTTATTTCTGGAG
TGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAGCTCAACCGTTCGTATACTCTTA
GCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGGTTTTGATGGTGTTCCCACGGATG
TACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTAAATGGAGGATATAGCTCAAAGTATTGGTTTACTGTC
AATTTTGACGCAATCTTTCCTTGGTCACCACTACATTTTTTGTATTCTTCTAGACTTTTT
GGTAACCTCTTTTTGCAAAATCGTTCTTGATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTA
CCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGATCTTTT
TCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGAAGTCA
TGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTT
CGTTCTACGTTTTTCATAAGGTCGCGCCACTTCTTCTCATCAAAAAACGAACTGCCCCAT
GCATCAGTCAACCATAAGAAGGTTTGTTGAGGCGCGGCTCCTATGG
CC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4G507JQ 646 0 0
CAC
AATCGTTCTTGATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATG
AACATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATG
AGATGTAACGGGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTC
ACCTTGATGACCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCATA
AGGTCGCGCCACTTCTTCTCATCAAAAAACGAACTGCCCCATGCATCAGTCAACCATAAA
AAGGTTTGTTGAGGCGCGGCTCCTATGGTCACTTCTAAGTTCATATGGTAAACACCCTTC
TTTGTTGTCACCTTGACCTTGGGAGGGGGACTATGCCAAGGATGCTTCTTCTCTTCGTCA
TACCAAAGTATATGTTCTATCATCTCCTGTTTTTCATCATAAACATATTCTTTCTTCTTC
TTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCTTCCTCTGACACCGACTTAAATTCGTCATTT
TCAGATCTCTTGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAGTGTTCTTACTGATCCAGCTACCA
AATCCAGGGAATATACCCATTTTCTATTACCTGA
TGAGAGCCC

QA 4 637 4 637
DS 

RD RR4G507TF 646 0 0
CAC
AATCGTTCTTGATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATG
AACATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTT*CTTCCACAATG
AGATGTAACGGGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTC
ACCTTGATGACCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCATA
AGGTCGCGCCACTTCTTCTCATCAAAAAACGAACTGCCCCATGCATCAGTCAACCATAAG
AAGGTTTGTTGAGGCGCGGCTCCTATGGTCACTTCTAAGTTCATATGGTAAACACCCTTC
TTTGTTGTCACCTTGACCTTGGGAGGGGGACTATGCCAAGGATGCTTCTTCTCTTCGTCA
TACCAAAGTATATGTTCTATCATCTCCTGTTTTTCATCATAAACATATTCTTTCTTCTTC
TTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCTTCCTCTGACACCGACTTAGATTCGTCATTT
TCAGATCTCTTGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAGTGTTCTTACTGATCCAGCTACCA
AATCCAGGGAATATACCCATTTTCTATTACCTGA
TGAGAGCCC

QA 4 637 4 637
DS 

RD RR4FZ51TF 666 0 0
TTTTTGGTAAC*TCTTTTTGCAAAATCGTTCTTGATCTATATATATAGGCTCCACTTTAA
AGTTACCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGAT
CTTTTTCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGA
AGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAA
CCTTTCGTTCTACGTTTTTCATAAGGTCGCGCCACTTCTTCTCATCAAAAAACGAACTGC
CCCATGCATCAGTCAACCATAAGAAGGTTTGTTGAGGCGCGGCTCCTATGGCCACTTCTA
AGTTCATATGGTAAACACCCTTCTTTGTTGTCACCTTGACCTTGGGAGGGGGACCATGCC
AAGGATGCTTCTTCTCTTCGTCATACCAAAGTATATGTTCTATCATCTCCTGTTTTTCAT
CATAAACATATTCTTTCTTCTTCTTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCTTTCTCTG
ACACCGACTTAGATTCGTCATTTTCAGATCTCTTGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAG
TGTTCTTACTGATCCAGCTACCAAATCCAGGGAATATACCCATTTCCTATTACCTGA
GAGCAAGCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4BT33TF 771 0 0
CGGAGGTAGATAAAT
GAGGATATAGCTCAAAGTATTG*TTTACTGTCAATTT*GACGCA*TCTTTCTTTG*TCAC
CACTACATTTTTTGTAT*CTTCTAGACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCAAAATCGTTCTT
GATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTACCTTGGAACACTTTCATGAATATTACTT
TCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACG
GGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGA
CCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCATAAGGTCGCGCC
ACTTCTTCTCATCAAAAAACGAACTGCCCCATGCATCAGTCAACCATAAGAAGGTTTGTT
GAGGCGCGGCTCCTATGGTCACTTCTAAGTTCATATGGTAAACACCCTTCTTTGTTGTCA
CCTTGACCTTGGGAGGGGGACCATGCCAAGGATGCTTCTTCTCTTCGTCATACCAAAGTA
TATGTTCTATCATCTCCTGTTTTTCATCATAAACATATTCTTTCTTCTTCTTGTTAGCAG
GAGCATTATTATTAGTGTCTTTCTCTGACACCGACTTAGATTCGTCATTTTCAGATCTCT
TGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAGTGTTCTTACTGATCCAGCTACCAAATCCAGGGA
ATATACCCATTTCCTATTACCTGAGAGCAAGAGTCC

QA 16 771 16 771
DS 



AS 1 6

CO CL1491Contig1 698 6 2 U
TTTTTTTGTCTGTTGCCATTTTTGAGCTTATCGTCACCCAGAAAGGGTAGATATGTTTAG
AAGACGATACATACAAGTGGAAATAAAAGGCATTATCAAGAAAAACACAATCAATCACAG
AGACAGAGAAAAAGAAGCTTTTGAGATTTACAATTTAGAGATCAATTTGAGAGGGTCTGA
TGCATCTTTGACGTGATCAAGGACAGGAAGATTACAGAGGAGTGTGACTCTAGAGGAAGA
TATTAAGGTTCTGTTCTCTGACCCTTCCTTTGACTTCCACAGCTTAACTTCCCAAACCTG
AATAGTCTTTCCTGTACTCATAGGAGATGCTTCGGCGAAGACAAGGTCTCCGAGATCAGC
ACTCTTTATATGGTTGATCGATAGTTGAATCCCAGCGACCCTTTTGAAGCCAGAAGCCAT
GTGAGCTCCCATACTTGCTAAAGACTCCGCGATCAGAGCAGATACACCACCGTGTAACAC
CTTGAAAGGCTGGCAGCAGATTGGAGAGACGGGAAGACGACCTGTGACACGTGTAGGAGA
TAACTCATCGATCTCGAAACCTAATGCGTAGAGCGGAGGGTCTAAAGCTTTGGTCTTGGA
CGATGCAGAAACCATTTTGTGTTCCTCTGTTTCAGAGAAAGAGAGAGGAGGTTAGGTGGG
TGAAGTTCTAAAAGATGATAAGAGAGGTTGAGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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AF RR4E069TF C 1
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AF RR4EO41JQ U 72
AF RR4EO41TF C 72
AF RR4DT56TF C 43
AF RR4E069JQ U 8
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BS 8 698 RR4DT56JQ

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CGATGCAGAAACCATTTTGTGTTCCTCTGTTTCAGAGAAAGAGAGAGGAGGTTAGGTGGG
TGAAGTTCTAAAAGATGATAAGAGAGGTTGAGAAAAAA

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GAAAAAGAAGCTTTTGAGATTTACAATTTAGAGATCAATTTGAGAGGGTCTGATGCATCT
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GTTCTGTTCTCTGACCCTTCCTTTGACTTCCACAGCTTAACTTCCCAAACCTGAATAGTC
TTTCCTGTACTCATAGGAGATGCTTCGGCGAAGACAAGGTCTCCGAGATCAGCACTCTTT
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CCCATACTTGCTAAAGACTCCGCGATCAGAGCAGATACACCACCGTGTAACACCTTGAAA
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DS 

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CT
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GATGATAAGAGAGGTTGAGAAAAAA

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DS 

RD RR4EO41TF 627 0 0
CT
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TGATCAGGGACAGGAAGATTACAGAGGAGTGTGACTCTAGAGGAAGATATTAAGGTTCTG
TTCTCTGACCCTTCCTTTGACTTCCACAGCTTAACTTCCCAAACCTGAATAGTCTTTCCT
GTACTCATAGGAGATGCTTCGGCGAAGACAAGGTCTCCGAGATCAGCACTCTTTATATGG
TTGATCGATAGTTGAATCCCAGCGACCCTTTTGAAGCCAGAAGCCATGTGAGCTCCCATA
CTTGCTAAAGACTCCGCGATCAGAGCAGATACACCACCGTGTAACACCTTGAAAGGCTGG
CAGCAGATTGGAGAGACGGGAAGACGACCTGTGACACGTGTAGGAGATAACTCATCGATC
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GATGATAAGAGAGGTTGAGAAAAAA

QA 3 627 3 627
DS 

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TACACCACCGTGTAACACCTTGAAAGGCTGGCAGCAGATTGGAGAGACGGGAAGACGACC
TGTGACACGTGTAGGAGATAACTCATCGATCTCGAAACCTAATGCGTAGAGCGGAGGGTC
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QA 1 656 1 656
DS 

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GAAAAAGAAGCTTTTGAGATTTACAATTTAGAGATCAATTTGAGAGGGTCTGATGCATCT
TTGACGTGATCAAGGACAGGAAGATTACAGAGGAGTGTGACTCTAGAGGAAGATATTAAG
GTTCTGTTCTCTGACCCTTCCTTTGACTTCCACAGCTTAACTTCCCAAACCTGAATAGTC
TTTCCTGTACTCATAGGAGATGCTTCGGCGAAGACAAGGTCTCCGAGATCAGCACTCTTT
ATATGGTTGATCGATAGTTGAATCCCAGCGACCCTTTTGAAGCCAGAAGCCATGTGAGCT
CCCATACTTGCTAAAGACTCCGCGATCAGAGCAGATACACCACCGTGTAACACCTTGAAA
GGCTGGCAGCAGATTGGAGAGACGGGAAGACGACCTGTGACACGTGTAGGAGATAACTCA
TCGATCTCGAAACCTAATGCGTAGAGCGGAGGGTCTAAAGCTTTGGTCTTGGACGATGCA
GAAACCATTTTGTGTTCCTCTGTTTCAGAGAAAGAGAGAGGAGGTTAGGTGGGTGAAGTT
CTAAAAGATGATAAG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

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GCAACGCTCTAGCTCCTCCGGAGAACCAAATTCCGTCGTAAGTCTTATCAGGATGAGTAA
CGAACTTCTCGACATCGATCCTATCGACCTTCAATTCCCTTTTGAATTGAAGAAGCAGAT
CTCTTCGTCTCTCTATCTGGCTAACAAAACCGACAATTATGTCGCCTTCAAGGTTAAAAC
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CTATGTTGATCCACCACGGCCACCATCACCCGTTCGTGAAGGATCGGAAGAGGGCTCTTC
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TCTTCTGGTGGGATTAATCGGTCTAATCTTGGGATACATCATGAAGAGGACATGATCACG
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AAGACATGAAAAAAAAGAAAAATCAAATTGTGTCGGAAAGGACATTCAGTCTTCTCTCTT
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TTTTCAGCGTGTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4AI39TF U 1
AF RR4AI39JQ C 309
AF RR4GE74TF U 905
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GCAAGGACAAGTTCTTACTTCAGTGTGTTATCGCCAGTCCCGGAGCCACTGCCAAGGAAG
TTACTCCTGAGATGTTTGGCAAAGAGGCAGGGCATCGAGTTAAGGAGACTAAATTGAGAG
TTGTCTATGTT

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DS 

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GCAACGCTCTAGCTCCTCCGGAGAACCAAATTCCGTCGTAAGTCTTATCAGGATGAGTAA
CGAACTTCTCGACATCGATCCTATCGACCTTCAATTCCCTTTTGAATTGAAGAAGCAGAT
CTCTTCGTCTCTCTATCTGGCTAACAAAACCGACAATTATGTCGCCTTCAAGGTTAAAAC
GACGAATCCGAAGAAGTGTTGTGTTAGGCCTAACACTGGTGTTGTTCTTCCGAGATCCCC
TTCCGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAAAAGGAAGCTCCTGCTGATATGCAGTGCAA
GGACAAGTTCTTACTTCAGTGTGTTATCGCCAGTCCCGGAGCCACTGCCAAGGAAGTTAC
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CTATGTTGATCCACCACGGCCACCATCACCCGTTCGTGAAGGATCGGAAGAGGGCTCTTC
TCCTAGAGCTTCTGTCTCTGACAGTGCCAACGTTTCTGATTTTACTGCTGCTCCAAGATT
TAGCGTGGACAGGCTTGAACCTCAGGAAAACTCATCTGAGGCGAGAGCTCTCATCACAAG
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GCAGTTGAAGCGTGAAA

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ATAAAACAAACCCACCCCCACAAAGTCTCAAAAGTAGCTCGGACAAACCAAAAAGACATG
AAAAAAAAGAAAAATCAAATTGTGTCGGAAAGGACATTCAGTCTTCTCTCTTGTCTTGTC
GTCGTCAGTTCACCTTTGGTTGAATCTTGAACTCTAGTTGCATTAGAGAATTGTTAATTA
CGGTTTATCATAAGACTTAGAATTTCCATCCTTTTGTAATCAAGAAGACATTTTTTC

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DS 

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GGAA
AAAAAAAAGAAAAATCAAATTGTGTCGGAAAGGACATTCAGTCTTCTCTCTTGTCTTGTC
GTCGTCAGTTCACCTTTGGTTGAATCTTGAACTCTAGTTGCATTAGAGAATTGTTAATTA
CGGTTTATCACAAGACTTAGAATTTCCATCCTTTTGTAATCAAGAAGACATTTTTTCAGC
GTGTT

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DS 



AS 1 6

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AACTGGCTACCTTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACAATGTGACTAAGTACATCTACGCAAC
AGCTTCTATAAAGCTACCGCTCTGTTTCATCGTCAGGTCTTTGTCGAAGAAAGCATCACG
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AGGGAGGAGAGACATTGTTGTAGCTTGGAGAGGAACTCTTCAGCCGTATGAATGGGCTAA
CGACTTCGATTTTCCTCTCGAGTCAGGTGTCAAAGTTTTCCCTGTGACCGACACCAAACA
CGTGCCTCGTATTGGAAGTGGCTGGCTTGATGTTTATACAGCTTCTGATGCTATGTCTCC
TTATGACACGAGTAGCGCACGTGAACAGGTACAAGCAGAGCTCAAGAGACTGCTAGAAGT
ATACAAGAACGAAGAAGTAAGCATCACTTTCACAGGCCACAGCTTGGGAGGAGTAATGTC
AACTCTAGCAGCTGCAGATCTTGTCCACAGCAGGAAAAACAAGATCGAAGCAGGTCTTCA
AAGCAAACAAGTTCCCATCACGGTTTTTGCATTCGGGTGTCCTCGAATCGGGGACCAAGA
CTTCAAAAGAACAGTCAACTCACACAAAGACCTAAACATCCTAAGAATAGTAAACGTTCC
GGACGTCGCACCGAACTATCCACTCTTCCTGTATGCAGAAGTAGGCGAGGTGCTGCAGAT
CAATACGCTGAACTCGACTTACCTCAAACGGTTTCTGAACTGGAGGAACTACCATAACCT
GGAGATATACCTTCACGGGATAGCAGGGATGCAAGACAAATCCGGGGTGTTCAGACTGGA
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AGTGCCGAGTACGTGGAGGTGTCTTGCAAACAGCGGGATGGTTCAAATGGATGATGGGAC
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AAAAAAATCAATTAGAAGAAGAAAGAATCTAAGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BP33TF U 9
AF RR4F203TF U 1
AF RR4AZ44TF U 10
AF RR4AZ44JQ C 617
AF RR4BP33JQ C 656
AF RR4F203JQ C 830
BS 1 161 RR4F203TF
BS 162 162 RR4BP33TF
BS 163 262 RR4F203TF
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BS 1010 1010 RR4BP33JQ
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BS 1279 1375 RR4AZ44JQ
BS 1376 1417 RR4BP33JQ

RD RR4BP33TF 554 0 0
GGG
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TTCCTCTCGAG

QA 4 554 4 554
DS 

RD RR4F203TF 748 0 0
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GCGTCGCTACCTCATCCACTATGGCGAGATGGCTCAGGTTGGTTATGACGCCTTTAACTG
GGACCGTAAGTCCGAATACTGCAGTGATTGTTATTACCCCAAGAGTCAAATCCACGCTCG
AACCGGCTACCTTAAAGCCAATCCTTTCAGGTACAATGTGACTAAGTACATCTACGCAAC
AGCTTCTATAAAGCTACCGCTCTGTTTCATTGTCAAGTCTTTGTCGAAGAAAGCGTCACG
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AGGGAGGAGAGACATTGTTGTAGCTTGGAGAGGAACTCTTCAGCCGTATGAATGGGCTAA
CGACTTCGATTTTCCTCTCGAGTCAGGTGTCAAAGTTTTCCCTGTGACCGACACCAAACA
CGTGCCTCGTATTGGAAGTGGCTGGCTTGATGTTTATACAGCTTCTGATGCTATGTCTCC
TTATGACACGAGTAGCGCACGAGAACAGGTACAAGCAGAGCTCAAGAGACTGCTAGAAGT
ATACAAGAACGAAGAAGTAAGCATCACT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4AZ44TF 842 0 0
GG
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GTGGCCAAAACAAATGGAAAGGCCTGCTTGATCCACTTGACTCCGACTTGCGTCGCTACC
TCATCCACTATGGCGAGATGGCTCAGGTTGGTTATGACGCCTTTAACTGGGACCGTAAGT
CCGAATACTGCGGTGATTGTTATTACCCCAAGAGTCAAATCCACGCTCGAACTGGCTACC
TTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACAATGTGACTAAGTACATCTACGCAACAGCTTCTATAA
AGCTACCGCTCTGTTTCATCGTCAGGTCTTTGTCGAAGAAAGCATCACGCGTGCAGACTA
ACTGGATGGGTTACATTGCGGTCGCTACAGACGAGGGAAAGGCGATGCTAGGGAGGAGAG
ACATTGTTGTAGCTTGGAGAGGAACTCTTCAGCCGTATGAATGGGCTAACGACTTCGATT
TTCCTCTCGAGTCAGGTGTCAAAGTTTTCCCTGTGACCGACACCAAACACGTGCCTCGTA
TTGGAAGTGGCTGGCTTGATGTTTATACAGCTTCTGATGCTATGTCTCCTTATGACACGA
GTAGCGCACGTGAACAGGTACAAGCAGAGCTCAAGAGACTGCTAGAAGTATACAAGAACG
AAGAAGTAAGCATCACTTTCACAGGCCACAGCTTGGGAGGAGTAATGTCAACTCTAGCAG
CTGCAGATCTTGTCCACAGCAG*AAAAACAAGATCGAAGCAG*TCTTCAAAGCAAACAAG

QA 3 842 3 842
DS 

RD RR4AZ44JQ 759 0 0
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GCACGTGAACAGGTACAAGCAGAGCTCAAGAGACTGCTAGAAGTATACAAGAACGAAGAA
GTAAGCATCACTTTCACAGGCCACAGCTTGGGAGGAGTAATGTCAACTCTAGCAGCTGCA
GATCTTGTCCACAGCAGGAAAAACAAGATCGAAGCAGGTCTTCAAAGCAAACAAGTTCCC
ATCACGGTTTTTGCATTCGGGTGTCCTCGAATCGGGGACCAAGACTTCAAAAGAACAGTC
AACTCACACAAAGACCTAAACATCCTAAGAATAGTAAACGTTCCGGACGTCGCACCGAAC
TATCCACTCTTCCTGTATGCAGAAGTAGGCGAG*TGCTGCAGATCAATACGCTGAACTCG
ACTTACCTCAAACGGTCTCTGAACTGGAGGAACTACCATAACCTGGAGATATACCTTCAC
GGGATAGCAGGGATGCAAGACAAATCCGGGGTGTTCAGACTGGAGATTGGTCGGGATGTT
TCGTTGGTCAATAAAGGGTTGGATGCTCTGAAGGATAAGTACTTAGTGCCGAGTACGTGG
AGGTGTCTTGCAAACAGCGGGATGGTTCAAATGGATGATGGGACATGGAAGCTGGATGTA
CCCAGGTATGAAGATGATGATGATGATGACTCCACAAATAAGTAACAAGTTCAGTTACAA
AACACTTTTATAATGTTCCGGACAATATGTTTGTAATTG

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GTCT
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AAAGCAAACAAGTTCCCATCACGGTTTTTGCATTCGGGTGTCCTCGAATCGGGGACCAAG
ACTTCAAAAGAACAGTCAACTCACACAACGACCTAAACATCCTAAGAATAGTAAACGTTC
CGGACGTCGCACCGAACTATCCACTCTTCCTGTATGCAGAAGTAGGCGAGGTGCTGCAGA
TCAATACGCTGAACTCGACTTACCTCAAACGGTTTCTGAACTGGAGGAACTACCATAACC
TGGAGATATACCTTCACGGGATAGCAGGGATGCAAGACAAATCCGGGGTGTTCAGACTGG
AGATTGGTCGGGATGTTTCGTTGGTCAATAGAGGGTTGGATGCTCTGAAGGATAAGTACT
TAGTGCCGAGTACGTGGAGGTGTCTTGCAAACAGCGGGATGGTTCAAATGGATGATGGGA
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CAAAAAAATCAATTAGAAGAAGAAAGAATCTAAGGGCC

QA 5 762 5 762
DS 

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GGGGACCAAGACTTCAAAAGAACAGTCAACTCACACAAAGACCTAAACATCCTAAGAATA
GTAAACGTTCCGGACGTCGCACCGAACTATCCGCTCTTCCTGCATGCAGAAGTAGGCGAG
GTGCTGCAGATCAATACGCTGAACTCGACTTACCTCAAACGGTTTCTGAACTGGAGGAAC
TACCATAACCTGGAGATATACCTTCACGGGATAGCAGGGATGCAAGACAAATCCGGGGTG
TTCAAACTGGAGATTGGTCGGGATGTTTCGTTGGTGAATCAAGGGTTGGATGCTCTGAAG
GATAAGTACTTAGTGCCGAGTACGTGGAGGTGTCTTGCAAACAGCGGGATGGTTCAAATG
GATGATGGGACATGGAAGCTGGATGTCCACGGGTATGTAGATGATGATGGTGATGACTCC
ACAAATAAGTAACAAGTTCAGTTACAAAACACTTTTATAATGTTCCGGACAATATGTTTG
TAATTGTACACAAAAAAATCAATTAGAAGAAGAAAGAATCTAAGGGCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 4

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GGCTGGAAAGAGTTTTCATACAAACAAAGATACTACTAGCTTGTCCTTTGTTGTCATGAG
ACATTTGCGTAAATTTTAAAAAACTATTCAAACACACAAACTTGACACATTACATGTAAG
CAGATGTGGTTTATGGGGAAGGAACCCTCTCATCATTCCTCACCATCTTTGTCTTCTTCG
TCATCATCTTCATCAGAGTCACCTTCTTTCCCCTCCTCATCATCATCATCCTCATCACCA
TCATCAAAATCCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTGGGCAATAAA
TCTTCCTTGATGACATCCGCAACCTGCTCGTCGTTAATCTCTAAATCAA*GGTCCTCCTT
GTGTTGCGCATCGCTAAACCAGGTAAA*GAAACTCTCTTCAGGTAATGCACGTTTGTTTC
CGTTCTTCTCCTGACTCACTCCATTTGGCAAGCCCTTGCCCTCTTTCCACCTGATAGGTG
TGGCTGTGATTTTGGTGCTCCCTTCTTCGAGGAAGGTAAAAGTCTTGGTGAGTTTCTCAT
CCTCAAAGTAGGGGTTGGGATTGAAGTGAAAAGTGATGGAGTATCCAGACTTCACATCTT
TGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTAAGATATTTGAAAACCTTTTGGTCTTCTTCTGTCA
AAAGCTCGCCTAAAGCAGGGTGGCTCAAGAAAGCAGTGAGCCAAAAATCAGGGATGGCTT
TGATGATCTCGTTACGCTTGTCATAAACAGGCTTCCTTATCACGTTGTACTTCTGTTCCA
CTTCCAAGACTTCATCGCTAGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGGATCTCCT
GAAGCTTCTCGATCGAGAGGACAAGCTCTTCATCGATCTGCTCGACGTTTTCCTCTTCAA
TTTTCGCCTTCTTGTTCTTGTCCGCCACCATTTTCACTTCTTTTTGAGGAAACCCTAATC
GAAGAGGTATCGACTCCTCCCTCTCCCTCTCCTTCTGTCCGAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT14JQ U 129
AF RR4D840JQ U 1
AF RR4GH04JQ U 18
AF RR4AT14TF C 209
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QA 1 707 1 707
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CGCAACCTGCTCGTCGTTAATCTCTACATCAA*GGTCCTCCTTGTGTTGCGCATCGTTAA
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CTAGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGGATCT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4AT14TF 799 0 0
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CGTCGTTAATCTCTAAATCAAAGGTCCTCCTTGTGTTGCGCATCGCTAAACCAGGTAAAA
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CAAGCCCTTGCCCTCTTTCCACCTGATAGGTGTGGCTGTGATTTTGGTGCTCCCTTCTTC
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GTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGGATCTCCTGAAGCTTCTCGATCGAGAGGACAAGCTC
TTCATCGATCTGCTCGACGTTTTCCTCTTCAATTTTCGCCTTCTTGTTCTTGTCCGCCAC
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CTCCTTCTGTCCGAAGACC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 6

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GAAAAAACTATAACATACCGAAATAAATAAGATCATCACAATATAGTGACACCGCCACCA
ACAGTTTCAAAACTAATCTTTTGACACTGAGTCACCATAACCGCCTGGTTCACCATAATA
TGCACACAAAATGTAATATAAATAGGGGTCTAAAAGACACCTCCTGGGACGGCATTGGGG
TTGGCCTGTGGAGTGACAGAGACGAATGGATTGATCCTGACCCAAAGCAACGAAAAGATG
GAGGCGAGAAGAACAGACCAGACAATGACGATGGTTGGCGTTCTGTTCTGTCTTCCCAGT
AGACCTTTCAAGAACGGGTAGAGATGGGCAATGACCCATAAGGCAAAGAAAAGCTTCCCA
AAGAGCGGACCCCATGACTGGTACCCGCTGTTCACAGCATAAGAGACACCAGCCACAATG
CCTATGAGGTTCACAACTAGGACAGTGGTTGGTGGAATGAGAAGAGCTGTCCATTTGAAG
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GTGTCGATACCGGCTAGTACCTTGAGTAGACCTTGGAAGACAGCAAAAAGATGGGCAGAT
GTGCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACACCACTC
CATCTCAGCTCCAGGATTCCAGTCACAGCAATAGAGATAAAGAGTAGAATAAACCAAATA
CTCGCGTAGTTGCTTATCTCAGGTATGATGAACTTGTCGGTGATGAGGCAAAAAGCTGGA
AGGATACAATAGGCGATGAGAGGGAGAGCTGTAATAGGGTAGACAATGGTGTTGATGTAA
GCGAGCCTCTCCAAAAGTCTCAACCTTCCTGTATAGCCATACCAGATGGGGCAATGTATG
CTCAAAAGAATCTCGATAGATCCCAGTGCCCATCGAAGAACTTGGTTCAAACGATCAGAA
AGATTGATTGGTGCAGATCCCTTGAAGGCAGGTCGTGGAGGATTGCAGTAGATAGACATC
CAACCACGGGCATGCATCTTGAACCCAGTAAGAATATCTTCTGTCACTGAACCGTAGATC
CAACCAATCTCTTTTCCCCATTCACTCTTGTCCTCGTAACCACAGCTTATAACATGAATA
GCCTCCTTGAGAAGAGTAGCTGGATTGGTTGTTGGTGGAATGCCACCTTGTTCCATGAAG
GTGGCCGCAATAAATACTGGCGACTGACCAAAACGCTTCTCCACACTCTTCTGGGACATT
AGAATAGACCTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD20JQ U 1
AF RR4AQ21JQ U 5
AF RR4C155JQ U 2
AF RR4AQ21TF C 83
AF RR4GD20TF C 373
AF RR4B748TF C 535
BS 1 116 RR4GD20JQ
BS 117 117 RR4AQ21JQ
BS 118 218 RR4GD20JQ
BS 219 219 RR4AQ21JQ
BS 220 579 RR4GD20JQ
BS 580 580 RR4AQ21JQ
BS 581 769 RR4GD20JQ
BS 770 770 RR4C155JQ
BS 771 771 RR4AQ21TF
BS 772 777 RR4C155JQ
BS 778 778 RR4AQ21TF
BS 779 796 RR4C155JQ
BS 797 846 RR4AQ21TF
BS 847 847 RR4GD20TF
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BS 852 852 RR4GD20TF
BS 853 865 RR4AQ21TF
BS 866 1141 RR4GD20TF
BS 1142 1332 RR4B748TF

RD RR4GD20JQ 769 0 0
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GAAAAAACTATAACATACCGAAATAAATAAGATCATCACAATATAGTGACACCGCCGCCA
ACAGTTTCAAAACTAATCTTTTGACACTGAGTCACCATAACCGCCTGGTTCACCATAATA
TGCACACAAAATGTAATATAAATAGGGGTCTAAAAGACGCCTCCTGGGACGGCATTGGGG
TTGGCCTGTGGAGTGACAGAGACGAATGGATTGATCCTGACCCAAAGCAACGAAAAGATG
GAGGCGAGAAGAACAGACCAGACAATGACGATGGTTGGCGTTCTGTTCTGTCTTCCCAGT
AGACCTTTCAAGAACGGGTAGAGATGGGCAATGACCCATAAGGCAAAGAAAAGCTTCCCA
AAGAGCGGACCCCATGACTGGTACCCGCTGTTCACAGCATAAGAGACACCAGCCACAATG
CCTATGAGGTTCACAACTAGGACAGTGGTTGGTGGAATGAGAAGAGCTGTCCATTTGAAG
ATGTAAAGCTCTGCGAAATCCCCATCTTCGTCCGAGGCTCTGGATGTGACAGTGAAGTTA
GTGTCGATACCGGCTAGTACCTTGAGTAGACCTTGGAAGACAGCAAAAAGATGGGCAGAT
GTGCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACACCACTC
CATCTCAGCTCCAGGATTCCAGTCACAGCAATAGAGATAAAGAGTAGAA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4AQ21JQ 717 0 0
AGATGAATAACAATTATATTATGTATCATTTGGTTTCCACATCATCATCTCCACTGGAAA
AAACTATAACATACCGAAATAAATAAGATCATCACAATATAGTGACACCGCCACCAACAG
TTTCAAAACTAATCTTTTGACACTGAGTCACCATAACCGCCTGGTTCACCATAATATGCA
CACAAAATGTAATATAAATAGGGGTCTAAAAGACACCTCCTGGGACGGCATTGGGGTTGG
CCTGTGGAGTGACAGAAACGAATGGATTGATCCTGACCCAAAGCAACGAAAAGATGGAGG
CGAGAAGAACAGACCAGACAATGACGATGGTTGGCGTTCTGTTCTGTCTTCCCAGTAGAC
CTTTCAAGAACGGGTAGAGATGGGCAATGACCCATAAGGCAAAGAAAAGCTTCCCAAAGA
GCGGACCCCATGACTGGTACCCGCTGTTCACAGCATAAGAGACACCAGCCACAATGCCTA
TGAGGTTCACAACTAGGACAGTGGTTGGTGGAATGAGAAGAGCTGTCCATTTGAAGATGT
AAAGCTCTGCGAAATCCCCATCTTCGTCCGAGGCTTTGGATGTGACAGTGAAGTTAGTGT
CGATACCGGCTAGTACCTTGAGTAGACCTTGGAAGACAGCAAAAAGATGGGCAGATGTGC
CACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACACCACTCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4C155JQ 795 0 0
GCA
AGATGAATAACAATTATATTATGTATCATTTGGTTTCCACATCATCATCTCCACTGGAAA
AAACTGTAACATACCGAAATAAATAAGATCATCACAACA**GTGACACAGCCACCAACAG
TTTCAAAACTAATCTTTTGACACTGAGTCACCATAACCGCCAGGTTCACCATAATATGCA
CACAAAATGTAATATAAATAGGGGTCTAAAAGACACCTCCTGGGACGGCATTGGGGTTGG
CCTGTGGAGTGACAGAGACGAATGGATTGATCCTGACCCAAAGCAACGAAAAGATGGAGG
CGAGAAGAACAGACCACACAATGACGATGGTTGGTGTTCTGTTCTGTCTTCCCAGTAGAC
CTTTCAAGAACGGGTAGAGATGAGCAATGACCCATAAGGCGAAGAAAAGCTTCCCAAAGA
GCGGACCCCATGACTGGTACCCGCTGTTCACAGCATAAGAGACACCAGCCACAATGCCTA
TGAGGTTCACAACTAGGACAGTGGTTGGTGGAATGAGAAGAGCTGTCCATTTAAAGATGT
AAAGCTCCGCGAAATCCCCATCTTCGTCAGAGGCTTTGGATGTGACAGTGAAGTTAGTGT
CGATACCGGCAAGTACCTTGAGTAGACCTTGGAAGACTGCAAAAAGATGAGCAGATGTGC
CACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACACCACTCCATC
TCAGCTCCAGGATTCCAGTCACAGCAATAGAGATAAAGAGTAGAATGAACCAA*TACTCG
CGTAGTTGCTTA

QA 4 795 4 795
DS 

RD RR4AQ21TF 784 0 0
ATAAATAAGATCATCACAATATAGTGACACCGCCACCAACAGTTTCAAAACTAATCTTTT
GACACTGAGTCACCATAACCGCCTGGTTCACCATAATATGCACACAAAATGTAATATAAA
TAGGGGTCTAAAAGACACCTCCTGGGACGGCATTGGGGTTGGCCTGTGGAGTGACAGAGA
CGAATGGATTGATCCTGACCCAAAGCAACGAAAAGATGGAGGCGAGAAGAACAGACCAGA
CAATGACGATGGTTGGCGTTCTGTTCTGTCTTCCCAGTAGACCTTTCAAGAACGGGTAGA
GATGGGCAATGACCCATAAGGCAAAGAAAAGCTTCCCAAAGAGCGGACCCCATGACTGGT
ACCCGCTGTTCACAGCATAAGAGACACCAGCCACAATGCCTATGAGGTTCACAACTAGGA
CAGTGGTTGGTGGAATGAGAAGAGCTGTCCATTTGAAGATGTAAAGCTCTGCGAAATCCC
CATCTTCGTCCGAGGCTTTGGATGTGACAGTGAAGTTAGTGTCGATACCGGCTAGTACCT
TGAGTAGACCTTGGAAGACAGCAAAAAGATGGGCAGATGTGCCACCGATGACCCAGAACT
GCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACACCACTCCATCTCAGCTCCAGGATTCCAG
TCACAGCAATAGAGATAAAGAGTAGAATAAACCAAATACTCGCGTAGTTGCTTATCTCAG
GTATGATGAACTTGTCGGTGATGAGGCAAAAAGCTGGAAGGATAGAATATGCGATGAGAG
GGA
C

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4GD20TF 770 0 0
GAAC
GGTAGAGATG*GCAATGACCCATAAGGCAAAGAAA*GCTTCCCAAAGAGCGGACCCCATG
ACTG*TACCCGCTGTTCACAGCATAAGAGACACCAGCCACAATGCCTATGAGGTTCACAA
CTAGGACAGTGGTTGGTGGAATGAGAAGAGCTGTCCATTTGAAGATGTAAAGCTCTGCGA
AATCCCCATCTTCGTCCGAGGCTCTGGATGTGACAGTGAAGTTAGTGTCGATACCGGCTA
GTACCTTGAGTAGACCTTGGAAGACAGCAAAAAGATGGGCAGATGTGCCACCGATGACCC
AGAACTGCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACACCACTCCATCTCAGCTCCAGGA
TTCCAGTCACAGCAATAGAGATAAAGAGTAGAATAAACCAAATACTCGCGTAGTTGCTTA
TCTCAGGTATGATGAACTTGTCGGTGATGAGGCAAAAAGCTGGAAGGATACAATAGGCGA
TGAGAGGGAGAGCTGTAATAGGGTAGACAATGGTGTTGATGTAAGCGAGCCTCTCCAAAA
GTCTCAACCTTCCTGTATAGCCATACCAGATGGGGCAATGTATGCTCAAAAGAATCTCGA
TAGATCCCAGTGCCCATCGAAGAACTTGGTTCAAACGATCAGAAAGATTGATTGGTGCAG
ATCCCTTGAAGGCAGGTCGTGGAGGATTGCAGTAGATAGACATCCAACCACGGGCATGCA
TCTTGAACCCAGTAAGAATATCTTCTGTCACTGAACCGTAGATCC
C

QA 5 769 5 769
DS 

RD RR4B748TF 798 0 0
TTGAAGATGTAAAGCTCTGCGAAATCCCCATCTTCGTCCGAGGCTTTGGATGTGACAGTG
AAGTTAGTGTCGATACCGGCTAGTACCTTGAGTAGACCTTGGAAGACAGCAAAAAGATGG
GCAGATGTGCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTCCTCCACCAGTCTTCAATGCTCACA
CCACTCCATCTCAGCTCCAGGATTCCAGTCACAGCAATAGAGATAAAGAGTAGAATAAAC
CAAATACTCGCGTAGTTGCTTATCTCAGGTATGATGAACTTGTCGGTGATGAGGCAAAAA
GCTGGAAGGATACAATAGGCGATGAGAGGGAGAGCTGTAATAGGGTAGACAATGGTGTTG
ATGTAAGCGAGCCTCTCCAAAAGTCTCAACCTTCCTGTATAGCCATACCAGATGGGGCAA
TGTCTGCTCAAAAGAATCTCGATAGATCCCAGTGCCCATCGAAGAACTTGGTTCAAACGA
TCAGAAAGATTGATTGGTGCAGATCCCTTGAAGGCAGGTCGTGGAGGATTGCAGTAGATA
GACATCCAACCACGGGCATGCATCTTGAACCCAGTAAGAATATCTTCTGTCACTGAACCG
TAGATCCAACCAATCTCTTTTCCCCATTCACTCTTGTCCTCGTAACCACAGCTTATAACA
TGAATAGCCTCCTTGAGAAGAGTAGCTGGATTGGTTGTTGGTGGAATGCCACCTTGTTCC
ATGAAGGTGGCCGCAATAAATACTGGCGACTGACCAAAACGCTTCTCCACACTCTTCTGG
GACATTAGAATAGACCTC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 2 5

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TAAACTTACCATCCACAAACTGAGCCAAGTCAAAAGAAGTGCTTACAACATAACACAAGA
AAGGATTTAAACTCAAAAGTCCACAAAATGAAACGAATTAAAAAGCAATGCAACACAACA
TAACACAATAGAGAGACTCTTATCAACTAGTTCTTGGGGATATTAACTCCGACGATCTTA
GCGGGAGTAATACGGAGGAGATTCCCAGGCTTACCAGGCAAAGCACCTTGGATCATAACA
ACATCCAACTCCTTATCAACCTTAACAATCCTAAGCTTCCTAATCTTCGTCCTCGTCCCA
CCCATCCTCCCAGGCATCTTCTTCCCTTTATAAACCCTCCCGGGAGTCGTACCCGCACCA
ATCGACCCCAAAGCACGATGACTCTTGGAACCATGAGTCATCTGCCCTCTCTTGAAATTA
TGCCTCTTAATCCCACCCTGAAACCCTTTCCCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV13JQ U 1
AF RR4EU29JQ U 12
BS 1 258 RR4GV13JQ
BS 259 514 RR4EU29JQ

RD RR4GV13JQ 258 0 0
GCATACAACATACACAAAAGAGTTGAGTCTTGTCTGTTGTCAAGATAACACAAATGGTTG
TAAACTTACCATCCACAAACTGAGCCAAGTCAAAAGAAGTGCTTACAACATAACACAAGA
AAGGATTTAAACTCAAAAGTCCACAAAATGAAACGAATTAAAAAGCAATGCAACACAACA
TAACACAATAGAGAGACTCTTATCAACTAGTTCTTGGGGATATTAACTCCGACGATCTTA
GCGGGAGTAATACGGAGG

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR4EU29JQ 503 0 0
AG
ACAAGAGAGTTGAGTCTTGTCTGTTGTCAAGATAACACAAATGGTTGTAAACTTACCATC
CACAAACTGAGCCAAGTCAAAAGAAGTGCTTACAACATAACACAAGAAAGGATTTAAACT
CAAAAGTCCACAAAATGAAACGAATTAAAAAGCAATGCAACACAACATAACACAATAGAG
AGACTCTTATCAACTAGTTCTTGGGGATATTAACTCCGACGATCTTAGCGGGAGTAATAC
GGAGGAGATTCCCAGGCTTACCAGGCAAAGCACCTTGGATCATAACAACATCCAACTCCT
TATCAACCTTAACAATCCTAAGCTTCCTAATCTTCGTCCTCGTCCCACCCATCCTCCCAG
GCATCTTCTTCCCTTTATAAACCCTCCCGGGAGTCGTACCCGCACCAATCGACCCCAAAG
CACGATGACTCTTGGAACCATGAGTCATCTGCCCTCTCTTGAAATTATGCCTCTTAATCC
CACCCTGAAACCCTTTCCCGA

QA 3 503 3 503
DS 



CO CL1496Contig2 941 3 14 U
GGGTAAAGCTCCGACATTCATTCACAATGGCGATGACAATGGCGTCTCTTTCCTTCCCAT
CTCCACTCCACAAAACAAACTTATCCTCCTCACTCTCCCTCCCATCGAAAGCCTCTTCCT
TTCTCACCAAACCCTCTCCCAAACGACGAACCCTCACAATCTCCATGTCCATGGAAGCCG
GAATCGGCGTGATGGCCTCGAAGCTCGGCATGATGTCTTTCTTCGAGCCAGACGGAACCG
TAGTCCCCGTGACCGTCGTCGGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCT
TAGCCACCGACGGATACGACGCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGC
TCACCAAGCCCGAGACGGGTCACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCGCTCCGGCATCTCC
AGGAGTTCAGGCTCACGAGCGTGGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAGGCTCGTCTTCGACG
AGATTTTCAAGGAAGGAGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACCACGATCGGGAAAGGGTTTC
AGGGTGGGATTAAGAGGCATAACTTCAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCCAAGAGTC
ATCGTGCTTTGGGGTCAATTGGTGCCGGGACGACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGA
AGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGACGAGGACGAAGATTAGGAAGCTTAGGATTGTTAAGG
TTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTATGATCCAAGGCGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATC
TCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGATCGTCGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTTTATAA
GAGTCTCTATTGTGTTATGTTTGTGTTGCTTTTGCTTTTGAATTTGTTCATTTTGTGGAC
TTTGAGTTTAAATCCTTTCTTGTGTTATGTTGACAACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU29TF U 262
AF RR4GV13TF U 1
AF RR4FC96JQ C 201
BS 1 241 RR4GV13TF
BS 242 242 RR4FC96JQ
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RD RR4EU29TF 214 0 0
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ACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCGCTCCGGCATCTCCAGGAGTTCAGGCTCACGAGCG
TGGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAGGCTCGT
TTT

QA 1 211 1 211
DS 

RD RR4GV13TF 681 0 0
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CTCCACTCCACAAAACAAACTTATCCTCCTCACTCTCCCTCCCATCGAAAGCCTCTTCCT
TTCTCACCAAACCCTCTCCCAAACGACGAACCCTCACAATCTCCATGTCCATGGAAGCCG
GAATCGGCGTGATGGCCTCGAAGCTCGGCATGATGTCTTTCTTCGAGCCAGACGGAACCG
TGGTCCCCGTGACCGTCGTCGGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCT
TAGCCACCGACGGATACGACGCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGC
TCACCAAGCCCGAGACGGGTCACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCGCTCCGGCATCTCC
AGGAGTTCAGGCTCACGAGCGTGGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAGGCTCGTTTTCGACG
AGATTTTCAAGGAAGGGGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACCACGATCGGGAAAGGGTTTC
AGGGTGGGATTAAGAGGCATAATTTCAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCCAAGAGTC
ATCGTGCTTTGGGGTCAATTGGTGCGGGTACGACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGA
AGATGCCTGGGAGGATGGGTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4FC96JQ 741 0 0
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GGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCTTAGCCACCGACGGCTACGAC
GCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGCTCACCAAGCCCGAGACGGGT
CACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCGCTCCGGCATCTCCAGGAGTTCAGGCTCACGAGC
GTGGACGGGTTCGAGCCGAACCAGAAGCTCGTCTTCGACGAGATTTTCAAGGAAGGAGAT
CTTGTCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGGGTGGGATTAAGAGGCAT
AACTTTAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCCAAGAGTCATCGTGCTTTGGGGTCGATT
GGTGCCGGGACGACTCCTGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTGGGAGGATGGGT
GGGACGAGGACGAAGATTAGGAAGCTTAGGATTGTTAAGGTTGATAAGGAGTTGAATGTT
GTTATGATCCAAGGCGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTATTACTCCCGCT
AAGATCGTCGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTTTATAAGAGTCTCTATTGTGTTATGT
TTGTGTTGCTTTTGCTTTTGAATTTGTTCATTTTGTGGACTTTGAGTTTAAATCCTTTCT
TGTGTTATGTTGACAACTCCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 6

CO CL1497Contig1 912 6 11 U
GTCATTGGGGTGTTTTTTATACCCTTGATGCTTCATTTACCCAATGGTGATACTCTTTAA
CAAGTTCATACCTACTTTTCCATTTCGCATAAACACAATGTGTTTTCTTGAATTTGGATT
GTACATATGGTAGAACCTAACATTAAAAATGTTTCAAACAAACAAAGAGAAGAAGAGGAA
GAACCAGCCAAACCAAGACATAAAAATCTCTTATTTATTCTCTCCCTCTCTTCTTCATAC
AATGACTAGAAATTTCTGACCGGAGAGAATCTTCATTATATCAGAACTCATCATGAGTCA
CTAACGAGTTCAGACATCTCGCTCCTGATGCTATTCTCCAGTGTGGACAATAATGGAGTT
CCAGATATAAAAGCCTTGAAGAGCGCAAGTGCCTCCTTTGGTCTGTGCAAAGGAACTTCA
TGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGACCAGCATACTGCTGAGTCCACCCTCCC
ACCTGCCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGACTAATTGTACTAAGGTTTAGAGCATCT
ATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCATCTCCACTGAAAACCCAT
ATGCGAATCCCGGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTCTAGAACCGAGGAACTACTATCG
TTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTTGTGGT
GGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAATACACTTTGGAGTGTTTCTCC
GTACAAGGATCATACTGTTCACTCACACGGCTATTCACTGGTCTTCTTCTCTTAAGCAAC
ATACTTGACTGGGAAGCACTTGCAACACAGGCCGGAGTGAAGACACTGTAATGGTCTATG
TTACCCATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK11JQ U 1
AF RR4H203JQ U 59
AF RR4CZ65JQ U 52
AF RR4DZ85JQ U 116
AF RR4E401JQ U 116
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BS 208 352 RR4FK11JQ
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BS 775 785 RR4CZ65JQ
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BS 865 912 RR4H203TF

RD RR4FK11JQ 774 0 0
GTCATTGGGGTGTTTTTTATACCCTTGATGCTTCATTTACCCAATGGTGATACTCTTTAA
CAAGTTCATACCTACTTTTCCATTTCGCATAAACACAATGTGTTTTCTTGAATTTGGATT
GTACATATGGTAGAACCTAACATTAAAAATGTTTCAAACAAACAAAGAGAAGAAGAGGAA
GAACCAGCCAAACCAAGACATAAAAACCTCTTATTTATTCTCTCCCTCTCTTCTTCATAC
AATGACTAGAAATTTCTGACCGGAGAGAATCTTCATTATATCAGAACTCATCATGAGTCA
CTAACGAGTTCAGACATCTCGCTCCTGATGCTATTCTCCAGTGTGGACAATAGTGGAGTT
CCAGATATAAAAGCCTTGAAGAGCGCAAGTGCCTCCTTTGGTCTGTGCAAAGGAACTTCA
TGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGACCAGCATACTGCTGAGTCCACCCTCCC
ACCTGCCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGACTAATTGTACTAAGGTTTAGAGCATCT
ATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCATCTCCACTGAAAACCCAT
ATGCGAATCCCGGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTCTAGAACCGAGGAACTACTATCG
TTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTTGTGGT
GGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAATACACTTTGGAGTGT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4H203JQ 725 0 0
AACAAGTTCATACCTACTTTTCCATTTCGCATAAACACAATGTGTTTTCTTGAATTTGGA
TTGTACATATGGTAAAACCTAACATTAAAAATGTTTCAAACAAACAAAGAGAAAAAAAGG
AAGAACCAGCCAAACCAAGACATAAAAATCTCTTATTTATTCTCTCCCTCTCTTCTTCAT
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CACTAACGAGTTCAAACATCTCGCTCCTGATGCTATTCTCCAGTGTGGACAATAATGGAG
TTCCAGATATAAAAGCCTTGAAAAGCGCAAGTGCCTCCTTTGGTCTGTGCAAAGGAACTT
CATGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGGCCAGCATACTGCTGAGTCCACCCTC
CCACCTGCCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGACTAATTGTACTAAGGTTTAAAGCAT
CTATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCATCTCCACTGAAAACCC
ATATGCGAATCCCGGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTCTAGAACCGAGGAACTACTAT
CGTTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTTGTG
GTGGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAATACACTTTGGAGTGTTTCT
CCGTA

QA 1 725 1 725
DS 

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ACTCTTT
AACAAGTTCATACCTACTTTTCCATTTCGCATAAACACAATGTGTTTTCTTGAATTTGGA
TTGTACATATGGTAGGACCTAGCATTAAAAATGTTTCAAACAAACAAAGAGAAGAAGAGG
AAGAACCAGCCAAACCAAGACATAAAAATCTCTTATTTATTCTCTCCCTCTCTTCTTCAT
ACAATGACTAGAAATTTCTGACCGGAGAGAATCTTCATTATATCAGAACTCATCATGAGT
CACTAACGAGTTCAGACATCTCGCTCCTGATGCTATTCTCCAGTGTGGACAATAATGGAG
TTCCAGATATAAAAGCCTTGAAGAGCGCAAGTGCCTCCTTTGGTCTGTGCAAAGGAACTT
CATGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGACCAGCATACTGCTGAGTCCACCCTC
CCACCTGCCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGACTAATTGTACTAAGGTTTAGAGCAT
CTATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCATCTCCACTGAAAACCC
ATATGCGAATCCCGGCAGCTA**AGCTCGTGGTAAATGTCTAGAACCGAGGAACTACTAT
CGTTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTTGTG
GTGGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAATACACTTTGGAGTGTTTCT
CCGTACA*GGATCATACTGTTCACTCACACGGCTATTCACTGGTCTTCTTCTCTTAAGCA
*CATACTTGACTGGGAAGCACTTGCA
C

QA 8 813 8 813
DS 

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A
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GGAAGAACCAGCCAAACCAAGACATAAAAATCTCTTATTTATTCTCTCTCTCTCTTCTTC
ATACAATGACTAGAAATTTCTGACCGGAGAGAATCTTCATTATATCAGAACTCATCATGA
GTCACTAACGAGTTCAGGCATCTCGCTCCTGATGCTCTTCTCCAGTGTGGACAATAATGG
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TTCATGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGACCAGCATACTGCTGAGTCCACCC
TCCCAACTGTCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGAG**ATTGTACTAAGGTTTAGAGC
ATCTATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCATCTCCACTGAAAAC
CCATATGCGAATCCCGGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTCTAGAACCGAGGAACTACT
ATCGTTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTTG
TGGTGGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAATACACTTTGGAGTGTTT
CTCCGTACAAGGATCATACTGTTCACTCACACGGCTATTCACTGGTCTTCTTCTCTTTAG
CAACATTCTTGACTGGGAAGCACTTGCA
AC

QA 2 749 2 749
DS 

RD RR4E401JQ 751 0 0
A
GATTGTACCTATGGTAGAACCTAACATTAAAAATGTTTCAAACAAACAAAGAGAA*AAGA
GGAAGAACCAGCCAAACCAAGACATAAAAATCTCTTATTTATTCTCTCTCTCTCTTCTTC
ATACAATGACTAGAAATTTCTGACCGGAGAGAATCTTCATTATATCAGAACTCATCATGA
GTCACTAACGAGTTCAGGCATCTCGCTCCTGATGCTCTTCTCCAGTGTGGACAATAATGG
AGTTCCAGATATAAAAGCCTTGAAGAGCGCAAGTGTCTCCTTTGGTCTGTGCAAAGGAAC
TTCATGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGACCAGCATACTGCTGAGTCCACCC
TCCCAACTGTCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGAG**ATTGTACTAAGGTTTAGAGC
ATCTATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCATCTCCACTGAAAAC
CCATATGCGAATCCCGGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTCTAGAACCGAGGAACTACT
ATCGTTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTTG
TGGTGGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAATACACTTTGGAGTGTTT
CTCCGTACAAGGATCATACTGTTCACTCACACGGCTATTCACTGGTCTTCTTCTCTTTAG
CAACATTCTTGACTGGGAAGCACTTGCA
AC

QA 2 749 2 749
DS 

RD RR4H203TF 693 0 0
CTCTCCCTCTCTTCTTCATACAATGACTAGAAATTTCTGACCGGAGAGAATCTTCATTAT
GTCAGAACTCATCATGAGTCACTAACGAGTTCAGACATCTCGCTCCTGATGCTATTCTCC
AGTGTGGACAATAATGGAGTTCCAGATATAAAAGCCTTGAAGAGCGCAAGTGCCTCCTTT
GGTCTGTGCAAAGGAACTTCATGCCCTGCGCCTCTCACAGTCACAAAGTTTAGGCCAGCA
TACTGCTGAGTCCACCCTCCCACCTGCCCGTCTATGTACCAAGGGCCATATGGACTAATT
GTACTAAGGTTTAGAGCATCTATGCTGTACCGGGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCT
GCATCTCCACTGAAAACCCATATGCGAATCCCGGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTCT
AGAACCGAGGAACTACTATCGTTCCAGTTTTCATTCACGACATAATTGCAAGTATCCCAT
TTGGATGGTGCAAGTTGTGGTGGGACATGGAGGGCTTTTTGAACCTCTGGGAGATTGAAA
TACACTTTGGAGTGTTTCTCCGTACAAGGATCATACTGTTCACTCACACGGCTATTCACT
GGTCTTCTTCTCTTAAGCAACATACTTGACTGGGAAGCACTTGCAACACAGGCCGGAGTG
AAGACACTGTAATGGTCTATGTTACCCATTTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 2 6

CO CL1498Contig1 941 4 11 U
GTCCTCTATATATAAACCATCTTAGATGCTTCACCATCACACACAACACTTAACACTTTT
AATCACAAATCACCCACTGGTCTCTCTCATACCTATCTAACAAAATGGGTTCTTCTTCTA
CACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATTCATCTGCCATTGTTCCTTCTCCGTTAGCTC
AGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAACCAGTTTGCTGAGTTCCCCGCCGGTT
GTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGTGTGACTGAGACTGAGGTCG
GGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAAGGATGTCTGCACTAACACAACGA
ACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTTCAGTATGATCCCAATGAGTGCACCTACGAGACTCTGC
TTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTAAATCGTCAGGGAAAACTTGTGG
GAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACACCAGAGCAAGAGAGGCTAGCACGTG
AATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACCGG
CCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGACGA
GTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAG
GAAAAGCCTTTGTTCCTCTTCACCCAAAACAGAGGATTCTCTGAGGTTCTGTATCTGTTT
GTGTGTGTGTGTGTG**TATGTGTGTGTGTTGATTTTTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGA
TGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACTTGTCTTAGTTTCTAAACTTTGAAC
TTATGTTTTTTGAATAATTAGTAAGTACCATCGTTATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV82TF U 1
AF RR4AR66TF U 37
AF RR4AR66JQ C 119
AF RR4BV82JQ C 421
BS 1 230 RR4BV82TF
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BS 232 719 RR4BV82TF
BS 720 720 RR4AR66JQ
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BS 909 941 RR4BV82JQ

RD RR4BV82TF 754 0 0
GTCCTCTATATATAAACCATCTTAGATGCTTCACCATCACACACAACACTTAACACTTTT
AATCACAAATCACCCACTGGTCTCTCTCATACCTATCTAACAAAATGGGTTCTTCTTCTA
CACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATTCATCTGCCATTGTTCCTTCTCCGTTAGCTC
AGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAACCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCCGGTT
GTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGTGTGACTGAGACTGAGGTCG
GGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAAGGATGTCTGCACTAACACAACGA
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AATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACCGG
CCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGACGA
GTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAA*
*GAAAGCCTTTGTTCCTCTTCACCCAAA
CAGAGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4AR66TF 774 0 0
GG
ACACACAACACTTAACACTTTTAATCACAAATCACCCACTGGTCTCTCTCATACCTATCT
AACAAAATGGGTTCTTCTTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATTCATCTGCC
ATTGTTCCTTCTCCGTTAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAACCAG
TTTGCTGAGTTCCCCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCT
GGTGTGACTGAGACTGAGGTCGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAAG
GATGTCTGCACTAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTTCAGTATGATCCCAAT
GAGTGCACCTACGAGACTCTGCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTA
AATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACACCA
GAGCAAGAGAGGCTAGCACGTGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAG
ATTGTGACTGAGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCAT
TACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGAC
CCTATCAGCTGCTTTGGCTAAAGAAAAGCCTTTGTTCCTCTTCACCCAAAACAGAGGATT
CTCTGAGGTTCTGTATCTGTTTGTGTGTGTGTGTGTG**T
ATGTGTGTGTGT

QA 3 762 3 762
DS 

RD RR4AR66JQ 794 0 0
TACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATTCATCTGCCATTGTTCCTTCTCCGTTAGC
TCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAACCAGTTTGCTGAGTTCCCCGCCGG
TTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGTGTGACTGAGACTGAGGT
CGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAAGGATGTCTGCACTAACACAAC
GAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTTCAGTATGATCCCAATGAGTGCACCTACGAGACTCT
GCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTAAATCGTCAGGGAAAACTTGT
GGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACACCAGAGCAAGAGAGGCTAGCACG
TGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACC
GGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGAC
GAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTA
AGGAAAAGCCTTTGTTCCTCTTCACCCAAAACAGAGGATTCTTTGAGGTTCTGTATCTGT
TTGTGTGTGTGTGTGTG**TATGTGTGTGTGTTGATTTTTAAGTCTCAGTTAGTGATAAA
GATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACTTGTCTTAGTTTCTAAACTTTGA
ACTTATGTTT
TTGG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4BV82JQ 521 0 0
TTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTAAATCGTCAGGGAAAACTTGTGG
GAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACACCAGAGCAAGAGAGGCTAGCACGTG
AATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACCGG
CCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGAGGA
GTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAG
GAAAAGCCTTTGTTCCTCTTCACCCAAAACAGAGGATTTTCTGAGGTTCTGTATCTGTTT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTTGATTTTTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGA
TGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACTTGTCTTAGTTTTTAAACTTTGAAC
TTATGTTTTTTGAATAATTAGTAAGTACCATCGTTATAACC

QA 1 521 1 521
DS 



CO CL1498Contig2 898 2 2 U
GGACACACAACACTTAACACTTTTAATCACAAACCACCCACTGGTCTCTCTCATACCTAT
CTAACAAAATGGGTTCTTCTTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATTCATCTG
CCATTGTTCCTTCTCCGTTAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCTGCGCCGGGAAACC
AGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCC
CTGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACA
AGGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTCCAGTATGATCCCA
ACGGGTGCACCTATGAGACTCTGCTTGACTTGTTCTGGTCTAAGCATGATCCCACCACCT
TGAATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACAC
CAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGA
AGATTGTGACTGAGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGC
ATTACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGTAAAG
ACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAGGAAAAGCCTTTGTTCCTCTTTACCCAAAACAGAGGA
TTCTCTGAGGTTCTGTATCTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATTTTTAAGTCTCA
GTTAGTAATAAAGATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACTTGTCTTAGTT
TCTAAACTTTGAACTGATGTTTGTTTGAATAATTAGTAAGTACCATCGTTATAACCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GW85TF U 1
AF RR4GW85JQ C 231
BS 1 451 RR4GW85TF
BS 452 898 RR4GW85JQ

RD RR4GW85TF 451 0 0
GGACACACAACACTTAACACTTTTAATCACAAACCACCCACTGGTCTCTCTCATACCTAT
CTAACAAAATGGGTTCTTCTTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATTCATCTG
CCATTGTTCCTTCTCCGTTAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCTGCGCCGGGAAACC
AGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCC
CTGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACA
AGGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTCCAGTATGATCCCA
ACGGGTGCACCTATGAGACTCTGCTTGACTTGTTCTGGTCTAAGCATGATCCCACCACCT
TGAATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCA

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4GW85JQ 668 0 0
CAGAGGATCCCTGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAAT
CCTTCTTACAAGGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTCCAG
TATGATCCCAACGGGTGCACCTATGAGACTTTGCTTGACTTGTTCTGGTCTAGGCATGAT
CCCACCACCTTGAATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATATAC
TTCTACACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAA
CTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAA
TACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAG
AGCTGTAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAGGAAAAGCCTTTGTTCCTCTTTACCCA
AAACAGAGGATTCTCTGAGGTTCTGTATCTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATTT
TTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACT
TGTCTTAGTTTCTAAACTTTGAACTGATGTTTGTTTGAATAATTAGTAAGTACCATCGTT
ATAACCTG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 6

CO CL1499Contig1 943 6 12 U
GGGTTTCTCTCACAAAAACAAAAATTGTTTTCTTTGCCTTGGGATCCGTGAGAAACAGAG
GATAAGCTATCATGGGTTCGATCTCTCTGTCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCAT
TACATACTTCATCACTCAATCCATGCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTC
TCTCTAATTCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCG
CTGCTCCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTG
ACTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATG
CATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGA
ATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCA
GCAGCCAAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACG
AACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTT
CTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAA
CGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCTGACAA
GGGGGAACGTTGTAAGGG*TGCACTGCAGATCAAGCGGGAAACCGAGAACTCAACCTAGC
CAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATTTTCTGCCATATAGTTAAATAGCAAATCTG
TTGATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAAAAATGTGTAACTATACCCTCTCATCTTTC
CACCTCCACAAGCAATTTTTTACTTAAAAAAACATTTTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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AF RR4FB33TF U 1
AF RR4EE84TF U 25
AF RR4FO56TF U 5
AF RR4FB33JQ C 212
AF RR4EE84JQ C 251
AF RR4FO56JQ C 290
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BS 719 724 RR4FO56TF
BS 725 725 RR4FB33JQ
BS 726 737 RR4FO56TF
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BS 739 763 RR4FO56TF
BS 764 907 RR4FB33JQ
BS 908 943 RR4EE84JQ

RD RR4FB33TF 718 0 0
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GATAAGCTATCATGGGTTCGATCTCTCTGTCCAATTCCCTGCCCATACCGCGACTTCCAT
TACATACTTCATCACTCAATCCATGCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTC
TCTCTAATTCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCG
CTGCTCCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTG
ACTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATG
CATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGA
ATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCA
GCAGCCAAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACG
AACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTT
CTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAA
CGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAA*CTGATTGGGATCCTGAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EE84TF 644 0 0
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CTCTGTCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCATTACATACTTCATCACTCAATCCAT
GCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTCTCTCTAATTCTCGTCGTCGCTCCG
CTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGCTGCTCCTTCAGGCGTTAATAACT
CTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTTATGACAGGGAAACAGCATC
TTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGTTGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGA
AAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATT
ACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCCAAAATGATACAAACATGT
TCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGA
CACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCA
CCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAGTTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4FO56TF 761 0 0
G
TCTCTCACAAAAACAAAAATTGTTTTCTTTGCCTTGGGATCCGTGAGAAACAGAGGATAA
GCTATCATGGGTTCGATCTCTCTGTCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCATTACAT
ACTTCATCACTCAATCCATGCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTCTCTCT
AATTCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGCTGCT
CCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTT
ATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATG*GTTGATGATGCATTG
GAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTG
GTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGC
CAAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTC
CAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCTCCT
CTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAG
TTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAA*CTGATTGGGATCCTGACAAGGGG*
AACGTTGTAAGGC*TGCACTGCAGATCAAGCGGGAAAC
GA

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4FB33JQ 696 0 0
ACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGCTGCTCCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCC
TGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGT
TGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCAC
GGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTT
GCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCCAAAATGATACAAACATGTTCCCTAA
CGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGG
AAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTT
AGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTC
AGATGGAAAACTGATTGGGATCCTGACAAGGGGGAACGTTGTAAGGG*TGCACTGCAGAT
CAAGCGGGAAACCGAGAACTCAACCTAGCCAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATT
TTCTGCCATATAGTTAAATAGCAAATCTGTTGATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAA
AAATGTGTAACTATACCCTCTCATCTTTCCACCTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4EE84JQ 693 0 0
AGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTTATGAC
AGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGTTGATGCATTGGAACT
TCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTGGTTGG
GGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCCAAAA
TGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCCAGAA
GCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTTTCCTCTGGT
TGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAGTTCCG
AAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCTGACAAGGGGGAACGT
TGTAAGGGCTGCACTGCGGATCAAGCGGGAAACCGAGAACTCAACCTAGCCAGCAGCAGT
TGTAGAGCAGAGCCCTTCATTTTCTGCCATATAGTTAAATAGCAAATCTGTTGATTCCAT
TTGATATAAAGTATATATAAAAAATGTGTAACTATACCCTCTCATCTTTCCACCTCCACA
AGCAATTTTTTACTTAAAAAAACATTTTCTCAC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4FO56JQ 652 0 0
CACGGTTGGTGACTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATG
*GTTGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGA
TGATGACTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCAT
TTCTGGGCGCAGCAGCCAAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAA
AACGTTTAACGAACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTT
GATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTT
GCTACTGGAAACGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGG
GATCCTGACAAGGGGGAACGTTGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGGGAAACCGAGAA
CTCAACCTAGCCAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATTTTCTGCCATATAGTTAAA
TAGCAAATCTGTTGATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAAAAATGTGTAACTATACCC
TCTCATCTTTCCACCTCCACAAGCAATTTTTTACTTAAAAAAACATTTTCTC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 6

CO CL1500Contig1 1003 6 6 U
GGAAAAGACTCAAGACTAACAATGGCGGCACTCATCGTTGACGCGGAGTACCTTAAGGAA
ATTGACAAGGCTCGCCGTGAACTTCGTGCTCTCATCGCCAAGAAGAACTGCGCTCCGATC
ATGCTCCGTTTGGCGTGGCATGATGCTGGAACCTATGATGCTGAATCCAAGACCGGTGGA
CCTAATGGCTCTATTAGGAACGAAGCAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAAG
ATAGCACTTGATCTTTGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAGATCAGTTATGCGGAC
CTGTACCAACTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCGGTTTT
GTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAAT
CAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACCGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATATT
GTGGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGAT
GGACCATGGACTGAAGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAAA
GAAGAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAAACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCCG
GAGTTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGTATTCTTCAGAGACTAT
GCAGAGTCACACAAGAAACTCTCAGAACTCGGGTTCACACCAACGTCTACGGTCACTATG
GCGATAACAGACTGCACCGCACTGGCACATACTGCAGTCGGAGTCGCGGTGGCTGCTGCT
GTTGTGACCTTTAGCTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATGAAGTAAATGAAATAGAAA
GCACGCATCTCCCTTCTCATCTCTCTGGTTTGTAAGCATGCATTTATCGAGATAATATGT
TCTCTAGATTCCTATATTTCTGCAATAAGATCACACATTGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4GK60TF U 1
AF RR4BV81TF U 1
AF RR4E269JQ C 300
AF RR4E269TF U 300
AF RR4BV81JQ C 353
AF RR4GK60JQ C 555
BS 1 308 RR4BV81TF
BS 309 309 RR4E269TF
BS 310 586 RR4BV81TF
BS 587 888 RR4E269TF
BS 889 889 RR4E269JQ
BS 890 1003 RR4E269TF

RD RR4GK60TF 528 0 0
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ATTGACAAGGCTCGCCGTGAACTTCGTGCTCTCATCGCCAAGAAGAACTGCGCTCCGATC
ATGCTCCGTTTGGCGTGGCATGATGCTGGAACCTATGATGCTGAATCCAAGACCGGTGGA
CCTAATGGCTCTATTAGGAACGAAGCAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAAG
ATAGCACTTGATCTTTGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAGATCAGTTATGCGGAC
CTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCGGTTTT
GTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAAT
CAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACCGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATATT
GTGGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4BV81TF 586 0 0
GGAAAAGACTCAAGACTAACAATGGCGGCACTCATCGTTGACGCGGAGTACCTTAAGGAA
ATTGACAAGGCTCGCCGTGAACTTCGTGCTCTCATCGCCAAGAAGAACTGCGCTCCGATC
ATGCTCCGTTTGGCGTGGCATGATGCTGGAACCTATGATGCTGAATCCAAGACCGGTGGA
CCTAATGGCTCTATTAGGAACGAAGCAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAAG
ATAGCACTTGATCTTTGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAGATCAGTTATGCGGAC
CTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCGGTTTT
GTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAAT
CAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACCGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATATT
GTGGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGAT
GGACCATGGACTGAAGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4E269JQ 704 0 0
G
CTGTACCAACTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCGGTTTT
GTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAAT
CAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACCGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATATT
GTGGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGAT
GGACCATGGACTGAAGATCCTCTAGAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAAA
GAAGAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAAACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCCG
GAGTTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGTATTCTTCAGAGACTAT
GCAGAGTCACACAAGAAACTCTCAGAACTCGGGTTCACACCAACGTCTACGGTCACTATG
GCGATAACAGACTGCACCGCACTGGCACATACTGCAGTCGGAGTCGCGGTGGCTGCTGCT
GTTGTGACCTTTAGCTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATGAAGTAAATGAAATAGAAA
GCACGCATCTCCCTTCTCATCTCTCTGGTTTGTAAGCATGCATTTATCGAGATAATATGT
TCTCTAGATTCCTATATTTCTGCAATAAGATCACACATTGACC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR4E269TF 704 0 0
G
CTGTACCAACTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCGGTTTT
GTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAAT
CAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACCGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATATT
GTGGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGAT
GGACCATGGACTGAAGATCCTCTAGAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAAA
GAAGAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAAACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCCG
GAGTTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGTATTCTTCAGAGACTAT
GCAGAGTCACACAAGAAACTCTCAGAACTCGGGTTCACACCAACGTCTACGGTCACTATG
GCGATAACAGACTGCACCGCACTGGCACATACTGCAGTCGGAGTCGCGGTGGCTGCTGCT
GTTGTGACCTTTAGCTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATGAAGTAA*TGAAATAGAAA
GCACGCATCTCCCTTCTCATCTCTCTGGTTTGTAAGCATGCATTTATCGAGATAATATGT
TCTCTAGATTCCTATATTTCTGCAATAAGATCACACATTGACC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR4BV81JQ 651 0 0
TCGGTTTTGTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTG
ATGCTAATCAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACCGGATGGGTTTGTCTGACA
AAGATATTGTGGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAG
GTTTCGATGGACCATGGACTGAAGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAAT
TGCTGAAAGAAGAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAAACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGG
AAGTCCCGGAGTTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGTATTCTTCA
GAGACTATGCAGAGTCACACAAGAAACTCTCAGAACTCGGGTTCACACCAACGTCTACGG
TCACTATGGCGATAACAGACTGCACCGCACTGGCACATACTGCAGTCGGAGTCGCGGTGG
CTGCTGCTGTTGTGACCTTTAGCTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATGAAGTAAATGA
AATAGAAAGCACGCATCTCCCTTCTCATCTCTCTGGTTTGTAAGCATGCATTTATCGAGA
TAATATGTTCTCTAGATTCCTATATTTCTGCAATAAGATCACACATTGACC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4GK60JQ 449 0 0
AGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAAAGAAGAAGAATCAGA
GGGCTTGCTGAAACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCCGGAGTTCCGTCAGTA
TGCTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGTATTCTTCAGAGACTATGCAGAGTCACACAA
GAAACTCTCAGAACTCGGGTTCACACCAACGTCTACGGTCACTATGGCGATAACAGACTG
CACCGCACTGGCACATACTGCAGTCGGAGTCGCGGTGGCTGCTGCTGTTGTGACCTTTAG
CTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATGAAGTAAATGAAATAGAAAACACGCATCTCCCT
TCTCATCTCTCTGGTTTGTAAGCATGCATTTATCGAGATAATATGTTCTCTAGATTCCTA
TATTTCTGCAATAAGATCACACATTGACC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 6

CO CL1501Contig1 1067 6 31 U
GGCACACAAACGTAGCAATGATAATTCCGTTGTTTCAAGAAGACAAGGTTACATGAGAAC
ATATCTCATATTGTCTGAAACTCAACTTAAATAAATGTTGAAACGAAAATCTGGAAAACC
ACCAAGTTGAGTTCAGCCTCATAAAACTAAAAGATTACACTGATCCTTCAAATAACATTT
GCAACTTCTAAACTTCATTTTAAGATTTCTTCCTATCATCTTCACCGTCATCGTCCGAGT
CACCGCTCTCACGGAATCGTGGGTTCTTTTCCGGTCTCATGTCATGATCAGAGTCTCTCC
TAGTCTCATGATCTGAGTTTCTTCTCGAGTTGTCGCGTCCATAACGATCATCGTCCCTTT
GACGTTTCCGATGAAAATCTCCGCCTCTTCCATGGCGATTAGATCCTCCTTGGCCATATC
CCCCTCCACGAGGTCCACCACGCCTTTCATAATTAGATGGCGCGGGTGCAGGGTAGGATC
CTCCGAGTGAACCAGTACCGTAATCTACGAGCTGTCTTTGTGCTTCGAGTTCCTTCTGAA
CTAATTTTCCATAACCACCTCTAGCAGGATCATAATCTGTACGGTATTCATCTCGAACCT
GGCCACCGCTTCTGCCACGTCCCCATTGCCATCCTTCTTGGAAGCCCCAATCAAAGTCCA
CACGAATAGGGCGGTCATCAAGAATGGTGCCACTTATATACTTGACTGCATCCTCTGTGT
CCTCTCTCGAGTAGAACAGGACGAAACAGAAACCACAGGGGGTTTTGGTGTTCTTGTCGA
GTCCCATGATAATCTTTTTAATCTCTCCAGCTCTGGAGAAAAGCTCGTAAATCTGCTCTT
CGGTTGTGTAGAAAGAGACGTTCCCAATGTACACGGTGGAAGAGGTCCTTAACGCCTCCT
CGAACTCCTCCTGTGTGCCTGAGAACCTTCTGTCTCGATAAGCCGACAGCTTTGCTTGCT
CCTTGAACAAAGAAGCCATAGCCTCCCGCTTTAGAGAGTGAATCTAGATGAGCGAAAAAT
CGAAAAGGCAGAGACGCTTGCTCTTCTTCTTCTTCCAAAACCCTAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT46JQ U 1
AF RR4FO22JQ U 1
AF RR4DY13JQ U 15
AF RR4C475JQ U 14
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AF RR4DY13TF C 413
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BS 40 40 RR4FO22JQ
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BS 91 91 RR4FO22JQ
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RD RR4BT46JQ 751 0 0
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GGCCACCGCTTCTGCCACGTCCCCATTGCCCTCCTTCTTGGAAGCCCCAATCAAAGTCCA
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QA 1 751 1 751
DS 

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CACCGCTCTCACGGAATCGTGGGTTCTTTTCCGGTCTCATGTCATGATCAGAGTCTCTCC
TAGTCTCATGATCTGAGTTTCTTCTCGAGTTGTCGCGTCCATAACGATCATCGTCCCTTT
GACGTTTCCGATGAAAATCTCCGCCTCTTCCATGGCGATTAGATCCTCCTTGGCCATATC
CCCCTCCACGAGGTCCACCACGCCTTTCATAATTAGATGGCGCGGGTGCAGGGTAGGATC
CTCCGAGTGAACCAGTACCGTAATCTACGAGCTGTCTTTGTGCTTCGAGTTCCTTCTGAA
CTAATTTTCCATAACCACCTCTAGCAGGATCATAATCTGTACGGTATTCATCTCGAACCT
GGCCACCGCTTCTGCCACGTCCCCATTGCCTTCCTTCTTGGAAGCCCCAATCAAAGTCCA
CACGAATAGGGCGGTCATCAAGAATGGTGCCACTTATATACTTGACTGCATCCTCTGTGT
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ACG

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DS 

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CCACGTCCCCATTGCCATCCTTCTTGGAAGCCCCAATCAAAGTCCACACGAATAGGGCGG
TCATCAAGAATGGTGCCACTTATATACTTGACTGCATCCTCTGTGTCCTCTCTCGAGTAG
A

QA 1 721 1 721
DS 

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A
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TCATTTTAAGATTTCTTCCTATCATCTTCACCGTCATCGTCCGAGTCACCGCTCTCACGG
AATCGTGGGTTCTTTTCCGGTCTCATGTCATGATCAGAGTCTCTCCTAGTCTCATGATCT
GAGTTTCTTCTCGAGTTGTCGCGTCCATAACGATCATCGTCCCTTTGACGTTTCCGATGA
AAATCTCCGCCTCTTCCATGGCGATTAAATCCTCCTTGGCCATATCCCCCTCCACGAGGT
CCACCACGCCTTTCATAATTAAATGGCGCGGGTGCAGGGTAGGATCCTCCGAGTGAACCA
GTACCGTAATCTACGAACTGTCTTTGTGCTTCGAGTTCCTTCTGAACTAATTTTCCATAA
CCACCTCTAGCAGGATCATAATCTGTACGGTATTCATCTCGAACCTGGCCACCGCTTCTG
CCACGTCCCCATTGCCTTCCTTCTTGGAAGCCCCAATCAAAGTCCACACGAATAGGGCGG
TCATCAAGAATGGTGCCACTCATATACTTGACTGCATCCTCTGTGTCCTCTCTCGAGT

QA 2 719 2 719
DS 

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GAG
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CACGCCTTTCATAATTAGATGGCGCGGGTGCAGGGTAGGATCCTCCGAGTGAACCAGTAC
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GTCCCCATTGCCCTCCTTCTTGGAAGCCCCAATCAAAGTCCACACGAATAGGGCGGTCAT
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GGACGAAACAGAAACCACAGGGGGTTTTGGTGTTCTTGTCGAGTCCCATGATAATCTTTT
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TAGCCTCCCGCTTTAGAGAGTGAATCTAGATGAGCGAAAAA

QA 4 704 4 704
DS 

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TCGAACCTGGCCACCGCTTCTGCCACGTCCCCATTGCCATCCTTCTTGGAAGCCCCAATC
AAAGTCCACACGAATAGGGCGGTCATCAAGAATGGTGCCACTTATATACTTGACTGCATC
CTCTGTGTCCTCTCTCGAGTAGAACAGGACGAAACAGAAACCACAGGGGGTTTTGGTGTT
CTTGTCGAGTCCCATGATAATCTTTTTAATCTCTCCAGCTCTGGAGAAAAGCTCGTAAAT
CTGCTCTTCGGTTGTGTAGAAAGAGACGTTCCCAATGTACACGGTGGAAGAGGTCCTTAA
CGCCTCCTCGAACTCCTCCTGTGTGCCTGAGAACCTTCTGTCTCGATAAGCCGACAGCTT
TGCTTGCTCCTTGAACAAAGAAGCCATCGCCTCCCGCTTTAGAGAGTGAATCTAGATGAG
CGAAAAATCGAAAAGGCAGAGACGCTTGCTCTTCTTCTTCTTCCAAAACCCTAAT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 2 6

CO CL1502Contig1 828 4 2 U
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ACACAAATTTTAAAGGAGCAATCGCCCTAAAACGGACTGAAATAATATTCCAAAGCGAGA
TCCTGTTTTCATGTTTTACGGTAAAAAAGGAAATCCTACAAGCATCTTTGAACCAGTCAC
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CTGAGACGGACGACTACCCATAGAACTGCCCGGACGAGCCTTCCTGGTAACCGGAACCAC
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CTAAACCTAATTGTGGAATTTAGGGTTTATAAAGAGAGACGATGATCC


BQ
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AF RR4EA92JQ U 1
AF RR4EA92TF C 1
AF RR4BB30JQ U 110
AF RR4BB30TF C 110
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TGCTTCG
C

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4EA92TF 368 0 0
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ACACAAATTTTAAAGGAGCAATCGCCCTAAAACGGACTGAAATAATATTCCAAAGCGAGA
TCCTGTTTTCATGTTTTACGGTAAAAAAGGAAATCCTACAAGCATCTTTGAACCAGTCAC
AAATCTTCTTAATCTAAATCAAAGACCTTCACCATAGAAGTATCAGAGAATCAAACACAC
TTCTCAGAGGTTAACTTTCCATAAACATACTAAGGATCACTGATCGTTAACGTTAATCAG
CTCGTACTCAACAAGAGATAGATTGTTATCTTCTTTGACCATGAAAGAAGCTGGCTCAGT
TGCTTCG
C

QA 1 367 1 367
DS 

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TACATGTCTATCCTCGAGTTCCGCAGTATCACCGTTTCCCCTGGCTTCATAAGATCCACT
TGGTCGTTACGAGCAGTGAAGAGAATACATCCGGTTTCGTCTCCAATGAGGCACTCAGCG
ATTCGACTAGGCTGAGACGGACGACTACCCATAGAACTGCCCGGACGAGCCTTCCTGGTA
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QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BB30TF 719 0 0
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GAACCAGTCACAAATCTTCTTAATCTAAATCAAAGACCTTCACCATAGAAGTATCAGAGA
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GCTGGCTCAGTTGCTTCGATGCGTCCCCATTTATCAACCCCTAGCCTCATTGTACCCTTG
TACATGTCTATCCTCGAGTTCCGCAGTATCACCGTTTCCCCTGGCTTCATAAGATCCACT
TGGTCGTTACGAGCAGTGAAGAGAATACATCCGGTTTCGTCTCCAATGAGGCACTCAGCG
ATTCGACTAGGCTGAGACGGACGACTACCCATAGAACTGCCCGGACGAGCCTTCCTGGTA
ACCGGAACCACCGGATTGGAGTCAACGACCTTAACGGTCAGTGTGTGAACAGTCGTTCCA
GGCTTTAGCTGTTCCACTTTCACGAACACTGGTTTCCTCTTCGCTGCCGTCGTCGACGAC
GACGTTCCCGTTGCAACCGATGCGTTTCCTGTTGTAGTCGCCATCGCTCTCTTAAGGTTT
ACGGAAAATCGCTAAACCTAATTGTGGAATTTAGGGTTTATAAAGAGAGACGATGATCC

QA 1 719 1 719
DS 



CO CL1502Contig2 659 2 2 U
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GTTACCCGGAAGGCTCGTCCTGGGATGAGTAGTCGTCCGTCTCAGCCTAGTCGAATCGCT
GAGTGTCTAATCGGAGATGAGACCGGTTGCATTCTCTTCACTGCTCGTAACGACCAAGTT
GATGTTATGAAACCAGGGGAGACGGTGATACTGCGGAACTCGAGGATAGACATGTACAAG
GGTACAATGAGGCTAGGTGTTGATAAATGGGGACGCATCGAAGCAACTGAGCCAGCGTCT
TTCACGGTCAAAGATGATAACAATCTGTCTCTTGTTGAGTACGAGCTGATTAACGTTAAC
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AAGATGCTTGTAGGATTTCCTTTTTTACCGTAAAACATGAAACCAGGATCTCGCTTTGG


BQ
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AF RR4FA20JQ C 1
AF RR4FA20TF U 1
BS 1 4 RR4FA20JQ
BS 5 659 RR4FA20TF

RD RR4FA20JQ 659 0 0
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GAGTGTCTAATCGGAGATGAGACCGGTTGCATTCTCTTCACTGCTCGTAACGACCAAGTT
GATGTTATGAAACCAGGGGAGACGGTGATACTGCGGAACTCGAGGATAGACATGTACAAG
GGTACAATGAGGCTAGGTGTTGATAAATGGGGACGCATCGAAGCAACTGAGCCAGCGTCT
TTCACGGTCAAAGATGATAACAATCTGTCTCTTGTTGAGTACGAGCTGATTAACGTTAAC
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AAGATGCTTGTAGGATTTCCTTTTTTACCGTAAAACATGAAACCAGGATCTCGCTTTGG

QA 1 659 1 659
DS 

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GGAA
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TTATGAAACCAGGGGAGACGGTGATACTGCGGAACTCGAGGATAGACATGTACAAGGGTA
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TGCTTGTAGGATTTCCTTTTTTACCGTAAAACATGAAACCAGGATCTCGCTTTGG

QA 5 659 5 659
DS 



AS 1 6

CO CL1503Contig1 1049 6 9 U
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TATCACTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTC
TGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTT
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CCATTTGCAGAGAAAGCGTTCAAAGAGTTGCACAAACATTACCTTGTGTTTGATGAAAAG
GTTGTTTCTAAGATCCCCATTGCTTCCCTCAAAGCTAAGTTGGGTTAACCAGAGACTTGT
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TCCGGCTATTTATGGAGAATACTTGAACT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ59TF U 1
AF RR4AW37TF U 1
AF RR4DM67TF U 11
AF RR4AU88TF U 7
AF RR4GZ59JQ C 272
AF RR4DM67JQ C 404
BS 1 299 RR4AW37TF
BS 300 300 RR4GZ59TF
BS 301 356 RR4AW37TF
BS 357 357 RR4GZ59TF
BS 358 711 RR4AW37TF
BS 712 791 RR4AU88TF
BS 792 977 RR4GZ59JQ
BS 978 978 RR4DM67JQ
BS 979 1049 RR4GZ59JQ

RD RR4GZ59TF 563 0 0
GGGTCT
CCATCCACTCACGTTCCATATATTTTCAAAAATCCTCTGTTCAATTTCGAAACTCGTGAA
AACCAATGGCGGAGGAAATTGAGAAATCGATGCCCGCGGAGCAGTCTCTGATGGAAAAGA
TCTCCGAGAAGATCCACCATCACGACTCGTCGTCTGACTCCGAGTACGAGAAACCTGATT
CGCCATCGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTTGTTTGGCAGAGAGAAACCTGTCCACA
AGGTTCTCGGTGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAAACTGTCA
GCTGCTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTTGAGTATCAC
TTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCC
AATGCTCACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAG
GAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATC
CTGCGAAGCATTGCCTT

QA 7 563 7 563
DS 

RD RR4AW37TF 711 0 0
GGGTCTCCATCCACTCACGTTCCATATATTTTCAAAAATCCTCTGTTCAATTTCGAAACT
CGTGAAAACCAATGGCGGAGGAAATTGAGAAATCGATGCCCGCGGAGCAGTCTCTGATGG
ACAAGATCTCCGAGAAGATCCACCATCACGACTCGTCGTCTGACTCCGAGTACGAGAAAC
CTGATTCGCCATCGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTTGTTTGGCAGAGAGAAACCTG
TCCACAAGGTTCTCGGTGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAA*
CTGTCAGCTGCTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTCGAG
TATCACTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTC
TGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTT
CCAGAGGAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTT
GTTATCCTGCGAAGCATTGCCTTAGGCAGGGACCGTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTT
GGTCTATGGATCATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATC
TGCTTCGTGTTGTTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAACACGAGGAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DM67TF 694 0 0
GG
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TGGCGGAGGAAATTGAGAAATCGATGCCCGCGGAGCAGTCTCTGATGGACAAGATCTCCG
AGAAGATCCACCATCACGACTCGTCGTCTGACTCCGAGTACGAGAAACCTGATTCGCCAT
CGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTTGTTTGGCAGAGAGAAACCTGTCCACAAGGTTC
TCGGTGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAA*CTGTCAGCTGCT
GTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTTGAGTATCACTTGTTG
AGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATGCT
CACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCT
TTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGA
AGCATTGCCTTAGGCAGGGACCGTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATC
ATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTG
TTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAACA

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4AU88TF 785 0 0
CCATCC
ACTCACGTTCCATATATTTTCAAAAATCCTCTGTTCAATTTCGAAACTCGTGAAAACCAA
TGGCGGAGGAAATTGAGAAATCGATGCCCGCGGAGCAGTCTCTGATGGACAAGATCTCCG
AGAAGATCCACCATCACGACTCGTCGTCTGACTCCGAGTACGAGAAACCTGATTCGCCAT
CGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTTGTTTGGCAGAGAGAAACCTGTCCACAAGGTTC
TCGGTGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAA*CTGTCAGCTGCT
GTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTCGAGTATCACTTGTTG
AGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATGCT
CACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCT
TTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGA
AGCATTGCCTTAGGCAGGGACCGTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATC
ATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTG
TTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAACACGAGGACAAGGTTGATCCATTTGCAGAG
AAAGCGTTCAAAGAGTTGCACAAACATTACCTTGTGTTTGATGAAAAGGTTGTTTCTAA

QA 7 785 7 785
DS 

RD RR4GZ59JQ 778 0 0
TGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAAACTGTCAGCTGCTGTTCTTGGTGTGGCCACTC
TCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTTGAGTATCACTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTT
CGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGA
GTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTT
CCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGAAGCATTGCCTTAGGCAGGG
ACCGTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATCATCTCGGTGGTAGGCAACT
GGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTGTTGCACACAGTGCCAATGA
TGTACGAGAAACACGAGGACAAGGTTGATCCATTTGCAGAGAAAGCGTTCAAAGAGTTGC
ACAAACATTACCTTGTGTTTGATGAAAAGGTTGTTTCTAAGATCCCCATTGCTTCCCTCA
AAGCTAAGTTGGGTTAACCAGAGACTTGTGTCTGTTTCCTTTCGTATACTTGTTTTTGTT
TTTTTGTTTTGATATTTTGATCAATGTGAAATTGGTGGGTCATTTTCAGAGTTTTGCACG
CTAATGACCCAAATGTTCTGCATCACATTTTGTTTGCAGTTTTTTT*GTTGTAATTTTTC
GAATTAAAAAGATATTACACATTTGCCTTTCCGGCTATTTATGGAGAATACTTGAACT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4DM67JQ 628 0 0
TTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGA
TTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACG
AACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGAAGCATTGCCTTAGGCAGGGACCGTAAAAAAT
TCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATCATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCC
TGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTGTTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAAC
ACGAGGACAAGGTTGATCCATTTGCAGAGAAAGCGTTCAAAGAGTTGCACAAACATTACC
TTGTGCTTGATGAAAAGGTTGTTTCTAAGATCCCCATTGCTTCCCTCAAAGCTAAGTTGG
GTTAACCAGAGACTTGTGTCTGTTTCCTTTCGTATACTTGTTTTTGTTTTTT*GTTTTGA
TATTTTGATCAATGTGAAATTGGTGGGTCATTTTCAGAGTTTTGCACGCTAATGACCCAA
ATGTTCTGCATCACGTTTTGTTTGCAGTTTTTTTTGTTGTAATTTTTCGAATTAAAAAGA
TATTACACATTTGCCTTTCCGGCTATT
C

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 5

CO CL1504Contig1 713 5 14 U
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CCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTG
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AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTTTGGTGA
AATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTGAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAT
ATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATATGATATGAAAGTGTTACGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4GK02TF U 1
AF RR4A873JQ C 1
AF RR4FE94TF U 296
AF RR4A873TF U 38
AF RR4GK02JQ C 1
BS 1 37 RR4GK02TF
BS 38 51 RR4A873TF
BS 52 52 RR4GK02TF
BS 53 193 RR4A873TF
BS 194 194 RR4GK02TF
BS 195 296 RR4A873TF
BS 297 389 RR4FE94TF
BS 390 391 RR4A873TF
BS 392 484 RR4FE94TF
BS 485 485 RR4A873TF
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BS 540 540 RR4A873TF
BS 541 711 RR4FE94TF
BS 712 713 RR4GK02JQ

RD RR4GK02TF 644 0 0
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CGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGGGAGATTAAAGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAG
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TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4A873JQ 712 0 0
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CCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGG
AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTTTGGTGA
AATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTGAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAT
ATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATATGATATGAAAGTGTTACG
G

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4FE94TF 416 0 0
G
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CTCCAAGCTTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAG
ATATTCATTGAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAAT
AATGTAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTT
TTATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATATGATATGAAAGTGTTACG

QA 2 416 2 416
DS 

RD RR4A873TF 675 0 0
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AGACGTTGAGATCAAAGCTCCAGCCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACA
AGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTGAAAACCTCAAGGGGTGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGAT
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CAATGAGAGGATCGAGGCAGTGGAACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGA
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AGGAGGATCTGGAGGTTTGGTGAAATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGT
GGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCCAAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAAT
GCTTTTGTCTAATGAGTAGATACTCATTGAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTAT
TTGAGTGTTTTATATCAATAATGTAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTAT
CTTTATGTATTTGGGTGTTTTATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATATGAT
ATGAAAGTGTTACG
G

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GK02JQ 713 0 0
GGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAG
CGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGGGAGATTAAAGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAG
CCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCATTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTG
AAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCA
CCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGG
AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTTTGGTGA
AATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTGAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAT
ATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATATGATATGAAAGTGTTACGAG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 5

CO CL1505Contig1 746 5 3 U
GAATTAAAATTGATATATAAATTAAACTTTAATTACAAATGATTCATAAGTTAAACTGGT
TTACATATAAAAAATAATTCAAATTTGGTTTACATGTAAACCAAAAAAATAAACAGAAAA
AAACTAAATCTAACAGAACCCTAATTCAGACACATCCTCCATCGTTATCCTTACCCTAGC
CGCTTCCATCAGGAAATCCTCCTCCATCCTCGACACTTAAGCCACGCCGTCAGCCACGTC
CTCCATCGTTATGCTCTCCGCCAGATCTGGTTCTCTACTCCTCTGCCTCTGCAGCTTCTT
CGTTCGTCTTTCCTTTCTCCCTCTCCAAACCCGTCTCTTTCGTGTGAGCTTTAGAAGCTT
GCTACATCTGTACTTTGTCGACAGGAAGAAGATAAACACAGATTTATAAACACAACAGAA
AAAGAATCAAACTTTACGCATTCAAAAGGTTAAGAAAAATGAGAAATCAAAAACACATTT
CTATAGAGAAACTGAAAAGAAAAGAGAGATCTAGGGAAAGAGAGGATATGAGAAATGGAG
ATTGGGAGATGGGTTTGAAGTTGAAGCGGTTTTGGTGAAGAACAACATTGGTCGGATGCG
TCAGATCTGTCAACACCAAAATCGATCTGTGAGGGTGGAGGCCAGAGGCCGAGACTGTTG
TTGATTGTGTACAGAGAGAATTTGAGATTGAGATGGTGAGACACAGAGAGATTTGTGAGA
AAGAGAATGGTGAGATAATTGTGTCC


BQ
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GTCC

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CC

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DS 



AS 1 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G648JQ U 140
AF RR4C802JQ U 1
AF RR4H214JQ U 1
AF RR4C802TF C 406
BS 1 353 RR4C802JQ
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BS 355 712 RR4C802JQ
BS 713 801 RR4H214JQ
BS 802 1240 RR4C802TF

RD RR4G648JQ 347 0 0
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GAACCAACGCCTTTGAGGACACCAACGATGGTTGTTGTTAGTGCAGAGTTCACGATGGTG
CAAAGAAACATGGTGAAGTTGAGGACAATGCCCATAACCAGTGAAAGAACAAGCAGCACC
AAGAACGGCAAGTAAAAACACTTTGCAAGTAGTAGAGATAAAGAGTTTGGGAATTCGCCA
GTAACTATGATGAGGAAGGACAAGAATGGGAGGGAAAGGAAGCTGTT

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4C802JQ 715 0 0
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GGTGTGCAAACCGAATCGGACCAGAAATTCTCATTTTTTATGAGCTTCCAAATCAGACAA
TGTCTTAGCCGGTTTAGCCTTTTTCTGCCGGTACTTGGCATAAGAGTACCACACACCACC
AGCTGTGTTGACCACCAAACCGGACACGTTCAGAGCATGCACTTCAACACCACCCAAGAG
GACAAAACCGAGCGTGGTGGAACCAACGCCTTTGAGGACACCAACGATGGTTGTTGTTAG
TGCAGAGTTCACGATGGTGCAAAGAAACATGGTGAAGTTGAGGACAATGCCCACAACCAG
TGAAAGAACAAGCAGCACCAAGAACGGCAAGTAAGAACACTTTGCAAGTAGTAGAGATAA
AGAGTTTGGGAATTCGCCAGTAACTATGATGAGGAAGGACAAGAATGGGAGGGAAAGGAA
GCTGTTATAGAACATTATCTCTATCGAGGACAGCCCGTCTTCTGCACCAGACTTCTCCAC
CAGCACGAGGTACATGGTCTGGAAAAAGACAGATGTTAAAGCCAAACCATACCCGAAAAG
ATCAAAAGAAAAATCTCCAAGAGCTGCAATTACACAACCTGCAGCCGTCAGTAGTACAGA
TAGAGCAACCTGAGTTGTTGGTTTGCCGCCTTTACCAAAGAGATAACCAGCA
TCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4H214JQ 801 0 0
AG
CGTAACATCCATGGTTTTATATATTTGAATATTCTGAGCAGTATAAAATTTATTTTTTGG
TGTGCAAACCGAATCGGACCAGAAATTCTCATTTTTTATGAGCTTCCAAATCAGACAATG
TCTTAGCCGGTTTAGCCTTTTTCTGCCGGTACTTGGCATAAGAGTACCACACACCACCAG
CTGTGTTGACCACCAAACCGGACACGTTCAGAGCATGCACTTCAACACCACCCAAGAGGA
CAAAACCGAGCGTGGTGGAACCAACGCCTTTGAGGACACCAACGATGGTTGTTGTTAGTG
CAGAGTTCACGATGGTGCAAAGAAACATGGTGAAGTTGAGGACAATGCCCATAACCAGTG
AAAGAACAAGCAGCACCAAGAACGGCAAGTAAGAACACTTTGCAAGTAGTAGAGATAAAG
AGTTTGGGAATTCGCCAGTAACTATGATGAGGAAGGACAAGAATGGGAGGGAAAGGAAGC
TGTTATAGAACATTATCTCTATCGAGGACAGCCCGTCTTCTGCACCAGACTTCTCCACCA
GCACGAGGTACATGGTCTGGAAAAAGACAGATGTTAAAGCCAAACCATGCCCGAAAAGAT
CAAAAGAAAAATCTCCAAGAGCTGCAATTACACAACCTGCAGCCGTCAGTAGTACAGATA
GAGCAACCTGAGTTGTTGGTTTGCCGCCTTTACCAAAGAGATAACCAGCAATCAAAACAG
CGAGTGGAGTGAGTCTCTTGATTGCGATATACATAGGAATATTGACTCCTTTCAAGCTAG
CAAGAGCAAATGCAACATT

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR4C802TF 835 0 0
AAGTAGTAGAGATAAAGAGTT*GGGAAT*CGCCAGTAACTATGATGAGGAAGGACAAGAA
TGG*AGGGAAAGGAAGCTGTTATAGAACAT*ATCTCTATCGAGGACAGCCCGTCTTCTGC
ACCAGACTTCTCCACCAGCACGAGGTACATGGTCTGGAAAAAGACAGATGTTAAAGCCAA
ACCATACCCGAAAAGATCAAAAGAAAAATCTCCAAGAGCTGCAATTACACAACCTGCAGC
CGTCAGTAGTACAGATAGAGCAACCTGAGTTGTTGGTTTGCCGCCTTTACCAAAGAGATA
ACCAGCAATCAAAACAGCGAGTGGAGTGAGTCTCTTGATTGCGATATACATAGGAATATT
GACTCCTTTCAAGCTAGCAAGAGCAAATGCAACATTAGCATTGTAGAAGATTGAAACGGG
AAGAAGCTTTTTCGCGGTGGCCAAATCGATTCCTCTGGCTCTTGTGTACCCCATTCTTCT
GCCACAGTGAATAAGCAAAGAAGTAGCCAATTGCTGTAGAGTAAGAACAGTCATGGAGTG
TGGATACTGCATGATGACAGCTTTGTTGATAAAGACCATAGCCATTGAAGCAATGCCATA
TGAAACAGCTGCGACTAAACTAATGGACGAGCTGGGCTCCATTTCGGGTTGAACCTCCAT
GGAAAAGAAGAGTGCTTTCCGAGATTTTAAATCTAAATGCACAGTAATCAAAGAACAATC
ACGAGATGGTTCCTTAGGGAACACGTTTCTTATCGTGATTCAAAACGCATTACAAGGAGA
AAGGTCGATTAAAAATTTGATTGTTTAATCAGCTTTTCATTTTCTGTTTCGTTCC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 2 5

CO CL1507Contig1 1035 3 30 U
GGATTAACACAATCGTCGCTGCTCTTTCATTCCTCTCTTTCACCGGTAATGGCAAAACTC
TCTCAACGGAACAAGAAGATCATTGAGGACGAAACTATTGATAACACAGCCATTGCGTCT
GCGTCGTCCGTGGTCTTTAAATGCAAACGCAAACGGAAGTCGCCGCCTCAAAACGCTCCT
CCGCAACGCAGCTCCTCCCACAGAGGGGTGACAAGGCATAGATGGACAGGGAGATACGAG
GCGCATTTGTGGGATAAGAACAGCTGGAACGAGACGCAGACCAAGAAAGGACGTCAAGTT
TATCTAGGAGCATATGACGAAGAAGAAGCAGCAGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCATTG
AAGTATTGGGGAAGAGACACACTCTTGAACTTCCCTCTATCTACTTACGAAGAAGACATC
AAAGAAATGGAAGGCAACTCCAGGGAAGAGTACATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGTAGT
GGATTTTCTCGCGGTGTTTCAAAATACAGAGGCGTTGCAAGGCACCACCATAATGGGAGA
TGGGAAGCTCGGATTGGAAGGGTGTTTGGTAATAAATATCTATACCTTGGGACATACGCA
ACGCAAGAATAAGCAGCCAGAGCATACGACATCGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTTAAC
GCCGTTACCAACTTCGACGTCAGCCGTTATCTAGACTTACCGGCATCGAAAAAAACCAAC
GCCGCCGCAAGTCCAGAATCGCCAAATGATCAAACATCGTCGGATGATACAAAAACAGAG
GAGATAACCGAACCGTCTACGCCGCCGGAAGCTATTCAATCTCGCCGGAGCTTTCCCGAC
GACATCCAGACGTATTTCGAGTGTCAGGATTCCGGCAAGTTAGCGACGGAGGAAGACGTT
GTCTTCGGTGGTTTTAGTTCTTTCATAAGCCCTGGTTTATGTAACGAGTTTGATTATTGG
TCTTGATCGTTATGTTTACCATGTTATGCTTCAAAAAAAATGATTACTTGGCGGTAAAGT
TATGCTGTTTCAATC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H083TF U 1
AF RR4F922TF U 1
AF RR4H083JQ C 200
BS 1 52 RR4F922TF
BS 53 53 RR4H083TF
BS 54 87 RR4F922TF
BS 88 88 RR4H083TF
BS 89 239 RR4F922TF
BS 240 240 RR4H083TF
BS 241 265 RR4F922TF
BS 266 266 RR4H083TF
BS 267 407 RR4F922TF
BS 408 408 RR4H083TF
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BS 443 443 RR4H083TF
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BS 610 610 RR4H083TF
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BS 711 711 RR4H083JQ
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BS 753 753 RR4H083JQ
BS 754 755 RR4F922TF
BS 756 756 RR4H083JQ
BS 757 769 RR4F922TF
BS 770 1035 RR4H083JQ

RD RR4H083TF 666 0 0
GG
ATTAACACAATTGTCGCTGCTCTTTCATTCCTCTCTTTCACCGGTAATGGCAAAACTCTC
TCAACGGAACAAGAAGATCATTGAGGACGAAACTATTGATAACACAGCCATTGCGTCTGC
GTCGTCCGTGGTCTTTAAATGCAAACGCAAACGGAAGTCGCCGCCTCAAAACGCTCCTCC
GCAACGCAGCTCCTCCCACAGAGGGGTGACAAGGCATAGATGGACAGGGAGATACGAGGC
GCATTTGTGGGATAAGAACAGCTGGAACGAGACGCAGACCAAGAAAGGACGTCAAGTTTA
TCTAGGAGCATATGACGAAGAAGAAGCAGCAGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCATTGAA
GTATTGGGGAAGAGACACACTCTTGAACTTCCCTCTATCTACTTACGAAGAAGACATCAA
AGAAATGGAAGGCAACTCCAGGGAAGAGTACATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGTAGTGG
ATTTTCTCGCGGTGTTTCAAAATACAGAGGCGTTGCAAGGCACCACCATAATGGGAGATG
GGAAGCTCGGATTGGAAGGGTGTTTGGTAATAAATATCTATACCTTGGGACATACGCAAC
GCAAGAATAAGCAGCCAGAGCATACGACATCGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTTAACGC
CGTT

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4F922TF 785 0 0
GGATTAACACAATCGTCGCTGCTCTTTCATTCCTCTCTTTCACCGGTAATGGTAAAACTC
TCTCAACGGAACAAGAAGATCATTGAGTACGAAACTATTGATAACACAGCCATTGCGTCT
GCGTCGTCCGTGGTCTTTAAATGCAAACGCAAACGGAAGTCGCCGCCTCAAAACGCTCCT
CCGCAACGCAGCTCCTCCCACAGAGGGGTGACAAGGCATAGATGGACAGGGAGATACGAA
GCGCATTTGTGGGATAAGAACAGCTAGAACGAGACGCAGACCAAGAAAGGACGTCAAGTT
TATCTAGGAGCATATGACGAAGAAGAAGCAGCAGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCATTG
AAGTATTGGGGAAGAGACACACTCTTGAACTTCCCTCTATCTACTTATGAAGAAGACATC
AAAGAAATGGAAGGCAACTCCAAGGAAGAGTACATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGTAGT
GGATTTTCTCGCGGTGTTTCAAAATACAGAGGCGTTGCAAGGCACCACCATAATGGGAGA
TGGGAAGCTCGGATTGGAAGGGTGTTTGGTAATAAATATCTATACCTTGGGACATACGCA
ACGCAAGAAGAAGCAGCCAGAGCATACGACATCGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTTAAC
GCCGTTAC*AACTTCGACGTCAGCCGTTATCTAGACTTACCGGCATCGAAGAAACCCAAC
GCCGCTGCAAGTCCAGACTCGCCAAATGATCAGACTTCGTCGGATGATA
GCGATGTACGAAAACA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4H083JQ 836 0 0
ACAGAGGGGTGACAAGGCATAGATGGACAGGGAGATACGAGGCGCATTTGTGGGATAAGA
ACAGCTGGAACGAGACGCAGACCAAGAAAGGACGTCAAGTTTATCTAGGAGCATATGACG
AAGAAGAAGCAGCAGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCATTGAAGTATTGGGGAAGAGACA
CACTCTTGAACTTCCCTCTATCTACTTACGAAGAAGACATCAAAGAAATGGAAGGCAACT
CCAGGGAAGAGTACATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGTAGTGGATTTTCTCGCGGTGTTT
CAAAATACAGAGGCGTTGCAAGGCACCACCATAATGGGAGATGGGAAGCTCGGATTGGAA
GGGTGTTTGGTAATAAATATCTATACCTTGGGACATACGCAACGCAAGAATAAGCAGCCA
GAGCATACGACATCGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTTAACGCCGTTACCAACTTCGACG
TCAGCCGTTATCTAGATTTACCGGCATCGAAAAAAATCAACGCCGCCGCAAGTCCAGAAT
CGTCAAATGATCAAACATCGTCGGATGATACAAAAACAGAGGAGATAACCGAACCGTCTA
CGCCGCCGGAAGCTATTCAATCTCGCCGGAGCTTTCCCGACGACATCCAGACGTATTTCG
AGTGTCAGGATTCCGGCAAGTTAGCGACGGAGGAAGACGTTGTCTTCGGTGGTTTTAGTT
CTTTCATAAGCCCTGGTTTATGTAACGAGTTTGATTATTGGTCTTGATCGTTATGTTTAC
CATGTTATGCTTCAAAAAAAATGATTACTTGGCGGTAAAGTTATGCTGTTTCAATC

QA 1 836 1 836
DS 



CO CL1507Contig2 749 2 2 U
GAAAAAATTCTCTTAGTGGTGTTGTGTTTTTATAAAAAAGTTGCTACCTTTAATTGAACA
ATGGTAACTCTACCGCCAAGTAATCATTTTTTTGAAGCATAACATGGTAAACATAACGAT
CAAGACCAATAATCAAACTCGTTACATAAACCAGGGCTTATGAAAAAATTAAAACCACCG
AAAACAACGTCTTCCTCCGTCCCTAACTTGCCGGAATCCTGACACTCGAAATACGTCTGG
ATGTCGTCGGGAAAGCTCCGGCGAGATTGAATAGCTTCCGGCGGCGTAAACGGTTCGGTC
ATCTCCTCTGTTTTCGTACATTCGCTATCATCCGACGAAGTCTGATCATTTGGCGAGTCT
GGACTTGCAGCGGCGTTGGGTTTCTTCGATGCCGGTAAGTCTAGATAACGGCTGACGTCG
AAGTTGGTAACGGCGTTAAGTCCACGGTACTCTATTGCCGCGATGTCGTATGCTCTGGCT
GCTTCTTCTTGCGTTGCGTATGTCCCAAGGTATAGATATTTATTACCAAACACCCTTCCA
ATCCGAGCTTCCCATCTCCCATTATGGTGGTGCCTTGCAACGCCTCTGTATTTTGAAACA
CCGCGAGAAAATCCACTACTTTTCCTTCTCAAAGATCCTATGTACTCTTCCTTGGAGTTG
CCTTCCATTTCTTTGATGTCTTCTTCATAAGTAGATAGAGGGAAGTTCAAGAGTGTGTCT
CTTCCCCAATACTTCAATGCCGCTAAGTC


BQ
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G
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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G
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TT

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GGT

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DS 

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AAACGCCGTCGTATTACTCACGCACTCTTCTTCCCCCTCCTTCTTCTAACCCACCGACGA
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QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 6

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4GE34TF U 1
AF RR4AL83TF U 127
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AF RR4AL83JQ C 753
AF RR4DV35JQ C 778
AF RR4GE34JQ C 1071
BS 1 708 RR4GE34TF
BS 709 709 RR4AL83TF
BS 710 724 RR4GE34TF
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BS 726 740 RR4GE34TF
BS 741 741 RR4AL83TF
BS 742 751 RR4GE34TF
BS 752 919 RR4AL83TF
BS 920 920 RR4DV35TF
BS 921 937 RR4AL83TF
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BS 1222 1487 RR4AL83JQ
BS 1488 1490 RR4DV35JQ

RD RR4GE34TF 755 0 0
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CGATTTCAACACAACGTTTAGGTTCGTACCATTCTTCAACAAGGAGATGATGATCAAAAA
CCAAGCATCATGTTTCGTCTATGGAGCACCAGGTTCCTTCTACTCTAGGCTCTTCTCTCG
CAACAGCCTCCACCTTATACACTCCTCGTACGCTCTCCACTGGCTCTCTAAGGTTCCAGA
AAAACTCGAAAATGATAAGGAAAATGTGTTCATAACAAATTCAAGTCCTCTAAGTGCATA
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AGAA*TTGTCTCTAACGGACTAATGGTTTTT
AGCT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4AL83TF 811 0 0
G
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ATGGTGAATGTAAACTTCCCTAACTATATCAAAGTTGCTGAATTGGGATGTTCCTCGGGG
CAAAACACGTTTTTGGCTATCTCTGAGATCATCAACACCATCAATGTGTTGTGCCAAGAC
TCTAACCAAAACCCTCCGGAAATCGATTGTTGTCTGAATGATCTTCCCGAAAACGATTTC
AACACAACGTTTAGGTTCGTACCATTCTTCAACAAGGAGATGATGATCAAAAACCAAGCA
TCATGTTTCGTCTATGGAGCACCAGGTTCCTTCTACTCTAGGCTCTTCTCTCGCAACAGC
CTCCACCTTATACACTCCTCGTACGCTCTCCACTGGCTCTCTAAGGTTCCAGAAAAACTC
GAAAATGATAAGGAAAATGTGTTCACAACAAATTCAAGTCCTCTAAGTGCATACAAAGCT
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AAACGAACAAGA*CTCAAAGAAGTGATAGA

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DS 

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G
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ACAGCCTCCACCTTATACACTCCTCGTACGCTCTCCACTGGCTCTCTAAGGTTCCAGAAA
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AAGCTTATTTGAATCAATTCCAAAGAGACTTCACAATGTTTCTTAGGATACGTTCTGAAG
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GATCCATTGTATAGAGATTGTTGTCACTTTTGGACACTGCTATCAAAATCACTCCGTGAC
CTAGTCTTCGAGGGCCTAGTGAGTAAACAAAAACTGGAAGCATTCAACATGCCATTTTAT
GATCCAAACGAACAAGAACTCAAAGAAGTGATAGAAAACGAAGGTTCTTTTGAAATCAAT
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AAATAATCAGCATTTGCTT

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR4AL83JQ 735 0 0
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TATGTTCTATGTGTGATTGTAAGAACTCTTGCTCAATATTTGTAATAATCATCAATGATA
AATTGCATTGACAAT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4DV35JQ 713 0 0
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TTTATGATCCAAACGAACAAGAACTCAAAGAAGTGATAGAAAACGAAGGTTCTTTTGAAA
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TGCTCATTGCTCATTTTGGAGAAGATGTTATCGATATCTTGTTTGATAAGTATGCTCGCC
ACGTGACACAACACTCAAGCTGCAGAAACAAAACAAGTGTCACTCTTGTCCTTTCGTTGA
CTAAGAAATAATCAGCATTTGCTTGAAAAAAATGCTTCTATATTTACTTATTATTTCCCG
ATTCCGTTAATAAATTCTAAGACATGCCCTTCATGTGATGATGTGATGCGTGTCCTGGAA
AACAGATTGTGATTGTAATATGTTATATGTTCTATGTGTGATTGTAATATGTTATACTTA
TATGTTCTATGTGTGATTGTAATATGTTATACGTATATGTTCTATGTGTGATTGTAAGAA
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QA 1 713 1 713
DS 

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GCTCGCCACGTGACACAACACTCAAGCTGCAGAAACAAAACGAGTGTCACTCTTGTCCTT
TCGTTGACTAAGAAATAATCAGCATTTGCTTGAAAAAAATGCTTCTATATTTACTTATTA
TTTCCCGATTCCGTTAATAAATTTTAAGACATGCCCTTCATGTGATGATGTGATGCGTGT
CCTGGAAAACAGATTGTGATTGTAATATGTTATATGTTCTATGTGTGATTGTAATATGTT
ATACTTATATGTTCTATGTGTGATTGTAATATGTTATACGTATATGTTCTATGTGTGATT
GTAAGAACTCTTGCTCAATATTTGTAATAATCATCAATGATAAATTGCATTGACAAT
G

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 6

CO CL1510Contig1 873 6 12 U
GGAACAGAACAGATACTGAAAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGAC
CTTAACACTCTCACCAGCACCTGCACTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGT
AGAACGGGAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACAA
CAGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTT
GGCGAAAGTAATGTCTCTCTAGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTT
CCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGTACAAGAACGTTCTTG
AAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAG
AATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGACTTGATCGGAGCAGACACGTTAAACTATGTT
AAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCT
GTTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAAC
TTTGAAAAGCTCGAAGATGCAGCAAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACAGAAGCGTGTTAT
AAAGATACAAAGATAATTCTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAGGCCCCAGT
TCCGGTTCTAAAACACCGTTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATGATTCCATGGTTCATAA
CTCTTCCATTGGTCATGAAAATGTAATATTAATTTGTTGCTGCCTTCACTGTAGTTCAAG
TACTTTTGTTGAGTAAAAATATACTCAATATCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G034TF U 1
AF RR4BV64JQ C 163
AF RR4EO08TF U 25
AF RR4AE09TF U 4
AF RR4G034JQ C 129
AF RR4EO08JQ C 225
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GGCGAAAGTAATGTCTCTCTAGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTT
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AAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAG
AATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGACTTGATCGGAGCAGACACGTTAAACTATGTT
AAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACTTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCT
GTTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAAC
TTTGAAAAGCTCGAAGATGCAGCAAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACAGAAGCGTGTTAT
AAAGATACAAAGATAATTCTTCAAGAG*TTATGATCAGAATGGCGTGAAAAG*CCCCAGT
TCCG
TTCTA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BV64JQ 609 0 0
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TCTCTAACTGGAGCTTTTGGCGAAAGTAATGTCTCTCTAGCACAAGACAACAATGGTTTT
TGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACG
GGTACAAGAACGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGA
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GACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCCACGAT
TTCGACAACCTCATCTCTGTTGCTGCCTCTCGAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCC
AATATACTCTTCGACGACTTTGAAAAGCTCGAAGATGCAGCAAAAAGGAAGAACTTAGCT
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GCGTGAAAAGGCCCCAGTTCCGGTTCTAAAACACCGTTTTAATTGCTAT*GAAGAAGAGA
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QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4EO08TF 703 0 0
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GTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACAACAGCTCACAAGACGGATGGCTTTG
GGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTTGGCGAAAGTAATGTCTCTCTAGCA
CAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTACAACAAC
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GAGGACTTGATCGGAGCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCC
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AAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGATACAAAGATAATTCTTCAA
GAGGT*ATGATCAGAATGGCGTGAAAAGGCCCCAGTTCCG
TTC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4AE09TF 781 0 0
GG
AGAACAGATACTGAAAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTAA
CACTCTCACCAGCACCTGCACTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGTAGAAC
GGGAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACAACAGCT
CACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTTGGCGA
AAGTAATGTCTCTCTAGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAAC
TCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGTACAAGAACGTTCTTGAAGAA
AGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCAAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGAATGC
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GTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCTGTTGC
TGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATATACTCTTCGACAACTTTGA
AAAGCTCGAAGATGCAGCAAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGA
TACAAAGATAATTCTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAGGCCCCAGTTCCGG
TTCTAAAACACCGTTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATGATTCCATGGTTCATAACTCT

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR4G034JQ 697 0 0
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AAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTTGGCGAAAG
TAATGTCTCTCTAGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCC
TCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGTACAAGAACGTTCTTGAAGAAAGG
AGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGAATGCATT
CGATCTCTTGGCAATGGAGGACTTGATCGGAGCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTA
CTTGAGGCTTAAGTCCACTTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCTGTTGCTGC
CTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAACTTTGAAAA
GCTCGAAGATGCAGCAAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGATAC
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TAAAACACCGTTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATGATTCCATGGTTCATAACTCTTCCA
TTGGTCATGAAAATGTAATATTAATTTGTTGCTGCC
G

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4EO08JQ 649 0 0
TCTAACTGGAGCTTTTGGCGAAAGTAATGTCTCTCTAGCACAAGACAACAATGGTTTTTG
GATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGG
TACAAGAACGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAAC
ATATAGAGTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGACTTGATCGGAGCAGA
CACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTT
CGACAACCTCATCTCTGTTGCTGCCCCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAA
TAGACTCTTCGACAACTTTGAAAAGCTCGAAGATGCAGCAAAAAGGAAGAACTTAGCTGA
GACAGAAGCGTGTTATAAAGATACAAAGATAATTCTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGC
GTGAAAAGGCCCCAGTTCCGGTTCTAAAACACCGTTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATG
ATTCCATGGTTCATAACTCTTCCATTGGTCATGAAAATGTAATATTAATTTGTTGCTGCC
TTCACTGTAGTTCAAGTACTTTTGTTGAGTAAAAATATACTCAATATCT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 6

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ACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAATTAAGCTCAAACAAAAGATTG
TCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGCAGA
GCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTTTC
CGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCGCTG
GTCCCGGAATTGCAGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGCTGCTA
AGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGACTATGG
AAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCATGCTT
CTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGGGAGCG
TGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGA
TCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCAAAA
TTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGT
GTGTGGTTGTTTATCACATATACTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4G296TF U 1
AF RR4D180JQ C 121
AF RR4D180TF U 121
AF RR4BL08JQ C 56
AF RR4G296JQ C 350
AF RR4BL08TF U 56
BS 1 744 RR4G296TF
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RD RR4G296TF 744 0 0
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GCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTTTC
CGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCGCTG
GTCCCGGAATTGCAGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGCTGCTA
AGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGACTATGG
AAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCATGCTT
CTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGGGAGCG
TGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGA
TCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCAAAA
TTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGT
GTGTGGTTGTTTATCACATATACT

QA 1 744 1 744
DS 

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GG
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TTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCGCTGGT
CCCGGAATTGCAGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGCTGCTAAG
GTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGACTATGGAA
GTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCTTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCATGCTTTT
CTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGGGAGCGTG
AGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATC
AAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCAAAATT
GTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGTGT
GTGGTTGTTTATCACATAT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR4D180TF 621 0 0
GG
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ACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTTTCCG
TTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCGCTGGT
CCCGGAATTGCAGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGCTGCTAAG
GTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGACTATGGAA
GTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCTTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCATGCTTCT
CTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGGGAGCGTG
AGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATC
AAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCAAAATT
GTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGTGT
GTGGTTGTTTATCACATAT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR4BL08JQ 694 0 0
GG
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TTGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGC
AGAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATT
TTCCGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCG
CTGGTCCCGGAATTGCAGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGCTG
CTAAGGTCGTCGACAAGGCCAAAGGAACCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGACTA
TGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCATG
CTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGGGA
GCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTA
AGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCA
AAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTT
TGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACTCTTTT

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR4G296JQ 400 0 0
TACCGCTGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGA
CGCGACTATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAA
ACACCATGCTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGT
TATGGGGAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAA
GAAGCCTAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAG
TCAAATCAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAG
ACAATCTTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACT
CTTTT

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DS 

RD RR4BL08TF 694 0 0
GG
GCTACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAATTAAGCTCAAACAAAAGA
TTGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGC
AGAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATT
TTCCGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCG
CTGGTCCCGGAATTGCAGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGCTG
CTAAGGTCGTCGACAAGGCCAAAGGAACCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGACTA
TGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCATG
CTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGGGA
GCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTA
AGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCA
AAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTT
TGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACT
CTTTT

QA 3 689 3 689
DS 



AS 1 6

CO CL1512Contig1 836 6 9 U
GGAAGAAAAAAAAAAATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACA
AGCTTCCTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGTCATCATTCTCTTCCTCAGTCGCCCTGTGCTCA
GCGACACTGATGAAGAGGACGTCCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGA
ATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGATC
AATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAAC
CACAGTTCTCAGATTACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAA
GAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAA
ACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATACCAAGTATACAGGGATGGGGA
TTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACT
ATTCTCCAGCTACGAAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATT
ACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTAC
CACACATGTTATGAGTTTTTTTTT**GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACT
AAATTTCTTTAAAGTTTTTATACATATTAAAAGGCATCTTAAATTCTAATTATAAACAAA
AAAAATTTTGTGATTAACTACTTTATAATTTTAAAGTAATAAACATAACAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS90JQ C 2
AF RR4AS90TF U 2
AF RR4FG44TF U 3
AF RR4GR54JQ C 1
AF RR4DZ76TF U 15
AF RR4DZ76JQ C 119
BS 1 6 RR4GR54JQ
BS 7 675 RR4AS90TF
BS 676 683 RR4FG44TF
BS 684 684 RR4GR54JQ
BS 685 712 RR4FG44TF
BS 713 722 RR4DZ76TF
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BS 754 836 RR4DZ76JQ

RD RR4AS90JQ 674 0 0
GCGAG
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CAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGATCAATTCA
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TCTCAGATTACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACG
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TGTTATGAG

QA 6 674 6 674
DS 

RD RR4AS90TF 674 0 0
GCGAG
AAAAAAAAAATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTC
CTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGTCATCATTCTCTTCCTCAGTCGCCCTGTGCTCAGCGACA
CTGATGAAGAGGACGTCCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCA
CAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGATCAATTCA
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TCTCAGATTACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACG
GCTCTATTATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCA
CCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATACCAAGTATACAGGGATGGGGATTGGTA
AGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTC
CAGCTACGAAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGC
TTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACA
TGTTATGAG

QA 6 674 6 674
DS 

RD RR4FG44TF 710 0 0
GGGA
AAAAAAAAAATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTC
CTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGTCATCATTCTCTTCCTCAGTCGCCCTGTGCTCAGCGACA
CTGATGAAGAGGACGTCCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCA
CAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGATCAATTCA
AGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGT
TCTCAGATTACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACG
GCTCTATTATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCA
CCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATACCAAGTATACAGGGATGGGGATTGGTA
AGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTC
CAGCTACGAAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGC
TTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACA
TGTTATGAGTTTTTTTT***GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGT

QA 5 710 5 710
DS 

RD RR4GR54JQ 724 0 0
GGAAGAAAAAAAAAAATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACA
AGCTTCCTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGTCATCATTTTCTTCCTCAGTCGCCCTGTGCTCA
GCGACACTGATGAAGAGGACGTCCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGA
ATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGATC
AATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAAC
CACAGTTCTCAGATTACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTTTCAGACACAA
GAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAA
ACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATACCAAGTATACAGGGATGGGGA
TTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACT
ATTCTCCAGCTAA*AAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATT
ACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTAC
CACACATGTTATGAGTTTTTTTTTTTGTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACT
AA
AT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4DZ76TF 745 0 0
AATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTCCTCTTCTT
CTCCTTCTCTCAGTCATCATTCTCTTCCTCAGTCGCCCTGTGCTCAGCGACACTGATGAA
GAGGACGTCCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACAACCTTA
AACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGATCAATTCAAGAACAAA
CCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAGAT
TACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTATT
ATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCG
CAATACTCCATGAGTTTGAACGATACCAAGTATACAGGGATGGGGATTGGTAAGGAAGAT
GATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACG
AAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGCTTTC
ACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTTATGA
GTTTTTTTT***GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAA*TTTCTTTAAAG
TTTTTATACATATTAAAAG
CATCTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4DZ76JQ 718 0 0
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GAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTAGCCGA
TCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGTTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGA
ACCACAGTTCTCAGATTACCCCAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTTTCAGACAC
AAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCAC
AAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATACCAAGTATACAGGGATGGG
GATTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAA
CTATTCTCCAGCTACGAAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAA
TTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCT
ACCACACATGTTATGAGTTTTTTTTT**GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTA
CTAAATTTCTTTAAAGTTTTTATACATATTAAAAGGCATCTTAAATTCTAATTATAAACA
AAAAAAATTTTGTGATTAACTACTTTATAATTTTAAAGTAATAAACATAACAATTTCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 6

CO CL1513Contig1 996 6 17 U
TTTTTTTGCTATCGTCGTCAAGAGCCCGAGAGAGAGAGAGAGGAATCGGTTGTGTGTTGT
CGAAGCTTCTTGGCTCTCTCTTCTCTTGTTAACGCGCTTATCTCATCTGCGATCTCTCGT
TGATCAGAGGATTTCCAGAGCTTCAGAGATCAACAATCATGGCCACCGCTGGAGGAAACA
AGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGGGATGTTGGAGCTGGAAAATCAAGTCTTG
TGCTTCGATTCGTTAAAGATCAGTTTGTTGAATTCCAGGAATCAACGATAGGTGCAGCTT
TCTTCTCTCAAACATTGGCTGTCAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTG
CTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGG*CTCCTATGTACTACCGGGGTGCTGCTGCTGCC
ATTATTGTCTTTGACATTACTAATCAAGCCTCATTTGAGAGGGCTAAGAAATGGGTTCAG
GAACTTCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTCTTGCTGGAAACAAAGCTGAT
TTATTAGATGCAAGGAAAGTGTCTGCCGAGGAGGCAGAGACGTACGCACAAGAGAACAGC
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AATCGCAAAA*GGCTACCACGTGTACAGCCAGCAGAAAACCCAGCAGGAATGGTTCTCCC
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CTCTTGGTTAGTCACTGTAGAAAGGAAACATCCAGTCTCTTTATGTGTTTTCTTCTTGTC
TTAACGTTGTCGCTTTGCTTTGCATTGTATATCAAGATGTTTCCGCTCTGTGGAAATCTA
AAGATACTTGTATTTGAAGAGGTTTGATTTGTAATTAGATATCACAACTTACTATGCGTG
TGATCGCTTCTCTATATATTGTGCACCAAAATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AGGATTTCCAGAGCTTCAGAGATCAACAATCATGGCCACCGCTGGAGGAAACAAGAACAT
CAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGGGATGTTGGAGCTGGAAAATCAAGTCTTGTGCTTCG
ATTCGTTAAAGATCAGTTTGTTGAATTCCAGGAATCAACGATAGGTGCAGCTTTCTTCTC
TCAAACATTGGCTGTCAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTGCTGGTCA
GGAACGTTACCATAGCTTGG*CTCCTATGTACTACCGGGGTGCTGCTGCTGCCATTATTG
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TCTTCTCTCAAACATTGGCTGTCAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTG
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CTC

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AAGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGGGATGTTGGAGCTGGAAAATCAAGTCTT
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TCTCT*GGTTAGTCACTGTAGAAAGGAAACATCCAGTCTCTTTATGTGTTT
CTCTGTC

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ATACTGCTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGG*CTCCTATGTACTACCGGGGTGCTGCT
GCTGCCATTATTGTCTTTGACATTACTAATCAAGCCTCATTTGAGAGGGCTAAGAAATGG
GTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTCTTGCTGGAAACAAA
GCTGATTTATTAGATGCAAGGAAAGTGTCTGCCGAGGAGGCAGAGACGTACGCACAAGAG
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TTT
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TCTCTCTCTTGGTTAGTCACTGTAGAAAGGAAACATCCAGTCTCTTTATGTGTTTTCTTC
TTGTCTTAACGTTGTCGCTTTGCTTTGCATTGTATATCAAGATGTTTCCGCTCTGTGGAA
ATCTAAAGATACTTGTATTTGAAGAGGTTTGATTTGTAATTAGATATCACAACTTACTAT
GCGTGTGATCGCTTCTC
C

QA 4 320 4 320
DS 



AS 1 4

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ACATTAGGAAGCATCTGCTGCACCATAAATGCATTATTTTGTTTTAGAATGTATGATTCA
TTCTGGAGCATGCTCTAGTAAAATGACAAAAGCTTCACCAAAGAAACCATCTCTTCCGAG
TAGAAGGTTTCGCCGACTGATCAGGCGCTTCCTTTTTCCTGTTTTCCATTCCTTGCTTCA
GTGACTCCAGTCTTTTTTTGGTATCCGTCATACGACCGTGCAAACTCCATCTCCGACGAA
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CAGCTTCAAGCTGAGTAATCCTTTCCTTAGCAAGACCAATAGGCATTGACGATCCTAACT
TGTATTCGCTCTCTTGAAGCCTTACTCTCAATACCTTGTCCCTGTTTTCAGCACACTGAC
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AAAGATTCCTCAAAATACCATCGCAGAGTTCAACACCTTGGAGGACATGTGAAGCAATTT
CAGGAGGGATGACAGGAGATGGAGGACCCATCATTAGGTCGTCACCGACCAGTATGGTTT
CCTCCATCATTGGCTGTGAATCAACATCCATGGCTGCTGCGTATCAGAACAGACCAAAAC
CTGTGAACCCGAGAGAGTCGCCGGGAGATGTCGAGAGAGACGAAGATGGAGAGTCGCCGA
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GAACCCAAAACGAAACTGAAGAACCCTAAAACGAAACCCATCAACACAACACAATCACAT
ACTCACAAGTCCC


BQ
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20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D556JQ U 1
AF RR4EQ69JQ U 2
AF RR4FG88JQ U 2
AF RR4EQ69TF C 390
BS 1 395 RR4D556JQ
BS 396 396 RR4EQ69JQ
BS 397 544 RR4D556JQ
BS 545 545 RR4EQ69JQ
BS 546 567 RR4D556JQ
BS 568 711 RR4EQ69JQ
BS 712 1033 RR4EQ69TF

RD RR4D556JQ 567 0 0
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AAAGGTTCCTCAAAATACCATCGCAGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4EQ69JQ 710 0 0
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TCTGGAGCATGCTCTAGTAAAATGACAAAAGCTTCACCAAAGAAACCATCTCTTCCGAGT
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GTATTCGCTCTCTTGAAGCCTTACTCTCAATACCTTGTCCCTGTTTTCAGCACACTGACG
ATACAAGGCAAGCTCATCTTGGCAAAATGGTTCAATATCATTAATTTGCAAGCATAGGAA
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CTCCATCATTGGCTGTGAATCAACATCCATGGCTGCTGCGTATCAGAACA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4FG88JQ 706 0 0
CACAATTCAAAAGAGTGCTTTAAGTAAATAATTTTTACTTTCCATACAAAATTATGGTTA
CATTAGGAAGCATCTGCTGCACCATAAATGCATTATTTTGTTTTAGAATGTATGATTCAT
TCTGGAGCATGCTCTAGTAAAATGACAAAAGCTTCACCAAAGAAACCATCTCTTCCGAGT
AGAAGGTTTCGCCGACTGATCAGGCGCTTCCTTTTTCCTGTCTTCCATTCCTTGCTTCAG
TGACTCCAGTCTTTTTTTGGTATCCGTCATACGACCGTGCAAACTCCATCTCCGACGAAA
CCCTACAATTCCTTCAGCTCCACTTGCTAGAATCAAGTGCCTTTCTAGTGATGTGGCTTC
AGCTTCAAGCTGAGTAATCCTTTCCTTAGCAAGATCAATAGGCATTGACGATCCTAACTT
GTATTCGCTCTCTTGAAGCCTTACTCTCAATACCTTGTCCCTGTTTTCAGCACACTGACG
ATACAAGGCAAGCTCATCTTGGCAAAATGGTTCAATATCATTAATTTGCAAGCATAGGAA
AAGATTCCTCAAAATACCATCGCAGAGTTCAACACCTTGGAGGACATGTGAAGCAATTTC
AGGAGGGATGACAGGAGATGGAGGACCCATCATTAGGTCGTCACCGACCAGTATGGTTTC
CTCCATCATTGGCTGTGAATCAACATCCATGGCTGCTGCGTATCAG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EQ69TF 644 0 0
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AATACCTTGTCCCTGTTTTCAGCACACTGACGATACAAGGCAAGCTCATCTTGGCAAAAT
GGTTCAATATCATTAATTTGCAAGCATAGGAAAAGATTCCTCAAAATACCATCGCAGAGT
TCAACACCTTGGAGGACATGTGAAGCAATTTCAGGAGGGATGACAGGAGATGGAGGACCC
ATCATTAGGTCGTCACCGACCAGTATGGTTTCCTCCATCATTGGCTGTGAATCAACATCC
ATGGCTGCTGCGTATCAGAACAGACCAAAACCTGTGAACCCGAGAGAGTCGCCGGGAGAT
GTCGAGAGAGACGAAGATGGAGAGTCGCCGAGAGAGGAGATGGAGAGTCAAGAGTACCAC
CACCACCGAGAAGAGAGAGTCAAGAGTCACGAGAGTCACCACCACCACCGAGAAGAGAGA
GTCGCGAGAGTCAAGAGTCACCACCACCACCGAGAAGAGAGTCGCTGTACACAATCAGAG
AAGAGAAAACACAACACAATCAGAAACTGAAGAACCCAAAACGAAACTGAAGAACCCTAA
AACGAAACCCATCAACACAACACAATCACATACTCACAAGTCCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 2 6

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CCTGAAATTATGGTTTAATCCCCCCAACAAAATGACATCATATAAAGAAAAAAACAAGAC
ATTACAAATAACACGAAATTGTCCAAGTACTATAAAACGAAAAACACACTCAGCTGTATG
AGTAAGAATCCATCCGTACCATACCGGAAACTATACCGGCCAAGGAGTGATAAAAGATAA
ATCTCTACATTATTTTGCTTAAACGCTTCCCTCCGTAGTAAACAGGTTAAACCAACAAAA
AAATTCCTCAAGAGAGAAACAAACAAACGTGGTTTAAACCTGTTACCTTGTGCCCCACCA
TTCCAAGCCTCAGCTGCTACCCTTTTGTTTGAGGGTGATCTTGTCCCCAAGACTTAAAGC
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CTCGATACTCACATTCACTAAAGCATCCTCACCGAACACACTTTTTGCGTATAAGTTTGC
TGCAAGGAACCCACATTCTCCGTCTAGTTCAGATGGGCCAGTGAGACACCTCATGTTTGT
GGATTTGATAATGTGGTCGAGGAACTCTCTTTCGTTCTCAATCTTGGTGTTCACAGCAAC
CTTGTTTTCCCATTCAAACTCTGCCCACATGGTTCTGAAAGCAACATCTGAGCAAACAGC
AGGGGAGATATAATCCATGATATCGATGTGAATGTCGTTAGGTACCACCACGTTTCGCTC
CATAACATTTGATGTCTCATAGACGATGTTCCCGAATATGAC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG65JQ U 2
AF RR4FG65TF C 2
AF RR4DV06JQ U 1
BS 1 20 RR4DV06JQ
BS 21 21 RR4FG65JQ
BS 22 54 RR4DV06JQ
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BS 371 498 RR4DV06JQ
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BS 530 530 RR4FG65JQ
BS 531 762 RR4DV06JQ

RD RR4FG65JQ 603 0 0
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TT
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4FG65TF 603 0 0
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TTACAAATAACACGAAATTGTCCAAGTACTATAAAACGAAGAACACACTCAGCTGTATGA
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TCTCTACATTATTTTGCTTAAACGCTTCCCTCCGTAGTAAACAGGTTAAACCAACAAAAA
AATTCCTCAAGAGAGAAACAAACAAACGTGGTTTAAACCTGTTACCTTGTGCCCCACCAT
TCCAAGCCTCAGCTGCTACCCTTTTGTTTGAGGGTGATCTTGTCCCCAAGACTTAGAGCA
ATCCCTTGCGTCTTGCTCCTTATCCTTATGTAGCCACTCAATGCTCCGTCTGTTTGCTTC
TCGATACTCACATTCACTAGAGCATCCTCACCGAACACACTTTTTGCGTATAAGTTTGCT
GCAAGGAACCCACATTCTCCGTCTAGTTCAGATGGGCCAGTGAGACACCTCATGTTTGTG
GATTTGATAATGTGGTCGAGGAACTCTCTTTCGTTCTCAATCTTGGTGTTCACAGCAACC
TT
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4DV06JQ 762 0 0
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AATCCCTTGTGTCTTGCTCCTTATCCTTATGTAGCCACTCAATGCTCCGTCTGTTTGCTT
CTCGATACTCACATTCACTAAAGCATCCTCACCGAACACACTTTTTGCGTATAAGTTTGC
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GGATTTGATAATGTGGTCGAGGAACTCTCTTTCGTTCTCAATCTTGGTGTTCACAGCAAC
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AGGGGAGATATAATCCATGATATCGATGTGAATGTCGTTAGGTACCACCACGTTTCGCTC
CATAACATTTGATGTCTCATAGACGATGTTCCCGAATATGAC

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL1515Contig2 1388 3 13 U
GAGTCACACAGGCTTTGCTGATCATGGTTTCCATGTTGCAACTCGGGCAATCTCCTGCTT
CCCCACACCCTATTGATAATGATTCTTATGAGAGGATTGTTTTGTGCATAAAATTGCTTT
GCCATAGGAAATATGAGATGAAAAAGATATGGTTGGAATCCTGCCGCCAGAGTTTTGTCA
AGATGATTTCTGAAAAACAGCTTAGAGAGATGGAGGAACTTAAGGCAAAGACCCTAACAA
CTCATGCTCAACCTGATGATCTAATCGACTTCTTCCACCTAAAGAGCCGGAAGGGAATGA
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CCAAGGACGAGAACGATGCGAACAAACTCAACCGTATTCTTCAACTCACAGGATTCAGTG
ATCCAGTCTATGCTGAAGCATATGTGACAGTCCATCACTACGACATCGCACTCGAGGTTA
CCGTTATCAACCGTACAAAGGATACTCTTCAGAATCTGTGCTTGGAGTTAGCAACCATGG
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AGATAAAAGCAAACATCAAGGTCTCGTCCACAGAAACCGGAGTCATATTCGGGAACATCG
TCTATGAGACATCAAATGTTATGGAGCGAAACGTGGTGGTACTTAACGACATTCACATCG
ATATCATGGACTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCGGATGTTGCTTTCAGAACCATGTGGG
CAGAGTTTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCAAGATTGAGAACGAAAGAGAGT
TCCTCTACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGGCCCATCTGAACTAG
ACGGAGAATGTGGGTTCCTTGCAGCAAACTTATACGCAAAAAGTGTGTTCGGTGAGGACG
CTCTAGTGAATGTGAGTATCGAGAAGCAAACAGACGGAGCATTGAGTGGCTACATAAGGA
TAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGAGACAAAATCACCCTCAAACAAA
GGGGTAGCAGCTGAGGCTTGGAATGGTGGGGCACAAGGTAACAGGTTTAGACTACGTTCG
TTTGTTTCTCCTCTTGGGCAACTTTTTTGTTGGTTTAACCTGTTTACTACGGAGGGAAGC
GTTTAAGCAAAATAATGTAGAGATTTATCGTTTATCACTCTTTGGCCGGTATAGTTTCCC
GGTATGGTACGGATGGATTCTTACTCATACAGCTGAGTGTGTTCTTCGTTTTATAGTACT
TGGACGATTTCGTGTTATTTATAATGTCTTTTTTTACTTTATATGATGTCATTTTGTTGG
GGGGGATT


BQ
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CAGAGTTTGA
TGG

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DS 

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AGAT

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DS 

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ATCATGGACTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCGGATGTTGCTTTCAGAACCATGTGGGCA
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CTCTACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGGCCCATTTGAACTAGAC
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TATGGTACGGATGGATTTTTACTCATACAGCTGAGTGTGTTTTTCGTTTTATAGTACTTG
GACGATTTCGTGTTATTTATAATGTCTTTTTTTACTTTATATGATGTCATTTTGTTGGGG
GGGATT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 2 5

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ATATTACATTCTTACTATTACTACTGCCGTAATATATTTTCTTCTACACTAACAAAAACA
AACA****GACTTTACACATAACACATGGAAGACCATCTGCCTAATGCCTCGTACTTGTA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX18JQ U 33
AF RR4DP78JQ U 33
AF RR4BX89JQ U 1
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BS 651 651 RR4DX18JQ
BS 652 803 RR4BX89JQ

RD RR4DX18JQ 721 0 0
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AACTGAGGGGG*CATGACTCTCTTCCTTACAAGCATTTCCGCTGTAACTTGCTTTCTCTT
TAGTCCACCTCTAGGTCTCGAGGTGAAATCTTCATCCGCTTCAACAAAATCACCGCAGGT
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TTTCTGAAGATTAAAAGGCTTTGAGAATGTGGAAGAACAACCCTCCACTTCACACTTGAA
CTCTCCTGGTGATGATGAATCTTCGTCATGAGTCCGTAGATGTCTCTTGATGTTTTTCTT
TAAATGCTCAGAACCACATATCTCACAGTTGGCGTGCTGATGGCAGGATCTTATGTGTGC
CTTGAGACATTCCTCGTTTGTAAAGTACTTCATACACCCAATCTCGGAACAAAAAGCCTC
CACAGAGTCCAATTTCACATGAGAATCCTCATGCTTCTGGAGCTGTGAAGGATACTTGAA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4DP78JQ 701 0 0
AACAAGCTCTCCAAGTTGGGTTCATAAAATATTACATTCTTACTATTACTACTGCCGTAA
TATATTTTCTTCTACACTAACAAAAACAAACA****GACTTTACACATAACACATGGAAG
ACCATCTGCCTAATGCCTCGTACTTGTAAAAACTAACAAGTCTCGTGTTCTTCTGAATCA
AACTGAGGGGG*CATGACTCTCTTCCTTACAAGCATTTCCGCTGTAACTTGCTTTCTCTT
TAGTCCACCTCTAGGTCTCGAGGTGAAATCTTCATCCGCTTCAACAAAATCACCGCAGGT
ATATATGTGGCTGCCAGAATTCTCATGGTTGTTTCTGACGTGTTTGTATGCAAATCTCAT
GCCACAACCTGGAAAGCCACATACAAAGGGTCGGATATCCTCGTGCACTGCTTTCAAGTG
TTTCTGAAGATTAAAAGGCTTTGAGAATGTGGAAGAACAACCCTCCACTTCACACTTGAA
CTCTCCTGGTGATGATGAATCTTCGTCATGAGTCCGTAGATGTCTCTTGATGTTTTTCTT
TAAATGCTCAGAACCACATATCTCACAGTTGGCGTGCTGATGGCAGGATCTTATGTGTGC
CTTGAGACATTCCTCGTTTGTAAAGTACTTCATACACCCAATCTCGGAACAAAAAGCCTC
CACAGAGTCCAATTTCACATGAGAATCCTCATGCTTCTGGA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4BX89JQ 803 0 0
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ATATTACATTCTTACTATTACTACTGCCGTAATATATTTTCTTCTACACTAACAAAAACA
AACAAACAGACTTTACACATAACACATGGAAGACCATCTGCCTAATGCCTCGTACTTGTA
AAAACTAGCAAGTCTCGTGTTCTTCTGAATCAAACTGAGGGGGGCATGACTCTCTTCCTT
ACAAGCATTTCCGCTGTAACTTGCTTTCTCTTTAGTCCACCTCTAGGTCTCGAGGTGAAA
TCTTCATCCGCTTCAACAAAATCACCGCAGGTATATATGTGGCTGCCAGAATTCTCATGG
TTGTTTCTGACGTGTTTGTATGCAAATCTCATGCCACAACCTGGAAAGCCACACACAAAG
GGTCGTATATCCTCGTGCACTGCTTTCAAGTGTTTCTGAAGATTAGAAGGCTTTGAGAAT
GTGGAAGAGCAACCCTCAACTTCACACTTGAACTCTCCTGGTGATGATGAATCTTCGTCA
TGAGTCCGTAGATGTCTCTTGATGTTTTTCTTTAAATGCTTAGAACCACATATCTCACAG
TTGACGTGCTGATGGCAGGATCTTATGTGCGCCTTGAGACATTCCTCGTTAGTAAAGTAC
TTCATACACCCAATCTCGGAACAAAAAGCCTCCACAGAGTCCAATTTCACATGAGAATCC
TCATGCTTCTGGAGCTGTGAAGGATACTTGAAAGCCTTTCCACTACCAAATTCTTTGCAG
ACAAGCTTCTTCTGACAGAAGAA

QA 1 803 1 803
DS 



CO CL1516Contig2 755 2 1 U
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TGTGAGGAGGATGAAGATGAGATCTCTGGTAAAAAACACACTTGCCAAGAGTGTGGTGCT
GAGTTCAAGAAACCTGCTCACTTGAAGCAGCATATGCAAAGCCACTCCCTTGAGAGACCT
TTCGCTTGCTATGTGGATGATTGTACTGCGAGTTATAGGAGAAAAGATCATCTCAATAGA
CATCTTTTGACCCATAAAGGAAAGCTCTTCAAGTGTCCAGTTGAGAATTGCAAGAGTGAA
TTCTCAATTCATGGCAATATCAGCAAGCATGTGAAGAAGTTTCATACTGACAGCGATAGT
AACAAGGATGATGACGCTGTTGTTGGAGATTCTCAACCCTCGGAATTTTCTTCTGGTCAG
AAGAAGCTTGTCTGCAAAGAATTTGGTTGTGGAAAGGCTTTCAAGTATCCTTCACAGCTC
CAGAAGCATGAGATCTCATGTGAAATTGGACTCTGTGGAGCTTTTGTCCGAGATTGGGTG
TATGAGTACTTTACAAACGAGATGTCTCAGCACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DX18TF U 13
AF RR4DP78TF U 1
BS 1 755 RR4DP78TF

RD RR4DX18TF 688 0 0
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GAAGATGAGATCTCTGGTAAAAAACACACTTGCCAAGAGTGTGGTGCTGAGTTCAAGAAA
CCTGCTCACTTGAAGCAGCATATGCAAAGCCACTCCCTTGAGAGACCTTTCGCTTGCTAT
GTGGATGATTGTACTGCGAGTTATAGGAGAAAAGATCATCTCAATAGACATCTTTTGACC
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GGCAATATCAGCAAGCATGTGAAGAAGTTTCATACTGACAGCGATAGTAACAAGGATGAT
GACGCTGTTGTTGGAGATTCTCAACCCTCGGAATTTTCTTCTGGTCAGAAGAAGCTTGTC
TGCAAAGAATTTGGTTGTGGAAAGGCTTTCAAGTATCCTTCACAGCTCCAGAAGCATGAG
ATCTCATGTGAAATTGGACTCTGTGG
GA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DP78TF 755 0 0
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GACATACGAAACTACCTCTGCCAGTACTGCGGAATCAGCAGATCGAAAAAGTACCTCATC
ACTTCACACATCGAATCTCATCACAAGATGGAAGTCGAAGAGGAAAGAAATGAAGAAGCT
TGTGAGGAGGATGAAGATGAGATCTCTGGTAAAAAACACACTTGCCAAGAGTGTGGTGCT
GAGTTCAAGAAACCTGCTCACTTGAAGCAGCATATGCAAAGCCACTCCCTTGAGAGACCT
TTCGCTTGCTATGTGGATGATTGTACTGCGAGTTATAGGAGAAAAGATCATCTCAATAGA
CATCTTTTGACCCATAAAGGAAAGCTCTTCAAGTGTCCAGTTGAGAATTGCAAGAGTGAA
TTCTCAATTCATGGCAATATCAGCAAGCATGTGAAGAAGTTTCATACTGACAGCGATAGT
AACAAGGATGATGACGCTGTTGTTGGAGATTCTCAACCCTCGGAATTTTCTTCTGGTCAG
AAGAAGCTTGTCTGCAAAGAATTTGGTTGTGGAAAGGCTTTCAAGTATCCTTCACAGCTC
CAGAAGCATGAGATCTCATGTGAAATTGGACTCTGTGGAGCTTTTGTCCGAGATTGGGTG
TATGAGTACTTTACAAACGAGATGTCTCAGCACAC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 6

CO CL1517Contig1 861 6 9 U
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TGATGTAAAATAACTTTCAATCGAAAGATTGAATCTTTTGCTTCGCTTTGGCGATCTTTC
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ATAGGAGTTGTTCTTCAAGTTCTATCTTTCCCTGATTTGTTTTGAAATAAAATAAAGTTA
TTCTCTCCTCTTTCACAGCATATTTTAAATCCCTTTGTTTTTGTGTTTGATTTCTCTTTC
TTCATGGATATTCACTTAATCCTTTCTGATGAGAGTCAATCTCTATTCTCCTTTGTGAAG
CCAATGATAGGCTTTTAATAGAGTATCCCTGAGGAAAGGAAGCTGTGGTATTGGATTTGA
TCTTGGCTGATTATTATGGAGATTTAGATGAGCCGGCATCTTTCTAAAGATGGTCCGACA
ATAATCTCTCGTAAGTCATCCGAGCTTTCCCCGAGTTATCATCTGTTGGAGTTTGAGTTT
TTCAAGCACAAGCAAAGGATGGAGTGAAAGATGGAGTTCATGAAGTACAGATCAAGGAGG
ATGCAGTACGGTGGAGAAGGTGAAGATGAAGCTTCAGCAGGGATGATTCATGAACTTGTC
GACGGCGGAGCTTCAATTTTCAGATTTGCATGTTTAATTATTGACACGTGCTGTATCTCC
TTTTTTAAGCTGACACGTATGTATAGAGGAAATTTATCTGTACTCATGTTGCCTGTGGGC
TTTTATAAAAGCCAAAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H512TF U 17
AF RR4GM23TF U 1
AF RR4EX37TF U 6
AF RR4GM23JQ C 121
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BS 726 784 RR4EX37TF
BS 785 861 RR4GM23JQ

RD RR4H512TF 672 0 0
GGGGGGCT
CTCTCTCTCTCCTTTCTAGAGAGAGAAAATTCTCTAGTCCTATCCCTCTTATCAGACTTC
TATTTTTCAGAGGGAGGACGAGATTTGCCCTGTTTTTGATGTAAAATAACTTTCAATCTA
AAGATTGAATCTTTTGCTTCGCTTTGGCGATCTTTCTTTTCCTGTTGAGGAAGTAGTTTT
CGCTTTGGGCGATTTTGTTGTGTATTTTCAAAACAAATAGGAGTTGTTCTTCAAGTTCTA
TCTTTCCCTGATTTGTTTTGAAATAAAATAAAGTTATTCTCTCCTCTTTCACAGCATATT
TTAAATCCCTTTGTTTTTGTGTTTGATTTCTCTTTCTTCATGGATATTCACTTAATCCTT
TCTGATGAGAGTCAATCTCTATTCTCCTTTGTGAAGCCAATGATAGGCTTTTAATAGAGT
ATCCCTGAGGAAAGGAAGCTGTGGTATTGGATTTGATCTTGGCTGATTATTATGGAGATT
TAGATGAGCCGGCATCTTTCTAAAGATGGTCCGACAATAATCTCTCGTAAGTCATCCGAG
CTTTCCCCGAGTTATCATCTGTTGGAGTTTGAGTTTTTCAAGCACAAGCAAAGGATGGAG
TGAAAGATGGAGTTCATGAAGTACAGATCAAGGAGGATGCAGTACGGTGGAGAAGGTGAA
GATG

QA 9 672 9 672
DS 

RD RR4GM23TF 722 0 0
GGGGGAGATAAGCAAAGTGGGGCTCTCTCTCTCTCCTTTCTAGAGAGAGAAAATTCTCTA
GTCCTATCCCTCTTATCAGACTTCTATTTTTCAGAGGGAGGACGAGATTTGCCCTGTTTT
TGATGTAAAATAACTTTCAATCGAAAGATTGAATCTTTTGCTTCGCTTTGGCGATCTTTC
TTTTCCTGTTGAGGAAGTAGTTTTCGCTTTGGGCGATTTTGTTGTGTATTTTCAAAACAA
ATAGGAGTTGTTCTTCAAGTTCTATCTTTCCCTGATTTGTTTTGAAATAAAATAAAGTTA
TTCTCTCCTCTTTCACAGCATATTTTAAATCCCTTTGTTTTTGTGTTTGATTTCTCTTTC
TTCATGGATATTCACTTAATCCTTTCTGATGAGAGTCAATCTCTATTCTCCTTTGTGAAG
CCAATGATAGGCTTTTAATAGAGTATCCCTGAGGAAAGGAAGCTGTGGTATTGGATTTGA
TCTTGGCTGATTATTATGGAGATTTAGATGAGCCGGCATCTTTCTAAAGATGGTCCGACA
ATAATCTCTCGTAAGTCATCCGAGCTTTCCCCGAGTTATCATCTGTTGGAGTTTGAGTTT
TTCAAGCACAAGCAAAGGATGGAGTGAAAGATGGAGTTCATGAAGTACAGATCAAGGAGG
ATGCAGTACGGTGGAGAAAGTGAAGATGAAGCTTCAGCAGG*ATGATTCATGAACTTGTC
GA

QA 1 722 1 722
DS 

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G
GATAAGCAAAGTGGGGCTCTCTCTCTC**CTTTCTAGAGAGAGAAAATTCTCTAGTCCTA
TCCCTCTTATCAGACTTCTATTTTTCAGAGGGAGGACGAGATTTGCCCTGTTTTTGATGT
AAAATAACTTTCAATCGAAAGATTGAATCTTTTGCTTCGCTTTGGCGATCTTTCTTTTCC
TGTTGAGGAAGTAGTTTTCGCTTTGGGCGATTTTGTTGTGTATTTTCAAAACAAATAGGA
GTTGTTCTTCAAGTTCTATCTTTCCCTGATTTGTTTTGAAATAAAATAAAGTTATTCTCT
CCTCTTTCACAGCATATTTTAAATCCCTTTGTTTTTGTGTTTGATTTCTCTTTCTTCATG
GATATTCACTTAATCCTTTCTGATGAGAGTCAATCTCTATTCTCCTTTGTGAAGCCAATG
ATAGGCTTTTAATAGAGTATCCCTGAGGAAAGGAAGCTGTGGTATTGGATTTGATCTTGG
CTGATTATTATGGAGATTTAGATGAGCCGGCATCTTTCTAAAGATGGTCCGACAATAATC
TCTCGTAAGTCATCCGAGCTTTCCCCGAGTTATCATCTGTTGGAGTTTGAGTTTTTCAAG
CACAAGCAAAGGATGGAGTGAAAGATGGAGTTCATGAAGTACAGATCAAGGAGGATGCAG
TACGGTGGAGAA*GTGAAGATGAAGCTTCAGCAGG*ATGATTCATGAACTTGTCGACG*C
GGAGCTTCAATTTTCAGATTTGCATGTTTAATTATTGACACGTGCTGTATCTCCTTTT

QA 2 779 2 779
DS 

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TTTTCCTGTTGAGGAAGTAGTTTTCGCTTTGGGCGATTTTGTTGTGTATTTTCAAAACAA
ATAGGAGTTGTTCTTCAAGTTCTATCTTTCCCTGATTTGTTTTGAAATAAAATAAAGTTA
TTCTCTCCTCTTTCACAGCATATTTTAAATCCCTTTGTTTTTGTGTTTGATTTCTCTTTC
TTCATGGATATTCACTTAATCCTTTCTGATGAGAGTCAATCTCTATTCTCCTTTGTGAAG
CCAATGATAGGCTTTTAATAGAGTATCCCTGAGGAAAGGAAGCTGTGGTATTGGATTTGA
TCTTGGCTGATTATTATGGAGATTTAGATGAGCCGGCATCTTTCTAAAGATGGTCCGACA
ATAATCTCTCGTAAGTCATCCGAGCTTTCCCCGAGTTATCATCTGTTGGAGTTTGAGTTT
TTCAAGCACAAGCAAAGGATGGAGTGAAAGATGGAGTTCATGAAGTACAGATCAAGGAGG
ATGCAGTACGGTGGAGAAGGTGAAGATGAAGCTTCAGCAGGGATGATTCATGAACTTGTC
GACGGCGGAGCTTCAATTTTCAGATTTGCATGTTTAATTATTGACACGTGCTGTATCTCC
TTTTTTAAGCTGACACGTATGTATAGAGGAAATTTATCTGTACTCATGTTGCCTGTGGGC
TTTTATAAAAGCCAAAAGTTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4EX37JQ 694 0 0
TTTGCTTCGCTTTGGCGATCTTTCTTTTCCTGTTGAGGAAGTAGTTTTCGCTTTGGGCGA
TTTTGTTGTGTATTTTCAAAACAAATAGGAGTTGTTCTTCAAGTTCTATCTTTCCCTGAT
TTGTTTTGAAATAAAATAAAGTTATTCTCTCCTCTTTCACAGCATATTTTAAATCCCTTT
GTTTTTGTGTTTGATTTCTCTTTCTTCATGGATATTCACTTAATCCTTTCTGATGAGAGT
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AGGAAGCTGTGGTATTGGATTTGATCTTGGCTGATTATTATGGAGATTTAGATGAGCCGG
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TATCATCTGTTGGAGTTTGAGTTTTTCAAGCACAAGCAAAGGATGGAGTGAAAGATGGAG
TTCATGAAGTACAGATCAAGGAGGATGCAGTACGGTGGAGAAGGTGAAGATGAAGCTTCA
GCAGGGATGATTCATGAACTTGTCGACGGCGGAGCTTCAATTTTCAGATTTGCATGTTTA
ATTATTGACACGTGCTGTATCTCCTTTTTTAAGCTGACACGTATGTATAGAGGAAATTTA
TCTGTACTCATGTTGTCTTTGGGCTTTTATAAAA

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DS 

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TGTATTTTCAAAACAAATAGGAGTTGTTCTTCAAGTTCTATCTTTCCCTGATTTGTTTTG
AAATAAAATAAAGTTATTCTCTCCTCTTTCACAGCATATTTTAAATCCCTTTGTTTTTGT
GTTTGATTTCTCTTTCTTCATGGATATTCACTTAATCCTTTCTGATGAGAGTCAATCTCT
ATTCTCCTTTGTGAAGCCAATGATAGGCTTTTAATAGAGTATCCCTGAGGAAAGGAAGCT
GTGGTATTGGATTTGATCTTGGCTGATTATTATGGAGATTTAGATGAGCCGGCATCTTTC
TAAAGATGGTCCGACAATAATCTCTCGTAAGTCATCCGAGCTTTCCCCGAGTTATCATCT
GTTGGAGTTTGAGTTTTTCAAGCACAAGCAAAGGATGGAGTGAAAGATGGAGTTCATGAA
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GATTCATGAACTTGTCGACGGCGGAGCTTCAATTTTCAGATTTGCATGTTTAATTATTGA
CACGTGCTGTATCTCCTTTTTTAAGCTGACACGTATGTATAGAGGAAATTTATCTGTACT
CATGTTGCCTGTGGGCTTTTATAAAAGCCAAAAGTTG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 6

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AATTTTCACCGTCAATTCTCTATAGAAAAGAATTAACCGATCATTTTTTCTTCAATGCTC
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CTACAACTAGTGGGACTCCATCTTTACAGTATCATAACTTACCAGAGCAACCGGTTGCTT
CTCCTCCTCCTCTTGTGACTCAGTTTCAGAGACAAAAACGCCAATGCTTTGGAGATTCAA
CTCCAGGAGAGTTCCCTTTAGCAGCTAACCCTTCCATTGTCCTTCATGTTCTCACTGAAT
GTAGATTGGATCCTCTTGACCTCGCTAATCTCGAGGCAACATGCTCCTTCTTTAGCCAGC
CAGCAAACTTTGCCCCGGACTGTAGTTTATCACTACCTGAGCTCGCTGCTCTCGACATGT
GTAACAAAAGGGTGATTTTTAAACCTATGAATGAACAAGAACGTGAAGAAATGAAAAGCA
GATACGGAGGGTCATGGAAACTAGTCCTTAGGTTTTTGCTGGCTGGTGAAGCGTGTTGTC
GAAGAGAGAAATCTCAAGCAGTTGCTGGTCCTGGTCACAGCATTGCCGTCACATCGAAGG
GACAAGTCTATACCTTTGGTCACAATAGCTCTGGACAGCTAGGACATGGACATACCGATG
AAGAAGCTCGGATACTTCCCATCAGGTCACTGCAGGGAATCAGAATCATCCAAGCAGCAG
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ATCTGTTCGGTGAAGCTGAGTACGGAGGAGGGCAAGGAGGGTCTAGACAGGTTACGACTC
CTCAGCTTGTGACATCTTTAAAGAACATATTTATTGTGCAAGCGGCGATAGGGAACTCTT
TACCGCTGTTCTGTCACGAGAAGGGAAGGTTTATACATTCTCTTGGGGTGAAGATGGTAG
ACTCGGTCACCAAACCGAGGCTAATGATGTCGAGCCACGTCCTTTGCTAGGTCCGTTAGA
GAATGTACCCGTTGTCCAGATTGCTGCTGGTTATTGCTACCTTCTTGCTTTAGTTTGTCA
ACCAAATGGCATGTCGGTTTATTCGGTTGGTTGCGGTTTGGGAGGCAAACTCGGTCACGG
GTCGAAAATCGATGAGAAGTACCCACGTGTTATCGAGCAGTTTAA*GGTACTGAACTTTC
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TGTGTACTTGGGGTTGGGGGAGATACGGTTGCTTAGGACACGGTAACGAGGAGGGTGAGT
CAGTTCCTAAGGTCGTTGAAGGGCTAAGCCATGTCAAGGCGGTTCATGTCGCAACAGGAG
ACTACACTACTTTTGTGGTCTCGGATGATGGAGATGTTTACTCTTTTGGTTGTGGTGAAT
CTGCTAGTCTCGGTCACCATACAGCCGTTGATGAACAGCGTGATCGGCAAGCTAATGTGT
TGAGTCCAGCGGTAGTAACATCGCTGAAACAAGTGAAAGAGCGGGTGGTTCAGATTAGTC
TAACGAGCTCGATATACTGGAACGCTCATACGTTTGCGCTCACGGAATCGGGGAAACTAT
TTGCGTTTGGTGCAGGAGATAAGGGTCAGCTTGGAGCAGAGCTTGGTCGTGACCAAACAG
AGAGGTGTGTACCCGAAAGAGTAAATATCGATCTCAGTTAGTATTTGCACGGAAAAAGCT
AGGAAGTTGCGTTTTAACTTTGTTATGTTTGGAAGTTTGTACAAAGGGGGGTGGGACATA
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AAGGGGTCATGTTTTAGGTTATGTTGTTAGTAATTGTCGAATAATTTCAATTAATCCATT
TGGTAAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TACGGAGGAGGGCAAGGAGGGTCTAGACAGGTTACGACTCCTCAGCTTGTGACATCTTTA
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AG

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AACTTGTCTTAACATAATAATTGTTTGTGGTTTTAGATTATTCTAATTGTTCAAGGGGTC
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G

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TCTGCTAGTCTCGGTCACCATACAGCCGTTGATGAACAGCGTGATCGGCAAGCTAATGTG
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CAAGGGGTCATGTTTTAGGTTATGTTGTTAGTAATTGTCGAATAATTTCAATTAATCCAT
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DS 



AS 1 6

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TCTCTCCAGAAGAGTCAAACCATCACCGACAATGTTGTCTCCATCCTCGGCTCCTTCGAT
AGCCGTCTCTCCGCTCTCGAATCCGCCATGCGTCCCACTCAGATTAGAACGCATGCGATA
AGGAAAGCTCATGAGAATATTGATAAGACTCTCAAATCTGCTGAGGTTATCCTGTCTCAG
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AGCTTTAAGAACAGCGATGGAGTCCTTAACCATGCTGATAGCTTACTTGCCAAAGCTCAG
TCTAAGCTGGAGGATGAGTTTAAACAGTTGCTAGTTTCTTACAGCAAAGCGGTGGAACCT
GATCGCCTTTTTGATGGCCTTCCTAACTCACTGAGACCATCCGCAGACGGTGAGGGTAAT
GGAAAATCCCACGGAGGACACCATAACGATGACTCATAAACTGCTGCTTATACACTTCCA
ATCCTTATTCCATCAAGGGTATTGCCACTTTTGCATGATTTGGCTCAGCAAATGGTTCAA
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GAGAGCTTAAGGAAATTGGGAGTTGAAAAACTTAGCAAAGAAGATGTTCAGAGGATGCAG
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GATGCTATAGCTAGGAGCAAGAGATCTCCAGAAAAGTTGTTTGTACTCTTAGACATGTAT
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GAAATTAGAACTCTGCCACGGGGTTG


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G095TF U 1
AF RR4GT43JQ C 370
AF RR4GT43TF U 44
AF RR4GL31TF U 39
AF RR4GL31JQ C 112
AF RR4GT84TF U 499
BS 1 307 RR4G095TF
BS 308 308 RR4GL31TF
BS 309 443 RR4G095TF
BS 444 444 RR4GL31TF
BS 445 516 RR4G095TF
BS 517 517 RR4GL31TF
BS 518 548 RR4G095TF
BS 549 549 RR4GL31TF
BS 550 605 RR4G095TF
BS 606 728 RR4GL31TF
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BS 730 813 RR4GL31TF
BS 814 1226 RR4GT84TF

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TCTTCAACTTCGTCTATCGACGGCGAAGAAAAGTAACTTCAATCAGTTTTTTGAGGATTC
GCCATGGCAATTGATAACGGAATGGATCTGCTCAGCGAAAGAGCTGTGTTGATGAGAGAG
TCTCTCCAGAAGAGTCAAACCATCACCGACAATGTTGTCTCCATCCTCGGCTCCTTCGAT
AGCCGTCTCTCCGCTCTCGAATCCGCCATGCGTCCCACTCAGATTAGAACGCATGCGATA
AGGAAAGTTCATGAGAATATTGATAAGACTCTCAAATCTGCTGAGGTTATCCTGTCTCAG
TTTGATCTCCTCCGTCAGGCAGAGACTAAAGTACTCAAGGGGCCACATGAGGACCTGGAA
AGTTATTTGGAGGCAATAGCTCAGCTTAGAAAAGTTATTCGTTATTTTAGCAGCAACAGA
AGCTTTAAGAACAGCGATGGAGTCCTTAACCATGCTAATAGCTTACTTGCCAAAGCTCAG
TCTAAGCTTGAGGATGAGTTTAAACAGTTGCTAGTTTCTTACAGCAAAGCGGTGGAACCT
GATCG

QA 1 605 1 605
DS 

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GAGGCAATAGCTCAACTTAGAAAAGTTATTCGTTATTTTAGCAGCAACAGAAGCTTTAAG
AACAGCGATGGAGTCCTTAACCATGCTGATAGCTTACTTGCCAAAGCTCAGTCTAAGCTG
GAGGATGAGTTTAAACAGTTGCTAGTTTCTTACAGCAAAGCGGTGGAACCTGATCGCCTT
TTTGATGGCCTTCCTAACTCACTGAGACCATCCGCAGACGGTGAGGGTAATGGAAA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR4GT43TF 681 0 0
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CTGTGTTGATGAGAGAGTCTCTCCAGAAGAGTCAAACCATCACCGACAATGTTGTCTCCA
TCCTCGGCTCCTTCGATAGCCGTCTCTCCGCTCTCGAATCCGCCATGCGTCCCACTCAGA
TTAGAACGCATGCGATAAGGAAAGCTCATGAGAATATTGATAAGACTCTCAAATCTGCTG
AGGTTATCCTGTCTCAGTTTGATCTCCTCCGTCAGGCAGAGACTAAAGTACTCAAGGGGC
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ATTTTAGCAGCAACAGAAGCTTTAAGAACAGCGATGGAGTCCTTAACCATGCTGATAGCT
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GCAAAGCGGTGGAACCTGATCGCCTTTTTGATGGCCTTCCTAACTCACTGAGACCATCCG
CAGACGGTGAGGGTAATGGAAAATCCCACGGAGGACACCATAACGATGACTCATAAACTG
CTGCTTATACACTTCCAATCC

QA 1 681 1 681
DS 

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GGGTC
GTCGTCTCTCTTTCATCTCTTCAACTTCGTCTATCGACGGCGAAGAAAAGTAACTTCAAT
CAGTTTTTTGAGGATTCGCCATGGCAATTGATAACGGAATGGATCTGCTCAGCGAAAGAG
CTGTGTTGATGAGAGAGTCTCTCCAGAAGAGTCAAACCATCACCGACAATGTTGTCTCCA
TCCTCGGCTCCTTCGATAGCCGTCTCTCCGCTCTCGAATCCGCCATGCGTCCCACTCAGA
TTAGAACGCATGCGATAAGGAAAGCTCATGAGAATATTGATAAGACTCTCAAATCTGCTG
AGGTTATCCTGTCTCAGTTTGATCTCCTCCGTCAGGCAGAGACTAAAGTACTCAAGGGGC
CACATGAGGACCTGGAAAGTTATTTGGAGGCAATAGCTCAACTTAGAAAAGTTATTCGTT
ATTTTAGCAGCAACAGAAGCTTTAAGAACAGCGATGGAGTCCTTAACCATGCTGATAGCT
TACTTGCCAAAGCTCAGTCTAAGCTGGAGGATGAGTTTAAACAGTTGCTAGTTTCTTACA
GCAAAGCGGTGGAACCTGATCGCCTTTTTGATGGCCTTCCTAACTCACTGAGACCATCCG
CAGACGGTGAGGGTAATGGAAAATCCCACGGAGGACACCATAACGATGACTCATAAACTG
CTGCTTATACACTTCCAATCCTTAT*CCATCAAGGGTATTGCCACTTTTGCATGATTTGG
CTCAGCAAATGGTTCAAGCTGGCCACCAGCAACTGCTACTGCAAATTTAT

QA 6 775 6 775
DS 

RD RR4GL31JQ 754 0 0
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ATGAGAGAGTCTCTCCAGAAGAGTCAAACCATCACCGACAATGTTGTCTCCATCCTCGGC
TCCTTCGATAGCCGTCTCTCCGCTCTCGAATCCGCCATGCGTCCCACTCAGATTAGAACG
CATGCGATAAGGAAAGCTCATGAGAATATTGATAAGACTCTCAAATCTGCTGAGGTTATC
CTGTCTCAGTTTGATCTCCTCCGTCAGGCAGAGACTAAAGTACTCAAGGGGCCACATGAG
GACCTGGAAAGTTATTTGGAGGCAATAGCTCAACTTAGAAAAGTTATTCGTTATTTTAGC
AGCAACAGAAGCTTTAAGAACAGCGATGGAGTCCTTAACCATGCTGATAGCTTACTTGCC
AAAGCTCAGTCTAAGCTGGAGGATGAGTTTAAACAGTTGCTAGTTTCTTACAGCAAAGCG
GTGGAACCTGATCGCCTTTTTGATGGCCTTCCTAACTCACTGAGACCATCCGCAGACGGT
GAGGGTAATGGAAAATCCCACGGAGGACACCATAACGATGACTCATAAACTGCTGCTTAT
ACACTTCCAATCCTTATTCCATCAAGGGTATTGCCACTTTTGCATGATTTGGCTCAGCAA
ATGGTTCAAGCTGGCCACCAGCAACTGCTACTGCAAATTTATAGAGAAACACGTACTTTC
GTATTGGAAGAGAGCTTAAGGAAATTGGGAGTTG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4GT84TF 728 0 0
GGAGTCCTTAATCATGCTAATAGCTTGCTTGCCAAAGCTCAGTCTAAGCTGGAGGATGAG
TTTAAACAGTTGCTAGTTTCTTACAGCAAAGCGGTGGAGCCTGATCGCCTTTTTGATGGC
CTTCCTAACTCACTGAGACCATCCGCAGACGGTGAGGGTAATGGAAAATCCCACGGAGGA
CACCATAACGATGACTCAGAAACTGCTGCTTATACACTTCCAATCCTTATTCCGTCAAGG
GTATTGCCACTTTTGCATGATTTGGCTCAGCAAATGGTTCAAGCTGGTCACCAGCAACTG
CTACTACAAATTTATAGAGAAACACGTACTTTCGTATTGGAAGAGAGCTTAAGGAAATTG
GGAGTTGAAAAACTTAGCAAAGAAGATGTTCAGAGGATGCAGTGGGAAGTTTTGGAGGCA
AAAATTGGAAATTGGATCCATTTCATGCGCATTGCTGTTAAATTGCTCTTTGCCGGAGAA
AGGCAAGTATGTGACCAGATATTCCGAGGCTTCGATTCTCTTAGTGATCAGTGTTTTGCA
GAAGTCACAGTGAGCAGTGTCTCAATGCTACTTAGCTTTGGGGATGCTATAGCTAGGAGC
AAGAGATCTCCAGAAAAGTTGTTTGTACTCTTAGACATGTATGAGATAATGCGGGAGCTT
CATACGGAGATTGAGACAATTTTCAAAGGTAAAGCATGCCTTGAAATTAGAACTCTGCCA
CGGGGTTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 4

CO CL1520Contig1 1022 4 18 U
TATTACTCCTCAGTGCCACTACACACACAAAACGCATGTATATGTTATTACTTAAACAGA
CACCAGTAGTCTTTGGGCTCTTTTTTTGTTCTTTGTTTTTCCAACTACCGACATACATAT
ATACTTATTACATAATAATAGATGTGATATTTGATAAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAG
ATCCATCCCCAATTTTTTAAAAAGTTGTTTCAGTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGA
CCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGTTGTTCTCAAAGTTCTCCAAAGGAATGTGT
TAAAAAGGTCCTTCTATTGGGATAGTTCCACACAAATTGTTGTTCGACACATCAAAGACT
TTAAGGCTTGGGATTTTCGTCAGTTCTCTAGGGATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTG
GGCCGGAGAAAGACCAGAGACTTCAATTTCCCCAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGA
TTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCTGATGAGACTTTTCAATTTTCCAAGTTCAGAAGGTATA
GTTCCTTGGATGTTGTTTTTGTAGAGCTCCAGATACTGTAAATGTTCGAGCTTCCCAAGC
TCAGGGGCAAGATGTCCAGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGTTG
TCTTGATTACAGGTGACATGGAACCAGGTGCAAGGAGTAACAAGATTCTGATCCCAGCTC
TGGAGCACATGGTCTG*ATCCGACAAGCTCTGTCGAAGAGCGTAGAGAGCATCTCCATCT
GAGTTCGCATCCACCAGGTTAATCAGAACAAAGGCTAAGGCCAGAGAAGCTGCCAAGAGC
TCCAGCCCACAGTTTTTTCGAAACGCCATGTGAGATATATTTGAGAGAAATAGAAAATAA
AGAATTTGAGTAAATGGAACTTTTCAGATCAGACGAGAAGATTTAAATTAGGGTTTCGTT
ACTCTCCCTTTACTCTCTCTCTTTCTTCTCTCTTCTGTTCAAGTTGTTGAAATCGATTAC
CC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EZ18JQ U 1
AF RR4EG63JQ U 21
AF RR4EG63TF C 306
AF RR4ED33TF C 429
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BS 876 1022 RR4ED33TF

RD RR4EZ18JQ 742 0 0
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CACCAGTAGTCTTTGGGCTCTTTTTTTGTTCTTTGTTTTTCCAACTACCGACATACGTAT
ATACTTATTACATAATAATAGATGTGATATTTGATAAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAG
ATCCATCCCCAATTTTTTAAAAAGTTGTTTCAGTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGA
CCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGTTGTTCTCAAAGTTCTCCAAAGGAATGTGT
TAAAAAGGTCCTTCTATTGGGATAGTTCCACACAAATTATTGCTCGACACATCAAAGACT
TTAAGGCTTGGGATTTTCGTCAGTTCTCTAGGGATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTG
AGCCGGAGAAAGACCAGAGACTTCAATTTCCCCAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGA
TTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCTGATGAGACTTTTCAATTTTCCAAGTTCAGAAGGTATA
GTTCCTTGGATGTTGTTTTTGTAGAGCTCCAGATACTGTAAATGTTCGAGCTTCCCAAGC
TCAGGGGCAAGATGTCCAGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGTTG
TCTTGATTACAGGTGACATGGAACCAGGTGCAAGGAGTAACAAGATTCTGATCCCAGCTC
TGGAGCACATGGTCTG
GATCCG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4EG63JQ 732 0 0
ACACACACAAA
ACGCATGTATATGTTATTACTTAAACAGACACCAGTAGTCTTTGGGCTCTTTTTTTGTTC
TTTGTTTTTCCAACTACCGACATACATATATACTTATTACATAATAATAGATGTGATATT
TGATAAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAGATCCATCCCCAATTTTTTAAAAAGTTGTTTC
AGTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGT
TGTTCTCAAAGTTCTCCAAAGGAATGTGTTCAAAAGGTCCTTCTATTGGGATAGTTCCAC
ACAAATTGTTGTTCGACACATCAAAGACTTTAAGGCTTGGGATTTTCGTCAGTTCTCTAG
GGATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGGGCCGGAGAAAGACCAGAGACTTCAATTTCC
CCAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCTGATGAGAC
TTTTCAATTTTCCAAGTTCAGAAGGTATAGTTCCTTGGATGTTGTTTTTGTAGAGCTCCA
GATACTGTAAATGTTCGAGCTTCCCAAGCTCAGGGGCAAGATGTCCAGAAAGGTTTGAAT
TACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGTTGTCTTGATTACAGGTGACATGGAACCAGGTGC
AAGGAGTAACAAGATTCTGATCCCAGCTCTGGAGCACATGGTCTG*ATCCGACAAGCTCT
G

QA 12 732 12 732
DS 

RD RR4EG63TF 583 0 0
AGGT
CCTTCTATTGGGATAGTTCCACACAAATTGTTGTTCGACACATCAAAGACTTTAAGGCTT
GGGATTTTCGTCAGTTCTCTAGGGATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGGGCCGGAGA
AAGACCAGAGACTTCAATTTCCCCAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTG
TAAAGATCCAAGCTGATGAGACTTTTCAATTTTCCAAGTTCAGAAGGTATAGTTCCTTGG
ATGTTGTTTTTGTAGAGCTCCAGATACTGTAAATGTTCGAGCTTCCCAAGCTCAGGGGCA
AGATGTCCAGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGTTGTCTTGATTA
CAGGTGACATGGAACCAGGTGCAAGGAGTAACAAGATTCTGATCCCAGCTCTGGAGCACA
TGGTCTG*ATCCGACAAGCTCTGTCGAAGAGCGTAGAGAGCATCTCCATCTGAGTTCGCA
TCCACCAGGTTAATCAGAACAAAGGTTAGGGTCAGAGAAGCTGCCAAGAGCTCCAGCCCA
CAGTTTTTTCGAAACGCCATGTGAGA
GAAATCCAAAAAA

QA 5 570 5 570
DS 

RD RR4ED33TF 594 0 0
AAAGACCAGAGACTTCAATTTCCCCAAGGAAGTAGGGATCTTCCCAGTAAGATTGTTGTT
GTAAAGATCCAAGCTGATGAGACTTTTCAATTTTCCAAGTTCAGATGGTATAGTTCCTTG
GATGTTGTTTTTGTAGAGCTCCAGATACTGTAAATGTTCGAGCTTCCCAAGCTCAGGGGC
AAGATGTCCAGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACGCGAGTGACGCGGTTGTCTTGGTT
ACAGGAGACATGGAACCAGGTGCAAGGAGTAACAAGATTTTGATCCCAGCTCTGGAGTAC
ATGGTCTGGATCCGACAAGCTCTGTCGAAGAGCGTA*AGAGCATCTCCATCTGAGTTCGC
CTCCACCAGGTTAATCAGAACAAAGGCTAAGGCTAGAGAAGCTGCCAAGAGCTCCAGCCC
ACAGTTTTTTCTAAACGCCATGTGAGATATATTTGAGAGAAATAGAAAATAAAGAATTTG
AGTAAATGGAACTTTTCAGATCAGACGAGAAGATTTAAATTAGGGTTTCGTTACTCTCCC
TTTACTCTCTCTCTTTCTTCTCTCTTCTGTTCAAGTTGTTGAAATCGATTACCC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 2 6

CO CL1521Contig1 957 4 7 U
GTCTTCACTGGGAGTCCTCTAAAATGCTCAAATACCATATCAAGAATGTTGAAAGAGTTT
TCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGAGAGAGAGAG**TAGAGGGAGTTTAAACTAAAAC
TTACAAAGCCTAACAGTTTTTAATATAATAAACTGTTTGGCTTGGTGCAGTAAAAAAAAT
GAAGGTTGTGGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGACGCAGTCATAAA
GACGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAATCTTGAGGGAAT
CACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCC*ATGCCTTCTAAGATG
ACCAAGTCTGCATCGGTTGCAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTTGCCAGATCAATA
ACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCAACGCCCATCAGT
TGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTTGATAAGATCTCTGCAAGCTCGGTATAAGTGACATCA
TTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGACGTAGCATTTCT
CCAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCAACAAATATCACA
GCCTTCTTCCAAGGCTTCTTGAGCCATCTGGCTTGAAAGTTTTCCAAGTCATCAATGACC
CATGGCCGTGGAACCAAGTTTTGACAGCTAGCCAAGAATGACATTCCATCCTTTGAGAAT
ACCTCCGCAAGCTGTGCAGAACCGAGATCAAAGATGTTTCCAGCGAAGATGCCTCTTACA
AGATTCTCAATGCGCTTTCCTTCATCTTCAATAGCATCACTCAGACGGACGACTTCAGGA
AATAGTGATATAGCCTTTGCATTCTCCTATCCTTAACTTTCTTGAAAATGTCTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C653JQ U 46
AF RR4AM48JQ U 1
AF RR4BZ43JQ U 16
AF RR4AM48TF C 193
BS 1 44 RR4AM48JQ
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BS 46 96 RR4AM48JQ
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BS 99 747 RR4AM48JQ
BS 748 804 RR4BZ43JQ
BS 805 957 RR4AM48TF

RD RR4C653JQ 537 0 0
G
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GTTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAACAGTTTTTAATATAATAAACTGTTTGGCTTGGT
GCAGTAAAAAAAATGAAGGTTGTGGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGAT
GACGCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCC
AATCTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCACAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCC*A
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QA 2 537 2 537
DS 

RD RR4AM48JQ 747 0 0
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TCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGAGAGAGAGAGAGTAGAGGGAGTTTAAACTAAAAC
TTACAAAGCCTAACAGTTTTTAATATAATAAACTGTTTGGCTTGGTGCAGTAAAAAAAAT
GAAGGTTGTGGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGACGCAGTCATAAA
GACGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAATCTTGAGGGAAT
CACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCC*ATGCCTTCTAAGATG
ACCAAGTCTGCATCGGTTGCAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTTGCCAGATCAATA
ACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCAACGCCCATCAGT
TGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTTGATAAGATCTCTGCAAGCTCGGTATAAGTGACATCA
TTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGACGTAGCATTTCT
CCAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCAACAAATATCACA
GCCTTCTTCCAAGGCTTCTTGAGCCATCTGGCTTGAAAGTTTTCCAAGTCATCAATGACC
CATGGCCGTGGAACCAAGTTTTGACAG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4BZ43JQ 789 0 0
CCTCTAAAATGCTCAAATACCATATCAAGAATGTTGAAAGAGTTTTCAAATTCTTATATC
TGAGTGCAGAGAGAGAGAGAG**TAGAGGGAGTTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAACA
GTTTTTAATATAATAAACTGTTTGGCTTGGTGCAGTAAAAAAAATGAAGGTTGTGGGAAT
ACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGACGCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAGAA
ACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAATCTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAG
CATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCC*ATGCCTTCTAAGATGACCAAGTCTGCATCG
GTTGCAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCCTGCCAGATCAATAACCGGTAAGTCATTC
CCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCAACGCCCATCAGTTGTCCATTTTCATCC
TTAAGCTTTGATAAGATCTCTGCAAGCTCGGTATAAGTGACATCATTGATAGATGGAAGC
TCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGACGTAGCATTTCTCTAGCAAACGGCAAG
ATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCAACAAATATCACAGCCTTCTTCCAAGGC
TTCTTGAGCCATCTAGCTTGAAAGTTTTCCAAGTCATCAATGACCCATGGCCGTGGAACC
AAGTTTTGACAGCTAGCCAAGAATGACATTCCATCCTTTGAGAATACCTCCGCAAGCTGT
GCAGAACCG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4AM48TF 765 0 0
AATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGACGCAGTCATAAAGACGTCCTCCCA
GAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAATCTTGAGGGAATCACACTTGAACT
GAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCCCATGCCTTCTAAGATGACCAAGTCTGCA
TCGGTTGCAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTTGCCAGATCAATAACCGGTAAGTCA
TTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCAACGCCCATCAGTTGTCCATTTTCA
TCCTTAAGCTTTGATAAGATCTCTGCAAGCTCGGTATAAGTGACATCATTGATAGATGGA
AGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGACGTAGCATTTCTCCAGCAAACGGC
AAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCAACAAATATCACAGCCTTCTTCCAA
GGCTTCTTGAGCCATCTGGCTTGAAAGTTTTCCAAGTCATCAATGACCCATGGCCGTGGA
ACCAAGTTTTGACAGCTAGCCAAGAATGACATTCCATCCTTTGAGAATACCTCCGCAAGC
TGTGCAGAACCGAGATCAAAGATGTTTCCAGCGAAGATGCCTCTTACAAGATTCTCAATG
CGCTTTCCTTCATCTTCAATAGCATCACTCAGACGGACGACTTCAGGAAATAGTGATATA
GCCTTTGCATTCTCCTATCCTTAACTTTCTTGAAAATGTCTCTGC

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL1521Contig2 688 2 5 U
GGATGTGTGTCTCATCGTTAAAATAACAACATCGAGGGGAGTGCTGATTTCGTTTTAGAA
AGATTCTGAATCTCTCTCTCTCTCCCACACGCCTAGGTTGCAATTTTTGTTACTGCTTTG
GAGTGAAGAAGAAGGATCATCAAAAAAATGGAGAGCGACTCAGTGATGGTAGCGTTGCCT
CTGTTACCGATACCGATAGAATCAAACTACAGAGCGTGCACCATTCCTTACCGATTCCCT
TCTGATAACCCCAAGAAGGCTACCCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCTTCCTCAAC
TCCATCCCTTCTTTCAAGGAGCGTGCAGAGAGCGATACATCTGTTCCAGATGCTCCTGTT
CGAGCTGAAAAGTTTGCTCAAAGGTATGCGGAGATTCTTGAGGACTTGAAGAAAGATCCG
GAGAGCCATGGTGGACCACCAGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAGCTAATACTC
AGAGAATTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATGCAAAGGCT
ATATCACTATTTCCTGAAGTCGTCCGTCTGAGTGATGCTATTGAAGATGAAGGAAAGCGC
ATTGAGAATCTTGTAAGAGGCATCTTCGCTGGAACATCTTTGATCTCGGTCTGCACAGCT
TGCGGAGGTATCTCAAAGGATGGAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C653TF U 239
AF RR4BZ43TF U 1
BS 1 336 RR4BZ43TF
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BS 399 399 RR4C653TF
BS 400 688 RR4BZ43TF

RD RR4C653TF 176 0 0
CTTCTGATAACCCCAAGAAGGCTACCCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCTTCCTCA
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TTCGAGCTGAAAAGTTTGCTCAAAGGTATGCGGAGATTCTTGAGGACTTGAAGAAA

QA 1 176 1 176
DS 

RD RR4BZ43TF 688 0 0
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GAGTGAAGAAGAAGGATCATCAAAAAAATGGAGAGCGACTCAGTGATGGTAGCGTTGCCT
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TCTGATAACCCCAAGAAGGCTACCCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCTTCCTCAAC
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CGAGCTGAAAAGTTTGCTCAAAGGTATGCGGAGATTCT*GAGGACTTGAAGAAAGATCCG
GAGAGCCATGGTGGACCACCAGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAGCTAATACTC
AGAGAATTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATGCAAAGGCT
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TGCGGAGGTATCTCAAAGGATGGAATGT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 2 6

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BQ
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AF RR4GC76JQ U 1
AF RR4CQ35JQ U 1
AF RR4CY67JQ U 1
BS 1 731 RR4CQ35JQ
BS 732 753 RR4CY67JQ

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TTAGCTCCCCAAAT

QA 1 554 1 554
DS 

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GAGGACGACGCATTGTCTTTGAATATCATCTTTGCAGTAGTGTCCAACAACGCAGTTCTC
TGCAAACACAGCTCCACCTGCATAGCCTTGAGCTTCTTCAGCTTCTCCTCCAACTCCCTC
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TTAGCTCCCCAAATCTTCCTCGACAAGTCGAAAGCCTTCTGGTCAAGATCCTTGGAACAC
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QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4CY67JQ 753 0 0
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GGAGGAGACTTCACATCCTCTTTCGAAGACATCTTCCTCGGTTTGGCGGGAAGAACACCG
TTAGCTCCCCAAATCTTCCTCGACAAGTCGAAAGCCTTCTGGTCAAGATCCTTGGAACAC
GTGACCTTATCCTCAGTCTTTCCTTTCTTAAGCGCGTTCTTGACTATATTGACGAACTTC
TTCTTACACCTCTGGAGCTTGGTGACTATCTGAGCTTTGGAAGCGTTGAAATCGATCAAC
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QA 1 753 1 753
DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4GC76TF U 1
AF RR4CQ35TF U 26
AF RR4CY67TF U 26
BS 1 195 RR4GC76TF
BS 196 196 RR4CQ35TF
BS 197 223 RR4GC76TF
BS 224 225 RR4CQ35TF
BS 226 264 RR4GC76TF
BS 265 267 RR4CQ35TF
BS 268 715 RR4GC76TF
BS 716 717 RR4CQ35TF
BS 718 718 RR4CY67TF
BS 719 731 RR4CQ35TF

RD RR4GC76TF 719 0 0
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TCCGGAGAAGAAGAAGAATCCGGATCTTCCGACGACGAAGCTGT*GACGTCCAGTCCAAG
CTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCT***ACGAAGAAAAATCCTGAATCCGATTCCGAAGAA
GACGAATCCGAATCCGATTCCGATTCCGAACCTCCCACCAAGACCAAGCCTCTCAACACC
GTCGCCTCCAAACCAAAGCCAGAGACATCCGGATCCGCTTCCGTGTCTCTCCCCGAGAGC
TCTACTACAGCCAAACGCTCCCTAAAGCAAGCAGACGAAGAAGAGCCTAAGAAGAAGGCG
AAGACAACAACAGAGAATGTAAAGAAGAAGAAGGATGAAGAGGTTAAGAAGATCTCCGGA
GAAGACGCGAAGAAGATGTTCCAGAGACTGTTCAGCGAGACCGACGAAATCGCGATGCTT
CGTGGCTTTCTAGACTTCACATCCACTAGAGGCGACCCTTACGAGAACATGGACGCCTTC
TGCGATACGTCAAGACGTTGATCGATTTCAACGCTTCCAAAGCTCAGATAGTCAC
AAGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CQ35TF 706 0 0
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CTTCCGACGACGAAGCTGGCGACGTCCAGTCCAAGCTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCTC
CTACGAAGAAAAATCCTGAATCCGATTCCGAAGAAGACGAATCCGAATCCGATTCCGATT
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QA 1 706 1 706
DS 

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GCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTCCGGCTCATCCGGAGAAGAAGAATAATCCGGAT
CTTCCGACGACGAAGCTGGCGACGTCCAGTCCAAGCTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCTC
CTACGAAGAAAAATCCTGAATCCGATTCCGAAGAAGACGAATCCGAATCCGATTCCGATT
CCGAACCTCCCACCAAGACCAAGCCTCTCAACACCGTCGCCTCCAAACCAAAGCCAGAGA
CATCCGGATCCGCTTCCGTGTCTCTCCCCGAGAGCTCTACTACAGCCAAACGCTCCCTAA
AGCAAGCAGACGAAGAAGAGCCTAAGAAGAAGGCGAAGACAACAACAGAGAATGTAAAGA
AGAAGAAGGATGAAGAGGTTAAGAAGATCTCCGGAGAAGACGCGAAGAAGATGTTCCAGA
GACTGTTCAGCGAGACCGACGAAATCGCGATGCTTCGTGGCTTTCTAGACTTCACATCCA
CTAGAGGCGACCCTTACGAGAACATGGACGCCTTCTGCGATACGTCAAGACGTTGATCGA
TTTCAACGCTTCCAAAGCTCAGATAGTCACCAAGCTCCAGAG
TGTAA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 6

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TGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTACT
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GCCCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGTATCTACGGCCTTTAGGCAATA
AACATTACTTTCTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 10 10 

AF RR4D092TF U 1
AF RR4G872JQ C 41
AF RR4H231JQ C 204
AF RR4H231TF U 80
AF RR4G872TF U 41
AF RR4D092JQ C 391
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RD RR4D092TF 737 0 0
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TGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTACT
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GCCCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGTATCTACG*CCTTTAG*CAATA
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AC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4G872JQ 697 0 0
GG
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T

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TCCTGCAAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGCAGGATTATCAAACATTTCAGGTTCAAG
AGTTGGGTCGTCGTTTGATGGGAATTCTATCAAGCTTTCATTCCCTTTTCTCGCCATCCT
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QA 4 533 4 533
DS 

RD RR4H231TF 657 0 0
GG
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AATGCTGTCAGGTCGTCTCCTGAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAGGTGGAGGTCCCCAG
CTTGGGATCAATGTTAGTCAAACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTTAA
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ATCCTATCCACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATACTGACCTTTTTCGTTAGAAACC
ACAAAGCTTTTGGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCTATTGAATATGAAGT
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CGACAAATAGTGTGTTGTATCTACGGCCTTTAGGCAATAAACATTACTTTCTAGG

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR4G872TF 697 0 0
GG
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CTGCTGCTGCTTACAGTTTCAGTGGCAGTGATATGGTCCACAACGACGGTTTCTGCTCAA
TCTGACTGCACAAATGTTCTTATAAGCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACATCACTGGGAAC
TCTACTACTCCTTCCCAGCAGTGTTGCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAGGTCGTCTCCT
GAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAGGTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAATGTTAGTCAA
ACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTATCTGC
AATGTTAATTCGCATGCAGGATTATCAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTCT
GATGGGAATTCTATCAAGCTCTCATTCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTAC
ATTATATGCTCAAAATACTGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTG
ATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCTATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTGTTGTGTTATG
TATTTTGTGCTTTATAAAGCCCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGTATC
TACGGCCTTTAGGCAATAAACATTACTTTCTAGG
T

QA 3 696 3 696
DS 

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ACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATACTGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTT
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GTGTGTTGTATCTACGGCCTTTAGGCAATAAACATTACTTTCTAGGAC

QA 1 348 1 348
DS 



AS 1 6

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GCAGCTTGACTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGC
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AGTAAAAACAAAAACACATGTAGTTTATAGACTTATAGCTAAGAAAACATTGTGTATTAT
GGCTTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAACACTGTAAGAATTTTTCATCTCTGATGTT
CAATACAAAATGCTTATAAGG


BQ
10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 20 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4E681TF U 2
AF RR4F967TF U 1
AF RR4H378TF U 1
AF RR4E681JQ C 3
AF RR4F967JQ C 6
AF RR4H378JQ C 88
BS 1 277 RR4F967TF
BS 278 278 RR4E681TF
BS 279 372 RR4F967TF
BS 373 373 RR4E681TF
BS 374 422 RR4F967TF
BS 423 423 RR4E681TF
BS 424 607 RR4F967TF
BS 608 609 RR4H378TF
BS 610 613 RR4F967TF
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BS 615 706 RR4F967TF
BS 707 741 RR4F967JQ

RD RR4E681TF 608 0 0
T
TTTTTTCCTGTTCGTCTTCTTCATCTTCCTCTCAGCAGCGCTCGACGATGATGGCGTTCG
CTGGAATCACGACTTTTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACAAGGT
TAAGTCATGTGACTCCACGTAATTCGATTTCATTTCCTCGTTTTTCATACGTGACTCTCA
ATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGAGG
GATTGAAACCGGCGATATCCTTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAA
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AGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGC
AGCTTGACTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGCTA
CACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTTGCTGCCGAGATGTGAAACAATTGTGTTGCAG
TAAAA
CA

QA 2 606 2 606
DS 

RD RR4F967TF 706 0 0
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CGCTGGAATCACGACTTTTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACAAG
GTTAAGTCATGTGACTCCACGTAATTCGATTTCATTTCCTCGTTTTTCATACGTGACTCT
CAATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGA
GGGATTGAAACCGGCGATATCCTTGACGGATAGTGCGTTTAAGCATCTGAATAAGATGAG
AACAGAGCGCGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGG
GATGTCTTACACTATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCGAGACCAGACGATTCCACCAT
CGGGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAAT
GCAGCTTGACTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGC
TACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTTGCTGCCGAGATGTGAAACAATTGTGTTGC
AGTAAAACAAAAA*CACATGTAGTTTATAGACTTATAGCTAAGAAAACATTGTGTATTAT
GGCTTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAACACTGTAAGAATTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4H378TF 685 0 0
TT
TTTTTTCCTGTTCGTCTTCTTCATCTTCCTCTCAGCAGCGCTCGGCGATGATGGCGTTCG
CTGGAATCACGACTTTTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACAAGGT
TAAGTCATGTGACTCCACGTAATTCGATTTCATTTCCTCGTTTTTCATACGTGACTCTCA
ATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGAGG
GATTGAAACCGGCGATATCCTTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAA
CAGAGCGCGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGA
TGTCTTACACGATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCGAGACCAGACGATTCCACCATCG
AGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGC
AGCTTGACTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGCTA
CACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTTGCTGCCGAGATGTGAAACAATTGTGTTGCAG
TAAAAACAAAA*CACATGTAGTTTATAGACTTATAGCTAAGAAAACATTGTGTATTATGG
CTTGTAGAATTTCTCAACTGAAT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR4E681JQ 707 0 0
TTTTTTCCTGTTCGTCTTCTTCATCTTCCTCTCAGCAGCGCTCGACGATGATGGCGTTCG
CTGGAATCACGACTTTTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACAAGGT
TAAGTCATGTGACTCCACGTAATTCGATTTCATTTCCTCGTTTTTCATACGTGACTCTCA
ATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGAGG
GATTGAAACCGGCGATATCCTTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAA
CAGAGCGCGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGA
TGTCTTACACGATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCGAGACCAGACGATTCCACCATCG
AGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGC
AGCTTGACTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGCTA
CACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTTGCTGCCGAGATGTGAAACAATTGTGTTGCAG
TAAAAACAAAAACACATGTAGTTTATAGACTTATAGCTAAGAAAACATTGTGTATTATGG
CTTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAACACTGTAAGAATTTT
TCG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4F967JQ 736 0 0
TTTCCTGTTCGTCTTCTTCATCTTCCTCTCAGCAGCGCTCGGCGATGATGGCGTTCGCTG
GAATCACGACTTTTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACAAGGTTAA
GTCATGTGACTCCACGTAATTCGATTTCATTTCCTCGTTTTTCATACGTGACTCTCAATC
GGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGAGGGAT
TGAAACCGGCGATATCCTTGACGGATAGTGCGTTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAACAG
AGCGCGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGATGT
CTTACACTATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCGAGACCAGACGATTCCACCATCGGGT
ACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGCAGC
TTGACTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGCTACAC
AAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTTGCTGCCGAGATGTGAAACAATTGTGTTGCAGTAA
AAACAAAAACACATGTAGTTTATAGACTTATAGCTAAGAAAACATTGTGTATTATGGCTT
GTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAACACTGTAAGAATTTTTCATCTCTGATGTTCAATA
CAAAATGCTTATAAGG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4H378JQ 650 0 0
AACTTTTCTTCAGCTAAGGATCTCTACCACAAGGTTAAGTCATGTGACTCCACGTAATTC
GATTTCATTTCCTCGTTTTTCATACGTGACTCTCAATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCG
ATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGAGGGATTGAAACCGGCGATATCCTTGAC
GGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAACAGAGCGCGGGGAAGATCTGTGCTT
GAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACGATGGACTTTGAGAA
CAGAGCCAACGCGAGACCAGACGATTCCACCATCGAGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTG
TGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGAATGCAGCTTGACTACAGCGATGCTTTGAT
CGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCAAACGCTACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTC
TTTTGCTGCCGAGATGTGAAACAATTGTGTTGCAGTAAAAACAAAAACACATGTAGTTTA
TAGACTTATAGCTAAGAAAACATTGTGTATTATGGCTTGTAGAATTTCTCAACTGAATCA
GAAACACTGTAAGAATTTTTCATCTCTGATGTTCAATACAAAATGCTTAT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 6

CO CL1525Contig1 768 6 2 U
AAAGTCTCGAATCCAAACCGAATTAAACCGGCCGGCTATTTGAATTAAACCAAACGGTTA
AGCTTCAGAATAAGCGATTCGTTTTGGATGATCAATACACGAGAGAATGTAAACTAAAGA
ACCAAACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTACTTTCTTCGGTTTGTTGTTCGTAAGAGAA
GAAGAATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTTGTAGGAGAGAGGTTCTAAAGCTTGGATTT
GCCACCGCGAGGAGGATCCTTTGCCCAGAGAGGTGGGATGATCCTATGGTCTTGTTGCAC
AGGCTGCTGCTGCTCTTCCTCCTTTTTATCGTCCTCAAGAACCTCTTTAGAGAATGCGTT
TGGGTTGGCTTTGATACAGCTTTGCAATGCAACGAATGGATGAACACAGTCTGATCCCTT
TTCTTCAGCAGTGCTTATGAGAAAGCAACGGAAAGCCTCGGTGAACTGAGACCCGCAGGA
TCCATTACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAATCGAGGGCTTTTTGTGCCTTGACTTCAAG
CGACTCATTCTCATTGTCACCTTCCCCAAATGCTGCAGCTTCTGCAAGGAGAGACCCCAT
CGGAGACGACGAAGTATCGTCAGAATCCCGCGGCGAATTCGTGGAAGGAGGAGGGGTATT
ACTAGTCGACGCAGAGTTCTCGTTACTCAGAGCTTGACCCATCTCTTCCTTTCTCCTCCG
TCTGAGCCAAAACCTCCCAAATAATTTTTTGTTTAGCCGACGACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN94JQ U 90
AF RR4DE60JQ U 97
AF RR4FX62JQ U 1
AF RR4DE60TF C 126
AF RR4FX62TF C 89
AF RR4FN94TF C 112
BS 1 748 RR4FX62JQ
BS 749 768 RR4FN94TF

RD RR4FN94JQ 520 0 0
GCTCAATA
CACGAGAGAATGTAAACTAAAGAACCAAACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTACTTTCT
TCGGTTTGTTGTTCGTAAGAGAAGAAGAATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTTGTAGGA
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TCGGTGAACTGAGACCCGCAGGATCCATTACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAATCGAGG
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GCTTCTGCAAGGAGAGACCCCATCGGAGACGA

QA 9 520 9 520
DS 

RD RR4DE60JQ 517 0 0
C
CACGAGAGAATGTAAACTAAAGAACCAAACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTACTTTCT
TCGGTTTGTTGTTCGTAAGAGAAGAAGAATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTTGTAGGA
GAGAGGTTCTAAAGCTTGGATTTGCCACCGCGAGGAGGATCCTTCGCCCAGAGAGGTGGG
ATGATCCTATGGTCTTGTTGCACAGGCTGCTGCTGCTCTTCCTCCTTTTTATCGTCCTCA
AGAACCTCTTTAGAGAATGCGTTTGGGTTGGCTTTGATACAGCTTTGCAATGCAACGAAT
GGATGAACACAGTCTGATCCCTTTTCTTCAGCAGTGCTTATGAGAAAGCAACGGAAAGCC
TCGGTGAACTGAGACCCGCAGGATCCATTACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAATCGAGG
GCTTTTTGTGCCTTGACTTCAAGCGACTCATTCTCATTGTCACCTTCCCCAAATGCTGCA
GCTTCTGCAAGGAGAGACCCCATCGGAGACGACGAA

QA 2 517 2 517
DS 

RD RR4FX62JQ 756 0 0
AAAGTCTCGAATCCAAACCGAATTAAACCGGCCGGCTATTTGAATTAAACCAAACGGTTA
AGCTTCAGAATAAGCGATTCGTTTTGGATGATCAATACACGAGAGAATGTAAACTAAAGA
ACCAAACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTACTTTCTTCGGTTTGTTGTTCGTAAGAGAA
GAAGAATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTTGTAGGAGAGAGGTTCTAAAGCTTGGATTT
GCCACCGCGAGGAGGATCCTTTGCCCAGAGAGGTGGGATGATCCTATGGTCTTGTTGCAC
AGGCTGCTGCTGCTCTTCCTCCTTTTTATCGTCCTCAAGAACCTCTTTAGAGAATGCGTT
TGGGTTGGCTTTGATACAGCTTTGCAATGCAACGAATGGATGAACACAGTCTGATCCCTT
TTCTTCAGCAGTGCTTATGAGAAAGCAACGGAAAGCCTCGGTGAACTGAGACCCGCAGGA
TCCATTACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAATCGAGGGCTTTTTGTGCCTTGACTTCAAG
CGACTCATTCTCATTGTCACCTTCCCCAAATGCTGCAGCTTCTGCAAGGAGAGACCCCAT
CGGAGACGACGAAGTATCGTCAGAATCCCGCGGCGAATTCGTGGAAGGAGGAGGGGTATT
ACTAGTCGACGCAGAGTTCTCGTTACTCAGAGCTTGACCCATCTCTTCCTTTCTCCTCCG
TCTGAGCCAAAACCTCCCAAATAATTTT
TTGTTTCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DE60TF 625 0 0
ACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTACTTTCTTCGGTTTGTTGTTCGTAAGAGAAGAAGA
ATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTTGTAGGAGAGAGGTTCTAAAGCTTGGATTTGCCAC
CGCGAGGAGGATCCTTCGCCCAGAGAGGTGGGATGATCCTATGGTCTTGTTGCACAGGCT
GCTGCTGCTCTTCCTCCTTTTTATCGTCCTCAAGAACCTCTTTAGAGAATGCGTTTGGGT
TGGCTTTGATACAGCTTTGCAATGCAACGAATGGATGAACACAGTCTGATCCCTTTTCTT
CAGCAGTGCTTATGAGAAAGCAACGGAAAGCCTCGGTGAACTGAGACCCGCAGGATCCAT
TACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAATCGAGGGCTTTTTGTGCCTTGACTTCAAGCGACT
CATTCTCATTGTCACCTTCCCCAAATGCTGCAGCTTCTGCAAGGAGAGACCCCATCGGAG
ACGACGAAGTATCGTCAGAATCCCGCGGCGAATTCGTGGAAGGAGGAGGGGTATTACTAG
TCGACGCAGAGTTCTCGTTACTAAGAGCTTGACCCATCTCTTCCTTTCTCCTCCGTCTGA
GCCAAAACCTCCCAAATAATTTT
CC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4FX62TF 668 0 0
TGA
TCAATACACGAGAGAATGTAA*CTAAAGAACCAAACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTA
CTTTCTTCGGTTTGTTGTTCGTAAGAGAAGAAGAATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTT
GTAGGAGAGAGGTTCTAAAGCTTGGATTTGCCACCGCGAGGAGGATCCTTTGCCCAGAGA
GGTGGGATGATCCTATGGTCTTGTTGCACAGGCTGCTGCTGCTCTTCCTCCTTTTTATCG
TCCTCAAGAACCTCTTTAGAGAATGCGTTTGGGTTGGCTTTGATACAGCTTTGCAATGCA
ACGAATGGATGAACACAGTCTGATCCCTTTTCTTCAGCAGTGCTTATGAGAAAGCAACGG
AAAGCCTCGGTGAACTGAGACCCGCAGGATCCATTACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAA
TCGAGGGCTTTTTGTGCCTTGACTTCAAGCGACTCATTCTCATTGTCACCTTCCCCAAAT
GCTGCAGCTTCTGCAAGGAGAGACCCCATCGGAGACGACGAAGTATCGTCAGAATCCCGC
GGCGAATTCGTGGAAGGAGGAGGGGTATTACTAGTCGACGCAGAGTTCTCGTTACTCAGA
GCTTGACCCATCTCTTCCTTTCTCCTCCGTCTGAGCCAAAACCTCCCAAATAATTTT
TTGTTTCC

QA 4 660 4 660
DS 

RD RR4FN94TF 657 0 0
AACTAAAGAACCAAACGTGTTTACACAATGGCTTCTTTTACTTTCTTCGGTTTGTTGTTC
GTAAGAGAAGAAGAATCGAAAAGAACAAGCTTCCATTGTTGTAGGAGAGAGGTTCTAAAG
CTTGGATTTGCCACCGCGAGGAGGATCCTTTGCCCAGAGAGGTGGGATGATCCTATGGTC
TTGTTGCACAGGCTGCTGCTGCTCTTCCTCCTTTTTATCGTCCTCAAGAACCTCTTTAGA
GAATGCGTTTGGGTTGGCTTTGATACAGCTTTGCAATGCAACGAATGGATGAACACAGTC
TGATCCCTTTTCTTCAGCAGTGCTTATGAGAAAGCAACGGAAAGCCTCGGTGAACTGAGA
CCCGCAGGATCCATTACGCAGATCTGCGATGCAAGGACAATCGAGGGCTTTTTGTGCCTT
GACTTCAAGCGACTCATTCTCATTGTCACCTTCCCCAAATGCTGCAGCTTCTGCAAGGAG
AGACCCCATCGGAGACGACGAAGTATCGTCAGAATCCCGCGGCGAATTCGTGGAAGGAGG
AGGGGTATTACTAGTCGACGCAGAGTTCTCGTTACTCAGAGCTTGACCCATCTCTTCCTT
TCTCCTCCGTCTGAGCCAAAACCTCCCAAATAATTTTTTGTTTAGCCGACGACGTCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 6

CO CL1526Contig1 744 6 10 U
GGACTCAGGGTTTAAGCGCCTCAACCTCACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAG
CTAATCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGT
TCTGAAGAAAGTTAATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCAT
CACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAG
GATGGTTCAGAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTAT
TCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTATACCAACTAGGAA
AAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGTTATCAAC
TGTGCTGGTTCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCA
AGGTCACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAA
CATGGAAGATTTCATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTA
CAATGACAAGTTGGATGATTACGACATGATGCTTGCTTAACTCTCTCTATTTGTCTTGCT
TCTCAAAAGTGTAAACCTTTTTCTCTATTGCC*AAACTATATGTTTTCATTACTTATCAA
ACCTTTTGCAACAGATTTAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP12TF U 1
AF RR4FR88TF U 12
AF RR4G821TF U 13
AF RR4G821JQ C 13
AF RR4H393JQ C 70
AF RR4FP12JQ C 168
BS 1 586 RR4FP12TF
BS 587 602 RR4FR88TF
BS 603 603 RR4G821TF
BS 604 667 RR4FR88TF
BS 668 668 RR4G821TF
BS 669 706 RR4FR88TF
BS 707 718 RR4G821TF
BS 719 727 RR4G821JQ
BS 728 738 RR4H393JQ
BS 739 744 RR4FP12JQ

RD RR4FP12TF 586 0 0
GGACTCAGGGTTTAAGCGCCTCAACCTCACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAG
CTAATCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGT
TCTGAAGAAAGTTAATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCAT
CACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAG
GATGGTTCAGAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTAT
TCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTATACCAACTAGGAA
AAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGTTATCAAC
TGTGCTGGTTCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCA
AGGTCACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAA
CATGGAAGATTTCATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4FR88TF 695 0 0
GG
AAGCGCCTCAACCTCACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTC
TCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTT
AATTTCTTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAGACCTCATCACGGGTCGTTAC
CACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAG
CTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGAT
AACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTATACCAACTAGGAAAAGCTTGGCTTTA
ACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGTTATCAACTGTGCTGGTTCAC
CTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGTCACATTCGT
GTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTC
ATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACATTGACAAGTTG
GATGATTACGACATGATGCTTGCTTAACTCTCTCTATTTGTCTTGCTTCTCAAA*GTGTA
AACCTTTTTCTCTATTGCC*AAACTATATGTTT

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR4G821TF 706 0 0
G
AAGCGCCTCAACCTCACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTC
TCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTT
AATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACGGGTCGTTAC
CACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAG
CTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGAT
AACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTATACCAACTAGGAAAAGCTTGGCTTTA
ACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGTTATCAACTGTGCTGGTTCAC
CTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGTCACATTCGT
GTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTC
ATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAATGACAAGTTG
GATGATTACGACATGATGCTTGCTTAACTCTCTCTATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTA
AACTTTTTTCTCTATTGCC*AAACTATATGTTTTCATTACTTATC

QA 2 706 2 706
DS 

RD RR4G821JQ 716 0 0
G
AAGCGCCTCAACCTCACCGCTTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTC
TCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTT
AATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACGGGTCGTTAC
CACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAG
CTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGAT
AACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTATACCAACTAGGAAAAGCTTGGCTTTA
ACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGTTATCAACTGTGCTGGTTCAC
CTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGTCACATTCGT
GTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTC
ATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAATGACAAGTTG
GATGATTACGACATGATGCTTGCTTAACTCTCTCTATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTA
AACTTTTTTCTCTATTGCCTAAACTATATGTTTTCATTACTTATCAAACCTTTT
C

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR4H393JQ 669 0 0
TCTCTCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAA
AGTTAATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACGGGTCG
TTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTTCA
GAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGAC
TGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTATACCAACTAGGAAAAGCTTGGC
TTTAACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGTTATCAACTGTACTGGT
TCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGTCACAT
TCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGA
TTTCATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAATGACAA
GTTGGATGATTACGACATGATGTTTGCTTAACTCTCTCTATTTGTCTTGCTTCTCAAAAG
TGTAAACCTTTTTCTCTATTGCC*AAACTATATGTTTTCATTACTTATCAAACCTTTTGC
AACAGATTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4FP12JQ 577 0 0
TCGAAAACCTCATCACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATT
CAGGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTG
ATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGCGTTA
TACCAACTAGGAAAAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGC
GTAGGTTATCAACTGTGCTGGTTCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGA
CATACATAGAGCAAGGTCACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTTT
TAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTCATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCA
AGGTGCTTCAGTACAATGACAAGTTGGATGATTACGACATGATGCTTGCTTAACTCTCTC
TATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTAAACCTTTTTCTCTATTGCC*AAACTATATGTTTT
CATTACTTATCAAACCTTTTGCAACAGATTTAAGACC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 6

CO CL1527Contig1 1141 6 10 U
GGATCACCAACAAACCCTAGCTTCGTCTCTCTCTCCTCCTCATCCTTTGGTTTCTCGATC
TCCATGACGATTCTCATCGATCACCACTCTGATCACAATGATGCAGGGGATGATATCGTA
GAGAAGAATGTAACAGAGGAAGAAACAGAGTTGGTGTTAGATGGAGGTTTTGTGGCTCCT
CACACCAACTCTTTTGGTCACACCTTCAGAGATTATGATACTCAAAGTGAGAGGAGGAGA
AGCGTAGAGGAGTTCTACAAAACCAATCATATTGGCCAAACAGTTGACTTTGTTAGGAGG
ATGAGAGAGGAATACGGGAAGCTAAACCGAACCGAGATGAGCATTTGGGAATGCTGTGAG
CTTCTCAATGAGTTTGTCGACGAGAGTGATCCTGATTTGGACGAGCCTCAGATCGAACAT
TTGCTTCAGACAGCTGAAGCCATCAGAAAAGATTACCCTGGTGAAGACTGGCTCCATCTG
ACCGGTCTTATCCATGATCTTGGAAAAGTTCTTCTCCACCCTTCATTTGGTGAGCTGCCT
CAATGGGCTGTTGTTGGTGATACTTATCCAGTGGGATGTGCTTTTGACGAGTCTATTGTT
CACCACAAGTACTTCAAGGAGAATCCAGACTTCAACAACCCGAGTTACAACACCGAGCAC
GGGATATATAAAGAAGGCTGTGGGCTTGACAACGTGTTCATGTCTTGGGGACATGATGAT
TACATGTACCTTGTTGCCAAGGCGAACAAAACTACATTACCATCGGCTGGCCTTTTCATT
ATCAGATACCACTCGTTTTACGCGCTTCACAAATCAGAAGCATACAAGCATTTGATGAAC
GATGAAGACAGAGAGAACATGAAGTGGCTGAAAGTGTTTAACAAGTATGATCTCTACAGC
AAAAGCAAAGTCCGCATAAACGTGGAGGAGGTGAAACCATACTATCTCTCCCTTATCAAC
AAGTACTTTCCGGCAAAGTTAAAATGGTGAAAATCACAAGCAAGAGGAGGCTTTTTAATA
AACAGGATGTGATGAATGTGACTACAAATATGTGTAAACATATAAGGCAGATATGCCTTG
ATGAATAAAAAACGTTGTTATTTTCATTTGTGCTTAGTTTTCCAGTGGTTAATTCCGGTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4CT71TF U 64
AF RR4BX85TF U 1
AF RR4C735TF U 154
AF RR4CT71JQ C 289
AF RR4C735JQ C 397
AF RR4BX85JQ C 491
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BS 677 729 RR4BX85TF
BS 730 733 RR4C735TF
BS 734 877 RR4CT71JQ
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TCCATGACGATTCTCATCGATCACCACTCTGATCACAATGATGCAGGGGATGATATCGTA
GAGAAGAATGTAACAGAGGAAGAAACAGAGTTGGTGTTAGATGGAGGTTTTGTGGCTCCT
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TACATGTAC
TTGT

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DS 

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CTTT
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TTTTCATTATCAGATACCACTCGTTTTACGCGCTTCACAAATCAGAAGCATACAAGCATT
TGATGAACGATGAAGACAGAGAGAACATGAAGTGGCTGAAAGTGTCTAACAAGTATGATC
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CACCCTTCATTTGGTGAGCTGCCTCAATGGGCTGTTGTTGGTGATACTTATCCAGTGGGA
TGTGCTTTTGACGAGTCTATTGTTCACCACAAGTACTTCAAGGAGAATCCAGACTTCAAC
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TTCATGTCTTGGGGACATGATGATTACATGTACCTTGTTGCCAAGGCGAACAAAACTACA
TTACCATCGGCTGGCCTTTTCATTATCAGATACCACTCGTTTTACGCGCTTCACAAATCA
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CCATACTATCTCTCCCTTATCAACAAGTACTTTCCGGCAAAGTTAAAATGGTGAAAATCA
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AACATATAAGGCAGATATGCCTTGATGAATAAAAAACGTTGTTATTTTCATTTGTGCTTA
GTTTTCCAGTGGTTAATTCCGGTTG

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ACTTCAAGGAGAATCCAGACTTCAACAACCCGAGTTACAACACCGAGCACGGGATATATA
AAGAAGGCTGTGGGCTTGACAACGTGTTCATGTCTTGGGGACATGATGATTACATGTACC
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DS 



AS 2 6

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TATCTCATGGTTTTGTT


BQ
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15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C166TF U 1
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GCTAAGTGATT*AAAGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTA
CTATTATGTTCTAAA

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DS 

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TTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGAAAAGGTATCTACGAAA
AAAAGCAAAAAAAAAGAAACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCTCACCGACGATCAGATC
TCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGTATTACCACC
AAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAA
GACATGATCAACGAAGTTGACGCTGACGGTAACGGCACCATTGATTTCCCTGAGTTCTTG
AACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTC
CGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTCCGCCATGTGATG
ACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAGCTGAT
GTTGATGGTGATGGACAGATCAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGA
TTTAAAGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTACTATTATGT
TCTAAA
GT

QA 1 666 1 666
DS 

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GCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACAT
GATCAACGAAGTTGACGCTGACGGTAACGGCACCATTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCT
CATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCCGGGT
TTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATTTCAGCTGCTGAGCTCCGCCATGTGATGACAAA
CTTAGGTGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGA
TGGTGATGGACAGATCAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAA
GGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTACTATTATGTTCTAA
AGTTTTTTATTCATGGGACATGGTTTTGTTTTATGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTCT
CTTTATGCTCTGTTTTGTGTCTGAACATTTTTCAGTCTTGGTCTTTGTAAGTTGTAACTT
GGTCTAGTTTCGTGGTG

QA 1 617 1 617
DS 

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TCTAATTTC
TCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGAAAAGGTATCTA
CGAAAAAAAGCAAAAAAAA*GAAACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCTCACCGACGATC
AGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGTATTA
CCACCAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGC
TCCAAGACATGATCAACGAAGTTGACGCTGACGGTAACGGCACCATTGATTTCCCTGAGT
TCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAAG
CCTTCCGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTCCGCCATG
TGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAG
CTGATGTTGATGGTGATGGACAGATCAACTATGAGGAGTTTGTCAAGATCATGATGGCTA
AGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTACTAT
TATGTTCTAAAGTTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTTTTATGGCTGTTTAAGATGCA
AATGTTGTCTCTTTATGCTCTGTTTTGTGTCTGAACATTTCTCAGTCTTGGTCTTTGTAA
GTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTGTTATTAATGGTCTCTAGTAAAGCATTATC
TCATGGTTTTGTT

QA 10 802 10 802
DS 



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GTTGTATTACCACCAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACAG
AAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTTGACGCTGACGGTAACGGAACCATTGATT
TCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGC
TCAAGGAAGCGTTCCGGGTCTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGC
TCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGGGGTTGATGAGATGA
TCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCA
TGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATATTTTACTATTAT
GTTCTAAAGTTTTTTATTCATGGAACTTGGTTCTGTTTTATGGCTGTTTAAGATGCAAAT
GTTGTCTCTTTTATACTCTGTTTTGTGTCTGAACATTTCAAGTCTTGGTCTTTGTAAGTT
TGTAACTTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTGTTATTAATGGTCTCTAGTAAAGCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB25TF U 1
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RD RR4DB25TF 707 0 0
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GTTCTAAAGTTTTT*ATTCATGGAACTTGGTTCTGTTTTATGGCTGT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DB25JQ 734 0 0
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ATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGTATTACCACCAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTC
TCTTGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTTGACGCTGA
CGGTAACGGAACCATTGATTTCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGA
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TTTCATCTCAGCTGCTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGA
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CTTTTATATTTTACTATTATGTTCTAAAGTTTTTTATTCATGGAACTTGGTTCTGTTTTA
TGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTCTCTTTTATACTCTGTTTTGTGTCTGAACATTTCA
AGTCTTGGTCTTTGTAAGTTTGTAACTTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTGTTATTAATGG
TCTCTAGTAAAGCA

QA 1 734 1 734
DS 



AS 2 5

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AGATGCAGCATGACGAGGTTATATGGCAAGTCATCAGGCACAAGCACTGCAGTTACATGG
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GAAGCTCTTGTCCTCTCGCTAACAGTCGCTACGCCACCATTAGAGAACACGAAGGTGTTT
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TGAAGCTGCCAAGAAACTACGAGAAGGCTCTTGAAACCATTGACAAGCACTTGTTGTATT
GGCCTAAGTTGTTACAGCACAAGATCAAACAAAGACTGACTAAAATGACTCAGATGCGTA
TTCGTATGAGGAAACTTGCTCTCAAAACAAGGGAGAAGATAATGACTACGCCTAGAAGGG
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CCATTGAGACGGAGTTGTTGGAGCGTTGAAGAAGGGTATTTATGGTGACATATACAATTA
CCCGGAGCTTGAGTGGAACAAGGTTCTTGATGAAGAAAAGCAAGTGGCTGAGGATGTTGA
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TGGACATGATTCAGATGATGAGGAGGAAGATGAAGATGACGTTGAGGAGCAAGTTGTGAT
TCACAAAAAAGGAAAAAGAGATTCAAGAAAGCCTGATGATGTTGGAAAATCAAAGAAGAA
GAAGAGAGTAGTTGTTGAGGTCGAGCAAGAAGATGGAGACGTGGGGCGAACCATGAAAAC
CGCATGGTGGGCTTAGATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC69TF U 1
AF RR4CC69JQ C 535
BS 1 575 RR4CC69TF
BS 576 576 RR4CC69JQ
BS 577 622 RR4CC69TF
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BS 654 663 RR4CC69TF
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RD RR4CC69TF 666 0 0
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TTTATTTGTATATGAAGACGATAGAGAGAGCCCATATGCCAAAGAACTTGTGGGAGAGGG
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GGCCTAAGTTGTTACAGCACAAGATCAAACAAAGACTGACTAAAATGACTCAGATGCGTA
TTCGTATGAGGAAACTTGCTCTCAAAACAAGGGAGAAGATAATGACTACGCCTAGAAGGG
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GGA
GAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CC69JQ 445 0 0
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TGTTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAACCAGAGATTGAATATGTTGAAGACTATGAAGAACT
TGAGGAAGAGGAGGATATGGAAGATTTTTTTGGTTTTCCCTTTAAGGGGTCTGGCTTTGA
TGATGATGGACATGATTCAGATGATGAGGAGGAAGATGAAGATGACGTTGAGGAGCAAGT
TGTGATTCACAAAAAAGGAAAAAGAGATTCAAGAAAGCCTGATGATGTTGGAAAATCAAA
GAAGAAGAAGAGAGTAGTTGTTGAGGTCGAGCAAGAAGATGGAGACGTGGGGCGAACCAT
GAAAACCGCATGGTGGGCTTAGATG

QA 1 445 1 445
DS 



CO CL1529Contig2 808 3 4 U
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TTTTCCTTTTTTATGAATCACAACTTGCTCCTCAACGTCATCTTCATCTTCCTCCTCATC
ATCTGAATCATGTTCATCATCATCAAAGCCAGACCCCTTAGAGGGAAAACCAGAGAAATC
TTCCATATCCTCCTCTTCCTCAAGTTCTTCATATCCTTCAACATATTCAATCTCTGGTTC
CTCCTCCTCTTCTTCCTGAACATCCTCAGCCAATTGCTTTTTCATCAAGAACCTTGTTCC
ACTCAAGCTCCGGGTAATTGTATATGTCACCGTAAATACCCTTCTTCAAACGCTCTAGCA
ACTCGGTCTCAATGGCCTTATCCAACACCGCTGCTTTGATAGCCTTCTCCTCTCTTCTTG
ATTCTCTCTTTATATCCCTCCTAGGCGTAGTCATTATCTTCTCCCTTGTTTTGAGAGCAA
GTTTCCTCATCCGGATACGCATCTGAGTCATTTTAGTCAGTCTTTGTTTGATCTTGTGCT
GTAACAACTTAGGCCAATACAACAAGTC


BQ
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AF RR4EF79JQ U 1
AF RR4EF78JQ U 1
AF RR4EF79TF C 150
BS 1 414 RR4EF78JQ
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BS 416 675 RR4EF78JQ
BS 676 808 RR4EF79TF

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TTTTCCTTTTTTATGAATCACAACTTGCTCCTCAACGTCATCTTCATCTTCCTCCTCATC
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QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4EF78JQ 675 0 0
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CATCTAAGCTCACCATGCGGTTTTCATGGTTCGCCTCACGCCTCCATCTTCTTGCTCGAC
CTCAACAACTACTCTCTTCTTCTTTGATTTTCCAACATCATCAGGCTTTCTTGAATCTCT
TTTTCCTTTTTTATGAATCACAACTTGCTCCTCAACGTCATCTTCATCTTCCTCCTCATC
ATCTGAATCATGTTCATCATCATCAAAGCCAGACCCCTTAGAGGGAAAACCAGAAAAATC
TTCCATATCCTCCTCTTCCTCAAGTTCTTCATATCCTTCAACATATTCAATCTCTGGTTC
CTCCTCCTCTTCTTCCTGAACATCCTCAGCCAATTGCTTTTTCATCAAGAACCTTGTTCC
ACTCAAGCTCCGGGTAATTGTATATGTCACCGTAAATACCCTTCTTCAAACGCTCTAGCA
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QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EF79TF 659 0 0
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ACGCCTCCATCTTCTTGCTCGACCTCAACAACTACTCTCTTCTTCTTTGATTTTCCAACA
TCATCAGGCTTTCTTGAATCTCTTTTTCCTTTTTTATGAATCACAACTTGCTCCTCAACG
TCATCTTCATCTTCCTCCTCATCATCTGAATCATGTTCATCATCATCAAAGCCAGACCCC
TTAGAGGGAAAACCAGAGAAATCTTCCATATCCTCCTCTTCCTCAAGTTCTTCATATCCT
TCAACATATTCAATCTCTGGTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTGAACATCCTCAGCCAATTGC
TTTTTCATCAAGAACCTTGTTCCACTCAAGCTCCGGGTAATTGTATATGTCACCGTAAAT
ACCCTTCTTCAAACGCTCTAGCAACTCGGTCTCAATGGCCTTATCCAACACCGCTGCTTT
GATAGCCTTCTCCTCTCTTCTTGATTCTCTCTTTATATCCCTCCTAGGCGTAGTCATTAT
CTTCTCCCTTGTTTTGAGAGCAAGTTTCCTCATCCGGATACGCATCTGAGTCATTTTAGT
CAGTCTTTGTTTGATCTTGTGCTGTAACAACTTAGGCCAATACAACAAGTC

QA 9 659 9 659
DS 



AS 1 3

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GCTTAAATCAGGAAGTGTGTAGTCTCTGCTTTTGTCGCTAAATGCCTTAACATTGAGATC
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TTCCAGTGCTTCTTTCGCTATTGTCGCCGTTGGTATGTCAGAATATTGAATTAAGGCTTG
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CGTGTGAAGAACATCCACGGTGACAGCGTACTGCATATTCTCAATCAACGCAAGCAAGAC
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GGCAATTTTGTGCACAAAGCCATAAGCAGAAAACACCAGATGAATGACATCGATGCTGAC
ATCGTGAGACTCGACTCCTTCAAAGGTAACCAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A038JQD U 1
AF RR4A038JQ U 775
AF RR4A038TFB C 224
BS 1 894 RR4A038JQD
BS 895 935 RR4A038JQ
BS 936 1056 RR4A038TFB

RD RR4A038JQD 895 0 0
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AACTCCCATTCTCCCAGTTCAGTCTTTAACATAATCCGAAATTTATATAAAGTAGAAAAC
AGAGTATATGGATCAACCATAGTAAGGTGGATGACCAGAAGAAGGTGAAGCTCCTGTGGG
ATCAGCTGGTGAGTACATATATGAACTTCCCGCGTATTGAGTCTGCACCTGCCCATTGTG
CCAACCATCTGTTGGCCCACTAGCTGCAGCCACTCCTGGAACTTTTTGCCCCACCAGTTG
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AGTATGACGAGAGTATGTTAGTCGAAGCTTACAGTAGCCACCGTCATATATGCAGTGTCC
TTCCAGTGCTTCTTTCGCTATTGTCGCCGTTGGTATGTCAGAATATTGAATTAAGGCTTG
CGTTGAACCATTTTTCTCAAATATTGCAATCTTCTGCACAGTTCCATAAGCGGAAAACAC
CGTGTGAAGAACATCCACGGTGACAGCGTACTGCATATTCTCAATCAACGCAAGCAAGAC
GTTGCTCTGAGTTTCTACCCTCTTTCCATCAGCACCCAAAGCAGGCTGCATAGAACCATC
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AAACTTGATATTTAGATCAGTATGAGCTGAATAAGACATTCGCAAATTGCAAGAACCTAC
ATGTTCTGGAAGCAGATATTTTGGTATACTTCTGCCATCCAGCGCAGTCCTTGC
C

QA 1 894 1 894
DS 

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GGACTGAAACTTGATATTTAGATCAGTATGAGCTGAATAAGACATTCGCAAATTGCAAGA
ACCTACATGTTCTGGAAGCAGATATTTTGGTATACTTCTGCCATCCAGCGCAGTCCTTGC
CGCTAAAGCAGTGTCCACATCAGTAAACTGAACTAGTGCCT

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR4A038TFB 833 0 0
GGTGAAGCTCCTGTGGGATCAGCTGGTGAGTACATATATGAACTTCCCGCGTATTGAGTC
TGCAC*TGCCCATTGTGCCAACCATCTGTTGGCCCACTAGCTGCAGCCACTCCTGGAACT
TTTTGCCCCACCAGTTGGCTTAGATCAGGAAGTGTGTAGTCTCTGCTTTTGTCGCTAAAT
GCCTTAACATTGAGATCAGTATGACGAGAGTATGTTAGTCGAAGCTTACAGTAGCCACCG
TCATATATGCAGTGTCCTTCCAGTGCTTCTTTCGCTATTGTCGCCGTTGGTATGTCAGAG
TATTGAATTAAGGCTTGCGTTGAACCATTTTTCTCAAATATTGCAATCTTCTGCACAGTT
CCATAAGCGGAAAACACCGTGTGAAGAACATCCACGGTGACAGCGTACTGCATATTCTCA
ATCAACGCAAGCAAGACGTTGCTCTGAGTTTCTACCCTCTTTCCATCAGCACCCAAAGCA
GGCTGCATAGAACCATCCATAGCGGTTTGATTCACTGGAAGGTATGGATTTGTGTAGTCC
CTGCTGCGGTGGGACTGAAACTTGATATTTAGATCAGTATGAGCTGAATAAGACATTCGC
AAATTGCAAGAACCTACATGTTCTGGAAGCAGATATTTTGGTATACTTCTGCCATCCAGC
GCAGTCCTTGCCGCTAAAGCAGTGTCCACATCAGTAAACTGAACTAGTGCCTGGAAACCA
GCAGCTTTCTCAAAAGTGGCAATTTTGTGCACAAAGCCATAAGCAGAAAACACCAGATGA
ATGACATCGATGCTGACATCGTGAGACTCGACTCCTTCAAAGGTAACCAAGAG

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 6

CO CL1531Contig1 937 6 21 U
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GGTTGGCCCGTTGGAGCATATCCTGGTCCTCAGGGTCCTTACTACTGTGGAGTTGGAGCT
GAAAAGTCTTGGGGACGTGACATTTCAGATGCTCATTACAAAGCTTGTTTGTATGCCGGA
ATTAACATCAGTGGTACTAATGGTGAAGTTATGCCAGGACAGTGGGAATTCCAAGTTGGC
CCGAGCGTAGGAATCGAAGCAGGTGATCATGTTT*GGTGTGCTAGATACCTTCTTGAGAG
AATCACAGAACAAGCTGGTGTCGTCCTAACCCTTGATCCCAAACCGATTGAGGGTGACTG
GAACGGTGCTGGTTGCCATACCAATTACAGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGGATT
TGAGGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAGTGC
CTACGGTGAAGGCAACGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGACCA
ATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGATGCTCAATTCGTGTTGGACGTGATACCGAGAA
GAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACATGGACCCATACATTGT
GACTTCACTGTTGGCGGAGACCACACTTCTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGCACT
TGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAACACGCGTGTCTATTTAT
GTGGTCTTCCCCGGATCATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTCTTG
CCTCCTTTTTTTCATTTTCACTGTTGAAAAAACAATAATTTCATGGACAATCATCATTTT
CTATTGGTTATTTACGGTCTTACTGAAGATCTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H877TF U 1
AF RR4DZ14TF U 37
AF RR4G820TF U 177
AF RR4DZ14JQ C 192
AF RR4H877JQB C 319
AF RR4G820JQ C 324
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GAACGGTGCTGGTTGCCATACCAATTACAGTACAA*GAGCATGAGAGAGGATGGAGGATT
TGAG*TGATTAAAA**GCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACA

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR4DZ14TF 769 0 0
G
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CTTACTACTGTGGAGTTGGAGCTGAAAAGTCTTGGGGACGTGACATTTCAGATGCTCATT
ACAAAGCTTGTTTGTATGCTGGAATTAACATCAGTGGTACTAATGGTGAAGTTATGCCAG
GACAGTGGGAATTCCAAGTTGGCCCGAGCGTAGGAATCGAAGCAGGTGATCATGTTT*GG
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CGTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAACGAGAGAAGGTTGACCGGAAAG
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CGTGTTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCG
TCTAACATGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCGGAGACCACACTTCTCTGGGAG
CCAACCCTTGAG*CTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATT
CCTGAACACGCGTGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATCATAAATGC

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR4G820TF 691 0 0
G
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GGCCCGAGCGTAGGGATCGAAGCAGGTGATCATGTTT*GGTGTGCTAGATACCTTCTTGA
GAGAATCACAGAACAAGCTGGTGTCGTCCTAACCCTTGATCCCAAACCGATTGAGGGTGA
CTGGAACGGTGCTGGTTGCCATACCAATTACAGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGG
ATTTGAGGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAG
TGCCTACGGTGAAGGCAACGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGA
CCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGATGCTCAATTCGTGCTGGACGTGATACCGA
GAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACATGGACCCATACAT
TGTGACTTCACTGTTGGCGAAGACCACACTTCTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGC
ACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAACACGCGTGTCTATT
TATGTGGTCTTCCCCGGATCATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTC
TTGCCTCCTTTTTTTCATTTTCACTGTTGA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4DZ14JQ 717 0 0
TGGTAC
TAATGGTGAAGTTATGCCAGGACAGTGGGAATTCCAAGTTGGCCCGAGCGTAGGAATCGA
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GTGTCGTCCTAACCCTTGATCCCAAACCGATTGAGGGTGACTGGAACGGTGCTGGTTGCC
ATACCAATTACAGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGGATTTGAGGTGATTAAAAAGG
CCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAACG
AGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGG
CTAACCGTGGATGCTCAATTCGTGTTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACT
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AGACCACACTTCTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTT
CTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAACACGCGTGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATC
ATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTCTTGCCTCCTTTTTTTCATTT
TCACTGTTGAAAAAACAATAATTTCATGGACAATCATCATTTTCTATTGG
C

QA 7 716 7 716
DS 

RD RR4H877JQB 619 0 0
TGTCGTCCTAACCCTTGATCCCAAACCGATTGAGGGTGACTGGAACGGTGCTGGTTGCCA
TACCAATTACAGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGGATTTGAGGTGATTAAAAAGGC
CATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAACGA
GAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGC
TAACCGTGGATGCTCAATTCGTGTTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTT
GGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACATGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCGGA
GACCACACTTTTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTC
TTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAACACGCGTGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATCA
TAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTCTTGCCTCCTTTTTTTCATTTT
CACTGTTGAAAAAACAATAATTTCATGGACAATCATCATTTTCTATTGGTTATTTACGGT
CTTACTGAAGATCTTGTCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4G820JQ 586 0 0
TCCTAACCCTTGATCCCAAACCGATTGAGGGTGACTGGAACGGTGCTGGTTGCCATACCA
ATTACAGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGGATTTGAGGTGATTAAAAAGGCCATCT
TGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAACGAGAGAA
GGTTGACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACC
GTGGATGCTCAATTCGTGCTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAG
ATCGGCGTCCAGCGTCTAACATGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCGAAGACCA
CACTTCTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGA
AAGTTTAATTTATTCCTGAACACGCGTGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATCATAAAT
GCTGTTTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTCTTGCCTCCTTTTTTTCATTTTCACTG
TTGAAAAAACAATAATTTCATGGACAATCATCATTTTCTATTGG
TC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 6

CO CL1532Contig1 1070 6 17 U
GGATTATCGATCTGAGAAACTCGATTCGAATCCGAGATTCAATCAAATTATCAACTTTGG
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GTTTGGCACCAAAGTCCTCTACAAGACCACAAGGCAATCGCCTTGACAAGCAAGAGTATA
CTGAACTTATCAAAAGGGGTTCAACTGCCGAGGACCTGGGTGCAGGGAAGGCTGATGCAG
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ACGAGGAAAGGAAACCTGCGAAGAGAGAGAGGGAAGAGAGACATGAGAGGCACGAAAAAC
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GGAAGAAGCACAAGAAAGAGAAGAAGGATAGGAAGAGGAGGCACGACTCTGATTCCGATT
GAATTGAACTCTACCAGTGTGTAGAGAAGCCTGTCTCTTTTGCAAGATTTGAAAATTTTC
TTAGCTCATTTTCGTTTACAAAACATGGAGTAAAAGAACTATCAATATGTTTTGTGTGTT
GACCGTTGATGTAATCCACTTGAAAAATAAAAAAAAAATGATCTATGTTTGATTAATGAC
ATGGACAAAGTTATGTGATCCCTGTAATAAAACCAGAGGCATGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB12TF U 1
AF RR4F834TF U 21
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GG
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AACAAGGGGGTCCCAACACGGATGCTATGAAAGAGGAGATTCAAAGGGTTAAGGAACAAG
AGGAACAAGCCATGAGGGAGGCTCTGGGTTTGGCACCAAAGTCCTCTACAAGACCACAAG
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TGATTCCGATTGAATTGAACTCTACCAGTGTGTAGAGAAGCCTGTCTTTTTTGCAAGATT
TGAAAATTTTTTTAGCTCATTTTCGTTTACAAAACATGGAGTAAAAGAACTATCAATATG
TTTTGTGTGTTGACCGTTGATGTAATCCACTTG

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RD RR4DB12JQ 733 0 0
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AGATTCAAAGGGTTAAGGAACAAGAGGAACAAGCCATGAGGGAGGCTCTGGGTTTGGCAC
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TCAAAAGGGGTTCAACTGCCGAGGACCTGGGTGCAGGGAAGGCTGATGCAGTTTGGGTTC
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TGTAATCCACTTG

QA 1 733 1 733
DS 

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GGACAAAGTTATGTGATCCCTGTAATAAAACCAGAGGCATGTTTTATC

QA 1 168 1 168
DS 



AS 1 5

CO CL1533Contig1 1397 5 18 U
AGGAAAAAATAATAATATTCAATTGAGAAATGTTTTGATAAGTTACAAAAAAATAGAGAC
AAACACCAAATGACTAAACAAGATAAGATATACATCATTTTGTTTATACTTTTATTCAAA
GCCAAAGAAGAATAACAGAAGCAACAAAGTTTGAGAGAGATAAAATACACAAAAAAA*CA
AAAAAGAAGATCCCACATAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTT
GATCTCCTTGTGTGGCAAAACAACCCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAAC
ATCTTCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCA
CCCTACGATACTGCTCGAGACACACGCATGCTTCTTAATCCTTGCCTCACGCATGACCGT
GCATCGCGAAAGCCTCACCCCTGACTCAACAACGCATCCCGGACCAATGGCCACGTCTGG
TCCTATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCGACCAGAACATTCCCAACGAT
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CAGGCCCGTTATGTAGTCCTTGGGTTGTCCAATGTCCATCCAGAATCCAGGTAGCACCAT
GGCGTAGAGCCCTTGAGCTGTTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCTCGATTGACGTTGG
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TGTTGCCTACAAACAGTTTTGGCTTCTCCACAAACTTCTCAACTTTTCCTGTAGTTTCAT
CCATGACAACAACTCCATACTTGGACGGTTCATCAACCTTTGTCACCATAATGGAGGCTT
CACCACCGTGAGCTTTGTGAAACTCAATCATCTCTTTGAGAGGGTACTCACTGATCACAT
CACTGTTGAGGACAAAGAAGGGCTCTCCAGATCCATCAACCAGTTTGTCTCTAGCTAGAG
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GGGTCAGGCTGAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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A*CAAAAAAGAAGATCCCACATAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGG
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GAACATCTTCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGT
GCCACCCTACGATACTGCTCGAGACACACGCATGCTTCTTAATCCTTGCCTCACGCATGA
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CTGGTCCTATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCGACCAGAACATTCCCAA
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CCATGGCGTAAAGCCCTTGAGCTGCTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCTCGATCGATG
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C

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AAAAAGAAGATCCCACATAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTT
GATCTCCTTGTGTGGCAAAACAACCCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAAC
ATCTTCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCA
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QA 1 802 1 802
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*GTCGAGAACCGATGGGTTCAGAAGGTAAATCCCAGCGTTGATCTTGTTGCCTACAAACA
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TGTGAAACTCAATCATCTCTTTGAGAGGGTACTCACTGATCACATCACTGTTGAGGACAA
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CTTTCAAGAAGTTAAGCATCACCTCTGGTTGGTAATTGATGGCCAAAACCACTTCGTCAA
CTCCAACTGCCTTGAGCGCCTCTATCTGATGAAGGATCATGGGTTTGTTAGCAAGGTCAA
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ATCTCACGGGATCGAGAGATCTGAGATCGGAAACAGAGAGTTGGGGGGTCAGGCTGAGCT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 2 4

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CGCACCCTTCTCTCTCGATTGCTCTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCAACATCTCAA
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TCTCATGCGAACATCACCATCAACAGTTTTGATATATTGTTGTGCATTGGGAACAAGGCT
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TACC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4CU51TF U 1
AF RR4CU51JQ C 362
BS 1 656 RR4CU51TF
BS 657 657 RR4CU51JQ
BS 658 713 RR4CU51TF
BS 714 714 RR4CU51JQ
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BS 760 760 RR4CU51JQ
BS 761 793 RR4CU51TF
BS 794 1144 RR4CU51JQ

RD RR4CU51TF 800 0 0
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CGCACCCTTCTCTCTCGATTGCTCTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCAACATCTCAA
ACACAAGTTCATGACTGGACGATTAACACCAAGTATTACTCTGCGGATGTATCTGTATGG
ATTTCAAATATTTGCGACGATGACTACTCTCTCCCTCACTCAGATCATCCACTTGTGGCG
TTAGTTATGGTCTTCGACTTGACTCAGATGACAACTCTTGTTGCTCTTCAAGAATGGGTT
TCTCATGCGAACATCACCATCAACAGTTTTGATATATTGTTGTGCATTGGGAACAAGGCT
GATCTTCACCCACCTCATGATAGTGCATCACTGGATGTCAGGGGAACATGTCTTGACTGG
TGCCGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGATTTTGACAAG
TGTTTATCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTGTTTGGTGCACTTTCGGCA
CATATGTGGCCGAATGATTCTCAAATCTGGTGATAAGATTAATGAACCTCATGGCCAAGA
GTTTTCAGAAGAAGAAGAATCTGAATATGAATTGGAGTACGAAGTACTATCATCAG*CTC
AGCCACCGATCTATGTGAAGCGCTTTCATACTACGCAGATGCTGGCGGATCCA*CACCTC
ACCAGATGTAGAGAT*AATGATATGGTGA*TCCA*TGAA*GTTGAGCTGCGGTCTTCAGG
GTCACAGAGTGAG
GAGACTG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4CU51JQ 783 0 0
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GCCGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGATTTTGACAAGT
GTTTATCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTGTTTGGTGCACTTTCGGCAC
ATATGTGGCCGAATGATTCTCAAATCTGGTGATAAGATTAATGAACCTCATGGCCAAGAG
TTTTCAGAAGAAGAAGAATCTGAATATGAATTGGAGTACGAAGTACTATCATCAGGCTCA
GCCACCGATCTATGTGAAGCGCTTTCATACTACGCAGATGCTGGCGGATCCAACACCTCA
CCAGATGTAGAGATTAATGATATGGTGAATCCAATGAAAGTTGAGCTGCGGTCTTCAGGG
TCACAGAGTGAGGAGACTGACAGAGCAACAGATGAGAAACCTTTGGGTTATGACTTTGAA
GAAGTGGAACAGTTGATGTCAGAAATAGGGAACATCCGTGACAACTTGCGGTTGATGCCT
GATTTCCAGAGGAGGGAAATAGCTGCAAATCTAGCCATGAAAATGGCTTCCATGTTTGGA
GGAGGAGGAGGAGGCGACGACAGTGATAACGAGGAAGAATCTGAGTGGAGCCCGTTTGTA
TCTTCAAGTATTTCAGCATGAACCACATGAGTTTTAATCCGACCGAACTTTGTGTCTCTG
ATACTTTTAGACTTGAAAGATGAAATAAGAAACTTCGGTTAAATAAAAGTTAAATTTTTT
ACC

QA 1 783 1 783
DS 



CO CL1534Contig2 1139 2 8 U
GGGATGGAAGGAGGCAGACCGGGAGTTGTCGTCGTCGGTTCCCCTGGTGTCGGCAAGCGC
ACCCTTCTCTCTCGATTGCTCTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCAACATCTCAAACA
CAAGTTCATGACTGGACGATTAACACCAAGTATTACTCTGCGGATGTATCTGTATGGATT
TCAAATATTTGCGACGATGACTACTCTCTCCCTCACTCAGATCATCCACTTGTGGCGTTA
GTTATGGTCTTCGACTTGACTCAGATGTCAACTCTTGTTGCTCTTCAAGAATGGGTTTCT
CATGCGGACATCATCATCAACAGATTTGATATATTGTTGTGCATTGGGAACAAAGCTGAT
CTTCTCCCACCTCATGATAGTGCATCACTGGATGTCAGGGGAACATGTCTTGACTGGTGC
CGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGATTTTGACAAGTGT
TTATCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTGTTTGGTGCACTTTCGGCACAT
ATGTGGCCTGGAATGATTCTGAAATCTGGTGATAAGATTAATGAACCTACTCATGGCCAA
GAGTTTTCAGAAGAAGAAGAATCTGAATATGAATTGGAGTACCAAGTGCTATCATCAGGC
TCAGCCACCGATCTATGTGAAGTGCATTCATACTACGCAGATGCTGGCGGATCCAACACC
TCACCAGATGTAGAGATTAATAATATGGTGAATCCAAAGGAAGTTGAGCTGCGGTCTTCA
GGGTCACAGAGTGAGACTGACATAGCAACAGATGAGAAACCTTTGGGTTATGACTTGGAA
GAAGTGGAACAGTTGATGTCAGAAATAGGGAACATCCGTGACAACTTGCGGTTGATGCCT
GATTTTCAGAGGAGGGAAATAGCTGCAAATCTAGCCATGAAAATGGCTTCCATGTTTGGA
GGAGGAGGCGACGACAGTGATAGCGAGGAAGACTCTGAGTGGAGCCCGTTTGTATCTTCA
AGTATTTCAGCATGAAACCACATGAGTTTTAATCCGAGCGAACTTTGTGTCTCTGATACG
TTTAGACTTGAAAGATGAAATAAGAAACTTCGGTTAAATAAAAGTTAATTTTTTTGCCC


BQ
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AF RR4E055TF U 1
AF RR4E055JQ C 439
BS 1 658 RR4E055TF
BS 659 659 RR4E055JQ
BS 660 715 RR4E055TF
BS 716 716 RR4E055JQ
BS 717 724 RR4E055TF
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BS 726 736 RR4E055TF
BS 737 1139 RR4E055JQ

RD RR4E055TF 736 0 0
GGGATGGAAGGAGGCAGACCGGGAGTTGTCGTCGTCGGTTCCCCTGGTGTCGGCAAGCGC
ACCCTTCTCTCTCGATTGCTCTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCAACATCTCAAACA
CAAGTTCATGACTGGACGATTAACACCAAGTATTACTCTGCGGATGTATCTGTATGGATT
TCAAATATTTGCGACGATGACTACTCTCTCCCTCACTCAGATCATCCACTTGTGGCGTTA
GTTATGGTCTTCGACTTGACTCAGATGTCAACTCTTGTTGCTCTTCAAGAATGGGTTTCT
CATGCGGACATCATCATCAACAGATTTGATATATTGTTGTGCATTGGGAACAAAGCTGAT
CTTCTCCCACCTCATGATAGTGCATCACTGGATGTCAGGGGAACATGTCTTGACTGGTGC
CGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGATTTTGACAAGTGT
TTATCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTGTTTGGTGCACTTTCGGCACAT
ATGTGGCCTGGAATGATTCTGAAATCTGGTGATAAGATTAATGAACCTACTCATGGCCAA
GAGTTTTCAGAAGAAGAAGAATCTGAATATGAATTGGAGTACCAAGTGCTATCATCAG*C
TCAGCCACCGATCTATGTGAAGTGCATTCATACTACGCAGATGCTGGCGGATCCA*CACC
TCAC*AGATGTAGAGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4E055JQ 701 0 0
TTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGATTTTGACAAGTGTTTATCAGTGGATGGGGAT
ACTCAAGGGGTTGAACGTCTGTTTGGTGCACTTTCGGCACATATGTGGCCTGGAATGATT
CTGAAATCTGGTGATAAGATTAATGAACCTACTCATGGCCAAGAGTTTTCAGAAGAAGAA
GAATCTGAATATGAATTGGAGTACCAAGTGCTATCATCAGGCTCAGCCACCGATCTATGT
GAAGTGCATTCATACTACGCAGATGCTGGCGGATCCAACACCTCACCAGATGTAGAGATT
AATAATATGGTGAATCCAAAGGAAGTTGAGCTGCGGTCTTCAGGGTCACAGAGTGAGACT
GACATAGCAACAGATGAGAAACCTTTGGGTTATGACTTGGAAGAAGTGGAACAGTTGATG
TCAGAAATAGGGAACATCCGTGACAACTTGCGGTTGATGCCTGATTTTCAGAGGAGGGAA
ATAGCTGCAAATCTAGCCATGAAAATGGCTTCCATGTTTGGAGGAGGAGGCGACGACAGT
GATAGCGAGGAAGACTCTGAGTGGAGCCCGTTTGTATCTTCAAGTATTTCAGCATGAAAC
CACATGAGTTTTAATCCGAGCGAACTTTGTGTCTCTGATACGTTTAGACTTGAAAGATGA
AATAAGAAACTTCGGTTAAATAAAAGTTAATTTTTTTGCCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 6

CO CL1535Contig1 703 6 8 U
ATGCTTCATGAAAGACCAATCACCACAAATAATCAAATCTCAACGTACCAAAGTTTTCTC
ATCATCAACATCCAATCTTAACTTCCAAAAGAAGAAAACAAAAAATAATAGCATGGTCTA
ATAAACCAAAATAAAATGATCTGAAACCAAGAAAGCTCAGAAAGAAGGAAAAAAGAAAAA
AGAAAAAGACAGCCGGTTTGTGTTAAACCGGGATAGTTTACGAAGCTTAGGCCGCAGGTT
TCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGAAATGTTCTGAG
CATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTCTCCTCCAAAGCCATCACTATCTCTACGG
TGTCGAGAGAATCAGCTCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCGG
CCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACGGTCTCTGGTTTTG
CTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGCTTCTTTGAAGACTGAAAACGTCCAAAGGAGATAG
ACTGGAAACTCAAGGGTTTTCTTAACACCTGAGAAATTCTGGTAGGGAGGGAGGGAGCTT
TGAAGCTTAGAGAACTGGTTGATAGGGAAGCCATTGAAGGAGATGTAGTTCAATACACAG
CTCAGAGACGCAAAAGATAATTTGGCTTCTCCTAATGCAACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4F559JQ U 1
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AF RR4F559TF C 1
AF RR4G073TF C 15
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AF RR4F623TF C 52
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ATGTTAAACTTCTCCTCCAAAGCCATCACTATCTCTACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCA
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CTTAACAACTGAGAAATTCTGGTAGGGAGGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTT
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QA 1 637 1 637
DS 

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ATCATCAACATCCAATCTTAACTTCCAAAAGAAGAAAACAAAAAATAATAGCATGGTTTA
ATAAACCAAAATAAAATGATCTGAAACCAAGAAAGCTCAGAAAGAAGGAAAAAAGAAAAA
AGAAAAAGACAGCCGGTTTGTGTTAAACCGGGATAGTTTACGAAGCTTAGGCCGCAGGTT
TCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGAAATGTTCTGAG
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TGTCGAGAGAATCAGCTCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCGG
CCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACGGTCTCTGGTTTTG
CTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGCTTCTTTGAAGACTGAAAACGTCCAAAGGAGATAG
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TGAAGCTTAGAGAACTGGTTGATAGGGAAGCCATTGAAGGAGATGTAGTTCAATACACAG
CTTAGAGACGCAAAAGATAATTTG
CC

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DS 

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TTTTTT
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CTGAAACCAAGAAAGCTCAGAAAGAAGGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGACAGCCGGTTTG
TGTTAAACCGGGATAGTTTACGAAGCTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCA
ATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGAAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTT
ATGTTAAACTTCTCCTCCAAAGCCATCACTATCTCTACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCA
AGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCC
CTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACGGTCTCTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGA
CGAAGCTTCTTTGAAGACTGAAAACGTCCAAAGGAGATAGACTGGAAACTCAAGGGTTTT
CTTAACAACTGAGAAATTCTGGTAGGGAGGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTT
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TTTGGCTTCTCCTAATGC
CC

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AAGAAAGCTCAGAAAGAAGGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGACAGCCGGTTTGTGTTAAAC
CGGGATAGTTTACGAAGCTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATT
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CTTCTCCTCCAAAGCCATCACTATCTCTACGGTGTCGA*AGAATCAGCTCCAAGAGCAGA
GAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAAT
GTCACTCACTTTCTGCACGGTCTCTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGCTT
CTTTGAAGACTGAAAACGTCCAAAGGAGATAGACTGGAAACTCAAGGGTTTTCTTAACAC
CTGAGAAATTCTGGTAGGGAGGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTTGATAGGGA
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CTCCTAATGCAACCC

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TCTCTACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCG
CAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACGGTCT
CTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGCTTCTTTGAGGACTGAAAACGTCCAA
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AGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTTGATAGGGAAGCCATTGAAGGAGATGTAGTTC
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CC

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DS 



AS 1 6

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TCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGT
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 10 10 10 10 

AF RR4FY33TF C 1
AF RR4F587JQ U 3
AF RR4FY33JQ U 54
AF RR4HA89JQB U 6
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AF RR4F587TF C 3
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CC

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DS 

RD RR4F587JQ 656 0 0
GGAA
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G
CC

QA 1 601 1 601
DS 

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G
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CCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGTTTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCT
TCTGCTTAAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCA
ATGGCAATAACCCATTAGGCATATTCACTTCCTTGAGGAACACCTTCGTCTTCTCACGGC
ATAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCA
TCTCTCTGTTTTTCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGG
CC

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR4HA89TF 650 0 0
G
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TGATTAAGATAATTAAAAATAGAGAGTGCGGCTTAAGTAACTAAGCATCGCTGACTGCAA
CAGCCTCTTTAACTTCAGTGGTTGCATTGTTCTTCACCATTGCAGGATTCTCAACCTCAG
GAACCACAAAAGCTGAAACTGGAAAAGTCCTGGAGAGACCAGTCGGTGTCCTGAAATTGA
TCTTACCTGAACTTGTTGGCTGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAAATAAGAA
GCTCTTTGGCCTTAACACCGGTCAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCACAGCAGTGA
CCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGTTTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCT
TCTGCTTAAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCA
ATGGCAATAACCCATTAGGCATATTCACTTCCTTGAGGAACACCTTCGTCTTCTCACGGC
ATAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCA
TCTCTCTGTTTTTCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGG
CC

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR4F587TF 656 0 0
GGAA
AGTGGAATCATAACTCTTATTAATGTAGAAAATTAAGCAGCAGAAGCAGAAGGTATTACG
TGATTAAGATAATTAAAAATAGAGAGTGCGGCTTAAGTAACTAAGCATCGCTGACTGCAA
CAGCCTCTTTAACTTCAGTGGTTGCATTGTTCTTCACCATTGCAGGCTTCTCAACCTCAG
GAACCACAAAAGCTGAAACTGGAAAAGTCCTGGAGAGACCAGTCGGTGTCCTGAAATTGA
TCTTACCTGAACTTGTTGGCTGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAAATAAGAA
GCTCTTTGGCCTTAACACCGGTCAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCACAGCAGTGA
CCTCGGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATTGTTTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCT
TCTGCTTCAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCA
ATGGCAATAACCCATTAGGCATATTGACTTCCTTGAGGAACACCTTCGTCTTCTCACGGC
ATAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCA
TCTCTCTGTTTTTCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGGG
ATCC

QA 5 652 5 652
DS 



AS 1 4

CO CL1537Contig1 1074 4 10 U
CCTAGAAGTTGTTCTTTTTAGCCATTGTCGTTTCTTACAAAAGACGGATATGTTCATCAC
AAAGGGTGTTACAATACGACGAAGCTGGTGATACCAAGAGAAAGCAACAAGATTGAAGGA
TACAAGAGAATGAGAGACCAACATAAAACACATGGGATGATGTGATGATCATCTCAGTGG
AACTTAAGGCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACTGAATCCGCCAAATGATCAAGAAGGTTC
TGGTAAGGCCCCACACCGGTCACTAGTCCCTGCACAAAATAGCCTAGGATTGCGAGCATA
GCCAGTCTACCATTCTTGACCTCCTTGAGTTTCAGCTCCTTCATTGACTTCTCGTCTTTT
CCAAACCCAAGAGGGTTAAAGAAAGGTCCACCGGGGTAAGACGGGTCTCCTGAACCAGCA
AAACCTTTCTCTAAGCCTAAGAAGTACTGTTTTCCCATTGATCCTGGGTTGTACCAGTCC
TGCAACCTCCGGTGCTCAGCAAATCCCATCAAAGCCATCTCGAGAACAAAGAATGTGTAT
GGGTCTGCCCAGTAGCTGTATGTCCCTGCAGGTGGAATCACACCGGTTTGGAACCAGGGA
AGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAAACCAGCTTTGCCAAGAATCTCAGGGGCAATAGCTCCA
GCTGCACCCAACATAGCGAACCTTCCGTTGATGATCTCTCCGTAGGCTAACCATCTTGGC
TCGATGAAACCTCCAGTACCTTCTGGGTCTGAAAGACCAAGAGGGTCGAATCCATAGTCG
CCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGACAGAGATTGTGAAGATGCAAACCACAATGGTCTG
TTTGCTCCTTGCTTTACAGGTGGAGTTGAAGCAGCCTTAACAACAAAGCAAGTCTTCCTC
ACGGACACAACTGGTTTTGTGCCGAATATCTGTCTAGCGGTCTGAACAGAGGAGGTAAGT
GAAGAAGACACAAGTGCTTGTGCTGCCATTTTTTATCTGTTTCTTGAACTTTTCTTTGTG
TCACCAAGAGATGATGTGGTTCAGTTATAGTCTGGAAGGCAGTGTTGGGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D852JQ U 1
AF RR4AY38JQ U 34
AF RR4D879TF C 328
AF RR4AY38TF C 347
BS 1 214 RR4D852JQ
BS 215 215 RR4AY38JQ
BS 216 251 RR4D852JQ
BS 252 252 RR4AY38JQ
BS 253 532 RR4D852JQ
BS 533 533 RR4AY38JQ
BS 534 636 RR4D852JQ
BS 637 893 RR4AY38JQ
BS 894 1017 RR4D879TF
BS 1018 1074 RR4AY38TF

RD RR4D852JQ 636 0 0
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AAAGGGTGTTACAATACGACGAAGCTGGTGATACCAAGAGAAAGCAACAAGATTGAAGGA
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AACTTAAGGCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACTGGATCCGCCAAATGATCAAGAAGGTTC
TGGTAAGGCCC*ACACCGGTCACTAGTCCCTGCACAAAATAGCCTAGGATTGCGAGCATA
GCCAGTCTACCATTCTTGACCTCCTTGAGTTTCAGCTCCTTCATTGACTTCTCGTCTTTT
CCAAACCCAAGAGGGTTAAAGAAAGGTCCACCGGGGTAAGACGGGTCTCCTGAACCAGCA
AAACCTTTCTCTAAGCCTAAGAAGTACTGTTTTCCCATTGATCCTGGGTTGTACCAGTCC
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GGGTCTGCCCAGTAGCTGTATGTCCCTGCAGGTGGAATCACACCGGTTTGGAACCAGGGA
AGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAAACCAGCTTTGCCA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4AY38JQ 860 0 0
G
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CAAGAGAAAGCAACAAGATTGAAGGATACAAGAGAATGAGAGACCAACATAAAACACATG
GGATGATGTGATGATCATCTCAGTGGAACTTAAGGCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACTG
AATCCGCCAAATGATCAAGAAGGTTCTGGTAAGGCCCCACACCGGTCACTAGTCCCTGCA
CAAAATAGCCTAGGATTGCGAGCATAGCCAGTCTACCATTCTTGACCTCCTTGAGTTTCA
GCTCCTTCATTGACTTCTCGTCTTTTCCAAACCCAAGAGGGTTAAAGAAAGGTCCACCGG
GGTAGGACGGGTCTCCTGAACCAGCAAAACCTTTCTCTAAGCCTAAGAAGTACTGTTTTC
CCATTGATCCTGGGTTGTACCAGTCCTGCAACCTCCGGTGCTCAGCAAATCCCATCAAAG
CCATCTCGAGAACAAAGAATGTGTATGGGTCTGCCCAGTAGCTGTATGTCCCTGCAGGTG
GAATCACACCGGTTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAAACCAGCTTTGC
CAAGAATCTCAGGGGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAACCTTCCGTTGATGA
TCTCTCCGTAGGCTAACCATCTTGGCTCGATGAAACCTCCAGTACCTTCTGGGTCTGAAA
GACCAAGAGGGTCGAATCCATAGTCGCCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGACAGAGATT
GTGAAGATGCAAACCACAATGGTCTGTTTGCTCCTTGCTTTACAGGTGGAGTTGAAGCAG
CCTTAACAACAAAGCAAGT

QA 2 860 2 860
DS 

RD RR4D879TF 694 0 0
AGTTTCAGCTC*TTCATTGACTTCTCGTCTTT*CCAAACCCAGGAGGGTTAAAGAAAGGT
CCACCGGGGTAAGACGGGTCTC*TGAACCAGCAAAACCTTTCTCTAAGCCTAAGAAGTAC
TGTTTTCCCATTGATCCTGGGTTGTACCAGTACTGCAACCTCCGGTGCTCAGCAAATCCC
ATCAAAGCCATCTCGAGAACAAAGAGTGTGTATGGGTCTGCCCAGTAGCTGTATGTCCCT
GCAGGTGGAATCACACCGGTTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAAACCA
GCTTTGCCAAGAATCTCAGGGGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAACCTTCCG
TTGATGATCTCTCCGTAGGCTAACCATCTTGGCTCGATGAAACCTCCAGTACCTTCTGGG
TCTGAAAGACCAAGAGGGTCGAATCCATAGTCGCCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGAC
AGAGATTGTGAAGATGCAAACCACAATGGTCTGTTTGCTCCTTGCTTTACAGGTGGAGTT
GAAGCAGCCTTAACAACAAAGCAAGTCTTCCTCACGGACACAACTGGTTTTGTGCCGAAT
ATCTGTCTAGCGGTCTGAACAGAGGAGGTAAGTGAAGAAGACACAAGTGCTTGTGCTGCC
ATTTTTTATCTGTTTCTTGAACTTTTCTTT
GTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4AY38TF 728 0 0
ACTTCTCGTCTTTTCCAAACCCAAGAGGGTTAAAGAAAGGTCCACCGGGGTAGGACGGGT
CTCCTGAACCAGCAAAACCTTTCTCTAAGCCTAAGAAGTACTGTTTTCCCATTGATCCTG
GGTTGTACCAGTCCTGCAACCTCCGGTGCTCAGCAAATCCCATCAAAGCCATCTCGAGAA
CAAAGAATGTGTATGGGTCTGCCCAGTAGCTGTATGTCCCTGCAGGTGGAATCACACCGG
TTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAAACCAGCTTTGCCAAGAATCTCAG
GGGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAACCTTCCGTTGATGATCTCTCCGTAGG
CTAACCATCTTGGCTCGATGAAACCTCCAGTACCTTCTGGGTCTGAAAGACCAAGAGGGT
CGAATCCATAGTCGCCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGACAGAGATTGTGAAGATGCAA
ACCACAATGGTCTGTTTGCTCCTTGCTTTACAGGTGGAGTTGAAGCAGCCTTAACAACAA
AGCAAGTCTTCCTCACGGACACAACTGGTTTTGTGCCGAATATCTGTCTAGCGGTCTGAA
CAGAGGAGGTAAGTGAAGAAGACACAAGTGCTTGTGCTGCCATTTTTTATCTGTTTCTTG
AACTTTTCTTTGTGTCACCAAGAGATGATGTGGTTCAGTTATAGTCTGGAAGGCAGTGTT
GGGGTCCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 6

CO CL1538Contig1 709 6 20 U
GGAGATCAGGTCTCAGTATCCTACATTCACATAATAAAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGT
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAAGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAAT
CTCGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTG
ACCTCCGACGGCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGCGTCGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGAT
AAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGAT
TTCAATAAAGAAAAATGATTCGATCAAATAAAATTTCAGTTTTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN55TF U 67
AF RR4BN55JQ C 1
AF RR4GQ32JQ C 200
AF RR4H283TF U 16
AF RR4H283JQ C 16
AF RR4GQ32TF U 16
BS 1 17 RR4BN55JQ
BS 18 66 RR4H283TF
BS 67 224 RR4BN55TF
BS 225 242 RR4H283TF
BS 243 243 RR4GQ32TF
BS 244 248 RR4H283TF
BS 249 249 RR4GQ32TF
BS 250 261 RR4H283TF
BS 262 262 RR4GQ32TF
BS 263 335 RR4H283TF
BS 336 336 RR4GQ32TF
BS 337 374 RR4H283TF
BS 375 375 RR4GQ32TF
BS 376 542 RR4H283TF
BS 543 543 RR4GQ32TF
BS 544 661 RR4H283TF
BS 662 662 RR4GQ32TF
BS 663 675 RR4H283TF
BS 676 699 RR4GQ32TF
BS 700 709 RR4BN55JQ

RD RR4BN55TF 163 0 0
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GCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGTACTGAA
TCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGA
TACAT

QA 1 158 1 158
DS 

RD RR4BN55JQ 709 0 0
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GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGT
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAAGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAAT
CTCGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTG
ACCTCCGACGGCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGGG
AGCGTCGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACCCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGAT
AAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGAT
TTCAATAAAGAAAAATGATTCGATCAAATAAAATTTCAGTTTTTGTTGC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4GQ32JQ 501 0 0
CTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAACCTAGAAGCATGGGGTG
GGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTCGACATTTTCAGTGGGA
AAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCGACGGCTCCGGCG
ACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTCCACGCTAAGT
GCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGACTTGCGACCGATACTTCGCCTTATAATC
TCACTGCTGTTAGGAATTACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAGAGCGTCGGTCGGGTCGGGT
CTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGATAAATGAATGAATGTGTGTG
TTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGATTTCAATAAAGAAAAATGAT
TCGATCAAATAAAATTTCAG
C

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4H283TF 660 0 0
GG
ATCCTACATTCACATAATAAAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGTTCTCCTCCTCTCCGC
CCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGATGATGCAGAATGTGT
GTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGCACTGAATCGATCATAAG
CGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAATCTAGAGGCATGGGG
TGGGCTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTCGACATTTTCAGTGG
GAAAGCACCGTGTCTTCCAAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCGACGGCTCTGG
CGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTCCACGCTAA
GTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACCGATACTTCGCCTTATAA
TCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAGAGTGTCGGTCGGGTCGG
GTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGATAAATGAATGAATGTGTG
TGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGATTGCAATAAAGAAAAA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4H283JQ 670 0 0
GG
ATCCTACATTCACATAATAAAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGTTCTCCTCCTCTCCGC
CCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGATGATGCAGAATGTGT
GTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGCACTGAATCGATCATAAG
CGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAATCTAGAGGCATGGGG
TGGGCTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTCGACATTTTCAGTGG
GAAAGCACCGTGTCTTCCAAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCGACGGCTCTGG
CGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTCCACGCTAA
GTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACCGATACTTCGCCTTATAA
TCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAGAGTGTCGGTCGGGTCGG
GTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGATAAATGAATGAATGTGTG
TGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGATTGCAATAAAGAAAA
ATTATTCGATC

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR4GQ32TF 685 0 0
GG
ATCCTACATTCATATAATATAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGTTCTCCTCCTCTCCGT
CCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGATGATGCAGAATGTGT
CTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGTACTGAATCGATCATAAG
CGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAACCTAGAAGCATGGGG
TGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTCGACATTTTCAGTGG
GAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCGACGGCTCCGG
CGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTCCACGCTAA
GTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGACTTGCGACCGATACTTCGCCTTATAA
TCTCACTGCTGTTAGGAATTACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAGAGCGTCGGTCGGGTCGG
GTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGATAAATGAATGAATGTGTG
TGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGATTTCAATAAAGAAAA*TG
ATTCGATCAAATAAAATTTCAG
C

QA 3 684 3 684
DS 



AS 1 6

CO CL1539Contig1 661 6 4 U
GGCTGCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTGTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTA
CTACTCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTG
GCTAATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAA*GCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTAT
GAACTACACAATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTG
CACCGCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGA
TTGTGCAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTT
TGCAAACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTAC
TCTAGTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAA
CTTTATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTC
TTAGCCTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTCCGGTTAATAA
TATGTATCTTAACATGATGAATATCAAGAAGCTATAAAAGTGCTCCTATGTCTACCTGTA
C


BQ
10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AF18TF U 5
AF RR4FT88JQ C 3
AF RR4FT88TF U 3
AF RR4BQ29TF U 1
AF RR4DF58TF U 3
AF RR4DF58JQ C 130
BS 1 528 RR4BQ29TF
BS 529 529 RR4AF18TF
BS 530 646 RR4BQ29TF
BS 647 661 RR4DF58TF

RD RR4AF18TF 527 0 0
GG
AACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTGTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTACTC
TCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTAAT
GGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAA*GCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACTA
CACAATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACCGC
ATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGTGC
AACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCAAA
CCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTAGT
TTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTTTAT
CAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCAT

QA 3 527 3 527
DS 

RD RR4FT88JQ 545 0 0
GG
GCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTGTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAA*GCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAAC
TACACAATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACC
GCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACTCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGT
GCAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCA
AACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTA
GTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTTT
ATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTCTTAG
CCT

QA 3 545 3 545
DS 

RD RR4FT88TF 545 0 0
GG
GCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTGTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAA*GCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAAC
TACACAATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACC
GCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACTCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGT
GCAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCA
AACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTA
GTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTTT
ATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTCTTAG
CCT

QA 3 545 3 545
DS 

RD RR4BQ29TF 647 0 0
GGCTGCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTGTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTA
CTACTCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTG
GCTAATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAA*GCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTAT
GAACTACACAATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTG
CACCGCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGA
TTGTGCAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTT
TGCAAACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTAC
TCTAGTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAA
CTTTATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGTATCACATGGTC
TTAGCCTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTCCGGTTAATAA
TATGTATCTTAACATGATGAATATCAAGAAGCTATAAAAGTGCTCC
G

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DF58TF 659 0 0
GG
GCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTGTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAA*GCATGTCCAGTTAACTTTTAGTTTATGAAC
TACACAATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACC
GCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGT
GCAACCACTATGTTCAGCTACATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCA
AACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTA
GTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTTT
ATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTCTTAG
CCTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTCCGGTTAATAATATG
TATCTTAACATGATGAATATCAAGAAGCTATAAAAGTGCTCCTATGTCTACCTGTAC

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR4DF58JQ 532 0 0
AGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAAAGCATGTCCAGTTAACTTTTAGTTTATGAACTACAC
AATCATAACGAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACCGCATT
CAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGTGCAAC
CACTATGTTCAGCTACATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCAAACCG
ATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTAGTTTA
ACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTTTATCAA
TAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTCTTAGCCTTC
ATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTCCGGTTAATAATATGTATCT
TAACATGATGAATATCAAGAAGCTATAAAAGTGCTCCTATGTCTACCTGTAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 6

CO CL1540Contig1 764 6 12 U
GGAATCTCTTCTTCAGCTAATGCTTTTGGTGAAATGGGTTTCGGTGCGATTAGATCGGTT
CTCCGACCACTGTCGAGAACCCTAGCTCCGCGTGTCGCCGCTAGCTGCTCCTCTACGCCG
GCGATCCCGGCTGCGAGACACGAGTTATGCTCCTCCTTCTCCGGTGGATCGAAGTTGCCA
TGGCTCTCCGTGGTTAACCATTTTCATAGCTTGAGCTTAACTGATACTCGGCTCCCGAAG
AGACGGCCCATGAGTCATCCCAAGAAGAAAAGATTCAAACTTAAACCTCCAGGGCCTTAT
GCATATGTTCAGTATACTCCTGGGGAGCCAATTGCTTCAAACAATCCCAACAAGGGCAGT
GTCAAAAGAAGGAATGCTAAGAAACGGATCGGGCAGCGCCGTGCTTTCATACTGTCTGAG
AAGAAGAAGAGGCAAGCGCTGGTGCAAGAGGCGAAGAGGAAGAAGAGAATCAAGGAAGTG
GAACGCAAGATGGCTAAAGTCGCAAGGGAGCGAGCTTGGGAAGAAGGGCTGGCTGAGCTT
CAGCGACTCGAAGAAGAGAAGAAGAAATCAATGTCTTCTTGAATTGCTTTTTTCATTCAT
CCAAAAAAAAAACATAGAATAAATCTCTTTTCTTTTTGAGTTAGGTTTTGCTCCTACCTC
TTTCTTGTGTTACCGAGATTCACTCACTCTAGTCCCTCTACAAGAACCGAGAGTTACTTG
ACGTTTCTGGTCTTTATAATCTCAGTCATGTGTTTCTCCTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4HB53TF U 171
AF RR4GN05TF U 13
AF RR4CL13TF U 1
AF RR4CL13JQ C 1
AF RR4HB53JQB C 51
AF RR4GN05JQ C 163
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BS 15 26 RR4GN05TF
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BS 162 249 RR4GN05TF
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BS 605 764 RR4CL13JQ

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GG
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TAACCATTTTCATAGCTTGAGCTTAACTGATACTCGGCTCCCGAAGAGACGGCCCGTGAG
TCATCCCAAGAAGAAAAGATTCAAACTTAAACCTCCAGGGCCTTATGCATATGTTCAGTA
TACTCCTGGGGAGCCAATTGCTTCAAACAATCCCAACAAGGGCAGTGTCAAAAGAAGGAA
TGCTAAGAAACGGATCGGGCAGCGCCGTGCTTTCATACTGTCTGAGAAGAAGAAGAGGCA
AGCGCTGGTGCAAGAGGCGAAGAGGAAGAAGAGAATCAAGGAAGTGGAACGCAAGATGGC
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DS 

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CAGCGACTCGAAGAAGAGAAGAAGAAATCAATGTCTTCTTGAATTGCTTTTTTCATTCAT
CCAA

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DS 

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GCGATCCCGGCTGCGAGACACGAGTTATGCTCCTCCTTCTCCGGTGGATCGAAGTTGCCA
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AAAAAGAAGAGGCAAGCGCTGGTGCAAGAGGCGAAGAGGAAGAAGAGAATCAAGGAAGTG
GAACGTAAGATGGCTAAAGTCGCAAGGGAGCGAGCTTGGGAAGAAGGGTTGGCTGAGCTT
CAGCGACTCGAAGAAGAGAAGAAGAAATCAATGTCTTCTTGAATTGCTTTTTTCATTCAT
CCAAAAAAAAAACATAGAATAAATCTCTTTTCTTTTTGAGTTAGGTTTTGCTCCTACCTC
TTTCTTGTGTTACCGAGATTCACTCACTCTAGTCCCTCTACAAGAACCGAGAGTTACTTG
ACGTTTCTGGTCTTTATAATCTCAGTCATGTGTTTCTCCTTTCT

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DS 

RD RR4HB53JQB 714 0 0
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CTCTACGCCGGCGATCCCGGCTGCGAGACACGAGTTATGCTCCTCCTTCTTCGGTGGATC
GAAGTTGCCATGGCTCTCCGTGGTTAACCATTTTCATAGCTTGAGCTTAACTGATACTCG
GCTCCCGAAGAGACGGCCCATGAGTCATCCCAAGAAGAAAAGATTCAAACTTAAACCTCC
AGGGCCTTATGCATATGTTCAGTATACTCCTGGGGAGCCAATTGCTTCAAACAATCCCAA
CAAGGGCAGTGTCAAAAGAAGGAATGCTAAGAAACGGATCGGGCAGCGCCGTGCTTTCAT
ACTGTTTGAGAAGAAGAAGAGGCAAGCGCTGGTGCAAGAGGCGAAGAGGAAGAAGAGAAT
CAAGGAAGTGGAACGCAAGATGGCTAAAGTCGCAAGGGAGCGAGCTTGGGAAGAAAGGCT
GGCTGAGCTTCAGCGACTCGAAGAAGAGAAGAAGAAATCAATGTCTTCTTGAATTGCTTT
TTTCATTCATCCAAAAAAAAAACATAGAATAAATCTCTTTTCTTTTTGAGTTAGGTTTTG
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GAGTTACTTGACGTTTCTGGTCTTTATAATCTCAGTCATGTGTTTCTCCTT
TCG

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DS 

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GGTGGATCGAAGTTGCCATGGCTCTCCGTGGTTAACCATTTTCATAGCTTGAGCTTAACT
GATACTCGGCTCCCGAAGAGACGGCCCGTGAGTCATCCCAAGAAGAAAAGATTCAAACTT
AAACCTCCAGGGCCTTATGCATATGTTCAGTATACTCCTGGGGAGCCAATTGCTTCAAAC
AATCCCAACAAGGGCAGTGTCAAAAGAAGGAATGCTAAGAAACGGATCGGGCAGCGCCGT
GCTTTCATACTGTCTGAGAAGAAGAAGAGGCAAGCGCTGGTGCAAGAGGCGAAGAGGAAG
AAGAGAATCAAGGAAGTGGAACGCAAGATGGCTAAAGTCGCAAGGGAGCGAGCTTGGGAA
GAAGGGCTGGCTGAGCTTCAGCGACTCGAAGAAGAGAAGGAGAAATCAATGTCTTCTTGA
ATTGCTTTTTTCATTCATCCAAAAAAAAAACATAGAATAAATCTCTTTTCTTTTTGAGTT
AGGTTTTGCTCCTACCTCTTTCTTGTGTTACCGAGATTCACTCACTCTAGTCCCTCTACA
AGAACCGAGAGTTACTTGACGTTTCTGGTCTTTATAATCTCAGTCATGTGTTTCTCCTT
CC

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DS 



AS 1 6

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ACCCAACCCGGTTTACGACATCTTCATACTCGGAGCATCCGGATTCACCGGGAAATACGT
CGTCCGGGAAGCTCTCAAGTTCCTCCAAACTCCGTCTTCTCCGCTAAAGTCCCTAGCTTT
AGCGGGTCGTAACCCGACCCGGTTAACCCAGTCTCTCCAATGGGCATCCCGCCCGAACCC
GCCTCCTTCCTCCGTCGATATCCTCACTGCCGATACGTCAGATCAGGACTCGCTTCGCCG
TCTCTGTACTCAGACCAAACTCATACTCAACTGTGTTGGACCGTTCCGTATCCATGGCGA
TCCCGTCGTCGCCGCTTGTGCCGACTCTGGGTGTGATTATTTGGATATAAGTGGTGAACC
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AATCGTTTCCGCTTGTGGTTTCGACTCAATCCCTGCTGAGTTGGGTCTTCTCTTCAACTC
CAAACAATGGGAGCCTCCATCGGTCCCTAACCAGATAGAAGCGTACCTCGCCTTGGAGTC
TACCAAAAAGATGGCTGGAAACTTCGGGACGTACGAGTCCGCGGTTCTAGGTGTCGCCAA
TGCAGATAAGCTTAAAGAACTTAGACGTTCCAGACCAAGAAAGCCTAGACCATATATTCA
TGGTCCACCTGCTAAAGGGCCAACGCTAGAAAACCAGAAGAAGATCGGTCTTTGGGCTCT
GAAGCTACCTTCTGCTGATGCTGTAGTCGTTCGTAGAACACTCACAACTCTAACGGAGAA
GCCACGTGGTCTCCCTGGGGTTAACGAGAGTCCTGATCAGATACAAAAGAGAGAAGCTTT
CTGGTCAGCGATCAAAGCGGCTCACTTCGGTGTGAAGATAACATCAAAATCACTCTTTGG
TATATTTAGATACGTTACGCTTGGTGTCTCCCTCGGTCTGCTCTCCAAGTTCTCCTTCGG
GAGATGGCTTCTACTGAAGTTCCCTTCGGTTTTTAGCCTCGGCTGGTTCCAGAAGAAAGG
TCCGAGCGAAGAAGAGGTGGAGAGCGCTACGTTTAAGATGTGGTTCATAGGTCGTGGCTA
CAGCGAAGAGGGTCTTGTCTCGGAAGGGAAGACGAAGCCTGACATGGAGATTATCACGAG
AATCTCGGGGCCTGAGATTGGGTACATAACCACACCGATAGCGCTTGTTCAGTGCGGTTT
GATAGTCTTGGGACAGCGTGAAAGCCTAGTTAAAGGAGGAGTCTACACACCAGGCATTGT
GTTTGGTTCAACGGATATACAGCAGCGGCTTGAAGACAATGGCATATCCTTTGAGGTCAT
TTCGAAGAACAAGATCCAAAACTAGAAAGTGATCATGTTCCTCTTCTCATGCTTTTTCTT
CTTTTCTGTTTCTTAAGTTATGTTTTGTCCACCTACGTAGCTTGGTCTAAGAGCTTACGA
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TCGTGAAAAATGGATGGTGAGAGAAGTCCAAAGATCGCATTACTCTCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM16TF U 1
AF RR4DI79TF U 234
AF RR4GM37TF U 305
AF RR4DI79JQ C 767
AF RR4GM37JQ C 905
AF RR4CM16JQ C 791
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CAAACAATGGGAGCCTCCATCGGTCCCTAACCAGATAGAAGCGTACCTCGCCTTGGAGTC
TACCAAAAAGATGGCTGGAAACTTCGGGACGTACGAGTCCGCGGTTCTAGGTGTCGCCAA
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G
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TGAACCCGAGTTCATGGAAAGGATGGAAGCTAAGTACCACGAAAGAGCGGAAGAGACTGG
CTCTTTAATCGTTTCCGCTTGTGGTTTCGACTCAATCCCTGCTGAGTTGGGTCTTCTCTT
CAACTCCAAACAATGGGAGCCTCCATCGGTCCCTAACCAGATAGAAGCGTACCTCGCCTT
GGAGTCTACCAAAAAGATGGCTGGAAACTTCGGGACGTACGAGTCCGCGGTTCTAGGTGT
CGCCAATGCAGATAAGCTTAAAGAACTTAGACGTTCCAGACCAAGAAAGCCTAGACCATA
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GGAGAAGCCACGTGGTCTCCCTGGGGTTAACGAGAGTCCTGATCAGATACAAAAGAGAGA
AGCTTTCTGGTCAGCGATCAA*GCGGCTCACTTCGGTGTGAAGATAACATCAAAATCACT
CTTTGGTATATTTAGATACGTTACGCTTGGTG

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DS 

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G
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TCATGGAAAGGATGGAAGCTAAGTACCACGGAAGGGCGGAAGAGACTGGCTCTTTAATCG
TTTCCGCTTGTGGTTTCGACTCAATCCCTGCTGAGTTGGGTCTTCTCTTCAACTCCAAAC
AATGGGAGCCTCCATCGGTCCCTAACCAGATAGAAGCGTACCTCGCCTTGGAGTCTACCA
AAAAGATGGCTGGAAACTTCGGGACGTACGAGTCCGCGGTTCTAGGTGTCGCCAATGCAG
ATAAGCTTAAAGAACTTAGACGTTCCAGACCAAGAAAGCCTAGACCATATATTCATGGTC
CACCTGCTAAAGGGCCAACGCTAGAAAACCAGAAGAAGATCAGTCTTTGGGCTCTGAAGC
TACCTTCTGCTGATGCTGTAGTCGTTCGTAGAACACTCACAACTCTAACGGAGAAGCCAC
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CAGCGATCAAAGCGGCTCACTTCGGTGTGAAGATAACATCAAAATCACTCTTTGGTATAT
TTAGATACGTTACGCTTGGTGTCTCCCTCGGTCTGCTCTCCAAGTTCTCCTTCGGGAGAT
GGCTTCTACTGAAGTTCCCT

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DS 

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G
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CTCTAACGGAGAAGCCACGTGGTCTCCCTGGGGTTAACGAGAGTCCTGATCAGATACAAA
AGAGAGAAGCTTTCTGGTCAGCGATCAAAGCGGCTCACTTCGGTGTGAAGATAACATCAA
AATCACTCTTTGGTATATTTAGATACGTTACGCTTGGTGTCTCCCTCGGTCTGCTCTCCA
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TCCAGAAGAAAGGTCCGAGCGAAGAAGAGGTGGAGAGCGCTACGTTTAAGATGTGGTTCA
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AGATTATCACGAGAATCTCGGGGCCTGAGATTGGGTACATAACCACACCGATAGCGCTTG
TTCAGTGCGGTTTGATAGTCTTGGGATAGCGTGAAAGCCTAGTTAAAGGAGGAGTCTACA
CACCAGGCATTGTGTTTGGTTCAACGGATATACAGCAGCGGCTTGAAGACAATGGCATAT
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CATGCTTTTTCTTCTTTTCTGTTTCTTAAGTTATGTTTTTTCCACCTACGTAGCTTGGTC
TAAGAGCTTACGATGAGGACGGCTTAGTCAACTTGTAATAAAATTTAAAACTTTAC
CC

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DS 

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TTTAGATACGTTACGCTTGGTGTCTCCCTCGGTCTGCTCTCCAAGTTCTCCTTCGGGAGA
TGGCTTCTACTGAAGTTCCCTTCGGTTTTTAGCCTCGGCTGGTTCCAGAAGAAAGGTCCG
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GAAGAGGGTCTTGTCTCGGAAGGGAAGACGAAGCCTGACATGGAGATTATCACGAGAATC
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GTCTTGGGACAGCGTGAAAGCCTAGTTAAAGGAGGAGTCTACACACCAGGCATTGTGTTT
GGTTCAACGGATATACAGCAGTGGCTTGAAGACAATGGCATATCCTTTGAGGTCATTTCG
AAGAACAAGATCCAAAACTAGAAAGTGATCATGTTCCTCTTCTCATGCTTTTTCTTCTTT
TCTGTTTCTTAAGTTATGTTTTGTCCACCTACGTAGCTTGGTCTAAGAGCTTACGATGAG
GACGGCTTAGTCAACTTGTAATAAAATTTAAAACTTTAC
TC

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DS 

RD RR4CM16JQ 821 0 0
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ATCAAAGCGGCTCACTTCGGTGTGAAGATAACATCAAAATCACTCTTTGGTATATTTAGA
TACGTTACGCTTGGTGTCTCCCTCGGTCTGCTCTCCAAGTTCTCCTTCGGGAGATGGCTT
CTACTGAAGTTCCCTTCGGTTTTTAGCCTCGGCTGGTTCCAGAAGAAAGGTCCGAGCGAA
GAAGAGGTGGAGAGCGCTACGTTTAAGATGTGGTTCATAGGTCGTGGCTACAGCGAAGAG
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CCTGAGATTGGGTACATAACCACACCGATAGCGCTTGTTCAGTGCGGTTTGATAGTCTTG
GGACAGCGTGAAAGCCTAGTTAAAGGAGGAGTCTACACACCAGGCATTGTGTTTGGTTCA
ACGGATATACAGCAGCGGCTTGAAGACAATGGCATATCCTTTGAGGTCATTTCGAAGAAC
AAGATCCAAAACTAGAAAGTGATCATGTTCCTCTTCTCATGCTTTTTCTTCTTTTCTGTT
TCTTAAGTTATGTTTTGTCCACCTACGTAGCTTGGTCTAAGAGCTTACGATGAGGACGGC
TTAGTCAACTTGTAATAAAATTTAAAACTTTACTCAGAAGCAGACTATCCTCGTGAAAAA
TGGATGGTGAGAGAAGTCCAAAGATCGCATTACTCTCTATC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

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ACTTACGAGGCAAGATAAATACTTGAGGGCTAAAAACAAAACCCTTAATAATAATAAAAT
CAATACTACTACTTCTTTAGACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAACGACGCA
AAAGATAAACTTGGAGGACACTTGCCCCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGT
GTACTGCTCTTTTGCCCATGTTCTCGTTCACAATGGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTA
ACCAATGCTGTTCAAACTGAATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAGCTTTGATATCTGCTCCA
TCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGATCATAGTAGGCAAAGTGACCAAGCT
GCACATCGAAGTCGATGGTTTCGTGGTAAGGAGACTTGTTAGTGAAACAGAAACGGTAAA
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CTTGTTCCCCTGTTGGCCCATGTATCACAAGATCTACACCATCCTCGTTAAAATGCCACT
GAGAATCAGACTTGATGACGACGAAAGAGACGTGAAGGGTATCGCCTTCGTATTCAGCCT
TGTGGGGAGAAGCATTCTTCTCTGTCTATCACGAATCTAATCCCTAACGCTGCCTGGAAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D223JQ U 1
AF RR4H089JQ U 3
BS 1 566 RR4D223JQ
BS 567 832 RR4H089JQ

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CTCAAATGAACTACGGTTGTCTGTAAAAAAAGAGTTAAAGAATTTGTGGTACATTTTATA
ACTTACGAGGCAAGATAAATACTTGAGGGCTAAAAACAAAACCCTTAATAATAATAAAAT
CAATACTACTACTTCTTTAGACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAACGACGCA
AAAGATAAACTTGGAGGACACTTGCCCCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGT
GTACTGCTCTTTTGCCCATGTTCTCGTTCACAATGGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTA
ACCAATGCTGTTCAAACTGAATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAGCTTTGATATCTGCTCCA
TCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGATCATAGTAGGCAAAGTGACCAAGCT
GCACATCGAAGTCGATGGTTTCGTGGTAAGGAGACTTGTTAGTGAAACAGAAACGGTAAA
CCCCTTTCTTTTGGACGACAAAGTCGTGCTTGGCACTAATCTGCTCCCTGAAGTCATGAA
CTTGTTCCCCTGTTGGCCCATGTATC
TGTTACAAAAA

QA 1 566 1 566
DS 

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AAG
ATGAACTACGGTTGTCTGTAAAAAAAGAGTTAAAGAATTTGTGGTACATTTTATAACTTA
CGAGGCAAGATAAATACTTGAGGGCTAAAAACAAAACCCTTAATAATAATAAAATCAATA
CTACTACTTCTTTAGACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAACGACGCAGAAGA
TAAACTTGGAGGACACTTGCCCCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACT
GCTCTTTTGCTCATGTTCTCGTTCACAATGGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTAACCAA
TGCTGTTCAAACTGAATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAGCTTTGATATCTGCTCCATCAAG
GGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGATCATAGTAGGCAAAGTGACCAAGCTGCACA
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TTCTTTTGGACGACAAAGTCGTGCTTGGCACTAATCTGCTCCCTGAAGTCATGAACTTGT
TCCCCTGTTGGCCCATGTATCACAAGATCTACACCATCCTCGTTAAAATGCCACTGAGAA
TCAGACTTGATGACGACGAAAGAGACGTGAAGGGTATCGCCTTCGTATTCAGCCTTGTGG
GGAGAAGCATTCTTCTCTGTCTATCACGAATCTAATCCCTAACGCTGCCTGGAAGCTCCA
CGCGAGCCCTAATATTAAGATCGTAGCCTTCAAGAGCATCTTTAAAGAGTGATAGATAGA
TCGAAGATTGGTCGGAGAAGAGAAGAGATGGGAGAGAAAGAGCGAGT

QA 4 830 4 830
DS 



AS 1 5

CO CL1543Contig1 1132 5 12 U
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GTCTCAACAAAGTCATCCGTAAATATAATATGTAGTCACACTCAGGAGAGCACAGACTAC
TCCTGCTTCCATACTTCGACTCTAGCCACTTTGGAAATCCTTCAGCTGTCTTGCCTTGCG
CCACAAGCTTTTCATCCACCTATTAACCATTGCCAAAGATACCTTGAGCTTATATGCGGA
AGCATATTTACACTTCAGTTGCAGGAAGGCGAGAGAGATGATGCTCACTGCTCCATAGAC
AGAAAACGATGTAGAAACTTAATAACTGTTATCCAGACAAAGCATTTTTCTTCACATATT
TTCCCTTAACCAAACCAATGATTTAACAACTTCTTGGCTCTTGACACTATCAAATATAGT
CCTCGGGTTTACTCCCCTATATATCCACTTTGGAAAAAA*TTCCTTTTCTTTCAACAAAA
TAATCATCAACAATGATTCCTCCTAGATTCATAGTGTTTTAATATTATGTACTGATAGTC
CATCAGTGTTTCTTCTCTTGCGCAGACCATTGTACTTACAGATCAAGAAACTCAGACAAA
ACGATTCCTTCTACTACCATCTCCTATGCATCTAAATCAAGAGAACTGAGAAACCTTTTG
TAGGCTGAAGGGAAGGTAAGATTGATTTGATCAGGAGAATTGAGAAGCCGTTTGTAGACG
GAAGTGGAGAAAACTGTTTCCGTCGCTGCTTGACACAGAAAACGCAGATCAGGTCCGGCT
ACGGAGGCAAGGAACAGAAGCGTAACTAAGTTGATTGAATGCACCCCAAACCATTATGCC
TTGGTTGACCAGAGGTGGTGGTGTGAATATCGAACGTCATGGCAACGACTCAGTCTTCAC
GCAATGATGGCAGGTGAAAGACGGTGGAAAATACAAATACGCATAGTACAGAGAGATAGA
CCTCGACTCAGCAGGCCCCTCGAAGGTGGTGATCTATCTATACGGTAAAATCACCGCCTT
TCAGATCGAAACAGAGCATTGAAGACAACGTAGTTGATGAGCGAATTGATGGGATCAAAC
ATGGACCACTAACTCAGACCGTTTTGGTGAGGGTAAGGGGAAACGACATCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO14JQ U 1
AF RR4GU06JQ U 20
AF RR4B260JQ U 1
AF RR4B260TF C 381
AF RR4GU06TF C 463
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RD RR4DO14JQ 589 0 0
GG
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AAAACGATGTAGAAACTTAATAACTGTTATCCAGACAAAGCATTTTTCTTCACATATTTT
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TCGGGTTTACTCCCCTATATATCCACTTTGGAAAAAA*TTCCTTTTCTTTCAACAAAATA
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TCAGTGTTTCTTCTCTTGC**AGACCATTGTACTTACAGATCAAGAA

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR4GU06JQ 676 0 0
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TGCAGGAAGGCGAGAGAGATGATGCTCACTGCTCCATAGACAGAAAACGATGTAGAAACT
TAATAACTGTTATCCAGACAAAGCATTTTTCTTCACATATTTTCCCTTAACCACACCAAT
GATTTAACAACTTCTTGGCTCTTGACACTATCAAATATAGTCCTCGGGTTTACTCCCCTA
TATATCCACTTTGGAAAAAAATTCCTTTTCTTTCAACAAAATAATCATCAACAATGATTC
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GCGCAGACCATTGTACTTACAGATCAAGAAACTCAGACAAAACGATTCCTTCTACTACCA
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GATTGATTTGATCAGG

QA 1 676 1 676
DS 

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CCACAAGCTTTTCATCCACCTATTAACCATTGCCAAAGATACCTTGAGCTTATATGCGGA
AGCATATTTACACTTCAGTTGCAGGAAGGCGAGAGAGATGATGCTCACTGCTCCATAGAC
AGAAAACGATGTAGAAACTTAATAACTGTTATCCAGACAAAGCATTTTTCTTCACATATT
TTCCCTTAACCAAACCAATGATTTAACAACTTCTTGGCTCTTGACACTATCAAATATAGT
CCTCGGGTTTACTCCCCTATATATCCACTTTGGAAAAAA*TTCCTTTTCTTTCAACAAAA
TAATCATCAACAATGATTCCTCCTAGATTCATAGTGTTTTAATATTATGTACTGATAGTC
CATCAGTGTTTCTTCTCTTGCGCAGACCATTGTACTTACAGATCAAGAAACTCAGACAAA
ACGATTCCTTCTACTACCATCTCCTATGCATCTAAATCAAGAGAACTGAGAAACCTTTTG
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GAAGTGGAGAAAACTGTTTCCGTCGCTGCTTGACACAGAAAACGCAGATCAGGTCCGGCT
ACGGAGGCAAGGAACAGAAGCGTAACTAAGT

QA 1 811 1 811
DS 

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ATATCCACTTTGGAAAAAA*TTCCTTTTCTTTCAACAAAATAATCATCAACAATGATTCC
TCCTAGATTCATAGTGTTTTAATATTATGTACTGATAGTCCATCAGTGTTTCTTCTCTTG
CGCAGACCATTGTACTTACAGATCAAGAAACTCAGACAAAACGATTCCTTCTACTACCAT
CTCCTATGCATCTAAATCAAGAGAACTGAGAAACCTTTTGTAGGCTGAAGGGAAGGTAAG
ATTGATTTGATCAGGAGAATTGAGAAGCCGTTTGTAGACGGAAGTGGAGAAAACTGTTTC
CGTCGCTGCTTGACACAGAAAACGCAGATCAGGTCCGGCTACGGAGGCAAGGAACAGAAG
CGTAACTAAGTTGATTGAATGCACCCCAAACCATTATGCCTTGGTTGACCAGAGGTGGTG
GTGTGAATATCGAACGTCATGGCAACGACTCAGTCTTCACGCAATGATGGCAGGTGAAAG
ACGGTGGAAAATACAAATACGCATAGTACAGAGAGATAGATCTCGACTCAGCAGGCCCCT
CGAAGGTGGTGATCTATTTATACGGTAAAATCACCGCCTTTTAGATCGAAACAGAGCATT
GAAGACAACGTAGTTGATGAGCGAATTGATGGGATCAAACATGGACCACTAACTCAGGCC
GTTTTGGTGAGGGTAAGGGGAAACGACATCCC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4GU06TF 664 0 0
CCTTTTCTTTCAACAAAATAATCATCAACAATGATTCCTCCTAGATTCATAGTGTTTTAA
TATTATGTACTGATAGTCCATCAGTGTTTCTTCTCTTGCGCAGACCATTGTACTTACAGA
TCAAGAAACTCAGACAAAACGATTCCTTCTACTACCATCTCCTATGCATCTAAATCAAGA
GAACTGAGAAACCTTTTGTAGGCTGAAGGGAAGGTAAGATTGATTTGATCAGGAGAATTG
AGAAGCCGTTTGTAGACGGAAGTGGAGAAAACTGTTTCCGTCGCTGCTTGACACAGAAAA
CGCAGATCAGGTCCGGCCACGGAGGCGAGGAACAGAAGCGTAACTAAGTTGATTGAATGC
ACCCCAAACCATTATGCCTTGGTTGACCAGAGGTGGTGGTGTGAATATCGAACGTCATGG
CAACGACTCAGTCTTCACGCAATGATGGCAGGTGAAAGACGGTGGAAAATACAAATACGC
ATAGTACAGAGAGATAGACCTCGACTCAGCAGGCCCCTCGAAGGTGGTGATCTATCTATA
CGGTAAAATCACCGCCTTTCAGATCGAAACAGAGCATTGAAGACAACGTAGTTGATGAGC
GAATTGATGGGATCAAACATGGACCACTAACTCAGACCGTTTTGGTGAGGGTAAGGGGAA
ACGA

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 6

CO CL1544Contig1 865 4 19 U
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TCGTGACTCAATCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAA
GCGAAAGTACGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCCAGCAACAAGACGGT
CAGAAGAATCCGTGTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGG
TAACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTTCTTGATGTTGTCTA
CAACGCCTCCAACAACGAGCTTGTCCGTACAAAGACGCTAGTCAAGAGTGCTATTGTTCA
GGTGGATGCTGCTCCTTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCG
CAAGAAGAAGAATGCTGCTTCCTCTGCCAAGAAGGAAGCAGAGGATGGTGAAGAAGCAGC
TCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT***CCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCT
GAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGG*ACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGT
TTGCGAGCGGTCGTTTGTTTGCTTGCATCTCATCAAG*CCCGGCCAGTGCGGACGTGCTG
ATGGATACATTCTGGAAGGTAAAGAGCTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGA
AGGGAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCTTGTTCTTTGCCTGAAACCTTTTTGTTTTCTTTATA
CATGCTGTTTTGAGGTTTCAGTTTGTAATACTGTGTGAGAACTTATGTTTTTTGATTAGC
TTAATTCGTATTTCTTAGTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR12TF U 9
AF RR4CE70TF U 1
AF RR4CE34TF U 9
AF RR4BR12JQ C 150
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A
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CCC

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DS 

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TAACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCAGTTACCCGCAAGACCAGAGTTCTTGATGTTGTCTA
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GGTGGATGCCGCTCCCTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCG
CAAGAAGAAGAATGCTGCGTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCAGAGGATGGTGAAGAAGCAGC
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GAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGG*ACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGT
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ATGGATACATTCTG

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DS 

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C
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CGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCCAGCAACAAGACGGTCAGAAGAAT
CCGTGTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTC
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CAACAACGAGCTTGTCCGTACAAAGACGCTAGTCAAGAGTGCTATTGTTCAGGTGGATGC
CGCTCCCTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAA
GAATGCTGCGTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCAGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGC
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TGAGAGCCGTCAAGAGGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCG
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CTTTGCCTGAAACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCTGTTTTGAGGTTTCAGTTTGTAAT
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DS 



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AGGTTAATTCTGGATTGGATGTATAACAATATAAATGACAGAGTACTTAAGAATGAAGCA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F983JQ C 1
AF RR4F983TF U 1
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TAGTATTTGGAGCCC

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DS 

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CATCAGTTATTATTGCACAATGCTTTGAGATTACTATTTTCATGGTTTCCCTTTATTATT
AGGTTAATTCTGGATTGGATGTATAACAATATAAATGACAGAGTACTTAAGAATGAAGCA
TAGTATTTGGAGCCC

QA 1 315 1 315
DS 



AS 1 5

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ATGTTATAAAGATCAGTGAGGACGAGATTACATTCCTGACTGG*TGGAGATGATCCTTAC
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AGCTTAGCTTCTGATCTCACTCTTCTCACTGATGAGAAGAAGCTAAGGGAGGCGCTTCTA
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ACCATGGATGCTGTTCAAGAACTTGTCAAATCTTCTCGCTCCTGAAAATGCTCATAAAGA
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TGCGGAGGAAGGATATTTTAGTTTTAAACTGCTTGCCGTTTTGTC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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GTCGTTTATTGGTTGCGGAGGAAGGATATTTTA

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DS 



AS 1 5

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TCATCCTCCTCTGTGTCTTTCTTGGCCAATGCTTCCTCTAACTCCTTGATCTTCTTCATT
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ATCTCTTTCCCCATTGAAGATACCTCTTCATCAAACTTCTTCACGTGGTTCACCAAACCG
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GCAGTCTCTAACAGCTGCTGACTTCCCAAGATCCTGACATTGCCTACTCCCAACCGTCGC
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GACAATCTCAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ36JQ U 1
AF RR4EI57JQ U 15
AF RR4EB69JQ U 26
AF RR4EB69TF C 207
AF RR4EI57TF C 750
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TCAACTTCAACTGTATCATCATCATCACCATCTGTAGAATCTTCTTTCTCTTCTCTGTTC
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TCCTGAAGATAACTCACCTCATCTTCCACTTCTTTAAGATCATCTCTCATCTGAGACTCT
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ATCTC
CCCATTGA

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DS 

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GTCTTTCTTGGCCAATGCTTCCTCTAACTCCTTGATCTTCTTCATTGAATCATCCTGTTT
CACTCTGAGCAAATCATTCTCATGAAGAACGCTTTGAAACTCTGCTTCTTTGTCCAGCAT
TTTCGCATTTAGTTTCAAACTCTCAGCTCTTGCTTCCCTGAGAGTCTCCTGAAGATAACT
CACCTCATCCTCCACTTCTTTAAGATCATCTCTCATCTGAGACTCTTTCCTCAACGCTCC
ATCAGCTTCTTCCTTTGTCTTTTTAACCAAGTTTCCCAACCTGTTCATCTCTTTCCCCAT
TGAAGATACCTCTTCATCA
A

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DS 

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AGAAAAACATGCAAGTAATCAAAGAGATGTTTATTTACTTCCCCTTGTGGAAAGCTTCTT
TCTTCCCAGTATGATAACTTTCCCACATACTATATTCAACTTCAACTGTATCATCATCAT
CACCATCTGTAGAATCTTCTTTCTCTTCTCTGTTCTCCTCAAGCTTCACGTTCGTGCCAT
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CCAATGCTTCCTCTAACTCCTTGATCTTCTTCATTGAATCATCCTGTTTCACTCTGAGCA
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CCTTTGTCTTTTTAACCAAGTTTCCCAACCTGTTCATCTCTTTCCCCATTGAAGATACCT
CTTCATCAAACTTCTTCACGTGGTTCACCAAACCGGTCTCTCTCATCTTGGTTTGTTCCA
CCTCACTGAAAAGCACATCGATCTCATG
T

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DS 

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AAGGGTTTCTACTAAATCATAGTCTTGTTCACCATCATCCTCCTCTGTGTCTTTCTTGGC
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ATCATTCTCATGAAGAACGCTTTGAAACTCTGTTTCTTTGTCCAGCATTTTCGCATTTAG
TTTCAAACTCTCAGCTCTTGCTTCCCTGAGAGTCTCCTGAAGATAACTCACCTCATCCTC
CACTTCTTTAAGATCATCTCTCATCTGAGACTCTTTCCTCAACGCTCCATCAGCTTCTTC
CTTTGTCTTTTTAACCAAGTTTCCCAACCTGTTCATCTCTTTCCCCATTGAAGATACCTC
TTCATCAAACTTCTTCACGTGGTTCACCAAACCGGTCTCTCTCATCTTGGTTTGTTCCAC
CTCACTGAAAAGCACATCGATCTCATGTCTCGCCTCGTCAAGCATCTTCTTGTAATGTTC
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TTCACTCGACGCTTGTTTCTTCTCCTCCTTGACGGTTTCAAGCTCAGCCTTGAGCTTCCT
CGCCTCTTTCTCAGCCTTTGATAACAACTCTTCAGCAGTCTCTAGCAGCTGC
C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4EI57TF 702 0 0
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ATGCAAGAGAAGCCGAGGCTGATCTCTTCATCATGTTGGCTTCCTCTAACTCTCTCTCTA
ATACTACGGCGGAGCCTTGCGCGTAAGACTTTTCCATCTTCAGAACTTCTATCTCACCGT
CAAGCTTCTCAATGATCTTATCTCGTCTTTTAACCTCTGCTTGAAAACACCTCGCCTTCT
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CGTCGTTAGATGCAGCCAGTTCTTGAGTTACTTTCTCCAGCTCCCGGGTTACTAAAAGAA
GAACAGCTGAGTCTGAAGCGTTTTGGTTCTTGACAATCTCAC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 5

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TTCTTGCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGAAAAACTCCTGCAGAACTACTGC
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TGGGAGCTGTGAAAGTGATGGCAAAGGACCTTATCAGAACGCGACACCAGATTGAGAAGT
TTTACAAGCTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTTTCTCTCAGGATCCAGACTCTCAAATCAA
CACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAATGGGGCAAATGAACAGGC
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TGGAGATGACCTCTGAGGTGATGGGAGATGCTATTGATGATGCCTTGGAAGGAGATGAGG
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CAAGGTTGGACAACCTTCGAAAAATGTGAGGCCTTCCCGGATTCTGTATAATATTTGTTG
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GTTACGATTTGAGGGTGGGTTTGTAATAATTTCATAATTTGAGCCCTGAATTTATAAATC
TCATTGTCGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C119TF U 1
AF RR4C107TF U 1
AF RR4GQ51JQ C 244
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QA 1 587 1 587
DS 

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AGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTGAGAGGCAAAACGAGAAAA
TGGAGATGACCTCTGAGGTGATGGGAGATGCTATTGATGATGCCTTGGAAGGAGATGAGG
AAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGACGAGATCGGTATCGATATCA
ACCAAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCACCAGCAG
AAAGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4GQ51JQ 729 0 0
AGACACAAGAGAAGAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGACCGCGAAGCAGGGACAGATGG
GAGCTGTGAAAGTGATGGCAAAGGACCTTATCAGAACACGACACCAGATTGAGAAGTTTT
ACAAGCTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTTTCTCTCAGGATCCAGACTCTCAAACCAACAC
AAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAATGGGGCAAATGAACAGGCAGA
TGAATCTGCCTTTTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTGAGAGGCAAAACGAGAAAATGG
AGATGACCTCTGAGGTGATGGGAGATGCTATTGACGATGCCTTGGAAGGAGATGAGGAAG
AGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGACGAGATCGGTATCGATATCAACC
AAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCACCAGCAGGAAAGAATAAGGTGG
TGCAAGCTGAGGCGGCAGGAGCTGAGGACGGTGGGGGAATAGATAGTGATCTTCAGGCAA
GGTTGGACAACCTTCGAAAAATGTGAGGCCTTCCCGGATTCTGTATAATATTTGTTGACT
TGTTACCCGATTATTACTTTTAAACTCCAAAGGAATATGTGGCAAACTAGAGACATGGTT
ACGATTTGAGGGTGGGTTTGTAATAATTTCATAATTTGAGCCCTGAATTTATAAATCTCA
TTGTCGTCC

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL1547Contig2 762 2 18 U
GGGAGTATTGACGAAGGAAAAGAGAATAATCCCTTTTCCGCGTTTCCTGACCAAAAGTTT
CATAACTGAGATTTGTTCCAACTCCGATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGCTCGCGTCAAA
ATCCTATTCAAAGTTTCCGAGATTTCGATCACGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAA
ACTCCTACAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTCGATAAGTCAATCAGAGACATC
GAGAGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAGAAACTTATTACCGAGATTAAGAAG
ACCGCAAAGCAGGGCCAGATGGGAGCTGTGAAAGTAATGGCAAAGGACCTCATCAGAACA
CGGCACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTATCTCTCAGG
ATCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGCGTGACTAAAGCA
ATGGGGCAAATGAACAGACAGATGAATCTGCCATCTCTGCAGAAAACCATGCAAGAGTTT
GAGAGGCAGAATGAGAAAATGGAGATGGTCTCCGAGGTGATGAGAGATGCTATTGATGAT
GCCTTGGAAGGAGATGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGAC
GAGATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGATGCTCATCTGGTGCGGTGGCTGCACC
AGCAGCAAAGAACAAGTGGTGCAAGCTGAGCGGCCGGAGCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ58TF U 1
AF RR4EW78TF U 1
BS 1 113 RR4EJ58TF
BS 114 114 RR4EW78TF
BS 115 186 RR4EJ58TF
BS 187 187 RR4EW78TF
BS 188 410 RR4EJ58TF
BS 411 411 RR4EW78TF
BS 412 467 RR4EJ58TF
BS 468 468 RR4EW78TF
BS 469 485 RR4EJ58TF
BS 486 486 RR4EW78TF
BS 487 497 RR4EJ58TF
BS 498 498 RR4EW78TF
BS 499 512 RR4EJ58TF
BS 513 513 RR4EW78TF
BS 514 526 RR4EJ58TF
BS 527 527 RR4EW78TF
BS 528 530 RR4EJ58TF
BS 531 762 RR4EW78TF

RD RR4EJ58TF 530 0 0
GGGAGTATTGACGAAGGAAAAGAGAATAATCCCTTTTCCGCGTTTCCTGACCAAAAGTTT
CATAACTGAGATTTGTTCCAACTCCGATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGCTCGTGTCAAA
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ACTCCTGCAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTCGATAAGTCAATCAGAGACATC
GAGAGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAGAAACTTATTACCGAGATTAAGAAG
ACCGCAAAGCAGGGCCAGATGGGAGCTGTGAAAGTAATGGCAAAGGACCTCATCAGAACA
CGGCACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTTTCTCTCAGG
ATCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCA
ATGGGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCAT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4EW78TF 762 0 0
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CATAACTGATATTTGTTCCAACTCCGATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGCTCGCGTCAAA
ATCCTATTCAAAGTT*CCGAGATTTCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAA
ACTCCTACAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTCGATAAGTCAATCAGAGACATT
GAGAGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAGAAACTTATTACCGAGATTAAGAAG
ACCGCAAAGCAGGGCCAGATGGGAGCTGTGAAAGTGATGGCAAAGGACCTTATCAGAACA
CGGCACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTATCTCTCAGG
ATCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGCGTGACTAAAGCA
ATGGGGCAAATGAACAGACAGATGAATCTTCCATCTCTGCAGAAAACCATGCAAGAGTTT
GAGAGGCAGAATGAGAAAATGGAGATGGTCTCCGAGGTGATGAGAGATGCTATTGATGAT
GCCTTGGAAGGAGATGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGAC
GAGATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGATGCTCATCTGGTGCGGTGGCTGCACC
AGCAGCAAAGAACAAGTGGTGCAAGCTGAGCGGCCGGAGCTG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 2 6

CO CL1548Contig1 647 4 4 U
GGATCTTCATGTTTTGTATCTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTG
GATTTGTCCCCGAATCAATTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCA
TCATGATGACCAATCACAACACAACCTCCCATGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACAT
TCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGTGACGAATG
CATCAAGGCGTTAGACCAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAG
AGGACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAG
GCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAAG
ACTTT*GCTTTAGGCTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATA
GAAAGCTAAGATGAACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTCT
ATTAGATCAAGCGCAGATAAGCTTTCATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTTTAG
ATGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAGAATTATTTACCGTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A122JQ C 1
AF RR4A122TF U 51
AF RR4A122JQD C 1
AF RR4A122TFB U 1
BS 1 50 RR4A122TFB
BS 51 425 RR4A122TF
BS 426 426 RR4A122TFB
BS 427 647 RR4A122TF

RD RR4A122JQ 647 0 0
GGATCTTCATGTTTTGTATCTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTG
GATTTGTCCCCGAATCAATTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCA
TCATGATGACCAATCACAACACAACCTCCCATGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACAT
TCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGTGACGAATG
CATCAAGGCGTTAGACCAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAG
AGGACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAG
GCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAAG
ACTTT*GCTTTAGGCTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATA
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ATTAGATCAAGCGCAGATAAGCTTTCATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTTTAG
ATGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAGAATTATTTACCGTTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4A122TF 597 0 0
AGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAATCAATTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAA
TGTGTACTCATCATGATGACCAATCACAACACAACCTCCCATGTCTCCATTGTCAACCAC
ATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTC
GTGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCA
CCATTTGGAGAGGACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCG
TCTCTCCTAGGCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGA
TACAGTGAAGACTTTTGCTTTAGGCTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAG
GTTACTTATAGAAAGCTAAGATGAACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAA
AAGTTTCTCTATTAGATCAAGCGCAGATAAGCTTTCATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTT
GCTTGTTTAGATGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAGAATTATTTACCGTTT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4A122JQD 647 0 0
GGATCTTCATGTTTTGTATCTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTG
GATTTGTCCCCGAATCAATTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCA
TCATGATGACCAATCACAACACAACCTCCCATGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACAT
TCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGTGACGAATG
CATCAAGGCGTTAGACCAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAG
AGGACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAG
GCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAAG
ACTTT*GCTTTAGGCTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATA
GAAAGCTAAGATGAACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTCT
ATTAGATCAAGCGCAGATAAGCTTTCATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTTTAG
ATGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAGAATTATTTACCGTTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4A122TFB 647 0 0
GGATCTTCATGTTTTGTATCTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTG
GATTTGTCCCCGAATCAATTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCA
TCATGATGACCAATCACAACACAACCTCCCATGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACAT
TCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGTGACGAATG
CATCAAGGCGTTAGACCAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAG
AGGACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAG
GCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAAG
ACTTT*GCTTTAGGCTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATA
GAAAGCTAAGATGAACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTCT
ATTAGATCAAGCGCAGATAAGCTTTCATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTTTAG
ATGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAGAATTATTTACCGTTT

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL1548Contig2 647 2 1 U
GGATCTTCATGTTTTGTATCTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTG
GATTTGTCCCCGAATCAATTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCA
TCATGATGACCAATCACAATACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACAT
TCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGTGACGAATG
CATCAAGGCGTTAGACTAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAG
AGGACTTCAAAGGGAAAATAAGGATTTCTTTGAAACGTATGGGAATTTCGTCTCTCCTAG
GCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTGGCGAGAAGGATACAGTGAAG
ACTTTGCTTTAGGCTTCTAGATATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTAT
AGAAAGCTAAGATGAATTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTA
TCAGATCAAGCGCAAATAAGCTTTTATTATGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTCTAGA
TGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAAGAATTATTTACCGTTT


BQ
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AF RR4BD46JQ C 1
AF RR4BD46TF U 1
BS 1 647 RR4BD46TF

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DS 

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TCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGTGACGAATG
CATCAAGGCGTTAGACTAACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAG
AGGACTTCAAAGGGAAAATAAGGATTTCTTTGAAACGTATGGGAATTTCGTCTCTCCTAG
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AGAAAGCTAAGATGAATTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTA
TCAGATCAAGCGCAAATAAGCTTTTATTATGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTCTAGA
TGCAGTCTAGTAATTGAAAACCCTTAATAAAGAATTATTTACCGTTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 6

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ACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTATTGGGTTTCTT
CTACTTCTGTAATGACTACGATTCTCCTCCCTCAACCCAGTTTTTTTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A006TF U 32
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AF RR4A006TFB U 1
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BS 639 649 RR4A006TFB

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CCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGATAAGGAG
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GG
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C

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR4B836TF 603 0 0
GG
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GGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAG
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ATT*GATGATGAAGGCTTCTCATATTTGCATGAAGACAATGAAATCTTTTACCCCCCATT
TT*GGTTCTGTATAGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTC
TACTCAAGACTATTGGGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTCCTCTCTCAACC
C

QA 3 603 3 603
DS 

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GGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGA
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GGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGA
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QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 6

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G935JQ U 1
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AF RR4E836JQ U 178
AF RR4GC23JQ U 183
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TCCATGATAAGTAGATAGGAGCTAATCACTCCTGCTCGTCTGCAGCAGCAAATGAGTGGT
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TGAGCTCACCACAGAGGCTGCCTTTTTCAAGCTAACTCGGACTTGGTCTTTGCTGTCTCT
TTCTCTGATTGTCACCGTATCATCCGAGTCCACTGTTATTGCAAATGGCACTCCTAGCTC
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CAACTGTTCGTCCCCTGCTTTGCTTGGCCTTGTGCTGAAACAATGCTCGTACAGACAATA
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CTCTTTC
C

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TCCCGAAAGATGGTT

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DS 

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G
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AGGCTGCCTTTTTCAAGCTAACTCGGACTTGGTCTTTGCTGTCTCTTTCTCTGATTGTCA
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ATCTTTTCCCTATCGATGTACCAGTGATGTCAATCTTATGTGAGATGCCAACCGAAGTGA
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TCCCGAAAGATGGTTCGATCACTGACGGTGTGAAAACACGCTGGTGCTCTTTCTTCTTCT
CCTTTGAGATTGACACCATGTTCTTCTTGATGCTCACGTTTTTCCCGAGTGTACACACG

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DS 



AS 1 6

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ATGTATGTTTCCTCCAGCTAGAACGATCTCTCTTGCATTCTCGATCCCCACAACCGAGTG
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TTCATCGTCTGTCCAAGACAGTAACACTACTCCCGGTTTAGCAAAGCAGCACATGTTATC
AATGTGGCCGTTTGTGTCATCATCACCGTATAGACCACGAGGAAGCCAGATGAATGTTTG
TACTCCGAGATATCTCTTGAGCTCTTCCTCTATCTGCTCTCTGCTCATGTGAGGGTTCCG
GTTTTTGTTCAAGAGACACTCTTCAGTCACAAGACAGGTACCTTCGCCGTCGACATGGAT
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TCGTGACTCCTCCATTCTCTCTGCGTGATAGGTGGGAGAGCTGACAAGTCGGATATTTTT
AACTACTGTTGTGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H236JQ U 1
AF RR4FY10JQ U 31
AF RR4F689JQ U 6
AF RR4H236TF C 640
AF RR4FY10TF C 673
AF RR4F689TF C 783
BS 1 57 RR4H236JQ
BS 58 58 RR4F689JQ
BS 59 69 RR4H236JQ
BS 70 70 RR4F689JQ
BS 71 175 RR4H236JQ
BS 176 176 RR4F689JQ
BS 177 239 RR4H236JQ
BS 240 240 RR4F689JQ
BS 241 258 RR4H236JQ
BS 259 478 RR4F689JQ
BS 479 479 RR4FY10JQ
BS 480 721 RR4F689JQ
BS 722 816 RR4H236TF
BS 817 817 RR4FY10TF
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BS 1261 1261 RR4FY10TF
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BS 1307 1342 RR4H236TF
BS 1343 1396 RR4FY10TF

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ATGTTAAACAGATCCGGTTTTAGAAAACAATACAACAGTTCTGGTTCGCTCTTCTGAATC
GAATACAGGATTCATAAAAATCCCGGGAACGGCAGTATCTTTTCATTCCCGCGAAAAACA
CCGTCAATGGCCGTTGACGGCGACGGAATTAGGCTCCGCCGGCTGCTGCTGCGTAATGCC
ATGTATGTTTCCTCCAGC

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR4FY10JQ 585 0 0
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TACAACAGTTCTGGTTCGCTCTTCTGAATCGAATACAGGATTCATAAAAATCCCGGGAAC
GGCAGTATCTTTTCATTCCCGCGAAGAACACCGTCAATGGCCGTTGACGGCGACGGAATT
AGGCTCCGCCGGCTGCTGCTGCGTAATGCAATGTATGTTTCCTCCAGCTAGAACGATCTC
TCTTGCATTCTCGATCCCCACAACCGAGTGATGAGGATACGTCTCTGAGAGGACGCGAAT
CGCTTCTTCATCGCGTTTAGCGTCACCGAATTGCGGTACGATTATTCCTCCGTTAGCGAT
GTAGAAGTTCACATACGATGCTGCCAGTCTTGTCCCTGCAAGCCTTGCTTTAGCTTCACC
TTCCTGAATGATTCCAGAGGATTCTTCTACGGTCATATAAAGCGGTCCAGGGACGTGGAG
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TTCTACTGATCTTTCGTATTGAGGATCAGCTTCATCGTCTGTCCA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4F689JQ 716 0 0
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AAACCGATCCGGTTTTAGAAAACAATACAACAGTTCTGGTTCGCTCTTCTGAATCGAATA
CAGGATTCATAAAAATCCCGGGAACGGCAGTATCTTTTCATTCCCGCGAAGAACACCGTC
AATGGCCGTTGACGGCGACGGAATTAGGCTCCGCCGGCTGCTGCTGCGTAATGCAATGTA
TGTTTCCTCCAGCTAGAACGATCTCTCTTGCATTCTCGATCCCCACAACCGAGTGATGAG
GATACGTCTCTGAGAGGACGCGAATCGCTTCTTCATCGCGTTTAGCGTCACCGAATTGCG
GTAAGATTATTCCTCCGTTAGCGATGTAGAAGTTCACATACGATGCTGCCAGTCTTGTCC
CTGCAAGCCTTGCTTTAGCTTCACCTTCCTGAATGATTCCAGAGGATTCTTCTTCGGTCA
TATAAAGCGGTCCAGGGACGTGGAGCTTGATGACTTGAATCTTCCTGCCACGAGCATCAA
CAGAGTTCGAGAAAACCGTAAGAGCTTCTACTGATCTTTCGTATTGAGGATCAGCTTCAT
CGTCTGTCCAAGACAGTAACACTACTCCCGGTTTAGCAAAGCAGCACATGTTATCAATGT
GGCCGTTTGTGTCATCATCACCGTATAGACCACGAGGAAGCCAGATGAATGTTTGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4H236TF 706 0 0
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AGGAAGCCAGATGAATGTTTGTACTCCGAGATATCTCTTGAGCTCTTCCTCTATCTGCTC
TCTGCTCATGTGAGGGTTCCGGTTTTTGTTCAAGAGACACTCTTCAGTCACAAGACATGT
ACCTTCGCCGTCGACATGGATGCTGCCTCCTTCAAGAATCATCGAGTGCTGAAATCTTGG
AATCCGCTCAACAGCGAGAATCTTTTTTGAAACAAGGAGGTCATGACTCCAATCATTATA
GCAGCCATCATCAGCTCCTCCCCAGGCATTGAAATTCCAGTCGACTCCAGCGATGTTTCG
GGTTAGGGAACTGAGCTTTAATGGTATTTTCCGCACAACAAAAGTTGGCCCAGAGTCGCG
GAACCAAGAATCATTCATGCTCATCTCAACAACTCTGATCTCCTCTGGAAGTTGTTTCCT
TGCATTTTCCCACTGAGCGGAGCTTGCACAGACTGTAACAGGCTCGAACATTGAGATCGC
CTTTGCAACATCTACAAACACTCGTTCTGCAGGCAAAGCGTTGTGACGCCAGTTATCTTG
CCGTTCAGGCCAACCGATCCAGGTTTGAGCATGAGGTTCCCACTCCGCCGGCATGTAGAA
GCCGTGTTCCGCCGGAGATTCTCGTGACTCCTCCATTCTCTCT
CTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FY10TF 724 0 0
TGTGTCATCATCAC*GTATAGACCACGAGGAAGCCAGATGAATGTTTGTACTCCGAGATA
TCTCTTGAGCTCTTCCTCTATCTGCTCTTTGCTCATGTGAGGGTTCCTGTTTTTGTTCAA
GAGACACTCTTCAGTCACAAGACAGGTACCTTCGCCGTCGACATGGATGCTGCCTCCTTC
AAGAATCATAGAGTGCTGAAATCTTGGAATCCGCTCAACAGCGAGAAT**TTTTTGAAAC
AAGGAGGTCATGACTCCAATCATTATAGCAGCCATCATCAGCTCCTCCCCAGGCATTGAA
ATTCCAGTCAACTCCAGCGATGTTTAGGGTAAGGGAACTGAGCTTTAATGGTATTTTCCG
CACAACAAAAGTTGGTCCAGAGTCGCGGAACCAAGAATCATTCATGCTCATCTCAACAAC
TCTGATCTCCTCTGGAAGTTGTTTCCTTGCATTTTCCCACTGAGCGGAGCTTGCACAGAC
TGTAACAGGCTCGAACATTGAGATCGCCTTTGCAACATCTACAGACACTCGTTGTGCAGG
CAAAGCGTTGTGACGCCAGTTATCTTGCCTTTCAGGCCAACCGATCCATGTTTGAGCATG
AGGTTCCCACTCCGCCGGCATGTAGAAGCCGTGATCCGCCGGAGATTCTCGTGACTCCTC
CATTCTCTCTGCGTGATAGGTGGGAGAGCTGACAAGTCGGATATTTTTAACTACTGTTGT
GTCC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4F689TF 614 0 0
TTTTGTTCAAGAGACACTCTTCAGTCACAAGACAGGTAC*TTCGC*GTCGACATGGATGC
TGCCTCCTTCAAGAATCATCGAGTGCTGAAATCTTGGAATCCGCTCAACAGCGAGAATCT
TTTTTGAAACAAGGAGGTCATGACTCCAATCATTATAGCAGCCATCATCAGCTCCTCCCC
AGGCATTGAAATTCCAGTCAACTCCAGCGATGTTTCGGGTAAGGGAACTGAGCTTTAATG
GTATTTTCCGCACAACAAAAGTTGGTCCAGAGTCGCGGAACCAAGAATCATTCATGCTCA
TCTCAACAACTCTGATCTCCTCTGGAAGTTGTTTCCTTGCATTTTCCCACTGAGCGGAGC
TTGCACAGACTGTAACAGGCTCGAACATTGAGATCGCCTTTGCAACATCTACAAACACTC
GTTGTGCAGGCAAAGCGTTGTGACGCCAGTTATCTTGCCTTTCAGGCCAACCGATCCATG
TTTGAGCATGAGGTTCCCACTCCGCCGGCATGTAGAAGCCGTGATCCGCCGGAGATTCTC
GTGACTCCTCCATTCTCTCTGCGTGATAGGTGGGAGAGCTGACAAGTCGGATATTTTTAA
CTACTGTTGTGTCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 2 6

CO CL1552Contig1 819 2 5 U
GTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCGCCAAGAGAGATAGAGACACTCAGCATCAGCAGCT
GAAGAAGAAGATTCTGAGTCCCGTTTCGAATTCGATTCAACCATCTCTGATCTCCATTCT
CAGGGTTTCTCCTTTTGAACTCTCTCTCCTCTACCTCTCTCACATGGCGATGAGAGGTGT
CGATATCAAGTTATACGATGGGTTCTTCTTGTCTATGCTTGCCATTAGTGTAATTATTGT
TGGTATCAACTGGAAGAGGTATAGTAGGTGCGAGTACCCTTTGCATATTTGGATTGTGGT
CGACTACACCACCGTCTTTATCTTCCGCGTCCTTATGTTTCTTGACAATGCTCTTGCTGC
TCGTCTCGGCTTGGATTTTGGAAGTCAACAGCGGAACATTGGGTTTTGTGGGAGAGTGGT
GGTGCTCTCTCTCCTATCTCTCCTTCTCTATCCATTTCTCTGGGCTTGGACTGTTATCGG
TACTATACGGTTTATTAGGGCTAAAAGCTGTTTACCTGAAGATGGCCAAAAATGGGGTTT
CCTCATTTGGCTCGTGTTCAGCTACTGTGGACTCCTCTGCATTGATTGCATCTGTGTCGG
AAAGTGGTTGGCCCGAAGACAGGTACACTCACTACGTGCTCAGCAGGGAATTCCGAGTTC
AGAATTTGGTATTTTGGTTGACATGATCAGGGTACCGGACTGGGCAGTTGAAGCCGCAGA
CAAGAGATGAGAAGCATGGATCAAGATGCTGCTACTTACCATCCTGGACTTTACTTGACT
CCAGCTCAGACGAAGCTGTTGAGCACTCATTCAAGACTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG83TF U 4
AF RR4AK57TF U 1
BS 1 161 RR4AK57TF
BS 162 162 RR4FG83TF
BS 163 385 RR4AK57TF
BS 386 386 RR4FG83TF
BS 387 819 RR4AK57TF

RD RR4FG83TF 639 0 0
CTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCGCCAAGAGAGATAGAGACACTCAGCATCAGCAGCTGAA
GAAGAAGATTCTGAGTCCCGTTTCGAATTCGATTCAACCATCTCTGATCTCCATTCTCAG
GGTTTCTCCTTTTGAACTCTCTCTCCTCTACCTCTCTCACATGGCGATGAGAGGTGTCGA
TATCAAGTTATACGATGGGTTCTTCTTGTCTATGCTTGCCATTAGTGTAATTATTGTTGG
TATCAACTGGAAGAGGTATAGTAGGTGCGAGTACCCTTTGCATATTTGGATTGTGGTCGA
CTGCACCACCGTCTTTATCTTCCGCGTCCTTATGTTTCTTGGCAATGCTCTTGCTGCTCG
TCTCGGCTTGGATTTTGGAAGTCAACAGCGGAACATTGGGTTTTGTGGGAGAGTGGTGGT
GCTCTCTCTCCTATCTCTCCTTCTCTATCCATTTCTCTGGGCTTGGACTGTTATCGGTAC
TATATGGTTTATTAGGGCTAAAAGCTGTTTACCTGAAGATGGCCAAAAATGGGGTTTCCT
CATTTGGCTCGTGTTCAGCTACTGTGGACTCCTCTGCATTGATTGCATCTGTGTCGGAAA
GTGGTTGGCCCGAAGACAGGTACACTCACTACGTGCTCA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AK57TF 819 0 0
GTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCGCCAAGAGAGATAGAGACACTCAGCATCAGCAGCT
GAAGAAGAAGATTCTGAGTCCCGTTTCGAATTCGATTCAACCATCTCTGATCTCCATTCT
CAGGGTTTCTCCTTTTGAACTCTCTCTCCTCTACCTCTCTCGCATGGCGATGAGAGGTGT
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TGGTATCAACTGGAAGAGGTATAGTAGGTGCGAGTACCCTTTGCATATTTGGATTGTGGT
CGACTACACCACCGTCTTTATCTTCCGCGTCCTTATGTTTCTTGACAATGCTCTTGCTGC
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GGTGCTCTCTCTCCTATCTCTCCTTCTCTATCCATTTCTCTGGGCTTGGACTGTTATCGG
TACTATACGGTTTATTAGGGCTAAAAGCTGTTTACCTGAAGATGGCCAAAAATGGGGTTT
CCTCATTTGGCTCGTGTTCAGCTACTGTGGACTCCTCTGCATTGATTGCATCTGTGTCGG
AAAGTGGTTGGCCCGAAGACAGGTACACTCACTACGTGCTCAGCAGGGAATTCCGAGTTC
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QA 1 819 1 819
DS 



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CAGCGGAACATTGGGTTTTGTGGGAGAGTCGTGGTGCTCTCTCTCCTATCTCTCCTTCTC
TATCCATTTCTCTGGGCTTGGACTGTTATCGGTACTATATGGTTTATTAGGGCTAAAGGC
TGTGTAAGCCTGTTTTTTTTAATGATCAATGTCATAAGATTATTCTTGCTGCATATCCTG
TTTCTGAGCTATTATTATGTATTTCGCTCTTGATATATATATATAGTTACCTGAAGATGG
CCAAAAATGGGGTTTCCTCATTTGGCTCGTGTTCAGCTACTGTGGACTCCTCTGCATTGA
TTGCATCTGTGTCGGAAAGTGGTTGGCCCGAAGACAGGTACACTCACTACGTGCTCAGCA
GGGAATTCCGAGTTCAGAATTTGGTATTTTGGTTAACATGATCAGGGTACCGGACTGGGC
AGTTGAAGCCGCAGGACAAGAGATGAGAAGCATGAATCAAGATGCTGCTACTTACCATCC
TGGACTTTACTTGACTCCAGCTCAGACGGAAGCTGTTGAGGCACTCATTCAAGAACTTCC
AAAGTTCAGGCTAAAAGCTGTCCCAGATGATTGCGGCGAATGCTTAATCTGCTTAGAGGA
GTTCCAGATTGGACATGAGGTTAGAGGATTACCTTGCGCCCATAATTTCCATGTGGAGTG
CATAGACCAGTGGCTGCGCTTGAATGTCAAATGTCCTCGGTGCCGGAGCTCGGTCTTTCC
AGACCTTGATCTCAGAGCATTATCCAACCTCCAGAGTTCAGAAACACAACAGCCCCCACA
AGGGAACACGGAGACAACAGAAGCTCGGTACATAAGAAGCCAACCACAAAGCGATAGCTA
TTTCTTGAGACTTCAACCCGTAATCCACCCTCCTGTCCACACAGACACCGCTCTGGAGAC
TGCAGAGAATGTTGGAGTTCCTCCTGTCTTGGCTGGTGGATCTCAATCTAGGAGATAGAG
AAAAAGAAGTCTCAGAGTATGAAAATTCTACTCATTACTAACTCTTGGACTTATTGAAGG
GAAGAGAAAAAAAGATATTTGGAGTCTACCCCCATCCCTTTCAAAAGTTTCTTTGAGGCT
TTGACAGTCTTGCAATGTAAATAAATTGTGGTTGAAAGAACAAAAAGTCTTGGGGGCTTT
ACATTTTGTAAGAATGAAGAATTGTTTATTCGTACACTATTTACGGTAGAGAATGTTCAT
ATATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4H661TF U 1
AF RR4AK57JQ C 451
AF RR4CT28TF U 737
AF RR4H661JQB C 570
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AAAGTTCACGCTAAA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4AK57JQ 732 0 0
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ATGTCCTCGGTGCCGGAGCTCGGTCTTTCCAGACCTTGATCTCAGAGCATTATCCAACCT
CCAGAGTTCAGAAACACAACAGCCCCCACAAGGGAACACGGAGACAACAGAAGCTCGGTA
CATAAGAAGCCAACCACAAAGCGATAGCTATTTCTTGAGACTTCAACCCGTAATCCACCC
TCCTGTCCACACAGACACCGCTCTGGAGACTGCAGAGAATGTTGGAGTTCCTCCTGTCTT
GGCTGGTGGATCTCAATCTAGGAGATAGAGAAAAAGAAGTCTCAGAGTATGAAAATTCTA
CTCATTACTAACTCTTGGACTTATTGAAGGGAAGAGAAAAAAAGATATTTGGAGTCTACC
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GTTGAAAGAAC
G

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4CT28TF 521 0 0
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GCATTATCCAACCTCCAGAGTTCAGAAACACAACACCCCCCACAAGGGAACACGGAGACA
ACAGAAGCTCGGTACATAAGAAGCCAACCACAAAGCGATAGCTATTTCTTGAGACTTCAA
CCCGTAATCCACCCTCCTGTCCACACAGACACCGCTCTGGAGACTGCAGAGAATGTTGGA
GTTCCTCCTGTCTTGGCTGGTGGATCTCAATCTAGGAGATAGAGAAAAAGAAGTCTCAGA
GTATGAAAATTCTACTCATTACTAACTCTCGGACCTATTGAAGGGAAGAGAAAAAAAGAT
ATTTGGAGTCTACCCCCATCCCTTTCAAAAGTTTCTTTGAGGCTTTGACAGTCTTGCAAT
GTAAATAAATTGTAGTTGAAAGAACAAAAAGTCTTGGGGGCTTTACATTTTGTAAGA*TG
AAGAATTGTTTATTCGTACACTATTTACGGTAGAGAATGTT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4H661JQB 697 0 0
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ATTGCGGCGAATGCTTAATCTGCTTAGAGGAGTTCCAGATTGGACATGAGGTTAGAGGAT
TACCTTGCGCCCATAATTTCCATGTGGAGTGCATAGACCAGTGGCTGCGCTTGAATGTCA
AATGTCCTCGGTGCCGGAGCTCGGTCTTTCCAGACCTTGATCTCAGAGCATTATCCAACC
TCCAGAGTTCAGAAACACAACAGCCCCCACAAGGGAACACGGAGACAACAGAAGCTCGGT
ACATAAGAAGCCAACCACAAAGCGATAGCTATTTCTTGAGACTTCAACCCGTAATCCACC
CTCCTGTCCACACAGACACCGCTTTGGAGACTGCAGAGAATGTTGGAGTTCCTCCTGTCT
TGGCTGGTGGATCTCAATTTAGGAGATAGAGAAAAAGAAGTCTCAGAGTATGAAAATTCT
ACTCATTACTAACTCTTGGACTTATTGAAGGGAAGAGAAAAAAAGATATTTGGAGTCTAC
CCCCATCCCTTTCAAAAGTTTCTTTGAGGCTTTGACAGTCTTGCAATGTAAATAAATTGT
GGTTGAAAGAACAAAAAGTCTTGGGGGCTTTACATTTTGTAAGAATGAAGAATTGTTTAT
TCGTACACTATTTACGGTAGAGAATGTTCATATATAG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 6

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ATCATCATCTACTCCTCCTCCAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCCTTGTCTTAACGCT
CCTTTCATCGATCGCCATGGCCGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCGGAAGCGAAGGTTCA
CATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCT
TTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGTTACAAGGA
AGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTCGAAGAGATATCCAAGCA
ACCAGGTGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACTTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGC
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TGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTGGATTCGACT
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TTATTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AG51JQ C 209
AF RR4DI59JQ C 102
AF RR4AG51TF U 209
AF RR4DI59TF U 7
AF RR4F821JQ C 1
AF RR4F821TF U 1
BS 1 8 RR4F821JQ
BS 9 609 RR4F821TF

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GG
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AATTGCCATGAGTTTGCTTTGGATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAGAATTGGGTTTT
ATAAATATATTATGATTTTAAGAT
G

QA 3 386 3 386
DS 

RD RR4DI59JQ 493 0 0
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TCGAAGAGATATCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACTTACCAGT
TGCACAAACCTGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGACCTAAGTTTGACTTTGTGTAGCGT
CTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGA
GTTTGCTTTGGATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAGAATTGGGTTTTATAAATATATT
ATGATTTTAAG
CT

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DS 

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GG
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GAAGGATGCTTTGATTTACAGTTACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCAC
ACCTGCGCAAGTCGAAGAGATATCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCA
GACTTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGACCTAAGTTTGACT
TTGTGTAGCGTCTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAAT
AATTGCCATGAGTTTGCTTTGGATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAGAATTGGGTTTT
ATAAATATATTATGATTTTAAGAT
G

QA 3 386 3 386
DS 

RD RR4DI59TF 586 0 0
GG
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CTACTCCTCCTCCAAGAAGAAGTCTCTCTCTGATCCTCCTTGTCTTAACGCTCCTTTCAT
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DS 

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ATCATCATCTACTCCTCCTCCAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCCTTGTCTTAACGCT
CCTTTCATCGATCGCCATGGCCGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCGGAAGCGAAGGTTCA
CATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCT
TTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGTTACAAGGA
AGCTGCTTCTGGTTTTTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTCGAAGAGATATCCAAGCA
ACCAGGTGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACTTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGC
TGGTGGTTTCAAGCTGACCTAAGTTTGACTTTGTGTAGCGTCTTGTTGTTGTAAATGTCG
TGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTGGATTCGACT
TGTTCTGTGTTGTTGAGAGAATTGGGTTTTATAAATATATTATGATTTTAAGATAAATCT
TTATTCTGC

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DS 

RD RR4F821TF 609 0 0
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GAACTTTCCCAATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAACATCATCAT
CTACTCCTCCTCCAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCCTTGTCTTAACGCTCCTTTCAT
CGATCGCCATGGCCGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCGGAAGCGAAGGTTCACATCGTCT
ACACAGAGAAACCCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCTTTCCTCCG
CTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGTTACAAGGAAGCTGCTT
CTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTCGAAGAGATATCCAAGCAACCAGGTG
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TCAAGCTGACCTAAGTTTGACTTTGTGTAGCGTCTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTG
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GTTGTTGAGAGAATTGGGTTTTATAAATATATTATGATTTTAAGATAAATCTTTATTCTG
C

QA 9 609 9 609
DS 



AS 1 6

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CATCAAGGTTCTCACTGTCATGCAGAAACATGGTTACATTGGCGAGTTCGAGTACGTTGA
TGACCACAGGTCTGGTAAGATTGTGGTTGAGCTTAATGGAAGGCTGAACAAATGTGGTGT
CATCAGTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCT
TCCTTCCAGACAGTTTGGTTACATTGTTCTCACAACCTCTGCCGGTATCATGGATCACGA
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AGAATCATCTTTGCCCGGCTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAAAAGGGTGGTAGA
TTTTTTTGTTGCGTTTGCTATCTTATAGATATTATGCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTG
CGCCCGAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4FR02TF U 1
AF RR4GP54TF U 2
AF RR4GP54JQ C 69
AF RR4EA80TF U 4
AF RR4FR02JQ C 69
AF RR4EA80JQ C 69
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BS 547 547 RR4GP54TF
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DS 

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DS 

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GG
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GTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCTTCCTT
CCAGACAGTTTGGTTACATTGTTCTCACAACCTCTGCCGGTATCATGGATCACGAAGAAG
CCAGGAGGAAGAATGTTGGTGGAAAGGTGCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAGAGAAT
CATCTTTGCCCGACTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAAAAGGGTGGTAGATTTTT
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GAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGCC

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DS 

RD RR4EA80JQ 568 0 0
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TTCTCACTGTCATGCAGAAACATGGTTACATTGGCGAGTTCGAGTACGTTGATGACCACA
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CTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCTTCCTTCCA
GACAGTTTGGTTACATTGTTCTCACAACCTCTGCCGGTATCATGGATCACGAAGAAGCCA
GGAGGAAGAATGTTGGTGGAAAGGTGCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAGAGAATCAT
CTTTGCCCGACTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAAAAGGGTGGTAGATTTTTTTG
TTGCGTTTGCTATCTTATAGATATTATTCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTGCGCCCGAA
GTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGCC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 2 6

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TCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGCTCTCAAAACTCCAAATCGAATCAAATCCAC
AACCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCTGTCGTCGTACCGAGAAACTTCAG
GTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGGAGATGGAACTGTTAGCTATGG
AATGGACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCA
CAACACTGTTCATTAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCC
GGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGA
AACTGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACAC
GATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCCTCGCATAACCGTAAGCT
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TGAAAAAATCTTTGCCCTTTCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGT
TCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCCGAATTTATGATAAAAAATGGTCTATGTGGATGGTGAT
GATGTTGATGTTGTTTGATTAATCATCTCAACTTTATCCTTTGTGTGCAAATTATCAAAA
ACAGCGTCCTCGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B038JQ C 1
AF RR4B038TF U 1
BS 1 794 RR4B038TF

RD RR4B038JQ 794 0 0
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TGAAAAAATCTTTGCCCTTTCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGT
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GATGTTGATGTTGTTTGATTAATCATCTCAACTTTATCCTTTGTGTGCAAATTATCAAAA
ACAGCGTCCTCGCC

QA 1 794 1 794
DS 

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AATGGACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCA
CAACACTGTTCATTAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCC
GGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGA
AACTGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACAC
GATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCCTCGCATAACCGTAAGCT
TGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGC
TGAAAAAATCTTTGCCCTTTCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGT
TCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCCGAATTTATGATAAAAAATGGTCTATGTGGATGGTGAT
GATGTTGATGTTGTTTGATTAATCATCTCAACTTTATCCTTTGTGTGCAAATTATCAAAA
ACAGCGTCCTCGCC

QA 1 794 1 794
DS 



CO CL1555Contig2 787 4 5 U
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AACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGG
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TTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTC
CATTGTCGTTCGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAAATGGTATG
TGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCAAGTTTATCCTTTGTGTGCA
AATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4B265TF U 1
AF RR4EB25TF U 17
AF RR4B134TF U 52
AF RR4B265JQ C 185
BS 1 707 RR4B265TF
BS 708 712 RR4EB25TF
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RD RR4B265TF 707 0 0
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GAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAAC
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TTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTC
CATTGTCGTTCGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGAT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EB25TF 696 0 0
GGA
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TGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATA
TACTGACACAGCTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTC
CAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCT
TTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGTTCGTTCTCAC
GCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAA

QA 4 696 4 696
DS 

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GG
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GGCAGTCCATTGTCGTTCGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAA*
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QA 3 710 3 710
DS 

RD RR4B265JQ 603 0 0
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ACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACC
ATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGT
ACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTA
AGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGT
TTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATT
GTCGTTCGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAAATGGTATGTGGA
TGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCAAGTTTATCCTTTGTGTGCAAATT
ATC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 6

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CCAGTCATGCGACGCCAAGTACGAGACGGAGCTCCGTTACGACACGAACATCACCGGGAC
GATAGGCTCTGCCAACATCGGAGATTTGTCGGGGATATCGGCTCAGGAGCTGTTCCTTTG
GTTTCCGGTTAAAGGGATTCGGGTCGACGTGCCGAGCTCGGTGCTTATATACTTCGATGT
CGGCGTTGTTCGCAAGCAGTACTCTTTGTCTTTGTTCGAGACGCCGAGGGATTGCGTTGC
GGTTCGTGGTGGAAA*TGAGGTTGAATCTTCAGTGTTGTCATTGCATCAAGTAGATCAAA
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CTATACCCACCACAAAGATTGACAGATGTTCTCATCAAAATTCTTGAAGATACTTGTGTT
ACTGTTCTTTTTGGTCTCAAATTCAAAATGGTTCAACTCTTTTCCCCTCCTCATTCCAGT
TTTGTTTCTGTATTGCATTCTTTGTTCCTGGGGAGGAGTTAGATGGAAAAGAAACAAGAT
CTGGTTTGTTTTGGAGAAAAAAAAA*GGTGTTGGAAGGAATGGTCCATATTTTGGTTCAA
GTGATTGATGATAACAGTGATGTGAGGTGATGAATGTTGTATTATTTTT*GTTGTCTATT
GTTTAAACAGATATTATTATCCTATATATAGCCAAATAAGTCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4EV20TF U 1
AF RR4AW54JQ C 378
AF RR4EV20JQ C 244
AF RR4AS92JQ C 280
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AF RR4AW54TF U 280
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GAAAGGCGTGACGGAATTCGCCTTCGACGGCGACACGGGACGCTTCTCCGTTTACTTGAA
CCAGTCATGCGACGCCAAGTACGAGACGGAGCTCCGTTACGACACGAACATCACCGGGAC
GATAGGCTCTGCCAACATCGGAGATTTGTCGGGGATATCGGCTCAGGAGCTGTTC
TT

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DS 

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GAGGTTGAATCTTCAGTGTT

QA 1 140 1 140
DS 

RD RR4EV20JQ 703 0 0
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AGGCTCTGCCAACATCGGAGATTTGTCGGGGATATCGGCTCAGGAGCTGTTCCTTTGGTT
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CGTTGTTCGCAAGCAGTACTTTTTGTCTTTGTTCGAGACGCCGAGGGATTGCGTTGCGGT
TCGTGGTGGAAA*TGAGGTTGAATTTTCAGTGTTGTCATTGCATCAAGTAGATCAAACTC
TTGGGAGAAACGTTATTTAGCCCGGAGGGTTTAAAAAAAAA**GAAATGTTGTTATACTA
TACCCACCACAAAGATAGACAGATGTTTTCATCAAAATTCTTGAAGATACTTGTGTTACT
GTTCTTTTTGGTCTCAAATTCAAAATGGTTCAACTCTTTTCCCCTCCTCATTCCAGTTTT
GTTTCTGTATTGCATTCTTTGTTCCTGAGGAGGAGTTAGATGGAAAAGAAACAAGATTTG
GTTTGTTTTGAAAAAAAAAAAAAGGTGTTGGAAGGAATGGTCCATATTTTGGTTCAAGTG
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DS 

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G
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AAAAAAGAAATGTTGTTATACTATACCCACCACAAAGATTGACAGATGTTCTCATCAAAA
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DS 

RD RR4AS92TF 653 0 0
G
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AAAAAAGAAATGTTGTTATACTATACCCACCACAAAGATTGACAGATGTTCTCATCAAAA
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QA 2 653 2 653
DS 

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G
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AAAAAAGAAATGTTGTTATACTATACCCACCACAAAGATTGACAGATGTTCTCATCAAAA
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TTTCCCCTCCTCATTCCAGTTTTGTTTCTGTATTGCATTCTTTGTTCCTGGGGAGGAGTT
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ATTATTTTT*GTTGTCTATTGTTTAAACAGATATTATTATCCTATATATAGC

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 5

CO CL1557Contig1 823 5 11 U
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ACAAAGCATGCGAGTTTATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACTTTC
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TCTGCTGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAACACA
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CTTTAAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGGTAACGTAT
AGCACAAGTCAAGTCCTGTGGATCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCATCCGCGAAGTAA
ACTCCTTCTTCAATGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAAT
CTATGATCATGCCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAAA
GACGTTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGCTAG
GGTTTCGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCT
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TAGCGGTCAAGCAATAAGAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCGGTC
CACGACCAAGACCTACAAGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B093JQ U 1
AF RR4B093TF C 6
AF RR4B173TF C 6
AF RR4B401JQ U 58
AF RR4G778JQ U 58
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BS 417 418 RR4G778JQ
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BS 698 730 RR4B401JQ
BS 731 823 RR4G778JQ

RD RR4B093JQ 159 0 0
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ACAAAGCATGCGAGTTTATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACTTTC
CACATTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAA

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR4B093TF 709 0 0
AAACTTGATTTTATTAATTTTCATTTTCGATTTTCTGGGAGATATCTATTTTGTCACAAA
GCATGCGAGTTTATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACTTTCCACAT
TCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATTAAAATTCTGC
TGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGGTTTCCCCATAGCCAAACACAAAACA
CCAGTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCGCACCTTTA
AAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGGTAACGTATAGCAC
AAGTCAAGTCCTGTGGATCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCGTCCGCGAAGTAAACTCC
TTCTTCAATGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAATCTATG
ATCATGCCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAAAGACGT
TTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGCTAGGGTTT
CGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCTTGACT
ATATTCGAGGCTAGAGATCCAATAAACAGAGAGCTAGATGCTTTG
CCCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4B173TF 709 0 0
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TCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATTAAAATTCTGC
TGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGGTTTCCCCATAGCCAAACACAAAACA
CCAGTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCGCACCTTTA
AAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGGTAACGTATAGCAC
AAGTCAAGTCCTGTGGATCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCGTCCGCGAAGTAAACTCC
TTCTTCAATGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAATCTATG
ATCATGCCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAAAGACGT
TTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGCTAGGGTTT
CGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCTTGACT
ATATTCGAGGCTAGAGATCCAATAAACAGAGAGCTAGATGCTTTG
CCCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4B401JQ 673 0 0
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TTCCACATTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATTAA
AATTCTGCTGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAAC
ACAAAACACCAGTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCG
CACCTTTAAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGGTAACG
TATAGCACAAGTCAAGTCCTGGGGATCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCATCCGCGAAA
*AAACTCCTTCTTCAATGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAG
AATCTATGATCATGCCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAG
AAAGACGTTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGC
TAGGGTTTCGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTT
TCTTGACTATATTCGAGGCTAGAGATCCAATAAACAGAGCGCTAGATGCTTTGGTATCAT
CAATAGCGGTCAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4G778JQ 766 0 0
GC
CACAAAGCATGCGAGTTTATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACTTT
CCACATTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATTAAAA
TTCTGCTGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAACAC
AAAACACCAGTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCGCA
CCTTTAAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGGTAACGTA
TAGCACAAGTCAAGTCCTGTGGATCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCATCCGCGAAGTA
AACTCCTTCTTCAATGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAA
TCTATGATCATGCCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAA
AGACGTTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGCTA
GGGTTTCGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTC
TTGACTATATTCGAGGCTAGAGATCCAATAAACAGAGAGCTAGATGCTTTGGTATCATCA
ATAGCGGTCAAGCAATAAGAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCGGT
CCACGACCAAGACCTACAAGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTC

QA 3 766 3 766
DS 



AS 1 6

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GTGTGGAAGATAAGGGTTGAGCTTCCAGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCCGTTGGT
TTCATCACCAAGATTTATCACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGAT
GTGATCAACCAGACTTGGAGTCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTT
CCTCAGCTTCTTTTGTATCCAAACCCATCTGATCCTTTGAATGGAGAAGCTGCTGCATTG
ATGATGCGTGATCGTCCTACTTATGAACTACGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATGCA
AAACCAGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAATAT
GGTTCTGATGACAATGAAGATGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCAGATCCTTAA
ACCGGGATTTGCTAGAGCACTTGCTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATTTATGCTTAT
AAGCTGCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTTGTGCTTGTTCCCCTGTTT
AAATGTACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACAGAACCGTATTGTTAAATCTT
TCCGATTTCAAAATAAACGCGTCATTCCGGTTTAGATCGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4DI12TF U 1
AF RR4DS10TF U 1
AF RR4DI12JQ C 2
AF RR4DS10JQ C 149
AF RR4B253JQ C 171
AF RR4B253TF U 171
BS 1 211 RR4DI12TF
BS 212 212 RR4DS10TF
BS 213 634 RR4DI12TF
BS 635 665 RR4DS10TF
BS 666 823 RR4B253TF

RD RR4DI12TF 634 0 0
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ACCGGGATTTGCTAGAGCACTTGCTTTTTATGTA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4DS10TF 665 0 0
AATCC
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GCGTGATCGTCCTACTTATGAACTACGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATGCAAAACC
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QA 6 665 6 665
DS 

RD RR4DI12JQ 788 0 0
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CACCAAGATTTATCACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGAT
CAACCAGACTTGGAGTCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCA
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GCGTGATCGTCCTACTTATGAACTACGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATGCAAAACC
AGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAATATGGTTC
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GCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTTGTGCTTGTTCCCCTGTTTAAATG
TACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACAGAACCGTATTGTTAAATCTTTCCGA
TT
TC

QA 5 786 5 786
DS 

RD RR4DS10JQ 641 0 0
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ATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCCGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATCACCCTAATG
TTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTGGAGTCCTATGT
TTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATCCAAACCCAT
CTGATCCTTTGAATGGAGAAGCTGCTGCATTGATGATGCGTGATCGTCCTACTTATGAAC
TACGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATGCAAAACCAGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGT
CTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAATATGGTTCTGATGACAATGAAGATGATGATG
ATGTTGCAATTGCAGGCAACCCAGATCCTTAAACCGGGATTTGCTAGAGCACTTGCTTTT
TATGTATATCATGCATTTCTATTTATGCTTATAAGCTGCCGAACTGTGAAATCTGTCTGC
TGTTTCTCCCTTTTGTGCTTGTTCCCCTGTTTAAATGTACCGGTTCCGGACGTTTGTGTA
CATTATTAGACAGAACCGTATTGTTAAATCTTTCCGATT
CC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4B253JQ 649 0 0
G
GAAGGAGGAGTGTG*AAGATAAGGGTTGAGCTTCCAGATGCTTATCCTTACAAATCTCCT
TCCGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATCACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTT
TGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTGGAGCCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAG
ACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATCCAAACCCATCTGATCCTTTGAATGGAGAAGCT
GCTGCATTGATGATGCGTGATCGTCCTACTTATGAACTACGAGTTAAAGAATACTGTGAG
AAGTATGCAAAACCAGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGTCTAGCGAT*AAGAGCTAAGTGAT
GAGGAATATGGTTCTGATGACAATGAAGATGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCA
GATCCTTAAACCGGGATTTGCTAGAGCACTTGCTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATT
TATGCTTATAAGCTGCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTTGTGCTTGTT
CCCCTGTTTAAATGTACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACAGAACCGTATTG
TTAAATCTTTCCGATTTCAAAATAAACGCGTCATTCCGGTTTAGATCG

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR4B253TF 653 0 0
G
GAAGGAGGAGTGTG*AAGATAAGGGTTGAGCTTCCAGATGCTTATCCTTACAAATCTCCT
TCCGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATCACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTT
TGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTGGAGCCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAG
ACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATCCAAACCCATCTGATCCTTTGAATGGAGAAGCT
GCTGCATTGATGATGCGTGATCGTCCTACTTATGAACTACGAGTTAAAGAATACTGTGAG
AAGTATGCAAAACCAGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGTCTAGCGAT*AAGAGCTAAGTGAT
GAGGAATATGGTTCTGATGACAATGAAGATGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCA
GATCCTTAAACCGGGATTTGCTAGAGCACTTGCTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATT
TATGCTTATAAGCTGCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTTGTGCTTGTT
CCCCTGTTTAAATGTACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACAGAACCGTATTG
TTAAATCTTTCCGATTTCAAAATAAACGCGTCATTCCGGTTTAGATCGAAAA

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 5

CO CL1559Contig1 973 5 17 U
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAAAAA
AAAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCG
GCGTCTCATTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTC
TCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCGCCGTCTTAGCCTAC
TCACGCCCCGACGGCAACTCTCTCCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGTATAGACGGGATCTAC
TGTACCTTCCTAGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGACTAACG
GGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCGAACGCTGCGCGACCGT
GGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTGGTG
TACGATACTCAGAGCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCAGATGGAGGGGAGAGTCTT
TACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATCATAAAG
CAAGGATGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACA
GGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAGGAACGAGATGAAGGCGATGCCGAGGATTGATAGT
GAAGGTGTGTTGTGTGGTGCTAATTTCAAAGTGGATGCTTGTTCTAAGGTTAATGGCATT
CCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTTGCTAACTCTCGTTAACTTTCTTCTTAT
GATTGTAGCTCTTGAGTTGTTCTGCTCCTCTCTTGTTGCACTTTCTTTTTACCTGCTTTG
TTTTATGTAATTATTAGACCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATCTTAC
ATTGCAAAGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 0 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ25TF U 1
AF RR4CV74TF U 3
AF RR4BE51JQ C 134
AF RR4AZ25JQ C 218
AF RR4BK36TF U 794
BS 1 63 RR4AZ25TF
BS 64 64 RR4CV74TF
BS 65 682 RR4AZ25TF
BS 683 688 RR4CV74TF
BS 689 689 RR4BE51JQ
BS 690 697 RR4CV74TF
BS 698 698 RR4AZ25JQ
BS 699 699 RR4BE51JQ
BS 700 706 RR4CV74TF
BS 707 707 RR4BE51JQ
BS 708 713 RR4CV74TF
BS 714 714 RR4BE51JQ
BS 715 722 RR4CV74TF
BS 723 724 RR4BE51JQ
BS 725 742 RR4CV74TF
BS 743 793 RR4BE51JQ
BS 794 973 RR4BK36TF

RD RR4AZ25TF 682 0 0
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAAAAA
AAA*TGTTGGCAATATTTCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCG
GCGTCTCATTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTC
TCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCGCCGTCTTAGCCTAC
TCACGCCCCGACGGCAACTCTCTCCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGTATAGACGGGATCTAC
TGTACCTTCCTAGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGACTAACG
GGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCGAACGCTGCGCGACCGT
GGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTGGTG
TACGATACTCAGAGCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCAGATGGAGGGGAGAGTCTT
TACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATCATAAAG
CAAGGATGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACA
GGGCTTAAGAGCTTTGAGCATC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4CV74TF 742 0 0
GGACCTCACCA
AAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAAAAAAAAATGTTGGCAA
TATTTCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCGGCGTCTCATTCCT
CCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTCTCCCTCCACGAGG
ACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCGCCGTCTTAGCCTACTCACGCCCCGACG
GCAACTCTCTCCGCAAGAGGCCGTTCTGCGGTATAGACGGGATCTACTGTACCTTCCTAG
GCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGACTAGCGGGGAAGAACACGA
GCGTGGCGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCGAACGCTGCGCGACCGTGGTCCTTACCCTG
CTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTGGTGTACGATACTCAGA
GCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCAGATGGAGGGGAGAGTCTTTACTGGGGGATCT
CCGGTGATGGTTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATCATAAAGCAAGGATGTGCTA
AATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACAGG*CTTAAGAGCT
TTGAGCATCCGAGGA*CGAGATGA**GCGATGCTGAGGAT*GATAGTGA**GTGTGTTGT
GTGGTGCTA
TT

QA 12 740 12 740
DS 

RD RR4BE51JQ 825 0 0
CCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTCTCCCTCCACGAGG
ACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTC*GCCGTCTTAGCCTACTCACGCCCCGACG
GCAACTCTCTCCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGTATAGACGGGATCTACTGTACCTTCCTAG
GCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGACTAACGGGGAAGAACACGA
GCGAGGTGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCGAACGCTGCGCGACCGTGGTCCTTACCCTG
CTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTGGTGTACGATACTCAGA
GCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCAGATGGAGGGGAGAGTCTTTACTGGGGGATCT
CCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATCATAAAGCAAGGATGTGCTA
AATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACAGGGCTTAAGAGCT
TTGAGCATCCGAGGAACGAGATGACGGCGATGCCGAGGATTGATAGTGAAGGTGTGTTGT
GTGGTGCTAATTTCAAAGTGGATGCTTGTTCTAAGGTTAATGGCATTCCTAGGAGAGGAA
GTGAAGCTAACTGGGCTCTTGCTAACTCTCGTTAACTTTCTTCTTATGATTGTAGCTCTT
GAGTTGTTCTGCTCCTCTCTTGTTGCACTTTCTTTTTACCTGCTTTGTTTTATGTAATTA
TTAGACCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATC
TT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4AZ25JQ 739 0 0
GCGACTC
CGCCGTCTTAGCCTACTCACGCCCCGACGGCAACTCTCTCCGCAAGAGGCTGTTCTGCGG
TATAGACGGGATCTACTGTACCTTCCTAGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCG
ACAGTACGGACTAACGGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCG
AACGCTGCGCGACCGTGGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAG
CTTCGCCTTCGTGGTGTACGATACTCAGAGCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCAGA
TGGAGGGGAGAGTCTTTACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGA
TGTGAAGATCATAAAGCAAGGATGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTAT
GTTTCACAGTGAGACAGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAGGAACGAGATGAAGGCGAT
GCCGAGGATTGATAGTGAAGGTGTGTTGTGTGGTGCTAATTTCAAAGTGGATGCTTGTTC
TAAGGTTAATGGCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTTGCTAACTCTCG
TTAACTTTCTTCTTATGATTGTAGCTCTTGAGTTGTTCTGCTCCTCTCTTGTTGCACTTT
CTTTTTACCTGCTTTGTTTTATGTAATTATTAGACCTTTGATGCCATATTAATAAAGAAA
CTAAATTGCATC

QA 8 739 8 739
DS 

RD RR4BK36TF 180 0 0
GTGAAGCTAACTGGGCTCTTGCTAACTCTCGTTAACTTTCTTCTTATGATTGTAGCTCTT
GAGTTGTTCTGCTCCTCTCTTGTTGCACTTTCTTTTTACCTGCTTTGTTTTATGTAATTA
TTAGACCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATCTTACATTGCAAAGAGCT

QA 1 180 1 180
DS 



AS 2 6

CO CL1560Contig1 751 4 13 U
GGAAGAAAAAAAGAGTTAGCACACAAAAATAAGGAAGGGAAACCGAACCCACTCCGCCGT
TCAGGTCCAATCGTCGTAGGAACTAACTAAAAGGTATTATTAGGGTTCTCTTCCCCCCAA
ATCGTGGCCATTTCATTTCACAACCACCCCTAAAAACCTAATGTTGTCTGCTCTCCGATC
TCGCTCCTCTTCTC**CTCAAATCGCCACCATCACCTTCACTTCTAGATCAATCATGGAA
GAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTCTCTTCCTCTTCTTCCGCCGC
CCGTGACATCTCAGAGGTCCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGACGTGAA
AGCGGACAACGTGATTGTGATTCCGACGGAGAACCAGTCTTGCTGGGCCGACGTCACAAT
CATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAG
GGCTAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTGCAAGGCTACGA
TACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGC
CAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAATGATAA
CTCAGATAAGGATTTACAAAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCCAAAAA
GAAGAATCCGGCTAAAGTGAGCTCTTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI40TF U 1
AF RR4BJ95TF U 54
AF RR4CC04TF U 54
AF RR4CC04JQ C 54
BS 1 194 RR4CI40TF
BS 195 196 RR4CC04TF
BS 197 285 RR4CI40TF
BS 286 363 RR4BJ95TF
BS 364 364 RR4CC04TF
BS 365 419 RR4BJ95TF
BS 420 420 RR4CC04TF
BS 421 505 RR4BJ95TF
BS 506 506 RR4CC04TF
BS 507 638 RR4BJ95TF
BS 639 639 RR4CC04TF
BS 640 719 RR4BJ95TF
BS 720 751 RR4CC04JQ

RD RR4CI40TF 285 0 0
GGAAGAAAAAAAGAGTTAGCACACAAAAATAAGGAAGGGAAACCGAACCCACTCCGCCGT
TCAGGTCCAATCGTCGTAGGAACTAACTAAAAGGTATTATTAGGGTTCTCTTCCCCCCAA
ATCGTGGCCATTTCATTTCACAACCACCCCTAAAAACCTAATGTTGTCTGCTCTCCGATC
TCGCTCCTCTTCTCTCCTCAAATCGCCACCATCACCTTCACTTCTAGATCAATCATGGAA
GAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTCTCTTC

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR4BJ95TF 673 0 0
GG
GCCGTTCAGGTCCAATCGTCGTAGGAACTAACTAAAAGGTATTATTAGGGTTCTCTTCCC
CCCAAATCGTGGCCACTACATTTCACAACCACCCCTAAAAACCTAATGTTGTCTGCTCTC
CGATCTCGCTCCTCTTCTCTCCTCAAATCGCCACCATCACCTTCACTTCTAGATCAATCA
TGGAAGAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTCTCTTCCTCTTCTTCC
GCCGCCCGTGACATCTCAGAGGTCCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGAC
GTGAAAGCAGACAACGTGATTGTGATTCCGACGGAGAACCAGTCTTGCTGGGCCGACGTC
ACAACCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTC
TACAGGGCTAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGGAACATGTAATGCTTCCTTGTGTGCAAGGC
TACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAG
AAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGGACCTGCTTCAGCTAAT
GATAACTCAGATAAGGATTTACAAAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCC
AAAA
GAAGAAT

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4CC04TF 666 0 0
GG
GCCGTTCAGGTCCAATCGTCGTAGGAACTAACTAAAAGGTATTATTAGGGTTCTCTTCCC
CCCAAATCGTGGCCATTTCATTTCACAACCACCCCTAAAAACCTAATGTTGTCTGCTCTC
CGATCTCGCTCCTCTTCTC**CTCAAATCGCCACCATCACCTTCACTTCTAGATCAATCA
TGGAAGAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTCTCTTCCTCTTCTTCC
GCCGCCCGTGACATCTCAGAGGTCCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGAC
GTGAAAGCGGACAACGTGATTGTGATTCCGACGGAGAACCAGTCTTGCTGGGCCGACGTC
ACAATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTC
TACAGGGCTAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTGCAAGGC
TACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAG
AAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAAT
GATAACTCAGATAAGGATTTACAAAACGCTTTTGTTAAG*TCCGACCAATTAACAACTCC
AAAA

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4CC04JQ 698 0 0
GG
GCCGTTCAGGTCCAATCGTCGTAGGAACTAACTAAAAGGTATTATTAGGGTTCTCTTCCC
CCCAAATCGTGGCCATTTCATTTCACAACCACCCCTAAAAACCTAATGTTGTCTGCTCTC
CGATCTCGCTCCTCTTCTC**CTCAAATCGCCACCATCACCTTCACTTCTAGATCAATCA
TGGAAGAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTTTCTTCCTCTTCTTCC
GCCGCCCGTGACATTTCAGAGGTCCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTTTCCGAC
GTGAAAGCGGACAACGTGATTGTGATTCCGACGGAGAACCAGTCTTGCTGGGCCGACGTC
ACAATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTC
TACAGGGCTAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTGCAAGGC
TACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAG
AAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAAT
GATAACTCAGATAAGGATTTACAAAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCC
AAAAAGAAGAATCCGGCTAAAGTGAGCTCTTAATCC

QA 3 698 3 698
DS 



CO CL1560Contig2 893 2 4 U
GGGAACACACTTCGCCGTTCAGGTCCAATCGTCGTAGGACTAAAAGGTATTATTAGGGTT
CTCTTCCAACCAAATCGTGGCCATTTCATTTCATAACCACGCCTAAAAACCTAATGTTGT
CTGCTCTCCGATCTCGCTGCTCTTCTCTCCTCAAATCGCCACCATCATCTTCACTTCTAG
ATCAGTCATGGAAGAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTCTCTTCCT
CTTCTTCCGCCGCCGGCTCCGGCGCTCGTGATATCTCAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAG
TGGAGAAGATACTCTCCGGCGTGAAGGCAGACAACGTGATTGTGATTCCGACGGAGAACC
AGTCTTGCTGGGCCGACGTTACGATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGA
ACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTGA
TGCTTCCTTGTGTGCAAGGCTACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTG
TGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTG
GTGAACCTGCTTCAGCTAATGATAATTCAGATAAGGATTTACAAAACGCTTTTGTTAAGG
TCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCCGGCTAAACTGAGCTCTTAATCCAGAA
AAAAAAACAAAAAGCCACTGTTCGATTGACAAACAGCTTGTAATAAACATATCCTCATTT
AAGGATATACTCCTAGATGGGTTGAGGATGGGTTTCTTTTTCTTCTAAATTTTTAAAAAT
ATTTGATGGAGAAAACATGGTGGAATACAAAAACCGTTGGAAAGTATTCCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GG07TF U 1
AF RR4GG07JQ C 108
BS 1 657 RR4GG07TF
BS 658 658 RR4GG07JQ
BS 659 680 RR4GG07TF
BS 681 893 RR4GG07JQ

RD RR4GG07TF 689 0 0
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CTCTTCCAACCAAATCGTGGCCATTTCATTTCATAACCACGCCTAAAAACCTAATGTTGT
CTGCTCTCCGATCTCGCTGCTCTTCTCTCCTCAAATCGCCACCATCATCTTCACTTCTAG
ATCAGTCATGGAAGAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCCTTCTCTTCCT
CTTCTTCCGCCGCCGGCTCCGGCGCTCGTGATATCTCAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAG
TGGAGAAGATACTCTCCGGCGTGAAGGCAGACAACGTGATTGTGATTCCGACGGAGAACC
AGTCTTGCTGGGCCGACGTTACGATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGA
ACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTGA
TGCTTCCTTGTGTGCAAGGCTACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTG
TGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTG
GTGAACCTGCTTCAGCTAATGATAATTCAGATAAGGATTTACAAAACGCTTTTGTTA*GG
TCCGACCAATTAACAACTCC
CAAAAGAAG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GG07JQ 786 0 0
AAA
CTAATGTTGTCTGCTCTCCGATCTCGCTGCTCTTCTCTCCTCAAATCGCCACCATCATCT
TCACTTCTAGATCAGTCATGGAAGAAGCTGCTAGCTCTCTCCGCTTCGAATCCTCCCTCC
TTCTCTTCCTCTTCTTCCGCCGCCGGCTCCGGCGCTCGTGATATCTCAGAGGTTCTGTCC
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ACGGAGAACCAGTCTTGCTGGGCCGACGTTACGATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGG
CACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAG
AAACATGTGATGCTTCCTTGTGTGCAAGGCTACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTAC
GGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGT
CTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAATGATAATTCAGATAAGGATTTACAAAACGCT
TTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCCGGCTAAACTGAGCTCT
TAATCCAGAAAAAAAAACAAAAAGCCACTGTTCGATTGACAAACAGCTTGTAATAAACAT
ATCCTCATTTAAGGATATACTCCTAGATGGGTTGAGGATGGGTTTCTTTTTCTTCTAAAT
TTTTAAAAATATTTGATGGAGAAAACATGGTGGAATACAAAAACCGTTGGAAAGTATTCC
TAC

QA 4 786 4 786
DS 



AS 1 5

CO CL1561Contig1 1266 5 18 U
GGAAACGGCTCTCGATCTTCGTCACTGTTCTCGAGATTCTCTGTGATTTTTTTTTTTTCT
CTCTCTCTCGTTATTCAATTCTCGGATTAGCTTTTTTGGTTTCCTTGTTGTTGTCTGGAT
CATCGAAGAAGGATGGTAGCTGATAGCAAATCCGACCTTTCATTGCCAAAAACTTTCGCC
TGCAGTGCCTTCGCTGCCTGCGTCGGCGAGGTATGTACGATTCCGTTGGACACTGCGAAA
GTGAGGCTTCAGCTCCAAAAGTCTGCCATTGCTGGAGATGTTACTCTGCCTAAGTATCGT
GGATTACTCGGGACTGTTGGTACCATAGCAAGAGAAGAAGGGCTTCGTTCACTATGGAAA
GGTGTTGTACCTGGCTTACATCGTCAATGCCTCTTTGGAGGTCTTAGGATCGGAATGTAT
GAGCCGGTCAAAAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGCGATGTTCCTTTGAGCAAG
AAGATCCTTGCTGGTTTGACCACAGGTGCTCTGGGTATCATGGTAGCGAATCCCACTGAT
CTTGTGAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTGCCAAGACGCTAT
ACTGGATCTTTGAATGCCTATTCAACCATTGTCAGACAGGAAGGAGTCAGAGCACTTTGG
ACTGGTCTTGGACCTAATGTTGCTAGAAACGCAATTATCAATGCTGCTGAATTAGCGAGT
TACGATCAAGTGAAGCAGACAATCTTGAAGATTCCGGGTTTCACGGATAACATTGTCACG
CATATTCTATCTGGACTGGGAGCAGGATTCCTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCTGTTGAC
GTGGTTAAGTCAAGAATGATGGGAGATCCTTCTTACAAAGGCACTATCGACTGCTTCGTC
AAAACTCTGAAGGCTGACGGACCCATGGCATTTTACAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGA
CGCCTCGGCTCATGGAACGTCATCATGTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTC
CGGGAACTAGAATCGTCTAAGAAATAATAGTGAGACAAAATAAAAAAATTTATGCAGAGA
GAATAAAAAAAAACATTGTTTTCTTCTTAATTTCGGTGGTCGAGAGAGAGAGAGAGAGTG
TTGCCAGAACATAATCGAATATTGTTTTGGAATAGAGACTTGATTTCGAGCAAACTGTGA
AATAAATTTCTATGGGTGGCTGTACCATTCAAACAATCATTAAAATCATAATACATTTTT
TCGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC90TF U 1
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CT
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CATCGAAGAAGGATGGTAGCTGATAGCAAATCCGACCTTTCATTGCCAAAAACTTTCGCC
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GTGAGGCTTCAGCTCCAAAAGTCTGCCATTGCTGGAGATGTTACTTTGCCTAAGTATCGT
GGATTACTCGGGACTGTTGGTACCATAGCAAGAGAAGAAGGGCTTCGTTCACTATGGAAA
GGTGTTGTACCTGGCTTACATCGTCAATGCCTCTTTGGAGGTCTTAGGATCGGAATGTAT
GAGCCGGTCAAAAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGCGATGTTCCTTTGAGCAAG
AAGATCCTTGCTGGTTTGACCACAGGTGCTCTGGGTATCATGGTAGCGAATCCCACTGAT
CTTGTGAAAGTTAGACTTCAGTCTGAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTGCCAAGACGCTAT
ACTGGATCTTTGAATGCCTATTCAACCATTGTCAGACAGGAAGGAGTCAGAGCACTTTGG
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TACGATCAAGTGAAGCAGACAATCTTGAAGA
TT

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GTGAGGCTTCAGCTCCAAAAGTCTGCCATTGCTGGAGATGTTACTCTGCCTAAGTATCGT
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AAGATCCTTGCTGGTTTGACCACAGGTGCTCTGGGTATCATGGTAGCGAATCCCACTGAT
CTTGTGAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTTCCAAGACGCTAT
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DS 

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TGTTGACGTGGTTAAGTCAAGAATGATGGGAGATCCTTCTTACAAAGGCACTATCGACTG
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DS 

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AGAATAAAAAAAAACATTGTTTTCTTTTTAATTTCGGTGGTCGAGAGAGAGAGAGAGAGT
GTTGCCAGAACATAATCGAATATTGTTTTGGAATAGAGACTTGATTTCGAGCAAACTGTG
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TTCGTCG

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DS 



AS 1 6

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GCTCTGGCTCTTGGGATCTGGGGAATCTGTGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGC
ATCCCTAACCTCTACAGCCTCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCC
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AACGCAGCTTT*AGGGTTTCTGGAGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGA
CAAGTACGGTCCAGAAGCGTTTCTTGTGAACTTCACAGCCATTGTCACCATTCTCTTTGG
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TTGTTGCTACTTGGTGCTATCAACAGATCATATTCTTATTTGATGTATTTGTAGTGAAAA
ACACTTTGTGTTTGTGGTTTCGCTGATTATGAGTTTGCTACTTCTGGTGTGTAAAATCTT
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ATGATAGTGAGATAACGGTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAATCGCTTCCCTTGGAGAAACCGGTGAAGAAGCTGATCCATCTTATTCTCCATGCCATT
GCTCTGGCTCTTGGGATCTGGGGAATCTGCGCAGCCTTCAAGAACCACAATGAAAGTGGC
ATCCCTAACCTCTACAGCCTCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCC
TTCCAGTGGGTGTACAGCTTCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGGTCACCGAATCTGAGA
AGCGGTTTGCTTCCGTGGCACGCAATTCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGG
AACGCAGCTTTTAGGGTTTCTGGAGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGA
CAAG

QA 1 664 1 664
DS 

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GG
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AAAAAGGAAACAATAGAGTTCAGTTATGGCTGTCGGGATAAACGCGATGCCGGTGACGTT
TGCGGCCCACGCGCTGGCTGTAATAGCGGCGATTATGGTGCTGGTTTGGAATATCAGCTA
CAGAGGTGGTCTGGCTTGGGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAACCTGCATCCTGT
TCTGATGCTCATTGGATTTGTAATCTTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCT
CCTGTTGGAGAAACCAGTGAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCTGGC
TCTTGGGATCTGGGGAATCTGTGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCCTAA
CCTCTACAGCCTCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCAGTG
GGTGTACAGCTTCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGGTTT
GCTTCCGTGGCACGCAATTCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGGAACGCAGC
TTT*AGGGTTTCTGGAGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGACAAGT

QA 3 659 3 659
DS 

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GAACC
ATCGAGATTAATCTGACAACAGAAGTAGAAGAAGAGGAGAGAAAAAGACAAGAACAA*AA
AAAAAGGAAACAAAAGAGTTCAGTTATGGCTGTCGGGATAAACGCGATGCCGGTGACGTT
TGCGGCCCACGCGCTGGCTGTAATAGCGGCGATTATGGTGCTGGTTTGGAATATCAGCTA
CAGAGGTGGTCTGGCTTGGGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAACCTGCATCCTGT
TCTGATGCTCATTGGATTTGTAATCTTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCT
CCCGTTGGAGAAACCAGTGAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCTGGC
TCTTGGGATCTGGGGAATCTGTGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCCTAA
CCTCTACAGCCTCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCAGTG
GGTGTACAGCTTCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGGTTT
GCTTCCGTGGCACGCAATTCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGGAACGCAGC
TTT*AGGGTTTCTGGAGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGACAAGTACG
*TCCAGAAGCGTTTCTTGTGAACTTCACAGCCATTGTCAC*ATTCTCTTTGGTGCCTTAG
TGGTGCTCACTGCTTCTGCTAAGTCTCC*TCTGCCAT*GATGATGCTGACA*CTACAGCT
ACTCTGCTATATGAAA*CGCTTTGTACATTTCCGCAGTTC
TCGCATATC

QA 6 825 6 825
DS 

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TTCTGGAGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGACAAGTACGGTCCAGAAG
CGTTTCTTGTGAACTTCACAGCCATTGTCACCATTCTCTTTGGTGCCTTAGTGGTGCTCA
CTGCTTCTGCTAAGTCTCCCTCTGCCATTGATGATGCTGACAACTACAGCTACTCTGCTA
TATGAAAACGCTTTGTACATTTCCGCAGTTCCTCGCATACCTTTTGTTGCTACTTGGTGC
TATCAACAGATCATATTCTTATTTGATGTATTTGTAGTGAAAAACACTTTGTGTTTGTGG
TTTCGCTGATTATGAGTTTGCTACTTCTGGTGTGTAAA*TCTTCAGTAATTATTGTTGAA
AATTTGCAACAGTTGGTAAAG
CC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4FK33JQ 689 0 0
TTCTCCATGCCATTGCTCTGGCTCTTGGGATCTGGGGAATCTGTGCAGCCTTCAAGAACC
ACAACGAAAGTGGCATCCCTAACCTCTACAGCCTCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCA
TTTCTCTTTATGCCTTCCAGTGGGTGTACAGCTTCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGCT
CACCAAACCTTAGAAGCGGTTTGCTTCCGTGGCACGCAATTCTAGGCCTATTTGTTTATA
TTCTTGCGGTTGGGAACGCAGCTTT*AGGGTTTCTGGAGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGT
GGTGCTAAGCTTGACAAGTACGGTCCAGAAGCGTTTCTTGTGAACTTCACAGCCATTGTC
ACCATTCTCTTTGGTGCCTTAGTGGTGCTCACTGCTTCTGCTAAGTCTCCCTCTGCCATT
GATGATGCTGACAACTACAGCTACTTTGCTATATGAAAACGCTTTGTACATTTCCGCAGT
TCCTCGCATATCTTTTGTTGCTACTTGGTGCTATCAACAGATCATATTCTTATTTGATGT
ATTTGTAGTGAAAAACACTTTGTGTTTGTGGTTTCGCTGATTATGAGTTTGCTACTTCTG
GTGTGTAAAATCTTCAGTAATTATTGTTGAAAATTTGCAACAGTTGGTAAAGTTTTCATA
TTGCCATTTAACAGAGTGGTAGTTATGTG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4AM07JQ 316 0 0
ATTT
TGCTATATGAAAACGCTTTGTACATTTCCGCAGTTCCTCGCATATCTTTTGTTGCTACTT
GGTGCTATCAACAGATCATATTTTTATTTGATGTATTTGTAGTGAAAAACACTTTGTGTT
TGTGGTTTCGCTGATTATGAGTTTGCTACTTCTGGTGTGTAAAATCTTCAGTAATTATTG
TTGAAAATTTGCAACAGTTGGTAAAGTTTTCATATTGCCATTTAACAGAGTGGTAGTTAT
GTGTTAAGTCTCTTTGTAGCAACTTGTAACATGTTGTAATGTGTCATTATGATAGTGAGA
TAACGGTATTCC

QA 5 316 5 316
DS 



AS 1 3

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ATTGCAAAAATCTGAAGAAAAA*CCAGTCTGATATACAAAAACTGAGATTCAAACGATGA
CAAGATAAAAAGAGTTTCTTGTAAGGGAGTTCTCTCACTTCTTCTCTTCCTTCTCAGCAT
CAGCAGCTCTCTTGGCTCTAGCACCGGCGTGTCTCTTGTTTGTGCGCTCTAGACGGATCT
TGTCATAAGCCTTGAACGATTTCATCTCAGCGGTAAGCTTCACAAGCTCAGTTGCTTGCT
TCTCACGGACTATTGGCATGTAGTCTCCTTGGACTTGAGTGGCATTGGCCAACTCTTATG
CAGTAGAATCACCAGCCTTGGTCTTCCTGGCACGACGAGGGAAGATGACCAACTTAGCCT
TGTAGGTTTTGAGCCTCTGGACATTGGACTGAAGACCCTCGAGAGATCTGTTCTTGCGAC
GATGGTCAACAGAAATACCGATGGTTGGTGCCAACTTCTTGGGGATTCCAGCAGACTTGA
GCTCTTCAAGAGTGAAACCTTTACCGGTTCGGACTTTCATGTTGTACTTGAGAGTCTGAC
CATGCACAACAGGGCGGAGAGGTCCAGCAGTAGGACGAGGGAAGATCTTCACAGCCTTCT
TTTGTCTCGCAACTCTTCTCCTTGTTTTCCTGGCAGGCTGATTGAACCAAGTCTTGACAT
AGTTCTGCCAGTGCTTCTTGAAGTGACCATTGGGGATGACATTGTTGTGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL34JQ U 59
AF RR4C249JQ U 17
AF RR4CL34TF C 1
BS 1 16 RR4CL34TF
BS 17 77 RR4C249JQ
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BS 233 266 RR4CL34JQ
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BS 692 774 RR4CL34TF

RD RR4CL34JQ 208 0 0
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AAAAA*CCAGTCTGATATACAAAAACTGAAATTCAAACGATGACAAGATAAAAAGAGTTT
CTTGTAAGGGAGTTCTCTCACTTCTTCTCTTCCTTCTCAGCATCAGCAGCTCTCTTGGCT
CTAGCACCGGCGTGTCTCTTGTTTGTGCGCTCTAAACGGATCTTGTCATAAGCCTTGAAC
GATTTCATC

QA 20 208 20 208
DS 

RD RR4C249JQ 675 0 0
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TCTAGCACCGGCGTGTCTCTTGTTTGTGCGCTCTAGACGGATCTTGTCATAAGCCTTGAA
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TCTCCTTGTTTTCCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4CL34TF 774 0 0
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CAAGATAAAAAGAGTTTCTTGTAAGGGAGTTCTCTCACTTCTTCTCTTCCTTCTCAGCAT
CAGCAGCTCTCTTGGCTCTAGCACCGGCGTGTCTCTTGTTTGTGCGCTCTAGACGGATCT
TGTCATAAGCCTTGAACGATTTCATCTCAGCGGTAAGCTTCACAAGCTCAGTTGCTTGCT
TCTCACGGACTATTGGCATGTAGTCTCCTTGGACTTGAGTGGCATTGGCCAACTCTTCTG
CAGTAGAATCACCAGCCTTGGTCTTCCTGGCACGACGAGGGAAGATGACCAACTTAGCCT
TGTAGGTTTTGAGCCTCTGGACATTGGACTGAAGACCCTCGAGAGATCTGTTCTTGCGAC
GATGGTCAACAGAAATACCGATGGTTGGTGCCAACTTCTTGGGGATTCCAGCAGACTTGA
GCTCTTCAAGAGTGAAACCTTTACCGGTTCGGACTTTCATGTTGTACTTGAGAGTCTGAC
CATGCACAACAGGGCGGAGAGGTCCAGCAGTAGGACGAGGGAAGATCTTCACAGCCTTCT
TTTGTCTCGCAACTCTTCTCCTTGTTTTCCTGGCAGGCTGATTGAACCAAGTCTTGACAT
AGTTCTGCCAGTGCTTCTTGAAGTGACCATTGGGGATGACATTGTTGTGCCTCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 2 5

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TTACATACAGAAAGAGAGGACTTTCGAAATAAATTCAAGAAGAAATAATGCATGCAAGAC
ATACATTTATACACATGTATTTTCAGTCAAAAGTATAGAATAATAGTTGGCTGCCACAAA
ATATTGGGCCCAGACGATAAGCGTCCCACTCTCCATGGTTCCGAATTTAGAGGCCGTCCC
GTCCAAGGTCAAGGTCGTTTCTGCACCAGGTTTAACCATCAATGTAATGAATGGTCGACC
TACGTCGATTGTGACTTTCTCACGGTATACACCAGGAGCCAACTTGATGATCACACGCTT
TGTGTTCCCTGTCGGAATGCTCTTGATCGCTTCATTCATTGTCTTAAAATCACCGCCTCC
TCCTTGATTCACGGTAATAATCTGTGGCGATGCTTCAGCTGCATCCAGGGCAGGGTCGAG
TGTGCCTCGCCTCCCTGAATAGGGTTGAATGTTGGCCTTGAACCATGCCTCGACTCGGCC
TTTGTCTTCTGGAATCGGAGTTATATCGTTGGCGACAACCGCCGGTAAGGCAAAAATAAC
AAGAAACGCAATCATGGTCAGAAAAATGTAACCCATCTCTTATTTTATTTTTTATTTTTT
ATTTTTTTAAGATAAAAGAAAGCAAAATAATAATATATATATAAGAAAATTGTTATTACT
AGTTTTATTAAACTAGTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A853TF C 1
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TCACGGTATACACCAGGAGCCAACTTGATGATCACACGCTTTGTGTTCCCTGTCGGAATG
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ATCTGTGGCGATGCTTCAGCTGCATCCAGGGCAGGGTCGAGTGTGCCTCGCCTCCCTGAA
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GTTATATCGTTGGCGACAACCGCCGGTAAGGCAAAAATAACAAGAAACGCAATCATGGTC
AGAAAAATGTAACCCATCTCTTATTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTTAAGATAAAAGA
AAGCAAAATAATAATATATATATAAGAAAATTGTTATTACTAGTTTTATTAAACTAGTTT
TATT

QA 1 544 1 544
DS 



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TATCGCCGTTGATCCTCATAGCGAGCGCTTGTCCTTGTGATCCTGCT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM79JQ U 1
AF RR4AM79TF C 1
AF RR4AJ42JQ U 1
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G
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C

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G
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TACATTTATACACATGTATTTTCAGTCGAAAGTATAGAATAATAGTTATGAGATGGGTGT
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TCTTCCGAAGATAAAATCATAGGTTCCCTCGATGTAACAGTCCTTGAAGAAATGGTTGCC
C

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QA 1 767 1 767
DS 



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TGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 

AF RR4H784TF U 1
AF RR4GL95TF U 46
AF RR4FQ47JQ C 46
AF RR4H784JQB C 162
AF RR4GL95JQ C 73
AF RR4FQ47TF U 46
BS 1 151 RR4H784TF
BS 152 152 RR4GL95TF
BS 153 250 RR4H784TF
BS 251 251 RR4GL95TF
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BS 725 725 RR4FQ47JQ

RD RR4H784TF 700 0 0
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TAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGC
GGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACCACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCA
CCACATCCAAAGTGTCGCCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGAT
TTGGAACTACGCATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGA
CGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGT
GTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCAC
TATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGT
CAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAATCCCATCCTC
CCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTTTGTGTGTGTCGGTT
TATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAAGAGGCTCATGTATGGTATTATTAATTACTAT
TACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTTAA

QA 1 700 1 700
DS 

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G
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GACGCCATTGGCCACCACATCCAAAGTGTCGCCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCAT
GGAGCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTTCAAGGAGAGG
AGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATG
GAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATC
ATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAAC
TACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAA
AAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTT
TGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTA
TTATTAATTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTTA

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR4FQ47JQ 680 0 0
G
CAACACAAAGAAGATAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCG
TTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGGACCACGTCTTTCCC
GACGCCATTGGCCACCACATCCAAAGTGTCGCCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCAT
GGAGCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTTCAAGGAGAGG
AGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATG
GAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATC
ATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAAC
TACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAA
AAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTT
TGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTA
TTATTAATTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTTAAAAAAGG
TTTATATGCTTTCATGTTC

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR4H784JQB 564 0 0
TTCCCGACGCCATTGGCCACCACATCCAAAGTGTCGCCGTCCACGACGGTGAATGGGACT
TTCATGGAGCCATCAAGATTTGGAACTACGCATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTTCAAGG
AGAGGAGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACC
CGATGGAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATG
ATATCATTTGCAAGATCACTATGATTTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCA
TCAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAG
CTTAAAAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTC
GTGTTTGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTA
TGGTATTATTAATTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTTAAA
AAAGGTTTATATGCTTTCATGTT
T

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4GL95JQ 653 0 0
GGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTA
CAAGCGATGGAGAAATGAGGACCACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCACCACATCCAAAG
TGTCGCCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGATTTGGAACTACAC
ATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGACGAGAACAATGC
TGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCAT
CTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGA
GAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGT
TGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCG
AACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTTTGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAA
TCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAATTACTATTACTGCTTGCGG
TTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTTAAAAAAGGTTTATATGCTTTCATGTT
C

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4FQ47TF 680 0 0
G
CAACACAAAGAAGATAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCG
TTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGGACCACGTCTTTCCC
GACGCCATTGGCCACCACATCCAAAGTGTCGCCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCAT
GGAGCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTTCAAGGAGAGG
AGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATG
GAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATC
ATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAAC
TACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAA
AAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTT
TGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTA
TTATTAATTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTTAAAAAAGG
TT*ATATGCTTTCATGTT
C

QA 2 679 2 679
DS 



AS 1 6

CO CL1566Contig1 682 6 10 U
GGTCGCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCG
ATGAAGCCAAGCAGGAGCGACGAGGTACCCGACCTGGATCAACAGATCAAGAACACCAAC
CAGATCAGAGCTGGTTTCGATTCCTTGGCTCCTAAACGAGCCACTAAACCCACCCGGAGC
GAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCT
GACAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGGTAATATTCTGCATGGAGGAGCTTCA
GCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGAT
AAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAA
GAGACCGTTATAGCCGCCGCTGCAATGAGTGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGC
AACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACCTTGCTACAGAAGCTTCG
TCTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCT
TCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAA
ATAAGTTTCTGACAAAAAAAAA


BQ
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A269TF U 130
AF RR4G733TF U 3
AF RR4A269JQ C 1
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AF RR4A269TFB U 1
AF RR4CP01TF U 1
BS 1 4 RR4A269TFB
BS 5 129 RR4G733TF
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BS 317 452 RR4G733TF
BS 453 453 RR4A269TFB
BS 454 528 RR4G733TF
BS 529 529 RR4A269TFB
BS 530 649 RR4G733TF
BS 650 671 RR4A269TFB
BS 672 682 RR4CP01TF

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CCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGACAAGTTC
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CAAGATG

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR4G733TF 647 0 0
GG
GCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCGATGA
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CAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGACA
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AACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCTTCTT
CCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAAT

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR4A269JQ 675 0 0
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TCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAA
ATAAGTTTCTG
TCAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4A269JQD 675 0 0
GGTCGCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCG
ATGAAGCCAAGCAGGAGCGACGAGGTACCCGACCTGGATCAACAGATCAAGAACACCAAC
CAGATCAGAGCTGGTTTCGATTCCTTGGCTCCTAAACGAGCCACTAAACCCACCCGGAGC
GAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCT
GACAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGGTAATATTCTGCATGGAGGAGCTTCA
GCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGAT
AAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAA
GAGACCGTTATAGCCGCCGCTGCAATGAGTGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGC
AACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACCTTGCTACAGAAGCTTCG
TCTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCT
TCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAA
ATAAGTTTCTG
TCAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4A269TFB 673 0 0
GGTCGCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCG
ATGAAGCCAAGCAGGAGCGACGAGGTACCCGACCTGGATCAACAGATCAAGAACACCAAC
CAGATCAGAGCTGGTTTCGATTCCTTGGCTCCTAAACGAGCCACTAAACCCACCCGGAGC
GAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCT
GACAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGGTAATATTCTGCATGGAGGAGCTTCA
GCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGAT
AAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAA
GAGACCGTTATAGCCGCCGCTGCAATGAGTGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGC
AACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACCTTGCTACAGAAGCTTCG
TCTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCT
TCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAA
ATAAGTTTCTG
TC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CP01TF 682 0 0
GGTCGCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCG
ATGAAGCCAAGCAGGAGCGACGAGGTACCCGACCTGGATCAACAGATCTAGAACACCAAC
CAGATCAGAGCTGGTTTCGATTCCTTGGCTCCTAAACGAGCCACTAAACCCACCCGGAGC
GAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCT
GACAAGTTCCAAACTCTCCGGTCACAAACTCATGGTAATATTCTGCATGGAGGAGCTTCA
GCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGAT
AAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGAAAGGAAGATGGCGGTGAA
GAGACCGTTATAGCCGCCGCTGCAATGAGTGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGC
AACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACCTTGCTTCAGAAGCTTCG
TCTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCT
TCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAA
ATAAGTTTCTGACAAAAAAAAA

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 6

CO CL1567Contig1 634 6 5 U
GAAACCAAAGGCGACATAGACGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGATGAGAGAGACGGTGAA
GTTGATAAGCATGGAAGGTTTCGAGTTCGTGATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCACA
GACTATAAGAAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTCGAAAGATGGCGTGGT
GACTTTCCCTGATATCAGCACAACAATTCTTGAGAAGATTTGCCAGTACTTCTATTGGTC
TCTTCAATACTCCAGAGGCAAAGAGACCGAGTTCCACATTGAGCCTGAGCTGACCTTGGA
GCTCATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAAGAGTTTATTAACATTATTAAACTC
TTTATTCTGTGTAGTGTAGTTTTTCTTTGTAACCATAAGTTGTGAATCCCCCGGAGCACT
TCGTGTGGGGTTATTATAAGTGTAAGCGTTTGACTCAAAAATGGTTTGTGCTTTAACTAT
TGAATAGCTCCGACGGATAGTTGTTCTTTTTTATTTACTAGTTATGACTATTGACCGCAC
CATCAATGTTCTTGTGGGGTTTTTAGTTGTTGCCTTTCAAACAGCTTAAGTTAAGCACAA
CATTTTATGCTAATGATGACTGGTTTTCGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F431JQ C 1
AF RR4F431TF U 1
AF RR4DD67TF U 5
AF RR4DD67JQ C 5
AF RR4EI43TF U 44
AF RR4EI43JQ C 84
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BS 357 357 RR4DD67TF
BS 358 478 RR4F431TF
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RD RR4F431JQ 478 0 0
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GACTATAAGAAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTCGAAAGATGGCGTGGT
GACTTTCCCTGATATCAGCACAACAATTCTTGAGAAGATTTGCCAGTACTTCTATTGGTC
TCTTCAATACTCCAGAGGCAAAGAGACCGAGTTCCACATTGAGCCTGAGCTGACCTTGGA
GCTCATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAAGAGTTTATTAACATTATTAACCTC
TTTATTCTGTGTAGTGTAGTTTTTCTTTGTAACCATAAGTTGTGAATCCCCCGGAGCACT
TCGTGTGGGGTTATTATAAGTGTAAGCGTTTGACTCAAAAATGGTTTGTGCTTTAACT

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DS 

RD RR4F431TF 478 0 0
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AAGAAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTCGAAAGATGGCGTGGTGACTTT
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CTGTGTAGTGTAGTTTTTCTTTGTAACCATAAGTTGTGAATCCCCCGGAGCACTTCGTGT
GGGGTTATTATAAGTGTAAGCGTTTGACTCAAAAATGGTTTGTGCTTTAACT

QA 7 478 7 478
DS 

RD RR4DD67TF 457 0 0
GG
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AAGCATGGAAGGTTTCGAGTTCGTGATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCACAGACTAT
AAGAAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTCGAAAGATGGCGTGGTGACTTT
CCCTGATATCAGCACAACAATTCTTGAGAAGATTTGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTTCA
ATACTCCAGAGGCAAAGAGACCGAGTTCCACATTTAGCCTGAGCTGACCTTGGAGCTTAT
GATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAAGAGTTTATTAACATTATTAAACTCTTTATT
CTGTGTAGTGTAGTTTTTCTTTGTAACCATAAGTTGTGAATCCCCCGGAGCACTTCGTGT
GGGGTTATTATAAGTGTAAGCGTTTGACTCAAAAA

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DS 

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GG
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AAGCATGGAAGGTTTCGAGTTCGTGATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCACAGACTAT
AAGAAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTCGAAAGATGGCGTGGTGACTTT
CCCTGATATCAGCACAACAATTCTTGAGAAGATTTGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTTCA
ATACTCCAGAGGCAAAGAGACCGAGTTCCACATTTAGCCTGAGCTGACCTTGGAGCTTAT
GATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAAGAGTTTATTAACATTATTAAACTCTTTATT
CTGTGTAGTGTAGTTTTTCTTTGTAACCATAAGTTGTGAATCCCCCGGAGCACTTCGTGT
GGGGTTATTATAAGTGTAAGCGTTTGACTCAAAAATGGTTTGTGCTTTAACTATTGAATA
GCTCCGACGGATAGTT*TTCTTTTTTATTTACTAGTTATGACTATTGACCGCACCA
AAAAAAA

QA 3 538 3 538
DS 

RD RR4EI43TF 591 0 0
GG
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CGCCATGGTTTCACAGACTATAAGAAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTC
GAAAGATGGCGTGGTGACTTTCCCTGATATCAGCACAACAATTCTTGAGAAGATTTGCCA
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AACATTATTAAACTCTTTATTCTGTGTAGTGTAGTTTTTCTTTGTAACCATAAGTTGTGA
ATCCCC*GGAGCACTTCGTGTGGGGTTATTATAAGTGTAAGCGTTTGACTCAAAAATGGT
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GACTATTGACCGCACCATCAATGTTCTTGTGGGGTTTTTAGTTGTTGCCTTTCAAACAGC
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QA 3 591 3 591
DS 

RD RR4EI43JQ 551 0 0
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CTCCAGGTGGGTTTTCGGAGTCGAAAGATGGCGTGGTGACTTTCCCTGATATCAGCACAA
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AGACCGAGTTCCACATTGAGCCTGAGCTGACCTTGGAGCTCATGATGGCTGCTAATTATC
TTCACACTTGAAAGAGTTTATTAACATTATTAAACTCTTTATTCTGTGTAGTGTAGTTTT
TCTTTGTAACCATAAGTTGTGAATCCCC*GGAGCACTTCGTGTGGGGTTATTATAAGTGT
AAGCGTTTGACTCAAAAATGGTTTGTGCTTTAACTATTGAATAGCTCCGACGGATAGTTG
TTCTTTTTTATTTACTAGTTATGACTATTGACCGCACCATCAATGTTCTTGTGGGGTTTT
TAGTTGTTGCCTTTCAAACAGCTTAAGTTAAGCACAACATTTTATGCTAATGATGACTGG
TTTTCGTGTCC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 6

CO CL1568Contig1 959 6 13 U
GGGATCCCAAAAAAAAAAAACGCCGCCTCATCGGAAACCTAACTAAGCCGATCTTCTCAA
CATGTCTCCAACGGAGGGATGCGCGACAAAAGGGATGAGTCTACTGACATTGAACGAAAG
GGAAACCACTACTAAGAGATCCAAACCACGAAAACGC*ACATTGGGAGAATTCGTGTAAA
GGGATATAGCATCGACCTTCCCCGAGATGATGTGGAAAGCGCGTTGAGAAAACATTTCTC
TTCATGTGGAGAGATCACGGATGTTTGTGTCCACGTACTCACGGATAATTTACTCAGCGA
TCGTGGTTTTATTTATTTTCTGGGAGGACAAGGCACAGTTGACAAGGCTATGCAACTTAG
TGGAACTGACGTTGGTGGATGGAATGTCATTGTTGAGCCTTATCCTTTTCTGGAATATGC
AGACTGGGACCCTGTTGCCTTTGTCCAAGGATATGACACTGGTCTTGGGAAGACTGAAAT
CAAGAGAATGTTGTTTAATCATTTCTCTTCATGTGGACAGATCATGGATATCGAGTTTCA
CAATAGCACCATCGGTGTAGCTTCTGTGTATCTTTATGGAGAAGGTGCAGAAGACAAGGT
GTTGGATCTTGATGGGTCCTACATGGGAGGATGCAAAATACTTGTTAAGCATATTATAAC
GAATGGAATATACACTGTCCACCCTCGTCGTCGTCATTATGGCTGGCCCAGGTAACTAGG
CTACTGCTGCGAGAAAACCTCTCGGATCTACTGGGAGAAGGTGAAGAGACAGACATCTAT
GTAGTTTGTGTTTGTGAAATAATGCAACGTTCTACTCTAAAACATTTAAAGCTATTTTCT
ATCTTCTGGATTTTAATATCGACTCTGATAATCATTTTCTGCTTTCAATCGAACTTTATG
TATTGTTTTTTTACGTTTCGATGTTTTAAACTAAATGTTCAATAATCAAATTAAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI25TF U 1
AF RR4EI28TF U 43
AF RR4EI28JQ C 115
AF RR4GI25JQ C 203
AF RR4D356TF U 231
AF RR4D356JQ C 234
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BS 159 185 RR4GI25TF
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BS 444 444 RR4EI28TF
BS 445 717 RR4GI25TF
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BS 800 905 RR4D356TF
BS 906 959 RR4GI25JQ

RD RR4GI25TF 717 0 0
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GGAAACCACTACTAAGAGATCCAAACCACGAAAACGCGACATTGGGAGAATTCGTGTAAA
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TCGTGGTTTTATTTATTTTCTGGGAGGACAAGGCACAGTTGATAAGGCTATGCAACTTAG
TGGAACTGACGTTGGTGGATGGAATGTCATTGTTGAGCCTTATCCTTTTCTGGAATATGC
AGACTGGGACCCTGTTGCCTTTGCCCAAGGATATGACACTGGTCTTGGGAAGACTGAAAT
CAAGAGAATGTTGTTTAATCATTTCTCTTCATGTGGACAGATCATGGATATCGAGTTTCA
CAATAGCACCATCGGTGTAGCTTCTGTGTATCTTTATGGAGAAGGTGCAGAAGACAAGGT
GTTGGATCTTGATGGGTCCTACATGGGAGGATGCAAAATACTTGTTAAGCATATTATAAC
GAATGGAATATACACTGTCCACCCTCGTCGTCGTCATTATGGCTGGCCCAGGTAACT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EI28TF 673 0 0
GG
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TGAGAAAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATCACGGATGTTTGTGTCCACGTACTCACGG
ATAATTTACTCAGCGATCGTGGTTTTATTTATTTTCTGGGAGGACAAGGCACAGTTGACA
AGGCTATGCAACTTGGTGGAACTGACGTTGGTGGATGGAATGTCATTGTTGAGCCTTATC
CTTTTCTGGAATATGCAGACTGGGACCCTGTTGCCTTTGTCCAAGGATATGACACTGGTC
TTGGGAAGACTGAAATCAAGAGAATGTTGTTTAATCATTTCTCTTCATGTGGACAGATCA
TGGATATCGAGTCTCACAATAGCACCATCGGTGTAGCTTCTGTGTATCTTTATGGAGAAG
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TTAAGCATATTATAACGAATGGAATATACACTGTCCACCCTCGTCGTCGTCATTATGGCT
GGCCCAGGTAA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4EI28JQ 792 0 0
CGAAAGGGAAACCACTACTAAGAGATCCAAACCACGAAAACGC*ACATTGGGAGAATTCG
TGTAAAGGGATATAGCATCGACCTTCCCCGAGATGATGTGGAAAGCGCGTTGAGAAAACA
TTTCTCTTCATGTGGAGAGATCACGGATGTTTGTGTCCACGTACTCACGGATAATTTACT
CAGCGATCGTGGTTTTATTTATTTTCTGGGAGGACAAGGCACAGTTGACAAGGCTATGCA
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ATATGCAGACTGGGACCCTGTTGCCTTTGTCCAAGGATATGACACTGGTCTTGGGAAGAC
TGAAATCAAGAGAATGTTGTTTAATCATTTCTCTTCATGTGGACAGATCATGGATATCGA
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CAAGGTGTTGGATCTTGATGGGTCCTACATGGGAGGATGCAAAATACTTGTTAAGCATAT
TATAACGAATGGAATATACACTGTCCACCCTCGTCGTCGTCATTATGGCTGGCCCAGGTA
ACTAGGCTACTACTGCGAGAAAACCTCTCGGATCTACTGGGAGAAGGTGAAGAGACAGAC
ATCTATGTAGTTTGTGTTTGTGAAATAATGCAACGTTCTACTCTAAAACATTTAAAGCTA
TTTTCTATCTTCTGGATTTTAATATCGACTCTGATAATCATTTTCTGCTTTCAATCGAAC
TTTATGTATTG
C

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4GI25JQ 757 0 0
CGAGATGATGTGGAAAGCGCGTTGAGAAAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATCACGGAT
GTTTGTGTCCACGTACTCACGGATAATTTACTCAGCGATCGTGGTTTTATTTATTTTCTG
GGAGGACAAGGCACAGTTGATAAGGCTATGCAACTTAGTGGAACTGACGTTGGTGGATGG
AATGTCATTGTTGAGCCTTATCCTTTTCTGGAATATGCAGACTGGGACCCTGTTGCCTTT
GCCCAAGGATATGACACTGGTCTTGGGAAGACTGAAATCAAGAGAATGTTGTTTAATCAT
TTCTCTTCATGTGGACAGATCATGGATATCGAGTTTCACAATAGCACCATCGGTGTAGCT
TCTGTGTATCTTTATGGAGAAGGTGCAGAAGACAAGGTGTTGGATCTTGATGGGTCCTAC
ATGGGAGGATGCAAAATACTTGTTAAGCATATTATAACGAATGGAATATACACTGTCCAC
CCTCGTCGTCGTCATTATGGCTGGCCCAGGTAACTAGGCTACTACTGCGAGAAAACCTCT
CGGATCTACTGGGAGAAGGTGAAGAGACAGACATCTATGTAGTTTGTGTTTGTGAAATAA
TGCAACGTTCTACTCTAATACATTTAAAGCTATTTTCTCTCTTCTGGATTTTAATATCGA
CTCTAATAATCATTTTCTGCTTTCAATCGAACTTTATGTATTGTTTTTTTACGTTTCGAT
GTTTTAAACTAAATGTTCAATAATCAAATTAAAACCG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4D356TF 681 0 0
G
ACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATCACGGATGTTTGTGTCCACGTACTCACGGATAATTT
ACTCAGCGATCGTGGTTTTATTTATTTTCTGGGAGGACAAGGCACAGTTGACAAGGCTAT
GCAACTTAGTGGAACTGACGTTGGTGGATGGAATGTCATTGTTGAGCCTCATCCTTTTCT
GGAATATGCAGACTGGGACCCTGTTGCCTTTGTCCAAGGATATGACACTGGTCTTGGGAA
GACTGAAATCAAGAGAATGTTGTTTAATCATTTCTCTTCATGTGGACAGATCATGGATAT
CGAGTTTCACAATAGCACCATCGGTGTAGCTTCTGTGTATCTTTATGGAGAAGGTGCAGA
AGACAAGGTGTTGGATCTTGATGGGTCCTACATGGGAGGATGCAAAATACTTGTTAAGCA
TATTATAACGAATGGAATATACACTGTCCACCCTCGTCGTCGTCATTATGGCTGGCCCAG
GTAACTAGGCTACTGCTGCGAGAAAACCTCTCGGATCTACTGGGAGAAGGTGAAGAGACA
GACATCTATGTAGTTTGTGTTTGTGAA*TAATGCAACGTTCTACTCTAAAACATTTAAAG
CTATTTTCTATCTTCTGGATTTTAATATCGACTCTGATAATCATTTTCTGCTTTCAATCG
AACTTTATGTATTG
TTTTTT

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR4D356JQ 678 0 0
ATTTCTCTTCATGTGGAGAGATCACGGATGTTTGTGTCCACGTACTCACGGATAATTTAC
TCAGCGATCGTGGTTTTATTTATTTTCTGGGAGGACAAGGCACAGTTGACAAGGCTATGC
AACTTAGTGGAACTGACGTTGGTGGATGGAATGTCATTGTTGAGCCTCATCCTTTTCTGG
AATATGCAGACTGGGACCCTGTTGCCTTTGTCCAAGGATATGACACTGGTCTTGGGAAGA
CTGAAATCAAGAGAATGTTGTTTAATCATTTCTCTTCATGTGGACAGATCATGGATATCG
AGTTTCACAATAGCACCATCGGTGTAGCTTCTGTGTATCTTTATGGAGAAGGTGCAGAAG
ACAAGGTGTTGGATCTTGATGGGTCCTACATGGGAGGATGCAAAATACTTGTTAAGCATA
TTATAACGAATGGAATATACACTGTCCACCCTCGTCGTCGTCATTATGGCTGGCCCAGGT
AACTAGGCTACTGCTGCGAGAAAACCTCTCGGATCTACTGGGAGAAGGTGAAGAGACAGA
CATCTATGTAGTTTGTGTTTGTGAAATAATGCAACGTTCTACTCTAAAACATTTAAAGCT
ATTTTCTATCTTCTGGATTTTAATATCGACTCTGATAATCATTTTCTGCTTTCAATCGAA
CTTTATGTATTG
TTTTTT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 5

CO CL1569Contig1 858 5 4 U
CGGACTCTAAAAACAAACTCTTATTGATTTCATAAATAGACAAAAGAACAAAAAACGTAT
AGAAAAAACAAGAGTACAGAGGCTTTTATTATTGATTATATTTGTGTATTTTGTGACGGA
CAACTTTTGCTACATCCAAGGGGAGTTGTGAAGAGGCATAGCAATGGATTTGACTTGTAG
ATAGCTATCGAGAGCGTCCATGCCACTTTCACGACAGTTGCCACTCATCTTGTAGCCACC
GTAAGGCGAGTCGAGGTCAAACGCGAAGTAGCAGTTAACCCAAATGACCCCAGCTCTGAT
TGATCTCGAAACCGTGTTGATAACGTCTATGTTCTGGCTCACTATTCCAGCTGCAAGACC
GTATTTCGTGTTGTTTGCGCATTTGATTCCTTCCTCTATAGTCTTGAATTTCATCAAAGA
CATGACTGGTCCAAAGATTTCTTCTTTGTATATCTTCATATCTTCCGTAACATCTGCGAA
TATAGTTGGTTCGATGAAATATCCTTTGTCTCCAATGGCGTTCCCTCCAGTTAATAACGT
AGCTCCGTCGTTTTTGCCATGCTCAATGTAAGAGAGAATCTTCTCATATTGTTTTTTATC
CACTTGAGGTCCTTGTCGAGAAGTGGAATCAAAAGGGTCACCAACGGTCCAGTCTTTAGC
CTTCTACACCATCTTCGCTACAACCTTATCGTATATACCTTCTTGGACAAACACACGAGA
GCTCGCCACGCAGATCTCACCCTTGTTGTAGAAGCAACCTAGTAGCGCAAGTTCGGCGGC
TTTGTTAACATCTGCGTCATCGAATATAAGAAGAGGCGATTTTCCTCCTAATTCAAGTGA
CACTTTCTTTAGATTGCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE69JQ U 3
AF RR4EC04JQ U 229
AF RR4F144JQ U 182
AF RR4FP26JQ U 1
AF RR4EE69TF C 173
BS 1 665 RR4FP26JQ
BS 666 666 RR4EE69TF
BS 667 732 RR4FP26JQ
BS 733 858 RR4EE69TF

RD RR4EE69JQ 510 0 0
GG
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CTATCGAGAGCGTCCATGCCACTTTCACGACAGTTGCCACTCATCTTGTAGCCACCGTAA
GGCGAGTCGAGGTCAAACGCGAAGTAGCAGTTAACCCAAATGACCCCAGCTCTGATTGAT
CTCGAAACCGTGTTGATAACGTCTATGTTCTGGCTCACTATTCCAGCTGCAAGACCGTAT
TTCGTGTTGTTTGCGCATTTGATTCCTTCCTCTATAGTCTTGAATTTCATCAAAGACATG
ACTGGTCCAAAGATTTCTTCTTTGTATATCTTCATATCTTCCGTAACATCTGCGAATATA
GTTGGTTCGATGAAATATCCTTTGTCTC

QA 3 510 3 510
DS 

RD RR4EC04JQ 312 0 0
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GGTTAATAACGT

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR4F144JQ 364 0 0
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TAAGGCGAGTCGAGGTCAAATGCGAAGTAACAGTTAACCCAAATGACTCCAGCTCTGATT
GATCTCAAAACCGTGTTGATAACGTCTATGTTCTGGCTCACTATTCCAGCTGCTAAACCG
TATTTCGTGTTGTTTGCGCATTTGATTCCTTCCTCTATAGTCTTGAATTTCATCAAAGAC
ATGACTGGTCCAAAGATTTCTTCTT*GTATATCTTCATATCTTCCGTAACATCTGCGAAT
ATAGTTGGTTCGATGAAATATCCTTTGTCTCCAATGGCGTTCCCTCCGGTTAATAACGTA
ACTC

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR4FP26JQ 732 0 0
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CAACTTTTGCTACATCCAAGGGGAGTTGTGAAGAGGCATAGCAATGGATTTGACTTGTAG
ATAGCTATCGAGAGCGTCCATGCCACTTTCACGACAGTTGCCACTCATCTTGTAGCCACC
GTAAGGCGAGTCGAGGTCAAACGCGAAGTAGCAGTTAACCCAAATGACCCCAGCTCTGAT
TGATCTCGAAACCGTGTTGATAACGTCTATGTTCTGGCTCACTATTCCAGCTGCAAGACC
GTATTTCGTGTTGTTTGCGCATTTGATTCCTTCCTCTATAGTCTTGAATTTCATCAAAGA
CATGACTGGTCCAAAGATTTCTTCTTTGTATATCTTCATATCTTCCGTAACATCTGCGAA
TATAGTTGGTTCGATGAAATATCCTTTGTCTCCAATGGCGTTCCCTCCAGTTAATAACGT
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CACTTGAGGTCCTTGTCGAGAAGTGGAATCAAAAGGGTCACCAACGGTCCAGTCTTTAGC
CTTCTCCACCATCTTCGCTACAACCTTATCGTATATACCTTCTTGGACAAACACACGAGA
GCTCGCCACGCA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4EE69TF 686 0 0
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TAGCCACCGTAAGGCGAGTCGAGGTCAAACGCGAAGTAGCAGTTAACCCAAATGACCCCA
GCTCTGATTGATCTCGAAACCGTGTTGATAACGTCTATGTTCTGGCTCACTATTCCAGCT
GCAAGACCGTATTTCGTGTTGTTTGCGCATTTGATTCCTTCCTCTATAGTCTTGAATTTC
ATCAAAGACATGACTGGTCCAAAGATTTCTTCTTTGTATATCTTCATATCTTCCGTAACA
TCTGCGAATATAGTTGGTTCGATGAAATATCCTTTGTCTCCAATGGCGTTCCCTCCAGTT
AATAACGTAGCTCCGTCGTTTTTGCCATGCTCAATGTAAGAGAGAATCTTCTCATATTGT
TTTTTATCCACTTGAGGTCCTTGTCGAGAAGTGGAATCAAAAGGGTCACCAACGGTCCAG
TCTTTAGCCTTCTACACCATCTTCGCTACAACCTTATCGTATATACCTTCTTGGACAAAC
ACACGAGAGCTCGCCACGCAGATCTCACCCTTGTTGTAGAAGCAACCTAGTAGCGCAAGT
TCGGCGGCTTTGTTAACATCTGCGTCATCGAATATAAGAAGAGGCGATTTTCCTCCTAAT
TCAAGTGACACTTTCTTTAGATTGCT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 4

CO CL1570Contig1 1168 4 9 U
GTGGAAGTAGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATATCCGGATTACGC
TTCACGTATCCAGGAATCGACGGCCATCCACCACCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGGAT
TTCTCTCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGG
AAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGG
GTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACATCTTCTGGTGATCTCTGCTAT
CTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAAATG
GACATTTCTGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCT
GAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGC
CAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTG
GATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCTGAGA
AAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTT
GAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGCCA
ATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACTGTTGAGAGTTGGTTG
AGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTTCCT
GAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTCAAC
AATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACATTTCGTC
CTTAGCTCAAACAGAGTTCTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAAAG
GTCATAATAATAATATGTTCTTCTTCTTTTTTCGTTCTTTTACCACGAATAATACTTCTT
TTCCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTTTCTAG
CTATATCTTAGTTTGGTAATGAGAAGGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU35TF U 1
AF RR4C872TF U 2
AF RR4DB16JQ C 339
AF RR4AH07JQ C 354
BS 1 122 RR4AU35TF
BS 123 123 RR4C872TF
BS 124 433 RR4AU35TF
BS 434 434 RR4C872TF
BS 435 600 RR4AU35TF
BS 601 601 RR4C872TF
BS 602 693 RR4AU35TF
BS 694 1156 RR4DB16JQ
BS 1157 1168 RR4AH07JQ

RD RR4AU35TF 693 0 0
GTGGAAGTAGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATATCCGGATTACGC
TTCACGTATCCAGGAATCGACGGCCATCCACCACCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGGAT
TTGTCTCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGG
AAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGG
GTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACATCTTCTGGTGATCTCTGCTAT
CTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAAATG
GACATTTCTGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCT
GAACTTATCAAGGGGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGC
CAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTG
GATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCTGAGA
GAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTT
GAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4C872TF 691 0 0
G
GGAAGTAGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATCTCTGGATTACGCTT
CACGTATCCAGGAATCGACGGCCATCCACCACCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGGATTT
CTCTCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGGAA
AACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGGGT
TCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACATCTTCTGGTGATCTCTGCTATCT
CGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAAATGGA
CATTTCTGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCTGA
ACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGCCA
GAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTGGA
TGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTCTTGACATTTCTGAGAAA
GGAATGCCAAGAGCGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTTGA
GGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGC

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4DB16JQ 819 0 0
GGATTGTAG
TCCGATTCAAATGGACATTTCTGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCC
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GGTCTCTGATGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAA
GGTTCTCCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTT
GACATTTCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATTTACGCCACTCATAT
TTTCGATGGTCTTGAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCA
ATTAGCTATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACTGT
TGAGAGTTGGTTGAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGC
CAATGGCCTTCCTGAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGC
TCGGATGCTCAACAATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGA
AGAACATTTCGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTCTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCC
AATGGAGCAAAAGGTCATAATAATAATATGTTCTTCTTCTTTTTTCGTTCTTTTACCACG
AATAATACTTCTTTTCCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTCTGAGATATGAATTTTA
TATTATTTTCTAGCTATATCTTAGTTTGG
C

QA 10 818 10 818
DS 

RD RR4AH07JQ 815 0 0
TCAAATGGACATTTCTGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAG
AAGAGCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTC
TGATGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCT
CCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATT
TCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGA
TGGTCTTGAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGC
TATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACTGTTGAGAG
TTGGTTGAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGG
CCTTCCTGAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGAT
GCTCAACAATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACA
TTTCGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTTTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGA
GCAAAAGGTCATAATAATAATATGTTCTTCTTCTTTTTTCGTTCTTTTACCACGAATAAT
ACTTCTTTTTCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTTTGAGATATGAATTTTATATTAT
TTTCTAGCTATATCTTAGTTTGGTAATGAGAAGGA

QA 1 815 1 815
DS 



AS 2 6

CO CL1571Contig1 683 2 2 U
CTCTGTAAACATACAACTTCAAATATATCCTCATATCATTTTCAAGAAGAAGCAGTAAGA
TGTTTAAGGACAGCATCAGAAGAATGATGAGCAAAGTGCTTCTGCCTGAGCTTGACATAA
GGATAACCAAGGAAGGACAAGAAATGAGCTGGCTTTGACAAGGACGTTATCTCATACCAC
ACTTTACCATCTCCATCCAGCTCAATCGAGAACCGCTCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCC
TCGAGAGTGCCGCATCCGTAACCGAAATGCGCGGGGCCTTTCCTAGACTTCTTTCTTTCG
TCCACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAGCATCACCCACGAAAGAACTTCTTTCACACGTACG
CACAACTTCTTACCGGTTTCAACCGGAGTTTTGGGATCAACAAATGCCCAATCCATACCA
ATGTGCTTCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCTTGTCGTAACTCTCTTTACCAGAACCC
ACTAAGACACGAGAGTGATTGATGAAGAACCCATCTTTGTTGACTTCTGAATCTTCTTTT
AGTTTAGATGCTGTTCTAGACGAAGCTCCTCTGTACTTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCT
GATTTGTTGATAACTTGTTGTTGTTGCTCGGTAGATGGACGGCCCCAGCTCAAGAACACC
ATCTCTTCCCCCACTAGAATTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AF21TF C 1
AF RR4AF21JQ U 3
BS 1 2 RR4AF21TF
BS 3 683 RR4AF21JQ

RD RR4AF21TF 683 0 0
CTCTGTAAACATACAACTTCAAATATATCCTCATATCATTTTCAAGAAGAAGCAGTAAGA
TGTTTAAGGACAGCATCAGAAGAATGATGAGCAAAGTGCTTCTGCCTGAGCTTGACATAA
GGATAACCAAGGAAGGACAAGAAATGAGCTGGCTTTGACAAGGACGTTATCTCATACCAC
ACTTTACCATCTCCATCCAGCTCAATCGAGAACCGCTCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCC
TCGAGAGTGCCGCATCCGTAACCGAAATGCGCGGGGCCTTTCCTAGACTTCTTTCTTTCG
TCCACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAGCATCACCCACGAAAGAACTTCTTTCACACGTACG
CACAACTTCTTACCGGTTTCAACCGGAGTTTTGGGATCAACAAATGCCCAATCCATACCA
ATGTGCTTCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCTTGTCGTAACTCTCTTTACCAGAACCC
ACTAAGACACGAGAGTGATTGATGAAGAACCCATCTTTGTTGACTTCTGAATCTTCTTTT
AGTTTAGATGCTGTTCTAGACGAAGCTCCTCTGTACTTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCT
GATTTGTTGATAACTTGTTGTTGTTGCTCGGTAGATGGACGGCCCCAGCTCAAGAACACC
ATCTCTTCCCCCACTAGAATTCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4AF21JQ 681 0 0
CTGTAAACATACAACTTCAAATATATCCTCATATCATTTTCAAGAAGAAGCAGTAAGATG
TTTAAGGACAGCATCAGAAGAATGATGAGCAAAGTGCTTCTGCCTGAGCTTGACATAAGG
ATAACCAAGGAAGGACAAGAAATGAGCTGGCTTTGACAAGGACGTTATCTCATACCACAC
TTTACCATCTCCATCCAGCTCAATCGAGAACCGCTCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCCTC
GAGAGTGCCGCATCCGTAACCGAAATGCGCGGGGCCTTTCCTAGACTTCTTTCTTTCGTC
CACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAGCATCACCCACGAAAGAACTTCTTTCACACGTACGCA
CAACTTCTTACCGGTTTCAACCGGAGTTTTGGGATCAACAAATGCCCAATCCATACCAAT
GTGCTTCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCTTGTCGTAACTCTCTTTACCAGAACCCAC
TAAGACACGAGAGTGATTGATGAAGAACCCATCTTTGTTGACTTCTGAATCTTCTTTTAG
TTTAGATGCTGTTCTAGACGAAGCTCCTCTGTACTTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCTGA
TTTGTTGATAACTTGTTGTTGTTGCTCGGTAGATGGACGGCCCCAGCTCAAGAACACCAT
CTCTTCCCCCACTAGAATTCC

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL1571Contig2 686 4 4 U
AGATGCAACATGTTTTACTGTAAACATACAACTTAAAATATATATCCTCATATCATTTTG
AAGAAGATGAAGAAGAAGCACTAAGATGTTTAAGGACAGCATCAGAGGAATGATGAGCAA
AGTGCTTCTGTCTGAGCTTGACATAAGGATAACCAAGGAAGGACAAGAAATGAGCTGGCT
TTGACAAGGACGTTATCTCATACCACACTTTACCCTCTCCATCCAGCTCAATCGAAAATC
GCTCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCCTCGAGAGTGCCGCATCCGTAACCGAAACGCGCGG
GGCCTTTCATAGACTTCTTGCTTTCGTCCACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAACATCACCC
ACGGAAGAACTTCTTTCACACATACGCAAAACTTCTTACCGGTTTCAACCGGTGTTTTGG
GATCAACAAATACCCAATCCATACCAATGTGCTTCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCT
TGTCGTAACTCTCTTTACCAGAACCCACTAAGACACGAGAGTGGTTGATAAAGAACCCAT
CTTTGTTGACTTCTGAATCTTCTTTTAGTTTAGATACTGATCTAGACGAAGCTCCTCTGT
ACTTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCTGATTTGTTAATTACTTGTTGTTGTTGCTCGGTAG
ATGGACGGCCCCAGCTCAAGAACACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF70JQ U 79
AF RR4D816JQ U 1
AF RR4D816TF C 1
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GGCCTTTCCTAGACTTCTTGCTTTCGTCCACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAACATCACCC
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GATCAACAAATACCCAATCCATACCAATGTGCTTCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCT
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ATGGACGGCCC

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DS 



AS 1 6

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TTGCCAGTAGTGATATTCTTCAGTACACTTCTCTCTTCTCCAAGCATCAAGATCAAAGAA
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ATCATCGTCCAGAAACAGTATCCTATGCAGCTTCGGGTACACCTCAGGCAAATAGAATCT
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GGTCGCATTCTCAAGCTTATTCTCGAAATAGAACTTCCGAAGATTGGCAGACTCAAGCTG
CTTCAACACAGGCACATACGAAGAGTTCAAAAACGTATAGTCCTCAACAGCTTTCACTTC
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AGCGATCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D047JQ U 64
AF RR4FB26JQ U 1
AF RR4CD06TF C 5
AF RR4CD06JQ U 24
AF RR4FB26TF C 216
AF RR4D047TF C 389
BS 1 124 RR4FB26JQ
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RD RR4D047JQ 494 0 0
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QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4FB26JQ 687 0 0
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ATGAACAAAATACATTATTCTAGTTCCCAAAAATATATGATAATAACACATAAAAACTAA
GGTTAAAACCTCAAATAGCTGAAATAAAAACATTTGATTTT*TTTAAGATTCTGTTGATA
AAGAAAATAATTCATAGTTCAAAGGCCGAAATTGCAAGCCTGAACAAACTCCAAGTCGTA
GTCGACGTGCTTGGTCCAAAGCGGTCGGAACTGGTTCATAGCAATGTCTAGCCACGGTTT
CATATTACCGTTGAAGTGTACCACTGCGGCGTTACGGATCTCGTCCATGCTAATACTCGG
ATTGTAACCCAGCCCAAGCACATGCCATGTTTTGTCCAGCGGTTTTGTGGTCGAGTAAAA
CGTGATCAGTCCCGGTGGCAACGTTCCAAGTTTCCACAGCGTCCTGTTCTCATTCAGATT
TTGCCAGTAGTGATATTCTTCAGTACACTTCTCTCTTCTCCAAGCATCAAGATCAAAGAA
GTTCATTCCATAAGTCCACGCGCATGCTTTCGGATTAAACTTCTCTTTGATCAAAGGATG
CGAGAAGTTCATGTACTGAGCATACCGATGGAACGAACCAAAACAAGTCTCCACAGCTCC
ATTCACTTTCCCGTCCATATCAATCTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CD06TF 693 0 0
CTCCGACTTAGATACTGTGGTAGTACCCATAATATATATGAAGAATTACGGCAGCTATGA
ACAAAATACATTATTCTAGTTCCCAAAAATATATGATAATAACACATAAAAACTAAGGTT
GAAACCTCAAATAGCTGAAATAAAAACATTTGATTTAATTTAAGATTCTGTTGATAAAGA
AAATAATTCATAGTTCAGAGGCCGAAATTGCAAGCCTGAACAAACTCCAAGTCGTAGTCG
ACGTGCTTGGTCCAAAGCGGTCGGAACTGGTTCATAGCAATGTCTAGCCACGGTTTCATA
TTACCGTTGAAGTGTACCACTGCGGCGTTACGGATCTCGTACATGCTAATACTCGGATTG
TAACCCAGCCCAAGCACATGCCATGTTTTGTCCAGCGGTTTTGTG*TCGAGTAAAACGTG
ATCAGTCCCGGTGGCAACGTTCCAAGTTTCCACAGCGTCCTGTTCTCATTCAGATTTTGC
CAGTAGTGATATTCTTCAGTACACTTCTCTCTTCTCCAAGCATCAAGATCAAAGAAGTTC
ATTCCATAAGCCCACGCGCATGCTTTCGGATTAAACTTCTCTTTGATCAAAGGATGCGAG
AAGTTCATGTACTGAGCATACCGATGGAACGAACCAAAACAAGTCTCCACAGCTCCATTC
ACTTTCCCGTCCATATCAATCTCCCAAAGCCCC

QA 1 693 1 693
DS 

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GTAGTACCCATAATATATATGAAGAATTACGGCAGCTATGAACAAAATACATTATTCTAG
TTCCCAAAAATATATGATAATAACACATAAAAACTAAGGTTGAAACCTCAAATAGCTGAA
ATAAAAACATTTGATTTAATTTAAGATTCTGTTGATAAAGAAAATAATTCATAGTTCAGA
GGCCGAAATTGCAAGCCTGAACAAACTCCAAGTCGTAGTCGACGTGCTTGGTCCAAAGCG
GTCGGAACTGGTTCATAGCAATGTCTAGCCACGGTTTCATATTACCGTTGAAGTGTACCA
CTGCGGCGTTACGGATCTCGTACATGCTAATACTCGGATTGTAACCCAGCCCAAGCACAT
GCCATGTTTTGTCCAGCGGTTTTGTG*TCGAGTAAAACGTGATCAGTCCCGGTGGCAACG
TTCCAAGTTTCCACAGCGTCCTGTTCTCATTCAGATTTTGCCAGTAGTGATATTCTTCAG
TACACTTCTCTCTTCTCCAAGCATCAAGATCAAAGAAGTTCATTCCATAAGCCCACGCGC
ATGCTTTCGGATTAAACTTCTCTTTGATCAAAGGATGCGAGAAGTTCATGTACTGAGCAT
ACCGATGGAACGAACCAAAACAAGTCTCCACAGCTCCATTCACTTTCCCGTCCATATCAA
TCTCCCAAAGCCCC
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4FB26TF 759 0 0
CAAG
CTGAACAAACTCCAAGTCGTAGTCGACGTGCTTG*TCCAAAGCGGTCGGAACTGGTTCAT
AGCAATGTCTAGCCACGGTTTCATATTACCGTTGAAGTGTACCACTGCGGCGTTACGGAT
CTCGTCCATGCTAATACTCGGATTGTAACCCAGCCCAAGCACATGCCATGTTTTGTCCAG
CGGTTTTGTGGTCGAGTAAAACGTGATCAGTCCCGGTGGCAACGTTCCAAGTTTCCACAG
CGTCCTGTTCTCATTCAGATTTTGCCAGTAGTGATATTCTTCAGTACACTTCTCTCTTCT
CCAAGCATCAAGATCAAAGAAGTTCATTCCATAAGTCCACGCGCATGCTTTCGGATTAAA
CTTCTCTTTGATCAAAGGATGCGAGAAGTTCATGTACTGAGCATACCGATGGAACGAACC
AAAACAAGTCTCCACAGCTCCATTCACTTTCCCGTCCATATCAATCTCCCAAAGCCCCGT
CAAATCCTTCTGCACAACCACATCATCGTCCAGAAACAGTATCCTATGCAGCTTCGGGTA
CATCTCAGGCAAATAGAATCTCAAGTGATTCAATATAGACAAATACTTGGGGTTCCTAAA
CTTCATATTAGTCGTATCTTTGGTCGCATTCTCAAGCTTATTCTCGAAATAGAACTTCTG
AAGATTGGCAGACTCAAGCTGCTTCAACACAGGCACATACGAAGAGTTCAAAAACGTATA
GTCCTCAACAGCTTTCACTTCCACATGAGCTCC
CC

QA 5 757 5 757
DS 

RD RR4D047TF 821 0 0
CATGTTTGTCCAGCG
TTTGTGGTCGAGTAAA*CGTGATCAGTCCCGGTGGCAACGTTCCAAGTTTCCACAGCGTC
*TGTTCTCATTCAGATTT*GCCAGTAGTGATAT*CTTCAGTACACTTCTCTCTTCTCCAA
GCATCAAGATCAAAGAAGTTCATTCCATAAGCCCACGCGCATGCTTTCGGATTAAACTTC
TCTTTGATCAAAGGATGCGAGAAGTTCATGTACTGAGCATACCGATGGAACGAACCAAAA
CAAGTCTCCACAGCTCCATTCACTTTCCCGTCCATATCAATCTCCCAAAGCCCCGTCAAA
TCCTTCTGCACAACCACATCATCGTCCAGAAACAGTATCCTATGCAGCTTCGG*TACACC
TCAGGCAAATAGAATCTCAAGTGATTCAATATAGACAAATACTTGGGGTTCCTAAACTTC
ATATTAGTCGTATCTTTGGTCGCATTCTCAAGCTTATTCTCGAAATAGAACTTCCGAAGA
TTGGCAGACTCAAGCTGCTTCAACACAGGCACATACGAAGAGTTCAAAAACGTATAGTCC
TCAACAGCTTTCACTTCCACATGAGCTCCTTTATACTCCTTGAGCTTAAACATCACCTGC
ATCGCACCGAGATTCATCTTATCCGTCACGACGTGGAAGACATGCTTCCACGGCTCCTTG
GCATTCTTCACAGCAGAGTTCACCACCACCGAAGCTGCAATCACGTTATCCGAAAAGATA
GCGTAATGGTAAAGACTCGGATCCTCTAACTCCGCCGCTCTAGCTTTCCCTCCTTCATCC
GTATACTTCTCCGGATGAGCGATCCC

QA 16 821 16 821
DS 



AS 1 6

CO CL1573Contig1 1042 6 36 U
GCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTT
TTACTGATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTC
CTAGCACAATCACGTTTGGTTATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGAT
TATCAAGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAG
CTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGAAG
CAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATG
CGCTCAAACACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTATCTCGATTCTTCTGGCA
AGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAGT
TGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTCGAGTTCCATCCTGAATCAA
GTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATG
TGGACATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGAGCAGACCGCAGTTTACTATACA
TAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCA
GCGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTAAGTTCC
ACGTAAGTTACAGGAACAAAGCCCTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAGCC
TGAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTTAT
AAGAAAAAAAGGAAATACAAATTGAAATATCATCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTG
CTTCATTTTAATGGCCGTTTCATACATCTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTTCGATCAG
TTATCAAATTTACCTTCATCCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 

AF RR4CI31TF U 1
AF RR4BY32TF U 121
AF RR4GQ92TF U 4
AF RR4CG95TF U 6
AF RR4BY32JQ C 302
AF RR4CG95JQ C 388
BS 1 108 RR4CI31TF
BS 109 109 RR4GQ92TF
BS 110 201 RR4CI31TF
BS 202 202 RR4GQ92TF
BS 203 255 RR4CI31TF
BS 256 276 RR4GQ92TF
BS 277 277 RR4CG95TF
BS 278 300 RR4GQ92TF
BS 301 301 RR4CG95TF
BS 302 330 RR4GQ92TF
BS 331 331 RR4CG95TF
BS 332 676 RR4GQ92TF
BS 677 677 RR4CG95TF
BS 678 691 RR4GQ92TF
BS 692 692 RR4CG95TF
BS 693 698 RR4GQ92TF
BS 699 702 RR4CG95TF
BS 703 703 RR4BY32JQ
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BS 732 774 RR4BY32JQ
BS 775 775 RR4CG95JQ
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BS 788 805 RR4BY32JQ
BS 806 806 RR4CG95JQ
BS 807 808 RR4BY32JQ
BS 809 809 RR4CG95JQ
BS 810 838 RR4BY32JQ
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BS 840 909 RR4BY32JQ
BS 910 911 RR4CG95JQ
BS 912 976 RR4BY32JQ
BS 977 977 RR4CG95JQ
BS 978 1019 RR4BY32JQ
BS 1020 1020 RR4CG95JQ
BS 1021 1042 RR4BY32JQ

RD RR4CI31TF 255 0 0
GCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTT
TTACTGATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTCCTGTCTTCCTC
CTAGCACAATCACGTTTGGTTATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGAT
TATCAAGTTTGAAGCCACGAGTTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAG
CTGATTCTGACAAAG

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4BY32TF 498 0 0
CTAGCACAATCGCGTTTGGTTATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGAT
TATCAAGTTTTAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAG
CTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGAAG
CAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATG
CGCTCAAACACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTATCTCGATTCTTCTGGCA
AGCACAACAAATTTGCCATTACTAGAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCCGAGT
TTCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTCGAGTTCCATCCTGAATCAA
GTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAGCAG*TTGATG
TGGACATTGCAACACATA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4GQ92TF 713 0 0
GG
GGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACT
GATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGC
ACAATCACGTTTGGTTATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCA
AGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGAT
TCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAACCGACCAAGATTCTGACCCTGAAGTAACC
GTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCTTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATGCGCTC
AAACACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTATCTCGATTCTTCTGGCAAGCAC
AACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAGTTGCTC
GAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTCGAGTTCCATCCTGAATCAAGTTCT
CAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGAC
ATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGAGCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAA
ACAGCGGATAG*CCTGGACTATTAGTAGAGCTG
TGAGATGATACAGATATC

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR4CG95TF 726 0 0
GGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACT
GATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGC
ACAATCACGTTTGGTTATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCA
AGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGAT
TCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGAAGCAACC
GTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATGCGCTC
AAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTATCTCGATTCTTCTGGCAAGCAC
AACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGCGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAGTTGCTC
GAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTCGAGTTCCATCCTGAATCAAGTTCT
CAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGGC
ATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGAGCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAA
ACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGA*GATGATTACAGATATCAGCGTA
GCTGTC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4BY32JQ 741 0 0
AACCGTTCTGGAAGT*ACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATGC
GCTCAAACACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTATCTCGATTCTTCTGGCAA
GCACAACAAATTTGCCATTACTAGAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCCGAGTT
TCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTCGAGTTCCATCCTGAATCAAG
TTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAGCAGGTTGATGT
GGACATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGAGCAGACCGCAGTTTACTATACAT
AGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCAG
CGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTATGTTCCA
CGTAATTTACAGGAACAAAGCCCTGATTAAGCCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAGTCT
GAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTTATA
AGAAAAAA**GAAATACAAATTGAAATATCATCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTGC
TTCATTTTAATGGCCTTTTCATACATCTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTTCGATCATT
TATCAAATTTACCTTCATCCT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4CG95JQ 654 0 0
TCAAGGCTAATGTCTATCTCGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAG
CGGATAGCGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAGTTGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCA
TAAACAATTTGCTCGAGTTCCATCCTGAATCAAGTTTTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTT
TTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGGCATTGCAACACATATAAAAATTG
AAGATGATGGAGCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTAT
TAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCAGCGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTG
ACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTAAGTTCCACGTAAGTTACAGGAACAAAGCCCTAA
TCAAGCCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAGCCTGAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTA
CTGACGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTTATAAGAAAAAAAGGAAGTACAAATTGAAA
TATCATCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTGCTTCATTTTAGTGGCCGTTTCATACAT
CTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTTCGATCAGTTATCAAATTTACCTTTATCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 5

CO CL1574Contig1 1431 5 11 U
CAGATAGATATAAATTGATAGGGGGGATGGGATCATCGCTCATGATGTGTAATATTTTCT
TCAATAACTTTTTTTTATTATTATCACATAATAAAACTCACATACGCACACCAGTGAATT
AACATATTCTTATTCAAATATAGACATGTATGTTACTACCACAAAAACCTTCTGAACGCA
GATTTAAATCAAGGACACTTAACGTTACGACCAGGACCACCATAGAAGAAATGAATCCCC
CAAGAAGTTCCAGCATTTCCGGTCTTCACATTGTAACAGTTATGTTTATCAGCAAAGTAG
TAAAGACTCTTTGGTTCTCTCAAAGTATTAGTTCCATCAACTGTCTTAATATTCCTGACA
TAGCTCACTTTCTTATAACCTTCATCTGCAAAATGCCCACTTCCCATGTCCGTGCTCGTG
CGTTTCCCACCAGTCTCCAGGTTAACGATTTCACCTCCCCATTGAACTCTCGTAGCTCCA
TTTCCTAGTGAAGTGAACAACTTGCCAGGCCAGTAACCTATAATGTCTTTGCCAACCCTT
AGCCACCAGTTTCCTGTTTTTCGGTCCTTCCATATAAGTATGGCGAGTTCGTACTGAGTT
CCACCGTAGCGTGAAACGATGTTGTAAGCTCCACCTACTGAATATCGATTACTTGTCTGA
ACAAAACCGGAGCACAGAAGGTTGTAGCAACCTGTTGTTCGATACCCATCACGCGTCCAG
TAAACAAAGAATCTTGGTCTGTTATCATCATATAGTTCTGGATAAACCTGCCAACCAGCT
TCAATGGTGTTAAGACTAGAGCCGGATCCGGACACAATCCAAGTCTGAGCCAAGCTAAAC
TCGTCCGGAACTTGGACGTACGGTTTCCACAGATTTATCACAACTTCTGTCCCATAAAAA
TTTTCGTTCCTTGCACCCATTATCGCGTACTGATGACCTCTTGTCGGATCGAAGGTTGTA
GTTCGTGGGATGCTATGATGAGGCTTTCTCCCAAATCTATTCATGGATTTAGGTCTTAAG
AGATCTTCTCTCTTTGTTCTTCTGATGGGAACGGTGTTATCAGGACACGCTCCAGCCTTG
TGCCAAACCTGAGTTATAGTCTTTGCCTCTTTCTTGGTGTATGTAGAATCACTTTCCGGG
CTGAAACTCGGTCTCATCTGGATGGTATGGTTTTTAAGTAAAGGATGATCAAAAGCTGGT
TGGTTGGTGATAGGAACACAATCTATAACATCTCCATCTTCACTCTTAATGGATTTAACA
GCAGGCTTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTCTAAGTATTTCAACTTCCTGGTGATGGGAGAAC
TCATTTCCATCAACTCGAAAAGCTATTGTCGCCCCTATCACTATCAGAGCCAGAGCTACC
GTGAAACCAGCCATTCTCATCATGGTTGTATATGTACACAGTTCTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE84JQ U 1
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AF RR4AG74JQ U 62
AF RR4FE84TF C 542
AF RR4AG74TF C 696
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BS 896 1245 RR4FE84TF
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TAAAGACTCTTTGGTTCTCTCAAAGTA

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CCT
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ACATATTCTTATTCAAATATAGACATGTATGTTACTACCACAAAAACCTTCTGAACGCAG
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AAAGACTCTTTGGTTCTCTCAGAGTATTAGTTCCATCAACTGTCTTAATATTCCTGACAT
AGCTCGCTTTCTTATAACCTTCATCTGCAAAATGCCCACTTCCCATGTCCGTGCTCGTGC
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CGTCCGGA
CT

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DS 

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ATTTAAATCAAGGACACTTAACGTTACGACCAGGACCACCATAGAAGAAATGAATCCCCC
AAGAAGTTCCAGCATTTCCGGTCTTCACATTGTAACAGTTATGTTTATCAGCAAAGTAGT
AAAGACTCTTCGGTTCTCTCAAAGTATTAGTTCCATCAACTGTCTTAATATTCCTGACAT
AGCTCACTTTCTTATAACCTTCATCTGCAAAATGCCCACTTCCCATGTCCGTGCTCGTGT
GTTTCCCACCAGTCTCCAGGTTAACGATTTCACCTCCCCATTGAACTCTCGTAGCTCCAT
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GCCACCAGTTTCCTGTTTTTCGGTCCTTCCATATAAGTATGGCGAGTTCGTACTGAGTTC
CACCGTAGCGTGAAACGATGTTGTAAGCTCCACCTACTGAATATCGATTACTTGTCTGAA
CAAAACCGGAGCACAGAAGGTTGTAGCAACCTGTTGTTCGATACCCATCACGCGTCCAGT
AAACAAAGAATCTTGGTCTGTTATCATCATATAGTTCTGGATAAACCTGCCAACCAGCTT
CAATGGTGTTAAGACTAGAGCCGGATCCGGACACAATCCAAGTCTGAGCCAAGCTAAACT
CGTCCGGAACTTGGACGTACGGTTTCCACAGATTTATCACAACTTCTGTCCCAT

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DS 

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GCCACCAGTTTCCTGTTTT*CGGTCCTTCCATATAAGTATGGCGAGTTCGTACTGAGTTC
CACCGTAGCGTGAAACGATGTTGTAAGCTCCACCTACTGAATATCGATTACTTGTCTGAA
CAAAACCGGAGCACAGAAGGTTGTAGCAACCTGTTGTTCGATACCCATCACGCGTCCAGT
AAACAAAGAATCTTGGTCTGTTATCATCATATAGTTCTGGATAAACCTGCCAACCAGCTT
CAATGGTGTTAAGACTAGAGCCGGATCCGGACACAATCCAAGTCTGAGCCAAGCTAAACT
CGTCCGGAACTTGGACGTACGGTTTCCACAGATTTATCACAACTTCTGTCCCATAAAAAT
TTTCGTTCCTTGCACCCATTATCGCGTACTGATGACCTCTTGTCGGATCGAAGGTTGTAG
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GCCAAACCTGAGTTATAGTCTTTGCCTCTTTCTTGGTGTATGTAGAATCACTTTCCGGGC
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C

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4AG74TF 736 0 0
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TTCTGGATAAACCTGCCAACCAGCTTCAATGGTGTTAAGACTAGAGCCGGATCCGGACAC
AATCCAAGTCTGAGCCAAGCTAAACTCGTCCGGAACTTGGACGTACGGTTTCCACAGATT
TATCACAACTTCTGTCCCATAAAAATTTTCGTTCCTTGCACCCATTATCGCGTACTGATG
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GGTGTATGTAGAATCACTTTCCGGGCTGAAACTCGGTCTCATCTGGATGGTATGGTTTTT
AAGTAAAGGATGATCAAAAGCTGGTTGGTTGGTGATAGGAACACAATCTATAACGTCTCC
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TTCAACTTCCTGGTGATGGGAGAACTCATTTCCATCAACTCGAAAAGCTATTGTCGCCCC
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ACACAGTTCTTAGTCC

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DS 



AS 2 6

CO CL1575Contig1 1053 4 12 U
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ACACTGAAACGTTATATCATTTTATTCTCCAAACAGACTGAAACCTTTTAGCACAAAACC
AAGTATTAAAGACAAATCAAACACAAAAGTAGTTAATGCAGAAGAACACACTATGGAAGA
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GGATGCGATGGCAGTAACTGATAACAAGAGATAAGAGAGGAGGCGAAACCAAAAGCGCCA
GTGACACGGGGAGTGACTTTCTTGGGAGCCAATTGAAGCAAACCGAAAGCAACAACGAAA
TCCATTCCGGCTTTGATAAGAGCCAATGACCTCTCGTTTGATCTCTGCAGTTTCGCGCGG
TATTGCTCATTTTGGTGTTTATCCTTGTTGCCGATCTCTTTTTCAAGCTTCTTAATTGAA
GCTGAGAGCCTACCAAGCTCCCCAATCTCGAGTAAGGACGTGCAAGCCGAAGAACCCATC
CAACAGAAGAGGGATATACGTCCAAGAAGCTCAGCTCGTTCTTTGTTCTTGTAAATGCCA
GTCCTGCCAAGCCACACAATTTGATCAAGGAACAAGAAGGTAGAGAGCAATGCGTTCTTG
GACTTTCCGAGGAGAGCAAGAGGGAGTGGTGTGCCTTTGGGAAGAGGGCTAATGAGGGCA
TGAAGGTCATTCACAAACTTGAAGAGACGGAAGACTTTACGGGCCAAGCTGGTTGACTTG
TCCACGTTCTGAGCAGTGCCAGGCTGTCCATCACTCAAGAACTTGGATCCGACTGTATAG
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GACGACAAAGGAGAGTAAGAATATTGATTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 10 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH19JQ U 61
AF RR4CF44JQ U 1
AF RR4EP62JQ U 61
AF RR4EP62TF C 263
BS 1 377 RR4CF44JQ
BS 378 378 RR4EP62JQ
BS 379 485 RR4CF44JQ
BS 486 486 RR4CH19JQ
BS 487 518 RR4CF44JQ
BS 519 519 RR4EP62JQ
BS 520 531 RR4CF44JQ
BS 532 532 RR4CH19JQ
BS 533 538 RR4CF44JQ
BS 539 539 RR4CH19JQ
BS 540 745 RR4CF44JQ
BS 746 1053 RR4EP62TF

RD RR4CH19JQ 563 0 0
A
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GATGCGATGGCAGTAACTGATAACAAGAGATAAGAGAGGAGGCGAAACCAAAAGCGCCAG
TGACACGGGGAGTGACTTTCTTGGGAGCCAATTGAAGCAAACCGAAAGCAACAACGAAAT
CCATTCCGGCTTTGATCAGAGCCAATGACCTCTCGTTTGATCTCTGCAGTTTCGCGCGGT
ATTGCTCATTTTGGTGTTTATCCTTGTTGCCGATCTCTTTTTCAAGCTTCTTAATTGAAG
CTGAGAGCCTACCAAGCTCCCCAATCTCGAGTAAGGATGTGCAAGCCGAAGAACCCATCC
AACAGAAGAGGGATATACGTCCAAGAAGCTCAGCTCGTTCTTTGTTCTTGTAAATGCCAG
TCCTGCCAAGCCACACAATTTG

QA 2 563 2 563
DS 

RD RR4CF44JQ 745 0 0
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ACACTGAAACGTTATATCATTTTATTCTCCAAACAGACTGAAACCTTTTAGCACAAAACC
AAGTATTAAAGACAAATCAAACACAAAAGTAGTTAATGCAGAAGAACACACTATGGAAGA
TCAAGAAACTCTGACTCTCTACTTCATCTTTTCCTTGTTTCCTAAACCGTCTTGGACTTG
GGATGCGATGGCAGTAACTGATAACAAGAGATAAGAGAGGAGGCGAAACCAAAAGCGCCA
GTGACACGGGGAGTGACTTTCTTGGGAGCCAATTGAAGCAAACCGAAAGCAACAACGAAA
TCCATTCCGGCTTTGATCAGAGCCAATGACCTCTCGTTTGATCTCTGCAGTTTCGCGCGG
TATTGCTCATTTTGGTGTTTATCCTTGTTGCCGATCTCTTTTTCAAGCTTCTTAATTGAA
GCTGAAAGCCTACCAAGCTCCCCAATCTCGAGTAAGGATGTGCAAGCCGAAAAACCCACC
CAACAGAAGAGGGATATACGTCCAAGAAGCTCAGCTCGTTCTTTGTTCTTGTAAATGCCA
GTCCTGCCAAGCCACACAATTTGATCAAGGAACAAGAAGGTAGAGAGCAATGCGTTCTTG
GACTTTCCGAGGAGAGCAAGAGGGAGTGGTGTGCCTTTGGGAAGAGGGCTAATGAGGGCA
TGAAGGTCATTCACAAACTTGAAGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EP62JQ 686 0 0
G
CACTGAAACGTTATATCATTTTATTCTCCAAACAGACTGAAACCTTTTAGCACAAAACCA
AGTATTAAAGACAAATCAAACACAAAAGTAGTTAATGCAGAAGAACACACTATGGAAGAT
CAAGAAACTCTGACTCTCTACTTCATCTTTTCCTTGTTTCCTAAACCGTCTTGGACTTGG
GATGCGATGGCAGTAACTGATAACAAGAGATAAGAGAGGAGGCGAAACCAAAAGCGCCAG
TGACACGGGGAGTGACTTTCTTGGGAGCCAATTGAAGCAAACCGAAAGCAACAACGAAAT
CCATTCCGGCTTTGATAAGAGCCAATGACCTCTCGTTTGATCTCTGCAGTTTCGCGCGGT
ATTGCTCATTTTGGTGTTTATCCTTGTTGCCGATCTCTTTTTCAAGCTTCTTAATTGAAG
CTGAAAGCCTACCAAGCTCCCCAATCTCGAGTAAGGACGTGCAAGCCGAAGAACCCATCC
AACAGAAGAGGGATATACGTCCAAGAAGCTCAGCTCGTTCTTTGTTCTTGTAAATGCCAG
TCCTGCCAAGCCACACAATTTGATCAAGGAACAAGAAGGTAGAGAGCAATGCGTTCTTGG
ACTTTCCGAGGAGAGCAAGAGGGAGTGGTGTGCCTTTGGGAAGAGGGCTAATGAGGGCAT
GAAGGTCATTCACAAACTTGAAGA
G

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4EP62TF 791 0 0
CTGATACAGAGAT
AGAGAGAGCGAACC**AAAGCGCCAGTGACACGGG*AGTGACTTTCTTGGGAGCCAATTG
AAGCAAACCGAAAGCAACAACGAAATCCAT*CCGGCTTTGATAAGAGCCAATGACCTCTC
GTTTGATCTCTGCAGTTTCGCGCGGTATTGCTCATTTTGGTGTTTATCCTTGTTGCCGAT
CTCTTTTTCAAGCTTCTTAATTGAAGCTGAGAGCCTACCAAGCTCCCCAATCTCGAGTAA
GGACGTGCAAGCCGAAGAACCCATCCAACAGAAGAGGGATATACGTCCAAGAAGCTCAGC
TCGTTCTTTGTTCTTGTAAATGCCAGTCCTGCCAAGCCACACAATTTGATCAAGGAACAA
GAAGGTAGAGAGCAATGCGTTCTTGGACTTTCCGAGGAGAGCAAGAGGGAGTGGTGTGCC
TTTGGGAAGAGGGCTAATGAGGGCATGAAGGTCATTCACAAACTTGAAGAGACGGAAGAC
TTTACGGGCCAAGCTGGTTGACTTGTCCACGTTCTGAGCAGTGCCAGGCTGTCCATCACT
CAAGAACTTGGATCCGACTGTATAGCTCTGCATATCTTGTCCCTCGCCTCCGCTTTGTTC
AAATACACTACCACCAGCCCCAGCTCTGCTCTCGTCGTCTCCACCACGCTACTACTCATC
TTTAGAGAATAATCTTCTGGTGCAGACGAGGAGATTGAATCAAAGAGAGAGTGAGTTTCT
CCGCCCCTACCAACTTTAATTTGATGACGACAAAGGAGAGTAAGAATATTGATTACCC

QA 14 791 14 791
DS 



CO CL1575Contig2 733 2 2 U
GAACTCACTCTCTCTTTGATTCAATCTCCTCGTCTGCACCAGAAGATTATTCTCTAAAGA
AGATGAGTAGTAGCGTGGTGGAGACGACGAGAGCAGAGCTGGGGCTGGTGGTAGTGTATT
TGAACAAAGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGCTATACAGTACGGATCCAAGTTCT
TGAGTGATGGACAGCCTGGCACTGCTCAGAACGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTA
AAGTCTTCCGTCTCTTCAAGTTTGTGAATGACCTTCATGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCA
AAGGCACACCACTCCCTCTTGCTCTCCTCGGAAAGTCCAAGAACGCATTGCTCTCTACCT
TCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTGGCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAAGAAC
GAGCTGAGCTTCTTGGACGTATATCCCTCTTCTGTTGGGTGGGTTCTTCGGCTTGCACAT
CCTTACTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGCTCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAG
AGATCGGCAACAAGATAAACACCAAAATGAGCAATACCGCGCGAAACTGCAGAGATCAAA
CGAGAGGTCATTGGCTCTGATCAAAGCAGATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGTTTGCTTCA
ATTGGCTCCAAGAAAGTCACTCCCCGTGTCACTGGCGCTTTGGTTCGCTCTCTCTTATCT
CTTGTATCAGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH19TF U 1
AF RR4CF44TF U 16
BS 1 281 RR4CH19TF
BS 282 733 RR4CF44TF

RD RR4CH19TF 281 0 0
GAACTCACTCTCTCTTTGATTCAATCTCCTCGTCTGCACCAGAAGATTATTCTCTAAAGA
AGATGAGTAGTAGCGTGGTGGAGACGACGAGAGCAGAGCTGGGGCTGGTGGTAGTGTATT
TGAACAAAGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGCTATACAGTACGGATCCAAGTTCT
TGAGTGATGGACAGCCTGGCACTGCTCAGAACGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTA
AAGTCTTCCGTCTCTTCAAGTTTGTGAATGACCTTCATGCC

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4CF44TF 718 0 0
GG
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GTGGAGACGACGAGAGCAGAGCTGGGGCTGGTGGTAGTGTATTTGAACAAAGCGGAGGCG
AGGGACAAGATATGCAGAGCTATACAGTACGGATCCAAGTTCTTGAGTGATGGACAGCCT
GGCACTGCTCAGAACGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTAAAGTCTTCCGTCTCTTC
AAGTTTGTGAATGACCTTCATGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCAAAGGCACACCACTCCCT
CTTGCTCTCCTCGGAAAGTCCAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAA
ATTGTGTGGCTTGGCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCTTGGA
CGTATATCCCTCTTCTGTTGGGTGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTACTCGAGATTGGG
GAGCTTGGTAGGCTCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAGAGATCGGCAACAAGATA
AACACCAAAATGAGCAATACCGCGCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGGTCATTGGCTC
TGATCAAAGCAGATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGTTTGCTTCAATTGGCTCCAAGAAAGT
CACTCCCCGTGTCACTGGCGCTTTGGTTCGCTCTCTCTTATCTCTTGTATCAGTAC

QA 3 718 3 718
DS 



AS 1 6

CO CL1576Contig1 984 6 16 U
TTTTTTCAACAAAATTCATTTATAACAGCCCAAAGGCATGTTTACAAGAGTCGGGCTTTT
TTAAAATTTCGAGGCCCAATACCAACATTAACTAAAGATTACAAATAAGCTCATTTGGGT
ATATCTAATATTTTATCAAGACACGTGTTTGATGTAGGGTTTCCTAGAAACATGTGGCAT
CACACGCGGACTTCATGCAGGGACTGCATCTCCGCCACCGCTCCGTCTCTGGTACACCAC
CGTAGTAAGTCGCCGTCTTGATTTTTTCTTCATCAACCTATACCCGATTTTGATGCCTCT
TCTTCGACGATTCAACCACTTTCCGACTCGAATTGTGCTTCACTCTCTGCGCGCCTCTGT
TACCAAGTATCTCCAATCTCTTTGCCGGATGTGAGAGTCTCCTTGTAACTCCAATTGATT
CAAAACCGCCATCGTCAAAACACTTGCAAACTAGCAAGCTCTGACTCTTCTTAGGTCAGC
CTCAAACCACGAAGTTCCCAAGCAAAACTCAAAACTTTATCTCTTTAGAACACTTTGCTA
GAGATATTTAACGCAAAGATTGATATCTTCAGAGAACAAAGATTGAGGTTAACCGACAAA
TAAAATGAAGATCCAAAGAGAACAGCCGGAATAAATTTTGATAAGAGGAAGCTTAGTTTT
AACCGATCTTAAAGATCGGATCATTATTAAAAGGGTCAAGAGAAAATAGAGAAAAGATTA
GATTGAAGAAACTGCTCTGTTCCCTTGACTCTACACACACCAAAAATCGCCTCGCGAAAA
GTGAAATCCGCAACCGGAATAAAATCAATTCGCCTGACGAAGCGAGTATATACAGAAAAA
ACAAAGATAAAGAGTATGGCGACCGGCGGCAGAAGGCTACCGGCCACCGGATCGGGAAAG
CTTAAGTTGGTGTTTTTAGAGAGAGGTCGGAGAAAACTCTAGAGAGAGATTGATTTTTGG
TAGTGTTAACTGATAATAGAATCC


BQ
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25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4E353JQ U 7
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A
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T*AAAATTTCGAGGCCCAATACCAACATTAACTAAAGATTACAAATAAGCTCATTTGGGT
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G

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CAAAACCGCCATCGTCAAAACACTTGCAAACTAGCAAGCTATGACTCTTCTTAGGTCAGC
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GAGATATTTAACGCAAAGATTGATATCTTCAGAGAACAAAGATTGAGGTTAACCGACAAA
TAAAATGAAGATCCAAAGAGAACAGCCGGAATAAATTTTGATAAGAGGAAGCTTAGTTTT
AACCGATCTTAAAGATCGGATCATTATTAAAAGGGTCAAGAGAAAATAGAGAAAAGATTA
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TAGTGTTAACT
CC

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DS 

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CAAACCACGAAGTTCCCAAGCAAAACTCAAAACTTTATCTCTTTAGAACACTTTGCTAGA
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AAAGATAAAGAGTATGGCGACCGGCGGCAGAAGGCTACCGGCCACCGGATCGGGAAAGCT
TAAGTTGGTGTTTTTAGAGAGAGGTCGGAGAAAACTCTAGAGAGAGATTGATTTTTGGTA
GTGTTAACTGATAATAGAATCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 3

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TTCGAAGTCACAAAATGCAGCAAGGAATGTAGCAACAAAGGCAAACACAAAAACTCAAAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CW24JQ U 43
AF RR4AI43JQ U 1
AF RR4FI51JQ U 647
BS 1 316 RR4AI43JQ
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BS 625 822 RR4AI43JQ
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RD RR4CW24JQ 713 0 0
AG
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ACACAAAAACTCAAATACTTTTTTACTAGTTTCAACAAAGCCAACGATGATAACTTTTTT
TTCTTACACAGACAAAATCATCAACTGATTCTCACTTCTCCACTGGCGTGTACTTGCTTT
ACAGTCTTATCATACTCATCTTCTTCGTCTTCCTCTTCCTCCACTACTTCCTCTTCATCC
ACCTCCTCTTCCTCTTCCTCTTTCCCGTCTTCATCTCCCCAGCCAAAACCTCCAATGGAA
CGGGAAACAGGCGGAGGCGTTTTGGCGTCATCAACTATCTTCATGATCTCTTCAGCTGTC
TGGAGGGAGAAGGTTGGATTCTCTTTCCTGAAATATGCAGCTTGAGCTGTCTCCGTCAGT
TCTCTTGGCAAGTTCTTCAGGAACCATGGGTGTTTCTTGATCTCTGCAATGGTTATCCTC
TGGAGTGAATTGGCGACAAAAATACGGGAAAGGAGATGTTTGCAATCCTGTGAGATGTGG
ACGTAGTCCGGGATCTTGTACTGAACAGCCATGATTTTTTGTATTGTTTTCCTGAAGTTT
TTGGGGTCTTCTTGGTCTTCGAATGGGTAGGCTCCAACCAGCATGACATAAAGAGTTACA
CCACAAGACCATACATCAGCCATCTTGCCATCGTATTCTCTCCTGGAAAGG

QA 3 713 3 713
DS 

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TTCGAAGTCACAAAATGCAGCAAGGAATGTAGCAACAAAGGCAAACACAAAAACTCAAAT
ACTTTTTTACTAGTTTCAACAAAGCCAACGATGATAACTTTTTTTTCTTACACAGACAAA
ATCATCAACTGATTCTCACTTCTCCACTGGCGTGTACTTGCTTTACAGTCTTATCATACT
CATCTTCTTCGTCTTCCTCTTCCTCCACTACTTCCTCTTCATCCACCTCCTCTTCCTCCT
CCTCTTTCCCGTCTTCGTCTCCCCAGCCAAAACCTCCAATGGAACGGGAAACAGGCGGAG
GCGTTTTGGCGTCATCAACTATCTTCATGATCTCTTCAGCTGTCTGGAGGGAGAAGGTTG
GATTCTCTTTCCTGAAATATGCAGCTTGAGCTGTCTCCGTCAGTTCTCTTGGCAAGTTCT
TCAGGAACCATGGGTGTTTCTTGATCTCTGCAATGGTTATCCTCTTGAGTGAGTTGGCAA
CAAAAATACGGGAAAGGAGATGTTTGCAATCCTGTGAGATGTGGACGTAGTCCGGGATCT
TGTACTGAACAGCCATGATTTTT*GTATTGTTTTCCTGAAGTTTTTGGGGTCTTCTTGGT
CTTCGAATGGGTAGGCTCCAACAAGCATGACATAAAGAGTTACACCACAAGACCATACAT
CAGCCATCTTGCCATCGTATTCTCTCCTCGAAAGGACCTCAGGTGCAATATATGCTGGAG
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TGGAATAACCAAAATC

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DS 

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AAAGAATGGAAGAAGGAAAAAGCTAATAACTTGAAAGTCCTTTTACGACAATGGTGAAAA
ACAGAATCGGGTCTCGTATATACGACAATTGCAGAACTTGGAAGTTCTAAAATATAGTGT
GTCAGACCTTGGAATAACCAAAATCACAGATTTTGAGACGTGGAGCAGGACATCCATCAA
GGAGTGTATTCTCCAGCTTCAGATCTCTATGACATATTTGCATAGCATGGCAATAGCTAA
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TGCAAATACGCTCGAAAAGTTCACCACCAGCAGCATACTCCATGGCAATAGCAAGATGAG
TTGGA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 6

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TCATGGTTTCTTTCTTTTATAACTTCTAACATCACTTAAAGCTATAGAAAAACTCTAACA
AAAGAAAAAGAAATAACACTTTTTAGGATAAAAAGAAAAATAGAAAACCAATTTAAGACT
TGAAGAACATATCAAACACCCACAATGTAACCTGCCAACTAGATAAGAATGCACGGCATC
ACCTCGTCAGTTTGACGAATTCATCATAGCTGACCTAACCACGCATCACAATCAACATCA
AATGTTTTGATGGAATTACGAGCATCCTCATCGGTTTCTTTTTGCCCAATAATTTTCAAT
TTTTTTTGCGAAATTATATTCTATTAAATAATTTTCAACTTATATTTTTGATAGTCTTCT
GCAGCTTAAGAAACCATTCTGGTTTACATCCAATGGCCTGCCAGTTTGTTGAAAATTTTC
TTTATTTTCCTTCCATGACAGTTCGAACTTTCCCACCATGGCACATTTTCTATATCAACC
TTTTACATGAATTTGACGAACTCATCATAGCTGATCCGACCATCATGATCAGCATCAGCT
GCCTTGATGGTCTTACGAACTTGTCTATCAGTTACTTTGACCCCACTTTTTGCTATCACA
TATTGAAGCTCTTCTTTAGTTATGAAACCATTCTGGTCTACATCGTGGATCCCAAACTCT
TCCTTGAGCTTTTCCATTTTCAGTTTGTTCAACATAACTGTGGAAATCTTTTCGAGCATC
TCAGCATCATCATGACACTTAAGAGAGTGTTCTGCAGTTATGGTTGCTACACATGTCAAA
GCTTCGATCCATCTCCGCTTCTTTTCCTCTGATGCACCATCACAGGTTGTCTTAAATATG
ATCCCGAAGTCTCCCTTCTGTTTCTTTACATCCGACGGCTCAACGTCGTAGAAAACCGGC
ATCACAATCTGCCCTGAAGCTTCTTGGCAGTTCAAGATTTCAAGCAGTTCATCTAAACAA
CATCTCGAAGAAGCATAATTCTTCGAGATCAAAACGATGGAAGCTTTTGCTTCTCTAATG
GCTTGTATGAGTGTGGATCCAATCGGCTGGCATCTCTCCATCTCCTGATCATTGAACATG
GTGATTTTTTTCCTCGCAAAGACATTGTGTAAATGACTAAGGATTCCTTTACGAACATCT
GGCCCATGGAAGCTCGGGAAGACAAAGTGAGGCAAGGAAGAAGAAGCCGCCATGACAGAG
ATAGAGGAGCAAAAGAGAGTTTGAAGAAAGTATCC


BQ
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AF RR4GV37JQ U 264
AF RR4EK13JQ U 1
AF RR4BT55JQ U 42
AF RR4GV37TF C 126
AF RR4EK13TF C 437
AF RR4BT55TF C 526
BS 1 240 RR4EK13JQ
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BS 313 313 RR4GV37JQ
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BS 991 1295 RR4BT55TF

RD RR4GV37JQ 248 0 0
TCATAGCTGACCTAACCCCCCATCACAATCAACATCAAATGTTTTGATGGAATTACAAGC
ATCCCCATCGGTTTCTTTTTGCCCAATAATTTTCAATTTTTTTTGCGAAATTATATTCTA
TTAAATAATTTTCAACTTATATTTTTGATAGTCTTCTGCAGCTTAAAAAACCATTCTGGT
TTACATCCAATGGCCTGCCAGTTTGTTGAAAATTTTCTTTATTTTCCTTCCATGACAGTT
CGAACTTT

QA 1 248 1 248
DS 

RD RR4EK13JQ 546 0 0
GGAATTTAATTTTCCTTTGGGTTTCTATTAGTTTTTTTTTAAAAAAGTGCAAACAAGGAT
TCATGGTTTCTTTCTTTTATAACTTCTAACATCACTTAAAGCTATAGAAAAACTCTAACA
AAAGAAAAAGAAATAACACTTTTTAGGATAAAAAGAAAAATAGAAAACCAATTTAAGACT
TGAAGAACATATCAAACACCCACAATGTAACCTGCCAACTAGATAAGAATGCACGGCATC
CCCTCGTCAGTTTGACGAATTCATCATAGCTGACCTAACCACGCATCACAATCAACATCA
AATGTTTTGATGAAATTACGAGCATCCTCATCGGTTTCTTTTTGCCCAATAATTTTCAAT
TTTTTTTGCGAAATTATATTCTATTAAATAATTTTCAACTTATATTTTTGATAGTCTTCT
GCAGCTTAAGAAACCATTCTGGTTTACATCCAATGGCCTGCCAGTTTGTTGAAAATTTTC
TTTATTTTCCTTCCATGACAGTTCGAACTTTCCCACCATGGCACATTTTCTATATCAACC
TTTT
CC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4BT55JQ 799 0 0
AAAAAGTGCAAACAAGGATTCATGGTTTCTTTCTTTTATAACTTCTAACATCACTTAAAG
CTATAGAAAAACTCTAACAAAAGAAAAAGAAATAACACTTTTTAGGATAAAAAGAAAAAT
AGAAAACCAATTTAAGACTTGAAGAACATATCAAACACCCACAATGTAACCTGCCAACTA
GATAAGAATGCACGGCATCACCTCGTCAGTTTGACGAATTCATCATAGCTGACCTAACCA
CGCATCACAATCAACATCAAATGTTTTGATGAAATTACGAGCATCCTCATCGGTTTCTTT
TTGCCCAATAATTTTCAATTTTTTTTGCGAAATTATATTCTATTAAATAATTTTCAACTT
ATATTTTTGATAGTCTTCTGCAGCTTAAGAAACCATTCTGGTTTACATCCAATGGCCTGC
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ATCATGATCAGCATCAGCTGCCTTGATGGTCTTACGAACTTGTCTATCAGTTACTTTGAC
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GGAAATCTTTTCGAGCATCTCAGCATCATCATGACACTTAAGAGAGTGTTCTGCAGTTAT
GGTTGCTACACATGTCAAA

QA 1 799 1 799
DS 

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AAAAGAAATAACACTTTT*AGGATAAAAG**AAAATAGAAAACCAATTTAAGACTTGAAG
AACATATCAAACACCCACAATGTAAC*TGCCAACTAGATAAGAATGCACGGCATCACCTC
GTCAGTTTGACGAATTCATCATAGCTGACCTAACCACGCATCACAATCAACATCAAATGT
TTTGATGGAATTACGAGCATCCTCATCGGTTTCTTTTTGCCCAATAATTTTCAATTTTTT
TTGCGAAATTATATTCTATTAAATAATTTTCAACTTATATTTTTGATAGTCTTCTGCAGC
TTAAGAAACCATTCTGGTTTACATCCAATGGCCTGCCAGTTTGTTGAAAATTTTCTTTAT
TTTCCTTCCATGACAGTTCGAACTTTCCCACCATGGCACATTTTCTATATCAACCTTTTC
CATGAATTTGACGAACTCATCATAGCTGATCCGACCATCATGATCAGCATCAGCTGCCTT
GATGGTCTTACGAACTTGTCTATCAGTTACTTTGACCTCACTTTTTGCTATCACATATTG
AAGCTCTTCTTTAGTTATGAAACCATTCTGGTCTACATCGTGAATCCCAAACTCTTCCTT
GAGCTTTTCCATTTTCAGTTTGTTCAACATAACTGTGGAAATCTTTTCGAGCATCTCAGC
ATCATCATGACACTTAAGAGAGTGTTCTCCAGTTATGGTTGCTACACATGTCAAAGCTTC
GATCCATCTCCGCTTCTTTTCCTCTGATGCACC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EK13TF 556 0 0
TTCTGGTTTACATCCAATGGCCTGCCAGTTTGTTGAAAATTTTCTTTATTTTCCTTCCAT
GACAGTTCGAACTTTCCCACCATGGCACATTTTCTATATCAACCTTTTCCATGAATTTGA
CGAACTCATCATAGCTGATCCGACCATCATGATCAGCATCAGCTGCCTTGATGGTCTTAC
GAACTTGTCTATCAGTTACTTTGACCCCACTTTTTGCTATCACATATTGAAGCTCTTCTT
TAGTTATGAAACCATTCTGGTCTGCATCGTGAATCCCAAACTCTTCCTTGAGCTTTTCCA
TTTTCAGTTTGTTCAACATAACTGTGGAAATCTTTTCGAGCATCTCAGCATCATCATGAC
ACTTAAGAGAGTGTTCTCCAGTTATGGTTGCTACACATGTCAAAGCTTCGATCCATCTCC
GCTTCTTTTCCTCTGATGCACCATCACAGGTTGTCTTAAATATGATCCCGAAGTCTCCCT
TCTGTTTCTTTACATCCGACGGCTCAACGTCGTAGAAAACCGGCATCACAATCTGCCCTG
AAGCTTCTTGGCAG
CC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4BT55TF 770 0 0
ACATTTCTATATCA
CTTTTACATGAATT*GACGA*CTCATCATAGCTGATCCGACCATCATGATCAGCATCAGC
TGC*TTGATG*TCTTACGAACTTGTCTATCAGTTACTTTGACCCCACTTTTTGCTATCAC
ATATTGAAGCTCTTCTTTAGTTATGAAACCATTCTGGTCTACATCGTGGATCCCAAACTC
TTCCTTGAGCTTTTCCATTTTCAGTTTGTTCAACATAACTGTGGAAATCTTTTCGAGCAT
CTCAGCATCATCATGACACTTAAGAGAGTGTTCTGCAGTTATGGTTGCTACACATGTCAA
AGCTTCGATCCATCTCCGCTTCTTTTCCTCTGATGCACCATCACAGGTTGTCTTAAATAT
GATCCCGAAGTCTCCCTTCTGTTTCTTTACATCCGACGGCTCAACGTCGTAGAAAACCGG
CATCACAATCTGCCCTGAAGCTTCTTGGCAGTTCAAGATTTCAAGCAGTTCATCTAAACA
ACATCTCGAAGAAGCATAATTCTTCGAGATCAAAACGATGGAAGCTTTTGCTTCTCTAAT
GGCTTGTATGAGTGTGGATCCAATCGGCTGGCATCTCTCCATCTCCTGATCATTGAACAT
GGTGATTTTTTTCCTCGCAAAGACATTGTGTAAATGACTAAGGATTCCTTTACGAACATC
TGGCCCATGGAAGCTCGGGAAGACAAAGTGAGGCAAGGAAGAAGAAGCCGCCATGACAGA
GATAGAGGAGCAAAAGAGAGTTTGAAGAAAGTATCC

QA 15 770 15 770
DS 



AS 1 6

CO CL1579Contig1 1001 6 10 U
GATATATAAACGTTTCTCGTAATTTCTTGCATCTTTTGTTTCCTTAAGAAGATGGCTAGA
TGCCTTGTTCCAATTGGAGTCTAAGCAAAAAAAAAGCCTGAATAAAAGCGTAAAGTTTAA
TTAAACTGCTACATCATCATCATCAGACAAACCAGGAATGTTCAAAGCAGGATGTTAACT
AAAAACACAACGTTTGCTTTTTTCGGCACATGAGATCGAAACACCCATCTTCTTCTGATG
AAACTACTTCAGTAAGCTACCTGCAACCATGCTAGGTTTTGTCAAAGTTTTACTGATGAG
ATCTCTCAGCTCGATCTCTCCAGGGAATCTACCCTCTTTCAACTTAGAGAACACCAGTTG
CCCGTTGCAGAGAACTTCAAATGCGCCTGAGCTTTGAAGGTAAGACTGGAGAAAGTTACC
GATAAGCCAAGTGGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGCCCTCAAGGAGTTGAACCATGC
GGGTGGATGCGCAATTCCAATCATGGGAAAGACACGATCACCCGCAACTATCATCCCAAT
AACTCCCATCTGAGCAACGGGGACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTGGTGGTGGTGGTGG
G*TAGTTTGCAAGAACCACATCTAAACCGGGAAAAGCCGTCTCTAACATCTTCTTCATAG
TCACTGCAGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGAAGTTGATCTCCACAGTGTTTCCAT
ATCCAACTGCTCCTCCTAAGCCACTTGCCTGCTTCTGTGAAGGAAAATCTAGGGTTCCGG
GAACGACCACAGGCGGAGGCTGCTGGTGAGGGATGTGCGGTGGATGATTGGGACGGTGAC
TCGGAGGTTTCGGAGGCGGAGGAGTGAAAAGGTTGAAGAGATCCGAACAGAACAAGAAAA
TCGGTAAACCTATCAACAGCAATTGTGATCTGTCCATGGCGAATTATTATAAAATCTCCG
ATGAACAACAGAGTCCGTAAGTCTACAATCCGATCGAAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO34JQ U 96
AF RR4GU47JQ U 1
AF RR4G827JQ U 21
AF RR4GU47TF C 228
AF RR4G827TF C 276
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BS 941 986 RR4G827TF
BS 987 1001 RR4DO34TF

RD RR4DO34JQ 550 0 0
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GAATGTTCAAAGCAGGATGTTAACTAAAAACACAACGTTTGCTTTTTTCGGCACATGAGA
TCGAAACACCCATCTTCTTCTGATGAAACTACTTCAGTAAGCTACCTGCAACCATGCTAG
GTTTTGTCAAAGTTTTACTGATGAGATCTCTCAGCTCGATCTCTCCAGGGAATCTACCCT
CTTTCAACTTAAAGAACACCAGTTGCCCGTTGCAGAAAACTTCAAATGCGCCTGAACTTT
GAAGGTAAGACTGGAGAAAGTTACCGATAAGCCAAGTGGAAGCCATGGATCCAAACCTAT
TGGCCCTCAAGGAGTTGAACCATGCGGGTGGATGCGCAATTCCAATCATGGGAAAGACAC
GATCACCCGCAACTATCATCCCAATAACTCCCATCTGAGCAACGGGGACAACCTTAGCTA
GAAGACGCTTTGGTGGTGGTGGTGGG*TAGTTTGCAAGAACCACATCTAAACCGGGAAAA
GCCGTCTCTA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4GU47JQ 758 0 0
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TGCCTTGTTCCAATTGGAGTCTAAGCAAAAAAAAAGCCTGAATAAAAGCGTAAAGTTTAA
TTAAACTGCTACATCATCATCATCAGACAAACCAGGAATGTTCAAAGCAGGATGTTAACT
AAAAACACAACGTTTGCTTTTTTCGGCACATGAGATCGAAACACCCATCTTCTTCTGATG
AAACTACTTCAGTAAGCTACCTGCAACCATGCTAGGTTTTGTCAAAGTTTTACTGATGAG
ATCTCTCAGCTCGATCTCTCCAGGGAATCTACCCTCTTTCAACTTAGAGAACACCAGTTG
CCCGTTGCAGAGAACTTCAAATGCGCCTGAGCTTTGAAGGTAAGACTGGAGAAAGTTACC
GATAAGCCAAGTGGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGCCCTCAAGGAGTTGAACCATGC
GGGTGGATGCGCAATTCCAATCATGGGAAAGACACGATCACCCGCAACTATCATCCCAAT
AACTCCCATCTGAGCAACGGGGACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTGGTGGTGGTGGGGG
GGTAGTTTGCAAGAACCACATCTAAACCGGGAAAAGCCGTCTCTAACATCTTCTTCATAG
TCACTGCAGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGAAGTTGATCTCCACAGTGTTTCCAT
ATCCAACTGCTCCTCCTAAGCCACTTGCCTGCTTCTGT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4G827JQ 738 0 0
AATTTCTTGCATCTTTTGTTTCCTTAAGAAGATGGCTAGATGCCTTGTTCCAATTGGAGT
CTAAGCAAAAAAAA*GCCTGAATAAAAGCGTAAAGTTTAATTAAACTGCTACATCATCAT
CATCAGACAAACCAGGAATGTTCAAAGCAGGATGTTAACTAAAAACACAACGTTTGCTTT
TTTCGGCACATGAGATCGAAACGCCCATCTTCTTCTGATGAAACTACTTCAGTAAGCTAC
CTGCAACCATGCTAGGTTTTGTCAAAGTTTTACTGATGAGATCTCTCAGCTCGATCTCTC
CAGGGAATCTACCCTCTTTCAACTTAGGGAACACCAGTTGCCTGTTGCAGAGAACTTCAA
ATGCGCCTGAGCTTTGAAGGTAAGACTGGAGAAAGTTACCGATAAGCCAAGTGGAAGCCA
TGGATCCAAACCTATTGGCCCTCAAGGAGTTGAACCATGCGGGTGGATGCGCAATTCCAA
TCATGGGAAAGACACGATCACCCGCAACTATCATCCCAATAACTCCCATCTGAGCAACGG
GGACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTGGTGGTGGTGGTGGG*TAGTTTGCAAGAACCACA
TCTAAACCGGGAAAAGCCGTCTCTAACATCTTCTTCATAGTCACTGCAGTTCCCTTGAAA
GAACAGGAGACGCAGAAGTTGATCTCCACAGTGTTTCCATATCCAACTGCTCCTCCTAAG
CCACTTGCCTGCTTCTGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4GU47TF 715 0 0
TCTTCTTCTGATGAAACTACTTCAGTAAGCTAC*TGCAACCATGCTAGGTTTTGTCAAAG
TTTTACTGATGAGATCTCTCAGCTCGATCTCTCCAGGGAATCTACCCTCTTTCAACTTAG
AGAACACCAGTTGCCCGTTGCAGAGAACTTCAAATGCGCCTGAGCTTTGAAGGTAAGACT
GGAGAAAGTTACCGATAAGCCAAGTGGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGCCCTCAAGG
AGTTGAACCATGCGGGTGGATGCGCAATTCCAATCATGGGAAAGACACGATCACCCGCAA
CTATCATCCCAATAACTCCCATCTGAGCAACGGGGACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTG
GTGGTGGTGGTGGG*TAGTTTGCAAGAACCACATCTAAACCGGGAAAAGCCGTCTCTAAC
ATCTTCTTCATAGTCACTGCAGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGAAGTTGATCTCC
ACAGTGTTTCCATATCCAACTGCTCCTCCTAAGCCACTTGCCTGCTTCTGTGAAGGAAAA
TCTAGGGTTCCGGGAACGACCACAGGCGGAGGCTGCTGGTGAGGGATGTGCGGTGGATGA
TTGGGACGGTGACTCGGAGGTTTCGGAGGCGGAGGAGTGAAAAGGTTGAAGA*ATCCGAA
CAGAACAAGAAAATCGGTAAACCTATCAACAGCAATTGTGATCTGTCCATGGC
CC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4G827TF 713 0 0
GG
TTTGTCAAAGTTTTACTGATGAGATCTCTCAGCTCGATCTCTCCAGGGAATCTACCCTCT
TTCAACTTAGGGAACACCAGTTGCCTGTTGCAGAGAACTTCAAATGCGCCTGAGCTTTGA
AGGTAAGACTGGAGAAAGTTACCGATAAGCCAAGTGGAAGCCATGGATCCAAACCTATTG
GCCCTCAAGGAGTTGAACCATGCGGGTGGATGCGCAATTCCAATCATGGGAAAGACACGA
TCACCCGCAACTATCATCCCAATAACTCCCATCTGAGCAACGGGGACAACCTTAGCTAGA
AGACGCTTTGGTGGTGGTGGTGGG*TAGTTTGCAAGAACCACATCTAAACCGGGAAAAGC
CGTCTCTAACATCTTCTTCATAGTCACTGCAGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGAA
GTTGATCTCCACAGTGTTTCCATATCCAACTGCTCCTCCTAAGCCACTTGCCTGCTTCTG
TGAAGGAAAATCTAGGGTTCCGGGAACGACCACAGGCGGAGGCTGCTGGTGAGGGATGTG
*GGTGGATGATTGGGACGGTGACTCGGAGGTTTCGGAGGCGGAGGAGTGAAAAGGTTGAA
GAGATCCGAACAGAACAAGAAAATCGGTAAACCTATCAACAGCAATTGTGATCTGTCCAT
GGCGAATTATTATAAAATCTCCGATGAACAACAGAGTCCGTAAGTCTAC
CC

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR4DO34TF 715 0 0
AG
TTTACTGATGAGATCTCTCAGCTCGATCTCTCCAGGGAATCTACCCTCTTTCAACTTAGA
GAACACCAGTTGCCCGTTGCAGAGAACTTCAAATGCGCGTGAGCTTTGAAGGTAAGACTG
GAGAAAGTTACCGATAAGCCAAGTGGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGCCCTCAAGGA
GTTGAACCATGCGGGTGGATGCGCAATTCCAATCATGGGAAAGACACGATCACCCGCAAC
TATCATCCCAATAACTCCCATCTGAGCAACGGGGACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTGG
TGGTGGTGGTGGG*TAGTTTGCAAGAACCACATCTAAACCGGGAAAAGCCGTCTCTAACA
TCTTCTTCATAGTCACTGCAGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGAAGTTGATCTCCA
CAGTGTTTCCATATCCAACTGCTCCTCCTAAGCCACTTGCCTGCTTCTGTGAAGGAAAAT
CTAGGGTTCCGGGAACGACCACAGGCGGAGGCTGCTGGTGAGGGATGTGCGGTGGATGAT
TGGGACGGTGACTCGGAGGTTTCGGAGGCGGAGGAGTGAAAAGGTTGAAGAGATCCGAAC
AGAACAAGAAAATCGGTAAACCTATCAACAGCAATTGTGATCTGTCCATGGCGAATTATT
ATAAAATCTCCGATGAACAGCAGAGTCCGTAAGTCTACAATCCGATCGAAGGA

QA 3 715 3 715
DS 



AS 1 6

CO CL1580Contig1 1020 6 26 U
GAACTGAGCTCGAACTCATAGATAGCTTCTTTGACTAAGAAACAACAATGATCTTACCAA
TGAAAATTCTTCATCCACTCCATCACTCTCTCTCTTCCTCAATTCCTTTTCAATCAAGAA
GAAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCA
GACCAGAGACCGTTGTTTCTCCTGTGCCACCGGTGAGCAACGAAGGAAGAAGATTTTTAC
TTGGATGTATCCTCTCCGCTGCGTCTGGGGTTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAA
GCACCAGCAGAAGAGCGCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAATTTACTACTCTCC
CCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGAT
CTCGGGTCGCAGTACGGTCCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAG
TCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGA
GAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCA
GAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCC
TCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTCTTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGG
GACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAGATACTAATAAGAAGCGAGAAATGGATCCAGA
GCTATGGAAGCTTCATCTGTATCAGAAGAATCTGTTTAATGATACCGGCTAGTCTGGATT
CATACCCACTTCTCATCTCTTGTTCTTCTATTAGTACATGTTTGTTGTGCTTTGCAAAAA
CATCAGACTCGGTTCAATCCCATAAGCCGATAAGATACTTTACTTATGGTTCGAATATAA
AATCTAGGCTGGAACCTTTTTACAGAAGTTCTTAACCTTTTAAATGGAAATTTTCCTATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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AF RR4FO72TF U 4
AF RR4CK51TF U 4
AF RR4CK51JQ C 210
AF RR4FO72JQ C 347
AF RR4G836JQ C 361
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GAAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCA
GACCAGAGACCGTTGTTTCTCCTGTGCCACCGGTGAGCAATGAAGGAAGAAGATTTTTAC
TTGGATGTATCCTCTCCGCTGCGTCTGGGGTTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAA
GCACCAGCAGAAGAGCGCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAATTTACTACTCTCC
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GAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCC
TCCTAACG

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GG
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CAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCAGACCA
GAGACCGTTGTTTCTCCTGTGCCACCGGTGAGCAACGAAGGAAGAAGATTTTTACTTGGA
TGTATCCTCTCCGCTGCGTCTGGGGTTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAAGCACC
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GTCGCAGT*****CCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGAC
AAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGAGAACG
GGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGAC
TGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTA
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GG
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ATTCTTC***CACTCCATCACTCTCTCTCTTCCTCAATTCCTTTTCAATCAAGAAGAAGG
CAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCAGACCA
GAGACCGTTGTTTCTCCTGTGCCACCGGTGAGCAACGAAGGAAGAAGATTTTTACTTGGA
TGTATCCTCTCCGCTGCGTCTGGGGTTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAAGCACC
AGCAGAAGAGCGCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAATTTACTACTCTCCCCAAT
GGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATCTCGG
GTCGCAGTACGGTCCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGAC
AAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGAGAACG
GGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGAC
TGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTA
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GGA*GCT*CATCTGTATCAGAAGA*TCTGTT**ATGATACCGGCTAGTCTGGAT
C

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AAGATACCTGACAGCGAATTTACTACTCTCCCCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAA
GTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATCTCGGGTCGCAGTACGGTCCACTATGTTG
CAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAA
CGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACC
TTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTG
CTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTG
AGCTCTTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGGGACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAG
ATACTAATAAGAAGCGAGAAATGGATCCAGAGCTATGGAAGCTTCATCTGTATCAGAAGA
ATCTGTTTAATGATACCGGCTAGTCTGGATTCATACCCACTTCTCATCTCTTGTTCTTCT
ATTAGTACATGTTTGTTGTGCTTTGCAAAAACGTCAGACTCGGTTCAATCCCATAAGCCG
ATAAGATACTTTACTTATGGTTCGAATATAAAATCTAGGCTGGAACCTTTTTACAG
C

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DS 

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GGCTGTGAAAGGATCTCGGGTCGCAGT*****CCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATA
ACGTTCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGAC
GTTGGACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATG
CATGTAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGA
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CAGAGTCCTTTCGGGACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAGATACTAATAAGAAGCGA
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GGCTAGTCTGGATTCATACCCACTTCTCATCTCTTGTTCTTCTATTAGTACATGTTTGTT
GTGCTTTGCAAAAACATCAGACTCGGTTCAATCCCATAAGCCGATAAGATACTTTACTTA
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GAAATTTTCCTATC

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DS 

RD RR4G836JQ 660 0 0
CCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGAT
CTCGGGTCGCAGTACGGTCCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAG
TCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGA
GAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCA
GAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCC
TCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTCTTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGG
GACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAGATACTAATAAGAAGCGAGAAATGGATCCAGA
GCTATGGAAGCTTCATCTGTATCATAAGAATCTGTTTAATGATACCGGCTAGTCTGGATT
CATACCCACTTCTCATCTCTTGTTCTTCTATTAGTACATGTTTGTTGTGCTTTGCAAAAA
CATCAGACTCGGTTCAATCCCATAAGCCGATAAGATACTTTACTTATGGTTCGAATATAA
AATCTAGGCTGGAACCTTTTTACAGAAGTTCTTAACCTTTTAAATGGAAATTTTCCTA
CC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 4

CO CL1581Contig1 731 4 6 U
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GGAGGTTACACTAGAAACCTCCATGGGTCCGTTCACCGTCGAGATGTATTACAAACACTC
CCCGAGAACTTGCCGTAACTTCGTCGAGCTATCACGGAGAGGTTACTACGACAACGTTCT
CTTCCACAGAATCATCAAGGATTTCATCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAACTGGAAG
AGGTGGCCAATCCATTTACGGTTCAAAGTTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTTGAAGCA
CACGGGAGCTGGGATCTTGTCAATGGCAAACGCTGGTCCTAACACAAACGGGAGCCAGTT
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CTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACACCGACAG
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AACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTACTATGGG
GACTGGTTTTTGTCAGGTTTTGACTCTTCCTGACCAAAAAAAATGTTTCAAGGTTGATTT
TAATCAGTTCACTATCTATGTTTCTGTAATACGGATCGTTTCTATCAAAAACCATCTATC
CTAATTTCTCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D869TF U 1
AF RR4CD90JQ C 10
AF RR4BV37JQ C 173
AF RR4BV37TF U 173
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BS 386 613 RR4D869TF
BS 614 731 RR4BV37TF

RD RR4D869TF 613 0 0
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CCCGAGAACTTGCCGTAACTTCGTCGAGCTATCACGGAGAGGTTACTACGACAACGTTCT
CTTCCACAGAATCATCAAGGATTTCATCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAACTGGAAG
AGGTGGCCAATCCATTTATGGTTCAAAGTTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTTGAAGCA
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CTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCTTCATTGGATGGAAAGCACACGATATTTGGCAGAGT
CTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACACCGACAG
GCCAATCCATGAAGTGAAGATTCTGAGGACCAAAGTGATTGATTAGAAGCAACATTAGTA
AACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTACTATGGG
GACTGGTTTTTGT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4CD90JQ 678 0 0
TGTCGCTGCTCTCTCTGAG
AAAATGACGGCGAGACCTGAAGGAAGTCCCCCGGAGGTTACACTAGAAACCTCCATGGGT
CCGTTCACCGTCGAGATGTATTACAAACACTCCCCGAGAACTTGCCGTAACTTCGTCGAG
CTATCACGGAGAGGTTACTACGACAACGTTTTCTTCCACAGAATCATCAAGGATTTCATC
GTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAACTGGAAGAGGTGGCCAATCCATTTATGGTTCAAAG
TTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTTGAAGCACACGGGAGCTGGGATCTTGTCAATGGCA
AACGCTGGTCCTAACACAAACGGGAGCCAGTTCTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCTTCA
TTGGATGGAAAGCACACGATATTTGGCAGAGTCTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGG
CTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACACCGACAGTCCAATCCATGAAGTGAAGATTCTGAGG
ACCAAAGTGATTGATTAGAAGCAACATTAGTAAACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACC
TATTCTATACTGATCCTTGCTACTACTATGGGGACTGGTTTTTGTCAGGTTTTGACTCTT
CCTGACCAAAAAAAATGTTTCACGGTTGATTTTAATCAGTTCACTATCTATGTTTCTG
C

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GG
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TCAGTTCTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCCTCCTTGGATGGAAAGCATACGATATTTGG
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TTATTAAACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTAC
TATGGGGACTGGTTTTTGTCAGGTTTTGACTCTTCCTGACCAAAAAAAATGTTTCAAGGT
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QA 3 539 3 539
DS 

RD RR4BV37TF 559 0 0
GG
CGTTCTGTTCCACAGAATTATTAAGGATTTCATCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAAC
TGGAAGAGGTGGCCAATCCATTTACGGTTCCAAGTTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTT
GAAGCACACGGGAGCTGGGATCTTGTCAATGGCAAACGCTGGTCCTAACACAAATGGGAG
TCAGTTCTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCCTCCTTGGATGGAAAGCATACGATATTTGG
CAGAGTCTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACAC
CGACAGGCCAATCCATGAAGTGAAGATTCTGAGGACCAAAGTGATTGATTAGAAGCAACA
TTATTAAACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTAC
TATGGGGACTGGTTTTTGTCAGGTTTTGACTCTTCCTGACCAAAAAAAATGTTTCAAGGT
TGATTTTAATCAGTTCACTATCTATGTTTCTGTAATACGGATCGTTTCTATCAAAAACCA
TCTATCCTAATTTCTCT

QA 3 559 3 559
DS 



AS 1 5

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TCTGTAGATTTCCAGACTTCAAAGTCAAGTATCTGAATCCAAATCTCTGACAATGGAAGC
AAACCAGTTATATGGTTTGTCTACACTTGTCCTCATTCTACTACTATCACTGACTTCGAC
AGTGACATCAAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACAATGTGTTCTTCCTGCGACAATCCTTG
TAATCCCGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCACCTTCCCGTCCACCACCGTCACCATC
AACCACTACCGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTCCGGTGGTGGTAGCTCTTA
CTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGACAAATACCCTCCTCCTTACGGTGACGG
CGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTATCCCACGCCGCCTCCGCC
GAACCCTATCGTCCCTTATTTCTCGTTTTACTATCATACGCCACCGCCAGGTTCTGGTTC
AGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTT*CGCCATGTTCCTCTGTT
TAATATAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGCCTCGCCGGATAATACGTTCAAGACGGA
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CATGAAAACCAGATGTTGGACCAAATGATTGATTAGCTTTTACTTTCTTGAATCTGTATA
ACTCTTTTTCTTGAAAATTTGTGTTGAAAAGTTTATTGTTAATTAACAATTTAATTACTC
GATATTCAGAAATAAATAATTGTTACTTTCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN29TF U 1
AF RR4BB17JQ C 538
AF RR4FL40TF U 38
AF RR4BB17TF U 43
AF RR4BN29JQ C 229
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BS 751 760 RR4FL40TF
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BS 797 797 RR4BN29JQ
BS 798 873 RR4BB17TF

RD RR4BN29TF 696 0 0
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TAATCCCGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCACCTTCCCGTCCACCACCGTCACCATC
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CGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTATCCCACGCCGCCTCCGCC
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AGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTT*CGCCATGTTCCTCTGTT
TAATATAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGCCTCGCCGGATAATACGTTCAAGACGGA
ACAGTGGGGGCAGATCGGTAGATCTACCATAGTCCT

QA 1 696 1 696
DS 

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QA 1 160 1 160
DS 

RD RR4FL40TF 741 0 0
TTTTT
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TTCTTGCGACAATCCTTGTAATCCCGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCACCTTCCCG
TCCACCACCGTCACCATCAACCACTACCGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTC
CGGTGGTGGTAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGACAAATACCC
TCCTCCTTACGGTGACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTA
TCCCACGCCGCCTCCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCCCGTTTTACTATCATACGCC
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TCGCCATGTTCCTCTGTTTAATATAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGCCTCGCCGGA
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*TTTTAGATATCATTGATCATGAAAAC*AGATGTTGGAC*AAATGAT*GATTAGCTTT*A
CTTTCTTGA
TCTGTAT

QA 6 734 6 734
DS 

RD RR4BB17TF 831 0 0
CTCACTCTCTCTCTTACCTCTGTAGATTTCCAGACTTCAAAGTCAAGTATCTGAATCCAA
ATCTCTGACAATGGAAGCAAACCAGTTATATGGTTTGTCTACACTTGTCCTCATTCTACT
ACTATCACTGACTTCGACAGTGACATCAAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACAATGTGTTC
TTCCTGCGACAATCCTTGTGGTCCCGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCACCTTCCCG
CCCACCACCGTCACCATCAACCACTACCGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTC
CGGTGGTGGTAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGACAAATACCC
TCCTCCTTACGGTGACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTA
TCCCACGCCGCCTCCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCCCGTTTTACTATCATACGCC
ACCGCCAGGTTCTGGTTCAGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTT
*CGCCATGTTCCTCTGTTTAATATAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGCCTCGCCGGA
TAATACGTTCAAGACGGAACAGTGGGGGCAGATCGGTAGATCTACCATAGTCCTTTGAAG
GTTTTAGATATCATTGATCATGAAAACCAGATGTTGGACCAAATGATTGATTAGCTTTTA
CTTTCTTGAATCTGTATAACTCTTTTTCTTGAAAGTTTGTGTTGAAAAGTTTATTGTTAA
TTAACAATTTAATTACTCGATATTCAGAAATAAATAATTGTTACTTTCCAA

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4BN29JQ 621 0 0
CGACAATCCTTGTAATCCCGTCCCATCATATCCTCCCCTTCCGCCACCTTCCCGTCCACC
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TGGTAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGACAAATACCCTCCTCC
TTACGGTGACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTATCCCAC
GCCGCCTCCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCTCGTTTTACTATCATACGCCACCGCC
AGGTTCTGGTTCAGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTT*CGCCA
TGTTCCTCTGTTTAATATAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGCCTCGCCGGATAATAC
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TGAATCTGTATAACTCTTTTTCTTGAAAATTTGTGTTGAAAAGTTTATTGTTAATTAACA
ATTTAATTACTCGATATTCAG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 6

CO CL1583Contig1 772 6 8 U
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TACAGAAGAAAAAAAGAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCA
CTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCACCT
TCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAG
ATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGACGAACT
AGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCT
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AGGAGATTCAACGCGCTTGCTATAAAGAGACTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTA
AGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTT
AAGGGGAAGAAAGTTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACCTATCTG
ATCTTGTATGTCCTTGCTGGTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTATTTTGTCTAGTTTCTCT
GTTTAAAATGTGATTTGTGTAATCCCTGATACTTTGGTTTGAATCGCGCGAGTCATGTAA
AAGTTCAAAACTAATACCGTTCCAGCAGATAATGTCAAAGATGATCAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY24TF U 1
AF RR4DY24JQ C 32
AF RR4FY36JQ C 227
AF RR4DY40JQ C 167
AF RR4DY40TF U 47
AF RR4FY36TF U 48
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BS 198 198 RR4DY40TF
BS 199 488 RR4DY24TF
BS 489 489 RR4DY40TF
BS 490 545 RR4DY24TF
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BS 722 726 RR4FY36TF
BS 727 772 RR4DY24JQ

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TACAGAAGAAAAAAAGAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCA
CTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCACCT
TCAAACGCTCCCAATAATCAGAGTCTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAG
ATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGACGAACT
AGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCT
GAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTG
AGGAGATTCAACGCGCTTGCTATAAAGAGACTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTA
AGGCACATTCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTT
AAGGG

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4DY24JQ 741 0 0
TCTTCGTTCTTCTTCTTCGTCGCAAAGGATACAGAAGAAAAAAAGAAATGGCGCAGATGG
TTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTC
TCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCACCTTCAAACGCTCCCAATAATCAGAGTCTAAGCA
TCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTC
TTCAGTACATTCACGGCATTGGACGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGA
TGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAG
TCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAACGCGCTTGCTATAAAGAGAC
TGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTAAGGCACATTCAAGGCCTGCCATGTCGTGGAC
AGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGGAAGAAAGTTGCTATTGCTGGCAAGA
AGAAAGTTTCCAAGTAACCTACCTATCTGATCTTGTATGTCCTTGCTGGTGTTCTGTAAT
ACTCCTTTTTTATTTTGTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTGTGTAATCCCTGATA
CTTTGGTTTGAATCGCGCGAGTCATGTAAAAGTTCAAAACTAATACCGTTCCAGCAGATA
ATGTCAAAGATGATCAGCTCC

QA 1 741 1 741
DS 

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GTTACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACA
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TGTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTGTGTAATCCCTGATACTTTGGTTTGAATCG
CGGGAGTCATGTAAAAGTTC

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DS 

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TTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACG
GCATTGGACGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCA
CCAAATACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGA
TCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAACGCGCTTGCTATAAAGAGACTGAAGGAGATCCAAT
GTTACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACA
ACTGCAGGACTCTTAGGGGGAAGAAAGTTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGT
AACCTACCTATCTGATCTTGTATGTCCTTGCTGGTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTATTT
TGTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTGTGTAATCCCTGATACTTTGGTTTGAATCG
CGCGAGTCATGTAAAAGTTC

QA 1 560 1 560
DS 

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GGG
GTCGCAAAGGATACAGGAGAAAAAA*GAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGC
ACTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTT
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GTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCA
TTGGACGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCA
AATACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCG
AGGGTGATCTGAGGAGATTCAACGCGCTTGCTATAAAGAGACTGAAGGAGATCCAATGTT
ACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACT
GCAGGACTCTTAGGGGGAAGAAAGTTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAAC
CTACCTATCTGATCTTGTATGTCCTTGCTGGTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTATTTTGT
CTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTGTGTAATCCCTGATACTTTGGTTTGAATCGCGC
GAGTCATGTAAA
GTTCAAACC

QA 4 675 4 675
DS 

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GG
GTCGCAAAGGATACAGAAGAAAAAA*GAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGC
ACTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTT
CTCTCCCACCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTG
GTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCA
TTGGACGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCA
AAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCG
AGGGTGATCTGAGGAGATTCAACGCGCTTGCTATAAAGAGACTGAAGGAGATCCAATGTT
ACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACT
GCAGGACTCTTAAGGGGAAGAAAGTTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAAC
CTACCTATCTGATCTTGTATGTCCTTGCTGGTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTATTTTGT
CTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTGTGTAATCCCTGATACTTTGGTTTGAATCGCGC
GAGTCATGTAAAAGTTC

QA 3 679 3 679
DS 



AS 1 3

CO CL1584Contig1 1280 3 12 U
GAACATTATTGGATCATTATCGTTACTACTTATCTACAAAGTTTACTAATGACTTGTCAA
GTTTTTTTAACAAGTAAACGCTATGAATGAATCATTAATATGATTTCAAATGTATATCTG
AGTTCTGCTTCCATCAAAGTAATAGTAGTGGTTGCATATAAAACAAAGTTGATTCTTTAG
GCTTCTGAGAAAAAAAAACTAAAAAGCAATTTGATCGATTCACAGATGGGAGTGTAGATG
CAGCGTCTTGCTAGTTTTACCTTTGAGGAGCTTTCACAAGAACAGAGATGTGGAGATAGA
ATTCTGGGTTCATCAAGTTATTTACCACCCATGAAAACGGTATCTCTAGTCTCACTTCTA
TCCCTTGGATCCTTACCAGTTTGACTTCTCCCCTCGTCTCCTGCGACCCATCTCCTTCCT
CTTCTCCACTCGTTTGAGCTCTGTCTCCACTGTACTCCGGGAGGAGACTTTCAATGGCGT
CACGTAAAGTAAAGCATTTCCCTTCTTCTCTGAGGAACTCAACAGGGCGATTCAAGTACG
AAATCTCATCCCATGTATCGATCTCAGGTACATCTTCAAGATTCTCGAAATCTTTATTCA
CACTTCGAACATACAGCCGAACAGGAATCCTCGCTGTCTTAACTTGTCCAGCCACATCTG
TCTCAGTCCCACCTTGTTTAGATTGTGGAGATGACAAATTTGTTTTTCTTGAAAACTCAT
CTTCGATATTTCCCATTTTAAGCTTGGGTAATAATCTTGTGTAGGACTCAAGATCACCGT
TCATGACAGAGGTCCATAGATCCTCTTGATCACTCTGAGACATATTCGTAACATTCTTGC
AGTTTCCGTTGATGATATACGCCGCCTCTTTCAAAGAATTAACAAAGTTCCATTTGACAG
AATCTTCTCCTTCACATGGAATCAGCACGTTGCTAGGATATCCCCTAAAGTGTATAGTGA
GATTCCAAGGTCTTTCAGGTTCTGTGCATATGAGATCGAAAAGAACACCTGTTGGTATAT
ACCATTTAAGAGGAAAGCCTTTGTAATCGAACCAGATGGAATCTTCACCAGGAGGAAGTG
AATCCTTGAAGTAAGGCTTTATAAGAGGAATTAACAGAGGCAAGTACCCTATCCTTGGTG
CTAATACGAGAGCAGGAGGAGGAGCAGGGTGAGAAGCGACTTCGGATTTGTGGAGATGGA
TCTGCAGCGGAATTGCTCCTTCCCATACATACTTCACCGCTTCTTCTTCATTCGCCGCCA
TTCTCTTCTTCTTCCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO37JQ U 1
AF RR4BJ07JQ U 89
AF RR4CO37TF C 595
BS 1 136 RR4CO37JQ
BS 137 137 RR4BJ07JQ
BS 138 201 RR4CO37JQ
BS 202 202 RR4BJ07JQ
BS 203 241 RR4CO37JQ
BS 242 242 RR4BJ07JQ
BS 243 486 RR4CO37JQ
BS 487 487 RR4BJ07JQ
BS 488 541 RR4CO37JQ
BS 542 542 RR4BJ07JQ
BS 543 834 RR4CO37JQ
BS 835 1280 RR4CO37TF

RD RR4CO37JQ 834 0 0
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GTTTTTTTAACAAGTAAACGCTATGAATGAATCATTAATATGATTTCAAATGTATATCTG
AGTTCTGCTTCCATCAGAGTAATAGTAGTGGTTGCATATAAAACAAAGTTGATTCTTTAG
GCTTCTGAGAAAAAAAAACTAGAAAGCAATTTGATCGATTCACAGATGGGAGTGTAGATG
CGGCGTCTTGCTAGTTTTACCTTTGAGGAGCTTTCACAAGAACAGAGATGTGGAGATAGA
ATTCTGGGTTCATCAAGTTATTTACCACCCATGAAAACGGTATCTCTAGTCTCACTTCTA
TCCCTTGGATCCTTACCAGTTTGACTTCTCCCCTCGTCTCCTGCGACCCATCTCCTTCCT
CTTCTCCACTCGTTTGAGCTCTGTCTCCACTGTACTCCGGGAGGAGACTTTCAATGGCGT
CACGTACAGTAAAGCATTTCCCTTCTTCTCTGAGGAACTCAACAGGGCGATTCAAGTACG
AGATCTCATCCCATGTATCGATCTCAGGTACATCTTCAAGATTCTCGAAATCTTTATTCA
CACTTCGAACATACAGCCGAACAGGAATCCTCGCTGTCTTAACTTGTCCAGCCACATCTG
TCTCAGTCCCACCTTGTTTAGATTGTGGAGATGACAAATTTGTTTTTCTTGAAAACTCAT
CTTCGATATTTCCCATTTTAAGCTTGGGTAATAATCTTGTGTAGGACTCAAGATCACCGT
TCATGACAGAGGTCCATAGATCCTCTTGATCACTCTGAGACATATTCGTAACAT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4BJ07JQ 709 0 0
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TGGTTGCATATAAAACAAAGTTGATTCTTTAGGCTTCTGA**AAAAAAAACTAAAAAGCA
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AGCTTTCACAAGAACAGAGATGTGGAGATAGAATTCTGGGTTCATCAAGTTATTTACCAC
CCATGAAAACGGTATCTCTAGTCTCACTTCTATCCCTTGGATCCTTACCAGTTTGACTTC
TCCCCTCGTCTCCTGCGACCCATCTGCTTCCTCTTCTCCACTCGTTTGAGCTCTGTCTCC
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TCTGAGGAACTCAACAGGGCGATTCAAGTACGAAATCTCATCCCATGTATCGATCTCAGG
TACATCTTCAAGATTCTCGAAATCTTTATTGACACTTCGAACATACAGCCGAACAGGAAT
CCTCGCTGTCTTAACTTGTCCAGCCACATCTGTCTCAGTCCCACCTTGTCGAGATTGTGG
AGATGACAAATTTGTTTTTCTTGAAAACTCATCTTCGATATTTCCCATTTTAAGCTTGGG
TAATAATCTTGTGTAGGACTCAAGATCACCGTTCATGACAGAGGTCCAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4CO37TF 686 0 0
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CATCTGTCTCAGTCCCACCTTGTTTAGATTGTGGAGATGACAAATTTGTTTTTCTTGAAA
ACTCATCTTCGATATTTCCCATTTTAAGCTTGGGTAATAATCTTGTGTAGGACTCAAGAT
CACCGTTCATGACAGAGGTCCATAGATCCTCTTGATCACTCTGAGACATATTCGTAACAT
TCTTGCAGTTTCCGTTGATGATATACGCCGCCTCTTTCAAAGAATTAACAAAGTTCCATT
TGACAGAATCTTCTCCTTCACATGGAATCAGCACGTTGCTAGGATATCCCCTAAAGTGTA
TAGTGAGATTCCAAGGTCTTTCAGGTTCTGTGCATATGAGATCGAAAAGAACACCTGTTG
GTATATACCATTTAAGAGGAAAGCCTTTGTAATCGAACCAGATGGAATCTTCACCAGGAG
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GATGGATCTGCAGCGGAATTGCTCCTTCCCATACATACTTCACCGCTTCTTCTTCATTCG
CCGCCATTCTCTTCTTCTTCCGTCCC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

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GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
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CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATCATACTCAAAAAGACTGCCACAG
AGTTCAGTCTGTATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4A312JQ C 1
AF RR4A312JQD C 1
AF RR4GO88JQ C 1
AF RR4GO88TF U 1
AF RR4A312TF U 1
AF RR4A312TFB U 1
BS 1 528 RR4GO88TF
BS 529 529 RR4A312TF
BS 530 584 RR4GO88TF

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TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
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CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTTTGCATCATACTCAAAAAGACTGCCACAG
AGTTCAGTCTGTATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4A312JQD 584 0 0
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ATCCATCATCATCATCGTTCACAAGGAGCTTCATTCCGATCTGATCAAACATGGCTTTCC
TTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAATCT
GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATCATACTCAAAAAGACTGCCACAG
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QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4GO88JQ 575 0 0
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GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
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QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4GO88TF 584 0 0
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GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
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GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
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QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4A312TF 584 0 0
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GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
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QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4A312TFB 584 0 0
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GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
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QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 6

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CTTCCTTCCACCGCGTGATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGA
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AGCACACCGGGGCTGGGATCCTCTCGATGGCGAACTCTGGTCCCAACACCAACGGATCTC
AGTTTTTTATTTGCACCGCGGAGACGTCGTGGCTGGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGA
AGGTCGTTGAAGGTATTGAGGTTGTGAAGGCGATCGAGAAGGTTGGATCGTCTTCAGGGA
CGACGAAGAAGAAGGTGGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGAT
CTTTTGAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGT
AAAACCCTCAGTGGTTTTGGATTTGACTATCTATGAATAATTATGAATAACTATGAGCTT
TTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 10 10 40 10 40 10 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4EO29TF U 1
AF RR4EO29JQ C 40
AF RR4CO65TF U 4
AF RR4AL69TF U 4
AF RR4CO65JQ C 34
AF RR4AL69JQ C 42
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GGTTTTTTATTTGCACCGCGGAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGA
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CTTTTGAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGT
AAAACCCTCAGCGGTTTTGGATTTGACTATCTATGAATAATTATGAA
CAAAAAA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EO29JQ 666 0 0
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CTCTCGACGGAACCCC*GCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTTTTCAAAGACACGACGCCGG
ACACCGCGGAGAATTTCCGAGCCCTTTGCACCGGAGAGAAAGGAGTCGGGAGGATGGGGA
AGCCGCTCCACTACAAGGAATCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCGGGGTTCATGTGCCAAG
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AGGTTGGATCGTCTTCAGGGACGACTAAGAAGAAGGTGGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGC
TTTAGAGATCTGTGCGAAGATCTTTTGAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTTGCTTTTG
CTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAAACCCTCAGCGGTTTTGGATTTGACTATCTATGAATA
ATTATG

QA 1 666 1 666
DS 

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TGCACCAGAGAGAAAGGAGTCGGGAGGATGGGGAAGCCGCTCCACTACAAGGGATCTTCC
TTCCACCGCGTGATGGTGATGGTGATGGTCCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGAACGGA
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ACCGGGGCTGGGGTCCTCTCCATGGCCAACTCTGGTCCCAACACCAACGGATCTCATTTT
TTTATTTGCACCGCGGAGACGTCGTGGCTGGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTC
GTTGAAGGTATTGAGGTTGTGAAGGCGATCGAGAAGGTTGGATCGTCTTCAGGGACGACG
AAGAAGAAGGTGGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGATCTTTT
GAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAA*C
CCTCAGTGGTTTTGGATTTGACTATCTATGAATAATTATGA*TAACTATGAG

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR4AL69TF 722 0 0
GG
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GAAATGGCTAACCCTAGAGTTTACTTCGACATGGCTCTCGACGGAACCCCCGCCGGCCGC
ATCGTGATGGAGCTTTTCAAAGACACGACGCCGGACACCGCGGAGAATTTCCGAGCCCTT
TGCACCGGAGAGAAAGGAGTCGGGAGGATGGGGAAGCCGCTCCACTACAAGGGATCTCCC
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ACCGGGGCTGGGATCCTCTCGATGGCGAACTCTGGTCCCAACACCAACGGATCTCAGTTT
TTTATTTGCACCGCGGAGACGTCGTGGCTGGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTC
GTTGAAGGTATTGAGGTTGTGAAGGCGATCGAGAAGGTTGGATCGTCTTCAGGGACGACG
AAGAAGAAGGTGGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGATCTTTT
GAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTTGAGTTTGTAAAAC
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QA 3 722 3 722
DS 

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CTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAAACCCTCAGTGGTTTTGGATTTGACTATCTA
TGAATAATTATGAATAACTATGAGCTTTTTAA
CC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4AL69JQ 686 0 0
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CTCGACGGAACCCCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTTTTCAAAGACACGACGCCGGAC
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CCGCTCCACTACAAGGGATCTCCCTTCCACCGCGTGATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGA
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CCCAACACCAACGGATCTCAGTTTTTTATTTGCACCGCGGAGACGTCGTGGCTGGATGGG
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GTTGGATCGTCTTCAGGGACGACGAAGAAGAAGGTGGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGCTT
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TCGTATCGTTTGAGTTTGTAAAACCCTCAGTGGTTTTGGATTTGACTATCTATGAATAAT
TATGAATAACTATGAGCTTTTTAACT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

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AATATTGTTACAAAAAAGAGTAATTATTAATACCTACTAATCAATCAAAAAATGAAGACC
ATTCCGTTAATGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAAG
AGTAACAAGCTCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCA
AAAAATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCA
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CTTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAG
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TCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATTTTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAG
TTCAATATCTGTATTTGTTTTTTTTTTTTAATGTATTTTCCTAAATAAAACTGAAAAGGT
TTAGTC


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 10 

AF RR4CO54TF U 1
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AF RR4DR91JQ C 36
AF RR4DZ64JQ C 3
AF RR4DZ64TF U 3
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AAAAATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCA
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TCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATTTTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAG
TTCA*TATCTGTATTTGTTTTTTTTTT**AATGTATTTTCCTAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4CC71TF 651 0 0
GGA
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CTG

QA 4 648 4 648
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RD RR4DR91TF 664 0 0
GG
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ATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCATCAA
GATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATACAGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAACTTT
TCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGCGTA
AGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATCGTC
AGTTATTTCCTAATTTTGTTTTAATCAAGTTATTGTTTAATAGGAGAGATTATTGGTCTT
GTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATTTTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAGTTCA
ATATCTGTATTTGTTTTTTTTTTTTAATGTATTTTCCTAAATAAAACTGAAAAGGTTTAG
TC

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4DR91JQ 627 0 0
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TGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAAAAAATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACA
ACATACAGGAATACAAAGACCTCCATCAAGATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATAC
AGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAACTTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGA
TCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGCGTAAGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCT
TCAAACCAAATTGGAGATATTTTATCGTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTTTAATCAAGTT
ATTGTTTAATAGGAGAGATTATTGGTCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATT
TTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAGTTCAATATCTGTATTTGTTTTTTTTTTTTAATGTA
TTTTCCTAAATAAAACTGAAAAGGTTT

QA 1 627 1 627
DS 

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GG
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ATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCATCAA
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AGTC

QA 3 660 3 660
DS 

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GG
AACTAAATT*GTTTCAAATTTCTCAATAAATATTTATTCAAGGCTAAGTAATTATCAATA
TTGTTACAAAAAAGAGTAATTATTAATACCTACTAATCAATCAAAAAATGAAGACCATTC
CGTTAATGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAAGAGTA
ACAAGCTCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAAAAA
ATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCATCAA
GATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATACAGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAACTTT
TCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGCGTA
AGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATCGTC
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GTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATTTTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAGTTCA
ATATCTGTATTTGTTTTTTTTTTTTAATGTATTTTCCTAAATAAAACTGAAAAGGTTT
AGTC

QA 3 660 3 660
DS 



AS 1 6

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GAACAAAAGTTTTTTTAACATGGCCACAATGGGATATGAAAAAACAATTATGTCCAAAAT
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TCTCTTAGAATCCAGATCAAATCATTTTGAGACTATCACAAGCCACAGCTTCCGATGACT
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ATTGTGTGTGAGTGATGAATTTCATCGACGATGCTGAGATCTTTGGTTTCAAGCTGCGGA
CTTTGGAGCCTCGCTGCCTCTGATGACTCTGCTATAAGCAATCTTGAACGGTTGAGAATC
ATAAGGCCTGTTGAGCAAACTGATGGGCATTCTCAGTGTCTGTTTCCGGTTTCTTCTTCC
TCCTAACAAAATGCTAAAAGTCCTCTCGTCATCCTCAAATTTCTTGTTTCCATTCTCCAT
TTCACTGCTAGCAACTACATTCACATGATTAACAGAATCCATAGTTTCACCCGCGGTTGC
CGCCACATCTTGCTTGCTTTCTTCCACTCCTGAAGTGTCAATATCAGTTGGTAGAATCAC
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GCCATGGGAACTGATTGGGATGGAAAGGACCGCTGGTTACAGGATACGTACTTGTGGGGA
CTGATTGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF59JQ U 55
AF RR4GF59TF C 55
AF RR4FF44JQ U 112
AF RR4FF44TF C 110
AF RR4FT05JQ U 1
AF RR4DG48JQ U 60
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C

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ATAAGGCC
C

QA 7 434 7 434
DS 

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T
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CCGCGGTTGCCGCCACATCTTGCTTGCTTTC

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DS 

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QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4DG48JQ 852 0 0
C
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CTTTGGAGCCTCGCTGCCTCTGATGACTCTGCTATAAGCAATCTTGAACGGTTGAAAATC
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TCTTAACAAAATGCTAAAAGTCCTCTCGTCATCCTCAAATTTCTTGTTTCCATTCTCCAT
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GCCATGGGAACTGATTGGGATGGAAAGGACCGCTGGTTACAGGATACGTACTTGTGGGGA
CTGATTGAGTG

QA 2 852 2 852
DS 



AS 2 6

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CCTCGTTCCTTAACCAGTCCACCAAACCCATCTCTCTAAAGCGGAGAACCGTGGCTCTTG
CAGCTCCAGAGACCCTCACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCAC
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GGATGGAGAAGAACATAGGATTGGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCAAATCCC
ACTGAGTCCTTACTTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCT
TGAAGCCAAGCCCATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCCTTAATCAAGCCCAC
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TTTTTTATTTATTTTGCAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTGTCTTATTGATATTTT
GCTATTCAGACCTATTTGTTACAATCATATCTAAACAATACCTCCCATCATATATAAACA
ATACCCTCGAGTTGATTGAATGTTG


BQ
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A292JQ C 72
AF RR4A292TF U 12
AF RR4A292JQD C 1
AF RR4A292TFB U 1
BS 1 23 RR4A292TFB
BS 24 429 RR4A292TF
BS 430 685 RR4A292TFB

RD RR4A292JQ 364 0 0
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AACCAGTCCACCAAACCCATCTCTTTAAAGCGGAGAACCGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAG
ACCCTCACATTTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAG
GTGGTGAATCAACAAGATGAAAAGGCAAGAGTGGTTTTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAG
AACATAGGATTGGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCAAATCCCACTGAGTCCTT
ACTTTTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAA
GCCCTG

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4A292TF 418 0 0
TCAAGAAACAAG
AAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCTTCTTTC
ATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAGTCCACC
AAACCCATCTCTCTAAAGCGGAGAACCGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACCCTCACATCT
GAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTGGTGAATCAA
CAAGATGAAAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAACATAGGATTG
GGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCAAATCCCACTGAGTCCTTACTTCTTCTGGC
CAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAA

QA 13 418 13 418
DS 

RD RR4A292JQD 685 0 0
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CTGCTTCCCTCTGCTCTTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTC
CCTCGTTCCTTAACCAGTCCACCAAACCCATCTCTCTAAAGCGGAGAACCGTGGCTCTTG
CAGCTCCAGAGACCCTCACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCAC
AGCCAAAACAGGTGGTGAATCAACAAGATGAAAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGT
GGATGGAGAAGAACATAGGATTGGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCAAATCCC
ACTGAGTCCTTACTTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCT
TGAAGCCAAGCC*ATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCC*TTAATCAAGCC*AC
TGACATCATCAATCTCTGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCC*AATAATCTCTCT
TTTTTTATTTATTTTGCAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTGTCTTATTGATATTTT
GCTATTCAGACCTATTTGTTACAATCATATCTAAACAATACCTCCCATCATATATAAACA
ATACCCTCGAGTTGATTGAATGTTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4A292TFB 685 0 0
GGATAGCTCTCTCAAGAAACAAGAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCAT
CTGCTTCCCTCTGCTCTTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTC
CCTCGTTCCTTAACCAGTCCACCAAACCCATCTCTCTAAAGCGGAGAACCGTGGCTCTTG
CAGCTCCAGAGACCCTCACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCAC
AGCCAAAACAGGTGGTGAATCAACAAGATGAAAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGT
GGATGGAGAAGAACATAGGATTGGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCAAATCCC
ACTGAGTCCTTACTTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCT
TGAAGCCAAGCCCATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCCTTAATCAAGCCCAC
TGACATCATCAATCTCTGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCCAATAATCTCTCT
TTTTTTATTTATTTTGCAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTGTCTTATTGATATTTT
GCTATTCAGACCTATTTGTTACAATCATATCTAAACAATACCTCCCATCATATATAAACA
ATACCCTCGAGTTGATTGAATGTTG

QA 1 685 1 685
DS 



CO CL1589Contig2 662 2 1 U
GGATATCTTCTTCTTTCTTATCCATTTGACATAAAATCTCCATTGCTATCTCAAGAAACA
AGAAAAAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCT
TCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAG
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AAGAATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAAC
ATAGGATTAGGATTGTACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTAC
TTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGTTAAGCCA
TGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCCACTGACATCATCAATCTC
TGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTCTCTTTCTTTTTTATTTTAT
TTTGCAATTCAAGAACTTAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTTATTGATATTTTGCTATT
CT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4F380JQ C 1
AF RR4F380TF U 1
BS 1 662 RR4F380TF

RD RR4F380JQ 662 0 0
GGATATCTTCTTCTTTCTTATCCATTTGACATAAAATCTCCATTGCTATCTCAAGAAACA
AGAAAAAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCT
TCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAG
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CTCACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTG
AAGAATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAAC
ATAGGATTAGGATTGTACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTAC
TTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGTTAAGCCA
TGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCCACTGACATCATCAATCTC
TGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTCTCTTTCTTTTTTATTTTAT
TTTGCAATTCAAGAACTTAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTTATTGATATTTTGCTATT
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4F380TF 662 0 0
GGATATCTTCTTCTTTCTTATCCATTTGACATAAAATCTCCATTGCTATCTCAAGAAACA
AGAAAAAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCT
TCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAG
TCCACCAAACCCATCTCTCTAAACCGGAAAACCGTGGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACC
CTCACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTG
AAGAATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAAC
ATAGGATTAGGATTGTACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTAC
TTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGTTAAGCCA
TGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCCACTGACATCATCAATCTC
TGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTCTCTTTCTTTTTTATTTTAT
TTTGCAATTCAAGAACTTAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTTATTGATATTTTGCTATT
CT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 5

CO CL1590Contig1 1088 5 20 U
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AGGGGTGAAGTGGTTGTTTCGTCTCTTCAATTCACCTGCTCCGACGATATCTCCTCCAAC
GTCGCCGCCGCCGAAAGGCTGGTCAGAGAAGCACACTCAAAAGGAGCAAACATCGTTCTT
ATTCAGGAACTTTTTGAGGGATATTACTTCTGTCAAGCACAAAGAGAAGACTTCTTTCAG
AGAGCCAAGCCTTACAAGGACCATCCTACCATTGCAAGGATGCAGAAGCTGGCAAAGGAG
CTGGGTGTTGTGATACCCGTTAGCTTCTTCGAGGAGGCAAACAATGCGCATTACAACTCT
ATTGCCATTATTGACGCTGATGGAACTGATCTCGGGATTTATAGGAAATCCCATATTCCT
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TTCCAGACAAAGTTTGCAAAAATTGGAGTTGCTATATGTTGGGATCAATGGTTTCCTGAG
GCAGCTCGAGCTATGGTTCTACAGGGTGCTGAAATACTCTTTTATCCAACTGCCATTGGC
TCTGAGCCTCAAGACCAGGGGTTGGATTCGCGTGATCATTGGAAGAGAGTCATGCAAGGG
CATGCTGGAGCTAATGTGGTGCCTCTAGTAGCTTCGAACCGCATAGGGAAGGAAGTAATT
GAAACCGAGCATGGACCGAGTCAGATCACTTTCTATGGAAACTCCTTCATTACCGGACCG
ACGGGTGAAATTGTGGCCGAGGCCGATGACAAAACGGAAGCTGTTCTCGTGGCACAGTTT
GATCTTGACAAGATCAAGTTGAAGAGGCAAAGCTGGGGAGTGTTTCGTGACCGCCGTCCA
GATTTGTACAAGGTGCTTCTTACGATGGACGGTAACCTTTGAATCTTTTTATGCTGTTGA
AACGTCGTTCCCTAAGATGACACTGAGAAACATCGTATCTCCATAAGACCTTTACAGTAA
GTTTTATTTCTATTTTCTTCAATAAATAGAGCTCTAAATTTGCTGGCTCGTCCAGTTTTG
CTTACCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF89TF U 1
AF RR4CH16TF U 347
AF RR4BE79TF U 16
AF RR4BE79JQ C 271
AF RR4FF89JQ C 443
BS 1 93 RR4FF89TF
BS 94 94 RR4BE79TF
BS 95 305 RR4FF89TF
BS 306 306 RR4BE79TF
BS 307 310 RR4FF89TF
BS 311 311 RR4BE79TF
BS 312 603 RR4FF89TF
BS 604 605 RR4BE79TF
BS 606 688 RR4FF89TF
BS 689 689 RR4BE79TF
BS 690 710 RR4FF89TF
BS 711 813 RR4BE79TF
BS 814 814 RR4BE79JQ
BS 815 850 RR4BE79TF
BS 851 965 RR4BE79JQ
BS 966 966 RR4FF89JQ
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BS 1000 1081 RR4BE79JQ
BS 1082 1088 RR4FF89JQ

RD RR4FF89TF 710 0 0
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AGGGGTGAAGTGGTTGTTTCGTCTCTTCAATTCGCCTGCTCCGACGATATCTCCTCCAAC
GTCGCCGCCGCCGAAAGGCTGGTCAGAGAAGCACACTCAAAAGGAGCAAACATCGTTCTT
ATTCAGGAACTTTTTGAGGGATATTACTTCTGTCAAGCACAAAGAGAAGACTTCTTTCAG
AGAGCCAAGCCTTACAAGGACCATCCTACCATTGCAAGGATGCAGAAGCTGGCAAAGGAG
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ATTGCCATTATTGACGCTGATGGAACTGATCTCGGGATTTATAGGAAATCCCATATTCCT
GATGGACCAGGGTATCAGGAGAAATTTTATTTCAATCCTGGAGACACTGGCTTTAAGGTT
TTCCAGACAAAGTTTGCAAAAATTGGAGTTGCTATATGTTGGGATCAATGGTTTCCTGAG
GCAGCTCGAGCTATGGTTCTACAGGGTGCTGAAATACTCTTTTATCCAACTGCCATTGGC
TCT**GCCTCAAGACCAGGGGTTGGATTCGCGTGATCATTGGAAGAGAGTCATGCAAGGG
CATGCTGGAGCTAATGTGGTGCCTCTAGCAGCTTCGAACCGCATAGGGAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4CH16TF 462 0 0
CGCATTACAACTCCATTGCCATTATTGACGCTGATGGAACTGACCTCGGGATTTATAGGA
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CTGGCTTTAAGGTTTTCCAGACAAAGTTTGCAAAAATCGGAGTTGCTATATGTTGGGATC
AATGGTTTCCTGAGGCAGCTCGAGCTATGGTTCTACAGGGTGCTGAAATACTCTTTTATC
CAACTGCCATCGGCTCTGAGCCTCAAGACCAGGGGTTGGATTCGCGTGATCATTGGAGGA
GAGTCATGCAAGGGCATGCTGGAGCTAATGTGGTGCCTCTAGTTGCTTCGA*CCGCATAG
GGAAGGA*GTAATTGAAACCGAGCATGGACCGAGTCAGATCACTTTCTATGGAA*CTC*T
TCAT*ACCGGAC*GACGGGTGAAATTGTGGCCGAGGC
GATGA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4BE79TF 846 0 0
GG
ACCCGAGAGAAAACACAGATAGGAACGGAAAATGGAAGGAAGAAGGGGTGAAGTGGTTGT
TTCGTCTCTTCAATTCACCTGCTCCGACGATATCTCCTCCAACGTCGCCGCCGCCGAAAG
GCTGGTCAGAGAAGCACACTCAAAAGGAGCAAACATCGTTCTTATTCAGGAACTTTTTGA
GGGATATTACTTCTGTCAAGCACAAAGAGAAGACTTCTTTCAGAGAGCCAAGCCTTACAA
GGACCATCCTACCATTGCAAGGATGCAGAAGCTGGCAAAGGAGCTGGGTGTTGTGATACC
CGTTAGCTTCTTCGAGGAGGCAAACAATGCGCATTACAACTCTATTGCCATTATTGACGC
TGATGGAACTGATCTCGGGATTTATAGGAAATCCCATATTCCTGATGGACCAGGGTATCA
GGAGAAATTTTATTTCAATCCTGGAGACACTGGCTTTAAGGTTTTCCAGACAAAGTTTGC
AAAAATTGGAGTTGCTATATGTTGGGATCAATGGTTTCCTGAGGCAGCTCGAGCTATGGT
TCTACGGGGTGCTGAAATACTCTTTTATCCAACTGCCATTGGCTCTGAGCCTCAAGACCA
GGGGTTGGATTCGCGTGATCATTGGAAGAGAGTCATGCAAGGGCATGCTGGAGCTAATGT
GGTGCCTCTAGTAGCTTCGAACCGCATAGGGAAGGAAGTAATTGAAACCGAGCATGGACC
GAGTCAGATCACTTTCTATGGAAACTCCTTCATTACCGGACCGACGGGTGAAATTGTGGC
CGAGGCCGATGACAAA*CGGAAGCTGTTCTCGTGGCACAGTTTGATCTTGACA
GATCAAGTTGA

QA 3 835 3 835
DS 

RD RR4BE79JQ 811 0 0
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GAGGAGGCAAACAATGCGCATTACAACTCTATTGCCATTATTGACGCTGATGGAACTGAT
CTCGGGATTTATAGGAAATCCCATATTCCTGATGGACCAGGGTATCAGGAGAAATTTTAT
TTCAATCCTGGAGACACTGGCTTTAAGGTTTTCCAGACAAAGTTTGCAAAAATTGGAGTT
GCTATATGTTGGGATCAATGGTTTCCTGAGGCAGCTCGAGCTATGGTTCTACGGGGTGCT
GAAATACTCTTTTATCCAACTGCCATTGGCTCTGAGCCTCAAGACCAGGGGTTGGATTCG
CGTGATCATTGGAAGAGAGTCATGCAAGGGCATGCTGGAGCTAATGTGGTGCCTCTAGTA
GCTTCGAACCGCATAGGGAAGGAAGTAATTGAAACCGAGCATGGACCGAGTCAGATCACT
TTCTATGGAAACTCCTTCATTACCGGACCGACGGGTGAAATTGTGGCCGAGGCCGATGAC
AAAACGGAAGCTGTTCTCGTGGCACAGTTTGATCTTGACAAGATCAAGTTGAAGAGGCAA
AGCTGGGGAGTGTTTCGTGACCGCCGTCCAGATTTGTACAAGGTGCTTCTTACGATGGAC
GGTAACCTTTGAATCTTTTTATGCTGTTGAAACGTTGTTCCCTAAGATGACACTGAGAAA
CATCGTATTTCCATAAGACCTTTACAGTAAGTTTTATTTCTATTTTCTTCAATAAATAGA
GCTCTAAATTTGCTGGCTCGTCCAGTTTTGC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4FF89JQ 646 0 0
AATTTTATTTCAATCCTGGAGACACTGGCTTTAAGGTTTTCCAGACAAAGTTTGCAAAAA
TTGGAGTTGCTATATGTTGGGATCAATGGTTTCCTGAGGCAGCTCGAGCTATGGTTCTAC
AGGGTGCTGAAATACTCTTTTATCCAACTGCCATTGGCTCT**GCCTCAAGACCAGGGGT
TGGATTCGCGTGATCATTGGAAGAGAGTCATGCAAGGGCATGCTGGAGCTAATGTGGTGC
CTCTAGCAGCTTCGAACCGCATAGGGAAGGAAGTAATTGAAACCGAGCATGGACCGAGTC
AGATCACTTTCTATGGAAACTCCTTCATTACCGGACCGACGGGTGAAATTGTGGCCGAGG
CCGATGACAAAACGGAAGCTGTTCTCGTGGCACAGTTTGATCTTGACAAGATCAAGTTGA
AGAGGCAAAGCTGGGGAGTGTTTCGTGACCGCCGTCCAGATTTGTACAAGGTGCTTCTTA
CGATGGACGGTAACCTTTGAATCTTTTTATGCTGTTGAAACGTCGTTCCCTAAGATGACA
CTGAGAAACATCGTATCTCCATAAGACCTTTACAGTAAGTTTTATTTCTATTTTCTTCAA
TAAATAGAGCTCTAAATTTGCTGGCTCGTCCAGTTTTGCTTACCAG

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 6

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ACATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTCCTCACACCCGCAACCACCGCCGCATTCTCCCACC
AAAACCCAAACTCCATCTCCTTCCACGGCCTCCGTCCCCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCT
CCGCCTTACCCAAACTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCGTCCGCCGTCGTGA
AAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTGGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAG
GCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTGGCCAAACAGGTGCCGGAGCAGA
ACGGTAAACCCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGA
AGTCGAACGATCCAGTTGGATTCAACATCGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTC
ACATCGTTGCTTACTACGTCTTGGCCACCTCTAGCAATGGCTATGATCCTAGCTTCTTTG
GCTGATTCTTTTTTTTTCAATTTCTGTTTCAGTGTGTCTGTATATGTTTGACTTGTATCG
CAAGCTACATAATCTGTTATCCTTCTTTCCCTTGTCTCTTTCGCTTTGCAACATTTATAT
TTCCTAGTCAGAGATTAAATTCGAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H956JQB C 2
AF RR4H956TF U 175
AF RR4ED50TF U 1
AF RR4ED50JQ C 1
AF RR4F021JQ C 83
AF RR4F021TF U 1
BS 1 1 RR4ED50JQ
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BS 17 17 RR4ED50TF
BS 18 665 RR4F021TF
BS 666 685 RR4ED50JQ

RD RR4H956JQB 636 0 0
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CATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTCCTCACACCCGCAACCACCGCCGCATTCTCCCACCA
AAACCCAAACTCCATCTCCTTCCACGGCCTCCGTCCCCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTC
CGCCTTACCCAAACTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCGTCCGCCGTCGTGAA
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CCGGCTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTGGCCAAACAGGTGCCGGAGCAGAA
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CATCGTTGCTTACTACGTCTTGGCCACCTCTAGCAATGGCTATGATCCTAGCTTCTTTGG
CTGATTCTTTTTTTTTCAATTTCTGTTTCAGTGTGTCTGTATATGTTTGACTTGTATCGC
AAGCTACATAATCTGTTATCCTTCTTTCCCTTGTCT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4H956TF 463 0 0
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TCGTGAAAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTGGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCT
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AGCAGAACGGTAAACCCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCC
TCTTGAAGTCGAACGATCCAGTTGGATTCAACATCGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTA
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TCTTTGGCTGATTCTTTTTTTTTCAATTTCTGTTTCAGTGTGTCTGTATATGTTTGACTT
GTATCGCAAGCTACATAATCTGTTATCCTTCTTTCCCTTGTCT

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4ED50TF 657 0 0
G
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AAACCCAAACTCCATCTCCTTCCACGGCCTCCGTCCCCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTC
CGCCTTACCCAAACTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCGTCCGCCGTCGTGAA
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CCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTGGCCAAACAGGTGCCGGAGCAGAA
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AAGCTACATAATCTGTTATCCTTCTTTCCCTTGTCTCTTTCGCTTTGCAACATTTA

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR4ED50JQ 685 0 0
GGAAGATCATAAATCCAAAACCACTCATTCTCTCCAAAGAAGAAGAA**AAAAGAAGATA
ACATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTCCTCACACCCGCAACCACCGCCGCATTCTCCCACC
AAAACCCAAACTCCATCTCCTTCCACGGCCTCCGTCCCCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCT
CCGCCTTACCCAAACTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCGTCCGCCGTCGTGA
AAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTGGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAG
GCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTGGCCAAACAGGTGCCGGAGCAGA
ACGGTAAACCCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGA
AGTCGAACGATCCAGTTGGATTCAACATCGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTC
ACATCGTTGCTTACTACGTCTTGGCCACCTCTAGCAATGGCTATGATCCTAGCTTCTTTG
GCTGATTCTTTTTTTTTCAATTTCTGTTTCAGTGTGTCTGTATATGTTTGACTTGTATCG
CAAGCTACATAATCTGTTATCCTTCTTTCCCTTGTCTCTTTCGCTTTGCAACATTTATAT
TTCCTAGTCAGAGATTAAATTCGAC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4F021JQ 583 0 0
TTTCCTCACACCCGCAACCACCGCCGCATTCTCCCACCAAAACCCAAACTCCATCTCCTT
CCACGGCCTCCGTCCCCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTCCGCCTTACCCAAACTATCCAC
CACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCGTCCGCCGTCGTGAAAGCCGAGCTCAGCCCATCCGT
GGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGCCGGTTCGTTTTCTTCAACTT
CCAGAGAGAGAACGTGGCCAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGTAAACCCCACTTCGAAGC
CGGAGATGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAGTCGAACGATCCAGTTGGATT
CAACATCGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTACGTCTT
GGCCACCTCTAGCAATGGCTATGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTTTTTTTCAATT
TCTGTTTCAGTGTGTCTGTATATGTTTGACTTGTATCGCAAGCTACATAATCTGTTATCC
TTCTTTCCCTTGTCTCTTTCGCTTTGCAACATTTATATTTCCT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4F021TF 665 0 0
G
GAAGATCATAAATCCCAAACCACTCATTCTCTCCAAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGATAA
CATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTCCTCACACCCGCAACCACCGCCGCATTCTCCCACCA
AAACCCAAACTCCATCTCCTTCCACGGCCTCCGTCCCCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTC
CGCCTTACCCAAACTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCGTCCGCCGTCGTGAA
AGCCGAGCTCAGCCCATCCGTGGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGG
CCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTGGCCAAACAGGTGCCGGAGCAGAA
CGGTAAACCCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAA
GTCGAACGATCCAGTTGGATTCAACATCGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCA
CATCGTTGCTTACTACGTCTTGGCCACCTCTAGCAATGGCTATGATCCTAGCTTCTTTGG
CTGATTCTTTTTTTTTCAATTTCTGTTTCAGTGTGTCTGTATATGTTTGACTTGTATCGC
AAGCTACATAATCTGTTATCCTTCTTTCCCTTGTCTCTTTCGCTTTGCAACATTTATATT
TCCT

QA 2 665 2 665
DS 



AS 1 6

CO CL1592Contig1 1329 6 13 U
GGGGATTGCCTCTCACTCTGCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGGAATCGAA
TCCAAAGCCTTGTTCTGTTTTCCCGATCTGATCAGAAGACGCGGTAATGGGTTCGGCGGC
TCCGAAGGACGCAACTGTGGATCTGGATGAGCAGATCTCTCAGCTTATGCAGTGCAAGCC
TCTCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCCTTATGCGAGAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGA
AAGCAATGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGTGACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAATT
CCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGAGGAATGTGCCCTGATACTAATTATTTATT
TATGGGAGATTATGTCGACCGTGGATACTATTCTGTCGAAACTGTTACGCTGTTAGTTGG
CTTGAAAGTACGGTATCCTCAGCGAATCACTATTCTTCGAGGAAACCATGAAAGTCGTCA
GATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTATGGCAATGCCAATGT
TTGGAAGATATTTACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTGGAGTCGGA
AATATTCTGCCTGCACGGTGGATTGTCACCGTCTATTGAGACCCTTGACAACATTAGGAA
CTTTGACCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGACCCATGTGTGACTTACTATGGTCTGA
TCCTGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACATTTGGTCA
GGACATTTCCGAACAATTCAACCACAGCAACAGCTTAAAACTTATCGCTCGAGCGCATCA
GCTGGTTATGGATGGATACAACTGGGCACACGAGCAGAAGGTGGTTACTATCTTCAGTGC
ACCAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCTATTCTTGAGGTCGATGACTGCAG
GAACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCAGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGATGTGACCCG
AAGGACACCTGACTACTTCCTTTAAACAAAGGTCACCTCCTCTCAGATGCAAAATCCGGT
TGATGGTTTTTGAAGGTCTCTGCTTATTCCATTTTGGCAATGCATTTTGTTCGAGGTTGC
ATCTCCTTAAAATCGCTTTAGCCTTCTCCCTTGGAATAGTGTAATATAGGCAATGAGGTC
AATGAACTATAAAAAAAAAA*CCTTATGAATATTTGTGTTTTGGCTGAAATTATTCAGTA
TCTTCTGCATCCGAATCTATTTCCTGTGAGATATTATTTTGGCTTAATTTCATGTTATTC
TTTCCTTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FQ12TF U 1
AF RR4G060TF U 1
AF RR4G262TF U 456
AF RR4G262JQ C 589
AF RR4FQ12JQ C 593
AF RR4G060JQ C 790
BS 1 526 RR4FQ12TF
BS 527 653 RR4G060TF
BS 654 1135 RR4G262TF
BS 1136 1136 RR4G262JQ
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BS 1185 1193 RR4G262TF
BS 1194 1220 RR4G262JQ
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BS 1222 1268 RR4G262JQ
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RD RR4FQ12TF 526 0 0
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TCCAAAGCCTTGTTCTGTTTTCCCGATCTGATCAGAAGACGCGGTAATGGGTTCGGCGGC
TCCGAAGGACGCAACTGTGGATCTGGATGAGCAGATCTCTCAGCTTATGCAGTGCAAGCC
TCTCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCCTTATGCGAGAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGA
AAGCAATGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGTGACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAATT
CCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGAGGAATGTGCCCTGATACTAATTATTTATT
TATGGGAGATTATGTCGACCGTGGATACTATTCTGTCGAAACTGTTACGCTGTTAGTTGG
CTTGAAAGTACGGTATCCTCAGCGAATCACTATTCTTCGAGGAAACCATGAAAGTCGTCA
GATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTAT

QA 1 526 1 526
DS 

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TCCAAAGCCTTGTTCTGTTTTCCCGATCTGATCAGAAGACGCGGTAATGGGTTCGGCGGC
TCCGAAGGACGCAACTGTGGATCTGGATGAGCAGATCTCTCAGCTTATGCAGTGCAAGCC
TCTCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCCTTATGCGAGAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGA
AAGCAATGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGTGACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAATT
CCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGAGGAATGTGCCCTGATACTAATTATTTATT
TATGGGAGATTATGTCGACCGTGGATACTATTCTGTCGAAACTGTTACGCTGTTAGTTGG
CTTGAAAGTACGGTATCCTCAGCGAATCACTATTCTTCGAGGAAACCATGAAAGTCGTCA
GATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTATGGCAATGCCAATGT
TTGGAAGATATTTACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTGGAGTCGGA
AATATTCTGCCTGCACGGTGGATTGTCACCGTCTATTGAGACCCTTGACAACA

QA 1 653 1 653
DS 

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GGT
GAGGAAACCATGAAAGTCGTCAGATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGCCTGC
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TGACAGCCTTGGTGGAGTCGGAAATATTCTGCCTGCACGGTGGATTGTCACCGTCTATTG
AGACCCTTGACAACATTAGGAACTTTGACCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGACCCA
TGTGTGACTTACTATGGTCTGATCCTGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTG
GTGCCGGATATACATTTGGTCAGGACATTTCCGAACAATTCAACCACAGCAACAGCTTAA
AACTTATCGCTCGAGCGCATCAGCTGGTTATGGATGGATACAACTGGGCACACGAGCAGA
AGGTGGTTACTATCTTCAGTGCACCAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCTA
TTCTTGAGGTCGATGACTGCAGGAACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCAGCCCCAAGGA
GAGGAGAACCAGATGTGACCCGAAGGACACCTGACTACTTCCTTTAAACAAAGGTCACCT
CCTCTCAGATGCAAAATCCGGTTGATGGTTTTTGAAGGTCTCTGCTTATTCCATTTTGGC
AATGCATTTTGTTCGAG*TTGCATCTCCTTAAA*TCGCTTTAGCCTTCTCCCTTGGAATA
GTGTA*TATAGGCAA

QA 4 738 4 738
DS 

RD RR4G262JQ 680 0 0
GGTG
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ATTAGGAACTTTGACCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGACCCATGTGTGACTTACTA
TGGTCTGATCCTGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACA
TTTGGTCAGGACATTTCCGAACAATTCAACCACAGCAACAGCTTAAAACTTATCGCTCGA
GCGCATCAGCTGGTTATGGATGGATACAACTGGGCACACGAGCAGAAGGTGGTTACTATC
TTCAGTGCACCAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCTATTCTTGAGGTCGAT
GACTGCAGGAACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCAGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGAT
GTGACCCGAAGGACACCTGACTACTTCCTTTAAACAAAGGTCACCTCCTCTCAGATGCAA
AATCCGGTTGATGGTTTTTGAAGGTCTCTGCTTATTCCATTTTGGCAATGCATTTTGTTC
GAGGTTGCATCTCCTTAAAATCGCTTTAGCCTTCTCCCTTGGAATAGTGTAATATAGGCA
ATGAGGTCAATGAACTATAAAAAAAAAAACCTTATGAATATTTGTGTTTTGGCTGAAATT
ATTCAGTATCTTCTGC

QA 5 680 5 680
DS 

RD RR4FQ12JQ 737 0 0
GAGTCGGAAATATTCTGCCTGCACGGTGGATTGTCACCGTCTATTGAGACCCTTGACAAC
ATTAGGAACTTTGACCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGACCCATGTGTGACTTACTA
TGGTCTGATCCTGATGACAGATGTGGCTGGG*AATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACA
TTTGATCAGGACATTTCCGAACAATTCAACCACAGCAACAGCTTAAAACTTATCGCTCGA
GCGCATCAGCTGGTTATGGATGGATACAACTGGGCACACGAGCAAAAGGTGGTTACTATT
TTCAGTGCACCAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCTATTCTTGAGGTCGAT
GACTGCAGGAACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCAGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGAT
GTGACCCGAAGGACACCTGACTACTTCCTTTAAACAAAGGTCACCTCCTTTCAGATGCAA
AATCCGGTTGATGGTTTTTGAAGGTCTTTGCTTATTCCATTTTGGCAATGCATTTTGTTC
GAGGTTGCATCTCCTTAAAATCGCTTTAGCCTTCTCCCTTGGAATAGTGTAATATAGGCA
ATGAGGTCAATGAACTATAAAAAAAAAA*CCTTATGAATATTTGTGTTTTGGCTGAAATT
ATTCAGTATTTTCTGCATCCGAATCTATTTCCTGTGAGATATTATTTTGGCTTAATTTCA
TGTTATTCTTTCCTTCG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4G060JQ 540 0 0
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GGATGGATACAACTGGGCACACGAGCAAAAGGTGGTTACTATCTTCAGTGCACCAAACTA
TTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCTATTCTTGAGGTCGATGACTGCAGGAACCACAC
CTTCATTCAGTTTGAACCAGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGATGTGACCCGAAGGACACC
TGACTACTTCCTTTAAACAAAGGTCACCTCCTTTCAGATGCAAAATCCGGTTGATGGTTT
TTGAAGGTCTCTGCTTATTCCATTTTGGCAATGCATTTTGTTCGAGGTTGCATCTCCTTA
AAATCGCTTTAGCCTTCTCCCTTGGAATAGTGTAATATAGGCAATGAGGTCAATGAACTA
TAAAAAAAAAA*CCTTATGAATATTTGTGTTTTGGCTGAAATTATTCAGTATCTTCTGCA
TCCGAATCTATTTCCTGTGAGATATTATTTTGGCTTAATTTCATGTTATTCTTTCCTTCG

QA 1 540 1 540
DS 



AS 3 6

CO CL1593Contig1 784 2 6 U
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AAGAATCTCGCTCTCTGGTCTACCGGCGGAGATTCTCCCATCCCGTCCTTAGCTACTTTC
TTCGGTCGGCGTCTCGCAGCCGATGGACAAGCTTCCGACATTCCTCACGATCCTGACCTC
TTCTCTTGTCAAAGGTGTGAGACTGTTCTTCAGCCTGGCTTCAATTGTAATGTTAGAATC
GACAAGGTTTCGGCTAACAAGAAGAAACACATGAGGAGAAGGTACAAGAAGAAGCCTAAC
ATGTTTCTGCCTCAGAACAATGTAGTTTACTACTGCAACTTGTGTTCTCACCGTAATCTC
AAGAGAGGTACTACAAAAGGTCAGATGAAAGACATGTACCCGCCCAAGCCGAAAACAACT
CGTCCACGTCCCAAGATTGATAAAGATGTGACGATGGTGGTAGCGCCTCAAGAAATCCAA
CTTCCTTCTTCACCTGAAAGAAGAGTTGAGAATGCTAGTGTTGTGGAGAATATACCAAAG
CCAATGCTTACTCTGGAAAGAGAGAAGAGAATAAGGAAATCCAAAAGTAAGAAACCAGCT
GAGCCGGAAAGTGTTCCTGAGAAAAAAGCAACAGTTGGTGGTGTTGGTGGAGGATCGAAT
AAGAGGAAGAGAAAAGCATGGACAAGTATGAAGGAGTTGTCTGAGACTACTACAACAAAC
AAGGGTTCCAGTTCTGTAAACTTTAAAATACCTTTTCTCTTGTGATCTGCTTCTGTGTGT
GATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4CA12TF U 1
AF RR4CA12JQ C 409
BS 1 626 RR4CA12TF
BS 627 627 RR4CA12JQ
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AAGAATCTCGCTCTCTGGTCTACCGGCGGAGATTCTCCCATCCCGTCCTTAGCTACTTTC
TTCGGTCGGCGTCTCGCAGCCGATGGACAAGCTTCCGACATTCCTCACGATCCTGACCTC
TTCTCTTGTCAAAGGTGTGAGACTGTTCTTCAGCCTGGCTTCAATTGTAATGTTAGAATC
GACAAGGTTTCGGCTAACAAGAAGAAACACATGAGGAGAAGGTACAAGAAGAAGCCTAAC
ATGTTTCTGCCTCAGAACAATGTAGTTTACTACTGCAACTTGTGTTCTCACCGTAATCTC
AAGAGAGGTACTACAAAAGGTCAGATGAAAGACATGTACCCGCCCAAGCCGAAAACAACT
CGTCCACGTCCCAAGATTGATAAAGATGTGACGATGGTGGTAGCGCCTCAAGAAATCCAA
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CCAATGCTTACTCTGGAAAGAGAGAAGAGAATAAGGAAATCCAAAAGTAAGAAACCAGCT
GAGCCGGAAAGTGTTCCTGAGAAAAA*GCAACAGTTGGTGGTGTTGGTGGAGGATCGAAT
AAGAGGAAGAGAAAAGCATGGACAAGTATGAAG*AGTTGTCTGAGACTACTACAACAA

QA 1 718 1 718
DS 

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CAAGAAATCCAACTTCCTTCTTCACCTGAAAGAAGAGTTGAGAATGCTAGTGTTGTGGAG
AATATACCAAAGCCAATGCTTACTCTGGAAAGAGAGAAGAGAATAAGGAAATCCAAAAGT
AAGAAACCAGCTGAGCCGGAAAGTGTTCCTGAGAAAAAAGCAACAGTTGGTGGTGTTGGT
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GCTTCTGTGTGTGATA

QA 1 376 1 376
DS 



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GTTCAAGCCGCCATAATATTACCTCATCTGTTTCGTCTCTTTAGTAATCCTAACGAAAAG
AACTGAGCAAGAACGCGGAGAGATGGGGAAACGGGGAGGAGCTAACAAGCTTACAAAAGC
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TAACAAGAAGAAACACATGAGGAGAAGGTACAAGAAGAAGCCTAACATGTTTCCGCCTCA
GAACAATGTAGTTTACTACTGCAACTTGTGTTCTCACCGTAATCTCAAGAGAGTACTACA
AAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RR4EZ08TF U 1
AF RR4F826TF U 11
BS 1 125 RR4EZ08TF
BS 126 127 RR4F826TF
BS 128 147 RR4EZ08TF
BS 148 148 RR4F826TF
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BS 321 322 RR4F826TF
BS 323 348 RR4EZ08TF
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BS 352 713 RR4EZ08TF
BS 714 714 RR4F826TF
BS 715 771 RR4EZ08TF
BS 772 784 RR4F826TF

RD RR4EZ08TF 771 0 0
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AAAAGCAGAGAGGGGACGAAAAAGAAGGTTTCTCCCAAGAGAGAAAAAGCAACAACTCTC
TCTCT**CGCTTTGATTTTGAGATTTTTAACTTCCTCTTCCGGATTCAATCTCGAGAAAG
ACAGGTCGCTGGTCGCGGGTCGCTGCGACCGGGAAAAGAACAGGACCGTCATTACCACTT
TCGTTCTGTATTTGTGTTTCGAAAGCTCTAGGTATTTTCGCTTCTGGATTTGAAGCTGGA
GTTCAAGCCGCCATAATATTCTCTCATCTGTTTCGTCTCTTTAGTAAT***AACGAAAAG
AACTGAGCAAGAACGCGGAGAGATGGGGAAACGGGGAGGAGCTAACAAGCTTACAAAAGC
TCAAGGAGGACCTAATCTCAAGTCTGTGCTCAGACACGAGCACTTGAAGAATCTCGCTCT
CTGGTCTACCGGCGGAGATTCTCCCATCCCGTCCTTAGCTACTTTCTTCGGTCGGCGTCT
CGCAGCCGATGGACAAGCTTCCGACATTCCTCACGATCCTGACCTCTTCTCTTGTCAAAG
GTGTGAGACTGTTCTTCAGCCTGGCTTCAATTGTAATGTTAGAATCGACAAGGTTTCGGC
TAACAAGAAGAAACACATGAGGAGAAGGTACAAGAAGAAGCCTAACATGTTTCTGCCTCA
GAACAATGTAGTTTACTACTGCAACTTGTGTTCTCACCGTAATCTCAAGAG

QA 1 771 1 771
DS 

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GG
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TGATTTTGAGATTTTGAACTTCCTCTTCCGGATTCAATCTCGAGAAAG****GTCGCTGG
TCGCGGGTCGCTGCGACCGGGAAAAGAACAGGACCGTCATTACCACTTTCGTTCTGTATT
TGTGTTTCGAAAGCTCTAGGGATTTTCGCTTCTGGATTTGAAGCTGGAGTTCAAGCCGCC
ATAATATTACCTCATCTGTTTCGTCTCTTTAGTAATCCTAACGAAGAGAACTGAGCAAGA
ACGCGGAGAGATGGGGAAACGGGGAGGAGCTAACAAGCTTACAAAAGCTCAAGGAGGACC
TAATCTCAAGTCTGTGCTCAGACACGAGCACTTGAAGAATCTCGCTCTCTGGTCTACCGG
CGGAGATTCTCCCATCCCGTCCTTAGCTACTTTCTTCGGTCGGCGTCTCGCAGCCGATGG
ACAAGCTTCCGACATTCCTCACGATCCTGACCTCTTCTCTTGTCAAAGGTGTGAGACTGT
TCTTCAGCCTGGCTTCAATTGTAATGTTAGAATCGACAAGGTTTCGGCTAACAAGAAGAA
ACACATGAGGAGAAG*TACAAGA*GAAGCCTAACATGTTTCCGC*TCAGAACAATGTAGT
TTACTACTGCAACTTGTGT*CTCACCGTA*TCTCAAGAGAGTACTACAAAAG

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DS 



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ATCACAAGACAAAAGGTATTTTAAAGTTTACAGAACTGGAACTCCGGTTTGTTGTTGTAG
TCTCAGACAACTCCTTCATACTTGTCCATGCTTTTCTCTTCCTCTTATTCGATCCTCCAC
CACCACCACCACCACCAACTGTTGCTTTTTTCTCAGGAACACTTTCGGGATCAACTGGTT
TCTTACTTTTAGATCTCCTTATTCTCTTCTCCCTCTCCAGTGTAAGCATTGGCTTTGGTG
TATTCTCCACAACACTAACATTCTCAACTCTTCTTTCAGGTGAAGAAGGAAGTTGGATTT
CTTGAGGCGCTACCACCATCGTCACATCTTTATCAATCTTGGGACGTGGACGAGTTGTTT
TCGGCTTGGGCGGGTACATGTCTTTCATCTGACCTTTTGTAGTACCTCTCTTGAGATTAC
GGTGAGAACACAAGTTGCAGTAGTAAACTACATTGTTCTGAGGCAGAAACATGTTAGGCT
TCTTCTTGTACCTTCTCCTCATGTGTTTCTTCTTGTTAGCCGAAACCTTGTCGATTCTAA
CATTACAATTGAAGCCAGGCTGAAGAACAGTCTCACACCTTTGACAAGAGAAGAGGTCAG
GATCGTGAGGAATGTCGGAAGCTTGTCCATCGGCTGCGAGACGCCGACCGAAGAAAGTAG
C


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4F826JQ U 1
AF RR4EZ08JQ U 3
BS 1 104 RR4F826JQ
BS 105 105 RR4EZ08JQ
BS 106 194 RR4F826JQ
BS 195 197 RR4EZ08JQ
BS 198 271 RR4F826JQ
BS 272 272 RR4EZ08JQ
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BS 525 525 RR4EZ08JQ
BS 526 675 RR4F826JQ
BS 676 721 RR4EZ08JQ

RD RR4F826JQ 675 0 0
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ATCACAAGACAAAAGGTATTTTAAAGTTTACAGAACTGGAACTCTGGTTTGTTGTTGTAG
TCTCAGACAACTCCTTCATACTTGTCCATGCTTTTCTCTTCCTCTTATTCGATCCTCCAC
CACCACCACCACCA***ACTGTTGCTTTTTTCTCAGGAACACTTTCGGGATCAACTGGTT
TCTTACTTTTAGATCTCCTTATTCTCTTCTCTCTCTCCAGTGTAAGCATTGGCTTTGGTG
TATTCTCCACAACACTAACATTCTCAACTCTTCTTTCAGGTGAAGAAGGAAGTTGGATTT
CTTGAGGCGCTACCACCATCGTCACATCTTTATCAATCTTGGGACGTGGACGAGTTGTTT
TCGGCTTGGGCGGGTACATGTCTTTCATCTGACCTTTTGTAGTACCTCTCTTGAGATTAC
GGTGAGAACACAAGTTGCAGTAGTAAACTACATTGTTCTGAGGCGGAAACATGTTAGGCT
TCTTCTTGTACCTTCTCCTCATGTGTTTCTTCTTGTTAGCCGAAACCTTGTCGATTCTAA
CATTACAATTGAAGCCAGGCTGAAGAACAGTCTCACACCTTTGACAAGAGAAGAGGTCAG
GATCGTGAGGAATGT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EZ08JQ 719 0 0
GGCTAATTCGAAAAACTTCACTTAGTGTTGGGTCAGATATCACACACCACAGAAGCAGAT
CACAAGACAAAAGGTATTTTAAAGTTTACAGAACTGGAACTCCGGTTTGTTGTTGTAGTC
TCAGACAACTCCTTCATACTTGTCCATGCTTTTCTCTTCCTCTTATTCGATCCTCCACCA
CCACCACCACCACCAACTGTTGCTTTTTTCTCAGGAACACTTTCGGGATCAACTGGTTTC
TTACTTTTAGATCTCCTTATTCTCTTCTCCCTCTCCAGTGTAAGCATTGGCTTTGGTGTA
TTCTCCACAACACTAACATTCTCAACTCTTCTTTCAGGTGAAGAAGGAAGTTGGATTTCT
TGAGGCGCTACCACCATCGTCACATCTTTATCAATCTTGGGACGTGGACGAGTTGTTTTC
GGCTTGGGCGGGTACATGTCTTTCATCTGACCTTTTGTAGTGCCTCTCTTGAGATTACGG
TGAGAACACAAGTTGCAGTAGTAAACTACATTGTTCTGAGGCAGAAACATGTTAGGCTTC
TTCTTGTACCTTCTCCTCATGTGTTTCTTCTTGTTAGCCGAAACCTTGTCGATTCTAACA
TTACAATTGAAGCCAGGCTGAAGAACAGTCTCACACCTTTGACAAGAGAAGAGGTCAGGA
TCGTGAGGAATGTCGGAAGCTTGTCCATCGGCTGCGAGACGCCGACCGAAGAAAGTAGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 6

CO CL1594Contig1 950 6 8 U
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CCAGCAGATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGT
CTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATTGAGAAGTTGCAGCTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAA
GATTAGACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTA
CTCAATGCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCACAAGATGACATTGTCAA
TGCGATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAA
CCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAG
ACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTC
GATGCTT*GACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGA
TTATAGTTGACAAGCACATTTTCCTT*CCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCT
CCTTTCTGTGCTGG*AGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATTGTGTGTGAAAA
CACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCTGAGATTCGAAAGGC
GCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGACTCCAACTTTGAACCATG
AGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCCATTACCAATTTTAAACTCT
GTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCTTGGCCTACATTGGCCTTT
GTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATGTACCTTTTCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
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35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO40TF U 1
AF RR4BC58TF U 393
AF RR4GO40JQ C 145
AF RR4BC58JQ C 100
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AF RR4BV94TF U 402
BS 1 601 RR4GO40TF
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CCAGCAGATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGT
CTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATTGAGAAGTTGCAGCTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAA
GATTAGACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTA
CTCAATGCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCACAAGATGACATTGTCAA
TGCGATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAA
CCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAG
ACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTC
GATGCTT*GACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGA
TTATAGTTGACAAGCACATTTTCCTT*CCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCT
C
TTTCTGTG

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4BC58TF 415 0 0
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GCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTTTGACGATGCAACTGAAGAATACTGC
GAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGCACATTTTCCTTTCCTCC
TGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGGGAGGAGTGGTGCTGGCTT
CTCGTGATGGGAAAATTGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCC
GCAAGAAACTCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGA
TGATGAGTGACTCCAACTTTGAACCATGAGAGCAG*TAATGGCTCCATTATCTAC

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4GO40JQ 660 0 0
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GGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAATGCAATTGAACGCATCGAG
GATCAAAGTTCTGCAAGCACAAGATGACATTGTCAATGCGATGAAAGAAGAGGCTGCAAA
GCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACA
TTTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACT
GCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTT*GACGATGCAACTGAAG
AATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGCACATTTTCC
TT*CCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGG*AGGAGTGGT
GCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATTGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGT
CGCTTTCCGCAAGAAACTCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGC
TTGATTGATGATGAGTGACTCCAACTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4BC58JQ 851 0 0
AAAGGCCAATGAGATCTCTGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATTGAGAAGTTGCAGCT
GGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAGACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGA
TGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAATGCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCA
AGCACAAGATGACATTGTCAATGCGATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGT
CAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCT
CATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGGGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGA
AGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTT*GACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAG
CAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGCACATTTTCCTT*CCTCCTGCTCCT
TCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGG*AGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGA
TGGGAAAATTGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAA
ACTCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAG
TGACTCCAACTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTT
CTATTACCAATTTTAAACTCCGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGA
CCTTGGCCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATGTAC
CTTTTCTTCTC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4BV94JQ 531 0 0
GTGTG
CAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCTTTGTCGCCAAGAAGACCTT
CACATAGTGGAGTCGATGCTT*GACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGT
TCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGGACATTTTCCTT*CCTCCTGCTCCTTCCGAAG
ATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGG*AGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGAAAA
ATCGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCT
GAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGACTCC
AACTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCCATTAC
CAATTTTAAACTCTGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCTTGGC
CTACATTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTG

QA 6 531 6 531
DS 

RD RR4BV94TF 531 0 0
GTGTG
CAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCTTTGTCGCCAAGAAGACCTT
CACATAGTGGAGTCGATGCTT*GACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGT
TCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGGACATTTTCCTT*CCTCCTGCTCCTTCCGAAG
ATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGG*AGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGAAAA
ATCGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCT
GAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGACTCC
AACTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCCATTAC
CAATTTTAAACTCTGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCTTGGC
CTACATTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTG

QA 6 531 6 531
DS 



AS 1 6

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GTGAGTCAACTCAAAACTCAATCGGAAGAAGGAAGGAAGAAAAACAATGGCGGAAGAGAA
GAAAAACGGGAAGAAGCAGGTGATGGTGGCGATCGACGAAAGCGATTGCAGCAAACACGC
TCTCCGATGGACGCTCGCGTATCTCAAAGACAGCCTCGCCGATTCCGATATCATCCTCTT
CACCGCTCAGCCTCAGCTCGATCTCAGCTCCGTCTACGCTTCCTCTTACGGCGCCGCTCC
GATAGAGCTGATAAACTCAATGCAGCAGAACTACAAAAACGCAGCGTTGAATCGGATTGA
TGAAGGGACCAAGATTTGCGCTGAGAGCGGGGTTACTACACCAAAGAAGGTGATGGAGTT
TGGAAACCCTAAAGAAGCGATATGTGATGCTGTTGAGAAGCTTGGTGTTGATTTGCTTAT
CGTTGGGAGCCATGGCAAAGGGGCTCTAGAAAGGACTTTCCTTGGGAGTGTTAGCAATTA
CTGTGTTAACAAGGCTAAGTGCCCTGTTCTTGTGGTGAGGACTAAGGCTTGAGGACCCTT
CTCTCAGACAAGAGAGTTCAAGAACTGTATGTGTGTTGTGTAAACATATTTGGAATAATG
CTTCTGCTTGTATACTACTGTTTGAAGAAACTTAATAAATATATTATTAGTTTGATTG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 

AF RR4F359TF U 1
AF RR4AC71JQ C 2
AF RR4AC71TF U 2
AF RR4F359JQ C 5
AF RR4DI06TF U 19
AF RR4DI06JQ C 145
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CTTCTGCTTGTATACTACTGTTTGAAGAAACTTAATAAATATATTATTAGTTTGATTG

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GCTCAGCCTCAGCTCGATTTCAGCTCCGTTTACGCTTCCTCTTACGGCGCCGCTCCGATA
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DS 

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GGA
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GCTCAGCCTCAGCTCGATCTCAGCTCCGTCTACGCTTCCTCTTACGGCGCCGCTCCGATA
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AACCCTAAAGAAGCGATATGTGATGCTGTTGAGAAGCTTGGTGTTGATTTGCTTATCGTT
GGGAGCCATGGCAAAGGGGCTCTAGAAAGGACTTTCCTTGGGAGTGTTAGCAATTACTGT
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CAGACAAGAGAGTTCAAGAACTGTATGTGTGTTGTGTAAACATATTTGGAATAATGCTTC
TGCTTGTATACTACTGTTTGAAGAAACTTAATAAATATATTATTAGTTTG

QA 4 653 4 653
DS 

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CGATGGACGCTCGCGTATCTCAAAGACAGCCTCGCCGATTCCGATATCATCCTCTTCACC
GCTCAGCCTCAGCTCGATCTCAGCTCCGTTTACGCTTCCTCTTACGGCGCCGCTCCGATA
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AACCCTAAAGAAGCGATATGTGATGCTGTTGAGAAGCTTGGTGTTGATTTGCTTATCGTT
GGGAGCCATGGCAAAGGGGCTCTAGAAAGGACTTTCCTTGGGAGTGTTAGCAATTACTGT
GTTAACAAGGCTAAGTGCCCTGTTCTT**TGTGAGGACTAAGGCTTGAGGACCCTTCTTT
CAGACAAGAGAGTTCAAGAACTGTATGTGTGTTGTGTAAACATATTTGGAATAATGCTTC
TGCTTGTATACTACTGTTTGAAGAAACTTAATAAATATATTATTAGTTTGATTG

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DS 

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G
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TATCTCAAAGACAGCCTCGCCGATTCCGATATCATCCTCTTCACCGCTCAGCCTCAGCTC
GATCTCAGCTCCGTCTACGCTTCCTCTTACGGCGCCGCTCCGATAGAGCTGATAAACTCA
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GCTGAGAGCGGGGTTACTACACCAAAGAAGGTGATGGAGTTTGGAAACCCTAAAGAAGCG
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GTTTGAAGAAACTTAATAAATATATTATTAGTTTGATTG

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DS 

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CAGCTCCGTTTACGCTTCCTCTTACGGCGCCGCTCCGATAGAGCTGATAAACTCAATGCA
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GAGCGGGGTTACTACACCAAAGAAGGTGATGGAGTTTGGAAACCCTAAAGAAGCGATATG
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AAGAAACTTAATAAATATATTATTAGTTTGATTG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 6

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TGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGT
GGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTT
TAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCA
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TGTTTTAT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AX94JQ C 1
AF RR4AX94TF U 1
AF RR4A185JQ C 1
AF RR4A185TF U 1
AF RR4A185JQD C 1
AF RR4A185TFB U 1
BS 1 117 RR4AX94TF
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BS 119 122 RR4AX94TF
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RD RR4AX94JQ 633 0 0
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TACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGTTAAATG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4AX94TF 633 0 0
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TACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGTTAAATG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4A185JQ 668 0 0
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TGTTTTAT

QA 1 668 1 668
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RD RR4A185TF 668 0 0
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TGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGG
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TGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGT
GGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTT
TAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCA
TACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTT
TGTTTTAT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4A185JQD 668 0 0
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TACCGTGGGTGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGC
GGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGC
TGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGA
ATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGA
TGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGG
AGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCT
TGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGT
GGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTT
TAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCA
TACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTT
TGTTTTAT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4A185TFB 668 0 0
GGACTTTAGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACG
TACCGTGGGTGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGC
GGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGC
TGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGA
ATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGA
TGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGG
AGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCT
TGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGT
GGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTT
TAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCA
TACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTT
TGTTTTAT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 6

CO CL1597Contig1 679 6 8 U
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGG
CAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTA
ACCGCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCT
CAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTA
GCGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGC
GCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCA
TGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAG
AGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCT
AGAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGT
TTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTT
TCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAAT
GTTCTTTATCTTCTGTTGC


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 25 25 0 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D462TF U 1
AF RR4CO45JQ C 2
AF RR4CO45TF U 2
AF RR4EX41JQ C 2
AF RR4EX41TF U 2
AF RR4D462JQ C 33
BS 1 334 RR4D462TF
BS 335 335 RR4CO45TF
BS 336 336 RR4D462TF
BS 337 337 RR4CO45TF
BS 338 338 RR4D462TF
BS 339 340 RR4CO45TF
BS 341 341 RR4EX41TF
BS 342 679 RR4D462TF

RD RR4D462TF 679 0 0
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CAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTA
GCGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGC
GCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCAAACCAT*AAAGAAAACAGGACAATCA
TGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAG
AGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCT
AGAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGT
TTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTT
TCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAAT
GTTCTTTATCTTCTGTTGC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4CO45JQ 669 0 0
GATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGC
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GTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGA
GGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTTTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTA
GAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTT
TCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTT
CTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATG
TTCTTTA
CC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CO45TF 669 0 0
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CCGC*GCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTC
AGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAG
CGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCG
CTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCA*AAA***AACAGGACAATCAT
GTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGA
GGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTA
GAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTT
TCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTT
CTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATG
TTCTTTA
CC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EX41JQ 670 0 0
GATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGC
AAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAA
CCGCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTC
AGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAG
CGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCG
CTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCAT
GTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGA
GGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTTTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTA
GAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTTTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTT
TCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTT
CTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATG
TTCTTTATC
G

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4EX41TF 670 0 0
GATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGC
AAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAA
CCGCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTC
AGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAG
CGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCG
CTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCAT
GTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGA
GGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTA
GAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTT
TCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTT
CTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATG
TTCTTTATC
G

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4D462JQ 647 0 0
AAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGA
TGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAACCGCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAG
CGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAAT
GAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAA
GTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGG
CA*AACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGAC
ACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCT
TTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTCT
TATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGG
TTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTTCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGT
TTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATGTTCTTTATCTTCTGTTGC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 5

CO CL1598Contig1 1063 5 4 U
GGGCAGCATCTGTGCTCTCGAGGTTAGGGTTCTGTAGAGAGAGTTTATATATATTTTATC
AAACGATCCTTCGGATCCTGTAATGGAAGTGTAAACATTAACATGTTTTAAGTACAATCT
TTTCGTTTTCTCCTTTTGTTATTATAAACCCTGATTTTTTTCAACTTATAGGGCTTTTCG
ATCGCAATATTTGGTAGATCGTCGCCATTTAAAACACATATACAGAATTATCTTTCCTGC
TTTCCCTTGAAACACCCTCTTCTTTAACCAAAAATATAGATATACCATCTTGTCTTGGAA
CTATATTAAAGTAAATTTTCATATTTTATCGATGGAAACAATATCTATGCAACGTTCGCA
GGGCAAAGAAGTTTCTGGTCTGAGACCATTCAAGAACCCTAAAAGAAGGAGTTCTCGCGG
AGGAAGCTTGGCTCTTCCGATCAACCCGACGTCGTCTTGGGGATCTTCTCCGACGCATCT
TCCACCGCCGCCTAGCTACTCCCAGCCTCCTCTTCTCCCTCTTCCACACGTCAACAGCTC
TACTCTCCCTCTGCAACGCGTCAACAGCTCTCGACCACGTGTGAACAACTCTAGTCTCCC
TTACTCCCAGGCAAGAGAAAAATCTGAAACTGTACCGAGACTCACTCGAACCGGTTCGGT
TCCGGTCCGGACTAACCACAAGCGTGATTTCCCGGAAGGATTTGATGGATATCCCGGTCC
AGCGATCATGTTACTATCTCCTCCGCCGTGTAGTTTGCCCATGCCTAGGTTTTCGATCAA
ACCGAAGCTCAGTTGCAACGCAGAAGCTGCCGGTAAAACTGACGTAGCCACCGATAACAT
CCGTCGTGTATTACAGCTACGTTAAGTTAAGGTCGACGATGTTACAAAAAAAATAAAGCC
CGTGGGCTTGGGTCTGTCTTGTTTTTAAAAGTGATAGAACTCTCTCCTTTTGTGTGATTT
GCCAAGCCATAACTTTTTTTAAAAGGTTACGTTGGCACAAAGTATAAGCCTTGCCGGATT
ACATTTCTTTCAAGTTATTTCCTTCTATAAGATTATTATTACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK03TF U 1
AF RR4F927TF U 3
AF RR4CF30JQ C 513
AF RR4CF30TF U 360
AF RR4F927JQ C 553
BS 1 413 RR4GK03TF
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BS 607 971 RR4CF30TF
BS 972 1063 RR4F927JQ

RD RR4GK03TF 413 0 0
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AAACGATCCTTCGGATCCTGTAATGGAAGTGTAAACATTAACATGTTTTAAGTACAATCT
TTTCGTTTTCTCCTTTTGTTATTATAAACCCTGATTTTTTTCAACTTATAGGGCTTTTCG
ATCGCAATATTTGGTAGATCGTCGCCATTTAAAACACATATACAGAATTATCTTTCCTGC
TTTCCCTTGAAACACCCTCTTCTTTAACCAAAAATATAGATATACCATCTTGTCTTGGAA
CTATATTAAAGTAAATTTTCATATTTTATCGATGGAAACAATATCTATGCAACGTTCGCA
GGGCAAAGAAGTTTCTGGTCTGAGACCATTCAAGAACCCTAAAAGAAGGAGTT

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4F927TF 606 0 0
GG
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GTTTTCTCCTTTTGTTATTATAAACCCTGATTTTTTTCAACTTATAGGGCTTTTCGATCG
CAATATTTGGTAGATCGTCGCCATTTAAAACACATATACAGAATTATCTTTCCTGCTTTC
CCTTGAAACACCCTCTTCTTTAACCAAAAATATAGATATACCATCTTGTCTTGGAACTAT
ATTAAAGTAAATTTTCATATTTTATCGATGGAAACAATATCTATGCAACGTTCGCAGGGC
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AGCTTGGCTCTTCCGATCAACCCGACGTCGTCTTGGGGATCTTCTCCGACGCATCTTCCA
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CTCCCTCTGCAACGCGTCAACAGCTCTCGACCACGTGTGAACAACTCTAGTCTCCCTTAC
TC
TC

QA 3 604 3 604
DS 

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GACCACGTGTGAACAACTCTAGTCTCCCTTACTCCCAGGCAAGAGAAAAATCTGAAACTG
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TCGACGATGTT

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DS 

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CCGCCTAGCTACTCCCAGCCTCCTCTTCTCCCTCTTCCACACGTCAACAGCTCTACTCTC
CCTCTGCAACGCGTCAACAGCTCTCGACCACGTGTGAACAACTCTAGTCTCCCTTACTCC
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CGGACTAACCACAAGCGTGATTTCCCGGAAGGATTTGATGGATATCCCGGTCCAGCGATC
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CTCAGTTGCAACGCAGAAGCTGCCGGTAAAACTGACGTAGCCACCGATAACATCCGTCGT
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TTGGGTCTGTCTTGTTTTTAAAAGTGATAGAACTCTCTCCTTTTGTGTGATTTGCCAAGC
CATA

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DS 

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TAACCACAAGCGTGATTTCCCGGAAGGATTTGATGGATATCCCGGTCCAGCGATCATGTT
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TTGCAACGCAGAAGCTGCCGGTAAAACTGACGTAGCCACCGATAACATCCGTCGTGTATT
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TCTGTCTTGTTTTTAAAAGTGATAGAACTCTCTCCTTTTGTGTGATTTGCCAAGCCATAA
CTTTTTTTAAAAGGTTACGTTGGCACAAAGTATAAGCCTTGCCGGATTACATTTCTTTCA
AGTTATTTCCTTCTATAAGATTATTATTACC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 6

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GTGCTATGTGAAGTATGAACTCATGGCTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCT
CGTTTTCATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4EQ30JQ C 1
AF RR4FR91JQ C 116
AF RR4FR91TF U 1
AF RR4G316JQ C 1
AF RR4G316TF U 1
AF RR4EQ30TF U 1
BS 1 667 RR4FR91TF
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GATTTATGATGTCTGTGACATCGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTA
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CGTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FR91JQ 552 0 0
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CGGGACCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGA
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CTCTGCTGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGA
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AAAACGATTTATGATGTCTGTGACATCGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTT
GGTTAGTGCTATGTGAAGTATGAACTCATGGCTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGT
TCTCTCGTTTTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4FR91TF 674 0 0
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TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCCTATTTATCCCCTCTGAAAGAAAAAAC
GATTTATGATGTCTGTGACATCGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTA
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CGTTTTC
AAAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 

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CGTTTTC

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DS 

RD RR4G316TF 667 0 0
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CTGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGCCAGATCAACTACGATGAGTTCG
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GTGCTATGTGAAGTATGAACTCATGGCTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCT
CGTTTTC

QA 1 667 1 667
DS 

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CTGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGCCAGATCAACTACGATGAGTTCG
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GATTTATGATGTCTGTGACATCGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTA
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CGTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 6

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CAAAAGTGGTTTAACTCTGCACCATAGAGAAAGAAAGAAAAATACAAAATGGTAAGAGCT
AATTGAGTTGTTTGCAAACAAGTAGTCCAGAAGTCACCAAACCAAGGATCGAGAAGGCGC
CTTGCCTTGAACGCCAAAACTCAATCCATGTCAACGGTCTTCTGATCTCAGACAAAACCT
TGTCAAACTGTTGGTGTAGCTGGTCGAGACCGCCGTTATTATCAATCACAATATCCGCTT
TGCTTCTTTTCGAATCCAAAGACATCTGAGCCATCGCTCTGTTTCTTGCATCTTCCTCAC
TCAGTCCATCTCTCTCCATCAGTCTATTGAGCTGTGTTTCTTGACTAACCCACACAACAA
CAACGGGTTTAGTCCATCTATCCATCTTAGTTTCGAACAGCAATGGGATATCGACGACTA
TCACTTTAGCTCCTTTCGCCCATTGTTTCAGTATCTCCCAAAGGATACCAGATGATATGT
ACGGAGCCATTAACTTGTTGAGAAGTTGGCGCTTGGAATCTGAAGAGAAGACCATCTGAC
CAAGCTTTGGCCGATCAACTTCTCTACTAGGAAGAAGAATCTCCTCACCAAAAGCAGCAA
CTACTCTCTTCCATCCACCACTTCCTTTCTTCAGTACATTACGAGCAATGACATCAGCAT
CAACAACAGGAATGCCATTAGCCTTGAAGAGGTTGGAGACTGTACTCTTCCCAGACGCTA
TTCCTCCCGTTAGACCCACTATTCTCATTCTCCTGAGAAACTGAACTGGAAGCGGAGCAA
AGATTTAGGAATTCGGAGGTGATAGAATAGTCCCGATCTAGAAGCTCTTCGATAGACGAA
AGCTGTAGTGATATTAACCGGTTTACAAACTATCATTCGCCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E051JQ U 1
AF RR4EB87JQ U 1
AF RR4BX55JQ U 27
AF RR4EB87TF C 169
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CAAAAGTGGTTTAACTCTGCACCATAGAGAAAGAAAGAAAAATACAAAATGGTAAGAGCT
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CTTGCCTTGAACGCCAAAACTCAATCCATGTCAACGGTCTTCTGATCTCAGACAAAACCT
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CTACTC

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DS 

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CAAAAGTGGTTTAACTCTGCACCATAGAGAAAGAAAGAAAAATACAAAATGGTAAGAGCT
AATTGAGTTGTTTGCAAACAAGTAGTCCAGAAGTCACCAAACCAAGGATCGAGAAGGCGC
CTTGCCTTGAACGCCAAAACTCAATCCATGTCAACGGTCTTCTGATCTCAGACAAAACCT
TGTCAAACTGTTGGTGTAGCTGGTCGAGACCGCCGTTATTATCAATCACAATATCCGCTT
TGCTTCTTTTCGAATCCAAAGACATCTGAGCCATCGCTCTGTTTCTTGCATCTTCCTCAC
TCAGTCCATCTCTCTCCATCAGTCTATTGAGCTGTGTTTCTTGACTAACCCACACAACAA
CAACGGGTTTAGTCCATCTATCCATCTTAGTTTCGAACAGCAATGGGATATCGACGACTA
TCACTTTAGCTCCTTTCGCCCATTGTTTCAGTATCTCCCAAAGGATACCAGATGATATGT
ACGGAGCCATTAACTTGTTGAGAAGTTGGCGCTTGGAATCTGAAGAGAAGACCATCTGAC
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CTACTCTCTTCCATCCACCACTTCC

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C
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TCAGTATCCCCCAAAAGATACCAAATGATATGTACGGAGCCATTAACTTGTTGAGAAGTT
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TCTTCAGTACATTACGAGCAATGACATCAGCATCAACAACAGGAATGCCATT

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TGCTTCTTTTCGAATCCAAAGACATCTGAGCCATCGCTCTGTTTCTTGCATCTTCCTCAC
TCAGTCCATCTCTCTCCATCAGTCTATTGAGCTGTGTTTCTTGACTAACCCACACAACAA
CAACGGGTTTAGTCCATCTATCCATCTTAGTTTCGAACAGCAATGGGATATCGACGACTA
TCACTTTAGCTCCTTTCGCCCATTGTTTCAGTATCTCCCAAAGGATACCAGATGATATGT
ACGGAGCCATTAACTTGTTGAGAAGTTGGCGCTTGGAATCTGAAGAGAAGACCATCTGAC
CAAGCTTTGGCCGATCAACTTCTCTACTAGGAAGAAGAATCTCCTCACCAAAAGCAGCAA
CTACTCTCTTCCATCCACCACTTCCTTTCTTCAGTACATTACGAGCAATGACATCAGCAT
CAACAACAGGAATGCCATTAGCCTTGAAGAGGTTGGAGACTGTACTCTTCCCAGACGCTA
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CAATATCCGCTTTGCTTCTTTTCGAATCCAAAGACATCTGAGCCATCGCTCTGTTTCTTG
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CCCACACAACAACAACGGGTTTAGTCCATCTATCCATCTTAGTTTCGAACAGCAATGGGA
TATTGACGACTATCACTTTAGCTCCTTTCGCCCATTGTTTCAGTATCCCCCAAAAGATAC
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AGACCATCTGACCAAGCTTTGGCCGATCAACTTCTCTACTAGGAAGAAGAATCTCCTCAC
CAAAAGCAGCAACTACTCTCTTCCATCCACCACTTCCTTTCTTCAGTACATTACGAGCAA
TGACATCAGCATCAACAACAGGAATGCCATTAGCCTTGAAGAGGTTGGAGACTGTACTCT
TCCCAGACGCTATTCCTCCCGTTAGACCCACTATTCTCATCCTCCTGAGAAACTGAACTG
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ACACAACAACAACGGGTTTAGTCCATCTATCCATCTTAGTTTCGAACAGCAATGGGATAT
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ATAGACGAAAGCTGTAGTGATATTAACCGGTTTA

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DS 



AS 1 6

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CTTATATGCCGGTAAATACCTCGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCTGACATCCCTGG
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TATTGTCGCCGACTTCATTTTGGTAGTTTTGAAAAGATAATCAAGGGCAAAGACAAGTGT
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F223JQ U 5
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AF RR4BI27JQ U 1
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GT
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TGCCGGTAAATACCTCGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCTGACATCCCTGCTTTCCC
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GTCCTTGATTTTGATGACCACCCAAGCATTGATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAGTACGC
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GATTTTGATGACCACCCAAGCATTGATATACTTGTCCCATGCCTCGTAGTACGCTTCCAG
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GATGTGTAATTAGGTAGCGAGTATAGGGTTCCTTTCTTCATCGATATCTATGGCAAGGAC
ACGCTCAGGTTCCGAGCCGCTTGGTCCTTCAGCGTAAAGCGTCGGAAGATACGCCTTATA
TGCCGGTAAATACCTCGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCTGACATCCCTGGTTTCCC
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GATTTTGATGACCACCCAAGCATTGATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAGTACGCTTCCAG
GTTCTTATTCACTGTCTCCAGCTGGGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGGGG
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AACTTTCATCTTCATGCCGTCCTTGGTCAGTTGAGTCAGGGCTTCTATTGTTTCCACAGA
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AGACATTGAGTCACGGCCTTGAACCGGGGAGGAGTAAGAAGCGGTGACGACATCCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 5

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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AF RR4BC27TF U 42
AF RR4BC02TF U 42
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AF RR4BC27JQ C 144
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RD RR4D964TF 729 0 0
TTTTTTTGTTGCTCTCTTCTCCTTTCGGTTTGAGCCTATTTGGATTTGTTATTTTTCTCT
GTCTATTTCTGACATTCTGGGATCTGAGAAGATCGGAATCGAAAAAAATCCTGATCTTTG
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TTATAGTTACAGTAACAATAGGATCATGGATGGTGTTTGAGAGCTTTTCTTACACAATCC
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CTGCATCTATTCTCAACAGGCCGTCACCTCCATTGCCAGAGTTTCAAATAAGTGAAGAAA
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TGTTCATCTACAACAAAGCTAAAGAGCTTTACCTTAGAT*CCAGATATGGGCTTATCCGG
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A

QA 1 728 1 728
DS 

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AAAAAAATCCTGATCTTTGCTCTAGAAATGGGTTCTTGTTCGGACAAGTTGTTCAACAGA
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QA 1 768 1 768
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AAAAAAATCCTGATCTTTGCTCTAGAAATGGGTTCTTGTTCGGACAAGTTGTTCAACAGA
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GCTTGA

QA 1 838 1 838
DS 

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DS 

RD RR4BC27JQ 756 0 0
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GATGTGATCTTGTGGAGGAACAAGAACGTGAGTGTTGGTATAGTTACAGTAACAATAGGA
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CTCCTCTTGCTCTCTATCCTATTCCTTTGGTCCAAATCTGCATCTATTCTCAACAGGCCG
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TATGTTTTTTTTCTGATAAATGTTTGAATGGTACAGCCAGAATATGGGCAACCCACAGAA
ATTTATTTCACAGTTTGCTTGAAACTGTGTTGCC
CC

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DS 



AS 1 6

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AATCAAGAATGTGCCAAAAAAAAATCAAGACTTTAATTTTGATTTGCAGAGTAAACAATA
CACCTATAGATTTTATGGCCAGTTTAGCTATAATTTTAATTTTTGGTTAATGCAATAGTT
TAAGATGGCTTTGAGTAATACGAGTGGCTACATATTCTTCTGGTGTGATTCAATTGAACA
TAACCTGCCGATAATATATCAAGAAGTATTCGTCTGTTACACAAAATATAACATCGGGAT
ACAGAAAATATCAAGATGTACGTATCTAATGTATATGTATAGCAACAATATATAAGCATC
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TGTTGTTGCTGTTGTTATTGTTCTTTGAAGAAGGGCTTCCAAGATTTGTTTCGGCTACTC
CAGGAGATTCATGATCCTCCTCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4A259JQ U 321
AF RR4EJ92JQ U 1
AF RR4EJ92TF C 1
AF RR4A259JQD U 237
AF RR4A259TF C 248
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BS 1 413 RR4EJ92JQ
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CATTGACCAATGGAATCAG

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DS 

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C

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DS 

RD RR4EJ92TF 631 0 0
CATGTCTTTTACTGGATAGGAACTAATAGTATATTTAATCGCGTGAATATCTTCTAAAAA
AATCAAGAATGTGCCAAAAAAAAATCAAGACTTTAATTTTGATTTGCAGAGTAAACAATA
CACCTATAGATTTTATGGCCAGTTTAGCTATAATTTTAATTTTTGGTTAATGCAATAGTT
TAAGATGGCTTTGAGTAATACGAGTGGCTACATATTCTTCTGGTGTGATTCAATTGAACA
TAACCTGCCGATAATATATCAAGAAGTATTCGTCTGTTACACAAAATATAACATCGGGAT
ACAGAAAATATCAAGATGTACGTATCTAATGTATATGTATAGCAACAATATATAAGCATC
AAGAGGTACTCACAAA*GGGAAACAAAACAATATAATATATATAAAAGAAAAGTACAAAC
AATTTAGGACTCACACTGACCATTGACCAATGGAATCAGTGTTGTCATGCTGCTGCTGCT
GCGGGAACTGTTTCTGCAATGATTTAGGTGAAAAAGGGAGATTTGGAAAAGGTTGATGAT
CAGCGGGAAAGAACGGAGAAGGATGATGATGAGAGATGTAACTAGTACATGACATGTTGT
TATGGTCCTGTTCTTGGAACTGGAAATGAT
C

QA 1 630 1 630
DS 

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C
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GATACAGAAAATATCAAGATGTACGTATCTAATGTATATGTATAGCAACAATATATAAGC
ATCAAGAGGTACTCACAAA*GGGAAACAAAACAATATAATATATATAAAAGAAAAGAACA
AACAATTTAGGACTCACACTGACCATTGACCAATGGAATCAGTGTTGTCATGCTGCTGCT
GCTGCGGGAACTGTTTCTGCAATGATTTAGGTGAGAAAGGGAGATTTGGAAAAGGTTGAT
GATCAGCGGGAAAGAACGGAGAAGGATGATGATGAGAGATGTAACTAGTACATGACATGT
TGTTATGGTCCTGTTCTTGGAACTGGAAATGATTATTCTGTTGTACTTGTTGTTGTCTCT
GTTTTGGGCTATTGGCTTTCTCTCCTTCGGTTTCTCGGTATTTGTTGAGATAGACCTTTA
ACGGAGCCACGTAGTCTTCGAAACCGAGAGTTGTAATGGCCCAAATTATGTCATCTCCAT
TGATGGTTTTCCTCTTCTCTCTTTGACACTTATCAGAAGCTTCACCAGTAACGAAACTGA
TGAACTCTGATACACATTCTTGAACGGTTTCTTTGGCGTCTTTCGAGATCTTACCATTAC
CGGGAAGGACCTTTTTCATAATTCTTCCGACATTGGCAATTGGAAGAAACCGGTCTTGTT
CTTTGTTGTTGCTGTTGTTATTGTTCTTTGAAGAAGGGCTTCCAAGATTTGTTTCGGCTA
CTCCAGGAGATTCATGATCCTCCTCTC

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR4A259TF 798 0 0
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CTGTTTCTGCAATGATTTAGGTGAGAAAGGGAGATTTGGAAAAGGTTGATGATCAGCGGG
AAAGAACGGAGAAGGATGATGATGAGAGATGTAACTAGTACATGACATGTTGTTATGGTC
CTGTTCTTGGAACTGGAAATGATTATTCTGTTGTACTTGTTGTTGTCTCTGTTTTGGGCT
ATTGGCTTTCTCTCCTTCGGTTTCTCGGTATTTGTTGAGATAGACCTTTAACGGAGCCAC
GTAGTCTTCGAAACCGAGAGTTGTAATGGCCCAAATTATGTCATCTCCATTGATGGTTTT
CCTCTTCTCTCTTTGACACTTATCAGAAGCTTCACCAGTAACGAAACTGATGAACTCTGA
TACACATTCTTGAACGGTTTCTTTGGCGTCTTTCGAGATCTTACCATTACCGGGAAGGAC
CTTTTTCATAATTCTTCCGACATTGGCAATTGGAAGAAACCGGTCTTGTTCTTTGTTGTT
GCTGTTGTTATTGTTCTTTGAAGAAGGGCTTCCAAGATTTGTTTCGGCTACTCCAGGAGA
TTCATGATCCTCCTCTCC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4A259TFB 794 0 0
TAATATATCAAGAAGTATTCGTCTGTTACACAAAATATAACATCGGGATACAGAAAATAT
CAAGATGTACGTATCTAATGTATATGTATAGCAACAATATATAAGCATCAAGAGGTACTC
ACAAA*GGGAAACAAAACAATATAATATATATAAAAGAAAAGAACAAACAATTTAGGACT
CACACTGACCATTGACCAATGGAATCAGTGTTGTCATGCTGCTGCTGCTGCGGGAACTGT
TTCTGCAATGATTTAGGTGAGAAAGGGAGATTTGGAAAAGGTTGATGATCAGCGGGAAAG
AACGGAGAAGGATGATGATGAGAGATGTAACTAGTACATGACATGTTGTTATGGTCCTGT
TCTTGGAACTGGAAATGATTATTCTGTTGTACTTGTTGTTGTCTCTGTTTTGGGCTATTG
GCTTTCTCTCCTTCGGTTTCTCGGTATTTGTTGAGATAGACCTTTAACGGAGCCACGTAG
TCTTCGAAACCGAGAGTTGTAATGGCCCAAATTATGTCATCTCCATTGATGGTTTTCCTC
TTCTCTCTTTGACACTTATCAGAAGCTTCACCAGTAACGAAACTGATGAACTCTGATACA
CATTCTTGAACGGTTTCTTTGGCGTCTTTCGAGATCTTACCATTACCGGGAAGGACCTTT
TTCATAATTCTTCCGACATTGGCAATTGGAAGAAACCGGTCTTGTTCTTTGTTGTTGCTG
TTGTTATTGTTCTTTGAAGAAGGGCTTCCAAGATTTGTTTCGGCTACTCCAGGAGATTCA
TGATCCTCCTCTC
C

QA 1 793 1 793
DS 



AS 2 6

CO CL1604Contig1 835 4 3 U
TTGGAGTTTGATAGATGATTCTATTCAAACAAATAATACCCGGTTATTTAGTGTACCGG*
AGTCGAAAATTTACATTCTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTAGTTTCTCTCCTCTCTAATG
ATCTTTAGACAAATGTTGGGCTTGTGAAAAAGCTTCAAGCTTCTCTTTATCAGTGTTGGG
AAGAATCTTTGTTCACTTGTTTTTCTCTTCCGGGGG*AGTCACCTGAAGCAGCTCTATGT
TTAACTCAAACGTAGCTCCAGGCGGTATCTCGTTCATTCCTCTCTGACCATAACCAGCTT
CAGGTGGAACAATCACCGTTCTCTTGCCACCGACTTTCATTCCTTCAGTTATGTAATACA
TAGCTGGAGGAGGCTTTGGTGCAGCCTGTGCAGAGAACAACCCGTTTGGATTGTCTACAA
ACTCTCGTTTCCTTTCCTTTCCTGGAGTTGATCCGACCTTGAACTCGTATGGCTGAGCAA
TACTACGATTCCCAGCCAAAAGCTTGGACTCTCTGGTGGAGATTGCAGTGATGCTTCTGT
AACGGCAATCAAAATGCACCTGAGCAGTTGATCCTATTGTGGCTACTGGACCTTTGCCTT
CCTCAATGTCATAGTACTTCAACCCTTCAGGGCTAGTGGAATACTCGTCGAGGGGGATGA
CTTTCCTGCTCCGTCTCTCTCTCGCCTCCGAAGAACTCGGCGGTAGAACGAAGAAGCTAG
TCAACGGAAGCGAGCCGAGGAGGATAAGATTCGCGTCTCTTCTGGAAATAGGAAACGAAG
AAAAAGTGACGATTTGGTTTGTCTGACGAGATTGATCCGCTGCGTCAGAGATTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4BH08JQ U 3
AF RR4BH08TF C 1
AF RR4BG33TF C 2
AF RR4BG33JQ U 3
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TTAACTCAAACGTAGCTCCAGGCGGTATCTCGTTCATTCCTCTCTGACCATAACCAGCTT
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TACTACGATTCCCAGCCAAAAGCTTGGACTCTCTGGTGGAGATTGCAGTGATGCTTCTGT
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C

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T
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AACTCAAACGTAGCTCCAGGCGGTATCTCGTTCATTCCTCTCTGACCATAACCAGCTTCA
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C

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QA 1 833 1 833
DS 



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GAGACGGAGCAGGAAAGTCATCCCCCTCGAGGAGTATTCCACTAGCCCTGAAGGGTTGAA
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GCATTTTGATTGCCGTTACAGAAGCATCACTGCAATCTCCACCAGAGAGTCCAAGCTTTT
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AGCTACGTTTGAGTTAAACATAGAGCTGCCTCAGGTGACTCCCCCAGAAGTGAACTATGA
TTCTTCCCAACACTGATAGAGAGAAAGCTTGAAGCTTGAAGCTTTTCACAAGCCCAACAT
TTGTCTAAAGATCATTAGAGAGGAGAGAAACTAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAGAATGTA
AATTTTCAACTCCGGTACACTAAATAACCGGGTATTATTTGTTGAGTATTTGAGTAGAAT
CATCTATCAAAAGTAGCTGGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GJ84TF U 1
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BS 526 925 RR4GJ84JQ

RD RR4GJ84TF 525 0 0
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GGAGAGGAAACGTGAGTTTGTAGACAATCCAAACGGGTTGTTCTC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4GJ84JQ 634 0 0
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AGCTCAGGTGCATTTTGATTGCCGTTACAGAAGCATCACTGCAATCTCCACCAGAGAGTC
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CAAGAGAACTGTGATTGTTCCGCCTGAAGCTGGTTATGGTCAGAAAGGAATGAACGAGAT
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GAGTAGAATCATCTATCAAAAGTAGCTGGTTCTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 5

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TCCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGG
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TCCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTGCTTTACGATCAATATTAAAAGTTACCTTCAAAGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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RD RR4EZ27JQ 786 0 0
G
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QA 7 792 7 792
DS 

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GATATACCATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCTTAACACCATCGTAAGCACCGTCA
TCCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGG
GTTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGTTGACACAGTCTCCGGCAAACCCA
TGAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAGTGAAATGAGTACCGTCATCGTAT
CCAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTTGGATATGAACTTAAGCCCTTGAATGAAACCATCA
GGGTTATACCAACCTTCTACAGAAACTAGATGCTCCTCTGGATGGTTAATAACAAACGGA
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TTCACATAATCAAACTTGACGTATTGAATGCCGATTCCACCTGCTCCGACCTGAATCTTG
GTTACGGCATCGTGTTCGGATCCATCGTCCCATTGAATACCTCCTTTCCCTCCTTGTGCT
TCCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTGCTTTACGATCAATATTAAAAGTTACCTTCAAAGG
GAGAGTAGATTGTTACAGGTGCTATCCC

QA 11 818 11 818
DS 

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TCCTACGTACACCTTCTTAACACCATCGTAAGCACCATCATCCCATGCAGTTCCTGCATC
AGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGGTTGAAGTCAACGGAGCAAA
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GTCTTGAACTTGGAGAGTGAAATGAGTACCGTCATCGTATCCAATGACATCAGAGGTTTT
CTTGTTGGATATGAACTTAAGCCCTTGAATGAAACCATCAGGGTTATACCAACCTTCTAC
AGAAACTAGATGCTCCTCTGGATGGTTAATAACAAACGGATCAGCTGCGATACTACGGCC
TTTGACTCCGCGAAGAGGGGCTTCTTCGGTTTGTCCGTTCTTCACATAATCAAACTTGAC
GTATTGAATGCCGATTCCACCTGCTCCGACCTGAATCTTGGTTACGGCATCGTGTTCGGA
TCCATCGTCCCATTGAATACCTCCTTTCCCTCCTTGTGCTTCCACCTTTTGGGCCATCTT
TGTTTGCTTTACGATCAATATTAAAAGTTACCTTCAAAGGGAGAGTAGATTGTTACAGGT
GCTATCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 5

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CTAAGTTTCGCAACTCGGGTGCTTTGGTCTGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGA
TAATGACGAGAATATACTCTGTCTATTCCTCTTCAACAATCTTGCTCTTCTCGCTTACAT
AGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAA
GAGCACAAGACCTCGACACAAGCTCGATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAA
CTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAACATCTCCACTTTTCTCACCTTCTTCT
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GAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTAACACCGGTGATGA
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TCTTCATCGTCTCCTCACTTTTTCTACTCGTTCACTCTGCTTTCGTCTACTCCCCAGCTC
ACAGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE56JQ U 488
AF RR4BP30JQ U 1
AF RR4BP30TF C 18
AF RR4C675JQ U 1
AF RR4CE56TF C 72
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BS 342 342 RR4C675JQ
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BS 743 743 RR4C675JQ
BS 744 759 RR4BP30JQ
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RD RR4CE56JQ 138 0 0
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ATGCTTGAAGTCGCGAAC

QA 1 138 1 138
DS 

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AGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAA
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CTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAACATCTCCGCTTTTCTCACCTTCTTCT
CACCGAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGG
GAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTAACACCGGTGATGA
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ACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCTGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGA
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TGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCGGGGATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCG
TCTTCATCGTCTCCTCACTTTT*CTACTCGTTCACTCTG

QA 1 759 1 759
DS 

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TGTCAAGTAAT
AAAATCTCCAGCAGAAGG**ACAAAGGAGAAGCTAAGTTTCGCAACTCGGGTGCTTTGGT
CTGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGATAATGACGAGAATATACTCTGTCTATTC
CTCTTCAACAATCTTGCTCTTCTCGCTTACATAGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATC
CTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCACAAGACCTCGACACAAGCTCGAT
GTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACC
GTCCAACATCTCCGCTTTTCTCACCTTCTTCTCACCGAGGAAGTTACGGATCTCGATAGA
CTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTT
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GATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACCACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCC
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TTTGCCGCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTC
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CGTTCACTCTG

QA 12 742 12 742
DS 

RD RR4C675JQ 787 0 0
GGGTCTCCAAAAACTTGTCAAGTAAATAAAAATCTCCAACAGAAAGGAACAAAGGAGAAG
CTAAGTTTCGCAACTCGGGTGCTTTGGTCTGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGA
TAATGACGAGAATATACTCTGTCTATTCCTCTTCAACAATCTTGCTCTTCTCGCTTACAT
AGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAA
GAGCACAAGACCTCGACACAAGCTCGATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAA
CTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAACATCTCCACTTTTCTCACCTTCTTCT
CACCGAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGG
GAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTAACACCGGTGATGA
GGTTGTCGACGTGGCTGAAAGCGGTTCTGATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACC
ACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCTGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGA
GGTTCAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCT
TGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCGGGGATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCG
TCTTCATCGTCTCCTCACTTTTTCTACTCGTTCACTCTGCTTTCGTCTACTCCCCAGCTC
ACAGCCC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4CE56TF 716 0 0
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ATATACTCTGTCTAT*CCTCTTCAACAATCTTGCTCTTCTCGCTTACATAGATACCATCA
AGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCACAAGAC
CTCGACACAAGCTCGATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGAC
CGAACAATGGTTACACCGTCCAACATCTCCACTTTTCTCACCTTCTTCTCACCGAGGAAG
TTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCG
TAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTAACACCGGTGATGAGGTTGTCGACG
TGGCTGAGAGCGGTTCTGATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACCACGAATCGATC
TTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCTGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTCAGATGC
TTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACC
TTGATGGTAATGCCTTCGGGGATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCGTC
TCCTCACTTTTTCTACTCGTTCACTCTGCTTTCGTCTACTCCCCAGCTCA
ACACCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 6

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CTGACTAGGGAGAGAGAACAAAGATCTCTGTTTCATGTTCGGAAATTTAATAAATAGAAT
AATATTTCAGATTAAAGTTTCTCTCTCAGAAGAAGGCCCAGAATCCAAGAAGAAGCCCAA
CGACACCC*AAGAAGCTGGTGAGCTTAGCAGCGCCACTAGTAGGCGCGACGGCGGGACCG
TCAAACGGAGAAGGAGCCGGAGAGAAAGCAGAGACATGAGGAATGTAAACGACAAGGCGA
AGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTTGCGTTCCACTGATGAAGTAGACCGGACCGGGT
TGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCATCTGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTG
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TGTGAGCGTGTTGAATGAGTTGAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4CC87JQ U 304
AF RR4DN82JQ U 1
AF RR4DN82TF C 50
AF RR4CC87TF C 9
AF RR4BO32JQ U 10
AF RR4BO32TF C 37
BS 1 153 RR4DN82JQ
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BS 698 699 RR4BO32JQ
BS 700 749 RR4DN82JQ

RD RR4CC87JQ 172 0 0
TTCC
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GCTTCACCTTGGTGTTCCCATCTGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTGTTGCATT
TCTCGTAAGCCTCTCTCGTCACTTGCAAAACTGAGTCTTTACCGGCTT

QA 5 172 5 172
DS 

RD RR4DN82JQ 749 0 0
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CTGACTAGGGAGAGAGAACAAAGATCTCTGTTTCATGTTCGGAAATTTAATAAATAGAAT
AATATTTCAGATTAAAGTTTCTCTCTCAGAAGAGGGCCCAGAATCCAAGAAGAAGCCCAA
CGACACCC*AAGAAGCTGGTGAGCTTAGCAGCGCCACTAGTAGGCGCGACGGCGGGACCG
TCAAACGGAGAAGGAGTCGGAGAGAAAGCAGAGACATGAGGAATGTAAACGACAAGGCGA
GGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTTGCGTTCCACTGATGAAGTAGACCGGACCGGGT
TGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCATCTGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTG
TTGCATTTCTCGTAAGCCTCTCTCGTCACTTGCAGAACTGAGTCTTTACCGGCTTCGTAG
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AAAGAAGAGGAAGATGGGATCTTCCAGCCACCGGACTTTCCACCAACGGTAACCTCATTG
GCATTTACGGACAAGAAGAAAATGGAGAGGCAGATGGTTACCAGAAGAGAAGGAGACATA
GCTAACAAATATTTTTGTACTGTTCAACCAAAAAA****TATTTTTGTACTGAATGTTAG
TGTGAGCGTGTTGAATGAGTTGAAGATCC

QA 1 749 1 749
DS 

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ATAAATAGAATAATATTTCAGATTAAAGTTTCTCTCTCAGAAGAGGGCCCAGAATCCAAG
AAGAAGCCCAACGACACCC*AAGAAGCTGGTGAGCTTAGCAGCGCCACTAGTAGGCGCGA
CGGCGGGACCGTCAAACGGAGAAGGAGTCGGAGAGAAAGCAGAGACATGAGGAATGTAAA
CGACAAGGCGAGGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTTGCGTTCCACTGATGAAGTAGA
CCGGACCGGGTTGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCATCTGCTGTGTAGCTGGCTTTCG
GGCTCGTGGTGTTGCATTTCTCGTAAGCCTCTCTCGTCACTTGCAGAACTGAGTCTTTAC
CGGCTTCGTAGCTGAAAACGAGAAAGTCGCCGATTATGAAACGAGACTTGTCACCCCATT
CGTTGAAAGAGAAAGAAGAGGAAGATGGGATCTTCCAGCCACCGGACTTTCCACCAACGG
TAACCTCATTGGCATTTACGGACAAGAAGAAAATGGAGAGGCAGATGGTTACCAGAAGAG
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CTGAATGTTAGTGTGAGCGTGTTGAATGAGTTGAAGATCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4CC87TF 741 0 0
A
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GTTGAATGAGTTGAAGATCC

QA 2 741 2 741
DS 

RD RR4BO32JQ 740 0 0
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GAGAGAGAACAAAGGTCTCTGTTTCATGTTCGGAAATTTAATAAATAGAATAATATTTCA
GATTAAAGTTTCTCTCTCAGAAGAAGGCCCAGAATCCAAGAAGAAGCCCAACGACACCC*
AAGAAGCTGGTGAGCTTAGCAGCGCCACTAGTAGGCGCGACGGCGGGACCGTCAAACGGA
GAAGGAGCCGGAGAGAAAGCAGAGACATGAGGAATGTAAACGACAAGGCGAAGCTTCTGA
CCCTTTTGACAGTGACCTTGCGTTCCACTGATGAAGTAGACCGGACCGGGTTGGTCTAGC
TTCACCTTGGTGTTCCCATCTGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTGTTGCATTTC
TCGTAAGCCTCTCTCGTCACTTGCAGAACTGAGTCTTTACCGGCTTCGTAGCTGAAAACG
AGAAAGTCGCCGATTATGAAACGAGACTTGTCACCCCATTCGTTGAAAGAGAAAGAAGAG
GAAGATGGGATCTTCCAGCCACCGGACTTTCCACCAACGGTAACCTCATTGGCATTTACG
GACAAGAAGAAAATGGAGAGGCAGATGGTTACCAGAAGAGAAGGAGACATAGCTAACAAA
TATTTTTGTACTGTTCAACCAAAAAAA*TATATTTTTGTACTGAATGTTAGTGTGAGCGT
GTTGAACGAGTTGAAGATCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4BO32TF 713 0 0
AGTACTAAATTAGTAACAACAAGACTGACTAGGGAGAGAGAACAAAGGTCTCTGTTTCAT
GTTCGGAAATTTAATAAATAGAATAATATTTCAGATTAAAGTTTCTCTCTCAGAAGAAGG
CCCAGAATCCAAGAAGAAGCCCAACGACACCC*AAGAAGCTGGTGAGCTTAGCAGCGCCA
CTAGTAGGCGCGACGGCGGGACCGTCAAACGGAGAAGGAGCCGGAGAGAAAGCAGAGACA
TGAGGAATGTAAACGACAAGGCGAAGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTTGCGTTCCA
CTGATGAAGTAGACCGGACCGGGTTGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCATCTGCTGTG
TAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTGTTGCATTTCTCGTAAGCCTCTCTCGTCACTTGCAGA
ACTGAGTCTTTACCGGCTTCGTAGCTGAAAACGAGAAAGTCGCCGATTATGAAACGAGAC
TTGTCACCCCATTCGTTGAAAGAGAAAGAAGAGGAAGATGGGATCTTCCAGCCACCGGAC
TTTCCACCAACGGTAACCTCATTGGCATTTACGGACAAGAAGAAAATGGAGAGGCAGATG
GTTACCAGAAGAGAAGGAGACATAGCTAACAAATATTTTTGTACTGTTCAACCAAAAAAA
*TATATTTTTGTACTGAATGTTAGTGTGAGCGTGTTGAACGAGTTGAAGATCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 5

CO CL1608Contig1 1088 5 15 U
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ATTCATACTTAGCAAACAAAGCCCGAATGATTTACGGGAACCAGCACCCAAGAGATTAAT
GGGGATCCAAGCCCAGACATCAGGCATCTAGAGGAACGCATAAAACAACACTGATACATT
AAACATAGGAGGCTAATCTCAAGAGAGTCCAATTCCAAGAGACTCAAACATACCAAATGC
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TGAAGACCAAGAGCTCAAGTCTAATCACACTGCTACAAAGCGAAGAGTGAACCTGACGAA
CTCCACCAGACTCCAAAAAGCTGAGATAGTTGCAAGAAAGAAGAGGTACAGCGGCAGAAA
CTTCACCTCAACCAATACCAAGAGGAGCCAAACTGAAACTAATATCAAGCACAAGATGAA
AACCTTGAACTCTGACCTGGGAAAACGCCTTCTAAGACCTCCAACTCTAACACACGGACA
CTCGCATTCCAAACTCAGCCATCTACCGACTGAAGAATGGCCACCTCCACGCAAGAAAAG
ACCTGAAGGACAGAACCACTGCGACGCTAATAACCCAACCAGAAACACACAGCTTCTAGG
AAGAGAAAGTAGATGCTCCCGCAACAAGACCACATCCGAAAGACGAACCCCAAACCAGAC
CTGAATCAACACTCAGAAGAGCAACCTTGGAACTGATAGGAAGAAAAGCCGAGAACAGGA
ACAAGACCAGGTCAAAACCAACAGGCAATCTGTTGTAGAAACTGAAGCCGGAGTATCTGG
CCCCGCCATATACACACCCGTTGCTAAAGACACGACAAACGCCAACCGGAATGACCAACA
CTATCAATAAGCCCTAACACCACCTAATCACGAGATCTATCAAACACAACGAAAGCGAGG
CTAACGGTACCGGAGGTGCAGCTAAGACAGCCGCCACAAGCAGGTCACCGGAGTTGCAGC
TGAGACTTTTGGTTGAAGGAGGAAGGGAGAAATGAGAGGATAATGGAGAGAGAGAGTTAC
GAGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 0 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 0 0 15 0 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE47JQ U 26
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AF RR4E158JQ U 21
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AF RR4FG46TF C 511
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BS 1005 1088 RR4FG46TF

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QA 1 656 1 656
DS 

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QA 1 755 1 755
DS 

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AAAAG
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AATGATTTACGGGAACCAGCACCCAAGAGATTAATGGGGATCCAAGCCCAGACATCAGGC
ATCTAGAGGAACGCATAAAACAACACTGATACATTAAACATAGGAGGCTAATCTCAAGAG
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AAAGGAACAATATCAGGGAAGCACGAGAAAGGAGCTGAAGACCAAGAGCTCAAGTCTAAT
CACACTGCTACAAAGCGAAGAGTGAACCTGACGAACTCCACCAGACTCCAAAAAGCTGAG
ATAGTTGCAAGAAAGAAGAGGTACAGCGGCAGAAACTTCACCTCAACCAATACCAAGAGG
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CGCCTTCTAAGACCTCCAACTCTAACACACGGACACTCGCATTCCAAACTCAGCCATCTA
CCGACTGAAGAATGGCCACCTCCACGCAAGAAAAGACCTGAAGGACAGAACCACTGCGAC
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CCTTG

QA 6 723 6 723
DS 

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AAGACCTCCAACTCTAACACACGGACACTCGCATTCCAAACTCAGCCATCTACCGACTGA
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TGATAGGAAGAAAAGCCGAGAACAGGAACAAGACCAGGTCAAAACCAACAGGCAATCTGT
TGTAGAAACTGAAGCCGGAGTATCTGGCCCCGCCATATACACACCCGTTGCTAAAGACAC
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GTTGAAGGAGG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4FG46TF 578 0 0
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TGAAGAATGGCCACCTCCACGCAAGAAAAGACCTGAAGGACAGAACCACTGCGACGCTAA
TAACCCAACCAGAAACACACAGCTTCTAGGAAGAGAAAGTAGATGCTCCCGCAACAAGAC
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AACTGATAGGAAGAAAAGCCGAGAACAGGAACAAGACCAGGTCAAAACCAACAGGCAATC
TGTTGTAGAAACTGAAGCCGGAGTATCTGGCCCCGCCATATACACACCCGTTGCTAAAGA
CACGACAAACGCCAACCGGAATGACCAACACTATCAATAAGCCCTAACACCACCTAATCA
CGAGATCTATCAAACACAACGAAAGCGAGGCTAACGGTACCGGCGGTGGCGCTAAGGGAG
CCGCCACGCGCCGGTCACCGGAGTTGCAGCTGAGACTTTTGGTTGAAGGAGGAAGGGAGA
AATGAGAGGATAATGGAGAGAGAGAGTTACGAGCCTCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 6

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AACAAAACAGAGTAGAACAACAAATCAAGAACGTATATATACAAATCTCAAGCTCCATCC
AGCTAGTTCCGTCCGAGACAAAATAAGACAAAATGGTAACTCAGTTCTGTTTCTGATGAT
AAAACTACATCTCCACAACACAAAAGTATCCAACCAATAAACCCAAAGACACAGAACACT
ACTCATAAACCCCCCAAAGAAACTCAAATCAATCATCTTTGAATTCTTTAGTGGGACGTG
CTTCAAACCCACCACCTTCTCTCTTCTCAAGCGAGTAAGGCATGTAAGTCCCAAGAATCC
GATCCCACGCGGAGAAGAAAGGCTGAGAGAAATTATACTTGGTCCCATAGAGCTGGTGAT
GCACATCATGGTAAGCCGAGTTGTTCTTAAACACCATATGGAACAGGTTCCCCGGAAGGC
AGAGACCGCAGTGGTCGTCCACGGTCTTGATCGTGGCAAAGGAGAAGAAGAAGATGGACG
TTCTAGGCGACATGCCAGAGATTAGGAAAGACAAGGCGCCTCCGACTGTGTCCAACAGAA
GGCCTTCCACTGGATGGTTGTATAAGGCTCCGTATGCGTAAGGGACGATGAGACGGTGGT
GCTGAGAGTGGATGTGTTTGTATAAGAACTTGTTGTGGTGCATGTAACGGTGCATGAAGT
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CGACAGCAGCTTGAACGACCTGTTGGAGGAGAACCCCTTTGACGACGGCTGATTTGGAGA
CGAGATTCTTCTCGTCCTCCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4EP75JQ U 12
AF RR4EP75TF C 1
AF RR4AR61JQ U 76
AF RR4AR85JQ U 76
AF RR4AR85TF C 155
AF RR4AR61TF C 734
BS 1 30 RR4EP75TF
BS 31 368 RR4EP75JQ
BS 369 369 RR4AR61JQ
BS 370 376 RR4EP75JQ
BS 377 377 RR4AR61JQ
BS 378 386 RR4EP75JQ
BS 387 387 RR4AR61JQ
BS 388 448 RR4EP75JQ
BS 449 449 RR4AR61JQ
BS 450 515 RR4EP75JQ
BS 516 866 RR4AR61JQ
BS 867 925 RR4AR85JQ

RD RR4EP75JQ 504 0 0
ACTAAATAGAAAAGGTGGT
TGTACAAATATCATAACAAATGCAAAACAAAACAAAACAGAGTAGAACAACAAATCAAGA
ACGTATATATACAAATCTCAAGCTCCATCCAGCTAGTTCCGTCCGAGACAAAATAAGACA
AAATGGTAACTCAGTTCTGTTTCTGATGATAAAACTACATCTCCACAACACAAAAGTATC
CAACCAATAAACCCAAAGACACAGAACACTACTCATAAACCCCCCAAAGAAACTCAAATC
AATCATCTTTGAATTCTTTAGTGGGACGTGCTTCAAACCCACCACCTTCTCTCTTCTCAA
GCGAGTAAGGCATGTAAGTCCCAAGAATCCGATCCCACACGGAGAAAAAAGGCTGAAAGA
AATTATACTTGGTCCCATAGAGCTGGTGATGCACATCATGGTAAGCCGAGTTGTTCTTGA
ACACCATATGGAACAGGTTCCCCGGAAGGCAGAGACCGCAGTGGTCGTCCACGGTCTTGA
TCGTG

QA 20 504 20 504
DS 

RD RR4EP75TF 793 0 0
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AACAAA*CAGAGTAGAACAACAAATCAAGAACGTATATATACAAATCTCAAGCTCCATCC
AGCTAGTTCCGTCCGAGACAAAATAAGACAAAATGGTAACTCAGTTCTGTTTCTGATGAT
AAAACTACATCTCCACAACACAAAAGTATCCAACCAATAAACCCAAAGACACAGAACACT
ACTCATAAACCCCCCAAAGAAACTCAAATCAATCATCTTTGAATTCTTTAGTGGGACGTG
CTTCAAACCCACCACCTTCTCTCTTCTCAAGCGAGTAAGGCATGTAAGTCCCAAGAATCC
GATCCCACACGGAGAAGAAAGGCTGAGAGAAATTATACTTGGTCCCATAGAGCTGGTGAT
GCACATCATGGTAAGCCGAGTTGTTCTTGAACACCATATGGAACAGGTTCCCCGGAAGGC
AGAGACCGCAGTGGTCGTCCACGGTCTTGATCGTGGCAAAGGAGAAGAAGAAGATGGACG
TTCTAGGCGACATGCCAGAGATTAGGAAAGACAAGGCGCCTCCGACTGTGTCCAACAGAA
GGCCTTCCACTGGATGGTTGTATAAGGCTCCGTATGCGTAAGGGACGATGAGACGGTGGT
GCTGAGAGTGGATGTGTTTGTATAAGAACTTGTTGTGGTGCATGTAACGGTGCATGAAGT
ATTGCCATGTGTCGAGGACTATCATGGCGATTGCGAACTGTCTGGTTAGGACTAAAAGAG
AGAACTGTTGCGC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4AR61JQ 793 0 0
AAA
AACAAATCAAGAACGTATATATACAAATCTCAAGCTCCATCCAGCTAGTTCCGTCCGAGA
CAAAATAAGACAAAATGGTAACTCAGTTCTGTTTCTGATGATAAAACTACATCTCCACAA
CACAAAAGTATCCAACCAATAAACCCAAAGACACAGAACACTACTCATAAACCCCCCAAA
GAAACTCAAATCAATCATCTTTGAATTCTTTAGTGGGACGTGCTTCAAACCCACCACCTT
CTCTCTTCTCAAGCGAGTAAGGCATGTAAGTCCCAAGAATCCGATCCCACGCGGAGAAGA
AAGGCTGAGAGAAATTATACTTGGTCCCATAGAGCTGGTGATGCACATCATGGTAAGCCG
AGTTGTTCTTAAACACCATATGGAACAGGTTCCCCGGAAGGCAGAGACCGCAGTGGTCGT
CCACGGTCTTGATCGTGGCAAAGGAGAAGAAGAAGATGGACGTTCTAGGCGACATGCCAG
AGATTAGGAAAGACAAGGCGCCTCCGACTGTGTCCAACAGAAGGCCTTCCACTGGATGGT
TGTATAAGGCTCCGTATGCGTAAGGGACGATGAGACGGTGGTGCTGAGAGTGGATGTGTT
TGTATAAGAACTTGTTGTGGTGCATGTAACGGTGCATGAAGTATTGCCATGTGTCGAGGA
CTATCATGGCGATTGCGAACTGTCTGGTTAGGACTAGAAGAGAGAACTGTTGCGCTTTGT
CTGCTTCAGCATCACTTCCTGTGACCGTAAACAAGAGGATAGCGACAGCAGCTTGAACGA
CCTGTTGG
AG

QA 4 791 4 791
DS 

RD RR4AR85JQ 850 0 0
AAA
AACAAATCAAGAACGTATATATACAAATCTCAAGCTCCATCCAGCTAGTTCCGTCCGAGA
CAAAATAAGACAAAATGGTAACTCAGTTCTGTTTCTGATGATAAAACTACATCTCCACAA
CACAAAAGTATCCAACCAATAAACCCAAAGACACAGAACACTACTCATAAACCCCCCAAA
GAAACTCAAATCAATCATCTTTGAATTCTTTAGTGGGACGTGCTTCAAACCCACCACCTT
CTCTCTTCTCAAGCGAGTAAGGCATGTAAGTCCCAAGAATCCGATCCCACGCGGAGAAGA
AAGGCTGAGAGAAATTATACTTGGTCCCATAGAGCTGGTGATGCACATCATGGTAAGCCG
AGTTGTTCTTAAACACCATATGGAACAGGTTCCCCGGAAGGCAGAGACCGCAGTGGTCGT
CCACGGTCTTGATCGTGGCAAAGGAGAAGAAGAAGATGGACGTTCTAGGCGACATGCCAG
AGATTAGGAAAGACAAGGCGCCTCCGACTGTGTCCAACAGAAGGCCTTCCACTGGATGGT
TGTATAAGGCTCCGTATGCGTAAGGGACGATGAGACGGTGGTGCTGAGAGTGGATGTGTT
TGTATAAGAACTTGTTGTGGTGCATGTAACGGTGCATGAAGTATTGCCATGTGTCGAGGA
CTATCATGGCGATTGCGAACTGTCTGGTTAGGACTAGAAGAGAGAACTGTTGCGCTTTGT
CTGCTTCAGCATCACTTCCTGTGACCGTAAACAAGAGGATAGCGACAGCAGCTTGAACGA
CCTGTTGGAGGAGAACCCCTTTGACGACGGCTGATTTGGAGACGAGATTCTTCTCGTCCT
CCTCCCC

QA 4 850 4 850
DS 

RD RR4AR85TF 771 0 0
GGTAACTCAGTTCTGTTTCTGATGATAAAACTACATCTCCACAACACAAAAGTATCCAAC
CAATAAACCCAAAGACACAGAACACTACTCATAAACCCCCCAAAGAAACTCAAATCAATC
ATCTTTGAATTCTTTAGTGGGACGTGCTTCAAACCCACCACCTTCTCTCTTCTCAAGCGA
GTAAGGCATGTAAGTCCCAAGAATCCGATCCCACGCGGAGAAGAAAGGCTGAGAGAAATT
ATACTTGGTCCCATAGAGCTGGTGATGCACATCATGGTAAGCCGAGTTGTTCTTAAACAC
CATATGGAACAGGTTCCCCGGAAGGCAGAGACCGCAGTGGTCGTCCACGGTCTTGATCGT
GGCAAAGGAGAAGAAGAAGATGGACGTTCTAGGCGACATGCCAGAGATTAGGAAAGACAA
GGCGCCTCCGACTGTGTCCAACAGAAGGCCTTCCACTGGATGGTTGTATAAGGCTCCGTA
TGCGTAAGGGACGATGAGACGGTGGTGCTGAGAGTGGATGTGTTTGTATAAGAACTTGTT
GTGGTGCATGTAACGGTGCATGAAGTATTGCCATGTGTCGAGGACTATCATGGCGATTGC
GAACTGTCTGGTTAGGACTAGAAGAGAGAACTGTTGCGCTTTGTCTGCTTCAGCATCACT
TCCTGTGACCGTAAACAAGAGGATAGCGACAGCAGCTTGAACGACCTGTTGGAGGAGAAC
CCCTTTGACGACGGCTGATTTGGAGACGAGATTCTTCTCGTCCTCCTCCCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AR61TF 192 0 0
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TTTGTCTGCTTCAGCATCACTTCCTGTGACCGTAAACAAGAGGATAGCGACAGCAGCTTG
AACGACCTGTTGGCGGAGAACCCCTTTGACGACGGCTGATTTGGAGACGAGATTCTTCTC
GTCCTCCTCCCC

QA 1 192 1 192
DS 



AS 1 4

CO CL1610Contig1 954 4 4 U
GCGGCAAACAACACAAGAATTATTATTTTTTATTACCGGGGAATGAGAGATGGAAAAAAA
AAAAAGAAAAAGCTTCAATGTCAATGGAAGCTTCAGACAGAGTACGGAATCAAATAAAAA
AGCGAAAGTAAAAGAGACACAAAAACTGGACACTGTCTTGTCTGAAAAAGAAGATCTTCT
TCAATGGGTGGAGACTTTGAGGCTAAAAGACTTGTTGATCCAAGCCTTCAAGCTTCCTCC
TTTCCTCGCTCCATTAATGGAATTAGATTCTCCTTCCTTGACCTCTTTCTTCTCCTCTGG
TTTCCTACACAGAGTAAAGTTCCTTGCACCAAGCGATCCAATTGCACTCCACGCGCTTAA
AGCTTCAGGTCCAACCATGGGACAATAGAGAAGAAAATCATTGAAATCGGATCCGAGAAG
AGGAAGACGACCTTCGCGAGCGTAGCATTTAAGAGCAGTATCGATAACCGAGGCGACGAG
ATCTTCCTCGTAAGCAACGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCAAGAACCGTAACGCTGAT
TAGGATTCTGTTTCCCTTTGCGTTGTTCTGGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTAAAGCAACAT
CTTTTTCGATATTTTCAAGAGAGATTTAAAGAAAAAAAATAAACAGATCTCAGATCGAGA
TTAGGGTTGTTGTGGGGGGGAGATTGGATTCACGGGTCGATGCCGAAGCAGCGAAAGTAC
CAGCCTTCTTTGCAGGAACCGAAAGCGAAAACAGAGGAGGCAGAGAGAGGGATTAAAAGG
CTCGCCCTTTCGATTGGAAAGGAGAGCGTAGAGTTGCCACCGAGCCGATTCGTTTCCACC
ATTCACAAACGATTCCGCAGAGAGAAAAAATTGAGATCGAAAGGAGCAATGAAGAAGCGC
TTTTTTGGTTGCGCGAAGCAAGAGGAAGAAGAACGTATGAATGAATGTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B818JQ U 14
AF RR4BH69JQ U 1
AF RR4B818TF C 78
AF RR4BH69TF C 171
BS 1 39 RR4BH69JQ
BS 40 40 RR4B818JQ
BS 41 755 RR4BH69JQ
BS 756 954 RR4B818TF

RD RR4B818JQ 673 0 0
CAAGAATTATTATTTTTTATTACCGGGGAATGAGAGATGGAAAAAAAAAAAAGAAAAAGC
TTCAATGTCAATGGAAGCTTCAGACAGAGTACGGAATCAAATAAAAAAGCGAAAGTAAAA
GAGACACAAAAACTGGACACTGTCTTGTCTGAAAAAGAAGATCTTCTTCAATGGGGGGAG
ACTTTGAGGCTAAAAGACTTGTTGATCCAAGCCTTCAAGCTTCCTCCTTTCCTCGCTCCA
TTAATGGAATTAGATTCTCCTTCCTTGACCTCTTTCTTCTCCTCTGGTTTCCTACACAGA
GTAAAGTTCCTTGCACCAAGCGATCCAATTGCACTCCACGCGCTTAAAGCTTCAGGTCCA
ACCATGGGACAATAGAGAAGAAAATCATTGAAATCGGATCCGAGAAGAGGAAGACGACCT
TCGCGAGCGTAGCATTTAAGAGCAGTATCGATAACCGAGGCGACGAGATCTTCCTCGTAA
GCAACGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCAAGAACCGTAACGCTGATTAGGATTCTGTTT
CCCTTTGCGTTGTTCTGGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTAAAGCAACATCTTTTTCGATATT
TTCAAGAGAGATTTAAAGAAAAAAAATAAACAGATCTCAGATCGAGATTAGGGTTGTTGT
GGGGGGG
GAAATT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BH69JQ 755 0 0
GCGGCAAACAACACAAGAATTATTATTTTTTATTACCGGTGAATGAGAGATGGAAAAAAA
AAAAAGAAAAAGCTTCAATGTCAATGGAAGCTTCAGACAGAGTACGGAATCAAATAAAAA
AGCGAAAGTAAAAGAGACACAAAAACTGGACACTGTCTTGTCTGAAAAAGAAGATCTTCT
TCAATGGGTGGAGACTTTGAGGCTAAAAGACTTGTTGATCCAAGCCTTCAAGCTTCCTCC
TTTCCTCGCTCCATTAATGGAATTAGATTCTCCTTCCTTGACCTCTTTCTTCTCCTCTGG
TTTCCTACACAGAGTAAAGTTCCTTGCACCAAGCGATCCAATTGCACTCCACGCGCTTAA
AGCTTCAGGTCCAACCATGGGACAATAGAGAAGAAAATCATTGAAATCGGATCCGAGAAG
AGGAAGACGACCTTCGCGAGCGTAGCATTTAAGAGCAGTATCGATAACCGAGGCGACGAG
ATCTTCCTCGTAAGCAACGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCAAGAACCGTAACGCTGAT
TAGGATTCTGTTTCCCTTTGCGTTGTTCTGGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTAAAGCAACAT
CTTTTTCGATATTTTCAAGAGAGATTTAAAGAAAAAAAATAAACAGATCTCAGATCGAGA
TTAGGGTTGTTGTGGGGGGGAGATTGGATTCACGGGTCGATGCCGAAGCAGCGAAAGTAC
CAGCCTTCTTTGCAGGAACCGAAAGCGAAAACAGA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4B818TF 877 0 0
ATGTCAATGGAAGCTTCAGACAGAGTACGGAATCAAATAAAAAAGCGAAAGTAAAAGAGA
CACAAAAACTGGACACTGTCT*GTCTGAAAAAGAAGATCTTCTTCAATGGGTGGAGACTT
TGAGGCTAAAAGACTTGTTGATCCAAGCTTTCAAGCTTCCTCCTTTCCTCGCTCCATTAA
TGGAATTAGATTCTCCTTCCTTGAC*TCTTTCTTCTCCTCTGGTTTCCTACACAGAGTAA
AGTTCCTTGCACCAAGCGATCCAATTGCACTCCACGCGCTTAAAGCTTCAGGTCCAACCA
TGGGACAATAGAGAAGAAAATCATTGAAATCGGATCCGAGAAGAGGAAGACGACCTTCGC
GAGCGTAGCATTTAAGAGCAGTATCGATAACCGAGGCGACGAGATCTTCCTCGTAAGCAA
CGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCAAGAACCGTAACGCTGATTAGGATTCTGTTTCCCT
TTGCGTTGTTCTGGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTAAAGCAACATCTTTTTCGATATTTTCA
AGAGAGATTTAAAGAAAAAAAATAAACAGATCTCAGATCGAGATTAGGGTTGTTGTGGGG
GGGAGATTGGATTCACGGGTCGATGCCGAAGCAGCGAAAGTACCAGCCTTCTTTGCAGGA
ACCGAAAGCGAAAACAGAGGAGGCAGAGAGAGGGATTAAAAGGCTCGCCCTTTCGATTGG
AAAGGAGAGCGTAGAGTTGCCACCGAGCCGATTCGTTTCCACCATTCACAAACGATTCCG
CAGAGAGAAAAAATTGAGATCGAAAGGAGCAATGAAGAAGCGCTTTTTTGGTTGCGCGAA
GCAAGAGGAAGAAGAACGTATGAATGAATGTGATTCC

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR4BH69TF 784 0 0
GAAGATC
TCTTCAATGGGTGGAGACTTTGAGGCTAAAAGACTTGTTGATCCAAGCCTTCAAGCTTCC
TCCTTTCCTCGCTCCATTAATGGAATTAGATTCTCCTTCCTTGACCTCTTTCTTCTCCTC
TGGTTTCCTACACAGAGTAAAGTTCCTTGCACCAAGCGATCCAATTGCACTCCACGCGCT
TAAAGCTTCAGGTCCAACCATGGGACAATAGAGAAGAAAATCATTGAAATCGGATCCGAG
AAGAGGAAGACGACCTTCGCGAGCGTAGCATTTAAGAGCAGTATCGATAACCGAGGCGAC
GAGATCTTCCTCGTAAGCAACGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCAAGAACCGTAACGCT
GATTAGGATTCTGTTTCCCTTTGCGTTGTTCTGGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTAAAGCAA
CATCTTTTTCGATATTTTCAAGAGAGATTTAAAGAAAAAAAATAAACAGATCTCAGATCG
AGATTAGGGTTGTTGTGGGGGGGAGATTGGATTCACGGGTCGATGCCGAAGCAGCGAAAG
TACCAGCCTTCTTTGCAGGAACCGAAAGCGAAAACAGAGGAGGCAGAGAGAGGGATTAAA
AGGCTCGCCCTTTCGATTGGAAAGGAGAGCGTAGAGTTGCCACCGAGCCGATTCGTTTCC
ACCATTCACAAACGATTCCGCAGAGAGAAAAAATTGAGATCGAAAGGAGCAATGAAGAAG
CGCTTTTTTGGTTGCGCGAAGCAAGAGGAAGAAGAACGTATGAATGAATGTGATTCC

QA 8 784 8 784
DS 



AS 1 6

CO CL1611Contig1 944 6 13 U
GGGTTTTCAATGTCTTTGGCAAGAGATCGCACACGACAAATCTCAGTTTAATCCATCCAC
ACTAACAAACACCTCATGGCCATTCTTATTGAATAGGCCAAAAGCGTAGAAACTGAAACC
ACACTGGTTGACAAGTTATGAGAGACACAGAATCATACAAATCATCACACTATTACATAA
ATAAAAACAAATGGGAAATAAAACAGAGAGTT*GTCTTAAAAGGCAAGAGCCCAAACGGG
AAAGACGACAAGAGCAATGATCCCAAGTGTGTTGGAGATGCCATGAGCTTTTGTGAATGC
GTTTCTAAATCCACCTGAAGCTCTAATATGTTCTTGGAGCAAGTAACATCCGATCAACAA
GCATGTGACTAAACCAACCCAGTTGTCTCTGAATGTGCCGGCGATTAGTCCTGGAGCCAC
CACTATGAGTAGAATCAGAGCCGCCGGTAATTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAA
GAAGAGTTGTACAACAACAGCTACAAACGCGATCCATTTACCAACATCTCCTCTGAAAAG
GCCAAAGATCACGGAAGGAAGACTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCAT
ATTCGTCTTCCAATTAGTTCGATCCAAGACCAACAAGTATATGGCGGCGATTGAAGCAAT
CCATTCGAGGATAGAAGTCCCAAAGCCTAAACCAGTGAGCATGAAGGTGTGATTAACGAG
ATTCTTAGCAGCGGTAGCTAGCTCGTTGAGATCGGATCCGACCATAGCTTGAAGGGTTCC
ATGGTCTCTCCTCATCGCTGTGAAAGTCATCTCTTTGCCCGAGAGATTACAGAGGAACAA
GGAAGAGAACTGGTTAGAGATTTGAAAAATGAAGATGATGGTGATGAATGTTGTGAAAGA
CACGTGATTCTTGTTAGAAACATATAGAAGTGAATCGATGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH32JQ U 1
AF RR4AV03JQ U 35
AF RR4AT60JQ U 64
AF RR4AV03TF C 83
AF RR4GH32TF C 523
AF RR4AT60TF C 127
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BS 865 944 RR4AT60TF

RD RR4GH32JQ 579 0 0
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ACACTGGTTGACAAGTTATGAGAGACACAGAATCATACAAATCATCACACTATTACATAA
ATAAAAACAAATGGGAAATAAAACAGAAAGTTTGTCTTAAAAGGCAAGAGCCCAAACGGG
AAAGACGACAAGAGCAATGATCCCAAGTGTGTTGGAGATGCCATGAGCTTTTGTGAATGC
GTTTCTAAATCCACCTGAAGCTCTAATATGTTCTTGGAGCAAGTAACATCCGATCAACAA
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CACTATGAGTAGAATCAGAACCGCCGGTAATTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAA
GAAGAGTTGTACAACAACAGCTACAAACGCGATCCATTTACCAACATCTCCTCTGAAAAG
GCCAACGATCACGGAAGGAAGACTGAAGAAGATGTAAGG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4AV03JQ 797 0 0
GAG
AAATCTCAGTTTAATCCATCCACACTAACAAACACCTCATGGCCATTCTTATTGAATAGG
CCAAAAGCGTAGAAACTGAAACCACACTGGTTGACAAGTTATGAGAGACACAGAATCATA
CAAATCATCACACTATTACATAAATAAAAACAAATGGGAAATAAAACAGAGAGTT*GTCT
TAAAAGGCAAGAGCCCAAACGGGAAAGACGACAAGAGCAATGATCCCAAGTGT**TGGAG
ATGCCATGAGCTTTTGTGAATGCGTTTCTAAATCCACCTGAAGCTCTAATATGTTCTTGG
AGCAAGTAACATCCGATCAACAAGCATGTGACTAAACCAACCCAGTTGTCTCCGAATGTG
CCGGCGATTAGTCCTGGAGCCACCACTATGAGTAGAATCAGAGCCGCCGGTAATTCAAAC
CATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTACAACAACAGCTACAAACGCGATCCAT
TTACCAACATCTCCTCTGAAAAGGCCAAAGATCACGGAAGGAAGACTGAAGAAGATGTAA
GGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTCGTCTTCCAATTAGTTCGATCCAAGACCAACAAG
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CCGACCATAGCTTGAAGGGTTCCATGGTCTCTCCTCATCGCTGTGAAAGTCATCTCTTTG
CCCGAGAGATTACA

QA 4 797 4 797
DS 

RD RR4AT60JQ 774 0 0
GC
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AACAAATGGGAAATAAAACAGAGAGTT*GTCTTAAAAGGCAAGAGCCCAAACGGGAAAGA
CGACAAGAGCAATGATCCCAAGTGTGTTGGAGATGCCATGAGCTTTTGTGAATGCGTTTC
TAAATCCACCTGAAGCTCTAATATGTTCTTGGAGCAAGTAACATCCGATCAACAAGCATG
TGACTAAACCAACCCAGTTGTCTCTGAATGTGCCGGCGATTAGTCCTGGAGCCACCACTA
TGAGTAGAATCAGAGCCGCCGGTAATTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGA
GTTGTACAACAACAGCTACAAACGCGATCCATTTACCAACATCTCCTCTGAAAAGGCCAA
AGATCACGGAAGGAAGACTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTCG
TCTTCCAATTAGTTCGATCCAAGACCAACAAGTACATGGCGGCGATTGAAGCAATCCATT
CGAGGATAGAAGTCCCAAAGCCTAAACCAGTGAGCATGAAGGTGTGATTAACGAGATTCT
TAGCAGCGGTAGCTAGCTCGTTGAGATCGGATCCGACCATAGCTTGAAGGGTTCCATGGT
CTCTCCTCATCGCTGTGAAAGTCATCTCTTTGCCCGAGAGATTACAGAGGAA

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR4AV03TF 782 0 0
TTCTTATTGAATAGGCCAAAAGCGTAGAAACTGAAACCACACTGGTTGACAAGTTATGAG
AGACACAGAATCATACAAATCATCACACTATTACATAAATAAAAACAAATGGGAAATAAA
ACAGAGAGTT*GTCTTAAAAGGCAAGAGCCCAAACGGGAAAGACGACAAGAGCAATGATC
CCAAGTGT**TGGAGATGCCATGAGCTTTTGTGAATGCGTTTCTAAATCCACCTGAAGCT
CTAATATGTTCTTGGAGCAAGTAACATCCGATCAACAAGCATGTGACTAAACCAACCCAG
TTGTCTCCGAATGTGCCGGCGATTAGTCCTGGAGCCACCACTATGAGTAGAATCAGAGCC
GCCGGTAATTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTACAACAACAGCT
ACAAACGCGATCCATTTACCAACATCTCCTCTGAAAAGGCCAAAGATCACGGAAGGAAGA
CTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTCGTCTTCCAATTAGTTCGA
TCCAAGACCAACAAGTATATGGCGGCGATTGAAGCAATCCATTCGAGGATAGAAGTCCCA
AAGCCTAAACCAGTGAGCATGAAGGTGTGATTAACGAGATTCTTAGCAGCGGTAGCTAGC
TCGTTGAGATCGGATCCGACCATAGCTTGAAGGGTTCCATGGTCTCTCCTCATCGCTGTG
AAAGTCATCTCTTTGCCCGAGAGATTACAGAGGAACAAGGAAGAGAACTGGTTAGAGATT
TG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4GH32TF 347 0 0
C
ACATCTCCTCTGAAAAGGCCA*CGATCACGGAAGGAAGA*TGAAGAAGATGTAAGGAATC
AAAAGTGATGTGAGCATATTCGTCTTCCAATTAGTTCGATCCAAGACCCACAAGTATATG
GCGGCTATTGAAGCAATCCATTCGAGGATAGAAGTCTCAAAGCCTAAACCAGTGAGCATG
AAGGTGTGATTAACGAGATTCTTAGCAGCGGTAGCTAGCTCGTTGAGATCGGATCCGACC
ATAGCTTGAAGGGTTCCATGGTCTCTCCTCATCGCTGTGAAAGTCATCTCTTTGCCCGAG
AGATTACAGAGGAACAAGAAAGAGAACTGGTTAGAGATTTG
AAAAA

QA 2 342 2 342
DS 

RD RR4AT60TF 818 0 0
GTTGACAAGTTATGAGAGACACAGAATCATACAAATCATCACACTATTACATAAATAAAA
ACAAATGGGAAATAAAACAGAGAGTT*GTCTTAAAAGGCAAGAGCCCAAACGGGAAAGAC
GACAAGAGCAATGATCCCAAGTGTGTTGGAGATGCCATGAGCTTTTGTGAATGCGTTTCT
AAATCCACCTGAAGCTCTAATATGTTCTTGGAGCAAGTAACATCCGATCAACAAGCATGT
GACTAAACCAACCCAGTTGTCTCTGAATGTGCCGGCGATTAGTCCTGGAGCCACCACTAT
GAGTAGAATCAGAGCCGCCGGTAATTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAG
TTGTACAACAACAGCTACAAACGCGATCCATTTACCAACATCTCCTCTGAAAAGGCCAAA
GATCACGGAAGGAAGACTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTCGT
CTTCCAATTAGTTCGATCCAAGACCAACAAGTACATGGCGGCGATTGAAGCAATCCATTC
GAGGATAGAAGTCCCAAAGCCTAAACCAGTGAGCATGAAGGTGTGATTAACGAGATTCTT
AGCAGCGGTAGCTAGCTCGTTGAGATCGGATCCGACCATAGCTTGAAGGGTTCCATGGTC
TCTCCTCATCGCTGTGAAAGTCATCTCTTTGCCCGAGAGATTACAGAGGAACAAGGAAGA
GAACTGGTTAGAGATTTGAAAAATGAAGATGATGGTGATGAATGTTGTGAAAGACACGTG
ATTCTTGTTAGAAACATATAGAAGTGAATCGATGGATC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 2 6

CO CL1612Contig1 765 3 5 U
AACATTTTCACAGTTTTCTTTCAAATGGTTCTTAATTATCATACAAACAA*TATTAAAAG
CATGGAGAAGAAAAAAGAACGTTCACGTGAGGTCAGTAACTCATATAGAGAAGAAACTTT
TGTTCCTCAAAAGAAAGAAGGGTCTTTGTACCTTCTGAACACGGCTTCAATATCAGCCAT
GACCTCTGGCGACAACGGCCCTTCCGTCATCAGATAAGCATCAATGTCTTCTTTAAGCTG
TTCCATTGACGTAGCTCCGATGATCGTGCTCGTCACAAAAGGCCTGTCACGTACAAACCC
CAGAGCTAGCTCCACCGGAGTTAAACCGTGCTTCTTCGCCACCTCAATGTATTGAATCGT
TGCTTCCTTGGCTAGGGATCCTTTGTAACGCTCCATGAATCCAGGGAAAAGATTCAGCCT
TGCGTTCTTCGTAGCTTCTGGGTCTGTAACCAAGTATTTCCCAGACAAGGAGCCGCCACC
AAGAGGGGAATATGCAAGCAAGCCGACATTGCAATTTTTTGGATGGCATACTTCTACCAG
ATCAACTTCAAAACGGGTCCGAGCTAGCAAGCTGTAACCATTCTGGATGCTCACAATCTT
TGGTAGTCCTTCTAGTTTTGCTGTGTGAACAAACTCCATCACTCCATATGAAGTTTCATT
TGAGACACCGATGTAGCGAACCTTCCCTTCGTTAATGAGATCCTGGAACGCTCTTAGCTG
CTCCACAAATGGCACACTACTTCTCCATTTTGATGGATCATAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY78JQ U 1
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QA 1 765 1 765
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QA 1 739 1 739
DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY78TF U 1
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AF RR4EO50TF U 7
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QA 1 701 1 701
DS 

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GG
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ACTTCGGTTTTGGTGAAAGCGTCGACTGAGAAGACGATGGAGTACAGGAAGTTAGGGGAT
TCGGAGCTCAATATCAGCGAGATTACTATGGGCACTATGACGTTTGGGGAGCAGAATACT
GAGAAAGAATCTCATGAGATGCTGAGTTATGCAGCTGAGCATGGCATCAACTGCATTGAC
ACTGCTGAAGCCTATCCTGTCCCGATGAAGAAGGAGACCCAAGGGAAAACTGATCTTTAT
ATCAGTAGCTGGTTGAAGTCTCAGAGCCGTGACAAGATTGTTTTGGCAACTAAATTATGT
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DS 



AS 1 6

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BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 

AF RR4C955JQ C 10
AF RR4C955TF U 10
AF RR4DN75TF U 1
AF RR4DL63TF U 1
AF RR4DL63JQ C 2
AF RR4DN75JQ C 2
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G
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AGATGTGTCTCTGTTTTTAGAATTTTCTCATTTTTGATTTTAATTATTAAAAATAGAGAG
GTGATCGTTGGTGAACAAAACACTTGTTGTCGTTGTTCT

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DS 

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G
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ATCGATCTCGTTGCGCGCATAGGGAAACACGTGTACAGCAAAAATGGCGTACTCACGGAG
GTCAAATCATTCGGCAAGGTCGAATTGGGTTACGGTATTAAGAAGCTCGACGGAAGACAC
TATCAGGGACAACTGATGCAGATAACAATGATGGCAACACCAAACATGAACAAGGAGCTT
CACTACCTCAACAAGGAAGACAAACTCCTGCGCTGGCTCCTCGTTAAACACCGCGACATC
AAGATTGGATCATCTGAAATGGAAGATCGTCAGGACGAGTTTAGCAGAGTTACTAACAGG
AGCTTATATGAGGAATCCTCAACGGACGAAGAAGGCGATCTCCTTGGCTTAAGACGATGA
TGAGGAGAAGAGGAAATCGTTTTTTACTCGGACCAGAGTCTGTCCCCTTCATCTTTGTCT
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AGATGTGTCTCTGTTTTTAGAATTTTCTCATTTTTGATTTTAATTATTAAAAATAGAGAG
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T
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CT

QA 2 752 2 752
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AAGACGATGATGAGGAGAAGAGGAAATCGTTTTTTACTCGGACCAGAG***GTCCCCTTC
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TACAG

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DS 

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GGAAGACACTATCAGGGACAACTGATGCAGATAACAATGATGGCAACACCAAACATGAAC
AAGGAGCTTCACTACCTCAACAAGGAAGACAAACTCCTGCGCTGGCTCCTCGTTAAACAC
CGCGACATCAAGATTGGATCATCTGAAATGGAAGATCGTCAGGACGAGTTTAGCAGAGTT
ACTAACAGGAGCTTATATGAGGAATCCTCAACGGACGAAGAAGACGATCTCCTTGGCTTA
AGACGATGATGAGGAGAAGAGGAAATCGTTTTTTACTCGGACCAGAG***GTCCCCTTCA
TCTTTGTCTTATGGTTTTATTGGCTGATAAATGCAAACATGTATTGACACGTCATCTTTG
CATGGGCAGAGATGTGTCTCTGTTTTTAGAATTTTCTCATTTTTGATTTTAATTATTAAA
AATAGAGAGGTGATCGTTGGTGAACAAAACACTTGTTGTCGTTGTTCTATTTTTTACCCT
TGGTCGCTCCATCTTCTTCGTCCATCGGTTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCTCATTGTTGT
TACAG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 6

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TACAAACTGTTATACAAATGAGTTGTGTCC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB04JQ C 1
AF RR4BB04TF U 1
AF RR4BE68TF U 1
AF RR4BE68JQ C 3
AF RR4AZ89TF U 112
AF RR4AZ89JQ C 112
BS 1 2 RR4BB04JQ
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CCTGTTGCCAAGATTTCCATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCC
CCCAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATG
GCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTTGGGGATGACAACGTGACG
ACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGG
TTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTC
ATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGAT
GCTGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACT
CACATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGA
GAAGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGTTTATA
TCAAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTA
CTAGACCATTACCCATTTGCGTATATATTTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTTC

QA 1 833 1 833
DS 

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GT
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TGTTGCTTACCATGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCC
TGTTGCCAAGATTTCCATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCCCC
CAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATGGC
TGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTTGGGGATGACAACGTGACGAC
TGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTT
CGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCAT
GGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGC
TGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACTCA
CATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGAGA
AGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGTTTATATC
AAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTACT
AGACCATTACCCATTTGCGTATATATTTT

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR4BE68TF 833 0 0
GT
TCTTGCGGCGAGGCGTGAGCTTAAGGAGATAAGCAAGGACGAGATCTCTGATGCGCTTGA
GAGGATCATTGCTGGACCTGAGAAGAAGAATGCTGTTGTCTCTGATGAGAAGAAGAGGCT
TGTTGCTTACCATGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCC
TGTTGCCAAGATTTCCATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCCCC
CAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATGGC
TGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTTGGGGATGACAACGTGACGAC
TGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTT
CGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCAT
GGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGC
TGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACTCA
CATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGAGA
AGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGTTTATATC
AAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTACT
AGACCATTACCCATTTGCGTATATATTTTCTTT*GTAAAATACTCTGTTTC

QA 3 833 3 833
DS 

RD RR4BE68JQ 831 0 0
TCTTGCGGCGAGGCGTGAGCTTAAGGAGATAAGCAAGGACGAGATCTCTGATGCGCTTGA
GAGGATCATTGCTGGACCTGAGAAGAAGAATGCTGTTGTCTCTGATGAGAAGAAGAGGCT
TGTTGCTTACCATGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCC
TGTTGCCAAGATTTCCATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCCCC
CAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATGGC
TGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTTGGGGATGACAACGTGACGAC
TGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTT
CGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCAT
GGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGC
TGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACTCA
CATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGAGA
AGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGTTTATATC
AAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTACT
AGACCATTACCCATTTGCGTATATATTTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTTC

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4AZ89TF 758 0 0
G
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TTTTTGCCCCCAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGA
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ACGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGCGGCACGTCAAATGA
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ATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATA
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TAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCGGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTG
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AGTTTATATCAAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAAT
GTATACTACTAGACCATTACCCATTTGCGTATATATTTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTT
CTACTTGGACTGAATCCTTATGAACCATCATACTTAG

QA 2 758 2 758
DS 

RD RR4AZ89JQ 819 0 0
G
AGAAGAGGCTTGTTGCTTACCATGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAG
AGTATGATCCTGTTGCCAAGATTTCCATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCT
TTTTTGCCCCCAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGA
ATCAGATGGCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTTGGGGATGACA
ACGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGCGGCACGTCAAATGA
TCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCGTTTGTGGCCCTGGTGGAA
ATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATA
TCGTAGATGCTGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCA
TAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCGGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTG
TTGATGGAGTAGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTT
AGTTTATATCAAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAAT
GTATACTACTAGACCATTACCCATTTGCGTATATATTTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTT
CTACTTGGACTGAATCCTTATGAACCATCATACTTAGTAAGGTAGAGAAAGGCAGTATCT
TAACAACTTACAAACTGTTATACAAATGAGTTGTGTCC

QA 2 819 2 819
DS 



AS 1 4

CO CL1615Contig1 1489 4 32 U
GATGAAATCGGGTACTGTTATGCTTAAGAGCATTACGTGTTTAGGCAGTAGTAAACAACT
TTGTTTTCAAATGCTTAAAGAGAACAAACATAAATTATTTCAGAGAAAAACCACATGCAA
TAACACAGAGATATACCTTCCTACTTCCAGAGCGTACGCAAAGACATGTTCTTCTCTGTG
TCTTTCTTCATAACCTTCCCCACTGCCATCTCAAAGTCTTCCTGTGTCACGTGTACTCTC
CTCTCCCGCAGCGCAAACATACCCGCCTCCGTGCACACCGCCTTCAGCTCAGCACCTGAA
GCACCATTCATCTTCTCGGCAATCTTCTTCAGATCAATTCCACGCATCAAATTCATCTTC
CTCGAGTGAATCTTCAAGATATCAAAACGTGAATCTTCATTAGGATTGGGGAATTCGATT
TTCCTATCAATCCTTCCTGGCCTGAGAAGAGCTTGATCCAGAATATCAATACGATTTGTC
GCCATCAAAACCTTGATTTTGTTTGACGCTTCGAATCCGTCAAGTTGATTGAGAAGCTCA
AGCATAGTCCGTTGCACCTCACTGTCACCGTTTCCACTTCCAGATTCCATACGAGCAGAC
CCGATACTATCAATCTCATCCATGAAGATGATTGATGGTGCATGCTCCCTTGCCATCACA
AAAAGTTCTCGGACCATTCGAGAACCTTCTCCAATGTACTTCTGGACCAGCTCGGAACCA
GAAACTCTGATGAACGTACAATCAGTGTGATGTGCCACAGCTCGAGCCAAAAGTGTCTTC
CCAGTTCCAGGTGGACCATATAACAACACACCCTTTGGCTACGCAATTCCAAGAGACTCG
AACAGTTCAGGATGCTTGATTGGCAGCTCAATGAACTCCTTTATTTCCTTAATTTGCTGG
TCAAGACCACCAATCATGTCATATGTAGAGTCGGGAACCTTCTCAACCTTCATAAGGTTG
ACTAGCGGATCAACTTTACTCGGCAGGACGAGGTGGAGAACATAGCTATCGTTACGAAGA
GCAACTCTAGTTGATGGTGTGATTTTCGTAATGTCTATGCTTTTGTCAATATCAACGACA
TACTTCCCCTCTGGATGAACCTCAACCAAGACCTTGTTTTTTCCCATCACTTTGACCACT
TCACCGACATAGGAACCAGGTTCCTGAAGTAGCTGCAACTCTTCTCTGAGCATTCGTACT
CGAGAATTGAGTTCATTCCTCTGAGCTTCAAGGCGATTGAGGTTGTTAGTTTTCTGGCGG
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TTCGCCGCCCCTATCTTGATGTTGCAGGTTTCCTCCACCGCTGTCTCCGGACGCATCGAT
TCCACTCCTACGGCAGCCATGTCTTCAACGATTGTCGCGGGTATTGTGATGATGTTGATG
AGACCCACAAGGAGAAAGAGAGAACAGTGTTGTTGTTTTCGATCGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4FY88JQ U 1
AF RR4AC22JQ U 46
AF RR4CO33TF C 709
AF RR4AC22TF C 715
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BS 111 112 RR4FY88JQ
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BS 131 134 RR4FY88JQ
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BS 136 153 RR4FY88JQ
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RD RR4FY88JQ 820 0 0
GATGAAATCGGGTACTGTTATGCTTAAGAGCATTACGTGTTTAGGCAGTAGTAAACAACT
TTGTTTTCAAATGCTTAAAGAGAGCAAACATAAATTATTTCAGAGAAAA*CCTCATGCAA
TAACACAGATATATTCCTTCCTACTTCCAGAGCTTACGCAAAGACATGTTCTTCTCTGTG
TCTTTCTTCATAACCTTCCCCACTGCCATCTCAAAGTCTTCCTGTGTCACGTGTACTCTC
CTCTCCCGCAGCGCAAACATACCCGCCTCCGTGCACACCGCCTTCAGCTCAGCACCTGAA
GCACCATTCATCTTCTCGGCAATCTTCTTCAGATCAATTCCACGCATCAAATTCATCTTC
CTCGAGTGAATCTTCAAGATATCAAAACGTGAATCTTCATTAGGATTGGGGAATTCGATT
TTCCTATCAATCCTTCCTGGCCTGAGAAGAGCTTGATCCAGAATATCAATACGATTTGTC
GCCATCAAAACCTTGATTTTGTTTGACGCTTCGAATCCGTCAAGTTGATTGAGAAGCTCA
AGCATAGTCCGTTGCACCTCACTGTCACCGTTTCCACTTCCAGATTCCATACGAGCAGAC
CCGATACTGTCAATTTCATCCATGAAGATGATTGATGGTGTATGCTCCCTTGCCATCACA
AAAAGTTCTCGGACCATTCGAGAACCTTCTCCAATGTATTTCTGGACCAGCTCGGAACCA
GAAACTCTGATGAAGGTACAGTCAGTGTGATGTGCCACAGCTCGAGCCAAAAGTGTCTTC
CCAGTTCCAGGTGGACCATATAACAACACACCCTTTGGCT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4AC22JQ 780 0 0
AGGC
AGTAAACAACTTTGTTTTCAAATGCTTAAAGAGAACAAACATAAATTATTTCAGAGAAAA
ACCACATGCAATAA*ACAGAGATATA**TTCCTACTTCCAGAGCGTACGCAAAGACATGT
TCTTCTCTGTGTCTTTCTTCATAACCTTCCCCACTGCCATCTCAAAGTCTTCCTGTGTCA
CGTGTACTCTCCTCTCCCGCAGCGCAAACATACCCGCCTCCGTGCACACCGCCTTCAGCT
CAGCACCTGAAGCACCATTCATCTTCTCGGCAATCTTCTTCAGATCAATTCCACGCATCA
AATTCATCTTCCTCGAGTGAATCTTCAAGATATCAAAACGTGAATCTTCATTAGGATTGG
GGAATTCGATTTTCCTATCAATCCTTCCTGGCCTGAGAAGAGCTTGATCCAGAATATCAA
TACGATTTGTCGCCATCAAAACCTTGATTTTGTTTGACGCTTCGAATCCGTCAAGTTGAT
TGAGAAGCTCAAGCATAGTCCGTTGCACCTCACTGTCACCGTTTCCACTTCCAGATTCCA
TACGAGCAGACCCGATACTATCGATCTCATCCATGAAGATGATTGATGGTGCATGCTCCC
TTGCCATCACAAAGAGTTCTCTGACCATTCGAGAACCTTCTCCAATGTACTTCTGGACCA
GCTCGGAACCAGAAACTCTGATGAACGTACAATCAGTGTGATGTGCCACAGCTCGAGCCA
AAAGTGTCTTCCCAGTTCCAGGTGGACCATATAACAACACACCCTTTGGCTACGCA

QA 5 780 5 780
DS 

RD RR4CO33TF 778 0 0
CAGCTCGG
ACCAGAAACTCTGATGAACGTACAATCAGTGTGATGTGCCACAGCTCGAGCCAAAAGTGT
CTTCCCAGTTCCAGGTGGACCATATAACAACACACCCTTTGGCTGCGCAATTCCAAGAGA
CTCGAACAGTTCAGGATGCTTGATTGGCAGCTCAATGAACTCCTTTATTTCCTTAATTTG
CTGGTCAAGACCACCAATCATGTCATATGTAGAGTCGGGAACCTTCTCAACCTTCATAAG
GTTGACTAGCGGATCAACTTTACTCGGCAGGACGAGGTGGAGAACATAGCTATCGTTACG
AAGAGCAACTCTAGTTGATGGTGTGATTTTCGTAATGTCTATGCTTTTGTCAATATCAAC
GACATACTTCCCCTCTGGATGAACCTTAACCAAGACCTTGTTTTTTCCCATCACTTTGAC
CACTTCACCGACATAGGAACCAGGTTCCTGAAGTAGCTGCAACTCTTCTCTGAGCATTCG
TACTCGAGAATTGAGTTCATTCCTCTGAGCTTCAAGGCGATTGAGGTTGTTAGTTTTCTG
GCGGAGCTGGCGCTGGAGCTCATGGATGTGCTGGAGATAGTACTGCTTGAGCCCCTCCCC
TTGTTTCGCCGCCCCTATCTTGATGTTGCAGGTTTCCTCCACCGCTGTCTCCGGACGCAT
CGATTCCACTCCTACGGCAGCCATGTCTTCAATGATTGTCGCGGGTATTGTGATGATGTT
GATGAGACCCACAAGGAGAAAGAGAGAACAGTGTTGTTGTTTTCGATC
CC

QA 9 776 9 776
DS 

RD RR4AC22TF 775 0 0
GA
ACCAGAAACTCTGATGAACGTACAATCAGTGTGATGTGCCACAGCTCGAGCCAAAAGTGT
CTTCCCAGTTCCAGGTGGACCATATAACAACACACCCTTTGGCTACGCAATTCCAAGAGA
CTCGAACAGTTCAGGATGCTTGATTGGCAGCTCAATGACCTCCTTTATTTCCTTAATTTG
CTGGTCAAGACCACCAATCATGTCATATGTAGAGTCGGGAACCTTCTCAACCTTCATAAG
GTTGACTAGCGGGTCAACTTTACTCGGCAGGACGAGGTGGAGAACATAGCTATCGTTACG
AAGAGCAACTCTAGTTGATGGTGTGATTTTCGTAATGTCTATGCTTTTGTCAATATCAAC
GACATACTTCCCCTCTGGATGAACCTCAACCAAGACCTTGTTTTTTCCCATCACTTTGAC
CACTTCACCGACATAGGAACCAGGTTCCTGAAGTAGCTGCAACTCTTCTCTGAGCATTCG
TACTCGAGAATTGAGTTCATTCCTCTGAGCTTCAAGGCGATTGAGGTTGTTAGTTTTCTG
GCGGAGCTGGCGCTGGAGCTCATGGATGTGCTGGAGATAGTACTGCTTGAGCCCCTCCCC
TTGTTTCGCCGCCCCTATCTTGATGTTGCAGGTTTCCTCCACCGCTGTCTCCGGACGCAT
CGATTCCACTCCTACGGCAGCCATGTCTTCAACGATTGTCGCGGGTATTGTGATGATGTT
GATGAGACCCACAAGGAGAAAGAGAGAACAGTGTTGTTGTTTTCGATCGGACC

QA 3 775 3 775
DS 



AS 1 6

CO CL1616Contig1 975 6 16 U
GCCTCAAAACATGGATGAGTGACAACCGTCATTATACCCCAAACGGAAACAGAGTTTTTT
ACATTCGAATGCTGCATATTGTTCTGTATATCTGATGCACACAAGAGAGAATAAAATAGT
ACACCATCCACTAGTATGTTCTCTAAACGTTTTACAGTAGAGCCGTACTAGTTAGTAGCT
CCAACTGTTCGTTTCTGAATAACTCTAGCTCACTAAGGCTTAGCGAGTCTGGTACGCCAT
AATCTAAAGGAAACTCAATAGGTAGGGACTTCCAGTAAAGACTCGGTTTCCACTCCGCTT
CTCTCACTACCTTCAACACCTCCTTCGCCACAATCTCGCTTGCCTTGGCTGTGAAATGGA
TCCCATCTGTGAAGCAGGTGTTCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATAACGTTCCAGAGAT
CAACACATTTCACATCGATCTCACTGCATAGGTTCAACAACGCTTCTGCATATGGACGGC
AAGCTTCGTTTCTCCGGCCTTTTATTGCATCTCCAAAAACTAACTCGATCTGTCTCTCGT
TCATTGGTGGTGGAGAGAGGAAAATGACACGGGTCTTGTCTGAAAGGCTCAGAAGATGCT
CCCCAATCTTCCTCATGTTGTCAATGAACTCAGGGATAGGAACATGGGCTCCCTTCCCTG
ATGGATGAGGAGGCATTGAATCATTCCCACCGAAGTAAACTATCACCAAAGAAGGTTGTA
CTACAGCATCCTTTGGGAAGACTTGGTCAAGAACCTTTAAGGCAAATCTTGAGTTCCAAC
CACCATATCCACGAAGGATAACATCAGCCGTGCGAGAGTAGACGTCAGCGAGAGTGGCTC
CCCAGCCACCATTGCTGAAACTGTACTGAACGATTGAAGAACCGAAGAGGACGATTTGAG
GTCTTCCTGGTCCAACCATGGCGGCTTTGCTTCCTCTTCTCTCGCCTGGAGAAGGAGGAA
CAACACTTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EZ81JQ U 17
AF RR4AG20JQ U 14
AF RR4EL06JQ U 1
AF RR4AG20TF C 106
AF RR4EZ81TF C 257
AF RR4EL06TF C 262
BS 1 91 RR4EL06JQ
BS 92 92 RR4AG20JQ
BS 93 172 RR4EL06JQ
BS 173 173 RR4AG20JQ
BS 174 760 RR4EL06JQ
BS 761 761 RR4AG20JQ
BS 762 794 RR4EL06JQ
BS 795 795 RR4AG20JQ
BS 796 800 RR4EL06JQ
BS 801 801 RR4AG20JQ
BS 802 849 RR4EL06JQ
BS 850 850 RR4AG20TF
BS 851 859 RR4EL06JQ
BS 860 860 RR4AG20TF
BS 861 874 RR4EL06JQ
BS 875 975 RR4AG20TF

RD RR4EZ81JQ 404 0 0
GG
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TTGTTCTGTATATCTGATGCACACAAGAAAGAATAAAATAGTACACCATCCACTAATATG
TTCTCTAAACGTTTTACAGTAAAGCCGTACTAATTAGTAGCTCCAACTGTTCGTTTCTGA
ATAACTCTAGCTCACTAAGGCTTAACGAGTCTGGTACGCCATAATCTAAAGGAAACTCAA
TAGGTAGGGACTTCCAGTAAAGACTCGGTTTCCACTCCGCTTCTCTCACTACCTTCAACA
CCTCCTTCGCCACAATCTCGCTTGCCTTGGCTGTGAAATGGATCCCATCTGTGAAGCAGG
TGTTCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATAACGTTCCAGA
AAT

QA 3 401 3 401
DS 

RD RR4AG20JQ 816 0 0
GGTGA
GTGACAACCGTCATTATACCCCAAACGGAAACAGAGTTTTTTACATTCGAATGCTGCATA
TTGTTCTGTATATCTGATGCACACAAGAGAGAATAAAATAGTACACCATCCACTAGTATG
TTCTCTAAACGTTTTACAGTAGAGCCGTACTAGTTAGTAGCTCCAACTGTTCGTTTCTGA
ATAACTCTAGCTCACTAAGGCTTAGCGAGTCTGGTACGCCATAATCTAAAGGAAACTCAA
TAGGTAGGGAATTCCAGTAAAGACTCGGTTTCCACTCCGCTTCTCTCACTACCTTCAACA
CCTCCTTCGCCACAATCTCGCTTGCCTTGGCTGTGAAATGGATCCCATCTGTGAAGCAGG
TGTTCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATAACGTTCCAGAAATCAACACATTTCACATCGA
TCTCACTGCATAGGTTCAACAACGCTTCTGCATATGGACGGCAAGCTTCGTTTCTCCGGC
CTTTTATTGCATCTCCAAA**CTAACTCGATCTGTCTCTCGTTCATTGGTGGTGGAGAGA
GGAAAATGACACGGGTCTTGTCTGAAAGGCTCAGAAGATGCTCCCCAATCCTCCTCATGT
TGTCAATGAACTCAGGGATAGGAACATGGGCTCCCTTCCCTGATGGATGAGGAGGCATTG
AATCATTCCCACCGAAGTAAACTATCACCAAAGAAGGTTGTACTACAGCATCCTTTGGGA
AGACTTGGTCAAGAACCTTTAAGGCAAATCTTGAGTTCCAACCACCATATCCACGAAGGA
TAACATCAGCCGTGCGAGAGTAGACGTCAGC

QA 6 816 6 816
DS 

RD RR4EL06JQ 879 0 0
GCCTCAAAACATGGATGAGTGACAACCGTCATTATACCCCAAACGGAAACAGAGTTTTTT
ACATTCGAATGCTGCATATTGTTCTGTATATATGATGCACACAAGAGAGAATAAAATAGT
ACACCATCCACTAGTATGTTCTCTAAACGTTTTACAGTAGAGCCGTACTAGT*AGTAGCT
CCAACTGTTCGTTTCTGAATAACTCTAGCTCACTAAGGCTTAGCGAGTCTGGTACGCCAT
AATCTAAAGGAAACTCAATAGGTAGGGACTTCCAGTAAAGACTCGGTTTCCACTCCGCTT
CTCTCACTACCTTCAACACCTCCTTCGCCACAATCTCGCTTGCCTTGGCTGTGAAATGGA
TCCCATCTGTGAAGCAGGTGTTCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATAACGTTCCAGAGAT
CAACACATTTCACATCGATCTCACTGCATAGGTTCAACAACGCTTCTGCATATGGACGGC
AAGCTTCGTTTCTCCGGCCTTTTATTGCATCTCCAAAAACTAACTCGATCTGTCTCTCGT
TCATTGGTGGTGGAGAGAGGAAAATGACACGGGTCTTGTCTGAAAGGCTCAGAAGATGCT
CCCCAATCTTCCTCATGTTGTCAATGAACTCAGGGATAGGAACATGGGCTCCCTTCCCTG
ATGGATGAGGAGGCATTGAATCATTCCCACCGAAGTAAACTATCACCAAAGAAGGTTGTA
CTACAGCATCCTTTGGGAAGACTTGGTCAAGAACCTTTAACGCAAATCTTGAGTTCCAAC
CACCATATCCACGAGGGATA*CATCAGCCGTGCGAGAGTAGACGTCAGCGAGAGTGGCTC
CCCAGCCAC*ATTGCTGAA*CTGTACTGAACGAT
GAAGA

QA 1 874 1 874
DS 

RD RR4AG20TF 870 0 0
AG
AGAATAAAATAGTACACCATCCACTAGTATGTTCTCTAAACGTTT*ACAGTAGAGCCGTA
CTAGTTAGTAGCTCCAACTGTTCGTT*CTGAATAACTCTAGCTCACTAAGGCTTAGCGAG
TCTGGTACGCCATAATCTAAAGGAAACTCAATAGGTAGGGAATTCCAGTAAAGACTCGGT
TTCCACTCCGCTTCTCTCACTACCTTCAACACCTCCTTCGCCACAATCTCGCTTGCCTTG
GCTGTGAAATGGATCCCATCTGTGAAGCAGGTGTTCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATA
ACGTTCCAGAGATCAACACATTTCACATCGATCTCACTGCATAGGTTCAACAACGCTTCT
GCATATGGACGGCAAGCTTCGTTTCTCCGGCCTTTTATTGCATCTCCAAA**CTAACTCG
ATCTGTCTCTCGTTCATTGGTGGTGGAGAGAGGAAAATGACACGGGTCTTGTCTGAAAGG
CTCAGAAGATGCTCCCCAATCCTCCTCATGTTGTCAATGAACTCAGGGATAGGAACATGG
GCTCCCTTCCCTGATGGATGAGGAGGCATTGAATCATTCCCACCGAAGTAAACTATCACC
AAAGAAGGTTGTACTACAGCATCCTTTGGGAAGACTTGGTCAAGAACCTTTAAGGCAAAT
CTTGAGTTCCAACCACCATATCCACGAAGGATAACATCAGCCGTGCGAGAGTAGACGTCA
GCGAGAGTGGCTCCCCAGCCACCATTGCTGAAACTGTACTGAACGATTGAAGAACCGAAG
AGGACGATTTGAGGTCTTCCTGGTCCAACCATGGCGGCTTTGCTTCCTCTTCTCTCGCCT
GGAGAAGGAGGAACAACACTTTGCTTCC

QA 3 870 3 870
DS 

RD RR4EZ81TF 719 0 0
AATAGGTAGGGACTTCCAGTAAAGACTCGGTTTCCACTCCGCTTCTCTCACTAC*TTCAA
CACCTCTTTCGCCACAATCTCGCTTGCCTTGGCTGTGAAATGGATCCCATCTGTGAAGCA
GGTGTTCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATAACGTTCCAGAGATCAACACATTTCACATC
GATCTCACTGCATAGGTTCAACAACGCTTCTGCATATGGACGGCAAGCTTCGTTTCTCCG
GCCTTTTATTGCATCTCCAAAAACTAACTCGATCTGTCTCTCGTTCATTGGTGGTGGAGA
GAGGAAAATGACACGGGTCTTGTCTGAAAGGCTCGGAAGATGCTCCCCAATCTTCCTCGT
GTTGTCAATGAACTCAGGGATAGGAACATGGGCTCCCTTCCCTGATGGATGAGGAGGCAT
TGAATCATTCCCTCCGAAGTAAACTATCACCAAAGAAGGTTGTACTACAGCATCCTTTGG
GAAGACTTGGTCAAGAACCTTTAAGGCAAATCTTGAGTTCCAACCACCATATCCACGAAG
GATAACATCAGCCGTGCGAGAGTAGACGTCAGCGAGAGTGGCTCCCCAGCCACCATTGCT
GAAACTGTACTGAACGATTGAAGAACCGAAGAGGACGATTTG**GTCTTCCTGGTCCAAC
CATGGCGGCTTTGCTTCCTCTTCTCTCGCCTGGAGAAGGAGGAACAACACTTTGCTTCC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4EL06TF 714 0 0
GTAGGGACTTCCAGTAAAGACTCGGTTTCCACTCCGCTTCTCTCACTACCTTCAACACCT
CCTTCGCCACAATCTCGCTTGC*TTGGCTGTGAAATGGATCCCATCTGTGAAGCAGGTGT
TCAACCAATCATCTTGTTGCTGTATAACGTTCCAGAGATCAACACATTTCACATCGATCT
CACTGCATAGGTTCAACAACGCTTCTGCATATGGACGGCAAGCTTCGTTTCTCCGGCCTT
TTATTGCATCTCCAAAAACTAACTCGATCTGTCTCTCGTTCATTGGTGGTGGAGAGAGGA
AAATGACACGGGTCTTGTCTGAAAGGCTCAGAAGATGCTCCCCAATCTTCCTCATGTTGT
CAATGAACTCAGGGATAGGAACATGGGCTCCCTTCCCTGATGGATGAGGAGGCATTGAAT
CATTCCCACCGAAGTAAACTATCACCAAAGAAGGTTGTACTACAGCATCCTTTGGGAAGA
CTTGGTCAAGAACCTTTAAGGCAAATCTTGAGTTCCAACCACCATATCCACGAGGGATAA
CATCAGCCGTGCGAGAGTAGACGTCAGCGAGAGTGGCTCCCCAGCCACCATTGCTGAAAC
TGTACTGAACGATTGAAGAACCGAAGAGGACGATTTGAGGTCTTCCTGGTCCAACCATGG
CGGCTTCGCTTCCTCTTCTCTCGCCTGGAGAAGGAGGAACAACACTTTGCTTCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 5

CO CL1617Contig1 771 5 8 U
GGTGGAAGGATTATGTGTTTCATTTGCTGGTGATCGTGGCTCATCTGATCCTGTTCTAGC
TGTTAAGGAATATCTGAAAGAAGAACCATACACGGCTGAGGAGATTGAGAAAATCGTCCA
GGAGAAACTACCATCGATCTTGAACAACGATCCAACATCTTTAGCTGTACTTAATGCTGC
AACGCATTTCAAACTGCATCAGAGAGCTGCACATGTTTACTCCGAAGCACGGAGAGTTCA
TGGTTTCAAGGACACAGTTGATTCAAACCTAAGTGACGAAGAGAAGTTAAAGAAACTTGG
TGATCTCATGAACGAGAGCCATTACAGCTGCAGTGTCCTATACGAGTGCAGTTGCCCGGA
GTTGGAAGAACTAGTTAAAGTGAGCAGAGAGAATGGAGCACTTGGAGCAAGGCTGACAGG
AGCTGGATGGGGCGGTTGCACTGTGTCATTGGTTAAAGAATCTGGTGTCTCTCAGTTCAT
CGCTGATGTTAAGGAAAAATACTACAGGAAGAGGATAGAGAAAGGAGTGGTGAAGGAAGA
AGACATGGAGCTTTACCTTTTTGCTTCCAAGCCTTCAAGTGGTGCTGCCATCTTCAACCT
CTAAACATTGCCTCTTCCACTCTTCTTTTGTTTTAATTTATTCAAGTCTTTCTCAATTTG
AACTGTTTGCAGTTGCCATCTTACATTGAATTAGATCATATCATTTGTTGCTGAATAATT
GGTTGGCCTGAGATCAAATAAAATATTAGAATAGTGGAAATCTTTTTTTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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C

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G
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C

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T

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TCTTTTTTTCC

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DS 



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CAGTTTTCACG


BQ
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TTCATAACTATCTTCAAAATTGATCTGTTTACTCAGGTGAAATGGCGTCTTCGTCGGATT
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TGTTCTTGCATGTCA*TGCTCTTGTCAGTGCT
G

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GG
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GCTTGGGTCGTCGGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTGGCATGGATAA
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T

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AAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATGAACCGACGCAAGGATATGATTGGGAATTTGAGATCG
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TTGCCCGCTCTGGTGTGAATGGTCTCGGTTATATCTACTGATTCCACGTTTGTGCTTTTC
ATTTTCTCTTCTGTTGTGAGAACCTTAAATAAAGTATATATATTATGTGATCAGTTTTCA
CG

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DS 



AS 1 4

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GTATAAAGAGAATGTCTCGCCCGTTCTTCAAAGTTATGGGATTGCTGCTATTTCTCCGTT
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GAAACTTGCGTTGGCCAAGTATAGGCAAATGATATGGCAAGGAAGAGTGTTGAACTCTCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GD47TF U 1
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AF RR4CK13JQ C 796
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GGTGTTTCTAGATGGAGGACTTAACCAGCAACGAATGGGGATATGTGATGCAGTTGCTGT
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GTATAAAGAGAATGTCTCACCCGTTCTTCAAAGTTACGGGATTGCTGCTATTTCTCCGTT
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QA 1 747 1 747
DS 

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TCTTGAAGTGAATCCTGTTTGGCAGGACTCCAGCTCTTTTGTTGATATCTTTGATGTGGA
TCATTTTATCAATTCCCTAAAGGATGACATAAGGGTAGTTAGAGAACTTCCTGAGGAACT
CTCTTGGAGCACAAGAGAGTATTACAGCATAGCGGTTCGTGAAACCCGAGTTAAAACCGC
GCCTGTTCATGCTTCTGCTAAATGGTATAAAGAGAATGTCTCGCCCGTTCTTCAAAGTTA
TGGGATTGCTGCTATTTCTCCGTTCTCTCACCGTCTATCGTTCGATCACTTACCTGCTGA
GATCCAACGTCTAAGATGCAAAGTAAACTTCCAAGCTTTACGCTTTGTCCCTCACATTAC
ATCGCTTGGTGACGCTCTCGTAAGCCGTCTTAGAAACCCGTTGTGGAGAAGCAGCAAGGA
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TGGGAAATCGC

QA 1 779 1 779
DS 

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G
GGAACTCTCTTGGAGCACAAGAGAGTATTACAGCATAGCGGTTCGTGAAACCCGAGTTAA
AACCGCGCCTGTTCATGCTCCTGCTAAATGGTATAAAGAGAATGTCTCGCCCGTTCTTCA
AAGTTATGGGATTGCTGCTATTTCTCCGTTCTCTCACCGTCTATCGTTCGATCACTTACC
TGCTGAGATCCAACGTCTAAGATGCAAAGTAAACTTCCAAGCTTTACGCTTTGTCCCTCA
CATTACATCGCTTGGTGACGCTCTCGTGAGCCGTCTTAGAAACCCGTTGTGGAGAAGCAG
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AGAGCCTGGGAAATTCGCCGTTCTTCATCTTCGTTTCGACAAGGACATGGCTGCGCATTC
GGCGTGTGATTTTGGTGGAGGCAAAGCGGAGAAACTTGCGTTGGCCAAGTATAGGCAAAT
GATATGGCAAGGAAGAGTGTTGAACTCTCAGTTCACAGATGAAGAGCTGAGAAGTCAAGG
ACGGTGTCCGCTAACACCTGAAGAGATGGGACTTCTTCTGGCTGCTTTCGGTTTCGACAA
CAACACTCGTCTCTACCTAGCGTCTCACAAGGTGTATGGAGGAGAAGCTAGAATCTCAGC
ACTAAGACAAGTATTCCCAAGAATGGAAGACAAAAGAAGCCTTGCTTCCTCTGAGGAACG
AGCTCGAATCAAAGGCAAAGCTTCTTTATTAGCCGCACTTGATTACTACGTAAGCATGCA
CAGCGACATTTTCATCTCTGCATCGCCTGGAAACATGCACAACGCTCTCG

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DS 

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CTCTCACAGCAGACGAGAGCCTGGGAAATTCGCCGTTCTTCATCTTCGTTTCGACAAGGA
CATGGCTGCGCATTCGGCGTGTGATTTTGGTGGAGGCAAAGCGGAGAAACTTGCGTTGGC
CAAGTATAGGCAAATGATATGGCAAGGAAGAGTGTTGAACTCTCAGTTCACAGATGAAGA
GCTGAGAAGTCAAGGACGGTGTCCGCTAACACCTGAAGAGATGGGACTTCTTCTGGCTGC
TTTCGGTTTCGACAACAACACTCGTCTCTACCTAGCGTCTCACAAGGTGTATGGAGGAGA
AGCTAGAATCTCAGCACTAAGACAAGTATTCCCAAGAATGGAAGACGAAAGAAGCCTTGC
TTCCTTTGAGGAACGAGCTCGAATCAAAGGCAAAGCTTCTTTATTAGCCGCACTTGATTA
CTACGTAAGCATGCACAGCGACATTTTCATCTTTGCATCGCCTGGAAACATGCACAACGC
TCTCGTGGGTCATCGAACGTTCGAGAATCTCAAGACTATTCGACCAAACATGGCTTTGAT
AGGACAGCTTTTCCTTAACAAAAGCATCACGTGGGTCGATTTCCAACAGGCGCCTGGGGA
AGGACACGTGAACAGACAAGGACAGATCCGGTTAAGGAAACCGAAACAGTCGATTTATAC
TTATCCGGCTCCTGATTGTATGTGCCATGTCTGATTTGATAGTCCTTTAGATTGTTTTCT
GATAATAAAAGCTCGGTTCTTTGACG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 6

CO CL1620Contig1 844 6 9 U
AGATAGCACAGCATAGCAGCAACATTTCAATAAAACCCAATGACTGTAATAACAATAAAA
ACATTGCTGCTCGAGTCATAGACAAAAACAAAAAGTTTGAGTTTTGCTTTGCTTAGTACA
TTACATTCTCTGAGATTAGTACAGCTTTACTTAAACTAGCTATGCAGCATTACTCTCATC
TTCTAGCTTCTTGACATAAGCCTTGAGCACCATGATAACCTCAATAGCTGGTGCTTGCAA
CGTAGAGACGAGATTAATGGCCGGACTCTGCAGAGCTCCGAGCATCTTAGCGTAGACCTC
AGCACGAGTAGGCATGGTCTCCAGAGCTTTGAAGTTGTCAGGAGCGTAGAACTTACCTTC
AAAGACAGCGCCTGCAAAGTCATTGTCTTCGAGCTTGCGTTCCTTTTGGAAACTCCGGTA
AGGTTTGATGGCGGAAGGGATCTCATCGGTCTGGACAAAGAGCCAAGCGTTCATGCCTTT
CATACAAGGCTTGAGAGCTTCCCATTTGGTGCCTTCGATGGCTTTGATGACCAAAGTGTT
CTTGGCGACGACGAGTTTTGTTGTGTCGGGGAGAGTTCTCCTGAGGTCTTGGAACTGCTT
GACGGTGAGGCCTTTGTAGTTGATGGCGGCGAGGAGGTGGCATTTCTCGAGGTGGGACTT
GACTGTCTCGACGGTTTCTTCCTTTTTGGAACGAGACACAGCGGATCTGATGACAGGGAG
ACGAGGGTAGTTTTGGGATTTGGAGAGTTTGGGAGATAGGGTTAAGGTTCGGTTGTGGCA
GAGAGGAGACAGGGAAGAAGAGAATGAGAGAAGAGCCACTTCCATGTTTGCACGAATAGG
ATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4C704JQ U 6
AF RR4CB60JQ U 1
AF RR4B032JQ U 41
AF RR4CB60TF C 103
AF RR4C704TF C 444
AF RR4B032TF C 41
BS 1 120 RR4CB60JQ
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CTTGACATAAGCCTTGGGCACCATGATAACCTCAATAGCTGGTGCTTGCAACGTA
A

QA 5 239 5 239
DS 

RD RR4CB60JQ 711 0 0
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CTTGGCGACGACGAGTTTTGTTGTGTCGGGGAGAGTTCTCCTGAGGTCTTGGAACTGCTT
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GACTGTCTCGACGGTTTCTTCCTTTTTGGAACGAGACACAGCGGATCTGAT

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DS 

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CGG
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ATGTTTG
CACGAAT

QA 4 790 4 790
DS 

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TGCAGCATTACTCTCATCTTCTAGCTTCTTGACATAAGC*TTGAGCACCATGATAACCTC
AATAGCTGGTGCTTGCAACGTAGAGACGAGATTAATGGCCGGACTCTGCAGAGCTCCGAG
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TAAGGTTCGGTTGTGGCAGAGAGGAGACAGGGAAGAAGAGAATGAGAGAAGAGCCACTTC
CATGTTTGCACGAAT
CC

QA 1 735 1 735
DS 

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TGGCGGCGAGGAGGTGGCATTTCTCGAGGTGGGACTTGACTGTCTCGACGGTTTCTTCCT
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ATGAGAGAAGAGCCACTTCCATGTTTG

QA 1 387 1 387
DS 

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CGG
CTGTAATAACAATAAAAACATTGCTGCTCGAGTCATAGACAAAAACAAAAAGTTTGAGTT
TTGCTTTGCTTAGTACATTACATTCTCTGAGATTAGTACAGCTTTACTTAAACTAGCTAT
GCAGCATTACTCTCATCTTCTAGCTTCTTGACATAAGCCTTGAGCACCATGATAACCTCA
ATAGCTGGTGCTTGCAACGTAGAGACGAGATTAATGGCCGGACTCTGCAGAGCTCCGAGC
ATCTTAGCGTAGACCTCAGCACGAGTAGGCATGGTCTCCAGAGCTTTGAAGTTGTCAGGA
GCGTAGAACTTACCTTCAAAGACAGCGCCTGCAAAGTCATTGTCTTCGAGCTTGCGTTCC
TTTTGGAAACTCCGGTAAGGTTTGATGGCGGAAGGGATCTCATCGGTCTGGACAAAGAGC
CAAGCGTTCATGCCTTTCATACAAGGCTTGAGAGCTTCCCATTTGGTGCCTTCGATGGCT
TTGATGACCAAAGTGTTCTTGGCGACGACGAGTTTTGTTGTGTCGGGGAGAGTTCTCCTG
AGGTCTTGGAACTGCTTGACGGTGAGGCCTTTGTAGTTGATGGCGGCGAGGAGGTGGCAT
TTCTCGAGGTGGGACTTGACTGTCTCGACGGTTTCTTCCTTTT*GGAACGAGACACAGCG
GATCTGATGACAGGGAGACGAGGGTAGTTTTGGGATTTGGAGAGTTTGGGAGATAGGGTT
AAGGTTCGGTTGTGGCAGAGAGGAGACAGGGAAGAAGAGAATGAGAGAAGAGCCACTTCC
ATGTTTGCACGAATAGGATCC

QA 4 804 4 804
DS 



AS 1 5

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GGATCACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAG
CTATGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAG
ATGGCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAG
AAGCTGTGACTCTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTTGTCATGGGAACTCTTTTGT
CTGAGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTC
ACAACTGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCGATGTCCCAACAACAAAGATG
ATGAGGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGTTG
CTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAG
CAGATGATTCTGATTCTGAAGGAATGGATGAAGACGGTTCTGATGATGAAGATGATTCAG
AGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCAC
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CAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAACCCCCCACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACA
CTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCA
AGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCCAAGCACTCTGCTA
CCGCCAAGTGAAGTGGTTTCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTTTGGATTTAGTTGGAG
ACTTATCTTTTTGAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTCTCGGATTTGTATTTACCA
GTTACCGATATCTTTCAGTATTCTTTCTTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B259TF U 1
AF RR4AO67TF U 3
AF RR4AV79TF U 4
AF RR4B259JQ C 186
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ATGAGGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGTTG
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DS 

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GAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTG
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GA
GTGGTTTC

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DS 

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GGACCT
CAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTATGGAGT
TCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGCACTC
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CTCTGAATGTGGAGGTTGGGGACAAGAAGTTTGTCATGGGAATTCTTTTGTCTGAGAGCA
TTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAACTGGG
GAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAGGGAG
GAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTG
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CTGATTCTGAAGGAATGGATGAAGACGGTTCTGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAG
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AGAAGAAAGGTGGACCTGCAACCCCCCACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAA
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TCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGCC**AGCACTCTGCTAC*GCCAAGT
GAAGTGGTTTC
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CGATATCTTTCAGTATTCTTTCTTAGTC

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DS 

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AAGGAATGGATGAAGATGGTTCTGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTC
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AGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCAT
CGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCCAAGCACTCTGCTACCGCCAAGTGAAGTGGTT
TCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTTTGGATTTAGTTGGAGACTTATCTTTTTGAACTT
TGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTCTCGGATTTGTATTTACCAGTTACCGATATCTTT

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DS 



AS 1 6

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GCCCACACATGGAAAACTAACTGAAACAACAAACAGCAATTCTAAGATAGATGGCTAAAC
TTATAAGATCAAACAGACCAAGAACTTGATAAAACCACAAAAGACAGATTAAAAAGTTGA
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GATCAAAGTAAACTGGTTGGGGATCTGCATGAGAAAGAACCGAGAAGAACCTTCGATTGA
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GGTGCTTAGGGAGCCACCAGAACCGATAGATCACCCAAGGAATTGAAGAAACCTTTAGAG
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4BS78JQ U 1
AF RR4GD13JQ U 16
AF RR4AW05JQ U 16
AF RR4BS78TF C 231
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AF RR4GD13TF C 301
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RD RR4BS78JQ 652 0 0
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GCCCACACATGGAAAACTAACTGAAACAACAAACAGCAATTCTAAGATAGATGGCTAAAC
TTATAAGATCAAACAGACCAAGAACTTGATAAAACCACAAAAGACAGATTAAAAAGTTGA
AACCGAACTTTTCACTTCACTCTCACACCAGTTATGTCATTGTGCTGTCGAAGCCATGAG
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CTACGAAAGGAAAGCGGCGGTAAGGTTTCAATCAAGCCAAAGAAAGAAGATCCCATAGCT
TCAATGGATACGAAGACACAATCAATAACCGCAAGCTCCAGACCCGGACCGGTTACAACA
GATCAAAGTAAACTGGTTGGGGATCTGCATGAGAAAGAACCGAGAAGAACCTTCGATTGA
GGTACAATACCTCCAAAACGCCATCCCGTCATATGATTGACGAAACCAAAGATCACTTCC
AAAGAGGAAGATTAGAAACAAATCAGGAACTTCTAGGGAAAGGAGAAGGGAG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4GD13JQ 622 0 0
CTCAAACATATTTTCATTAGAACACAACACCATTACACAACGGGAGATCTACACAATTCC
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ACTAACTGAAACAACAAACAGCAATTCTAAGATAGATGGCTAAACTCATAAGATCAAACA
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ATCGGAGAGACAGAACTCATCCCGACGAACCGTCGCTTGACCTCACAAGATCTATAACAA
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CCGGTAAACATCGGAGAGACAGAACTCATCCCGACGAACCGTCGCTTGACCTCACAAGAT
CTATAACAAAAGAAAGACAATCCGCTTAAACAAAACAAAAGGAAGTCCGGTTCCGGTGCT

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DS 

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CTTATAAGATCAAACAGACCAAGAACTTGATAAAACCACAAAAGACAGATTAAAAAGTTG
AAACCGAACTTTTCACTTCACTCTCACACCAGTTATGTCATTGTGCTGTCGAAGCCATGA
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AGCCAAACCGGTAAACATCGGAGAGACAGAACTCATCCCGACGAACCGTCGCTTGACCTC
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CGGTGCTTAGGGAGCCACCAGAACCGATAGATCACCCAAGGAATTGAAGAAACCTTTAGA
GATGGAAGAGAGGAAGTACAGGTTTAGAGAGAGAGGTGGTGAATGGTCGTTTTCTTGTTT
CC

QA 1 842 1 842
DS 

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G
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ATCAAAGTAAACTGGTTGGGGATCTGCATGAGAAAGAACCGAGAAGAACCTTCGATTGAG
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AAGAGGAAGATTAGAAACAAATCAGGAACTTCTAGGGAAAGGAGAAGGGAGATCGACAAG
ACCACAACCCATACCAACCATCATCGAATCATAAACATCACTATACATAGACATGCAAAG
CCAAACCGGTAAACATCGGAGAGACAGAACTCATCCCGACGAACCGTCGCTTGACCTCAC
AAGATCTATAACAAAAGAAAGACAATCCGCTTAAACAAAACAAAAGGAAGTCCGGTTCCG
GTGCTTAGGGAGCCACCAGAACCGATAGATCACCCAAGGAATTGAAGAAACCTTTAGAGA
TGGAAGAGAGGAAGTACAGGTTTAGAGAGAGAGGTGGTGAATGGTCGTTTTCTTGTTTCC

QA 2 661 2 661
DS 



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GTAGTTAGCCTTCTCGTTAACCCAAAGCCTAACGGCATCGACCCCTGATAAGTCGCGGTT
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GGCTACGCCCACCTCCGCTCGTGCATTGTTGTGAGCCCTTACATAGTCTTGTGGGCTGTC
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

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G
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TAT
CC

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ACACCTCGCTTTGGCACATCCAAGCCTCACCGAAGTTCTCCAAACAACCTGCATATAGTG
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CTTATTAT
CC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CR05TF 729 0 0
CAAT
AAAACAAAATCATCTGGGAACGT*GGTTACAAATGGACTACATATATCTTTAGGTAGGGT
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TTACACTGTTGCTGTGAGGATCATAGTTGCAAGAGATGACGGTTTCACCATTGTTACACC
TCGCTTTGGCACATCCAAGCCTCACCGAAGTTCTCCAAACAACCTGCATATAGTGACCGC
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AAGCTGCAACCCTATCGTCCCACTGTATGGGGGCTACGCCCACCTCCGCTCGTGCATTGT
TGTGAGCCCTTACATAGTCTTGTGGGCTGTCTTGAGCCTTCGAGGGAAGAACAAGAGCTC
CTACAAGGGCTGCCAAGATTAGTTGACGTAGAGAATAGCTCACAACCTTCATTTTCTTAT
TAT
CC

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DS 

RD RR4AN52TF 751 0 0
G
ACCCATTATAAATTTTCCAATAAAAACAAAATCATCTGGGAACGTTGGTTACAAATGGAC
TACATATATCTTTAGGTAGGGTCTTTATATGTATAGACGTATAGTGGACAAGGCGACGGA
AATACTATTATTTCATAATTAGTTTTACACATCCTGCAACCTGCATATTGTGCTCCAAAT
AGGAATATGTATACCCGTCCAGCCGTCCTATATGCATGTGCTTATGTCTGTATGCATAAT
AACGTTTAGTAAGGCCTCTCGTTTACACAGTTGCCGTGAGGATCATAGTTGCAAGAGATG
ACGGTTTCACCATTGTTACACCTCGCTTTGGCACATCCAAGCCTCACCGAAGTTCTCCAA
ACAACCTGCATATAGTGACCGCAAACTCCGTTGCAAGTGTTCAAAGCGTAGTTGTAGTTA
GCCTTCTCGTTAACCCAAAGCCTAACGGCATCGACCCCTGATAAGTCGCGGTTACTCTTG
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TTCGAGGGAAGAACAAGAGCTCCTACAAGGGCTGCCAAGATTAGTTGACGTCGAGAATAG
CTCACAACCTTCATTTTCTTATTAT
AATCC

QA 2 746 2 746
DS 



AS 1 5

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CGGCAGCCTTCTTGGCATCTCCATTGGCCTCTGCCATAACTGGTGCAACCATCTATGTGG
ACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCTCTTGACAGCCCTGTTTTCGAAGACCTCAACA
ATTAAGGTTTATTAATCGACGAATATAGCATATGTGACCCCTATCGGCTTTGTTATTTTT
TTTCCCTTTTAAAGAAGATGTTATGTTTTTAGTTTGTCACTTTAGCAATGTTATGTAATA
ACCGCTGCACTATTTCTCTTTTTTCTTTTTGTGCGACGACCGCTGCACTATTTCTCTAAT
GATTGAAGTTTGCAAGTTTTTCCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 15 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 785 797 RR4C939TF
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GACCT

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G
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A

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G
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GACAATGGCTT

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TTT
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GTTATGTAATAACCGCTGCACTATTTCTCTTTTTTCTTTTTGTGCGACGACCGCTGCACT
ATTTCTCTAATGATTGAAGTTT

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DS 

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CTTTAGCAATGTTATGTAATAACCGCTGCACTATTTTTCTTTTTTCTTTTTGTGCGACGA
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QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 5

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CGTCCCACTCTGTTCCTCAACAACTCATGATGTCATAAACCCACCAACTGTCTTCCCTAC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK03TF U 3
AF RR4AK73TF U 1
AF RR4AW56TF U 3
AF RR4EK03JQ C 821
AF RR4AK73JQ C 703
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GG
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ATAGGGGTTGGAACTCCACCAGCTGT

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RD RR4AK73TF 796 0 0
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AAACCCTACAACTACACCACCTGCTACTACATTTCCTCCGGTGACCATAACGCCCACAAA
TCCATCTCCAGCACTTCCTCTTAACCCTCCAGTCACAGTAGTCCCTCCTACACTCACACC
ACCAGTGAGCAATCCAGTGACTCAGTATCCTCCAACTCAACCCTCAGGGACGGTTCCTGT
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AAAGCCTGGAGCCTCCCAAACCTCACTCCAGTTGGCTCTTGACTATGCCTGTGGGATCGG
TAAAGCGGATTGCTCTCAGATACAACAAGGAGGCAGCTGTTATTCGCCCATCAGTCTTCA
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TGATTTTGGCGGTGCAGCCTCAGTTGTTACCACCAACCCAAGTACTGGTTCTTGCGTTTA
CCAGACAGGTTCTAGTTCATCAACGTCAACTCCTGTAGGAACAACAACACCAACTCCATC
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TCTACCCAATCCATCC

QA 1 796 1 796
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GG
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CCACTCTGTTCCTCAACAACTCATGATGTCATAAACCCACCAACTGTCTTCCCTACAAAC
CCTACAACTACACCACCTGCTACTACATTTCCTCCGGTGACCATAACGCCCACAAATCCA
TCTCCAGCACTTCCTCTTAACCCTCCAGTCACAGTAGTCCCTCCTACACTCACACCACCA
GTGAGCAATCCAGTGACTCAGTATCCTCCAACTCAACCCTCAGGGACGGTTCCTGTGATT
CCACCGCCCGTTTCCTCAAATTCTCCATCGGTTTCAGGACAAAGCTGGTGCGTGGCAAAG
CCTGGAGCCTCCCAAACCTCACTCCAGTTGGCTCTTGACTATGCCTGTGGGATCGGTAAA
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CATGCCTCATTTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAACCCTTCTCCACAAAGCTGTGAT
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ATAGGGGTTGGAACTCCACCAGCTGTTTTTAACCCGGCGAATCCTTCATCAAACACTCTA
CCCAATCCATCC

QA 3 794 3 794
DS 

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CACTTTGGTCACACTATGGTGGTAACATTGATTCTTCAAGCAATGCTATTTCATTAGAAA
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TTTAGAGCATCGT

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GAATCCTTCATCAAACACTCTACCCAATCCATCCTCAGGAGGTTCAGCGGTTTACGGGTT
TGATGGTTCACCTAATGGGAACAATCCAACACCATCAGACTCTACCAACTTGCAGATTCA
CTTTGGTCACGCTATGGTGGTAACATTGATTCTTCAAGCAATGCTATTTCATTAGAAATA
GAATATAAATAGGAGTTGGATTAGTTTTATTACATAGTTATGCGCAAGTTCAAGCTCATT
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CGCTCATACACTGTAGGATACTGGTCTATCTACTTTAATATGATCTACTTCTCTAATTCA
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CAGTTGGACTAGATCGCGCGGAAAATTCAATTGTATTTTTTATCACTTGAAAAATAGAAA
GCCACGTGGAGAAAGTGAAAGAGTTTGAGAATTGAGGTCACTCCTATAGAAGAACCACTA
TTGTTAGCCTCAAATGTCTTCTTACATAATCCTCATCATGGCTATTATACTGCACTTCTT
ATAAGCTATGTGTTGAGAACGTGAAGAGCTTGAAAAGCCTATAGAGACACTATTCGTTAT
ACGTGTCGCATCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 6

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GAGAGAAGTGCTGGACTTCTGAAAAGGTTAACCCATAATTAAGTTTTAATGGCTGTGTGG
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TCTGCTTTCTGTGTTGGATCATATTGAAAAAAATGAATAAAAAATCTGAATCTTTCTCTT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 10 

AF RR4FO50TF U 1
AF RR4FR07TF U 1
AF RR4C202TF U 4
AF RR4C202JQ C 13
AF RR4FO50JQ C 39
AF RR4FR07JQ C 70
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ATTACTTGAATCTTAAAAGTAATCAGAGGCTTTTGTTCTCATCCATGATTAGTGGA

QA 1 596 1 596
DS 

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GGATT
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AAGTGCTGGACTTCTGA

QA 6 622 6 622
DS 

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GG
GAAAGGACGAAACTGTGTGAAGAAGACAAGAGGATGGGAACAGCAGCTGCAGCGCCATGG
AAGCAGCTTCTCTTTGGTGCGATCGAGGCCAATTCTCACCTAAAACACTATTCTTACGCT
CAGCTCGCGACGATTGGTGTTAATGGACGCCCTTCTAATCGCACCGTCGTATTCAGGGGA
TTTGAAGAGAACAGTGACAAAATTCAAATCAACACCGATCTTCGTAGTCGTAAGATTCAA
GAGCTTAAGCAGTGTCCGTTCTCCGAGATGTGTTGGTATTTCTCTGATACTTGGGAGCAG
TTTCGGATCAATGGAAGGGTTGAAGTCATTGATGCATCCAGTTCTGACCAGACCAAGCTT
CAGTTAAGAGAGAAGGCTTGGTTTGCTAATTCTCTAAAGTCAAGGCTGATGTACATCTGT
CCTGCGCCTGGTACTACTTACAATGGTGAGCAACCAGATCAAGAAGTTAAGTTAGATCCC
TCAAGTGGTCCAGTTCCTGATTACTGTCTAATGCTTCTAGAGCCTGAAAAGGTTGATTAC
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AAGTGCTGGACTTCTGAAAAGGTTAACCCATAATTAAGTTTTAATGGCTGTGTGGTAGAT
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DS 



AS 1 5

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX61TF U 1
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AF RR4GE64JQ C 974
AF RR4AD64JQ C 757
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GGACCCCGAGTGCACCTGGCGTCATGGGTTATTTACACTTTTATCTCTTCATCGAGAAAG
GTTTATCTCCTCTTAAAGATGAGAGTTGTTTGACGAAGGAACACTTGGACACAGCAATGG
ATTGGATACCATCGATGAAGAATCTGAAACTAAAAGACATCCCCACCTTCGTCCGTACCA
CTAACCCCAACGACATAATGCTCAACTTCCTTGTCCGCGAGACAGACCGATCCAA*CGCG
CCTCTGCCATCATTCTCA*CACGTTCGATGACCTCGATCATGACA

QA 1 765 1 765
DS 

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G
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ACAACCACAAGCGCATACTCCGTTCCCGTGGTCCCAACGCCCTGGACGGACTTCCTTCCT
TTCAGTTTGAAGCCATACCTGATGGTCTACCGGAGACTGAGGTTGATGCCACGCAAGACA
TCCCTTCCCTTTCCGAGTCCACCATGAAGAACTGTCTAACTCCTTTCAATGAACTTCTCC
GGCAGATCAACGCCAGAGATGATGTTCCTTCGCTCAGTTGTATTGTATCGGACGGTGCCA
TGAGCTTTACACTTGACGCTGCCGAGGAGCTCGGTGTCCCGGAGGTTCTTTTCTGGACCC
CGAGTGCACCTGGCGTCATGGGTTATTTACACTTTTATCTCTTCATCGAGAAAGGTTTAT
CTCCTCTTAAAGATGAGAGTTGTTTGACGAAGGAACACTTGGACACAGCAATAGATTGGA
TACCATCGATGAAGAATCTGAAACTAAAAGACATCCCCACCTTCGTCCGTACCACTAACC
CCAACGACATAATGCTCAACTTC*TTGTCCGCGAGACAGACCGATCCAAACGCGCCTCTG
CCATCATTCTCAGCACGTTCGATGACCTCGATCATGACATCATC
GAGCTATGCAGTCCAT

QA 2 765 2 765
DS 

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G
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ACTTGACGCTGCCGAGGAGCTCGGTGTCCCGG***TTCTTTTCTGGACCCCGAGTGCACC
TGGCGTCATGGGTTATTTACACTTTTATCTCTTCATCGAGAAAGGTTTATCTCCTCTTAA
AGATGAGAGTTGTTTGACGAAGGAACACTTGGACACAGCAATAGATTGGATACCATCGAT
GAAGAATCTGAAACTAAAAGACATCCCCACCTTCGTCCGTACCACTAACCCCAACGACAT
AATGCTCAACTTCCTTGTCCGCGAGACAGACCGATCCAAACGCGCCTCTGCCATCATTCT
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GGTTTATTCTATTGGACCGCTTCACCTCTTAGTAAACCGGGAGATTGAAGAAGGTAGTGA
GACAGAAAGGTTAGGATCAAACCTTTGGAGAGAGGAGACGGAGTGTTTGGATTGGCTCGA
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GAAGCAGCTCGTGGAGTTTGCTTGGGGGTTGGCAGCATCAAGAAAAGAGTTTTTATGGGT
GATCCGACCAGATTTAGTAGCTGGAGAAGAGGCGGTGATTCCGACAGAGTTTTTAACAGA
GACAGAAGGTAGAAGAATGTTGTTGAGTTGGTGTCCTCAGGAGAAAGTCCTGTCTCATCC
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CCGGAGTTCCAATG

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AGAGACAGAAGGTAGAAGAATGTTGTTGAGTTGGTGTCCTCAGGAGAAAGTCCTGTCTCA
TCC*GGCGGTCGGACGATTTTTAACACATAATGGATGGAACTCAACGTTAGAGAGTATAT
CTGCCGGAGTTCCAATGGTGTGTTGGCCTTTTTTTGCGGAGCAGCAAACGAACGCGAAGT
TCTGTTGCGACGAGTGGGGAGTGGGAATGGAGATTGGCGAGGATGTGAAAAGAGAAGAGG
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QA 1 385 1 385
DS 

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ACCTTTGGAGAGAGGAGACGGAGTGTTTGGATTGGCTCGATGCCAAGGCTCGAAACACCG
TTGTTTACGTTAACTTTGGGAGCATAACGGTAATGACCGCGAAGCAGCTCGTGGAGTTTG
CTTGGGGGTTGGCAGCATCAAGAAAAGAGTTTTTATGGGTGATCCGACCAGATTTAGTAG
CTGGAGAAGAGGCGGTGATTCCGACAGAGTTTTTAACAGAGACAGAAGGTAGAAGAATGT
TGTTGAGTTGGTGTCCTCAGGAGAAAGTCCTGTCTCATCC*GGCGGTCGGAGGATTTTTA
ACACATAATGGATGGAACTCAACGTTAGAGAGTATATCTGCCGGAGTTCCAATGGTGTGT
TGGCCTCTTTTTGCGGAGCAGCAAACGAACGCGAAGTTCTGTTGCGGCGAGTGGGGAGTG
GGAATGGAGATTGGCGAGGATGTGAAAAGAGAAGCGGTTGAGGTGGTGGTAAGAGAGCTG
ATGGATGGAGAAAAGGGAAAGAAGTTAAGAGAGAAGGCGGAGGAGTGGCGGCGTTTGGCG
GAGAAAGCGACAAAGGATCCGTGTGGTTCGTCGGTTGTGAATTTTGAGACGGTTGTTAAT
AAGATTCTCTTGGCGAGATGATTAGAACATAAGTGTTATCATATGATCATCAAGAAGTTA
TTGTTTTTGTTACTGGCATCGTATGTTATAATTTATAGGTAAG

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DS 



AS 1 6

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TCTGCTAAAATGGATGAATTTTCATCTCAAGAAAGCTGGTTATGAAAAGCAGGTTACAAA
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AGAACACTCTACGCATGCTACATTAGAGACCAAAGACCCCACCGAAAGAGCGAAAAAGGT
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CGGCTCAGCAAATCTTAACCTTGCATTTGTGGCGCAAATATTTCAGCACAGGAATGGATT
AACTGATGACAGTTCAAAGTCAACGTCATTTGCTGAGATGATGACAGATGGTGTGGAAAC
TTCACGAGAAGAAAGATGTTTCCGCCTCTGGATTAACAGTCTTGGTACTGCCACTTATGT
CAACAATGTTTTCGATGATCTAAGGAATGGATGGGTTCTTCTTGAAGTTCTTGACAAAGT
TTCGCCTGGCTCAGTCAACTGGAAACATGCGAATAAACCTCCCATAAAAATGCCATTTAA
AAAGGTTGAGAACTGCAATGAAGTTATAAAGATCGGCAAAGAACTTCGATTCTCCCTTGT
CAATGTAGCTGGAAATGACATTGTGCAAGGAAATAAGAAACTCCTCCTCGCTTTTCTGTG
GCAACTAATGAGATATACAATGCTCCAACTTCTGAAGAACTTGAGATCTCACTCGCAAGG
TAAAGAAATTACAGATGCAGATATTCTAAACTGGGCGAATAGGAAAGTGAAGAGAGTTGG
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AACAGAGGAGGATAAGAAGTTGAATGCCACATACATCATCAGTGTTGCAAGGAAGCTCGG
ATGCTCCATATTCTTGTTGCCTGAGGATATCATAGAGGTGAACCAGAAAATGATGCTTAT
TTTGGCGGCCAGCATCATGTACTGGAGCCTTCAGCAACAATCAGACACAGAGTCTAATGT
CTCAGAAGATGCTGCTGACGAAGGCGATGCAAACTCTGTTACTGGTGACGTCTCCAACTT
GTCCCTTGATGAGGCCTCTGACTCCTCTCCAAGCGCCCAAGATCAAGATCTGGTAACAAA
CGCAGACGAGGATGAGGTTGAGGTTGAGGTTGATAATGAGAATAATAAAGATGCATAGCG
AGTTTGAATGGTAATTTGATTTCTGTTTCTTTTTGTTTTTTTCCTTGAAATTGTGCATTG
GTTTTTCTTTTGGACATTTGTGCATTGGTTTCTTTCTTGTCAATTGCATGAGATTATTGG
TTTCTTGTTTTGACTGCTTCGTGGAACATTAATAAATTATTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A445TF U 1
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AF RR4A274TF U 355
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TTTTTCTTCTGATGTGAAGGACGGCGAGGCATATGCGTATCTGCTTAATGCTCTTGCTCC
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AAAGGTTGAGAACTGCAATGAAGTTATAAAGATCGGCAAAGAACTTCGATTCTCCCTTGT
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GCAACTAATGAGATATACAATGCTCCAACTTCTGAAGAACTTGAGATCTCACTCGCAAGG
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DS 

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QA 2 748 2 748
DS 

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G
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GAAACTTCACGAGAAGAAAGATGTTTCCGCCTCTGGATTAACAGTCTTGGTACTGCCACT
TATGTCAACAATGTTTTCGATGATCTAAGGAATGGATGGGTTCTTCTTGAAGTTCTTGAC
AAAGTTTCGCCTGGCTCAGTCAACTGGAAACATGCGAATAAACCTCCCATAAAAATGCCA
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CTTGTCAATGTAGCTGGAAATGACATTGTGCAAGGAAATAAGAAACTCCTCCTCGCTTTT
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CAAGGTAAAGAAATTACAGATGCAGATATTCTAAACTGGGCGAATAGGAAAGTGAAGAGA
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TTTCTGGAACTTCTGACTGCGGTATAACCAAGAGTTGTCAACTGGAGTCTCGTTACCAGT
GGAGAAACAGAGGAGGATAAGAAGTTGAATGCCACATACATCATCAGTGTTGCAAGGAAG
CTCGGATGCTCCATATTCTTGTTGCCTGAGGATATCATAGAGGTGAACCAGAAAATGATG
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AATGTCTCAGA*GATGCTGCTGAC

QA 2 805 2 805
DS 

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G
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CTTCGATTCTCCCTTGTCAATGTAGCTGGAAATGACATTGTGCAAGGAAATAAGAAACTC
CTCCTCGCTTTTCTGTGGCAACTAATGAGATATACAATGCTCCAACTTCTGAAGAACTTG
AGATCTCACTCGCAAGGTAAAGAAATTACAGATGCAGATATTCTAAACTGGGCGGATAGG
AAAGTGAAGAGAGTTGGCCGAACTTCTCAGGCTGATAGCTTCAGAGACAAGAATCTGTCA
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GACACAGAGTCTAATGTCTCAGAAGATGCTGCTGACGAAGGCGATGCAAACTCTGTTACT
GGTGACGTCTCCAACTTGTCCCTTGATGAGGCCTCTGACTCCTCTCCAAGCGCCCAAGAT
CAAGATCTGGTAACAAACGCAGA

QA 2 684 2 684
DS 

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AAGGTAAAGAAATTACAGATGCAGATATTCTAAACTGGGCGGATAGGAAAGTGAAGAGAG
TTGGCCGAACTTCTCAGGCTGATAGCTTCAGAGACAAGAATCTGTCAACTGGAATCTTCT
TTCTGGAACTTCTGACTGCGGTAGAACCAAGAGTTGTCAGCTGGAGCCTCGTTACCAGTG
GAGAAACAGAGGAGGATAAGAAGTTGAATGCCACATACATCATCAGTGTTGCAAGGAAGC
TCGGATGCTCCATATTCTTGTTGCCTGAGGATATCATAGAGGTGAACCAGAAAATGATGC
TTATTTTGGCGGCCAGCATCATGTACTGGAGCCTTCAGCAACAATCAGACACAGAGTCTA
ATGTCTCAGAAGATGCTGCTGACGAAGGCGATGCAAACTCTGTTACTGGTGACGTCTCCA
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CAAACGCAGACGAGGATGAGGTTGAGGTTGAGGTTGATAATGAGAATAATAAAGATGCAT
AGCGAGTTTGAATGGTAATTTGATTTCTGTTTCTTTTTGTTTTTTTCCTTGAAATTGTGC
ATTGGTTTTTCTTTTGGACATTTGTGCATTGGTTTCTTTCTTGTCAATTGCATGAGATTA
TTGGTT
C

QA 1 726 1 726
DS 

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G
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TCTTTCTGGAACTTCTGACTGCGGTAGAACCAAGAGTTGTCAACTGGAGCCTCGTTACCA
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AGCTCGGATGCTCCATATTCTTGTTGCCTGAGGATATCATAGAGGTGAACCAGAAAATGA
TGCTTATTTTGGCGGCCAGCATCATGTACTGGAGCCTTCAGCAACAATCAGACACAGAGT
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CCAACTTGTCCCTTGATGAGGCCTCTGACTCCTCTCCAAGCGCCCAAGATCAAGATCTGG
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CATAGCGAGTTTGAATGGTAATTTGATTTCTGTTTCTTTTTGTTTTTTTCCTTGAAATTG
TGCATTGGTTTTTCTTTTGGACATTTGTGCATTGGTTTCTTTCTTGTCAATTGCATGAGA
TTATTGGTTTCTTGTTTTGACTGCTTCGTGGAACATTAATAAATTATTTTTC

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 6

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ATATCGTTTTGAGATGCTTGGTCCTTATCCCAAGGATCTATCACCTAAACATCTCATGGG
TCTCAAAACACCTAAGATCCCTTGTCCGCTCGCCTGAGCTCACCGCCTTGCGATCCATCC
ACCCAAGGAGCTCCTCCCTCCATGTATGTTTTGAAGAAATCCACGGCAACAACGTTGACG
AAGAAGACCATTCAACCTTCCACTGGTTTACTCTGACTAGTACAGAAGAGGAGAATGAGT
TCGTTCTGAACCCAACTCCCTTCCCTCCTCATCCTAATTACTGTTCTTCAGCCGTCGTTT
CAGTGGGCTCAAAGATCTTCTTCGTTGGCGGATCTAGAGAACCTTCGACGGATCTATGGA
TCCTTGATACACGAACTGGAAACATCACTCAGGGACCAAGCATGAGTGTGCCTCGAGTAC
ATCTCCAAGCAGCTGTGGGAGTAATCGACGGGATGATATACGTAGTCGGAGGCGGGAAGT
TTAACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAGCTTGCTG
GGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTACTGGAGGGGAAGGTTT
ATATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACAATCCGAGAGAAGGTGGAGGGCAACGGA
TGGTTCATATGGCAAGCCAGAGACTCAGGGAAGACGACGACGGAAGCAAGGTTAAGTTCA
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ATTGGGTTGATGTGGTTTGATAGAAAGCTCAATGTGTGGAGGAAATTGATTGGTCGTGAT
GGGAAGGAACTGGTTATCTCACGTGTGAGGGCCATGTCGGAATATGACGGAAGGCTTGTT
GTTTTTACCTACATTATCCCAGCTGACGTCTTGAGGAAATCAAATGCAGTTGATATGAAG
ATTAAGGTTCAGTGTATGTTGGTCTCACTGGATAGAGCTGGAGAAAAGATCTGTGGGACG
ATCGATTGGTCTGGTATTGTGGCTACAGTCCCAGTCTGGTTTAATTCTCAGCATTGTTTA
GCTGTTTCCGAGTGATTGGTTAGAGTATGTGTTCTTGAGAGAGCAAGTTGTTTGCAAACT
AGAAAGAGATTTACATGAAACACAATAAAGAAATGAACATGTTTTGAAGTTTTTTTTGGA
ATTAAAGGCATATGTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EM63TF U 1
AF RR4CA60TF U 179
AF RR4CO17TF U 179
AF RR4CA60JQ C 423
AF RR4EM63JQ C 476
AF RR4CO17JQ C 474
BS 1 301 RR4EM63TF
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BS 303 469 RR4EM63TF
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BS 645 646 RR4CA60TF
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BS 910 932 RR4CO17TF
BS 933 1280 RR4CA60JQ

RD RR4EM63TF 707 0 0
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ATATCGTTTTGAGATGCTTGGTCCTTATCCCAAGGATCTATCACCTAAACATCTCATGGG
TCTCAAAACACCTAAGATCCCTTGTCCGCTCGCCTGAGCTCACCGCCTTGCGATCCATCC
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TTGTTCTGAACCCAACTCCCTTCCCTCCTCATCCTAATTACTGTTCTTCAGCCGTCGTTT
CAGTGGGCTCAAAGATCTTCTTCGTTGGCGGATCTAGAGAACCTTCGACGGATCTATGGA
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TTAACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAGCTTGCTG
GGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTATGGGAGGGGAAG*TTT
ATATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACA*TCCGAGAGAAG
TG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4CA60TF 698 0 0
G
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TCAGTGGGCTCAAAGATCTTCTTCGTTGGCGGATCTAGAGAACCTTCGACGGATCTATGG
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TTTAACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAGCTTGCT
GGGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTACTGGAGGGGAAGGTT
TATATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACAATCCGAGAGAAGGTGGAGGGCAACGG
ATGGTTCATATGGCAAGCCAGAGACTCAGGGAAGACGACGACGGAAGCAAGGTTAAGTTC
ACTGAAATGGCGTATCACGTGTGTGTGG*TGGAGGATGTTCTCTTTGCTTTTTTTACCCG
GATTGGGTTGATGTGGTTTGATAGAAAGCTCAATGTG

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4CO17TF 769 0 0
G
CACCCAAGGAGCTCCTCCCTCCATGTATGTTTTGAAGAAATCCACGGCAACAACGTTGAC
GAAGAAGACCATTCAACCTTCCACTGGTTTACTCTGACTAGTACAGAAGAGGAGAATGAG
TTCGTTCTGAACCCAACTCCCTTCCCTCCTCATCCTAATTACTGTTCTTCAGCCGTCGTT
TCAGTGGGCTCAAAGATCTTCTTCGTTGGCGGATCTAGAGAACCTTCGACGGATCTATGG
ATCCTTGATACACGAACTGGAAACATCACTCAGGGACCAAGCATGAGTGTGCCTCGAGTA
CATCTCCAAGCAGCTGTGGGAGTAATCGACGGGATGATATACGTAGTCGGAGGCGGGAAG
TTTAACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAGCTTGCT
GGGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTACTGGAGGGGAAGGTT
TATATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACAATCCGAGAGAAGGTGGAGGGCAACGG
ATGGTTCATATGGCAAGCCAGAGACTCAGGGAAGACGACGACGGAAGCAAGGTTAAGTTC
ACTGAAATGGCGTATCACGTGTGTGTGGGTGGAGGATGTTCTCTTTGCTTTTTT*ACCCG
GATTGGGTTGATGTGGTTTGATAGAAAGCTCAATGTGTGGAGGAA*TTGATTGGTCGTGA
TGGGAAGGA*CTGGTTATCTCACGTGTGAGGGC
ATGTCGGATATGACG

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR4CA60JQ 858 0 0
CTTGATACACGAACTGGAAACATCACTCAGGGACCAAGCATGAGTGTGCCTCGAGTACAT
CTCCAAGCAGCTGTGGGAGTAATCGACGGGATGATATACGTAGTCGGAGGCGGGAAGTTT
AACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAGCTTGCTGGG
GCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTACTGGAGGGGAAGGTTTAT
ATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACAATCCGAGAGAAGGTGGAGGGCAACGGATG
GTTCATATGGCAAGCCAGAGACTCAGGGAAGACGACGACGGAAGCAAGGTTAAGTTCACT
GAAATGGCGTATCACGTGTGTGTGG*TGGAGGATGTTCTCTTTGCTTTTTTTACCCGGAT
TGGGTTGATGTGGTTTGATAGAAAGCTCAATGTGTGGAGGAAATTGATTGGTCGTGATGG
GAAGGAACTGGTTATCTCACGTGTGAGGGCCATGTCGGAATATGACGGAAGGCTTGTTGT
TTTTACCTACATTATCCCAGCTGACGTCTTGAGGAAATCAAATGCAGTTGATATGAAGAT
TAAGGTTCAGTGTATGTTGGTCTCACTGGATAGAGCTGGAGAAAAGATCTGTGGGACGAT
CGATTGGTCTGGTATTGTGGCTACAGTCCCAGTCTGGTTTAATTCTCAGCATTGTTTAGC
TGTTTCCGAGTGATTGGTTAGAGTATGTGTTCTTGAGAGAGCAAGTTGTTTGCAAACTAG
AAAGAGATTTACATGAAACACAATAAAGAAATGAACATGTTTTGAAGTTTTTTTTGGAAT
TAAAGGCATATGTTTGTT

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR4EM63JQ 805 0 0
AGTACATCTCCAAGCAGCTGTGGGAGTAATCGACGGGATGATATACGTAGTCGGAGGCGG
GAAGTTTAACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAGCT
TGCTGGGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTACTGGAGGGGAA
GGTTTATATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACAATCCGAGAGAAGGTGGAGGGCA
ACGGATGGTTCATATGGCA*GCCAGAGACTCAGGGAAGACGACGACGGAAGCAAGGTTAA
GTTCACTGAAATGGCGTATCACGTGTGTGTGG*TGGAGGATGTTCTCTTTGCTTTTTTTA
CCCGGATTGGGTTGATGTGGTTTGATAGAAAGCTCAATGTGTGGAGGAAATTGATTGGTC
GTGATGGGAAGGAACTGGTTATCTCACGTGTGAGGGCCATGTCGGAATATGACGGAAGGC
TTGTTGTTTTTACCTACATTATCCCAGCTGACGTCTTGAGGAAATCAAATGCAGTTGATA
TGAAGATTAAGGTTCAGTGTATGTTGGTCTCACTGGATAGAGCTGGAGAAAAGATCTGTG
GGACGATCGATTGGTCTGGTATTGTGGCTACAGTCCCAGTTTGGTTTAATTTTCAGCATT
GTTTAGCTGTTTCCGAGTGATTGGTTAGAGTATGTGTTCTTGAGAGAGCAAGTTGTTTGC
AAACTAGAAAGAGATTTACATGAAACACAATAAAGAAATGAACATGTTTTGAAGTTTTTT
TTGGAATTAAAGGCATATGTTTGTT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4CO17JQ 807 0 0
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GGGAAGTTTAACGAAGAGATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAGTCGGAGACTTGGGAG
CTTGCTGGGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGGAGTGGTGCCTCGGTACTGGAGGGG
AAGGTTTATATGGTGGAGTACGGGGAGACAAATGTGTACAATCCGAGAGAAGGTGGAGGG
CAACGGATGGTTCATATGGCAAGCCAGAGACTCAGGGAAGACGACGACGGAAGCAAGGTT
AAGTTCACTGAAATGGCGTATCACGTGTGTGTGG*TGGAGGATGTTCTCTTTGCTTTTTT
TACCCGGATTGGGTTGATGTGGTTTGATAGAAAGCTCAATGTGTGGAGGAAATTGATTGG
TCGTGATGGGAAGGAACTGGTTATCTCACGTGTGAGGGCCATGTCGGAATATGACGGAAG
GCTTGTTGTTTTTACCTACATTATCCCAGCTGACGTCTTGAGGAAATCAAATGCAGTTGA
TATGAAGATTAAGGTTCAGTGTATGTTGGTCTCACTGGATAGAGCTGGAGAAAAGATCTG
TGGGACGATCGATTGGTCTGGTATTGTGGCTACAGTCCCAGTCTGGTTTAATTCTCAGCA
TTGTTTAGCTGTTTCCGAGTGATTGGTTAGAGTATGTGTTCTTGAGAGAGCAAGTTGTTT
GCAAACTAGAAAGAGATTTACATGAAACACAATAAAGAAATGAACATGTTTTGAAGTTTT
TTTTGGAATTAAAGGCATATGTTTGTT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 2 6

CO CL1630Contig1 781 2 4 U
TTGATGAATTTTGCTTGTAATTATGCCAAACGGCGAAGTACAAAAGTTCCCATTTTATAA
GAACATTGGATAGAATAGAAGACATTAACACCGAGATTGCAAAAGTTCAGAACAGACAGA
CTACTCATGCCGAGAGACCAAATAGCTTAAAGAAAAATCGATCACAATGTGTTATTTAAC
CATTAGATCACAAACTGCTTTGGAATAGGTAATTCAGTCCTACATAGTGATTAGACTGAC
TTGATGAAGTAGGCTTGACCTTCTCCCGCATATACTGGAGTAGATGCTCGCGTTTCCAGT
TGTCGATTCTGATTGTTTCCTTACGTTCATCATCTCCATCGAGCATGATCAACTTGGGTG
GTGAATTGAAAATGTACTCAACTTTAAGGGTAGGGAAGTTTTGTTTCTCTTCTTCAATAA
AACCAACAATCTCAGGATAGAAAACCAGCTTTCTCATACACACCTCCAATATAGCTCCTG
AATAGGTAACCTTACTCATGGAATCCTCAGAATCATCAGCGCAACATTTCAAGCAGTCAG
ATACCAACTCTTGGTCCTTGACGTATTCAGAGAGTGAGTGGCAATCGGAGCAGAGAGCAA
GACCGGTGAACCCTAGATCCTCGCACTCTTTAGTGCTCAGCTGCTCTTTTGCTGAGATCG
TCGATGTGAGCATCATGATGATCATCACCATCATCATCATCTTCGACCAAGCTCGATTCA
TCTCCATCTCTCTTTTTTCGAATCAACAGATCCAAAGCCTTCGCAGATGCGAGTGTCCCC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4AG33TF C 1
AF RR4AG33JQ U 17
BS 1 16 RR4AG33TF
BS 17 134 RR4AG33JQ
BS 135 135 RR4AG33TF
BS 136 781 RR4AG33JQ

RD RR4AG33TF 781 0 0
TTGATGAATTTTGCTTGTAATTATGCCAAACGGCGAAGTACAAAAGTTCCCATTTTATAA
GAACATTGGATAGAATAGAAGACATTAACACCGAGATTGCAAAAGTTCAGAACAGACAGA
CTACTCATGCCGAGAGACCAAATAGCTTAAAGAAAAATCGATCACAATGTGTTATTTAAC
CATTAGATCACAAACTGCTTTGGAATAGGTAATTCAGTCCTACATAGTGATTAGACTGAC
TTGATGAAGTAGGCTTGACCTTCTCCCGCATATACTGGAGTAGATGCTCGCGTTTCCAGT
TGTCGATTCTGATTGTTTCCTTACGTTCATCATCTCCATCGAGCATGATCAACTTGGGTG
GTGAATTGAAAATGTACTCAACTTTAAGGGTAGGGAAGTTTTGTTTCTCTTCTTCAATAA
AACCAACAATCTCAGGATAGAAAACCAGCTTTCTCATACACACCTCCAATATAGCTCCTG
AATAGGTAACCTTACTCATGGAATCCTCAGAATCATCAGCGCAACATTTCAAGCAGTCAG
ATACCAACTCTTGGTCCTTGACGTATTCAGAGAGTGAGTGGCAATCGGAGCAGAGAGCAA
GACCGGTGAACCCTAGATCCTCGCACTCTTTAGTGCTCAGCTGCTCTTTTGCTGAGATCG
TCGATGTGAGCATCATGATGATCATCACCATCATCATCATCTTCGACCAAGCTCGATTCA
TCTCCATCTCTCTTTTTTCGAATCAACAGATCCAAAGCCTTCGCAGA
TGCGAGTGTCCCCT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4AG33JQ 765 0 0
GTAATTATGCCAAACGGCGAAGTACAAAAGTTCCCATTTTATAAGAACATTGGATAGAAT
AGAAGACATTAACACCGAGATTGCAAAAGTTCAGAACAGACAGACTACTCATGCCGAGGG
ACCAAATAGCTTAAAGAAAAATCGATCACAATGTGTTATTTAACCATTAGATCACAAACT
GCTTTGGAATAGGTAATTCAGTCCTACATAGTGATTAGACTGACTTGATGAAGTAGGCTT
GACCTTCTCCCGCATATACTGGAGTAGATGCTCGCGTTTCCAGTTGTCGATTCTGATTGT
TTCCTTACGTTCATCATCTCCATCGAGCATGATCAACTTGGGTGGTGAATTGAAAATGTA
CTCAACTTTAAGGGTAGGGAAGTTTTGTTTCTCTTCTTCAATAAAACCAACAATCTCAGG
ATAGAAAACCAGCTTTCTCATACACACCTCCAATATAGCTCCTGAATAGGTAACCTTACT
CATGGAATCCTCAGAATCATCAGCGCAACATTTCAAGCAGTCAGATACCAACTCTTGGTC
CTTGACGTATTCAGAGAGTGAGTGGCAATCGGAGCAGAGAGCAAGACCGGTGAACCCTAG
ATCCTCGCACTCTTTAGTGCTCAGCTGCTCTTTTGCTGAGATCGTCGATGTGAGCATCAT
GATGATCATCACCATCATCATCATCTTCGACCAAGCTCGATTCATCTCCATCTCTCTTTT
TTCGAATCAACAGATCCAAAGCCTTCGCAGATGCGAGTGTCCCCT

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL1630Contig2 794 4 21 U
GGAAAACCGGATATAACCGAATTGGATTACTAGCATCTCTCTGCGAAGGCTTTGGATCTG
TTGATGAGAAAAAGAGAGATGGAGATGGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGTTGATG
ATCATGATGCTCACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAG
GATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCTGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTC
AAGGACCAAGAGTTGGTATCTTACTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCC
ATGAGTAAGGTTACCTATTCAGGAGCTATATTGGAGGTGTGCATGAGAAAGCTGGTTTTC
TATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACAAAGCTTCCCTACCCTAAAAGTT
GAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTCGATGCAGATGATGAACGTAAG
GAAACAATAAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAG
GTCAAGCCTACTTCATCTAGTTAGTCCAAATCACTGTGTAGGACTGAATTACCTATTCCA
AAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATTGACTTGTCTTTAAGCTAT
TTGGTCCCTCGGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTTGTAATATCGGTGTTAATGT
CTTCTATTCTATCCAATGTTCTTATAAAATGGGAACTTTTGTACTTGGCTGTTTGGCATA
ATTACAATCAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK24TF U 1
AF RR4GZ56JQ C 41
AF RR4GZ56TF U 41
AF RR4E924TF U 58
BS 1 261 RR4EK24TF
BS 262 262 RR4GZ56TF
BS 263 299 RR4EK24TF
BS 300 300 RR4GZ56TF
BS 301 365 RR4EK24TF
BS 366 366 RR4GZ56TF
BS 367 400 RR4EK24TF
BS 401 402 RR4GZ56TF
BS 403 413 RR4EK24TF
BS 414 414 RR4GZ56TF
BS 415 426 RR4EK24TF
BS 427 427 RR4GZ56TF
BS 428 463 RR4EK24TF
BS 464 464 RR4GZ56TF
BS 465 488 RR4EK24TF
BS 489 489 RR4GZ56TF
BS 490 566 RR4EK24TF
BS 567 567 RR4GZ56TF
BS 568 679 RR4EK24TF
BS 680 746 RR4GZ56TF
BS 747 794 RR4E924TF

RD RR4EK24TF 679 0 0
GGAAAACCGGATATAACCGAATTGGATTACTAGCATCTCTCTGCGAAGGCTTTGGATCTG
TTGATGAGAAAAAGAGAGATGGAGATGGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGTTGATG
ATCATGATGCTCACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAG
GATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCTGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTC
AAGGACCAAGAGTTGGTATCTGACTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCA
ATGAGTAAGGTTACCTATTCAGGAGCTATATTGGAGGTGTGCATGAGAAAGCTGGTTTTC
TATCCCGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACAAATTTTCCCTACCCTTAAAGTT
GAGTACATTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTCGATGGAGATGATGAACGTAAG
GAAACAATCAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAG
GTCAAGCCTACTTCATCTAGTTAGTCTAAATCACTGTGTAGGACTGAATTACCTATTCCA
AAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATTGACTTGTCTTTAAGCTAT
TTGGTCCCTCGGCATCAGT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4GZ56JQ 705 0 0
GG
GCGAAGGCTTTGGATCTGTTGATGAGAAAAAGAGAGATGGAGATGGATCGAGCTTGGTCG
AAGATGATGATGTTGATGATCATGATGCTCACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTG
AGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCTGATTGCCAC
TCACTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATCTTACTGCTTGAAATGTTGCGCT
GATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTCAGGAGCTATATTGGAGGTGTGC
ATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACAAAGC
TTCCCTACCCTAAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTCGAT
GCAGATGATGAACGTAAGGAAACAATAAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCTACTC
CAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCTAGTTAGTCCAAATCACTGTGTAGG
ACTGAATTACCTATTCCAAAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATT
GACTTGTCTTTAAGCTATTTGGTCCCTCGGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTTG
TAATATCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTATCCAATGTTCTTAT

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR4GZ56TF 706 0 0
GG
GCGAAGGCTTTGGATCTGTTGATGAGAAAAAGAGAGATGGAGATGGATCGAGCTTGGTCG
AAGATGATGATGTTGATGATCATGATGCTCACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTG
AGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCTGATTGCCAC
TCACTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATCTTACTGCTTGAAATGTTGCGCT
GATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTCAGGAGCTATATTGGAGGTGTGC
ATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACAAAGC
TTCCCTACCCTAAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTCGAT
GCAGATGATGAACGTAAGGAAACAATAAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCTACTC
CAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCTAGTTAGTCCAAATCACTGTGTAGG
ACTGAATTACCTATTCCAAAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATT
GACTTGTCTTTAAGCTATTTGGTCCCTCGGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTTG
TAATATCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTATCCAATGTTCTTATA

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR4E924TF 737 0 0
GG
GTTGATGAGAAAAAGAGAGATGGAGATGGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGTTGAT
GATCATGATGCTCACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAG**TGCGA
GGATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCTGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGT
CAAGGACCAAGAGTTGGTATCTGACTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTC
CATGAGTAAGGTCACCTATTCAGGAGCTATATTGGAGGTGTGCATGAGAAAGCTGGTTTT
CTATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACAAAGCTTCCCTACCCTAAAAGT
TGAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTCGATGCAGATGATGAACGTAA
GGAAACAATAAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAA
GGTCAAGCCTACTTCATCTAGTTAGTCTAAATCACTGTGTAGGACTGAATTACCTATTCC
AAAGCAGCATTGCGATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATTGACTTGTCTTTAAGCTA
TTTGGTCCCTCGGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTTGTAATATCGGTGTTAATG
TCTTCTATTCTATCCAATGTTCTTATAAAATGGGAACTTTTGTACTTGGCTGTTTGGCAT
AATTACAATCAAAAT

QA 3 737 3 737
DS 



AS 2 6

CO CL1631Contig1 890 3 4 U
GGATTAACTAGCTATTTGAATATGTAACAAGATAACAAAAACCGTTTCCCATATAGTAAC
AGATACCATACACAATTTCAACAAACAAAAACAAAGAGAGAGAGTTATAAGGAAACAACA
AAAAATGTATGAAAAGAAAGGTATAGAAACGTACAACATACATACTGAGATGAGACCCCC
CTAAGCTTCATCATCGTCTTCATCGTCGAGCTTATAGGAACTAAAATGATCGACGCGAAA
CTTCCACTCGCCTTTCACGGGATCAAACGACACAAACTCAACTCCTTGTGCCTCAGCTTT
CCTCTTAAGCATCATCTTATACTTTTCAACTCTATCTCCTTCTGTAAACTGTTTCCCTGT
CTTCTTATCAACACATTTTATATTCAGCAACGTTACCTCAGCCGGTTTGTTCAACCCTTC
CCCAACCGCTGGTTTCTGGCTTTCGTCTAGGTATACAATCACTTCCCGGTTATTGAACTG
AACCAGAGATTCCAAGTCGAGTCCACGAACATCGGTCTCTCCCATGAACTTGATGCTCCC
GTAACCGTGGCGTCCCACCACGAAGTCTTTCACTCGACTGCAATAACCAGGATCCGCTCT
TTCTTTAGCCGCTAGTTCTGGGATTCGTGGCTCGGTAAAATAATCGGATTGACGGAGCTT
TGGCATTATCGCCACGATGTCCGTTGCTGCTTCTCCGCCGGCGTGTCCGCCTCCTAGTGT
TCTGTAGGGACGGTCTTTCTCCCCAGCGAGATCTGTGCTTGTTGTGCCGTTTGATTTCTG
ATTTCCATTGATAGATGGATGAGTTCTTTCTTCAGCAGAAGCGAGTTTCCCGTTACCATT
TTCGTCATGGTTTACTGCATCAGTAGCTATGTCTGGACTCTTCCCATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A314JQD U 1
AF RR4A314JQ U 1
AF RR4A925JQ U 1
BS 1 726 RR4A314JQ
BS 727 727 RR4A314JQD
BS 728 883 RR4A314JQ
BS 884 890 RR4A925JQ

RD RR4A314JQD 809 0 0
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AAAAATGTATGAAAAGAAAGGTATAGAAACGTACAACATACATACTGAGATGAGACCCCC
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CTTCTTATCAACACATTTTATATTCAGCAACGTTACCTCAGCCGGTTTGTTCAACCCTTC
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TTCTTTAGCCGCTAGTTCTGGGATTCGTGGCTCGGTAAAATAATCGGATTGACGGAGCTT
TGGCATTATCGCCACGATGTCCGTTGCTGCTTCTCCGCCGGCGTGTCCGCCTCCTAGTGT
TCTGTAGGGACGGTCTTTCTCCCCAGCGAGATCTGTGCTTGTTGTGCCGTTTGATTTCTG
ATTTCCATTGATAGATGGATGAGTTCTTT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4A314JQ 883 0 0
GGATTAACTAGCTATTTGAATATGTAACAAGATAACAAAAACCGTTTCCCATATAGTAAC
AGATACCATACACAATTTCAACAAACAAAAACAAAGAGAGAGAGTTATAAGGAAACAACA
AAAAATGTATGAAAAGAAAGGTATAGAAACGTACAACATACATACTGAGATGAGACCCCC
CTAAGCTTCATCATCGTCTTCATCGTCGAGCTTATAGGAACTAAAATGATCGACGCGAAA
CTTCCACTCGCCTTTCACGGGATCAAACGACACAAACTCAACTCCTTGTGCCTCAGCTTT
CCTCTTAAGCATCATCTTATACTTTTCAACTCTATCTCCTTCTGTAAACTGTTTCCCTGT
CTTCTTATCAACACATTTTATATTCAGCAACGTTACCTCAGCCGGTTTGTTCAACCCTTC
CCCAACCGCTGGTTTCTGGCTTTCGTCTAGGTATACAATCACTTCCCGGTTATTGAACTG
AACCAGAGATTCCAAGTCGAGTCCACGAACATCGGTCTCTCCCATGAACTTGATGCTCCC
GTAACCGTGGCGTCCCACCACGAAGTCTTTCACTCGACTGCAATAACCAGGATCCGCTCT
TTCTTTAGCCGCTAGTTCTGGGATTCGTGGCTCGGTAAAATAATCGGATTGACGGAGCTT
TGGCATTATCGCCACGATGTCCGTTGCTGCTTCTCCGCCGGCGTGTCCGCCTCCTAGTGT
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ATTTCCATTGATAGATGGATGAGTTCTTTCTTCAGCAGAAGCGAGTTTCCCGTTACCATT
TTCGTCATGGTTTACTGCATCAGTAGCTATGTCTGGACTCTTC

QA 1 883 1 883
DS 

RD RR4A925JQ 890 0 0
GGATTAACTAGCTATTTGAATATGTAACAAGATAACAAAAACCGTTTCCCATATAGTAAC
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CCTCTTAAGCATCATCTTATACTTTTCAACTCTATCTCCTTCTGTAAACTGTTTCCCTGT
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CCCAACCGCTGGTTTCTGGCTTTCGTCTAGGTATACAATCACTTCCCGGTTATTGAACTG
AACCAGAGATTCCAAGTCGAGTCCACGAACATCGGTCTCTCCCATGAACTTGATGCTCCC
GTAACCGTGGCGTCCCACCACGAAGTCTTTCACTCGACTGCAATAACCAGGATCCGCTCT
TTCTTTAGCCGCTAGTTCTGGGATTCGTGGCTCGGTAAAATAATCGGATTGACGGAGCTT
TGGCATTATCGCCACGATGTCCGTTGCTGCTTCTCCGCCGGCGTGTCCGCCTCCTAGTGT
TCTGTAGGGACGGTCTTTCTCCCCAGCGAGATCTGTGCTTGTTGTGCCGTTTGATTTCTG
ATTTCCATTGATAGATGGATGAGTTCTTTCTTCAGCAGAAGCGAGTTTCCCGTTACCATT
TTCGTCATGGTTTACTGCATCAGTAGCTATGTCTGGACTCTTCCCATTTT

QA 1 890 1 890
DS 



CO CL1631Contig2 882 3 2 U
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TTAGGACAGAATAGTGCTCCTGCATTCGGCCAAACTAACATGTTCAATAAGCCTTCGACT
GGATTTGGCAACCTGTTTTCAAGTTCGTCAACATTAACCACGTCTAGCAGCTCTCCATTT
GGACAAACCACGCCTGCTGGTGTGACACCTTTTCAATCATCTCAGCCAGGTCAAGCATCA
AATGGTTTTGGTTTCAACAACTTCGGTCAAACACAAGCAGCTAATGCAACTGGGAATGCT
GGTGGACTGGGATTTTTTGGTCAAGGCAACTTTGGGCAAACGCCTGCTCCGCCGAGCTCT
GCTGTTTTGCAACCGGTTGTTGTTACAAATCCATTTGGAACTCTTCCTGCTATGCCTCAG
ATTTCAATAAATCAAAGCGGAAACTCATCGTCGATTCAATATGGAATCTCCAGCTTACCT
GTGGTTGACAAACCTGTTCCTGTTAGAGTCTCATCTCTTCTGACTTCTCGACACCTTTTA
CAAAGGCGGGTGAGGTTGCCTGCGAGAAAGTACCGTCCTGGCGACAATGGTCCAAAGGTT
CCATTTTTCATTGATGACGAGGAGACCCCTTCAAGTACACCAAAGGCGGATGCTCTTTTC
ATTCCAAGGGAGAACCCTAGAGCTCTAGTTATACGCCCAGCTCAACAGTGGTCTTCGAGA
GGCAAATCATCATCAATTCCAAAGGACCGTCCGACTGCCCCAGTACATGAAAATGGGAAG
AGTCCAGACATAGCTACTGATGCAGTAACCATGACGAAAATGGTAACGGGAAACTCGCTT
CTGCTGAGAAAGACTCATCCATCTATCAATGGAAATCAGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A314TF U 123
AF RR4A314TFB U 1
AF RR4A925TF U 25
BS 1 844 RR4A314TFB
BS 845 882 RR4A925TF

RD RR4A314TF 219 0 0
ATTTGGCAACCTGTTTTCAAGTTCGTCAACATTAACCACGTCTAGCAGCTCTCCATTTGG
ACAAACCACGCCTGCTGGTGTGACACCTTTTCAATCATCTCAGCCAGGTCAAGCATCAAA
TGGTTTTGGTTTCAACAACTTCGGTCAAACACAAGCAGCTAATGCAACTGGGAATGCTGG
TGGACTGGGATTTTT*GGTCAAGGCAACTTTGGGCAAAC

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR4A314TFB 844 0 0
GACCCCTTGATGGGACAGACTGGTTCTGCATTTGGACAGACTGGTTCTGCTTTTGGACAG
TTAGGACAGAATAGTGCTCCTGCATTCGGCCAAACTAACATGTTCAATAAGCCTTCGACT
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GGACAAACCACGCCTGCTGGTGTGACACCTTTTCAATCATCTCAGCCAGGTCAAGCATCA
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AGTCCAGACATAGCTACTGATGCAGTAACCATGACGAAAATGGTAACGGGAAACTCGCTT
CTGC

QA 1 844 1 844
DS 

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ACACCTTTTCAATCATCTCAGCCAGGTCAAGCATCAAATGGTTTTGGTTTCAACAACTTC
GGTCAAACACAAGCAGCTAATGCAACTGGGAATGCTGGTGGACTGGGATTTTTTGGTCAA
GGCAACTTTGGGCAAACGCCTGCTCCGCCGAGCTCTGCTGTTTTGCAACCGGTTGTTGTT
ACAAATCCATTTGGAACTCTTCCTGCTATGCCTCAGATTTCAATAAATCAAAGCGGAAAC
TCATCGTCGATTCAATATGGAATCTCCAGCTTACCTGTGGTTGACAAACCTGTTCCTGTT
AGAGTCTCATCTCTTCTGACTTCTCGACACCTTTTACAAAGGCGGGTGAGGTTGCCTGCG
AGAAAGTACCGTCCTGGCGACAATGGTCCAAAGGTTCCATTTTTCATTGATGACGAGGAG
ACCCCTTCAAGTACACCAAAGGCGGATGCTCTTTTCATTCCAAGGGAGAACCCTAGAGCT
CTAGTTATACGCCCAGCTCAACAGTGGTCTTCGAGAGGCAAATCATCATCAATTCCAAAG
GACCGTCCGACTGCCCCAGTACATGAAAATGGGAAGAGTCCAGACATAGCTACTGATGCA
GTAACCATGACGAAA*TGGTAACGGGAAACTCGCTTCTGCTGAGAAAGACTCATCCATCT
ATCAATGGAAATCAGAAA

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 6

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GGCGAGAGGTTTAAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCTAAGCATTGGATGCTTGA
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CCTTCCTCTTGTTCTTATCATCGGGAACAGGTTGAAGTATGCTCTTACCTACCGTGAAGT
CATCTCCATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAAGACCGACAAGAC
CTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACCAATGAGAACTTCCGTCT
TCTCTATGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTAAGTT
TAAGCTTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACAC
ATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAA
GCTCGATCTTGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTGT
GATGGTGACCGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCA
TAAGGGAAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGAG
GTTGGGTAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGGACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAAGGG
TAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCCAAGAAGAGGCTTGCTGGTCAACAGGC
TGCTTGATTTTTGTGATTTTTCCAGCTCTTTTATTATGTCTTTTAAGACGTTTTACGTTT
TCGTAGACTCGCTTTGCTTCTTTTTGTTTTGGAACTTGTGTTATTTTCTCTGTTTCAAGA
ATTCAACAAAAACTTCAAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GT55TF U 57
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AF RR4B211TF U 1
AF RR4AU18JQ C 237
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AF RR4B211JQ C 368
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AGTTTAAGCCTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACGAAAGGGCATTCCTTACCTCA
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AGCAT

QA 1 605 1 605
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TAAGGGAAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGAG
GTTGGGTAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGG*ACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCA
GGGT

QA 1 776 1 776
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GGCGAGAGGTTTAAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCTAAGCATTGGATGCTTGA
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CATCTCCATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAAGACCGACAAGAC
CTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACCAATGAGAACTTCCGTCT
TCTCTATGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTAAGTT
TAAGCTTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACAC
ATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAA
GCTCGATCTTGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTGT
GATGGTGACCGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCA
TAAGGGAAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGAG
GTTGGGTAATGTGTTCACCCTTGGCA

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DS 

RD RR4AU18JQ 744 0 0
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AGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACCAATGAGAACTTCC
GTCTTCTCTATGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTA
AGTTTAAGCTTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCA
ACACATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCA
TCAAGCTCGATCTTGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACG
TTGTGATGGTGACCGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGA
AGCATAAGGGAAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGA
CGAGGTTGGGTAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGGACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCA
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AGGCTGCTTGATTTTTGTGATTTTTCCAGCTCTTTTATTATGTCTTTTAAGACGTTTTAC
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QA 1 744 1 744
DS 

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G
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CTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGAGGTTGGGTAA
TGTGTTCACCCTTGGCAAAGGGACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAAGGGTAAAGGTAT
TAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCCAAGAAGAGGCTTGCTGGTCAACAGGCTGCTTGATT
TTTGTGATTTTTCCAGCTCTTTTATTATGTCTTTTAAGACGTTTTACGTTTTCGTAGACT
CGCTTTGCTTCTTTTTGTTTTGGAACTTGTGTTATTTTCTCTGTTTCAAGAATTCAACAA
AAA

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DS 

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TGCAAGGTCCGAACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACACATACGAC
GGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTCGAT
CTTGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTGTGATGGTG
ACCGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGA
AGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGAGGTTGGGT
AATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGGACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAAGGGTAAAGGT
ATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCCAAGAAGAGGCTTGCTGGTCAACAGGCTGCTTGA
TTTTTGTGATTTTTCCAGCTCTTTTATTATGTCTTTTAAGACGTTTTACGTTTTCGTAGA
CTCGCTTTGCTTCTTTTTGTTTTGGAACTTGTGTTATTTTCTCTGTTTCAAGAATTCAAC
AAAAACTTCAAAC

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DS 



AS 1 6

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CGACGTCGGGAACATACGCGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAGCGGCGGAGAAACACTACA
AGAAGTGGAAGAGCGAGAACCATATATTCCCTGATGCCATCGGCCACCACATCAAAAATG
TCACCGTTCACGAGGGAGAATCTGACTCTCACGGATCCATCAGGAGTTGGAACTACACAT
GGGATGGAAAGGAAGAGGTATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACAT
TGGCTTTAAGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTTTGATGTCATCT
ACCAATTTATCCCCAAAACTGAGGATACCATCTCCTGCAAAATCACTATAATATGGGAGA
AGCGCAAAGATGAGTTCCCTGAACCAATCACCTACATGAAATTCAACAAGAGCTTGATCG
TTGACATGGGCCACCACGCCAGCAAAGCTTAATCGTCACCACCATTGATCATCATCAACA
TGCCCATCACAATCACCATCATCACTATATATTCTATTTACTTATTAAACAGGTTTCAAA
ATAATGATCAATAAATGGGCCGGGGGGTCTTCAGTCTTGTACGTGGAGTTTCAATTCTAT
GTAATTGTTTGGCTTTTGTAAGATGGTTTAATTTGTTGTTATGGTCTCATCATCGAGTTT
GATGTAATGATACTAAGAATAATGTATGTTGTTCACCTATCTACATTTCTCAGTCTTTTA
CTGAGTTAATGGTCCG


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BZ70TF U 625
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AF RR4B124TF U 1
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TATGTTGTTCACCT

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GGGGGGTCTTCAGTCTTGTACGTGGAGTTTCAATTCTATGTAATTGTTTGGCTTTTGTAA
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GGGATGGAAAGGAAGAGGTATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACAT
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CCCATCACAATCACCATCATCACTATATATTCTATTTACTTATTAAACAGGTTTCAAAAT
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ACGTCGGGAACATACGCGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAGCGGCGGAGAAACACTACAAG
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GATGGAAAGGAAGAGGTATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACATTG
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CCCATCACAATCACCATCATCACTATATATTCTATTTACTTATTAAACAGGTTTCAAAAT
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AATTGTTTGGCTTTTGTAAGATGGTTTAATTTGTTGTTATGGTCTCATCATCGAGTTTGA
TGTAATGATACTAAGAATAATGTATGTTGTTCACCTATCTACATTTCTCAGTCTTTTACT
GAGTTAATGGTCCG

QA 3 796 3 796
DS 



AS 1 5

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TTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR4CY96TF U 4
AF RR4E571TF U 1
AF RR4EB41TF U 1
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AF RR4EB41JQ C 229
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GG
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TCTGCTCTGA*GAAACTTGGCTGTTGCTCAAATTGATAGGCTT
CTCT

QA 3 705 3 705
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TCTGTTGAGGA
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QA 1 731 1 731
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GGGCC
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TC

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DS 



AS 1 4

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ACACCGTTAACATTAACGCCGTTTAGCTTCATCTCAAAGTTAACGTTTTGGAAGTTCATC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 756 1 756
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QA 1 747 1 747
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AACAACAGCGACGCC

QA 1 675 1 675
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AS 1 6

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP74TF U 111
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AF RR4CJ83TF U 76
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ATTTGCAAAACATGATTCCAAGTGAACGCATCTCCAAGCTCGTC

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DS 

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GCGTCTATTCGGCGTTGGTTTAACAACCAGCCGCCTCCTTCGATCTCCCAAGCTCACGTC
CACCGTCATCCCTTTCAATCTCTGCACTTCGTCGATGGGTAACACCGAATCACCAATTAG
CAATCAGTCGGGTCCCACGGCGGCTTCGTCTCCTTCCACGGCTACAGGGGAAGGACCTCG
TAAGAAACCAAGACCCGAGTTCCAGGAAGAGCAAGCTCGCGTTCTCTCAGCGTCTCTCCG
TCACGTGCCGAGGTTAGGTTGGACGGAGGAAGCGATGATGGCTGGTTCAAGAGATGTCGG
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CATGATTCCAAGTGAACGCATCTCCAAGCTCGTCAGAATCCGGTTAGAAATGCAGGTTCC
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GATTTACATGC

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DS 

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G
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GAGTTCCAGGAAGAGCAAGCTCGCGTTCTCTCAGCGTCTCTCCGTCACGTGCCGAGGTTA
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CGCATCTCCAAGCTCGTCAGAATCCGGTTAGAAATGCAGGTTCCTTACATGTCAAAATGG
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GCAATGCTGGTTGATGAGATATGGCACAGTGTTGGAGATGGAGCCTCGGATTTAGATTGG
TATGTGAAACGCACTGTTCTTGGAGGTGTTTACTCAACCACCGAGATTTACATGCTTACA
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GCACAGACATTG

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GTTGGAGATGGAGCCTCGGATTTAGATTGGTATGTGAAACGCACTGTTCTTGGAGGTGTT
TACTCAACCACCGAGATTTACATGCTTACAGATGACTCCCCAG*******GGATACATGG
GCATTCCTTGATGACAGAGTCAAAGATGCTTTTGATCTCAAGAAAAGCATACAAGAGGCC
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GGAGTTATGCACACCATGTCCACACGTCGTGGTGGTGGTGGTAGTAGCTTTGCGTTTTGA
GAAGATGCACACCTTTAGAAAAAAAATAATTTGCTTCATCCTTATAGAGATAATCACAAT
ATTTTGAGTTTGAGATATGCTTATAATAAAATTGTATCACTATGTATGACTTGAGAAGTG
TATAAACTTTTTTTTGTCGAGTAAAAAA

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DS 

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TCCATTGTTGGGTCTTTCTCCAGGAAAGAAGCTGCTCTTGTCGAGTACTTCATGGATGAA
TGCCTACAACTGCTTATCGACAGAGTTGACTCTGGATTGGATTTGCAAAACATGATTCCA
AGTGAACGCATCTCCAAGCTCGTCAGAATCCGGTTAGAAATGCAGGTTCCTTACATGTCA
AAATGGCCTCAAGCTCTCAGCATCCAAGCGCATCCAGTGAACGTATCAACGAGTTTTAAG
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CTTACAGATGACTCCCCAGAGTATAGGGATACATGGGCATTCCTTGATGACAGAGTCAAA
GATGCTTTTGATCTCAAGAAAAGCATACAAGAGGCCAAGTATTTTGCACAAGACATTGGA
GCTGGAGTAGGGAAATCTTTTGAAGGTCTGATGAATGGAGTTATGCACACCATGTCCACA
CGTCGTGGTGGTGGTGGTAGTAGCTCTACGTTTTGAGAAGATGCACACCTTTAGAAAAAA
AATAATTTGCTTCATCCTTATAGAGATAATCACAATATTTTGAGTTTGAGATATGCTTAT
AATAAAATTGTATCACTATCTATGACTTGAGAAGTGTATAAACTTTTTTTTGTCGAGTAA
AAAACCAATGAGTTTGTGAATGGC

QA 1 804 1 804
DS 

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CTTATCGACAGAGTTGACTCTGGATTGGATTTGCAAAACATGATTCCAAGTGAACGCATC
TCCAAGCTCGTCAGAATCCGGTTAGAAATGCAGGTTCCTTACATGTCAAAATGGCCTCAA
GCTCTCAACATCCAAGCGCATCCAGTGAACGTACCAACGAGTTTTAAGCAGAGGGCAATG
CTGGTTGATGAGATATGGCACAGTGTTGGAGATGGAGCCTCGGATTTAGATTGGTATGTG
AAACGCACTGTTCTTGGAGGTGTTTACTCAACCACCGAGATTTACATGCTTACAGATGAC
TCCCCAG*******GGATACATGGGCATTCCTTGATGACAGAGTCAAAGATGCTTTTGAT
CTCAAGAAAAGCATACAAGAGGCCAAGTATTTTGCACAAGACATTGGAGCTGGAGTAGGG
AAATCGTTTGAAGGTTTGATGAATGGAGTTATGCACACCATGTCCACACGTCGTGGTGGT
GGTGGTAGTAGCTTTGCGTTTTGAGAAGATGCACACCTTTAGAAAAAAAATAATTTGCTT
CATCCTTATAGAGATAATCACAATATTTTGAGTTTGAGATATGCTTATAATAAAATTGTA
TCACTATGTATGACTTGAGAAGTGTATAAACTTTTTTTTGTCGAGTAAAAAACCAATGAG
TTTG
CG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 6

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GATAATTTTCCTTTTCGACGACGGCCCCGTAGTGATTCCATTCCTCCCAGCGCCTTGCAA
ATTCAGAACCGCGATTTTGTCTTTTGAAAATCAATCAAAAAGGGTTTGATCGTCGTATTG
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TAAAGCTCTCTGAGGATATCAATGGCATGATGTCTGAAAGGAACTCGTCTGGTGTAACGG
GGCCTGATGCTCAGCGTCGTGCTTCTGCTATTCGAAGAAAGATCACCATTTTGGGGACTC
GATTAGACACTCTTCAATCCCTTCTTGTTGGGAAGCAACATGTGTCAGAGAAGGAGGTGA
ATCGTCGCAAGGATATGGTTGGGAACTTGAGATCAAAGGCGAACCAGGTGGCGTCTGCTT
TGAACATGTCAAACTTTGCGAATAGAGACAGCTTGCTCGGGCCAGATACAAAGCCTGATG
ATGCAATGAACAGAGTCTCCGGCATGGACAACCAAGGCATTGTTGGATTTCAAAGACAAG
TTATGAGAGAACAAGACGAAGGGCTGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACCAAAC
ACATTGCTCTCGCTGTCAATGAAGAGCTCACTCTGCAGACAAGGCTTATCGAAGACTTAG
ACTACCATGTGGATGTTACAGACTCTCGCTTACGGCGGGTGCAGAAGAGCCTAGCGGTGA
TGAACAAGAATATGAAAGGAGGTTGCTCGAGCATGTCAATGCTATTGTCAGTGCTTGGAA
TCGTTGGTCTTGCTCTTGTCATTTGGCTGCTGGTTAAGTACCTCTAAATCTAATCCCCCA
CCACCACCAATGTGACGATGAATGGATTTGATATATAAGCAATGAAAAATGTGTACCTCT
TCTCCTTTCTGCCTCTCCTCTATGCGAGAGTGGTTGTCATTATTAATATATTTGTATTGT
TTCCTCTTTTGTGCCTTCTCTTCTCTCATTACTGTGAGAAGAATGTCGCTGCGTGTGCAA
GAAACAAGTCTTATTCAATCTGTATTGCCCTTGGTCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ34TF U 1
AF RR4EL80TF U 345
AF RR4B850TF U 49
AF RR4E170TF U 52
AF RR4DZ34JQ C 385
AF RR4E170JQ C 385
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BS 624 678 RR4DZ34TF
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BS 796 809 RR4DZ34JQ
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BS 877 877 RR4E170JQ
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GATAATTTTCCTTTTCGACGACGGCCCCGTAGTGATTCCATTCCTCCCAGCGCCTTGCAA
ATTCAGAACCGCGATTTTGTCTTTTGAAAATCAATCAAAAAGGGTTTGATCGTCGTATTG
CAAAGAGGGTCAAAATGGGGTCTTCTTCTGATGCATGGATAAGAGAGTACAATGAGGCTT
TAAAGCTCTCTGAGGATATCAATGGCATGATGTCTGAAAGGAACTCGTCTGGTGTAACGG
GGCCTGATGCTCAGCGTCGTGCTTCTGCTATTCGAAGAAAGATCACCATTTTGGGGACTC
GATTAGACACTCTTCAATCCCTTCTTGTTGGGAAGCAACATGTGTCAGAGAAGGAGGTGA
ATCGTCGCAAGGATATGGTTGGGAACTTGAGATCAAAGGCGAACCAGGTGGCGTCTGCTT
TGAACATGTCAAACTTTGCGAATAGAGACAGCTTGCTCGGGCCAGATACAAAGCCTGATG
ATGCAATGAACAGAGTCTCCGGCATGGACAACCAAGGCATTGTTGGATTTCAAAGACAAG
TTATGAGAGAACAAGACGAAGG*CTGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACCAAAC
ACATTGCTCTCGCTGTCA*TGAAGAGCTCACTCTGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4EL80TF 317 0 0
ACCATTTTGGGGACTCGATTAGACACTCTTCAATCCCTTCTTGTTGGGAAGCAACATGTG
TCAGAGAAGGAGATGAATCGTCGCAAGGATATGGTTGGGAACTTGAGATCAAAGGCGAAT
CAGGTGGCGTCTGCTTTGAACATGTCGAACTTTGCGAATAGAGACAGCTTGCTTGGGCCA
GATACAAAGCCTGACGATGCAATGAACAGAGTCTCTGGCATGGACAACCAAGGCATTGTT
GGATTTCAAAGACAAGTTATGAGAGAACAGGACGAAGGCCTGGAGAAGTTGGAGGAAACA
GTGATGAGTACCAAACA

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DS 

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GGG
CGGTCGCGTGATAATTTTCCTTTTCGACGACGGCCCCGTAGTGATTCCATTCCTCCCAGC
GCCTTGCAAATTCAGAACCGCGATTTTGTCTTTTGAAAATCAATCAAAAAGGGTTTGATC
GTCGTATTGCAAAGAGGGTCAAAATGGGGTCTTCTTCTGATGCATGGATAAGAGAGTACA
ATGAGGCTTTAAAGCTCTCTGAGGATATCAATGGCATGATGTCTGAAAGGAACTCGTCTG
GTGTAACGGGGCCTGATGCTCAGCGTCGTGCTTCTGCTATTCGAAGAAAGATCACCATTT
TGGGGACTCGATTAGACACTCTTCAATCCCTTCTTGTTGGGAAGCAACATGTGTCAGAGA
AGGAGGTGAATCGTCGCAAGGATATGGTTGGGAACTTGAGATCAAAGGCGAACCAGGTGG
CGTCTGCTTTGAACATGTCAAACTTTGCGAATAGAGACAGCTTGCTCGGGCCAGATACAA
AGCCTGATGATGCAATGAACAGAGTCTCCGGCATGGACAACCAAGGCATTGTTGGATTTC
AAAGACAAGTTATGAGAGAACAAGACGAAGGGCTGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGA
GTACCAAACACATTGCTCTCGCTGTCAATGAAGAGCTCACTCTGCAGACAAGGCTTATCG
AAGACTTAGACTACCATGTGGATGTTACAGACTCTCGCTTACGGCGGGTGCAGAAGAGCC
TAGCGGTGATGAACAAGAATATGA

QA 4 747 4 747
DS 

RD RR4E170TF 731 0 0
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GCCTTGCAAATTCAGAACCGCGATTTTGTCTTTTGAAAATCAATCAAAAAGGGTTTGATC
GTCGTATTGCAAAGAGGGTCAAAATGGGGTCTTCTTCTGATGCATGGATAAGAGAGTACA
ATGAGGCTTTAAAGCTCTCTGAGGATATCAATGGCATGATGTCTGAAAGGAACTCGTCTG
GTGTAACGGGGCCTGATGCTCAGCGTCGTGCTTCTGCTATTCGAAGAAAGATCACCATTT
TGGGGACTCGATTAGACACTCTTCAATCCCTTCTTGTTGGGAAGCAACATGTGTCAGAGA
AGGAGGTGAATCGTCGCAAGGATATGGTTGAGAACTTGAGATCAAAGGCGAACCAGGTGG
CGTCTGCTTTGAACATGTCAAACTTTGCGAATAGAGACAGCTTGCTCGGGCCAGATACAA
AGCCTGATGATGCAATGAACAGAGTCTCCGGCATGGACAACCAAGGCATTGTTGGATTTC
AAAGACAAGTTATGAGAGAACAAGACGAAGAGCTGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGA
GTACCAAACACATTGCTCTCGCTGTCAATGAAGAGCTCACTCTGCAGACAAGGCTTATCG
AAGACTTAGACTACCATGTGGATGTTACAGACTCTCGCTTACG*CGGGTGCAGA*GAGCC
TAGCGGTGATG

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DS 

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TGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACCAAACACATTGCTCTCGCTGTCAATGAAG
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CTCGCTTACGGCGGGTGCAGAAGAGCCTAGCGGTGATGAACAAGAATATGAAAGGAGGTT
GCTCGTGCATGTCAATGCTATTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTCTTGTCATTT
GGCTGCTGGTTAGGTACCTCTAAATCTAATCCCCCACCACCACCAATGTGACGATGAATG
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CTCATTACTGTGAGAAGAATGTCGCTGCGTGTGCAAGAAACAAGTCTTATTCAATCTGTA
TTGCCCTTGGTCGTGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4E170JQ 712 0 0
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ACTTGAGATCAAAGGCGAACCAGGTGGCGTCTGCTTTGAACATGTCAAACTTTGCGAATA
GAGACAGCTTGCTCGGGCCAGATACAAAGCCTGATGATGCAATGAACAGAGTCTCCGGCA
TGGACAACCAAGGCATTGTTGGATTTCAAAGACAAGTTATGAGAGAACAAGACGAAGAGC
TGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACCAAACACATTGCTCTCGCTGTCAATGAAG
AGCTCACTCTGCAGACAAGGCTTATCGAAGACTTAGACTACCATGTGGATGTTACAGACT
CTCGCTTACGGCGGGTGCAGAAGAGCCTAGCGGTGATGAACAAGAATATGAAAGGAGGTT
GCTCGAGCATGTCAATGCTATTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTCTTGTCATTT
GGCTGCTGGTTAAGTACCTCTAAATCTAATCCCCCACCACCACCAATGTGACGATGAATG
GATTTGATATATAAGCAATGAAAAATGTGTACCTCTTCTCCTTTCTGCCTCTCCTCTATG
CGAGAGTGGTTGTCATTATTAATATATTTGTATTGTTTCCTCTTTTGTGCCTTCTCTTCT
CTCATTACTGTGAGAAGAATGTCGCTGCGTGTGCAAGAAACAAGTCTTATTC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 6

CO CL1638Contig1 1125 6 13 U
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TTCTCCTTCTCTCTCCGATACATTTTGGAAACAAACTTCTCAAGGCTTTTTTTGAGAAGG
GAGGAGGGGGAGGAAGACGAGTTGATCTGATCTGATTTTGATTTGATGTCTGGAGCTGTA
TCTGGTTCCAGGGACATGGGGTTCGACGACGAAAACACTTCCAAAACGTCTCATCAACAC
GATGGCACCGACGACGAGGGTGCTGGATCCTTGGGTAGGCAAATGAGCGAAGCTTCTCTT
AGCGCTGCCGAGGAAGAAGAAGACGATGATTCCAAATTACAATTGGGTCCTCAGTACACT
ATCAAGGAACATCTCGAGAAGGATAAGGATGATGAGAGTCTGAGGAAGTGGAAAGAACAG
CTTCTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATC
ATTAGCCTGGCCATCTTGTCCCCTGGAAGACCAGATATCGTTCTTATGGTTCCGGAGAAT
GGGAATCCAAAGGGGATGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACAACTTGAAGTTC
ACGTTTCAGGTTAATAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAG
ACCGGTGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTCGGAG
CCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCACTCCTTCTGGCATGTTTGCTCGAGGATCA
TATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTAC
AGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGGCTGCGGTTTGAAACTCGAGAACAAAGTCTCCTGAG
ATGAAGTGTTTGTCAGTAGAAGTTGTGTGTTTGTTATTTCACTCCCTATCTCCTTTTTCT
CATCGTTGAACATATTATTGTGAATCGTTTTTTTTCCTCTTCCGGTTATTATCGTAGAAC
AAGAGCGACATTTATTTCCTCTTTGGTCTTGATTTTTTTTGTCGAGTAAGAATGACAGTG
ATTGTTCTCAAGTCAATCTTTAGCTTCATAAAATGTGTTTGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY59TF U 1
AF RR4A634TF U 7
AF RR4B201TF U 112
AF RR4B201JQ C 405
AF RR4A634JQ C 317
AF RR4FY59JQ C 333
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RD RR4FY59TF 810 0 0
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TTCTCCTTCTCTCTCCGATACATTTTGGAAACAAACTTCTCAAGGCTTTTTTTGAGAAGG
GAGGAGGGGGAGGAAGACGAGTTGATCTGATCTGATTTTGATTTGATGTCTTGAGCTGTA
TCTGGTTCCAGGGACATGGGGTTCGACGACGAAAACACTTCCAAAACGTCTCATCAACAC
GATGGCACCGACGACGAGGGTGCTGGATCCTTGGGTAGGCAAATGAGCGAAGCTTCTCTT
AGCGCTGCCGAGGAAGAAGAAGACGATGATTCCAAATTACAATTGGGTCCTCAGTACACT
ATCAAGGAACATCTCGAGAAGGATAAGGATGA***GAGTCTGAGGAAGTGGAAAGAACAG
CTTCTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATC
ATTAGCCTGGCCATCTTGTCCCCTGGAAGACCAGATATCGTTCTTATGGTTCCGGAGAAT
GGGAATCCAAAGGGGATGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGGGCAAGTACAACTTGAAGTTC
ACGTTTCAGGTTAATAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAG
ACCGGTGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTCGGAG
CCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGAC*ACTCCTTCTGGCATGTTTGCTCGAGGATCA
TATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGAT

QA 1 810 1 810
DS 

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GG
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CTCTCTCCGATACATTTTGGAAACAAACTTCTCAAGGCTTTTTTTGAGAAGGGAGGAGGG
GGAGGAAGACGAGTTGATCTGATCTGATTTTGATTTGATGTCTGGAGCTGTATCTGGTTC
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CCACGTGATGCCTGAAGAGACCACTCCTTCTGGCATGTTTGCTCGAGGATCATATTCTGC
TAGAACTAAGTTTCTTGATGAT

QA 3 804 3 804
DS 

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GG
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AGCTGTATCTGGTTCCAGGGACATGGGGTTCGACGACGAAAACACTTCCAAAACGTCTCA
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GTCGGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCACTCCTTCTGGCATGTTTGCTCG
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CAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGGCTGCGGTTTGAAACTCGAGAACAAAGTC
TCCTGAGATGAAGTGTTTGTCAGTAGAAGTTGTGTGTTT

QA 3 821 3 821
DS 

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CCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTGTCCCCTGGAAGACCAGATATCGTTTT
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TAGTCCTCAGTCGGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCACTCCTTTTGGCAT
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CCTATCTCCTTTTTTTCATCGTTGAACATATTATTGTGAATCGTTTTTTTTCCTCTTCCG
GTTATTATCGTAGAACAATAGCGATATTTATTTC

QA 1 634 1 634
DS 

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AAGAAGACGATGATTCCAAATTACAATTGGGTCCTCAGTACACTATCAAGGAACATCTCG
AGAAGGATAAGGATGATGAGAGTCTGAGGAAGTGGAAAGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTG
ATGTCACCAACATTGGATAGACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCT
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TGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACAACTTGAAGTTCACGTTTCAGGTTAATA
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AAGAATGGGCTGCGGTTTGAAACTCGAGAACAAAGTCTCCTGAGATGAAGTGTTTGTCAG
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TCCTCTTTGGTCTTGATTTTTTTTGTCGAGTAAGAATGACAGTGATTGTTCTCAAGTCAA
TCTTTAGCTTCATAAAATGTGTTTGATGG

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DS 

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***GAGTCTGAGGAAGTGGAAAGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGG
AGAGACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTGTCCCCTGGAAGACC
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TCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAAAT
GCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTCGGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCAC
TCCTTCTGGCATGTTTGCTCGAGGATCATATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGATGA
TAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGGCTGCGGT
TTGAAACTCGAGAACAAAGTCTCCTGAGATGAAGTGTTTGTCAGTAGAAGTTGTGTGTTT
GTTATTTCACTCCCTATCTCCTTTTTCTCATCGTTGAACATATTATTGTGAATCGTTTTT
TT*CCTCTTCCGGTTATTATCGTAGAACAAGAGCGACATTTATTTCCTCTTTGGTCTTGA
TTTTTTTTGTCGAGTAAGAATGACAGTGATTGTTCTC

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DS 



AS 2 5

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CAAGAGTTATGTCATACAACACCGGATCTTCATCATCTTTTGCTAATGTGTTACTCGTCG
TGTCACTTATGCTTCTGAGTTTGTCGGCTGATGCGTACAAGAACTATACTGTGGGAGGGT
CCACGGGATGGTTCGATATCCAGGAGAAATCTTCTGCAAATTATCAGAAATGGGCTGATT
CCAAAACATTTTCTTTGGGTGATTTCCTCAGTAAGTTCACACCACACTTGATCTCTGGTT
TCTTTGTTTGGATAGTAATATAATAGAAATACTCTTTAATTTTAGTTCGGGTGTGATGAA
CTTTTAAAGAAATGGCGTAATGCTCAAATGAATATAGTTTCTGTGTTTTAGATATTCAAA
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GTATCGTGAAAACTATTTTTTAGAAACAGAGCGAGTACAATAGTTTAGTTTAGTAGGATG
TATACTCTGAAACGACTCTCTTGTTATTGGTTTATGCTTAAGATGAACTCTCAGATCATA
AACGTCTATGTGTTGTTGTTCAATGTAGTTTTCAACACAGATAGCAACCATTCGGTGGTA
CAAACATATGATTTCAAAACTTACAAAGAATGTGATTACAACAATGGTGAAGACAATAGT
ACAACAGAGTGGTCGGCTGCAAACCCTTCAGCGACATCTCCAGTTCCGGTCTCAGTTAGT
GTTCCTCTAGTTAAAGAAGGTTCCAATTATTTCTTCTCAGGAAATTATGACGGTGAACAA
TGTAAATTTGGACAGCATTTCATGATAAATGTAACACATGGTCAGGGCCTACCATCACCA
GATGAAGATGGTGAAACGGCCCCTGGACCAGGCCAATCCTCTCAATCCGGTGATGATGAA
GTTGCTCCAGATACCATAGTTCCCGCCAATTTTGACCATCCTAAAGATATTGAGAGTGAT
GATGATAGTTTGGTTAAGGGTCGTAAAAGTTCTTCTTCCGTTACAAAATATAATTTGTTA
TGTTTAGTTTTAATGGGGTTCCTAGCATCATTCTTTTGATCAAATTATTCTTCTGTGTGT
ATTATAATCATTGTCTTTTGGATATATCAGTATAATTATCTTAGCTGATAATTATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI50TF U 1
AF RR4DI50JQ C 532
BS 1 652 RR4DI50TF
BS 653 1318 RR4DI50JQ

RD RR4DI50TF 652 0 0
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CCACGGGATGGTTCGATATCCAGGAGAAATCTTCTGCAAATTATCAGAAATGGGCTGATT
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TCTTTGTTTGGATAGTAATATAATAGAAATACTCTTTAATTTTAGTTCGGGTGTGATGAA
CTTTTAAAGAAATGGCGTAATGCTCAAATGAATATAGTTTCTGTGTTTTAGATATTCAAA
AAATTTATTGTTTAAAAATATTTTTTTAGATTTTGAAATACTTATCATTAATTGATAAAA
TAAATTGTAATTTTTATATATTAATTAAAAATATTTGAATTGATTAAATAGTTTTTGGTT
GATATTTATTAGAAAGTATATAGTAAAAATAAAGAATATATTAAATTCTAAACATTTATC
GTATCGTGAAAACTATTTTTTAGAAACAGAGCGAGTACAATAGTTTAGTTTA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4DI50JQ 787 0 0
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CAGATCATAAACGTCTATGTGTTGTTGTTCAATGTAGTTTTCAACACAGATAGCAACCAT
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TCAGTTAGTGTTCCTCTAGTTAAAGAAGGTTCCAATTATTTCTTCTCAGGAAATTATGAC
GGTGAACAATGTAAATTTGGACAGCATTTCATGATAAATGTAACACATGGTCAGGGCCTA
CCATCACCAGATGAAGATGGTGAAACGGCCCCTGGACCAGGCCAATCCTCTCAATCCGGT
GATGATGAAGTTGCTCCAGATACCATAGTTCCCGCCAATTTTGACCATCCTAAAGATATT
GAGAGTGATGATGATAGTTTGGTTAAGGGTCGTAAAAGTTCTTCTTCCGTTACAAAATAT
AATTTGTTATGTTTAGTTTTAATGGGGTTCCTAGCATCATTCTTTTGATCAAATTATTCT
TCTGTGTGTATTATAATCATTGTCTTTTGGATATATCAGTATAATTATCTTAGCTGATAA
TTATCAT

QA 1 787 1 787
DS 



CO CL1639Contig2 1207 3 23 U
GGATCTAAAATTCCATATAGTAGACTGTAGAAAGGACAGTTGGCAGATAAAATTATATTT
TTGAAAGACGGGAGAATAGAGAAGCGAAGACAGCAAAAGTAAGCTGAGAGATCACGTGGG
GACGGAGAAGGAGGCGTTGGTATATGATTGGACCGACCAGTTTGCACTGTTTCATGTTAT
CGCCAAACATCAAGACTTGTCCACATGCCGCCAGTGACGAGCTCATTACTTTATGTATAG
ACGACTCCTCTTCCTATTATTACTTTTATAGCAAAGAAAAGTGTCTAGAATCAAGAAAAT
CGGAAGAGGAAAAGAGAGGAAGAACAAGAGTTATGTCATACAACACCGGATCTTCATCAT
CTTTTGCTAATGTGTTACTCGTCGTGTCACTTATGCTTCTGAGTTTGTCGGCTGATGCGT
ACAAGAACTATACTGTGGGAGGGTCCACGGGATGGTTCGATATCCAGGAGAAATCTTCTG
CAAATTATCAGAAATGGGCTGATTCCAAAACATTTTCTTTGGGTGATTTCCTCATTTTCA
ACACAGATAGCAACCATTCGGTGGTACAAACATATGATTTCAAAACTTACAAAGAATGTG
ATTACAACAATGGTGAAGACAATAGTACAACAGAGTGGTCGGCTGCAAACCCTTCAGCGA
CATCTCCAGTTCCGGTCTCAGTTAGTGTTCCTCTAGTTAAAGAAGGTTCCAATTATTTCT
TCTCAGGAAATTATGACGGTGAACAATGTAAATTTGGACAGCATTTCATGATAAATGTAA
CACATGGTCAGGGCCTACCATCACCAGATGAAAGATGGTGAAACGGCCCCTGGACCAGGC
CAATCCTCTCAATCCGGTGATGGTGATGAAGTTGCTCCAGATACCATAGTTCCCGCCAAT
TTTGACCATCCTAAAGATATTGAGAGTGATGATGATGATAGTTTGGTTAAGGGTCGTAAA
AGTTCTTCTTCCGTTACAAAATATAATTTGTTATGTTTAGTTTTAATGGGGTTCCTAGCA
TCATTCTTTTGATCAAATTATTCTTCTGTGTGTATTATAATCATTGTCTTTTGGAGATAT
CAGTATAATTATCTTAGCTGATAATTATCATAATAATATTTACGAAATTCTATACATAGA
ATGCGTTTCTGGAGGTGTAATAATAAGTATCCTAGTAAAAGAAATGAAATCAGTATAAGT
TTAGCTC


BQ
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4AP32JQ U 22
AF RR4DY77JQ U 1
AF RR4DU20JQ U 1
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AF RR4DU20TF C 597
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GCATTAGCGGGTGAGCAAAATAGGCTCCAACTGTTAACGCCGTGATTGCAAGATAAGGCA
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CAAAAGGAATCACACTCGTTCTCTTCTTGATGCCTTCGAAAGCATCTCCGTATCTTTTAG
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GTTTTTACGAGGAACTCCCTCTTTGAATACACCATGAGCTAATAAAAAGAATCTACCAAT
GAAGCCTGAAGCTTGCACCTTGCATTAGCGGGTGAGCAAAATAGGCTCCAACTGTTAACG
CCGTGATTGCAAGATAAGGCAACCGAACGAACTCTTTGTAGTAATCCTCAGGCAAAACTT
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AAGCATCTCCGTATCTTTTAGCTAGTCTCCTGTCTCCATTCCACGCCCCAAACAAATGGT
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TTTTGTATTTATACAGTTCTTTTTTTTGTAGTAAAATAATTATACATTGTTCCTTGAGAA
GTTTTTACGAGGAACTCCCTCTTTGAATACACCATGAGCTAATAAAAAGAATCTACCAAT
GAAGCCTGAAGCTTGCACCTTGCATTAGCGGGTGAGCAAAATAGGCTCCAACTGTTAACG
CCGTGATTGCAAGATAAGGCAACCGAACGAACTCTTTGTAGTAATCCTCAGGCAAAACTT
GGCGTCCTTCAATAATGGCAGCAAAAGGAATCACACTCGTTCTCTTCTTGATGACTTCGA
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DS 

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TCACCTATGAGCTTCTCTCCTACATCTCTGAGACTAGCTAACCCACTGTGCACAGTTGCG
AAGATGAGTATAAGCATTAACATCGCCACCTCCGGCGAGCCGGAGACGGCGGAGACGGCG
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TCTCCTACATCTCTGAGACTAGCTAACCCACTGTGCACAGTTGCGAAGATGAGTATAAGC
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CCGAAACCAGTGGAGTTATCGATCCAGACTACGTTGAGGATGTAGAGAACGACTCCAAGG
ATAACGCCGAAATAAACCCAGGAAACGAGCTTCTGTTTGCCTAATTCGAAAGCAGCAGAG
TCTTCTCCGATCAGCAGAGTTGGACTCTCGGAGTCCGGAGAGACGGGGTCTTCCCGGAGA
GTGCTGCGGACGAGAATTTTCCGAATTACTGGTGGAGACGAAGAAGGTGAGGTGGGGAAT
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CGAGGAGGAAGAACAAGCGAAGGAGAGGTCGTCGAGAGGAGGGGATGATAAACCGCCATT
GTTGCTGTTGTGTTTGGTAAGAACTCTTGCGAGTCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 6

CO CL1641Contig1 898 6 17 U
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ATCTTCTTCTTCAACCCTTATACCTTTTCTGTCTGTCTTCAATTCTTCGAAACCAAAGAA
GCTAACTCGTCTTCAAAGTCACTACCTTTCTCCTAAGCCTAAGCTTCTTTCGTTCTCGAC
TAAACAGTCTGATGTCTCTCGTCACATAGCGTTTTCCGTTTCCTCTTCTTCCCCACCAGA
GGAAACAGTCTCAATGGTCGATTTCCATGAGAAAGATTGGTCCTTTCTCGAATCCATGGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4DI19TF U 1
AF RR4AD87JQ C 178
AF RR4AF54JQ C 178
AF RR4AD87TF U 178
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AF RR4DI19JQ C 198
BS 1 177 RR4DI19TF
BS 178 178 RR4AD87TF
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BS 275 275 RR4AD87TF
BS 276 378 RR4DI19TF
BS 379 379 RR4AD87TF
BS 380 423 RR4DI19TF
BS 424 424 RR4AD87TF
BS 425 489 RR4DI19TF
BS 490 490 RR4AD87TF
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BS 669 768 RR4DI19TF
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ATCTTCTTCTTCAACCCTTATACCTTTTCTGTCTGTCTTCAATTCTTCGAAACCAAAGAA
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TAAACAGTCTGATGTCTCTCGTCACATAGCGTTTTCCGTTTCCTCTTCTTCCCCACCAGA
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AACCGAACAGAACCAGAAGCTCGAAAAGATCATCAAGGCTGGAGAAGTAACAGAGTCTTC
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TTCCCAGCTCTTGCTTATAGTCCACGACTCTCTTTTCGTGTTAGCCTGTGTCAAAGAAAA
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CTTACATGTCGTGTTTCTCTATTTCCTTCCAGCTCTGCCTTTCGGTCTCGACGAGGTGTT
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TCCCTTACATGTCGTGTTTCTCTATTTCCTTCCAGCTCTGCCTTTCGGTCTCGACGAGGT
GTTCAAGACACTGTCTCAACTTTGTTCCTCAGGTGCACGAGTAGTGATAAGTCACCCGCT
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ACCTGATGACTCCACCTTGAGAAGTGTTGCTAAGAAGCATTCGTTTGAGTTAACTCAGTT
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QA 1 720 1 720
DS 

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GTTGGCAGGGAGAACTGATCTATGTTCCAGAGAAATGGTCTCCCTTACATGTCGTGTTTC
TCTATTTCCTTCCAGCTCTGCCTTTCGGTCTCGACGAGGTGTTCAAGACACTGTCTCAAC
TTTGTTCCTCAGGTGCACGAGTAGTGATAAGTCACCCTCTAGGAAGAGAAGGGTTAAAGC
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ACCTTGCTGTTCTAAAGTTCTCCAAGCGATAGATTATGTCCCCCTGTCACAGATTTTTCC
TGTCCTTGTTTTGTAATGAATTATTTAAACCGGAACCTTCG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 5

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GTTCTCCGACCGGCGTCGGTTGGCTTCTATAGCCACGGCGTCGGTTGGTTGTTTTTAACT
TTGTTTATAATTCTTCTTCTCTCTGTTGTGTTTTTTATGTTATCAAAATCTAGCTTTTCA
GTTTCAGATCTAGATTAGATGATAAATCTGAGAGTTTGACTAGTTTTTGGCTCTTTGGAT
GGTTGCATGCAGCGATTTCTTTTGGTCCCTGGTTATGGTCAGATTATCCGCCGTCTTTGG
CGATTGGACTCTTTCTCACCGGTTGCATGTTCTCCTCTGCAGCTCAGACTCTGGTCTCCT
CTTCTCTGTTTTATCAGTGTTTTGTCTTGTCTCACCTTGGTTAGTGAATCTTCCGGGTAC
AGATGGAGTGCTTATCCTTGAATCTGGTAGCAACGGGTCGATTGTGGTTGTGACTGTTCT
CTCGTCTTACTGCATGATTTTTCCGGCTCGATTCAATGGATTTGGAGCTTTGGCTCTCTC
GTCCTGTTGTCGTTGGAAGTAGTTTGGTCAAATCAAGTTCTCACCACTTCTTCCAAGGAT
AGTTACATGCATGTCTTACTCGTGGCTCCTCTGATGTTTGGAGCAATATAATGAGTTCTT
GTGTGTGCTACCTCAATAAAGCTCGACCTACGGACTACGCTCAATCAAATCCTTCTTGTC
GGTTGTATTCTCTTCCTCTTAAGGTGTTAATTTGATTATCTGATCTGTTTTCTGCAAGTT
AGATTTTGTTTCATCTTCCAGTCGTTGTTGTTTGTTGTTAGCTTCCCTTTCTTAGGGCTT
TATTCCAGAAGAACTTGTTTTTGCTGGCTTTGTATCCTTCAATCGGATTCCACCCTGTAA
TCCTCCTTGATGTTGTTAATATAATTCCAGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GZ30TF U 5
AF RR4CB36TF U 1
AF RR4AA73TF U 14
AF RR4CB36JQ C 118
AF RR4AA73JQ C 157
BS 1 330 RR4CB36TF
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RD RR4GZ30TF 712 0 0
GG
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ATGCAGCGATTTCTTTTGGTCCCTGGTTATGGTCAGATTATCCGCCGTCTTTGGCGATTG
GACTCTTTCTCACCGGTTGCATGTTCTCCTCTGCAGCTCAGACTCTGGTCTCCTCTTCTC
TGTTTTATCAGTGTTTTGTCTTGCCTCACCTTGGTTAGTGAATCTTCCGGGTACAGATGG
AGTGCTTATCCTTGAATCTGGTAGCAACGGGTCGATTGTGGTTGTGACTGTTCTCTCGTC
TTACTGCATGATTTTTCCGGCTCGATTCAATGGATTTGGAGCTTTGGCTCTCTCGTCCTG
TTGTCGTTGGAAGTAGTTTGGTCAAATCAAGTTCTCACCACTTCTTCCAAGGATAGTTAC
ATGCATGTCTTACTCGTGGCTCCTCTGATGTTTGGAGCAATATAATGAGTTCTTGTGTGT
GCTACCTCAATAAAGCTCGACCTACGGACTACGCTCA*TCAAATCCTTCT

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR4CB36TF 775 0 0
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TTGTTTATAATTCTTCTTCTCTCTGTTGTGTTTTTTATGTTATCAAAATCTAGCTTTTCA
GTTTCAGATCTAGATTAGATGATAAATCTGAGAGTTTGACTAGTTTTTGGCTCTTTGGAT
GGTTGCATGCAGCGATTTCTTTTGGTCCCTGGTTATGGTCAGATTATCCGCCGTCTTTGG
CGATTGGACTCTTTCTCACCGGTTGCATGT*CTCCTCTGCAGCTCAGACTCTGGTCTCCT
CTTCTCTGTTTTATCAGTGTTTTGTCTTGTCTCACCTTGGTTAGTGAATCTTCCGGGTAC
AGATGGAGTGCTTATCCTTGAATCTGGTAGCAACGGGTCGATTGTGGTTGTGACTGTTCT
CTCGTCTTACTGCATGATTTTTCCGGCTCGATTCAATGGATTTGGAGCTTTGGCTCTCTC
GTCCTGTTGTCGTTGGAAGTAGTTTGGTCAAATCAAGTTCTCACCACTTCTTCCAAGGAT
AGTTACATGCATGTCTTACTCGTGGCTCCTCTGATGTTTGGAGCAATATAATGAGTTCTT
GTGTGTGCTACCTCAATAAAGCTCGACCTACGGACTACGCTCAATCAAATCCTTCTTGTC
GGT*GTATTCTCTTCCTCTTAA*GTGTTAATTTGATTATCTGATCTGTTTTCTGC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4AA73TF 826 0 0
GG
TCTCTCTTCTCTCTAAGAGCATAAGCGTTTCTTTTTTCTTTCTCTGTTCTCCGACCGGCG
TCGGTTGGCTTCTATAGCCACGGCGTCGGTTGGTTGTTTTTAACTTTGTTTATAATTCTT
CTTCTCTCTGTTGTGTTTTTTATGTTATCAAAATCTAGCTTTTCAGTTTCAGATCTAGAT
TAGATGATAAATCTGAGAGTTTGACTAGTTTTTGGCTCTTTGGATGGTTGCATGCAGCGA
TTTCTTTTGGTCCCTGGTTATGGTCAGATTATCCGCCGTCTTTGGCGATTGGACTCTTTC
TCACCGGTTGCATGTTCTCCTCTGCAGCTCAGACTCTGGTCTCCTCTTCTCTGTTTTATC
AGTGTTTTGTCTTGTCTCACCTTGGTTAGTGAATCTTCCGGGTACAGATGGAGTGCTTAT
CCTTGAATCTGGTAGCAACGGGTCGATTGTGGTTGTGACTGTTCTCTCGTCTTACTGCAT
GATTTTTCCGGCTCGATTCAATGGATTTGGAGCTTTGGCTCTCTCGTCCTGTTGTCGTTG
GAAGTAGTTTGGTCAAATCAAGTTCTCACCACTTCTTCCAAGGATAGTTACATGCATGTC
TTACTCGTGGCTCCTCTGATGTTTGGAGCAATATAATGAGTTCTTGTGTGTGCTACCTCA
ATAAAGCTCGACCTACGGACTACGCTCAATCAAATCCTTCTTGTCGGTTGTATTCTCTTC
CTCTTAACGTGTTAATTTGATTATCTGATCTGTTTTCTGCAAGTTAGATTTTGTTTCATC
TTCCAGTCGTTGTTGTTTGT*GTTAGCTTCC*TTTCTTAGG
CTT

QA 3 823 3 823
DS 

RD RR4CB36JQ 818 0 0
ACTTTGTTTATAATTCTTCTTCTCTCTGTTGTGTTTTTTATGTTATCAAAATCTAGCTTT
TCAGTTTCAGATCTAGATTAGATGATAAATCTGAGAGTTTGACTAGTTTTTGGCTCTTTG
GATGGTTGCATGCAGCGATTTCTTTTGGTCCCTGGTTATGGTCAGATTATCCGCCGTCTT
TGGCGATTGGACTCTTTCTCACCGGTTGCATGT*CTCCTCTGCAGCTCAGACTCTGGTCT
CCTCTTCTCTGTTTTATCAGTGTTTTGTCTTGTCTCACCTTGGTTAGTGAATCTTCCGGG
TACAGATGGAGTGCTTATCCTTGAATCTGGTAGCAACGGGTCGATTGTGGTTGTGACTGT
TCTCTCGTCTTACTGCATGATTTTTCCGGCTCGATTCAATGGATTTGGAGCTTTGGCTCT
CTCGTCCTGTTGTCGTTGGAAGTAGTTTGGTCAAATCAAGTTCTCACCACTTCTTCCAAG
GATAGTTACATGCATGTCTTACTCGTGGCTCCTCTGATGTTTGGAGCAATATAATGAGTT
CTTGTGTGTGCTACCTCAATAAAGCTCGACCTACGGACTACGCTCAATCAAATCCTTCTT
GTCGGTTGTATTCTCTTCCTCTTAAGGTGTTAATTTGATTATCTGATCTGTTTTCTGCAA
GTTAGATTTTGTTTCATCTTCCAGTTGTTGTTGTTTGTTGTTAGCTTCCCTTTCTTAGGG
CTTTATTCCAGAAGAACTTGTTTTTGCTGGCTTTGTATCCTTCAATCGGATTCCACCCTG
TAATCCTCCTTGATGTTGTTAATATAATTCCAGTGTT
C

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4AA73JQ 779 0 0
ATGTTATCAAAATCTAGCTTTTCAGTTTCAGATCTAGATTAGATGATAAATCTGAGAGTT
TGACTAGTTTTTGGCTCTTTGGATGGTTGCATGCAGCGATTTCTTTTGGTCCCTGGTTAT
GGTCAGATTATCCGCCGTCTTTGGCGATTGGACTCTTTCTCACCGGTTGCATGTTCTCCT
CTGCAGCTCAGACTCTGGTCTCCTCTTCTCTGTTTTATCAGTGTTTTGTCTTGTCTCACC
TTGGTTAGTGAATCTTCCGGGTACAGATGGAGTGCTTATCCTTGAATCTGGTAGCAACGG
GTCGATTGTGGTTGTGACTGTTCTCTCGTCTTACTGCATGATTTTTCCGGCTCGATTCAA
TGGATTTGGAGCTTTGGCTCTCTCGTCCTGTTGTCGTTGGAAGTAGTTTGGTCAAATCAA
GTTCTCACCACTTCTTCCAAGGATAGTTACATGCATGTCTTACTCGTGGCTCCTCTGATG
TTTGGAGCAATATAATGAGTTCTTGTGTGTGCTACCTCAATAAAGCTCGACCTACGGACT
ACGCTCAATCAAATCCTTCTTGTCGGTTGTATTCTCTTCCTCTTAAGGTGTTAATTTGAT
TATCTGATCTGTTTTCTGCAAGTTAGATTTTGTTTCATCTTCCAGTCGTTGTTGTTTGTT
GTTAGCTTCCCTTTCTTAGGGCTTTATTCCAGAAGAACTTGTTTTTGCTGGCTTTGTATC
CTTCAATCGGATTCCACCCTGTAATCCTCCTTGATGTTGTTAATATAATTCCAGTGTTT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 6

CO CL1643Contig1 1350 6 6 U
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AAGGGATCAAGTTCACCTCTTCAGATTACAACTATGGTTCCTTCTCCTATCTTCCTTTGG
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GCCTATCTATATCTCTATTCTCATGGTGAAGTATCTTTGGCTGCTTCACAACCGGTGCTG
CTGTACATTGCTTTTGCTTTGGTTCTGATATTTCCCTTCGACATTTTCTACTTGTCAAGT
CGATATTTTCTGCTGAGAACGTTATGGAGGATAGCTTTTCCACTGCAGCCAATTACATTT
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CTCACTCTACTCATTCTACTGGGATGTAACTCGAGATTGGGACTTGAGCGGTTTCACTAA
GATATTCAAGTTTAACCGTCCAAGTAACATATCATATCTCTTATATGGCCGACAATGGGT
GTATTTCTGGGTGATAGGGAGCAATCTGGTGCTGAGGTGCGCATGGACATATAAGTTATC
GGCACATTTGAGGCACAACTACATAACGGTGTTCGCAGTGACAGCCATGGAGATGTTTAG
ACGCTTTCAGTGGGTATTTTTCAGAGTAGAGAACGAGTGGAACAAGACCACTAAATCGCA
TCCATTGGCTGAGATTTCACTTGAAGAAGACAAACTACTTGGTTCTACTACAACCCATGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 

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G
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TTGTGACCATGATGGTTTGGCTCTGGGGAGTCAACTTATGGGTGTTCTCTCAAGGAAGTG
TCAATTATTCCAAAGTCTTTGATCTCGACCATAACTACCTCACTCATCGAGAGATGTGGA
AGTGTAGCATGTGGATGACAATCATTGTCCCTACGAGCATGACTGCCTATCTATATCTCT
ATTCTCATGGTGAAGTATCTTTGGCTGCTTCACAACCGGTGCTGCTGTACATTGCTTTTG
CTTTGGTTCTGATATTTCCCTTCGACATTTTCTACTTGTCAAGTCGATATTTTCTGCTGA
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CATCAAATTGCAATCCCTTTGGTTCTTGTTTTCCCCTACATTTGTCGTCTGTTGCAATGT
CTTCGAC

QA 2 728 2 728
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TGAGATTTCACTTGAAGAAGACAAACTACTTGGTTCTACTACAACCCATGATGTCTAGTT
TTTTT*CCTCTATTCCTATG
C

QA 1 740 1 740
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RD RR4AO22JQ 722 0 0
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CAGGTCGCAACAATTGCGTGGTTTGAAGCTGACGCTGTATGTGGCAGTCATCAAATTGCA
ATCCCTTTGGTTCTTGTTTTCCCCTACATTTGTCGTCTGTTGCAATGTTTTCGACAGTAC
AAGGATACAAAGGAAAAGTCATCTCTTTTAAATGCTTTGAAGTATTCGACAGCAGTGCCT
GTGACCTTTCTTTTTGCGCTTAAATACCACGTGATGCCTGAGAGCTGGACATCATTTTAC
CGACCTTTCTGGCTTTTTTCAAGTGTTATCAACTCACTCTACTCATTTTACTGGGATGTA
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GACAAACTACTTGGTTTTACTACAACCCATGATGTCTAGTTTTTTTTCCTCTAGTCCTAT
GG

QA 1 722 1 722
DS 

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G
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GCAATCCCTTTGGTT*TTGTTTTCCCCTACATTTGTCGTCTGTTGCAATGTCTTCGACAG
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TACCGACCTCTCTGGCTTTTCTCAAGTGTCATCAACTCACTCTACTCATTCTACTGGGAT
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TATG
C

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DS 

RD RR4F924TF 666 0 0
G
AGACAGGTCGCAACAATTGCGTGGTTTGAAGCTGACGCTGTATGTGGCAGTCATCAAATT
GCAATCCCTTTGGTT*TTGTTTTCCCCTACATTTGTCGTCTGTTGCAATGTCTTCGACAG
TACAAGGATACAAAGGAAAAGTCATCTCTTTTAAATGCTCTGAAGTATTCAACAGCAGTG
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AACATATCATATCTCTTATATGGCCGACAATGGGTGTATTTCTGGGTGATAGGGAGCAAT
CTGGTGCTGAGGTGCGCATGGACATATAAGTTATCGGCACATTTGAGGCACAACTACATA
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GAAGACAAACTACTTGGTTCTACTACAACCCATGATGTCTAGTTTTTTTTCCTCTAGTCC
TATG
C

QA 2 665 2 665
DS 



AS 1 5

CO CL1644Contig1 1354 5 5 U
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TCTCGTCCTCTTTTGTACTCCTAACGACTCTCCCGTTTGTAACATTATCATTCTCTACTC
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TATTTGTTCATGGTTTGTGTCACGTCCTCATCCGTCCTCTGGAATATATCACTGGAAAAC
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TATACTGGCCTCTACTAAACCGCTACATGGAAACATAAATACAAATGAGAAGGGACAGTC
TTGGGTTCGATTTGTTAACGTAGATATGACTAATAAGAAAAAGAGGGAAATAGAAAATAA
TTGTACTCGTGACCAGAAAGCATATGTGCATATCTCCCAACAGCACACCATGATTTTGGA
GATAGACGGTTATCTGAAATCAGCTTGCCTATCATCATCATCATCGTCGTCTCAACGACG
ACAGTTTAGTTGGGTTCTTGGTCGTGATAACGTTAAACGCAGTGCACCATTCTCGTCTCA
ACGAATCTTGAACCTTGTCATCCCTAACAAAAGGTGTCCAAGCTTCCTCTCCTGCTTTTG
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GGTGGCCGAGGCGGAGGAGGAGGAGGCTACTCTTTAGATTTTCTGCTGGATTCATTGCTT
CCTTGCCCTTCTAAATGGTCTGAATTGGAATCAGCTTTGTCTGGTTTCTTGCTTCCTTTC
TTAGAAATCCCATGTTCCAAGTAGTAGAGCACTTCGGTCCTGGATCGAAACTTACATCCT
GTGATTGGTTCATAATAGTACTTATCAACGGAACCAGCAGTAGCACCGGAGGTTCGAACT
TTGTCTTCAACTCTCCAACCAGGAGGCAACCAATTGTTGTCTTCCGGCGCCGCACGCTTC
CGCGACTGATCCGTACCGTTCGACATCTCCGATTCGTACGCTCTCTCCCCCTCAATCAAT
TTGCTCCCCTGAAGTAGGGAGTCGTTGGACAATTGATTACTCTACAGATCGATTATAGTG
GAGATGGAGAGATAAAACGTCGTTTGATCGACCC


BQ
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A

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CGAACGGCACACCCAAAACCACCCGAGAAACTAAATTGTCTGTCAAAAGGACAAATGATT
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4B881JQ U 32
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GAT

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AACAAGAATGGTGAGAGGAAGAACAACGCAGTAAAAACAAAATGTGACCCAATGTGCAAT
GACTTTCCTCACAAAGAAGAAGC
C

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CTTGGGAA
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CCCACGGAGTTTAGGATAGTGATGATGGAAGGGATATAAACGGAGCCCCAAATGGGAACT
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DS 



AS 1 6

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FY34TF U 46
AF RR4FC92TF U 11
AF RR4B204TF U 1
AF RR4FC92JQ C 410
AF RR4FY34JQ C 478
AF RR4B204JQ C 451
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BS 346 667 RR4B204TF
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BS 849 1214 RR4FC92JQ
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GG
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TTGCTGTTGGGTCCAGTAACCGTCAAGGTGGTTATCCTTGCCCATCGTTTAAGATCATTA
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GTGCTCG

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CTCGAGACTGCTAACTGTCCGCACATGCTCTTTTATGGACCACCAGGAACCGGGAAAACC
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TTCGATAT
GCAAA

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DS 

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ATTATATCAGCAGGATCATAGAGCCTCTTGCTTCAAGATGTGCCAAGTTCAGATTTAAAC
CACTTTCTGAAGAAGTCATGAGTAACCGTATCTTGCATATTTGTAATGAAGAAGGTCTCA
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GAATTTTGGTTTTGCTTTGAAACGGACATCTACGGTATGAATTGTCATAATGACACTTGT
CGAGTTATTATTATTTAATGTTGAC
AAGC

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GATGAGTACCTGCAGCTTCTGGACGTGGCAAGCAATACAATTACTGCACTCTCAGAAATG
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TATTATTTAATGTTGAC

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DS 

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TTGTCATAATGACACTTGTCGAGTTATTATTATTTAATGTTGACAAACAAAAAAAAACTT
GGGAGGTTACAACTGAAAAAAAGTTTGGGTAGT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 6

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TACACACTTTTTATCCATTCTTTTCAAATGTTTTTACCGTTCATACAAATGACCATCGTC
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TTCTTTATCAAGCCTTTTGATCGCTAAAGACGTTTTCCAAATTCCGATTTTACCCCTGAA
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AACGATCTCGCCGTAGCTGAACCGGACCAAAGTATAGCTACCGGAGAGATACTCTTCTCC
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TGGGTTTCGTGGATGAACAGACGCTCCTTCATAAAAACCCATTCTTTTTTTTTTCCTAAG
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TGCTTGATGGAAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCTTACCATGTTGGAAATACTCTGGAGCTAGATATCCGAATGTGCCTTTCACGGTTTTGC
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AAGGAAGGTGCTCCTCCTTTCATCTTCTCGAGCTCGGTTTGCGAGCAGAGACTGAATCTA
AACGAGGAGTGAACAGAGTGAGGG*TCATGGTTTATATTCTCCGGAGCTGTCTCCGCCAA
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AACAGACGCTCCTTCATAAAAACCCATTCTTTTTTTTTTCCTAAGTAAACAGATCTCAAG
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CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 2 6

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BQ
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AF RR4BA57JQ C 506
AF RR4B611TF U 1
AF RR4BA57TF U 1
AF RR4B611JQ C 581
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A
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ATATGTTCTTTTGCTTTGGCGTCAAATGAATCGACCGAAACTTCTCATTCTTATTGGGTG
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QA 1 772 1 772
DS 



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BQ
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AF RR4FY93TF U 1
AF RR4FY93JQ C 379
BS 1 569 RR4FY93TF
BS 570 898 RR4FY93JQ

RD RR4FY93TF 569 0 0
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AGATCGTGTAGTTTTATCTAAGAAAAGCC

QA 1 569 1 569
DS 

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CTCTATCCAACCAGCTTGAACAAGGCCCTCTTTGTGCCTATATCATTTTGGTATCAGAGC
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QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 6

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TCTCCATGGTGGATACTATGATTTTGTAAACTGTACATTTGAGAAATGGACTGTAGATTA
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ATCATCTTTGTCCACTGTAATGGGGATAAGATGCTTACAGTCAGTACTCAATACATTTGT
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RR4AX07TF U 1
AF RR4AX07JQ C 280
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RD RR4B194TF 778 0 0
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QA 1 778 1 778
DS 

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GG
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GAAACAGGGAAGACACCTGGACTGACTCAGGAAGCTACAATTGACAGAGAAGATAACGCT
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AACTTGGAACATTTCAAAAAACTGGCAGATGCTCAAGCTCCAAAGTTTCTGGTGATTGCT
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AGCCGGTGTGGAGGAATTCAAGCTTTGATGGGTATGCAAGACGAAGGAGATCCCAGAAGT
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QA 1 885 1 885
DS 

RD RR4AX07JQ 944 0 0
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TCTTTTGATTTTCTTGATATAATCATCTTTGTCCACTGTAATGGGGATAAGATGCTTACA
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DS 

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GT

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DS 

RD RR4B194JQ 775 0 0
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AACTGTACATTTGAGAAATGGACTGTAGATTATGGAGAAAGCAGAGGCAAGAAAGAAGGC
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QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 6

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ACCATTGTCTACGGTCGGAAACTCGAGGAACATAAAGTGGCATGAATGTCCTGTTGAGAA
AGTTGATAGACAGAGGTTGCTTGACCAGAAAGGATGTGTGATTTGGGTCACTGGTCTTAG
TGGTTCAGGGAAGAGCACTTTAGCTTGTGCTTTGAGCCAGAAACTCTTCCAAAAGGGAAA
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AGTTTGTGAGGCTAGGGATCCAAAGGGTCTGTACAAGCTTGCACGTGCTGGAAAGATTAA
AGGTTTTACCGGGATTGATGACCCTTACGAGCCACCATTGAACTGCGAGATTTCTCTAGG
AGAAGAGGGAATGGGAACTTCTCCAATCGAAATGGCTGAAACAGTCGTTGCATACTTAGA
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ATTTGTTGTTCCATGGTTTTAGTTTCTATTACACAAGCCAAGAGTACAAAATTGATAAAG
TTCATGGCTGTTAATTATGGAATCACATGTTTAAAAGAATAAATAAAATCTCCTAATTTT
TCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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T

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G

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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AV59TF U 1
AF RR4AX27TF U 1
AF RR4GO34JQ C 551
AF RR4GO34TF U 551
AF RR4AX27JQ C 404
AF RR4AV59JQ C 516
BS 1 759 RR4AV59TF
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BS 1216 1283 RR4AX27JQ

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AGCTGTCCAAACGCTGAGAAAATAATTTCAGATCATATTAAAAAGCATATCCATAATGGT
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GCTGAGGCTTCGAACAACATTCCCGGACCGACGAGTAACTTCACAACGTTACAACAACGT
TTCGCTAACCAAGGACTTAATCTCAAAGACCTTGTTCTACTCTCGGGGGCTCACACGATT
GGCGTCTCGCATTGTTCTTCCATGAGTGAACGTCTCTACAACTTCTCGACGACAGTGAAA
CAAGATCCATCTCTGGACAGCGAGTACGCAGCGAACATA

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DS 

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GGAAAGTATCTAATGAAGACGACGAATCGCTTCAATGTCATTGTTGCGGTTGCAGCGACT
GTTCTTATGGGAATGTTTGAGTCATCCGATGCTCAGCTTCAAATGAATTTCTACGCCAAA
AGCTGTCCAAACGCTGAGAAAATAATTTCAGATCATATTAAAAAGCATATCCATAATGGT
CCTTCTCTTGCAGCTCCTCTCATCAGAATGCATTTCCATGATTGCTTCGTCAGGGGATGC
GACGGATCAGTGTTGATAAATTCAACATCTGGAAACGCAGAGAGAGATGCACCACCAAAT
CTAGCACTCAGAGGATTCGGTTTCGTGGAGAGGATTAAAAGTCTTCTTGAAGCAGAGTGT
CCTAAGACTGTTTCATGCGCTGATATCATCGCTTTGACCGCTCGAGACTCAGTTGTTGCT
ACCGGAGGTCCTTGGTGGAGAGTTCCAACCGGAAGAAGAGACGGTAGGATCTCAAATTTG
GCTGAGGCTTCGAACAACATTCCCGGACCGACGAGTAACTTCACAACGTTACAACAACGT
TTCGCTAACCAAGGACTTAATCTCAAAGACCTTGTTCTACTCTCGGGGGCTCACACGATT
GGCGTCTCGCATTGTTCTTCCATGAGTGAACGTCTCTACAACTTCTCGACGACAGTGAAA
CAAGATCCATCTCTGGACAGCGAGTACGCAGCGAACATAAAAGGCCAACAAATGTAAGAG
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DS 

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G
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TTGTTCTTCCATGAGTGAACGTCTCTACAACTTCTCGACGACAGTGAAACAAGATCCATC
TCTGGACAGCGAGTACGCAGCGAACATAAA*GGCCAACAAATGTAAGAGCCTCACCGACA
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TGCTTGTCTTGAAGAGGAGAGGTCTCTTTCAGTCTGATTCTGCTTTGACAAAGAACTCAG
CCACGTTGAAGATGGTCAACGATTTGGTCAACGGTTCTGAAAAGAAGTTCTACAGGGCTT
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TTCTGTTTTTTTTTTTTAATTGTGCATTGTTGTGTTTTGAGTCTTGGGGGTAAAGCCGTA
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AAAAATATATGTTTGTGGTTCTA
CT

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DS 

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G
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AGGACTTAATCTCAAAGACCTTGTTCTACTCTCGGGGGCTCACACGATTGGCGTCTCGCA
TTGTTCTTCCATGAGTGAACGTCTCTACAACTTCTCGACGACAGTGAAACAAGATCCATC
TCTGGACAGCGAGTACGCAGCGAACATAAA*GGCCAACAAATGTAAGAGCCTCACCGACA
ACACCACCATCCTTGAGATGGACCCCGGTAGCAGTAGAAGCTTCGATCTCAGTTACTACA
TGCTTGTCTTGAAGAGGAGAGGTCTCTTTCAGTCTGATTCTGCTTTGACAAAGAACTCAG
CCACGTTGAAGATGGTCAACGATTTGGTCAACGGTTCTGAAAAGAAGTTCTACAGGGCTT
TCGCCAAGTCAATGGAGAAGATGGGGAGAGTTAAAGTGAAGACGGGCTCAGCCGGTGTGA
TCAGGACCCGTTGTTCCGTTGCCGGAAGTTAGTTAGCCTGATTGGAAAAATGATGTAATG
TTCTGTTTTTTTTTTTTAATTGTGCATTGTTGTGTTTTGAGTCTTGGGGGTAAAGCCGTA
AGGGTGTTGTTAATTTGATTTTAATCTTATTCCATTTGCCATTTGGGTTTATGTACCCAA
AAAA

QA 2 665 2 665
DS 

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GTAGGATCTCAAATTTGGCTGAGGCTTCGAACAACATTCCCGGACCGACGAGTAACTTCA
CAACGTTACAACAACGTTTCGCTAACCAAGGACTTAATCTCAAAGACCTTGTTCTACTCT
CGGGGGCTCACACGATTGGCGTCTCGCATTGTTCTTCCATGAGTGAACGTCTCTACAACT
TCTCGACGACAGTGAAACAAGATCCATCTCTGGACAGCGAGTACGCAGCGAACATAAA*G
GCCAACAAATGTAAGAGCCTCACCGACAACACCACCATCCTTGAGATGGACCCCGGTAGC
AGTAGAAGCTTCGATTTCAGTTACTACAGGCTTGTCTTGAAGAGGAGAGGTCTCTTTCAG
TCTGATTCTGCTTTGACAAAGAACTCAGCCACGTTGAAGATGGTCAACGATTTGGTCAAC
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TTAGCCTGATTGGAAAAATGATGTAATGTTCTGTTTTTTTTTTT*AATTGTGCATTGTTG
TGTTTTGAGTCTTGGGGGTAAAGCCGTAAGGGTGTTGTTAATTTGATTTTAATCTTATTC
CATTTGCCATTTGGGTTTATGTACCCAAAAAAATATATGTTTGTGGTTCTATTAAAATAT
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DS 

RD RR4AV59JQ 768 0 0
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TCTACTCTCGGGGGCTCACACGATTGGCGTCTCGCATTGTTCTTCCATGAGTGAACGTCT
CTACAACTTCTCGACGACAGTGAAACAAGATCCATCTCTGGACAGCGAGTACGCAGCGAA
CATAAA*GGCCAACAAATGTAAGAGCCTCACCGACAACACCACCATCCTTGAGATGGACC
CCGGTAGCAGTAGAAGCTTCGATCTCAGTTACTACAGGCTTGTCTTGAAGAGGAGAGGTC
TCTTTCAGTCTGATTCTGCTTTGACAAAGAACTCAGCCACGTTGAAGATGGTCAACGATT
TGGTCAACGGTTCTGAAAAGAAGTTCTACAAGGCTTTCGCCAAGTCAATGGAGAAGATGG
GGAGAGTTAAAGTGAAGACGGGCTCAGCCGGTGTGATCAGGACTCGTTGTTCCGTTGCCG
GAAGTTAGTTAGCCTGATTGGAAAAATGATGTAATGTTCTGTTTTTTTTTTT*AATTGTG
CATTGTTGTGTTTTGAGTCTTGGGGGTAAAGCCGTAAGGGTGTTGTTAATTTGATTTTAA
TCTTATTCCATTTGCCATTTGGGTTTATGTACCCAAAAAAATATATGTTTGTGGTTCTAT
TAAAATATGAATCATAATAAGATTTACAATAATTGCAATTGAAGGTAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 6

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ACAAGAGCGTGTTACACGAGTAGCTCAAGCTTCTAAAGGTCCAGTCATTCTTGTGCTTAT
GAGTGGTGGCCCCATCGATGTTACCTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTTGCTGCCATCAT
CTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCTGGTGGAGCTGCTATCGCCAATATAATCTTTGGTGC
TGTTAACCCTGGAGGAAAACTACCTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGT
GCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATT
CTACAAAGGTCCAGTTGTGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCA
CAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGC
CATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCC
AAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGT
GTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATT
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TGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGGAGGAGGATCCCAATGGG
*TGAACATAAACTGCATATCGGTGATCTTAAACATACTATTTT*GGTTCAACCGCAACTT
TAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACAAATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTT
TCCTCTTATTTACATGTTACATTATATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAGAAATTAC
TCAAGAAATGGTTCAATCCAACATGAGAAGCACCAAAGGGTCGCTTCTTGGATTTGTATG
TTTTATTTCTTCTACTTTTTTCGTCACC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY30TF U 1
AF RR4EZ52TF U 1
AF RR4EZ52JQ C 141
AF RR4CY30JQ C 255
AF RR4BE38TF U 183
AF RR4BE38JQ C 271
BS 1 68 RR4CY30TF
BS 69 69 RR4EZ52TF
BS 70 574 RR4CY30TF
BS 575 575 RR4EZ52TF
BS 576 587 RR4CY30TF
BS 588 588 RR4EZ52TF
BS 589 597 RR4CY30TF
BS 598 598 RR4EZ52TF
BS 599 626 RR4CY30TF
BS 627 627 RR4BE38TF
BS 628 694 RR4EZ52TF
BS 695 780 RR4BE38TF
BS 781 781 RR4EZ52JQ
BS 782 823 RR4BE38TF
BS 824 824 RR4EZ52JQ
BS 825 955 RR4BE38TF
BS 956 956 RR4BE38JQ
BS 957 992 RR4BE38TF
BS 993 1048 RR4BE38JQ

RD RR4CY30TF 632 0 0
GGGCCAGTCGATAGAGGCCGAGACACGAGATCGAACCGGGTTGCTGTTACCAGGTTACCA
ACAAGAGCTTGTTACACGAGTAGCTCAAGCTTCTAAAGGTCCAGTCATTCTTGTGCTTAT
GAGTGGTGGCCCCATCGATGTTACCTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTTGCTGCCATCAT
CTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCTGGTGGAGCTGCTATCGCCAATATAATCTTTGGTGC
TGTTAACCCTGGAGGAAAACTACCTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGT
GCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATT
CTACAAAGGTCCAGTTGTGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCA
CAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGC
CATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCC
AAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACACGTGAATTCGACG*AACCCACACAGT
GTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAA
CGGGAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4EZ52TF 696 0 0
GGGCCAGTCGATAGAGGCCGAGACACGAGATCGAACCGGGTTGCTGTTACCAGGTTACCA
ACAAGAGCGTGTTACACGAGTAGCTCAAGCTTCTAAAGGTCCAGTCATTCTTGTGCTTAT
GAGTGGTGGCCCCATCGATGTTACCTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTTGCTGCCATCAT
CTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCTGGTGGAGCTGCTATCGCCAATATAATCTTTGGTGC
TGTTAACCCTGGAGGAAAACTACCTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGT
GCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATT
CTACAAAGGTCCAGTTGTGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCA
CAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGC
CATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCC
AAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGT
GTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAA*CGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATT
GATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACGGCAGGG
CA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4EZ52JQ 813 0 0
GTTA
CTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTTGCTGCCATCATCTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGC
TGGTGGAGCTGCTATCGCCAATATAATCTTTGGTGCTGTTAACCCTGGAGGAAAACTACC
TATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGTGCCAATGACGATAATGGCTATGAG
AGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTTGTGTTTCC
ATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGC
CCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGCCATTTTCAACTCGTCATCTGATTC
CATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGT
ATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAA
AAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGT
CACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGT
AGTAGATGAGTATGGAAGGAGGAGGATCCCAATGGG*TGAACATAAACTGCATATCGGTG
ATCTTAAACATACTATTTT*GGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGC
AACAAATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGTTACATTA
TATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAG

QA 5 813 5 813
DS 

RD RR4CY30JQ 699 0 0
AGGAAACTA
CTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGTGCCAATGACGATAATGGCTATGA
GAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTTGTGTTTC
CATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAG
CCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGCCATTTTCAACTCGTCATCTGATT
CCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAG
TATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGA
AAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATG
TCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTG
TAGTAGATGAGTATGGAAGGAGGAGGATCCCAATGGG*TGAACATAAACTGCATATCGGT
GATCTTAAACATACTATTTT*GGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAG
CAACAAATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGCTACATT
ATATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAG

QA 10 699 10 699
DS 

RD RR4BE38TF 810 0 0
GGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCTGGTGGAGCTGCTATCGCCAATATAATCTTTGGTGCTG
TTAACCCTGGAGGAAAACTGCCTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGTGC
CAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCT
ACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACA
GTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGCCA
TTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAA
AAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGT
TCGTCTTTGCCGAGCCGCCAAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGA
TAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTG
ATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGGAGGAGGATCCCAATGGGGT
GAACATAAACTGCATATCGGTGATCTTAAACATACTATTTTTGGTTCAACCGCAACTTTA
AAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACAAATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTC
CTCTTATTTACATGTTACATTATATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAGAA*TTACTC
AAGAAATGGTTCAATCCAACATGAGAAGCA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4BE38JQ 778 0 0
ATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGTGCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATA
TGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGG
GTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACT
ATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGCCATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAA
AGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAA
CACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCAAAAAACGG
GATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACGGC
AGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTAGA
TGAGTATGGAAGGAGGAGGATCCCAATGGG*TGAACATAAACTGCATATCGGTGATCTTA
AACATACTATTTT*GGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACAAA
TAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGTTACATTATATATA
GAGAGATAGGTTATTTTCTTGAGAAATTACTCAAGAAATGGTTCAATCCAACATGAGAAG
CACCAAAGGGTCGCTTCTTGGATTTGTATGTTTTATTTCTTCTACTTTTTTCGTCACC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 2 6

CO CL1653Contig1 631 2 3 U
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TGATAAAATAAGAAAATTTACAAGAATTTCAACGTCGTCCAAAACACACTATGCTACAAA
TGTTATTATTCTTATTCTCCTCTCCATCATCACCTTCTTTGGAAGTTGAGGAACTTGATT
CCATAAGCAAAGACAAAGACAAACAGCAGTATCCATCCAATGTGGACAGCAGCTACAACT
GGCAAGAAGTCATGTTCGAACCCGAACCCATCTTTCAGCAACGTTCTGAGGCTCGTGTCT
CCAACACCAGCGATCTGCACCGTCGCATCTTTGTCTCCTACTTGAGAAGTGATGATCCCG
TACAACGTCCATGCCACTGGTGTTGCCCAGTAGTACCATCTCCACCATATCGGTATTTGC
GGTCTTGGGATGAGGAAACCGGAAAAAAAATTCCAGAAACTGAGGAAAAAGGACATGCAG
ATCCCAGCTATTTGATAGTTTGGTGTCAAGGCCACAAGCATCATACCGTATAGAGTGAAG
TAGATGAAGCTTGTCAACATGTAGTAGTAGAACCACAAGAACCTTGCCACGGTCCAGTCA
TATCCAATCATCGAGTAAAGGATTAGCGTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ82JQ U 1
AF RR4BH79JQ U 1
BS 1 151 RR4BH79JQ
BS 152 152 RR4BJ82JQ
BS 153 631 RR4BH79JQ

RD RR4BJ82JQ 446 0 0
GCATAATTTGGTAACGTAAGCTGTTAAAATTGTTGTTAACTGACCAAATAAAAACCAATA
TGATAAAATAAGAAAATTTACAAGAATTTCAACGTCGTCCAAAACACACTATGCTACAAA
TGTTATTATTCTTATTCTCCTCTCCATCATCACCTTCTTTGGAAGTTGAGGAACTTGATT
CCATAAGCAAAGACAAAGACAAACAGCAGTATCCATCCAATGTGGACAGCAGCTACAACT
GGCAAGAAGTCATGTTCGAACCCGAACCCATCTTTCAGCAACGTTCTGAGGCTCGTGTCT
CCAACACCAGCGATCTGCACCGTCGCATCTTTGTCTCCTACTTGAGATGTGATGATCCCG
TACAACGTCCATGCCACTGGTGTTGCCCAGTAGTACCATCTCCACCATATCGGTATTTGC
GGTCTTGGGATGAGGAAACCGGAGAA

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4BH79JQ 631 0 0
GCATAATTTGGTAACGTAAGCTGTTAAAATTGTTGTTAACTGACCAAATAAAAACCAATA
TGATAAAATAAGAAAATTTACAAGAATTTCAACGTCGTCCAAAACACACTATGCTACAAA
TGTTATTATTCTTATTCTCCTCTCCATCATCCCCTTCTTTGGAAGTTGAGGAACTTGATT
CCATAAGCAAAGACAAAGACAAACAGCAGTATCCATCCAATGTGGACAGCAGCTACAACT
GGCAAGAAGTCATGTTCGAACCCGAACCCATCTTTCAGCAACGTTCTGAGGCTCGTGTCT
CCAACACCAGCGATCTGCACCGTCGCATCTTTGTCTCCTACTTGAGAAGTGATGATCCCG
TACAACGTCCATGCCACTGGTGTTGCCCAGTAGTACCATCTCCACCATATCGGTATTTGC
GGTCTTGGGATGAGGAAACCGGAAAAAAAATTCCAGAAACTGAGGAAAAAGGACATGCAG
ATCCCAGCTATTTGATAGTTTGGTGTCAAGGCCACAAGCATCATACCGTATAGAGTGAAG
TAGATGAAGCTTGTCAACATGTAGTAGTAGAACCACAAGAACCTTGCCACGGTCCAGTCA
TATCCAATCATCGAGTAAAGGATTAGCGTGT

QA 1 631 1 631
DS 



CO CL1653Contig2 928 4 11 U
GGAACGAAAATTGAGAAAGAGCAAGACCTAAATAACTTCTTTGGAGCTATGTTCGCCGCG
GTATTGTTCCTCGGTGCCACCAATGCTGCAACAGTTCAACCAGCAATAGCCATTGAGAGA
ACTGTGTTCTACCGTGAGAAAGCAGCTGGAATGTACTCAGCCATACCCTATGCAATCTCT
CAGGTAGCGGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACAGCAGTCTACACGCTAATCCTT
TACTCGATGATTGGATATGACTGGACCGTGGCAAGGTTCTTGTGGTTCTACTACTACATG
TTGACAAGCTTCATCTACTTCACTCTATACGGTATGATGCTTGTGGCCTTGACACCAAAC
TATCAAATAGCTGGGATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTCTGGAATCTCTTCTCCGGT
CTCCTCATCCCAAGACCGCAAATACCGATATGGTGGAGATGGTACTACTGGGCAACACCA
GTGGCATGGACGTTGTACGGGATCATCACATCTCAAGTAGGAGACAAAGATGCGACGGTT
CAGATCGCTGGTGTTGGAGACACGAGCCTCAGAACGTTGCTGAAAGATGGGTTCGGGTTC
GAACATGACTTCTTGCCAGTTGTAGCTGCTGTCCACATCGGATGGATACTGCTGTTTGTC
TTTGTCTTTGCTTATGGAATAAAGTTCCTCAACTTCCAAAGAAAGTGATGATGGAGGAGA
AGAAGAATAAGAATAACATTTGTAGCATAGTGTGTTTTGGACGTTGTTGAAATTCATGTA
AATTTTCTTATTTTATCATATTGGTTTTGGTTTTTATTTGGTCAGTTAACAATAATTTTA
ACAGCTTACGTTACCAAATTATGCTTTTGATCTATGGAATATTATTTATTTTTTTTCAAA
AAACTATATATGCACTACCACTGAATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH79TF U 1
AF RR4BJ82TF U 1
AF RR4BH95TF U 46
AF RR4BH95JQ C 380
BS 1 420 RR4BH79TF
BS 421 421 RR4BH95TF
BS 422 539 RR4BH79TF
BS 540 540 RR4BH95TF
BS 541 638 RR4BH79TF
BS 639 639 RR4BH95TF
BS 640 680 RR4BH79TF
BS 681 681 RR4BH95TF
BS 682 702 RR4BH79TF
BS 703 807 RR4BH95TF
BS 808 928 RR4BH95JQ

RD RR4BH79TF 702 0 0
GGAACGAAAATTGAGAAAGAGCAAGACCTAAATAACTTCTTTGGAGCTATGTTCGCCGCG
GTATTGTTCCTCGGTGCCACCAATGCTGCAACAGTTCAACCAGCAATAGCCATTGAGAGA
ACTGTGTTCTACCGTGAGAAAGCAGCTGGAATGTACTCAGCCATACCCTATGCAATCTCT
CAGGTAGCGGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACAGCAGTCTACACGCTAATCCTT
TACTCGATGATTGGATATGACTGGACCGTGGCAAGGTTCTTGTGGTTCTACTACTACATG
TTGACAAGCTTCATCTACTTCACTCTATACGGTATGATGCTTGTGGCCTTGACACCAAAC
TATCAAATAGCTGGGATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTCTGGAATCTCTTCTCCGGT
TTCCTCATCCCAAGACCGCAAATACCGATATGGTGGAGATGGTACTACTGGGCAACACCA
GTGGCATGGACGTTGTACGGGATCATCACATCTCAAGTAGGAGACAAAGATGCGACGGTG
CAGATCGCTGGTGTTGGAGACACGAGCCTCAGAACGTTGCTGAAAGATGGGTTCGGGTTC
GAACATGACTTCTTGCCAGTTGTAGCTGCTGTCCACATTGGATGGATACTGCTGTTTGTC
TTTGTCTTTGCTTATGGAATCAAGTTCCTCAACTTCCAAAGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BJ82TF 698 0 0
GGAACGAAAATTGAGAAAGAGCAAGACCTAAATAACTTCTTTGGAGCTATGTTCGCCGCG
GTATTGTTCCTCGGTGCCACCAATGCTGCAACAGTTCAACCAGCAATAGCCATTGAGAGA
ACTGTGTTCTACCGTGAGAAAGCAGCTGGAATGTACTCAGCCATACCCTATGCAATCTCT
CAGGTAGCGGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACAGCAGTCTACACGCTAATCCTT
TACTCGATGATTGGATATGACTGGACCGTGGCAAGGTTCTTGTGGTTCTACTACTACATG
TTGACAAGCTTCATCTACTTCACTCTATACGGTATGATGCTTGTGGCCTTGACACCAAAC
TATCAAATAGCTGGGATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTCTGGAATCTCTTCTCCGGT
TTCCTCATCCCAAGACCGCAAATACCGATATGGTGGAGATGGTACTACTGGGCAACACCA
GTGGCATGGACGTTGTACGGGATCATCACATCTCAAGTAGGAGACAAAGATGCGACGGTG
CAGATCGCTGGTGTTGGAGACACGAGCCTCAGAACGTTGCTGAAAGATGGGTTCGGGTTC
GAACATGACTTCTTGCCAGTTGTAGCTGCTGTCCACATTGGATGGATACTGCTGTTTGTC
TTTGTCTTTGCTTATGGAATCAAGTTCCTCAACTTCCA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4BH95TF 762 0 0
GCTATGTTCGCTGCGGTACTTTTCCTCGGTGCCACCAATGCTGCAACAGTTCAACCAGCA
ATAGCCATTGAGAGAACTGTGTTCTACCGTGAGAAAGCAGCTGGAATGTACTCAGCCATA
CCCTATGCAATCTCTCAGGTAGCGGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACAGCAGTC
TACACGCTAATCCTTTACTCGATGATTGGATATGACTGGACCGTGGCAAGGTTCTTGTGG
TTCTACTACTACATGTTGACAAGCTTCATCTACTTCACTCTATACGGTATGATGCTTGTG
GCCTTGACACCAAACTATCAAATAGCTGGGATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTCTGG
AATCTCTTCTCCGGTCTCCTCATCCCAAGACCGCAAATACCGATATGGTGGAGATGGTAC
TACTGGGCAACACCAGTGGCATGGACGTTGTACGGGATCATCACATCTCAAGTAGGAGAC
AAAGATGCGACGGTTCAGATCGCTGGTGTTGGAGACACGAGCCTCAGAACGTTGCTGAA*
GATGGGTTCGGGTTCGAACATGACTTCTTGCCAGTTGTAGCTGCTGTCCACATCGGATGG
ATACTGCTGTTTGTCTTTGTCTTTGCTTATGGAATAAAGTTCCTCAACTTCCAAAGAAAG
TGATGATGGAGGAGAAGAAGAATAAGAATAACATTTGTAGCATAGTGTGTTTTGGACGTT
GTTGAAATTCATGTAAATTTTCTTATTTTATCATATTGGTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BH95JQ 549 0 0
GCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTCTGGAATCTCTTCTCCGGTCTCCTCATCCCAAGACCGC
AAATACCGATATGGTGGAGATGGTACTACTGGGCAACACCAGTGGCATGGACGTTGTACG
GGATCATCACATCTCAAGTAGGAGACAAAGATGCGACGGTTCAGATCGCTGGTGTTGGAG
ACACGAGCCTCAGAACGTTGCTGAAAGATGGGTTCGGGTTCGAACATGACTTCTTGCCAG
TTGTAGCTGCTGTCCACATCGGATGGATACTGCTGTTTGTCTTTGTCTTTGCTTATGGAA
TAAAGTTCCTCAACTTCCAAAGAAGGTGATGATGGAGGAGAAGAAGAATAAGAATAACAT
TTGTAGCATAGTGTGTTTTGGACGTTGTTGAAATTCATGTAAATTTTCTTATTTTATCAT
ATTGGTTTTGGTTTTTATTTGGTCAGTTAACAATAATTTTAACAGCTTACGTTACCAAAT
TATGCTTTTGATCTATGGAATATTATTTATTTTTTTTCAAAAAACTATATATGCACTACC
ACTGAATGC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 5

CO CL1654Contig1 891 5 12 U
GGAAGAAGCAAACTAACAGTGAGCTAAAAAAAAAAGAGACGATGGCGGAGAGATCAGAGG
AAGTGAAGCTACTGGGGATGTAGGCGAGTCCTTTCAGCCGCAGGGTCGAGATAGCTCTCA
CCCTCAAAGGCGTACCATACGAGTTCTCTGAGCAAGATATCGTCAACAAGAGCCCTCTGC
TACTCCAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCGGTTCTTCTCCATAACGGTAAACCAA
TCTCAGAATCACTCGTGATCCTTGAGTACATCGATGATACATGGCAGAACAATCCCATCC
TGCCTCAAGGTCCGTACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGAAGATTCGTCGATGAAC
AGATCTATGTAACGGCGATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGG
TGGAAGCGACTAGAGATTTATTGAAGTTGTTGGAGAAAGAGCTTGTTGGGAAAGATTTTC
TCGGTGGGGAAAGGTTAGGGTTCGTGGACATAGTTGCAACGTTGGTGGCGTTTTGGCTGA
TGAGAACGGAAGAGGTGGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAGATGTTCCC*AGAGATT
CACAGATGGGTTAAGAATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATC*CCTCCTGA
AGATGAACATCTCAACTACATTAGAGCTCGCATGGATCGCCTCAAACTCAAATCTGTTTG
ATAACCATATATATATATAAATTCAATAAATCAAATAAACTATTTGTTATTAGTTTGTAT
CTTGTTATATGTTGTTGAAATAACATTGCCAGTTCTTATGTTGTGTAAGAGTTTTTTTTT
TT*CGGTCACTTATATGTATATTTACTCTATTCAACTTGAACTGTTACAGG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4FG49TF U 2
AF RR4A205TF U 579
AF RR4A205TFB U 1
AF RR4A205JQD C 98
AF RR4A205JQ C 182
BS 1 33 RR4A205TFB
BS 34 37 RR4FG49TF
BS 38 81 RR4A205TFB
BS 82 82 RR4FG49TF
BS 83 101 RR4A205TFB
BS 102 102 RR4FG49TF
BS 103 103 RR4A205TFB
BS 104 104 RR4FG49TF
BS 105 842 RR4A205TFB
BS 843 843 RR4A205JQD
BS 844 871 RR4A205TFB
BS 872 891 RR4A205JQD

RD RR4FG49TF 662 0 0
GG
AGAAGCAAACTAACAGTGAGCTAAAAAAAAAAGAGACGATGGCGGAGAGATCAGAGGAAG
TGAAGCTACTGGGGATGTAGGCGAGTCCTTTCAGCCGTAGGGTCGAGATAGCTCTCACCC
TCAAAGGCGTACCATACGAGTTCTCTGAGCAAGATATCGCCAACAAGAGCCCCCTGCTAC
TCCAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCGGTTCTTCTCCATAACGGTAAACCAATCT
CAGAATCGCTCGTGATCCTTGAGCATATCGATGGTACATGGCAGAATAATCCCATCCTGC
CTCAAGATCCATACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGAAGATTCGTCGATGAACAGA
TCTATGTAGCGGCGATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGGTGG
AATCGACTAGAGATTTATTGAAGTTGCTGGAGAAAGAGCTTGTCGGGAAAGATTTTCTCG
GTGGGGAAAGGTTAGGGTTCGTGGACATAGTTGCAACTTTGGTGGCGTTTTGGCTGATGA
GAACGGAAGAGGTGGTTGGAGTCAAGATTGTTACTATAGAGATGTTCCC*AGAGATTCAC
AGATGGGTTAAGAATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATC*CCTCCTGAAGA

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR4A205TF 187 0 0
TG
GGAGATGTTCCCCAGAGATTCACAGATGGGTTAAGAATCTTTTGGACGTTGATGTCATCA
AGAAATGTATCTCCTCCTGAAGATGAACATCTCAACTACATTAGAGCTCGCATGGATCGC
CTCAAACTCAAATCTGTTTGATAACCATATATATATATAAATTCAATAAATCAAATAAAC
TATTT

QA 3 187 3 187
DS 

RD RR4A205TFB 871 0 0
GGAAGAAGCAAACTAACAGTGAGCTAAAAAAAA****GACGATGGCGGAGAGATCAGAGG
AAGTGAAGCTACTGGGGATGTGGGCGAGTCCTTTCAGCCGCCGTGTCGAGATAGCTCTCA
CCCTCAAAGGCGTACCATACGAGTTCTCTGAGCAAGATATCGTCAACAAGAGCCCTCTGC
TACTCCAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCGGTTCTTCTCCATAACGGTAAACCAA
TCTCAGAATCACTCGTGATCCTTGAGTACATCGATGATACATGGCAGAACAATCCCATCC
TGCCTCAAGGTCCGTACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGAAGATTCGTCGATGAAC
AGATCTATGTAACGGCGATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGG
TGGAAGCGACTAGAGATTTATTGAAGTTGTTGGAGAAAGAGCTTGTTGGGAAAGATTTTC
TCGGTGGGGAAAGGTTAGGGTTCGTGGACATAGTTGCAACGTTGGTGGCGTTTTGGCTGA
TGAGAACGGAAGAGGTGGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAGATGTTCCC*AGAGATT
CACAGATGGGTTAAGAATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATC*CCTCCTGA
AGATGAACATCTCAACTACATTAGAGCTCGCATGGATCGCCTCAAACTCAAATCTGTTTG
ATAACCATATATATATATAAATTCAATAAATCAAATAAACTATTTGTTATTAGTTTGTAT
CTTGTTATATGTTGTTGAAATAACATTGCCAGTTCTTATGTTGTGTAAGAGTTTTTTTTT
TTTCGGTCACTTATATGTATATTTACTCTAT

QA 1 871 1 871
DS 

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CCGCCGT
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AACAAGAGCCCTCTGCTACTCCAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCGGTTCTTCTC
CATAACGGTAAACCAATCTCAGAATCACTCGTGATCCTTGAGTACATCGATGATACATGG
CAGAACAATCCCATCCTGCCTCAAGGTCCGTACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGA
AGATTCGTCGATGAACAGATCTATGTAACGGCGATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAA
GAAAAAGACGCGGCGGTGGAAGCGACTAGAGATTTATTGAAGTTGTTGGAGAAAGAGCTT
GTTGGGAAAGATTTTCTCGGTGGGGAAAGGTTAGGGTTCGTGGACATAGTTGCAACGTTG
GTGGCGTTTTGGCTGATGAGAACGGAAGAGGTGGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAG
ATGTTCCC*AGAGATTCACAGATGGGTTAAGAATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAA
ATGTATC*CCTCCTGAAGATGAACATCTCAACTACATTAGAGCTCGCATGGATCGCCTCA
AACTCAAATCTGTTTGATAACCATATATATATATAAATTCAATAAATCAAATAAACTATT
TGTTATTAGTTTGTATCTTGTTATATGTTGTTGAAATAACATTGCCAGTTCTTATGTTGT
GTAAGAGTTTTTTTTTTT*CGGTCACTTATATGTATATTTACTCTATTCAACTTGAACTG
TTACAGG

QA 8 794 8 794
DS 

RD RR4A205JQ 710 0 0
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CTCAGAATCACTCGTGATCCTTGAGTACATCGATGATACATGGCAGAACAATCCCATCCT
GCCTCAAGGTCCGTACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGAAGATTTGTCGATGAACA
GATCTATGTAACGGCGATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGGT
GGAAGCGACTAGAGATTTATTGAAGTTGTTGGAGAAAGAGCTTGTTGGGAAAGATTTTCT
CGGTGGGGAAAGGTTAGGGTTCGTGGACATAGTTGCAACGTTGGTGGCGTTTTGGCTGAT
GAGAACGGAAGAGGTGGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAGATGTTCCC*AGAGATTC
ACAGATGGGTTAAGAATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATC*CCTCCTGAA
GATGAACATCTCAACTACATTAGAGCTCGCATGGATCGCCTCAAACTCAAATCTGTTTGA
TAACCATATATATATATAAATTCAATAAATCAAATAAACTATTTGTTATTAGTTTGTATC
TTGTTATATGTTGTTGAAATAACATTGCCAGTTCTTATGTTGTGTAAGAGTTTTTTTTTT
T*CGGTCACTTATATGTATATTTACTCTATTCAACTTGAACTGTTACAGG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 6

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GGATTCATCTCAGATTATTACTTTGATCATTTCACATTCTCATAAAACCTAGCAAACGTT
TTCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTGGTTCATGAGCAAGATGTGCCA
AAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGATGTTACGGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTG
GGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGGGACCATCGACTCTGAGTTTGAACATAAG
GTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAGAAGAAGCAT
AGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTTCTACA
ACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCTGAAG
GAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCA
CCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAG
AAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAA
AAGGAATCTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCT
TTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTTCAGTTTCCCTATTA
TTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCAAGATGTTTTAATGTTATAAATGTTTTT
TTTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DP19TF U 1
AF RR4EN34TF U 1
AF RR4C932TF U 11
AF RR4EN34JQ C 2
AF RR4DP19JQ C 27
AF RR4C932JQ C 336
BS 1 14 RR4DP19TF
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BS 16 52 RR4DP19TF
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BS 54 129 RR4DP19TF
BS 130 130 RR4EN34TF
BS 131 609 RR4DP19TF
BS 610 610 RR4EN34TF
BS 611 648 RR4DP19TF
BS 649 657 RR4EN34TF
BS 658 658 RR4EN34JQ
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BS 674 737 RR4EN34TF
BS 738 827 RR4EN34JQ
BS 828 844 RR4C932JQ

RD RR4DP19TF 652 0 0
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CCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAG
AAGATCAAG*AGAAGCTTCCAGGTTACCATCCCAAGACCGTAGATGAG
TGAA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EN34TF 737 0 0
G
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TCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTGGTTCATGAGCAAGATGTGCCAA
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GGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGGGACCATCGACTCTGAGTTTGAACATAAGG
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TTGTGTTGTTTTAAGT

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR4C932TF 730 0 0
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GTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCAGGA
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AAGTTTGC

QA 6 722 6 722
DS 

RD RR4EN34JQ 826 0 0
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TCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTGGTTCATGAGCAAGATGTGCCAA
AGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGATGTTACGGATCGTGGACT**TCGATTTCTTGG
GGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGGGACCATCGACTCTGAGTTTGAACATAAGG
TTCATATCTCAGAACCGGTGGTGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAGAAGAAGCATA
GTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAG
GTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTTCTACAA
CTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCTGAAGG
AGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCAC
CGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAGA
AGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAAA
AGGAATCTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTT
TTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTTCAGTTTCCCTATTAT
TCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCAAGATGTTTTAATGT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4DP19JQ 804 0 0
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AACCAAGAACGTGGTTCATGAGCAAGATGTGCCAAAGGTAACGTCCGAGGAATCATCAGC
CGATGTTACGGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACC
AGAGGGGACCATCGACTCTGAGTTTGAACATAAGGTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGCC
TGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAGAAGAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAG
CGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAA
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CGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAA
GCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGA
AGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTTA
CCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAAAAGGAATCTGATTAATGATGATGGTG
TGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCT
TTTATGTTGTTCCTTTTTTTCAGTTTCCCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATAT
GATATCAAGATGTTTTAATGT
TAT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4C932JQ 509 0 0
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GAAAGGGTTTATGGACAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGA
TGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCC
GGCGGAGAAGAAGGGGATTTTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTTACCATCCCAA
GACCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAAAAGGAATTTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGT
GATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGCTGGCTTTTATGTTG
TTCCTTTTTTTCAGTTTCCCTATTATTCTGTTTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCAAG
ATGTTTTAATGTTATAAATGTTTTTTTTT

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 4

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TTGTTCTTTTATCACAATTGAGTTAATTTTCATTAACTTGCTCTAACGGTTCGGTCAGAA
TCAAGATTCTAGCTTAGCTCGTTTGAAGGAGGGAAGGAAAAGATAAGAAAAGAAAAAAAT
GGTGATGGCTTGTGATGATCTTAAACAACAATCTTTGAAAGCTGCCGCTGATTCTTCTTC
TGTACCGATCCCTCCACCTCTTCCCTCAAAATCTGATGGGAACCAGAAAAGATACGGCAA
CGATGTAGCTCCATGGCTCAACCATAGCTGCGTTCCTACAGAAACAAGAGATGTGTGGGA
TCGTCTTTTCAACGAAGGATACAAAGCTGATGTTGTCATCTACACTGACAATGGCGGCAT
CGTCCATGCTCATGCTAATATCATTGGGATTGCTTCGAGTGTGATCAAAGGAATGTTGAA
GCAAGCCAAAAAACATGGAAAGTGGTATACAATCTCAATCCGTGGCGTCCCTCATGAAGC
TGTCCGAGCTTTCATTCGTTTCCTCTACTCTTCTTGCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGA
GTATATCATGCACTTGCTGCTTATGTCTCACGCGTACGTGGTACCTCAGCTGAAACGGGT
CTGTGAATGGCATCTAGAACATGGTTTGCTTAC*ACTGAGAACGTAATTGATGTCTTCCA
GCTCGCCCTCCTCTGTGATTTCCCTCGCCTCAGCGTCATATCTCACCGTATGATCATGAA
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TCTCGAGAAAGAACTTAGAGACTCTGTCTTCATCGAAGAAAATACGCGGAAAGAGAGGAT
CAGAAAACGCAATGAACAGAGGATATACTCGGAGCTATACGAAGCGATGGAAGCGCTTGT
TCATATATGCAGAGACGGGTGTAAGACGATAGGACCGCACGATAAAGATTTAAAACCCAA
CCACGCTACGTGTCACTACGAATCTTGCAAAGGGTTGGAATCGCTCATCAGGCATTTCGC
TGGATGTAAGCTTAGGGTTCCAGAAGGTGGCTTGCATTGCAAGAGAATGTGGCAGCTCCT
CGAGTTACATTCACGCGTTTGCGCTGATTCTGATCAGTGTCGAGTCCCACTATGCAGGAA
CTTTAAGGAGAAGATGGAGAAACAGAGCAAGAAGGATGAGGTTAGATGGAAACTTCTGGT
GAAGAATGTGTTAGGGTCTAAAAAAATCGGAGCCTCTCCTTTCTTTTTACCTGTGACCAG
CTCTTTCTCCACCACCACCATGTCTTAATCCGTGAGTCGTTTTCTTGAATCCCAAGAATG
GCAAGTTTTAAGCGTTTCTTGTGATTTTCTCCCTAAAAAAAATGTAACATAATAAAATGA
AATGAAATGAAAGAAACACATTTGGTGGGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
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AF RR4EZ03JQ C 771
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TGTCCGAGCTTTCATTCGTTTCCTCTACTCTTCTTGCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGA
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GTACCGATCCCTCCACCTCTTCCCTCAAAATCTGATGGGAACCAGAAAAGATACGGCAAC
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CGTCTTTTCAACGAAGGATACAAAGCTGATGTTGTCATCTACACTGACAATGGCGGCATC
GTCTATGCTCATGCTAATATCATTGGGATTGCTTCGAGTGTGATCAAAGGAATGTTGAAG
CAAGCCAAAAAACATGGAAAGTGGTATACAATCTCAATCCGTGGCGTCCCTCATGAAGCT
GTCCGAGCTTTCATTCGTTTCCTCTACTCTTCTTGCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGAG
TATATCATGCACTTGCTGCTTATGTCTCACGCGTACGTGGTACCTCAGCTGAAACGGGTC
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GAAGAATGTGTTAGGGTCTAAAAAAATCGGAGCCTCTCCTTTCTTTTTACCTGTGACCAG
CTCTTTCTCCACCACCACCATGTCTTAATCCGTGAGTCGTTTTCTTGAATCCCAAGAATG
GCAAGTTTTAAGCGTTTCTTGTGATTTTCTCCCTAAAAAAAATGTAACATAATAAAATGA
AATGAAATGAAAGAAACACATTTGGTGG
TC

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GCCATCCCTTTCTTGAGAAAGAACTTAGAGACTCTGTCTTCATCGAAGAAAATACGCGGA
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AAGCGCTTGTTCATATATGCAGAGACGGGTGTAAGACGATAGGACCGCACGATAAAGATT
TAAAACCCAACCACGCTACGTGTCACTACGAATCTTGCAAAGGGTTGGAATCGCTCATCA
GGCATTTCGCTGGATGTAAGCTTAGGGTTCCAGAAGGTTGCTTGCATTGCAAGAGAATGT
GGCAGCTCCTCGAGTTACATTCACGCGTTTGCGCTGATTCTGATCAGTGTCGAGTCCCAC
TATGCAGGAACTTTAAGGAGAAGATGGAGAAACAGAGCAAGAAGGATGAGGTTAGATGGA
AACTTCTGGTGAAGAATGTGTTAGGGTCTAAAAAAATCGGAGCCTCTCCTTTCTTTTTAC
CTGTGACCAGCTCTTTCTCCACCACCACCATGTCTTAATCCGTGAGTCGTTTTCTTGAAT
CCCAAGAATGGCAAGTTTTAAGCGTTTCTTGTGATTTTCTCCCTAAAAAAAATGTAACAT
AATAAAATGAAATGAAATGAAAGAAACACATTTGGTGGGC

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DS 



AS 1 5

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CCAACACATAGAAACATCCAGCTCAAATACAACATTATCCGGTACGTAGATCTCTGGAAG
ATTAACCGAAGTTGATTCCTTGCGCTAGAGGTAACTCATTCCCATAGTTGATCGTGCAAG
TGGAACGACGCATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCACGACCACCACCGGTCG
CTTTCTCACCCCCAAAAGCTCCTCCAATCTCAGCTCCATTCGTCGGTATGTTCACATTCA
CTATCCCACAGTCACTTCCCATTGGTCCGATCCATTTGAAGATGTTCCCGGGGCTACGAG
TGAATATAGAGCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAA
ATGTCTTAAACTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTTCTTTAACAACAGCAG
CATCTGATGAGATCTCTATTATCGTAGGCTCCACAAAGTTTCCTTCACCTTCAACTGCTT
TACCTCCGGTTAATACTTTCCCGCCCTGGGACTTGATGACTTCGATCCCCTTCTCAAAGT
TTTTCTTTGATTCAGGAGTGTGTAGTGGTCCTAACAATGTCCCTTTCTCAAGAGGATCAC
CGATCTTGACTTGTTTGTATGAAGTCAGGAGTTGCTCAAGTACTTTGTCATATACACTCC
CATGCAAAAGCAGCCTACGGCAAGTTGTGCAGCGTTGACCAGCGGTTCCAACAGCAGCAA
ACAGAACGGAACGGGCAGCTAACTGAATGTCAGCATCGTCCATGACTATGATTGCATTGT
TCCCACTCAGTTCAAGCAGAGTTTTGCAGATCTT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F115JQ U 1
AF RR4EZ56JQ U 11
AF RR4FJ81TF C 33
AF RR4EP66JQ U 1
AF RR4BN09JQ U 8
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ATAGAAACATCCAGCTCAAATACAACATTATCCGGTACGTAGATCTCTGGAAGATTAACC
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ACGCATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCACGACCACCACCGGTCGCTTTCTC
ACCCCCAAAAGCTCCTACAATCTCAGCTCCATTCGTCGGTATGTTCACATTCACTATCCC
ACAGTCACTTCCCATTGGTCCGATCCATTTGAAGATGTTCCCGGGGCTACGAGTGAATAT
AGAGCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAAATGTCTT
AAACTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTTCTTTAACAACAGCAGCATCTGA
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GGTTAATACTTTCCCGCCCTGGGACTTGATGAC

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GTTGATTCCTTGCGCTAGAGGTAACTCATTCCCATAGTTGATAGTGCAAGTGGAACGACG
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CCCAAAAGCTCCTCCAATCTCAGCTCCATTCGTCGGTATGTTCACATTCACTATCCCACA
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GCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAAATGTCTTAAA
CTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTTCTTTAACAACAGCAGCATCTGATGA
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CATTTGAAGATGTTCCCGGGGCTACGAGTGAATATAGAGCTGCTTAGACCTTGGGGAACT
GAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAAATGTCTTAAACTTTAGAGCATATAGAACCGGA
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ACAAAGTTTCCTTCACCTTCAACTGCTTTACCTCCGGTTAATAATTTCCCGCCCTGGGAC
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AACAATGTCCCTTTCTCAAGAGGATCACC

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TGGAACGACGCATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCACGACCACCACCGGTCG
CTTTCTCACCCCCAAAAGCTCCTACAATCTCAGCTCCATTCGTCGGTATGTTCACATTCA
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TGAATATAGAGCTGCTTAAACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAA
ATGTCTTAAACTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTTCTTTAACAACAGCAG
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TACCTCCGGTTAATACTTTCCCGCCCTGGGACTTGATGACTTCGATCCCCTTCTCAAAGT
TTTTCTTTGATTCAGGAGTGTGTAGTGGTCCTAACAATGTCCCTTTCTCAAGAGGATCAC
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CATGCAAAAGCAGCCTACGGCAAGTTGTGCAGCGTTGACCAGCGGTTCCAACAGCAGCAA
ACAGAACGGAACGGGCAGCTAACTGAATGTCAGCATCGTCCATGACTATGATTGCATTGT
TCCCACTCAGTTCAAGCAGAGTTTTGCAGATCTT

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DS 

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GAG
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GAAACATCCAGCTCAAATACAACATTATCCGGTACGTAGATCTCTGGAAGATTAACCGAA
GTTGATTCCTTGCGCTAGAGGTAACTCATTCCCATAGTTGATCGTGCAAGTGGAACGACG
CATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCACGACCACCACCGGTCGCTTTCTCACC
CCCAAAAGCTCCTCCAATCTCAGCTCCATTCGTCGGTATGTTCACATTCACTATCCCACA
GTCACTTCCCATTGGTCCGATCCATTTGAAGATGTTCCCGGGGCTACGAGTGAATATAGA
GCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAAATGTCTTAAA
CTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTTCTTTAACAACAGCAGCATCTGATGA
GATCTCTATTATCGTAGGCTCCACAAAGTTTCCTTCACCTTCGACTGCTTTACCTCCGGT
TAATACTTTCCCGCCCTGGGACTTGATGACTTCGATCCCCTTCTCAAAGTTTTTCTTTGA
TTCAGGAGTGTGTAGTGGTCCTAACAATGTCCCTT*CTCAAGAGGATCACCGATCTTGAC
TTGTTTGTATGAAGTCAGGAGTTGCTCAAGTACTTTGTCATATACACTCCCATGCAAAAG
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ACGGGCAGCTAACTGA*TGTCAGCATCGTCCATGACTATGGTTGCATTGTTCCCCCTCAG
T
CCAGCAGAGTT

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DS 



AS 1 5

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GAGAAGGTCAAAGCTGAAGACGATGCATTCAAAGAAGAACAATGTACGCCTTTGGCTATA
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TATGCTTCTTGAACTAGCTTTCGTGAAGCTGTTTCCGCATCTGAAATGTCTCGTGCTATT
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TCCAACGTGCTTAGATCCTCCTCCTGAATCTCTGGCTCCGCAATTACATATGGCTTAAGT
TGCTTGTCTCCAAATGCCCGGGACACAGCAAGAATTCCACCAACTCGCCATGTTCCAGCC
CAGATGATGAAGCCACCAGCATCTTCAATCCTCTGTCGCTCATCTGATCTATCAGGTTTG
TGATCATTAGAAAGCGGAACAGCTGAGGCATTTCTAGACGCTACAACTCTAGAATCACCA
ACGTTAGCAACAATTAACTTATCTCCAACAAGCAAAGCAGTTGATGCGGTTGAGCCAGCA
TTCTTAGGCTGTCCACTCTCTTCAACGAGATACTCCTCATCCGTCTGCTTAAACACTTGC
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CGTTTACCCTTGAGACTAGAATAACCATAACTAAACTTCACAGGCCGATGATTCCCCGCT
AAAAAGCTGATTCCACCGCCGCTAAAGAGAGCGTCGGGATCTCTGGAAGATATCATAGCA
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AAAGAGTGGTTCGTAGGTGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D775JQ U 35
AF RR4F176JQ U 102
AF RR4AC01JQ U 1
AF RR4F176TF C 1002
AF RR4AC01TF C 345
BS 1 228 RR4AC01JQ
BS 229 229 RR4D775JQ
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RD RR4D775JQ 252 0 0
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AAGAACAATGTGCGCCTTTGGCTATATCTCAAGAAACCTCAAATCGAACAACAATGCAAG
TGATATTGTCGCAGCTACCCCGTGCGTATGCTTCTTGAACTAGCTTTCGTGAAGCTGTTT
CCGCATCTGAAATGTCTCGTGCTATTGCCACGGCATCCTCGTTTGACAACACATTCCACA
ATCCATCGCTGG

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4F176JQ 320 0 0
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GTCGCAGCTACCCCGTGCGTATGCTTCTTGAACTAGCTTTCGTGAAGCTGTTTCCGCATC
TGAAATGTCTCGTGCTATTGCCACGGCATCCTCGTTTGACAACACATTCCACAATCCATC
GCTGGGGATAACAATAAAGTCCAACGTGCTTATATCCTCCTCCTGAATCTCTGGCTCCGC
AATTACATATGGCTTAAGTTGCTTGTCTCCAAATGCCCGGGACACAGCAAGAATTCCACC
AACTCGCCATGTTCCAGCCC

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR4AC01JQ 776 0 0
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GAGAAGGTCAAAGCTGAAGACGATGCATTCAAAGAAGAACAATGTACGCCTTTGGCTATA
TCTCAAGAAACCTCAAATCGAACAACAATGCAAGTGATATTGTCGCAGCTACCCCGTGCG
TATGCTTCTTGAACTAGCTTTCGTGAAGCTGTTTCCGCATCTGAAATGCCTCGTGCTATT
GCCACGGCATCCTCGTTTGACAACACATTCCACAATCCATCGCTGGCGATAACAATAAAG
TCCAACGTGCTTAGATCCTCCTCCTGAATCTCTGGCTCCGCAATTACATATGGCTTAAGT
TGCTTGTCTCCAAATGCCCGGGACACAGCAAGAATTCCACCAACTCGCCATGTTCCAGCC
CAGATGATGAAGCCACCAGCATCTTCAATCCTCTGTCGCTCATCTGATCTATCAGGTTTG
TGATCATTAGAAAGCGGAACAGCTGAGGCATTTCTAGACGCTACAACTCTAGAATCACCA
ACGTTAGCAACAATTAACTTATCTCCAACAAGCAAAGCAGTTGATGCGGTTGAGCCAGCA
TTCTTAGGCTGTCCACTCTCTTCAACGAGATACTCCTCATCCGTCTGCTTAAACACTTGC
ACAATGGCTTTCTTGGTGTCTGAGATAAAGTCATGATGAGTAACTAAGTTGTTGAAAAGA
TTGTTTTTAAGATACTCTGCAGTCCTTGCACCACCGTGACCATCGAAGACGCCGAA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4F176TF 137 0 0
GGAAGAGGATTGCGGAGAAGCTTGGTCTGTCAGGATTGGTGTTTGGGAGATCCAGAAGAA
GAAAGTTAGGGAAAAGAAGAAGACGATGAAGGAATATATGGTTTTGGAGCTGAAGAAGAA
ACCTCGAAGAAGAAG
CC

QA 1 135 1 135
DS 

RD RR4AC01TF 820 0 0
TACATATGGCTTAAGTTGCTTGTCTCCAAATGCCCGGGACACAGCAAGAATTCCACCAAC
TCGCCATGTTCCAGCCCAGATGATGAAGCCACCAGCATCTTCAATCCTCTGTCGCTCATC
TGATCTATCAGGTTTGTGATCATTAGAAAGCGGAACAGCTGAGGCATTTCTAGACGCTAC
AACTCTAGAATCACCAACGTTAGCAACAATTAACTTATCTCCAACAAGCAAAGCAGTTGA
TGCGGTTGAGCCAGCATTCTTAGGCTGTCCACTCTCTTCAACGAGATACTCCTCATCCGT
CTGCTTAAACACTTGCACAATGGCTTTCTTGGTGTCTGAGATAAAGTCATGATGAGTAAC
TAAGTTGTTGAAAAGATTGTTTTTAAGATACTCTGCAGTCCTTGCACCACCGTGACCATC
GAAGACGCCGAAGAAGGCAACCATTTGTCCATCAACATCAGATATTCTAGTCTCGAAGAA
GTCCTCCATTGTTGCTCGTTTACCCTTGAGACTAGAATAACCATAACTAAACTTCACAGG
CCGATGATTCCCCGCTAAAAAGCTGATTCCACCGCCGCTAAAGAGAGCGTCGGGATCTCT
GGAAGATATCATAGCATCAGGCGGAGAACTGGAGGAGGATTCCGCATCCCCACGAGAGGA
AGAGGATTGCGGAGAAGCTTGGTCTGTCAGGATTGGTGTTTGGGAGATCCAGAAGAAGAA
AGTTAGGGAAAAGAAGAGGACGATGAAGGAATATATGGTTTCGGAGCTGAAGAAGAAACC
TCGAAGAAGAAGAAGGAAAGAGTGGTTCGTAGGTGGACCC

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 6

CO CL1659Contig1 847 6 8 U
GGCTGAAGACATCAGTCTATGGCCACCGATCTCTTTCCGGTTATTATAACTTCGTCGCTT
CTTCTCAGTCGCTTCTTCCGTGACGGTATCGTATCGGAGACTGTTCGTCTTTCCTTAAAT
CCTTAAATCAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGG
CGTCTTGAAACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTT
TCCTGTCGTCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACAC
TACACGCGAAGACAATCTGGTTTTCTCCTTCGAGTTGGGTTCAGGAAGTGTTATCCGGTC
ATGGGACATTGCGCTTAAGACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGAAAATCACATGTAAGCC
AGAGTATGCTTACGGAAGTGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCACCTGATGCAACTTTGAT
ATTTGAAGTGGAATTGGTTGCTTGTAGACCGAGGAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTC
TGAGGATAGAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAA
AGAGGATGATAAGAAAAAGAGAGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAGCTGCTAGGATTCAAGC
TAAGCTAGACGCTAAGAAGGGTCCAGGCAAGGGAAAAGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGG
GACAAAGCATGAGTCCAACGTTGTTGTAAACTCCTAAAGATTATATAAGTTCATGATTTT
AAAGCTTGTTGTTAAGTGGCACTCATCAATTATCATAATGAGCAATACATGAGTTGTTTT
GGGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4CO26TF U 1
AF RR4C404TF U 106
AF RR4AR07JQ C 637
AF RR4AR07TF U 637
AF RR4C404JQ C 64
AF RR4CO26JQ C 79
BS 1 433 RR4CO26TF
BS 434 434 RR4C404TF
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BS 800 843 RR4C404JQ
BS 844 847 RR4CO26JQ

RD RR4CO26TF 678 0 0
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CTTCTCAGTCGCTTCTTCCGTGACGGTATCGTATCGGAGACTGTTCGTCTTTCCTTAAAT
CCTTAAATCAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGG
CGTCTTGAAACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTT
TCCTGTCGTCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACAC
TACACGCGAAGACAATCTGGTTTTCTCCTTCGAGTTGGGTTCAGGAAGTGTTATCCGGTC
ATGGGACATTGCGCTTAAGACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGAAAATCACATGTAAGCC
AGAGTATGCTTACTGAAGTGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCACCTGATGCAACTTTGAT
ATTTGAAGTGGAATTGGTTGCTTGTAGACCGAGGAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTC
TGAGGATAGAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAA
AGAGGATGATAAGAAAAAGAGAGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAGCTGCTAG*ATTCAAGC
TAAGCTAGACGCTAAGAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4C404TF 581 0 0
CGTCTTTCCTTAAATCCTTAAATCAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTT
GAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGAAACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGC
ACCTTCTGATGATTTTCCTGTCGTCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGG
AAAGGTCTTTGACACTACACGCGAAGACAATCTGGTTTTCTCCTTCGAGTTGGGTTCAGG
AAGTGTTATCCGGTCATGGGACATTGCGCTTAAGACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGAA
AATCACATGTAAGCCAGAGTATGCTTACGGAAGTGTAGGATCTCCTCCTGACATCCCACC
TGATGCAACTTTGATATTTGAAGTGGAATTGGTTGCTTGTAGACCGAGGAAAGGTGCTAG
TGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATAGAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGAT
TGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATGATAAGAAAAAGAGAGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAGC
TGCTAG*ATTCAAGCTAAGCTAGACGCTAAGAAGG
TCAAGG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4AR07JQ 167 0 0
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AGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGGGACAAAGCATGAGTCCAACGTTGTTGTAAACTCCTA
AAGATTATATAAGTTCATGATTTTAAAGCTTGTTGTTAAGTGG
TACC

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR4AR07TF 167 0 0
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AGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGGGACAAAGCATGAGTCCAACGTTGTTGTAAACTCCTA
AAGATTATATAAGTTCATGATTTTAAAGCTTGTTGTTAAGTGG
TACC

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR4C404JQ 782 0 0
CTCAGTCGCTTCTTCCGTGACGGTATCGTATCGGAGACTGTTCGTCTTTCCTTAAATCCT
TAAATCAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGGCGT
CTTGAAACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTTTCC
TGTCGTCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACACTAC
ACGCGAAGACAATCTGGTTTTCTCCTTCGAGTTGGGTTCAGGAAGTGTTATCCGGTCATG
GGACATTGCGCTTAAGACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGAAAATCACATGTAAGCCAGA
GTATGCTTACGGAAGTGTAGGATCTCCTCCTGACATCCCACCTGATGCAACTTTGATATT
TGAAGTGGAATTGGTTGCTTGTAGACCGAGGAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTCTGA
GGATAGAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAAAGA
GGATGATAAGAAAAAGAGAGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAGCTGCTAGGATTCAAGCTAA
GCTAGACGCTAAGAAGGGTCAAGGCAAGGGAAAAGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGTGAC
AAGGCATGAGTCCAACGTTGTTGTAAACTCCTAA*GATTATATAAGTTCATGATTTTAAA
GCTTGTTGTCAAGTGGCACTCATCAATTATCATAATGAGCAATACATGAGTTGTTTTGGG
CC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4CO26JQ 769 0 0
CGTGACGGTATCGTATCGGAGACTGTTCGTCTTTCCTTAAATCCTTAAATCAGGTTTCTT
TGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGAAACAGATTGT
AAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTTTCCTGTCGTCGATGTTCA
CTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACACTACACGCGAAGACAATCT
GGTTTTCTCCTTCGAGTTGGGTTCAGGAAGTGTTATCCGGTCATGGGACATTGCGCTTAA
GACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGAAAATCACATGTAAGCCAGAGTATGCTTACTGAAG
TGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCACCTGATGCAACTTTGATATTTGAAGTGGAATTGGT
TGCTTGTAGACCGAGGAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATAGAGCTAGGCT
AGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATGATAAGAAAAA
GAGAGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAGCTGCTAGGATTCAAGCTAAGCTAGACGCTAAGAA
GGGTCAAGGCAAGGGAAAAGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGTGACAAGGCATGAGTCCAA
CGTTGTTGTAAACTCCTAA*GATTATATAAGTTCATGATTTTAAAGCTTGTTGTCAAGTG
GCACTCATCAATTATCATAATGAGCAATACATGAGTTGTTTTGGGTTTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 3

CO CL1660Contig1 882 3 8 U
GGGAGCAGTCTAAGCTCCGAGCTGGATTGAACTCTGCGATTGTGAGGGAGAAGCCTAACA
TTAAGTGGACTGATGTTGCTGGGCTCGAGAGCGCTAAGCAAGCTTTGCAGGAAGCTGTGA
TTTTGCCTGTCAAGTTTCCTCAGTTCTTCACCGGAAAGAGGAGGCCATGGCGAGCTTTTC
TCTTGTATGGGCCGCCTGGAACAGGAAAGTCCTACTTGGCCAAAGCTGTTGCTACTGAAG
CTGACTCTACCTTCTTTAGCGTGTCTTCATCAGATCTGGTCTCGAAGTGGATGGGTGAAA
GTGAGAAGCTAGTGTCAAACCTTTTCGAGATGGCCCGTGAAAGTTCTCCCTCGATTATTT
TCGTTGATGAGATAGATTCCTTGTGTGGTCAACGTGGAGAAGGAAACGAGAGTGAAGCTT
CAAGACGTATCAAAACAGAGCTTCTTGTGCAGATGCAGGGTGTTGGACACAGTGATGATA
AAGTACTTGTGCTTGCAGCAACCAATACACCTTATGCTCTTGATCAGGCTATTAGGCGAC
GTTTTGATAAACGTATTTATATTCCTCTCCCAGAAGCCAAGGCTAGGCAGCACATGTTCA
AAGTTCATTTGGGAGACACGCCTCATAATTTAACTGAATCTGATTTTGAATATTTGGGGC
TCAAGACAGAAGGGTTTTCTGGTTCAGATGTTTCCGTTTGTGTAAAAGATGTCCTTTTTG
AGCCTGTTCGCAAAACTCAAGACGCAATGTTCTTTTTCAAGTCACCTGATGGTACATGGA
TGCCATGTGGACCGAGGCAGCCTGGAGCTATCCAAACCACAATGCAAGATTTAGCAGCTA
AAGCCTTGCCGAAAAGATATTCCACCACCAATCACAAGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ02TF U 1
AF RR4FN65TF U 156
AF RR4FB04TF U 153
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DS 

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G
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AATCTGATTTTGAATATTTGGGGCTCAAGACAGAAGGGTTTTCTGGTTCAGATGTTTCCG
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CCACAATGCAAGATTTAGCAGCTAAAGCCTTGCCGAAAAGATATTCCACCACCAATCACA
AGAACA

QA 5 730 5 730
DS 



AS 1 6

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CCCATCTCTCTGAAATCACTAGACGCATGTCTCAACACCGAATCACTCGAGTATCCATCA
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CTTGGGTCGTTCATGCATGGGAAATCCTCTTTTGGCAATTCTCCTTTGCTACGCTTCTCG
ATGAGCTCCTCAACCATGGGGTAAAAACGAGATAGCTGCCATGCTGCTTCCTCTTGGCGC
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GCAATCTCCACATGGAGAGACAGCTTGTCAATTTGTTCACTGTATTGTGGCAATGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FR79JQ U 1
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AF RR4EM31JQ U 23
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RD RR4FR79JQ 784 0 0
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TCTTTCCTGACAGCTCGCTTCTTCTTGTGAAGATCAAACTTCAAAGTGAA*CCTCCCGGA
GTAT

QA 1 784 1 784
DS 

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QA 1 774 1 774
DS 

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CGACAAACAATAAGGGTAAACTTACAGTCATGATCTCAAAATCTGATTGTTTTTTTTCAA
TCCCTTTTACATGCCTTTAACTTGGTTACAAATTAGAATGGGAGATATCAAAGAGCAAGG
ACAATGATTTGAACTGAGATCTGAATTCTTATATTTGGAGATCGTCTATAGATAGCTCAT
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CGAGGATAACTTCTCTTTTAAGTTTCGTGGTTAGTTTGTGGCATACTTTTAACTCTGGTC
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ACGCATGTCTCAACACCGAATCACTCGAGTATCCATCATCTGAACCTCGAGGTTTAGCCC
ATGTTGGTGCGCGTCTTGATCTCATGGACTGAGCAGCAGCTTGACCTTGATTACTACTTG
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TCTTGTGAAGATCAAACTTCAAAGTGAAACCTCCCGGAGTATTCTTTTTAGCATCAACGG
CTGAACCAAGCAATCTCATATTATTCACAGCGCTCATGTCATCAGATGAGAGTTT
G

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4FR79TF 798 0 0
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T**TTTTTTTCGATCCCTTTTACATGC*TTTAACTTGGTTACAAAT*AGAATGGGAGATA
TCAAAGAGCAAGGGCAATGATTTGAACTGAGATCTGAATTCTTATATTTGGAGATCGTCT
ATAGATAGCTCATTTGCAGACAGGAGCTTCAGTTTCGTTATGAACTGTGGAGGATCATCG
AGGCTTGTAGACCCGAGGATAACTTCTCTTTTAAGTTTCGTGGTTAGTTTGTGGCATACT
TTTAACTCTGATCTTGTCGCTCCACCTACAATAAACACAAATATTCGCTGTCCCATCTTT
CTGAAATCACTAGACGCATGTCTCAACACCGAATCACTTGAGTATCCATCATCTGAACCT
CGAGGTTTAGCCCATGTTGGTGTGCGTCTTGATCTCATGGACTGAGCAGCAGCTTGACCT
TGATTACTACTTGCTGATGAAGAAAGCGAAGTTGATCCGTGGAAGCTAGGGCTTGGGTCG
TTCATGCATGGGAAATCCTCTTTTGGCAATTCTCCTTTGCTAAGCTTCTCGATGAGCTCC
TCAACCATGGGGTAAAAACGAGATAGCCGCCATGCTGCTTCCTCTTGGCGCTCTTTCCTG
ACAGCTCGCTTCTTCTTGTGAAGATCAAACTTCAAAGTGAAACCTCCCGGAGTATTCTTT
TTAGCATCAACGGCTGAACCAAGCAATCTCATATTATTCACAGCGCTCATGTCATCAGAT
GAGAGTTTTGCCAGCTTC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4FE05TF 796 0 0
AG
TTCGTGGTTAGTT*GTGGCATACTTT*AACTCTG*TCTTGTCGCTCCACCAACAATAAAC
ACAAATATTCGCTGTCCCATCTCTCTGAAATCACTAGACGCATGTCTCAACACCGAATCA
CTCGAGTATCCATCATCTGAACCTCGAGGTTTAGCCCATGTTGGTGCGCGTCTTGATCTC
ATGGACTGAGCAGCAGCTTGACCTTGATTACTACTTGCTGATGAAGAAAGCGAAGTTGAT
CCGTGGAAGCTCGGGCTTGGGTCGTTCATGCATGGGAAATCCTCTTTTGGCAATTCTCCT
TTGCTACGCTTCTCGATGAGCTCCTCAACCATGGGGTAAAAACGAGATAGCTGCCATGCT
GCTTCCTCTTGGCGCTCTTTCCTGACAGCTCGCTTCTTCTTGTGAAGATCAAACTTCAAA
GTGAAACCTCCCGGAGTATTCTTTTTAGCATCAACGGCTGAACCAAGCAATCTCATATTA
TTCACAGCGCTCATGTCATCAGATGAGAGTTTTGCCAGCTTCATTAGATTTTGACCTTTT
TCACCTTCGAACTTTTCAGGGTAAATTGTTACGAGGATCATCAGCAGGCGTAACTTACCT
TCACGACTTGCCTCCTCTTGAGTACTCAAATATTTAATCACATCCTTCATCCCAGCATCA
CCAAAGACAAGGTCTTGTTCAAGTTGTCCAAGCTCCCGCAGTTCCTGCTCTCTGATAAGG
TCGTTGATTTTTCTAGCAATCTCCACATGGAGAGACAGCTTGTCAATTTGTTCACTGTAT
TGTGGCAATGCTTC

QA 3 796 3 796
DS 

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ACCTCGAGGTTTAGCCCATGTTGGTGCGCGTCTTGATCTCATGGACTGAGCAGCAGCTTG
ACCTTGATTACTACTTGCTGATGAAGAAAGCGAAGTTGATCCGTGGAAGCTCGGGCTTGG
GTCGTTCATGCATGGGAAATCCTCTTTTGGCAATTCTCCTTTGCTACGCTTCTCGATGAG
CTCCTCAACCATGGGGTAAAAACGAGATAGCTGCCATGCTGCTTCCTCTTGGCGCTCTTT
CCTGACAGCTCGCTTCTTCTTGTGAAGATCAAACTTCAAAGTGAAACCTCCCGGAGTATT
CTTTTTAGCATCAACGGCTGAACCAAGCAATCTCATATTATTCACAGCGCTCATGTCATC
AGATGAGAGTTTTGCCAGCTTCATTAGATTTTGACCTTTTTCACCTTCGAACTTTTCAGG
GTAAATTGTTACGAGGATCATCAGCAGGCGTAACTTACCTTCACGACTTGCCTCCTCTTG
AGTACTCAAATATTTAATCACATCCTTCATCCCAGCATCACCAAAGACAAGGTCTTGTTC
AAGTTGTCCAAGCTCCCGCAGTTCCTGCTCTCTGATAAGGTCGTTGATTTTTCTAGCAAT
CTCCACATGGAGAGACAGCTTGTCAATTTGTTCACTGTATTGTGGCAATGCTTC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 6

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AGAAGGGCAAAAGATTCGTTCCGATCCGATACTCAAGAAGAAGAGAGTGGCATATCATCA
CCATTCATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAAGGAGAAGCAAAAAGAGGAAGCTAAGAAC
AACAACACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAA
GATATAACAGAGCTGAATCTGCCAAAGTCTTGTTCAATATCTTTTCCTAATGGAAAGAAT
GACTTGATGAACTTTGAAGTCACCATCAAACCCGACGACGGCTATTACTTAGGTGGTAAA
TTCGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTATCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGC
AAGACCAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTTAGAAGGTAACGTTTGTCTCAACATCTTG
CGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTCTCATCTACGGTCTTTTCCATCTC
TTCACGGAACCCAATCACGAGGATCCTCTCAACCATGACGCAGCAGCGGTTTTAAGGGAT
AACCCCAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAGGGCTATGAGTGGTGGCTATGTTGGCCAA
ACCTCATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAATAAGCTATGCTTCTGTTTCACTTCACTTT
TCTTCTTCTCTAGAGACTTTTTGTGTTTGCTCTCTTGTACATTTTGGCTTTTATGACATC
GCTTTTATTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4EN79JQ C 87
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AF RR4AQ06JQ C 1
AF RR4DX71JQ C 234
AF RR4DX71TF U 180
AF RR4AQ06TF U 1
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TCAACCATGAC

QA 1 251 1 251
DS 

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GCTTTTATTAT

QA 1 791 1 791
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CATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTTTCATTTACGGTCTTTT
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QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4DX71TF 612 0 0
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CAAGACCAGGGTGTACCATCCGAATATCGATTTAGAAGGTAACGTTTGTCTCAACATCTT
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TTCTTCTTCTCTAGAGACTTTTTGTGTTTGCTCTCTTGTACATTTTGGCTTTTATGACAT
CGCTTTTATTAT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4AQ06TF 782 0 0
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CCATTCATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAAGGAGAAGCAAAAAGAGGAAGCTAAGAAC
AACAACACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAA
GATATAACAGAGCTGAATCTGCCAAAGTCTTGTTCAATATCTTTTCCTAATGGAAAGAAT
GACTTGATGAACTTTGAAGTCACCATCAAACCCGACGACGGCTATTACTTAGGTGGTAAA
TTCGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTATCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGC
AAGACCAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTTAGAAGGTAACGTTTGTCTCAACATCTTG
CGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTCTCATCTACGGTCTTTTCCATCTC
TTCACGGAACCCAATCACG*GGATCCTCTCAACCATGACGCAGCAGCGGTTTTAAGGGAT
AACCCCAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAGGGCTATGAGTGGTGGCTATGTTGGCCAA
ACCTCATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAATAAGCTATGCTTCTGTTTCACTTCACTTT
TCTTCTTCTCTAGAGACTTTTTGTGTTTGCTCTCTTGTACATTTTGGCTTTTATGACATC
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 6

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TCTTTTGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTTAGACAGAAGTTTAGACACAAT
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GATGAATTCCGTCCTGGCATCTTTAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTT
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GACTTTTCAAGGACTGGAAGCACTACAGTTGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTA
GAACAGTTCACTCATGAGATGGAACCGTTTCTAAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTC
AACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTT
TCACCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTGTTGGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTC
AACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAATGACTTTGAGCTTTATCGAGAAGGTTTGGATCTC
TCGGACGTCGAAACCTCTTGAAAAGGCTCAACTTTTTTTTTATCGAACTCTAAAGTTTTC
GTATCGTATCTATCATTCACTTGGATGATGCTTGCTCTTGTGGTTGTATTTGCAGTTTTA
TGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAGTGTTTGTAGAATACCAGATTATCTTCTTGAGTTCCCTT
CTGCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4GH13TF U 1
AF RR4DC16TF U 84
AF RR4DC16JQ C 269
AF RR4AD07JQ C 152
AF RR4GH13JQ C 171
AF RR4AD07TF U 152
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BS 351 351 RR4DC16TF
BS 352 411 RR4GH13TF
BS 412 412 RR4DC16TF
BS 413 481 RR4GH13TF
BS 482 483 RR4DC16TF
BS 484 515 RR4GH13TF
BS 516 516 RR4DC16TF
BS 517 649 RR4GH13TF
BS 650 650 RR4DC16TF
BS 651 716 RR4GH13TF
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BS 718 737 RR4GH13TF
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BS 770 770 RR4AD07TF
BS 771 805 RR4DC16TF
BS 806 806 RR4AD07TF
BS 807 810 RR4DC16TF
BS 811 813 RR4AD07TF
BS 814 856 RR4DC16TF
BS 857 964 RR4AD07TF
BS 965 968 RR4AD07JQ

RD RR4GH13TF 737 0 0
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TCTTTTGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTTAGACAGAAGTTTAGACACAAT
GGAAAGTTCTTCCTTGGTTCGAACAAAGTGATGCAGGTTGCTCTTGGTCGCTCCGCTTCT
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G**TTTTCAAGGACTGGAAGCACTACAGTTGAAACAGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTA
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AACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAG*CAAACCTCTT
TCACCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTGTTGGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAA*CTC
AACTTAGTCTGCAGATG

QA 1 737 1 737
DS 

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CAAGTTCAAGGAGTTTAGACAGAAGTTTAGACACAATGGAAAGTTCTTCCTTGGTTCGAA
CAAAGTGATGCAGGTTGCTCTTGGTCGTTCCGCTTCTGATGAATTCCGTCCTGGCATCTT
TAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTAACAGATATGCCAAAGGA
AGAGGTCGAAAGCTTGTTTAATGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACTGGAAGCAC
TACAGTTGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTAGAACAGTTCACTCATGAGATGGA
ACCGTTTCTAAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACT
CTCGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTTT
GCGTCTGTTGGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCC
TAATGACTTTGAGCTTTATCGAGAAG*TTTGGATCTCTCGGACGTCGAAACCTCTTGAAA
AG*CTCAC**TTTTTTTTATCGAACTCTAAAGTTTTCGTATCGTATCTATCAT

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DS 

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TTCTAAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGG
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TGTTGGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAATG
ACTTTGAGCTTTATCGAGAAGGTTTGGATCTCTCGGACGTCGAAACCTCTTGAAAAGGCT
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DS 

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G
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TGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGG
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TTTGGATCTCTCGGACGTCGAAACCTCTTGAAAAGGCTCAACTTTTTTTTTATCGAACTC
TAAAGTTTTCGTATCGTATCTATCATTCACTTGGATGATGCTTGCTCTTGTGGTTGTATT
TGCAGTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAGTGTTTGTAGAATACCAGATTATCTTCTT
GAGTTCCCTTCTGC
TAGT

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DS 

RD RR4AD07TF 813 0 0
G
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GGAGTTTAGACAGAAGTTTAGACACAATGGAAAGTTCTTCCTTGGTTCGAACAAAGTGAT
GCAGGTTGCTCTTGGTCGTTCCGCTTCTGATGAATTCCGTCCTGGCATCTTTAAAGCCTC
CAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTAACAGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGA
AAGCTTGTTTAATGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACTGGAAGCACTACAGTTGA
AACGGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTAGAACAGTTCACTCATGAGATGGAACCGTTTCT
AAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGGACTT
TGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTGTT
GGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAATGACTT
TGAGCTTTATCGAGAAGGTTTGGATCTCTCGGACGTCGAAACCTCTTGAAAAGGCTCAAC
TTTTTTTTTATCGAACTCTAAAGTTTTCGTATCGTATCTATCATTCACTTGGATGATGCT
TGCTCTTGTGGTTGTATTTGCAGTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAGTGTTTGTAGA
ATACCAGATTATCTTCTTGAGTTCCCTTCTGC

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DS 



AS 1 6

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GGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTG
GCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAAT
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AAACTTCTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BM42JQ U 1
AF RR4BB48JQ U 3
AF RR4BD66JQ U 3
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BS 783 838 RR4BD66JQ
BS 839 870 RR4BD66TF

RD RR4BM42JQ 579 0 0
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AAGTAAAGAAGTGAAGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCT
GGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTG
GCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAAT
CAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGG
TCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCTTCATCAGCTTCCTCTCCGTCCTTCTTGG
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ACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGAGTCTTGG
TCCTGACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACAT

QA 1 579 1 579
DS 

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C
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TAGTAGAAACTGAAACTCAAAACATGTTT*GATGATAAGATAAAAAAAAAAGTTTGAAAG
TAAAAAAGTGAAGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGGT
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TAAATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCAA
GGCTGCGACCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCT
CCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCCTCACCGTCCTCTCCGTCCTTCTTGGACG
CAGCAGCAACAGCACTCTTTTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACC
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CCGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGT
TACCTCCACGGACTCGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAACTTGGTGTTAGCTG
GCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTG

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4BD66JQ 836 0 0
C
GGGGTAGTTTATGAAATATCATTGCAAGCTAATCCAAAAGCATCTCGGGTTCTCAGACAA
TAGTAGAAACTGAAACTCAAAACATGTTT*GATGATAAGATAAAAAAAAAAGTTTGAAAG
TAAAAAAGTGAAGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGGT
AGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTGGCC
TAAATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCAA
GGCTGCGACCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCT
CCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCCTCACCGTCCTCTCCGTCCTTCTTGGACG
CAGCAGCAACAGCACTCTTTTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACC
ACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGAGTCTTGGTCC
TGACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAAACGACATCGAGAACCCTGGTCTTGCGTGTCA
CCGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGT
TACCTCCACGGACTCGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAACTTGGTGTTAGCTG
GCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGG
CACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAG

QA 2 836 2 836
DS 

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GGATCTTCTTCTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTC
CACACTGGCCTGGCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCT
CGATGTGGGAATCAAGGCTGCGACCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGT
TACTCTTCTTGGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCCTCACCGTCCTCTC
CGTCCTTCTTGGACGCAGCAGCAACAGCACTCTTTTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGT
AATGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCACTCTTCA
CAAGAGTCTTGGTCCTGACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCGAGAACCC
TGGTCTTGCGTGTCACCGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACG
CACGCCACTTGACGTTACCTCCACGGACTCGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACA
ACTTGGTGTTAGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCT
GCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCT
CTTCCGCGAGATAAACTTCTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTCC

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DS 

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CTTCTGGATCTTCTTCTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGCTTTCCAGAATGTATCCATCGGC
ACGTCCACACTGGCCTGGCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTG
ATCCTCGATGTGGGAATCAAGGCTGCGACCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGAC
GTGGTTACTCTTCTTGGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCCTCACCGTC
CTCTCCGTCCTTCTTGGACGCAGCAGCAACAGCACTCTTTTTCTTGCGACCAACCTCAAC
TCCGTAATGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCACT
CTTCACAAGAGTCTTGGTCCTGACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCGAG
AACCCTGGTCTTGCGTGTCACCGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCT
CAACGCACGCCACTTGACGTTACCTCCACGGACTCGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCT
TGACAACTTGGTGTTAGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCC
CTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGT
TGCCTCTTCCGCGAGATAAACTTCTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTCC

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DS 

RD RR4BH80TF 626 0 0
AGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCAAG
GCTGCGACCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCTC
CTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCCTCACCGTCCTCTCCGTCCTTCTTGGACGC
AGCAGCAACAGCACTCTTTTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACCA
CTGCTTGAAAGGAGCGGCGTCGACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGAGTCTTGGTCCT
GACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCGAGAACCCTGGTCTTGCGTGTCAC
CGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCGACGCACGCCACTTGACGTT
ACCTCCACGGACTCGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAACTTGGTGTTAGCTGG
CTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGT
ACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAGATAAAC
TTCTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL1665Contig1 941 4 4 U
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AATCCACTCCAGTACATAGTATGTTAACAACATCACATGAAATAAAAATAAAGAGGCAGA
GCTTGATCTCAAGATTGATAAATAGGCTTCTTACCAGGAGCCTTGAGCACCAGCAGTTGG
GTTGTGGAAAGCCTGGAACTCCCAAAACGTCTTCAACGAGTAGGGCTGAAAGACCGTCAC
CCCTTCCTCCGTGATCTTCGCAATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAAAG
AAGCACACGCATACACTTCTCAAGGAGCTTGACACCTTCTTCGAAGCTCAGATCCGCATG
CCACTCATCACGAAGAATTGGCCTAGCTAGGTGGTTTCCAAATCCAGTGGCAACATGATT
GTCCTCGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAGCTTTCACCATTTTTAAC
ACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAAAGGGTTAAACTTGTTGCGGCGGTTGTACATGAC
ACGAGTCAGATAGTTGTGAACCTCTTTTGGTCCCAAAGAGTTACCATCATCCCACATGTT
ATCATTCAAGACGAGCTCATCAAGATAACGAAGAATCTCCTGAAAGTCGCTGATTTCTCC
ACTGGCACCGAGAAGAGAATGCTTGCCAATAGCCTTCACTCTCTCAATGTTCTTGTATCT
TAAGGTCGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAGAACACCATCTTTGTACTT
GATTGCGACAATCGATGTCCCAGTGACATATGGGTACAGTGTTCTTTGTGAATCAGCTTC
TGCGTTCTTCACGGCATCTCCGTTATCAATCGGAATAGTAAAAGTCATCTTTTTCGAAGT
AACCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTAGAGGTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AE42JQ U 22
AF RR4CJ11JQ U 14
AF RR4B316JQ U 1
AF RR4CJ11TF C 341
BS 1 229 RR4B316JQ
BS 230 230 RR4CJ11JQ
BS 231 835 RR4B316JQ
BS 836 941 RR4CJ11TF

RD RR4AE42JQ 658 0 0
GC
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TTAACAACATCACATGAAATAAAAATAAAGAGGCAG**CTTGATCTCAAGATTGATAAAT
AGGCTTCTTACCAGGAGCCTTGAGCACCAGCAGTTGGGTTGTGGAAAGCCTGGAACTCCC
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TCTGAAGTTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAAAGAAGCACACGCATACACTTCTCAA
GGAGCATGACACCTTCTTCGAAGCTCAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAATTGGAC
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TTGACACCATGCCGAGGTAGCTTTCACCATTTTTAACACCTCCAAGGACGAAAGTGTTCC
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CTTTTGGTCCCAAAGAGTTACCATCATCCCACATGTTATCATTCAAGACGAGCTCATCAA
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QA 3 658 3 658
DS 

RD RR4CJ11JQ 755 0 0
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ACATAGTATGTTAACAACATCACATGAAATAAAAATAAAGAGGCAGAGCTTGATCTCAAG
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TGGAACTCCCAAAACGTCTTCAACGAGTAGGGCTGAAAGACCGTCACCCCTTCCTCCGTG
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AGAATTGGCCTAGCTAGGTGGTTTCCAAATCCAGTGGCAACATGATTGTCCTCGAAACTA
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AGAGTGTTCCAGAAAGGGTTAAACTTGTTGCGGCGGTTGTACATGACACGAGTCAGATAG
TTGTGAACCTCTTTTGGTCCCAAAGAGTTACCATCATCCCACATGTTATCATTCAAGACG
AGCTCATCAAGATAACGAAGAATCTCCTGAAAGTCGCTGATTTCTCCACTGGCACCGAGA
AGAGAATGCTTGCCAATAGCCTTCACTCTCTCAATGTTCTTGTATCTTAAGGTCGATCCA
TATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAGAACACC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4B316JQ 835 0 0
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GCTTGATCTCAAGATTGATAAATAGGCTTCTTACCAGGAGCCTTGAGCACCAGCAGTTGG
GTTGTGGAAAGCCTGGAACTCCCAAAACGTCTTCAACGAGTAGGGCTGAGAGACCGTCAC
CCCTTCCTCCGTGATCTTCGCAATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAAAG
AAGCACACGCATACACTTCTCAAGGAGCTTGACACCTTCTTCGAAGCTCAGATCCGCATG
CCACTCATCACGAAGAATTGGCCTAGCTAGGTGGTTTCCAAATCCAGTGGCAACATGATT
GTCCTCGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAGCTTTCACCATTTTTAAC
ACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAAAGGGTTAAACTTGTTGCGGCGGTTGTACATGAC
ACGAGTCAGATAGTTGTGAACCTCTTTTGGTCCCAAAGAGTTACCATCATCCCACATGTT
ATCATTCAAGACGAGCTCATCAAGATAACGAAGAATCTCCTGAAAGTCGCTGATTTCTCC
ACTGGCACCGAGAAGAGAATGCTTGCCAATAGCCTTCACTCTCTCAATGTTCTTGTATCT
TAAGGTCGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAGAACACCATCTTTGTACTT
GATTGCGACAATCGATGTCCCAGTGACATATGGGTACAGTGTTCTTTGTGAATCA

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4CJ11TF 601 0 0
TCGAAGCTCAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAATTGGCCTAGCTAGGTGGTTTCCA
AATCCAGTGGCAACATGATTGTCCTCGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGG
TAGCTTTCACCATTTTTAACACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTG
TTGCGGCGGTTGTACATGACACGAGTCAGATAGTTGTGAACCTCTTTTGGTCCCAAAGAG
TTACCATCATCCCACATGTTATCATTCAAGACGAGCTCATCAAGATAACGAAGAATCTCC
TGAAAGTCGCTGATCTCTCCACTGGCACCGAGAAGAGAATGCTTGCCAATAGCCTTCACT
CTCTCAATGTTCTTGTATCTTAAGGTCGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATT
AGAACACCATCTTTGTACTTGATTGCGACAATCGATGTCCCAGTGACATATGGGTACAGT
GTTCTTTGTGAATCAGCTTCTGCGTTCTTCACGGCATCTCCGTTATCAATCGGAATAGTA
AAAGTCATCTTTTTCGAAGTAACCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTAGAGGTTCTT
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 5

CO CL1666Contig1 796 5 29 U
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TCAAACGTTTCAATAAGGTTTTAATAGAAGCTCATGTACACAACCAAAACATGGCTTATA
ATAATAAGATAATTAAATCAAGCAACCAAGCAAAAGCCAAATTCATGTTTTTTTTTATTT
CTCCAATTCTTAGAACAAATGCGCAATTTACTGGTGCGGATCCATTATTGCCAACCATCA
TCATCCCATTGCATACTTCTGGGTCCAGGATCGGGCAGTGTTCTCGTACTTGGGACGGTC
TGTCTTGTAGATGTTAGCTATTTCAGGAACCAGAGGATCATCAGGGTTTGGATCTGTCAG
CAATGAGCATATCGACAGAAGAACCTTGGATAGGGTAAGTGCAGGGCTCCATTGCTCTTT
CAGAATGTCAAGACAGATGCTGCCATTACTGTTGACATTCGGGTGATAAACCTTGGTGCG
GAAAGAAACCTTAGGTGGCTTGAAGGGGTAATCTGGAGGGAAGTGAATGGAAACAAGAAA
GACACCTCCGGCGAATGGGCTATCAGTGGGACCCATAATAGTTGCTTGCCAGTGGTACAT
ATCATCACCCACAGGACCGGCGCTGCAAGACACAGGAGGGTCCTTTT*GCAGGTCCCTAA
GCTCCTTGTTAATTCTTATCGAAGCCATAGCGTGAGATTAGTCCTCCTCGCTGCTGCCTG
TGCTTAGCTACAAAACAATCAAAGCCTAGGGTTTTTGGTTTGATCTTCGGAGAGGGTTGG
GTTGGTTCGCAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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CT
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CGCAATTTACTGGTGCGGATCCATTATTGCCAACCATCATCATCCCATTGCATACTTCTG
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DS 



AS 1 6

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TGAATGCATTAACCCCAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AQ82TF U 1
AF RR4A822TF U 1
AF RR4AQ70TF U 1
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ79TF U 1
AF RR4AD16TF U 63
AF RR4AY42TF U 256
AF RR4CZ79JQ C 541
AF RR4AD16JQ C 285
AF RR4AY42JQ C 382
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BS 358 358 RR4AD16TF
BS 359 587 RR4CZ79TF
BS 588 648 RR4AD16TF
BS 649 649 RR4AY42TF
BS 650 816 RR4AD16TF
BS 817 817 RR4AY42TF
BS 818 856 RR4AD16TF
BS 857 857 RR4AY42TF
BS 858 897 RR4AD16TF
BS 898 971 RR4AY42TF
BS 972 1159 RR4AD16JQ
BS 1160 1213 RR4AY42JQ

RD RR4CZ79TF 587 0 0
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AGTCGGCGCAGAGAGATAGAGATGGAGGAAGCTCAGAAGATACAGTCTTTGTTCATCTAT
CCAATCAAATCTTGCCGTGGAATCTCCGTCCCTCAGGCAACCGTAACTCAGACTGGATTT
CAATGGGACCGGTATTGGTTAGTGGTGAACTACAAAGGAAGAGCATACACTCAAAGAGTT
GAGCCAAAGCTTGCTCTTGTCGAATCTGAGCTGCCTAAGGAAGCCTTCTTGGAAGATTGG
GAGCCAACAAAAGACTCATTTTTGGTGGTAAAAGCTCCAGGTATGAGTCCGTTAAAGTTT
CCATTGACTAAGCCGACCTCGATCGCAGAAGGTGTGTCTATGTGGGAGTGGTCTGGCTCT
GCGTTTGATGAGGGAGAAGAAGCTGCAAAATGGTTTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGC
CGTTTGGTTCGGTTTAACAAAGAAACTGAAACCAGGCCTTCACCTCCTGAGTTTGCAGCA
GGCTATTCTACAACGTTTACAGATATGTTCCCCTTCTTGTTTGCATC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4AD16TF 835 0 0
GG
GGCGCAGAGAGATAGAGATGGAGGAAGCTCAGAAGATACAGTCTTTGTTCATCTATCCAA
TCAAATCTTGCCGTGGAATCTCCGTCCCTCAGGCAACCGTAACTCAGACTGGATTTCAAT
GGGACCGGTATTGGTTAGTGGTGAACTACAAAGGAAGAGCATACACTCAAAGAGTTGAGC
CAAAGCTTGCTCTTGTCGAATCTGAGCTGCCTAAGGAAGCCTTCTTGGAAGATTGGGAGC
CAACAAAAGACTCATTTTTGGTGGTAAAAGCTCCAGGTATGAGTCCGTTAAAGATTCCAT
TGACTAAGCCGACCTCGATCGCAGAAGGTGTGTCTATGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGT
TTGATGAGGGAGAAGAAGCTGCAAAATGGTTTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGCCGTT
TGGTTCGGTTTAACAAAGAAACTGAAACCAGGCCTTCACCTCCTGAGTTTGCAGCAGGCT
ATTCTACAACGTTTACAGATATGTTCCCCTTCTTGTTTGCATCTCAGGCTTCTTTAGACC
AGCTGAATACACTACTACCAGAACCGGTGCCTATTAACCGTTTTTGACCAAATTTTCTTG
TGGATAACTGTGATCCTTTTGGGGAAGATCTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAATTAG
TCTTCCAAGGAGTTAGGCTGTGTAGCCGCTGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAAACCG
GAGTTCCAGATGTAGCAGAACCAACTGAAACTTTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCT
TAGTGCCAGACA*GAAGCCACGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTT

QA 3 835 3 835
DS 

RD RR4AY42TF 716 0 0
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TCATTTTTGGTGGTAAAAGCTCCAGGTATGAGTCCGTTAAAGATTCCATTGACTAAGCCG
ACCTCGATCGCAGAAGGTGTGTCTATGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGTTTGATGAGGGA
GAAGAAGCTGCAAAATGGTTTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGCCGTTTGGTTCGGTTT
AACAAAGAAACTGAAACCAGGCCTACACCTCCTGAGTTTGCAGCAGGCTATTCTACAACG
TTTACAGATATGTTCCCCTTCTTGTTTGCATCTCAGGCTTCTTTAGACCAGCTGAATACA
CTACTACCAGAACCGGTGCCTATTAACCGTTTTCGACCAAATTTTCTTGTGGATAACTGT
GATCCTTTTGGGGAAGATCTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAATTAGTCTTCCAAGGA
GTTAGGCTGTGTAGCCGCTGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAAACCGGAGTTCCAGAT
GTAGCAGAACCAACTGAAACTCTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGAC
AAGAAGCCACGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGC
AACAGTGAAGGCAAAGGCAATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGT

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DS 

RD RR4CZ79JQ 576 0 0
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GACCAGCTGAATACACTACTACCAGAACCGGTGCCTATTAACCGTTTTCGACCAAATTTT
CTTGTGGATAACTGTGATCCTTTTGGGGAAGATCTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAA
TTAGTCTTCCAAGGAGTTAGGCTGTGTAGCCGCTGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAA
ACCGGATTTCCAGATGTAGCAGAACCAACTGAAACTCTGATGAAATTCAGATCAGACAAA
GTCTTAGTGCCAGACAAGAAGCCACGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGG
AACTGGAACATAAGCAACAGTGAAGGCAAAGGCAATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACC
ATTTCTGTTGTAAGGAAGATGCCTTCCAGAGCTGAAGCCGCTGTTTAACTCCCAACATAT
TTGCTTTTCTTCCTTTTCTTCTTCTGTGTGTTATCTTCTTGTTATCTCTAAACTAAAGTT
ATCATCTAAATCAAACAAACTTCACTT
GTTTTGAGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4AD16JQ 876 0 0
CC
TCTTGGAAGATTGGGAGCCAACAAAAGACTCATTTTTGGTGGTAAAAGCTCCAGGTATGA
GTCCGTTAAAGATTCCATTGACTAAGCCGACCTCGATCGCAGAAGGTGTGTCTATGTGGG
AGTGGTCTGGCTCTGCGTTTGATGAGGGAGAAGAAGCTGCAAAATGGTTTTCAGATTATC
TTGGCAAACAAAGCCGTTTGGTTCGGTTTAACAAAGAAACTGAAACCAGGCCTTCACCTC
CTGAGTTTGCAGCAGGCTATTCTACAACGTTTACAGATATGTTCCCCTTCTTGTTTGCAT
CTCAGGCTTCTTTAGACCAGCTGAATACACTACTACCAGAACCGGTGCCTATTAACCGTT
TTTGACCAAATTTTCTTGTGGATAACTGTGATCCTTTTGGGGAAGATCTTTGGGATGAAA
TCAAGATTAACGAATTAGTCTTCCAAGGAGTTAGGCTGTGTAGCCGCTGCAAGGTACCAC
TTGTGAATCAAGAAACCGGAGTTCCAGATGTAGCAGAACCAACTGAAACTTTGATGAAAT
TCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGACAAGAAGCCACGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTA
AGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGCAACAGTGAAGGCAAAGGCAATAAGACAATCA
AAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGTAAGGAAGATGCCTTCCAGAGCTGAAGCCGCTGTTT
AACTCCCAACATATTTGCTTTTCTTCCTTTTCTTCTTCTGTGTGTTATCTTCTTGTTATC
TCTAAACTAAAGTTATCATCTAAATCAAACAAACTTCACTTGTTCTGAGAGATACATCTT
GTTGAATGTGTGATCATGTTTTTCTGTTTTGAC
C

QA 3 875 3 875
DS 

RD RR4AY42JQ 832 0 0
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GCTGCAAAATGGTTTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGCCGTTTGGTTCGGTTTAACAAA
GAAACTGAAACCAGGCCTACACCTCCTGAGTTTGCAGCAGGCTATTCTACAACGTTTACA
GATATGTTCCCCTTCTTGTTTGCATCTCAGGCTTCTTTAGACCAGCTGAATACACTACTA
CCAGAACCGGTGCCTATTAACCGTTTTCGACCAAATTTTCTTGTGGATAACTGTGATCCT
TTTGGGGAAGATCTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAATTAGTCTTCCAAGGAGTTAGG
CTGTGTAGCCGCTGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAAACCGGAGTTCCAGATGTAGCA
GAACCAACTGAAACTCTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGACAAGAAG
CCACGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGCAACAGT
GAAGGCAAAGGCAATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGTAAGGAAGATG
CCTTCCAGAGCTGAAGCCGCTGTTTAACTCCCAACATATTTGCTTTTCTTCCTTTTCTTC
TTCTGTGTGTTATCTTCTTGTTATCTCTAAACTAAAGTTATCATCTAAATCAAACAAACT
TCACTTTTTCTGAGAGATACATCTTGTTGAATGTGTGATCATGTTTTTCTGTTTTGACTA
TTTTAAACTGTGCAATATTGCTACTATTTAATAAGTTCTCAGTTATAAACTT

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 6

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GATCCTTCCCCAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAAA
ATGGCTATGGCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAACAACAAAGAAGAGTTCA
ACAACAAGAACAACAAGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCC
TGAGCGAGACCGAAGAGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGA
GCTACGACAACAACCGTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAAGTACGATGAAAACGTCA
AGGAAGAGTTCAACAACAATAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAACAACA
ACAAGTACGACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAAAG
GTATCTACAACTCCAACGCTTACGGAACGGAGTTAGAGCGTGAAACGCCGTACAAAGGTT
ACAGCCACAACTTGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGGTTCATGGAAAAGGGTAACT
ACTACTATGACCTTTACAACGACAGAAACCACGGCCACTTCTACCGGAAGCCTCATCAGA
AAAGCCCTGCCGGTTATTATTCTTCTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAGTCGTACA
ACAACTACAACAATGAGGAGGAGAAGAGCTTCAAGGATCAGTACAATCCAAAGTGGGAGA
AGAACATGATGAACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAGTTCAAGC
CTTGATGAAGATTTGATGTTTGATTTCCTCTCAAGATCATTACAATCTTAAAAGTGTTTT
CTTTTATTTCAACTAAGTTATGTTACTTCTGGTTGATTAGTCAAACTAAGTCGTTGTTAT
ATCATTGCAAGTGAAAAAGGGAAAAGGGGAGGGGTTTGTGTTTTCTTTTAGTTGAAATGG
GTTTGCTTTTTATGGGATTTTGAACTTTGATGTTTGCGTTTGCATATAATATTCGAAGAA
AAAACAGTAAAATATATGGTGCTACTTTATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX65TF U 1
AF RR4DP86TF U 114
AF RR4AK26JQ C 288
AF RR4DP86JQ C 329
AF RR4AK26TF U 288
AF RR4EX65JQ C 429
BS 1 124 RR4EX65TF
BS 125 125 RR4DP86TF
BS 126 461 RR4EX65TF
BS 462 462 RR4DP86TF
BS 463 629 RR4EX65TF
BS 630 630 RR4DP86TF
BS 631 673 RR4EX65TF
BS 674 707 RR4DP86TF
BS 708 708 RR4AK26TF
BS 709 709 RR4DP86TF
BS 710 710 RR4AK26TF
BS 711 844 RR4DP86TF
BS 845 845 RR4AK26TF
BS 846 861 RR4DP86TF
BS 862 1043 RR4AK26TF
BS 1044 1053 RR4EX65JQ

RD RR4EX65TF 673 0 0
GATCCTTCCCCAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAAA
ATGGCTATGGCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAACAACAAAGAAGAGTTCA
ACAAGAAGAACAACAAGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCC
TGAGCGAGACCGAAGAGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGA
GCTACGACAACAACCGTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAAGTACGATGAAAACGTCA
AGGAAGAGTTCAACAACAATAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAACAACA
ACAAGTACGACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAAAG
GTATCTACAACTCCAACGCTTACGGAACGGAGTTAGAGCGTAAAACGCCGTACAAAGGTT
ACAGCCACAACTTGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGGTTCATGGAAAAGGGTAACT
ACTACTATGACCTTTACAACGACAGAAACCACGGCCACTTCTACCGGAAGCCTCATCAGA
AAAGCCCTGCCGGTTATTATTCTTCTCAG*CGACCGAGAATAACTACGACCAGTCGTACA
ACAACTACAACAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4DP86TF 750 0 0
GAGTTCAACAACAAGGACAACAAGTACGATGAAAAATTCAACTGTGAGACTTTCTCAACT
CCAAGCCTGAGCGAGACCGAAGAGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAG
ACCGAGAGCTACGACAACAACCGTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAAGTACGATGAA
AACGTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTC
AACAACAACAAGTACGACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCCGAGAACAACCAAGAC
AAGAGAGGTATCTACAACTCCAACGCTTACGGAACGGAGTTAGAGCGTGAAACGCCGTAC
AAAGGTTACAGCCACAACTTGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGTTTCATGGAGAAA
GGTAACTACTACTACGACCTTTACAACGACAGAAACCACGGCCATTTCTACCGGAAGCCT
CATCAGAAAAGCCCTGCCGGTTACTATTCTTCTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAG
TCGTACAACAACTACAACAATGAGGAGGAGAAGAGCTTCAAGGATCAGTACAATTCCAAG
TGGGAGAAGAACATGATGAACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAG
TTCAAGCCTTGATGAAGATTTGATGTTTGATTTCCTCTCAAGATCATTACAATCTTAAAA
GTGTTTTCTTT*ATTTCAACTAAGTTAT
TT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4AK26JQ 756 0 0
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GAGTTCAACAACAACAAGTACGACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAAT
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AGGCTCTCTCTCCAGCAACCCTTCTCTCTGAGCTAAACACAATAGGAGGGAAACACGGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4C596JQ C 385
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AG

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G

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CTTCACGGACTTTGTAAAGCGTTATCTTATGAGCCCTCAAGAACTTGGAAGTAAAACTAG
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TTTTCGCATCAGAAACCGCAGATTCTGGATTCGCGGTGGGTAAGCTGGCAACGACGGCGA
TTGGGATCTTTCTGCGTGAGGAGACGGAGGCGGGAGAATCGAGAGAGAGAGAAGAATCAC
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GTGACGGAGAAGGTAGTTTCTGGTTGTAGAAAGAATCGATCTTTAGGTTCGCCAAAGTAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H644JQB U 1
AF RR4CZ52JQ U 10
AF RR4F794JQ U 10
AF RR4H644TF C 94
AF RR4F794TF C 101
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BS 708 708 RR4F794TF
BS 709 894 RR4H644TF

RD RR4H644JQB 616 0 0
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TGCAAACTGCAACCATAAATTTGGAGACTTTAGTATGAAAATTAAGATGGCATAAATGGA
GGATGATAAATGTAACAAAGACACACTATTCATCAGGAAATCCAGATTCAGAGGCAAAGG
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GAGATTCAACTTCATACCAGATTCCCAGCAATATATGGGCTGGCATTATTTCCCCAATAC
CACCTGCTTTGAGATTCTGATTGACAGCAGAGTCAAGAGCTCTCTGTGCATCTTGGGTTA
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CTTCACGGACTTTGTAAAGCGTTATCTTATGAGCCCTCAAGAACTTGGAAGTAAAACTAG
TCCCTTCAACCAAGATACCCATGAGAAGTGATTCAGTACCAGTGTTGGGATACTTGAGCT
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TTTTCGCATCAGAAAC

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DS 

RD RR4CZ52JQ 606 0 0
CA
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ACCATAAATTTGGAGACTTTAGTATGAAAATTAAGATGGCATAAATGGAGGATGATAAAT
GTAACAAAGACACACTATTCATCAGGAAATCCAAATTCAAAGGCAAAGGACTCTAACTCT
GTAGCTTTTTCATCAGTGAAACCAAAAGTTGCCAGTATCTTGTGACCAGGAAATTCAACT
TCATACCAAATTCCCAGCAATATATGGGCTGGCATTATTTCCCCAATACCACCTGCTTTG
AAATTCTGATTGACAGCAAAGTCAAAAGCTCTCTGTGCATCTTGGGTTAAAGGAGGATGT
TCAGGGCTGAAGGAATACAAATCACCTTTACCTAGTAACTTGACTGTTTCTTCACGGACT
TTGTAAAGCGTTATCTTATGAGCCCTCAAGAACTTGGAAGTAAAACTAGTCCCTTCAACC
AAAATACCCATGAAAAGTGATTCAGTACCAGTGTTGGGATACTTGAGCTTCCTAGCTTCC
AGCTCCCCCATTGCAAATGATTTGATTCCTCTCCATGACCATTTTGGCTTTTTCGCATCA
AAAA

QA 3 602 3 602
DS 

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CC
AAGAAGTGAAAATTAATAATCAGTAGGATGAACAGATAAGTAACATCATTGCAAACTGCA
ACCATAAATTTGGAGACTTTAGTATGAAAATTAAGATGGCATAAATGGAGGATGATAAAT
GTAACAAAGACACACTATTCATCAGGAAATCCAGATTCAGAGGCAAAGGACTCTAACTCT
GTAGCTTTTTCATCAGTGAAACCAAGAGTTGCCAGTATCTTGTGACCAGGAGATTCAACT
TCATACCAGATTCCCAGCAATATATGGGCTGGCATTATTTCCCCAATACCACCTGCTTTG
AGATTCTGATTGACAGCAGAGTCAAGAGCTCTCTGTGCATCTTGGGTTAAAGGAGGATGT
TCAGGGCTGAAGGAATACAAATCAGCTTTACCTAGTAACTTGACTGTTTCTTCACGGACT
TTGTAAAGCGTTATCTTATGAGCCCTCAAGAACTTGGAAGTAAAACTAGTCCCTTCAACC
AAGATACCCATGAGAAGTGGTTCAGTACCAGTGTTGGGATACTTGAGCTTCCTAGCTTCC
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GAAACCGCAGATTCTGGATTCGCGGTGGGTAAGCTGGCAACGACGGCGATTGGGATCTTT
CTGCGTGAGG

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DS 

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AAATTAAGATGGCATAAATGGAGGATGATAAATGTA*CAAAGACACACTATTCATCAGGA
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TTACCTAGTAACTTGACTGTTTCTTCACGGACTTTGTAAAGCGTTATCTTATGAGCCCTC
AAGAACTTGGAAGTAAAACTAGTCCCTTCAACCAAGATACCCATGAGAAGTGATTCAGTA
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GGATTTCTTGTGGAGAAGAAGTGTGACGGAGAAGGTAGTTTCTGGTTGTAGAAAGAATCG
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AGAAAGTGGTGTTTCC

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TCCAGATTCAGAGGCAAAGGACTCTAACTCTGTAGCTTTT*CATCAGTGAAACCAAGAGT
TGCCAGTATCTTGTGACCAGGAGATTCAACTTCATACCAGATTCCCAGCAATATATGGGC
TGGCATTATTTCCCCAATACCACCTGCTTTGAGATTCTGATTGACAGCAGAGTCAAGAGC
TCTCTGTGCATCTTGGGTTAAAGGAGGATGTTCAGGGCTGAAGGAATACAAATCAGCTTT
ACCTAGTAACTTGACTGTTTCTTCACGGACTTTGTAAAGCGTTATCTTATGAGCCCTCAA
GAACTTGGAAGTAAAACTAGTCCCTTCAACCAAGATACCCATGAGAAGTGGTTCAGTACC
AGTGTTGGGATACTTGAGCTTCCTAGCTTCCAGCTCCCCCATTGCAAATGATTTGATTCC
TCTCCATGACCATTTTGGCTTTTTCGCATCAGAAACCGCAGATTCTGGATTCGCGGTGGG
TAAGCTGGCAACGACGGCGATTGGGATCTTTCTGCGTGAGGAGACGGAGGCGGGAGAATC
GAGAGAGAGAGAAGAATCACCGCGCATCCATGGATTCGTCAGGTTCGGGGATTTTAATGG
ATTTCTTGTGGAGAAGAAGTGTGACGGAGAAGGTAGTTTCTGGTTGTAGAAAGAATCGAT
CTTTAGGTTCGCCAAAGTAAAAGATTGAGCAGCCATTTCTGTCGCGGAGAAAGGACTGAG
AAAGTGGTGTTTCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 6

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CGACGAATCTGATTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACACCTTTCGTGTTTGAATTTGC
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CTTCTGCAGCCCCAAGCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGGCAGACGAACAGGGCGG
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CACATCATCACGAGAGCTTTATGGAGTCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCA
ATTCGATCCCTGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTA
ATATAACAGAGGAAGAAGAAGAGGATGTTGCTGCTGATGATGATGACAACGACGACGGTT
GCTTGGATGACTGGGAGGCCTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATG
AGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGCATGAGAGTGTCAAGCAATCAGCTTCGCTTAGGG
ATTCATCTGATGTGAAGCCTGTAAGGAAGCAAAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACG
ATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGGAAGCAGCGTAGTTTTCCTGTCATGA
ACATGCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCATGCCCCATCTGCTACGAGGATCTGG
ACTTGACGGATTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTCTGCCTTTTCTGCC
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ACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCGTT
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CTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTGTCTTTTGGCACCTAAGAACTATATG
ATGTATGTTCTTCTATGTCAGCGACTTCTTCTTCGTCTGAAACATGTGGTTGTGGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC64TF U 1
AF RR4A340TF U 768
AF RR4A340TFB U 131
AF RR4A340JQ C 381
AF RR4A340JQD C 481
AF RR4AC64JQ C 396
BS 1 567 RR4AC64TF
BS 568 568 RR4A340TFB
BS 569 603 RR4AC64TF
BS 604 604 RR4A340TFB
BS 605 794 RR4AC64TF
BS 795 893 RR4A340TFB
BS 894 894 RR4A340JQ
BS 895 963 RR4A340TFB
BS 964 970 RR4A340JQ
BS 971 971 RR4A340JQD
BS 972 1297 RR4A340JQ
BS 1298 1319 RR4AC64JQ

RD RR4AC64TF 794 0 0
GGACAGACACAACAAACAAAGAAAGATAACAATAAAAAATCGCACAGCTCCTTGTCCGCG
CGACGAATCTGATTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACACCTTTCGTGTTTGAATTTGC
GATATCGGAATCAGCTGCGAAAAAAAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAACGCATCTG
CTTCTGCAGCCCCAAGCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGGCAGACGAACAGGGCGG
CGAAATTGAAACAGAGCAAGCTTGGTCTCCACCGTGAGCAATGGCTTTCTCAAGTTGCGA
TGATCAACAAAGGGGATAAGGAGGAGACGTGTCCGAATCGAAAAACTGGAAGTGAAAAAA
CCGTTCAGAGAGATCCTCCGGTTGAGAATTTAGAAGGGCAGCGTGGAGGGGAAGAAGAAG
CACATCATCACGAGAGCTTTATGGAGTCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCA
ATTCGATCCCTGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTA
ATATAACAGAGGAAGAAGAAGAGGATGCTGCTGCTGATGATGATGACAACGACGACGGTT
GCTCGGATGACTGGGAGGCCTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATG
AGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGCATGAGAGTGTCAAGCAATCAGCTTCGCTTAGGG
ATTCATCTGATGTGAAGCCTGTAAGGAAGCAAAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACG
ATAAGCTCCGTCCT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4A340TF 137 0 0
TGGAGGGCAGACGATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGGAAGCAGCGTAGT
TTTCCTGTCATGAACATGCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCATGCCTCATCTGC
TACGAG*ATCTGGACTT

QA 1 137 1 137
DS 

RD RR4A340TFB 845 0 0
TCAGCTGCGAAAAAAAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAACGCATCTGCTTCTGCAGC
CCCAAGCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGGCAGACGAACAGGGCGGCGAAATTGAA
ACAGAGCAAGCTTGGTCTCCGCCGTGAGCAATGGCTTTCTCAAGTTGCGATGATCAACAA
AGGGGATAAGGAGGAGACGTGTCCGAATCGAAAAACTGGAAGTGAAAAAACCGTTCAGAG
AGATCCTCCGGTTGAGAATTTAGAAGGGCAGCGTGGAGGGGAAGAAGAAGCACATCATCA
CGAGAGCTTTATGGAGTCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCAATTCGATCCC
TGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTAATATAACAGA
GGAAGAAGAAGAGGATGTTGCTGCTGATGATGATGACAACGACGACGGTTGCTTGGATGA
CTGGGAGGCCTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATGAGAAAGTGAA
TCCTCCTCCTGAAGAGCATGAGAGTGTCAAGCAATCAGCTTCGCTTAGGGATTCATCTGA
TGTGAAGCCTGTAAGGAAGCAAAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACGATAAGCTCCG
TCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGGAAGCAGCGTAGTTTTCCTGTCATGAACATGCATTT
TAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCATGCCCCATCTGCTACGAG*ATCTGGACTTGACGGA
TTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTCTGCCTTTTCTGCCACA
GACGATCTGCGA

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DS 

RD RR4A340JQ 919 0 0
GGTTGAG
ATTTAGAAGGGCAGCG*GGAGGG*AAGAAGAAGCACATCATCACGAGAGCTTTATGGAGT
CATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCAATTCGATCCCTGATTTTAGCAGCGGGA
GTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTAATATAACAGAGGAAGAAGAAGAGGATG
TTGCTGCTGATGATGATGACAACGACGACGGTTGCTTGGATGACTGGGAGGCCTTTGCTG
ATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATGAGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGC
ATGAGAGTGTCAAGCAATCAGCTTCGCTTAGGGATTCATTTGATGTGAAGCCTGTAAGGA
AGCAAAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACGATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTA
ATCTGGGGAAGCAGCGTAGTTTTCCTGTCATGAACATGCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGC
CGTCTTCATGCCCCATCTGCTACGAGGATCTGGACTTGACGGATTCTAGTTTCTTGCCAT
GCCCTTGTGGATTCCGGCTCTGCCTTTTTTGCCACAAGACGATTTGCGATGGAGATGGGC
GTTGTCCGGGTTGCAGGAAGCCGTATGAAAAGAACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTC
ACGCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCGTTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTGAA
GTAAAGAGGATATGGGTTTTCTCGGACTGTGTCTGTTTGTTTTCTTTTCTTTTTTTCTCC
TTTCCCTTCGCATGTTCTATGTTTTTCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTAT
AGCATTTGTCTTTTGGCACCTAAGAACTATATGATGTATGTTCTTCTATGTCAGCGACTT
CTTCTTCGTC
CG

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DS 

RD RR4A340JQD 819 0 0
ATTCGATCCCTGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTA
ATATAACAGAGGAAGAAGAAGAGGATGTTGCTGCTGATGATGATGACAACGACGACGGTT
GCTTGGATGACTGGGAGGCCTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATG
AGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGCATGAGAGTGTCAAGCAATCAGCTTCGCTTAGGG
ATTCATCTGATGTGAAGCCTGTAAGGAAGCAAAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACG
ATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGGAAGCAGCGTAGTTTTCCTGTCATGA
ACATGCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCATGCCCCATCTGCTACGAGGATCTGG
ACTTGACGGATTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTCTGCCTTTTCTGCC
ACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCGGGTTGCAGGAAGCCGTATGAAAAGA
ACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCGTT
CCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTGAAGTAAAGAGGATATGGGTTTTCTCGGACTGTGTC
TGTTTGTTTTCTTTTCTTTTTTTCTCCTTTCCCTTCGCATGTTCTATGTTTTTCACATGT
CTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTGTCTTTTGGCACCTAAGAACTATATG
ATGTATGTTCTTCTATGTCAGCGACTTCTTCTTCGTC
CG

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DS 

RD RR4AC64JQ 924 0 0
GGGCAGCGTGGAG
GGGAAGAAGAAGCACATCATCACGAGAGCTTTATGGAGTCATCGCTTTCGAATAGCCCCA
ACAGTATCCTCAATTCGATCCCTGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCT
CTTGCTCTGGTAATATAACAGAGGAAGAAGAAGAGGATGCTGCTGCTGATGATGATGACA
ACGACGACGGTTGCTCGGATGACTGGGAGGCCTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAG
AAAAAAAGCATGAGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGCATGAGAGTGTCAAGCAATCAG
CTTCGCTTAGGGATTCATCTGATGTGAAGCCTGTAAGGAAGCAAAAGAGCAACCAGGCGT
GGAGGGCAGACGATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGGAAGCAGCGTAGTT
TTCCTGTCATGAACATGCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCATGCCCCATCTGCT
ACGAGGATCTGGACTTGACGGATTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTCT
GCCTTTTCTGCCACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCGGGTTGCAGGAAGC
CGTATGAAAAGAACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTGACTATTA
GGCTTGCTCGTTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTGAAGTAAAGAGGATATGGGTTTTC
TCGGACTGTGTCTGTTTGTTTTCTTTTCTTTTTT*CTCCTTTCCCTTCGCATGTTCTATG
TTTTTCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGTATTTGTCTTTTGGCACCT
AAGAACTATATGATGTATGTTCTTCTATGTCAGTGACTTCTTCTTCGTCTGAAACATGTG
GTTGTGGTGAC

QA 14 924 14 924
DS 



AS 1 6

CO CL1673Contig1 1303 6 27 U
GGAATACAAGATCTCGACTCTCTCTTCTACGAAGGAAGGAGAATCTCCCCCATGGCTGCT
CTACAATACCTCGAATCTCAGAAAAACTCGCACCCAGACCTCACCGAGTGGTACAATTCG
CTCGCAGATCTGTACCAGAAGAAGCTATGGCACCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTC
ATCGCCCTCTCCGTCTTTCAGGCTGGAGATGCTTTGATACAGCTTTACAACAACTTCATA
ACCGACTTTGAGACGAAGATCAACCTCCTGAAGCTAGCCCACTTCGCGGTCGTTGTCTCA
AGGCAGTACCCTGAGAAAGAACCTGCGGTTAGTTATCTCCAGGGAGTGATTGAGAAGCTT
AGAGCGACTAAGGAGTCGCGGATCAGTGAGCCGGTTAGCTATGTAGAAACGCAGATAGCT
TTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGACCAGAAGGAGTGCAAGAAGATACTTGACGATGTTAAA
AGCTCTCTCGATAGTATGACTGATATCGATCCGTCGGTGTATGCCAACTTCTTCTGGGTG
TCTTCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAGAATGCTCTTCTT
TATCTTGCGTATACCTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCTTTT
GATCTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTGGGGAACTGTTAGCC
CATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTACAG
GCGTTCAACCACGGTGATTTGGTTCAGTACCAAGAACTCTGCCGTGTTCACAATGCAGCC
TTGAGCGCACAACCAGCATTGGTTGAGAATGAGAAGAAGCTGTTAGAGAAGATCAACATT
CTCTGCCTTATTGAGATCATTTTCAGCCGACCAGCTGAAGATAGGACCATACCGTTGAGT
GTCATTGCTGAGCGTACTAAGCTCTCAATCGAAGATGTTGAGCACCTTCTCATGAAGAGC
TTATCTGTCCACTTGATAGAGGGGATAATAGACCAGGTGGATGGAACGGTGCATGTCTCA
TGGGCGCAACCGAGGGTGCTAGGGATACCGCAGATCAAGTCATTGAGGGATCAGCTAGAT
AGCTGGGTTGATAAGGTTCACACGACCTTGTTGTCCGTTGAGGCTGAGACACCTGATCTT
GTTGCAGTTTAAAACTCTTGTTTCTTCTTTGTTTTCCTTTTGAGCTACAAGATTGTGTAT
CATTTTGCTGGATACTCTTAATGCAACTTCTTTCCCTTTTTAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ31TF U 1
AF RR4DO71TF U 244
AF RR4DW31TF U 244
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AF RR4DJ31JQ C 538
AF RR4DO71JQ C 684
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BS 999 999 RR4DW31TF
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BS 1022 1296 RR4DW31JQ
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CTCGCAGATCTGTACCAGAAGAAGCTATGGCACCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTC
ATCGCCCTCTCCGTCTTTCAGGCTGGAGATGCTTTGATACAGCTTTACAACAACTTCATA
ACCGACTTTGAGACGAAGATCAACCTCCTGAAGCTAGCCCACTTCGCGGTCGTTGTCTCC
AGGCAGTACCCTGAGAAAGAAGCTGCGGTTAGTTATCTCCAAGGAGTGATTGAGAAGCTT
AGAGCTACTAAGGAGTCGCGGATCAGTGAGCCGGTTAGCTATGTAGAAACGCAGATAGCT
TTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGACCAGAAGGAGTGCAAGAAGATACTTGACGATGTTAAA
AGCTCTCTCGATAGTATGACTGATATCGATCCGTCGGTGTATGCCAACTTCTACTGGGTG
TCTTCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAGAATGCTCTTCTT
TATCTTGCGTATACTTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCTTTT
GATCTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGA*TATTTACAACTTTGGGGAACTGTTAGCT
CATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGG

QA 1 746 1 746
DS 

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TTCAAGCTTGAGCAAGGTGACCAGAAGGAGTGCAAGAAGATACTTGACGATGTTAAAAGC
TCTCTCGATAGTATGACTGATATCGATCCGTCGGTGTATGCCAACTTCTTCTGGGTGTCT
TCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAGAATGCTCTTCTTTAT
CTTGCGTATACCTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCTTTTGAT
CTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTGGGGAACTGTTAGCCCAT
CCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTACAGGCG
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TGCCTTATTGAGATCATTTTCAGCCGACCAGCTGA*GATAGGAC*ATACCGTTGAGTGTC
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DS 

RD RR4DW31TF 783 0 0
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CAGTACCCTGAGAAAGAACCTGCGGTTAGTTATCTCCAGGGAGTGATTGAGAAGCTTAGA
GCGACTAAGGAGTCGCGGATCAGTGAGCCGGTTAGCTATGTAGAAACGCAGATAGCTTTG
TTCAAGCTTGAGCAAGGTGACCAGAAGGAGTGCAAGAAGATACTTGACGATGTTAAAAGC
TCTCTCGATAGTATGACTGATATCGATCCGTCGGTGTATGCCAACTTCTTCTGGGTGTCT
TCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAGAATGCTCTTCTTTAT
CTTGCGTATACCTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCTTTTGAT
CTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTGGGGAACTGTTAGCCCAT
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ATTGCTGAGCGTACTAAGCTCTCAATCGA*GATGTTGAGCAC*TTCTCATGAAGAGCT
ATCTG

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RD RR4DW31JQ 813 0 0
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TCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAGAATGCTCTTCTTTAT
CTTGCGTATACCTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCTTTTGAT
CTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTGGGGAACTGTTAGCCCAT
CCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTACAGGCG
TTCAACCACGGTGATTTGGTTCAGTACCAAGAACTCTGCCGTGTTCACAATGCAGCCTTG
AGCGCACAACCAGCATTGGTTGAGAATGAGAAGAAGCTGTTAGAGAAGATCAACATTTTC
TGCCTTATTGAGATCATTTTCAGCCGACCAGCTGAAGATAGGACCATACCGTTGAGTGTC
ATTGCTGAGCGTACTAAGCTCTCAATCGAAGATGTTGAGCACCTTCTCATGAAGAGCTTA
TCTGTCCACTTGATAGAGGGGATAATAGACCAGGTGGATGGAACGGTGCATGTCTCATGG
GCGCAACCGAGGGTGCTAGGGATACCGCAGATCAAGTCATTGAGGGATCAGCTAGATAGC
TGGGTTGATAAGGTTCACACGACCTTGTTGTCCGTTGAGGCTGAGACACCTGATCTTGTT
GCAGTTTAAAACTCTTGTTTCTTCTTTGTTTTCCTTTTGAGCTACAAGATTGTGTATCAT
TTTGCTGGATACTCTTAATGCAACTTCTTTCCC

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DS 

RD RR4DJ31JQ 766 0 0
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CTTTATCTTGCGTATACTTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCT
TTTGATCTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTGGGGAACTGTTA
GCTCATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTA
CAGGCGTTCAACCACGGTGATTTGGTTCAGTACCAAGAACTCTGCCGTGTTCACAATGCA
GCCTTGAGCGCACAGCCAGCATTGGTTGAGAATGAGAAGAAGCTGTTAGAGAAGATCAAC
ATTCTCTGCCTTATTGAGATCATTTTCAGCCGACCAGCTGAAGATAGGACAATACCGTTG
AGTGTCATTGCTGAGCGTACTAAGCTCTCAATCGAAGATGTTGAGCACCTTCTCATGAAG
AGCTTATCCGTCCATTTGATTGAGGGAATAATAGACCAGGTGGATGGAACGGTGCATGTG
TCATGGGCGCAACCGAGGGTGCTAGGGATACCGCAGATCAAGTCATTGAGGGATCATCTA
GATAGCTGGGTTGATAAGGTTCACACGACCTTGTTGTCCGTTGAGGCTGAGACACCTGAT
CTTGTTGCAGTTTAAAACTCTTGTTTCTTCTTTGTTTTCCTTTTGAGCTACAAGATTGTG
TATCATTTTGCTGGATACTCTTAATGCAACTTCTTTCCCTTTTTAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4DO71JQ 613 0 0
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TGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTACAGGCGTTCAACCACGGTGATTTGGT
TCAGTACCAAGAACTCTGCCGTGTTCACAATGCAGCCTTGAGCGCACAACCAGCATTGGT
TGAGAATGAGAAGAAGCTGTTAGAGAAGATCAACATTCTCTGCCTTATTGAGATCATTTT
CAGCCGACCAGCTGAAGATAGGACCATACCGTTGAGTGTCATTGCTGAGCGTACTAAGCT
CTCAATCGAAGATGTTGAGCACCTTCTCATGAAGAGCTTATCTGTCCACTTGATAGAGGG
GATAATAGACCAGGTGGATGGAACGGTGCATGTCTCATGGGCGCAACCGAGGGTGCTAGG
GATACCGCAGATCAAGTCATTGAGGGATCAGCTAGATAGCTGGGTTGATAAGGTTCACAC
GACCTTGTTGTCCGTTGAGGCTGAGACACCTGATCTTGTTGCAGTTTAAAACTCTTGTTT
CTTCTTTGTTTTCCTTTTGAGCTACAAGATTGTGTATCATTTTGCTGGATACTCTTAATG
CAACTTCTTTCCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 6

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CTCTTTCTTCTCACTTCTTCTTCTTCATTTCCCCGCCGTTTCCTTGGGCCAGACGCTCTT
CGTCTTTGGCGATAGTCTTTACGACGCCGGCAACAAACAGTTCGTCTCTTCGAATCGTGT
CGACTCTAGATTTCCTCCGTATGGAGTTACTGTAGGAGAGGCTACGGGACGGTGGTCCGA
TGGTCGTATCATTCCCGACTATCTCGCTACTTTCATGGGTATTCCTGAAATCCCTCCGAT
TCTCCGAGGCACGGCGGATTTCACTCATGGAGCTAACTTTGCCATCGCGGACGCCACCGT
TCTCGGCTCCCCTCCGGAGACGTTGACTCTGTCACAACAAGTGATGAAGTTCTCTGACAA
CAAGAACAAATGGACAGCTCAAACACGTTCCGAAGCTATCTACTTGTTCTACATTGGCTC
TGATGATTACTTGAACTATGCAAAGAACAACCCGAATCCTTCTGATGATCAGAAAGAAGC
TTTTGTGGATCGAGTCATCACTTCTGTAGAAGCAGAACTAAAGGTGATTTACGGGTATGG
AGGCAGGAAGTTTGCGTTACAGAGCTTGGCACCGCTGGGTTGCTTACCGGCCGTCAAACA
AGCAAGCGGTAATGTTCAGGAATGCGTGAGATTGCCTTCGGAGATGGCGGCTTTGCATAA
CAAGAAGCTGATGCAGCTCTTGGTTGAACTTTCTCGACAACTCAGTGGTTTCCAGTACTC
TTTTTATGACTTCTTCAGCTCCATCCAGAACAGAGTTATCAAGTCTACGACTTACACATT
CGAGACGGGAATGGTTGCTTGTTGTGGAACTGGAAGCAGTTGCTCTACGAACAATGTATG
CGCTAACCCTGAAGACTATCTCTT*TTCGACGGTAAGCATTTGACACAAGAAGGGAACCT
TCAGGCTGGACATTTGATTTGGGGATCAGATCCGGAAGTGATTGGACCGAACAATCTCAG
GGAGCTTCTTTTCATTCCTTTGGACACTGAAGTCATCTTAGCTGATATACAGGAAGCTAG
AGATTCCACGAGGAGGCCGAGACAGATCAAGATTGAGAGTCTACATTATCAAGAAGTTGG
AATCAGTGATGGAGAACCAATGGCTTTATCAAGTTGATAAAGCTAGCTCCTTTCTGATCG
AAGATTGTGTTGCAATATTTGGTCAAAGCCAGAAAGATGGAGTTTAAGGAGTTATTGTAA
TAATAAGCAAAACAAGAAAAATGAGACTATCTTTTTCTTTTGTTTTGTGATAAAACAGTG
ATGTGGGTACAGATTGTGTTGCAATATGTGGTAAAAAAACCAAACATTATTATATTTCGA
GTTATTCTTGGATCCCCCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX76TF U 1
AF RR4EX76JQ C 590
AF RR4BB21JQ C 928
AF RR4BB21TF U 615
AF RR4DJ06TF U 621
AF RR4DJ06JQ C 621
BS 1 679 RR4EX76TF
BS 680 680 RR4BB21TF
BS 681 699 RR4EX76TF
BS 700 700 RR4BB21TF
BS 701 705 RR4EX76TF
BS 706 706 RR4DJ06TF
BS 707 863 RR4BB21TF
BS 864 864 RR4DJ06TF
BS 865 924 RR4BB21TF
BS 925 925 RR4DJ06TF
BS 926 972 RR4BB21TF
BS 973 973 RR4DJ06TF
BS 974 1218 RR4BB21TF
BS 1219 1219 RR4DJ06TF
BS 1220 1314 RR4BB21TF
BS 1315 1315 RR4DJ06TF
BS 1316 1352 RR4BB21TF
BS 1353 1373 RR4EX76JQ
BS 1374 1400 RR4DJ06JQ

RD RR4EX76TF 705 0 0
GGATTCCAACATCGCTTTGGTTTTCTCTCAATGGCGAATCCCAAATCTCACCTCCTCTCT
CTCTTTCTTCTCACTTCTTCTTCTTCATTTCCCCGCCGTTTCCTTGGGCCAGACGCTCTT
CGTCTTTGGCGATAGTCTTTACGACGCCGGCAACAAACAGTTCGTCTCTTCGAATCGTGT
CGACTCTAGATTTCCTCCGTATGGAGTTACTGTAGGAGAGGCTACGGGACGGTGGTCCGA
TGGTCGTATCATTCCCGACTATCTCGCTACTTTCATGGGTATTCCTGAAATCCCTCCGAT
TCTCCGAGGCACGGCGGATTTCACTCATGGAGCTAACTTTGCCATCGCGGACGCCACCGT
TCTCGGCTCCCCTCCGGAGACGTTGACTCTGTCACAACAAGTGATGAAGTTCTCTGACAA
CAAGAACAAATGGACAGCTCAAACACGTTCCGAAGCTATCTACTTGTTCTACATTGGCTC
TGATGATTACTTGAACTATGCAAAGAACAACCCGAATCCTTCTGATGATCAGAAAGAAGC
TTTTGTGGATCGAGTCATCACTTCTGTAGAAGCAGAACTAAAGGTGATTTACGGGTATGG
AGGCAGGAAGTTTGCGTTACAGAGCTTGGCACCGCTGGGTTGCTTACCGGCCGTCAAACA
AGCAAGCGGTAATGTTCAG*AATGCGTGAGATTGCCTTCTGAGAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4EX76JQ 785 0 0
TACGGGTATGGAGGCAGGAAGTTTGCGTTACAGAGCTTGGCACCGCTGGGTTGCTTACCG
GCCGTCAAACAAGCAAGCGGTAATGTTCAGGAATGCGTGAGATTGCCTTCGGAGATGGCG
GCTTTGCATAACAAGAAGCTGATGCAGCTCTTGGTTGAACTTTCTCGACAACTCAGTGGT
TTCCAGTACTCTTTTTATGACTTCTTCAGCTCCATCCAGAACAGAGTTATCAAGTTTACG
ACTTACACATTCGAGACGGGAATGGTTGCTTGTTGTGGAACTGGAAGCAGTTGCTTTACG
AACAATGTATGCGCTAACCCTGAAGACTATTTTTTTTTTGACGGTAAGCATTTGACACAA
GAAGGGAACCTTCAGGCTGGACATTTGATTTGGGGATCAGATCCGGAAGTGATTGGACCG
AACAATTTCAGGGAGCTTTTTTTCATTCCTTTGGACACTGAAGTCATTTTAGCTGATATA
CAGGAAGCTAGAGATTCCACGAGGAGGCCGAGACAGGTCAAGATTGAGAGTTTACATTAT
CAAGAAGTTGGAATCAGTGATGGAGAACCAATGGCTTTATCAAGTTGATAAAGCTAGCTC
CTTTTTGATCGAAGATTGTGTTGCAATATTTGGTCAAAGCCAGAAAGATGGAGTTTAAGG
AGTTATTGTAATAATAAGCAAAACAAGAAAAATGAGACTATCTTTTTCTTTTGTTTTGTG
ATAAAACAGTGATGTGGGTACAGATTGTGTTGCAATATGTGGTAAAAAAACCAAACATTA
TTAT
G

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4BB21JQ 425 0 0
CGACGGTAAGCATTTGACACAAGAAGGGAACCTTCAGGCTGGACACTTGATTTGGGGATC
AGATCCGGAAGTGATTGGACCGAACAATCTCAGGGAGCTTCTTTTCATTCCTTTGGACAC
TGAAGTCATCTTAGCTGATATACAGGAAGCTAGAGATTCCACGAGGAGGCCGAGACAGAT
CAAGATTGAGAGTCTACATTATCAAGAAGTTGGAATCAGTGATGGAGAACCAATGGCTTT
ATCAAGTTGATAAAGCTAGCTCCTTTCTGATCGAAGATTGTGTTGCAATATGTGGTCAAA
GCCAGAAAGATGGAGTTTAAGGAGTTATTGTAATAATAAGCAAAACAAGAAAAATGAGAC
TATCTTTTTCTTTTGTTTTGTGATAAAACAGTGATGTGGGTACAGATTGTGTTGCAATAT
GTGGT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4BB21TF 738 0 0
GGTTACA
GAGCTTGGCACCGCTGGGTTGCTTACCGGCCGTCAAACAAGCAAGCGGTAATGTTCAGGA
ATGCGTGAGATTGCCTTCGGAGATTGCGGCTTTGCATAACAAGAAGCTGATGCAGCTCTT
GGTTGAACTTTCTCGACAACTCAGTGGTTTCCAGTACTCTTTTTATGACTTCTTCAGCTC
CATCCAGAACAGAGTTATCAAGTCTACGACTTACACATTCGAGACGGGAATGGTTGCTTG
TTATGGAACTGGAAGCAGTTGCTCTACGAACAATGTATGCGCTAACCCTGAAGACTATCT
CTTCTTCGACGGTAAGCATTTGACACAAGAAGGGAACCTTCAGGCTGGACACTTGATTTG
GGGATCAGATCCGGAAGTGATTGGACCGAACAATCTCAGGGAGCTTCTTTTCATTCCTTT
GGACACTGAAGTCATCTTAGCTGATATACAGGAAGCTAGAGATTCCACGAGGAGGCCGAG
ACAGATCAAGATTGAGAGTCTACATTATCAAGAAGTTGGAATCAGTGATGGAGAACCAAT
GGCTTTATCAAGTTGATAAAGCTAGCTCCTTTCTGATCGAAGATTGTGTTGCAATATGTG
GTCAAAGCCAGAAAGATGGAGTTTAAGGAGTTATTGTAATAATAAGCAAAACAAGAAAAA
TGAGACTATCTTTTTCTTTTGTTTTGTGATAAA*CAGTGATGTGGGTACAGATTGTGTTG
CAATATGTGGT

QA 8 738 8 738
DS 

RD RR4DJ06TF 723 0 0
G
GAGCTTGGCACCGCTGGGTTGCTTACCGGCCGTCAAACAAGCAAGCGGTAATGTTCAGGA
ATGCGTGAGATTGCCTTCGGAGATGGCGGCTTTGCATAACAAGAAGCTGATGCAGCTCTT
GGTTGAACTTTCTCGACAACTCAGTGGTTTCCAGTACTCTTTTTATGACTTCTTCAGCTC
CATCCAGAACAGAGTTATCAAGTCTACGACTTACACATTCGAGACGGGAATGGTTGCTTG
TTGTGGAACTGGAAGCAGTTGCTCTACGAACAATGTATGCGCTAACCCTGAAGACTATCT
CTT**TCGACGGTAAGCGTTTGACACAAGAAGGGAACCTTCAGGCTGGACATTTGATTTG
GGGATCAGATCCGGAAGTGATTGGACCGAACAATCTCAGGGAGCTTCTTTTCATTCCTTT
GGACACTGAAGTCATCTTAGCTGATATACAGGAAGCTAGAGATTCCACGAGGAGGCCGAG
ACAGATCAAGATTGAGAGTCTACATTATCAAGAAGTTGGAATCAGTGATGGAGAACCAAT
GGCTTTATCAAGTTGATAAAGCTAGCTCCTTTCTGATCGAAGATTGTGTTGCAATATTTG
GTCAAAGCCAGAAAGATGGAGTTTAAGGAGTTATTGTAATAATAAGCAAAACAAGAAAAA
TGAGACTATCTTTTTCTTTTGTTTTGTGA**AAACAGTGATGTGGGTACAGATTGTGTTG
CA

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR4DJ06JQ 780 0 0
G
GAGCTTGGCACCGCTGGGTTGCTTACCGGCCGTCAAACAAGCAAGCGGTAATGTTCAGGA
ATGCGTGAGATTGCCTTCGGAGATGGCGGCTTTGCATAACAAGAAGCTGATGCAGCTCTT
GGTTGAACTTTCTCGACAACTCAGTGGTTTCCAGTACTCTTTTTATGACTTCTTCAGCTC
CATCCAGAACAGAGTTATCAAGTCTACGACTTACACATTCGAGACGGGAATGGTTGCTTG
TTGTGGAACTGGAAGCAGTTGCTCTACGAACAATGTATGCGCTAACCCTGAAGACTATCT
CTT**TCGACGGTAAGCGTTTGACACAAGAAGGGAACCTTCAGGCTGGACATTTGATTTG
GGGATCAGATCCGGAAGTGATTGGACCGAACAATCTCAGGGAGCTTCTTTTCATTCCTTT
GGACACTGAAGTCATCTTAGCTGATATACAGGAAGCTAGAGATTCCACGAGGAGGCCGAG
ACAGATCAAGATTGAGAGTCTACATTATCAAGAAGTTGGAATCAGTGATGGAGAACCAAT
GGCTTTATCAAGTTGATAAAGCTAGCTCCTTTCTGATCGAAGATTGTGTTGCAATATTTG
GTCAAAGCCAGAAAGATGGAGTTTAAGGAGTTATTGTAATAATAAGCAAAACAAGAAAAA
TGAGACTATCTTTTTCTTTTGTTTTGTGA*AAAACAGTGATGTGGGTACAGATTGTGTTG
CAATATGTGGTAAAAAAACCAAACATTATTATATTTCGAGTTATTCTTGGATCCCCCTT

QA 2 780 2 780
DS 



AS 1 4

CO CL1675Contig1 824 4 5 U
GGTAAAAGATCAAATCTTGCACAATAAAACAGAGAAAAACAGAGGTACAAAAGAGAGAAA
CAAATTAAAGTGAGAATCACAACATCAACACACCAAAAGACGTTAACATCAAATATTTTA
TAGTTTAATCTTCCTATTTTCACACAACAAAGCCTCCATTGGCCCTAATAACCTGACCGT
TGATCCATTCCCCACCATCACCTGCCAAAAATCCTACAATCTCCGCAACATCCTTTGGCT
CGCCAATCCTCCCCATTGGAGACGCGCTTGCAAGCATCTTCACCGTTTCATCACTTTTTC
CTGCATAGAACATCTCAGTCGCAACCGGCCCTGGAGCAACACAGTTTGCGGTAATCTGGC
TTCCCTTCAGTTCTTTTGCCAACACTCTTACCATAGTTTCCACCGCAGCCTTTGACGCGG
TATAGACTCCATAACCTGGCGAGAGTGCTCCGACCTGCGAAGTAGACATCATAATGATTC
TTCCACCACCTCCTCTAACAACCCTCTTAGCAGCTTCCTTGCAACACACGAAAGCCCCTC
TCGTGTTAGTTCTGAACGTTTTCTCGAAATCGTCAAGTGTAGTCTCGGATATAGATGGAT
ACTTTGGGTCCAAGACACCTGCACAATTTATGAGAATGTGAACTTTTGATCCGAACTCTT
GTTCGGTTTGATCAAACAAGTTGTTGATCTGGTCAGGATCTGAAACATCTGCTCTCACTG
CTATTGCTGAGTTTTGTTGAGATGACGCGTTTAGTTCCGAAGCCAGAAGTTCAGCTTCTG
ATGAGCTCGAGACATAATTGAGGGTGACTCTTGCGCCAAAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI43JQ U 1
AF RR4H380JQ U 1
AF RR4D140JQ U 6
AF RR4AK70TF C 170
BS 1 394 RR4FI43JQ
BS 395 395 RR4D140JQ
BS 396 634 RR4FI43JQ
BS 635 775 RR4H380JQ
BS 776 824 RR4AK70TF

RD RR4FI43JQ 634 0 0
GGTAAAAGATCAAATCTTGCACAATAAAACAGAGAAAAACAGAGGTACAAAAGAGAGAAA
CAAATTAAAGTGAGAATCACAACATCAACACACCAAAAGACGTTAACATCAAATATTTTA
TAGTTTAATCTTCCTATTTTCACACAACAAAGCCTCCATTGGCCCTAATAACCTGACCGT
TGATCCATTCCCCACCATCACCTGCCAAAAATCCTACAATCTCCGCAACATCCTTTGGCT
CGCCAATCCTCCCCATTGGAGACGCGCTTGCAAGCATCTTCACCGTTTCATCACTTTTTC
CTGCATAGAACATCTCAGTCGCAACCGGCCCTGGAGCAACACAGTTTGCGGTAATCTGGC
TTCCCTTCAGTTCTTTTGCCAACACTCTTACCATTGTTTCCACCGCAGCCTTTGACGCGG
TATAGACTCCATAACCTGGCGAGAGTGCTCCGACCTGCGAAGTAGACATCATAATGATTC
TTCCACCACCTCCTCTAACAACCCTCTTAGCAGCTTCCTTGCAACACACGAAAGCCCCTC
TCGTGTTAGTTCTGAACGTTTTCTCGAAATCGTCAAGTGTAGTCTCGGATATAGATGGAT
ACTTTGGGTCCAAGACACCTGCACAATTTATGAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4H380JQ 775 0 0
GGTAAAAGATCAA
ATCTTGCACAATAAAACAGAGAAAAACAGAGGTACAAAAGAGAGAAACAAATTAAAGTGA
GAATCACAACATCAACACACCAAAAGACGTTAACATCAAATATTTTATAGTTTAATCTTC
CTATTTTCACACAACAAAGCCTCCATTGGCCCTAATAACCTGACCGTTGATCCATTCCCC
ACCATCACCTGCCAAAAATCCTACAATCTCCGCAACATCCTTTGGCTCGCCAATCCTCCC
CATTGGAGACGCGCTTGCAAGCATCTTCACCGTTTCATCACTTTTTCCTGCATAGAACAT
CTCAGTCGCAACCGGCCCTGGAGCAACACAGTTTGCGGTAATCTGGCTTCCCTTCAGTTC
TTTTGCCAACACTCTTACCATTGTTTCCACCGCAGCCTTTGACGCGGTATAGACTCCATA
ACCTGGCGAGAGTGCTCCGACCTGCGAAGTAGACATCATAATGATTCTTCCACCACCTCC
TCTAACAACCCTCTTAGCAGCTTCCTTGCAACACACGAAAGCCCCTCTCGTGTTAGTTCT
GAACGTTTTCTCGAAATCGTCAAGTGTAGTCTCGGATATAGATGGATACTTTGGGTCCAA
GACACCTGCACAATTTATGAGAATGTGAACTTTTGATCCGAACTCTTGTTCGGTTTGATC
AAACAAGTTGTTGATCTGGTCAGGATCTGAAACATCTGCTCTCACTGCTATTGCTGAGTT
TTGTTGAGATGACGCGTTTAGTTCCGAAGCCAGAAGTTCAGC

QA 14 775 14 775
DS 

RD RR4D140JQ 740 0 0
GGTAAAAG
ATCTTGCACAATAAAACAGAGAAAAACAGAGGTACAAAAGAGAGAAACAAATTAAAGTGA
GAATCACAACATCAACACACCAAAAGACGTTAACATCAAATATTTTATAGTTTAATCTTC
CTATTTTCACACAACAAAGCCTCCATTGGCCCTAATAACCTGACCGTTGATCCATTCCCC
ACCATCACCTGCCAAAAATCCTACAATCTCCGCAACATCCTTTGGCTCGCCAATCCTCCC
CATTGGAGACGCGCTTGCAAGCATCTTCACCGTTTCATCACTTTTTCCTGCATAGAACAT
CTCAGTCGCAACCGGCCCTGGAGCAACACAGTTTGCGGTAATCTGGCTTCCCTTCAGTTC
TTTTGCCAACACTCTTACCATAGTTTCCATCGCAGCCTTTGACGCGGTATAGACTCCATA
ACCTGGCGAGAGTGCTCTGACCTGCGAAGTAGACATCATAATGATTCTTCCACCACCTCC
TCTAACAACCCTCCTAGCAGCTTCCTTGCAACACACGAAAGCCCCTCTCGTGTTAGTTCT
GAACGTTTTCTCGAAATCGTCAAGTGTAGTCTCGGATATAGATGGATACTTTGGGTCCAA
GACACCTGCACAATTTATGAGAATGTGAACTTTTGATCCGAACTCTTGTTCGGTTTGATC
AAACAAGTTGTTGATCTGGTCAGGATCTGAAACATCTGCTCTCACTGCTATTGCTGAGTT
TTGTTGAGATGA

QA 9 740 9 740
DS 

RD RR4AK70TF 655 0 0
TAA
CTGACCGTTGATCCATTCCCCACCATCAC*TGCCAAAAATCGTACAATCTCCGCAACATC
CTTTGGCTCGCCAATCCTCCCCATTGGAGACGCGCTTGCAAGCATCTTCACCGTTTCATC
ACTTTTTCCTGCATAGAACATCTCAGTCGCAACCGGCCCTGGAGCAACACAGTTTGCGGT
AATCTGGCTTCCCTTCAGTTCTTTTGCCAACACTCTTACCATAGTTTCCACCGCAGCCTT
TGACGCGGTATAGGCTCCATAACCTGGCGAGAGTGCTCCGACCTGCGAAGTAGACATCAT
AATGATTCTTCCACCACCTCCTCTAACAACCCTCTTAGCAGCTTCCTTGCAACACACGAA
AGCCCCTCTCGTGTTAGTTCTGAACGTTTTCTCGAAATCGTCAAGTGTAGTCTCGGATAT
AGATGGATACTTTGGGTCCAAGACACCTGCACAATTTATGAGAATGTGAACTTTTGATCC
GAACTCTTGTTCGGTTTGATCAAACAAGTTGTTGATCTGGTCAGGATCTGAAACATCTGC
TCTCACTGCTATTGCTGAGTTTTGTTGAGATGACGCGTTTAGTTCCGAAGCCAGAAGTTC
AGCTTCTGATGAGCTCGAGACATAATTGAGGGTGACTCTTGCGCCAAAGCTC

QA 4 655 4 655
DS 



AS 1 6

CO CL1676Contig1 998 6 14 U
TTTTTATATAAGCATAACATAAAAATCAATCAGCAAAGCAAAATATTTTAATATCAAGTC
AAAACATACTTGTTATACATAGATTTCGTACTTTGAACCAGTGTAGAAATGGCGGGGATC
GTTCCGGAACAATGGTCAGCGGCGGAGAACGGGAACGCAACCATGACTGCGAAGGGATCG
AGCAGAGAGCTGAGATATGGAGGAAGAACAGCTCACAGCATGTCTTCTTCATCGTTGAGG
AAAAAATCAGACCCCCGAGTGATCCAGAAGGTTCCTTACAAAGGTCTTAAAGATTTTCTC
TCTAATCTTCAAGAAGTCATTCTCGGCACAAAGCTTGCCATTCTTTTTCCGGCCATACCT
GCCGCCATTATTGGCACCTATTGCGGCTTCAGTCAGGTGAGATTTGTTTCATTTTCTTAT
AACTTTTCTCGTAAACTTAACATTAAGAATACTATCAAACAGAATAGCATTCAAACTCCT
TCAGTTTTTTTTATTTATTATTGTTTTGAACAAATATACCAAATTACATCAAGATATTGA
TCATTTTACGTGTCAGAATCAGAATAAAGATATGAAATACTATCAGTTACTATCTTTTTT
ATTCGACATTGATCAAACATAGAACAATTGATTTGTTTTAAACAATTAATTCTCCAAAAT
GTAAACAATTAATGAGAAAATTTGCAATTAATTTGTCATATATTTTGGCATTATTCGCGC
ATCAAATTGAATTATTACTTATTAGACTCCACTAAATTAGGGAGATGTATTCAATGGAAG
AATTTAATTGATTGGTTTTGCAATCATTAACGTTTTTTGATTATTTGGTGTGTGTTACCA
CGTAATTGATAAAGAATATATTTACCAAACATTTTTTTTTTTTTTT**GCCATCTAAAAT
TTTATTAAACATATAAAAACCTTACAAGGCCCAAGAGCGGCCCAAACTAAAAACTGAAGA
TTTACAACACAAACCCACGCACACCAACCCCCAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B081JQ U 1
AF RR4AV40TF C 183
AF RR4DL46JQ U 16
AF RR4AV40JQ U 1
AF RR4DL46TF C 142
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CCACATTCAATAGTCCCACTGGTTTATCATGGATTCCAAGCTGTGCCCAAGTGATTACTT
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CTTTTGGCATCAGTGTCTTGGGGATAACCCCGATGACATAGCGACCTCCATTGTAAACAG
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TGCTCCATCTCCC*AACTTTTCTTTGAGGCGACTTTCTCATGCTTTGGTACATATTCCTC
AAGTTTCTTGACAAGGTCTTTAGCAAAAGGAGCAGAGACAATGATATGACGAGCAGTTGG
TGTAATGAAGCCTTCTTCGACTGCTTTGTCTATGAATGATAACAATGAATTATAGTATCC
TTCCACATTCAATAGTCCCACTGGTTTATCATGGATTCCAAGCTGTGCCCAAGTGATTAC
TTCAAGAAGCTCTTCAAGTGTATCATATCCACCAGGCAAAGCAA*TAAAAGCATCAGAGT
GCTTAGCCATTTCAGCTTTTCTTTGGTGCATGTCTGCTACTGCCTTCACTTCTCCCACTG
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CTCCATTGTAAACAGCTTGAGAAATCAAACCCATTAAACCAATGCTCCCTCCACCATATA
CAAGATCTATATTTCTTGATACCAGTTCGGCTCCGAGTTCGATAGCAGCATCTCTGTAAC
TGGTTTTATTACCAGCACTACTTCCACAAAACACACATATTCTCTTGAACTTCGGTTCAA
CTTCCATCTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTCC

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DS 

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CTTTGAGGCGACTTTCTCATGCTTTGGTACATATTCCTCAAGTTTCTTGACAAGGTCTTT
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TGCTTTGTCTATGAATGATAACAATGAATTATAGTATCCTTCCACATTCAATAGTCCCAC
TGGTTTATCATGGATTCCAAGCTGTGCCCAAGTGATTACTTCAAGAAGCTCTTCAAGTGT
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GCATCAGTGTCTTGGGGATAACCCCGATGACATAGCGACCTCCATTGTAAACAGCTTGAG
AAATCAAACCCATTAAACCAATGCTCCCTCCACCATATACAAGATCTATATTTCTTGATA
CCAGTTCGGCTCCGAGTTCGATAGCAGCATCTCTGTAACTGGTTTTATTACCAGCACTAC
TTCCACAAAACACACATATTCTCTTGAACTTCGGTTCAACTTCCATCTCTTTC******T
TTTCTTTTTTTTCCAGTACACAGTTTTGTTTTTAAAATATTGAAAGAAGAATCTATTTCT
CGTTGTCC

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DS 



AS 1 5

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TTTGTTTGTTCTGTCAGCGACTCCGGTGTTTTATTCGGCTCTGTCTCCGGCGACGTGTTC
ATCATTCGGCGGTCGTGCGGCTTAGTTTCTGGCGTCGTCATCTTCCTTTCCGATGAAGGC
GGCCGGCTTTAGCTTCCGATTACGACCTTATCGTTTAAGGTGTGATTCGGCTTTTGGTTT
GGTTTAAAAGATGAAGGCGTATGTGTGTAGCCTTTGGTTTTTTTCTGTTTCTGGTGTTGT
TAGTGTTTGTGGTGGTCGGATGAGATCTCGGATCTTCCGATGTACGTTCTCCAACAAACT
TTAGGGGTTTTTGTATGTGGCGGCTCTCTATCCCGGATGAGATCTCGACGGATTTGATTG
ATGCTCTCTGTGGAAGAAGCGGTGGTGGTGTGGTGAGATGCGATGAAGATGCATGCTCAT
GGAGTGGTTTGGTGAGACGGCGTGCTTTCCGTTTTCGGTTTCTCTCGACAGACGGAGACG
GCGTGGTTGGTCAAGAGCTGTGTTTTTAGGGTTTCCAGTTAGTATTGGGCTCGGTTGTGG
GCCTTGTTTTAATGCTCTATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATGGGCTTTGCCCTTTGG
GCTTTGCCCTTTGGGCTTTGGTCCCTTTATAATATCAAGATGGT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4GP25TF U 1
AF RR4AB35TF U 2
AF RR4AY58TF U 1
AF RR4GP25JQ C 18
AF RR4AY58JQ C 466
BS 1 119 RR4AY58TF
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GA
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GTTTGTTCTGTCAGCGACTCCGGTGTTTTATTCGGCTCTGTCTCCGGCGACGTGTTCATC
ATTCGGCGGTCGTGCGGCTTAGTTTCTGGCGTCGTCATCTTCCTTTCCGATGAAGGCGGC
CGGCTTTAGCTTCCGATTACGACCTTATCGTTTAAGGTGTGATTCGGCTTTTGGTTTGGT
TTAAAAGATGAAGGCGTATGTGTGTAGCCTTTGGTTTTTTTCTGTTTCTGGTGTTGTTAG
TGTTTGTGGTGGTCGGATGAGATCTCGGATCTTCCGATGTACGTTCTCCAACAAACTTTA
GGGGTTTTTGTATGTGGCGGCTCTCTATCCCGGATGAGATCTCGACGGATTTGATTGATG
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QA 3 712 3 712
DS 

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GGAGTGGTTTGGTGAGACGGCGTGCTTTCCGTTTTCGGTTTCTCTCGACAGACGGAGACG
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GCCTTGTTTTAATGCTCTATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATGGGCTTTGCCCTTTGG
GCTTTGCCCTTTGGGCTTTGGTCC*TTTATAATATCAAG
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DS 

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CGGCTTAGTTTCTGGCGTCGTCATCTTCCTTTCCGATGAAGGCGGCCGGCTTTAGCTTCC
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GGATGAGATCTCGGATCTTCCGATGTACGTTCTCCAACAAACTTTAGGGGTTTTTGTATG
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TATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATGGGCTTTCCCCTTTGGGCTTTGCCCTTTGGGCT
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DS 

RD RR4AY58JQ 294 0 0
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AAGATGCATGCTCATGGAGTGGTTTGGTGAGACGGCGTGCTTTCCGTTTTCGGTTTCTCT
CGACAGACGGAGACGGCGTGGTTGGTCAAGAGCTGTGTTTTTAGGGTTTCCAGTTAGTAT
TGGGCTCGGTTGTGGGCCTTGTTTTAATGCTCTATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATG
GGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGGTCCCTTTATAATATCAAG

QA 1 294 1 294
DS 



AS 1 6

CO CL1679Contig1 1008 6 9 U
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TACGCTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATG
CCCCTCACCATTGGAGCCTTGACAAACTCGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTG
GACCCCACAAGTCGAGGGAGTGCCTTCCCCTGGTTCTTATCATCAGGAACAGGTTGAAGT
ATGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATG
GCAAAGTCAGGACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCA
AGACTAACGAGAACTTCCGTCTCCTCTATGATACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCC
TCAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGAACCATCCAGTTAGGACAGA
AGGGCATTCCTTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCACTCA
TCAAGCCTAACGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCA
AGTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGACCGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTG
TGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTTGAGACTATCCACATCCAAGACTCTA
CAGGACATGAGTTTGCAACTAGGTTGGGAAACGTCTTCACCCTCGGCAAAGGGACTAAGC
CATGGGTTTTTCTTCCTAAGGGTAAAGGTATTAAGTTGACCATCATCGAGGAAGCCAGGA
AGAGGCTCGCTGGCCAACAGGCTGCTTAATTTTGTTGTGTTTTCAGTGCTTTATTGTGTC
GTTTTAGATGACTTTTGTTTCCTTAGACTCACTTTGCATCTTTTGGTTTCGCTACTCGGT
TTTGAGACGTGTTATTTTATATTGAGTTTTAAAATACATTATCTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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AF RR4A807TF U 6
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GG
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TACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGCAAAGT
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CGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGAACCATCCAGTTAGGACAGAAGGGCAT
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AC

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TCGCACCATCCGTTACCCTGACCCACTCATCAAGCCTAACGACACCATCAAGCTCGACCT
GGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGAC
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CTTTGAGACTATCCACATCCAAGACTCTACAGGACATGAGTTTGCAACTAGGTTGGGAAA
CGTCTTCACCCTCGGCAAAGGGACTAAGCCATGGGTTTCTCTTCCTAAGGGTAAAGGTAT
TAAGTTGACCATCATCGAGGAAGCCAGGAAGAGGCTCGCTGGCCAACAGGCTGCTTAATT
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CTTTGCATCTTTTGGTTTCGCTACTCGGTTTTGAGACGTGTTATTTTATATTGAGTTTTA
AAATACATTATCTAGCC

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DS 

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CATCCAGTTAGGACAGAAGGGCATTCCTTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCG
TTACCCTGACCCACTCATCAAGCCTAACGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGAGAACAA
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CCACATCCAAGACTCTACAGGACATGAGTTTGCAACTAGGTCGGGAAACGTCTTCACCCT
CGGCAAAGGGACTAAGCCATGGGTTTTTCTTCCTAAGGGTAAAGGTATTAAGTTGACCAT
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CAGTGCTTTATTGTGTCGTTTTAGATGACTTTTGTTTCCTTAGACTCACTTTGCATCTTT
TGGTTTCGCTACTCGGTTTTGAGACGTGTTATTTTATATTGAGTTTTAAAATACATTATC
TAGC

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DS 



AS 2 6

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CAACGGAGATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4D634TF U 1
AF RR4A225TF U 142
AF RR4AI14TF U 124
AF RR4A225TFB U 142
BS 1 411 RR4D634TF
BS 412 412 RR4AI14TF
BS 413 673 RR4D634TF
BS 674 674 RR4AI14TF
BS 675 693 RR4D634TF
BS 694 694 RR4AI14TF
BS 695 700 RR4D634TF
BS 701 853 RR4AI14TF
BS 854 854 RR4A225TFB
BS 855 867 RR4AI14TF
BS 868 868 RR4A225TFB
BS 869 910 RR4AI14TF
BS 911 913 RR4A225TFB

RD RR4D634TF 700 0 0
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GAAGATTACGGTTAGGATTGTTGAGAGGCTAAGGGATGATATAATGTCAGGGAAGCTTAA
GTCAGGAAGCGAGATCAAGGATGCATTGAAGGGAAGTGTGTTGGAGATGCTGTCTAAGAA
AGACAGCAAGACTGAGCTTCAACTTGGTTTCAGGAAACCAGCTGTTATAATGATAGTTGG
AGTGAATGGAGGTGGAAAGACTACTTCTCTTGGAAAGTTGGCTCATAGATTGAAGAATGA
AGGGACCAAGGTATTGATGGCAGCAGGTGATACGTTTAGAGCAGCTGCAAGTGACCAGTT
AGAGATATGGGCTGAGAGGACTGGGTGTGAGATTGTTGTGGCTGAAGGAGACAAAGCTAA
AGCAGCAACAGTTCTCTCGAAGGCTGTGAAAAGAGGGAAGGAGGAAGGTTACGATGTTGT
ACTATGTGATACATCTGGACGTCTTCACACTAATTACAGCTTGATGGAGGAGTTGATTGC
GTGCAAAAAGGCAGTAGGCAAAGTAGTCTCTGGTGCACCTAATGAGATCCTACTTGTCCT
TGATGGAAATACCGGTCTGAACATGCTTCCACAAGCTAGGGAATTCAACGAGATTGTTGG
TATTACCGGTTTGGTTTTGACGAAACTGGATGGGTCTGCT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4A225TF 605 0 0
G
GCATTGAAGGGAAGTGTGTTGGAGATGCTGTCTAAGAAAGACAGCAAGACTGAGCTTCAA
CTTGGTTTCAGGAAACCAGCTGTTATAATGATAGTTGGAGTGAATGGAGGTGGAAAGACT
ACTTCTCTTGGAAAGTTGGCTCATAGATTGAAGAATGAAGGGACCAAGGTATTGATGGCA
GCAGGTGATACGTTTAGAGCAGCTGCAAGTGACCAGTTAGAGATATGGGCTGAGAGGACT
GGGTGTGAGATTGTTGTGGCTGAAGGAGAGAAAGCTAAAGCAGCAACAGTTCTCTCGAAG
GCTGTGAAAAGAGGGAAGGAGGAAGGTTACGATGTTGTACTATGTGATACATCTGGACGT
CTTCACACTAATTACAGCTTGATGGAGGAGTTGATTGCGTGCAAAAAGGCAGTAGGCAAA
GTAGTCTCTGGTGCACCTAATGAGATCCTACTTGTCCTTGATGGAAATACCGGTCTGAAC
ATGCTTCCACAAGCTAGGGAATTCAACGAGATTGTTGGTATTACCGGTTTGATTTTGACG
AAACTGGATGGTTCTGCTACAGGAGGCTGTGTGGTCAGTGTGGTTGAGGAACTGGGCATT
CCTG

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR4AI14TF 787 0 0
G
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AGCAAGACTGAGCTTCAACTTGGTTTCAGGAAACCAGCTGTTATAATGATAGTTGGAGTG
AATGGAGGTGGAAAGACTACTTCTCTTGGAAAGTTGGCTCATAGATTGAAGAATGAAGGG
ACCAAGGTATTGATGGCAGCAGGTGATACGTTTAGAGCAGCTGCAAGTGACCAGTTAGAG
ATATGGGCTGAGAGGACTGGGTGTGAGATTGTTGTGGCTGAAGGAGAGAAAGCTAAAGCA
GCAACAGTTCTCTCGAAGGCTGTGAAAAGAGGGAAGGAGGAAGGTTACGATGTTGTACTA
TGTGATACATCTGGACGTCTTCACACTAATTACAGCTTGATGGAGGAGTTGATTGCGTGC
AAAAAGGCAGTAGGCAAAGTAGTCTCTGGTGCACCTAATGAGATCCTACTTGTCCTTGAT
GGAAATACCGGTCTGAACATGCTTCCACAAGCTAGGGAATTCAACGAGATTGTTGGCATT
ACCGGTTTGATTTTGACGAAACTGGATGGTTCTGCTAGAGGAGGCTGTGTGGTCAGTGTG
GTTGAGGAACTGGGCATTCCTGTAAAGTTTATAGGTGTAGGAGAAGCTGTGGAAGATCTC
CAACCATTTGATGCTGAGGCCTTTGTCAACGCTATATTCTCCTGAGGCATGCAAAACCTG
ATTTTTTTT*CCAACTAGTATCATATTCAAAGCACGCGAGAGACACATGTGCTTAGCAAC
GGAGAT

QA 2 787 2 787
DS 

RD RR4A225TFB 772 0 0
G
GCATTGAAGGGAAGTGTGTTGGAGATGCTGTCTAAGAAAGACAGCAAGACTGAGCTTCAA
CTTGGTTTCAGGAAACCAGCTGTTATAATGATAGTTGGAGTGAATGGAGGTGGAAAGACT
ACTTCTCTTGGAAAGTTGGCTCATAGATTGAAGAATGAAGGGACCAAGGTATTGATGGCA
GCAGGTGATACGTTTAGAGCAGCTGCAAGTGACCAGTTAGAGATATGGGCTGAGAGGACT
GGGTGTGAGATTGTTGTGGCTGAAGGAGAGAAAGCTAAAGCAGCAACAGTTCTCTCGAAG
GCTGTGAAAAGAGGGAAGGAGGAAGGTTACGATGTTGTACTATGTGATACATCTGGACGT
CTTCACACTAATTACAGCTTGATGGAGGAGTTGATTGCGTGCAAAAAGGCAGTAGGCAAA
GTAGTCTCTGGTGCACCTAATGAGATCCTACTTGTCCTTGATGGAAATACCGGTCTGAAC
ATGCTTCCACAAGCTAGGGAATTCAACGAGATTGTTGGTATTACCGGTTTGATTTTGACG
AAACTGGATGGTTCTGCTAGAGGAGGCTGTGTGGTCAGTGTGGTTGAGGAACTGGGCATT
CCTGTAAAGTTTATAGGTGTAGGAGAAGCTGTGGAAGATCTCCAACCATTTGATGCTGAG
GCCTTTGTCAACGCTATATTCTCCTGAGGCATGCAAAACCTGATTTTTTTTTCCAACTAG
TATCACATTCAAAGCACGCGAGAGACACATGTGCTTAGCAACGGAGATAAA

QA 2 772 2 772
DS 



CO CL1680Contig2 473 2 2 U
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GGAGGCTGTGTGGTCAGTGTGGTTGAGGAACTGGGCATTCCTGTAAAGTTCATTGGTTTA
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TCCTGAGCTGATTTATCATATTCAAAGCAGCGCGAGAGACGCATGTTGCTTAGCACGGAG
ATGAAAATGGAGCCATTCCTTAAAATGTTTCTTGGAGATGTTAAAGATCGTTAAGCTTCT
CTACAAAGGGTTTCAAGTTTTGTTTGTTTTAACGATGTGACAGAATGATACTCTGTGTCT
GTGGTATACACAAGAGTGATCGATCACTTGCACATGAATGTGACGAGCCAGAGAAGTTAC
TTACTCTGTATCTTATTAATGTCTGTATATTAATATAAGCTTAGAGATTTACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4HA40JQB C 1
AF RR4HA40TF U 1
BS 1 1 RR4HA40JQB
BS 2 473 RR4HA40TF

RD RR4HA40JQB 473 0 0
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GGAGGCTGTGTGGTCAGTGTGGTTGAGGAACTGGGCATTCCTGTAAAGTTCATTGGTTTA
GGAGAAGCTGTGGAAGATCTCCAACCATTTGATGCTGAGGCCTTTGTCAACGCTATATTC
TCCTGAGCTGATTTATCATATTCAAAGCAGCGCGAGAGACGCATGTTGCTTAGCACGGAG
ATGAAAATGGAGCCATTCCTTAAAATGTTTCTTGGAGATGTTAAAGATCGTTAAGCTTCT
CTACAAAGGGTTTCAAGTTTTGTTTGTTTTAACGATGTGACAGAATGATACTCTGTGTCT
GTGGTATACACAAGAGTGATCGATCACTTGCACATGAATGTGACGAGCCAGAGAAGTTAC
TTACTCTGTATCTTATTAATGTCTGTATATTAATATAAGCTTAGAGATTTACC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR4HA40TF 473 0 0
G
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GAGGCTGTGTGGTCAGTGTGGTTGAGGAACTGGGCATTCCTGTAAAGTTCATTGGTTTAG
GAGAAGCTGTGGAAGATCTCCAACCATTTGATGCTGAGGCCTTTGTCAACGCTATATTCT
CCTGAGCTGATTTATCATATTCAAAGCAGCGCGAGAGACGCATGTTGCTTAGCACGGAGA
TGAAAATGGAGCCATTCCTTAAAATGTTTCTTGGAGATGTTAAAGATCGTTAAGCTTCTC
TACAAAGGGTTTCAAGTTTTGTTTGTTTTAACGATGTGACAGAATGATACTCTGTGTCTG
TGGTATACACAAGAGTGATCGATCACTTGCACATGAATGTGACGAGCCAGAGAAGTTACT
TACTCTGTATCTTATTAATGTCTGTATATTAATATAAGCTTAGAGATTTACC

QA 2 473 2 473
DS 



AS 1 5

CO CL1681Contig1 1301 5 6 U
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AAGTGGTTGGGTGGCACATCAAGTATCAGACATATGGGCGAAAACTTCACCGGATAGAGG
TGAGGCAGTGTGGGCTCTATGGCCAATGGGTGGAGCTTGGCTCTGCACTCATGCATGGGA
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AGGATGCACATCGTTTCTATTGGACTGGCTAATCAAAGGCAAAGATGGATATCTTCAGAC
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TAGCTACTCATCAACCATGGATATTGCCATTGTAAAAGAAGTCTTCTCTGCTATTGTTTC
CGCATCAGAGGTTTTGGGGAAAACGAATGAGACTCTGATAGGAAAAGTCATTGCTGCACA
AGCAAACCTTCCACCCACTAGACTATCAAAGGACGGTTCTATAATGGAATGGGCAGAGGA
CTTTGAGGACCCTGAGGTGCATCATAGACATGTTTCTCATCTCTTTGGTCTGTTCCCTGG
TCACACAATCACACTTGAAAAGTCTCCGGAGCTTGCTAAAGCTGTGGAAGTATCACTTAA
GAAAAGAGGAGAGGAAGGACCAGGGTGGTCCACCACTTGGAAAGCTGCCTTGTGGGCAAG
GCTTCACAACAGTGAGCACGCGTATAGACTAGTTACTCATATTTTTGATCTGGTTGATCC
GTTAAACGAACGTAACTATGAAGGAGGACTGTATACTAACTTGTTCACAGCTCATCCGCC
GTTCCAGATCGACGCCAACTTTGGATTCTCAGCAGCTGTGGCAGAGATGTTAGTGCAGAG
CACGACGAAGGATCTGTATTTACTACCAGCGCTTCCTGCTGATAAATGGCCTAACGGTTA
TGTGAAAGGGCTGAGGGCACGGGGTGGTGTGACGGTGAATATAAGGTGGATGGAAGGGAA
CCTTGTGGAGTTTGGTCTTTGGTCGGAACAGAGTGTGTCTACCAGAATAGTGTACAGAGG
AAACTCTGTGGTTTCCACATTGTCGCCAGGGAAAGTCTTTACTTTTGACAAAGATTTGAG
ATGCATTCGGACAGAGAACTTATAGAAAGTAAAGATCGAGATCTGTTTTGTCATCATATG
TTTTGTTCATCTAAGAGGAAAAAAAAGTACAAGTACAAGTGTAACCCACATGTATCCACA
CAAAAAAGTTTACAGTGAAGTAATGTATTTTGTTATATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA61TF U 1
AF RR4EA86TF U 308
AF RR4CE94TF U 311
AF RR4CE94JQ C 561
AF RR4EA86JQ C 1166
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DS 

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GCCA
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TTTTGGGGAAAACGAATGAGACTCTGATAGGAAAAGTCATTGCTGCACAAGCAAACCTTC
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CACTTGAAAAGTCTCCGGAGCTTGCTAAAGCTGTGGAAGTATCACTTAAGAAAAGAGGAG
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ACGCCAACTTTGGATTCTCAGCAGCTGTGGCAGAGATGTTAGTGCAGAGCACGA

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DS 

RD RR4CE94TF 668 0 0
G
CATCCCCTGAGCATATGTTCA*AGCTCCAGATGGCAAACCTGCCAGTGTTAGCTACTCAT
CAACCATGGATATTGCCATTGTAAAAGAAGTCTTCTCTGCTATTGTTTCCGCATCAGAGG
CTTTGGGGAAAACGAATGAGACTCTGATAGGAAAAGTCATTGCTGCACAAGCAAACCTTC
CACCCACTAGACTATCAAAGGACGGTTCTATAATGGAATGGGCAGAGGACTTTGAGGACC
CTGAGGTGCATCATAGACATGTTTCTCATCTCTTTGGTCTGTTCCCTGGTCACACAATCA
CACTTGAAAAGTCTCCGGAGCTTGCTAAAGCTGTGGAAGTATCACTTAAGAAAAGAGGAG
AGGAAGGACCAGGGTGGTCCACCACTTGGAAAGCTGCCTTGTGGGCAAGGCTTCACAACA
GTGAGCACGCGTATAGACTAGTTACTCATATTTTTGATCTGGTTGATCCGTTAAACGAAC
GTAACTATGAAGGAGGACTGTATACTAACTTGTTCACAGCTCATCCGCCGTTCCAGATCG
ACGCCAACTTTGGATTCTCAGCAGCTGTGGCAGAGATGTTAGTGCAGAGCACGACGAAG*
ATCTGTATTTACTACCAGCGCTTCCTGCTGATAAATGGCCTAACGGTTATGTGAAAGGGC
TGAGGGC

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DS 

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ATCATAGACATGTTTCTCATCTCTTTGGTCTGTTCCCTGGTCACACAATCACACTTGAAA
AGTCTCCGGAGCTTGCTAAAGCTGTGGAAGTATCACTTAAGAAAAGAGGAGAGGAAGGAC
CAGGGTGGTCCACCACTTGGAAAGCTGCCTTGTGGGCAAGGCTTCACAACAGTGAGCACG
CGTATAGACTAGTTACTCATATTTTTGATCTGGTTGATCCGTTAAACGAACGTAACTATG
AAGGAGGACTGTATACTAACTTGTTCACAGCTCATCCGCCGTTCCAGATCGACGCCAACT
TTGGATTCTCAGCAGCTGTGGCAGAGATGTTAGTGCAGAGCACGACGAAGGATCTGTATT
TACTACCAGCGCTTCCTGCTGATAAATGGCCTAACGGTTATGTGAAAGGGCTGAGGGCAC
GGGGTGGTGTGACGGTGAATATAAGGTGGATGGAAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTTT
GGTCGGAACAGAGTGTGTCTACCAGAATAGTGTACAGAGGAAACTCTGTGGTTTCCACAT
TGTCGCCAGGGAAAGTCTTTACTTTTGACAAAGATTTGAGATGCATTCGGACAGAGAACT
TATAGAAAGTAAAGATCGAGATCTGTTTTGTCATCATATGTTTTGTTCATCTAAGAGGAA
AAAAAAGTACAAGTACAAGTGTAACCCACATGTATCCACACAAAAAAGTTTACAGTGAAG
TAATGTATTTTGTTATATACC

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DS 

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AAAGTAAAGATCGAGATCTGTTTTGTCATCATATGTTTTGTTCATCTAAGAGGAAAAAAA
*GTACAAGTACAAGTGTAACCCACATGTATCCACACAAAAAA

QA 1 102 1 102
DS 



AS 1 6

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GGGCATCTCACTCTCTTCTAACACACACAACATTTAATCTCAGCCGTTCGATCTCTCTCC
CATCATGCCGATCAGAAACATCGCCGTTGGCCGTCCCGACGAGGCCACCCGTCCCGACGC
CTTAAAGGCGGCGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGATCTTCGTCTTCGCCGGCTCAGG
CTCAGGAATGGCTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCC**GCCGGCCTC
GTAGCCGCCTCACTGGCTCACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAAC
ATCTCAGGTGGACACGTCAACCCCGCCGTCACGTTCGGCGCTTTCGTTGGTGGTAACATC
ACTCTCCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGT
CTCCTCCTCAAGTTCGCCACCGGCGGTTTGGCTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCGGA
GTAGGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACA
GTCTACGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCA
ATCGGTTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCCTTCAGCGGAGCCTCCATG
AACCCTGCCGTGGCTTTCGGACCAGCTGTGGTGAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTC
TACTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTC
ATCAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATCTCTCTGTTTCT
CTCATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTTGTGTACTT
TCGCATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGAT
TTCCAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G216TF U 1
AF RR4D702TF U 63
AF RR4BC92TF U 39
AF RR4BC92JQ C 132
AF RR4D702JQ C 512
AF RR4G216JQ C 296
BS 1 328 RR4G216TF
BS 329 329 RR4BC92TF
BS 330 478 RR4G216TF
BS 479 894 RR4BC92TF
BS 895 1010 RR4BC92JQ

RD RR4G216TF 478 0 0
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CTTAAAGGCGGCGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGATCTTCGTCTTCGCCGGCTCAGG
CTCAGGAATGGCTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCC**GCCGGCCTC
GTAGCCGCCTCACTGGCTCACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAAC
ATCTCAGGTGGACACGTCAACCCCGCCGCCACGTTCGGCGCTTTCGTTGGTGGTAACATC
ACTCTCCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGT
CTCCTCCTCAAGTTCGCCACCGGCGGTTTGGCTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCG

QA 1 478 1 478
DS 

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GG
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AAGGCGGCGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGATCTTCGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCA
GGAATGGCTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCC**GCCGGCCTCGTAG
CCGCCTCACTGGCTCACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAACATCT
CAGGTGGACACGTCAACCCCGCCGTCACGTTCGGCGCTTTCGTTGGTGGTAACATCACTC
TCCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGTCTCC
TCCTCAAGTTCGCCACCGGCGGTTTGGCTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCGGAGTAG
GAGTGTCCGACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACAGTCT
ACGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCAATCG
GTTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTA

QA 3 568 3 568
DS 

RD RR4BC92TF 856 0 0
G
TCAGCCGTTCGATCTCTCTCCCATCATGCCAATCAGAAACATCGCCGTTGGCCGTCCCGA
CGAGGCCACCCGTCCCGACGCCTTAAAGGCGGCGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGAT
CTTCGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATGGCTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGC
CACCACTCCC**GCCGGCCTCGTAGCCGCCTCACTGGCTCACGCTTTCGGACTCTTTGTC
GCCGTCTCCGTCGGCGCCAACATCTCAGGTGGACACGTCAACCCCGCCGTCACGTTCGGC
GCTTTCGTTGGTGGTAACATCACCCTCCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTA
CTCGGCTCAGTCGTTGCTTGTCTCCTCCTCAAGTTCACCACCGGCGGTTTGGCTGTGCCG
GCTTTTGGCCTCTCCGCCGGAGTAGGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATG
ACCTTCGGGCTTGTTTACACAGTCTACGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTT
GGAACCATCGCTCCCATCGCAATCGGTTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGA
GCCTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCTGCCGTGGCTTTCGGACCAGCTGTGGTGAGCTGG
TCGTGGAACAACCACTGGGTCTACTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGA
CTCATCTACGAGGTTTTCTTCATCAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTAC
TGAATCAATCTCTCTGTTTCTCTCATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATG
CTTTTTCCGTTTTGT

QA 2 856 2 856
DS 

RD RR4BC92JQ 879 0 0
CGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGATCTTCGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATGG
CTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCCCGCCCGGCCTCGTAGCCGCCTC
ACTGGCTCACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAACATCTCAGGTGG
ACACGTCAACCCCGCCGTCACGTTCGGCGCTTTCGTTGGTGGTAACATCACCCTCCTCCG
TGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGTCTCCTCCTCAA
GTTCACCACCGGCGGTTTGGCTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCGGAGTAGGAGTGTC
CAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACAGTCTACGCCAC
CGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCAATCGGTTTCAT
TGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCCTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCTGCCGT
GGCTTTCGGACCAGCTGTGGTGAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTACTGGGCCGG
ACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCATCAACACCAC
CCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATCTCTCTGTTTCTCTCATGTGTAA
TTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTTGTGTACTTTCGCATCAGCA
TGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTCCAGAGTTG
TAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCGT

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR4D702JQ 494 0 0
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GAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCAATCGGTTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTAG
CAGGAGGAGCCTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCTGCCGTGGCTTTCGGACCAGCTGTGG
TGAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTACTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAA
TCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCATCAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCA
CCGACTACTGAATCAATCTCTCTGTTTCTCTCATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAG
TTTTAATGCTTTTTCCGTTTTGTGTACTTTCGCATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGAT
CTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTCCAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAAT
TATGTA
TCTATCTC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4G216JQ 704 0 0
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ACATCACTCTCCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTG
CTTGTCTCCTCCTCAAGTTCGCCACCGGCGGTTTGGCTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCG
CCGGAGTAGGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTT
ACACAGTCTACGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCA
TCGCAATCGGTTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCCTTCAGCGGAGCCT
CCATGAACCCTGCCGTGGCTTTCGGACCAGCTGTGGTGAGCTGGTCGTGGAACAACCACT
GGGTCTACTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTT
TCTTCATCAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATCTCTCTG
TTTCTCTCATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTTGTG
TACTTTCGCATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTG
TTGATTTCCAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTA
CC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 4

CO CL1683Contig1 1143 4 11 U
GAGGTGTTTGTGTTTTGAAAGATTGTTCCGTGTTTGTTATGGATGAGGCTGATAAGCTTT
TATCTCAAGAGTTCCAACCTTCAGTGGAGCATCTGATCAGCTTTCTACTGCAAAACCGTC
AGATACTGATGTTCTCAGCCACGTTTCCTGTCACTGTCAAGGATTTTAAGGATAGATTTC
TGACGAATCCTTACATCATCAATCTCATGGATGAGCTTACGCTCAAGGGTATTACGCAGT
TCTATGCTTTCGTTGAAGAACGACAGAAAATTCATTGCTTGAATACGCTATTCTCCAAGC
TGCAAATTAACCAACCGATCATTTTCTGCAATTCTGTGAACCGTGTGGAGCTCTTAGCTA
AGAAAATTACAGAACTTGGGTATTCGTGCTTCTACATCCATGCAAAGATGCTTCAAGACC
ACCGAAACAGAGTGTTCCATGACTTCCGCAATGGTGCATGCCGCAATCTTGTGTGTACTG
ACCTGTTCACACGTGGTATTGACATTCAAGCAGTCAATGTGGTGATAAACTTTGATTTCC
CAAAGACTGCAGAAACTTATCTACATAGGGTTGGTCGATCAGGAAGGTTTGGCCATCTTG
GTTTAGCTGTGAATCTCATCACCTATGAGGACCGCTTTAACCTTTACCGGATTGAGCAAG
AGCTTGGAACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCGCATATCGATCAGGCAATTTATTGCCAAT
AACCAAGGGTTTGACCCCCCTTGGTCTGCTGTTAGGTGTCTCAGTAATAAGTGGTTGGTT
GAAGCAATGGGTAGAAAGTTGTCTTATCTAGCCATGGCAGGACAGCGAGAACCCAAAAAG
TCTTCTCATTCTGCCTCTACCA**AAAATAATATTATGTGTGCGTCTTTTGAGTTTCCCT
TATTTATAAGGTTCAACCACATATAGACAAGGCCTAGAAGGTTTGAAATTCCGGGTAGTT
GTGGAAGTGAAGTTTTTCTAATGTAGTTTTCACAAATCGTTTGATGCTATTACGTGTCTT
TTTTTGCCGTAGACTGGTCAGTGGTTTAAATGTTGTGATGCGTTTTCAAGAAGCTGTGCT
TTGGTGACTCTTTAGTGTCCTGTTTTGGGCTTTTCAACTTCAAATATTAAGTCTTTGCAA
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 

AF RR4CR83TF U 1
AF RR4D061TF U 170
AF RR4D061JQ C 580
AF RR4CR83JQ C 428
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BS 820 820 RR4CR83JQ
BS 821 860 RR4D061TF
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BS 863 908 RR4D061TF
BS 909 909 RR4CR83JQ
BS 910 915 RR4D061TF
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BS 917 929 RR4D061TF
BS 930 1143 RR4CR83JQ

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TGACGAATCCTTACATCATCAATCTCATGGATGAGCTTACGCTCAAGGGTATTACGCAGT
TCTATGCTTTCGTTGAAGAACGACAGAAAATTCATTGCTTGAATACGCTATTCTCCAAGC
TGCAAATTAACCAACCGATCATTTTCTGCAATTCTGTGAACCGTGTGGAGCTCTTAGCTA
AGAAAATTACAGAACTTGGGTATTCGTGCTTCTACATCCATGCAAAGATGCTTCAAGACC
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GTTTAGCTGTGAATCTCATCACCTATGAGGACCGCTTTAACCTTTACCGGATTGAGCAAG
AGCTTGGAACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCGCATATCGA

QA 1 700 1 700
DS 

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TATTACGCAGTTCTATGCTTTCGTTGAAGAACGACAGAAAATTCATTGCTTGAATACGCT
ATTCTCCAAGCTGCAAATTAACCAATCGATCATTTTCTGCAATTCTGTGAACCGTGTGGA
GCTCTTAGCTAAGAAAATTACAGAACTTGGGTATTCGTGCTTCTACATCCATGCAAAGAT
GCTTCAAGACCACCGAAACAGAGTGTTCCATGACTTCCGCAATGGTGCATGCCGCAATCT
TGTGTGTACTGACCTGTTCACACGTGGTATTGACATTCAAGCAGTCAATGTGGTGATAAA
CTTTGATTTCCCAAAGACTGCAGAAACTTATCTACATAGGGTTGGTCGATCAGGAAG*TT
TGGCCATCTTGGTTTAGCTGTGAATCTCATCACCTATGAGGACCGCTTTAACCTTTACCG
GATTGAGCAAGAGCTTGGAACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCGCATATCGATCAGGCAAT
TTATTGCCAATAACCAAGGGTTTGACCCCCCTTGGTCTGCTGTTAGGTGTCTCAGTAATA
AGTGGTTGGTTGAAGCAATGGGTAGAAAGTTGTCTTATCTAGCCATGGCACGACAGCGAG
AACCCAAAAAGTCTTCTCATTCTGCCTCTAC****AAAATAATATTATGTGTGCGTCTTT
TGAGTTTCCCTTATTTATA*GGTTCA*CCACATATAGACA
CGCC

QA 1 760 1 760
DS 

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TCAGAAA
GTTTGGCCATCTTGGTTTAGCTGTGAATCTCATCACCTATGAGGACCGCTTTAACCTTTA
CCGGATTGAGCAAGAGCTTGGAACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCGCATATCGATCAGGC
AATTTATTGCCAATAACCAAGGGTTTGACCCCCCTTGGTCTGCTGTTAGGTGTCTCAGTA
ATAAGTGGTTGGTTGAAGCAATGGGTAGAAAGTTGTTTTATCTAGCCATGGCAGGACAGC
GAGAACCCAAAAAGTCTTCTCATTCTGCCTCTACCA**AAAATAATATTATGTGTGCGTC
TTTTGAGTTTCCCTTATTTATAAGGTTCAACCACATATAGACAAGGCCTAGAAGGTTTGA
AATTCCGGGTAGTTGTGGAAGTGAAGTTTTTTTAATGTAGTTTTCACAAATCGTTTGATG
CTATTACGTGTCTTTTTTTGTCGTAGACTGGTCAGTGGTTTAAATGTTGTGATGCGTTTT
CAAGAAGCTGTGCTTTGGTGACTCTTTAGTGTCCTGTTTTGGGCTTTTCAACTTCAAATA
TTAAGTCTTTGC

QA 8 559 8 559
DS 

RD RR4CR83JQ 716 0 0
CAGAGTGTTCCATGACTTCCGCAATGGTGCATGCCGCAATCTTGTGTGTACTGACCTGTT
CACACGTGGTATTGACATTCAAGCAGTCAATGTGGTGATAAACTTTGATTTCCCAAAGAC
TGCAGAAACTTATCTACATAGGGTTGGTCGATCAGGAAGGTTTGGCCATCTTGGTTTAGC
TGTGAATCTCATCACCTATGAGGACCGCTTTAACCTTTACCGGATTGAGCAAGAGCTTGG
AACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCGCATATCGATCAGGCAATTTATTGCCAATAACCAAG
GGTTTGACCCCCCTTGGTCTGCTGTTAGGTGTCTCAGTAATAAGTGGTTGGTTGAAGCAA
TGGGTAGAAAGTTGTCTTATCTAGCCATGGCAGGACAGCGAGAACCCAAAAAGTCTTCTC
ATTCTGCCTCTACCACCAAAATAATATTATGTGTGCGTCTTTTGAGTTTCCCTTATTTAT
AAGGTTCAACTACATATAGACAAGGCCTAGAAGGTTTGAAATTCCGGGTAGTTGTGGAAG
TGAAGTTTTTCTAATGTAGTTTTCACAAATCGTTTGATGCTATTACGTGTCTTTTTTTGC
CGTAGACTGGTCAGTGGTTTAAATGTTGTGATGCGTTTTCAAGAAGCTGTGCTTTGGTGA
CTCTTTAGTGTCCTGTTTTGGGCTTTTCAACTTCAAATATTAAGTCTTTGCAACCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 5

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GGATATAAAAATATATAGGCTCTTCAAATATTTGTGAGTTCCATCCGTTTTCACTTTGGT
GGAAGATCTGCAAATATAGGTTGGACTCTATTATTGTTTGTATATAAACTATCGACCAAT
CTGATTCTTACATAAATGACGATGCAAAGACATTAAGTACAAGGAGAAATGATGTCAGGC
AAGTATAGTTTTTATGAGACTCGAGCAAGTTCCACAGCTCGTTTGAGTGCTCCCAAGAGA
CTTCTCATGATTCTTTCTTCTCCTGGAGGTGCCTTATCTTTCTTCCTCCCATTACGTGTA
GCTCGGAAGACTGGTCCTGAACCTGAACCACTCTCTGTGCTTTGGTAAACCAAGCAGTCT
ATGTAAACCGGAACATCGGTTTTGCCTTCATCTTCCATCACTATGAATCCTAACCTCGCT
CCTCCACTTATTCTATCCACCTTGAGAGGAACAGGGAGAGGTATGTTGGCTCCTTGGCAA
AGACTGTTCGCCCACTGAAAGAGAAGAGTTTCGAATCTTGGAAGATCGGTATCTACAGGA
AGCTTCATGGTGCCGAGTGAAACACCGTCGTCCTCCACAGGCAAAGCATTTGCTACTACA
AATGACCTCTTCATTTGCCTGCGCGCGCCGTTCTTGGTGCTCGCTGCGCCATTCGTCGGA
GGAACAAGAAGCCGGCAAGGATTAGAGGGACGGAGAAGGATGTTAGCCGGAGATCGGACG
CTCACAGTAGACGGGAAGAAGAGAGGCCCTGCTGCTACTGCGTAAGACATTTTGGAGACG
AGAGAATCTGAGAGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F321JQ U 1
AF RR4F332JQ U 1
AF RR4F321TF C 49
AF RR4F332TF C 52
AF RR4CH08JQ U 69
BS 1 197 RR4F321JQ
BS 198 198 RR4CH08JQ
BS 199 238 RR4F321JQ
BS 239 239 RR4CH08JQ
BS 240 502 RR4F321JQ
BS 503 510 RR4F332JQ
BS 511 517 RR4CH08JQ
BS 518 518 RR4F321TF
BS 519 604 RR4CH08JQ
BS 605 605 RR4F321TF
BS 606 798 RR4CH08JQ

RD RR4F321JQ 502 0 0
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GGAAGATCTGCAAATATAGGTTGGACTCTATTATTGTTTGTATATAAACTATCGACCAAT
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AAGTATAGTTTTTATGAAACTCGAGCAAGTTCCACAGCTCGTTTGAGTGCTCCCAAGAAA
CTTCTCATGATTCTTTCTTCTCCTGGAGGTGCCTTATCTTTCTTCCTCCCATTACGTGTA
GCTCGGAAGACTGGTCCTGAACCTGAACCACTCTCTGTGCTTTGGTAAACCAAGCAGTCT
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AGACTGTTCGCCCACTGAAAGA

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4F332JQ 510 0 0
GGATATAAAAATATATAGGCTCTTCAAATATTTGTGAGTTCCATCCGTTTTCACTTTGGT
GGAAGATCTGCAAATATAGGTTGGACTCTATTATTGTTTGTATATAAACTATCGACCAAT
CTGATTCTTACATAAATGACGATGCAAAGACATTAAGTACAAGGAGAAATGATGTCAGGC
AAGTATAGTTTTTATGAAACTCGAGCAAGTTCCACAGCTCGTTTGAGTGCTCCCAAGAAA
CTTCTCATGATTCTTTCTTCTCCTGGAGGTGCCTTATCTTTCTTCCTCCCATTACGTGTA
GCTCGGAAGACTGGTCCTGAACCTGAACCACTCTCTGTGCTTTGGTAAACCAAGCAGTCT
ATGTAAACCGGAACATCGGTTTTGCCTTCATCTTCCATCACTATGAATCCTAACCTCGCT
CCTCCACTTATTCTATCCACCTTGAGAGGAACAGGGAGAGGTATGTTGGCTCCTTGGCAA
AGACTGTTCGCCCACTGAAAGAGAAGAGTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4F321TF 733 0 0
TTT
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ATGTCAGGCAAGTATAGTTTTTATGAGACTCGAGCAAGTTCCACAGCTCGTTTGAGTGCT
CCCAAGAGACTTCTCATGATTCTTTCTTCTCCTGGAGGTGCCTTATCTTTCTTCCTCCCA
TTACGTGTAGCTCGGAAGACTGGTCCTGAACCTGAACCACTCTCTGTGCTTTGGTAAACC
AAGCAGTCTATGTAAACCGGAACATCGGTTTTGCCTTCATCTTCCATCACTATGAATCCT
AACCTCGCTCCTCCACTTATTCTATCCACCTTGAGAGGAACAGGGAGAGGTATGTTGGCT
CCTTGGCAAAGACTGTTCGCCCACTGAAAGAGAAGAGTTTCGAATCTTGGAAGATCGGTA
TCTACAGGAAGCTTCATGGTGCCGAGTGAAACACCGTCGTCCTCCACAGGCAAAGCATTT
GCTACTACAAATGACCTCTTCATTTGCCTGCGCGCGCCGTTCTTGGTGCTCGCTGCGCCA
TTCGTCGGAGGAACAAGAAGCCGGCAAGGATTAGAGGGACGGAGAAGGATGTTAGCCGGA
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TTGGAGAC
CC

QA 4 731 4 731
DS 

RD RR4F332TF 730 0 0
CACTTTGGTGGAAGATCTGCAAATATAGGTTGGACTCTATTATTGTTTGTATATAAACTA
TCGACCAATCTGATTCTTACATAAATGACGATGCAAAGACATTAAGTACAAGGAGAAATG
ATGTCAGGCAAGTATAGTTTTTATGAGACTCGAGCAAGTTCCACAGCTCGTTTGAGTGCT
CCCAAGAGACTTCTCATGATTCTTTCTTCTCCTGGAGGTGCCTTATCTTTCTTCCTCCCA
TTACGTGTAGCTCGGAAGACTGGTCCTGAACCTGAACCACTCTCTGTGCTTTGGTAAACC
AAGCAGTCTATGTAAACCGGAACATCGGTTTTGCCTTCATCTTCCATCACTATGAATCCT
AACCTCGCTCCTCCACTTATTCTATCCACCTTGAGAGGAACAGGGAGAGGTATGTTGGCT
CCTTGGCAAAGACTGTTCGCCCACTGAAAGAGAAGAGTTTCGAATCTTGGAAGATCGGTA
TCTACAGGAAGCTTCATGGTGCCGAGTGAAACACCGTCGTCCTCCACAGGCAAAGCATTT
GCTACTACAAATGACCTCTTCATTTGCCTGCGCGCGCCGTTCTTGGTGCTCGCTGCGCCA
TTCGTCGGAGGAACAAGAAGCCGGCAAGGATTAGAGGGACGGAGAAGGATGTTAGCCGGA
GATCGGACGCTCACAGTAGACGGGAAGAAGAGAGGCCCTGCTGCTACTGCGTAAGACATT
TTGGAGAC
CC

QA 1 728 1 728
DS 

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C
GCAAATATAGGTTGGACTCTATTATTGTTTGTATATAAACTATCGACCAATCTGATTCTT
ACATAAATGACGATGCAAAGACATTAAGTACAAGGAGAAATGATGTCAGGCAAGTATAGT
TTTTATGAGACTCGAGCAAGTTCCACAGCTCGTTTGAGTGCTCCCAAGAGACTTCTCATG
ATTCTTTCTTCTCCTGGAGGTGCCTTATCTTTCTTCCTCCCATTACGTGTAGCTCGGAAG
ACTGGTCCTGAACCTGAACCACTCTCTGTGCTTTGGTAAACCAAGCAGTCTATGTAAACC
GGAACATCGGTTTTGCCTTCATCTTCCATCACTATGAATCCTAACCTCGCTCCTCCACTT
ATTCTATCCACCTTGAGAGGAACAGGGAGAGGTATGTTGGCTCCTTGGCAAAGACTGTTC
GCCCACTGAAAGAGAAGAGTTTCGAATCCTGGAAGATCGGTATCTACAGGAAGCTTCATG
GTGCCGAGTGAAACACCGTCGTCCTCCACAGGCAAAGCATTTGCTACTACAAATGTCCTC
TTCATTTGCCTGCGCGCGCCGTTCTTGGTGCTCGCTGCGCCATTCGTCGGAGGAACAAGA
AGCCGGCAAGGATTAGAGGGACGGAGAAGGATGTTAGCCGGAGATCGGACGCTCACAGTA
GACGGGAAGAAGAGAGGCCCTGCTGCTACTGCGTAAGACATTTTGGAGACGAGAGAATCT
GAGAGATCC

QA 2 730 2 730
DS 



AS 1 2

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CACTCGTTTCATCACTAGGAAGACACTAAGAATCTTAAATTTTGTTCAGCATAGATTTTT
AATCTCTGCTCTAATCAAGAAGAGTTAAACACGAAATACAGAGAAAACAAACAAATCACT
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CACCTCTCATCTCCAGCGACTTGTCATCCTTTTCAGCAGACTTGTCGCCTTTGTTTCCGC
AGTAAATGAAGTAGAGAATCAGCTGCAGTGTTCCTAAAGCACATCCAAACCCATTTGGTA
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ACACAAAGAGTGAGAGAAAGAAGGGCATGTACTCTACACTCTTCGTCTTTATCACCAATC
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AGATGAGGAAGATCAGCACGTAGACTGTCTCGATCACTGCTCCTGTTCCGTTGATCGTGC
TCACAAGCGTGTTGTCCTTTGACAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ68JQ U 42
AF RR4DB69JQ U 1
BS 1 97 RR4DB69JQ
BS 98 98 RR4FJ68JQ
BS 99 304 RR4DB69JQ
BS 305 305 RR4FJ68JQ
BS 306 745 RR4DB69JQ

RD RR4FJ68JQ 277 0 0
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TTGTTCAGCATAGATTTTTAATCTCTGCTCTAATCAAGAAGAGTTAAACACGAAATACAG
AGAAAACAAACAAATCACTGAAAGATCTAAACATGCTGCTCTTGCTGCTTTGCATTAACA
ACATGTTGCTTCTTCTCCTCACCTCTCATCTCCAGCGACTTGTCATCCTTTTCAGCAGAC
TTGTCGCCTTTGTTTCCGCAGTAAATGAAGTAGAGAA

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR4DB69JQ 745 0 0
GTGCAGAGTTTTGTTTTACATATGTTTGTATATGTCACAAAGGTATTAGTCTTCTTTAAT
CACTCGTTTCATCACTAGGAAGACACTAAGAATCTTACATTTTGTTCAGCATAGATTTTT
AATCTCTGCTCTAATCAAGAAGAGTTAAACACGAAATACAGAGAAAACAAACAAATCACT
GAAAGATCTAAACATGCTGCTCTTGCTGCTTTGCATTAACAACATGTTGCTTCTTCTCCT
CACCTCTCATCTCCAGCGACTTGTCATCCTTTTCAGCAGACTTGTCGCCTTTGTTTCCGC
AGTAGATGAAGTAGAGAATCAGCTGCAGTGTTCCTAAAGCACATCCAAACCCATTTGGTA
TTGCAACAAAAGGGTCACGACCGATAAGACCATAGATGAACCAAGAAGTTCCACAGAGGA
ACACAAAGAGTGAGAGAAAGAAGGGCATGTACTCTACACTCTTCGTCTTTATCACCAATC
TCATGATTGAGAGTGGAGAAGCGTACATGATGATGGAGAAAACTGTGGCTGCAATACCAC
AGAAGAGTTTTCTAGCGTTACCATGGAGGGCAAAGAGAGAGACGAGAGCCACGGTTGCGA
ACACGGCCAAGACGGCAGTGAAGATGCCAAAGATCTTAGCTTTCTCCTTCTTCGGTGCGT
AGATGAGGAAGATCAGCACGTAGACTGTCTCGATCACTGCTCCTGTTCCGTTGATCGTGC
TCACAAGCGTGTTGTCCTTTGACAC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 6

CO CL1686Contig1 846 6 7 U
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TGGAAATACAAGAACATTAAAAGCAACAATCACAGAGTTTGAAAAACACACGGAAGACAG
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TAGGATCACAGAGCAATGACTGAATGGAGGTAAGTATAGCAGCGACATCATATATAGGAC
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ACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCAGAAAACTGGA
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TCCAGAGCATGATATTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTAATACCAGCAGGAGGGTCTTGCT
GCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATTCTTCTCTTTA
CTTGTTGAGCACAAAAGAAAAGGGTAAAGATGGAGGCGAGAACGGTCGTCGTCAAGCAAG
CATCTCTTGTCGCGCCGACAAACGGTTGTGAATTAAAAGGAAGATGATGACGGCCGGGGG
TGAGAGAAGAGTCTCCGGATCGATCCTCGATTGAGAAATGATGAAGTGGGTGACAACTTC
GTATCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 

AF RR4GK34JQ U 1
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AF RR4GK34TF C 66
AF RR4BS85TF C 61
AF RR4GB03TF C 79
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CTTGTTGAGCACAAAAGAAAAGGGTAAAGATGGAGGCGAG

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DS 

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C
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AAATACAAGAACATTAAAAGCAACAATCACAGAGTTTGAAAAACACACGGAAGACAGGAA
AGAGAAAGGGAAAGAGCTAGTAGAACCAAACACAAAAGAGAGGATGTTCCAGAGCATATT
ATAATAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACT
CGC*TTTGCTTTCGCTGAACATTCGTGCAGCTTCGGAATTGGCAGGAGAATTCGGATTAG
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TCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCAGAAAACTGGAGTG
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AGAGCATGATATTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTAATACCAGCAGGAGGGTCTTGCTGCA
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GTTGAGCACAAAAGAAAAGGGTAAAGATGGAGGCGAGAACGGTCGTCGTCAAGCAAGCAT
CTCTTGTCGCGCCGACAAACGGTTGTGAATTAAAAGGAAGATGATGACGGCCGGGGGTGA
GAGAAGAGTCTCCGGATCGATCCTCGATTGAGAAATGATGAAGTGGGTGACA
CTTCGTATC

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G
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ACACAAAAGAGAGGATGTTCCAGAGCATATTATAATAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGT
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GCTTCGGAATTGGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCAATGACTGAATGGAGGTA
AGTATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGAGGATGTCCAAGCATATA
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TTAAAAGGAAGATGATGACGGCCGGGGGTGAGA

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DS 

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AGAAAGGGAAAGAGCTAGTAGAACCAAACACAAAAGAGAGGATGTTCCAGAGCATATTAT
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CGTTTGCTTTCGCTGAACATTCGTGCAGCTTCGGAATTGGTAGGAGAATTCGGATTAGGA
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AGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGGGTGTCATCAGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAG
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CTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATTCTTCTCTTTACTTGT
TGAGCACAAAAGAAAAGGGTAAAGATGGAGGCGAGAACGGTCGTCGTCAAGCAAGCATCT
CTTGTCGCGCCGACAAACGGTTGTGAATTAAAAGGAAAATGATGACGGCCGGGGGTGAGA
GAAGAGTCTCCGGATCGATCCTCGATTGAGAAATGATGAAGTGGGTGACA
ACTTCGTATAACCC

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DS 

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GAAAGAGAAAGGGAAAGAGCTAGTAGAACCAAACACAAAAGAGAGGATGTTCCAGAGCAT
ATTATAATAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGT
ACTCGC*TTTGCTTTCGCTGAACATTCGTGCAGCTTCGGAATTGGCAGGAGAATTCGGAT
TAGGATCACAGAGCAATGACTGAATGGAGGTAAGTATAGCAGCGACATCATATATAGGAC
TCCACTGGTTTTGGAGGATGTCCAAGCATATACTCCCATCAGCATAAATGTTTGGATGGA
ACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCAGAAAACTGGA
GTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGGGTGTCATCAGGCCCGGAAATAACAGCAT
TCCAGAGCATGATATTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTAATACCAGCAGGAGGGTCTTGCT
GCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATTCTTCTCTTTA
CTTGTTGAGCACAAAAGAAAAGGGTAAAGATGGAGGCGAGAACGGTCGTCGTCAAGCAAG
CATCTCTTGTCGCGCCGACAAACGGTTGTGAATTAAAAGGAAGATGATGACGGCCGGGGG
TGAGAGAAGAGTCTCCGGATCGATCCTCGATTGAGAAATGATGAAGTGGGTGACAACTTC
GTATCC

QA 1 786 1 786
DS 

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GCTAGTAGGACCAAACACAAAAGAGAGGATGTTCCAGAGCATATTATAATAACTAGTCAG
CAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCGCGTTTGCTTTCGC
TGAACATTCGTGCAGCTTCGGAATTGGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCAATG
ACTGAATGGAGGTAAGTATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGAGGA
TGTCCAAGCATATACTCCCATCAGCATAAATGTTTGGATGGAACATCCGTGAAACAAACC
GAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCAGAAAACTGGAGTGAGAGTTTGAAAGTAC
CTCCATCCCATGGGGTGTCATCAGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAGAGCATGATATTGT
TGTCTTGAGGAGCACCGCTAATACCAGCAGGAGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCC
TCATCAACCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATTCTTCTCTTTACTTGTTGAGCACAAAAGA
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CAAACGGTTGTGAATTAAAAGGAAGATGATGACGGCCGGGGGTGAGAGAAGAGTCCCCGG
ATCGATCCTCGATTGAGAAATGATGAAGTGGGTGACAACTTCGTAT
CC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 6

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CATCATAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACAAAACC
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CTACGACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAGC
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GAACGTTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTTCTATCTTCTTTTTATTATTATTATA*
TAAAATCAAATCATTTTCTATTT


BQ
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30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 0 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4A882JQ C 249
AF RR4A882TF U 249
AF RR4B174TF U 1
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GG
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TTTCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCTACTACGACCGT
CTCCACGTTTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAGCAATCCCTCCG
ACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCTGGTCTCTGTTTGTGTACGGAACCGCTGTT
CCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGGAGACGAGCAAAGTCATGGACTCGTTCGG
TTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGATCACTGGAAAA
TATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAGCTTCTGGTGTT
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AACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTTCTATCTTCTTTTTATTATTAT

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DS 

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GG
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ATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTTAACGTTTAG
AACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTTCTATCTTCTTTTTATTATTAT

QA 3 527 3 527
DS 

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GAGAGAAAAAGAAGCACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCGG
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GG
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TCTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAGCAATCCCTCCGACGTACC
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ACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTACTTTTTGTTATTATTATTATATAATCAAATCATTTT
CT

QA 1 782 1 782
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GAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCGGCAACCACGGTGGTGGCAAAGAAGCAGC
CGTCCGGCGAATCTGCGGCGCCGTTATCGCCTTCATCATAATAGTTCTAATCACCATCTT
CCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACAAAGCCAAGATTCATTCTCCAAGACGCCACCGT
CTTCGCCTTCAACCTCTCGCAACCAAACCTCCTCACCTCAAACTTTCAGATCACATTCGC
ATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATTTACTACGACCGTCTCCACGTTTACGCTAC
GTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAGCAATCCCTCCGACGTACCAAGGGCACAA
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CTCCGTCGCTTTGGGAGACGAGCAAAGTCATGGACTCGTTCGGTTG***ATATGCGCCGA
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GTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAGCTTCTGGTGTTATTGTCGGTGATAACGC
CGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTGAACGTTTAGAACTTTGACGCCGTTAA
GTTGCTTCTATCTTCTTTTTATTATTATTATA*TAAAATCAAATCATTTTCTATTT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 6

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AAATAAAAATTTAACAACACAAAACTTGAAAATTTGAACATATATATGTAACTATGAATA
TTCAAAATAAAGTCGGAAAAATGAATATTCAAAATAATAAATTCCGTAAAATATTTTATT
GCAGGGGGATACTGGAAGCGTAAACTTCTTTCCGTATATGCGAAGATAACGTGTTGTTGT
TGGTTCATCTCCTCAAGGTATGGAGAATATACTCAGCGTACAGATCCATGGAGTACTGGA
TCGCTTCATGTGCCTTCTCCGATGGCAAGAAATCGTTTACAGCCACCTCCTTGTGCTCGT
TCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAACGGCGGATTTCTGAGAGGCGGTGAGGAGCGAGTTGTT
TGATGTCGGTGAAATGTTTGTACTCTGGATCGTCTGCACATACGGCTATGATCTTGTCGT
CCATCTCTCCCTGATCAATCATGGGCATTAATCCAATGGCTCTAGCACGAAGAAAACATC
CTGGAAGCACTGGTTCCTGCATGAGGACAAGAACATCAAGAGGATCGTTGTCTTCACACA
ATGTCCTTGGGATGAATCCGTAGTTGTGAGGATAAACAACCGATGAGTACAAGATTCGAT
CAACCTTGATAAGACCAGTCTTTTTGTCAAGTTCATATTTCACTTTGCTCCCCTTTGTGA
TCTCAACCACCACGTTGAAGACTAATGGAGCTTCAGGACCGATCTCAAGGTCGTGCCACG
GATGCGCAGCTACAGATCTCCTGGATAGAGTTGAGAGGATCCTCTCGTTCAGCTTTGGAG
CAGGACGAGGAGATTGACTTGTTTCCATCGTTTCTTCATATGTTTCTTCACTCATCTTTG
GATCCTTGTTTCGTTTAAAAGGGACAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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TTCATGTGCCTTCTCCGATGGCAAGAAATCGTTTACAGCCACCTCCTTGTGCTCGTTCTT
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GTCGGTGAAATGTTTGTACTCTGGATCGTCTGCACATACGGCTATGATCTTGTCGTCCAT
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CCTTGGGATGAATCCGTAGTTGTGAGGATAAACAACCGATGAGTACAAGATTCGATCAAC
CTTGATAAGACCAGTCTTTTTGTCAAGTTCATATTTCACTTTGCTCCCCTTTGT

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DS 

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TCTCAACCACCACGTTGAAGACTAATGGAGCT

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DS 

RD RR4CF27JQ 775 0 0
G
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ATATTTTATTGCAGGGGGATACTGGAAGCGTAAACTTCTTTCCGTATATGTGAAGATAAC
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GAGTACTGGATCGCTTCATGTGCCTTCTCCGATGGCAAGAAATCGTTTACAGCCACCTCC
TTGTGCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAACGGCGGATTTCTGAGAGGCGGTGAGGA
GCGAGTTGTTTGATGTCGGTGAAATGTTTGTACTCTGGATCGTCTGCACATACGGCTATG
ATCTTGTCGTCCATCTCTCCCTGATCAATCATGGGCATTAATCCAATGGCTCTAGCACGA
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TCTTCACACAATGTCCTTGGGATGAATCCGTAGTTGTGAGGATAAACAACCGATGAGTAC
AAGATTCGATCAACCTTGATAAGACCAGTCTTTTTGTCAAGTTCATATTTCACTTTGCTC
CCCTTTGTGATCTCAACCACCACGTTGAAGACTAATGGAGCTTCAGGACCGATCTCAAGG
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CTC

QA 2 772 2 772
DS 

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AAATAAAAATTTAACAACACAAAACTTGAAAATTTGAACATATATATGTAACTATGAATA
TTCAAAATAAAGTCGGAAAAATGAATATTCAAAATAATAAATTCCGTAAAATATTTTATT
GCAGGGGGATACTGGAAGCGTAAACTTCTTTCCGTATATGCGAAGATAACGTGTTGTTGT
TGGTTCATCTCCTCAAGGTATGGAGAATATACTCAGCGTACAGATCCATGGAGTACTGGA
TCGCTTCATGTGCCTTCTCCGATGGCAAGAAATCGTTTACAGCCACCTCCTTGTGCTCGT
TCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAACGGCGGATTTCTGAGAGGCGGTGAGGAGCGAGTTGTT
TGATGTCGGTGAAATGTTTGTACTCTGGATCGTCTGCACATACGGCTATGATCTTGTCGT
CCATCTCTCCCTGATCAATCATGGGCATTAATCCAATGGCTCTAGCACGAAGAAAACATC
CTGGAAGCACTGGTTCCTGCATGAGGACAAGAACATCAAGAGGATCGTTGTCTTCACACA
ATGTCCTTGGGATGAATCCGTAGTTGTGAGGATAAACAACCGATGAGTACAAGATTCGAT
CAACCTTGATAAGACCAGTCTTTTTGTCAAGTTCATATTTCACTTTGCTCCCCTTTGTGA
TCTCAACCACCACGTTGAAGACTAATGGAGCTTCAG*ACCGATCTCAAGGTCGTGCCACG
GATGCGCAGCTACAGATCTCCTGGATAGAGTTGAGAGGATC*TCTCGT*CAGCTT*GGAG
CAGGACGAGGAGAT*GACTTGTTTC
ATCGTT

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DS 

RD RR4CF27TF 717 0 0
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CGTTTACAGCCACCTCCTTGTGCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAACGGCGGATTT
CTGAGAGGCGGTGAGGAGCGAGTTGTTTGATGTCGGTGAAATGTTTGTACTCTGGATCGT
CTGCACATACGGCTATGATCTTGTCGTCCATCTCTCCCTGATCAATCATGGGCATTAATC
CAATGGCTCTAGCACGAAGAAAACATCCTGGAAGCACTGGTTCCTGCATGAGGACAAGAA
CATCAAGAGGATCGTTGTCTTCACACAATGTCCTTGGGATGAATCCGTAGTTGTGAGGAT
AAACAACCGATGAGTACAAGATTCGATCAACCTTGATAAGACCAGTCTTTTTGTCAAGTT
CATATTTCACTTTGCTCCCCTTTGTGATCTCAACCACCACGTTGAAGACTAATGGAGCTT
CAGGACCGATCTCAAGGTCGTGCCACGGATGCGCAGCTACAGATCTCCTGGATAGAGTTG
AGAGGATCCTCTCGTTCAGCTTTGGAGCAGGACGAGGAGATTGACTTGTTTCCATCGTTT
CTTCATATGTTTCTTCACTCATCTTTGGATCCTTGTTTCGTTTAAAAGGGACAAAAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4DU05TF 714 0 0
TATGCGAAGATAACGTGT*GTTGTTGGT*CATCTCCTCAAGGTATGGAGAATATACTCAG
CGTACAGATCCATGGAGTACTGGATCGCTTCATGTGCTTTCTCCGATGGCAAGAAATCGT
TTACAGCCACCTCCTTGTGCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAACGGCGGATTTCTG
AGAGGCGGTGAGGAGCGAGTTGTTTGATGTCGGTGAAATGTTTGTACTCTGGATCGTCTG
CACATACGGCTATGATCTTGTCGTCCATCTCTCCCTGATCAATCATGGGCATTAATCCAA
TGGCTCTAGCACGAAGAAAACATCCTGGAAGCACTGGTTCCTGCATGAGGACAAGAACAT
CAAGAGGATCGTTGTCTTCACACAATGTCCTTGGGATGAATCCGTAGTTGTGAGGATAAA
CAACCGATGAGTACAAGATTCGATCAACCTTGATAAGACCAGTCTTTTTGTCAAGTTCAT
ATTTCACTTTGCTCCCCTTTGTGATCTCAACCACCACGTTGAAGACTAATGGAGCTTCAG
GACCGATCTCAAGGTCGTGCCACGGATGCGCAGCTACAGATCTCCTGGATAGAGTTGAGA
GGATCCTCTCGTTCAGCTTTGGAGCAGGACGAGGAGATTGACTTGTTTCCATCGTTTCTT
CATATGTTTCTTCACTCATCTTTGGATCCTTGTTTCGTTTAAAAGGGACAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 6

CO CL1689Contig1 1258 6 15 U
GGAAACACTATTCGATCAAACAGTTTGAGATGGTTTCGCAGATGATCTCGTGTCTATCTA
AATCACCGTCTCTTCTCTGCATCTCCGGTTCCAGGAGTTTAATTCCGCCGAAGACTTATA
ACCGCGGCGGTTTGAACCGGTTTTCTCCGGGATTTGCTAGCCAACGGTTATCTACGGTTA
TTCGGAAGAAATGGAGATCCTCTTGCATTTTCAATTCTGGAAAAGAAACTGGAGGAGAGG
GAAAGTTACAGGGAGGTAGCTTAGAGTGGCCAATACTTGAGAGATGGGAAGTGCCATGGG
GATGGCAGACAGTTTCGTTAACTTCGCTTGCTTGTGTATTAAGTTTTGTTTTGACAGGAT
TAACTGAGATGGCAGCCTTACCGTATTTGGGAATCGACGCTGAGAAGCTTAGCTTGGACG
AAAAGGCAGAGATTTTATTCCTGGATCAAGGCATAACAACTGCAGTGATACTTGCTGTAA
TATTCACCGTTGCCAAAACCTCTGAGCCACTTCCTGAAGACATTTTGCGCTATGATTTGA
AACAGCCATTCAACTTGCAAAAGGGATGGCTCGTGTGGGGTGGAATAGGTCTGGCTGCTG
CTGTTGGTGGTATTGCGTTAACAGGTGTTGCTTTATCCGAAAGGGAGGTCGACTCTTTGA
TGCAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACATAAGCACCTTGAGCTTAGTGGGGATAA
CTGGAATCCTTGCTCCGCTTCTTGAGGAGACCGTGTTCCGCGGATTCTTCATGGTCTCTC
TTACCAAATGGGTCCCAACCCCAATAGCGATCATCATCAGCTCAGCTGCGTTTGCTCTTG
CCCACCTCACACCCGGTGAATTCCCACAGTTGTTTATACTTGGATCGGTTTTGGGATTGA
CTTATGCTCAAACCCGCAACCTCATTACCCCGATGGTTATACACGGTCTCTGGAACTCTG
GAGTTATTTTGCTGCTCACCTTTCTTCAGGTCCAAGGGTATGACATCAAGGAACTATTGC
AGGGAAGCTAGCTTTGCTGTCTCGTCTCTGTTCGCAGTTAACATGAGAATGCTTCATTAC
GTGATCGATCATCTTAGTACCAAATAATTCAAAACTTGATGTAATTAATATATTTAAAAT
ATGACCATGGGCCAGTATCATTTTTATACCAAATTAAAATTTAGTTACTTCTAAACATGA
TCAACTATATTTATTGTCTTTTGTTTTATTTGTCGAATAAAGAAAAAAACTCGTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H825TF U -2
AF RR4FA06TF U 1
AF RR4GK56TF U 1
AF RR4H825JQB C 397
AF RR4GK56JQ C 421
AF RR4FA06JQ C 573
BS 1 287 RR4FA06TF
BS 288 288 RR4H825TF
BS 289 372 RR4FA06TF
BS 373 373 RR4H825TF
BS 374 458 RR4FA06TF
BS 459 459 RR4GK56TF
BS 460 555 RR4FA06TF
BS 556 556 RR4GK56TF
BS 557 690 RR4FA06TF
BS 691 691 RR4H825JQB
BS 692 737 RR4FA06TF
BS 738 1035 RR4H825JQB
BS 1036 1036 RR4GK56JQ
BS 1037 1188 RR4H825JQB
BS 1189 1258 RR4FA06JQ

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GATGGCAGACAGTTTCGTTAACTTCGCTTGCTTGTGTATTAAGTTTTGTTTTGACAGGAT
TAACTGAGATGGTAGCCTTACCGTATTTGGGAATCGACGCTGAGAAGCTTAGCTTGGACG
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AGATCCTCTTGCATTTTCAATT**GGAAAAGAAACTGGAGGAGAGGGAAAGTTACAGGGA
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TCGTTAACTTCGCTTGCTTGTGTATTAAGTTTTGTTTTGACAGGATTAACTGAGATGGCA
GCCTTACCGTATTTGGGAATCGACGCTGAGAAGCTTAGCTTGGACGAAAAGGCAGAGATT
TTATTCCTGGATCAAGGCATAACAACTGCAGTGATACTTGCTGTAATATTCACCGTTGCC
AAAACCTCTGAGCCACTTCCTGAAGACATTTTGCGCTATGATTTGAAACAGCCATTCAAC
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GCGTTAACAGGTGTTGCTTTATCCGAAAGGGAGGTCGACTCTTTGATGCAGCTTCTCCCA
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QA 15 723 15 723
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TCCGCGGATTCTTCATGGTCTCTCTTACCAAATGGGTCCCAACCCCAATAGCGATCATCA
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TACTTGGATCGGTTTTGGGATTGACTTATGCTCAAACCCGCAACCTCATTACCCCGATGG
TTATACACGGTCTCTGGAACTCTGGAGTTATTTTGCTGCTCACCTTTCTTCAGGTCCAAG
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TGATGTAATTAATATATTTAAAATATGACCATGGGCCAGTATCATTTTTATACCAAATTA
AAATTTAGTTAC
CT

QA 1 792 1 792
DS 

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AACAGCCATTCAACTTGCAAAAGGGATGGCTCGTGTGGGGTGGAATAGGTCTGGCTGCTG
CTGTTGGTGGTATTGCGTTAACAGGTGTTGCTTTATCCGAAAGGGAGGTCGACTCTTTGA
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CTGGAATCCTTGCTCCGCTTCTTGAGGAGACCGTGTTCCGCGGATTCTTCATGGTCTCTC
TTACCAAATGGGTCCCAACCCCAATAGCGATCATCATCAGCTCAGTTGCGTTTGCTCTTG
CCCACCTCACAGCCGGTGAATTCCCACAGTTGTTTATACTTGGATCGGTTTTGGGATTGA
CTTATGCTCAAACCCGCAACCTCATTACCCCGATGGTTATACACGGTCTCTGGAACTCTG
GAGTTATTTTGCTGCTCACCTTTCTTCAGGTCCAAGGGTATGACATCAAGGAACTATTGC
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ATGACCATGGGCCAGTATC
G

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DS 

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GTGTTCCGCGGATTCTTCATGGTCTCTCTTACCAAATGGGTCCCAACCCCAATAGCGATC
ATCATCAGCTCAGCTGCGTTTGCTCTTGCCCACCTCACACCCGGTGAATTCCCACAGTTG
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ATGGTTATACACGGTCTCTGGAACTCTGGAGTTATTTTGCTGCTCACCTTTCTTCAGGTC
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ATTAAAATTTAGTTACTTCTAAACATGATCAACTATATTTATTGTCTTTTGTTTTATTTG
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DS 



AS 1 3

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ACACCACACCAGAACAGTTATTGAACACAAAACATTACAAGTCCACTTCCTTTTATTGAT
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TGAGAATGGTGAGTGATGTGGTCTTCGATGAAGGTGGCAATAAAATAGTAAGAGTGGTCG
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TTGTTTGGCAATAACTGATCAGGGAAGAACTGGTCGTTTTCTCCCTGATCAATAAGAATT
GTGGCAGACAGATTGTTGAACTTTGAAATAAGACAAGTGGCATCATATTCCTCCCAAGCA
GCCTTGTTGTCACCTAGATAATTGGTGAATGCTTTCTGTCCCCACTGGCAGTTTATGGGA
TTGGCAATTGGTGCAAATGCTGGCACAGACTTATACTTGTCTAGGTTCTTCAGGTAAATA
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GTGCAGGTGAGTCCAGAGAGCCAGTAAAGCACAGGGAATCTACGGGAAGATGAAGAAGAA
GGAGGGAAGTAGATGGAGAAAGTCATGGAACAGCCAAGTGTAGCACTGTAGTGTTTATAT
CTTTTGTTAAACCCATCGAACATCTTCGTGCTTCCGATCTCGCTTAGCCCAGACTCCATT
TTCTCTTTCTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ63JQ U 21
AF RR4BM79JQ U 1
AF RR4BM79TF C 312
BS 1 793 RR4BM79JQ
BS 794 794 RR4BM79TF
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BS 850 1034 RR4BM79TF

RD RR4AJ63JQ 770 0 0
GTCA
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TTCAATCCTCTTGGAGAAGTATCTGGAACAACAAGAGCAATGCCGC

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DS 

RD RR4BM79JQ 849 0 0
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TATCCTGGGTGGAGACGCAGTAAGAGTGGCGCATTCACTTTCTTGCATGCCTCTTCAAAA
TTGTTTGGCAATAACTGATCAGGGAAGAACTGGTCGTTTTCTCCCTGATCAATAAGAATT
GTGGCAGACAGATTGTTGAACTTTGAAATAAGACAAGTGGCATCATATTCCTCCCAAGCA
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TTGGCAATTGGTGCAAATGCTGGCACAGACTTATACTTGTCTAGGTTCTTCAGGTAAATA
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GTGCAGGTG

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ATTGTTGAACTT*GAAATAAGACAAGTGGCATCATATTCCTCCCAAGCAGCCTTGTTGTC
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TGCAAATGCTGGCACAGACTTATACTTGTCTAGGTTCTTCAGGTAAATAGTAAGAGCTCC
ATGTCCACCCATGGAGTGTCCAGAGATAGATGCCATTGTTGTGTCAAGCTGTGAAAAGTT
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CTTCTCCTGAGTAGCATTCAGGTAAAACCCAGCTCCTACACCAAAGTCATAACTGTCTGC
CTCCCCTTCAATATTCAATCCTCTTGGAGAAGTATCTGGAACAACAAGAGCAATGCCGCG
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CCCATCGAACATCTTCGTGCTTCCGATCTCGCTTAGCCCAGACTCCATTTTCTCTTTCTT
TGA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 6

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GCAAAATTTCGAGCTTTTTACATATTTTATTAGATTATACTATTAAATTCTCAGCTATAT
ATACATAATTTGATGATTGTCTACTTTATAATTTAAATCAATAAAAATTCAATAAATTTA
ATTG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RR4DZ46JQ C 1
AF RR4DZ46TF U 1
AF RR4DY71TF U 1
AF RR4E204TF U 1
AF RR4E204JQ C 13
AF RR4DY71JQ C 23
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QA 1 617 1 617
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RD RR4DZ46TF 617 0 0
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QA 1 617 1 617
DS 

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ATACATA*TTTGATGATTGTCTACTTTATA*TTTAAATCA
TAAAATTCAT

QA 1 760 1 760
DS 

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ACAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGATACAAGGTCAAGTACCAACCTATTGTCTCTG
GCTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTGCTTTACT
TCTGGCTCAGCATCGGGGAGGTGACTAGTGACGGCCAGGAACTCGAACTCTCAGTTGGGG
CTGCTTCGGAAGAATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGT
TTTATTGTCGTGAGCTCAAATTTTCCTTCTAAAGCTAATGGGTCTCCAAGTTGTTATGAA
TAAAATAAATAAACAACCACTTTACCTAATAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGG
TGCTATGGATTGGTGACTGAATAAATTGCAGTACTAAAACTTTATCCATGTCAAACTGAT
GCAAAATTTCGAGCTTTTTACATATTTTATTAGATTATACTATTAAATTCTCAGCTATAT
ATACATAATTTGATGATTGTCTACTTTATA*TTTAAATCAATAAAA
TTCAAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4E204JQ 772 0 0
CACGACAAAACGAGACAAGAATCCAAGAGAGCACACGACGTTAATTAGAAAAAATGTCCA
TATTCTTCCTGTCACTCTTTCTTTTTGCCACTTCTTTGTATGTTTCCTGCACAAACCTAA
CAGCTTACGATGTTGTCCAAAAATACAAGTTACCACGAGGAATACTACCAGAAGGTGTCA
TTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTTTTCAAAGTCTATTTCAACAACACGTGTC
GGTTCCCAATCGAGGGATACAAGGTCAAGTACCAACCTATTGTCTCTGGCTTCATAAAAA
ACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTGCTTTACTTCTGGCTCAGCA
TCGGGGAGGTGACTAGTGACGGCCAGGAACTCGAACTCTCAGTTGGGGCTGCTTCGGAAG
AATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGTTTTATTGTCGTG
AGCTCAAATTTTCCTTCTAAAGCTAATGGGTCTCCAAGTTGTTATGAATAAAATAAATAA
ACAACCACTTTACCTAATAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGGTGCTATGGATTG
GTGACTGAATAAATTGCAGTACTAAAACTTTATCCATGTCAAACTGATGCAAAATTTCGA
GCTTTTTACATATTTTATTAGATTATACTATTAAATTCTCAGCTATATATACATAATTTG
ATGATTGTCTACTTTATAATTTAAATCAATAAAAATTCAATAAATTTAATTG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4DY71JQ 762 0 0
CGAGACAAGAATCCAAGAGAGCACACGACGTTAATTAGAAAAAATGTCCATATTCTTCCT
GTCACTCTTTCTTTTTGCCACTTCTTTGTATGTTTCCTGCACAAACCTAACAGCTTACGA
TGTTGTCCAAAAATACAAGTTACCACGAGGAATACTACCAGAAGGTGTCATTGACTACGA
CCTAAACCACAAAACTGGCTTTTTCAAAGTCTATTTCAACAACACGTGTCGGTTCCCAAT
CGAGGGATACAAGGTCAAGTACCAACCTATTGTCTCTGGCTTCATAAAAAACGGACGGAT
CAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTGCTTTACTTCTGGCTCAGCATCGGGGAGGT
GACTAGTGACGGCCAGGAACTCGAACTTTCAGTTGGGGCTGCTTCGGAAGAATTCTCGGT
GCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGTTTTATTGTCGTGAGCTCAAATT
TTCCTTCTAAAGCTAATGGGTCTCCAAGTTGTTATGAATAAAATAAATAAACAACCACTT
TACCTAATAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGGTGCTATGGATTGGTGACTGAAT
AAATTGCAGTACTAAAACTTTATCCATGTCAAACTGATGCAAAATTTCGAGCTTTTTACA
TATTTTATTAGATTATACTATTAAATTCTCAGCTATATATACATAATTTGATGATTGTCT
ACTTTATAATTTAAATCAATAAAAATTCAATAAATTTAATTG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 6

CO CL1692Contig1 723 6 7 U
GGGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATAACACAACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCTG
TCTCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCT
CCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGC
ATCCTTTGGTCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAAT
CCAAGGAGTACGTCCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCATTACTACTGGTTCCTCACTAACG
AAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTT
TGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGCCCTCGTGGCCCACCTC
GTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGT
CTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGG
CACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTC
CAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTT*GGTT
ATATTGTACTTTGGATTTGAGATGAATTATCCTTTACTCAAGATGATTGTTTTTTTACGT
TAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4D269JQ C 206
AF RR4H285TF U 8
AF RR4H285JQ C 115
AF RR4D269TF U 3
AF RR4AJ71TF U 1
AF RR4AJ71JQ C 1
BS 1 8 RR4AJ71JQ
BS 9 593 RR4D269TF
BS 594 594 RR4H285TF
BS 595 700 RR4D269TF
BS 701 701 RR4AJ71TF
BS 702 715 RR4D269TF
BS 716 723 RR4AJ71JQ

RD RR4D269JQ 403 0 0
TCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAATCCAAGGAGTACGTCCGCGAGACGTT
TGCGTGGATGCATTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTA
CCTCAACTTACCTTTTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGCAGAAGCCTTTTGG
TCGTCCCATGGGTGACCGCCCTCGTGGCCCACCTCGTTTTGATGGAGAGAGGAGATTTGG
TGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTTTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAG
TGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAGCTGGATTTAGGCCTGG
GTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTTTTGGTCCAGCTGCT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4H285TF 625 0 0
G
GGAGAGAACGCCGTCACATAACACAACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCTGTCTCCTCC
ACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTAC
CTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTG
GTCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAATCCAAGGAG
TACGTCCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCATTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATT
GACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAG
CAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGCCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGAT
GGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGT
GAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGA
GCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCT
GGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGA

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR4H285JQ 609 0 0
CAATCTCCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGG
CGCAGCATCCTTTGGTCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCT
TCAAATCCAAGGAGTACGTCCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCATTACTACTGGTTCCTCA
CTAACGAAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCG
CCACTTTGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGCCCTCGTGGCC
CACCTCGTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCAC
CTAGGTCTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCT
TCAGGGCACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTG
CTGGTCCAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTT
TTGGTTATATTGTACTTTGGATTTGAGATGAATTATCCTTTACTCAAGATGATTGTTTTT
T
TACGTTAC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4D269TF 720 0 0
GGAGAA
GGAGAGAACGCCGTCACATAACACAACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCTGTCTCCTCC
ACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTAC
CTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTG
GTCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAATCCAAGGAG
TACGTCCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCATTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATT
GACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAG
CAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGCCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGAT
GGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGT
GAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGA
GCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTTCTGGTCCAGCTGCT
GGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTT*GGTTATATTGTA
CTTTGGATTTGAGATGAATTATCCTTTACTCA*GATGATTGTTTTTT
ACGTTAC

QA 7 713 7 713
DS 

RD RR4AJ71TF 723 0 0
GGGTAGAA
GGAGAGAACGCCGTCACATAACACAACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCTGTCTCCTCC
ACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTAC
CTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTG
GTCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATACAGAGCTTCAAATCCAAGGAG
TACGTCCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATT
TACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAG
CAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCCTGGGTGACCGCCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGAT
GGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGT
GAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGA
GCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCT
GGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTT*GGTTATATTGTA
CTTTGGATTTGAGATGAATTATCCTTTACTCAAGATGATTGTTTTTT
TACGTTAC

QA 9 715 9 715
DS 

RD RR4AJ71JQ 723 0 0
GGGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATAACACAACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCTG
TCTCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCT
CCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGC
ATCCTTTGGTCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATACAGAGCTTCAAAT
CCAAGGAGTACGTCCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACG
AAGGCATTTACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTT
TGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCCTGGGTGACCGCCCTCGTGGCCCACCTC
GTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGT
CTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGG
CACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTC
CAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTT*GGTT
ATATTGTACTTTGGATTTGAGATGAATTATCCTTTACTCAAGATGATTGTTTTTTTACGT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 6

CO CL1693Contig1 1318 6 18 U
GGAGATCCCACTACTTCAGCTGATGGGGGCTTTGTACATGGGTAACAAACCTCTTCTTAA
AGTGGACAGCAAGGTGAGCATTGTAATGGAGCAAATGATGCGGTTGCTTCACTACTGTGG
TTTACCCGTTGAAGATGTTGACTTTATAAACTCCGATGGCAAGACTATGAACAAGATATT
GCTAGAGGCGAGTCCAAGGATGACTCTCTTCACGGGTAGCTCTAGAGTAGCTGAAAAGTT
GGCACTTGACCTCAAAGGTCGGATCAGACTAGAAGATGCTGGATTTGATTGGAAAGTCTT
GGGACCAGATGTTCAGGAGATTGATTATGTTGCATGGGTATGTGATCAATATGCATACGC
GTGCAGTGGACAGAAGTGTTCTGCACAGTCTATACCTTTTGTGCATGAGAACTGGTCAAA
AACTCCTCTGCTTTCCAAGTTAAAAGATCTTGCAGGAAGACGCAAGCTGGAAGACTTGAC
CATTGGTCCTGTCCTAACATTTACAACAGAGGCAATGTTGGAGCACATGGAGAATCTGCT
TAAGATTCCAGGCTCAAAGCTACTCTTTGGTGGGAAACCATTGAAGAACCACTCTGTTCC
TTCTATCTACGGAGCTTTGGAGCCCACCGCAGTTTATGTTCCCATTGAAGAAATCTTGAA
GGACAGTAAAACCTACGAACTCGTCACCAAAGAAATCTTTGGACCCTTTCAGATTGTAAC
GGAATACAAAAAGGATCAACTTCCTCTTGTGTTGGATGCTTTGGAGAGGATGCACGCTCA
TCTAACTGCTGCTGTTGTTTCAAACGACCCCATCTTTATCCAGGAAGTGATAGGGAACAC
GGTGAATGGGACTACATATGCTGGACTCAGAGGAAGAACAACTGGAGCTCCTCAGAATCA
CTGGTTTGGTCCTGCTGGGGATCCAAGAGGAGCAGGGATAGGAACACCAGAGGCAATAAA
GCTGGTGTGGTCATGCCACAGAGAGGTCATCTATGACTATGGTCCTATTCCACATGGTTG
GGAACTTCCTGCATCTACTTAAATTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAG**CACTTAGT
TTGCTCTATTACCGAATAAAAGTGAGAGTTTTTGTAGTGTACCTACCTCCCTACTGGTTT
GTAGTTTCAGAGTATTGAGTGT**GGGGGAGGCATAACAACAACTTTTGAATCATGAAAT
AAAAGAGTTGACTTAGTTAGTCAACGGTTGAGAGGCTGATTATTATTATTATTGTAAAAC
TCTACTGAATCTTTATGATGTTTTTTTCTTTTTTTTTCATTTTAGATCCGCTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH92TF U 1
AF RR4EG92TF U 346
AF RR4EG92JQ C 504
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BS 479 511 RR4FH92TF
BS 512 512 RR4EG92TF
BS 513 595 RR4FH92TF
BS 596 596 RR4EG92TF
BS 597 661 RR4FH92TF
BS 662 662 RR4EG92TF
BS 663 705 RR4FH92TF
BS 706 706 RR4EG92TF
BS 707 718 RR4FH92TF
BS 719 826 RR4EG92TF
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BS 846 1068 RR4AP93TF
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BS 1071 1281 RR4AP93TF
BS 1282 1318 RR4FH92JQ

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TTTACCCGTTGAAGATGTTGACTTTATAAACTCCGATGGCAAGACTATGAACAAGATATT
GCTAGAGGCGAGTCCAAGGATGACTCTCTTCACGGGTAGCTCTAGAGTAGCTGAAAAGTT
GGCACTTGACCTCAAAGGTCGGATCAGACTAGAAGATGCTGGATTTGATTGGAAAGTCTT
GGGACCAGATGTTCAGGAGATTGATTATGTTGCATGGGTATGTGATCAATATGCATACGC
GTGCAGTGGACAGAAGTGTTCTGCACAGTCTATACCTTTTGTGCATGAGAACTGGTCAAA
AACTCCTCTGCTTTCCAAGTTAAAAGATCTTGCAGGAAGACGCAAGCTGGAAGACTTTAC
CATTGGTCCTGTCCTAACATTTACAACAGAGACAATGTTGGAGCACATGGAGAATCTGCT
TAAGATTCCAGGCTCAAAGCTACTCTTTGGTGGGAAACCATTGAAGAACCACTCTATTCC
TTCTATCTACGGAGCTTTGGAGCCCACCGCAGTTTATGTTCCCATTGAAGAAATCTTGAA
G*ACAGTAAAACCTACGAACTCGTCACCAAAGAAATCTTTGGACC*TTTCAGATTGTA
CGGATACAAA

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DS 

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GCAAG
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AAGACTTGACCATTGGTCCTGTCCTAACATTTACAACAGAGGCAATGTTGGAGCACATGG
AGAATCTGCTTAAGATTCCAGGCTCAAAGCTACTCTTTGGTGGGAAACCATTGAAGAACC
ACTCTGTTCCTTCTATCTACGGAGCTTTGGAGCCCACCGCAGTTTATGTTCCCATTGAAG
AAATCTTGAAGGACAGTAAAACCTACGAACTCGTCACCAAAGAAATCTTTGGACCCTTTC
AGATTGTAACGGAATACAAAAAGGATCAACTTCCTCTTGTGTTGGATGCTTTGGAGAGGA
TGCACGCTCATCTAACTGCTGCTGTTGTTTCAAACGACCCCATCTTTATCCAGGAA

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DS 

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TCTTTGGTGGGAAACCATTGAAGAACCACTCTGTTCCTTCTATCTACGGAGCTTTGGAGC
CCACCGCAGTTTATGTTCCCATTGAAGAAATCTTGAAGGACAGTAAAACCTACGAACTCG
TCACCAAAGAAATCTTTGGACCCTTTCAGATTGTAACGGAATACAAAAAGGATCAACTTC
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ACGACCCCATCTTTATCCAGGAAGTGATAGGGAACACGGTGAATGGGACTACATATGCTG
GACTCAGAGGAAGAACAACTGGAGCTCTTCAGAATCACTGGTTTGGTCCTGCTGGGGATC
CAAGATGAGCAGGGATAGGAACACCAGAGGCAATAAAGCTGGTGTGGTCATGCCACAGAG
AGGTCATCTATGACTATGTTCCTATTCCACATGGTTGGGAACTTCCTGCATCTACTTAAA
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GAGAGTTTTTGTAGTGTACCTACCTCCCTACTGGTTTGTAGTTTCAGAGTATTGAGTGT*
*GGGGGAGGCATAACAACAACTTTTGAATCATGAAATAAAAGAGTTGACTTAGTTAGTCA
ACGGTTGAGAGGCTGATT

QA 1 738 1 738
DS 

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ATTCCAGGCTCAAAGCTACTCTTTGGTGGGAAACCATTGAAGAACCACCCTATTCCTTCT
ATCTACGGAGCTTTGGAGCCCACCGCAGTTTATGTTCCCATTGAAGAAATCTTGAAGGGC
AGTAAAACCTACGAACTCGTCACCAAAGAAATCTTTGGACCCTTTCAGATTGTAACGGAA
TACAAAAAGGATCAACTTCCTCTTGTGTTGGATGCTTTGGAGAGGATGCACGCTCATCTA
ACTGCTGCTGTTGTTTCAAACGACCCCATCTTTATCCAGGAAGTGATAGGGAACACGGTG
GATGGGACTACATATGCTGGACTCAGAGGAAGAACAACTGGAGCTCCTCAGAATCACTGG
TTTGGTCCTGCTGGGGATCCAAGAGGAGCAGGGATAGGAACACCAGAGGCAATAAAGCTG
GTGTGGTCATGCCACAGAGAGGTCATCTATGACTATGGTCCTATTCCACATGGTTGGGAA
CTTCCTGCATCTACTTAAATTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAG****CACTTAGTTTGC
TCTATTACCGAATAAAAGTGAGAGTTTTTGTAGTGTACCTACCTCCCTACTGGTTTGTAG
TTTCAGAGTATTGAGTGT**GGGGGAGGCATAACAACAACTTTTGAATCATGAAATAAAA
GAGTTGACTTAGTTAGTCAACGGTTGAGAGGCTGATTATTATTATTATTGTAAAACTCTA
CTGAATCTTTATGATGT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4BB68TF 785 0 0
G
AACAGAGGCAATGTTGGAGCACATGGAGAATCTGCTTAAGATTCCAGGCTCAAAGCTACT
CTTTGGTGGGAAACCATTGAAGCACCACTCTTTTCCTTCTATCTACGGAGCTTTGGAGCC
CACCGCAGTTTATGTTCCCATTGAAGAAATCTTGAAGGACAGTAAAACCTACGAACTCGT
CACCAAAGAAATCTTTGGACCCTTTCAGATTGTAACGGAATACAAAAAGGATCAACTTCC
TCTTGTGTTGGATGCTTTGGAGAGGATGCACGCTCATCTAACTGCTGCTGTTGTTTCAAA
CGACCCCATCTTTATCCAGGAAGCGATGGGGAACACGGTGAATGGGACTACATATGCTGG
ACTCAGAGGAAGAACAACTGGAGCTCCTCAGAATCACTGGTTTGGTCCTGCTGGGGATCC
AAGAGGAGCAGGGATAGGAACACCAGAGGCAATAAAGCTGGTGTGGTCATGCCACAGAGA
GGTCATCTATGACTATGGTCCTATTCCACATGGTTGGGAACTTCCTGCATCTACTTCAAT
TGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAG**CACTTAGTTTGCTCTATTACCGAATAAAAGTG
AGAGTTTTTGTAGTGTACCTACCTCCCTACTGGTTTGTAGTTTCAGAGTATTGAGTGGTG
GGGGGAGGCATAACAACAACTTTTGAATCATGAAATAAAAGAGTTGACTTAGTTAGTCAA
CGGTTGAGAGGCTGATTATTATTATTATTGTAAAACTCTACTGAATCTTTATGATGT
TTTATCT

QA 2 778 2 778
DS 

RD RR4FH92JQ 634 0 0
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TCTTGTGTTGGATGCTTTGGAGAGGATGCACGCTCATCTAACTGCTGCTGTTGTTTCAAA
CGACCCCATCTTTATCCAGGAAGTGACAGGGAACACGGTGAATGGGACTACATATGCTGG
ACTCAGAGGAAGAACAACTGGAGCTCCTCAGAATCACTGGTTTGGTCCTGCTGGGGATCC
AAGAGGAGCAGGGATAGGAACACCAGAGGCAATAAAGCTGGTGTGGTCATGCCACAGAGA
GGTCATCTATGACTATGGTCCTATTCCACATGGTTGTGAACTTCCTGCATCTACTTAAAT
TGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAG****CACTTAGTTTGCTCTATTACCGAATAAAAGTG
AGAGTTTTTGTAGTGTACCTACCTCCCTACTGGTTTGTAGTTTCAGAGTATTGAGTGT**
GGGGGAGGCATAACAACAACTTTTGAATCATGAAATAAAAGAGTTGACTTAGTTAGTCAA
CGGTTGAGAGGCTGATTATTATTATTATTGTAAAACTCTACTGAATCTTTATGATGTTTT
TTTCTTTTTTTTTCATTTTAGATCCGCTTTTTCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 6

CO CL1694Contig1 1169 6 2 U
GTCGACAATAATATAATATCAGTAGTATTCAGTACTACAAGAGTGGCTTAATAATAACAA
GTAGTAGCAAAATACACTTTGAAAGTAGAGGCAATACTCGAAACGCCAAGACGTTCACTA
GTGAATGATAAAATGACAACAGAGAAAACGCTAAACCGCTTGAAACACAACAAACCGATT
CCTTTTTTTTTGGTTTCCAGCAGAAGTCAATACCCGAACCTCTTTACCCTTTTCTTTCTC
AAGCCTCTTTTTGGCCAGCCCGCAAACAAATGCGCAATGAAAGCAAACGCAAAAGGTGCG
TTCTTGACTTCCTTTTGGAAAATCTTTTTTTTTTTTGGAAAATCTTTAAAAAACAAGAAA
TAAATATTACCATGAAAAACTCCTAAACCTTCCTCCTCTTTCACTTCTGAAAGGAAACTT
CAATCAGGCACCTTCACATGCCAAGGCAGCTTTGATCCGCTCAACAGTGCATTTAATCAG
ACTGTTGACTGTAGCCACTGAGCCTAGAGAGAGCTTAGCGGTTGGAACAGAGTCAACAAG
AATCTGAAACGCTACGGTGAGTAGCGAACCGCCATTACTTGCGGTGGATGTAACCACTTC
GAGGTTATTTCAATCTACTACTCCTTCAGCTCCTGCACTAGCATTTACCCTTGAAGAGCC
ATCAGGTAATACAGCGAACCCGGATGGCAACAAAGCGACATAATCTGGATCCCCGCCGCT
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AACCAAGCCTCCGTTCGAAAGTATGTCCCACTCGCTTCTAGAGTTTTCATCTATCAGAAA
ATCGAACACACGTTTAGGTGCCACTGGGATCCAGAAGGAAGTGGCGGCGCTCAAGACGAT
ACCCGGAGGCCTTCCCGGATCATCCATGCTCTTCCTGGTCATGACCCGAACGTCGTCGGA
TCCTGTGGTAGCCAGTGTCGTCCATGCGTGTGCATTAGACGCGCCTACTCCGCTACAGAA
GCTCATCACCATCCTCTCCGCTAGCTTCA


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D328JQ U 1
AF RR4D328TF C 249
AF RR4BF70JQ U 351
AF RR4BD47TF C 711
AF RR4BD47JQ U 351
AF RR4BF70TF C 409
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BS 425 1169 RR4BD47JQ

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GTAGTAGCAAAATACACTTTGAAAGTAGAGGCAATACTCGAAACGCCAAGACGTTCACTA
GTGAATGATAAAATGACAACAGAGAAAACGCTAAACCGCTTGAAACACAACAAACCGATT
CCTTTTTTTTTGGTTTCCAGCAGAAGTCAATACCCGAACCTCTTTACCCTTTTCTTTCTC
AAGCCTCTTTTTGGCCAGCCCGCAAACAAATGCGCAATGAAAGCAAACGCAAAAGGTGCG
TTCTTGACTTCCTTTTGGAAAATCTTTTTTTTTTTTGGAAAATCTTTAAAAAACAAGAAA
TAAATATTACCATGAAAAACTCCTAAACCTTCCTCCTCTTTCACTTCTGAAAGGAAACTT
CAAT

QA 1 424 1 424
DS 

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TTTTGGCCAGCCCGCAAACAAATGCGCAATGAAAGCAAACGCAAAAGGTGCGTTCTTGAC
TTCCTTTTGGAAAATCTTTTTTTTTTTTGGAAAATCTTTAAAAAACAAGAAATAAATATT
ACCATGAAAAACTCCTAAACCTTCCTCCTCTTTCACTTCTGAAAGGAAACTTCAATCAGG
CACCTTCACATGCCAAGGCAGCTTTGATCAGCTCAACAGTGCATTTAATCAGACTGTTGA
CTGTAGCCACTGAGCCTAGAGAGAGCTTAGCGGTTGGAACAGAGTCAACAAGAATCTGAA
ACGCTACGGTGAGTAGCGAACCGCCATTACTTGCGGTGGATGTAACCACTTCGAGGTTAT
TTCCATCTACTACTCCTTCAGCTCCTGCACTAGCATTTACCCTTGAAGAGCCATCAGGTA
ATACAGCGAACCCGGATGGCAACAAAGCGACATAATCTGGATCCCCGCCGCTTAGGACAA
CATTCATAGCCATTATGTCTACTGGTGCGTATATTACATACGATCCTGATGCGTCCGTAC
AGCTTTCTTGTAAGATCAACATGTTGCTCTGTCCTGAGTTCGCGCTATTAACTCGGAACA
AGGAGACAGAGTTCCCAGGGTCACGACCATTAGCGATGTGAGCCATTTCTTGAACCAAGC
CTCCGTTCGAAAGTATGTC
AC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4BF70JQ 645 0 0
AAACAAGAAATAAATATTACCATGAAAAACTCCTAAACCTTCCTCCTCTTTCACTTCTGA
AAGGAAACTTCAATCAGGCACCTTCACATGCCAAGGCAGCTTTGATCCGCTCAACAGTGC
ATTTAATCAGACTGTTGACTGTAGCCACTGAGCCTAGAGAGAGCTTAGCGGTTGGAACAG
AGTCAACAAGAATCTGAAACGCTACGGTGAGTAGCGAACCGCCATTACTTGCGGTGGATG
TAACCACTTCGAGGTTATTTCAATCTACTACTCCTTCAGCTCCTGCACTAGCATTTACCC
TTGAAGAGCCATCAGGTAATACAGCGAACCCGGATGGCAACAAAGCGACATAATCTGGAT
CCCCGCCGCTTAGGACAACATTCATAGCCATTATGTCTACTGGTGCGTATATTACATACG
ATCCTGATGCGTCCGTACAGCTTTCTTGTAAGATCAACATGTTGCTCTGTCCTGAGTTCG
CGCTATTAACTCGGAACAAGGAGACAGAGTTCCCAGGGTCACGACCATTAGCGATGTGAG
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CTATCAGAAAATCGAACACACGTTTAGGTGCCACTGGGATCCAGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4BD47TF 424 0 0
CCCCGCCGCTTAGGACAACATTCATAGCCATTATGTCTACTGGTGCGTATATTACATACG
ATCCTGATGCGTCCGTACAGCTTTCTTGTAAGATCAACATGTTGCTCTGTCCTGAGTTCG
CGCTATTAACTCGGAACAAGGAGACAGAGTTCCCAGGGTCACGACCATTAGCGATGTGAG
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CTATCAGAAAATCGAACACACGTTTAGGTGCCACTGGGATCCAGAAGGAAGTGGCGGCGC
TCAAGACGATACCCGGAGGCCTTCCCGGATCATCCATGCTCTTCCTGGTCATGACCCGAA
CGTCGTCGGATCCTGTGGTAGCCAGTGTCGTCCATGCGTGTGCATTAGACGCGCCTACTC
CGCT

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4BD47JQ 819 0 0
AAACAAGAAATAAATATTACCATGAAAAACTCCTAAACCTTCCTCCTCTTTCACTTCTGA
AAGGAAACTTCAATCAGGCACCTTCACATGCCAAGGCAGCTTTGATCCGCTCAACAGTGC
ATTTAATCAGACTGTTGACTGTAGCCACTGAGCCTAGAGAGAGCTTAGCGGTTGGAACAG
AGTCAACAAGAATCTGAAACGCTACGGTGAGTAGCGAACCGCCATTACTTGCGGTGGATG
TAACCACTTCGAGGTTATTTCAATCTACTACTCCTTCAGCTCCTGCACTAGCATTTACCC
TTGAAGAGCCATCAGGTAATACAGCGAACCCGGATGGCAACAAAGCGACATAATCTGGAT
CCCCGCCGCTTAGGACAACATTCATAGCCATTATGTCTACTGGTGCGTATATTACATACG
ATCCTGATGCGTCCGTACAGCTTTCTTGTAAGATCAACATGTTGCTCTGTCCTGAGTTCG
CGCTATTAACTCGGAACAAGGAGACAGAGTTCCCAGGGTCACGACCATTAGCGATGTGAG
CCATTTCTTGAACCAAGCCTCCGTTCGAAAGTATGTCCCACTCGCTTCTAGAGTTTTCAT
CTATCAGAAAATCGAACACACGTTTAGGTGCCACTGGGATCCAGAAGGAAGTGGCGGCGC
TCAAGACGATACCCGGAGGCCTTCCCGGATCATCCATGCTCTTCCTGGTCATGACCCGAA
CGTCGTCGGATCCTGTGGTAGCCAGTGTCGTCCATGCGTGTGCATTAGACGCGCCTACTC
CGCTACAGAAGCTCATCACCATCCTCTCCGCTAGCTTCA

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DS 

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GCATTTAATCAGACTGTTGACTGTAGCCACTGAGCCTAGAGAGAGCTTAGCGGTTGGAAC
AGAGTCAACAAGAATCTGAAACGCTACGGTGAGTAGCGAACCGCCATTACTTGCGGTGGA
TGTAACCACTTCGAGGTTATTTCAATCTACTACTCCTTCAGCTCCTGCACTAGCATTTAC
CCTTGAAGAGCCATCAGGTAATACAGCGAACCCGGATGGCAACAAAGCGACATAATCTGG
ATCCCCGCCGCTTAGGACAACATTCATAGCCATTATGTCTACTGGTGCGTATATTACATA
CGATCCTGATGCGTCCGTACAGCTTTCTTGTAAGATCAACATGTTGCTCTGTCCTGAGTT
CGCGCTATTAACTCGGAACAAGGAGACAGAGTTCCCAGGGTCACGACCATTAGCGATGTG
AGCCATTTCTTGAACCAAGCCTCCGTTCGAAAGTATGTCCCACTCGCTTCTAGAGTTTTC
ATCTATCAGAAAATCGAACACACGTTTAGGTGCCACTGGGATCCAGAAGGAAGTGGCGGC
GCTCAAGACGATACCCGGAGGCCTTCCCGGATCATCCATGCTCTTCCTGGTCATGACCCG
AACGTCGTCGGATCCTGTGGTAGCCAGTGTCGTCCATGCGTGTGCATTAGACGCGCCTAC
TCCGCTACAGAAGCTCATCACCATCCTCTCCGCTAGCTTCA

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DS 



AS 1 5

CO CL1695Contig1 1403 5 5 U
GATTCTTCAAACATCTATACCATTCTTGTGTAATGAAAATTTTACCCCTTAAGGCAGAAG
TAAATAGCTGTGCCAGAACTCAAAATGTAAAACAATAAAAATACATGAGAAACCAATGGT
GGCTTTGTTTCTTCTCATAGGAAGATGATCAAAAGGAGAGAGAGATAAAAAAA*CGTGAG
CAAGAATATCTGGAGGGTAAATCCTCAAAGGAAAGTCCCAATGGCGAATGAATAAGTAGA
GAAATAATGGGTGGTTAGAGATGATCACATATGGCTTTTGTGAACTCTGTAGTGGTTGAG
GTGCCTCCAAGATCAGCGGTTCTATACTTTCCCTCCGCTATTGTGTTGATGATGGCGCTG
TGAATTTGCTCTGCTTGTTTGTTGAGCTTCAGATGCCTCAACATCATCACTCCACTCAAA
AGCAAAGCTGTCGGGTTCGCCAAGTTCTTTCCAGCAATATCTGGTGCAGAGCCGTGCACA
GCTTCAGCAAGGGCAATACCATCCTCCCCGATGTTACAACTTGGAGTCAGTCCT*GTCCC
CCAACTAGTCCAGCACACAAATAGCTTATAATATCTCCATAGAGATTTGGCATCACCAGG
ACATCAAAAAGTGCTGGGTTCTTCACAAGCATCATACAGCAATTGTCAATAACAACCTTC
TCGTATTCTATCTCAGGATACTTCTCAGCTACCTCATCACAGCACTGAAGGAAAAGACCA
TCAGTTTTCTGCATAATATTGGCTTTATGAATCGCAGAAACTTTCTTCCTTCCGTGAGTC
TTAGCATATAGAAACGCATACTCCGCAACTCTCATACTCGCCTTACGTGTAATAATCTTA
ATACTCTCCACCACACCCTTAACAACCTGGTGTTCAAGCCCACTGTACTCTCCTTCAGTG
TTCTCACGAATAGTAATAAGATCAACGTCATCATAACGTGTCTTATATCCAGGAAGGCTA
TAACAAGGCCTAACGTTAGCATAGAGATTCAGCTCTTTCCTAAGAGTAAGGTTCAAGGAA
CGGTGACCCTTCCCAATGGGAGTAGCCATAGGTCCTTTCAAACCAACCTTGTTGTCAAGC
ACAGACTGAAGACTCTCCCACGTCAAGAAACTATTGGTCCTCGGATCCACTTCGGTGCTA
ACATAGTGCTCGTCCCATTCAATTGCCACGTCAGCGGCAGTAAACACCTGTTTGACGGAT
TCGGCGATCTCGGGACCGATCCCGTCTCCGGGGAAGAGGGTTGCTTTGATCGGAGTGGTG
GAGGAGAAGGAGGAGAAGGGTCTAGAAGCGGAAATGAGCGCTCTGGAGGTAGACGTTGAA
GTACGGAGAAGGCGTCTCGCGAGAGATGCTGCTGCCATGGTGATCGATGAAGGGAGAGAG
AGAAGAGGAGACTTTTGTGCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A117JQ U 1
AF RR4A117JQD U 1
AF RR4F635JQ U 86
AF RR4A117TF C 1130
AF RR4A117TFB C 660
BS 1 238 RR4A117JQ
BS 239 239 RR4A117JQD
BS 240 763 RR4A117JQ
BS 764 825 RR4F635JQ
BS 826 1403 RR4A117TFB

RD RR4A117JQ 763 0 0
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TAAATAGCTGTGCCAGAACTCAAAATGTAAAACAATAAAAATACATGAGAAACCAATGGT
GGCTTTGTTTCTTCTCATAGGAAGATGATCAAAAGGAGAGAGAGATAAAAAAA*CGTGAG
CAAGAATATCTGGAGGGTAAATCCTCAAAGGAAAGTCCCAATGGCGAATGAATAAGTAAA
GAAATAATGGGTGGTTAGAGATGATCACATATGGCTTTTGTGAACTCTGTAGTGGTTGAG
GTGCCTCCAAGATCAGCGGTTCTATACTTTCCCTCCGCTATTGTGTTGATGATGGCGCTG
TGAATTTGCTCTGCTTGTTTGTTGAGCTTCAGATGCCTCAACATCATCACTCCACTCAAA
AGCAAAGCTGTCGGGTTCGCCAAGTTCTTTCCAGCAATATCTGGTGCAGAGCCGTGCACA
GCTTCAGCAAGGGCAATACCATCCTCCCCGATGTTACAACTTGGAGTCAGTCCT*GTCCC
CCAACTAGTCCAGCACACAAATAGCTTATAATATCTCCATAGAGATTTGGCATCACCAGG
ACATCAAAAAGTGCTGGGTTCTTCACAAGCATCATACAGCAATTGTCAATAACAACCTTC
TCGTATTCTATCTCAGGATACTTCTCAGCTACCTCATCACAGCACTGAAGGAAAAGACCA
TCAGTTTTCTGCATAATATTGGCTTTATGAATCGCAGAAACTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4A117JQD 763 0 0
GATTCTTCAAACATCTATACCATTCTTGTGTAATGAAAATTTTACCCCTTAAGGCAGAAG
TAAATAGCTGTGCCAGAACTCAAAATGTAAAACAATAAAAATACATGAGAAACCAATGGT
GGCTTTGTTTCTTCTCATAGGAAGATGATCAAAAGGAGAGAGAGATAAAAAAA*CGTGAG
CAAGAATATCTGGAGGGTAAATCCTCAAAGGAAAGTCCCAATGGCGAATGAATAAGTAGA
GAAATAATGGGTGGTTAGAGATGATCACATATGGCTTTTGTGAACTCTGTAGTGGTTGAG
GTGCCTCCAAGATCAGCGGTTCTATACTTTCCCTCCGCTATTGTGTTGATGATGGCGCTG
TGAATTTGCTCTGCTTGTTTGTTGAGCTTCAGATGCCTCAACATCATCACTCCACTCAGA
AGCAAAGCTGTCGGGTTCGCCAAGTTCTTTCCAGCAATATCTGGTGCAGAGCCGTGCACA
GCTTCAGCAAGGGCAATACCATCCTCCCCGATGTTACAACTTGGAGTCAGTCCT*GTCCC
CCAACTAGTCCAGCACACAAATAGCTTATAATATCTCCATAGAGATTTGGCATCACCAGG
ACATCAAAAAGTGCTGGGTTCTTCACAAGCATCATACAGCAATTGTCAATAACAACCTTC
TCGTATTCTATCTCAGGATACTTCTCAGCTACCTCATCACAGCACTGAAGGAAAAGACCA
TCAGTTTTCTGCATAATATTGGCTTTATGAATCGCAGAAACTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4F635JQ 740 0 0
C
GTAAAACAATAAAAATACATGAGAAACCAATGGTGGCTTTGTTTCTTCTCATAGGAAGAT
GATCAAAAGGAGAGAGAGATAAAAAAAACGTGAGCAAGAATATCTGGAGGGTAAATCCTC
AAAGGAAAGTCCCAATGGCGAATGAATAAGTAGAGAAATAATGGGTGGTTAGAGATGATC
ACATATGGCTTTTGTGAACTCTGTAGTGGTTGAGGTGCCTCCAAGATCAGCGGTTCTATA
CTTTCCCTCCGCTATTGTGTTGATGATGGCGCTGTGAATTTGCTCTGCTTGTTTGTTGAG
CTTCAAATGCCTCAACATCATCACTCCACTCAAAAGCAAAGCTGTCGGGTTCGCCAAGTT
CTTTCCAGCAATATCTGGTGCAGAGCCGTGCACAGCTTCAGCAAGGGCAATACCATCCTC
CCCGATGTTACAACTTGGAGTCAGTCCTAGTCCCCCAACTAGTCCAGCACACAAATCGCT
TATAATATCTCCATAGAGATTTGGCATCACCAGGACATCAAAAAGTGCTGGGTTCTTCAC
AAGCATCATACAGCAATTGTCAATAACAACCTTCTCGTATTCTATCTCAGGATACTTCTC
AGCTACCTCATCACAGCACTGAAGGAAAAGACCATCAGTTTTCTGCATAATATTGGCTTT
ATGAATCGCAGAAACTTTCTTCCTTCCGTGAGTCTTAGCATATAGAAACGCATACTCCGC
AACTCTCATACTCGCCTTA

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR4A117TF 128 0 0
CTTCGGTGCTAACATAGTGCTCGTCCCATTCAATTGCCACGTCAGCGGCAGTAAACACCT
GTTTGACGGATTCGGCGATCTCGGGACCGATCCCGTCTCCGGGGAAGAGGGTTGCTTTGA
TCGGAGTG

QA 1 128 1 128
DS 

RD RR4A117TFB 744 0 0
CTCGTATTCTATCTCAGGATACTTCTCAGCTACCTCATCACAGCACTGAAGGAAAAGACC
ATCAGTTTTCTGCATAATATTGGCTTTATGAATCGCAGAAACTTTCTTCCTTCCGTGAGT
CTTAGCATATAGAAACGCATACTCCGCAACTCTCATACTCGCCTTACGTGTAATAATCTT
AATACTCTCCACCACACCCTTAACAACCTGGTGTTCAAGCCCACTGTACTCTCCTTCAGT
GTTCTCACGAATAGTAATAAGATCAACGTCATCATAACGTGTCTTATATCCAGGAAGGCT
ATAACAAGGCCTAACGTTAGCATAGAGATTCAGCTCTTTCCTAAGAGTAAGGTTCAAGGA
ACGGTGACCCTTCCCAATGGGAGTAGCCATAGGTCCTTTCAAACCAACCTTGTTGTCAAG
CACAGACTGAAGACTCTCCCACGTCAAGAAACTATTGGTCCTCGGATCCACTTCGGTGCT
AACATAGTGCTCGTCCCATTCAATTGCCACGTCAGCGGCAGTAAACACCTGTTTGACGGA
TTCGGCGATCTCGGGACCGATCCCGTCTCCGGGGAAGAGGGTTGCTTTGATCGGAGTGGT
GGAGGAGAAGGAGGAGAAGGGTCTAGAAGCGGAAATGAGCGCTCTGGAGGTAGACGTTGA
AGTACGGAGAAGGCGTCTCGCGAGAGATGCTGCTGCCATGGTGATCGATGAAGGGAGAGA
GAGAAGAGGAGACTTTTGTGCTCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 6

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CGCTCAAAGACTTGACTCTTTCTTCATTTATTATTTTATGTTAGAACGTTTAAACACAAA
TTCATGAACTTTCGCACAAACATACAGACAAGCATAACGAAACCAAAGACAAGTCTACAC
AAAGAAAGAAAGAAAGCATTTCTCAAACCCGGTAGTTCTGAGGTAGAGGCATAACACCGT
CAAAGAAATCACCAAAATAGCCAGGTGGCTCATGTACAAGTCTTGCTATGATGTCTCTGA
AAGTGATGAGTCCTTCCAGGTTACCTGAATCATCCACCACATACATCCTATGGATCTTCT
CAGCGTCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAACGTATGGTTCTTAGTGCAAGCAATGACAC
CACTCAAGATAGGTGCTGAAGTATCTCCATGCTTCTCCAGATGCTCCCTAACCGCTACTA
AGAAGTTCTTCGTTGTGATTGACCTGTAGTCATGGTAGATCTCTGGTGCAGTGAGGAGAA
AGTGGACATCTCTAAGGCTAATGTTGCCTACTGGCTTCTCAGTTTGTCTTTCAACAACGG
GTAAGCCTCCGATTCTCTTTCTCCTCATCAGCTTGAACGCCTGAAGAACTGGTTCATCTT
CATAAATCTTTATGATATGATCTTTTGACATAGTGGGAAGACCGACTTCAGATAGAGTTT
TGACTCCCCAATCTTCAAACCAGTGAAGACCCGCGCATTCTGCTAGCATATGGATAACTC
CTGACTGTGTGATTATGTTCTCAATCTTTGCTTCCCCTAAATCAACCACTGGGATGCTCT
TCATTTTGTGCTTGGAAAGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B144JQ U 1
AF RR4CF55JQ U 624
AF RR4BN37JQ U 2
BS 1 145 RR4B144JQ
BS 146 146 RR4BN37JQ
BS 147 240 RR4B144JQ
BS 241 241 RR4BN37JQ
BS 242 330 RR4B144JQ
BS 331 331 RR4BN37JQ
BS 332 379 RR4B144JQ
BS 380 380 RR4BN37JQ
BS 381 406 RR4B144JQ
BS 407 407 RR4BN37JQ
BS 408 627 RR4B144JQ
BS 628 628 RR4BN37JQ
BS 629 647 RR4B144JQ
BS 648 648 RR4BN37JQ
BS 649 700 RR4B144JQ
BS 701 701 RR4BN37JQ
BS 702 754 RR4B144JQ
BS 755 800 RR4BN37JQ

RD RR4B144JQ 754 0 0
CGCTCAAAGACTTGACTCTTTCTTCATTTATTATTTTATGTTAGAACGTTTAAACACAAA
TTCATGAACTTTCGCACAAACATACAGACAAGCATAACGAAACCAAAGACAAGTCTACAC
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GAGTGATGAGTCCTTCCAGGTTACCTGAATCATCCACCACATACATCCTATGGATCTTCT
CAGCGTCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAGCGTATGGTTCTTAGTGCAAGCAATGACAC
CACTCAAGATAGGTGCTGAGGTATCTCCATGCTTCTCCAGATGCTCTCTAACCGCTACTA
AGAAGTTCTTCGTTGTGATTGACCTGTAGTCATGGTAGATCTCTGGTGCAGTGAGGAGAA
AGTGGACATCTCTAAGGCTAATGTTGCCTACTGGCTTCTCAGTTTGTCTTTCAACAACGG
GTAAGCCTCCGATTCTCTTTCTCCTCATCAGCTTGAACGCCTGAAGAACTGGTTCATCTT
CATAAATCTTTATGATATGATCTTTTGGCATAGTGGGAAGACCGACTCCAGATAGAGTTT
TGACTCCCCAATCTTCAAACCAGTGAAGACCCGCGCATTCAGCTAGCATATGGATAACTC
CTGACTGTGTGATTATGTTCTCAATCTTTGCTTC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4CF55JQ 156 0 0
TTTGACATAGTGGGAAGAC
CGACTTCAGATAGAGTTTTGACTCCCCAATCTTCAAACCAGTGAAGACCCGCGCATTCTG
CTAGCATATGGATAACTCCTGACTGTGTGATTATGTTCTCAATCTTTGCTTCCCCTAAAT
CA*CCACTGGGATGCTC

QA 20 156 20 156
DS 

RD RR4BN37JQ 799 0 0
GCTCAAAGACTTGACTCTTTCTTCATTTATTATTTTCTGTTAGAACGTTTAAACACAAAT
TCATGAACTTTCGCACAAACATACAGACAAGCATAACGAAACCAAAGACAAGTCTACACA
AAGAAAGAAAGAAAGCATTTCTTAAACTCGGTAGTTCTGAGGTAGAGGCATAACACCGTC
AAAGAAATCACCAAAATAGCCAGGTGGCTCATGTACAAGTCTTGCTATGATGTCTCTGAA
AGTGATGAGTCCTTCCAGGTTACCTGAATCATCCACCACATACATCCTATGGATCTTCTC
AGCGTCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAACGTATGGTTCTTAGTGCAAGCAATGACACC
ACTCAAGATAGGTGCTGAAGTATCTCCATGTTTCTCCAGATGCTCCCTAACCGCTACTAA
GAAGTTCTTCGTTGTGATTGACCTGTAGTCATGGTAGATCTCTGGTGCAGTGAGGAGAAA
GTGGACATCTCTAAGGCTAATGTTGCCTACTGGCTTCTCAGTTTGTCTTTCAACAACGGG
TAAGCCTCCGATTCTCTTTCTCCTCATCAGCTTGAACGCCTGAAGAACTGGTTCATCTTC
ATAAATCTTTATGATATGATCTTTTGACATAGTGGGAAGACCGACTTCAGATAGAGTTTT
GACTCCCCAATCTTCAAACCAGTGAAGACCCGCGCATTCTGCTAGCATATGGATAACTCC
TGACTGTGTGATTATGTTCTCAATCTTTGCTTCCCCTAAATCAACCACTGGGATGCTCTT
CATTTTGTGCTTGGAAAGA

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL1696Contig2 896 3 6 U
GATACTTCAATCTCAATTACAAATCAAAGATCAAGACAGCCTACTTGTCGGATAAGAAAA
ACAGAGGATTTTTGTTATCACTTTTTGTGTCGCCGGAGATAAAAAGACGATGGCGAGTGT
GCCGGAGATAAAGATAGTGAGGAGCGAGAGCTTAGGGCATCGAAGTGAGGTGTCGAGCCC
GGAAGCTAAGCTAGGGATGCGTGTGGAAGATCTATGGGATGAGCAGAAACCACAGCTCAG
CCCTAACGAGAAGCTCAACGCATGTTTCGAGAGCATCCCTGTCTCTGCTTTCCCTCTCTC
CTCTGATTCACAAGACATCGAGTTAAGATCAGACACAAGCTTGGCTGAAGCTGTTGAGAC
ACTGTCGAAACTCAAGGTGTTGAGCGCTCCTGTTGTAGATGTTGACGCTCCTGAAGACGC
CAGCTGGATTGACCGCTACATCGGTATTGTGGAGTTTCCAGGCATTGTTGTCTGGCTCTT
GCATCAGTTGGACCCAACATCTCCAAGGAGTCCTGCTGTTGCAGGTTCAAATGGAGTTTC
TCATGACTTCACCGCCGATATCCTGGACAATGGAGATTCAGCTGTAACTTCTGGAAACTT
CTTTGAGGTCCTTACTTCTTCAGAGCTATACAAGAACACCAAGGTTCGAGATATCTCTGG
AACATTCAGATGGGCACCTTTCCTTGCTCTGCAGAAAGAGAACTCCTTTTTAACCATGCT
GTTACTTCTTTCCAAGCACAAAATGAAGAGCATCCCAGTGGTTGATCTAGGGGAAGCAAA
GATTGAGAACATAATCACACAGTCAGGAGTTATCCATATGCTAGCTGAATGCGCGGGTCT
TCACTGGTTTGAAGATTGGGGAGTCAAACTCTATCTGGAGTCGTCTCCCACTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CF55TF U 1
AF RR4BN37TF U 69
AF RR4B144TF U 31
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CTT

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GG
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QA 3 866 3 866
DS 



AS 1 6

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BQ
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15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 
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35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 
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AF RR4GI36JQ U 1
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AF RR4AD45JQ U 65
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RD RR4AM64TF 794 0 0
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AAGCCTCAACATCCATATAGTCTAGTCCAATCTTCTCAGCCTCCTCGACATGCTGAGCAT
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CGACAAAGTTGCGCTTTTTCTCATCAGCTTTGCCCTTAACAGCTGCGATTCCTTCTCTAA
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DS 

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TGGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAATTCTTCTTCAACAGCGAGACAA
GGAAGTTAACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGAGCTGCTTCTCTTCCATGGAAAGGTTAC
CAACAGCAACACCCATACACAGAACCTTCTTCAACTGGAACTTCACTGTCGCTTTGGTCT
CATTCACCTTTCCTTCCAACGACTCCTGGTGACTCACTAGAGTAGGGAACTTTCCTGCCT
TGTTAAGACCAGGACCAAGAAGACGAGGAATCTGCTTAATGACGGATTCAGAAGCCAGGA
AAGCATGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTAACAAGCTTCTTGTTCTTGTTGAGCTTTTTCA
AAGCCTCAACATCCATATAGTCTAGTCCAATCTTCTCAGCCTCCTCAACATGCTGAGCAT
CTCCGAGCATACAGATCTTCATTTTAGGGCGAGGAATGTGAGGGAGCTTGACAGAGCCAC
TGAAACGCTTGTCCTTTTGCGGGTCATAGTTCTTGAGACCAATCTGAAGCTCAACTGTCT
CGACAAAGTTGCGTTTTTTCTCATCAGCTTTGCCCTTAACAGCTGCGATTCCTTCTCTAA
GTACCTCACTTTGAAGCTTACTCATCTTGAGTTTCTCTCAATTGACGAATCTCTG
AACCTG

QA 1 775 1 775
DS 

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GAGAGCTCAAAAGATCCTTTGTGGTGGTCCCATGGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCAC
GTTTTGCCAATTCTTCTTCAACAGCGAGACAAGGAAGTTAACGCTCATCTGAACATTCTG
AAAGAGCTGCTTCTCTTCCATGGAAAGGTTACCAACAGCAACACCCATACACAGAACCTT
CTTCAACTGGAACTTCACTGTCGCTTTGGTCTCATTCACCTTTCCTTCCAACGACTCCTG
GTGACTCACTAGAGTAGGGAACTTTCCTGCCTTGTTAAGACCAGGACCAAGAAGACGAGG
AATCTGCTTAATGACGGATTCAGAAGCCAGGAAAGCATGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTT
AACAAGCTTCTTGTTCTTGTTGAGCTTTTTCAAAGCCTCAACATCCATATAGTCTAGTCC
AATCTTCTCAGCCTCCTCAACATGCTGAGCATCTCCGAGCATACAGATCTTCATTTTAGG
GCGAGGAATGTGAGGGAGCTTGACAGAGCCACTGAAACGCTTGTCCTTTTGCGGGTCATA
GTTCTTGAGACCAATCTGAAGCTCAACTGTCTCGACAAAGTTGCGTTTTTTCTCATCAGC
TTTGCCCTTAACAGCTGCGATTCCTTCTCTAAGTACCTCACTTTGAAGCTTACTCATCTT
GAGTTTCTCTCAATTGACGAATCTCTGAACCTGAGAGGGTGAAACAGAGGAAGAAGCACT
AGCCTCCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4GI36TF 631 0 0
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TCCATGGAAAGGTTACCAACAGCAACACCCATACACAGAACCTTCTTCAACTGGAACTTC
ACTGTCGCTTTGGTCTCATTCACCTTTCCTTCCAACGACTCCTGGTGACTCACTAGAGTA
GGGAACTTTCCTGCCTTGTTAAGACCAGGACCAAGAAGACGAGGAATCTGCTTAATGACG
GATTCAGAAGCCAGGAAAGCATGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTAACAAGCTTCTTGTTC
TTGTTGAGCTTTTTCAAGGCCTCAACATCCATATAGTCTAGTCCAATCTTCTCAGCCTCC
TCAACATGCTGAGCATCTCCGAGCATACAGATCTTCATTTTAGGGCGAGGAATGTGAGGG
AGCTTGACAGAGCCACTGAAACGCTTGTCCTTTTGCGGGTCATAGTTCTTGAGACCAATC
TGAAGCTCAACTGTCTCGACAAAGTTGCGTTTTTTCTCATCAGCTTTGCCCTTAACAGCT
GCGATTCCTTCTCTAAGTACCTCACTTTGAAGCTTACTCATCTTGAGTTTCTCTCAATTG
ACGAATATCTGAACCTGAGAGGGTGAAAC
CC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 6

CO CL1698Contig1 898 4 2 U
GCACATCAGTGGTTTAGCCGGTCTTTTGAAAGCAGCTCACCCTGAGTGGAGTCCAAGCGC
CATCAAATCAGCCCTCATGACCACAGCTTACAATCTCGACAACACCAACTCTCCTCTCCG
TGATGCTGCAGATAACAGCCTCTCCAACCCACACGCTCACGGCTCGGGCCACGTAGATCC
TCAAAAGGCTCTCTCGCCGGGTCTTGTCTACGACATCTCGACTGAGGAATACATCAGGTT
CTTGTGCTCTCTCGACTACACAGTAGATCACATCGTGGCGATTGTGAAGCGACCAAGCGT
TAACTGCTCGAAGAAGTTCTCTAATCCTGGGCAGCTCAATTACCCAAGTTTCTCGGTTTT
GTTTGGTGACAAAAGGGTTGTGCGGTACACCAGGGAGGTAACCAACGTGGGTGAAGCGAA
CTCGGTTTATAAAGTGGTGGTTAGTGGAGCGCCTAGTGTTGGGATATCGGTTAAACCATC
GAAGCTCGCGTTTAGAAGTGTGGGAGAGAAGAAGAGGTACACGGTCACGTTTATAAGCAA
AAAGGGAGTGAGTTTGACGAACAAGGCTGAGTATGGATCCATCACTTGGAGCAATCCGCA
ACACCAAGTAAGAAGTCCCGTGGCATTCTCATGGAACCGGTTTTGATTACAAAAAAATAA
ACACAAATCTAAATCTAACATCCCAGTGATGTTTTCTGTTTTTAAGTTTATTTACTGTTC
GAGAAGATTTCAGTTCCTAAAGTGACTGTGGTTTAGGATAAACAAAAACTTATCCTGAGC
CATAAGCAATGCTAATCGTTCTTTGTTTGATTTGTGTTTGAATGTACTGTGTGGATGGAT
GGGTAGAAAAAATGTTGTCAAGGAAAGAACGTTGATGTTATATGTTATTATTGTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AV55TF U 1
AF RR4AV55JQ C 59
AF RR4F621JQ C 470
AF RR4F621TF U 322
BS 1 846 RR4AV55TF
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RD RR4AV55TF 846 0 0
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TAACTGCTCGAAGAAGTTCTCTAATCCTGGGCAGCTCAATTACCCAAGTTTCTCGGTTTT
GTTTGGTGACAAAAGGGTTGTGCGGTACACCAGGGAGGTAACCAACGTGGGTGAAGCGAA
CTCGGTTTATAAAGTGGTGGTTAGTGGAGCGCCTAGTGTTGGGATATCGGTTAAACCATC
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AAAGGGAGTGAGTTTGACGAACAAGGCTGAGTATGGATCCATCACTTGGAGCAATCCGCA
ACACCAAGTAAGAAGTCCCGTGGCATTCTCATGGAACCGGTTTTGATTACAAAAAAATAA
ACACAAATCTAAATCTAACATCCCAGTGATGTTTTCTGTTTTTAAGTTTATTTACTGTTC
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CATAAGCAATGCTAATCGTTCTTTGTTTGATTTGTGTTTGAATGTACTGTGTGGATGGAT
GGGTAG

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4AV55JQ 840 0 0
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CCTCAAAAGGCTCTCTCGCCGGGTCTTGTCTACGACATCTCGACTGAGGAATACATCAGG
TTCTTGTGCTCTCTCGACTACACAGTAGATCACATCGTGGCGATTGTGAAGCGACCAAGC
GTTAACTGCTCGAAGAAGTTCTCTAATCCTGGGCAGCTCAATTACCCAAGTTTCTCGGTT
TTGTTTGGTGACAAAAGGGTTGTGCGGTACACCAGGGAGGTAACCAACGTGGGTGAAGCG
AACTCGGTTTATAAAGTGGTGGTTAGTGGAGCGCCTAGTGTTGGGATATCGGTTAAACCA
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AAACACAAATCTAAATCTAACATCCCAGTGATGTTTTCTGTTTTTAAGTTTATTTACTGT
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GCCATAAGCAATGCTAATCGTTCTTTGTTTGATTTGTGTTTGAATGTACTGTGTGGATGG
ATGGGTAGAAAAAATGTTGTCAAGGAAAGAACGTTGATGTTATATGTTATTATTGTTTGG

QA 1 840 1 840
DS 

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AGCAATCCGCAACACCAAGTAAGAAGTCCCGTGGCATTTTCATGGAACCGGTTTTGATTA
CAAAAAAATAAACACAAATTTAAATTTAACATCCCAGTGATGTTTTTTGTTTTTAAGTTT
ATTTACTGTTCGAGAAGATTTCAGTTCCTAAAGTGACTGTGGTTTAGGATAAACAAAAAA
TTATCCTGAGCCATAAGCAATGCTAATCGTTTTTTGTTTGATTTGTGTTTGAATGTACTG
TGGGGATGGATGGGTAGAAAAAATGTTGTCAAGGAAAGAACGTTGATGTT
TTAT

QA 1 410 1 410
DS 

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G
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AGTGGAGCGCCTAGTGTTGGGATATCGGTTAAACCATCGAAGCTCGCGTTTAGAAGTGTG
GGAGAGAAGAAGAGGTACACGGTCACGTTTATAAGCAAAAAGGGAGTGAGTTTGACGAAC
AAGGCTGAGTATGGATCCATCACTTGGAGCAATCCGCAACACCAAGTAAGAAGTCCCGTG
GCATTCTCATGGAACCGGTTTTGATTACAAAAAAATAAACACAAATCTAAATCTAACATC
CCAGTGATGTTTTCTGTTTTTAAGTTTATTTACTGTTCGAGAAGATTTCAGTTCCTAAAG
TGACTGTGGTTTAGGATAAACAAAAACTTATCCTGAGCCATAAGCAATGCTAATCGTTCT
TTGTTTGATTTGTGTTTGAATGTACTGTGTGGATGGATGGGTAGAAAAAATGTTGTCAAG
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QA 2 577 2 577
DS 



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CTTGATGTTCGTCCTTCTCCTGTGGTTGCTGCGTTTAGCTCTAGAGGTCCAAACACTGTC
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TCTGATGCTATTGGTCCTACTGGTCTTGACAAGGACTCGAGGAGGACCCAGTTCAACATC
ATGTCAGGTACGTCCATGTCATGCCCACACATCAGTGGTTTAGCCGGTCTTTTGAAAGCA
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CTCGACAACACCAACTCTCCTCTCCGTGATGCTGCAGATAACAGCCTCTCCAACCCACAC
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GAGAAGAAGAGGTACACGGTCACGTTTATAAGCAAAAAGGGAGTGAGTTTGACGAACAAG
GCTGAGTATGGATCCATCACTTGGAGCAATCCGCAACACCAAGTAAGAAGTCCCGTGGCA
TTCTCATGGAACCGGTTTTGATTACAAAAAAATAAACACAAATCTAAATCTAACATCCCA
GTGATGTTTTCTGTTTTTAAGTTTATTTACTGTTCGAGAAGATTTCAGTTCCTAAAGTGA
CTGTGGTTTAGGATAAACAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CF31TF U 1
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CACTTGGAGCAATCCGCAACACCAAGTAAGAAGTCCCGTGGCATTCTCATGGAACCGGTT
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TAAGTTTATTTACTGTTCGAGAAGATTTCAGTTCCTAAAGTGACTGTGGTTTAGGATAAA
CAAAAA

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 6

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CGGAGCTTGTGGGTACGGAGATCTCTACTCGGCGGGGTACGGGATAATGACGGCGGCGTT
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CTTCTGCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAATAACGACGGTGGTTGGTGCAACCCGCCGCT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A514TF U 1
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AF RR4A368TF U 66
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GG
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TGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGTCAATCTCTTTCTTTCTCCATTACTACTACTGAT
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TCTGCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAATAACGACGGTGGTTGGTGCAACCCGCCGCTCA
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TCCCCGTCGTGTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAGAGAGGAGGAGTGAGATTCAGAATCA
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CTTATTCTTCAAGAGTTCAGTTTTAAGATTGTTTTGTTTGTCTGTCTGTCTGAAGAGTTA
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ATTCTATTTGAGGAAATGATTACATATAATTTTTGTGTGC

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DS 

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GGAGCTTCGGTGGTCATTACAGCAACCAACTTCTGCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAAT
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TACAAGAGAGGAGGAGTGAGATTCAGAATCAACGGAAGAGATTACTTCGAGCTAGTGAAC
ATATCGAACGTAGGAGGAGCTGGTTCGATTCAATCTGTATCCACTAAAGGATCAAAGACT
GACTGGTTAGCTATGTCTCGCAATTGGGGAGCTAATTGGCAATCAAACGCTTATCTCGAT
GGTCAATCTCTTTCTTTCTCCATTACTACTACTGATGGTGCTACAAGAGTCTTCCTCAAT
GTTGTTCCTTCTTCTTGGTCTTTCGGACAGACTTATTCTTCAAGAGTTCAGTTTTAAGAT
TGTTTTGTTTGTCTGTCTGTCTGAAGAGTTATTGGCTGTGGTCGCGCTCTGTGTCTCTGT
TTCTTCTCTTCTGGAGCGACCCGCCCCCCCGCTTTTTTTTTT**CTTTGTGGTTTTATGG
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TTTTTGTGTGC

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DS 

RD RR4A368JQD 791 0 0
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GTCTGTAACGTCTGTTAATGGAGAAGATCCGATTCTATTTGAGGAAATGATTACATATAA
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QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 6

CO CL1700Contig1 1395 6 8 U
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TTGAAAATTCGAAAAACCGATAATATAGCAGATGATTGCAGAATTGAAGCAGGTGATGCT
GCTTTGGCTCGAGGGTTTCCTAGAAGCTTGTTCTCTCCACCGTGTTGTAATTCTCTGTCA
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TTGACGCATAGTTATCTGATATCAGTGCTCATGATAAGATATTATGCTGCAAACTGCAAA
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TCAGTTCTCCGGTTTGGCATGCATAGTGTACAGTTCCTTTAATTATCTAACTGACAGCAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A051TF U 380
AF RR4EF17TF U 1
AF RR4A051TFB U 22
AF RR4A051JQ C 564
AF RR4A051JQD C 566
AF RR4EF17JQ C 840
BS 1 43 RR4EF17TF
BS 44 44 RR4A051TFB
BS 45 247 RR4EF17TF
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BS 253 625 RR4EF17TF
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BS 749 1293 RR4A051JQ
BS 1294 1395 RR4EF17JQ

RD RR4A051TF 126 0 0
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ATCTGGTATAACGATGTTTGCAAAATATGGATTCGAGGCAATTGGAAAATCTGACATAAG
CTCGGC

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR4EF17TF 625 0 0
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TTGAAAATTCGAAAAACCGATAATATAGCAGATGATTGCAGAATTGAAGCAGGTGATGCT
GCTTTGGCTCGAGGGTTTCCTAGAAGCTTGTTCTCTCCACCGTGTTGTAATTCTCTGTCA
CAGGTCGCGAAAGCTCCTATTACGAACGGGGCAGTGTTTTCTTTTGAATGGTTTGATTTT
CTTAGGA*****AGGCGTCTTTAAGTGGTTTGTTAATCCAGCCCTTCAGTGGATATTACC
TAACCCATGCGCTCCTATCACGTCTCAAGACTTCTGTTCGTACAATGGATCTTATGCCTT
TCTACGGGGTGGTCTTTTGCAGCTATTTTACGTTCTTTGGTTCTATCCTCTGTATATGCT
CAGCTTCATCTTAAGTAACATCTGGTATAACGATGTT*GCAAAATATGGATTCGAGGCAA
TTGGAAAATCTGACATAAGCTCGGCAGAAACATTCAGGCAATGTGAAGTTCCTGCGTCAG
TGGTCATGACAAATGCTGAAAGACCTTCTGGTCTTGGAGGGGTGATGATTGGTATTGGAG
TGCAGGTGTATTCGATACTGCTTCT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4A051TFB 727 0 0
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AATATAGCAGATGATTGCAGAATTGAAGCAGGTGATGCTGCTTTGGCTCGAGGGTTTCCT
AGAAGCTTGTTCTCTCCACCGTGTTGTAATTCTCTGTCACAGGTCGCGAAAGCTCCTATT
ACGAACGGGGCAGTGTTTTCTTTTGAATGGTTTGATTTTCTTAGGAAGTTTAGGCGTCTT
TAAGTGGTTTGTTAATCCAGCCCTTCAGTGGATATTACCTAATCCATGCGCTCCTATCAC
GTCTCAAGACTTCTGTTCGTATAATGGATCTTATGCGTTTCTACGGGGTGGTCTTTTGCA
GCTATTTTACGTTCTTTGGTTCTATCCTCTGTATATGCTCAGCTTCATCTTAAGTAACAT
CTGGTATAACGATGTT*GCAAAATATGGATTCGAGGCAATTGGAAAATCTGACATAAGCT
CGGCAGAAACATTCAGGCAATGTGAGGTTCCTGCGTCAGTGGTCATGACAAATGCTGAAA
GACCTTCTGGTCTTGGAGGGGTGATGATTGGTATTGGAGTGCAGGTGTATTCGATACTGC
TTCTGACATTTTTCTTTATGGAGGTTTATGTTGTTGGCGTTATACCATACATTGGGAAGA
TACTGAATTTCTTACTTCTTTCATGGATGTATGCCTACTATTGTTACGAATATAAGTGGA
ACTTCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4A051JQ 732 0 0
CC
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GACATTTTTCTTTATGGAGGTTTATGTTGTTGGCGTTATACCATACATTGGGAAGATACT
GAATTTCTTACTTCTTTCATGGATGTATGCCTACTATTGTTACGAATATAAGTGGAACTT
CTTGGAGGTCCCTCTCGAGAAAAGGCTTGAGTTCTTTGAATCCAACTGGGCATTCTTTGC
TGGTTTTGGAAGCCCCTGCGTGTTATCCATTTTCTTTTTCTCGCCTCTTGTGAGCGGAGC
GCTTATGGCCATCCTGTTTCCATTGTTTGTTTTAACTGCTACAGGGTCAGGACCTGAAAA
ATCTATCGTTACCCCAAGTTGTTTATTGAGGCTTCCAATATTCTACGTAGCTGACAGACT
CTCGATGCTGGCATTGTCCATCTTCCGGTTGGAGTCCCTGCAACATGAGAAGACAGGCTG
AAGCTGAAATATTTTCTCTGGATCTGTTAATCTCTTGTCAACACTGCCGTCTCGGTGATT
TCATGTGGCCGTGCTTTAGAAGTGTAGTTGTGGCTTTGACGCATAGTTATCTGATATCAG
TGCTCATGATAAGATATTATGCTGCAAACTGCAAAACAACGAATATGAAAGCAGGCGTGT
CATGTCAGAAGTAGAGTTTGATTGTTAATTAATAGAATCCACAAATTTAAAGTAAGTCTG
TGTTTCAT
CC

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR4A051JQD 730 0 0
TTCTGGTCTTGGAGGGGTGATGATTGGTATTGGAGTGCAGGTGTATTCGATACTGCTTCT
GACATTTTTCTTTATGGAGGTTTATGTTGTTGGCGTTATACCATACATTGGGAAGATACT
GAATTTCTTACTTCTTTCATGGATGTATGCCTACTATTGTTACGAATATAAGTGGAACTT
CTTGGAGGTCCCTCTCGAGAAAAGGCTTGAGTTCTTTGAATCCAACTGGGCATTCTTTGC
TGGTTTTGGAAGCCCCTGCGTGTTATCCATTTTCTTTTTCTCGCCTCTTGTGAGCGGAGC
GCTTATGGCCATCCTGTTTCCATTGTTTGTTTTAACTGCTACAGGGTCAGGACCTGAAAA
ATCTATCGTTACCCCAAGTTGTTTATTGAGGCTTCCAATATTCTACGTAGCTGACAGACT
CTCGATGCTGGCATTGTCCATCTTCCGGTTGGAGTCCCTGCAACATGAGAAGACAGGCTG
AAGCTGAAATATTTTCTCTGGATCTGTTAATCTCTTGTCAACACTGCCGTCTCGGTGATT
TCATGTGGCCGTGCTTTAGAAGTGTAGTTGTGGCTTTGACGCATAGTTATCTGATATCAG
TGCTCATGATAAGATATTATGCTGCAAACTGCAAAACAACGAATATGAAAGCAGGCGTGT
CATGTCAGAAGTAGAGTTTGATTGTTAATTAATAGAATCCACAAATTTAAAGTAAGTCTG
TGTTTCAT
CC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4EF17JQ 556 0 0
TTTTTCTCGCCTCTTGTGAGCGGAGCGCTTATGGCCATCCTGTTTCCATTGTTTGTTTTA
ACTGCTACAGGGTCAGGACCTGAAAAATCTATCGTTACCCCAAGTT***TATTGAGGCTT
CCAATATTCTACGTAGCTGACAGACTCTCGATGCTGGCATTGTCCATCTTCCGGTTGGAG
TCCCTGCAACATGAGAAGACAGGCTGAAGCTGAAATATTTTCTCTGGATCTGTTAATCTC
TTGTCAACACTGCCGTCTCGGTGATTTCATGTGGCCGTGCTTTAGAAGTGTAGTTGTGGC
TTTGACGCATAGTTATCTGATATCAGTGCTCATGATAAGATATTATGCTGCAAACTGCAA
AACAACGAATATGAAAGCAGGCGTGTCATGTCAGAAGTAGAGTTTGATTGTTAATTAATA
GAATCCACAAATTTAAAGTAAGTCTGTGTTTCATTCCTTTACTTCATATTTGCTGTTAGG
TTCAGTTCTCCGGTTTGGCATGCATAGTGTACAGTTCCTTTAATTATCTAACTGACAGCA
CAGCATTTTAAAATTC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 6

CO CL1701Contig1 804 6 4 U
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CTAACTATAAGAGGTGATGGCATGGGAAACACACTCAAATTCTCTTACGGAGTTACAACC
AAAACAAAGTACAGATCAAAAGCAAAGCACTGACTCCACCCTGGCTCTCTAAACCATTCA
CATCCACAAACCATAACCCAACACCATCGAGACCCCGACCAAAACGTAACTCATCACTCC
CTTTGAGGCACCACTTGCCTTCGGTGGTGGAGGAGAAGTTGACCCTGAAGCCGGTGTACC
TGGAGTTCCGGCAGACGGCGGTGATCCCGGTGTGGAAGGAGTTCCGGGAGTTGTAGCGGG
CGGCGTGGGGGCGGATGGAGTTCCGGAAGATGCGGCTACGACCGTAACGGCTAGCTTCAT
GCCACCTTGACAGTGACCAGGTGTCGGACAGTAGAAGTACCGTGGACCTACTTTGTCGAG
ATCAATCGTGGTGTCTCCACCAGAATGAGTATCGATCGCTGTGCCTCCACAGCTATCGTA
ACCGGCTTTGTTCACTTCGTCCACTGAGTGTGAAGGGCCATACTTGAACTCTAGAGTGTC
ACCAACTCTGAAAGTCTTTCCTTTGACCCAAGCTGTGTAGTCCACACCAGTATTCCATTG
AGCAGTGTCTCCAACCGTGTACGTCACAGCAAGCGCGGCTGGGACGATGGCCAGGACTAG
GAGAAGAGAGGTTGCAGCAATCTTGGACAAACCATTAATTGCCATATTTTGTTAAGAAGA
GAAATATAAGTGAAAAGATTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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BQ
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AGGCGGCATGGCCACTAAAGGTTATGGATTAGCTTTGAACTCTCTTGTGTTGGCCTTGTT
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QA 1 732 1 732
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QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4AW77TF 760 0 0
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TCCTCTTCTTCACTCTCTCCTCCGCGCAGACCCCTCCGGCACCAGAACCAGTGCCCGCAG
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CGTACGTTCAGGTAGGGAGTACCGAGACTAAGCCAGAATCTGCCTGTTGCCCTGAGCTTG
CTGGGATGGCTCAGAGCTCGCCGGAGTGCGTCTGTAATCTTCACGGCGGCGGTGCATCGC
CGCGTTTCGGAGTCAAGCTTGATAAGCAGAGAGCTGAGGAACTTTCTTCAATCTGCGGTG
TGAAAGCTCCATCGCCTAGTCTGTGTTCAGTTCTTGGTTTTCCAACCATCTCTCCAGCAG
GAAGTGAAGATTCATCATCTGGAGGTTCTGAAGGATCGGACAAAGATAAGAAAAACGGAG
GCGGCATGGCCACTAAAGGTTATGGATTAGCTTTGAACTCTCTTGTGTTGGCCTTGTTCA
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TGGATGTTGATTTACGGATAAAGATATCATTTTTCCAATT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 5

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AAGTTGATATAAGCCACTAAACCTTGCCAACCACCTCCAATAGCCACACCGGAAATAACT
GGCTGCACGCTGTTGAGAACCATTGTTATACTGAGAAGATAAGCTAGCTTAGACACTGCA
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GCCACCATAAAGACAAGACCTATGAGGA***ACTGGAACACCGTTACATAGACAGAGTAT
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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D459JQ U 1
AF RR4ET68JQ U 1
AF RR4EZ91JQ U 1
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QA 1 711 1 711
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GG
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AACAGC

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DS 

RD RR4EZ91JQ 742 0 0
GG
CAAAAAGCACAGTTGTTACTTTGACCGATTGAATAATTTTCCAACAGCCAAATACAGTTA
CTGGGGGCTAGTACAAATACAAACACAATGAAAAAAGAAAAAGCAAACAAAAGAGAACCC
CAATAATCACGCAACTACTTCCTTTGATGTTGTTTCAGTACTCCCTCCCCATTTCTTCAT
ACGTTCAGTCGTCTCCTCCACCTCTTTATTCCAGTTTGTCTTGTACAGAACAAACATCAG
TAGCAACGTTTGAAGCGCTGTTCCTGCTATCATTCCAGCCCAAAGTCCCATCACTCCCAA
GTTTGCTTTGTAACCAAGAAGATACCCAAAGGGAAGGCCAAAAATGTAGTAACAACCCAA
GTTGATATAAGCCACTAAACCTTGCCAACCACCTCCAATAGCCACACCGGAAATAACTGG
CTGCACGCTGTTGAGAACCATTGTTATACTGAGAAGATAAGCTAGCTTAAACACTGCACG
TTGAAGTACTTCGCTGTTTGTGAAGATGATAGCAAAATGGTCTCTGGCTATGGTGATAGC
CACCATAAAGACAAGACCTATGAGGA***ACTGGAACACCGTTACATAGACAGAGTATTT
CGCTGCTCGTGGACGGCCTAAGCCAAGCTCATTGGAGACACGGACACTTATAGCTGCGTT
TATTCCAATAAACAACATTGCTTCCAAGCCATTGAGATTCATGCATATAGAAAGGGAACC
AACAGCGATAACAGCGTTGT

QA 3 742 3 742
DS 



CO CL1703Contig2 1069 2 8 U
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TGGATAATACGACACCGCTTCTTCCGCACGGTGGCGAGGTAGAGGAAGATTACGCTCCGG
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TCGGCACCTTCTCCTTCGGCTTTCTGCTTGGCATGGGAAGTGCACTTGAAACCCTCTGTG
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CCATTGCATCTGCGGTTATGCTTTGTCTTGAAATGTGGTATATGATGAGTATCATCGTCC
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CATGAGCTTGGCTTAGCCGTCCACGAGCAGCGAAATACTCTGTCTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D459TF U 254
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DS 

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G
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ATCATCGTGTTTGGTTTGGGAACAAACGGTGCAGCTTTGGCTTTTAATATCACAAACTGG
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AGCCGTCCACGAGCAGCGAAATACTCTGTCTATGT

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DS 



AS 1 5

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AAAGAGATAGAAAATGAAAGAGCAATCC


BQ
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GAAATCATAGATTCTTATGACAACATATCTTTTATTAGTTTGTTCTTTAAAGCCAGTTCA
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TTGGCACCGTAATCATTGTGATAGATTTCATTAGCAAGCTTCATTACATCATTGTCATTC
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TCATCGATCTTGGACCACCTTTGCTTACAGTTGCTAACCTCTCTATCTGGCATACCGACA
AGATGAGGACTTGCATTGAAGTAAGCTCCAACTCTTTTCCA

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GG
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CATAAGCAGAAGCAGACTGACTCTATAGACATCATAGATTCTTATGACAACATATCTTTT
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GTCTCCAACTTATGTTGCTTAGTAAGCTTCTCCTTCATTTCAAAGTAATGCTTCCTTATC
TCAAACATCTCTTGGAACTTCTCCACAGGCTTTCTGCTGGTTGCTTCCATCTCTTTGGCA
CTCCTTTGAGCCTTCAACCTTGCCTTTGCCTTCTTCACACCTTCAGGACGAGCCTCTTCT
TCATCTCCAAGGCTTGATGACTGGACAGAAGAAGATTGAGAACCATCTTCACCCTTCCTT
CTTTTTGACTTGCTGTTATCTGTCCCAAAATTTACCCGCCATTTCTGTTCATTTTTGAGC
TCCCTCCAACAATGCTCAAGTGTGAACTTGGCACCGTAATCATTGTGATAGATTTCATTA
GCAAGCTTCATTACATCATTGTCATTCTGCCCACTTGACTGCATTCTTGTTGCAGCACAT
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C

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ATAGATTCTTATGACAACATATCTTTTATTAGTTTGTTCTTTAAAGCCAGTTCAATCTCA
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TTCATTTCAAAGTAATGCTTCCTTATCTCAAACATCTCTTGGAACTTCTCCACAGGCTTT
CTGCTGGTTGCTTCCATCTCTTTGGCACTCCTTTGAGCCTTCAACCTTGCCTTTGCCTTC
TTCACACCTTCAGGACGAGCCTCTTCTTCATCTCCAAGGCTTGATGACTGGACAGAAGAA
GCTTGAGAACCATCTTCACCCTTCCTTCTTTTTGACTTGCTGTTATCTGTCCCAAAATTT
ACCCGCCATTTCTGTTCATTTTTGAGCTCCCCCCAACAATGCTCAAGTGTGAACTTGGCA
CCGTAATCATTGTGATAGATTTCATTAGCAAGCTTCATTACATCATTGTCATTCTGCCCA
CTTGACTGCATTCTTGTTGCAGCACATAACGAGCCAACAAACTCGTTGACTTGGTCATCG
ATCTTGGACCACCTTTGCTTACAGTTGCTAACCTCTCTATCTGGCATACCGACAAGATG

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DS 

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CTTCTTTTTGACTTGCTGTTATCTGTCCCAAAATTTACCCGCCATTTCTGTTCATTTTTG
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TTAGCAAGCTTCATTACATCATTGTCATTCTGCCCACTTGACTGCATTCTTGTTGCAGCA
CATAACGAGCCAACAAACTCGTTGACTTGGTCATCGATCTTGGACCACCTTTGCTTACAG
TTGCTAACCTCTCTATCTGGCATACCGACAAGATGAGGACTTGCATTGAAGTAAGCTCCA
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TTAAGCCAAGCACGTATGAGCACCACATCTTCCTTCTGTGACCAATCCCTTCCGCCTCTT
ATGTCTTCAGTTGTCTCTTCAGCTTGAGTTGGAGCATTAGTCCCCTGGGAACTAAAAAGA
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AACGGATCCAGAAGGCCTGAAGACTGAGTAAATGGATTTGAAGAATCCATTCCTACTTTC
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QA 1 778 1 778
DS 

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C
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CTGAAGACTGAGTAAATGGATTTGAAGAATCCATTCCTACTTTCTGGTGGAGAAAAGAGA
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AGCAAAGGATAAAGAAAGAGATAGAAAATGAAAGAGCAATCC

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DS 



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CCTTCTCTCTTGAAGCTTCCTGCGTTTTCATGGAGGACCGGCGCGGGGTGGCTTCTTCAG
CACTAGCGTCGGTCCTATATTCTTGTTTTATTTCATGCTTGCTTCTCTGTTATTCGGTGT
GTGACTTTGCTTCCGTTTTTGAAGGAGATACGCATCTACCAAGTCGACTTATACTTTCAG
ATCTGGTGTGGATTCTCTCATAAAAGTACCGGATCTGTTGATTTACGGTGTAGCCTAGCT
ACAATAGCTTTTATCCTTGAATCTCATTCTAGATCTGATTGGTTCTGTTGATTTTGCGTT
TCTCTTTGGCTACTGTATGGTTTTCTATTGCAGATGTTGTCTTTCCGGTTGGGGTTTACT
ATGGATTCCGCCTAATCATTATTTTGCCATTCATGGCCTGCGGTCGTTTTTCGGATTTGG
TGGACTTCGCTCTTAGTTGCTTGTTGCAGATCTCGTGGAGATCATGTCTTTTGTGGCTTC
ATACCTAGGCTTTCAATGGTCTGTTTGACTCAGCCGCTTTCGGGAGTGATTAGTGGAATC
AAAAGGATTCTCACTTGCCGGTTTATGAAGTTCTTGTTACTTGGTTCTGGAGGTGTATCC
TCGTTGTGCTAGGAGGAAGTGGGATTTCGGTGGTCTGGCCGAGGGCAGTCCCGTTAACCA
GTTTCATGGATTCTCTAAAAGTCAGATATGTCTGTAAGTGTTGTTTATCATCAGTTGTTT
GGAAGTTAGTTGCTTAGTTTAATGTTGTTGTTGTAAGCGCCCTGGTCTGTATTCTTTTGG
GCTAATGCATCCCCTTTGTGGGATCTAGTTTCCGGGGTTTGTCTGTTGTCCGGCCTGTTA
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AGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 

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AF RR4A694TF U 16
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TATATTCTTGTTTTATTTCATGCTTGCTTCTCTGTTATTCGGTGTGTGACTTTGCTTCCG
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TCTCATAAAAGTACCGGATCTGTTGATTTACGGTGTAGCCTAGCTACAATAGCTTTTATC
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ATGGTCTGTTTGACTCAGCCGCTTTCGGGAGTGATTAGTGGAATCAAAAGGATTCTCACT
TGCCGGTTTATGAAGTTCTTGTTACTTGGTTCTGGAGGTGTATCCTCGTTGTGCTAGGAG
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AGTTTAATGTTGTTGTTGTAAGCGCCC

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DS 

RD RR4CA62JQ 852 0 0
C
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CTTTCAGATCTGGTGTGGATTCTCTCATAAAAGTACCGGATCTGTTGATTTACGGTGTAG
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TGTATCCTCGTTGTGCTAGGAGGAAGTGGGATTTCGGTGGTCTGGCCGAGGGCAGTCCCG
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GTTGTTTGGAAGTTAGTTGCTTAGTTTAATGTTGTTGTTGTAAGCGCCCTGGTCTGTATT
CTTTTGGGCTAATGCATCCCCTTTGTGGGATCTAGTTTCCGGGGTTTGTCTGTTGTCCGG
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AACTTTGA
GGG

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DS 

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TGTGTGACTTTGCTTCCGTTTTTGAAGGAGATACGCATCTACCAAGTCGACTTATACTTT
CAGATCTGGTGTGGATTCTCTCATAAAAGTACCGGATCTGTTGATTTACGGTGTAGCCTA
GCTACAATAGCTTTTATCCTTGAATCTCATTCTAGATCTGATTGGTTCTGTTGATTTTGC
GTTTCTCTTTGGCTACTGTATGGTTTTCTATTGCAGATGTTGTCTTTCCGGTTGGGGTTT
ACTATGGATTCCGCCTAATCATTATTTTGCCATTCATGGCCTGCGGTCGTTTTTCGGATT
TGGTGGACTTCGCTCTTAGTTGCTTGTTGCAGATCTCGTGGAGATCATGTCTTTTGTGGC
TTCATACCTAGGCTTTCAATGGTCTGTTTGACTCAGCCGCTTTCGGGAGTGATTAGTGGA
ATCAAAAGGATTCTCACTTGCCGGTTTATGAAGTTCTTGTTACTTGGTTCTGGAGGTGTA
TCCTCGTTGTGCTAGGAGGAAGTGGGATTTCGGTGGTCTGGCCGAGGGCAGTCCCGTTAA
CCAGTTTCATGGATTCTCTAAAAGTCAGATATGTCTGTAAGTGTTGTTTATCATCAGTTG
TTTGGAAGTTAGTTGCTTAGTTTAATGTTGTTGTTGTAAGCGCCCTGGTCTGTATTCTTT
TGGGCTAATGCATCCCCTTTGTGGGATCTAGTTTCCGGGGTTTGTCTGTTGTCCGGCCTG
TTAACCATGGATAGTAACTTCATCCATTGGTCTTGTATCTTTCTTTGGTAATAATAAACT
TTGA
CG

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR4A694JQ 824 0 0
TCTTGTTTTATTTCATGCTTGCTTCTCTGTTATTCGGTGTGTGACTTTGCTTCCGTTTTT
GAAGGAGATACGCATCTACCAAGTCGACTTATACTTTCAGATCTGGTGTGGATTCTCTCA
TAAAAGTACCGGATCTGTTGATTTACGGTGTAGCCTAGCTACAATAGCTTTTATCCTTGA
ATCTCATTCTAGATCTGATTGGTTCTGTTGATTTTGCGTTTCTCTTTGGCTACTGTATGG
TTTTCTATTGCAGATGTTGTCTTTCCGGTTGGGGTTTACTATGGATTCCGCCTAATCATT
ATTTTGCCATTCATGGCCTGCGGTCGTTTTTCGGATTTGGTGGACTTCGCTCTTAGTTGC
TTGTTGCAGATCTCGTGGAGATCATGTCTTTTGTGGCTTCATACCTAGGCTTTCAATGGT
CTGTTTGACTCAGCCGCTTTCGGGAGTGATTAGTGGAATCAAAAGGATTCTCACTTGCCG
GTTTATGAAGTTCTTGTTACTTGGTTCTGGAGGTGTATCCTCGTTGTGCTAGGAGGAAGT
GGGATTTCGGTGGTCTGGCCGAGGGCAGTCCCGTTAACCAGTTTCATGGATTCTCTAAAA
GTCAGATATGTCTGTAAGTGTTGTTTATCATCAGTTGTTTGGAAGTTAGTTGCTTAGTTT
AATGTTGTTGTTGTAAGCGCCCTGGTCTGTATTCTTTTGGGCTAATGCATCCCCTTTGTG
GGATCTAGTTTCCGGGGTTTGTCTGTTGTCCGGCCTGTTAACCATGGATAGTAACTTCAT
CCATTGGTCTTGTATCTTTCTTTGGTAATAATAAACTTTGAGGG

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 6

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ACATTTCAAAAGGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCAAGA
GACTGATCTTAATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCTTGGCTCTCTTCCGAGAAGCTGGTCGT
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TTTCGCTGAAGTTGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAGTGG
ATGCAAAGGACCCATCACGACTTTCATTGTTGAGCCCTTTGTCCCACACAATGAGGAGTT
TTATCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTTGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGG
GATTGACATCGAGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCCACTGGTTCTTC
CTTGACACCTGAGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCC*TTCCTCTTGAGATCAAAGGGG
AACTTGAAGATTTT*ATTCAAGTTATTTTCACCC**TTTTCCAAGATCTTGATTTCACTT
TCTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCGTATCCTCTGGATATGAGGG
GTGAGCTTGATGACACCGCTGCTTTCAAAAACTTTAAGAAGTGGGGAGACATTGAATTCC
CCATGCCATTTGGAAGAGTGATGAGCCCCACAGAGAGCTTCATCCACGGTCTAGATGAGA
AGACAAGCGCATCTTTGAAGTTCACTGTTCTGAATCCCAAGGGAAGGATTTGGACTATGG
TCGCTGGAGGAGGTGCAAGTGTCATCTATGCCGATACGGTTGGAGATCTCGGGTACGCAT
CTGAGCTTGGAAACTATGCTGAATACAGTGGAGCACCCAAAGAAGACGAGGTTTTACAGT
ACGCTAGAGTCGTCATTGATTGTGCTACAGCGAATCCGGATGGAAAAACCAGAGCACTAG
TGATCGGAGGTGGAATTGCTAACTTCACCGATGTTGCTGCTACCTTCAATGGCATTATCC
GAGCTCTCAAGGAAAAGGAAGCAAAGCTGAAAGCAGCAAGGATGCATATATATGTGAGGA
GAGGAGGACCAAACTACCAAAAGGGACTTGCTAAAATGAGATCCCTTGGAGATGAAATCG
GTGTCCCAATCGAGGTGTATGGTCCTGAAGCAACAATGACAGGTATCTGCAAGGAGGCAA
TTGAGTACATCACAGCGGCTGCATAAAAAGCCTTTAACTCTACTGTGTTACTTCAAATGC
TCTTTAAGATTTGTGTTGAGTCTTATGGTTGGATTATATGTTTCACTTCTTAAGTTTCTT
ATTTGTATTCATAATAATCATCGAGGATCTTTGGTACTCTTTTCTCTTTTTACTTGGTGT
GTTTCACTTTTGATTGTCACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AZ61TF U 1
AF RR4AT50TF U 1
AF RR4H316TF U 437
AF RR4H316JQ C 951
AF RR4AT50JQ C 711
AF RR4AZ61JQ C 713
BS 1 578 RR4AT50TF
BS 579 579 RR4AZ61TF
BS 580 614 RR4AT50TF
BS 615 615 RR4AZ61TF
BS 616 634 RR4AT50TF
BS 635 636 RR4AZ61TF
BS 637 750 RR4AT50TF
BS 751 751 RR4H316TF
BS 752 840 RR4AT50TF
BS 841 1067 RR4H316TF
BS 1068 1068 RR4AT50JQ
BS 1069 1101 RR4H316TF
BS 1102 1102 RR4AT50JQ
BS 1103 1128 RR4H316TF
BS 1129 1521 RR4AT50JQ

RD RR4AZ61TF 746 0 0
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GACTGATCTTAATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCTTGGCTCTCTTCCGAGAAGCTGGTCGT
CAAACCCGACATGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGAGCGGTTTGGTCGCCTTGAAACTCGA
TTTCGCTGAAGTTGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAGTGG
ATGCAAAGGACCCATCACGACTTTCATTGTTGAGCCCTTTGTCCCACACAATGAGGAGTT
TTATCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTTGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGG
GATTGACATCGAGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCCACTGGTTCTTC
CTTGACACCTGAGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCC*TTCCTCTTGAGATCAAAGGGG
AACTTGAAGATTTT*ATTCAAGTTATTTTCACCC**TTTTCCAAGATCTTGATTTCACTT
TCTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCGTATCCTCTGGATATGAGGG
GTGAGCTTGATGACACCGCTGCTTTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AT50TF 848 0 0
GGGTGTCGATTTAGTTCGCCAACTACCGAAGAAGCAAGCACCTACCTCTCTCTCTCAACG
CTCAGAAGAAATGGCAAGGAAGAAGATCAGAGAGTACGACTCAAAGAGACTCGTGAAGGA
ACATTTCAAAAGGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCAAGA
GACTGATCTTAATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCTTGGCTCTCTTCCGAGAAGCTGGTCGT
CAAACCCGACATGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGAGCGGTTTGGTCGCCTTGAAACTCGA
TTTCGCTGAAGTTGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAGTGG
ATGCAAAGGACCCATCACGACTTTCATTGTTGAGCCCTTTGTCCCACACAATGAGGAGTT
TTATCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTTGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGG
GATTGACATCGAGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCCACTGGTTCTTC
CTTGACACCTGAGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCCCTTCCTCTTGAGATCAAAGGGG
AACTTGAAGATTTTTATTCAAGTTATTTTCACCCCTTTTTCCAAGATCTTGATTTCACTT
TCTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCGTATCCTCTGGATATGAGGG
GTGAGCTTGATGACACCGCTGCTTTCAAAA*CTTTAAGAAGTGGGGAGACATTGAATTCC
CCATGCCATTTGGAAGAGTGATGAGCCCCACAGAGAGCTTCATCCACGGTCTAGATGAGA
GACAGCGC

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4H316TF 705 0 0
G
CGGATAGGCTTGGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGGGATTGACATCGAGGAGA
ACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCCACTGGTTCTTCCTTGACACCTGAGATAT
GTGCACCTCTTGTTGCTACCC*TTCCTCTTGAGATCAAAGGGGAACTTGAAGATTTT*AT
TCAAGTTATTTTCACCC**TTTTCCAAGATCTTGATTTCACTTTCTTGGAGATGAATCCT
TTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCGTATCCTCTGGATATGAGGGGTGAGCTTGATGACACC
GCTGCTTTCAAAAACTTTAAGAAGTGGGGAGACATTGAATTCCCCATGCCATTTGGAAGA
GTGATGAGCCCCACAGAGAGCTTCATCCACGGTCTAGATGAGAAGACAAGCGCATCTTTG
AAGTTCACTGTTCTGAATCCCAAGGGAAGGATTTGGACTATGGTCGCTGGAGGAGGTGCA
AGTGTCATCTATGCCGATACGGTTGGAGATCTCGGGTACGCATCTGAGCTTGGAAACTAT
GCTGAATACAGTGGAGCACCCAAAGAAGACGAGGTTTTACAGTACGCTAGAGTCGTCATT
GATTGTGCTACAGCGAATCCGGATGGAAAA*CCAGAGCACTAGTGATCGGAGGTGGAATT
GCTA*CTTCACCGATGTTGCTGCTACCTTCA
TGGCATATCCGGG

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR4H316JQ 525 0 0
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GTTTTACAGTACGCTAGAGTCGTCATTGATTGTGCTACAGGGAATCCGGATGGAAAAACC
AGAGCACTAGTGATCGGAGGTGGAATTGCTAACTTCACCGATGTTGCTGCTACCTTCAAT
GGCATTATCCGGGCTTTCAAGGAAAAGGAAGCAAAGCTGAAAGCAGCAAGGATGCATATA
TATGTGAGGAGAGGAGGACCAAACTACCAAAAGGGACTTGCTAAAATGAGATCCCTTGGA
GATGAAATCGGTGTCCCAATCGAGGTGTATGGTCCTGAAGCAACAATGACAGGTATTTGC
AAGGAGGCAATTGAGTACATCACAGCGGCTGCATAAAAAGCCTTTAACTTTACTGTGTTA
CTTCAAATGCTCTTTAAGATTTGTGTTGAGTTTTATGGTTGGATTATATGTTTCACTTCT
TAAGTTTCTTATTTGTATTCATAATAATCATCGAGGATCTTTGGT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4AT50JQ 811 0 0
GA
TATGAGGGGTGAGCTTGATGACACCGCTGCTTTCAAAAACTTTAAGAAGTGGGGAGACAT
TGAATTCCCCATGCCATTTGGAAGAGTGATGAGCCCCACAGAGAGCTTCATCCACGGTCT
AGATGAGAAGACAAGCGCATCTTTGAAGTTCACTGTTCTGAATCCCAAGGGAAGGATTTG
GACTATGGTCGCTGGAGGAGGTGCAAGTGTCATCTATGCCGATACGGTTGGAGATCTCGG
GTACGCATCTGAGCTTGGAAACTATGCTGAATACAGTGGAGCACCCAAAGAAGACGAGGT
TTTACATTACGCTAGAGTCGTCATTGATTGTGCTACAGCGAATCCGGATGGAAAAACCAG
AGCACTAGTGATCGGAGGTGGAATTGCTAACTTCACCGATGTTGCTGCTACCTTCAATGG
CATTATCCGAGCTCTCAAGGAAAAGGAAGCAAAGCTGAAAGCAGCAAGGATGCATATATA
TGTGAGGAGAGGAGGACCAAACTACCAAAAGGGACTTGCTAAAATGAGATCCCTTGGAGA
TGAAATCGGTGTCCCAATCGAGGTGTATGGTCCTGAAGCAACAATGACAGGTATCTGCAA
GGAGGCAATTGAGTACATCACAGCGGCTGCATAAAAAGCCTTTAACTCTACTGTGTTACT
TCAAATGCTCTTTAAGATTTGTGTTGAGTCTTATGGTTGGATTATATGTTTCACTTCTTA
AGTTTCTTATTTGTATTCATAATAATCATCGAGGATCTTTGGTACTCTTTTCTCTTTTTA
CTTGGTGTGTTTCACTTTTGATTGTCACC

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR4AZ61JQ 809 0 0
TATGAGGGGTGAGCTTGATGACACCGCTGCTTTCAAAAACTTTAAGAAGTGGGGAGACAT
TGAATTCCCCATGCCATTTGGAAGAGTGATGAGCCCCACAGAGAGCTTCATCCACGGTCT
AGATGAGAAGACAAGCGCATCTTTGAAGTTCACTGTTCTGAATCCCAAGGGAAGGATTTG
GACTATGGTCGCTGGAGGAGGTGCAAGTGTCATCTATGCCGATACGGTTGGAGATCTCGG
GTACGCATCTGAGCTTGGAAACTATGCTGAATACAGTGGAGCACCCAAAGAAGACGAGGT
TTTACATTACGCTAGAGTCGTCATTGATTGTGCTACAGCGAATCCGGATGGAAAAACCAG
AGCACTAGTGATCGGAGGTGGAATTGCTAACTTCACCGATGTTGCTGCTACCTTCAATGG
CATTATCCGAGCTCTCAAGGAAAAGGAAGCAAAGCTGAAAGCAGCAAGGATGCATATATA
TGTGAGGAGAGGAGGACCAAACTACCAAAAGGGACTTGCTAAAATGAGATCCCTTGGAGA
TGAAATCGGTGTCCCAATCGAGGTGTATGGTCCTGAAGCAACAATGACAGGTATCTGCAA
GGAGGCAATTGAGTACATCACAGCGGCTGCATAAAAAGCCTTTAACTCTACTGTGTTACT
TCAAATGCTCTTTAAGATTTGTGTTGAGTCTTATGGTTGGATTATATGTTTCACTTCTTA
AGTTTCTTATTTGTATTCATAATAATCATCGAGGATCTTTGGTACTCTTTTCTCTTTTTA
CTTGGTGTGTTTCACTTTTGATTGTCACC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 6

CO CL1707Contig1 1223 6 10 U
GGCCCCAACAACAAACTCGAAACCTTATTCATCAAAAAAAAATGTCATCGATAGTGCTCA
TGTTTGTGGTTCTAACCATTCTTTCCATGGGTTTGAACGTCTCTCAAGCGACATCTCGTG
TCACCTTCCACGAGCCACTATTGGCTGACCACCATCAACAATGGATGAATCGATTCTCTC
GAGTTTATAACAGCGAGCTCGAGAAACAGATGAGATTCGGCATGTTCAAGAAGAACTTTA
AATTCATTGAGGAATTTAATAGAAAGGGAGATAGAACCTACAAGCTTGGTGTCAACGAGT
TTGCGGATTGGCCCGAAGAGGATTTCATTGCCACACATACCGGTCTTAGGAGCACTGGCG
GATATTCACCAAGTGGATTTATGTATGAAGTGGAACCGTATCAGGACTGGAACGTCACTG
ATGTCGCCCCTCATGAGACCAAAGATTGGAGAAACGAAGGAGCTGTAACACCGGTTAGAT
ACCAAGGCCTATGCGGAGGTTGTTGGGCGTTCTCAGCTGTTGCCGCTGTGGAAGGTGTTA
CAAAGATTGCCGGAGGCAACCTTATACCATTATCTGAACAACAGCTTATAGATTGCGACA
GAGGGTATAATAATGGTTGTGGAGGTGGGATAATGACAGAAGCTTTCGACTACATAGTCC
AAAACCAAGGCATTGCCTCAGAGGAAGCTTACCCTTTCTCAGAGCAAGCGTACCCTTTCC
TATGGACATACGAGATGTGCCGGTACAATGCGAGACCCGCCGCATCAATCAGAGGTTTCC
AGACTGTTCCAAGCAACAACGAGCGTGCGTTGCTCGAGGCTGTGTCGAGACAGCCTGTCT
CGGTTTCCATTGATGCAGATGGACCCGGTTTCATGCATTACTCAGGGGGAGTGTATGATG
AGCCGTACTGTGGGACCAGAGTGAATCATGCGGTGACGTTCGTTGGGTACGGGACTAGCC
CTGAAGGGATCAAGTATTGGCTAGCTAAGAATTCTTGGGGTGAGACTTGGGGAGAGAATG
GTTACATTAGGATTCGTAGAGATGTGGACTGGCCTGAGGGTATGTGTGGTGTGGCTCAGA
ATGCTTATTATCCGATTGCTTAATTAAGTGGCAAATGGCTTATTGTTTAAGTGTTATATA
ATTATTATATAACATTAGAATAACAAAATGTGACTATAGTCTGGTTTATTAAATTGATTA
TATAGTCTGGTTTAGGACTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI10TF U 2
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AF RR4AI40JQ C 510
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ATAATAATGGCTGTGGAGGTGGGATAATGACAGAAGCTTTCGACTACATAGTCCAAAACC

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C

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GG
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TCCACGAGCCACTATTGGCTGACCACCATCAACAATGGATGAATCGATTCTCTCGAGTTT
ATAACAGCGAGCTCGAGAAACAGATGAGATTCGGCATGTTCAAGAAGAACTTTAAATTCA
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ATTGGCCCGAAGAGGATTTCATTGCCACACATACCGGTCTTAGGAGCACTGGCGGATATT
CACCAAGTGGATTTATGTATGAAGTGGAACCGTATCAAGACTGGAACGTCACTGATGTCG
CCCCTCATGAGACCAAAGATTGGAGAAACGAAGGAGCTGTAACACCGGTTAGATACCAAG
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ATAATAATGGTTGTGGAGGTGGGATAATGACAGAAGCTTTCGACTACATAGTCCAAAACC
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C

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T

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GCAACCTTATACCATTATCTGAACAACAGCTTATAGATTGCGACAGAGGGTATAATAATG
GTTGTGGAGGTGGGATAATGACAGAAGCTTTCGACTACATAGTCCAAAACCAAGGCGTTG
CCTCAGAGGAAGCTTACCCTTTTTCAGAGCAAGCGTACCCTTTCCTATGGACATACGAGA
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ACAACGAGCGTGCGTTGCTCGAGGCTGTGTCGAGACAGCCTGTCTCGGTTTCCATTGATG
CAGATGGACCCGGTTTCATGCATTACTCAGGGGGAGTGTATGATGAGCCGTACTGTGGGA
CCAGAGTGAATCATGCGGTGACGTTCGTTGGGTACGGGACTAGCCCTGAAGGGATCAAGT
ATTGGCTAGCTAAGAATTCTTGGGGTGAGACTTGGGGAGAGAATGGTTACATTAGGATTC
GTAGAGATGTGGACTGGCCTGAGGGTATGTGTGGTGTGGCTCAGAATGCTTATTATCCGA
TTGCTTAATTAAGTGGCAAATGGCTTATTGTTTAAGTGTTATATAATTATTATATAACAT
TAGAATAACAAAATGTGACTATAGTCTGGTTTATTAAATTGATTATATAGTCTGGTTTAG
GACTAAAG

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DS 



AS 1 6

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GTG****CAATAATATCTTTATT*GGTTATTAAACCTTAACGAAATCGCTGTTTGTAGCT
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GACCACCACGGCTCGGCCTATTAGATCCGCAACCTTGAGCTTCTCTTTCTTTCCCGTGTA
AAACGCCTCTCCGCTCTGGTCCGCCTCTAGTGTTCCCAGGTCCCCCAATGGCTCTGTGTT
GGTAAGATCTTGAAGTGGGTTGTACAAGTTCCCAGTGCTGGCTGCTCCGTTTGTGAGATC
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AAGTATCCTCACAACTTGGTTAGCCAAATCCACCTCCACTTTCTCAATCCCTTCAACAGT
GTCTAACTTGCTCTTCACGGCGTTAACACAACCTTCACACTTCATATCGACCATGAACTC
AGTAAGAAGCTGAGGCATGACGACTCGATCCTCCTGAGGGAGATTACGATCGGAAACGGG
GACGGTCGTCATCGGAGAGCTAGCGAAGCTTCGTGAAAGACCCAATCGGCGGGGTAACGA
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35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 5 35 35 5 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BA46TF C 1
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AF RR4AN72JQ U 7
AF RR4AM37JQ U 7
AF RR4AN72TF C 262
AF RR4AM37TF C 327
BS 1 11 RR4BA46TF
BS 12 26 RR4AM37JQ
BS 27 27 RR4BA46JQ
BS 28 34 RR4AM37JQ
BS 35 35 RR4BA46JQ
BS 36 62 RR4AM37JQ
BS 63 67 RR4BA46JQ
BS 68 210 RR4AM37JQ
BS 211 211 RR4BA46JQ
BS 212 790 RR4AM37JQ
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RD RR4BA46TF 757 0 0
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GTG****CAATAATATCTTTATT*GGTTATTAAACCTTAACGAAATCGCTGTTTGTAGCT
TCCCCAAATGACAGTACCATCACAAGTACAAAGCTTCTTGTAGTTTTCTCCAACTCCTGC
GCTTCTAGCAATCACTGCAGCTGTCAATCCCGGGCCTGAGTTCTTATCCTCTGTCTTGTA
GACCACCACGGCTCGGCCTATTAGATCCGCAACCTTGAGCTTCTCTTTCTTTCCCGTGTA
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AAGTATCCTCACAACTTGGTTAGCCAAATCCACCTCCACTTTCTCAATCCCTTCAACAGT
TTCTAACTTGCTCTTCACGGCGTTAACACAACCTTC
C

QA 1 756 1 756
DS 

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TTTATTAGGTTATTAAACCTTAACGAAATCGCTGTTTGTAGCTTCCC*AAATGACAGTAC
CATCACAAGTACAAAGCTTCTTGTAGTTTTCTCCAACTCCTGCGCTTCTAGCAATCACTG
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CTATTAGATCCGCAACCTTGAGCTTCTCTTTCTTTCCCGTGTAAAACGCCTCTCCACTCC
GATCTGCCTCTAGTGTTCCCAGGTCCCCCAATGGCTCTGTGTTGGTATGATCTTGAAGTG
GATTGTACAAGTTCCCGGTGCTGGCTGCTCCGTTTGTGAGATCACCATACTCGTTGATAC
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CGGCGTTAACACAACCTTC
C

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DS 

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CGCTCTGGTCCGCCTCTAGTGTTCCCAGGTCCCCCAATGGCTCTGTGTTGGTAAGATCTT
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TCTT

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CAAAG
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AATATCTTTATT*GGTTATTAAACCTTAACGAAATCGCTGTTTGTAGCTTCCC*AAATGA
CAGTACCATCACAAGTACAAAGCTTCTTGTAGTTTTCTCCAACTCCTGCGCTTCTAGCAA
TCACTGCAGCTGTCAATCCGGGGCCTGAGTTCTTATCCTCTGTCTTGTAGACCACCACGG
CTCGGCCTATTAGATCCGCAACCTTGAGCTTCTCTTTCTTTCCCGTGTAAAACGCCTCTC
CGCTCTGGTCCGCCTCTAGTGTTCCCAGGTCCCCCAATGGCTCTGTGTTGGTAAGATCTT
GAAGTGGGTTGTACAAGTTCCCAGTGCTGGCTGCTCCGTTTGTGAGATCACCATACTCGT
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GCTCCATACTGACCTGAGCAAATCTCACCACTCCAAAGATGTCTGGACCTTTGAACTCCA
CCACTGCAGCCGAGACCAAGAAATCTTGAGGAACACCTTGGCCAATCAAACGAGCTTTAC
GACCGGTTTGCTCCAGAGCTTGAGTCATAGCCTTAACAGGGGAAGATCCAAGTATCCTCA
CAACTTGGTTAGCCAAATCCACCTCCACTTTCTCAATCCCTTCAACAGTGTCTAACTTGC
TCTTCACGGCGTTAACACAACCTTCACACTTCATATCGACCATGAACTCAGTAAGAAGC

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CGCCTCTAGTGTTCCCAGGTCCCCCAATGGCTCTGTGTTGGTAAGATCTTGAAGTGGGTT
GTACAAGTTCCCAGTGCTGGCTGCTCCGTTTGTGAGATCACCATACTCGTTGATACACCA
GCTGTGTTTCCCGGGAGACAAACCAGTAAAGTTGGCTTCGATTCTCGCAAGCTCCATACT
GACCTGAGCAAATCTCACCACTCCAAAGATGTCTGGACCTTTGAACTCCACCACTGCAGC
CGAGACCAAGAAATCTTGAGGAACACCTTGGCCAATCAAACGAGCTTTACGACCGGTTTG
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AGCCAAATCCACCTCCACTTTCTCAATCCCTTCAACAGTGTCTAACTTGCTCTTCACGGC
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TGCTTTCCTCC

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DS 

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AGTTCCCAGTGCTGGCTGCTCCGTTTGTGAGATCACCATACTCGTTGATACACCAGCTGT
GTTTCCCGGGAGACAAACCAGTAAAGTTGGCTTCGATTCTCGCAAGCTCCATACTGACCT
GAGCAAATCTCACCACTCCAAAGATGTCTGGACCTTTGAACTCCACCACTGCAGCCGAGA
CCAAGAAATCTTGAGGAACACCTTGGCCAATCAAACGAGCTTTACGACCGGTTTGCTCCA
GAGCTTGAGTCATAGCCTTAACAGGGGAAGATCCAAGTATCCTCACAACTTGGTTAGCCA
AATCCACCTCCACTTTCTCAATCCCTTCAACAGTGTCTAACTTGCTCTTCACGGCGTTAA
CACAACCTTCACACTTCATATCGACCATGAACTCAGTAAGAAGCTGAGGCATGACGACTC
GATCCTCCTGAGGGAGATTACGATCGGAAACGGGGACGGTCGTCATCGGAGAGCTAGCGA
AGCTTCGTGAAAGACCCAATCGGCGGGGTAACGATCGGGAGGAAAAGGAGAGATTGGGAG
ATTGAGATTTGGTAGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAGAAGGCGATCGCGATTGGAATCGCAG
ACGCGGCGGCTACGGCGGCTGTAGTCGTTGCCACTGACCGGAGAATAGATACCATTGCTT
TCCTCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 6

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CTGAGCCAGCTGCAATTCCAGAGGACATGGATCTGTTGACTGCATTGGAGCTGACTCTAA
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TTGTTGGATGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGGTGAGGAGACAACTGCACTCAACA
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX62JQ C 1
AF RR4ED11JQ C 2
AF RR4ED11TF U 2
AF RR4BX62TF U 1
AF RR4G628TF U -2
AF RR4G628JQ C 33
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DS 

RD RR4ED11JQ 647 0 0
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TGTTGGATGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGGTGAGGAGACAACTGCACTCAACAT
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GTTTGGGACAACTTTTTGATGTTATCTTAGCTCATATTTAAAACTC
G

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4ED11TF 642 0 0
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TCCAAAATTCACCATGTCTGGGGAAGAAGCTGCTCCTGCTGTTGTTGTTCCTCCGGCTGC
TGAGCCAGCTGCAATTCCAGAGGACATGGATCTGTTGACTGCATTGGAGCTGACTCTAAG
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GAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAA
GCTTGTCAAAGCTCTATGCGCTGATCACAACAT*AACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCTAA
AACCCTCGGTGAATGGGCTGGTCTTTGCAAGATCGATTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGT
TGTTGGATGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGGTGAGGAGACAACTGCACTCAACAT
TGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAAATCAGCAAAGTCAGATTTCAGATGCTATTTC
CTCTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTAATTCTTGTTTAGTGGACGTGTCTTGACTTGAGATAT
GTTTGGGACAACTTTTTGATGTTATCTTAGCTCATATTTAAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4BX62TF 660 0 0
G
GGTCGTGGTCGTAGTCTCTCTAACTCTCTCTTAAGATTCAAAAAGGACTTTTGCTTATCT
TCCAAAATTCACCATGTCTGGGGAAGAAGCTGCTCCTGCTGTTGTTGTTCCTCCGGCTGC
TGAGCCAGCTGCAATTCCAGAGGACATGGATCTGTTGACTGCATTGGAGCTGACTCTAAG
GAAAGCCCGTGCTCACGGCGGTGTGACCCGTGGTCTCCATGAAAGCGCCAAGCTTATCGA
GAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAA
GCTTGTCAAAGCTCTATGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCTAA
AACCCTCGGTGAATGGGCTGGTCTTTGCAAGATCGATTCAGAGGGCAATGCGAGGAAGGT
TGTTGGATGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGGTGAGGAGACAACTGCACTCAACAT
TGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAAATCAGCAAAGTCAGATTTCAGATGCTATTTC
CTCTTGTTTTTTTT*GTTTTTTTAATTCTTGTTTAGTGGACGTGTCTTGACTTGAGATAT
GTTTGGGACAACTTTTTGATGTTATCTTAGCTCATATTTAAAACTC
GACCAATTCACCC

QA 2 647 2 647
DS 

RD RR4G628TF 659 0 0
GGCTC
GTCGTGGTCGTAGTCTCTCTAACTCTCTCTTAAGATTCAAAAAGGACTTTTGCTTATCTT
CCAAAATTCACCATGTCTGGGGAAGAAGCTGCTCCTGCTGTTGTTGTTCCTCCGGCTGCT
GAGCCAGCTGCAATTCCAGAGGACATGGATCTGTTGACTGCATTGGAGCTGACTCTAAGG
AAAGCCCGTGCTCACGGCGGTGTGACCCGTGGTCTCCATGAAAGCGCCAAGCTTATCGAG
AAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAG
CTTGTCAAAGCTCTATGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCTAAA
ACCCTCGGTGAATGGGCTGGTCTTTGCAAGATCGATTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTT
GTTGGATGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGGTGAGGAGACAACTGCACTCAACATT
GTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAAATCAGCAAAGTCAGATTTCAGATGCTATTTCC
TCTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTAATTCTTGTTTAGTGGACGTGTCTTGACTTGAGATATG
TTTGGGACAACTTTTTGATGTTATCTTAGCTCATATTTAAAACTC
CAAAAAAAA

QA 6 650 6 650
DS 

RD RR4G628JQ 616 0 0
TAAGATTCAAAAAGGACTTTTGCTTATCTTCCAAAATTCACCATGTCTGGGGAAGAAGCT
GCTCCTGCTGTTGTTGTTCCTCCGGCTGCTGAGCCAGCTGCAATTCCAGAGGACATGGAT
CTGTTGACTGCATTGGAGCTGACTCTAAGGAAAGCCCGTGCTCACGGCGGTGTGACCCGT
GGTCTCCATGAAAGCGCCAAGCTTATCGAGAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCT
GAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTCAAAGCTCTATGCGCTGATCACAAC
ATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCTAAAACCCTCGGTGAATGGGCTGGTCTTTGCAAG
ATCGATTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTTGTTGGATGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGAT
TACGGTGAGGAGACAACTGCACTCAACATTGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAAAT
CAGCAAAGTCAGATTTCAGATGCTATTTCCTCTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTAATTCTTG
TTTAGTGGACGTGTCTTGACTTGAGATATGTTTGGGACAACTTTTTGATGTTATCTTAGC
TCATATTTAAAACTC
C

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 6

CO CL1710Contig1 750 6 9 U
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CAAGGCGTCTGTCTTCTACAAGAACGAGTCGAGCTCGGCTGGCTCCTCCATGACTGATAA
CTCTGGCATCAGGAAGATACTTCCTGGATCACAAATCTGCGACTTTGAGTTCGAGCCATG
CGGCTACTCGATGAACAGCGTCGAAGGTGACGCCATCTCCACCATCCATGTGACCCCTGA
AGACGGATTCAGCTACGCTAGCTTTGAGGCTGTGGGGTACGATTTCACTACCATGGACTT
GAGCCACCTCGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCGAGCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGT
ACACTCTAGCGTGGCGCATAAGAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGATTA
CGGATGCAAGGAGTCGACGGTGGAGTCTCTAGGGGAAGAGAGCGGAACGGTTATGTATCA
GAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGTGTGAGTG
GAGCAGCAACAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTT
TTAGTTT*GTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAA
CCTTTGATAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCAAGTATTATGAAATT
ATCTATCAATAAGACCATTTTCGTGATACT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR4AU60JQ C 1
AF RR4AF27JQ C 7
AF RR4AF27TF U 7
AF RR4AW50JQ C 1
AF RR4AU60TF U 1
AF RR4AW50TF U 1
BS 1 7 RR4AU60TF
BS 8 241 RR4AF27TF
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BS 243 435 RR4AF27TF
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BS 609 748 RR4AF27TF
BS 749 750 RR4AU60TF

RD RR4AU60JQ 750 0 0
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CGGATGCAAGGAGTCGACGGTGGAGTCTCTAGGGGAAGAGAGCGGAACGGTTATGTATCA
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GAGCAGCAACAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTT
TTAGTTT*GTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAA
CCTTTGATAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCAAGTATTATGAAATT
ATCTATCAATAAGACCATTTTCGTGATACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AF27JQ 744 0 0
G
GAGAACAAGAATGTCTACACTCTCGAGATGTGTATGACTGGTCTGGATAAAGACAAGGCG
TCTGTCTTCTACAAGAACGAGTCGAGCTCGGCTGGCTCCTCCATGACTGATAACTCTGGC
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AGCGTGGCGCATAAGAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGATTACGGATGC
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TGTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAACCTTTGA
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AATAAGACCATTTTCGTGATA
GT

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR4AF27TF 744 0 0
G
GAGAACAAGAATGTCTACACTCTCGAGATGTGTATGACTGGTCTGGATAAAGACAAGGCG
TCTGTCTTCTACAAGAACGAGTCGAGCTCGGCTGGCTCCTCCATGACTGATAACTCTGGC
ATCAGGAAGATACTTCCTGGATCACAAATCTGCGACTTTGAGTTCGAGCCATGCGGCTAC
TCGATGAACAGCGTCGAAGGTGACGCCATCTCCACCATCCATGTGACCCCTGAATACGGA
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CTCGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCGAGCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGTACACTCT
AGCGTGGCGCATAAGAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGATTACGGATGC
AAGGAGTCTACGGTGGAGTCTCTAGGGGAAGAGAGCGGAACGGTTATGTATCAGAGGTTT
GAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGC
AACAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTTTTAGTTT
TGTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAACCTTTGA
TAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCAAGTATTATGAAATTATCTATC
AATAAGACCATTTTCGTGATA
GT

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR4AW50JQ 750 0 0
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GAGCCACCTCGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCGAGCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGT
ACACTCTAGCGTGGCGCATAAGAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGATTA
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GAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGTGTGAGTG
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TTAGTTT*GTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAA
CCTTTGATAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCAAGTATTATGAAATT
ATCTATCAATAAGACCATTTTCGTGATACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AU60TF 750 0 0
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CGGCTACTCGATGAACAGCGTCGAAGGTGACGCCATCTCCACCATCCATGTGACCCCTGA
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ACACTCTAGCGTGGCGCATAAGAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGATTA
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TTAGTTT*GTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAA
CCTTTGATAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCAAGTATTATGAAATT
ATCTATCAATAAGACCATTTTCGTGATACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AW50TF 750 0 0
GAACTGCGAGAACAAGAATGTCTACACTCTCGAGATGTGTATGACTGGTCTGGATAAAGA
CAAGGCGTCTGTCTTCTACAAGAACGAGTCGAGCTCGGCTGGCTCCTCCATGACTGATAA
CTCTGGCATCAGGAAGATACTTCCTGGATCACAAATCTGCGACTTTGAGTTCGAGCCATG
CGGCTACTCGATGAACAGCGTCGAAGGTGACGCCATCTCCACCATCCATGTGACCCCTGA
AGACGGATTCAGCTACGCTAGCTTTGAGGCTGTGGGGTACGATTTCACTACCATGGACTT
GAGCCACCTCGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCGAGCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGT
ACACTCTAGCGTGGCGCATAAGAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGATTA
CGGATGCAAGGAGTCGACGGTGGAGTCTCTAGGGGAAGAGAGCGGAACGGTTATGTATCA
GAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGTGTGAGTG
GAGCAGCAACAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTT
TTAGTTT*GTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAA
CCTTTGATAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCAAGTATTATGAAATT
ATCTATCAATAAGACCATTTTCGTGATACT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 6

CO CL1711Contig1 1073 6 8 U
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AAAAGATTGAGAAACTAAGCAGGCAGATAATATATTATCTCCTGAGACTAAAAGCTCCAC
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TCCCTTCATAAACCAAGGCAAAGGATCGCTGGAGACAATCAAATTAAAGCTCTAAAAGAC
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CAATGATAGTTGTGGGTAACCAACAATTCCTGCAAGAACTATCACGAATCACAAACAAAG
GCTAGAACTTTAAGGGCAAAGAGAAACCACCAGGACAGATCCGCCTCACATAACGCTACC
GGCAACCGCAATTAGACGAACCAAAGATTGCGGATAGAACCCAGGCCGGCAAAGATCAGC
AACGGCAAAGAGGAGGAAACTGAGAGAGCTTTCCTCAAGATAAGCATATCCGTAAAAACA
CGATCTTTCACGAGCGGGAGAAGCGGAACCCAGGAGGTCACACCCAAACACCAGCATCGA
CAAAACCATCAAGCGATACATCAGCAAGGGCAAACACAAGACATGGGGCAATCCAAAACA
CCGCGAAAATAGGCCAAACCCTGAGCCATAGCTCCAAAGGGAAACCAGATCTGAAAACTC
AGAACGCAAAAACACTTCTCAATCGCCACAAGCGAGGAGCTTGAACAGTAACAAAGGAAG
AAGCTGAGGACTAGAGACCGTCGACTGTCAAAACGGAGGCGGAGCCGGAGCGCTGCTTCA
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TACACGAGAATAAGACACACTAAAAACAGAAAAGAGCCCCGCTCCGATGCTATGGTAGCC
ACCGGAGCCGGCGGACGAGCTTCGCTTGGATCTGGGTTTCTAGAGAGATGTGGGAGGTAG
AGAGAGAATCAAGACAATAATATTTTATAACGTACATTCTACTCAAGTCTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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A
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TTTAT
CC

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CC

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DS 



AS 2 5

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BQ
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CGTGTATATACTTCGATTAACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCCGAAATCAGAA
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AGGGCGCTGAAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTCACAACTGAAGGATCT
GTTAAACAGACAAGGTTTTCTGTAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCC
GACTTATTGGAGCAGATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCGGAA
TGTA*CGAACAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAAAAAG*TT
GATGTTGATATCGCGACTCACATACATGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4A349TF 870 0 0
GGAGTGTTGTTCTCTTCTGACTTCAGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAAGTCAGTTACAACA
AGGACTTCAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTCTGCTACTCATCCTCTCCCTTCTTCT
TCCGCGATCAGCCGGCGAACTCGTTTCCCCGCTCAAATTCCACCTCCAGATCTATCGCTT
GCTTTGTTCGGTGATCGCCGCAACTTCGTAATGCCTCTATTGACGATGAGTATGAGAAAC
CGTGTATATACTTCGATTAACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCCGAAATCAGAA
GACAACGACGATGACTCTGTTCCAATGCCAATGGTTTTTATAGACCAGGATGCTGACCCT
GAAGCTACTATTGTACAACTCATTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATG
AGGGCGCTGAAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTCACAACTGAAGGATCT
GTTAAACAGACAAGGTTTTCTATAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCT
GACTTGTTGGAGCAAATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCGGAA
TGTAGCGAACAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAATAAGGTT
GATGTTGATATCGCGACTCACATACATGTGAAGGAAGACG*ACCAAAGAGTAGCCTGCTT
TGCATAGAGACAGCGGGCAGGCCAGGTCTGGTTGTAGAGATGATAAAAGTGATGGCTGAT
ATCAACATAGACGTCGAATCCGCAGAGATAGACACAGAAG*ACTGGTTGCGAAAGATAAA
TTTCACGTAAGCTACCAAGGCAGCACTAAA

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4A349TFB 860 0 0
GGAGTGTTGTTCTCTTCTGACTTCAGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAAAGTCAGTTACAACA
AGGACTTCAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTCTGCTACTCATCCTCTCCCTTCTTCT
TCCGCGATCAGCCGGCGAACTCGTTTCCCCGCTCAAATTCCACCTCCAGATCTATCGCTT
GCTTTGTTCGGTGATCGCCGCAACTTCGTAATGCCTCTATTGACGATGAGTATGAGAAAC
CGTGTATATACTTCGATTAACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCCGAAATCAGAA
GACAACGACGATGACTCTGTTCCAATGCCAATGGTTTTTATAGACCAGGATGCTGACCCT
GAAGCTACTATTGTACAACTCATTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATG
AGGGCGCTGAAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTCACAACTGAAGGATCT
GTTAAACAGACAAGGTTTTCTATAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCT
GACTTGTTGGAGCAAATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCGGAA
TGTAGCGAACAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAATAAGGTT
GATGTTGATATCGCGACTCACATACATGTGAAGGAAGACGGACCAAAGAGTAGCCTGCTT
TGCATAGAGACAGCGGGCAGGCCAGGTCTGGTTGTAGAGATGATAAAAGTGATGGCTGAT
ATCAACATAGACGTCGAATCCGCAGAGATAGACACAGAAGGACTGGTTGCGAAAGATAAA
TTTCACGTAAGCTACCAAGG

QA 1 860 1 860
DS 



CO CL1712Contig2 531 2 5 U
AACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCCGACTTATTGGAGCAGATTCGGTT
AACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCCGGAATGTAGCGAACAACTTGCAATGG
GTGAGACATTTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAAAAAGGTTGATGTTGATATCGCGACTCAC
ATACATGTGAAGGAAGACGGACCAAAGGGAGCCTGCTTTGCATAGAGACAGCGGACAGGC
CAGTTCTGGTTGTAGGGATGATAAAAGTGATGGCTGATATCAACGTAGACGTGGAATCTG
CAGAGATAGATACCGAAAGACTGGTTGCGAAAGACAAATTTCACGTAAGCTACCAAGGAC
AAGCACTAAACAGTTCTTTGTCCCAGGAGCTGGTGAACTGTTTGCGTTACTTCCTGAGAA
GGCCTGAAACGGATGTCGACAGCTATTAATAAAGCTATTGTTTACTCCAAACAGAAACTG
CCCTCTATCCTAACGCAATCAGCTATGCTACTGGGAAACTTTCAAAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA42TF U 38
AF RR4AA42JQ C 1
BS 1 37 RR4AA42JQ
BS 38 361 RR4AA42TF
BS 362 362 RR4AA42JQ
BS 363 381 RR4AA42TF
BS 382 531 RR4AA42JQ

RD RR4AA42TF 344 0 0
GACTTATTGGAGCAGATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCCGGA
ATGTAGCGAACAACTTGCAATGGGTGAGACATTTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAAAAAGG
TTGATGTTGATATCGCGACTCACATACATGTGAAGGAAGACGGACCAAAGGGAGCCTGCT
TTGCATAGAGACAGCGGACAGGCCAGTTCTGGTTGTAGGGATGATAAAAGTGATGGCTGA
TATCAACGTAGACGTGGAATCTGCAGAGATAGATACCGAAAGACTGGTTGCGAAAGACAA
ATTTCACGTAAGCTACCAAGGACA*GCACTAAACAGTTCTTTGT

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR4AA42JQ 531 0 0
AACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCCGACTTATTGGAGCAGATTCGGTT
AACAATCATCAACAATTTCTTGAAATACCATCC*GGAATGTAGCGAACAACTTGCAATGG
GTGAGACATTT*GGAATAAAGGCTCCAGAAAAAAAGGTTGATGTTGATATCGCGACTCAC
ATACATGTGAAGGAAGACGGACCAAAGGGAGCCTGCTTTGCATAGAGACAGCGGACAGGC
CAGTTTTGGTTGTAGGGATGATAAAAGTGATGGCTGATATCAACGTAGACGTGGAATTTG
CAGAGATAGATACCGAAGGACTGGTTGCGAAAGACAAATTTCACGTAAGCTACCAAGGAC
AAGCACTAAACAGTTTTTTGTCCCAGGAGCTGGTGAACTGTTTGCGTTACTTCCTGAGAA
GGCCTGAAACGGATGTCGACAGCTATTAATAAAGCTATTGTTTACTCCAAACAGAAACTG
CCCTCTATCCTAACGCAATCAGCTATGCTACTGGGAAACTTTCAAAAGTTT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 5

CO CL1713Contig1 776 5 13 U
CTTGCCTCAAACTACTCATAACATTAAAAGAGAACCGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACC
CAAAAGAAAAACAAAAGAAAAGAGGCAAAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAA
AACTCTAACGAATAGACACACAAACACCTTATCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTAC
CAAACTAGGCTAGCAGCTAAGAGACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTCGTCCTTAACG
GCCTCAGCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATG
AAGCTTATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCT
GATCTCAAGTATATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTT
GCGGTTGCGTCTAGCTTAGCTATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACT
TCGTCCAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGC
AAGACGTTCTTTC*AGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGCTCTCAGCAACAACAACCTTC
ACTGGCTCGTTGTTTTCGGTTGGGATGGGTTGAGATTTTTGTGTGGGGCAACTTTTCCAT
CTTTGAAGTCCTTGACCCACGATCCAATCTGGTCAATCTCCACATTTGTTTTCAGATATT
TCTTGTCGTCAGTAGTCTGGATGATGATGAGAGGAACTTGGCTCTCTTCTAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F063JQ U 205
AF RR4DX66JQ U 1
AF RR4F063TF C 6
AF RR4B918JQ U 4
AF RR4B918TF C 4
BS 1 31 RR4DX66JQ
BS 32 32 RR4B918JQ
BS 33 150 RR4DX66JQ
BS 151 151 RR4B918JQ
BS 152 267 RR4DX66JQ
BS 268 270 RR4B918JQ
BS 271 438 RR4DX66JQ
BS 439 439 RR4B918JQ
BS 440 553 RR4DX66JQ
BS 554 554 RR4B918JQ
BS 555 583 RR4DX66JQ
BS 584 764 RR4B918JQ
BS 765 776 RR4B918TF

RD RR4F063JQ 283 0 0
CAACACACTTCTCCTTTTCAGAACTCGTCCTTAACGGCCTCAGCTGTCGTTTCCTCCTTC
TTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCTTATGATGTCTTCCTTTGTC
CTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCTCAAGTATATTGTCGGGAAG
CCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCTAGCTTAGCTATG
ACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTCCA

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4DX66JQ 583 0 0
CTTGCCTCAAACTACTCATAACATTAAAAGAAAACCGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACC
CAAAAGAAAAACAAAAGAAAAGAGGCAAAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAA
AACTCTAACGAATAGACACACAAACACCTTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTAC
CAAACTAGGCTAGCAGCTAAGAGACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTCGTCCTTAACG
GCCTCAGCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAAAATCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATG
AAGCTTATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCT
GATCTCAAGTATATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTT
GCGGTTGCGTCTAGCTTAACTATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACT
TCGTCCAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGC
AAGACGTTCTTTCCAGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGCTCT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4F063TF 552 0 0
CTCAAACTACTCATAACATTAAAAGAGAACCGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACCCAAAA
GAAAAACAAAAGAAAAGAGGCAAAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAAAACTC
TAACGAATAGACACACAAACACCTTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTACCAAAC
TAGGCTAGCAGCTAAGAGACAACACACTTCTCCTTTTCAGAACTCGTCCTTAACGGCCTC
AGCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCT
TATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCT
CAAGTATATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGT
TGCGTCTAGCTTAGCTATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTC
CAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGCAAGAC
GTTCTTTC
CAGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4B918JQ 761 0 0
GG
CTCAAACTACTCATAACATTAAAAGAGAACCGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACCCAAAA
GAAAAACAAAAGAAAAGAGGCAAAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAAAACTC
TAACGAATAGACACACAAACACCTTATCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTACCAAAC
TAGGCTAGCAGCTAAGAGACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTCGTCCTTAACGGCCTC
AGCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCT
TATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCT
CAAGTATATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGT
TGCGTCTAGCTTAGCTATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTC
CAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGCAAGAC
GTTCTTTC*AGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGCTCTCAGCAACAACAACCTTCACTGG
CTCGTTGTTTTCGGTTGGGATGGGTTGAGATTTTTGTGTGGGGCAACTTTTCCATCTTTG
AAGTCCTTGACCCACGATCCAATCTGGTCAATCTCCACATTTGTTTTCAGATATTTCTTG
TCGTCAGTAGTCTGGATGATGATGAGAGGAACTTGGCTC

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR4B918TF 773 0 0
GG
CTCAAACTACTCATAACATTAAAAGAGAACCGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACCCAAAA
GAAAAACAAAAGAAAAGAGGCAAAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAAAACTC
TAACGAATAGACACACAAACACCTTATCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTACCAAAC
TAGGCTAGCAGCTAAGAGACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTCGTCCTTAACGGCCTC
AGCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCT
TATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCT
CAAGTATATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGT
TGCGTCTAGCTTAGCTATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTC
CAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGCAAGAC
GTTCTTTC*AGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGCTCTCAGCAACAACAACCTTCACTGG
CTCGTTGTTTTCGGTTGGGATGGGTTGAGATTTTTGTGTGGGGCAACTTTTCCATCTTTG
AAGTCCTTGACCCACGATCCAATCTGGTCAATCTCCACATTTGTTTTCAGATATTTCTTG
TCGTCAGTAGTCTGGATGATGATGAGAGGAACTTGGCTCTCTTCTAGTCCC

QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 6

CO CL1714Contig1 1066 6 25 U
GCTTTTGTCTCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAATGCTGGGTAGGCTCGCTGCGAAGCG
TCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCACCATCTTCTTCTCAGGCGTCTCGAAG
CTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAACCGGATCTTCCATG
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GGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGATCACTGTGGCAGATTACTC
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AGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAAATCCAAA
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ACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTGCTAAGCTGAGTTCTTATAAGCCGACGTTTTTTCTTT
TTCTTTTGAAGATCAATAACGCTAAAGGCTATAGTGATGTTTGAAGCCTATAGCATCAAA
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AACAAATGACCAAAGAGCATTCTCTTTTGTTATTATCTCCCTTCCAAGATTCCAAGGTTT
ATGGTGAAAGTGAATTTTGTTGTAATAAGGACTTGTATGTGTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE88TF U 1
AF RR4EH05TF U 1
AF RR4FA04TF U 153
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AF RR4DE88JQ C 445
AF RR4EH05JQ C 886
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QA 1 598 1 598
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AAAGCCA

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AGTGATGTTTGA*GCCTATAGCATCAA*CTGAGAT*GCATACTCTTTGTAGTTTGTCT

QA 1 778 1 778
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RD RR4FA04JQ 821 0 0
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CCTCAAACTACAAGCAGTCTGCAGTGATTCCTCTTCTTGATCTTGCCCAACAACAGCATG
GAGGCTGGCTCCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTGGCTCCTA
TCCGTGTTTATGAGGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACAGGGCAAAGGTCGGAAAGT
ACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGAGAGATCGAAT
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CTGTTGGGGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGATCACTGTGGCAG
ATTACTCCAATGGATCAGAAGGATATACATATAACTATTTCGAAGATGTTACACCTGAGA
AAGTTGTAGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAA
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AGCCACCACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTGCTAAGCTGAGTTCTTATAAGCCGACGTTT
TTTCTTTTTCTTTTGAAGATCAATAACGCTAAAGGCTATAGTGATGTTTGAAGCCTATAG
CATCAAACTGAGATTGCATACTCTTTGTAGTTTGTCTTCTTGGTTTGGAATATCGACCCC
ATTTTAAAACAAATGACCAAAGAGCATTCTCTTTTGTTATT

QA 1 821 1 821
DS 

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CGGCGAAGTCACAAAGGATGGTTTGTTCTCTGTTGGGGAGATGGAATGCATGGGATGCTG
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AGGAAACACGACACTGCTTGGCGAGCCAAAGCCACCACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTG
CTAAGCTGAGTTCTTATAAGCCGACGTTTTTTCTTTTTCTTTTGAAGATCAATAACGCTA
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TTGTCTTCTTGGTTTGGAATATCGACCCCATTTTAAAACAAATGACCAAAGAGCATTCTC
TTTTGTTATTATCTCCCTTCCAAGATTCCAAGGTTTATGGTGAAAGTGAATTTTGTTGTA
ATAAGGACTTGTATGTGTTTCC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4EH05JQ 158 0 0
GCCTATAGCATCAAACTGAGATTGCATACTCTTTGTAGTTTGTCTTCTTGGTTTGGAATA
TCGACCCCATTTTAAAACAAATGACCAAAGAGCATTCTCTTTTGTTATTATCTCCCTTCC
AAGATTCCAAGGTTTATGGTGAAAGTGAATTTTGTTGT

QA 1 158 1 158
DS 



AS 2 6

CO CL1715Contig1 1127 4 10 U
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TAGAATGAAGAAGACAATGGAAGATCCAATCAAAATCATGAGAAGATCAATCCACACACT
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CACTCTCTTCCGCGGTGCTGGCTTCTCTTCTTCCCTTGGTTTCTTCAACATCTTAAGCCT
TAAACTCTCACAAACACTCTCTTCCTCTTTACTCACTCTCCCTTTCTCCCTCACTTTCCT
CCTCTTCTCCAAAGCTTACATCATCAAACTTCTATCAAACAATCATGACTCTCCCTATTA
CTTTCCTCTTCTCGGAAGTTATATTTGCAACTCATTCTTCCTCCTCTCAGCAAACGCCTC
TGCTTTTGCTCTGTTCTTCATATCATTCAACATCCTAGACTCCTTTGGATTCTCTTCTAG
AAACTTCTACACTCTCTTCTCCTTATCCTCAGCCATTATCTACTCACTCATCCTCGCAAA
CGCCTTTGTCATCTCCAACTTAGCCTTGGTTTCATCTCCTTCCTCGTCCTCAGGAGGATA
CACAACACTC*TCAAGGCGTGTCTTCTCATTCGCGGAAGAACATCAACAGCATTGGCTCT
TGCTCTGCCTACTAACCTCGGCTTAGCTGGTGTGGAAGCCCTGTTTCGGTACAGAGTAAT
GAGATCATTTTACAAAGGAGACAGAGATGTCACTTCGATAGCTATTGAAGGGACGTTCAT
AGCTTACTTGTACACTCTCTTCTTGGTTCTTGACACCATAGTCAACTTCTTTTCTTACCA
AAGCTGCGTCAAGAACGAGGAGGATGAGAAGACATGTGGAGAAGATGAGTACTCGATCAA
GATCCAGATATGTGAAACAGAAAACACTAAGATATGCATCAAAGGACCAAAGATTTTATT
TTAGTCATTACAATTTTTTTTTCTCTTTTTGCTTATTGTGTCATCATGTAAAGTTTACAT
ATCAGAAACTACATAATCAATGCCAATCTTGGAATTCACGTTTGGTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 
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AF RR4AM78TF U 2
AF RR4AN26TF U 2
AF RR4B608TF U 1
AF RR4B608JQ C 304
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GAA

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AGAATGAAGAAGACAATGGAAGATCCAATCAAAATCATGAGAAGATCAATCCACACACTC
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CTCCTCCTCTCTCAGCTCTTCTTCTCATCTTCCTCTTCCTCCATTCACATGAAGCTAAAC
ACTCTCTTCCGCGGTGCTGGCTTCTCTTCTTCCCTTGGTTTCTTCAACATCTTAAGCCTT
AAACTCTCACAAACACTCTCTTCCTCTTTACTCACTCTCCCTTTCTCCCTCACTTTTTTC
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AGATCATTTTAC

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AGCTTACT*GTACACTCTCT
CTGGTCTGACACAT

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DS 

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CTTTGTCATCTCCAACTTAGCCTTGGTTTCATCTCCTTCCTCGTCCTCAGGAGGATACAC
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QA 1 824 1 824
DS 



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AGAATGAAGAAGACAATGGGAGATCCAAGCAAGATCATGAGAAGATCAATCCACACATTC
CTACAACACTACCACCGTGCCACCACCGCAGCTGCCGTTGCTCTCCCTTTCTCCACCGCT
CTCCTCCTCTCTCAGCTCTTCTTCTCATCTTCCTCTTCATCCCTTCACATGAAGCTAAAC
ACCCTCTTCCGTGGTGCTGGTTTCTCTTCTTCTCTTGGCTTCTTCAACATCTTGAGCCTT
AAACTCTCACAAACACTCTCTTCCTCTTTGCTCACTCTCCCTTTCTCCCTCACTTTCCTC
CTCTTCTCCAAAGCTTACATCATCAAACTTCTATCAAACAATCATGACTCTCCCTATTAC
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GCTTTTGCTCTGTTCATCATATCATTCAACATCCTAGAATCCTTTGGCTTCTCTTCTAGC
AACTTCTACACTCTCTTCTCCTTATCCTCAGCCATTATCTACTCACTCATCCTCGCAAAC
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GCTCTGCCTACTAACCTCGGCTTAGCTGGTGTTGAAGCCTTGTTTCGATACAGAGTAATG
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CATTGCCGACACAATTGTGTATATCATATATTCATATTATCACTAAGGAATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H895TF U 1
AF RR4H895JQB C 376
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CTACAACACTACCACCGTGCCACCACCGCAGCTGCCGTTGCTCTCCCTTTCTCCACCGCT
CTCCTCCTCTCTCAGCTCTTCTTCTCATCTTCCTCTTCATCCCTTCACATGAAGCTAAAC
ACCCTCTTCCGTGGTGCTGGTTTCTCTTCTTCTCTTGGCTTCTTCAACATCTTGAGCCTT
AAACTCTCACAAACACTCTCTTCCTCTTTGCTCACTCTCCCTTTCTCCCTCACTTTCCTC
CTCTTCTCCAAAGCTTACATCATCAAACTTCTATCAAACAATCATGACTCTCCCTATTAC
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GCTTTTGCTCTGTTCATCATATCATTCAACATCCTAGAATCCTTTGGCTTCTCTTCTAGC
AACTTCTACACTCTCTTCTCCTTATCCTCAGCCATTATCTACTCACTCATCCTCGCAAAC
GCCTTCGTCATCTCCAACTTAGCCTTGGTTTCATCTCCTTCCTCGTCCCCAGGAGGATAC
ACAACACTTCTCAAGGCGTGTCTTCTCATTCGCGGAAGAACATCAACAGCATTGGCTCTT
GCTCTGCCTACTAACCTCGGCTTAGCTGGTGT
TGA

QA 1 752 1 752
DS 

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TTCTCCTTATCCTCAGCCATTATCTACTCACTCATCCTCGCAAACGCCTTCGTCATCTCC
AACTTAGCCTTGGTTTCATCTCCTTCCTCGTCCCCAGGAGGATACACAACACTTCTCAAG
GCGTGTCTTCTCATTCGCGGAAGAACATCAACAGCATTGGCTCTTGCTCTGCCTACTAAC
CTCGGCTTAGCTGGTGTTGAAGCCTTGTTTCGATACAGAGTAATGAGATCATTTTACAAA
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CTCTTCTTGGTCCTTGACACCATGGTCAACTTCTTTTTTTACCAAAGCTGCGTCAAGAAC
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TGCCAATCTTGGAATCCATGTTTGGTTAATCCTACAGTAGAATTTCATTGCCGACACAAT
TGTGTATATCATATATTCATATTATCACTAAGGAATC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 5

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TCCTTCTCCCTTCACATTTTTTTTGGGTCCCATTCCTTAAAAAAAAAGGAAAAGAAGAAG
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AGGCCATGTCGGTTAGTATCCGAGTGCGAACGTTGTGGACCTGAAAGTCAAACCCTTGTT
CCCAGTTGAAACAAAGTTGCCAGCTTTGCATCACTTCAGCGTACCCAGAGAAAAGTTCGC
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CCTTGTGATAGAGGGCCTTCCAAGCATTATCGTCATTAGCAGCCTTCCTCATCAAGGAAT
TGGTCATGGACAAGCGGCAAAGACTTGGATAATCCAAGTAACTGAGTGCGTGAGTTGTGA
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CCGGTCTCCCTCCTGCGTTTCCGTTGACACTGCCGTTGGCCACCGACGTCGACGGCATAG
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GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4B036JQ U 1
AF RR4FB90JQ U 14
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AF RR4FB90TF C 405
AF RR4AY53TF C 403
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AGGCCATGTCGGTTAGTATCCGAGTGCGAACGTTGTGGACCTGAAAGTCAAACCCTTGTT
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CCTTGTGATAGAGGGCCTTCCAAGCATTATCGTCATTAGCAGCCTCCCTCATCAAG

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AGAGCTGTGATGATGAACCATGTGCCACCTCCCATTGTGGTACTCAAAGACGTTGGTGAT
GAGGAAGGGACCAGCGTCCACGTTCAGGTATGCTTTCATTGTAACCCAGGCCATGTCGGT
TAGTATCCGAGTGCGAACGTTGTGGACCTGAAAGTCAAACCCTTGTTCCCAGTTGAAACA
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GCACTTGACATAGTCGGAGTTGAGCCACAACTGAGCCATATCTTGAAGAGACCTCTCTCT
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TTTCCACCCGTTGACAGGGGTTATAGCATCTTGTTCCAGAGTAAAATCCTTGTGATAGAG
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QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4AY53JQ 858 0 0
CG
AATAAACATTCAGTACATGTCATTAAAACTAAATAATAGCACTAATTAATCTAATATGCC
AATTTCCAAATACGCAGGTTTCCTTCTCCCTTCACATTTTTTTTGGGTCCCATTCCTTAA
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AACCTGTTGATTGACGCCATCGATGAGCATCACAGAGCTGTGATGATGAACCATGTGCCA
CCTCCCATTGTGGTACTCAAAGACGTTGGTGATGAGGAAGGGACCAGCGTCCACGTTCAG
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ACCTTGTTCCAGAGTAAAATCCTTGTGATAGAGGGCCTTCCAAGCATTATCGTCATTAGC
AGCCTTCCTCATCAAGGAATTGGTCATGGACAAGCGGCAAAGACTTGGATAATCCAAGTA
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ATCATCCGCCACAACAACATCCGGTCTCCCTCCTGCGTTTCCGTTGACACTGCCGTTGGC
CACCGACGTCGACGGC

QA 3 858 3 858
DS 

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TCCGCCACAACAACATCCGGTCTCTCTCCTGCGTTTCCGTTGACACTGCCGTTGGCCACC
GACGTCGACGGCATAGGTTTCTCCAGATTTATCTCCTGAATTGAGAAAACGATTGGGATT
GATACTTGTGAGGTGACGATGCTTAGGGTTTTGTGGAGAGATTGGTTTCTCCTGCGGAAA
CCCTAAAATTGAATTGGCGAGAGGAGACGAGGAAGTGGAGAGAGTTTTGTAGAAAGCGTT
TTGGGTC
C

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DS 

RD RR4AY53TF 682 0 0
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ACCCAGAGAAAAGTTCGCCAGAGGCATGGATGCACTTGACATAGTCGGAGTTGAGCCACA
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TAATGATTGCTCTAGTTGTTGCATAGTAAGCTTTCCACCCGTTGACAGGGGTTATAGCAC
CTTGTTCCAGAGTAAAATCCTTGTGATAGAGGGCCTTCCAAGCATTATCGTCATTAGCAG
CCTTCCTCATCAAGGAATTGGTCATGGACAAGCGGCAAAGACTTGGATAATCCAAGTAAC
TGAGTGCGTGAGTTGTGATCTCCGGAACCAACTGCTCCATCATCGACACTCCCGCCTTAT
CATCCGCCACAACAACATCCGGTCTCCCTCCTGCGTTTCCGTTGACACTGCCGTTGGCCA
CCGACGTCGACGGCATAGGTTTCTCCAGATTTATCTCCTGAATTGAGAAAACGATTGGGA
TTGATACTTGTGAGGTGACGATGCTTAGGGTTTTGTGGAGAGATTGGTTTTTCCTGCGGA
AACCCTAAAATTGAATTGGCGAGAGGAGACGAGGAAGTGGAGAGAGTTTTGTAGAAAGCG
TTTTGGGTCTCCAACTCCGTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 6

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GCGCATCGAGATTTGTAAAATGTGTGACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTT
TGTTGATCTCTTACACAAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTGCCCACCGTTTTCGATA
ATTTCAGTGCAAATGTGGTGGTCAATGGAGCCACCGTTAATCTTGGATTGTGGGATACCG
CAGGGCAAGAGGATTACAATAGATTAAGACCACTGAGTTACCGTGGAGCAGATGTTTTCA
TATTGGCCTTCTCTCTTATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAATGTCTCCAAAAAGTGGATCC
CTGAGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCCATCATTCTCGTTGGATCAAAGCTTGATC
TTCGAGATGATAAGCAGTTCTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCGATTACTACTGCTC
AGGGAGAGGAGCTGAGGAAGCTAATAGATGCACCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAAT
CTCAAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCAGCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGA
AGCAAAAGAAGAAGAAGAGCAAAGCGCAGAAGGCATGCTCCATCCTATGATGATATGATT
GGAAAAGCTCTGTTTTTTTT*ATTTATTTGTGGTTTTGGTAAACATTTCATCAATGAGTT
AATGGACATACCCACCAAGTTTGGTTTTGGTCTTTTCTTTTGATTTTTAATATTATTAAA
TCGAGTTTATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A737TF U 1
AF RR4A784TF U 214
AF RR4AM32TF U 19
AF RR4AM32JQ C 83
AF RR4A784JQ C 274
AF RR4A737JQ C 397
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AATCTTTGTGTTTTTTT***TTGTTCAATAATCTTTCCCAAAAAAAGAGGGAGAAAATGA
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AGGGAGAGGAGCTGAGGAAGCTAATAGATGCACCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAAT
CTCAAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCAGCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGA
AG

QA 1 722 1 722
DS 

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ATGAAAATGTCTCCAAAAAGTGTATCCCTGAGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCCA
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QA 1 622 1 622
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GG
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GTGTTTGACGCAGCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAGCAAAAGAAGAAGAAGAGC
AAAGCGCAGAAGGCATGCTCCATCCTATGATGATATGATTGGAAAAGCTCTGTTTTTTTT
*ATTTATTTGTGGTTTTGGTAAACATTTCATCAATGAGTTAATGGACATACCC
ACC

QA 3 835 3 835
DS 

RD RR4AM32JQ 774 0 0
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GTTCAATAATCTTTCCCAAAAAAAGAGGGAGAAAATGAGCGCATCGAGATTTGTAAAATG
TGTGACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTTTGTTGATCTCTTACACAAGCAA
CACTTTCCCTACGGACTATGTGCCCACCGTTTTCGATAATTTCAGTGCAAATGTGGTGGT
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TGGTGTCCCCATCATTCTCGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTTCTT
CGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCGATTACTACTGCTCAGGGAGAGGAGCTGAGGAAGCT
AATAGATGCACCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTGAAAGCGGT
GTTTGACGCAGCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAGCAAAAGAAGAAGAAGAGCAA
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ACC

QA 1 771 1 771
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TGAGTTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCTCTTATCAGTAAAGCCAGTT
ATGAAAATGTCTCCAAAAAGTGTATCCCTGAGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCCA
TCATTCTCGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTTCTTCGTCGACCATC
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CTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCAG
CCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAGCAAAAGAAGAAGAAGAACAAAGCGCAGAAGG
CATGCTCCATCCTATGATGATATGATTGGAAAAGCTCTGTTTTTTTT*ATTTATTTGTGG
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CC

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AAAATGTTTCCAAAAAGTGGATCCCTGAGGTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCCATCA
TTTTCGTTGGATCAAAGCTTGATTTTCGAGATGATAAGCAGTTTTTTGTCGACCATCCTG
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CTTACGTGGAATGCAGTTCCAAATTTCAAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCAGCCA
TACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAGCAAAAGAAGAAGAAGAGCAAAGCGCAGAAGGCAT
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TGGTAAACATTTCATCAATGAGTTAATGGACATACCCCCCAAGTTTGGTTTTGGTCTTTT
CTTTTGATTTTTAATATTATTAAATCGAGTTTATTCG

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 6

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TGCGTGAGGGTATTATCTCAACCATTATTTTTCATGATCTTGATCTTGACTAGTAGAATG
GGAACATTCTTAGACCTAACTTCTCAACACGAGAAGTAGAAGTAGTAGCCGTAGTAGCAT
CATTATCAACCTTCACAAACTTGACGAATAAAGTCTTAGCCACATCATTGGTGACAAGTA
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GAGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAGGAACGTAACGAGAAAAGAAGTCTTCATTTTGATTG
TTTTGTATGTGTTTTGGGGTTTGAGTGAGTTGAGTTGTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 5 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4HB47JQB U 1
AF RR4GJ47JQ U 4
AF RR4G246JQ U 9
AF RR4G246TF C 31
AF RR4HB47TF C 88
AF RR4GJ47TF C 174
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BS 116 116 RR4GJ47JQ
BS 117 132 RR4HB47JQB
BS 133 133 RR4GJ47JQ
BS 134 158 RR4HB47JQB
BS 159 159 RR4GJ47JQ
BS 160 205 RR4HB47JQB
BS 206 206 RR4GJ47JQ
BS 207 218 RR4HB47JQB
BS 219 219 RR4GJ47JQ
BS 220 256 RR4HB47JQB
BS 257 257 RR4GJ47JQ
BS 258 270 RR4HB47JQB
BS 271 271 RR4GJ47JQ
BS 272 294 RR4HB47JQB
BS 295 295 RR4GJ47JQ
BS 296 439 RR4HB47JQB
BS 440 440 RR4GJ47JQ
BS 441 482 RR4HB47JQB
BS 483 483 RR4GJ47JQ
BS 484 507 RR4HB47JQB
BS 508 508 RR4GJ47JQ
BS 509 518 RR4HB47JQB
BS 519 629 RR4GJ47JQ
BS 630 630 RR4G246JQ
BS 631 703 RR4GJ47JQ
BS 704 764 RR4G246JQ
BS 765 816 RR4G246TF
BS 817 820 RR4GJ47TF

RD RR4HB47JQB 518 0 0
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TGCGTGAGGGTATTATCTCACCCATTATTTTTCATGATCTTGATTTTGACTAGTAAAATG
GGAACATTCTTAAACCTAACTTCTCAACACGAGAAGTAAAAGTAGTAGCCGTAGTAGCAT
CATTATCAACCTTCACAAACTTGACAAATAAAGTCTTACCCACATCATTGGTGACAAGTA
GCTGTGGTGCACTCAAACAAGCCCCTGGGGGGGTTCCAACGGTTCCAGATGAGGGGGTCA
ACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGCAGCTTTTTCTATCTTAAACGCACTATTTGGGCTCTTCG
GTTCACCACCGATGATAACGGCAGGCTCCTTGGATGCGGATGAGGAATCGACTGCCCACA
ACTTAAAAAACTCGGTGCAAACAGGCCATATTGGGGACCTGAACTCGATGTTTATATCGG
CAAATGTGTCAATGGTGTCTCGGCCGAAAATGTTTGGA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4GJ47JQ 700 0 0
GCGAT
GGAAACACAAATTTATTTGATTTTTATGAAAGTAAAGACGAGTTCACATACATGCGTGAG
GGTATTATCTCAACCATTATTTTTCATGATCTTGATCTTGACTAGTAGAATGGGAACATT
CTTAGACCTAACTTCTCAACACGAGAAGTAGAAGTAGTAGCCGTAGTAGCATCATTATCA
ACCTTCACAAACTTGACGAATAAAGTCTTAGCCACATCATTGGTGACAAGTAGCTGTGGT
GCACTCAACCAAGCCCCTGGGGTGGTTCCAACGGTTCCAGATGAGGTGGTCAACTTGTAA
GTGTGTGCTCCTGCAGCTTTTTCTATCTTAAACGCACTATTTGGGCTCTTCGGTTCACCA
CCGATGATAACGGCAGGCTCCTTGGATGCGGATGAGGAATCGACTGCCCACAACTTAAAA
AACTCGGTGCAGACAGGCCATATTGGGGACCTGAACTCGATGTTTATATCGGCAGATGTG
TCAATGGTGTCTCGGCCGAGAATGTTTGGATGATATCCGAAGCTAACCGGCAGGCCCGGT
TGGTAGGGAAGAAGTGTTTGGGTGATGCCAAGTGGACAAAACGGAAGTATGTTAGTGGCA
GCTGGAACAAGACCTCCCCCGCTGTTACTCTCGGTCTTAACCGGCTGGATGAAGTATTGT
GCACCGACCCTAACTGGATTTCCGTTGGAATCCTT

QA 6 700 6 700
DS 

RD RR4G246JQ 756 0 0
GGAAACACAAATTTATTTGATTTTTATGAAAGTAAAGACGAGTTCACATACATGCGTGAG
GGTATTATCTCAACCATTATTTTTCATGATCTTGATCTTGACTAGTAGAATGGGAACATT
CTTAGACCTAACTTCTCAACAAGAGAAGTAGAAGTAGTAGCCGTAGTAGCATCATTATCA
ACCTTCACAAACTTGACGAATAAGGTCTTAGCCACATCATTGGTGACAAGTAGCTGTGGT
GCACTCAACCAAGCCCCTGGGGTGGTTCCGACGGTTCCAGATGAGGTGGTCAACTTGTAA
GTGTGTGCTCCTGCAGCTTTTTCTATCTTAAACGCGCTATTTGGGCTCTTCGGTTCACCA
CCGATGATAACGGCAGGCTCATTGGATGCGGATGAGGAATCGACTGCCCACAACTTAAAA
AACTCGGTGCAGACAGGCCATATAGGGGACCTGAACTCGATGTTTATATAGGCAGATGTA
TCAATGGTATCTCGGCCGAAAATGTTTGGATGATATCCGAAGCTAACCGGCAGGCCCGGT
TGGTAGGGAAGAAGTGTTTGAGTGATGCCAAGTGGACAAAACGGAAGTATGTTGGTGGCA
GCTGGAACAAGACCTCCCCCGTTGTTACTCTCGGTCTTAACCGGCTGGATGAAGTATTGT
GCACCGACCCTAACTGGATTTCCGTTGGAGTCCTTCACCTCTTCAAGGCCATGAGTGCAG
ACAGCTGCAGCCAACAGGAACGTAACGAGAAAAGAA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4G246TF 788 0 0
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TTCATGATCTTGATCTTGACTAGTAGAATGGGAACATTCTTAGACCTAACTTCTCAACAA
GAGAAGTAGAAGTAGTAGCCGTAGTAGCATCATTATCAACCTTCACAAACTTGACGAATA
AGGTCTTAGCCACATCATTGGTGACAAGTAGCTGTGGTGCACTCAACCAAGCCCCTGGGG
TGGTTCCGACGGTTCCAGATGAGGTGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGCAGCTTTTT
CTATCTTAAACGCGCTATTTGGGCTCTTCGGTTCACCACCGATGATAACGGCAGGCTCAT
TGGATGCGGATGAGGAATCGACTGCCCACAACTTAGAAAACTCGGTGCAGACAGGCCATA
TAGGGGACCTGAACTCGATGTTTATATAGGCAGATGTATCAATGGTATCTCGGCCGAGAA
TGTTTGGATGATATCCGAAGCTAACCGGCAGGCCCGGTTGGTAGGGAAGAAGTGTTTGAG
TGATGCCAAGTGGACAAAACGGAAGTATGTTGGTGGCAGCTGGAACAAGACCTCCCCCGT
TGTTACTCTCGGTCTTAACCGGCTGGATGAAGTATTGTGCACCGACCCTAACTGGATTTC
CGTTGGAGTCCTTCACCTCTTCAAGGCCATGAGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAGGAACG
TAACGAGAAAAGAAGTCTTCATTTTGATTGTTTTGTATGTGTTTTGGGGTTTGAGTGAGT
TGAGTT
CC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4HB47TF 731 0 0
TTTTTCATGATCTTGATCTTGACTAGTAGAATGGGAACATTCTTAGACCTAACTTCTCAA
CACGAGAAGTAGAAGTAGTAGCCGTAGTAGCATCATTATCAACCTTCACAAACTTGACGA
ATAAAGTCTTAGCCACATCATTGGTGACAAGTAGCTGTGGTGCACTCAAACAAGCCCCTG
GGGTGGTTCCAACGGTTCCAGATGAGGTGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGCAGCTT
TTTCTATCTTAAACGCACTATTTGGGCTCTTCGGTTCACCACCGATGATAACGGCAGGCT
CCTTGGATGCGGATGAGGAATCGACTGCCCACAACTTAGAAAACTCGGTGCAGACAGGCC
ATATTGGGGACCTGAACTCGATGTTTATATCGGCAGATGTGTCAATGGTGTCTCGGCCGA
GAATGTTTGGACGATATCCGAAGCTAACCGGCAGGCCCGGTTGGTAGGGAAGAAGTGTTT
GGGTGATGCCAAGTGGACAAAACGGAAGTATGTTAGTGGCAGCTGGAACAAGACCTCCCC
CGTTGTTACTCTCGGTCTTAACCGGCTGGATGAAGTATTGTGCACCGACCCTAACTGGAT
TTCCGTTGGAATCCTTCACCTCTTCATGGGCGTGGGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAGGA
ACGTAACGAGAAAAGAAGTCTTCATTTTGATTGTTTTGTATGTGTTTTGGGGTTTGAGTG
AGTTGAGTT
CC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4GJ47TF 647 0 0
GTAGCATCATTATCAAC*TTCACAAACTTGACGAATAAAGTCTTAGCCACATCATTGGTG
ACAAGTAGCTGTGGTGCACTCAACCAAGCCCCTGGGGTGGTTCCAACGGTTCCAGATGAG
GTGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGCAGCTTTTTCTATCTTAAACGCACTATTTGGG
CTCTTCGGTTCACCACCGATGATAACGGCAGGCTCCTTGGATGCGGATGAGGAATCGACT
GCCCACAACTTAGAAAACTCGGTGCAGACAGGCCATATTGGGGACCTGAACTCGATGTTT
ATATCGGCAGATGTGTCAATGGTGTCTCGGCCGAGAATGTTTGGATGATATCCGAAGCTA
ACCGGCAGGCCCGGTTGGTAGGGAAGAAGTGTTTGGGTGATGCCAAGTGGACAAAACGGA
AGTATGTTAGTGGCAGCTGGAACAAGACCTCCCCCGCTGTTACTCTCGGTCTTAACCGGC
TGGATGAAGTATTGTGCACCGACCCTAACTGGATTTCCGTTGGAATCCTTCACCTCTTCA
AGGGCGTGGGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAGGAACGTAACGAGAAAAGAAGTCTTCATT
TTGATTGTTTTGTATGTGTTTTGGGGTTTGAGTGAGTTGAGTTGTCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL1719Contig1 800 4 2 U
GGTGGCGTTGGAGAGAATCAGCTTATCTCCATTCAACCTGATGAACTCAAATTCCTTTTT
GAACTCGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAAAACCGAGAACTATGTT
GCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTGTC
ATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCACAAAGGGAGTATCCT
CCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACACT
GATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAGAG
TGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCAACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATCTGGA
GCAACCAGTGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATTTCAGTGACTACTATACAGCGGCTG
AAGGAAGAGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCAACATGAATTGGAGATG
TTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTATGGTT
GGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCACATAA
CAGCTATCATCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAACTTACGAGGGATAGCTGTTAA
CTCTCTATTGATCTTGTTCTACTTTGTTTTTGTCCATTAAAATTTGTTTCTTTGTCAATT
ATATTTGGATGTACATCATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ95TF U 1
AF RR4AR94TF U 1
AF RR4AQ36TF U 1
AF RR4AR01TF U 1
BS 1 700 RR4AQ36TF
BS 701 800 RR4AR01TF

RD RR4AQ95TF 529 0 0
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GCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTGTC
ATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCACAAAGGGAGTATCCT
CCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACACT
GATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAGAG
TGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCAACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATCTGGA
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QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4AR94TF 656 0 0
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GAACTCGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAAAACCGAGAACTATGTT
GCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTGTC
ATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCACAAAGGGAGTATCCT
CCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACACT
GATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAGAG
TGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCAACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATCTGGA
GCAACCAGTGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATTTCAGTGACTACTATACAGCGGCTG
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GGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4AQ36TF 713 0 0
GGTGGCGTTGGAGAGAATCAGCTTATCTCCATTCAACCTGATGAACTCAAATTCCTTTTT
GAACTCGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAAAACCGAGAACTATGTT
GCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTGTC
ATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCACAAAGGGAGTATCCT
CCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACACT
GATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAGAG
TGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCAACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATCTGGA
GCAACCAGTGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATTTCAGTGACTACTATACAGCGGCTG
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TTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTATGGTT
GGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCACATAA
CAGCTATCATCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAAC
TTACGAGGGATAG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4AR01TF 800 0 0
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GAACTCGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAAAACCGAGAACTATGTT
GCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTGTC
ATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCACAAAGGGAGTATCCT
CCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACACT
GATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAGAG
TGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCAACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATCTGGA
GCAACCAGTGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATTTCAGTGACTACTATACAGCGGCTG
AAGGAAGAGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCAACATGAATTGGAGATG
TTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTATGGTT
GGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCACATAA
CAGCTATCATCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAACTTACGAGGGATAGCTGTTAA
CTCTCTATTGATCTTGTTCTACTTTGTTTTTGTCCATTAAAATTTGTTTCTTTGTCAATT
ATATTTGGATGTACATCATT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 6

CO CL1720Contig1 887 6 7 U
GGGTAGACTAGTTTCCTAAGTTTACCTCATCACAGTTTCGTACTAACTCGAGAGCCCAAG
AAATAAGAAAGAAGAAAGAAGAAACACGAAACAATGGAGAATCTATTGGGACTTCTCAGA
ATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATCAGATATATCGCAAGCAGCGATCCCTAC
ATCGTTTTTAACTTCGGAAACAAGAAGCTGAAAACCCACGTGGTCAAACATAATGTAAAC
CCAGAGTGGAACGATGATTTGACTCTTTCTGTGACTGATCCAAATCTCCCTGTTAAACTT
ACGGTTTACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGC
ATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCCCTAAGATCGAAAGAGGACTTCCCAAT
GGAACCATAATAATGAAGACACAGCCAAATAGACGGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGTCAC
ATTGTGTGGAACCAAGGCAAGCTTCTTCAGAATATGTTCATTAGGCTCCAGAACGTGGAG
TCCGGAGAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAAGGGCCTTTAA
GTCACTTCATGCCACTCCGACCCGATCCTTATCCCTTGTGCATATATGGTTTAATTGGCC
ATTGAAGAATCTCAAACTGGTTATGTAGTAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCC
CAATAA*GGGTGCAAGTCCACTAGGACTGATTTAGTTAGTGTAACATTTGGATACCAGTT
ATATTCCTCTCTCTCGTTTGCTTGAATAGGCAACGATTCAACCAACCAAACTTCTGTAAG
ATGCTAAATTTATCATTGTAACTTAGATGGGGTAAAGTTTAGATCGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A935TF U 2
AF RR4B993TF U 1
AF RR4A935JQ C 187
AF RR4B758TF U 1
AF RR4B993JQ C 35
AF RR4B758JQ C 51
BS 1 726 RR4B758TF
BS 727 727 RR4A935TF
BS 728 838 RR4B758TF
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BS 857 879 RR4B993JQ
BS 880 887 RR4B758JQ

RD RR4A935TF 787 0 0
GGG
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AAGAAAGAAGAAAGAAGAAACACGAAACAATGGAGAATCTATTGGGACTTCTCAGAATTC
ATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATCAGAGATATCGCAAGCAGCGATCCCTACATCG
TTTTTAACTTCGGAAACAAGAAGCTGAAAACCCACGTGGTCAAACATAATGTAAACCCAG
AGTGGAACGATGATTTGACTCTTTCTATGACTGATCCAAATCCCCCTGTTAAACTTACGG
TTTACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGCATTG
CTCCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCCCTAAGATCGAAAG**GACTTCCCAGTGGAA
CCATAATAATGAAGATACAGCCAAATAGACAGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGTCACATTG
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GAGAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAAGGGCCTTTAAGTCA
CTTCATGTCACTCCGACCCGATCCTTATCCCTTGTGCATATATGGTTTAATTGGCCATTG
AAGAATCTCAAACTGGTTATGTAATAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCCCAAT
AA*GGGTGCAAGTCCACTAG*ACTGACTTAGTTAGTGTAACATTTGGATACCAGTTATAT
TCCT

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DS 

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GGGT
AGACTAGTTTCCTAAGTTTACCTCATCACAGTTTCGTACTAACTCGAGAGCCCAAGAAAT
AAGAAAGAAGAAAGAAGAAACACGAAACAATGGAGAATCTATTGGGACTTCTCAGAATTC
ATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATCAGATATATCGCAAGCAGCGATCCCTACATCG
TTTTTAACTTCGGAAACAAGAAGCTGAAAACCCACGTGGTCAAACATAATGTAAACCCAG
AGTGGAACGATGATTTGACTCTTTCTGTGACTGATCCAAATCTCCCTGTTAAACTTACGG
TTTACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGCATTG
CTCCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCCCTAAGATCGAAAGAGGACTTCCCAATGGAA
CCATAATAATGAAGACACAGCCAAATAGACGGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGTCACATTG
TGTGGAACCAAGGCAAGCTTCTTCAGAATATGTTCATTAGGCTCCAGAACGTGGAGTCCG
GAGAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAAGGGCCTTTAAGTCA
CTTCATGCCACTCCGACCCGATCCTTATCCCTTGTGCATATATGGTTTAATTGGCCATTG
AAGAATCTCAAACTGGTTATGTAGTAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCCCAAT
AAAGGGTGCAAGTCCACTATGACTGATTTAGTTAGTGTAACATTTGGATACCAGTTATAT
TCCT

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DS 

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TGGAACGATGATTTGACTCTTTCTATGACTGATCCAAATCCCCCTGTTAAACTTACGGTT
TACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGCATTGCT
CCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCCCTAAGATCGAAAG**GACTTCCCAGTGGAACC
ATAATAATGAAGATACAGCCAAATAGACAGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGTCACATTGTG
TGGAACCAAGGCAAGCTTCTTCAGAATATGTTCATTAGGCTCCAGAACGTAGAGTCCGGA
GAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAAGGGCCTTTAAGTCACT
TCATGTCACTCCGACCCGATCCTTATCCCTTGTGCATATATGGTTTAATTGGCCATTGAA
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*GGGTGCAAGTCCACTAGGACTGACTTAGTTAGTGTAACATTTGGATACCAGTTATATTC
CTCTCTCTCGTTTGCTTGAATAGGCAACGATTCAACCAACC

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DS 

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AAATAAGAAAGAAGAAAGAAGAAACACGAAACAATGGAGAATCTATTGGGACTTCTCAGA
ATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATCAGATATATCGCAAGCAGCGATCCCTAC
ATCGTTTTTAACTTCGGAAACAAGAAGCTGAAAACCCACGTGGTCAAACATAATGTAAAC
CCAGAGTGGAACGATGATTTGACTCTTTCTGTGACTGATCCAAATCTCCCTGTTAAACTT
ACGGTTTACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGC
ATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCCCTAAGATCGAAAGAGGACTTCCCAAT
GGAACCATAATAATGAAGACACAGCCAAATAGACGGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGTCAC
ATTGTGTGGAACCAAGGCAAGCTTCTTCAGAATATGTTCATTAGGCTCCAGAACGTGGAG
TCCGGAGAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAAGGGCCTTTAA
GTCACTTCATGCCACTCCGACCCGATCCTTATCCCTTGTGCATATATGGTTTAATTGGCC
ATTGAAGAATCTCAAACTGGTTATGTAGTAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCC
CAATAAAGGGTGCAAGTCCACTAGGACTGATTTAGTTAGTGTAACATTTGGATACCAGTT
ATATTCCTCTCTCTCGTTTGCTTGAATAGGCAACGATTCAACCAACCAAACTTCTGTA*G
ATGCTAAATTTATCAT
GTAACTTA

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DS 

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GTTTCGTACTAACTCGAGAGCCCAAGAAATAAGAAAGAAGAAAGAAGAAACACGAAACAA
TGGAGAATCTATTGGGACTTCTCAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATCA
GATATATCGCAAGCAGCGATCCCTACATCGTTTTTAACTTCGGAAACAAGAAGCTGAAAA
CCCACGTGGTCAAACATAATGTAAACCCAGAGTGGAACGATGATTTGACTCTTTCTGTGA
CTGATCCAAATCTCCCTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATG
ATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCC
CTAAGATCGAAAGAGGACTTCCCAATGGAACCATAATAATGAAGACACAGCCAAATAGAC
GGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGTCACATTGTGTGGAACCAAGGCAAGCTTCTTCAGAATA
TGTTCATTAGGCTCCAGAACGTGGAGTCCGGAGAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCG
ATGTCCCCGGTTCAAAGGGCCTTTAAGTCACTTCATGCCACTCCGACCCGATCCTTATCC
CTTGTGCATATATGGTTTAATTGGCCATTGAAGAATCTCAAACTGGTTATGTAGTAAGCT
CTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCCCAATAA*GGGTGCAAGTCCACTAGGACTGATTTA
GTTAGTGTAACATTTGGATACCAGTTATATTCCTCTCTCTCGTTTGCTTGAATAGGCAAC
GATTCAACCAACCAAACTTCTGTAAGATGCTAAATTTATCATTGTAACTTAGATGGGGTA
AAGTT

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DS 

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CGATCCCTACATCGTTTTTAACTTCGGAAACAAGAAGCTGAAAACCCACGTGGTCAAACA
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TGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACATACTCTCTGCGGATGATAAGATGGGAGAAGC
AGAGTTTAGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAGTTTCGCCCTAAGATCGAAAGAGG
ACTTCCCAATGGAACCATAATAATGAAGACACAGCCAAATAGACGGAACTGTCTGTCTGA
AGAGAGTCACATTGTGTGGAACCAAGGCAAGCTTCTTCAGAATATGTTCATTAGGCTCCA
GAACGTGGAGTCCGGAGAGGTTGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAA
GGGCCTTTAAGTCACTTCATGCCACTCCGACCCGATCCTTATCCCTTGTGCATATATGGT
TTAATTGGCCATTGAAGAATCTCAAACTGGTTATGTAGTAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTC
TTTTCGAGCCCAATAA*GGGTGCAAGTCCACTAGGACTGATTTAGTTAGTGTAACATTTG
GATACCAGTTATATTCCTCTCTCTCGTTTGCTTGAATAGGCAACGATTCAACCAACCAAA
CTTCTGTAAGATGCTAAATTTATCATTGTAACTTAGATGGGGTAAAGTTTAGATCGC

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DS 



AS 1 6

CO CL1721Contig1 900 6 19 U
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ACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCTGAACGTA
ACCGGAAAAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAG
GCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGT
GGCTCGTTTGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCA
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GCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCC
AAAGAATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCA
TATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATC
ATCTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTT
GATACCATCAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAG
TACTATTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTTAACCATTT
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ATACTCAAATCCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTACCCCCAAAACAATGGTAATT
TCTTGTGTATGCATTGGCCTTGCCTCAACCAAATAAATATTAAATTTAAATTCATATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F169TF U 7
AF RR4E125TF U 1
AF RR4C807TF U 2
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AF RR4E125JQ C 355
AF RR4F169JQ C 731
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GG
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AGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTT
TGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTC
CGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAA
GGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATC
TGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCA
GAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCTTC
CAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCAT
CAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATT

QA 3 661 3 661
DS 

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GGGTCTCTAAGAAACAAAAATAAAAATAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTC
ACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCTGAACGTA
ACCGGAAAAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAG
GCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGT
GGCTCGTTTGTTCAGGCCGCTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCA
CCTCCCTCCGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTG
GCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCC
AAAGAATCTACCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCA
TATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATC
ATCTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTT
GATTCCATCAACAACCTGGACTATGGGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAG
TACTATTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGT*CTCGCCAAGCTTGGTTAACCATTT
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DS 

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GGTCTCT
AAGAAACAAAAATAAAAATAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCC
CGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCTGAACGTAACCGGAAA
AGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCACC
AGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTT
TGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTC
CGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAA
GGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATC
TGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCA
GAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCTTC
CAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCAT
CAACAACCTGTACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATTC
AGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTTAACCATTTCGAGTCTG
CATTTTTCTTTGTAAATTTATTGTGTCTTGATTTT*GTTTCCTGAGTACTTAATACTCAA
*TCCCTGAATCTGAT*GTGTTTCAAGTTTT
ACCC

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DS 

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AGAGCGAGGCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTT
TAGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCC
CTCCTCCACCTCCCTCCGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATC
TGAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGG
CTAGAGCCAAAGAATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAG
CTTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTA
ACACAATCATCTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAA
AGCTCTTTGATACCATCAACAACCTGTACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATG
CTGAGAAGTACTATTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTT
AACCATTTCGAGTCTGCATTTTTCTTTGTAAATTTATTGTGTCTTGATTTTTGTTTCCTG
AGTACTTAATACTCAAATCCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTACCCCCAAAACAA
TGGTAATTTCTTGTG
C

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DS 

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AGAGCCAAAGAATCTACCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCT
TGGCCATATGTTCAGAACGATTTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAAC
ACAATCATTTTTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAG
CTCTTTGATTCCATCAACAACCTGGACTATGGGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCT
GAGAAGTACTATTCAGAGACTGTCTTTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTTAA
CCATTTCGAGTCTGCATTTTTCTTTGTAAATTTATTGTGTCTTGATTTTTGTTTCCTGAG
TACTTAATACTCAAATCCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTACCCCCAAAACAATG
GTAATTTCTTGTGTATGCATTGGCCTTGCCTCAACCAAATAAATATTAAATTTAAATTCA
TATCGC

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DS 

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CCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTACCCCCAAAACAATGGTAATTTCTTGTGTAT
GCATTGGCCTTGCCTCAACCAAATAAAT

QA 1 148 1 148
DS 



AS 1 6

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TCGAGAGGACCAGGTCGGTTGATACAGAACGTGACACAGTTCGCTGATGCTCAGTTCAAG
GAGTTCTCGACTCGCCATGGACAAAAAGTCATAGACATCCTCGACTTCCCAATCAAACTC
GTCTTGTCTCCTTTCACTCTCGCCTTCGACATCGCCGGCTCTGCTCCTCGCGGCTTTGGC
ATCCCCGAACTCATCTCCAAGATATCCTATCTCTCTGTTTTCGCGGTTGCTACGCTTGGG
ACTTATGACATTGCCTTGGACTTGGGGAAGAAAGTCATCTGCCAAAGGGATTGCAAAACA
TGTAACGGGTGGCAGGCGTTACGGTGCACCATGTGCAAAGGAACAGGGACTGTTCATTAC
CAGATCAAAGATTACAACTTGAGAAGTGGAGAGAAACCAACAGCAGATTGTGTGGCGGAT
GCAATAGTTGACAATCGAGCTGAGTTGGTTCATCTTCCTGCCTCCCTCAACCTTACTGCA
CCCTTGCCAACGAAAGACTGTCCAACTTGTGATGGAACAGGTGTGATGAGCTGTACTGAG
TGCAAGAACAAGCTGCAAGTCAGGATCTCAGCTGATGATATCATGGAACCTCCATGGAAA
GCATACAATGTCCTTCGGAAGATGGATTATCCCTACGAGCATATTGTTCACAGCATGAAA
GATCCAAGCATCGCAAATTTCTGGTTGATCACTTTGCCTCAGATTGTGGGTGGGTTTGAT
TATGATGAAGATGTCAAGAAGAAAATATGGCTGCAATACGAGGAATCCATGCGCTATGAT
CAGCTTAGGGACATGGTGGCTAAGAGAAACCCTGGCTGGGAATATTTGCAGGATGCATTG
TTCTCCATTGATCCTGTCCGTGCTCAGGAAGACCCCGTCATTGTAAAAAATGTCCCTTTT
TACAAGGCTAAGAAAGCTCTGGAGGCTGAAGTCACAAAGCTCAATCCACCTCCTCGTCCT
CAACATTGGGGTGAACTGAATCTCCCACTGAATACTTCCTCTTGGAGTGAAGAGGATCTC
AAAAACCCAGCAAAGCTGTACGAGAAGACAGTTTTTCTCAATGCGCAAAGGGAAATCGCT
GACAAGATCTTGGATGCACAATGGGAAGCTAAATGGCGTCAAGAGAAGGTAGAGGAAATG
CTGGAGGAGAAAGTGAGACCGTTCATCCAAGACTCAAGCATGTCTGTTTTTCCCCAGCCC
ATCTTGTTAAAATTTCAGAAGACTAATCGAAAGGGGAACCGGCAAAGGAAGTGGTGGTTT
TTTTAACCGTCCCGGTTCATCGAAACAGAGCTAGAGATAAATGGATTTTTGAATCGAGTA
TGTGCTTCATTTATGAAAATATGTTTTCACAATTACTTGGTGAGTCTATTACACTTGTGA
CTTGAGTCGGTCAATCTTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCTTTATATGACC
GATTCATCGCGTATTCCACGTGTACCACTGTTCTTTTTACCTTGTCACGTTGTTCTGCCT
CTCATGTTTTGAACTTTGCTGTCGACCATCGTCATCTCCATTACTTACGTGTTTTTTCAT
GCGTGGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ25TF U 1
AF RR4E227TF U 1
AF RR4B132TF U 18
AF RR4B132JQ C 711
AF RR4E227JQ C 1020
AF RR4DQ25JQ C 902
BS 1 592 RR4DQ25TF
BS 593 593 RR4E227TF
BS 594 623 RR4DQ25TF
BS 624 624 RR4E227TF
BS 625 757 RR4DQ25TF
BS 758 758 RR4E227TF
BS 759 770 RR4DQ25TF
BS 771 788 RR4E227TF
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BS 790 800 RR4E227TF
BS 801 818 RR4B132TF
BS 819 978 RR4B132JQ
BS 979 979 RR4DQ25JQ
BS 980 1037 RR4B132JQ
BS 1038 1038 RR4DQ25JQ
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BS 1050 1050 RR4DQ25JQ
BS 1051 1077 RR4B132JQ
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BS 1194 1194 RR4DQ25JQ
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BS 1450 1516 RR4B132JQ
BS 1517 1628 RR4DQ25JQ

RD RR4DQ25TF 775 0 0
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GTCTTGTCTCCTTTCACTCTCGCCTTCGACATCGCCGGCTCTGCTCCTCGCGGCTTTGGC
ATCCCCGAACTCATCTCCAAGATATCCTATCTCTCTGTTTTCGCGGTTGCTACGCTTGGG
ACTTATGACATTGCCTTGGACTTGGGGAAGAAAGTCATCTGCCAAAGGGATTGCAAAACA
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GCAATAGTTGACAATCGAGCTGAGTTGGTTCATCTTCCTGCCTCCCTCAACCTTACTGCA
CCCTTGCCAACGAAAGACTGTCCAACTTGTGATGGAACAGGTGTGATGAGCTTTACTGAG
TGCAAGAACAAGCTGCAAGTCAG*ATCTCAGCTGATGATATCATGGAACCTCCATGGAAA
GCATACAATGTCCTTCGGAAGATGGATTATCCCTACGAGCATATTGTTCACAGCATGAAA
GATCCAAGCATCGCAAATTTCTGGTTGATCACTTTGC*TCAGATTGTGGG
GGGTT

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DS 

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GGAAACAACATCCAGACCAGAGAGACTGAGAGGAAGCTCTTATCTTCTTCTTCTCCAATG
TCGAGAGGACCAGGTCGGTTGATACAGAACGTGACACAGTTCGCTGATGCTCAGTTCAAG
GAGTTCTCGACTCGCCATGGACAAAAAGTCATAGACATCCTCGACTTCCCAATCAAACTC
GTCTTGTCTCCTTTCACTCTCGCCTTCGACATCGCCGGCTCTGCTCCTCGCGGCTTTGGC
ATCCCCGAACTCATCTCCAAGATATCCTATCTCTCTGTTTTCGCGGTTGCTACGCTTGGG
ACTTATGACATTGCCTTGGACTTGGGGAAGAAAGTCATCTGCCAAAGGGATTGCAAAACA
TGTAACGGGTGGCAGGCGTTACGGTGCACCATGTGCAAAGGAACAGGGACTGTTCATTAC
CAGATCAAAGATTACAACTTGAGAAGTGGAGAGAAACCAACAGCAGATTGTGTGGCGGAT
GCAATAGTTGACAATCGAGCTGAGTTGGTTCATCTTCCTGCCTCCCTCAACCTTACTGCA
CCCTTGCCAACGAAAGACTGTCCAACTTGTGATGGAACAGGTGTGATGAGCTGTACTGAG
TGCAAGAACAAGCTGCAAGTCAGGATCCCAGCTGATGATATCATGGAACCTCCATGGAAA
GCATACAATGTCCTTCGGAAGATGGATTATCCCTACGAGCATATTGTTCACAGCATGAAA
GATCCAAGCATCGCAAATTTCTGGTTGATCACTTTGCCTCAGATTGTGGGTGGGTTTGAT
TATGATGA*GATGTCAAGAA
AAAA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4B132TF 801 0 0
GG
GAGAGACTGAGAGGAAGCTCTTATCTTCTTCTCCTCCAATGTCGAGAGGACCAGGTCGGT
TGATACAGAACGTGACACAGTTCGCCGATGCTCAGCTCAAGGAGTTCTCGACTCGTCATG
GACAAAAAGTCATAGACATCCTCGACTTCCCAATCAAACTCGTCTTGTCTCCCTTCACTC
TCGCCTTCGACATCGCCGGCTCTGCTCCACGTGGCTTTGGCATCCCCGAACTCATCTCCA
AGATATCCTATCTCTCTGTTTTCGCGGTTGCTACGCTTGGGACTTATGACATTGCCTTGG
ACTTGGGGAAGAAAGTCATCTGCCAAAGGGATTGCAAAACATGTAACGGGTGGCAGGCGT
TACGGTGCACCATGTGCAAAGGAACAGGGAGTGTTCATTACCAGATCAAAGATTACAACT
TGAGAAGTGGAGAGAAACCAACAGCAGATTGTGTCGCGGATGCCATAGTTGACAATCGAG
CTGAGTTGGTTCATCTTCCTGCCTCCCTCAACCTTACTGCACCCTTGCCAACAAAAGACT
GCCCGACTTGTGATGGAACCGGTGTGATGAGCTGTACCGAGTGCAAGAACAAGCTGCAAG
TTAGGATCTCAGCTGATGATATCATGGAACCTCCATGGAAAGCATACAATGTCCTGCGGA
AGATGGATTATCCCTACGAGCACATTGTTCACAGCATGAAAGATCCAAGCATCGCAAATT
TCTGGTTGATCACTTTGCCTCAGATTGTGGGTGGGTTTGATTATGATGAAGATGTCAAGA
AGAAAATATGGCTGCAATA

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR4B132JQ 813 0 0
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TGGGTTTGATTATGATGAAGATGTCAAGAAGAAAATATGGCTGCAATACGAGGAATCCAT
GCGCTATGATCAGCTTAGGGACATGGTGGCTAAGAGAAACCCTGGCTGGGAATATTTGCA
GGATGCATTGTTCTCCATTGATCCTGTCCGTGCTCAGGAAGACCCCGTCATTGTAAAAAA
TGTCCCTTTTTACAAGGCTAAGAAAGCTTTGGAGGCTGAAGTCACAAAGCTCAATCCACC
TCCTCGTCCTCAACATTGGGGTGAACTTAATCTCCCACTAAATACTTCCTCTTGGAGTGA
AGAGGATTTCAAAAACCCAGCAAAGCTGTACGAGAAGACAGTTTTTCTCAATGCGCAAAG
GGAAATCGCTGACAAGATTTTGGATGCACAATGGGAAGCTAAATGGCGTCAAGAGAAGGT
AGAAGAAATGCTGGAGGAGAAAGTGAGACCGTTCATTCAAGACTCAAGCATGTCTGTTTT
TCCCCAGCCCATCTTGTTAAAATTTCAGAAGACTAATCAAAAGGGGAACCGGCAAAGGAA
GTGGTGGTTTTTTTAACCGTCCCGGTTCATCGAAACAGATCTAGAGATAAATGGATTTTT
GAATCGAGTTTGTGCTTCATTTATGAAAATATGTTTTCACAATTACTTGGTGAGTTTATT
ACACTTGTGACTTGAGTCAGTCAATCTTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCT
TTATATGACCGATTCATCGCGTATTC
CACGTGT

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DS 

RD RR4E227JQ 497 0 0
TCAG
CATTGGGGTGAACTGAATCTCCCACTGAATACTTCCTCTTGGAGTGAAGAGGATCTCAAA
AACCCAGCAAAGCTGTACGAGAAGACAGTTTTTCTCAATGCGCAAAGGGAAATCGCTGAC
AAGATCTTGGATGCACAATGGGAAGCTAAATGGCGTCAAGAGAAGGTAGAGGAAATGCTG
GAGGAGAAAGTGAGACCGTTCATCCAAGACTCAAGCATGTCTGTTTTTCCCCAGCCCATC
TTGTTAAAATTTCAGAAGACTAATCGAAAGGGGAACCGGCAAAGGAAGTGGTGGTTTTTT
TAACCGTCCCGGTTCATCGAAACAGAGCTAGAGATAAATGGATTTTTGAATCGAGTATGT
GCTTCATTTATGAAAATATGTTTTCACAATTACTTGGTGAGTCTATTACACTTGTGACTT
GAGTCGGTCAATCTTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCTTTATATGACCGAT
TCATCGCGTATTC

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DS 

RD RR4DQ25JQ 727 0 0
TCTCCATTGATCCTGTCCGTGCTCAGGAAGACCCCGTCATTGTTAAAAATGTCCCTTTTT
ACAAGGCTAAGAAAGCTCTGGAGGCTGAAGTCACAAAGCTCAATCCACCTCCTCGTCCTC
AGCATTGGGGTGAACTGAATCTCCCACTGAATACTTCCTCTTGGAGTGAAGAGGATCTCA
AAAACCCAGCAAAGCTGTACGAGAAGACAGTTCTTCTCAATGCGCAAAGGGAAATCGCTG
ACAAGATCTTGGATGCACAATGGGAAGCTAAATGGCGTCAAGAGAAGGTAGAGGAAATGC
TGGAGGAGAAAGTGAGACCGTTCATCCAAGACTCAAGCATGTCTGTTCTTCCCCAGCCCA
TCTTGTTAAAATCTCAGAAGACTAATCGAAAGGGGAACCGGCAAAGGAAGTGGTGGTTCT
TTTAACCGTCCCGGTTCATCGAAACAGAGCTAGAGATAAATGGATTTTTGAATCGAGTAT
GTGCTTCATTTATGAAAATATGTTTTCACAATTACTTGGTGAGTCTATTACACTTGTGAC
TTGAGTCGGTCAATCTTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCTTTATATGACCG
ATTCATCGCGTATTCCACGTGTACCACTGTTCTTTTTACCTTGTCACGTTGTTCTGCCTC
TCATGTTTTGAACTTTGCTGTCGACCATCGTCATCTCCATTACTTACGTGTTTTTTCATG
CGTGGGC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 6

CO CL1723Contig1 922 6 12 U
GGTTACAAATTAAGTTTATTATTATTAGATAATAATCACATTTTTCCCATATCCTTTCCA
ACCACGAGGTCCATACATGATTATCACCTACAACATAGTAATTACAAATATACATCAAAA
AGGAACCCTTACAAGATTCCTAAAATATCTGAAAAACCCCAGTCGATGCACATTTTTCTT
TGTTATATATGTATAAGAATATGTATGTTAATAAATAAATCAATTGTAGTAAAACGACAA
AGGTGGTGGGAGCAACGAATCGGTATCTTGCTGGTTAAGTTTGGTCTTAATGTTTAAAGT
GTTAAAGACTTTGTCCATTCCAGCGAACACATCCAATGACTCACCACTCATTCTTTTCCC
AAGTCCTATCCCCCCTTGAACCTCTTTCAACAACTTTTTTT*CATAAATGTCATCGAGAC
AAGTCGATTGGTACGTGAAGATGGAAGTCATCTTCTTCTTGCATGTGAAGTAATTATCAG
CCATGCTGGTTATGTTTTCTCCCGCGGCTTTCCAGAAATCTGCAAAGTCTTCCAAGGCAT
TGTTTAGCTGTTTTTCGCAACCGTTGATGCAGTTTGTGGCGAATGCGTTTCCTTTGTACT
TGGGTTTGATTCCAGAGAGGAAGTTCAAACCCCTTTTAACAGAGGATTCTGCAGCTGTGG
CTAAGTAACGGACCAAGAAGGCTGGGTCATTGCTTGGGACGGTTTTCAAGGTTATGCTAC
AAAGATTTTTGTCTTCCACAACGCTGCAGATTCCTGCCACAGTTTTTTCGTGTTCCGGTG
TAACATCGGCACGTTTTGCTGGGACTACGAAAGCGGTTGCGGTTAGGGCGATGCAGAGAA
TGAGAAAAGTGAGTTTTATTGGAGTGTTCATCTTTTTTGTTTCTTTGTTGTTTTTACTTG
GACGTGGATTGGAAAGGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EB84JQ U 1
AF RR4FF29JQ U 1
AF RR4D246JQ U 5
AF RR4D246TF C 135
AF RR4EB84TF C 227
AF RR4FF29TF C 149
BS 1 260 RR4EB84JQ
BS 261 261 RR4FF29JQ
BS 262 300 RR4EB84JQ
BS 301 301 RR4FF29JQ
BS 302 411 RR4EB84JQ
BS 412 563 RR4FF29JQ
BS 564 564 RR4D246JQ
BS 565 607 RR4FF29JQ
BS 608 612 RR4D246JQ
BS 613 837 RR4D246TF
BS 838 839 RR4EB84TF
BS 840 922 RR4D246TF

RD RR4EB84JQ 411 0 0
GGTTACAAATTAAGTTTATTATTATTAGATAATAATCACATTTTTCCCATATCCTTTCCA
ACCACGAGGTCCATACATGATTATCACCTACAACATAGTAATTACAAATATACATCAAAA
AGGAACCCTTACAAGATTCCTAAAATATCTGAAAAACCCCAGTCGATGCACATTTTTCTT
TGTTATATATGTATAAGAATATGTATGTTAATAAATAAATCAATTGTAGTAAAACGACAA
AGGTGGTGGGAGCAACGAATTGGTATCTTGCTGGTTAAGTTTGGTCTTAATGTTTAAAGT
ATTAAAGACTTTGTCCATTCCAGCGAACACATCCAATGACTCACCACTCATTCTTTTCCC
AAGTCCTATCCCCCCTTGAACCTCTTTCAACAACTTTTTTT*CATAAATGT

QA 1 411 1 411
DS 

RD RR4FF29JQ 607 0 0
GGTTA
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GAGGTCCATACATGATTATCACCTACAACATAGTAATTACAAATATACATCAAAAAGGAA
CCCTTACAAGATTCCTAAAATATCTGAAAAACCCCAGTCGATGCACATTTTTCTTTGTTA
TATATGTATAAGAATATGTATGTTAATAAATAAATCAATTGTAGTAAAACGACAAAGGTG
GTGGGAGCAACGAATCGGTATCTTGTTGGTTAAGTTTGGTCTTAATGTTTAAAGTGTTAA
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CTATCCCCCCTTGAACCTCTTTCAACAACTTTTTTTTCATAAATGTCATCGAGACAAGTC
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CTGGTTATGTTTTCTCCCGCGGCTTTCCAGAAATCTGCAAAGTCTTCCAAGGCATTGTTT
AGCTGTTTTTCGCAACCGGTGATGCAGTTTGTGGCGAATGCGTTTCCTTTGTACTTGGGT
TT

QA 6 607 6 607
DS 

RD RR4D246JQ 608 0 0
C
CAAATTAAGTTTATTATTATTAGATAATAATCACATTTTTCCCATATCCTTTCCAACCAC
GAGGTCCATACATGATTATCACCTACAACATAGTAATTACAAATATACATCAAAAAGGAA
CCCTTACAAGATTCCTAAAATATCTGAAAAACCCCAGTCGATGCACATTTTTCTTTGTTA
TATATGTATAAGAATATGTATGTTAATAAATAAATCAATTGTAGTAAAACGACAAAGGTG
GTGGGAGCAACGAATCGGTATCTTGCTGGTTAAGTTTGGTCTTAATGTTTAAAGTGTTAA
AGACTTTGTCCATTCCAGCGAACACATCCAATGACTCACCACTCATTCTTTTCCCAAGTC
CTATCCCCCCTTGAACCTCTTTCAACAACTTTTTTT*CATAAATGTCATCGAGACAAGTC
GATTGGTACGTGAAGATGGAAGTCATCTTCTTCTTGCATGTGAAGTAATTATCAGCCATG
CTGGTTATGTTTTCTCCCGCGGCTTTCCAGAAATCTGCAAAGTCTTCCAAGGCATTGTTT
AGCTGTTTTTCGCAACCGTTGATGCAGTTTGTGGCGAATGCGTTTCCTTTGTACTTGGGT
TTGATTC

QA 2 608 2 608
DS 

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CAAGATCT
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QA 9 788 9 788
DS 

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TTAATGTTTAAAGTATTAAAGACTTTGTCCATTCCAGCGAACACATCCAATGACTCACCA
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GGCGATGCAGAGAATGAGAAAAGTGAGTTTTATTGGAGTGTTCATCTTTTTTGTTTCTTT
GTTGTTTTTACTTGGACGTGGATTGGAAAGGATTCC

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DS 

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TCTG
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GCGGTTGCGGTTAGGGCGATGCAGAGAATGAGAAAAGTGAGTTTTATTGGAGTGTTCATC
TTTTTTGTTTCTTTGTTGTTTTTACTTGGACGTGGATTGGAAAGGATTCC

QA 5 774 5 774
DS 



AS 1 6

CO CL1724Contig1 1251 6 19 U
GGACTTCTAACCTTCTCTTCTTCCACACACATAAATACACACACGCTTCAGATAATATAG
AAGAAGAACAAGAACAAGAATATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTT
CTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATAC
TCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAG
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ATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGA
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GGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGG
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TGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGG
GCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGA
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AGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAAC
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TTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAATT
GAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATTC
ATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATTGTCAT
GTGATATATTAGTATACGAGTGATGGGTAGAGGTTTTATATATTTTCCGGGAGCACACAA
TGTCAATGCTTTCTACAATTTTTTTATTTATTTTACAGCAACGTTCCCTAC


BQ
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL28TF U 1
AF RR4H020TF U 1
AF RR4E549TF U 1
AF RR4H020JQ C 426
AF RR4GL28JQ C 427
AF RR4E549JQ C 671
BS 1 18 RR4E549TF
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RD RR4GL28TF 616 0 0
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GCACTAGCCATGGACC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4H020TF 655 0 0
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AAGAAGAACAAGAACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTT
CTTGATGCCTCTACTTATGTAGGTTTC*GGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATAC
TCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAG
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TACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGT
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AGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTC
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GCACTAGCCATGGACCGTAG*CTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4E549TF 705 0 0
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AAGAAGAACAAGAACAAGAATATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTT
CTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATAC
TCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAG
ATGGAAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAGC
ATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGA
TACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGT
GGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGG
AGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTC
TGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGG
GCACTAGCCATGGACTGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCGATCCTGGTCTTATCGTCGGA
CCGTCG*TTGCACAACATAACCCTAG*CCCACCATGTCCTACCTC

QA 1 705 1 705
DS 

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AGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGTC
GGTTGCACAACATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACAAATGTA
TGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAGC
ATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGA
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TGAGAGTGTAATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAATTGAG
CAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAATTGAAAA
TGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATTCATACT
TCGTGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATTGTCATGTGAT
ATATTAGTATACGAGTGATGGGTAGAGGTTTT*TATATTTTCCGGGAGCACACAATGTCA
ATGCTTTCTAC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4GL28JQ 790 0 0
ACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGGAGAGAC
AACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAAAAGTGTTGGAGTGATTAAGACTTCTGTCGC
AGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGGGCACTA
GCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGTCG
GTTGCACAACATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACAAATGTAT
GAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAGCA
TTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGAA
GAAGAAGCTCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCCACCGAGGTAT
GAGAGTGTGATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAATTGAGC
AAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAATTGAAAAT
GAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATTCATACTT
CATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATTGTCATGTGATA
TATTAGTATACGAGTGATGGGTAGAGGTTTTATATATTTTCCGGGAGCACACAATGTCAA
TGCTTTCTAC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4E549JQ 581 0 0
CACAACATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACAAATGTACGAGA
ATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAGCATTGG
AGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGAAGAAG
AAGCTCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCCACCGAGGTATGAGA
GTGTGATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAATTGAGCAAGC
TGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAATTGAAAATGAGG
AGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATTCATACTTCATG
GTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATTGTCATGTGATATATT
AGTATACGAGTGATGGGTAGAGGTTTTATATATTTTCCGGGAGCACACAATGTCAATGCT
TTCTACAATTTTTTTATTTATTTTACAGCAACGTTCCCTAC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 5

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ATGAAAATAATTAGACATGTTTAAAAAAAATGTGATGATCCTTTTTAATGTCACTTATTA
AGGGGCTTAAGCAAGAGAGTAAGCAAGCTTGGTTTGGTAGTATCATGCTCTTGAGATTTC
AGGAGCTCCAACGAGGCGTGTCCGGATCTGGGGAAGCTTCTGTCTGAAGGCAACGTCTAG
ACGTGCGTCTAAAGTGTTCTCGCAGACAATCTTTCCATCTTGAGACGCCAGCACCACCCC
GCCCGAGCAATGAGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTTAGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAA
CACTTTTTCGTCAATTGTGATCTTAGGAGACCCGACTTTGGCTTTTTCTGCATACTGTCT
CTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCTTCTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAG
CACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGCTTCTT
GTACGCGTTCTTGTCGTTGGAGACACGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGA
GGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAATCCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGA
GTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGAGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAG
CTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTTCTCTATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGA
GATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCGTCAGCCTCTTGCCGGATGAACCGGACCATCTGTTG
TATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTTCATATCTCTTTCTCGCACACACAAACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4CU50JQ U 1
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AF RR4CU50TF C 206
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RD RR4CU50JQ 865 0 0
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CACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGCTTCTT
GTACGCGTTCTTGTCGTTGGAGACACGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGA
GGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAATCCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGA
GTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGGGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAG
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TTCATATCTCTTTCTCGCACACACAAAC

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR4B454TF 777 0 0
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TTTCTGCATACTGTCTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCTTCTTGTCCATCT
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CAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAATCCTACTTG
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CATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTTCTCTATGTTGA
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ACCGGATCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTTCATATCTCTTTCTC

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DS 

RD RR4BR82JQ 831 0 0
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ATCTTGAGACGCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAATGAGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTT
AGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCAATTGTGATCTTAGGAGACCCGAC
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GTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAAC
GATGAGAGCCTTGAGAAGCTTCTTGTACGCGTTCTTGTCGTTGGAGACACGAAGGAGATC
CTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAAT
CC*ACTTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGAG
CTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCGAGAAGCTGAAGTTTCTC
TATGTTGAATTCCTCCTCAGCGGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCGTCAGCCTCTTG
CCGGATGAACCGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTT

QA 1 831 1 831
DS 

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GGAGACCCGACTTTGGATTTT*CTGCATACTGTCTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCA
ACAACCTTCTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGC
AAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGCTTCTTGTACGCGTTCTTGTCGTTGGAGACA
CGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGA
AGGTACTTAATCCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCG
ACCTGCTTGGGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGTATTCTCAAGAAGC
TGAAGTTTCTCTATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCG
TCAGCCTCTTGCCGGATGAACCGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCG
TTCATATCTCTTTCTCGCACACACAAACAAAAA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 5

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GCCTCCACGCAGCCACTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAA
CTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGCAGATCTCTCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAG
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GCTCTGTACGCTTACTTCGATCGTGACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTC
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CGTGGTGGGAGGGTTAAACTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCT
GAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGTTGGCTCTATCATTGGAGAAACTGGTCAAT
GAAAAACTCCTAAACCTGCACAGTGTGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGAT
TTCATTGAGAGCGTGTTTTTGAACGAACAGGTTGAAGCAATTAAGAAAATCTCGGAGTAC
GTCTCTCAACTAAGAAGACTCGGCAAAGGACATGGGACATGGCATTTCGATCAGGAGCTT
CTCTAATAAACTGCTGCTGCTTAAGCTATTTTTGGTTGTAATCTCTAATAAACTGCTGCT
CCTGCTTGATCTATGGTTGTTGTACTCTCTTTAGAAACTGGTGTTGCTTAATCACTTTTG
GCTGAGGGTAATTTTTAAGCGTTTAGTTTTGTTTACTCACAAACCTTTGACTAATAAGTT
CATTTAAGTTGAGGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAA
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AAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAA
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GAAAAACTCCTAAACCTGCACAGTGTGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGAT
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TCC
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GAGCTTCTCTAATAAACTGCTGCTGCTTAAGCTATTTTTGGTTGTAATCTCTAATAAACT
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DS 

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DS 



AS 1 6

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CTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

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AGTCCTGGACAGTACGATGAACAAATGAACCGTGGAGCTGGCATCTATGCGGTTCCTGTA
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TACTTGTTCAACCAAGATGGATCAAGACAACGGCTTGCTCTTCTTGTGATTTTCGCTACC
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ATGCATAGAGCAGCAGTACCACCACCTCGAGCTCA*CGACCTGCTGCGAGAGCTGATA*T
GATCCCGCAGCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4BC74TF 761 0 0
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CTAGAAAAAAAATGGCGGAAGAGCCACAGAAGGCGGCTTCTTCATCGTTACATCAACCTT
CTTCCGACAAGAAACCGGAAGATGCTGAGATCAAGCCTCAGGATCCGGATCATGGTGTTT
CTCTAAAGTATCCGGTTTTATATCCGGGTCTTGTTCTCGGGTCGAGTCCTGGACAGTACG
ATGAACAAATGAACCGTGGAGCTGGCATCTATGCGGTTCCTGTACATCAGTTTGGAGGAC
ATGTGACGGGTCTTCCCTCAAACTATCTCATCCCTCTCACTTACAATGTTCCCACAACTA
GACCTAGCAATGATACTGAGGCTGGGGGAGAGAACCAAGCACAAGCCGGGCAGGGTCAGG
TGCAGCAGCAACAACCTGCAGGTCAAAGGCAAGTGGTGGTACGGAGGTTTGAGATTGCGT
TTCAGCTTGACATATTCCTCATACTCAAGCTTGCTGCTGTCATCTACTTGTTCAACCAAG
ATGGATCAAGACAACGGCTTGCTCTTCTTGTGATTTTCGCTACCGTAATCTACTTATACC
AAACCGGAGCCCTTGCACCTTTTATCCGATGGCTATCACAAGGTATGCATAGAGCAGCAG
TACCACCACCTCGAGCTCAACGACCTGCTGCGAGAGCTGATAATGATCCCGCAGCTGCAA
TGCCACTAAACCAAGATGCCGTTCCCGAGGGACAAGAGAAC

QA 1 761 1 761
DS 

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CTAGAAAAAAAATGGCGGAAGAGCCACAGAAGGCGGCTTCTTCATCGTTACATCAACCTT
CTTCCGACAAGAAACCGGAAGATGCTGAGATCAAGCCTCAGGATCCGGATCATGGTGTTT
CTCTAAAGTATCCGGTTTTATATCCGGGTCTTGTTCTCGGGTCGAGTCCTGGACAGTACG
ATGAACAAATGAACCGTGGAGCTGGCATCTATGCGGTTCCTGTACATCAGTTTGGAGGAC
ATGTGACGGGTCTTCCCTCAAACTATCTCATCCCTCTCACTTACAATGTTCCCACAACTA
GACCTAGCAATGATACTGAGGCTGGGGGAGAGAACCAAGCACAAGCCGGGCAGGGTCAGG
TGCAGCAGCAACAACCTGCAGGTCAAAGGCAAGTGGTGGTACGGAGGTTTGAGATTGCGT
TTCAGCTTGACATATTCCTCATACTCAAGCTTGCTGCTGTCATCTACTTGTTCAACCAAG
ATGGATCAAGACAACGGCTTGCTCTTCTTGTGATTTTCGCTACCGTAATCTACTTATACC
AAACCGGAGCCCTTGCACCTTTTATCCGATGGCTATCACAAGGTATGCATAGAGCAGCAG
TACCACCACCTCGAGCTCAACGACCTGCTGCGAGAGCTGATAATGATCCCGCAGCTGCAA
TGCCACTAAACCAAGATGCCGTTCCCGA

QA 1 748 1 748
DS 

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CTCGAGCTCAACGACCTGCTGCGAGAGCTGATAATGATCCCGCAGCTGCAATGCCACTAA
ACCAAGATGCCGTTCCCGAGGGACAAGAGAACGAAGGTGGTGATGGGATTAGGGCAAACG
GAAATGAAAATGTGGATGGAGGACAAGGAGGGAATCAGTGGTGGGGGATAGTGAAAGAGA
TTCAGATGATAGTTTTCGGCTTCATAACTTCACTACTCCCTGGCTTCCACAACATAGACT
AGACTCTCTCTCTCAACCTTCTTCAACAGAAGAAAGTGTTATGCTCTTACTCTGTCGTCT
GTGAAAAGTACATATAATTTTTAACTTTTGAGACTCGAATTTTAGTTGAATGTTCGCGCG
CTGCAGTTTTCATGTTTTTACCCTTTTGCTGCTGTTGACTTGTCCCATTTCGACCAAGTT
GGTCTTAGATATGTTCCCATTTAA
CC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4BC74JQ 821 0 0
CGGGTCTTCCCTCAAACTATCTCATCCCTCTCACTTACAATGTTCCCACAACTAGACCTA
GCAATGATACTGAGGCTGGGGGAGAGAACCAAGCACAAGCCGGGCAGGGTCAGGTGCAGC
AGCAACAACCTGCAGGTCAAAGGCAAGTGGTGGTACGGAGGTTTGAGATTGCGTTTCAGC
TTGACATATTCCTCATACTCAAGCTTGCTGCTGTCATCTACTTGTTCAACCAAGATGGAT
CAAGACAACGGCTTGCTCTTCTTGTGATTTTCGCTACCGTAATCTACTTATACCAAACCG
GAGCCCTTGCACCTTTTATCCGATGGCTATCACAAGGTATGCATAGAGCAGCAGTACCAC
CACCTCGAGCTCAACGACCTGCTGCGAGAGCTGATAATGATCCCGCAGCTGCAATGCCAC
TAAACCAAGATGCCGTTCCCGAGGGACAAGAGAACGAAGGTGGTGATGGGATTAGGGCAA
ACGGAAATGAAAATGTGGATGGAGGACAAGGAGGGAATCAGTGGTGGGGGATAGTGAAAG
AGATTCAGATGATAGTTTTCGGCTTCATAACTTCACTACTCCCTGGCTTCCACAACATAG
ACTAGACTCTCTCTCTCAACCTTCTTCAACAGAAGAAAGTGTTATGCTCTTACTCTGTCG
TCTGTGAAAAGTACATATAATTTTTAACTTTTGAGACTCGAATTTTAGTTGAATGTGCGC
GCGCTGCAGTTTTCATGTTTTTACCCTTTTGCTGCTGTTGACTTGTCCCATTTCGACCAA
GTTGGTCTTAGATATGTTCCCATTTAATCCTCATTTTTCTT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4BD85JQ 136 0 0
AACTTTTGAGACTCGAATTTTAGTTGAATGTGCGCGCGCTGCAGTTTTCATGTTTTTACC
CTTTTGCTGCTGTTGACTTGTCCCATTTCGACCAAGTTGGTTTTAGATATGTTCCCATTT
AATCCTCATTTTTCTT

QA 1 136 1 136
DS 



AS 2 6

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CCAGAGTAAAAGAATATTATTGTCAACGACTAGAATCCACACAAGAAAAAAAAGCCTTCA
CTATATAATGTATTCATTAGTTGTGAAATAAAAATAATAGGGACGTGTATCTTTTATTCA
CTACCTTAAGCATATGCACGAGGAGGATTGCTCGAGCAAAGAATGTAGGGAAAAAGTTGT
GGAGAAATAGAGAGACTAGGCTATTGCAGACTGTTTATCATCTTCAAGGTGTAACGCCCT
AAGTAGTTTCGGCCATGACTGTGGGATTCCACCTGGTAATTCAAACTCAAGGAGCTTCCC
ACGCTTCCTGTAGAACTCCTCCACTGGTTGAGTCATTTTGTGGTAAACCCTGAGTCTTTC
CTTGACAACTTCTTCAGTGTCATCAGCTCGGGTTATAAGCTTAGATTCACAGTTTGGTGG
AGGAAGAAGCGGAGGCATATACATTCTAGGACCAGAATCATCATCACCACCTTTGATATC
AATGCATGCAACGTTATAGTTTGCACCACACTCGCTGCAAATCCTTCTCCCTAGACATTT
CGCAACTAGTGCCTCTTCCTTTAGCTTCAGGTTGATCACTAGATCCACATTAATTACTCC
CTCCAGTATTTCCGCTTGTGTCACGGTTCTTGGAAAACCATCAAGAATGTAACCAGATTC
ACCCTACTCCTTGCCAGCTTCGAGACGCTTTGATAACAAGCTTATAATGAATTCATCAGG
AACCAATTTGCCATGGTTAACAAGCTCCTTTAGCTGAGAGGAGAGGAGACCAGAGGAGGA
AAGCTCTTCGCGTACGAGATCACCGGTGGCGATATGAGGAACGCCGAGGAGGGTAGAGAG
ACGAGAGGCGTAGGTGCCTTTACCAACACCGGGACATCCAAGAAACACCCAGTGAAAGTT
TCTACCTTTGGACGGAGTAGGAGAAGAAGAAGGAGAGGAAGACTTTTCCAGCTCCGCCGC
AGCTTCTTTGAGATCGATCTCAGAGTCCAACGATGGCCCATGGGAAGAAGAAGAAGACAG
AGACCTGATCAATAAAGAAGAAAGATTATTCCTTTCCGCCGTCAACGGCGAGAACAGCCT
GAAGAGACGGTGAGAAACCGCCATGAGGAAGAGAACAAAGGTGAATGAATTTGATGGTTT
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4DM07JQ U 1
AF RR4DN28JQ U 1
AF RR4FJ58TF C 375
BS 1 768 RR4DM07JQ
BS 769 770 RR4DN28JQ
BS 771 1142 RR4FJ58TF

RD RR4DM07JQ 768 0 0
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CTATATAATGTATTCATTAGTTGTGAAATAAAAATAATAGGGACGTGTATCTTTTATTCA
CTACCTTAAGCATATGCACGAGGAGGATTGCTCGAGCAAAGAATGTAGGGAAAAAGTTGT
GGAGAAATAGAGAGACTAGGCTATTGCAGACTGTTTATCATCTTCAAGGTGTAACGCCCT
AAGTAGTTTCGGCCATGACTGTGGGATTCCACCTGGTAATTCAAACTCAAGGAGCTTCCC
ACGCTTCCTGTAGAACTCCTCCACTGGTTGAGTCATTTTGTGGTAAACCCTGAGTCTTTC
CTTGACAACTTCTTCAGTGTCATCAGCTCGGGTTATAAGCTTAGATTCACAGTTTGGTGG
AGGAAGAAGCGGAGGCATATACATTCTAGGACCAGAATCATCATCACCACCTTTGATATC
AATGCATGCAACGTTATAGTTTGCACCACACTCGCTGCAAATCCTTCTCCCTAGACATTT
CGCAACTAGTGCCTCTTCCTTTAGCTTCAGGTTGATCACTAGATCCACATTAATTACTCC
CTCCAGTATTTCCGCTTGTGTCACGGTTCTTGGAAAACCATCAAGAATGTAACCAGATTC
ACCCTACTCCTTGCCAGCTTCGAGACGCTTTGATAACAAGCTTATAATGAATTCATCAGG
AACCAATTTGCCATGGTTAACAAGCTCCTTTAGCTGAGAGGAGAGGAG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4DN28JQ 770 0 0
CCAGAGT
AAAAGAATATTATTGTCAACGACTAGAATCCACACAAGAAAAAAAAGCCTTCACTATATA
ATGTATTCATTAGTTGTGAAATAAAAATAATAGGGACGTGTATCTTTTATTCACTACCTT
AAGCATATGCACGAGGAGGATTGCTCGAGCAAAGAATGTAGGGAAAAAGTTGTGGAGAAA
TAGAGAGACTAGGCTATTGCAGACTGTTTATCATCTTCAAGGTGTAACGCCCTAAGTAGT
TTCGGCCATGACTGTGGGATTCCACCTGGTAATTCAAACTCAAGGAGCTTCCCACGCTTC
CTGTAGAACTCCTCCACTGGTTGAGTCATTTTGTGGTAAACCCTGAGTCTTTCCTTGACA
ACTTCTTCAGTGTCATCAGCTCGGGTTATAAGCTTAGATTCACAGTTTGGTGGAGGAAGA
AGCGGAGGCATATACATTCTAGGACCAGAATCATCATCACCACCTTTGATATCAATGCAT
GCAACGTTATAGTTTGCACCACACTCGCTGCAAATCCTTCTCCCTAGACATTTCGCAACT
AGTGCCTCTTCCTTTAGCTTCAGGTTGATCACTAGATCCACATTAATTACTCCCTCCAGT
ATTTCCGCTTGTGTCACGGTTCTTGGAAAACCATCAAGAATGTAACCAGATTCACCCTAC
TCCTTGCCAGCTTCGAGACGCTTTGATAACAAGCTTATAATGAATTCATCAGGAACCAAT
TTGCCATGGTTAACAAGCTCCTTTAGCTGAGAGGAGAGGAGAC

QA 8 770 8 770
DS 

RD RR4FJ58TF 768 0 0
CAGTGTCATCAGCTCGGGT*ATAAGCTTAGATTCACAGTTTGGTGGAGGAAGGAGCGGAG
GCATATACATTCTAGGACTAGAATCATCATCACCACTTTTGATATCAATGCATGCAACGT
TATAGTTTGCACCACACTCGCTGCATATTCTTCTCCCTAGACATTTTGCAAGTAGTGCCT
CTTCCTTTAGCTTCAGGTTGATCACTAGATCCACATTAATCACTCCCTCCAGTATCTCCG
CTTGTGTCACGGTTCTTGGAAAACCATCAAGAATGTAACCAGATTCACCCTTCTCCTTGC
CAGCTTCGAGACGCTTTGATAACAAGCTTATAATGAATTCATCAGGAACCAATTTGCCAT
GGTTAACAAGCTCCTTTAGCTGAGAGGAGAGGAGACCAGAGGAGGAAAGCTCTTCGCGTA
CGAGATCACCGGTGGCGATATGAGGAACGCCGAGGAGGGTAGAGAGACGAGAGGCGTAGG
TGCCTTTACCAACACCGGGACATCCAAGAAACACCCAGTGAAAGTTTCTACCTTTGGACG
GAGTAGGAGAAGAAGAAGGAGAGGAAGACTTTTCCAGCTCCGCCGCAGCTTCTTTGAGAT
CGATCTCAGAGTCCAACGATGGCCCATGGGAAGAAGAAGAAGACAGAGACCTGATCAATA
AAGAAGAAAGATTATTCCTTTCCGCCGTCAACGGCGAGAACAGCCTGAAGAGACGGTGAG
AAACCGCCATGAGGAAGAGAACAAAGGTGAATGAATTTGATGGTTTTC

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL1728Contig2 1180 3 6 U
CTCTGACCTTGGAATGCACACAAACCATCAAATTCATTCACCTTTGTTCTCCTCCTCATG
GCGGTTTCTCACCGTCTCTTCAGGCTGTTCTCGCCGTTGACGGCGGAAAAGAATAATCTT
TCTTCTTTATTGATCAGGTCCCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTCTTCTTCT
TCGCATGGGCCATCGCTGGATCCTGAGATCGATATCAAGGAAGCTGCGGCGGAGCTGGAA
AAGTCTTCCTCTCCCTCTCCGACTCCGTCCAAAGGTAGAAACTTTCACTGGGTGTTTCTT
GGATGTCCCGGTGTTGGTAAAGGCACCTACGCCTCTCGTCTTTCTACCCTCCTCGGCGTT
CCTCACATCGCCACCGGTGATCTCGTACGCGAAGAGCTTTCCTCCTCTGGTCTCCTCTCC
TCTCAGCTAAAGGAGCTTGTTAACCATGGCAAATTGGTTCCTGATGAATTCATTATAAGC
TTGTTATCAAAGCGTCTCGAAGCTGGCAAGGAGTAGGGTGAATCTGGTTACATTCTTGAT
GGTTTTCCAAGAACCGTGACACAAGCGGAAATACTGGAGGGAGTAATTAATGTGGATCTA
GTGATCAACCTGAAGCTAAAGGAAGAGGCACTACTTGCAAAATGTCTAGGGAGAAGAATA
TGCAGCGAGTGTGGTGCAAACTATAACGTTGCATGCATTGATATCAAAAGTGGTGATGAT
GATTCTAGTCCTAGAATGTATATGCCTCCGCTCCTTCCTCCACCAAACTGTGAATTTAAG
CTTATAACCCGAGCTGATGACACTGAAGATGTTGTCAAGGAAAGACTCAGGGTTTACCAC
AAAATGACACAACCAGTGGAGGAGTTTTACAGGAAGCGTGGGAAGCTGTTGGAGTTTGAA
TTACCAGGTGGAATCCCACAGTCATGGCCGAAACTACTTAGGGCGTTACACCTTGAAGAT
GATAAACAGTTTGCAATAGCCTAGTCTCTCTATATCTTCACAACTTTTTTTCCTACATTC
TTTGCTCGAGCAATCCTCCTCGTGCATATGCTTAAGATAGTGAATAAAACATATGCGTGT
CCCTATAATTTTTACATCACAATTAATGCATGCATTATATAGTGAAATTTTTTTTTTGTG
TGGATTCTAGTCGTTGACAATAATATTCTTTTTACTCTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DM07TF U 1
AF RR4DN28TF U 1
AF RR4FJ58JQ C 511
BS 1 633 RR4DM07TF
BS 634 634 RR4FJ58JQ
BS 635 638 RR4DM07TF
BS 639 639 RR4FJ58JQ
BS 640 652 RR4DM07TF
BS 653 1180 RR4FJ58JQ

RD RR4DM07TF 652 0 0
CTCTGACCTTGGAATGCACACAAACCATCAAATTCATTCACCTTTGTTCTCCTCCTCATG
GCGGTTTCTCACCGTCTCTTCAGGCTGTTCTCGCCGTTGACGGCGGAAAAGAATAATCTT
TCTTCTTTATTGATCAGGTCCCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTCTTCTTCT
TCGCATGGGCCATCGCTGGATCCTGAGATCGATATCAAGGAAGCTGCGGCGGAGCTGGAA
AAGTCTTCCTCTCCCTCTCCGACTCCGTCCAAAGGTAGAAACTTTCACTGGGTGTTTCTT
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CCTCACATCGCCACCGGTGATCTCGTACGCGAAGAGCTTTCCTCCTCTGGTCTCCTCTCC
TCTCAGCTAAAGGAGCTTGTTAACCATGGCAAATTGGTTCCTGATGAATTCATTATAAGC
TTGTTATCAAAGCGTCTCGAAGCTGGCAAGGAGTAGGGTGAATCTGGTTACATTCTTGAT
GGTTTTCCAAGAACCGTGACACAAGCGGAAATACTGGAGGGAGTAATTAATGTGGATCTA
GTGATCAACCTGAAGCTAAAGGAAGAGGCACTAGTTGCGAAATGTCTAGGGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4DN28TF 617 0 0
CTCTGACCTTGGAATGCACACAAACCATCAAATTCATTCACCTTTGTTCTCCTCCTCATG
GCGGTTTCTCACCGTCTCTTCAGGCTGTTCTCGCCGTTGACGGCGGAAAAGAATAATCTT
TCTTCTTTATTGATCAGGTCCCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTCTTCTTCT
TCGCATGGGCCATCGCTGGATCCTGAGATCGATATCAAGGAAGCTGCGGCGGAGCTGGAA
AAGTCTTCCTCTCCCTCTCCGACTCCGTCCAAAGGTAGAAACTTTCACTGGGTGTTTCTT
GGATGTCCCGGTGTTGGTAAAGGCACCTACGCCTCTCGTCTTTCTACCCTCCTCGGCGTT
CCTCACATCGCCACCGGTGATCTCGTACGCGAAGAGCTTTCCTCCTCTGGTCTCCTCTCC
TCTCAGCTAAAGGAGCTTGTTAACCATGGCAAATTGGTTCCTGATGAATTCATTATAAGC
TTGTTATCAAAGCGTCTCGAAGCTGGCAAGGAGTAGGGTGAATCTGGTTACATTCTTGAT
GGTTTTCCAAGAACCGTGACACAAGCGGAAATACTGGAGGGAGTAATTAATGTGGATCTA
GTGATCAACCTGAAGCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4FJ58JQ 670 0 0
GAGA
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TGGAGGGAGTGATTAATGTGGATCTAGTGATCAACCTGAAGCTAAAGGAAGAGGCACTAC
TTGCAAAATGTCTAGGGAGAAGAATATGCAGCGAGTGTGGTGCAAACTATAACGTTGCAT
GCATTGATATCAAAAGTGGTGATGATGATTCTAGTCCTAGAATGTATATGCCTCCGCTCC
TTCCTCCACCAAACTGTGAATTTAAGCTTATAACCCGAGCTGATGACACTGAAGATGTTG
TCAAGGAAAGACTCAGGGTTTACCACAAAATGACACAACCAGTGGAGGAGTTTTACAGGA
AGCGTGGGAAGCTGTTGGAGTTTGAATTACCAGGTGGAATCCCACAGTCATGGCCGAAAC
TACTTAGGGCGTTACACCTTGAAGATGATAAACAGTTTGCAATAGCCTAGTCTCTCTATA
TCTTCACAACTTTTTTTCCTACATTCTTTGCTCGAGCAATCCTCCTCGTGCATATGCTTA
AGATAGTGAATAAAACATATGCGTGTCCCTATAATTTTTACATCACAATTAATGCATGCA
TTATATAGTGAAATTTTTTTTTTGTGTGGATTCTAGTCGTTGACAATAATATTCTTTTTA
CTCTGG

QA 5 670 5 670
DS 



AS 2 5

CO CL1729Contig1 754 2 1 U
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CTTATATCATAATTATGTGAATGGAAGACATTGGTTTGATGGGTCTGGCCCAAACGTAAG
AGTAGCTTAAATCGAGACTCTGAACTAGTTAAACCGTGACAAGTACATGACGTGTCCATG
GTGCTAACATCTCAAGGATCATATTTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTCAAAACT
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AGAAGATGTCAAACCCTGGATAGTCACAATGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGATTTTATC
TTCAACGATCACTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGACCTGTAGTAAAGCTCCTCGAGAGA
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AATAATTTCTTCTCTTTTAAGTAGAGTTGATGCAGGAGATATGTCTTTTAGTACAGCGTT
TAAGCATGTGGTCGGTTGATCATTGTCCACATTCAATCCCACACCAACACTACAGTGAAA
TTTTCTAGATCTGTAGGTAGAGGTACACAAAATGCCTCCGACTTTAAGGTCATTCAAGTA
AAGATCATTGGGCCACTTTATTTTAACATCTATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C852JQ U 1
AF RR4CG65JQ U 1
BS 1 754 RR4C852JQ

RD RR4C852JQ 754 0 0
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CTTATATCATAATTATGTGAATGGAAGACATTGGTTTGATGGGTCTGGCCCAAACGTAAG
AGTAGCTTAAATCGAGACTCTGAACTAGTTAAACCGTGACAAGTACATGACGTGTCCATG
GTGCTAACATCTCAAGGATCATATTTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTCAAAACT
ATTGCCATCAGGGTGAAGCTCATACATTTGATAATCATCTCCAATAGCCAGCAGATATCC
AGAAGATGTCAAACCCTGGATAGTCACAATGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGATTTTATC
TTCAACGATCACTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGACCTGTAGTAAAGCTCCTCGAGAGA
TTTAAAACCTTGGTCAATGAACAGATCAAAGAATTTCTCGAATTTATGAAAGAAGGCAGC
AATAATTTCTTCTCTTTTAAGTAGAGTTGATGCAGGAGATATGTCTTTTAGTACAGCGTT
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TTTTCTAGATCTGTAGGTAGAGGTACACAAAATGCCTCCGACTTTAAGGTCATTCAAGTA
AAGATCATTGGGCCACTTTATTTTAACATCTATA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4CG65JQ 754 0 0
GCTCATCAAATCACAAACATATAGTATCTTCCTTCAATGACATCCTTTCACATGAAATAA
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CTTATATCATAATTATGTGAATGGAAGACATTGGTTTGATGGGTCTGGCCCAAACGTAAG
AGTAGCTTAAATCGAGACTCTGAACTAGTTAAACCGTGACAAGTACATGACGTGTCCATG
GTGCTAACATCTCAAGGATCATATTTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTCAAAACT
ATTGCCATCAGGGTGAAGCTCATACATTTGATAATCATCTCCAATAGCCAGCAGATATCC
AGAAGATGTCAAACCCTGGATAGTCACAATGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGATTTTATC
TTCAACGATCACTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGACCTGTAGTAAAGCTCCTCGAGAGA
TTTAAAACCTTGGTCAATGAACAGATCAAAGAATTTCTCGAATTTATGAAAGAAGGCAGC
AATAATTTCTTCTCTTTTAAGTAGAGTTGATGCAGGAGATATGTCTTTTAGTACAGCGTT
TAAGCATGTGGTCGGTTGATCATTGTCCACATTCAATCCCACACCAACACTACAGTGAAA
TTTTCTAGATCTGTAGGTAGAGGTACACAAAATGCCTCCGACTTTAAGGTCATTCAAGTA
AAGATCATTGGGCCACTTTATTTTAACATCTATA

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL1729Contig2 1306 3 6 U
GGATCAATTTCATCATTTTCTTTCGATTTTCTTCATGGTTTTACCCAAATTTCATAGATC
TAACTAATTATAACACGACGATTCGAGCAAACTACGAAGGTTGCGACTAATAATCAATAG
AAAAAAGCAAACAGTCATAGTTTTCTCCACCAGAAAGCGACCTCTACCTCTACGTATATG
CAAGTGGCGAACTTGTCTCGTTTCATCTCTCTAACGCCTTTGAGTCGTCTTTCTTTCTCC
GTAGCTGCCGCAGCAATGGATGGTAATGATTCGTGTAGCTTGGTTTTGTGTGGGAAGTCC
TCTGTTGAGAATGATACAGCAAAGCGTTTGAAGAACGACAACGTGCTTAAGCTCCCAGAT
GATTCTCCTAAAGTTTCACTCTTTTAGCTTCCGAGATTAAGAATCTGGATGATGATGATT
CCTTCAATCTTTCACTCTTCATGAACTCGCTTTCAACTTCTCGGTTCGGTCGGTTTCTCA
TTTGGTCTCCCCGCTTGTCTTCCACTCACGATCTTGTTTCTCATAACTTTTCTGAGCTTC
CGGTTGGTTCAGTTTGCGTCTCAGATATTCAGTTTAAGGGTAGAGGCAGAACAAAGAATA
TCTGGGAATCTCCAAAGGGTTGTCTTATGTATTCTTTTACGGTAGAAATGGAAGATGGTC
GAATCGTGCCTTTGATTCAATATGTTGTATCTCTTGCTGTTACTGAGGCACTGAAAGATG
TTTGTGACAACAAGGGTTTGCCGTATATAGATGTTAAAATAAAGTGGCCCAATGATCTTT
ACTTGAATGACCTTAAAGTCGGAGGCATTTTGTGTACCTCTACCTACAGATCTAGAAAAT
TTCACTGTAGTGTTGGTGTGGGATTGAATGTGGACAATGATCAACCGACCACATGCTTAA
ACGCTGTACTAAAAGACATATCTCCTGCATCAACTCTACTTAAAAGAGAAGAAATTATTG
CTGCCTTCTTTCATAAATTCGAGAAATTCTTTGATCTGTTCATTGACCAAGGTTTTAAAT
CTCTCGAGGAGCTTTACTACAGGTCATGGCTTCACAGCGGGCAAAGAGTGATCGTTGAAG
ATAAAATCGAGGACCAAGTTGTTCAAAACATTGTGACTATCCAGGGTTTGACATCTTCTG
GATATCTGCTGGCTATTGGAGATGATTATCAAATGTATGAGCTTCACCTGATGGCATAGT
TTGACTTTTCAAAGTCTAGTCCGAGAAAATATGATCCTTGAGATGTAGCACCATGGACAC
GTCATGTACTGTCACGGTTTACTAGTTCAGAGTCTCGATTAAGCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DI24TF U 1
AF RR4CG65TF U 456
AF RR4C852TF U 456
BS 1 490 RR4DI24TF
BS 491 491 RR4C852TF
BS 492 556 RR4DI24TF
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BS 558 565 RR4DI24TF
BS 566 1306 RR4C852TF

RD RR4DI24TF 565 0 0
GGATCAATTTCATCATTTTCTTTCGATTTTCTTCATGGTTTTACCCAAATTTCATAGATC
TAACTAATTATAACACGACGATTCGAGCAAACTACGAAGGTTGCGACTAATAATCAATAG
AAAAAAGCAAACAGTCATAGTTTTCTCCACCAGAAAGCGACCTCTACCTCTACGTATATG
CAAGTGGCGAACTTGTCTCGTTTCATCTCTCTAACGCCTTTGAGTCGTCTTTCTTTCTCC
GTAGCTGCCGCAGCAATGGATGGTAATGATTCGTGTAGCTTGGTTTTGTGTGGGAAGTCC
TCTGTTGAGAATGATACAGCAAAGCGTTTGAAGAACGACAACGTGCTTAAGCTCCCAGAT
GATTCTCCTAAAGTTTCACTCTTTTAGCTTCCGAGATTAAGAATCTGGATGATGATGATT
CCTTCAATCTTTCACTCTTCATGAACTCGCTTTCAACTTCTCGGTTCGGTCGGTTTCTCA
TTTGGTCTCCTCGCTTGTCTTCCACTCACGATCTTGTTTCTCATAACTTTTCTGAGCTTC
CGGTTGGTTCAGTTTGTGTCTCAGA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4CG65TF 632 0 0
G
CTTCTCGGTTCGGTCGGTTTCTCATTTGGTCTCCCCGCTTGTCTTCCACTCACGATCTTG
TTTCTCATAACTTTTCTGAGCTTCCGGTTGGTTCAGTTTGCGTCTCAGATATTCAGTTTA
AGGGTAGAGGCAGAACAAAGAATATCTGGGAATCTCCAAAGGGTTGTCTTATGTATTCTT
TTACGGTAGAAATGGAAGATGGTCGAATCGTGCCTTTGATTCAATATGTTGTATCTCTTG
CTGTTACTGAGGCACTGAAAGATGTTTGTGACAACAAGGGTTTGCCGTATATAGATGTTA
AAATAAAGTGGCCCAATGATCTTTACTTGAATGACCTTAAAGTCGGAGGCATTTTGTGTA
CCTCTACCTACAGATCTAGAAAATTTCACTGTAGTGTTGGTGTGGGATTGAATGTGGACA
ATGATCAACCGACCACATGCTTAAACGCTGTACTAAAAGACATATCTCCTGCATCAACTC
TACTTAAAAGAGAAGAAATTATTGCTGCCTTCTTTCATAAATTCGAGAAATTCTTTGATC
TGTTCATTGACCAAGGTTTTAAATCTCTCGAGGAGCTTTACTACAGGTCATGGCTTCACA
GCGGGCAAAGAGTGATCGTTGAAGATAAAAT

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR4C852TF 851 0 0
G
CTTCTCGGTTCGGTCGGTTTCTCATTTGGTCTCCCCGCTTGTCTTCCACTCACGATCTTG
TTTCTCATAACTTTTCTGAGCTTCCGGTTGGTTCAGTTTGCGTCTCAGATATTCAGTTTA
AGGGTAGAGGCAGAACAAAGAATATCTGGGAATCTCCAAAGGGTTGTCTTATGTATTCTT
TTACGGTAGAAATGGAAGATGGTCGAATCGTGCCTTTGATTCAATATGTTGTATCTCTTG
CTGTTACTGAGGCACTGAAAGATGTTTGTGACAACAAGGGTTTGCCGTATATAGATGTTA
AAATAAAGTGGCCCAATGATCTTTACTTGAATGACCTTAAAGTCGGAGGCATTTTGTGTA
CCTCTACCTACAGATCTAGAAAATTTCACTGTAGTGTTGGTGTGGGATTGAATGTGGACA
ATGATCAACCGACCACATGCTTAAACGCTGTACTAAAAGACATATCTCCTGCATCAACTC
TACTTAAAAGAGAAGAAATTATTGCTGCCTTCTTTCATAAATTCGAGAAATTCTTTGATC
TGTTCATTGACCAAGGTTTTAAATCTCTCGAGGAGCTTTACTACAGGTCATGGCTTCACA
GCGGGCAAAGAGTGATCGTTGAAGATAAAATCGAGGACCAAGTTGTTCAAAACATTGTGA
CTATCCAGGGTTTGACATCTTCTGGATATCTGCTGGCTATTGGAGATGATTATCAAATGT
ATGAGCTTCACCTGATGGCATAGTTTGACTTTTCAAAGTCTAGTCCGAGAAAATATGATC
CTTGAGATGTAGCACCATGGACACGTCATGTACTGTCACGGTTTACTAGTTCAGAGTCTC
GATTAAGCTA

QA 2 851 2 851
DS 



AS 1 5

CO CL1730Contig1 1130 5 7 U
AGCATATCAATATTTATAAAACCAAATGGATTCAAGGAAAACATCAACTTCACAAGATCA
TTATTCTCACGGCTTCTTTTCATTAGCTATTTTACATATGAAACCAAGAAACTAAGTAAA
GAAACAGAAGATAACACAAGAGAAAGCAGAAGAAGACTCTGCATTCACACCACAACCACA
AGACAAACCTTCTTAAACCACACAAGACTCCTCAGTACCTCTTTCACTCTTCAACATCAA
CCACCACACAATACTCATAGCAAATCCCTCACCAGAGCATATTCCTCAACATACTCCACC
CAGCATTCTCTACATACTCACACTTCCATCTGGACCCTCTTCACCCGGTTGTTGAGGCGG
CAATGGAGGGTCACACACCGGCGTTGGATGCCTTATGTCAAAGTTCCATGAGTGGAGAAG
ATGTGCATTGGAAGAGCTCCCGTTCGTAGAGCTTAAACCCACCACGAACTCACCACCTTT
CAGTATCTCCTCCAAGTCTACAGAGAACTCAAAGAACGGATCCAACATCTTTCTCGTGCC
TAATTTT*CTGAACCGAACCATCATTCTCTTCAAACTCGCCTCATACTCAATCATACAGC
TCAACGTCCCTCCATTCTCCACCAACAAGTCACCCTCAAACGAAAGGTTTCTAATTTCGG
AAGATTCAGGTTTACCTATCAAGATCCTTGCACGGTTTCCTCTACTGGAAATATCAAACT
CAAAAGCCACAACTGTCTCGTTCTTTGCATGCTCAAACAAAAACCCTAAGGCAGAGGAAC
TTTTGTTTTCTTTAC*CGAACATACTAAGATCCAAACTAGTTGGAACGATTACAAAAGCC
ATGACACCATCGGTCTCGTTAGGCATGGAAAACGAGAAGTGAGTCGAGAAAGATAACGAG
TTACTACGACTCTCTTCACCTCGGAAAAGATTGATGGGTTCCTTGTAAACGACTCTTCCC
TCGCTTCCACTCACCGAGTTTGTCAGCTGAATCGAAGAACCTTCGTTGATCAGCTTCGAA
TCTCCAAACAGTTCAACTTCCTCGTCAAAACTCATAGGTTTGAACATCTTTGTTTTCTTG
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTGGTGGTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 15 15 30 15 15 30 15 15 15 15 30 30 30 15 15 30 15 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW47JQ U 37
AF RR4ET38JQ U 64
AF RR4B377JQ U 1
AF RR4B377TF C 462
AF RR4AW47TF C 570
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CTCTTCACCCGGTTGTTGAGGCGGCAATGGAGGGTCACACACCGGCGTTGGATGCCTTAT
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AC

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DS 

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ATA
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GAAGATAACACAAGAGAAAGCAGAAGAAGACTCTGCATTCACACCACAACCACAAGACAA
ACCTTCTTAAACCACACAAGACTCCTCAGTACCTCTTTCACTCTTCAACATCAACCACCA
CACAATACTCATAGCAAATCCCTCACCAGAGCATATTCCTCAACATACTTCACCCAGCAT
TCTCTACATACTCACACTTCCATCTGGACCCTCTTCACCCGGTTGTTGAGGCGGCAATGG
AGGGTCACACACCGGCGTTGGATGCCTCATGTCAAAGTTCCATGAGTGGAGAAGATGTGC
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CTCCTCCAAGTCTACAGAGAACTCAAAGAACGGATCCAACATCTTTCTCGTGCCTAATTT
T*CTGAACCGAACCATCATTCTCTTCAAACTCGCCTCATACTCAATCATACAGCTCAACG
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CTGA

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CCACCACACAATACTCATAGCAAATCCCTCACCAGAGCATATTCCTCAACATACTCCACC
CAGCATTCTCTACATACTCACACTTCCATCTGGACCCTCTTCACCCGGTTGTTGAGGCGG
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TAATTTT*CTGAACCGAACCATCATTCTCTTCAAACTCGCCCCATACTCAATCATACAGC
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AAGATTCAGGTTTACCTATCAAGATCCTTGCACGGTTTCCTCTACTGGAAATATCAAACT
CAAAAGCCACAACTGTCTCGTTCTTTGCATGCTCAAACAAAAACCCTAAGGCAGAGGAAC
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ATGACACCATCGGTCTCGTTAGGCATGGAAAACGAGAAGTGAGTCGAGAAAGATAACGAG
TTACTACGACTCT
CT

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CCATACTCAATCATACAGCTCAACGTCCCTCCGTTCTCCACCAACAAGTCACCCTCAAAC
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AACCCTAAGGCAGAGGAACTTTTGTTTTCTTTAC*CGAACATACTAAGATCCAAACTAGT
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CC

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ACTCATAGGTTTGAACATCTTTGTTTTCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTGGTGTGGTGGTTCTTCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 6

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TACTCCTGAATCCAATGGAACACCAAAAAAGAGTAAGAAGAAGCCCATTTCTGTGGAAGG
TAATGGTGACAAAGTAGAAGTAGGTAGGGAAGTGTTGGTTAATGGTGACAATGGAGGAGA
AGATAGGCAAGTGTTGGCTGGTGGTGAAAAGGGAAGAGAAGATAGAGAGGTGTTGGTTAA
TGGTGACAAGGTTGAAGAAGATAAGGAAGTATTGACGAATGCAGGAGGAGCTTCCAAGTC
TCTTGGTGTGATGAGAGCATCTGACTGGTTTGAACACTCGTTTCTTGTAGGATCTATTGC
GGGTTTAGGTGTGAGTGAACAGTTCGTGAAAGAGAAATGGAGTATGGTGACTGTGGAGAC
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GCAAAAGACTGACTTTATGCGTGAGATAGGCTCTGTGATTGCTGAAGCATCTTAAGAAGA
AGCCATTAGGTTTTCTTACTGGGTTTCGCTTTAAATGGAGATGCAATACTAGTTTCGTTA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C254TF U 1
AF RR4C266TF U 1
AF RR4DZ50TF U 436
AF RR4C254JQ C 395
AF RR4DZ50JQ C 440
AF RR4C266JQ C 411
BS 1 97 RR4C254TF
BS 98 98 RR4C266TF
BS 99 583 RR4C254TF
BS 584 584 RR4C266TF
BS 585 648 RR4C254TF
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BS 650 1054 RR4DZ50TF
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RD RR4C254TF 648 0 0
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GAACTCACCAGTAAGTCGATTAGCTTTGAGGCTAGTAAGATCCAGTTCGTGGATAAGATT
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AAATCTCATGATATTCAATGTTTGAAACTGGCCAAGTATATTTTGGGGATCTCATGGTAT
GGCTCTCGATTCTAATGTCAAGAAGACTGAGAAGAAAGTGGCTGCAGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4C266TF 649 0 0
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TTGGAAGATCCACCGACGGCGTCTTCAAGCGACGAAGATGAATTGGAGCCGCTGCCCGGA
GACGACGAAGAAGAACAGATCTCCGACGATTCTTCGTCCGACGATCTCATGAGTCCAGTC
AACATTCCGTCCGCGAAGAAGTCCAAATCTGAGAAGCCGATCGCCGTCACCGTGAAGAAG
CGGCCGATCGAAACGACCTCAGTTAGTGCAAAACGAGCCAAAACTGCAGAGGAGGCTAAG
AAACCGACGACGTTTCAGAGGCTGTGGAGCGAAGAAGACGAGATCTCAGTGCTTCAAGGT
ATGATCGATTTCAAAGCTGATACAGGGAAGAGTCCGTACGAAGACATGGATAGGTTTTAC
GAACTCACCAGTAAGTCGATTAGCTTTGAGGCTAGTAAGATCCAGTTCGTGGATAAGATT
AGGTCTTTGAAGAGGAAGTATATTGGGAAAGTGATGAAGCAAGGTGTTGAGTCTTTGACT
AAATCTCATGATATTCAATGTTTGAAACTGGCCAAGTATATTT*GGGGATCTCATGGTAT
GGCTCTCGATTCTAATGTCAAGAAGACTGAGAAGAAAGTGGCTGCAGAA

QA 1 649 1 649
DS 

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G
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AGTATATTGGGAAAGTGATGAAGCAAGGTGTTGAGTCTTTGACTAAAGCTCATGATATTC
AATGTTTGAAACTGGCCAAGTATATTT*GGGGATCTCATGGTATGGCTCTCGATTCTAAT
GTCAAGAAGACTGAGAATAAAGTGGCTGCAGAAGAAGAAGTTGTTACTCCTGAATCCAAT
GGAACACCAAAAAAGAGTAAGAAGAAGCCCATTTCTGTGGAAGGTAATGGTGACAAAGTA
GAAGTAGGTAGGGAAGTGTTGGTTAATGGTGACAATGGAGGAGAAGATAGGCAAGTGTTG
GCTGGTGGTGAAAAGGGAAGAGAAGATAGAGAGGTGTTGGTTAATGGTGACAAGGTTGAA
GAAGATAAGGAAGTATTGACGAATGCAGGAGGAGCTTCCAAGTCTCTTGGTGTGATGAGA
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GAGAAGTGGAAGTTATTA

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DS 

RD RR4C254JQ 878 0 0
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AGTATATTT*GGGGATCTCATGGTATGGCTCTCGATTCTAATGTCAAGAAGACTGAGAAG
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AAGAAGAAGCCCATTTCTGTGGAAGGTAATGGTGACAAAGTAGAAGTAGGTAGGGAAGTG
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AGAGAGGATAGAGAGGTGTTGGTTAATGGTGACAAGGTTGAAGAAGATAAGGAAGTATTG
ACGAATGCAGGAGGAGCTTCCAAGTCTCTTGGTGTGATGAGAGCATCTGACTGGTTTGAA
CACTCGTTTCTTGTAGGATCTATTGCGGGTTTAGGTGTGAGTGAACAGTTCGTGAAAGAG
AAATGGAGTATGGTGACTGTGGAGACAAAGAAGAGAATGGAAGAGAAGTGGAAGTTATTA
CAGGCCAAAGAAATGGAACTTGTGCTGCAAAAGACTGACTTTATGCGTGAGATAGGCTCT
GTGATTGCTGAAGCATCTTAAGAAGAAGCCATTAGGTTTTCTTACTGGGTTTCGCTTTAA
ATGGAGATGCAATACTAGTTTCGTTATCTTTCTACATGACTTTATGGTTTTCTAGTTGAT
CTTGTGAGTTCTTGCTTATTTATGTAAAAACTCCATGG

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DS 

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A
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TATTGGGAAAGTGATGAAGCAAGGTGTTGAGTCTTTGACTAAAGCTCATGATATTCAATG
TTTGAAACTGGCCAAGTATATTT*GGGGATCTCATGGTATGGCTCTCGATTCTAATGTCA
AGAAGACTGAGAATAAAGTGGCTGCAGAAGAAGAAGTTGTTACTCCTGAATCCAATGGAA
CACCAAAAAAGAGTAAGAAGAAGCCCATTTCTGTGGAAGGTAATGGTGACAAAGTAGAAG
TAGGTAGGGAAGTGTTGGTTAATGGTGACAATGGAGGAGAAGATAGGCAAGTGTTGGCTG
GTGGTGAAAAGGGAAGAGAAGATAGAGAGGTGTTGGTTAATGGTGACAAGGTTGAAGAAG
ATAAGGAAGTATTGACGAATGCAGGAGGAGCTTCCAAGTCTCTTGGTGTGATGAGAGCAT
TTGACTGGTTTGAACACTCGTTTCTTGTAGGATCTATTGCGGGTTTAGGTGTGAGTGAAC
AGTTCGTGAAAGAGAAATGGAGTATGGTGACTGTGGAGACAAAGAAGAGAATGGAAGAGA
AGTGGAAGTTATTACAGGCCAAAGAAATGGAACTTGTGTTGCAAAAGACTGACTTTATGC
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GGGTTTCGCTTTAAATGGAGATGCAATACTAGTTTCGTTATCTTTCTACATGACTTTATG
GTTTTCTAGTTGATCTTGTGAGTTCTTGCTTATTTATGTAAAAACTCCATGG

QA 2 833 2 833
DS 

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TAGGT
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AGATTAGGTCTTTGAAGAGGAAGTATATTGGGAAAGTGATGAAGCAAGGTGTTGAGTCTT
TGACTAAATCTCATGATATTCAATGTTTGAAACTGGCCAAGTATATTT*GGGGATCTCAT
GGTATGGCTCTCGATTCTAATGTCAAGAAGACTGAGAAGAAAGTGGCTGCAGAAGAAGAA
GTTGTTACTCCTGAATCCAATGGAACACCAAAAAAGAGTAAGAAGAAGCCCATTTCTGTG
GAAGGTAATGGTGACAAAGTAGAAGTAGGTAGGGAAGTGTTGGTTAATGGTGACAATGGA
GGAGAAGATAGGCAAGTGTTGGCTGGTGGTGAAAAGGGAAGAGAGGATAGAGAGGTGTTG
GTTAATGGTGACAAGGTTGAAGAAGATAAGGAAGTATTGACGAATGCAGGAGGAGCTTCC
AAGTCTCTTGGTGTGATGAGAGCATCTGACTGGTTTGAACACTCGTTTCTTGTAGGATCT
ATTGCGGGTTTAGGTGTGAGTGAACAGTTCGTGAAAGAGAAATGGAGTATGGTGACTGTG
GAGACAAAGAAGAGAATGGAAGAGAAGTGGAAGTTATTACAGGCCAAAGAAATGGAACTT
GTGCTGCAAAAGACTGACTTTATGCGTGAGATAGGCTCTGTGATTGCTGAAGCATCTTAA
GAAGAAGCCATTAGGTTTTCTTACTGGGTTTCGCTTTAAATGGAGATGCAATACTAGTTT
CGTTATCTTTCTACATGACTTTATGGTTTTCTAGTTGATCTTGTGAGTTCTTGCTTATTT
ATGTAAAAACTCCATGG

QA 6 862 6 862
DS 



AS 1 5

CO CL1732Contig1 1130 5 9 U
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TTTGTTGCACATCAGGGAACTCTGCGACCAGGTTCTGTCTCTTGCCGAGTACAGAGCTCA
GCTTTACGACTACCTGAAGAGTAGAATGAACACAATCGCACCGAATCTGACTGCCCTCGT
TGGAGAGCTTGTCGGTGCTCGTCTGATTTCTCATGGGGGTAGTCTGTTGAACCTCTCAAA
GCAGCCTGGGAGCACAGTTCAGATTCTTGGAGCTGAGAAGGCTCTATTTAGAGCCCTCAA
GACTAAACACAACACTCCTAAATACGGTCTGATTTACCATGCTTCTCTCGTTGGCCAAGC
TGCACCCAAGGACAAGGCTAAGATCTCACGTTCGCTAGCTGCAAAAGCTGCCCTTGCTAT
CCGGTGTGATGCTCTTGGTGATAGCGAAGACAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAA
GGTTGAAACACGGTTGAGAAGTCTGGAAGGGAAAGACATGGGACGTCTGTCTGGTTCAGC
TAAAGGCAAACCAAAGATTGAAGTTTATGACAAGGATAAGAAGATTGGATCTGGAGGTCT
GATCACTCCTGCTAAGACTTACAACGCTGCTGCAGACTCTCTTCTTGGACAAACTTCCGC
AGCTGAGAACGGTGCCAAGGAGAAGAAAGATAAAAAGAAAAAGAAGAAGGCTGATGATGC
AGAGGAAGAAGAAGCCAAAACCGAAGAACCTTCTAAGAAGAAGTCGAAGAAGAAGAAAAC
AGAAGTAGAAGCTGAAGCCGAAGAGCCCAAAACCGAGGAACCTTCAAAGAAGAAGAAGAA
GAGGAAACACGAGGAGGAAGAAACAGAAATGCCTGCCAAGAAGAAAGAAAAGAAAGATAA
AAAGAAAAAGAAGAGTGAGGTCTGAAGACAGGTTTAAAGTTTTGAATGTGTACGCTTATT
ATCTTTATAACGTTTTTTATCAGGAACAAAAAAAAGTCCACAAAAAATGTCCTGTTTTTG
TTTTGGTTTAAGAACTACTGCTCATGGTTTTTGTAAGGTTAAGGTATGTGGTTTAGTCAT
TTTCCTAGAGACATTTCTACTTAACTAATAGTATAAGTTAAGCATTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG64TF U 376
AF RR4GS67JQ C 414
AF RR4FL54TF U 1
AF RR4EG51TF U 134
AF RR4FL54JQ C 445
BS 1 192 RR4FL54TF
BS 193 193 RR4EG51TF
BS 194 393 RR4FL54TF
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BS 694 785 RR4EG51TF
BS 786 1130 RR4FL54JQ

RD RR4EG64TF 163 0 0
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TGGTGATAGCGAAGACAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAAGGTTGAAACACGGTT
GAGAAGTCTGGATGGGAAAGACATGGGACGTCTGTCTGGTTCA

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR4GS67JQ 191 0 0
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GTTTAAAGGTTGAAACACGGTTGAGAAGTCTGGAAGGGAAAGACATGGGACGTCTGTCTG
GTTCAGCTAAAGGCAAACCAAAGATTGAAGTTTATGACAAGGATAAGAAGATTGGATCTG
GAGGTCTGATC

QA 1 191 1 191
DS 

RD RR4FL54TF 693 0 0
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TTTGTTGCACATCAGGGAACTCTGCGACCAGGTTCTGTCTCTTGCCGAGTACAGAGCTCA
GCTTTACGACTACCTGAAGAGTAGAATGAACACAATCGCACCGAATCTGACTGCCCTCGT
TGGAGAGCTTGTTGGTGCTCGTCTGATTTCTCATGGGGGTAGTCTGTTGAACCTCTCAAA
GCAGCCTGGGAGCACAGTTCAGATTCTTGGAGCTGAGAAGGCTCTATTTAGAGCCCTCAA
GACTAAACACAACACTCCTAAATACGGTCTGATTTACCATGCTTCTCTCGTTGGCCAAGC
TGCACCCAAGGACAAGGCTAAGATCTCACGTTCACTAGCTGCAAAAGCTGCCCTTGCTAT
CCGGTGTGATGCTCTTGGTGATAGCGAAGACAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAA
GGTTGAAACACGGTTGAGAAGTCTGGAAGGGAAAGACATGGGACGTCTGTCTGGTTCAGC
TAAAGGCAAACCAAATATTGAAGTTTATGACAAGGATAAGAAGATTGGATCTGGAGGTCT
GATCACTCCTGCTAAGACTTACAACGCTGCTGCAGACTCTCTTCTTGGACAAACTTCCGC
AGCTGAGAACGGTGCCAAGGAGAAGAAAGATAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4EG51TF 662 0 0
GG
GAAGAGTAGAATGAACACAATCGCACCGAATCTGACTGCCCTCGTTGGAGAGCTTGTCGG
TGCTCGTCTGATTTCTCATGGGGGTAGTCTGTTGAACCTCTCAAAGCAGCCTGGGAGCAC
AGTTCAGATTCTTGGAGCTGAGAAGGCTCTATTTAGAGCCCTCAAGACTAAACACAACAC
TCCTAAATACGGTCTGATTTACCATGCTTCTCTCGTTGGCCAAGCTGCACCCAAGGACAA
GGCTAAGATCTCACGTTCGCTAGCTGCAAAAGCTGCCCTTGCTATCCGGTGTGATGCTCT
TGGTGATAGCGAAGACAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAAGGTTGAAACACGGTT
GAGAAGTCTGGATGGGAAAGACATGGGACGTCTGTCTGGTTCAGCTAAAGGCAAACCAAA
GATTGAAGTTTATGACAAGGATAAGAAGATTGGATCTGGAGGTCTGATCACTCCTGCTAA
GACTTACAACACTGCTTCAGACTCTCTTCTTGGACAAACTTCCGCAGCTGAGAACGGTGC
CAAGGAGAAGAAAGATAAAAAGAAAAAGAAGAAGGCTGATGATGCAGAGGAAGAAGAAGC
CAAAACCGAAGAACCTTCTAAGAAGAAGTCGAAGAAGAAGAAAACAGAAG
CTGAAGCCGA

QA 3 652 3 652
DS 

RD RR4FL54JQ 686 0 0
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GGAAGGGAAAGACATGGGACGTCTGTCTGGTTCAGCTAAAGGCAAACCAAATATTGAAGT
TTATGACAAGGATAAGAAGATTGGATCTGGAGGTCTGATCACTCCTGCTAAGACTTACAA
CGCTGCTGCAGACTCTCTTCTTGGACAAACTTCCGCAGCTGAGAACGGTGCCAAGGAGAA
GAAAGATAAAAAGAAAAAGAAGAAGGCTGATGATGCAGAGGAAGAAGAAGCCAAAACCGA
GGAACCTTTTAAGAAGAAGTCGAAGAAGAAGAAAACAGAAGTAGAAGCTGAAGCCGAAGA
GCCCAAAACCGAGGAACCTTCAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAACACGAGGAGGAAGAAAC
AGAAATGCCTGCCAAGAAGAAAGAAAAGAAAGATAAAAAGAAAAAGAAGAGTGAGGTCTG
AAGACAGGTTTAAAGTTTTGAATGTGTACGCTTATTATCTTTATAACGTTTTTTATCAGG
AACAAAAAAAAGTCCACAAAAAATGTCCTGTTTTTGTTTTGGTTTAAGAACTACTGCTCA
TGGTTTTTGTAAGGTTAAGGTATGTGGTTTAGTCATTTTCCTAGAGACATTTCTACTTAA
CTAATAGTATAAGTTAAGCATTTGGT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 5

CO CL1733Contig1 1139 5 34 U
AGATGACTTTCAAAATCCATACAGAAAAACAGAGAATATTACATTATAACTCTGGTCATG
ATGAATACACAGCTGCTAATTTGAGACCTCAAAATCACCCCCCAACTTCTTTCCTTTTGG
GGCAGACAAAAAAACACAAACCACTAATCGATTGTGATCTAAGAAGACAACAAGAAGTGA
TCACTCTCTAGTCACTAAGTACAAGTCTGCTTATGAATGGGGTCATGGCTGCAAGAAGCG
CCTTTGGACACTCCTCATGCGGCAGATGACCACATCCTGAGATTGCTACTAGCCTAGAGT
TGAAGAGTTTTGAAGCCATGACTTGGGAGGACTTGAGGGGAACAAGTGCGTCCTCAGCTC
CAGCAACGACTAATACTGGTAAGCTTTCCACTGCCTTGAGAAGCGACTGTGCATTTTGAG
TCGAAAGCACCATCTCGGATGAGAGTCTACCTATCTCGTGAAGTGCCTCGTCCCAGCCTT
CGACATGGAGCGGTGCCTTGTATAGCTTTAAGACATCTGTTGTCATCTTGGCAGGATCAT
ACCAAGCTCGTCGGTTCACCACCTGAGCTATCTCAGTTCGGAGTAGCGGACGAACAAGGT
GTTTCTTTCCTAGTGATGTGTGCAGAAGTATTCTTGCAAAAGCTGGGACTACTTCCCTCG
TCAAGCTTACGTTAAGCAAAACCACTCCTTTCACTTTGATAGTGGCGGCGGCATCTACCA
ATCTTTGTGCAGCCTTGAGAGCAATCAAACCTCCATCATCATGGCCAACCAAGACTACCG
AAGCAAATCCCATTTCACGGCAAAAAGCAACAAGCATGTCAACCTGATTTTCCAGAGTGT
AAGGGTTTGGCAAATCTCTTTCCTCCAAATCCTTGATATGAGGCCTAGCGGTTAATCCCC
AACCAGGCCTATCAAAAGCAGTGACAAGACAGCCAAGCTGGTGGGCGAGAGAAGGCATCA
CGTTCCTCCAAGAGAAGACCCCACCTCCAAATCCATGAACCAGCACTACACCAAATTGAC
CGCTTCCATCTGAGGGATCTTGCTGCTCCCCACAACTGGATGCATTCACGTCATCTGCTT
ATTCTTGAGTGTCTTTGAAAAGAAGAGGAGAAGTGGGAGAAGCCTCAAGGAGAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EB74JQ U 1
AF RR4AS35JQ U 18
AF RR4B339JQ U 18
AF RR4B339TF C 259
AF RR4AS35TF C 328
BS 1 45 RR4EB74JQ
BS 46 47 RR4AS35JQ
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BS 741 839 RR4B339JQ
BS 840 1139 RR4B339TF

RD RR4EB74JQ 713 0 0
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GGCAGACAAAAAAAAAGAAACCACTAATCGATTGTGATCTAAAAAGACAACAAGAAGTGA
TCACTCTCTAGTCACTAAGTACAAGTCTGCTTATGAATGGGGTCATGGCTGCAAGAAGCG
CCTTTGGACACTCCTCATGCGGCAGATGACCACATCCTGAGATTGCTACTAGCCTAAAGT
TGAAGAGTTTTGAAGCCATGACTTGGGAGGACTTGAGGGGAACAAGTGCGTCCTCAGCTC
CAGCAACGACTAATACTGGTAAGCTTTCCACTGCCTTGAGAAGCGACTGTTCATTTTGAG
TCGAAAGCACCATCTCGGATGAAAGTCTACCTATCTCGTGAAGTGCCTCGTCCCAGCCTT
CGACATGGAGCGGTGCCTTGTATAGCTTTAAGACATCTGCTGTCATCTTGGCAGGATCAT
ACCAAGCTCGTCGGTTCACCACCTGAGCTATCTCAGTTCGCAGTAGCGGGCGAACAAGGT
GTTTCTTTCCTAGTGATGTGTGCAGAAGTATTCTTGCAAAAGCTGGGACTACTTCCCTCG
TCAAGCTTACATTAAGCAAAACCACTCCTTTCACTTTGATAGTGG
TCGATGCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4AS35JQ 723 0 0
GCAAAATCCAT
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TCAAAATCACCCCCCAACTTCTTTCCTTTTGGGGCAGACAAAAAAACACAAACCACTAAT
CGATTGTGATCTAAGAAGACAACAAGAAGTGATCACTCTCTAGTCACTAAGTACAAGTCT
GCTTATGAATGGGGTCATGGCTGCAAGAAGCGCCTTTGGACACTCCTCATGCGGCAGATG
ACCACATCCTGAGATTGCTACTAGCCTAGAGTTGAAGAGTTTTGAAGCCATGACTTGGGA
GGACTTGAGGGGAACAAGTGCGTCCTCAGCTCCAGCAACGACTAATACTGGTAAGCTTTC
CACTGCCTTGAGAAGCGACTGTGCATTTTGAGTCGAAAGCACCATCTCGGATGAGAGTCT
ACCTATCTCGTGAAGTGCCTCGTCCCAGCCTTCGACATGGAGCGGTGCCTTGTATAGCTT
TAAGACATCTGTTGTCATCTTGGCAGGATCATACCAAGCTCGTCGGTTCACCACCTGAGC
TATCTCAGTTCGGAGTAGCGGACGAACAAGGTGTTTCTTTCCTAGTGATGTGTGCAGAAG
TATTCTTGCAAAAGCTGGGACTACTTCCCTCGTCAAGCTTACGTTAAGCAAAACCACTCC
TTTCACTTTGATAGTGGCGGCGGCATCTACCAATCTTTGTGCAGCCTTGAGA

QA 12 723 12 723
DS 

RD RR4B339JQ 822 0 0
GCAAAATCCAT
ACAGAGAATATTACATTATAACTCTGGTCATGATGAATACACAGCTGCTAATTTGAGACC
TCAAAATCACCCCCCAACTTCTTTCCTTTTGGGGCAGACAAAAAAACACAAACCACTAAT
CGATTGTGATCTAAGAAGACAACAAGAAGTGATCACTCTCTAGTCACTAAGTACAAGTCT
GCTTATGAATGGGGTCATGGCTGCAAGAAGCGCCTTTGGACACTCCTCATGCGGCAGATG
ACCACATCCTGAGATTGCTACTAGCCTAGAGTTGAAGAGTTTTGAAGCCATGACTTGGGA
GGACTTGAGGGGAACAAGTGCGTCCTCAGCTCCAGCAACGACTAATACTGGTAAGCTTTC
CACTGCCTTGAGAAGCGACTGTGCATTTTGAGTCGAAAGCACCATCTCGGATGAAAGTCT
ACCTATCTCGTGAAGTGCCTCGTCCCAGCCTTCGACATGGAGCGGTGCCTTGTATAGCTT
TAAGACATCTGTTGTCATCTTGGCAGGATCATACCAAGCTCGTCGGTTCACCACCTGAGC
TATCTCAGTTCGGAGTAGCGGACGAACAAGGTGTTTCTTTCCTAGTGATGTGTGCAGAAG
TATTCTTGCAAAAGCTGGGACTACTTCCCTCGTCAAGCTTACGTTAAGCAAAACCACTCC
TTTCACTTTGATAGTGGCGGCGGCATCTACCAATCTTTGTGCAGCCTTGAGAGCAATCAA
ACCTCCATCATCATGGCCAACCAAGACTACCGAAGCAAATCCCATTTCACGGCAAAAAGC
AACAAGCATGTCAACCTGATTTTCCAGAGTG

QA 12 822 12 822
DS 

RD RR4B339TF 881 0 0
TGC
GCAGATGACCACATC*TGAGATTGCTACTAGC*TAGAGTTGAAGAGTTT*GAAGCCATGA
CTTGGGAGGACTTGAGGGGAACAAGTGCGTC*TCAGCTCCAGCAACGACTAATACTGGTA
AGCTTTCCACTGCCTTGAGAAGCGACTGTGCATTTTGAGTCGAAAGCACCATCTCGGATG
AGAGTCTACCTATCTCGTGAAGTGCCTCGTCCCAGCCTTCGACATGGAGCGGTGCCTTGT
ATAGCTTTAAGACATCTGTTGTCATCTTGGCAGGATCATACCAAGCTCGTCGGTTCACCA
CCTGAGCTATCTCAGTTCGGAGTAGCGGACGAACAAGGTGTTTCTTTCCTAGTGATGTGT
GCAGAAGTATTCTTGCAAAAGCTGGGACTACTTCCCTCGTCAAGCTTACGTTAAGCAAAA
CCACTCCTTTCACTTTGATAGTGGCGGCGGCATCTACCAATCTTTGTGCAGCCTTGAGAG
CAATCAAACCTCCATCATCATGGCCAACCAAGACTACCGAAGCAAATCCCATTTCACGGC
AAAAAGCAACAAGCATGTCAACCTGATTTTCCAGAGTGTAAGGGTTTGGCAAATCTCTTT
CCTCCAAATCCTTGATATGAGGCCTAGCGGTTAATCCCCAACCAGGCCTATCAAAAGCAG
TGACAAGACAGCCAAGCTGGTGGGCGAGAGAAGGCATCACGTTCCTCCAAGAGAAGACCC
CACCTCCAAATCCATGAACCAGCACTACACCAAATTGACCGCTTCCATCTGAGGGATCTT
GCTGCTCCCCACAACTGGATGCATTCACGTCATCTGCTTATTCTTGAGTGTCTTTGAAAA
GAAGAGGAGAAGTGGGAGAAGCCTCAAGGAGAGGATCC

QA 4 881 4 881
DS 

RD RR4AS35TF 812 0 0
AGGACTTGAGGGGAACAAGTGCGTCCTCAGCTCCAGCAACGACTAATACTGGTAAGCTTT
CCACTGCCTTGAGAAGCGACTGTGCATTTTGAGTCGAAAGCACCATCTCGGATGAGAGTC
TACCTATCTCGTGAAGTGCCTCGTCCCAGCCTTCGACATGGAGCGGTGCCTTGTATAGCT
TTAAGACATCTGTTGTCATCTTGGCAGGATCATACCAAGCTCGTCGGTTCACCACCTGAG
CTATCTCAGTTCGGAGTAGCGGACGAACAAGGTGTTTCTTTCCTAGTGATGTGTGCAGAA
GTATTCTTGCAAAAGCTGGGACTACTTCCCTCGTCAAGCTTACGTTAAGCAAAACCACTC
CTTTCACTTTGATAGTGGCGGCGGCATCTACCAATCTTTGTGCAGCCTTGAGAGCAATCA
AACCTCCATCATCATGGCCAACCAAGACTACCGAAGCAAATCCCATTTCACGGCAAAAAG
CAACAAGCATGTCAACCTGATTTTCCAGAGTGTAAGGGTTTGGCAAATCTCTTTCCTCCA
AATCCTTGATATGAGGCCTAGCGGTTAATCCCCAACCAGGCCTATCAAAAGCAGTGACAA
GACAGCCAAGCTGGTGGGCGAGAGAAGGCATCACGTTCCTCCAAGAGAAGACCCCACCTC
CAAATCCATGAACCAGCACTACACCAAATTGACCGCTTCCATCTGAGGGATCTTGCTGCT
CCCCACAACTGGATGCATTCACGTCATCTGCTTATTCTTGAGTGTCTTTGAAAAGAAGAG
GAGAAGTGGGAGAAGCCTCAAGGAGAGGATCC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 6

CO CL1734Contig1 786 6 3 U
TTTTTCAATCTAAATCTTTCAACAATCTCTGAACACATCATCAATGGCGAAAGACGATAT
TCCGAGTCCAGGTGAAACCGCAGCAACGGATACGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGC
TTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCCTATCCTCAACTTGTA
CGGGTCATGTGCAAAAACAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGA
CCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAA
GTTTTTTGGTGAGTTGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGGAAGTGATATTGCCCCGGG
GAGAAAAGAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGA
TATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTG
GTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACTGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTT
TATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAA
AGATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAAACAGTATAT
TATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTT
GGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATT
CTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4C165TF U 1
AF RR4C141TF U 1
AF RR4C177TF U 1
AF RR4C165JQ C 6
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BS 1 641 RR4C141TF
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BS 652 786 RR4C165JQ

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TAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTT
TTG*TGAGTTGAA

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DS 

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CCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAA
GTTTTTTGGTGAGTTGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGGAAGTGATATTGCCCCGGG
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GTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACTGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTT
TATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAA
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DS 

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TTTTT
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GTCCAGGTGAAACCGCAGCAACGGATACGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTG
AATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCCTATCCTCAACTTGTACGGGT
CATGTGCAAAAACAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTT
TAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTT
TTGGTGAGTTGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGGAAGTGATATTGCCCCGGGGAGAA
AAGAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGA
TCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGG
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AGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATC
CTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAA

QA 6 651 6 651
DS 

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GTCCAGGTGAAACCGCAGCAACGGATACGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTG
AATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCCTATCCTCAACTTGTACGGGT
CATGTGCAAAAACAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTT
TAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTT
TTGGTGAGTTGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGGAAGTGATATTGCCCCGGGGAGAA
AAGAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGA
TCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGG
ACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACTGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGG
AGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATC
CTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAAACAGTATATTATAG
TGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTT
GGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCCA
C

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DS 

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CCGCAGCAACGGATACGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGA
CTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCCTATCCTCAACTTGTACGGGTCATGTGCAAAAA
CAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTC
AAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGGTGAGTTGA
AGATTGTTGAATACCACGTTCAAGGAAGTGATATTGCCCCGGGGAGAAAAGAGATACTAA
TAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCA
AACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTC
TGAGGAACAGAGACACTGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAA
GAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACT
GAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCT
TCAAAACACTACTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTT
GTAATATGTTAAACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCCAC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4C141JQ 755 0 0
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ACGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGAT
ACAATCATGCCTCCTATCCTCAACTTGTACGGGTCATGTGCAAAAACAAACGATTTTGAC
ATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAA
ATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGGTGAGTTGAAGATTGTTGAATAC
CACGTTCAAGGAAGTGATATTGCCCCGGGGAGAAAAGAGATACTAATAGACAACAAACAA
CACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAA
AATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGAC
ACTGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTA
GCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAAT
CATGGGTTCAGAAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTT
AGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAAC
GTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCCAC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 5

CO CL1735Contig1 930 5 2 U
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AAGTAAACCAACTTGAAGCTATGGGATCTCTTAGACACAAATGGTGGTATCTGGAGCCAC
AATACCCTCAAGTTTCCAACCACCAGGTCCAGCCAGAGAGAAAGCATCATCCCAGGAGTT
GCCAAAAGCATGAAGCAAAGCAGCATTGCAAGTTTTCAGCTTTACGGAAGCACCAGAGAG
CATGGAGGCTGCTTCTTCCCATCCCTTATTATGCCCCATACACATGACAGTGGTGATGTC
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CTTAGTTAGAGGACGATCATGGTCTAAAACAGAGATATCAAGATTGGTGTTTTTGATTGA
TGAGATGAGAGAGAGAGAAGAAAGAGTATACCTTTGAGGGAAAGATGGTCCCAGGAACTG
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AGTTCGGTGGATGCACGAGGAGAGCAAGAAGTGGTGGTCCGGTTTTGGTGGCCGGAGAAG
AAGAAAGGAGATGGAGACTGGAAGCTCAGCATAGATTATTCTTATCTCATTTCATCTCTC
TTGTAACTGATTTTTCCGGAAACATATCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FB46JQ U 36
AF RR4BP66JQ U 1
AF RR4CQ33JQ U 2
AF RR4BP66TF C 164
AF RR4CQ33TF C 158
BS 1 730 RR4BP66JQ
BS 731 930 RR4BP66TF

RD RR4FB46JQ 516 0 0
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GAGAGAAAGCATCATCCCAGGAGTTGCCAAAAGCATGAAGCAAAGCAGCATTGCAAGTTT
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CCATACACATGACAGTGGTGATGTCAGGGGATGAGTATTTGGAGATGATGTGGTGAAGAT
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TCGCCTCCATAAAGCCATCGACTTGCGCTTGCATTGACTTCAGCGTCTCCTTGGTCCGAG
TCGCGTCGCTTGAGAGGATGAGTTGGGGAAGCCAGC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4BP66JQ 730 0 0
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AACTACACAGCCTTTTGCATATTGTGTTGTAGCAAAAGTTACAAAGGATAGAGGAGAAGA
AAGTAAACCAACTTGAAGCTATGGGATCTCTTAGACACAAATGGTGGTATCTGGAGCCAC
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GCGATGGAGTAGAAGCTAGGGATGAAATGTATATTCGCCTCCATAAAGCCATCGACTTGC
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GGAAGCCAGCCAAGTGAGGAGAGGATTTGAGCAACTTTAGCAGCATCGGCTTGACCGGAC
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GAGCGTGAC
GTAG

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GTTTGGCCGTCCATAGCGGCGATGGAGTAGAAGCTAGGGATGAAATGTATATTCGCCTCC
ATAAAGCCATCGACTTGCGCTTGCATTGACTTCAGCGTCTCCTTGGTCCGAGTCGCGTCG
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ATCTCATTTCATCTCTCTTGTAACTGATTTTTCCGGAAACATATCCC

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DS 

RD RR4CQ33TF 773 0 0
ACACAAATGTGTATCT
GAGCCACAATACC*TCAAGTTTCCAACCACCAGGTCCAGCCAGAGAGAAAGCATCATCCC
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TGATGTCAGGGGATGAGTATTTGGAGATGATGTGGTGAAGATGGTCGGCGGTTTGGCCGT
CCATAGCGGCGATGGAGTAGAAGCTAGGGATGAAATGTATATTCGCCTCCATAAAGCCAT
CGACTTGCGCTTGCATTGACTTCAGCGTCTCCTTGGTCCGAGTCGCGTCGCTTGAGAGGA
TGAGTTGGGGAAGCCAGCCAAGTGAGGAGAGGATTTGAGCAACTTTAGCAGCATCGGCTT
GACCGGACTTAGTTAGAGGACGATCATGGTCTAAAACAGAGATATCAAGATTGGTGTTTT
TGATTGATGAGATGAGAGAGAGAGAAGAAAGAGTATACCTTTGAGGGAAAGATGGTCCCA
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GGAGAAGAAGAAAGGAGATGGAGACTGGAAGCTCAGCATAGATTATTCTTATCTCATTTC
ATCTCTCTTGTAACTGATTTTTCCGGAAACATATCCC

QA 17 773 17 773
DS 



AS 1 5

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AGTTCCCCATATTGCAGAGACATATTATTTGACAGGGAAGAGTTAAACCAGAGTTTAAAC
ACATACGAAGCAAACAAAGGGTCAAATATATAGATTTTTTTGTTTGTTTGTATCTTAAAC
ATCCTTGGCAATGAGATCGCCATTGAGAAACGCTCTGTAAGCAGCAACAGGCCAAATGAA
ACCACGGAAGACGAGACGACTAGCCAAAGGTACATCAATAATGATCTCTTTCATCGCTGG
TTTCTTCTCATCACTAATCGCTATCAAGTAGCTTCTCCCC*ACCCACCCTATCCATCCCG
CAATGTAGAGAAAGAGAAGTCCTGGAGTAATGAACTCTCCCCAATGCCTCTGGTCTCCGT
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CGAACCTGCGTTTGGTCTTCTCGATCTGAGCGTTGAGAGCAAGAGCAGGAGCACTCTCAG
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TGTTTTTGGATCTCGGGTTGAGGACGAGGTTCGTTGGGATCGTGAGCGACATTGCTTTCC
TCTGGAGTTGGAGACGAGTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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A
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G
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TCCCCATATTGCAGAGACATATTATTTGACAGGGAAGAGTTAAACCAGAGTTTAAACACA
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ACGGAAGACGAGACGACTAGCCAAAGGTACATCAATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTT
CTTCTCATCACTAATCGCTATCAAGTAGCTTCTCCCC*ACCCACCCTATCCATCCCGCAA
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G
GA

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DS 

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A
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AGCCAAAGGTACATCAATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTTCTTCTCATCACTAATCGC
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CGTCTGCACCGCACAGAAGTCCGTACTTGCCGTAGTTGTCGAACCTGCGTTTGGTCTTCT
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ACA
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GTTTGTATCTTAAACATC*TTGGCAATGAGATCGCCATTGAGAAACGCTCTGTAAGCAGC
AACAGGCCAAATGAAACCACGGAAGACGAGACGACTAGCCAAAGGTACATCAATAATGAT
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ACCCTATCCATCCCGCAATGTAGAGAAAGAGAAGTCCTGGAGTAATGAACTCTCCCCAAT
GCCTCTGGTCTCCGTTCACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCACAGAAGTCCGT
ACTTGCCGTAGTTGTCGAACCTGCGTTTGGTCTTCTCGATCTGAGCGTTGAGAGCAAGAG
CAGGAGCACTCTCAGGAGCGTAGAGTTTGAGAGATGGCTCGAGCTTCTTGATCTGCTGCT
TCTCCCTCTTGGCGAACTGTTTCGACTCCTTGCAAGGGGTTAGGCCCGAGATATCAGCGA
CGGCTGGCATCGGGGATGAGATGAGGATGGAAGAGAGGGCCACCGCCGCGGAGAATGCCT
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GCGACATTGCTTTCCTCTGGAGTTGGAGACGAGTCC

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DS 



AS 1 6

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ATACGACAAATGTACAAATCCACATTTCAGATTACTTTCCTT*ACCCACACAACCAAAAA
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ACATGTTTTATACTCACATCCTGATAATAATACGGCCAACAAGTAACCACAATATCATAT
ATATTATATAACATGTGACCGCCCGGTAATTAAACCACCCCAAAAGAAAACTAAAATCAC
AATTCACCTAGGTGAATTCTGACAAGCTGGTGACTGTAGCGCTATTAATTAGCCCGCGAT
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CCTTGGCTCATTCAAGAACGCCCAGTTGCTTCTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTG
GTTTTCGTAAGGATCCTCTATCCCTTGACTTTCCGCAACTTCCTCAGTAA***ACTTGGA
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TCCTGACATTAAAGAACCCATTTGCTTTTAGTATTTTTTTCCAATAGTCTTTTAAATTTA
TTTGATCAGTAGATCTATCTGTCC


BQ
10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4B870JQ U 2
AF RR4B870TF C 1
AF RR4DN37JQ U 1
AF RR4DN37TF C 22
AF RR4BA13JQ U 2
AF RR4BA13TF C 7
BS 1 1 RR4B870TF
BS 2 89 RR4B870JQ
BS 90 90 RR4DN37JQ
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BS 157 157 RR4DN37JQ
BS 158 695 RR4B870JQ
BS 696 744 RR4DN37JQ

RD RR4B870JQ 694 0 0
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TCTCTTGTAAGTGACTTGCACCTTCTCACTGAGTTGGGATCCTTTGTTGGAGAGTCCCAT
CCTGACATTAAAGAACCCATTTGCTTTTAGTATT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4B870TF 744 0 0
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AATATACATGGCACATAACAAAAGAGAAAAAAAAAA*TTTAAAACCCCACCACCCCTGTT
ACATGTTTTATACTCACATCCTGATAATAATACGGCCAACAAGTAACCACAATATCATAT
ATATTATATAACATGTGACCGCCCGGTAATTAAACCACCCCAAAAGAAAACTAAAATCAC
AATTCACCTAGGTGAATTCTGACAAGCTGGTGACTGTAGCGCTATTAATTAGCCCGCGAT
TTTGGCGATGTGAGCCACCTGGAACTGCGGAACGTAATTATTGGGTCGACCCTCTTCCTC
CCTTGGCTCATTCAAGAACGCCCAGTTGCTTCTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTG
GTTTTCGTAAGGATCCTCTATCCCTTGACTTTCCGCAACTTCCTCAGTAA***ACTTGGA
AACGGCTTGAACATGTTCCTCTTCAGTCTTCTTCTTTGTCTTCCAGAAAGCGTCGATTTC
TTCTCTTGTAAGTGACTTGCACCTTCTCACTGAGTTGGGATCCTTTGTTGGAGAGTCCCA
TCCTGACATTAAAGAACCCATTTGCTTTTAGTATTTTTTTCCAATAGTCTTTTAAATTTA
TTTGATCAGTAGATCTATCTGTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DN37JQ 744 0 0
A
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TACGACAAATGTACAAATCCACATTTCAGATTACTTTCCTT*ACCCACACAACCAAAAAA
ATATACATGGCACATAACAAAAGAGAAAAAAAAAAATTTAAAACCCCAC*ACCCCTGTTA
CATGTTTTATACTCACATCCTGATACTAATACGGCCAACAAGTAACCACAATATCATATA
TATTATATAACATGTGACCGCCCGGTAATTAAACCACCCCAAAAGAAAACTAAAATCACA
ATTCACCTAGGTGAATTCTGACAAGCTGGTGACTGTAGCGCTATTAATTAGCCCGCGATT
TTGGCGATGTGAGCCACCTGGAACTGCGGAACGTAATTATTGGGTCGACCCTCTTCCTCC
CTTGGCTCATTCAAGAACGCCCAGTTGCTTCTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTGG
TTTTCGCAAGGATCCTCTATCCCTTGACTTTCCGCAACTTCCTCAGTAACCAACTTGGAA
ACGGCTTGAACATGTTCCTCTTCAGTCTTCTTCTTTGTCTTCCAGAAAGCGTCGATTTCT
TCTCTTGTAAGTGACTTGCACCTTCTCACTGAGTTGGGATCCTTTGTTGGAGAGTCCCAT
CCTGACATTAAAGAACCCATTTGCTTTTAGTATTTTTTTCCAATAGTCTTTTAAATTTAT
TTGATCAGTAGATCTATCTGTCC

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR4DN37TF 723 0 0
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ACATTTCAGATTACTTTCTTT*ACCCACACAACCAAAAAAATATACATGGCACATAACAA
AAGAGAAAAAAAAAAATTTAAAACCCCAC*ACCCCTGTTACATGTTTTATACTCACATCC
TGATACTAATACGGCCAACAAGTAACCACAATATCATATATATTATATAACATGTGACCG
CCCGGTAATTAAACCACCCCAAAAGAAAACTAAAATCACAATTCACCTAGGTGAATTCTG
ACAAGCTGGTGACTGTAGCGCTATTAATTAGCCCGCGATTTTGGCGATGTGAGCCACCTG
GAACTGCGGAACGTAATTATTGGGTCGACCCTCTTCCTCCCTTGGCTCATTCAAGAACGC
CCAGTTGCTTCTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTGGTTTTCGCAAGGATCCTCTAT
CCCTTGACTTTCCGCAACTTCCTCAGTAACCAACTTGGAAACGGCTTGAACATGTTCCTC
TTCAGTCTTCTTCTTTGTCTTCCAGAAAGCGTCGATTTCTTCTCTTGTAAGTGACTTGCA
CCTTCTCACTGAGTTGGGATCCTTTGTTGGAGAGTCCCATCCTGACATTAAAGAACCCAT
TTGCTTTTAGTATTTTTTTCCAATAGTCTTTTAAATTTATTTGATCAGTAGATCTATCTG
TCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4BA13JQ 743 0 0
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TACGACAAATGTACAAATCCACATTTCAGATTACTTTCCTT*ACCCACACAACCAAAAAA
ATATACATGGCACATAACAAAAGA*AAAAAAAAAAATTTAAAACCCCAC*ACCCCTGTTA
CATGTTTTATACTCACATCCTGATAATAATACGGCCAACAAGTAACCACAATATCATATA
TATTATATAACATGTGACCGCCCGGTAATTAAACCACCCCAAAAGAAAACTAAAATCACA
ATTCACCTAGGTGAATTCTGACAAGCTGGTGACTGTAGCGCTATTAATTAGCCCGCGATT
TTGGCGATGTGAGCCACCTGGAACTGCGGAACGTAATTATTGGGTCGACCCTCTTCCTCC
CTTGGCTCATTCAAGAACGCCCAGTTGCTTCTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTGG
TTTTCGTAAGGATCCTCTATCCCTTGACTTTCCGCAACTTCCTCAGTAA***ACTTGGAA
ACGGCTTGAACATGTTCCTCTTCAGTCTTCTTCTTTGTCTTCCAGAAAGCGTCGATTTCT
TCTCTTGTAAGTGACTTGCACCTTCTCACTGAGTTGGGATCCTTTGTTGGAGAGTCCCAT
CCTGACATTAAAGAACCCATTTGCTTTTAGTATTTTTTTCCAATAGTCTTTTAAATTTAT
TTGATCAGTAGATCTATCTGTCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4BA13TF 738 0 0
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CATGGCACATAACAAAAGAGAAAAAAAAAA*TTTAAAACCCCAC*ACCCCTGTTACATGT
TTTATACTCACATCCTGATAATAATACGGCCAACAAGTAACCACAATATCATATATATTA
TATAACATGTGACCGCCCGGTAATTAAACCACCCCAAAAGAAAACTAAAATCACAATTCA
CCTAGGTGAATTCTGACAAGCTGGTGACTGTAGCGCTATTAATTAGCCCGCGATTTTGGC
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CTCATTCAAGAACGCCCAGTTGCTTCTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTGGTTTTC
GTAAGGATCCTCTATCCCTTGACTTTCCGCAACTTCCTCAGTAA***ACTTGGAAACGGC
TTGAACATGTTCCTCTTCAGTCTTCTTCTTTGTCTTCCAGAAAGCGTCGATTTCTTCTCT
TGTAAGTGACTTGCACCTTCTCACTGAGTTGGGATCCTTTGTTGGAGAGTCCCATCCTGA
CATTAAAGAACCCATTTGCTTTTAGTATTTTTTTCCAATAGTCTTTTAAATTTATTTGAT
CAGTAGATCTATCTGTCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 6

CO CL1738Contig1 829 6 3 U
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ATTCAATAGTTACAAATGAACAATCACACAGTAAAGTCCATATCCATTAACATGGAAACA
GTAACACATGAATGTACATAGACACAAACACACACACATACGTAGATATACACAAGACAA
ATGATCTTGAAA*GATATTTTGCTCATATCTAAAAGACATTGAGCGACGTTGCATAGAGA
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ATATTGGTTATGCTGTCTCCATCGATCTTTCTTGATCCATATCCTGGAGATGGAGGAAGC
GGTGGAGGAGGAGGAGGCGACATCAGTGGCTTCTTGAAACACAAATTCTCGGACTCATCC
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CTTCAAACTAAAGAGATACACATACACCTGAGATTCTTAAAGAGTCTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FM75JQ U 38
AF RR4FM75TF C 40
AF RR4AX66TF C 1
AF RR4B358JQ U 1
AF RR4B358TF C 1
AF RR4AX66JQ U 41
BS 1 40 RR4B358JQ
BS 41 650 RR4FM75JQ
BS 651 829 RR4B358JQ

RD RR4FM75JQ 615 0 0
TTA
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TATCCATTAACATGGAAACAGTAACACATGAATGTACATAGACACAAACACACACACATA
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ACAAATTCTC
CC

QA 4 613 4 613
DS 

RD RR4FM75TF 613 0 0
A
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TATCCATTAACATGGAAACAGTAACACATGAATGTACATAGACACAAACACACACACATA
CGTAGATATACACAAGACAAATGATCTTGAAA*GATATTTTGCTCATATCTAAAAGACAT
TGAGCGACGTTGCATAGAGAGGAACGCAAGGCTTGAAGGAAAAATAGTTTGGTACATAAG
ACGAAAACCTTTTTCTCTTCAGTGAATCAGAAGATCCAAGAGCAGGCTGGTTCAAGTATG
CGTACTTGCTCTTCATCCACCAGTCTTTTATTCCCTCATGAACTTCGATTTCCGGGTCCT
CCATGTCCAAGCTTTCTTCAAAGCGTTTGTAGTCCTCATCAGAGAGATTACGGGCTCTGA
CACGAGCTGCGGCCTTAATAGCAGCAAAAAGATGCTCCTCTTCAATGATCTGCTTCTGCC
TCCAGAACTTCTTGATCTGTATATTGGTTATGCTGTCTCCATCGATCTTTCTTGATCCAT
ATCCTGGAGATGGAGGAAGCGGTGGAGGAGGAGGAGGCGACATCAGTGGCTTCTTGAAAC
ACAAATTCTC
CC

QA 2 611 2 611
DS 

RD RR4AX66TF 829 0 0
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AGTGAATCAGAAGATCCAAGAGCAGGCTGGTTCAAGTATGCGTACTTGCTCTTCATCCAC
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AAGCGTTTGTAGTCCTCATCAGAGAGATTACGGGCTCTGACACGAGCTGCGGCCTTAATA
GCAGCAAAAAGATGCTCCTCTTCAATGATCTGCTTCTGCCTCCAGAACTTCTTGATCTGT
ATATTGGTTATGCTGTCTCCATCGATCTTTCTTGATCCATATCCTGGAGATGGAGGAAGC
GGTGGAGGAGGAGGAGGCGACATCAGTGGCTTCTTGAAACACAAATTCTCGGACTCATCC
ATAATCTGCTTCTTCATATTTATACAGCTAAAACAGATGAAGTATATGCACAACACAAGT
AGCTCAAAGATCACAAAGAGGAGAAAAAAGCTACTGAACCTAACAGATTCTGAATCTAAC
CTTCAAACTAAAGAGATACACATACACCTGAGATTCTTAAAGAGTCTCC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4B358JQ 829 0 0
AATAACGTTATCATCTATGAAACATGATGGGATTAATGTTCCATAGTAAGATTGAATTTT
ATTCAATAGTTACAAATGAACAATCACACAGTAAAGTCCATATCCATTAACATGGAAACA
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ATGATCTTGAAA*GATATTTTGCTCATATCTAAAAGACATTGAGCGACGTTGCATAGAGA
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AAGCGTTTGTAGTCCTCATCAGAGAGATTACGGGCTCTGACACGAGCTGCGGCCTTAATA
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CGTACTTGCTCTTCATCCACCAGTCTTTTATTCCCTCATGAACTTCGATTTCCGGGTCCT
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ACAAATTCTCGGACTCATCCATAATCTGCTTCTTCATATTTATACAGCTAAAACAGATGA
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DS 



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TCACTGAAATGGGAGTATCTGCTAGAGAAACTCCTTACGAAGTTGCTCAAGATAGCCAAG
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AGAGATAATTGGGAAAAGCCTGTCATGTTGGATGCTCCTGTATCAGGAGGTGTTCTTGCT
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ATGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 

AF RR4F202TF U 1
AF RR4H483TF U 1
AF RR4B767TF U 57
AF RR4B767JQ C 446
AF RR4F202JQ C 522
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QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4H483TF 735 0 0
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AATTCCAGAATGTTGGTTTCATAGGGCTTGGAAACATGGGATCCAGAATGGTGAATAATC
TAGTTAAAGCTGGTTTTAACGTTACCGTTCATGACATAAACAGTGATGTTATGAAGATGT
TCACTGAAATGGGAGTATCTGCTAGAGAAACTCCTTACGAAGTTGCTCAAGATAGCCAAG
TTGTGATTACCATGTTGCCTTCTTCATCTCACGTGATGGATGTGTACACAGGAAGAAATG
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ATCCACAAACCACCC*GCAAAATCTCTCTTGCGGTTTCTAACTGTAGTTTGAAAGATAAG
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GCAGAAGCTGCTACACTTACTTTCATGGTTGGAGGTCCCGAAGATGCTTACTTAGCCGCA
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TCTGCTGCAAAGATT

QA 1 735 1 735
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AATCTAGTTAAAGCTGGTTTTAACGTTACCGTTCATGACATAAACAGTGATGTTATGAAG
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CAGAAGCTTTAGCTCTTGGTCAGTCACTTGGAATATCTGCCACCACTTTAACTCAAGTGT
TAAACACATCCAGTGGCCGATGTTGGAGTAGCGACA*GTATAATCCAGTT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4B767JQ 818 0 0
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QA 6 818 6 818
DS 

RD RR4F202JQ 744 0 0
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GTATGCTGGGTACTTCAGAAGCTTTAGCTCTTGGTCAGTCACTTGGAATATCTGCCACCA
CTTTAACTCAAGTGTTAAACACATCCAGTGGCCGATGTTGGAGTAGCGACAAGTATAATC
CAGTTCCAGGAGTAATGAAAGGTGTGCCCTCTTCAAGAGATTACAATGGAGGTTTCGCCT
CCAAACTTATGGCTAAAGACTTAAGTTTAGCAGCAGCCTCAGCTGAAGAAGTTGAACACA
AGAGCGCATTGATATACAAAGCACAAGAAATTTACAAGAAGATGTGTGAGGATGGGCATG
AAACAAAGGACTTTTCCTGTGTTTTCGGACACTTCTACAATGGCAAAGATGAGGTTTGAG
GCAAAATCTGTACAAGTGACCCTGCAATATAATAAGCATCCATCCAAAGGTTTCCTTGTG
CATTTTAGATTGTTTGTTTTCTATTGCTAAGAGACAAATAAATATTGGAGGGATTGTGAT
GTTAATAAAACGGTTCGAAATGTG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 6

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TTACAAACATATACGCTGTGTACTTCACAAATATCCCACCGATATGCACTTATACAAACG
TACACAAACTACATAT****CTAATTAAGCACATACACATCAAGACGTACACACATCATG
TGAATATATGCAAGATGGGTACGTACATAAGCACCACCAAAAGTTACAAGGGTTTTACTA
GTATTTCTCATCATTCAGAAGCGGCCATTGAAATTACCCAACATGGAAATAGGGACGACG
CATAATCCTCTACTCCTCAAGTCCATATTATTGATGTTGCTTTTGTTGTTTCCTTCTCTG
AGATTCCTCATCATCTTCATCTTTTGTTCATCTCCTTCTTGGATTTGGATTTGATGATCC
GCCACGCCCCTCATATTTCCCATAACGAAACTAGAAGATACATAGTCCTCGTGTTTTCTA
GGAGGCGTCTGAATATGCTCCATCTGACTGATCTTAGGGCTATTAACCGGAGAGCTAGCC
GTATCCTCCAAAGAATCATCCTCACAAATCTTTTTGGTTCTTGCCTTCCCAAACTTCAAC
TTCACCGGAAAATTAACTGGAAAGCTCCGGCCAGAAAAGGCATCAGTGGCGGCGTCGGAG
ACCAGAGAAGGAGAGGCGTCCAGAATCGAGCACGAACTCTTATCTTCATGATCGTTATCT
TCAGGATGAGTTCCGTATTGATTTGAGAAATCTTCAAGATAAGTTGTCCATCCACTCTCC
TCCTGCTGAACACCATCATGATGATCATGATCGGAATCATCAATATCAATATCATTATCA
TGACGGTGGAAAGGGGCGTGATTTTGTTCACAAGAATTACAAGAGAATGTATCCATCATG
TGGAGAAAGGAGGGATAAACCAAAATATAATGGAATGATTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW30JQ U 1
AF RR4A450JQ U 82
AF RR4GB60JQ U 122
AF RR4BW30TF C 233
AF RR4A450TF C 85
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BS 141 202 RR4BW30JQ
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BS 654 865 RR4GB60JQ
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GCCACGCCCCTCATATTTCCCATAACGAAACTAGAAGATACATAGTCCTCGTGTTTTCTA
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GTATCCTCCAAAGAATCATCCTCACAAATCTTTTTGGTTCTTGCCTTCCCAAACTTCAAC
TTCACCGGAAAATTAACTGGAAAGCTCCGGCCA

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DS 

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GCT
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TGTTCATCTCCTTCTTGGATTTGGATTTGATGATCCGCCACGCCCCTCATATTTCCCATA
ACGAAACTAGAAGATACATAGTCCTCGTGTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGCTCCATC
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CTCCGGCCAGAAAAGGCATCAGTGGCGGC
AT

QA 4 572 4 572
DS 

RD RR4GB60JQ 744 0 0
ACACAAACTACATAT
ATATCTAATTAAGCACATACACATCAAGACGTACACACATCATGTGAATATATGCAAGAT
GGGTACATACATAAACACCACCAAAAGTTACAAGGGTTTTACTAGTATTTCTCATCATTC
AGAAGCGGCCATTGAAATTACCCAACATGGAAATAGGGACGACGCATAATCCTCTACTCC
TCAAGTCCATATTATTGATGTTGCTTTTGTTGTTTCCTTCTCTGAGATTCCTCATCATCT
TCATCTTTTGTTCATCTCCTTCTTGGATTTGGATTTGATGATCCGCCACGCCCCTCATAT
TTCCCATAACGAAACTAGAAGATACATAGTCCTCGTGTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATAT
GCTCCATCTGACTGATCTTAGGGCTATTAACCGGAGAGCTAGCCGTATCCTCCAAAGAAT
CATCCTCACAAATCTTTTTGGTTCTTGCCTTCCCAAACTTCAACTTCACCGGAAAATTAA
CTGGAAAGCTCCGGCCAGAAAAGGCATCAGTGGCGGCGTCGGAGACCAGAGAAGGAGAGG
CGTCCAGAATCGAGCACGAACTCTTATCTTCATGATCGTTATCTTCAGGATGAGTTCCGT
ATTGATTTGAGAAATCTTCAAGATAAGTTGTCCATCCACTCTCCTCCTGCTGAACACCAT
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CGTGATTTT

QA 16 744 16 744
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RD RR4BW30TF 618 0 0
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GATGATCCGCCACGCCCCTCATATTTCCCATAACGAAACTAGAAGATACATAGTCCTCGT
GTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGCTCCATCTGACTGATCTTAGGGCTATTAACCGGAG
AGCTAGCCGTATCCTCCAAAGAATCATCCTCACAAATCTTTTTGGTTCTTGCCTTCCCAA
ACTTCAACTTCACCGGAAAATTAACTGGAAAGCTCCGGCCAGAAAAGGCATCAGTGGCGG
CGTCGGAGACCAGAGAAGGAGAGGCGTCCAGAATCGAGCACGAACTCTTATCTTCATGAT
CGTTATCTTCAGGATGAGTTCCGTATTGATTTGAGAAATCTTCAAGATAAGTTGTCCATC
CACTCTCCTCTTGCTGAACACCATCATGATGATCATGATCGGAATCATCAATATCAATAT
CATTATCATGACGGTGGA

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DS 

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TTAAGCACATACACATCAAGACGTACACACATCATGTGAATATATGCAAGATGGGTACGT
ACATAAGCACCACCAAAAGTTACAAGGGTTTTACTAGTATTTCTCATCATTCAGAAGCGG
CCATTGAAATTACCCAACATGGAAATAGGGACGACGCATAATCCTCTACTCCTCAAGTCC
ATATTATCGATGTTGCTTTTGTTGTTTCCTTCTCTGAGATTCCTCATCATCTTCATCTTT
TGTTCATCTCCTTCTTGGATTTGGATTTGATGATCCGCCACGCCCCTCATATTTCCCATA
ACGAAACTAGAAGATACATAGTCCTCGTGTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGCTCCATC
TGACTGATCTTAGGGCTATTAACCGGAGAGCTAGCCGTATCCTCCAAAGAATCATCCTCA
CAAATCTTTTTGGTTCTTGCCTTCCCAAACTTCAACTTCACCGGAAAATTAACTGGAAAG
CTCCGGCCAGAAAAGGCATCAGTGGCGGCATCGGAGACCAGAGAAGGAGAGGCGTCCAGA
ATCGAGCACGAACTCTTATCTTCATGATCGTTATCTTCAAGATGAGTTCCGTATTGATTT
GAGAAATCTTCAAGATAAGTTGTCCATCCACTCTCCTCTTGCTGAACACCATCATGATGA
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ATATAATGGAATGATTCTTCC

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR4GB60TF 639 0 0
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TTGCTTTTGTTGTTTCCTTCTCTGAGATTCCTCATCATCTTCATCTTTTGTTCATCTCCT
TCTTGGATTTGGATTTGATGATCCGCCACGCCCCTCATATTTCCCATAACGAAACTAGAA
GATACATAGTCCTCGTGTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGCTCCATCTGACTGATCTTA
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GTTCTTGCCTTCCCAAACTTCAACTTCACCGGAAAATTAACTGGAAAGCTCCGGCCAGAA
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CTCTTATCTTCATGATCGTTATCTTCAGGATGAGTTCCGTATTGATTTGAGAAATCTTCA
AGATAAGTTGTCCATCCACTCTCCTCCTGCTGAACACCATCATGATGATCATGATCGGAA
TCATCAATATCAATATCATTATCATGACGGTGGAAAGGGGCGTGATTTTGTTCACAAGAA
TTACAAGAGAATGTATCCATCATGTGGAGAAAGGAGGGA

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 6

CO CL1741Contig1 1050 6 11 U
GGCTCTCTCATGATACATCATTTAACTGTCTTTGTTTTTCTTCCTGTTACCTTCTTCTCA
TTCTTTGTACAAAAAAAAAATAACAAACCCTTTAATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTT
TGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCCTCATCTCCAGGAAATCGTATTGAATCAAATCCA
ATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAGAACAATATATATCAAGAAAACAAAG
ATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAA
GGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTTTTTGTCCGACAGATGATGACGACGAA
GACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGATCGCCCTCAAAGAACAGCTCGAGAAA
GACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATG
GAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCA
CCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAA
CCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACACTCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACC
AACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTAATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTG
TATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTTTAGTCCACAGGCGGAACCGTATAACCATGTC
ATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGTATGCTTGTTAGAGGCTCCTATTCCGTTAAATCT
AAGTTCGTGGACGACGACAATAAGTGCTACCTGGAGAACAACTACACCTTCGACATTCGC
AAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAGTTAATGGAATAAAAAAAACATACTTCATCTG
TTTCAAGAAAAATGTCACTTTAGATTTTTTATTTTGTTTTCAAAATAAGTGTCATTCTAC
AATTTCAATATAATTTTGTACATTAAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FN47TF U 1
AF RR4GA04TF U 35
AF RR4CH94TF U 202
AF RR4CH94JQ C 859
AF RR4GA04JQ C 266
AF RR4FN47JQ C 285
BS 1 330 RR4FN47TF
BS 331 331 RR4GA04TF
BS 332 620 RR4FN47TF
BS 621 622 RR4GA04TF
BS 623 859 RR4CH94TF
BS 860 860 RR4GA04JQ
BS 861 901 RR4CH94TF
BS 902 902 RR4GA04JQ
BS 903 937 RR4CH94TF
BS 938 1049 RR4GA04JQ
BS 1050 1050 RR4FN47JQ

RD RR4FN47TF 620 0 0
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TTCTTTGTACAAAAAAAAAATAACAAACCCTTTAATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTT
TGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCCTCATCTCCAGGAAATCGTATTGAATCAAATCCA
ATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAGAACAATATATATCAAGAAAACAAAG
ATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAA
GGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCCCTTTTTGTCCGACAGATGATGACGACGAA
GACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGATCGCCCTCAAAGAACAGCTCGAGAAA
GACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATG
GAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCA
CCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAA
CCATGGTTTACTCTCAAAGA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4GA04TF 591 0 0
TTTTTCTTCCTGTTACCTTCTTCTCATTCTTTGTACAAAAAAAAA*TAACAAACCCTTTA
ATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCCTCATCTC
CAGGAAATCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCA
GAACAATATATATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAG
AAACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTT
TTTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGA
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AACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAA
AGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTG
AAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAG
CTC

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DS 

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GG
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CCACAGCTCTTTTTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACT
TGGTCCCATGATCGCCCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAG
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TCCGGTGGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATT
GACGGTGCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGG
CTCTAAGTACACTCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCG
GTACAGTAATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGG
AACGTTTAGTCCACAGGCGGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTC
TGGTATGCTTGTTAGAGGCTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTCGTGGACGACGACA*TAA
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CATAAGTTAATGGA
TAAAAAAA

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR4CH94JQ 150 0 0
A
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TCCACATAAGTTAATGGAATAAAAAAAACATACTTCATTTGTTTCAAGAAAAATGTCACT
TTAGATTTTTTATTTTGTTTTCAAAATAA

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DS 

RD RR4GA04JQ 785 0 0
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ACAGCTCTTTTTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTG
GTCCCATGATCGCCCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGA
GATGGAAAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATC
CGGTGGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGA
CGGTGCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCT
CTAAGTACACTCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGT
ACAGTAATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAA
CGTTTAGTCCACAGGCGGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTG
GTATGCTTGTTAGAGGCTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTCGTGGACGACGACAATAAGT
GCTACCTGGAGAACAACTACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACA
TAAGTTAATGGAATAAAAAAAACATACTTCATCTGTTTCAAGAAAAATGTCACTTTAGAT
TTTTTATTTTGTTTTCAAAATAAGTGTCATTCTACAATTTCAATATAATTTTGTACATTA
AATC
T

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DS 

RD RR4FN47JQ 766 0 0
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AGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGATCGCCCTCAA
AGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAACTTCT
AGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAATGTA
CTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACGGAAA
CCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACACTCTTGTATT
TACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTAATTCGGTTTGGAA
GACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTTTAGTCCACAGGCGGA
ACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTTTGGTATGCTTGTTAGAGGCTC
CTATTCCGTTAAATCTAAGTTCGTGGACGACGACAATAAGTGCTACCTGGAGAACAACTA
CACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAGTTAATGGAATAAAAA
AA*CATACTTCATCTGTTTCAAGAAAAATGTCACTTTAGATTTTTTATTTTGTTTTCAAA
ATAAGTGTCATTCTACAATTTCAATATAATTTTGTACATTAAATCG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 5

CO CL1742Contig1 1024 5 5 U
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GAGAGATGGCAGAAGACAAGGAAGCTACGACGAGTTCACTGAGTCAAGGACTCGCTCCTC
AAGACCCTGAAGATCCTCCCAAGTCTCCTCCCAACTCTCCCAATTCTTCTACTCGCAAGG
CTTGCTATGCTGTTCTTCAGAGTTGGGTGTCCAAGAAGTTTATGACTGGCTTTGTCGTCC
TATTTCCTGTTGCTGTTACATTCCTCATCACCTGGTGGTTTATCCAGTTCGTTGATGGTT
TCTTCAGTCCCATATACGAGACCCTTGGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATTACAT
CTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGAATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACGGTTT
TCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGGAGAATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATTCAGCTT
CCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCTCCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAGAGGTAG
CAATCATCCGTCACCCTCGCATTGGTGAATATGCATTTGGATTTATCACATCATCGGTGA
CACTTCAGACGGACCAGGGAGAAGAGGAGTTGTGTAGTGTGTATGTGCCTACGAATCATC
TGTACATAGGAGATATATTTCTGGTGAACAGTGAAGAAATCATTAGGCCAAATTTATCGA
TCCGAGAAGGAATAGAGATTATAGTATCGGTGGGGATGACGATGCCGCAAGTGATATCTC
ATGTGGACAGGACAAAGAGTAGAACTTCTCACCAACAAAGTCATAGGATTCCTCTCAACA
GACTTTGATTAATAGCTCTATTCATCTTGTAAAGATACTTCCCACACGTTGTGCTCACTC
AGGAATTATTACTATTACACTTGTTTTATCCGTAGTTTACTATGTTGCTCGGATTTGTAT
TATATTTCTTCAGTCATATTAAAATGCTAGTACCTTGAGGCACTATATCATACAAGACAT
CTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4AY61TF U 1
AF RR4AV34TF U 1
AF RR4E489TF U 235
AF RR4ER69JQ C 268
AF RR4E489JQ C 251
BS 1 702 RR4AV34TF
BS 703 706 RR4E489TF
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BS 708 724 RR4E489TF
BS 725 1024 RR4E489JQ

RD RR4AY61TF 173 0 0
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QA 1 173 1 173
DS 

RD RR4AV34TF 702 0 0
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GAGAGATGGCAGAAGACAAGGAAGCTACGACGAGTTCACTGAGTCAAGGACTCGCTCCTC
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CTTGCTATGCTGTTCTTCAGAGTTGGGTGTCCAAGAAGTTTATGACTGGCTTTGTCGTCC
TATTTCCTGTTGCTGTTACATTCCTCATCACCTGGTGGTTTATCCAGTTCGTTGATGGTT
TCTTCAGTCCCATATACGAGACCCTTGGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATTACAT
CTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGAATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACGGTTT
TCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGGAGAATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATTCAGCTT
CCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCTCCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAGAGGTAG
CAATCATCCGTCACCCTCGCATTGGTGAATATGCATTTGGATTTATCACATCATCGGTGA
CACTTCAGACGGACCAGGGAGAAGAGGAGTTGTGTAGTGTGTATGTGCCTACGAATCATC
TGTACATAGGAGATATATTTCTGGTGAACAGTGAAGAAATCA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4E489TF 490 0 0
TCGTCCTATTTCCTGTTGCTGTTACATTCCTCATCACCTGGTGGTTTATCCAGTTCGTTG
ATGGTTTCTTCAGTCCCATATACGAGACCCTTGGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCA
TTACATCTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGAATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTA
CGGTTTTCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGGAGAATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATT
CAGCTTCCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCTCCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAG
AGGTAGCAATCATCCGTCACCCTCGCATTGGTGAATATGCATTTGGATTTATCACATCAT
CGGTGACACTTCAGACGGACCAGGGAGAAGAGGAGTTGTGTAGTGTGTATGTGCCTACGA
ATCATCTGTACATAGGAGATATATTTCTGGTGAACAGTGAAGAAATCATTAG*CCAAATT
TATCGATCCG

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GTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATTACATCTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGAA
TATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACGGTTTTCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGGA
GAATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATTCAGCTTCCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCTC
CCGACCAAAACACAACCGCCCTTAAAGAGGTAGCAATCATCCGTCACCCTCGCATTGGTG
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ACAGTGAAGAAATCATTAGGCCAAATTTATCGATCCGAGAAGGAATAGAGATTATAGTAT
CGGTGGGGATGTCGATGCCGCAAGTGATATCTCATGTGGACAGGACAAAGAGTAGAACTT
CTCACCAACAAAGTCATAGGATTCCTCTCAACAGACTTTGATTAATAGCTCTATTCATCT
TGTAAAGATACTTCCCACACGTTGTGCTCACTCAGGAATTATTACTATTACACTTGTTTT
ATCCGTAGTTTACTATGTTGCTCGGATTTGTATTATATTTCTTCAGTCATATTAAAATGC
TAGTCCCTTGAGG

QA 1 733 1 733
DS 

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CATATACGAGACCCTTGGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATTACATCTGTACTTTT
CACTTTCTTTGTCGGAATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACGGTTTTCTGGCTTGG
GGAGCAGTTTATAAGGAGAATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATTCAGCTTCCAAACAAGT
TAGCACTGCTATTTCTCCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAGAGGTAGCAATCATCCG
TCACCCTCGCATTGGTGAATATGCATTTGGATTTATCACATCATCGGTGACACTTCAGAC
GGACCAGGGAGAAGAGGAGTTGTGTAGTGTGTATGTGCCTACGAATCATCTGTACATAGG
AGATATATTTCTGGTGAACAGTGAAGAAATCATTAGGCCAAATTTATCGATCCGAGAAGG
AATAGAGATTATAGTATCGGTGGGGATGACGATGCCGCAAGTGATATCTCATGTGGACAG
GACAAAGAGTAGAACTTCTCACCAACAAAGTCATAGGATTCCTCTCAACAGACTTTGATT
AATAGCTCTATTCATCTTGTAAAGATACTTCCCACACGTTGTGCTCACTCAGGAATTATT
ACTATTACACTTGTTTTATCCGTAGTTTACTATGTTGCTCGGATTTGTATTATATTTCTT
CAGTCATATTAAAATGCTAGTACCTTGAGGCACTATATCATACAAGACATCTTG

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 3

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GGATCATCATTCATCAAACCTCATCATTATCAAAATATATTCAAACCATGTCTTCTTCCG
AATGTCCGTCCCCGTTACCCACCGCCAAAACTTCAAGTTGATTCCGTGACTTTTCCACCG
TCTGTTATCTCACCGGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGTGTGCGAGGT
TTGGATATTCAAGGAAAGTTTGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGATCCTGTC
TCTGTACCGTCACTCTCCGTTAAGTGGAAAGGTAAAACGACAGAGGAATTAAAGGAATCC
GTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTGACGATG
AAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTGGCGATA
TGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAAAGGTTCTTGGAA
GTCTTCAAGGACGAAACGTTTCTTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCCCCTACA
GGCTCTCTTACGGTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAAGCGGTG
ATCGAAAATAAGTTGTTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATTGGAAAGAACGGTGTG
TCTCCTGGGGCTAGGTTGAGTGTTGCCGAGAGATTGGCTCAGCTGATGAAGGAGAATAAG
GTCGAAGAAGATGCAACAAAGACTGATCAAGAGGAAGCTAACGATCTCTCCCTGGCCAAA
GAAAACTGATCCTGTGGGAGATTTTTATGTTTCTATGCTTAATAACATTGTGTTTAGTTC
CCATCGCATGTTTTAACTCTGCTTATTTTCGTAAGAATTATTAGATAATCATATGAAGTT
GATTCAAAATTATTAAAATACCAAACGAATTCCCTAATCTATATTTGAGAAGTGATTTTG
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4G404TF U 1
AF RR4AD56TF U 712
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TGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAAAGGTTCTTGGAA
GTCTTCAAGGACGAAACGTTTCTTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCCCCTACA
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QA 1 224 1 224
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CGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAAGCGGTGATCGAAAATAAGTTGT
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AATACCAAACGAATTCCCTAATCTATATTTGAGAAGTGATTTTGCTC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

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TCAGCTTCCTTTTTTTTCAAAAGAATCACAAATGGACGGAGGAAGCGGCGGTGGTGACAT
GGCGACGCCTGTGCAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGGGTTTACAAGTACTACCTCGA
CAAGACTACGCCTCACTCAACCTACAGGTGGATCGGAACGCTCGTCGTCTTCCTCATCTA
CTGCTTGAGGGTTTTCTCTATCCACGGATTCTACATCATCCCCTACGGTCTCGGCATCTA
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CTGGATCGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGCACAA
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ACATTCATTCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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AF RR4FL23JQ C 395
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GG
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GTGGTGGTGCTTCTCTCCCTACTCGTGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGAC
TCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTACTCCATGACTAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGA
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TTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTC
CTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATAGCGGCCGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCT
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GTTTTTTGGCCTATACTGCTTTGCTACTGGATCGTTCTCTTTGTCCTCACCATTAGACGC
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AGCGGCCGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCTCTCGTGCTGATTGATTGATCCAGAAG
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DS 

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DS 



AS 1 4

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TATCTTCTGATGTTGTGCTTACACTTTCATTGTTTTTACGTCTTTTTCTGGAAACAAACA
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GACCATTCTTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY61TF U 1
AF RR4AN78TF U 28
AF RR4AN78JQ C 371
AF RR4CY61JQ C 861
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BS 841 896 RR4AN78TF
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BS 898 907 RR4AN78TF
BS 908 1061 RR4AN78JQ
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BS 1174 1275 RR4CY61JQ

RD RR4CY61TF 736 0 0
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AATCCGAAGAGACCAGACGCCAAAAATAAATCAATGGATTTAGATCAATGGATATCCAAG
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TTCACTATTCTTTTGCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACACTTTTGCGGGGA
AATCATGAAAGCAGACAGCTTACTCAGGTCTATGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAG
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GCTATTATCGATGGCACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTACGGACA
ATCGACCAGATAAGACTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGT
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TGGTTGGCTTTTCGGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4AN78TF 880 0 0
G
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GATATCCAGCCCATATCACACTTTTGCGGGGAAATCATGAAAGCAGACAGCTTACTCAGG
TCTATGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAATGCCAATGCTTGGAGATACT
GCACGGATG******ACTATCTCACTCTCTCAGCTATTATCGATGGCACCGTTCTATGTG
TTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTACGGACAATCGACCAGATAAGACTGATTGATCGAA
ATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGATCTTATGTGGGAGTGATCCTGAAGAC
ATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGGCTGGTTGGCTTTTCGGCTCTAGGGTTACC
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TACTGCTACCGCTGTGGGAATGTAGCTTCTATGTTGAGC

QA 2 880 2 880
DS 

RD RR4AN78JQ 803 0 0
TTTTGCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACACTTTTGCGGGGAAATCATGAAA
GCAGACAGCTTACTCAGGTCTATGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAATG
CCAATGCTTGGAGATACTGCACGGATG******ACTATCTCACTCTCTCAGCTATTATCG
ATGGCACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTACGGACAATCGACCAGA
TAAGACTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGATCTTATGT
GG*AGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGGCTGGTTGGCTT
TTCGGCTCTAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACTAGTTTGCCGC
GCACATCAGCTTGTGCAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTTCAAGACAAAGGCCTTGTAACT
GTGTGGTCTGCACCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTAGCTTTTATGTTGAGCTTC
AATGACAACATGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAAGAGAACAATCAAATG
AGAGGGCCAAGAACAGGTGTTCCTTACTTCCTATGATGATCACGTTATTAGTCTCATATT
GTTCTGACGAAGTTAGCGCCATTACCGTTGGTTTATGTTCTTGCAAGGTATATCTTCTGA
TGTTGTGCTTACACTTTCATTGTTTTTACGTCTTTTTCTGGAAACAAACACATTTTCTTG
TGGAACTGATCGTCACTTTAGCA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4CY61JQ 415 0 0
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TGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAA
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AGTTAGCGCCATTACCGTTGGCTTATGTTCTTGCAAGGTATATCTTCTGATGTTGTGCTT
ACACTTTCATTGTTTTTACGTCTTTTTCTGGAAACAAACACATTTTCTTGTGGAACTGAT
CGTCACTTTAGCAATTCTAGTGGTTTTTATGGAGTTTCTTTTTTCTTTTTAACTTTGATC
TCTGACTCCGGACGTTGTTATACATGTGTTCTGTATGTAAGACCATTCTTTTCAC

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 4

CO CL1746Contig1 1330 4 6 U
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GGTTATCAGTGGATACGACGAAAAGGGAAACCTGCTCGAAGAGAGATTGCTCCCATCGTT
GTATCAAACCATGTTTCTTATATTGAACCAATCTTCTACTTCTATGAGCTATCACCCACC
ATTGTTGCATCCGAGTCTCATGATTCACTTCCTGTTGTCGGAACTATTATCAGGGCTATG
CAGGTGATATATGTTAATAGATCCTCACAGGCATCAAAGAAGGACGCCGTGCATGAAATA
AAGAGAAAAGCTTCCTGCGGTAGATTTCCTCGTCTGCTGCTATTCCCGGAAGGAACCACT
ACCAATGGGAAAGCTATTATTTCCTTCCAGCTCGGTGCTTTCATCCCAGGTTACCCTATT
CAACCCGTCGTGGTCCGGTATCCCCATGTACATTTTGATCAATCCTGGGGAAACATTTCT
TTGTTGATGCTCATGTTCAGAATGTTCACCCAGTTTCACAATTTCATGGAGGTGGAATAC
CTTCCAGTAATTTATCCCAATGACAATCAAAAACAAAATGCTGTGCGTCTCTCGCAGAAG
ACAAGTCATGCAATTGCATCATCTTTGAATGTCGTCCAAACATCTCATTCTTATGGGGAC
TTGATGCTACTCAACAAAGCATCTGAGTTAAATCTGGAAAATCCTTCAAATTACATGGTT
GAAATGGCAAAGGTTGAGTCGCTATTCCATATAAGCAACTCAGAAGCAGTGCGGTATTTG
GAGACATTTTCTTCCATGAATCCGGATTCAAGTGGATGTGTTACGCTACATGACTTTCTT
CGGGTTCTCAAACTGAAGCCTTGCACTCTTTCTAGAGAGATATTCGGGTTCATCGATGTG
GAGAAGACAGGATCAATCACTTTCAGACAGTTCTTGTTTGCATCGGCTCACGTATCAACA
CAGCCGCTTTTTCAGCAAACATGCGAGCTATCCTTTTCACGTTGTGACGCAGATGGAGAT
GGCCATATCTCCATTCAAGAACTCGGAGATGTACTGAAACCCACAATCCCAAACTTGAAC
AAGGATGAGATTCAAGGGATGTACATTTTGCTTGATGACGACAAAGATCAAAGAATCAGC
AAGAATGATTTCTTGTCCTGCTTAAGAAGAAACCCTCTGCTCATAGCTATCTTTGCGCTT
ACCTTTGCTCCAACATAACACATAGAAACAAGATTATGACTTTGTCTTGTTGTATCATTA
TATACCTTTTGTTTTCTTTTGATATAGTAAAAAAGAAAGGGGCTGCTAAGTTTTAGGCCT
ATCCTCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK88TF U 1
AF RR4EN92TF U 577
AF RR4EN92JQ C 577
AF RR4AK88JQ C 572
BS 1 732 RR4AK88TF
BS 733 733 RR4EN92TF
BS 734 761 RR4AK88TF
BS 762 1242 RR4EN92TF
BS 1243 1243 RR4EN92JQ
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RD RR4AK88TF 761 0 0
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GTATCAAACCATGTTTCTTATATTGAACCAATCTTCTACTTCTATGAGCTATCACCCACC
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CAGGTGATATATGTTAATAGATCCTCACAGGCATCAAAGAAGGACGCCGTGCATGAAATA
AAGAGAAAAGCTTCCTGCGGTAGATTTCCTCGTCTGCTGCTATTCCCGGAAGGAACCACT
ACCAATGGGAAAGCTATTATTTCCTTCCAGCTCGGTGCTTTCATCCCAGGTTACCCTATT
CAACCCGTCGTGGTCCGGTATCCCCATGTACATTTTGATCAATCCTGGGGAAACATTTCT
TTGTTGATGCTCATGTTCAGAATGTTCACCCAGTTTCACAATTTCATGGAGGTGGAATAC
CTTCCAGTAATTTATCCCAATGACAATCAAAAACAAAATGCTGTGCGTCTCTCGCAGAAG
ACAAGTCATGCAATTGCATCATCTTTGAATGTCGTCCAAACATCTCATTCTTATGGGGAC
TTGATGCTACTCAACAAAGCATCTGAGTTAAATCTGGAAAATCCTTCAAATTACATGGTT
GAAATGGCAAAG*TTGAGTCGCTATTCCATATAAGCAACTC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EN92TF 670 0 0
G
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AAAATCCTTCAAATTACATGGTTGAAATGGCAAAGGTTGAGTCGCTATTCCATATAAGCA
ACTCAGAAGCAGTGCGGTATTTGGAGACATTTTCTTCCATGAATCCGGATTCAAGTGGAT
GTGTTACGCTACATGACTTTCTTCGGGTTCTCAAACTGAAGCCTTGCACTCTTTCTAGAG
AGATATTCGGGTTCATCGATGTGGAGAAGACAGGATCAATCACTTTCAGACAGTTCTTGT
TTGCATCGGCTCACGTATCAACACAGCCGCTTTTTCAGCAAACATGCGAGCTATCCTTTT
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AACCCACAATCCCAAACTTGAACAAGGATGAGATTCAAGGGATGTACATTTTGCTTGATG
ACGACAAAGATCAAAGAATCAGCAAGAATGATTTCTTGTCCTGCTTAAGAAGAAACCCTC
TGCTCATAGCTATCTTTGCGCTTACCTTTGCTCCAACATAACACATAGAAACAAGATTAT
GACTT
TGTC

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR4EN92JQ 711 0 0
G
ATGCTGTGCGTCTCTCGCAGAAGACAAGTCATGCAATTGCATCATCTTTGAATGTCGTCC
AAACATCTTATTCTTATGGGGACTTGATGCTACTCAACAAAGCATCTGAGTTAAATCTGG
AAAATCCTTCAAATTACATGGTTGAAATGGCAAAGGTTGAGTCGCTATTCCATATAAGCA
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GTGTTACGCTACATGACTTTCTTCGGGTTCTCAAACTGAAGCCTTGCACTCTTTCTAGAG
AGATATTCGGGTTCATCGATGTGGAGAAGACAGGATCAATCACTTTCAGACAGTTCTTGT
TTGCATCGGCTCACGTATCAACACAGCCGCTTTTTCAGCAAACATGCGAGCTATCCTTTT
CACGTTGTGACGCAGATGGAGATGGCCATATCTCCATTCAAGAACTCGGAGATGTACTGA
AACCCACAATCCCAAACTTGAACAAGGATGAGATTCAAGGGATGTACATTTTGCTTGATG
ACGACAAAGATCAAAGAATCAGCAAGAATGATTTCTTGTCCTGCTTAAGAAGAAACCCTC
TGCTCATAGCTATCTTTGCGCTTACCTTTGCTCCAACATAACACATAGAAACAAGATTAT
GACTTTGTCTTGTTGTATCATTATATACCTTTTGTTTTCTTTTGATATAG

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR4AK88JQ 759 0 0
AACAAA
ATGCTGTGCGTCTCTCGCAGAAGACAAGTCATGCAATTGCATCATCTTTGAATGTCGTCC
AAACATCTCATTCTTATGGGGACTTGATGCTACTCAACAAAGCATCTGAGTTAAATCTGG
AAAATCCTTCAAATTACATGGTTGAAATGGCAAAGGTTGAGTCGCTATTCCATATAAGCA
ACTCAGAAGCAGTGCGGTATTTGGAGACATTTTCTTCCATGAATCCGGATTCAAGTGGAT
GTGTTACGCTACATGACTTTCTTCGGGTTCTCAAACTGAAGCCTTGCACTCTTTCTAAAG
AGATATTCGGGTTCATCGATGTGGAGAAGACAGGATCAATCACTTTCAGACAGTTCTTGT
TTGCATCGGCTCACGTATCAACACAGCCGCTTTTTCAGCAAACATGCGAGCTATCCTTTT
CACGTTGTGACGCAGATGGAGATGGCTATATCTCCATTCAAGAACTCGGAGATGTACTGA
AACCCACAATCCCAAACTTGAACAAGGATGAGATTCAAGGGATGTACATTTTGCTTGATG
ACGACAAAGATCAAAGAATCAGCAAGAATGATTTCTTGTCCTGCTTAAGAAGAAACCCTC
TGCTCATAGCTATCTTTGCGCTTACCTTTGCTCCAACATAACACATAGAAACAAGATTAT
GACTT*GTCTTGTTGTATCATTATATACCTTTTGTTTTCTTTTGATATAGTAAAAAAGAA
AGGGGCTGCTAAGTTTTAGGCCTATCCTCCCAC

QA 7 759 7 759
DS 



AS 1 5

CO CL1747Contig1 525 5 9 U
GATAACATTCAAGGAATTAAAAAAATCGTAAAGAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGA
GAAAAAGTAGTTTCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGAAAGA
ATAAATGCTTATAGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAAT
GCACCGCCGGATATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAACGTGTGCGTCGTTGCAAG
GCGTCATCCGGAAAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCAC
TATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAG
AACGGAAAATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCGATAACTTCTCATTAATAC
TATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTTTAAACAAGAAATAATAACT
ATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B614JQ C 13
AF RR4B626JQ C 13
AF RR4B614TF U 13
AF RR4B626TF U 13
AF RR4E815TF U 1
BS 1 12 RR4E815TF
BS 13 14 RR4B614TF
BS 15 72 RR4E815TF
BS 73 73 RR4B614TF
BS 74 222 RR4E815TF
BS 223 223 RR4B614TF
BS 224 401 RR4E815TF
BS 402 402 RR4B614TF
BS 403 525 RR4E815TF

RD RR4B614JQ 390 0 0
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TCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAATGCTTAT
AGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAATGCACCGCCGGAT
ATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAACGTGTGCGTCGTTGCAAGGCGTCATCCGGA
AAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCACTATTGCCACTGC
TACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAA
ATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCG

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4B626JQ 390 0 0
GGAATTAAAAAAATCGTAAAGAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTAGTT
TCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAATGCTTAT
AGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAATGCACCGCCGGAT
ATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAACGTGTGCGTCGTTGCAAGGCGTCATCCGGA
AAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCACTATTGCCACTGC
TACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCCCCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAA
ATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCG

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4B614TF 390 0 0
GGAATTAAAAAAATCGTAAAGAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTAGTT
TCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAATGCTTAT
AGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAATGCACCGCCGGAT
ATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAACGTGTGCGTCGTTGCAAGGCGTCATCCGGA
AAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCACTATTGCCACTGC
TACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAA
ATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCG

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4B626TF 390 0 0
GGAATTAAAAAAATCGTAAAGAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTAGTT
TCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAATGCTTAT
AGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAATGCACCGCCGGAT
ATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAACGTGTGCGTCGTTGCAAGGCGTCATCCGGA
AAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCACTATTGCCACTGC
TACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAA
ATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCG

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4E815TF 525 0 0
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GAAAAAGTAGTTCCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGAAAGA
ATAAATGCTTATAGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAAT
GCACCGCCGGATATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAATGTGTGCGTCGTTGCAAG
GCGTCATCCGGAAAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCAC
TATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAG
AACGGAAAATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAACTTCTCATTAATAC
TATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTTTAAACAAGAAATAATAACT
ATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAA

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 5

CO CL1748Contig1 624 5 12 U
GGGTTGGTATAAAAGAAGAGGAGAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACT
TATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTG
TATTGGCCTTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACT
CATCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGC
TCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAA
GCCAACAACCTCGAATTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAG
GTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTA
GAA*GAAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCATGATTTTTTTTTTTAACTTCA
ATACAACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAG
AAGTTTTGGCGATATTTTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTTAT
GATAGTGGCCGACAAGATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B428TF U 34
AF RR4H270TF U 4
AF RR4DE44JQ C 155
AF RR4DE44TF U 45
AF RR4B428JQ C 1
BS 1 5 RR4B428JQ
BS 6 33 RR4H270TF
BS 34 182 RR4B428TF
BS 183 183 RR4H270TF
BS 184 392 RR4B428TF
BS 393 393 RR4H270TF
BS 394 417 RR4B428TF
BS 418 418 RR4H270TF
BS 419 423 RR4DE44TF
BS 424 424 RR4B428JQ
BS 425 559 RR4DE44TF
BS 560 624 RR4B428JQ

RD RR4B428TF 384 0 0
AAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAAGC
TAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTATTGTTTATAACTCCAACAT
CTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACTCACCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGA
TTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGA
TGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAATTACTTCTTCTTCTGGAA
AATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAA*
ATCTATCGATGGATTATCCAAGGT

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4H270TF 415 0 0
GG
GGTATAAAAGAAGAGGAGAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCA
AAGCTAAAATCACTTGATACAATGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTG
GCCTTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCGCACTAGCTACTCATCT
CCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATG
ATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAA
CGACCTCGAATTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGAC
GAAGGAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTT

QA 3 415 3 415
DS 

RD RR4DE44JQ 405 0 0
TTTTT
TGCAACTCCACACTAACTACTCATTTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTA
TTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGT
CAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAATTACTTCTTTTTCTGGAAAATCTA
TGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTAT
CGATGGATTATCCAAGGTTTAGAA*GAAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCA
TGATTTTTTTTTTTAACTTCAATACAACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAAC
TGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTTTG

QA 6 405 6 405
DS 

RD RR4DE44TF 515 0 0
G
ACAAACAGAGAAACTTATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAAGCTAATTAGAGTCT
CCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAAC
TCCACACTAACTACTCATCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGA
TGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAA
CTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAATTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACG
AAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGG
ATTATCCAAGGTTTAGAAAGAAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCATGATTT
TTTTTTTTAACTTCAATACAACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTA
AGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTTTG

QA 2 515 2 515
DS 

RD RR4B428JQ 624 0 0
GGGTTGGTATAAAAGAAGAGGAGAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACT
TATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTG
TATTGGCCTTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACT
CACCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGC
TCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAA
GCCAACAACCTCGAATTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAG
GTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAA*ATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTA
GAA*GAAGACGGCCAGTTCACAGCAAGTCTCTACGTCCATGATTTTTTTCT**AATTTCA
ATACAACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAG
AAGTTTTGGCGATATTTTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTTAT
GATAGTGGCCGACAAGATTTAAGC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 4

CO CL1749Contig1 1392 4 25 U
CGACGTTTCAAAAACACATTTATTACTCATCTAAATTAAAATCTTCCCACGAAACAACTA
ATGAGCTAACAATAATGTCTGCGAGAAACATAATCATAGGAAAGCAAGACTGAATAAGAA
ACAGTAAACA*GAAAGTTTTAGAGTACACAACAAAAGGACGTGCAAGGAAAATTAACCGC
AAACCGGTTTCACAAATAAATAAAAA*GAACGATCTGACCAGGTGAAACATTGAGACGCC
TTCAGAG**GCTTTACACCTTGCGGACTTGAATGTTATGAGTCGATTGAGATCTCCAGAT
TGGTTGTGACCCGCTCTGTACAATCGCTATTTCCTCTCCCTTCTTCACCATTCCTTGTTT
CAGCAGTGTAGCCAAAGCATTAGAGAAAGTGTCTTCTGCATCATCTGAGAACTCCATATA
TATGGGACATACACCTTGATACAAGGCTAATCTTTGCTGTATCTTTTTCTCATTTGTGAA
GGCATAGATTGTGCCGGAAGGGCGATAGTGACTTAGTAGTATGGCCATGAAACCAGTTCT
GGTGAAGACGACAGTTGAAGTTCCAAGTGTGTTTGACATCATGGTTGCGTGGTATGCAAA
CATCTCACTCATATGGTTCTTAAAGGCTTGGCCAAGATTAGCTGGCATTTCACTACTAGT
AGTAATGGTGGCTTCCGTTCGCAGTGCAACTGTATGCATCACTCCAGCAGCTTTCAATGG
GAATTTTCCGTGAGCAGTCTCTCCTGAAAGCATTACTGCATCAGCACCTTCTCTAACAGC
AATAGCAATGTCAGAAACCTCCGCCCTGGTTGGAGTTGGATGAACTATCATACTCTCAAG
CATGTTAGTCGCAACGATAACAGCTTTTCCCATGCTACGGCATAGGTTAATGATCTTTCC
CTGAAGTATGGGTACTTCTTCAATAGGAAGCTCTGCGCTTTCAATTTTAACTATCACGTG
AATATCAGCACCACAACCTTTAAGGTAATTCTTGAGTTCATGTACCACTTGTGCATCTTT
GACAAAAGAAACTGCATAAAAGTCAACTTTGTTCTCCACTCCAAACTTAATATCCTCCCA
ATCCTTCTCAGTGATTGAAGGTAACGTTGCACTCTTCCCTCGGACATTCAAGTGTCTCCT
TGACTTAAGCTCTCCACCATCAACAACTTCACATTTGACAGAGTCTTCGGTCTTCGACTT
CACCATAAACGACATCATACCACCATCAACAAGGAGCATGTCTCCCGCTTCAACATCGTT
GACAAAGTCATCATAGTTAACACTGACACAACTTGGTGTGCTGACTCCTCTCTCAATTGT
AAAAGTAAACTCTTGACCAGGCTCTAACATAATCGGTTGTGGTAAATCTCCACTCCTAAC
TTCTGGACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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C
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TTCACAAATAAATAAAAA*GAACGATCTGACCAGGTGAAACATTGAGACGCCTTCAGAG*
*GCTTTACACCTTGCGGACTTGAATGTTATGAGTCGACTGAGATCTCCAGATTGGTTGTG
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TGGGTACTT

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GACCCCC

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DS 



AS 1 5

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GATGCAAAATCTTGGTTTTTAATAGCTTCCTCCATTTGCACAATCCGTTTCGGCACAACT
TCTTTTGCTCTGTGCTGTAGAAACAAACTCGTCTCAACACTTTCTCGCATTCCAGAGGTG
CTGCTCGTTTCCTTCTGCCGTGAACTCACCACAGCAATGATGATAACAAGATCATCCCAA
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TTCCACTTGACAAATCCACCAAACAAACTACGGCAAGCACTTCCTGAACCTTGCCTGGCT
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AGACAAGCAAATCCAGCAGCAGAAGAAGCTAAGCCAGCAGCAGTAGGGAAGTTGTTATGA
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CGTCGTTGCGCAGAGAGAGAGATCTGGAGAGAGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GATGCAAAATCTTGGTTTTTAATAGCTTCCTCCATTTGCACAATCCGTTTCGGCACAACT
TCTTTTGCTCTGTGCTGTAGAAACAAACTCGTCTCAACACT

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DS 

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GT
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QA 3 745 3 745
DS 

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CCTTTTTGATCCTGAGATCCAATCTTGTCTTTCATTTCAGGTGGAGGTTGCAGATTCTCA
ACACTGTTTGCTCCCTCTAATCCTGCCTCCTTTAGAATCGAATTGTCTCCCGCTACGTAA
CTCTTCATATCAGTGTCAGACTTAGGAGGGAAATAGTAGAGAAGCCCCTGGAGAAGTTGA
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GTCTCAACACTTTCTCGCATTCCAGAGGTGCTGCTCGTTTC
CTTCT

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DS 

RD RR4C387TF 756 0 0
GAGGTGTCATCATGT
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TTTCGGCACAACTTCTTTTGCTCTGTGCTGTAGAAACAAACTCGTCTCAACACTTTCTCG
CATTCCAGAGGTGCTGCTCGTTTCCTTCTGCCGTGAACTTACCACAGCAATGATGATAAC
AAGATCATCCCAATGCTTCTCATCTGCAAGTTGAACTGCAACGCTATCACTTCCATCTTC
TTTGCTTCCCATTTTCCACTTGACAAATCCACCAAACAAACTACGGCAAGCACTTCCTGA
ACCTTGCCTGGCTATCGCAGAAAGCTGGCTTAGATCTTCCTCTACATTCATCAACTTTGC
AAGAGAGAAAACTAGACAAGCAAATCCAGCAGCAGCAGAAGCTAAGCCAGCAGCAGTAGG
GAAGTTGTTATGAGAAGCAATATGCAGATTCAATCTCTCCCAATCTTTCTTCTCAATCTT
CACACCTTTCTCCTTGTCTTCGACATCACCACCACGGCTTCGAATCTCCCTCAAACAGTT
CTGGTACCTACTCCCTGATAGAGAGATCTCCTTGCCGTTGAGCCACATTCGATCCCGATC
GAAAGCGGGACTGACGGCGACGGTGGTGACGGTGCAGAGGTGATCGGGATCGAGAGTTAC
GCTGATGCTGTCGTTTACTG
C

QA 16 755 16 755
DS 

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CGGCACACTC
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CTCGTTTC*TTCTGCCGTGA*CTCACCACAGCAATGATGATAACAAGATCATCCCAATGC
TTCTCATCTGCAAGTTGAACTGCAACGCTATCACTTCCATCTTCTTTGCTTCCCATTTTC
CACTTGACAAATCCACCAAACAAACTACGGCAAGCACTTCCTGAACCTTGCCTGGCTATC
GCAGAAAGCTGGCTTAGATCTTCCTCTACATTCATCAACTTTGCAAGAGAGAAAACTAGA
CAAGCAAATCCAGCAGCAGAAGAAGCTAAGCCAGCAGCAGTAGGGAAGTTGTTATGAGAA
GCAATATGCAGATTCAATCTCTCCCAATCTTTCTTCTCAATCTTCACACCTTTCTCCTTG
TCTTCGACATCACCACCACGGCTTCGAATCTCCCTCAAACAGTTCTGGTACCTACTCCCT
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ACTGGGAGGATCCGGACCTCGTCTCTCTTTCCCCAATACTTAATCACCGCGATGTTCGTC
GGAGTTTGAGCCGTCACCGTGTGCACCCATTTCTCCACCGCCATAAGAAGTGATCTTCGT
CGTTGCGCAGAGAGAGAGATCTGGAGAGAGAGTTT

QA 11 765 11 765
DS 



AS 1 5

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GATGAGAAGATGTCGAGGATTCAAGTTGAGACTAGGGTTAGATTTGTGGTGATCGGGGAG
AGGTGGATGGAGG*TGGAGAAGGAGTTTCAGGCGTTGGCTAGCCTTGAAGGAGACTATCT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4ET19TF U 1
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AF RR4CJ09JQ C 27
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ATCCACTGTCTGAAGATGCCTGATTACAAGTACATCCCGGGAGAGAACCCGATCTTCATG
GATGAGAAGATGTCGAGGATTCAAGTTGAGACTAGGGTTAGATTTGTGGTGATCGGGGAG
AGGTGGATGGA

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DS 

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GG
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TTCTCTTTACCTACATTCGGAATCTAAAGCAGAGAGGGGGTTGAAACATGTTTCTGAAAG
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AGCTCGGCTACTGCTTGGGAGTCACATCTCTGGACAAGATCGGGCAAGGGAAGATCAGAG
AGCACACCGGTGAAGTGATGTTCCCGGTTGTTTTCACCGGGATAACTTTCAAGATCTCCC
AAGGAGAGACACTCGAGGGTGTGGTGCACAAGGTGCTGAAGCAGGGTGTCTTCTTGAAGT
GTGGGCCGGTTGAGAACGTTTACATCCACTGTCTGAAGATGCCTGATTACAAGTACATCC
CGGGAGAGAACCCGATCTTCATGGATGAGAAGATGTCGAGGATTCAAGTTGAGACTAGGG
TTAGATTTGTGGTGATCGGGGAGAGGTGGATGGAGGGTGGAGAAGGAG
TT

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DS 

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GG
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GTGTGATGCTGAAGAGGTCTATCATGATACAGTTGCTGGACGCGTTTACTGCAAAGAAAG
CAACCAAGGAGCTCGGCTACTGCTTGGGAGTCACATCTCTGGACAAGATCGGGCAAGGGA
AGATCAGAGAGCACACCGGTGAAGTGATGTTCCCGGTTGTTTTCACCGGGATAACTTTCA
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TCTTGAAGTGTGGGCCGGTTGAGAACGTTTACATCCACTGTCTGAAGATGCCTGATTACA
AGTACATCCCGGGAGAGAACCCGATCTTCATGGATGAGAAGATGTCGAGGATTCAAGTTG
AGACTAGGGTTAGATTTGTGGTGATCGGGGAGAGGTGGATGGAGG*TGGAGAAGGAG

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GG
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TCTCTCTCTTTCTCTTTACCTACATTCGGAATCTAAAGCAGAGAGGGGGTTGAAACATGT
TTCTGAAAGTGGAGCTACCATGGAACGTGATGATTCCAGCTGCAAACATGGGTGAGAAAG
GTGTGATGCTGAAGAGGTCTATCATGATACAGTTGCTGGACGCGTTTACTGCAAAGAAAG
CAACCAAGGAGCTCGGCTACTGCTTGGGAGTCACATCTCTGGACAAGATCGGGCAAGGGA
AGATCAGAGAGCACACCGGTGAAGTGATGTTCCCGGTTGTTTTCACCGGGATAACTTTCA
AGATCTCCCAAGGAGAGACACTCGAGGGTGTGGTGCACAAGGTGCTGAAGCAGGGTGTCT
TCTTGAAGTGTGGGCCGGTTGAGAACGTTTACATCCACTGTCTGAAGATGCCTGATTACA
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CAGGCGTTGGCTAGCCTTGAAGGAGACTATCTTGGACCAATCTCTGAAGAGTGATCTGCT
TTGTCTCCTCATGTGATGTTGTTTTTAGGGAATTTCTATGTGATAATAACTCAAGTCTTT
AGTTTTTGTATTGGTAACTACTCTTTAGTTGTTCAAATAATTAATGAACCTTGATCTTTG
AATATTAATGATTATTTTCCACGCCCG

QA 3 809 3 809
DS 

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AGGAGCTCGGCTACTGCTTGGGAGTCACATCTCTGGACAAGATCGGGCAAGGGAAGATCA
GAGAGCACACCGGTGATGTGATGTTCCCGGTTGTTTTCACCGGGATAACTTTCAAGATCT
CCCAAGGAGAGACACTCGAGGGTGTGGTGCACAAGGTGCTGAAGCAGGGTGTCTTCTTGA
AGTGTGGGCCGGTTGAGAACGTTTACATCCACTGTCTGAAGATGCCTGATTACAAGTACA
TCCCGGGAGAGAACCCGATCTTCATGGATGAGAAGATGTCGAGGATTCAAGTTGAGACTA
GGGTTAGATTTGTGGTGATCGGGGAGAGGTGGATGGAGG*TGGAGAAGGAGTTTCAGGCG
TTGGCTAGCCTTGAAGGAGACTATCTTGGACCAATCTCTGAAGAGTGATCTGCTTTGTCT
CCTCATGTGATGTTGTTTTTAGGGAATTTCTATGTGATAATAACTCAAGTCTTTAGTTTT
TGTATTGGTAACTACTCTTTAGTTGTTCAAATAATTAATGAACCTTGATCTTTGAATATT
AATGATTATTTTCCACGCCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 5

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ATAATAATTAATTACTTATTTCCACATCTAAGTAATAGGTACATATGATATATAAATACT
TCCAACTGATGCTTTCTTCGTCCACATCTCCCAAACTTTGAGTTAAGCGTTCACGACTCA
TCCATAAACACAGCGCCATGACCACTTGACCTTACCAACTTCTTCAGCAAAAGAACCACT
ATCGCAATCGTGAGTCCAATCGCTGCCCACGTGAACAGCCTATCATCACCCCTTCTCTGA
GCCGCCCTGACAACAACAGTCCCTTGCTCCCTCCGCCTCACCAAACCGTTTCTGTTGTCT
CCTGCTGCAACCTCGACCGTTGCATTTGCTCCAGGAACAACCGTCTGACCTGCCTCTAAA
GCGATTTGATCGACTACATTTTCTGCAGTAGTTGTAACAGCTTCTGGTATAACAGGCTCA
GCAGCTTCAGTGTCCTGCGGCTTGGTTTGGGACTGACCGTCCGAATCAGCAGAAGAGGGT
TTGTTACATTCCCCAGGAATAGGTTTAGGAGAAGGTGTTTTGCTTAGCATGTATTGATGA
ATCTCATCAATAACTTTTTGACGCTCAGGAGAACCAAATTTGGGTGGTGACTCGCGTGAT
TTAGTGGCAAGTACACGTCTCTCCTCTTTTGGGTAATCTACAGAGCCAATTGCTCCACTG
GGGTTTGAAGGCATGAACGCAATGAGAGCCACCAATGCAGTCCGAACACTCCATGAGGGT
TGCCAATGCTCAGGATGGTAATTAGAAATACTCAAACAAATCTTGGTGTTAGTTTCAAAA
CGACCACTAGGGGTCAATAACAAGAAGGAAGGAGGCTTGAAAGGATAATCGGAAGGCAAC
TGAATCCTCCCGTGATAAATCCCTCCTTCAAATTCACTCTCGCTCGGCCCTCTGATCGCG
AATTGCCACTCAAATATATTCTCCTCGAGGGGAAGAGACATGAAATCGTCAGAGGGATTA
GCTTGCATCTCCTTAACCTCCTGGAGAATCCTCTTCACCGCCGGGTTCTTCCGGTTATAT
CTCTCGTCCGCCATCTTCTTCTCTCCCGCTCTGATCAGATCCAAATCCAATCCGCCGCTT
AAAAGTCTCGATAATGTTGTCAACAGAAGCAGATTTTATTATTGTTTTGAAATTAAATAC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4A208JQ U 60
AF RR4FM78JQ U 1
AF RR4A208JQD U 41
AF RR4FM78TF C 417
AF RR4A208TFB C 414
BS 1 325 RR4FM78JQ
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TTCCAACTGATGCTTTCTTCGTCCACATCTCCCAAACTTTGAGTTAAGCGTTCACGACTC
ATCCATAAACACAGCGCCATGACCACTTGACCTTACCAACTTCTTCAGCAAAAGAACCAC
TATCGCAATCGTGAGTCCAATCGCTGCCCACGTGAACAGCCTATCATCACCCCTTCTCTG
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AGCAGCTTCAGTGTCCTGCGGCTTGGTTTGGGACTGACCGTCCGAATCAGCAGAA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4FM78JQ 789 0 0
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ATAATAATTAATTACTTATTTCCACATCTAAGTAATAGGTACATATGATATATAAATACT
TCCAACTGATGCTTTCTTCGTCCACATCTCCCAAACTTTGAGTTAAGCGTTCACGACTCA
TCCATAAACACAGCGCCATGACCACTTGACCTTACCAACTTCTTCAGCAAAAGAACCACT
ATCGCAATCGTGAGTCCAATCGCTGCCCACGTGAACAGCCTATCATCACCCCTTCTCTGA
GCCGCCCTGACAACAACAGTCCCTTACTCCCTCCGCCTCACCAAACCGTTTCTGTTGTCT
CCTGCTGCAACCTCGACCGTTGCATTTGCTCCAGGAACAACCGTCTGACCTGCCTCTAAA
GCGATTTGATCGACTACATTTTCTGCAGTAGCTGTAACAGCTTCTGGTATAACAGGCTCA
GCAGCTTCAGTGTCCTGCGACTTGGTTTGGGACTGACCGTCCGAATCAGCAGAAGAGGGT
TTGTTACATTCCTCAGGAATGGGTTTAGGAGAAGGTGTTTTGCTTAGCATGTATTGATGA
ATCTCATCAATAACTTTTTGACGCTCAGGAGAACCAAATTTGGGTGGTGACTCGCGTGAT
TTAGTGGCAAGTACACGTCTCTCCTCTTTTGGGTAATCTACAGAGCCAATTGCTCCACTG
GGGTTTGAAG*CATGAACGCAATGAGAGCCACCAATGCAGTCCGAACACTCCATGAGGGT
TGCCAATGC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4A208JQD 749 0 0
G
TCAAACAAACTCGTTTGGTATAATAATTAATTACTTATTTCCACATCTAAGTAATAGGTA
CATATGATATATAAATACTTCCAACTGATGCTTTCTTCGTCCACATCTCCCAAACTTTGA
GTTAAGCGTTCACGACTCATCCATAAACACAGCGCCATGACCACTTGACCTTACCAACTT
CTTCAGCAAAAGAACCACTATCGCAATCGTGAGTCCAATCGCTGCCCACGTGAACAGCCT
ATCATCACCCCTTCTCTGAGCCGCCCTGACAACAACAGTCCCTTGCTCCCTCCGCCTCAC
CAAACCGTTTCTGTTGTCTCCTGCTGCAACCTCGACCGTTGCATTTGCTCCAGGAACAAC
CGTCTGACCTGCCTCTAAAGCGATTTGATCGACTACATTTTCTGCAGTAGTTGTAACAGC
TTCTGGTATAACAGGCTCAGCAGCTTCAGTGTCCTGCGGCTTGGTTTGGGACTGACCGTC
CGAATCAGCAGAAGAGGGTTTGTTACATTCCCCAGGAATAGGTTTAGGAGAAGGTGTTTT
GCTTAACATGTATTGATGAATCTCATCAATAACTTTTTGACGCTCAGGAGAACCAAATTT
GGGTGGTGACTCGCGTGATTTAGTGGCAAGTACACGTCTCTCCTCTTTTGGGTAATCTAC
AGAGCCAATTGCTCCACTGGGGTTTGAAGGCATGAACGCAATGAGAGCCACCAATGCAGT
CCGAACACTCCATGAGGGTTGCCAATGC

QA 2 749 2 749
DS 

RD RR4FM78TF 750 0 0
TAAAGCGATTTGATCGACTACATTTTCTGCAGTAGCTGTAACAGCTTCTGGTATAACAGG
CTCAGCAGCTTCAGTGTC*TGCGACTTGGTTTGGGACTGACCGTCCGAATCAGCAGAAGA
GGGTTTGTTACATTCCTCAGGAATGGGTTTAGGAGAAGGTGTTTTGCTTAGCATGTATTG
ATGAATCTCATCAATAACTTTTTGACGCTCAGGAGAACCAAATTTGGGTGGTGACTCGCG
TGATTTAGTGGCAAGTACACGTCTCTCCTCTTTTGGGTAATCTACAGAGCCAATTGCTCC
ACTGGGGTTTGAAGGCATGAACGCAATGAGAGCCACCAATGCAGTCCGAACACTCCATGA
GGGTTGCCAATGCTCAGGATGGTAATTAGAAATACTCAAACAAATCTTGGTGTTAGTTTC
AAAACGACCACTAGGGGTCAATAACAAGAAGGAAGGAGGCTTGAAAGGATAATCGGAAGG
CAACTGAATCCTCCCGTGATAAATCCCTCCTTCAAATTCACTCTCGCTCGGCCCTCTGAT
CGCGAATTGCCACTCAAATATATTCTCCTCGAGGGGAAGAGACATGAAATCGTCAGAGGG
ATTAGCTTGCATCTCCTTAACCTCCTGGAGAATCCTCTTCACCGCCGGGTTCTTCCGGTT
ATATCTCTCGTCCGCCATCTTCTTCTCTCCCGCTCTGATCAGATCCAAATCCAATCTGCC
GCTTAAAAGTCTCGATAATGTTGTCAAC
CC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4A208TFB 789 0 0
CTCTAAAGCGATTTGATCGACTACATTTTCTGCAGTAGTTGTAACAGCTTCTGGTATAAC
AGGCTCAGCAGCTTCAGTGTCCTGCGGCTTGGTTTGGGACTGACCGTCCGAATCAGCAGA
AGAGGGTTTGTTACATTCCCCAGGAATAGGTTTAGGAGAAGGTGTTTTGCTTAGCATGTA
TTGATGAATCTCATCAATAACTTTTTGACGCTCAGGAGAACCAAATTTGGGTGGTGACTC
GCGTGATTTAGTGGCAAGTACACGTCTCTCCTCTTTTGGGTAATCTACAGAGCCAATTGC
TCCACTGGGGTTTGAAGGCATGAACGCAATGAGAGCCACCAATGCAGTCCGAACACTCCA
TGAGGGTTGCCAATGCTCAGGATGGTAATTAGAAATACTCAAACAAATCTTGGTGTTAGT
TTCAAAACGACCACTAGGGGTCAATAACAAGAAGGAAGGAGGCTTGAAAGGATAATCGGA
AGGCAACTGAATCCTCCCGTGATAAATCCCTCCTTCAAATTCACTCTCGCTCGGCCCTCT
GATCGCGAATTGCCACTCAAATATATTCTCCTCGAGGGGAAGAGACATGAAATCGTCAGA
GGGATTAGCTTGCATCTCCTTAACCTCCTGGAGAATCCTCTTCACCGCCGGGTTCTTCCG
GTTATATCTCTCGTCCGCCATCTTCTTCTCTCCCGCTCTGATCAGATCCAAATCCAATCC
GCCGCTTAAAAGTCTCGATAATGTTGTCAACAGAAGCAGATTTTATTATTGTTTTGAAAT
TAAATACCC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL1753Contig1 769 2 5 U
GCGCGCAGCGTCCCTTTGAGCGGACTAAGGGCATCAATGGTCTTGAAAAGATCATCGTCC
GTGACGATCACGGCAGATCTTTTGAGGTATATATGTATGGAGGTCAAGTAACTTCTTGGA
AGAATGAAAAAGGAGAGGAGTTACTTGTTATGAGTAGCAAGGCTATATTCAATCCTCCAA
CACCAATTCGTGGAGGAATTCCAATATTGTTTCCGCAACACGCTAACACTGGTCCACTTC
CCTCACATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTCTGGGAAATCGACACTAATCCACCCCAGTTGC
CATCAAACTCTTACTATAAAGCTTGGGTTGATCTAATTCTAAGGTCATCCCAAGATGATT
TGAAGATCTGGCCTCATAAGTTTGAGTATAGACTAAGAGTACATTTGGGACCGGAAGGAG
ATTTGGTTTTGACATCTCGTGTTAAGAATACTGATGTAAAGCCGTTTAACTTCACAATAG
CTCTTCACCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTGAAATCCAGGTGGACGGATTGCAGA
ACTTGGATTATCTTGACCAACTAAAGAAGAGAACGCGTTTCACTGATCATGACAAGTCTA
TAACTTTTAAATCTCAGTTTGACAGGATATACCTAAGCACTCCAAATGACATCAGAATCG
TGGACAAGAAGAAACAGAAGACTATTGTTGTATACAAAGAGGGACAAGTTGATGCTGTGG
TGTGGAACCCATGGGAGAAGAAAGTGGAGGACTTGGGAACTGAAGACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GP79TF U 221
AF RR4FM49TF U 1
BS 1 292 RR4FM49TF
BS 293 293 RR4GP79TF
BS 294 478 RR4FM49TF
BS 479 479 RR4GP79TF
BS 480 769 RR4FM49TF

RD RR4GP79TF 289 0 0
G
GCTAACACTGGTCCACTTCCCTCACATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTCTGGGAAATCGAC
ACTAATCCACCCCAGTTGCCATCAAACTCTTACTATAAAGCTTGGGTTGATCTAATTCTA
AGGTCATCCCAAGATGATTTGAAGATCTGGCCTCATAAGTTTGAGTATAGACTAAGAGTA
CATTTGGGACCTGAAGGAGATTTGGTTT*GACATCTCGTGTTAAGAATACTGATGTAAAG
CCGTT*AACTTCACAATAGCTCTTCACCCCTATTTCTCTGTT
CCGATA

QA 2 283 2 283
DS 

RD RR4FM49TF 769 0 0
GCGCGCAGCGTCCCTTTGAGCGGACTAAGGGCATCAATGGTCTTGAAAAGATCATCGTCC
GTGACGATCACGGCAGATCTTTTGAGGTATATATGTATGGAGGTCAAGTAACTTCTTGGA
AGAATGAAAAAGGAGAGGAGTTACTTGTTATGAGTAGCAAGGCTATATTCAATCCTCCAA
CACCAATTCGTGGAGGAATTCCAATATTGTTTCCGCAACACGCTAACACTGGTCCACTTC
CCTCACATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTCTGGGAAATCGACACTAATCCACCTCAGTTGC
CATCAAACTCTTACTATAAAGCTTGGGTTGATCTAATTCTAAGGTCATCCCAAGATGATT
TGAAGATCTGGCCTCATAAGTTTGAGTATAGACTAAGAGTACATTTGGGACCGGAAGGAG
ATTTGGTTTTGACATCTCGTGTTAAGAATACTGATGTAAAGCCGTTTAACTTCACAATGG
CTCTTCACCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTGAAATCCAGGTGGACGGATTGCAGA
ACTTGGATTATCTTGACCAACTAAAGAAGAGAACGCGTTTCACTGATCATGACAAGTCTA
TAACTTTTAAATCTCAGTTTGACAGGATATACCTAAGCACTCCAAATGACATCAGAATCG
TGGACAAGAAGAAACAGAAGACTATTGTTGTATACAAAGAGGGACAAGTTGATGCTGTGG
TGTGGAACCCATGGGAGAAGAAAGTGGAGGACTTGGGAACTGAAGACTA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 5

CO CL1754Contig1 1135 5 7 U
GAACACATCAAGTGGATTCTATATTACTCACAAATGAAGATACAAATCAAAGCAGACCAG
TGCTGCGGAACGGGTTATTATTGTGTTGGTTAACCGCGAAATCACCAAACCCGCTCGTAT
TTGGCTGCTGTGAAACCGGGTTAACCGGGAATTCCCCAAACTCACCAAATGGATTATTAC
TGTAATTATTATTGGCTGTGGGGTTTGGGAGTGCTAGCTGTAGTTGCTGCTGCGGCTGAT
GATGATACGTTGGCTGGTAAGCACCAAAAGGGTTGTTGACAGCTGACTGCTGAGCTGCTG
GATTGCCATTGGACGATGCAAAAGGGTCATGATGAACCTCAAATGGGTTGGGAGCTGGTG
CACCGTAAACAGGACGTTGGGAGGCTATGTAGGCTCCATCATCGTATAGACTGTTTAGTG
TAAGCGTGTCTAAGCCTCCACCCAATTGCCTATCGGTGGCTGCAGAGATATCGTTGCTTG
GTGTTGTTACCAGGGCAAGCTCCCATCCTGAAGGGTCATAATCGTTTGCGTGACCAAACC
GAGGCGTTGAAGGGTTACCATCAGTTGAGATTATGGCTAAAGCAAGTGCGTTTTGGTTCT
CAATCGCTGATGCATCAGGACCACCAGTGTTCAGACCCAGTAAATCATCTGTATCAATGA
TGTTCTGAGACTGAGTGTTGGCTGGAGGAGGAGGAGGCGGGGGAGAAGGTTCAGTCTCTT
CAGATACAAGAACGACATCATCTGAAGGCAACACAACTTCACGTTCTACATGAGACGGTT
CAGCATCTTCGTCAGGAAGTCCATCATCCGGCCTATAAGTTAGAAGCAGTGGCTCAGCTG
GGGCATCGACCGCACGCGGTGCTTCTTTAATATACTCCTCCATTGTACTCAGAAAAGATT
GTGGGGGCTCTCTTAGTACAGGAAACTGAAAATTCCTTGCGAGTTCCAATCCTTTACAGG
CTTCATAGAATTCAGAAAGGCTACGAGCCTGTTGACCAGCACGCTTGTATATTTCAAGGG
AACTATGGCTTCGTGTTTTGGCATTTCAAAGAACTTGTCAATGAGATTGATAATTCCATC
ATTGATAGCACAATAGACTTTAAAACTCTCCTTCAACACCAGAGCAAGTGCATAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4DE36JQ U 2
AF RR4FD16JQ U 1
AF RR4B130JQ U 1
AF RR4FD16TF C 45
AF RR4B130TF C 343
BS 1 342 RR4B130JQ
BS 343 343 RR4FD16JQ
BS 344 466 RR4B130JQ
BS 467 467 RR4FD16JQ
BS 468 685 RR4B130JQ
BS 686 787 RR4FD16TF
BS 788 1135 RR4B130TF

RD RR4DE36JQ 405 0 0
A
ACACATCAAGTGGATTCTATATTACTCACAAATGAAGATACAAATCAAAGCAAACCAGTG
CTGCGGAACGGGTTATTATTGTGTTGGTTAACCGCGAAATCACCAAACCCGCTCGTATTT
GGCTGCTGTGAAACCGGGTTAACCGGGAGTTCCCCAAAATCACCGAATGGATTATTACTG
TAATTATTATTGGCTGTGGGGTTTGGAAGTGCTAGCTGTAGTTGCTGCTGCGGCTGATGA
TGATACGTTGGCTGGTAAGCACCAAAAGGGTTGTTGACAGCTGACTGCTGAGCTGCTGGA
TTGCCATTGGACGATGCAAAAGGGTCATGATGAACCTCAAATGGGTTGGGAGCTGGTGCA
CCATAAACAGGACGTTGGGAGGCTATGTAGGCTCCATCATCGTA

QA 2 405 2 405
DS 

RD RR4FD16JQ 614 0 0
GG
ACACATCAAGTGGATTCTATATTACTCACAAATGAAGATACAAATCAAAGCAGACCAGTG
CTGCGGAACGGGTTATTATTGTGTTGGTTAACCGCGAAATCACCAAACCCGCTCGTATTT
GGCTGCTGTGAAACCGGGTTAACCGGGAATTCCCCAAACTCACCAAATGGATTATTACTG
TAATTATTATTGGCTGTGGGGTTTGGGAGTGCTAGCTGTAGTTGCTGCTGCGGCTGATGA
TGATACGTTGGCTGGTAAGCACCAAAAGGGTTGTTGACAGCTGACTGCTGAGCTGCTGGA
TTGCCATTGGACGATGCAAAAGGGTCATGATGAACCTCAAATGGGTTGGGAGCTGGTGCA
CCGTAAACAGGACGTTGGGAGGCTATGTAGGCTCCATCATCGTATAGACTGTTTAGTGTA
AGCGTGTCTAAGCCTCCACCCAATTGCCTATCGGTGGCTGCAGAGATATCGTTGCTTGGT
GTTGTTACCAGGGCAAGCTCCCATCCTGAAGGGTCATAATCGTTTGCGTGACCAAACCGA
GGCGTTGAAGGGTTACCATCAGTTGAGATTATGGCTAAAGCAAGTGCGTTTTGGTTCTCA
ATCGCTGATGCA

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR4B130JQ 685 0 0
GAACACATCAAGTGGATTCTATATTACTCACAAATGAAGATACAAATCAAAGCAGACCAG
TGCTGCGGAACGGGTTATTATTGTGTTGGTTAACCGCGAAATCACCAAACCCGCTCGTAT
TTGGCTGCTGTGAAACCGGGTTAACCGGGAATTCCCCAAACTCACCAAATGGATTATTAC
TGTAATTATTATTGGCTGTGGGGTTTGGGAGTGCTAGCTGTAGTTGCTGCTGCGGCTGAT
GATGATACGTTGGCTGGTAAGCACCAAAAGGGTTGTTGACAGCTGACTGCTGAGCTGCTG
GATTGCCATTGGACGATGCAAAAGGGTCATGATGAACCTCAA*TGGGTTGGGAGCTGGTG
CACCGTAAACAGGACGTTGGGAGGCTATGTAGGCTCCATCATCGTATAGACTGTTTAGTG
TAAGCGTGTCTAAGCCTCCACCCAATTGCCTATCGGTGGCTGCAGAAATATCGTTGCTTG
GTGTTGTTACCAGGGCAAGCTCCCATCCTGAAGGGTCATAATCGTTTGCGTGACCAAACC
GAGGCGTTGAAGGGTTACCATCAGTTGAGATTATGGCTAAAGCAAGTGCGTTTTGGTTCT
CAATCGCTGATGCATCAGGACCACCAGTGTTCAGACCCAGTAAATCATCTGTATCAATGA
TGTTCTGAGACTGAGTGTTGGCTGG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FD16TF 744 0 0
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CCAAATGGATTATTACTGTAATTATTATTGGCTGTGGGGTTTGGGAGTGCTAGCTGTAGT
TGCTGCTGCGGCTGATGATGATACGTTGGCTGGTAAGCACCAAAAGGGTTGTTGACAGCT
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GGGTTGGGAGCTGGTGCACCGTAGACAGGACGTTGGGAGGCTATGTAGGCTCCATCATCG
TATAGACTGTTTAGTGTAAGCGTGTCTAAGCCTCCACCCAATTGCCTATCGGTGGCTGCA
GAGATATCGTTGCTTGGTGTTGTTACCAGGGCAAGCTCCCATCCTGAAGGGTCATAATCG
TTTGCGTGACCAAACCGAGGCGTTGAAGGGTTACCATCAGTTGAGATTATGGCTAAAGCA
AGTGCGTTTTGGTTCTCAATCGCTGATGCATCAGGACCACCAGTGTTCAGACCCAGTAAA
TCATCTGTATCAATGATGTTCTGAGACTGAGTGTTGGCTGGAGGAGGAGGAGGCGGGGGA
GAAGGTTCAGTCTCTTCAGATACAAGAACGACATCATCTGAAGGCAACACAACTTCACGT
TCTACATGAGACGGTTCAGCATC
C

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4B130TF 793 0 0
ATGGGTTGGGAGCTGGTGCACCGTAGACAGGACGTTGGGAGGCTATGTAGGCTCCATCAT
CGTATAGACTGTTTAGTGTAAGCGTGTCTAAGCCTCCACCCAATTGCCTATCGGTGGCTG
CAGAGATATCGTTGCTTGGTGTTGTTACCAGGGCAAGCTCCCATCCTGAAGGGTCATAAT
CGTTTGCGTGACCAAACCGAGGCGTTGAAGGGTTACCATCAGTTGAGATTATGGCTAAAG
CAAGTGCGTTTTGGTTCTCAATCGCTGATGCATCAGGACCACCAGTGTTCAGACCCAGTA
AATCATCTGTATCAATGATGTTCTGAGACTGAGTGTTGGCTGGAGGAGGAGGAGGCGGGG
GAGAAGGTTCAGTCTCTTCAGATACAAGAACGACATCATCTGAAGGCAACACAACTTCAC
GTTCTACATGAGACGGTTCAGCATCTTCGTCAGGAAGTCCATCATCCGGCCTATAAGTTA
GAAGCAGTGGCTCAGCTGGGGCATCGACCGCACGCGGTGCTTCTTTAATATACTCCTCCA
TTGTACTCAGAAAAGATTGTGGGGGCTCTCTTAGTACAGGAAACTGAAAATTCCTTGCGA
GTTCCAATCCTTTACAGGCTTCATAGAATTCAGAAAGGCTACGAGCCTGTTGACCAGCAC
GCTTGTATATTTCAAGGGAACTATGGCTTCGTGTTTTGGCATTTCAAAGAACTTGTCAAT
GAGATTGATAATTCCATCATTGATAGCACAATAGACTTTAAAACTCTCCTTCAACACCAG
AGCAAGTGCATAC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 4

CO CL1755Contig1 1025 4 10 U
AAAAACTGTTCGTAACACTATTATATAATGCCAGTTCTAATTCTCACAAAACAAACAAAC
TCTACAATTACATGTACTAAACTGAGTACAACATTAGAAATGAACGTCTCATGCTATAGA
TTTGGAATCAAGTTTGCTTATGGTTTTATAGAAGAGAAAAAATAGCCTTTAAGAGTGGCG
AAACACAAACAATGTTCGAGAAACGAAACATTCATTAAGAAAAACAGACAATTGCGAGAC
TCTGCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCATGATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGG
CTTTAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACCAGCCTGAGTCATCACGAGCTCAA
CGTCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATCATCATCGTCATCCTCCTCTTGTG
CAGCAACCGCGGCAGCTTCAGAAGCGTCGGCGTTAGGGATCATGGAAGCAACGTCCGGCA
TCTTGAACCTCCGAGCAGCATGAGCTTGTAGCTGAGAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCT
CACCGAATATCACATAGGTCTCAGAGTTGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGA
CGAACAAAACCTAAAGGGATGTGCAACAACAAACAGTATCAAGCATCATTGGTTTTCAAG
AAAGAACTTTGATTAAACATAATGTTATTTTACATTCTTTGATCTCTTGATAGTCACTCT
GCTAACATCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTTCTC
GCTTCTGCTTTGTTTAGAGCTCTCATTGTCACCACCTCCATGGACGTTGTCATCGTCATC
GTCATCCACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAACATCATCTTC
CTTCTCGAGCTTCATTTGCTCTTTGATGGATTCCTCAATCTTAACTTCTTCAACAACAGA
GCCTGGCATCTTCCTCTTATCTTCTTCCAACGAAACCCTTTTAGAACAGCGCAGTGAAAC
AACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4FJ16JQ U 124
AF RR4FL71JQ U 151
AF RR4C276JQ U 1
AF RR4C276TF C 416
BS 1 129 RR4C276JQ
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BS 401 403 RR4FJ16JQ
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BS 855 1025 RR4C276TF

RD RR4FJ16JQ 439 0 0
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GCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCATGATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGGCTT
TAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACCAGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACGT
CCTTGGCTTCAATACCGGTCTCATCAACATCATCATCATCGTCATCCTCCTCTTGTGCAG
CAACCGCGGCAGCTTCAGAAGCATCGGCGTTAGGGATCATGGAAGCAACGTCCGGCATCT
TGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAAAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCAC
CGAATATCACATAGGTCTC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4FL71JQ 412 0 0
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TTCATTAAGAAAAACAGACAATTGCGAGACTCTGCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCA
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AAACACCAGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACGTCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAA
CATCATCATCATCGTCATCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCAGCTTCAGAAGCATCGG
CGTTAGGGATCATTGAAGCAACGTCCGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTA
GCTGAGAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAGGTCTC

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4C276JQ 854 0 0
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TCTACAATTACATGTACTAAACTGAGTACAACATTAGAAATGAACGTCTCATGCTATAGA
TTTGGAATCGAGTTTGCTTATGGTTTTATGGAAGAGAAAAAATAGCCTTTAAGAGTGGCG
AAACACAAACAATGTTCGAGAAACGAAACATTCATTAAGAAAAACAGACAATTGCGAGAC
TCTGCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCATGATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGG
CTTTAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACCAGCCTGAGTCATCACGAGCTCAA
CGTCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATCATC***GTCATCCTCCTCTTGTG
CAGCAACCGCGGCAGCTTCAGAAGCGTCGGCGTTAGGGATCATGGAAGCAACGTCCGGCA
TCTTGAACCTCCGAGCAGCATGAGCTTGTAGCTGAGAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCT
CACCGAATATCACATAGGTCTCAGAGTTGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGA
CGAACAAAACCTAAAGGGATGTGCAACAACAAACAGTATCAAGCATCATTGGTTTTCAAG
AAAGAACTTTGATTAAACATAATGTTATTTTACATTCTTTGATCTCTTGATAGTCACTCT
GCTAACATCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTTCTC
GCTTCTGCTTTGTT*AGAGCTCTCATTGTCACCACCTCCATGGACGTTGTCATCGTCATC
GTCATCCACATCGT

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4C276TF 610 0 0
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CGGCATCTTGAACCTCCGAGCAGCATGAGCTTGTAGCTGAGAGCTCATGTCATCAATCTT
GGCCTCACCGAATATCACATAGGTCTCAGAGTTGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGA
GATGACGAACAAAACCTAAAGGGATGTGCAACAACAAACAGTATCAAGCATCATTGGTTT
TCAAGAAAGAACTTTGATTAAACATAATGTTATTTTACATTCTTTGATCTCTTGATAGTC
ACTCTGCTAACATCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTC
TTCTCGCTTCTGCTTTGTTTAGAGCTCTCATTGTCACCACCTCCATGGACGTTGTCATCG
TCATCGTCATCCACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAACATCA
TCTTCCTTCTCGAGCTTCATTTGCTCTTTGATGGATTCCTCAATCTTAACTTCTTCAACA
ACAGAGCCTGGCATCTTCCTCTTATCTTCTTCCAACGAAACCCTTTTAGAACAGCGCAGT
GAAACAACCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

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AAGCATTTATTTTTGTTTGGAATAAATAGATCGCAAAAGTCGTTCTTGAATCAGTTTAAA
CCAGATGGAAGCAATGATTTTAGCGGACTGGTAAGCTCTCTGCGTAGTAGAAGGCCAGAT
CCAGCATTTTTCGATCACATGCTCCTAAAATACTATACTTGGTGAGCAATTATACTATTT
GATTTCAGGTTTAAGGATCCTTAACCGGACAGAACCAAAAAGAACCCAAAACAAGAGAAC
CTCTATTTAATTATTACACTGATCTTAAACATCAAACTGTAATGGACGAGTTTTCTTTCT
CCAAACAATGTTGTAAAATAATTTAATAATGTAATAGAAATTACATATGGTTCAACATGT
CGAAGTTATAATCATTTCAATTTTAATCCAAAATGATGAAGGGAACCCCTTTCTTTCTTC
CTAATCAAGAAACGTTTAACTTTAAGGGTTCCTCTTCTTTTTTTTTGTATTTTCGCTGGC
ATTTCTTCTGATACTAATCCTAACGATGAAGCTGATCTCACCACTCGATGATGGTGCTTC
TTGTAAAACAGAAAAAAAAAATGGGGAAGTGCAATCCGTAGTTGCAATTATCAAGCTTGG
GAAAGCTCGATTTCAGCATTCAAATTGCTCCTTTCTTTATCTTCATCATCGTCTTTCCAG
TTAGTTGTTTTATAGTAAAGTGCGTATAATATAAATTGTATTGTTCCTGATAGGCATCCA
AGAGCATTTGGGATCAAAATATAGAGGTCGAATTTAAGACATGCATAAACGATCCAAATG
GCTCCGTTCATGAAGTTGGCTAAAGACAAGAAGAACGGCATGTACTTCACGCTCTTTGTC
TTTATCACAAGTGCCATGACGGTTAAAGGCGAAGCATACATGATAATATTGAAAATAATG
CACAAGATCCCAACAAGCATAGATCTCTGTTTTGTTGTATGCAAAAAATACAATGTGCAG
AAGACGACCACAGCCATGAATATCACCTCAATTACCATAGCTATTGCGATCCTTTTACGG
ACAGGCGAGGTAGCGAAGATGAAGAAGATGATGACATAAACGAGTTCCATGACAAGACCA
GCTCCGTTAATGGTGATGACGAGGAGACTGTCGGGTTGGACGAAAGGAAGTCCGTAAAAG
GTCCACATCATGCAGTTTAAAACAGTAGCTACGTAAGGATCTGGCTTAAATTCAGATACC
GATTTCATCTTCCATATCTCACCATCGTTGGTATTGGAGCCGAGAACAAGCCGAAGGCGA
TAACGTTTCCGATGATTCCGACGATCGTCCGGGCAGTGTTGGTGTCCGTCATGTTGCTAT
ATATCTCCACGAATTCTTGTCTTTTTATAAATTTTCTCAAAAATCTAGATTTCTAGAGAA
AAAAGATATTAGATTAATTAATTCGATTATTCTTTATATATAAAAGATATTTCTTTAGAG
TCTTGTCAATTTTTGTTTCTGATATGTGATAAGTTAGGTTTGATTGATGAAACAACTCCT
TTTTTGTTTTTTCCTAGTATTTGATTATTTTTGGTTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FK26JQ C 40
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T

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TT
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GAACCCAAAACAAGAGAACCTTTATTTAATTATTACACTGATTTTAAACATCAAACTGTA
ATGGAGGAGTTTTTTTTTTCCAAACAATGTTGTAAAATAATTTAATAATGTAATAGAAAT
TACATATGGTTCAACATGTGGAAGTTATAATCATTTCAATTTTAATCCAAAATGATGAAG
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T

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ATTTCTTCTGATACTAATCCTAACGATGAAGCTGATCTCACCACTCGATGATGGTGCTTC
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TATATATAAAAGATATTTCTTTAGAGTCTTGTCAATTTTTGTTTCTGATATGTGATAAGT
TAGGTTTGATTGATGAAACAACTCCTTTTTTGTTTTTTCCTAGTATTTGATTATTTTTGG
TTTACCC

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DS 



AS 1 5

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ACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCTACATTGCTCTT
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TGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTGAG
AAGGAGGGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGT
CCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCC
CACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGA
TCCCCCCCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTTGCATTCCGTTTGAAC
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GGTGGTATTGTGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGCTATGCTCAGACATTTTAAT
AAATTAATAACTCTTCACTATT


BQ
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35 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FT15TF U 1
AF RR4C288TF U 139
AF RR4FZ22TF U 1
AF RR4FT15JQ C 187
AF RR4FZ22JQ C 222
BS 1 661 RR4FT15TF
BS 662 666 RR4FZ22TF
BS 667 667 RR4FT15JQ
BS 668 735 RR4FZ22TF
BS 736 736 RR4C288TF
BS 737 757 RR4FZ22TF
BS 758 758 RR4C288TF
BS 759 778 RR4FZ22TF
BS 779 779 RR4FT15JQ
BS 780 801 RR4FZ22TF
BS 802 862 RR4FT15JQ

RD RR4FT15TF 661 0 0
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AGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAG
CTTGCTGGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGA
AGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGCTGT
GACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATCGTCGCT
TTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCT
TGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTGAG
AAGGAGGGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGT
CCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCC
CACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGA
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4C288TF 633 0 0
G
GGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCCG
TTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCCCAGC
CACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTTGAGACAGGTCT
TCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATCGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTC
TGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGACTTCAAACCCTCTCA
TCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTGAGAAGGAGGGTCTTCTTCAGC
TTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACG
CTGCCGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGC
TCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCTCGACACTCATGG
CTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCT
TAATGTGTACTCTCGACGGATCTGCGTAGCTT

QA 2 633 2 633
DS 

RD RR4FZ22TF 801 0 0
GTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCGCCTCGAGGACCGGTGGTCCCTTCGGA
ACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCTACATTGCTCTT
AGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAG
CTTGCTGGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGA
AGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGCTGT
GACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATCGTCGCT
TTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCT
TGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTGAG
AAGGAGGGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGT
CCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCC
CACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGA
TCCCCC*CGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTTGCATTCCGTTTGAAC
TTTTGTCATTTGATT*GCTTAATGTGTACTCTCGACG*ATCTGCGTAGCTTGTTTTTT*G
GGTGGTATTGTGAGTTTGTCG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4FT15JQ 676 0 0
GGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGAAGAGAG
GACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGCTGTGACCAC
TTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATCGTCGCTTTGTCT
GGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGACT
TCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTGAGAAGGAG
GGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTT
GTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCCCACTTG
AAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCC
CCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGT
CATTTGATTTGCTTAATGTGTACTCTCGACGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTTTGGGTGGT
ATTGTGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGCTATGCTCAGACATTTTAATAAATTA
ATAACTCTTCACTATT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FZ22JQ 641 0 0
AATTCCTTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCC
TGATGCCACCAAGGGCTGTGACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAAC
TGACCAGGACATCGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAG
GTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAA
GGAACTCTTGAGCGGTGAGAAGGAGGGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATT
GGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTT
CGCTGATTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGC
TGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGG
TTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTGTACTCTCGACGGATC
TGCGTAGCTTGTTTTTTTGGGTGGTATTGTGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGC
TATGCTCAGACATTTTAATAAATTAATAACTCTTCACTATT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 4

CO CL1758Contig1 770 4 4 U
TAAACAATCAATAATTCGGTATCATTAATAGACATTTATACAGTCTCTAACATGAAACAC
GAAAGTATCTTGTTACACTTAGTAGGGATTTGGTTGATATTCGTATTGTGTAAAAAAAAA
GTCTCTAACATCCTCTGTTTTGGAAGATAAGCAGAGTAAACTCAGCATTTTTTAAGCCGT
AGCAGCGCCACACATGAGTGGACTGTTGCAGGCTATGCCACAGGACTGCCCACCCTTTGA
CAGGTACTGCTGATGATACTCCTCAGCTCTGTAGAATTTCTTAGCAGGTAGAATCTCAGT
CATGATCTTGCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACGTTCCATTGACTCCACCGCTAGTTTCTC
CTGCTCAGGTGTGTAGAAGTATATCCCTGATCTGTATTGGGTTCCCACATCTTTTCCCTG
GCGATTCAAGGTGGTGGGGTCATGTCTAGACCAGAAGACATCAAGAAGAGACTCAAACTT
GCACTCTTTGGGATCATACTGAATCCTGACAACCTCTGCATGGTTCGTTGTGTTCGTGCA
AACATCCTCGTATGAAGGATTGTGGAGGAACCCTTGGGTGTATCCAACCTCCGTATGAGT
CACACCGGGGACTCTCTGAAACGCCAGCTCCACGCCCCAGAAGCATCCAGCGGTGAACTG
TGCAAACTCATTTCCCGGCGCCGGAGCGTCATTGTCGTTTCCCTGAGTGATAGCAGAGAG
ATTCATGGCGAAGTTTACGAGAGAGATTATTTAGATTTATGTATATGCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CV20JQ U 183
AF RR4HA71TF C 21
AF RR4CX06TF C 1
AF RR4CX06JQ U 2
BS 1 1 RR4CX06TF
BS 2 388 RR4CX06JQ
BS 389 389 RR4CV20JQ
BS 390 770 RR4CX06JQ

RD RR4CV20JQ 455 0 0
CAGCGCCACACATGAGTGGACTGTTGCAGGCTATGCCACAGGACTGCCCACCCTTTGACA
GGTACTGCTGATGATACTCCTCAGCTCTGTAAAATTTCTTAGCAGGTAGAATCTCAGTCA
TGATCTTGCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACGTTCCATTGACTCCACCGCTAGTTTCTCCT
GCTCAGGTGTGTAAAAGTATATCCCTGATCTGTATTGGGTTCCCACATCTTTTCCCTGGC
G***CAAGGGGGTGGGGTCATGTCTAGACCAAAAAACATCAAGAAAAAACTCAAACTTGC
ACTCTTTGGGATCATACTGAATCCTGACAACCTCTGCATGGTTCGTTGTGTTCGTGCAAA
CATCCTCGTATGAAGGATTGTGGAGGAACCCTTGGGTGTATCCAACCTCCGTATGAGTCA
CACCGGGGACTCTCTGAAACGCCAGCTCCACGCCC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4HA71TF 653 0 0
ATCAT
TAATAGACATTTATACAGTCTCTAACATGAAACACGAAAGTATCTTGTTACACTTAGTAG
GGATTTGGTTGATATTCGTATTGTGTAACAAAGAAGTCTCTAACATCCTCTGTTTTGGAA
GATAAGCAGAGTAAACTCAGCATTTTTTAAGCCGTAGCAGCGCCACACATGAGTGGACTG
TTGCAGGCTATGCCACAGGACTGCCCACCCTTTGACAGGTACTGCTGATGATACTCCTCA
GCTCTGTAGAATTTCTTAGCAGGTAGAATCTCAGTCATGATCTTGCTCTCCATTTTTTCC
TGGTGACGTTCCATTGACTCCACCGCTAGTTTCTCCTGCTCAGGTGTGTAGAAGTATATC
CCTGATCTGTATTGGGTTCCCACATCTTTTCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGGTCATGT
CTAGACCAGAAGACATCAAGAAGAGACTCAAACTTGCACTCTTTGGGATCATACTGAATC
CTGACAACCTCTGCATGGTTCGTTGTGTTCGTGCAAACATCCTCGTATGAAGGATTGTGG
AGGAACCCTTGGGTGTATCCAACCTCCGTATGAGTCACACCGGGGACTCTCTGAAACGCC
AGCTCCACGCCCCAGAAGCATCCAGCGGCGAACTGTGCAAACTCATTT

QA 6 653 6 653
DS 

RD RR4CX06TF 770 0 0
TAAACAATCAATAATTCGGTATCAT*AATAGACATTTATACAGTCTCTAACATGAAACAC
GAAAGTATCTTGT*ACACTTAGTAGGGATTTGGTTGATATTCGTATTGTGTAAAAAGAA*
GTCTCTAACATCCTCTGTTTTGGAAGATAAGCAGAGTAAACTCAGCATTTTT*AAGCCGT
AGCAGCGCCACACATGAGTGGACTGTTGCAGGCTATGCCACAGGACTGCCCACCCTTTGA
CAGGTACTGCTGATGATACTCCTCAGCTCTGTAGAATTTCTTAGCAGGTAGAATCTCAGT
CATGATCTTGCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACGTTCCATTGACTCCACCGCTAGTTTCTC
CTGCTCAGGTGTGTAGAAGTATATCCCT*ATCTGTATTGGGTTCCCACATCTTTTCCCTG
GCGATTCAAGGTGGTGGGGTCATGTCTAGACCAGAAGACATCAAGAAGAGACTCAAACTT
GCACTCTTTGGGATCATACTGAATCCTGACAACCTCTGCATGGTTCGTTGTGTTCGTGCA
AACATCCTCGTATGAAGGATTGTGGAGGAACCCTTGGGTGTATCCAACCTCCGTATGAGT
CACACCGGGGACTCTCTGAAACGCCAGCTCCACGCCCCAGAAGCATCCAGCGGTGAACTG
TGCAAACTCATTTCCCGGCGCCGGAGCGTCATTGTCGTTTCCCTGAGTGATAGCAGAGAG
ATTCATGGCGAAGTTTACGAGAGAGATTATTTAGATTTATGTATATGCCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4CX06JQ 769 0 0
AAACAATCAATAATTCGGTATCATTAATAGACATTTATACAGTCTCTAACATGAAACACG
AAAGTATCTTGTTACACTTAGTAGGGATTTGGTTGATATTCGTATTGTGTAAAAAAAAAG
TCTCTAACATCCTCTGTTTTGGAAGATAAGCAGAGTAAACTCAGCATTTTTTAAGCCGTA
GCAGCGCCACACATGAGTGGACTGTTGCAGGCTATGCCACAGGACTGCCCACCCTTTGAC
AGGTACTGCTGATGATACTCCTCAGCTCTGTAGAATTTCTTAGCAGGTAGAATCTCAGTC
ATGATCTTGCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACGTTCCATTGACTCCACCGCTAGTTTCTCC
TGCTCAGGTGTGTAGAAGTATATCCCT*ATCTGTATTGGGTTCCCACATCTTTTCCCTGG
CGATTCAAGGTGGTGGGGTCATGTCTAGACCAGAAGACATCAAGAAGAGACTCAAACTTG
CACTCTTTGGGATCATACTGAATCCTGACAACCTCTGCATGGTTCGTTGTGTTCGTGCAA
ACATCCTCGTATGAAGGATTGTGGAGGAACCCTTGGGTGTATCCAACCTCCGTATGAGTC
ACACCGGGGACTCTCTGAAACGCCAGCTCCACGCCCCAGAAGCATCCAGCGGTGAACTGT
GCAAACTCATTTCCCGGCGCCGGAGCGTCATTGTCGTTTCCCTGAGTGATAGCAGAGAGA
TTCATGGCGAAGTTTACGAGAGAGATTATTTAGATTTATGTATATGCCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 5

CO CL1759Contig1 541 5 1 U
GGGTAAAAACAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTC
TATTATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTCATCA
TTCTTTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCG
CAATTAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATT
ACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGTC
CTTGTTAGAGTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTACC
TTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTT
GTATCAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATGCAAT
TCCTAACCATAAGAATGTACTTTTTATTAATAAATGATCTCCAGTGTCATCTTTACTTGG
C


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DS85JQ C 26
AF RR4BC50JQ C 3
AF RR4DS85TF U 1
AF RR4C693TF U 3
AF RR4C114TF U 1
BS 1 541 RR4C114TF

RD RR4DS85JQ 447 0 0
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TCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTCATCATTCTTTCACTAGGAATGGTGACAGA
TGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCGCAATTAGCAGAGCATGGCCTTGCTC
TGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATTACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTG
TTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGTCCTTGTTAGAGTTCTCGCTAAATGTT
GTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTACCTTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAA
TTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTTGTATCAGATCTGTCAATTTATTTAT
TATAAATAATAATATGAATGTTAAAT
G

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4BC50JQ 469 0 0
GG
AAAAACAAAACACTTCATTTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTCTATT
ATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTCACCTTCTTAACTATATTCATCATTCT
TTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCGCAAT
TAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATTACCC
ACCTACTGGTACCGGTCTTTGTTCGGTTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGTCCTTG
TTAGAGTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAGCTCAAATTCTATATTACCTTTT
TAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTTGTAT
CAGATCTGTGAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAAT

QA 3 469 3 469
DS 

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GGGT
AAAAACAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTCTATT
ATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTCATCATTCT
TTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCGCAAT
TAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATTACCC
ACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGTCCTTG
TTAGAGTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTACCTTTT
TAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTTGTAT
CAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAAT
G

QA 5 471 5 471
DS 

RD RR4C693TF 483 0 0
GG
AAAAACAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTCTATT
ATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTCATCATTCT
TTCACTAGGAATGGTGACGGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCGCAAT
TAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATTACCC
ACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGTCCTTG
TTAGAGTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTACCTTTT
TAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTTGTAT
CAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATGCAGTTCCT
A

QA 3 483 3 483
DS 

RD RR4C114TF 541 0 0
GGGTAAAAACAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTC
TATTATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTCATCA
TTCTTTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCG
CAATTAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATT
ACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGTC
CTTGTTAGAGTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTACC
TTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTT
GTATCAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATGCAAT
TCCTAACCATAAGAATGTACTTTTTATTAATAAATGATCTCCAGTGTCATCTTTACTTGG
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 4

CO CL1760Contig1 960 4 6 U
GGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCGTGAGGTCAAGAAAGAAGGAGAGTATGAGCCTGCAG
AGAGACCAGACCGTGACACGGACTATATGAGGGCCCAAGAAGCACGTCGCTTCATGATCT
ACGTCCATAGCAAAATGATGATCGTTGACGATGAATACATTATCGTTGGGTCTGCTAACA
TCAACCAGAGGTCAATGGATGGTGCAAGGGACTCTGAGATAGCAATGGGAGGGTATCAAC
CTTGGAGATGATGTACAAGGATGTTACTCAGGCTCTCAGGGCACAGGGGTTGGAGGAAGA
TCCTAGAAACTATCTGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCGTGAGGTCAAGAAAGAAGGAGA
GTATGAGCCTGCAGAGAGACCAGACCGTGACACGGACTATATGAGGGCCCAAGAAGCACG
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TACTGGGACTTCTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGC
TACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTGAGCTTCCAGGATTTGAGTTCTTC
CCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACA
ACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCT
CTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACT
CCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACATGGTGATGTAACTTTGTGGTCTTTATGTACCT
TATTTATGTCTTATGTATCGTTCAACTTGTGAAACTTGTATTTGATCTTAGTTACACTTT
CTGGTTGTAAGATAGATAACACCAAATAACTTTACTAGGAAACGTAAGACTTGTTCTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F786TF U 1
AF RR4F786JQ C 458
AF RR4EB20JQ C 509
AF RR4EB20TF U 509
BS 1 790 RR4F786TF
BS 791 791 RR4EB20TF
BS 792 793 RR4F786TF
BS 794 794 RR4EB20TF
BS 795 815 RR4F786TF
BS 816 960 RR4EB20TF

RD RR4F786TF 815 0 0
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AGAGACCAGACCGTGACACGGACTATATGAGGGCCCAAGAAGCACGTCGCTTCATGATCT
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TCAACCAGAGGTCAATGGATGGTGCAAGGGACTCTGAGATAGCAATGGGAGGGTATCAAC
CTTGGAGATGATGTACAAGGATGTTACTCAGGCTCTCAGGGCACAGGGGTTGGAGGAAGA
TCCTAGAAACTATCTGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCGTGAGGTCAAGAAAGAAGGAGA
GTATGAGCCTGCAGAGAGACCAGACCGTGACACGGACTATATGAGGGCCCAAGAAGCACG
TCGCTTCATGATCCCTCAAGCTTGGAATGCATTGAGAAAGTTAACCGTATTGCTGAGAAG
TACTGGGACTTCTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGC
TACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTGAGCTTCCAGGATTTGAGTTCTTC
CCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACA
ACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCT
CTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACT
CCTTTGGTTT*AT*TTCGTACAATGACATGGTGAT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4F786JQ 348 0 0
AAGTTAACCGTATTGCTGAGAAGTACTGGGACTTCTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATG
ACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTG
AGCTTCCAGGATTTGAGTTTTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAG
ACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAG
CTTTGAATAAATTGAGTGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGT
GTGATGATATGCACTTTTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATG

QA 1 348 1 348
DS 

RD RR4EB20JQ 452 0 0
G
GGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAA
CATCAGTGAGCTTCCAGGATTTGAGTTCTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAA
CAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGC
TGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAAT
AAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACAT
GGTGATGTAACTTTGTGGTCTTTATGTACCTTATTTATGTCTTATGTATCGTTCAACTTG
TGAAACTTGTATTTGATCTTAGTTACACTTTCTGGTTGTAAGATAGATAACACCAAATAA
CTTTACTAGGAAACGTAAGACTTGTTCTCGG

QA 2 452 2 452
DS 

RD RR4EB20TF 452 0 0
G
GGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAA
CATCAGTGAGCTTCCAGGATTTGAGTTCTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAA
CAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGC
TGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAAT
AAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACAT
GGTGATGTAACTTTGTGGTCTTTATGTACCTTATTTATGTCTTATGTATCGTTCAACTTG
TGAAACTTGTATTTGATCTTAGTTACACTTTCTGGTTGTAAGATAGATAACACCAAATAA
CTTTACTAGGAAACGTAAGACTTGTTCTCGG

QA 2 452 2 452
DS 



AS 1 5

CO CL1761Contig1 750 5 8 U
AAAGAACATCAAAATCACACAGATACCGATTTACCACAATCAGACAAAAGTCTTGATAAT
GTTATAAACGAAATAAGACATGATAAGTAACAACCAAGAAAAGATTCATGACATGACACT
TAAACAAAACAAATTAACAATTCTAGAGGAAGTTTCTTTGAGATGGGAAGGAAGACCCGA
GGGGGAGAGAGAGATGGCAGTTTTGTCTTTGAGCTCATCAGAGCATGCAATCAGTTCTTG
CAGGAAGCCTCCTGAAGAAATTGGGAGGAACTGACGGTAGCCTGTACCTAAACCTCGGAT
GTCTCAGAACATAGATCCCAACCAGAAGCGCCACAACCTGAAACGGAGTCACATAGAGAA
CAACCGCAGCAATCAAACAGAACAAGACAAACAGAGCGGTTGCACGCGGATCACGCCAGC
TCAGCAGAGACTGAAGCCTTTCACCTTGAGTCGCAAGATCACCAACCACCGTCTGAATCC
TCCCAGCGATACTCCTCAACCTGTCGTACCTCATCCTGACGATATCAGAGGGTCTCGAAG
TAGGAAAAGTATCAAACTCTTCATCCAGCTCGTCAGGGTGAGCTGAGTCAGCGTGAGAGA
GACTATACAAGATCTCTGGGGTGAGAAGAAGAGTTACTATAAACGATTTTAGGCAGGCGA
GGTGGAAATCTCCATCTTGAAGAAGCAAAAGACTAGAGAGAAGTCTTCTTTCCTCGTTGT
TTTCAACCAAATAAAATAAGAGACGACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D316JQ U 1
AF RR4AG30JQ U -4
AF RR4FU69JQ U 1
AF RR4AR79JQ U 61
AF RR4AR79TF C 61
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GCTTAACA
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DS 

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ACAAATTAACAATTCTAGAGGAAGTTTCTTTGAGATGGGAAGGAAGATCCGAGGG**AGA
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AACTGAAGCCTTTCACCTTGAGTCGCAAGATCACCAACCACCGTCTGAATCCTCCCAGCG
ATACTCCTCAACCTGTCGTACCTCGTCCTGACGATATCAGAGGGTCTCGAAGTAGGAAAA
GT
GTCGAA

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DS 

RD RR4FU69JQ 617 0 0
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GTTATAAACGAAATAAGACATGATAAGTAACAACCAAGAAAAGATTCATGACATGACACT
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GAC
GCGTGTCCATGTGC

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DS 

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GGGGGAGAGAGAGATGGCAGTTTTGTCTTTGAGCTCATCAGAGCATGCAATCAGTTCTTG
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GTCTCAGAACATAGATCCCAACCAGAAGCGCCACAACCTGAAACGGAGTCACATAGAGAA
CAACCGCAGCAATCAAACAGAACAAGACAAACAGAGCGGTTGCACGCGGATCACGCCAGC
TCAGCAGAGACTGAAGCCTTTCACCTTGAGTCGCAAGATCACCAACCACCGTCTGAATCC
TCCCAGCGATACTCCTCAACCTGTCGTACCTCATCCTGACGATATCAGAGGGTCTCGAAG
TAGGAAAAGTATCAAACTCTTCATCCAGCTCGTCAGGGTGAGCTGAGTCAGCGTGAGAGA
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TTTCAACCAAATAAAATAAGAGACGACTCC

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DS 

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GTCTCAGAACATAGATCCCAACCAGAAGCGCCACAACCTGAAACGGAGTCACATAGAGAA
CAACCGCAGCAATCAAACAGAACAAGACAAACAGAGCGGTTGCACGCGGATCACGCCAGC
TCAGCAGAGACTGAAGCCTTTCACCTTGAGTCGCAAGATCACCAACCACCGTCTGAATCC
TCCCAGCGATACTCCTCAACCTGTCGTACCTCATCCTGACGATATCAGAGGGTCTCGAAG
TAGGAAAAGTATCAAACTCTTCATCCAGCTCGTCAGGGTGAGCTGAGTCAGCGTGAGAGA
GACTATACAAGATCTCTGGGGTGAGAAGAAGAGTTACTATAAACGATTTTAGGCAGGCGA
GGTGGAAATCTCCATCTTGAAGAAGCAAAAGACTAGAGAGAAGTCTTCTTTCCTCGTTGT
TTTCAACCAAATAAAATAAGAGACGACTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL1762Contig1 1001 4 19 U
CTCACAAACTCTTTAAGTCACTCACTACGAGCAACAAAAATATGGCAAGTTCAAGAACAA
ACAACAATAAAATAAAATAAAGCAAACCATATAAGACCCAAATCGGGAATACAACAATCC
AGGAAGTAGAAAGCAGAGGGAAAAAAAGATTTAAAAGAGCAAACCAATCAGCAGTTTTCA
TAAACGCATAAACAACTCTTGGTCAGCCATACCATAAGGTTTAAGGATAGTGTCTTCATT
TGTCACTCTTAACCGTAGTTGTCTGCTCTTCGGTTTTCGTTTCCTCTGATGCAGGAGCTT
GAGCTTCCTCCTTTTTCTCTCCAGACTTGACTTCTTCTCCTTCATCATCACTATCTTCAA
ATTCTTCCATACC*ACCCATTCCACCAAGCCCTCCCATACCTCCCATTCCACCGAGACCT
TCAAGCCCGGCCATTCCACCAAGCCCCTCGAGACCTCCCATACCGCCCATTCCACCC*AT
ACCTCCCATTCCTCCCATTCCACCAAAGTTCGAGAAATCCATTCCTCCCATGCCACCCAT
TCCGCCCATATCCATATCTCCAGGACCAGTGGCGGGATCTTCATCCTCATCTACCCACTT
GTCCCAATCAACTTTAACATAATGAGGAGGCTTCCCTCCACGCAATAGCTTACTCCACCA
TTTCGGCTCTGCTTTCTCCACGATGCAGAATATGCTTCTTAACCCAATGTTGATTTTGCT
TTCCTCTACATTGACCTTGTCATTAAGCTCAAGCTTAAGCTCATAAAGCTGGTTCTCTGG
TCCAGCTTTGGCAGAGAAATCAAAAACACCTTCAGGATCAAGCTTAACATTCGCATCCTT
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TGGATGGTGACTCATGATTACTGGAAGCAGGAGAAAACTTGAGTAAACCCTAGAGAAGGA
CGGAACGAAGACGCGCAGAGATATTTTTTATTTCGATCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EC31JQ U 1
AF RR4GX58JQ U 70
AF RR4GX58TF C 318
AF RR4E402TF C 559
BS 1 179 RR4EC31JQ
BS 180 180 RR4GX58JQ
BS 181 203 RR4EC31JQ
BS 204 204 RR4GX58JQ
BS 205 216 RR4EC31JQ
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BS 218 251 RR4EC31JQ
BS 252 252 RR4GX58JQ
BS 253 277 RR4EC31JQ
BS 278 278 RR4GX58JQ
BS 279 288 RR4EC31JQ
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BS 290 327 RR4EC31JQ
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BS 330 401 RR4EC31JQ
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BS 511 799 RR4GX58JQ
BS 800 1001 RR4GX58TF

RD RR4EC31JQ 510 0 0
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AGGAAGTAGAAAGCAGAGGGAAAAAAAGATTTAAAAGAGCAAACCAATCAGCAGTTTTCG
TAAACGCATAAACAACTCTTGGTTAGCCATACCATACGGTTTAAGGATAGTGTCTTCATT
TGTCACTCTTAGCCGTAGTTGTCTGCTCTTCGGTTTTGGTTTCCTCTGTTGCAGGAGCTT
GAGCTTCCTCCTTTTTCTCTCCAGACTCTACTTCTTCTCCTTCATCATCACTATCTTCAA
ATTCTTCCATACC*ACCCATTCCACCAAGCCCTCCCATACCGCCCATTCCACCGAGACCT
TCAAGCCCGGCCATTCCACCAAGCCCCTCGAGACCTCCCATACCGCCCATTCCACCC*AT
ACCTCCCATTCCTCCCATTCCACCAAAGTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4GX58JQ 730 0 0
ACT
TAAAATAAAGCAAACCATATAAGACCCAAATCGGGAATACAACAATCCAGGAAGTAGAAA
GCAGAGGGAAAAAA*GATTTAAAAGAGCAAACCAATCAGCAGTTTTCATAAACGCATAAA
CAACTCTTGGTCAGCCATACCATAAGGTTTAAGGATAGTGTCTTCATTTGTCACTCTTAA
C***AGTTGTCTGCTCTTCGGTTTTCGTTTCCTCTGATGCAGGAGCTTGAGCTTCCTCCT
TTTTCTCTCCAGACTTGACTTCTTCTCCTTCATCATCACTATCTTCAAATTCTTCCATAC
C*ACCCATTCCACCAAGCCCTCCCATACCTCCCATTCCACCGAGACCTTCAAGCCCGGCC
ATTCCACCAAGCCCCTCGAGACCTCCCATACCGCCCATTCCACCC*ATACCTCCCATTCC
TCCCATTCCACCAAAGTTCGAGAAATCCATTCCTCCCATGCCACCCATTCCGCCCATATC
CATATCTCCAGGACCAGTGGCGGGATCTTCATCCTCATCTACCCACTTGTCCCAATCAAC
TTTAACATAATGAGGAGGCTTCCCTCCACGCAATAGCTTACTCCACCATTTCGGCTCTGC
TTTCTCCACGATGCAGAATATGCTTCTTAACCCAATGTTGATTTTGCTTTCCTCTACATT
GACCTTGTCATTAAGCTCAAGCTTAAGCTCATAAAGCTGGTTCTCTGGTCCAGCTTTGGC
AGAGAAA

QA 4 730 4 730
DS 

RD RR4GX58TF 684 0 0
TCTCCAGACTTGACTTCTTCTCCTTCATCATCACTATCTTCAAATTCTTCCATACCCACC
CATTCCACCAAGCCCTCCCATACCTCCCATTCCACCGAGACCTTCAAGCCCGGCCATTCC
ACCAAGCCCCTCGAGACCTCCCATACCGCCCATTCCACCCCATACCTCCCATTCCTCCCA
TTCCACCAAAGTTCGAGAAATCCATTCCTCCCATGCCACCCATTCCGCCCATATCCATAT
CTCCAGGACCAGTGGCGGGATCTTCATCCTCATCTACCCACTTGTCCCAATCAACTTTAA
CATAATGAGGAGGCTTCCCTCCACGCAATAGCTTACTCCACCATTTCGGCTCTGCTTTCT
CCACGATGCAGAATATGCTTCTTAACCCAATGTTGATTTTGCTTTCCTCTACATTGACCT
TGTCATTAAGCTCAAGCTTAAGCTCATAAAGCTGGTTCTCTGGTCCAGCTTTGGCAGAGA
AATCAAAAACACCTTCAGGATCAAGCTTAACATTCGCATCCTTAGCACCAGGCAACAGCA
CTGTTAAGTAAACCTTATCCTCTCTCTCTGCCCACTTCACTTCTGGATGGTGACTCATGA
TTACTGGAAGCAGGAGAAAACTTGAGTAAACCCTAGAGAAGGACGGAACGAAGACGCGCA
GAGATATTTTTTATTTCGATCCAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4E402TF 443 0 0
TCCAGGACCAGTGGCGGGATATTCATCCTCATTTACCCACTTGTCCCAATCAACTTTAAC
ATAATGAGGAGGCTTCCCTCCACGCAATAGCTTACTCCACCATTTCGGCTCTGCTTTCTC
CACGATGCAGAATATGCTTCTTAACCCAATGTTGATTTTGCTTTCCTCTACATTGACCTT
GTCATTAAGCTCAAGCTTAAGCTCATAAAGCTGGTTCTCTGGTCCAGCTTTGGCAGAGAA
ATCAAAAACACCTTCAGGATCAAGCTTAACATTCGCATCCTTAGCATCAGGCAACAGCAC
TGTTAAGTAAACCTTATCCTCTCTCTCTGCCCACTTCACTTCTGGATGGTGACTCATGAT
TACTGGAAGCAGGAGAAAACTTGAGTAAACCCTAGAGAAGGACGGAACGAAGACGCGCAG
AGATATTTTTTATTTCGATCCAC

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 5

CO CL1763Contig1 772 5 2 U
ATCGAAAGAAATTGGGTTTCACCTCCGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAAAATG
ATCCGATTCATATTATTACAGAACAGACAAGGGAAGACTCGTCTCGCCAAGTACTATGTC
CCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAAC
CGCGACGCGAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGT
TACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTT
GAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTT
GATCTGGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGA
GAACTCCAAGAAACCCGCAAAAGGGCGATCATCGAGAGGATGTCAGAGCTCGAGAAGCTA
GAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACT
CTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTG
ATGTTAAGATTATTTGTAAAAGGATATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATT
TGCTTTATGTGAGATTTTCTTTCAACTAGTGAGGTTACTTGCTAGTTACCACAGCCATTA
AGGCATGTATAAAGAAAATGTTTGATATGAGTATATGATAAGATCCTAAACT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A310TF U 1
AF RR4A310TFB U 1
AF RR4CG94TF U 165
AF RR4A310JQD C 1
AF RR4A310JQ C 26
BS 1 718 RR4A310TF
BS 719 772 RR4A310JQD

RD RR4A310TF 718 0 0
ATCGAAAGAAATTGGGTTTCACCTCCGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAAAATG
ATCCGATTCATATTATTACAGAACAGACAAGGGAAGACTCGTCTCGCCAAGTACTATGTC
CCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAAC
CGCGACGCGAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGT
TACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTT
GAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTT
GATCTGGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGA
GAACTCCAAGAAACCCGCAAAAGGGCGATCATCGAGAGGATGTCAGAGCTCGAGAAGCTA
GAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACT
CTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTG
ATGTTAAGATTATTTGTAAAAGGATATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATT
TGCTTTATGTGAGATTTTCTTTCAACTAGTGAGGTTACTTGCTAGTTACCACAGCCAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4A310TFB 687 0 0
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ATCCGATTCATATTATTACAGAACAGACAAGGGAAGACTCGTCTCGCCAAGTACTATGTC
CCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAAC
CGCGACGCGAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGT
TACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTT
GAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTT
GATCTGGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGA
GAACTCCAAGAAACCCGCAAAAGGGCGATCATCGAGAGGATGTCAGAGCTCGAGAAGCTA
GAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACT
CTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTG
ATGTTAAGATTATTTGTAAAAGGATATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATT
TGCTTTATGTGAGATTTTCTTTCAACT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CG94TF 516 0 0
GG
GGTTAGTGGTGAACCGCGACGCGAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAGAACACACAAGG
TGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATATAACGGACAATG
AGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCATTTCTTCAGCA
ATGTCTGTGAGCTTGATCTGGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGATACTTGATGAAT
TCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCAGCAAAAGGGCGATCATCGAGAGGATGTCAG
AGCTCGAGAAGCTAGAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTATTGTTTAATAG
ATGCCTTGGTCACTCTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTTTGTTGAGTTGA
AGACGACAATGGTGATGTTAAGATTATTTGTAAAAGGATATAAAACGACTCTGTTGAGAT
CACTATCCAAA*TTTGCTTTATGTGAGATTTTCT

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR4A310JQD 772 0 0
ATCGAAAGAAATTGGGTTTCAC*TCCGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAAAATG
ATCCGATTCATATTATTACAGAACAGACAAGGGAAGACTCGTCTCGCCAAGTACTATGTC
CCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAAC
CGCGACGCGAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGT
TACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTT
GAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTT
GATCTGGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGA
GAACTCCAAGAAACCCGCAAAAGGGCGATCATCGAGAGGATGTCAGAGCTCGAGAAGCTA
GAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACT
CTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTG
ATGTTAAGATTATTTGTAAAAGGATATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATT
TGCTTTATGTGAGATTTTCTTTCAACTAGTGAGGTTACTTGCTAGTTACCACAGCCATTA
AGGCATGTATAAAGAAAATGTTTGATATGAGTATATGATAAGATCCTAAACT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4A310JQ 747 0 0
CGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAAAATGATCCGATTCATATTATTACAGAACA
GACAAGGGAAGACTCGTCTCGCCAAGTACTATGTCCCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACA
AAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAACCGCGACGCGAAATTCACCAATTTCG
TTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGT
GCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGA
TTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATCTGGTCTTCAACTTCCACAAGG
TGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCCGCAAAAGGG
CGATCATCGAGAGGATGTCAGAGCTCGAGAAGCTAGAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGA
GCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACTCTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATT
TGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTGATGTTAAGATTATTTGTAAAAGGAT
ATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATTTGCTTTATGTGAGATTTTCTTTCAA
CTAGTGAGGTTACTTGCTAGTTACCACAGCCATTAAGGCATGTATAAAGAAAATGTTTGA
TATGAGTATATGATAAGATCCTAAACT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 5

CO CL1764Contig1 684 5 7 U
GGATAATCTCTAAAAGTTATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGC
TTCTGTGCAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTGATGATCAT
GTCGTTCTTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGA
AGAGAAACTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGAC
CATAGAATCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCACAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTT
CGGGTGGCTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGAC
GAACTGGTGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGGGCTTGA
AGGTAGTGATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAGCCAAATCTTAC
TTTATGGGAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTTTTGGAGAAGTCCTG
ATATAACAAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATCACTTGAG
AAGACTAATTTACCAAAACTAGCATATGTATCAACATGGGAGTTGGATATGAATATATAA
TTTCAGTCACACGAATTTTCATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D243JQ C 1
AF RR4D243TF U 1
AF RR4EL73TF U 4
AF RR4GN84JQ C 46
AF RR4GN84TF U 4
BS 1 7 RR4D243JQ
BS 8 296 RR4D243TF
BS 297 297 RR4EL73TF
BS 298 330 RR4D243TF
BS 331 331 RR4EL73TF
BS 332 605 RR4D243TF
BS 606 684 RR4EL73TF

RD RR4D243JQ 606 0 0
GGATAATCTCTAAAAGTTATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGC
TTCTGTGCAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTGATGATCAT
GTCGTTCTTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGA
AGAGAAACTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGAC
CATAGAATCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCACAAAGCCCGGTCTTGAAGATGGTTT
CGGGTGGCTTAACGACTTTGATATTGGTCTTGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGAC
GAACTGGTGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGGGCTTGA
AGGTAGTGATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAGCCAAATCTTAC
TTTATGGGAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTTTTGGAGAAGTCCTG
ATATAACAAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATCACTTGAG
AAGAC
C

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4D243TF 606 0 0
GGATAAT
CTCTAAAAGTTATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGCTTCTGTG
CAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTGATGATCATGTCGTTC
TTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAAGAGAAA
CTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGACCATAGAA
TCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCACAAAGCCCGGTCTTGAAGATGGTTTCGGGTGG
CTTAACGACTTTGATATTGGTCTTGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACTGG
TGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGGGCTTGAAGGTAGT
GATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAGCCAAATCTTACTTTATGG
GAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTTTTGGAGAAGTCCTGATATAAC
AAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATCACTTGAGAAGAC
C

QA 8 605 8 605
DS 

RD RR4EL73TF 681 0 0
AGGG
CTCTAAAAGTTATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGCTTCTGTG
CAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTGATGATCATGTCGTTC
TTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAAGAGAAA
CTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGACCATAGAA
TCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCACAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTCGGGTGG
CTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACTGG
TGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGGGCTTGAAGGTAGT
GATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAGCCAAATCTTACTTTATGG
GAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTTTTGGAGAAGTCCTGATATAAC
AAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATCACTTGAGAAGACTA
ATTTACCAAAACTAGCATATGTATCAACATGGGAGTTGGATATGAATATATAATTTCAGT
CACACGAATTTTCATGA

QA 5 681 5 681
DS 

RD RR4GN84JQ 628 0 0
CTTCTCACAAATGGCTTCTGTGCAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGA
TGAGCTGATGATCATGTCGTTCTTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGT
TAACGAAGAGGAAGAAGAGAAACTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCGA
CATGAGTTCTCCGACCATAGAATCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCACAAAGCCCGG
TCTTGAAGATGATTTCGGGTGGCTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAA
TGATGATGAGATGACGAACTGGTGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAG
TGTTCTTGGGCTTGAAGGTAGTGATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGA
GGAGCCAAATCTTACTTTATGGGAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGT
TTTGGAGAAGTCCTGATATAACAAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATG
TAATGATCACTTGAGAAGACTAATTTACCAAAACTAGCATATGTATCAACATGGGAGTTG
GATATGAATATATAATTTCAGTCACAC
G

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4GN84TF 669 0 0
GGAT
CTCTAAAAGTTATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGCTTCTGTG
CAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTGATGATCATGTCGTTC
TTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAAGAGAAA
CTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCGACATGAGTTCTCCGACCATAGAA
TCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCACAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTCGGGTGG
CTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACTGG
TGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGGGCTTGAAGGTAGT
GATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAGCCAAATCTTACTTTATGG
GAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTTTTGGAGAAGTCCTGATATAAC
AAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATCACTTGAGAAGACTA
ATTTACCAAAACTAGCATATGTATCAACATGGGAGTTGGATATGAATATATAATTTCAGT
CACAC

QA 5 669 5 669
DS 



AS 1 5

CO CL1765Contig1 475 5 5 U
GGATATCAAAGAAAAAAAAACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACC
AACAAGTTTTTCTTCCTCCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACG
TTGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTCTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCC
AACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCAC
TCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTT
GCTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTA
TTCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACT
CTTAATTTCCATGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4AS52JQ C 1
AF RR4AS52TF U 72
AF RR4BS65TF U 1
AF RR4FZ33JQ C 1
AF RR4FZ33TF U 1
BS 1 71 RR4BS65TF
BS 72 461 RR4AS52TF
BS 462 462 RR4BS65TF
BS 463 474 RR4AS52TF
BS 475 475 RR4AS52JQ

RD RR4AS52JQ 475 0 0
GGATATCAAAGAAAAAAAAACTCAAAAACTTATTCCAATTTTCTTATAAAAATGTGGACC
AACAAGTTTTTCTTCCTCCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACG
TTGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTCTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCC
AACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCAC
TCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTT
GCTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTA
TTCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACT
CTTAATTTCCATGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATACTTCATGTTGATAC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4AS52TF 404 0 0
CTTCCTCCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACGTTGCCTTCGAT
ACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTCTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCCAACTGTATCTC
AGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCACTCTTGCTGCCA
TGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTTGCTCCCCTCTT
CCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTATTCTACATGTT
CTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACTCTTAATTTCCA
TGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATACTTCATGTTGATA
C

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4BS65TF 475 0 0
GGATATCAAAGAAAAAAAAACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACC
AACAAGTTTTTCTTCCTCCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACG
TTGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTCTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCC
AACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCAC
TCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTT
GCTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTA
TTCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACT
CTTAATTTCCATGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATA
T

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4FZ33JQ 475 0 0
GGATATCAAAGAAAAAAAAACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACC
AACAAGTTTTTCTTCCTCCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACG
TTGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTCTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCC
AACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCAC
TCTTGCTACCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTT
GCTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTA
TTCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACT
CTTAATTTCCATGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATA
T

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4FZ33TF 475 0 0
GGATATCAAAGAAAAAAAAACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACC
AACAAGTTTTTCTTCCTCCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACG
TTGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTCTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCC
AACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCAC
TCTTGCTACCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTT
GCTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTA
TTCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACT
CTTAATTTCCATGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATA
T

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 3

CO CL1766Contig1 1187 3 15 U
GGATATTTTCTTTCGTACATAATAGTCCTTGCTTTTTTATTACCTGAGCTAAGATAATGG
GAAGCAGCGAGGAGATGCCAGTGGTGCTCATCACGGGATGCTCTCAGGGAGGAATCGGCA
ACGCGCTTGCTCGTGAATTCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTGGTGGCGACGAGTCGATCGC
AAAGCACGATGGCCGATTTGGAGAAAGATCCCAAGTTTTTAGTGCAAGAGCTCGATGTTC
GGTCGGAACAGAGCGTGGGTAAAGTCTTGTCGGAAGTTATCGACAAGTTTGGTCAGAACG
ATGTTCTGGTCAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACCACTCGCGGAGGTTCCAATTC
AGACAATGGAGAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTG
TTGTACCTCACATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCA
CAATGGCACCAGGACCACGGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTC
TTACAGACACATTACGGTTGGAGCTTAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCC
C*AGGAGGTATTCAATCAAACATAGCCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACAAGTTACCT
GAACTGAAACTATACAAGCCGTTCCAAGAAGCTATCCGTGAAAGGGCGTTTTTGTCGCAA
AACGTTAAGCCAATACCCGCAGAGACGTTTGCGAAAGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAG
GAACACCCACCGGCTTGGTACTCTACAGGAAGATTATCCACCGTCGCCGCTATCATGCAC
CATATGCCCATTTCAGTCAAAGATTTTCTCCTGACTAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCA
AAAGAAACTGTTTGAATGTGTGTATCCAACAAGTAAAAATGTTGCCTAACCATGAAACAA
GCTAAATACAAAGCCACACAGAAAGTTATAAGACCAACACAGTTAGAATAAGATCCCAGT
AAGACTAAAGTCTGGTTCTTATTTCTTGTCACACAACTATCCTAAAGTATGTAATAGCCT
AATTGTACTAGGTAATAAATCAAGGCAATAATGTGTGTGGTTGGTAGGAATATCAATATC
TACAAATATCCTTCCAACAAATTAAAGAATATAGATGACAATTATAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU22TF U 1
AF RR4G082TF U 1
AF RR4G082JQ C 462
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GAACTGAAACTATACAAGCCGTTCCAAGAAGCTATCCGTG

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ACGCGCTTGCTCGTGAATTCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTGGTGGCGACGAGTCGATCGC
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ATGTTCTGGTCAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACCACTCGCGGAGGTTCCAATTC
AGACAATGGAGAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTG
TTGTACCTCACATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCA
CAATGGCACCAGGACCACGGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTC
TTACAGACACATTACGGTTGGAGCTTAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCC
C*AGGAGGTATTCAATCAAACATAGCCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACAAGTTACCT
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QA 1 751 1 751
DS 

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AAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACATTACGGTTGGAGCTTAGGCCATTTGGGATT
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TTGCCTAACCATGAAACAAGCTAAATACAAAGCCACACAGAAAGTTATAAGACCAACACA
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TGGTAGGAATATCAATATCTACAAATATCCTTCCAACAAATTAAAGAATATAGATGACAA
TTATAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

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ATTAAAAACATCACGCAATATTGCCACAATTATTAGAATATTACAATGGACCAAGACAAG
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GTGCCCATGCCATAGCCCCCCTTTGTTGATTGCTTAACCCTCGACTCCCCATAGGTGAAG
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CCCAGTCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACCACATCGGTCTTGTAGGGAAGATAG
CTTCGTTCTTTCTGTCGTACGTACGTATCGGTACATCATCTACGTAGAATACAATTTGAT
TAGTGTTCCACAAAATTGCGTAATGGTGGAAATTTTGAGTAGGGTCGAACCACAAATTGA
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GAAGGCTATATGGTTTCCCGGGCGTTGTTCCTAGAAATTCGATATCAACCTCGTCGTGGT
CTCCGGGGTGTTCTTGATTGTTTGAGAGGTAGAGAGATGTATCAACTCCAGCTGTGTAGC
CTGGTTGGAGCTTAATGGAAGCACCAAAGTAGCCCGACTTGTAAGAACGAAGAGACTTGA
ATCCACTCCCTGTTCATAATCACAGCTACTACTATTGATTAATTAAATACGTCAAAAAGC
AATAAATATATTCTACCGACACAGTTTTACAAGTCCTGCGCTGTATTATATAACATTTAA
ACTAATGCGTGCACTTTGACAAAGATATACAGAAACCGTCACTTTACTAAATTGATTCAA
ATTAAATTTGCATTAACTGATATTATTTTTCTGTGTTTTAATTATTCGAAATGGATAGCA
TAAAATGATAAAAAAAATTAAACGTGTATATAAAGCATGGACCACGAATTAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK78JQ U 1
AF RR4AP64JQ U 45
AF RR4AI20JQ U 165
AF RR4AI20TF C 387
BS 1 155 RR4BK78JQ
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BS 820 1000 RR4AI20JQ
BS 1001 1256 RR4AI20TF

RD RR4BK78JQ 744 0 0
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ATTCGTTCTTTCTGTCGTACGTACGTATCGATACATCATCTACGTAGAATACAATTTGAT
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ATTTCATTTCTCTCCCAATAACAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4AP64JQ 775 0 0
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AATGGACCAAGACAAGATTATAAATAACCTTTAAAAACAAATCTCAAATCAGGGAGGATT
GGACGCTCAACTGCTTCACTCTACTTTTCCAGTGTGGACCCGTCTCAATACACTCGTTAT
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QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4AI20JQ 836 0 0
GGACGCTCAACTGCTTCACTCTACTTTTCCAGCGTGGACCCGTCTCAATACACTCGTTAT
TAACTTAATGTATAATTGATAATGCATAACAAATGTTTTAAAATCTTTTTGTTTGTTTGT
TTCGCTTAACATTCTGGTGTTTGGGTATGGTCTCTTTTAGGGTCATGGCAATAGTTATAG
ACCAAGAAGTTCCTCTGTGCCCATGCCATAGCCCCCCTTTGTTGATTGCTTAACCCTCGA
CTCCCCATAGGTGAAGCCGATGGCGGTGTACATGAGCTAGACCCGTCTGCTGTGCATCCC
GCTAACTTAAAGTTTGTGTACTTAGCAATAAATGGTTGGTATCGATAGTCGGCTTTGATC
CTTCCATTTTCCGTGGCCCAGTCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACCACATCGGT
CTTGTAGGGAAGATAGCTTCGTTCTTTCTGTCGTACGTACGTATCGGTACATCATCTACG
TAGAATACAATTTGATTAGTGTTCCACAAAATTGCGTAATGGTGGAAATTTTGAGTAGGG
TCGAACCACAAATTGAATTTCATTTCTCTCCCAATAACATTTCGGTCACCACTTCCTCTG
ACGAATACGTTCGTCTGAAGGCTATATGGTTTCCCGGGCGTTGTTCCTAGAAATTCGATA
TCAACCTCGTCGTGGTCTCCGGGGTGTTCTTGATTGTTTGAGAGGTAGAGAGATGTATCA
ACTCCAGCTGTGTAGCCTGGTTGGAGCTTAATGGAAGCACCAAAGTAGCCCGACTTGTAA
GAACGAAGAGACTTGAATCCACTCCCTGTTCATAATCACAGCTACTACTATTGATT

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR4AI20TF 870 0 0
TTGTGATGCT
ACCCTCGACTCCCCATAGGTGAAGCCGATGGCGGTGTACATGAGCTAGACCCGTCTGCTG
TGCATCCCGCTAACTTAAAGTTTGTGTACTTAGCAATAAATGGTTGGTATCGATAGTCGG
CTTTGATCTTTCCATTTTCCGTGGCCCAGTCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACC
ACATCGGTCTTGTAGGGAAGATAGCTTCGTTCTTTCTGTCGTACGTACGTATCGGTACAT
CATCTACGTAGAATACAATTTGATTAGTGTTCCACAAAATTGCGTAATGGTGGAAATTTT
GAGTAGGGTCGAACCACAAATTGAATTTCATTTCTCTCCCAATAACATTTCGGTCACCAC
TTCCTCTGACGAATACGTTCGTCTGAAGGCTATATGGTTTCCCGGGCGTTGTTCCTAGAA
ATTCGATATCAACCTCGTCGTGGTCTCCGGGGTGTTCTTGATTGTTTGAGAGGTAGAGAG
ATGTATCAACTCCAGCTGTGTAGCCTGGTTGGAGCTTAATGGAAGCACCAAAGTAGCCCG
ACTTGTAAGAACGAAGAGACTTGAATCCACTCCCTGTTCATAATCACAGCTACTACTATT
GATTAATTAAATACGTCAAAAAGCAATAAATATATTCTACCGACACAGTTTTACAAGTCC
TGCGCTGTATTATATAACATTTAAACTAATGCGTGCACTTTGACAAAGATATACAGAAAC
CGTCACTTTACTAAATTGATTCAAATTAAATTTGCATTAACTGATATTATTTTTCTGTGT
TTTAATTATTCGAAATGGATAGCATAAAATGATAAAAAAAATTAAACGTGTATATAAAGC
ATGGACCACGAATTAGGCCC

QA 11 870 11 870
DS 



AS 1 4

CO CL1768Contig1 1277 4 9 U
AGAAGAAAACTAGTAAATTTGAATAACGTGTGATGTGATGAACAGAAAATTTTTGTACTT
CTATAGTCTTAAAAATAAAATACAAGTATTCGACGTGTAATTTGAAACTTGATAAAAAAG
CACACATTGTATCTATCTATACTTTAGTCTCACCGAGCTCAACATCTTTCAAATCGATAT
GCTCTATTCCTTCCTTGAGTGGCTTAACCTCATCTTCTGTCGTACTGTTTTTCCCTTGAG
AAGCTGACTTTGCGTTTCTCTGTTTCTCTAGATCAACCGCCCAACTATAGATCACCATTC
CGACAACAGCTACGACCATGCCGGAGATGTTCTTGAATGTCATCTCCGAATCAAAGAGAA
GCCATCCAAGCGTAAGGACGCAAACTGTTTTCATGTGGCCTAGAACTTGAAATGATGTTG
CAGAGAATCTTCCTATGCAGAGGTATTGGCTTATGTTACAGAAAACGGCTAATGCGCAGG
AGAGAAGAATACAGAAAATGGCACCATAAGTCATCTGATAAGTAGTTATGAACTTGCCGC
TCAAGAAATAGTCAACAAAGGGGCCAAAGATGAGGAGTGAAAGTGCTTGGATCGGAGCTG
TTTTGCTCAGCAACTCAAAAGACCCTACTGAGTACTTCTTCTGCAGAGAGCCTATTGAAA
TCTGCTGAAGGGAAGTGGAGAAGACGGCAGTACAAGCACAGATGAAACCTTTGGCATTAA
CTTTGACATCGGTGACAGTACAGATGCCAACACCGACAACCACAACCATAACAGACGCTT
TCACTTCTCTAGAGTAATGCTTGCTGTGTAGTATCCATTCCATCACGCATACAACCGGAA
TCATACTCAATTTCGATATCTGGTAGAAGCCGACAGAGTTGAGCATGAGGCTGAAGTCCA
TAGCAGCGATGGAGACGTTAGCTACAATAGAGAACCAAAGAAGCTCCCAAAGAGGAATGT
GCTTCGACGCAGAGAGCCCCGTAGCGTTTGACACCATACCAACAAGCGCCGTTAGCGCGA
AGTGGAATCCCGTTAGTGTTGTCGCGAAGCTGAATCCGAAGCCAGAGGAAGACATGAGCT
GTTTATTAGCCATGATGATCCCCACGGAGCTGACGATGTTCATACCCCATGCTCCCACGT
CGGAGACAGACGACTGCTTCTTCTCGCTCTCCATTTTGGGGAACAGATCTCGGTTTTGGC
TATCACAAGCTTTCCACCATTGATGATGCTTCGCTTCCTTGCGCTTTGAGATTTCGAAAT
TTGTATATATAATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H529JQB U 1
AF RR4EV14JQ U 34
AF RR4EV14TF C 714
AF RR4EC96TF C 760
BS 1 652 RR4H529JQB
BS 653 833 RR4EV14JQ
BS 834 834 RR4EV14TF
BS 835 853 RR4EV14JQ
BS 854 897 RR4EV14TF
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BS 1173 1173 RR4EC96TF
BS 1174 1277 RR4EV14TF

RD RR4H529JQB 652 0 0
AGAAGAAAACTAGTAAATTTGAATAACGTGTGATGTGATGAACAGAAAATTTTTGTACTT
CTATAGTCTTAAAAATAAAATACAAGTATTCGACGTGTAATTTGAAACTTGATAAAAAAG
CACACATTGTATCTATCTATACTTTAGTCTCACCGAGCTCAACATCTTTCAAATCGATAT
GCTCTATTCCTTCCTTGAGTGGCTTAACCTCATCTTCTGTCGTACTGTTTTTCCCTTGAG
AAGCTGACTTTGCGTTTCTCTGTTTCTCTAGATCAACCGCCCAACTATAGATCACCATTC
CGACAACAGCTACGACCATGCCGGAGATGTTCTTGAATGTCATCTCCGAATCAAAGAGAA
GCCATCCAAGCGTAAGGACGCAAACTGTTTTCATGTGGCCTAGAACTTGAAATGATGTTG
CAGAGAATCTTCCTATGCAGAGGTATTGGCTTATGTTACAGAAAACGGCTAATGCGCAGG
AGAGAAGAATACAGAAAATGGCACCATAAGTCATCTGATAAGTAGTTATGAACTTGCCGC
TCAAGAAATAGTCAACAAAGGGGCCAAAGATGAGGAGTGAAAGTGCTTGGATCGGAGCTG
TTTTGCTCAGCAACTCAAAAGACCCTACTGAGTACTTCTTCTGCAGAGAGCC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4EV14JQ 820 0 0
G
GTGATGAACAGAAAATTTTTGTACTTCTATAGTCTTAAAAATAAAATACAAGTATTCGAC
GTGTAATTTGAAACTTGATAAAAAAGCACACATTGTATCTATCTATACTTTAGTCTCACC
GAGCTCAACATCTTTCAAATCGATATGCTCTATTCCTTCCTTGAGTGGCTTAACCTCATC
TTCTGTCGTACTGTTTTTCCCTTGAGAAGCTGACTTTGCGTTTCTCTGTTTCTCTAGATC
AACCGCCCAACTATAGATCACCATTCCGACAACAGCTACGACCATGCCGGAGATGTTCTT
GAATGTCATCTCCGAATCAAAGAGAAGCCATCCAAGCGTAAGGACGCAAACTGTTTTCAT
GTGGCCTAGAACTTGAAATGATGTTGCAGAGAATCTTCCTATGCAGAGGTATTGGCTTAT
GTTACAGAAAACGGCTAATGCGCAGGAGAGAAGAATACAGAAAATGGCACCATAAGTCAT
CTGATAAGTAGTTATGAACTTGCCGCTCAAGAAATAGTCAACAAAGGGGCCAAAGATGAG
GAGTGAAAGTGCTTGGATCGGAGCTGTTTTGCTCAGCAACTCAAAAGACCCTACTGAGTA
CTTCTTCTGCAGAGAGCCTATTGAAATCTGCTGAAGGGAAGTGGAGAAGACGGCAGTACA
AGCACAGATGAAACCTTTGGCATTAACTTTGACATCGGTGACAGTACAGATGCCAACACC
GACAACCACAACCATAACAGACGCTTTCACTTCTCTAGAGTAATGCTTGCTGTGTAGTAT
CCATTCCATCACGCATACA*CCGGAATCATACTCAATTT

QA 2 820 2 820
DS 

RD RR4EV14TF 564 0 0
GCATTAACTTTGACATCGGTGACAGTACAGATGCCAACACCGACAACCACAACCATAACA
GACGCTTTCACTTCTCTAGAGTAATGCTTGCTGTGTAGTATCCATTCCATCACGCATACA
ACCGGAATCATACTCAATTTCGATATCTGGTAGAAGCCGACAGAGTTGAGCATGAGGCTG
AAGTTCATAGCAGCGATGGAGACGTTAGCTACAATAGAGAACCAAAGAAGCTCCCAAAGA
GGAATGTGCTTCGACGCAGAGAGCCCCGTAGCGTTTGACACCATACCAACAAGCGCCGTT
AGCGCGAAGTGGAATCCCGTTAGTGTTGTCGCGAAGCTGAATCCGAAGCCAGAGGAAGAC
ATGAGCTGTTTATTAGCCATGATGATCCCCACGGAGCTGACGATGTTCATACCCCATGCT
CCCACGTCGGAGACAGACGACTGCTTCTTCTCGCTCTCCGTTTTGGGGAACAGATCTCGG
TTTTGGCTATCACAAGCTTTCCACCATTGATGATGCTTCGCTTCCTTGCGCTTTGAGATT
TCGAAATTTGTATATATAATATCC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4EC96TF 513 0 0
CCACAACCATAACAGACGCTTTCACTTCTCTAGAGTAATGCTTGCTGTGTAGTATCCATT
CCAGCACGCATACAACCGGAATCATACTCAATTTCGATATCTGGTAGAAGCCGACAGAGT
TGAGCATGAGGCTGAAGTCCATAGCAGCGATGGAGACGTTAGCTACAATAGAGAACCAAA
GAAGCTCCCAAAGAGGAATGTGCTTCGACGCAGAGAGCCCCGTAGCGTTTGACACCATAC
CAACAAGCGCCGTTAGCGCGAAGTGGAATCCCGTTAGTGTTGTCGCGAAGCTGAATCCGA
AGCCAGAGGAAGACATGAGCTGTTTATTAGCCATGATGATCCCCACGGAGCTGACGATGT
TCATACCCCATGCTCCCACGTCGGAGACAGACGACTGCTTCTTCTCGCTCTCCATTTTGG
GGATCAGATCTCGGTTTTGGCTATCACAAGCTTTCCACCATTGATGATGCTTCGCTTCCT
TGCGCTTTGAGATTTCGAAATTTGTATATAT
CC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 4

CO CL1769Contig1 1289 4 7 U
GGGGTTCACTATAAAATCCTCTAGACTGAGATTTACGTTTGATAGACCGTAGACGACTGA
CGACAATGGAGGAGCCAACGACGGAGGAGATAGAGATTAGAACCGCGGACGTGACGACGA
AGACGCTGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGGACGGCGTCACCTCATCAGGAGCTAGTGGAGA
GGCTCAAGGATTACGGTCAGGAAGACGTTTTCGCTCTCTGGGAAGAGCTCTCACCTGAAG
AGCGTCACCTCCTCGTCACTGAAATCGAGAATTTGGATCTCCCAAGAATAGATCGGATCA
TCAGATGCTCACTTAACTCTCAAGGGTTGCCAGCGGCGGCGATTGAGGCACCGCCGGAGA
GTTGTGTGTCCACGGTGGAGGGAAGAAGAAAGGAAGACAAAGAAAAATGGTGGAAGATGG
GGTTGAAGGCTATCTATGAAGGGAAACTGGGTGTGGTGCTTTTATCTGGTGGACAGGGAA
CAAGACTTGGAAGTTCAGATCCCAAAGGGTGTTTTAATATCGGACTGCCATCTGGGAAGT
CACTTTTCCAGATTCAAGCTGAGAGGATCTTATGTGTCCAAAGGCTTGCTGCTCAGGCAA
TGGCAGGTCCAACTCGCTCAGTTGCAATACAGTGGTATATAATGACCAGTCCATTTACTC
ACGAACCAACACAAAAATTCTTCGAGAGTCACAAGTATTTTGGCCTTGAGCCAGGTCAAG
TCACATTTTTCCAACAAGGAACCCTACCTTGCATTACGAAAGATGGAAAGTTTATCATGG
AGACACCTTTCAGTCTAGCCAAAGCTCCAGATGGGAACGGGGGAGTTTATGCAGCTCTAA
AATATTCAAGGTTATTAGAAGATATGGCTTCCAGGGGGATCAAGTATGTGGATTGCTATG
GTGTTGACAATGTTCTGGTTCGAGTAGCTGACCCTACTTTTCTAGGATACTTCATTGACA
AAGGTGCAGCTTCTGCCGCAAAAGTAGTGCGCAAGGCATATCCACAAGAAAAGGTTGGAG
TATTTGTAAGGAGGGGAAAAGGTGGGCCACTGACCGTGGTTGAGTACACAGAGCTTGATG
AGTCCATGGCTTCTGCATCTAATCTTCTTCTCTTCCTTTTAAGTTTGGCCATCTTCTTTT
CTTTTTTGCTTGTTTGTTTCCCTTTTTTTTCTTCTTGTTGTTGTTGAGTTTGGTCCATGT
TTGTACTCTTTGTAACCGGCCAGGAGATAGTAGTCTCTGATGGGTTTGTTATACTCCTAT
TTTATTACAACACTAGCATTGGTTAGGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BS75TF U 1
AF RR4BW89TF U 1
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CACTTTTCCAGATTCAAGCTGAGAGGATCTTATGTGTCCAAAGGCTTGCTGCTCAGGCAA
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GATGAGTCCATGGCTTCTGCATCTAATCTTCTTCTCTTCCTTTTAAGTTTGGCCATCTTC
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TAGCATTGGTTAGGCC

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DS 



AS 1 5

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CTCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTT
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CACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCG
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GCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCA
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CATATGAACATTATCTTGCATGGTATCAGAGTCTTGGTGTGC


BQ
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AF RR4CC48TF U 1
AF RR4E248TF U 9
AF RR4D490TF U 13
AF RR4D490JQ C 138
AF RR4CC48JQ C 128
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BS 274 325 RR4CC48TF
BS 326 326 RR4E248TF
BS 327 373 RR4CC48TF
BS 374 374 RR4E248TF
BS 375 403 RR4CC48TF
BS 404 404 RR4E248TF
BS 405 453 RR4CC48TF
BS 454 454 RR4E248TF
BS 455 613 RR4CC48TF
BS 614 687 RR4E248TF
BS 688 688 RR4D490JQ
BS 689 752 RR4E248TF
BS 753 753 RR4D490JQ
BS 754 762 RR4D490TF
BS 763 763 RR4D490JQ
BS 764 787 RR4D490TF
BS 788 822 RR4CC48JQ

RD RR4CC48TF 613 0 0
GGACAATCCGAGAACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTACTCCTCCAATGGCGTCTTCTT
CCCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTT
CAGCTAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCC
CACATCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCG
GAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAGAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAA
CTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCTCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCT
GCAAGGACTACAACGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATTATTCCTGTCGAAATCA
CTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCCCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGT
TGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGG
TGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCA
CGACCATTGAATC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4E248TF 761 0 0
GGGG
AACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTACTCCTCCAATGGCGTCTTCTTCTCTATCAACTC
TTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGTTAT
CCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCCT
CAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCA
AGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTC
CGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTACA
ATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTATATCGTTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGATG
ATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGTTTTTGTTGCATAAGGCTG
CGGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCGAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAG
ACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTAAACTGCACGACCATTGAAT
CCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCAG
TTCTTGAACCCAAAA*GAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTGTGGTTTCTGTGCT
TTTGTTTGTTTCTAAATGTA
ATCTCCAACAAGACACT

QA 5 744 5 744
DS 

RD RR4D490TF 783 0 0
AACTCGCCTTCTCCTATCACAACCTTGTTCCTTCAATGGCGTCTTCTTCTCTATCAACTC
TTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGTTAT
CCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCCT
CAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCA
AGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTC
CGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTACA
ATGCTAGGACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGATG
ATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCTG
CAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAG
ACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTGAAT
CCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCAG
TTCTTGAACCCAAAA*GAAAGCAGTTTTGTTGTAAA*GCCTGCACTGTGGTTTCTGTGCT
TTTGTTTGTTTCTAAATGTA*TTTCCAACA*GACACTTGGGAGATCTCCATATGA
CATTAAAA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4D490JQ 655 0 0
AAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCCTCAACC
CCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAA
GTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTA
GGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTACAATGCT
AGGACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAG
AGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCTGCAGGT
GTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAG
CTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCT
ATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTT
GAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTGTGGTTTCTGTGCTTTTGT
TTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGACACTTGGGAGATCTCCATATGA
ACATT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4CC48JQ 695 0 0
GTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACATCT
CTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAA
AGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAGAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGC
TCCTCCGGTAGGTCCGGCTCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTTTGCAAGGA
CTACAACGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATTATTCCTGTCGAAATCACTGTTTT
CGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCCCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAA
GGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAAC
AATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATTTGAACTGCACGACCAT
TGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCC
TCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGCCGTAAAAGCCTGCACTGTGGTTTTT
GTGCTTTTGTTTGTTTTTAAATGTAATTTCCAACAAGACACTTGAGAGATCTCCATATGA
ACATTATCTTGCATGGTATCAGAGTCTTGGTGTGC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 5

CO CL1771Contig1 649 5 18 U
CGTCTCTGTAGCTCAAACACAGACTACGTTCACTATTATCACGACGTTTAGTTTGTTTGT
AAGATGAAAAGCACATCCGGTAAGTAAACGCCAGTAACCAAATAACAAAAAGCATGGTCT
TAGTTATGTATAATATTGTTGCAGACTCGAAAGAGTCAGAGATCACTTAACTTCGACATT
ATTCATCTGCATCTACAATCTCCATGCGAAACTTAAAATAAAACTAACTGGAACTTATTG
TCTCATAACCGAAATTAAGCAGTGGCAACACCAGTATGCTTGGCTATTGTGGCATGAAGA
TCTTCCTTCCTTGCACCAACGAGCTTCTCCACAACATTTCCGTCTTTGATGAACACAAAG
GTCGGCATTGCCTCCACACCAAACTCTTGCGCTACACTCTGCAGTTCGTCGACGTCCACC
TTGAAGAAGATGGCACTTGACATGAACTTCTTGGCCAAATCGGCGAAAACTGGAGCAATC
ATGCGGCATGGTGGACACCATGAAGCAGTGAAATCTATCACAATCAGCTTGTTGGTTTGT
TTGGCTGTATCGAGCTGCACGGCCCATACATCATTCGCGTGGCGACCGATCACTTGTCCC
TCTTCTGCCGCCATTTCTTCTCTAATCTGACAAAGTTGAGCAAACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DC65JQ U 171
AF RR4DI22JQ U 1
AF RR4DM21JQ U 59
AF RR4DM21TF C 59
AF RR4DC65TF C 75
BS 1 62 RR4DI22JQ
BS 63 63 RR4DM21JQ
BS 64 122 RR4DI22JQ
BS 123 123 RR4DM21JQ
BS 124 143 RR4DI22JQ
BS 144 144 RR4DM21JQ
BS 145 148 RR4DI22JQ
BS 149 149 RR4DM21JQ
BS 150 160 RR4DI22JQ
BS 161 161 RR4DM21JQ
BS 162 187 RR4DI22JQ
BS 188 188 RR4DM21JQ
BS 189 425 RR4DI22JQ
BS 426 426 RR4DM21JQ
BS 427 428 RR4DI22JQ
BS 429 429 RR4DM21JQ
BS 430 504 RR4DI22JQ
BS 505 649 RR4DM21JQ

RD RR4DC65JQ 239 0 0
CTTCGACATTATTCATCTGCATCTACAATCTCCATGCGAAACTTAAAATAAAACTAACTG
GAACTTATTGTCTCATAACCGAAATTAAGCAGTGGCAACACCAGTATGCTTGGCTATTGT
GGCATGAAAATCTTCCTTCCTTGCACCAACGAGCTTCTCCACAACATTTCCGTCTTTGAT
GAACACAAAGGTCGGCATTGCCTCCACACCAAACTCTTGCGCTACACTCTGCAGTTCGT

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR4DI22JQ 504 0 0
CGTCTCTGTAGCTCAAACACAGACTACGTTCACTATTATCACGACGTTTAGTTTGTTTGT
AAAATGAAAAGCACATCCGGTAAGTAAACGCCAGTAACCAAATAACAAAAAGCATGGTCT
TATTTATGTATAATATTGTTGCAAACTCCAAAGAGTCAGAAATCACTTAACTTCGACATT
ATTCATCCGCATCTACAATCTCCATGCGAAACTTAAAATAAAACTAACTGGAACTTATTG
TCTCATAACCGAAATTAAGCAGTGGCAACACCAGTATGCTTGGCTATTGTGGCATGAAGA
TCTTCCTTCCTTGCACCAACGAGCTTCTCCACAACATTTCCGTCTTTGATGAACACAAAG
GTCGGCATTGCCTCCACACCAAACTCTTGCGCTACACTCTGCAGTTCGTCGACGTCCACC
TTGAAAAAAATGGCACTTGACATGAACTTCTTGGCCAAATCGGCGAAAACTGGAGCAATC
ATGCGGCATGGTGGACACCATGAA

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4DM21JQ 591 0 0
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CTTAGTTATGTATAATATTGTTGCAGACTCGAAAGAGTCAGAGATCACTTAACTTCGACA
TTATTCATCTGCATCTACAATCTCCATGCGAAACTTAAAATAAAACTAACTGGAACTTAT
TGTCTCATAACCGAAATTAAGCAGTGGCAACACCAGTATGCTTGGCTATTGTGGCATGAA
GATCTTCCTTCCTTGCACCAACGAGCTTCTCCACAACATTTCCGTCTTTGATGAACACAA
AGGTCGGCATTGCCTCCACACCAAACTCTTGCGCTACACTCTGCAGTTCGTCGACGTCCA
CCTTGAAGAAGATGGCACTTGACATGAACTTCTTGGCCAAATCGGCGAAAACTGGAGCAA
TCATGCGGCATGGTGGACACCATGAAGCAGTGAAATCTATCACAATCAGCTTGTTGGTTT
GTTTGGCTGTATCGAGCTGCACGGCCCATACATCATTCGCGTGGCGACCGATCACTTGTC
CCTCTTCTGCCGCCATTTCTTCTCTAATCTGACAAAGTTGAGCAAACCTCC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4DM21TF 591 0 0
GTAAGATGAAAAGCACATCCGGTAAGTAAACGCCAGTAACCAAATAACAAAAAGCATGGT
CTTAGTTATGTATAATATTGTTGCAGACTCGAAAGAGTCAGAGATCACTTAACTTCGACA
TTATTCATCTGCATCTACAATCTCCATGCGAAACTTAAAATAAAACTAACTGGAACTTAT
TGTCTCATAACCGAAATTAAGCAGTGGCAACACCAGTATGCTTGGCTATTGTGGCATGAA
GATCTTCCTTCCTTGCACCAACGAGCTTCTCCACAACATTTCCGTCTTTGATGAACACAA
AGGTCGGCATTGCCTCCACACCAAACTCTTGCGCTACACTCTGCAGTTCGTCGACGTCCA
CCTTGAAGAAGATGGCACTTGACATGAACTTCTTGGCCAAATCGGCGAAAACTGGAGCAA
TCATGCGGCATGGTGGACACCATGAAGCAGTGAAATCTATCACAATCAGCTTGTTGGTTT
GTTTGGCTGTATCGAGCTGCACGGCCCATACATCATTCGCGTGGCGACCGATCACTTGTC
CCTCTTCTGCCGCCATTTCTTCTCTAATCTGACAAAGTTGAGCAAACCTCC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4DC65TF 575 0 0
TTTTTT
TAAGTAAACGCCAGTAACCAAATAACAAAAAGCATGGTCTTAGTTATGTATAATATTGTT
GCAGACTCGAAAGAGTCAGAGATCACTTAACTTCGACATTATTCATCTGCATCTACAATC
TCCATGCGAAACTTAAAATAAAACTAACTGGAACTTATTGTCTCATAACCGAAATTAAGC
AGTGGCAACACCAGTATGCTTGGCTATTGTGGCATGAAGATCTTCCTTCCTTGCACCAAC
GAGCTTCTCCACAACATTTCCGTCTTTGATGAACACAAAGGTCGGCATTGCCTCCACACC
AAACTCTTGCGCTACACTCTGCAGTTCGTCGACGTCCACCTTGAAGAAGATGGCACTTGA
CATGAACTTCTTGGCCAAATCGGCGAAAACTGGAGCAATCATGCGGCATGGTGGACACCA
TGAAGTAGTGAAATCTATCACAATCAGCTTGTTGGTTTGTTTGGCTGTATCGAGCTGCAC
GGCCCATACATCATTCGCGTGGCAACCGATCACTTGTCCCTCTTCTGCCGCCATTTCTTC
TCTAATCTGACAAAGTTGAGCAAACCTCC

QA 7 575 7 575
DS 



AS 1 5

CO CL1772Contig1 636 5 7 U
GGGACACTTCTTATTTCCAGCGTCCGTCTTTCTTCCGCTCATATCGTCGCTCGTCGCTCC
TGGATCGCATAGTTCCCTTACTCCTGTGACACCTTCTTCTTCTCCTTCGAAGTCAGGTGA
GAATCTTAAGAGAAGGAGACTTGTTTCAGCAGCCATGGCCAAGCATCATCCTGATTTGAT
CATGTGCCGGAAACAACCTGGCATCGCCATTGGGAGATTGTGCGAGAAATGTGATGGCAA
GTGCGTGGTCTGCGATTCCTACGTGCGCCCCTGTACGCTGGTTCGGATCTGCGATGAATG
CAACTATGGTTCGTTCCAAGGACGGTGCGTCATATGCGGAGGTGTTGGAATCTCAGATGC
TTACTACTGCAAAGAGTGTACACAGCAGGAGAAAGATCGAGATGGTTGTCCCAAGATTGT
CAATCTCGGGAGTGCGAAGACTGATTTGTTTTATGAACGTAAGAAGTATGGATTCAAGAA
ACGATAGATTGTTTTGATTACTCAGGGGTGTTCATTTATTATCCTATGTAAGTGTCTGTA
CTCGTCTGTGTTTAGGCATTGATTCAAAGAAAAGACCATTGTTTGTTACTCTTTGTTATG
GTTGTTTAATGTCTAGTATGTGATTGTTCCTCTACA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

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AF RR4F345JQ C 41
AF RR4F345TF U 41
AF RR4DP38TF U 3
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CGAGAAATGTGATGGCAAGTGCGTTGTCTGCGATTCCTACGTGCGCCCCTGTACGCTGGT
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CCTATGTAAGTGTCTGTACTCGTCTGTGTTTAGGCATTGATTCAAAGAAAAGACCATTGT
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ACTACTGCAAAGAGTGTACACAGCAGGAGAAAGATCGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCA
ATCTCGGGAGTGCGAAGACTGATTTGTTTTATGAACGTAAGAAGTATGGATTCAAGAAAC
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TGTTTAATGTCTAGTATGTGATTGTTCCTCTACA

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DS 



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GTTGCATAGATATAACGTTGAGATCAAAGGGAAAAGAGCAGTGGTTATTGGAAGGAGTAA
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GTATTACTGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FY54TF U 1
AF RR4DC04TF U 146
AF RR4FY54JQ C 637
AF RR4H688JQB C 709
BS 1 550 RR4FY54TF
BS 551 759 RR4DC04TF
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BS 761 1035 RR4FY54JQ
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BS 1387 1394 RR4FY54JQ

RD RR4FY54TF 554 0 0
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CGTGGTTCCTGGGTTAGCTGTGATTCTGGTCGGGGACAGGAAAGATTCGGCGACTTATGT
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CGAAGATTGC
CCTG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4DC04TF 618 0 0
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CAAGTCTCCTGCACGTAAACAGCCGCAGAAGCGCTATTCTCTTCCGTCAGTGCGTCGGCC
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CCTCTCCCACTTTAGTTGATGGAAAGGCCGTGGCAAAGACTATTAGAGATGAGGTCACAG
TCGAAGTATCGAGAATGAAGGAATCTATCGGCGTGGTTCCTGGGTTAGCTGTGATTCTGG
TCGGGGACAGGAAAGATTCGGCGACTTATGTGAGGAACAAGAAGAAAGCTTGCGAATCCG
TTGGAATCAAGTCGTTAGAAGTTAAGCTAGCCGAAGATTGCTCTGAAGAACAGGTGTTGA
AATCCATCTCCTGCTTCAACGATGATCCGTCTATCCACGGGATACTTGTTCAGTTGCCTC
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ATGGATTCCACCCGCTAAATATTGGACGACTCGCCATGCGTGGTAGAGAGCCCTTGTTCG
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CATTATTGCAGCAGTTGGGCGACCGAACATGGTTAGAGGAAGCTGGATTAAACCTGGCGC
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ATAACTTGAAAAGAAAAAAAAAACGAGGACTCCATATTATACACAGTGAAGAGCCCACTC
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TGACTAACATCCTCCATTACAAGTTCAGGTTGCAGTAACATCCTTGACTCATCATAGCCG
GTTAACCAAACACGGGGAGTTTGGTAATACTTGTCATACGTGATGCTAACATCATATGTT
CTGGTCCTAAGGATATTATCGTCATCTGGTTCGTGAGCCACAAGAAAATTCGACTGAAGA
GTTGCAGGATCATTGTCAATCTCATCAAAATCTTCCATGTCTGGAATATCTTCCTCCTCC
TCCTCCTGGCCTCCATCACACCTCTGTTGAGTAGTATCTCTCTCGCTTATTTCCAAGGCA
TCCATGGATGGCAAGTCTTCATCTTCATTGCTTTTATCTTTAGGTCTTACATGAGTAGCA
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TCCGCCACAGACGCAGCTCTTCGTAGACAAGGTACATTCCTAGTGATCAAAAACTGCTTG
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CCCTCTAAATTGGCGACGACAATATCAATAAGGAAACAGAATCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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TATCTTTAGGTC

QA 1 732 1 732
DS 

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AACTTCCTTGCTTCTCACAATTAAGAGCAAATGTGTGTGTTCCATCTCCAATTCAAGTGC
TTGAGCTACCGAGATCAAAGTCCATTGTGTAATCATACTCGATTGTTGGAATAACCGATG
CCATAAACTTCAAGAACAAGAAGAGATACTTGTCAACTTCAGGCTCTACTCCACGTGACA
TTAAGACATCAATGATCTTCTTCATAACAGCTCCGTGACGACATGGATGAACTGAAGCAT
GTTTCCCAGGTAAGTGCGGATGATCTTCTATTGTTACCGTTTTACGCGCATGGTCTTGAC
TAACATCCTCCATTACAAGTTCAGGTTGCAGTAACATCCTTGACTCATCATAGCCGGTTA
ACCAAACACGGGGAGTTTGGTAATACTTGTCATACGTGATGCTAACATCATATGTTCTGG
TCCTAAGGATATTATCGTCATCTGGTTCGTGAGCCACAAGAAAATTCGACTGAAGAGTTG
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CCTGGCCTCCATCACACCTCTGTTGAGTAGTATCTCTCTCGCTTATTTCCAAGGCATCCA
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DS 

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TCATTGCTTTTATCTTTAGGTCTTACATGAGTAGCAAGCCAACCATCATTATCTTCATCA
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GGACCGGTCATCCTCTCCACTGCGCCTTTGAATGCTCCATGAATCTTCTGCGAAAGCACC
ATTGCAACGAATTCGAGATTCGATTTGATCAAAAATCCCTCTAAATTGGCGACGACAATA
TCAATAAGGAAACAGAATCCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 5

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AA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 

AF RR4C056TF U 26
AF RR4C056JQ C 396
AF RR4H181JQ C 176
AF RR4EH45TF U 5
AF RR4H181TF U 1
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BS 64 662 RR4H181TF

RD RR4C056TF 211 0 0
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TTACATTGCAGTACCTTCTTTGTATTGGCATCTCAACGAGACCATTGAAGACTCTCTCCA
TTCCTCTTGTCCTCCTTGTGTCTGTGACTGTTCCTCTCAGCCTCTCCTCTCCATCCCTGA
CGG*TTGAGCAATCATAGCTTCTTA
ATTGAT

QA 1 205 1 205
DS 

RD RR4C056JQ 125 0 0
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GCTCTAGACGAACAGAGAAGACTGTCTTACATGTGGGAGCTTCGAGCTCGGCAAAATGGA
TGGAA

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR4H181JQ 482 0 0
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TATGAGACGTGAGGAAGGGAGTGAAGAGAGCGAGAGTAGTTTCATAGAAATGGTGGCTGA
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GCTAGATGCTAAGAAAGCAGCGTTTCAGTATCAGAAAGAAGCTGATAAGTGCAGCATGGG
GATGGAGACTTGTGAGCAAGCAAGAGAGAAGTCAGAGGGTGCTTTAGACGAACAGAGAAG
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TGTTGTTTCCTTTGATAATTTTTAAAAGAATCAATCAAATCTTTGTTTGTTTCCAACATA
TTTGACACTCTTTATAAGAGATTTTGAGTAATGTTTGTTTACTTTGTAGTGACCTTGACA
TT

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4EH45TF 628 0 0
GG
ATAGATAGAAAGAGATGATCAGAAGGCAGAAGAAGACGGTGAAGGTAGTTACAGGGGTAA
TGGGACTATGCATCCTTGCTTACATTGCAGTACCTTCTTTGTATTGGCATCTCAACGAGA
CCATTGAAGACTCTCTCCATTCCTCTTGTCCTCCTTGTGTCTGTGACTGTTCCTCTCAGC
CTCTCCTCTCCATCCCTGACGGATTGAGCAATCATAGCTTCTTAGATTGTATGAGACGTG
AGGAAGGGAGTGAAGAGAGCGAGAGTAGTTTCACAGAAATGGTGGCTGAAGAGCTGAAGC
TAAGAGAAGCACAAGCTCAAGAAGATGAATGGCGTGCAGACAGGTTGCTGCTAGATGCTA
AGAAAGCAGCGTCTCAGTATCAGAAAGAAGCTGATAAGTGCAGCATGGGGATGGAGACTT
GTGAGCAAGCAAGAGAGAAGTCAGAGGGTGCTCTAGACGAACAGAGAAGACTGTCTTACA
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CTGATAATCTCTAAAAGAATCAATCAAATCTTTGTTTGTTTCCAACATATCTGACACTCT
TTATAAGAGATTTTGAGTAATGTTTG

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR4H181TF 662 0 0
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GGTTAATGGGACTATGCATCCTTGCTTACATTGCAGTACCTTCTTTGTATTGGCATCTCA
ACGAGACCATTGAAGACTCTCTCCATTCCTCTTGTCCTCCTTGTGTCTGTGACTGTTCCT
CTCAGCCTCTCCTCTCCATCCCTGACGGATTGAGCAATCATAGCTTCTTAGATTGTATGA
GACGTGAGGAAGGGAGTGAAGAGAGCGAGAGTAGTTTCATAGAAATGGTGGCTGAAGAGC
TGAAGCTAAGAGAAGCACAAGCTCAAGAAGATGAATGGCGTGCAGACAGGTTGCTGCTAG
ATGCTAAGAAAGCAGCGTCTCAGTATCAGAAAGAAGCTGATAAGTGCAGCATGGGGATGG
AGACTTGTGAGCAAGCAAGAGAGAAGTCAGAGGGTGCTCTAGACGAACAGAGAAGACTGT
CTTACATGTGGGAGCTTCGAGCTCGGCAAAATGGATGGAAAGAAGTAGCCAACGTTGTTG
TTTCCTCTGATAATCTCTAAAAGAATCAATCAAATCTTTGTTTGTTTCCAACATATCTGA
CACTCTTTATAAGAGATTTTGAGTAATGTTTGTCTACTTTGTAGTGACCTTGACATTAAA
AA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 3

CO CL1776Contig1 1155 3 8 U
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TACAAATTTGTGGGAAACAAACATTCCAAAAGACATGCAAGCTTCAATTTATTTGAGAGG
AATAATGTAATCAAAGCGAGAGCGTAATTATATAATGGATAAACTTCAGATTCATTTTTT
AACATACAGTAGGATAGATATCTTATTGGCCGATGACCCGCTTGGCGCCGTCTAAGGTGT
TCCTCAGCAGCATTGCCACGGTCATTGGACCTACACCACCAGGGACCGGAGTTATGAACC
CTGCAACTTTACAAGCCTCTGCGTAATCCACATCTCCAACCAACCGGTATCCTGATTTCC
TGCTGGGGTCGCTGACTGCATTGGTTCCAACATCGATCACCGCAGCCCCTGGCTTAATCC
AGTCCCCCTTAATCATGCAGGGTTGTCCGGCTGCAGCAATAACGATGTCAGCTTCCCGTA
TGATAGCCTCAGGATCTCTGGTGTGGGAATGTACAGTGGTAACAGTAGCATCAGCCTTGA
GCAATAGAAGCGAAACAGGCAATCCAACGATGTTACTCCGACCTACTACAACAGCTCGTT
GCCCTTTTATCTTTATGCCACTTCTTACTAAGAGTTCCAAACATCCCTTAGGGGTGCATG
GAAGGAAGAGGGGTTCTCTGCCTTTCATGGCAAGCTTACCAATATTCAGAGGATGGAAGC
CATCTACATCTTTATCAATGCTGATTGCACTTAAAACATTCTCCTCATTAATATGTTTCG
GCAATGGGAGTTGAACTAATATACCATGAACATCAGGATCTGAATTGAGTAGATGAACTT
TGGTTATAAGATCAGCTTCAGAAACATCCTCTGGTAGGTCCACATCAAATGATTTGATCC
CAACCTCAGCACACGCTTTCCTCTTCATAGTCACATATGTCTGTGAATCTTTCCGTGCCC
CAACTATAACTACCGCTAGTCCTGGGACCTTGCCGTGTTTCTCAGATAGATCGCGAACTT
CCTCGGCGATCTCTGATCGGATGGTTTGAGCAATCGCCTTCCCATCGATTATCTTCGCCG
TTTGATCAGATGAAGCCATGAGCTGAAGTCTCTGGTTAGGTGTGCGACACACAGTGTATC
ATCCACTATCCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC10JQ U 107
AF RR4CS23JQ U 1
AF RR4HB95TF C 410
BS 1 577 RR4CS23JQ
BS 578 578 RR4HB95TF
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BS 818 834 RR4CS23JQ
BS 835 1155 RR4HB95TF

RD RR4BC10JQ 439 0 0
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CAGATTCATTTTTTAACATACAGTAGGATAGATATCTTATTGGCCGATGACCCGCTTGGC
GCCGTCTAAGGTGTTCCTCAGCAGCATTGCCACGGTCATTGGACCTACACCACCAGGGAC
CGGAGTTATGAACCCTGCAACTTTACAAGCCTCTGCGTAATCCACATCTCCAACCAACCG
GTATCCTGATTTCCTGCTGGGGTCGCTGACTGCATTGGTTCCAACATCGATCACCGCAGC
CCCTGGCTTAATCCAGTCCCCCTTAATCATGCAGGGTTGTCCGGCTGCAGCAATAACGAT
GTCAGCTTCCCGTATGATAGCCTCAGGATCTCTGGTGTGGGAATGTACAGTGGTAACAGT
AGCATCAGCCTTGAGCA
AT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4CS23JQ 834 0 0
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TACAAATTTGTGGGAAACAAACATTCCAAAAGACATGCAAGCTTCAATTTATTTGAGAGG
AATAATGTAATCAAAGCGAGAGCGTAATTATATAATGGATAAACTTCAGATTCATTTTTT
AACATACAGTAGGATAGATATCTTATTGGCCGATGACCCGCTTGGCGCCGTCTAAGGTGT
TCCTCAGCAGCATTGCCACGGTCATTGGACCTACACCACCAGGGACCGGAGTTATGAACC
CTGCAACTTTACAAGCCTCTGCGTAATCCACATCTCCAACCAACCGGTATCCTGATTTCC
TGCTGGGGTCGCTGACTGCATTGGTTCCAACATCGATCACCGCAGCCCCTGGCTTAATCC
AGTCCCCCTTAATCATGCAGGGTTGTCCGGCTGCAGCAATAACGATGTCAGCTTCCCGTA
TGATAGCCTCAGGATCTCTGGTGTGGGAATGTACAGTGGTAACAGTAGCATCAGCCTTGA
GCAATAGAAGCGAAACAGGCAATCCAACGATGTTACTTCGACCTACTACAACAGCTCGTT
GCCCTTTTATCTTTATGCCACTTCTTACTAAGAGTTCCAAACATCCCTTAGGGGTGCATG
GAAGGAAGAGGGGTTCTCTGCCTTTCATGGCAAGCTTACCAATATTCAGAGGATGGAAGC
CATCTACATCTTTATCAATGCTGATTGCACTTAAAACATTCTCCTCATTAATATGTTTCG
GCAATGGGAGTTGAACTAATATACCATGGACATCAG*ATCTGAATTGAGTAGAT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4HB95TF 746 0 0
TGGCTTAATCCAGTCCCC*TTAATCATGCAGGCTTGTCCGGCTGCAGCAATAACGATGTC
AGCTTCCCGTATGATAGCCTCAGGATCTCTGGTGTGGGAATGTACGGTGGTAACAGTAGC
ATCAGCCTTGAGCAGTAGAAGCGAAACAGGCAATCCAACGATGTTGCTCCGACCTACTAC
AACAGCTCGTTGCCCTTTTATCTTTATGCCACTTCTTACTAAGAGTTCCAAACATCCCTT
AGGGGTGCATGGAAGGAAGAGGGGTTCTCTGCCTTTCATGGCTAGCTTACCAATATTCAG
AGGATGGAAGCCATCTACATCTTTATCAATGCTGATTGCACTTAAAACATTCTCCTCATT
AATATGTTTCGGCAATGGGAGTTGAACTAATATACCATGAACATCAGGATCTGAATTGAG
TAGATGAACTTTGGTTATAAGATCAGCTTCAGAAACATCCTCTGGTAGGTCCACATCAAA
TGATTTGATCCCAACCTCAGCACACGCTTTCCTCTTCATAGTCACATATGTCTGTGAATC
TTTCCGTGCCCCAACTATAACTACCGCTAGTCCTGGGACCTTGCCGTGTTTCTCAGATAG
ATCGCGAACTTCCTCGGCGATCTCTGATCGGATGGTTTGAGCAATCGCCTTCCCATCGAT
TATCTTCGCCGTTTGATCAGATGAAGCCATGAGCTGAAGTCTCTGGTTAGGTGTGCGACA
CACAGTGTATCATCCACTATCCACCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 2 4

CO CL1777Contig1 768 2 8 U
ATAAAACTTCCATTATTACATACTTATAAACTGATCATCATATCACTTTTCTTTAGCATT
CGATGCTACAAGGATAACGACACCCCAAGGCTATATTTTACATTAAAACTGAAACAAATT
GACGATAATACTAAAAATAACAGTCCATAGTTGTTATTCAGATACATATATATATATAAT
ATACACACAAGGACAGGTAAAACCCAGTAGTGTCCTAATACTTCTACTGAGTTGAGGTGT
GAACAGCAGCAACAGTAGATACCATTGTGTCCATACCACAGATGTTATGACGTCCCCTGC
AGATTTTGTAGTAACCATGCTCGCCCCACGTCTCTCCCCATGAGTTCTTTATGATCCAGT
AAGGCTTCTCCTTGAGACGGATTGGTGCATAACCGGACGAGCCAAACCCAACCAAGAGCA
CTCCATGGTCTTAGCTCTTAGAACATACATACGGGCACGAGACTCCGCCAATGTAAGTTT
GCATCCACATTGCATTGATAGCAATGGCAAGAGGACCGTGGTGGACTAGATTTGCAGCTA
TTTGGTCTTCATCAGCAGAGACAACGCTGAAGTTAGACACTCTGGCAGCGATCATGCTCT
TGTCGAACTTGAAACCGGAATTGTCATGTCCCGTATAAGGATAGTCTGATTCTTTCATAA
GGCCACCAGCTTTGAGAGTGTACTCAAAAGCGTTGTTCATTAGTCCTCCACTGCATCCAG
AGTCACATGAATTGGCCTCTTCTGGATCACACTCATGGTCGCAATCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ30JQ U 1
AF RR4E922JQ U 76
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BS 731 768 RR4E922JQ

RD RR4CZ30JQ 734 0 0
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CTCCATGGTCTTGGCTCTTAGAACATACATACGGGCACGAGACTCCGCCAATGTAAGTTT
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TGCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4E922JQ 693 0 0
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GGTAAAACCCAGTAGTGTCCTAATACTTCTACTGAGTTGAGGTGTGAACAGCAGCAACAG
TAGATACCATTGTGTCCATACCACAGATGTTATGACGTCCCCTGCAGATTTTGTAGTAAC
CATGCTCGCCCCACGTCTCTCCCCATGAGTTCTTTATGATCCAGTAAGGCTTCTCCTTGA
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TCTTAGAACATACATACGGGCACGAGACTCCGCCAATGTAAGTTTGCATCCACATTGCAT
TGATAGCAATGGCAAGAGGACCGTGGTGGACTAGATTTGCAGCTATTTGGTCTTCATCAG
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CCTCTTCTGGATCACACTCATGGTCGCAATCCA

QA 1 693 1 693
DS 



CO CL1777Contig2 791 2 5 U
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TCTTCGAGGCTAATCTGCGTAGAGCTAGGCGTCACCAGCTGCTCGATCCGTCGGCCGTCC
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TGAAACGGAGGTTGCGTCTTCCCAAAGACGCTCAGAAGGCGCCGATCCTTCCGACTAGCG
ACCTCCCGACGGATTTCGATTGGCGTGACCAAGGAGCCGTCACTCCCGTTAAAAACCAGG
GTTCGTGCGGATCGTGCTGGTCGTTTAGCGCAACAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTC
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GTCTCTGCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E922TF U 1
AF RR4CZ30TF U 1
BS 1 657 RR4CZ30TF
BS 658 658 RR4E922TF
BS 659 700 RR4CZ30TF
BS 701 701 RR4E922TF
BS 702 791 RR4CZ30TF

RD RR4E922TF 713 0 0
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TACTCGTCGCCATCACGGGCCACGTATCAGAAGACGGTTTCGATAACCCGATCATCAGGC
AAGTCGTCCCGGAAGAAAACGATGAGCAGCTGCTCAACGCGGAGCACCACTTCTCTCTCT
TCAAGTCCAAGTACGACAAGACCTACGCGACTCAGGCGGAGCACGATCGTCGTTTCCGCG
TCTTCGAGGCTAATCTGCGTAGAGCTAGGCGTCACCAGCTGCTCGATCCGTCGGCCGTCC
ACGGCGTGACGCAATTCTCAGATCTTACTCCGAAGGAGTTCCGCCGCAAGCACCTAGGCC
TGAAACGGAGGTTGCGTCTTCCCAAAGACGCTCAGAAGGCGCCGATCCTTCCGACTAGCG
ACCTCCCGACGGATTTCGATTGGCGTGACCAAGGAGCCGTCACTCCCGTTAAAAACCAGG
GTTCGTGCGGATCGTGCTGGTCGTTTAGCGCAACAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTC
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GTGATCCAGAAGAGGCCAATTCATGTGACTCTGGATGCAGTGGAGGACTAATGAACAACG
CTTTTGAGTACACTCTCAAAGCTGGTGGCCTTATGAAAGAATCAGACTATCCT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4CZ30TF 791 0 0
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TACTCGTCGCCATCACGGGCCACGTATCAGAAGACGGTTTCGATAACCCGATCATCAGGC
AAGTCGTCCCGGAAGAAAACGATGAGCAGCTGCTCAACGCGGAGCACCACTTCTCTCTCT
TCAAGTCCAAGTACGACAAGACCTACGCGACTCAGGCGGAGCACGATCGTCGTTTCCGCG
TCTTCGAGGCTAATCTGCGTAGAGCTAGGCGTCACCAGCTGCTCGATCCGTCGGCCGTCC
ACGGCGTGACGCAATTCTCAGATCTTACTCCGAAGGAGTTCCGCCGCAAGCACCTAGGCC
TGAAACGGAGGTTGCGTCTTCCCAAAGACGCTCAGAAGGCGCCGATCCTTCCGACTAGCG
ACCTCCCGACGGATTTCGATTGGCGTGACCAAGGAGCCGTCACTCCCGTTAAAAACCAGG
GTTCGTGCGGATCGTGCTGGTCGTTTAGCGCAACAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTC
TGGCGACTAAAGAGCTTGTTAGCCTCAGTGAGCAGCAGCTTGTGGATTGCGACCATGAGT
GTGATCCAGAAGAGGCCAATTCATGTGACTCTGGATGCAGTGGAGGACTAATGAACA*CG
CTTTTGAGTACACTCTCAAAGCTGGTGGCCTTATGAAAGA*TCAGACTATCCTTATACGG
ACATGACATTCCGGTTCAGTCGACAGAGCATGATCGCTGCAGAGTGTCTACTTCAGCGTT
GTCTCTGCTGA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 5

CO CL1778Contig1 826 5 24 U
GGACAACCATCGGGTATCAAAGACGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGACACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCCGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCAGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAATCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAA
AATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTAT
GTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACT
CTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAAT
AGTTTGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGATTCTTACCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4G736TF U 1
AF RR4GK64JQ C 25
AF RR4GK64TF U 25
AF RR4G736JQ C 202
AF RR4GT95TF U 453
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BS 255 255 RR4GK64TF
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BS 291 553 RR4G736TF
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GTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCCACAGCCATACT

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TGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTACCAGCCGGTATTACCAC
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CATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAAC
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ATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACT
TTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGA
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AAATGTATGCGTTTTCGTTATCCACAGCCATACTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTTGT
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DS 

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G
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TTTTCAAGTAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGT
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GATTCTTAC

QA 2 370 2 370
DS 



AS 1 4

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AGCGAGAATGTTTCTCTGCGTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DF80JQ U 1
AF RR4GY10JQ U 9
AF RR4AE01TF C 59
AF RR4GY10TF C 120
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BS 487 863 RR4AE01TF

RD RR4DF80JQ 413 0 0
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CTATTGCTAAGGCATGCTGCTTTCCTTCTGCATATATAGCCACAGGCCTTTCTGCCTCAA
CTTCTTCATCCAGAACGCCTCCAGGGGATGTGAGACCAGGACACATTATGTT
T

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4GY10JQ 481 0 0
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AATATTTGAAAACAGATGACTAAGGTTGAGATCCGGACAAAAGCCCCATAAAAGTTTAAA
GACACATAAAAAAGGAAATCTCCTCCAAAATGATTGATTCACACGACATTTGACTTCTTT
CCTCAATCTAGTCGTTCCATCTTCCAAAAACCGTCGTTGAGGTAATGCATGTTGTCCACT
CCGATTCCTTTGTTGATGCTCTTAATGTCCTTGGCTGACATTTTGGTGAAGCCTATTGCT
AAGGCATGCTGCTTTCCTTCTGCATATATAGCCACAGGCCTTTCTGCCTCAACTTCTTCA
TCCAAAACACCTCCAGGAAATGTGAGACCAGGACACATTATGTTGGCACCAAAAAAAACA
AACTTTATAGCACGTCTATCAACTTGAAACCTCTTCATTATATTTGGGTACTGATGAA
AAA

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4AE01TF 805 0 0
CAAAACATCAAATATTTGAAAACAGATGACTAAGGTTGAGATCCGGACAAAAGCTCCATA
AAAGTTTAGAGACACATAAAAAAGGAGATCTCCTCCAGAATGATTGATTCACACGACATT
TGACTTCGTTCCTCAATCTAGTCGTTCCATCTTCCAGAGACCGTCGTTGAGGTAATGCAT
GTTGTCCACTCCGATTCCTTTGTTGATGCTCTTAATGTCCTTGGCTGACATTTTGGTGAA
GCCTATTGCTAAGGCATGCTGCTTTCCTTCTGCATATATAGCCACAGGCCTTTCTGCCTC
AACTTCTTCATCCAGAACACCTCCAGGAGATGTGAGACCAGGACACATTATGTTGGCACC
AGAGAAAACAAACTTTATAGCACCTCTATCAACTTGAAACCTCTTCATTATATTTGGGTA
CTGATGAAGAAGACGCAGAGTTGGCATGTATGGCCCATCACGGATACAGAAGAAGAGAGG
GACATTGTTGACAACAACTAGCGTCAGATGGTTTGGGCACTTGACTACAATGAGAGGAGA
CTTTTTGGGAAGTAGATCCTCCAACACCGTTTCAAGTCCCGGGTACTCTTCTTGAATACT
CTGACGAATCCTACGTTGGACAGAAGCCTTTACTTGGTTTTGCGATGAAACCTCCTCCAT
TGAAAACTTCTTGAACATGTTGGATGATGAGAGGTTATTTCTTTTGGTAAGTTTATGAGA
TTTGGTCGATGCAGCTGGAATACAACCGGAGAGAGAGAGAGAGAGGATGCGTTTCCGAAC
CGAGCGAGAATGTTTCTCTGCGTCC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4GY10TF 744 0 0
AAAGTTAGAGACACAT
AAAAAAGGAGATCTC*TCCAGAATGATTGATTCACACGACATTTGACTTCGT*CCTCAAT
CTAGTCGTTCCATCTTCCAGAGAC*GTCGTTGAGGTAATGCATGTTGTCCACTCCGATTC
*TTTGTTGATGCTCTTAATGTCCTTGGCTGACATTTTGGTGAAGCCTATTGCTAAGGCAT
GCTGCTTTCCTTCTGCATATATAGCCACAGGCCTTTCTGCCTCAACTTCTTCATCCAGAA
CACCTCCAGGAGATGTGAGACCAGGACACATTATGTTGGCACCAGAGAAAACAAACTTTA
TAGCACGTCTATCAACTTGAAACCTCTTCATTATATTTGGGTACTGATGAAGAAGACGCA
GAGTTGGCATGTATGGCCCATCACGGATACAGAAGAAGAGAGGGACATTGTTGACAACAA
CTAGCGTCAGATGGTTTGGGCACTTGACTACAATGAGAGGAGACTTTTTGGGAAGTAGAT
CCTCCAACACCGTTTCAAGTCCCGGGTACTCTTCTTGAATACTCTGGCGAATCCTACGTT
GGACAGAAGCCTTTACTTGGTTTTGCGATGAAACCTCCTCCATTGAAAACTTCTTGAACA
TGTTGGATGATGAGAGGTTATTTCTTTTGGTAAGTTTTTGAGATTTGGTCGATGCAGCTG
GAATACAACCGGAGAGAGAGAGAGAGAGGATGCGTTTCCGAACCGAGCGAGAATGTTTCT
CTGCGTCC

QA 17 744 17 744
DS 



AS 1 4

CO CL1780Contig1 979 4 6 U
GGGAGACACTCGTGAACGCGGAGACTTTTGAGGGATCATCCGAATTCTCAGTGCAACTTG
ACAAGTTATCATCATCATCTTCTCCCAAATCACAATCAAATCAAAACCACATCATCTGAT
CTCCAGATTCGTCGTCTCTGAGAAGAAAAAAAAAACGGCGGTTACTATGAAACAGATGTC
GTTGATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGTCGTTTATTCTCGGAGTCATCGCCGAGAACAA
GAAGCCTGCGTCTGGAATTCCAATAAATGGAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATC
TGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGC
AGGATACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGAAAGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTT
CAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACT
GTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATTACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAG
GAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAAGACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGT
GTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGA
AGACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGT
TAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGATCTGCATCTGCATCTGCTTATTGGTA
TTGGGGTGTAGTAAGGGGGTTTTATGTTATTCTACTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAA
ATAGTTTTTCTTTTTAAAATACATTTGATTTTAAAGATGCTATGAATTGCTTGTGAAGCT
TAATGCACTGTGATTCTCAAAGTTGTATATGTCTCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAAT
AATATTTTGATTTGGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4HB04TF U 10
AF RR4BJ41TF U 1
AF RR4BJ41JQ C 153
AF RR4HB04JQB C 185
BS 1 302 RR4BJ41TF
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BS 590 794 RR4BJ41TF
BS 795 979 RR4BJ41JQ

RD RR4HB04TF 769 0 0
GG
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TCATC***TTCTCCCAAATCACAATCAAATCAAAACCACATCATCTGATCTCCAGATTCG
TCGTCTCTGAGAAGAAAAAAAAAT*GGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGT
CTTTGTTTGGCGTCTTGTCGTTTATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGT
CTGGAATTCCAATAAATGGAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGATCCAACTG
TTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGCAGGATACAAAT
CCTTGTTCATCTCTTACAAGGGAAAGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCA
GCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGCCTTGATAACATCTTGACTGGCACTGTCTCTGTTGC
TATGGCCAACCATTACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGA
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CGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGG
ATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGTTAACCTCA*GA
TTGATGCTTGAGAGAATGA*TGATCTGCATTTGCATCTGCT
ATGGTA

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR4BJ41TF 797 0 0
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CTCCAGATTCGTCGTCTCTGAGAAGAAAAAAAAAACGGCGGTTACTATGAAACAGATGTC
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GAAGCCTGCGTCTGGAATTCCAATAAATGGAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATC
TGGTCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGC
AGGATACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGAAAGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTT
CAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACT
GTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATTACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAG
GAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAAGACTGGTCTGCTAGGTGGTGGTGCATTTGT
GTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGA
AGACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGT
TAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGATCTGCATCTGCATCTGCTTATTGGTA
TTGGGGTGTAGTAA
AGG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4BJ41JQ 827 0 0
AAAC
GGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGTCGTTTAT
TCTCGGAGTCATCGCCGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAATTCCAATAAATGGAAAGGG
AGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGGTCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGC
TTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGCAGGATACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGAAA
GTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGC
CTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATTACAGAGCAACT
TCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAAGACTGG
TCTGCTAGGTGGTGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCTCT
GATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGA
TGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGTTAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGATC
TGCATCTGCATCTGCTTATTGGTATTGGGGTGTAGTAAGGGGGTTTTATGTTATTCTACT
GCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAGTTTTTCTTTTTAAAATACATTTGATTTTAAAG
ATGCTATGAATTGCTTGTGAAGCTTAATGCACTGTGATTCTCAAAGTTGTATATGTCTCT
ACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATATTTTGATTTGGATTT

QA 5 827 5 827
DS 

RD RR4HB04JQB 795 0 0
ATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGTCGTTTATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGAAG
CCTGCGTCTGGAATTCCAATAAATGGAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGAT
CCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGCAGGA
TACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGAAAGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAA
AGCCCCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGCCTTGATAACATCTTGACTGGCACTGTCT
CTGTTGCTATGGCCAACCATTACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAAC
TTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAAGACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCA
TTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGAC
CATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGTTAAC
CTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGATCTGCATTTGCATCTGCTTATTGGTATTGG
GGTGTAGTAAGGGGGTTTTATGTTATTCTACTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAG
TTTTTCTTTTTAAAATACATTTGATTTTAAAGATGCTATGAATTGCTTGTGAAGCTTAAT
GCACTGTGATTCTCAAAGTTGTATATGTCTCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATA
TTTTGATTTGGATTT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 3

CO CL1781Contig1 758 3 7 U
TTGTTAAAAGGGCAGTCAAATCTTATTATTCGAGGAAGATGAATAATGCTATGGTCTATG
GAGCAAATATCAGATTGCGTCATAAACATTTACAGCAAATCAAATCAAATCCAAGATAAC
ATTTGAATATTAAATCAAACTATGATCCAATCTTCAAGTGTCCAAAACCAAAAGACTTGA
TCTAGGACACTTGGAATACAAAGCAAAACACTAAACAGTTCCTTTATTAGTTTGTCTCTC
CTCAAGCGCTGCTCACAAGCACGTTACTAGCCTTACTGGTCGCAGTCGCTGGGCTTCGGG
TGAAAGCTTTTACACTTAACGGACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCATCCTTCGCAC
AGACAGGGTATAACTGAGGGCAGCAGCTAGAGCCGTTCTCACAGCAAGTGGCTGACTCAA
ACGGACAACATCCCCAACTATCACATTTTCCTTTGTTCTCACTGACGCAACAACAAGTGG
ACTCGTCTGGACAACTGTAAGACTTGTCACAAACAACAGATCTGGTAGGGTAAGAAGCCA
ACATCGCCACACCACATTTCCCTGCCGAATCATTGACGTTACGTTGAAGCTTAATGTATC
CGCTCTCTCCCCAGTTCGATCCCACTGAGTCACGGATGATCCAGTAGTCTTGACCTTCTG
ATGAAGTTCCGTATCCCACAGCTAACGCAGCATGGTCCAAAGCTGTTCCGCATGCTCCTG
TGAACACACCTGATTTGTAAAGCTGGAATTCTCGTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX88JQ U 152
AF RR4AX88TF C 109
AF RR4CE79JQ U 1
BS 1 163 RR4CE79JQ
BS 164 164 RR4AX88JQ
BS 165 469 RR4CE79JQ
BS 470 470 RR4AX88JQ
BS 471 604 RR4CE79JQ
BS 605 605 RR4AX88JQ
BS 606 758 RR4CE79JQ

RD RR4AX88JQ 472 0 0
CTTCAAGTGTCCAAAACCAAAAGACTTGATCTAGGACACTTGGAATACAAAGCAAAACAC
TAAACAGTTCCTTTATTAGTTTGTCTCTCCTCAAGCGCTGCTCACAAGCACGTTACTAGC
CTTACTGGTCGCAGTCGCTGGGCTTCGGGTGAAAGCTTTTACACTTAACGGACTGTTTGC
CTTCATTCTACAAGTACCATCCTTCGCACAGACAGGGTATAACTGAGGGCAGCAGCTAGA
GCCGTTCTCACAGCAAGTGGCTGACTCAAACGGACAACATCCCCAACTATCACATTTTCC
TTTGTTCTCACTGACGCAACAACAAGTGGACTCGTCTGGACAACTGTAAGACTTGTCACA
AACAACAGATCTGGTAGGGTAAGAAGCCAACATCGCCACACCACATTTCCCTGCCGAATC
ATTGACGTTACGTTGAAGCTTAATGTATCCGCTCTCTCCCCAGTTCGATCCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR4AX88TF 515 0 0
CTC
CAAGATAACATTTGAATATTAAATCAAACTATGATCCAATCTTCAAGTGTCCAAAACCAA
AAGACTTGATCTAGGACACTTGGAATACAAAGCAAAACACTAAACAGTTCCTTTATTAGT
TTGTCTCTCCTCAAGCGCTGCTCACAAGCACGTTACTAGCCTTACTGGTCGCAGTCGCTG
GGCTTCGGGTGAAAGCTTTTACACTTAACGGACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCAT
CCTTCGCACAGACAGGGTATAACTGAGGGCAGCAGCTAGAGCCGTTCTCACAGCAAGTGG
CTGACTCAAACGGACAACATCCCCAACTATCACATTTTCCTTTGTTCTCACTGACGCAAC
AACAAGTGGACTCGTCTGGACAACTGTAAGACTTGTCACAAACAACAGATCTGGTAGGGT
AAGAAGCCAACATCGCCACACCACATTTCCCTGCCGAATCATTGACGTTACGTTGAAGCT
TAATGTATCCGCTCTCTCCCCAGTTCGATCCC

QA 4 515 4 515
DS 

RD RR4CE79JQ 758 0 0
TTGTTAAAAGGGCAGTCAAATCTTATTATTCGAGGAAGATGAATAATGCTATGGTCTATG
GAGCAAATATCAGATTGCGTCATAAACATTTACAGCAAATCAAATCAAATCCAAGATAAC
ATTTGAATATTAAATCAAACTATGATCCAATCTTCAAGTGTCCGAAACCAAAAGACTTGA
TCTAGGACACTTGGAATACAAAGCAAAACACTAAACAGTTCCTTTATTAGTTTGTCTCTC
CTCAAGCGCTGCTCACAAGCACGTTACTAGCCTTACTGGTCGCAGTCGCTGGGCTTCGGG
TGAAAGCTTTTACACTTAACGGACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCATCCTTCGCAC
AGACAGGGTATAACTGAGGGCAGCAGCTAGAGCCGTTCTCACAGCAAGTGGCTGACTCAA
ACGGACAACATCCCCAACTATCACATTTTCCTTTGTTCTCACTGACGCAGCAACAAGTGG
ACTCGTCTGGACAACTGTAAGACTTGTCACAAACAACAGATCTGGTAGGGTAAGAAGCCA
ACATCGCCACACCACATTTCCCTGCCGAATCATTGACGTTACGTTGAAGCTTAATGTATC
CGCTATCTCCCCAGTTCGATCCCACTGAGTCACGGATGATCCAGTAGTCTTGACCTTCTG
ATGAAGTTCCGTATCCCACAGCTAACGCAGCATGGTCCAAAGCTGTTCCGCATGCTCCTG
TGAACACACCTGATTTGTAAAGCTGGAATTCTCGTCCA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL1782Contig1 908 4 3 U
CCGTTTCTCTCTCTCTCTCTCCTACTTTTTTTTTGTCAGTAGGCCTCTTGCTAAGTACGC
AAGTTTCTAGTATTTCATTACCCCTTTTTGATCGAAGCTTTTTTTTATTTATTTCTGAGA
TATTTATTTGTGCCTGATGAAATTTTCTCCACCATCGTTAGTTTGTGTGGTTTCGTTTGG
TTTCGGTTTATTGGTGGATCGGATCACAATCTGCTGACGGAGAATTGAGATCTGTTGGTG
GTGTTTTTTTTTCTGTATGTTGATAGGTTGGATTTGTTGGAAATGGGAAGACTATTCGTG
ATCGACCTCCAAGGAGAAACCTATAGCTGCAAGCATTGCCATACTCCTTTCGCACTTACC
GATGATCTCATCTCCAAGTCATTTCACTGCAAGCATGGAAGGGCTTATCTTTTCGAAAAC
GTTGTCAATGTGACTGTTGGAGAGATGGAGCATCGCATCATGATGACTGGTTGGCATACT
GTAGCTGACATCTTCTGCGTTTGTTGCGGCTCTCTTGTTGGCTGGAAATACGAAATTGCA
TACGAAAAGTCTCAGAAGTACAAGGAAGGAAAATTCATCATTGAAAGGTTTAAAGTGCTT
GGACCCGATGGAGGCGGATACGACATGAACGAGGACGAGCCCATGATTGG*AAGTGACGA
ACATAAAACCGGCTTTTCTTTTTACCACTCTCTAATAGTTATTGGAGATTTTTGGCAAGT
GATCAATCCAAAACTCCACAATTTTTCTCGGGTAAGCCATAAGTAAGTAAGAAAAAAACC
AGATATTTATAAACTTAATTATAATTGAGTTCCAAAATCGTCTTTAGAAAACTTGTTTCG
AACGAATTAATCTCCAATTCAGACACTAACTTTAGTATATGCGTGCTTCTACTTACATGC
CTCTTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A320TF U 305
AF RR4A320TFB U 1
AF RR4A320JQ C 138
AF RR4A320JQD C 138
BS 1 824 RR4A320TFB
BS 825 852 RR4A320JQ
BS 853 908 RR4A320JQD

RD RR4A320TF 367 0 0
ACCTCCAAGGAGAAACCTATAGCTGCAAGCATTGCCATACTCCTTTCGCACTTACCGATG
ATCTCATCTCCAAGTCATTTCACTGCAAGCATGGAAGGGCTTATCTTTTCGAAAACGTTG
TCAATGTGACTGTTGGAGAGATGGAGCATCGCATCATGATGACTGGTTGGCATACTGTAG
CTGACATCTTCTGCGTTTGTTGCGGCTCTCTTGTTGGCTGGAAATACGAAATTGCATACG
AAAAGTCTCAGAAGTACAAGGAAGGAAAATTCATCATTGAAAGGTTTAAAGTGCTTGGAC
CCGATGGAGGCGGATACGACATGAACGAGGACGAGCCCATGATTGGGAAGTGACGAACAT
AAAACCG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4A320TFB 824 0 0
CCGTTTCTCTCTCTCTCTCTCCTACTTTTTTTTTGTCAGTAGGCCTCTTGCTAAGTACGC
AAGTTTCTAGTATTTCATTACCCCTTTTTGATCGAAGCTTTTTTTTATTTATTTCTGAGA
TATTTATTTGTGCCTGATGAAATTTTCTCCACCATCGTTAGTTTGTGTGGTTTCGTTTGG
TTTCGGTTTATTGGTGGATCGGATCACAATCTGCTGACGGAGAATTGAGATCTGTTGGTG
GTGTTTTTTTTTCTGTATGTTGATAGGTTGGATTTGTTGGAAATGGGAAGACTATTCGTG
ATCGACCTCCAAGGAGAAACCTATAGCTGCAAGCATTGCCATACTCCTTTCGCACTTACC
GATGATCTCATCTCCAAGTCATTTCACTGCAAGCATGGAAGGGCTTATCTTTTCGAAAAC
GTTGTCAATGTGACTGTTGGAGAGATGGAGCATCGCATCATGATGACTGGTTGGCATACT
GTAGCTGACATCTTCTGCGTTTGTTGCGGCTCTCTTGTTGGCTGGAAATACGAAATTGCA
TACGAAAAGTCTCAGAAGTACAAGGAAGGAAAATTCATCATTGAAAGGTTTAAAGTGCTT
GGACCCGATGGAGGCGGATACGACATGAACGAGGACGAGCCCATGATTGG*AAGTGACGA
ACATAAAACCGGCTTTTCTTTTTACCACTCTCTAATAGTTATTGGAGATTTTTGGCAAGT
GATCAATCCAAAACTCCACAATTTTTCTCGGGTAAGCCATAAGTAAGTAAGAAAAAAACC
AGATATTTATAAACTTAATTATAATTGAGTTCCAAAATCGTCTT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4A320JQ 715 0 0
TGAAATTTTCTCCACCATCGTTAGTTTGTGTGGTTTCGTTTGGTTTCGGTTTATTGGTGG
ATCGGATCACAATCTGCTGACGGAGAATTGAGATCTGTTGGTGGTGTTTTTTTTTCTGTA
TGTTGATAGGTTGGATTTGTTGGAAATGGGAAGACTATTCGTGATCGACCTCCAAGGAGA
AACCTATAGCTGCAAGCATTGCCATACTCCTTTCGCACTTACCGATGATCTCATCTCCAA
GTCATTTCACTGCAAGCATGGAAGGGCTTATCTTTTCGAAAACGTTGTCAATGTGACTGT
TGGAGAGATGGAGCATCGCATCATGATGACTGGTTGGCATACTGTAGCTGACATCTTTTG
CGTTTGTTGCGGCTCTCTTGTTGGCTGGAAATACGAAATTGCATACGAAAAGTCTCAGAA
GTACAAGGAAGGAAAATTCATCATTGAAAGGTTTAAAGTGCTTGGACCCGATGGAGGCGG
ATACGACATGAACGAGGACGAGCCCATGATTGG*AAGTGACGAACATAAAACCGGCTTTT
CTTTTTACCACTCTCTAATAGTTATTGGAGATTTTTGGCAAGTGATCAATCCAAAACTCC
ACAATTTTTCTCGGGTAAGCCATAAGTAAGTAAGAAAAAAACCAGATATTTATAAACTTA
ATTATAATTGAGTTCCAAAATCGTCTTTAGAAAACTTGTTTCGAACGAATTAATC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4A320JQD 771 0 0
TGAAATTTTCTCCACCATCGTTAGTTTGTGTGGTTTCGTTTGGTTTCGGTTTATTGGTGG
ATCGGATCACAATCTGCTGACGGAGAATTGAGATCTGTTGGTGGTGTTTTTTTTTCTGTA
TGTTGATAGGTTGGATTTGTTGGAAATGGGAAGACTATTCGTGATCGACCTCCAAGGAGA
AACCTATAGCTGCAAGCATTGCCATACTCCTTTCGCACTTACCGATGATCTCATCTCCAA
GTCATTTCACTGCAAGCATGGAAGGGCTTATCTTTTCGAAAACGTTGTCAATGTGACTGT
TGGAGAGATGGAGCATCGCATCATGATGACTGGTTGGCATACTGTAGCTGACATCTTCTG
CGTTTGTTGCGGCTCTCTTGTTGGCTGGAAATACGAAATTGCATACGAAAAGTCTCAGAA
GTACAAGGAAGGAAAATTCATCATTGAAAGGTTTAAAGTGCTTGGACCCGATGGAGGCGG
ATACGACATGAACGAGGACGAGCCCATGATTGG*AAGTGACGAACATAAAACCGGCTTTT
CTTTTTACCACTCTCTAATAGTTATTGGAGATTTTTGGCAAGTGATCAATCCAAAACTCC
ACAATTTTTCTCGGGTAAGCCATAAGTAAGTAAGAAAAAAACCAGATATTTATAAACTTA
ATTATAATTGAGTTCCAAAATCGTCTTTAGAAAACTTGTTTCGAACGAATTAATCTCCAA
TTCAGACACTAACTTTAGTATATGCGTGCTTCTACTTACATGCCTCTTGTA

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 5

CO CL1783Contig1 465 5 16 U
GGATCGAAGACACAAAGTCCGTCGTCTGGAAGTCTACTTTTCCGCAAATTCTCAGACAAG
CAGCATCAAACCCTAGCTCCAGAAACCGGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAA
ACCTTTGAAGCAGCCGAAAGCTGATAAGAAGGAATACGACGAGCACGATATGGCTAACCT
TCAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTGAGAGCCAAGGCATCACAGAA
GGGATCCTTTGGAGGCTCTGGACTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATTTCCGTTTCTTAT
CCATGTAGCCTGTCTTTGACAGTGCATATTTATCAACAACTTGGAAAACAAAATAAATCG
TTTGTTGTGGAACTTCTATCATGTTCCTAGGAGAGTAACTTTGTGTCTCCCCCATACGTA
TGTTTGCTTTTTATATTATGATAAAAGAAAAATGGTTTTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4AT19JQ C 100
AF RR4AT19TF U 1
AF RR4AB91TF U 3
AF RR4F379JQ C 25
AF RR4F379TF U 8
BS 1 16 RR4AT19TF
BS 17 17 RR4AB91TF
BS 18 28 RR4AT19TF
BS 29 29 RR4AB91TF
BS 30 35 RR4AT19TF
BS 36 36 RR4AB91TF
BS 37 38 RR4AT19TF
BS 39 39 RR4AB91TF
BS 40 70 RR4AT19TF
BS 71 71 RR4AB91TF
BS 72 194 RR4AT19TF
BS 195 195 RR4AB91TF
BS 196 417 RR4AT19TF
BS 418 418 RR4F379TF
BS 419 464 RR4AT19TF
BS 465 465 RR4AB91TF

RD RR4AT19JQ 162 0 0
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CGAGCACGATATGGCTAACCTTCAGAAGAAGAAAGTCGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACT
GAGAGCCAAGGCATCACAGAAGGGATCCTTTGGAGGCTCTGG

QA 1 162 1 162
DS 

RD RR4AT19TF 465 0 0
GGATCGAAGACACAAACTCCGTCGTCTGAAAGTCTGCTCTTCCGCAAATTCTCAGACAAG
CAGCATCAAAACCTAGCTCCAGAAACCGGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAA
ACCTTTGAAGCAGCCGAAAGCTGATAAGAAGGAATACGACGAGCACGATATGGCTAACCT
TCAGAAGAAGAAAGTCGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTGAGAGCCAAGGCATCACAGAA
GGGATCCTTTGGAGGCTCTGGACTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATTTCCGTTTCTTAT
CCATGTAGCCTGTCTTTGACAGTGCATATTTATCAACAACTTGGAAAACAAAATAAATCG
TTTGTTGTGGAACTTCTATCATGTTCCTAGGAGAGTAACTTTGTGTCTCCCCCATACATA
TGTTTGCTTTTTATATTATGATAAAAGAAAAATGGTTTTTATCC
C

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4AB91TF 463 0 0
GGGAAAT
ACACAAAGTCCGTCGTCTGGAAGTCTACTTTTCCGCAAATTCTCAGACAAGCAGCATCAA
ACCCTAGCTCCAGAAACCGGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAA
GCAGCCGAAAGCTGATAAGAAGGAATACGACGAGCACGATATGGCTAACCTTCAGAAGAA
GAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTGAGAGCCAAGGCATCACAGAAGGGATCCTT
TGGAGGCTCTGGACTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATTTCCGTTTCTTATCCATGTAGC
CTGTCTTTGACAGTGCATATTTATCAACAACTTGGAAAACAAAATAAATCGTTTGTTGTG
GAACTTCTATCATGTTCCTAGGAGAGTAACTTTGTGTCTCCCCCATACATATGTTTGCTT
TTTATATTATGATAAAAGAAAAATGGTTTTTATCCC

QA 8 463 8 463
DS 

RD RR4F379JQ 440 0 0
TCTGGAAGTCTACTTTTCCGCAAATTTTCAGACAAGCAGCATCAAACCCTAGCTCCAGAA
ACCGGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAAGCAGCCGAAAGCTGA
TAAGAAGGAATACGACGAGCACGATATGGCTAACCTTCAGAAGAGGAAAGACGAGGAAAA
GGCACTTAAAGAACTGAGAGTCAAGGCATCACAGAAGGGATCCTTTGGAGGCTCTGGACT
TAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATTTCCGTTTTTTATCCATGTAGCCTGTCTTTGACAGTG
CATATTTATCAACAACTTGGAAAACAAAATAAATCGTTTGTTGTGGAACTTCTATCATGT
TCCTAGGAGAGTAACTTTGTGTCTCCCCCATACGTATGTTTGCTTTTTATATTATGATAA
AAGAAAAATGGTTTTTATCC

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4F379TF 457 0 0
GG
ACACAAAGTCCGTCGTCTGGAAGTCTACTTTTCCGCAAATTCTCAGACAAGCAGCATCAA
ACCCTAGCTCCAGAAACCGGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAA
GCAGCCGAAAGCTGATAAGAAGGAATACGACGAGCACGATATGGCTAACCTTCAGAAGAG
GAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTGAGAGTCAAGGCATCACAGAAGGGATCCTT
TGGAGGCTCTGGACTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATTTCCGTTTCTTATCCATGTAGC
CTGTCTTTGACAGTGCATATTTATCAACAACTTGGAAAACAAAATAAATCGTTTGTTGTG
GAACTTCTATCATGTTCCTAGGAGAGTAACTTTGTGTCTCCCCCATACGTATGTTTGCTT
TTTATATTATGATAAAAGAAAAATGGTTTTTATCC

QA 3 457 3 457
DS 



AS 1 5

CO CL1784Contig1 1236 5 17 U
GGGAAATGGAAAACCAACACAACAAAAAGTGAGAGCATATACTGGTTTTCTCTCCCAAGC
ACAGCTATCGAGAATTCAAATTTGAATCTGATTTTCGACGCCGGCGGCGGAGGAGCTCGC
CGGCGTCGCCACTTCTTTTCATTTTATTTGTCTCTCTCTATCACTCTCTTCAACTTTTGT
TACTCTCTCTTTCGTGTTGCTTCTGTTTCGGACTTGATGTCGCCACCACCGTTGAAGTTC
TGCGTGCACTCGTGGTCGTCACTCTCGTCCGGAACAGTCCTCTTCTCCGGGGGTTCCCGG
AAAGTCAGGTCCCGGTTTAACTTGACTCGCTGTTATCGTCGTACCATCATCTCCTCTCCC
GTGCATCCCAGATCTATGAACTTTTACTCTTCAAAATCAAGCTATGCCGTCAAGAAGGCA
CTACGTACAGATCTGGTCCATCTTCTCCGTACCCCTCCACCGCAGTACCACTTCCTCTCT
GATCCTGGAATTCTTACGTCACTTGTCGGTGGGGCTCCACGTATGACTCGACGAACAGAT
CCGGCAGTTCGAAGTGTGTTGAAGTCGAGAGCACAT*GTCTCTTTCCCACCATCGCCACC
CCGACAGATCTCGCGGCCACTTTTCCGATCTGTCTCACCATCCACCACTGCTACTCCGGT
GGAACTAGTACCTCAACGACACACACCTTCTCTCAAGGTAGCATATCAACTAAGATTCCA
AGGCTCAATGAACTGAAATTCTTGTTACAATCACATGTGGTCTTGGCTAGTTTAAAGATT
TCCGATGGGTTCACCGGGATCTATAGTTCGAGCTTACTGTTATATCTTGCTTTTGTGAAG
AATTTATCGGTGGGTTCACCGAGTGCTTCCCTGTCTCAATTCATGTTTGTATCATCTTCC
TCAACCGAGGAATGGATTTCGCCACCATGCCTCCTTTCTTTGAAAGGAGATGATTTCCCG
GACTTGGTATCAAGTTTCGGCTTCAGCTTCTTCATTCGTGAGGACTGGTTTTCAACGTCA
CTATATGTGACTATTTCTCTGCTGTCTGACTCCGTCGGAAAAGCTACATCGACGCATTCA
AGCTTAGTCTCGAATCCGCTGTCATCTTCTCATGAAGAATTATCTCTTTTATTTTACATT
GTTGTAGTTTATGCTTTCAATCAAAGAGGATGGCAAATTCCCTCTAGTTATTGTAATCGA
TCAAGTTGAGAAGTAACGAAAAGTAATCTGTGTTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4DP85TF U 1
AF RR4BN03TF U 101
AF RR4G790TF U 3
AF RR4BN03JQ C 495
AF RR4G790JQ C 688
BS 1 227 RR4DP85TF
BS 228 228 RR4G790TF
BS 229 251 RR4DP85TF
BS 252 252 RR4G790TF
BS 253 368 RR4DP85TF
BS 369 412 RR4G790TF
BS 413 413 RR4BN03TF
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BS 564 576 RR4G790TF
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BS 578 727 RR4G790TF
BS 728 728 RR4BN03JQ
BS 729 745 RR4G790TF
BS 746 746 RR4BN03JQ
BS 747 770 RR4G790TF
BS 771 1236 RR4BN03JQ

RD RR4DP85TF 368 0 0
GGGAAATGGAAAACCAACACAACAAAAAGTGAGAGCATATACTGGTTTTCTCTCCCAAGC
ACAGCTATCGAGAATTCAAATTTGAATCTGATTTTCGACGCCGGCGGCGGAGGAGCTCGC
CGGCGTCGCCACTTCTTTTCATTTTATTTGTCTCTCTCTATCACTCTCTTCAACTTTTGT
TACTCTCTCTTTCGTGTTGCTTCTGTTTCGGACTTGATGTCGCCACCGCCGTTGAAGTTC
TGCGTGCACTCATGGTCGTCACTCTCGTCCGGAACAGTCCTCTTCTCCGGGGGTTCCCGG
AAAGTCAGGTCCCGGTTTAACTTGACTCGCTGTTATCGTCGTACCATCATCTCCTCTCCC
GTGCATCC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4BN03TF 609 0 0
CCGGCGGCGGAGGAGCTCGCCGGCGTCGCCACTTCTTTTCATTTTATTTGTCTCTCTCTA
TCACTCTCTTCAACTTTTGTTACTCTCTCTTTCGTGTTGCTTCTGTTTCGGACTTGATGT
CGCCACCACCGTTGAAGTTCTGCGTGCACTCGTGGTCGTCACTCTCGTCCGGAACAGTCC
TCTTCTCCGGGGGTTCCCGGAAAGTCAGGTCCCGGTTTAACTTGACTCGCTGTTATCGTC
GTACCATCATCTCCTCTCCCGTGCATCCCAGATCTATGAACTTTTACTCTTCAAAATCAA
GCTATGCCGTCAAGAAGGCACTACGTACAGATCTGGTCCATCTTCTCCGTACCCCTCCAC
CGCAGTACCACTTCCTCTCTGATCCTGGAATTCTTACGTCACTTGTCGGTGGGGCTCCAC
GTATGACTCGACGAACAGATCCGGCAGTTCGAAGTGTGTTGAAGTCGAGAGCACAT*GTC
TCTTTCCCACCATCGCCACCCCGACAGATCTCGCGGCCACTTTTCCGATCTGTCTCACCA
TCCACCACTGCTACTCCGGTGGAACTAGTACCTCAACGACACACACCTTCTCTCAAG*TA
GCATATCAA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4G790TF 768 0 0
GG
AATGGAAAACCAACACAACAAAAAGTGAGAGCATATACTGGTTTTCTCTCCCAAGCACAG
TTATCGAGAATTCAAATTTGAATCTGATTTTCGACGCCGGCGGCGGAGGAGCTCGCCGGC
GTCGCCACTTCTTTTCATTTTATTTGTCTCTCTCTATCACTCTCTTCAACTTTTGTTACT
CTCTCTTTCGTGTTGCTTCTGTTTCGGACTTGATGTCGCCACCACCGTTGAAGTTCTGCG
TGCACTCGTGGTCGACACTCTCGTCCGGAACAGTCCTCTTCTCCGGGGGTTCCCGGAAAG
TCAGGTCCCGGTTTAACTTGACTCGCTGTTATCGTCGTACCATCATCTCCTCTCCCGTGC
ATCCCAGATCTATGAACTTTTACTCTTCAAAATCAAGCTATGCCGTCAGGAAGGCACTAC
GTACAGATCTGGTCCATCTTCTCCGTACCCCTCCACCGCAGTACCACTTCCTCTCTGATC
CTGGAATTCTTACGTCACTTGTCGGTGGGGCTCCACGTATGACTCGACGAACAGATCCGG
CAGTTCGAAGTGTGTTGAGGTCGAGAGCACATCGTCTCTTTCCCACCATCGCCACCCCGA
CAGATCTCGCGGCCACTTTTCCGATCTGTCTCACCATCCACCACTGCTACTCCGGTGGAA
CTAGTACCTCAACGACACACACCTTCTCTCAAGGTAGCATATCAACTAAGATTCCAAGGC
TCA*TGAACTGAAATTCTTGT*ACAATCACATGTGGTCTTGGCTAG

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR4BN03JQ 742 0 0
TACGTCACTTGTCGGTGGGGCTCCACGTATGACTCGACGAACAGATCCGGCAGTTCGAAG
TGTGTTGAAGTCGAGAGCACAT*GTCTCTTTCCCACCATCGCCACCCCGACAGATCTCGC
GGCCACTTTTCCGATCTGTCTCACCATCCACCACTGCTACTCCGGTGGAACTAGTACCTC
AACGACACACACCTTCTCTCAAGGTAGCATATCAACTAAGATTCCAAGGCTCAATGAACT
GAAATTCTTGTTACAATCACATGTGGTCTTGGCTAGTTTAAAGATTTCCGATGGGTTCAC
CGGGATCTATAGTTCGAGCTTACTGTTATATCTTGCTTTTGTGAAGAATTTATCGGTGGG
TTCACCGAGTGCTTCCCTGTCTCAATTCATGTTTGTATCATCTTCCTCAACCGAGGAATG
GATTTCGCCACCATGCCTCCTTTCTTTGAAAGGAGATGATTTCCCGGACTTGGTATCAAG
TTTCGGCTTCAGCTTCTTCATTCGTGAGGACTGGTTTTCAACGTCACTATATGTGACTAT
TTCTCTGCTGTCTGACTCCGTCGGAAAAGCTACATCGACGCATTCAAGCTTAGTCTCGAA
TCCGCTGTCATCTTCTCATGAAGAATTATCTCTTTTATTTTACATTGTTGTAGTTTATGC
TTTCAATCAAAGAGGATGGCAAATTCCCTCTAGTTATTGTAATCGATCAAGTTGAGAAGT
AACGAAAAGTAATCTGTGTTTC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4G790JQ 549 0 0
TTCTCTCAAGGTAGCATATCAACTAAGATTCCAAGGCTCAATGAACTGAAATTCTTGTTA
CAATCACATGTGGTCTTGGCTAGTTTAAAGATTTCCGATGGGTTCACCGGGATCTATAGT
TCGAGCTTACTGTTATATCTTGCTTTTGTTAAGAATTTATCGGTGGGTTCACCGAGTGCT
TCCCTGTCTCAATTCATGTTTGTATCATCTTCCTCAACCGAGGAATGGATTTCGCCACCA
TGCCTCCTTTCTTTGAAAGGAGATGATTTCCCGGACTTGGTATCAAGTTTCGGCTTCAGC
TTCTTCATTCGTGAGGACTGGTTTTCAACGTCACTATATGTGACTATTTTTCTGCTGTCT
GACTCCGTCGGAAAAGCTACATCGACGCATTCAAGCTTAGTCTCGAATCCGCTGTCATCT
TCTCATGAAGAATTATCTCTTTTATTTTACATTGTTGTAGTTTATGCTTTCAATCAAAGA
GGATGGCAAATTCCCTCTAGTTATTGTAATCGATCAAGTTGAGAAGTAACGAAAAGTAAT
CTGTGTT
CC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 3

CO CL1785Contig1 531 3 2 U
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GAGACCATCTACATCCAGAAAATGGAGAAGGAGATACAAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAG
CAACAGAAGCCAGAAAGTGCTGGAAAGAAACCAGAGGAAAAGAAGCCCTGAGTTCAGCAT
CTGCAGTAGCATATGTGGTCACAAGGCAAGCAACAGTGAAAAATAAGCCTTTTGACAGTT
TGACCTTTGTCCTCCCTTGGTTTGAGACTTTGTACTTGTCACCCTCCTTGTATGTTTGTT
CGTGTGTGTGTTCTAAAGAAATCAAGTTTGAGACGATGATACAAATGACTGCCTCATTTG
AAAAACCACCATATGCATTTGATTCAAAATATTAAAACGGTACCAAACCAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL93TF U 1
AF RR4CL93JQ C 1
AF RR4E883TF U 6
BS 1 337 RR4CL93TF
BS 338 531 RR4E883TF

RD RR4CL93TF 343 0 0
GGAAACCAATTTCGAGAAAAATCTCACTAATTAGCAAACATGTCTTCAGCTCGTTCCGCG
ATCGCAGGTTTGGCTCGGTCCTTGAGGGAGAGTCAGATCGGTGCATCTTGCTCCGTTGGA
TCGATTCGGTGCTTCAGCGACGACAAAGGTCGTGTGCTCAGCGATGAGGAGCGCGCCAAA
GAGACCATCTACATCCAGAAAATGGAGAAGGAGATACAAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAG
CAACAGAAGCCAGAAAGTGCTGGAAAGAAACCAGAGGAAAAGAAGCCCTGAGTTCAGCAT
CTGCAGTAGCATATGTGGTCACAAGGCAAGCAACAGT
GAAAAA

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR4CL93JQ 462 0 0
GGAAACCAATTTCGAGAAAAATCTCACTAATTAGCAAACATGTCTTCAGCTCGTTCCGCG
ATCGCAGGTTTGGCTCGGTCCTTGAGGGAGAGTCAGATCGGTGCATCTTGCTCCGTTGGA
TCGATTCGGTGCTTCAGCGACGACAAAGGTCGTGTGCTCAGCGATGAGGAGCGCGCCAAA
GAGACCATCTACATCCAGAAAATGGAGAAGGAGATACAAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAG
CAACAGAAGCCAGAAAGTGCTGGAAAGAAACCAGAGGAAAAGAAGCCCTGAGTTCAGCAT
CTGCAGTAGCATATGTGGTCACAAGGCAAGCAACAGTGAAAAATAAGCCTTTTTACAGTT
TGACCTTTGTCCTCCCTTGGTTTGAGACTTTGTACTTGTCACCCTCCTTGTATGTTTGTT
CGTGTGTGTGTTCTAAAGAAATCAAGTTTGAGAC
GATGATAC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4E883TF 526 0 0
GG
AATTTCGAGAAAAATCTCACTAATTAGCAAACATGTCTTCAGCTCGTTCCGCGATCGCAG
GTTTGGCTCGGTCCTTGAGGGAGAGTCAGATCGGTGCATCTCGCTCCGTTGGATCGATTC
GGTGCTTCAGCGACGACAAAGGTCGTGTGCTCAGCGATGAGGAGCGCGCCAAAGAGACCA
TCTACATCCAGAAAATGGAGAAGGAGATACAAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAGCAACAGA
AGCCAGAAAGTGCTGGAAAGAAACCAGAGGAAAAGAAGCCCTGAGTTCAGCATCTGCAGT
AGCATATGTGGTCACAAGGCAAGCAACAGTGAAAAATAAGCCTTTTGACAGTTTGACCTT
TGTCCTCCCTTGGTTTGAGACTTTGTACTTGTCACCCTCCTTGTATGTTTGTTCGTGTGT
GTGTTCTAAAGAAATCAAGTTTGAGACGATGATACAAATGACTGCCTCATTTGAAAAACC
ACCATATGCATTTGATTCAAAATATTAAAACGGTACCAAACCAA

QA 3 526 3 526
DS 



AS 1 4

CO CL1786Contig1 885 4 19 U
GTGAAAAATCTTCATATAGCTAAAGTTACAATCTTAATATGATACAGACCCAAAGAGGAG
TAAACATAACCAAACCATAGTGCTCATAAATAATATGAAAGGAAAACACTTCAAAGCATA
TATATTATATATTTAAGAGCACACAGAGAGAATGGAAGAAGCTAAAGATCAACACATGCT
TGAACCAGACACAAACAGGAAGAAAGAAACAGAGTTTTGAGTTTCAGATCTTGTCAAGCT
TATCTGCCTTCACAACCGGGTTTGCTTTAGCTATAGCTTCTTGCCCAGCAGCATGGTAAT
CGAAAGAGCAGTTGTGTACGTCTGCATAGCGGTGCGTCCCGCAGAAGAGGTCACCACAGC
GACATTTGAATCCAGTCAAACCAACCCGTTTGTTGCAAGTACTACATCGGCTTGGTCCTT
CCTTTGGTTTTGCTGCAGCTTCTTCTGGTGCTACTACCTCTGCAACAGCTTGTACAGAGA
CAGCCATGGACTCAACGGATTTGGTTTCAGCATCAAGCAACGCAGCAGTGAAGGTTTCCT
TGATGATGTCGCTGGGTGATCCAGACACTGCAGATGCAAACTTAGCCCCCTGTTCCTGTT
GAAACAACATAGTCTTGTGACACTTGGAACACATGTTCATTGTGGCAGCACTTCCGAAGA
AACCGCAGTTGTTGATGCATAGCTTGGGACCTTCGGGTGGGCTTTGGCATCCCGTCTTGT
CGTGGTCCATTTCTGCACTGTTTTGCCCGAGAAGCCTTGATCGATCGATCGGTCGGTCCC
CTAATTAATCTCTCCGAAGAAGATCGTTCCGTCTGCTGGAGAGATCCAGCAGAAGCTGAG
AAGGGTTAGAGGGAGAGAAGAATAAAGGTCGAGGCTTTTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU18JQ U 1
AF RR4BE66JQ U 101
AF RR4BE66TF C 115
AF RR4DU18TF C 263
BS 1 161 RR4DU18JQ
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RD RR4DU18JQ 862 0 0
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TAAACATAACCAAACCATAGTGCTCATAAATAATATGAAAGGAAAACACTTCAAAGCATA
TATATTATATATTTAAGAGCACACAGAGAGAATGGAAGAAGGTAAAGATCAACACATGCT
TGAACCAGACACAAACAGGAAGAAGGAAACAGAGTTTTGAGTTTCAGATCTTGTCAAGCT
TATCTGCCTTCACAACCGGGTTTGCTTTAGCTATAGCTTCTTGCCCAGCAGCATGGTAAT
CGAAAGAGCAGTTGTGTACGTCTGCATAGCGGTGCGTCCCGCAGAAGAGGTCACCACAGC
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CCTTTGGTTTTGCTGCAGCTTCTTCTGGTGCTACTACCTCTGCAACAGCTTGTACAGAGA
CAGTCATGGGCTCAACGGATTTGGTTTCAGCATCAAGCAACGCAGCGGTGACGGTTTCCT
TGATGATGTTGCTGGGTGATCCAGACACTGCAGATGCAAACTTAGCCCCCTGTTCCTGTT
GAAACAACATAGTCTTGTGACACTTGGAACACATGTTCATTGTGGCAGCACTTCCGAAGA
AACCGCAGTTGTTGATGCATAGCTTGGGACCTTCGGGTGGGCTTTGGCATCCCGTCTTGT
CGTGGTCCATTTCTGCACTGTTTTGCCCGAGAAGCCTTGATCGATCGATCGGTCGGTCCT
CTAATTAATCTCTCCGAAGAAGATCGTTCCGTCTGCTGGAGAGATCCAGCAGAAGCTGAG
AAGG
TAGAGGAGAGAAGAAAAA

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR4BE66JQ 762 0 0
GGG
AAACACTTCAAAGCATATATATTATATATTTAAGAGCACACAGAGAGAATGGAAGAAGCT
AAAGATCAACACATGCTTGAACCAGACACAAACAGGAAGAAAGAAACAGAGTTTTGAGTT
TCAGATCTTGTCAAGCTTATCTGCCTTCACAACCGGGTTTGCTTTAGCTATAGCTTCTTG
CCCAGCAGCATGGTAATCGAAAGAGCAGTTGTGTACGTCTGCATAGCGGTGCGTCCCGCA
GAAGAGGTCACCACAGCGACATTTGAATCCAGTCAAACCAACCCGTTTGTTGCAAGTAGT
ACATCGGCTTGGTCCTTCCTTTGGTTTTGCTGCAGCTTCTTCTGGTGCTACTACCTCTGC
AACAGCTTGTACAGAGACAGCCATGGACTCAATGGATTTGGTTTCAGCATCAAGTAACGC
AGCAGTGAAGGTTTCCTTGATGATGTCGCTGGGTGATCCAGACACTGCAGATGCAAACTT
AGCCCCCTGTTCCTGTTGAAACAACATAGTCTTGTGACACTTGGAACACATGTTCATTGT
GGCAGCGCTTCCGAAGAAACCGCAGTTGTTGATGCATAGCTTGGGACCTTCGGGTGGGCT
TTGGCATCCTGTCTTGTCGTGGTCCATTTCTG*****TTTTGCCCGAGAAGCCTTGATCG
ATCGATCGGTCGGTCCCCTAATTAATCTCTCCGAAGAAGATCGTTCCGTCTGCTGGAGAG
ATCCAGCAGAAGCTGAGAAGGGTTAGAGGGAGAGAAGAA

QA 4 762 4 762
DS 

RD RR4BE66TF 771 0 0
AGCATATATATTATATAT
TTAAGAGCACACAGAGAGAATGGAAGAAGCTAAAGATCAACACATGCTTGAACCAGACAC
AAACAGGAAGAAAGAAACAGAGTTTTGAGTTTCAGATCTTGTCAAGCTTATCTGCCTTCA
CAACCGGGTTTGCTTTAGCTATAGCTTCTTGCCCAGCAGCATGGTAATCGAAAGAGCAGT
TGTGTACGTCTGCATAGCGGTGCGTCCCGCAGAAGAGGTCACCACAGCGACATTTGAATC
CAGTCAAACCAACCCGTTTGTTGCAAGTAGTACATCGGCTTGGTCCTTCCTTTGGTTTTG
CTGCAGCTTCTTCTGGTGCTACTACCTCTGCAACAGCTTGTACAGAGACAGCCATGGACT
CAATGGATTTGGTTTCAGCATCAAGTAACGCAGCAGTGAAGGTTTCCTTGATGATGTCGC
TGGGTGATCCAGACACTGCAGATGCAAACTTAGCCCCCTGTTCCTGTTGAAACAACATAG
TCTTGTGACACTTGGAACACATGTTCATTGTGGCAGCGCTTCCGAAGAAACCGCAGTTGT
TGATGCATAGCTTGGGACCTTCGGGTGGGCTTTGGCATCCTGTCTTGTCGTGGTCCATTT
CTG*****TTTTGCCCGAGAAGCCTTGATCGATCGATCGGTCGGTCCCCTAATTAATCTC
TCCGAAGAAGATCGTTCCGTCTGCTGGAGAGATCCAGCAGAAGCTGAGAAGGGTTAGAGG
GAGAGAAGAATAAAGGTCGAGGCTTTTTTTCCC

QA 19 771 19 771
DS 

RD RR4DU18TF 610 0 0
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TGCATAGCGGTGCGTCCCGCAGAAGAGGTCACCACAGCGACATTTGAATCCAGTCAAACC
AACCCGTTTGTTGCAAGTACTACATCGGCTTGGTCCTTCCTTTGGTTTTGCTGCAGCTTC
TTCTGGTGCTACTACCTCTGCAACAGCTTGTACAGAGACAGTCATGGGCTCAACGGATTT
GGTTTCAGCATCAAGCAACGCAGCGGTGACGGTTTCCTTGATGATGTTGCTGGGTGATCC
AGACACTGCAGATGCAAACTTAGCCCCCTGTTCCTGTTGAAACAACATAGTCTTGTGACA
CTTGGAACACATGTTCATTGTGGCAGCACTTCCGAAGAAACCGCAGTTGTTGATGCATAG
CTTGGGACCTTCGGGTGGGCTTTGGCATCCCGTCTTGTCGTGGTCCATTTCTGCACTGTT
TTGCCCGAGAAGCCTTGATCGATCGATCGGTCGGTCCCCTAATTAATCTCTCCGAAGAAG
ATCGTTCCGTCTGCTGGAGAGATCCAGCAGAAGCTGAGAAGGGT*AGAGGGAGAGAAGAA
TAAAGGTC
CC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 2 5

CO CL1787Contig1 585 3 6 U
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CTGCGAAGAAGACGACATAGGAATCGACGATGACGCTGCCTCTAGGACTTTACTCCGGCA
CGAGCTCTCTTGCTCTTGTGGTTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCTCGTCTACGGGA
GCATGAAGCTCAAGTTCTTGAAGATGACGAAGCCTCACAAGGTTGAAGCCAATGCTCATA
ATTAAACCAGTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGGGGGGAGGTTATGTCTCCCCATCCC
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AAGCTTGTTATACGTTTCCTAAGACCATCTCCAATGTACTTTGCTATTTTCATCTCTAAA
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AAATAGAGATCTCTATAATAGAGGAAGAAATAGAGGTGGATTGGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ37JQ C 1
AF RR4CZ37TF U 1
AF RR4CC28TF U 16
BS 1 181 RR4CZ37TF
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RD RR4CZ37JQ 166 0 0
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CTGCGAAGAAGACGACATAGGAATCGACGATGACGCTGCCTCTAGGACTTTATTCCGGCA
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QA 1 166 1 166
DS 

RD RR4CZ37TF 293 0 0
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CTGCGAAGAAGACGACATAGGAATCGACGATGACGCTGCCTCTAGGACTTTACTCCGGCA
CGAGCTCTCTTGCTCTTGTGGTTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCTCGTCTACGGGA
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ATTAAACCATTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGG
TGGGGGGGGGGAGGGTT

QA 1 276 1 276
DS 

RD RR4CC28TF 570 0 0
TTTTT
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GCTCGTGCTTCGGCTTTTAGCCTGGGTCTCGTCTACGGGAGCATGAAGCTCAAGTTCTTG
AAGATGACGAAGCCTCACAAGGTTGAAGCCAATGCTCATCATTAAACGAGTTTTTCTCTC
TTTACAATAAAGCAGGGGGGAGGTTATGTCTCCCCATCCCGGTTCTCAATTTTTCTTATT
CATTCTTCAGCGCTAAAAAGAAACCAGCTTTGTGTCTGAAAAGCTTGTTATACGTTTCCT
AAGACCATCTCCAATGTACTTTGCTATTTTCATCTCTAAAATAGAGGAATTCTATAATAG
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AATAAAGGATTGCTATTTCTTCCTCTATAAATAGAGGAAAAAATAGAGATCTCTATAATA
GAGGAAGAAATAGAGGTGGATTGGA

QA 6 570 6 570
DS 



CO CL1787Contig2 452 2 1 U
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CTGCGAAGAAGAGGACATAAGGATTCGGCGATGACGCTACCTCCAGGACTTTACTCCGGC
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AAAGCTTGTTATACGTTTCCTAAGACCTCTTTTTGGAGCCAAGTATTTCCCACTGGTTTA
CAAAACTCGAGTCAAGAGCATCTTTACCTTTT


BQ
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AF RR4H447JQB C 1
AF RR4H447TF U 1
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ACCAGCTCTCTTGCTCTTGTGGCTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCTCGTCTACGGG
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AATTAAACCATTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGGTGGGGGGTTATGTCTCCCCGTCC
CGGTTATCAATTTTTCTTATTCATCTTTCAGCGCTAAAAAGAAAACAACTTTGTGTTTGA
AAAGCTTGTTATACGTTTCCTAAGACCTCTTTTTGGAGCCAAGTATTTCCCACTGGTTTA
CAAAACTCGAGTCAAGAGCATCTTTACCTTTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4H447TF 452 0 0
GGACGAATCGCGAGAGTTTCCAGAAGCTTGGATCGATTTGGGAATTTAGGGTTTTTGTTT
CTGCGAAGAAGAGGACATAAGGATTCGGCGATGACGCTACCTCCAGGACTTTACTCCGGC
ACCAGCTCTCTTGCTCTTGTGGCTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCTCGTCTACGGG
AGCATGAAGCTCATGTTCTTGAAGATGACGAAGCCTCACAAGGTTGAAGCCAATGCTCAT
AATTAAACCATTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGGTGGGGGGTTATGTCTCCCCGTCC
CGGTTATCAATTTTTCTTATTCATCTTTCAGCGCTAAAAAGAAAACAACTTTGTGTCTGA
AAAGCTTGTTATACGTTTCCTAAGACCTCTTTTTGGAGCCAAGTATTTCCCACTGGTTTA
CAAAACTCGAGTCAAGAGCATCTTTACCTTTT

QA 1 452 1 452
DS 



AS 0 0

AS 1 5

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CTCTTCTTGAAAAGCAATGGATCGGCAAAACTCCGATGACATCATGAAGTTTCTTGACGG
AATGGCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTCCTCGACGAAGGAAACCATTCACCGGA
GGATTACCCTGATGCCGGTAGCTTCGCCGGCGGCGAAGAATCCGATGCTGACGATGCCGC
CGGTTGCAATTCCGAAGAGAGAAAAACGTTTTGGCATGAACAAGAACAGCTTCTCCAGGC
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CCGTAGCTGTCTGCGCGGTGAAGTGACTAGCCGTCTCCGAGACGCCGGCTATGATTGCGT
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GGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTATC
TTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCGACTCATTGGAAT
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GGAGACTCAGACGCAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGTGTGATGGCGATCAAGCATAGGGT
TTCTATGTTGAATTATGGTATTTTTGGCGATTTATCAGCCGGAATGGGCCGTCCAGCCGC
CGTCGCGGTCGTGTGATTATATATGTATACATAGACGTGCGAATACGATAAGTAAATTAG
GTGGAGATTAAGTGAATGAGTTTCACATTGAGAGTTTGCGTGGAATTGTCTCAGCGATGA
TTTTGTTTGCCCAAACAGGGCAACTCCTTGGACCCATTGTAGTATACACAACGTTGTTCT
AATTGAGATAAATTTAAATTGGTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4BO35TF U 2
AF RR4FK52TF U 1
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G
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AAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTATCTT
TTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCG
TCT

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DS 

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CTCTTCTTGAAAAGCAATGGATCGGCAAAACTCCGATGACATCATGAAGTTTCCTGACGG
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CAGA

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TCG

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AA
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AAAAATATTGTGCACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGTCC
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CC

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TAATTGAGATAAATTTAAATTGGTCC

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DS 



AS 1 5

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH23JQ U 1
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AGGAGCAAATAAGTTTTGTTCTTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTT
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GTTGAATCTCATCATGGTAAGATTCTGAACCAAGAGCTTATGATCATAAGGAAGATGGAC
GCTGGCCCTAATCCCCATCACACCTACGCTAGATTTGCCATCGTTTTTGAGAGCAA

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AGAG*TCAAGTTGATATCCAAATCCTGATCATCT

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GGCCAAATGAGTTCCCTCGAGCCACTCGTCCATTGATGCGTCGGTAGACCTGGTTCCTAC
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CTTCCCCTCCACGTCGTAGATGATATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGCAGGTA
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GCTGGCCCTAATCCCCATCACACCTACGCTAGATTTGCCATCGTTTTTGAGAGCAACAAG
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AC*ATCATCGCTGTGT*CTCCCACAACATCGTCA**CATACTCGAATGATCCTCGGTATC
TACTTGACATCTA

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DS 

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CTAGATTTGCCATCGTTTTTGAGAGCAACAAGGAGCTCGGTCTCTTCTCCAGCTGGCACC
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****TTTGTTATCAGGTCAACGAACAAGAAAATGCACAAGGGAAATAGTGTGTTCTGTAA
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GAGCTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATCCCCATCACACCTACGCTAGA
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TGCAAGGAGAAGGAGAGCTAGAAACAAAACCCTAACATTCATCTTCGATGCCTTTTTTTT
TTGTTATCTGGTCAACGAACAAGAAAATGCAC
CC

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DS 



AS 1 3

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TTACTCTTCCTCCTCCTCCCTCCACTTTTCTTCACGTCTCTCTCTCCATGGGAAATGCGA
ACGGCAAAGAAGAAGACGGCGATGCCACGTCATCTTCGGCGATTACGAAGGCCGGCGATC
CTTACTCCCACACTCGTCAACGTCGTCCTTCCTCAGAATCTATGAGCAGTTCTCCTCCGG
GAAGCCCAGCTCGATCTCCTTCTCCTTTCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCAT
TGCAGAGGACAAACGCCCCTCCTTCGCCTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAA
TTTTTGATATTCCGGAAGAGCAAGGGATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTA
ATGATGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAAT
CTGGAAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAGGTGA
TCGTCGACGGTGAATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCA
ATGTCTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAGCATAGCTG
AGTTTGAGGCGCCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGG
ATTTCACAAAAGATCCACTGGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTCGTGGACACTA
GTGACGAAACAGGCAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAG
AGCAAGGGTGGAGTCCTCAATCCATCGTAGCTTTGGGTTTAACTCACACGTTCGAGTCTA
AGTACATAACTGTTGTCCTCTACAAACCACTCACACGGTGAACCTAAAACCCAAATCCAA
CCAATGCCACATTGTCTTCCTTTTTTTCTTCTTAAATCTGTCAATTCTGTGAGAACTTTT
GTACTTTGATCATAGTGAGTGCACAACATTTCTGAGTCTAAAAACCTTTTTCGTGCCTTG
TTGGTGCTGTATGTAGTACAGAGCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GO84TF U 1
AF RR4A823TF U 92
AF RR4D906JQ C 334
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QA 1 693 1 693
DS 

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GGACGTCT
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TTACATGGAACCAGGGAGGTAATGATGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGAT
CAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGGAAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTG
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GAACCTAAAACCCAAATCCAACCAATGCCACATTGTCTTCCTTTTTTT
TCTTCTT

QA 9 896 9 896
DS 

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TTATCATTACTTGGAACCAGGGAGGTAATGATGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACT
GGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGGAAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTC
CATCTGGCATATACCACTACAAGGTTATTGTCGACGGCGAATCCAAATACATCCCAGATT
TGCCCTTTGTATCAGACGAAAGGGGCACTGTCTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTG
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TGGGTTTAACTCACAGGTTCGAGTCTAAGTACATAACTGTTGTCCTCTACAAACCACTCA
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AAATCTGTCAATTCTGTGAGAACTTTTGTACTTTGATCATAGTGAGTGCACAACATTTCT
GAGTCTAAAAACCTTTTTCGTGCCTTGTTGGTGCTGTATGTAGTACAGAGCTTCTC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 5

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TCTGAATCTTCTTTAAGCCATGGCTAATCGCTATGATCCGAATCCTTTCGCTGAGGAAGA
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AGCTGGAATAACTATTGAAGTGAAAAACTGGCCGCCTTTCTTCCCACTAATCCACCATGA
CATTGCCAACGAAATCCCGGTTCATCTCCAAAGGCTACAGTATGTTACCTTTGCAACCTA
TTTGGGGTCGGTTCTTTGTCTGTTCTGGAACATTATTGCCGTTACTACAGCTTGGATCAA
AGGAGAAGGAGTGACGATATGGCTTCTTGCCGTTATTTACTTCATAGCGGGTGTCCCAGG
AGGCTATGTGTTATGGTATCGCCCCCTCTACCGTGCCTTCAGAACTGATAGTGCTTTGAG
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TGCTCCACCTGTTGTCTTCAAAGGAAAATCTCTTGCTGGGATCTTACCTGCAATAGATGT
CATAAGCGGTAACACATTGGTTGGGATATTTTACTTCATTGGGTTTGGGCTTTTCTGCCT
TAATCAGTGGTCAGCATTTGGGTTATTCAGCAAGTGTATATGTACTTCCGAGGCAGCGGG
AAACAAGATGAGTTGAGACGAGAAGCGGCCAGAGGAGCCCTGAGAGCCGCCGTGTGAGAG
AGAGCTCACTGTAACACTTGGTTTGATGTATGTAATTTTCCCTGTTTCTTTCGTTTTTAG
ATTCTGTCTTCACGGCTCTCTGCTTTGTTTGCAAAAAACATATTAAATTTTTCTTTAATA
CCTTTTATGTGATGTAAATTTGTTTGTTCAAAAGTTTAGAGTTCACATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CAT

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ACATATTAAATTTTTCTTTAATACCTTTTATGTGATGTAAATTTGTTTGTTCAAAAGTTT
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DS 



AS 2 4

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AGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4G244JQ U 1
AF RR4DW61JQ U 30
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TATTATTATTACATCTAGAATTGTCTGAAATGGGCCATATGTCATCACAGTTTCGACCGT
TATGATGCAACATCAATCTTCTTCTGTAGATACCGGTAAACATGCGTTATTGAGAAGGAA
GGTGGCTCGTACCTCGATTTTACACAGAGTCGAGCCACTGCCAGCACCTTCTGGAGTTCT
CTAGAGTTGTAGCTGTTGCCGAGATCTGGATCAATCATCTTATCAATGGAGTTTGCAATG
CA

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR4DW61JQ 814 0 0
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GTCTAGTACAATGATATATCACTCTATTAGCTATTATTATTACATCTAGAATTGTCTGAA
ATGGGCCATATGTCATCACAGTTTCGACCGTTATGATGCAACATCAATCTTCTTCTGTAG
ATACCGGTAAACATGTGTTATTGAGAAGGAAGGTGGCTCGTACCTCGATTTTATACAGAG
TCGAGCCACTGCCAGCACCTTCTGGAGTTCTCTAGAGTTGTAGCTGTTGCCGAGATCTGG
ATCAATCATCTTATCAATGGAGTTTGCAATGCAAGAGTGTTGTACCCATTCGATCAAGTC
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AAGCATCGTTGGTTGTTTTGGGATGGCTTTGTGTGTGTCTGTTGATGCGGATGTCTGTAA
TTTTGGGGGTGAAGTTTTGATCCAGCATGATGTTACATGAGTTCACTGAAACATCATAGA
TCTGTGCATCACTACTGCTGAAGATCAGCAAATATTCTAATGCAGCTGCGACCCCAATAG
CTATTTGGATGCGAGTCTTCCAGTTCAAAGGAGTCTTAAGCGGATCATTGAGATGTTCTT
TCAAGCTTCCATTTTCATATTGTCATACACTAGC

QA 1 814 1 814
DS 



CO CL1793Contig2 778 2 3 U
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CTCAATCATTTCTCATTAGATAAAGAGAGAGAGATAGAAACTTCAGAGCTCAGTGAGGAA
GGAAACGCATCGCCATGGACGATCGACCTCCCCTCAGCCGCAGAATCCGTTTCCTTCTTC
TCGCCTGGCTCCGCCGTACTCGCTCCGGTAGAATAGAGTTTGTGAGACGATTCGGATACA
AGGAACTCGTGAAAGCAACCGAAGGTTTCCGTAAGGTTATTTACACCAACTATCACGGTT
CCGCATACACTGCCAAATTCAAAGGCGGCGAGGTTGCTCTGGTCAAAGAACTCAAGTCTC
TCGATCTCGGACGCGAGAGGTTCTATGAGGAAGTCCAGCTCTTGGGACGCTTACGTCACC
GCCATCTCCTCACTCTTCGCGGCTTTTGCACCGGACGCAAAAGGATGCTAGTGTATGACA
ATATTGAAAATGGAAGCTTGAAAGAACATCTCAATGATCCGCTTAAGACTCCTTTGAACT
GGAAGACTCGCATCCAAATAGCTATTGGGGTCGCAGCTGCATTAGAATATTTGCTGATCT
TCAGCAGTAGTGATGCACAGATCTATGATGTTTCAGTGAACTCATGTAACATCATGCTGG
ATCAAAACTTCACCCCCAAAATTACAGACATCCGCATCAACAGACACACACAAAGCCATC
CCAAACACCAACGATGCTTGCTCCGAAGATCATGTGCGGATGAGGATGCGGAAACGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G244TF U 1
AF RR4DW61TF U 47
BS 1 442 RR4G244TF
BS 443 443 RR4DW61TF
BS 444 778 RR4G244TF

RD RR4G244TF 778 0 0
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CTCAATCATTTCTCATTAGATAAAGAGAGAGAGATAGAAACTTCAGAGCTCAGTGAGGAA
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TCGCCTGGCTCCGCCGTACTCGCTCCGGTAGAATAGAGTTTGTGAGACGATTCGGATACA
AGGAACTCGTGAAAGCAACCGAAGGTTTCCGTAAGGTTATTTACACCAACTATCACGGTT
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TCGATCTCGGACGCGAGAGGTTCTATGAGGAAGTCCAGCTCTTGGGACGCTTACGTCACC
GCCATCTCCTCACTCTTCGCGGTTTTTGCACCGGACGCAAAAGGATGCTAGTGTATGACA
ATATTGAAAATGGAAGCTTGAAAGAACATCTCAATGATCCGCTTAAGACTCCTTTGAACT
GGAAGACTCGCATCCAAATAGCTATTGGGGTCGCAGCTGCATTAGAATATTTGCTGATCT
TCAGCAGTAGTGATGCACAGATCTATGATGTTTCAGTGAACTCATGTAACATCATGCTGG
ATCAAAACTTCACCCCCAAAATTACAGACATCCGCATCAACAGACACACACAAAGCCATC
CCAAACACCAACGATGCTTGCTCCGAAGATCATGTGCGGATGAGGATGCGGAAACGTG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4DW61TF 678 0 0
GGCTT
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AGTGAGGAAGGAAACGCATCGCCATGGACGATCGACCTCCCCTCAGCCGCAGAATCCGTT
TCCTTCTTTTCGCCTGGCTCCGCCGTACTCGCTCCGGTAGAATAGAGTTTGTGAGACGAT
TCGGATACAAGGAACTCGTGAAAGCAACCGAAGGTTTCCGTAAGGTTATTTACGCCAACT
ATCACGGTTCCGCATACACTGCCAAATTCAAAGGCGGCGAGGTTGCTCTGGTCAAAGAAC
TCAAGTCTCTCGATCTCGGACGCGAGAGGTTCTATGAGGAAGTCCAGCTCTTGGGACGCT
TACGTCACCGCCATCTCCTCACTCTTCGCGGCTTTTGCACCGGACGCAAAAGGATGCTAG
TGTATGACAATATTGAAAATGGAAGCTTGAAAGAACATCTCAATGATCCGCTTAAGACTC
CTTTGAACTGGAAGACTCGCATCCAAATAGCTATTGGGGTCGCAGCTGCATTAGAATATT
TGCTGATCTTCAGCAGTAGTGATGCACAGATCTATGATGTTTCAGTGAACTCATGTAACA
TCATGCTGGATCAAAACTTCACCCCCAAAATTACAGACATCCGCATCAACAGACACACAC
AAAGCCATCCCAA

QA 6 678 6 678
DS 



AS 1 5

CO CL1794Contig1 1282 5 15 U
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GCTCCGACAATGGCTGTCTGCGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCGGCA
TCCAAGGACCTTACAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCCAACAACTTG
AGCGTCGCACTCTGTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGGTAGAAGAGGCTCGAACAGATCC
TTGCCGGTAGTGGTCTCAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCT
TTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGG
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ACAAGGTTTGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGATCC*AAAGTACAA
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TGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTGGATGAAGCAAAAAATGCAGGGGCAGATATTG
TGGGCAGTGATGATTTGATCGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAA
TTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAG
GACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAGGCTATAGAGG
AGTTCAAGAAGGGCAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTTCACATTCCCT
TTGGGAAAGTAAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAAT
CGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATAT
GCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAGGGAGATGATAGACTTCAAGCCAT
AAATAAATAAA****CCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAGGAAGGTGTAGTATGTTTTT
GGGAGTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTT*ATCTCTTCTTTGTATA*CCT
CCTCACTGGTTGTATCACCTTTAACTCTGATAG***CTATTTGATGTATTG*ATTATTAC
TGTTAAAATTTGCATTGTGAGATCTGTATTATTGCCTTTGGAGAGAACAAATGAGTCGTT
TTAATAAATAATAATATTTCGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CH88TF U 1
AF RR4F310TF U 525
AF RR4CH88JQ C 372
AF RR4AZ77JQ C 425
AF RR4AZ77TF U 425
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BS 439 568 RR4CH88TF
BS 569 569 RR4F310TF
BS 570 590 RR4CH88TF
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BS 592 619 RR4CH88TF
BS 620 620 RR4F310TF
BS 621 630 RR4CH88TF
BS 631 676 RR4F310TF
BS 677 677 RR4AZ77TF
BS 678 1172 RR4F310TF
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BS 1247 1247 RR4AZ77JQ
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RD RR4CH88TF 630 0 0
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GCTCCGACAATGGCTGTCTGCGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCGGCA
TCCAAGGACCTTACAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCCAACAACTTG
AGCGTCGCACTCTGTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGGTAGAAGAGGCTCGAACAGATCC
TTGCCGGTAGTGGTCTCAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCT
TTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGG
GAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCCTTGCTCAAGCAAACCGCTAAC
ACAAGGTTTGTGGAGTCTGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGATCC*AAAGTACAA
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TGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTCGATGAAGCAAAAAATGCAGGG*CAGATATTG
TGGGCAGTGATGATTTGATTGAACAGATAA

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DS 

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ATTGTTCACATTCCCTTTGGGAAAGTAAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTC
CTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGG
AAAAGCGCACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAGGGAGATG
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CTTCTTTGTATA*CCTCCTCACTGGTTGTATCACCTTTAACTCTGATA
GCTAT

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DS 

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GATTTGATTGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCG
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AATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGACA
AACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATATGCTCGTCAATG
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CGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTTTATCTCTTCTTTGTATAACCTCCTCACTGGTT
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GCATTG
CG

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DS 

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CAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGC
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AAATAAA****CCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAGGAAGGTGTAGTATGTTTTTGGGA
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TAAATAATAATATTTCGC

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR4AZ77TF 858 0 0
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CAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAA*GGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGC
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CAGTGATGATTTTATCGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGC
ATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAGGACT
CATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAGGCTATAGAGGAGTT
CAAGAAGGGCAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTTCACATTCCCTTTGG
GAAAGTAAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGGT
GGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATATGCTC
GTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAGGGAGATGATAGACTTCAAGCCATAAAT
AAATAAA****CCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAGGAAAGTGTAGTATGTTTTTGGGA
GTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTT*ATCTCTTCTTTGTATA*CCTCCTC
ACTGGTTGTATCACCTTTAACTCTGATAG***CTATTTGATGTATTG*ATTATTACTGTT
AAAATTTGCATTGTGAGATCTGTATTATTGCCTTTGGAGAGA*CAAATGAGTCGTTTTAA
TAAATAATAATATTTCGC

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 5

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TGGAGAATCTCAAATCCCAAACAAAAGCCAAAGTTTCAGGAAACGGATGACAAAAATAGG
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GGATGATATGATAATAAATACTCAAAAGTTCCATATGCTGAAAATACAATCAGCCTCACA
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GATTCTGCATGATGTTACCGCTTACCGGGAGTGTGTTACTGCTTGCTGGATCCAAGTGCA
GCTGGAGGAACTTTGGAACAGCAGCCTGGAAGATAAAATCTGTGAAAGTATTAGGAGATA
GATTTATAAAAGTGGCTTGGACATTTGTTGTTTGTGGGTTCTCTGATGGCTTTGAGAAGG
TGAACTCAATCTTCAAGGTGCTGCTCTCGTATGCAACAATAGGTGGATATGCTGGACCAT
TGGTTGCTTCCTTCGATGGGCTTGGAGAAAGACCATCTAACAAATCAAACATACCACCAG
CAGAAGCAGTCGTTGCTAAGTGAGGTGGAGCTGGTGAAGAGAGTGGGTCTAGCGCAGTAG
AAGGACTACTGTTAATGCCAGCTGGCGATAACAAATCAATTGATGATGTGTTGTTTTGTG
CCGGAGAAGGTGTTCCAATTGATAAAATATCCATCAACAGATCTGCGCCGGCTTTTGGAC
CCGGGGCTGCACCAGATTGTGCCGGCGATGATCCTAAGTCAACACCAAGAAGATCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EE35JQ U 25
AF RR4BJ94JQ U 1
AF RR4BH88JQ U 66
AF RR4BH88TF C 100
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BS 736 816 RR4BH88JQ
BS 817 958 RR4BH88TF

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CC*GGAAGATAAAATCTGTGAAAGTATTAGGAGATAGATTTATAAAAGTGGCTTGGAC

QA 1 538 1 538
DS 

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GATTCTGCATGATGTTACCGCTTACCGGGAGTGTGTTACTGCTTGCTGGATCCAAGTGCA
GCTGGAGGAACTTTGGAACAGCAGCCTGGAAGATAAAATCTGTGAAAGTATTAGGAGATA
GATTTATAAAAGTGGCTTGGACATTTGTTGTTTGTGGGTTCTCTGATGGCTTTGAGAAGG
TGAACTCAATCTTCAAGGTGCTGCTCTCGTATGCAACAATAGGTGGATATGCTGGACCAT
TGGTTGCTTCCTTCGATGGGCTTGGAGAAAGACCATCTAACAAATCAAACATACCACCAG
CAGAAGCAGTCGTTG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4BH88JQ 751 0 0
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AAAAGCTGATTTTGTTGCGTCAGTGGGCGATACATATCTTTTTTTTTTGGAATACGGATG
ATATGATAATAAATACTCAAAAGTTCCATATGCTGAAAATACAATCAGCCTCACAAGCCA
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TGCATGATGTTACCGCTTACCGGGAGTGTGTTACTGCTTGCTGGATCCAAGTGCAGCTGG
AGGAACTTTGGAACAGCAGCCTGGAAGATAAAATCTGTGAAAGTATTAGGAGATAGATTT
ATAAAAGTGGCTTGGACATTTGTTGTTTGTGGGTTCTCTGATGGCTTTGAGAAGGTGAAC
TCAATCTTCAAGGTGCTGCTCTCGTATGCAACAATAGGTGGATATGCTGGACCATTGGTT
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AGATGATTGTC
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CAAAAATAGGAAGGTAAAAGCTGATTTTGTTGCGTCAGTGGGCGATACATATCTTTTTTT
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CAGCCTCACAAGCCACGAGGGAAGTTGTTGATCCGTCCTTCCTCCAGTACATCTTTTCCG
TTTACTTTGTACCCAATCCTCATGCGCATCACAAGAGATTTCTTTCCGTGCTGGCTGTTA
GTGACTTTCAGATTCTGCATGATGTTACCGCTTACCGGGAGTGTGTTACTGCTTGCTGGA
TCCAAGTGCAGCTGGAGGAACTTTGGAACAGCAGCCTGGAAGATAAAATCTGTGAAAGTA
TTAGGAGATAGATTTATAAAAGTGGCTTGGACATTTGTTGTTTGTGGGTTCTCTGATGGC
TTTGAGAAGGTGAACTCAATCTTCAAGGTGCTGCTCTCGTATGCAACAATAGGTGGATAT
GCTGGACCATTGGTTGCTTCCTTCGATGGGCTTGGAGAAAGACCATCTAACAAATCAAAC
ATACCACCAGCAGAAGCAGTCGTTGCTAAGTGAGGTGGAGCTGGTGAAGAGAGTGGGTCT
AGCGCAGTAGAAGGACTACTGTTAATGCCAGCTGGCGATAACAAATCAATTGATGATGTG
TTGTTTTGTGCCGGAGAAGGTGTTCCAATTGATAAAATATCCATCAACAGATCTGCGCCG
GCTTTTGGACCCGGGGCTGCACCAGATTGTGCCGGCGATGATCCTAAGTCAACACCAAGA
AGATCCTC

QA 12 859 12 859
DS 

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GAAGGTAAAAGCTGATTTTGTTGCGTCAGTGGGCGATACATATCTTTTTTTTTTGGAATA
CGGATGATATGATAATAAATACTCAAAAGTTCCATATGCTGAAAATACAATCAGCCTCAC
AAGCCACGAGGGAAGTTGTTGATCCGTCCTTCCTCCAGTACATCTTTTCCGTTTACTTTG
TACCCAATCCTCATGCGCATCACAAGAGATTTCTTTCCGTGCTGGCTGTTAGTGACTTTC
AGATTCTGCATGATGTTACCGCTTACCGGGAGTGTGTTACTGCTTGCTGGATCCAAGTGC
AGCTGGAGGAACTTTGGAACAGCAGCCTGGAAGATAAAATCTGTGAAAGTATTAGGAGAT
AGATTTATAAAAGTGGCTTGGACATTTGTTGTTTGTGGGTTCTCTGATGGCTTTGAGAAG
GTGAACTCAATCTTCAAGGTGCTGCTCTCGTATGCAACAATAGGTGGATATGCTGGACCA
TTGGTTGCTTCCTTCGATGGGCTTGGAGAAAGACCATCTAACAAATCAAACATACCACCA
GCAGAAGCAGTCGTTGCTAAGTGAGGTGGAGCTGGTGAAGAGAGTGGGTCTAGCGCAGTA
GAAGGACTACTGTTAATGCCAGCTGGCGATAACAAATCAATTGATGATGTGTTGTTTTGT
GCCGGAGAAGGTGTTCCAATTGATAAAATATCCATCAACAGATCTGCGCCGGCTTTTGGA
CCCGGGGCTGCACCAGATTGTGCCGGCGATGATCCTAAGTCAACACCAAGAAGATCCTC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 5

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ACATACTTCTTGCTAATTGTTTATTTCTTTGAAGTCAAGATCAAAGGGAGAGTTTGTGTT
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TCTGTTGGTAGAAGCAGCCATCGACGGACTCAAAGTGCAATCGATGATAAGGAAGTATTA
GCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACAGAG
TTTAAACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCCA
CTACCTGAACCATCCATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGGCATCT
ATGAGGATAAAAGGTGATTTGCAGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAAACCGCCT
CGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCTGAACACAACTTG
CTTAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGGCGGTAGCATCCAAGAATGGATGAAAC
AAAGTTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCC
TTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAGAACAA
ATCCAAATCATAGTGTAATGTTATATATATTATATACTCAACTAAAGTTCACT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B910JQ C 1
AF RR4B910TF U 1
AF RR4AG53TF U 3
AF RR4DG68JQ C 56
AF RR4DG68TF U 12
BS 1 4 RR4B910JQ
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RD RR4B910JQ 763 0 0
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TCTGTTGGTAGAAGCAGCCATCGACGGACTCAAAGTGCAATCGATGATAAGGAAGTATTA
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QA 1 759 1 759
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RD RR4B910TF 763 0 0
GGGA
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AACT

QA 5 759 5 759
DS 

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GG
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CAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACAGAGTTTA
AACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCCACTAC
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GGATAAAAGGTGATTTGCAGATTGCTGAACCTGATGGATCTGCACCAAAACCGCCTCGCC
CTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCTGAACACAACTTGCTTA
ATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGGCGGTAGCATCCAAGAATGGATGAAACAAAG
TTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCCTTGT
GAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAAAACAAATCC
AAATCATAGTGTAATGTTATATATATTATATACTCAACTAAAGTTCACT

QA 3 771 3 771
DS 

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GATTTTCTGTTGGTAGAAGCAGCCATCGACGGACTCAAAGTGCGATCGATGATAAGGAAG
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CAGAGTTTAAACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGT
GTCCACTACCTGAACCATCCATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGG
CATCTATGAGGATAAAAGGTGATTTGCAGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAAAC
CGCCTCGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCTGAACACA
ACTTGCTTAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGGCGGTAGCATCCAAGAATGGAT
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CCCCCTTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAG
AACAAATCCAAATCATAGTGTAATGTTATATATATTATATACTC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4DG68TF 724 0 0
GG
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TAATTGTTTATTTCTTTGAAGTCAAGATCAAAGGGAGAGTTTGTGTTTAAAGATCACGAG
AAGACTTCAGATTCAATCAAACCATGGTTGGTATCTTTTCAAGATTTTCTGTTGGTAGAA
GCAGCCATCGACGGACTCAAAGTGCGATCGATGATAAGGAAGTATTAGCTCCAAATCCTG
ATGTTACTTCCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACAGAGTTTAAACCAGTGG
AACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCCACTACCTGAACCAT
CCATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGGCATCTATGAGGATAAAAG
GTGATTTGCAGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAAACCGCCTCGCCCTAGCCAGC
CAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCTGAACACAACTTGCTTAATCTACTTG
AAGAATGTAATGCTATGCAGGCGGTAGCATCCAAGAATGGATGAAACAAAGTTCAGTAGT
TTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCCTTGTGAATCTATG
TGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAGAACAAATCCAAATCATAG
TG

QA 3 724 3 724
DS 



AS 1 5

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GATCCACTTGACTGAATAAGAATATAATATCTGAAGTGTTACAAGACAGGCATATAGATA
AAAATGGACAAAACACTCAAAGAACCCACCCCAATAGAGACTAGAGAGTCCTCAAGAAGA
AGAAGGAGTCTTGGTGTAAGAACGGATACCGAGAGCCAAGCCTAAGATGAGAAGAGGAAC
AAGGAACTGAAGGATCTTAACGAGAAAATCCGAGCTCTGGTTCTGGTTAGACTCGGTCTG
CTTAGGAGGAGGAGGAGGAACGAACTTGGTTTTGGCTGGGACAGTGGCTGTGTCAATATC
ACCAACATAGTACTCATCAAGCATAGCTTTAGCAGTCGAACTGTGTCCCACATCCTCAAA
ATCATCCGTCGCGTCTTTCCCTGTAGAAGTCAAGATGACCTCGTCACCACCTGGATGGTC
GTCCAAGAACTTTGTCACATCATAAACCTTGCCATCGATGACGATCCAGCAATCCTTGGC
GGTAGTGTGCTGAGAAACCTCCGCCAAGGTGTAAACTTTGCCGTCTCCGCCCATTTCTCC
TCCGATGCAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU22JQ U 1
AF RR4DU22TF C 1
AF RR4EK41JQ U 18
AF RR4EK41TF C 18
AF RR4EZ96JQ U 7
BS 1 513 RR4DU22JQ
BS 514 603 RR4EK41JQ
BS 604 614 RR4EZ96JQ

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GATCCACTTGACTGAATAAGAATATAATATCTGAAGTGTTACAAGACAGGCATATAGATA
AAAATGGACAAAACACTCAAAGAACCCACCCCAATAGAGACTAGAGAGTCCTCAAGAAGA
AGAAGGAGTCTTGGTGTAAGAACGGATACCGAGAGCCAAGCCTAAGATGAGAAGAGGAAC
AAGGAACTGAAGGATCTTAACGAGAAAATCCGAGCTCTGGTTCTGGTTAGACTCGGTCTG
CTTAGGAGGAGGAGGAGGAACGAACTTGGTTTTGGCTGGGACAGTGGCTGTGTCAATATC
ACCAACATAGTACTCATCAAGCATAGCTTTAGCAGTCGAACTGTGTCCCACATCCTCAAA
ATCATCCGTCGCGTCTTTCCCTGTAGAAGTCAAGATGACCTCGTCACCACCTGGATGGTC
GTCCAAGAACTTTGTCACATCATAAACCTTGCC

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DS 

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TGACTGAATAAGAATATAATATCTGAAGTGTTACAAGACAGGCATATAGATAAAAATGGA
CAAAACACTCAAAGAACCCACCCCAATAGAGACTAGAGAGTCCTCAAGAAGAAGAAGGAG
TCTTGGTGTAAGAACGGATACCGAGAGCCAAGCCTAAGATGAGAAGAGGAACAAGGAACT
GAAGGATCTTAACGAGAAAATCCGAGCTCTGGTTCTGGTTAGACTCGGTCTGCTTAGGAG
GAGGAGGAGGAACGAACTTGGTTTTGGCTGGGACAGTGGCTGTGTCAATATCACCAACAT
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TCGCGTCTTTCCCTGTAGAAGTCAAGATGACCTCGTCACCACCTGGATGGTCGTCCAAGA
ACTTTGTCACATCATAAACCTTGCCATCGATGACGATCCAGCAATCCTTGGCGGTAGTGT
GCTGAGAAACCTCCGCCAAGGTGTAAACTTTGCCGTCTCCGCCCATTTCTCCTCC
GA

QA 9 603 9 603
DS 

RD RR4EK41JQ 588 0 0
A
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AGAATATAATATCTGAAGTGTTACAAGACAGGCATATAGATAAAAATGGACAAAACACTC
AAAGAACCCACCCCAATAGAGACTAGAGAGTCCTCAAGAAGAAGAAGGAGTCTTGGTGTA
AGAACGGATACCGAGAGCCAAGCCTAAGATGAGAAGAGGAACAAGGAACTGAAGGATCTT
AACGAGAAAATCCGAGCTCTGGTTCTGGTTAGACTCGGTCTGCTTAGGAGGAGGAGGAGG
AACGAACTTGGTTTTGGCTGGGACAGTGGCTGTGTCAATATCACCAACATAGTACTCATC
AAGCATAGCTTTAGCAGTCGAACTGTGTCCCACATCCTCAAAATCATCCGTCGCGTCTTT
CCCTGTAGAAGTCAAGATGACCTCGTCACCACCTGGATGGTCGTCCAAGAACTTTGTCAC
ATCATAAACCTTGCCATCGATGACGATCCAGCAATCCTTGGCGGTAGTGTGCTGAGAAAC
CTCCGCCAAGGTGTAAACTTTGCCGTCTCCGCCCATTTCTCCTCC
CC

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DS 

RD RR4EK41TF 588 0 0
A
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AGAATATAATATCTGAAGTGTTACAAGACAGGCATATAGATAAAAATGGACAAAACACTC
AAAGAACCCACCCCAATAGAGACTAGAGAGTCCTCAAGAAGAAGAAGGAGTCTTGGTGTA
AGAACGGATACCGAGAGCCAAGCCTAAGATGAGAAGAGGAACAAGGAACTGAAGGATCTT
AACGAGAAAATCCGAGCTCTGGTTCTGGTTAGACTCGGTCTGCTTAGGAGGAGGAGGAGG
AACGAACTTGGTTTTGGCTGGGACAGTGGCTGTGTCAATATCACCAACATAGTACTCATC
AAGCATAGCTTTAGCAGTCGAACTGTGTCCCACATCCTCAAAATCATCCGTCGCGTCTTT
CCCTGTAGAAGTCAAGATGACCTCGTCACCACCTGGATGGTCGTCCAAGAACTTTGTCAC
ATCATAAACCTTGCCATCGATGACGATCCAGCAATCCTTGGCGGTAGTGTGCTGAGAAAC
CTCCGCCAAGGTGTAAACTTTGCCGTCTCCGCCCATTTCTCCTCC
CC

QA 2 586 2 586
DS 

RD RR4EZ96JQ 608 0 0
CG
GACAACAAACGTAGCTGATTTTTTTAATCAAAAAAGTTCTCAGACATAAACAGATCCACT
TGACTGAATAAGAATATAATATCTGAAGTGTTACAAGACAGGCATATAGATAAAAATGGA
CAAAACACTCAAAGAACCCACCCCAATAGAGACTAGAGAGTCCTCAAGAAGAAGAAGGAG
TCTTGGTGTAAGAACGGATACCGAGAGCCAAGCCTAAGATGAGAAGAGGAACAAGGAACT
GAAGGATCTTAACGAGAAAATCCGAGCTCTGGTTCTGGTTAGACTCGGTCTGCTTAGGAG
GAGGAGGAGGAACGAACTTGGTTTTGGCTGGGACAGTGGCTGTGTCAATATCACCAACAT
AGTACTCATCAAGCATAGCTTTAGCAGTCGAACTGTGTCCCACATCCTCAAAATCATCCG
TCGCGTCTTTCCCTGTAGAAGTCAAGATGACCTCGTCACCACCTGGATGGTCGTCCAAGA
ACTTTGTCACATCATAAACCTTGCCATCGATGACGATCCAGCAATCCTTGGCGGTAGTGT
GCTGAGAAACCTCCACCAAGGTGTAAACTTTGCCGTCTCCGCCCATTTCTCCTCCGATGC
AAACCC

QA 3 608 3 608
DS 



AS 1 5

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TTTTTGAGAACAAAAAAAAAGAGAATCGAAGGAGGAAAAGGGATTTGGTTTTATTGGAGA
GTGTGAATTGTTGT****TTAGAAGCGCCGAGATTACAAATTGGAGGGTGAATTTGAGCA
GAGAATGGAAGAAATAAGATCAGCGATGGAACAGCAGATGAATCTGATGGCGGATCTGGT
CCAGAAACTCTCCGGAGAGCTCCGTACCGGATTGCAACCTGCCTACGATAATTTCATTGG
TTTCTTCCACGCCATCGATTGGAAGGAACCTTGGATTATGGGATTAATGG*CGTTTCATG
CTCTGCTGCTAATTGTGACTCTTGTTTCGAGAAGG*CATCTCAA*CTTCCACATGTTCTT
GTTCTTATTGTCTTTGGGTGG*AGTTTACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGAA
AAAACTGGAGGAGCTTCTCAACTCAGAATTACTTTGACCCGCACGGAGCCTTCCTATCTG
TTCTTTGGTCAGGACCACTTTTGGTCATTGCAATCATAATCCTGATAAACACACTGTTCT
CGCTTTGCTACCTTATTGTAAAATGGAAAAGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTG
CTCGTCCCAAGCAGGAATAATAGATCCCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTCGTA
TCACATCCTTTTTGTCACATATATGTATACTCTCCTCCCTCATTT*GCAATGCAAACTGT
TAGTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGTTAACAGCAAACAGTTAGTTTTC
TATTTTATGTATTTCGTTTTGAAATGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B945JQ C 272
AF RR4DK31TF U 1
AF RR4DK31JQ C 480
AF RR4B945TF U 10
AF RR4BG77TF U 10
BS 1 59 RR4DK31TF
BS 60 60 RR4B945TF
BS 61 69 RR4DK31TF
BS 70 71 RR4B945TF
BS 72 72 RR4DK31TF
BS 73 73 RR4B945TF
BS 74 74 RR4DK31TF
BS 75 78 RR4B945TF
BS 79 82 RR4DK31TF
BS 83 83 RR4B945TF
BS 84 96 RR4DK31TF
BS 97 97 RR4B945TF
BS 98 118 RR4DK31TF
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BS 120 160 RR4DK31TF
BS 161 161 RR4B945TF
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BS 184 184 RR4B945TF
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BS 193 193 RR4B945TF
BS 194 228 RR4DK31TF
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BS 485 485 RR4B945TF
BS 486 727 RR4DK31TF
BS 728 811 RR4B945TF

RD RR4B945JQ 194 0 0
GGATTATG
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CTCAAACTTCCACATGTTCTTGTTCTTATTGTCTTTGGGTGGGAGTTTACTTTGCAGAGA
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CGCACG

QA 9 194 9 194
DS 

RD RR4DK31TF 731 0 0
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GTGTGAATTTGTTTAGCATTAGCAGCGCCGAGATTAGAAATTGGAGGGTGAATTTGAGGA
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CCACAAACTCTCGGGAGAGCTCCGTACCGGATTGCAACCTGCCTACGAGAATTTCATTGG
TTTTTTCCACGCCATTGATTGGAAGGAACCTTGGATTATGGGATTAATGG*CGTTTCATG
CTCTGGTGCTGATTGTGACTCTTGTTTCGAGAAGG*CATCTCAA*CTTCCACATGTTCTT
GTTCTTATTGTCTTTGGGTGG*AGTATACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGAA
AGAACTGGAAGAGCTTCTCAACTCAGAATTACTTTGACCCCCACGGAGCCTTCCTGTCTG
TTCTCTGGTCAGGACCACTTTTGGTCATTGCAATCATAATCCTGATAAACACACTGTTCT
CGCTTTGCTACCTTATTGTAAAATGGAAAAGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTG
CTCGTCCCAAGCAGGAATAATAGATCCCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTCGTA
TCACATCCTTTTTGTCACATATATGTATACTCTCCTCCCTCATTT*GCAATGCAAACTGT
TAGTTTT
CTTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4DK31JQ 256 0 0
GTTTTC
TGGTCAGGACCACTTTTGGTCATTGCAATCATAATCCTGATAAACACACTGTTCTCGCTT
TGCTACCTTATTGTAAAATGGAAAAGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGT
CCCAAGCAGGAATAATAGATCCCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTCGTATCACA
TCCTTTTTGTCACATATATGTATACTCTCCTCCCTCATTT*GCAATGCAAACTGTTAGTT
TT
TTTTTTTT

QA 7 248 7 248
DS 

RD RR4B945TF 802 0 0
GAGAACCAAAAAAAAAA
CGAAGGAGGAAAAGGGATTTGGTTTTATTGGAGAGTGTGAATTGTTGT****TTAGAAGC
GCCGAGATTACAAATTGGAGGGTGAATTTGAGCAGAGAATGGAAGAAATAAGATCAGCGA
TGGAACAGCAGATGAATCTGATGGCGGATCTGGTCCAGAAACTCTCCGGAGAGCTCCGTA
CCGGATTGCAACCTGCCTACGATAATTTCATTGGTTTCTTCCACGCCATCGATTGGAAGG
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TCGAGAAGG*CATCTCAA*CTTCCACATGTTCTTGTTCTTATTGTCTTTGGGTGG*AGTT
TACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGAAAAAACTGGAGGAGCTTCTCAACTCAG
AATTACTTTGACCCGCACGGAGCCTTCCTATCTGTTCTTTGGTCAGGACCACTTTTGGTC
ATTGCAATCATAATCCTGATAAACACACTGTTCTCGCTTTGCTACCTTATTGTAAAATGG
AAAAGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTCCCAAGCAGGAATAATAGATC
CCAACTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTCTCGTATCACATCCTTTTTGTCACATATATGT
ATACTCTCCTCCCTCATTTTGCAATGCAAACTGTTAGTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTC
TTTTTTTTTTGTTAACAGCAAACAGTTAGTTTTCTATTTTATGTATTTCGTTTTGAAATG
ATTCC

QA 18 802 18 802
DS 

RD RR4BG77TF 779 0 0
GAGAACCAAAAAAAAAA
CGAAGGAGGAAAAGGGATTTGGTTTTATTGGAGAGTGTGAATTGTTGT****TTAGAAGC
GCCGAGATTACAAATTGGAGGGTGAATTTGAGCAGAGAATGGAAGAAATAAGATCAGCGA
TGGAACAGCAGATGAATCTGATGGCGGATCTGGTCCAGAAACTCTCCGGAGAGCTCCGTA
CCGGATTGCAACCTGCCTACGATAATTTCATTGGTTTCTTCCACGCCATCGATTGGAAGG
AACCTTGGATTATGGGATTAATGG*CGTTTCATGCTCTGCTGCTAATTGTGACTCTTGTT
TCGAGAAGG*CATCTCAA*CTTCCACATGTTCTTGTTCTTATTGTCTTTGGGTGG*AGTT
TACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGAAAAAACTGGAGGAGCTTCTCAACTCAG
AATTACTTTGACCCGCACGGAGCCTTCCTATCTGTTCTTTGGTCAGGACCACTTTTGGTC
ATTGCAATCATAATCCTGATAAACACACTGTTCTCGCTTTGCTACCTTATTGTAAAATGG
AAAAGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTCCCAAGCAGGAATAATAGATC
CCAACTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTCTCGTATCACATCCTTTTTGTCACATATATGT
ATACTCTCCTCCCTCATTTTGCAATGCAAACTGTTAGTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTC
TTTTTTTTTTGTTAACAGCAA*CAGTTAGTTTTCTATTT
ATG

QA 18 776 18 776
DS 



AS 1 4

CO CL1799Contig1 818 4 10 U
GGATATACACAAGTACTAGCTAGCAGCAGGTGACATAGTATTTCTAAACTGGGGTCCAAT
TCACTAAAACTAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTTTCTCCGGTTTACTG
GCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAA
TCCGTTTACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGGGACCAACTTGTT
TTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGT
TGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCT
AAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAG
GTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCA
AGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCC
GGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGGTATATATTGGCCGTT
GGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGACTAAGGCTTTTGTATTGTTGC
ATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAACTTTCGAATTATTAATCCGTA
TTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCGTTATGTATTTCGAATATTGCATTTCTGATTTTG
TTATTGTATCCGTATTTCTCAGTTACTATGGTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET23TF U 33
AF RR4CN37TF U 1
AF RR4ET23JQ C 239
AF RR4CN37JQ C 98
BS 1 644 RR4CN37TF
BS 645 645 RR4CN37JQ
BS 646 684 RR4CN37TF
BS 685 685 RR4CN37JQ
BS 686 732 RR4CN37TF
BS 733 733 RR4CN37JQ
BS 734 760 RR4CN37TF
BS 761 761 RR4CN37JQ
BS 762 776 RR4CN37TF
BS 777 818 RR4CN37JQ

RD RR4ET23TF 600 0 0
GG
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TCATCCTGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGA
TAGGCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAAT
CTTTCAAAGTCGGGGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGC
TGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCT
CTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCC
CAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCG
CCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCT
CATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTG
TTTCCATTGGGTATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTT

QA 3 600 3 600
DS 

RD RR4CN37TF 776 0 0
GGATATACACAAGTACTAGCTAGCAGCAGGTGACATAGTATTTCTAAACTGGGGTCCAAT
TCACTAAAACTAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTTTCTCCGGTTTACTG
GCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAA
TCCGTTTACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGGGACCAACTTGTT
TTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGT
TGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCT
AAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAG
GTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCA
AGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCC
GGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGGTATATATTGGCCGTT
GGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGACTAAG*CTTTTGTATTGTTGC
ATCGAGGAATATATTTTGGGAGGG*AGAATATAAATAAACTTTCGAATTATTAATCCGTA
TTTGTTGTATTT*GCGAATTTGCGTCGTTATGTATTTCGA*TATTGCATTTCTGAT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4ET23JQ 521 0 0
TTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGA
GTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTT
CTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGA
AGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATT
CAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCT
CCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGGTATATATTGGCCG
TTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGACTAAGGCTTTTGTATTGTT
GCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAACTTTCGAATTATTAATCCG
TATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCGTTATGTATTTCG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4CN37JQ 721 0 0
TCCTGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAG
GCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTTACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTT
TCAAAGTCGGGGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGG
GAAGCGAAGCGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTG
GGAACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAG
GGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTTTCTGCTGACTCCACCGCCG
TTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCAT
CTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTT
CCATTGGGTATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAG
GACTAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATA
AACTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCGTTATGTATTT
CGAATATTGCATTTCTGATTTTGTTATTGTATCCGTATTTCTCAGTTACTATGGTTTTCC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 5

CO CL1800Contig1 884 5 2 U
TTTTGTGAACACTGCTACTTTATTCATATAGATAGATAGATATTCGGTTACAAGTAGACA
TAGACAGTAAATTATTATTCTCCTTTGATACGGATAAAAAGGTTTGACACAAGACATAAG
CGGGTGTAATGCGGGCAGTTGTGCCCGTAAGAAAAACTCAAACTTATGTTACAACATGTA
ATAAGGCTTCGTTTTGAGCTTT*ATCTAAAGACATACTATCAGTTTGCTTTCCGTTGTAG
TGTTGATCGAAAAGAGCATTCATATTTCTTGATTGTAAATGCTTAGCTCTGCATGTGTTT
CCTTGTAACGTTGGGTGAGGTATGTCGAACATTTGATCGCTGGATATTTGGGAACGTTGC
TTTCGGACTTGCACGTTGGGAGACACTCCACAAGACATTCATGATTTGGTTCAACAAAAA
ATGGAATGGAATATCGTTCCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAACGTGGATTTGAAAA
AGCCATTGCTCCAACGTTCCAGCATATCGCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTAATCG
CCGGTACATATTCCCACTTCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGGCCCA
TTACACCATCAGTGGCTAGCAGAGTCATCATTCCGTAATCAGAATGTGCTCCACAAGCAT
ATATTCCTTGCGAAGGGTCAGAAACCCCTTGATAATGCAGCAATCGCATAGTCGCAATAG
GCTTTCCAAGCATCTCCGGGGTATCAAAGTAATTCGCATCCAGATCAAGTGCTAACGCCA
ATAATCTTCCAATATCCTTAGAAACCCTCAATGCTTCTTGGTGATATTTTTTCCATGGTC
TCTCGCCACTGAGGCAATACATCAGAATCAGGCCAAGGGTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC89JQ U 63
AF RR4EY20JQ U 3
AF RR4FC89TF C 63
AF RR4AW26JQ U 1
AF RR4AW26TF C 78
BS 1 867 RR4AW26JQ
BS 868 884 RR4AW26TF

RD RR4FC89JQ 609 0 0
GC
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TGTAATGCGGGCAGTTGTGCCCGTAAGAAAGACTCAAACTTATGTTACAACATGTAATAA
GGCTTCGTTTTGAGCTTTTATCTAAAGACATACTATCAGTTTACTTTCCGTTGTAGTGTT
GATCGACATGAGCATTCATATTTCTTGATTGTAAATGCTCAACTCTGCATGTGTTTCCTT
GTAACGTTGGGTGAGGTATGCCGAACATTTGATCGCTGGATATTTGGGAACGTTGCTTTC
GGACTTGCACGTTGGGAGACACTCCACAAGACATTCATGATTTGGTTCAACAAAAAATGG
AATAAAATATCGTTCCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAACGTGGATTTGAAATAGCC
ATTGCTCCAACGTTCCAGCATATCTCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTAATCGCCGG
CACATATTCCCACTTCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGACCCATGAC
ACCATCAGTAGCTAACAGAGTCATCATTCCGTAATCAGAATGTGCTCCACAAGCATATAT
TCCTTGC

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR4EY20JQ 774 0 0
GTGA
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GTAAATTATTATTCTCCTTTGATACGGATAAAAAGGTTTGACACAAGACATAAGCGGGTG
TAATGCGGGCAGTTGTGCCCGTAAGAAAAACTCAAACTTATGTTACAACATGTAATAAGG
CTTCGTTTTGAGCTTT*ATCTAAAGACATACTATCAGTTTGCTTTCCGTTGTAGTGTTGA
TCGAAAAGAGCATTCATATTTCTTGATTGTAAATGCTTAGCTCTGCATGTGTTTCCTTGT
AACGTTGGGTGAGGTATGTCGAACATTTGATCGCTGGATATTTGGGAACGTTGCTTTCGG
ACTTGCACGTTGGGAGACACTCCACAAGACATTCATGATTTGGTTCAACAAAAA*TGGAA
TGGAATATCGTTCCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAACGTGGATTTGAAAAAGCCAT
TGCTCCGACGTTCCAGCATATCGCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTAATCGCCGGTA
CATATTCCCACTTCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGGCCCATTACAC
CATCAGTGGCTAGCAGAATCATCATTCCGTAATCAGAATGTGCTCCACAAGCATATATTC
CTTGCGAAGGGTCAGAAACCCCTTGATAATGCAGCAATCGCATAGTCGCAATAGGCTTTC
CAAGCATCTCCGGGGTATCAAAGTAATTCGCATCCAGATCAAGTGCTAAC

QA 5 774 5 774
DS 

RD RR4FC89TF 756 0 0
GC
CAGTAAATTATTATTCTCCTTTGATACGGATAAAA*GGT**GACACAAGACATAAGCGGG
TGTAATGCGGGCAGTTGTGCCCGTAAGAAAGACTCAAACTTATGTTACAACATGTAATAA
GGCTTCGTTTTGAGCTTTTATCTAAAGACATACTATCAGTTTACTTTCCGTTGTAGTGTT
GATCGACATGAGCATTCATATTTCTTGATTGTAAATGCTCAACTCTGCATGTGTTTCCTT
GTAACGTTGGGTGAGGTATGCCGAACATTTGATCGCTGGATATTTGGGAACGTTGCTTTC
GGACTTGCACGTTGGGAGACACTCCACAAGACATTCATGATTTGGTTCAACAAAAAATGG
AATAGAATATCGTTCCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAACGTGGATTTGAAATAGCC
ATTGCTCCAACGTTCCAGCATATCTCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTAATCGCCGG
CACATATTCCCACTTCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGACCCATGAC
ACCATCAGTAGCTAACAGAGTCATCATTCCGTAATCAGAATGTGCTCCACAAGCATATAT
TCCTTGCGAAGGGTCAGAAACCCCTTGATAATGAAGCAATCGCATAGTTGCAATAGGCTT
TCCAAGCATCTCCGGGGTATCAAAGTAATTCGCATCCAGATCAAGTGCTAACGCCAATAA
TCTTCCAATATCCTTAGAAACCCTCAATGCTTC
C

QA 3 755 3 755
DS 

RD RR4AW26JQ 867 0 0
TTTTGTGAACACTGCTACTTTATTCATATAGATAGATAGATATTCGGTTACAAGTAGACA
TAGACAGTAAATTATTATTCTCCTTTGATACGGATAAAAAGGTTTGACACAAGACATAAG
CGGGTGTAATGCGGGCAGTTGTGCCCGTAAGAAAAACTCAAACTTATGTTACAACATGTA
ATAAGGCTTCGTTTTGAGCTTT*ATCTAAAGACATACTATCAGTTTGCTTTCCGTTGTAG
TGTTGATCGAAAAGAGCATTCATATTTCTTGATTGTAAATGCTTAGCTCTGCATGTGTTT
CCTTGTAACGTTGGGTGAGGTATGTCGAACATTTGATCGCTGGATATTTGGGAACGTTGC
TTTCGGACTTGCACGTTGGGAGACACTCCACAAGACATTCATGATTTGGTTCAACAAAAA
ATGGAATGGAATATCGTTCCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAACGTGGATTTGAAAA
AGCCATTGCTCCAACGTTCCAGCATATCGCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTAATCG
CCGGTACATATTCCCACTTCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGGCCCA
TTACACCATCAGTGGCTAGCAGAGTCATCATTCCGTAATCAGAATGTGCTCCACAAGCAT
ATATTCCTTGCGAAGGGTCAGAAACCCCTTGATAATGCAGCAATCGCATAGTCGCAATAG
GCTTTCCAAGCATCTCCGGGGTATCAAAGTAATTCGCATCCAGATCAAGTGCTAACGCCA
ATAATCTTCCAATATCCTTAGAAACCCTCAATGCTTCTTGGTGATATTTTTTCCATGGTC
TCTCGCCACTGAGGCAATACATCAGAA

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR4AW26TF 807 0 0
A
TCTCCTTTGATACGGATAAAAAGGTTTGACACAAGACATAAGCGGGTGTAATGCGGGCAG
TTGTGCCCGTAAGAAAAACTCAAACTTATGTTACAACATGTAATAAGGCTTCGTTTTGAG
CTTT*ATCTAAAGACATACTATCAGTTTGCTTTCCGTTGTAGTGTTGATCGAAAAGAGCA
TTCATATTTCTTGATTGTAAATGCTTAGCTCTGCATGTGTTTCCTTGTAACGTTGGGTGA
GGTATGTCGAACATTTGATCGCTGGATATTTGGGAACGTTGCTTTCGGACTTGCACGTTG
GGAGACACTCCACAAGACATTCATGATTTGGTTCAACAAAAAATGGAATGGAATATCGTT
CCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAACGTGGATTTGAAAAAGCCATTGCTCCAACGTT
CCAGCATATCGCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTAATCGCCGGTACATATTCCCACT
TCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGGCCCATTACACCATCAGTGGCTA
GCAGAGTCATCATTCCGTAATCAGAATGTGCTCCACAAGCATATATTCCTTGCGAAGGGT
CAGAAACCCCTTGATAATGCAGCAATCGCATAGTCGCAATAGGCTTTCCAAGCATCTCCG
GGGTATCAAAGTAATTCGCATCCAGATCAAGTGCTAACGCCAATAATCTTCCAATATCCT
TAGAAACCCTCAATGCTTCTTGGTGATATTTTT*CCATGGTCTCTCGCCACTGAGGCAAT
ACATCAGAATCAGGCCAAGGGTTAGG

QA 2 807 2 807
DS 



AS 1 5

CO CL1801Contig1 771 5 7 U
GGACGTTCATCTCTGAATCTGTGAACTCCCTATCTCTCTCTCTCTGTGTGGGGAAATGGT
GATGGGTTCATCGAAAGGTAGAGTGATAGCATGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCT
TCTCCAGATCTTGCGTAGAGGTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCCGCACTCGG
CATTACCTTGGGAATATTTCCAATTTGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTAT
TGCATTTTTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCAACCGTCATGTTGTCTAACATTATTGCCAC
TCCTGTAGAAATAGCTCTGGTGGTGCCTTTCCTACGACTTGGTGAAAAAGTCACCGGTGG
TCCTCATTTTCCTTTGACGTCAGATGCCCTTAAGAAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCA
GGATGTCTTTTTAAGCATTGGTAATGCGTTACTAGGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTT
CTTTATTGCGCTATACGTTGTGTTGATGCCATGTTTCAAAATCCTGGTCCGCAAGTTTGG
CGCCGTTGCTTCAACCCCAAAGACACCTACAAGTGTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCC
AAGATTCGCTTGAATTCTACAAACGTTATTGTTCTGTTATCAACACGAAACCCTTGAAAT
GTAACACTTATGTATAGGGTATACACAGCCTGCACTTTATTTAAAACCTCCTTTTGAAAA
CGTCATTAACCGGAAATATTGGTTATTACATATGAATCAAAATATAAGCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G762JQ C 23
AF RR4G762TF U 23
AF RR4CQ05JQ C 1
AF RR4AR28TF U 13
AF RR4CQ05TF U 1
BS 1 14 RR4CQ05TF
BS 15 34 RR4AR28TF
BS 35 89 RR4G762TF
BS 90 90 RR4AR28TF
BS 91 702 RR4G762TF
BS 703 759 RR4AR28TF
BS 760 771 RR4CQ05JQ

RD RR4G762JQ 680 0 0
GGGAACTCCCTA
TCTCTCTCTCTGTGTGGGGAAATGGTGATGGGTTCATCGAAAGGTAGAGTGATAGTATGG
TTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTTCTCCAGATCTTGCGTAGAGGTACTGAGCCTAAG
CAGCTTGCTTTTTCCGCCGCACTCGGCATTACCTTGGGAATATTTCCAATTTGCGGTGTT
CCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCATTTTTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCAACC
GTCATGTTGTCTAACATTATTGCCACTCCTGTAGAAATAGCTCTGGTGGTGCCTTTCCTA
CGACTTGGTGAAAAAGTCACCGGTGGTCCTCATTTTCCTTTGACGTCAGATGCCCTTAAG
AAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCAGGATGTCTTTTTAAGCATTGGTAATGCGTTACTA
GGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTTCTTTATTGCGCTATACGTTGTGTTGATGCCATGT
TTCAAAATCCTGGTCCGCAAGTTTGGCGCCGTTGCTTCAACCCCAAAGACACCTACAAGT
GTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCCAAGATTCGCTTGAATTCTACAAACGTTATTGTTC
TGTTATCAACACGAAACCCTTGAAATGTAACACTTATGTATAGGGTATACACAGCCTGCA
CTTTATTT

QA 13 680 13 680
DS 

RD RR4G762TF 680 0 0
GGGAACTCCCTA
TCTCTCTCTCTGTGTGGGGAAATGGTGATGGGTTCATCGAAAGGTAGAGTGATAGTATGG
TTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTTCTCCAGATCTTGCGTAGAGGTACTGAGCCTAAG
CAGCTTGCTTTCTCCGCCGCACTCGGCATTACCTTGGGAATATTTCCAATTTGCGGTGTT
CCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCATTTTTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCAACC
GTCATGTTGTCTAACATTATTGCCACTCCTGTAGAAATAGCTCTGGTGGTGCCTTTCCTA
CGACTTGGTGAAAAAGTCACCGGTGGTCCTCATTTTCCTTTGACGTCAGATGCCCTTAAG
AAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCAGGATGTCTTTTTAAGCATTGGTAATGCGTTACTA
GGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTTCTTTATTGCGCTATACGTTGTGTTGATGCCATGT
TTCAAAATCCTGGTCCGCAAGTTTGGCGCCGTTGCTTCAACCCCAAAGACACCTACAAGT
GTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCCAAGATTCGCTTGAATTCTACAAACGTTATTGTTC
TGTTATCAACACGAAACCCTTGAAATGTAACACTTATGTATAGGGTATACACAGCCTGCA
CTTTATTT

QA 13 680 13 680
DS 

RD RR4CQ05JQ 771 0 0
GGACGTTCATCTCTGAATCTGTGAACTCCCTATCTCTCTCTCTCTGTGTGGGGAAATGGT
GATGGGTTCATCGAAAGGCAGAGTGATAGCATGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCT
TCTCCAGATCTTGCGTAGAGGTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCCGCACTCGG
CATTACCTTGGGAATATTTCCAATTTGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTAT
TGCATTTTTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCAACCGTCATGTTGTCTAACATTGTTGCCAC
TCCTGTAGAAATAGCTCTGGTGGTGCCTTTCCTACGACTTGGTGAAAAAGTCACCGGTGG
TCCTCATTTTCCTTTGACGTCAGATGCCCTTAAGAAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCA
GGATGTCTTTTTAAGCATTGGTAATGCGTTACTAGGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTT
CTTTATTGCGCTATACGTTGTGTTGATGCCATGTTTCAAAATCCTGGTCCGCAAGTTTGG
CGCCGTTGCTTCAACCCCAAAGACACCTACAAGTGTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCC
AAGATTCGCTTGAATTCTACAAACGTTATTGTTCTGTTATCAACACGAAACCCTTGAAAT
GTAACACTTATGTATAGGGTATACACAGCCTGCACTTTATTTAAAACCTCCTTTTGAAAA
CGTCATTAACCGGAAATATTGGTTATTACATATGAATCAAAATATAAGCAG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AR28TF 747 0 0
GG
GAATCTGTGAACTCCCTATCTCTCTCTCT**GTGTGGGGAAATGGTGATGGGTTCATCGA
AAGGTAGAGTGATAGCATGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTTCTCCAGATCTTGC
GTAGAGGTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCCGCACTCGGCATTACCTTGGGAA
TATTTCCAATTTGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCATTTTTTGGAT
CTACTTGTCATGCTCCAACCGTCATGTTGTCTAACATTATTGCCACTCCTGTAGAAATAG
CTCTGGTGGTGCCTTTCCTACGACTTGGTGAAAAAGTCACCGGTGGTCCTCATTTTCCTT
TGACGTCAGATGCCCTTAAGAAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCAGGATGTCTTTTTAA
GCATTGGTAATGCGTTACTAGGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTTCTTTATTGCGCTAT
ACGTTGTGTTGATGCCATGTTTCAAAATCCTGGTCCGCAAGTTTGGCGCCGTTGCTTCAA
CCCCAAAGACACCTACAAGTGTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCCAAGATTCGCTTGAA
TTCTACAAACGTTATTGTTCTGTTATCAACACGAAACCCTTGAAATGTAACACTTATGTA
TAGGGTATACACAGCCTGCACTTTATTTAAAACCTCCTTTTGAAAACGTCATTAACCGGA
AATATTGGTTATTACATATGAATCA

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR4CQ05TF 741 0 0
GGACGTTCATCTCTGAATCTGTGAACTCCCTATCTCTCTCTCTCTGTGTGGGGAAATGGT
GATGGGTTCATCGAAAGGCAGAGTGATAGCATGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCT
TCTCCAGATCTTGCGTAGAGGTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCCGCACTCGG
CATTACCTTGGGAATATTTCCAATTTGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTAT
TGCATTTTTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCAACCGTCATGTTGTCTAACATTGTTGCCAC
TCCTGTAGAAATAGCTCTGGTGGTGCCTTTCCTACGACTTGGTGAAAAAGTCACCGGTGG
TCCTCATTTTCCTTTGACGTCAGATGCCCTTAAGAAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCA
GGATGTCTTTTTAAGCATTGGTAATGCGTTACTAGGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTT
CTTTATTGCGCTATACGTTGTGTTGATGCCATGTTTCAAAATCCTGGTCCGCAAGTTTGG
CGCCGTTGCTTCAACCCCAAAGACACCTACAAGTGTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCC
AAGATTCGCTTGAATTCTACAAACGTTATTGTTCTGTTATCAACACGAAACCCTTGAAAT
GTAACACTTATGTATAGGGTATACACAGCCTGCACTTTATTTAAA*CCTCCTTTTGAAA*
CGTCATTAACCGGAAATATTG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 5

CO CL1802Contig1 457 5 12 U
GGGACCAAAAAGGAAAACGATCTTTAAAACACATAGACACACATAATGGCGGATAAAGCT
GAGCACGAACGTATATTCAAGAAATTTGATACTGACGGCGATGGTAAAATATCAGCAGCC
GAACTTGAAGAAGCTCTTAAGAAACTTGGCTCGGTGACCCCTGATGACGTGACTCGTATG
ATGGCTAAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTT
GCAGCTGCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGTTTTCTAAAATGGTAGTATT
TGCCATCGTCTTATTTTTGAATATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTAT
AAGCAACTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATA
AATCTCTCGAGTGTTTTTAATTTTGTTTATTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EQ51JQ C 1
AF RR4G532TF U 3
AF RR4EQ51TF U 1
AF RR4AJ40JQ C 3
AF RR4AJ40TF U 3
BS 1 6 RR4EQ51JQ
BS 7 49 RR4G532TF
BS 50 50 RR4EQ51TF
BS 51 139 RR4G532TF
BS 140 140 RR4EQ51TF
BS 141 365 RR4G532TF
BS 366 366 RR4EQ51TF
BS 367 419 RR4G532TF
BS 420 420 RR4EQ51TF
BS 421 428 RR4G532TF
BS 429 437 RR4EQ51TF
BS 438 457 RR4AJ40TF

RD RR4EQ51JQ 437 0 0
GGGACCAAAAAGGAAAACGATCTTTAAAACACATAGACACACATAATGGCGGATAAAGCT
GAGCACGAACGTATATTCAAGAAATTTGATACTGACGGCGATGGTAAAATATCAGCAGCC
GAACTTGAAGAAGCTCTTAAGAAACTTGGCTCGGTGACCCCTGATGACGTGACTCGTATG
ATGGCTAAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTT
GCAGCTGCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGTTTTCTAAAATGGTAGTATT
TGCCATCGTCTTATTTTTGAATATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTAT
AAGCAACTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATA
AATCTCTCGAGTGTTTT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4G532TF 426 0 0
GGAA
AAAAAGGAAAACGATCTTTAAAACACATAGACACACATAATGGGGGATAAAGCTGAGCAC
GAACGTATATTCAAGAAATTTGATACTGACGGCGATGGTAAAATATCAGCAGCCGAACTT
GAAGAAGCTCTTATGAAACTTGGCTCGGTGACCCCTGATGACGTGACTCGTATGATGGCT
AAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTTGCAGCT
GCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGTTTTCTAAAATGGTAGTATTTGCCAT
CGTCTTATTTTTGAATATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTATAAGCAT
CTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATGAATCTC
TC

QA 5 426 5 426
DS 

RD RR4EQ51TF 437 0 0
GGGACC
AAAAAGGAAAACGATCTTTAAAACACATAGACACACATAATGGCGGATAAAGCTGAGCAC
GAACGTATATTCAAGAAATTTGATACTGACGGCGATGGTAAAATATCAGCAGCCGAACTT
GAAGAAGCTCTTAAGAAACTTGGCTCGGTGACCCCTGATGACGTGACTCGTATGATGGCT
AAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTTGCAGCT
GCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGTTTTCTAAAATGGTAGTATTTGCCAT
CGTCTTATTTTTGAATATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTATAAGCAA
CTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATAAATCTC
TCGAGTGTTTT

QA 7 437 7 437
DS 

RD RR4AJ40JQ 455 0 0
GGAA
AAAAAGGAAAACGATCTTTAAAACACATAGACACACATAATGGCGGATAAAGCTGAGCAC
GAACGTATATTCAAGAAATTTGATACTGACGGCGATGGTAAAATATCAGCAGCCGAACTT
GAAGAAGCTCTTAAGAAACTTGGCTCGGTGACCCCTGATGACGTGACTCGTATGATGGCT
AAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTTGCAGCT
GCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGCTTTCTAAAATGGTAGTATTTGCCAT
CGTCTTATTTTTGAATATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTATAAGCAA
CTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATAAATCTC
TCGAGTGTTTTTAATTTTGTTTATTTCCCCC

QA 5 455 5 455
DS 

RD RR4AJ40TF 455 0 0
GGAA
AAAAAGGAAAACGATCTTTAAAACACATAGACACACATAATGGCGGATAAAGCTGAGCAC
GAACGTATATTCAAGAAATTTGATACTGACGGCGATGGTAAAATATCAGCAGCCGAACTT
GAAGAAGCTCTTAAGAAACTTGGCTCGGTGACCCCTGATGACGTGACTCGTATGATGGCT
AAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTTGCAGCT
GCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGCTTTCTAAAATGGTAGTATTTGCCAT
CGTCTTATTTTTGAATATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTATAAGCAA
CTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATAAATCTC
TCGAGTGTTTTTAATTTTGTTTATTTCCCCC

QA 5 455 5 455
DS 



AS 1 5

CO CL1803Contig1 811 5 11 U
GGACGAACAACAAGACTTATGACCGGCGATGGTTCCAAAGCTATTAGCCTATCATCATCA
TATATTCGATTTCAAAATCTCGATCTCGTCGACGATGAAATCCGCTTTAGATTTTGCTTT
ACCGGCTACCTTCCCGGCGAAATCGAGTTTTGTTGGCGGAAGAGCTCGACGCGTGATTCC
TTCTCCTAGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGAGTGTGCTCTCTTCCTCCTCCTTCTTCCTC
TCTCAAGGCCGAATCATGTTTAAAAAGAGAAGTGAACAGACAATTAAGCAGTCTTGAGTC
GATGTTCTGTTACGACAAGCCGATACCTGAGGAGATCATCGATGAGCCTGTCGGATTATC
TATGTCCGAGAAAGAGATCGGGGATAATAACCGTTGCACTTGTTGCGAAGCTAAAGGTGC
ATT*GCTTTGTGCCACTTGCTCTGGAACTGGTCTTTACGTTGACTCCATTATGGAGAGCC
AAGGCATCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGTTGTGGTGGAAGTGGTAACATTATGTGTA
AAAGCTGTGGCGGGCGTGGTCACGTAGGTCATTGATGACCCCCATGTTTCACTTTGTTTT
TAGTCATGTTTTTGCCACTTTTATGTGTTGTGACTTT*CTCTGATCTTATCGCAGAATCC
TTCCTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTCTTGTAATGATGTAATCCACAGTTTTG
TAAAAGGCTCGATTCATCTTCTGTGGTTAAATATAAAATTGTATCCTAAACGGAAGTGAC
TAAATTAGAAACTATCCCTCTCTTTTCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4GC03TF U 56
AF RR4A973JQ C 1
AF RR4A973TF U 156
AF RR4AK50TF U 66
AF RR4AK50JQ C 98
BS 1 56 RR4A973JQ
BS 57 155 RR4GC03TF
BS 156 351 RR4A973TF
BS 352 352 RR4GC03TF
BS 353 423 RR4A973TF
BS 424 424 RR4GC03TF
BS 425 637 RR4A973TF
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BS 639 722 RR4A973TF
BS 723 810 RR4AK50TF
BS 811 811 RR4AK50JQ

RD RR4GC03TF 565 0 0
G
ATCATATATTCGATTTCAAAATCTCGATCTCGTCGACGATGAAATCCGCTTTAGATTTTG
CTTTACCGGCTACCTTCCCGGCGAAATCGAGTTTTGTTGGCGGAAGAGCTCGACGCGTGA
TTCCTTCTCCTAGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGAGTGTGCTCTCTTCCTCCTCCTTCTT
CCTCTCTCAAGGCCGAATCATGTTTAAAAAGAGAAGTGAACAGACAATTAAGCAGTCTTG
AGTCGATGTTCTGTTACGACAAGCCGATACCTGAGGAGATCATCGATGAGCCTGTCGGAT
TATCTATGTCCGAGAAAGAGATCGGGGATAATAACCGTTGCACTTGTTGCGAAGCTAAAG
GTGCATT*GCTTTGTGCCACTTGCTCTGGAACTGGTCTTTACGTTGACTCCATTATGGAG
AGCCAAGGCATCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGTTGTGGTGGAAGTGGTAACATTATG
TGTAAAAGCTGTGGCGGGCGTGGTCACGTAGGTCATTGATGACCCCCATGTTTCACTTTG
TTTTTAGTCATGTTTTTGCCACTT

QA 2 565 2 565
DS 

RD RR4A973JQ 767 0 0
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TATATTCGATTTCAAAATCTCGATCTCGTCGACGATGAAATCCGCTTTAGATTTTGCTTT
ACCGGCTACCTTCCCGGCGAAATCGAGTTTTGTTGGCGGAAGAGCTCGACGCGTGATTCC
TTCTCCTAGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGAGTGTGCTCTCTTCCTCCTCCTTCTTCCTC
TCTCAAGGCCGAATCATGTTTAAAAAGAGAAGTGAACAGACAATTAAGCAGTCTTGAGTC
GATGTTCTGTTACGACAAGCCGATACCTGAGGAGATCATCGATGAGCCTGTTGGATTATC
TATGTCCGAGAAAGAGATCGGGGATAATAACCGTTGCACTTGTTGCGAAGCTAAAGGTGC
ATT*GCTTTGTGCCACTTGCTCTGGAACTGGTCTTTACGTTGACTCCATTATGGAGAGCC
AAGGCATCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGTTGTGGTGGAAGTGGTAACATTATGTGTA
AAAGCTGTGGCGGGCGTGGTCACGTAGGTCATTGATGACCCCCATGTTTCACTTTGTTTT
TAGTCATGTTTTTGCCACTTTTATGTGTTGTGACTTT*CTCTGATCTTATCGCAGAATCC
TTCCTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTCTTGTAATGATGTAATCCACAGTTTTG
TAAAAGGCTCGATTCATCTTCTGTGGTTAAATATAAAATTGTATCC
C

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4A973TF 567 0 0
GCGGAAGAGCTCGACGCGTGATTCCTTCTCCTAGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGAGTGT
GCTCTCTTCCTCCTCCTTCTTCCTCTCTCAAGGCCGAATCATGTTTAAAAAGAGAAGTGA
ACAGACAATTAAGCAGTCTTGAGTCGATGTTCTGTTACGACAAGCCGATACCTGAGGAGA
TCATCGATGAGCCTGTTGGATTATCTATGTCCGAGAAAGAGATCGGGGATAATAACCGTT
GCACTTGTTGCGAAGCTAAAGGTGCATTTGCTTTGTGCCACTTGCTCTGGAACTGGTCTT
TACGTTGACTCCATTATGGAGAGCCAAGGCATCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGTTGT
GGTGGAAGTGGTAACATTATGTGTAAAAGCTGTGGCGGGCGTGGTCACGTAGGTCATTGA
TGACCCCCATGTTTCACTTTGTTTTTAGTCATGTTTTTGCCACTTTTATGTGTTGTGACT
TTTCTCTGATCTTATCGCAGAATCCTTCCTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTCT
TGTAATGATGTAATCCACAGTTTTGTA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4AK50TF 745 0 0
GG
GATTTCAAAATCTCGATCTCGTCGACGATGAAATCCGCTTTAGATTTTGCTTTACCGGCT
ACCTTCCCGGCGAAATCGAGTTTTGTTGGCGGAAGAGCTCGACGCGTGATTCCTTCTCCT
AGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGAGTGTGCTCTCTTCCTCCTCCTTCTTCCTCTCTCAAG
GCCGAATCATGTTTAAAAAGAGAAGTGAACAGACAATTAAGCAGTCTTGAGTCGATGTTC
TGTTACGACAAGCCGATACCTGAGGAGATCATCGATGAGCCTGTCGGATTATCTATGTCC
GAGAAAGAGATCGGGGATAATAACCGTTGCACTTGTTGCGAAGCTAAAGGTGCATT*GCT
TTGTGCCACTTGCCCTGGAACTGGTCTTTACGTTGACTCCATTATGGAGAGCCAAGGCGT
CATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGTTGTGGTGGAAGTGGTAACATTATGTGTAAAAGCTG
TGGCGGGCGTGGTCACGTAGGTCATTGATGACCCCCATGTTTCACTTTGTTTTTAGTCAT
GTTTTTGCCACTTTTATGTGTTGTGACTTT*CTCTGATCTTATCGCAGAATCCTTCCTTT
GTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTCTTGTAATGATGTAATCCACAGTTTTGTAAAAGG
CTCGATTCATCTTCTGTGGTTAAATATAAAATTGTATCCTAAACGGAAGTGACTAAATTA
GAAACTATCCCTCTCTTTTCTAT

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR4AK50JQ 714 0 0
AAATCCGCTTTAGATTTTGCTTTACCGGCTACCTTCCCGGCGAAATCGAGTTTTGTTGGC
GGAAGAGCTCGACGCGTGATTCCTTCTCCTAGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGAGTGTGC
TCTCTTCCTCCTCCTTCTTCCTCTCTCAAGGCCGAATCATGTTTAAAAAGAGAAGTGAAC
AGACAATTAAGCAGTCTTGAGTCGATGTTCTGTTACGACAAGCCGATACCTGAGGAGATC
ATCGATGAGCCTGTCGGATTATCTATGTCCGAGAAAGAGATCGGGGATAATAACCGTTGC
ACTTGTTGCGAAGCTAAAGGTGCATT*GCTTTGTGCCACTTGCCCTGGAACTGGTCTTTA
CGTTGACTCCATTATGGAGAGCCAAGGCGTCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGTTGTGG
TGGAAGTGGTAACATTATGTGTAAAAGCTGTGGCGGGCGTGGTCACGTAGGTCATTGATG
ACCCCCATGTTTCACTTTGTTTTTAGTCATGTTTTTGCCACTTTTATGTGTTGTGACTTT
*CTCTGATCTTATCGCAGAATCCTTCCTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTCTTG
TAATGATGTAATCCACAGTTTTGTAAAAGGCTCGATTCATCTTCTGTGGTTAAATATAAA
ATTGTATCCTAAACGGAAGTGACTAAATTAGAAACTATCCCTCTCTTTTCTATT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 5

CO CL1804Contig1 916 5 9 U
GGGTTCTTGTTCTTTATGGATCCTAAAATGAAAACAGAAGGTTGGGGGTGAATCATAAAT
CCAAAGGAGGTTTCATGGCCAAAGGTAAAGACGTTCGAGTAACAATTATTTTGGAATGTA
CCAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAATCGGCTGGAATTTCCAGATATATTACTC
AAAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTT
ATAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAA
ATTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATA
TAAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTCTTAATTCTATATAGAAACT
CTATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGA
GGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCT
TTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGT
TTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTA
ACTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTG
TTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAGTGAGTCGACCCCTAGAACTACT
AGCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAATTGAATAACTAATCTGAAGGAAT
TAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATCAAGAATCAAAATTTGATTGTTA
CGTCTGTGTCTGTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GT64JQ U 241
AF RR4E955TF U 1
AF RR4G120TF U 143
AF RR4G120JQ C 242
AF RR4E955JQ C 268
BS 1 360 RR4E955TF
BS 361 362 RR4G120TF
BS 363 399 RR4E955TF
BS 400 401 RR4G120TF
BS 402 624 RR4E955TF
BS 625 800 RR4G120TF
BS 801 801 RR4G120JQ
BS 802 833 RR4G120TF
BS 834 916 RR4G120JQ

RD RR4GT64JQ 215 0 0
A
TAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAA
TTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATAT
AAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTCTTAATTCTATATAGAAACTC
TATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTT

QA 2 215 2 215
DS 

RD RR4E955TF 624 0 0
GGGTTCTTGTTCTTTATGGATCCTAAAATGAAAACAGAAGGTTGGGGGTGAATCATAAAT
CCAAAGGAGGTTTCATGGCCAAAGGTAAAGACGTTCGAGTAACAATTATTTTGGAATGTA
CCAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAATCGGCTGGAATTTCCAGATATATTACTC
AAAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTT
ATAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAA
ATTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATA
**AACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATAT**TTAATTCTATATAGAAACT
CTATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGA
GGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCT
TTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGT
TTAATTAGTCGATTTATTAGTGAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4G120TF 691 0 0
G
AAGAAAGAATCGGCTGGAATTTCCAGATATATTACTCAAAAGAATCGGCATAACACTCCT
AGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTATAAACATACAATTCATGGGGAA
ATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAATTTTATTTTAAGAACAGGAATA
ATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATATAAACAAATAAAATAATAGAAAG
AAATAAAATCCTATATTCTTAATTCTATATAGAAACTCTATCCTATATAGAAATAGAAAT
CGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAA
TAAATCTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGAT
CCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGA
ACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTAACTTTAAAACAACAACGATTAAT
TACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAA
ACAATTTGAGAGAAGTGAGTCGACCCCTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAA*TA
GACTTATTCTTCAATTGAATAACTAATCTG

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4G120JQ 675 0 0
TAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAA
TTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATAT
AAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTCTTAATTCTATATAGAAACTC
TATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGAG
GTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATTTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCTT
TTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGTT
TAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTAA
CTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGT
TACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAGTGAGTCGACCCCTAGAACTACTA
GCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAATTGAATAACTAATCTGAAGGAATT
AAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATCAAGAATCAAAATTTGATTGTTAC
GTCTGTGTCTGTCAT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4E955JQ 647 0 0
AGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAATTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGA
GAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATA**AACAAATAAAATAATAGAAAGAAAT
AAAATCCTATAT**TTAATTCTATATAGAAACTCTATCCTATATAGAAATAGAAATCGTT
TTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAA
TTTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAA
TCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAA
GGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTAACTTTAAAACAACAACGATTAATTACT
ATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAA
TTTGAGAGAAGTGAGTCGACCCCTAGAACTACTAGCCTTGGAACCAGAAAAAAATAGACT
TATTCTTCAATTGAATAACTAATCTGAAGGAATTAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGA
CAAATCCAATCAAGAATCAAAATTTGATTGTTACGTCTGTGTCTGTC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 2 4

CO CL1805Contig1 570 2 1 U
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ACGAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTTCGTTGTCCACTTGTCTGAGAAAGAGTACTTT
GCAGTGCCCAAAAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTTTGAACTCTATGACAATGTT
CAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCCATTTCAAC
ATGATTAGTTCGTGATTCTACTTTACTTGGTGTTCAAGAACAAGAAACATGTTTGATGGT
AAGTTACTAAGGCAGGTTTCAGAGATGATGCGTTTGGGTTTTTTACATTATAGACTTGAT
GATCTGTTTATGAAGAACCGGTTCATTCAAGTTTCAGCACAAACAGATTATTGGATCTCG
TTTCTATCGAAAAGCATTCGTTATCATATGACTAACGGTGGTCTTGTCTAACCGTGGAAC
ATGTATTCACTCATTGTTAAATGATATTTCCCTTCTGGTATCTATGACAGAAACAAGGCC
ATGTTAAAAGAAACTTTTTTTATTGGATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BE92JQ C 1
AF RR4BE92TF U 1
BS 1 570 RR4BE92TF

RD RR4BE92JQ 570 0 0
GCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTACCCTTACTGCCCTCCTCACATC
ACGAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTTTTCGTTGTCCACTTGTCTGAGAAAGAGTACTTT
GCAGTGCCCAAAAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTTTGAACTCTATGACAATGTT
CAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCCATTTCAAC
ATGATTAGTTCGTGATTCTACTTTACTTGGTGTTCAAGAACAAGAAACATGTTTGATGGT
AAGTTACTAAGGCAGGTTTCAGAGATGATGCGTTTGGGTTTTTTACATTATAGACTTGAT
GATCTGTTTATGAAGAACCGGTTCATTCAAGTTTCAGCACAAACAGATTATTGGATCTCG
TTTCTATCGAAAAGCATTCGTTATCATATGACTAACGGTGGTCTTGTCTAACCGTGGAAC
ATGTATTCACTCATTGTTAAATGATATTTCCCTTCTGGTATCTATGACAGAAACAAGGCC
ATGTTAAAAGAAACTTTTTTTATTGGATCG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4BE92TF 570 0 0
GCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTACCCTTACTGCCCTCCTCACATC
ACGAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTTCGTTGTCCACTTGTCTGAGAAAGAGTACTTT
GCAGTGCCCAAAAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTTTGAACTCTATGACAATGTT
CAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCCATTTCAAC
ATGATTAGTTCGTGATTCTACTTTACTTGGTGTTCAAGAACAAGAAACATGTTTGATGGT
AAGTTACTAAGGCAGGTTTCAGAGATGATGCGTTTGGGTTTTTTACATTATAGACTTGAT
GATCTGTTTATGAAGAACCGGTTCATTCAAGTTTCAGCACAAACAGATTATTGGATCTCG
TTTCTATCGAAAAGCATTCGTTATCATATGACTAACGGTGGTCTTGTCTAACCGTGGAAC
ATGTATTCACTCATTGTTAAATGATATTTCCCTTCTGGTATCTATGACAGAAACAAGGCC
ATGTTAAAAGAAACTTTTTTTATTGGATCG

QA 1 570 1 570
DS 



CO CL1805Contig2 746 2 7 U
GGGTAGTGGATATACGGTGTCGTATTAAACTCTCCGTCGAGATTACTCCTCTGTTTGCCG
TCGCCGCCGATATCAACAGTACAGAGAGAGAGAGATGGCGATGTCTCAGGTGGTGAACAC
GTACCCTCTCTCGAACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTGGAGAAGGACACCTC
CGTCGCCGACCGACTCGCTCGTATGAAAGTCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAG
CGTTGAAGGGATTCTTCTGGTACAAGAACACAACCATCCTCATATACTTCTCCTGCAAAT
TGGTAACACATTCTGCAAACTTCCAGGTGGACGCCTAAAGCCTGGAGAAAATGAAGTCGA
AGGACTGAAGAGAAAGTTGACCAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGACTGGTTTTGTACCCGA
CTGGAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTA
CCCGTATTGCCCTCCTCACATCACCAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCA
CTTGTCTGAGAAAGAGTACTTTGCAGTGCCCAAAAACTTGAAACTCTTGGCCGTCCCTTT
GTTTGAACTCTATGACAATGTTCAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCTCAACA
GCTATCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTCGTGATTCTACTCACTGTTCAAGAATAA
GAAACCTGTTAGATGATCAAGGTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CI60TF U 73
AF RR4G184TF U 1
BS 1 90 RR4G184TF
BS 91 91 RR4CI60TF
BS 92 147 RR4G184TF
BS 148 148 RR4CI60TF
BS 149 403 RR4G184TF
BS 404 404 RR4CI60TF
BS 405 746 RR4G184TF

RD RR4CI60TF 639 0 0
GG
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ACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTGGAGAAGGACACCTCCGTCGCCGACCGAC
TCGCTCGTATGAAAGTCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAGCGTTGAAGGGATTC
TTCTGGTACAAGAACACAACCATCCTCATATACTTCTCCTGCAAATTGGTAACACATTCT
GCAAACTTCCAGGTGGACGCCTAAAGCCTGGAGAAAATGAAGTCGAAGGACTGAAGAGAA
AGTTGACCAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGACTGGTTTTGTACCCGACTGGAAGGTAGGAG
AATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTACCCGTATTGCCCTC
CTCACATCACCAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTTGTCTGAGAAAG
AGTACTTTGCAGTGCCCAAAAACTTGAAACTCTTGGCCGTCCCTTTGTTTGAACTCTATG
ACAATGTTCAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCC
ATTTCAACATGATTAGTTCGTGATTCTACT
CACTGTT

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR4G184TF 746 0 0
GGGTAGTGGATATACGGTGTCGTATTAAACTCTCCGTCGAGATTACTCCTCTGTTTGCCG
TCGCCGCCGATATCAACAGTACAGAGAGAGGGAGATGGCGATGTCTCAGGTGGTGAACAC
GTACCCTCTCTCGAACTACAGCTTCGGGACTAAAGAACCGAAGCTGGAGAAGGACACCTC
CGTCGCCGACCGACTCGCTCGTATGAAAGTCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAG
CGTTGAAGGGATTCTTCTGGTACAAGAACACAACCATCCTCATATACTTCTCCTGCAAAT
TGGTAACACATTCTGCAAACTTCCAGGTGGACGCCTAAAGCCTGGAGAAAATGAAGTCGA
AGGACTGAAGAGAAAGTTGACCAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTTTTGTACCCGA
CTGGAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTA
CCCGTATTGCCCTCCTCACATCACCAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCA
CTTGTCTGAGAAAGAGTACTTTGCAGTGCCCAAAAACTTGAAACTCTTGGCCGTCCCTTT
GTTTGAACTCTATGACAATGTTCAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCTCAACA
GCTATCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTCGTGATTCTACTCACTGTTCAAGAATAA
GAAACCTGTTAGATGATCAAGGTCAA

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 5

CO CL1806Contig1 566 5 10 U
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ATTCCTCTGTGTTTGGTTTAGTTTCCAATAAGAATATATCTAGTGATGCTGACAGTACCT
TCAAATCTCAAACTGCTTACACTCACTATGGCAAAGACATGGGTAAGGAATATATTATGT
GTACAGAAGCTAATCTCGAACTTCCGTGGAAGCTTTCTTGTACAAGAGAATCTAAAGATG
TTGTTACAAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATA
AACACGGAAATTGCGGTGCATCAACCACCATGAAGGTTGTCAAAAAGAATTGTCTTGGAA
AACACATGTGTGTGTTTATGGTTACCGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAAAACGG
ATGTGAAGTTCTTTGTTCAATACACTTGTACAAAAGCATAGCCTTAGGTTTCTTATTTGC
TTCTTAATTACTAGTCTTTT*TTTTTGCTACTCCCTCAATTTTATAATATAAATCGTTTA
AGAAAATAATTAATTTCTTATATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4H053JQ C 1
AF RR4H053TF U 1
AF RR4G161TF U 8
AF RR4CB92TF U 8
AF RR4CG41TF U 8
BS 1 7 RR4H053JQ
BS 8 147 RR4H053TF
BS 148 148 RR4CB92TF
BS 149 182 RR4H053TF
BS 183 183 RR4CB92TF
BS 184 478 RR4H053TF
BS 479 479 RR4CB92TF
BS 480 539 RR4H053TF
BS 540 564 RR4CB92TF
BS 565 566 RR4CG41TF

RD RR4H053JQ 539 0 0
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ATTCCTCTGTGTTTGGTTTAGTTTCCAATAAGAATATATCTAGTGATGCTGACAGTACCT
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GTGCAGAAGCTAATCTCGAACTTCCGTGGAAGCTTTCTTGTACAAGAGAATCTAAAGATG
TTGTTACAAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATA
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AACACATGTGTGTGTTTATGGTTACCGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAAAACGG
ATGTGAAGTTCTTTGTTCAATACACTTGTACAAAAGCATAGCCTTAGGTTTCTTATTTTC
TTCTTAATTACTAGTCTTTT*TTTTTGCTACTCCCTCAATTTTATAATATAAATCGTTT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4H053TF 539 0 0
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AAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATAAACACGG
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GTGTGTGTTTATGGTTACCGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAAAACGGATGTGAA
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TTACTAGTCTTTT*TTTTTGCTACTCCCTCAATTTTATAATATAAATCGTTT

QA 8 539 8 539
DS 

RD RR4G161TF 539 0 0
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TGTGTTTGGTTTAGTTTCCAATAAGAATATATCTAGTGATGCTGACAGTACCTTCAAATC
TCAAACTGCTTACACTCACTATGGCAAAGACATGGGTAAGGAATATATTATGTGTACAGA
AGCTAATCTCGAACTTCCGTGGAAGCTTTCTTGTACAAGAGAATCTAAAGATGTTGTTAC
AAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATAAACACGG
AAATTGCGGTGCATCAACCACCATGAAGGTTGTCAAAAAGAATTGTCTTGGAAAACACAT
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TTACTAGTCTTTTCTTTTTGCTACTCCCTCAATTTTATAATATAAATCGTTT
AAGAAAA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4CB92TF 557 0 0
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AAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATAAACACGG
AAATTGCGGTGCATCAACCACCATGAAGGTTGTCAAAAAGAATCGTCTTGGAAAACACAT
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AATTAATTTCTTATATT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4CG41TF 559 0 0
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TCAAACTGCTTACACTCACTATGGCAAAGACATGGGTAAGGAATATATTATGTGTACAGA
AGCTAATCTCGAACTTCCGTGGAAGCTTTCTTGTACAAGAGAATCTAAAGATGTTGTTAC
AAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATAAACACGG
AAATTGCGGTGCATCAACCACCATGAAGGTTGTCAAAAAGAATCGTCTTGGAAAACACAT
GTGTGTGTTTATGGTTACCGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAAAACGGATGTGAA
GTTCTTTGTTCAATACACTTGTACAAAAGCATAGCCTTAGGTTTCTTATTTGCTTCTTAA
TTACTAGTCTTTT*TTTTTGCTACTCCCTCAATTTTATAATATAAATCGTTTAAGAAA*T
AATTAATTTCTTATATTTT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 2 5

CO CL1807Contig1 832 3 43 U
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AAAAAATGATGAAGTTTTGCTTCATGACCTCTCATGGCTATTCAATCCCTGGTGGGCTTG
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TGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAAGAGAAAGTGATGGAGTTTC
TACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAAGAAAGAGGGTTTGACATGTCTAAGCTATCAGAAC
TGATGGAGCTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTGCTTCCATACGGTGCTTCCTCTG
TTCTTTACTTGAATCAAGATTTGGAGAAACCGGTTTTGGATCTCGTTAGGGATATGATGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E980TF U 1
AF RR4E062TF U 105
AF RR4FH37TF U 155
BS 1 223 RR4E980TF
BS 224 224 RR4E062TF
BS 225 268 RR4E980TF
BS 269 269 RR4E062TF
BS 270 271 RR4E980TF
BS 272 272 RR4E062TF
BS 273 292 RR4E980TF
BS 293 293 RR4E062TF
BS 294 295 RR4E980TF
BS 296 296 RR4E062TF
BS 297 323 RR4E980TF
BS 324 324 RR4E062TF
BS 325 330 RR4E980TF
BS 331 331 RR4E062TF
BS 332 362 RR4E980TF
BS 363 363 RR4E062TF
BS 364 397 RR4E980TF
BS 398 398 RR4E062TF
BS 399 407 RR4E980TF
BS 408 408 RR4E062TF
BS 409 415 RR4E980TF
BS 416 416 RR4E062TF
BS 417 520 RR4E980TF
BS 521 521 RR4E062TF
BS 522 554 RR4E980TF
BS 555 555 RR4E062TF
BS 556 571 RR4E980TF
BS 572 572 RR4E062TF
BS 573 619 RR4E980TF
BS 620 620 RR4E062TF
BS 621 622 RR4E980TF
BS 623 623 RR4E062TF
BS 624 667 RR4E980TF
BS 668 668 RR4E062TF
BS 669 684 RR4E980TF
BS 685 685 RR4E062TF
BS 686 690 RR4E980TF
BS 691 691 RR4E062TF
BS 692 700 RR4E980TF
BS 701 701 RR4E062TF
BS 702 725 RR4E980TF
BS 726 792 RR4E062TF
BS 793 832 RR4FH37TF

RD RR4E980TF 727 0 0
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GGAACAGAGTTTTCTTCCAAAGGAATTGAATTTTGGTTTCTCTTCAATTATTATCAGAAA
AAAAAATGATGAAGTTTTGCTTCATGACCTCTCATGGCTATTCAATCCCTGGTGGGCTTG
GTCTTCCTCATGAGCTCAGTAAGGTTGAGATCATCAAGAGTAACCGGTCTTATCTGGTGA
ACCCTGGAGCAAAACAAGAGATCATACCTGCGAGCTCCTTCAACCTGAATCCAGACCACT
TGGAACCGTGGAAACCGGTTTCTCCACTGAACAAATCTAGCCAATTCGTGGAGCTTGACT
CACCCATGATGAGACCTCTGCTCATGGATGTTCATGGAAAGGACAAGGCACCAGAGTCTC
TGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAAGAGAAAGTGATGGAGTTTC
TACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAAGAAAGAGGGTTTGATATGTCTAAGCTATCAGAAC
TGATGGAGCTAGAGTCTATGAAATCAAGTTCCCAGCTGCTTCCATACGGTGCTTCCTCTG
TTCTTTACTTGAATCAAGAATTAGAGAAACCGGTTTTGGATCTCGTTAGGGATATGATGG
AGAATCCAGAGTTCTCTCTGAAAC*AAATGCTCACCTTCTCTTCTCCTCAAGTAGCAATG
CTGAG
CT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4E062TF 688 0 0
CAATTATTATCAGAAAAAAAAATGATGAAGTTTTGCTTCATGACCTCTCATGGCTATTCA
ATCCCTGGTGGGCTTGGTCTTCCTCATGAGCTCAGTAAGGTTGAGATCATCAAGAGTAAT
CGGTCTTATCTGGTGAACCCTGGAGCAAAACAAGAGATCATACCAGCAAGCTCCTTCAAC
CTGAATCCTGAACACTTGGAACCGTGGAAACCGGTTTCTTCACTGAGCAAATCTAGCCAA
TTCGTGGAGCTTGACTCATCCATGATGAGACCTCTGCTCATGGATGTTCATGGTAAGGAC
AAGCCACCAGAATCTCTGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAAGAG
AAAGTGATGGAGTTTCTACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAAGAAAGAGGGTTTGACATG
TCTAAGCTATCAGAACTGATGGAGCTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTGCTTCCA
TACGGTGCTTCCTCTGTTCTTTACTTGAATCAAGATTTGGAGAAACCGGTTTTGGATCTC
GTTAGGGATATGATGGAGAATCCGGAGTTCTCTCTGAAACCAAATGATCACCTTCTGTTC
TCCTCAAGTAGCAATGCTGAGTTGAATGATATACTTTCAGTCGCTTCTGAGTACAGTTTG
TCGAGAGATTCAACAAAATGGAGACAGC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FH37TF 678 0 0
AGGG
TATTCAATCCCTGGTGGGCTTGGTCTTCCTCATGAGCTCAGTAAGGTTGAGATCATCAAG
AGTAATCGGTCTTATCTGGTGAACCCTGGAGCAAAACAAGAGATCATACCAGCAAGCTCC
TTCAACCTGAATCCTGAACACTTGGAACCGTGGAAACCGGTTTCTTCACTGAGCAAATCT
AGCCAATTCGTGGAGCTCGACTCATCCATGATGAGACCTCTGCTCATGGATGTTCATGGT
AAGGACAAGCCACCAGAATCTCTGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGA
CAAGAGAAAGTGATG*AGTTTCTACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAAGAAAGAGGGTTT
GACATGTCTAAGCTATCAGAACTGATGGAGCTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTG
CTTCCATACGGTGCTTCCTCTGTTCTTTACTTGAATCAAGATTTGGAGAAACCGGTTTTG
GATCTCGTTAGGGATATGATGGAGAATCCGGAGTTCTCTCTGAAACCAAATGATCACCTT
CTGTTCTCCTCAAGTAGCAATGCTGAGTTGAATGATATACTTTCAGTCGCTTCTGAGTAC
AGTTTGTCGAGAGATTCAACAAAATGGAGACAGCTCTCACCGCTTATCCCACACTTCCAG
AGGTTTGGCAGTGA

QA 5 678 5 678
DS 



CO CL1807Contig2 900 2 8 U
CTGACAAAACATTATTTCTCTCTGCAAAATTCTTAGACCTCTTATCTTAGGTTATACAAG
CCACAAAATCATCTTCACATTTATATGCTCAGTACCAAACAAGTTTTAGTCATTTACAAA
CGACCTTTCAAGCTTTCCATTGAGTAGTAAAATCAAAGATTCTGAAACCTTTCACCGCTG
AGTCCTCAACATGCAAACCTAAGTGCAAACACAGCAAGTACAGTGGCAGCTCTGAAGTAT
ACCTCCTTGATACTCCTCTCTACATTGTTCACGATCTCATCCCCCTTCAAACTTGAGCAC
GGCTTGTTTGCTTTCCTATTGACGTGAACAATCACTTCCCTCAGTCTATTCACAGCCCAA
GACAGTATCACCAAACTGAAACCAAGTCCGGTGTCGAAAAACTTGTTTGCACAAAAGGGA
ACACCCCTTGAAGCAAGGCTGCAGACAACAGAGAAGAGCACAGCCATTCCTGTTCCAGCA
GCGGTGACTGAAAACTGAGTAAGAAGCTCTGAGAGCTCTCCGCATGATCTCTGTAAAGTG
AGTATTGTAGTCTGTTTATTCTGATGATCATTGCCTATCATTAAAGATAGAAGGCTCTCG
TAAGCGTGGAGATGGTTTCTTTTGTAGAGGTCTCTCTCTTTAGCTTTACGCTTTGTGTTT
TGTTTCTTTGGTGAAGGTTTGAGCTTGGTCTTCTCAGGACTCTTCAAAGGTGCCAATACT
GTAACTGGTGTTAATACTTCACTGCCAAACCTCTGGAAGTGTGGGATAAGCGGTGAGAGC
TGTCTCCATTTTGTTGAATCTCTCGACAAACTGTACTCAGAAGCGACTGAAAGTATATCA
TTCAACTCAGCATTGCTACTTGAGAGAACAAAGTGATCATTTGGTTTCAGAGAGACTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH37JQ U 1
AF RR4E062JQ U 59
BS 1 299 RR4FH37JQ
BS 300 300 RR4E062JQ
BS 301 454 RR4FH37JQ
BS 455 455 RR4E062JQ
BS 456 557 RR4FH37JQ
BS 558 558 RR4E062JQ
BS 559 809 RR4FH37JQ
BS 810 900 RR4E062JQ

RD RR4FH37JQ 814 0 0
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GGCTTGTTTGCTTTCCTATTGACGTGAACAATCACTTCCCTCAGTCTATTCACAGCCCAA
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TAAGCGTGGAGATGGTTTCTTTTGTAGAGGTCTCTCTCTTTAGCTTTACGCTTTGTGTTT
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GTAACTGGTGTTAATACTTCACTGCCAAACCTCTGGAAGTGTGGGATAAGCGGTGAGAGC
TGTCTCCATTTTGTTGAATCTCTCGACAA
CTGTA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4E062JQ 842 0 0
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AACGACCTTTCAAGCTTTCCATTGAGTAGTAAAATCAGAGATTCTGAAACCTTTCACCGC
TGAGTCCTCAACATGCAAACCTAAGTGCAAACACAGCAAGTACAGTGGCAGCTCTGAAGT
ATACCTCCTTGATACTCCTCTCTACATTGTTCACGATCTCATCCCCCTTCAAACTTGAGC
ACGGCTTGTTTGCTTTCCTATTGACGTGAACAATCACTTCCCTCAGTCTATTCACAGCCC
AAGACAGTATCACCAAACTGAAACCAAGTCCGGTGTCGAAGAACTTGTTTGCACAAAAGG
GAACACCCCTTGAAGCAAGGCTGCAGACAACAGAGAAGAGCACAGCCATTCCTGTTCCAG
CAGCGGTGACTGAAAACTGAGTAAGAAGCTCTGAGAGCTCTCCGCATGATCTCTGTAAAG
TGAGTATTGTAGTCTGTTTATTCTGATGATCATTGCCTATCATTAAAGATAGAAGGCTCT
CGTAAGCGTGGAGATGGTTTCTTTTGTAGAGGTCTCTCTCTTTAGCTTTACGCTTTGTGT
TTTGTTTCTTTGGTGAAGGTTTGAGCTTGGTCTTCTCAGGACTCTTCAAAGGTGCCAATA
CTGTAGCTGGTGTTAATACTTCACTGCCAAACCTCTGGAAGTGTGGGATAAGCGGTGAGA
GCTGTCTCCATTTTGTTGAATCTCTCGACAAACTGTACTCAGAAGCGACTGAAAGTATAT
CATTCAACTCAGCATTGCTACTTGAGAGAACAAAGTGATCATTTGGTTTCAGAGAGACTC
CG

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 3

CO CL1808Contig1 857 3 4 U
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ACAATTTGGGTACTGCTCACTAAAACAAACATTACATGAAACACAATACTTGGAAGCAAC
ATAGAACAAAAAAGAAGAAGAGATTGGAATCTCCATTCTGTATTTACAAATTCTGGTTCT
CAATCTGAATAATCAAACAGTCCTTTGTTGAAGGAAAATAACCTCACCAAGCGCTTTGCC
ACCACCCGGGATCTCTAGTTCATGGCAATCTGAATTGTAAACATGTTCTCTTTGCTTCTG
ATGTATATCATAGCTATACTATCACTGCTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTA
GATATTCTCAAAGGCTGTGTAAGTCTCTTCTCTCATCTTGGCTCCAGTTATAACAATCTT
CCCAGAAACAAAAATAAGTAGCACAATCTTTGGTTGTTTCATCCTATATATCAGCCCTGG
GAATAGTTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCACTGCGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGCCT
AATGGGGAATTTGACATCACAAGACCCTACAATGTTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTT
TGCAGGGAAGCCAAGCTTTTGAACAATCCGAGCGTACTTTCTCGCAGCAAGCTTTGAAAA
ATGTTCACTCTTGGCTCCGGTACACACCATTTCCCAGAGGCAAAAATCAAAGCTGTAGTC
TTTGGCTCTCTTATCCTCATGATTACTGCAGCAAAACGCTTGGGGTTATATTCAGCATTA
CGAGCCTGCAAAGCTATGGATTTAAGATCAAGCTTGCAGTCTAAGTTCACTGTCGAGACA
ATGTTTTGAAGAGTTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU29JQ U 1
AF RR4CG36JQ U 1
AF RR4CG36TF C 208
BS 1 755 RR4CG36JQ
BS 756 756 RR4CG36TF
BS 757 804 RR4CG36JQ
BS 805 857 RR4CG36TF

RD RR4CU29JQ 434 0 0
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ATAGAACAAAAAAGAAGAAGAGATTGGAATCTCCATTCTGTATTTACAAATTCTGGTTCT
CAATCTGAATAATCAAACAGTCCTTTGTTGAAGGAAAATAACCTCACCAAGCGCTTTGCC
ACCACCCGGGATCTCTAGTTCATGGCAATCTGAATTGTAAACATGTTCTCTTTGCTTCTG
ATGTATATCATAGCTATACTATCACTGCTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTA
GATATTCTCAAAGGCTGTGTAAGTCTCTTCTCTCATCTTGGCTCCAGTTATAACAATCTT
CCCAGAAACAAAAA

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR4CG36JQ 804 0 0
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ACAATTTGGGTACTGCTCACTAAAACAAACATTACATGAAACACAATACTTGGAAGCAAC
ATAGAACAAAAAAGAAGAAGAGATTGGAATCTCCATTCTGTATTTACAAATTCTGGTTCT
CAATCTGAATAATCAAACAGTCCTTTGTTGAAGGAAAATAACCTCACCAAGCGCTTTGCC
ACCACCCGGGATCTCTAGTTCATGGCAATCTGAATTGTAAACATGTTCTCTTTGCTTCTG
ATGTATATCATAGCTATACTATCACTGCTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTA
GATATTCTCAAAGGCTGTGTAAGTCTCTTCTCTCATCTTGGCTCCAGTTATAACAATCTT
CCCAGAAACAAAAATAAGTAGCACAATCTTTGGTTGTTTCATCCTATATATCAGCCCTGG
GAATAGTTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCACTGCGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGCCT
AATGGGGAATTTGACATCACAAGACCCTACAATGTTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTT
TGCAGGGAAGCCAAGCTTTTGAACAATCCGAGCGTACTTTCTCGCAGCAAGCTTTGAAAA
ATGTTCACTCTTGGCTCCGGTACACACCATTTCCCAGAGGCAAAAATCAAAGCTGTAGTC
TTTGGCTCTCTTATCCTCATGATTACTGCAGCAAA*CGCTTGGGGTTATATTCAGCATTA
CGAGCCTGCAAAGCTATGGATTTA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4CG36TF 650 0 0
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ATCTGAATTGTAAACATGTTCTCTTTGCTTCTGATGTATATCATAGCTATACTATCACTG
CTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTAGATATTCTCAAAGGCTGTGTAAGTCTC
TTCTCTCATCTTGGCTCCAGTTATAACAATCTTCCCAGAGACAAAAATAAGTAGCACAAT
CTTTGGTTGTTTCATCCTATATATCAGCCCTGGGAATAGTTCAGGCTCGTAACTTGAGAA
AGCACTGCGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGCCTAATGGGGAATTTGACATCACAAGACCC
TACAATGTTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTTTGCAGGGAAGCCAAGCTTTTGAACAAT
CCGAGCGTACTTTCTCGCAGCAAGCTTTGAAAAATGTTCACTCTTGGCTCCGGTACACAC
CATTTCCCAGAGGCAAAAATCAAAGCTGTAGTCTTTGGCTCTCTTATCCTCATGATTACT
GCAGCAAAACGCTTGGGGTTATATTCAGCATTACGAGCCTGCAAAGCTATGGATTTAAGA
TCAAGCTTGCAGTCTAAGTTCACTGTCGAGACAATGTTTTGAAGAGTTGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 2 5

CO CL1809Contig1 510 2 2 U
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GCCCACGGGGGAAGTAAGTCTTCTTCTGCTATTACACCTCCTAAGGGTGGATTTCTTAAC
TACTGTTGGAATCCTGGCAAAAAAGATTGTCAAATGAAGCCCAACCCGGTGACCATTGGA
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ATACATTTATCGTGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTATATA
TATCACAATTTATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTTAATATATTTCATACAATAAA
ATGTTCTTAATCTATATTTTATGCAATTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AW11JQ C 1
AF RR4AW11TF U 1
BS 1 2 RR4AW11JQ
BS 3 510 RR4AW11TF

RD RR4AW11JQ 510 0 0
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GTTTTCTTTCTAAAAGTCGACTCGGCAGTCCTTCGACTCGAACCACCCAAACACATCCCA
GCCCACGGGGGAAGTAAGTCTTCTTCTGCTATTACACCTCCTAAGGGTGGATTTCTTAAC
TACTGTTGGAATCCTGGCAAAAAAGATTGTCAAATGAAGCCCAACCCGGTGACCATTGGA
GATAATAAAAACTGCTGGTGCACGAAGTAGAATATGGTGAATAAATATTTTGACTATGAC
ATACATTTATCGTGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTATATA
TATCACAATTTATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTTAATATATTTCATACAATAAA
ATGTTCTTAATCTATATTTTATGCAATTCC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4AW11TF 510 0 0
GG
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TTTCTTTCTAAAAGTCGACTCGGCAGTCCTTCGACTCGAACCACCCAAACACATCCCAGC
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TAATAAAAACTGCTGGTGCACGAAGTAGAATATGGTGAATAAATATTTTGACTATGACAT
ACATTTATCGTGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTATATATA
TCACAATTTATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTTAATATATTTCATACAATAAAAT
GTTCTTAATCTATATTTTATGCAATTCC

QA 3 510 3 510
DS 



CO CL1809Contig2 557 3 2 U
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ACTGTTTTCTTTCTAAAAGTCGACTCGGCAGTCCTTCGACTCGAACCACCCAAACACATC
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AACTACTGTTGGAATCCTGGCAAAAAAGATTGTCAAATGAAGCCCAACCCGGTGACCATT
GGAGATAATAAAAACTGCTGGTGCACGAAGTAGGATATGGTGAATAAATATTTTGACTAT
GACATACATTGATCATGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTAT
ATATATCTAAATTTATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTAATATATTTCATACAATG
AAATGTTCTTAATCTATATTATATGCAATTCCAAGTTATATATTTTGAAGTATAAATTAA
AAGTGTGTTTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4CZ05TF U 1
AF RR4CR69TF U 2
AF RR4CR69JQ C 130
BS 1 555 RR4CZ05TF
BS 556 557 RR4CR69JQ

RD RR4CZ05TF 555 0 0
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ATGAATAGCGGATGGAGAGGAATTATAGCGAGTTGTCTCTTAGCACTTTTGATTTTAACC
ACTGTTTTCTTTCTAAAAGTCGACTCGGCAGTCCTTCGACTCGAACCACCCAAACACATC
CCAGCCCACGGGGGAAGTCAGTCTTCTTCTGCTATTACACCTCCTAAGGGTGGATTTCTT
AACTACTGTTGGAATCCTGGCAAAAAAGATTGTCAAATGAAGCCCAACCCGGTGACCATT
GGAGATAATAAAAACTGCTGGTGCACGAAGTAGGATATGGTGAATAAATATTTTGACTAT
GACATACATTGATCATGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTAT
ATATATCTAAATTTATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTAATATATTTCATACAATG
AAATGTTCTTAATCTATATTATATGCAATTCCAAGTTATATATTTTGAAGTATAAATTAA
AAGTGTGTTTTTTGG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4CR69TF 556 0 0
GGAA
ACAAAAAAAAATTAGTAATAAAATTATTTTGTAATTATTTTTGGAAGACAACATAATGAA
TAGCGGATGGAGAGGAATTATAGCGAGTTGTCTCTTAGCACTTTTGATTTTAACCACTGT
TTTCTTTCTAAAAGTCGACTCGGCAGTCCTTCGACTCGAACCACCCAAACACATCCCAGC
CCACGGGGGAAGTCAGTCTTCTTCTGCTATTACACCTCCTAAGGGTGGATTTCTTAACTA
CTGTTGGAATCCTGGCAAAAAAGATTGTCAAATGAAGCCCAACCCGGTGACCATTGGAGA
TAATAAAAACTGCTGGTGCACGAAGTAGGATATGGTGAATAAATATTTTGACTATGACAT
ACATTGATCATGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTATATATA
TCTAAATTTATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTAATATATTTCATACAATGAAATG
TTCTTAATCTATATTATATGCAATTCCAAGTTATATATTTTGAAGTATAAATTAAAAGTG
TGTTTTTTGG
TT

QA 5 554 5 554
DS 

RD RR4CR69JQ 428 0 0
TTTT
TAAAAGTCGACTCGGCAGTCCTTCGACTCGAACCACCCAAACACATCCCAGCCCACGGGG
GAAGTCAGTCTTTTTCTGCTATTACACCTCCTAAGGGTGGATTTTTTAACTACTGTTGGA
ATCCTGGCAAAAAAGATTGTCAAATGAAGCCCAACCCGGTGACCATTGGAGATAATAAAA
ACTGCTGGTGCACGAAGTAGGATATGGTGAATAAATATTTTGATTATGACATACATTGAT
CATGTAGCTTGTAGTAATAAATTCCACAAGGAAACTTTTATTATTATATATATCTAAATT
TATTTGTTAAAACTAATGTTTTAGTTTTTAATATATTTCATACAATGAAATGTTCTTAAT
CTATATTATATGCAATTCCAAGTTATATATTTTGAAGTATAAATTAAAAGTGTGTTTTTT
GGTT

QA 5 428 5 428
DS 



AS 1 5

CO CL1810Contig1 786 5 19 U
CAATCAAAACGAAGTGTTTATTTTACGCATGTGACTACGTAAACGGAAGTGATATTAACT
CAAATGTATACAATTCATTTATTATATCGAGAAATCCAAAACGAAAATAGCGAGGTTGGG
TTTTATTTAGTGCTTTTGCGATGTAGGCATGGCAAGAGATACTGAAGTTGGAATGTCCTT
CCACTGTTGTGTCACAGTCTTGATCTGAGTGAAAAAGTCTACTCCAGCTTTGCCATAAAA
ATTCAGGTCTCCTGCAAATGAAGCTTTGTTCCCAGTAAAGGAGAAGAACGGTAACGGAAC
CGGGATTGGAACGTTTATACCAATCTGTCCTGCTTCTATTTCCATCTGGAACTTTCTTGC
CGCAGCGCCCGATGCAGTGAAAATTGCAGCACCGTTTCCATACTTGTTTCTATTCAGTAT
GTCTATGGCTTCATCAAAGCTGCTTGCCTCCATGCATACAAGAACGGGGCCAAATATTTC
TTCCTTGTAACACTCCATGTCTGGGGTAACACCAGATAAAATGGTAGGACCGATAAAATT
CCCTTTCTCGTATCCAGGAACCACAATATTTCTTCCGTCAAGCAACAGTTTAGCACCATC
GTCCACACCAGACTGAATCAAGCGACATATCCGTTCTTTGGCCTGTTTACTAATCACAGG
ACCCAGGTCTGCATCTGGCTCCGTTCCACATGTGACTATAAGGGCTTTAGCTCGCTCGAC
AAGTTTATCCTCCCATGATTTTGAACTGCCAAAAAGACCACTGTACTCAGAGCCATGCAT
CTCTGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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C

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C

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G
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TCTACTCCAGCTTTGCCATAGAAATTCAGGTCTCCTGCAAATGAAGCTTTGTTCCCAGTA
AAGGAGAAGAACGGTAACGGAACCGGGATTGGAACGTTTATACCAATCTGTCCTGCTTCT
ATTTCCATCTGGAACTTTCTTGCCGCAGCGCCCGATGCAGTGAAAATTGCAGCACCGTTT
CCATACTTGTTTCTATTCAGTATGTCTATGGCTTCATCAAAGCTGCTTGCCTCCATGCAT
ACAAGAACGGGGCCAAATATTTCTTCCTTGTAACACTCCATGTCTGGGGTAACACCAGAT
AAAATGGTAGGACCGATAAAATTCCCTTTCTCGTATCCAGGAACCACAATATTTCTTCCG
TCAAGCAACAGTTTAGCACCATCGTCCACACCAGACTGAATCAAGCGACATATCCGTTCT
TTGGCCTGTTTACTAATCACAGGACCC
C

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G
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TTCCTTGTAACACTCCATGTCTGGGGTAACACCAGATAAAATGGTAGGACCGATAAAATT
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CTCTGT

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DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A377JQD U 1
AF RR4A377JQ U 1
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AGCCGTTCTTTCACTTCCAAAACTAG
CTTGTTGGCATTTTGAGAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4A377JQ 841 0 0
CGGCTTAATGTTTCCCTTTAATCCATAGTTTTTATAAATCTATGTTTGGGAGATACAACA
ACAGAAGATAATAGTGTTTTAAAGATCTCCTTTAGCTTCTGAAGTTTGATGGTATTGTTT
CCTCAGTGAAGTACTCCTTTCTCACAGTCTCTACCGAACAAAACTTGACCAGAGAGGCAT
ATGACTTAACCAGCGGTTTGGTGAACTGCCAAATAGGCTGGAAAATGAATGGAGCATCTA
CAAAGAGAACTTCATCCAAACGGCTTGGATAGTAATAGTAAAACACATCAAACAGAAAGG
TCAAGAATTTGAGATCTGCGTTCCGAGAACCGAATCCACGGAGATCAAATATCCC*AAGT
ATCTTGTGTCGTCCTGCTGGTAGTTTACTCAAAGCCTTTTCAAGTAAGAACACACAAAGC
TTTTCATCTTCTATTGGATCAAGCAGCCCTGGGATGTGTTTTGAAGGAGCTACAATAACT
ACTGGTCGACCTTTTACATCTAGAAAGCCATGGACATATGCTTTTCCTGTCTCAGCAGCG
GCTTTGACAGAATCTTCAGATAGTTCGTTTACCTTGAACTCATTACGCCATTTGATAGCT
TTAGTAAGCTTTCCAATGGCTTCATCAACAGAGAATCTCCGGTCTTTCAGAAACCAGAGG
ATCATTTCCTCATCATCTCTTCCGTTTTTGCCGATTGGGAGACTAGTACAGTCTTTAGCA
AGCCGTTCTTTCACTTCCAAAACTAGCTTGTTGGCATTTTGAGAATCTGACGACACGCAA
CTTCTGACGGAGAATCTGCAGTTCCGAGATCAATAACTGTAAAAGCTCTTCGAGTTTTTG
A

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4A377TFB 827 0 0
GCGGTTTGGTGAACTGCCAAATAGGCTGGAAAATGAATGGAGCATCTACAAAGAGAACTT
CATCCAAACGGCTTGGATAGTAATAGTAAAACACATCAAACAGAAAGGTCAAGAATTTGA
GATCTGCGTTCCGAGAACCGAATCCACGGAGATCAAATATCCCCAAGTATCTTGTGTCGT
CCTGCTGGTAGTTTACTCAAAGCCTTTTCAAGTAAGAACACACAAAGCTTTTCATCTTCT
ATTGGATCAAGCAGCCCTGGGATGTGTTTTGAAGGAGCTACAATAACTACTGGTCGACCT
TTTACATCTAGAAAGCCATGGACATATGCTTTTCCTGTCTCAGCAGCGGCTTTGACAGAA
TCTTCAGATAGTTCGTTTACCTTGAACTCATTACGCCATTTGATAGCTTTAGTAAGCTTT
CCAATGGCTTCATCAACAGAGAATCTCCGGTCTTTCAGAAACCAGAGGATCATTTCCTCA
TCATCTCTTCCGTTTTTGCCGATTGGGAGACTAGTACAGTCTTTAGCAAGCCGTTCTTTC
ACTTCCAAAACTAGCTTGTTGGCATTTTGAGAATCTGACGACACGCAACTTCTGACGGAG
AATCTGCAGTTCCGAGATCAATAACTGTAAAAGCTCTTCGAGTTTTTGAAACTGATTGAA
GCAGCAAAGAGGGTTGAGCTCAAACGGATCGACATTGAGGATAACAGTAACCCAGGAGCC
AAAAAAAAAATAGAAACTTTACTCTTCTTGGTGTTAGATGAGAGGTTACAAGGAACTATG
GTGGGTGGTGAATTGTCAATTAGGAATCTGGAATCATCTGGTTTTCC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 5

CO CL1812Contig1 958 5 10 U
GGGCCAAAATAAAACAAAAAACAGAAAAATAAAAAGATAGAAAACGTTTCAGTGTCTCCG
ACCAAGCTATACGACCATCTGAATCGGATTAGGGTATAAGACTAGTCGGAGAAAGAAGTC
ATGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGCAGTCAACAAGTCACT
TTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAA
TCGTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCCACCGGAAAACTCTATAGCTCCTCCTTTGGC
GATAGCATGGCCAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGCTGCACTTAAAAAC
ATGGATCTAGCAGAGAAATCTCGGAATTATCTTTCACACAAGGAGTTACTGGAAATAGTC
AAGTGCAAGCTTGATGAAGCGAATCTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAATTTACCTG
GAAGGGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTGG
GAGCTTGTGAAAAATCTTGAAGAGAAGGAAAAACTGTTGAGAGAAGAGAATCATACTTTG
GTCAGCCAGCTAGCAAAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGATGAAGGAGCA
ATGTCATCGGTAAATAGCTACGGCAACAGCCCACCGAAGACCCTCCCTCTTCTAAAGTAA
CAATCATCATCATCGGCTGCTTTTGCAGCATATCCTGGTTTTAAATAAATGTAAAAAAAA
ATCATATATGTATCCTAAACATCCTCCTCTTCACCTGATCATACGGAAAGTTGAAGAAAA
GAAACTCAGGGAAATCATTAAACTATCTTTGCTGTTACCTTTGGAGACATGATCACAGTT
TCATATGGTTTCTATGTTTTTTATGATCTTGTGTTGAAAAGTATGACTTATTGAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX73TF U 47
AF RR4H886TF U 1
AF RR4D783TF U 58
AF RR4H886JQB C 91
AF RR4D783JQ C 335
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BS 651 731 RR4D783TF
BS 732 806 RR4H886JQB
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BS 822 916 RR4H886JQB
BS 917 958 RR4D783JQ

RD RR4FX73TF 190 0 0
GG
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GAGAAAGAAGTCATGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGCAGT
CAACAAGTCACTTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCA
GTTCTTTG

QA 3 190 3 190
DS 

RD RR4H886TF 650 0 0
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TTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAA
TCGTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCCACCGGAAAACTCTATAGCTCCTCCTTTGGC
GATAGCATGGCCAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGCTGCACTTAAAAAC
ATGGATCTAGCAGAGAAATCTCGGAATTATCTTTCACACAAGGAGTTACTGGAAATAGTC
AAGTGCAAGCTTGATGAAGCGAATCTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAATTTACCTG
GAAGGGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTGG
GAGCTTGTGAAAAATCTTGAAGAGAAGGAAAAACTGTTGAGAGAAGAGAATCATATTTTG
GTCAGCCAGCTAGCAAAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4D783TF 674 0 0
GG
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CATGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGCAGTCAACAAGTCAC
TTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGA
ATCGTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCCCCACCGGAAAACTCTATAGCTCCTCCTTTGG
CTATAGCATGGCCAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGCTGCACTTAAAAG
CATGGATCTAGCAGAGAAATCTCGGAATTATCTTTCACACAAGGAGTTACTGGAAATAGT
CAAGTGCAAGCTTGATGAAGCGAATCTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAATTTACCT
GGAAGGGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTG
GGAGCTTGTGAAAAATCTTGAAGAGAAGGAAAAACTGTTGAGAGAAGAGAATCATACTTT
GGTCAGCCAGCTAGCAAAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGATGAAGGAGC
AATGTCATCGGTAAATAGCTACGGCAACAGCCCACCGAAGACCCTCCCTCTTCTAAAGTA
ACAATCATCATC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR4H886JQB 828 0 0
AGGGTATAAGACTAGTCGGAGAAAGAAGTCATGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGA
ATTGAGAGCAAAAGCAGTCAACAAGTCACTTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAG
AAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAATCGTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCC
ACCGGAAAACTCTATAGCTCCTCCTTTGGCGATAGCATGGCCAAAATCATCAAGCGTTAT
GAGATACAACATGCTGCTGCACTTAAAAACATGGATCTAGCAGAGAAATCTCGGAATTAT
CTTTCACACAAGGAGTTACTGGAAATAGTCAAGTGCAAGCTTGATGAAGCGAATCTCGAT
GATGCAAGTGTAGAGTCTCTAATTTACCTGGAAGGGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTA
ACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTGGGAGCTTGTGAAAAATCTTGAAGAGAAGGAA
AAACTGTTGAGAGAAGAGAATCATATTTTGGTCAGCCAGCTAGCAAAGATGGAGAAGAAG
AGGCTTCCGGAAACAGAGGATGAAGGAGCAATGTCATCGGTAAATAGCTACGGCAACAGC
CCACCGAAGACCCCCCCTCTTCTAAAGTAACAATCATCATCATCGGCTGCTTTTGCAGCA
TATCCTGGTTTTAAATAAATGTAAAAAAAAATCATATATGTATCCTAAACATCCTCTTCT
TCACCTGATCGTACGGAAAGTTGAAGAAAAGAAACTCAGGGAAATCATTAAACTATCTTT
GCTGTTACCTTTGGAGACATGATCACAGTTTCATATGGTTTCTATG
CC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4D783JQ 624 0 0
TACAACATGCTGCTGCACTTAAAAGCATGGATCTAGCAGAGAAATCTCGGAATTATCTTT
CACACAAGGAGTTACTGGAAATAGTCAAGTGCAAGCTTGATGAAGCGAATCTCGATGATG
CAAGTGTAGAGTCTCTAATTTACCTGGAAGGGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTA
GAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTGGGAGCTTGTGAAAAATCTTGAAGAGAAGGAAAAAC
TGTTGAGAGAAGAGAATCATACTTTGGTCAGCCAGCTAGCAAAGATGGAGAAGAAGAGGC
TTCCGGAAACAGAGGATGAAGGAGCAATGTCATCGGTAAATAGCTACGGCAACAGCCCAC
CGAAGACCCTCCCTCTTCTAAAGTAACAATCATCATCATCGGCTGCTTTTGCAGCATATC
CTGGTTTTAAATAAATGTAAAAAAAAATCATATATGTATCCTAAACATCCTCCTCTTCAC
CTGATCATACGGAAAGTTGAAGAAAAGAAACTCAGGGAAATCATTAAACTATCTTTGCTG
TTACCTTTGGAGACATGATCACAGTTTCATATGGTTTCTATGTTTTTTATGATCTTGTGT
TGAAAAGTATGACTTATTGAGCTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 5

CO CL1813Contig1 862 5 21 U
AGTAGAAAAACACCACTTAGCAACTAAGTTTATTGTGTTCCAAGTACATTACAAAGAATT
GAGAAGCTTTTGGACATAGTGATTGAAAAAAAAAA*CAACACATAAAATGAAGAAGAGAG
ACGATGTTCACATTCGGATTAGATAATATATGTGTTTTTCAAAAGAGAATTAAGAAGAGC
AGCAGCCTGATTGCTGGTTTACAGGTTGCCCTCGGATCTGGACGGTTGCTGGATTGGATC
CTCCTGAAGGATTACTCGCCATTCTTGTCTTGATTGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTT
CCTCGACATTGGTAGCGTTCTTGGCACTTGTCTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTG
CAAAAGCCTTGGCAGTTTCAGTGGATA*AACTTTCTGTGAAGGGAGATCGTTTTTGTTGC
CAACCAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGCGTAGCGGTCGATTTCGTTAAGCCATTGCT
TGACATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTACATCGTAAGTCACAATGATCCCATGAGCTC
CTCTGTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAAACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCT
GGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCGACAGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGG
TGCTGATGTAGCTATCCAGGTAGGAATAGTCAGCAAACCTTAGAAGCAAACATGATTTGC
CAACACCAGAATCACCAATTAGCAAAAGCTTGAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGG
GGGATCGAACTACCGGTAACAACAAAGAGGAGATTCCGCCGATCCTTCGTCGGTGAGAAG
CGCGATTGAGAGACGTAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX81JQ U 21
AF RR4DT83JQ U 21
AF RR4FN37JQ U 1
AF RR4DT83TF C 243
AF RR4FN37TF C 251
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BS 175 200 RR4FN37JQ
BS 201 201 RR4DT83JQ
BS 202 232 RR4FN37JQ
BS 233 233 RR4DT83JQ
BS 234 276 RR4FN37JQ
BS 277 277 RR4DT83JQ
BS 278 387 RR4FN37JQ
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BS 389 402 RR4FN37JQ
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BS 795 856 RR4DT83TF
BS 857 862 RR4FN37TF

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CGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCGACA
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DS 

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AAA*CAACACATAAAATGAAGAAGAGAGACGATGTTCACATTCGGATTAGATAATATATG
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CGGATCTGGACGGTTGCTGGATTGGATCCTCCTGAAGGATTACTCGCCATTCTTGTCTTG
ATTGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCCTCGACATTGGTAGCGTTCTTGGCACTTGTC
TCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTTGGCAGTTTCAGTGGATA*AACT
TTCTGTGAAGGGAGATCGTTTTTGTTGCCAACCAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGCG
TAGCGGTCGATTTCGTTAAGCCATTGCTTGACATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTACA
TCGTAAGTCACAATGATCCCATGAGCTCCTCTGTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAAA
CGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCGACA
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GCAAACCTTAGAAGCAAACATGATTTGCCAACACCAGAATCACCAATT

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DS 

RD RR4FN37JQ 794 0 0
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ACGATGTTCACATTCGGATTAGATAATATATGTGTTTTTCAAAAGAGAATTAAAAAGAGC
AGCAGCCTGATTGCTGGTTTGCAGGTTGCCCTCGGATCTGGACGGTTGCTGGCTTGGATC
CTCCTGAAGGATTACTCGCCATTCTTGTCTTGATTGAAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTT
CCTCGACATTGGTAGCGTTCTTGGCACTTGTCTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTG
CAAAAGCCTTGGCAGTTTCAGTGGATACAACTTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTGC
CAACCAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGCGTAGCGGTCGATTTCGTTAAGCCATTGCT
TGACATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTACATCGTAAGTCGCAATGATCCCATGAGCTC
CTCTGTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAAACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCT
GGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCGACAGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGG
TGCTGATGTAGCTATCCAGGTAGGAATCGTCAGCAAACCTTAGAAGCAAACATGATTTGC
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GGGATCGAACTACC

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DS 

RD RR4DT83TF 617 0 0
CG
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AGCCTTGGCAGTTTCAGTGGATA*AACTTTCTGTGAAGGGAGATCGTTTTTGTTGCCAAC
CAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGCGTAGCGGTCGATTTCGTTAAGCCATTGCTTGAC
ATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTACATCGTAAGTCACAATGATCCCATGAGCTCCTCT
GTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAAACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAG
TTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCGACAGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCT
GATGTAGCTATCCAGGTAGGAATAGTCAGCAAACCTTAGAAGCAAACATGATTTGCCAAC
ACCAGAATCACCAATTAGCAAAAGCTTGAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGGGGGA
TCGAACTACCGGTAACAACAAAGAGGAGATTCCGCCGATCCTTCGTCGGTGAGAAGCGCG
ATTGAGAGACGT
CCC

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DS 

RD RR4FN37TF 612 0 0
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GGCAGTTTCAGTGGATACAACTTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTGCCAACCAGTAG
CTTGTTCACATTCTCACTGGCGTAGCGGTCGATTTCGTTAAGCCATTGCTTGACATTGTT
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ACTGCTGGTGATCGTTCTGAAACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGAT
GGTCTTTCCATCTTGTTCGACAGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCTGATGTA
GCTATCCAGGTAGGAATCGTCAGCAAACCTTAGAAGCAAACATGATTTGCCAACACCAGA
ATCACCAATTAGCAAAAGCTTGAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGGGGGATCGAAC
TACCGGTAACAACAAAGAGGAGATTCCGCCGATCCTTCGTCGGTGAGAAGCGCGATTGAG
AGACGTAAGCCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 5

CO CL1814Contig1 878 5 3 U
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TCAGCTGCTCCATCAGTATTCCAGACTACATCCTTTAATCCGGATGAGAAGTTTTTGTAG
AACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTCCTAAGCTCTACAACATGCAACGAT
GGTGCCACTTCAAACACCTCTGTGGCAACTGAGAGCTGGCCTTTACGACCACTTTTGTCT
CCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATTGAAGCCTAATGGCTTTGCGGTT
TCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTTGAGAAGTAAACCGTGTCTCTTTC
TTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAAGACTGTTTGAGCTCGAGATAAGT
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TTACTGAAAGCAGCATCCACATCATCAATATTTATGTCTTCATCATCTTGACCAAACGAT
GGCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGTAACTCTGCAATGCTTATTCTG
GTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATGACTCCCTTGGCACCTGGCGAGAACCAT
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GCTGCTGCACCGTCATAGCCTTTGTCCGACAGAACCTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D767JQ U 1
AF RR4E392JQ U 2
AF RR4D944JQ U 1
AF RR4D944TF C 158
AF RR4D767TF C 172
BS 1 621 RR4D767JQ
BS 622 737 RR4D944JQ
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RD RR4D767JQ 621 0 0
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GGCGGCTTGTACCCTTGCTTG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4E392JQ 633 0 0
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CTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTTGAGAAGTAAACCGTGTCTCTTTCT
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GCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTT

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DS 

RD RR4D944JQ 737 0 0
A
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CTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTTGAGAAGTAAACCGTGTCTCTTTCT
TCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAAGACTGTTTGAGCTCGAGATAAGTT
CAAAAGCGTTCATCGATTCCGGTTTCTCCTTCTTCTCAGTTACGAGAGACTCCTTGGAGT
TACTGAAAGCAGCATCCACATCATCAATATTTATGTCTTCATCATCTTGACCAAACGATG
GCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGTAACTCTGCAATGCTTATTCTGG
TTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATGACTCCCTTGGCACCTGGCGAGAACCATG
ATGGGCAGCTGAACTC

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR4D944TF 721 0 0
TAT
CGGATGAGAAGTTTT*GTAGAACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTC*TAA
GCTCTACAACATGCAACGATGGTGCCACTTCAAACACCTCTGTGGCAACTGAGAGCTGGC
CTTTACGACCACTTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATTGA
AGCCTAATGGCTT*GCGGTTTCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTTGAG
AAGTAAACCGTGTCTCTTTCTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAAGAC
TGTTTGAGCTCGAGATAAGTTCAAAAGCGTTCATCGATTCCGGTTTCTCCTTCTTCTCAG
TTACGAGAGACTCCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCCACATCATCAATATTTATGTCTT
CATCATCTTGACCAAACGATGGCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGTA
ACTCTGCAATGCTTATTCTGGTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATGACTCCCT
TGGCACCTGGCGAGAACCATGATGGGCAGCTGAACTCAGCCTTGCATATACGTTTGTATA
ATGTCATGAGATTTGGCTCATCAAAAGGTAAGTAACCAGCCATGAGCACAAATAGAATAA
TACCACAGGACCAGACGTCTGCTGCTGCACCGTCATAGCCTTTGTCCGACAGAACCTC

QA 4 721 4 721
DS 

RD RR4D767TF 707 0 0
G
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TTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATTGAAGCCTAATGGCT
TTGCGGTTTCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTTGAGAAGTAAACCGTG
TCTCTTTCTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAAGACTGTTTGAGCTCG
AGATAAGTTCAAAAGCGTTCATCGATTCCGGTTTCTCCTTCTTCTCAGTTACGAGAGACT
CCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCCACATCATCAATATTTATGTCTTCATCATCTTGAC
CAAACGATGGCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGTAACTCTGCAATGC
TTATTCTGGTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATGACTCCCTTGGCACCTGGCG
AGAACCATGATGGGCAGCTGAACTCAGCCTTGCATATACGTTTGTATAATGTCATGAGAT
TTGGCTCATCAAAAGGTAAGTAACCAGCCATGAGCACAAATAGAATAATACCACAGGACC
AGACGTCTGCTGCTGCACCGTCATAGCCTTTGTCCGACAGAACCTC

QA 2 707 2 707
DS 



AS 1 3

CO CL1815Contig1 1279 3 17 U
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AGTTGTGATACACTGAAACCATCTGATTAAATATCAGAACATATATACTCTAAGATTATA
TGCTGGGAGGCACAAGCAAAAGAACAAAACTCTGGGGGAGTTATGTAGCTTCACATCTAA
AAGAGACAAAAGGTTGAAACTTTACACACTGAAACTCATGAGGCAATGAATATTACAGAC
TAAGGCGATTTTTACAATTCAACCGTATCCGTAAGTTACATCTCGTTTCGCTAACAACGA
GTCAAAGGGTATCTCGACTCTTTCCTTCACAAGACACCTCGTTTCACCGTCTTCAATCAC
TAGAACTTTCCCCTGAGGACATTGGTTCGGCTTCCCTCTGACTACTACTCTCTGCGGGAG
GAGAAACTTCAGTGATGCGCCTCTTTTCCTGATCTCCGG*ACCATATCCCGAAGCAGACA
AGATTGAAATCACACCGATGACCGGAAGCATGATCTTGGCGACAGAGCCTAAGAAGCGAA
AAACTCCACGATTTGAGCCTCCGCGGGGGCTTTCCCCCTCTGTTTCCTTTCTCACATGTC
CCGACCCAAACCCGTCTTCATCAGATATCTTCTGCTTAGACGGTAAATGAGGCAAGTAGC
CATTGCTGTTATCTAAACCGAGGGAGAGAGGAGGAGGATGAACAGGGTAAGGAGGAAGGA
GAAGATCGCTCTCATAGTCAACTCTCTCGCCAGCGAAAGTCGAAGCCTCGCGTAGTACGA
CAAGTTCTTTCCCTTTGTACTCCTTGAGCTTCTCGAGCAACACCTTCCTGCTGTGATCAA
TCTCAGAGAGAGCCACTTGCTTCTCATACTGTTGCCTCTGCCGTTGATTCTGTAAAGCAG
CAAGCTGAGATTCTAGGGATTCAAGAGCATCGCGTATACGCAAAAGCTGTTCAGCTTCTT
CTTCTTCTTCCTCTTCCTCTACATCTCCACAGCTGATTGAATCAAAATCTTTATCTTGAC
TCCTGATAATAGTCCTATCTTTCTCTCCTTCTCCGGGAAAAGAAAGCTCGTCTCCGTCTC
CGCCGACGGGGGTGCTGGAGCTGTCGATGCAATCGCTGATCTTGAGTCTGAGCTCGGTGG
CTCTGGCTAAAATCAACCCGATGCCTTCTTCGTCTTCCATTTTTCAACGATTGTGAGTGA
AGGAGAAAATTGGGGGTTTAGGGTTTTTTTGTAAGGTAGTGAGGGGAAGGAAGGAAGAGC
CAAAATCGGAGTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D696JQ U 1
AF RR4GD14JQ U 135
AF RR4AV70TF C 448
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BS 879 895 RR4GD14JQ
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BS 902 902 RR4AV70TF
BS 903 910 RR4GD14JQ
BS 911 1279 RR4AV70TF

RD RR4D696JQ 616 0 0
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TAGAACTTTCCCCTGAGGACATTGGTTCGGCTTCCCTCTGACTACTACTCTCTGCGG*AG
GAGAAACTTCAGTGATGCGCCTCTTTTCCTGATCTCCGG*ACCATATCCCGAAGCAGACA
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AAACTCCACGATTTGAGCCTCCGCGGGGGCTTTCCCCCTCTGTTTCCTTTCTCACATGTC
CCGACCCAAACCCGT
T

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4GD14JQ 778 0 0
CT
CAAAAGAACAAAACTCTGGGGGAGTTATGTAGCTTCACATCTAAAAGAGACAAAAGGTTG
AAACTTTACACACTGAAACTCATGAGGCAATGAATATTACAGACTAAGGCGATTTTTACA
ATTCAACCGTATCCGTAAGTTACATCTCGTTTCGCTAACACCGAGTCAAAGGGTATCTCG
ACTCTTTCCTTCACAAGACACCTCGTTTCACCGTCTTCAATCACTAGAACTTTCCCCTGA
GGACATTGGTTCGGCTTCCCTCTGACTACTACTCTCTGCGGGAGGAGAAACTTCAGTGAT
GCGCCTCTTTTCCTGATCTCCGG*ACAATATCCCGAAGCAGACAAGATTGAAATCACACC
GATGACCGGAAGCATGATCTTGGCGACAGAGCCTAAGAAGCGAAAAACTCCACGATTTGA
GCCTCCGCGGGGGCTTTCCCCCTCTGTTTCCTTTCTCACATGTCCCGACCCAAACCCGTC
TTCATCAGATATCTTCTGCTTAGACGGTAAATGAGGCAAGTAGCCATTGCTGTTATCTAA
ACCGAGGGAGAGAGGAGGAGGATGAACAGGGTAAGGAGGAAGGAGAAGATGGTTCTCATA
GTCAACTCTCTCGCCAGCGAAAGTCGAAGCCTCGCGTAGTACTACAAGTTCTTTCCCTTT
GTACTCCTTGAGCTTCTCGAGCAACACCTTCCTGCTGTGATCAATCTCAGAGAGAGCCAC
TTGCTTCTCATACTGTTGCCTTTGCCGTTGATTCTGTAA*GCAGCGAGCTGAGA
CT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR4AV70TF 832 0 0
A
CTGATCTCCGGGACCATATCCCGAAGCAGACAAGATTGAAATCACACCGATGACCGGAAG
CATGATCT*GGCGACAGAGCCTAAGAAGCGAAAAACTCCACGATTTGAGC*TCCGCGGGG
GCTTTCCACCTCTGTTTCCTTTCTCACATGTCCCGACCCAAACCCGTTTTCATCAGATAT
CTTCTGCTTAGACGGTAGATGAGGCAAGTAGCCATTGCTGTTATCTAAACCGAGGGAGAG
AGGAGGAGGATGAACATGGTAAGGAGGAAGGAGAAGATCGCTCTCATAGTCAACTCTCTC
GCCAGCGAAAGTCGAAGCCTCGCGTAGTACGACGAGTTCTTTCCCTTTGTACTCCTTGAG
CTTCTCGAGCAACACCTTCCTGCTGTGATCAATCTCAGAGAGAGCCACTTGCTTCTCATA
CTGTTGTCTCTGCCGTTGATTCTGTAAAGCAGCAAGCTGAGATTCTAGGGATTCAAGAGC
ATCGCGTATACGCAAAAGCTGTTCAGCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTACATCTCC
ACAGCTGATTGAATCAAAATCTTTATCTTGACTCCTGATAATAGTCCTATCTTTCTCTCC
TTCTCCGGGAAAAGAAAGCTCGTCTCCGTCTCCGCCGACGGGGGTGCTGGAGCTGTCGAT
GCAATCGCTGATCTTGAGTCTGAGCTCGGTGGCTCTGGCTAAAATCAACCCGATGCCTTC
TTCGTCTTCCATTTTTCAACGATTGTGAGTGAAGGAGAAAATTGGGGGTTTAGGGTTTTT
TTGTAAGGTAGTGAGGGGAAGGAAGGAAGAGCCAAAATCGGAGTGTGTTCC

QA 2 832 2 832
DS 



AS 2 4

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GATCAAATTCAGTTTTCAAGAAAATAATAATACAATTACAAGCATTTTTATAAAAAAAAA
AACCAAATCACATGTAGGATTTGAGACGTGGTCTCATAAGAAACTGTGCTCCATCGACCA
TCACAGTGGTACCTGTCATGAAGCATGAACCGTCACTGATCAAATAAATAACAGTCGAGT
AGATATCTTTCTCCGGGTTCAACCACTGTCCCAGAGGAGCAGCGTCCTTCACAAGCTTCT
CCGCTCGATCAATCCCTACTGCAACTGGATATTCATCTCCAAGATGCAGACCTCTAGAGA
TCATGTTGACCCTTATCTTGTGCTTCCCTAGACTCATGGCTGATGCCCGAACCAGCTGGT
GAATCCCAGCAGCGGCTGTAGCATAGGCATCAGCTCCAGGGTAAAGCCCTCTCTCCCCAC
TAGCGATTGTAGCCAAAAATACAACGGAACCTCCTGATCCATGCTCCTTCATCATACTCG
CCACAGCCTTCAAGATAAACCATGGAGCCGTGAGATTGATCTTTGTGATCCTCTTGAACT
CATCTTCAGACACTTGGAGAATGTCCTGCATCTTCCCTTGGTAGGTATAGCAGTTGACAA
AAGCATCCAAAGATCCCAAACGATTCCATGCCTTTTGGACAGCAACATGGAAAGCTTCCT
CACTGTCAGCTTCCATGTCGGCTCCAATGACCTCCACTGGGAAGGCACCCTCTATGGAGA
CTCGTATGTGGTGTACAGTGCTCCTTAGAGAAGCCTCATGTTCCATCAAAACCAGCCGAC
AACCATGTTTGGCTAGCTGGATAGCGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BV43JQ U 1
AF RR4CU70JQ U 62
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RD RR4BV43JQ 705 0 0
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AAGCATCCAAAGATCCCAAACGATTCCATGCCTTTTGGACAGCAA

QA 1 705 1 705
DS 

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TTTTCAAGAAAGTAATAATACAGTTACAAGCATTTTTATAAAAAAA*****CAAATCACA
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CCGGGTTCAGCCACTGTCCCAGAGGAGCAGCGTCCTTCACAAGCTTCTCCGCTCGATCAA
TCCCTACTGCAACTGGATATTCATCTCCAAGATGCAGACCTCTAGAGATCATGTTGACCC
TTATCTTGTGCTTCCCTAGACTCATGGCTGATGCCCGAACGAGCTGGTGAATCCCAGCAG
CGGCTGTAGCATAGGCATCAGCTCCAGGGTAAAGCCCTCTCTCCCCACTAGCGATTGTAG
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AGATAAACCATGGAGCCGTGAGATTGATCTTTGTGATTCTCTTGAACTCTTCTTCAGACA
CTTGGAGAATGTCCTGCATCTTCCCTTGGTAGGTATAGCAGTTGACAAAAGCATCCAAAG
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CCATGTCGGCTCCAATGACCTCCACTGGGAAGGCACCCTCTATGGAGACTCGTATGTGGT
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CTAGCTGGATAGCGATG

QA 12 808 12 808
DS 



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TTATAAAAATGCTTGTAACTGTATTATTACTTTCTTGAAAATTAATTTGATCAAGCTTGA
ATAAGTACTCCTGGAGGGAGGATACGAATGAATTGAATTCT


BQ
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AF RR4E558JQ C 1
AF RR4E558TF U 1
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GAAGCTTGTGAAGGACGCTGCTCCTCTGGGACAGTGGCTGAACCCGGAGAAAGATATCTA
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DS 

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G
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TCTAGAGGTCTGCATCTTGGAGATGAATATCCAGTTGCAGTAGGGATTGATCGAGCGGAG
AAGCTTGTGAAGGACGCTGCTCCTCTGGGACAGTGGCTGAACCCGGAGAAAGATATCTAC
TCGACTGTGATTTATTTGATCAGTGACGGTTCATGCTTCATGACAGGTCAACTGTGATGG
TCGATGGAGCACAGTCTCTTATGAGACCACGTCTCAAATCCTACATGTGATTTGTTTTTT
TATAAAAATGCTTGTAACTGTATTATTACTTTCTTGAAAATTAATTTGATCAAGCTTGAA
TAAGTACTCCTGGAGGGAGGATACGAATGAA
TTGAATTCT

QA 2 452 2 452
DS 



AS 1 5

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CACCATATGCTCACAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTGGCACGTAGAAAAGGAC
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TTAGAGCTCCCGAGCTCTTGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATGAGAGAACTGATA
TCTGGTCACTAGGCTGCACACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTCCGTTTGAATATG
TACTTGAAGAATCTGATGGAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTAAGATCAAATGGC
CAAAGGCAGGACCAAAGGCTTCGTATCCTGAAGCACTTCACCAGTTCGTAACTTGGATGC
TGCAACCTCAGGCTGCGGTTCGACCTCGCATTGACGATATCATCATCCATGTCGACAAAT
TGATCGCAAAATTCACCAAGTGATTCCCTATTCAGGTGGTATAATCTAAAGAGTTAAAAA
AAAAAAGGATTTTAATATACATTACTTGCTCTCTTTATTTATATGTTTTAGCTATTTTGA
AAATTCCCATATTAGATACATATTAAACCACATAATATTTTCGTTTTATCTATTTGTAAG
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TGCTATTAG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN43TF U 1
AF RR4BL65TF U 109
AF RR4CJ55TF U 103
AF RR4BL65JQ C 294
AF RR4DN43JQ C 499
BS 1 126 RR4DN43TF
BS 127 127 RR4CJ55TF
BS 128 198 RR4DN43TF
BS 199 199 RR4CJ55TF
BS 200 244 RR4DN43TF
BS 245 245 RR4CJ55TF
BS 246 262 RR4DN43TF
BS 263 263 RR4CJ55TF
BS 264 265 RR4DN43TF
BS 266 266 RR4CJ55TF
BS 267 300 RR4DN43TF
BS 301 301 RR4CJ55TF
BS 302 403 RR4DN43TF
BS 404 405 RR4CJ55TF
BS 406 433 RR4DN43TF
BS 434 434 RR4CJ55TF
BS 435 558 RR4DN43TF
BS 559 559 RR4CJ55TF
BS 560 612 RR4DN43TF
BS 613 613 RR4CJ55TF
BS 614 639 RR4DN43TF
BS 640 640 RR4CJ55TF
BS 641 670 RR4DN43TF
BS 671 671 RR4CJ55TF
BS 672 695 RR4DN43TF
BS 696 696 RR4CJ55TF
BS 697 721 RR4DN43TF
BS 722 737 RR4CJ55TF
BS 738 738 RR4BL65JQ
BS 739 791 RR4CJ55TF
BS 792 792 RR4BL65JQ
BS 793 838 RR4CJ55TF
BS 839 839 RR4BL65JQ
BS 840 850 RR4CJ55TF
BS 851 895 RR4BL65JQ
BS 896 896 RR4DN43JQ
BS 897 900 RR4BL65JQ
BS 901 901 RR4DN43JQ
BS 902 948 RR4BL65JQ
BS 949 949 RR4DN43JQ
BS 950 1022 RR4BL65JQ
BS 1023 1023 RR4DN43JQ
BS 1024 1076 RR4BL65JQ
BS 1077 1089 RR4DN43JQ

RD RR4DN43TF 721 0 0
CGTCGAAAGTCAAGGATCCAGCCCATCTCTCCGATGATGGAACCTATGCGATGAAGAAAG
TTCTGATTCAGAACAAGGAGCAGCTGGAACTGGTGCGGGAGGAGATTCGTGTTTCGTCCC
TGTTCAGCCACCCTAATTTGCTTCCTCTCCTTGATCATGCCATTATTCCTGTTAAGGGTG
GTGGCCAAGAGGGAGCTGAGAAACACGAGGCCTTCTTGCTGTTTCCTGTTCACCTGGATG
GGACTTTGCTGGATAATTCCACAGCCATGAAGGCTAAAAAGGAAACATTCTCAACAACTG
ATGTCTTGCATATATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACTCAAACACATGCACTCTCTGGAGC
CACCATATGCTCACAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTAACACGTAGAAAAGGAC
AGACTCCTCTTGCCATTTTGATGGACTTTGGGAGTGCTCGTCCTGCACGGAAGCAAATCC
GCTCCCGTCAAGAGGCCTTACAGTTACAGGAATGGACAGCTGAACATTCTTCAGCACCGT
TTAGAGCTCCCGAGCTCTGGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATGAGAGAACTGATA
TCTGGTCACTAG*CTGCACACTATACGCAATAATGTACG*TGTGTCTCCGTTTGAATATG
TACTTGAAGA*TCTGATGGAAGTCTTCAGCTTGCA*TCGTTAACGCTAAGATCAAATGGC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4BL65TF 624 0 0
GTGTTTCGTCCCTGTTCAACCACCCTAATTTGCTTCCTCTCCTTGATCATGCCATTATTC
CTGTTAAGGGTGGTGGCCAAGAGGGAGCTGGGAAACACGAGGCCTTCTTGCTGTTTCCTG
TTCACCTGGATGGGACCTTGCTGGATAATTCCACGGCGATGAAGGCTAAAAAGGAAACAT
TCTCAACAACTGGTGTCTTGCATATATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACTCAAACACATGC
ACTCTCTGGAGCCACCATATGCTCACAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTGGCAC
GTAGAAAAGGACAGACTCCTCTTGCGATTTTGATGGACTTTGGGAGTGCTCGTCCTGCAC
GGAAGCAAATCCGCTCCCGTCAAGAGGCCTTACAGTTACAGGAATGGACAGCTGAACATT
CTTCAGCACCGTTTAGAGCTCCCGAGCTCTTGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATG
AGAGAACTGATATCTGGTCACTAGGCTGCACACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTC
CGTTTGAATATGTACTTGAAGAATCTGATGGAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTA
AGATCAAATGGCCAAAGGCAG
ACC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4CJ55TF 748 0 0
GGATTC
GTGTTTCGTCCCTGTTCAACCACCCTAATTTGCTTCCTCTCCTTGATCATGCCATTATTC
CTGTTAAGGGTGGTGGCCAAGAGGGAGCTGGGAAACACGAGGCCTTCTTGCTGTTTCCTG
TTCACCTGGATGGGACCTTGCTGGATAATTCCACGGCGATGAAGGCTAAAAAGGAAACAT
TCTCAACAACTGGTGTCTTGCATATATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACTCAAACACATGC
ACTCTCTGGAGCCACCATATGCTCACAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTGGCAC
GTAGAAAAGGACAGACTCCTCTTGCGATTTTGATGGACTTTGGGAGTGCTCGTCCTGCAC
GGAAGCAAATCCGCTCCCGTCAAGAGGCCTTACAGTTACAGGAATGGACAGCTGAACATT
CTTCAGCACCGTTTAGAGCTCCCGAGCTCTTGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATG
AGAGAACTGATATCTGGTCACTAGGCTGCACACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTC
CGTTTGAATATGTACTTGAAGAATCTGATGGAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTA
AGATCAAATGGCCAAAGGCAGGACCAAAG*CTTCGTATCCTGAAGCACTTCACCAGTTCG
TAACTTGGATGCTGCAACCTCAG*CTGCGGTTCGACCTCGCATTGACGATATCATCATCC
ATGTCGACAA*TTGATCGCAAA

QA 7 748 7 748
DS 

RD RR4BL65JQ 785 0 0
ACAACTGGTGTCTTGCATATATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACTCAAACACATGCACTCT
CTGGAGCCACCATATGCTCACAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTGGCACGTAGA
AAAGGACAGACTCCTCTTGCGATTTTGATGGACTTTGGGAGTGCTCGTCCTGCACGGAAG
CAAATCCGCTCCCGTCAAGAGGCCTTACAGTTACAGGAATGGACAGCTGAACATTCTTCA
GCACCGTTTAGAGCTCCCGAGCTCTTGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATGAGAGA
ACTGATATCTGGTCACTAGGCTGCACACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTCCGTTT
GAATATGTACTTGAAGAATTTGATGGAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTAAGATC
AAATGGCCAAAGGCAGGACCAAAGGCTTCGTATCCTGAAGCACTTCACCAGTTCGTAACT
TGGATGCTGCAACCTCAGGCTGCGGTTCGACCTCGCATTGACGATATCATCATCCATGTC
GACAAATTGATCGCAAAATTCACCAAGTGATTCCCTATTCAGGTGGTATAATCTAAAGAG
TTTAAAAGAAAAAGGATTTTAATATACATTACTTGCTCTCTTTATTTATATGTTT*AGCT
ATTTTGAAAATTCCCATATTAGATACATATTAAACCACATAATATTTTCGTTTTATCTAT
TTGTAAGACTTCTTTTTAAAATAATGTTATTTATCAGACAGATAACAATTTTATATATGT
TTT
CG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4DN43JQ 591 0 0
TACAGTTACAGGAATGGACAGCTGAACATTCTTCAGCACCGTTTAGAGCTCCCGAGCTCT
GGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATGAGAGAACTGATATCTGGTCACTAGGCTGCA
CACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTCCGTTTGAATATGTACTTGAAGAATCTGATG
GAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTAAGATCAAATGGCCAAAGGCAGGACCAAAGG
CTTCGTATCCTGAAGCACTTCACCAGTTCGTGACTTGGATGCTGCAACCTCAGGCTGCGG
TTCGACCTCGCATTGACGATATCATCATCCATGTCGACAAATTGATCGCAAAATTCCCCA
AGTGATTCCCTATTCAGGTGGTATAATCTAAAGAGTTAAAAAAGAAAAGGATTTTAATAT
ACATTACTTGCTCTCTTTATTTATATGTTTTAGCTATTTTGAAAATTCCCATATTAGATA
CATATTAAACCACATGATATTTTCGTTTTATCTATTTGTAAGACGTCTTTTTAAAATAAT
GTTATTTATCAGACAGATAACAATTTTATATATGTTTTTAATTGCTATTAG

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 5

CO CL1818Contig1 626 5 2 U
GGAATCCTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGAATCA
GACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGTACAG
GAGAACAACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAACTTCT
GTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGATCAAGGAAACATCTCCTGCTGTTGAG
CCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACCTGAG
AAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGTCGTC
GCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGCTATT
TGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTTTACCACCTGGATTTGATT
TGCTACTAACTGGTTTTATCGAGCTGTTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTGATT
CAATTAAATAAAAATCAGTTTTGCTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4CK81TF U 41
AF RR4EH54TF U 1
AF RR4A847JQ C 1
AF RR4A847TF U 1
AF RR4CK81JQ C 1
BS 1 624 RR4A847TF
BS 625 626 RR4CK81JQ

RD RR4CK81TF 251 0 0
TCAATCTCCACAGCCTTAACCCAACCAAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGCG
CGAGTAAACCCAAGGAATCAGACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTG
TGTCTGAAACCATAGTACAGGAGAACAACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGA
CAGAGACTGAAACAACTTCTGTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGATCAAGG
AAACATCTCCT

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR4EH54TF 597 0 0
GGAATCCTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTTCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGAATCA
GACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGTACAG
GAGAACAACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAACTTCT
GTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGATCAAGGAAACATCTCCTGCTGTTGAG
CCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACCTGAG
AAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGTCGTC
GCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGCTATT
TGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTTTACCACCTGGATTTGATT
TGCTACTAACTGGTTTTATCGAGCTGTTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4A847JQ 625 0 0
GGAATCCTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGAATCA
GACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGTACAG
GAGAACAACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAACTTCT
GTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGATCAAGGAAACATCTCCTGCTGTTGAG
CCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACCTGAG
AAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGTCGTC
GCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGCTATT
TGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTTTCCCACCTGGATTTGATT
TGCTACTAACTGGTTTTATCGAGCTGTTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTGATT
CAATTAAATAAAAATCAGTTTTGC
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4A847TF 625 0 0
GGAATCCTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGAATCA
GACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGTACAG
GAGAACAACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAACTTCT
GTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGATCAAGGAAACATCTCCTGCTGTTGAG
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GCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGCTATT
TGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTTTACCACCTGGATTTGATT
TGCTACTAACTGGTTTTATCGAGCTGTTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTGATT
CAATTAAATAAAAATCAGTTTTGC
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4CK81JQ 626 0 0
GGAATCCTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGCGCGAGTAAACCCAAGGAATCA
GACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGTACAG
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GTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGATCAAGGAAACATCTCCTGCTGTTGAG
CCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACCTGAG
AAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGTCGTC
GCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGCTATT
TGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTTTACCACCTGGATTTGATT
TGCTACTAACTGGTTTTATCGAGCTGTTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTGATT
CAATTAAATAAAAATCAGTTTTGCTT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 5

CO CL1819Contig1 1694 5 21 U
GGAAAATATGGTTCTCATAAAAGTGATAACGTTTCTTGCTCTCTTCGTCTCTCTACTACC
ACCGTCGTCCTTGGCCTTGCCCCAGGCCAAAGATGGTGGTGGACACGTCTCGTTACTCGT
CTCTCATACGGGTCTTGACTTCGCTAAAGACTTCCTCGTCCACAAGGTGATATCCACGAC
CCTTCCGCTTCAGCTACCTGAGATAGAGAAGAAGGTTAAGATCCCTTTGGTTGGGAAAGT
AAGGATGGGTCTGACGAATATCAAGATTTACGCGGTCGATGTTCGGCCGTCGAGGGTCGA
GACCGGAGGAGATGGAATGGTTTTGAGTGTTTCAGGGGCGACGGCAGATGTGAGCATGGA
CTGGTCTTATGCTTACAAAGCTTCCTTCTTTCATATCTCTGATCATGGTGTTGCTTCTGT
TAAGGTTAAAGGAATGGATTTGAGAAGCACTGTCAGTTTGGTTGGTGAAAATGGAAGTCT
AAAGATTGCTTCAAGGGATAGTGATTGTAAGGTGAAGAGCATTGGTATTCATATCAATGG
TGGTGCTTCTTGGCTTTATCAAGGGGTGGTTGATGCATTTGAGAAGAAGATTATTTCAAC
TATTGAAGAGACTGTTTCTACTAAGATTCTGGAGAAGATGAAGAAGCTTGATGCTAAGTT
GCAATCACTTCCAAAAGAGAGGAAGATCGATGACAATGTTGCTGTGAACCTCACTTTTGC
AGGAAGCCCTGTCTTGGATGATTCTTCTGTTGAATTTGGAATCAATGGTTTGTTGTTCAT
GCCAAATGGTGATGGTGGTAAAGCTTCAGGATCTCAGTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCCTC
TTTTCCCAAGGTTAAAAGAATGATGGGAATAGCAATTAAAGAAGAAGTTTTCAACTCTGC
AACACTTGTCTACTTCATTGCAAGGAAGATGCATGTGGATATCGAGCAAACGAAGAACGG
GTCGGCTCTAAGCACATCTGACTGGAAACTCATACTTCCAGAGCTCTACAAACAATATCC
AAATGTTAAAATGATGCTTAACATGTCGGTTACATCTCCTCCTGCTGTCAACATCAGAGA
GACTGGCATTGATGCAATCATTGACTTAGAGATATCAATCGATGTCCAGAACTCTGGGGT
AGTCCTATCCGTGGCACGCATGTCAACGGTTCTGGAAGTTGCGGGTACTGCAGAGATAGC
AGAGAACAATTTAGCAGGTAGCCTAAGAATAAAAGGTTTCAATGCAACAATGACTTGGAG
TAAACTTGGAGATCTTCAAGCAAACTATATTCAGGATGTAGCGTCGACGATTCTTGAATC
CTTGTTTTTGCCGTACGTAAACGCACGTCTCAAAAAAGGTTTCCCTTTGCCGTTTACGCA
CGGTTTCAAGATCAAAAACACAGAGATAGTCTATGTTGAAAATGGCATTATGGTGTGCAG
TGATGTAGCCTTTGGTTAGGTTAATGAACAGCCTCTCACGATTAGTAATACTTGTGAATC
TGTTGCTATTTCTGTATAAAGCTGCGTTGTAAATTTGTTAAGACTTGAAAGTATCATCAT
GTATATATCTATCTCTCAGGTACTAGTTTGAATTACCTATGTTGTTACACACATGTTAGA
ACAACATTTATACAGCTTGTAGATAATTTATATAGTTTATACTGTTTGTGTATAATAACA
TTTACATTGATCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
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G
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CAGATCAAAA

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TCAACGGTTCTGGAAGTTGCGGGTACTGCAGAGATAGCAGAGAACAATTTAGCAGGTAGC
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AT

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G
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QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 5

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TGCAATTCTCCAACTTCCGAAACAGATCCCAAGCAGTTCGCAGTCGCGGAGGAATATATA
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TCTGAGTTTGTTTCTTTAGTGTCTTTAAGGACACAAGTTTGTGTGAGACTCCTGTGTTTT
GGCTGTACTGATTGGTAATAAGATTGTTGTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4EV91JQ C 358
AF RR4BX88JQ C 437
AF RR4BX88TF U 437
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TGCAATTCTCCAACTTCCGAAACAGATCCCAAGCAGTTCGCAGTCGCGGAGGAATATATA
CGACAATTCTGCCTGAAGCCAACAGTTTCTCCAAGGCGTTGTACACTATCGACTTTGGAC
AAAACGATCTCACCGCTGGTTACTTCGCCAAAAAGAGCGTACAAGAAATTGGAACCAGCG
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G
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G
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TCAGACTTTTACGCACACGGATGTGCTTCTCCCTTGAACCATTTGGCTCAACAGTTCAAC
GACGCCTTGTCACAAGCCGTGACCGAGCTTAGAGCTTCTTTGTCTGAAGCTGCCATTACT
TACGTAGATGTCTACTCTATCAAATACGAGTTGTTTGCTCACGCGCAGGAATATGGGTTC
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GGGTGTGGTAAGAAGATTATTGTGGATGGCAACGAGGTTCTTATTGGAAAATCGTGCGAT
GAGCCTGACAAGGCTATTGTTTGGGACGGTATACACTTCACTCAGGCTGCTAATAAAATC
ATATTCGATAAGATCGCAGCTGGGTTGAGCATGGCCTGTCACAAGCAGTGACAAAAACAA
GAACAAGAACAAGAGAGAGAGAAAGAGAAGCTTTTCTTTGTTTTCTGAGTTTGTTTCTTT
AGTGTCTTTAAGGACACAAGTTTGTGTGAGACTCCTGTGTTTTGGCTGTACTGATTGGTA
ATAAGATTGTTGTTGATCC

QA 2 620 2 620
DS 



AS 1 4

CO CL1821Contig1 985 4 11 U
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TCAGTCTTCCTTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACAGCTCTG
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GAGATCCGCCATTACTTTTGAGATTCCCTCTCCACACCGAAGAACCCAAAGAGTTAGAGA
ATGAAGATGAGAGGTGAAAGTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DG61JQ U 1
AF RR4DG61TF C 1
AF RR4B536JQ U 15
AF RR4BF64TF C 181
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BS 281 590 RR4DG61JQ
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C

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C

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ATAGCTTCACCTTGAGTAGCTTTGAGAAGAGACTTTCAAGACGTTCTCGTCGTGCTCCTT
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DS 



AS 1 4

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CATTAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAAGTCGGTACTTCCAGGTTG
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CTCAATGGGTAAGGTTACAAATGGTCTCTATCC


BQ
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AF RR4FB65JQ U 1
AF RR4FB65TF C 1
AF RR4A618JQ U 61
AF RR4A618TF C 387
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DS 

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CAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGAATGCACCCCAAGTGAGTGCAG
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CTTAAAGATCC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4A618JQ 797 0 0
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CATTAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAAGTCGGTACTTCCAGGTTG
TATGGTGCAGGACCTTTCCTGATCCTTCCAGAGATATCATAATGCGATCCGTGACACGGG
CAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGAATGCACCCCAAGTGAGTGCAG
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QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4A618TF 787 0 0
TCCA
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GGCAAAGGAATGCACCCCAAGTGAGTGCAGACTCCAACAACCACCAACCATTTCGGATTC
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AGCTTGATGTCGTCTTCAGTTCTTCTCCTGATGAAGACAGGCTTTCCACGCCACTTCACC
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CCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGTCATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGCGTCTTG
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ACTTGAGAAGAGAAACCTCTTAAAAGGCTCCGGTGGTAAGAATTGAAACATGAAAGATCT
GCAGAGGGAGCAGATCTGGTGGAGTCGTCGTCGCCTCCTTTGGAGATGGTGTAATCTCGG
GGAAGGATGAAAGAGGTGGCAGTGGAAGATCTCTGCTGAAGAGACAGAAGCCTCCTCCCT
GCAACTCGCAACATCTTTCTCTTCTCTTCGCTCAATGGGTAAGGTTACAAATGGTCTCTA
TCC

QA 5 787 5 787
DS 



AS 1 5

CO CL1823Contig1 1071 5 7 U
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TCACACGCTCTGTTGGGAAAAAAAAAGAGAGATGGGGTTCCAATGGTGTGATACAAGTAA
TGGATGTGTGATACAAAGTAATGGATACAGATGAGTGTGTAGCTTTTGGACCGGGTGGAT
ATGCAATTAATCAAATGAATCATGGCTTTGTTTTTTCTGCTGACTGGGGATTGCATGATT
TGCATCTTCGTCTCTGTTATCTGTCTCTGTGCTTGTGGAAGGTTTCGAAGTGTTGAGCAT
CCCTTTGAGCCAGGTGCCTTGAATTCTCAAGCTCCCATTCTCTGAATTGTTGACGGTTCC
AGGCCCTTGTGGTGAGATATTGGTGACGTTCGATCTAACATTGGAAAGGAAGCGATAGGC
CACCTTACTAGCTGATAAAAGTTCGGTTTTGGCTTGCTTTAACCGCATTGCTGTGGTTTC
TGCTACTTCCAAAGCTGTGTCGCCAGCATGCGCAAAACGATTCACCCAACCTGGGAGCTT
TGGCACGCCGAGCCTTTCACAGAGCACATCACAGAAGTGGTTGCAATTTCTGGACAAGAG
ATCATAAGTGTGTCCTGGCCATTCCCTGGTGAGCTCACGGAATATCTGATTAACCATAAA
GATAGTGCACTCTGTCCTCCCAAGAACAATTTTCTCACGATACGTGTACATAGGGTTCTT
GCTGCTAGGACATCTGAATACACCAGTGCCTTGTTCACAATACCCATAAGACCACTCATC
GTTTCCATATACCTGAATGGCGCTGTGGAAAATGCCGCCAAGACCGATGCCGTCTTTGAA
GATCCTGTTGATCTGAAGAATGGTGTTGTTAGTTTTGTCTGATCCTGTGTTTGTCACATC
GTATATGTGCACAACAACTTCCGCCATGAATTAGCTCTAGTGAAGAAGGAAATGTTATGT
CTTGTTGTACCAATCCCACTACAAAACAACTCTTTCTTCTTTCGTAGGTTTTGATCTAAA
GAGAGAGAGAGAGGAGAAACTGAGTTTTGTTTTTATATAATCGTCTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4FS45JQ U 1
AF RR4EB18JQ U 4
AF RR4H022JQ U 2
AF RR4FS45TF C 303
AF RR4EB18TF C 367
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DS 

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GG
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TGCACTCTGTCCTCCCAAGAACAATTTTCTCACGATACGTGTAC

QA 3 706 3 706
DS 

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GTGC
TGAGACTTGATTTATACTTGCCATTAACGTGTTGAAAATATATCCCTTAACAAAATCACA
CGCTCTGTTGGGAAAAAAAAAGAGAGATGGGGTTCCAATGGTGTGATACAAGTAATGGAT
GTGTGATACAAAGTAATGGATACAGATGAGTGTGTAGCTTTTGGACCGGGTGGATATGCA
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CTTCGTCTCTGTTATCTGTCTCTGTGCTTGTGGAAGGTTTCGAAGTGTTGAGCATCCCTT
TGAGCCAGGTGCCTTGAATTCTCAAGCTCCCATTCTCTGAATTGTTGACGGTTCCAGGCC
CTTGTGGTGAGATATTGGTGACGTTCGATCTAACATTGGAAAGGAAGCGATAGGCCACCT
TACTAGCTGATAAAAGTTCGGTTTTGGCTTGCTTTAACCGCATTGCTGTGGTTTCTGCTA
CTTCCAAAGCTGTGCCGCCAGCATGCGCAAAACGATTCACCCAACCTGGGAGCTTTGGCA
CGCCGAGCCTTTCACAGAGCACATCACAGAAGTGGTTGCAATTTCTGGACAAGAGATCAT
AAGTGTGTCCTGGCCATTCCCTGGTGAGCTCACGGAATATCTGATTAACCATAAAGATAG
TGCACTCTGTCCTCCCAAGAACAATTTTCTCACGATACGTGTACATAGGGTTCTTGCTGC
TAGGACATCTGAATACACCAGTGCCTTGTTCACAATACCCATA

QA 5 767 5 767
DS 

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GCCCTTGTGGTGAGATATTGGTGACGTTCGATCTAACATTGGAAAGGAAGCGATAGGCCA
C*TTACTAGCTGATAAAAGTTCGGTTTTGGCTTGCTTTAACCGCATTGCTGTGGTTTCTG
CTACTTCCAAAGCTGTGTCGCCAGCATGCGCAAAACGATTCACCCAACCTGGGAGCTTTG
GCACGCCGAGCCTTTCACAGAGCACATCACAGAAGTGGTTGCAATTTCTGGACAAGAGAT
CATAAGTGTGTCCTGGCCATTCCCTGGTGAGCTCACGGAATATCTGATTAACCATAAAGA
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TGCTAGGACATCTGAATACACCAGTGCCTTGTTCACAATACCCATAAGACCACTCATCGT
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TGTTGTACCAATCCCACTACAAAACAACTCTTTCTTCTTTCGTAGGTTTTGATCTAAAGA
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QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4EB18TF 704 0 0
TTGTGGTGAGATATTGGTGACGTTCGATCTAACATTGGAAAGGAAGCGATAGGCCAC*TT
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TTCCAAAGCTGTGTCGCCAGCATGCGCAAAACGATTCACCCAACCTGGGAGCTTTGGCAC
GCCGAGCCTTTCACAGAGCACATCACAGAAGTGGTTGCAATTTCTGGACAAGAGATCATA
AGTGTGTCCTGGCCATTCCCTGGTGAGCTCACGGAATATCTGATTAACCATAAAGATAGT
GCACTCTGTCCTCCCAAGAACAATTTTCTCACGATACGTGTACATAGGGTTCTTGCTGCT
AGGACATCTGAATACACCAGTGCCTTGTTCACAATACCCATAAGACCACTCATCGTTTCC
ATATACCTGAATGGCGCTGTGGAAAATGCCGCCAAGACCGATGCCGTCTTTGAAGATCCT
GTTGATCTGAAGAATGGTGTTGTTAGTTTTGTCTGATCCTGTGTTTGTCACATCGTATAT
GTGCACAACAACTTCCGCCATGAATTAGCTCTAGTGAAGAAGGAAATGTTATGTCTTGTT
GTACCAATCCCACTACAAAACAACTCTTTCTTCTTTCGTAGGTTTTGATCTAAAGAGAGA
GAGAG**GAGAAACTGAGTTTTGTTTTTATATAATCGTCTGT
CC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 4

CO CL1824Contig1 725 4 7 U
TTTTGGGCATTAAAGACTAAGTTTATTTAATTTGAAAATATAAAATATTTTTTACATTCT
TATATACAGACATCTCATAACACTTTCACCATCGAAACCAAAATTTTAAGGACATACGTA
TATAAGAATGTAAGAAACGTCTGAACCCAACCACACCAAACCAAATCAAAGCGAGTCCCT
GGGAGGCTGAGGATCAGGCAAGCCCTTGATAATGCCACAGCGGAAACCGTTTGCCGGAAA
GCTGTACTCATCCCTCTGGGATAATTCCGGCGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGACC
TAAGTAACGTTTCTCGAGAATCTCAGACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAAGT
CAACAAGATGGCTCCCCAACATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCGTC
TAACAGATTATAGTTCTTCCTCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACAGC
AAAGAAAGAGTATCCATCAAGATGCCAAGACTGTGCAGTCTTTTCGTGATTTTCGAACAC
AATCTCCACGAATGAACGGTGCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTACT
AGTGTCGACCGTGGTCGGCTCGTCCTTAATAGTGTCGTACTTGAACACCTTGTCGGCTAC
ACCAAAATACTGAGCCAGCTTAATCGGCGTTTCCGGTTCCACGTGTGACACTCCGCTAAG
CGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4E763JQ U 49
AF RR4FY45TF C 1
AF RR4FY45JQ U 21
AF RR4E763TF C 146
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AAGCTGTTGACCTAAGTAACGTTTCTCGAGAATCTCAGACCGGATATTCCACATGCCACA
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GTATACT

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DS 

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TATAAGAATGTAAGAAACGTCTGAACCCAACCACACTAAACCAAATCAAAGCGAGTCCCT
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GCTGTACTCATCCCTCTGGGATAATTCCGGCGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGACC
TAAGTAACGTTTCTCGAGGATCTCAGACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAAGT
CAACAAGATGGCTCCCCAACATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCGTC
TAACAGATTATAGTTCTTCCTCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACAGC
AAAGAAAGAGTATCCATCAAGATGCCAAGACTGTGCAGTCTTTTCGTGATTTTCGAACAC
AATCTCCACGAATGAACGGTGCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTACT
AGTGTCGACCGTGGTCGGCTCGTCCTTAATAGTGTCGTACTT
C

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CACTTTCACCATCGAAACCAAAATTTTAAGGACATACGTATATAAGAATGTAAGAAACGT
CTGAACCCAACCACACTAAACCAAATCAAAGCGAGTCCCTGGGAGGCTGAGGATCAGGCA
AGCCCTTGATAATGCCACAGCGGAAACCGTTTGCCGGAAAGCTGTACTCATCCCTCTGGG
ATAATTCCGGCGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGACCTAAGTAACGTTTCTCGAGGA
TCTCAGACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAAGTCAACAAGATGGCTCCCCAAC
ATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCGTCTAACAGATTATAGTTCTTCC
TCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACAGCAAAGAAAGAGTATCCATCAA
GATGCCAAGACTGTGCAGTCTTTTCGTGATTTTCGAACACAATCTCCACGAATGAACGGT
GCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTACTAGTGTCGACCGTGGTCGGCT
CGTCCTTAATAGTGTCGTACTT
C

QA 1 622 1 622
DS 

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TCCGGCGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGACCTAAGTAACGTTTCTCGAGAATCTCA
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GGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCGTCTAACAGATTATAGTTCTTCCTCTTC
GCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACAGCAAAGAAAGAGTATCCATCAAGATGC
CAAGACTGTGCAGTCCTTTCGTGATTTTCGAACACAATCTCCACGAATGAACGGTGCTCG
ATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTACTAGTGTCGATCGTGGTCGGCTCGTCC
TTAATAGTGTCGTACTTGAACACCTTGTCGGCTACACCAAAATACTGAGCCAGCTTAATC
GGCGTTTCCGGTTCCACGTGTGACACTCCGCTAAGCGCGC

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DS 



AS 1 5

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ACTTTTACAAGATCATAACCCCCAACAATGATTCACTCTTTTCTCTACTCACTACAACAA
ACAAGGGGTTACAAATACTTGATGTGATATAGCAGATAACTCACAAACCGAGCCATGGAC
ACTGCTTTCTTGCATGTTCCGGTACTAACTTAGCCACCATCTCCACAGGCACACCTTTAA
GCTCATGATGCTTGAAGTTGAAAAGTGGTGGAAAGAAACGTCCATTGGGCAACCGTGCAT
TAGGATCTCTAAGCTCGTCAAAGAACGGGTGGACCAATGCATCAAGAGCACCACAACGGA
GATTAGGAGAGTATTGAAGAAGCCTTGATACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCT
TGTGGAAAATCTTATGCCATGGATGAGCTTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGT
TTGGGTTCATGCATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAA
CAAGTTGATCAACACCACTCTCACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGA
GAACACATCCAGCAGACCAGACATCAATGGCTGTAGTATACTCTGTAGCTCCAAAAATAA
GCTCAGGTGCTCTGTAATACCTCGAGCATATATATGAAATGTTTGGCTCTCCTTTGACCA
ATACTTTAGCACTTCCAAAATCACATAGCTTCACTTGATGAGTGCGTGGGTTTACCAACA
AGTTTTGAGGCTTAATGTCACGATAACACACGCCTATACATCGGTGAATGTAACATAAGG
ACCTGAAAATCTGATAGGTGTAGAGTTTGACGTAAACGATAGGCATTCGTTGGTTAAGTT
TGTTGTAGTGTTTGATAACACGGTGTACTGTTTCCGGAACGTATTCGAGGACTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ29JQ U 82
AF RR4G960JQ U 1
AF RR4DU13JQ U 82
AF RR4DU13TF C 269
AF RR4G960TF C 278
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CACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATCCAGCAGACCAGA

QA 1 600 1 600
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ACTGCTTTCTTGCATGTTCCGGTACTAACTTAGCCACCATCTCCACAGGCACACCTTTAA
GCTCATGATGCTTGAAGTTGAAAAGTGGTGGAA*GAAATGTCCATTGGGCAACCGTGCAT
TAGGATCTCTAAGCTCGTCAAAGAACGGGTGGACCAATGCATCAAGAGCACCACAACGGA
GATTAGGAGAGTATTGAAGAAGCCTTGATACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCT
TGTGGAAAATCTTATGCCATAGATGAGCTTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGT
TTGG*TTCATGCATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAA
CAAGTTGATCAACACCACTTTCACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGA
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GCTCAGGTGCTCTGTAATACCTCGAGCATATATATGAAATGTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4DU13JQ 673 0 0
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CCAACAATGATTCACTCCTTTCTCTACTCACTACAACAAACAAGGGGTTACAAATACTTG
ATGTGATATAGCAGATAACTCACAAACCGAGCCATGGACACTGATTTCTTGCATGTTCCG
GTACTAACTTAGCCACCATCTCCACAGGCACACCTTTAAGCTCATGATGCTTGAAGTTGA
AAAGTGGTGGAAAGAAACGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTCTAAGCTCGTCAA
AGAACGGGTGAACCAATGCATCAAGAGCACCACAACGGAGATTAGGAGAGTATTGAAGAA
GCCTTGATACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCCTGTGGAAAACCTTATGCCATG
GATGAGCTTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTTGGGTTCATGCATTTGATCT
CTTCCCTTGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAACAAGTTGATCAACACCACTCT
CACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACGCATCCAGCAGACCAGA
CATCAATGGCTGTAGTATACTTTGTAGCTCCAAAAATAAGCTCAGGTGCTCTGTAATACC
TCGAGCATATATA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4DU13TF 748 0 0
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TGGAAAGAAACGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTCTAAGCTCGTCAAAGAACGG
GTGAACCAATGCATCAAGAGCACCACAACGGAGATTAGGAGAGTATTGAAGAAGCCTTGA
TACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCCTGTGGAAAACCTTATGCCATGGATGAGC
TTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTTGGGTTCATGCATTTGATCTCTTCCCT
TGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAACAAGTTGATCAACACCACTCTCACCAGG
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TATATATGAAATGTTTGGCTCTCCTTTGACCAATACTTTAGCACTTCCAAAATCACATAG
CTTCACTTGATGAGTGCGTGGGTTTACCAACAAGTTTTGAGGCTTAATGTCACGATAACA
CACGCCTATACATCGGTGAATGTAACATAAGGACCTGAAAATCTGATAGGTGTAGAGTTT
GACGTAAACGATAGGCATTCGTTGGTTAAGTTTGTTGTAGTGTTTGATACCACGGTGTAC
TGTTTCCGGAACGTATTCGAGGACTAAC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4G960TF 720 0 0
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ATGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTCTAAGCTCGTCAAAGAACGGGTGGACCAA
TGCATCAAGAGCACCACAACGGAGATTAGGAGAGTATTGAAGAAGCCTTGATACTAAATC
AACAGCTTCTGGAGGCATCCTCTTGTGGAAAATCTTATGCCATAGATGAGCTTTAATCTG
AGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTTGG*TTCATGCATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTGT
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CTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATCCAGCAGACCAGACATCAATGGCTGTAGT
ATACTCTGTAGCTCCAAAAATAAGCTCAGGTGCTCTGTAATACCTCGAGCATATATATGA
AATGTTTGGCTCTCCTTTGACCAATACTTTAGCACTTCCAAAATCACATAGCTTCACTTG
ATGAGTGTGTGGGTTTACCAACAAGTTTTGAGGCTTAATGTCACGATGACACACGCCTAT
ACATCGGTGAATGTAACATAAGGACCTGAAAATCTGATAGGTGTAGAGTTTGACGTAAAC
GATAGGCATTCGTTGGTTAAGTTTGTTGTAGTGTTTGATAACACGGTGTACTGTTTCCG
C

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 5

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GGATTCTTCAAACGAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGAAACAGCGAAAATGGCTTCCAAGAGT
TATCATCCACTGCATCTGATCATCCTCTTCGTCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTT
CTCGCCGTCAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGAAGAGATGAGAAGCGGCGGGCGT
AGGATCCTTCTAGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCT
CCTTCAGGTCCTTGCGTCTCCTGCAATTCCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGC
AGCGAAACTGGTTATCGGATTCCTTTCAAATGTAGAGAGGTGATTAGAGGAGAGGAAGCT
TCTTCACACAAGAAAGACGTTGAAGAGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAAT
AATGATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGAC
ACTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTT
CCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTG
TTACTCGTAAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGATAATACCGATGGCCGGC
GTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTT*CGATT
TATGTGAGAAACAGAGATATTACTACGAGTGTATAGAATATAAGCTTTTAGGGGCTTTGA
TATAACTGGATTACTTACTTGTTTATGAGATCAATTCCCATCTGAAAAAAAGATGTTATC
ACTTTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F908TF U 1
AF RR4A860TF U 26
AF RR4A860JQ C 26
AF RR4A672TF U 37
AF RR4F908JQ C 36
BS 1 186 RR4F908TF
BS 187 187 RR4A860TF
BS 188 323 RR4F908TF
BS 324 324 RR4A860TF
BS 325 546 RR4F908TF
BS 547 547 RR4A860TF
BS 548 634 RR4F908TF
BS 635 768 RR4A860TF
BS 769 813 RR4A672TF
BS 814 824 RR4A860JQ
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RD RR4F908TF 634 0 0
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TATCATCCACTGCATCTGATCATCCTCTTCGTCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTT
CTCGCCGTCAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGAAGAGATGAGAAGCGGCGGGCGT
AGGATC*TTCTAGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCT
CCTTCAGGTCCTTGCGTCTCCTGCAATTCCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGC
AGCGAAACTGGTTATCGGATTCCCTTCAAATGTAGAGAGGTGATTAGAGGAGAGGAAGCT
TCTTCACACAAGAAAGACGTTGAAGAGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAAT
AATGATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGAC
ACTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTT
CCTTCTTCGGATGAGGAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTG
TTACTCGTAAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAA

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DS 

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TCGTCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCGTCAGATCACACGAACAGAACA
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CAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCAGGTCCTTGCGTCTCCTGCAATT
CCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGCAGCGAAACTGGTTATCGGATTCCTTTCA
AATGTAGAGAGGTGATTAGAGGAGAGGAAGCTTCTTCACACAAGAAAGACGTTGAAGAGA
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CGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGACACTTCACCGGCATCGAAAGCTTAGAAGT
CTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTTCCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCGG
TTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTGTTACTCGTAAGTGGATCCGCTGTATATT
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DS 

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TCGTCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCGTCAGATCACACGAACAGAACA
ACGGAGACGAAGAGATGAGAAGCGGCGGGCGTAGGATCCTTCTAGGTTTCAAAGAGACTC
CAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCAGGTCCTTGCGTCTCCTGCAATT
CCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGCAGCGAAACTGGTTATCGGATTCCTTTCA
AATGTAGAGAGGTGATTAGAGGAGAGGAAGCTTCTTCACACAAGAAAGACGTTGAAGAGA
CGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATGATGACGAAGAAGTTGTTGATGCAT
CGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGACACTTCACCGGCATCGAAAGCTTAGAAGT
CTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTTCCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCGG
TTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTGTTACTCGTAAGTGGATCCGCTGTATATT
ACAGAAAGAAACAGATAATACCGATGGCCGGCGTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATT
CCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTT*CGATTTATGTGAGAAACAGAGATATTACTACGA
GTGTATAGAATATAAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTACTTGTTTATGA
GATCAATTCCCATCTG
T

QA 4 799 4 799
DS 

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GG
AGCGAAAATGGCTTCCAAGAGTTATCATCCACTGCATCTGATCATCCTCTTCGTCTACGC
TGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCGTCAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGA
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CAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCAGGTCCTTGCGTCTCCTGCAATTCCTCCGAAAA
GAGAAAAGAGAAGTATCGTTGTAGCGAAACTGGTTATCGGATTCCTTTCAAATGTAGAGA
GGTGATTAGAGGAGAGGAAGCTTCTTCACACAAGAAAGACGTTGAAGAGACGCAACAAAA
TGATCAATCTAATGCCAGTAATAATGATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAA
GCAGAGGAACCTGCGTGATGACACTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTA
CAAAACTTACAGAAGCTGTGTTCCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTT
CGAGGCGGTTATGCTAGGACTGTTACTCGTAAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAA
ACAGATAATACCGATGGCCGGCGTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTA
AGAGAAAACCTTTTTT*CGATTTATGTGAGAAACAGAGATATTACTACGAGTGTATAGAA
TATAAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTACTTGTTTATGAGATCA

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR4F908JQ 814 0 0
AAACAGCG
AAATGGCTTCCAAGAGTTATCATCCACTGCATCTGATCATCCTCTTCGTCTACGCTGTTG
CTATCTCATCATCGTTTCTCGCCGTCAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGAAGAGA
TGAGAAGCGGCGGGCGTAGGATC*TTCTAGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACG
TCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCAGGTCCTTGCGTCTCCTGCAATTCCTCCGAAAAGAGAA
AAGAGAAGTATCGTTGCAGCGAAACTGGTTATCGGATTCCCTTCAAATGTAGAGAGGTGA
TTAGAGGAGAGGAAGCTTCTTCACACAAGAAAGACGTTGAAGAGACGCAACAAAATGATC
AATCTAATGCCAGTAATAATGATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGA
GGAACCTGCGTGATGACACTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAA
CTTACAGAAGCTGTGTTCCTTCTTCGGATGAGGAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTTCGAGG
CGGTTATGCTAGGACTGTTACTCGTAAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGA
TAATACCGCTGGCCGGCGTATCCAGTGGAAGATCACATAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGA
AAACCTTTTTTTCGATTTATGTGAGAAACAGAGATATTACTACGAGTGTATAGAATATAA
GCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTACTTGTTTATGAGATCAATTCCCATCT
GAAAAAAAGATGTTATCACTTTACCG

QA 9 814 9 814
DS 



AS 1 5

CO CL1827Contig1 882 5 14 U
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CCATCAAAAGAGAATTCAGCGAAGTGAAGAAAACAAAATGTAATCCACGAAATGGTAGAA
ACAAGAAAATGTCAAAGCTACCGAAAAGGACAGAGGTG*ATGGGTAAATTAACAGACACG
GTTGGTGATACTCATGGAAAGAGACTTGAGCTGTGTGTTCCATTTATCAACCGCCTTGTG
AAGTTTCCTTCCATTAGCGCTGTCACCTCTCAGCAAGTAACGGTTGATCTCATCAATGTG
TCCATCGATTCGGCTGTCCAGTATAAGCGACACCAGCAACTCCGTCACATCCTTCTCTGG
CACGTTAAGCTCCTTCGATATGAAAGGGATCCCGATCTTTGTGTAGGGCTTTATCAGCTT
CAGCAACACCTGTGTCCTCACCTTCTTCAGCAGATCTTCCATGTAGTTTCTGATGAATGG
ATCGTCCATTATTGTCTTCCGGTTATTCTTGAGTATTTTCTCAAACTCTATGATTTCGTT
TCGTTGATAGGCTGCTACCAGATTCGTCATAGCCAAGATCTCAGGGTCGTTTTTGTACGG
CTTTGCCTCTTGACCGTCAAATGGATTCACTTCCAACTCCATCAGCATGTTCGCAAGAAC
AAGATACTTTAAGCACTGAATACGCCTTTGGTTGCCAGCTTCATCATAATTTTTGAAAGC
CTCAAAGAAGTCAGTGGCCGCTTCAGCCCACTGACGTTCGGCCATGTGCATCTTGCCACC
ACACTCGCGGATAATACCCATGATCCTAGGATGAGGAATAGCAGATTTGATAGCAAGTGC
TTTCTGGTACAGTTGCTTGAGCTTTTTGTTGTCCTTAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B102JQ U 37
AF RR4GB50JQ U 1
AF RR4B340JQ U 37
AF RR4B340TF C 47
AF RR4B102TF C 79
BS 1 68 RR4GB50JQ
BS 69 69 RR4B102JQ
BS 70 147 RR4GB50JQ
BS 148 148 RR4B102JQ
BS 149 158 RR4GB50JQ
BS 159 159 RR4B102JQ
BS 160 319 RR4GB50JQ
BS 320 320 RR4B102JQ
BS 321 624 RR4GB50JQ
BS 625 625 RR4B340JQ
BS 626 634 RR4GB50JQ
BS 635 635 RR4B340JQ
BS 636 805 RR4GB50JQ
BS 806 882 RR4B340TF

RD RR4B102JQ 539 0 0
GAACAAAATGTAACTCACATATCACCATCAAAAGAGAATTCAGCGAAGTGAAGAAAACAA
AATGTAATCCACGAAATGGTAGAAACAAGAAAATGTCAAAGCTACCGAAAAGGACAGAGG
TG*ATGGGTAAATTAACAGACACGGTTGGTGATACTCATGGAAAGAGACTTGAGCTGTGT
GTTCCATTTATCAACCGCCTTGTGAAGTTTCCTTCCATTAGCGCTGTCACCTCTCAGCAA
GTAACGGTTGATCTCATCAATGTGTCCATCGATTCGGCTGTCCAGTATAAGCGACACCAG
CAACTCCGTCACATCCTTCTCTGGCACGTTAAGCTCCTTCGATATGAAAGGGATCCCGAT
CTTTGTGTAGGGCTTTATCAGCTTCAGCAACACCTGTGTCCTCACCTTCTTCAGCAAATC
TTCCATGTAGTTTCTGATGAATGGATCGTCCATTATTGTCTTCCGGTTATTCTTGAGTAT
TTTCTCAAACTCTATGATTTCGTTTCGTTGATAGGCTGCTACCAGATTCGTCATAGCCA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4GB50JQ 805 0 0
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CCATCAAAGGAGAATTCAGCGAAGTGAAGAAAACAAAATGTAATCCACGAAATGGTAGAA
ACAAGAAAATGTCAAAGCTACCGAAAAAGACAGAGGTGGATGGGTAAATTAACAGACACG
GTTGGTGATACTCATGGAAAGAGACTTGAGCTGTGTGTTCCATTTATCAACCGCCTTGTG
AAGTTTCCTTCCATTAGCGCTGTCACCTCTCAGCAAGTAACGGTTGATCTCATCAATGTG
TCCATCGATTCGGCTGTCCGGTATAAGCGACACCAGCAACTCCGTCACATCCTTCTCTGG
CACGTTAAGCTCCTTCGATATGAAAGGGATCCCGATCTTTGTGTAGGGCTTTATCAGCTT
CAGCAACACCTGTGTCCTCACCTTCTTCAGCAGATCTTCCATGTAGTTTCTGATGAATGG
ATCGTCCATTATTGTCTTCCGGTTATTCTTGAGTATTTTCTCAAACTCTATGATTTCGTT
TCGTTGATAGGCTGCTACCAGATTCGTCATAGCCAAGATCTCAGGGTCGTTTTTGTACGG
CTTTGCCTCTTGACCGTCAAATGGGTTCACTTCCGACTCCATCAGCATGTTCGCAAGAAC
AAGATACTTTAAGCACTGAATACGCCTTTGGTTGCCAGCTTCATCATAATTTTTGAAAGC
CTCAAAGAAGTCAGTGGCCGCTTCAGCCCACTGACGTTCGGCCATGTGCATCTTGCCACC
ACACTCGCGGATAATACCCATGATC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4B340JQ 753 0 0
GAACAAAATGTAACTCACATATCACCATCAAAAGAGAATTCAGCGAAGTGAAAAAAACAA
AATGTAATCCACGAAATGGTAAAAACAAGAAAATGTCAAAGCTACCGAAAAGGACAGAGG
TG*ATGGGTAAATTAACAGACACGGTTGGTGATACTCATGGAAAGAGACTTGAGCTGTGT
GTTCCATTTATCAACCGCCTTGTGAAGTTTCCTTCCATTAGCGCTGTCACCTCTCAGCAA
GTAACGGTTGATCTCATCAATGTGTCCATCGATTCGGCTGTCCAGTATAAGCGACACCAG
CAACTCCGTCACATCCTTCTCTGGCACGTTAAGCTCCTTCGATATGAAAGGGATCCCGAT
CTTTGTGTAGGGCTTTATCAGCTTCAGCAACACCTGTGTCCTCACCTTCTTCAGCAAATC
TTCCATGTAGTTTCTGATGAATGGATCGTCCATTATTGTCTTCCGGTTATTCTTGAGTAT
TTTCTCAAACTCTATGATTTCGTTTCGTTGATAGGCTGCTACCAGATTCGTCATAGCCAA
GATCTCAGGGTCGTTTTTGTACGGCTTTGCCTCTTGACCGTCAAATGGATTCACTTCCAA
CTCCATCAGCATGTTCGCAAGAACAAGATACTTTAAGCACTGAATACGCCTTTGGTTGCC
AGCTTCATCATAATTTTTGAAAGCCTCAAAGAAGTCAGTGGCCGCTTCAGCCCACTGACG
TTCGGCCATGTGCATCTTGCCACCACACTCGCG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4B340TF 836 0 0
TAACTCACATATCACCATCAAAAGAGAATTCAGCGAAGTGAAGAAAACAAAATGTAATCC
ACGAAATGGTAGAAACAAGAAAATGTCAAAGCTACCGAAAAGGACAGAGGTG*ATGGGTA
AATTAACAGACACGGTTGGTGATACTCATGGAAAGAGACTTGAGCTGTGTGTTCCATTTA
TCAACCGCCTTGTGAAGTTTCCTTCCATTAGCGCTGTCACCTCTCAGCAAGTAACGGTTG
ATCTCATCAATGTGTCCATCGATTCGGCTGTCCAGTATAAGCGACACCAGCAACTCCGTC
ACATCCTTCTCTGGCACGTTAAGCTCCTTCGATATGAAAGGGATCCCGATCTTTGTGTAG
GGCTTTATCAGCTTCAGCAACACCTGTGTCCTCACCTTCTTCAGCAGATCTTCCATGTAG
TTTCTGATGAATGGATCGTCCATTATTGTCTTCCGGTTATTCTTGAGTATTTTCTCAAAC
TCTATGATTTCGTTTCGTTGATAGGCTGCTACCAGATTCGTCATAGCCAAGATCTCAGGG
TCGTTTTTGTACGGCTTTGCCTCTTGACCGTCAAATGGATTCACTTCCAACTCCATCAGC
ATGTTCGCAAGAACAAGATACTTTAAGCACTGAATACGCCTTTGGTTGCCAGCTTCATCA
TAATTTTTGAAAGCCTCAAAGAAGTCAGTGGCCGCTTCAGCCCACTGACGTTCGGCCATG
TGCATCTTGCCACCACACTCGCGGATAATACCCATGATCCTAGGATGAGGAATAGCAGAT
TTGATAGCAAGTGCTTTCTGGTACAGTTGCTTGAGCTTTTTGTTGTCCTTAGTTTC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR4B102TF 804 0 0
GCGAAGTGAAGAAAACAAAATGTAATC*ACGAAATGGTAGAAACAAGAAAATGTCAAAGC
TACCGAAAAGGACAGAGGTG*ATGGGTAAATTAACAGACACGGTTGGTGATACTCATGGA
AAGAGACTTGAGCTGTGTGTTCCATTTATCAACCGCTTTGTGAAGTTTCCTTCCATTAGC
GCTGTCACCTCTCAGCAAGTAACGGTTGATCTCATCAATGTGTCCATCGATTCGGCTGTC
CAGTATAAGCGACACCAGCAACTCCGTCACATCCTTCTCTGGCACGTTAAGCTCCTTCGA
TATGAAAGGGATCCCGATCTTTGTGTAGGGCTTTATCAGCTTCAGCAACACCTGTGTCCT
CACCTTCTTCAGCAGATCTTCCATGTAGTTTCTGATGAATGGATCGTCCATTATTGTCTT
CCGGTTATTCTTGAGTATTTTCTCAAACTCTATGATTTCGTTTCGTTGATAGGCTGCTAC
CAGATTCGTCATAGCCAAGATCTCAGGGTCGTTTTTGTACGGCTTTGCCTCTTGACCGTC
AAATGGATTCACTTCCAACTCCATCAGCATGTTCGCAAGAACAAGATACTTTAAGCACTG
AATACGCCTTTGGTTGCCAGCTTCATCATAATTTTTGAAAGCCTCAAAGAAGTCAGTGGC
CGCTTCAGCCCACTGACGTTCGGCCATGTGCATCTTGCCACCACACTCGCGGATAATACC
CATGATCCTAGGATGAGGAATAGCAGATTTGATAGCAAGTGCTTTCTGGTACAGTTGCTT
GAGCTTTTTGTTGTCCTTAGTTTC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 5

CO CL1828Contig1 765 5 2 U
GGAGTTTTCCTCCGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTTAAGCT
GTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAA
CGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCA
TGAGATTCCTCCAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGAT
TGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGG
ACAGAACACGGTTCTCCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGG
TCCTGCACCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAA
GTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCA
AAACTGTTTCGAGCTTCTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTT
GTAGACCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTC
TGTTCTAATCGACAATTGAATGTTTTGCTTCCGCCAATATTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G072TF U 1
AF RR4D350TF U 77
AF RR4G072JQ C 144
AF RR4FM52JQ C 83
AF RR4FM52TF U 83
BS 1 740 RR4G072TF
BS 741 765 RR4D350TF

RD RR4G072TF 740 0 0
GGAGTTTTCCTCCGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTTAAGCT
GTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAA
CGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCA
TGAGATTCCTCCAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGAT
TGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGG
ACAGAACACGGTTCTCCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGG
TCCTGCACCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAA
GTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCA
AAACTGTTTCGAGCTTCTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTT
GTAGACCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTC
TGTTCTAATCGACAATTGAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4D350TF 689 0 0
GCTCCAA
AGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTTAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAA
CCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGG
CTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAAGATTGCTG
TGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTCCAATGAAGGTTA
CTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCT
TGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTCCTAAGAG
GACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCACCTGGTGTGCCACACA
GCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGC
GAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAGCTTCCTGTTT
CCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCGCTTTTGTTACTTTTT
GCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAATGT
TTTGCTTCCGCCAATATTCTTG

QA 8 689 8 689
DS 

RD RR4G072JQ 597 0 0
CCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGG
CTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAAGATTGCTG
TGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTCCAATGAAGGTTA
CTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCT
TGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTCCTAAGAG
GACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCACCTGGTGTGCCACACA
GCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGC
GAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAGCTTCTTGTTT
CCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCGCTTTTGTTACTTTTT
GCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4FM52JQ 658 0 0
G
AGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTTAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAA
CCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGG
CTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAAGATTGCTG
TGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTCCAATGAAGGTTA
CTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCT
TGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTCCTAAGAG
GATCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCACCTGGTGTGCCACACA
GCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGT
GAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAGCTTCTTGTTT
CCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCGCTTTTGTTACTTTTT
GCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAA

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR4FM52TF 658 0 0
G
AGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTTAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAA
CCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGG
CTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAAGATTGCTG
TGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTCCAATGAAGGTTA
CTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCT
TGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTCCTAAGAG
GATCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCACCTGGTGTGCCACACA
GCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGT
GAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAGCTTCTTGTTT
CCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCGCTTTTGTTACTTTTT
GCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAA

QA 2 658 2 658
DS 



AS 1 5

CO CL1829Contig1 870 5 4 U
GGAAAACGCTCAGTATCTCCGGCTACTTGAAACCAGACCTCGAGATCAAATTAGGGCACA
AAGCCCTGTCGGAGACAGAAGCTATGGGGAGGAAGAAACTTGAAATCAAACGAATTGAGA
ACAAAAGTAGCCGACAAGTTACCTTCTCCAAACGACGCAACGGTCTCATCGAGAAAGCTC
GCCAGCTTTCCGTTCTCTGTGACGCATCCGTCGCTCTCCTTGTCGTCTCCGCCTCCGGAA
AACTCTACAGCTTCTCCTCCGGTGATAGCCTGGTCAAGATCCTTGATCGCTATGGAAAGC
AACATGACGATGATCTTAAAGCCTTGGAGCGTCAGTCAAATCCTCTGAACTGTGGTTCAC
ACCATGAGCTACTGGAACTAGTGGAAAGCAAGCTTGAGGAATCAAATGTCGATAATGTAA
GTGTCGGTTCCCTCGTTCAGCTGGAGGAACAACTTGAGAACGCCCTCTCCGTAACAAGAG
CTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCTTAAAGAAAAGGAGAAATTGC
TGGAAGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGATGGAGAAGAATAATCTTTTGAGAGCTG
AAGCTGATAATATGGAGGTGTCACCTGGACAAATCTCCGACATCAATCTTCCGGTAACTC
TCCCACTGCTTAATTAGTCACCTTTATTAATTGGTGGATAAATAAAATCCAAAACATATA
ATTTTTAAAAAGAAGATGTGTAGTTATCCCCTTTTAAAGGGTGTACGTTGTATAATCTCA
ATACCCTCTCCGGCTGAGAGACTTTGGATGTAAAATTACTTGAGATTTAACTATGTAAAA
TAAAAAATCTATGTAAGACACTTTGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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ATTTTT

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G
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T

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H362JQ U 1
AF RR4G957JQ U 49
AF RR4CQ83JQ U 203
AF RR4CQ83TF C 656
AF RR4H362TF C 895
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TATCGATATTGACCGTCAAATAAATATACACTGATACAAATACATAAA****AGAAAAAC
AAAAAGTACAATACATCACCCATGAGAAACAACATTACAAAAAGAAGAGCATCGTATCAA
AGTAGAAAATACTCGAGGAAGAAGTTTGTCTATGTATACCCAACAAGCAAAAAGCAATAT
CATCAAGGCTTTCTTGCTGCAAATTGATTCCCAGACTTGAGATTATCTTGAGGGACGTCC
ATGGGCAGCTTGGTCCAGTTAAAGACGTCATCTCTGACTTTCTTCCTCTGAACCACAACG
TAAAAGCTCATGAATATACACATAAAGGCCATCATTGCGATGAATATGCTTAGGTTTCTT
CTATTTGGGCAAGAAGTGAGAATCATATCTGTTGAAACAAACCCATCAAGACTCCCCATC
GAGTTATTCATCTTCATGATCTCAACACCGTTCAACATCGCATCCACCCCACGCTCATCA
ACACTGGTCTTGTTTGATGGTCCCACACTTACTCTAATCGATGATCCTGAAGGGTTGTTG
GAATCAGCTGTAAGATCCACCACGAAATCCATGTAATAAGGGGAAGCTAGGACGTAACCA
GTAGAGTCAGAGATATCGAAATCTTGATACGCCGAGTTCCCGTTGATGTAAACGTTGAAA
TAGAGGAGACCGAGTGATTTGCTAGCAATG

QA 1 750 1 750
DS 

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GAAAAAAAAAACAAAAAGTACAATACATCACCCATGAGAAACAACATTA*AAAAAGAAGA
ACATCGTATCAAAGTAGAAAATACTCGAGGAAGAAGTTTGTTTATGTATACCCAACAAGC
AAAAAGCAATATCATCAAGGCTTTCTTGCTGCAAATTGATTCCCAGACTTGAGATTATCT
TGAGGGACGTCCATGGGCAGCTTGGTCCAGTTAAAGACGTCATCTCTGACTTTCTTCCTC
TGAACCACAACGTAAAAGCTCATGAATATACACATAAACGCCATCATTGCGATGAATATG
CTTAGGTTTCTTCTATTTGGGCAAGAAGTGAGAATCATATCTGTTGAAACAAACCCATCA
AGACTCCCCATCGAGTTATTCATCTTCATGATCTCAACACCGTTCAACATCGCATCCACC
CCATGCTCATCAACACTGGTCTTGTTTGATGGTCCCACACTTACTCTAATCGATGATCCC
GAAGGGTTGTTGGAATCAGCGGTAAGATCCACCACGAAATCCATGTAATAAGGGGAAGCA
AGGACGTAACCAGTAGAGTCAGAGATATCGAAATCTTGATACACCAAGTTCCCGTTGATG
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ATCAGATATTTGTAACCCGTGCTCACAGGGAAGTCCCAACTCATAACGTTGCCCACAC

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DS 

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ATTGATTCCCAGACTTGAGATTATCTTGAGGGACGTCCATGGGCAGCTTGGTCCAGTTAA
AGACGTCATCTCTGACTTTCTTCCTCTGAACCACAACGTAAAAGCTCATGAATATACACA
TAAACGCCATCATTGCGATGAATATGCTTAGGTTTCTTCTATTTGGGCAAGAAGTGAGAA
TCATATCTGTTAAAACAAACCCATCAAGACTCCCCATCGAGTTATTCATCTTCATGATCT
CAACACCGTTCAACATCGCATCCACCCCATGCTCATCAACACTGGTCTTGTTTGATGGTC
CCACACTTACTCTAATCGATGATCCCGAAGGGTTGTTGGAATCAGCGGTAAGATCCACCA
CGAAATCCATGTAATAAGGGGAAGCAAGGACGTAACCAGTAGAGTCAGAGATATCGAAAT
CTTGATACACCAAGTTCCCGTTGATGTAAACGTTGGAATAGAGGAGACCGAGTGATTTGC
TAGCAATGTCACAGAAATGCATCCGGATCAGATATTTGTAACCCGTGCTC

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DS 

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T
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GGAATAGAGGAGACCGAGTGATTTGCTAGCAATGTCACAGAAATGCATCCGGATCAGATA
TTTGTAACCCGTGCTCACAGGGAAGTCCCAACTCATAACGTTGCCCACACGGGCAGTGTT
GTAGACGTTATCAGGACCAACTTCCCGGCTCGCACCTCCGGGCCTATACTTAATCCTACC
GGTGAAGTAAGCTTTGCGAGAAGAAGACCCACCAACGGATTTGAACAAGTCATCATCAGG
GAGCCAAGTTCTCCACAAGGTGTCATTGAAAGGAGTGACCTTTCTACCACCAACATTGAT
TCTGTACATCACTTCCATAGCTTGCTTAGCTAAACCATTCACTTTCCCAGTCCCATCACC
AGAGACAGAGGTTGCCACGTCAGCAATCAAATCCTTAGGCGCGGATATAACTTCTATAGC
GTTAACGAACGCTAATTTCGGATCTTTACTAGGAACAAACCTGACCACAACCTCTCCAAC
ACCGACCCAAATCAGAAATTCCCTAACTTTATTAGACGACGTGCCGTTAAAATTTGTAAG
GACGACGTGGCCGTTAACGGTGACGTGAAACTCAGCGCCGTTAAGATCGATTTTAGAGGA
AGTGAGTCGATTGAAATGGAGACGTACCATGTGAGTCCCTTTCTCGCGGACATTGAACTC
GTACTTGGCCTGTCGCGTGAATACCCTGGCGGTCCGGTAG
C

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DS 

RD RR4H362TF 716 0 0
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GGCAGCCAAGTTCTCCACAAGGTGTCAT*GAAAGGAGTGACCTTTCTACCACCAACATTG
ATTCTGTACATCAGTTCCATAGCTTGCTTAGCTAAACCATTCACTTTCCCAGTTCCATCA
CCAGATACAGAGGTTGCCACGTCAGCGATCAAATCCTTAGGCGCGGATATAACTTCTATA
GCGTTAACGAACGCTAATTTCGAATCTTTACTAGGAACAAACCTGACCACAACCTCTCCA
ACACCGACCCAAATCAGAAATTCCCTAACTTTATTAGGAAACGTGCCGTTAAAATTTGTA
AGGACGACGTGGCCGTTAACGGTGACGTGAAACTCAGCGCCGTTAAGATCGATTTTAGAG
GAAGTGAGTCGATTGAAATGGAGAAGTACCATGTGAGTCCCTTTCTCGCGGACATTGAAC
TCGTACTTGGCCTGTCGCGTGAATACCCTGGCGGTCCGGTAGATCTGAGGGACGTTCGGA
GCTAGATCTTCTCCCTGGAGGGAGACTGATCCTTCCGATGAGAAGAACTTCACTTTCGAT
GATGCGTCGGAGACGAAACGGCGGTTATCCACGGTGGAGTCAACGTCCGAGCCGCAGTTC
ACGAGGTAGTCGTCGGAGGGGGAGAAAGAGAGAGATGAGATTGAGATTGAGGATGC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 5

CO CL1831Contig1 968 5 13 U
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GTGAAAAAGAGACGTCGAATCGTAATCAAACCGCCGTCGCCGCTTCACCGTTCGAATCTC
GTTGAATCTCAAAATGGCTCATTTCGCGCAAAGCCGAAACGTGATCCGGCATGTAGTATC
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GAAAGCAGGTGAGACGGTGAAGGTAGCTCCTGGTTACTTCAGGAATCACCTTATGCCTAA
ACTCCTTGCTGTCCCCAACATTGACAAGTATGCTCATCTCATCCGTGAGCAACGCATGAT
GCGTAACTATGAAGAAAAGGAAGAGGTTAAGGTGGTTCATAAGTCTTCTGAAGTCCAGAC
TAAAGAGTTTGAAAAGGCAGCTAAGCGTCTGGCCAATGCCAACTTGGTACTGAGGAAGTT
AATTGACAAGGAGAAGTTCAAAAACCGCTCCTCAAAAGAGGACAAACCGGATGTGCAAAC
ACCTGTGACAAAGGAAGAGATTGTCGCTGAGGTGGCGAGGCAGCTGTGTGTGAAGATTGA
TCCGGACAATGTGGTTCTTACGGAGCCGTTGGCAACTTTTGGCGAGTACGAGGTTCCTTT
GAAGTTCCCAAAGACTATTCCAATGCCACCAGGAACTGTTCAATGGATTTTCAAAGTCAA
ACTCCGTGGCCATTAAAATCTCCTTCCTTTTTATATTTTTGTTTTACTTCAATTTGGTTC
ATGTAGCCTTGAAATTGCAGATCAGCTGCATTTGTCTTTTTATATGTAAACCGGTTTTAG
TTTAAACCATGATTCGAATTTTGTATGCCCAACTACAAGGAAATTAATAAGTTTTTTTTT
TTTGGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4DW56TF U 1
AF RR4GU90TF U 67
AF RR4G363TF U 92
AF RR4DW56JQ C 243
AF RR4GU90JQ C 467
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RD RR4DW56TF 708 0 0
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GTTGAATCTCAAAATGGCTCATTTCGCGCAAAGCCGAAACGTGATCCGGCATGTAGTATC
CAGAGGCACAGCTGTCCACAAATACGAGAACGCGATCCACCATCCTCTCCTTTTCGCCTG
TCAAGGAGTTCGATACAGAAAACTGGAAGTCATCCTCACCACGGGCATAGAGAAGCTTGG
GAAAGCAGGTGAGACGGTGAAGGTAGCTCCTGGTTACTTCAGGAATCACCTTATGCCTAA
ACTCCTTGCTGTCCCCAACATTGACAAGTATGCTCATCTCATCCGTGAGCAACGCATGAT
GCGTAACTATGAAGAAAAGGAAGAGGTTAAGGTGGTTCATAAGTCTTCTGAAGTCCAGAC
TAAAGAGTTTGAAAAGGCAGCTAAGCGTCTGGCCAATGCCAACTTGGTACTGAGGAAATT
AATTGACAAGGAGAAGTTCAAAAACCGCTTCTCAAAAGAGGACAAACCGGATGTGCAAAC
ACCTGTGACAAAGGAAGAGATTGTCGCTGAGGTGGCGAGGCAGCTGTGTGTGAAGATTGA
TCCGGACAATGTGGTTCTTACG*AGCCGTTGGCAACTTTTGGCGAGTA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4GU90TF 651 0 0
GG
GAGACGTCGAATCGTAATCAAACCGCCGTCGCCGCTTCACCGTTCGAATCTCGTTGAATC
TCAAAATGGCTCATTTCGCGCAAAGCCGAAACGTGATCCGGCATGTAGTATCCAGAGGCA
CAGCTGTCCACAAATACGAGAACGCGATCCACCATCCTCTCCTTTTCGCCTGTCAAGGAG
TTCGATACAGAAAACTGGAAGTCATCCTCACCACGGGCATAGAGAAGCTTGGGAAAGCAG
GTGAGACGGTGAAGGTAGCTCCTGGTTACTTCAGGAATCACCTTATGCCTAAACTCCTTG
CTGTCCCCAACATTGACAAGTATGCTCATCTCATCCGTGAGCAACGCAAGATGCGTAACT
ATGAAGAAAAGGAAGAGGTTAAGGTGGTTCATAAGTCTTCTGAAGTCCAGACTAAAGAGT
TTGAAAAGGCAGCTAAGCGTCTGGCCAATGCCAACTTGGTACTGAGGAAGTTAATTGACA
AGGAGAAGTTCAAAAACCGCTCCTCAAAAGAGGACAAACCGGATGTGCAAACACCTGTGA
CAAAGGAAGAGATTGTCGCTGAGGTGGCGAGGCAGCTGTGTGTGAAGATTGATCCGGACA
ATGTGGTTCTTACGGAGCCGTTGGCAACTTTTGGCGAGTACGAG
TTCCT

QA 3 646 3 646
DS 

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G
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GCCGAAACGTGATCCGGCATGTAGTATCCAGAGGCACAGCTGTCCACAAATACGAGAACG
CGATCCACCATCCTCTCCTTTTCGCCTGTCAAGGAGTTCGATACAGAAAACTGGAAGTCA
TCCTCACCACGGGCATAGAGAAGCTTGGGAAAGCAGGTGAGGTGGTGAAGGTAGCTCCTG
GTTACTTCAGGAATCACCTTATGCCTAAACTCCTTGCTGTCCCCAACATTGACAAGTATG
CTCATCTCATCCGTGAGCAACGCAAGATGCGTAACTATGAAGAAAAGGAAGAGGTTAAGG
TGGTTCATAAGTCTTCTGAAGTCCAGACTAAAGAGTTTGAAAAGGCAGCTAAGCGTCTGG
CCAATGCCAACTTGGTACTGAAGAAGTTAATTGACAAGGAGAAGTTCAAAAACCGCTCCT
CAAAAGAGGACAAACCGGATGTGCAAACACCTGTGACAAAGGAAGAGATTGTCGCTGAGG
TGGCGAGGCAGCTGTGTGTGAAGATTGATCCGGACAATGTGGTTCTTACGGAGCCGTTGG
CAACTTTTGGCGAGTACGAG*TTCCTTTGAAGTTCCCAAAGACTATTCCAATGCCACCAG
GAACTGTTCAATGGATTCTCAA
GT

QA 2 683 2 683
DS 

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AAGCAGGTGAGACGGTGAAGGTAGCTCCTGGTTACTTCAGGAATCACCTTATGCCTAAAC
TCCTTGCTGTCCCCAACATTGACAAGTATGCTCATCTCATCCGTGAGCAACGCATGATGC
GTAACTATGAAGAAAAGGAAGAGGTTAAGGTGGTTCATAAGTTTTTTGAAGTCCAGACTA
AAGAGTTTGAAAAGGCAGCTAAGCGTCTGGCCAATGCCAACTTGGTACTGAGGAAATTAA
TTGACAAGGAGAAGTTCAAAAACCGCTTTTCAAAAGAGGACAAACCGGATGTGCAAACAC
CTGTGACAAAGGAAGAGATTGTCGCTGAGGTGGCGAGGCAGCTGTGTGTGAAGATTGATC
CGGACAATGTGGTTTTTACGGAGCCGTTGGCAACTTTTGGCGAGTACGAGGTTCCTTTGA
AGTTCCCAAAGACTATTCCAATGCCACCAGGAACTGTTCAATGGATTTTCAAAGTCAAAC
TCCGTGGCCATTAAAATCTCCTTCCTTTTTATATTTTTGTTTTACTTCAATTTGGTTCAT
GTAGCCTTGAAATTGCAGATCAGCTGCATTTGTCTTTTTATATGTAAACCGGTTTTAGTT
TAAACCATGATTCGAATTTTGTATGCCCAACTACAAGGAAATTAATAAGTTTTTTTTTTT
TGGGCG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4GU90JQ 502 0 0
TCTGAAGTCCAGACTAAAGAGTTTGAAAAGGCAGCTAAGCGTCTGGCCAATGCCAACTTG
GTACTGAGGAAGTTAATTGACAAGGAGAAGTTCAAAAACCGCTCCTCAAAAGAGGACAAA
CCGGATGTGCAAACACCTGTGACAAAGGAAGAGATTGTCGCTGAGGTGGCGAGGCAGCTG
TGTGTGAAGATTGATCCGGACAATGTGGTTTTTACGGAGCCGTTGGCAACTTTTGGGGAG
TACGAGGTTCCTTTGAAGTTCCCAAAGACTATTCCAATGCCACCAGGAACTGTTCAATGG
ATTTTCAAAGTCAAACTCCGTGGCCATTAAAATTTCCTTCCTTTTTATATTTTTGTTTTA
CTTCAATTTGGTTCATGTAGCCTTGAAATTGCAGATCAGCTGCATTTGTCTTTTTATATG
TAAACCGGTTTTAGTTTAAACCATGATTCGAATTTTGTATGTCCAACTACAAGGAAATTA
ATAAGTTTTTTTTTTTTGGG
TG

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 4

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AACAATTACAAAAAAGAAGATTAATATTCAAGCAAAACCAAACCAAAAACAACTGTCTGT
TGAATCAATTATTTCTCATATTACCCGATGAAAAAGATAACATATTATTAATCCTCACTG
AAACATTCATTCATCATCATCATCTGACTTTGTGAGAGCAACTAAGAAGAGATCACCAGA
CATCAGGACGGAGTTCCCCAGTGGCCGGTGGCATCCAACGACCAGAATTGTAAACGTTCT
CACCAACTTTCCATCCCGGAACATCCTTCATCACATCAGCCTCGTAGTCCAGATACTTTT
TCCACTCCGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGGGAAGTATTACTCTAC
GAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAACGCCCTGCGGATTTTGTTTCCTTGCCCGACCTGGT
ACATTCCCCAAGCAAAGGCACCAGAGACGGTGAGGAAAATCGCCATGGCGCTAGGACCCG
TATTGGATATCCGACGAGCGTATCGGACCGGCGCGAACCCACCCGGCGGCGGACCATCCT
GAAGCAGCGGCATATCCTTCACACTCGCCATCCCTGGCTTTTTCCTTATCATCGCCTCCG
TCATCTTCGCTCGATCGAATTGACTCTCTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FE11TF C 1
AF RR4FE11JQ U 22
AF RR4BU24JQ U 67
AF RR4BU24TF C 72
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BS 22 201 RR4FE11JQ
BS 202 204 RR4BU24JQ
BS 205 645 RR4FE11JQ
BS 646 695 RR4BU24JQ

RD RR4FE11TF 646 0 0
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TGAATCAATTATTTCTCATATTACCCGATGAAAAAGATAACATATTATTAATCCTCACTG
AAACATTCATTCATCATCATC***TGACTTTGTGAGAGCAACTAAGAAGAGATCACCAGA
CATCAGGACGGAGTTCCCCAGTGGCCGGTGGCATCCAACGACCAGAATTGTAAACGTTCT
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TCCACTCCGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGGGAAGTATTACTCTAC
GAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAACGCCCTGCGGATTTTGTTTCCTTGCCCGACCTGGT
ACATTCCCCAAGCAAAGGCACCAGAGACGGTGAGGAAAATCGCCATGGCGCTAGGACCCG
TATTGGATATCCGACGAGCGTATCGGACCGGCGCGAACCCACCCGGCGGCGGACCATCCT
GAAGCAGCGGCATATCCTTCACACTCGCCATCCCTGGCTTTTTCC
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4FE11JQ 625 0 0
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TAATATTCAAGCAAAACCAAACCAAAAACAACTGTCTGTTGAATCAATTATTTCTCATAT
TACCCGATGAAAAAGATAACATATTATTAATCCTCACTGAAACATTCATTCATCATCATC
***TGACTTTGTGAGAGCAACTAAGAAGAGATCACCAGACATCAGGACGGAGTTCCCCAG
TGGCCGGTGGCATCCAACGACCAGAATTGTAAACGTTCTCACCAACTTTCCATCCCGGAA
CATCCTTCATCACATCAGCCTCGTAGTCCAGATACTTTTTCCACTCCGACACAAACCTTT
CATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGGGAAGTATTACTCTACGAGCAGCATATTTCTCTTCCT
TCAACGCCCTGCGGATTTTGTTTCCTTGCCCGACCTGGTACATTCCCCAAGCAAAGGCAC
CAGAGACGGTGAGGAAAATCGCCATGGCGCTAGGACCCGTATTGGATATCCGACGAGCGT
ATCGGACCGGCGCGAACCCACCCGGCGGCGGACCATCCTGAAGCAGCGGCATATCCTTCA
CACTCGCCATCCCTGGCTTTTTCC
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4BU24JQ 629 0 0
C
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ATTATTTCTCATATTACCCGATGAAAAAGATAACATATTATTAATCCTCACTGAAACATT
CATTCATCATCATCATCTGACTTTGTGAGAGCAACTAAAAAGAGATCACCAGACATCAGG
ACGGAGTTCCCCAGTGGCCGGGGGCATCCAACGACCAGAATTGTAAACGTTCTCACCAAC
TTTCCATCCCGGAACATCCTTCATCACATCAGCCTCGTAGTCCAAATACTTTTTCCACTC
CGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAAAATGGGAAGTATTGCTCTACGAGCAGC
ATATTTCTCTTCCTTCAACGCCCTGCGGATTTTGTTTCCTTGCCCGACCTGGTACATTCC
CCAAGCAAAGGCACCAAAAACGGTGAGGAAAATCGCCATGGCGCTAGGACCCGTATTGGA
TATCCGACGAGCGTATCGGACCGGCGCGAACCCACCCGGCGGCGGACCATCCTGAAGCAG
CGGCATATCCTTCACACTCGCCATCCCTGGCTTTTTCCTTATCATCGCCTCCGTCATCTT
CGCTCGATCGAATTGACTCTCTGTTCCC

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR4BU24TF 624 0 0
AAAAGAAGATTAATATTCAAGCAAAACCAAACCAAAAACAACTGTCTGTTGAATCAATTA
TTTCTCATATTACCCGATGAAAAAGATAACATATTATTAATCCTCACTGAAACATTCATT
CATCATCATCATCTGACTTTGTGAGAGCAACTAAGAAGAGATCACCAGACATCAGGACGG
AGTTCCCCAGTGGCCGGTGGCATCCAACGACCAGAATTGTAAACGTTCTCACCAACTTTC
CATCCCGGAACATCCTTCATCACATCAGCCTCGTAGTCCAGATACTTTTTCCACTCCGAC
ACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGGGAAGTATTGCTCTACGAGCAGCATAT
TTCTCTTCCTTCAACGCCCTGCGGATTTTGTTTCCTTGCCCGACCTGGTACATTCCCCAA
GCAAAGGCACCAGAGACGGTGAGGAAAATCGCCATGGCGCTAGGACCCGTATTGGATATC
CGACGAGCGTATCGGACCGGCGCGAACCCACCCGGCGGCGGACCATCCTGAAGCAGCGGC
ATATCCTTCACACTCGCCATCCCTGGCTTTTTCCTTATCATCGCCTCCGTCATCTTCGCT
CGATCGAATTGACTCTCTGTTCCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 5

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GGATACTAAACTATCATCCCAACACA*AAAACACACACATACAGAGTCCCTCGCTTCTGA
TCAGTGTGGTGTGCGGTACCTTTGAAAGAGAAGGAAAAAAATGGGATTCCCTTTTGAAGA
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GCTCGGTGTTTTCGATACTCTCCACGCCGAAGCTGCTCGTACCGACGCCTTCCTCTCACC
ATCTGAGATAGCGAGTAGGCTACCAACTACTCCACGTAACCCTGAGGCGCCGGTTCTGTT
GGACCGGATGCTTCGTCTACTAGCTAGCTACTCGATGGTCAAATGTGATAAGGCTGGAAA
GGACGAGAGAGTCTATAGGGCCGAGCCAATTTGTAGGTTCTTCTTGAAAGATAACATTCA
AGATATTGGATCCCTTGCGTCTCAAGTTATTGTGAATTTTGACAGCGTCTTCCTGAATAC
CTGGGCACAATTGAAAGACGTGGTACTTGAAGGAGGAGATGCATTTGGCCGTGCACATGG
TGGCATGAAACTCTTCGACTATATGGGAACTGATGAGAGGTTCAGCAAGCTCTTTAACCA
GACAGGGTTCACCATCGCTGTGGTGAAGAAG*CTCTTGAAGTTTACCAAGGCTTCGAAGA
TGTGGATGTTTTGGTTGATGTTGGAGGAGGAGTTGGCAACACGCTTGGTGTTGTTACTTC
TAAGTATCCCAATATTAAGGGTATCAACTTTGATCTGACTTGTGCCTTGGCACAAGCACC
TTCTTACCCTGGAGTGGAACATGTCGCTGGAGATATGTTTGTGGATGCTCCAAAGGGAGA
TGCTATGATCTTAAAACGTATACTACATGATTGGACCGACGAAGACTGCGTAAAAATTCT
CAAGAATTGTTGGAAATCACTACCGGAGAACGGTAAGGTTGTTGTGATAGAATTAGTCAC
CCCTGATGACGCGGAGAATGGAGATATTAACGCCAACATTGCCTTTGATATGGATATGTT
GATGTTCACACAATGTTCTGGTGGAAAAGAAAGGTCACGAGCCGAGTTTGAAGCTTTGGC
TGCAGCTTCTGGCTTCACCCATTGCAAATTCGTTTGCCAGGCTTATCACTGCTGGATTAT
TGAGTTTTGTAAAGAAAATGCGTAAAATACAAAACTAAGACGTTTCATCTTTGTTTGATC
AGTTCTTTGTTTGTGATGATGATACTTTGTATGTATGTGTGTTCGAGCAATATGAAAGAA
AAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4EM40TF U 1
AF RR4EY94TF U 1
AF RR4D630TF U 11
AF RR4EM40JQ C 522
AF RR4D630JQ C 845
BS 1 706 RR4EM40TF
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BS 889 1111 RR4EM40JQ
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BS 1113 1247 RR4EM40JQ
BS 1248 1324 RR4D630JQ

RD RR4EM40TF 714 0 0
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TCAGTGTGGTGTGCGGTACCTTTGAAAGAGAAGGAAAAAAATGGGATTCCCTTTTGAAGA
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GATGGCCGTGAGAATAGCCAATGCAGCAGCCTTTCCGATGGTTCTCAAGGCTTCTCTCGA
GCTCGGTGTTTTCGATACTCTCCACGCCGAAGCTGCTCGTACCGACGCCTTCCTCTCACC
ATCTGAGATAGCGAGTAGGCTACCAACTACTCCACGTAACCCTGAGGCGCCGGTTCTGTT
GGACCGGATGCTTCGTCTACTAGCTAGCTACTCGATGGTCAAATGTGATAAGGCTGGAAA
GGACGAGAGAGTCTATAGGGCCGAGCCAATTTGTAGGTTCTTCTTGAAAGATAACATTCA
AGATATTGGATCCCTTGCGTCTCAAGTTATTGTGAATTTTGACAGCGTCTTCCTGAATAC
CTGGGCACAATTGAAAGACGTGGTACTTGAAGGAGGAGATGCATTTGGCCGTGCACATGG
TGGCATGAAACTCTTCGACTATATGGGAACTGATGAGAGGTTCAGCAAGCTCTTTAACCA
GACAGGGTTCACCATCGCTGTGGTGAAGAAG*CTCTTGAAGTTTAC
AAGCTTCG

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DS 

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TCAGTGTGGTGTGCGGTACCTT*GAAAGAGAAGAAAAAAAATGGGATTCCCTTTTGAAGA
AACCTTGAGCTCTAACCCTAAAACCCAAACTGTTGTTGATGATGATAACGAGTTGGGTTT
GATGGCCGTGAGACTAGCCAATGCAGCAGCCTTTCCGATGGTTCTCAAGGCCTCTCTCGA
GCTCGGTGTTTTCGATACTCTCCACGCCGAAGCTGCTCGTACCGACGCCTTCCTCTCACC
ATCTGAGATTGCGAGTAGGCTACCAACTACTCCACGTAACCCTGAGGCACCGGTTTTGTT
GGACCGGATGCTTCGTCTACTAGCTAGCTACTCCATGGTCAAATGCGATAAGGCTGGGAA
GGGTGAGAGAACCTATAGGGCCGAGCCAATTTGCAGGTTCTTCTTGAAAGATAACATTCA
AGATATTGGATCCCTTGCGTCTCAAGTTATTGTCAACTTTGACAGCGTCTTCCTCAATAC
CTGGGCACAACTGAAAGATGTGGTACTTGAAGGAGGAGATGCATTTGGCCGTGCACATGG
TGGCATGAAACTCTTCGACTATATGGAAACTGATGAGAGGTTCAGCAAGCTCTTTAACCA
GACAGG*TTCACCATCGCTGTGGTGAAGAAG*CTCTTGAAGT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4D630TF 651 0 0
GG
ATCATCCCAACACA*AAAACACACACATACAGAGTCCCTCGCTTCTGATCAGTGTGGTGT
GCGGTACCTTTGAAAGATAAGGAAAAAAATGTGATTCCCTTTTGAAGAAACCTTGAGCTC
TAACCCTAAAACCCAAACTGTTGTTGATGATGATAACGAGTTGGGTTTGATGGCCGTGAG
AATAGCCAATGCAGCAGCCTTTCCGATGGTTCTCAAGGCTTCTCTCGAGCTCGGTGTTTT
CGATACTCTCCACGCCGAAGCTGCTCGTACCGACGCCTTCCTCTCACCATCTGAGATAGC
GAGTAGGCTACCAACTACTCCACGTAACCCTGAGGCGCCAGTTCTGTTGGACCGGATGCT
TCGTCTACTAGCTAGCTACTCGATGGTCAAATGTGATAAGGCTGGAAAGGACGAGAGAGT
CCATAGAGCCGAGCCAATTTGTAGGTTCTTCTTGAAAGATAACATTCAAGATATTGGATC
CCTTGCGTCTCAAGTTATTGTGAATTTTGACAGCGTCTTCCTGAATACCTGGGCACAATT
GAAAGACGTGGTACTTGAAGGAGGAGATGCATTTGGCCGTGCACATGGTGGCATGAAACT
CTTCGACTATATGGGAACTGATGAGAG*TTCAGCAAGCTCTTTAACCAG

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DS 

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TCAGCAAGCTCTTTAACCAGACAGGGTTCACCATCGCTGTGGTGAAGAAGGCTCTTGAAG
TTTACCAAGGCTTCGAAGATGTGGATGTTTTGGTTGATGTTGGAGGAGGAGTTGGCAACA
CGCTTGGTGTTGTTACTTCTAAGTATCCCAATATTAAGGGTATCAACTTTGATCTGACTT
GTGCCTTGGCACAAGCACCTTCTTACCCTGGAGTGGAACATGTCGCTGGAGATATGTTTG
TGGATGTTCCAAAGGGAGATGCTATGATCTTAAAACGTATACTACATGATTGGACCGACG
AAGACTGCGTAAAAATTCTCAAGAATTGTTGGAAATCACTACCGGAGAACGGTAAGGTTG
TTGTGATAGAATTAGTCACCCCTGATGACGCGGAGAATGGAGATATTAACGCCAACATTG
CCTTTGATATGGATATGTTGATGTTCACACAATGTTCTGGTGGAAAAGAAGGGTCACGAG
CCGAGTTTGAAGCTTTGGCTGCAGCTTCTGGCTTCACCCATTGCAAATTCGTTTGCCAGG
CTTATCACTGCTGGATTATTGAGTTTTGTAAAGAAAATGCGTAAAATACAAAACTAAGAC
GTTTCA
CC

QA 1 726 1 726
DS 

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ATGATCTTAAAACGTATACTACATGATTGGACCGACGAAGACTGCGTAAAAATTCTCAAG
AATTGTTGGAAATCACTACCGGAGAACGGTAAGGTTGTTGTGATAGAATTAGTCACCCCT
GATGACGCGGAGAATGGAGATATTAACGCCAACATTGCCTTTGATATGGATATGTTGATG
TTCACACAATGTTCTGGTGGAAAAGAAAGGTCACGAGCCGAGTTTGAAGCTTTGGCTGCA
GCTTCTGGCTTCACCCATTGCAAATTCGTTTGCCAGGCTTATCACTGCTGGATTATTGAG
TTTTGTAAAGAAAATGCGTAAAATACAAAACTAAGACGTTTCATCTTTGTTTGATCAGTT
CTTTGTTTGTGATGATGATACTTTGTATGTATGTGTGTTCGAGCAATATGAAAGAAAAAA

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 5

CO CL1834Contig1 789 5 15 U
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ATCTGCTCGAAGCGCGTGGTCGTAGACGCGTGGCACCACATGCTCGGTCGCCTGGCGTCG
ATCGTGGCCAAGGAGCTCCTCAACGGCCAGAAGGTCGTCATCGTGAGATGCGAGGAGATC
TGCCTCTCAGGTGGACTCGTGCGTCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCCGCAAACGC
ATGAACACCAAACCCTCGCACGGTCCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGG
CGTACCGTTCGCGGTATGATTCCACATAAAACGAAGCGTGGAGCTGCTGCACTTGCACGC
ATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAAGTCAAGAGGATGGTTATCCCT
GACGCTCTAAAGGTATTGAGGCTTCAAGCTGGGCACAAGTACTGTCTGTTGGGTCGTCTT
TCTTCTGAAGTTGGGTGGAATCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGGCAAAGAGGAAG
GAGAGATCTCAAGTGGTTTACGAGAGGAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAGCCAAGGCC
*GAGAAGGTCGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTA
CTGAGATCATCACT**AGGGTTTGTCTTGTGCAAGTTTTGAGCCGACCTATCATACTTTT
GTTTTACCTCTTTACGTAGGTGTTGTTTCAGATGTTTTCTTTCTTGAATTCCAATGATTT
GCTGACAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4B946TF U 124
AF RR4B908JQ C 1
AF RR4AN61TF U 44
AF RR4B946JQ C 38
AF RR4B908TF U 1
BS 1 43 RR4B908TF
BS 44 90 RR4AN61TF
BS 91 91 RR4B908TF
BS 92 123 RR4AN61TF
BS 124 600 RR4B946TF
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BS 730 739 RR4AN61TF
BS 740 740 RR4B908TF
BS 741 767 RR4AN61TF
BS 768 768 RR4B908TF
BS 769 783 RR4AN61TF
BS 784 789 RR4B908TF

RD RR4B946TF 606 0 0
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CTCTCAGGTGGACTCGTGCGTCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCCGCAAACGCATG
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TCTGAAGTTGGGTGGAATCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGGCAAAGAGGAAGGAG
AGATCTCAAGTGGTTTACGAGAGGAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAGCCAAGGCCCGA
GAAGGTCGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTG
AGATCATCACCTAAGGGTTTGTCTTGTGCAAGTTTTGAGCCGACCTATCATACTTTTGTT
TTACCT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4B908JQ 786 0 0
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ATCTGCTCGAAGCGCGTGGTCGTAGACGCGTGGCACCACATGCTCGGTCGCCTGGCGTCG
ATCGTGGCCAAGGAGCTCCTCAACGGCCAGAAGGTCGTCATCGTGAGATGCGAGGAGATC
TGCCTCTCAGGTGGACTCGTGCGTCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCCGCAAACGC
ATGAACACCAAACCCTCGCACGGTCCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGG
CGTACCGTTCGCGGTATGATTCCACATAAAACGAAGCGTGGAGCTGCTGCACTTGCACGC
ATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAAGTCAAGAGGATGGTTATCCCT
GACGCTCTAAAGGTATTGAGGCTTCAAGCTGGGCACAAGTACTGTCTGTTGGGTCGTCTT
TCTTCTGAAGTTGGGTGGAATCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGGCAAAGAGGAAG
GAGAGATCTCAAGTGGTTTACGAGAGGAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAGCCAAGGCC
*GAGAAGGTCGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTA
CTGAGATCATCACT**AGGGTTTGTCTTGTGCAAGTTTTGAGCCGACCTATCATACTTTT
GTTTTACCTCTTTACGTAGGTGTTGTTTCAGATGTTTTCTTTCTTGAATTCCAATGATTT
GCT
GAC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4AN61TF 740 0 0
TGGTGTCAGGATCAGGCATCTGCTCGAAGCGCGTGGTCGTAGACGCGCGGCACCACATGC
TCGGTCGCCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTCCTCAACGGCCAGAAGGTCGTCATCG
TGAGATGCGAGGAGATCTGCCTCTCAGGTGGACTCGTGCGTCAGAAAATGAAGTACATGA
GGTTCCTCCGCAAACGCATGAACACCAAACCCTCGCACGGTCCCATTCACTTCCGTGCTC
CCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGCGGTATGATTCCACATAAAACGAAGCGTGGAG
CTGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAAGTCA
AGAGGATGGTTATCCCTGACGCTCTAAAGGTATTGAGGCTTCAAGCTGGGCACAAGTACT
GTCTGTTGGGTCGTCTTTCTTCTGAAGTTGGGTGGAATCACTATGACACCATCAAGGAGC
TGGAGGCAAAGAGGAAGGAGAGATCTCAAGCGGTTTACGAGAGGAAGAAGCAACTTAACA
AACTCATAGCCAAGGCC*GAGAAGGTCGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATT
CTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATCATCACT**AGGGTTTGTCTTGTGCAAGTTTTGAGC
CGACCTATCATACTTTTGTTTTACCTCTTTACGTAG*TGTTGTTTCAGATGTTTTCTTTC
TTGA*TTCCAATGATTTGCT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4B946JQ 749 0 0
AGAAAA
TGGTGTCAGGATCAGGCATCTGCTCGAAGCGCGTGGTCGTAGACGCGTGGCACCACATGC
TCGGTCGCCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTCCTCAACGGCCAGAAGGTCGTCATCG
TGAGATGCGAGGAGATCTGCCTCTCAGGTGGACTCGTGCGTCAGAAAATGAAGTACATGA
GGTTCCTCCGCAAACGCATGAACACCAAACCCTCGCACGGTCCCATTCACTTCCGTGCTC
CCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGCGGTATGATTCCACATAAAACGAAGCGTGGAG
CTGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAAGTCA
AGAGGATGGTTATCCCTGACGCTCTAAAGGTATTGAGGCTTCAAGCTGGGCACAAGTACT
GTCTGTTGGGTCGTCTTTCTTCTGAAGTTGGGTGGAATCACTATGACACCATCAAGGAGC
TGGAGGCAAAGAGGAAGGAGAGATCTCAAGTGGTTTACGAGAGGAAGAAGCAACTTAACA
AACTTAGAGCCAAGGCC*GAGAAGGTCGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATT
CTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATCATCACT**AGGGTTTGTCTTGTGCAAGTTTTGAGC
CGACCTATCATACTTTTGTTTTACCTCTTTACGTAGGTGTTGTTTCAGATGTTTTCTTTC
TTGAATTCCAATGATTTGCT
GAC

QA 7 746 7 746
DS 

RD RR4B908TF 789 0 0
GGGGAACCACTCAGCCGCTAACACACAGAGCAGAACAAGAAAATGGTGTCAGGATCAGGC
ATCTGCTCGAAGCGCGTGGTCGTAGACGCGTGGCACCACATGCTCGGTCGCCTGGCGTCG
ATCGTGGCCAAGGAGCTCCTCAACGGCCAGAAGGTCGTCATCGTGAGATGCGAGGAGATC
TGCCTCTCAGGTGGACTCGTGCGTCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCCGCAAACGC
ATGAACACCAAACCCTCGCACGGTCCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGG
CGTACCGTTCGCGGTATGATTCCACATAAAACGAAGCGTGGAGCTGCTGCACTTGCACGC
ATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAAGTCAAGAGGATGGTTATCCCT
GACGCTCTAAAGGTATTGAGGCTTCAAGCTGGGCACAAGTACTGTCTGTTGGGTCGTCTT
TCTTCTGAAGTTGGGTGGAATCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGGCAAAGAGGAAG
GAGAGATCTCAAGTGGTTTACGAGAGGAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAGCCAAGGCC
*GAGAAGGTCGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTA
CTGAGATCATCACT**AGGGTTTGTCTTGTGCAAGTTTTGAGCCGACCTATCATACTTTT
GTTTTACCTCTTTACGTAGGTGTTGTTTCAGATGTTTTCTTTCTTGAATTCCAATGATTT
GCTGACAAA

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 5

CO CL1835Contig1 815 5 13 U
GAACACAGCCGGTCCAAATGGACATCAAGCCGTGGCCATCCGAGTCAATGGAGACCGTGC
AGTGATCTTCAACTGTAGATTCGACGGTTACCAAGACACTCTATACGTCAACAACGGTCG
TCAATTCTACAGAAACTGTGTCATCTCAGGAACAGTCGATTTCATCTTCGGAAAATCAGC
AACCGTTATCCAAAACTCACTCATCGTCGTCCGTAGAGGAAACAAGGGACAATACAACAC
CGTCACAGCCGACGGAAACGAAATGGGATTT*GCCATGAAACTCGGTATCGTCCTCCAAC
ACTGCC*GCATCGTTCCGGACAGGAAACTAGCAGCAGAGAGGTTGACCGTAGAGTCATAC
TTGGGAAGGCCATGGAAGAAATACTCAACCACGGTGGTCATCAACACTGAACTCGGTGAT
TTGATCAGACCAGAAGGTTGGAGAATGTGGGATGGTGAAAGTAACCACAAGACATGTAGG
TACGTTGAATACAACAACCGTGGACCAGGAGCTAACACTAATAGGAGAGTTAACTGGGCT
AAGGTCGCTAGGACTGCAGGTGAAGTAAGTCAGTTCACTGTGGCTAACTGGTTAAGTCCC
GTTAACTGGATTCAACAAACTAACGTTCCTGTCACGCTTCGATTATAAAGCGTATAAAGA
AAAACAAAAAGACCAGTACTTGTTTATGTAAAAGGTGAAAAATACAACATTTGTTTTCGA
TAGGATAAACTGTATGGGAATGAATTTGTAATAACAAATTATTTTTTTGTTTGTCTCTCG
TATGAAAGATGAATAAAGACACATTCTTTTAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4CR20TF U 1
AF RR4CT65JQ C 37
AF RR4AY32TF U 69
AF RR4CR20JQ C 100
AF RR4BI24TF U 486
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BS 501 503 RR4CT65JQ
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BS 769 783 RR4AY32TF
BS 784 815 RR4BI24TF

RD RR4CR20TF 341 0 0
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QA 1 341 1 341
DS 

RD RR4CT65JQ 774 0 0
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CACTCTATACGTCAACAACGGTCGTCAATTCTACAGAAACTGTGTCATCTCAGGAACAGT
CGATTTCATCTTCGGAAAATCAGCAACCGTTATCCAAAACTCACTCATCGTCGTCCGTAG
AGGAAACAAGGGACAATACAACACCGTCACAGCCGACGGAAACGAAATGGGATTT*GCCA
TGAAACTCGGTATCGTCCTCCAACACTGCC*GCATCGTTCCGGACAGGAAACTAGCAGCA
GAGAGGTTGACCGTAGAGTCATACTTGGGAAGGCCATGGAAGAAATACTCAACCACGGTG
GTCATCAACACTGAACTCGGTGATTTGATCAGACCAGAAGGTTGGAGAATGTGGGATGGT
GAAAGTAACCACAAGACATGTAGGTACGTTGAATACAACAACCGTGGACCAGGAGCTAAC
ACTAATAGGAGAGTTAACTGGGCTAAGGTCGCTAGGACTGCAGGTGAAGTAAGTCAGTTC
ACTGTGGCTAACTGGTTAAGTCCCGTTAACTGGATTCAACAAACTAACGTTCCTGTCACG
CTTCGATTATAAAGCGTATAAAGAAAAACAAAAAGACCAGTACTTGTTTATGTAAAAGGT
GAAAAATACAACATTTGTTTTCGATAGGATAAACTGTATGGGAATGAATTTGTAATAACA
AATTATTTTTTTGTTTGTCTCTCGTATGAAAGATGAATAAAGACACATTCTTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AY32TF 723 0 0
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ACAGAAACTGTGTCATCTCAGGAACAGTCGATTTCATCTTCGGAAAATCAGCAACCGTTA
TCCAAAACTCACTCATCGTCGTCCGTAGAGGAAACAAGGGACAATACAACACCGTCACAG
CCGACGGAAACGAAATGGGATTT*GCCATGAAACTCGGTATCGTCCTCCAACACTGCC*G
CATCGTTCCGGACAGGAAACTAGCAGCAGAGAGGTTGACCGTAGAGTCATACTTGGGAAG
GCCATGGAAGAAATACTCAACCACGGTGGTCATCAACACTGAACTCGGTGATTTGATCAG
ACCAGAAGGTTGGAGAATGTGGGATGGTGAAAGTAACCACAAGACATGTAGGTACGTTGA
ATACAACAACCGC**ACCAGGAGCTAACACTAATAGGAGAGTTAACTGGGCTAAGGTCGC
TAGGACTGCAGGTGAAGTAAGTCAGTTCACTGTGGCTAACTGGTTAAGTCCCGTTAACTG
GATTCAACAAACTAACGTTCCTGTCACGCTTCGATTATAAAGCGTATAAAGAAAAACAAA
AAGACCAGTACTTGTTTATGTAAAAGGTGAAAAATGCAACATTTGTTTTCGATAGGATAA
ACTGTATGGGAATGAATTTGTAATAACAAATTATTTTTT*GTTTGTCTCTCGTAT
TAAGATGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CR20JQ 711 0 0
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TTTCATCTTCGGAAAATCAGCAACCGTTATCCAAAACTCACTCATCGTCGTCCGTAGAGG
AAACAAGGGACAATACAACACCGTCACAGCCGACGGAAACGAAATGGGATTT*GCCATGA
AACTCGGTATCGTCCTCCAACACTGCC*GCATCGTTCCGGACAGGAAACTAGCAGCAGAG
AGGTTGACCGTAGAGTCATACTTGGGAAGGCCATGGAAGAAATACTCAACCACGGTGGTC
ATCAACACTGAACTCGGTGATTTGATCAGACCAGAAGGTTGGAGAATGTGGGATGGTGAA
AGTAACCACAAGACATGTAGGTACGTTGAATACAACAACCGTGGACCAGGAGCTAACACT
AATAGGAGAGTTAACTGGGCTAAGGTCGCTAGGACTGCAGGTGAAGTAAGTCAGTTCACT
GTGGCTAACTGGTTAAGTCCCGTTAACTGGATTCAACAAACTAACGTTCCTGTCACGCTT
CGATTATAAAGCGTATAAAGAAAAACAAAAAGACCAGTACTTGTTTATGTAAAAGGTGAA
AAATACAACATTTGTTTTCGATAGGATAAACTGTATGGGAATGAATTTGTAATAACAAAT
TATTTTTTTGTTTGTCTCTCGTATGAAAGATGAATAAAGACACATTCTTTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BI24TF 330 0 0
GGAATACAACAACCGTGG
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AGTAAGTCAGTTCACTGTGGCTAACTGGTTAAGTCCCGTTAACTGGATTCAACAAACTAA
CGTTCCTGTCACGCTTCGATTATAAAGCGTATAAAGAAAAACAAAAAGACCAGTACTTGT
TTATGTAAAAGGTGAAAAATACAACATTTGTTTTCGATAGGATAAACTGTATGGGAATGA
ATTTGTAATAACAAATTATTTTTT*GTTTGTCTCTCGTATGAAAGATGAATAAAGACACA
TTCTTTTAGAAG

QA 19 330 19 330
DS 



AS 1 5

CO CL1836Contig1 447 5 7 U
GGGAATAGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAG
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TTTGACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATG
ATCATTCACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCTTTGAACTGCTGGTTCG
TCGTGTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGATTTATCGCC
GTTGTGTTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTT
ATTCGATTCTTTAATTAGTATTTACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4H679TF U 6
AF RR4BA61JQ C 1
AF RR4G191JQ C 5
AF RR4G191TF U 5
AF RR4BA61TF U 1
BS 1 6 RR4BA61JQ
BS 7 7 RR4G191TF
BS 8 273 RR4H679TF
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BS 360 446 RR4G191TF
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RD RR4H679TF 356 0 0
GG
GAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGAGCT
TAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCT
CTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGACG
CTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCATTC
ACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTACCTTCATCTCTTTGAACTGCTGGTTCGTCGTGTT
TTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGATTTATCGC
TG

QA 3 354 3 354
DS 

RD RR4BA61JQ 447 0 0
GGGAATAGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAG
AAGAGCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTT
GCCTCCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGT
TTTGACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATG
ATCATTCACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCTTTGAACTGCTGGTTCG
TCGTGTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGATTTATCGCT
GTTGTGTTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTT
ATTCGATTCTTTAATTAGTATTTACTG

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4G191JQ 442 0 0
GG
AGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGAGC
TTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCC
TCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGAC
GCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCATT
CACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCTTTGAGCTGCTGGTTCGTCGTGT
TTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGATTTATCGCCGTTGTG
TTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGGGCTTGTTTATTCGA
TTCTTTAATTAGTATTTACT

QA 3 442 3 442
DS 

RD RR4G191TF 442 0 0
GG
AGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGAGC
TTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCC
TCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGAC
GCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCATT
CACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCTTTGAGCTGCTGGTTCGTCGTGT
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TTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTTATTCGA
TTCTTTAATTAGTATTTACT

QA 3 442 3 442
DS 

RD RR4BA61TF 447 0 0
GGGAAT
AGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGAGC
TTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCC
TCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGAC
GCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCATT
CACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCTTTGAACTGCTGGTTCGTCGTGT
TTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGATTTATCGCTGTTGTG
TTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTTATTCGA
TTCTTTAATTAGTATTTACT
G

QA 7 446 7 446
DS 



AS 1 4

CO CL1837Contig1 1074 4 8 U
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TTCGATTTCATAACTTACCGATTCTCGAGGGATGGCGGCGGTAAATGGGCACCAAGGAAA
CACTCCGGCGGAGACAACCCCGGCGGCCACCGGATCGAAACAACCTGCTCCTCCGGCTAA
ACCCGTAGATAGCCACTCCGTTCTCAAAAGGTTCTTTCTTCCGATCTTTAAATAATTTAA
AAGGGGAAAGTTCTTTTAGGCTGCCTTCGATTTGATACTATCATAGCTTCGATTTGATTC
CGTAGCTAGTAGATTAGATTAGATTAGATTAGCATTTGGATCCGTTTCTATATGCTTTAT
GTTTCTCTCCTTTGTCTACCAACTGTTTGTTACAATTCCTCTGAGACAAAACGATGCATT
GAACTGTTTCTCAAAGGCCAAAGCTTCGTTTCATGTTTTATTTTATTTTTCTTCTGATTT
TCTAATCAATTGTTTCCTCTTAAACACGCAGGCTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGA
TGGG*AGGTGATCCGGGGATATCTGCTTTCCCAGAGGAAGACAATATATTCTGCTGGAAA
GGAACAATCACTGGGAGCAAAGATACTGTGTTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTC
GCTTTCTCCAACGATTACCCTTTCAAACCTCCCAAAGTTAAGTTCGAGACTTGCTGCTTC
CATCCCAATGTCGACCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCA
TCGGCTTACGATGTGAGGACGTTATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTCGGAGAACCCAAC
ATCAGCTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAATCAAAAAGAGTACAGG
AAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAACCATTGAACGCATGATTCTCGATGTAATTGGTACAG
CTATATTATGATTTTCCAGAAGAAAGAGAAATCACTGCTTTCAATAGATCATGTTTCTTC
TACTTTGTAATCTCAGTTCGAGCCTATATTAGCAAATCAAAGACCCTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 25 10 25 10 25 10 25 10 10 
10 25 10 10 10 25 10 10 25 25 10 25 10 10 10 25 10 10 25 10 25 10 10 10 25 25 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BZ33TF U 1
AF RR4BZ33JQ C 252
AF RR4E031JQ C 469
AF RR4BP90TF U 510
BS 1 544 RR4BZ33TF
BS 545 545 RR4BP90TF
BS 546 670 RR4BZ33TF
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BS 839 839 RR4BZ33JQ
BS 840 1074 RR4BP90TF

RD RR4BZ33TF 690 0 0
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CACTCCGGCGGAGACAACCCCGGCGGCCACCGGATCGAAACAACCTGCTCCTCCGGCTAA
ACCCGTAGATAGCCACTCCGTTCTCAAAAGGTTCTTTCTTCCGATCTTTAAATAATTTAA
AAGGGGAAAGTTCTTTTAGGCTGCCTTCGATTTGATACTATCATAGCTTCGATTTGATTC
CGTAGCTAGTAGATTAGATTAGATTAGATTAGCATTTGGATCCGTTTCTATATGCTTTAT
GTTTCTCTCCTTTGTCTACCAACTGTTTGTTACAATTCCTCTGAGACAAAACGATGCATT
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TGGGGAGGTGATCCGGGGATATCTGCTTTCCCAGAGGAAGACAATATATTCTGCTGGAAA
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GCTTTCTCCA*CGATTACCCTTTCAA
CCTC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4BZ33JQ 770 0 0
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TTGTCTACCAACTGTTTGTTACAATTCCTCTGAGACAAAACGATGCATTGAACTGTTTCT
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TCCGGGGATATCTGCTTTCCCAGAGGAAGACAATATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCAC
TGGGAGCAAAGATACTGTGTTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTTCTCCAA
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CGACCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCGGCTTACGA
TGTGAGGACGTTATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTCGGAGAGCCCAACATCAGCTCGCC
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GAAGCTCTACAAACCATTGAACGCATGATTCTCGATGTAATTGGTACAGCTATATTATGA
TTTTCCAGAAGAAAGAGAAATCACTGCTTTCAATAGATCATGTTTCTTC
C

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4E031JQ 606 0 0
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TGGGTTTAATGATGGG*AGGTGATCCGGGGATATCTGCTTTCCCAGAGGAAGACAATATA
TTCTGCTGGAAAGGAACAATCACTGGGAGCAAAGATACTGTGTTCCAAGGAACTGAGTAC
AGACTCTCCCTCGCTTTCTCCAACGATTACCCTTTCAAACCTCCCAAAGTTAAGTTCGAG
ACTTGCTGCTTCCATCCCAATGCCGACCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCTTCAG
GATAAATGGTCATCGGCTTACGATGTGAGGACGTTATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTC
GGAGAACCCAACATCAGCTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAATCAA
AAAGAGTACAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAACCATTGAACGCATGATTCTCGATG
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TTTATT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4BP90TF 565 0 0
G
GGCTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGG*AGGTGATCCGGGGATATCTGCTTTC
CCAGAGGAAGACAATATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACTGGGAGCAAAGATACTGTG
TTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTTCTCCAACGATTACCCTTTCAAACCT
CCCAAAGTTAAGTTCGAGACTTGCTGCTTCCATCCCAATGTCGACCTCTATGGCAATATT
TGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCGGCTTACGATGTGAGGACGTTATTACTC
TCGATTCAAAGCCTTCTCGGAGAACCCAGCATCAGCTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCT
CAGCTTTGGAGCAATCAAAAAGAGTACAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAACCATTG
AACGCATGATTCTCGATGTAATTGGTACAGCTATATTATGATTTTCCAGAAGAAAGAGAA
ATCACTGCTTTCAATAGATCATGTTTCTTCTACTTTGTAATCTCAGTTCGAGCCTATATT
AGCAAATCAAAGACCCTTTTTATT

QA 2 565 2 565
DS 



AS 1 5

CO CL1838Contig1 629 5 2 U
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GGTCCGATCACTTTCCTCCGTCGAGATGCTTCCTCTTTGAGCATCTTCTTTCGTATCCTT
TTCCTCTGCGCTCGACTAGGTTTTGTCTCTGACTCGTCTCCTTCGTTTTCATCAACGTCG
TCGTCGTGGTTTGATGAATCAATGTTCACGTAATCCTCTGAATAAAATCGACTTTAAAAA
CAATTAGAGATGGAAGGAGAAAATACCGGAGACGGAGAAGAGGAAGGAGAAGGAGGGGAT
GCAGGAGGATACAGTGTTTGAATAAGAGCTTCGTGTAACTTTCTTCGCTTTTCTTCTCGC
CGTCGCATCTTCCAATATTGCTCTCACCACTCGGCGGCGAAATCTCCGTACCCCGATCCC
CCTAATGTGCAACTTTTCACAGATTTTCTTTTGTACCCCTACACTTTTGTGATATTTATT
TTCTTGACCAGAAACTTTGTATCCAGATACGTACACCCCAAGACAGTTCTTTATTTTATT
TGAAACGGTTGACGTTGGTGTCGTGTGAAGGAGAGAAAATGCTAAAAGTGAAAGACTTCC
TAACAACTTTTTTTTGTTTGACCTTCGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO44TF U 1
AF RR4GO44JQ C 181
AF RR4H144JQ C 1
AF RR4H144TF U 1
AF RR4CH36TF U 289
BS 1 535 RR4GO44TF
BS 536 629 RR4CH36TF

RD RR4GO44TF 537 0 0
TGTACGCAACTTGCCTCTTCTTTGTCTTCACGCCTCTCAATCATTTCTGTCGGAAGCAGA
GGTCCGATCACTTTCCTCCGTCGAGATGCTTCCTCTTTGAGCATCTTCTTTCGTATCCTT
TTCCTCTGCGCTCGACTAGGTTTTGTCTCTGACTCGTCTCCTTCGTTTTCATCAACGTCG
TCGTCGTGGTTTGATGAATCAATGTTCACGTAATCCTCTGAATAAAATCGACTTTAAAAA
CAATTAGAGATGGAAGGAGAAAATACCGGAGACGGAGAAGAGGAAGGAGAAGGAGGGGAT
GCAGGAGGATACAGTGTTTGAATAAGAGCTTCGTGTAACTTTCTTCGCTTTTCTTCTCGC
CGTCGCATCTTCCAATATTGCTCTCACCACTCGGCGGCGAAATCTCCGTACCCCGATCCC
CCTAATGTGCAACTTTTCACAGATTTTCTTTTGTACCCCTACACTTTTGTGATATTTATT
TTCTTGACCAGAAACTTTGTATCCAGATACGTACACCCCAAGACAGTTCTTTATT
TT

QA 1 535 1 535
DS 

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CAATTAGAGATGGAAGGAGAAAATACCGGAGACGGAGAAGAGGAAGGAGAAGGAGGGGAT
GCAGGAGGATACAGTGTTTGAATAAGAGCTTCGTGTAACTTTTTTCGCTTTTCTTCTCGC
CGTCGCATCTTCCAATATTGCTCTCACCACTCGGCGGGGAAATCTCCGTACCCCGATCCC
CCTAATGTGCAACTTTTCACAGATTTTCTTTTGTACCCCTACACTTTTGTGATATTTATT
TTCTTGACCAGAAACTTTGTATCCAGATA

QA 1 329 1 329
DS 

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GGTCCGATCACTTTCCTCCGTCGAGATGCTTCCTCTTTGAGCATCTTCTTTCGTATCCTT
TTCCTCTGCGCTCGACTAGGTTTTGTTTCTGACTCGTCTCCTTCGTTTTCATCAACGTCG
TCGTCGTGGTTTGATGAATCAATGTTCACGTAATCCTCTGAATAAAATCGACTTTAAAAA
CAATTAGAGATGGAAGGAGAAAATACCGGAGACGGAGAAGAGGAAGGAGAAGGAGGGGAT
GCAGGAGGATACAGTGTTTGAATAAGAGCTTCGTGTAACTTTCTTCGCTTTTCTTCTCGC
CGTCGCATCTTCCAATATTGCTCTCACCACTCGGCGGCGAAATCTCCGTACCCCGATCCC
CCTAATGTGCAACTTTTCACAGATTTTCTTTTGTACCCCTACACTTTTGTGATATTTATT
TTCTTGACCAGAAACTTTGTATCCAGATACGTACACCCCAAGACAGTTCTTTATT
GC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4H144TF 537 0 0
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GGTCCGATCACTTTCCTCCGTCGAGATGCTTCCTCTTTGAGCATCTTCTTTCGTATCCTT
TTCCTCTGCGCTCGACTAGGTTTTGTCTCTGACTCGTCTCCTTCGTTTTCATCAACGTCG
TCGTCGTGGTTTGATGAATCAATGTTCACGTAATCCTCTGAATAAAATCGACTTTAAAAA
CAATTAGAGATGGAAGGAGAAAATACCGGAGACGGAGAAGAGGAAGGAGAAGGAGGGGAT
GCAGGAGGATACAGTGTTTGAATAAGAGCTTCGTGTAACTTTCTTCGCTTTTCTTCTCGC
CGTCGCATCTTCCAATATTGCTCTCACCACTCGGCGGCGAAATCTCCGTACCCCGATCCC
CCTAATGTGCAACTTTTCACAGATTTTCTTTTGTACCCCTACACTTTTGTGATATTTATT
TTCTTGACCAGAAACTTTGTATCCAGATACGTACACCCCAAGACAGTTCTTTATT
GC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4CH36TF 341 0 0
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TTTTCTTCTCGCCGTCGCATCTTCCAATATTGCTCTCACCACTCGGCGGCGAAATCTCCG
TACCCCGATCCCCCTAATGTGCAACTTTTCACAGATTTTCTTTTGTACCCCTACACTTTT
GTGATATTTATTTTCTTGACCAGAAACTTTGTATCCAGATACGTACACCCCAAGACAGTT
CTTTATTTTATTTGAAACGGTTGACGTTGGTGTCGTGTGAAGGAGAGAAAATGCTAAAAG
TGAAAGACTTCCTAACAACTTTTTTTTGTTTGACCTTCGTT

QA 1 341 1 341
DS 



AS 1 5

CO CL1839Contig1 1207 5 12 U
GGAGGACAACTTACCCCAATATCGAACCCGTGGGTGGGCCATGTGCCGCAACCACAACAT
GGAGGTTTACACTTCAGGTGCACTCGGCCTAAACTCGACAGTCGCTTTGTGCTTGATGTG
AATGTACTTGATGGAACAGTTTTTGCTCCTTCTGCTCAATTCACCAAGGTTTGGAAAATG
AGGAACAATGGCTCGCTGGTGTGGCCGCATGGCACACGAATAGTCTGGATCGGTGGGGAC
AAACTCAGCAGCTCGTTGTCAGTTGATTTACAGATTCCAGTGGAGGGTGCGCCTATCGAC
AGTGAGCTTGACGTGAAAGTTGATTTTGTTGCACCAGAGTTACCTGGTCGATACATTTCT
TATTGGAGGATGGCTTCCTCTAGTGGAGCTAAGTTTGGGCAACGTGTTTGGGTGTTGATA
CATGTTGATGCATCCTTGAAGGGTTCTGCTGTGAATGAGTTTCAAGGACTGAACTTAAAT
GTCTCCCCTGATGAAGAATCTACAGGGATCAATGTACATGAGCCAGCTCAAGCTGGCAGC
TCCTGTGTTAACCCTGGGGCAGTGGAAGGTGCTGATCTAGAAGGAGAAGCAGTTGGATCG
CAAATCCCAGAAAAAGATGACCTGCCGGTTGGGGAAGAAGTTGAGCCTGCTACTACTCTT
ACACCATCTTCATCTTCGTCATCATTCAACATGATCGAGTTCCCAAACATGCCTGCTGTT
GAGGCCTTGGGTGGTGGTTCGTCGTCATCTACAAAGGACATCCCTGTTGATCTTCAAAAG
GATATTGAGGAGAACGACATGGAGATAGCCATGCTCAAGGAGCTGGAAGAAATGGGATTC
AAAGAGATGGTTTTGAACAAGGAGGTCTTAAGGGAAAACGAGTACAACTTGGAGCAGTCT
GTTGACGCTCTTTGTGGAGTTAGCGAGTGGGATCCTATCCTAGAGGAGCTTCAGGAAATG
GGCTTCTGTGATGATGTGACGAACAAGAAGCTGCTGAAGAAGAATAATGGAAGCATTAAA
GGCGTAGTGATGGACCTCCTCACTGGTGAGAAGGAGGCTTAATGTGTGGCTTTTGATTCT
GGGAACTTCTTATCTATCAGGGGTTAAACTATGTTTTAGAAATAATAATATATCCTGGTT
AATGCTTTGTTTGATGAATGATGGATTCTGTTTTCCGAAATAAATGTTAAGATATTATCT
CTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE31TF U 1
AF RR4FE08TF U 164
AF RR4BG24TF U 500
AF RR4FE08JQ C 676
AF RR4EE31JQ C 775
BS 1 278 RR4EE31TF
BS 279 279 RR4FE08TF
BS 280 562 RR4EE31TF
BS 563 599 RR4FE08TF
BS 600 600 RR4BG24TF
BS 601 819 RR4FE08TF
BS 820 820 RR4BG24TF
BS 821 861 RR4FE08TF
BS 862 1121 RR4BG24TF
BS 1122 1122 RR4FE08JQ
BS 1123 1200 RR4BG24TF
BS 1201 1207 RR4EE31JQ

RD RR4EE31TF 562 0 0
GGAGGACAACTTACCCCAATATCGAACCCGTGGGTGGGCCATGTGCCGCAACCACAACAT
GGAGGTTTACACTTCAGGTGCACTCGGCCTAAACTCGACAGTCGCTTTGTGCTTGATGTG
AATGTACTTGATGGAACAGTTTTTGCTCCTTCTGCTCAATTCACCAAGGTTTGGAAAATG
AGGAACAATGGCTCGCTGGTGTGGCCGCATGGCACACGAATAGTCTGGATCGGTGGGGAC
AAACTCAGCAGCTCGTTGTCAGTTGATTTACAGATTCCGGTGGAGGGTGCGCCTATCGAC
AGTGAGCTTGACGTGAAAGTTGATTTTGTTGCACCAGAGTTACCTGGTCGATACATTTCT
TATTGGAGGATGGCTTCCTCTAGTGGAGCTAAGTTTGGGCAACGTGTTTGGGTGTTGATA
CATGTTGATGCATCCTTGAAGGGTTCTGCTGTGAATGAGTTTCAAGGACTGAACTTAAAT
GTCTCCCCTGATGAAGAATCTACAGGGATCAATGTACATGAGCCAGCTCAAGCTGGCAGC
TCCTGTGTTAACCCTGGGGCAG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4FE08TF 698 0 0
G
CAAGGTTTGGAAAATGAGGAACAATGGCTCGCTGGTGTGGCCGCATGGCACACGAATAGT
CTGGATCGGTGGGGACAAACTCAGCAGCTCGTTGTCAGTTGATTTACAGATTCCAGTGGA
GGGTGCGCCTATCGACAGTGAGCTTGACGTGAAAGTTGATTTTGTTGCACCAGAGTTACC
TGGTCGATACATTTCTTATTGGAGGATGGCTTCCTCTAGTGGAGCTAAGTTTGGGCAACG
TGTTTGGGTGTTGATACATGTTGATGCATCCTTGAAGGGTTCTGCTGTGAATGAGTTTCA
AGGACTGAACTTAAATGTCTCCCCTGATGAAGAATCTACAGGGATCAATGTACATGAGCC
AGCTCAAGCTGGCAGCTCCTGTGTTAACCCTGGGGCAGTGGAAGGTGCTGATCTAGAAGG
AGAAGCAGTTGGATCTCAAATCCCAGAAAAAGATGACCTGCCGGTTGGGGAAGAAGTTGA
GCCTGCTACTACTCTTACACCATCTTCATCTTCGTCATCATTCAACATGATCGAGTTCCC
AAACATGCCTGCTGTTGAGGCCTTGGGTGGTGGTTCGTCGTCATCTACAAAGGACATCCC
TGTTGATCTTCAAAAGGATATTGAGGAGAACGACATGGAGATAGCCATGCTCAAG*AGCT
GGAAGAAATGGGATTCAAAGAGATGGTTTTGAACAAG

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4BG24TF 701 0 0
G
TACAGGGATCAATGTACATGAGCCAGCTCAAGCTGGCAGCTCCTGTGTTAACCCTGGGGC
AGTGGAAGGTGCTGATCTAGAAGGAGAAGCAGTTGGATCGCAAATCCCAGAAAAAGATGA
CCTGCCGGTTGGGGAAGAAGTTGAGCCTGCTGCTACTCTTACACCATCTTCATCTTCGTC
ATCATTCAACATGATCGAGTTCCCAAACATGCCTGCTGTTGAGGCCTTGGGTGGTGGTTC
GTCGTCATCTACAAAGGACATCCCTGTTGATCTTCAAAAGGATATTGAGGAGAACGACAT
GGATATAGCCATGCTCAAGGAGCTGGAAGAAATGGGATTCAAAGAGATGGTTTTGAACAA
GGAGGTCTTAAGGGAAAACGAGTACAACTTGGAGCAGTCTGTTGACGCTCTTTGTGGAGT
TAGCGAGTGGGATCCTATCCTAGAGGAGCTTCAGGAAATGGGCTTCTGTGATGATGTGAC
GAACAAGAAGCTGCTGAAGAAGAATAATGGAAGCATTAAAGGCGTAGTGATGGACCTCCT
CACTGGTGAGAAGGAGGCTTAATGTGTGGCTTTTGATTCTGGGAACTTCTTATCTATCAG
GGGTTAAACTATGTTTTAGAA*TAATAATATATCCTGGTTAATGCTTTGTTTGATGAATG
ATGGATTCTGTTTTCCGAAATAAATGTTAAGATATTATCT

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR4FE08JQ 478 0 0
TCGTCATCATTCAACATGATCGAGTTCCCAAACATGCCTGCTGTTGAGGCCTTGGGTGGT
GGTTCGTCGTCATCTACAAAGGACATCCCTGTTGATCTTCAAAAGGATATTGAGGAGAAC
GACATGGAGATAGCCATGCTCAAGGAGCTGGAAGAAATGGGATTCAAAGAGATGGTTTTG
AACAAGGAGGTCTTAAGGGAAAACGAGTACAACTTGGAGCAGTCTGTTGACGCTCTTTGT
GGAGTTAGCGAGTGGGATCCTATCCTAGAGGAGCTTCAGGAAACGGGCTTCTGTGATGAT
GTGACGAACAAGAAGCTGCTGAA**AGAATAATGGAAGCATTAAAGGCGTAGTGATGGAC
CTCCTCACTGGTGAGAAGGAGGCTTAATGTGTGGCTTTTGATTCTGGGAACTTCTTATCT
ATCAGGGGTTAAACTATGTTTTAGAAATAATAATATATCCTGGTTAATGCTTTGTTTG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4EE31JQ 433 0 0
CAAAAGGATATTGAGGAGAACGACATGGAGATAGCCATGCTCAGGGAGCTGGAAGAAATG
GGATTCAAAGAGATGGTTTTGACCAAGGAGGTCTTAAGGGAAAACGAGTACAACTTGGAG
CAGTCTGTTGACGCTCTTTGTGGAGTTAGTGAGTGGGATCCTATCCTAGAGGAGCTTCAG
GAAATGGGCTTCTGTGATGATGTGACGAACAAGAAGCTGCTGAAGAAGAATAATGAAAGC
ATTAAAGGCGTAGTGATGGACCTCCTCACTGGTGAGAAGGAGGCTTAATGTGTGGCTTTT
GATTCTGGGAACTTCTTATCTATCAGGGGTTAAACTATGTTTTAGAAATAATAATATATC
CTGGTTAATGCTTTGTTTGATGAATGGTGGATTCTGTTTTCCGAAATAAATGTTAAGATA
TTATCTCTTTCTC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 5

CO CL1840Contig1 803 5 5 U
GGATCATCACTCCTAAGTCCTAACCGCAGCCAGAGAAGGAAAATGAAGTCGTTAGCTTCC
CCTCCGTGTCTCCGCCTAACTCCGACGACACGTCGTCATCACCTCCCTTCGCGTCAATCT
TCTTCCGCCTGTTACCCTCACGTTGTCTCCTCTGTAATCAAATCCAGTAGTACCCTATCA
TTCGCCTCATCCGCATCCGGTTTCGCGTCACCACTCTCCGTAGAGAAGGAGCTACGCTTA
CAGACGGCTGCTGTCCGCCACGTCACTGGGTCGCTAATCAGAGGAGAAGGTCTTAGATTC
GCTATTGTTGTTACTCGTTTCAATGAGGTTGTGACGAAGTTGCTTTTGGAAGGAGCTATT
GAGACTTTCAACAAGTACTCTGTTAGAGAAGAAGACATCGAGGTTATT*GGGTTCCTGGT
AGCTTTGAGATAGGTGTTGTTGCACAGAACCTTGGGAACTCAGGAAAGTTTCATGCCGTT
TTATGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTACTCATTATGATGCTGTTGCCAACTCT
GCTGCATCTGGAGTACTTTCTGCTGCCATTAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTA
CTGACATGTGAGGACATGGATCAGGCTCTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGGAAACAAG
GGAGCTGAAACTGCTTTGACTGCGCTCGAGATGGCGTCGTTGTTTGAGCACCACCTGAAA
TAGCTCCTCGTTCCATGGGAGGAGCAATGATCATCACGTACAATCCAATCTTCCGAAACT
GTACCTGAAAAGATTGTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ70TF U 274
AF RR4CH58TF U 1
AF RR4CH58JQ C 234
AF RR4A077TF U 644
AF RR4A077TFB U 410
BS 1 624 RR4CH58TF
BS 625 625 RR4A077TFB
BS 626 653 RR4CH58TF
BS 654 798 RR4A077TF
BS 799 803 RR4CH58JQ

RD RR4CJ70TF 283 0 0
G
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CGAAGTTGCTTTTGGAAGGAGCTATTGAGACTTTCAACAAGTACTCTGTTAGAGAAGAAG
ACATCGAGGTTATTTGGGTTCCTGGTAGCTTTGAGATAGGTGTTGTTGCACAGAACCTTG
GGAACTCAGGAAAGTTTCATGCCGTTCTATGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTA
CTCATTATGATGCTGTTGCCAACTCTGCTGCATCTGGAGTAC

QA 2 283 2 283
DS 

RD RR4CH58TF 653 0 0
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CCTCCGTGTCTCCGCCTAACTCCGACGACACGTCGTCATCACCTCCCTTCGCGTCAATCT
TCTTCCGCCTGTTACCCTCACGTTGTCTCCTCTGTAATCAAATCCAGTAGTACCCTATCA
TTCGCCTCATCCGCATCCGGTTTCGCGTCACCACTCTCCGTAGAGAAGGAGCTACGCTTA
CAGACGGCTGCTGTCCGCCACGTCACTGGGTCGCTAATCAGAGGAGAAGGTCTTAGATTC
GCTATTGTTGTTACTCGTTTCAATGAGGTTGTGACGAAGTTGCTTTTGGAAGGAGCTATT
GAGACTTTCAACAAGTACTCTGTTAGAGAAGAAGACATCGAGGTTATT*GGGTTCCTGGT
AGCTTTGAGATAGGTGTTGTTGCACAGAACCTTGGGAACTCAGGAAAGTTTCATGCCGTT
TTATGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTACTCATTATGATGCTGTTGCCAACTCT
GCTGCATCTGGAGTACTTTCTGCTGCCATTAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTA
CTGACATGTGAGGACATGGATCAG*CTCTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGG

QA 1 653 1 653
DS 

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ACGCTTACAGACGGCTGCTGTCCGCCACGTCACTGGGTCGCTAATCAGAGGAGAAGGTCT
TAGATTCGCTATTGTTGTTACTCGTTTCAATGAGGTTGTGACGAAGTTGCTTTTGGAAGG
AGCTATTGAGACTTTCAACAAGTACTCTGTTAGAGAAGAAGACATCGAGGTTATT*GGGT
TCCTGGTAGCTTTGAGATAGGTGTTGTTGCACAGAACCTTGGGAACTCAGGAAAGTTTCA
TGCCGTTTTATGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTACTCATTATGATGCTGTTGC
CAACTTTGCTGCATCTGGAGTACTTTCTGCTGCCATTAATTCAGGTGTTCCATGCATATT
TGGTGTACTGACATGTGAGGACATGGATCAGGCTTTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCCGG
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CCTGAAATAGCTCCTCGTTCCATGGGAGGAGCAATGATCATCACGTACAATCCAATCTTC
CGAAACTGTACCTGAAAAGATTGTCAAAAA

QA 1 570 1 570
DS 

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TTGAGCACCACCTGAAATAGCTCCTCGTTCCATGGGAGGAGCAATGATCATCACGTACAA
TCCAATCTTCCGAAACTGTACCTGAAAAGATTGTC

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DS 

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TTCATGCCGTTTTGTGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTACTCATTATGATGCTG
TTGCCAACTCTGCTGCATCTGGAGTACTTTCTGCTGGCATTAATTCAGGTGTTCCATGCA
TATTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGATCAGGCTCTGAATCGATCTGGTGGCAAAG
CCGGAAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACTGCGCTCGAGATGGCGTCGTTGTTTGAGC
ACCACCTGAAATAGCTCCTCGTTCCATGGGAGGAGCAATGATCATCACGTACAATCCAAT
CTTCCGAAACTGTACCTGAAAAGATTGTC

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 3

CO CL1841Contig1 1100 3 9 U
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TTTTAGTAGAATTTACTAACACTTGCATTGCAAATCTAAACTTAACTTCAACATAATGCC
TCTTTAATAATCATAACTGTATCTCAATTTAGTATACTAATAGAAGCGAGATTAGTCACA
GTTTGGTGGGTTTGTGCATTTATATACAGCAGAAGCAGGTTGCTTATAGACAGGGATGCT
GTCTGCGTCCAACAACCTTACTTCTCCTGGTCCAAAATACAACTCAAAATGCCTTCGTAG
GTCGAGACCTTGACACCAGCTTGTAACACAGATAAGTTGTCTGAATCAGGCGATACAATG
ACGACTGTGTCCCCTGAATATTGAGTCTCGAGAATGGACATTAGCTGTGTCACACGCACA
AACACATCTGATACACTCTCGTTAGGGGTACCGTCACTGATAGGAGGAGGTTTTGTCTTC
ATCGATATCGAGTCTAATGCATACACTTCTGATATGGAATCTAGCTTCTTGCCTTCGTAA
GCTCCTAAACCACGAGCATCAAGGAAGCTATATTCTGGAACTATATAG****GACTAATC
CCATTAATGGAGGCGATGATTTCAGCAGCCTGATAAGCTCTCTGTGTAATGGAAGGCCAT
AGCCAACAGTTTCTGTCACATGCCCCCATTGCCTTCAACTGTAACGCAGCCCTCACAGTC
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TTGATGATCCCTAAGCTTTCGTAATCAGATTCACCAGCTCTCACCAGGTAATAACGATTA
GAGAGACGGAGAGGCGGCATTTGAAACAGGCCCCGTGCGTGGACTGGTGCTACTGAGAGT
GATGGTGCGGCGAGGAGACATAAGGAGAGAGTCTTGATAAGGTATCTACGAGTAATCTGC
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ATGATGGCCGCCGGTGATGATGATAACATAATTCAATCGTTGTCAAGGTAATCCGGAAGC
TCTGGTCCTCGTGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS41JQ U 1
AF RR4CW06JQ U 355
AF RR4CW06TF C 355
BS 1 372 RR4BS41JQ
BS 373 373 RR4CW06JQ
BS 374 588 RR4BS41JQ
BS 589 592 RR4CW06JQ
BS 593 741 RR4BS41JQ
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BS 744 824 RR4BS41JQ
BS 825 977 RR4CW06JQ
BS 978 1100 RR4CW06TF

RD RR4BS41JQ 833 0 0
AATTTCAAATTGTGTCGAATAATCGATCACAAAGGCTGTTCTTAAACAGTTATGACTCTA
TTTTAGTAGAATTTACTAACACTTGCATTGCAAATCTAAACTTAACTTCAACATAATGCC
TCTTTAATAATCATAACTGTATCTCAATTTAGTATACTAATAGAAGCGAGATTAGTCACA
GTTTGGTGGGTTTGTGCATTTATATACAGCAGAAGCAGGTTGCTTATAGACAGGGATGCT
GTCTGCGTCCAACAACCTTACTTCTCCTGGTCCAAAATACAACTCAAAATGCCTTCGTAG
GTCGAGACCTTGACACCAGCTTGTAACACAGATAAGTTGTCTGAATCAGGCGATACAATG
ACGACTGTGTCCTCTGAATATTGAGTCTCGAGAATGGACATTAGCTGTGTCACACGCACA
AACACATCTGATACACTCTCGTTAGGGGTACCGTCACTGATAGGAGGAGGTTTTGTCTTC
ATCGATATCGAGTCTAATGCATACACTTCTGATATGGAATCTAGCTTCTTGCCTTCGTAA
GCTCCTAAACCACGAGCATCAAGGAAGCTATATTCTGGAACTATATAGCTGCGACTAATC
CCATTAATGGAGGCGATGATTTCAGCAGCCTGATAAGCTCTCTGTGTAATGGAAGGCCAT
AGCCAACAGTTTCTGTCACATGCCCCCATTGCCTTCAACTGTAACGCAGCCCTCACAGTC
TGCTTTTTACCTTTCTCTGACAATCCGCTATCTACCGATGTTTTCTCCACCGGGTTTGTG
TTGATGATCCCTAAGCTTTCGTAATCAGATTCACCAGCTCTCAC
AGGTATACG

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4CW06JQ 623 0 0
G
CAATGACGACTGTGTCCCCTGAATATTGAGTCTCGAGAATGGACATTAGCTGTGTCACAC
GCACAAACACATCTGATACACTCTCGTTAGGGGTACCGTCACTGATAGGAGGAGGTTTTG
TCTTCATCGATATCGAGTCTAATGCATACACTTCTGATATGGAATCTAGCTTCTTGCCTT
CGTAAGCTCCTAAACCACGAGCATCAAGGAAGCTATATTCTGGAACTATATAG****GAC
TAATCCCATTAATGGAGGCGATGATTTCAGCAGCCTGATAAGCTCTCTGTGTAATGGAAG
GCCATAGCCAACAGTTTCTGTCACATGCCCCCATTGCCTTCAACTGTAACGCAGCCCTCA
CAGTCTGCTTTTTACCTTTCTCTGACGGTCCGCTATCTACCGATGTTTTCTCCACCGGGT
TTGTGTTGATGATCCCTAAGCTTTCGTAATCAGATTCACCAGCTCTCACCAGGTAATAAC
GATTAGAGAGACGGAGAGGCGGCATTTGAAACAGGCCCCGTGCGTGGACTGGTGCTACTG
AGAGTGATGGTGCGGCGAGGAGACATAAGGAGAGAGTCTTGATAAGGTATCTACGAGTAA
TCTGCGGCAAGGGAAGTAAGTT

QA 2 623 2 623
DS 

RD RR4CW06TF 746 0 0
G
CAATGACGACTGTGTCC*CTGA*TAT*GAGTCTCGAGAATGGACATTAGCTGTGTCACAC
GCACAAACACATCTGATACACTCTCGTTAGGGGTAC*GTCACTGATAGGAGGAGGTTTTG
TCTTCATCGATATCGAGTCTAATGCATACACTTCTGATATGGAATCTAGCTTCTTGCCTT
CGTAAGCTCCTAAACCACGAGCATCAAGGAAGCTATATTCTGGAACTATATAG****GAC
TAATCCCATTAATGGAGGCGATGATTTCAGCAGCCTGATAAGCTCTCTGTGTAATGGAAG
GCCATAGCCAACAGTTTCTGTCACATGCCCCCATTGCCTTCAACTGTAACGCAGCCCTCA
CAGTCTGCTTTTTACCTTTCTCTGACGGTCCGCTATCTACCGATGTTTTCTCCACCGGGT
TTGTGTTGATGATCCCTAAGCTTTCGTAATCAGATTCACCAGCTCTCACCAGGTAATAAC
GATTAGAGAGACGGAGAGGCGGCATTTGAAACAGGCCCCGTGCGTGGACTGGTGCTACTG
AGAGTGATGGTGCGGCGAGGAGACATAAGGAGAGAGTCTTGATAAGGTATCTACGAGTAA
TCTGCGGCAAGGGAAGTAAGTTCAGAGGAAGTTTGGAGGATTCCGGCGACGGAGGTGGAT
GTGCGATGATGGCCGCCGGTGATGATGATAACATAATTCAATCGTTGTCAAGGTAATCCG
GAAGCTCTGGTCCTCGTGTTTTTCC

QA 2 746 2 746
DS 



AS 1 3

CO CL1842Contig1 1035 3 6 U
GCCCCAAAAAATGGATATAGAGTTTTATATAATCTTTTCAGACATAATCTTAAGACACTG
GAAAAAAATATCGGAAAAGGACAAGGTACAGGTGACCTAGAGCTAATAACAACCATTTAA
AGAATAACCCTGTTCTTGTTCTGTCTTTTTAAACATTAGGCATCATGGCTTTTGTAGCAC
ATACTAAGAATTAAAAAAGAAGAAACAATGTTGTTGATCGCATATAAGACGACAAGGAGG
AACTTGTTTTTGTATTTTTGGCTTTTATTATGAGAGATGCGAGATGAGAGAGAGTTCAAA
GAGCCACTGCTGTCTACTTCTCGTGCACGAAAGGGCTGTAAATTGGGAACCACATGTTCC
GTGTGATGTAATCCACCGTCTCCTCCTTGGACATGTGACTGAAATCTCTGGGACCAACAT
CCCCATGTCCTTCTACAATGTCATCAGATACTGCAGCTCTTAAAACAGCCGCCCC*TACC
TCAGCTGTTATGTGTCGGATGTTGTTGATCGAAGGGTAAAGGATGCCTTTTTGGACTTCT
TCGTCAGTCATGTAGGACGCAAGGCATTCAGCAGCAGCTAGCAGCATTCCATCAGTTACA
ATACGTGCACCAGACAGAAGAGTCCCTAACCCGATCCCGGGGAATAGGTACATGTTGTTG
GCCTGATTCACATGCCCAACACTACCACTCTCAAGTTGAACGTTTTCAAAATGGGCTTCC
GCTTCCAAAGACAAATGTTTTCTCCGGCGTGCTTAAATGCGTCAGCAGCGGTGCACTCGG
CATTCAAGGTGGGATTCGACATAGCAAAAATGGCCGGCTTGCATGAATCAGATTCTCGCA
TTGCCTTGAGAACTTCTTCATTGAATATGCCACCCACTCCAGATAAACCAAGAAGAACAT
GTGGCCTCACTGTCTTCACCACTTCAACGATGCTTGCTCCCTCACGTATCCCAGCTGGAT
TTTTGGCAAAAGGTACAACTGCTGGGTCAAGTTTTGACCTCTCCGTGGTGACAAGACCAT
CTTTATCTATCAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ47JQ U 247
AF RR4CU57JQ U 1
AF RR4CU57TF C 382
BS 1 710 RR4CU57JQ
BS 711 711 RR4CU57TF
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BS 735 735 RR4CU57TF
BS 736 788 RR4CU57JQ
BS 789 1035 RR4CU57TF

RD RR4FJ47JQ 299 0 0
TTTTTGTATTTTTGGCTTTTATTATGAGAGATGCGAGATGAGAGAGAGTTCAAAGAGCCA
CTGCTGTCTACTTCTCGTGCACGAAAGGGCTGTAAATTGGGAACCACATGTTCCGTGTGA
TGTAATCCACCGTCTCCTCCTTGGACATGTGACTGAAATCTCTGGGACCAACATCCCCAT
GTCCTTCTACAATGTCATCAGATACTGCAGCTCTTAAAACAGCCGCCCC*TACCTCAGCT
GTTATGTGTCGGATGTTGTTGATCGAAGGGTAAAGGATGCCTTTTTGGACTTCTTC
CTC

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR4CU57JQ 805 0 0
GCCCCAAAAAATGGATATAGAGTTTTATATAATCTTTTCAGACATAATCTTAAGACACTG
GAAAAAAATATCGGAAAAGGACAAGGTACAGGTGACCTAGAGCTAATAACAACCATTTAA
AGAATAACCCTGTTCTTGTTCTGTCTTTTTAAACATTAGGCATCATGGCTTTTGTAGCAC
ATACTAAGAATTAAAAAAGAAGAAACAATGTTGTTGATCGCATATAAGACGACAAGGAGG
AACTTGTTTTTGTATTTTTGGCTTTTATTATGAGAGATGCGAGATGAGAGAGAGTTCAAA
GAGCCACTGCTGTCTACTTCTCGTGCACGAAAGGGCTGTAAATTGGGAACCACATGTTCC
GTGTGATGTAATCCACCGTCTCCTCCTTGGACATGTGACTGAAATCTCTGGGACCAACAT
CCCCATGTCCTTCTACAATGTCATCAGATACTGCAGCTCTTAAAACAGCCGCCCC*TACC
TCAGCTGTTATGTGTCGGATGTTGTTGATCGAAGGGTAAAGGATGCCTTTTTGGACTTCT
TCGTCAGTCATGTAGGACGCAAGGCATTCAGCAGCAGCTAGCAGCATTCCATCAGTTACA
ATACGTGCACCAGACAGAAGAGTCCCTAACCCGATCCCGGGGAATAGGTACATGTTGTTG
GCCTGATTCACATGCCCAACACTACCACTCTCAAGTTGAACGTTTTCAAA*TGGGCTTCC
GCTTCCAAAGACAA*TGTTTTCTCCGGCGTGCTTAAATGCGTCAGCAGCGGTGCACTCGG
CATTCAAG
TGGGATCGACATAGCAA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4CU57TF 654 0 0
TCCTCC
TGGACATGTGACTGAGATCTCTGGGACCAACATCCCCATGTC*TTCTACAATGTCATCAG
ATACTGCAGCTCTTAGAACAGCCGCCCCCTACCTCAGCTGTTATGTGTCGGATGTTGTTG
ATCGAAGGGTAAAGGATGCCTTTTTGGACTTCTTCGTCAGTCATGTAGGACGCAAGGCAT
TCAGCAGCAGCTAGCAGCATTCCATCAGTTACAATACGTGCACCAGACAGAAGAGTCCCT
AACCCGATCCCGGGGAATAGGTACATGTTGTTGGCCTGATTCACATGCCCAACACTACCA
CTCTCAAGTTGAACGTTTTCAAAATGGGCTTCCGCTTCCAAAGACAAATGTTTTCTCCGG
CGTGCTTAAATGCGTCAGCAGCGGTGCACTCGGCATTCAAGGTGGGATTCGACATAGCAA
AAATGGCCGGCTTGCATGAATCAGATTCTCGCATTGCCTTGAGAACTTCTTCATTGAATA
TGCCACCCACTCCAGATAAACCAAGAAGAACATGTGGCCTCACTGTCTTCACCACTTCAA
CGATGCTTGCTCCCTCACGTATCCCAGCTGGATTTTTGGCAAAAGGTACAACTGCTGGGT
CAAGTTTTGACCTCTCCGTGGTGACAAGACCATCTTTATCTATCAAGT

QA 7 654 7 654
DS 



AS 1 2

CO CL1843Contig1 780 2 15 U
GGAAGAAGACAAAACAAAAAAAAAACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAATCG
TGAACAAAAAAATGTCGTCAGGATCCGACAAAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTA
AGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGCTACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGA
AGGTGGACAGCGAGCTTACGGTGGAAGAGAGGAACCTGTTGTCAGTTGGTTACAAGAACG
TGATCGGAGCGAGACGGGCCTCGTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGT
CTAAAGGCAACGAATCAAACGTGAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACG
AGCTCGCAGACATCTGTCAAGACATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACG
CTACCTCTGGAGAAGCCACTGTTTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACT
TGGCTGAGTTTAAGACCGAGCAAGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCT
ACGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTG
GCCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTT
GCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAGCGATTGCGGAGTTGGATACTCTTAGCGAGGA
GTCATACAAGACAGCACTTTGATCATGCAGCTCCTTAGAGACACCTCACCCTCTGGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF58TF U 1
AF RR4GB17TF U 9
BS 1 71 RR4EF58TF
BS 72 72 RR4GB17TF
BS 73 142 RR4EF58TF
BS 143 143 RR4GB17TF
BS 144 145 RR4EF58TF
BS 146 146 RR4GB17TF
BS 147 172 RR4EF58TF
BS 173 173 RR4GB17TF
BS 174 214 RR4EF58TF
BS 215 215 RR4GB17TF
BS 216 336 RR4EF58TF
BS 337 337 RR4GB17TF
BS 338 541 RR4EF58TF
BS 542 542 RR4GB17TF
BS 543 780 RR4EF58TF

RD RR4EF58TF 780 0 0
GGAAGAAGACAAAACAAAAAAAAAACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAATCG
TGAACAAAAAA*TGTCGTCAGGATCCGACAAAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTA
AGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGTTATGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAGGTGGCGA
AGGTGGACAGCGAGCTTACGGTGGAAGAGAGGAATCTGTTGTCAGTTGGTTACAAGAACG
TGATCGGAGCGAGACGGGCCTCGTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGT
CTAAAGGCAACGAATCAAACGTGAAAACAATCAAGGTGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACG
AGCTCGCAGACATCTGTCAAGACATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACG
CTACCTCTGGAGAAGCCACTGTTTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACT
TGGCTGAGTTTAAGACCGAGCAAGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCT
ATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTG
GCCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTT
GCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAGCGATTGCGGAGTTGGATACTCTTAGCGAGGA
GTCATACAAGACAGCACTTTGATCATGCAGCTCCTTAGAGACACCTCACCCTCTGGACTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4GB17TF 717 0 0
GGGACCA
AAAAAAAAAACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAGTCGTGAACAAAAAAATGT
CGTCAGGATCCGACAAAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAG
CCGAGCGCTACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAGC
TTACGGTGGAAGAGAGGAACCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGAC
GGGCCTCGTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGGAACGAAT
CAAACGTGAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACGAGCTCGCAGACATCT
GTCAAGACATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCATGCTACCTCTGGAGAAG
CCACTGTTTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGA
CCGAGCAAGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTACGAGGCTGCAACAC
AAGCTGCAAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACT
TCTCTGTTTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGC
AAGCCTTCGATGAGCGATTGCGGAGTTGGATACTCTTAGTGAGGAGTC
GT

QA 8 715 8 715
DS 



AS 1 4

CO CL1844Contig1 746 4 7 U
GGTCACTCGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTTTTGCTCTCCTCTCTC
TCTCTCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTCGAGAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACC
GAGACCAGGAGCTCTAAGCTGTCTGTGACCAAGAAGCCTGCCAAGGCAGCAGGCCGTAGC
AAAGCGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTTTTC
ATGGAAGATTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCT
GTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCCTTATCGGACGCTGAGAAGGCACCTTAC
GTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAACAAG
AAACAGGAGGAAGGTCCGAAGGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTCAAT
GATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGACGATGACTAATAAATTGAA
GTTTGTAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATGTTAAAA
TGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACTTCCCAC
AACCTATATCCCATGTTACCAAGCCCTTTGTACGGTGAAAGTGAAATGTAGAATGTTTAG
ATGGTGATAAGAGAGACTTGCAGCTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C296TF U 3
AF RR4DF23TF U 1
AF RR4EC10TF U 2
AF RR4AC66TF U 355
BS 1 64 RR4DF23TF
BS 65 66 RR4C296TF
BS 67 232 RR4DF23TF
BS 233 233 RR4C296TF
BS 234 618 RR4DF23TF
BS 619 645 RR4EC10TF
BS 646 746 RR4AC66TF

RD RR4C296TF 524 0 0
GG
ACTCGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTTTTGCTCTCCTCTCTCTCTC
TCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTCGAGAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACCGAGA
CCAGGAGCTCTAAGCTGTCTGTGACCAAGAAGCCTGCCAAGGCAGCAGGCCGTAGCAAAG
CGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGG
AAGATTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCTGTTG
GAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCACCTTACGTTG
CTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAGGAACATGAAGGCCTACAACAAGAAAC
AGGAGGAAGGTCCGAAGGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTTAATGATG
AAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGATGATG

QA 3 524 3 524
DS 

RD RR4DF23TF 618 0 0
GGTCACTCGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTTTTGCTCTCCTCTCTC
TCTC**AAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTCGAGAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACC
GAGACCAGGAGCTCTAAGCTGTCTGTGACCAAGAAGCCTGCCAAGGCAGCAGGCCGTAGC
AAAGCGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTACGTTTTC
ATGGAAGATTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCT
GTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCCTTATCGGACGCTGAGAAGGCACCTTAC
GTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAACAAG
AAACAGGAGGAAGGTCCGAAGGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTCAAT
GATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGACGATGACTAATAAATTGAA
GTTTGTAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATGTTAAAA
TGTTTATGGGGCTGATTA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4EC10TF 644 0 0
GGC
ACTCGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTTTTGCTCTCCTCTCTCTCTC
TCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTCGAGAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACCGAGA
CCAGGAGCTCTAAGCTGTCTGTGACCAAGAAGCCTGCCAAGGCAGCAGGCCGTAGCAAAG
CGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGG
AAGATTTCCGTCAGACTT**AAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCTGTTG
GAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCCTTATCGGACGCTGAGAAGGCACCTTACGTTG
CTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAACAAGAAAC
AGGAGGAAGGTCCGAAGGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTCAATGATG
AAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGTACGATGACTAATAAATTGAAGTTT
GTAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATGTTAAAATGTT
TATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGT

QA 4 644 4 644
DS 

RD RR4AC66TF 392 0 0
CCTTACGTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTAC
AACAAGAAACAGGAGGAAGGTCCGAAGGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAA
GTCAATGATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGACGATGACTAATAA
ATTGAAGTTTGTAACATTAGTATATATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATG
TTAAAATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACT
TCCCACAACCTATATCCCATGTTACCAAGCCCTTTGTACGGTGAAAGTGAAATGTAGAAT
GTTTAGATGGTGATAAGAGAGACTTGCAGCTC

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 5

CO CL1845Contig1 1298 5 41 U
GTACCTTCGGCGGTCAAGTTCCTGTCATAAAGGTTGGGAGAATGGCTGGTCAGTTTGCGA
AGCCTAGATCCGATCCATTCGAGGAGAAGGATGGTGTTAAGTTGCCTAGCTACAAGGGAG
ACAACATCAACGGCGACACTTTTGATGAGAAGTCCAGAATCCCTGATCCCAACAGGATGA
TTCGTGCTTACACGCAATCTGCAGCTACGTTGAACCTTCTTAGAGCCTTTGCCACTGGAG
GTTACGCTGCTATTCAAAGAGTTACGCAGTGGAACCTTGATTTCGTTGAGCAAAGCGAGC
AAGCTGACAGGTACCAGGAGCTAGCCAACAGGGTTGATGAGGCCTTGGGGTTCATGTCTG
CTTGTGGACTTACCACGGATCATCCACTCATGACTACAACTGATTTCTACACGTCCCATG
AGTGTTTGCTTCTGCCTTATGAGCAGTCTCTCACGAGGCTGGACTCAACTTCTGGTCTCT
ACTATGATTGCTCTGCACACATGGTGTGGTGTGGAGAGCGTACCCGACAATTGGATGGTG
CTCATGTCGAGTTTCTCAGGGGGATTGCTAATCCTCTTGGCATTAAGGTGAGCAACAAAA
TGGATCCCAATGAGCTTGTAAAGCTTGTGGAGATCCTGAATCCTAACAACAAACCTGGAA
GAATCACTGTGATTGTTAGAATGGGTGCGGAGAACATGAGAGTTAAGCTTCCTCACCTCA
TCAGAGCAGTGCGCAGGTCAGGCCAGATTGTGACATGGGTCTGCGATCCAATGCATGGAA
ACACCATCAAAGCACCTTGCGGTCTCAAAACAAGAGCCTTTGACTCTATCCTGGCTGAAG
TGAGAGCCTTCCTAGATGTGCACGAGCAAGAAGGAAGCCACGCGGGAGGTATCCATCTAG
AGATGACAGGACAGAATGTGACAGAGTGCATTGGAGGGTCCCGTACTGTGACTTACGATG
ACTTAAGCTCTCGCTACCACACCCACTGTGACCCAAGGCTCAACGCGTCTCAGTCTCTTG
AACTGGCCTTCATTGTTGCTGAACGGCTCAGGAAGAGAAGAACCGCTACTCAGCGTCTAT
CTTAAGTGCCGTGCCGTCTTTTCTCTCTTTTGTTTTGTGAGTTTGGTGTCTTTATGACCT
GCCTCTTTAGGAGGGAGCAAACCTTGCTTTGAACCCTGTTCCGTTTTGCTGTGCCCCAGA
CAATCTCACGTCTTTGTTGTTTCAATTTAATGTTTAACTGTATGAATGCTACTACTGTAA
ACTCCTCTTCCTCCTTATTACATACATACAGTATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H030TF U 1
AF RR4GV01TF U 81
AF RR4A583TF U 490
AF RR4GV01JQ C 471
AF RR4H030JQ C 516
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BS 1197 1239 RR4GV01JQ
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GTTACGCTGCTATTCAAAGAGTTACGCAGTGGAACCTTGATTTCGTTGAGCAGAGCGAGC
AAGCTGACAGGTACCAGGAGCTGGCGAACAGGGTTGATGAGGCCTTGGGGTTCATGTCTG
CTTGTGGACTTACCACTGATCATCCACTCATGACTACAACTGATTTTTACACGTCTCATG
AGTGTTTGCTTCTGCCTTATGAGCAGTCTCTCACGAGGCTGGACTCAACTTCTGGTCTCT
ACTATGATTGCTCTGCGCACATGGTGTGGTGTGGAGAGCGTACCCGACAATTGGATGGTG
CTCATGTCGAGTTTCTCAGGGGGATTGCTAATCCTCTTGGCATTAAGGTGAGCAACAAAA
TGGATCCCAATGAGCTTGTCAAGCTTGTGGAGATCCTGAATCCTAACAACAAACCTGGA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4GV01TF 780 0 0
GG
GGAGAAGGATGGTGTTAAGTTGCCTAGCTACAAGGGAGACAACATCAACGGCGACACTTT
TGATGAGAAGTCCAGAATCCCTGATCCCAACAGGATGATTCGTGCT*ACACGCAATCTGC
AGCTACGTTGAACCTTCTTAGAGCCTTTGCTACTGGAGGTTACGCTGCTATTCAAAGAGT
TG*GCAGTGGAACCTTTATTTTGTTGAGCAAAGCGAGCAAGCTGACAGGTACCAGGAGCT
AGCCAACAGGGTTGATGAGGCCTTGGGGTTCATGTCTGCTTGTGGACTTACCACGGATCA
TCCACTTATGACTACAACTGATTTCTACACGTCCCATGAGTGTTTGCTTTTGCCTTATGA
GCAGTCTCTCACGAGGCTGGACTCAACTTCTGGTCTCTACTATGATTGCTCTGCACACAT
GGTGTGGTGTGGAGAGCGTACCCGACAATTGGATGGTGCTCATGTCGAGTTTCTCAGGGG
GATTGCTAATCCTCTTGGCATTAAGGTGAGCAACAAAATGGATCCCAATGAGCTTGTAAA
GCCTGTGGAGATCCTGAATCCTAACAACAAACCTGGAAGAATCACTGTGATTGTTAGAAT
GGGTGCGGAGAACATGAGAGTTAAGCTTCCTCACCTCATCAGAGCAGTGCGCAG*TCAGG
GCCGATTGTGACATGGGTCTGCGATCCTATGCATGGAAACACCATCAAAGCACCTTGCGG
TCTCAAAC**AGAGCCTTTGACTCTATCCTGGCTGA*GTGAGAGCCTTTCTAGATGTG

QA 3 780 3 780
DS 

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AGTTTCTCAGGGGGATTGCTAATCCTCTTGGCATTAAGGTGAGCAACAAAATGGATCCCA
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TGATTGTTAGAATGGGTGCGGAGAACATGAGAGTTAAGCTTCCTCACCTGATCAGAGCAG
TGCGCAGGTCAGGCCAGATTGTGACATGGGTCTGCGATCCAATGCATGGAAACACCATCA
AAGCACCTTGCGGTCTCAAAACAAGAGCCTTTGACTCTATCCTGGCTGAAGTGAGAGCCT
TCCTAGATGTGCACGAGCAAGAAGGAAGCCACGTGGGAGGTATCCATCTAGAGATGACAG
GACAGAATGTGACAGAGTGCATTGGAGGGTCCCGTACTGCGACTTACGATGACTTAAGCT
CTCGCTACCACACCCACTGTGACCCAAGGCTCAACGCGTCTCAGTCTCTTGAACTGGCCT
TCATTGTTGCTGAACGGCTCAGGAAGAGAAGAACCGCTACTCAGCGTCTATCTTAAGTGC
CGTGCCGTCTTTTCTCTCTTTTGTTTTGTGAGTTTGGTGTCTTTATGACCTGCCTCTTTA
GGAGGGAGCAAACCTTGCTTTGAACCCTGTTCCGTTTTGCTGT

QA 1 703 1 703
DS 

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TTGGATGGTGCTCATGTCGAGTTTCTCAGGGGGATTGCTAATCCTCTTGGCATTAAGGTG
AGCAACAAAATGGATCCCAATGAGCTTGTAAAGCCTGTGGAGATCCTGAATCCTAACAAC
AAACCTGGAAGAATCACTGTGATTGTTAGAATGGGTGCGGAGAACATGAGAGTTAAGCTT
CCTCACCTCATCAGAGCAGTGCGCAGGTCAGGGCCGATTGTGACATGGGTCTGCGATCCT
ATGCATGGAAACACCATCAAAGCACCTTGCGGTCTCAAAACAAGAGCCTTTGACTCTATC
CTGGCTGAAGTGAGAGCCTTTCTAGATGTGCACGAGCAAGAAGGAAGCCACGCGGGAGGT
ATCCATCTAGAGATGACAGGACAGAATGTGACAGAGTGCATTGGAGGGTCCCGTACTGTG
ACTTACGATGACTTGAGCTCTCGCTACCACACACACTGTGACCCAAGGCTCAACGCGTCT
CAGTCTCTTGAACTGGCCTTCATTGTTGCTGAACGGCTCAGGAAGAGAAGAACCGCTACT
CAGCGTCTATCTTAAGTGCCCCTCCGTCTTTTCTCTCTTTTGTTTTGTGAGTTTGGTGTC
TTTATGACCTGCCTCTTTAGGAGGGAGCAAACCTTGCTTTGAACCCTGTTCCGCTTTGCT
GTGCCTCAGACAATCTCACGTCTTTGTTGTTTCAATTTAATGTTTAACT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4H030JQ 783 0 0
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CTTGGCATTAAGGTGAGCAACAAAATGGATCCCAATGAGCTTGTCAAGCTTGTGGAGATC
CTGAATCCTAACAACAAACCTGGAAGAATCACTGTGATTGTTAGAATGGGTGCGGAGAAC
ATGATAGTTAAGCTTCCTCACCTGATCAGAGCAGTGCGCAGGTCAGGCCAGATTGTGACA
TGGGTCTGCGATCCAATGCATGGAAACACCATCAAAGCACCTTGCGGTCTCAAAACAAGA
GCCTTTGACTCTATCCTGGCTGAAGTGAGAGCCTTCCTAGATGTGCACGAGCAAGAAGGA
AGCCACGCGGGAGGTATCCATCTAGAGATGACAGGACAGAATGTGACAGAGTGCATTGGA
GGGTCCCGTACTGTGACTTACGATGACTTAAGCTCTCGCTACCACACCCACTGTGACCCA
AGGCTCAACGCGTCTCAGTCTCTTGAACTGGCCTTCATTGTTGCTGAACGGCTCAGGAAG
AGAAGAACCGCTACTCAGCGTCTATCTTAAGTGCCGTGCCGTCTTTTCTCTCTTT*GTTT
TGTGAGTTTGGTGTCTTTATGACCTGCCTCTTTAGGAGGGAGCAAACCTTGCTTTGAACC
CTGTTCCGTTTTGCTGTGCCCCAGACAATCTCACGTCTTTGTTGTTTCAATTTAATGTTT
AACTGTATGAATGCTACTACTGTAAACTCCTCTTCCTCCTTATTACATACATACAGTATC
TAC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 2 5

CO CL1846Contig1 849 3 2 U
GGGCCCTCTCTTCTCTTCTCTCTCTGCAATGGCGTCTCTTCAGCAAACCATGTTCTCTCT
GCAGTCCAAACTCCCTCCCTCATCTTTCCACATCGGAGGATCTCTCCC*TCTGCGAAAGA
AGACAGCCTTACCCCTCCGAATCAGAGGCGGAAACGCCGCAGGCGCAAGAATGTCAGCCA
CTGCTGCAGGAAGCTACGCGATGGCTCTCGCGGACGTCGCGAAGAGGAACGACACTCTCG
AGCTCACGAGCGCGGACGTGGAGAAGCTCGAGAACGTCTTCTCGGACCCGCAGGTGCTCA
ACTTCTTCGCCAACCCAACCGTCGAGGTCGAGAAGAAGCGTCTCGTGATCGACGAGATCG
TCAAAGCGTCCTCTCTCCAGATCCACACCTCCAACTTCCTCAACCTCCTGGTCGACGCGA
ACCGGGTCGGCATCGTGACGGACATCGTGAAGGAGTTCGAGATTGTGTACAACAAGATAA
CGGACACGCAGCTGGCGGAGGTTAGGTCGGTGGTGAAGCTGGAGCCGCCGCAGCTCGCTC
AGATCGCGAAGCAGGTTCAGAAGCTGACCGGGGCGAATAACGTGAGGGTTAAGACGGTTC
TTGATCCGAGTCTTGTCGCTGGGTTTACGATTCGGTATGGTGACTCTGGGTCGAAGCTTA
TTGATATGAGTGTGAAGAAGCAGCTTGAGGATATCGCTGCTCAGCTAGAGCTCGGTGAGA
TTCAGTTAGCTGCATGAAGAAAAATTGTATTGACAACTGGCTTTTCTTTTTTTACTTGTG
CAAGTTTAATTCTTTCTCTCTCTTTTTTCCTCCATCAATCGTCTACATATATAATATACT
GATATAAAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4D871TF U 1
AF RR4AY67JQ C 1
AF RR4AY67TF U 1
BS 1 848 RR4AY67TF
BS 849 849 RR4AY67JQ

RD RR4D871TF 652 0 0
GGGCCCTCTCTTCTCTTCTCTCTCTGCAATGGCGTCTCTTCAGCAAACCATGTTCTCTCT
GCAGTCCAAACTCCCTCCCTCATCTTTCCACATCGGAGGATCTCTCCC*TCTGCGAAAGA
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CTGCTGCAGGAAGCTACGCGATGGCTCTCGCAGACGTCGCGAAGAGGGACGACACTCTCG
AGCTGACGAGCGCCGACGTGGAGAAGCTCGAAAACGTCTTCTCGGACCCTCAGGTGCTCA
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CAAGTTTAATTCTTTCTCTCTCTTTTTTCCTCCATCAATCGTCTACATATATAATATACT
GATATAAA

QA 1 848 1 848
DS 



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ACCGACCTAACCTCCGCCAGCTGCGTGTCCGTTATCTTGTTGTACACAATCTCGAACTCC
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TCGACCTCGACGGTTGGGTTGGCGAAGAAGTTGAGCACCTGAGGGTCCGAGAAGACGTTT
TCGAGCTTCTCCACGTCGGCGCTCGTCAGCTCGAGAGTGTCGTCCCTCTTCGCGACGTCT
GCGAGAGCCATCGCGTAGCTTCCTGCAGCAGTGGCGGACATTCTTGCTCCTGCGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F569TF C 1
AF RR4D871JQ U 65
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QA 1 309 1 309
DS 

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QA 1 713 1 713
DS 



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ACAACAGCGTGCACTTTATACTTTCCTAGAGCCTTTGTAGCCTTCTCTATCAAAATCTTT
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GGCTGGCAAGTTCCACTCCTATACAGAAACACTACAGCATATCCAGCCTTGACAAAATTC
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GGTAACGATTCAAAAAAAGAGCTCACTTCATCTTCCCCCAACCCAGAGATCGAACTCATT
ATCTCTACGCAAACAGTAAATTAATCAGTACAAATGCTGATTCGCAAATCTCCCACCTCT
AACTCCACGATCTCGTCTCCGGTCATCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G373JQ U 1
AF RR4AO65JQ U 73
AF RR4G373TF C 500
AF RR4AO65TF C 601
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BS 851 1101 RR4G373TF
BS 1102 1291 RR4AO65TF

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AACCAAACTATTCAATATTCAAGAAAATTCTCACTCGTTTTAATAAAATCTGAAATTACT
GATCAATGGTCAAAACCC

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR4AO65JQ 778 0 0
CG
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ACCCCAATCATCATTTGTTCACATAGCGTACACAAATAAAGAGAGAGAGAGGAGGAACCT
TGTTTTTGTTGAGTGGATGAAAGATTCACACATGTTTTTGACTTGGAAGCATTTAAAAAA
TCAAGTGTGAGATTCTTTGATGTATGTTGAGTGCCGATCTACAATGAGGCGAATAAAATT
GTCTTCTACGATAGATTCAGGCTTATCGCTATCACGCCTAACCACAACATTACCGCTGCT
TGAAACAACCACAACTTCTTCCTTACGTGTTGACAGCTCATTGGCTACAACAGCGTGCAC
TTTATACTTTCCTAGAGCCTTTGTAGCCTTCTCTATCAAAATCTTTGAGTCTGTCTCAAG
CTTGAATGATATGCAAAAAGCCTTTGGAGCCCAAGTTGTTCTCAAGATTGAAAGCATTTT
AGGGACTTGAGCAAGTCTTATGTCCAAAGGACCAGATCCCGATTCTATTTTGTGCTCTGT
CATGCTATTCCAGGGCACATAAAAGTCAGAGGCAGCAGCAGCAAGATAAAACATTGAACA
TGGACCGACGTCTTTCAATGCCGTTGCAATCAACCGCAACATCTGAAGATACTCATGTAT
GGTTGTGAATGGGAGCTTCAGTAAGCGAGATTCAGCTACTGCAGCTTGCTGGTCCATAAC
AGCCATTCTCACAGCTTCCACATGTGACGGATGAACTTGAATGTTGGTCTTATCTG

QA 3 778 3 778
DS 

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CTTGAGCAAGTCTTATGTCCAAAGGACCAGATCCTGATTCTATTTTGTGCTCTGTCATGC
TATTCCAGGGCACATAAAAGTCAGAGACAGCAGCAGCAAGATAAAACATTGAACATGGAC
CGACGTCCTTCAATGCCGTTGCAATCAACCGCAACATCTGAAGATACTCATGTATGGTTG
TGAATGGGAGCTTCAGTAAGCGAGATTCAGCTACTGCAGCTTGCTGGTCCATAACAGCCA
TTCTCACAGCTTCCACATGTGACGGATGAACCTGAATGTTGGTCTTATCTGGAAACTGAA
AACATTCAAGGAATGGATCATCAGGAAGAGACCGGCAATACGGCTGGCAAGTTCCACTCC
TATACAGAAACACTACAGCATATCCAGCCTTGACAAAATTCTCAGTGGAAGCAGCACCTC
TGTTTCCAGAGCTGAAGTTATCGATATATCTTACGCAGCGTTGCTCCAGTGGAACCGTAG
TTCCGCCTGAAGTCACACATACGATCCTCCTCCCTCCCGAAGAATTGTGCTCTATGAAGC
CA
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4AO65TF 691 0 0
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TAAAACATTGAACATGGACCGACGTCTTTCAATGCCGTTGCAATCAACCGCAACATCTGA
AGATACTCATGTATGGTTGTGAATGGGAGCTTCAGTAAGCGAGATTCAGCTACTGCAGCT
TGCTGGTCCATAACAGCCATTCTCACAGCTTCCACATGTGACGGATGAACTTGAATGTTG
GTCTTATCTGGAAACTGAAAACATTCAAGGAATGGATCATCAGGAAGAGACCGGCAATAC
GGCTGGCAAGTTCCACTCCTATACAGAAACACTACAGCATATCCAGCCTTGACGAAATTC
TCAGTGGAAGCAGCACCTCTGTTTCCAGAGCTGAAGTTATCGATATATCTTACGCAGCGT
TGCTCCAGTGGAACCGTAGTTCCGCCTGAAGTCACACATACGATCCTCCTCCCTCCTGAA
GAATTGTGCTTTATGAAGCCATTAAGCTTCTCCACTATACCTTCCTTGTTCTTCAGCGGT
GGTAACGATTCAAAAAAAGAGCTCACTTCATCTTCCCCCAACCCAGAGATCGAACTCATT
ATCTCTACGCAAACAGTAAATTAATCAGTACAAATGCTGATTCGCAAATCTCCCACCTCT
AACTCCACGATCTCGTCTCCGGTCATCATCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 4

CO CL1848Contig1 1204 4 15 U
GGGAGGATACATTTTCTTCAGAGAATCTTGCTTCCATCAATCTGGAGACAGCAAGCGAAA
ATCGAACCCCACCCACTATCGTGAACCAAGATTCTATACAAAGGTTTTCCAGGAATGCCA
AGCACGTGATGCTTCTGGCAAATCATTTGAGCTCACTATGGTTGGTTGCAAATGCATTGG
AGCGTACGTGAAGAACAAGAAGAATCAAAATCAGATATGCTGGATTTGGCAAAAAGTAAG
CGTGGAGAATGACAAGGACTTCCAGCGTTTCTTGGACAATGCTCAGTACAAGTCCAATGG
GATCTTGCGGTATGAGCGTGTCTTTGGGCAAGGATATGTGAGCACTGGCGGTTTTGAGAC
AACTAAAGAGTTTGTGGCGATGATGGAGCTGAAACCAGGACAGAAAGTCCTAGATGTTGG
TTGTGGTATCGGTGGAGGTGACTTCTACATGGCTGAGACTTTCGATGTTCATGTTGTTGG
TATCGATCTATCTGTCAACATGATATCTTTCGCCTTGGAGCGTGCTATTGGACTCAAATG
CTCAGTCGAGTTTGAAGTCGCGGACTGCACCACAAAGACGTATCCTGATAACTCTTTCGA
CGTCATTTACAGCCGTGACACTATCCTCCACATCCAAGACAAGCCGGCTCTGTTCAAGAA
GTTCTTCAAGTGGCTTAAACCAGGTGGAAGAGTTCTCATCACGGACTATTGCAAGAGTGC
TGAAACTCCATCTCCAGTATTCGCGGAGTACATCAAACAAAGAGGATATGATCTCCATGA
TGTTCAAGCTTATGGACAGATGCTGAAAGACGCAGGCTTTGAGGATGTGATCGCAGAGGA
CCGTACTGATCAGTTTGTACAAGTCCTGAGGCGTGAGTTGGAGAAAGTGGAGAAAGAAAA
AGAAGAATTCATCAGCGACTTCTCACAAGAGGATTACAATGACATTGTGGGAGGATGGAA
AGCAAAGCTTGAAAGGTCTGACGAACAGAAATGGGGATTATTCATCGCCAACAAGAAGTA
AAAAAAGAAAACAAAGTCCAATTGTGTTACCCCAAAGCGATAAACTTATTTTTTTACCGT
TCAATAAAAAGTGTTCCTTGGGAGGACAAACACTTGCTTGTTTTTACTATCATGGAACCG
TAAATTGTAACAAAAAAAAAACTCATGTGTTGTTCTGTTTCTTAATCCACTTGCTTTAAT
TCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 

AF RR4DU78TF U 1
AF RR4CP22TF U 96
AF RR4CP22JQ C 366
AF RR4DU78JQ C 505
BS 1 198 RR4DU78TF
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BS 200 642 RR4DU78TF
BS 643 815 RR4CP22TF
BS 816 816 RR4CP22JQ
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BS 873 1074 RR4CP22JQ
BS 1075 1075 RR4DU78JQ
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BS 1161 1161 RR4DU78JQ
BS 1162 1204 RR4CP22JQ

RD RR4DU78TF 642 0 0
GGGAGGATACATTTTCTTCAGAGAATCTTGCTTCCATCAATCTGGAGACAGCAAGCGAAA
ATCGAACCCCACCCACTATCGTGAACCAAGATTCTATACAAAGGTTTTCCAGGAATGCCA
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AGCGTACGTGAAGAACAATAAGAATCAAAATCAGATATGCTGGATTTGGCAAAAAGTAAG
CGTGGAGAATGACAAGGACTTCCAGCGTTTCTTGGACAATGCTCAGTACAAGTCCAATGG
GATCTTGCGGTATGAGCGTGTCTTTGGGCAAGGATATGTGAGCACTGGCGGTTTTGAGAC
AACTAAAGAGTTTGTGGCGATGATGGAGCTGAAACCAGGACAGAAAGTCCTAGATGTTGG
TTGTGGTATCGGTGGAGGTGACTTCTACATGGCTGAGACTTTCGATGTTCATGTTGTTGG
TATCGATCTATCTGTCAACATGATATCTTTCGCCTTGGAGCGTGCTATTGGACTCAAATG
CTCAGTCGAGTTTGAAGTCGCGGACTGCACCACAAAGACGTATCCTGATAACTCTTTCGA
CGTCATTTACAGCCGTGACACTATCCTCCACATCCAAGACAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4CP22TF 743 0 0
GATA
AAAGGTTTTCCAGGAATGCCAAGCACGTGATGCTTCTGGCAAATCATTTGAGCTCACTAT
GGTTGGTTGCAAATGCATTGGAGCGTACGTGAAGAACAAGAAGAATCAAAATCAGATATG
CTGGATTTGGCAAAAAGTAAGCGTGGAGAATGACAAGGACTTCCAGCGTTTCTTGGACAA
TGTTCAGTACAAGTCCAATGGGATCTTGCGGTATGAGCGTGTCTTTGGGCAAGGATATGT
GAGCACTGGCGGTTTTGAGACAACTAAAGAGTTTGTGGCGATGATGGAGCTGAAACCAGG
ACAGAAAGTCCTAGATGTTGGTTGTGGTATCGGTGGAGGTGACTTCTACATGGCTGAGAC
TTTCGATGTTCATGTTGTTGGTATCGATCTATCTGTCAACATGATATCTTTCGCCTTGGA
GCGTGCTATTGGACTCAAATGCTCAGTCGAGTTTGAAGTCGCGGACTGCACCACAAAGAC
GTATCCTGATAACTCTTTCGACGTCATTTACAGCCGTGACACTATCCTCCACATCCAAGA
CAAGCCGGCTCTGTTCAAGAAGTTCTTCAAGTGGCTTAAACCAGGTGGAAGAGTTCTCAT
CACGGACTATTGCAAGAGTGCTGAAACTCCATCTCCAGTATTCGCGGAGTACATCAAACA
AAGAGGATATGATCTCCATGATGTTCAAGCTTATGGACAGATGCTGAAAGACGCAG*CTT
TGAG*ATGTGATCGCAGAG

QA 5 743 5 743
DS 

RD RR4CP22JQ 839 0 0
AAGAGTTTGTG*CGATGATGGAGCTGAAACCAGGACAGAAAGTCCTAGATGTTGGTTGTG
GTATCGGTGGAGGTGACTTCTACATGGCTGAGACTTTCGATGTTCATGTTGTTGGTATCG
ATCTATCTGTCAACATGATATCTTTCGCCTTGGAGCGTGCTATTGGACTCAAATGCTCAG
TCGAGTTTGAAGTCGCGGACTGCACCACAAAGACGTATCCTGATAACTCTTTCGACGTCA
TTTACAGCCGTGACACTATCCTCCACATCCAAGACAAGCCGGCTCTGTTCAAGAAGTTCT
TCAAGTGGCTTAAACCAGGTGGAAGAGTTCTCATCACGGACTATTGCAAGAGTGCTGAAA
CTCCATCTCCAGTATTCGCGGAGTACATCAAACAAAGAGGATATGATCTCCATGATGTTC
AAGCTTATGGACAGATGCTGAAAGACGCAGGCTTTGAGGATGTGATCGCAGAGGACCGTA
CTGATCAGTTTGTACAAGTCCTGAGGTGTGAGTTGGAGAAAGTGGAGAAAGAAAAAGAAG
AATTCATCAGCGACTTCTCACAAGAGGATTACAATGACATTGTGGGAGGATGGAAAGCAA
AGCTTGAAAGGTCTGACGAACAGAAATGGGGATTATTCATCGCCAACAAGAAGTAAAAAA
AGAAAACAAAGTCCAATTGTGTTACCCCAAAGCGATAAACTTATTTTTT*ACCGTTCAAT
AAAAAGTGTTCCTTGGGAGGACAAACACTTGCTTGTTTTTACTATCATGGAACCGTAAAT
TGTAACAAAAAAAAA*CTCATGTGTTGTTCTGTTTCTTAATCCACTTGCTTTAATTCCT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4DU78JQ 700 0 0
ATCTTTCGCCTTGGAGCGTGCTATTGGACTCAAATGCTCAGTCGAGTTTGAAGTCGCGGA
CTGCACCACAAAGACGTATCCTGATAACTCTTTCGACGTCATTTACAGCCGTGACACTAT
CCTCCACATCCAAGACAAGCCGGCTCTGTTCAAGAAGTTCTTCAAGTGGCTTAAACCAGG
TGGAAGAGTTCTCATCACGGACTATTGCAAGAGTGCTGAAACTCCATTTCCAGTATTCGC
GGAGTACATCAAACAAAGAGGATATGATCTCCATGATGTTCAAGCTTATGGACAGATGCT
GAAAGACGCAGGCTTTGAGGATGTGATCGCAGAGGACCGTACTGATCAGTTTGTACAAGT
CCTGAGGCGTGAGTTGGAGAAAGTGGAGAAAGAAAAAGAAGAATTCATCAGCGACTTCTC
ACAAGAGGATTACAATGACATTGTGGGAGGATGGAAAGCAAAGCTTGAAAGGTCTGACGA
ACAGAAATGGGGATTATTCATCGCCAACAT*AAGTAAAAAAAGAAAACAAAGTCCAATTG
TGTTACCCCAAAGCGATAAACTTATTTTTTTACCGTTCAATAAAAAGTGTTCCTTGGGAG
GACAAACACTTGCTTGTTTTTACTATCATGGAACCGTAAATTGTAACAAAAAAAAAACTC
ATGTGTTGTTCTGTTTCTTAATCCACTTGCTTTAATTC
TT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 5

CO CL1849Contig1 769 5 6 U
GTATGTAAGGGGATGATATGTTATTTTGAAACAAACAAACCAGAAGGTAGTCAGAAATAT
GGGTTTTTAGATAATCACTGAATACATATGCATAAAGATAGATAAACTCGACAGGAATCA
AAGTAGAGGCAGGCTGATGGAAGAATAACAAACGAGATTCCTAACAAAAGAGGCTCTCTC
TAGCGTCTTGATCAAACACACACACACAGACTCTCGTAATACTTAAAAAGAAAGAAACAT
GAGAAGCAAAAGCAAGAAGAAATCTATTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAGACTTGTGG
ATGTGAGGGATGACACCACCACCAGCAATAGTACCTTTGATGAGGGTATCAAGCTCCTCA
TCTCCACGGATGGCAAGCTGCAAGTGCCTTGGGGAGATACGTTTCACCTTGAGGTCCTTG
CTGGCGTTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCGGTCAGATACTCGAGTATGGCTGCTGTG
TAAACCGCTGCGGTTGCACCAACCCTTCCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCAATAGTCGA
TGCACCCTACCTACTGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAGCGGGTGATGGGTTGTTTC
TTCTTGTCCTTGTCCTTGTCGCTACCGCTAGGTTTCCCCATTATCAATCCTTTCGCTCCT
TTCCCCGACATTTTCCCGCCAAAAGTTTCACACCCGCCCCCGCGCAGTTAGAGAGAGAGA
GATAGATAGATCGCACCAGAAGAGAGACGATGAAGAAGAAGAAGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D125JQ U 85
AF RR4GI41JQ U 1
AF RR4E219JQ U 49
AF RR4E219TF C 58
AF RR4GI41TF C 46
BS 1 635 RR4GI41JQ
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BS 690 751 RR4GI41JQ
BS 752 769 RR4GI41TF

RD RR4D125JQ 597 0 0
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ATAACAAACGAGATTCCTAACAAAAGAGGCTCTCTCTAGCGTCTTGATCAAACACACACA
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TGCCTTGGGGAGATACGTTTCACCTTGAGGTCCTTGCTGGCGTTACCAGCCAACTCCAAA
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AGACCAGCTCGAGCAGAGCGGGTGATGGGTTGTTTCTTCTTGTCCTTGTCCTTGTCGCTA
CCGCTAGGTTTCCCCATTATCAATCCTTTCGCTCCTTTCCCCGACATTTTCCCGCCA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4GI41JQ 755 0 0
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GGGTTTTTAGATAATCACTGAATACATATGCATAAAGATAGATAAACTCGACAGGAATCA
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TAGCGTCTTGATCAAACACACACACACAGACTCTCGTAATACTTAAAAAGAAAGAAACAT
GAGAAGCAAAAGCAAGAAGAAATCTATTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAGACTTGTGG
ATGTGAGGGATGACACCACCACCAGCAATAGTACCTTTGATGAGGGTATCAAGCTCCTCA
TCTCCACGGATGGCAAGCTGCAAGTGCCTTGGGGAGATACGTTTCACCTTGAGGTCCTTG
CTGGCGTTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCGGTCAGATACTCGAGTATGGCTGCTGTG
TAAACCGCTGCGGTTGCACCAACCCTTCCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCAATAGTCGA
TGCACCCTACCTACTGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAGCGGGTGATGGGTTGTTTC
TTCTTGTCCTTGTCCTTGTCGCTACCGCTAGGTTTTCCCATTATCAATCCTTTCGCTCCT
TTCCCCGACATTTTCCCGCCAAAAGTTTTACACCCGCCCCCGCGCAGTTAGAGAGAGAGA
GATAGATAGATCGCACCAGAAGAGAGACGAT
GAAG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4E219JQ 705 0 0
GGTCAGAAATATGGGT
TTTTAGATAATCACTGAATACATATGCATAAAGATAGATAAACTCGACAGGAATCAAAGT
AGAGGCAGGCTGATGGAAGAATAACAAACGAGATTCCTAACAAAAGAGGCTCTCTCTAGC
GTCTTGATCAAACACACACACACAGACTCTCGTAATACTTAAAAAGAAAGAAACATGAGA
AGCAAAAGCAAGAAGAAATCTATTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAGACTTGTGGATGT
GAGGGATGACACCACCACCAGCAATAGTACCTTTGATGAGGGTATCAAGCTACTCATCTC
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CCGCTGCGGTTGCACCAACCCTTCCGTGGGCAGTGGACCTTGTCTTCAATAGTCGATGCA
CCCTACCTACTGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAGCGGGTGATGGGTTGTTTCTTCT
TGTCCTTGTCCTTGTCGCTACCGCTAGGTTTCCCCATTATCAATCCTTTCGCTCCTTTCC
CCGACATTTTCCCGCCAAAAGTTTCACACCCGCCCCCGCGCAGTTAGAGAGAGAGAGATA
GATAGATCGCACCAGAAGAGAGACGAT
CC

QA 17 703 17 703
DS 

RD RR4E219TF 696 0 0
ATATGGG
TTTTAGATAATCACTGAATACATATGCATAAAGATAGATAAACTCGACAGGAATCAAAGT
AGAGGCAGGCTGATGGAAGAATAACAAACGAGATTCCTAACAAAAGAGGCTCTCTCTAGC
GTCTTGATCAAACACACACACACAGACTCTCGTAATACTTAAAAAGAAAGAAACATGAGA
AGCAAAAGCAAGAAGAAATCTATTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAGACTTGTGGATGT
GAGGGATGACACCACCACCAGCAATAGTACCTTTGATGAGGGTATCAAGCTACTCATCTC
CACGGATGGCAAGCTGCAAGGGCCTTGGGGAGATACGTTTCACCTTGAGGTCCTTGCTGG
CGTTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCGGTCAGATACTCGAGTATGGCTGCTGTGTAAA
CCGCTGCGGTTGCACCAACCCTTCCGTGGGCAGTGGACCTTGTCTTCAATAGTCGATGCA
CCCTACCTACTGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAGCGGGTGATGGGTTGTTTCTTCT
TGTCCTTGTCCTTGTCGCTACCGCTAGGTTTCCCCATTATCAATCCTTTCGCTCCTTTCC
CCGACATTTTCCCGCCAAAAGTTTCACACCCGCCCCCGCGCAGTTAGAGAGAGAGAGATA
GATAGATCGCACCAGAAGAGAGACGAT
CC

QA 8 694 8 694
DS 

RD RR4GI41TF 724 0 0
GAAGGTAGTCAGAATATGG
TTTTAGATAATCACTGAATACATATGCATAAAGATAGATAAACTCGACAGGGATCAAAGT
AGAGGCAGGCTGATGGAAGAATAACAAACGAGATTCCTAACAAAAGAGGCTCTCTCTAGC
GTCTTGATCAAACACACACACACAGACTCTCGTAATACTTAAAAAGAAAGAAACATGAGA
AGCAAAAGCAAGAAGAAATCTATTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAGACTTGTGGATGT
GAGGGATGACACCACCACCAGCAATAGTACCTTTGATGAGGGTATCAAGCTCCTCATCTC
CACGGATGGCAAGCTGCAAGTGCCTTGGGGAGATACGTTTCACCTTGAGGTCCTTGCTGG
CGTTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCGGTCAGATACTCGAGTATGGCTGCTGTGTAAA
CCGCTGCGGTTGCACCAACCCTTCCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCAATAGTCGATGCA
CCCTACCTACTGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAGCGGGTGATGGGTTGTTTCTTCT
TGTCCTTGTCCTTGTCGCTACCGCTAGGTTTTCCCATTATCAATCCTTTCGCTCCTTTCC
CCGACATTTTCCCGCCAAAAGTTTTACACCCGCCCCCGCGCAGTTAGAGAGAGAGAGATA
GATAGATCGCACCAGAAGAGAGACGATGAAGAAGAAGAAGCTCCC

QA 20 724 20 724
DS 



AS 1 2

CO CL1850Contig1 779 2 5 U
AGATAAGAACAAAACATGAATAATCCAACGATAGAGAGATAACAACAAAACATGAATAAT
CCAACGACAGAGAGATAACAACAAACCAGATATTTTTGAAAGTTACTTCATACAAGTAAG
TAACAGTTTTTATTAAAATAACAAAAGTACTCTTTTTTTATCACCAAAAAACAGAAGTAC
ACATTTGAAAAACTAGAGGTTTATGCTTTGGTCAAAGCGTCGTCTTACCAAATACATTCC
GGTTCTATGATCCCAACGTGTGGTTTTACAATTTAAGCAAAGTCGCAGATAGAGCTTTGC
CTAAAACAGAGTAAACGGATTTCCATCCTTCCTGAGTAGGGTGAACCCCATCCCAGAAGA
AAGCAGACTCTGGATCATCACATAAGGTATACTTATTAGCACCCTTTTCATCCACAACCC
CACAACTGCCTTCGCAACATGATTTCAACGGGGTTTCAAAACTCTTACTCCCTGGATTCT
CTCCTTTGTTCTTGATGACGGTCAAGAAGGCGTTATAGAAATCAATAATGGCAAAAGTCG
AATGATTGGTCTCGTTGTTGAGCTTGCCCACTACTTTCTACAACAAGCTGTTATGGTATT
GAACCAACGCGTTAAAAGCCTCGTTGCAACCCTGGGACGACGAGTAGCTGGGGAGGCATC
CGAGAGGCTGCAGCGTTTGTATTGCTATCTTTTTCACTCCCAAGGCCTGGATTCGCCTCA
GATTCAGCTCGGTTTGATCCACAACTTGCTTGATAAATATTGGGAGGGCAGCGATGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EI05JQ U 1
AF RR4EB09JQ U 33
BS 1 168 RR4EI05JQ
BS 169 169 RR4EB09JQ
BS 170 579 RR4EI05JQ
BS 580 580 RR4EB09JQ
BS 581 779 RR4EI05JQ

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ACATTTGAAAAACTAGAGGTTTATGCTTTGGTCAAAGCGTCGTCTTACCAAATACATTCC
GGTTCTATGATCCCAACGTGTGGTTTTACAATTTAAGCAAAGTCGCAGATAGAGCTTTGC
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AAGCAGACTCTGGATCATCACATAAGGTATACTTATTAGCACCCTTTTCATCCACAACCC
CACAACTGCCTTCGCAACATGATTTCAACGGGGTTTCAAAACTCTTACTCCCTGGATTCT
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AATGATTGGTCTCGTTGTTGAGCTTGCCCACTACTTTCTCCAACAAGCTGTTATGGTATT
GAACCAACGCGTTAAAAGCCTCGTTGCAACCCTGGGACGACGAGTAGCTGGGGAGGCATC
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TTTTTTTATCACCAAAAAACAGAAGTACACATTTGAAAAACTAGAGGTTTATGCTTTGGT
CAAAGCGTCGTCTTACCAAATACATTCCGGTTCTATGATCCCAACGTGTGGTTTTACAAT
TTAAGCAAAGTCGCAGATAGAGCTTTGCCTAAAACAGAGTAAACGGATTTCCATCCTTCC
TGAGTAGGGTGAACCCCATCCCAGAAGAAAGCAGACTCTGGATCATCACATAAGGTATAC
TTATTAGCACCCTTTTCATCCACAACCCCACAACTGCCTT*GCAACATGATTTCAACGGG
GTTTCAAAACTCTTACTCCCTGGATTCTCTCCTTTGTTCTTGATGACGGTCAAGAAGGCG
TTATAGAAATCAATAATGGCAAAAGTCGAATGATTGGTCTCGTTGTTGAGCTTGCCCACT
ACTTTCTACAACAAGCTGTTATGGTATTGAACCAACGCGTTAAAAGTCTCGTTGCAACCC
TGGGACGACGAGTAGCTGGGGAGGCATCCGAGAGGCTGCAGCGTTTGTATTGCTATCTTT
TTCACTCCCAAGGCCTGGATTCGCCTCAGATTCAGCTCGGTTTGATCCACAACTTGCTTG
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 5

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CACAATTTTTTTTCCATTACCCGTAGAATCAGAATCAGAATCAGAATCAGAATCAGAATC
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ATAATGCTGCCAACTTCAACTTGTTAGTCAATCGTCTTCCTCCTCATCACTCTTATCATC
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TGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCCTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCG
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TCCACCAGCTTTTCCAACAGCAGCAACAGATTTGTTGTTGGGATGATCCTTCTTGTAAGT
C*GACGGAAGTCCTCCATGAAAACGAAGAAAGCACTGGCAGGCCTCTTAGGTTTGTTAGG
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TTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4A394JQ U 1
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AF RR4FR37TF C 137
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AF RR4A394TF C 1
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TGAG

QA 1 719 1 719
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QA 1 612 1 612
DS 

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AGAAAAACATGAGAGAGAGAGGGATCGTTGCAGCTGTCCTTTATATAATGCTGCAAACTT
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CTAACGTCAGAGACTGACTTATCATCAGATTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGC
TTCTTGCTGTAGGCCTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTAGCT
ACGTAGGGAGCCTTCTCAGCGTCTGATAAGGATTTCCACTTCTCTCCACCAGCTTTTCCA
ACAGCAGCAACAGATTTGTTGTTGGGATGATCCTTCTTGTAAGTC*GACGGAAGTCCTCC
ATGAAAACGAAGAAAGCACTGGCAGGCCTCTTAGGTTTGTTAGGATCTTTACCAGCAGCA
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TAGGGTTTGAAATTAGGGGAGGAGTAAAAGGGAATACTGCGT
CC

QA 1 642 1 642
DS 

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TCAGCATCCTCCTCTTCACTAACGTCAGAGACTGACTTATCATCAGATTCCTCGTCCTAC
TTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTATTGTAGGCCTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTG
CGCTTATCAGCCTTAGCTACGTAGGGAGCCTTCTCAGCGTCTGATAAGGATTTCCACTTC
TCTCCACCAGCTTTTCCAACAGCAGCAACAGATTTGTTGTTGGGATGATCCTTCTTGTAA
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T

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TAACATTTTAAGAGAAAGAAAAACATGAGAGAGAGAGGGATCGTTGCAGCTGTCCTTTAT
ATAATGCTGCCAACTTCAACTTGTTAGTCAATCGTCTTCCTCCTCATCACTCTTATCATC
AGCATCCTCCTCTTCACTAACGTCAGAGACTGACTTATCATCAGATTCCTCGTCCTCCTT
TGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCCTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCG
CTTATCAGCCTTAGCTACGTAGGGAGCCTTCTCAGCGTCTGATAAGGATTTCCACTTCTC
TCCACCAGCTTTTCCAACAGCAGCAACAGATTTGTTGTTGGGATGATCCTTCTTGTAGTC
T*GACGGAAGTCCTCCATGAAAACGAAGAAAGCACTGGCAGGCCTCTTAGGTTTGTTAGG
ATCTTTACCAGCAGCAGCTCCTTTGCTCGCCTTCGTAGGCTTCTTGTTCACAGACAGCTT
TGAGTTTCTGGAGTCGGCCTTTGAATTACCTCCTTTCATGGTCTCTCGATTCTTGATGAT
GAGGAGGAGGAAGAGCTAGGGTTTGAAATTAGGGGAGGAGTAAAAGGGAATACTGCGTGT
TTGTCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 5

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TGAACAATCTCC*AAACAACAC*******AAGACACAAGAAAGACCAAACTGGTAGACAA
TTTTAATAGGGGGACGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACATAAACTTAAAGAGAG
TCGCTGCGACCCGACC*ATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCTCAGTCAGCACTTGA
CTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGT
AAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCT
TGAGCTTGGGG*AGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGC
TGCTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCAATGAAG
CCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACC
TTTTCAACACTGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCGGATGGGTTGGCA
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BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RR4AT42JQ U 47
AF RR4D591JQ U 1
AF RR4AT42TF C 47
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GA
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TTCTCAATCTCCTTGTACGGGAAAG

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DS 

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AAACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCT
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DS 

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AATA
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AGAGATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGTGAGGCC

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H587TF U 1
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TAA

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G

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DS 

RD RR4EZ72TF 632 0 0
G
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T

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR4H587JQB 782 0 0
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TTCGTTGGAAAGACAATTGAAGAGGATAACTGATAGACATGAGTCCGAGGAATTTATCAG
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TA

QA 1 782 1 782
DS 

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AGCAAAGATGGACGCTTCGCCGTTGTGGCGTTCCTCTACAATTTGGGAAGACCTGACCCT
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TTAGGATCACTCACAACTCCCCCCTGTTCTGAAAATGTTACTTGGTCCATTTCCAGAGAG
ACGAGGACTGTAACGTTGAAACAGTTGAGCCTGCTTCGTGTGACTGTACATGATCAATCT
AATTCGAATGCTAGACCGCTTCAACGTCAAAACCAGCGTCCAGTGAAATTCTACTTACCA
ACATGGCATATTTAACCAATATAAAAGTTGTTGTTCACTCTATTTGAGCTTTGGTTAAAC
CTAGTTTTCATTAGTTTTATGTACTGAGAACCAAAAGAGAACACTAATAAAAAAAATTGT
TTTTGAGTTCATTTTAAAGAGAGATATCACTTAAAATTTGAGC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

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AATCTTCTCCTGCCGTTTGCCGATTGAATCTTGAAACTGCATCTTGAGCATTTCGACATG
GCTGATAACAAGGATGAAGTAAGCCCCAAGAGCGTTGCTGCTTCCCCTCTGAGGAACCCT
AATGTTACTCTTAACGAGAGGAATTTCGCAGCCTTCACAAACAGATCAGCTGCTGCTCAT
CCTTGGCATGACTTGGAGATTGGCCCGGAAGCTCCTGCTGTTTTCAACTGTGTTGTTGAA
ATTAGCAAAGGTGGCAAGGTGAAGTACGAGCTAGACAAGAACAGTGGCCTTATTAAGGTT
GATCGTGTTCTCTACTCATCCATTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCCCGAACC
ATTTGTGAAGACAGTGACCCTATTGATGTCCTGGTACTCATGCAGGAGCCTGTGCTGACT
GGGTCGTTCCTTCGTGCCCGCGCTATTGGTTTAATGCCAATGATTGACCAGGGTGAAAAA
GACGACAAGATCATTGCAGTTTGCGCTGATGATCCAGAGTTCCGTCATTACAGAGACATC
AAAGAGCTTCCTCCTCACCGTCTAGCTGAGATCCGCCGCTTCTTCGAAGACTACAAGAAG
AACGAGAACAAGAAAGTCGCTGTTGAAGGTTTCCTCCCTGCTCAAGCTGCCATCGACGCA
ATTAAGGACTCCATGGATCTTTACGCAGCTTACATCAAAGCTGGCCTGCAGCGTTAATGA
*CAGACCTCGGTCGAGCCCGTTACTCCCGGGTTGCTTTGACTTCACTATCCCTGAAGCCT
TCTTATACTCTGCATTCATGGTAAACTTGGTGCATTTTTGCAATGTACATTGAAATACTT
TGTCGAACTTTGGAAGTTTCTGATGATGACGATTGAGAAATTCCAATTTCAATCACTATA
TTTGAATATTCACATTAGCTATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK86TF U 2
AF RR4AN07TF U 1
AF RR4AN07JQ C 237
AF RR4BK86JQ C 280
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AAAGTCGCTGTTGA

QA 12 685 12 685
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*CAGACCTCGGTCGAGCCCGTTACTCCCGGGTTGCTTTGACTTCACTATCCCTGAAGCCT
TCTTATACTCTGCATTCATGGTAAACTTGGTGCATTTTTGCAATGTACA

QA 1 889 1 889
DS 

RD RR4AN07JQ 751 0 0
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GGTTGATCGTGTTCTCTACTCATCCATTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCCCG
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GACTGGGTCGTTCCTTCGTGCCCGCGCTATTGGTTTAATGCCAATGATTGATCAGGGTGA
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QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4BK86JQ 692 0 0
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AACAGTGGCCTTATTAAGGTTGATCGTGTTCTCTACTCATCCATTGTGTACCCACACAAC
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ATGCAGGAGCCTGTGCTGACTGGGTCGTTCCTTCGTGCCCGCGCTATTGGTTTAATGCCA
ATGATTGACCAGGGTGAAAAAGACGACAAGATCATTGCAGTTTGCGCTGATGATCCAGAG
TTCCGTCATTACAGAGACATCAAAGAGCTTCCTCCTCACCGTCTAGCTGAGATCCGCCGC
TTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGAACAAGAAAGTCGCTGTTGAAGGTTTCCTCCCT
GCTCAAGCTGCCATCGACGCAATTAAGGACTCCATGGATCTTTACGCAGCTTACATCAAA
GCTGGCCTGCAGCGTTAATGAACAGACCTCGGTCGAGCCTATTACTCTCGGGTTGCTTTG
AGTTCACTATCC*TGAAGCCTTCTTATACTCTGCATTCATGGTAAACTTGGTGCATTTTT
GCAATGTACATTGAAATACTTTGTCGAACTTTGGAAGTTTCTGATGATGACGATTGAGAA
ATTCCAATTTCAATCACTATATTTGAA
GATCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 5

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GGAAAATCAATTTTGTGTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**TATTTCTA
GGGTTTGTTCGATTCTCCGACAACGATGATGAATCCCGAGGATGCGAAGGCGAAACGAGA
TTCGACGGAGGTGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAA*CCGAAGATCGAAGATGAAG
AAGACGACACAAGCATGG*AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCGATAACGAAGGCTTATGG
AGTACCGACGATGATGACGTCGTAAGGTCTCCGACGATTAACTATTCAAACTATCGAGAT
CCGGATCCGGTGTGGGATGTTGACAGTTACGACGAACACGAATTGGTATTCGATGCTGAC
GGCCGTGAAGGTTTCTCCAGCGACAAGGCGTACGCAGAGTTCCGCGAGTATAAAACCATG
TGCTTTAAGAATAGGGGGTTTTTAGATGATCCATTTAGATCCATCTACCCAATGAGAAAC
CTGGACGATCTCTGGACAACCATGACTAAGAGGCAATATTTGACTGATATTGCTTCGCTG
TGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGCAGCGTTTGTCTGTGGAAGTTGTGAGCATTGTGAGA
GGCAATCTAAAACCAGGAGATGGGTGGAAGCTGTACATCACTTTTATGGCTCGTGAGTCT
CCGGGTGGTCCTCTCATCGAGTATCAAGCCAAGGCCTTGGATTTTGGAGGAAAACCTCCC
TTTCCCATTCTCTGCAGGCGTGCCTCTAGCATGCCCCTTTAATCAAGATTGGGTATGATG
CTAGCTCTTCTCTTCTTGGCGACGATGAAGATCAAAATATGTCTTTCCAGTTATAAGTAC
CATGCGTCCATGTGGATTTAGTTTTTTTTTTTATTTTATTTTGGCGTTCAAACTTATGGC
CCTACCTTTTAACTTGCATCGTATGATTATGGATTTCCACAATGGTTGCTATGTTATATT
CAATGTTTATTTTATATTTTCGATGCTCG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4BT93TF U 2
AF RR4D623TF U 1
AF RR4FI55TF U 2
AF RR4FI55JQ C 250
AF RR4D623JQ C 439
BS 1 50 RR4D623TF
BS 51 52 RR4BT93TF
BS 53 689 RR4D623TF
BS 690 702 RR4FI55TF
BS 703 809 RR4FI55JQ
BS 810 810 RR4D623JQ
BS 811 871 RR4FI55JQ
BS 872 872 RR4D623JQ
BS 873 989 RR4FI55JQ

RD RR4BT93TF 223 0 0
GG
AAATCAATTTTGTGTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**TATTTCTAGGG
TTTGTTCGATTCTCCGACAACGATGATGAATCCCGAGGATGCGAAGGCGAAACGAGATTC
GACGGAGGTGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAA*CCGAAGATCGAAGATGAAGAAG
ACGACACAAGCATGGGAAGAAGAAGAAGAA
AGCGATAACGA

QA 3 212 3 212
DS 

RD RR4D623TF 689 0 0
GGAAAATCAATTTTGTGTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATTTCTA
GGGTTTGTTCGATTCTCCGACAACGATGATGAATCCCGAGGATGCGAAGGCGAAACGAGA
TTCGACGGAGGTGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAA*CCGAAGATCGAAGATGAAG
AAGACGACACAAGCATGG*AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCGATAACGAAGGCTTATGG
AGTACCGACGATGATGACGTCGTAAGGTCTCCGACGATTAACTATTCAAACTATCGAGAT
CCGGATCCGGTGTGGGATGTTGACAGTTACGACGAACACGAATTGGTATTCGATGCTGAC
GGCCGTGAAGGTTTCTCCAGCGACAAGGCGTACGCAGAGTTCCGCGAGTATAAAACCATG
TGCTTTAAGAATAGGGGGTTTTTAGATGATCCATTTAGATCCATCTACCCAATGAGAAAC
CTGGACGATCTCTGGACAACCATGACTAAGAGGCAATATTTGACTGATATTGCTTCGCTG
TGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGCAGCGTTTGTCTGTGGAAGTTGTGAGCATTGTGAGA
GGCAATCTAAAACCAGGAGATGGGTGGAAGCTGTACATCACTTTTATGGCTCGTGAGTCT
CCGGGTGGTCCTCTCATCGAGTATCAAGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4FI55TF 701 0 0
GG
AAATCAATTTTGTGTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**TATTTCTAGGG
TTTGTTCGATTCTCCGACAACGATGATGAATCCCGAGGATGCGAAGGCGAAACGAGATTC
GACGGAGGTGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAAACCGAAGATCGAAGATGAAGAAG
ACGACACAAGCATGG*AAGAAGAAGAAGAATAAGAAAGCGATAACGAAGGCTTATGGAGT
ACCGACGATGATGACGTCGTAAGGTCTCCGACGATTAACTATTCAAACTATCGAGATCCG
GATCCGGTGTGGGATGTTGACAGTTACGACGAACACGAATTGGTATTCGATGCTGACGGC
CGTGAAGGTTTCTCCAGCGACAAGGCGTACGCAGAGTTCCGCGAGTATAAAACCATGTGC
TTTAAGAATAGGGGGTTTTTAGATGATCCATTTAGATCCATCTACCCAATGAGAAACCTG
GACGATCTCTGGACAACCATGACTAAGAGGCAATATTTGACTGATATTGCTTCGCTGTGT
GTTAAGAAACTCAACGAGGAGCAGCGTTTGTCTGTGGAAGTTGTGAGCATTGTGAGAGGC
AATCTAAAACCAGGAGATGGGTGGAAGCTGTACATCACTTTTATGGCTCGTGAGTCTCCG
GGTGGTCCTCTCATCGAGTATCAAGCCAAGGCCTTGGAT

QA 3 701 3 701
DS 

RD RR4FI55JQ 740 0 0
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GTGTGGGATGTTGACAGTTACGACGAACACGAATTGGTATTCGATGCTGACGGCCGTGAA
GGTTTCTCCAGCGACAAGGCGTACGCAGAGTTCCGCGAGTATAAAACCATGTGCTTTAAG
AATAGGGGGTTTTTAGATGATCCATTTAGATCCATCTACCCAATGAGAAACCTGGACGAT
CTCTGGACAACCATGACTAAGAGGCAATATTTGACTGATATTGCTTCGCTGTGTGTTAAG
AAACTCAACGAGGAGCAGCGTTTGTCTGTGGAAGTTGTGAGCATTGTGAGAGGCAATCTA
AAACCAGGAGATGGGTGGAAGCTGTACATCACTTTTATGGCTCGTGAGTCTCCGGGTGGT
CCTCTCATCGAGTATCAAGCCAAGGCCTTGGATTTTGGAGGAAAACCTCCCTTTCCCATT
CTCTGCAGGCGTGCCTCTAGCATGCCCCTTTAATCAAGATTGGGTATGATGCTAGCTCTT
CTCTTCTTGGCGACGATGAATATCAAAATATGTCTTTCCAGTTATAAGTACCATGCGTCC
ATGTGGATTTAGTTTTTTTTTT*ATTTTATTTTGGCGTTCAAACTTATGGCCCTACCTTT
TAACTTGCATCGTATGATTATGGATTTCCACAATGGTTGCTATGTTATATTCAATGTTTA
TTTTATATTTTCGATGCTCG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4D623JQ 550 0 0
TTTTTAGATGATCCATTTAGATCCATCTACCCAATGAGAAACCTGGACGATCTCTGGACA
ACCATGACTAAGAGGCAATATTTGACTGATATTGCTTCGCTGTGTGTTAAGAAACTCAAC
GAGGAGCAGCGTTTGTCTGTGGAAGTTGTGAGCATTGTGAGAGGCAATCTAAAACCAGGA
GATGGGTGGAAGCTGTACATCACTTTTATGGCTCGTGAGTCTCCGGGTGGTCCTCTCATC
GAGTATCAAGCCAAGGCCTTGGATTTTGGAGGAAAACCTCCCTTTCCCATTCTCTGCAGG
CGTGCCTCTAGCATGCCCCTTTAATCAAGATTGGGTATGATGCTAGCTCTTCTCTTCTTG
GCGACGATGAAGATCAAAATATGTCTTTCCAGTTATAAGTACCATGCGTCCATGTGGATT
TAGTTTTTTTTTTTATTTTATTTTGGCGTTCAAACTTATGGCCCTACCTTTTAACTTGCA
TCGTATGATTATGGATTTCCACAATGGTTGCTATGTTATATTCAATGTTTATTTTATATT
TTCGATGC
CC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 4

CO CL1856Contig1 545 4 1 U
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GAATGAAACACAAGATCGTATACTCACTTATGCTGCTGAGCTATGCGACCATATACCAAA
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CAACATTGGTGGCAAACCCTTTGATCTCTCACCTCAAGATTATATATTCAAGATTGGGGA
TGGAGTTCAGTCTCAGTGCACCAGTGGTTTCACTGCTATGGACATCCCTCCACCTCGTGG
ACCTCTCTGGATCTTGGGTGATATCTTCATGGGACCATACCATACTGTGTTCGATTATGG
AAAAGCAAGAGTTGGATTCGCAAAATCTGCTTAAAAATATCTCTTCTTTAACACCCTTTG
TTAATATTATATTGACTATATTTGTGAATTTGTTTAAATCTTAAATGGTTGTAATAACTT
AAAAGCACTGCTATCTTAGAATGGTGTATCATCTTAAATACAGATTCTCAAGGTTTTACC
TTTTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 

AF RR4AF89JQ C 1
AF RR4AN49JQ C 1
AF RR4AF89TF U 1
AF RR4AN49TF U 1
BS 1 545 RR4AF89TF

RD RR4AF89JQ 545 0 0
GGAAGCAATGTGCAGCGTTTGTGAAATGGCAACCGTGTGGATGCAGAGTGAATTGAATCA
GAATGAAACACAAGATCGTATACTCACTTATGCTGCTGAGCTATGCGACCATATACCAAA
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CAACATTGGTGGCAAACCCTTTGATCTCTCACCTCAAGATTATATATTCAAGATTGGGGA
TGGAGTTCAGTCTCAGTGCACCAGTGGTTTCACTGCTATGGACATCCCTCCACCTCGTGG
ACCTCTCTGGATCTTGGGTGATATCTTCATGGGACCATACCATACTGTGTTCGATTATGG
AAAAGCAAGAGTTGGATTCGCAAAATCTGCTTAAAAATATCTCTTCTTTAACACCCTTTG
TTAATATTATATTGACTATATTTGTGAATTTGTTTAAATCTTAAATGGTTGTAATAACTT
AAAAGCACTGCTATCTTAGAATGGTGTATCATCTTAAATACAGATTCTCAAGGTTTTACC
TTTTT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4AN49JQ 545 0 0
GGAAGCAATGTGCAGCGTTTGTGAAATGGCAACCGTGTGGATGCAGAGTGAATTGAATCA
GAATGAAACACAAGATCGTATACTCACTTATGCTGCTGAGCTATGCGACCATATACCAAA
CCCGAACCAACAAACAGCAGTGAACTGTGAGAGGGTTTCATCGATGCCTATTGTCACATT
CAACATTGGTGGCAAACCCTTTGATCTCTCACCTCAAGATTATATATTCAAGATTGGGGA
TGGAGTTCAGTCTCAGTGCACCAGTGGTTTCACTGCTATGGACATCCCTCCACCTCGTGG
ACCTCTCTGGATCTTGGGTGATATCTTCATGGGACCATACCATACTGTGTTCGATTATGG
AAAAGCAAGAGTTGGATTCGCAAAATCTGCTTAAAAATATCTCTTCTTTAACACCCTTTG
TTAATATTATATTGACTATATTTGTGAATTTGTTTAAATCTTAAATGGTTGTAATAACTT
AAAAGCACTGCTATCTTAGAATGGTGTATCATCTTAAATACAGATTCTCAAGGTTTTACC
TTTTT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4AF89TF 545 0 0
GGAAGCAATGTGCAGCGTTTGTGAAATGGCAACCGTGTGGATGCAGAGTGAATTGAATCA
GAATGAAACACAAGATCGTATACTCACTTATGCTGCTGAGCTATGCGACCATATACCAAA
CCCGAACCAACAAACAGCAGTGAACTGTGAGAGGGTTTCATCGATGCCTATTGTCACATT
CAACATTGGTGGCAAACCCTTTGATCTCTCACCTCAAGATTATATATTCAAGATTGGGGA
TGGAGTTCAGTCTCAGTGCACCAGTGGTTTCACTGCTATGGACATCCCTCCACCTCGTGG
ACCTCTCTGGATCTTGGGTGATATCTTCATGGGACCATACCATACTGTGTTCGATTATGG
AAAAGCAAGAGTTGGATTCGCAAAATCTGCTTAAAAATATCTCTTCTTTAACACCCTTTG
TTAATATTATATTGACTATATTTGTGAATTTGTTTAAATCTTAAATGGTTGTAATAACTT
AAAAGCACTGCTATCTTAGAATGGTGTATCATCTTAAATACAGATTCTCAAGGTTTTACC
TTTTT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4AN49TF 545 0 0
GGAAGCAATGTGCAGCGTTTGTGAAATGGCAACCGTGTGGATGCAGAGTGAATTGAATCA
GAATGAAACACAAGATCGTATACTCACTTATGCTGCTGAGCTATGCGACCATATACCAAA
CCCGAACCAACAAACAGCAGTGAACTGTGAGAGGGTTTCATCGATGCCTATTGTCACATT
CAACATTGGTGGCAAACCCTTTGATCTCTCACCTCAAGATTATATATTCAAGATTGGGGA
TGGAGTTCAGTCTCAGTGCACCAGTGGTTTCACTGCTATGGACATCCCTCCACCTCGTGG
ACCTCTCTGGATCTTGGGTGATATCTTCATGGGACCATACCATACTGTGTTCGATTATGG
AAAAGCAAGAGTTGGATTCGCAAAATCTGCTTAAAAATATCTCTTCTTTAACACCCTTTG
TTAATATTATATTGACTATATTTGTGAATTTGTTTAAATCTTAAATGGTTGTAATAACTT
AAAAGCACTGCTATCTTAGAATGGTGTATCATCTTAAATACAGATTCTCAAGGTTTTACC
TTTTT

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 5

CO CL1857Contig1 776 5 15 U
GGGTTTAGGTTTCTTCTTTCTACCGACGAAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCA
GGTTGTAGGAAGAACTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAA
GCTATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCT
GAAGAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAA
CCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCA
CAACATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACAC
CGAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGAC
TGTTCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAA
GTTCCCATTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAA
GGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACTA
CTTCACATAAAACCTTTTTGTTTGGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGCT
GTTTTGTTTCTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACTTTTTAGTATTATTCATGGAA
CTAAACTCGACTGTCTTGATTTTGTGGTTCTTGTTTCTTGTTCATTTAGACAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
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AF RR4GZ89TF U 1
AF RR4C803TF U 5
AF RR4E620TF U 183
AF RR4C803JQ C 264
AF RR4E620JQ C 303
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CGAGATGGCTTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGAC
TGTTCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAA
GTTCCCATTGGTTTTCCG

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GG
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GGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAA
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GTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACCGAGAT
GGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACTGTTCC
AGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTTCCC
ATTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGCCTC
CAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTCTCTCTCTCTCTGATTTACCGACTACTTCAC
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TTTCTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACTTTTTAGTATTATTCATGGAACTAAAC
TCGACTGTCT

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G
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GATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACTGT
TCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTT
CCCATTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGC
CTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACTACTT
CACATAAAACCTTTTTGTTTGGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATTTGCTGTT
TTGTTTCTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACTTTTTAGTATTATTCATGGAACTA
AACTCGACTGTCT
GG

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TGTGAAAACAGTCTCTCTCTTTCTGATTTACCGACTACTTCACATAAAACCTTTTTGTTT
GGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGCTGTTTTGTTTCTCTTTTCAAGGAT
ATTTTTCTTTATCAACTTTTTAGTATTATTCATGGAACTAAACTCGACTGTCTTGATTTT
GTGGTTCTTGTTTCTTGTTCATTTAGACAGTCC

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DS 

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AGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACTG
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TCCCATTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGG
CCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACTACT
TCACATAAAACCTTTTTGTTTGGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATTTGCTGT
TTTGTTTCTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACTTTTTAGTATTATTCATGGAACT
AAACTCGACTGTCT
GG

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DS 



AS 0 0

AS 1 5

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AATGGCGGCGACGGCAGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGCCAAGCATCTCTAG
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CAAACTCGCTTGCACTCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGAGAAACAACAGTTCTCT
TCCAACTTCTAAAAAGAGTTTTTCCTTTTCAACAAAGGCAATGTCTGAATCCAGCCAGAA
CAACGCTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCTTTCATTGCTGGTAT
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AATATTGGTTGGGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGACGTGG
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TTTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACTCACTTGCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACC
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TGTTTCCCTCCTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATATCTCT
TACTTACATTGCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGGTGGAGGTATGAGTTCCGCGAA
AGCCGCACTAGAGAGTGATACACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAGGAAACAAAACAT
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CATAGACACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAACATTGACCGC
AGATGAAGTTGGGAATGCAGCAGCCTTCTTGGTATCTCCATTGGCCTCTGCCATAACTGG
TGCAACCATCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCCATCGACAGTCCAGT
TTTCAAAGACCTCAAATAGAGACTTTAAGTAACTGCGGAAACTCTTTTTCTTGTGTTGCA
TTTGTTTTTTTTTGTTTCTATTGAGAATGTTTTTTTTTTCGAACAAACTTGTTTCTAGAA
CAAAATATAATATTTAAAACAATCAGAATAAATTCCAGCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL49TF U 1
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AF RR4EF16TF U 508
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AF RR4EF16JQ C 841
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AATGGCGGCGACGGCAGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGCCAAGCATCTCTAG
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CAAACTCGCTTGCACTCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGAGAAACAACAGTTCTCT
TCCAACTTCTAAAAAGAGTTTTTCCTTTTCAACAAAGGCAATGTCTGAATCCAGCCAGAA
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AATATTGGTTGGGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGACGTGG
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TCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGAAGATGTGCCCGAGGATGTGAAAGCGAATAA
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TCTTCTG

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DS 

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G
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TGTGAGAAAAGATTTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACTCACTTGCAAATGGACCAGA
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GAGTTCCGCGAAAGCCGCACTAGAGAGTGATACACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAG
GAAACAAAACATTAAGGTCAACACCATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCGAGCAGCAAA
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GAGGTTAGCAAACCTCTTCTGGAGACATCAAGAAAAGGCTACCTCGCTGCTATCTCTGCT
TCGAGTTACTCTTTTGTTTCCCTCCTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGT
GCTTCTATATCTCTTACTTACATTGCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGGTGGAGGT
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TCTGCCATAACTGGTGCAACCATCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCC
ATCGACAGTCCAGTTTTCAA
GACCTC

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TTGCATTTGTTTTTTTTTGTTTCTATTGAGAATGTTTTTTTTT*CGAACAAACTTGTTTC
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DS 

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CATAGACACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAACATTGACCGC
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TGCAACCATTTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCCATCGACAGTCCAGT
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CAAAATATAATATTTAAAACAATCAGAATAAATTCCAGCC

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DS 



AS 1 4

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ATTACATTCCTCTGCCAATTCGTGACTCTCACCTCTCCCCGGATGGAGTTCTCTAGAGAA
GCTGGAATGATGATGGAAAATAAGCGGAGTGTATGCTCTCTCGAAGAAAGTAGCATCAAG
CGTCACAAGTCTGATCTCTCTTTCAGTTCCAAGAGAAAGGACAAAGCTGGAGAACGTATC
TCAGCTCTTCAACAGATAGTTTCCCCTTACGGAAAGACCGACACTGCATCAGTTCTTCAA
GACGCGTTTCATTACATAGAGTTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGCTAAGCGCTCCGTAT
CTGCAAACAATGACCGCTGCTACGCAGGAGGAGCTGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGA
GGATTATGTCTTGTTCCAATGGAGTATACAGCAGGAGTTGCTCAAAGCAACGGTGCTGAT
ATCTGGGCGCCCGTGAAGACTCCTCCATCTCCAGCTTTTGGCGTCAAGTCTCAATCACCC
TTTAGATGACTGATTCAGACTCTCCCCAACCTACTAAGATCTTTGTCTTAAGCCTTAAGA
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ATATGTAATTTGCCTAAGCTTAAACCAAACGATTCTAATGCTAAGTAATCTTTATGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4CB11TF U 1
AF RR4AZ63TF U 138
AF RR4AZ63JQ C 218
AF RR4GI28JQ C 431
BS 1 192 RR4CB11TF
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BS 334 422 RR4CB11TF
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RD RR4CB11TF 743 0 0
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AAGAAAAGTTTGAGCTTTGAGAAGTTGTGAGTGGTGTGTTCTTGAAGAACAAAGCTTTTT
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CGTCACAAGTCTGATCTCTCCTTCAGTTCCAAGAGAAAGGACAAAGCTGGAGAACGTATC
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GACGCGTTTCATTACATAGAGTTTCTACATGAACAAGTGAAG*TGCTTAGCGCTCCGTAT
CTGCAAACAATGACCGCTGCTAC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4AZ63TF 673 0 0
GG
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TGGAGTATACA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4AZ63JQ 922 0 0
GGTTTGGGATTTT
CTTTTGGACTGAGAAAACTCAAAACATAGAGAGTGTGTGAGAGAGAAACATCATTGTCTT
CTCGGTTTTTGTGTTGTCAAGAAGCTCCAGGACAAAAAAA***TAATACAATTGTTTTAG
GGTTTTGAGGAAGAAAAGTTTGAGCTTTGAGAAGTTGTGAGTGGTGTGTTCTTGAAGAAC
AAAGCTTTTTATTACATTCCTCTGCCAATTCGTGACTCTCACCTCTCCCCGGATGGAGTT
CTCTAGAGAAGCTGGAATGATGATGGAAAATAAGCGGAGTGTATGCTCTCTCGAAGAAAG
TAGCATCAAGCGTCACAAGTCTGATCTCTCTTTCAGTTCCAAGAGAAAGGACAAAGCTGG
AGAACGTATCTCAGCTCTTCAACAGATAGTTTCCCCTTACGGAAAGACCGATACTGCATC
AGTTCTTCAAGACGCGTTTCATTACATAGAGTTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGCTAAG
CGCTCCGTATCTGCAAACAATGACCGCTGCTACGCAGGAGGAGCTGGAGCAGTACAGCCT
GAGAAACAGAGGATTATGTCTTGTTCCAATGGAGTATACAGCAGGAGTTGCTCAAAGCAA
CGGTGCTGATATCTGGGCGCCCGTGAAGACTCCTCCATCTCCAGCTTTTGGCGTCAAGTC
TCAATCACCCTTTAGATGACTGATTCAGACTCTCCCCAACCTACTAAGATCTTTGTCTTA
AGCCTTAAGAAGATGGTCAATTGTTATTGTTCAGATCCTGCCTCTGTATCATACATAGAC
CAGAGGCAAATGAAGTTGGTTTTGGAACAGCTCAGAGTTGGTGATGGCTGTTTCTATTTG
ACCGCCTTAAATATGTAATTTGCCTAAGCTTAAACCAAACGATTCTAATGCTAAGTAATC
TTTATGCCT

QA 14 922 14 922
DS 

RD RR4GI28JQ 708 0 0
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TGATGGAAAATAAGCGGAGTGTATGCTCTCTCGAAGAAAGTAGCATCAAGCGTCACAAGT
CTGATCTCTCTTTCAGTTCCAAGAGAAAGGACAAAGCTGGAGAACGTATCTCAGCTCTTC
AACAGATAGTTTCCCCTTACGGAAAGACCGACACTGCATCAGTTCTTCAAGACGCGTTTC
ATTACATAGAGTTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGCTAAGCGCTCCGTATCTGCAAACAA
TGACCGCTGCTACGCAGGAGGAGCTGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGAGGATTATGTC
TTGTTCCAATGGAGTATACAGCAGGAGTTGCTCAAAGCAACGGTGCTGATATCTGGGCGC
CCGTGAAGACTCCTCCATCTCCAGCTTTTGGCGTCAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGAC
TGATTCAGACTCTCCCCAACCTACTAAGATCTTTGTCTTAAGCCTTAAGAAGATGGTCAA
TTGTTATTGTTCAGATCCTGCCTCTGTATCATACATAGACCAGAGGCAAATGAAGTTGGT
TTTGGAACAGCTCAGAGTTGGTGATGGCTGTTTCTATTTGACCGTCTTAAATATGTAATT
TGCCTAAGCTTAAACCAAACGATTCTAATGCTAAGTAATCTTTATG
CC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 5

CO CL1861Contig1 931 5 3 U
AAAAGAATGTCATTTGATTTTACTAGTACCTGAAAAAATATAATAGAAGTTTCAAAAAGA
ACAAACTTACAAATATGGTTATGGTAAAATTATCAAAGAAAAACATATAATATCACTAAA
GCTGGCTCTCCGGTTTTAGTTTCATCTAAAATGAGAACAAACCGTGTAGTATCAAATATG
ATTGGTTCTCATCCTCTTAACACTTTTTGACATAAAAGCTTTTTATTGTTTCTTTCCTTT
GGCGGCCACCCTAACAAAATATTAATGCACGCAAGGGTAGTTAAATCACCTCTTCTTGCT
GCTGTTCTTCTTCCTTCCCTTAACTTGGCTCTCCAAAGCCTTGAGCCTCCTACTAACAGG
ACTCATGGACGCTGAAGAGATCCTCGGGTTTACTGGCGAAGATGGTTGTTGAGTCTGGTT
CTCGGTATTGTCCTGTGTCATGGCTTTCATTTTCTTGAGAGCTGCGAACAGGTCAAAGGA
AGGTTGTTGACCAGGAGGTGGTGGAGGCAGTTCAGGTATCTTTAACATCTTCTTCACTTG
AGGACGCTTGATGACAAGTCCATACGTGAGAGAGAAGAGGTTGGAAGTGATCCAATAACA
AAATATGGCCTGTGGGAAACTCATTGTCATTGGGACTGTGAGGAGAGCGAAACCCCGGAA
AACGTTTTTTATAGTGCCTGCCATTGGGTTTCCTTCCATGCCTTCTTGTGCATTTAACTC
AACGGTTATCAAGAATGTCAATGCTGTTATAACCGGTAAGATGTATAAGCTGTCAGGTGT
GGTTAGATCGGTAAACCATAATGCACCTCCGGTTTGGAACGAAGGTACCTTCTCTGCCAT
GTTTCGTATAGCAAGGAAAAGCAGATGAAGAGAGGTCCCTGAATAAGCATCCCTTTCATT
GGGGTGAATGGAGTCACTCCATATTCTTTAC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H636JQB U 4
AF RR4H636TF C 4
AF RR4C277JQ U 43
AF RR4BH73JQ U 1
AF RR4BH73TF C 166
BS 1 49 RR4BH73JQ
BS 50 50 RR4H636JQB
BS 51 931 RR4BH73JQ

RD RR4H636JQB 573 0 0
G
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QA 2 573 2 573
DS 

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G
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ATGGACGCTGAAGAGATCCTCGGGTTTACTGGCGAAGATGGTTGTTGAGTCTGGTTCTCG
GTATTGTCCTGTGTCATGGCTTTCATTTTCTTGAGAGCTGCGAACAGGTCAAAGGAAGGT
TGTTGACCAGGAGGTGGTGGAGGCAGTTCAGGTATCTTTAACATCTTCTTCACTTGAGGA
CGCTTGATGACAAGTCCATACGTGAGAGAGAAGAGGTTGGAAGTGATCCAATGACAAAAT
ATGGCCTGTGGGAAACTCATTGTCATTGGGACTGTGAGGAGAGCGAAACCCCGGAAAACG
TTTTTTATAGTGCC

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR4C277JQ 767 0 0
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AAATCACCTCTTCTTGCTGCTGTTCTTCTTCCTTCCCTTAACTTGGCTCTCCAAAGCCTT
GAGCCTCCTACTAACAGGACTCATGGACGCTGAAGAGATCCTCGGGTTTACTGGCGAAAA
TGGTTGTTGAGTCTGGTTCTCGGTATTGTCCTGTGTCATGGCTTTCATTTTCTTGAGAGC
TGCGAACAGGTCAAAGGAAGGTTGTTGACCAGGAGGTGGTGGAGGCAGTTCAGGTATCTT
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GGAAGTGATCCAATAACAAAATATGGCCTGTGGGAAACTCATTGTCATTGGGACTGTGAG
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QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BH73JQ 931 0 0
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GCTGGCTCTCCGGTTTTAGTTTCATCTAAAATGAGAACAAACCGTGTAGTATCAAATATG
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GGCGGCCACCCTAACAAAATATTAATGCACGCAAGGGTAGTTAAATCACCTCTTCTTGCT
GCTGTTCTTCTTCCTTCCCTTAACTTGGCTCTCCAAAGCCTTGAGCCTCCTACTAACAGG
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AGGACGCTTGATGACAAGTCCATACGTGAGAGAGAAGAGGTTGGAAGTGATCCAATAACA
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AACGGTTATCAAGAATGTCAATGCTGTTATAACCGGTAAGATGTATAAGCTGTCAGGTGT
GGTTAGATCGGTAAACCATAATGCACCTCCGGTTTGGAACGAAGGTACCTTCTCTGCCAT
GTTTCGTATAGCAAGGAAAAGCAGATGAAGAGAGGTCCCTGAATAAGCATCCCTTTCATT
GGGGTGAATGGAGTCACTCCATATTCTTTAC

QA 1 931 1 931
DS 

RD RR4BH73TF 766 0 0
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TCACCTCTTCTTGCTGCTGTTCTTCTTCCTTCCCTTAACTTGGCTCTCCAAAGCCTTGAG
CCTCCTACTAACAGGACTCATGGACGCTGAAGAGATCCTCGGGTTTACTGGCGAAGATGG
TTGTTGAGTCTGGTTCTCGGTATTGTCCTGTGTCATGGCTTTCATTTTCTTGAGAGCTGC
GAACAGGTCAAAGGAAGGTTGTTGACCAGGAGGTGGTGGAGGCAGTTCAGGTATCTTTAA
CATCTTCTTCACTTGAGGACGCTTGATGACAAGTCCATACGTGAGAGAGAAGAGGTTGGA
AGTGATCCAATAACAAAATATGGCCTGTGGGAAACTCATTGTCATTGGGACTGTGAGGAG
AGCGAAACCCCGGAAAACGTTTTTTATAGTGCCTGCCATTGGGTTTCCTTCCATGCCTTC
TTGTGCATTTAACTCAACGGTTATCAAGAATGTCAATGCTGTTATAACCGGTAAGATGTA
TAAGCTGTCAGGTGTGGTTAGATCGGTAAACCATAATGCACCTCCGGTTTGGAACGAAGG
TACCTTCTCTGCCATGTTTCGTATAGCAAGGAAAAGCAGATGAAGAGAGGTCCCTGAATA
AGCATCCCTTTCATTGGGGTGAATGGAGTCACTCCATATTCTTTAC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 5

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AAAATGGTGAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAAG
GCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGCT
ATTGCTTTTGGCAAGATAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATT
GCGGTGGCTCACGCCTTCGCTTTGTTCGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGGT
GGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCACACTGATC
ACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCTT
GTCTTCGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTTAGGAGCG
GTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCC
ACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTTC
ATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCATTTAGTGGTGGCTCCATGAACCCAGCA
AGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTG
GGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTTATCTACGGAGACGTGTTCATCGGTTCT
CCTTACGAATCTGTTGAAACCCGCGAGATCCGAGTTTAACTAACCGGGTTTGTGGTTGTT
TATGTTTGCTTGTTGGTTGGTTTGATGGTTGTGTGTTTGCTTGGGTATGCTTGATGTCCC
TTTTCTTTTAAGATTGCCTGTAGAGAAAAGAGTCATCTCTTGCTAATAATAAGAAAATGT
ATATTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4CH25TF U 1
AF RR4FG68TF U 15
AF RR4FG68JQ C 264
AF RR4CH25JQ C 340
AF RR4BE43TF U 812
BS 1 575 RR4CH25TF
BS 576 576 RR4FG68TF
BS 577 673 RR4CH25TF
BS 674 674 RR4FG68TF
BS 675 721 RR4CH25TF
BS 722 760 RR4FG68TF
BS 761 761 RR4FG68JQ
BS 762 777 RR4FG68TF
BS 778 807 RR4FG68JQ
BS 808 808 RR4CH25JQ
BS 809 811 RR4FG68JQ
BS 812 970 RR4BE43TF

RD RR4CH25TF 728 0 0
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AAAATGGTGAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAAG
GCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGCT
ATTGCTTTTGGCAAGATAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATT
GCGGTGGCTCACGCCTTCGCTTTGTTCGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGGT
GGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCACACTGATC
ACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCTT
GTCTTCGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTTAGGAGCG
GTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCC
ACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACTATCGCACCAATCGCTATTGGTTTC
ATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCATTTAGTGGTGGCTCCATGAACCCAGCA
AGGTCGTTCGGAC*AGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTG
G
TCCACTC

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FG68TF 768 0 0
GG
AACACACCAAAAACCAACCAAAAGCAAAAGTCTTCGAGTTTTAAAAAATGGTGAAGATCG
CAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAAGGCTTACTTGTCTGAGT
TCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGCTATTGCTTTTGGCAAGA
TAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCACGCCT
TCGCTTTGTTCGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGGTGGCCACTTAAACCCAG
CCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCACACTGATCACAGGTTTCTTGTACT
GGGTTGCTCAGTGTTTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCTTGTCTTCGTTACCAACG
GCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTTAGGAGCGGTCGAAGCTATCGTGA
TGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCAA
AGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTTCATCGTTGGTGCCAACA
TCCTCGCTGCTGGTCCATTTAGTGGTGGCTCCATGAACCCAGCAAGGTCGTTCGGACCAG
CTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTG
GTGCACTTGCTGGACTTATCTACG*AGACGTGTTCATCGGT
CTCCT

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR4FG68JQ 707 0 0
GTTCGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGGTGGCCACTTAAACCCAGCCGTGAC
TCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCACACTGATCACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGC
TCAGTGTTTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCTTGTCTTCGTTACCAACGGCGAGAG
CGTACCAACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTTAGGAGCGGTCGAAGCTATCGTGATGGAGAT
CATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGG
TTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGC
TGCTGGTCCATTTAGTGGTGGCTCCATGAACCCAGCAAGGTCGTTCGGACCAGCTATTGT
AAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACT
TGCTGGACTTATCTACGGAGACGTGTTCATCGGTTCTCCTTACGAATCTGTTGAAACCCG
CGAGGTCCGAGTTTAACTAACCGGGTTTGTGGTTGTTTATGTTTGCTTGTTGGTTGGTTT
GATGGTTGTGTGTTTGCTTGGGTATGCTTGATGTCCCTTTTCTTTTAAGATTGCCTGTAG
AGAAAAGAGTCATCTCTTGCTAATAATAAGAAAATGTATATTATTCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4CH25JQ 631 0 0
GGAGGAAACATCACACTGATCACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCC
ATCGTTGCATGCCTTCTCCTTGTCTTCGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGA
GTTGGAGCCGGTTTAGGAGCGGTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCT
TTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACTATC
GCACCAATCGCTATTGGTTTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCATTTAGT
GGTGGCTCCATGAACCCAGCAAGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCA
CAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTTATCTAC
GGAGACGTGTTCATCGGTTCTCCTTACGAATCTGTTGAAACCCGCGAGATCCGAGTTTAA
CTAACCGGGTTTGTGGTTGTTTATGTTTGCTTGTTGGTTGGTTTGACGGTTGTGTGTTTG
CTTGGGTATGCTTGATGTCCCTTTTCTTTTAAGATTGCCTGTAGAGAAAAGAGTCATCTC
TTGCTAATAATAAGAAAATGTATATTATTCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BE43TF 159 0 0
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TGTGTTTGCTTGGGTATGCTTGATGTCCCTTTTCTTTTAAGATTGCCTGTAGAGAAAAGA
GTCATCTCTTGCTAATAATAAGAAAATGTATATTATTCC

QA 1 159 1 159
DS 



AS 1 4

CO CL1863Contig1 822 4 4 U
CGTCCTAATTTCTCTTCTTTTTAATATTATTTAATATTACTTTCATTTTCTTATATAAAA
TGAGAAGTATCTGTTTCCTTCTCTCGTTCACACTTCACACACATTTAGCTACATACATTA
CCAGTCCTGATATTAATTGGTTACCCCCAAAAAAAGGTCCCCAACTTGGAACCAAAAATT
ACAAAAAGATGCAATTACTAAAACCAAGCGAACCAAACCGGTTTACTATATAAACCACTT
TTATATAAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGTGTAGGTCTGGCCAAAGGACCAACCGGG
AGGAGCAACATTGAACGACACGACACTTCGGCGATCACTTGTGGTGACAACAAACGACAG
ACTCTGACCATTGAGATAAGAGTTGCTTTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCTTGACATTAA
TTGCCATTTTGACCTCGACCCTTTCATTGACACAGAGTGTACATCCCCGGCTCCACCGAC
ATTTGTGACCAGCACCAAGTTAAAGTATGAGTGACCGTTGATCGTGAACCTTATCCCACC
GCTTCTCCCGCACCGTACCCTTCTGTACATAACCGGAATGATACCGGACTTGTAAATAGC
GATGTGCTCGTAGATGGGCTGAGAAAGATCGAAATGGTGGTTAGGAGGATCGCAGGCGCC
ACCAGGAGGACAAAAGTTAGTGGCAGTGACCACAATGGACCGGCCTTGTATGCACCACTG
AGGATCGTTGACACACTTAAGCTCGAAGCAGGCACCACAGCTAAGTCCGTTATCGAATAA
GGCCGTGCTCAGCGCGGCAGTCTCTGTTCCATAGCCTTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B795JQ U 112
AF RR4EQ93JQ U 1
AF RR4EQ93TF C 1
AF RR4B795TF C 215
BS 1 331 RR4EQ93JQ
BS 332 332 RR4B795JQ
BS 333 506 RR4EQ93JQ
BS 507 822 RR4B795TF

RD RR4B795JQ 238 0 0
CATACATTACCAGTCCTGATATTAATTGGTTACCCCCAAAAAAAGGTCCCCAACTTGGAA
CCAAAAATTACAAAAAAATGCAATTACTAAAACCAAGCCAACCAAACCGGTTTACTATAT
AAACCACTTTTATATAAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGTGTAGGTCTGGCCAAAGGA
CCAACCGGGAGGAGCAACATTGAACGAAACGACACTTCGGCGATCACTTGTGGTGACA

QA 1 238 1 238
DS 

RD RR4EQ93JQ 507 0 0
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TGAGAAGTATCTGTTTCCTTCTCTCGTTCACACTTCACACACATTTAGCTACATACATTA
CCAGTCCTGATATTAATTGGTTACCCCCAAAAAAAGGTCCCCAACTTGGAACCAAAAATT
ACAAAAAGATGCAATTACTAAAACCAAGCGAACCAAACCGGTTTACTATATAAACCACTT
TTATATAAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGTGTAGGTCTGGCCAAAGGACCAACCGGG
AGGAGCAACATTGAACGACACGACACTTCGG*GATCACTTGTGGTGACAACAAACGACAG
ACTCTGACCATTGAGATAAGAGTTGCTTTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCTTGACATTAA
TTGCCATTTTGACCTCGACCCTTTCATTGACACAGAGTGTACATCCCCGGCTCCACCGAC
ATTTGTGACCAGCACCAAGTTAAAGT
C

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4EQ93TF 507 0 0
CGTCCTAATTTCTCTTCTTTTTAATATTATTTAATATTACTTTCATTTTCTTATATAAAA
TGAGAAGTATCTGTTTCCTTCTCTCGTTCACACTTCACACACATTTAGCTACATACATTA
CCAGTCCTGATATTAATTGGTTACCCCCAAAAAAAGGTCCCCAACTTGGAACCAAAAATT
ACAAAAAGATGCAATTACTAAAACCAAGCGAACCAAACCGGTTTACTATATAAACCACTT
TTATATAAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGTGTAGGTCTGGCCAAAGGACCAACCGGG
AGGAGCAACATTGAACGACACGACACTTCGG*GATCACTTGTGGTGACAACAAACGACAG
ACTCTGACCATTGAGATAAGAGTTGCTTTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCTTGACATTAA
TTGCCATTTTGACCTCGACCCTTTCATTGACACAGAGTGTACATCCCCGGCTCCACCGAC
ATTTGTGACCAGCACCAAGTTAAAGT
C

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4B795TF 608 0 0
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TCACTTGTGGTGACAACAAACGACAGACTCTGACCATTGAGATAAGAGTTGCTTTGCCAG
TTTTGCCCCCAGTTTCTTGACATTAATTGCCATTTTGACCTCGACCCTTTCATTGACACA
GAGTGTACATCCCCGGCTCCACCGACATTTGTGACCAGCACCAAGTTAAAGTATGAGTGA
CCGTTGATCGTGAACCTTATCCCACCGCTTCTCCCGCACCGTACCCTTCTGTACATAACC
GGAATGATACCGGACTTGTAAATAGCGATGTGCTCGTAGATGGGCTGAGAAAGATCGAAA
TGGTGGTTAGGAGGATCGCAGGCGCCACCAGGAGGACAAAAGTTAGTGGCAGTGACCACA
ATGGACCGGCCTTGTATGCACCACTGAGGATCGTTGACACACTTAAGCTCGAAGCAGGCA
CCACAGCTAAGTCCGTTATCGAATAAGGCCGTGCTCAGCGCGGCAGTCTCTGTTCCATAG
CCTTGGCC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 5

CO CL1864Contig1 1266 5 17 U
GGGTCGGGAAATTTTGTGGTATCTGACATTATCAACACAAACGTTACAAAAGTATGAGCT
GCTTAATGAATAAAGTTAAGATACACGAGCCCAACGACTATATGATACATAATATATTAA
AAAAAGGACAGCAAACCATCCATCCCCGAACTAGAACACCCTAATACGGATGATAAATAT
GCGACCATTAAACTCATATCCCACACGCCAAGAAACTATACCCCACAAACCAAAACTAGA
AGGTAATAACATTGGAGAAAGACAAAAAAAAACGAGATATCATAGAAAGCAGACTGAATA
AAAGTTGAAAGAGAGAACTAAAGCCCAAACGAATGAACTCTACAAATCACAACTAAACCA
CCACCACAAAAACTGACTTCTCTACCGTTACGGCATCTCAATTTACAACAACCCCCTGAT
ATCTCCAGACAGACTCTCATCGTTTCTCGCTTAGCGCTCATCTTTTCTGCACACAAACAA
GAGGAACACCAGGAGGCAGATGTTACAAAAGTGTTTGGCTGCGGTACGTATGTGCACGAG
TGCAGTGCCTCTTTCGTCTATCTTACATCCAAGCCAGAGAGCCTCCTTTGTCATTTGGGG
CTTGTGGCCGTCCTCTAGTTGGTGTCGCTGGCCTATTTGCGTTCAGCTCCTGCATCCATG
TGTCATCTGGATGTGAAGCTTCAGTTGATGAAAGTGCTGGAGGTAACGGATGAATGAGCT
TAGGAACCACTACAAGATCTCTCCCCAATACCAAGATGGCCCCAGCATTGTTTGCAGTAC
CACAATAGTTTGTAGCGGAAAAGAGAGTTATCAAATGCCCCTGAGCAAAACGCTCAAACC
CACCCATCACGCATTCGTGTGCACGTACGATTAATTGAAGATCATTGTTGTTGCAGAACT
CCATGACACGGTCAGGCCCAAATGTAACCAACCCAGGGCCTCTAGCATTGGGCCTCAAAC
CTTCCACACTGTCATTTTCAGTCGGATCCGACCATAATAAATCCATGAGCACAATGGAAC
CAGCTTCCATTGTAATTGGACGTTGAATACTCTCTATCTGCTCCACATGATTTATAGAAC
GGCCAATACCCCCATGCATACATAAGATTTTCTTCCCAATCGATGCAGCAAGCGGTAGCC
AATTAAATAAACGGTTTATTCGGTGCCACACCCAGATTCCATCACGTTCACCCATTCGCT
CAATACACTCTATTCGAAAGCCAAAAAGAGCATTAATATCAGCAGCTTCATGGTTTCCCC
GAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

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TACATCCAAGCCAGAGAGCCTCCTTTGTCATTTGGGGCTTGTGGCCGTCCTCTAGTTGGT
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TGAATACTCTCTATCTGCTCCACATGATTTATAGAACGGCCAATACCCCCATGCATACAT
AAGATTTTCTTCCCAATCGATGCAGCAAGCGGTAGCCAATTAAATAAACG
TTTATTCGTGCC

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ATCTGGATGTGAAGCTTCAGTTGATGAAAGTGCTGGAGGTAACGGATGAATGAGCTTAGG
AACCACTACAAGATCTCTCCCCAATACCAAGATGGCCCCAGCATTGTTTGCAGTACCACA
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TC

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AAACGCTCAAACCCACCCATCACGCATTCGTGTGCACGTACGATTAATTGAAGATCATTG
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GCAAGCGGTAGCCAATTAAATAAACGGTTTATTCGGTGCCACACCCAGATTCCATCACGT
TCACCCATTCGCTCAATACACTCTATTCGAAAGCCAAAAAGAGCATTAATATCAGCAGCT
TCATGGTTTCCCCGAATTC

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DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH78TF U 1
AF RR4GC01TF U 7
AF RR4DH78JQ C 39
AF RR4CN15TF U 1
BS 1 68 RR4CN15TF
BS 69 69 RR4DH78TF
BS 70 81 RR4CN15TF
BS 82 82 RR4DH78TF
BS 83 145 RR4CN15TF
BS 146 146 RR4DH78TF
BS 147 472 RR4CN15TF
BS 473 473 RR4DH78TF
BS 474 760 RR4CN15TF

RD RR4DH78TF 650 0 0
CTCCGATC
AGATCCAAAAAGTAAATTCGCTTTCCCTACGCCGCGCGATGTCTCTCCGTCGTTCCATCC
*CGGCCTTCACCGGCAAACCAACAACCTCTCCCTCTCAAAGTCTTCACCTTTCTCGATAA
CCAACAACATCTCCTCCACGTCCGCCGCCGCGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCT
CGATCCCATTTTCACTAACCCAGAAACTCAAACCGTTCTCTGGGAGTCTCGTCACCGATG
CTTCTCTTGGCCAATCTCAATTGGGTCGTCTCCCATCTTCCAGAGGCTACAGCAACGCGT
CTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCAACGCGGGGATGGAGGAGGTTTTGG
CGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATCTCATGGTGATCTCTCTTGGCTTGTTCC
AGATCATCGTTATCAAAGATGTCGTCGTGTTTCTCTTCTTCTGAGCAAAGGAATCATCTT
TGTGTGGGGGTCTCATCACCTGTTAATGAAATAGTGAGCTTAAAAGTCGTTCCCTTTTAT
CTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCATAACCTTGCTTGTGTTTTCTC
TTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAGTTCGTATTACTA

QA 9 650 9 650
DS 

RD RR4GC01TF 645 0 0
GG
AGATCCAAAAAGTAAATTCGCTTTCCCTACGCTGCGCGATGTCTCTCCGTCGTTCCATCC
TCGGCCTTCACCGCCAAACCAACAACCTCTCCCTCTCAAAGTCTTCACCTTTCTCGATAA
CCAACAACATCTC*TCCCCGTCCGCCGCCGCGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCT
CGATCCCCTTTTCACTAACCCAGAAACTCAAACCGTTCTCTGGGAGTCTCGTCACCGATG
CTTCTCTTGGCCAATCTCAATTGGGTCGTCTCCCATCTTCCAGAGGCTACAGCAACGCGC
CTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCAACGCGGGGATGGAGGAGGTTTTGG
CGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATCTCATGGTGATCTCTCTTGGCTTGTTCC
AGATCATCGTTATCAAAGATGTCGTCGTGTTTCTCTTCTTCTGAGCAAAGGAATCATCTT
TGTGTGGGGGTCTCATCACCTGTTAATGAAATAGTGAGCTTAAAAGTCGTTCCCTTTTAT
CTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCATAACCTTGCTTGTGTTTTCTC
TTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAGTTCGTATTACTAT

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR4DH78JQ 656 0 0
GCC
GCGCGATGTCTCTCCGTCGTTCCATCC*CGGCCTTCACCGGCAAACCAACAACCTCTCCC
TCTCAAAGTCTTCACCTTTCTCGATAACCAACAACATCTCCTCCACGTCCGCCGCCGCGA
GGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCACTAACCCAGAAACTCAAAC
CGTTCTCTGGGAGTCTCGTCACCGATGCTTCTCTTGGCCAATCTCAATTGGGTCGTCTCC
CATCTTCCAGAGGCTACAGCAACGCGTCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACA
TCAACGCGGGGATGGAGGAGGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATC
TCATGGTGATCTCTCTTGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCGTCGTGTTTC
TCTTCTTCTGAGCAAAGGAATCATCTTTGTGTGGGGGTCTCATCACCTGTTAATGAAATA
GTGAGCTTAAAAGTCGTTCCCTTTTATCTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCA
ATCGCATAACCTTGCTTGTGTTTTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAGTTC
GTATTACTATTAAGGCTTAAGTGGAATGAAAAGTGTGTGTGTGTTT
TAAGTCC

QA 4 649 4 649
DS 

RD RR4CN15TF 760 0 0
CTCCGATCAGATCCAAAAAGTAAATTCGCTTTCCCTACGCTGCGCGATGTCTCTCCGTCG
TTCCATCCTCGGCCTTCACCGCCAAACCAACAACCTCTCCCTCTCAAAGTCTTCACCTTT
CTCGATAACCAACAACATCTCCTCCCCGTCCGCCGCCGCGAGGAACCCAATCGGAAGAGA
AATCTCCTCGATCCCATTTTCACTAACCCAGAAACTCAAACCGTTCTCTGGGAGTCTCGT
CACCGATGCTTCTCTTGGCCAATCTCAATTGGGTCGTCTCCCATCTTCCAGAGGCTACAG
CAACGCGTCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCAACGCGGGGATGGAGGA
GGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATCTCATGGTGATCTCTCTTGG
CTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCGTCGTGTTTCTCTTCTTCTGATCAAAGGA
ATCATCTTTGTGTGGGGGTCTCATCACCTGTTAATGAAATAGTGAGCTTAAAAGTCGTTC
CCTTTTATCTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCATAACCTTGCTTGT
GTTTTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAGTTCGTATTACTATTAAAGCTTA
AGTGGAATGAAAAGTGTGTGTGTGTTTAAGTCCTTTACTTTCCTGGATGGAGACAGAAAA
TGAGATCTCTGTGAAGCTTTGATGATAAAGAGAGTTTCTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL1866Contig1 947 3 6 U
GGAACCCGGCGACGGCTGAGAACTTTCGGGCTCTGTGTACAGGCGAGAAAGGAATAGGGG
AGTCTGGTACACCACTCCACTATAAGGGATCTATCATCCACTCAGTGAACCCAGGTATGA
TGTGGCTCGGAGGAGATATCACTCATGGGAACGGACTTGGAGGCGAATCGATCTACGAAT
CGATCTACGGCCGTGACCATCAAGTCACGGACAGTAAATTCCTAAGGAAGCACGACAAGA
AAGGTATCCTCTCCACGGTCAACCTTGATGAATGCGTCATCGGATCTCAGTTCATGCTCC
TCTTGACGGAGGAGTTTCCCACCCTCGATGGCTACCAGTACGCATTTGGACAAGTTGTGC
AAGGGTTTGATGTGATCAGTCAAGTTGAGCAGATGGTCGGAGATGATTCGCGCTACCCTT
TCCAGCCTTTGACAATCGCCGACTGCGGTCAGCTTGATGAGGGTGGTTCTGTCTCAACAA
TGGTAGGTTGTTCTGTCCCGGAACATGTTCATAAGATGCTCAAACAGTTGCGAGCTTGGC
AACTGAAGACCGCCGAGATGGAGAATATACTGGCAATGCAGACCATTTCATATGAAAAGG
GAAACCGCAATTTCGAGATAAAGGAGTCCCTTGCTCTGCACAAGCTGTTCATGGTACCTT
GTATCCAGCACTCGGTGCCACTGGAGAGTGGAGGAGAAGGCTCCTCTGGTCCTGAAGAGC
CCTCTGTGGCACATGCAAAAGAAGAGGAAGGCGATGGTCTCGTTTAGTAGCTTCTCGCTG
TTTTTTAATGTTATGTTTCATTCGTTTTTCTTCTTGTTGGTTGTTCGTGTGTGGTCTTGT
TGTTACCTTCTTGTTTTAATTTGGATTCTATTAAAATATAATGTTAAACCTTAGATTGTT
GTCCCATTGTCAATTTCCCCTTATAATAAAAGCATCTCATTATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DC75TF U 1
AF RR4FY23JQ C 591
AF RR4FY23TF U 591
BS 1 685 RR4DC75TF
BS 686 686 RR4FY23TF
BS 687 699 RR4DC75TF
BS 700 700 RR4FY23TF
BS 701 743 RR4DC75TF
BS 744 947 RR4FY23TF

RD RR4DC75TF 743 0 0
GGAACCCGGCGACGGCTGAGAACTTTCGGGCTCTGTGTACAGGCGAGAAAGGAATAGGGG
AGTCTGGTACACCACTCCACTATAAGGGATCTATCATCCACTCAGTGAACCCAGGTATGA
TGTGGCTCGGAGGAGATATCACTCATGGGAACGGACTTGGAGGCGAATCGATCTACGAAT
CGATCTACGGCCGTGACCATCAAGTCACGGACAGTAAATTCCTAAGGAAGCACGACAAGA
AAGGTATCCTCTCCACGGTCAACCTTGATGAATGCGTCATCGGATCTCAGTTCATGCTCC
TCTTGACGGAGGAGTTTCCCACCCTCGATGGCTACCAGTACGCATTTGGACAAGTTGTGC
AAGGGTTTGATGTGATCAGTCAAGTTGAGCAGATGGTCGGAGATGATTCGCGCTACCCTT
TCCAGCCTTTGACAATCGCCGACTGCGGTCAGCTTGATGAGGGTGGTTCTGTCTCAACAA
TGGTAGGTTGTTCTGTCCCGGAACATGTTCATAAGATGCTCAAACAGTTGCGAGCTTGGC
AACTGAAGACCGCCGAGATGGAGAATATACTGGCAATGCAGACCATTTCATATGAAAAGG
GAAACCGCAATTTCGAGATAAAGGAGTCCCTTGCTCTGCACAAGCTGTTCATGGTACCTT
GTATCCAGCACTCGGTGCCACTGGAAAGTGGAGGAGAAG*CTCCTCTGGTCCTGAAGAGC
CCTCTGTGGCACATGCAAAAGAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4FY23JQ 357 0 0
G
ATGAAAAGGGAAACCGCAATTTCGAGATAAAGGAGTCCCTTGCTCTGCACAAGCTGTTCA
TGGTACCTTGTATCCAGCACTCGGTGCCACTGGAGAGTGGAGGAGAAGGCTCCTCTGGTC
CTGAAGAGCCCTCTGTGGCACATGCAAAAGAAGAGGAAGGCGATGGTCTCGTTTAGTAGC
TTCTCGCTGTTTTTTAATGTTATGTTTCATTCGTTTTTCTTCTTGTTGGTTGTTCGTGTG
TGGTCTTGTTGTTACCTTCTTGTTTTAATTTGGATTCTATTAAAATATAATGTTAAACCT
TAGATTGTTGTCCCATTGTCAATTTCCCCTTATAATAAAAGCATCTCATTATCTAC

QA 2 357 2 357
DS 

RD RR4FY23TF 357 0 0
G
ATGAAAAGGGAAACCGCAATTTCGAGATAAAGGAGTCCCTTGCTCTGCACAAGCTGTTCA
TGGTACCTTGTATCCAGCACTCGGTGCCACTGGAGAGTGGAGGAGAAGGCTCCTCTGGTC
CTGAAGAGCCCTCTGTGGCACATGCAAAAGAAGAGGAAGGCGATGGTCTCGTTTAGTAGC
TTCTCGCTGTTTTTTAATGTTATGTTTCATTCGTTTTTCTTCTTGTTGGTTGTTCGTGTG
TGGTCTTGTTGTTACCTTCTTGTTTTAATTTGGATTCTATTAAAATATAATGTTAAACCT
TAGATTGTTGTCCCATTGTCAATTTCCCCTTATAATAAAAGCATCTCATTATCTAC

QA 2 357 2 357
DS 



AS 1 5

CO CL1867Contig1 557 5 9 U
CAGTGAAGCTAGATTTCATATACTAAGAGTGGTTACAGAGACTAGTAGAGATACAACAAC
ACATATTCACATCACATAAAATCTTGCTTCTCCTTTCTTTCTAGTAGACATCTTTTTGAT
AGTCAGGTTCGCAGAACTCTCCTCCAAGATCATCACAAGCCTCTGCGGGGAAAACTGTTT
TGGGGTTGTTATACTCTAGGTATTCTCGGTCTACAGGCTCTGAAGCCACGGGGGGTGAGA
CGGGCTTTGTTTCAAGCTTAACTTCAGGGTAAATATCAGCAGAACAGGCGTAACCGCTGA
TCACTTCACATGCTTCAGCTGGGAAAACAGAAAGGGGAGAGTCATCGTAGTTTACGGTGA
GTGGATCAGAGGTTGAAGGAGATGATGAGTTTGGTCTGAGTCTGAGAGAAGAAGAGAGTC
TTGAAGCTTTGGTGGTGGAGATGGTGTGGGGAAGAAGAAGAGTAAGCTTTGGAGAAGAAA
GTGGAAGAATGGTTGGTTTGATGCACAAAGCTCCCTGCATTTTTTATGTGTCTGTAAGAA
GATTGGTTTAGTGATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR4AG49JQ U 1
AF RR4GG80JQ U 12
AF RR4GH94JQ U 12
AF RR4GH94TF C 12
AF RR4AG49TF C 1
BS 1 133 RR4AG49JQ
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BS 406 498 RR4AG49JQ
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TGGGGTTGTTATACTCTAGGTATTCTCGGTCTACAGGCTCTGAAGCCACGGGAGGTGAGA
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QA 1 557 1 557
DS 

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DS 

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GATTGGTTTAGTGATTT

QA 1 557 1 557
DS 



AS 2 4

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CTTCCGAAACTTCCTCCTGATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAAT
TCACCTCTTTAAGGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAATTTGTTTTTC
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GATGAAGCTTTTTGGTT


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C756JQ C 1
AF RR4C756TF U 11
BS 1 10 RR4C756JQ
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TCACCTCTTTAAGGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAATTTGTTTTTC
CTGCTAAAATTTGGTGTGTTTCAAGAATAAATTGTACTAAACTTTCCTTTGTCGAGTATT
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CACATGCGCAAAATGTGTTGGACATTTAGGTCGTGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCAC
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TTGGTGTGTTTCAAGAATAAATTGTACTAAACTTTCCTTTGTCGAGTATTGATGAAGCTT
TTTGGTT

QA 1 607 1 607
DS 



CO CL1868Contig2 699 2 3 U
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AAAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGG
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AAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCTCTTA
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TGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAGTAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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AF RR4D404TF U 1
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GG
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TGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAGTAC

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DS 



AS 1 5

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AATGGGTTTCCATCTCCGTGGAGAAAGTCTCGACCTTTCGCTCCCAAACTCTCCCAATCC
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TACTAATTTGAAACAATCTTCCACTG


BQ
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AF RR4BC71TF U 1
AF RR4CS49TF U 1
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TTTGTCCTCCTGCTAGGGTTCTCTTCTTCGAGACCTGCTTTAGCGCTGCCCACTGCGAGT
ACCGCGAGCTCTCAATCGGAGGAAGAAGAAATGTTGGAGAAGGTTCTGGAAAGCGAGCCG
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TCTTCCAAGGGTTTCCTCCAGACTCTAGCGAGAAAAGCCGCGGTTTTGCTCGTCGGGTCG
TTTGTCCTCCTGCTAGGGTTCTCTTCTTCGAGACCTGCTTTAGCGCTGCCCACTGCGAGT
ACCGCGAGCTCTCAATCGGAGGAAGAAGAAATGTTGGAGAAGGTTCTGGAAAGCGAGCCG
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AAGAATATTCTCAAAGATAACCCTCTTCTCATCAGAGCTTTGCACGGTCTAGCTATGGTG
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CATATTGTCA

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TCTAGCTATGGTGATGCACAAGTCTCATGACGACTCTTCTGTCTTTGATATGCTGAATGA
AGCTATGGAAGTTGCTCGACGAGGAAACCGAGTGACCGAGGAGAGAAACATTCAAGTCTT
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CTTGATGGATAATAAGGAGGAAGCAGATCAGCAGTTTGAGATATATTGGAGTCTTGTACC
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AGTTTTTGGTTTTTTTGTGTGCGATTGTTGTTGATTCATCTCTTGGACTCTTCCACCATT
ATCAGCTTTTTGGTACTAATTTGAAACAATCTTCCACTG

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DS 

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ATGGTGATGCACAAGTCTCATGACGACTCTTCTGTCTTTCATATGCTGAATGAAGCTATG
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TTTATCTTTCTTAAAAGCTTCATCAGTTAAAATTTTGTTCCTGGAGTAACATGTGTCGTT
TTAAAGACAAAACCGCTCTCAGAGCAGGCAGCGTATGGAACCGTGGAGAAGGCAGTTTTT
GGTTTTTT*GTGCGCGATTGTTGTTGATTCATCTCTTGGACTCTTCCACCATTATCTGCT
TTTTGGTACTAATTTGAAACAATCTTCCAC
C

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DS 



AS 1 5

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GACATCACAGCCTTGGAGAAGCCCCAGTACCCTGTCGTAGATCGGAACCCTCCGTTCACG
AAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGGCGTT
TCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATAAAACCAGGGATCAAGGGACCGTCGATGGTG
ACGGGAGGATTGATCGGAGTCATGGGTGGTTTCATGTACGCTTACCAGAACTCCGCGGGT
CGGCTCATGGGATTTTTCCCTAACGAAGGAGAGGTCGCTGCTCACCAGAAGCAGAAGCGT
GGTGCTGCTGGTTCCTTCAATTGAATCTTCTAGGGGGGTTTTTCCTGGGTCTGTCTTTAT
CCTTTGATTAAAAAAAAA*CTATCTTTTTTTCTGTAATTGGATTGATTTTCTTTGCTGAT
ACATTTGCCTCTGTTTGTCTGTTATGATGACTTACGGTTAATAATAAAAAAAACTGAGCT
TTCTCACAC


BQ
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU17JQ C 1
AF RR4EY11TF U 3
AF RR4F053JQ C 1
AF RR4BU17TF U 1
AF RR4F053TF U 1
BS 1 4 RR4BU17TF
BS 5 417 RR4EY11TF
BS 418 418 RR4BU17TF
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BS 439 439 RR4BU17TF
BS 440 533 RR4EY11TF
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CGGCTCATGGGATTTTTCCCTAACGAAGGAGAGGTCGCTGCTCACCAGAAGCAGAAGCGT
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CTGAGC

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DS 

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GG
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TCACAGCCTTGGAGAAGCCCCAGTACCCTGTCGTAGATCGGAACCCTCCGTTCACGAAAG
TCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGGCGTTTCCG
TCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATAAAACCAGGGATCAAGGGACCGTCGATGGTGACGG
GAGGATTGATCGGAGTCATGGGTGGTTTCATGTACGCTTACCAGAACTCCGCGGGTCGGC
TCATGGGATTTTTCCCTAACGAAGGAGAGGTCGCTGCTCACCAGAAGCAGAAGCGTGGTG
CTGCTGGTTCCTTCAATTGAATCTTCTAGGGGGGTTTTTCCTGGGTCTGTCTTAATCCTT
TGATTAAAAAAAAAACTATCTTTTTTTCTGTAATTGGATTGATTTTCTTTGCTGATACAT
TTGCCTCTGTTTGTCTGTTATGATGACTTACGGTTAATAATAAAAAAAA

QA 3 531 3 531
DS 

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CCTTTGATTAAAAAAAAA*CTATCTTTTTTTCTGTAATTGGGTTGATTTTCTTTGCTGAT
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QA 1 533 1 533
DS 

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CTGAGC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4F053TF 549 0 0
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GACATCACAGCCTTGGAGAAGCCCCAGTACCCTGTCGTAGATCGGAACCCTCCGTTCACG
AAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGGCGTT
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GGTGCTGCTGGTTCCTTCAATTGAATCTTCTAGGGGGGTTTTTCCTGGGTCTGTCTTTAT
CCTTTGATTAAAAAAAAA*CTATCTTTTTTTCTGTAATTGGGTTGATTTTCTTTGCTGAT
ACATTTGCCTCTGTTTGTCTGTTATGATGACTTACGGTTAATAATAAAAAAAACTGAGCT
TTCTCACAC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 3

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TCAGACTTTGGGTTAGCGAGGGACGGTCCAATGGGAGAAACAAGCTATGTTAGTACAAGA
GTCATGGGTACATTTGGCTATGCTGCTCCTGAGTATGTGTCCACAGGTCACTTGAATGCT
AGAAGCGACGTGTACAGTTTCGGGGTTGTGCTTCTAGAACTACTATCAGGAAGGCGAGCA
TTGGACCATAACCGACCAGCCAGGGAGCACAACCTTGTGGACTGGGCTAGACCGTACCTC
ACAAGCAGGCGAAAGGTTCTACTAATTGTGGACTCTCGTCTTGAGTCACAGTACAAACCT
GAAGAGGCAGTGAGATTGGCAAGCATTGCTGTGCAGTGCATCTCGTCTGAACCCAAGTCA
AGACCGACCATGGACCAAGTGGTCAGAGCCTTGTTACAACTGCAGGAAAGTATGGCTAAA
CGGGCTAAAGTTGATCCGGGTAAAGATACCAAGAAGGTTGTGGGAGTGAAAACGGAAGAC
AAGGACCAGAAAA*GGGATTTAACAAAAAGACTGTTGGTTTGTAGTAGGTAGATGATGTA
TGTGGTTTATTTACTGTGGTTAGGGTCTCATGTCTACTCGTGTGTTGTTGTAATATTACG
TGTAGTGAATTTGTAACACTGGTTGTTGTAGTTTTGCTCCTGAAATACTGATTTGGAGAT
TGTTTTTTCTTCTTCTTGTTTTCTCTGTCTATTTGATTAGATACATAGTTACATTTTGAT
TTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4G523TF U 1
AF RR4G609TF U 1
AF RR4FL30JQ C 23
BS 1 704 RR4G523TF
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BS 779 786 RR4FL30JQ

RD RR4G523TF 730 0 0
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TCAGACTTTGGGTTAGCGAGGGACGGTCCAATGGGAGAAACAAGCTATGTTAGTACAAGA
GTCATGGGTACATTTGGCTATGCTGCTCCTGAGTATGTGTCCACAGGTCACTTGAATGCT
AGAAGCGACGTGTACAGTTTCGGGGTTGTGCTTCTAGAACTACTATCAGGAAGGCGAGCA
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AAGGACCAGAAAA*GGGATTTAACAAAAAGACTGTTGGTTTGTAGTAGGTAGATGATGTA
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TGTAGTGAATTTGTAACACTGGTTGTTGTAGTTTTGCTCCTGAA*TACTGATTTGGAGAT
TGTTTTT
CTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4G609TF 778 0 0
GTATACCGAGACA
TCAAGGCCTCCAACATCTTGCTCGACTCGGACTTCAATGGAAAACTTTCAGACTTTGGGT
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ACAGTTTCGGGGTTGTGCTTCTAGAACTACTATCAGGAAGGCGAGCATTGGACCATAACC
GACCAGCCAGGGAGCACAACCTTGTGGACTGGGCTAGACCGTACCTCACAAGCAGGCGAA
AGGTTCTACTAATTGTGGACTCTCGTCTTGAGTCACAGTACAAACCTGAAGAGGCAGTGA
GATTGGCAAGCATTGCTGTGCAGTGCATCTCGTCTGAACCCAAGTCAAGACCGACCATGG
ACCAAGTGGTCAGAGCCTTGTTACAACTGCAGGAAAGTATGGCTAAACGGGCTAAAGTTG
ATCCGGGTAAAGATACCAAGAAGGTTGTGGGAGTGAAAACGGAAGACAAGGACCAGAAAA
*GGGATTTAACAAAAAGACTGTTGGTTTGTAGTAGGTAGATGATGTATGTGGTTTATTTA
CTGTGGTTAGGGTCTCATGTCTACTCGTGTGTTGTTGTAATATTACGTGTAGTGAATTTG
TAACACTGGTTGTTGTAGTTTTGCTCCTGAAATACTGATTTGGAGATTGTTTTT*CTTCT
TCTTGTTTTCTCTGTCTATTTGATTAGATACATAGTTACATTTTG

QA 14 778 14 778
DS 

RD RR4FL30JQ 764 0 0
CCAACATCTTGCTCGACTCGGACTTCAATGGAAAACTTTCAGACTTTGGGTTAGCGAGGG
ACGGTCCAATGGGAGAAACAAGCTATGTTAGTACAAGAGTCATGGGTACATTTGGCTATG
CTGCCCCTGAGTATGTGTCCACAGGTCACTTGAATGCTAGAAGCGACGTGTACAGTTTCG
GGGTTGTGCTTCTAGAACTACTATCAGGAAGGCGAGCATTGGACCATAACCGACCAGCCA
GGGAGCACAACCTTGTGGACTGGGCTAGACCGTACCTCACAAGCAGGCGAAAGGTTCTAC
TAATTGTGGACTCTCGTCTTGAGTCACAGTAC***CCTGAAGAGGCAGTGAGATTGGCAA
GCATTGCTGTGCAGTGCATCTCGTCTGAACCCAAGTCAAGACCGACCATGGACCAAGTGG
TCAGAGCCTTGTTACAACTGCAGGAAAGTATGGCTAAACGGGCTAAAGTTGATCCGGGTA
AAGATACCAAGAAGGTTGTGGGAGTGAAAACGGAAGACAAGGACTAGAAAAAGGGATTTA
ACAAAAAGACTGTTGGTTTGTAGTAGGTAGATGATGTATGTGGTTTATTTACTGTGGTTA
GGGTCTCATGTCTACTCGTGTGTTGTTGTAATATTGCGTGTAGTGAATTTGTAACACTGG
TTGTTGTAGTTTTGCTCCTGAAATACTGATTTGGAGATTGTTTTTTCTTCTTCTTGTTTT
CTCTGTCTATTTGATTAGATACATAGTTACATTTTGATTTACTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 5

CO CL1872Contig1 1653 5 14 U
CGGAACAAAAGACCTTAAATACAAAATTAATAAAAATTTTGTACCAATCATTACAATACC
GTTAATTTAAACATGTCTCTTTATTAATATGATTAAGAGAAACAACATTAAAAACACAAC
AGTTTAAAGCCTGATAAGATTGATATTATTAAGAGCAAGGCTTTGAGAGACACGAGGGAA
AGAGCGATGATATTAGGGAGCAAGCCTTTGAGAATCACGAGCGAATAGAGAAGCCTTGCG
GATGTTATCGAGGGCACATAAGAGCATTACCACACGCTCCAGCCCCACTCCAAATCCACC
ATGAGGCGGTGCACCATACCTGAATGCATCGATGTATGTGGATATTGTCTTGACATCAAT
GCCGCATTCTCTTGCACGCTTCTCCAAGATTTCTGGGTCATGGATACGTTGAGCTCCTGA
CATGATCTCCTCTCCTCTGATGAAGACATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGAATCGTCTTC
ACATGGCATCGTGTAAAACGGTCTGACAGCAGATGGATAGCGATGCAGTATGTAGAACTC
TGTCTTGTACTTTTCCAGAACAAGCTGGCCAAGTTTCTTCTCAGATTCTGTGTTTAAATC
ACAAAGAGGATCAACCTCCATGCCAGCTTCCTTAAGCATTTGAATCCCTTCCGCAAAGGT
TAGTCTCAATGTTTGCGGAAGAAACTTCAAAGATTGAAATGGGTATTGCTTTCTGACAGA
TTCAAGTTCCTTTGGGCACCTTTCTTCTATTTTAGTGAATATGAACGGAAACAAGTCATC
CACAAGATCCATTATCTCAGAGTAGTGCATTCGTATCTCCATCTCCACATCAAGACCCAC
GAATTCACACAGGTGTCTATGAGTGAAAGAGTTTTCAGCTATGAAAACAGGACCAACCTC
AAAGACGCGTCGCATGTCACCACATATGGCCATCTGCTTATGAAGCTGAGGAGACTGAGC
CAGACAAGCAGGCTGCCCTTTGTAGTCCAACCTAAATACAGCGGAACCTCCTTCACTACT
GCCAGCCATCAATTTCGGTGTGTGGATTTCAAGAAACCCCTTGGATTGTAAGAATTCTCT
GAACGCAATTTGGACTTGGCCCTGAATACGGAAGATGGCTTGATTAGCCGGTGTTCGGAT
GTCAAGAACCCTATTATTCAAACGCGTGTCCTGAAGGACACGAGCAGCTGGTTTGCCATC
CTTGACAGATTTTTCAATATCTGCTTCACTTCGAGCAGCATCCTCCACAATAAGTGGTAA
ATTTGGCAAGGATCTGCTGATGCAGTACATTTTTGTGACATGTATTTCAACCTGCTGAGT
GGGTCCTGTGAGAGGCTTCTTAGGGAGAGAGACGAGACCGATAAGCTCAACAATGGATTC
ATGACTCAGCTGCTTGACAAATTTAAGCATGCTTGTACCAACTCTGGCCTCCTCCACGAC
GCATTGAACCGCTAATCCACTTGCCCTCAAGATCACAAACAATCTTTTAGAGACTAAGCG
ATGATTGTGCACTCGACCTCTGATGGAAACCTCTGACCCCACAATCTCTTCAACCAAGTT
GTTCACATCAGTGAACTCTTTTCCCTCAACAGCATCGCTCCAGCTTCTTCTACCTGCAGC
CGACTTCACGTCACCGTAGTTGCTGGAAAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BL10TF C 521
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TGTA
GAAC

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G
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CATGTCTCTTTATTAATATGATTAAGAGAAACAACATTAAAAACACAACAGTTTAAAGCC
TGATAAGATTGATATTATTAAGAGCAAGGCTTTGAGAGACACGAGGGAAAGAGCGATGAT
ATTAGGGAGCAAGCCTTTGAGAATCACGAGCGTATAGAGAAGCCTTGCGGATGTTATCGA
GGGCACATAAGAGCATTACCACACGCTCCAGCCCCACTCCAAATCCACCATGAGGCGGTG
CACCATACCTGAATGCATCGATGTATGTGGATATTGTCTTGACATCAATGCCGCATTCTC
TTGCACGCTTCTCCAAGATTTCTGGGTCATGGATACGTTGAGCTCCTGACATGATCTCCT
CTCCTCTGATGAAGACATCGAATGAGTTGCTGTAGTTAGAATCGTCTTCACATGGCATCG
TGTAAAACGGTCTGACAGCAGATGGATAGCGATGCAGTATGTAGAACTCTGTCTTGTACT
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CAACCTCCATGCCAGCTTCCTTAAGCATTTGAATCCCTTCCGCAAAGGTTAGTCTCAATG
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TTGGGCACCTTT
T

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GGGTATTGCTTTCTGACAGATTCAAGTTCCTTTGGGCACCTTTCTTCTATTTTAGTGAAT
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ATCTCCACATCAAGACCCACGAATTCACACAGGTGTCTATGAGTGAAAGAGTTTTCAGCT
ATGAAAACAGGACC
C

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TATGAGTGAAAGAGTTTTCAGCTCTGAAAACAGGACCAACCTCAAAGACGCGTCGCATGT
CACCACATATGGCCATCTGCTTATGAAGCTGAGGAGACTGAGCCAGACAAGCAGGCTGCC
CTTTGTAGTCCAACCTAAATACAGCGGAACCTCCTTCACTACTGCCAGCCATCAATTTCG
GTGTGTGGATTTCAAGAAACCCCTTGGATTGTAAGAATTCTCTGAACGCAATTTGGACTT
GGCCCTGAATACGGAAGATGGCTTGATTAGCCGGTGTTCGGATGTCAAGAACCCTATTAT
TCAAACGCGTGTCCTGAAGGACACGAGCAGCTGGTTTGCCATCCTTGACAGATTTTTCAA
TATCTGCTTCACTTCGAGCAGCATCCTCCACAATAAGTGGTAAATTTGGCAAGGATCTGC
TGATGCAGTACATTTTTGTGACATGTATTTCAACCTGCTGAGTGGGTCCTGTGAGAGGCT
TCTTAGGGAGAGAGACGAGACCGATAAGCTCAACAATGGATTCATGACTCAGCTGCTTGA
CAAATTTAAGCATGCTTGTACCAACTCTGGCCTCCTCCACGACGCATTGAACCGCTAATC
CACTTGCCCTCAAGATCACAAACAATCTTTTAGAGACTAAGCGATGATTGTGCACTCGAC
CTCTGATGGAAACCTCTGACCCCACAATCTCTTCAACCAAGTTGTTCACATCAGTGAACT
CTTTTCCCTCAACAGCATCGCTCCAGCTTCTTCTACCTGCAGCCGACTTCACGTCACCGT
AGTTGCTGGAAAACGC

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 5

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TCTCTGTGTAAAAACATAAAAGCGAACAGAGACTATTCAACAATACCCAGTAGTCCTTAC
CCAGCATCAGAGATTTCTTCTAACGCGAAAAGGTCTCGCCCTTTGGGAGGGCAAAGATGA
ATTCGATTTTCTCTCGTAGAGTCGTCGTCGACTCATCCTCGCGTCTCACCAAACTGCTCG
CGAACCCACCCAATCACCACTCCTCCTTCACTTCCATCTATCGACCGAGCCAGACCCGCC
ATTTTCGGACCCACTACCTTCCTTCGACCCCATCTCCTCCTCTTCCCGCGAGCCGCTTCG
ACCCTTCTCTCCTATGGCGATCGGAGAAGATTCGTGGGTTTTTCGCTGGCGCTCTGACGA
AGAACAAATCCGTTAAACTGGGGAATCTCGTGGAATCGAAAGTTGTGTTCTTCCGTTCTC
AGTTTCCCAGAAAGGGTTTCGAGTTCGGAGGCTATTCTGGGAGGCGTGGATGGAAGAATT
GGCTTCAAGGGTTATCATCTAATGACGTTGTTCTTGGATTACTATTAGCTAACGCTGGTG
TCTTTATCATGTGGCGTGTTT*CGACCAACGTTTCATGATGAATAATTTCATGATATCGT
TGGACAATTTCACCAGTGGACGTCTACACACTCTGATAACTTCG*CATTCAGTCATATTG
ATATTGGACATATCGTCTCA*ACATGATTGGTCTCTACTTCTTTGGAACCAGTATCGCAA
GAAACTTTGGCCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW34TF U 1
AF RR4BW46TF U 1
AF RR4BY49TF U 1
AF RR4BX03TF U 1
AF RR4GA03TF U 420
BS 1 708 RR4BW34TF
BS 709 769 RR4BW46TF
BS 770 770 RR4GA03TF
BS 771 783 RR4BX03TF
BS 784 793 RR4GA03TF

RD RR4BW34TF 708 0 0
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CGAACCCACCCAATCACCACTCCTCCTTCACTTCCATCTATCGACCGAGCCAGACCCGCC
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TCTTTATCATGTGGCGTGTTT*CGACCAACGTTTCATGATGAATAATTTCATGATATCGT
TGGACAATTTCACCAGTGGACGTCTACACACTCTGATAACTTCG*CAT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BW46TF 775 0 0
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TCTCTGTGTAAAAACATAAAAGCGAACAGAGACTATTCAACAATACCCAGTAGTCCTTAC
CCAGCATCAGAGATTTCTTCTAACGCGAAAAGGTCTCGCCCTTTGGGAGGGCAAAGATGA
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CGAACCCACCCAATCACCACTCCTCCTTCACTTCCATCTATCGACCGAGCCAGACCCGCC
ATTTTCGGACCCACTACCTTCCTTCGACCCCATCTCCTCCTCTTCCCGCGAGCCGCTTCG
ACCCTTCTCTCCTATGGCGATCGGAGAAGATTCGTGGGTTTTTCGCTGGCGCTCTGACGA
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AGTTTCCCAGAAAGGGTTTCGAGTTCGGAGGCTATTCTGGGAGGCGTGGATGGAAGAATT
GGCTTCAAGGGTTATCATCTAATGACGTTGTTCTTGGATTACTATTAGCTAACGCTGGTG
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ATATTGGACATATCGTCTCA*ACATGATTGGTCTCTACTTCTTTGGAAC
AGTATC

QA 1 769 1 769
DS 

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CGAACCCACCCAATCACCACTCCTCCTTCACTTCCATCTATCGACCGAGCCAGACCCGCC
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AGTTTCCCAGAAAGGGTTTCGAGTTCGGAGGCTATTCTGGGAGGCGTGGATGGAAGAATT
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ATATTGGACATATCGTCTCA*ACATGATTGGTCTCTACTTCTTTGGA
CCAGTAT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BX03TF 786 0 0
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TCTCTGTGTAAAAACATAAAAGCGAACAGAGACTATTCAACAATACCCAGTAGTCCTTAC
CCAGCATCAGAGATTTCTTCTAACGCGAAAAGGTCTCGCCCTTTGGGAGGGCAAAGATGA
ATTCGATTTTCTCTCGTAGAGTCGTCGTCGACTCATCCTCGCGTCTCACCAAACTGCTCG
CGAACCCACCCAATCACCACTCCTCCTTCACTTCCATCTATCGACCGAGCCAGACCCGCC
ATTTTCGGACCCACTACCTTCCTTCGACCCCATCTCCTCCTCTTCCCGCGAGCCGCTTCG
ACCCTTCTCTCCTATGGCGATCGGAGAAGATTCGTGGGTTTTTCGCTGGCGCTCTGACGA
AGAACAAATCCGTTAAACTGGGGAATCTCGTGGAATCGAAAGTTGTGTTCTTCCGTTCTC
AGTTTCCCAGAAAGGGTTTCGAGTTCGGAGGCTATTCTGGGAGGCGTGGATGGAAGAATT
GGCTTCAAGGGTTATCATCTAATGACGTTGTTCTTGGATTACTATTAGCTAACGCTGGTG
TCTTTATCATGTGGCGTGTTT*CGACCAACGTTTCATGATGAATAATTTCATGATATCGT
TGGACAATTTCACCAGTGGACGTCTACACACTCTGATAACTTCG*CATTCAGTCATATTG
ATATTGGACATATCGTCTCA*ACATGATTGGTCTCTACTTCTTTGGAAC*AGTATCGCAA
GAA
CTT

QA 1 783 1 783
DS 

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CAGTTTCCCAGAAAGAGTTTCGAGTTCGGAGGCTATTCTGGGAGGCGTGGATGGAAGAAT
TGGCTTCAAGGGTTATCATCTAATGACGTTGTTCTTGGATTACTATTAGCTAACGCTGGT
GTCTTTATCATGTGGCGTGTTTTCTACCAACGTTTCATGATGAATAATTTCATGATATCG
TTGGACAATTTCACCAGTGGACGTCTACACACTCTGATAACTTCGGCATTCAGTCATATT
GATATTGGACATATCGTCTCACACATGATTGGTCTCTACTTCTTTGGAACCAGTATCGCA
AGAAACTTTGGCCC

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 4

CO CL1874Contig1 855 4 10 U
ATAATACCAGCTCTCCTGCTTCTGCACCACCCTTGATCTATTATTATTCTTACCCATTCT
GCTTTCTCTAACTCAAAATAATTCTCCTCCCTTTGTTCATCAGCAATAACTCTCTGTAGT
TTTCAAAGGCTAAACTACTAAATTAGCATCTAAAGTCGGCAGAGATCCATTGGTACTGAC
AATCTCTTCAACGATAAAATGGAGATACACAACCAAGAAGACAACCTAGCAGCATTGGGT
GACTCTGGAGGAGACTTCGACTGCAACATATGTTTGGATCAGGTCCGTGACCCGGTCGTG
ACTTTGTGTGGCCACTTATTTTGTTGGCCCTGCATTTACAAGTGGACTACTTCCACCAAT
AATTCAAGACAACGCGTCGACCAGTACGATAACATGAAGGAATCCACTAAATGTCCGGTC
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CCCCAGTCTGGTTCAAACGTACCGACCAGACCATCCGGTCTGGTTTATGACTTGAGAAGA
GTTGGTCAACGTGCTGGACAAGGTGAGAGTCAACGGTACATGTATAGAATGCCTGATCTA
GTGGTTGGTGTGGTATGCGAAATGGTATATCGGAGACTATTTGGAGAGTCTTCAAGCAAC
GTGACACCTTACCGGAGCGACCGCTACACAAGTCGGCGGACAATGCAGGCGGATGAGTCA
CTAAGCGTAGTCTACTTATTCCTGCTTTGCTTCATGGTTATGTGTCTAATTCTTTTCTAA
TTGTATGTCTTATCCTATATATTTATGGAAGTAAAGTATAAGTTGTTGGTTTAAAAAAAA
AGTATAAGTTGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD29TF U 1
AF RR4D603TF U 38
AF RR4DT16TF U 38
AF RR4AD29JQ C 122
BS 1 60 RR4AD29TF
BS 61 61 RR4D603TF
BS 62 74 RR4AD29TF
BS 75 75 RR4D603TF
BS 76 117 RR4AD29TF
BS 118 118 RR4D603TF
BS 119 651 RR4AD29TF
BS 652 663 RR4D603TF
BS 664 707 RR4DT16TF
BS 708 855 RR4AD29JQ

RD RR4AD29TF 651 0 0
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TTTCAAAGGCTAAACTACTAAATTAGCATCTAAAGTCGGCAGAGATCCATTGGTACTGAC
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QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4D603TF 626 0 0
GG
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TACGGGCGGGGACAAAAAGTCCCCCAGTCTGGTTCAAACGTACCGACCAGACCATCCGGT
CCGGTTTATGACTTGAGAAGAGTTGGTCAACGTGCTGGACAAGGTGAGAGTCAACGGTAC
ATGTATAGAATGCCTGATCCAGTGGTTGGTGTGGTATGCGAAATGGTATATCGGAGACTA
TTTGGAGAGTCTTCAAGCAACGTG

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR4DT16TF 670 0 0
GG
ATTATTATTCTTATCCATTCTGCTTTCTCTAACTCAAAATAATTCTCCTCCCTTTGTTCA
TCAGCAATAACTCTCTGTAGTTTTCAAAGACTAAACTA********GCATCTAAAGTCGG
CAGAGATCCATTGGTACTGACAATCTCTTCAACGATAAAATGGAGATACACAACCAAGAA
GACAACCTAGCAGCATTGGGTGACTCTGGAGGAGACTTCGACTGCAACATATGTTTGGAT
CAGGTTCGTGACCCGGTCGTGACTTTGTGTGGCCACTTATTTTGTTGGCCCTGCATTTAC
AAGTGGACTACTTCCACCAATAATTCAAGACAACGCGTCGACCAGTACGATAATATGAAG
GAATCCACAAAATGTCCGGTCTGCAAATCCGATGTCTCGGACGCTACGCTTGTCCCTATA
TACGGGCGGGGACAAAAAGTCCCCCAGTCTGGTTCAAACGTACCGACCAGACCATCCGGT
CCGGTTTATGACTTGAGAAGAGTTGGTCAACGTGCTGGACAAGGTGAGAGTCAACGGTAC
ATGTATAGAATGCCTGATCCAGTGGTTGGTGTGGTATGCGAAATGGTATATCGGAGACTA
TTTGGAGAGTCTTCAAGCAACGTGACACCTTACCGGAGCGACCGCTACACAAGTCGGCGG
ACAATGCA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4AD29JQ 734 0 0
TTCAAAGGCTAAACTA
CTAAATTAGCATCTAAAGTCGGCAGAGATCCATTGGTACTGACAATCTCTTCAACGATAA
AATGGAGATACACAACCAAGAAGACAACCTAGCAGCATTGGGTGACTCTGGAGGAGACTT
CGACTGCAACATATGTTTGGATCAGGTCCGTGACCCGGTCGTGACTTTGTGTGGCCACTT
ATTTTGTTGGCCCTGCATTTACAAGTGGACTACTTCCACCAATAATTCAAGACAACGCGT
CGACCAGTACGATAACATGAAGGAATCCACTAAATGTCCGGTCTGCAAATCCGATGTCTC
GGACGCTACGCTTGTCCCTATATACGGGCGGGGACAAAAAGTCCCCCAGTCTGGTTCAAA
CGTACCGACCAGACCATCCGGTCTGGTTTATGACTTGAGAAGAGTTGGTCAACGTGCTGG
ACAAGGTGAGAGTCAACGGTACATGTATAGAATGCCTGATCTAGTGGTTGGTGTGGTATG
CGAAATGGTATATCGGAGACTATTTGGAGAGTCTTCAGGCAACGTGACACCTTACCGGAG
CGACCGCTACACAAGTCGGCGGACAATGCAGGCGGATGAGTCACTAAGCGTAGTCTACTT
ATTCCTGCTTTGCTTCATGGTTATGTGTCTAATTCTTTTCTAATTGTATGTCTTATCCTA
TATATTTATGGAAGTAAAGTATAAGTTGTTGGTTTAAAAAAAAAGTATAAGTTGTTGG

QA 17 734 17 734
DS 



AS 1 2

CO CL1875Contig1 898 2 2 U
GTTCCTTCAATAGATGCCAAGTCCAAGAGAAAAGCGGCAACATCCACAGCAACTTGCATT
GGGTCTTTACCTTTCTTCAAATCCTCAAAACGACCTTCATCACTCACTTTCTCTCTTATG
AATTCGATTTGCTCATCTTCCCATTGTGCAATACTAGCAACCTCCTCATAAGGACATCCT
AATGTCCACCAAGGTGATTTTAGTGCTACTCTGGCCGATTCTTTTGCTTCTGAATTGCGT
CCTACCTTCTGTAGTATGTTTGCATAATATACAAAAGGCCGTCCAAATCCTGGAAACAGA
TCTTTCTTTGTGTAGAATTCTCCTGTCACCATAGCTGAAACATGATCTCCTTCATCGAAA
TGCCGTAATACTTTTCGCTCCAACACATCAGGAAACAGACCAACCTTTTTTAAGACATAG
ACATCGAGATTATCAATCTGAGATTCAGCAAAAGCACCCTTTTTGTAAAGCTTATCGCCT
GCCTCCGCTGAAGCAATGTAAAGTTCTGACAACTCTTTTGCATCTTCTTCAACAAGAATC
CGGTGAATATACTCATCTACATTTCTAGCTATTAGCCGGACACCACTCCTCCAAACTTCA
ACGACAGGCATATCCATTCCTGGTGGAGCAGTAGGCCATCTCAGAAGCGCAGTAACAGAG
CCTGAGGAGTCCTTAGAAAGCGGAATAGCAAGAGGGATGAGTCCCTGCTTAGCTCCAGGA
GATATGATGGTTTCACCTCTTGTTTGAAGAACTTTGAGTAGGTGTTGAAGATGCATTGGT
GGTTCAGTGACAGCTACATCTTTGATAAATGATACATGCCCAGAAGAGCAACAGGAGACA
GTAGCTCTGGTATGGCGCAGAGGAAGAGCAGAGAAAGGAGTGAACAGCGAACTCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH54JQ U 1
AF RR4BH43TF C 231
BS 1 598 RR4GH54JQ
BS 599 898 RR4BH43TF

RD RR4GH54JQ 598 0 0
GTTCCTTCAATAGATGCCAAGTCCAAGAGAAAAGCGGCAACATCCACAGCAACTTGCATT
GGGTCTTTACCTTTCTTCAAATCCTCAAAACGACCTTCATCACTCACTTTCTCTCTTATG
AATTCGATTTGCTCATCTTCCCATTGTGCAATACTAGCAACCTCCTCATAAGGACATCCT
AATGTCCACCAAGGTGATTTTAGTGCTACTCTGGCCGATTCTTTTGCTTCTGAATTGCGT
CCTACCTTCTGTAGTATGTTTGCATAATATACAAAAGGCCGTCCAAATCCTGGAAACAGA
TCTTTCTTTGTGTAGAATTCTCCTGTCACCATAGCTGAAACATGATCTCCTTCATCGAAA
TGCCGTAATACTTTTCGCTCCAACACATCAGGAAACAGACCAACCTTTTTTAAGACATAG
ACATCGAGATTATCAATCTGAGATTCAGCAAAAGCACCCTTTTTGTAAAGCTTATCGCCT
GCCTCCGCTGAAGCAATGTAAAGTTCTGACAACTCTTTTGCATCTTCTTCAACAAGAATC
CGGTGAATATACTCATCTACATTTCTAGCTATTAGCCGGACACCACTCCTCCAAACTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BH43TF 668 0 0
TGAATTGCGTCCTACTTTCTGTAGTATGTTTGCATAATATACAAAAGGCCGTCCAAATCC
TGGAAACAGATCTTTCTTTGTGTAGAATTCTCCTGTCACCATAGCTGAAACATGATCTCC
TTCATCGAAATGCCGTAATACTTTTCGCTCCAACACATCAGGAAACAGACCAACCTTTTT
TAAGACATAGACATCGAGATTATCAATCTGAGATTCAGCAAAAGCACCCTTTTTGTAAAG
CTTCTCGCCTGCCTCCGCTGAAGCAATGTAAAGTTCTGACAACTCTTTTGCATCTTCTTC
AACAAGAATCCGGTGAATATACTCATCTACATTTCTAGCTATTAGCCGGACACCACTCCT
CCAAACTTCAACGACAGGCATATCCATTCCTGGTGGAGCAGTAGGCCATCTCAGAAGCGC
AGTAACAGAGCCTGAGGAGTCCTTAGAAAGCGGAATAGCAAGAGGGATGAGTCCCTGCTT
AGCTCCAGGAGATATGATGGTTTCACCTCTTGTTTGAAGAACTTTGAGTAGGTGTTGAAG
ATGCATTGGTGGTTCAGTGACAGCTACATCTTTGATAAATGATACATGCCCAGAAGAGCA
ACAGGAGACAGTAGCTCTGGTATGGCGCAGAGGAAGAGCAGAGAAAGGAGTGAACAGCGA
ACTCATGG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 5

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AATAAAAAGACCAAAGCAAACACAAGCGTTCAAATTAGGTCCCAAGTAAATGGTTTGCAA
GAATCAGTTTCATACATATATATATATATGACCTATACAAAACCAATTTCAACAAGTGCA
AATCTAAGCAAGAGAAACATAGCCATGAGAAATTTTAAACCAAAAAGAAAAAAAAAAAGC
ACAACAAACTGAATGAGGATGATGTTCTCGGAAATCAGAGATGTTCCGGACTTATTTGCC
GCAGTTGAAGCCACCGCAGACTGAGAGGACGATGATGAGGATCAAAGCGATGATGATTGC
AAGAACAATGAGTTTTATCTTCATGTTCTGAAACCACATCTTTCTTCTCATTTGAGTTCC
TTGTGTTCTGAAATCTTGCGCCTGTGAGCGAAGGTTTTCGGTTTTGTCCACCAAAAGTTC
GATTTTCTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCAATGTTTTCCATCATGACACCTTTAACTTC
AGAAACTTGAGCTTTAACCTTAGCAAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATA
CTGCATGTGCTCTTTCAGTTTCGACCCAAATTCCTTATTCAAGGAGTTGGGTTGAGCAGT
AGCAGCCTTGCCACCACCATATCTCTTGTTGAAATCCTCCTTAACTCGCTCCAAGAAAGC
CATAGGAATCTGCCTCCCAGCAGAATCAACTGCAACCACACAATAAGTGAATCCATTTTC
AACCAAGTAATTGAAGGTATGACCATCGCAGTTGTAGGTGAACTTGTTGTTGGAAGAAGG
AAGCTTTTGGAGGCACTGTGCAGCGATCGATGTGAAATTTCCCTTGAAATCGGTGAACTC
CACCAGGATCACCGTCCCTCGAGCCACGAAACTGTAGATCAAAGATTGTTGCTGTTGCGC
CATCCCTTTTTTTCCTGTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTACTGGGAACAAAAAAACA
ACAACGCTGTTCCGATGGATTTTATTGACTGATCAGAGAGTTTTGTTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4A115JQ U 60
AF RR4F852JQ U 8
AF RR4A115JQD U 1
AF RR4A115TFB C 166
AF RR4F852TF C 364
BS 1 907 RR4A115JQD
BS 908 939 RR4A115TFB
BS 940 1012 RR4F852TF

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CGATTTTCTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCAATGTTTTCCATCATGACACCTTTAACTT
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CCATAGGAATCTGCCTCCCAGCAGAATCAACTGCAACCACACAATAAGTGAATCCATTTT
CAACCAAGTAATTGAAGGTATGACCATCGCAGTTGTAGGTGAACTTGTTGTTGGAA

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DS 

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CTGAAATCTTGCGCCTGTGAGCGAAGGTTTTCGGTTTTGTCCACCAAAAGTTCGATTTTC
TCACCACGGTCAAGAACCTTCTCAATGTTTTCCATCATGACACCTTTAACTTCAGAAACT
TGAGCTTTAACCTTAGCAAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCATG
TGCTCTTTCAGTTTCGACCCAAATTCCTTATTCAAGGAGTTGGGTTGAGCAGTAGCAGCC
TTGCCACCACCATATCTCTTGTTGAAATCCTCCTTAACTCGCTCCAAGAAAGCCATAGGA
ATCTGCCTCCCAGCAGAATCAACTGCAACCACACAATAAGTGAATCCATTTTCAACCAAG
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DS 

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GAATCAGTTTCATACATATATATATATATGACCTATACAAAACCAATTTCAACAAGTGCA
AATCTAAGCAAGAGAAACATAGCCATGAGAAATTTTAAACCAAAAAGAAAAAAAAAAAGC
ACAACAAACTGAATGAGGATGATGTTCTCGGAAATCAGAGATGTTCCGGACTTATTTGCC
GCAGTTGAAGCCACCGCAGACTGAGAGGACGATGATGAGGATCAAAGCGATGATGATTGC
AAGAACAATGAGTTTTATCTTCATGTTCTGAAACCACATCTTTCTTCTCATTTGAGTTCC
TTGTGTTCTGAAATCTTGCGCCTGTGAGCGAAGGTTTTCGGTTTTGTCCACCAAAAGTTC
GATTTTCTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCAATGTTTTCCATCATGACACCTTTAACTTC
AGAAACTTGAGCTTTAACCTTAGCAAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATA
CTGCATGTGCTCTTTCAGTTTCGACCCAAATTCCTTATTCAAGGAGTTGGGTTGAGCAGT
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CATAGGAATCTGCCTCCCAGCAGAATCAACTGCAACCACACAATAAGTGAATCCATTTTC
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AAGCTTTTGGAGGCACTGTGCAGCGATCGATGTGAAATTTCCCTTGAAATCGGTGAACTC
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CATCCCT

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DS 

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AGAAAAAAAAAAAGCACAACAAACTGAATGAGGATGATGTTCTCGGAAATCAGAGATGTT
CCGGACTTATTTGCCGCAGTTGAAGCCACCGCAGACTGAGAGGACGATGATGAGGATCAA
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TCTCATTTGAGTTCCTTGTGTTCTGAAATCTTGCGCCTGTGAGCGAAGGTTTTCGGTTTT
GTCCACCAAAAGTTCGATTTTCTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCAATGTTTTCCATCAT
GACACCTTTAACTTCAGAAACTTGAGCTTTAACCTTAGCAAGCTTGCTAATCTCATCAGG
ATGATCCATACAATACTGCATGTGCTCTTTCAGTTTCGACCCAAATTCCTTATTCAAGGA
GTTGGGTTGAGCAGTAGCAGCCTTGCCACCACCATATCTCTTGTTGAAATCCTCCTTAAC
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AGTGAATCCATTTTCAACCAAGTAATTGAAGGTATGACCATCGCAGTTGTAGGTGAACTT
GTTGTTGGAAGAAGGAAGCTTTTGGAGGCACTGTGCAGCGATCGATGTGAAATTTCCCTT
GAAATCGGTGAACTCCACCAGGATCACCGTCCCTCGAGCCACGAAACTGTAGATCAAAGA
TTGTTGCTGTTGCGCCATCCCTTTTTTTCCTGTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTACTACTGGGAAC

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DS 

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GTG
TCTGAAATCTTGCGCCTGTGAGCGAAGGTTTTCGGTTTTGTCCACCAAAAGTTCGATTTT
CTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCAATGTTTTCCATCATGACACCTTTAACTTCAGAAAC
TTGAGCTTTAACCTTAGCAAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCAT
GTGCTCTTTCAGTTTCGACCCAAATTCCTTATTCAAGGAGTTGGGTTGAGCAGTAGCAGC
CTTGCCACCACCATATCTCTTGTTGAAATCCTCCTTAACTCGCTCCAAGAAAGCCATAGG
AATCTGCCTCCCAGCAGAATCAACTGCAACCACACAATAAGTGAATCCATTTTCAACCAA
GTAATTGAAGGTATGACCATCGCAGTTGTAGGTGAACTTGTTGTTGGAAGAAGGAAGCTT
TTGGAGGCACTGTGCAGCGATCGATGTGAAATTTCCCTTGAAATCGGTGAACTCCACCAG
GATCACCGTCCCTCGAGCCACGAAACTGTAGATCAAAGATTGTTGCTGTTGCGCCATCCC
TTTTTTTCCTGTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTACTGGGAACAAAAAAACAACAACG
CTGTTCCGATGGATTTTATTGACTGATCAGAGAGTTTTGTTATTCC

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DS 



AS 1 5

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GGAGATTACAAAGACAGC***GATAGTAAAACATCGGTTTATAAGATTACAAGCATCATT
ATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAATAGTATCTTTTGAAGGATTTAACGACCA
AGCGATGATGGATCGATGAGAATATCATATGACTGTACCTTTGAGAGACAAGCATATCTG
TAGATTGG***TCTCTAGATGCTTGGCCTTACATTGAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCC
AAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGA
CGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTTTTAACAAACCTGTCTTGCCTGTCTGGTGCC
CAGGATCTGTACCTATCTCCAGCCTGCTTGAAGTTGTTCTCCTTCTTGATGACACACTTT
GTTCTTATTCCAGTGTAGGATTTGCTAGGGATTGGAACTTTCTCGGCGCAACGGACAGGA
TCAAACTTTGATGGGTAATAATTGATCTCCTCATCTCTATGCATGAAGTTCATGAAACCT
TCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAGCATTCACCGGTAGCTGCAGATAGTTA
GGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATACGCAAAGATCCTACACTGAAGCAGCTTA
TCATCCGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGGTTGAAAGCAAGCTGCTCAGTT
TCATTAAAGAAGTTATCAATGGTCCTGTTCAGAACCAAGCGACCAACGGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT84JQ U 33
AF RR4AT84TF C 33
AF RR4G009JQ U 26
AF RR4DX21JQ U 1
AF RR4FZ92JQ U 31
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A
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QA 2 424 2 424
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A
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TTG

QA 2 424 2 424
DS 

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AGTATCTTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCGATGATGGATCGATGAGAATATCATATGAC
TGTACCTTTGAGAGACAAGCATATCTGTAGATTGG***TCTCTAGATGCTTGGCCTTACA
TTGAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATC
CAGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTTTTA
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QA 9 656 9 656
DS 

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AAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGA
CGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTTTTAACAAACCTGTCTTGCCTGTCTGGTGCC
CAGGATCTGTACCTATCTCCAGCCTGCTTGAAGTTGTTCTCCTTCTTGATGACACACTTT
GTTCTTATTCCAGTGTAGGATTTGCTAGGGATTGGAACTTT*TCGGCGCAACGGACAGGA
TCAAACTTTGATGGGTAATAATTGATCTCCTCATCTCTATGCATGAAGTTCATGAAACCT
TCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAGCATTCACCGGTAGCTGCAGATAGTTA
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TCATTAAAGAAGTTATCAATGGTCCTGTTCAGAACCAAGCGACCAACGGGTTGC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4FZ92JQ 786 0 0
ACT
ACTCAAGAAACATTGATTTATTGTGAAGGAGATTACAAAGACAGCAGCGATAGTAAAACA
TCGGTTTATAAGATTACAAGCATCATTATTATACAGACACGAAACAACCATACATGGAAT
AGTATCTTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCGATGATGGATCGATGAGAATATCAT**GAC
TGTACCTTTGAGAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACA
TTGAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATC
CAGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGACAGGGTCTCGACCCATCTCTTA
ACAAACCTGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCCTGCTTGAAG
TTGTTCTCCTTCTTGATGACACACTTTGTTCTTATTCCAGTGTAGGATTTGCTAGGGATT
GGAACTTTCTCGGCGCAACGGACAGGATCAAACTTTGAAGGGTAATAATTGATCTCCTCA
TCTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGA
GCATTCACCGGTAGCTGCAGATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCGTAC
GCAAAGATCCTACACTGAAGCAGCTTATCATCCGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGA
CCAGGGTTGAAAGCAAGCTGCTCAGTTTCATTAAAGAAGTTGTCGATGGTCCTGTTGAGA
ACC

QA 4 786 4 786
DS 



AS 2 5

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CTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCCGATGAGGACACCGTCGTTGGATTCT
TGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATCAGGAGGAAGACTAACTACCTCATTGTGGATT
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TTGCTATCATCCTCATCAGCCAATACGTTGCCAATATGATCCGTTTCTTGGTGGATAGCT
ACAACAAGCCAGTGCCTGCGATTCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCCCTATGATCCTG
CTCATGATTCGGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTTTCTGCTGAATCTGTGTCACAGC
GTTAAACATAATGCAAGCTCGCTTGATCCTCTATATCATTTGTTTGTTTTTGACATTCTT
GTATTTCTCTTTTCAAACTCAGAAACTTTCAATAAATGTATAACTCTTGATTTTTATTTG
GAGATAATTGTTATATTATTGAGAATCAATGGTAACACCATCCGATTCCTTTTGGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CB65JQ C 1
AF RR4CB65TF U 1
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BS 9 599 RR4CB65TF

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TGTTATATTATTGAGAATCAATGGTAACACCATCCGATTCCTTTTGGATTG

QA 9 599 9 599
DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN30JQ C 10
AF RR4GN30TF U 10
AF RR4DV32TF U 1
BS 1 146 RR4DV32TF
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DS 

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GG
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AACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCCGATGAGGACACCGTAGTTGGATTCTTGATGGCT
GGAGTTGGTAATGTTGACATCAGGAGGAAGACTAACTACCTCATCGTGGATTCAAAGACA
ACTGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAATTCTCATCGAGAGATGATATTGCTATC
ATCCTCATCAGCCAATACGTTGCCAATATGATCCGTTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAG
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TAGCTCTCGCTGAACCTATATCATTTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCCTTTCA
AACTCAAAAACTTTCAATAAATGTAAAACTC

QA 3 513 3 513
DS 

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ATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATACGTTGCCAATATGATCCGTTTCTTGGTGGATA
GCTACAACAAGCCAGTGCCTGCGATTCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCCCTATGATC
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TTCTCCTTTCAAACTCAAAAACTTTCAATAAATGTAAAACTCTTGATTTTTATTCGGAGA
TGATTGTTATATT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 5

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TTACAAGATAAATCAATTGTTTCTTATCGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A622TF U 1
AF RR4A622JQ C 241
AF RR4D149TF U 2
AF RR4DC17JQ C 241
AF RR4DC17TF U 2
BS 1 124 RR4A622TF
BS 125 125 RR4D149TF
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TTCTTTGATTATTTCTTATTTCAGTATTTC
CC

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DS 

RD RR4A622JQ 332 0 0
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CC

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TACAAGATAAATCAATTGTTTCTTATCGC

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DS 

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ATTGTCGAGAGAGCTTTTCAGCTAGACATTGTTGTTACCAACAGGCTTGTTAGGCTCCGT
AGCCAGGAAGACGAGTGAAGAAGGCAATACACTTGAGAGAGATATCTTATTGTTTCTGGT
TTATTACTACTGTGTTTTGTGTTTGCATTCAACAAACATGAGTTTTGGTTTTCAGACCGT
TTCTTTGATTATTTTTTATTTCAGTATTTCTCAAAGGCTAGGCGTTTTATGGTCTCTTTC
TTACAAGA
AAA

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CCAATGGATTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGATCTGGAGTTGTTGATGATGC
ACAACAGGACTTACTGCGCGGAGATTGCTCACAACGTCTCTACCAAGAAGAGGAAGGCCA
TTGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTA
GCCAGGAAGACGAGTGAAGAAGGCAATACACTTGAGAGAGATATCTTATTGTTTCTGGTT
TATTACTACTGTGTTTTGTGTTTGCATTCAACAAACATGAGTTTTGGTTTTCAGACCGTT
TCTTTGATTATTTCTTATTTCAGTATTTCTCAAAGGCTAGGCGTTTTATGGTCTCTCTCT
TACAAGA

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

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ACAGCTAAACCCCAAAAGACGAGTTAAAAAAACCAAAACCGAAAGGTAAGAGAGTTCATT
ATTTATCATTCCTTTCGGTTGGGCTAGTAGCCAAGAAAGTGGTGCTTCATCAGCAGTAGA
ACATAACATCCTTGACGTTATCTTTGATGGCTGGTAGACGCGAGACAACAGCACTCGTGC
TTGCGGTTGTGTTCCTGCTCTTGCTTGAACCCCCATCAGAGGTCTCACTTTCCATGTAGT
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TGAAACCGTTTTCGTCCACAAGCACATGGTAATGTGCAGGCCTGCTTGTTCCCTGAATGC
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CGGTCCCTGGCAATGTTGCCACTTCTATCAGTAGTATCACGGTTTCCGTGTTGAGCAGGA
AACAAACGTGTGTGGTGTCTTTTTCTGGACCACCACAAACGTTACACGCGGAAGATAGCC
ATTTTCGAGAGAGGCACAGGCAATATTATAATAAGAAGTTGAAGAGTAGATGCCCTTTGG
TGGATATCACGAAGTGCTTCCTCAATTCTTTGAGGCTGGCAAGAGACGAACGGAATAGCA
GGTTGCGGATTGAATTGCATTCCTTTGCTGACACACATGTCAATTAATTGACGGCAGAAT
TCTTGTGGTAAATTCCGGTCAATCCGAGTGGAGAAGTTCACGCAAGTCCAAGTTGCAACT
CTTGATCCATTAATCATTTTCTTATCAATCATGTTCCACTGGCCTAGCCTTGAATTCACC
ATTTTTTCTCTGCCACTTTCATGGTATTTCAACAAGGGTGGAGGTAGGACCCGAGCCTCA
ACTGAGGCTAGCTGATCAGTAACTGACATTCCAAACTCTTTGCTCACCAGATCAATCTCG
TTATACCTATTATTCTTGACCATCCCTTTTATCGCATTCTCTCTCTGTTGAGGTCGTTGG
CAGGTAGCTCTCAGCATCGCAGTCACCTGCCTCTCGTTGAGCTTTTTGGTGTATCGCTGG
CCTTCTGCTATTCGGCAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT12JQ U 25
AF RR4AG57JQ U 1
AF RR4AG57TF C 657
BS 1 87 RR4AG57JQ
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RD RR4GT12JQ 634 0 0
C
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AAACTTCCGAGTCGGAGAACGGTCTAAAGAAAAACCATAGCTAAACCCTTTTCCTTTTTT
TCCACAACGACAAACTTGAAGTCAGATCATTGTCGTGGAACCAAAACGCATAAAAGTTCC
GAGAGAAAATATTAGCCGCATAATTCAAAATATTCACAGCTAAACCCCAAAAGACGAGTT
AAAAAAGCCAAAACCGAAAGGTAAGAGAGTTCATTATTTATCTTTCCTTTCGGTTGGGCT
AGTAGCCAAGAAAGTGGTGCTTCATCAGCAGTAGAACATAACATCCTTGACGTTAT**TT
GATGGCTGGTAGACGCGAGACAACAGCACTCGTGCTTGCGGTTGTGTTCCTGCTCTTGCT
TGAACCCCCATCAGAGGTCTCACTTTCCATGTAGTAACGAGCCCTGAACGCAGCCAGGTG
GGCATAGTAAGCCGGTGGCACAATCGAGACAGATCTCGTGCACCTCGCAAACGTGTAACA
AAGGTTGTTGGTGAGCATTTGTAAACCATCGGCAGTGAAACCGTTTTCGTCCACAAGCAC
ATGGTAATGTGCAGGCCT
GCTTGTTCCCTGAAT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR4AG57JQ 798 0 0
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AAACTAACGCAGAACAAAGCACATGAA*CTTCCGAGTCGGAGAACGGTCTAAAGAAAAAC
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TGGAACCAAAACGCATAAAAGTTCCGAGAGAAAATATTAGCCGAATAATTCAAAATATTC
ACAGCTAAACCCCAAAAGACGAGTTAAAAAAACCAAAACCGAAAGGTAAGAGAGTTCATT
ATTTATCATTCCTTTCGGTTGGGCTAGTAGCCAAGAAAGTGGTGCTTCATCAGCAGTAGA
ACATAACATCCTTGACGTTATCTTTGATGGCTGGTAGACGCGAGACAACAGCACTCGTGC
TTGCGGTTGTGTTCCTGCTCTTGCTTGAACCCCCATCAGAGGTCTCACTTTCCATGTAGT
AACGAGCCCTGAACGCAGCCAGGTGGGCATAGTAAGCCGGTGGCACAATCGAGACAGATC
TCGTGCACCTCGCAAACGTGTAACAAAGGTTGTTGGTGAGCATTTGTAAACCATCGGCAG
TGAAACCGTTTTCGTCCACAAGCACATGGTAATGTGCAGGCCTGCTTGTTCCCTGAATGC
CAGCGTGGCTGTTTAAAAAGAAATCGAATTCAGTTGGATGACAGATTTTAGTATCCACAA
CGGTCCCTGGCAATGTTGCCACTTCTATCAGTAGTATCACGGTTTCCGTGTTGAGCAGGA
AACAAACGTGTGTGGTGT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4AG57TF 744 0 0
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ACAACGGTCCCTGGCAATGTTGCCACTTCTATCAGTAGTATCACGGTTTCCGTGTTGAGC
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AGCCATTTTCGAGAGAGGCACAGGCAATATTATAATAAGAAGTTGAAGAGTAGATGCCCT
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AGCAGGTTGCGGATTGAATTGCATTCCTTTGCTGACACACATGTCAATTAATTGACGGCA
GAATTCTTGTGGTAAATTCCGGTCAATCCGAGTGGAGAAGTTCACGCAAGTCCAAGTTGC
AACTCTTGATCCATTAATCATTTTCTTATCAATCATGTTCCACTGGCCTAGCCTTGAATT
CACCATTTTTTCTCTGCCACTTTCATGGTATTTCAACAAGGGTGGAGGTAGGACCCGAGC
CTCAACTGAGGCTAGCTGATCAGTAACTGACATTCCAAACTCTTTGCTCACCAGATCAAT
CTCGTTATACCTATTATTCTTGACCATCCCTTTTATCGCATTCTCTCTCTGTTGAGGTCG
TTGGCAGGTAGCTCTCAGCATCGCAGTCACCTGCCTCTCGTTGAGCTTTTTGGTGTATCG
CTGGCCTTCTGCTATTCGGCAAAC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 4

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GGGCTGTATACTTAATAACTTTAGGAGCTGTCATGGCTCTCTGTTCAGCTCTAATGGGTT
CCCTTCTCCCTCAGCCGCGAATTCTGATGGCAATGGCTAGGGATGGTCTGCTGCCTTCTC
TTTTCTCAGATGTTAATAGACGTACTCAGGTTCCTGTTAAAGCGACTCTAGCAACTGGGT
TTTGCGCTGCAACCTTGTCCTTCTTTTTGGATGTTTCACAGCTCGCAGGCATGGCGAGTG
TTGGCACACTTTTGGCATTTACAATGGTGGCAATATCAGTGTTGATACTCAGATTTGTTC
CTCCGGATGAGCTACCTCTTCCGTCATCTCTTCAACAGAGAATTGATTCTGTTTCCTTCA
TATCTGGTGAAACAAAGCCATCCGATCATGTTGGCACTTCTAGTAACAGTTCCAAACAAC
CGTTAATTGGCGAGAATGATGCTTCGGTTATGGAGAAGCAAGAAGCTCTTGGATTCTGGG
TTCTGAGCGAAGAGAACAGAAGGAAGGTCGCTGGATGGAGCATTATGTTCACTTGTATTG
GGGCCTTCCTTCTAAGTTATTCGGCGTCAAGCCTCAACTTCCCAGGGTTTATTAGATATC
CACTGTGTGGTGTTGGTGGAAGTCTCCTCCTTGCTGGTTTGATTGCTCTGAGTTCTATAG
ATCAGGATGATGCCAGACACACTTTTGGACATTCTGGAGGTTTTATATGCCCGTTAGTGC
CACTCCTGCCAATCATATGCATCCTCATCAACATGTACCTTTTGGTAAACCTTGGATCTG
CGACATGGGCTCGTGTATCTGTGTGGCTGGTGATTGGAGTGTTGGTGTATGTTTTCTACG
GAAGAAAACA*CAGCTCTCTGGCTAATGCAGTTTACGTAACTACAGCTCATGCGGAAGAG
ATGTATCGTGAACATGGAGCTTCTTTGGCATAGTCTGTCAACTCTTTTGTAACAAAAGCT
GTACTGTTATTTTGATTTGGATGAAACAAAGACTGGCGTAATCACCTCTCAAACACTTTG
TAAATAACATTATATATATGTATAATTCATCATAAATTCATAATCAGGAAAGACCATCTT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR4DN57TF U 1
AF RR4DN57JQ C 305
AF RR4BL82JQ C 442
AF RR4BL82TF U 442
BS 1 627 RR4DN57TF
BS 628 628 RR4BL82TF
BS 629 725 RR4DN57TF
BS 726 726 RR4BL82TF
BS 727 763 RR4DN57TF
BS 764 764 RR4BL82TF
BS 765 780 RR4DN57TF
BS 781 1143 RR4BL82TF

RD RR4DN57TF 780 0 0
GCTATGCCATGGATCCTGACACTCCCATATCCTCTGCGTTTGCTAGTCACGACATGCAAT
GGGCTGTATACTTAATAACTTTAGGAGCTGTCATGGCTCTCTGTTCAGCTCTAATGGGTT
CCCTTCTCCCTCAGCCGCGAATTCTGATGGCAATGGCTAGGGATGGTCTGCTGCCTTCTC
TTTTCTCAGATGTTAATAGACGTACTCAGGTTCCTGTTAAAGCGACTCTAGCAACTGGGT
TTTGCGCTGCAACCTTGTCCTTCTTTTTGGATGTTTCACAGCTCGCAGGCATGGCGAGTG
TTGGCACACTTTTGGCATTTACAATGGTGGCAATATCAGTGTTGATACTCAGATTTGTTC
CTCCGGATGAGCTACCTCTTCCGTCATCTCTTCAACAGAGAATTGATTCTGTTTCCTTCA
TATCTGGTGAAACAAAGCCATCCGATCATGTTGGCACTTCTAGTAACAGTTCCAAACAAC
CGTTAATTGGCGAGAATGATGCTTCGGTTATGGAGAAGCAAGAAGCTCTTGGATTCTGGG
TTCTGAGCGAAGAGAACAGAAGGAAGGTCGCTGGATGGAGCATTATGTTCACTTGTATTG
GGGCCTTCCTTCTAAGTTATTCGGCGTTAAGCCTCAACTTCCCAGGGTTTATTAGATATC
CACTGTGTGGTGTTGGTGGAAGTCTCCTCCTTGCTGGTTTGATTGCTCTGAGTTCTATAG
ATCAG*ATGATGCCAGACACACTTTTGGACATTCTGGAGGTTT*ATATGCCCGTTAGTGC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4DN57JQ 785 0 0
GCACAC
TTTGGCATTTACAATGGTGGCAATATCAGTGTTGATACTCAGATTTGT*CCTCCGGATGA
GCTACCTCTTCCGTCATCTCTTCAACAGAGAATTGATTCTGTTTCCTTCATATCTGGTGA
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CGAGAATGATGCTTCGGTTATGGAGAAGCAAGAAGCTCTTGGATTCTGGGTTCTGAGCGA
AGAGAACAGAAGGAAGGTCGCTGGATGGAGCATTATGTTCACTTGTATTGGGGCCTTCCT
TCTAAGTTATTCGGCGTTAAGCCTCAACTTCCCAGGGTTTATTAGATATCCACTGTGTGG
TGTTGGTGGAAGTCTCCTCCTTGCTGGTTTGATTGCTCTGAGTTCTATAGATCAGGATGA
TGCCAGACACACTTTTGGACATTCTGGAGGTTTTATATGCCCGTTAGTGCCACTCCTGCC
AATCATATGCATCCTCATCAACATGTACCTTTTGGTAAACCTTGGATCTGCGACATGGGC
TCGTGTATCTGTGTGGCTGGTGATTGGAGTGCTGGTGTATGTTTTCTATGGAAGAAAAAA
ACAGCTCTCTGGCTAATGCAGTTTACGTAACTACAGCTCATGCGGAGGATATATATCGTG
AACATGGAGCTTCTTTGGCATAGTTTGTCAACTCTTTTGTAACAAAAGCTGTACTGTTAT
TTTGATTTGGATGAAACAAAGTCTTGCGTAATCACCTCTCAAACACTTTGTAAATAACA

QA 7 785 7 785
DS 

RD RR4BL82JQ 702 0 0
G
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TTTTGGACATTCTGGAGGTTTTATATGCCCGTTAGTGCCACTCCTGCCAATCATATGCAT
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QA 2 702 2 702
DS 

RD RR4BL82TF 702 0 0
G
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TTCGGTTATGGAGAAGCAAGAAGCTCTTGGATTCTGGGTTCTGAGCGAAGAGAACAGAAG
GAAGGTCGCTGGATGGAGCATTATGTTCACTTGTATTGGGGCCTTCCTTCTAAGTTATTC
GGCGTCAAGCCTCAACTTCCCAGGGTTTATTAGATATCCACTGTGTGGTGTTGGTGGAAG
TCTCCTCCTTGCTGGTTTGATTGCTCTGAGTTCTATAGATCAGGATGATGCCAGACACAC
TTTTGGACATTCTGGAGGTTTTATATGCCCGTTAGTGCCACTCCTGCCAATCATATGCAT
CCTCATCAACATGTACCTTTTGGTAAACCTTGGATCTGCGACATGGGCTCGTGTATCTGT
GTGGCTGGTGATTGGAGTGTTGGTGTATGTTTTCTACGGAAGAAAACA*CAGCTCTCTGG
CTAATGCAGTTTACGTAACTACAGCTCATGCGGAAGAGATGTATCGTGAACATGGAGCTT
CTTTGGCATAGTCTGTCAACTCTTTTGTAACAAAAGCTGTACTGTTATTTTGATTTGGAT
GAAACAAAGACTGGCGTAATCACCTCTCAAACACTTTGTAAATAACATTATATATATGTA
TAATTCATCATAAATTCATAATCAGGAAAGACCATCTTCCC

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 4

CO CL1882Contig1 676 4 8 U
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CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TAT*TATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGATTCCGAAGTCTGAGTATTGGAGA
TACACTACGTGTCTTT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
0 0 0 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E462TF U 2
AF RR4EC93TF U 1
AF RR4FG63TF U 1
AF RR4GQ87TF U 1
BS 1 227 RR4EC93TF
BS 228 228 RR4FG63TF
BS 229 543 RR4EC93TF
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RD RR4E462TF 569 0 0
GA
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****AAGGGGCTTCAATCATCTCTATC

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR4EC93TF 619 0 0
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TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
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QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4FG63TF 622 0 0
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****AAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAA
AGTGGAACCTCCTTAT
GAA

QA 4 619 4 619
DS 

RD RR4GQ87TF 676 0 0
GGA
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DS 



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BQ
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AF RR4BS45TF C 665
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DS 

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CAAAAGGGGAACCAAATTCACAAGTATAGGCTCTTTTAAACTCAACTCCCCTCTCAGACG
AC

QA 6 667 6 667
DS 



AS 1 5

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AAAAAATCAGATCTTCTCTGTACTCAGCAAAGATCGTCTCCCTCAAACGATGAAACTCGC
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AAAGATACAAATTTTGAAAGAGAACCAAGAGAAATTATAAAG

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AAGATTTAGCGAGCATCTCATTCTCATAAATTAAAGACAAATCTCTTATCAGTTCCCGCA
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CTCTCTCTCGATGAGTGATCTCTTCGATTAGGATTTGATGGTTTCGAAAGAGACCAGAGA
ATGTTTCTTGATGGAGATCGCCTTTCTCGACGTCGTGCTCTGACTCAACTTTTCGTCGTG
TCCAGAGAATGCTTGATTCGCAATGAACGGCTCCTCTCTCAATCAATCAAAAGGGATTCT
CTCTCTGGCGATTTCTCAAAGATCTGAATGAAGGAAAGATACAAATTTTGAAAGAGAACC
AAGAGAAATTATAAAGAAGATCTTCAAGAATCCGATTTTCAGAAATCCCTTTTAATCGCC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

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GCGAATCCCAAACCTCACCTCTTCTCTCTCTCCTTCTTCTCACTTCTCCTTCTCCACATC
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AACAAACAGTTCGTCTCTTCGAACCGTGTCGACGCTAGCTTTCCTCCCTATGGAATGACT
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TTCATGGGTATTCCTCACATCCCTCCGATTCTCAAGGGCACTGCGGACTTCTCTCACGGA
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TCACAACAAGTGATCAAGTTCTCGGACAGCAAGAACAAGTGGTCAGCTCAAGCACGTTCT
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CCATTAGGTTGCTTACCAGCCGTGAAACAAGCCAACGGAAACGTTCAGGAATGCGTGAGG
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AGAGTTATCAATTCCAAGACCTACACATTTGAGACGGGAATGGCAGCTTGTTGTGGAACC
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TGGGGAGCCGATCCGGAAGTGGTTGGACCGAACAATCTCAGGGAGCTTCTTTTCCTTCCT
CTGAATGTTACAGTCACGTTGGCTGAGATACAGGAAGCTATGGCTGCAATGAGCCCGAAG
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BQ
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10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BB46TF U 1
AF RR4DB48TF U 737
AF RR4BB46JQ C 539
BS 1 716 RR4BB46TF
BS 717 747 RR4BB46JQ
BS 748 1209 RR4DB48TF
BS 1210 1210 RR4BB46JQ
BS 1211 1349 RR4DB48TF
BS 1350 1425 RR4BB46JQ

RD RR4BB46TF 716 0 0
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TCACAACAAGTGATCAAGTTCTCGGACAGCAAGAACAAGTGGTCAGCTCAAGCACGTTCT
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CCATTAGGTTGCTTACCAGCCGTGAAACAAGCCAACGGAAACGTTCAGGAATGCGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DB48TF 613 0 0
GGGATTTGCAT
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ACTAACAATGTGTGCACTAAGCCTGGAGATTATCTCTTCTTTGACGGTAAGCATTTGACG
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CCGAACAATCTCAGGGAGCTTCTTTTCCTTCCTCTGAATGTTACAGTCACGTTGGCTGAG
ATACAGGAAGCTATGGCTGCAATGAGCCCGAAGCAGATCAAAATAGAGAGTCTTTATGAT
ATCAAGATGCAGTCGGAGATGGAGAATCAATGGCTTTCTCTATTTGACAAGGCTGTCTCC
TTCCTGCTCTAAGATTGTGTTACACTATGTGATCAAAGCTTAAAAGGGAGCTATTCTACT
AAAAAATAAATAAGACAACTGTTTGAGTGTGTTTTTGCAATAAATAACGTGGACGTTGTT
TG

QA 12 613 12 613
DS 

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ATATCC
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GACAACTCCGTGGCTTCCAGTACTCGTTTTACGACTTCTATAGCTCGATCCAACACAGAG
TTATCAATTCCAAGACCTACACATTTGAGACGGGAATGGCAGCTTGTTGTGGAACCGGGT
CTGTCAATGGAACCAGTTGTTCGACTAACAATGTGTGCACTAAGCCTGGAGATTATCTCT
TCTTTGACGGTAAGCATTTGACGCAAGAAGGGAACCTTCAGGTTGGCCATTTGATGTGGG
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ATGTTACAGTCACGTTGGCTGAGATACAGGAAGCTATGGCTGCAATGAGCCCGAAGCAGA
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CAATAAATAACGTGGACGTTGTTTGTTCGGTTTGGTTTGACTTTATTTGGATTTAGAGCT
TTTGGGAGTATAACTCTGAGCTCTGAATTCATAATTAATAA

QA 7 887 7 887
DS 



AS 1 4

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GCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCT
TTGGCACAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTG
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CTAGTGTTTTGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AJ92JQ C 9
AF RR4AJ92TF U 9
AF RR4CL74JQ C 1
AF RR4CL74TF U 1
BS 1 10 RR4CL74TF
BS 11 508 RR4AJ92TF
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BS 511 586 RR4AJ92TF
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GG
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TGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTG

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR4AJ92TF 578 0 0
GG
ATAGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGAACATGG
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TGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCGTCTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCG
CGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACT
TGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCG
TCGACAAGTACGGTGCCAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAAGACGAGTGGT
CAGCAAGTGGTGACGTTTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACAC
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AAAATCTTGAAAGTGTGT**ACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTGTTCTGTTCTA
TGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTG

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR4CL74JQ 612 0 0
GGGCGAGAACATAGAGATCGAGATCGAGAGAGAG**AAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGA
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CTAGTGTTTTGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4CL74TF 612 0 0
GGGCGAGAACATAGAGATCGAGATCGAGAGAGAG**AAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGA
GAGAACATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACG
GTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCGTCTCCTTCTTCCTTC
AGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGC
AGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTT
TACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCCAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAA
GACGAGTGGTCAGCAAGTGGTGACGTTTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGG
GCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCT
TTGGCACA**AAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTG
TTCTGTTCTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATATATAAGACCT
CTAGTGTTTTGT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL1887Contig1 1122 4 5 U
CGAATACCTTACCCCATCCATCTAGAAATCTTGGTTCAAACCCTACGTTACCGGGTAAAA
GATGCCTCTTCTTTGCATTTTTTTCGGTTCTGTCTATACGAGTATTGCAATTGGAAGAAT
TTTGATAGTAAAAAAAAATCAATTTTGAATCCAAGATTTTTATTGTTCTTATATAATTCT
TATGTATATGAATACGAATCCATCTTTTTTTTTCTACGCAAGCAGTCTTCTCATTTACGA
TCGACATCTTATGACGTCTTTTTTGAGCGAATTTTTTTCTATGGAAAAATACAACATTTT
TTAAAAGTCTTTGTTAATAAATTTCCGGCGCTTTTAGGGTTGTTCAAGGATCCTTTCCTA
CATTATGTTAGATATCATGGAAAATACATTCTGGCAACAAAGGATACGCCACTTCTGATG
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TCGCAAAAGGTTAATATAAATCAATTATCTAAAGATAATTTAGAATTTCTGGGTTATCTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A820JQ C 467
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AATGCGGAGATAAC

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TTCTGGGTTATCTCTCAAGTTTGCGACTAAATCCTTTAGTGGTACGTAGTCAAATGCTAG
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AGGCTCCATAAATTAAATCAAAATTTATCAGAACGTAAACGGAATGCGGAGATAAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 4

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GAGTGATCAATAACTCTCCTCGATACCGTGTATGCGTCGGATTCTTCTACGAGATCAACT
TTGATGCGATGGCTGAACCATTGGATATCTTCAAAGGCCCGGGAAATAAAAGATCTCAAG
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ATTCAATGGAAAACATTTAGTTTGATTGGTTGGGCTTTCAATTGCAATTTTTTTATCTGG
ATTTCTAGTTCTAATAAAAAAACATTACTAAACG


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30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E589TF U 1
AF RR4C683TF U 1
AF RR4B094TF U 1
AF RR4B094JQ C 302
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BS 724 804 RR4B094TF
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AGCTCTTGGGGGATCACCTTATGAATTTGAGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTGGAT
AATGCGTATTATTGGTTATCCAGGTGTAAACCAAGAAAATGTTATCGGATGTGGAGCTCA
CACTGACTATGGCTTGTTGTCGCTAATAAATCAAGATGATGATAAA
CTGCTCT

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B522JQ U 8
AF RR4B522TF C 8
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AF RR4AM90JQ U 1
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C

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C

QA 1 569 1 569
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DS 



AS 1 5

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
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QA 1 542 1 542
DS 

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CACACCAATCACATTTTCACACCAACACAAACAAGCAATAATTCATTGAATGATACAACA
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QA 1 542 1 542
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QA 1 542 1 542
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CACACCAATCACATTTTCACACCAACACAAACAAGCAATAATTCATTGAATGATACAACA
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ACCCACTGGAGGCAAAGGAGTATGAAAGTGGTGAGACCAATCCACGAGTGAAGAGAGACC
ATGTCTTTAAGGTTTAATTTGTCGTGGAATCTAAAAGCGGCGCAGATTCCGACGATACCT
AC

QA 1 542 1 542
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GGCCCAATTAGATATCACACCAATCACATTTTCACACCAACACAAACAAGCAATAATTCA
TTGAATGATACAACAAAGAAAGATTAATTAAACGGCAGACTAATTAATATAGGAATCCAT
CAAGTGTAACGGCCAAGAGCGACGGAAAAATCGACAGAAACGCCAAAGAGTAAAATGGCT
AAGCCGGTGAAGTTAATGAGGCGTGACTCAGCGCTTGTGCTCTGACCAAGCATCGTGGCT
CTCTGCATGAGTCCGGTAAGTGCCGCGACAATACCCATATAAAGTAGAGCCCGACCACCT
AAGACGTGCCACGGCATCATCCTCGTTCTTGTCCCTGATGAAGATTGTGGCGCAAGGAAT
GTGAATGCGCCGAGCACCCACTGGAGGCAAAGGAGTATGAAAGTGGTGAGACCAATCCAT
GAGTGAAGAGAGACCATGTCTTTAAGGTTTAATTTGTCGTGGAATCTAAAAGCGGCGCAG
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TACTCGATGCCTTCACGGTAATGGAGAAGCCATATGAGCATTAGAATCACGGCTAAGATG
CCAAAGAATGAGCCACAAGTGTCGAAAGCGACGAGTGACGCTTAA

QA 1 825 1 825
DS 



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TTGCAAGAGACATATCTTATTCTATAATATTTAGAGTTTCAGACTATTTCTTACGTATTA
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CAGCAGGAGCGCTCTCGAGACCATAAGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTC
GTATATAGGGAAGCACAAACTCCAAGAACTCCGAGTATTTGGGCAAGTAATCGATGGTGT
TAAACCCTTGAATACGTATACGTTTGTAGGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAG
GAACCTGCAGATTGTACTGTGAGATCATACCGCATGCTGCGATACGGCCGTGTGGTCTCA
TGTTTAGGATCACTGCGTCCAGCATTTTGCCTCCCACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGC
CTACAGGGAAACACCTCTTTAAGGCAGCGTTGAGATCGTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATG
CATCATCGAATCCAAACTTGTTCTTGAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCATCCGGCGCTTC
CAACGACATAGCAACCCATCAGCTTAGCAAACTGTCCAACAAGCTGACCAACAGCACCTG
ATGCAGCTGACACAAACACAGTCTCTCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCATAAAACCCAG
CATATGCAGTCATACCAGGCATACCAAGAAGACCAGTGTAGTGGGATAAGGGAACATCGG
TATGATGGATCTTGAAGTGAATATTAGGAATAGGAGTGATAACACTGTACTCCTCCCATC
CAACAGCTCCCCAAAGCAAGTCACCTTCTTTGTAATCTGGGTGCCCTGAATCCATCACTT
TAGACACTCCAAACCCTGAGATAGGCTTGCCGGGAACGAAAGACAGAGCAGTAGCGGGAC
TAGAGGGATCAGGCTTTCTCATACGGTTGCGCATGTAAGGATCGCAAGACAAGTAGAGAT
TTTTACCAACGCTGTCATTGATCCAGCCGGTACCTTAAGATTTACGGTGGTAGAGTTGTT
GATCACAAGGTCGGATTCGCTGAGGAATCCAGTAACGTAGTCTCTGAAGATGACTTGCTT
GTTGCTCGTTACCATCGTCTCCATTACTCCTAGATGTCTTTTTTTTTCTTGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY49TF C 356
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AF RR4AB03JQ U 93
AF RR4AB03TF C 543
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GCTTCCAACGACATAGCAACC

QA 1 321 1 321
DS 

RD RR4H723JQB 770 0 0
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TTGCAAGAGACATATCTTATTCTATAATATTTAGAGTTTCAGACTGTTTCTTACGTATTA
GACAAGAAAACAAGACCATATAGTTCAACAGTTTGGTACTTCTCAGTCAAGGTCACGAGA
A*******ACCACGACAAGCTGTTTCCCAACGTTCTTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCG
CAGCAGGAGCGCTCTCGAGACCATAAGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTC
GTATATAGGGAAGCACAAACTCCAAGAACTCCGAGTATTTGGGCAAGTAATCGATGGTGC
TAAACCCTTGAATACGTATACGTTTGTAGGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAG
GAATCTGCAGATTGTACTGTGAGATCATACCACATGCTGCGATACGGCCGTGTGGTCTCA
TGTTTAGGATCACTGCGTCTAGCATTTTGCCTCCTACGTTCTCAAAGTATATGTCAACGC
CTACAGGGAAACACCTCTTTAAGGCAGCGTTGAGATCGTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATG
CATCATCAAATCCAAACTTGTTCTTGAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCTTCCGGCGCTTC
CAACGACGTAGCAACCCATCAGCTTAGCAAACTGTCCAACAAGCTGACCAACAGCACCAG
ATGCAGCTGACACAAACACAGTCTCTCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4AB03JQ 880 0 0
GGGGGTTT
AGACTATTTCTTACTTATTACACAAGAAAACAAGACCATATAGTTCAACAGTTTGGTACT
TCTCAGTCAAGGTCACGAGAACGGAGAAACCACGACAAGCTGTTTCCCAACGTTCTTACC
ATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAGCGCTCTCGAGCCCGTCAGCAACATCTTCCAC
GTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGGGAAGCACAAACTCCAAGAACTCCGAGTATTT
GGGCAAGTAATCGATGGTGTTAAACCCTTGAATACGTATACGTTTGTAGGTAATGAGCCA
GAGGTTGTATACTGCTTCAGGAACCTGCAGATTGTACTGTGAGATCATACCGCATGCTGC
GATACGGCCGTGTGGTCTCATGTTTAGGATCACTGCGTCCAGCATTTTGCCTCCCACGTT
CTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGAAACACCTCTTTAAGGCAGCGTTGAGATCGTT
TTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATCATCGAATCCAAACTTGTTCTTGAGAAGATCAACCTT
TTCTTTGCATCCGGCGCTTCCAACGACATAGCAACCCATCAGCTTAGCAAACTGTCCAAC
AAGCTGACCAACAGCACCTGATGCAGCTGACACAAACACAGTCTCTCCTTTCTTTGGTGA
ACAGATCTCATAAAACCCAGCATATGCAGTCATACCAGGCATACCAAGAAGACCAGTGTA
GTGGGATAAGGGAACATCGGTATGATGGATCTTGAAGTGAATATTAGGAATAGGAGTGAT
AACACTGTACTCCTCCCATCCAACAGCTCCCCAAAGCAAGTCACCTTCTTTGTAATCTGG
GTGCCCTGAATCCATCACTTTAGACACTCCAA

QA 9 880 9 880
DS 

RD RR4AB03TF 715 0 0
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TCATCGAATCCAAACTTGTTCTTGAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCATCCGGCGCTTCCA
ACGACATAGCAACCCATCAGCTTAGCAAACTGTCCAACAAGCTGACCAACAGCACCTGAT
GCAGCTGACACAAACACAGTCTCTCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCATAAAACCCAGCA
TATGCAGTCATACCAGGCATACCAAGAAGACCAGTGTAGTGGGATAAGGGAACATCGGTA
TGATGGATCTTGAAGTGAATATTAGGAATAGGAGTGATAACACTGTACTCCTCCCATCCA
ACAGCTCCCCAAAGCAAGTCACCTTCTTTGTAATCTGGGTGCCCTGAATCCATCACTTTA
GACACTCCAAACCCTGAGATAGGCTTGCCGGGAACGAAAGACAGAGCAGTAGCGGGACTA
GAGGGATCAGGCTTTCTCATACGGTTGCGCATGTAAGGATCGCAAGACAAGTAGAGATTT
TTACCAACGCTGTCATTGATCCAGCCGGTACCTTAAGATTTACGGTGGTAGAGTTGTTGA
TCACAAGGTCGGATTCGCTGAGGAATCCAGTAACGTAGTCTCTGAAGATGACTTGCTTGT
TGCTCGTTACCATCGTCTCCATTACTCCTAGATGTCTTTTTTTTTCTTGTTATCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

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TGATGAAAACGACCAAGGCAGAGGAGGAGATGATGAAAACGACCAAGGCAGAGGAGAAGA
CGACGAAAACGACCAAGGCAGAGGAGGAGTTGATGCAGGCGAAGATGCACCGTGAGATTA
CGAAGCTCGATGATGAGAAGCTTTGGGCAGAGTTTGAACCGTTGGAAATCGATAAGATCG
AGAGTGGTGAAATCAAACCCAAGACCTTGATCACCAATCGTGGTCGGTTCCACTCTCCGC
TATTTCGTAAGAGGGAACCTATAATTGTAAAGGAGATGCTCTCAG*GTTCCCTAATTCTA
CTTACATTAAGTGGAAGAGAAGGTGGAATCCCGACTCGGTAAAAGACCTGATGGTAATAG
CAAAAGAGAGAGAGTGTACGTCTCTCGTTCTCGTCGATGCAAACCCTTTGGGACATGATG
AAATATGTATTGTAAGCTTGTTGAATGGTGCTGCCGCTTATTTCAGGGTTTGTAATCACA
TCCCGCGTGAGGATATACCGGATCAAGCAAACGCCCCGAAATGCCTCCTCGATCCTTATG
TTCATATGGCACTTTTTACATCTCAGGCCGGTCTTGGCCTTAGCAGATTGATACAATCAC
TCTTCCCCAAGGCCCCCACTAATTCCAGAACCAGCAAACCCTGTCGAAAGAACGCTGCAC
TTTTCCAGTACAAAGATGGTTTTGTCTTTTACCGACATCATTGGCTCCACTCTGAGAAAG
CAGCCGTTTCAGAAGAAAGGCCAAAGCTCACCTGGAAGGAAGTTGGACCTCGTTTCCAAC
TCTTGTTTCTAGGTGTGAAGAAGGTACCACTTGTCACGGGGAATTTCAAACTTATCTGCA
TGCCTCGCCCCTCTCACTATTGCTGCCCACAACGTCACCTTATGATTCCGCCTATTTAGA
TGCTCTCTCCATGTTTTTATTTTTTCTGTGCAACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FZ58TF U 265
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CAAAAGAGAGAGAGTGTACGTCTCTCGTTCTCGTCGATGCGAACCCTTTGGGACATGATG
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TTCATATGGCACTTTTTACATC

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G
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G
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TGTAAAGGAGATGCTCTCAG*GTTCCCTAATTCTACTTACATTAAGTGGAAGAGAAGGTG
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CGTTCTCGTCGATGCAAACCCTTTGGGACATGATGAAATATGTATTGTAAGCTTGTTGAA
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AGCAAACGCCCCGAAATGCCTCCTCGATCCTTATGTTCATATGGCACTTTTTACATCTCA
GGCCGGTCTTGGCCTTAGCAGATTGATACAATCACTCTTCCCCAAGGCCCCCACTAATTC
CAGAACCAGCAAACCCTGTCGAAAGAACGCTGCACTTTTCCAGTACAAAGATGGTTTTGT
CTTTTACCGACATCATTGGCTCCACTCTGAGAAAGCAGCCGTTTCAGAAGAAAGGCCAAA
GCTCACCTGGAAGGAAGTTGGACCTCGTTTCCAACTCTTGTTTCTAGGTGTGAAGAAGGT
ATCACTTGTCACGGGGA*TTTCAAACTTATCTGCATGCCTCGCCCCTCTCACTATTGCTG
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CTGTGCA
CAAA

QA 2 728 2 728
DS 

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TGTAATCACATCCCGCGTGAGGATATACCGGATCAAGCAAACGCCCCGAAATGCCTCCTC
GATCCTTATGTTCATATGGCACTTTTTACATTTCAGGCCGGTTTTGGCCTTAGCAGATTG
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CGTTTCCAACTCTTGTTTTTAGGTGTGAAGAAGGTACCACTTGTCACGGGGAATTTCAAA
CTTATTTGCATGCCTCGCCCCTCTCACTATTGCTGCCCACAACGTCACCTTATGATTCCG
CCTATTTAGATGCTCTCTCCATGTTTTTATTTTTTCTGTGCAACAAAAA

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 5

CO CL1894Contig1 994 5 6 U
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TAATGGCTGCCTCAACCATGGCTCTGTCCTCCCCTGCCTTCGCCGGAAAGGCCGTGAAGC
TCTCACCAGGAGCCTCCGAAGTCTTTGGAACCGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCA
AACCCACCGGTCCATCAGGCTCCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTC
CATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGTGACTACGGGTGGG
ACACCGCCGGTCTATCAGCCGACCCCGAGACTTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTA
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GTAACGGAGTGAAGTTCGGTGAAGCCGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCGCAGATCTTCAGCG
AAGGAGGACTTGACTACTTGGGTAACCCGAGCCTTGTCCATGCTCAGAGCATCTTAGCCA
TTTGGGCTACTCAG*TGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTCGCCGGAGAGG
GACCGTTGGGAGAGGCAGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGCAGCTTCGACCCATTGGGCC
TCGCTACCGACCCAGAGGCTTTCGCCGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGGAAGGT
TGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAGGCTATTGTCACCGGAAAGGGACCGT
TGGAGAATCTCGCTGACCATTTGGCTGACCCAGTCAACAACAACGCATGGGCCTTCGCCA
CCAACTTCGTCCCCGGAAAGTGAACGAGTTAAAGCTTATGTGAGTGAGAGACAGAGAAAG
AGAAGTTTGTTTGTGATCTTTCCTATGTAAACTTGTTGCAATTTCCTTTGTCGTATCTTT
GTATGATTCATCAGAAATCGAACCTCTTTTTCTC


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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G050TF U 1
AF RR4CW47TF U 1
AF RR4DW91TF U 1
AF RR4DW91JQ C 275
AF RR4G050JQ C 349
BS 1 205 RR4CW47TF
BS 206 206 RR4G050TF
BS 207 639 RR4CW47TF
BS 640 640 RR4DW91TF
BS 641 690 RR4CW47TF
BS 691 994 RR4DW91JQ

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TCTCACCAGGAGCCTCCGAAGTCTTTGGAACCGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCA
AACCCACCGGTCCATCAGGCTCCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTC
CATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGTGACTACGGGTGGG
ACACCGCCGGTCTACCAGCCGACCCCGAGACTTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTA
TCCACTGCAGATGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCTTGGCTC
GTAACGGAGTGAAGTTCGGTGAAGCCGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCGCAGATCTTCAGCG
AAGGAGGACTTGACTACTTGGGTAACCCGAGCCTTGTCCATGCTCAGAGCATCTTAGCCA
TTTGGGCTACTCAG*TGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTCGCCCGAGAGG
GACCGTTGGGAGAGGCAGAGGACTTGCTTTACC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4CW47TF 692 0 0
GGACTCTCACCCAGTCACACAAAAAAAAAACATAAAATCAACAAAAAAGAAGAAAAGTTC
TAATGGCTGCCTCAACCATGGCTCTGTCCTCCCCTGCCTTCGCCGGAAAGGCCGTGAAGC
TCTCACCAGGAGCCTCCGAAGTCTTTGGAACCGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCA
AACCCACCGGTCCATCAGGCTCCCCGTGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTC
CATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGTGACTACGGGTGGG
ACACCGCCGGTCTATCAGCCGACCCCGAGACTTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTA
TCCACTGCAGATGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCTTGGCTC
GTAACGGAGTGAAGTTCGGTGAAGCCGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCGCAGATCTTCAGCG
AAGGAGGACTTGACTACTTGGGTAACCCGAGCCTTGTCCATGCTCAGAGCATCTTAGCCA
TTTGGGCTACTCAG*TGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTCGCCGGAGAGG
GACCGTTGGGAGAGGCAGAGGACTTGCTTTACCCAGGAG*CAGCTTCGACCCATTGGGCC
TCGCTACCGACCCAGAGGCTTTCGCCGAGT
GA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4DW91TF 690 0 0
GGACTCTCACCCAGTCACACAAAAAAAAA*CATAAAATCAACAAAAAAGAAGAAAAGTTC
TAATGGCTGCCTCAACCATGGCTCTGTCCTCCCCTGCCTTCGCCGGAAAGGCCGTGAAGC
TCTCACCAGGAGCCTCCGAAGTCTTTGGAACCGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCA
AACCCACCGGTCCATCAGGCTCCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTC
CATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGTGACTACGGGTGGG
ACACCGCCGGTCTATCAGCCGACCCCGAGACTTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTA
TCCACTGCAGATGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCTTGGCTC
GTAACGGAGTGAAGTTCGGTGAAGCCGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCGCAGATCTTCAGCG
AAGGAGGACTTGACTACTTGGGTAACCCGAGCCTTGTCCATGCTCAGAGCATCTTAGCCA
TTTGGGCTACTCAG*TGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTCGCCGGAGAGG
GACCGTTGGGAGAGGCAGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGCAGCTTCGACCCATTGGGCC
TCGCTACCGACC*AGAGGCTTTCGCCGAGT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4DW91JQ 720 0 0
AGAGTTCCCCGGTGACTACGGGTGGGACACCGCCGGTCTATCAGCCGACCCCGAGACTTT
CGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTATCCACTGCAGATGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGG
CTGTGTTTTCCCTGAGCTCTTGGCTCGTAACGGAGTGAAGTTCGGTGAAGCCGTTTGGTT
CAAGGCCGGTTCGCAGATCTTCAGCGAAGGAGGACTTGACTACTTGGGTAACCCGAGCCT
TGTCCATGCTCAGAGCATTTTAGCCATTTGGGCTACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGT
TGAGGGTTACAGAGTCGCCGGAGAGGGACCGTTGGGAGAGGCAGAGGACTTGCTTTACCC
AGGAGGCAGCTTCGACCCATTGGGCCTCGCTACCGACCCAGAGGCTTTCGCCGAGTTGAA
GGTGAAGGAGATCAAGAACGGAAGGTTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCA
GGCTATTGTCACCGGAAAGGGACCGTTGGAGAATCTCGCTGACCATTTGGCTGACCCAGT
CAACAACAACGCATGGGCCTTCGCCACCAACTTCGTCCCCGGAAAGTGAACGAGTTAAAG
CTTATGTGAGTGAGAGACAGAGAAAGAGAAGTTTGTTTGTGATCTTTCCTATGTAAACTT
GTTGCAATTTCCTTTGTCGTATCTTTGTATGATTCATCAGAAATCGAACCTCTTTTTCTC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4G050JQ 646 0 0
AGCTAGAAGTTATCCACTGCAGATGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTG
AGCTCTTGGCTCGTAACGGAGTGAAGTTCGGTGAAGCCGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCGC
AGATCTTCAGCGAAGGAGGACTTGACTACTTGGGTAACCCGAGCCTTGTCCATGCTCAGA
GCATCTTAGCCATTTGGGCTACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAG
TCGCCGGAGAGGGACCGTTGGGAGAGGCAGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGCAGCTTCG
ACCCATTGGGCCTCGCTACCGACCCAGAGGCTTTCGCCGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCA
AGAACGGAAGGTTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAGGCTATTGTCACCG
GAAAGGGACCGTTGGAGAATCTCGCTGACCATTTGGCTGACCCAGTCAACAACAACGCAT
GGGCCTTCGCCACCAACTTCGTCCCCGGAAAGTGAACGAGTTAAAGCTTATGTGAGTGAG
GGACAGAGAAAGAGAAGTTTGTTTGTGATCTTTCCTATGTAAACTTGTTGCAATTTCCTT
TGTCGTATCTTTGTATGATTCATCAGAAATCGAACCTCTTTTTCTC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 2 5

CO CL1895Contig1 968 3 2 U
CTTTACAAACACAAGTGTTTCATTTTTATTACAAAATGTGTTACATGGTTGATGGTTTTT
GCAAAACTACAAACCTTTTTGGTATTATACAAGATGAGCCTATGTTACAGCTTCTTTATT
CTCACACATTTTAGTATAAAAACATATTCTACATAGGAAGGAGACTTACCCAACCTCGCA
AACCAATATTATACAATAGTTATTGGATGTTAGGGAGATGATACTAACAGTGACAACCTT
CATGGTTCCAGTGCAACCCCTTGGCTGCAATCAACTCCAATCTCTGAGAATGCTTCGACG
AGTTTTGGGTAGAGTTTAGTAAGCATGATCTTGAAACCGGTGGAGTTTGTGGTTGAGCTC
TCCTGCAGTTTCGATGATGATCCTACAGGGACGCCTTCCATGTAAGCCTTGCACGCAGCA
AGGACATGCTGAGCACGTTGCGTGAAGTGGTCCTTCACAAGCACCTCAAAAAGCTTTGGA
GGCTTACGGAGCAACGAGATCATGAATTTGCAGGTGATGAGGAAAGCATTCTCATTGTAA
CTCACTGAGTTTTTCTCTCCCTCAGCTCGGCCCAACTGCTTATCGTAGCCAGCTTCGTTG
AAGTAAGGCTTCTCATTCAGAACAAGAGCCTGAAACGAGAGAAGGACTTGAAGGATGGAG
GAGCTCCCTGGGCTCCACACTTCAGTGCCAGAGCCATTCCATGTGTTCAGCAGACTCAGG
CAGACTCTTCCTGACTCGTACAGATTAGGATTCAGTCGCATCCCACCTGAATGATAGTGT
ACCATTGGTGGCTCATGAGGATACAGTGGTGGAAGCATTATGTCGAAGAAGAATAGTCCA
TCATGGTATGGTGTTCCAGGTGCACCAACAAGGGCTGCACGAATAAGGTCCATCCTTTCT
TCATACACACGCACGTATATTGTGTTGGGAAGATCTGCCTCCAAATTGCTCCATTCTTGC
TGGACTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW83JQ U 1
AF RR4B180JQ U 1
AF RR4AW39TF C 264
BS 1 824 RR4AW83JQ
BS 825 968 RR4AW39TF

RD RR4AW83JQ 824 0 0
CTTTACAAACACAAGTGTTTCATTTTTATTACAAAATGTGTTACATGGTTGATGGTTTTT
GCAAAACTACAAACCTTTTTGGTATTATACAAGATGAGCCTATGTTACAGCTTCTTTATT
CTCACACATTTTAGTATAAAAACATATTCTACATAGGAAGGAGACTTACCCAACCTCGCA
AACCAATATTATACAATAGTTATTGGATGTTAGGGAGATGATACTAACAGTGACAACCTT
CATGGTTCCAGTGCAACCCCTTGGCTGCAATCAACTCCAATCTCTGAGAATGCTTCGACG
AGTTTTGGGTAGAGTTTAGTAAGCATGATCTTGAAACCGGTGGAGTTTGTGGTTGAGCTC
TCCTGCAGTTTCGATGATGATCCTACAGGGACGCCTTCCATGTAAGCCTTGCACGCAGCA
AGGACATGCTGAGCACGTTGCGTGAAGTGGTCCTTCACAAGCACCTCAAAAAGCTTTGGA
GGCTTACGGAGCAACGAGATCATGAATTTGCAGGTGATGAGGAAAGCATTCTCATTGTAA
CTCACTGAGTTTTTCTCTCCCTCAGCTCGGCCCAACTGCTTATCGTAGCCAGCTTCGTTG
AAGTAAGGCTTCTCATTCAGAACAAGAGCCTGAAACGAGAGAAGGACTTGAAGGATGGAG
GAGCTCCCTGGGCTCCACACTTCAGTGCCAGAGCCATTCCATGTGTTCAGCAGACTCAGG
CAGACTCTTCCTGACTCGTACAGATTAGGATTCAGTCGCATCCCACCTGAATGATAGTGT
ACCATTGGTGGCTCATGAGGATACAGTGGTGGAAGCATTATGTC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4B180JQ 822 0 0
CTTTACAAACACAAGTGTTTCATTTTTATTACAAAATGTGTTACATGGTTGATGGTTTTT
GCAAAACTACAAACCTTTTTGGTATTATACAAGATGAGCCTATGTTACAGCTTCTTTATT
CTCACACATTTTAGTATAAAAACATATTCTACATAGGAAGGAGACTTACCCAACCTCGCA
AACCAATATTATACAATAGTTATTGGATGTTAGGGAGATGATACTAACAGTGACAACCTT
CATGGTTCCAGTGCAACCCCTTGGCTGCAATCAACTCCAATCTCTGAGAATGCTTCGACG
AGTTTTGGGTAGAGTTTAGTAAGCATGATCTTGAAACCGGTGGAGTTTGTGGTTGAGCTC
TCCTGCAGTTTCGATGATGATCCTACAGGGACGCCTTCCATGTAAGCCTTGCACGCAGCA
AGGACATGCTGAGCACGTTGCGTGAAGTGGTCCTTCACAAGCACCTCAAAAAGCTTTGGA
GGCTTACGGAGCAACGAGATCATGAATTTGCAGGTGATGAGGAAAGCATTCTCATTGTAA
CTCACTGAGTTTTTCTCTCCCTCAGCTCGGCCCAACTGCTTATCGTAGCCAGCTTCGTTG
AAGTAAGGCTTCTCATTCAGAACAAGAGCCTGAAACGAGAGAAGGACTTGAAGGATGGAG
GAGCTCCCTGGGCTCCACACTTCAGTGCCAGAGCCATTCCATGTGTTCAGCAGACTCAGG
CAGACTCTTCCTGACTCGTACAGATTAGGATTCAGTCGCATCCCACCTGAATGATAGTGT
ACCATTGGTGGCTCATGAGGATACAGTGGTGGAAGCATTATG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AW39TF 705 0 0
GCTGCAATCAACTCCAATCTCTGAGAATGCGTCGACAAGTTTTGGGTAGAGTTTAGTAAG
CATGATCTTGAAACCGGTGGAGTTTGTGGTTGAGCTCTCCTGCAGTTTCGATGATGATCC
TACAGGGACGCCTTCCATGTAAGCCTTGCACGCAGCCAGAACATGGTGAGCCCGTTGCGT
GAAGTGGTCCTTCACAAGCACCTCAAAATGCTTTGGAGGCTTGCGGAGCAACGAGATCAT
GGATTTGCAGGTGATGAGGAAAGCATTCTCATTGTAACTCACAGAGTTTTTCTCTCCCTC
AGCTCGGCCCAGCTGCTTATCATAGCCAGCTTCGTTGAAGTAAGGCTTCTCATTCAGAAC
AAGAGCCTGAAACGAGAGAAGGACTTGAAGGATGGAGGAGCTCCCTGGGCTCCACACTTC
AGTGCCAGAGCCATTCCATGTGTTCAGCAGACTCAGGCAGACTCTTCCTGACTCGTACAG
GTTAGGATTCAGTCGCATCCCACCTGAATGATAGTGTACCAATGGAGGCTCATGAGGATA
CTGTGGCGGAAGCATTATGTCGAAGAAGAATAGTCCATCATGGTATGGTGTTCCAGGTGC
ACCAACAAGGGCTGCACGAATAAGGTCCATCCTTTCTTCATACACACGCACGTATATTGT
GTTGGGAAGATCTGCCTCCAAATTGCTCCATTCTTGCTGGACTTC

QA 1 705 1 705
DS 



CO CL1895Contig2 853 2 2 U
GGGAGGATGGAAAGGTCTGAATTTTCCAACTCTAGCACTATAAGTTCTGCAAGTAGTGTC
CAAGATCTAAGTCAGAAGATAGGTCAATCAGATGAATCATCTTCAAACCCTCAGCAAACG
GGTCTGGTGAATCTCTACAGTGCTGGTGAAAGCTGCAACAATAACGTTCTGGAATCTAGT
TCATTTTTCCTTCCAAAAGCTGCCATAGGATTCATCACAAACCTTGCTTCAAGCCTATTC
GGTTCTCATGGTTCCGCTCCTGCTATAAGTTCGCATTCACGTTGCAGTGACACTGAAGAA
CAAAGAGACTCTGAGGTCCTTGTTGAAGAAGCAACAGAATCACATGACACCTCTGAATCT
AAATCAGATGAAGTGGATATGGACACGATGGTCAACTTACCTGCAGCAGGGATTAACAAG
ACACTAGATTCAACTCTTCTAGACAACAGCAGGAATCTAGTGAGATTTAGACAGTTTGAT
ATGGTTACTGACTGCTCAGACCATCATTTCTTTTCTTCGGCGAAAGAGTTGGCACAACCA
CCGGTTACAAAGAGTTGGGTGAAGAAAGTCCAGCAAGAATGGAGCAACTTGGAGGCAGAT
CTTCCCAACACAATCTACGTGCGTGCGTATGAAGAAAGGATGGACCTTCTCCGTGCAGCC
CTAGTTGGTGCCCCTGGAACACCATACCATGATGGACTATTCTTTTTCGACATAATGCTT
CCACCACTGTATCCTCATGAGCCACCAATGGTACACTATCATTCAGTGGGATGCGACTGA
ATCCTAATCTGTACGAGTCAGAAGAGTCTGCCTGAGTCTGCTGAACACATGGAATGGCTC
TGGCACTGAGTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW83TF U 1
AF RR4B180TF U 1
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BS 830 853 RR4B180TF

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AAATCAGATGAAGTGGATATGGACACGATGGTCAACTTACCTGCAGCAGGGATTAACAAG
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QA 1 829 1 829
DS 

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CAAGATCTAAGTCAGAAGATAGGTCAATCAGATGAATCATCTTCAAACCCTCAGCAAACG
GGTCTGGTGAATCTCTACAGTGCTGGTGAAAGCTGCAACAATAACGTTCTGGAATCTAGT
TCATTTTTCCTTCCAAAAGCTGCCATAGGATTCATCACAAACCTTGCTTCAAGCCTATTC
GGTTCTCATGGTTCCGCTCCTGCTATAAGTTCGCATTCACGTTGCAGTGACACTGAAGAA
CAAAGAGACTCTGAGGTCCTTGTTGAAGAAGCAACAGAATCACATGACACCTCTGAATCT
AAATCAGATGAAGTGGATATGGACACGATGGTCAACTTACCTGCAGCAGGGATTAACAAG
ACACTAGATTCAACTCTTCTAGACAACAGCAGGAATCTAGTGAGATTTAGACAGTTTGAT
ATGGTTACTGACTGCTCAGACCATCATTTCTTTTCTTCGGCGAAAGAGTTGGCACAACCA
CCGGTTACAAAGAGTTGGGTGAAGAAAGTCCAGCAAGAATGGAGCAACTTGGAGGCAGAT
CTTCCCAACACAATCTACGTGCGTGCGTATGAAGAAAGGATGGACCTTCTCCGTGCAGCC
CTAGTTGGTGCCCCTGGAACACCATACCATGATGGACTATTCTTTTTCGACATAATGCTT
CCACCACTGTATCCTCATGAGCCACCAATGGTACACTATCATTCAGTGGGATGCGACTGA
ATCCTAATCTGTACGAGTCAGAAGAGTCTGCCTGAGTCTGCTGA*CACATGGAATGGCTC
TGGCACTGAGTGT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 4

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CATGACTCCAAGCGATTCCGTCTCAACGGGAAGCAGTATCATGCCGCAGAAGAAGAATCC
AGACCCGATGGAGCTCGTCAGAGGAAAGTCTGCTCGAGTCATAGGCGATCTGGTCACCGT
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CCATCAGGCTAATTGTCTCGGCGGTTTGTCCCCCCCACCCCAAAATAAAATAAAAGCTTT
GTTAAAGTTTCTTAGTATCTGAAACCGACATTTTTGTTCAAGTTCTATGATACCAATGTT
TTTATTTTTTACAATGGTAAGAAGATTTAACTT


BQ
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AF RR4DL81TF U 1
AF RR4FH50TF U 511
AF RR4FH50JQ C 1031
AF RR4AU73TF U 1578
BS 1 553 RR4DL81TF
BS 554 554 RR4FH50TF
BS 555 744 RR4DL81TF
BS 745 1152 RR4FH50TF
BS 1153 1577 RR4FH50JQ
BS 1578 1660 RR4AU73TF
BS 1661 1661 RR4FH50JQ
BS 1662 1773 RR4AU73TF

RD RR4DL81TF 744 0 0
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TCTTTCTCTCTCACAGAGTCTCCTCTTCTCTCCGTCACGCTCATATCCTCCCTCCTCCTC
AACGCACCGCTCCGTCTCTTTTTTGCCGCCGGGGAGTAAGTCACGGTCTCTGCCTCCCTT
GCGCTCAATGAACAGCCACGATGAGAACGAGACGGCCTCCAAGGAGGTGAAGCTCTGGGG
TGGAAGGTTCGAAGAGAGCGTCACAGAGAAGGTGGAGAAGTTCACTGAGTCCATTTCCTT
CGACAAAGTTCTCTACAAGCAGGACATCATGGGCAGCAAAGCTCATGCTACAATGCTCGC
TCACCAGGGGCTTATAACTGATGGCGACAGAGACAGCATTTTGGGAGGTCTTGATGAAAT
CGAGAGGAAGATTGAAGGAGATGAATTTGAGTGGAGGACTGATCGAGAGGATGTGCACAT
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ACGGAGCAGAAACTACCAGGTTGCTACTGATTTCAGGCTTTGGTGTCGTGATGCTATCGA
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CGAGGGTTTGATTGTCCCTGGTTATACTCATCTTCAGAGGGCTCAGCCTGTATTGCTCCC
ACATGTACTCTTAACTTATGTTGA

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DS 

RD RR4FH50TF 643 0 0
G
GGTGAGCCTGCTAAGAAGCTTCACACAGCACGGAGCAGAAACGACCAGGTTGCTCCTGAT
TTCAGGCTTTGGTGTCGTGATGCTATCGACTCGATCGTTGTCAAAATCAAACATCTTCAG
ACAGCTCTTGTTCAGCTCGCTTTGAAGAACGAGGGTTTGATTGTCCCTGGTTATACTCAT
CTTCAGAGGGCTCAGCCTGTTTTGCTCCCACATGTACTCTTAACTTATGTTGAGCAGCTC
GAGCGTGATGCTGGTCGTTATATTGACTGTCGAGAGAGGCTAAATTTCTGTCCCCTAGGG
GCTTGTGCTTTGGCTGGAACTGGTCTACCTATTGATAGGTTCATGACCGCAACTGCTCTT
GGATTTACCGAACCGATGAGAAACAGCATCGACGCAGCTTCAGACCGGGATTTCGTGTTG
GAGTTTCTATATGCAAACTCCAACACAGCCATTCATCTATCACGGCTTGGAGAAGAGTGG
GTACTCTGGGCCTCAGAGGAGTTTGGTTTCATGACTCCAAGCGATTCCGTCTCAACGGGA
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GCTCGAGTCATAGGCGATCTGGTCACCGTCCTAACACTGTG
T

QA 2 642 2 642
DS 

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GAGCTCGTCAGAGGAAAGTCTGCTCGAGTCATAGGCGATCTGGTCACCGTCCTAACACTG
TGTAAGGGACTTCCTCTTGCTTACAACCGTGATTTTCAAGAAGATAAGGAACCCATGTTC
GACAGCACCAAGACAATAATGGGAATGATCGATGTCTCTGCGGAATTTGCCCAGAATGTC
ACATTCAATGAAGACAGGATTAAGAGAAGTCTCCCTGCTGGACACCTTGATGCTACTACT
CTTGCTGATTACCTTGTGAAGAAGGGGATGCCTTTTAGGTCATCACACGACGTTGTTGGG
AAACTAGTTGGAGTTTGTGTTTCAAGAGGCTGTGAACTCCAGAACCTAAGTCTTGAAGAG
ATGAAGAAGCTGAGCCCTGTTTTTGAAGAAGATGTGTTTGGGTTTTTAGGTGTCGAAAAT
TCAGTTAATAAGTTCAGTTCCTACGGGTCAACTGGATCGAACTGTGTCGCTGAGCAACTC
GGATACTGGGTCAACAAGCTAAAGATTACTAGCACCTGAGTTGGACCAAACCATCAGGCT
AATTGTCTCGGCGGTTTGTCCCCCCCCCCCCAAAATAAAATAAAAGCTTTGTTAAAGTTT
CTTAGTATCTGAAACCGACATTTTTGTTCAAGTTCTATGATACCAATGTTTTTATTTTTT
ACAATGGTAAGAAGATTTAACT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4AU73TF 196 0 0
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TCGGCGGTTTGTCCCCCCCACCC*AAAATAAAATAAAAGCTTTGTTAAAGTTTCTTAGTA
TCTGAAACCGACATTTTTGTTCAAGTTCTATGATACCAATGTTTTTATTTTTTACAATGG
TAAGAAGATTTAACTT

QA 1 196 1 196
DS 



AS 1 3

CO CL1897Contig1 918 3 3 U
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GAGAGAGAGGTTGACTACAGACAATGGCGGTTCCGAGGGGAGACAATGGTTTGATGGAAG
AAGACGATGTTGACGCTATTATCGAGGAAAACGGTGTTGACTACGAAAGCGAGCCCGAGC
TTTCCTCAAACCTCCGTGACTTAGCCGCCGCATCTCAGTCCGGTGACGTCGTCGCCTTGC
GCACCGCCATTGACAAGTTGAATGGGAGAGTTGATGAGCCCCTTGAGGATAACGACTCTG
CACTTCACCTGGCGTGTCTCTATGGTCACCTCCCTTGTGTTCAGCTTCTCCTGGAAAGAG
GTGCTAATATGGAGGTCAAAGATGAAGATGAAGCCATTCCCCTGCGTGATGCTTGTGCTG
GAGGATACTTAGAGATAGTAGAGCTTCTTTTCAGCCGAGCTAGTGGTCCTGAATGTGTGA
AGAGGATGATTGAAACTATCGATGTAGAAGGCGACACTCCTCTGCATCATGCAGCAAGAG
GCGAGCACGTCAACGTGATTAATTTTTTACTGGGTTCAGGGGCTTCACCAACAGTCAAAA
ACTCGTATGGGAAGACACCAGGTGAGTTAGCTGATGTAAACACTGATGCTAGGAGGATCC
TCGAAGCTGCCACTGGCGGCGACTCAACTTAGCTCCTAATGTTTCTGCAAAGTTCTTGAG
CCAGTTTTTGCGTGTCAGTGAAGTTAGGGAATATTTTTCAAAACGTTCTCAATTATCTTT
GACTGTTCTTATACAAAGGATTATAACCTAAGAGTTTTAGAATGTTGTGTCGATTTCGAA
TATCAAATTTGTTATCAGATTTAAAAGTCTTGAATGGCTTCTCGTTAAGACTTTTATATA
AAGGTGAACAAAGATGCT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B601TF U 1
AF RR4BA11TF U 1
AF RR4BA11JQ C 100
BS 1 750 RR4B601TF
BS 751 789 RR4BA11TF
BS 790 918 RR4BA11JQ

RD RR4B601TF 769 0 0
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GCACCGCCATTGACAAGTTGAATGGGAGAGTTGATGAGCCCCTTGAGGATAACGACTCTG
CACTTCACCTGGCGTGTCTCTATGGTCACCTCCCTTGTGTTCAGCTTCTCCTGGAAAGAG
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AGAGGATGATTGAAACTATCGATGTAGAAGGCGACACTCCTCTGCATCATGCAGCAAGAG
GCGAGCACGTCAACGTGATTAATTTTTTACTGGGTTCAGGGGCTTCACCAACAGTCAAAA
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CCAGTTTTTGCGTGTCAGTGAAGTTAGGGA
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DS 

RD RR4BA11TF 793 0 0
GG
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TCCTCAAACCTCCGTGACTTAGCCGCCGCATCTCAGTCCGGTGACGTCGTCGCCTTGCGC
ACCGCCATTGACAAGTTGAATGGGAGAGTTGATGAGCCCCTTGAGGATAACGACTCTGCA
CTTCACCTGGCGTGTCTCTATGGTCACCTCCCTTGTGTTCAGCTTCTCCTGGAAAGAGGT
GCTAATATGGAGGTCAAAGATGAAGATGAAGCCATTCCCCTGCGTGATGCTTGTGCTGGA
GGATACTTAGAGATAGTAGAGCTTCTTTTCAGCCGAGCTAGTGGTCCTGAATGTGTGAAG
AGGATGATTGAAACTATCGATGTAGAAGGCGACACTCCTCTGCATCATGCAGCAAGAGGC
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CTGTTCT
ATAC

QA 3 789 3 789
DS 

RD RR4BA11JQ 819 0 0
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ACTACGAAAGCGAGCCCGAGCTTTCCTCAAACCTCCGTGACTTAGCCGCCGCATCTCAGT
CCGGTGACGTCGTCGCCTTGCGCACCGCCATTGACAAGTTGAATGGGAGAGTTGATGAGC
CCCTTGAGGATAACGACTCTGCACTTCACCTGGCGTGTCTCTATGGTCACCTCCCTTGTG
TTCAGCTTCTCCTGGAAAGAGGTGCTAATATGGAGGTCAAAGATGAAGATGAAGCCATTC
CCCTGCGTGATGCTTGTGCTGGAGGATACTTAGAGATAGTAGAGCTTCTTTTCAGCCGAG
CTAGTGGTCCTGAATGTGTGAAGAGGATGATTGAAACTATCGATGTAGAAGGCGACACTC
CTCTGCATCATGCAGCAAGAGGCGAGCACGTCAACGTGATTAATTTTTTACTGGGTTCAG
GGGCTTCACCAACAGTCAAAAACTCGTATGGGAAGACACCAGGTGAGTTAGCTGATGTAA
ACACTGATGCTAGGAGGATCCTCGAAGCTGCCACTGGCGGCGACTCAACTTAGCTCCTAA
TGTTTCTGCAAAGTTCTTGAGCCAGTTTTTGCGTGTCAGTGAAGTTAGGGAATATTTTTC
AAAACGTTCTCAATTATCTTTGACTGTTCTTATACAAAGGATTATAACCTAAGAGTTTTA
GAATGTTGTGTCGATTTCGAATATCAAATTTGTTATCAGATTTAAAAGTCTTGAATGGCT
TCTCGTTAAGACTTTTATATAAAGGTGAACAAAGATGCT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 5

CO CL1898Contig1 826 5 32 U
ACTCTGTACTTAACTCTAGATGCAGCTCTGCGTTCTTGTTTAATGTAATATACATTGAAG
TTTGTCAGCGCCTAGGTGTGCCTATTGTGGGAGCTAGAGTTGGGGAAGACTTTTTGGTTT
GGCCTAAGACTGAGAATCCTGAAGAACTCTTTCAAGTAACAACAACAACTTCAGGGAAGA
AGAGCTTGTTCGCTACTGTCAATGGAGAGTGTGTTGATGATCCTAAATCAATGGCATCGG
AGTTAACCGGAGAGTCACTTCTAGACTTTGCTGTTGCAACAAACAGAGACATTATAAGCA
TTGCTCTCTCCAATCTGATTAGGGTTCACTGGAGACGTGCTTCGAAGCCAACACCTGGAC
AAATGCTGACTGCTCCGCTTAGTGAACTTAACAACTTTAGGATTTCTAATTTTCCATTGT
TGCGGCCTCAAGATCTTAGGTTGGCTATTGCGGCTGCAGAAAGGCTGTTGATATTGGAAC
CTAATAACTGGATAGTTCGAAGAGAACTTGGCATGATGTACTACTACGTCAGGCAATGTA
GAGATGCGATTTTTGAGCTGAGCATATGCATAGCCAACTTTGCGATTGGGGAAGAAGAAG
CAAAAGAGTTGGAGATTTTCGTTGAGAAACTTCATCGACTCTTTTCATTGATGTCGTCTC
CCTTAGACTCTGATCGCTTGGCCGTTCATTAGAAAACTCTCTGTTTCACTTGTAAATACT
CTCTTTCTATTGGAAAAGACCCTTTTGTGGGAGACCATGGAACTTTTGGTTGTGTAACTC
TTTTACTTTCTTCTGATCAGAGTAATAAACAATTTATTTCCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
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AF RR4FG60TF U 29
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AF RR4A479JQ C 1
AF RR4BD56TF U 116
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GG
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GTGTTGATGATCCTAAATCAATGGCATCGTAGTTAACCGGAGAGTCACTTCTAGACTTTG
CTGTTGCAACAAACAGAGACATTATAAGCATTGCTCTCTCCAATCTGATTAGGGTTCACT
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ACAACTTTAGGATTTCTAATTTTCCATTGTTGCGGCCTCAAGATCTTC**TTGGCTATTG
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GCATGATGTACTACTACGTCAGGCAATGTAGAGATGCGATTTTTGAGCTGAGCATATGCA
TAGCCAACTTTGCGCTTGGGGAAGAAGAAGCAAAAGAGTTGGAGATTTTCGTTGAGAAAC
TTCATCGACTCTTTTCATTGATGTCGTCTCCCTTAGACTCTGATCGCTTGGCCGTTCATT
AGAAAACTCTCTGTTTCACTTGTAAATACTCTCTTTCTATTGGAAAAGACCCTTTTGTGG
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CC

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DS 

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A

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GAAGA***GCTTGTTCGCTACTGTCAATGGAGAGTGTGTTGATGATCCTAAATCAATGGC
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GGAACCTAATAACTGGATAGTTCGAAGAGAACTTGGCATGATGTACTACTACGTCAGGCA
ATGTAGAGATGCGATTTTTGAGCTGAGCATATGCATAGCCAACTTTGCGATTGGGGAAGA
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GTCTCCCTTAGACTCTGATCGCTTGGCCGTTCATTAGAAAACTCTCTGTTTCACTTGTAA
ATACTCTCTTTCTATTGGAAAAGACCCTTTTGTGGGAGACCATGGAACTTTTGGTTGTGT
AACTCTTTTACTTTCTTCTGATCAGAGTAATAAACAATTTATTTCCA

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 5

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BQ
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AF RR4AP81TF U 1
AF RR4AP81JQ C 459
BS 1 742 RR4AP81TF
BS 743 743 RR4AP81JQ
BS 744 768 RR4AP81TF
BS 769 1221 RR4AP81JQ

RD RR4AP81TF 768 0 0
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CCCATTTCTCCTTTCCTCTCAAAACCTTTGTTTCCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCC
CTGCAACCTACCCCCTCTACCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGT
ATGGGAATCATGGGTTCTCCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTTACT
GTGTGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTGATCCTCTCATCGGATTAGGAGCAAAATACAAG
TCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATCCT
GAAAGTGCAATCGATGTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGA
AAAGGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGGTGTTAATCAGCAAGCAA
ATAAAGGACACCGGAGCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCC
GAAGATGGTCAGCTGATATTCCTAACTGCAGGTGACAAACTGCTATACGAGAAAGCTGCT
CCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCA
GCAATGAAACTTGTCGTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGA
ATACTCCTAAGCCAGAAAGTAG*ACTTGATCCAAATGTACTGGTCGAA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4AP81JQ 763 0 0
ATCGG
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GTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGCTGATATTCCTAACTGCAGGTGACAAACTGC
TATACGAGAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTG
ATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCGTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGG
CATCATTCGCCGAGGGAATACTCCTAAGCCAGAAAGTAGGACTTGATCCAAATGTACTGG
TCGAAGTAGTCTCACAGGGAGCCATAAATGCGCCAATGTACTCACTTAAGGGTCCTTCAA
TGATCAAGTCAATGTATCCTACAGCTTTCCCATTGAAGCACCATCAGAAGGATATGAGAC
TAGCACTGGGACTAGCTGAGTCAGTTTCTCAGTCTACTCCAATTGCGGCTGCAGCAAACG
AGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCATATGGTTTGAGCGATGAAGACTTCTCTGCTGTTATTG
AAGCACTGAAAGCTGCAAGATCTCAACAAAGCTAAAGCTTTTAAAAAGATTCGTTCTTTC
TTTTCTCATTTCTATGTGGAAAAGAAAAAAAGAGAGTTTCTTTGTTGTTGTTGTTGTATG
TAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCAAACACAATTCAACCTTTGATCTCCTCTG
ATGTTTTGACTAAAAAGCGATAAAAGAAATGTTTGACC

QA 6 763 6 763
DS 



CO CL1899Contig2 1249 3 20 U
GTGTTCCATTATCTTCTTCTCCTTCTTGTCCAAGAGACATGGCTTTGTGCTCGATCTTCT
GCCCTCGTATCCCTGTTCGATTCAGACCTAAACCCGTTTCTCCTTTCTTCTCAAAACCTA
TGTTTCCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCTCTGCAACCTACTCCCTCTACCAAAGATG
AACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGTATGGGAATCATGGGTTCCCCAATGGCAC
AGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGTCTGTTTGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTG
ATCCTCTCATCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAACTT
GCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCAGATCCTGAGAGTGCAATCGATGTTGCTTGTGGAA
AGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGTTCAGGAAAAGGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTG
ATGCTGCCTCGTCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGATACGGGAGCATTGTTTTTGG
AGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAATATTCCTCACTG
CAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCTGCTCCTTACTTAGACATCATGGGAAAGTCAA
GATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCGTCAACATGATCA
TGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCTGAGGGAATACTTCTAAGCCAGAAAGTAGGGCTTG
ATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAATGCGCCAATGTACTCGC
TTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACAGCTTTCCCATTGAAGCACCAGC
AGAAGGATATGAGACTAGCACTGGGACTAGCTGAGTCAGTCTCTCAGTCAACTCCAATTG
CGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCATATGGCTTGAGCGATGAAGACT
TCTCTGCGGTTATTCAAGCACTGAAAGCTGCAAAATCTCAACAAAGCTAAAGCTTTAAAA
AAGATTCGTTCTTCCATTTCTCATTTCTATGTGGAAAAAAAAGAGAGTTTCTTTGTTGTT
GTTGTATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCAAACACAATTCAACCTTCGAT
CTCCTCTGATGTTGTTTGACTAATAAACCGATAAAAGAAATGTTTGACC


BQ
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE03TF U 1
AF RR4BL49TF U 323
AF RR4GE03JQ C 477
BS 1 419 RR4GE03TF
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BS 909 910 RR4GE03JQ
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BS 941 941 RR4GE03JQ
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BS 1005 1018 RR4BL49TF
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BS 1020 1053 RR4BL49TF
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BS 1055 1081 RR4BL49TF
BS 1082 1249 RR4GE03JQ

RD RR4GE03TF 753 0 0
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GCCCTCGTATCCCTGTTCGATTCAGACCTAAACCCGTTTCTCCTTTCTTCTCAAAACCTA
TGTTTCCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCTCTGCAACCTACTCCCTCTACCAAAGATG
AACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGTATGGGAATCATGGGTTCCCCAATGGCAC
AGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGTCTGTTTGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTG
ATCCTCTCATCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAACTT
GCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCAGATCCTGAGAGTGCAATCGATGTTGCTTGTGGAG
AGAATGGAGCCGTATCTGGGATTAGTTCAGGAAAAGGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTG
ATGCTGCCTCGTCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGATACGGGAGCATTGTTTTTGG
AGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAATATTCCTCACTG
CAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCTGCTCCTTACTTAGACATCATGGGAAAGTCAA
GATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCGTCAACATGATCA
TGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCTGAGGGA
T

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4BL49TF 759 0 0
G
AAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAACTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTA
GCAGATCCTGAGAGTGCAATCGATGTTGCTTGTGGAAAGGATGGAGCCGTATCTGGAATT
AGTTCCGGAAAAGGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTGATGCTGCCTCGTCGATGTTAATC
AGCAAGCAAATAAAGGATACCGGAGCACTGTTTTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAA
AAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAATATTCCTCACTGCAGGTGATAAGCTACTATACGAA
AAAGCTGCTCCTTACTTAGACATCATGGTAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGT
AATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCGTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTC
GCTGAGGGAGTACTTCTAAGCCAGAAAGTAGGGCTTGATCCAAATGTACTGGTCGAAGTT
GTCTCACAGGGAGCCATCAATGCGCCAATGTACTCGCTTAAGGGTCCTTCAATGATCAAG
TCAGTGTACCCTACTGCTTTCCCATTGAAGCACCAGCAGAAGGAT**GAGACTAGCACTG
GGACTAGCTGAGTCAGTTTCTCAGTCAACTCCAATTGCGGCTGCAGCAAACGAGCTTTAC
AAAGTTGCCAAGTCATATGGTTTGAGCGATGAAGATTTCTCTGCGGTTATTCAAGCACTG
AAAGCTGCAAGATCTCAACAAAGCTAAAGCTTTAAAAA

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4GE03JQ 773 0 0
GTTGATGCTGCCTCGTCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGATACGGGAGCATTGTTT
TTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAATATTCCTC
ACTGCAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCTGCTCCTTACTTAGACATCATGGGAAAG
TCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCGTCAACATG
ATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCTGAGGGAATACTTTTAAGCCAGAAAGTAGGG
CTTGATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAATGCGCCAATGTAC
TCGCTTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACAGCTTTCCCATTGAAGCAC
CAGCAGAAGGATATGAGACTGGCACTGGGACTAGCTGAGTCAGTCTCTCAGTCAACTCCA
ATTGCGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCTTATGGCTTGAGTGATGAA
GACTTCTCTGCGGTTATTGAGGCACTGAAAGCTGCAAAATCTCAACAAAGCTAAAGCTTT
TAAAAAGATTCGTTCTTCCATTTCTCATTTCTATGTGGAAAAAAAAGAGAGTTTCTTTGT
TGTTGTTGTATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCAAACACAATTCAACCTT
CGATCTCCTCTGATGTTGTTTGACTAATAAACCGATAAAAGAAATGTTTGACC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 4

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AACCTGAAATTAGATGGGAAAGGACGGAAAAGGTGGTGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGC
AAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGGAAAAGGCAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGG
TCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAGACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGAT
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TGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGAGTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGG
AGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGATGGCAGGTCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAA
CACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTTCAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTT
GTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTACATCTCTGTTCTGGCTGGCTCTGGCCGCTCT
GCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTAACCAATATATAAAAAAAATAC
ACAGCCTTTGTTGTTTTGGCCAAAATGTTTGCTACAAATTGTTTGAAAAATCTCCTGTCC
TTTAAAATAATGAATTTCTTAAGGCTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 0 0 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC81JQ C 70
AF RR4EC81TF U 70
AF RR4EJ73JQ C 1
AF RR4EJ73TF U 1
BS 1 71 RR4EJ73TF
BS 72 589 RR4EC81TF
BS 590 649 RR4EJ73TF
BS 650 650 RR4EJ73JQ
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GA
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QA 3 520 3 520
DS 

RD RR4EC81TF 520 0 0
GA
AGATGGGAAAGGACGGAAAAGGTGGTGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCAAGTGGCAGTG
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GCACCTATGTTAAAGCGAGACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCCT
ACAAAAAGTTGCAGGATGGTTGGTTGAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTG
CAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGAGTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGGAGATCTTGGAT
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TGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTAACCAATATAT

QA 3 520 3 520
DS 

RD RR4EJ73JQ 689 0 0
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CACACCTGTTGGTGTCGCTAGTGCACCTTTCAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTT
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QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4EJ73TF 679 0 0
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AAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGGAAAAGGCAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGG
TCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAGACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGAT
CAACGAGGCCTACAAAAAGTTGCAGGATGGTTGGTTGAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCC
TGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGAGTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGG
AGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGATGGCAGGTCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAA
CACACCTGTTGGTGTCGCTAGTGCACCTTTCAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTT
GTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTACTTCTCTGTTCTGGCTGGCTCT*********
GCTCTTATGGATGTATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTAACCAATATATAAAAAAAATAC
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TTTAAA*TAATGAATTTCT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 5

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TGAAACACAGGGTTTTTGAGGTGTCTCTTGCTGATCTTCAAAGCGATGAGGATCATTCTT
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CACAGAACATCTACCCATTGCAGAATGTGTTCATCCGTAAAGTCGATATCCTCAAGGCTC
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TATAACTCTTGTTTATCATAATTTTTATATTGTCTTCATTCCTGGATTTTCTTAAAATAT
TAGGAAGAAAATATTTATAAATAATGGAATTATAACTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE44TF U 1
AF RR4EJ84TF U 1
AF RR4DY58TF U 81
AF RR4DY58JQ C 157
AF RR4EJ84JQ C 356
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BS 645 656 RR4EJ84TF
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BS 658 672 RR4EJ84TF
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BS 717 717 RR4DY58JQ
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GAAATGTCGGAAAGACCCTTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCCTCTGAGGGTT
TAAAACACAGGGTTTTTGAGGTCTCTCTCGCTGATCTTCAAAGCGATGAGGATCATTCTT
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G
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TAG

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C

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DS 



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TGCGCTTTTGTGTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4H345TF U 1
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CGTACACAATAGTA
CATTCATA

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AAATGGATATGCCGACGATACTAAGGCATTCATTGATGCATGGAAAGACGCGTGCAATTT
CATTGGATCTAAATCAACCATTGAAATTCCTCAAGGAAGAACTTTTCTTCTTCAGCCAAT
CGAGTTTCATGGTCCTTGTAAATCCAAGAAAATCGTTTTTTCGATCAGTGGAAACTTAAC
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ATTTGCTCATATTAATGGACTTTATATCGATGGTTCTGGTACGATTGATGGCCAAGGGCC
AAAATGGGGGTCGTTAAATTGCAAAAAGTATAAACAAGCATGCCAGAGAAGACCACGGGG
TATGGTTATATCACATTCGAGTAATGTGCATATAAGTAACATTGTGGTTAAAGACAGTCC
AAACTTTCAAATGTCTTTGGAAGATTCTAAATGGATTTTCGTTAAGCAACTCACCATAAC
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CGTACACA*TAGTA*CATTCATACGGGTGATGATTGTATATCTATCGGTGATGGCTCAAA
GTAC

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AGGGCCAAAATGGTGGTCGTTAAATTGCAAAAAGTATAAACAAGCATGCCAGAGAAGACC
ACGGGGTATGGTTATATCACATTCGAGTAATGTGCATATAAGTAACATTGTGGTTAAAGA
CAGTCCAAACTTTCAAATGTCTTTGGAAGATTCTAAATGGATTTTCGTTAAGCAACTCAC
CATAACTGCCGATGGTGATAGCCCCAATACTGATGGCATTCACATTCAACGTTCTCGGAA
TGTCTTCGTACACAATAGTAACATTCATACAGGTGATGATTGTATATCTATCGGTGATGG
CTCAAAGTACGTTAACATATCAGGAATCTCGTGTGGTCCGGGTCATGGAATAAGCATCGG
AAGCTTAGGTCAAAATGGGAGTAAAGAAACAGTGGAAAACGTCATCGTTCGATACTGTAT
CTTCAGGAAAACAGATAATGGAGTTAGAATCAAGACATGGCAGGGAGGTAGAGGACTAGT
TCAAAATATTTTGTTTGAACGTATAAAGCTACATGCTGTAACCCTACCTATCATCATCGA
TCAGTTTTACTGTCCTCACTCCCAGTGCCGTAACCATACAGAAGCTGTGGAGATCAAGAA
TATAATGTACAAGCACATACATGGAACAGCTGTCAG*AAACCGTTTGTGAAACTCGTATG
CAGCAAATCAGTTCCATGCAGAGAGATATACATGA
CGATA

QA 1 875 1 875
DS 

RD RR4AB67JQ 847 0 0
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GGTGATAGCCCCAATACTGATGGCATTCACATTCAACGTTCTCGGAATGTCTTCGTACAC
AATAGTAACATTCATACAGGTGATGATTGTATATCTATCGGTGATGGCTCAAAGTACGTT
AACATATCAGGAATCTCGTGTGGTCCGGGTCATGGAATAAGCATCGGAAGCTTAGGTCAA
AATGGGAGTAAAGAAACAGTGGAAAACGTCATCGTTCGATACTGTATCTTCAGGAAAACA
GATAATGGAGTTAGAATCAAGACATGGCAGGGAGGTAGAGGACTAGTTCAAAATATTTTG
TTTGAACGTATAAAGCTACATGCTGTAACCCTACCTATCATCATCGATCAGTTTTACTGT
CCTCACTCCCAGTGCCGTAACCATACAGAAGCTGTGGAGATCAAGAATATAATGTACAAG
CACATACATGGAACAGCTGTCAGGAAACCGTTTGTGAAACTCGTATGCAGCAAATCAGTT
CCATGCAGAGAGATATACATGAACGATATAAACATTCTTGACCACGACGAAGGAAAAGGA
AAGAAATATCACAAACGATCGTCACATCCTCCTTCTGAATGCATCAATGTTAGAGGAGAG
TCTTATGGTACAATAAAGCCTAAACTAGCTTGTTTAGATTCTGAAAGACATTGATTGTCT
AAAGTTCATCCTTAGTTTATTTTTTTTGCTTCTGGTGAACTAGTTAGGAATAGAACCACC
AGTATTCATGTTTTTTCTTCTTCTTTTGATCTGCTTAAGAAATAATAAAAAGTTGCGCTT
TTGTGTT

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR4CI08JQ 786 0 0
GTGATAGCCCCAATACTGATGGCAT*CACATTCAACGTTCTCGGAATGTCTTCGTACACA
ATAGTAACATTCATACGGGTGATGATTGTATATCTATCGGTGATGGCTCAAAGTACGTTA
ACATATCAGGAATCTCGTGTGGCCCGGGTCATGGAATAAGCATCGGAAGCTTAGGTCAAG
ATGGGAGTAAAGAAACAGTGGAAAACGTCATCGTTCGAGACTGTATCTTCAGGAAAACAG
ATAATGGAGTTAGAATCAAGACATGGCAGGGAGGTAGAGGACTAGTTCAAAATATTTTGT
TTGAACGTATAAAGCTACATGCTGTAACCCTACCTATCATCATCGATCAGTTTTACTGTC
CTCACTCCCAGTGCAGTAACCATACAGAAGCTGTGGAGATCAAGAATATAATGTACAAGC
ACATACATGGAACAGCTGTCAGGAAACCGTTTGTGAAACTCGTATGCAGCAAATCAGTTC
CATGCAGAGAGATATACATGAACGATATAAACATTCTTGACCACGACGAAGGAAAAGGAA
AGAAATATCACAAACGATCGTCACATCCTCCTTCTGAATGCATCAATGTTAGAGGAGAGT
CTTATGGTACAATAAAGCCTAAACTAGCTTGTTTAGATTCTGAAAGACATTGATTGTCTA
AAGTTCATCCTTAGTTTATTTTTTTTGCTTCTGGTGAACTAGTTAGGAATAGAACCACCA
GTATTCATGTTTTTTCTTCTTCTTTTGATCTGCTTAAGAAATAATAAAAAGTTGCGCTTT
TGTGT
C

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL1903Contig1 825 3 7 U
GGGTCGAAGATGGCTCCGATCATCAGATCTAGCCCAGCTCTCGCTTTCCTCGTTTTGCAG
ATTAGCTTCATCTTCTTTGCTTCACTCTCCCATACTCTTCTGGGTCTGAGGATGGCTACA
CAATCACTGGCAGAGTGAAGATTCCACCAAGCAACGTGATTGGTCACACAGCAAAGAGCT
CTAATGTCAAAGTTATACTCAATGGTGGACAGAGTGTTACATTTCTCAGGCCTGATGGAT
ATTTCACTTTTCACAAAGTGCCTGCTGGGACTCATTTGATCGAAGTATCTGCAATGGGCT
ACTTCTTTTCTCCGGTACGAGTCGATGTTAGTGCACGGCACCATGGCAAAGTTCATGCAA
CACTAACCGAAACCAGGAGGAGTCTTACTGAGCTGGTTTTAGAGCCATTAAGGGAAGAGC
AATACTACGAGATTCGAGAGCCTTTCTCCATGTTGTCAATGGTGAAGAGTCCTATGGGTC
TCATGGTGGGATTCATGGTCGTGGTTGTGTTCCTAATGCCCAAACTGATGGAAAACATAG
ATCCAGAGGAGATGAAGCAAGCACAAGAGGAAATGAGGAGGCAAGGTGTGCCTTCGCTCT
CGAGTTTGTTGCCAAGCGCCGGGGCTAGCCGTTAAGAGTTTCTCTGTCAGCTCAATGTAT
CACAAAACGAGCGGAGAAAGGGTATCCCGTTCTTGTGAGAGACACACACACTGTAATAGA
TTTGTATTGTGTAATAGATCTTCATATTTGTATTGTGTAATAGATCTTAATATTTGTGTT
GTGTAATAGCTATTAAGAACATAAGAAAAAACGATAATTTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GH96TF U 1
AF RR4GH96JQ C 283
AF RR4GY26TF U 624
BS 1 534 RR4GH96TF
BS 535 535 RR4GH96JQ
BS 536 548 RR4GH96TF
BS 549 623 RR4GH96JQ
BS 624 670 RR4GY26TF
BS 671 671 RR4GH96JQ
BS 672 825 RR4GY26TF

RD RR4GH96TF 559 0 0
GGGTCGAAGATGGCTCCGATCATCAGATCTAGCCCAGCTCTCGCTTTCCTCGTTTTGCAG
ATTAGCTTCATCTTCTTTGCTTCACTCTCCCATACTCTTCTGGGTCTGAGGATGGCTACA
CAATCACTGGCAGAGTGAAGATTCCACCAAGCAACGTGATTGGTCACACAGCAAAGAGCT
CTAATGTCAAAGTTATACTCAATGGTGGACAGAGTGTTACATTTCTCAGGCCTGATGGAT
ATTTCACTTTTCACAAAGTGCCTGCTGGGACTCATTTGATCGAAGTATCTGCAATGGGCT
ACTTCTTTTCTCCGGTACGAGTCGATGTTAGTGCACGGCACCATGGCAAAGTTCATGCAA
CACTAACCGAAACCAGGAGGAGTCTTACTGAGCTGGTTTTAGAGCCATTAAGGGAAGAGC
AATACTACGAGATTCGAGAGCCTTTCTCCATGTTGTCAATGGTGAAGAGTCCTATGGGTC
TCATGGTGGGATTCATGGTCGTGGTTGTGTTCCTAATGCCCAAACTGATGGAAA*CATAG
ATCCAGAG
AGATGAGCAGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4GH96JQ 543 0 0
AAGTATCTGCAATGGGCTACTTCTTTTCTCCGGTACGAGTCGATGTTAGTGCACGGCACC
ATGGCAAAGTTCATGCAACACTAACCGAAACCAGGAGGAGTCTTACTGAGCTGGTTTTAG
AGCCATTAAGGGAAGAGCAATACTACGAGATTCGAGAGCCTTTCTCCATGTTGTCAATGG
TGAAGAGTCCTATGGGTCTCATGGTGGGATTCATGGTCGTGGTTGTGTTCCTAATGCCCA
AACTGATGGAAAACATAGATCCAGAGGAGATGAAGCAAGCACAAGAGGAAATGAGGAGGC
AAGGTGTGCCTTCGCTCTCGAGTTTGTTGCCAAGCGCCGGGGCTAGCCGTTAAGAGTTTC
TCTGTCAGCTCAATGTATCACAAAACGAGCGGAGAAAGGGTATCCCGTTCTTGTGAGAGA
CACACTCACTGTAATAGATTTGTATTGTGTAATAGATCTTCATATTTGTATTGTGTAATA
GATCTTAATATTTGTGTTGTGTAATAGCTATTAAGAACATAAGAAAAAACGATAATTTAA
TGC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4GY26TF 202 0 0
GCTAGCCGTTAAGAGTTTCTCTGTCAGCTCAATGTATCACAAAACGATCGGAGAAAGGGT
ATCCCGTTCTTGTGAGAGACACACACACTGTAATAGATTTGTATTGTGTAATAGATCTTC
ATATTTGTATTGTGTAATAGATCTTAATATTTGTGTTGTGTAATAGCTATTAAGAACATA
AGAAAAAACGATAATTTAATGC

QA 1 202 1 202
DS 



AS 1 5

CO CL1904Contig1 742 5 21 U
TTTTTATTCTTCATTCAATATTTGAACCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTC
ATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGT
TAGATTCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGA
AATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATG
AGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTACGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACA
TGCTTAGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTA
GATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGCTATTCGAGCACT
TGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCT
ATACTTGTTGACATTGATCTTATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTA
CTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTG
TGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAACCATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCA
ATTTTATGATAATGATGAGCATGTGTAGCTTCTTACTTTGTTACTCTACCAACACATAAT
TACTCATTTAACAATCATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BY93TF U 1
AF RR4H431TF U 32
AF RR4BY93JQ C 1
AF RR4AO20JQ C 6
AF RR4AO20TF U 6
BS 1 5 RR4BY93JQ
BS 6 91 RR4BY93TF
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BS 93 148 RR4BY93TF
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BS 150 274 RR4BY93TF
BS 275 275 RR4H431TF
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BS 381 381 RR4H431TF
BS 382 407 RR4BY93TF
BS 408 408 RR4H431TF
BS 409 451 RR4BY93TF
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BS 453 497 RR4BY93TF
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BS 501 501 RR4H431TF
BS 502 543 RR4BY93TF
BS 544 544 RR4H431TF
BS 545 600 RR4BY93TF
BS 601 742 RR4AO20TF

RD RR4BY93TF 600 0 0
TTTTT
ATTCTTCATTCAATATTTGAACCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTCATAAA
CCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAAATATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGAT
TCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGTAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGG
CCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTC
TCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTT
AGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCT
GCAGAACAAGAACGTAAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTG
TGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGGGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACT
TGTTGACATTGACCT*ATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTCC
TATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTG

QA 6 600 6 600
DS 

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G
ACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTCATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAAC
TATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGATTCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAG
CTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCAC
TCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTT
TACGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGAACGGACATCATCTCTCACCCACTC
TTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTA
GCTTGTGAAGTTGTGCTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGA
GGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGATCTTATCGATTTTTA
CGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTAC
TGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTG

QA 2 569 2 569
DS 

RD RR4BY93JQ 648 0 0
TTTTTATTCTTCATTCAATATTTGAACCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTC
ATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAAATATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGT
TAGATTCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGTAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGA
AATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATG
AGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACA
TGCTTAGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTA
GATCTGCAGAACAAGAACGTAAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACT
TGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGGGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCT
ATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTA
CTTCCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTG
CGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAACCATATCATTTGCTTTGTTTT
CC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4AO20JQ 737 0 0
ATTCTTCATTCAATATTTGAACCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTCATAAA
CCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGAT
TCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGG
CCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTC
TCAGAGTACAACAATCTCCATGTTGTTTACGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTT
AGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCT
GCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGCTATTCGAGCACTTGTTG
TGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACT
TGTTGACATTGATCTTATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTC
TATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAA
CCAAAACGTGATCTCGTAAACCATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTT
ATGATAATGATGAGCATGTGTAGCTTCTTACTTTGTTACTCTACCAACACATAATTACTC
ATTTAACAATCATCTTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AO20TF 737 0 0
ATTCTTCATTCAATATTTGAACCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTCATAAA
CCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGAT
TCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGG
CCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTC
TCAGAGTACAACAATCTCCATGTTGTTTACGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTT
AGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCT
GCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGCTATTCGAGCACTTGTTG
TGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACT
TGTTGACATTGATCTTATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTC
TATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAA
CCAAAACGTGATCTCGTAAACCATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTT
ATGATAATGATGAGCATGTGTAGCTTCTTACTTTGTTACTCTACCAACACATAATTACTC
ATTTAACAATCATCTTT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL1905Contig1 767 4 8 U
GGATTTCTAACAATCTATTCTTCTCTCCATATCCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACA
ATATAAAAGGAGAAAAAAA**TGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCT
TACACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGA
AAAACCGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGT
GCCAAACCGCAAAAAA*TCTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACG
AAAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAG
GACAATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTG
GGCTTGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACT
CTTGGGATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAG
ATATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCT
TTTACAAAGATGTTGAAAAGAGAATAATTTATTAAGACATGGATTAAAGATTATCCTATG
TGGTATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGG*TTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGGCCTT
CTTTAACTGGATCTTTTATGGAAATTGAATACCAATGCTGATTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4D284TF U 1
AF RR4DR88TF U 7
AF RR4H889JQB C 27
AF RR4D284JQ C 228
BS 1 79 RR4D284TF
BS 80 81 RR4DR88TF
BS 82 559 RR4D284TF
BS 560 687 RR4DR88TF
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RD RR4D284TF 559 0 0
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TACACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGA
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GCCAAACCGCAAAAAA*TCTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACG
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ATATCTCCGTTTATAAAAA

QA 1 559 1 559
DS 

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GG
AACAATCTATTCTTCTCTCCATATCCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAATATAAAA
GGAGAAAAAAA**TGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACACGTT
TTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAACCGA
AAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGTGCCAAACC
GCAAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAACGAA
GAGAGTGCACGCACAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAGGACAATGA
CATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTGGC
TATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGGAT
GGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCTCC
GTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTACAAA
GATGTTGAAAAGAGAATAATTTATTAAGACATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGTATGG
TAAGTTAAGAGTAACTGGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCT

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR4H889JQB 741 0 0
GG
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TCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACATGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCT
CATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAACCGAAAAGTACCCAAACTCGATTT
CTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGTGCCAAACCGCAAAAAA*TTTCAGCGAAC
TAGTTTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATGA
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GTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGGATGGAGAGCATGGATGCTTGCG
ATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGT
TTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCCGTAGCTTTTACAAAGA*GTTGAAAAGAGAATAAT
TTATTAAGACATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGTATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGG*
TTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGGCCTTCTTTAACTGGATCTTTTATGGAAATTGA
ATACCAATGCTGATTATG
G

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR4D284JQ 540 0 0
GGGTGTCGGCAGTGCCAAACCGCAAAAAA*TCTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAA
GAACGCTAGGACGAAAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAA
GAAGTATCCCAAGGACAATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCAC
TGTTCAGATATTGGGCTTGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTAT
CAGTCGTATGACTCTTGGGATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAG
ATCAACGCCTCAGATATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCA
GATTCCTGTAGCTTTTACAAAGATGTTGAAAAGAGAATAATTTATTAAGACATGGATTAA
AGATTATCCTATGTGGTATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGG*TTGCTCAATAATGTACGTA
GCCTCTAGGCCTTCTTTAACTGGATCTTTTATGGAAATTGAATACCAATGCTGATTATGT

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 5

CO CL1906Contig1 528 5 5 U
GGACACACTTAACATTTGTTTCCTTCCAACTCCGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATTTTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTAAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTC
AAGGGTACATGTGTGAGCGCAACAAACTGCGCAAACGTGTGTCACAACGAAGGCTTTACT
GGTGGTAATTGCCGTGGACTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCTTCGATCCATCGTCCCTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTT
TGTGTGTTTTCTCTCTTTTTT*CTGTAACGTAAGTGTGTTTTCGGTATTCATGTAAGGTT
ATATCAACTTGTGGTTCTCTTATCAAGAAGCCTCTACAGAGGTATTTA


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4BR57TF U 1
AF RR4CL39JQ C 1
AF RR4EH95JQ C 1
AF RR4EH95TF U 1
AF RR4CL39TF U 1
BS 1 252 RR4BR57TF
BS 253 253 RR4EH95TF
BS 254 441 RR4BR57TF
BS 442 442 RR4EH95TF
BS 443 528 RR4BR57TF

RD RR4BR57TF 528 0 0
GGACACACTTAACATTTGTTTCCTTCCAACTCCGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATTTTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTAAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTC
AAGGGTACATGTGTGAGCGCAACAAACTGCGCAAACGTGTGTCACAACGAAGGCTTTACT
GGTGGTAATTGCTGTGGACTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCTTCGATCCATCGTCCCTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTT
TGTGTGTTTTCTCTCTTTTTTTCTGTAACGTAAGTGTGTTTTCGGTATTCATGTAAGGTT
ATATCAACTTGTGGTTCTCTTATCAAGAAGCCTCTACAGAGGTATTTA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4CL39JQ 527 0 0
GGACACACTTAACATTTGTTTCCTTCCAACTCCGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATTTTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTAAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTC
AAGGGTACATGTGTGAGCGCAACAAACTGCGCAAACGTGTGTCACAACGAAGGCTTTACT
GGTGATAATTGCCGTGGACTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCTTCGATCCATCGTCCCTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTT
TGTGTGTTTTCTCTCTTTTTT*CTGTAACGTAAGTGTGTTTTCGGTATTCATGTAAGGTT
ATATCAACTTGTGGTTCTCTTATCAAGAAGCCTCTACAGAGGTATTT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4EH95JQ 527 0 0
GGACACACTTAACATTTGTTTCCTTCCAACTCCGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTTTCTATGCGTTTGATTTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATTTTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTAAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTC
AAGGGTACATGTGTGAGCGCAACAAACTGCGCAAACGTGTGTCACAACGAAGGCTTTACT
GGTGGTAATTGCCGTGGACTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCTTCGATCCATCGTCCCTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTT*GGTT
TGTGTGTTTTCTCTCTTTTTT*CTGTAACGTAAGTGTGTTTTCGGTATTCATGTAAGGTT
ATATCAACTTGTGGTTCTCTTATCAAGAAGCCTCTACAGAGGTATTT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4EH95TF 527 0 0
GGACACACTTAACATTTGTTTCCTTCCAACTCCGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATTTTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTAAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTC
AAGGGTACATGTGTGAGCGCAACAAACTGCGCAAACGTGTGTCACAACGAAGGCTTTACT
GGTGGTAATTGCCGTGGACTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCTTCGATCCATCGTCCCTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTT*GGTT
TGTGTGTTTTCTCTCTTTTTT*CTGTAACGTAAGTGTGTTTTCGGTATTCATGTAAGGTT
ATATCAACTTGTGGTTCTCTTATCAAGAAGCCTCTACAGAGGTATTT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4CL39TF 527 0 0
GGACACACTTAACATTTGTTTCCTTCCAACTCCGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATTTTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTAAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTC
AAGGGTACATGTGTGAGCGCAACAAACTGCGCAAACGTGTGTCACAACGAAGGCTTTACT
GGTGATAATTGCCGTGGACTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCTTCGATCCATCGTCCCTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTT
TGTGTGTTTTCTCTCTTTTTT*CTGTAACGTAAGTGTGTTTTCGGTATTCATGTAAGGTT
ATATCAACTTGTGGTTCTCTTATCAAGAAGCCTCTACAGAGGTATTT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 5

CO CL1907Contig1 1279 5 12 U
GTGGACATGGTCATCGAGGCTGTCATTGAGAATATATCTCTGAAGCAGCAAATTTTTGCT
GATCTCGAGAAGTACTGTCCTCAACATTGTATTCTTGCTAGCAACACATCTACCATTGAT
CTGAACAAAATTGGGGAGCGGACCAAGTCCCAGGATCGGATTATCGGAGCACATTTTTTC
AGTCCAGCACATGTCATGCCACTACTTGAAATAGTTCGGACCAATCATACCTCTGCCCAA
GTAATTGTTGACCTGTTAGATGTTGGGAAGAAGATTAGGAAAACACCAGTTGTGGTTGGA
AACTGCACAGGGTTTGCAGTTAACAGGATGTTCTTCCCATACACACAGGCAGCTATGTTC
CTTGTTGAGCATGGAGCAGATCCATATCTCATCGACAAAGCAGTCAGCAAGTTTGGAATG
CCAATGGGTCCCTTCAGATTGTGCGACCTGGTTGGATTCGGTGTTGCGATTGCAACCGCA
ACACAATTCATCGAGAACTTCACAGAACGGACATACAAATCAATGATTATCCCACTCATG
CAAGAGGACAAGAGAGCTGGTGAAGCCACTCGTAAAGGATTCTATCTTTATGATGATAAG
CGCAAGGCTAAACCTGACCCTGAATTAAAGAAATATATCGAGAAGGCAAGGAGCGTATCA
GGAGCAAAGCTTGATCCGAAGTTGGAGAAACTGTCGGAGAAGGAAATTATTGAAATGACG
TTTTTCCCGGTAGTGAACGAGGCCTGTAGAGTTTTTGCGGAAGGTATTGCTGTCAAGGCA
GCAGACCTTGACATTGCTGGCATATTTGGAATGGGTTTCCCACCTTACAGAGGTGGAATC
ATGTTCTGGGCTGATTCCATTGGATCGAAATACATTTACTCAAAGCTAGAGGAGTGGTCC
AAGACTTATGGTGATTTCTTCAAGCCTTGTGCTTTTTCGGCTGAAAGGGGATCTAAAGGA
GCTCCTTTGAGCGCTCCCTTGGAACAAGGCAGGTCGCGGTTGTAAGGTCAGCGTTTCAAC
GAGGAACTTTTCTTTATTGCTGCATTTACTGTTTTTCTTTGTCCACATTTACTTGCCAGG
AAGTTGGGATCTTTGGCCTCAGTAACTTTTTAAAATAAAGTCTCATCTCAAGACAGATGA
ACAAAGTAGAAAGTACGAACAGCAATAAGATTTGTATTTTTGGGATGTTACTCATATATA
ATGCTTTGTCATACAAAGGCTGTCAGGTACATTTGTTATTAAAGCTTTTTGGAGTAATAA
GTTCTGTGATTTGTTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW11TF U 1
AF RR4CQ23TF U 106
AF RR4H465TF U 311
AF RR4H465JQB C 1052
AF RR4CQ23JQ C 465
BS 1 606 RR4GW11TF
BS 607 607 RR4CQ23TF
BS 608 641 RR4GW11TF
BS 642 761 RR4CQ23TF
BS 762 762 RR4H465TF
BS 763 813 RR4CQ23TF
BS 814 922 RR4H465TF
BS 923 1159 RR4CQ23JQ
BS 1160 1160 RR4H465JQB
BS 1161 1182 RR4CQ23JQ
BS 1183 1183 RR4H465JQB
BS 1184 1279 RR4CQ23JQ

RD RR4GW11TF 641 0 0
GTGGACATGGTCATCGAGGCTGTCATTGAGAATATATCTCTGAAGCAGCAAATTTTTGCT
GATCTCGAGAAGTACTGTCCTCAACATTGTATTCTTGCTAGCAACACATCTACCATTGAT
CTGAACAAAATTGGGGAGCGGACCAAGTCCCAGGATCGGATTATCGGAGCACATTTTTTC
AGTCCAGCACATGTCATGCCACTACTTGAAATAGTTCGGACCAATCATACCTCTGCCCAA
GTAATTGTTGACCTGTTAGATGTTGGGAAGAAGATTAGGAAAACACCAGTTGTGGTTGGA
AACTGCACAGGGTTTGCAGTTAACAGGATGTTCTTCCCATACACACAGGCAGCTATGTTC
CTTGTTGAGCATGGAGCAGATCCATATCTCATCGACAAAGCAGTCAGCAAGTTTGGAATG
CCAATGGGTCCCTTCAGATTGTGCGACCTGGTTGGATTCGGTGTTGCGATTGCAACCGCA
ACACAATTCATCGAGAACTTCACAGAACGGACATACAAATCAATGATTATCCCACTCATG
CAAGAGGACAAGAGAGCTGGTGAAGCCACTCGTAAAGGATTCTATCTTTATGATGATAAG
CGCAAG*CTAAACCTGACCCTGAATTAAAGAAATATATCGA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4CQ23TF 708 0 0
G
CATCTACCATTGATCTGAACAAAATTGGGGAGCGGACCAAGTCCCAGGATCGGATTATCG
GAGCACATTTTTTCAGTCCAGCACATGTCATGCCACTACTTGAAATAGTTCGGACCAATC
ATACCTCTGCCCAAGTAATTGTTGACCTGTTAGATGTTGGGAAGAAGATTAGGAAAACAC
CAGTTGTGGTTGGAAACTGCACAGGGTTTGCAGTTAACAGGATGTTCTTCCCATACACAC
AGGCAGCTATGTTCCTTGTTGAGCATGGAGCAGATCCATATCTCATCGACAAAGCAGTCA
GCAAGTTTGGAATGCCAATGGGTCCCTTCAGATTTTGCGACCTGGTTGGATTCGGTGTTG
CGATTGCAACCGCAACACAATTCATCGAGAACTTCACAGAACGGACATACAAATCAATGA
TTATCCCACTCATGCAAGAGGACAAGAGAGCTGGTGAAGCCACTCGTAAAGGATTCTATC
TTTATGATGATAAGCGCAAGGCTAAACCTGACCCTGAATTAAAGAAATATATCGAGAAGG
CAAGGAGCGTATCAGGAGCAAAGCTTGATCCGAAGTTGGAGAAACTGTCGGAGAAGGAAA
TTATTGAAATGACGTTTTTCCCGGTAGTGAACGAGGCCTGTAGAGTTTTTGCGGAGGGTA
TTGCTGTCAAGGCAGCAGACCTTGACATTGCTGGCATATTTGGAATG

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR4H465TF 619 0 0
GGTTTGCAGTTAACAGGATGTTCTTCCCATACACACAGGCAGCTATGTTCCTTGTTGAGC
ATGGAGCAGATCCATATCTCATCGACAAAGCAGTCAGCAAGTTTGGAATGCCAATGGGTC
CCTTCAGATTGTGCGACCTGGTTGGATTCGGTGTTGCGATTGCAACCGCAACACAATTCA
TCGAGAACTTCACAGAACGGACATACAAATCAATGATTATCCCACTCATGCAAGAGGACA
AGAGAGCTGGTGAAGCCACTCGTAAAGGATTCTATCTTTATGATGATAAGCGCAAGGCTA
AACCTGACCCTGAATTAAAGAAATATATCGAGAAGGCAAGGAGCGTATCAGGAGCAAAGC
TTGATCCGAAGTTGGAGAAACTGTCGGAGAAGGAAATTATTGAAATGACGTTTTTCCCGG
TAGTGAACGAGGCCTGTAGAGTTTTTGCGGAAGGTATTGCTGTCAAGGCAGCAGACCTTG
ACATTGCTGGCATATTTGGAATGGGTTTCCCACCTTACAGAGGTGGAATCATGTTCTGGG
CTGATTCCATTGGATCGAAATACATTTACTCAAAGCTAGAGGAGTGGTCCAAGACTTATG
GTGATTTCTTCA
GCCTTGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4H465JQB 185 0 0
TTTTTTTTTGTCCACATTTACTTGCCAGGAAGTTGGGATTTTTGGCCTCAGTAACTTTTT
AAAATAAAGTTTCATTTCAAGACAGATGAACAAAGTAGAAAGTACGAACAGCAATAAGAT
TTGTATTTTTGGGATGTTACTCATATATAATGCTTTGTCATACAAAGG
TTTCAGATACATTTGTT

QA 1 168 1 168
DS 

RD RR4CQ23JQ 815 0 0
TGCGATTGCAACCGCAACACAAATCATCGAGA*CTTCACAGAACGGACATACAAATCAAT
GATTATCCCACTCATGCAAGAGGACAAGAGAGCTGGTGAAGCCACTCGTAAAGGATTCTA
TCTTTATGATGATAAGCGCAAGGCTAAACCTGACCCTGAATTAAAGAAATATATCGAGAA
GGCAAGGAGCGTATCAGGAGCAAAGCTTGATCCGAAGTTGGAGAAACTGTCGGAGAAGGA
AATTATTGAAATGACGTTTTTCCCGGTAGTGAACGAGGCCTGTAGAGTTTTTGCGGAAGG
TATTGCTGTCAAGGCAGCAGACCTTGACATTGCTGGCATATTTGGAATGGGTTTCCCACC
TTACAGAGGTGGAATCATGTTTTGGGCTGATTCCATTGGATCGAAATACATTTACTCAAA
GCTAGAGGAGTGGTCCAAGACTTATGGTGATTTTTTCAAGCCTTGTGCTTTTTCGGCTGA
AAGGGGATCTAAAGGAGCTCCTTTGAGCGCTCCCTTGGAACAAGGCAGGTCGCGGTTGTA
AGGTCAGCGTTTCAACGAGGAACTTTTCTTTATTGCTGCATTTACTGTTTTTCTTTGTCC
ACATTTACTTGCCAGGAAGTTGGGATCTTTGGCCTCAGTAACTTTTTAAAATAAAGTCTC
ATCTCAAGACAGATGAACAAAGTAGAAAGTACGAATAGCAATAAGATTTGTATTTTTGTG
ATGTTACTCATATATAATGCTTTGTCATACAAAGGCTGTCAGGTACATTTGTTATTAAAG
CTTTTTGGAGTAATAAGTTCTGTGATTTGTTGATG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 5

CO CL1908Contig1 1200 5 21 U
AGTCTCAATACTTTGTTTAATTTTCTCCCAAACGACAAGTTTATACAATTGACTTATTAA
GCAAAGACGGTGTCTTCTTCCTTTTTTCTGATGGGATAATGAGATCCCAAGAACTACTTG
AGTATATAACAATCCAAAGGTCTTATCTTTTGTTCCAAATGATGCGAGAGGAAATTGAAA
AGACGACACAACCCACATGTGGGTTTTACTTTTAGAAGCCTCTCTACTTCTTTGGATTCA
CTTCCAAATTCATCTCCTGTAGGTTAAGCAAGAGATCATCAGAGCTCAGGTACACCTTGT
TGGCCGAGTGTGCTATGGTTTGAGCAATCTCTCTCGCCGCCTCGATCTTCCTGAGCGTTA
TGAACGCTTGGTTGTTTGCAATCGCTTGGCCTATAAGCTGAGCACTCTTGGCTTCTCCCT
GGGCGCGGATAACTGCACTTCTCTTGTCTTGTTCAGCCTTCTCAACGATGAACTTAGCCC
TCTCAGCCTCTTGAGCCGCCACCTGCTTTGCTTCAATGGCAGCAGTGAACTCTTTTCCGA
ATGTCAGGGTCGTGATGGACACATCGTCAAGCGCAATGTTGAAGTTAGTTGCTCGTTGAG
TCAGAATCTTCCTGATCTCCCTACTAACCGCCTCTCTCTGGGTGATAAGCTGGCTTGCAT
TGTACTGAGCAACAACAGCTTTCAGAGTCTCGTGGATTATGGAAGGCAGAACTCTCTCGC
TGTAGTTCTCACCGAGGGTTCTGTAGATCTCAGGTAACTGATCCGCCATGGGACGAGTGA
GAACTCTCAGCCCAATCTTCACCATCTGGAGATCACGACTTCCAGATGTAATCTCAACAA
GGTAAGGTCGAGCACGAACGTCGTAAATGACCGGCCCTTCGAACCAAGGAACCATAAGGT
GCGTGCCCTCAGGGTAAACCTTGTCTTTAACACCGACTAAACGGTTGAACATGATAGCTC
GATGACCTCCGTCGACATTGTAGAGACTCTGCGTGGCAGCGTAGAGACCGAGCCCACCGA
TAATCCCAACCTTAAGAAACGCAGATACAGCACCACCACCTGGCACCTTGGGAACTTTCA
CGTTGTTGAGATTCATCTACCTGAGAGGCTGATAGCTTTTGCTAATATCGCGGAGAAGAG
AGGGGGGAAGATCGTCGGAAATGGGTTTAGGGTTTAAGCTCTCACCGGCTTTCTACTCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GR96JQ U 42
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AF RR4EM70JQ U 1
AF RR4D791TF C 505
AF RR4EM70TF C 616
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TA
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ATCCCAAGAACTACTTGAGTATATAACAATCCAAAGGTCTTATCTTTTGTTCCAAATGAT
GCGAGAGGAAATTGAAAAGACGACAC

QA 3 148 3 148
DS 

RD RR4D791JQ 544 0 0
G
TACAATTGACTTATTAAGCAAAGACGGTGTCTTCTTCCTTTTTTCTGATGGGATAATGAG
ATCCCAAGAACAACTTGAGTATATAACAATCCAAAGGTCTTATCTTTTGTTCCAAATGAT
GCGAGAGGAAATTGAAAAGACGACACAACCCACATGTGGGTTTTACTTTTAGAAGCCTCT
CTACTTCTTTGGATTCACTTCCAAATTCATCTCCTGTAGGTTAAGCAAGAGATCATCAGA
GCTCAGGTACGCCTTGTTGGCCGAGTGTGCTATGGTTTGAGCAATCTCTCTCGCCGCCTC
GATCTTCCTGAGCGTTATGAACGCTTGGTTGTTTGCAATCGCTTGGCCTATAAGCTGAGC
ACTCTTGGCTTCTCCCTGGGCGCGGATAACTGCACTTCTCTTGTCTTGTTCAGCCTTCTC
AACGATGAACTTAGCCCTCTCAGCCTCTTGAGCCGCCACCTGCTTTGCTTCAATGGCAGC
AGTGAACTCTTTTCCGAATGTCAGGGTCGTGATGGACACATCGTCAAGCGCAATGTTGAA
GTT

QA 2 544 2 544
DS 

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GCAAAGACGGTGTCTTCTTCCTTTTTTCTGATGGGATAACGAGATCCCAAGAACTACTTG
AGTATATAACAATCCAAAGGTCTTATCTTTTGTTCCAAATGATGCGAGAGGAAATTGAAA
AGACGACACAACCCACATGTGGGTTTTACTTTTAGAAGCCTCTCTACTTCTTTGGATTCA
CTTCCAAATTCATCTCCTGTAGGTTAAGCAAGAGATCATCAGAGCTCAGGTACACCTTGT
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TGAACGCTTGGTTGTTTGCAATCGCTTGGCCTATAAGCTGAGCACTCTTGGCTTCTCCCT
GGGCGCGGATAACTGCACTTCTCTTGTCTTGTTCAGCCTTCTCAACGATGAACTTAGCCC
TCTCAGCCTCTTGAGCCGCCACCTGCTTTGCTTCAATGGCAGCAGTGAACTCTTTCCCGA
ATGTCAGGGTCGTGATGGACACATCGTCAAGCGCAATGTTGAAGTTAGTTGCTCGTTGAG
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TGTACTGAGCAACAACAGCTTTCAGAGTCTCGTGGATTATGGA

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DS 

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GCTTTGCTTCAATGGCAGCAGTGAACTCTTTTCCGAATGTCAGGGTCGTGATGGACACAT
CGTCAAGCGCAATGTTGAAGTTAGTTGCTCGTTGAGTCAGAATCTTCCTGATCTCCCTAC
TAACCGCCTCTCTCTGGGTGATAAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAACAACAGCTTTCA
GAGTCTCGTGGATTATGGAAGGCAGAACTCTCTCGCTGTAGTTCTCACCGAGGGTTCTGT
AGATCTCAGGTAACTGATCCGCCATGGGACGAGTGAGAACTCTCAGCCCAATCTTCACCA
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CTTTGACACCGACTAAACGGTTGAACATGATGGCTCGATGACCTCCGTCGACATTGTAGA
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GTTTAGGGTTT
CC

QA 1 671 1 671
DS 

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TCTCCCTACTAACCGCCTCTCTCTGGGTGATAAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAACAA
CAGCTTTCAGAGTCTCGTGGATTATGGAAGGCAGAACTCTCTCGCTGTAGTTCTCACCGA
GGGTTCTGTAGATCTCAGGTAACTGATCCGCCATGGGACGAGTGAGAACTCTCAGCCCAA
TCTTGACCATCTGGAGATCACGGCTTCCGGATGTGCTCTCAACAAGGTAAGGTCGAGCAC
GAACGTCGTAAATGACCGGCCTTTCGAACCAAGGAACCATAAGGTGCGTGCCCTCAGGGT
AAACCTTGTCTTTAACACCGACTAAACGGTTGAACATGATAGCTCGATGACCTCCGTCGA
CATTGTAGAGACTCTGCGTGGCAGCGTAGAGACCGAGCCCACCGATAATCCCAACCTTAA
GCAACGCAGATACAGCACCACCACCTGGCACCTTGGGAACTTTCACGTTGTTGAGATTCA
TCTACCTGAGAGGCTTATAGCTTTTGCTAATATCGCGGAGAAGAGAGGGGGGA*GATCGT
CGGAAATGGGTTTAGGGTTTAAGCTCTCACCGGCTTTCTACTCCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 5

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GGGAAACGATAAGAGAAATTGCTAATTACAAGTTTTAAAAATCTCGTTAAAATAAATAAC
TATTTTTTTGACTGATCTCGTTCTCCGCGTAGGATACTGCTTTTTGGTTTAATTTCATAG
ATTAAATGAAGAAAACTGCTCTACTATATCCACTTTATTCAAAAAAAGTTCTATGTTTTA
ACTGAAGTTATATAATAGAGTTATTTTTTTATGTATTATTTTTTCTTATTAATTTCTTAA
AGTAAAGGGTTTTTCAATGAATCAGTTACGTGAATTCTGAATCCTGAGATGGTACAGATG
CCAAAGACGATGAATTTAGTTTTTTTCTTTTTATCTATTTTTGTTCATACCACCGATAAT
GATTGATAACTCACAAATTTTCAAGTGAATTTTTTGATTCTTGGAACTAGTATTTGTATC
TATCTTAAAAATTTTTTTTTATTGAAACTTCGGGAAGTACTTTAGAAACATATGTATAAA
AAAACATATTTTATTGAGTCCCTTCATGCCTACTATAACTAGTTATTTCGGTTTTCTACT
AGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTATTTATTGGTCTAAGCAAAATACGACTTATTTG
AAATTAATTGAATGAATCTTTTTTGATCAAAAAAGATTTATATGGTATTTCATATGTTCG
ATAGTTCTTTACCGTGTTAATTACCCAATTTTGGTCATTGAGATTCATCGGCAATACAGA
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AAATTGAAATGATTGAAGTTTCTTTATTTGGAATCGTCTTAGGTCTAATTCCTATTACTT
TGGCTGGATTATTCGTAACTGCTCATTTACAATACAGACGTGGTGATCAGTTGGACTTTT
GATTAATTAACATCTCTTTTTTTTTGACTGACCTCCTTCTTGCTTTCATATGCGGGAGGT
CTAATTCAGATTGCTGCTCAATTATTTGCGAACAGTGGAATTTTGACACAATCTAATAAA
CAAGAGTGACATCACGCTCTGTAGGATTTGAACCTACGACATTGGGTTTTGGAGACCCAC
GTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTTTTCTTGTTTTTCT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC31TF U 1
AF RR4BW77JQ U 346
AF RR4BC31JQ C 625
AF RR4BW77TF C 346
AF RR4E927TF U 448
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ATTAAATGAAGAAAACTGCTCTACTATATCCACTTTATTCAAAAAAAGTTCTATGTTTTA
ACTGAAGTTATATAATAGAGTTATTTTTTTATGTATTATTTTTTCTTATTAATTTCTTAA
AGTAAAGGGTTTTTCAATGAATCAGTTACGTGAATTCTGAATCCTGAGATGGTACAGATG
CCAAAGACGATGAATTTAGTTTTTTTCTTTTTATCTATTTTTGTTCATACCACCGATAAT
GATTGATAACTCACAAATTTTCAAGTGAATTTTTTGATTCTTGGAACTAGTATTTGTATC
TATCTTAAAAATTTTTTTTTATTGAAACTTCGGGAAGTACTTTAGAAACATATGTATAAA
AAAACATATTTTATTGAGTCCCTTCATGCTTACTATAACTAGTTATTTCGGTTTTCTACT
AGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTATTTATTGGTCTAAGCAAAATACGACTTATTTG
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ATAGTTCTTTACCGTGTTAATTACCCAATTTTGGTCATTGAGATTCATCGGCAATACAGA
TTAAGAGCTAGGAATAGATAGTACCTCTCTTTTCTCCCTTT

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TTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTATTTATTGGTCTAAGCAA
AATACGACTTATTTGAAATTAATTGAATGAATCTTTTTTGATCAAAAAAGATTTATATGG
TATTTCATATGTTCGATAGTTCTTTACCGTGTTAATTACCCAATTTTGGTCATTGAGATT
CATCGGCAATACAGATTAAGAGCTAGGAATAGATAGTACCTCTCTTTTCTCCCTTTCAAA
AATGAAAACAAAAGAAAATTGAAATGATTGAAGTTTCTTTATTTGGAATCGTCTTAGGTC
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C

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CCAATTTTGGTCATTGAGATTCATCGGCAATACAGATTAAGAGCTAGGAATAGATAGTAC
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TATTTGGAATCGTTTTAGGTCTAATTCCTATTACTTTGGCTGGATTAT

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DS 

RD RR4BW77TF 540 0 0
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AAACATATGTATAAAAAAACATATTTTATTGAGTCCCTTCATGCCTACTATAACTAGTTA
TTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTATTTATTGGTCTAAGCAA
AATACGACTTATTTGAAATTAATTGAATGAATCTTTTTTGATCAAAAAAGATTTATATGG
TATTTCATATGTTCGATAGTTCTTTACCGTGTTAATTACCCAATTTTGGTCATTGAGATT
CATCGGCAATACAGATTAAGAGCTAGGAATAGATAGTACCTCTCTTTTCTCCCTTTCAAA
AATGAAAACAAAAGAAAATTGAAATGATTGAAGTTTCTTTATTTGGAATCGTCTTAGGTC
TAATTCCTATTACTTTGGCTGGATTATTCGTAACTGCTCATTTACAATACAGACGTGGT
C

QA 1 539 1 539
DS 

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G
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CTTACTATAACTAGTTATTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTA
TTTATTGGTCTAAGCAAAATACGACTTATTTGAAATTAATTGAATGAATCTTTTTTGATC
AAAAAAGATTTATATGGTATTTCATATGTTCGATAGTTCTTTACCGTGTTAATTACCCAA
TTTTGGTCATTGAGATTCATCGGCAATACAGATTAAGAGCTAGGAATAGATAGTACCTCT
CTTTTCTCCCTTTCAAAAATGAAAACAAAAGAAAATTGAAATGATTGAAGTTTCTTTATT
TGGAATCGTCTTAGGTCTAATTCCTATTACTTTGGCTGGATTATTCGTAACTGCTTAGTT
ACAATACAGACGTGGTGATCAGTTGGACTTTTGATTAATTAACATCTCTTTTTTTTTGAC
TGACCTCCTTCTTGCTTTCATATGCGGGAGGTCTAATTCAGATTGCTGCTCAATTATTTG
CGAACAGTGGAATTTTGACACAATCTAATAAACAAGAGTGACATCACGCTCTGTAGGATT
TGAACCTACGACATTGGGTTTTGGAGACCCACGTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTT
TTCTTGTTTTTCT

QA 2 674 2 674
DS 



AS 1 5

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AACACGACGAATCTGTGACGGCGCCGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGT
TGATGGATAAGATAACGGAGAAGATCCACCACGGTGGCGATTCCTCTTCGTCGTCTTCAT
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AATCAAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCATAAGGTTCTCGGCGGTG
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GTGCTACAGCCGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTT
GCCACGTGATGATTGTTGTGCTTGCCGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCAACCATGTTCA
TCAACAAGTCGCCACCAAAGATACCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGC
TCGCATCTGGGCTCAGAATCGAGATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATTGCTT
CTGGCCGGGATCTCAAGAAATTCCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTATCCATCA
TGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTTCTCTTCACGG
TCCCTCTTGTATACGACAAGTACGAAGACAAGGTCGACCCATTAGGTGAGAAAGCAATGA
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GCCCGTTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGGTTTACAAAATGGTGATTGTGTTCGTCAGA
TAGCAAGAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAA
TATGTTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTTTTGTTTATGCCATTGT
TGGTGAACGTGGAAGGGATACGATTAGTGTTGGTTCTTTTTTCTCTCTAAACCTATAACC
ATTTGAATATTCTATTTTGCAATCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ20TF U 121
AF RR4GH89TF U 1
AF RR4ED06TF U 121
AF RR4CZ20JQ C 475
AF RR4GH89JQ C 485
BS 1 665 RR4GH89TF
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GGGTAGCTTGAAAGC
TGTTGAAATCGAATCGGAGAAGAGAAGAGATGGCTGAGGAACACAAACACGACGAATCTG
TGACGGCGCCGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGTTGATGGATAAGATAA
CGGAGAAGATCCACCACGGTGGCGATTCCTCTTCGTCGTCTTC*TCGTCTGATGACGAGG
ACGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGGAGTCTCCGTCTTCTGTGAAATCAAAA*TCTACC
GCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCATAAGGT*CTCGGCGGTGGAAAGCCGGCGGATA
TATTCATGTGGAAGG
TAAG

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DS 

RD RR4GH89TF 665 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGAAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGAAATCGAATCGGAGAAGAGAAGAGATGGCTGAGGAACACA
AACACGACGAATCTGTGACGGCGCCGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGT
TGATGGATAAGATAACGGAGAAGATCCACCACGGTGGCGATTCCTCTTCGTCGTCTTCAT
CGTCTGATGACGAGGACGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGGAGTCTCCGTCTTCTGTGA
AATCAAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCATAAGGTTCTCGGCGGTG
GAAAGCCGGCGGATATATTCATGTGGAAGGATAAGAAGATGTCTGGTGGTGTGCTTGGTG
GTGCTACAGCCGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTT
GCCACGTGATGATTGTTGTGCTTGCCGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCAACCATGTTCA
TCAACAAGTCGCCACCAAAGATACCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGC
TCGCA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4ED06TF 754 0 0
GGGTAGCTTGAAAGC
TGTTGAAATCGAATCGGAGAAGAGAAGAGATGGCTGAGGAACACAAACACGACGAATCTG
TGACGGCGCCGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGTTGATGGATAAGATAA
CGGAGAAGATCCACCACGGTGGCGATTCCTCTTCGTCGTCTTCATCGTCTGATGACGAGG
ACGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGGAGTCTCCGTCTTCTGTGAAATCAAAAGTCTACC
GCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCATAAGGTTCTCGGCGGTGGAAAGCCGGCGGATA
TATTCATGTGGAAGGATAAGAAGATGTCTGGTGGTGTGCTTGGTGGTGCTACAGCCGCGT
GGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCACGTGATGATTG
TTGTGCTTGCCGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCAACCATGTTCATCAACAAGTCGCCGC
CAAAGATACCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTCGCATCTGGGCTCA
GAATCGAGATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATTGCTTCTGGCCGGGATCTCA
AGAAATTCCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTATCCATCATGGGCGGCTGGTTCA
ATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTTCTCTTCACGGTCC*TCTTGTATACG
ACAAGTACGAAGACA
GTCG

QA 16 750 16 750
DS 

RD RR4CZ20JQ 714 0 0
TTGGTGGTGCTACAGCCGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTT
TGCTTTGCCACGTGATGATTGTTGTGCTTGCCGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCAACCA
TGTTCATCAACAAGTCGCCGCCAAAGATACCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCC
TTCAGCTCGCATCTGGGCTCAGAATCGAGATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGA
TTGCTTCTGGCCGGGATCTCAAGAAATTCCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTAT
CCATCATGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTTCTCT
TCACGGTCCCTCTTGTATACGACAAGTACGAAGACAAGGTCGACCCATTAGGTGAGAAAG
CAATGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCC
CAATGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGGTTTACAAAATGGTGATTGTGTTC
GTCAGATAGCAAGAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATC
TTTTAATATGTTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTTT*GTTTATGC
CATTGTTGGTGAACGTGGAAGGGATACGATTAGTGTTGGTTCTTTTTTCTCTCT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GH89JQ 741 0 0
TACAGCCGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCA
CGTGATGATTGTTGTGCTTGCCGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCAACCATGTTCATCAA
CAAGTCGCCACCAAAGATACCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTCGC
ATCTGGGCTCAGAATCGAGATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATTTCTTCTGG
CCGGGATCTCAAGAAATTCCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTATCCATCATGGG
CGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTTCTCTTCACGGTTCC
TCTTGTATACGACAAGTACGAAGACAAGGTCGACCCATTAGGTGAGAAAGCAATGATCGA
GATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCAATGGGCCC
GTTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGGTTTACAAAATGGTGATTGTGTTCGTCAGATAGC
AAGAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAATATG
TTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTTTTGTTTATGCCATTGTTGGT
GAACGTGGAAGGGATACGATTAGTGTTGGTTCTTTTTTCTCTCTAAACCTATAACCATTT
GAATATTCTATTTTGCAATCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 2 4

CO CL1911Contig1 565 2 7 U
GGGAACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAG
AGTCGCTCTTGTGAACTATGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGT
CGACCAGAACAGGGCTTTAGTAGATGCCCCTGACACGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTTACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTTCCAAAGAAGAAGGCATT
GATTGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGCGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCCTGGGGTAG
GAAGCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTTAATGATTTTGACAGATTCAAGATCAT
GTTGGCCAAGATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGA
GATCACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGT
AGTTAGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTATTGTCGGATGTTAATTTC
AATTTTGAATGAAACCTTGTTTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A761TF U 1
AF RR4DX77TF U 1
BS 1 58 RR4A761TF
BS 59 59 RR4DX77TF
BS 60 178 RR4A761TF
BS 179 179 RR4DX77TF
BS 180 535 RR4A761TF
BS 536 536 RR4DX77TF
BS 537 565 RR4A761TF

RD RR4A761TF 565 0 0
GGGAACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGGG
AGTCGCTCTTGTGAACTATGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGT
CGACCAGAACAGGGCTTTAGTAGATGCCCCTGACACGGAGAGGATCCAGATGAACTTCGA
GAGGTTGTCTCTTACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTTCCAAAGAAGAAGGCATT
GATTGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGCGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCCTGGGGTAG
GAAGCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTTAATGATTTTGACAGATTCAAGATCAT
GTTGGCCAAGATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGA
GATCACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGT
AGTTAGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTATTGTCGGATGTTACTTTC
AATTTTGAATGAAACCTTGTTTGGA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4DX77TF 544 0 0
GGGAAC
ATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTCGC
TCTTGTGAACTATGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTCGACCA
GAACAGGGCTTTAGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGGTT
GTCTCTTACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTTCCAAAGAAGAAGGCATTGATTGA
GGCCATGGAGAAAGCTGACGCGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCCTGGGGTAGGAAGCT
CATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTTAATGATTTTGACAGATTCAAGATCATGTTGGC
CAAGATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAGATCAC
CGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTAGTTAG
TGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTATTGTCGGATGTTAATTTCAATT

QA 7 544 7 544
DS 



CO CL1911Contig2 545 2 2 U
GGATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTC
GCGCTTGTGAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTGGAC
CAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGG
TTGTCTCTCACTGACATCGTTATCGAAATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCTTTGATT
GAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAG
CTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTTGACAGATTCAAGATCATGTTG
GCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAGATC
ACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTAGTT
AGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTATTGTCGGATGTTAATTTCAATT
TTGAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR4DD15JQ C 1
AF RR4DD15TF U 1
BS 1 2 RR4DD15JQ
BS 3 545 RR4DD15TF

RD RR4DD15JQ 545 0 0
GGATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTC
GCGCTTGTGAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTGGAC
CAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGG
TTGTCTCTCACTGACATCGTTATCGAAATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCTTTGATT
GAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAG
CTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTTGACAGATTCAAGATCATGTTG
GCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAGATC
ACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTAGTT
AGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTATTGTCGGATGTTAATTTCAATT
TTGAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4DD15TF 545 0 0
GG
ATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTCGC
GCTTGTGAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTGGACCA
GAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGGTT
GTCTCTCACTGACATCGTTATCGAAATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCTTTGATTGA
GGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCT
CATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTTGACAGATTCAAGATCATGTTGGC
CAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAGATCAC
CGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTAGTTAG
TGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTATTGTCGGATGTTAATTTCAATTTT
GAA

QA 3 545 3 545
DS 



AS 1 4

CO CL1912Contig1 800 4 17 U
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACGAAAGTAACAAAAAAAA*GGACGATTTGATAGCAA
TCAAAATGGTGGAAGAGAAGAGCTTCAGGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCCG
GATACGCGGCTAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATCT
CCAGGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGACCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTCC
AGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAGT
TCCCTCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAAG
CAGACCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACTGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACCT
TGATCGCTGCTACTGGTTCTTCTGTCACAAGGCTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCAG
ATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGATGCTGATGAGCTTCTGACCGCAA
TGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATCGGTCTTGAAC
TCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGGT
GCATGCC*TCGGCTTTTCACCGCTGACATTGCTTCCTTCTATGAGGGTTACTACGCCAAC
AAAGGGATCAACATTGTCAAA*GGCACCGTTGCTGCCGGTTTCACCACTAACTCTGCTGG
AGAGGTCACTGAGTGTTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4AZ95TF U 1
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BS 132 331 RR4AM30TF
BS 332 332 RR4AW64TF
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BS 366 667 RR4AM30TF
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BS 669 741 RR4AM30TF
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TCCCTCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAAG
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TCCCTCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAAG
CAGACCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACTGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACCT
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QA 1 778 1 778
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G
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CCTAAGAGAGCTTGTAGATGCTGATGAGCTTCTGACCGCAATGCTCGAAAAGGAAAATGG
CAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATCGGTCTTGAACTCAGTTCTGCTCTCAAGGT
TAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGGTGCATGCC*TCGGCTTTTCA
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AA**GCACCGTTGCTGCCGGTTTCACCACTAACTCTGCTGGAGAGGTCACTGAGTGTTAT
T

QA 2 662 2 662
DS 



AS 1 5

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TAAAAGTGCGTTTGAAACGGCTTTTATAGGAGCGGTAGCCTCAGGGGCTGCTTTTTGTTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G826TF U 11
AF RR4CZ86TF U 14
AF RR4BJ51TF U 1
AF RR4G826JQ C 172
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CATATTCGGCTATGGAAAAGGGCATTTCACCGGCAGCAAACAATTTAAAAGTGCGTTTGA
A

QA 6 726 6 726
DS 

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GG
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CACCGCAGGAGAGATCGTTCGTGACATCATCATCGGCGTTTCTGACGGTTTAACCGTTCC
ATTTGCACTCGCCGCCGGACTCTCCGGTGCTAACGCCTCTTCGTCTATCATACTCACCGC
TGGTATAGCCGAAGTCGCCGCCGGCGCTATCTCCATGGGACTCGGCGGGTATCTAGCGGC
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CATTCCTGAGACTGAAGCAGCAGAGGTGGCAGAGATGTTGGAACACTATGGAGTAGAGCC
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TATGATGAGGTTTGAGCTGGGATTAGAGAAGCCTGAGCCAAAAAGAGCACTACAAAGTGC
GTTCACGATTGCAATCGCTTATGTTCTTGGTGGTTTCATACCTCTATTTCCCTATATCTT
CATACCGCAAGCAATGGATGCGGTAGCGGCGTCTGTGGTTATAACTCTGCTGGCTCTCTT
CATATTCG*CTATGGAAAAGGGCATTTCACCGGCAGCAA*CAATTTAAAAGTGCGTTTGA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4BJ51TF 791 0 0
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AGGAGATAAAATAACGAGGATCACTATAGAGCCTGAGAAGCAATCACTTCTCGATCATCA
TACCGAGAAACACTTCACCGCAGGAGAGATCGTTCGTGACATCATCATCGGCGTTTCTGA
CGGTTTAACCGTTCCATTTGCACTCGCCGCCGGACTCTCCGGTGCTAATGCCTCTTCGTC
TATCATACTCACCGCTGGTATAGCCGAAGTCGCCGCCGGCGCTATCTCCATGGGACTCGG
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AGAAGAGATCAAGACCATTCCTGAGACTG******CAGAGGTGGCAGAGATGTTGGAACA
CTATGGAGTAGAGCCACATGAATATTCACCTGTTGTTAATGCTCTTCGTAAAAATCCTCA
AGCATGGTTTGATTTTATGATGAGGTTTGAGCTGGGATTAGAGAAGCCTGAGCCAAAAAG
AGCACTACAAAGTGCGTTCACGATTGCAATCGCTTTTGTTCTTGGTGGTTTCATACCTCT
ATTTCCCTATATCTTCATACCGCAAGCAATGGATGCGGTAGTGGCGTCTGTGGTTATAAC
TCTGCTGGCTCTCTTCATATTCGGCTATGGAAAAGGGCATTTCACCGGCAGCAAACAATT
TAAAAGTGCGTTTGAAACGGCTTTTATAGGAGCGGTAGCCTCAGGGGCTGCTTTTTGTTT
GGCTAAAGTGG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4G826JQ 759 0 0
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CTCTTCGTCTATCATACTCACCGCTGGTATAGCCGAAGTCGCCGCCGGCGCTATCTCCAT
GGGACTCGGCGGGTATCTAGCGGCCAAGAGCGAAGCGGATCATTATGCGAGAGAGGTAAA
ACGAGAACAAGAAGAGATCAAGACCATTCCTGAGACTGAAGCAGCAGAGGTGGCAGAGAT
GTTGGAACACTATGGAGTAGAGCCACATGAATATTCACCTGTTGTTAATGCTCTTCGTAA
AAATCCTCAAGCATGGTTTGATTTTATGATGAGGTTTGAGCTGGGATTAGAGAAGCCTGA
GCCAAAAAGAGCACTACAAAGTGCGTTCACGATTGCAATCGCTTATGTTCTTGGTGGTTT
CATACCTCTATTTCCCTATATCTTCATACCGCAAGCAATGGATGCGGTAGTGGCGTCTGT
GGTTATAACTCTGCTGGCTCTCTTCATATTCGGCTATGGAAAAGGGCATTTCACCGGCAG
CAAACAATTTAAAAGTGCGTTTGAAACGGCTTTTATAGGAGCGGTAGCCTCAGGGGCTAC
TTTTTGTTTGGCTAAAGTGGTGCAGCTTTGATAAAACTAATGTTGCGTTTTAATGTTTTA
AATTGGAGTGATATTGCATGCAATGTGACGGTAAAAGTACAACTTATTGTGACATAATGC
AAACTTAAAGAAGCAAATATTTGGTTGTTCATTGTTCAG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4F796JQ 667 0 0
GGTATAGCCGAAGTCGCCGCCGGCGCTATCTCCATGGGACTCGGCGGGTATCTAGCGGCC
AAGAGCGAAGCGGATCATTATGCGAGAGAGGTAAAACGAGAACAAGAAGAGATCAAGACC
ATTCCTGAGACTGAAGCAGCAGAGGTGGCAGAGATGTTGGAACACTATGGAGTAGAGCCA
CATGAATATTCACCTGTTGTTGATGCTCTTCGTAAAAATCCTCAAGCATGGTTTGATTTT
ATGATGAGGTTTGAGCTGGGATTAGAGAAGCCTGAGCCAAAAAGAGCACTACAAAGTGCG
TTCACGATTGCAATCGCTTATGTTCTTGGTGGTTTCATACCTCTATTTCCCTATATCTTC
ATACCGCAAGCAATGGATGCGGTAGTGGCGTCTGTGGTTATAACTCTGCTGGCTCTCTTC
ATATTCGGCTATGGAAAAGGGCATTTCACCGGCAGCAAACAATTTAAAAGTGCGTTTGAA
ACGGCTTTTATAGGAGCGGTAGCCTCAGGGGCTGCTTTTTGTTTGGCTAAAGTGGTGCAG
CTTTGATAAAACTAATGTTGCGTTTTAATGTTTTAAATTGGAGTGATATTGCATGCAATG
TGACGGTAAAAGTACAACTTATTGTGACATAATGCAAACTTAAAGAAGCAAATATTTGGT
TGTTCAT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 5

CO CL1914Contig1 638 5 8 U
GGGCCGGCAAGGTAGAGAGAGAGAGTGAGAGACGACACCATGGTTAAGTTTCTGAAGCAG
AACAAAGCTGTGATCCTCCTCCAAGGTCGTTATGCCGGCAAGAAGGCAGTGATCATCCGT
TCATTCGACGACGGCAACCGCGAGCGTCCCTACGGACACTGTCTCGTCGCCGGGCTCAAG
AAGTATCCGAGCAAGGTCATCCGCAAGGACTCGGCCAAGAAGACGGCGAAGAAGTCGAGA
GTCAAGTGTTTCATCAAGGTCGTGAACTACCAGCATCTGATGCCTACTCGTTACACGTTG
GACGTGGATCTGAAGGAGGTTGCGACTCTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTG
GCGGCTCTTAAGGAAGCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACCGGTAAGAACAGG
TGGTTCTTCACCAAGCTCAGGTTCTGAGAAATGAGTTTTTCTTTTTATCTTTTGTAATGG
AATTTACGGATTACTTTTGTAGTTCTAAAATGGTGATGTGGATCGTGTTTAAGACTTGTT
GGTTTGAAAGATTTTGCCTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAA
GATTTACAGTGCTGGATTGGTAGTGAAATGTGCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW70JQ C 7
AF RR4CW70TF U 7
AF RR4AB92JQ C 1
AF RR4AB92TF U 1
AF RR4GY76TF U 3
BS 1 8 RR4AB92JQ
BS 9 232 RR4CW70TF
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GG
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QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4CW70TF 565 0 0
GG
AAGGTAGAGAGAGAGAGTGAGAGACGACACCATGGTTAAGTTTCTGAAGCAGAACAAAGC
TGTGATCCTCCTCCAAGGTCGTTATGCCGGCAAGAAGGCAGTGATCATCCGTTCATTCGA
CGACGGCAACCGCGAGCGTCCCTACGGACACTGTCTCGTCGCCGGGCTCAAGAAGTATCC
GAGCAAGGTCATCCGCAAGGACTCGGCCAAGAAGACGGCGAAGA*GTCGAGAGTCAAGTG
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TCTGAAGGAGGTTGCGACTCTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGACGGCTCT
TAAGGAAGCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACCGGTAAGAACAGGTGGTTCTT
CACCAAGCTCAGGTTCTGAGAAATGAGTTTTTCTTTTTATCTTTTGTAATGGAATTTACG
GATTACTTTTGTAGTTCTAAAATGGTGATGTGGATCGTGTTTAAGACTTGTTGGTTTGAA
AGATTTTGCCTTTTTTAACATTT

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4AB92JQ 601 0 0
GGGCCGGCAAGGTAGAGAGAGAGAGTGAGAGACGACACCATGGTTAAGTTTCTGAAGCAG
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GCGGCTCTTAAGGAAGCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACCGGTAAGAACAGG
TGGTTCTTCACCAAGCTCAGGTTCTGAGAAATGAGTTTTTCTTTTTATCTTTTGTAATGG
AATTTACGGATTACTTTTGTAGTTCTAAAATGGTGATGTGGATCGTGTTTAAGACTTGTT
GGTTTGAAAGATTTTGCCTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAA
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4AB92TF 601 0 0
GGGCCGGC
AAGGTAGAGAGAGAGAGTGAGAGACGACACCATGGTTAAGTTTCTGAAGCAGAACAAAGC
TGTGATCCTCCTCCAAGGTCGTTATGCCGGCAAGAAGGCAGTGATCATCCGTTCATTCGA
CGACGGCAACCTCGAGCGTCCCTACGGACACTGTCTCGTCGCCGGGCTCAAGAAGTATCC
GAGCAAGGTCATCCGCAAGGACTCGGCCAAGAAGACGGCGAAGAAGTCGAGAGTCAAGTG
TTTCATCAAGGTCGTGAACTACCATCATCTGATGTCTACTCGTTACACGTTGGACGTGGA
TCTGAAGGAGGTTGCGACTCTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCTCT
TAAGGAAGCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACCGGTAAGAACAGGTGGTTCTT
CACCAAGCTCAGGTTCTGAGAAATGAGTTTTTCTTTTTATCTTTTGTAATGGAATTTACG
GATTACTTTTGTAGTTCTAAAATGGTGATGTGGATCGTGTTTAAGACTTGTTGGTTTGAA
AGATTTTGCCTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAAG

QA 9 601 9 601
DS 

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GGGCCGGCAAGGT
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AAGGTCGTGAACTACCAGCATCTGATGCCTACTCGTTACACGTTGGACGTGGATCTGAAG
GAGGTTGCGACTCTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATGAGAAGGTGGCGGCTCTTAAGGAA
GCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACCGGTAAGAACAGGTGGTTCTTCACCAAG
CTCAGGTTCTGAGAAATGAGTTTTTCTTTTTATCTTTTGTAATGGAATTTACGGATTACT
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GCCTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAAGATTTACAGTGCTGG
ATTGGTAGTGAAATGTGCTTGTC

QA 14 636 14 636
DS 



AS 1 5

CO CL1915Contig1 907 5 25 U
CGGTCCCAAGAATAAAAAAGATAAATATATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTT
ATGCAGCTTCATGTGTAAATGAGCTAAAGATAAATTTTATCATCATCATAAGTGTTAATC
CTTTATTAACAAACCTTGAGAAGTAAGAATAAGTCCAGATTATTAAGGGAGAGATACCTG
GTTTTGGTTTGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATGGCAGTAACAACAGCCTT
GACTTGCAAGTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTT
ATACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTACC
AACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGATTCGCTGTGTCCAGATTCTGAGTGAACACTCCTGC
AGCTAAACCGTACCCAGAGTTGTTAGCCCTTGCAATCACCTCATCCAGATTCTTGAATTT
CAGGATGGTTTGAACAGGTCCAAAGATCTCGTCCGTTGCTATGAGCATGTCGTCTTTGAC
GTCCGAGAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAGCCCTTGGAACCAAACCGGTCACCTCCAGC
TTGTAAGGTGGCTCCATTCTCAACTCCATGTTTAATGAACTTCAAGATTTTCTTGAACTG
CTCTGAGTCCACCTGGGGACCCTGCTCAATGCCAGACTTGAAGGGATCGCCAACAGCGCG
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TGTGCGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGTCCCTGGTTAAAGAACAAAGCGAAATGAGCAAG
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CTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 0 0 0 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU96JQ U 10
AF RR4E890JQ U 10
AF RR4AQ59JQ U 1
AF RR4FD17JQ U 29
AF RR4FD17TF C 158
BS 1 63 RR4AQ59JQ
BS 64 64 RR4DU96JQ
BS 65 228 RR4AQ59JQ
BS 229 229 RR4FD17JQ
BS 230 384 RR4AQ59JQ
BS 385 385 RR4FD17JQ
BS 386 434 RR4AQ59JQ
BS 435 435 RR4FD17JQ
BS 436 501 RR4AQ59JQ
BS 502 502 RR4FD17JQ
BS 503 747 RR4AQ59JQ
BS 748 748 RR4FD17JQ
BS 749 774 RR4AQ59JQ
BS 775 775 RR4FD17JQ
BS 776 780 RR4AQ59JQ
BS 781 819 RR4FD17JQ
BS 820 820 RR4FD17TF
BS 821 825 RR4FD17JQ
BS 826 826 RR4FD17TF
BS 827 844 RR4FD17JQ
BS 845 845 RR4FD17TF
BS 846 857 RR4FD17JQ
BS 858 858 RR4FD17TF
BS 859 872 RR4FD17JQ
BS 873 907 RR4FD17TF

RD RR4DU96JQ 554 0 0
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CATGTGTAAATGAGCTAAAGATAAATTTTATCATCATCATAAGTGTTAATCCTTTATTAA
CAAACCTTGAGAAGTAAGAATAAGTCCAGATTATTAAGGGAGAGATACCTGGTTTTGGTT
TGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATGGCAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAA
GTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCC
AAATGGAATTGTGGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTACCAACCCTGAG
CGCTCTCATCAGCCGGTTCGCTGTGTCCAGATTCTGAGTGAACACTCCTGCAGCTAAACC
GTACCTAGAGTTGTTAGCCCTTGCAATCACCTCATCCAGATTCTTGAATTTCAGGATGGT
TTGAACAGGTCCGAAGATCTCGTCCGTTGCTATGAGCATGTCGTCTTTGACGTCCGAAAA
GACAGTGGGTTGAA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4E890JQ 691 0 0
GAATAAAAAAGATAAATATATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTTATGCAGCTT
CATGTGTAAATGAGCTAAAGATAAATTTTATCATCATCATAAGTGTTAATCCTTTATTAA
CAAACCTTGAGAAGTAAGAATAAGTCCAGATTATTAAGGGAGAGATACCTGGTTTTGGTT
TGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATGGCAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAA
GTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCC
AAATGGAATTGTGGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTACCAACCCTGAG
CGCTCTCATCAGCCGGTTCGCTGTGTCCAGATTCTGAGTGAACACTCCTGCAGCTAAACC
GTACCTAGAGTTGTTAGCCCTTGCAATCACCTCATCCAGATTCTTGAATTTCAGGATGGT
TTGAACAGGTCCGAAGATCTCGTCCGTTGCTATGAGCATGTCGTCTTTGACGTCCGAGAA
GACAGTGGGTTGAATGTAGTAGCCCTTGGAACCAAACCGGTCACCTCCAGCTTGTAAGGT
GGCTCCATTCTCAACTCCATGTTTAATGAACTTCAAGATTTTCTTGAACTGCTCTGAGTC
CACCTGGGGACCCTGCTCAATGCCAGACTTG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4AQ59JQ 784 0 0
CGGTCCCAAGAATAAAAAAGATAAATATATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTT
ATGTAGCTTCATGTGTAAATGAGCTAAAGATAAATTTTATCATCATCATAAGTGTTAATC
CTTTATTAACAAACCTTGAGAAGTAAGAATAAGTCCAGATTATTAAGGGAGAGATACCTG
GTTTTGGTTTGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATGGCAGTGACAACAGCCTT
GACTTGCAAGTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTT
ATACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTACC
AACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGGTTCGCTGTGTCCAGATTCTGAGTGAACACTCCTGC
AGCTAAACCGTACCTAGAGTTGTTAGCCCTTGCAATCACCTCATCCAGATTCTTGAATTT
CAGGATGGTTTGAACAGGTCCGAAGATCTCGTCCGTTGCTATGAGCATGTCGTCTTTGAC
GTCCGAGAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAGCCCTTGGAACCAAACCGGTCACCTCCAGC
TTGTAAGGTGGCTCCATTCTCAACTCCATGTTTAATGAACTTCAAGATTTTCTTGAACTG
CTCTGAGTCCACCTGGGGACCCTGCTCAATGCCAGACTTGAAGGGATCGCCAACAGCGCG
TTTGATTGCGCGAGCTTTAGCTTTCTCTACAAACTCATCATACACACGTTCATGTACAAA
CGTA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4FD17JQ 844 0 0
ATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTTATGTAGCTTCATGTGTAAATGAGCTAAA
GATAAATTTTATCATCATCATAAGTGTTAATCCTTTATTAACAAACCTTGAGAAGTAAGA
ATAAGTCCAGATTATTAAGGGAGAGATACCTGGTTT******GGTTTGGTTTAAAGCCAA
GCGGGGTTCTTGATGGCAGTAACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGTTGAGACTGTAG
ATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTGTACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCA
AACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTTCCGACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGATTG
GCTGTGTCCAGATTTTGAGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCCTGAGTTGTTCGCC
CTTGCAATCACCTCATCCAGATTCTTGAATTTCAGGATGGTTTGAACAGGTCCAAAGATC
TCGTCCGTTGCTATGAGCATGTCGTCTTTGACGTCTGAGAAGACAGTGGGTTGAATGTAG
TAGCCCTTGGAACCAAACCGGTCACCTCCAGCTTGTAAGGTGGCTCCATTCTCAACTCCA
TGTTTAATGAACTTCAAGATTTTCTTGAACTGCTCTGAGTCCACCTGGGGACCCTGCTCA
ATGCCAGACTTGAAGGGATCGCCAACAGCGCGTTTGATTGCGCGAGCTTTAGCTTTCTCC
ACAAACTCATCATACACACGTTCATGCACAAATGTGCGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGT
CCCTGGTTAAA*AACAA*GCGAAATGAGCAAGCTCA*CTGCCTGATCAA*ATCAGCATCC
TCAC

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR4FD17TF 750 0 0
CAGATA
TAAGGGAGAGATACCTGGTTT******GGTTTGGTT*AGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATG
GCAGTAACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGTTGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTT
CCAATGCCACTCATCTTGTACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCAAACACATCGAAACAG
TTTATCCAAACGCTTCCGACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGATTGGCTGTGTCCAGATTT
TGAGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCCTGAGTTGTTCGCCCTTGCAATCACCTCA
TCCAGATTCTTGAATTTCAGGATGGTTTGAACAGGTCCAAAGATCTCGTCCGTTGCTATG
AGCATGTCGTCTTTGACGTCTGAGAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAGCCCTTGGAACCA
AACCGGTCACCTCCAGCTTGTAAGGTGGCTCCATTCTCAACTCCATGTTTAATGAACTTC
AAGATTTTCTTGAACTGCTCTGAGTCCACCTGGGGACCCTGCTCAATGCCAGACTTGAAG
GGATCGCCAACAGCGCGTTTGATTGCGCGAGCTTTAGCTTTCTCCACAAACTCATCATAC
ACACGTTCATGCACAAATGTGCGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGTCCCTGGTTAAAGAAC
AAAGCGAAATGAGCAAGCTCAACTGCCTGATCCACATCAGCATCCTCACATACAATGAAT
GGTGACTTGCCTCCAAGCTCAAGC

QA 7 750 7 750
DS 



AS 1 5

CO CL1916Contig1 831 5 25 U
GGGCCTTCGTTCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTCGCTCGAACTTGGATTCTGAG
ACCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTTTTT*AGGGTTTTTGGTTAGGGGTGGAAGAACAA
TGTCCTCTTCTTCGGTAATTACGCCAGAAGACGTACTCGAATCTCTTATGAACGATGGCA
CCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCCAATGAAGAGTTGAAGA
GCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACACCTGGTGCTGAGAAAC
AGACTAAACGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAAGGGCCAGTGCTAGAGA
AGGCATCAAAATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAGAGATAA
ATGAAACAGTAGAGCGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCGAGAACCGCCCTTGTTTTCAT
CATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGGACAATA
GCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTTACAA
TGAGGAAGAAGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCATGTAACGCCATGAGCCTGGT
TATGAGACATTCATCATGTAACGTTCTGTTAATGTTTTTATTTGTGAAATATCTCTTCCC
AGCAATATCTCATGTAATTTATATTTGCATAAAACATTGGACCGAATTAGTAATTACCAT
CACGTCACATTTCTGCTATGAAAATAATCTCTTTACTAGATCTTTGATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN76TF U 1
AF RR4EL52TF U 6
AF RR4H867TF U 115
AF RR4H867JQB C 8
AF RR4EN76JQ C 129
BS 1 60 RR4EN76TF
BS 61 61 RR4EL52TF
BS 62 154 RR4EN76TF
BS 155 155 RR4EL52TF
BS 156 226 RR4EN76TF
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BS 261 382 RR4EN76TF
BS 383 383 RR4EL52TF
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BS 434 434 RR4EL52TF
BS 435 458 RR4EN76TF
BS 459 459 RR4EL52TF
BS 460 601 RR4EN76TF
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BS 603 690 RR4EN76TF
BS 691 691 RR4EL52TF
BS 692 728 RR4EN76TF
BS 729 729 RR4EL52TF
BS 730 756 RR4EN76TF
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BS 766 822 RR4H867JQB
BS 823 831 RR4EN76JQ

RD RR4EN76TF 756 0 0
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CCCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTTTTT*AGGGTTTTTGGTTAGGGGTGGAAGAACAA
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AGGCATCAAAATCGGTTTGGGAATTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAGAGATAA
ATGAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGAGAGAACCGCCCTTGTTTTCAT
CATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGGACAATA
GCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTTACAA
TAAGGAAGAAGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCATGTAACGCCATGAGCCTGGT
TATGAGACATTCATCATGTAACGTTCTGTTCATGTTTTTATTTGTGAAATATCTCTTCCC
AGCAATATTTCATGTAATTTATATTTGCATAAAACA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4EL52TF 735 0 0
GGCC
TTCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTCGCTCGAACTTGGATTCTGAGACCGTTTGG
ATTAGTGGGAGACACTTTTTTTAGGGTTTTTGGTTAGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTT
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CCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCCAATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCA
TTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACACCTGGTGCTGAGAAACAGACTAAAC
GAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAAGGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAA
AATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAGAGATAAATGAAACAG
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TGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGGACAATAGCTCAAATA
CGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTTACAATGAGGAAGA
AGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCATGTAACGCCATGAGCCTGGTTATGAGACA
TTCATCATGTAACGTTCTGTTAATGTTTTTATTTGTGAAATATCTCTTCCCAGCAATATC
TCATGTAATT
A

QA 5 734 5 734
DS 

RD RR4H867TF 642 0 0
GAACAATGTCCTCTTCTTCGGTAATTACGCCAGAAGACGTACTCGAATCTCTTATGAACG
ATGGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCCAATGAAGAGT
TGAAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACACCTGGTGCTG
AGAAACAGACTAAACGAGAACTCCTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAAGGGCCAGTGC
TAGAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAG
AGATAAATGAAACAGTAGAGCGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCGAGAACCGCCCTTGT
TTTCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGG
ACAATAGCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAG
TTACAATGAGGAAGAAGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCATGTAACGCCATGAG
CCTGGTTATGAGACATTCATCATGTAACGTTCTGTTAATGTTTTTATTTGTGAAATATCT
CTTCC*AGCAATATCTCATGTAATTTATATTTGCATAGAACA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4H867JQB 815 0 0
GC
TTCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTCGCTCGAACTTGGATTCTGAGACCGTTTGG
ATTAGTGGGAGACACTTTTTT*AGGGTTTTTGGTTAGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTT
CTTCGGTAATTACGCCAGAAGACGTACTCGAATCTCTTATGAACGATGGCACCATCGATG
CCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCCAATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCA
TTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACACCTGGTGCTGAGAAACAGACTAAAC
GAGAACTCCTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAAGGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAA
AATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAGAGATAAATGAAACAG
TAGAGCGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCGAGAACCGCCCTTGTTTTCATCATCAAACG
TGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGGACAATAGCTCAAATA
CGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTTACAATGAGGAAGA
AGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCATGTAACGCCATGAGCCTGGTTATGAGACA
TTCATCATGTAACGTTCTGTTAATGTTTTTATTTGTGAAATATCTCTTCCCAGCAATATC
TCATGTAATTTATATTTGCATAGAACATTGGACCGGATTAGTAATTACCATCACGTCACA
TTTCTGCTATGAAAATAATCTCTTTACTAGATC

QA 3 815 3 815
DS 

RD RR4EN76JQ 703 0 0
TCTTCGGTAATTACGCCAGAAGACGTTCTCGAATCTCTTATGAACGATGGCACCATCGAT
GCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCCAACGAAGAGTTGAAGAGCACAACC
ATTAAGATGGCAGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACACCTGGTGCTGAGAAACAGACTAAA
CGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAAGGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCA
AAATCGGTTTGGGAATTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAGAGATAAATGAAACA
GTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGAGAGAACCGCCCTTGTTTTCATCATCAAAC
GTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGGACAATAGCTCAAAT
ACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTTACAATAAGGAAG
AAGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCATGTAACGCCATGAGCCTGGTTATGAGAC
ATTCATCATGTAACGTTCTGTTCATGTTTTTATTTGTGAAATATCTCTTCCCAGCAATAT
TTCATGTAATTTATATTTGCATAAAACATTGGACCGAATTAGTAATTACCATCACGTCAC
ATTTCTGCTATGAAAATAATCTCTTTACTAGATCTTTGATTTT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 5

CO CL1917Contig1 504 5 1 U
CAAAACGATTAACATAAGAAAGAAAGACAGAAGAGAAGGTTTTACATTTGGGCATTAACC
TCAAAGTACTTGTCCATTTGACCAAAAAAAAGGAAACAATTCAAAATCATATGAGTGTTT
TCTGAATACCCTGCTGATCTTCGCATGGGTTCACTTACTGCTTTATCATCCTTCTCTACT
CTTCTGCCGCCTGAGATACAGAAGTGTCTGCATCAAAAGCACGAGAGCAATCAGTGTATG
CAGAGCCAATACCGATTCCAGCACCAAAGGCAATAGACGCCCATCTTGTAACAGGACTCC
TGAAGAAGAGAAGACCG*CGAAGGCGCCGCCGAGGGAGGAGTAGACGAAACGGCGCGTCG
TGAGATCGATGCACGCGTCCCACTTAGCGTTCACGTCGTATTCCGGTGCCACCATCTCCT
TCTTCTCTCCCATTTTCTTTCTTCCGAAATTGACTTTTACCTCTCTCCGATTTGATTCTT
CTGAGTTCGAGTTTGGTGCTTCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

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AF RR4DL22TF C 26
AF RR4BW23TF C 1
AF RR4BW47JQ U 1
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QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 5

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4FY43TF U 1
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AF RR4AG72TF U 112
AF RR4FY43JQ C 146
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C

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TTTCTTTGTTTGTGTACTTTCTAGCTTCTAAAAGCATGAAAATCCATAATAAATAAATGT
TTG

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR4FY43JQ 751 0 0
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CAAGAAAGAACTGCTTGAACATTTCAAGACACTTGAAACAGAGCTTGGAGACAAAGCTTA
CTA*TGTGGGGAAGTGTTTGGGTTCGTAGACATCGCGTTGATGGGTTATTACAGCTGGTT
CGTAGTTATGGAGAAGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGAAACAGAGTTCCCAAAGCTGACTGA
GTGGACCAAGAGGTGTTTAGAGAGAGAGAGCGTGGTTAAGGCATTGGCTGATTCTGACAA
GATTATTGAGTATGCTTATGTGCTCAGGAAGAAGTTTGGAGCCGAGTAGATGTTTGCCTA
ACTTGGTCTGAACACACAGGAAAGAAAATGGTTCGGTATCACCGTTATGTTCTGTTCTTA
TGTGAAATTTGTATTTTCTCTCCTGTATTTTCTTTGTTTGTGTACTTTCTAGCTTCTAAA
AGCATGAAAATCCATAATAAATAAATGTTTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 2 5

CO CL1919Contig1 633 2 2 U
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CTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATCTTTTACAAGGATTGTGGAAC
AAAGGGAAGGATGGACACGAATGATAGCTTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCA
CGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGTTGCTCTGGCATCGAGCTTCTCCAAGC
TGATACCTTTGATCTCCATTGTTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTTTG
TGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAACCTTCTTAGATACATTTACGAACTCTACACTGA
CTACGTCTTGAAGAACCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGA
CATCAACCTCACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGAGCATA
AGATTGATTCGATCTCTCACCTCTTTGCCTTCTTTTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTTCTT
ATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTGTTT
TTTTTTAAATGCCAAGAAAGAGCACCTAAGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP88TF U 1
AF RR4AP88JQ C 1
BS 1 343 RR4AP88TF
BS 344 633 RR4AP88JQ

RD RR4AP88TF 343 0 0
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CTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATCTTTTACAAGGATTGTGGAAC
AAAGGGAAGGATGGACACGAATGATAGCTTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCA
CGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGTTGCTCTGGCATCGAGCTTCTCCAAGC
TGATACCTTTGATCTCCATTGTTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTTTG
TGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAACCTTCTTAGATACATT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4AP88JQ 633 0 0
GGGATCGTCTCGCTGAGAGATTTGTCTTGTGGGATCTTTTGGGGGAAAAATGGCAGCGAT
CTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATCTTTTACAAGGATTGTGGAAC
AAAGGGAAGGATGGACACGAATGATAGCTTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCA
CGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGTTGCTCTGGCATCGAGCTTCTCCAAGC
TGATACCTTTGATCTCCATTGTTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTTTG
TGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAACCTTCTTAGATACATTTACGAACTCTACACTGA
CTACGTCTTGAAGAACCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGA
CATCAACCTCACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGAGCATA
AGATTGATTCGATCTCTCACCTCTTTGCCTTCTTTTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTTCTT
ATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTGTTT
TTTTTTAAATGCCAAGAAAGAGCACCTAAGTCC

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL1919Contig2 611 3 7 U
GGGGGATCTTTTGGGGGAAAAATGGCAGCGATCTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCT
GGTGGTTTGATCTTTTACAAGGATTGTGGAACGAAGGGAAGGATGGACACGAATGATAGC
TTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTC
AATGGCTGTTCCGGAATCGAGCTTCTCCAAGCCTATACCTTTGATCTCCATTGTTTCCAG
TCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAAC
CTTCTTAGATACATTTACGAACTCTACACTGACTACGTCTTGAAGAACCCTTTCTATGAG
ATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTCACTCAAGCTGTTCAGTCT
GATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGACCTCCACAAGATTGATTCTCTGCTGTGATCTCT
CACCTCTTTGCCTTCTTTTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTTCTTATCCATATAACATTTTA
TATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTGTTTTTTTTTTTAAATGCCAA
GAAAGAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP09JQ C 77
AF RR4GP09TF U 77
AF RR4B270TF U 1
BS 1 110 RR4B270TF
BS 111 112 RR4GP09TF
BS 113 213 RR4B270TF
BS 214 214 RR4GP09TF
BS 215 529 RR4B270TF
BS 530 530 RR4GP09TF
BS 531 611 RR4B270TF

RD RR4GP09JQ 513 0 0
G
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ATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTCAATGGCTGTTCCGGAAT
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GTTCTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAACCTTCTTAGATACATTTA
CGAACTCTACACTGACTACGTCTTGAAGAACCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCG
TTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTCACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTT
AGGACGTTGACCTCCACAAGATTGATTCTCTGCTGTGATCTCTCACCTCTTTGCCTTCTT
TTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTTCTTATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTG
AACATTGCAACAAAACCTTTGTGTTTTTTTTT

QA 2 513 2 513
DS 

RD RR4GP09TF 513 0 0
G
CAAGGATTGTGGAACGAAGGGAAGGATGGACACGAATGATAGCTTGAGGGTAGCCAGTTT
ATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTCAATGGCTGTTCCGGAAT
CGAGCTTCTCCAAGCCTATACCTTTGATCTCCATTGTTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAA
GTTCTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAACCTTCTTAGATACATTTA
CGAACTCTACACTGACTACGTCTTGAAGAACCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCG
TTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTCACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTT
AGGACGTTGACCTCCACAAGATTGATTCTCTGCTGTGATCTCTCACCTCTTTGCCTTCTT
TTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTTCTTATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTG
AACATTGCAACAAAACCTTTGTGTTTTTTTTT

QA 2 513 2 513
DS 

RD RR4B270TF 611 0 0
GGGGGATCTTTTGGGGGAAAAATGGCAGCGATCTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCT
GGTGGTTTGATCTTTTACAAGGATTGTGGAACGAAGGGAAGGATGGACAC**ATGATAGC
TTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTC
AATGGCTGTTCCGGAATCGAGCTTCTCCAAGCCGATACCTTTGATCTCCATTGTTTCCAG
TCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCTCACATGGAGAAC
CTTCTTAGATACATTTACGAACTCTACACTGACTACGTCTTGAAGAACCCTTTCTATGAG
ATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTCACTCAAGCTGTTCAGTCT
GATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGACCTCCACAAGATTGATTCTCTGCTGTGATCTCT
CACCTCTTTGCCTTCTTTTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTTCTTATCCATGTAACATTTTA
TATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTGTTTTTTTTTTTAAATGCCAA
GAAAGAGCACC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 5

CO CL1920Contig1 1449 5 15 U
GAAAGATAAAAATTACATAACGTTTATTAGAAACATGAACTCCTACAAGGCTAAGACACC
AAATAAAATAAGTAGCAAAAGAGAGTCTAAGGAACATGAGGGTACAAAGCAAAGGCCTAC
ACAGATACACGGACGCTCGAAAAACAGAGAGATGATGGTACATGAACAATGGCAACATCC
TAATCACTTTACAGACATTACCCTACCTCTCCTTGTTGTTTGGTTAGAGACACAATCATC
ATCATCATCATCATTTTGTGTGTTTCTCTCTTCCAAACACCCTCAAGATTAAAAAAAGAA
ACATCCATGGAACACACACGACAAACAAACTCACCACCACTTGCTAGCTTTCATAAGTTG
TGCGCTCTTTTCAGAACAGAGCTTCTTGCATAGCCTCTGTTTCTGTCTGCACCTGCCCAT
ATCCGTGTCCCTCAGGTTGGGGTTCATTTTCAAAGTGATGTTCATCTGGCTGCACGTGGC
CTGGCTCCTCCGTTGCCTCCCTTTTTGTTACTGTTAGCTCTTCCAGGTCATGTATAGCTT
GAACCACAGCTTGATTATAACTTCCCCCGACCTCCGCTTTCAACACATTAACAATTTCCT
TAGCTTTCTCTTGAAACAATTCAAACTTCTTCTTGAGTTCACCATAGCTAATATCTTGTT
GTCCGCAAGCTCCCTTCGACGCAACATTCTTTCTGGGTCTTCCAACGGGTCTTCCAGTAC
GAGAATAGCCTCTCTTTGGCTTCATCGCCTTCCTGATCACACCTCCGATCTTAGGAGGTC
GTCCTCGTCCTCTCTTAGCAACCAGCTCTCCTCCTCCACCCACTGCCTTAGGTGGTGCAA
GTGCAATAGAAGAAGCACCTGCGTCAACTCTCTTTGGTCTCCCTCTGCGTCTAACACCAC
CACCACCACCGTTAGCAACGTAAGGAAACACAGAAGCCGGAGCTGAGACCAATGCCGGCT
TTCTCTGCCTCCCTGCAGCTCTTCCGCTAGGAGGCCGACCTCTCCGTTTCGCAATTTCCT
CACCCCCGGAAACAACGGGAGCCGCCGCCTTCACTGTCATCGGCGTCGGCGAAGCTCCAT
CTTTCCTAGGACGACCTGGCGGTCTCTTACTCGGCTGAGGCTGCGGTGGTGGAGCCTGTA
ACTGCAGTTGCATCTGCTGCTCCTCCGGTCTCGGAACAGGTAACTCGATCTGTCCGTAGC
TGGATTGTCCGTTTGTCTGAACATCAGCAGCGGGTTTTGCCTTTGGAGGTCGACCACGAC
CACGCTTCTGAGTTTGAGGAGTTTGAGTTTGAGGAGGAGCAGATGTGGGAGGAGGAGGCA
ACTGTTGTTGGGTGTCGTTGACTCTGTTGTTGAAGTCAGATCTGGGGGGTTCAAGAGCAG
CAGCAGCTGCTGCAGAGGGAGGAGCAGAAGCTGCGAGTCTGTAAGATTTCTTAACCATGA
CAAGAACGC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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C
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C

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C
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AAAATAAGTAGCAAAAGAGAGTCTAAGGAACATGAGGGTACAAAGCAAAGGCCTACACAG
ATACACGGACGCTCGAAAAACAGAGAGATGATGGTACATGAACAATGGCAACATCCTAAT
CACTTTACAGACATTACCCTACCTCTCCTT
C

QA 2 211 2 211
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TAATCACTTTACAGACATTACCCTACCTCTCCTTGTTGTTTGGTTAGAGACACAATCATC
ATCATCATCATCATTTTGTGTGTTTCTCTCTTCCAAACACCCTCAAGATTAAAAAAAGAA
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GGTTAGAGACACAATCATCATCATCATCATCATTTTGTGTGTTTCTCTCTTCCAAACACC
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TCATCTGGCTGCACGTGGCCTGGCTCCTCCGTTGCCTCCCTTTTTGTTACTGTTAGCTCT
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CCTCTGCGTCTA

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GCTGCAGAGGGAGGAGCAGAAGCTGCGAGTCTGTAAGATTTCTTAACCATGACAAGAACG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 5

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CTCTCTCTCTAGTCGTTCCTTATCATCTTTATCTCGATTTCCGTCTACG**ATGAGCTCG
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GAGAAAGGTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTAT
ATGCAGTCCTGGACTGGCACTATTCTCGGCCCTCATAATACTGCATACGATGGGAAAATC
TTCCAGCTCAAGCTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTC
CAGACCCGGATTAACATGGCCTGCGTTAACCCTCAGACTGGAGTGGTTGAACCGAGTCTC
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AAAAAAGAAATGATGACTTCACATAACCGCAAGTTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCGAG
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TTTGAAAATTGCCTACAACTTAAATGTCACAGTGTTGTTTGAGAGATTATTATATATGTA
TAAACCAATAACAGGTAATGATCATCCTAATAAATCTTCTCTTTCATAGTCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4EI16TF U 3
AF RR4AF38JQ C 1
AF RR4CW03TF U 3
AF RR4EI16JQ C 29
AF RR4AF38TF U 1
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GAGAAAGGTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTAT
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DS 

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QA 3 761 3 761
DS 

RD RR4EI16JQ 743 0 0
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T

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DS 

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GGAC
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AAGGTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGC
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CTATGCTCGCTAACTGGCGCCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAA
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CCAATAACAGGTAATGATCATCCTAATAAATCTTCTCTTTCATAGT
CG

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DS 



AS 1 5

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GAAAACGTTTTGTCAATCGCAGGAAGAATCTGAGTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAAC
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TGTTGTTAGCTAATATCATTTCAAGCTTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH47TF U 1
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AF RR4A219JQD C 143
AF RR4A219TFB U 143
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TGT
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QA 3 521 3 521
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AACAGAAGAAATGATCTAATTTGGTGCGAAGAATGAAAGCAGTA*TATGGAATCTTTAAA
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TTTTGTTGTTAGCTAATATCATTTCAAGCTTCAAT

QA 3 577 3 577
DS 



AS 2 5

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TTTTTAGATTTTCCAGTGAAGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B746TF U 75
AF RR4G283JQ C 1
AF RR4G283TF U 1
BS 1 2 RR4G283JQ
BS 3 74 RR4G283TF
BS 75 445 RR4B746TF
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BS 447 529 RR4B746TF
BS 530 562 RR4G283TF

RD RR4B746TF 455 0 0
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TATTTGTTCGTCCAATCCTAAGCACAAGCAAAGGCAGGGATTCTGCTCCATTGCTCATGA
TGGAATCATTCCTCCTCCCTTGTTTTCGGAGTCGGTTGCTAATCAGGAGGTGGTGAGGAT
GCCTGGCCAGGGAGTATCAGCTGGTCTCGCATCGCTCTTACACAAAAGGCCTGAGCCAGC
AGCGGTTTTCGGATGGAGGTCAGGTCTTGCATCAATTCTCTTCAAGCAAGGGAATTAGCA
AAGTTAAAACCAGCATTTAATATTTTGCATTTTCTCAAGTTGTAATCCAAAGTTTGGTTC
TCAACACATTTCCTTTGGTCAGTTGTAGGCTCTTCTAGACCCCGTTTGATTTGCTTGCCC
TTATATCTTGAATAAAGAGATAATATTAAACTTGA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4G283JQ 562 0 0
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CGACGTGTCTATGTTATTTGTTCGTCCAATCCTAAGCACAAGCAAAGGCAGGGATTCTGC
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TTTTTAGATTTTCCAGTGAAGC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4G283TF 562 0 0
GG
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GAAGGTGAGATCATCTGTGAAGAAGTTGTGTGAGTTTTGTAAGACAGTGAAACGCCGTCG
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GCCTGAGCCAGCAGCGGTTTTCGGATGGAGGTCAGGTCTTGCATCAATTCTCTTCAAGCA
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AAAGTTTGGTTCTCAACACATTTACTTTGGTCAGTTGTAGGCTCTTCTAGACCCCGTTTG
ATTTGCTTGCCCTTATATCTTGAATAAAGAGATAATATTAAACTTGAGTATTTTACTTTT
TTTAGATTTTCCAGTGAAGC

QA 3 562 3 562
DS 



CO CL1923Contig2 543 2 1 U
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CTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR4G945JQ C 1
AF RR4G945TF U 1
BS 1 543 RR4G945TF

RD RR4G945JQ 543 0 0
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CTT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4G945TF 543 0 0
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CAAGGGAATTAGCAAAGTTAAAACCAGCATTTAATATTTTGCATTTTCTCAAGTTGTAAT
CCAAAGTTTGGTTCTCAACACATTTACTTTGGTCAGTTGTAGGCTCTTCTAGACCCCGTT
TGATTTGCTTGCACCTTATATGACTTGAATAAAGATATAATATTAAACTTGAGTATTTTA
CTT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 5

CO CL1924Contig1 631 5 6 U
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ATCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGA
TATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCC


BQ
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C018JQ U 1
AF RR4C080JQ U 1
AF RR4C018TF C 1
AF RR4C080TF C 1
AF RR4EF87JQ U 5
BS 1 196 RR4C018JQ
BS 197 421 RR4EF87JQ
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QA 1 196 1 196
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QA 1 191 1 191
DS 

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T
C

QA 1 601 1 601
DS 

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ATCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGA
T
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4EF87JQ 627 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGCAGAAATAAATGAAGA
TTACATCACAAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATCACACGCCTCTTTATT
CATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTATAGATCATTAAACAGAGACGATGTTG
GTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAATATAATAGCATCATTCACCAAATACCCT
TTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACTCCCACACCATAATCG
CTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCGCTGATTC
TTTAACCGCAGATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGCCCATGGTCT
TGAGCAAATAAGAAGATTGGTAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCCGTCTCCTTTCGGGTTA
AACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAGAATTTATCT
TCCAAGTTGAAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGATATG
AATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 4

CO CL1925Contig1 1044 4 6 U
GTGTAGAACATGCAACATTTATTTGTAATAGCAACAAGGTTTACAACAATCACTTTAGCC
GGTCAGAAGCAAAGCCCCTGTAAATGCATAGACTCCATGAATCTTACTTCTTACATTCAT
TGTATTGGATATCATTACATAATGATTCTCTTATTTATCTGGAGGCACTGGAAACTTGAC
AAGTGGAAAAAACATTATACAAAAGAGCTCTTAAGGTAGACTAGTCAAGGCTCATGGAAG
TTCAACTTGCTTAATATTCCATATATCTTTGGCATATTCATGGATCGTCCTATCACTGCT
GAACTTGGATGAACCTGCTGTGTTCAAGATTGACATTCTCGTCCATCTTTTCTGGTCCCT
GTATGCCTCGTCAACTTTCTCTTGGCATTCAACGTAGCTAGGAAAGTCTTTGCCAACAAG
GAAGTAATCCGCTCGTCCGAAACCTTCGTTTCCTTCCAAAGAGCCAATCAGTTCATCGTA
CTTGTTTGAGCCAAAGACACCGCTTCTAACGAATTGCTTCACTTCTTCAAAACTAGGATC
TGGAACAAACTTTCCCTCTGCTCTCTCTTTCCTGAGGTCTGCAATCTCATCAGCTTTGGC
ACCAAAGAGGAAGAAGTTTTCTTCACCAACTTCTTCTCTGATCTCCACATTCGCCCCATC
CAAAGTTCCGATCAAAATGCAACCGTTCATAGAAAACTTCATGTTGCTTGTCCCGCTCGC
TTCCATCCCAGCGGTACTGATGTGCTGAGAAAGCTCGCTTGCTGGAATGAGCAGTTCAGC
AACACTGACATTGTAATCAGGAACAAAGATAACCTTAAGCAGGTCACCTATTTCCGGATC
ATGGTTAATTGTAGCCCCAACATCTGTGATGAATTTCACAATCCTCTTAGCTTGCACATA
CGTGGCGAATGCTTTCCCCCCAAATATGCAAACTCTTGGAACAAATGCCTTCTCCCTCTC
ACTCGCACTCATTTCCTTCATCTTTTTGTAGCGGTACACTATTCCCGAGATGTTAAGCAG
TTGTCGCTTGTACTCGTGAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG48JQ U 57
AF RR4AG48TF C 57
AF RR4GH69JQ U 1
AF RR4FB31TF C 320
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BS 600 771 RR4GH69JQ
BS 772 1044 RR4FB31TF

RD RR4AG48JQ 598 0 0
G
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QA 2 598 2 598
DS 

RD RR4AG48TF 598 0 0
G
GCCGGTCAGAAGCAAAGCCCCTGTAAATGCATAGACTCCATGAATCTTACTTCTTACATT
CATTGTATTGGATATCATTACATAATGATTCTCTTATTTATCTGGAGGCACTGGAAACTT
GACAAGTGGAAAAAACATTATACAAAAGAGCTCTTAAGGTAGACTAGTCAAGGCTCATGG
AAGTTCAACTTGCTTAATATTCCATATATCTTTGGCATATTCATGGATCGTCCTATCACT
GCTGAACTTGGATGAACCTGCTGTGTTCAAGATTGACATTCTCGTCCATCTTTTCTGGTC
CCTGTATGCCTCGTCAACTTTCTCTTGGCATTCAACGTAGCTAGGAAAGTCTTTGCCAAC
AAGGAAGTAATCCGCTCGTCCGAAACCTTCGTTTCCTTCCAAAGAGCCAATCAGTTCATC
GTACTTGTTTGAGCCAAAGACACCGCTTCTAACGAATTGCTTCACTTCTTCAAAACTAGG
ATCTGGAACAAACTTTCCCTCTGCTCTCTCTTTCCTGAGGTCTGCAATCTCATCAGCTTT
GGCACCAAAGAGGAAGAAGTTTTCTTCACCAACTTCTTCTCTGATCTCCACATTCGC

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR4GH69JQ 771 0 0
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GGTCAGAAGCAAAGCCCCTGTAAATGCATAGACTCCATGAATCTTACTTCTTACATTCAT
TGTATTGGATATCATTACATAATGATTCTCTTATTTATCTGGAGACACTGGAAACTTGAC
AAGTGGAAAAAACATTATACAAAAGAGCTCTTAAGGTAGACTAGTCAAGGCTCATGGAAG
TTCAACTTGCTTAATATTCCATATATCTTTGGCATATTCATGGATCGTCCTATCACTGCT
GAACTTGGATGAACCTGCTGTGTTCAAGATTGACATTCTCGTCCATCTTTTCTGGTCCCT
GTATGCCTCGTCAACTTTCTCTTGGCATTCAACGTAGCTAGGAAAGTCTTTGCCAACAAG
GAAGTAATCCGCTCGTCCGAAACCTTCGTTTCCTTCCAAAGAGCCAATCAGTTCATCGTA
CTTGTTTGAGCCAAAGACACCGCTTCTAACGAATTGCTTCACTTCTTCAAAACTAGGATC
TGGAACAAACTTTCCCTCTGCTCTCTCTTTCCTGAGGTCTGCAATCTCATCAGCTTTGAC
ACCAAAGAGGAAGAAGTTTTCTTCACCAACTTCTTCTCTGATCTCCACATTCGCCCCATC
CAAAGTTCCGATCAAAATGCAACCGTTCATAGAAAACTTCATGTTGCTTGTCCCGCTCGC
TTCCATCCCAGCGGTACTGATGTGCTGAGAAAGCTCGCTTGCTGGAATGAG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4FB31TF 725 0 0
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TCTTGGCATTCAACGTAGCTAGGGAAGTCTTTGCCAACAAGGAAGTAATCCGCTCGTCCG
AAACCTTCGTTTCCTTCCAAAGAGCCAATCAGTTCATCGTACTTGTTTGAGCCAAAGACA
CCGCTTCTAACGAATTGCTTCACTTCTTCAAAACTAGGATCTGGAACAAACTTTCCCTCT
GCTCTCTCTTTCCTGAGGTCTGCAATCTCATCAGCTTTGGCACCAAAGAGGAAGAAGTTT
TCG***CCAACTTCTTCTCTGATCTCCACATTCGCCCCATCCAAGGTTCCGATCAAAATG
CAACCGTTCATAGAAAACTTCATGTTGCTTGTCCCGCTCGCTTCCATCCCAGCGGTACTG
ATGTGCTGAGAAAGCTCGCTTGCTGGAATGAGCAGTTCAGCAACACTGACATTGTAATCA
GGAACAAAGATAACCTTAAGCAGGTCACCTATTTCCGGATCATGGTTAATTGTAGCCCCA
ACATCTGTGATGAATTTCACAATCCTCTTAGCTTGCACATACGTGGCGAATGCTTTCCCC
CCAAATATGCAAACTCTTGGAACAAATGCCTTCTCCCTCTCACTCGCACTCATTTCCTTC
ATCTTTTTGTAGCGGTACACTATTCCCGAGATGTTAAGCAGTTGTCGCTTGTACTCGTGA
ATACC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 5

CO CL1926Contig1 1141 5 6 U
GGACGGCCGACAATATCTAAGTGTCAAAGCCTTGGTTCCTCCGAATCTTGTCCGGTGCTG
CTTATCCCTGTTACCTAACAAGCTTTGCAAACAATGAGTGGTCGGTTTTCTCGGTCCATC
TATGTTGGTAACTTGCCCGGTGACATAAGGGAGTCTGAGATTGAAGATCTCTTCTACAAG
TATGGCCGCATTGTGGATATTGAATTGAAGGTTCCACCTCGTCCTCCATGTTACTGTTTT
GCTGAGTTTGAGCATCCTCGGGATGCTGAAGATGCTATCGATGGCCGTGACGGGTACAAC
TTTGACGGCTCTCGTTTGAGGGTTGAGCTTGCCCATGGTGGTAGAGGACAGTCTTCAGGT
GATCGCCGTGGCGGTGGTGGATATCGTGGTGGGGGTG*TGGCTATGGAGGTGGTGGAGGA
TCTGCCCGGTTTGGTGTCTCACGACACTCTGAATTCCGAGTTATTGTACGTGGGCTCCCA
TCATCTGCTTCATGGCAAGATTTGAAGGATCATATGCGGAAAGCTGGTGATGTGTGCTTT
GCTGAGGTCACTCGTGACAGTGATGGAACTTATGGTGTTGTTGACTACACCAATTATGAT
GATATGAAGTATGCGATAAGGAAACTTGATGATACAGAGTTCAGAAACCCCTGGGCTAGA
GGCTATATCCGGGTTAAGAAGTATGAAAGCTCCCAGTCTAGAAGCCCAAGCAGAAGCAGG
AGCCGTAGTAGAGGCCGTGGTCGCAGCCCTAGTCGTAGCGTTAGCAGAAGCAGGAGCCCA
AGAAAGGATCTGAGTAAATCACCCAGACGTTCTCTTTCAAGATCGTTGTCAAAATCTAGA
TCTCTATCTCCCGACAGGAAGAAGAGTCCTCCTAGGGCAATGTCGAGATCGAGGTCCAGG
TCTCTTTCAAAATCTCCTGCCAAGGTTCAGGAAGGAACTGAGTGAGTGATGGCACTTCGA
ACCGTCCATGGCAAAGATCAAATCGGATAAATGGGGAGTTCTATGCAAAATTGTAATTTG
TTCTTAGGCTACTAGTTCTGGATTCTTTCTTTTTCCTCTGCTACTACTACTTTGATCTTT
AAAACATGTTATCTTTACCGGTTCTTTAAATTTTTATGTTTACTGTTTGGGAGTTTTAGG
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AW70TF U 1
AF RR4CA65TF U 1
AF RR4B392TF U 1
AF RR4CA65JQ C 308
AF RR4B392JQ C 385
BS 1 702 RR4AW70TF
BS 703 712 RR4B392TF
BS 713 789 RR4CA65JQ
BS 790 790 RR4B392JQ
BS 791 1139 RR4CA65JQ
BS 1140 1141 RR4B392JQ

RD RR4AW70TF 702 0 0
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TATGTTGGTAACTTGCCCGGTGACATAAGGGAGTCTGAGATTGAAGATCTCTTCTACAAG
TATGGCCGCATTGTGGATATTGAATTGAAGGTTCCACCTCGTCCTCCATGTTACTGTTTT
GCTGAGTTTGAGCATCCTCGGGATGCTGAAGATGCTATCGATGGCCGTGACGGGTACAAC
TTTGACGGCTCTCGTTTGAGGGTTGAGCTTGCCCATGGTGGTAGAGGACAGTCTTCAGGT
GATCGCCGTGGCGGTGGTGGATATCGTGGTGGGGGTG*TGGCTATGGAGGTGGTGGAGGA
TCTGCCCGGTTTGGTGTCTCACGACACTCTGAATTCCGAGTTATTGTACGTGGGCTCCCA
TCATCTGCTTCATGGCAAGATTTGAAGGATCATATGCGGAAAGCTGGTGATGTGTGCTTT
GCTGAGGTCACTCGTGACAGTGATGGAACTTATGGTGTTGTTGACTACACCAATTATGAT
GATATGAAGTATGCGATAAGGAAACTTGATGATACAGAGTTCAGAAACCCCTGGGCTAGA
GGCTATATCCGGGTTAAGAAGTATGAAAGCTCCCAGTCTAGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4CA65TF 677 0 0
GGACGGCCGACAATATCTAAGTGTCAAAGCCTTGGTTCCTCCGAATCTTGTCCGGTGCTG
CTTATCCCTGTTACCTAACAAGCTTTGCAAACAATGAGTGGTCGGTTTTCTCGGTCCATC
TATGTTGGTAACTTGCCCGGTGACATAAGGGAGTCTGAGATTGAAGATCTCTTCTACAAG
TATGGCCGCATTGTGGATATTGAATTGAAGGTTCCACCTCGTCCTCCATGTTACTGTTTT
GTTGAGTTTGAGCATCCTCGGGATGCTGAAGATGCTATCGATGGCCGTGACGGGTACAAC
TTTGACGGCTCTCGTTTGAGGGTTGAGCTTGCCCATGGTGGTAGAGGACAGTCTTCAGGT
GATCGCCGTGGCGGTGGTGGATATCGTGGTGGGGGTGGTGGCTATGGAGGTGGTGGAGGA
TCTGCCCGGTTTGGTGTCTCACGACACTCTGAATTCCGAGTTATTGTACGTGGGCTCCCA
TCATCTGCTTCATGGCAAGATTTGAAGGATCATATGCGGAAAGCTGGTGATGTGTGCTTT
GCTGAGGTCACTCGTGACAGTGATGGAACTTATGGTGTTGTTGACTACACCAATTATGAT
GATATGAAGTATGCGATAAGGAAACTTGATGATACAGAGTTCAGAAACCCCTGGGCTAGA
GGCTATATCCGGGTTAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4B392TF 712 0 0
GGACGGCCGACAATATCTAAGTGTCAAAGCCTTGGTTCCTCCGAATCTTGTCCGGTGCTG
CTTATCCCTGTTACCTAACAAGCTTTGCAAACAATGAGTGGTCGGTTTTCTCGGTCCATC
TATGTTGGTAACTTGCCCGGTGACATAAGGGAGTCTGAGATTGAAGATCTCTTCTACAAG
TATGGCCGCATTGTGGATATTGAATTGAAGGTTCCACCTCGTCCTCCATGTTACTGTTTT
GCTGAGTTTGAGCATCCTCGGGATGCTGAAGATGCTATCGATGGCCGTGACGGGTACAAC
TTTGACGGCTCTCGTTTGAGGGTTGAGCTTGCCCATGGTGGTAGAGGACAGTCTTCAGGT
GATCGCCGTGGCGGTGGTGGATATCGTGGTGGGGGTG*TGGCTATGGAGGTGGTGGAGGA
TCTGCCCGGTTTGGTGTCTCACGACACTCTGAATTCCGAGTTATTGTACGTGGGCTCCCA
TCATCTGCTTCATGGCAAGATTTGAAGGATCATATGCGGAAAGCTGGTGATGTGTGCTTT
GCTGAGGTCACTCGTGACAGTGATGGAACTTATGGTGTTGTTGACTACACCAATTATGAT
GATATGAAGTATGCGATAAGGAAACTTGATGATACAGAGTTCAGAAACCCCTGGGCTAGA
GGCTATATCCGGGTTAAGAAGTATGAAAGCTCCCAGTCTAGAAGCCCAAGCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4CA65JQ 832 0 0
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GTGGCGGTGGTGGATATCGTGGTGGGGGTGGTGGCTATGGAGGTGGTGGAGGATCTGCCC
GGTTTGGTGTCTCACGACACTCTGAATTCCGAGTTATTGTACGTGGGCTCCCATCATCTG
CTTCATGGCAAGATTTGAAGGATCATATGCGGAAAGCTGGTGATGTGTGCTTTGCTGAGG
TCACTCGTGACAGTGATGGAACTTATGGTGTTGTTGACTACACCAATTATGATGATATGA
AGTATGCGATAAGGAAACTTGATGATACAGAGTTCAGAAACCCCTGGGCTAGAGGCTATA
TCCGGGTTAAGAAGTATGAAAGCTCCCAGTCTAGAAGCCCAAGCAGAAGCAGGAGCCGTA
GTAGAGGCCGTGGTCGCAGCCCTAGTCGTAGCGTTAGCAGAAGCAGGAGCCCAAGAAAGG
ATTTGAGTAAATCACCCAGACGTTCTCTTTCAAGATCGTTGTCAAAATCTAGATCTCTAT
CTCCCGACAGGAAGAAGAGTCCTCCTAGGGCAATGTCGAGATCGAGGTCCAGGTCTCTTT
CAAAATCTCCTGCCAAGGTTCAGGAAGGAACTGAGTGAGTGATGGCACTTCGAACCGTCC
ATGGCAAAGATCAAATCGGATAAATGGGGAGTTCTATGCAAAATTGTAATTTGTTCTTAG
GCTACTAGTTCTGGATTCTTTCTTTTTCCTCTGCTACTACTACTTTGATCTTTAAAACAT
GTTATCTTTACCGGTTCTTTAAATTTTTATGTTTACTGTTTGGGAGTTTTAG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4B392JQ 757 0 0
GTGGTG
GGGGGTG*TGGCTATGGAGGTGGTGGAGGATCTGCCCGGTTTGGTGTCTCACGACACTCT
GAATTCCGAGTTATTGTACGTGGGCTCCCATCATCTGCTTCATGGCAAGATTTGAAGGAT
CATATGCGGAAAGCTGGTGATGTGTGCTTTGCTGAGGTCACTCGTGACAGTGATGGAACT
TATGGTGTTGTTGACTACACCAATTATGATGATATGAAGTATGCGATAAGGAAACTTGAT
GATACAGAGTTCAGAAACCCCTGGGCTAGAGGCTATATCCGGGTTAAGAAGTATGAAAGC
TCCCAGTCTAGAAGCCCAAGCAGAAGCAGGAGCCGTAGTAGAGGCCGTGGTCGCAGCCCT
AGTCGTAGCGTTAGCAGAAGCAGGAGCCCAAGAAAGGATCTGAGTAAATCACCCAGACGT
TCTCTTTCAAGATCGTTGTCAAAATCTAGATCTCTATCTCCCGACAGGAAGAAGAGTCCT
CCTAGGGCAATGTCGAGATCGAGGTCCAGGTCTCTTTCAAAATCTCCTGCCAAGGTTCAG
GAAGGAACTGAGTGAGTGATGGCACTTCGAACCGTCCATGGCAAAGATCAAATCGGATAA
ATGGGGAGTTCTATGCAAAATTGTAATTTGTTCTTAGGCTACTAGTTCTGGATTCTTTCT
TTTTCCTCTGCTACTACTACTTTGATCTTTAAAACATGTTATCTTTACCGGTTCTTTAAA
TTTTTATGTTTACTGTTTGGGAGTTTTAGGC

QA 7 757 7 757
DS 



AS 1 5

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AAAGCAAGGGCAAAGAAGCAGCCTTACGAATTTAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTC
AGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGATGAAAGCCTCTCCCTTG
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TCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAATTTGGTCTGTACTATTCACTCAAACTATTCTAT
GTTTAATTATCCTCTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 

AF RR4GN70JQ C 1
AF RR4GN70TF U 1
AF RR4H005JQ C 15
AF RR4H005TF U 15
AF RR4GG14TF U 10
BS 1 41 RR4GN70TF
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BS 43 407 RR4GN70TF
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BS 409 496 RR4GN70TF
BS 497 498 RR4GG14TF

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AAAGCAAGGGCAAAGAAGCAGCCTTACGAATTTAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTC
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CAATCTTTTCGGCTGCCTTTTGTCGAAATTCTTAAGAATATAACTCTTTTTGCTTCTCGT
TCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAATTTGGTCTGTACTATTCACTCAAACTATTCTAT
GTTTAATTATCCTCTT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4GN70TF 496 0 0
GGGAGTCGATAATAAACACAGAGAGAGAAGAAGGGAGAGAATAAAATGGAGAAGTATTTT
GGAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAAC
ATATGGATTGGTTCGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAG
CTCTCCAACCAATTCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAA
AAAGCAAGGGCAAAGAAGCAGCCTTACGAATTTAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTC
AGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGATGAAAGCCTCTCCCTTG
CAATCTTTTCGGCTGCCTTTTGTCGAAATTCTTAAGAATATAACTCTTTTTGCTTCTCGT
TCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAATTTGGTCTGTACTATTCACTCAAACTATTCTAT
GTTTAATTATCCTCTT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4H005JQ 484 0 0
GGG
ACAGAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGAGAAGTATTTTGGAAATGCGTACAGGGG
AGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTTCGGC
TGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAACCAATTCAA
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TTTTGTCGAAATTCTTAAGAATATAACTCTGTTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTGTT
GGATTTTAAATTTGGTCTGTACTATTCACTCAAACTATTCTATGTTTAATTATCCTCTT
CT

QA 4 482 4 482
DS 

RD RR4H005TF 484 0 0
GGG
ACAGAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGAGAAGTATTTTGGAAATGCGTACAGGGG
AGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTTCGGC
TGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAACCAATTCAA
TTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCAAAGAA
GCAGCCTTACGAATTTAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATTATTA
CAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGATGAAAGCCTCTCCCTTGCAATCTTTTCGGCTGCC
TTTTGTCGAAATTCTTAAGAATATAACTCTGTTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTGTT
GGATTTTAAATTTGGTCTGTACTATTCACTCAAACTATTCTATGTTTAATTATCCTCTT
CT

QA 4 482 4 482
DS 

RD RR4GG14TF 489 0 0
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CCAGGAGTGCCGCACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTTCGGCTGCC
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CATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGAGCAAAGAAGCAG
CCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCAAAAGAAGTCAGGGACTCGTATTATTACAAC
TGGCCTGTCTACTTCCCTTAGATGAAAGTCTCTCCCTTGCAATCTTTTCGGCTGCCTTTT
GTCGAAATTCTTAAGAATATAACTCTGTTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTGTTGGAT
TTTAAATTTGGTCTGTACTAATCACTCAAACTATTATATGTTTAATTATCCTCTTCT

QA 13 489 13 489
DS 



AS 2 5

CO CL1928Contig1 961 2 2 U
GATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGCTTTATTACTTACAAACGAAGAAGAAC
CGAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAAGAGAGAGCATCTCAGAGTAGAAGAAGCA
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ATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCAGAATCAAGAAATCTCAGGTCGT
GGTTACCATATTGGACTCGGTCAAACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATCT
CGGTTTCGCTTCAGCCATCTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGG
TTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGT
CTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTCCTCGTGCTGCTCACTGCAGC
TTCCCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGAAGACTCCCGACAGCTACTTCTGCTACAT
TGTGAAACCAGGCGTTTTCTTCATCGGCTCCATCCTCTCGCTTTTCACTATAGGCCTCGG
GATTGTCTACTATTTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCTGCCACAAC
CACGCCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGA
TCCCGTCTTTGTTCATGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAGAAAAAAAAAAT
ACAGAACAAGGCTTGCTTGTGAATCACGCTAGTTATATAGGAGGATATTTTAGGTTTTAA
AAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGTTTTTTTTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGA
AAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGT
T


BQ
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10 

AF RR4BN51TF U 1
AF RR4BN51JQ C 208
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BS 626 961 RR4BN51JQ

RD RR4BN51TF 625 0 0
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DS 

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TTTTTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAG
TAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGTT

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL1928Contig2 1005 3 5 U
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GAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGT


BQ
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AF RR4ED51TF U 1
AF RR4FV51TF U 112
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GAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGC
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G
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GTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGC
AACAACCACGCCGGTTAA

QA 2 588 2 588
DS 

RD RR4ED51JQ 590 0 0
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GAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAA
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TACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACTTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTT
AACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTT
GTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAAAAAATACAGAACAAGG
CTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATGGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAAAGGGCTTGG
TGCTTGTTTTGATTTTTTATTTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAAC
TATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 5

CO CL1929Contig1 845 5 4 U
ATACTGAAAACAAGCACAACATTCTCAATCTGTCTAATATAGCTTACAGAAAATTATTGA
CTCATTGGTCATTGTTGCTAGATTAAGAATTCTCGAGTTCTACTTATGTTGCTGCTATAA
TAAAACACGAAACAATATGATATGAGAAACTGAGAATCGTAGCAGGACAGGGATATTTTT
TT*AGGCCTCTGTTCATTTCTTCCCATCCACTTCGACTGGTTCAACCACTTCAGCTTCTA
ACAGCTCTGCATTGTGAGTTTGTGTCATATGCTGCTGTGCCTGGACCTCGGGGCTCGACC
ATTTCCCGAAAAGAGCAGTATCCATCATCTCATATATCTTTCCACCGAGCTCTGCTGGAT
TCTCGGGCGTGAAACCACTAGAAACTAGTGCTGCATCATACATAAGATCTATGGCTTTCA
TCGCTTCTTCATCATTTGGGTTACTCTTGTAAGCAGCATTTATGTTCTTGATAATCGAGT
GGTCAGGATTGATCTCAAACACTCTTCTCCCTTTCATGAACTCGAGGCTTGTTGTGTCAC
CTGCTGACTGGGCCTTCATTAGCCTCTCCATATTGGCTGACCAACCAAATTTACCAGATA
CAAGAACACAGGGGGATGAACTGAGACGGCTAGAAATTTGAACACTGGCAACCTTATCGC
CCAATCGTTTCTTTATCCAATCAGATGTCTGCCCAAACTCCTTTTTGGCAGCTGCCTCTT
TCTCCTCATTCTTGTCACCTAGGTCTAAGTCTTCCTTGCTGATGTCGATAAAGTCCTTAT
CCTTGTAAGATTTCAAGCTCTGTATGGCAACTTCATCAATGGGTTCTACCAGATATAGTA
CCTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4A866JQ U 1
AF RR4A866TF C 26
AF RR4FN10JQ U 3
AF RR4AQ43JQ U 1
AF RR4AQ43TF C 194
BS 1 380 RR4A866JQ
BS 381 381 RR4AQ43JQ
BS 382 680 RR4A866JQ
BS 681 845 RR4AQ43JQ

RD RR4A866JQ 680 0 0
ATACTGAAAACAAGCACAACATTCTCAATCTGTCTAATATAGCTTACAGAAAATTATTGA
CTCATTGGTCATTGTTGCTAGATTAAGAATTCTCGAGTTCTACTTATGTTGCTGCTATAA
TAAAACACGAAACAATATGATATGAGAAACTGAGAATCGTAGCAGGACAGGGATATTTTT
TT*AGGCCTCTGTTCATTTCTTCCCATCCACTTCGACTGGTTCAACCACTTCAGCTTCTA
ACAGCTCTGCATTGTGAGTTTGTGTCATATGCTGCTGTGCCTGGACCTCGGGGCTCGACC
ATTTCCCGAAAAGAGCAGTATCCATCATCTCATATATCTTTCCACCGAGCTCTGCTGGAT
TCTCGGGCGTGAAACCACTAAAAACTAGTGCTGCATCATACATAAGATCTATGGCTTTCA
TCGCTTCTTCATCATTTGGGTTACTCTTGTAAGCAGCATTTATGTTCTTGATAATCGAGT
GGTCAGGATTGATCTCAAACACTCTTCTCCCTTTCATGAACTCGAGGCTTGTTGTGTCAC
CTGCTGACTGGGCCTTCATTAGCCTCTCCATATTGGCTGACCAACCAAATTTACCAGATA
CAAGAACACAGGGGGATGAACTGAGACGGCTAGAAATTTGAACACTGGCAACCTTATCGC
CCAATCGTTTCTTTATCCAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4A866TF 779 0 0
CAATCTGTCTAATATAGCTTACAGAAAATTATTGACTCATTGGTCATTGTTGCTAGATTA
AGAATTCTCGAGTTCTACTTATGTTGCTGCTATAATAAAACACGAAACAATATGATATGA
GAAACTGAGAATCGTAGCAGGACAGGGATATTTTTTT*AGGCCTCTGTTCATTTCTTCCC
ATCCACTTCGACTGGTTCAACCACTTCAGCTTCTAACAGCTCTGCATTGTGAGTTTGTGT
CATATGCTGCTGTGCCTGGACCTCGGGGCTCGACCATTTCCCGAAAAGAGCAGTATCCAT
CATCTCATATATCTTTCCACCGAGCTCTGCTGGATTCTCGGGCGTGAAACCACTAGAAAC
TAGTGCTGCATCATACATAAGATCTATGGCTTTCATCGCTTCTTCATCATTTGGGTTACT
CTTGTAAGCAGCATTTATGTTCTTGATAATCGAGTGGTCAGGATTGATCTCAAACACTCT
TCTCCCTTTCATGAACTCGAGGCTTGTTGTGTCACCTGCTGACTGGGCCTTCATTAGCCT
CTCCATATTGGCTGACCAACCAAATTTACCAGATACAAGAACACAGGGGGATGAACTGAG
ACGGCTAGAAATTTGAACACTGGCAACCTTATCGCCCAATCGTTTCTTTATCCAATCAGA
TGTCTGCCCAAACTCCTTTTTGGCAGCTGCCTCTTTCTCCTCATTCTTGTCACCTAGGTC
TAAGTCTTCCTTGCTGATGTCGATAAAGTCCTTATCCTTGTAAGATTTCAAGCTCTGTA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4FN10JQ 826 0 0
G
CTGAAAACAAGCACAACATTCTCAATCTGTCTAATATAGCTTACAGAAAATTATTGACTC
ATTGGTCATTGTTGCTAGATTAAGAATTCTCGAGTTCTACTTATGTTGCTGCTATAATAA
AACACGAAACAATATGATATGAGAAACTGAGAATCGTAGCAGGACAGGGATATTTTTTTT
AGGCCTCTGTTCATTTCTTCCCATCCACTTCGACTGGTTCAACCACTTCAGCTTCTAACA
GCTCTGCACTGTGAGTTTGTGTCATATGCTGCTGTGCCTGGACCTCGGGGCTTGACCATT
TCCCGGAAAGAGCAGTATCCATCATCTCATATATCTTTCCACCGAGCTCTGCTGGATTCT
CGGGCGTGAAACCACTAGAAACTAGTGCTGCATCGTACATAAGATCTATGGCTTTCATCG
CTTCTTCATCATTTGGGTTACTCTTGTAAGCAGCATTTATGTTCTTGATAATCGAGTGGT
CAGGATTGATCTCAAACACTCTTCTCCCTTTCATGAACTCGAGGCTTGTTGTGTCACCTG
CTGACTGGGCCTTCATTAGCCTCTCCATATTGGCTGACCAACCAAATTTACCAGATACAA
GAACACAGGGGGATGAACTGAGACGGCTAGAAATTTGAACACTGGCAACCTTATCGCCCA
ATCGTTTCTTTATCCAATCACATGTCTGCCCAAACTCCTTTTTGGCAGCTGCCTCTTTCT
CCTCATTCTTGTCACCTAGGTCTAAGTCTTCCTTGCTGATGTCGATAAAGTCCTTATCCT
TGTAAGATTTCAAGCTCTGTATGGCAACTTCATCAATGGGTTCTA

QA 2 826 2 826
DS 

RD RR4AQ43JQ 845 0 0
ATA
CTGAAAACAAGCACAACATTCTCAATCTGTCTAATATAGCTTACAGAAAATTATTGACTC
ATTGGTCATTGTTGCTAGATTAAGAATTCTCGAGTTCTACTTATGTTGCTGCTATAATAA
AACACGAAACAATATGATATGAGAAACTGAGAATCGTAGCAGGACAGGGATATTTTTTT*
AGGCCTCTGTTCATTTCTTCCCATCCACTTCGACTGGTTCAACCACTTCAGCTTCTAACA
GCTCTGCATTGTGAGTTTGTGTCATATGCTGCTGTGCCTGGACCTCGGGGCTCGACCATT
TCCCGAAAAGAGCAGTATCCATCATCTCATATATCTTTCCACCGAGCTCTGCTGGATTCT
CGGGCGTGAAACCACTAGAAACTAGTGCTGCATCATACATAAGATCTATGGCTTTCATCG
CTTCTTCATCATTTGGGTTACTCTTGTAAGCAGCATTTATGTTCTTGATAATCGAGTGGT
CAGGATTGATCTCAAACACTCTTCTCCCTTTCATGAACTCGAGGCTTGTTGTGTCACCTG
CTGACTGGGCCTTCATTAGCCTCTCCATATTGGCTGACCAACCAAATTTACCAGATACAA
GAACACAGGGGGATGAACTGAGACGGCTAGAAATTTGAACACTGGCAACCTTATCGCCCA
ATCGTTTCTTTATCCAATCAGATGTCTGCCCAAACTCCTTTTTGGCAGCTGCCTCTTTCT
CCTCATTCTTGTCACCTAGGTCTAAGTCTTCCTTGCTGATGTCGATAAAGTCCTTATCCT
TGTAAGATTTCAAGCTCTGTATGGCAACTTCATCAATGGGTTCTACCAGATATAGTACCT
CC

QA 4 845 4 845
DS 

RD RR4AQ43TF 652 0 0
TCATTTCTTCCCATCCACTTCGACTGGTTCAACCACTTCAGCTTCTAACAGCTCTGCATT
GTGAGTTTGTGTCATATGCTGCTGTGCCTGGACCTCGGGGCTCGACCATTTCCCGAAAAG
AGCAGTATCCATCATCTCATATATCTTTCCACCGAGCTCTGCTGGATTCTCGGGCGTGAA
ACCACTAGAAACTAGTGCTGCATCATACATAAGATCTATGGCTTTCATCGCTTCTTCATC
ATTTGGGTTACTCTTGTAAGCAGCATTTATGTTCTTGATAATCGAGTGGTCAGGATTGAT
CTCAAACACTCTTCTCCCTTTCATGAACTCGAGGCTTGTTGTGTCACCTGCTGACTGGGC
CTTCATTAGCCTCTCCATATTGGCTGACCAACCAAATTTACCAGATACAAGAACACAGGG
GGATGAACTGAGACGGCTAGAAATTTGAACACTGGCAACCTTATCGCCCAATCGTTTCTT
TATCCAATCAGATGTCTGCCCAAACTCCTTTTTGGCAGCTGCCTCTTTCTCCTCATTCTT
GTCACCTAGGTCTAAGTCTTCCTTGCTGATGTCGATAAAGTCCTTATCCTTGTAAGATTT
CAAGCTCTGTATGGCAACTTCATCAATGGGTTCTACCAGATATAGTACCTCC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 5

CO CL1930Contig1 676 5 2 U
GGATAGCAAAAGGAATAAAAAAAGAAGGAGCGCTTCTGAAGATCAAAGGACAGAGTAGCG
GAGCAAACGAAGGAAGAGAAGGGGAAGAGGGAAGATGAAGGCGTTAGGGTATTGGCTAAT
GGTGGTTGGTTCACTGAGATTAGCTTCCGTCTGGTTTGGTTTCTTCAACATTTGGGCTCT
TCGTCTCGCCGTCTTCTCTCAGACCACCATGAGTGAAGTTCATGGACGTACATTCGGAGT
ATGGACACTGTTGACCTGCACTCTCTGCTTTCTTTGTGCATTCAACCCCGACAACAAACC
GCTATACTTAGCTACCTTTCTCTCATTCATCTACGCCTTGGGCCATTTTCTGACTGAATA
CCTCTTCTACCATACAATGACCATCGCAAACCTCTCGACCGTAGCCTTCTTTGCAGGCAC
ATCGATTGTGTGGATGCTCTGGGAATGGAACTCCCTTGAACAACCGCACTCCAAACTTTC
TTGATCTTCTTTTTAAGCTGCTGAGTCATATTTCATCTATAATCTTTGAAGGAGTATTGA
TTTGTGGTCAAAGTTTTGAACTATGAGAATACAATGAAAAAAAATCATGGATTTGTTTTA
TAACTCAAACCAGTTTCATAGGTTAAATGTTGTTCCTTTATCAGAGTCTTTTATAGTTTT
GAGTTGCAAAAAAAAA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ36TF U 1
AF RR4CX20TF U 47
AF RR4GE92JQ C 1
AF RR4GE92TF U 1
AF RR4FZ36JQ C 436
BS 1 577 RR4FZ36TF
BS 578 676 RR4GE92TF

RD RR4FZ36TF 577 0 0
GGATAGCAAAAGGAATAAAAAAAGAAGGAGCGCTTCTGAAGATCAAAGGACAGAGTAGCG
GAGCAAACGAAGGAAGAGAAGGGGAAGAGGGAAGATGAAGGCGTTAGGGTATTGGCTAAT
GGTGGTTGGTTCACTGAGATTAGCTTCCGTCTGGTTTGGTTTCTTCAACATTTGGGCTCT
TCGTCTCGCCGTCTTCTCTCAGACCACCATGAGTGAAGTTCATGGACGTACATTCGGAGT
ATGGACACTGTTGACCTGCACTCTCTGCTTTCTTTGTGCATTCAACCCCGACAACAAACC
GCTATACTTAGCTACCTTTCTCTCATTCATCTACGCCTTGGGCCATTTTCTGACTGAATA
CCTCTTCTACCATACAATGACCATCGCAAACCTCTCGACCGTAGCCTTCTTTGCAGGCAC
ATCGATTGTGTGGATGCTCTGGGAATGGAACTCCCTTGAACAACCGCACTCCAAACTTTC
TTGATCTTCTTTTTAAGCTGCTGAGTCATATTTCATCTATAATCTTTGAAGGAGTATTGA
TTTGTGGTCAAAGTTTTGAACTATGAGAATACAATGA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4CX20TF 570 0 0
G
GGACAGAGTAGCGGAGCAAACGAAGGAAGAGAGGGGGAAGAGGGAAGATGAAGGCGTTAG
GGTATTGGCTAATGGTGGTTGGTTCACTGAGATTAGCTTCCGTCTGGTTTGGTTTCTTCA
ACATTTGGGCTCTTCGTCTCGCCGTCTTCTCTCAGACCACCATGAGTGAAGTTCATGGAC
GTACATTCGTAGTATGGACACTGTTGACCTGCACTCTCTGCTTTCTTTGTGCATTCAACC
CCGACAACAAACCGCTATACTTAGCTACCTTTCTCTCATTCATCTACGCCTTGGGCCATT
TTCTGACTGAATACCTCTTCTACCATACAATGACCATCGCAAACCTCTCGACCGTAGCCT
TCTTTGCAGGCACATCGATTGTGTGGATGCTCTGGGAATGGAACTCCCTTGAACAACCGC
ACTCCAAACTTTCTTGATCTTCTTTTTAAGCTGCTGAGTCATATTTCATCTATAATCTTT
GAAGGAGTATTGATTTGTGGTCAAAGTTTTGAACTATGAGAATACAATGAAAAAAAATCA
TGGATTTGTTTTATAACTCAA
CCAGTTTC

QA 2 562 2 562
DS 

RD RR4GE92JQ 667 0 0
GGATAGCAAAAGGAATAAAAAAAGAAGGAGCGCTTCTGAAGATCAAAGGACAGAGTAGCG
GAGCAAACGAAGGAAGAGAAGGGGAAGAGGGAAGATGAAGGCGTTAGGGTATTGGCTAAT
GGTGGTTGGTTCACTGAGATTAGCTTCCGTCTGGTTTGGTTTCTTCAACATTTGGGCTCT
TCGTCTCGCCGTCTTCTCTCAGACCACCATGAGTGAAGTTCATGGACGTACATTCGGAGT
ATGGACACTGTTGACCTGCACTTTCTGCTTTCTTTGTGCATTCAACCCCGACAACAAACC
GCTATACTTAGCTACCTTTCTCTCATTCATCTACGCCTTGGGCCATTTTCTGACTGAATA
CCTCTTCTACCATACAATGACCATCGCAAACCTCTCGACCGTAGCCTTCTTTGCAGGCAC
ATCGATTGTGTGGATGCTCTGGGAATGGAACTCCCTTGAACAACCGCACTCCAAACTTTC
TTGATCTTCTTTTTAAGCTGCTGAGTCATATTTCATCTATAATCTTTGAAGGAGTATTGA
TTTGTGGTCAAAGTTTTGAACTATGAGAATACAATGAAAAAAAATCATGGATTTGTTTTA
TAACTCAAACCAGTTTCATAGGTTAAATGTTGTTCCTTTATCAGAGTCTTTTATAGTTTT
GAGTTGC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4GE92TF 676 0 0
GGATAGCAAAAGGAATAAAAAAAGAAGGAGCGCTTCTGAAGATCAAAGGACAGAGTAGCG
GAGCAAACGAAGGAAGAGAAGGGGAAGAGGGAAGATGAAGGCGTTAGGGTATTGGCTAAT
GGTGGTTGGTTCACTGAGATTAGCTTCCGTCTGGTTTGGTTTCTTCAACATTTGGGCTCT
TCGTCTCGCCGTCTTCTCTCAGACCACCATGAGTGAAGTTCATGGACGTACATTCGGAGT
ATGGACACTGTTGACCTGCACTCTCTGCTTTCTTTGTGCATTCAACCCCGACAACAAACC
GCTATACTTAGCTACCTTTCTCTCATTCATCTACGCCTTGGGCCATTTTCTGACTGAATA
CCTCTTCTACCATACAATGACCATCGCAAACCTCTCGACCGTAGCCTTCTTTGCAGGCAC
ATCGATTGTGTGGATGCTCTGGGAATGGAACTCCCTTGAACAACCGCACTCCAAACTTTC
TTGATCTTCTTTTTAAGCTGCTGAGTCATATTTCATCTATAATCTTTGAAGGAGTATTGA
TTTGTGGTCAAAGTTTTGAACTATGAGAATACAATGAAAAAAAATCATGGATTTGTTTTA
TAACTCAAACCAGTTTCATAGGTTAAATGTTGTTCCTTTATCAGAGTCTTTTATAGTTTT
GAGTTGCAAAAAAAAA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FZ36JQ 232 0 0
GT
TCTGGGAATGGAACTCCCTTGAACAACCGCACTCCAAACTTTCTTGATCTTCTTTTTAAG
CTGGTGAGTCATATTTCATCTATAATCTTTGAAGGAGTATTGATTTGTGGTCAAAGTTTT
GAACTATGAGAATACAATGAAAAAAAATCATGGATTTGTTTTATAACTCAAACCAGTTTC
ATAGGTTAAATGTTGTTCCTTTATCAGAGTCTTTTATAGTTTTGAGTTGC

QA 3 232 3 232
DS 



AS 2 5

CO CL1931Contig1 589 2 3 U
GGATTTGTGTTTTATCTACAACTAGGATGTGTGCCTTTTGAGCTTCATCTTCTCTACACC
TCTTGTTTCGGCCCTTTTAAATAACAGCTTTTGTTGTTCTGTTTTTTGAATACTAATCTA
TTCTCTGTCTCTGTTTTCTAAATTATCAGAGGAAAAAAAATCTGCTACTCTAAAATTTTT
CAATCTTCACAACGTTGGCGTTTTAGGTATTCTTAATTTGGTAAATTCAAAATCTCTCTT
TCTAGATTAAAAAGCGTTCTAGAGACTTGAATACACAAGGAACTTGATACAGCATGGAAA
TCAGACTATATGAATTGATGAACTGAGGTTCAACCTGAAAACAAAGAAGATAGATTTTTA
TGAGTTTTTATGAGTTTTTATGAAACAAAACAGAAACAAATGGAAGATGAATGAGATGCT
GATTCTATGATGAACTAAATAAGATAAATAAGCAAAGGATAGGATGGAATTAGGCTGCTG
GGATGTGTATCACTCTCAGCCTAATCAGTTGATGATTGAAGTGGATTGAGATGGTGCTCT
GCTTGCTGGTTGTGTAACTCTCTCAAGCTTGGCAAATGAATGGGATGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C727JQ U 1
AF RR4C755JQ U 1
BS 1 481 RR4C727JQ
BS 482 482 RR4C755JQ
BS 483 589 RR4C727JQ

RD RR4C727JQ 589 0 0
GGATTTGTGTTTTATCTACAACTAGGATGTGTGCCTTTTGAGCTTCATCTTCTCTACACC
TCTTGTTTCGGCCCTTTTAAATAACAGCTTTTGTTGTTCTGTTTTTTGAATACTAATCTA
TTCTCTGTCTCTGTTTTCTAAATTATCAGAGGAAAAAAAATCTGCTACTCTAAAATTTTT
CAATCTTCACAACGTTGGCGTTTTAGGTATTCTTAATTTGGTAAATTCAAAATCTCTCTT
TCTAGATTAAAAAGCGTTCTAGAGACTTGAATACACAAGGAACTTGATACAGCATGGAAA
TCAGACTATATGAATTGATGAACTGAGGTTCAACCTGAAAACAAAGAAGATAGATTTTTA
TGAGTTTTTATGAGTTTTTATGAAACAAAACAGAAACAAATGGAAGATGAATGAGATGCT
GATTCTATGATGAACTAAATAAGATAAATAAGCAAAGGATAGGATGGAATTAGGCTGCTG
G*ATGTGTATCACTCTCAGCCTAATCAGTTGATGATTGAAGTGGATTGAGATGGTGCTCT
GCTTGCTGGTTGTGTAACTCTCTCAAGCTTGGCAAATGAATGGGATGGA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4C755JQ 546 0 0
GGATTTGTGTTTTATCTACAACTAGGATGTGTGCCTTTTGAGCTTCATCTTCTCTACACC
TCTTGTTTCGGCCCTTTTAAATAACAGCTTTTGTTGTTCTGTTTTTTGAATACTAATCTA
TTCTCTGTCTCTGTTTTCTAAATTATCAGAGGAAAAAAAATCTGCTACTCTAAAATTTTT
CAATCTTCACAACGTTGGCGTTTTAGGTATTCTTAATTTGGTAAATTCAAAATCTCTCTT
TCTAGATTAAAAAGCGTTCTAGAGACTTGAATACACAAGGAACTTGATACAGCATGGAAA
TCAGACTATATGAATTGATGAACTGAGGTTCAACCTGAAAACAAAGAAGATAGATTTTTA
TGAGTTTTTATGAGTTTTTATGAAACAAAACAGAAACAAATGGAAGATGAATGAGATGCT
GATTCTATGATGAACTAAATAAGATAAATAAGCAAAGGATAGGATGGAATTAGGCTGCTG
GGATGTGTATCACTCTCAGCCTAATCAGTTGATGATTGAAGTGGATTGAGATGGTGCTCT
GCTTGC

QA 1 546 1 546
DS 



CO CL1931Contig2 755 3 3 U
GGGAGAACGGTCTTGTTCCCATCGTTGAGCCTGAGATTCTCGTTGACGGTTCCCATGACA
TCCACAAGTGTGCTGCCGTCACCGAGCGTGTCCTTGCCGCTTGCTACAAGGCTCTTAGCG
ACCACCACGTCTTGCTTGAGGGAACTCTGTTGAAGCCTAACATGGTTACACCAGGATCCG
ACAGTGCTAAGGTTGCTCCTGAGGTGATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCCCTTCAGAGAA
CGGTCCCAACTGCTGTTCCAGCCATTGTGTTCTTGTCTGGTGGGCAGAGCGAGGAGGAGG
CGACCAATAACTTGAACGCGACGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTT
TCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAACAGAGCACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGA
ATGTCAAGGCTGCTCATGAGGCCTTGTATGTGAGGTGCAAGGCTAACTCTGAAGCTACGC
TTGGAACTTACAAAGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGA
AGGATTACAAGTACTGAGAATCGTCGTTATCATTATTACCCTCAGACATTATCGGCCTTT
TTCTCATTTTTCTTTGGATTTGTGTTTTATCTACAACTAAGATGTGTGCCTTTTGATTGA
GCTTCATCTTCTCTACACCTCTTGTTTCGGCCCTTTTAAATAACAGCTTTTGTTGTTCTG
CTTTTTGAATACTAATCTATTCTCTGTCTCTGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4CR72TF U 1
AF RR4C950TF U 1
AF RR4FK20TF U 230
BS 1 725 RR4C950TF
BS 726 726 RR4FK20TF
BS 727 755 RR4C950TF

RD RR4CR72TF 689 0 0
GGGAGAACGGTCTTGTTCCCATCGTTGAGCCTGAGATTCTCGTTGACGGTTCCCATGACA
TCCACAAGTGTGCTGCCGTCACCGAGCGTGTCCTTGCCGCTTGCTACAAGGCTCTTAGCG
ACCACCACGTCTTGCTTGAGGGAACTCTGTTGAAGCCTAACATGGTTACACCAGGATCCG
ACAGTGCTAAGGTTGCTCCTGAGGTGATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCCCTTCAGAGAA
CGGTCCCAACTGCTGTTCCAGCCATTGTGTTCTTGTCTGGTGGGCAGAGCGAGGAGGAGG
CGACCAATAACTTGAACGCGACGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTT
TCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAACAGAGCACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGA
ATGTCAAGGCTGCTCATGAGGCCTTGTATGTGAGGTGCAAGGCTAACTCTGAAGCTACGC
TTGGAACTTACAAAGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGA
AGGATTACAAGTACTGAGAATCGTCGTTATCATTATTACCCTCAGACATTATCGGCCTTT
TTCTCATTTTTCTTTGGATTTGTGTTTTATCTACAACTAAGATGTGTGCCTTTTGATTGA
GCTTCATCTTCTCTACACCTCTTGTTTCG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4C950TF 755 0 0
GGGAGAACGGTCTTGTTCCCATCGTTGAGCCTGAGATTCTCGTTGACGGTTCCCATGACA
TCCACAAGTGTGCTGCCGTCACCGAGCGTGTCCTTGCCGCTTGCTACAAGGCTCTTAGCG
ACCACCACGTCTTGCTTGAGGGAACTCTGTTGAAGCCTAACATGGTTACACCAGGATCCG
ACAGTGCTAAGGTTGCTCCTGAGGTGATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCCCTTCAGAGAA
CGGTCCCAACTGCTGTTCCAGCCATTGTGTTCTTGTCTGGTGGGCAGAGCGAGGAGGAGG
CGACCAATAACTTGAACGCGACGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTT
TCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAACAGAGCACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGA
ATGTCAAGGCTGCTCATGAGGCCTTGTATGTGAGGTGCAAGGCTAACTCTGAAGCTACGC
TTGGAACTTACAAAGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGA
AGGATTACAAGTACTGAGAATCGTCGTTATCATTATTACCCTCAGACATTATCGGCCTTT
TTCTCATTTTTCTTTGGATTTGTGTTTTATCTACAACTAAGATGTGTGCCTTTTGATTGA
GCTTCATCTTCTCTACACCTCTTGTTTCGGCCCTTTTAAATAACAGCTTTTGTTGTTCTG
CTTTT*GAATACTAATCTATTCTCTGTCTCTGTTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4FK20TF 523 0 0
GCTA
CAGAGAACGGTCCCAACTGCTGTTCCAGCCATTGTGTTCTTGTCTGGTGGGCAGAGCGAG
GAGGAGGCGACCAATAACTTGAACGCGATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCG
TTGTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAACAGAGCACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAA
GAGGAGAATGTCAAGGCTGCTCAAGAGGCCTTGTATGTGAGGTGCAAGGCTAACTCTGAA
GCTACGCTTGGAACTTACAAAGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTT
CACGTGAAGGATTACAAGTACTGAGAATCGTCGTTATCATTATTACCCTCAGACATTATC
GGCCTTTTTCTCATTTTTCTTTGGATTTGTGTTTTATCTACAACTAAGATGTGTGCCTTT
TGATTGAGCTTCATCTTCTCTACACCTCTTGTTTCGGCCCTTTTAAATAACAGCTTTTGT
TGTTCTGCTTTTTGAATACTAATCTATTCTCTGTCTCTG

QA 5 523 5 523
DS 



AS 1 3

CO CL1932Contig1 826 3 11 U
GGCTTCCCCTCTTACCAAATCAACATCTCTAATCTATTACTACATGATCGGACAGCTTAT
GAACCTCAAGGAGACAGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCCGGGGCCGCTGAAACCCTCGATAC
TCCAGCCAGATCGGCGGTGGGGAACAAGAGAGGCTTTTCCGAGACCGTTGATCTCATGCT
CAATCTTCAGTCCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTAACAACGCTACAGCTTCTAAACA
GAAAACTCTTCTCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTGGTGGGATGGCC
ACCAGTGAGGAACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGA
TGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAA
GGTATCCATGGACGGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTA
TCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGAAACTATGG
AGCACAAGGAATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTC
TGATTATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGTCGGCGATGTCCC
ATGGGAAATGTTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAAAGGGATCTGAAGCAA
TTGGACTTGCTACAGAGAACAATCGAGAAGTATTCCAAGAACAGATCATAATTTTTATAT
TAAGAAAAAAGAATCTTCAGTGCTCAATCATATGACGAGCTCTTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 0 0 0 15 0 15 0 0 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ74TF U 1
AF RR4E142TF U 12
AF RR4B933TF U 1
BS 1 142 RR4B933TF
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BS 745 826 RR4B933TF

RD RR4GZ74TF 702 0 0
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QA 1 702 1 702
DS 

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GG
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AAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCAGTGAGGAAC
TCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGATGCCAGCAGCGAG
AAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAAGGTATCCATGGAC
GGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTATCAGGATCTCTCT
GATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATG
ATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTCTGATTATGTTCCA
AGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGTCGGCGATGTCCCATGGGAAATGTTT
GTCGAGTCATTCAGACGTTTTCGCATTATGAA**GGATCTGA*GCA*TTGGACTTGGTAC
ATTTAACTCTC

QA 3 733 3 733
DS 

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TCCAGCCAGATCGGCGGTGGGGGACAAGAGAGGCTTTTCCGAGACCGTTGATCTCATGCT
CAATCTTCAGTCCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTAACAACGCTACAGCTTCTAAACA
GAAAACTCTTCTCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTGGTGGGATGGCC
ACCAGTGAGGAACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGA
TGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAA
GGTATCCATGGACGGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTA
TCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGAAACTATGG
AGCACAAGGAATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTC
TGATTATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGTCGGCGATGTCCC
ATGGGAAATGTTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAAAGGGATCTGAAGCAA
TTGGACTTGCT*CCGAGAGCAATGGAGAAGTATTCCAAGAACAGATCATAATTTTTATAT
TAAGAAAAAAGAATCTTCAGTGCTCAATCATATGACGAGCTCTTGA

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 5

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4BZ19TF C 1
AF RR4GB39JQ U 60
AF RR4A031JQD U 61
AF RR4A031TFB C 61
AF RR4A031JQ U 233
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C

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DS 

RD RR4GB39JQ 566 0 0
G
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QA 1 565 1 565
DS 

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QA 1 393 1 393
DS 



AS 1 2

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CAATGTTATCTTCCCAAGCCACGCGAGAAGGGTCAAACTGTAGCCGCGGAAAGACTGTGT
GATGTTCCGGAGACAGATATAAACAGTTATTGGAATCCAAGAGGTGTAAGGATGGTATTT
GTTGTAAGTTAGATTGTCCATCTTGTATATGTACTCAAACCAAAAATATCCCACCGTAAG
CGCTACAAGTGCCACAGTTGTTTTGACAGCCATCCTGAACTTCATCTCGGCTTCCTCTAG
TTTATCCATCCACTTTCAACAGTTGGGTG


BQ
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15 15 0 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AE23JQ U 1
AF RR4DS70JQ U 6
BS 1 16 RR4AE23JQ
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BS 18 49 RR4AE23JQ
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BS 674 701 RR4AE23JQ
BS 702 809 RR4DS70JQ

RD RR4AE23JQ 701 0 0
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TTCAGTTTAATAACATAGATACAAACAGATGACAATATACCAAACACTGTATGCATCTCT
ACCTCTCTGATTCCTTCTATCTTCTTCGTATAACTACCATATTGCGTTGTTCATCAACTC
CTCTGGAAATTGATATTAATTCCACCCAAATTAATGCCCACGCTGGGCCGGTTCAGACGT
GCTTCATACCATTTTTTGGGGGATTTGGATGAGAACAAACGAGAAAAAGTAGAGGCAAGT
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GAAGGCTGTTTTCAGAGTGTTGGTAAGCTCGAAGAGCCTATAAGAGACAGCGACGTAAAT
AGAAGTTGTGAGCATGAAGTTCAACAATGGGTATTCCGGGATTAGAGACAGTAGCAATTT
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CAATGTTATCTTCCCAAGCCACGCGAGAAGGGTCAAACTGTAGCCGCGGAAAGACTGTGT
GATGTTCCGGAGACAGATATAAACAGTTATTGGAATCGAAGAGGTGTAAGGATGGTATTT
GTTGTAAGTTAGCTTGTCCATCTTGTATATGTACTCAAACC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4DS70JQ 804 0 0
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***AATAACATAGATACAAACAGATGACAATATACCAAACACTGTATGCATCTCTACCTC
TCTGATTTCTTCTATCTTCTTCGTATAACTACCATATTGCGTTGTTCATCAACTCCTCTG
GAAATTGATATTAATTCCACCCAAACTAATGCCCACGCTGGGCCGGTTCAGACGTGCTTC
ATACCATTTTTTGGGGGATTTGGATGAGAACAAACGAGAAAAAGTAGAGGCAAGTGCAGA
TTATGAGAGCTGAGATGGTATTGTAGACAAGGCGCTTGTCGTCTTTGGTTGGTATGAAGG
CTGTTTTCAATGTGTTGGTAAGCTCGAAGAGCCTATAAGAGACAGCGACGTAAATAGAAG
TTGTGAGCATGAAGTTCAACAATGGGTATTCCGGGATTAGAGAGAGTAGCAATTTGGGTT
GACCATCAGGTACTCCAGATCTGAGCCATATATGAAACTGGGAGATATATGTCTCCAATG
TTATCTTCCCAAGCCACGCGAGAAGGGTCAAACTGTAGCCGCGGAAAGACTGTGTGATGT
TCCGGAGACAGATGTAAACAGTTATTGGAATCCAAGAGGTGTAAGGATGGTATTTGTTGT
AAGTTAGATTGTCCATCTTGTATATGTACTCAAACCAAAAATATCCCACCGTAAGCGCTA
CAAGTGCCACAGTTGTTTTGACAGCCATCCTGAACTTCATCTCGGCTTCCTCTAGTTTAT
CCATCCACTTTCAACAGTTGGGTG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 5

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TTTCTAAAAACCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACATGAAAGCC
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CAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTATCTTTCCGAGGAACTT
CAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTAGCTCTCGTTGAGAGA
GAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCTTCCTTAA
GCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAACTC
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TTGTTACATTTTCATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACACAAGTCTGGTTTTCAGT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GB16TF U 1
AF RR4EJ04JQ C 12
AF RR4AL58TF U 267
AF RR4GB16JQ C 58
AF RR4EJ04TF U 12
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BS 635 660 RR4EJ04TF

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TTTCTAAAAACCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACATGAAAGCC
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CAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTAGCTCTCGTTGAGAGA
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GCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAACTC
ATCTCCAAATGGATGACATTTATATTTTCGAAATCATATTCTGAACCTGAGCTATTTACT
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TTGTTAC
G

QA 1 607 1 607
DS 

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GTG
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QA 4 649 4 649
DS 

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TGAATAAA
TCG

QA 1 368 1 368
DS 

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TACCACATGGACATCAAAGAGGCTCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTTGTCGACGCTCGT
AACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTATCTTTCCGAGGAA
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CTGTTGTTAC
G

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4EJ04TF 649 0 0
GTG
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CCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCT**TATGCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCT
CCGTAGATACGGTCTGAGGTACGATGACACGTACGATCAGTATTACCACATGGACATCAA
AGAGGCTCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCG
TGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTATCTTTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGAC
TCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTAGCTCTCGTTGAGAGAGAAAGAAAGGAACG
TGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCAC
CCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGAT
GACATTTATATTTTCGAAATCATATTCTGAACCTGAGCTATTTACTCTCTTAAAATGCAT
AAGTCTTGTAATAGTTTCTCTAAACCTGGGATATATTACTCGTCTGTTGTTACATTTTCA
TGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACACAAGTCTGGTTTTCAGT

QA 4 649 4 649
DS 



AS 1 3

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TCCCCCTGCCTGCATCTCAACGATGGAATTCACTACCGCCGACATGGAAAAGGTGTTTCT
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AGGGAAGCATGAGGCGCTTTGGTGTCTTGGCAACGCGTACACTACCCAGGCTTTTCTTTT
TCCTGATGCCGATGTAGCCAAAGGTCACTTCGATAAAGCCGTTGAATATCTCCAAAGAGC
TGTAGATGAGGATCCAGGTAATGAGATATATCGCAAGGCCTTGGATGTTGCAATAAGGGG
CCCGGAAATGCTAATGGAGCTGACACAGAGTGGAATGATGCAGCAGGCACTAGCTGGAGG
AGGAGGAGGAGGAGGTCGCTCAGCTTCGTCAAATGCTAGCAGTGGTAAGAAGAAGAGGAA
CAATGACTTCACTTACGATGTATGTGGTTGGATCATTCTAGCATGTGGGATTGTTGCTTG
GGTTGGCATGGTAAAAGCCCTTGGCCCTCCACCACCTCCTGCTAGATAAAATCCGTAGTA
GTGGTTCTAAGTGAAAGAGAGTAACGGTTTATTATGGTTTTCTTTTTGCCGACCAGATCA
TGTACACCTATCAAATTGTTTTGTTTCTAGAGTGTTTGAGGAGAGTTCCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GD82TF U 1
AF RR4BD41JQ C 50
AF RR4BD41TF U 74
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AATTGTTT*GTTTCTAGAGTGTTTGAGGAGAGTTCCTTAT

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DS 



AS 1 4

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CCAAATCCAGTGAGCCAAAGCTTTGTATTCTCACCGAACCTAAGAGCCGTCGATTTCACA
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GCAGCCCATCCTAACAATGCTCCCCAGTTTATGGTCAACCCTAAAAATGCTTGAGGCCAA
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TTCCATAGAGTATGCTTACACAAAGGGTTCC


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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AGAAAAAGCCTCTGTGTTGGCTAGAAGGTTTTACTTGGTCAACAATATGAACAAAGACGT
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ATAATAGCACCAAACCACTTGTTCGACACAAATTTTCTACTGCAGTCAGCGCCAGATGAT
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TTCGGATCCTGAAGGAACAGCTTTACTCTGTGTACTCTCAGAACAGCTTCATCAAGAGAG
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ACCACTTGTTCGACACAAATTTTCTACTGCAGTCAGCGCCAGATGATAAGTCAGCTGTCC
CTATTTGCCATCCTAACTGTCCCAATGCAGCCACCAGTGATGCGTAGTATTGCCACCCAA
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CCCCAGTTTATGGTCAACCCTAAAAATGCTTGAGGCCAAAATGTAAACCTCTTCATAAGT
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CCAAACAAACCCATCATTTTAAAACTTGGAAGGCTCCCAGGATCAGCAGCCAACGCAATT
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TTAGCATAACCTCTAGCTCTTTCTGGTAAATACAAATCTATCCAAGAATCTTCTTCCTTA
ACACCATCAAAATCCC
C

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DS 

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CTTGTACGATCAACCTTTGTATCAATGTCCTGATCAAGTAGATCATTAATAGTACAGCCA
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CCAATAGGTTTATCCAAACGAGCAAGCTTAGCATAACCTCTAGCTCTTTCTGGTAAATAC
AAATCTATCCAAGAATCTTCTTCCTTAACACCACCAAAATCCCTCGTCTCCTTACGACCC
CTCTCCAGAACCAAAGACGACGACCACATTCCGCCAACTAATATATTAGCTTGGTGGTCA
CGGTTATTCCATAGAGTATGCTTACACAAAGGGTTCC

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DS 



AS 1 5

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TCTCCAAGGGAAACGGCTCTAAGAAAGATGTGTCGTCCTCAACCATAAACCTAAGGGAAT
CCACAAAAATTCCTTTGTCTTCCGCACTCCCTACTCCATCTAACTATGAGGATGACGTGA
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CGAGTATATACTGTCCCTTTTATCGACCTCATCTCCGGTTCTGCACTTGTACCACCCTAC
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ATACTATGTAATAATACCTACTATTGTGCTATAAATGAGTTTGTCTCCTA


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
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AACAGACTCGATTGGAAGGAGCAGAAATCAATAAGAGCTTACTCGCCTTGAAGGAGTGTA
TTAGAGCTCTGGATAATGATCAAGGTCACATCCCTTTTAGAGGCAGTAAGTTGACTGAAG
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TCTCCAAGGGAAACGGCTCTAAGAAAGATGTGTCGTCCTCAACCATAAACCTAAGGGAAT
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AAGTTGACTGAAGTACTCAGGGACTCCTTCATGGGAAATTCTCGTACTGTAATGATATCT
TGCATATCTCCAAGCTCTGGATCATGTGAGCACACCCTTAACACCTTAAGATACGCCGAC
AGGGTTAAGAGTCTCTCCAAGGGAAACGGCTCTAAGAAAGATGTGTCGTCCTCAACCATA
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GCATCGGACTACGAGCAAGAGAAACAAATGTGGAAGAAAAACGTGAAGCCAGAGCCAACC
TATAACAGTACGGCACAGGATAGAATCCCGAAACCTAGTATTCCCATGAAGTCGAGAGAA
ATGCCAAGGCCCGATATAAAGAAGTCAAACTCCGATGATAATCTAAACGCACTTCTGCAG
GAAGAGGAAGACCTTGTGAATGCTCACCGTAAACAAGTTGAGGATACCATGAACATCGTG
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ATTTCAAGACTGAACACAATCCTCTCTCAGAAGGCTGCAGGTATACTCCAACTGCAGAAC
CGTCTTGCTCATTTCCAGAAACGCCTTAGGGAGCACAATGTATTGGTATCTACCACTGGG
TACTGAGTACTGACCCCCTCCTCTTCGAGTATATACTGTCCCTTTTATCGACCTCATCTC
CGGTTCTGCACTTGTACCACCCTACTGGCTTGGACTGGAGATCAGAAGTTTTATCTATTT
ATCGCCTTCTGAGAGCTTTACAGGGAAGAGTGATGGATGATCACAGAGTTTCTCAGACAG
TAAAACCCGAGATGCATTTTGTTCTCTCTGCAGCACTTTGCATTCTATCAGATGCTTGTA
ATGGATTTTTTACTTAAAAGATGAAATACTATGTAATAATACCTACTATTGTGCTATAAA
TGAGTTTGTCTCC
T

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4H107TF 694 0 0
G
GTGAAGCCAGAGCCAACCTATAACAGTACGGCACAGGAGAGAATCCCGAAACCTAGTATT
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GATACCATGAACATCGTGAAAGAGGAGATGAATCTACTTGTTGAAGCATACCAGCCTGGA
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ATACTCCAACTGCAGAACCGTCTTGCTCATTTCCAGAAACGCCTTAGGGAGCACAATGTA
TTGGTATCTACCACTGGGTACTGAGTACTGACCCCCTCATCTTCGAGTATATACTGTCCC
TTTTATCGACCTCATCTCCGGTTCTGCACTTGTGCCACCCTACTGGCTTGGACTGGAGAT
CAGAAGTTTTATCTATTTATCGCCTTCTGAGAGCTTTACAGGGAAGAGTGATGGATGATC
ACAGAGTTTCTCAGACAGTAAAACCCGAGATGCATTTTGCTCTATCTGCAGCACTTTGCA
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CTACTATTGTGCTATAAATGAGTTTGTCTCCTA

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DS 



AS 1 5

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GAAAACGGTAAGTGGAGGAGAGATGCAATTGTTTGCGCTGAATCCAGCAGCCATCATGTC
GGCGCCACGAACCCTAGGCCTTGAGCCGTCCTCTTCCTCGTCCTCTCGTCTTCTTTCTTC
TGCTCAGATTTTGAGCTCTCATCGCGCTTTTGGTCTCCTAGTCCTAGCTAGGCCTCGTCA
CCGGTTCCGAGGATTATCTCCATCTCAAGTTGTAAAGGCAGTGGCAACCCCAGACCCACT
GTTGGAAGTACCCCTGACTGAGGAAAATGTAGAGAGCGTTCTGGACGAAATCAGACCTTA
CCTCATGTCTGATGGTGGTAATGTGGCATTACATGAGATCGATGGAAATATTGTGCGAGT
CAAATTGCAGGGAGCTTGCGGGTCATGCCCAAGTTCTGTTATGACTATGAAAATGGGTAT
TGAGCGTCGCCTTATGGAAAAGATACCTGAGATTGTGGCTGTCGAATCAGTTCCAGATGA
AGAGACTGGCCTTGAACTCAATGACGAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAGATCAGGCC
TTACTTAATTGGAACAGCTGATGGGTCGCTTGAGCTGGTGGAGATCGAAGAGCCGATCGT
GAAGATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACAGTACGAGTAGCGGTAACTCA
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CTTTCTTGTATCTGTTTCTCTTTCTTTCCTTTGTATTACTAGCCTCTCCTTGTATAGTGT
ATAGATACTGTGTTGACGTTTGATATTTGTCTCCAAAATAAGGTTTTAACATTTTTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CW49TF U 1
AF RR4A102TFB U 1
AF RR4A102TF U 1
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GAATC

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CCGGTTCCGAGGATTATCTCCATCTCAAGTTGTAAAGGCAGTGGCAACCCCAGACCCACT
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CAAATTGCAGGGAGCTTGCGGGTCATGCCCAAGTTCTGTTATGACTATGAAAATGGGTAT
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QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4CW49JQ 734 0 0
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TCCTTGTATAGTGTATAGATACTGTGTTGACGTTTGATATTTGTCTCCAAAATAAGGTTT
TAACATTTTTGG
TC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4A102JQD 732 0 0
TCTTCTTTCTTCTGCTCAGATTTTGAGCTCTCATCGCGCTTTTGGTCTCCTAGTCCTAGC
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GAAAATGGGTATTGAGCGTCGCCTTATGGAAAAGATACCTGAGATTGTGGCTGTCGAATC
AGTTCCAGATGAAGAGACTGGCCTTGAACTCAATGACGAAAACATTGAAAAGGTGCTGGA
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AGAGCCGATCGTGAAGATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACAGTACGAGT
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CTTGTATAGTGTATAGATACTGTGTTGACGTTTGATATTTGTCTCCAAAATAAGGTTTTA
ACATTTTTGGCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL1940Contig1 1283 2 2 U
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GGAGATGGCGGGGATCCTGAATAAATTGAGGAATCTGGATGCATATCCAAAGATCAACGA
GGACTTTTACAGCCGTACGTTATCCGGCGGCGTTATCACCCTCGTCTCCTCCGTTGTCAT
GTTCCTTCTCTTCTTCTCCGAGCTAAGATTATATCTTCATAGCGTTACCGAGACGAAGCT
CGTTGTGGATACTTCTAGAGGAGAGACGTTACGCATCAATTTTGATATGACTTTTCCTGC
TCTAGCGTGTTCCATTCTAAGTGTTGATGCTATGGATATTAGTGGAGAGCTCCATCTTGA
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ACAGGACAGCATAGGCGCTACTAAGATTGAGAAGCCACTGCAGAAACATGGTGGTCGGCT
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CTGCAATTCATGTGAGGATGTTCGTGAAGCATATAGAAAGACAGTTTTAACATAAGTCAC
AAGATCAATCGACTGACTTTTGGGGACTACTTTCCTGGCGTCGTGAACCCTCTGGACAAA
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ACAGTATACACAGATATCAGTGGACACACAATTCAGTCAAATCAGTTTTCAGTGACCGAA
CATGTTAAGAGCTCAGATGCAGGCCAACTGCAATCCTCACCAGGAGTTTTTTTTTTTTAT
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ACGAATGTCTGTGCCATAGTCGGAGGTGTTTTCACGGTGTTTGGGATAATAGATGCGTTT
ATATATCATGGTCAAAAAGCAATCAAGAAGAAGATGGAAATTGGTAAATTTAGCTGATCT
TTTTAATCATGTGGTTTCACTTTTTTTTTTTTTCAAATGGGGTTGGTCTCTCTTAAATGA
AAGTTGGTAAATTGGTACATTTTATATCATGTTCGTTTTGCGACGTAAATCTATTCATTC
GAGGCTTAATGAAAGTTGAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAA

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AAAAAATTAATTTTTTTGGTAAGAAAAGAGAAAAAA


BQ
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BS 844 883 RR4CC18TF
BS 884 884 RR4DW26TF
BS 885 898 RR4CC18TF
BS 899 936 RR4DW26TF

RD RR4E792JQ 626 0 0
GGTCAAGCATCTTTTTATTCCATCAATATACACAGTCGAGAACAAATAGTACAAAAAA*T
GAATAGTAAATAATAAACTTCTCTTCTTCCAGTAGCTTATGCGATGGATCACACCCAATT
CTTGCGAATGTCGAAGGTGTAGTTGTTCTCCAAGTAGCACTTATCATCATCATCGACGAA
CTTAGATTTAACGGAATAGGAACCTCTAACAAGCATACCAGACGGTGTCGATTCTTCAAA
CATGACATGGGTATACGGTTCGGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAACATCTCCTTTCTACC
ATACACCTTGATTCCAGTCTTCCAAACCGTATTGCTGTATCGGAAACCGGACACAATATT
GTTGGTCACACGGAAAGTAAATACGAGTGTGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCA
TGGTCCTTTGGATGTCGGGTTTCCATCTTCAGGGACCGTCAATACCATGTCTTCTCTATC
GGGTGACCTAATTGTTAAGGTCAATATCTTCACCACCGGATCAGGAGTCTCTCCAACTTC
CTCAAGATCCACTTTTCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCATCAAGCTTTCATCATCCTT
GTCTTTCTCCATCTGTTCTTTGA
AAG

QA 1 623 1 623
DS 

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GAATAGTAAATAATAAACTTCTCTTCTTCCAGTAGCTTATGCGATGGATCACACCCAATT
CTTGCGAATGTCGAAGGTGTAGTTGTTCTCCAAGTAGCACTTATCATCATCATCGACGAA
CTTAGATTTAACGGAATAGGAACCTCTAACAAGCATACCAGACGGTGTCGATTCTTCAAA
CATGACATGGGTATACGGTTCGGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAACATCTCCTTTCTACC
ATACACCTTGATTCCAGTCTTCCAAACCGTATTGCTGTATCGGAAACCGGACACAATATT
GTTGGTCACACGGAAAGTAAATACGAGTGTGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCA
TGGTCCTTTGGATGTCGGGTTTCCATCTTCAGGGACCGTCAATACCATGTCTTCTCTATC
GGGTGACCTAATTGTTAAGGTCAATATCTTCACCACCGGATCAGGAGTCTCTCCAACTTC
CTCAAGATCCACTTTTCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCATCAAGCTTTCATCATCCTT
GTCTTTCTCCATCTGTTCTTTGAGAG*GATCATTGGACCAAGTTCAAGCTTCTTGTCTTC
GTCTTCTTCGTCATCTTCTGTCGGACAAAAAGAGCTGTGGCTGTTCTTTCTGCTTAACGT
CCCTTGTCCCTTTGGATCTTCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4CC18JQ 843 0 0
GGTCAAGCATCTTTTTATTCCATCAATATACACAGTCGAGAACAAATAGTACAAAAAAAT
GAATAATAAATAATAAACTTCTCTTCTTCCAGTAACTTATGCGATGGATCACACCCAATT
CTTGCGAATGTCGAAGGTGTAGTTGTTCTCCAAGTAGCACTTATCATCATCATCGACGAA
CTTAGATTTAACGGAATAGGAACCTCTAACAAGCAAACCAGACGGTGTCGATTCTTCAAA
CATGACATGGGTATACGGTTCGGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAACATCTCCTTTCTACC
ATACACCTTGATTCCAGTCTTCCAAACCGTATTGCTGTATCGGAGACCGGACACAATATT
GTTGGTCACACGGAAAGTAAATACGAGTGTGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCA
TGGTCCTTTGGATGTCGGGTTTCCATCTTCAGGGACCGTCAATACCATGTCTTCTCTATC
GGGTGACCTAATTGTTAAGGTCAATATCTTCACCACCGGATCAGGAGTCTCTCCAACTTC
CTCAAGATCCACTTTTCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCATCAAGCTTTCATCATCCTT
GTCTTTCTCCATCTGCTCTTTGAGAGCGATCATTGGACCAAGTTCAAGCTTCTTGTCTT*
*TCTTCTTCGTCATCTTCTGTCGGACAAAAAGAGCTGTGGCTGTTCTTTCTGCTTAACGT
CCCTTGTCCCTTTGGATCTTCTGAAGATTCCTCAGCTTTGCTCTCCTCATCTTTCAAACC
CATCTTTGTTTTCTTGACTCTATTGGTTGTATGATTCGAATACTAGAAA*TCTCAATCGT
TGG

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR4CC18TF 791 0 0
TCACACCCAATTCT*GCGA*TGTCGAAGGTGTAGTG**TCTCCAAGTAGCACTTATCATC
ATCATCGACGAACTTAGATTTAACGGAATAGGAAC*TCTAACAAGCAAACCAGACGGTGT
CGAT*CTTCAAACATGACATGGGTATACGGTTCGGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAACAT
CTCCTTTCTACCATACACCTTGATTCCAGTCTTCCAAACCGTATTGCTGTATCGGAGACC
GGACACAATATTGTTGGTCACACGGAAAGTAAATACGAGTGTGTACTTAGAGCCTTCTTT
GAGAGTAAACCATGGTCCTTTGGATGTCGGGTTTCCATCTTCAGGGACCGTCAATACCAT
GTCTTCTCTATCGGGTGACCTAATTGTTAAGGTCAATATCTTCACCACCGGATCAGGAGT
CTCTCCAACTTCCTCAAGATCCACTTTTCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCATCAAGCT
TTCATCATCCTTGTCTTTCTCCATCTGCTCTTTGAGAGCGATCATTGGACCAAGTTCAAG
CTTCTTGTCTT**TCTTCTTCGTCATCTTCTGTCGGACAAAAAGAGCTGTGGCTGTTCTT
TCTGCTTAACGTCCCTTGTCCCTTTGGATCTTCTGAAGATTCCTCAGCTTTGCTCTCCTC
ATCTTTCAAACCCATCTTTGTTTTCTTGACTCTATTGGTTGTATGATTCGAATACTAGAA
AATCTCAATCGTTGGTTTTTGGAGATCGTTATTCAACCGAGTTTGACGAGGAGACGACCA
AATACTCTTC
C

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4DW26TF 773 0 0
TCATCATCATCGACGAACTTAGATT*AACG*AATAGGAAC*TCTAACAAGCATACCAGAC
GGTGTCGAT**CTCAAACATGACATGGGTATACGGTTCGGC*TGTGGACTAAACGTTC*T
AACATCTCCTTTCTACCATACAC*TTGATTCCAGTCTTCCAAACCGTATTGCTGTATCGG
AGACCGGACACAATATTGTTGGTCACACGGAAAGTAAATACGAGTGTGTACTTAGAGCCT
TCTTTGAGAGTAAACCATGGTCCTTTGGATGTCGGGTTTCCATCTTCAGGGACCGTCAAT
ACCATGTCTTCTCTATCGGGTGACCTAATTGTTAAGGTCAATATCTTCACCACCGGATCA
GGAGTCTCTCCAACTTCCTCAAGATCCACTTTTCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCATC
AAGCTTTCATCATCCTTGTCTTTCTCCATCTGTTCTTTGAGAG*GATCATTGGACCAAGT
TCAAGCTTCTTGTCTTCGTCTTCTTCGTCATCTTCTGTCGGACAAAAAGAGCTGTGGCTG
TTCTTTCTGCTTAACGTCCCTTGTCCCTTTGGATCTTCTGAAGATTCCTCAGCTTTGCTC
TCCTCATCTTTCAAACCCATCTTTGTTTTCTTGACTCTATTGGTTGTATGATTCGAATAC
TAGAAAATCTCAATCGTTGGTTTTTGGAGATCGTTATTCAACCGAGTTTGACGAGGAGAC
AACCAAATACTCTTCACAAAAAATTAATTTTTTTGGTAAGAAAAGAGAAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 5

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CAACATTTGATAAAACTAGTAACCACAAACTCGTACCCATCCATCATCATTTTTATTACA
GAAGCAGCTTTCACTTTCAAAGCGAAGGAGGTACGTATTGCCTAGACAAACTAAACAGAT
CTTTACCCTCAAACGGCGATGTCCATTCTCTTCCATTCCCCACTAATGCAGCTTCCTGAA
TTCCCATAGTTCTCGTCCTTCCATTCATGTTTACTTCATATGAGGATGATGCCGCTAGGT
TTGGCCTCGGACTAGCTAGGCCTCTGTCTAAACTCCAATCAATGTTGTTGTAATCCGAGT
ATCCCACTGACCCATCCGTGTTCCAGTCCAGCCCAGATGAAGATGTTGATCCATACCCCG
AGAAGAGCCCAAGAGAAGCAGCTGGAGCCACATCATGCGTTGCAGCACCCCCTGACATCC
TGTGACCGCTGCTCACCTGGCCTTGATAGTGTTGGTACTGAAGTTGCTGGTACATCAGGT
TTGAATTTTGATCATTAGGAGGCAGAGTTCTTGTGGGTAAATACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B934JQ U 81
AF RR4BI21JQ U 81
AF RR4B934TF C 81
AF RR4BI21TF C 81
AF RR4EE23JQ U 1
BS 1 173 RR4EE23JQ
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BS 402 402 RR4B934JQ
BS 403 587 RR4EE23JQ

RD RR4B934JQ 391 0 0
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QA 1 391 1 391
DS 

RD RR4BI21JQ 391 0 0
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GTCCATTCTCTTCCATTCCCCACTAATGCAGCTTCCTGAATTCCCATAGTTCTCGTCCTT
CCATTCATGTTTACTTCATATGAGGATGATGCCGCTAGGTTTGGCCTCGGACTAGCTAGG
CCTCTGTCTAAACTCCAATCAATGTTGTTGTAATCCGAGTATCCCACTGACCCATCCGTG
TTCCAGTCCAGCCCAAATGAAGATGTTGATCCATACCCCGAGAAGAGCCCAAGAGAAGCA
GCTGGAGCCACATCATGCGTTGCAGCACCCC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR4B934TF 391 0 0
AACCACAAACTCGTACCCATCCATCATCATTTTTATTACAGAAGCAGCTTTCACTTTCAA
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GTCCATTCTCTTCCATTCCCCACTAATGCAGCTTCCTGAATTCCCATAGTTCTCGTCCTT
CCATTCATGTTTACTTCATATGAGGATGATGCCGCTAGGTTTGGCCTCGGACTAGCTAGG
CCTCTGTCTAAACTCCAATCAATGTTGTTGTAATCCGAGTATCCCACTGACCCATCCGTG
TTCCAGTCCAGCCCAGATGAAGATGTTGATCCATACCCCGAGAAGAGCCCAAGAGAAGCA
GCTGGAGCCACATCATGCGTTGCAGCACCCC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR4BI21TF 391 0 0
AACCACAAACTCGTACCCATCCATCATCATTTTTATTACAGAAGCAGCTTTCACTTTCAA
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GTCCATTCTCTTCCATTCCCCACTAATGCAGCTTCCTGAATTCCCATAGTTCTCGTCCTT
CCATTCATGTTTACTTCATATGAGGATGATGCCGCTAGGTTTGGCCTCGGACTAGCTAGG
CCTCTGTCTAAACTCCAATCAATGTTGTTGTAATCCGAGTATCCCACTGACCCATCCGTG
TTCCAGTCCAGCCCAGATGAAGATGTTGATCCATACCCCGAGAAGAGCCCAAGAGAAGCA
GCTGGAGCCACATCATGCGTTGCAGCACCCC

QA 1 391 1 391
DS 

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ATCCCACTGACCCATCCGTGTTCCAGTCCAGCCCAGATGAAAATGTTGATCCATACCCCG
AGAAGAGCCCAAGAGAAGCAGCTGGAGCCACATCATGCGTTGCAGCACCCCCTGACATCC
TGTGACCGCTGCTCACCTGGCCTTGATAGTGTTGGTACTGAAGTTGCTGGTACATCAGGT
TTGAATTTTGATCATTAGGAGGCAGAGTTCTTGTGGGTAAATACCCG

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 4

CO CL1943Contig1 1192 4 2 U
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CAAATGGAAGGAGAAGATGAGCTCCGGAAACCCAACGGCGAGGTTTCGTCTCAACGAGAC
ACAGTTGTAGAAGACGACGATCCGTTAGTATTGAGCTCTCAAGCTTTGGCGGCGCTCCAG
GAGTTTCTAGCCGACCAGAACAAGACCGTCACAGTCAGCCGCCACCTTCTTCCCTCACCG
GTGAAGATGATTCCGCTAAAGTGGAGCTAGTCACGGAGGACTGGAGACTAAGCCAGTTCT
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TCTCGGGCTGCAGAGTCGCTTGCATCGCTTGCCCTACTCTTTACGTGTATCTCAAGAAGA
AGGATCCGAGTCTCCAGGTGCAGTTGCTGGAGTACGATATGAGGTTTGAGAGATATGGAA
GCGAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCTGAAGATTTGCCACCTCATCTTAAACATT
GCTTCCATATAATCGTTGCGGATCCTCCCTACTTGAGTAAGGAATGTCTAGAAAGAGTTA
CTCAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTCTTTGTTACTTCTTCTCACAGGAG
ATGTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGAGCTATTGGGTGTTCGTCCTTGCGTGTTTAAGCCTC
ATCATTCTAGCAAACTAGGAAACGAGTTTCGACTGTTTATAAGTTATGATCCAGGTACCA
GACTAGGGGGCTTGGAAGAAGAAGAAGACAGCTAGTTTGCGACTTGTGGATTGTCCATCT
TTTCATCTACCATTTACGTTGACTTGCTTGTTTTCTGGTTGTCACAGTGGTTTGTGGTGG
CGGAGAAGGCTCATGTCTTCCATCAAGTCAACTGGTCTTGAAGCTTTCTTTGTTCTGTAT
CTTGTTGCAGCCGCCGTTTAGGTCAAAGCCTGCCTTGTTGTTGAGATACCGAAGTTTTTT
TTTTTTTTTTGGGTTATTGATATTTTACTGCATTACAAAAAGGTTATAATGCTTTGTAAC
GAAGTGAAGTGATTCACAAAAAAGATCTTTAGTATGAGCCTGACTGGTGTAACCGCAGCA
CTTACGAGAGTTTGCGGGTGTGGATGGTTGCTGTTTTAAGCGTTTTCTAGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ64TF U 1
AF RR4B190TF U 1
AF RR4AZ64JQ C 398
AF RR4B190JQ C 398
BS 1 782 RR4AZ64TF
BS 783 1192 RR4AZ64JQ

RD RR4AZ64TF 782 0 0
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ACAGTTGTAGAAGACGACGATCCGTTAGTATTGAGCTCTCAAGCTTTGGCGGCGCTCCAG
GAGTTTCTAGCCGACCAGAACAAGACCGTCACAGTCAGCCGCCACCTTCTTCCCTCACCG
GTGAAGATGATTCCGCTAAAGTGGAGCTAGTCACGGAGGACTGGAGACTAAGCCAGTTCT
GGTACGAACCTGAGACCGCAGAGACTGTAGCCGAAGAAGTGGTCACTCTCTCGAGTAGAT
TCTCGGGCTGCAGAGTCGCTTGCATCGCTTGCCCTACTCTTTACGTGTATCTCAAGAAGA
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GCGAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCTGAAGATTTGCCACCTCATCTTAAACATT
GCTTCCATATAATCGTTGCGGATCCTCCCTACTTGAGTAAGGAATGTCTAGAAAGAGTTA
CTCAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTCTTTGTTACTTCTTCTCACAGGAG
ATGTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGAGCTATTGGGTGTTCGTCCTTGCGTGTTTAAGCCTC
ATCATTCTAGCAAACTAGGAAACGAGTTTCGACTGTTTATAAGTTATGATCCAGGTACCA
GA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4B190TF 782 0 0
GGACTGAGCCGTGTCCGTTAAAGTCCTCTCCTTTCCGACTTTATCGCGAACGCCGAATCT
CAAATGGAAGGAGAAGATGAGCTCCGGAAACCCAACGGCGAGGTTTCGTCTCAACGAGAC
ACAGTTGTAGAAGACGACGATCCGTTAGTATTGAGCTCTCAAGCTTTGGCGGCGCTCCAG
GAGTTTCTAGCCGACCAGAACAAGACCGTCACAGTCAGCCGCCACCTTCTTCCCTCACCG
GTGAAGATGATTCCGCTAAAGTGGAGCTAGTCACGGAGGACTGGAGACTAAGCCAGTTCT
GGTACGAACCTGAGACCGCAGAGACTGTAGCCGAAGAAGTGGTCACTCTCTCGAGTAGAT
TCTCGGGCTGCAGAGTCGCTTGCATCGCTTGCCCTACTCTTTACGTGTATCTCAAGAAGA
AGGATCCGAGTCTCCAGGTGCAGTTGCTGGAGTACGATATGAGGTTTGAGAGATATGGAA
GCGAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCTGAAGATTTGCCACCTCATCTTAAACATT
GCTTCCATATAATCGTTGCGGATCCTCCCTACTTGAGTAAGGAATGTCTAGAAAGAGTTA
CTCAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTCTTTGTTACTTCTTCTCACAGGAG
ATGTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGAGCTATTGGGTGTTCGTCCTTGCGTGTTTAAGCCTC
ATCATTCTAGCAAACTAGGAAACGAGTTTCGACTGTTTATAAGTTATGATCCAGGTACCA
GA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AZ64JQ 795 0 0
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TATGAGGTTTGAGAGATATGGAAGCGAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCTGAAGA
TTTGCCACCTCATCTTAAACATTGCTTCCATATAATCGTTGCGGATCCTCCCTACTTGAG
TAAGGAATGTCTAGAAAGAGTTACTCAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTC
TTTGTTACTTCTTCTCACAGGAGATGTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGAGCTATTGGGTGT
TCGTCCTTGCGTGTTTAAGCCTCATCATTCTAGCAAACTAGGAAACGAGTTTCGACTGTT
TATAAGTTATGATCCAGGTACCAGACTAGGGGGCTTGGAAGAAGAAGAAGACAGCTAGTT
TGCGACTTGTGGATTGTCCATCTTTTCATCTACCATTTACGTTGACTTGCTTGTTTTCTG
GTTGTCACAGTGGTTTGTGGTGGCGGAGAAGGCTCATGTCTTCCATCAAGTCAACTGGTC
TTGAAGCTTTCTTTGTTCTGTATCTTGTTGCAGCCGCCGTTTAGGTCAAAGCCTGCCTTG
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AAAAGGTTATAATGCTTTGTAACGAAGTGAAGTGATTCACAAAAAAGATCTTTAGTATGA
GCCTGACTGGTGTAACCGCAGCACTTACGAGAGTTTGCGGGTGTGGATGGTTGCTGTTTT
AAGCGTTTTCTAGAG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4B190JQ 782 0 0
TCTTTACGTGTATCTCAAGAAGAAGGATCCGAGTCTCCAGGTGCAGTTGCTGGAGTACGA
TATGAGGTTTGAGAGATATGGAAGCGAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCTGAAGA
TTTGCCACCTCATCTTAAACATTGCTTCCATATAATCGTTGCGGATCCTCCCTACTTGAG
TAAGGAATGTCTAGAAAGAGTTACTCAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTC
TTTGTTACTTCTTCTCACAGGAGATGTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGAGCTATTGGGTGT
TCGTCCTTGCGTGTTTAAGCCTCATCATTCTAGCAAACTAGGAAACGAGTTTCGACTGTT
TATAAGTTATGATCCAGGTACCAGACTAGGGGGCTTGGAAGAAGAAGAAGACAGCTAGTT
TGCGACTTGTGGATTGTCCATCTTTTCATTTACCATTTACGTTGACTTGCTTGTTTTTTG
GTTGTCACAGTGGTTTGTGGTGGCGGAGAAGGCTCATGTCTTCCATCAAGTCAACTGGTC
TTGAAGCTTTCTTTGTTCTGTATCTTGTTGCAGCCGCCGTTTAGGTCAAAGCCTGCCTTG
TTGTTGAGATACCGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTATTGATATTTTACTGCATTACA
AAAAGGTTATAATGCTTTGTAACGAAGTGAAGTGATTCACAAAAAAGATCTTTAGTATGA
GCCTGACTGGTGTAACCGCAGCACTTACGAGAGTTTGCGGGTGTGGATGGTTGCTGTTTT
AA

QA 1 782 1 782
DS 



AS 2 4

CO CL1944Contig1 694 2 2 U
GACATTAGCTGGTAACGTACCACCGAAAGCTAACCTCGGTGATCTGAGAGGTTTAGCTGG
TGGGTTGAACGGTTTGAACAGCTCGGCGATGATCGATGGAGGAGAATTCGACGGTGCAAA
GGCCTACAAAGACAGCAAAGTGTGCAACATGTTGACGATGCAAGAGTTTCACAGGCGTTA
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TTTATTCAGAGAGCACATCCCGCTTTTCCGTACCCTCTTCCCTCCGTTTCAGAAGTACAT
CACCAAAGGATACGTCTCCGAGACAGAGTCTGGCAAAAGACTTGCTCAGGTGGTGAGTGA
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GAACCAGTTATCGGAAGAAGCGAGTGATGTTGAGAAGGCTCGTAAAGTGTGGGAGATCAG
TGAGAAGCTCGTTGGCTTGGCCTAAGACGGACTTCAAAGTCTCTTTCCCTTGATGAGACC
TCTCTATTACCACCTACCAACTGATGAGTCCTAGAGGGTGTTCGGGTTTTTTAGATTGTC
TGATATTGTAACTGCGAATTTTTCATTAGTGCATGTTGAGTGTAGCTCTGTTTGGCGAAT
AGCCCACAATAATGAAATAAAGTTGGTTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT11TF U 1
AF RR4E335TF U 15
BS 1 679 RR4AT11TF
BS 680 694 RR4E335TF

RD RR4AT11TF 679 0 0
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TGGGTTGAACGGTTTGAACAGCTCGGCGATGATCGATGGAGGAGAATTCGACGGTGCAAA
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CACCAAAGGATACGTCTCCGAGACAGAGTCTGGCAAAAGACTTGCTCAGGTGGTGAGTGA
TCCGAGTTTGACGAAATCAGGAGTGTACTGGAGCTGGAACAAGGCTTCGGCTTCTTTTGA
GAACCAGTTATCGGAAGAAGCGAGTGATGTTGAGAAGGCTCGTAAAGTGTGGGAGATCAG
TGAGAAGCTCGTTGGCTTGGCCTAAGACGGACTTCAAAGTCTCTTTCCCTTGATGAGACC
TCTCTATTACCACCTACCAACTGATGAGTCCTAGAGGGTGTTCGGGTTTTTTAGATTGTC
TGATATTGTAACTGCGAATTTTTCATTAGTGCATGTTGAGTGTAGCTCTGTTTGGCGAAT
AGCCCACAATAATGAAATA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4E335TF 680 0 0
G
CGTACCACCGAAAGCTAACCTCGGTGATCTGAGAGGTTTAGCTGGTGGGTTGAACGGTTT
GAACAGCTCGGCGATGATCGATGGAGGAGAATTCGACGGTGCAAAGGCCTACAAAGACAG
CAAAGTGTGCAACATGTTGACGATGCAAGAGTTTCACAGGCGTTACCATGAAGAAACTGG
AATCACATTCGCCTCGCTTTACCCTGGTTGCATCGCCTCCACAGGTTTATTCAGAGAGCA
CATCCCGCTTTTCCGTACCCTCTTCCCTCCGTTTCAGAAGTACATCACCAAAGGATACGT
CTCCGAGACAGAGTCTGGCAAAAGACTTGCTCAGGTGGTGAGTGATCCGAGTTTGACGAA
ATCAGGAGTGTACTGGAGCTGGAACAAGGCTTCGGCTTCTTTTGAGAACCAGTTATCGGA
AGAAGCGAGTGATGTTGAGAAGGCTCGTAAAGTGTGGGAGATCAGTGAGAAGCTCGTTGG
CTTGGCCTAAGACGGACTTCAAAGTCTCTTTCCCTTGATGAGACCTCTCTATTACCACCT
ACCAACTGATGAGTCCTAGAGGGTGTTCGGGTTTTTTAGATTGTCTGATATTGTAACTGC
GAATTTTTCATTAGTGCATGTTGAGTGTAGCTCTGTTTGGCGAATAGCCCACAATAATGA
AATAAAGTTGGTTTATCCC

QA 2 680 2 680
DS 



CO CL1944Contig2 701 2 3 U
GATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGATGCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAG
ACAGTTCGTTGATAGCTTCAGGAGATCGGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGC
TGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGAGCCTACTTACAGCGCAGAAGGGTTTGAGCTTAG
CGTTGCGACAAATCATTTGGGACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGTTACTTGATGACTTGAA
GAAGTCTGATTACCCTTCAAAGCGTCTCATCATTGTCGGATCCATTACAGGGAACACGAA
TACATTGGCTGGTAACGTACCACCGAAAGCTAACCTAGGCGACTTGAGAGGTTTAGCTGG
TGGGTTGAACGGTTTGAACAGCTCGGCGATGATAGATGGAGGAGATTTCGACGGTGCAAA
GGCTTACAAAGACAGCAAAGTGTGCAACATGTTGACGATGCAAGAGTTTCACAGGCGTTA
CCATGAAGAAACAGGAATCACATTCGCCTCGCTTTACCCTGGTTGCATCGCCTCCACAGG
TTTGTTCAGAGAGCACATTCCGCTTTTCCGAACGCTCTTCCCTCCGTTTCAGAAGTACAT
CACCAAAGGATACGTCTCCGAGACAGAGTCTGGCAAAAGACTTGCTCAGTGGTGAGTGAT
CCAAGTTTGACGAAATCACGAGTGTACTGGAGCTGGAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F349TF U 1
AF RR4DW68TF U 1
BS 1 74 RR4DW68TF
BS 75 75 RR4F349TF
BS 76 701 RR4DW68TF

RD RR4F349TF 610 0 0
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ACAGTTCGTTGATAGCTTCAGGA**TCGGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGC
TGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGAGCCTACTTACAGCGCAGAAGGGTTTGAGCTTAG
CGTTGCGACAAATCATTTGGGACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAA
GAAGTCTGATTACCCTTCAAAGCGTCTCATCATTGTCGGATCCATTACAGGGAACACGAA
TACATTGGCTGGTAACGTACCACCGAAAGCTAACCTAGGCGACTTGAGAGGTTTAGCTGG
TGGGTTGAACGGTTTGAACAGCTCGGCGATGATAGATGGAGGAGATTTCGACGGTGCAAA
GGCTTACAAGGACAGCAAAGTGTGCAACATGTTGACGATGCAAGAGTTTCACAGGCGTTA
CCATGAAGAAACAGGAATCACATTCGCCTCGCTTTACCCTGGTTGCATCGCCTCCACAGG
TTTGTTCAGAGAGCACATTCCGCTTTTCCGAACGCTCTTCCCTCCGTTTCAGAAGTACAT
CACCAAAGGA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4DW68TF 701 0 0
GATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGATGCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAG
ACAGTTCGTTGATATCTTCAGGAGATCGGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGC
TGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGAGCCTACTTACAGCGCAGAAGGGTTTGAGCTTAG
CGTTGCGACAAATCATTTGGGACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGTTACTTGATGACTTGAA
GAAGTCTGATTACCCTTCAAAGCGTCTCATCATTGTCGGATCCATTACAGGGAACACGAA
TACATTGGCTGGTAACGTACCACCGAAAGCTAACCTAGGCGACTTGAGAGGTTTAGCTGG
TGGGTTGAACGGTTTGAACAGCTCGGCGATGATAGATGGAGGAGATTTCGACGGTGCAAA
GGCTTACAAAGACAGCAAAGTGTGCAACATGTTGACGATGCAAGAGTTTCACAGGCGTTA
CCATGAAGAAACAGGAATCACATTCGCCTCGCTTTACCCTGGTTGCATCGCCTCCACAGG
TTTGTTCAGAGAGCACATTCCGCTTTTCCGAACGCTCTTCCCTCCGTTTCAGAAGTACAT
CACCAAAGGATACGTCTCCGAGACAGAGTCTGGCAAAAGACTTGCTCAGTGGTGAGTGAT
CCAAGTTTGACGAAATCACGAGTGTACTGGAGCTGGAAAAA

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

CO CL1945Contig1 953 4 10 U
GGGAAATCGGTGAGAAGACAAAAGGGTAGAGCAGTTTGTCTGATCAGAAATCTCACTAAC
TTCGGAGGAACCCTAAGTCAAATTGGGTGAATATGAATTGCGAAGCTTGTCATCTGAAGG
AACTGGAAGTGGAAACCTTCGAGATACGCGAGGTTCTACGCTGCATTCTACATACTATTG
TCTTTCACCGAGCACTTGGTCTTATCCGTCCTAAAGATATCGACTTGGAGCTTTTTGACA
TCACTTACGTAGAATGTGGTGAAATCGAAGTGGAAAAGAAAATTGATGACAAGATTGAGC
ACTTCATTACCTGGATTGACAAACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATCTCTATCGTTTT
ATGAAGTCAAAACCAAACAGCCCTCTTGGTTCACTAATAAGATTGAACGGCTATACTGGG
AACAATGGTATATCAATCTCAATGTCCTTCAGCAGCCCACTAAATCCCCGACCGGAAAGT
CTCACCACTCCAAACTAATTATGGACCCTGGAGAGGAGTCTGAGGAGAGAAGTTCACGTA
GGACACTGCTTGAGCAATCTCTTCAAGAAGTCTTGTTCCAAATCATAAAATTCGTGAATG
AGAAAAAGGATCACGTTCCTCCTATCAACGATGGTGTTATCTACTGCCCCTTTGAGATCA
CTTTCCCTAGCTCATCGGACTCAACCTTTGGGATGGATATGATAAAGAGGATGCTCCACA
GTGGTGGTCATCCATCCATGCTCAGTTGATTTCACTTTCATCCACGCAACTTTAATTAGT
AGTAGTAGTAGTACAAATACACTTGATGTTACTGGTTCCAGCCTAACTCCAGTCAACACT
TTTATTTTTTCTCTCCTACATGCATTTCGTGTGTAAATATGTAACACTTTGCCTCTCTTC
GTAATGTTTCCGAAGTTTAATTTCCTTAAAAATAAATTGGATGCTTGTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH43TF U 1
AF RR4DI40TF U 12
AF RR4E666JQ C 142
AF RR4EH43JQ C 262
BS 1 666 RR4EH43TF
BS 667 667 RR4DI40TF
BS 668 723 RR4EH43TF
BS 724 768 RR4DI40TF
BS 769 769 RR4E666JQ
BS 770 795 RR4DI40TF
BS 796 843 RR4E666JQ
BS 844 844 RR4EH43JQ
BS 845 926 RR4E666JQ
BS 927 953 RR4EH43JQ

RD RR4EH43TF 723 0 0
GGGAAATCGGTGAGAAGACAAAAGGGTAGAGCAGTTTGTCTGATCAGAAATCTCACTAAC
TTCGGAGGAACCCTAAGTCAAATTGGGTGAATATGAATTGCGAAGCTTGTCATCTGAAGG
AACTGGAAGTGGAAACCTTCGAGATACGCGAGGTTCTACGCTGCATTCTACATACTATTG
TCTTTCACCGAGCACTTGGTCTTATCCGTCCTAAAGATATCGACTTGGAGCTTTTTGACA
TCACTTACGTAGAATGTGGTGAAATCGAAGTGGAAAAGAAAATTGATGACAAGATTGAGC
ACTTCATTACCTGGATTGACAAACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATCTCTATCGTTTT
ATGAAGTCAAAACCAAACAGCCCTCTTGGTTCACTAATAAGATTGAACGGCTATACTGGG
AACAATGGTATATCAATCTCAATGTCCTTCAGCAGCCCACTAAATCCCCGACCGGAAAGT
CTCACCACTCCAAACTAATTATGGACCCTGGAGAGGAGTCTGAGGAGAGAAGTTCACGTA
GGACACTGCTTGAGCAATCTCTTCAAGAAGTCTTGTTCCAAATCATAAAATTCGTGAATG
AGAAAAAGGATCACGTTCCTCCTATCAACGATGGTGTTATCTACTGCCCCTTTGAGATCA
CTTTCC*TAGCTCATCGGACTCAACCTTTGGGATGGATATGATAAAGAGGATGCTCCACA
GTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4DI40TF 785 0 0
GG
GAAGACAAAAGGGTAGAGCAGTTTGTCTGATCAGAAATCTCACTAACTTCGGAGGAACCC
TAAGTCAAATTGGGTGAATATGAATTGCGAAGCTTGTCATCTGAAGGAACTGGAAGTGGA
AACCTTCGAGATACGCGAGGTTCTACGCTGCATTCTACATACTATTGTCTTTCACCGAGC
ACTTGGTCTTATCCGTCCTAAAGATATCGACTTGGAGCTTTTTGACATCACTTACGTAGA
ATGTGGTGAAATCGAAGTGGAAAAGAAAATTGATGACAAGATTGAGCACTTCATTACCTG
GATTGACAAACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATCTCTATCGTTTTATGAAGTCAAAAC
CAAACAGCCCTCTTGGTTCACTAATAAGATTGAACGGCTATACTGGGAACAATGGTATAT
CAATCTCAATGTCCTTCAGCAGCCCACTAAATCCCCGACCGGAAAGTCTCACCACTCCAA
ACTAATTATGGACCCTGGAGAGGAGTCTGAGGAGAGAAGTTCACGTAGGACACTGCTTGA
GCAATCTCTTCAAGAAGTCTTGTTCCAAATCATAAAATTCGTGAATGAGAAAAAGGATCA
CGTTCCTCCTATCAACGATGGTGTTATCTACTGCCCCTTTGAGATCACTTTCCCTAGCTC
ATCGGACTCAACCTTTGGGATGGATATGATAAAGAG*ATGCTCCACAGTGGTGGTCATCC
ATCCATGCTCAGTTGATTTCACTTTCATCCACGCA*CTTTAATTAGTAGTAGTAGTAGTA
CA
T

QA 3 784 3 784
DS 

RD RR4E666JQ 786 0 0
AGATACGCGAGGTTCTACGCTGCATTCTACATACTATTGTCTTTCACCGAGCACTTGGTC
TTATCCGTCCTAAAGATATCGACTTGGAGCTTTTTGACATCACTTACGTAGAATGTGGTG
AAATCGAAGTGGAAAAGAAAATTGATGACAAGATTGAGCACTTCATTACCTGGATTGACA
AACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATCTCTATCGTTTTATGAAGTCAAAACCAAACAGC
CCCCTTGGTTCACTAATAAGATTGAACGGCTATACTGGGAACAATGGTATATCAATCTCA
ATGTCCTTCAGCAGCCCACTAAATCCCCGACCGGAAAGTCTCACCACTCCAAACTAATTA
TGGACCCTGGAGAGGAGTCTGAGGAGAGAAGTTCACGTAGGACACTGCTTGAGCAATCTC
TTCAAGAAGTCTTGTTCCAAATCATAAAATTCGTGAATGAGAAAAAGGATCACGTTCCTC
CTATCAACGATGGTGTTATCTACTGCCCCTTTGAGATCACTTTCCCTAGCTCATCGGACT
CAACCTTTGGGATGGATATGATAAAGAGGATGCTCCACAGTGGTGGTCATCCATCCATGC
TCAGCTGATTTCACTTTCATCCACGCAACTTTAATTAGTAGTAGTAGTAGTACAAATACA
CTTGATGTTACTGGTTCCAGCCTAACTCCAGTCAACACTTTTGTTTTTTCTCTCCTACAT
GCATTTCGTGTGTAAATATGTAACACTTTGCCTCTCTTCGTAATGTTTCCGAAGTTTAAT
TTCCT
C

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4EH43JQ 692 0 0
AAATCGAAGTGGAAAAGAAAATTGATGACAAGATTGAGCACTTCATTACCTGGATTGACA
AACACCCCAACAAGAAAAGTCAGATATCTCTATCGTTTTATGAAGTCAAAACCAAACAGC
CCTCTTGGTTCACTAATAAGATTGAACGGCTATACTGGGAACAATGGTATATCAATCTCA
ATGTCCTTCAGCAGCCCACTAAATCCCCGACCGGAAAGTCTCACCACTCCAAACTAATTA
TGGACCCTGGAGAGGAGTCTGAGGAGAGAAGTTCACGTAGGACACTGCTTGAGCAATCTC
TTCAAGAAGTCTTGTTCCAAATCATAAAATTCGTGAATGAGAAAAAGGATCACGTTCCTC
CTATCAACGATGGTGTTATCTACTGCCCCTTTGAGATCACTTTCCCTAGCTCATCGGACT
CAACCTTTGGGATGGATATGATAAAGAGGATGCTCCACAGTGGTGGTCATCCATCCATGC
TCAGTTGATTTCACTTTCATCCACGCAACTTTAATTAGTAGTAGTAGTAGTACAAATACA
CTTGATGTTACTGGTTCCAGCCTAACTCCAGTCAACACTTTTATTTTTTCTCTCCTACAT
GCATTTCGTGTGTAAATATGTAACACTTTGCCTCTCTTCGTAATGTTTCCGAAGTTTAAT
TTCCTTAAAAATAAATTGGATGCTTGTAGTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 5

CO CL1946Contig1 904 5 5 U
GGGGTGGGACCCCGTTTTCTCTCATTTTCTCTCAACCTTCTATCTAAAAAGTTTCACAAA
AAAGCAAATCGTGATAAGGGGCCGGTGGTTCGACCACCGCCGGTCACCTCTTTTTCTTTT
GTTTTTTGTTTTATGTAAATATCTGTTTAGTTTTTCGGCTAAGTCCGAACTCCTATTCCG
TCTGCGGATGTTTTCTTTGGTTTAGCCGATCTAGATCATCGCTAGGCGATGTTTTTGTGG
TGTTTTCATATAATCTTCCTATACTTTCTGGGCTTATATAAGATTCCGGCTGTTTCTTTG
GGTTTTCATCTCCTCTTATGGTCATCCTCAATCTCTATCACTGAATGATATCAATCTTTG
ATACTAAAAAACTAAGCAAAGTTTTCAGAAAGTATAGAGTTTTGAGCTTTGCAGATTAAC
CTTTCCGGTTTTTGTTTCAACTTAAGAAAAGCCAAAGTTTGTTTCCAACAAATGTTTTGG
CAATAGCTGGAGCTAAATCGATGAAGGTATTTGGAATTCTTCACATCCAAAGGAAGAGAT
TGGAGATTGAAGGAACAGAGGCACGAAGGAGAGTATTGATCTCAGATTCATTGAAAAGAT
GCTTGCTGATTATGAAAGAGGAAGAAACAGAAGAGATTGACAGAACAGGTCTTTCCGGTG
GCTTCGGGTTGACGGCGTCGATGGCTCTGGTTCATGACGTCAGCGACTATTGTTCGAAGC
ATGGAAGACACGTGTTACCACGTGTAGCAAGTACAAGAAGCTGCTAGGATTATCTAGATT
TTGGGCTTTTCTCTCTATTTGGTTCTAATCTTTATGTTTTCTTCCAGTGAACCCATTTCA
ATGTAATCTGGATCTCTGTAGAAGCCCTATGAGCTCTTTCTTATGAATGGAAGTTTGTTG
ACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 10 10 

AF RR4FG02TF U 1
AF RR4G667TF U 165
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AF RR4G667JQ C 165
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GTTTTTTGTTTTATGTAAATATCTGTTTAGTTTTTCGGCTAAGTCCGAACTCCTATTCCG
TCTGCGGATGTTTTCTTTGGTTTAGCCGATCTAGATCATCGCTAGGCGATGTTTTTGTGG
TGTTTTCATATAATCTTCCTATACTTTCTGGGCTTATATAAGATTCCGGCTGTCTCTTTG
GGTTTTCATCTCCTCTTATGGTCATCCTCAATCTCTATCACTGAATGATATCAATCTTTG
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CTTTCCGGTTTTTGTTTCAACTTAAGAAAAGCCAAAGTTTGTTTCCAACAAATGTTTTGG
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TGGAGATTGAAGGAACAGAGGCACGAAGGAGAGTATTGATCTCAGATTCATTGAAAAGAT
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GG
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CTTTGCAGATTAACCTTTCCGGTTTTTGTTTCAACTTAAGAAAAGCCAAAGTTTGTTTCC
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AG
TCTTT

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G
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TGGTTTAGCCGATCTAGATCATCGCTAGGCGATGTTTTTGTGGTGTTTTCATATAATCTT
CCTATACTTTCTGGGCTTATATAAGATTCCGGCTGTTTCTTTGAGTTTTCATCTCCTCTT
ATGGTCATCCTCAATCTCTATCACTGAATGATATCAATCTTTGATACTAAAAAACTAAGC
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GAGGAAGAAACAGAAGAGATTGACAGAACAGGTCTTTCCGGTGGCTTCGGGTTGACGGCG
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GG
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CGGCTGTTTCTTTGGGTTCTCATCTCCTCTTATGGTCATCCTCAATCTCTATCACTGAAT
GATATCAATCTTTGATACTAAAAAACTAAGCAAAGTTTTCAGAAAGTATAGAGTTTTGAG
CTTTGCAGATTAACCTTTCCGGTTTTTGTTTCAACTTAAGAAAAGCCAAAGTTTGTTTCC
AACAAATGTTTTGGCAATAGCTGGAGCTAAATCGATGAAGGTATTTGGAATTCTTCACAT
CCAAAGGAAGAGATTGGAGATTGAAGGAACAGAGGCACGAAGGAGAGTATTGATCTCAGA
TTCATTGAAAAGATGCTTGCTGATTATGAAAGAGGAAGAAACAGAAGAGATCGACAGAAC
AGGTCTTTCCGGTGGCTTCGGGTTGACGGCGTCGATGGCTCTGGTTCATGACGTCAGCGA
CTATTGTTCGAAGCATGGAAGACACGTGTTACCACGTGTAGCAAGTACAAGAAGCTGCTA
GGATTATCTAGATTTTGGGCTTTTCTCTCTATTTGGTTCTAATCTTTATGTTTTCTTCCA
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ATGGAAGTTTGTTGACCG

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RD RR4FG02JQ 727 0 0
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GTGGTGTTTTCATATAATCTTCCTATACTTTCTGGGCTTATATAAGATTCCGGCTGTCTC
TTTGGGTTTTCATCTCCTCTTATGGTCATCCTCAATCTCTATCACTGAATGATATCAATC
TTTGATACTAAAAAACTAAGCAAAGTTTTCAGAAAGTATAGAGTTTTGAGCTTTGCAGAT
TAACCTTTCCGGTTTTTGTTTCAACTTAAGAAAAGCCAAAGTTTGTTTCCAACAAATGTT
TTGGCAATAGCTGGAGCTAAATCGATGAAGGTATTTGGAATTCTTCACATCCAAAGGAAG
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GGTGGCTTCGGGTTGACGGCGTCGATGGCTCTGGTTCATGACGTCAGCGACTATTGTTCG
AAGCATGGAAGACACGTGTTACCACGTGTAGCAAGTACAAGAAGCTGCTAGGATTATCTA
GATTTTGGGCTTTTCTCTCTATTTGGTTCTAATCTTTATGTTTTCTTCCAGTGAACCCAT
TTCAATGTAATCTGGATCTCTGTAGAAGCCCTATGAGCTCTTTCTTATGAATGGAAGTTT
GTTGAC
C

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

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GATCATCCCCTAAGCCGAAAACCTTATCTCATCTCTTCTCATTCACTTCACAATGGCAGC
TTCAGCTTCGTCTCTCGCTCTCTCCACCTTCAACCCTAACTCCCTTCCTTTCTCCATCTC
CAAACCCTCCTCCTCCCTCTCTTTCAAACTCAACTCCCCCTTCTCTTCCTCCTCCGCCAA
ATGCAACTCTCCCGCCTCTCGCTTCCTCCGTAACGTCGCCGTCACGGAAGACTTCTCTGT
CGAAGAAGAAGACATCGGTTTCGCCGATGACGTGGCGCCGCCGCCACAGGAGCAGTCCTT
CTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTTCCGTTCGACGTTGACAGTGCTCAGCC
CGCTCAGCTGTTCGATAGCCAGGGAACGTTGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAGGTG
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GCTGCTCAGCAGTTTAATGGCTATGAGTTGGATGGTAGACAGTTGAGAGTAAACGCAGGT
CCTCCTCCACCAAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCTTTGGAGAT
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ATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAAGGAAAGGTTGTTGAGGCTAGAGTCATCTAC
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GTCCAAAATGCTATCCAAACCTTGAATGGTGCTGATTTGGACGGGAGACAAATTAGAGTC
TCGGAAGCTGAAGCTAGGCCTCCTAGGCGCCAGTTTTGAGCCACCCCAAACGATGGTTTC
CTTTTCTCAAAAACGCATATTCTAGAGGGCGCTTTGAAGCATATAGAGTTTTGTGAGAGG
ATGGCAGTTTCGGACCCGTACTAAGAAGCTCTTCTTCACCTATGCTTGTTATGCAATGGA
TGCTCGGGATGGTCTTTATATTTCGAGAAACATATAATTAAGATTATAAAGTGAAGAACA
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ22TF U 1
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CGAAGAAGAAGACATCGGTTTCGCCGATGACGTGGCGCCGCCGCCACAGGAGCAGTCCTT
CTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTTCCGTTCGACGTTGACAGTGCTCAGCC
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GCTGCTCAGCAGTTTAATGGCTATGAGTTGGATGGTAGACAGTTGAGAGTTAACGCAGGT
CCTCCTCCACCAAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCTTTGGAG**
*GTGGTGGTGGTTCAGGAAACCGTGTTTACGTCGGTAATCTCTCGTGGGGAGTCGATGAC
ATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGGAGCAAGGAATGGTTGTTGAGGCTAGAGTCATCTAC
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DS 

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CCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTTCCGTTCGACGTTGACAGTGCTC
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GGCTGCTGCTCAGCAGTTTAATGGCTATGAGTTGGATGGTAGACAGTTGAGAGTTAACGC
AGGTCCTCCTCCACCAAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCTTTGG
AG***GTGGTGGTGGTTCAGGAAACCGTGTTTACGTCGGTAATCTCTCGTGGGGAGTCGA
TGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGGAGCAAGGAATGGTTGTTGAGGCTAGAGTCAT
CTACGACAGGGACAGTGGTCGGTCCAAGGGTTTTGGGTTTGTGACGTATAACTCTGCTCA
AGAGGTCCAAAATGCTATCCAAAGCTTGAATGGTGCTGATTTGGACGGGAGACAAATTAG
AGTCTCGGAAGCTGAAGCTAGGCCTCCTAGGCGCCAGTTTTGAGCTACCCC

QA 1 651 1 651
DS 

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CCACCAAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCTTTGGAGATGGTGGT
GGTGGTTCAGGAAACCGTGTTTACGTCGGGAATCTTTCTTGGGGAGTCGATGACATGGCT
CTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAAGGAAAGGTTGTTGAGGCTAGAGTTATTTACGACAGG
GACAGTGGTCGGTCCAAGGGTTTTGGGTTTGTGACATACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAA
AATGCTATCCAAACCTTGAATGGTGCTGATTTGGACGGGAGACAAATTAGAGTCTCGGAA
GCTGAAGCTAGGCCTCCTAGGCGCCAGTTTTGAGCCACCCCAAACGATGGTTTCCTTTTC
TCAAAAACGCATATTCTAGAGGGCGCTTTGAAGCATATAGAGTTTTGTGAGAGGATGGCA
GTTTCGGACCCGTACTAAGAAGCTCTTCTTCACCTATGCTTGTTATGCAATGGATGCTCG
GGATGGTCTTTTTATTTCGAGAAACATATAATTAAGATTATAAAGTGAAGAACATGTTCT
TGTCTGTCTGAATGCTGGCCATTGACGGCTTCCCTTTGCTTTGCT
CC

QA 1 645 1 645
DS 

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G
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GGTAGACAGTTGAGAGTAAACGCGGGTCCTCCTCCACCAAAGAGGGAAGACTCCTTCTCC
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GGGAATCTTTCTTGGGGAGTCGATGACGTGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAAGGA
AAGGTTGTTGAGGCTAGAGTTATCTACGACAGGGACAGTGGTCGGTCCAAGGGTTTTGGG
TTTGTGACATACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAAAATGCTATCCAAACCTTGAATGGTGCT
GATTTGGACGGGAGACAAATTAGAGTCTCGGAAGCTGAAGCTAGGCCTCCTAGGCGCCAG
TTTTGAGCCACCCCAAACGATGGTTTCCTTTTCTCAAAAACGCATATTCTAGAGGGCGCT
TTGAAGCATATAGAGTTTTGTGAGAGGATGGCAGTTTCGGACCCGTACTAAGAAGCTCTT
CTTCACCTATGCTTGTTATGCAATGGATGCTCGGGATGGTCTTTATATTTCGAGAAACAT
ATAATTAAGATTATAAAGTGAAGAACATGTTCTTGTCTGTCTGAATGCTGGCCATTGACG
GCTTCCCTTTGCTTTGCTTCAAGTTTTATCTCTATTCAATTTGCTTCTCTATTTAACA

QA 2 719 2 719
DS 



AS 1 5

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GCATTTGGCTCTTGAAGCGGCTCATCAAGGAATTGTTCTTCTCAAAAACTCTGGCCGGTC
ACTTCCCCTGTCTCCTAGGCGCCACCACACCGTCGCCGTAATTGGACCCAACTCCGACGT
CACTGAGACCATGATTGGAAACTATGCAGGAAAAGCATGTGCTTATACGTCACCGTTACA
AGGAATCTCAAGATACGCAAAGACACTTCACCAAGAAGGTTGTGCTGGTGTAGCATGTTC
AGGGAATCAAGGATTTGGTGCAGCAGAGGCTGCGGCGCGTCAAGCAGACGCAACGGTTCT
TGTAATGGGACTGGACCAGTCGATAGAGGCAGAGACACTAGATCGAACCGGGCTGCTCTT
ACCGGGCTACCAACAAAACCTTGTGACACGTGTGGCTCAAGCCTCTAGGGGTCCAGTCAT
TCTGGTACTTATGAGTGGTGGACCAATTGATGTATCCTTCGCTAAGAACGATCCACGTGT
TGCTGCCATCATTTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCGGGTGGAGCTGCTATTGCTGATGT
CATTTTTGGTGCTGCTAATCCCGGAGGTAAACTACCAATGACATGGTATCCACAAGAATA
CGTGGCAAAACTGCCAATGACGTTAATGGCTATGAGAGCCTCAGGAAACTATCCGGGTCG
GACCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGGGTTCGGCTTAAGCTATAC
TACCTTCACTCACAGTTTAGCCCAAAGCCCATTAGCCCAATTATCAGTTTCACCCGACAA
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GAACAAGCAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACTGCAGGTGCAAAACGGACCGT
TAAAGTCGATATTGAGGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTGGATGAATATGGGATGAGGAG
AATCCCAATGGGTGAACATAAATTACACATTGGTGAGATCAAACATACTATTTTGGTCCA
ACCGCAACTTTGACTGATGCATATAAAAGAAAGAAACAACAAATACAGACATTCTCTTAA
ATAAGTGGAATGTCTCTGATTTATATTATAAGATAGAGAGATACGTTATTTTCTTGTGAA
ATTACTCAAGAAAGGTTTTAATCCGTAAAGAAGCACCAAAGGGGTCGCTTCTTGGATGTG
TGTGTTTTCTTTAATTTTATTTTTGTGTCAATTGCCAAAGATATTGTAACTTGTGGCTCC
CAAAATGTAAAAGGAGCCCTTGTAAGATGTTGAAACTAAAGAAAAATGAAAATAAATGAC
AAATTTGATAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DW47TF U 1
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AF RR4CY06JQ C 871
AF RR4AT80TF U 998
BS 1 704 RR4DW47TF
BS 705 835 RR4CY06TF
BS 836 836 RR4DW47JQ
BS 837 1290 RR4CY06TF
BS 1291 1291 RR4AT80TF
BS 1292 1320 RR4CY06TF
BS 1321 1321 RR4AT80TF
BS 1322 1338 RR4CY06TF
BS 1339 1458 RR4AT80TF
BS 1459 1459 RR4DW47JQ
BS 1460 1511 RR4AT80TF

RD RR4DW47TF 710 0 0
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GCATTTGGCTCTTGAAGCGGCTCATCAAGGAATTGTTCTTCTCAAAAACTCTGGCCGGTC
ACTTCCCCTGTCTCCTAGGCGCCACCACACCGTCGCCGTAATTGGACCCAACTCCGACGT
CACTGAGACCATGATTGGAAACTATGCAGGAAAAGCATGTGCTTATACGTCACCGTTACA
AGGAATCTCAAGATACGCAAAGACACTTCACCAAGAAGGTTGTGCTGGTGTAGCATGTTC
AGGGAATCAAGGATTTGGTGCAGCAGAGGCTGCGGCGCGTCAAGCAGACGCAACGGTTCT
TGTAATGGGACTGGACCAGTCGATAGAGGCAGAGACACTAGATCGAACCGGGCTGCTCTT
ACCGGGCTACCAACAAAACCTTGTGACACGTGTGGCTCAAGCCTCTAGGGGTCCAGTCAT
TCTGGTACTTATGAGTGGTGGACCAATTGATGTATCCTTCGCTAAGAACGATCCACGTGT
TGCTGCCATCATTTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCGGGTGGAGCTGCTATTGCTGATGT
CATTTTTGGTGCTGCTAATCCCGGAGGTAAACTACCAATGACATGGTATCCACAAGAATA
CGTGGCAAAACTGCCAATGACGTTAATGGCTATGAGAGCCTCAG
AAACTA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4CY06TF 744 0 0
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TGGCAAAACTGCCAATGACGTTAATGGCTATGAGAGCCTCAGGAAACTATCCGGGTCGGA
CCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGGGTTCGGCTTAAGCTATACTA
CCTTCACTCACAGTTTAGCCCAAAGCCCATTAGCCCAATTATCAGTTTCACCCTACAAGA
TCAACACTGCCATGTTCAACTCCTCATCTAACTCCATTAAAGTGTCTCATGCCAACTGTG
GAACGTTTCCAAAAATGCCTCTCCATGTTGAAGTGTCAAACACCGTCGAATTCGATGGAA
CCCACACGGTGTTTGTGTTTGCCGAGCCTCCAGAAAATGGGATAAAAGGACTGGGAGTGA
ACAAGCAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACTGCAGGTGCAAAACGGACCGTTA
AAGTCGATATTGAGGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTGGATGAATATGGGATGAGGAGAA
TCCCAATGGGTGAACATAAATTACACATTGGTGAGATCAAACATACTATTTTGGTCCAAC
CGCAACTTTGACTGATGCATATAAAAGAAAGAAACAACAAATACAGACATTCTCTTAAAT
AAGTGGAATGTCTCTGATTTATATTATA*GATAGAGAGATACGTTATTTTCTTGTGAA*T
TACTCAAGAAAGGTTT
AATCCGTA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4DW47JQ 750 0 0
AGATTCTACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGGGTTCGGCTTAAGCTATACTACCTTC
ACTCACAGTTTAGCCCAAAGCCCATTAGCCCAATTATCAGTTTCACCCGACAAGATCAAC
ACTGCCATGTTCAACTCCTCATCTAACTCCATTAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACG
TTTCCAAAAATGCCTCTCCATGTTGAAGTGCCAAACACCGGCGAATTCGATGGAACCCAC
ACGGTGTTTGTGTTTGCCGAGCCTCCAGAAAATGGGATAAAAGGACTGGGAGTGAACAAG
CAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACTGCAGGTGCAAAACGGACCGTTAAAGTC
GATATTGAGGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTGGATGAATATGGGATGAGGAGAATCCCA
ATGGGTGAACATAAATTACACATTGGTGAGATCAAACATACTATTTTGGTCCAACCGCAA
CTTTGACTGATGCATATAAAAGAAAGAAACAACAAATACAGACATTCTCTTAAATAAGTG
GAATGTCTCTGATTTATATTATAAGATAGAGAGATACGTTATTTTCTTGTGAAATTACTC
AAGAAAGGTTTTAATCCGTAAAGAAGCACCAAAGGGGTCGCTTCTTGGATGTGTGTGTTT
TCTTTAATTTTATTTTTGTGTCAATTGCCAAAGATATTGTAACTTGTGGCTCCCAAAATG
TAAAAGGAGCCCTTGTAAGATGTTGAAACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4CY06JQ 641 0 0
TAACTCCATTAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGCCTCTCCATGT
TGAAGTGTCAAACACCGTCGAATTCGATGGAACCCACACGGTGTTTGTGTTTGCCGAGCC
TCCAGAAAATGGGATAAAAGGACTGGGAGTGAACAAGCAATTGATAGCGTTTGAGAAGGT
TCATGTCACTGCAGGTGCAAAACGGACCGTTAAAGTCGATATTGAGGCTTGCAAGCATCT
TGGTGTAGTGGATGAATATGGGATGAGGAGAATCCCAATGGGTGAACATAAATTACACAT
TGGTGAGATCAAACATACTATTTTGGTCCAACCGCAACTTTGACTGATGCATATAAAAGA
AAGAAACAACAAATACAGACATTTTTTTAAATAAGTGGAATGTTTTTGATTTATATTATA
AGATAGAGAGATACGTTATTTTTTTGTGAAATTACTCAAGAAAGGTTTTAATCCGTAAAG
AAGCACCAAAGGGGTCGCTTCTTGGATGTGTGTGTTTTCTTTAATTTTATTTTTGTGTCA
ATTGCCAAAGATATTGTAACTTGTGGCTCCCAAAATGTAAAAGGAGCCCTTGTAAGATGT
TGAAACTAAAGAAAAATGAAAATAAATGACAAATTTGATAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4AT80TF 514 0 0
GGG
GGGATAAAAGGACTGGGAGTGAACAAGCGATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACT
GCAGGTGCAAAACGGACCGTTAAAGTCGATATTGAGGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTG
GATGAATATGGGATGAGGAGAATCCCAATGGGTGAACATAAATTACACATTGGTGAGATC
AAACATACTATTTTGGTCCAACCGCAACTTTGACTGATGCATATAAAAGAAAGAAACAAC
AAATACAGACATTCTCTTAAATAAGTGGAATGTCTCTGATTTATATTATAAGATAGAGAG
ATACGTTATTTTCTTGTGAAATTACTCAAGAAAGGTTTTAATCCGTAAAGAAGCACCAAA
GGGGTCGCTTCTTGGATGTGTGTGTTTTCTTTAATTTTATTTTTGTGTCAATTGCCAAAG
ATATTGTAACTTGTGGCTCCCAAAATGTAAAAGGAGCCTTTGTAAGATGTTGAAACTAAA
GAAAAATGAAAATAAATGACAAATTTGATAT

QA 4 514 4 514
DS 



AS 2 5

CO CL1949Contig1 1020 2 8 U
GATGGGAACTTGGGTATGGATGAAGTTGACTTGGCTCTTGAGAACTATGAAGAGCTCTTT
GGGACAGCCTTTAACACCTCTGGAGAGCTCTTTGGACAAAGTGGAATCGATTGTCTTTTC
CAGAAGCATCATCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCCTGAGGGAGGGAATCTGGTGCAGCCA
GCTGAGAGCAATGATGATTCTTTCATGAGTTCGAAGACCGAGCCGATCATCTGCTTCACA
TCGAAGCCAGCACATTCCAACAACATATCTTTCTCTGGAGTCACAGGAGACAGCAGTGCT
GGTGATTTTCAAGAATGTGGTGCATCATCTTCCATGCAGCTCTCAGGCGAGCCACCATGG
TATCCTCAAACATCGCAGGATAACAATGCTTGCTCACAGTCAGTGACACGTAATAACGCG
GTCATGCGTTACAAGGAGAAAAAGAAGGCTCGTAGGTTTGATAAGACAGTGAGGTATGCT
TCTCGGAAAGCAAGAGCTGATGTGAGACGGCGTGTAAAAGGGAGGTTTGCAAAGCTGGTG
AAGCTTATGACTACGACCCACTCACCCCAACCAGAAGCTACTGAAGGATTCTCTCTTTAA
AAAGGTAAACAAAGTAGATGCACATGGGGCAAACAAAATCAAACAAGAAAGGGTTTTTTG
ACTTATGGAGGAGAGTTCTCTCAGTCATAAACTGTGAAAAACAAAGACTACTACACTCTC
TGGGGTTTGAGAAGACATTAAACTGATGAGTATTGTAAGCAAATCATTCATTCTTGGGAT
TCAATCTGTTTTTTTTGGCCTTTAGGAAGCTTCATTCTTGTTCAGAGATATAGTTCTCTG
ACAAAAAAAACATTTATCCGAGTTGGGTTTCTGCTGCTTCAGGGCGTTACACAGATCAGG
GTTCCATGAATTTGTCTTGGTAGTTGAAAAATGCAGGGAGACTATAGTGTAAAAAGTTAA
AAACAAAATGATTGTATATGACTTGTTTATGTATGTATGTATGCTCATAAGTGCTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ45TF U 1
AF RR4BQ45JQ C 268
BS 1 700 RR4BQ45TF
BS 701 701 RR4BQ45JQ
BS 702 732 RR4BQ45TF
BS 733 733 RR4BQ45JQ
BS 734 738 RR4BQ45TF
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BS 740 753 RR4BQ45TF
BS 754 1020 RR4BQ45JQ

RD RR4BQ45TF 756 0 0
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GGGACAGCCTTTAACACCTCTGGAGAGCTCTTTGGACAAAGTGGAATCGATTGTCTTTTC
CAGAAGCATCATCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCCTGAGGGAGGGAATCTGGTGCAGCCA
GCTGAGAGCAATGATGATTCTTTCATGAGTTCGAAGACCGAGCCGATCATCTGCTTCACA
TCGAAGCCAGCACATTCCAACAACATATCTTTCTCTGGAGTCACAGGAGACAGCAGTGCT
GGTGATTTTCAAGAATGTGGTGCATCATCTTCCATGCAGCTCTCAGGCGAGCCACCATGG
TATCCTCAAACATCGCAGGATAACAATGCTTGCTCACAGTCAGTGACACGTAATAACGCG
GTCATGCGTTACAAGGAGAAAAAGAAGGCTCGTAGGTTTGATAAGACAGTGAGGTATGCT
TCTCGGAAAGCAAGAGCTGATGTGAGACGGCGTGTAAAAGGGAGGTTTGCAAAGCTGGTG
AAGCTTATGACTACGACCCACTCACCCCAACCAGAAGCTACTGAAGGATTCTCTCTTTAA
AAAGGTAAACAAAGTAGATGCACATGGGGCAAACAAAATCAAACAAGAAAGGGTTTTTTG
ACTTATGGAGGAGAGTTCTCTCAGTCATAAACTGTGAAAA*CAAAGACTACTACACTCTC
TGGGGTTTGAGA*GACAT*AAACTGATGAGTAT
GTA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4BQ45JQ 753 0 0
TCTTTCTCTGGAGTCACAGGAGACAGCAGTGCTGGTGATTTTCAAGAATGTGGTGCATCA
TCTTCCATGCAGCTCTCAGGCGAGCCACCATGGTATCCTCAAACATCGCAGGATAACAAT
GCTTGCTCACAGTCAGTGACACGTAATAACGCGGTCATGCGTTACAAGGAGAAAAAGAAG
GCTCGTAGGTTTGATAAGACAGTGAGGTATGCTTCTCGGAAAGCAAGAGCTGATGTGAGA
CGGCGTGTAAAAGGGAGGTTTGCAAAGCTGGTGAAGCTTATGACTACGACCCACTCACCC
CAACCAGAAGCTACTGAAGGATTCTCTCTTTAAAAAGGTAAACAAAGTAGATGCACATGG
GGCAAACAAAATCAAACAAGAAAGGGTTTTTTGACTTATGGAGGAGAGTTCTTTCAGTCA
TAAACTGTGAAAAACAAAGACTACTACACTCTCTGGGGTTTGAGAAGACATTAAACTGAT
GAGTATTGTAAGCAAATCATTCATTCTTGGGATTCAATCTGTTTTTTTTGGCCTTTAGGA
AGCTTCATTCTTGTTCAGAGATATAGTTCTCTGACAAAAAAAACATTTATCCGAGTTGGG
TTTCTGCTGCTTCAGGGCGTTACACAGATCAGGGTTCCATGAATTTGTCTTGGTAGTTGA
AAAATGCAGGGAGACTATAGTGTAAAAAGTTAAAAACAAAATGATTGTATATGACTTGTT
TATGTATGTATGTATGCTCATAAGTGCTTTGCC

QA 1 753 1 753
DS 



CO CL1949Contig2 1444 3 7 U
GCTGATAAAGATTCTGGATACTGTCTTTAATTTACAAGAATGCACAGTGCAAAGCACTTA
TGAGCATACATACATTACATACACAAGTCATATACAATCATTTTGTTTTTAACTTTTTAC
ACTATAGTCTCCCTGCATTTTCCAACTACCAAGACAAATTCATGGAACCCTGATCTGTGT
AACGCCCCTGAAGCAACAGAAACCCAACTTGGATAAATGTTTTCTTTTTTTGTCAGAGAA
CAAGAATGAAGCTTCCTAAGGCCAAAAAAACAGATTGAATCCCAAGAATGAATGATTTGC
TTTACAATACTCATCAGTTTAATGTCTTCTCAAACCCCAGAGAGTAGTAGTAGTCTTGTT
TTTTCACAGTTTATGACTTTGAGAACTCTCTCCTCCATAAGTCAAAAACCCCTTTCTTGT
TTGATTTTTTTTTTCCCGCCATGTAAATCTATTTTTTTTTTACCTTTTTAAAGAGAAATC
CTTCAGTAGCTTCTGGTTGGGGTGAGAGGGTCGTAGTCATAAGCTTCACCAGCTTTGACA
AACCTCCCTTTTACACGCCTTCTCACATCAGCTCTTGCTTTCCGAGAAGCATACCTCACT
GTCTTATCAAACTTGCGAGCCTTCTTTTTCTCCTTGTAACGCATAACCGCGTTATTACGT
GTCACTGACTGTGAGCAAGCATTGTTATCCTGCGATGTTTGAGGATACCATGGTGGCTCC
CCTGAGAGCTGCATGGAAGATGATGCACCACATTCTTGAAAATCTCCAGCATATGATCGG
CTCGGTTTTCGAACTCATGAAAGAATCATCAATGCTCTCAGCTGGCTGCACCAGATTCCC
TCCCTCAGGAGCTGCTGCTGCTGCTGCTTGATGATGCTTCTGGAAAAGACAATCGATTCC
ACCTTGTCCAAAGAGCTCTCCAGAGGTGTTAAAGGCTGTCCCAAAGAGCTCTTCATAGTT
CTCAAGAGCCAAGTCAACTTCATCCATACCCAAGTTCCCATAAAAGTCATCTTCACATAC
TCTTACCTCCTTAGGAAATGATGAAGTTGCAGGTGCTGCTGCAGAGCTCGAAGGGCAACC
AGAGTAGCAGCTTATGGTTTGCCTCTTGTGATTATTTGACGAGGAAGAACTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTGGCCAGACCAGTCACAGTTTTGACAGAGGGAAACTCTTTCTTCAACACA
CCTGACTGTAGCAGGCTGAGCATTGCATCTCTCGCAGACGAGTGTTCTAGAATGTCGCTT
GGACAATGCGTTAGCGGAATGAACACTCCGGTCGCAGGAGAGACAGAGACAGGCTGCGTC
GGAGCGACAGTACACCATTGATCTTTGTTCACCACAAAAGTCACACATGTAACCCATCTT
CTTTCACTCTTTGACTCGGTAATAAAAAGATGATCTTCTGATGAAGTTGAATTAAGGAAA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DS42JQ U 1
AF RR4G939JQ U 255
AF RR4G939TF C 883
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BS 758 1025 RR4G939JQ
BS 1026 1444 RR4G939TF

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TTTTCACAGTTTATGACTTTGAGAACTCTCTCCTCCATAAGTCAAAAACCCCTTTCTTGT
TTGATTTTTTTT**CCCGCCATGTACATCTATTTTTTTTTTACCTTTTTAAAGAGAAATC
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AACCTCCCTTTTACACGCCTTCTCACATCAGCTCTTGCTTTCCGAGAAGCATACCTCACT
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GTCACTGACTGTGAGCAAGCATTGTTATCCTGCGATGTTTGAGGATACCATGGTGGCTCC
CCTGAGAGCTGCATGGAAGATGATGCACCACATTCTT

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GTCTTCTCAAACCCCAGAGAGTGGTAGTAGTCTTGTTTTTTCACAGTTTATGACTTTGAG
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TAAATCTATTTTTTTTT*ACCTTTTTAAAGAGAAATCCTTCAGTAGCTTCTGGTTGGGGT
GAGAGGGTCGTAGTCATAAGCTTCACCAGCTTTGACAAACCTCCCTTTTACACGCCTTCT
CACATCAGCTCTTGCTTTCCGAGAAGCATACCTCACTGTCTTATCAAACTTGCGAGCCTT
CTTTTTCTCCTTGTAACGCATAACCGCGTTATTACGTGTCACTGACTGTGAGCAAGCATT
GTTATCCTGCGATGTTTGAGGATACCATGGTGGCTCCCCTGAGAGCTGCATGGAAGATGA
TGCACCACATTCTTGAAAATCTCCAGCATATGATCGGCTCGGTTTTCGAACTCATGAAAG
AATCATCAATGCTCTCAGCTGGCTGCACCAGATTCCCTCCCTCAGGAGCTGCTGCTGCTG
CTGCTTGATGATGCTTCTGGAAAAGACAATCGATTCCACCTTGTCCAAAGAGCTCTCCAG
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CCATACCCAAGTTCCCATAAAAGTCATCTTCACATACTCTTA

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AAAGTCATCTTCACATACTCTTACCTCCTTAGGAAATGATGAAGTTGCAGGTGCTGCTGC
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GGAAGAACTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGCCAGACCAGTCACAGTTTTGACAGAGGGA
AACTCTTTCTTCAACACACCTGACTGTAGCAGGCTGAGCATTGCATCTCTCGCAGACGAG
TGTTCTAGAATGTCGCTTGGACAATGCGTTAGCGGAATGAACACTCCGGTCGCAGGAGAG
ACAGAGACAGGCTGCGTCGGAGCGACAGTACACCATTGATCTTTGTTCACCACAAAAGTC
ACACATGTAACCCATCTTCTTTCACTCTTTGACTCGGTAATAAAAAGATGATCTTCTGAT
GAAGTTGAATTAAGGAAAAAAA

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 5

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TGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTCTATACTGC
CAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGCTGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGG
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CTTTGAATAAATGAGTCAATATTAGAGG


BQ
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AF RR4GW42TF U 1
AF RR4GS09TF U 3
AF RR4DR35TF U 1
AF RR4GS09JQ C 3
AF RR4DR35JQ C 131
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GGACC
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GGCCTCCTGGCTAAAGAGATCTCATCTACTAGTGATTGATGTCCTGGTTATAAAAGGAAC
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CTTTATGATTGTGATGAACCATGGTCTATGGTATGAAGAGAATATTTGACTGTTCTCTTT
TGTGGAGCCCCTTTTTTATTGTTGACTTTGTTAAAACATTTCAGTGGTAAAAA

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DS 

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GGA
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CTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTA
AAGAAATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATCA
CTCCACAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGACC
TCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTCTATACTGCCAAGC
TTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGCTGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTC
AAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGTCGCCAAATGAACT
GGCCTCCTGGCTAAAGAGATCTCATCTACT**TGATTGATGTCCTGGTTATAAAAGGAAC
ACTACCCTGAGTTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAAGCTTAGGACATAA
CTTTATGATTGTGATGAACCATGGTCTATGGTATGAAGAGAATATTTGACTGTTCTCTTT
TGTGGAGCCCCT

QA 4 615 4 615
DS 

RD RR4DR35TF 687 0 0
GGACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAA
AGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCAT
CAGTAAAGAAATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGA
CATCACTCCACAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAAC
TGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTCTATACTTC
CAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGCTGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGG
TCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGTCGCCAAAT
GAACTGGCCTCCTGGCTAAAGAGATCTCATCTACTAGTGATTGATGTCCTGGTTATAAAA
GGAACACTACCCTGAGTTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAAGCTTAGGA
CATAACTTTATGATTGTGATGAACCATGGTCTATGGTATGAAGAGAATATTTGACTGTTC
TCTTTTGTGGAGCCCCTTTTTTATTGTTGACTTTGTTAAAACATTTCAGTGGTAAAAAAG
CTTTGAATAAATGAGTCAATATTAG
GG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GS09JQ 686 0 0
GGA
AAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGG
CTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTA
AAGAAATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATCA
CTCCACAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGACC
TCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTCTATACTGCCAAGC
TTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGCTGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTC
AAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGTCGCCAAATGAACT
GGCCTCCTGGCTAAAGAGATCTCATCTACT**TGATTGATGTCCTGGTTATAAAAGGAAC
ACTACCCTGAGTTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAAGCTTAGGACATAA
CTTTATGATTGTGATGAACCATGGTCTATGGTATGAAGAGAATATTTGACTGTTCTCTTT
TGTGGAGCCCCTTTTTTATTGTTGACTTTGTTAAAACATTTCAGTGGTAAAAAAGCTTTG
AATAAATGAGTCAATATTAGAGG

QA 4 686 4 686
DS 

RD RR4DR35JQ 557 0 0
ATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATCACTCCA
CAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCT
AAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTCTATACTTCCAAGCTTGTA
GCCAAACAAGAAGGACTAGCTGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGC
TGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGTCGCCAAATGAACTGGCCT
CCTGGCTAAAGAGATCTCATCTACTAGTGATTGATGTCCTGGTTATAAAAGGAACACTAC
CCTGAGTTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAAGCTTAGGACATAACTTTA
TGATTGTGATGAACCATGGTCTATGGTATGAAGAGAATATTTGACTGTTCTCTTTTGTGG
AGCCCCTTTTTTATTGTTGACTTTGTTAAAACATTTCAGTGGTAAAAAAGCTTTGAATAA
ATGAGTCAATATTAG
GG

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 4

CO CL1951Contig1 388 4 25 U
GATGAATGATGATATAATATAGAAACAGATGGTTACATTAAGAATAATACAACGCTCTAT
ACAAAATAGAATCAAATCACACACAAACTCATGAACGAAACAATAAAACTAATGGAGAAA
AATGAAATATTTGTTTTGACTCAAAAGAGAAGACCTGATGCCAAAGCAACAACAGATGCA
AACAATGCCGGTACGAACATGGCAGCATCAGAGGTTGGACTTGGAGCTGGAGCTTCCACG
GTGGCAGCCGCCGCTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACTGCAACGACCATGAAAACAACC
ATCATCTTCATTGACTCCATTACTTGCGTCTCTTTGATGTATGAAGAAAGATTTTAATAT
TTTGTGTATCTGTGCTGTGTTGTGATCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DW42JQ U 1
AF RR4DW42TF C 1
AF RR4D594JQ U 2
AF RR4D594TF C 2
BS 1 21 RR4DW42JQ
BS 22 22 RR4D594JQ
BS 23 41 RR4DW42JQ
BS 42 42 RR4D594JQ
BS 43 68 RR4DW42JQ
BS 69 69 RR4D594JQ
BS 70 116 RR4DW42JQ
BS 117 117 RR4D594JQ
BS 118 146 RR4DW42JQ
BS 147 147 RR4D594JQ
BS 148 148 RR4DW42JQ
BS 149 149 RR4D594JQ
BS 150 151 RR4DW42JQ
BS 152 152 RR4D594JQ
BS 153 210 RR4DW42JQ
BS 211 211 RR4D594JQ
BS 212 241 RR4DW42JQ
BS 242 242 RR4D594JQ
BS 243 269 RR4DW42JQ
BS 270 270 RR4D594JQ
BS 271 345 RR4DW42JQ
BS 346 346 RR4D594JQ
BS 347 349 RR4DW42JQ
BS 350 350 RR4D594JQ
BS 351 388 RR4DW42JQ

RD RR4DW42JQ 388 0 0
GATGAATGATGATATAATATAAAAACAGATGGTTACATTAAAAATAATACAACGCTCTAT
ACAAAATAAAATCAAATCACACACAAACTCATGAACGAAACAATAAAACTAATGGAAAAA
AATGAAATATTTGTTTTGACTCAAAAAAAAAAACCTGATGCCAAAGCAACAACAGATGCA
AACAATGCCGGTACGAACATGGCAGCATCAAAGGTTGGACTTGGAGCTGGAGCTTCCACG
GGGGCAGCCGCCGCTTGTCCTACGGCTGAAAAAGCCACTGCAACGACCATGAAAACAACC
ATCATCTTCATTGACTCCATTACTTGCGTCTCTTTGATGTATGAAAAAAAATTTTAATAT
TTTGTGTATCTGTGCTGTGTTGTGATCC

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4DW42TF 388 0 0
G
ATGAATGATGATATAATATAGAAACAGATGGTTACATTAAGAATAATACAACGCTCTATA
CAAAATAGAATCAAATCACACACAAACTCATGAACGAAACAATAAAACTAATGGAGAAAA
ATGAAATATTTGTTTTGACTCAAAAGAGAAGACCTGATGCCAAAGCAACAACAGATGCAA
ACAATGCCGGTACGAACATGGCAGCATCAGAGGTTGGACTTGGAGCTGGAGCTTCCACGG
TGGCAGCCGCCGCTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACTGCAACGACCATGAAAACAACCA
TCATCTTCATTGACTCCATTACTTGCGTCTCTTTGATGTATGAAGAAAGATTTTAATATT
TTGTGTATCTGTGCTGTGTTGTGATCC

QA 2 388 2 388
DS 

RD RR4D594JQ 387 0 0
ATGAATGATGATATAATATAGAAACAGATGGTTACATTAAGAATAATACAACGCTCTATA
CAAAATAGAATCAAATCACACACAAACTCATGAACGAAACAATAAAACTAATGGAGAAAA
ATGAAATATTTGTTTTGACTCAAAAGAGAAGACCTGATGCCAAAGCAACAACAGATGCAA
ACAATGCCGGTACGAACATGGCAGCATCAGAGGTTGGACTTGGAGCTGGAGCTTCCACGG
TGGCAGCCGCCGCTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACTGCAACGACCATGAAAACAACCA
TCATCTTCATTGACTCCATTACTTGCGTCTCTTTGATGTATGAAGAAAGATTTTAATATT
TTGTGTATCTGTGCTGTGTTGTGATCC

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4D594TF 387 0 0
ATGAATGATGATATAATATAGAAACAGATGGTTACATTAAGAATAATACAACGCTCTATA
CAAAATAGAATCAAATCACACACAAACTCATGAACGAAACAATAAAACTAATGGAGAAAA
ATGAAATATTTGTTTTGACTCAAAAGAGAAGACCTGATGCCAAAGCAACAACAGATGCAA
ACAATGCCGGTACGAACATGGCAGCATCAGAGGTTGGACTTGGAGCTGGAGCTTCCACGG
TGGCAGCCGCCGCTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACTGCAACGACCATGAAAACAACCA
TCATCTTCATTGACTCCATTACTTGCGTCTCTTTGATGTATGAAGAAAGATTTTAATATT
TTGTGTATCTGTGCTGTGTTGTGATCC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 4

CO CL1952Contig1 736 4 6 U
GTGGTAACGAATTTGAGACAAGAAAAGAAAAACAGAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATG
GGCCGCCGGAGAACGATCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAG
CCAATTGCTCTCATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTA
TATTACAGCCATGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAG
AGGACACTATCAGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAA
CCTACAACCGACGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTC
CGTTCTTACTTCGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTG
TCATCAGAGCTCGAGTTTATATCGCAGATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCA
ATAGATATCATTCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATA
GCCTTGATTTGTTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCAT
GCCGGTTCTTGAACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCT
TCCGTCTTTGTCTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATG
GAAACTTAGATCAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4FF60TF U 1
AF RR4EI51TF U 12
AF RR4C895JQ C 131
AF RR4C895TF U 131
BS 1 321 RR4FF60TF
BS 322 322 RR4EI51TF
BS 323 446 RR4FF60TF
BS 447 447 RR4C895TF
BS 448 713 RR4FF60TF
BS 714 736 RR4EI51TF

RD RR4FF60TF 713 0 0
GTGGTAACGAATTTGAGACAAGAAAAGAAAAACAGAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATG
GGCCGCCGGAGAACGATCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAG
CCAATTGCTCTCATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTA
TATTACAGCCATGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAG
AGGACACTATCAGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAA
CCTACAACCGACGCTTTGGTG*ACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTC
CGTTCTTACTTCGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTG
TCATCAGAGCTCGAGTTTATATCGCA*ATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCA
ATAGATATCATTCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATA
GCCTTGATTTGTTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCAT
GCCGGTTCTTGAACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCT
TCCGTCTTTGTCTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4EI51TF 725 0 0
GGGGT
GACAAGAAAAGAAAAACAGAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATGGGCCGCCGGAGAACGA
TCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAGCCAATTGCTCTCATTG
GTTCTGCGAAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATATTACAGCCATGCAA
ATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAGGACACTATCAGAGA
CCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACCTACAACCGACGCTT
TGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAGGACCTTCCGTTCTTACTTCGGAG
ATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTCATCAGAGCTCGAGT
TTATATCGCA*ATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAATAGATATCATTCCAG
AAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGCCTTGATTTGTTTCC
TCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATG**GGTTCTTGAACCA
ATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTCCGTCTTTGTCTTTG
ATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATGGAAACTTAGATCAGTG

QA 6 725 6 725
DS 

RD RR4C895JQ 605 0 0
G
CATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATATTACAGCCA
TGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAGGACACTATC
AGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACCTACAACCGA
CGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTCCGTTCTTACTT
CGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTCATCAGAGCT
CGAGTTTATATCGCAGATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAATAGATATCAT
TCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGCCTTGATTTG
TTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATGCCGGTTCTTG
AACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTCCGTCTTTGT
CTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATGGAAACTTAGAT
CAGT

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR4C895TF 605 0 0
G
CATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATATTACAGCCA
TGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAGGACACTATC
AGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACCTACAACCGA
CGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTCCGTTCTTACTT
CGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTCATCAGAGCT
CGAGTTTATATCGCAGATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAATAGATATCAT
TCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGCCTTGATTTG
TTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATGCCGGTTCTTG
AACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTCCGTCTTTGT
CTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATGGAAACTTAGAT
CAGT

QA 2 605 2 605
DS 



AS 1 3

CO CL1953Contig1 1263 3 7 U
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GCTAATGGCGATTCATGTAACCCAATCCAAGAAAATGTTTCCGTGCTGCCTCCCTTAGAT
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TAT


BQ
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10 10 

AF RR4AC04TF U 1
AF RR4GT67TF U 696
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CGGTTT
TGTTTG

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QA 1 889 1 889
DS 



AS 2 5

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ATGGTATCTGGTTTGTTGTACTTTTGACATCGGATCCAAAACTCAACTTTTTATTGCAAT
GAAAAATTTATGCTTTAAACGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RR4D574TF U 1
AF RR4D574JQ C 56
BS 1 651 RR4D574TF
BS 652 684 RR4D574JQ

RD RR4D574TF 651 0 0
TTTTTGCCACTAGAAGGTGGTCCAGCTCGAAAAGCTCCAGCGACCAAACCTATCGAGAAC
AAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGGCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATTGAA
GCTTTCTTCACACAGTTTGGAACAGTAGAGAGTCAGAGTCGCACGAAACAAAAAGACTGG
GAAATCAAAACATTTTGGATTCATTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAGATTGCAGC
AGGTGCAATGAATGACTATCTGTTGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATTCCACC
AGAGGATGTTAAACCAAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTTGATTG
GGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAACGGACATTGGAAGAACATAGGAAAAT
GTTGAATAAGGTTGTGAAACGTGATCAGAAAAGGAGAATCGAAGCTGCTGGAATAGAATA
TCAATGCCCCGAGCTTGTTGGAAATACCCAGCCATTACCTAAGAAGATTAAGTTTAGTGA
AGACTAGTTTTACCCAAAGCTTTCTAAAAACACACATTTTGGATAAGCTTTTGTTTTTGT
ATGGTATCTGGTTTGTTGTACTTTTGACATCGGATCCAAAACTCAACTTTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4D574JQ 629 0 0
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TTGAAGCTTTCTTCACACAGTTTGGAACAGTAGAGAGTCAGAGTCGCACGAAACAAAAAG
ACTGGGAAATCAAAACATTTTGGATTCATTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAGATT
GCAGCAGGTGCAATGAATGACTATCTGTTGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATT
CCACCAGAGGATGTTAAACCAAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTT
GATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAACGGACATTGGAAGAACATAGG
AAAATGTTGAATAAGGTTGTGAAACGTGATCAGAAAAGGAGAATCGAAGCTGCTGGAATA
GAATATCAATGCCCCGAGCTTGTTGGAAATACCCAGCCATTACCTAAGAAGATTAAGTTT
AGTGAAGACTAGTTTTACCCAAAGCTTTCTAAAAACACACATTTTGGATAAGCTTTTGTT
TTTGTATGGTATCTGGTTTGTTGTACTTTTGACATCGGATCCAAAACTCAACTTTTTATT
GCAATGAAAAATTTATGCTTTAAACGACC

QA 1 629 1 629
DS 



CO CL1954Contig2 730 3 3 U
TTTTTATAAAACCCTACCTTTGAAAATCTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCCGCCGACGACA
GTAAAAATGGGTGCTAAGGCAAAAAAAGCCCTGAAGAAGAACATGAAGAAGATCTCTGCT
TCCGCTGCTGCTACTTCCTCATCTCAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCATCAGCC
GACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAGCTTGAAAAGCTCCAGTGACCAAATCTATCGAG
AACAAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATT
AAAGCTTTCTTCACGCAGTTTGGAACAGTAAATAGAGTCAGAGTCGCGCGAAACAAAAAG
ACTGGGAA*TCAAAACATTTTGGATTCATTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCAGAGATT
GCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTGTTACTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATT
CCACCAGAGGATGTTAAACCAAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTT
GATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAAAGGACATTGGAAGAACATAGG
AAAATGCTGAACAAGTTGTAAAACGTGATCAGAAAAGAGAAAGAGAATCGAAGCTGCTGG
AATAGAATATCAATGCCCCGAGCTTGTTGGAAATACCCAGCCATTACCTAAGAAGATCAA
GTTTAGTGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV16TF U 1
AF RR4DW71TF U 1
AF RR4F180TF U 1
BS 1 570 RR4DV16TF
BS 571 633 RR4DW71TF
BS 634 730 RR4F180TF

RD RR4DV16TF 570 0 0
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TCCGCTGCTGCTACTTCCTCATCTCAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCATCAGCC
GACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAGCTTGAAAAGCTCCAGTGACCAAATCTATCGAG
AACAAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATT
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QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4DW71TF 633 0 0
TTTTTATAAAACCCTACCTTTGAAAATCTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCCGCCGACGACA
GTAAAAATGGGTGCTAAGGCAAAAAAAGCCCTGAAGAAGAACATGAAGAAGATCTCTGCT
TCCGCTGCTGCTACTTCCTCATCTCAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCATCAGCC
GACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAGCTTGAAAAGCTCCAGTGACCAAATCTATCGAG
AACAAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATT
AAAGCTTTCTTCACGCAGTTTGGAACAGTAAATAGAGTCAGAGTCGCGCGAAACAAAAAG
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GCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTGTTACTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATT
CCACCAGAGGATGTTAAACCAAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTT
GATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAAAGGACATTGGAAGAACATAGG
AAAATGCTGAACAAGTTGTAAAACGTGATCAGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4F180TF 730 0 0
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TCCGCTGCTGCTACTTCCTCATCTCAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCATCAGCC
GACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAGCTCGAAAAGCTCCAGTGACCAAATCTATCGAG
AACAAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATT
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CCACCAGAGGATGTTAAACCAAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTT
GATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAAAGGACATTGGAAGAACATAGG
AAAATGCTGAACA*GTTGTAAAACGTGATCAGAAAAGAGAAAGAGAATCGAAGCTGCTGG
AATAGAATATCAATGCCCCGAGCTTGTTGGAAATACCCAGCCATTACCTAAGAAGATCAA
GTTTAGTGAA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL1955Contig1 885 3 6 U
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CTTCAGCAACAGCCGTCAACAACAGCCCCACCACAGATCCGCGTCTCCTACACGCGTGAA
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ATCCCCGAACCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAATAAGATCGCCGATTC
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AGGGGAGTGGGTGAGAAGAGCTTTGACGACGCTGATAAGGCCTTCGTCTCATCAGCTCAA
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AGGTGTTTGATTTGGTTTTTTTTCAGGTTTGTTCTTGTGTCTGAATCAGCCAACAGAAAA
ATCTCTATTTCCGGATAGATCCGGCAGAAGAAGTCCGGATCCGAAGCGAGCTGGATCTGC
GCGGACGGGTCGAGTCAAATTGGACCGAATTATGTAAACCGGAGATTGAAAACGACACTG
TCTTAAAAAGACTTTGTTATGTTGGATGAAGATGAGATTGTACCTAGGACTCATATGATG
ATTTCGAAGCAGATAATGTTTCCCTAAGCAGAAAATATCTTAGAACAAATATAAAAAAAA
AATCGAACAGCAGTGTTGAATTGCGTAATTAAAACTGGATATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ90TF U 1
AF RR4DJ90JQ C 77
AF RR4AA58TF U 269
BS 1 711 RR4DJ90TF
BS 712 712 RR4AA58TF
BS 713 728 RR4DJ90TF
BS 729 729 RR4AA58TF
BS 730 778 RR4DJ90TF
BS 779 885 RR4AA58TF

RD RR4DJ90TF 778 0 0
GTCTCCTTCCTCATCAGGCTTCGCTTCCTCCACAAGCTCCAGCTTCTCCTCCACATCCTT
CTTCAGCAACAGCCGTCAACAACAGCCCCACCACAGATCCGCGTCTCCTACACGCGTGAA
CCTCTTCTCATCAACGCCGTTAAACCAGTCGTTCCGTTACTCCATCGACAACAGATCCGT
ATCCCCGAACCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAATAAGATCGCCGATTC
TAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGACGACTCACCCCGGATCTTTCCGGTGCGGTCT
CCACAAGAACGTGGCGAATCCTCACGGCCAGGGCGCTGCGACGGCGTATTCGTCGAATAA
CGGATTGAACATGCGGAGGTCGGCGATGACGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGGGTTGA
AGGGGAGTGGGTGAGAAGAGCTTTGACGACGCTGATAAGGCCTTCGTCTCATCAGCTCAA
GAGGCGATCCGCTTATCAGCCCAGGCCTAGCAGGCTATCGTCTATGTCCAAAGCGGAAGA
AGGTGTTTGATTTGGTTTTTTTTCAGGTTTGTTCTTGTGTCTGAATCAGCCAACAGAAAA
ATCTCTATTTCCGGATAGATCCGGCAGAAGAAGTCCGGATCCGAAGCGAGCTGGATCTGC
GCGGACGGGTCGAGTCAAATTGGACCGAATTATGTAAACCGGAGATTGAAA*CGACACTG
TCTTAAAA*GACTTTGTTATGTTGGATGAAGATGAGATTGTACCTAGGACTCATATGA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4DJ90JQ 729 0 0
CAACAACAGCCCCACCACAGATCCGCGTCTCCTACACGCGTGAACCTCTTCTCATCAACG
CCGTTAAACCAGTCGTTCCGTTACTCCATCGACAACAGATCCGTATCCCCGAACCAATCC
GTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAATAAGATCGCCGATTCTAGGAGGAGGACGTGT
ATGTGTTCGCCGACGACTCACCCCGGATCTTTCCGGTGCGGTCTCCACAAGAACGTGGCG
AATCCTCACGGCCAGGGCGCTGCGACGGCGTATTCGTCGAATAACGGATTGAACATGCGG
AGGTCGGCGATGACGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGGGTTGAAGGGGAGTGGGTGAGA
AGAGCTTTGACGACGCTGATAAGGCCTTCGTCTCATCAGCTCAAGAGGCGATCCGCTTAT
CAGCCCAGGCCTAGCAGGCTATCGTCTATGTCCAAAGCGGAAGAAGGTGTTTGATTTGGT
TTTTTTTCAGGTTTGTTCTTGTGTCTGAATCAGCCAACAGAAAAATCTCTATTTCCGGAT
AGATCCGGCAGAAGAAGTCCGGATCCGAAGCGAGCTGGATCTGCGCGGACGGGTCGAGTC
AAATTGGACCGAATTATGTAAACCGGAGATTGAAAACGACACTGTCTTAAAAAGACTTTG
TTATGTTGGATGAAGATGAGATTGTACCTAGGACTCATATGATGATTTCGAAGCAGATAA
TGTTTCCCT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4AA58TF 617 0 0
G
CGACTCACCCCGGATCGTTCCGGTGCGGTCTCCACAAGAACGTGGCGAATCCTCACGGCC
AGGGCGCTGCGACGGCGTATTCGTCGAATAACGGATTGAACATGCGGAGGTCGGCGATGA
CGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGGGTTGAAGGGGAGTGGGTGAGAAGAGCTTTGACGA
CGCTGATAAGGCCTTCGTCTCATCAGCTCAAGAGGCGATCCGCTTATCAGCCCAGGCCTA
GCAGGCTATCGTCTATGTCCAAAGCGGAAGAAGGTGTTTGATTTGGTTTTTTTTCAGGTT
TGTTCTTGTGTCTGAATCAGCCAACAGAAAAATCTCTATTTCCGGATAGATCCGGCAGAA
GAAGTCCGGATCCGAAGCGAGCTGGATCTGCGCGGACGGGTCGAGTCAAATTGGACCGAA
TTATGTAAACCGGAGATTGAAAACGACACCGTCTTAAAAAGACTTTGTTATGTTGGATGA
AGATGAGATTGTACCTAGGACTCATATGATGATTTCGAAGCAGATAATGTTTCCCTAAGC
AGAAAATATCTTAGAACAAATATAAAAAAAAAATCGAACAGCAGTGTTGAATTGCGTAAT
TAAAACTGGATATGAT

QA 2 617 2 617
DS 



AS 1 5

CO CL1956Contig1 899 5 13 U
CGCACTAAAAACTTCATTAACATTGCAAGAACATTGCAATAACTTATACAGGGGTGGGAT
ACATTTTTGGGATACTTCAAGCCAGCAGGTACAACACAACACCTCTGGAGACAAAAGCTA
GCGGAACAAAGAACAACCATTCTCTAGAGACTAAGCAAAACAGACTATAGAGACATAATC
CTACTGGCTACTAAGAGAACAACAAGCAACAGAGATAAGATCACAAAACAAAATAAGATA
CCCTATCAGTGATTTCTTCAAGAACATGGAGAGTTGAAGAGAAGCATAGCAACTGAAGCC
GAATTATTGAAGATGGCCACCGACATGAACTCCTTCTATTGCTCTGGAGCATGCCACGAG
CCACGAGTTCGAACGCAATGAACCATCCAAGGGAGACGAAGAAACAACTTTACCATTCGA
CCACCCACGGCGAGAAGCGAGAAGGAGCGAAAGCCCCCTTTTCCTTTGGAATGAGCCGGA
GACTCCGTAACCACATGGAAACTAGCAAGAGCTAACCCAGGGATCTTCAACCAAGGTGAA
GGAGCCCTTTCTACGCTGATGATGGAGACACTAAAACCTGAGACCACACGATCCAGAAAC
CACCACGGCAAGGCCAAGATAGAAGAGATCCGCGACCACTGAAAATCTGTTCATCAATTT
GGATCTGAAACCCTAGATCTACCTCTGTTTTTTGAAGTAATCAAGCCAAAAACCACAAAT
ATACACAAAATACAGAAAAATTAAAGATTTAAGACAAGGCCGGACCGATGCCGTGGCTGG
AAGAGCCAACGTCATCGGCCGGAATCTGAATCAGTCGGAGTTTAGACTAGAGAGAAGAGG
GAGCTTTTGGAAGAGAGAGAAAAGGAGGGCGACAAGCTTTTGGAAGAGGGAGCTTTTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4BS28JQ U 70
AF RR4E093JQ U 2
AF RR4EI95JQ U 1
AF RR4E093TF C 145
AF RR4EI95TF C 395
BS 1 152 RR4EI95JQ
BS 153 153 RR4BS28JQ
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BS 728 783 RR4E093TF
BS 784 784 RR4EI95TF
BS 785 894 RR4E093TF
BS 895 899 RR4EI95TF

RD RR4BS28JQ 389 0 0
GGATACTTCAAGCCAGCAGGTA*AACACAACACCTCTGGAGACAAAAGCTAGCGGAACAA
AGAACAACCATTCTCTAGAGACTAAACAAAACAGACTATAGAGACATAATCCTACTGGCT
ACTAAGAGAACAACAAGCAACAGAGATAAGATCACAAAACAAAATAAGATACCCTATCAG
TGATTTCTTCAAGAACATGGAGAGTTGAAGAGAAGCATAGCAACTGAAGCCGAATTATTG
AAGATGGCCACCGACATGAACTCCTTCTATTGCTCTGGAGCATACCACGAGCCACGAGTT
CGAACGCAATGAACCATCCAAGGGAGACGAAAAAACAACTTTACCATTCGACCACCCACG
GCGAGAAGCGAGAAGGAGCGAAAGCCCCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4E093JQ 711 0 0
A
CACTAAAAACTTCATTAACATTGCGAGAACATTGCAATAACTTATACAGGGGTGGGATAC
ATTTTTGGGATACTTCAAGCCAGCAGGTACAACACAACACCTCTGGAGACAAAAGCTAGC
GGAACAAAGAACAACCATTCTCTAGAGACTAAGCAAAACAGACTATAGAGACATAATCCT
ACTGGCTACTAAGAGAACAACAAGCAACAGAGATAAGATCACAAAACAAAATAAGATACC
CTATCAGTGATTTCTTCAAGAACATGGAGAGTTGAAGAGAAGCATAGCAACTGAAGCCGA
ATTATTGAAGATGGCCACCGACATGAACTCCTTCTATTGCTCTGGAGCATGCCACGAGCC
ACGAGTTCGAACGCAATGAACCATCCAAGGGAGACGAAGAAACAACTTTACCATTCGACC
ACCCACGGCGAGAAGCGAGAAGGAGCGAAAGCCCCCTTTTCCTTTGGAATGAGCCGGAGA
CTCCGTAACCACATGGAAACTAGCAAGAGCTAACCCAGGGATCTTCAACCAAGGTGAAGG
AGCCCTTTCTACGCTGATGATGGAGACACTAAAACCTGAGACCACACGATCCAGAAACCA
CCACGGCAAGGCCAAGATAGAAGAGATCCGCGACCACTGAAAATCTGTTCATCAATTTGG
ATCTGAAACCCTAGATCTACCTCTGTTTTTTGAAGTAATCAAGCCAAAAA

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR4EI95JQ 727 0 0
CGCACTAAAAACTTCATTAACATTGCAAGAACATTGCAATAACTTATACAGGGGTGGGAT
ACATTTTTGGGATACTTCAAGCCAGCAGGTACAACACAACACCTCTGGAGACAAAAGCTA
GCGGAACAAAGAACAACCATTCTCTAGAGACTGAACAAAACAGACTATAGAGACATAATC
CTACTGGCTACTAAGAGAACAACAAGCAACAGAGATAAGATCACAAAACAAAATAAGATA
CCCTATCAGTGATTTCTTCAAGAACATGGAGAGTTGAAGAGAAGCATAGCAACTGAAGCC
GAATTATTGAAGATGGCCACCGACATGAACTCCTTCTATTGCTCTGGAGCATACCACGAG
CCACGAGTTCGAACGCAATGAACCATCCAAGGGAGACGAAGAAACAACTTTACCATTCGA
CCACCCACGGCGAGAAGCGAGAAGGAGCGAAAGCCCCCTTTTCCTTTGGAATGAGCCGGA
GACTCCGTAACCACATGGAAACTAGCAAGAGCTAACCCAGGGATCTTCAACCAAGGTGAA
GGAGCCCTTTCTACGCTGATGATGGAGACACTAAAACCTGAGACCACACGATCCAGAAAC
CACCACGGCAAGGCCAAGATAGAAGAGATCCGCGACCACTGAAAATCTGTTCATCAATTT
GGATCTGAAACCCTAGATCTACCTCTGTTTTT*GAAGTAATCAAGCCAAAAACCACAAAT
ATACACA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4E093TF 752 0 0
TAGAGACTAAGCAAAACAGACTATAGAGACATAATC*TACTGGCTACTAAGAGAACAACA
AGCAACAGAGATAAGATCACAAAACAAAATAAGATACCCTATCAGTGATTTCTTCAAGAA
CATGGAGAGTTGAAGAGAAGCATAGCAACTGAAGCCGAATTATTGAAGATGGCCACCGAC
ATGAACTCCTTCTATTGCTCTGGAGCATGCCACGAGCCACGAGTTCGAACGCAATGAACC
ATCCAAGGGAGACGAAGAAACAACTTTACCATTCGACCACCCACGGCGAGAAGCGAGAAG
GAGCGAAAGCCCCCTTTTCCTTTGGAATGAGCCGGAGACTCCGTAACCACATGGAAACTA
GCAAGAGCTAACCCAGGGATCTTCAACCAAGGTGAAGGAGCCCTTTCTACGCTGATGATG
GAGACACTAAAACCTGAGACCACACGATCCAGAAACCACCACGGCAAGGCCAAGATAGAA
GAGATCCGCGACCACTGAAAATCTGTTCATCAATTTGGATCTGAAACCCTAGATCTACCT
CTGTTTTTTGAAGTAATCAAGCCAAAAACCACAAATCTACACAAAATACAGAAAAATTAA
AGATTTAAGACAAGGCCGGACCGATGCCGTGGCTGGAAGGGCCAACGTCATCGGCCGGAA
TCTGAATCAGTCGGAGTTTAGACTAGAGAGAAGAGGGAGCTTTTGGAAGAGAGAGAAAAG
GAGGGCGACAAGCTTTTGGAAGAGGGAGCT
CC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4EI95TF 505 0 0
GACGAAGAAACAACTTTACCATTCGACCACCCACGGCGAGAAGCGAGAAGGAGCGAAAGC
CCCCTTTTCCTTTGGAATGAGCCGGAGACTCCGTAACCACATGGAAACTAGCAAGAGCTA
ACCCAGGGATCTTCAACCAAGGTGAAGGAGCCCTTTCTACGCTGATGATGGAGACACTAA
AACCTGAGACCACACGATCCAGAAACCACCACGGCAAGGCCAAGATAGAAGAGATCCGCG
ACCACTGAAAATCTGTTCATCAATTTGGATCTGAAACCCTAGATCTACCTCTGTTTTT*G
AAGTAATCAAGCCAAAAACCACAAATATACACAAAATACAGAAAAATTAAAGATTTAAGA
CAAGGCCGGACCGATGCCGTGGCTGGAAGAGCCAACGTCATCGGCCGGAATCTGAATCAG
TCGGAGTTTAGACTAGAGAGAAGAGGGAGCTTTTGGAAGAGAGAGAAAAGGAGGGCGACA
AGCTTTTGGAAGAGGGAGCTTTTCC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 3

CO CL1957Contig1 660 3 2 U
GTGGCTTTCGACCGTGATTTGATTGGACCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGT
CAGCCTATTGGTCGCTACGACGATATGTGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGAC
CATTTGGGGTTGGGAGTGAAGACTGGTTTGCCATACATATACCACAGCAAAGCTAGCAAC
CCGTTTGTGAACCTGAAGAAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCT
TTCTTCCAGAACGTGAAGCTATCTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACCTTGAG
CTCTCAAAGATGGTCAAGGAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCGTACTTTGACAAGCTTGCA
GATGCCATGGTCACATGGATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGA
GCAAACCAAAAGAAGACCATCGCAGTTTTGGTTATTTTTAGCTCAAATTATCTTTTCTAT
ATTATGGATTTTATGGAAGTCGCTTTTGTTTAG***TAACTTATCATCACTTTCTCATCA
TCCACCTGTTTATTTATAAACAGTGGTGGATTTGTAGTGTTATTGATGTTTTGTTTTTTT
TGCTATTCCTCCCAGCTTTTTTTCCTTCTTTGTTTCATTAATCAATAAAAAGCATTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW01TF U 1
AF RR4FD64TF U 119
AF RR4GW01JQ C 79
BS 1 631 RR4GW01TF
BS 632 660 RR4GW01JQ

RD RR4GW01TF 631 0 0
GTGGCTTTCGACCGTGATTTGATTGGACCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGT
CAGCCTATTGGTCGCTACGACGATATGTGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGAC
CATTTGGGGTTGGGAGTGAAGACTGGTTTGCCATACATATACCACAGCAAAGCTAGCAAC
CCGTTTGTGAACCTGAAGAAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCT
TTCTTCCAGAACGTGAAGCTATCTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACCTTGAG
CTCTCAAAGATGGTCAAGGAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCGTACTTTGACAAGCTTGCA
GATGCCATGGTCACATGGATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGA
GCAAACCAAAAGAAGACCATCGCAGTTTTGGTTATTTTTAGCTCAAATTATCTTTTCTAT
ATTATGGATTTTATGGAAGTCGCTTTTGTTTAG***TAACTTATCATCACTTTCTCATCA
TCCACCTGTTTATTTATAAACAGTGGTGGATTTGTAGTGTTATTGATGTTTTGTTTTTTT
TGCTATTCCTCCCAGCTTTTTTTCCTTCTTT

QA 1 631 1 631
DS 

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GCCAT
TTGGGGTTGGGAGTGAAGACTGGTTTGCCATACATATACCACAGCAAAGCTAGCAACCCG
TTTGTGAACCTGAAGAAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTC
TTCCAGAACGTGAAGCTATCTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACCTTGAGCTC
TCAAAGATGGTCAAGGAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCGTACTTTGACAAGCTTGCAGAT
GCCATGGTCACATGGATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCA
AACCAAAAAAAGACCATCGCAGTTTTGGTTATTTTTAGCTCAAATTATCTTTTCTATATT
ATGGATTTTATGAAAGTCGCTTTTGTTTAGTTGTTACTTATCATCACTTTCTCATCATCC
ACCTGTTTATTTATAAACAGTGGTGGATTTGTAGTGTTATTGATGTTTTGTTTTTTTTGC
TATTCCTCCCAGCTTTTTT

QA 6 504 6 504
DS 

RD RR4GW01JQ 582 0 0
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AAGACTGGTTTGCCATACATATACCACAGCAAAGCTAGCAACCCGTTTGTGAACCTGAAG
AAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTTTTCCAGAACGTGAAG
CTATTTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACCTTGAGCTTTCAAAGATGGTCAAG
GAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCGTACTTTGACAAGCTTGCAGATGCCATGGTCACATGG
ATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCAAACCAAAAGAAGACC
ATCGCAGTTTTGGTTATTTTTAGCTCAAATTATCTTTTCTATATTATGGATTTTATGGAA
GTCGCTTTTGTTTAG***TAACTTATCATCACTTTCTCATCATCCACCTGTTTATTTATA
AACAGTGGTGGATTTGTAGTGTTATTGATGTTTTGTTTTTTTTGCTATTCCTCCCAGCTT
TTTTTCCTTCTTTGTTTCATTAATCAATAAAAAGCATTTCGC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 5

CO CL1958Contig1 1015 5 16 U
GGACACACTTGAGTACATTATCATAAAGAAGGATAATAGGGGAACAGTGAAAAAAAGATT
AGCCACAATGTATCTTCCTCTTCTCTGTCTTCTCCTTCTAGCTTCTAGCTTGTCACATCA
AGCTTTTGGCCGTGGTCGTGGCCATTCACCACCGGGAGGAAGCTCGGACCCTTCTTCTCG
CATCACAGTCGTCGGAGTAGTCTACTGTGACACTTGTTCAATCAACACTTTCTCAAGACA
GAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGAAGTTCATGTGAGCTGTAGATTCAAAGCGAGTTCACC
GAAAACAACTGAGGAAGTGAACATATCGGTGAACAGAACAACAAACAGAAACGGCGTTTA
CAAGCTCGACATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTCGACGGAATCGCCATAGCCTC
TCAGTGCAGCGCCAAGCTGCTCAAACCTTCCTCCGACAACAACAACGTCGGCTGCAACAT
CCCCGTTTTTCAGACAGCAGCAAACGAAGTATCTATCAAGTCGAAGCAGGATCGTGTCTG
TATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCTTCCCACAGAAACACCACACTTTGCAG
CGGCGGAAAGAGACATCACCACCAGCGAGAGGAGAAGGTGGAGAATAAGTTGAGAGATTC
GAAGCTCTTCTGGCCTTATATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTCAACTCTGCC
GCCGTTGCCTACTCTGCCTCCGCTTCCGTCTTTCCCTTTTCCTTTTCTTCCCTTAGGAAA
CCCTAACGCATCATTGCCTGCGTTTGACTGGAGAGATCCTACAACATGGATACCTTATCT
CCCACGCTTTCCTCCAAGTGATAACAATCCTTAGGGCTCAGATTCTCTTCCCTTTTACCT
TCATATCTTCTCTGTTTCCTCTGTTTTTTTTGTGTGTGTTTTTTATGTGTGATTGATTTA
CTTATTAATGTGTAATTAATTATTGTTCAGATAAACAAAATAAGGATTTGGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL36TF U 54
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AF RR4DH88TF U 59
AF RR4AE20JQ C 232
AF RR4EL36JQ C 346
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RD RR4EL36TF 566 0 0
GGGGATT
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AGCTTTTGGCCGTGGTCGTGGCCATTCACCACCGGGAG*AAGCTCGGACCCTTCTTCTCG
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GAAAACAACAGAGGAAGTGAACATATCGGTGAACAGAACAACAAACAGAAACAGCGTTTA
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TCAGTGCAGCGCCAAGCTGCTCAAACCTTCCTCCGACAACAACAACGTCGGCTGCAACAT
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CGGCGGAAAGAGACATCAC

QA 8 566 8 566
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AGCTTTTGGCCGTGGTCGTGGCCATTCACCACCGGGAGGAAGCTCGGACCCTTCTTCTCG
CATCACAGTCGTCGGAGTAGTCTACTGTGACACTTGTTCAATCAACACCTTCTCAAGACA
GAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGAAGTTCATGTGAGCTGTAGATTCAAAGCGAGTTCACC
GAAAACAACTGAGGAAGTGAACATATCGGTGAACAGAACAACAAACAGAAACGGCGTTTA
CAAGCTCGACATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTCGACGGAATCGCCATAGCCTC
TCAGTGCAGCGCCAAGCTGCTCAAACCTTCCTCCGACAACAACAACGTCGGCTGCAACAT
CCCCGTTTTTCAGACAGCAGCAAACGAAGTATCTATCAAGTCGAAGCAGGATCGTGTCTG
TATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCTTCCCACAGAAACACCACACTTTGCAG
CGGCGGAAAGAGACATCACCACCAGCGAGAGGAGAAGGTGGAGAATAAGTTGAGAGGTTC
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GCCGTTGCCTACTCTGCCTCCGCTTCCGTCTTTCCCTTTTCCTTTTCTTCC
CTTA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4DH88TF 770 0 0
GG
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AGCTTTTGGCCGTGGTCGTGGCCATTCACCACCGGGAGGAAGCTCGGACCCTTCTTCTCG
CATCACAGTCGTCGGAGTAGTCTACTGTGACACTTGTTCAATCAACACTTTCTCAAGACA
GAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGAAGTTCATGTGAGCTGTAGATTCAAAGCGAGTTCACC
GAAAACAACAGAGGAAGTGAACATATCGGTGAACAGAACAACAAACAGAAACGGCGTTTA
CAAGCTCGACATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTCGACTGAATCGCCATAGCATC
TCAGTGCAGCGCCAAGTTGCTCAAACCTTCCTCCGACAACAACAACGTCGGCTGCAACAT
CCCCGTTTTTCAGACAGCAGCCAACGAAGTATCTATCAAGTCGAAGCAGGATCGTGTCTG
TATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCTCCTCACAGAAACACCACACTTTGCAG
CGGCGGAAAGAGATATCACCACCAGCGAGAGGAGAAGGTGGAGGATAAGTTGAGAGATTC
GAAGCTCTTCTGGCCTTATATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTCAACTCTGCC
GCCGTTGCCTACTCTGCCTCCGTTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTTCTTCCTTTAG*AAA
CCCTAATGCATCATTGCCTGCGTTTGATTGGAGAGATCCGACAACATG

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR4AE20JQ 784 0 0
CTCAAGACAGAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGAAGTTCATGTGAGCTGTAGATTCAAAGC
GAGTTCACCGAAAACAACTGAGGAAGTGAACATATCGGTGAACAGAACAACAAACAGAAA
CGGCGTTTACAAGCTCGACATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTCGACGGAATCGC
CATAGCCTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTGCTCAAACCTTCCTCCGACAACAACAACGTCGG
CTGCAACATCCCCGTTTTTCAGACAGCAGCAAACGAAGTATCTATCAAGTCGAAGCAGGA
TCGTGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCTTCCCACAGAAACACCAC
ACTTTGCAGCGGCGGAAAGAGACATCACCACCAGCGAGAGGAGAAGGTGGAGAATAAGTT
GAGAGGTTCGAAGCTCTTCTGGCCTTATATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTC
AACTCTGCCGCCGTTGCCTACTCTGCCTCCGCTTCCGTCTTTCCCTTTTCCTTTTCTTCC
CTTAGGAAACCCTAACGCATCATTGCCTGCGTTTGACTGGAGAGATCCTACAACATGGAT
ACCTTATCTCCCACGCTTTCCTCCAAGTGATAACAATCCTTAGGGCTCAGATTCTCTTCC
CTTTTACCTTCATATCTTCTCTGTTTCCTCTGTTTTTTTTGTGTGTGTTTTTTATGTGTG
ATTGATTTACTTATTAATGTGTAATTAATTATTGTTCAGATAAACAAAATAAGGATTTGG
TTTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4EL36JQ 647 0 0
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AATCGCCATAGCCTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTGCTCAAACCTTCCTCCGACAACAACAA
CGTCGGCTGCAACATCCCCGTTTTTCAGACAGCAGCAAACGAAGTATCTATCAAGTCGAA
GCAGGATCGTGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTTCAAACCTTCCCACAGAAA
CACCACACTTTGCAGCGGCGGAAAGAGACATCACCACCAGCGAGAGGAGAAGGTGGAGAA
TAAGTTGAGAGATTCGAAGCTCTTCTGGCCTTATATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCC
GTACTCAACTCTGCCGCCGTTGCCTACTCTGCCTCCGCTTCCGTCTTTCCCTTTTCCTTT
TCTTCCCTTAGGAAACCCTAACGCATCATTGCCTGCGTTTGACTGGAGAGATCCTACAAC
ATGGATACCTTATCTCCCACGCTTTCCTCCAAGTGATAACAATCCTTAGGGCTCAGATTC
TCTTCCCTTTTACCTTCATATCTTCTCTGTTTCCTCTGTTTTTTTTGTGTGTGTTTTTTA
TGTGTGATTGATTTACTTATTAATGTGTAATTAATTATTGTTC
TGAT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 5

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GTTGGCGGAATGTCGAGTTACCAAATCAAGTTTGGAGCTTCAGCTACTACAATTCGCAAA
TGATATAAGTTCCGAAGCTCATGTAGAGGTTATGAGGAGAGTCACACCTGGCATGAAAGA
ATATCAGATGGAAAGTATGTTTTTGCACCACACCTACATGTACGGCGGCTGTAGGCACTG
CTCGTACACATGCGTCTGCGCGACAGGGGATAATAGTGCTGTTCTTCATTATGGGCACGC
TGCAGCTCCAAATGATAGGACTTTCGAAGATGGAGATCTGGCATTACTTGATATGGGTGG
TGAATACCATTTTTATGCATCTGACATAACATGCTCATTCCCCGTCAATGGTAAATTTAC
AAGTGACCAGAGTCTAATCTACAATGCTGTTCTGAAAGCACATAATTCTGTAATCTCTGC
AATGAAGCCAGGAGTTAACTGGGTGGATATGCACAAGCTAGCCGAAAGAATCATCCTTGA
GTCACTGAAGAAGGGGTCCATCCTCACTGGTGATGTGGACGAGATGATGGTAGAACGTTT
GGGAGCTGTTTTCATGCCTCATGGACTAGGTCACTTCATGGGCATTGACACACACGATAC
CGGTGGTTATCCAATGGGAGTGGAAAGACCAAAGGAACCGGGACTGAAGTCATTACGCAC
TGCAAGAGATCTCCTTGAAGGAATGGTAATAACGGTGGAGCCAGGATGCTATTTCATCAA
GGCATTGCTAGTCCCAGCCATGGAAAACGCAAAAACCTCCAAGTTCTTCAACCGTGAAAC
AATAGAGAGATTCAAGAACATAGGAGGTGTCAGAATCGAAAGCGATTTGGTCGTTACTGC
GAATGGCTGCAAGAACATGACGAATGTTCCAAGGGAGACGTGGGAGATCGAAGCTGTGAT
GGCTGGAGCGCCTTGGCCTCCCGCCACTACAGGAAACAATACTACCAAGTGATCTTAACT
TACGGAAACTAAAAGAACTGCTTTAGAAACTCAATAATAAAACCCCCTTTATATAATGGG
GAATAAGAATCTGAGAACTATTGGCTACATTTGTTCATCTATCTTAGTATGTTCTACTTT
GTTTCTGTTTCCGTGTGTTTGGTCAACTTCTCTCGCTAGTTGAAGAGAAGATACGCTTAT
TTGAATATTCAGTGAAGCGAACCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F361TF U 1
AF RR4CY64TF U 456
AF RR4CA80JQ C 542
AF RR4CA80TF U 542
AF RR4F361JQ C 672
BS 1 611 RR4F361TF
BS 612 612 RR4CY64TF
BS 613 682 RR4F361TF
BS 683 683 RR4CY64TF
BS 684 719 RR4F361TF
BS 720 720 RR4CY64TF
BS 721 739 RR4F361TF
BS 740 745 RR4CY64TF
BS 746 746 RR4CA80TF
BS 747 1079 RR4CY64TF
BS 1080 1166 RR4F361JQ

RD RR4F361TF 739 0 0
GTTGGCGGAATGTCGAGTTACCAAATCAAGTTTGGAGCTTCAGCTACTACAATTCGCAAA
TGATATAAGTTCCGAAGCTCATGTAGAGGTTATGAGGAGAGTCACACCTGGCATGAAAGA
ATATCAGATGGAAAGTATGTTTTTGCACCACACCTACATGTACGGCGGCTGTAGGCACTG
CTCGTACACATGCGTCTGCGCGACAGGGGATAATAGTGCTGTTCTTCATTATGGGCACGC
TGCAGCTCCAAATGATAGGACTTTCGAAGATGGAGATCTGGCATTACTTGATATGGGTGG
TGAATACCATTTTTATGCATCTGACATAACATGCTCATTCCCCGTCAATGGTAAATTTAC
AAGTGACCAGAGTCTAATCTACAATGCTGTTCTGAAAGCACATAATTCTGTAATCTCTGC
AATGAAGCCAGGAGTTAACTGGGTGGATATGCACAAGCTAGCCGAAAGAATCATCCTTGA
GTCACTGAAGAAGGGGTCCATCCTCACTGGTGATGTGGACGAGATGATGGTAGAACGTTT
GGGAGCTGTTTTCATGCCTCATGGACTAGGTCACTTCATGGGCATTGACACACACGATAC
CGGTGGTTATC*AATGGGAGTGGAAAGACCAAAGGAACCGGGACTGAAGTCATTACGCAC
TGCAAGAGATCTCCTTGAAGGA*TGGTAATAACGGTGGAGCCAGGATGCTATTTCATCA*
GGCATTGCTAGTCCCAGCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4CY64TF 627 0 0
G
GCTAGCCGAAAGAATCATCCTTGAGTCACTGAAGAAGGGGTCCATCCTCGCTGGTGATGT
GGACGAGATGATGGTAGAACGTTTGGGAGCTGTTTTCATGCCTCATGGACTAGGTCACTT
CATGGGCATTGACACACACGATACCGGTGGTTATCCAATGGGAGCGGAAAGACCAAAGGA
ACCGGGACTGAAGTCATTACGCACTGCAAGAGATCTCCTTGAAGGAATGGTAATAACGGT
GGAGCCAGGATGCTATTTCATCAAGGCATTGCTAGTCCCAGCCATGGAAGACGCAAAAAC
CTCCAAGTTCTTCAACCGTGAAACAATAGAGAGATTCAAGAACATAGGAGGTGTCAGAAT
CGAAAGCGATTTGGTCGTTACTGCGAATGGCTGCAAGAACATGACGAATGTTCCAAGGGA
GACGTGGGAGATCGAAGCTGTGATGGCTGGAGCGCCTTGGCCTCCCGCCACTACAGGAAA
CAATACTACCAAGTGATCTTAACTTACGGAAACTAAAAGAACTGCTTTAGAAACTCAATA
ATAAAACCCCCTTTATATAATGGGGAATAAGAATCTGAGAACTATTGGCTACATTTGTTC
ATCTATCTTAGTATGTTCTACTT
TGT

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR4CA80JQ 538 0 0
GGAGCTGTTTTCATGCCTCATGGACTAGGTCACTTCATGGGCATTGACACACACGATACC
GGTGGTTATCCAATGGGAGTGGAAAGACCAAAGGAACCGGGACTGAAGTCATTACGCACT
GCAAGAGATCTCCTTGAAGGAATGGTAATAACGGTGGAGCCAGGATGCTATTTCATCAAG
GCATTGCTAGTCCCAGCCATGGAAAACGCAAAAACCTCCAAGTTCTTCAACCGTGAAACA
ATAGAGAGATTCAAGAACATAGGAGGTGTCAGAATCGAAAGCGATTTGGTCGTTACTGCG
AATGGCTGCAAGAACATGACGAATGTTCCAAGGGAGACGTGGGAGATCGAAGCTGTGATG
GCTGGAGCGCCTTGGCCTCCCGCCACTACAGGAAACAATACTACCAAGTGATCTTAACTT
ACGGAAACTAAAAGAACTGCTTTAGAAACTCAATAATAAAACCCCCTTTATATAATGGGG
AATAAGAATCTTATAACTATTGGCTACATTTGTTCATCTATCTTAGTATGTTCTACTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4CA80TF 538 0 0
GGAGCTGTTTTCATGCCTCATGGACTAGGTCACTTCATGGGCATTGACACACACGATACC
GGTGGTTATCCAATGGGAGTGGAAAGACCAAAGGAACCGGGACTGAAGTCATTACGCACT
GCAAGAGATCTCCTTGAAGGAATGGTAATAACGGTGGAGCCAGGATGCTATTTCATCAAG
GCATTGCTAGTCCCAGCCATGGAAAACGCAAAAACCTCCAAGTTCTTCAACCGTGAAACA
ATAGAGAGATTCAAGAACATAGGAGGTGTCAGAATCGAAAGCGATTTGGTCGTTACTGCG
AATGGCTGCAAGAACATGACGAATGTTCCAAGGGAGACGTGGGAGATCGAAGCTGTGATG
GCTGGAGCGCCTTGGCCTCCCGCCACTACAGGAAACAATACTACCAAGTGATCTTAACTT
ACGGAAACTAAAAGAACTGCTTTAGAAACTCAATAATAAAACCCCCTTTATATAATGGGG
AATAAGAATCTTATAACTATTGGCTACATTTGTTCATCTATCTTAGTATGTTCTACTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4F361JQ 495 0 0
TCCTTGAAGGAATGGTAATAACGGTGGAGCCAGGATGCTATTTCATCAAGGCATTGCTAG
TCCCAGCCATGGAAAACGCAAAAACCTCCAAGTTCTTCAACCGTGAAACAATAGAGAGAT
TCAAGAACATAGGAGGTGTCCGAATCGAAAGCGATTTGGTCGTTACTGCGAATGGCTGCA
AGAACATGACGAATGTTCCAAGGGATACGTGGGAGATCGAAGCTGTGATGGCTGGAGCGC
CTTGGCCTCCCGCCACTACAGGAAACAATACTACCAAGTGATCTTAACTTACGGAAACCA
AAAGAACTGCTTTAGAAACTCAATAATAAAACCCCCTTTATATAATGGGGAATAAGAATT
TGAGAACTATTGGCTACATTTGTTCATCTATCTTAGTATGTTCTACTTTGTTTCTGTTTC
CGTGTGTTTGGTCAACTTCTCTCGCTAGTTGAAGAGAAGATACGCTTATTTGAATATTCA
GTGAAGCGAACCGGG

QA 1 495 1 495
DS 



AS 2 5

CO CL1960Contig1 606 2 9 U
TGCTTACAAAGGTATGTCGGCTTTCTTGGGGGCTTTGGAGAGTAAGTGTCCTGCCACAGC
AGAGTTCAAAGATCTCTTTGTAAAGGTAGCGGACTACATGGCCTGCTTCGAGTCGGGGAT
CAAGGTTGAGATGCCAGAAAAATCCGAGAAACTCTTTAGGGCTATTTCTGCATTGGATGG
TACTAACGGTGGAGCATCGGTGGATACTTGGAGGATGGTCGACGGTATGTTGTCAATGGG
AAAAATTGTGATTGAGATGAAGAAGAGTGCTTCAGAGGAGATAACTTTTGAACAAAGAAA
GGAACTGATAGGGGGTATGGTGAAATGGGCTCGAGGTATCGGTCTACTTGTTAAGACAGC
ATCCGAAAAAAAGGAAAATCTATTGATCTAGCATCTTTTGGAGTTGATTATAGCCCCCAT
GTTAGTTCTCCTTTCAAAGGAGCTAGCGGTGAGCTATAAAGATTTTCCCTGCAGTTGCAA
CTTTTAACTAATTCCAATAATGTAAAAAAGTAAATTATTATTTCAACAAGAAATCTTTTA
TCAGTTGTAAAAGATTTAGCTATTGTAAATATCTATCTATTCTAATAAAATAAAAGTTCA
AACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4F832TF U 213
AF RR4DE74JQ C 1
BS 1 212 RR4DE74JQ
BS 213 366 RR4F832TF
BS 367 367 RR4DE74JQ
BS 368 417 RR4F832TF
BS 418 418 RR4DE74JQ
BS 419 437 RR4F832TF
BS 438 438 RR4DE74JQ
BS 439 461 RR4F832TF
BS 462 606 RR4DE74JQ

RD RR4F832TF 249 0 0
GGATGGTCGACGGTATGTTGTCAATGGGAAAAATTGTGATTGAGATGAAGAAGAGTGCTT
CAGAGGAGATAACTTTTGAACAAAGAAAGGAACTGATAGGGGGTATGGTGAAATGGGCTC
GAGGTATCGGTCTACTTGTTAAGACAGCATCCGAGAAAAAGGAAAATCTATTGATCTAGC
ATCTTTTGGAGTTGATTATAGCCCC*ATGTTAGTTCTCCTTTCAA*GGAGCTAGCGGTGA
GCTATAAAG

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR4DE74JQ 606 0 0
TGCTTACAAAGGTATGTCGGCTTTCTTGGGGGCTTTGGAGAGTAAGTGTCCTGCCACAGC
AGAGTTCAAAGATCTCTTTGTAAAGGTAGCGGACTACATGGCCTGCTTCGAGTCGGGGAT
CAAGGTTGAGATGCCAGAAAAATCCGAGAAACTCTTTAGGGCTATTTCTGCATTGGATGG
TACTAACGGTGGAGCATCGGTGGATACTTGGAGGATGGTCGACGGTATGTTGTCAATGGG
AAAAATTGTGATTGAGATGAAGAAGAGTGCTTCAGAGGAGATAACTTTTGAACAAAGAAA
GGAACTGATAGGGGGTATGGTGAAATGGGCTCGAGGTATCGGTCTACTTGTTAAGACAGC
ATCCGAAAAAAAGGAAAATCTATTGATCTAGCATCTTTTGGAGTTGATTATAGCCCCCAT
GTTAGTTCTCCTTTCAAAGGAGCTAGCGGTGAGCTATAAAGATTTTCCCTGCAGTTGCAA
CTTTTAACTAATTCCAATAATGTAAAAAAGTAAATTATTATTTCAACAAGAAATCTTTTA
TCAGTTGTAAAAGATTTAGCTATTGTAAATATCTATCTATTCTAATAAAATAAAAGTTCA
AACTCC

QA 1 606 1 606
DS 



CO CL1960Contig2 739 3 1 U
GGAGTTGAAACTTTTATTTTAATAGAATAGATAGATATTTACAATAGCTAAATCTTTTAC
AACTGATAAAAGATTTCTTGTTGAAATAATAATTTACTTTTTTACATTATTGGAAGGGTT
CCCTTATTGGAATTAGTTAAAAGTTGCAACTGCAGGGAAAAATCTTTATAGCTCACCGCT
AGCTCCTTTGAAAGGAGAACTAACATGGGGGCTATAATCAACTCCAAAAGATGCTAGATC
AATAGATTTTCCTTTTTTCTCGGATGATGTCTTAACAAGTAGACCGATACCTCGAGCCCA
TTTCACCATACCCCCTATCAGTTCCTTTCTTTGTTCAAAAGTTATCTCCTCTGAAGCACT
CTTCTTCATCTCAATCACAATTTTTCCCATTGACAACATACCGTCGACCATCCTCCAAGT
ATCCACCGATGCTCCACCGTTAGTACCATCCAATGCAGAAATAGCCCTAAAGAGTTTCTC
GGATTTTTCTGGCATCTCAACCTTGATCCCCGACTCGAAGCAGGCCATGTAGTCCGCTAC
CTTTACAAAGAGATCTTTGAACTCTGCTGTGGCAGGACACTTACTCTCCAAAGCCCCCAA
GAAAGCCGACATACCTTTGTAAGCAAAAGGCTCAAAGTCTTCGCTCATTTTTGGAAAATC
CTTCAAGTGGTGGGGCAATGAGAACGTTCCTTGTGTTTCGTAAAGAGCTCTCTCAGATGG
AGAAGACACATTGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F832JQ U -4
AF RR4GF77JQ U 1
AF RR4GF77TF C 3
BS 1 739 RR4GF77JQ

RD RR4F832JQ 418 0 0
GAAATGAAGTTGAAACTC
TTATTTTAATAGAATAGATAGATATTTACAATAGCTAAATCTTTTACAACTGATAAAAGA
TTTCTTGTTGAAATAATAATTTACTTTTTTACATTATTGGAAGGGTTCCCTTATTGGAAT
TAGTTAAAAGTTGCAACTGCAGGGAAAAATCTTTATAGCTCACCGCTAGCTCCTTTGAAA
GGAGAACTAACATGGGGGCTATAATCAACTCCAAAAGATGCTAGATCAATAGATTTTCCT
TTTTTCTCGGATGCTGTCTTAACAAGTAAACCGATACCTCGAGCCCATTTCACCATACCC
CCTATCAGTTCCTTTCTTTGTTCAAAAGTTATCTCCTCTGAAGCACTCTTCTTCATCTCA
ATCACAATTTTTCCCATTGACAACATACCGTCGACCATCC

QA 19 418 19 418
DS 

RD RR4GF77JQ 739 0 0
GGAGTTGAAACTTTTATTTTAATAGAATAGATAGATATTTACAATAGCTAAATCTTTTAC
AACTGATAAAAGATTTCTTGTTGAAATAATAATTTACTTTTTTACATTATTGGAAGGGTT
CCCTTATTGGAATTAGTTAAAAGTTGCAACTGCAGGGAAAAATCTTTATAGCTCACCGCT
AGCTCCTTTGAAAGGAGAACTAACATGGGGGCTATAATCAACTCCAAAAGATGCTAGATC
AATAGATTTTCCTTTTTTCTCGGATGATGTCTTAACAAGTAGACCGATACCTCGAGCCCA
TTTCACCATACCCCCTATCAGTTCCTTTCTTTGTTCAAAAGTTATCTCCTCTGAAGCACT
CTTCTTCATCTCAATCACAATTTTTCCCATTGACAACATACCGTCGACCATCCTCCAAGT
ATCCACCGATGCTCCACCGTTAGTACCATCCAATGCAGAAATAGCCCTAAAGAGTTTCTC
GGATTTTTCTGGCATCTCAACCTTGATCCCCGACTCGAAGCAGGCCATGTAGTCCGCTAC
CTTTACAAAGAGATCTTTGAACTCTGCTGTGGCAGGACACTTACTCTCCAAAGCCCCCAA
GAAAGCCGACATACCTTTGTAAGCAAAAGGCTCAAAGTCTTCGCTCATTTTTGGAAAATC
CTTCAAGTGGTGGGGCAATGAGAACGTTCCTTGTGTTTCGTAAAGAGCTCTCTCAGATGG
AGAAGACACATTGGTGTCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GF77TF 737 0 0
GGAGTGAAACT
TTATTTTAATAGAATAGATAGATATTTACAATAGCTAAATCTTT*ACAACTGATAAAAGA
TTTCTTGTTGAAATAATAATTTACTTTTTTACATTATTGGAAGGGTTCCCTTATTGGAAT
TAGTTAAAAGTTGCAACTGCAGGGAAAAATCTTTATAGCTCACCGCTAGCTCCTTTGAAA
GGAGAACTAACATGGGGGCTATAATCAACTCCAAAAGATGCTAGATCAATAGATTTTCCT
TTTTTCTCGGATGATGTCTTAACAAGTAGACCGATACCTCGAGCCCATTTCACCATACCC
CCTATCAGTTCCTTTCTTTGTTCAAAAGTTATCTCCTCTGAAGCACTCTTCTTCATCTCA
ATCACAATTTTTCCCATTGACAACATACCGTCGACCATCCTCCAAGTATCCACCGATGCT
CCACCGTTAGTACCATCCAATGCAGAAATAGCCCTAAAGAGTTTCTCGGATTTTTCTGGC
ATCTCAACCTTGATCCCCGACTCGAAGCAGGCCATGTAGTCCGCTACCTTTACAAAGAGA
TCTTTGAACTCTGCTGTGGCAGGACACTTACTCTCCAAAGCCCCCAAGAAAGCCGACATA
CCTTTGTAAGCAAAAGGCTCAAAGTCTTCGCTCATTTTTGGAAAATCCTTCAAGTGGTGG
GGCAATGAGAACGTTCCTTGTGTTTCGTAAAGAGCTCTCTCAGATGGAGAAGACACATTG
GTGTCC

QA 12 737 12 737
DS 



AS 1 5

CO CL1961Contig1 841 5 9 U
GGACAGACCGAACAGTATCGGCCGATGATTCTTCAGACTTCAACTTCTTAGCTATGTCGG
CCGATGATTCTTCAAATGTTACAGATATCGACGGGAAGCGAGAGCTCAATTCAAACCTTA
ACTCTGACGGTGACGATGCAGCCGATAATGATTCCTCAAAGGCATTGACTATTCCTGCTC
CCGCCGTTTGTCTTGTCCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTA
TCTTTGGATATGGTTCAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATG
CAGGGCAGTCTGCAAAGACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCC
TTCTGAAACAACTCAGAGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCA
CCGGTCTTGCTCTTAGTTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTT
TTGGGGCTTTCTCTTTTATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACT
CTGTCTCCTTGAGACACCAAACCGGAGACTTGGGAGATCATCAACGTCCTTTACCACTCT
CCCTGGCTCTCCCGATCCATGAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCT
TAGCTAAACCCAAGAAGATCTAATTTCGCCATGATTCTCCTTTTCTAGTGCCTTAGTTCT
CTCTGTAGATTGTTTTTTAATCATTCCCTGCTTTTGTTCTACTTTGTGAGAGAGAATGTT
TTATGAATTGAAAGTTAATTGATATACTCCGTGTACCGTTTGCTCCATAAATACGATCTT
T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DP83TF U 15
AF RR4F461TF U 1
AF RR4FK56TF U 1
AF RR4E671TF U 15
AF RR4A961TF U 681
BS 1 177 RR4F461TF
BS 178 178 RR4DP83TF
BS 179 333 RR4F461TF
BS 334 334 RR4DP83TF
BS 335 486 RR4F461TF
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BS 488 672 RR4F461TF
BS 673 737 RR4FK56TF
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RD RR4DP83TF 574 0 0
GG
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TGTTACAGATATCGACGGGAAGCGAGAGCTCAATTCAAACCTTAACTCTGACGGTGACGA
TGCAGCCGATAATGATTCCTCAAAGGCATTGACTATTCCTGCTCCCGCCGTTTGTCTTGT
CCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGATATGGTTC
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GACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAACAACTCAG
AGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACCGGTCTTGCTCTTAG
TTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGGGCTTTCTCTTT
TATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTCTCCTTGAGACA
CCAAACCGGAGACTTGGGAGATCATCAACGTC

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR4F461TF 672 0 0
GGACAGACCGAACAGTATCGGCCGATGATTCTTCAGACTTCAACTTCTTAGCTATGTCGG
CCGATGATTCTTCAAATGTTACAGATATCGACGGGAAGCGAGAGCTCAATTCAAACCTTA
ACTCTGACGGTGACGATGCAGCCGATAATGATTCCTCAAAGGCATTGACTATTCCTGTTC
CCGCCGTTTGTCTTGTCCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTA
TCTTTGGATATGGTTCAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATG
CAGGGCAGTCTGCAAAGACTTTTGCTGTTTTGTTTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCC
TTCTGAAACAACTCAGAGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCA
CCGGTCTTGCTCTTAGTTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTT
TTGGGGTTTTCTCTTTTATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACT
CTGTCTCCTTGAGACACCAAACCGGAGACTTGGGAGATCATCAACGTCCTTTACCACTCT
CCCTGGCTCTCCCGATCCATGAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCT
TAGCTAAACCCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4FK56TF 737 0 0
GGACAGACCGAACAGTATCGGCCGATGATTCTTCAGACTTCAACTTCTTAGCTATGTCGG
CCGATGATTCTTCAAATGTTACAGATATCGACGGGAAGCGAGAGCTCAATTCAAACCTTA
ACTCTGACGGTGACGATGCAGCCGATAATGATTCCTCAAAGGCATTGACTATTCCTGTTC
CCGCCGTTTGTCTTGTCCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTA
TCTTTGGATATGGTTCAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATG
CAGGGCAGTCTGCAAAGACTTTTGCTGTTTTGTTTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCC
TTCTGAAACAACTCAGAGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCA
CCGGTCTTGCTCTTAGTTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTT
TTGGGGTTTTCTCTTTTATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACT
CTGTCTCCTTGAGACACCAAACCGGAGACTTGGGAGATCATCAACGTCCTTTACCACTCT
CCCTGGCTCTCCCGATCCATGAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCT
TAGCTAAACCCAAGAAGATCTAATTTCGCCATGATTCTCCTTTTCTAGTGCCTTAGTTCT
CTCTGTAGATTGTTTTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4E671TF 707 0 0
GG
ATCGGCCGATGATTCTTCAGACTTCAACTTCTTAGCTATGTCGGCCGATGATTCTTCAAA
TGTTACAGATATCGACGGGAAGCGAGAGCTCAATTCAAACCTTAACTCTGACGGTGACGA
TGCAGCCGATAATGATTCCTCAAAGGCATTGACTATTCCTGCTCCCGCCGTTTGTCTTGT
CCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGATATGGTTC
AGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATGCAGGGCAGTCTGCAAA
GACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAACAACTCAG
AGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACCGGTCTTGCTCTTAG
TTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGGGCTTTCTCTTT
TATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTCTCCTTGAGACA
CCAAACCGGAGACTTGGGAGATCATCAACGTCCTTTACCACTCTCCCTGGCTCTCCCGAT
CCATGAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCTTAGCTAAACCCAAGAA
GATCTAATTTCGCCATGATTCTCCTTTTCTAGTGCCTTAGTTCTC

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR4A961TF 161 0 0
TAATCTCGCCATGATTCTCCTTTTCTAGTGCCTTAGTACTCTCTGTAGATTGTTTTTTAA
TCATTCCCTGCTTTTGTTCTACTTTGTGAGAGAGAATGTTTTATGAATTGAAAGTTAATT
GATATACTCCGTGTACCGTTTGCTCCATAAATACGATCTTT

QA 1 161 1 161
DS 



AS 1 5

CO CL1962Contig1 901 5 18 U
GGAAAGTGGTTGTCAGTGTGCTTTCTTTTCTTTCGTTGTTTCTGAAACGTACACACTTTC
ACCACCGATCTTCGAATCTTTTGCGCTTTTTTTCCCCTCAGTCTCTCTTCAAAAGCACAC
AAATGGCGTCTGCGAACAGAGACATGGCTGTGTACTGTTTCGACACTTTGGTCTCTCACT
ACAACAACGAAGAGTCTCCTCCACCTGCCTTTGACGACGCCAATCACCCATTGTTTGTCA
CCTGGAAGAAAATAGTTAACGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTATCGGTACACTCG
AAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATC
GTAGGTTCCCGCCAATACAACCCAAAGAACTGCCGTTTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCC
TTACTGATTACGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAA
TCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACTAATATAAAGCGTAACGCCACGTATCTCCCTGAGG
TGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAG
GATACAATGGGGAGATAACGGAGTCGGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACACGTTATCAGA
GCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGGCCACAAGGGGCC
TTGTCCCGGCTATTAATGGGACCAGCAAGCCCGCCACGGCCTTCTCCTGATTTGCACCAT
GAAACTGGGTGCGTGAGATTGGTCCTGTTTGGGACCTCTCCTAATTTATCTTTAGTATTT
GTGATTCGAAAACTGTAAGGCTCTCTCTGATTTGTTTTTCAAACGAGACAAGATTTGCCC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4BR95TF U 1
AF RR4CH84TF U 85
AF RR4GX16TF U 85
AF RR4BR95JQ C 217
AF RR4CH84JQ C 238
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ACCACCGATCTTCGAATCTTTTGCGCTTTTTTTCCCCTCAGTCTCTCTTGAAAAGCACAC
AAATGGCGTCTGCGAACAGAGACATGGCTGTGTACTGTTTTGACACTTTGGTCTCTCACT
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TTACTGATTACGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAA
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TGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAG
*ATACAATGGGGAGATAACGGAGTCGGTGC

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DS 

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TT
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QA 3 619 3 619
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RD RR4GX16TF 620 0 0
TT
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GCTGTGTACTGTTTCGACACTTTGGTCTCTCACTACAACAACGAAGAGTCTCCTCCACCT
GCCTTTGACGACGCCAATCACCCATTGTTTGTCACCTGGAAGAAAATAGTTAACGGTGGG
GAGCCTCGTTTGCGTGGATGTATCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTC
AAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCAATACAACCCAAA
GAACTGCCGTTTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTACGAAGATGCGGAGGAT
TATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACT
AATATAAAGCGTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAG
ATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCG
GTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACACGTTATCAGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGT
GAATACCTTTCGTACGT
G

QA 3 619 3 619
DS 

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TGCGTGGATGTATCGGTGCACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATG
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TTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTACGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACT
GGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACTAATATAAAGC
GTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAA
TAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCGGTGCGTAGGC
GTATCCAGCTAACACGTTATCAGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTT
CGTACGTGAAGGCCACAAGGGGCCTTGTTCCGGCTATTAATGGGACCAGCAAGCCCGCCA
CGGCCTTCTCCTGATTTGCACCATGAAACTGGGTGCGTGAGATTGGTCCTGTTTGGGACC
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TTTCAAACGAGACAAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4CH84JQ 664 0 0
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TCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGG
ATCGTAGGTTCCCGCCAATACAACCCAAAGAGCTGCCGTTTCTGCAGTGTACGGTCTCAG
TCCTTACTGATTACGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTA
TAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACTAATATAAAGCGTAACGCCACGTATCTCCCTG
AGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAG
CAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCGGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACACGTTATC
AGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGGCCACAAGGG
GCCTTGTCCCTGCTATTAATGGGACCAGCAAGCCCTCCACGGCCTTCTCCTGATTTGCAC
CATGAAACTGGGTGCGTGAGATTGGTCCTGTTTGGGACCTCTCCTAATTTATCTTTAGTA
TTTGTGATTCGAAAACTGTAAGGCTCTCTTTGATTTGTTTTTCAAACGAGACAAGATTTG
CCCG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 5

CO CL1963Contig1 1579 5 10 U
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TCATCACATACATGAAAAAACTGGAGGATTCCACTGAACCAGGTTCACAAGCTATCATAG
TACGAATATGAATTCAGAGAAACTTGAAAATCGTCATCAGTTTCAGTTTATAAATAAGAA
TCAGAGAAGCTGCGGGTACATACGCTCGGGCCATTTGGGATAAGCACGCTTGTACAACTT
CATGCACACAACATCATGTTGCTGCACCACTCCATTGAATATGCATTTCATTGCCCCGTG
TGTACCAACCGGCTCCTTCACGCGACCACGACAACCACATTTAGAGAATACTTCTACCGG
CTTAAACCATCTCACGTCTTCAGGGTTATGGAACATATATCTCACTGATGCTTTCATCTT
TGATACTCTCTGCGGATACCCAGTTAATATTATCTTCTTCAAGATTATTTTGTTGGGTTC
AATGCTTTTCAAGGAACCAAGAGCAGTAACGGCAGGAGAACCCGACCCTTCAGAAATCTT
CAGAACTACCAAAGGAAGTGATGGGAAAGATATTGGGCCGTATACTGAAGCCAATGAGAA
ACGCCCTGGATGCAGGAAACGTTCCATCTTGTGCTTGTCTGAGCTGAAATTGTCGGTTGA
GAATACTGGCCTTGCAACGAATTGGCGGAAACCAACATGAAACATAAGTTCTTCTTTTGT
TTTAATAGGATCTTCGTAACCATCATACTTCTTAACGCTAAAGTGCAGAACCGACATCTT
GGATTCATGCTGTAAAAGCCCAAATGCTATAATGGGTTTCGTGTTCACAAGGGAGGATAG
TTTAGAGGCAGCGACAATAGGCACCTCCTTAATATGCAGCCGTACATATGATCCAGTTGG
TACACAATCATCTCTGCTTTCTTCTTCCATGTTCAGGGCTTGCTCGAGCACAAGCTTTTG
AGTCCTTGCAAGATTATCAAAAGCAAAGATTCTGGCATAGTCCTGAGGTAGGGACTCATT
TGGATCCCACGAGGACGTTCGGAAGGATTTGAGACCCCTGTACTTTGCAAAACGTTTTCT
TGCAGGCTGATCGATGGGTGTCTCTACTTCATCAGGAAATTCCTCATCCTCGGCATGTGC
CTCTTTTATTTTCTTCATTTGTTCCTCATACTGCTCCTTTGTCAAGCTTTCATCATCTAT
CATCTCGGAGTCATTATAAGATTCATTATCCACATCCCGCAGTGTTTCTGTATCATCCTC
AAAATCTTGGTCTTGATTGGAGAAGTGATCCTCTTCTTTATCCAATACCATAACATCATC
ATCGGAATCACCATTATCAGAATCCTCTTCATCTATTTCATCAATTATCCAAGCAGCCTG
ATATTCCGACGTCCCTCGCGGTAATAAAGTCCTCTTCTTTAATTTTCCCTGTTTCTGATT
TTTTTCTGCCTCAGCCATCTCTGCCTCAGTTGGCCATGTCTACACAATTGGAGCATCACA
CAACAAGTGAAGTTTCAGAACAGATAAAAACGGCCGCTTCATCTGTTAAAGAACTAATCA
GACATACCTGTTCCCCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF07JQ U 1
AF RR4FD33JQ U 43
AF RR4AH08JQ U 21
AF RR4EF07TF C 327
AF RR4AH08TF C 755
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BS 993 1579 RR4AH08TF

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TCATCACATACATGAAAAAACTGGAGGATTCCACTGAACCAGGTTCACAAGCTATCATAG
TACGAATATGAATTCAGAGAAACTTGAAAATCGTCATCAGTTTCAGTTTATAAATAAAAA
TCAAAGAAGCTGCGGGTACATACGCTCGGGCCATTTGGGATAAGCACGCTTGTACAACTT
CATGCACACAACATCATGTTGCTGCACCACTCCATTGAATATGCATTTCATTGCCCCGTG
TGTACCAACCGGCTCCTTCACGCGACCACGACAACCACATTTAGAGAATACTTCTACCGG
CTTAAACCATCTCACGTCTTCAGGGTTATGGAACATATATCTCACTGATGCTTTCATCTT
TGATACTCTCTGCGGATACCCAGTTAATATTATCTTCTTCAAGATTATTTTGTTGGGTTC
AATGCTTTTCAAGGAACCAAGAGCAGTAACGGCAGGAGAACCCGACCCTTCAGAAATCTT
CAGAACTACCAAAGGAAGTGATGGGAAAGATATTGGGCCGTATACTGAAG

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DS 

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TCAGTTTATAAATAAGAATCAGAGAAGCTGCGGGTACATACGCTTGGGCCATTTGGGATA
AGCACGCTTGTACAACTTCATGCACACAACATCATGTTGCTGCACCACTCCATTGAATAT
GCATTTCATTGCCCCGTGTGTACCAACCGGCTCCTTCACGCGACCACGACAACCACATTT
AGAGAATACTTCTACCGGCTTAAACCATCTCACGTCTTCAGGGTTATGGAACATATATCT
CACTGATGCTTTCATCTTTGATACTCTCTGCGGATACCCAGTTAATATTATCTTCTTCAA
GATTATTTTGTTGGGTTCAATGCTTTTCAAGGAACCAAGAGCAGTAACGGCAGGAGAACC
CGACCCTTCAGAAATCTTCAGAACTACCAAAGGAAGTGATGGGAAAGATATTGGGCCGTA
TACTGAAGCCAATGAGAAACGCCCTGGATGCAGGAAACGTTCCATCTTGTGCTTGTCTGA
GCTGAAATTGTCGGTTGAGAATATTGGCCTTGCAACGAATTGGCGGAAACCAACATGAAA
CATAAGTTCTTCTTTTGTTTTAATAGG

QA 1 687 1 687
DS 

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G
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TGGAGGATTCCACTGAACCAGGTTCACAAGCTATCATAGTACGAATATGAATTCAGAGAA
ACTTGAAAATCGTCATCAGCTTCAGTTTATAAATAAGAATCAGAGAAGCTGCGGGTACAT
ACGCTCGGGCCATTTGGGATAAGCACGCTTGTACAACTTCATGCACACAACATCATGTTG
CTGCACCACTCCATTGAATATGCATTTCATTGCCCCGTGTGTACCAACCGGCTCCTTCAC
GCGACCACGACAACCACATTTAGAGAATACTTCTACCGGCTTAAACCATCTCACGTCTTC
AGGGTTATGGAACATATATCTCACTGATGCTTTCATCTTTGATACTCTCTGCGGATACCC
AGTTAATATTATCTTCTTCAAGATTATTTTGTTGGGTTCAATGCTTTTCAAGGAACCAAG
AGCAGTAACGGCAGGAGAACCCGACCCTTCAGAAATCTTCAGAACTACCAAAGGAAGTGA
TGGGAAAGATATTGGGCCGTATACTGAAGCCAATGAGAAACGCCCTGGATGCAGGAAACG
TTCCATCTTGTGCTTGTCTGAGCTGAAATTGTCGGTTGAGAATACTGGCCTTGCAACGAA
TTGGCGGGAACCAACATGAAACATAAGTTCTTCTTTTGTTTTAATAGGATCTTCGTAACC
ATCATACTTCTTAACGCTAAAGTGCAGAACCGACATCTTGG

QA 2 762 2 762
DS 

RD RR4EF07TF 667 0 0
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TATGGAACATATATCTCACTGATGCTTTCATCTTTGATACTCTCTGCGGATACCCAGTTA
ATATTATCTTCTTCAAGATTATTTTGTTGGGTTCAATGCTTTTCAAGGAACCAAGAGCAG
TAACGGCAGGAGAACCCGACCCTTCAGAAATCTTCAGAACTACCAAAGGAAGTGATGGGA
AAGATATTGGGCCGTATACTGAAGCCAATGAGAAACGCCCTGGATGCAGGAAACGTTCCA
TCTTGTGCTTGTCTGAGCTGAAATTGTCGGTTGAGAATACTGGCCTTGCAACGAATTGGC
GGAAACCAACATGAAACATAAGTTCTTCTTTTGTTTTAATAGGATCTTCGTAACCATCAT
ACTTCTTAACGCTAAAGTGCAGAACCGACATCTTGGATTCATGCTGTAAAAGCCCAAATG
CTATAATGGGTTTCGTGTTCACAAGGGAGGATAGTTTAGAGGCAGCGACAATAGGCACCT
CCTTAATATGCAGCCGTACATATGATCCAGTTGGTACACAATCATCTCTGCTTTCTTCTT
CCATGTTCAGGGCTTGCTCGAGCACAAGCTTTTGAGTCCTTGCAAGATTATCAAAAGCAA
AGATTC
C

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4AH08TF 825 0 0
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GGTTTCGTGTTCACAAGGGAGGATAGTTTAGAGGCAGCGACAATAGGCACCTCCTTAATA
TGCAGCCGTACATATGATCCAGTTGGTACACAATCATCTCTGCTTTCTTCTTCCATGTTC
AGGGCTTGCTTGAGCACAAGCTTTTGAGTCCTTGCAAGATTATCAAAAGCAAAGATTCTG
GCATAGTCCTGAGGTAGGGACTCATTTGGATCCCACGAGGACGTTCGGAAGGATTTGAGA
CCCCTGTACTTTGCAAAACGTTTTCTTGCAGGCTGATCGATGGGTGTCTCTACTTCATCA
GGAAATTCCTCATCCTCGGCATGTGCCTCTTTTATTTTCTTCATTTGTTCCTCATACTGC
TCCTTTGTCAAGCTTTCATCATCTATCATCTCGGAGTCATTATAAGATTCATTATCCACA
TCCCGCAGTGTTTCTGTATCATCCTCAAAATCTTGGTCTTGATTGGAGAAGTGATCCTCT
TCTTTATCCAATACCATAACATCATCATCGGAATCACCATTATCAGAATCCTCTTCATCT
ATTTCATCAATTATCCAAGCAGCCTGATATTCCGACGTCCCTCGCGGTAATAAAGTCCTC
TTCTTTAATTTTCCCTGTTTCTGATTTTTTTCTGCCTCAGCCATCTCTGCCTCAGTTGGC
CATGTCTACACAATTGGAGCATCACACAACAAGTGAAGTTTCAGAACAGATAAAAACGGC
CGCTTCATCTGTTAAAGAACTAATCAGACATACCTGTTCCCCTGC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 5

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CAGAGTTTTACAAGTGGAGCTTGAAATGGAGGAAAGAGCTGAGGATATCGTTAAAGACCC
AAGACTTAACTATGGCTTGTTCTCCAAGGAATTCCTTAGACGCCATGGTCTTCCCCTCCT
TGGATGTACATCCACTTGGTTCTTGCTTGACATTGCCTTCTACAGCCAAAATTTGTTCCA
AAAGGATATCTTCTCGGCTATCGGGTGGATCCCCAAGGCATCAACCATGAACGCCGTCCA
TGAGGTTTTCAAGATTGCTAGGGCACAGACTCTCATCGCTCTCTGCAGTACTGTCCCAGG
CTACTGGTTCACGGTTGCGTTCATTGACATCATTGGAAGATTTGCGATCCAGCTAATGGG
ATTCTTCATGATGACTGTGTTCATGTTTGCCATTGCTTTTCCTTACGACCACTGGATCAA
ACCAGACAACCGCATCGGATTCGTGATTATGTACTCTCTCACTTTCTTCTTTGCCAATTT
TGGACCGAATGCAACAACCTTCATTGTACCGGCTGAGATCTTTCCGGCTAGGCTAAGGTC
CACATGCCATGGAATATCAGCAGCGACAGGTAAAGCTGGAGCCATCGTGGGAGCTTTCGG
GTTCTTATACGCAGCTCAGCCACAGGACAAGACCAAGACAGACGCAGGATACCCACCAGG
CATTGGAGTCAAGAACTCACTGATCATGCTTGGCGTCATTAACTTTGTCGGTATGCTCTT
CACGTTCCTTGTCCCTGAGCCCAA*GGGTAAGTCCCTTGAAGAACTCTCCGGTGAGACTG
AGGTTGAGAAATGATCACGACAAAACTGTTGTAATACATTTTCAAATTATATTATTTCGA
GTTACATGTTTGCTTTTATTTTGCAATATATTTCTTCCCTGCTCTTGACGTTATGATGTT
CTATTTGTGAATTTTGACTTTTCTCCATTATGCTTATGTATCTTGGATTTAATTGAGTTT
TGCGATCTTTGGC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D241TF U 1
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AF RR4E363TF U 237
AF RR4GV93JQ C 301
AF RR4GV93TF U 301
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TGGATGTACATCCACTTGGTTCTTGCTTGACATTGCCTTCTACAGCCAAAATTTGTTCCA
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CACGTTCCT
GTCTGAGCCCAAGG

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C

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DS 

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TCCATGAGGTTTTCAAGATTGCTAGGGCACAGACTCTCATCGCTCTCTGCAGTACTGTCC
CAGGCTACTGGTTCACGGTTGCGTTCATTGACATCATTGGAAGATTTGCGATCCAGCTAA
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TCAAACCAGACAACCGCATCGGATTCGTGATTATGTACTCTCTCACTTTCTTCTTTGCCA
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TCGAGTTACATGTTTGCTTTA**TTTGCA*TATATTTCTTCCCTGCTCTTGAC

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DS 

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G
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GCGATC

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G
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TACTGGTTCACGGTTGCGTTCATTGACATCATTGGAAGATTTGCGATCCAGCTAATGGGA
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CCAGACAACCGCATCGGATTCGTGATTATGTACTCTCTCACTTTCTTCTTTGCCAATTTT
GGACCGAATGCAACAACCTTCATTGTACCGGCTGAGATCTTTCCGGCTAGGCTAAGGTCC
ACATGCCATGGAATATCAGCAGCGACAGGTAAAGCTGGAGCCATCGTGGGAGCTTTCGGG
TTCTTATACGCAGCTCAGCCACAGGACAAGACCAAGACAGACGCAGGATACCCACCAGGC
ATTGGAGTCAAGAACTCACTGATCATGCTTGGCGTCATTAACTTTGTCGGTATGCTCTTC
ACGTTCCTTGTTCCTGAGCCCAA*GGGTAAGTCCCTTGAAGAACTCTCCGGTGAGACTGA
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TTTCATGTTTGCTTTTATTTTGCAATATATTTCTTCCCTGCTCTTGACGTTATGATGTTC
TATTTGTGAATTTTGACTTTTCTCCATTATGCTTATGTATCTTGGATTTAATTGAGTTTT
GCGATCTTTGGC

QA 2 733 2 733
DS 



AS 1 5

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AAAAA*TGGAGACAGTAACAGTGATGAAGCCATTGATCAGAGTCGCTGCTCTCTCCGGTT
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TTAAGAACGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGTCTGGGCGGACAAACCTGCCG
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AACCGCCTGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGATGAACCAGCTAAGGAGAGGT
TGAAAAAAGTCCTTATCTCATTGCAAGAATTTACTATTCGACTTCAGGGTCGTGATTGAG
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TAAAAACAGTGTGTCACTTATCTTATAATTGTTTATGTTTATTATAAATATGTATATGAT
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AAATTATGGTTAGTTTTGATATTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG59TF U 5
AF RR4FX69TF U 1
AF RR4DH63TF U 6
AF RR4FX69JQ C 281
AF RR4DH63JQ C 26
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ATTTGTAAG*CTTGTTTGTGTGATGGAAATAATGCAAATTGTTGTA
TAAAAA

QA 10 715 10 715
DS 

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TAAAAA

QA 1 726 1 726
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AGTAACAGTGATGAAGCCATTGATCAGAGTCGCTGCTCTCTCCGGTTCCCTGCGGAAAGG
CTCTTACCACAATGGTCTTCTCCGTGCCGCGATCGACTTGACGAAAGAATTGGTGCCGGG
AATGCAGATTGAGTATATCGACATATCTCCACTGCCGTTCATCAATACCGACCTGGAAAT
AAATGGTACCTATCCTGCTATCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAAATCCTTGAAGCCGATAG
TATTCTGTCCGCCTCCCCTGAGTATAATTACTCTGTCTCAGCTCCTCTTAAGAACGCGAT
TGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGTCTGGGCGGACAAACCTGCCGCCATCATTAGCAC
CGGTGGAATATTTGGTGGAAGAGTATCTCAATATCATCTTCGCCAAATTGGTGTATTCCT
TGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAGAATTTACTCTCAATGCATTCCAACCGCCTGAGAA
ATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGATGAACCAGCTAAGGAGAGGTTGAAAAAAGTCCT
TATCTCATTGCAAGAATTTACTATTCGACTTCAGGGTCGTGAGTGAGGGAATTCTTAATC
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TCACTTATCTTATAATTGTTT
TGTT

QA 9 749 9 749
DS 

RD RR4FX69JQ 462 0 0
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TTACTCTGTGTCAGCTCCTCTTAAGAACGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGT
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TCAATATCATTTTCGCCAAATTGGTGTATTCCTTGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAGA
ATTTACTCTCAATGCATTCCAACCGCCTGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGA
TGAACCAGCTAAGGAGAGGTTGAAAAAAGTCCTTATCTCATTGCAAGAATTTACTATTCG
ACTTCAGGGTCGTGATTGAGGGAATTCTTGATCATTTGTAAGGCTTGTTTGTGTGATGGA
AATAATGCAAATTGTTGTAATAAAAACAGTGTGTCACTTA
CC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4DH63JQ 904 0 0
TTATCGTCAGTCAC
AATTGTGAAGCTCT*ATCAGAAAAAA*TGGAGACAGTA*CAGTGATGAAGCCAT*GATCA
GAGTCGCTGCTCTCTCCGGTTCC*TGCGGAAAGGCTCTTACCACAATGGTCTTCTCCGTG
CCGCGATCGACTTGACGAAAGAATTGGTGCCGGGAATGCAGATTGAGTATATCGACATAT
CTCCACTGCCGTTCATCAATACCGACCTGGAAATAAATGGTACCTATCCTGCTATCGTCG
AAGCTTTCCGGCAGAAAATCCTTGAAGCCGATAGTATTCTGTCCGCCTCCCCTGAGTATA
ATTACTCTGTCTCAGCTCCTCTTAAGAACGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATG
TCTGGGCGGACAAACCTGCCGCCATCATTAGCACCGGTGGAATATTTGGTGGAGGAGTAT
CTCAATATCATCTTCGCCAAATTGGTGTATTCCTTGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAG
AATTTACTCTCAATGCATTCCAACCGCCTGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCG
ATGAACCAGCTAAGGAGAGGTTGAAAAAAGTCCTTATCTCATTGCAAGAATTTACTATTC
GACTTCAGGGTCGTGAGTGAGGGAATTCTTAATCATTTGTAAGGCTTGTTCGTGTGATGG
AAATAATGCAAATTGTTGTAATAAAAACAGTGTGTCACTTATCTTATAATTGTTTATGTT
TATTATAAATATGTATATGATGTTAGCGGTTTGTCCGTGCTACGCGCGGAATGTTTATTA
ATTGTGTAGCTAAATGTTTGAAATATGTTTGATGCTGATACTGTTGATACTAGAAGTAAG
TATTCAAACTTTGTGATGCTGAAATTATGGTTAGTTTTGATATTTATTTT

QA 15 904 15 904
DS 



AS 1 5

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GTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGTTCACAG
ATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAAGGTGGAGGAAACCCGCCTCCT
CCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAA
GCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAAT
GCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTG
GACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGCCATGCAGCAATAATATAAA
GTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAAACTGTTTGG
ATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATACATCTAGACAATTTTC
TCTAGTCTAAATGTTCTAAATTTTTTAAGTAGGAGTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTG
ATTAGTACTATTAACAGAAAACAGTATAGTAGTGTATCTACTTTATAGCATGTGAACAAA
AGTAAGACGCTTTCCGTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FB86JQ C 1
AF RR4FB86TF U 1
AF RR4FS09JQ C 160
AF RR4EV08TF U 108
AF RR4FS09TF U 160
BS 1 245 RR4FB86TF
BS 246 246 RR4EV08TF
BS 247 402 RR4FB86TF
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BS 557 680 RR4EV08TF

RD RR4FB86JQ 507 0 0
TTTTTCATCCATAAGTGGAAAATGAGGAACATTACTAAAAACCAGACCATGTTATTGCTT
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GTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAAACTGTTTGG
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QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4FB86TF 507 0 0
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GTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGTTCACAG
ATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAAGGTGGAGGAAACCCGCCTCCT
CCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAA
GCAGCCTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAAT
GCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTG
GACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGCCGTGCAGCAATAATATAAA
GTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAAACTGTTTGG
ATACTTTATACATGTAATCATATAAAT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4FS09JQ 379 0 0
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GTCCCTTTCTTTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACG
GCCATGCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAG
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TCATACATCTAGACAATTT

QA 1 379 1 379
DS 

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G
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CCCGATAAACAATCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGGATTC
AACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTC
TCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGCCATGCAG
CAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAAC
AAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATACATC
TAGACAATTTTCTCTAGTCTAAATGTTTTAAATTTTTTAAGTAGGAGTAATTAGCCAAGT
TAATTATCTTTGATTAGTACTATTAACAGAAAACAGTATAGTAGTGTATCTACTTTATAG
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QA 2 573 2 573
DS 

RD RR4FS09TF 521 0 0
GGTGGAGGAAACCCGCCTCCTCCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCG
CCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATA
TCCGGATTCAACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGG
GTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACG
GCCATGCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAG
CATTATAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAAT
TCATACATCTAGACAATTTTCTCTAGTCTAAATGTTCTAAATTTTTTAAGTAGGAGTAAT
TAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTAGTACTATTAACAGAAAACAGTATAGTAGTGTATCT
ACTTTATAGCATGTGAACAAAAGTAAGACGCTTTCCGTGAC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 5

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CAAT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM71TF U 1
AF RR4GZ67JQ C 1
AF RR4AD35JQ C 1
AF RR4AD35TF U 1
AF RR4C889TF U 1
BS 1 60 RR4AD35TF
BS 61 61 RR4C889TF
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BS 350 669 RR4AD35TF
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RD RR4GM71TF 495 0 0
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GTGAATCAGCGAGAGTAAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
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GCCTCGGAGTCGCAC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4GZ67JQ 495 0 0
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AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
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GTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACCGCGACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
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GCCTCGGAGTCGCAC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4AD35JQ 670 0 0
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TTGAATCAGCGAGAGTAAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
GTGGGAGCTGGTGATGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGA
GTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACCGTGACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTT*AAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAA*TCTATCAGCCTCG
GTGAAAAAAGG***TAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGT
GAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAA
TATTCTTCC
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4AD35TF 670 0 0
GGATCAAAAGACAGAGTTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGTTCGACTT
TTGAATCAGCGAGAGTAAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
GTGGGAGCTGGTGATGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGA
GTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACCGTGACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTT*AAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAA*TCTATCAGCCTCG
GTGAAAAAAGG***TAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGT
GAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAA
TATTCTTCC
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4C889TF 724 0 0
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GTGAATCAGCGAGAGTAAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
GTGGGAGCTGGTGATGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGA
GTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACCGTGACAGGTAACGAGTCAGACGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GTCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAATAAAAAAACAAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCG
GTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGT
GAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAA
TATTCTTCCGTTATGAGCTTCGTGTTTATCAAAATCTATCGCATATATATGTTATATAAG
CAAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 5

CO CL1968Contig1 555 5 9 U
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TCTCAAAGGTTTCTTCTTTCTGTTTACTCCTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCCTCAGTTCTC
AACCTGCACTCTCACTCCGTGTCCCAAAACCACAATCAGAAACAGCATCACCTCAAACCA
TGATCGATGATGATTCGTCTCCAATTATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTG
CTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTT
TCACAATGGTCAACCCTAACATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGA
AACTACCTTCTTCCCCAAGTAATCTTAACAAAGATGGAGGAAACGCATGAAGAATGAAGT
TTCACTCGTGCTCAAAAACACTTATATGGTTTTATATTTCATCATAAAAAATAAAAATTG
TATCTTTAATTGAATGGTAAAGAGAAAGAAGATGTTATCTATCTATCTATCAATCAGCTC
AAAACGATTTTAGCC


BQ
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU83TF U 2
AF RR4G913JQ C 1
AF RR4G913TF U 1
AF RR4GL17TF U 1
AF RR4GL17JQ C 1
BS 1 1 RR4G913TF
BS 2 281 RR4AU83TF
BS 282 413 RR4G913TF
BS 414 414 RR4GL17TF
BS 415 505 RR4G913TF
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BS 507 520 RR4G913TF
BS 521 533 RR4GL17TF
BS 534 555 RR4GL17JQ

RD RR4AU83TF 280 0 0
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CTCAAAGGTTTCTTCTTTCTGTTTACTCCTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCCTCAGTTCTCA
ACCTGCACTCTCACTCCGTGTCCCAAAACCACAATCAGAAACAGCATCACCTCAAACCAT
GATCGATGATGATTCGTCTCCAATTATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGC
TGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGCTGGCCT

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4G913JQ 520 0 0
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AACCTGCACTCTCACTCCGTGTCCCAAAACCACAATCAGAAACAGCATCACCTCAAACCA
TGATCGATGATGATTCGTCTCCAATTATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTG
CTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTT
TCACAATGGTCAACCCTAACATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGA
AACTACCTTCTTCCCCAAGTAATCTTAACAAAGATGGAGGAAACGCATGAAGACTGAAGT
TTCACTCGTGCTCAAAAACACTTATATGGTTTTATATTTCATCATAAAAAATAAAAATTG
TATCTTTAATTGAATGGTAAAGAGATAGAAGATGTTATCT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4G913TF 520 0 0
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TCTCAAAGGTTTCTTCTTTCTGTTTACTCCTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCCTCAGTTCTC
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TGATCGATGATGATTCGTCTCCAATTATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTG
CTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTT
TCACAATGGTCAACCCTAACATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGA
AACTACCTTCTTCCCCAAGTAATCTTAACAAAGATGGAGGAAACGCATGAAGACTGAAGT
TTCACTCGTGCTCAAAAACACTTATATGGTTTTATATTTCATCATAAAAAATAAAAATTG
TATCTTTAATTGAATGGTAAAGAGATAGAAGATGTTATCT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4GL17TF 533 0 0
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TGATCGATGATGATTCGTCTCCAATTATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTG
CTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTATCCACCTT
TCACAATGGTCAACCCTAACATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGA
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TTCACTCGTGCTCAAAAACACTTATATGGTTTTATATTTCATCATAAAAAATAAAAATTG
TATCTTTAATTGAATGGTAAAGAGAAAGAAGATGTTATCTATCTATCTATCAA

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4GL17JQ 555 0 0
GGACACACAAATATCACAAAGCAAGTGCTTGAAAAACACCAAGAGCAACAATGTCGAAAA
TCTCAAAGGTTTCTTCTTTCTGTTTACTCCTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCCTCAGTTCTC
AACCTGCACTCTCACTCCGTGTCCCAAAACCACAATCAGAAACAGCATCACCTCAAACCA
TGATCGATGATGATTCGTCTCCAATTATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTG
CTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTATCCACCTT
TCACAATGGTCAACCCTAACATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGA
AGCTACCTTCTTCCCCAAGTAATCTTAACAAAGATGGAGGAAACGCATGAAGAATGAAGT
TTCACTCGTGCTCAAAAACACTTATATGGTTTTATATTTCATCATAAAAAATAAAAATTG
TATCTTTAATTGAATGGTAAAGAGAAAGAAGATGTTATCTATCTATCTATCAATCAGCTC
AAAACGATTTTAGCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 4

CO CL1969Contig1 553 4 2 U
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TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
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GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTGAAAGGG
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
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GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTTTAATCTACAAAACTTGTCTTT
GAATTCCAGCGACTTCTCAGCTTTTTTTTCAGACTTTTGTTTTGTTCCTATATATGTTAT
CCTTTTGAGTTTG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4C065TF U 1
AF RR4BX33JQ C 267
AF RR4B737TF U 1
AF RR4B737JQ C 2
BS 1 549 RR4B737TF
BS 550 553 RR4B737JQ

RD RR4C065TF 373 0 0
T
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AGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTCGAGGAGA
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GCTCTCCTG
TGT

QA 2 370 2 370
DS 

RD RR4BX33JQ 249 0 0
CAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACCAACACATGGGACAGATTTGA
GCTCCGTGTGCACAAGGGTGTGATCGATCTGTTCAGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGAT
CACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGAT
TCATGCTTTTTTTTAATCTACAAAACTTGTCTTTGAATTCCAGCGACTTCTCAGCTTTTT
GTTTGTTTC

QA 1 240 1 240
DS 

RD RR4B737TF 553 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTGAAAGGG
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTTTAATCTACAAAACTTGTCTTT
GAATTCCAGCGACTTCTCAGCTTTTTTTTCAGACTTTTGTTTTGTTCCTATATATGTTAT
CCTTTTGAG
TTTG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4B737JQ 552 0 0
CATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAGT
AGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAGA
CACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTTG
AGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTGAAAGGGC
CAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAG
GAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTCA
GCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTCG
AGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTTTAATCTACAAAACTTGTCTTTG
AATTCCAGCGACTTCTCAGCTTTTTTTTCAGACTTTTGTTTTGTTCCTATATATGTTATC
CTTTTGAGTTTG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 5

CO CL1970Contig1 1283 5 3 U
CTTCAGTCTAACGTTATATATTAAACCAAACATTAAAATGTCATACAATCATTGTTTTTA
TAAATATCTCCTCGCATTTTCGAAACCCAGTCCAACACGACCGTTGATCAAACAAACCTA
GTACTCAAACTCAAGAAAGAAAATCCTCAGCACAACCAAAAAAAAAAGTAGTAATAAGAA
ACCCATCTTCTGAACAACGAGGTCTTAGACGGCTGTAGTAGATTTCCGGACAGTGTAACG
ATAAGCAGCAACTTTCTTCTTGCGGGACAAAGTGTTATCAACAGAGAGAATGAGTTTCCC
AGCTTCACCTGTCGTGAAAGAGTTGCACACAGCTTCATCTGAAGCTTTCATCTT**TTGG
TTTCTCCACCACAATTGCATAACTCCCTTCGGCGTTTGGTACAAACTCTGCCGTGTACTC
TAAGTCCCAGCCTCCAACTACTATATCCCATGTTATAGTTGCTCCACCCTCAATGCCTTC
GATCTGAATGTTAACTTTCTCACCGCCCTT*AATGGAGAATTCAGAGGCGGGTTTTGGTG
GTCCATTTTGTGAGTCCGTAGGACGGCTAAGACCGCCGTACTGCACCGGAATATCTTCCG
GCCTTATGAACTTGTAGAGTGTTTCAGCTGCATTTCCTTCTTTGGACATTACAAACTTGC
TCTTTGTTCTATGTGTCAAGAAAGGGCTGAACATTGAGTAGATGACACTGAAGTACCAAG
GCACATTGATGAATATCTTAGTAGCAACCATCTCAGGGTAATTATCCTGAAAGAGAGAAA
GGATCTGGTTCGAAGCAACTCTAAGCTCTCTCTTAGGCATGTCCTTGAGATCCGTAACCT
GAATCATAGAATTAACACCACCAGGTCTGAAATGAAGCATCTTGACACCTCTCTCCAGAA
CCTGAACTCTCCACCTCAGAAAGCTTTTGAGTTTCTCTTCGTCACCGAAGACCCTCTCGT
ACATCTCTCTCTCTTTAAACACGCCGTACGCGTTGTAACACACGGGGTGTCCTTCTTTGT
CGTATCCTCTCATGTAAGCGACTTTGCCTTCCAAATCCTTGAAACCACCGAGATCTTCTT
CCGTCAGCTTCTCTGCTTTGAACTCCTCTCTCCACTCCAAACACTTCTCGAGCATCCTCA
GCGAGTCACCGACTTTGAAGTCTCTTGCTCTGAGGAACTTGAGGAGGATGACGTCAGCTC
TGTCGTCACCGCCGAGGAGAGGGACTCCCCACATGGAAGAAGCTCCGAAGGAGGAAGATG
AGAGCTTGTCTTTGAGCTCTTGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4AM83JQ U 1
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CTT
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AGCAGCAACTTTCTTCTTGCGGGACAAAGTGTTATCAACAGAGAGAATGAGTTTCCCAGC
TTCACCTGTCGTGAAAGAGTTGCACACAGCTTCATCTGAAGCTTTCATCTT**TTGGTTT
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CTGAATGTTAACTTTCTCACCGCCCTT*AATGGAGAATTCAGAGGCGGGTTTTGGTGGTC
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TTGTTCTATGTGTCAAGAAAGGGCTGAACATTGAGTAGATGACACTGAAGTACCAAGGCA
CATTGATGAATA

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GTACTCAAACTCAAGAAAGAAAATCCTCAGCACAACCAAAAAAAAAAGTAGTAATAAGAA
ACCCATCTTCTGAACAACGAGGTCTTAGACGGCTGTAGTAGATTTCCGGACAGTGTAACG
ATAAGCAGCAACTTTCTTCTTGCGGGACAAAGTGTTATCAACAGAGAGAATGAGTTTCCC
AGCTTCACCTGTCGTGAAAGAGTTGCACACAGCTTCATCTGAAGCTTTCATCTT**TTGG
TTTCTCCACCACAATTGCATAACTCCCTTCGGCGTTTGGTACAAACTCTGCCGTGTACTC
TAAGTCCCAGCCTCCAACTACTATATCCCATGTTATAGTTGCTCCACCCTCAATGCCTTC
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GTCCATTTTGTGAGTCCGTAGGACGGCTAAGACCGCCGTACTGCACCGGAATATCTTCCG
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ATATCTCCTCGCATTTTCGAAACCCAGTCCAACACGACCGTTGATCAAACAAACCTAGTA
CTCAAACTCAAGAAAGAAAATCCTCAGCACAACCAAAAAAAGAAGTAGTAATAAGAAACC
CATCTTCTGAACAACGAGGTCTTAAACGGCTGTAGTAAATTTCCGGACAGTGTAACGATA
AGCAGCAACTTTCTTCTTGCGGGACAAAGTGTTATCAACAGAGAGAATGAGTTTCCCAGC
TTCACCTGTCGTGAAAGAGTTGCACACAGCTTCATCTGAAGCTTTCATCTTTCTTGGTTT
CTCCACCACAATTGCATAACTCCCTTCGGCGTTTGGTACAAACTCTGCCGTGTACTCTAA
GTCCCAGCCTCCAACTACTATATCCCATGTTATAGTTGCTCCACCCTCAATGCCTTCGAT
CTGAATGTTAACTTTCTCACCGCCCTT*AATGGAAAATTCAAAGGCGGGTTTTGGTGGTC
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CATTGATGAATATCTTAGTAGCAACCATCTCAGGGTAATTATCCTGAAAGAGAGAAAGGA
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C

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CGGGTTTTGGTGGTCCATTTTGTGAGTCCGTAGGACGGCTAAGACCGCCGTACTGCACCG
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TTACAAACTTGCTCTTTGTTCTATGTGTCAAGAAAGGGCTGAACATTGAGTAGATGACAC
TGAAGTACCAAGGCACATTGATGAATATCTTAGTAGCAACCATCTCAGGGTAATTATCCT
GAAAGAGAGAAAGGATCTGGTTCGAAGCAACTCTAAGCTCTCTCTTAGGCATGTCCTTGA
GATCCGTAACCTGAATCATAGAATTAACACCACCAGGTCTGAAATGAAGCATCTTGACAC
CTCTCTCCAGAACCTGAACTCTCCACCTCAGAAAGCTTTTGAGTTTCTCTTCGTCACCGA
AGACCCTCTCGTACATCTCTCTCTCTTTAAACACGCCGTACGCGTTGTAACACACGGGGT
GTCCTTCTTTGTCGTATCCTCTCATGTAAGCGACTTTGCCTTCCAAATCCTTGAAACCAC
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TTTCCTTCTTTGGACATTACAAACTTGCTCTTTGTTCTATGTGTCAAGAAAGGGCTGAAC
ATTGAGTAGATGACACTGAAGTACCAAGGCACATTGATGAATATCTTAGTAGCAACCATC
TCAGGGTAATTATCCTGAAAGAGAGAAAGGATCTGGTTCGAAGCAACTCTAAGCTCTCTC
TTAGGCATGTCCTTGAGATCCGTAACCTGAATCATAGAATTAACACCACCAGGTCTGAAA
TGAAGCATCTTGACACCTCTCTCCAGAACCTGAACTCTCCACCTCAGAAAGCTTTTGAGT
TTCTCTTCGTCACCGAAGACCCTCTCGTACATCTCTCTCTCTTTAAACACGCCGTACGCG
TTGTAACACACGGGGTGTCCTTCTTTGTCGTATCCTCTCATGTAAGCGACTTTGCCTTCC
AAATCCTTGAAACCACCGAGATCTTCTTCCGTCAGCTTCTCTGCTTTGAACTCCTCTCTC
CACTCCAAACACTTCTCGAGCATCCTCAGCGAGTCACCGACTTTGAAGTCTCTTGCTCTG
AGGAACTTGAGGAGGATGACGTCAGCTCTGTCGTCACCGCCGAGGAGAGGGACTCCCCAC
ATGGAAGAAGCTCCGAAGGAGGAAGATGAGAGCTTGTCTTTGAGCTCTTGC

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DS 



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TCCATACGGTGGCAGACTTTGACACCGCGTATGCAGTCTTCGGCAGCGAATGGTTCAGGC
TCAAAGAAAAACTATGGTACAAGTCGGAGTTCGGTGAACCAGGAACAAGGTGACTTCTCA
CTAGAGCTTTGGAAAAAGGCTTTCAGAGATGCACACGAGCGTTTATGCCCTCTGCAAGCT
AGTGGCCATGAATGTGGTTGTTTGCCCGTCCCTGCCCGTCTGATAATGGAACAGTGCGTG
GCTCGGCTGGATGTCGCAATGTTCAATGCTATACTTCGTGATTCTGATGAAAACTTCCCT
ACAGACCCTGTCTCTGATCCCATTGCTGACTCCAGGGTCTTGCCTATTCCTTGTTCAATA
ACAAGTTTCGGTTCTGGTGCCCTCCTCAAAAACTCGCTAGGAAACTGGTCCAGGTGGCTC
ACTGATTTATTCGGCATCGATGATGATGACCAAGAGAATAGCTACGTTGGTACTGCACCT
TTCAAGACTTTTATTCTTCTCAAGGCCTTGAGCGATCTAATGATGCTTCCAAAAGATATG
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AGAGTCTTGAATCATTTTGTCCCCGATGAGTTCTGCCCTGACCCAGTTCCTGTTGCTCTA
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GATTTTGGACAGCCTCAAGCGCCTCACCTATGCCGAATCAGGTCTTCGGTTACAAGAAAA
GCCTACACAAGCGACGACGAGCTTGATGAGCTCAGTTCACCGTTGGCTGTTGTCCTTCTT
CAACATTCGGATTCTAACAAGGTCAATAATGTGGGTGCAGATGAGACAGTCAGGTATCAA
CTTCTCAGGGAGTGTTGGACCAACGGGGACTGACCAGACATTGATGTGTGTTTTCTGTTT
CAATTGTGACTTCTGAAGGTATTATTATGTGTCTTTGCCAGTTCGTTGTTTGGTATTGCT
ATGTATAGAGAATGTAGCCCGAACTCTAATTAACAGAAGTAACAGTATCAAAGACATGTT
TACACTCTTGAAATAGAATGTTGCCCGAGCGGAGTGTGTGTTAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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G

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G

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TCTCCACTATCATTGGAGACTTTGGACAGCCTCAAGCGCCTCACCTATGCCGAATCAGGT
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C

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DS 



AS 1 5

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TTACGGAAGAAAGAGAAGCTGCTACTTGTTTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGA
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AATCTCCTGGTGAGGCTCGTGGGTTTGATCTTATGGCGGAGGAACCGGTTCATCCGGTAG
AGGAAGTACCGCCAGAGCTTCAACTAGGACTTGGGAACAAGACAATATTGAGGGGAGACG
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CTTCAGTGTTTGTTGTAAAAC


BQ
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35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F584TF U 1
AF RR4BH68TF U 1
AF RR4F584JQ C 390
AF RR4BH68JQ C 268
AF RR4G263TF U 307
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BS 465 581 RR4BH68TF
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BS 783 816 RR4BH68TF
BS 817 989 RR4G263TF
BS 990 990 RR4BH68JQ
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BS 1073 1094 RR4G263TF
BS 1095 1101 RR4BH68JQ

RD RR4F584TF 755 0 0
GC
ACAGAAACCGCAAGAGAAAAAAACTTTAAAGAGAAGAGGAAGAAGCAAAGGGAGGAGGTA
GCCGAAGAAGAATATCAAAATACACTCGAATGCTTTCATTTGTTATCTTATTT*GAGAAA
ACATATAATTCTCCAACCTTTCGAACCACTACTACGTTTGGTTCACGTCGCTTGGTCCAG
AGAATGAATCCGTTCATCGTATCCTCCACAAGCTCACCTCCTCCTGTTGCTAATCATCTC
GCGGCGAAGCGAAAGAGAGGCCGTCCACGTAAGGATGCATCCATGACTCAGCCAGAAAGT
TCTCGAGGGACGACTCCAAAGGAGGACGTTAATCTGGTTGGTAAGACCATTTCTGGTGAG
GTCGAAGGATCTTTCGAAGCGGGGTTCATCATCAATGTGAAGGTGAAAGAAAGTGACATG
AGACTGAGAGGTCTTGTGTTCGCACGGGGGAAAGTCGTTCCTGTGACTCCAGAAAACGAC
GTGGCTCCTCATGTCAAAATGATCGTAAGAGAAGAGATTAAGAAACACACTGATGATCGT
GATCAATCTCCTAATGATCAGACAGTGAAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAA
TGTGCTCGAGCATTGTTTTTACTACCACATGGGATAAATGGAGAAGACCCCAGGGAAGTT
ACG*AAGAAAGAGAAGCTGCTACTTGTTTGGTGGAGTTTTT**AAACTCCAGAGACGAC*
ACAGTGACTCCTCA*CATAGTCTTGTCATGGCA

QA 3 755 3 755
DS 

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TAGCCGAAGAAGAATATCAAAATACACTCGAATGCTTTCATTTGTTATCTTATTTTGAGA
AAACATATAATTCTCCAACCTTTCGAACCACTACTACGTTTGGTTCACGTCGCTTGGTCC
AGAGAATGAATCCGTTCATCGTATCCTCCACAAGCTCACCTCCTCCTGTTGCTAATCATC
TCGCGGCGAAGCGAAAGAGAGGCCGTCCACGTAAGGATGCATCCATGACTCAGCCAGAAA
GTTCTCGAGGGACGACTCCAAAGGAGGACGTTAATCTGGCTGGTAAGACCATTTCTGGTG
AGGTCGAAGGATCTTTCGAAGCGGGGTTCATCATCAATGTGAAGGTGAAAGAAAGTGACA
TGAGACTGAGAGGTCTTGTGTTCGCACGGGGGAAAGTCGTTCCCGTGACTCCAGAAAACG
ACGTGGCTCCTCATGTCAAAATGATCGTAAGAGAAGAGATTAAGAAACACACTGATGATC
GTGATCAATCTCCTAATGATCAGACAGTGAAAGATGCTGTCACTGACTCGGAGATGTCTG
AATGTGCTCGAGCATTGTTTTTACTACCACATGGGATAAATGGAGAAGACCCCAGGGAAG
TTACGGAAGAAAGAGAAGCTGCTACTTGTTTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGA
CCACAGTGACTCCTCAACATAGTCTTGTCATGGCACGGAAAGAGACCAACGCGCAACATA
A*TCTCCTGGTGAGGCTCGTGGGTTTGATCTTATGG

QA 1 816 1 816
DS 

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GGGAAAGTCGTTCCTGTGACTCCAGAAAACGACGTGGCTCCTCATGTCAAAATGATCGTA
AGAGAAGAGATTAAGAAACACACTGATGATCGTGATCAATCTCCTAATGATCAGACAGTG
AAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTCGAGCATTGTTTTTACTACCA
CATGGGATAAATGGAGAAGACCCCAGGGAAGTTACGGAAGAAAGAGAAGCTGCTACTTGT
TTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGACCACAGTGACTCCTCAACATAGTCTTGTC
ATGGCACGGGAAGAGACCAACGCGCAACATAAATCTCCTGGTGAGGCTCGTGGGTTTGAT
CTTATGGCGGAGGAACCGGTTCATCCGGTAGAGGAAGTACCGCCAGAGCTTCAACTAGGA
CTTGGGAACAAGACAATATTGAGGGGAGACGACAACAAAAACAGCACCGCAATGGAGATA
GATCCTAAAAGCTCTGTGTCTAGGAATGGCATAGCG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4BH68JQ 834 0 0
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TCATCATCAATGTGAAGGTGAAAGAAAGTGACATGAGACTGAGAGGTCTTGTGTTCGCAC
GGGGGAAAGTCGTTCCCGTGACTCCAGAAAACGACGTGGCTCCTCATGTCAAAATGATCG
TAAGAGAAGAGATTAAGAAACACACTGATGATCGTGATCAATCTCCTAATGATCAGACAG
TGAAAGATGCTGTCACTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTCGAGCATTGTTTTTACTAC
CACATGGGATAAATGGAGAAGACCCCAGGGAAGTTACGGAAGAAAGAGAAGCTGCTACTT
GTTTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGACCACAGTGACTCCTCAACATAGTCTTG
TCATGGCACGGAAAGAGACCAACGCGCAACATAAATCTCCTGGTGAGGCTCGTGGGTTTG
ATCTTATGGCGGAGGAACCGGTTCATCCGGTAGAGGAAGTACCGCCAGAGCTTCAACTAG
GACTTGGGAACAAGACAATATTGAGGGGAGACGACAACAAAAACAGCACCGCAATGGAGA
TAGATCCTAAAAGCTCTGTGTCTAGGAATGGCATAGCGAACTTGTTTAAAGGAAAAGAAA
AGGTCGACTATTAGTTTAAAACTCTCTCTTTTATATTTCAGACTCTTCAATACATTTCTT
CTCTCTTTTGTTTCAGTACTTTGTATTATCAGACTTCAGTGTTTGTTGTAAAAC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4G263TF 788 0 0
GAGGGACGACTCCAAAGGAGGACGTTAATCTGGTTGGTAAGACCATTTCTGGTGAGGTCG
AAGGATCTTTCGAAGCGGGGTTCATCATCAATGTGAAGGTGAAAGAAAGTGACATGAGAC
TGAGAGGTCTTGTGTTCGCACGGGGGAAAGTCGTTCCTGTGACTCCAGAAAACGACGTGG
CTCCTCATGTCAAAATGATCGTAAGAGAAGAGATTAAGAAACACACTGATGATCGTGATC
AATCTCCTAATGATCAGACAGTTAAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTG
CTCGAGCATTGTTTTTACTACCACATGGGATAAATGGAGGAGACCCCAGGGAAGTTACGG
AAGAAAGAGAAGCTGCTACTTGTTTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGACCACAG
TGACTCCTCAACATAGTCTTGTCATGGCACGGAAAGAGACCAACGCGCAACATAAATCTC
CTGGTGAGGCTCGTGGGTTTGATCTTATGGCGGAGGAACCGGTTCATCCGGTAGAGGAAG
TACCGCCAGAGCTTCAACTAGGACTTGGGAACAAGACAATATTGAGGGGAGACGACAACA
AAAACAGCACCGCAATGGAGATAGATCCTAAAAGCTCTGTGTCTAGGAATGGCATAGCGA
ACTTGTTTAAAGGAAAAGAAAAG*TCGACTATTAGTTTAAA*CTCTCTCTTTTATATTTC
AGACTCTTCAATACATT*CTTCTCTCTTT*GTTTCAGTACTTTGT*TTATCAGACTTCAG
TGTTTGTT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 5

CO CL1973Contig1 1391 5 12 U
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CTCACACGAAGTGGTTGAGACTAGGCCTAGTTGAGACTGTTGCCATAAATAAACAAAAGC
TCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTGATTGATTGATTGTTTGGTAGGTTCGACGAAAGCTTTGA
TCTTTTGCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGCCGGAAAGTGGCTGTTCCGGG
CTCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACGACGACGTCGTGTGGATCAGAAACCGTGAA
GTCATTGAACCTCTACTCTGCTATTAACCAAGCTCTTCACATCGCCTTGGAAACCGATCC
TCGGTCTTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGCTGCACAACAGG
ATTAGCTGAACGGTTCGGGAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGTGAACAAGGCAT
TGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTAGAAATTCAATT
TGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCAAAGTTCAGATA
CCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCGTATGGGGCGGT
TGGTCATGGTGGACATTACCATTCGCAATCCCCTGAGGCTTTCCTCTGCCATGTCCCTGG
CATTAAGGTTGTTATCCCTCGGAGTCCACGAGAAGCTAAGGGACTGCTCTTGTCCTCTAT
CCGTGATCCTAATCCTGTTGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGTCAAGCGGTAGA
AGAAGTCCCAGAGCATGACTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTTATTAGACAAGG
CAATGACATAACACTTGTTGGATGGGGAGCTCAGCTTACCGTTATGGAACAAGCTTGTCT
AGACGCGGAGAAGGAAGGAATATCATGTGAACTGATAGATCTCAAGACTCTACTACCTTG
GGACAAAGAAACAGTGGAGGCCTCTGTTAAAAAGACTGGCAGGCTTCTTATAAGCCATGA
AGCTCCTGTGACAGGAGGTTTTGGAGCAGAGATCTCCGCAACAATCCTCGAACGTTGCTT
CTTGAAGTTAGAAGCGCCAGTAAGCAGAGTTTGTGGTCTGGACACTCCATTCCCTCTTGT
GTTTGAGCCGTTCTACATGCCCACCAAGAACAAGATATTGGATGCAATCAAGTCCACTGT
CAATTACTAGCCATCCATTATGTTTCTTTGGAAAACTTGAAGAATTATTGTTTGTTATGT
ATTATGTAGCTATTTATGCGGTACTGTTGTGTTTATATGACAAACTGATAAGCAACGAAT
TGCCTAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA72TF U 1
AF RR4GR15TF U 219
AF RR4AD84TF U 236
AF RR4AD84JQ C 544
AF RR4GR15JQ C 787
BS 1 413 RR4AA72TF
BS 414 414 RR4GR15TF
BS 415 545 RR4AA72TF
BS 546 546 RR4GR15TF
BS 547 684 RR4AA72TF
BS 685 685 RR4AD84TF
BS 686 703 RR4AA72TF
BS 704 704 RR4AD84TF
BS 705 721 RR4AA72TF
BS 722 970 RR4AD84TF
BS 971 1376 RR4AD84JQ
BS 1377 1391 RR4GR15JQ

RD RR4AA72TF 721 0 0
GGAACTTAGAAAAATCTGTTTTCTTTCAGCTTAAAGGACAAACCTTTTTTGATCCTATCT
CTCACACGAAGTGGTTGAGACTAGGCCTAGTTGAGACTGTTGCCATAAATAAACAAAAGC
TCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTGATTGATTGATTGTTTGGTAGGTTCGACGAAAGCTTTGA
TCTTTTGCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGCCGGAAAGTGGCTGTTCCGGG
CTCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACGACGACGTCGTGTGGATCAGAAACCGTGAA
GTCATTGAACCTCTACTCTGCTATTAACCAAGCTCTTCACATCGCCTTGGAAACCGATCC
TCGGTCTTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGCTGCATAACAGG
ATTAGCTGAACGGTTCGGGAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGTGAACAAGGCAT
TGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTAGAAATTCAATT
TGCAGGCTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCAAAGTTCAGATA
CCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCGTATGGGGCGGT
TGGTCATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGGCTTTCTTCTGCCATGTCCCTGG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4GR15TF 503 0 0
GCCGGAAAGTGGCTGTTCCGGGCTCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACGACGACGT
CGTGTGGATCAGAAACCGTGAAGTCATTGAACCTCTACTCTGCTATTAACCAAGCTCTTC
ACATCGCCTTGGAAACCGATCCTCGGTCTTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTG
GAGTCTTCCGCTGCACAACAGGATTAGCTGAACGGTTCGGGAAAAACCGTGTCTTCAACA
CTCCTCTTTGTGAACAAGGCATTGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATC
GAGCAGTTGTAGAAATTCAATTTGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTA
ATGAAGCTGCAAAGTTCAGATACCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAA
TAAGAGCACCGTATGGGGCGGTTGGTCATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGG
CTTTCTTCTGCCATGTCCCTGGC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4AD84TF 735 0 0
GG
GGGCTCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACGACGACGTCGTGTGGATCAGAAACCGT
GAAGTCATTGAACCTCTACTCTGCTATTAACCAAGCTCTTCACATCGCCTTGGAAACCGA
TCCTCGGTCTTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGCTGCACAAC
AGGATTAGCTGAACGGTTCGGGAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCACTTTGTGAACAAGG
CATTGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTAGAAATTCA
ATTTGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCAAAGTTCAG
ATACCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCGTATGGGGC
GGTTGGTCATGGTGGACATTACCATTCGCAATCCCCTGAGGCTTTCCTCTGCCATGTCCC
TGGCATTAAGGTTGTTATCCCTCGGAGTCCACGAGAAGCTAAGGGACTGCTCTTGTCCTC
TATCCGTGATCCTAATCCTGTTGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGTCAAGCGGT
AGAAGAAGTCCCAGAGCATGACTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTTATTAGACA
AGGCAATGACATAACACTTGTTGGATGGGGAGCTCAGCTTACCGTTATGGAACAAGCTTG
TCTAGACGCGGAG

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR4AD84JQ 833 0 0
AGA
CTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCAAAGTTCAGATACCGAAG
TGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCGTATGGGGCGGTTGGTCA
TGGTGGACATTACCATTCGCAATCCCCTGAGGCTTTCCTCTGCCATGTCCCTGGCATTAA
GGTTGTTATCCCTCGGAGTCCACGAGAAGCTAAGGGACTGCTCTTGTCCTCTATCCGTGA
TCCTAATCCTGTTGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGTCAAGCGGTAGAAGAAGT
CCCAGAGCATGACTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTTATTAGACAAGGCAATGA
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CTAGCCATCCATTATGTTTCTTTGGAAAACTTGAAGAATTATTGTTTGTTATGTATTATG
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DS 

RD RR4GR15JQ 605 0 0
TCCTAATCCTGTTGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGTCAAGCGGTAGAAGAAGT
CCCAGAGCATGACTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTTATTAGACAAGGCAATGA
CATAACACTTGTTGGATGGGGAGTTCAGCTTACCGTTATGGAACAAGCTTGTCTAGACGC
GGAGAAGGAAGGAATATCATGTGAACTGATAGATCTCAAGACTCTACTACCTTGGGACAA
AGAAACAGTGGAGGCCTCTGTTAAAAAGACTGGCAGGCTTTTTATAAGCCATGAAGCTCC
TGTGACAGGAGGTTTTGGAGCAGAGATCTCTGCAACAATCCTCGAACGTTGCTTCTTGAA
GTTAGAAGCGCCAGTAAGCAGAGTTTGTGGTCTGGACACTCCATTCCCTCTTGTGTTTGA
GCCGTTCTACATGCCCACCAAGAACAAGATATTGGATGCAATCAAGTCCACTGTCAATTA
CTAGCCATCCATTATGTTTCTTTGGGAAACTTGAAGAATTATTGTTTGTTATGTATTATG
TAGCTATTTATGTGGTACTGTTGTGTTTATATGACAAACTGATAAGCAACGAATTGCCTA
AACCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 5

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GGATACTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTCTCAAACCCGAGTCTTGTCTGAAGAAA
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TGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCACCGCTA
CGTCGTCTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAACCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCC
AGCAGAGAGCTACGACGACTTCTTGGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGT
TTACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGC
ATGGTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAG
GTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGT
TGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAAGGGATATATTTGTTCTCTCTATTTA
AGAAAAATACTCTTTATGGTGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTC
TCGTGGGTGCATCTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACT
CCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTACAAACAAGCCTCTTTGCAAAAAAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH16TF U 1
AF RR4G155TF U 1
AF RR4FQ67JQ C 31
AF RR4FQ67TF U 2
AF RR4G155JQ C 12
BS 1 151 RR4EH16TF
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BS 564 713 RR4G155TF

RD RR4EH16TF 563 0 0
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GCAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGACTTAGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGG
TGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACTAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCACCGCTA
CGTCGTCTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAACCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCC
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TTACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGC
ATGGTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAG
GTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGT
TGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAAGGGATATATTTGTTCTCTCTATTTA
AGAAAAATACTCTTTATGGTGTA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4G155TF 713 0 0
G
GATACTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTCTCAAACCCGATTCTTGTCTGAAGAAAG
CAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGACTTAGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGT
GTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCACCGCTAC
GTCGTCTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAACCAAGTGGTGTTTGAGAAACCAGGGAACCCA
GCAGAGAGCTACGACGACTTCTTGGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTT
TACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCA
TGGTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGG
TTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTT
GATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAAGGGATATATTTGTTCTCTCTATTTAA
GAAAAATACTCTTTATGGTGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCT
CGTGGGTGCATCTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTC
CAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTACAAACAAGCCTCTTTGCAAAAAAAA

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR4FQ67JQ 675 0 0
TCTCTCAAACCCGAGTCTTGTCTGAAGAAAGCAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGACT
TAGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGTGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCA
CGAGCTCCAGAGGAAGAAGGCTCACCGCTACGTCGTCTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAA
CCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCCAGCAGAGAGCTACGACGACTTCTTGGCTTC
TCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAA
TTGCCAGAAGAGCAAAATCTTTTTCGTCGCATGGTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGC
GAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTA
CGAGACTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTTGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAA
CTGAAGGGATATATTTGTTCTCTCTATTTAAGAAAAATACTCTTTATGGTGTAATGTAAT
GAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCTCGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTC
TTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTATA
AACAAGCCTCTTTG
T

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4FQ67TF 704 0 0
GATACTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTCTCAAACCCGAGTCTTGTCTGAAGAAAG
CAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGACTTAGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGT
GTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGAGGAAGAAGGCTCACCGCTAC
GTCGTCTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAACCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCCA
GCAGAGAGCTACGACGACTTCTTGGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTT
TACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCA
TGGTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGG
TTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGACTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTT
GATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAAGGGATATATTTGTTCTCTCTATTTAA
GAAAAATACTCTTTATGGTGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCT
CGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTC
CAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTATAAACAAGCCTCTTTG
T

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4G155JQ 694 0 0
TTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTCTCAAACCCGATTCTTGTCTGAAGAAAGCAGAATCAAT
CCATGTCTTTCCGAGGACTTAGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGTGTTGCGGATC
AGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCACCGCTACGTCGTCTTCA
AGATCGATGAGCTCAAAAACCAAGTGGTGTTTGAGAAACCAGGGAACCCAGCAGAGAGCT
ACGACGACTTCTTGGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTACGACTTTG
ATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCAT
CGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAG
AGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTTGATCTTGATG
TCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAAGGGATATATTTGTTCTCTCTATTTAAGAAAAATACT
CTTTATGGTGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCTCGTGGGTGCA
TCTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGT
TTCAGATTACTCATCTACAAACAAGCCTCTTTG
C

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 5

CO CL1975Contig1 665 5 7 U
AGATCCATGAAAATATATCTATTGTCTTGCAAAGATAGAGAAAAATGTAACAAAATCTCT
TTCAACAACACAAAAAGGAGAGACTTTAAAAAAAAA*CAAAGAAAGCTTTTAAGCTGCTG
ATTTCTTTGACTTGGCTGCCAACTGCGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGACTCTTCCTTCT
CAGACAAAATCAACTCAATGTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGATTGATTCTTCCGTGGG
CACGGTAAGTCCTTCTCCTTTGCTTTGCAGCCTGGTTAACTTGGATGTGAGATATGAAGA
GTGCATCAACATCCAAACCTTTCACCTCAGCGTTGCTCTCAGCGTTCTTAAGCAAATCGA
GAACGAACTGAGCAGATTTCGCAGGCCAACGTCCCTGACCGTTAGAGTGCCTGTTCTTGG
CTTGGGCAGTCCTTCCAACACCTCTGCAGAAACGGGTGAAGGGAATGGCTTGCTTGTGAG
CTATCACGTCTTCAAGGTATCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCG
CTGTTTCACGGGTGTTCTTGAAGTGAACCCTAAGGTCGGAACCTCTAGCCTTGCAGGACT
TGGTCTGATTGTCGGGTTCTTGCGAGTACTTCACCATGGCTGCTAAACGGAAGAATTGGC
TGCCC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 

AF RR4DS88JQ U 1
AF RR4DS88TF C 1
AF RR4DE90JQ U 2
AF RR4DE90TF C 2
AF RR4B750JQ U 26
BS 1 96 RR4DS88JQ
BS 97 97 RR4DE90JQ
BS 98 388 RR4DS88JQ
BS 389 389 RR4DE90JQ
BS 390 415 RR4DS88JQ
BS 416 416 RR4DE90JQ
BS 417 665 RR4DS88JQ

RD RR4DS88JQ 665 0 0
AGATCCATGAAAATATATCTATTGTCTTGCAAAGATAGAGAAAAATGTAACAAAATCTCT
TTCAACAACACAAAAAGGAGAGACTTTAAAAAAAAAACAAAGAAAGCTTTTAAGCTGCTG
ATTTCTTTGACTTGGCTGCCAACTGCGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGACTCTTCCTTCT
CAGACAAAATCAACTCAATGTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGATTGATTCTTCCGTGGG
CACGGTAAGTCCTTCTCCTTTGCTTTGCAGCCTGGTTAACTTGGATGTGAGATATGAAGA
GTGCATCAACATCCAAACCTTTCACCTCAGCGTTGCTCTCAGCGTTCTTAAGCAAATCGA
GAACGAACTGAGCAGATTTCGCAGGCCAGCGTCCCTGACCGTTAGAGTGCCTGTTATTGG
CTTGGGCAGTCCTTCCAACACCTCTGCAGAAACGGGTGAAGGGAATGGCTTGCTTGTGAG
CTATCACGTCTTCAAGGTATCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCG
CTGTTTCACGGGTGTTCTTGAAGTGAACCCTAAGGTCGGAACCTCTAGCCTTGCAGGACT
TGGTCTGATTGTCGGGTTCTTGCGAGTACTTCACCATGGCTGCTAAACGGAAGAATTGGC
TGCCC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4DS88TF 665 0 0
AGA
TCCATGAAAATATATCTATTGTCTTGCAAAGATAGAGAAAAATGTAACAAAATCTCTTTC
AACAACACAAAAAGGAGAGACTTTAAAAAAAAAACAAAGAAAGCTTTTAAGCTGCTGATT
TCTTTGACTTGGCTGCCAACTGCGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGACTCTTCCTTCTCAG
ACAAAATCAACTCAATGTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGATTGATTCTTCCGTGGGCAC
GGTAAGTCCTTCTCCTTTGCTTTGCAGCCTGGTTAACTTGGATGTGAGATATGAAGAGTG
CATCAACATCCAAACCTTTCACCTCAGCGTTGCTCTCAGCGTTCTTAAGCAAATCGAGAA
CGAACTGAGCAGATTTCGCAGGCCAGCGTCCCTGACCGTTAGAGTGCCTGTTATTGGCTT
GGGCAGTCCTTCCAACACCTCTGCAGAAACGGGTGAAGGGAATGGCTTGCTTGTGAGCTA
TCACGTCTTCAAGGTATCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTG
TTTCACGGGTGTTCTTGAAGTGAACCCTAAGGTCGGAACCTCTAGCCTTGCAGGACTTGG
TCTGATTGTCGGGTTCTTGCGAGTACTTCACCATGGCTGCTAAACGGAAGAATTGGCTGC
CC

QA 4 665 4 665
DS 

RD RR4DE90JQ 664 0 0
GG
TCCATGAAAATATATCTATTGTCTTGCAAAGATAGAGAAAAATGTAACAAAATCTCTTTC
AACAACACAAAAAGGAGAGACTTTAAAAAAAAA*CAAAGAAAGCTTTTAAGCTGCTGATT
TCTTTGACTTGGCTGCCAACTGCGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGACTCTTCCTTCTCAG
ACAAAATCAACTCAATGTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGATTGATTCTTCCGTGGGCAC
GGTAAGTCCTTCTCCTTTGCTTTGCAGCCTGGTTAACTTGGATGTGAGATATGAAGAGTG
CATCAACATCCAAACCTTTCACCTCAGCGTTGCTCTCAGCGTTCTTAAGCAAATCGAGAA
CGAACTGAGCAGATTTCGCAGGCCAACGTCCCTGACCGTTAGAGTGCCTGTTCTTGGCTT
GGGCAGTCCTTCCAACACCTCTGCAGAAACGGGTGAAGGGAATGGCTTGCTTGTGAGCTA
TCACGTCTTCAAGGTATCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTG
TTTCACGGGTGTTCTTGAAGTGAACCCTAAGGTCGGAACCTCTAGCCTTGCAGGACTTGG
TCTGATTGTCGGGTTCTTGCGAGTACTTCACCATGGCTGCTAAACGGAAGAATTGGCTGC
CC

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4DE90TF 664 0 0
GG
TCCATGAAAATATATCTATTGTCTTGCAAAGATAGAGAAAAATGTAACAAAATCTCTTTC
AACAACACAAAAAGGAGAGACTTTAAAAAAAAA*CAAAGAAAGCTTTTAAGCTGCTGATT
TCTTTGACTTGGCTGCCAACTGCGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGACTCTTCCTTCTCAG
ACAAAATCAACTCAATGTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGATTGATTCTTCCGTGGGCAC
GGTAAGTCCTTCTCCTTTGCTTTGCAGCCTGGTTAACTTGGATGTGAGATATGAAGAGTG
CATCAACATCCAAACCTTTCACCTCAGCGTTGCTCTCAGCGTTCTTAAGCAAATCGAGAA
CGAACTGAGCAGATTTCGCAGGCCAACGTCCCTGACCGTTAGAGTGCCTGTTCTTGGCTT
GGGCAGTCCTTCCAACACCTCTGCAGAAACGGGTGAAGGGAATGGCTTGCTTGTGAGCTA
TCACGTCTTCAAGGTATCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTG
TTTCACGGGTGTTCTTGAAGTGAACCCTAAGGTCGGAACCTCTAGCCTTGCAGGACTTGG
TCTGATTGTCGGGTTCTTGCGAGTACTTCACCATGGCTGCTAAACGGAAGAATTGGCTGC
CC

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4B750JQ 640 0 0
CTTGCAAAGATAGAGAAAAAAGTAACAAAATCTCTTTCAACAACACAAAAAGGAGAGACT
TTAAAAAAAAA*CAAAGAAAGCTTTTAAGCTGCTGATTTCTTTGACTTGGCTGCCAACTG
CGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGACTCTTCCTTCTCAGACAAAATCAACTCAATGTGGCA
TGGGTTGGACATGTAAGGATTGATTCTTCCGTGGGCACGGTAAGTCCTTCTCCTTTGCTT
TGCAGCCTGGTTAACTTGGATGTGAGATATGAAGAGTGCATCAACATCCAAACCTTTCAC
CTCAGCGTTGCTCTCAGCGTTCTTAAGCAAATCGAGAACGAACTGAGCAGATTTCGCAGG
CCAACGTCCCTGACCGTTAGAGTGCCTGTTCTTGGCTTGGGCAGTCCTTCCAACACCTCT
GCAGAAACGGGTGAAGGGAATGGCTTGCTTGTGAGCTATCACGTCTTCAAGGTATCTCTT
CGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTGTTTCACGGGTGTTCTTGAAGTG
AACCCTAAGGTCGGAACCTCTAGCCTTGCAGGACTTGGTCTGATTGTCGGGTTCTTGCGA
GTACTTCACCATGGCTGCTAAACGGAAGAATTGGCTGCCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 4

CO CL1976Contig1 771 2 8 U
GGAACAAAGAAAACTCTCTCTCAAGGCTTTTCTCTATAAGATCTCTCGTTCATATTCCCA
GAGAAGAACACGACTGACTGATTTCATCTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCG
GCGCCGGCGGGGGTCTAGGCCACGCATCTCCCGATTCCCCAACTCTCGACACCTCGGAGC
AAGTCTACATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGC
CTATGGAGGTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGAGTTG
CGGATGTATTCGCGATGCCGCAGAGTGGGACTGGTGTGAGTGTTGAAGCTGTTGATCATG
TTTTTCAGACTAATATGCTTGACATGCTTAAACAGACTGGCAGACCTGAAATGGTGGTGG
GTTGGTATCATTCACATCCTGGGTTTGGATGCTGGCTTTCCGGTGTTGATATTAATACTC
AACAGAGTTTTGAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTAGCTGTGGTGGTTGATCCTATTCAGA
GTGTGAAGGGTAAAGTGGTGATTGATGCTTTCCGCTCGATAAACCCTCAGACCATTATGC
TTGGGCAAGAGCCTCGTCAAACAACGTCCAACCTTGGCCACCTGAACAAACCATCGATCC
AGGCCTTGATTCATGGATTGAACAGACACTATTATTCAATAGCCATCAACTACAGGAAGA
ACGAGCTCGAGGAGAAGATGTTACTTAACCTCCACAAGAAGACATGGACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AA35TF U 1
AF RR4BM83TF U 68
BS 1 300 RR4AA35TF
BS 301 301 RR4BM83TF
BS 302 681 RR4AA35TF
BS 682 682 RR4BM83TF
BS 683 704 RR4AA35TF
BS 705 705 RR4BM83TF
BS 706 750 RR4AA35TF
BS 751 771 RR4BM83TF

RD RR4AA35TF 750 0 0
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GAGAAGAACACGACTGACTGATTTCATCTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCG
GCGCCGGCGGGGGTCTAGGCCACGCATCTCCCGATTCCCCAACTCTCGACACCTCGGAGC
AAGTCTACATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGC
CTATGGAGGTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGAGTTG
TGGATGTATTCGCGATGCCGCAGAGTGGGACTGGTGTGAGTGTTGAAGCTGTTGATCATG
TTTTTCAGACTAATATGCTTGACATGCTTAAACAGACTGGCAGACCTGAAATGGTGGTGG
GTTGGTATCATTCACATCCTGGGTTTGGATGCTGGCTTTCCGGTGTTGATATTAATACTC
AACAGAGTTTTGAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTAGCTGTGGTGGTTGATCCTATTCAGA
GTGTGAAGGGTAAAGTGGTGATTGATGCTTTCCGCTCGATAAACCCTCAGACCATTATGC
TTGGGCAAGAGCCTCGTCAAACAACGTCCAACCTTGGCCACCTGAACAAACCATCGATCC
AGGCCTTGATTCATGGATTGAGCAGACACTATTATTCAATAGCCGTCAACTACAGGAAGA
ACGAGCTCGAGGAGAAGATGTTACTTAACC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4BM83TF 704 0 0
G
CACGACTGACTGATTTCATCTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGCGCCGGC
GGGGGTCTAGGCCACGCATCTCCCGATTCCCCAACTCTCGACACCTCGGAGCAAGTCTAC
ATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGCCTATGGAG
GTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGAGTTGCGGATGTA
TTCGCGATGCCGCAGAGTGGGACTGGTGTGAGTGTTGAAGCTGTTGATCATGTTTTTCAG
ACTAATATGCTTGACATGCTTAAACAGACTGGCAGACCTGAAATGGTGGTGGGTTGGTAT
CATTCACATCCTGGGTTTGGATGCTGGCTTTCCGGTGTTGATATTAATACTCAACAGAGT
TTTGAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTAGCTGTGGTGGTTGATCCTATTCAGAGTGTGAAG
GGTAAAGTGGTGATTGATGCTTTCCGCTCGATAAACCCTCAGACCATTATGCTTGGGCAA
GAGCCTCGTCAAACAACGTCCAACCTTGGCCACCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTG
ATTCATGGATTGAACAGACACTATTATTCAATAGCCATCAACTACAGGAAGAACGAGCTC
GAGGAGAAGATGTTACTTAACCTCCACAAGAAGACATGGACAG

QA 2 704 2 704
DS 



CO CL1976Contig2 1159 2 14 U
GGGACGCCCGATTTCATCTAATCCATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGCGCCGGCGGG
GGTCTAGGTCACGCATCTCCCGATTCCCCCACTCTCGACACCTCGGAGCAAGTCTACATC
TCCTCTCTCGCCCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTTCCTATGGAGGTT
ATGGGATTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTGAGAGTTGTGGATGTTTTC
GCCATGCCTCAGAGTGGGACAGGTGTTAGTGTTGAAGCTGTTGATCATGTTTTCCAGACT
AATATGCTCGACATGCTTAAACAGACTGGAAGACCTGAAATGGTGGTGGGTTGGTATCAT
TCACATCCTGGGTTTGGATGCTGGCTTTCCGGTGTTGATATTAATACTCAACAGAGTTTT
GAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTAGCTGTGGTGGTTGATCCTATTCAGAGTGTGAAGGGG
AAAGTGGTGATTGATGCCTTCCGCTCGATAAACCCTCAGACCATTATGCTTGGGCAAGAG
CCTCGTCAAACAACGTCCAACCTTGGCCACCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTGATT
CATGGATTGAACAGACACTATTATTCAATAGCCATCAACTACAGGAAGAACGAGCTCGAG
GAGAAGATGTTACTAAACCTCCACAAGAAGAAATGGACAGATGGCCTGACGCTAAGACGC
TTTGACACCCACTCCAAGACAAACGAACAGACGGTGCAGGAAATGTTGAACTTGGCTGCT
AAGTATAACAAGGCGGTACAAGAGGAGGACGAGTTGTCACCGGAGAAACTGGCGATTGTG
AATGTGGGAAGACAAGACGCAAAGAAGCATCTGGAAGAACATGTTTCCAACTTGACGTCT
TCCAACATTGTTCAGACACTAGGCACCATGCTTGACACTGTTGTCTTCTAGAGAGCTTCT
TCACTTTTCCAGCCAGTAATTGCTATGGTTCAATCAGTTGGCTAGAATGTTGAGCTTTGT
TCTTCTTATGCACCTCTTTGTTTTCTGTTGAATCTTCTCTTATGTCCTACCTCCTAGCAC
TTGATAAGTTTGTATTGTACTATCCGGTTTCCTTCTTTCTATGAAGGCCATGGATTGATT
ACTATTTCATTCAAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FG90TF U 1
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GGTCTAGGTCACGCATCTCCCGATTCCCCCACTCTCGACACCTCGGAGCAAGTCTACATC
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GCCATGCCTCAGAGTGGGACAGGTGTTAGTGTTGAAGCTGTTGATCATGTTTTCCAGACT
AATATGCTCGACATGCTTAAACAGACTGGAAGACCTGAAATGGTGGTGGGTTGGTATCAT
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GAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTAGCTGTGGTGGTTGATCCTATTCAGAGTGTGAAGGGG
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CATGGATTGAACAGACACTATTATTCGATAGCCATCAACTACAGGAAGAACGAGCTCGAG
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TTTGACACTCACTC
CA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4AA35JQ 820 0 0
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ATTAATACTCAACAGAGTTTTGAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTAGCTGTGGTGGTTGAT
CCTATTCAGAGTGTGAAGGGTAAAGTGGTGATTGATGCTTTCCGCTCGATAAACCCTCAG
ACCATTATGCTTGGGCAAGAGCCTCGTCAAACAACGTCCAACCTTGGCCACCTGAACAAA
CCATCGATCCAGGCCTTGATTCATGGATTGAGCAGACACTATTATTCAATAGCCGTCAAC
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GATGGCCTGACGCTAAGACGCTTTGACACCCACTCCAAGACAAACGAACAGACGGTGCAG
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CATGTTTCCAACTTGACGTCTTCCAACATTGTTCAGACACTAGGCACCATGCTTGACACT
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TTATGTCCTACCTCCTAGCACTTGATAAGTTTGTATTGTACTATCCGGTTTCCTTCTTTC
TATGAAGGCCATGGATTGATTACTATTTCATTCAAAACTT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 4

CO CL1977Contig1 1171 4 12 U
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CTCTCAGACGAGACAGACGGAGAAGGGCAAGATCATCATCTCATAACAGCACCAAACAGC
GACATTGCGTATCTTCAAGACAGACCAGTGCGACTTGCTCGAGAGCTCCTCCAAGAACCA
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TATATTCTTTGGGTCTAGAAATGTAAAAAGATTTGAATTTAAAGTGAGAGCCCATGGTAG
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GCGATGCTATTAATTAGTATTCAATTTTTCA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ27TF U 1
AF RR4BL47JQ C 326
AF RR4CQ27JQ C 795
AF RR4AA84TF U 375
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BS 678 704 RR4CQ27TF
BS 705 705 RR4AA84TF
BS 706 733 RR4CQ27TF
BS 734 872 RR4AA84TF
BS 873 873 RR4BL47JQ
BS 874 1097 RR4AA84TF
BS 1098 1099 RR4BL47JQ
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BS 1102 1102 RR4BL47JQ
BS 1103 1171 RR4AA84TF

RD RR4CQ27TF 733 0 0
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TCAACCTGTAAGAAACAAAAAAAAAAAAGAGATCGTCCTTTTCCCTAATCTCCGATCCCC
AGATTCTTACAGATTTTAGGAGGGAGGTCATGATTGTTTGATTTTGGATTTGTATTGGGA
AGAGAGACAGTGATTGTTTGGTGGATCTGTGTAAAATGCGTGTGCTTGGATTGAGCTCAA
GCTTATGTTCATCTAACACCTGTCAACAATTATCTCTATTGGTTTGGTCTTGGCATCTTT
CACTCTGGTATTGAAGCTCATGGTTTCGAATATGGATATGGTGCTCACGAGTACTCAAGC
AGTGGGGTGTTTGAAGTTGAACCTAGGAACTGTCCTGGTTTCATCTTTAGGCGGTCAGTT
TTGTTGGGAACCACAAGCATGTCTCCCTCAGATTTCCGCTCGTTCATGGAGAAGCTTTCG
AGGAAGTATCATGGGGACACATACCATTTGATTGCCAAGAACTGTAACCATTTCACTGAA
GAAGTGTGCTTGCAGGTAACAGGAAAGCCTATTCCCGGATGGATTAACCGGATGGCTCGT
GTAGGTTCGTTCTGTAACTGTATCCTTCCAGAAAGCATACAGCTCTCAACTGTTGGACAG
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CTCTCAGACGAGA

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DS 

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AGCCTATTCCCGGATGGATTAACCGGATGGCTCGTGTAGGTTCGTTCTGTAACTGTATCC
TTCCAGAAAGCATACAGCTCTCAACTGTTGGACAGCCAGAAGCCCTTGAATTCTCTGATG
ATGATGATGGATCAGAAGAATCAGCTGCATCTTCTCTTTCAGACGAGACAGACGGAGAAG
GGCAAGATCATCATCTCATAACAGCACCAAACAGCGACATTGCGTATCTTCAAGACAGAC
CAGTGCGACTTGCTCGAGAGCTCCTCCAAGAACCAACCGATGGGTCTCCTATGTTGAGGC
GGTCTTGAGCTCTCTGAAGCATCCATCTCCCCCATGGAAATATCAACTATTGAAGCAAAA
GCAGAGTATTTGCCTGAAAATTTCCATCTTTTGAGTATATTCTTTGGGTCTAGAAATGTA
AAAAGATTTGAATTTAAAGTGAGAGCCCATGGTAGTGAGTTTTAACATTATGATGTGTAC
TTGTTGACAATATTTGTATTCCCTTTTCTCCTGAAGGCAACTCTTATCCTCTCTGAGTCA
CATTGCTGATTTGTGTGTCA
C

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DS 

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TATGTTGAGGCGGTCTTGAGCTCTCTGAAGCATCCATCTCCCCCATGGAAATATCAACTA
TTGAAGCAAAAGCAGAGTATTTGCCTGAAAATTTCCATCTTTTGAGTATATTCTTTGGGT
CTAGAAATGTAAAAAGATTTGAATTTAAAGTGAGAGCCCATGGTAGTGAGTTTTAACATT
ATGATGTGAACTTGTTGACAATATTTGTGTTCCCTTTTCTCCTGAAGGCAACTTTTATCC

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DS 

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G
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AGCATGTCTCCCTCAGATTTCCGCTCGTTCATGGAGAAGCTTTCGAGGAAGTATCATGGG
GACACATACCATTTGATTGCCAAGAACTGTAACCATTTCACTGAAGAAGTGTGCTTGCAG
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AACTGTATCCTTCCAGAAAGCATACAGCTCTCAACTGTTGGACAGCCAGAAGCCCTTGAA
TTCTCTGATGATGATGATGGATCAGAAGAATCAGCTGCATCTTCTCTCTCAGACGAGACA
GACGGAGAAGGGCAAGATCATCATCTCATAACAGCACCAAACAGCGACATTGCGTATCTT
CAAGACAGACCAGTGCGACTTGCTCGAGAGCTCCTCCAAGAACCAACCGATGGGTCTCCT
ATGTTGAGGCGGTCTTGGGCTCTCTGAAGCATCCATCTCCCCCATGGAAATATCAACTAT
TGAAGCAAAAGCAGAGTATTTGCCTGAAAATTTCCATCTTTTGAGTATATTCTTTGGGTC
TAGAAATGTAAAAAGATTTGAATTTAAAGTGAGAGCCCATGGTAGTGAGTTTTAACATTA
TGATGTGAACTTGTTGACAATATTTGTGTTCCCTTTTCTCCTGAAGGCAACTCTTATCCT
CT**GATTCACATTGCTGATTTGTGTGTCATACTTTATGATATCTGCGATGCTATTAATT
AGTATTCAATTTTTCA

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DS 



AS 2 5

CO CL1978Contig1 1279 3 15 U
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AAGATATTCAAAGAAATCGAAGAGATATGTCCACCACATTGTATTTTGGCGAGCAACACA
TCTACTATCGACCTCAACGTAATTGGGGAAAAAACTAACTCAAAAGATCGCATAGTTGGC
GCACATTTCTTCAGCCCGGCACATATCATGACCCTTCTCGAGATAGTTCGTACAGAGAAT
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TCTTTTGGCTTACCACTGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGACACGGGATTGGA
ATGGCAGTTAAGGAGATATATGCCAAGGTCTATGGTGACCGAATGTTTCAGTCTCCATTG
ACAGAGCTTCTGGTTAAGAGCGGACGAAATGGCAAAATCAACGGGAGAGGATACTATATT
TACGAGAAGGGAGGCAAACCAAAGCCTGATTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCG
AGGAAACTTACCAATATCATGCCCGGTGGGAAGCCTATATCAGTAACTGATAAAGAAATT
GTAGAGATGATCTTGTTCCCTGTGGTTAACGAGGCTTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTT
GTGATCCGAGCCTCTGACTTGGACGTTGCGTCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTAC
CGCGGGGGAATTGTTTTCTGGGCAGACACGGTTGGACCTAAGTACATATATGAAAGGCTC
AAGAGATTGTCCGAGACTTATGGAGGCTTTTTCAAACCATCAAGGTATCTGGAGGAAAGG
GCAATGAATGGGATGCTTCTGAGTGAACCTAAAGCGTCCAGGTCTCGAATGTGAATGCAC
AAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAGTAATCAGCAAATAAAACGTCTGAAACAACTACATGGA
GAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACTAAATGAGAGAATAAATAACTCTCTATTGTTAATTCTC
AAAGCAACAGTTAATAAGGTGTTTTGTTTTAACTTTTAAGCGCTTGAAAAGACGAATTAT
TATGTTCTTCACAAAACGTTTGTAGTGACTTCATTCTCATGTAATTGTTCGAATGGTTAA
GAATATAGTAAAACTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B188TF U 1
AF RR4BJ91TF U 251
AF RR4B188JQ C 444
BS 1 272 RR4B188TF
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BS 274 286 RR4B188TF
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BS 437 815 RR4B188TF
BS 816 941 RR4BJ91TF
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BS 943 1023 RR4BJ91TF
BS 1024 1279 RR4B188JQ

RD RR4B188TF 815 0 0
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AAGATATTCAAAGAAATCGAAGAGATATGTCCACCACATTGTATTTTGGCGAGCAACACA
TCTACTATCGACCTCAACGTAATTGGGGAAAAAACTAACTCAAAAGATCGCATAGTTGGC
GCACATTTCTTCAGCCCGGCACATATCATGACCCTTCTCGAGATAGTTCGTACAGAGAAT
ACTTCTGCTCAGGTGATCCTGGATCTCATGGCTCTTGGAAAGGCCATAAAGAAAGTTCCA
GTGGTGGTTGGAAACTGCATAGGCTTTGCAGTGAACAGGACATTCTTTCCGTATACACAA
GGTGCTCATATGTTGGTCAATCTAGGTGTTGACTTGTTCAGAGTCGACAGGGTTATCACC
TCTTTTGGCTTGCCATTGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGACACGGGATTGGA
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TACGAGAAGGGAGGCAAACCAAAGCCTGATTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCG
AGGAAACTTACCAATATCATGCCCGGTGGGAAGCCTATATCAGTAACTGATAAAGAAATT
GTAGAGATGATCTTGTTCCCTGTGGTTAACGAGGCTTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTT
GTGATCCGAGCCTCTGACTTGGACGTTGCGTCTGT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4BJ91TF 773 0 0
G
GGTGATCCTGGATCTCATGGCGCTTGGAAAGGCCACAAAGAAAGTCCCAGTGGTGGTTGG
AAACTGCATAGGCTTTGCAGTGAACAGGACATTCTTTCCGTATACACAAGGTGCTCATAT
GTTGGTCAATCTTGGTGTTGACTTGTTCAGAGTCGACAGGGTTATCACCTCTTTTGGCTT
ACCACTGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGACGCGGGATTGGAATGGCAGTTAA
GGAGATATATGCCAAGGTCTATGGTGACCGAATGTTTCAGTCTCCATTGACAGAGCTTCT
GGTTAAGAGCGGACGAAATGGCAAAATCAACGGGAGAGGATACTATATTTACGAAAAGGG
AAGCAAACCAAAGCCTGATTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCGAGGAAGCTTAC
CAATATCGTGCCCCATGGGAAGCCTATATCAGTAACTGATAAAGAAATTGTAGAGATGAT
TTTGTTCCCTGTGGTTAACGAAGCGTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGC
CTCTGACTTGGACGTTGCATCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGAAT
TGTTTTCTGGGCAGACACGGTTGGACCTAAGTACATATATGAAAGGCTCAAGAGATTGTC
CGAGACTTATGGAGGCTTTTTCAAACCATCGAGGTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAATGG
GATGCTTCTGAGTGAACCTAAAGCGTCCAGGTCTCGAATGTGAATGCACAAA

QA 2 773 2 773
DS 

RD RR4B188JQ 836 0 0
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CAAGGTCTATGGTGACCGAATGTTTCAGTCTCCATTGACAGAGCTTCTGGTTAAGAGCGG
ACGAAATGGCAAAATCAACGGGAGAGGATACTATATTTACGAGAAGGGAGGCAAACCAAA
GCCTGATTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCGAGGAAACTTACCAATATCATGCC
CGGTGGGAAGCCTATATCAGTAACTGATAAAGAAATTGTAGAGATGATCTTGTTCCCTGT
GGTTAACGAGGCTTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCTGACTTGGA
CGTTGCGTCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGAATTGTTTTCTGGGC
AGACACGGTTGGACCTAAGTACATATATGAAAGGCTCAAGAGATTGTCCGAGACTTATGG
AGGCTTTTTCAAACCATCAAGGTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAATGGGATGCTTCTGAG
TGAACCTAAGGCGTCGAGGTCTCGAATGTGAATGCACAAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAG
TAATCAGCAAATAAAACGTCTGAAACAACTACATGGAGAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACT
AAATGAGAGAATAAATAACTCTCTATTGTTAATTCTCAAAGCAACAGTTAATAAGGTGTT
TTGTTTTAACTTTTAAGCGCTTGAAAAGACGAATTATTATGTTCTTCACAAAACGTTTGT
AGTGACTTCATTCTCATGTAATTGTTCGAATGGTTAAGAATATAGTAAAACTACCG

QA 1 836 1 836
DS 



CO CL1978Contig2 784 2 2 U
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TGGCAAAATCAACGGGAGAGGTTACTATATTTACGAAAAGGGAACCAAACCGAAACCTGA
TTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCAAGGAAACTTACCAATATCATGCCTGGTGG
GAAGCCAATATCAGTAACTGATAAAGAAATTGTAGAGATGATCTTGTTCCCTGTGGTTAA
CGAAGCGTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCAGACTTGGACGTTGC
ATCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGAATTGTTTTCTGGGCAGACAC
GGTTGGACCTAAGTACATATGTGAAAGGCTCAAGAGATTGTCCGAGACTTATGGAGGCTT
TTTCAAACCATCGAGGTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAATGGGATGCTTCTGAGTGAACC
TAAGGCGTCGAGGTCTCGAATGTGAATGCACAAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAGCAATCA
TCAAATAAAACGTCCGAAACAACTATATGCCTTGGAGAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACTA
AATGAGAGAATAAATCACTCTCTATTGTTAATTCTCAAAGCAACAGTTAATAAGGTGTTT
TGTTTTAACTTTTAAGCACTTGAAAAGACGAATTGTTATGTTCTTCATAAAACGTTTGTA
GTGACTTCATTCTCATGTAATTGTTCGAATGGTTATGAATATAGTAAAACTACCTAGTGC
AGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DW79TF U 1
AF RR4DW79JQ C 46
BS 1 649 RR4DW79TF
BS 650 784 RR4DW79JQ

RD RR4DW79TF 649 0 0
GTATGGTGACCGAATGTTTCAGTCTCCATTAACAGAGCTTCTGGTTAAGAGCGGACGAAA
TGGCAAAATCAACGGGAGAGGTTACTATATTTACGAAAAGGGAACCAAACCGAAACCTGA
TTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCAAGGAAACTTACCAATATCATGCCTGGTGG
GAAGCCAATATCAGTAACTGATAAAGAAATTGTAGAGATGATCTTGTTCCCTGTGGTTAA
CGAAGCGTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCAGACTTGGACGTTGC
ATCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGAATTGTTTTCTGGGCAGACAC
GGTTGGACCTAAGTACATATGTGAAAGGCTCAAGAGATTGTCCGAGACTTATGGAGGCTT
TTTCAAACCATCGAGGTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAATGGGATGCTTCTGAGTGAACC
TAAGGCGTCGAGGTCTCGAATGTGAATGCACAAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAGCAATCA
TCAAATAAAACGTCCGAAACAACTATATGCCTTGGAGAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACTA
AATGAGAGAATAAATCACTCTCTATTGTTAATTCTCAAAGCAACAGTTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4DW79JQ 739 0 0
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TATCATGCCTGGTGGGAAGCCAATATCAGTAACTGATAAAGAAATTGTAGAGATGATCTT
GTTCCCTGTGGTTAACGAAGCGTGCCGTGTCCTAGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTC
AGACTTGGACGTTGCATCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGAATTGT
TTTCTGGGCAGACACGGTTGGACCTAAGTACATATGTGAAAGGCTCAAGAGATTGTCCGA
GACTTATGGAGGCTTTTTCAAACCATCGAGGTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAATGGGAT
GCTTCTGAGTGAACCTAAGGCGTCGAGGTCTCGAATGTGAATGCACAAACAAGAAGGGGA
GCTTAAAAGCAATCATCAAATAAAACGTCCGAAACAACTATATGCCTTGGAGAGGTTGAA
AGTGTTAAGTCACTAAATGAGAGAATAAATCACTCTCTATTGTTAATTCTCAAAGCAACA
GTTAATAAGGTGTTTTGTTTTAACTTTTAAGCACTTGAAAAGACGAATTGTTATGTTCTT
CATAAAACGTTTGTAGTGACTTCATTCTCATGTAATTGTTCGAATGGTTATGAATATAGT
AAAACTACCTAGTGCAGAT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 5

CO CL1979Contig1 619 5 8 U
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GTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTG
TATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAG
CAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACA
GCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGA
ACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTT
GGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCT
GGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAA
AGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTAAGTGAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACC
TTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAAT
ACAAAAGCCCATTAATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4F031JQ C 2
AF RR4F031TF U 2
AF RR4BI03TF U 1
AF RR4AD40JQ C 6
AF RR4AD40TF U 6
BS 1 38 RR4BI03TF
BS 39 39 RR4F031TF
BS 40 260 RR4BI03TF
BS 261 261 RR4F031TF
BS 262 524 RR4BI03TF
BS 525 525 RR4F031TF
BS 526 617 RR4BI03TF
BS 618 619 RR4AD40JQ

RD RR4F031JQ 579 0 0
GGGATC
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GTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTGTATGGTC
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TGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGAC
TGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGA
TATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTT
CCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAA
ATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTAAGTGAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACCTTGTGTA
AAATGCAGTAAAATGTATATTGTTTGTGGGTTC

QA 7 579 7 579
DS 

RD RR4F031TF 579 0 0
GGGATC
AAGGCTTGTGAGTTTGGAAA*GCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCACTT
GTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTGTATGGTC
TTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAGTGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCA
AGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTGTGG
TGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGAC
TGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGA
TATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTT
CCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAA
ATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTAAGTGAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACCTTGTGTA
AAATGCAGTAAAATGTATATTGTTTGTGGGTTC

QA 7 579 7 579
DS 

RD RR4BI03TF 617 0 0
GTGGATCAAGGCTTGTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACGATGGCAAGCTTCACTTCCTCC
GTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTG
TATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAG
CAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACA
GCTGTGGTGAGTAGTAGCCCGGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGA
ACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTT
GGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCT
GGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAA
AGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTAAGTGAAAAAAAA*GAGAGAGACCAGACC
TTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAAT
ACAAAAGCCCATTAATG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4AD40JQ 614 0 0
GG
AAGGCTTGTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCACTT
GTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTGTATGGTC
TTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCA
AGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTGTGG
TGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGAC
TGCCTTTTGGTTTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGA
TATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTT
CCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAA
ATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTAAGTGAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACCTTGTGTA
AAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAATACAAAAG
CCCATTAATGTC

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR4AD40TF 614 0 0
GG
AAGGCTTGTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCACTT
GTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTGTATGGTC
TTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCA
AGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTGTGG
TGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGAC
TGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGA
TATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTT
CCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAA
ATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTAAGTGAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACCTTGTGTA
AAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAATACAAAAG
CCCATTAATG
TC

QA 3 612 3 612
DS 



AS 1 5

CO CL1980Contig1 1149 5 10 U
GGGACGTCACTTTCGGGACCTTGACGGAGATTGGAGTTCTTCTTCTTCGATCACAAGTTA
CAGCGTCTTTTAGATTCTGAGATCGAGCTCTTAGTAGAAGGATTGTGGATTCAACAGCAT
ACTAAATCTTTAAGTTCCACGTCATTCCCCGATGATGTCGCCGAAGCAAATCTCCGACGA
TCGAGGATCCTCACATTTCCGGCATACCCCTTTCCAGATAATCCATGTCATTGGGAACTT
CTTTAGGATATGGTCAGTCTATTCCATGTACCGCTACTTGAATCAGACTGGAGCGCCTGT
TGTTCTCTTTCTCTTCTGCTGTCTGGTGCCCTCATCCTTGGTCTTCTTGATCCTTCAGAA
ACCGTGGAAAGGAAGGGCCCTTTCTAATCAGCAGATTGTACCTTCTCTTATCAATGGAGT
CATCACTGCTCTGTACTTCATCTTGTGGGGG*AAGGGTCTTAAGTCTTGTGGACCTCTTA
GAGCGATCTTGTCAGAGTACTCTGGTGCTGTTCTTGGAGTGCTTTCTGGAGTACTATATG
GACGGAGAGGCCACGTGTGGAAAAAGGTAGGTGGCCTTGTTGCTATGCTGGTAGCTCTTT
TTTTCTTATCTCAAGGATGGGCAACATCATCTCTCTCCCCATTTTCATCGAAAGATAGTA
CTGACACCAAAGAGGAAGAATTAGTAACAGAGCAAGCACTAGGACTGATGGGAATGATGA
TACCCGTTGTTGCTGGAATCTTATCAGCATTAAGGCGAGTTATTGCAAGGCGTGTTTCTC
TTAAGAACCAGCAAAAGAAACGACTCCATGCGATAACCATTACTTCTGCAACCTGTTTTC
TGTTTCCTTTGGCCATGTGGGACCTTGTCACAGGTTCGTCTTCTGGGAAAGCTGTGGAGT
TGCCATTTTCTGCGTGGGCTTTCCTTGGCACCATTGTTTTCGGGATCATTTTAATATTCA
TGTTGACAATATCGCAGAAGAGAGATTGCATATGGTGTTTTCTTCCCCGAGGCATTTAAT
GGTAGCTGGAGCATGCATAATCGTCATGGAGATTGCTTACGAGATGGATTTTTCTCTTCC
TGGTTTCATTGTCTGTTGCTTAGTGTTAGGGTTTGGAATATACGAAGCAACATCTCTAGA
ACGCAGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4FR49TF U 1
AF RR4EP59TF U 21
AF RR4GT04TF U 130
AF RR4GT04JQ C 405
AF RR4FR49JQ C 505
BS 1 34 RR4FR49TF
BS 35 35 RR4EP59TF
BS 36 479 RR4FR49TF
BS 480 635 RR4EP59TF
BS 636 674 RR4GT04TF
BS 675 675 RR4GT04JQ
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BS 704 737 RR4GT04TF
BS 738 1149 RR4GT04JQ

RD RR4FR49TF 479 0 0
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CAGCGTCTTTTAGATTCTGAGATCGAGCTCTTAGTAGAAGGATTGTGGATTCAACAGCAT
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CATCACTGCTCTGTACTTCATCTTGTGGGGG*AAGGGTCTTAAGTCTTGTGGACCTCTT

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DS 

RD RR4EP59TF 615 0 0
GG
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TCGAGCTCTTAGTAGAAGGATTGTGGATTCAACAGCATACTAAATCTTTAAGTTCCACGT
CATTCCCCGATGATGTCGCCGAAGCAAATCTCCGACGATCGAGGATCCTCACATTTCCGG
CATACCCCTTTCCAGATAATCCATGTCATTGGGAACTTCTTTAGGATATGGTCAGTCTAT
TCCATGTACCGCTGCTTGAATCAGACTGGAGCGCCTGTTGTTCTCTTTCTCTTCTGCTGT
CTGGTGCCCTCATCCTTGGTCTTCTTGATCCTTCAGAAACCGTGGAAAGGAAGGGCCCTT
TCTAATCAGCAGATTGTACCTTCTCTTATCAATGGAGTCATCACTGCTCTGTACTTCATC
TTGTGGGGG*AAGGGTCTTAAGTCTTGTGGACCTCTTAGAGCGATCTTGTCAGAGTACTC
TGGTGCTGTTCTTGGAGTGCTTTCTGGAGTACTATATGGACGGAGAGGCCACGTGTGGAA
AAAGGTAGGTGGCCTTGTTGCTATGCTGGTAGCTCTTTTTTTCTTATCTCAAGGATGGGC
AACATCATCTCTC

QA 3 615 3 615
DS 

RD RR4GT04TF 615 0 0
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CTCACATTTCCGGCATACCCCTTTCCAGATAATCCATGTCATTGGGAACTTCTTTAGGAT
ATGGTCAGTCTATTCCATGTACCGCTACTTGAATCAGACTGGAGCGCCTGTTGTTCTCTT
TCTCTTCTGCTGTCTGGTGCCCTCATCCTTGGTCTTCTTGATCCTTCAGAAACCGTGGAA
AGGAAGGGCCCTTTCTAATCAGCAGATTGTACCTTCTCTTATCAATGGAGTCATCACTGC
TCTGTACTTCATCTTGTGGGGGGAAGGGTCTTAAGTCTTGTGGACCTCTTAGAGCGATCT
TGTCAGAGTACTCTGGTGCTGTTCTTGGAGTGCTTTCTGGAGTACTATATGGACGGAGAG
GCCACGTGTGGAAAAAGGTAGGTGGCCTTGTTGCTATGCTGGTAGCTCTTTTTTTCTTAT
CTCAAGGATGGGCAACATCATCTCTCTCCCCATTTTCATCGAAAGATAGTACTGACACCA
AAGAG*AAGAATTAGTAACAGAGCAAGCACTAG*ACTGATGGGAATGATGATACCCGTTG
TTGCTGGA
TCTTATC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4GT04JQ 745 0 0
CTCTTATCAATGGAGTCATCACTGCTCTGTACTTCATCTTGTGGGGG*AAGGGTCTTAAG
TCTTGTGGACCTCTTAGAGCGATCTTGTCAGAGTACTCTGGTGCTGTTCTTGGAGTGCTT
TCTGGAGTACTATATGGACGGAGAGGCCACGTGTGGAAAAAGGTAGGTGGCCTTGTTGCT
ATGCTGGTAGCTCTTTTTTTCTTATCTCAAGGATGGGCAACATCATCTCTCTCCCCATTT
TCATCGAAAGATAGTACTGACACCAAAGAGGAAGAATTAGTAACAGAGCAAGCACTAGGA
CTGATGGGAATGATGATACCCGTTGTTGCTGGAATCTTATCAGCATTAAGGCGAGTTATT
GCAAGGCGTGTTTCTCTTAAGAACCAGCAAAAGAAACGACTCCATGCGATAACCATTACT
TCTGCAACCTGTTTTCTGTTTCCTTTGGCCATGTGGGACCTTGTCACAGGTTCGTCTTCT
GGGAAAGCTGTGGAGTTGCCATTTTCTGCGTGGGCTTTCCTTGGCACCATTGTTTTCGGG
ATCATTTTAATATTCATGTTGACAATATCGCAGAAGAGAGATTGCATATGGTGTTTTCTT
CCCCGAGGCATTTAATGGTAGCTGGAGCATGCATAATCGTCATGGAGATTGCTTACGAGA
TGGATTTTTCTCTTCCTGGTTTCATTGTCTGTTGCTTAGTGTTAGGGTTTGGAATATACG
AAGCAACATCTCTAGAACGCAGCAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4FR49JQ 643 0 0
GTGCTGTTCTTGGAGTGCTTTCTGGAGTACTATATGGACGGAGAGGCCACGTGTGGAAAA
AGGTAGGTGGCCTTGTTGCTATGCTGGTAGCTCTTTTTTTCTTATCTCAAGGATGGGCAA
CATCATCTCTCTCCCCATTTTCATCGAAAGATAGTACTGACACCAAAGAGGAAGAATTAG
TAACAGAGCAAGCACTAGGACTGATGGGAATGATGATACCCGTTGTTGCTGGAATCTTAT
CAGCATTAAGGCGAGTTATTGCAAGGCGTGTTTCTCTTAAGAACCAGCAAAAGAAACGAC
TCCATGCGATAACCATTACTTCTGCAACCTGTTTTCTGTTTCCTTTGGCCATGTGGGACC
TTGTCACAGGTTCGTCTTCTGGGAAAGCTGTGGAGTTGCCATTTTCTGCGTGGGCTTTCC
TTGGCACCATTGTTTTCGGGATCATTTTAATATTCATGTTGACAATATCGCAGAAGAGAG
ATTGCATATGGTGTTTTCTTCCCCGAGGCATTTAATGGTAGCTGGAGCATGCATAATCGT
CATGGAGATTGCTTACGAGATGGATTTTTCTCTTCCTGGTTTCATTGTCTGTTGCTTAGT
GTTAGGGTTTGGAATATACGAAGCAACATCTCTAGAACGCAGC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 5

CO CL1981Contig1 953 5 10 U
GCTGGAAAGAGATACATAAAATTGGGTGGTTGTTGCCGACGACGCGTCTTTTTGGGTTCT
CTCCGTCTTTTGATCTTCAAATCTCCTTTCCTCCATCCCACCAGCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCGAGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAA
TTGGTGTTGCTTGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCAAGCCTTGTGTTACGGTTTGTTAAA
GATCAGTTTGTTGAGTTTCAGGAATCAACCATCGGTGCTGCTTTTTTTCTCACAAACACT
AGCTGTCAACGATGCGACTGTCAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTA
CCATAGTTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGT
TACAAACCAAGCCTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGG
TAACGCTAATATGGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAA
GGTTTCCGCAGAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAAC
TTCAGCAAAAACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACC
GAGAGTACAACCAACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTACCAGATAGGGCCATGGATAG
GGCAGTGAGTTCATCTTGTTGTGCTTAGTTATATGTAATGGAATACACTTCCCTTAAAGG
GACCTTCTGGTCAGTCAACATTGAGTTATGGACTTCTGTGCTTTGCATGTCTTTGCTTTG
TTTTGCTTGTGTGGACATTTATTTTACCAATTAAAAAGGGTTGTAAATGAAGATATTTCA
TATTGAGATATGATGTCTAGCTCATATTGGAACTATGTATGTATCCAATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN75TF U 1
AF RR4B409TF U 12
AF RR4EW36TF U 121
AF RR4B409JQ C 140
AF RR4EN75JQ C 522
BS 1 166 RR4EN75TF
BS 167 167 RR4B409TF
BS 168 193 RR4EN75TF
BS 194 194 RR4B409TF
BS 195 272 RR4EN75TF
BS 273 747 RR4B409TF
BS 748 748 RR4EW36TF
BS 749 753 RR4B409TF
BS 754 923 RR4B409JQ
BS 924 953 RR4EN75JQ

RD RR4EN75TF 272 0 0
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CTCCGTCTTTTGATCTTCAAATCTCCTTTCCTCCATCCCACCAGCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCGAGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGATCATTAACGCCAAA
TTGGTGTTGCTTGTAGATGTTGGCGCTGGGAAATCAAGCCTTGTGTTACGGTTTGTTAAA
GATCAGTTTGTTGAGTTTCAGGAATCAACCAT

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR4B409TF 742 0 0
G
TACATAAAATTGGGTGGTTGTTGCCGACGACGCGTCTTTTTGGGTTCTCTCCGTCTTTTG
ATCTTCAAATCTCCTTTCCTCCATCCCACCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC****G
AGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTGCTT
GGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCAAGCCTTGTGTTACGGTTTGTTAAAGATCAGTTTGTT
GAGTTTCAGGAATCAACCATCGGTGCTGCTTTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAACGA
TGCGACTGTCAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTGGC
TCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAAGC
CTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAATAT
GGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCAGA
GGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAAAC
CGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACCGAGAGTACAACC
AACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTACCAGATAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGTTC
ATCTTGTTGTGCTTACTTATA

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR4EW36TF 634 0 0
GG
CTCTCTCTCGAGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATT
GGTGTTGCTTGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCAAGCCTTGTGTTACGGTTTGTTAAAGA
TCAGTTTGTTGAGTTTCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCGTTTTT*CTCACAAACACTAG
CTGTCAACGATGCGACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACC
ATAGTTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTA
CAAACCAAGCCTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTA
ACGCTAATATGGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGG
TTTCCGCAGAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTT
CAGCAAAAACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACCGA
GAGTACAACCAACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTACCAGATAGGGCCATGGATAGGG
CAGTGAGTTCATCTTGTTGTGCTTAGTTATA
T

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DS 

RD RR4B409JQ 784 0 0
TCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTGCTTGGAGATG
TTGGCGCTGGGAAATCAAGCCTTGTGTTACGGTTTGTTAAAGATCAGTTTGTTGAGTTTC
AGGAATCAACCATCGGTGCTGCTTTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAACGATGCGACT
GTCAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTGGCTCCTATG
TACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAAGCCTCGTTT
GAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAATATGGTGATG
GCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCAGAGGAGGCA
CAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAAACCGCAGCT
AATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACCGAGAGTACAACCAACAGAA
AACCCAACAGGAATGGTTCTACCAGATAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGTTCATCTTGT
TGTGCTTAGTTATATGTAATGGAATACACTTCCCTTAAAGGGACCTTCTGGTCAGTCAAC
ATTGAGTTATGGACTTCTGTGCTTTGCATGTCTTTGCTTTGTTTTGCTTGTGTGGACATT
TATTTTACCAATTAAAAAGGGTTGTAAATGAAGATATTTCATATTGAGATATGATGTCTA
GCTC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4EN75JQ 432 0 0
ATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCAGAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACG
GTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAAACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATG
AAATTGCAAGAAGGTTACCGAGAGTACAACCAACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTAC
CAGATAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGTTCATCTTGTTGTGCTTAGTTATATGTAATGG
AATACACTTCCCTTAAAGGGACCTTCTGGTCAGTCAACATTGAGTTATGGACTTCTGTGC
TTTGCATGTCTTTGCTTTGTTTTGCTTGTGTGGACATTTATTTTACCAATTAAAAAGGGT
TGTAAATGAAGATATTTCATATTGAGATATGATGTCTAGCTCATATTGGAACTATGTATG
TATCCAATTGCC

QA 1 432 1 432
DS 



AS 2 5

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ACACAAGTCTTTAGACAACTTAAAATGATTATTACGCAAGTCTGTAGACAACTTATAAGG
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TAACCTCCACGGATCAGACTAACTCCAAACGAGATGGTGCAGATCATGAGACCAAGCAAT
CCCAAGAAACCGTATTTCCCGATGGTGAGGCGTTTCATTGGATCTCCAGTAGAGTAGCCT
TTGAAGTAGAAGAAACGAGTGATATTGTAGAGCAAACCCAAACCAGCGCAGACACAAGGG
TGTTTCATTCCACCAAGGATCATCAGTATGAAGTACATTGGCATCATCTCCAGAGAGTTT
TGATGACCTCTCTGAACGCAGTTGAAGCGTTTAGCATCTTTGTTTTCTGATTCTAAAGCG
TATAGAGTTGGATACGGCACATTGTACCTTTTGCGAGCCATGCCGACTTGAGCTCCCATC
CAGAGGTTGAGGAAGCAGTAGAAGACGAGGACGAGAGCCATATATCCGTACTCGTTAGGC
AGGAAGTCGGTGAGCGCCATGGATGATTTCAGCGATTAGCTTCTTGAAACTGGCAAGAAA
GTTTGTGAAGGAATTGATTGCAAAATGCGAAATGATTTGTTTTTGAGTCGGCAGATGTAT
TTCTGATTTTTGAGTCCCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4AA04JQ U 1
AF RR4GF79JQ U 8
AF RR4GF79TF C 2
BS 1 149 RR4AA04JQ
BS 150 150 RR4GF79JQ
BS 151 475 RR4AA04JQ
BS 476 476 RR4GF79JQ
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BS 581 581 RR4GF79JQ
BS 582 739 RR4AA04JQ

RD RR4AA04JQ 739 0 0
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ACACAAGTCTTTAGACAACTTAAAATGATTATTACGCAAGTCTGTAGACAACTTATAAGG
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TAACCTCCACGGATCAGACTAACTCCAAACGAGATGGTGCAGATCATGAGACCAAGCAAT
CCCAAGAAACCGTATTTCCCGATGGTGAGGCGTTTCATTGGATCTCCAGTAGAGTAGCCT
TTGAAGTAGAAGAAACGAGTGATATTGTAGAGCAAACCCAAACCAGCGCAGACACAAGGG
TGTTTCATTCCACCAAGGATCATCAGTATGAAGTACATTGGCATCATCTCCAGAGAGTTT
TGATGACCTCTCTGAACGCAGTTGAAGCGTTTAGCATCTTTGTTTTCTGATTCTATAGCG
TATAGAGTTGGATACGGCACATTGTACCTTTTGCGAGCCATGCCGACTTGAGCTCCCATC
CAGAGGTTGAGGAAGCAGTAGAAGACGAGGACGAGAGCCACATATCCGTACTCGTTAGGC
AGGAAGTCGGTGAGCGCCATGGATGATTTCAGCGATTAGCTTCTTGAAACTGGCAAGAAA
GTTTGTGAAGGAATTGATTGCAAAATGCGAAATGATTTGTTTTTGAGTCGGCAGATGTAT
TTCTGATTTTTGAGTCCCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GF79JQ 729 0 0
GG
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AGGAAGCAGTAGAAGACGAGGACGAGAGCCATATATCCGTACTCGTTAGGCAGGAAGTCG
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TTGAGTC

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR4GF79TF 735 0 0
TTTTTTGG
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TTTAGACAACTTAAAATGATTATTACGCAAGTCTGTAGACAACTTATAAGGACTGGATCA
AAAGTTCAAGAACAAACACAGAGAACCATCAACCTCACAAAAAAACTGGCTTAACCTCCA
CGGATCAGACTAACTCCAAACGAGATGGTGCAGATCATGAGACCAAGCAATCCCAAGAAA
CCGTATTTCCCGATGGTGAGGCGTTTCATTGGATCTCCAGTAGAGTAGCCTTTGAAGTAG
AAGAAACGAGTGATATTGTAGAGCAAACCCAAACCAGCGCAGACACAAGGGTGTTTCATT
CCACCAAGGATCATCAGTATGAAGTACATTGGCATCATCTCCAGAGAGTTTTGATGACCT
CTCTGAACGCAGTTGAAGCGTTTAGCATCTTTGTTTTCTGATTCTAAAGCGTATAGAGTT
GGATACGGCACATTGTACCTTTTGCGAGCCATGCCGACTTGAGCTCCCATCCAGAGGTTG
AGGAAGCAGTAGAAGACGAGGACGAGAGCCATATATCCGTACTCGTTAGGCAGGAAGTCG
GTGAGCGCCATGGATGATTTCAGCGATTAGCTTCTTGAAACTGGCAAGAAAGTTTGTGAA
GGAATTGATTGCAAAATGCGAAATGATTTGTTTTTGAGTCGGCAGATGTATTTCTGATTT
TTGAGTC

QA 9 735 9 735
DS 



CO CL1982Contig2 624 2 1 U
GGATTTCGCATTTTGCAAATCCATTCCTCGACGAACTCTCTCGCGAATTTCAAGAAAGCT
CATCGCCGAAATCATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTACCTAACGAGTACGGATACGTGG
CTCTCGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAGTCGGCATGG
CTCGCAAAAGGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCTATAGAATCAGAAAACAAAG
ATGCTAAACGCTTCAACTGCGTTCAGAGAGTTCATCAAAACTCTCTGGAGATGATGCCAA
TGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGCATTTGCGCTGGTTTGG
GTTTGCTCTACAATATCACTCGATTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCAA
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CCATCTCATTTGGAGTTATTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCTAGTCTTTTGTGAGGTTGAT
GGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTACAGACTTG
CGTAATAATCATTTTAAGTTGTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GL01JQ C 1
AF RR4GL01TF U 1
BS 1 624 RR4GL01TF

RD RR4GL01JQ 624 0 0
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GTTTGCTCTACAATATCACTCGATTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCAA
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GGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTACAGACTTG
CGTAATAATCATTTTAAGTTGTCT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4GL01TF 624 0 0
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CATCGCCGAAATCATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTACCTAACGAGTACGGATACGTGG
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CTCGCAAAAGGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCTATAGAATCAGAAAACAAAG
ATGCTAAACGCTTCAACTGCGTTCAGAGAGTTCATCAAAACTCTCTGGAGATGATGCCAA
TGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGCATTTGCGCTGGTTTGG
GTTTGCTCTACAATATCACTCGATTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCAA
TGAAACGCCTCACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCATGATCTGCA
CCATCTCATTTGGAGTTATTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCTAGTCTTTTGTGAGGTTGAT
GGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTACAGACTTG
CGTAATAATCATTTTAAGTTGTCT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

CO CL1983Contig1 988 3 11 U
GGACCTTTGTCGGCACCACCGCTTCTGTGTCTTAAGAAGAGAGAAGCAGACGCAAAAAAT
GACGACTCTTTCGGCCTCCTCTCTATTATCTTCTTCTTCTTCTTCGCCTCTATGCAAATC
CAGATTCTCTCCAACAACTCGAAATGACTTCATCTCTTTCTCCCATCGGACAACTCTTTC
CTCGCCGCCGATTCTTTCCTTCTCCGTCAAACATCATCATCGCCACAGAAACTCGCTCCA
AGTGAAATCAGTAGCTAGCCCGGCGGAGACGGCGTCGGAGTTCGATGAGATGGTCTCCGG
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TCCAGCTCATTCCTTGAGTGACTCCTTTGCTCAGGATTTGACTGGAGGAATGCTTGTGCC
TGTTGAAGGACCTGAATCTCCTCTGTTTGCTCTTGAAATAAACCCTGAGAAGGCGAGAGA
AGAGTTTCGTAGTGCCTCTCAGGCGAATGGAGGGACTGGTGTTAAAGATTTTATGGATGG
TATGGGTCTTGGGATGCTTGTTGAACAGTTGGGGGAACTTAAACTTGGTGAGTTGCTTGA
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TGCTCTGCGTTTCTTGGGAGATATCATTTGGAAATGAGTTACACAGCACATATTGTTATT
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CATAGTTTTTTGGCACATTTGTTGGAATGGTCCTTTGAACAATAAATATTGCAATCCTTG
GGGAGCAAAAGCCTCAAGATATATTTAC


BQ
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AF RR4CY11TF U 1
AF RR4DJ53TF U 1
AF RR4DJ53JQ C 267
BS 1 374 RR4CY11TF
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GACGACTCTTTCGGCCTCCTCTCTATTATCTTCTTCTTCTTCTTCGCCTCTATGCAAATC
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CTCGCCGCCGATTCTTTCCTTCTCCGTCAAACATCATCATCGCCACAGAAACTCGCTCCA
AGTGAAATCAGTAGCTAGCCCGGCGGAGACGGCGTCGGAGTTCGATGAGATGGTCTCCGG
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TCCAGCTCATTCCTTGAGTGACTCCTCTGCTCAGGATTTGACTGGAGGAATGCTTGTGCC
TGTTGAAGGACCTGAATCTCCTCTGTTTGCTCTTGAAATAAACCCTGAGAAGGCGTGAGA
AGAGTTTCGTAGTGCCTCTCAGGCGAATGGAGGGACTGGTGTTAAAGATTTTATGGATGG
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CACACCTCCTCCTGGAT
G

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4DJ53TF 715 0 0
GGACCTTTGTCGGCACCACCGCTTCTGTGTCTTAAGAAGAGAGAAGCAGACGCAAAAAAT
GACGACTCTTTCGGCCTCCTCTCTATTATCTTCTTCTTCTTCTTCGCCTCTATGCAAATC
CAGATTCTCTCCAACAACTCGAAATGACTTCATCTCTTTCTCCCATCGGACAACTCTTTC
CTCGCCGCCGATTCTTTCCTTCTCCGTCAAACATCATCATCGCCACAGAAACTCGCTCCA
AGTGAAATCAGTAGCTAGCCCGGCGGAGACGGCGTCGGAGTTCGATGAGATGGTCTCCGG
GACGAAGAGGAAGTATTACATGCTTGGAGGGAAAGGAGGAGTGGGGAAAACTAGCTGCGC
TGCTTCTTTAGCTGCGAGGTTTGCTAACAACGGACACCCAACTCTCGTTGTGTCCACAGA
TCCAGCTCATTCCTTGAGTGACTCCTTTGCTCAGGATTTGACTGGAGGAATGCTTGTGCC
TGTTGAAGGACCTGAATCTCCTCTGTTTGCTCTTGAAATAAACCCTGAGAAGGCGAGAGA
AGAGTTTCGTAGTGCCTCTCAGGCGAATGGAGGGACTGGTGTTAAAGATTTTATGGATGG
TATGGGTCTTGGGATGCTTGTTGAACAGTTGGGGGAACTTAAACTTGGTGAGTTGCTTGA
CACACCTCCTCCTGGATTGGATGAAGCTATTGCTATTTCTAAG*TCATTCAATTT

QA 1 715 1 715
DS 

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ATGGAGGGACTGGTGTTAAAGATTTTATGGATGGTATGGGTCTTGGGATGCTTGTTGAAC
AGTTGGGGGAACTTAAACTTGGTGAGTTGCTTGACACACCTCCTCCTGGATTGGATGAAG
CTATTGCTATTTCTAAGGTCATTCAATTTTCGGAACTCTCAGGTTTGACGTTGATGCAGG
CTCCGTTGGTGGACATGGAGATTAGAGGTGTCCCTGCTCTGCGTTTCTTGGGAGATATCA
TTTGGAAATGAGTTACACAGCACATATTGTTATTGTAACGAAGAAGCAAAGCAAGTTCAG
TTGTATGAAGTTAGTGTTGGTTACTTACAACTTACATAGTTTTTTGGCACATTTGTTGGA
ATGGTCCTTTGAACAATAAATATTGCAATCCTTGGGGAGCAAAAGCCTCAAGATATATTT
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 5

CO CL1984Contig1 1190 5 2 U
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ATTTCTCCATGCCTTGAACCAAAGTTATTAGTAACCCAAAGAATGTTAATGAAATAAATC
CTT*GATTTATTTTCTTCTCCATATAATATAAAAAAAATACTTACGAAGGTAAGGAGGCC
TTCCATGCTGTCCTCATCGCTGAAACAGCTGTTTTTCTTGCCACTGATGATCTCCAGAAC
CAAAACTCTGAAACTGTAAACATCTGTTTTAAACGAGAACTGTCCTTGAATTACATACTC
TGGAGCCATATATCCAAAAGTCCCTACGACCCTATTCGTGTAGCGTTGAGTCGTGTGGTC
GATATCAAATAGCCTTGCCAATCAGAAGTCTGCGATTTTGGGGGTCATTTCCTCGTCTAA
CAGAATGTTACTAGCTTTAAGATCACGGTGAATGATCCTGAGACGAGAGTCTTGATGAAG
ATAAAGAAGCCCCCTAGCTTCACCTCCAATGATTTTGTATCTAATTTCCCAATCCAGTTC
CTTACCATGGATCGGATCGAAGATGAACTTGTCGAGACTAGTGTGTGGAAGGTACTCATA
GACGAGGAGCCTTTCAGTTCCATCTATTGAGTAACCTAAGAGCTTGACGAGGTTACGATG
TTGAAGCTTTGCACCAATAAGAACTCGTTCTTGAATTCGATTTCACCTTGTTGTGCATTT
TGCGACAACCTTTTCACTGCTATTTCTTGTCCATCAGATAGCACGCCCTTATAAACTGCG
CCAAATCCACCTTCTCCAAGTTTATTTTCGAGTGAAAATTGACTTGTGGCTTCTTGTAAC
AAAGTGAAATCAAATCTCAATGAATCTATGCTGATGTCTTCGTATGTATC


BQ
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AF RR4BI01JQ U 331
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AF RR4B928TF C 289
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GA

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AACTTTATCTTGGACACAAAGAAGACCAATGTTTATGCATCTCAGGATCATGTTCGATGA
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CAAAACTCTGAAACTGTAAACATCTGTTTTAAACGAGAACTGTCCTTGAATTACATACTC
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QA 1 887 1 887
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AATGTTACTAGCTTTAAGATCACGGTGAATGATCCTGAGACGAGAGTCTTGATGAAGATA
AAGAAGCCCCCTAGCTTCACCTCCAATGATTTTGTATCTAATTTCCCAATCCAGTTCCTT
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AATCCACCTTCTCCAAGTTTATTTTCGAGTGAAAATTGACTTGTGGCTTCTTGTAACAAA
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AGTTCCATCTATTGAGTAACCTAAGAGCTTGACGAGGTTACGATGTTGAAGCTTTGCACC
AATAAGAACTCGTTCTTGAATTCGATTTCACCTTGTTGTGCATTTTGCGACAACCTTTTC
ACTGCTATTTCTTGTCCATCAGATAGCACGCCCTTATAAACTGCGCCAAATCCACCTTCT
CCAAGTTTATTTTCGAGTGAAAATTGACTTGTGGCTTCTTGTAACAAAGTGAAATCAAAT
CTCAATGAATCTATGCTGATGTCTTCGTATGTATC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 5

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ACGGCGCTCCTTCTGTTCATTCTGGTTTCTGTCGGTGAGGCGGTTTGGCTAGACGTGCCT
GCCACGGGAATGAAGCGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGAT
TACATCATCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTATATCCGTCAAGGTGACTTCC
CCATACGGTAAGAACCTGCACCACATGGAAAACGTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACA
ACGCAAGAATCAGGGAACTACATGGCGTGCTTTACGGCAGACGCAAAGAGTCACGGAAAC
AAAAACGTTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGCTGCAAAGGATTGGAAAAAT
ATTGCTAAGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTAGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCA
GTGGAATCCATCCATGAAAATTTAGTTTACATAAGAAACAAGGAAGCAGATATGAGGACA
GTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTTGCTTGGTATAGTACGATGTCGATGGGTATTTGC
ATTGCTGTCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTT
ATCTAAGCATAGCTTTTTCACTCATCCACATCCTTTCTAAGAGTTTTCTTTTTGTTGGGT
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AACAGATTTTCAGTTCTAC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD80TF U 36
AF RR4A892TF U 1
AF RR4AL76TF U 9
AF RR4A892JQ C 42
AF RR4AL76JQ C 219
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GATGCAATACGGCCTCTTGACGGCGCTCCTTCTGTTCATTCTGGTTTCTGTCGGTGAGGC
GGTTTGGCTAGACGTGCCTGCCACGGGAATGAAGTGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAA
TGTGGTTGTCTTGGCA*ATTACATCATCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTAT
ATCCGTCAAGGTGACTTCCCCATACGGTAAGAACCTGCACCACATGGAAAACGTGACGGT
TGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAGAATCAGGGAACTACATGGCGTGCTTTACGGCAGA
CGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACGTTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGC
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ACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAATCCATCCATGAAAATTTAGTTTACATAAGAAACAA
GGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTTGCTTGGTATAGTAC
GATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTGTCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATA
CTTTCAGAAGAA*AAGCTTATCTAAGCATAGCTTTT*CACTCATCCACATCCTTTCTAAG
AGTTTTC

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GCCACGGGAATGAAGCGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGAT
TACATCATCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTATATCCGTCAAGGTGACTTCC
CCATACGGTAAGAACCTGCACCACATGGAAAACGTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACA
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AAAAACGTTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGCTGCAAAGGATTGGAAAAAT
ATTGCTAAGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTAGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCA
GTGGAATCCATCCATGAAAATTTAGTTTACATAAGAAACAAGGAAGCAGATATGAGGACA
GTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTTGCTTGGTATAGTACGATGTCGATGGGTATTTGC
ATTGCTGTCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTT
ATCTAAGCATAGCTTTTTCACTCATCCACATCCTTTCTAAGAGTTTTCTTTTTGTTGGGT
TCAAAGTAATAA

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G
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CTTCTGTTCATTCTGGTTTCTGTCGGTGAGGCGGTTTGGCTAGACGTGCCTGCCACGGGA
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ATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTATATCCGTCAAGGTGACTTCCCCATACGGT
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AAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTAGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAATCC
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TCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTTATCTAAGCA
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TAATAAAGATCTAATTTGCAGTTTTTGTTACT

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GATGCAATACGGCCTCTTGACGGCGCTCCTTCTGTTCATTCTGGTTTCTGTCGGTGAGGC
GGTTTGGCTAGACGTGCCTGCCACGGGAATGAAGCGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAA
TGTGGTTGTCTTGGCCGATTACATCATCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTAT
ATCCGTCAAGGTGACTTCCCCATACGGTAAGAACCTGCACCACATGGAAAACGTGACGGT
TGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAGAATCAGGGAACTACATGGCGTGCTTTACGGCAGA
CGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACGTTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGC
TGCAAAGGATTGGAAAAATATTGCTAAGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTAGAGAT
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GGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTTGCTTGGTATAGTAC
GATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTGTCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATA
CTTTCAGAAGAAGAAGCTTATCTAAGCATAGCTTTTTCACTCATCCACATCCTTTCTAAG
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CGCTGCAAAGGATTGGAAAAATATTGCTAAGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTAGA
GATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAATCCATCCATGAAAATTTAGTTTACATAAGAAA
CAAGGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTTGCTTGGTATAG
TACGATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTGTTTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCA
ATACTTTCAGAAGAAGAAGCTTATTTAAGCATAGCTTTTTCACTCATCCACATCCTTTCT
AAGAGTTTTCTTTTTGTTGGGTTCAAAGTAATAATAAGGATTTAATTTGCAGTTTTTGTT
ACTTCAGGGCTATAACCCAATAAACAGA

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DS 



AS 1 4

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ATGATCGAGCGAGGTAAGCATGAGGAGGCCAAAACCAAGCTCAGACGTATCCGTGGCGTC
GATGACGTTAGCCAAGAGTTTGACGATTTAGTCGAAGCTAGTAAAGAGCCTCAGTCGATA
GACAACCCATGGACTAACCTCCTCCGCCGTAAATACCGGCCGCATCTCACCATGGCCATT
ATGATTCCTTTCTTTCAGCAGCTCACCGGGATCAATGTGATTATGTTTTACGCTCCTGTT
TTGTTCAACACCATTGGTTTCACGAACGACGCTTCTCTCATGTCTGCCGTGGTCACTGGC
TCGGTCAACGTCGCCGCTACTGTTGTGTCGATCTACGGTGTTGACAGGTGGGGACGTAGG
TTTCTCTTTCTTGAAGGCGGTACACAAATGCTTATATGCCAGGCTGTGGTTGCTGCATGC
ATAGGGGCCAAGTTTGGGGTAGACGGGACCCCTGGTGAGCTACCAAAGTGGTACGCTATA
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GGGTGGTTAGTACCCAGTGAGATCTTCCCGCTGGAGATAAGGTCGGCCGCGCAGAGTATA
ACAGTGTCCGTGAACATGATCTTCACTTTCATAATCGCTCAGATCTTCTTGACGATGCTT
TGTCATTTGAAGTTTGGGTTGTTCCTTGTGTTCGCCTTCTTCGTGGT**TGATGTCTATT
TTCGTCTACATATTCTTGCCAGAGACGAAAGGGATTCCGATTGAGGAAATGGGACAAGTG
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TAAATGAGAGGATGTTTTAAGGAAAAAAAAAGATTTGTAATTTCTAATTTCGGTAAAGAA
AAACAAAGTGTATTCATCTAGATATATTTATGTTTTTATAATTCAGTACCACATGGTGGA
GAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4FI27TF U 1
AF RR4B113TF U 287
AF RR4B113JQ C 287
AF RR4FI27JQ C 477
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RD RR4FI27TF 696 0 0
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GGGTGGTTAGTACCCAGTGAGATCTTCCCGCTGGAG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4B113TF 757 0 0
G
CACCATGGCCATTATGATTCCTTTCTTTCAGCAGCTCACCGGGATCAATGTGATTATGTT
TTACGCTCCTGTTTTGTTCAACACCATTGGTTTCACGAACGACGCTTCTCTCATGTCTGC
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GTGGGGACGTAGGTTTCTCTTTCTTGAAGGCGGTACACAAATGCTTATATGCCAGGCTGT
GGTTGCTGCATGCATCGGGGCCAAGTTTGGGGTAGACGGGACCCCTGGTGAGCTACCAAA
GTGGTATGCTATAGTGGTTGTAACTTTTATATGCATCTATGTGGCCGGTTTCGCATGGTC
ATGGGGTCCGCTAGGGTGGTTAGTACCTAGTGAGATCTTCCCGTTGGAGATAAGGTCGGC
CGCGCAGAGTATAACAGTGTCCGTGAACATGATCTTCACTTTCATAATCGCTCAGATCTT
CTTGACGATGCTTTGTCATTTGAAGTTTGGGTTGTTCCTTGTGTTCGCCTTCTTCGTGGT
**TGATGTCTATTTTCGTCTACATATTCTTGCCAGAGACGAAAGGGATTCCGATTGAGGA
AATGGGACAAGTGCGGAGGTCACACTGGGTATTGGTCAAGGTTCGTGGAGGACGGTGAGT
ATGGGTAATGGGAATGGGCTTCAGATGGAGAAGAGCAGCAGCAACCAAGGAACTAAACAT
GTTTAGTTTGTTTTAAATGAGAGGATGTTTTAAGG
A

QA 2 756 2 756
DS 

RD RR4B113JQ 819 0 0
G
CACCATGGCCATTATGATTCCTTTCTTTCAGCAGCTCACCGGGATCAATGTGATTATGTT
TTACGCTCCTGTTTTGTTCAACACCATTGGTTTCACGAACGACGCTTCTCTCATGTCTGC
CGTGGTCACTGGCTCGGTCAACGTCGCCGCTACTGTTGTGTCGATCTACGGTGTTGACAG
GTGGGGACGTAGGTTTCTCTTTCTTGAAGGCGGTACACAAATGCTTATATGCCAGGCTGT
GGTTGCTGCATGCATCGGGGCCAAGTTTGGGGTAGACGGGACCCCTGGTGAGCTACCAAA
GTGGTATGCTATAGTGGTTGTAACTTTTATATGCATCTATGTGGCCGGTTTCGCATGGTC
ATGGGGTCCGCTAGGGTGGTTAGTACCTAGTGAGATCTTCCCGTTGGAGATAAGGTCGGC
CGCGCAGAGTATAACAGTGTCCGTGAACATGATCTTCACTTTCATAATCGCTCAGATCTT
CTTGACGATGCTTTGTCATTTGAAGTTTGGGTTGTTCCTTGTGTTCGCCTTCTTCGTGGT
**TGATGTCTATTTTCGTCTACATATTCTTGCCAGAGACGAAAGGGATTCCGATTGAGGA
AATGGGACAAGTGCGGAGGTCACACTGG*TATTGGTCAAGGTTCGTGGAGGACGGTGAGT
ATGGGTA*TGGGAATGGGCTTCAGATGGAGAAGAGCAGCAGCAACCAAGGAACTAAACAT
GTTTAGTTTGTTTTAAATGAGAGGATGTTTTAAGGAAAAAAAAAGATTTGTAATTTCTAA
TTTCGGTAAAGAAAA*CAAAGTGTATTCATCTAGATA
C

QA 2 818 2 818
DS 

RD RR4FI27JQ 670 0 0
TAGGTTTCTCTTTCTTGAAGGTGGTACACAAATGCTTATATGCCAGGCTGTGGTTGCTGC
ATGCATAGGGGCCAAGTTTGGGGTAGACGGGACCCCTGGTGAGCTACCAAAGTGGTACGC
TATAGTGGTCGTAACTTTTATATGCATATATGTGGCCGGTTTCGCATGGTCATGGGGTCC
TCTAGGGTGGTTAGTACCCAGTGAGATCTTCCCGCTGGAGATAAGGTCGGCCGCGCAGAG
TATCACAGTGTCCGTGAACATGATCTTCACTTTCATAATCGCTCAGATCTTCTTGACGAT
GCTTTGTCATTTGAAGTTTGGGTTGTTCCTTGTGTTCGCCTTCTTCGTGGTGGTGATGTC
TATTTTCGTCTACATATTCTTGCCGGAGACGAAAGGGATTCCGATTGAGGAAATGGGACA
AGTGTGGAGGTCACACTGG*TATTGGTCAAGGTTTGTGGAGGATGGTGAGTATGGCTA*T
GGGAATGGGCTTCAGATGGAGAAGAGCAGCAGCAACCAAGGGACTAAACATGTTTAGTTT
GTTTTAAATGAGAGGATGTTTTAAGGGAAAAAA**GATTTGTAATTTCTAATTTCGGTAA
AGAAAAACAAAGTGTATTCATCTAGATATATTTATGTTTTTATAATTCAGTACCACATGG
TGGAGAAATT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL1987Contig1 893 4 2 U
GACAATAACACATTCATACATAATTTTAACGGAAACACAACCTTCATAAAGTGATAAAAA
CAAAAAAGTATTAAAATGACATTGCCGAACCAAAGTGTTTTAAGCAATTACACTAAAATG
CTATGTAAAGAAGTCTGAATGTTTTTTGCTCATTTTCTTTGTTGTTCTCTTTTTAAAAGG
CTGAACATTAGTGTAAACCCCAGATAAATCGAGGTAACTCTGTAAAACATGGAGGAGAGA
GTACACAATCAACTCGAGGATGAAACAGTAGTGGCTGCATCTACCTCGTTGTTAACGCCT
TTAGTAGTGTGACGTGAAGTTGTTGCCTCTGTTTTACTGCCTTTTGCGCCATCATCTTCT
TCCTCTTCTTCTTCATAGAACGACCCTGAGGACCTTAGTTCCTTCACCTTCCGAAACTCA
TCGTAATGTACTCTTCTAAGTTCGTTGAAACGTGCGTTTTTCTCATCATCCACATCTGTG
TCTTCATCATCTTGATCCATTGGATCAGCTTCATCCTCCTCAGACGAGCTCCAGCCACCA
GAACCAGACCCCTGGCTAGTATTTCTGCTTGACGAAGCTGCTGCCTAGTTCAGAACGTTC
CTCAGTTCTTCCGCACGTTGCATATCATCAACGCATTCGTCAAACGATCTTCCTCTAGGA
GACAGAGAACCATCATCATCATCATCGATCATAGGGTGGTAGGGAGTCTTAGGTTCAGTG
ATCTTCTGCCTAACAGGTTTGTTAGATTCAATTTCCACTATATTAGCTTCATCCCATTGT
ACACGCCCCTTTTTTGAATCACCCATCTTCTTCTTCCACAAACTTTTTTTCTCGATCGCA
AACAAAAGTTTTAAAGACTTCAGCGGGCGTGTTGAAGACGCACGATTACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK94TF C 513
AF RR4FW25JQ U 131
AF RR4CK94JQ U 1
AF RR4AS10TF C 287
BS 1 733 RR4CK94JQ
BS 734 893 RR4AS10TF

RD RR4CK94TF 205 0 0
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AGGGTGGTAGGGAGTCTTAGGTTCA

QA 1 205 1 205
DS 

RD RR4FW25JQ 566 0 0
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CCTGGCTAGTATTTCTGCTTGACGAAGCTGCTGCCCCGTTCAGAACGTTCCTCAGTTCTT
CCGCACGTTGCATATCATCAACGCATTCGTCAAACGATCTTCCTCTAGGAGACAGAAAAC
CACCATCATCATCATCGATCATAGGG

QA 1 566 1 566
DS 

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CTATGTAAAGAAGTCTGAATGTTTTTTGCTCATTTTCTTTGTTGTTCTCTTTTTAAAAGG
CTGAACATTAGTGTAAACCCCAGATAAATCGAGGTAACTCTGTAAAACATGGAGGAGAGA
GTACACAATCAACTCGAGGATGAAACAGTAGTGGCTGCATCTACCTCGTTGTTAACGCCT
TTAGTAGTGTGACGTGAAGTTGTTGCCTCTGTTTTACTGCCTTTTGCGCCATCATCTTCT
TCCTCTTCTTCTTCATAGAACGACCCTGAGGACCTTAGTTCCTTCACCTTCCGAAACTCA
TCGTAATGTACTCTTCTAAGTTCGTTGAAACGTGCGTTTTTCTCATCATCCACATCTGTG
TCTTCATCATCTTGATCCATTGGATCAGCTTCATCCTCCTCAGACGAGCTCCAGCCACCA
GAACCAGACCCCTGGCTAGTATTTCTGCTTGACGAAGCTGCTGCCTAGTTCAGAACGTTC
CTCAGTTCTTCCGCACGTTGCATATCATCAACGCATTCGTCAAACGATCTTCCTCTAGGA
GACAGAGAACCATCATCATCATCATCGATCATAGGGTGGTAGGGAGTCTTAGGTTCAGTG
ATCTTCTGCCTAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4AS10TF 607 0 0
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CCTTCCGAAACTCATCGTAATGTACTCTTCTAAGTTCGTTGAAACGTGCGTTTTTCTCAT
CATCCACATCTGTGTCTTCATCATCTTGATCCATTGGATCAGCTTCATCCTCCTCAGACG
AGCTCCAGCCACCAGAACCAGACCCCTGGCTAGTATTTCTGCTTGACGAAGCTGCTGCCT
CGTTCAGAACGTTCCTCAGTTCTTCCGCACGTTGCATATCATCAACGCATTCGTCAAACG
ATCTTCCTCTAGGAGACAGAGAACCATCATCATCATCATCGATCATAGGGTGGTAGGGAG
TCTTAGGTTCAGTGATCTTCTGCCTAACAGGTTTGTTAGATTCAATTTCCACTATATTAG
CTTCATCCCATTGTACACGCCCCTTTTTTGAATCACCCATCTTCTTCTTCCACAAACTTT
TTTTCTCGATCGCAAACAAAAGTTTTAAAGACTTCAGCGGGCGTGTTGAAGACGCACGAT
TACCTCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

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TTGAGTTAACATTTACACACTGAACTCATGGAGAGAGACACACCAGGAGCAGTTTTACAG
ATTTGGTGACAATAATGTAATCAAAGCAAGTAAACTCTATAATGTATAGTATTTGAGTAA
GATGACATATTATCCACTTCTACTGCGTCAGTGAGGCGATCCGGATCAGTAATTTGGCGT
ATATTAATCCAACGCACCAAACCATAGTCTGGTCTAAGCTTCACGTTTGAGCCGTATTTT
CATCTCCTTGAGGATTTTCATCCCCTTGAGGTGAATTGCTGCTACTAGGCTTATCATTTC
CACCATACCTCTTTTTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGTACTTGATCATGTGCACGA
TCTGTCGTTTCATAGTGAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGCAAAGCAAGATTGGCCAGA
ACACAGGCACATCCAAAAACGAGAAGAAGGTCATCACAAACGCCACAACAAAAGCTTTAG
TAGCTGCATACCAGAACTTGAACTCAGGAAGACGACGAACAAACGGCTTGAACTCATCAG
AACCTTTACTAGTCTCAGGAGAAGCAGAAGGATCCAAGGCTTCGAGCTCTGGATCGACTT
TGGGAGAGAGGAAACCGATCAAGAGGTTTAAGATGTAAGTCGCGAGACCATACGAGACGA
CGAAGAATCCGTAAGCGTAGTAAACTCTGTAGATGTAGATCACCGCGGCGATTAGCGTCA
CTAGCCATCTTCGAACGAGGTGTGGAGCCGATTTGTCGAGGTGATTCTGAAACGATTTCG
AGAATTCGATTCTCCATCGTGCAAGCGGTGAATCGCTCGTTGCGTATCCGTCTCCTTCGT
TTCCTGATTCGTCCTCCATGCCTAAACCCTAATTCAATCACTGATTAAGATCACAATTAT
CTTCGAATCGAACACGTCGTTCTTCAAAGAGGGGGAGAGAGTCGGTTTCTTGGTTTCGCG
GAAAGAAAGAGGAAACTGAATGACGTCCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D402JQ U 1
AF RR4BI88JQ U 1
AF RR4D402TF C 376
BS 1 862 RR4BI88JQ
BS 863 1050 RR4D402TF

RD RR4D402JQ 499 0 0
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TTGAGTTAACATTTACACACTGAACTCATGGAGAGAGACACACCAGGAGCAGTTTTACAG
ATTTGGTGACAATAATGTAATCAAAGCAAGTAAACTCTATAATGTATAGTATTTGAGTAA
GATGACATATTATCCACTTCTACTGCGTCAGTGAGGCGATCCGGATCAGTAATTTGGCGT
ATATTAATCCAACGCACCAAACCATAGTCTGGTCTAAGCTTCACGTTTGAGCCGTATTTT
CATCTCCTTGAGGATTTTCATCCCCTTGAGGTGAATTGCTGCTACTAGGCTTATCATTTC
CACCATACCTCTTTTTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGTACTTGATCATGTGCACGA
TCTGTCGTTTCATAGTGAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGCAAAGCAAGATTGGCCAGA
ACACAGGCACATCCAAAAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4BI88JQ 862 0 0
CGCAACTTGTATATTGTTCTGATTCATTCAATAAAAGGACAAGTTACATTCAGTTCTGAT
TTGAGTTAACATTTACACACTGAACTCATGGAGAGAGACACACCAGGAGCAGTTTTACAG
ATTTGGTGACAATAATGTAATCAAAGCAAGTAAACTCTATAATGTATAGTATTTGAGTAA
GATGACATATTATCCACTTCTACTGCGTCAGTGAGGCGATCCGGATCAGTAATTTGGCGT
ATATTAATCCAACGCACCAAACCATAGTCTGGTCTAAGCTTCACGTTTGAGCCGTATTTT
CATCTCCTTGAGGATTTTCATCCCCTTGAGGTGAATTGCTGCTACTAGGCTTATCATTTC
CACCATACCTCTTTTTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGTACTTGATCATGTGCACGA
TCTGTCGTTTCATAGTGAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGCAAAGCAAGATTGGCCAGA
ACACAGGCACATCCAAAAACGAGAAGAAGGTCATCACAAACGCCACAACAAAAGCTTTAG
TAGCTGCATACCAGAACTTGAACTCAGGAAGACGACGAACAAACGGCTTGAACTCATCAG
AACCTTTACTAGTCTCAGGAGAAGCAGAAGGATCCAAGGCTTCGAGCTCTGGATCGACTT
TGGGAGAGAGGAAACCGATCAAGAGGTTTAAGATGTAAGTCGCGAGACCATACGAGACGA
CGAAGAATCCGTAAGCGTAGTAAACTCTGTAGATGTAGATCACCGCGGCGATTAGCGTCA
CTAGCCATCTTCGAACGAGGTGTGGAGCCGATTTGTCGAGGTGATTCTGAAACGATTTCG
AGAATTCGATTCTCCATCGTGC

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4D402TF 675 0 0
TTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGTACTTGATCATGTGCACGATCTGTCGTTTCATAG
TGAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGCAAAGCAAGATTGGCCAGAACACAGGCACATCCA
AAAACGAGAAGAAGGTCATCACAAACGCCACAACAAAAGCTTTAGTAGCTGCATACCAGA
ACTTGAACTCAGGAAGACGACGAACAAACGGCTTGAACTCATCAGAATCTTTACTAGTCT
CAGGA**AGCAGAAGGATCCAAGGCTTCGAGCTCTGGATCGACTTTGGGAGAGAGGAAAC
CGATCAAGAGGTTTAAGATGTAAGTCGCGAGACCATACGAGACGACGAAGAATCCGTAAG
CGTAGTAAACTCTGTAGATGTAGATCACCGCGGCGATTAGCGTCACTAGCCATCTTCGAA
CGAGGTGTGGAGCCGATTTGTCGAGGTGATTCTGAAACGATTTCGAGAATTCGATTCTCC
ATCGTGCAAGCGGTGAATCGCTCGTTGCGTATCCGTCTCCTTCGTTTCCTGATTCGTCCT
CCATGCCTAAACCCTAATTCAATCACTGATTAAGATCACAATTATCTTCGAATCGAACAC
GTCGTTCTTCAAAGAGGGGGAGAGAGTCGGTTTCTTGGTTTCGCGGAAAGAAAGAGGAAA
CTGAATGACGTCCCT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 5

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TCACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTG
GAGGAAAAGGAAAGTCTGCTGACGATGGATTGACTCCGAAGCAACGCCGTGAAAGAGATG
GAAAAGCATTGCAAGAGAAAGCCGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTT
CTGGTGGAGGAGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCT
TGGGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTT*ATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAA
TTTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAATCCCGGTATGCTGTCTCTGTT
GAAAAATTGATATCTTATGCTT*GTGGTAACTTATTTTGTCTTTATATGATCTCTTATGA
ATATTCCTGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 15 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 15 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY56JQ C 27
AF RR4B827TF U 1
AF RR4FY56TF U 3
AF RR4AH59TF U 13
AF RR4DI13TF U 3
BS 1 196 RR4B827TF
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BS 220 262 RR4B827TF
BS 263 263 RR4DI13TF
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BS 311 311 RR4FY56TF
BS 312 367 RR4B827TF
BS 368 368 RR4DI13TF
BS 369 380 RR4B827TF
BS 381 381 RR4DI13TF
BS 382 393 RR4B827TF
BS 394 394 RR4DI13TF
BS 395 457 RR4B827TF
BS 458 458 RR4DI13TF
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BS 470 540 RR4B827TF
BS 541 550 RR4DI13TF

RD RR4FY56JQ 425 0 0
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GGATTGACTCCGAAGCAACGCCGTGAAAGAGATGGAAAAGCATTGCAAGAGAAAGCCGCA
AAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTTTGGTGGAGGAGCAGGAGGCAAAGGA
ACTGCTAAGAAGTGATTTCATTTGGTTTGTTTCTTGGGGAAATAATGTAGACTTTTACGG
TTTTTTT*ATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAATTTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGT
ACTCT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4B827TF 547 0 0
GGGGGACTTGACTTAAAAGAGAATCGAATCGAATCCCCTCATTATAAAATCCAAATCCCT
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TCACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTG
GAGGAAAAGGAAAGTCGGCTGACGACGGATTGACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGAGATG
GAAAAGCATTGCAAGAGAAAGCAGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTT
CTGGTGGAGGTGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCT
TGGGGAA*TAATGTAGACTTCTACGGTTCTTTTTATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAA
TTTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGGATCCCGGTATACTGTCTCTGTT
GAAAAATTGATATCTTATGCTT*GTGGTAACTTATTTTGTCTTTATATGATCTCTTATGA
TTATTCT

QA 1 540 1 540
DS 

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GGGACTTGACTTAAAAGAGAATCGAATCGAATCCCCTCATTATAAAATCCAAATCCCTTC
GTTGCGTTTCTTCTGCATTGACCGGATCGCTTCCTTCTTACGCGGATTCATCCTCAATTC
ACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGGA
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GGTGGAGGAGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCTTG
GGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTT*ATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAATT
TGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAATCCCGGTATGCTGTCTCTGTTGA
AAAATTGATATCTTATGCTT
GTGGT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4AH59TF 530 0 0
GG
AAAAGAGAATCGAATCGAATCCCCTCATTATAAAATCCAAATCCCTTCGTTGCGTTTCTT
CTGCATTGACCGGATCGCTTCCTTTTTACGCGTATTCATCCTCAATTCACCATGACTCGT
GGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGGAGGAAAAGGAAAG
TCTGCTGACGATGGATTGACTCCGGAGCAACGCCGTGAAAGAGATGGAAAAGCATTGCAA
GAGAAAGCCGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTCTGGTGGAGGAGCA
GGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCTTGGGGAAATAATGT
AGACTTTTACGGTTCTTTT*ATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAATTTGGGTTAACTTC
GACTCGAGTTGTACTCTTGTCTGAATCCCGGTATGCTGTCTCTGTTGAAAAATTGATATC
TTATGCTT*GTGGTAACTTATTTTGTCTTTATATGATCTTTTATGA
AT

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR4DI13TF 548 0 0
GGGACTTGACTTAAAAGAGAATCGAATCGAATCCCCTCATTATAAAATCCAAATCCCTTC
GTTGCGTTACTTCTGCATTGACCGGATCGCTTCCTTCTTACGCGGATTCATCCTCAATTC
ACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGGA
GGAAAAGGAAAGTCTGCTGACGATGGATTGACTCCGGAGCAACGCCGTGAAAGAGATGGA
AAAGCATTGCAAGAGAAAGCCGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTCT
GGTGGAGGTGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCTTG
GGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTT*ATAAACATCTCGCAAAATATTCCAAATT
TGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAATCCCGGTATGCTGTCTCTGTTGA
AAAATTGATAACTTATGCTTTGTGGTAACTTATTTTGTCTTTATATGATCTGTTATGAAT
ATTCCTGC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 5

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CCGATGCCGTAGAAGCCTTTAGAAAATGCGATAAGTGTAAAGGTGGTAAAATTGGGATTG
CTCATACTCCGGCTTTGTTTGACCAGCGCGACCTCACGGATGACCCGCACCAGCACTCGG
AAGAAGAACACGAAACTCCTGCAACTAATTTGATTGACTTCGTCATGGGATGGCATTTGA
ATCCGACCACGTATGGAGATTATCCACAATCGATGAAAGATCATGTCGGAGATCGACTAC
CAGAATTTACTGAAGCACAGAAGAACAAGTTGAAAAATTCTGCTGATTTTGTAGGAATCA
ATTACTATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTT
GGCAGAGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTA
CAATCAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGA
ACTACATAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAG
AAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACAT
ACTACATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACG
TTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCG
CGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTAT
CAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGC
ACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCT
CTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCAACTGATGTATTTCTTTTAA
CATTTTAGATAAAAAAAAACCTAATGTATTTCCATACTCCAGAAAAATAATCAGATTTAT
CGATATAAAAACAAATGAAGTTTGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK06TF U 1
AF RR4DH68TF U 279
AF RR4DH68JQ C 367
AF RR4AU08JQ C 396
AF RR4A451TF U 546
BS 1 727 RR4FK06TF
BS 728 728 RR4DH68TF
BS 729 760 RR4FK06TF
BS 761 761 RR4DH68TF
BS 762 772 RR4FK06TF
BS 773 773 RR4DH68TF
BS 774 779 RR4FK06TF
BS 780 780 RR4DH68TF
BS 781 805 RR4FK06TF
BS 806 928 RR4DH68TF
BS 929 929 RR4A451TF
BS 930 943 RR4DH68TF
BS 944 944 RR4A451TF
BS 945 1007 RR4DH68TF
BS 1008 1108 RR4A451TF

RD RR4FK06TF 805 0 0
GCGATGGACGATCAGGACACGAGGCTTATATCGTTAGTCATAACATGCTTTTGGCACATG
CCGATGCCGTAGAAGCCTTTAGAAAATGCGATAAGTGTAAAGGTGGTAAAATTGGGATTG
CTCATACTCCGGCTTTGTTTGACCAGCGCGACCTCACGGATGACCCGCACCAGCACTCGG
AAGAAGAACACGAAACTCCTGCAACTAATTTGATTGACTTCGTCATGGGATGGCATTTGA
ATCCGACCACGTATGGAGATTATCCACAATCGATGAAAGATCATGTCGGAGATCGACTAC
CAGAATTTACTGAAGCACAGAAGAACAAGTTGAAAAATTCTGCTGATTTTGTAGGAATCA
ATTACTATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTT
GGCAGAGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTA
CAATCAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGA
ACTACATAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAG
AAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACAT
ACTACATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACG
TTACAGG*TATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGA*TGGCAAGAGGG*TACAGCT
CGAGATTTGGACTATACTACGTCGA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4DH68TF 729 0 0
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TCTGCTGATTTTGTAGGAATCAATTACTATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAG
CCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTAT
GTGGATAAATTCAATGCATTTACAATCAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCA
AATGGTTTGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATT
ATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCG
CTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCA
ATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTT
GAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAAT
TTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTA
AAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGCA*CACGAGCAC
GATGATTTGTAGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACAC
TCAACTGAT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4DH68JQ 720 0 0
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GTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATCA
AGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGAACTACA
TAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATC
TAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACA
TTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAG
GGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGAT
TTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCC
AGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATG
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AGATAAAAAAAA*CCTAATGTATTTCCATACTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCGATA
C

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DS 

RD RR4AU08JQ 691 0 0
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TATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATCAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTAC
GCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTC
ATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTG
GCGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATTTCTTGAGCTTGCACCAA
GCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAAT
TTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAAT
AATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGA
CTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGCAACACGAG
CACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTA
CACTCAACTGATGTATTTCTTTTAACATTTTAGATAAAAAAAAACCTAATGTATTTCCAT
ACTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCGATA
C

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4A451TF 563 0 0
G
TAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATGCGGAGAAGATC
TAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACA
TTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAG
GGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGAT
TTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCC
AGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATG
AGCAACACGAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTACTA
CAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCAACTGATGTATTTCTTTTAACATTTT
AGATAAAAAAAAACCTAATGTATTTCCATACTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCGATAT
AAAAACAAATGAAGTTTGAATT

QA 2 563 2 563
DS 



AS 2 5

CO CL1991Contig1 507 3 13 U
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TGAAGATTCAAAAATGTATTCGAATGCCCAAGCAAGACAAGTACCAAACAAAAGATAAAA
AAAAAAAAGTAGATAGAGGAAACAACTTAAAAGAGAGATGTTCCTTTTCCCTTCTTGTCT
CCACCAATCTCAAAGTGCTTGCACCTCTTAATTGAGTGTTGAGAGAAATGCTTGCAGGTT
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TTGGTCTGACCACCATAACCAGATTGCTTGCGGTCATAACGACGCTTTCCTTGGGCAGCA
AGACTGTCTTTACCCTTCTTGTACTGGGTCACCTTGTGCAAGGTATGCTTCTTGCATTCC
TTGTTCTTACAGTAAGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGATCTTCGGTGA
AGCTCGTGCCGTCCGCTGCCAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM18JQ U 1
AF RR4EL33JQ U 13
AF RR4EL33TF C 13
BS 1 51 RR4CM18JQ
BS 52 52 RR4EL33JQ
BS 53 73 RR4CM18JQ
BS 74 74 RR4EL33JQ
BS 75 79 RR4CM18JQ
BS 80 80 RR4EL33JQ
BS 81 112 RR4CM18JQ
BS 113 113 RR4EL33JQ
BS 114 164 RR4CM18JQ
BS 165 165 RR4EL33JQ
BS 166 401 RR4CM18JQ
BS 402 402 RR4EL33JQ
BS 403 507 RR4CM18JQ

RD RR4CM18JQ 507 0 0
ATATCATCACATACGAAAATGTCCTCTTAATTAAAAGATCATAGGTCCATAACCATTTTT
TGAAGATTCAAAA*TGTATGCGAATGCCCAAGCAAGACAAGTACCAAACAAAGGATAAAA
AAAAAAAAGTAGATAGAGGAAACAACTTAAAAGAGAGATGTTCCCTTTCCCTTCTTGTCT
CCACCAATCTCAAAGTGCTTGCACCTCTTAATTGAGTGTTGAGAGAAATGCTTGCAGGTT
TGGCATTGGAGCCTCAGCACAATCTTCTTGGTCGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACGGGT
TTGGTCTGACCACCATAACCAGATTGCTTGCGGTCATAACGACGCTTTCCTTGGGCAGCA
AGACTGTCTTTACCCTTCTTGTACTGGGTCACCTTGTGCAACGTATGCTTCTTGCATTCC
TTGTTCTTACAGTAAGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGATCTTCGGTGA
AGCTCGTGCCGTCCGCTGCCAAAACCC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4EL33JQ 489 0 0
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ATAGAGGAAACAACTTAAAAGAGAGATGTTCCTTTTCCCTTCTTGTCTCCACCAATCTCA
AAGTGCTTGCACCTCTTAATTGAGTGTTGAGAGAAATGCTTGCAGGTTTGGCATTGGAGC
CTCAGCACAATCTTCTTGGTCGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACGGGTTTGGTCTGACCA
CCATAACCAGATTGCTTGCGGTCATAACGACGCTTTCCTTGGGCAGCAAGACTGTCTTTA
CCCTTCTTGTACTGGGTCACCTTGTGCAAGGTATGCTTCTTGCATTCCTTGTTCTTACAG
TAAGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGATCTTCGGTGAAGCTCGTGCCGT
CCGCTGCC
C

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4EL33TF 489 0 0
ACGAAAATGTCCTCTTAATTAAAAGATCATAGGTCCATAGCCATTTTTTGAAGATTCAAA
AATGTATTCGAATGCCCAAGCAAGACAAGTACCAAACAAAAGATAAAAAAAAAAAAGTAG
ATAGAGGAAACAACTTAAAAGAGAGATGTTCCTTTTCCCTTCTTGTCTCCACCAATCTCA
AAGTGCTTGCACCTCTTAATTGAGTGTTGAGAGAAATGCTTGCAGGTTTGGCATTGGAGC
CTCAGCACAATCTTCTTGGTCGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACGGGTTTGGTCTGACCA
CCATAACCAGATTGCTTGCGGTCATAACGACGCTTTCCTTGGGCAGCAAGACTGTCTTTA
CCCTTCTTGTACTGGGTCACCTTGTGCAAGGTATGCTTCTTGCATTCCTTGTTCTTACAG
TAAGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGATCTTCGGTGAAGCTCGTGCCGT
CCGCTGCC
C

QA 1 488 1 488
DS 



CO CL1991Contig2 443 2 1 U
GCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACTTACTGTAAGAA
CAAGGAATGCAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTGACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAG
TCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAATCTGGATATGGTGGTCAGAC
CAAACCCGTCTTCTACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGATTGTGCTGAGGCTCCAATG
CCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGTGCAAGCACTTTGAGATTGG
TGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACGTCTCTCTTTTAAGTTGTTTCCTCTATCTACTTTTT
TTTTTAATCTTTTGTCTTGCTTGGGCTTTCGAATACATTTTGAATCTTCAAAAAATGGTT
ATGGACTTATGATCTTTTAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H041JQ C 1
AF RR4H041TF U 1
BS 1 443 RR4H041TF

RD RR4H041JQ 443 0 0
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CAAACCCGTTTTTTACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGATTGTGCTGAGGCTCCAATG
CCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGTGCAAGCACTTTGAGATTGG
TGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACGTCTCTCTTTTAAGTTGTTTCCTCTATCTACTTTTT
TTTTTAATCTTTTGTCTTGCTTGGGCTTTCGAATACATTTTGAATTTTCAAAAAATGGTT
ATGGACTTATGATCTTTTAATTG

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR4H041TF 443 0 0
GCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACTTACTGTAAGAA
CAAGGAATGCAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTGACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAG
TCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAATCTGGATATGGTGGTCAGAC
CAAACCCGTCTTCTACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGATTGTGCTGAGGCTCCAATG
CCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGTGCAAGCACTTTGAGATTGG
TGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACGTCTCTCTTTTAAGTTGTTTCCTCTATCTACTTTTT
TTTTTAATCTTTTGTCTTGCTTGGGCTTTCGAATACATTTTGAATCTTCAAAAAATGGTT
ATGGACTTATGATCTTTTAATTG

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 4

CO CL1992Contig1 932 4 20 U
GGGATAATGTGTCTTTTGTTTGTGCACGTTACATGTTTGATGAAATGCCTCACAGACATG
GATCCAGAACCCGGGTTTCTATCCCAGATTTGATTCAACGGAAGAGAAGAAGCGAAACGG
AAAATGAGATCCCCAAGAACCCTAGAGGTTTGGAAGCTAGGGACTGTGAACTATTTGAAG
TCCCTTAAACTTCAAGACAAGTTAGTTTCCGAGAGAAAAGCTAACCGAATCCCCGATACA
CTCCTCTCGCTTCAGCATCCACCAACTTACACGCTCGGAAAACGTAGAACCGATCACAAC
TTACTCATCCCTGAAGCTGAACTCAAGAGCATTGGAGCTGAGCTTCATTATACTCAAAGA
GGAGGAGATATCACTTTCCATGGCCCTCGCCAAGCCGTCTTATACCCCATCCTCTCCTTA
CGCAGCATAGGTTTTGGTGCTAGGAGCTATGTGGAGGCATTGGAGAGGTCAATGATCGAG
TTTGCTTCGCTTTATGGGGTGAAAGCTCGTCCAGGAAACAAATGTGAGACTGGGGTTTGG
GTGGGAGATGGAAAGATTGGTGCTATTGGGGTTCGTATATCCTCTGGAATCACTTGTCAT
GGTCTGGCCTTCAACATAGATCCTGACATGAAGTACTTTGAGCACATTGTTCCGTGTGGG
ATTGCTGATAAAGAAGTTACATCTCTGAGAAGGGAGACAGATGCGCAGCTTCCTTCCGAA
GAAGTGATTCACGAGCAGTTGGTTTCTTGTTTGGCAAAAGTGTTTTCATATGATGTTGTG
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CTTAAAGTTATCTTTCAACTTTCAATGCATTTGATTTCAGATTTGTAACACTTTATATCA
TTTGATCAATCTATAAACGTTCATCATTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 0 0 0 0 15 0 0 0 0 15 0 0 0 15 0 0 0 0 0 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS76TF U 1
AF RR4AA17TF U 99
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AF RR4DS76JQ C 188
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AAAATGAGATCCCCAAGAACCCTAGAGGTTTGGAAGCTAGGGACTGTGAACTATTTGAAG
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TTACTCATCCCTGAAGCTGAACTCAAGAGCATTGGAGCTGAGCTTCATTATACTCAAAGA
GGAGGAGATATCACTTTCCATGGCCCTCGCCAAGCCGTCTTATACCCCATCCTCTCCTTA
CGCAGCATAGGTTTTGGTGCTAGGAGCTATGTGGAGGCATTGGAGAGGTCAATGATCGAG
TTTGCTTCGCTTTATGGGGTGAAAGCTCGTCCAGGAAACAAATGTGAGACTGGGGTTTGG
GTGGGAGATGGAAAGATTGGTGCTATTGGGGTTCGTATATCCTCTGGAATCACTTGTCAT
GGTCTGGCCTTCAACATAGATCCTGACATGAAGTACTTTGAGCACATTGTTCCGTGTGGG
ATTGCTGATAAAGAAGTTACATCTCTGAGAAGG*AGACAGATGCGCAGCTTCCTTCCGA*
*GAGTGAT*CACGAGCAGTTGGTTTCT*GTTTGGCAAA*GTGTTTTCATATGATGTTGTG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AA17TF 834 0 0
G
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GCTAACCGAATCCCCGATACACTCCTCTCGCTTCAGCATCCACCAACTTACACGCTCGGA
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GAGCTTCATTATACTCAAAGAGGAGGAGATATCACTTTCCATGGCCCTCGCCAAGCCGTC
TTATACCCCATCCTCTCCTTACGCAGCATAGGTTTTGGTGCTAGGAGCTATGTGGAGGCA
TTGGAGAGGTCAATGATCGAGTTTGCTTCGCTTTATGGGGTGAAAGCTCGTCCAGGAAAC
AAATGTGAGACTGGGGTTTGGGTGGGAGATGGAAAGATTGGTGCTATTGGGGTTCGTATA
TCCTCTGGAATCACTTGTCATGGTCTGGCCTTCAACATAGATCCTGACATGAAGTACTTT
GAGCACATTGTTCCGTGTGGGATTGCTGATAAAGAAGTTACATCTCTGAGAAGGGAGACA
GATGCGCAGCTTCCTTCCGAAGAAGTGATTCACGAGCAGTTGGTTTCTTGTTTGGCAAAA
GTGTTTTCATATGATGTTGTGTGGAAGGAAGATCCTTCAGCCATTTTAGACACCCTGGAG
GATAAAGACTAATAGTACATTCTTAAAGTTATCTTTCAACTTTCAATGCATTTGATTTCA
GATTTGTAACACTTTATATCATTTGATCAATCTATAAACGTTCATCATTCTTT

QA 2 834 2 834
DS 

RD RR4GR02JQ 672 0 0
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AAGCTGAACTCAAGAGCATTGGAGCTGAGCTTCATTATACTCAAAGAGGAGGAGATATCA
CTTTCCATGGCCCTCGCCAAGCCGTCTTATACCCCATCCTCTCCTC*CGCAGCATAGGTT
TTGGTGCTAGGAGCTATGTTGAGGCATTGGAGAGGTCAATGATCGAGTTTGCTTCGCTTT
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AGATTGGTGCTATTGGGGTTCGTATATCCTCTGGAATCACTTGTCATGGTCTGGCCTTCA
ACATAGATCCTGACATGAAGTACTTTGAGCACATTGTTCCGTGTGGGATTGCTGATAAAG
AAGTTACATCTCTGAGAAGGGGGACAGATGCGCAGCTTCCTTCCGAAGAAGTGATTCACG
AGCAGTTGGTTTCTTGTTTGGCAAAAGTGTTTTCATATGATGTTGTGTGGAAGGAAGATC
CTTCAGCCATTTTAGACACCCTGGAGGATAAAGACTAATAGTACATTCTTAAAGTTATCT
TTCAACTTTCAATGCATTTGATTTCAGATTTGTAACACTTTATATCATTTGATCAATCTA
TAAACGTTCATC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4DS76JQ 738 0 0
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TCCCTGAAGCTGAACTCAAGAGCATTGGAGCTGAGCTTCATTATACTCAAAGAGGAGGAG
ATATCACTTTCCATGGCCCTCGCCAAGCCGTCTTATACCCCATCCTCTCCTTACGCAGCA
TAGGTTTTGGTGCTAGGAGCTATGTGGAGGCATTGGAGAGGTCAATGATCGAGTTTGCTT
CGCTTTATGGGGTGAAAGCTCGTCCAGGAAACAAATGTGAGACTGGGGTTTGGGTGGGAG
ATGGAAAGATTGGTGCTATTGGGGTTCGTATATCCTCTGGAATCACTTGTCATGGTCTGG
CCTTCAACATAGATCCTGACATGAAGTACTTTGAGCACATTGTTCCGTGTGGGATTGCTG
ATAAAGAAGTTACATCTCTGAGAAGGGAGACAGATGCGCAGCTTCCTTCCGAAGAAGTGA
TTCACGAGCAGTTGGTTTCTTGTTTGGCAAAAGTGTTTTCATATGATGTTGTGTGGAAGG
AAGATCCTTCAGCCATTTTAGACACCCTGGAGGATAAAGACTAATAGTACATTCTTAAAG
TTATCTTTCAACTTTCAATGCATTTGATTTCAGATTTGTAACACTTTATATCATTTGATC
AATCTATAAACGTTCATC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

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GGCTGGGGATTCTTTGAGTGTGTGAACCATGGGATTCCGCACGAGCTACTTGACAGAGTA
GAGAAGATGACCAAGGAACACTACAAGAAATGTATGGAAGACAGATTCAAGGAGTCCATT
AAGAACAGAGGACTCGACTCTGTTCGGTCTGAAGTCAATGACGTTGACTGGGAGTCAACT
TTCTTCCTTAAGCACCTTCCCCTCCCCAATATCTCCCATGTGCCTGATCTCCACGACGAT
TACAGGACGTTGATGAAAGAGTTCGCGGGAAAGATAGAGAAGTTGTCGGAGGAGCTACTG
GATCTGCTTTGCGAGAATCTCGGGTTGGAGAAGGGCTATCTGAAAAAGGTGTTTTACGGG
TCGAAAAGCCCGACTTTTGGAACCAAAGTGAGCAACTATCCACCTTGTCCTAAACCGGAT
TTAATCAAGGGGCTCCGAGCACATACCGACGCAGGCGGCATCATCCT**CCTCTTCCAGG
ACGATAAAGTCAGTGGACTTCAGCTCCTTAAGGACGGCGAGTGGG*TGGATGTTCCTCCG
GTTAAGCATACAATCGTCGTTAATCTCGGTGATCAGCTTGAGGTGATAACCAATGGGAAG
TACAAGAGCGTGGAGCATAGAGTGATAGCTCAGACGGATGCAGAAGGAAGAATGTCCATT
GCATCATTCTACAATCCTGGAAGCGACTCTGTTATTTTCCCGGCGCCGGAGTTGATCGGA
AAAGATTCGGAGAAGAAGGATAACTATCCAAAATTTGTGTTCGAGGATTACATGAAACTT
TACTCTGCTGTCAAGCTTCAAGCCAAAGAACCTAGGTTTGAAGCCATGAAAGCTATGGAG
ACAACTGTGTCCAACAATGTTGGACCATTGGCAACTGCCTAAATGAATGGCATTATAATA
CATAGTTTTCATATTCGAATAACTTTTATGTGGTATATGTTGTTGCATGTCTTTTTTTTT
TTTTTTAATAAAGGGTTAAACCCGGGTCAATGATGACACAAGCCTAACCCCGGGTGGAAA
TACATCTCACAGATAGACCCTCTCTTAGGCATTCAAATGAGCCGAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A146TF U 126
AF RR4A146TFB U 1
AF RR4ER08TF U 199
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GCTTTGCGAGAATCTCGGGTTGGAGAAGGGCTATCTGAAAAAGGTGTTTTACGGGTCGAA
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TTCGGAGAA

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TTCTTCCTTAAGCACCTTCCCCTCCCCAATATCTCCCATGTGCCTGATCTCCACGACGAT
TACAGGACGTTGATGAAAGAGTTCGCGGGAAAGATAGAGAAGTTGTCGGAGGAGCTACTG
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GCATCATTCTACAATCCTGGAAGCGACTCTGTTATTTTCCCGGCGCCGGAGTTGATCGGA
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TACTCTGCTGT
TAAGTT

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G
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CCCATACCGACGCAAGCGGCATCATCCT**CCTCTTCCAGGACGATAAAGTCAGTGGACT
TCAGCTCCTTAAGGACGGCGAGTGGG*TGGATGTTCCTCCGGTTAAGCATTCTATCGTCG
TTAATCTCGGTGATCAGATTGAGGTGATAACAAATGGGAAGTACAAGAGCGTGGAGCATA
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GAAGCGACTCTGTTATTTTCCCGGCGCCGGAGTTGATCGGAAAAGATTCGGAGAAGAAGG
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AAGCCAAAGAAC

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TACTGGATCTGCTTTGCGAGAATCTCGGGTTGGAGAAGGGCTATCTGAAAAAGGTGTTTT
ACGGGTCGAAAAGCCCGACTTTTGGAACCAAAGTGAGCAACTATCCACCTTGTCCTAAAC
CGGATTTAATCAAGGGGCTCCGAGCACATACCGACGCAGGCGGCATCATCCT**CCTCTT
CCAGGACGATAAAGTCAGTGGACTTCAGCTCCTTAAGGACGGCGAGTGGG*TGGATGTTC
CTCCGGTTAAGCATACAATCGTCGTTAATCTCGGTGATCAGCTTGAGGTGATAACCAATG
GGAAGTACAAGAGCGTGGAGCATAGAGTGATAGCTCAGACGGATGCAGAAGGAAGAATGT
CCATTGCATCATTTTACAATCCTGGAAGCGACTCTGTTATTTTCCCGGCGCCGGAGTTGA
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AACTTTACTCTGCTGTTAAGTTTCAAGCCAAAGAACCTAGGTTTGAAGCCATGAAAGCTA
TGGAGACAACTGTGTCCAACAATGTTGGACCATTGGCAACTGCCTAAATGAATGGCATTA
TAATACATAGTTTTCATATTCGAATAACTTTTATGTGGTATATGTTGTTGCATGTCTTTT
TTTTTTTTTTTAATAAAGGGTTAAACCCGGGTCAATGATGACACAAGCCTAACCCCGGGT
GGAAATACATCTCACAGATAGACCCTCTCTTAGGCATTCAAATGAGCCGAAAAT

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 5

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AATAAAACATGATAATAACTTCGTTCAGCAGTTATGCATAACTTCAGGCTTGGAAGCTTA
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CATGTTGAGGATGATGTCAGAGCCTCCAATAAACTCTCCCTTGATGAAGATCTGTGGAAA
TGTTGGCCAATGGCTGAAGGATTTCACAGCTTCTTTAATCTCTGGATCAGCAAGAATGTT
CCTAGCACCGACAGGAACATTATACTGTTGGAGAACCCTAACGGCGAGTGAGCTAAAGCC
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AACTTGCGGAGATTATAATAGAAGCTACGACGGAGAACGGAACAGAAAGAGTTGCAAAAC
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BQ
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AF RR4C765JQ U 1
AF RR4AU82JQ U 13
AF RR4FN06JQ U 23
AF RR4AU82TF C 13
AF RR4FN06TF C 136
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RD RR4C765JQ 717 0 0
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CGACAAAGCAGCCGCCATCTCTGAATCAAAGCTGATTTATTCAGCCCACGAA
AGAGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4AU82JQ 704 0 0
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TACCGTACATCAAAATGCATTCTTATGTAAATAAACAAAACAAAACAAAATAAAACATGA
TAATAACTTCGTTCAGCAGTTATGCATAACTTCAGGCTTGGAAGCTTACTGAGACTTTTG
GTTTGCAGAGACGTCTTTAAGCTTCTCCTCCAGTTCACCTTCCTTGTGCATGTTGAGGAT
GATGTCAGAGCCTCCAATAAACTCTCCCTTGATGAAGATCTGTGGAAATGTTGGCCAATG
GCTGAAGGATTTCACAGCTTCTTTAATCTCTGGATCAGCAAGAATGTTCCTAGCACCGAC
AGGAACATTATACTGTTGGAGAACCCTAACGGCGAGTGAGCTAAAGCCACACTGAGGAGC
TTCAGGGACTCCTTTCATGTAGATCATCACAGGATTTTCCTTCACATCATTCTCAACGAG
ATCCTTGAGCGAGTCCGTGGAACCAGAAGGGACTTTCTGTGTAGGCTTGAAGTCATCATG
TGTGTCTGAATCGCCGGGAACTGTAGTGGAGTATCTCATCATCCCATTTTGATAGATTGA
TGATACAGATGCCAATCTGGAAGAACGAACGGTGTTGAGAAACCTGCTCGACAAAGCAGC
CGCCATCTCTGAATCAAAGCTGATTTATTCAGCCCACGAA
GGAG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4FN06JQ 664 0 0
AG
TAAATATCAAGTTTTGTTCATACCAAGTTCTCTTGAGACTTTCATTATTACCGTACATCA
AAATGCATTCTTATGTAAATAAACAAAACAAAACAAAATAAAACATGATAATAACTTCGT
TCAGCAGTTATGCATAACTTCAGGCTTGGAAGCTTACTGAGACTTTTGGTTTGCAGAGAC
GTCTTTAAGCTTCTCCTCCAGTTCACCTTCCTTGTGCATGTTGAGGATGATGTCAGAGCC
TCCAATAAACTCTCCCTTGATGAAGATCTGTGGAAATGTTGGCCAATGGCTGAAGGATTT
CACAGCTTCTTTAATCTCTGGATCAGCAAGAATGTTCCTAGCACCGACAGGAACATTATA
CTGTTGGAGAACCCTAACGGCGAGTGAGCTAAAGCCACACTGAGGAGCTTCAGGGACTCC
TTTCATGTAGATCATCACAGGATTTTCCTTCACATCATTCTCAACGAGATCCTTGAGCGA
GTCCGTGGAACCAGAAGGGACTTTCTGTGTAGGCTTGAAGTCATCATGTGTGTCTGAATC
GCCGGGAACTGTAGTGGAGTATCTCATCATCCCATTTTGATAGATTGATGATACAGATGC
CAATCTGGAAGAACGAACGGTGTTGAGAAACCTGCTCGACAAAGCAGCCGCCATCTCTGA
AT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4AU82TF 798 0 0
GTTCTTTAATAATAAATATCAAGTTTTGTTCATACCAAGTTCTCTTGAGACTTTCATTAT
TACCGTACATCAAAATGCATTCTTATGTAAATAAACAAAACAAAACAAAATAAAACATGA
TAATAACTTCGTTCAGCAGTTATGCATAACTTCAGGCTTGGAAGCTTACTGAGACTTTTG
GTTTGCAGAGACGTCTTTAAGCTTCTCCTCCAGTTCACCTTCCTTGTGCATGTTGAGGAT
GATGTCAGAGCCTCCAATAAACTCTCCCTTGATGAAGATCTGTGGAAATGTTGGCCAATG
GCTGAAGGATTTCACAGCTTCTTTAATCTCTGGATCAGCAAGAATGTTCCTAGCACCGAC
AGGAACATTATACTGTTGGAGAACCCTAACGGCGAGTGAGCTAAAGCCACACTGAGGAGC
TTCAGGGACTCCTTTCATGTAGATCATCACAGGATTTTCCTTCACATCATTCTCAACGAG
ATCCTTGAGCGAGTCCGTGGAACCAGAAGGGACTTTCTGTGTAGGCTTGAAGTCATCATG
TGTGTCTGAATCGCCGGGAACTGTAGTGGAGTATCTCATCATCCCATTTTGATAGATTGA
TGATACAGATGCCAATCTGGAAGAACGAACGGTGTTGAGAAACCTGCTCGACAAAGCAGC
CGCCATCTCTGAATCAAAGCTGATTTATTCAGCCCACGAAGGAGAAAAAACTTGCGGAGA
TTATAATAGAAGCTACGACGGAGAACGGAACAGAAAGAGTTGCAAAACACAAGATCTTTA
CAGCGACCGCTTCTCT
CC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4FN06TF 686 0 0
AT
ACTTCGTTCAGCAGTTATGCATAACTTCAGGCTTGGAAGCTTACTGAGACTTTTGGTTTG
CAGAGACGTCTTTAAGCTTCTCCTCCAGTTCACCTTCCTTGTGCATGTTGAGGATGATGT
CAGAGCCTCCAATAAACTCTCCCTTGATGAAGATCTGTGGAAATGTTGGCCAATGGCTGA
AGGATTTCACAGCTTCTTTAATCTCTGGATCAGCAAGAATGTTCCTAGCACCGACAGGAA
CATTATACTGTTGGAGAACCCTAACGGCGAGTGAGCTAAAGCCACACTGAGGAGCTTCAG
GGACTCCTTTCATGTAGATCATCACAGGATTTTCCTTCACATCATTCTCAACGAGATCCT
TGAGCGAGTCCGTGGAACCAGAAGGGACTTTCTGTGTAGGCTTGAAGTCATCATGTGTGT
CTGAATCGCCGGGAACTGTAGTGGAGTATCTCATCATCCCATTTTGATAGATTGATGATA
CAGATGCCAATCTGGAAGAACGAACGGTGTTGAGAAACCTGCTCGACAAAGCAGCCGCCA
TCTCTGAATCAAAGCTGATTTATTCGGCCCACGAAGGAGAAAAAACTTGCGGAGATTATA
ATAGAAGCTACGACGGAGAACGGAACAGAAAGAGTTGCAAAACACAAGATCTTTACAGCG
ACCGCTTCTCTGGCGTTCACAGTC

QA 3 686 3 686
DS 



AS 1 5

CO CL1995Contig1 1220 5 14 U
GGAACCATTGACAGTTTAATACTTTAGAAGTGACTGTAAAACAAAATGGCGAGATTCGGG
TTAGTTGTAGTGACGATTCTTGTGATTCTAGGGCTTGTGAGCTTTTCAGAAGCTCAACTG
AAGCTAGGGTTCTACGAAAAAAACTTGCCCTAACGCAGAGAAGATCGTACAAGCTGTTGT
CAACCAACATATCCGCAGAGTACCATCTTTGGCTGCTGGCCTTATTAGGATGCATTTCCA
TGATTGCTTTGTTCGGGGCTGTGATGGTTCGATCTTGATCAACGCGACATCGAGCAACCA
ACAAGTGGAGAAGGTTGCTCCTCCAAATCTAACTGTTAGAGGTTTTGACTTTATCGATTT
AGTGAAGACTGTTCTGGAGAAGAAGTGTCCAGGAGTAGTTTCATGCGCCGATATCATTAC
TCTCGCGACTAGAGACTCCGTTGCTGCCATTGGTGGACCGACATGGAATGTTCCAACAGG
ACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAACAACATTCCTCCTCCTTT
CGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGAAAGACCT
TGTCTTGTTATCCGGCGCGCACACAATCGGAGTGTCTCATTGTTCCTCCTTCTCAAACCG
TCTCTTCAACTTTACCGGCGTAGGAGACCAAGATCCATCGCTTGACAGCGAATATGCAGA
CAATCTCAAGTCACGGAAATGTTTATCTATTGCCGACAATACCACACAGGTTGAAATGGA
TCCTGGTAGTAGAAACACCTTTGATCTTAGCTACTTCAAGCTCGTCTTGAAACGCCGTGG
GCTTTTTGAGTCTGATGCGGCGTTGACTAAGGATCCCACGGCGTTGGGTCAGGTCAGAGG
CTTCGCCGGAGGATCTCTGCAAGATTTCTTTGTCGAATTCGGCAAGTCAATGGAGAAAAT
GGGAAGGATTGGGGTGAAAACCGGGTCGGATGGAGAGATCCGAAGAACCTGTTCAGTGGT
TAATTGAAAAGCTTTCTTTTGTTTTATTTTTATTTTTGGTGATTTTGGGTGTTTTT*GTT
TTTCGACTACTTT*GGGTGTTTACGATTTCGAAATGTTTATTTGTGTATGTGGTCGAAAT
GTTATTTTCGAATAAGCTCACGTTTGTGAAGTCGTTGTAATAAATAATTCAATCGATTTG
TTTTCAATAAAATGTTCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE03TF U 1
AF RR4G973TF U 1
AF RR4G973JQ C 474
AF RR4EE03JQ C 561
AF RR4BC55TF U 561
BS 1 581 RR4EE03TF
BS 582 582 RR4G973TF
BS 583 614 RR4EE03TF
BS 615 615 RR4G973TF
BS 616 636 RR4EE03TF
BS 637 699 RR4BC55TF
BS 700 700 RR4G973JQ
BS 701 1070 RR4BC55TF
BS 1071 1071 RR4G973JQ
BS 1072 1076 RR4BC55TF
BS 1077 1077 RR4G973JQ
BS 1078 1093 RR4BC55TF
BS 1094 1094 RR4G973JQ
BS 1095 1220 RR4BC55TF

RD RR4EE03TF 636 0 0
GGAACCATTGACAGTTTAATACTTTAGAAGTGACTGTAAAACAAAATGGCGAGATTCGGG
TTAGTTGTAGTGACGATTCTTGTGATTCTAGGGCTTGTGAGCTTTTCAGAAGCTCAACTG
AAGCTAGGGTTCTACGAAAAAAACTTGCCCTAACGCAGAGAAGATCGTACAAGCTGTTGT
CAACCAACATATCCGCAGAGTACCATCTTTGGCTGCTGGCCTTATTAGGATGCATTTCCA
TGATTGCTTTGTTCGGGGCTGTGATGGTTCGATCTTGATCAACGCGACATCGAGCAACCA
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AGTGAAGACTGTTCTGGAGAAGAAGTGTCCAGGAGTAGTTTCATGCGCCGATATCATTAC
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ACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAACAACATTCCTCCTCCTTT
CGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAG*ACTTGATGTGAAAGACCT
TGTCTTGTTATCCG*CGCGCACACAATCGGAGTGTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4G973TF 622 0 0
GGAACCATTGACAGTTTAATACTTTAGAAGTGACTGTAAAACAAAATGGCGAGATTCGGG
TTAGTTGTAGTGACGATTCTTGTGATTCTAGGGCTTGTGAGCTTTTCAGAAGCTCAACTG
AAGCTAGGGTTCTACGAAAAAA*CTTGCCCTAACGCAGAGAAGATCGTACAAGCTGTTGT
CAACCAACATATCCGCAGAGTACCATCTTTGGCTGCTGGCCTTATTAGGATGCATTTCCA
TGATTGCTTTGTTCGGGGCTGTGATGGTTCGATCTTGATCAACGCGACATCGAGCAACCA
ACAAGTGGAGAAGGTTGCTCCTCCAAATCTAACTGTTAGAGGTTTTGACTTTATCGATTT
AGTGAAGACTGTTCTGGAGAAGAAGTGTCCAGGAGTAGTTTCATGCGCCGATATCATTAC
TCTCGCGACTAGAGACTCCGTTGCTGCCATTGGTGGACCTACATGGAATGTTCCAACAGG
ACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAACAACATTCCTCCTCCTTT
CGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGAAAGACCT
TGTCTTGTTATCCGGCGCGCAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4G973JQ 689 0 0
CAACAGGACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAACAACATTCCTC
CTCCTTTCGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGA
AAGACCTTGTCTTGTTATCCGGCGCGCACACAATCGGAGTGTCTCATTGTTCCTCCTTCT
CAAACCGTCTCTTCAACTTTACCGGCGTAGGAGACCAAGATCCATCGCTTGACATCGAAT
ATGCAGACAATCTCAAGTCACGGAAATGTTTATCTATTGCCGACAATACCACACAGGTTG
AAATGGATCCTGGTAGTAGAAACACCTTTGATCTTAGCTACTTCAAGCTCGTCTTGAAAC
GCCGTGGGCTTTTTGAGTCTGATGCGGCGTTGACTAAGGATTCCACGGCGTTGGGTCAGG
TCAGAGGCTTCGCCGGAGGATCTCTGCAAGATTTCTTTGTCGAATTCGGCAAGTCAATGG
AGAAAATGGGAAGGATTGGGGTGAAAACCGGGTCGGATGGAGAGATCCGAAGAACCTGTT
CAGTGGTTAATTGAAAAGCTTTCTTTTGTTTTATTTTTATTTTTGGTGATTTTGGGTGTT
TTT*GTTTTTCGACTACTTT*GGGTGTTTACGATTCCGAAATGTTTATTTGTGTATGTGG
TCGAAATGTTATTTTCGAATAAGCTCACG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4EE03JQ 630 0 0
TTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGAAAGACCTTGTCTTGTTATCCGGCGCGC
ACACAATCGGAGTGTCTCATTGTTCCTCCTTCTCAAACCGTCTCTTCAACTTTACCGGCG
TAGGAGACCAAGATCCATCGCTTGACAGCGAATATGCAGACAATCTCAAGTCACGGAAAT
GTTTATCTATTGCCGACAATACCACACAGGTTGAAATGGATCCTGGTAGTAGAAACACCT
TTGATCTTAGCTACTTCAAGCTCGTCTTGAAACGCCGTGGGCTTTTTGAGTCTGATGCGG
CGTTGACTAAGGATCCCACGGCGTTGGGTCAGGTCAGAGGCTTCGCCGGAGGATCTCTGC
AAGATTTCTTTGTCGAATTCGGCAAGTCAATGGAGAAAATGGGAAGGATTGGGGTGAAAA
CCGGGTCGGATGGAGAGATCCGAAGAACCTGTTCAGTGGTTAATTGAAAAGCTTTCTTTT
GTTTTATTTTTATTTTTGGTGATTTTGGGTGTTTTT*GTTTTTCGACTACTTT*GGGTGT
TTACGATTTCGAAATGTTTATTTGTGTATGTGGTCGAAATGTTATTTTCGAATAAGCTCA
CGTTTGTGAAGTCGTTGTAATAAATAATTC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4BC55TF 660 0 0
TTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGAAAGACCTTGTCTTGTTATCCGGCGCGC
ACACAATCGGAGTGTCTCATTGTTCCTCCTTCTCAAACCGTCTCTTCAACTTTACCGGCG
TAGGAGACCAAGATCCATCACTTGACAGCGAATATGCAGACAATCTCAAGTCACGGAAAT
GTTTATCTATTGCCGACAATACCACACAGGTTGAAATGGATCCTGGTAGTAGAAACACCT
TTGATCTTAGCTACTTCAAGCTCGTCTTGAAACGCCGTGGGCTTTTTGAGTCTGATGCGG
CGTTGACTAAGGATCCCACGGCGTTGGGTCAGGTCAGAGGCTTCGCCGGAGGATCTCTGC
AAGATTTCTTTGTCGAATTCGGCAAGTCAATGGAGAAAATGGGAAGGATTGGGGTGAAAA
CCGGGTCGGATGGAGAGATCCGAAGAACCTGTTCAGTGGTTAATTGAAAAGCTTTCTTTT
GTTTTATTTTTATTTTTGGTGATTTTGGGTTTTTTTTGTTTTTCGACTACTTTTGGGTGT
TTACGATTTCGAAATGTTTATTTGTGTATGTGGTCGAAATGTTATTTTCGAATAAGCTCA
CGTTTGTGAAGTCGTTGTAATAAATAATTCAATCGATTTGTTTTCAATAAAATGTTCTCT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 4

CO CL1996Contig1 749 4 7 U
AATTAAGGTCACTAATGCTAGAACTATTGTTTTGATCTCATGAAAAGATAAAAGAGTCTC
GAGATCAATATTCTCCATCGCGAATAAAGAAAGACACAACGATTTGTTCTGATGCGATAA
GTCCCCAAACTCTAGCTAGCAAACTAGCAAGTACCAAACCAAAACTCCTACTGACAAATA
GAAAATGTAAAGAGTACATAAGCATAGTGGTCATATGGAATCCACTCATGGAAGCTTATT
GTTACCAGTGACCTCTTCCTTGTCCTCTCCCGCGACCACCTCCGCGTCTTCGGTTTCCTC
CTCTACCACCACCGTGAGATGATATTCCCTGAAAAGCCTTGTTCACAAGCTGGTTTGACA
TACCACTCGAACCTCGTCCCCTCTTTGCAGAGACATTGTTACCACTTCCAGTGTTGCTAT
TAGCAGGTCGTTTTCCTCCGATTGTTGTTGTTGCAGAGGGTAACGGCTTTGTGGCTTCTT
TCCAAGAAAGGTTGATATTAGTATCTCCGATAAATGAAGGCACTTTTGCATGCAGTGGCT
TTGTCATCGCCAATATGTTATTACAGGTCCTAAGTCCAGTTGTCGTATTCCGCTTCTTTG
TTTTAACGCTTGCCTTCTCTTCATCTGTCTTAGCAGCCGACATGGCTTTGTTGTGCTCAG
TCATTCCCTGAGTTAATTTTTTCATCGTTGTCTTGGTTAGATCTTCAACGGTAGTCAATC
TCTCAGTGAAGTCCTTGTTCAACTCCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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AA
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CACCACCGTGAGATGATATTCCCTGAAAAGCCTTGTTCACAAGCTGGTTTGACATACCAC
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CCTGAGTTAATTTTTTCATCGTTGTCTTGGTTAGATCTTCAACGGTAGTCAATCTCTC

QA 3 720 3 720
DS 



AS 1 5

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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DS 

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G
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AAGGAGACCCTGAATTGCTTGTCTTTGTACCATTCACATCAGACGTCAAGATCAAGAGCA
TATCAATTGTTGGTGGTCCTGATGGAACAAGTCCTTCTAAGTTGAGAGTGTTCATCAATC
GTGAAGGGATTGACTTCTCTGACGCTGAGGGCATGCAAGCCGTTCAGGAATGGGAGTTAG
CTGAAAATTTGCAAGGTGAATTAGAATACCAGACCAGGTATTCGAAATTCCAAAGTGTTG
GCAACATCACATTGCATTTCCCTGAGAGTTTTGGTGGTGACACAACCCAAATACGCTACA
TCGGTTTTAAAGGTGAAGCAACCCAGTTGAAAAGGGATGTTGTTGCAACGATTGTATATG
AGATAAGACCGAATCCTTCAGATCACAAGACAAAAGCTGAGACTGGTG

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR4EC17JQ 476 0 0
GGCATGCAAGCCGTTCAGGAATGGGAGTTAGCTGAAAATTTGCAAGGTGAATTAGAATAC
CAGACCAGGTATCCGAAATTCCAAAGTGTTGGCAACATCACATTGCATTTCCCTGAGAGT
TTTGGTGGTGACACAACCCAAATACGCTACATCGGTTTTAAAGGTGAAGCAACCCAGTTG
AAAAGGGATGTTGTTGCAACGATTGTATATGAGATAAGACCGAATCCTTCAGATCACAAG
ACAAAAGCTGAGACTGGTGGAGGTTTCTCACAAGTTGAGTGAAGATATTATTTGCTTCCA
ACTTCACTCCTTAGCCTTTTCACATACCTATGTTTCCTCAATAAGCTTTGGCCTATTGTA
ACAAACATATATGTATCGAATAAAATGCCGGAGACTTGTTAAATGTGGAATCTTTCTATA
CTTGAACCGGTATGAGTTATTTTGAACTTTTATAACAATGAACTCTATTTTATTTT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4E387JQ 356 0 0
AAAGTGTTGGCAACATCACATTGCATTTCCCTGAGAGTTTTGGTGGTGACACAACCCAAA
TACGCTACATCGGTTTTAAAGGTGAAGCAACCCAGTTGAAAAGGGATGTTGTTGCAACGA
TTGTATATGAGATAAGACCGAATCCTTCAGATCACAAGACAAAAGCTGAGACTGGTGGAG
GTTTCTCACAAGTTGAGTGAAGATATTATCTGCTTCCAACTTCACTCCTTAGCCTTTTCA
CATACCTATGTTTCCTCAATAAGCTTTGGCCTATTGTAACAAACATATATGTATCGAATA
AAATGCCGGAGACTTGTTAAATGTGGAATCTTTCTATACTTGAACCGGTATGAGTT

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 5

CO CL1998Contig1 683 5 7 U
GAGAGTAAAAGTTGGATCAACTTCACAACACGGTTTGTAGATATGTTAAAAATTTCCAAG
AAAGACAACATAAAATACATGAAAAGTCTCACTTCAATTTCAAACGAACGAATCAAACAA
ACAAAAAGACTCTCAAAGAAGACATTATTACATTTTCACGTCAATCAAAAGAAATTTTGT
TTAGTAGTAAGTAGGTTCAGAGGTGTAGAAAAAAGGACCAGCCCAGTAAAGCTTGAAGCT
CTTGTCTTCAAGAACACGGTACTTGCTCAATGACATTCCTCTCACACCTTTGTTCACATC
GGTCGGGAAATCGCAATCAGCGATTGGAGACTTGTAAAGGAAAACTTTGCACTTCGTCAC
CGTCCTTCCTGCACGAAGCTGTGAAGGGAATAACGTGGCGAAGAAGTAACCTTTAGCATC
AGTTTTGCTGCTCATTATTGAGATTGGAACTATCTCTTTGCCATATGCGTCTGTCTTTAC
ACATGCGATTCTTGCCGTAGCACCTTGAATTGGGTAAGATTTGTCACCGGACTTGCACAT
GATGACACCTTCAACGGCGACAGGAATAAATTTTCCGGTCTCGGGGTTGGCTTCATTGCC
GTAATTAGCAACTGAGGATATGATTAGGGATGAGAAGACAACGAGAGAAGCAGCAAATGA
AAGGCGTGAGAAAGCCATTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA95JQB U 14
AF RR4HA95TF C 14
AF RR4FV23TF C 395
AF RR4D615JQ U 40
AF RR4FV23JQ U 1
BS 1 37 RR4FV23JQ
BS 38 38 RR4HA95JQB
BS 39 157 RR4FV23JQ
BS 158 158 RR4HA95JQB
BS 159 174 RR4FV23JQ
BS 175 175 RR4HA95JQB
BS 176 683 RR4FV23JQ

RD RR4HA95JQB 503 0 0
GGATCAACTTCACAACACGGTTTGTAGATATGTTAAAAATTTCCAAGAAAGACAACATAA
AATACATGAAAAGTCTCACTTCAATTTCAAACGAACGAATCAAACAAACAAAAAGACTCT
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GGTTCAGAGGTGTAGAAAAAAGGACCAGCCCAGTAAAGCTTGAAGCTCTTGTCTTCAAGA
ACACGGTACTTGCTCAATGACATTCCTCTCACACCTTTGTTCACATCGGTCGGGAAATCG
CAATCAGCGATTGGAGACTTGTAAAGGAAAACTTTGCACTTCGTCACCGTCCTTCCTGCA
CGAAGCTGTGAAGGGAATAACGTGGCGAAGAAGTAACCTTTAGCATCAGTTTTGCTGCTC
ATTATTGAGATTGGAACTATCTCTTTGCCATATGCGTCTGTCTTTACACATGCGATTCTT
GCCGTAGCACCTTGAATTGGGT
C

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4HA95TF 503 0 0
GGATCAACTTCACAACACGGTTTGTAGATATGTTAAAAATTTCCAAGAAAGACAACATAA
AATACATGAAAAGTCTCACTTCAATTTCAAACGAACGAATCAAACAAACAAAAAGACTCT
CAAAGAAGACATTATTACATTTTCACGTCAATCAAAAGAAATTTTGTTTAGTAGTAAGTA
GGTTCAGAGGTGTAGAAAAAAGGACCAGCCCAGTAAAGCTTGAAGCTCTTGTCTTCAAGA
ACACGGTACTTGCTCAATGACATTCCTCTCACACCTTTGTTCACATCGGTCGGGAAATCG
CAATCAGCGATTGGAGACTTGTAAAGGAAAACTTTGCACTTCGTCACCGTCCTTCCTGCA
CGAAGCTGTGAAGGGAATAACGTGGCGAAGAAGTAACCTTTAGCATCAGTTTTGCTGCTC
ATTATTGAGATTGGAACTATCTCTTTGCCATATGCGTCTGTCTTTACACATGCGATTCTT
GCCGTAGCACCTTGAATTGGGT
C

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4FV23TF 154 0 0
GTGGCGAAGAAGTAACCTTTAGCATCAGTTTTGCTGCTCATTATTGAGATTGGAACTATC
TCTTTGCCATATGCGTCTGTCTTTACACATGCGATTCTTGCCGTAGCACCTTGAATTGGG
TAAGATTTGTCACAGGACTTGCACATGATGACAC

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR4D615JQ 547 0 0
GG
TATGTTAAAAATTTCCAAGAAAGACAACATAAAATACATGAAAAGTCTCACTTCAATTTC
AAACGAACGAATCAAACAAACAAAAAGACTCTCAAAGAAGACATTACTACATTTTCACGT
CAATCAAAAGAAACTTTGTTTAGTAGTAAGTAGGTTCAGAGGTGTAGAAAAAAGGACCAG
CCCAGTAAAGCTTGAAGCTCTTGTCTTCAAGAACACGGTACTTGCTCAATGACATTCCTC
TCACACCTTTGTTCACATCGGTCGGGAAATCGCAATCAGCGATTGGAGACTTGTAAAGGA
AAACTTTGCACTTCGTCACCGTCCTTCCTGCACGAAGCTGTGAAGGGAATAACGTGGCGA
AGAAGTAACCTTTAGCATCAGTTTTGCTGCTCATTATTGAGATTGGAACTATCTCTTTGC
CATATGCGTCTGTCTTTACACATGCGATTCTTGCCGTAACACCTTGAATTGGGTAAGATT
TGTCACCGGACTTGCACATGATGACACCTTCAACGGCGACAGGAATAAATTTTCCGGTCT
CGGGG

QA 3 547 3 547
DS 

RD RR4FV23JQ 683 0 0
GAGAGTAAAAGTTGGATCAACTTCACAACACGGTTTGCAGATATGTTAAAAATTTCCAAG
AAAGACAACATAAAATACATGAAAAGTCTCACTTCAATTTCAAACGAACGAATCAAACAA
ACAAAAAGACTCTCAAAGAAGACATTATTACATTTTCGCGTCAATCAAAAGAAACTTTGT
TTAGTAGTAAGTAGGTTCAGAGGTGTAGAAAAAAGGACCAGCCCAGTAAAGCTTGAAGCT
CTTGTCTTCAAGAACACGGTACTTGCTCAATGACATTCCTCTCACACCTTTGTTCACATC
GGTCGGGAAATCGCAATCAGCGATTGGAGACTTGTAAAGGAAAACTTTGCACTTCGTCAC
CGTCCTTCCTGCACGAAGCTGTGAAGGGAATAACGTGGCGAAGAAGTAACCTTTAGCATC
AGTTTTGCTGCTCATTATTGAGATTGGAACTATCTCTTTGCCATATGCGTCTGTCTTTAC
ACATGCGATTCTTGCCGTAGCACCTTGAATTGGGTAAGATTTGTCACCGGACTTGCACAT
GATGACACCTTCAACGGCGACAGGAATAAATTTTCCGGTCTCGGGGTTGGCTTCATTGCC
GTAATTAGCAACTGAGGATATGATTAGGGATGAGAAGACAACGAGAGAAGCAGCAAATGA
AAGGCGTGAGAAAGCCATTTCTT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 5

CO CL1999Contig1 1025 5 10 U
GGAAACTGAGTTTCTATATAGTTTAATAATCTATGAGATCTTCTTTCCTTTGGTAGAAAG
CAAAAGCAATGAATAATCTGCCAGAGGACTGCATCGCTAAGATCCTTTCCTTGACTACGC
CTCGAGACGTTTGCCGATCATCGGCTGTCTCCAGGTGTTTCAGATCCGCCGCTGACACCG
ACCATGTCTGGAATCACTTCTTACCTTCCGAGTTCCCCGAGGGTTTTAGGGCACCTGAGG
GTCTTCCCACCAAGAAACACCTCTTCTTCTCCCTCGTCCATAACCCTCTCCTTCTCCACG
GTTCCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACATGATGGCTG
CTAGGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGATCTCTCTTC
CTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTGACATCACTG
GAAAAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACCTTGTCTTTA
AGTGGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTAGAGGCATCCCTTATTTTGGCTG
GCACCGATCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATCCGGGAAGCG
AACAAGGTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAGGTGGAGTTGGGACAGT
TCTTCAAAAGGAGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCCTCAAGGAGACAAAGAGGC
CTTTTGAGAAGAAAGGTCTTATCGTCCATGGAATTGAGATTAGGCCAGTACTGCCCTAAT
TTTATCCTACTGCTAATAACACCTTTTGCTCTTTGCAATTGTTGTTCTCCGTGTTGTGTT
ATCTTCTTCTCTTCTTATTTTCCCCTGCTTCTTTGTTTTTTTTCTTCCTATATTGATGCA
GAAAAAAATTGTATTTCAGTTTGATGGTTGCTTTGTTATTCAGAATAATTATTGACTACT
ACCGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR4GM28TF U 1
AF RR4GT02TF U 1
AF RR4DH22TF U 162
AF RR4GM28JQ C 295
AF RR4GT02JQ C 312
BS 1 665 RR4GM28TF
BS 666 666 RR4DH22TF
BS 667 703 RR4GM28TF
BS 704 704 RR4GT02TF
BS 705 712 RR4GM28TF
BS 713 730 RR4GT02TF
BS 731 731 RR4DH22TF
BS 732 767 RR4GT02TF
BS 768 820 RR4DH22TF
BS 821 1025 RR4GM28JQ

RD RR4GM28TF 712 0 0
GGAAACTGAGTTTCTATATAGTTTAATAATCTATGAGATCTTCTTTCCTTTGGTAGAAAG
CAAAAGCAATGAATAATCTGCCAGAGGACTGCATCGCTAAGATCCTTTCCTTGACTACGC
CTCGAGACGTTTGCCGATCATCGGCTGTCTCCAGGTGTTTCAGATCCGCCGCTGACACCG
ACCATGTCTGGAATCACTTCTTACCTTCCGAGTTCCCCGAGGGTTTTAGGGCACCTGAGG
GTCTTCCCACCAAGAAACACCTCTTCTTCTCCCTCGTCCATAACCCTCTCCTTCTCCACG
GTTCCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACATGATGGCTG
CTAGGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGATCTCTCTTC
CTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTGACATCACTG
GAAAAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACCTTGTCTTTA
AGTGGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTAGAGGCATCCCTTATTTTGGCTG
GCACCGATCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATCCGGGAAGCG
AACAA*GTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAAGTGGAGTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4GT02TF 770 0 0
GGAAACTGAGTTTCTATATAGTTTAATAATCTATGAGATCTTCTTTCCTTTGGTAGAAAG
CAAAAGCAATGAATAATCTGCCAGAGGACTGCATCGCTAAGATCCTTTCCTTGACTACGC
CTCGAGACGTTTGCCGATCATCGGCTGTCTCCAGGTGTTTCAGATCCGCCGCTGACACCG
ACCATGTCTGGAATCACTTCTTACCTTCCGAGTTCCCCGAGGGTTTTAGGGCACCTGAGG
GTCTTCCCACCAAGAAACACCTCTTCTTCTCCCTCGTCCATAACCCTCTCCTTCTCCACG
GTTCCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACATGATGGCTG
CTAGGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGATCTCTCTTC
CTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTGACATCACTG
GAAAAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACCTTGTCTTTA
AGTGGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTAGAGGCATCCCTTATTTTGGCTG
GCACCGATCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATCCGGGAAGCG
AACAACGTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAGGTGGAGTTGGGACAGT
TCTTCAAAAG*AGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCCTCAAG
AGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4DH22TF 659 0 0
G
GATCCGCCGCTGACACCGACCATGTCTGGAATCACTTCTTACCTTCCGAGTTCCCCGAGG
GTTTTAGGGCACCTGAGGGTCTTCCCACCAAGAAACACCTCTTCTTCTCCCTCGTCCATA
ACCCTCTCCTTCTCCACGGTTCCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACA
AGTGCTACATGATGGCTGCTAGGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACT
GGCAGTGGATCTCTCTTCCTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTAT
GGTGGCTTGACATCACTGGAAAAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACG
CCGCTTACCTTGTCTTTAAGTGGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTAGAGG
CATCCCTTATTTTGGCTGGCACCGAGCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCC
TGC*GAATCCGGGAAGCGAACAAGGTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACG
AGGTGGAGTTGGGACAGTTCTTCAAAAGGAGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCC
TCAAGGAGACAAAGAGGCCTTTTGAGAAGAAAGGTCTTATCGTCCATGGAATTGAGAT

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4GM28JQ 731 0 0
CCACGGTTC
CCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACATGATGGCTGCTA
GGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGATCTCTCTTCCTG
ATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTGACATCACTGGAA
AAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACCTTGTCTTTAAGT
GGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTAGAGGCATCCCTTATTTTGGCTGGCA
CCGATCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATCCGGGAAGCGAAC
AAGGTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAGGTGGAGTTGGGACAGTTCT
TCAAAAGGAGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCCTCAAGGAGACAAAGAGGCCTT
TTGAGAAGAAAGGTCTTATCGTCCATGGAATTGAGATTAGGCCAGTACTGCCCTAATTTT
ATCCTACTGCTAATAACACCTTTTGCTCTTTGCAATTGTTGTTCTCCGTGTTGTGTTATC
TTCTTCTCTTCTTATTTTCCCCTGCTTCTTTGTTTTTTTTCTTCCTATATTGATGCAGAA
AAAAATTGTATTTCAGTTTGATGGTTGCTTTGTTATTCAGAATAATTATTGACTACTACC
GT

QA 10 731 10 731
DS 

RD RR4GT02JQ 714 0 0
AGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACATGATGGCTGCTAGGGCCTTG
AATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGATCTCTCTTCCTGATGCCAGG
TTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTGACATCACTGGAAAAATCAAC
ATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACCTTGTCTTTAAGTGGAACCTT
GATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTAGAGGCATCCCTTATTTTGGCTGGCACCGATCAT
GATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATCCGGGAAGCGAACAAGGTCAG
CGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAGGTGGAGTTGGGACAGTTCTTCAAAAGG
AGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCCTCAAGGAGACAAAGAGGCCTTTTGAGAAG
AAAGGTCTTATCGTCCATGGAATTGAGATTAGGCCAGTACTGCCCTAATTTTATCCTACT
GCTAATAACACCTTTTGCTCTTTGCAATTGTTGTTCTCCGTGTTGTGTTATCTTCTTCTC
TTCTTATTTTCCCCTGCTTCTTTGTTTTTTTTCTTCCTATATTGATGCAGAAAAAAATTG
TATTTCAGTTTGATGGTTGCTTTGTTATTCAGAATAATTATTGACTACTACCGT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL2000Contig1 760 4 12 U
GGAACTGGTCTTTCTCGATCTCTGTGGGAACCGAACCATCTATCGACTCTCGCGAGCTCT
CTTGTCTCCTCTGCTGCGATCTCTCTCCTCTTCTCTCTATCAGCGCAGCAAATTGTGAGA
CTTTTGGCGGGAAAAATGTCGGGGAAAGGAGCTAACGGATTGATAATGGGGAAACCCAGC
GGTAGCGAGAAGGATAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGTTCTGCTCGAGCTGGT
CTTCAGTTCCCTGTAGGAAGGGTGCATAGGCTGTTGAAGACAAGGTCCACTGCTCACGGA
AGGGTCGGAGCAACTGCAGCTGTCTACACCGCAGCGATACTTGAGTATCTGACCGCAGAA
GTTTTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGATCTCAAGGTGAAACGTATCTCTCCCAGG
CACTTGCAGCTTGCGATTCGTGGAGATGAAGAGCTTGATACTCTCATCAAAGGAACTATA
GCTGGTGGTGGTGTTATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAATCCGCCAAGGAA
TAATGGATTCTTAACCACTCGCCCTTACTTCTCTGTTTCTTTTAAGTATCTCTGGAGAGA
GAGA**GTCTGTGTTTGATAAAAGAAGACGCTAGAGAGCTCCTTGTTTAGGATGGATCTC
TTTGTGTTATGCCTATGTATTTGATGATTATCTAAAACTCATTTTCTGACTAGAAGCTTG
TAAGCAAATCAGTGGGTAAAGATTTGTGTGTTTTCTCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F065TF U 1
AF RR4C812TF U 22
AF RR4GC25TF U 22
AF RR4C812JQ C 72
BS 1 95 RR4F065TF
BS 96 96 RR4C812TF
BS 97 131 RR4F065TF
BS 132 132 RR4C812TF
BS 133 155 RR4F065TF
BS 156 156 RR4C812TF
BS 157 236 RR4F065TF
BS 237 628 RR4C812TF
BS 629 641 RR4GC25TF
BS 642 642 RR4C812JQ
BS 643 709 RR4GC25TF
BS 710 760 RR4C812JQ

RD RR4F065TF 236 0 0
GGAACTGGTCTTTCTCGATCTCTGTGGGAACCGAACCATCTATCGACTCTCGCGAGCTCT
CTTGTCTCCTCTGCTGCGATCTCTCTCCTCTTCTCACTATCAGCGCAGCAAATTGTGAGA
CTTTTGGCGGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCTAAAGGATTGATAATGGGGAAACCCAGC
GGTAGCGAGAAGGATAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGTTCTGCTCGAGC

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR4C812TF 626 0 0
GG
GTGGGAACCGAACCATCTATCGACTCTCGCGAGCTCTCTTGTCTCCTCTGCTGCGATCTC
TCTCCTCTTCTCTCTATCAGCGCAGCAAATTGTGAGACTTTTGGCGGGAAAAATGTCGGG
GAAAGGAGCTAACGGATTGATAATGGGGAAACCCAGCGGTAGCGAGAAGGATAAGGACAA
GAAGAAACAACCCATCACCCGTTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCTGTAGGAAGGGT
GCATAGGCTGTTGAAGACAAGGTCCACTGCTCACGGAAGGGTCGGAGCAACTGCAGCTGT
CTACACCGCAGCGATACTTGAGTATCTGACCGCAGAAGTTTTGGAGTTGGCTGGTAACGC
CAGCAAGGATCTCAAGGTGAAACGTATCTCTCCCAGGCACTTGCAGCTTGCGATTCGTGG
AGATGAAGAGCTTGATACTCTCATCAAAGGAACTATAGCTGGTGGTGGTGTTATCCCTCA
CATCCACAAGTCTCTCATCAACAAATCCGCCAAGGAATAATGGATTCTTAACCACTCGCC
CTTACTTCTCTGTTTCTTTTAAGTATCTCTGGAGAGAGAGA**GTCTGTGTTTGATAAAA
GAAGA
CGCTAGAGAGCTCCTTGTT

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR4GC25TF 688 0 0
GG
GTGGGAACCGAACCATCTATCGACTCTCGCGAGCTCTCTTGTCTCCTCTGCTGCGATCTC
TCTCCTCTTCTCTCTATCAGCGCAGCAAATTGTGAGACTTTTGGCGGGAAAAATGTCGGG
GAAAGGAGCTAAAGGATTGATAATGGGGAAACCCAGCGGTAGCGGGAAGGATAAGGACAA
GAAGAAACAACCCATCACCCGTTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCTGTAGGAAGGGT
GCATAGGCTGTTGAAGACAAGGTCCACTGCTCACGGAAGGGTCGGAGCAACTGCAGCTGT
CTACACCGCAGCGATACTTGAGTATCTGACCGCAGAAGTTTTGGAGTTGGCTGGTAACGC
CAGCAAGGATCTCAAGGTGAAACGTATCTCTCCCAGGCACTTGCAGCTTGCGATTCGTGG
AGATGAAGAGCTTGATACTCTCATCAAAGGAACTATAGCTGGTGGTGGTGTTATCCCTCA
CATCCACAAGTCTCTCATCAACAAATCCGCCAAGGAATAATAGATTCTTAACCACTCGCC
CTTACTTCTCTGTTTCTTTTAAGTATCTCTGGAGAGAGAGAGAGTCTGTGTTTGATAAAA
GAAGACGCTAGAGAGCTCTTTGTTTAGGATGGATCTCTTTGTGTTATGCCTATGTATTTG
ATGATTATCTAAAACTCATTTTCTGA

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR4C812JQ 689 0 0
TGCTGCGATCTCTCTCCTCTTCTCTCTATCAGCGCAGCAAATTGTGAGACTTTTGGCGGG
AAAAATGTCGGGGAAAGGAGCTAACGGATTGATAATGGGGAAACCCAGCGGTAGCGAGAA
GGATAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGTTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCC
TGTAGGAAGGGTGCATAGGCTGTTGAAGACAAGGTCCACTGCTCACGGAAGGGTCGGAGC
AACTGCAGCTGTCTACACCGCAGCGATACTTGAGTATCTGACCGCAGAAGTTTTGGAGTT
GGCTGGTAACGCCAGCAAGGATCTCAAGGTGAAACGTATCTCTCCCAGGCACTTGCAGCT
TGCGATTCGTGGAGATGAAGAGCTTGATACTCTCATCAAAGGAACTATAGCTGGTGGTGG
TGTTATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAATCCGCCAAGGAATAATGGATTCT
TAACCACTCGCCCTTACTTCTCTGTTTCTTTTAAGTATCTCTGGAGAGAGAGA**GTCTG
TGTTTGATAAAAGAAGACGCTAGAGAGCTCCTTGTTTAGGATGGATCTCTTTGTGTTATG
CCTATGTATTTGATGATTATCTAAAACTCATTTTCTGACTAGAAGCTTGTAAGCAAATCA
GTGGGTAAAGATTTGTGTGTTTTCTCCGT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 5

CO CL2001Contig1 932 5 13 U
GGGAGAACATTCATATTAAATACCTCTTCTGATTCATAGATATCGGAGACTCAGATCTGC
AATCGAAGTTCTTGGGAGATCCAATTTGACGGGAGAAGAAGAAGCATGGACACTTTTACG
GTGGAGGATCTGTCAACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTCGCTCCTTCACTCGTTTATT
CCGACGCATTGGCTGCCTTTCTCAATCGTCGGACGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGA
ACACTCTTCGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTTCTCTTCTCGGT
ATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCT
TCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTATGTCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGT
GGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAAAAAATGGCTGTTGCTGGGCTTGTTCTC
GTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCAACAACTCTCCCGGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCA
AAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATCAGCACCATATTGGTGATGACA
TCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGA
TACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTATCCTAACCCTCCTCTTC
CATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACATCAACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTT
TAGAGACGGCTTTCAAATCTCTGTTTTGTCTGTCATGTCTGTTTGTTGTAGAGCGGCTTA
AGGTCTTCCCGGTTGTATGTCTATAACTAGTTGTAACGCTCTCTGTTTGCGCGTGAAAAA
AA*CATATTGCAGTCTTAATTTCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H805TF U 1
AF RR4FQ43TF U 46
AF RR4H805JQB C 32
AF RR4BZ90TF U 274
AF RR4BZ90JQ C 286
BS 1 292 RR4H805TF
BS 293 346 RR4FQ43TF
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BS 348 529 RR4FQ43TF
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BS 702 761 RR4FQ43TF
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BS 763 768 RR4FQ43TF
BS 769 769 RR4BZ90TF
BS 770 788 RR4FQ43TF
BS 789 932 RR4BZ90TF

RD RR4H805TF 292 0 0
GGGAGAACATTCATATTAAATACCTCTTCTGATTCATAGATATCGGAGACTCAGATCTGC
AATCGAAGTTCTTGGGAGATCCAATTTGACGGGAGAAGAAGAAGCATGGACACTTTTACG
GTGGAGGATCTGTCAACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTCGCTCCTTCACTCGTTTATT
CCGACGCATTGGCTGCCTTTCTCAATCGTCGGACGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGA
ACACTCTTCGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTTCTC

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR4FQ43TF 758 0 0
GG
GACTCAGATCTGCAATCGAAGTTCTTGGGAGATCCAATTTGACGGGAGAAGAAGAAGCAT
GGACACTTTTACGGCGGAGGATCTGTCGACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTCGCTCCT
TCACTCGTTTATTCCGACGCATTGGCTACCTTTCTCAATCGTCGGACGCGCGCGGAAATG
GACGCTTTCCAGAACACTCTTCGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCAC
TTCTCTTCTCGGTATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGACTGC
TCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTATGTCGTATTGTTTTT
GGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAAAAAATGGCTGTTGC
TGGGCTTGTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCAACAACTCTCCCGGTTTTCCTCGC
TGCTGGAAATTCAAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATCAGCACCAT
ATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCA
CTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAG*TATCCT
AACCCTCCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACATCAACTCCC*AGGAA
A*TCATTACTCTTTAGAGACG
CTTTCAATCTCTGTT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR4H805JQB 896 0 0
GA
TCATAGATATCGGAGACTCAGATCTGCAATCGAAGTTCT*GGGAGATCCAATTTGACGGG
AGAAGAAGAAGCATGGACACTTTTACGGTGGAGGATCTGTCAACGATCGGCGGAATCGCC
ACCGTGTCGCTCCTTCACTCGTTTATTCCGACGCATTGGCTGCCTTTCTCAATCGTCGGA
CGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGAACACTCTTCGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTG
CATGTCATATCCACTTCTCTTCTCGGTATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCC
GGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTAT
GTCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAA
AAAATGGCTGTTGCTGGGCTTGTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCAACAACTCTC
CCGGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCAAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTG
CTGATCAGCACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGC
CAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGCGT
CTGGTAGGTATCCTAACCCTCCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACAT
CAACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTTTAGAGACGGCTTTCAAATCTCTGTTTTGTCTGT
CATGTCTGTTTGTTGTAGAGCGGCTTAAGGTCTTCCCGGTTGTATGTCTATAACTAGTTG
TAACGCTCTCTGTTTGCGCGTGAAAAAAA*CATATTGCAGTCTTAA
CTTCATTC

QA 3 888 3 888
DS 

RD RR4BZ90TF 659 0 0
G
ATGTCATATCCACTTCTCTTCTCGGTATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCCG
GTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTATG
TCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAAA
AAATGGCTGTTGCTGGGCTTGTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCAACAACTCTCC
CGGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCAAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGC
TGATCAGCACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCC
AGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTC
TGGTAGGTATCCTAACCCTCCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACATC
AACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTTTAGAGACGGCTTTCAAATCTCTGTTTTGTCTGTC
ATGTCTGTTTGTTGTAGAGCGGCTTAAGGTCTTCCCGGTTGTATGTCTATAACTAGTTGT
AACGCTCTCTGTTTGCGCGTGAAAAAAA*CATATTGCAGTCTTAATTTCAAAAAAAAA

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4BZ90JQ 638 0 0
ACTTCTCTTCTCGGTATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGACT
GTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTATGTCGTATTGTTT
TTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAAAAAATGGCTGTT
GCTGGGCTTGTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCAACAACTCTCCCGGTTTTCCTC
GCTGTTGGAAATTCAAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTTTGCTGATCAGCACC
ATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTT
CACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTATC
CTAACCCTCCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACATCAACTCCCCAGG
AAAATCATTACTCTTTAGAGACGGCTTTCAAATCTCTGTTTTGTCTGTCATGTCTGTTTG
TTGTAGAGCGGCTTAAGGTCTTCCCGGTTGTATGTCTATAACTAGTTGTAACGCTCTCTG
TTTGCGCGTGAAAAAAAACATATTGCAGTCTTAA
TTTC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 5

CO CL2002Contig1 847 5 24 U
GGGTGCTTAAGCTGATATGAACTCAAAGGTCTTAGCCTCTGATCAGAACTCCTTGCCTAC
TTCGTTGAGCAACGGATCTGTACCTTTGTCCTGGTTTAATATTCTAATCCATGTCCTGTC
TCCCAATGCATTGGGATGGACTTTTCTAGTAGCGCTGGAATGATGATGGAGAATAAGAGG
AATGATGTCTGCTCTCTCGAAAAAAACAACATCAAACGCCATAAGTCAGATCTCTCTTTC
AGTTCCAAGGAGAGGAAAGACAAAGCTGGAAGTATGTCAGCTCTTCAACAGATAGTTTCC
CCTTACGGAAAGACCGACGCTGCGTCAGTTCTTCTAGACGCGATGCACTACATAGAGTTT
CTTCACGAACAAGTCAAGGTGCTAAGCGCTCCGTATCTGCAAACAATATCCCCTGCTACG
CAGGTGGAGATGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGAGGATTGTGTCTTTTTCCAATGGAT
TCTACTGTAGGAGTCGCTCAAAGCAACGGAGCTGATATATGGGCGTCAGTGAAGACTCCT
CCATCTCCTGCATTGAACGTCAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGACCGCTTCAGACTCGT
CACAACCTACTAAGATCTTTCTTTCTCTTAAAACCATTAAGAAGATAACCAATTATTATC
ATTCTGATGATTCTCTGTAACATATTTAGTAGACAGAAAGACACAGAAACATGGCTGTTA
TTACTTGGCTACTAAATGCATCCCCTTACTTGAAAACTTATGTAATAGAAAACCGGAAAA
GTGTTTATCGCTTTTTGACCTGAACCAAACCATATGATAACAAATTATTATGATTTTGAT
GATCCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F143TF U 1
AF RR4D778TF U 1
AF RR4FA46TF U 1
AF RR4F143JQ C 330
AF RR4D778JQ C 561
BS 1 90 RR4D778TF
BS 91 91 RR4F143TF
BS 92 126 RR4D778TF
BS 127 127 RR4F143TF
BS 128 227 RR4D778TF
BS 228 228 RR4F143TF
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BS 282 282 RR4F143TF
BS 283 301 RR4D778TF
BS 302 302 RR4F143TF
BS 303 318 RR4D778TF
BS 319 319 RR4F143TF
BS 320 329 RR4D778TF
BS 330 330 RR4F143TF
BS 331 478 RR4D778TF
BS 479 479 RR4F143TF
BS 480 558 RR4D778TF
BS 559 559 RR4F143TF
BS 560 740 RR4D778TF
BS 741 755 RR4FA46TF
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BS 757 780 RR4FA46TF
BS 781 811 RR4F143JQ
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RD RR4F143TF 615 0 0
GGGTGCTTAAGCTGATATGAACTCAAAGGTCTTAGCCTCTGATCAGAACTCCTTGCCTAC
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AATGATGTCTGCTCTCTCGAAATAA*CAACATCAAACGCCATAAGTCAGATCTCTCTTTC
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CCTTACGGAAAGACCGACGCTGCGTCAGTTCTTCTAGACGCGATGCACTACATAGAGTTT
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CAGGTGGAGATGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGAGGATTGTGTCTTTTTCCAATGGAT
TCTACTGTAGGAGTCGCTCAAAGCAACGGAGCTGATATATGGGCGTCAGTGAAGACTCCT
CCATCTCCTGCATTGAACGTCAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGACCGCTTCAGACTCGT
CACAACCTACTAAGA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4D778TF 740 0 0
GGGTGCTTAAGCTGATATGAACTCAAAGGTCTTAGCCTCTGATCAGAACTCCTTGCCTAC
TTCGTTGAGCAACGGATCTGTACCTTTGTCTTGGTTTAATATTCTAATCCATGTCCTGTC
TCCCAACGCATTGGGATGGACTTTTCTAGTAGCGCTGGAATGATGATGGAGAATAAGAGG
AATGATGTCTGCTCTCTCGAAAAAAACAACATCAAACGCCATAAGTCTGATCTCTCTTTC
AGTTCCAAGGAGAGGAAAGACAAAGCTGGAAGTATGTCAGCCCTTCAACAGATAGTTTCC
C*TTACGGAAAGACCGACACTGCGTCAGTCCTTCTAGACGCGATGCACTACATAGAGTTT
CTTCACGAACAAGTCAAGGTGCTAAGCGCTCCGTATCTGCAAACAATATCCCCTGCTACG
CAGGTGGAGATGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGAGGATTGTGTCTTTTTCCAATGGGT
TCTACTGTAGGAGTCGCTCAAAGCAACGGAGCTGATATATGGGCGTCAGTGAAGACTCCT
CCATCTCCTGCATTGAACTTCAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGACCGCTTCAGACTCGT
CACAACCTACTAAGATCTTTCTTTCTCTTAAAACCATTAAGAAGATAACCAATTATTATC
ATTCTGATGATTCTCTGTAACATATTTAGTAGACAGAAAGACACAGAAACATGGCTGTTA
TTACTTGGCTACTAAATGCA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4FA46TF 780 0 0
GGGTGCTTAAGCTGATATGAACTCAAAGGTCTTAGCCTCTGATCAGAACTCCTTGCCTAC
TTCGTTGAGCAACGGATCTGTACCTTTGTCCTGGTTTAATATTCTAATCCATGTCCTGTC
TCCCAATGCATTGGGATGGACTTTTCTAGTAGCGCTGGAATGATGATGGAGAATAAGAGG
AATGATGTCTGCTCTCTCGAAAAAAACAACATCAAACGCCATAAGTCAGATCTCTCTTTC
AGTTCCAAGGAGAGGAAAGACAAAGCTGGAAGTATGTCAGCTCTTCAACAGATAGTTTCC
CCTTACGGAAAGACCGACGCTGCGTCAGTTCTTCTAGACGCGATGCACTACATAGAGTTT
CTTCACGAACAAGTCAAGGTGCTAAGCGCTCCGTATCTGCAAACAATATCCCCTGCTACG
CAGGTGGAGATGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGAGGATTGTGTCTTTTTCCAATGGAT
TCTACTGTAGGAGTCGCTCAAAGCAACGGAGCTGATATATGGGCGTCAGTGAAGACTCCT
CCATCTCCTGCATTGAACGTCAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGACCGCTTCAGACTCGT
CACAACCTACTAAGATCTTTCTTTCTCTTAAAACCATTAAGAAGATAACCAATTATTATC
ATTCTGATGATTCTCTGTAACATATTTAGTAGACAGAAAGACACAGAAACATGGCTGTTA
TTACTTGGCTACTAAATGCATCCCCTTACTTGAAA*CTTATGTAATAGAAAACCGGAAAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4F143JQ 482 0 0
T
CTTCTAGACGCGATGCACTACATAGAGTTTCTTCACGAACAAGTCAAGGTGCTAAGCGCT
CCGTATCTGCAAACAATATCCCCTGCTACGCAGGTGGAGATGGAGCAGTACAGCCTGAGA
AACAGAGGATTGTGTCTTTTTCCAATGGATTCTACTGTAGGAGTCGCTCAAAGCAACGGA
GCTGATATATGGGCGTCAGTGAAGACTCCTCCATCTCCTGCATTGAACGTCAAGTCTCAA
TCACCCTTTAGATGACCGCTTCAGACTCGTCACAACCTACTAAGATCTTTCTTTTTCTTA
AAACCATTAAGAAGATAACCAATTATTATCATTCTGATGATTCTCTGTAACATATTTAGT
AGACAGAAAGACACAGAAACATGGCTGTTATTACTTGGCTACTAAATGCATCCCCTTACT
TGAAAACTTATGTAATAGAAAACCGGAAAAGTGTTTATCGCTTTTTGACCTGAACCAAAC
C

QA 2 482 2 482
DS 

RD RR4D778JQ 287 0 0
CAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGACCGCTTCAGACTCGTCACAACCTACTAAGATCTTT
CTTTCTCTTAAAACCATTAAGAAGATAACCAATTATTATCATTCTGATGATTCTCTGTAA
CATATTTAGTAGACAGAAAGACACAGAAACATGGCTGTTATTACTTGGCTACTAAATGCA
TCCCCTTACTTGAAAACTTATGTAATAGAAAACCGGAAAAGTGTTTATCGCTTTTTGACC
TGAACCAAACCATATGATAACAAATTATTATGATTTTGATGATCCTC

QA 1 287 1 287
DS 



AS 1 5

CO CL2003Contig1 780 5 11 U
GGTGATCCAACACATTCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAACACAAAAAAGCTAAAGAGCGAA
AATGGCAGCGACGACGACTCTCTCCACCGCAAGCTCAATCCTTTCCTCATCTTCCCCAAC
TCTCACCTCCTCCCACGCCTTCCTCTCCCGACCCACCACTCTCGAATTCCCATCTCGCTT
CCTCTCTTCCTCCTCCACCATCAGCCACCGCGCGACCCACCTCCGCCCCATCGCCGCCGT
CGAAGCCCCCGAAAAAA*TCGAGAAAATCGGATCCGAGATCTCCTCCCTCACACTCGAGG
AGGCCCGCATCCTCGTCGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGTCTCCCCCCTCTCCCTGG
CTCCCGCCGCGGCGGCTGTCGCCGCTCCGGGAGACGGCGGAGGCGCGGCGGCCGCGGTGG
AGGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTGCCCAGCAGCTCGCGTATCGCGG
TGATTAAGGCGGTGAGGGCTTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAGGCGAAGGAGCTTATCG
AAGGTCTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTGACTAAGGATGAAGCTGAGGAGGCTAAGA
AGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCTAAGGTTTCCATTGCTTAAATGTGTTTTTTTT*AACAA
TCTCAACTTTTTATAATATAAAAATTGTGTTTTTATTTCCCGAGTTTATGGGTCTTTTTT
GTTTGAATTGTTGGTTAAGCTTTGAGAAAGTATTGTAATTTGAATCAGTTCGTTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D331TF U 1
AF RR4GR83TF U 3
AF RR4AP45JQ C 24
AF RR4AP45TF U 24
AF RR4GR83JQ C 167
BS 1 284 RR4D331TF
BS 285 285 RR4GR83TF
BS 286 341 RR4D331TF
BS 342 342 RR4GR83TF
BS 343 625 RR4D331TF
BS 626 626 RR4AP45TF
BS 627 649 RR4D331TF
BS 650 650 RR4GR83TF
BS 651 722 RR4AP45TF
BS 723 774 RR4AP45JQ
BS 775 780 RR4GR83JQ

RD RR4D331TF 649 0 0
GGTGATCCAACACATTCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAACACAAAAAAGCTAAAGAGCGAA
AATGGCAGCGACGACGACTCTCTCCACCGCAAGCTCAATCCTTTCCTCATCTTCCCCAAC
TCTCACCTCCTCCCACGCCTTCCTCTCCCGACCCACCACTCTCGAATTCCCATCTCGCTT
CCTCTCTTCCTCCTCCACCATCAGCCACCGCGCGACCCACCTCCGCCCCATCGCCGCCGT
CGAAGCCCCCGAAAAAA*TCGAGAAAATCGGATCCGAGATCTCCCCCCTCACACTCGAGG
AGGCCCGCATCCTCGTCGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCATCTCCCCCCTCTCCCTGG
CTCCCGCCGCGGCGGCTGTCGCCGCTCCGGGAGACGGCGGAGGCGCGGCGGCCGCGGTGG
AGGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTGCCCAGCAGCTCGCGTATCGCGG
TGATTAAGGCGGTGAGGGCTTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAGGCGAAGGAGCTTATCG
AAGGTCTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTGACTAAGGATGAAGCTGAGGAGGCTAAGA
AGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCTAA*GTTTCCATTGCTTAAATGTGTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4GR83TF 648 0 0
GGAC
CCAACACATTCACAGAGAGAGAGAGAGA**AACACAAAAAAGCTAAAGAGCGAAAATGGC
AGCGACGACGACTCTCTCCACCGCAAGCTCAATCCTTTCCTCATCTTCCCCAACTCTCAC
CTCCTCCCACGCCTTCCTCTCCCGACCCACCACTCTCGAATTCCCATCTCGCTTCCTCTC
TTCCTCCTCCACCATCAGCCACCGCGCGACCCACCTCCGCCCCATCGCCGCCGTCGAAGC
CCCCGAAAAAAATCGAGAAAATCGGATCCGAGATCTCCTCCCTCACACTCGAGGAGGCCC
GCATCCTCGTCGGCTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGTCTCCCCCCTCTCCCTGGCTCCCG
CCGCGGCGGCTGTCGCCGCTCCGGGAGACGGCGGAGGCGCGGCGGCCGCGGTGGAGGAGC
AGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTGCCCAGCAGCTCGCGTATCGCGGTGATTA
AGGCGGTGAGGGCTTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAGGCGAAGGAGCTTATCGAAGGTC
TGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTGACTAAGGATGAAGCTGAGGAGGCTAAGAAGCAGC
TTGAAGAAGCTGGTGCTAAAGTTTCCATTGCTTAAATGTGTTTT

QA 5 648 5 648
DS 

RD RR4AP45JQ 753 0 0
G
GAGAGAGAGAGAAACACAAAAAAGCTAAAGAGCGAAAATGGCAGCGACGACGACTCTCTC
CACCGCAAGCTCAATCCTTTCCTCATCTTCCCCAACTCTCACCTCCTCCCACGCCTTCCT
CTCCCGACCCACCACTCTCGAATTCCCATCTCGCTTCCTCTCTTCCTCCTCCACCATCAG
CCACCGCT**ACCCACCTCCGCCCCATCGCCGCCGTCGAAGCCCCCGAAAAAA*TCGAGA
AAATCGGATCCGAGATCTCCTCCCTCACACTCGAGGAGGCCCGCATCCTCGTCGACTACC
TCCAGGACAAGTTCGGCGTCTCCCCCCTCTCCCTGGCTCCCGCCGCGGCGGCTGTCGCCG
CTCCGGGAGACGGCGGAGGCGCGGCGGCCGCGGTGGAGGAGCAGACCGAGTTCGACGTGG
TGATCAACGAGGTGCCCAGCAGCTCGCGTATCGCGGTGATTAAGGCGGTGAGGGCTTTGA
CTAGCTTGGCGTTGAAGGAGGCGAAGGAGCTTATCGAAGGTCTGCCGAAGAAGTTTAAGG
AAGGTGTGACTAAGGATGAAGCTGAGGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCTA
AGGTTTCCATTGCTTAAATGTGTTTTTTTT*AACAATCTCAACTTTTTATAATATAAAAA
TTGTGTTTTTATTTCCCGAGTTTATGGGTCTTTTTTGTTTGAATTGTTGGTTAAGCTTTG
AGAAAGTATTGTAATTTGAATCAGTTCGTT
CC

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR4AP45TF 699 0 0
G
GAGAGAGAGAGAAACACAAAAAAGCTAAAGAGCGAAAATGGCAGCGACGACGACTCTCTC
CACCGCAAGCTCAATCCTTTCCTCATCTTCCCCAACTCTCACCTCCTCCCACGCCTTCCT
CTCCCGACCCACCACTCTCGAATTCCCATCTCGCTTCCTCTCTTCCTCCTCCACCATCAG
CCACCGCT**ACCCACCTCCGCCCCATCGCCGCCGTCGAAGCCCCCGAAAAAA*TCGAGA
AAATCGGATCCGAGATCTCCTCCCTCACACTCGAGGAGGCCCGCATCCTCGTCGACTACC
TCCAGGACAAGTTCGGCGTCTCCCCCCTCTCCCTGGCTCCCGCCGCGGCGGCTGTCGCCG
CTCCGGGAGACGGCGGAGGCGCGGCGGCCGCGGTGGAGGAGCAGACCGAGTTCGACGTGG
TGATCAACGAGGTGCCCAGCAGCTCGCGTATCGCGGTGATTAAGGCGGTGAGGGCTTTGA
CTAGCTTGGCGTTGAAGGAGGCGAAGGAGCTTATCGAAGGTCTGCCGAAGAAGTTTAAGG
AAGGTGTGACTAAGGATGAAGCTGAGGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCTA
AGGTTTCCATTGCTTAAATGTGTTTTTTTT*AACAATCTCAACTTTTTATAATATAAAAA
TTGTGTTTTTATTTCCCGAGTTTATGGGTCTTTTTTGT

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR4GR83JQ 614 0 0
TTCCCATCTCGCTTCCTCTCTTCCTCCTCCACCATCAGCCACCGCGCGACCCACCTCCGC
CCCATCGCCGCCGTCGAAGCCCCCGAAAAAAATCGAGAAAATCGGATCCGAGATCTCCTC
CCTCACACTCGAGGAGGCCCGCATCCTCGTCGGCTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGTCTC
CCCCCTCTCCCTGGCTCCCGCCGCGGCGGCTGTCGCCGCTCCGGGAGACGGCGGAGGCGC
GGCGGCCGCGGTGGAGGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTGCCCAGCAG
CTCGCGTATCGCGGTGATTAAGGCGGTGAGGGCTTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAGGC
GAAGGAGCTTATCGAAGGTCTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTGACTAAGGATGAAGC
TGAGGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCTAAGGTTTCCATTGCTTAAATGTG
TTTTTTTTTAACAATCTCAACTTTTTATAATATAAAAATTGTGTTTTTATTTCCCGAGTT
TATGGGTCTTTTTTGTTTGAATTGTTGGTTAAGCTTTGAGAAAGTATTGTAATTTGAATC
AGTTCGTTTCACCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 5

CO CL2004Contig1 1058 5 9 U
GGGAAGGCAATCATAAGTGTTTTTTTTTAAGCCACAATACACAAATATGGTACAAATCTC
TTGTCGCAGAGAACAGAACACACAGTACAATCTTACAGTGGTTTTATTTGGGAAGCTTTT
TGATACACAAACAGAAGCTTCTGTGCGAAGTGGTACTATTGAACATGAAATGTGAACTTG
TGGGACACGGAATCTCTGCATTCAAGCAGAAATGGCAGCTTCGGAAACCCTTCCATTACC
AGACTCTGCGTTGAGACTGTCGTAATAATCAACCAACACTTTCCAACCAGAGGGACACAT
GAAACCGTCTGGTGGGTTCTCTTTCTTCTTCGCCAAGCCACGCATCTTGGTTCCTGAAAT
GAGGAGGAAGTCTTGAGACCTGGAAGGATCAAAGAAAGCCATTTTCCCCTGAGTTGTATC
ATACGCAGCAACCTTAAAGGGAAGAATGTTGAGGCGTTCGAGTCCTGGAGCCATGCTGAG
TACTTGCTTCCCGTGATCAGCATCATATAGATCCCTCTTTTCTGTTGGATGGCCCATGCC
TGCCGGATCACGGCCAACAATGTAGAAATTGGCTCCCGCGTTGATCCTAGCTTTGGCATG
CCACTGAACCTCTGTGGGCCCAGCATAGTGCATCGGAGATGGGAAGATGGAGACCACTGC
AGTCTCTGGATCAAGAACACCATCCTCAAGCACCTTCTCGTGTTGCCTCATACGCCAGCT
GAGAGGTACATCATCGGCTTTAGTGAATCCACCAAGTGGATTAAGCAACAAGACAGGGTT
TTTGCAACCCATCTCAAGAAGTCTCCTTCGAGTATCGGTCATGAGAAGGGCGTGACCATT
GTGTACCGGGTTCCTAAGCTGGAACGCGAAAACCGCGTCTGCGTCACGCTTCCTGAACTC
CTCACGAAGCTGAGACGGAGACAGACGGAACCGGTCGAGACCGTCGTTGTACTTGATCGG
CTCCAGGACTTGTAAATCGCCCCCGATCGGCCAGTTTCCTGATCTGGTGATCGCTTCTTC
TGCGTAAGGAAGACCTGGTGCTGTTGTCCCCCAGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4BP95JQ U 73
AF RR4GC07JQ U 1
AF RR4B548JQ U 29
AF RR4B548TF C 236
AF RR4GC07TF C 437
BS 1 290 RR4GC07JQ
BS 291 291 RR4B548JQ
BS 292 362 RR4GC07JQ
BS 363 363 RR4B548JQ
BS 364 784 RR4GC07JQ
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BS 786 798 RR4GC07JQ
BS 799 922 RR4B548TF
BS 923 1058 RR4GC07TF

RD RR4BP95JQ 181 0 0
ACAGAACACACAGTACAATCTTACAGTGGTTTTATTTGGGAAGCTTTTTGATACACAAAC
AGAAGCTTCTGTGCGAAGTGGTACTATTGAACATGAAATGTGAACTTGTGGGACACGGAA
TCTCTGCACTCAAGCAGAAATGGCAGCTTCGGAAACCCTTCCATTACCAGACTCTGCGTT
G

QA 1 181 1 181
DS 

RD RR4GC07JQ 802 0 0
GGGAAGGCAATCATAAGTGTTTTTTTTTAAGCCACAATACACAAATATGGTACAAATCTC
TTGTCGCAGAGAACAGAACACACAGTACAATCTTACAGTGGTTTTATTTGGGAAGCTTTT
TGATACACAAACAGAAGCTTCTGTGCGAAGTGGTACTATTGAACATGAAATGTGAACTTG
TGGGACACGGAATCTCTGCATTCAAGCAGAAATGGCAGCTTCGGAAACCCTTCCATTACC
AGACTCTGCGTTGAGACTGTCGTAATAATCAACCAACACTTTCCAACCAGGGGGACACAT
GAAACCGTCTGGTGGGTTCTCTTTCTTCTTCGCCAAGCCACGCATCTTGGTTCCTGAAAT
GAAGAGGAAGTCTTGAGACCTGGAAGGATCAAAGAAAGCCATTTTCCCCTGAGTTGTATC
ATACGCAGCAACCTTAAAGGGAAGAATGTTGAGGCGTTCGAGTCCTGGAGCCATGCTGAG
TACTTGCTTCCCGTGATCAGCATCATATAGATCCCTCTTTTCTGTTGGATGGCCCATGCC
TGCCGGATCACGGCCAACAATGTAGAAATTGGCTCCCGCGTTGATCCTAGCTTTGGCATG
CCACTGAACCTCTGTGGGCCCAGCATAGTGCATCGGAGATGGGAAGATGGAGACCACTGC
AGTCTCTGGATCAAGAACACCATCCTCAAGCACCTTCTCGTGTTGCCTCATACGCCAGCT
GAGAGGTACATCATCGGCTTTAGTGAATCCACCAAGTGGATTAAGCAACAAGACAGGGTT
TTTGTAACCCATCTCAAG
AAGT

QA 1 798 1 798
DS 

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AAGCCACAATACACAAATATGGTACAAATCTCTTGTCGCAGAGAACAGAACACACAGTAC
AATCTTACAGTGGTTTTATTTGGGAAGCTTTTTGATACACAAACAGAAGCTTCTGTGCGA
AGTGGTACTATTGAACATGAAATGTGAACTTGTGGGACACGGAATCTCTGCATTCAAGCA
GAAATGGCAGCTTCGGAAACCCTTCCATTACCAGACTCTGCGTTGAGACTGTCGTAATAA
TCAACCAACACTTTCCAACCAGAGGGACACATGAAACCGTCTGGTGGGTTCTCTTTCTTC
TTCGCCAAGCCACGCATCTTGGTTCCTGAAATGAGGAGGAAGTCTTGAGACCTGGAAGGA
TCAAAGAAAGCCATTTTCCCCTGAGTTGTATCATACGCAGCAACCTTAAAGGGAAGAATG
TTGAGGCGTTCGAGTCCTGGAGCCATGCTGAGTACTTGCTTCCCGTGATCAGCATCATAT
AGATCCCTCTTTTCTGTTGGATGGCCCATGCCTGCCGGATCACGGCCAACAATGTAAAAA
TTGGCTCCCGCGTTGATCCTAGCTTTGGCATGCCACTGAACCTCTGTGGGCCCAGCATAG
TGCATCGGAAATGGGAAGATGGAGACCACTGTAGTCTCTGGATCAAGAACACCATCCTCA
AGCACCTTCTCGTGTTGCCTCATACGCCAGCTGAGAGGTACATCATCGGCTTTAGTGAAT
CCACCAAGTGGATTAAGCAACAAGACAGGGTTTTTGCAACCCATCTCAAG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4B548TF 687 0 0
TTACCAGACTCTGCGTTGAGACTGTCGTAATAATCAACCAACACTTTCCAACCAGAGGGA
CACATGAAACCGTCTGGTGGGTTCTCTTTCTTCTTCGCCAAGCCACGCATCTTGGTTCCT
GAAATGAGGAGGAAGTCTTGAGACCTGGAAGGATCAAAGAAAGCCATTTTCCCCTGAGTT
GTATCATACGCAGCAACCTTAAAGGGAAGAATGTTGAGGCGTTCGAGTCCTGGAGCCATG
CTGAGTACTTGCTTCCCGTGATCAGCATCATATAGATCCCTCTTTTCTGTTGGATGGCCC
ATGCCTGCCGGATCACGGCCAACAATGTAGAAATTGGCTCCCGCGTTGATCCTAGCTTTG
GCATGCCACTGAACCTCTGTGGGCCCAGCATAGTGCATCGGAGATGGGAAGATGGAGACC
ACTGTAGTCTCTGGATCAAGAACACCATCCTCAAGCACCTTCTCGTGTTGCCTCATACGC
CAGCTGAGAGGTACATCATCGGCTTTAGTGAATCCACCAAGTGGATTAAGCAACAAGACA
GGGTTTTTGCAACCCATCTCAAGAAGTCTCCTTCGAGTATCGGTCATGAGAAGGGCGTGA
CCATTGTGTACCGGGTTCCTAAGCTGGAACGCGAAAACCGCGTCTGCGTCACGCTTCCTG
AACTCCTCACGAAGCTGAGACGGAGAC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4GC07TF 622 0 0
AAGGGAAGAATGTTGAGGCGTTCGAGTCCTGGAGCCATGCTGAGTACTTGCTTCCCGTGA
TCAGCATCATATAGATCCCTCTTTTCTGTTGGATGGCCCATGCCTGCCGGATCACGGCCA
ACAATGTAGAAATTGGCTCCCGCGTTGATCCTAGCTTTGGCATGCCACTGAACCTCTGTG
GGCCCAGCATAGTGCATCGGAGATGGGAAGATGGAGACCACTGCAGTCTCTGGATCAAGA
ACACCATCCTCAAGCACCTTCTCGTGTTGCCTCATACGCCAGCTGAGAGGTACATCATCG
GCTTTAGTGAATCCACCAAGTGGATTAAGCAACAAGACAGGGTTTTTGTAACCCATCTCA
AGAAGTCTCCTTCGAGTATCGGTCATGAGAAGGGCGTGACCATTGTGTACCGGGTTCCTA
AGCTGGAACGCGAAAACCGCGTCTGCGTCACGCTTCCTGAACTCCTCACGAAGCTGAGAC
GGAGACAGACGGAACCGGTCGAGACCGTCGTTGTACTTGATCGGCTCCAGGACTTGTAAA
TCGCCCCCGATCGGCCAGTTTCCTGATCTGGTGATCGCTTCTTCTGCGTAAGGAAGACCT
GGTGCTGTTGTCCCCCAGGTTC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2005Contig1 1423 4 9 U
ACTATCAATCAGAAGTAACATTTTGAAGTTAATCGAGCAAGAAGCAATAGAGCTGAAGGA
CAGATTCTCTACTCCCAGGCGTTCAGTGTTGGAAGACTCTGACAGTGGTGATCTGGATGA
TATAGATGTCATTCCAAATGAAGAGATGTTGATGGCAATCAGCGAAAAGGGTTATGTAAA
AAGGATGAAGCCTGATACGTTCAATCTCCAGAACCGTGGAACCATTGGGAAATCTGTCGG
GAAACTGAGAGTTGATGATTCGATGTCTGACTTTCTCGTTTGTCATGCACATGACCATGT
ACTCTTCTTCAGTGACCGGGGTATAGTTTACTCAACCCGTGCTTACAAGATTCCAGAATG
CTCTCGCAATGCAGCTGGCACACCTTTGGTTTAGATATTATCCATGTCAGAAGGCGAAAG
AGTAACCTCCATCGTTCCTGTTAGCGAGTTTCCTGAAGACCAGTATCTCCTGATGCTTAC
TGTGAATGGCTGCATCAAGAAAGTACCTTTGAAGCTATTCTCAGGGATACGCTCAACTGG
AATCATAGCGATTCAACTGAATTCTGGTGATGAACTGAAATGGGTTCGTTGCTGCTCCAG
CGTTGATCTTGTGGCCATGGCGTCCCAAAACGGAATGGTTGTCCTGAGTACATGTGACGG
TGTTCGAACACTGAGCAGAAACACAAAGGGAGTGACTGCCATGAGACTCAAGAATGCGGA
TAAGATGGCGAGCATGGACATCATACCTTCATCTCTGAGGAAAGATATGGTGAAGTCGGA
AGAAACTTCGGCTGACAGGAAACAATCCACCGGTCCATGGCTGTTATTCGTGTGTGAGAA
TGGCTATGGAAAGCGTGTTCCTCTGAGTAGCTTCAAGCCTTCTCGTCTGAACAGAGTTGG
TTTGATCGGATCAAAGTTCGCCGAGGATGATCGTTTAGCTGCTGTTTTTGTGGTTGGTTA
CTCCCTAGCTGAGGATGGAGAAAGCGATGAACAAGTGGTTCTAGTGAGCCAAAGCGGAAC
AGTGAACAGGACCAAAGTCAGGGACATCTCAATCCAATCACGCCGTGCACGGGGAGTGAT
TCTCATGAGACTTGATCATGCTGGGAAGATTCAGTCCGCATCTCTAATCTCTGCAGCAGA
TGAAGAAGAAGAAGGGGAAGGAGTTCAGAGCCTTGAAGAGGCTACTGCTAGCTTGTAGAT
TTTTACCTTTCTCTCCCCCCATCCAAAATCCGTACAGAGGCTTTAGTATATCTATGCTTT
TGAATTGCTTCTCTTCCTATTTACTTTTTTTGTTTCCCGATGATGATACTACTACGAGAA
GAGAAGGTCCTGACTCCTGATCATAATCTGTTATTAACACTAGTGTCATGTGTATTCGTA
AGTTCCAAACAAAAGATGCCTACTTGAGAAGTTGAGTATCACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D391TF U 1
AF RR4AA86TF U 430
AF RR4AA86JQ C 647
AF RR4D391JQ C 648
BS 1 680 RR4D391TF
BS 681 681 RR4AA86TF
BS 682 759 RR4D391TF
BS 760 1147 RR4AA86TF
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BS 1391 1423 RR4AA86JQ

RD RR4D391TF 771 0 0
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TATAGATGTCATTCCAAATGAAGAGATGTTGATGGCAATCAGCGAAAAGGGTTATGTAAA
AAGGATGAAGCCTGATACGTTCAATCTCCAGAACCGTGGAACCATTGGGAAATCTGTCGG
GAAACTGAGAGTTGATGATTCGATGTCTGACTTTCTCGTTTGTCATGCACATGACCATGT
ACTCTTCTTCAGTGACCGGGGTATAGTTTACTCAACCCGTGCTTACAAGATTCCAGAATG
CTCTCGCAATGCAGCTGGCACACCTTTGGTTTAGATATTATCCATGTCAGAAGGCGAAAG
AGTAACCTCCATCGTTCCTGTTAGCGAGTTTCCTGAAGACCAGTATCTCCTGATGCTTAC
TGTGAATGGCTGCATCAAGAAAGTACCTTTGAAGCTATTCTCAGGGATACGCTCAACTGG
AATCATAGCGATTCAACTGAATTCTGGTGATGAACTGAAATGGGTTCGTTGCTGCTCCAG
CGTTGATCTTGTGGCCATGGCGTCCCAAAACGGAATGGTTGTCCTGAGTACATGTGACGG
TGTTCGAACACTGAGCAGAA*CACAAAGGGAGTGACTGCCATGAGACTCAAGAATGCGGA
TAAGATGGCGAGCATGGACATCATACCTTCATCTCTGAG
AAGATATGGTGA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4AA86TF 718 0 0
GATC
GTTCCTGTTAGCGAGTTTTCTGAAGACCAGTATCTCCTGATGCTTACTGTGAATGGCTGC
ATCAAGAAAGTACCTTTGAAGCTATTCTCAGGGATACGCTCAACTGGAATCATAGCGATT
CAACTGAATTCTGGTGATGAACTGAAATGGGTTCGTTGCTGCTCCAGCGTTGATCTTGTG
GCCATGGCGTCCCAAAACGGAATGGTTGTCCTGAGTACATGTGACGGTGTTCGAACACTG
AGCAGAAACACAAAGGGAGTGACTGCCATGAGACTCAAGAATGCGGATAAGATGGCGAGC
ATGGACATCATACCTTCATCTCTGAGGAAAGATATGGTGAAGTCGGAAGAAACTTCGGCT
GACAGGAAACAATCCACCGGTCCATGGCTGTTATTCGTGTGTGAGAATGGCTATGGAAAG
CGTGTTCCTCTGAGTAGCTTCAAGCCTTCTCGTCTGAACAGAGTTGGTTTGATCGGATCA
AAGTTCGCCGAGGATGATCGTTTAGCTGCTGTTTTTGTGGTTGGTTACTCCCTAGCTGAG
GATGGAGAAAGCGATGAACAAGTGGTTCTAGTGAGCCAAAGCGGAACAGTGAACAGGACC
AAAGTCAGGGACATCTCAATCCAATCACGCCGTGCACGGGGAGTGATTCTCATGAGACTT
GATCATGCTGGGAAGATTCAGTCCGCATCTCTAATCTCTGCAGCAGATGAAGAA

QA 5 718 5 718
DS 

RD RR4AA86JQ 777 0 0
AGTACATGTGACGGTGTTCGAACACTGAGCAGAAACACAAAGGGAGTGACTGCCATGAGA
CTCAAGAATGCGGATAAGATGGCGAGCATGGACATCATACCTTCATCTCTGAGGAAAGAT
ATGGTGAAGTCGGAAGAAACTTCGGCTGACAGGAAACAATCCACCGGTCCATGGCTGTTA
TTCGTGTGTGAGAATGGCTATGGAAAGCGTGTTCCTCTGAGTAGCTTCAAGCCTTCTCGT
CTGAACAGAGTTGGTTTGATCGGATCAAAGTTCGCCGAGGATGATCGTTTAGCTGCTGTT
TTTGTGGTTGGTTACTCCCTAGCTGAGGATGGAGAAAGCGATGAACAAGTGGTTCTAGTG
AGCCAAAGCGGAACAGTGAACAGGACCAAAGTCAGGGACATCTCAATCCAATCACGCCGT
GCACGGGGAGTGATTCTCATGAGACTTGATCATGCTGGGAAGATTCAGTCCGCATCTCTA
ATCTCTGCAGCAGATGAAGAAGAAGAAGGGGAAGGAGTTCAGAGCCTTGAAGAGGCTACT
GCTAGCTTGTAGATTTTTACCTTTCTCTCCCCCCATCCAAAATCCGTACAGAGGCTTTAG
TATATCTATGCTTTTGAATTGCTTCTCTTCCTATTTACTTTTTTTGTTTCCCGATGATGA
TACTACTACGAGAAGGGAAGGTCCTGACTCCTGATCATAATCTGTTATTAACACTAGTGT
CATGTGTATTCGTAAGTTCCAAAGAAAAGATGCCTACTTGAGAAGTTGAGTATCACT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4D391JQ 761 0 0
GTACATGTGACGGTGTTCGAACACTGAGCAGAAACACAAAGGGAGTGACTGCCATGAGAC
TCAAGAATGCGGATAAGATGGCGAGCATGGACATCATACCTTCATCTCTGAGGAAAGATA
TGGTGAAGTCGGAAGAAACTTCGGCTGA***GAAACAATCCACCGGTCCATGGCTGTTAT
TCGTGTGTGAGAATGGCTATGGAAAGCGTGTTCCTCTGAGTAGCTTCAAGCCTTCTCGTC
TGAACAGAGTTGGTTTGATCGGATCAAAGTTCGCCGAGGATGATCGTTTAGCTGCTGTTT
TTGTGGTTGGTTACTCCCTAGCTGAGGATGGAGAAAGCGATGAACAAGTGGTTCTAGTGA
GCCAAAGCGGAACAGTGAACAGGACCAAAGTCAGGGACATCTCAATCCAATCACGCCGTG
CACGGGGAGTGATTCTCATGAGACTTGATCATGCTGGGAAGATTCAGTCCGCATCTCTAA
TCTCTGCAGCAGATGAAGAAGAAGAAGGGGAAGGAGTTCAGAGCCTTGAAGAGGCTACTG
CTAGCTTGTAGATTTTTACCTTTCTCTCCCCCCATCCAAAATCCGTACAGAGGCTTTCGT
ATATCTATGCTTTTGAATTGCTTCTCTTCCTATTTATTTTTTTTGTTTCCCGATGATGAT
ACTACTACGAGAAGAGAAGGTCCTGACTCCTGATCATAATCTGTTATTAACACTAGTGTC
ATGTGTATTCGTAAGTTCCAAACAAAAGATGCCTACTTGAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 5

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GTCGACACATCCAAACTATAACTTCAAACAACACGAAACTAAATCCATTGAATTCTTGGC
GGTAAGGACAAGATCTCGACAACTAGTAGTAAAAGTTTATTCTGAAAAAAAAAACCAAAA
ACAAAAAAAAAAACAAAAGATCTTGACCAGCATTTTGAATAAGGACACGAGTTTCTTGCC
ACAGAACCGGCAAAAGTCTATTAAAAAAAATCGTAACCAGCAGCATTTGGATATCTCACT
GCTGGGCACATTGCACACGCTGAGCACCGCCTGGACCTTCTTCATCATCATCGTCATCAT
CATAAGCCTCTCTCTGAGCACGAGCCTTCTTTCTCATCTCATCCTCCATGTCCACATCGT
GCAGCGTCGTCTCTTCGCACTCGTCTATCTCCATGTCGCTCAAAGTCGCTTTTGCTGGCC
TTGGCAAAACCGCTTCAATGGCCTTTGTCTGGTTCGGGCCCAGTGAGTCTGGGAACTCTA
CAGTGAAGTGGATGTACAGCTTACCCTTCATGAAGGGCCTTTGGTGTATCGGCATTCCCT
CGTCAGTTATCGCCCTGTATGAATCTGGCTTCACAACCTCTCCAGGATGCGATTTGATGA
GAAGCTGTCTTGTGTCCAAGTGAGTCAACACGAACTGGAACCCACAGAGGGCTTCGGTTA
GCGAGAGGGTGTGCTCCACGAAGAGGTCATCTCCCTTTCTCTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4BS43JQ U 78
AF RR4BS43TF C 78
AF RR4GX42JQ U 1
AF RR4D428JQ U 80
AF RR4C350JQ U 85
BS 1 101 RR4GX42JQ
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BS 483 523 RR4GX42JQ
BS 524 524 RR4D428JQ
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BS 542 542 RR4D428JQ
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BS 762 765 RR4C350JQ

RD RR4BS43JQ 323 0 0
GT
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ACGAGCCTTCTTTCTCATCTC

QA 3 323 3 323
DS 

RD RR4BS43TF 323 0 0
GT
AACTTCAAACAACACGAAACTAAATCCATTGAATTCTTGGCGGTAAGGACAAGATCTCGA
CAACTAGTAGTAAAAGTTTATTCTGAAAAAAAAAACCAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAG
ATCTTGACCAGCATTTTGAATAAGGACACGAGTTTCTTGCCACAGAACCGGCAAAAGTCT
ATTAAAAAAAATCGTAACCAGCAGCATTTGGATATCTCACTGCTGGGCACATTGCACACG
CTGAGCACCGCCTGGACCTTCTTCATCATCATCGTCATCATCATAAGCCTCTCTCTGAGC
ACGAGCCTTCTTTCTCATCTC

QA 3 323 3 323
DS 

RD RR4GX42JQ 761 0 0
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GTCGACACATCCAAACTATAACTTCAAACAACACGAAACTAGATCCATTGAATTCTTGGC
GGTAAGGACAAGATCTCGACAACTAGTAGTAAAAGTTTATTCTGAAAAAAAAA*CCAAAA
ACAAAAAAAAAA*CAAAAGATCTTGACCAGCATTTTGAATAAGGACACGAGTTTCTTGCC
ACAGAACCGGCAAAAGTCTATTAAAAAAAATCGTAACCAGCAGCATTTGGATATCTCACT
GCTGGGCACATTGCACACGCTGAGCACCGCCTGGACCTTCTTCATCATCATCGTCATCAT
CATAAGCCTCTCTCTGAGCACGAGCCTTCTTTCTCATCTCATCCTCCATGTCCACATCGT
GCAGCGTCGTCTCTTCGCACTCGTCTATCTCCATGTCGCTCAAAGTCGCCTTCGCTGGCC
TCGGCAAAACCGCTTCAATGGCCTTTGTCTGGTTCGGGCCCAGCGAGTCTGGGAACTCTA
CGGTGAAGTGGATGTACAGCTTACCCTTCATGAAGGGCCTTTGGTGTATCGGCATTCCCT
CGTCGCTTATCGCCCTGTATGAATCTGGCTTCACAACCTCTCCAGGATGCGATTTGATGA
GAAGCTGTCTTGTGTCCAAGTGAGTCAAGACGAACTGGAACCCACAGAGGGCTTCGGTTA
GAGAGAGGGTGTGCTCCACGAAGAGATCATCTCACTTTCTC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4D428JQ 683 0 0
AACTTCAAACAACACGAAACTAGATCCATTGAATTCTTGGCGGTAAGGACAAGATCTCGA
CAACTAGTAGTAAAAGTTTATTCTGAAAAAAAAA*CCAAAAACAAAAAA*****CAAAAG
ATCTTGACCAGCATTTTGAATAAGGACACGAGTTTCTTGCCACAGAACCGGCAAAAGTCT
ATTAAAAAAAATCGTAACCAGCAGCATTTGGATATATCACTGCTGGGCACATTGCACACG
CTGAGCACCGCCTGGGCCTTCTTCATCATCATCGTCATCATCATAAGCCTCTCTCTGAGC
ACGAGCCTTCTTTCTCATCTCATCCTCCATGTCCACATCGTGCAGCGTCGTCTCTTCGCA
CTCGTCTATCTCCATGTCGCTCAGAGTCGCTTTTGCTGGCCTTGGCAAAACCGCTTCAAT
GGCCTTTGTCTGGTTCGGGCCCAGTGAGTCTGGGAACTCTACAGTGAAGTGGATGTACAG
CTTACCCTTCATGAAGGGCCTTTGGTGTATCGGCATTCCCTCGTCAGTTATCGCCCTGTA
TGAATCTGGCTTCACAACCTCTCCAGGATGCGATTTGATGAGAAGTCGTCTTGTGTCCAA
GTGAGTCAACACGAACTGGAACCCACAGAGGGCTTCGGTTAGCGAGAGGGTGTGCTCCAC
GAAGAGGTCATCTCCCTTTCTC
T

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4C350JQ 681 0 0
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AGTAGTAAAAGTTTATTCTGAAAAAAAAAACCAAAAACAAAAAA*****CAAAAGATCTT
GACCAGCATTTTGAATAAGGACACGAGTTTCTTGCCACAAAACCGGCAAAAGTCTATTAA
AAAAAATCGTAACCAGCAGCATTTGGATATATCACTGCTGGGCACATTGCACACGCTGAG
CACCGCCTGGGCCTTCTTCATCATCATCGTCATCATCATAAGCCTCTCTCTGAGCACGAG
CCTTCTTTCTCATCTCATCCTCCATGTCCACATCGTGCAGCGTCGTCTCTTCGCACTCGT
CTATCTCCATGTCGCTCAAAGTCGCTTTTGCTGGCCTTGACAAAACCGCTTCAATGGCCT
TTGTCTGGTTCGGGCCCAGTGAGTCTGGGAACTCTACAGTGAAGTGGATGTACAGCTTAC
CCTTCATGAAGGGCCTTTGGTGTATCGGCATTCCCTCGTCAGTTATCGCCCTGTATGAAT
CAGGCTTCACAACCTCTCCAGGATGCGATTTGATGAGAAGCTGTCTTGTGTCCAAGTGAG
TCAACACGAACTGGAACCCACAGAGGGCTTCGGTTAGCGAGAGGGTGTGCTCCACGAAGG
GGTCATCTCCCTTTCTCTTGA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 5

CO CL2007Contig1 1130 5 25 U
GGACACAAGTTCTGGGGAAAAGGAACATTCTTCTGAGAAAGAGACTCTCTAATGGCGCCT
AAGCTTCTCTC*TCCACTAACTTCAAATCTCTGTTCAATTCTGTCGACACTTTCCTCTTT
GACTGCGATGGTGTTATATGGAAGGGGGATACGCTCATCGATGGCGTCCCTCAAACTCTC
GACTTACTCCGATCCAAGGGTAAAAACATAGTCTTTGTGACGAACAATTCGATGAAATCG
AGGAGGCAATACGCAGAGAAGTTCCAATCTTTGGGTCTAACTTCTGTTACTCAGGAAGAG
ATATTTTCTTCGTCTTTTGCGGCAGCTATGTACCTCAAAACCAACAACTTCCCCAAGGAC
AAGAAGGTTTATGCGATTGGTGGAGAAGGCATTCTTGAGGAGCTTCAGCTTGCTGGTTTT
ACAGGTCTTGGTGGTCCTGCAGACGGTGAAAAGAAGGCACAATGGAAATCAAACTGTCTC
TTTGAACATGATAAAACCGTGGGAGCAGTTGTGGTTGG*CTAGACCCCAACATCAACTAC
TATAAGCTTCAGTACGCGACGCTATGTGTACGCGAGAATCCGGGATGTCTTTTCATCGCA
ACCAACCGTGATGCGGTTGGACATATGACGGATCTTCAAGAATGGCCTGGTGCTGGTTGT
ATGGTTGCTGCCATGTGTGGTTCAACCGAAAGAGAACCAATAGTGGTTGGTAAACCAGCT
ACTTTCATGATGGACTTTCTGATGCAGAAATTTGGGACAGAAACGTCGAGAATGTGCATG
GTGGGTGATAGGCTCGACACTGATGTATTGTTTGGACAGAACGCTGGCTGCAAAACTCTC
CTCGTCCTAACAGGGTGTACAAGTGAGTCTAACCTACTAGACGAGAGAAACAAGATTGAA
CCAGACTATTACACAAGCATGGTCTCTGATATCACTAAACTTATGGACTCCCCTTAGTAA
GTAAAAGGGCATCATCACCATCTTGGTCTAACCCTGAAACAGTTTTGGGTATATATGGCA
AGATGAAATTTCTGATTTTTTTTTTGTTTTACTGTAATAATCAATCTGGTGATCTGTTAT
ACTATACATCAACAGAAAACATGGCTTTTATAAAAAGTTGAGTTGAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FN79TF U 1
AF RR4DI76TF U 10
AF RR4D981TF U 10
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AF RR4D981JQ C 360
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GACTTACTCCGATCCAAGGGTAAAAACATAGTCTTTGTGACGAACAATTCGATGAAATCG
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AAGAAGGTTTATGCGATTGGTGGAGAAGGCATTCTTGAGGAGCTTCAGCTTGCTGGTTTT
ACAGGTCTTGGTGGTCCTGCAGACGGTGAAAAGAAGGCACAATGGAAATCAAACTGTCTC
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ATGGTTGCCGCCATGTGTGGTTCAACCGAAAGAGAACCAATAGTGGTTGGTAAACCAGCT
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GG
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TGGTCCTGCAGACGGTGAAAAGAAGGCACAATGGAAATCAAACTGTCTCTTTGAACATGA
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GG
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*TCCACTAACTTCAAATCTCTGTTCAATTCTGTCGACACTTTCCTCTTTGACTGCGATGG
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TGCGATTGGTGGAGAAGGCATTCTTGAGGAGCTTCAGCTTGCTGGTTTTACAGGTCTTGG
TGGTCCTGCAGACGGTGAAAAGAAGGCACAATGGAAATCAAACTGTCTCTTTGAACATGA
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GGACTTTCTGATGCAGAAATTTGGGACAGAA*CGTCGAGA*TGTGCATGGTGGGTGATAG
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TTCATCGCAACCAACCGTGATGCGGTTGGACATATGACGGATCTTCAAGAATGGCCTGGT
GCTGGTTGTATGGTTGCTGCCATGTGTGGTTCAACCGAAAGAGAACCAATAGTGGTTGGT
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CCTTAGTAAGTAAAAGGGCATCATCACCATCTTGGTCTAACCCTGAAACAGTTTTGGGTA
TATATGGCAAGATGAAATTTCTGATTTTTTTTTTGTTTTACTGTAATAATCAATCTGGTG
ATCTGTTATACTATACATCAACAGAAAACATGGCTTTTATAAAAAGTTGAGTTGAATAC

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DS 

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TACAGGTCTTGGTGGTCCTGCAGACGGTGAAAAGAAGGCACAATGGAAATCAAACTGTCT
CTTTGAACATGATAAAACCGTGGGAGCAGTTGTGGTTGG*CTAGACCCCAACATCAACTA
CTATAAGCTTCAGTACGCGACGCTATGTGTACGCGAGAATCCGGGATGTCTTTTCATCGC
AACCAACCGTGATGCGGTTGGACATATGACGGATCTTCAAGAATGGCCTGGTGCTGGTTG
TATGGTTGCTGCCATGTGTGGTTCAACCGAAAGAGAACCAATAGTGGTTGGTAAACCAGC
TACTTTCATGATGGACTTTCTGATGCAGAAATTTGGGACAGAAACGTCGAGAATGTGCAT
GGTGGGTGATAGGCTCGACACTGATGTATTGTTTGGACAGAACGCTGGCTGCAAAACTCT
CCTCGTCCTAACAGGGTGTACAAGTGAGTCTAACCTACTAGACGAGAGAAACAAGATTGA
ACCAGACTATTACACAAGCATGGTCTCTGATATCACTAAACTTATGGACTCCCCTTAGTA
AGTAAAAGGGCATCATCACCATCTTGGTCTAACCCTGAAACAGTTTTGGGTATATATGGC
AAGATGAAATTTCTGATTTTTTTTTTGTTTTACTGTAATAATCAATCTGGTGATCTGTTA
TACTATACATCAACAGAAAACATGGCTTTTATAAAAAGTTGAGTTGAATAC

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DS 



AS 1 4

CO CL2008Contig1 1043 4 5 U
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TTGGTATATTCAAAGATTTATAGATCAGAATATACAAGTGAGTAGAAAAACGTGTGTATA
TCTATCTAAGCGGTAGAGAAGTAGAAAACTACTTCAACTTGGGTCTTGAGAGAAAAAAAT
AAAACTCAAAGATCATGAATAACACCTTCAATGAGTTTCTGAGCTGCATCTCTAACACTC
AAAAGGTTAGTTTTGATCTCATTACACAATCTTCCTTCAACTAGCCGTACAGGTAACCAC
ATCTTTGGTTTTACATCCACGGTGTACGCAAGCGTGGTCGGAAAATCTTTAAACTGTAAA
TCCAAAGCCTCCCCTTTGTCTAATTGTTCGATGGACCATTTGCCTTCAAACAATTGAAAA
TCTCCTTCGACCATCTTGAAATCGATTTCACGTCTCCTCCCATGTGGCAGAATCTCAAGC
TCCTTCTCGAAACAATCTAGAACAGCTTTGGCATTGAACTTAAGACCCAATGCTAAGTTT
TGCTGTCCCATCTGGAAAAGACGAACACGGTTTCCTTCCTTCTCCACCAACTCGCTGACG
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TCAAGGCTAGCTTCCATTCCGATCTTCGAACGGATTCGCCGCGAGCTCTTCTCCTCGAGC
TTCTCCACCGAGATGAGAACCCCATCCTCCACCGTCTTCCCATCTGTCAAGCATTCAACC
AAATAATCATCCCTTTCACTCTCATCCTCCTCCTCATAATAATAATAATAATCTTCGTCG
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GCGAGCTGCATTGTTTTCTATCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GT
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DS 



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BQ
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BS 1190 1209 RR4BF46JQ

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CCCACAAAACAGAGGAAAGAGGAGCGGTGAAAATGGGTAGCAAGATGTTGTTCAGTTTGA
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**GTGTACAGTGATCTCGCAGTGGAT*ATTTCAAA*TGTTCTTGCTAA*TGT*CCAGCA*
CTGTTGTTGCTCTCGGACTGTTTT
CT

QA 1 744 1 744
DS 

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GG
AACCATAGGTTCATCTTGACAAAACTTTCCCACAAAACAGAGGAAAGAGGAACGGTGAAA
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GATAACCTTAAGGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTGATGCTAAGTTCTGAT
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QA 3 865 3 865
DS 

RD RR4AE55TF 825 0 0
G
TCAATTGGTGAAATGGAACAAGAGTTTCTCCAAGCCTTGCAATCGTTCTATTATGATGGC
AAAGCGGTCATGTCAAATGAGGAGTTTGATAACCTTAAGGAAGAGTTGATGTGGGAAGGA
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GTTTCTGGAAATCCAATCCTCAATGATGAAGAATTTGATAAGCTCAAACTCAAACTAAAG
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CCTTGTCCTAATTGTGGAACCGAGAATACTTCCTTCTTTGGAACAATTCTGTCGATCTCT
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GATGGAAAAAGAAGAAGAATGGGTTTTGTCAGAGGA*CAATAGATATGATGTTGTATACT
TAAGATCTTGCATGTTCTTTCACATGTTTTCTGATATCCAAGTA

QA 2 825 2 825
DS 

RD RR4BF46JQ 796 0 0
TATTATGGTGGCAAAGCGGTCATGTCAAATGAGGAGTTTGATAACCTTAAGGAAGAGTTG
ATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTGATGCTAAGTTCTGATGAACAAAGGTTCTTGGAAGCT
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CTCAAACTAAAGATTGATGGTAGCGATATTGTGTGTGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGT
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GTTCCTTTGATTGTATATCTGGCTCTAACAATCACCAAATTGATTGTCAAAGACTTCTTG
ATTTTGAAGGGTCCTTGTCCTAATTGTGGAACCGAGAATACTTCCTTCTTTGGAACAATT
CTGTCGATCTCTAGTGGTGGCAAAACTAACTCTGTCAAATGCACCAACTGTGGAACCGCA
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ATGTTGTATACTTAAGATCTTGCATGTTCTTTCACATGTTTTCTGATATCCAAGTATTGT
ATAAGAAATAAGGGAA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4AE55JQ 555 0 0
GTAAAAAGGTGTACAGTGATCTCGCAGTGGATTATTTCAAAATGTTCTTGCTAAATGTTC
CAGCAACTGTTGTTGCTCTCGGACTGTTTTTCTTCCTGGACGACATTACAGGTTTTGAGA
TCACATACATCTTGGAGCTTTCAGAACCATACAGTTTCATATTCACGTGGTTCGCGGCCG
TTCCTTTGATTGTATATCTGGCTCTAACAATCACCAAATTGATCGTCAAAGACTTCTTGA
TTTTGAAGGGTCCTTGTCCTAATTGTGGAACCGAGAATACTTCCTTCTTTGGAACAATTC
TGTCGATCTCTAGTGGTGGCAAAACTAACTCTGTCAAATGCACCAACTGTGGAACCGCAA
TGGAGTATGACTCGGGTACTCGGTTGATCACATTGCCAGACGGAAGCCAAGCTTGAACCC
TGTGAGATGAGGATGGAAAAAGAAGAAGAATGGGTTTTGTCAGAGGAACAATAGATATGA
TGTTGTATACTTAAGATCTTGCATGTTCTTTCACATGTTTTCTGATATCCAAGTATTGTA
TAAGAAATAAGGGAA

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

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GCGGATGATTGGTACCGACGCGTTCCAGGAGACGCCCATCGTCGAGGTAACCAGGTCTAT
CACAAAACATAACTATCTTGTCATGGATGTTGATGACATACCTAGGATCGTTCAAGAAGC
TTTCTTTCTAGCGACTTCCGGTAGACCCGGACCGGTTTTGGTCGATGTTCCTAAGGATAT
TCAGCAGCAGCTTGCGATTCCTAACTGGGATCAGCCTATGCGTTTACCTGGTTACATGTC
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GTCTAAGAGGCCTGTTTTGTATGTTGGTGGTGGAAGCTTGAACTCGAGTGAAGAGCTGGG
GAGATTTGTCGAGCTTACTGGGATCCCTGTTGCCAGTACTTTGATGGGGCTCGGCTCTTA
TCCTTGTAACGATGAGTTGTCCCTGCAGATGCTTGGCATGCACGGTACTGTGTATGCTAA
TTACGCTGTGGAGCATAGTGATCTGTTGCCGGCGTTTGGTGTTAGGTTTGATGACCGTGT
CACGGGAAAGCTCGAGGCTTTTGCGAGTAGGGCTAAGATTGTGCACATAGACATTGATTC
TGCTGAGATTGGGAAGAACAAGACGCCTCATGTGTCTGTTTGTGGTGATGCGAAGCTTGC
TTTGCAGGGCATGAACAAGATTCTTGAGAACCGAGCAGAGGAGCTCAAGCTTGACTTCGG
GGTTTGGAGGAGTGAATTGAAAGAGCAGAAGCAAAAGTTCCCGTTGAGTTTCAAGACGTT
TGGAGAAGCCATACCTCCGCAGTACGCGATTCAGGTCCTCGACGAGCTTACCGATGGGAA
GGCTATCATCAGTACTGGCGTTGGACAGCATCAGATGTGGGCAGCACAGTTTTACAAGTA
CAGGAAGCCGAGGCAGTGGTTGTCATCATCAGGCCTTGGAGCTATGGGTTTTGGACTCCC
TGCTGCTATTGGAGCGTCTGTGGCCAACCCTGATGCGATTGTTGTGGACATTGACGGAGA
TGGAAGCTTCATAATGAACGTCCAGGAGCTGGCCACAATCCGTGTCGAGAATCTTCCTGT
GAAGATACTCTTGTTAACACCAGCATCTTGGGATGGTCATGCAATGGGAAGATCGGTCTA
CAAAGCTACAGAGCGCACACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI80TF U 1
AF RR4CY32TF U 406
BS 1 664 RR4BI80TF
BS 665 1162 RR4CY32TF

RD RR4BI80TF 664 0 0
GCGGATGATTGGTACCGACGCGTTCCAGGAGACGCCCATCGTCGAGGTAACCAGGTCTAT
CACAAAACATAACTATCTTGTCATGGATGTTGATGACATACCTAGGATCGTTCAAGAAGC
TTTCTTTCTAGCGACTTCCGGTAGACCCGGACCGGTTTTGGTCGATGTTCCTAAGGATAT
TCAGCAGCAGCTTGCGATTCCTAACTGGGATCAGCCTATGCGTTTACCTGGTTACATGTC
TAGGTTGCCTCAGCCTCCGGAGGTTTCTCAGTTAAGGCAGATCGTTAGGTTGATCTCTGA
GTCTAAGAGGCCTGTTTTGTATGTTGGTGGTGGAAGCTTGAACTCGAGTGAAGAGCTGGG
GAGATTTGTCGAGCTTACTGGGATCCCTGTTGCCAGTACTTTGATGGGGCTCGGCTCTTA
TCCTTGTAACGATGAGTTGTCCCTGCAGATGCTTGGCATGCACGGTACTGTGTATGCTAA
TTACGCTGTGGAGCATAGTGATCTGTTGCCGGCGTTTGGTGTTAGGTTTGATGACCGTGT
CACGGGAAAGCTCGAGGCTTTTGCGAGTAGGGCTAAGATTGTGCACATAGACATTGATTC
TGCTGAGATTGGGAAGAACAAGACGCCTCATGTGTCTGTTTGTGGTGATGCGAAGCTTGC
TTTG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4CY32TF 757 0 0
GGGGCTCGGCTCTTATCCTTGTAACGATGAGTTGTCCCTGCAGATGCTTGGCATGCACGG
TACTGTGTATGCTAATTACGCTGTGGAGCATATTGATCTGTTGCTGGCGTTTGGTGTTAG
GTTTGATGACCGTGTCACGGGAAAGCTCGAGGCTTTTGCGAGTAGGGCTAAGATTGTGCA
CATATACATTGATTCTGCTGAGATTGGGAAGAACAAGACGCCTCATGTGTCTGTTTGTGG
TGATGTGAAGCTTGCTTTGCAGGGCATGAACAAGATTCTTGAGAACCGAGCAGAGGAGCT
CAAGCTTGACTTCGGGGTTTGGAGGAGTGAATTGAAAGAGCAGAAGCAAAAGTTCCCGTT
GAGTTTCAAGACGTTTGGAGAAGCCATACCTCCGCAGTACGCGATTCAGGTCCTCGACGA
GCTTACCGATGGGAAGGCTATCATCAGTACTGGCGTTGGACAGCATCAGATGTGGGCAGC
ACAGTTTTACAAGTACAGGAAGCCGAGGCAGTGGTTGTCATCATCAGGCCTTGGAGCTAT
GGGTTTTGGACTCCCTGCTGCTATTGGAGCGTCTGTGGCCAACCCTGATGCGATTGTTGT
GGACATTGACGGAGATGGAAGCTTCATAATGAACGTCCAGGAGCTGGCCACAATCCGTGT
CGAGAATCTTCCTGTGAAGATACTCTTGTTAACACCAGCATCTTGGGATGGTCATGCAAT
GGGAAGATCGGTCTACAAAGCTACAGAGCGCACACTA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL2011Contig1 1020 2 2 U
GGATTCTCTAATCGAATCTGAAAGCTTCTTAACATCTGCGTGAAATCGAATCGGAGAAGA
TGACTGACGAACACAAACACGACGAACCTGTAACCGTTTCTGAGCCAGCTGTCGAGATTG
TGGAGAGGGAATCGCTGATGGACAAAATATCGGAGAAGCTCCACCACGACGGTTCTTCGT
CGTCAGATGACGAAGACGACAAGAAGAAGAAGAACTCTCCAGAGAGCTCTCCCTCTTCGA
TGAAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGGGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCG
GCGGAAAACCGGCGGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGGTGTCTGGGGGTGTACTCG
GTGGTGCTACAGCCGCTTGGGTTCTCTTTGAGCTGATGGAGTATCATCTCCTCACTCTCC
TCTGCCACGTCATAATTGTTGTGCTCGCTGTGCTCTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGT
TTATTAACAAGTCTCCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTCTTCTCC
AGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATCGAGATCAATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTG
CATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTTGTTACTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTTTGTCGA
TCTTGGGTGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCCCTTGTGCTGCTCTTCA
CGATTCCTCTTGCCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTCGACCCGTTGGGTGAGAAAGCGA
TGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAAATCCCCT
TGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGTTTACATTCGTCGATTAGAAAGAACGA
ACACGGTGTTGTGAAATGGTGTCGAAGCTATGTGTTAGACATCTTTTAATATGTTATTTG
GTTTTTTGTTAATTGTTGGTGAACGTGGAGGTGATACAGTTAGTGTTGGTTGCTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO10TF U 1
AF RR4GO10JQ C 399
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BS 742 1020 RR4GO10JQ

RD RR4GO10TF 748 0 0
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TCTTGGGTGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCCCTTGTGCTGCTCTTCA
CGATTCCTCTTGCCTACGACA
GTACGAA

QA 1 741 1 741
DS 

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GTTAGTGTTGGTTGCTCTCTCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

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TCT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4GM96JQ U 8
AF RR4GC68TF C 1
AF RR4GM96TF C 29
AF RR4GC68JQ U 8
BS 1 7 RR4GC68TF
BS 8 555 RR4GM96JQ
BS 556 663 RR4GC68JQ

RD RR4GM96JQ 548 0 0
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CTTGCTTT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4GC68TF 663 0 0
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TAGATTTTCAAGTAAACACAATCCAAATTCTTATCAACTCGTATGTTTGCAGGCACACTC
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CAGCGTGTCTTACGTTTTCTCCTCCCCAAGCTCTTGTTCTTACCACTCTTGTCTATGTTC
CCATTCTCTTCTTCTCCTGTCTCCTTCTCTCTCTTGTCTTCTTGACTAAAAACGCTCATC
TCTTGTGTGACCGTTGAGGTTGAAAAATCTTGCCTCTCTGATTTCTGAGGAACATTTTCA
AAATGCTCTAACAGGCTGATTTGCTTTGTATGCTCATCCCCTGCTCTATCTGGCGACAAC
TCCTCGGCTTCTTGAACAGGAGTTGTATTTCTAACCATGTATATCACTCTATCTAGAGTC
CCTAAAGCTTGCTTTACCTCTGGACTTATGAAAAACTGTCTTCTGATGTCGCCGCCATTA
GTCTTGCCATTTATATTCCCCTCCTCTGAAGAAATACTTTCCTCAAAATCATCAT
GATCTTCT

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DS 

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TCTTATCAACTCGTATGTTTGCAGGCACACTCTTGGCAGAACAAACAATAGGGAACTTGA
GCTTCCTTTAGAGCCAAGACCTGAAAGCCAAGCAGCGTGTCTTACGTTTTCTCCTCCCCA
AGCTCTTGTTCTTACCACTCTTGTCTATGTTCCCATTCTCTTCTTCTCCTGTCTCCTTCT
CTCTCTTGTCTTCTTGACTAAAAACGCTCATCTCTTGTGTGACCGTTGAGGTTGAAAAAT
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TATGCTCATCCCCTGCTCTATCTGGCGACAACTCCTCGGCTTCTTGAACAGGAGTTGTAT
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AAGAAATACTTTCCTCAAAATCATCAT
GATCTTCT

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DS 

RD RR4GC68JQ 656 0 0
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TAGATCATGCATCTTTTTTTTTTTGGTCAACGCATAGATCATGCATCTAAGATTAGATTT
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CTTCTTCTCCTGTCTCCTTCTCTCTCTTGTCTTCTTGACTAAAAACGCTCATCTCTTGTG
TGACCGTTGAGGTTGAAAAATCTTGCCTCTCTGATTTCTGAGGAACATTTTCAAAATGCT
CTAACAGGCTGATTTGCTTTGTATGCTCATCCCCTGCTCTATCTGGCGACAACTCCTCGG
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CTTGCTTTACCTCTGGACTTATGAAAAACTGTCTTCTGATGTCGCCGCCATTAGTCTTGC
CATTTATATTCCCCTCCTCTGAAGAAATACTTTCCTCAAAATCATCATGATCTTCT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 5

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CTCACTCGCCATGTCCGGAGAAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTCAAGATCGGAGA
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AGTTCGAGAAATACTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAA
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GCAATGATATATGAATTATG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DB08JQ C 3
AF RR4CL75TF U 359
AF RR4DB08TF U 3
AF RR4FK40JQ C 1
AF RR4FK40TF U 1
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BS 250 250 RR4FK40TF
BS 251 269 RR4DB08TF
BS 270 270 RR4FK40TF
BS 271 309 RR4DB08TF
BS 310 310 RR4FK40TF
BS 311 312 RR4DB08TF
BS 313 313 RR4FK40TF
BS 314 357 RR4DB08TF
BS 358 358 RR4FK40TF
BS 359 512 RR4CL75TF
BS 513 513 RR4DB08TF
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DS 

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DS 

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GG
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QA 3 602 3 602
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QA 1 680 1 680
DS 

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GAGTAGTGCAAAACATTCTCAAGATCTAACATATTATAAACATAAATCTTTTTTAGCTGA
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TGATATATGAATTATG

QA 5 680 5 680
DS 



AS 1 5

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ATATTCACTCTACAGTCTCACACACTTTGACTCAATGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DZ02JQ U 1
AF RR4BD86JQ U 195
AF RR4BD86TF C 195
AF RR4DI93JQ U 255
AF RR4DI93TF C 255
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TCTTCAATGTCTG

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DS 

RD RR4BD86JQ 589 0 0
C
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DS 

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C
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TCTCAAGAAATGGCCTGACGTCTATTTCCGCATCTCCCATCTTGTCATGGGAAGTGAATG
TATCTTTATCATAAACTTCGAGATTCACAGGTTGATTATGATCATTGAATGCAAGCGTCA
ATTCGTCGTTCCACTCAGGGTTA**GTTATTTTCCACACGACTAGCCTTCAATGTCTGAG
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AAGATCCTCCATCC

QA 2 575 2 575
DS 

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GTATCTTTATCATAAACTTCGAGATTCACAGGTTGATTATGATCATTGAATGCAAGCGTC
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GGACCCATAGTTATGACGACGAAAGGGTCGCTGCTCTGAGAGTCTCTACTAACAAGATTA
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GTCTCACACACTTTGACTCAATGTCC

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DS 

RD RR4DI93TF 566 0 0
ACAATAGTTGTTCTTTCATGTCTTATTTCAAAGATCCCTTGACCCTATGGAACACTGATC
CACTCAATTTGAATCTCAACCTCACCTCTTTCGACATTTCTCAGCTTGAGAACCATGTCT
TGGACGATCTTTCCATTACTGAAAACGATTCTGCTCTCTTCAACCAAACAATTGTCTGTA
CTCGGCTTCACTCTCTTGACCTCGGTTCCATCAGGCAGTTCTTGAAGACCCGTTGCTTGA
ATCTCAAGAAACGGCCTGACGTCTATTTCCGCATCTCCCATCTTGTCATGGGAAGTGAAT
GTATCTTTATCATAAACTTCGAGATTCACAGGTTGATTATGATCATTGAATGCAAGCGTC
AATTCGTCGTTCCACTCAGGGTTACAGTTATTTTCCACACGACTAGTCTTCAATGTCTGA
GGACCCATAGTTATGACGACGAAAGGGTCGCTGCTCTGAGAGTCTCTACTAACAAGATTA
GTCCCTCTTTTCACTCGGATTCTAAGAAGTCCCACCATTTTTTTAAATATTCACTCTACA
GTCTCACACACTTTGACTCAATGTCC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 5

CO CL2015Contig1 948 5 4 U
GGTTACCATCGGTAACGGACCTGCGTTTGGGTGTGTGCTGATGAAGGATTTTCTTAGCGG
TTTAGCTAAACGAATCAAGCGTAACAACACTGCGTACGAGAATTACCATAGGATCTTTGT
CCCTGAAGGGAAGCCTCTGAGAGAACCCCAAGGAGCCTTTGAGGGTTAACGTGCTGTTTC
AGCACATTCAAAGTTTGCTGTCTGCTGAAACGGCTGTGCTCGCCGAGACGGGAGATTCTT
GGTTTAATTGTCAGAAGCTGAAGCTCCCTGAAGGATGTGGTTACGAGTTCCAGATGCAGT
ACGGGTCGATTGGTTGGTCTGTTGGTGCTACTCTAGGCTATGCTCAGGCCATACCTAACA
AACGTGTCATCGCTTGTATTGGAGACGGGAGTTTCCAGGTTACCGCGCAGGATGTGTCGA
CGATGATACGGTGTGGGCAGAAGACCATAGTCTTTCTCATCAACAATGGAGGGTACACGA
TTGAAGTGGAGATTCATGATGGTCCTTACAATGTGATAAAGAACTGGAACTACACGGCTT
TTGTTGAGGCTATTCACAATGGAGAAGGTAAATGCTGGACTGCGAAAGTGAGGTGCGAGG
AGGAGCTTGTGAAAGCGATTAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCA
TTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGACACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGGGGCTCTAGAG
TCTCTGCTGCTAACAGTCGTCCTCCAAATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATGTCCTCATCTT
TTATATATTTCCGACTTGGTAGTTCCTTCCTTTGTTGCTTTATGAAAAGTAGTTTGTATC
CTTTGGAGAAGAGCAGTGTGAGTCTCCTTGAGGATTAAACTTTGATTGCAAAAATAAAAA
TTCGGTTAAACTTTGTGTGTAAATGTAAAAGTTGATCATTTCGTTTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4FV01TF U 1
AF RR4G379TF U 1
AF RR4FV01JQ C 272
AF RR4G379JQ C 309
AF RR4AE41TF U 379
BS 1 736 RR4FV01TF
BS 737 781 RR4G379TF
BS 782 946 RR4AE41TF
BS 947 948 RR4FV01JQ

RD RR4FV01TF 736 0 0
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GGTTTAATTGTCAGAAGCTGAAGCTCCCTGAAGGATGTGGTTACGAGTTCCAGATGCAGT
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AGGAGCTTGTGAAAGCGATTAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCA
TTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGACACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGGGGCTCTAGAG
TCTCTGCTGCTAACAG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4G379TF 781 0 0
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TTTAGCTAAACGAATCAAGCGTAACAACACTGCGTACGAGAATTACCATAGGATCTTTGT
CCCTGAAGGGAAGCCTCTGAGAGAACCCCAAGGAGCCTTTGAGGGTTAACGTGCTGTTTC
AGCACATTCAAAGTTTGCTGTCTGCTGAAACGGCTGTGCTCGCCGAGACGGGAGATTCTT
GGTTTAATTGTCAGAAGCTGAAGCTCCCTGAAGGATGTGGTTACGAGTTCCAGATGCAGT
ACGGGTCGATTGGTTGGTCTGTTGGTGCTACTCTAGGCTATGCTCAGGCCATACCTAACA
AACGTGTCATCGCTTGTATTGGAGACGGGAGTTTCCAGGTTACCGCGCAGGATGTGTCGA
CGATGATACGGTGTGGGCAGAAGACCATAGTCTTTCTCATCAACAATGGAGGGTACACGA
TTGAAGTGGAGATTCATGATGGTCCTTACAATGTGATAAAGAACTGGAACTACACGGCTT
TTGTTGAGGCTATTCACAATGGAGAAGGTAAATGCTGGACTGCGAAAGTGAGGTGCGAGG
AGGAGCTTGTGAAAGCGATTAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCA
TTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGACACAAGCAAG*AGCTTTTGGAGTGGGGCTCTAGAG
TCTCTGCTGCTAACAGTCGTCCTCCAAATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATGTCCTCATCTT
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4FV01JQ 677 0 0
AGGATGTGGTTACGAGTTCCAGATGCAGTACGGGTCGATTGGTTGGTCTGTTGGTGCTAC
TCTAGGCTATGCTCAGGCCATACCTAACAAACGTGTCATCGCTTGTATTGGAGACGGGAG
TTTCCAGGTTACCGCGCAGGATGTGTCGACGATGATACGGTGTGGGCAGAAGACCATAGT
CTTTCTCATCAACAATGGAGGGTACACGATTGAAGTGGAGATTCATGATGGTCCTTACAA
TGTGATAAAGAACTGGAACTACACGGCTTTTGTTGAGGCTATTCACAATGGAGAAGGTAA
ATGCTGGACTGCGAAAGTGAGGTGCGAGGAGGAGCTTGTGAAAGCGATTAGCACGGCGAC
GAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCATTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGACACAAG
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TCAGTAGAGTTCGGAGATGTCCTCATCTTTTATATATTTCCGACTTGGTAGTTCCTTCCT
TTGTTGCTTTATGAAAAGTAGTTTGTATCCTTTGGAGAAGAGCAGTGTGAGTCTCCTTGA
GGATTAAACTTTGATTGCAAAAATAAAAATTCGGTTAAACTTTGTGTGTAAATGTAAAAG
TTGATCATTTCGTTTCG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4G379JQ 640 0 0
ATTGGTTGGTCTGTTGGTGCTACTCTAGGCTATGCTCAGGCCATACCTAACAAACGTGTC
ATCGCTTGTATTGGAGACGGGAGTTTCCAGGTTACCGCGCAGGATGTGTCGACGATGATA
CGGTGTGGGCAGAAGACCATAGTCTTTCTCATCAACAATGGAGGGTACACGATTGAAGTG
GAGATTCATGATGGTCCTTACAATGTGATAAAGAACTGGAACTACACGGCTTTTGTTGAG
GCTATTCACAATGGAGAAGGTAAATGCTGGACTGCGAAAGTGAGGTGCGAGGAGGAGCTT
GTGAAAGCGATTAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCATTGAAGTG
ATTGTGCATAAAGATGACACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGGGGCTCTAGAGTCTCTGCT
GCTAACAGTCGTCCTCCAAATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATGTCCTCATCTTTTATATAT
TTCCGACTTGGTAGTTCCTTCCTTTGTTGCTTTATGAAAAGTAGTTTGTATCCTTTGGAG
AAGAGCAGTGTGAGTCTCCTTGAGGATTAAACTTTGATTGCAAAAATAAAAATTCGGTTA
AACTTTGTGTGTAAATGTAAAAGTTGATCATTTCGTTT
CG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4AE41TF 568 0 0
G
TGGAGACGGTAGTTCCCAGGTTACCGCGCAGGATGTGTCGACGATGATACGGTGTGGGCA
GAAGACCATAGTCTTTCTCATCAACAATGGAGGGTACACGATTGAAGTGGAGATTCATGA
TGGTCCTTACAATGTGATAAAGAACTGGAACTACACGGCTTTTGTTGAGGCTATTCACAA
TGGAGAAGGTAAATGCTGGACTGCGAAAGTGAGGTGCAAGGAGGAGCTTGTGAAAGCGAT
TAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCATTGAAGTGATTGTGCATAA
AGATGACACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGGGGCTCTAGAGTCTCTGCTGCTAACAGTCG
TCCTCCAAATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATGTCCTCATCTTTTATATATTTCCGACTTGG
TAGTTCCTTCCTTTGTTGCTTTATGAAAAGTAGTTTGTATCCTTTGGAGAAGAGCAGTGT
GAGTCTCCTTGAGGATTAAACTTTGATTGCAAAAATAAAAATTCGGTTAAACTTTGTGTG
TAAATGTAAAAGTTGATCATTTCGTTT

QA 2 568 2 568
DS 



AS 1 5

CO CL2016Contig1 743 5 2 U
GGGACATCGTATTAAAGAGTAGCCGTCGTTTTCAGATCCTCGGAGAGAAGAGAAAGTTCC
CCCAATCAAGTCATCCTCTTTTTCCTCCTCACTTCAGTTGCACAAACATCAAGGGTTTGT
GAAGATGGCATCAAAGTTGATACAAGTTCAGTCAAAGGCATGTGAGGCTTCCAAGTTTGT
GGCCAAGCATGGAACTTCTTACTACAGGCAGTTGCTTGAGAAGAACAAGCACTATGTCCA
GGAACCTGCTACGGTGGACAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAACTTCTCTACACCCGTCT
TGCTAGCATTCCTGGACGCTGTGAAACCTTCCGGAAGGAAGTAGACTACGCAAAGAACTT
GTGGAAGAACAGAACCGATCTGAAGGTAGAGGATGCCGGAATCGCTGCATTGTTTGGTCT
CGAATGCTTTGCCTGGTACTGCGCTGGTGAAATCATCGGCAGAGGCTTCACCTTCACCGG
CTACTACCCTTGAATGTGAGGAACACTAACTTGAACAACATTGTGTAATCCCCATATTTT
AGTTCCCATGACTCAAAATTTTCTTCCAGCCTTTCTCTGAAACGGAAACAGAGCCTTTGG
AGCTGTGAAAGACATCCATTTTGCTAAACTCTTTTTGATAAAAATTGCGATCAATAAGAA
CAAAACTTTCCACAGGAAGTTTGATATCACTGTTTTTTTGTAACACTACATATGTTTCAT
TGAAGAAAGATTAGCCGTTGCGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4CB55TF U 94
AF RR4BD45JQ C 1
AF RR4GH87JQ C 79
AF RR4BD45TF U 1
AF RR4GH87TF U 79
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GG
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G

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DS 

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TGCG

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DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E994JQ U 183
AF RR4E994TF C 183
AF RR4BZ75JQ U 1
AF RR4BZ75TF C 521
AF RR4DZ17JQ U 524
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CGTGGATTTTTTTTGAACAGATAGTTCATGAATCATCTGATTACTCATTATTAAATCTTT
TTTTAGTTTCATTTAATTCATATATTGCTCTCGGGCC
C

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR4E994TF 278 0 0
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CAACTATTAGTTAGTTTTTCTTTTTCTTTTGAAATTTTTTTTGTTTGATCTCTGATTGTC
TTTATTTTATCAATCACATTTTTTTATTTTGTTTTCGCTGAGTGAAGAATTTGGCCACTC
CGTGGATTTTTTTTGAACAGATAGTTCATGAATCATCTGATTACTCATTATTAAATCTTT
TTTTAGTTTCATTTAATTCATATATTGCTCTCGGGCC
C

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR4BZ75JQ 662 0 0
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AGTTGTGTAGTAATTCTTGGAATATTAACGATACCTAGAAAAATAGTTATAGACAGTTGT
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TTAATGTCTGCCAACTTTTTTTTGATGACTCAATTATTTTAGAGTCATAACCCAGTTTGT
TACAACTATTAGTTAGTTTTTCTTTTTCTTTTGAAATTTTTTTTGTTTGATTTCTGATTG
TCTTTATTTTATAAATCACATTTTTT*ATTTTGTTTTCGCTGAGTGAAGAATTTGGCCAC
TCCGTGGATTTTTTTTGAACAGATAGTTCATGAATCATCTGATTACTCATTATTAAATCT
TTTTT*AGTTTCATTTAATTCATATATTGCTCTCGGGCCAACTAATGAAATTCTATTTTG
TTTTGAAAGGTTTTTTTTTTTTCTTTTAAAAAAAGCAAGTTTTTTATAATCCAGTTTTTA
ATTTCTTTTTCGACTTTTAGGAAAATTGTTGCTCTTTCTTTGAAAATCCTTAAAACCGGA
AAAGACTTCGTTTTGGATTTTTTGATTCTTTTTTT*AATTCTTTAAAAATAGGTTTTAAA
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4BZ75TF 648 0 0
TTT
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TAAAAATAGGTTTTAAAAAAGAAGGTTTTGGTTTGGTAGAACCAAAAGGTAGGTCAGTTT
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GAGCCTTCTGAGATGATTGAAATTTATATTTATGCCAAGGTTTAAGATAAAACGGAAATA
TGATTTTTATCTGAATACCATCCGTTAACCAGTTTCGTGGAAATTCTGTTTCGGATAGTT
GAACCCCATTATAAGTACATTTAACATGCATTTCACGTTTCCAATCCTTGAAATCCTCTC
CCCACTCGGGAAGTTGAAATAATATGATACGGATGCTATTTTTAATTATTATCAATAAAG
GTAATATAATATATTTTCTAAGAATAGATTGAGTTATTAAAATAAAACCTCTTATTATTT
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TTGATTGTTCTTCTTCGTTTTTATAAATAATAATTTTTTTTT
TCC

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DS 

RD RR4DZ17JQ 694 0 0
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AAATCCTTAAAACCGGAAAAGACTTCGTTTTGGATTTTTTGATTCTTTTTTTTAATTCTT
TAAAAATAGGTTTTAAAAAAGAAGGTTTTGGTTTGGTAGAACCAAAAGGTAGGTCAGTTT
CCAGCCCCCAAACTGTTAAAAAACGAAAATAAATTTTTTCTCCTTTTGTTTTTTTTAGTC
GAGCCTTCTGAGATGATTGAAATTTATATTTATGCCAAGGTTTAAGATAAAACGGAAATA
TGATTTTTATCTGAATACCATCCGTTAACCAGTTTCGTGGAAATTCTGTTTCGGATAGTT
GAACCCCATTATAAGTACATTTAACATGCATTTCACGTTTCCAATCCTTGAAATCCTCTT
CCCACTCGGGAAGTTGAAATAATATGATACGGATGCTATTTTTAATTATTATCAATAAAG
GTAATATAATATATTTTCTAAGAATAGATTGAGTTATTAAAATAAAACCTCTTATTATTT
GAGCAAATAGGAAGCTATCCCAAGTTTCCGCAATTTCTAGGCGTCTTTGTTCGTCTTTTT
TTGATTGTTCTTCTCCGTTTTTATAAATAATAATTTTTTTTTCCACATGAAATTTCTAAG
AATTTTTTTTTTTAGCCCCCATATATCAAACGAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 5

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ACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGT
TGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCTTCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGC
GCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAAGTCTTGAACGAGACGTGGAACGGA
GGCAAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTCAGCTTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCA
AAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATCCCCGTTACCGGTGAT
TACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGTACCAGCATGCCGTCATTGGGCAGCCTTCGAGG
AGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTG
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GACACACCACCTGAGGCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAA
TCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAAGACTTGTTTCCACCTCCTTTTACTT
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CTTTTGTTTTATATCCAACATCTAAATCTATTTGCGGTAACAGAGTACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B321TF U 1
AF RR4B219TF U 5
AF RR4BQ84TF U 1
AF RR4B321JQ C 27
AF RR4BQ84JQ C 147
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GACACACCACCTGAGGCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAA
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G
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CTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAAGACTTGTTTCCACCTCCTTTTACTTCCCTT
TGTCTGTGTAACATACTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCTTTT
GTTTT

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CGAGATTGCTTCTTTCCCTTCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCAC
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GAGAGGTTTCATCCAAGGGTCAGCTTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCAAAGTT
TAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATCCCCGTTACCGGTGATTACTG
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DS 

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CTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCTTTTGTTTTATATCCAACATCTAAA
TCTATTTGCGGT

QA 1 732 1 732
DS 

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CACGGTTAAAGTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTC
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TCCTTTCCTCCCTATCATCCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGA
GTACCAGCATGCCGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGAC
GGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTA
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TCTATTTGCGGTAACAGAGTACC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 4

CO CL2019Contig1 1348 4 26 U
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CTACTCGCATTCGACATTGTCCTCTTCATCTTCCTATTCTCCTCCTCCCAACCATTCTCT
TTCTATCCAAAACCTCCACAGCTTTTAACCAGAGACGACTTTAAACCAATAAGTTCTTCA
AATCCTTCTCTGTCTTTCGTTTCCGCCTCAAAGGTATCCACAGCTTCCTCCTCGTTAGCA
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GTTGACATGTTCCATCTCCACAACGTCTGCCATCAGATTGACTGACCAATCTAGCAGAGA
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CATGACTTGCTCGGGTGAGAGTGAGTCCAGCACACCAGTTGGAAGTTCCCTAAACCAAGC
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CAAATCTTGGAGTGATGGGTACCTCTAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H856JQB U 1
AF RR4AB08JQ U 4
AF RR4AB08TF C 329
AF RR4AA54TF C 663
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BS 126 268 RR4H856JQB
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CTACTCGCATTCGACATTGTCCTCTTCATCTTCCTATTCTCCTCCTCCCAACCATTCTCT
TTCTCTCCAAAACCTCCACAGCTTTTAACCAGAGACGACTTTAAACCAATAAGTTCTTCA
AATCCTTCTCTGTCTTTCGTTTCCGCCTCAAAGGTATCCACAGCTTCCTCCTCGTTAGCA
GCTTTCATGAAATGCAACAACTGCCTGCTGCTCTGATCATCACCGTTCTGGTCTCTAGGA
CCCGGGTTCGAGCCTTGAACCAACCTATCTCGAGCCTCTTTACGTTCTTTAAACGTTTTC
ACAATAAGCGTCTTAAAAAAGTTCATGACTTTCACCGCGTACATCAAAGCCGTCAACGG*
ATCCAACATCTGAGTCATGTTGGGCGCGAAAACCATAGCGATGTTTCGAGCGTTCATCTT
GTTGACATGTTCCATCTCCACAACGTCTGCCATCAAATTGACTGACCAATCTAGCAAAAA
AGCTTCTGTCGAAGGAAGAAGCTTTACAAGCTCCACGCACTCGTCTTCAGTTTCGGACTC
CATGACTTGCTCGGGTGAGAGTGAGTCCAGCACACCAGTTGGAAGTTCCCTAAACCAAGC
CTTAATGAGACTTGCCAAGCAATGTACATCAATGTTGTTTGGTATAACACCTTTGTTCAG
CTCTTCTCTTATGTACTCCTCTTGAGTATTCTCACCATTAATCCTGAATATTCCTTCTAC
CTGCAAGCCGCCTCTACTGTACAAGTGACTCTGCA

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DS 

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CTCGCATTCGACATTGTCCTCTTCATCTTCCTATTCTCCTCCTCCCAACCATTCTCTTTC
TATCCAAAACCTCCACAGCTTTTAACCAGAGACGACTTTAAACCAATAAGTTCTTCAGAT
CCTTCTCTGTCTTTCGTTTCCGCCTCAAAGGTATCCACAGCTTCCTCCTCGTTAGCAGCT
TTCATGAGATGCAACAACTGCCTGCCGCTCTGATCATCACCGTTCTGGTCTCTAGGACCC
GGGTTCGAGCCTTGAACCAACCTATCTCGAGCCTCTTTACGTTCTTTAAGCGTTTTCACG
ATAAGCGTCTTAAGAAAGTTCATGACTTTCACCGCGTACATCAGAGCCGTCAACGG*ATC
CAACATCTGAGTCATGTTGGGCGCGAAAACCATAGCGATGTTTCGAGCGCTCATCTTGTT
GACATGTTCCATCTCCACAACGTCTGCCATCAGATTGACTGACCAATCTAGCAGAGAAGC
TTCTGTCGAAGGAAGAAGCTTTACAAACTCCACGCACTCGTCTTCAGTTTCGGACTCCAT
GACTTGCTCGGGTGAGAGTGAGTCCAGCACACCAGTTGGAAGTTCCCTAAACCAAGCCTT
AATGAGACTTGCCAAGCAATGTACATCAATGTTGTTTGGTATAACACCTTTGTTCAGCTC
TTCTCTTATGTACTCCTCTTGAGTATTCTCACCATTAATCCTGAATATTCCTTCTACCTG
CAAGCCGCCTCTACTGTACAAGTGACTCTGCATCATCAAGAGTATTGTAGGCACAATGTT
CCCTCTAGTATCATATGATAGCTGCATTGACTCAGTTGAGACTCCAAA

QA 1 888 1 888
DS 

RD RR4AB08TF 720 0 0
TCTCGAG
CTCTTTACGTTCTTTAAGCGTTTTCACGATAAGCGTCTTAAGAAAGTTCATGACTTTCAC
CGCGTACATCAGAGCTGTCAACGGGATCCAACATCTGAGTCATGTTGGGCGCGAAAACCA
TAGCGATGTTTCGAGCGCTCATCTTGTTGACATGTTCCATCTCCACAACGTCTGCCATCA
GATTGACTGACCAATCTAGCAGAGAAGCTTCTGTCGAAGGAAGAAGCTTTACAAACTCCA
CGCACTCGTCTTCAGTTTCGGACTCCATGACTTGCTCGGGTGAGAGTGAGTCCAGCACAC
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TGTTTGGTATAACACCTTTGTTCAGCTCTTCTCTTATGTACTCCTCTTGAGTATTCTCAC
CATTAATCCTGAATATTCCTTCTACCTGCAAGCCGCCTCTACTGTACAAGTGACTCTGCA
TCATCAAGAGTATTGTAGGCACAATGTTCCCTCTAGTATCATATGATAGCTGCATTGACT
CAGTTGAGACTCCAAACACGGTTGCACTTGCACTAGGAGCTCGTCTAGGGACTTCAGGTT
CAAACTCAACAGGCAAACCAAGAAAGCCATGGAAACGATCAAAGGTGACATGAGCGACAT
GTCTAACATCTGAAGGGACACCAATCTCCATCGAACAAAGATCCTCTTCTCCA

QA 8 720 8 720
DS 

RD RR4AA54TF 686 0 0
TAATGAGACTTGCCAAGCAATGTACATCAATGTTGTTTGGTATAACACCTTTGTTCAGCT
CTTCTCTTATGTACTCCTCTTGAGTATTCTCACCATTAATCCTGAATATTCCTTCTACCT
GCAAGCCGCCTCTACTGTACAAGTGACTCTGCATCATCAAGAGTATTGTAGGCACAATGT
TCCCTCTAGTATCATATGATAGCTGCATTGACTCAGTTGAGACTCCAAACACGGTTGCAC
TTGCACTAGGAGCTCGTCTAGGGACTTCAGGTTCAAACTCAACAGGCAAACCAAGAAAGC
CATGGAAACGATCAAAGGTGACATGAGCGACATGTCTAACATCTGAAGGGACACCAATCT
CCATCGAACAAAGATCCTCTTCTCCAACACACCCACCAATCACAGATCTTCTGATTGCAG
AGACGACAATCTCCAATGCAGACGAAATCTCGAATCTTTCTTCCTCTTTCTCGCTTCTCT
CCTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTGACGAGAAATGTTAAAAAGAGAATGTGGGTCTCTGT
TACCATCATTGGCTCCGCATGATGTAGAAGAGGAGCTTGAAGGTGAAGGGAAACTACATG
ATTGGCTCGAGTTTAGTACTTTCGCCATCTCTTTAGTCAAGGATAATCCTATAAAAATCA
AATCTTGGAGTGATGGGTACCTCTAA

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 5

CO CL2020Contig1 1006 5 15 U
GGAAATAGCACAATAATAGAATAAGATCCGTCGTAGAAAGAGAGAAGCCGATTCTGAGAA
GAAGCTCCCTCATGATTCTGTAAGTTGCAGCCAGCGAGATCCTTCTCTAGAGTCAATTGA
GATTGTTGTAATAGGAAGAGGAGGAAGAAGATGGTGCTTCCGTTGATGAAACTGGGAACA
CTACTGGTGAAAACGATAAGCAAGCCATTGGCGAGTCAGCTGAAGCACCAGGCCAAGGTT
CATCCCAGGTTTCGTCAATCCATCATCAACTTCGCTCAGAGGAACCATAGGGTGACGACG
CAGATACAAAGGAGGATATATGGGCACGCCACCGATGTGGAGATTCGTCCCTTGAACGAA
GAAAAAGCTGTTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAGCTCTTCATCTTTGCCGTCGGT
GGAGGCGTTGTTATCTTTGAGGTGCAGAGAAGTTCACGTTCTGAAGCTAGAAAAGAGGAA
GCCCGTAAGCAGGAACTCGAGGAGTTGAGAAAAAAAGATGAACTACTGGAAAAGCAAATG
GCTGATCTCCAAAGCAAACTAGCTGAGGTTGAAGAACT*GCTAAGGCACGGGGACTGACC
GGTATTTTTAAGGGAAGACAGCAACCCGGTACCTCCTCTACTACAAAGGGTAGCAGCGAG
AAGCCAGATGAATCATCATCA***TCTTAAATCAATGGCCAAGACTCAACCAAGGTTAAC
AATAAAATTACTGGTAATGATTCTTGAAGAGCGAGAGGAGTTTCCAAATTCTCTCCTTCA
CATTCTTGTAGATGGAGCATCATAGATACAACATACATGTTTCGTCATCATCATCATTAA
AGAACAATCTGCTTTATAACAACTATCTAGTCAAATTAGGTGACAAATAAAAAAGGTCTT
GATGTTGAGGTTTCATAGTTCCTACTTCTTTTTGTATTTTCAACATTCGTTTGCTTCGTT
TTGGTATTGCTTGTTGGCAATGCTTGGATAATGACGAATTCTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G324TF U 1
AF RR4C144TF U 42
AF RR4BV33TF U 48
AF RR4BV33JQ C 130
AF RR4C144JQ C 168
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RD RR4G324TF 192 0 0
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GATTGTTGTAATAGGAAGAGGAGGAAGAAGATGGTGCTTCCGTTGATGAAACTGGGAACA
CTGCTGGTGAAA

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR4C144TF 539 0 0
GGGAAGCC
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CCTTGAACGAAGAAAAAGCTGTTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAGCTCTTCATCT
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GAAAAGAGGAAGCCCGTAAGCAGGAACTCGAGGAGTTGAGAAAAAAAGATGAACTACTGG
AAAAGCAAATGGCTGATCTCCAAAGCAAACTAGCTGAG*TTGAAGAACT
TG

QA 9 537 9 537
DS 

RD RR4BV33TF 669 0 0
GG
GATTCTGAGAAGAAGCTCCCTCATGATTCTGTAAGTTGCAGCCAGCGAGATCCTTCTCTA
GAGTCAATTGAGATTGTTGTAATAGGAAGAGGAGGAAGAAGATGGTGCTTCCGTTGATGA
AACTGGGAACACTACTGGTGAAAACGATAAGCAAGCCATTGGCGAGTCAGCTGAAGCACC
AGGCCAAGGTTCATCCCAGGTTTCGTCAATCCATCATCAACTTCGCTCAGAGGAACCATA
GGGTGACGACGCAGATACAAAGGAGGATATATGGGCACGCCACCGATGTGGAGATTCGTC
CCTTGAACGAAGAAAAAGCTGTTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAGCTCTTCATCT
TTGCCGTCGGTGGAGGCGTTGTTATCTTTGAGGTGCAGAGAAGTTCACGTTCTGAAGCTA
GAAAAGAGGAAGCCCGTAAGCAGGAACTCGAGGAGTTGAGAAAAAAAGATGAACTACTGG
AAAAGCAAATGGCTGATCTCCAAAGCAAACTAGCTGAGGTTGAAGAACT*GCTAAGGCAC
GGGGACTGACCGGTATTTTTAAGGGAAGACAGCAACCCGGTACCTCCTCTACTACAAAGG
GTAGCAGCGAGAAGCCAGATGA*TCATCATCA***TCTTAAATCAATGGCCAAGACTCAA
CCAAG
TT

QA 3 667 3 667
DS 

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AATAGGAAGAGGAGGAAGAAGATGGTGCTTCCGTTGATGAAACTGGGAACACTACTGGTG
AAAACGATAAGCAAGCCATTGGCGAGTCAGCTGAAGCACCAGGCCAAGGTTCATCCCAGG
TTTCGTCAATCCATCATCAACTTCGCTCAGAGGAACCATAGGGTGACGACGCAGATACAA
AGGAGGATATATGGGCACGCCACCGATGTGGAGATTCGTCCCTTGAACGAAGAAAAAGCT
GTTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAGCTCTTCATCTTTGCCGTCGGTGGAGGCGTT
GTTATCTTTGAGGTGCAGAGAAGTTCACGTTCTGAAGCTAGAAAAGAGGAAGCCCGTAAG
CAGGAACTCGAGGAGTTGAGAAAAAAAGATGAACTACTGGAAAAGCAAATGGCTGATCTC
CAAAGCAAACTAGCTGAGGTTGAAGAACT*GCTAAGGCACGGGGACTGACCGGTATTTTT
AAGGGAAGACAGCAACCCGGTACCTCCTCTACTACAAAGGGTAGCAGCGAGAAGCCAGAT
GAATCATCATCA***TCTTAAATCAATGGCCAAGACTCAACCAAGGTTAACAATAAAATT
ACTGGTAATGATTCTTGAAGAGCGAGAGGAGTTTCCAAATTCTCTCCTTCACATTCTTGT
AGATGGAGCATCATAGATACAACATACATGTTTCGTCATCATCATCATTAAAGAACAATC
TGCTTTATAACAACTATCTAGTCAAATTAGGTG
GC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4C144JQ 839 0 0
GAAACTGGGAACACTACTGGTGAAAACGATAAGCAAGCCATTGGCGAGTCAGCTGAAGCA
CCAGGCCAAGGTTCATCCCAGGTTTCGTCAATCCATCCTCAACTTCGCTCAGAGGAACCA
TAGGGTGACGACGCAGATACAAAGGAGGATATATGGGCACGCCACCGATGTGGAGATTCG
TCCCTTGAACGAAGAAAAAGCTGTTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAGCTCTTCAT
CTTTGCCGTCGGTGGAGGTGTTGTTATCTTTGAGGTGCAGAGAAGTTCACGTTCTGAAGC
TAGAAAAGAGGAAGCCCGTAAGCAGGAACTCGAGGAGTTGAGAAAAAAAGATGAACTACT
GGAAAAGCAAATGGCTGATCTCCAAAGCAAACTAGCTGAGGTTGAAGAACTTGCTAAGGC
ACGGGGACTGACCGGTATTTTTAAGGGAAGACAGCAACCCGGTACCTCCTCTACTACAAA
GGGTAGCAGCGAGAAGCCAGATGAATCATCATCATCATCTTAAATCAATGGCCAAGACTC
AACCAAGGTTAACAATAAAATTACTGGTAATGATTCTTGAAGAGCGAGAGGAGTTTCCAA
ATTCTCTCCTTCACATTCTTGTAGATGGAGCATCATAGATACAACATACATGTTTCGTCG
TCATCATCATTAAAGAACAATTTGCTTTATAACAACTATCTAGTCAAATTAGGTGACAAA
TAAAAAAGGTCTTGATGTTGAGGTTTCATAGTTCCTACTTCTTTTTGTATTTTCAACATT
CGTTTGCTTCGTTTTGGTATTGCTTGTTGGCAATGCTTGGATAATGACGAATTCTTTAG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 2 5

CO CL2021Contig1 801 2 10 U
GGGGTCGGATCAGTCGAAAAAAGCTTGAAGAATTTGATACTTTTGATTTCTAAGTCCATG
GAATCTGCAAAAGAGCGTGATACTTTCGTCTACCTCGCAAAGCTATCTGAACAAGCTGAG
CGCTATGAAGAAATGGTGGAGTCGATGAAGAACCTTGCGAAGTTGAACGTTGATCTGACG
TTGGAAGAGAGGAACTTGCTCTCTGTTGGATACAAGAACGTGATCGGTTCAAGGAGAGCT
TCGTGGAGGACCTTCTCGTCGATCGAGCAGAAAGAAGCAGTGAAAGGGAACGATGTTAAT
GTAAAGAGGATCAAAGATTATATGGAGAAGGTTGAGTTAGAGCTCACAAGTATATGCATT
GACATAATGTCTGTGTTAGATGAGCATCTGATCCCATCTGCTTCCGAGGGTGAATCAACC
GTCTTCTTCAACAAAATGAAAGGTGATTATTACCGCTATCTTACTGAGTTTAAATCAGGG
GATGAGAGGAAAGAGGCTGCTGATCAGTCTTTGAAAGCCTATGAGATTGCTACTACTTCT
GCTGAGGCTAAACTTCCTCCTACACATCCAATCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCT
GTCTTCTACTATGAGATCATGAACTCACCTGAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCACGCG
TTTGATGAAGCAATCTCAGAACTTGACAGTCTGAATGAGAATCTTACAAAGATAGCACTT
TGATTTTGCACTCCTTAGGGACATCTGACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAAAGGAG
TAGATGATGCACATAAGACGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW96TF U 1
AF RR4F402TF U 1
BS 1 29 RR4CW96TF
BS 30 31 RR4F402TF
BS 32 289 RR4CW96TF
BS 290 290 RR4F402TF
BS 291 384 RR4CW96TF
BS 385 385 RR4F402TF
BS 386 462 RR4CW96TF
BS 463 463 RR4F402TF
BS 464 772 RR4CW96TF
BS 773 801 RR4F402TF

RD RR4CW96TF 772 0 0
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GCTGAGGCTAAACTTCCTCCTACACATCCAATCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCT
GTCTTCTACTATGAGATCATGAACTCACCTGAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCACGCG
TTTGATGAAGCAATCTCAGAACTTGACAGTCTGAATGAGAATCTTACAAAGATAGCACTT
TGATTTTGCACTCCTTAGGGACATCTGACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4F402TF 801 0 0
GGGGTCGGATCAGTCGAAAAAAGCTTGAAGAATTTGATACTTTTGATTTCTAAGTCCATG
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CGCTATGAAGAAATGGTGGAGTCGATGAAGAACCTTGCGAAGTTGAACGTTGATCTGACG
TTGGAAGAGAGGAACTTGCTCTCTGTTGGATACAAGAACGTGATCGGTTCAAGGAGAGCT
TCGTGGAGTATCTTCTCGTCGATCGAGCAGAAAGAAGCAGTGAAAGGGAACGATGTTAAT
GTAAAGAGGATCAAAGATTATATGGAGAAGGTTGAGTTAGAGCTCACAAGTATATGCATT
GACATAATGTCTGTGTTAGATGAGCATCTGATCCCATCTGCTTCCGAGGGTGAATCAACC
GTCTTCTTCAACAAAATGAAAGGTGATTATTACCGCTATCTTACTGAGTTTAAATCAGGG
GATGAGAGGAAAGAGGCTGCTGATCAGTCTTTGAAAGCCTATGAGATTGCTACTACTTCT
GCTGAGGCTAAACTTCCTCCTACACATCCAATCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCT
GTCTTCTACTATGAGATCATGAACTCACCTGAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCACGCG
TTTGATGAAGCAATCTCAGAACTTGACAGTCTGAATGAGGATCTTACAAAGATGGCACTT
TGATTTTGCACTCCTTAGG*ACATCTGACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAAAGGAG
TAGATGATGCACATAAGACGA

QA 1 801 1 801
DS 



CO CL2021Contig2 691 3 10 U
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AGATCATGAACTCACCTGAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCAGGCGTTTGATGAAGCAA
TCTCAGAACTTGACAGTCTGAATGAGGAATCTTACAAAGATAGCACTTTGATTTT*GCAA
CTCCTTAGGGACAATCTGACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAGAAGGAGTAGATGAT
GCACATAAGACGAATGGTTCTGCTAAACACGGTGCAGGTGAAGACGACGCAGAGTGATCT
GATGATATGTGTGCACCCGCAGCAGCAGCAGTAATGGACAAACATGTTTCAAGAACAACT
GAATGTGCGGTGAATAATAGCCAAAAACCTATAGTTCTTATGTTTCCTAGTATCATTATT
GTCTATATATTGTACTCTCTGGTTTGAGTGTATGCTTGTCTCTCAAGACACTCTTTTCTT
ATTTGTGATTTGAATTCAGTACTGTCTTCTTCACCCATTGCTCTTCTCTCTCACTATGTA
TTCCTATGGATCCACTCTCATAACTCTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A231TF U 215
AF RR4F402JQ C 1
AF RR4A231TFB U 18
BS 1 18 RR4F402JQ
BS 19 29 RR4A231TFB
BS 30 30 RR4F402JQ
BS 31 215 RR4A231TFB
BS 216 216 RR4F402JQ
BS 217 352 RR4A231TFB
BS 353 355 RR4F402JQ
BS 356 395 RR4A231TFB
BS 396 396 RR4F402JQ
BS 397 691 RR4A231TFB

RD RR4A231TF 113 0 0
TT
CTAAGCAGGCGTTTGATGAAGCAATCTCAGAACTTGACAGTCTGAATGAGGAATCTTACA
AAGATAGCACTTTGATTTTTGCAACTCCTTAGGGACAATCTGACCTTGTGG

QA 3 113 3 113
DS 

RD RR4F402JQ 682 0 0
AAATGAAAGGTGATTATTACCGCTATCTTACTGAGTTTAAATCAGGGGATGAGAGGAAAG
AGGCTGCTGATCAGTCTTTGAAAGCCTATGAGATTGCTACTACTTCTGCTGAGGCTAAAC
TTCCTCCTACACATCCAATCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCTGTCTTCTACTATG
AGATCATGAACTCACCTGAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCAGGCGTTTGATGAAGCAA
TCTCAGAACTTGACAGTCTGAATGAGGAATCTTACAAAGATGGCACTTTGATTTT*GCAA
CTCCTTAGGGACAATCTGACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAGAAGGAGTAGATGAT
GCACATAAGACGAATGGTTTTGCTAAACACGGTGCAGGTGAAGACGACGCAGAGTGATCT
GATGATATGTGTGCACCCGCAGCAGCAGCAGTAATGGACAAACATGTTTCAAGAACAACT
GAATGTGCGGTGAATAATAGCCAAAAACCTATAGTTCTTATGTTTCCTAGTATCATTATT
GTCTATATATTGTACTCTCTGGTTTGAGTGTATGCTTGTCTCTCAAGACACTCTTTTCTT
ATTTGTGATTTGAATTCAGTACTGTCTTCTTCACCCATTGCTCTTCTCTCTCACTATGTA
TTCCTATGGATCCACTCT
TATA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4A231TFB 674 0 0
G
ACCGCTATCTTGCTGAGTTTAAATCAGGGGATGAGAGGAAAGAGGCTGCTGATCAGTCTT
TGAAAGCCTATGAGATTGCTACTACTTCTGCTGAGGCTAAACTTCCTCCTACACATCCAA
TCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATCATGAACTCACCTG
AAAGGGCATGTGAGCTT*CTAAGCAGGCGTTTGATGAAGCAATCTCAGAACTTGACAGTC
TGAATGAGGAATCTTACAAAGATAGCACTTTGATTTT*GCAACTCCTTAGGGACAATCTG
ACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAGAAGGAG***ATGATGCACATAAGACGAATGGT
TCTGCTAAACACGGTGCGGGTGAAGACGACGCAGAGTGATCTGATGATATGTGTGCACCC
GCAGCAGCAGCAGTAATGGACAAACATGTTTCAAGAACAACTGAATGTGCGGTGAATAAT
AGCCAAAAACCTATAGTTCTTATGTTTCCTAGTATCATTATTGTCTATATATTGTACTCT
CTGGTTTGAGTGTATGCTTGTCTCTCAAGACACTCTTTTCTTATTTGTGATTTGAATTCA
GTACTGTCTTCTTCACCCATTGCTCTTCTCTCTCACTATGTATTCCTATGGATCCACTCT
CATAACTCTGTTC

QA 2 674 2 674
DS 



AS 1 4

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AACGTTCGTTGAAACCGTTCCTTTCAAGACAATTGCAATGTTCACTATTTTCCAAACGGT
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AATGATCATGTTCTTAATCCCCGTTAGACAATACATCCTCCCTAGATTCTTCAAAGGAGC
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TTCAGGAAGCTCAATAAAACAAAACCACCCCAATGAGGATGAATGTTTAATTAGTTAATT
AATTTGGTCTTTAGTTATTATAAGAAACAAAAGCTTCTTGAATTAATCTCTCTTTAGTTT
ATGTGTTGTATGTGTTTGTATGTGTTGTATGTGTTTGTAATCCCCTTCCCTTGTGTTTTT
ATCTTTTGAGTTTTTGTAAAATCTTACCTATTTCGTAATATATGTAACTTTGCGTGGCAA
ATATGTATAAAGACTTAAAATGTTATAACGGTAACCAATCTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EY80TF U 1
AF RR4BL60TF U 258
AF RR4AR88TF U 811
AF RR4BL60JQ C 733
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BS 1156 1427 RR4BL60JQ

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TTGGGGTTACTTCGCCTTCATGGCCATCGAAAGCTTACCTGGAAACCAATTCTGGGAGAG
AATCTTACTTCTCTTCACAGCCCCAAGTCGCCGCTTCAAGGTTCTTGAAGACTACCACGC
AACGTTCGTTGAAACCGTTCCTTTCAAGACAATTGCAATGTTCACTATTTTCCAAACGGT
TTATCTGTTAATCTGCTTTGGCCTCACATGGATCCCAATA

QA 1 700 1 700
DS 

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GG
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ATGGCCATCGAAAGCTTACCTGGAAACCAATTCTGGGAGAGAATCTTACTTCTCTTCACC
GCCCCAAGTCGCCGCTTCAAGGTTCTTGAAGACTACCACGCAACGTTCGTTGAAACCGTT
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GGCCTCACATGGATCCCAATAGCAGGAGTCATGTTCCCTTTAATGATCATGTTCTTAATC
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GCAGCTGAGTACGAAGAAGCTCCAGCTTTACCCT

QA 3 576 3 576
DS 

RD RR4AR88TF 345 0 0
G
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TTTAGACACACGAGTAGTCCTAAGGTCACGAGTTCGAGTTCGACTCCTGTCAATAATAGG
AGTTTGTCTCAAGTGTTTAGTCCACGTGTGAGCGAACTAAGGTTCGGTCAGATGAGTCCT
CGAGTCGTTGGGAATAGTCCAAAGCCGGCTAGTTGTGGAAGGAGTCCCTTGAACCAGTCC
TCTTCAAAGTGATGCGATGATATAATATATTCAGGAAGCTCAAT

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DS 

RD RR4BL60JQ 695 0 0
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GTTCGGTCAGATGAGTCCTCGAGTCGTTGGGAATAGTCCAAAGCCGGCTAGTTGTGGAAG
GAGTCCCTTGAACCAGTCCTCTTCAAAGTGATGCGATGATATAATATATTCAGGAAGCTC
AATAAAACAAAACCACCCCAATGAGGATGAATGTTTAATTAGTTAATTAATTTGGTCTTT
AGTTATTATAAGAAACAAAAGCTTCTTGAATTAATCTCTCTTTAGTTTATGTGTTGTATG
TGTTTGTATGTGTTGTATGTGTTTGTAATCCCCTTCCCTTGTGTTTTTATCTTTTGAGTT
TTTGTAAAATCTTACCTATTTCGTAATATATGTAACTTTGCGTGGCAAATATGTATAAAG
ACTTAAAATGTTATAACGGTAACCAATCTTTTTAT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 5

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GGGTTTCTTCGGTACTGATCAGATTAATCAGGAGAGTCTTCCTGCAGCTGAAGTTCCGGA
GCTTTCTGTTTCGCATTTAGGTCATGTTCATTCATACAGACCAACCATGAAGTCGAATGT
TTCATACAAGAAGCCGAGGTTGGAGTTCAGAGATGATGATGATGATGAAGAGCACTTCAT
TGTCCCTGATCTAGGCTAAAATGCTATATGTAAGCTATGTGTAGACATTTCTCTATGGAA
AAATAAGGAAGATGATGTGTGGATGCAATGTCATATCTTTAGTTTTGTTAAGTTGAGTAA
AGCTATGTTGATAGCTTATTAGTTATTACACACTTTCTTATTTTCTGTCCGAATCTTTAT
TATAAGACATTTGTGTTTGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS41TF U 15
AF RR4C524TF U 1
AF RR4C524JQ C 372
AF RR4DS41JQ C 321
AF RR4BP92TF U 530
BS 1 101 RR4C524TF
BS 102 102 RR4DS41TF
BS 103 362 RR4C524TF
BS 363 363 RR4DS41TF
BS 364 727 RR4C524TF
BS 728 1104 RR4BP92TF

RD RR4DS41TF 660 0 0
GG
AAACCATTTCCTTATTGCATCATCTCTCCTATTCTTTGTTACTTCTTCTCCAAGATCCTT
TCCACCTTTACCTACATTTTCTGCTAAGCGAACAAAGTCAGATTCATTATATGTCTTCTT
GATTTAAAACCAAGAATCAATAATCAAGAACTGTGATTTAGAGAGCAAGGAAAGATGAAG
ATACAGTGTGATGTGTGTGAGAAAGCTCCGGCAACGGTGATATGTTGTGCCGACGAAGCA
GCTTTGTGTCCTAGATGCGACGTGGAGATTCACGCTGCTAACAAACTCGCAAGCAAGCAC
CGACGCCTTCATCTCAATGCTCTTGCCACCAAGTTCCCTCGTTGCGGTGTTTGCCAAGAG
AAGTCAGCTTTCATTTTCTGCGTTGAGGATAGAGCTCTGCTTTGCAGGGACTGTGATGAA
TCCATCCATGCAGCTAACTCTAGATCTGCAAACCACCAGAGGTTCTTAGCCACTGGGATC
AAAGTGGCTCTGAACTCAACTAGTTGCAGCAAGAATCAATCTGAGCCTTCCAAGAAGCAA
CAGAAAGCTAAGGAGATTCCAGCTAAAACCCTAAACCAGCAACAACCTTCTTCTGCTACT
CCTCTTCCGTGGGCGGTTGACGATTTCTTTCACTTCTCTGATCCTGAGTGTACCGAGA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4C524TF 727 0 0
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CTTCTCCAAGATCCTTTCCACCTTTACCTACATTTTCTGCTTAGCAAACAAAGTCAGATT
CATTATATGTCTTCTTGATTTAAAACCAAGAATCAATAATCAAGAACTGTGATTTAGAGA
ACAAGGAAAGATGAAGATACAGTGTGATGTGTGTGAGAAAGCTCCGGCAACGGTGATATG
TTGTGCCGACGAAGCAGCTTTGTGTCCTAGATGCGACGTGGAGATTCACGCTGCTAACAA
ACTCGCAAGCAAGCACCGACGCCTTCATCTCAATGCTCTTGCCACCAAGTTCCCTCGTTG
CGATGTTTGCCAAGAGAAGTCAGCTTTCATTTTCTGCGTTGAGGATAGAGCTCTGCTTTG
CAGGGACTGTGATGAATCCATCCATGCAGCTAACTCTAGATCTGCAAACCACCAGAGGTT
CTTAGCCACTGGGATCAAAGTGGCTCTGAACTCAACTAGTTGCAGCAAGAATCAATCTGA
GCCTTCCAAGAAGCAACAGAAAGCTAAGGAGATTCCAGCTAAAACCCTAAACCAGCAACA
ACCTTCTTCTGCTACTCCTCTTCCGTGGGCGGTTGACGATTTCTTTCACTTCTCTGATCC
TGAGTGTACCGAGAAGAAAGGACAGCTTGATCTTGGTGAGTTAGAGTGGTTTTCAGACAT
GGGTTTC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4C524JQ 638 0 0
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ATGAATCCATCCATGCAGCTAACTCTAGATCTGCAAACCACCAGAGGTTCTTAGCCACTG
GGATCAAAGTGGCTCTGAACTCAACTAGTTGCAGCAAGAATCAATCTGAGCCTTCCAAGA
AGCAACAGAAAGCTAAGGAGATTCCAGCTAAAACCCTAAACCAGCAACAACCTTCTTCTG
CTACTCCTCTTCCGTGGGCGGTTGACGATTTCTTTCACTTCTCTGATCCTGAGTGTACCG
AGAAGAAAGGACAGCTTGATCTTGGTGAGTTAGAGTGGTTTTCAGACATGGGTTTCTTCG
GTACTGATCAGATTAATCAGGAGAGTCTTCCTGCAGCTGAAGTTCCGGAGCTTTCTGTTT
CGCATTTAGGTCATGTTCATTCATACAGACCAACCATGAAGTCGAATGTTCCATACAAGA
AGCCGAGGTTGGAGTTCAGAGATGATGATGATGATGAAGAGCACTTCATTGTCCCTGATC
TAGGCTAAAATGCTATATGTAAGCTATGTGTAGACATTTCTCTATGGAAAAATAAGGAAG
ATGATGTGTGGATGCAATGTCATATCTTTAGTTTTGTT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4DS41JQ 731 0 0
GCCTTCATCTCAATGCTCTTGCCACCAAGTTCCCTCGTTGCGGTGTTTGCCAAGAGAAGT
CAGCTTTCATTTTCTGCGTTGAGGATAGAGCTCTGCTTTGCAGGGACTGTGATGAATCCA
TCCATGCAGCTAACTCTAGATCTGCAAACCACCAGAGGTTCTTAGCCACTGGGATCAAAG
TGGCTCTGAACTCAACTAGTTGCAGCAAGAATCAATCTGAGCCTTCCAAGAAGCAACAGA
AAGCTAAGGAGATTCCAGCTAAAACCCTAAACCAGCAACAACCTTCTTCTGCTACTCCTC
TTCCGTGGGCGGTTGACGATTTCTTTCACTTCTCTGATCCTGAGTGTACCGAGAAGAAAG
GACAGCTTGATCTTGGTGAGTTAGAGTGGTTTTCAGACATGGGTTTCTTCGGTACTGATC
AGATTAATCAGGAGAGTCTTCCTGCAGCTGAAGTTCCGGAGCTTTCTGTTTCGCATTTAG
GTCATGTTCATTCATACAGACCAACCATGAAGTCGAATGTTTCATACAAGGAGCCGAGGT
TGGAGTTCAGAGATGATGATGATGATGAAGAGCACTTCATTGTCCCTGATCTAGGCTAAA
ATGCTATATGTAAGCTATGTGTAGACATTTCTCTATGGAAAAATAAGGAAGATGATGTGT
GGATGCAATGTCATATCTTTAGTTTTGTTAAGTTGAGTAAAGCTATGTTGATAGCTTATT
AGTTATTAC
GC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4BP92TF 575 0 0
AATCAATCTGAGCCTTCCAAGAAGCAACAGAAAGCTAAGGAGATTCCAGCTAAAACCCTA
AACCAGCAACAACCTTCTTCCGCTACTCCTCTTCCGTGGGCGGTTGACGATTTCTTTCAC
TTCTCTGATCCTGAGTGTACCGAGAAGAAAGGACAGCTTGATCTTGGTGAGTTAGAGTGG
TTTTCAGACATGGGTTTCTTCGGTACTGATCAGATTAATCAGGAGAGTCTTCCTGCAGCT
GAAGTTCCGGAGCTTTCTGTTTCGCATTTAGGTCATGTTCATTCATACAGACCAACCATG
AAGTCGAATGTTTCATACAAGAAGCCGAGGTTGGAGTTCAGAGATGATGATGATGATGAA
GAGCACTTCATTGTCCCTGATCTAGGCTAAAATGCTATATGTAAGCTATGTGTAGACATT
TCTCTATGGAAAAATAAGGAAGATGATGTGTGGATGCAATGTCATATCTTTAGTTTTGTT
AAGTTGAGTAAAGCTATGTTGATAGCTTATTAGTTATTACACACTTTCTTATTTTCTGTC
CGAATCTTTATTATAAGACATTTGTGTTTGAGTTT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 5

CO CL2024Contig1 572 5 2 U
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TATGCATGCAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAA
AAGGTATAAATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAAAATTTATGGAGGAAATCGG
GTTTTAAATTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAA
TCATCCCAAGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGA
TGAGAAATTCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAA
AAAAGAAAATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAA
GTCGAGTCTTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCA
GTCCATGACTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCAGACTAAACA
TACCAATAGTCACCAGATTCATATGGGCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4DF78TF C 9
AF RR4DF78JQ U 49
AF RR4DA47TF C 1
AF RR4DA47JQ U 9
AF RR4GG48JQ U 9
BS 1 8 RR4DA47TF
BS 9 572 RR4DA47JQ

RD RR4DF78TF 246 0 0
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CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATA
AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGC
C

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR4DF78JQ 206 0 0
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CTCCAACAAGAAAAGGTATAAATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAAAATTTAT
GGAGGAAATCGGGTTTTAAATTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGG
CCGCACCTAAAATCATCCCAAGCGC
C

QA 1 205 1 205
DS 

RD RR4DA47TF 572 0 0
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TATGCATGCAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAA
AAGGTATAAATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGG
GTTTTAAATTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAA
TCATCCCAAGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGA
TGAGAAATTCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAA
AAAAGAAAATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAA
GTCGAGTCTTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCA
GTCCATGACTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCAGACTAAACA
TACCAATAGTCACCAGATTCATATGGGCTAC
C

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4DA47JQ 564 0 0
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CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATA
AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAAAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAAT
TCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAAAGAAA
ATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAAGTCGAGTC
TTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCAGTCCATGA
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GTCACCAGATTCATATGGGCTACC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4GG48JQ 563 0 0
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AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAAAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAAT
TCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAAAGAAA
ATGGTAGAGAAATTCGGCATAGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAGCAAGTCGAGTC
TTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCAGTCCATGA
CTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCAGACTAAACATACCAATA
GTCACCAGATTCATATGGGCTAC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 3

CO CL2025Contig1 1210 3 3 U
AGGCTTTTGATATCATCAGTGAGGAGGCTTTTGATATCAACCTGATGCTTGAAAGAGAAG
AATCGGATCCCCAAACACTAAACAAGACAGGTGTTTAGTCTTGATATACAATATTTACCA
CTATGGGTACTATTATATAAATATCAAAGATACTTAAAATAAGAAAAGGACCTCTGTGTA
ACCATGCATCCTGATCCTTGCCGTTGTCAAGTTGAGGATAATGGTGTATATGTCAGATTA
TGAACTATACAGATGCTGCTGAAGAATAAGTCTCGAAGAGGTAAGACAAAATCTTCTGGT
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CTCTACCAGCTCGGAGAAGTGTTGGCATCCATCCTGTGAACAAGGTGCTTTCCAGAAGTC
CTGTGGAAGGGCTTCTTCCATTACCATATTGATTATATAAGTACTTTACGATGTCACCAC
TCTCGTACATGGAAGTATCAGTATTGGGATCAATGAGGAAGGGAAACATCTCTTTTCCAC
CGGATCTTCTAACCATTTCCCTGTGTCTTACAGATCCTTTAGGACAAGGATAAACTTCTA
CAGAGAGGTCTAGCTCAGTCATGGCTTCGCGCACCCTCCGGCAAAAGGGACATGCCTCAA
ATTCAAAAGCTTCAATCGCAAAGGTGGAGTAAAAGAAACATCTTTACTCATGGATGCTAC
TCGAGATCCCCATGGAAGTCTTGCAATAGATGCTAAAGAAGAAGTTGCGACCTCAAGAGC
ATGATTCCGTTGCTGAGAAGGGTCCCCACCAGAGAAGAGTTTAAGCAAGGGACAGAGAAG
AGACAAGAAGCTTCCGCTCGTAGTGCTTTCACTAGACGATGTTTCTTCTTCATCAGCTTT
CGCCTCTGATTTCACGTATACTCTTCCTCTTTCGCGAATCCAGGCCCCGTTTCCTGAAAT
TCGCTGCTCGGGGAATCGACCAGAACGAAACGACGCTTTTGGACGGCCGAGATTGCCATA
TGCCACCGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTGT

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TGAGGATAATGGTGTATATGTCAGATTATGAACTATACAGATGCTGCTGAAGAATAAGTC
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CCTTCTCCAATGTTGTGTAATACATAGGGGAGCTCTAACTCGCACAGTGCTTCACGCACC
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GATGAAGCCTTGTCCCATAATGACATGCCTCTACCAGCTCGGAGAAGTGTTGGCATCCAT
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TTATATAAGTACTTTACGATGTCACCACTCTCGTACATGGAAGTATCAGTATTGGGATCA
ATGAGGAAGGGAAACATCTCTTTTCCACCGGATCTTCTAACCATTTCCCTGTGTCTTACA
GATCCT

QA 1 726 1 726
DS 

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GCCTTGTCCCATAATGACATGCCTCTACCAGCTCGGAGAAGTGTTGGCATCCATCCTGTG
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AAGTACTTTACGATGTCACCACTCTCGTACATGGAAGTATCAGTATTGGGATCAATGAGG
AAGGGAAACATCTCTTTTCCACCGGATCTTCTAACCATTTCCCTGTGTCTTACAGATCCT
TTAGGACAAGGATAAACTTCTACAGAGAGGTCTAGCTCAGTCATGGCTTCGCGCACCCTC
CGGCAAAAGGGACATGCCTCAAATTCAAAAGCTTCAATCGCAAAGGTGGAGTAAAAGAAA
CATCTTTACTCATGGATGCTACTCGAGATCCCCATGGAAGTCTTGCAATAGATGCTAAAG
AAGAAGTTGCGACCTCAAGAGCATGATTCCGTTGCTGAGAAGGGTCCCCACCAGAGAAGA
GTTTAAGCAAGGGACAGAGAAGAGACAAGAAGCTTCCGCTCGTAGTGCTTTCACTAGACG
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TCCAGGCCCCGTTTCCTGAAATTCGCTGCTCGGGGAATCGACCAGAACGAAACGACGCTT
TTGGACGGCCGAGATTGCCATATGCCACCGGC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 3

CO CL2026Contig1 856 3 7 U
GAACTTCTGATCAATATAAAAAAATGTGTTGATAAAAGTATGGTATGAAACCCAATAACA
CAAGGACGTAAGTCAAGAAACAAACAACAGGAGGAATGATATACAAGTAATCCATGACTA
CGAAGAGGAGAAGAGAGTTTTGTTTCAACTAAAACACAATAGAAAATCAAGTAACTCACA
CACGATCATCCATACTGGGAAAGACGATCGAGACTTCCTGGTTGCTATTCGTCTCTTGTC
GCAGGATCCATTCCGGTCGAAGGGCTATCAGCAAAATATTCTGGATGCTTCACGTTCACA
CCATACTCACGCAAAGCTTTTGAAAGGTCTTCCATTGTCAATACTAAACGCTTATCCTTC
TGCTGTTTTTTGTCTTTCACAACTGGTGCTGGTCTAGCCTTGCAGTGCTGAAGAGCATCG
CTGGCAACATCTGCAACAAACTTTTGTGTAGCCACAGCAACTAGCCTTATTAATCGTACG
TCGGGGCACTGAAACCCACTCTTAGCCAAGTAGTGCTCCACTAGATCATCAGGAATAGTA
GGAGTATAATCCATGAGAGACGCAAGGAACTCAGTAAGAGCAGCATCATCTTCATGCTTT
GCTTCGCCAGAATGTTGGCCATGATTATTCATCTCTCCCGCAAACCAGAGTACTTAATCC
CAAGTCTTTTGGCCAACGCCTTTAACTAAACGAAGCTGTAACGTGAAAACGGCAGAGAAT
TGAGCTGAGACGAGTCGATCAAATGCAAAGGAGGAGAATTTTCGAGCCGGAGAAGAAGGG
ATCGGACTTCGGAGAGTCGAGTACTCTGAGTCCCCGTTGAAACCCTAAATCCCCGACTGT
TTCCAGCTTCCAGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4FG91JQ U 18
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C
CAAAAGGAAAAAAAA

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DS 

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CAG
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TGTTTCAACTAAAACACAATAGAAAATCAAGTAACTCACACACGATCATCCATACTGGGA
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TGAAAGGTCTTCCATTGTCAATACTAAACGCTTATCCTTCTGCTGTTTTTTGTCTTTCAC
AACTGGTGCTGGTCTAGCCTTGCAGTGCTGAAGAGCATCGCTGGCAACATCTGCAACAAA
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CTCAGTAAGAGCAGCATCATCTTCATGCTTTGCTTCGCCAGAATGTTGGCCATGATTATT
CATCTCTCCCGCAAACCAGAGTACTTAATCCCAAGTCTTTTGGCCAACGCCTTTAACTAA
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GGAGGAGAATTTTCGAGCCGGAGAAGAAGGGATCGGACTTCGGAGAGTCGAGTACTCTGA
GTCCCCGTTGAAACCCTAAATCCCCGACTGTTTCCAGCTTCCAGCCC

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DS 



AS 1 5

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TTGTGAAAAAACCTTTCCATAAAGGCTTACATACATAAGAAAATGGCAACCATCTTTTGC
CTTCTCGTGCAAGAAAGGCACACATATAACCCTAGATGAACCTCTCCTTTTACAACTATA
TATTTTGAATAAAAATCAAAAACACACCAAAAAAGACAATATTATAAAAATAAAGCCCAA
ACACATTCCACCTCTTGTGGTATATAAGGTTTCGTTCATCTACTTACGAGCGCTTATAAG
CTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAAAGACGAGAAATCATCGCTCCTCATAGCATA
GAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAATCGCGACAAACCTGATGGAAGC
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AGCCACTAGCTCAATGGCTCTGCGACCTTGTGGAATTGAGAAGTGTTCTGTGTCTACGTA
CTTGACGGCTTTGAGAGAATCGACCATCCAACCGGGTAGAGGAGAGTGGTCGTCTTCTAT
GAACGGCGGGATCAAAACTCCTGTTGTTGAGCCTGGTAGTACTAGTGGACCTTCTTCAAA
TCCTCCGTTTTTCAAAATGTTCTTGTTGGTTGGTCTTGGAGGGTAGAGAGCTTTCATGGC
AATACCATCAATGAGTGGTCCACAAGCTGGATCTTCTTCTTGACCTGGATTATGAATCAC
TATCTCTGCAATCTCACTCTCAGCCTGAAACGCCCAAGAGTATAGATCCCATCCACTGCT
ACTATACACCGTCTGCACTGGAATCACCCCCGAGTCAGGTGCCACAGAGATGTTGAGCTT
TTCGTCCTGAGCACACGTCCTAGCAGCGCTGAAAGTGAGCGAGTAATACATCCCTTTCAC
CACGATGAGTCTTTGCTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DP71JQ U 1
AF RR4DP27JQ U 1
AF RR4B480JQ U 55
AF RR4DP27TF C 387
AF RR4DP71TF C 389
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AGCCACTAGCTCAATGGCTCTGCGACCTTGTGGAATTGAGAAGTGTTCTGTGTCTACGTA
CTT

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TTGTGAAAAAACCTTTCCATAAAGGCTTACATACATAAGAAAATGGCAACCATCTTTTGC
CTTCTCGTGCAAGAAAGGCACACATATAACCCTAGATGAACCTCTCCTTTTACAACTATA
TATTTTGAATAAAAATCAAAAACACACCAAAAAAGACAATATTATAAAAATAAAGCCCAA
ACACATTCCACCTCTTGTGGTATATAAGGTTTCGTTCATCTACTTACGAGCGCTTATAAG
CTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAAAGACGAAAAATCATCGCTCCTCATAGCATA
GAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAATCGCGACAAACCTGATGGAAGC
TCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGTACCTTAAGCGTATCTCTTCCCGC
AAAAGCTTCGACAACCATTGAGCCTTTGCAAGCGTTGTTAGCGTCTCCTACCGCAAAGGA
CAGGACATAAGTCTTTCCAACGATGGTCCGAGCAACTTGAGCGATGGCGCTCTCTTTGCC
AGCCACTAGCTCAATGGCTCTGCGACCTTGTGGAATTGAGAAGTGTTCTGTGTCTACGTA
CTTGACGGCTTTGAGAGAATCGACCATCCAACCGGGTAGAGGAGAGTGGTCGTCTTCTAT
GAACGGCGGGATCAAAACTCCTGTTGTTGAGCCTGGTAGTACTAGTGGACCTTCTTCAAA
TCCTCCG

QA 1 787 1 787
DS 

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TTTTGCCTTCTCGTGCAAGAAAGGCACACATATAACCCTAGATGAACCTCTCCTTTTACA
ACCATATATTTTGAATAAAAATCAAAAACACACCAAAAAAGACAATATTATAAAAATAAA
GCCCAAACACATTCCACCTCTTGTGGTATATAAGGTTTCGTTCATCTACTTACGAGCGCT
TATAAGCTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAAAGACGAGAAATCATCGCTCCTCAT
AGCATAAAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAATCGCGACAAACCTGAT
GGAAGCTCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGTACCTTAAGCGTATCTCT
TCCCGCAAAAGCTTCGACAACCATTGAGCCTTTGCAAGCGTTGTTAGCGTCTCCTACCGC
AAAGGACAGGACATAAGTCTTTCCAACGATGGTCCGAGCAACTTGAGCGATGGCGCTCTC
TTTGCCAGCCACTAGCTCAATGGCTCTGCGACCTTGTGGAATTGAGAAGTGTTCTGTGTC
TACGTACTTGACGGCTTTGAGAGACTCGACCATCCAACCGGGTAGAGGAGAGTGGTCGTC
TTCTATGAACGGCGGGATCAAAACTCCTGTTGTTGAGCCTGGTAGTACTAGTGGACCTTC
TTCAAATCCTCCGTTTTTCAAAATGTTCTTGTTGGTTGGTCTTGGAGGGTAGAGAGCTTT
CATGGCAATACCATCAATGAGTGGTCCACAAGCTGGATCTTCTTCTTGACCTGGATTATG
AATCACTATCTCTGCAATCTCACTCTCAGCCTGAAACGCCCAAGAGTATAGATCCCATCC
ACTGCTACTATACACCGTCTGCAC

QA 1 924 1 924
DS 

RD RR4DP27TF 713 0 0
AGTC
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TGGAATTGAGAAGTGTTCTGTGTCTACGTACTTGACGGCTTTGAGAGAATCGACCATCCA
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GAAAGTGAGCGAGTAATACATCCCTTTCACCACGATGAGTCTTTGCTTC

QA 5 713 5 713
DS 

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TC
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AGCGTTGTTAGCGTCTCCTACCGCAAAGGACAGGACATAAGTCTTTCCAACGATGGTCCG
AGCAACTTGAGCGATGGCGCTCTCTTTGCCAGCCACTAGCTCAATGGCTCTGCGACCTTG
TGGAATTGAGAAGTGTTCTGTGTCTACGTACTTGACGGCTTTGAGAGAATCGACCATCCA
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GCCTGGTAGTACTAGTGGACCTTCTTCAAATCCTCCGTTTTTCAAAATGTTCTTGTTGGT
TGGTCTTGGAGGGTAGAGAGCTTTCATGGCAATACCATCAATGAGTGGTCCACAAGCTGG
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CGAGTCAGGTGCCACAGAGATGTTGAGCTTTTCGTCCTGAGCACACGTCCTAGCAGCGCT
GAAAGTGAGCGAGTAATACATCCCTTTCACCACGATGAGTCTTTGCTTC

QA 3 711 3 711
DS 



AS 1 5

CO CL2028Contig1 1069 5 4 U
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GAAAAATGGAGGAGCGGTTTTCTATGACCTGCGATAATTAACCGGAGGATATCGCTTTGT
AGCCTTCCTTTTCTAATAACTTTGCCAAGGACCTGTCTCCGGTTTTAATGATTCTTCCAT
TCTCCATGATATGTATGAGTGTTGGTTTGATGTAGTCAAGTAGGCGTTGATAGTGGGTTA
TCATCAGAACCGAGTTTTTT*GGGGTTAAAAGCCCATTCACCGCCTTTGCCACATCTTGA
AGAGCATCAACATCCAACCCTGAATCTATCTCGTCGAGTATAGCCAACTCTGCTCCGAGG
ACCGCTAACTGTAGAATCTCATTGCGTTTCCTTTCACCACCACTAAACCCTTCATTGACA
TTCCGGTTCAGAAAATCCGTCTTCATATTCACAACTTCAAGTTTTGATACTAAGTGGCTG
TAGAACTGGATTGGATCAAGCTCTGGCTGACCAAGCTTCCTTTTGCGAGCATTGAAAGCC
ATATTCAAGAAATCCATATTGCTAACACCAGGGATCTCAACTGGGGACTGGAAACTCATA
AACAAACCAGCAAGAGATCTTTCCTCAGGTTCCATATCAAGAAGATTCTTCCCTTTAAAC
ACAATACTCCCTCCCGTCACTTCATAATCAGGATGACCAACAAGAACCTTAGAGAATGTG
CTCTTCCCTGAACCATTCTTCCCCATCACTGCGTGTATCTCTCCTTCGTAGACAACCAAG
TTGACTCCCTTTAGTATCTCTTGCCTCGATTCAACAATCACAGCTCTCAGATCCTTCACC
TCGAGCAAAGGCATCCTCCTTCCCGCTTCGTCTCCATCTCCCGCCAACGAACCCGAGGAG
GTGGAAGAACTGACGGGAGCCGCGGAAACAGTGTTTGAGCGGCGAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BQ60JQ U 14
AF RR4B673JQ U 1
AF RR4GQ30JQ U 14
AF RR4BQ60TF C 300
AF RR4B673TF C 292
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RD RR4BQ60JQ 689 0 0
G
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AACCAATGAAGCCAAAAAAAGCCTACCGGTCAAAAGATTGTTTCAAGAAAAATGGAGGAG
CGGTTTTCTATGACCTGCGATAATTAACCGGAGGATATCGCTTTGTAGCCTTCCTTTTCT
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ATGAGTGGTGGTTTGATGTAGTCAAGTAGGCGTTGATAGTGGGTTATCATCAGAACCGAG
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AATCTCATTGCGTTTCCTTTCACCACCACTAAACCCTTCATTGACATTCCGGTTCAGAAA
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CATATTGCTAACACCAGGGATCTCAACT

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TAGTTTGTCATGCAAACCAATGAAGCCAAAAAAAGCCTACCGGTCAAAAGATTGTTTCAA
GAAAAATGGAGGAGCGGTTTTCTATGACCTGCGATAATTAACCGGAGGATATCGCTTTGT
AGCCTTCCTTTTCTAATAACTTTGCCAAGGACCTGTCTCCGGTTTTAATGATTCTTCCAT
TCTCCATGATATGTATGAGTGTTGGTTTGATGTAGTCAAGTAGGCGTTGATAGTGGGTTA
TCATCAGAACCGAGTTTTTT*GGGGTTAAAAGCCCATTCACCGCCTTTGCCACATCTTGA
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ACCGCTAACTGTAGAATCTCATTGCGTTTCCTTTCACCACCACTAAACCCTTCATTGACA
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TAGAACTGGATTGGATCAAGCTCTGGCTGACCAAGCTTCCTTTTGCGAGCATTGAAAGCC
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AACAAACCAGCAAGAGATCTTTCC

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G
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ACTGTTCATAAACGATACATTAAAAAAAACAAATACAATAGTTTCATAGTTTGTCATGCA
AACCAATGAAGCCAAAAAAAGCCTACCGGTCAAAAGATTGTTTCAAGAAAAATGGAGGAG
CGGTTTTCTATGACCTGCGATAATTAACCGGAGGATATCGCTTTGTAGCCTTCCTTTTCT
AATAACTTTGCCAAGGACCTGTCTCCGGTTTTAATGATTCTTCCATTCTCCATGATATGT
ATGAGTGTTGGTTTGATGTAGTCAAGTAGGCGTTGATAGTGGGTTATCATCAGAACCGAG
TTTTTTTGGGGTTAAAAGCCCATTCACCGCCTTTGCCACATCTTGAAGAGCATCAACATC
CAACCCTGAATCTATCTCGTCGAGTATAGCCAACTCTGCTCCGAGGACCGCTAACTGTAG
AATCTCATTGCGTTTCCTTTCACCACCACTAAACCCTTCATTGACATTCCGGTTCAAAAA
ATCCGTCTTCATATTCACAACTTCAAGTTTTGATACTAAGTGGCTGTAGAACTGGATTGG
ATCAAGCTCTGGCTGACCAAGCTTCCTTTTGCGAGCATTGAAAGCCATATTCAAGAAATC
CATATTGCTAACACCAGGGATCTCAACTGGGGACTGGAAACTCATAAACAAACCAGCAAG
AGATCTTTCC

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ATCATCAGAACCGAGTTTTTT*GGGGTTAAAAGCCCATTCACCGCCTTTGCCACATCTTG
AAGAGCATCAACATCCAACCCTGAATCTATCTCGTCGAGTATAGCCAACTCTGCTCCGAG
GACCGCTAACTGTAGAATCTCATTGCGTTTCCTTTCACCACCACTAAACCCTTCATTGAC
ATTCCGGTTCAGAAAATCCGTCTTCATATTCACAACTTCAAGTTTTGATACTAAGTGGCT
GTAGAACTGGATTGGATCAAGCTCTGGCTGACCAAGCTTCCTTTTGCGAGCATTGAAAGC
CACATTCAAGAAATCCATATTGCTAACACCAGGGATCTCAACTGGGGACTGGAAACTCAT
AAACAAACCAGCAAGAGATCTTTCCTCGGGTTCCATATCAAGAAGATTCTTCCCTTTAAA
CACAATACTCCCTCCCGTCACTTCATAATCAGGATGACCAACAAGAACCTTAGAGAATGT
GCTCTTCCCTGAACCATTCTTCCCCATCACTGCGTGTATCTCTCCTTCGTAGACAACCAA
GTTGACTCCCTTTAGTATCTCTTGCCTCGATTCAACAATCACAGCTCTC

QA 1 649 1 649
DS 

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AGTGGGTTATCATCAGAACCGAGTTTTTT*GGGGTTAAAAGCCCATTCACCGCCTTTGCC
ACATCTTGAAGAGCATCAACATCCAACCCTGAATCTATCTCGTCGAGTATAGCCAACTCT
GCTCCGAGGACCGCTAACTGTAGAATCTCATTGCGTTTCCTTTCACCACCACTAAACCCT
TCATTGACATTCCGGTTCAGAAAATCCGTCTTCATATTCACAACTTCAAGTCTTGATACT
AAGTGGCTGTAGAACTGGATTGGATCAAGCTCTGGCTGACCAAGCTTCCTTTTGCGAGCA
TTGAAAGCCATATTCAAGAAATCCATATTGCTAACACCAGGGATCTCAACTGGGGACTGG
AAACTCATAAACAAACCAGCAAGAGATCTTTCCTCAGGTTCCATATCAAGAAGATTCTTC
CCTTTAAACACAATACTCCCTCCCGTCACTTCATAATCAGGATGACCAACAAGAACCTTA
GAGAATGTGCTCTTCCCTGAACCATTCTTCCCCATCACTGCGTGTATCTCTCCTTCGTAG
ACAACCAAGTTGACTCCCTTTAGTATCTCTTGCCTCGATTCAACAATCACAGCTCTCAGA
TCCTTCACCTCGAGCAAAGGCATCCTCCTTCCCGCTTCGTCTCCATCTCCCGCCAACGAA
CCCGAGGAGGTGGAAGAACTGACGGGAGCCGCGGAAACAGTGTTTGAGCGGCGAGTGC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 2 4

CO CL2029Contig1 697 2 1 U
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CCAGAGTCCTCGACATTGATCTCCAGAAACAGCTCAGACCTTACATGGAGCGCATGGTCC
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BQ
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AF RR4GK94TF U 1
AF RR4DT12TF U 1
BS 1 697 RR4DT12TF

RD RR4GK94TF 297 0 0
GGGT
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AGTCCTCGACATTGATCTCCAGAAACAGCTCAGACCTTACATGGAGCGCATGGTCCCTCT
CCCTGGTGTCTACGACCCTGACTTCATCGCTGCGAACCAAGGGTCACGTGCTAATAGCGT
GATCAAAGGTACCAAGAAAGAACAAGTTGATCACATCATCAAGGACATGAGGGATTTTAA
GGAGAAGAACAAAGTGGATAAGCTAGTTGTGT*ATGGACAGCCAACACGGAGC

QA 5 297 5 297
DS 

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CCAGAGTCCTCGACATTGATCTCCAGAAACAGCTCAGACCTTACATGGAGCGCATGGTCC
CTCTCCCTGGTGTCTACGACCCTGACTTCATCGCTGCGAACCAAGGGTCACGTGCTAATA
GCGTGATCAAAGGTACCAAGAAAGAACAAGTTGATCACATCATCAAGGACATGAGGGAGT
TTAAGGAGAAGAACAAAGTGGATAAGCTAGTTGTGTTATGGACAGCCAACACGGAGCGTT
ACAGCGATGTGGATGTAGGGCTTAATGACACGATGGAGAATCTATTGGCTTCTGTTGAGA
AGAACGAGTCTGAGATCTCGCCTTCTACGCTTTATGCTATCGCTTGTGTTCTTGAAGGCG
TCCCTTTCATCAATGGGAGTCCTCAGAATACTTTTGTCCGGGGGCTTATAGAGCTTTCTA
TATCGAGGAACTGCTTGATTGGTGGGGATGATTTCAAGAGTGGTCAGACTAAGATGAAAT
CTGTTTTGGTTGATTTTCTTGTTGGAGCTGGTATCAAGCCTACTTCAATTGTGAGTTACA
ATCACTTGGGAAACAACGATGGGATGAACCTCTCAGCGCCGCAGACTTTCCGGTCCAAGA
GATTTCAAAGAGTAATGTTGTTGACGACATGGTGGCC

QA 1 697 1 697
DS 



CO CL2029Contig2 704 2 5 U
AATAAAAATAGAGAAAGTTTGATATAACACAAGGAGGCATAAACATAGTTACTCTTTAAG
TCTATTACACATTTGATCCAAAAGCTTAGCTAACCTTCCCAGATCATTATCACACAAATT
ACCCATAACCATCTCCATCTTCTCCCACTTCACATAAACAAAAACAATGGAGCATTCATA
AAAAGTCTCATATCCTAAAACTCTTCGTCCTCCCTGACCTTCACTTGTACTCCAAGATCA
TGTTGTTCTCTGGCGCAAGCCCAACGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATAGCCCTCA
GCTTCGACAGAGCGTTTACCACCGGTGTCCCAGGCGGTACAAGAGGTGCCTTTGTGAGGT
AACTGAGTATTGTTGCTACTGGGTGGAACGAGTGGAACTTCCCCTCCCCTTCGGCTTTGA
ATTGGATTCTGGTGCTGAGTTCGGCGAGAAGAACAAGATCCAAGATGATTGGAGCAGCCA
AAAGAGAATCCTCACAGGTGTTATGCATAACAATCGTATTCTTCCCTCCCATGAATATCT
CAGAGGTGTACTCATCCATGGCTCTCTTACTATACGCAACATATGGTACATACTTGATGA
CAACGACGTGGTCAGGATGTTCACCAGGCTCAAAGAGGATACCATTACTAGCCACCATGT
CGTCAACAACATTACTCTTTGAAATCTCCTTGGACCGGAAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT12JQ U 34
AF RR4GK94JQ U 1
BS 1 299 RR4GK94JQ
BS 300 300 RR4DT12JQ
BS 301 573 RR4GK94JQ
BS 574 574 RR4DT12JQ
BS 575 704 RR4GK94JQ

RD RR4DT12JQ 580 0 0
GG
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TTCCCAGATCATTATCACACAAATTACCCATAACCATCTCCATCTTCTCCCACTTCACAT
AAACAAAAACAATGGAGCATTCATAAAAAGTCTCATATCCTAAAACTCTTCGTCCTCCCT
GACCTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCTGGCGCAAGCCCAACGCAGGCCCTA
AGAATGTTCTCCAGCATAGCCCTCAGCTTCGACAGAGCGTTTACCACCGGTGTCCCAGGC
GGTACAAGAGGTGCCTTTGTGAGGTAACTGAGTATTGTTGCTACTGGGTGGAACGAGTGG
AACTTCCCCTCCCCTTCGGCTTTGAATTGGATTCTGGTGCTGAGTTCGGCGAGAAGAACA
AGATCCAAGATGATTGGAGCAGCCAAAAGAGAATCCTCACAGGTGTTATGCATAACAATC
GTATTCTTCCCTCCCATGAATATCTCAGAGGTGTACTCATCCATGGCTCTCTTACTATAC
GCAACATATGGTACATACTTGATGACAACGACGTGGTC

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR4GK94JQ 704 0 0
AATAAAAATAGAGAAAGTTTGATATAACACAAGGAGGCATAAACATAGTTACTCTTTAAG
TCTATTACACATTTGATCCAAAAGCTTAGCTAACCTTCCCAGATCATTATCACACAAATT
ACCCATAACCATCTCCATCTTCTCCCACTTCACATAAACAAAAACAATGGAGCATTCATA
AAAAGTCTCATATCCTAAAACTCTTCGTCCTCCCTGACCTTCACTTGTACTCCAAGATCA
TGTTGTTCTCTGGCGCAAGCCCAACGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATAGCCCTCT
GCTTCGACAGAGCGTTTACCACCGGTGTCCCAGGCGGTACAAGAGGTGCCTTTGTGAGGT
AACTGAGTATTGTTGCTACTGGGTGGAACGAGTGGAACTTCCCCTCCCCTTCGGCTTTGA
ATTGGATTCTGGTGCTGAGTTCGGCGAGAAGAACAAGATCCAAGATGATTGGAGCAGCCA
AAAGAGAATCCTCACAGGTGTTATGCATAACAATCGTATTCTTCCCTCCCATGAATATCT
CAGAGGTGTACTCATCCATGGCTCTCTTACTATCCGCAACATATGGTACATACTTGATGA
CAACGACGTGGTCAGGATGTTCACCAGGCTCAAAGAGGATACCATTACTAGCCACCATGT
CGTCAACAACATTACTCTTTGAAATCTCCTTGGACCGGAAAGTC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 5

CO CL2030Contig1 1039 5 10 U
GGAGAGACAATTAATCAGTTTTGTGTGTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGATCTTCAAAGAGA
TTTAACATCTCAAACGCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTAC
TGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAG
GCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAA
ATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCT
GCCGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCG
GCTGTGATGAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTG
AAAGAAGCTGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTC
GAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAA
GTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAA
ACCGAAGAAACAAGTGGCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCA
ACCGCGGTCGTTGAGGAGAAGAAACCTGAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTC
GTCGAAGAAGTGAAAAAGGAAGAAGCTGCTCCAACTCCAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACT
CCGGTTACGGCACCAGCTGAGACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGAGCCACCGAAGCCT
TGATTCGTTTCAAGATGGTACGGTTTGCTTTATCCTGTATGAAAACATCTTTGTACGTGA
CAAAAAGTGAAAGGAACAAAAAAAAAAAACTATTTTCATTCTTTTTATTTTATTTGGTTT
GTCTTTGTGTGGATAAATCTCTGTTTCTGGAAGTCGTTGATGTGTTGTTTATTTGTATTC
ATTTGAATTTGTAAAAAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN24TF U 2
AF RR4CE06TF U 89
AF RR4BA09TF U 1
AF RR4FN24JQ C 257
AF RR4BA09JQ C 311
BS 1 425 RR4BA09TF
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BS 438 735 RR4BA09TF
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BS 928 929 RR4BA09JQ
BS 930 1039 RR4FN24JQ

RD RR4FN24TF 702 0 0
GG
GAGACAATTAATCAGTTTTGTGTGTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGATCTTCAAAGAGATTT
AACATCTCAAACGCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGG
AATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAGGCT
GTTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATT
GAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCTGCC
GAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCT
GTGATGAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAA
GAAGCTGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAG
AAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTG
AAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACC
GAAGAAACAAGTGGCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCAACC
GCGGTCGTTGAGGAGAAGAAACCTGAAGTAGAAAAGGAGG

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR4CE06TF 607 0 0
GTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCA
AGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAGGCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCT
TTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAAC
CAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCTGCCGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACC
CTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGATGAAATATCTCGAGGCTCTTG
TCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAAGCTGCCTCTAGCTTCGGAGCTG
GCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGG
AGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCG
AGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGAAACAAGTGGCGAGAAGGAGA
TTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCAACCGCGGTCGTTGAG*AGA*GAAACCTG
AAGTAGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4BA09TF 735 0 0
GGAGAGACAATTAATCAGTTTTGTGTGTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGATCTTCAAAGAGA
TTTAACATCTCAAACGCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTAC
TGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAG
GCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAA
ATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCT
GCCGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCG
GCTGTGATGAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTG
AAAGAGGCTGCCTCTATCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTC
GAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAA
GTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAA
ACCGAAGAAACAAGTGGCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCA
ACCGCGGTCGTTGAGGAGAAGAAACCTGAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTC
GTCGAAGAAGTGAAA

QA 1 735 1 735
DS 

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TGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGATGAAATATC
TCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAAGCTGCCTCTA
GCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGTATGTGTGT
TCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAACCGAAGAAC
CAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGAAACAAGTG
GCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCAACCGCGGTCGTTGAGG
AGAAGAAACCTGAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAGTGAAAA
AGGAAGAAGCTGCTCCAACTCCAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACTCCGGTTACGGCACCAG
CTGAGACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGAGCCACCGAAGCCTTGATTCGTTTCAAGAT
GGTACGGTTTGCTTTATCTTGTATGAAAACATCTTTGTACGTGACAAAAAGTGAAAGGAA
CAAAAAAAAAA**CTATTTTCATTCTTTTTATTTTATTTGGTTTGTCTTTGTGTGGATAA
ATCTCTGTTTCTGGAAGTCGTTGATGTGTTGTTTATTTGTATTCATTTGAATTTGTAAAA
AAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4BA09JQ 722 0 0
AGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGATGA
AATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAGGCTG
CCTCTATCTTCGGAGCTGGCTATGTTTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGTAT
GTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAACCG
AAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGAAA
CAAGTGGCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCAACCGCGGTCG
TTGAGGAGAAGAAACCTGAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAG
TGAAAAAGGAAGAAGCTGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACTCCGGTTACGG
CACCAGCTGAGACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGAGCCCCCGAAGCCTTGATTCGTTT
CAAGATGGTACGGTTTGCTTTATCCTGTATGAAAACATCTTTGTACGTGACAAAAAGTGA
AAGGAACAAAAAAAAAAAACTATTTTCATTCTTTTTATTTTATTTGGTTTGTCTTTGTGT
GGATAAATCTCTGTTTCTGGAAGTCGTTGATGTGTTGTTTATTTGTATTCATTTGAATTT
GT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 2 4

CO CL2031Contig1 1002 2 4 U
GGCTCCTCCCTTTGAACTGTAGCGGCAGTTTGAACTCTGCCATCATCAGAAGATGTGATA
ACAAGATCTCTTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAACAGGACTTTTTCATGAGGCAAGCTC
CCACTGACCAGACTAGCGGCGGTGGCATCACTTTGAAGAACTCTGTCATTAGAAGAGGTG
ACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGCACAGGGTCTTTTTATGAGGCAGG
CTTCAACTGATGATATGAACGCTGCATCTACCAAGTGCTCTGCCACCAAAACGAATGGCT
TGTCTTCTTCACAACAACCATTGCTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTCCA
AAGCTGCCGCAAAAGATGAGTTCTTTGTTTCTTTTGATTCACCATGTCAGCAAAAGGAAG
ACTTGGAAAAGCCATACACGCCTGACCTTCCCAAGTTAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGT
CTCCGAGATCGAATGTTGAAGAGTATGAACATAACTATGTTGTGGCTGTAGAGCTACCAG
GGGCTAGTATCAATGATATAAGAGTTGAGGTCGACAACCTAAACTTGACTGTGACAGGTA
GACGCACAGCTGTCTGTCAAAAAGTTGGTGGATGCACCAAAGGTTCAATGTATCATCACA
AGCAAGAAATACTACAAGGACCATTCAATGCTTCCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACA
AGGATAACGTTGCTGCTGAATTTATGGATGGGATTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTTT
AAGGGTTAATCGTTCTGGAACCATATACAAAACAGTAAATAATGTTGTATAATATATGGT
GTTTGTGTGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCAATAATTGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTG
GTCTTTATTTATCATAGATTGCAGACAGGCATGCTCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAA
CAATCCATTAATATAAGAATAAAATAAAGCTTGATTACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D085TF U 1
AF RR4D085JQ C 488
BS 1 582 RR4D085TF
BS 583 583 RR4D085JQ
BS 584 674 RR4D085TF
BS 675 1002 RR4D085JQ

RD RR4D085TF 674 0 0
GGCTCCTCCCTTTGAACTGTAGCGGCAGTTTGAACTCTGCCATCATCAGAAGATGTGATA
ACAAGATCTCTTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAACAGGACTTTTTCATGAGGCAAGCTC
CCACTGACCAGACTAGCGGCGGTGGCATCACTTTGAAGAACTCTGTCATTAGAAGAGGTG
ACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGCACAGGGTCTTTTTATGAGGCAGG
CTTCAACTGATGATATGAACGCTGCATCTACCAAGTGCTCTGCCACCAAAACGAATGGCT
TGTCTTCTTCACAACAACCATTGCTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTCCA
AAGCTGCCGCAAAAGATGAGTTCTTTGTTTCTTTTGATTCACCATGTCAGCAAAAGGAAG
ACTTGGAAAAGCCATACACGCCTGACCTTCCCAAGTTAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGT
CTCCGAGATCGAATGTTGAAGAGTATGAACATAACTATGTTGTGGCTGTAGAGCTACCAG
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GACGCACAGCTGTCTGTCAAAAAGTTGGTGGATGCACCAAAGGTTCAATGTATCATCACA
AGCAAGAAATACTA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4D085JQ 515 0 0
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AGCTGTCTGTCAAAAAGTTGGTGGATGCACCAAAGGTTCAATGTATCATCACAAGCAAGA
AATACTACAAGGACCATTCAATGCTTCCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAAGGATAA
CGTTGCTGCTGAATTTATGGATGGGATTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTTTAAGGGTT
AATCGTTCTGGAACCATATACAAAACAGTAAATAATGTTGTATAATATATGGTGTTTGTG
TGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCAATAATTGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTGGTCTTTA
TTTATCATAGATTGCAGACAGGCATGCTCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAACAATCCA
TTAATATAAGAATAAAATAAAGCTTGATTACAACT

QA 1 515 1 515
DS 



CO CL2031Contig2 1146 2 4 U
GGACACATCCAAGAGAGAGAGAGAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTAGGCGCAGA
CTCGCCACCGTCGCCGCTCACTTCCCGTTAGCCACCACCACCAACGATCCCGTCTCCTCC
CCATCGCTCGTCCCTTTGAACTGTAGCGGTAGTTTGAACTCTGCCATCATCAGAAGATGT
GACAACAAGATCTCTTTTGCTCGACAAGCATCTTCTGAACAGGGCTTTTTCATGAGGCAG
GCTCCCACTGACCAGCAGACTAGCGGCGGTGGCATCACTTTGAAGAACTCTGTCATTAGA
AGAGGTGACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCGTCCTCTGCACAGGGTCTTTTCATG
AGGCAGGCTTCAACTGATGATACGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCAAGTGCTCT
GCGACCAAAACTGATGGCTTCTCTTCTTCTTCACAACTACCATTGCTTTCCAGACCTGAG
TACGCCCCACCACAGTTTTCCAAGGCCTCCGCAAAAGACGAGTTCTTTGTTTCTTTTGAT
TCGCCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGGAAAAGCCATACAAGCCTGACCTTCCTAAGTTA
GCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCGAATGTTGAAGAGTATGAACATAACTAT
GTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCTAGTATCAATGATATAAGAGTTGAGGTCGACAAC
CTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACATCCGTCTGTCAAAAAGTTGATGCATGCACC
AACGGTTCAATCTTTGGATATCACAAGCACGAAATACTACAAGGTCCATTCAAAGTTTCC
TGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAAGGATGACGTTGGTGCTGAATTTATGGGTGGGATT
CTGAGAATAGCGATTCCAAAGCTCTGAGAGTTCATCGTTCTGGAACCATATACAAAACGG
TAAATAATGTTGTATAAATATATGGTGTTTGTGTGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCAATAAG
TGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTGGTCTTTATTTATCATAGATTGCAGACAGGCATGC
TCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAACAATCCATTAATATAAGAAAAAAATAAAGCTTGA
TTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4D383TF U 1
AF RR4D383JQ C 420
BS 1 739 RR4D383TF
BS 740 740 RR4D383JQ
BS 741 764 RR4D383TF
BS 765 1146 RR4D383JQ

RD RR4D383TF 768 0 0
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CCATCGCTCGTCCCTTTGAACTGTAGCGGTAGTTTGAACTCTGCCATCATCAGAAGATGT
GACAACAAGATCTCTTTTGCTCGACAAGCATCTTCTGAACAGGGCTTTTTCATGAGGCAG
GCTCCCACTGACCAGCAGACTAGCGGCGGTGGCATCACTTTGAAGAACTCTGTCATTAGA
AGAGGTGACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCGTCCTCTGCACAGGGTCTTTTCATG
AGGCAGGCTTCAACTGATGATACGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCAAGTGCTCT
GCGACCAAAACTGATGGCTTCTCTTCTTCTTCACAACTACCATTGCTTTCCAGACCTGAG
TACGCCCCACCACAGTTTTCCAAGGCCTCCGCAAAAGACGAGTTCTTTGTTTCTTTTGAT
TCGCCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGGAAAAGCCATACAAGCCTGACCTTCCTAAGTTA
GCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCGAATGTTGAAGAGTATGAACATAACTAT
GTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCTAGTATCAATGATATAAGAGTTGAGGTCGACAAC
CTAAACTTGACTGTGACAG*TAGACGCACATCCGTCTGTCAAAA
GTGA

QA 1 764 1 764
DS 

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GTACGCCCCACCACAGTTTTCCAAGGCCTCCGCAAAAGACGAGTTCTTTGTTTCTTTTGA
TTCGCCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGGAAAAGCCATACAAGCCTGACCTTCCTAAGTT
AGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCGAATGTTGAAGAGTATGAACATAACTA
TGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCTAGTATCAATGATATAAGAGTTGAGGTCGACAA
CCTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACATCCGTCTGTCAAAAAGTTGATGCATGCAC
CAACGGTTCAATCTTTGGATATCACAAGCACGAAATACTACAAGGTCCATTCAAAGTTTC
CTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAAGGATGACGTTGGTGCTGAATTTATGGGTGGGAT
TCTGAGAATAGCGATTCCAAAGCTCTGAGAGTTCATCGTTCTGGAACCATATACAAAACG
GTAAATAATGTTGTATAAATATATGGTGTTTGTGTGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCAATAA
GTGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTGGTCTTTATTTATCATAGATTGCAGACAGGCATG
CTCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAACAATCCATTAATATAAGAAAAAAATAAAGCTTG
ATTACAT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 4

CO CL2032Contig1 697 2 7 U
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AGGAATGAAAAACAATCCTTGCAAAATCTCACACGACCCTTTTTCTAAAGAGAAAGGAAG
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TTTTAAAAAGCATTGAACTTGGGAGTAGAAAGAGGAGGAGCACTTCCACTCTTCTTCTAA
ATTTTCTGAAGAGTCATTCACTCTCTTCACACCTTTCTTCACACCTTTCTTCAACCCTTC
TATATTCACCCGAAAAAGCAAAATGAAAATAAAAAAAGACCAAACCTTTAAACCTTCTTG
ACGAAACAGAGGGAAAAACCAACACTTTCTTCTTCTTCTTCTCACGACCTATACACACTG
TGATTCCTTTTGAAGTAGTTGTTGTCCGGTCAAGCCAAAGTGTAGCTTGAAACCGCGACG
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BQ
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AF RR4CD95JQ U 46
AF RR4CD95TF C 1
BS 1 46 RR4CD95TF
BS 47 282 RR4CD95JQ
BS 283 283 RR4CD95TF
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BS 308 308 RR4CD95TF
BS 309 337 RR4CD95JQ
BS 338 697 RR4CD95TF

RD RR4CD95JQ 292 0 0
T
TTTTTTGAGGTACAAGGAATGAAAAACAATCCTTGCAAAATCTCACACGACCCTTTTTCT
AAAGAGAAAGGAAGATCTCACAAAACACTATCCTTCTTTCTATCTTCCTCTCTCTCTCAC
TTTGTATATATAAATTTTAAAAAGCATTGAACTTGGGAGTAGAAAGAGGAGGAGCACTTC
CACTCTTCTTCTAAATTTTCTGAAGAGTCATTCACTCTCTTCACACCTTTCTTCACCCCT
TTCTTCAACCCTTCTATATTCCCCCGAAAAAGCAAAATGAAAATAAAAAAA

QA 2 292 2 292
DS 

RD RR4CD95TF 697 0 0
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AGGAATGAAAAACAATCCTTGCAAAATCTCACACGACCCTTTTTCTAAAGAGAAAGGAAG
ATCTCACAAAACACTATCCTTCTTTCTATCTTCCTCTCTCTCTCACTTTGTATATATAAA
TTTTAAAAAGCATTGAACTTGGGAGTAGAAAGAGGATGAGCACTTCCACTCTTCTTCTAA
ATTTTCTGAAGAGTCATTCACTCTCTTCACACCTTTCTTCACACCTTTCTTCAACCCTTC
TATATTCACCCGAAAAAGCAAAATGAAAATAAAAAAAGACCAAACCTTTAAACCTTCTTG
ACGAAACAGAGGGAAAAACCAACACTTTCTTCTTCTTCTTCTCACGACCTATACACACTG
TGATTCCTTTTGAAGTAGTTGTTGTCCGGTCAAGCCAAAGTGTAGCTTGAAACCGCGACG
TTTGCGGGAGATGTTGAGTGAATGTAGACGAACTCTAGGGACTTCCCGGATTGCAATGAG
TGCATCCAGGAAGGTAAACCGAACGAGTTTCCTGATCTAGAGAGTCCCCAGATTGGTCCG
TAGAGATTCTTGATCGAAAGGTTAAGACTTTTCAGAGGTCTAGGTGATTTGTTAATAACA
GTCGTTGAGTATCTGTAGTAAGTCCTTCCCTTTGACC

QA 1 697 1 697
DS 



CO CL2032Contig2 818 2 2 U
AATGCCTATTCGTAAACCGAGAGCGACTTCCCCGGTCCGAGCTTCTGGTCCAGTGGCTAT
AGTTCAGAAGATGACAGGTTCATGGGTGTCAAAGGGAAGGACTTACTACAGATACTCAGC
AACTGTGATTAACAAATCACCTAGACCTCTGAAAAGTCTTAACCTTTCGATCAAGAATCT
CTACGGACCAATCTGGGGACTCTCTAGATCAGGAAACTCATTTGGTTTACCTTCCTGGAT
GCACTCATTGCAATCCGGAAAGTCCCTAGAGTTCGTCTACATTCACTCAACATCTCCCGC
AAACGTCGCGGTTTCAAGCTACACTTTTGGCTTGACCAGACAACATCTACTTCAAAAGGA
ATCACAGTGTGTATAGGTCGTGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGTGTTGGTTTTTCCCTC
TGGTTCGTCAAGAAAGTTTAAAGGTTTGGTCTTTTTATCTTCATTTTGCATTTTGGGGTG
AATTAAAGGGTTGAAGAAGGGTGGAAGAAAGGTGTGAAGAGAGTGAATCACTCTTCAGAA
AATTTAAAGAAGAGTGAAAGTGCTCATCCCCTTTCTACTCCGAAGTTCAATGCTTTTTTT
AAAATCTACGTATAAATATATATAGTGCGAGAGAGAGAGTGAGGAAGATAGAAAGAAAGA
TAGCGTCTTGTGAGAATTTGCAAGGATTGTTTTTTTCATTCCTTGTAGCTCAAAAAACAT
GTGCATGCCTTTGTCTTTTTGTGTGTTTTATCCTTCTTGGTGGTCAGTTGTAAAACTCAA
CAACAGTCCTTAAATGAAATGTGATATGGTTATTAGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK55TF U 1
AF RR4CK55JQ C 15
BS 1 386 RR4CK55TF
BS 387 818 RR4CK55JQ

RD RR4CK55TF 386 0 0
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AGTTCAGAAGATGACAGGTTCATGGGTGTCAAAGGGAAGGACTTACTACAGATACTCAGC
AACTGTGATTAACAAATCACCTAGACCTCTGAAAAGTCTTAACCTTTCGATCAAGAATCT
CTACGGACCAATCTGGGGACTCTCTAGATCAGGAAACTCATTTGGTTTACCTTCCTGGAT
GCACTCATTGCAATCCGGAAAGTCCCTAGAGTTCGTCTACATTCACTCAACATCTCCCGC
AAACGTCGCGGTTTCAAGCTACACTTTTGGCTTGACCAGACAACATCTACTTCAAAAGGA
ATCACAGTGTGTATAGGTCGTGAGAA

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4CK55JQ 804 0 0
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CAGGTTCATGGGTGTCAAAGGGAAGGACTTACTACAGATACTCAGCAACTGTGATTAACA
AATCACCTAGACCTCTGAAAAGTCTTAACCTTTCGATCAAGAATCTCTACGGACCAATCT
GGGGACTCTCTAGATCAGGAAACTCATTTGGTTTACCTTCCTGGATGCACTCATTGCAAT
CCGGAAAGTCCCTAGAGTTCGTCTACATTCACTCAACATCTCCCGCAAACGTCGCGGTTT
CAAGCTACACTTT*GGCTTGACCAGACAACATTTACTTCAAAAGGAATCACAGTGTGTAT
AGGTCGTGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGTGTTGGTTTTTCCCTCTGGTTCGTCAAGAA
AGTTTAAAGGTTTGGTCTTTTTATCTTCATTTTGCATTTTGGGGTGAATTAAAGGGTTGA
AGAAGGGTGGAAGAAAGGTGTGAAGAGAGTGAATCACTCTTCAGAAAATTTAAAGAAGAG
TGAAAGTGCTCATCCCCTTTCTACTCCGAAGTTCAATGCTTTTTTTAAAATCTACGTATA
AATATATATAGTGCGAGAGAGAGAGTGAGGAAGATAGAAAGAAAGATAGCGTCTTGTGAG
AATTTGCAAGGATTGTTTTTTTCATTCCTTGTAGCTCAAAAAACATGTGCATGCCTTTGT
CTTTTTGTGTGTTTTATCCTTCTTGGTGGTCAGTTGTAAAACTCAACAACAGTCCTTAAA
TGAAATGTGATATGGTTATTAGCT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 5

CO CL2033Contig1 881 5 35 U
GGTGTTCCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTTCTACCACATCCCTGTGTTTA
TTTACAGCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAG***GTAAAGAAGAT
GGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCT
AAACCAGGGATCATGT**CAGGACATAACTACGCTACTTCTCGACACTGAGGCCTTTAAG
GATACTATTGATATATTTGTTGAACGATACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGT
GTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTT
GTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTG
GAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCT
ATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGTACTCTCGCTGCTGCAATCCGACTACTC
GAGCGAGTAGGAGTGGAGATAGTAGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAG
GGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAA
ACAAGAATAATAAAGCCCCTAAAAAAAGGAAAATGGGGGTGGTTTGTTGGAGTTTATCAA
AAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGTTTTTCA
ACTTTATCATAACTGGCTCGGACTATAAAAATTGTAGCATTCTGGATTTGATTGTAGTGT
TCTGATTGTTTTCTATCCAAAATAAAGTCCGAATTAAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 5 5 20 5 5 20 5 
20 20 5 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB67TF U 48
AF RR4GP59TF U 46
AF RR4AA33TF U 1
AF RR4GP59JQ C 75
AF RR4EB67JQ C 401
BS 1 53 RR4AA33TF
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BS 57 58 RR4EB67TF
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BS 61 62 RR4AA33TF
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BS 64 64 RR4AA33TF
BS 65 69 RR4EB67TF
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BS 101 106 RR4AA33TF
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BS 368 673 RR4AA33TF
BS 674 674 RR4GP59TF
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BS 807 815 RR4GP59JQ
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RD RR4EB67TF 633 0 0
GGGTG
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ACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACTACGCTACTTCTCGACACTGAGG
CCTTTAAGGATACTATTGATATTTTTGTTGAACGATACAAAGGGAAAGACATCTCTGTTG
TTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTG
CCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGT
ATTCATTGGAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTG
AGCGTGCTATCGTCATAGACGACCTCATTGCCACGGGTGGTACTCTCGCTGCTGCAATCC
GACTACTCGAGCGAGTAGGAGTGGAGATAGTAGAGTGTGCATGCGTGATCGAGTTACCAG
AGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATG
CTGCCTAAACAAGAATAATAA
GCCCCTA

QA 6 626 6 626
DS 

RD RR4GP59TF 641 0 0
GGGTGTA
TGTGTTTATTTACAGCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAG***GTA
AAGAAGATGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTG
ACTTCCCTAAACCAGGGATCATGT**CAGGACATAACTACGCTACTTCTCGACACTGAGG
CCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGATACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTG
TTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTG
CCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGT
ATTCGTTGGAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGCG
AGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACAGGTGGTACTCTCGCTGCTGCAATCC
GACTACTCGAGCGAGTAGGAGTGGAGATAGTAGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAG
AGCTCAAGGGAAGAGAGAAACTAGGAGAGGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATG
CTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCCCTAAAAAA

QA 8 641 8 641
DS 

RD RR4AA33TF 806 0 0
GGTGTTCCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTTCTACCACATCCCTCCGCCTC
TTCAACTGCGCAGCGAGTAGGGAGAGTGAAATAATGGCAGCAGCAGCGAGTAAAGAAGAT
GAGCAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCT
AAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACTACGCTACTTCTCGACACTGAGGCCTTTAAG
GATACTATTGATATTTTTGTTGAACGATACAAAGGGAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGT
GTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGCCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTT
GTACCCGTGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTG
GAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCT
ATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGTACTCTCGCTGCTGCAATCCGACTACTC
GAGCGAGTAGGAGTGGAGATAGTAGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAG
GGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAA
ACAAGAATAATAA*GCCCCTAAAAAAAGGAAAATGGGGGTGGTTTGTTGGAGTTTATCAA
AAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGTTTTTCA
ACTTTATCATAACTGGCTCGGACTAT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4GP59JQ 751 0 0
GAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAG***GTAAAGAAGATGGACAAGATCCGAG
AATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCAT
GT**CAGGACATAACTACGCTACTTCTCGACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATAT
ATTTGTTGAACGATACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGG
TTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAA
GCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGA
CACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGCGAGCGTGCTATCGTCATAGATGA
CCTCATTGCCACAGGTGGTACTCTCGCTGCTGCAATCCGACTACTCGAGCGAGTAGGAGT
GGAGATAGTAGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGAGAGAAACT
AGGAGAGGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAA
GCCCCTAAAAAA*GGAAAATGGGGGTGGTTTGTTGGAGTTTATCAAAA*TGTGATTTTTA
TTTGTGTTCCTTTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGTTTTTCAACTTTATCATAACT
GGCTCGGACTATAAAAATTGTGGCATTCTGG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4EB67JQ 481 0 0
TATCTGTGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAG
TAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGACGACCTCATTGCCACGGGTGGTACTCTCG
CTGCTGCAATCCGACTACTCGAGCGAGTAGGAGTGGAGATAGTAGAGTGTGCATGCGTGA
TCGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTG
TAACCTCGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAA*GCCCCTAAAAAAAGGAAAATGGGGGT
GGTTTGTTGGAGTTTATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGGGATATGATGAT
CACTTTCTTCTTGTTTTTCAACTTTATCATAACTGGCTCGGACTATAAAAATTGTAGCAT
TCTGGATTTGATTGTAGTGTTCTGATTGTTTTCTATCCAAAATAAAGTCCGAATTAAGTG
C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 3

CO CL2034Contig1 1221 3 5 U
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AATCACACATGTTCGAACCAAAAACAAGAGGTAATAAATAACACTTATGTCAAGTGTTCC
TATCACTTGCCTATTCCATTTTGTTTTGAAACTCAAATGTGTCATAAACACGAGCAGTGT
TGTCAACAGAAACCGACACAATGAAGTCGTTGTTGGTGGAGACTGAGATGGCTTGGACTG
AATCCTGGTGGCCACGGTAGGTGTGGACGCAGTTTCCTAATAAGCTGTCCCAAACGCTCA
CTGTACCATCGGCACAGCCTGTGGCTAAGTACTTTGAGGTTCCTATCCATGTCACGCATG
TCACACCTTCCGCGTGGTCGCAGATGAACCTAGGAGTTGAATGTTGAAGATCCCAGATGA
CAAGCTTCTTGTCCATCCCACCTGTTGCAGCCATAGGGATAGTAGCGGAGCTTGGTGAAA
ACTTTACGCATTCAACTGACTCTGTATGAGAACTCAAAGAGCTCACAACCTTTCCAGTGA
CTATATTGACAATGTGAACAGAACCGTCTTTTGAGCCACTGATAGCAAGACTGGAGTTGG
AGTTAATGTCCAAGCATATCAACCCTTCTGTATGGTATGGATGACCTTTAACCACATGAA
TGCTTTCACAACTCTTTGGGTTCCATACTATCAAACTAGCATCATCAGAGCCAGTACAGA
TTAGTTTACCGTCAGGAGTGAAGTCACCGCAAGTGACGCTCTGGTTGTGACCAGAAAACA
TATTAAGATAAGCTTCTTTATCAGCATTCCACACCCACATAGAACAATCTTCTGATCCAG
CCAACACAACGTGTCCTCTCGATGCCACTTCACCCACTCGATGCCACCACCAGGACCGTC
CAAAACACATTTCAAAGTCCCAGACGATGCGTCAAAGATATGAACGACACCATCCAACCC
ACCAGAGGCAACTAACTGTCCATCGTAGCTAAAAGCTAGAGAAGAAACAGAGTCTTTGTG
ACCTAGAAGCTCAGCAGCCCAGTACTGGCAAGCATTTTCCAAAGAGGTCTGTAACACCAT
CTTGAGAGTTAGTTGTGGCTCCCGCAGGGTACAGCTTCACCGCATAAACCACACCACTTT
CCCTGGCAAGCTTGATCTCCTCAGGTTGGGTTTTGTCAGTCAAATAAAGTGTCATCAGTG
GATCAAAGCTGGTCCCAACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G815JQ U 1
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TGGTCCCAACCC

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DS 



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CT


BQ
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10 

AF RR4BJ19TF U 1
AF RR4BG66TF U 1
AF RR4BJ19JQ C 141
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BS 792 902 RR4BJ19JQ

RD RR4BJ19TF 735 0 0
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TAAGAGATCTTGAAGCCTCCAAATCCGTAGCCAATAGGCAGATGAGTAAAGCTAGAGTGT
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CCATAGAAGAAGCCA

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CAAAAACCTCATCCATGGCGATCCGTACCTACATCTCAGCAACATCCACAACTCCGCCGA
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CGGAGAAATGGTCCACCGGCGTCGCTCCCGGAGAGTACGGTGGTCCTCCGACCACCACGA
AGCTCCGGAAGTACTGGGGAGGAGAGAAAGAAGACCCCATTACCTCCAAGGACTTGATAT
GGAACAGAGACTTCATGGATCAGATGAAGAAGCTGTTCGATTCCCCTGATGATGCTCCTC
TCGACCCATCTCCCTCTAAGGAAGAGTCATCTTGGTTTCTGAGCTTTAATAGAGTTATGA
GTCTTGACAGTATGGATGTTGACTTAAGCAAAGAGCTTGCTTCGCCTTCTAAATCCGTCT
TAAGAGATCTTGAAGCCTCCAAATCCGTAGCCAATAGGCAGATGAGTAAAGCTAGAGTGT
CTCCTAAATGGAAGCTGGCACCTACGCGTCGTGAGCAAGATAAATGGGATAGAGCAACCA
AGGCTGCAACTGGTGGCAGTGATGTGATGTTAAGGGACCTGAGTATGGATTCATGCACTT
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CAGTGTCTATA

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GTAAGAAAATGTATTCATACTAAATAAACTCATATTATAGCT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

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TCTTATAATTTGTTCTTATAAACGAACAGAAGGTGAAGGTGGATTATATAAGACAAAAGA
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ACTGAATGCTACTCAATGTAAGGCCAGTCTCTTGCATCCTGATCTCTATCCAGAAAAGAG
CTTTAAAACTCAGTATAATAAGGCTCCTCCCTAGCTTCAGGCCCTTGATGTGGGAGCAGA
AGCATCAGATTTCTCAGCCAAATAGTGCTCAAGCATGTCTTCTTCATCATCTTCAAAGTC
ATCGTCTTCAAAGTCAATGTCTTCATCATCTTCCTCCTCAGATTCTTGATCAGCAGTGAC
CACTACTCCTCACGCTTTGCCACTCTCGAACCACTGTCTTCCTGTAAGCTTCTTCTCCTT
GGGTGCCGTAAGAGCAGACTCTGGCATCAGCTTGGCTCGCTCAAGTGCAAGCTCTGCCTC
ATATCTCTCTCTCCATGCCACAAATGTCTCCAGAGTAACAGGTTCTCCATGAGGAACAAT
TACCTCATCCTCTTTGGCCGCTTCTTCCTCGGCATAGTCAGCCCCATCATCTTGCCCATA
GTGTTCAGATAACCAGTCCTTTGCTGATGAGACCAATGTATACATCATTGCCATACCAAG
ACTTTCAGTCGCCTCTTGTTCAAGCTTCTCTTTTAAGATGGTGAGGTCACCAACATGGAT
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AGGAGTGACTGTAATCTGAAAGCATCGATTCGAAGTGTTAAGCCCACTTTCGCCAGTGTG
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CTCCTTATACTCCGTCATGATGACCAAATTTGAAAGCTTTGTCGTGAAAGCTTCGAGATT
TTGTCTGAATATCCAACTCCACAGTGAGTCGCCGTGACGAGACAGAGAGAGATGAAAGAC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4FX46JQ U 1
AF RR4F206JQ U 65
AF RR4F206TF C 375
AF RR4CQ86TF C 536
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ATGT

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DS 

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AATGCTACTCAA*GTAAGGCCAGTCTCTTGCATCCTGATCTCTATCCAGAAAAGAGCTTT
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TCAGATTTCTCAGCCAAATAGTGCTCAAGCATGTCTTCTTCATCATCTTCAAAGTCATCG
TCTTCAAAGTCAATGTCTTCATCATCTTCCTCCTCAGATTCTTGATCAGCAGTGACCACT
ACTCCTCACGCTTTGCCACTCTCGAACCACTGTCTTCCTGTAAGCTTCTTCTCCTTGGGT
GCCGTAAGAGCAGACTCTGGCATCAGCTTGGCTCGCTCAAGTGCAAGCTCTGCCTCATAT
CTCTCTCTCCATGCCACAAATGTCTCCAGAGTAACAGGTTCTCCATGAGGAACAATTACC
TCATCCTCTTTGGCCGCTTCTTCCTCGGCATAGTCAGCCCCATCATCTTGCCCATAGTGT
TCAGATAACCAGTCCTTTGCTGATGAGACCAATGTATACATCATTGCCATACCAAGACTT
TCAGTCGCCTCTTGTTCAAGCTTCTCTTTTAAGATGGTGAGGTCACCAACATGGATTCCT
CGAATACTTTTAACATCCAAGAGAGGTGCCTCGTCCGGGTAATTTTCTGTGTGCGA

QA 1 776 1 776
DS 

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CTTTGCCACTCTCGAACCACTGTCTTCCTGTAAGCTTCTTCTCCTTGGGTGCCGTAAGAG
CAGACTCTGGCATCAGCTTGGCTCGCTCAAGTGCAAGCTCTGCCTCATATCTCTCTCTCC
ATGCCACAAATGTCTCCAGAGTAACAGGTTCTCCATGAGGAACAATTACCTCATCCTCTT
TGGCCGCTTCTTCCTCGGCATAGTCAGCCCCATCATCTTGCCCATAGTGTTCAGATAACC
AGTCCTTTGCTGATGAGACCAATGTATACATCATTGCCATACCAAGACTTTCAGTCGCCT
CTTGTTCAAGCTTCTCTTTTAAGATGGTGAGGTCACCAACATGGATTCCTCGAATACTTT
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TCATGATGACCAAATTTGAAAGCTTTGTCGTGAAAGCTTCGAGATTTTGTCTGAATATCC
AACTCCACAGTGAGTCGCCGT
CC

QA 1 741 1 741
DS 

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TGCGAGAAAACCAAACCAAGCTGAACTGGTGGGATTGATGATGACTCATCTATATCATCA
TCCTGAGGAGTGACTGTAATCTGAAAGCATCGATTCGAAGTGTTAAGCCCACTTTCGCCA
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TGTTCCTCCTTATACTCCGTCATGATGACCAAATTTGAAAGCTTTGTCGTGAAAGCTTCG
AGATTTTGTCTGAATATCCAACTCCACAGTGAGTCGCCGTGACGAGACAGAGAGAGATGA
AAGACCT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 5

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AAAACTAACTTTACTTCAATTCCCTTTTTCTCGATTAGCTCACGATGGCGTTCCGAAACT
GTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCCTGACTTTAGCTCTGATTCACCACCCGG
TGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGCCCTTTACGCTCTTCGCAGGAGCTTATCGGATCCAG
ACCACGTGCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCA
CCTGTAACCAAGACAGCCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGAC
ATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACA
ACATCAAAGGGACTATACCTTCTGAACTAGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATC
TGTACAACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCTTCTTTGGGGAAATTGAAGTCTCTGG
TCTTTCTACGGCTCAACGACAACCAATTGACTGGACCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAA
TCCCAAGCCTTAAAGTTGTTGATGTATCGAACAATGATTTGTGTGGAACTATCCCAACAG
AAGGACCTTTCGGACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGAGATTGGAGGGGC
CGGAACTAATCGGTCTTGCTAGCTACGACACCAACTGCAACTGAAACAACTGGCAAATGA
CCTGAAAAAAACAAGAAATGAGGGGGTGACCTTAGAAGAACACTTCACCACTTTATCAAA
ATATCACATCTATTATGTAACAAGTATATATATGTATGTTCGTTGTGTGATACACTGAGA
TGTAACATTTGTTGTATTGGTAGCAAGTTCTTTACCTTTGTCTGCATTAACATTTGTGTG
TATGATATGTCATATTAATACGAAAACTATGGATTTGTGTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ35TF U 1
AF RR4GE62TF U 37
AF RR4FJ88TF U 61
AF RR4FJ88JQ C 366
AF RR4FR27JQ C 905
BS 1 82 RR4AQ35TF
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BS 779 1064 RR4FJ88JQ

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TCTTTCTACGGCTCAACGACAACCAATTGACTGGACCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAA
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AAGGACCTTCGGGACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGA
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DS 

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GG
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AAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCTTCT
TTGGGGAAATTGAAGTCTCTGGTCTTTCTACGGCTCAACGACAACCAATTGACTGGACCA
ATCCCTAGAGAACTCA**AAAATCCCAAGCCTTAAAGTTGTTGATGTATCGAACAATGAT
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A
CACTCGAGATTG

QA 3 723 3 723
DS 

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AGACAGCCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACATCTTGCACC
TGAGCTTGGGAAGCTCGAGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAACATCAAAGG
GACTATACCTTCTGAACTAGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAA
CAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCTTCTTTGGGGAAATTGAAGTCTCTGGTCTTTCTACG
GCTCAACGACAACCAATTGACTGGACCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCT
TAAAGTTGTTGATGTATCGAACAATGATTTGTGTGGAACTATCCCAACAGAAAGACCTTT
CGGACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGAGATTGGAGGG
GCG

QA 11 718 11 718
DS 

RD RR4FJ88JQ 699 0 0
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GCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAACATC
AAAGGGACTATACCTTCTGAACTAGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTAC
AACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCTTCTTTGGGGAAATTGAAGTTTCTGGTCTTT
TTACGGCTCAACGACAACCAATTGACTGGACCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCA
AGCCTTAAAGTTGTTGATGTATCGAACAATGATTTGTGTGGAACTATCCCAACAGAAGGA
CCTTTCGGACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGAGATTGGAGGGGCCGGAA
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AAAAAACAAGAAATGAGGGGGTGACCTTAGAAGAACACTTCACCACTTTATCAAAATATC
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CATTTGTTGTATTGGTAGCAAGTTCTTTACCTTTGTCTGCATTAACATTTGTGTGTATGA
TATGTCATATTAATACGAAAACTATGGATTTGTGTGCTC

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TATTAATACGAAAACTATGGATTTGTG

QA 9 155 9 155
DS 



AS 2 5

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FJ96JQ C 1
AF RR4FJ96TF U 1
BS 1 622 RR4FJ96TF

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QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4FJ96TF 622 0 0
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CAAGCATCTCTGTCGAAATCGAGCTTGCTAAACAATCCTCTTCCTTCAAGGATCATGAAC
TCCGTGGACCGGTCTCTCGAACTGGAAACGATAACGACGCCAAGCAAAGTCGGAAACCGA
AACGGCTCAAGACGAGCAACAC

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL2038Contig2 867 3 3 U
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TCTATAAATTTTTGAAAAAGAAAGCCCTGTTTTGAGATAAAGAAGAATGAAAACAGACGA
TTCAACTTTGGGGTTATTATACCCGATTGTGATGCCTTTTTTTTAACTTGTGTTGTTCGT
CTTGAGCCGTTTCGGTTTCCGACTTTGCTTGGCGTCGTCATCGTTTCCAGTTCGAGAGAC
CGGTCCACGGAGTTCATGATCCTTGAAGGAAGAGGATTGTTTAGCAAGCTCGATTTCGAC
AGAGATGCTTGCTTTTGTTAAGTCCACTCCTGAGTTCTCCAATGCTTCTCTTAGTGTTTT
CACCAATCCTTGCGAGTAAACACTTGATATACTGATGTTGCCCGCATGAACTTCCTCGTC
GTCACCTTCTTCTTTCAAAGGCTGAGTATGACTCCGTGAACTCTCACTTGGCTCTACCGT
CTCTGATGCTGCGACTCTTGTGTGCAAATGAGTAGTTACAGGGTTACCCGCAATTACGGG
AGAGAGAAAACTGTTGCTTTGAGCTGACAAAGGAACTGTCCCGGTCGTTGGCGTTGCTCG
GTGATTCAGTGTTTCTGGACGGTCTATAACAACGCCTTGTGTTGTTGCAAGGACCGGAAT
CGGAATGTTATTCTTCTCTTCTTCCAATTTTGGAGCAAAAGCAACGGTTCCTTCAGGTAC
TAGATGTTGGTTGTTCCTTTGCTGTAATGTAGTAAACAGATTAACATTACGATTTGTCGG
CTTTTAGTTTTAAACAGGCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G040JQ U 1
AF RR4EX45JQ U 46
AF RR4G040TF C 119
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BS 761 867 RR4G040TF

RD RR4G040JQ 759 0 0
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AACATTATAAAAATTATAGTTTCCAATGTACAAAGTAAGAAAAATTTAAGATTGAATATA
TCTATAAATTTTTGAAAAAGAAAGCCCTGTTTTGAGATAAAGAAGAATGAAAACAGACGA
TTCAACTTTGGGGTTATTATACCCGATTGTGATGCCTTTTTTTTAACTTGTGTTGTTCGT
CTTGAGCCGTTTCGGTTTCCGACTTTGCTTGGCGTCGTCATCGTTTCCAGTTCGAGAGAC
CGGTCCACGGAGTTCATGATCCTTGAAGGAAGAGGATTGTTTAGCAAGCTCGATTTCGAC
AGAGATGCTTGCTTTTGTTAAGTCCACTCCTGAGTTCTCCAATGCTTCTCTTAGTGTTTT
CACCAATCCTTGCGAGTAAACACTTGATATACTGATGTTGCCCGCATGAACTTCCTCGTC
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CTCTGATGCTGCGACTCTTGTGTGCAAATGAGTAGTTACAGGGTTACCCGCAATTACGGG
AGAGAGAAAACTGTTGCTTTGAGCTGACAAAGGAACTGTCCCGGTCGTTGGCGTTGCTCG
GTGATTCAGTGTTTCTGGACGGTCTATAACAACGCCTTGTGTTGTTGCAAGGACCGGAAT
CGGAATGTTATTCTTCTCTTCTTCCAATTTTGGAGCAAA

QA 1 759 1 759
DS 

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AATGAAAACGGACGTTTCAACTTTGGGGTTATTATACCCGACTGTGATGC*TTTTTTTTA
ACTTGTGTTGTTCGTCTTGAGCCGTTTTGGTTTCCGACTTTGCTTGGCGTCGTCATCGTT
TCCTATTCGAGAGACCGGTCCACGGAATTCATGATCCTTGAAGGAAGAGGATTGTTTAGC
AAGTTCGATTTCGACAGAAATGCTTGCTTTTGTTAAGTCCACTCCTGAGTTCTCCAATGC
TTCTCTTAGTGTTTTCACCAATCCTTGCGAGTAAACACTTGATATACTGATGTTGCCCGC
ATGAACTTCCTCGTCGTCACCTTCTTCTTTCAAAGGCTGAGTATGACTCCGTGAACTATC
ACTTGGCTCTACCGTCTCTGATGCTGCGACTCTTGTGTGCAAATGAGTAGTTACGGGGTT
ACCCGCAATTACGGGAGAGAGAAAACTGTTGCTTTGAGCTGACAAAGGAACTGTCCCGGT
CGTTGGCGTTGCTCGGTGGTTAAGTGTTTCTGGACGGTCTATAACAACGCCTTGTGTTGT
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QA 1 715 1 715
DS 

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GATTCAACTTTGGGGTTAT*ATACCCGATTGTGATGCCTTTTTTT*AACTTGTGTTGTTC
GTCTTGAGCCGTTTCGGTTTCCGACTTTGCTTGGCGTCGTCATCGTTTCCAGTTCGAGAG
ACCGGTCCACGGAGTTCATGATCCTTGAAGGAAGAGGATTGTTTAGCAAGCTCGATTTCG
ACAGAGATGCTTGCTTTTGTTAAGTCCACTCCTGAGTTCTCCAATGCTTCTCTTAGTGTT
TTCACCAATCCTTGCGAGTAAACACTTGATATACTGATGTTGCCCGCATGAACTTCCTCG
TCGTCACCTTCTTCTTTCAAAGGCTGAGTATGACTCCGTGAACTCTCACTTGGCTCTACC
GTCTCTGATGCTGCGACTCTTGTGTGCAAATGAGTAGTTACAGGGTTACCCGCAATTACG
GGAGAGAGAAAACTGTTGCTTTGAGCTGACAAAGGAACTGTCCCGGTCGTTGGCGTTGCT
CGGTGATTCAGTGTTTCTGGACGGTCTATAACAACGCCTTGTGTTGTTGCAAGGACCGGA
ATCGGAATGTTATTCTTCTCTTCTTCCAATTTTGGAGCAAAAGCAACGGTTCCTTCAGGT
ACTAGATGTTGGTTGTTCCTTTGCTGTAATGTAGTAAACAGATTAACATTACGATTTGTC
GGCTTTTAGTTTTAAACAGGCAAAAAAAA

QA 1 749 1 749
DS 



AS 2 5

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GAGAGTGTGTCGGGATACGATTCGCCGGTTATCGAAACCCTCGAAGGAGAAGTTTAGTTT
CCAGCTGTTAATTTTTCTTTTTTTGAGATAAGATGTCCGGCGAGGAAGACGCGACCGTGA
GGGAGCCGCTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTCGACGAGAGAATCTACGTCAAACTCCGCT
CAGACCGCGAGCTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTGG
GAGATGTTGAAGAAGTTATCACAACATTTGAGATTGATGATGAGACGTACGAGGAGATTG
TCCGGACGACTAAGCGCAATATACAGTTTCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGTGATATTGG
TGTCTCCACCACTGAGAGCACCCTGAGGTTAAAACTCAAATTTGAAGCCTAAAGTTAAGG
AGCTTAGGTTCTCTCTATGGGAACTATTGGGGTGTATTTTTAGTTACTTGTTGTCTGAAA
CTTTTTTAAAAAGCTTGAACGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4AM52TF U 1
AF RR4G482JQ C 18
AF RR4G482TF U 18
BS 1 63 RR4AM52TF
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RD RR4AM52TF 600 0 0
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GAGCGTGTGTCGGGATACGATTCGCCGGTTATCGAAACCCTCGAAGGAGAATTTTAGTTT
CCAGCTGTTAATTTTTCTTTTTTTGAGATAAGATGTCCGGCGAGGAAGACGCGACCGTGA
GGGAGCCGCTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTCGACGAGAGAATCTACGTCAAACTCCGCT
CAGACCGCGAGCTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTGG
GAGATGTTGAAGAAGTTATCACAACAGTTGAGATTGATGATGAGACGTACGAGGAGATTG
TCCGGACGACTAAGCGCAATATACAGTTTCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGTGATATTGG
TGTCTCCACCACTGAGAGCACCCTGAGGTTAAAACTCAAATTTGAAGCCTAAAGTTAAGG
AGCTTAGGTTCTCTCTATGGGAACTATTGGGGTGTATTTTTAGTTACTTGTTGTCTGAAA
CTTTTTTAAAAAGCTTGAACGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTATACC

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GG
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CGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTAT

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR4G482TF 580 0 0
GG
ATCGGCGAAACAGCGGTTCGGTCGTGAGATCGATCATCTCAGAGAGTGTGTCGGGATACG
ATTCGCCGGTTATCGAAACCCTCGAAGGAGAAGTTTAGTTTCCAGCTGTTAATTTTTCTT
TTTTTGAGATAAGATGTCCGGCGAGGAAGACGCGACCGTGAGGGAGCCGCTAGATCTGAT
TCGTCTGAGTCTCGACGAGAGAATCTACGTCAAACTCCGCTCAGACCGCGAGCTTCGCGG
CAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTGGGAGATGTTGAAGAAGTTAT
CACAACATTTGAGATTGATGATGAGACGTACGAGGAGATTGTCCGGACGACTAAGCGCAA
TATACAGTTTCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGTGATATTGGTGTCTCCACCACTGAGAGC
ACCCTGAGGTTAAAACTCAAATTTGAAGCCTAAAGTTAAGGAGCTTAGGTTCTCTCTATG
GGAACTATTGGGGTGTATTTTTAGTTACTTGTTGTCTGAAACTTTTTTAAAAAGCTTGAA
CGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTAT

QA 3 580 3 580
DS 



CO CL2039Contig2 543 2 3 U
GGAGAGCGTGTGTCGGGATACGATTCGCCGGTTATCGAAACCCTCGAAGGAGAAGTTTAG
TTTCCAGCTGTTAATTTTTTTTTCTTGTTGATAAGATGTCCGGCGAGGAAGACGCCACCG
TGAGAGAGCCGCTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTCGACGAGAGAATCTACGTCAAACTCC
GCTCAGACCGCGAGCTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTC
TGGGAGATGTTGAAGAAGTTATCACAACAGTTGAGATTGATGATGAGACGTACGAGGAGA
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TGGTGTCTCCACCACTGAGAGCACCCTGAGGTTAAAACTCAAATTTGAAGCCTAAAGTTA
AGGAGCTTAGGTTCTCTCTATGGGAACTATTGGTGTGTATTTTTAGTTACTTGTTGTCTG
AAACTTTTTTAAAAAGCTTGAACGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTAT
ACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 

AF RR4H328TF U 1
AF RR4H328JQ C 1
BS 1 2 RR4H328JQ
BS 3 540 RR4H328TF
BS 541 543 RR4H328JQ

RD RR4H328TF 543 0 0
GG
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TCCAGCTGTTAATTTTTTTTTCTTGTTGATAAGATGTCCGGCGAGGAAGACGCCACCGTG
AGAGAGCCGCTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTCGACGAGAGAATCTACGTCAAACTCCGC
TCAGACCGCGAGCTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTCTG
GGAGATGTTGAAGAAGTTATCACAACAGTTGAGATTGATGATGAGACGTACGAGGAGATT
GTCCGGACGACTAAGCGCAATATACAGTTTCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGTGATATTG
GTGTCTCCACCACTGAGAGCACCCTGAGGTTAAAACTCAAATTTGAAGCCTAAAGTTAAG
GAGCTTAGGTTCTCTCTATGGGAACTATTGGTGTGTATTTTTAGTTACTTGTTGTCTGAA
ACTTTTTTAAAAAGCTTGAACGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTAT
ACC

QA 3 540 3 540
DS 

RD RR4H328JQ 543 0 0
GGAGAGCGTGTGTCGGGATACGATTCGCCGGTTATCGAAACCCTCGAAGGAGAAGTTTAG
TTTCCAGCTGTTAATTTTTTTTTCTTGTTGATAAGATGTCCGGCGAGGAAGACGCCACCG
TGAGAGAGCCGCTAGATCTGATTCGTCTGAGTCTCGACGAGAGAATCTACGTCAAACTCC
GCTCAGACCGCGAGCTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATATGATTC
TGGGAGATGTTGAAGAAGTTATCACAACAGTTGAGATTGATGATGAGACGTACGAGGAGA
TTGTCCGGACGACTAAGCGCAATATACAGTTTCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGTGATAT
TGGTGTCTCCACCACTGAGAGCACCCTGAGGTTAAAACTCAAATTTGAAGCCTAAAGTTA
AGGAGCTTAGGTTCTCTCTATGGGAACTATTGGTGTGTATTTTTAGTTACTTGTTGTCTG
AAACTTTTTTAAAAAGCTTGAACGATCTTTTTTTGCTTTAATCCCAGTTTGCTCTTTTAT
ACC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 5

CO CL2040Contig1 652 5 15 U
GGAGGTATCGCCGACGAGTTAACTGGTAAACAAAGCTTTTACAATGGAGCAAACTTTCAT
CATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGA
AAAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGA
GAAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCAT
ATCCGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGAAA
GATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGC
TATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGA
AGCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGAT
CTACGAATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTGTTCCTTCGGTTATG
AAACTCAAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATG
AAGACCTATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTGAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 5 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4D796TF U 1
AF RR4EF22JQ C 1
AF RR4EQ18TF U 5
AF RR4D796JQ C 29
AF RR4EF22TF U 1
BS 1 29 RR4D796TF
BS 30 30 RR4EF22TF
BS 31 35 RR4D796TF
BS 36 36 RR4EF22TF
BS 37 37 RR4D796TF
BS 38 38 RR4EF22TF
BS 39 39 RR4D796TF
BS 40 40 RR4EF22TF
BS 41 240 RR4D796TF
BS 241 241 RR4EF22TF
BS 242 270 RR4D796TF
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BS 272 620 RR4D796TF
BS 621 647 RR4EQ18TF
BS 648 652 RR4EF22TF

RD RR4D796TF 620 0 0
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CATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGA
AAAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGA
GAAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCAT
CTCCGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAAGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGAAA
GATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGC
TATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGA
AGCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGAT
CTACGAATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTGTTCCTTCGGTTATG
AAACTCAAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATG
AAGACCTATCTTCTGTCTTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4EF22JQ 647 0 0
GGAGGT
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GGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAACA
CTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCTTTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATATCCGG
ACCCGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAGATCAT
TGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCTATCGA
CATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGC
GTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTACGA
ATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTT*TTCCTTCGGTTATGAAACTC
AAAACATGTTTGTTCTGGCTTTTTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGACC
TATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTG

QA 7 647 7 647
DS 

RD RR4EQ18TF 643 0 0
GG
ATCGCCGACGAGTTAACTGGTAA*CAAAGATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATCATGAT
CAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAA
GGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGTTGAGAAACA
CTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATCTCCGG
ACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGAAAGATCAT
TGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCTATCGA
CATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGC
GTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTACGA
ATGATTCTACCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTGTTCCTTCGGTTATTAAACTC
AAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGACC
TATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTG

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4D796JQ 593 0 0
AACAAAGATCTC
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GAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACT
GTTGACCGTCCTTTCGCTGAGAAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAAC
GGCCTTGTTGATTACATCATTTCCGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAAGGGAAGAAT
GTTGTCTTGACAGGAAGAAAGATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGA
ACCATCCGTGGGGATTATGCTATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCC
GTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAG
AGCAGCCTTCATTTTTGGATTTACGAATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTT
TTTTTGTTCCTTCGGTTATGAAACTCAAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCC
TTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGACCTATTTTCTGTCTTTT

QA 13 593 13 593
DS 

RD RR4EF22TF 652 0 0
GGAGGT
ATCGCCGACGAGTTAACTGGTAAACAAAGCTTTTACAATGGAGCAAACTTTCATCATGAT
CAAGCCCGACGGCGTTCAGAGGGGTCTGATTGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAA
GGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAACA
CTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCTTTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATATCCGG
ACCCGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAGATCAT
TGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCTATCGA
CATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGC
GTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTACGA
ATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTT*TTCCTTCGGTTATGAAACTC
AAAACATGTTTGTTCTGGCTTTTTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGACC
TATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTGAATAA

QA 7 652 7 652
DS 



AS 1 5

CO CL2041Contig1 1181 5 8 U
GTCGAGAAAAGAAGAACGAATTTTATTAGATTCAATTCAAAAGTCAAGCTGGAAACGAGA
CGAAAACTACGACGCTCTAATCTCCTATAGAGATTAGACATTTACACATTTCTCTCAAAG
GCCGCAATGCAACTATAATATAAGTTTGACTATATATTCATACACACCTAACGTTCTCTA
ATAATTCCATAAGTACCCATTGAGGAACTCTTGACTATTCAATAGTTCATCGAAGTCACC
AGTAAAGCTTGGAAAATTTCCGATTCCAGATAACAAATCCGATGGCAAACTGGTATTCAT
GCCTTCTATAACTTCGGTTGCTTGGTAGGGACTCATTTCTGAAATCCCCATGTCTTGAAC
CGCAACGGAAGATTCATCAGTAGATGTGATCATGGGGTTGCTTGTGGGAGAAGAAACCAC
TTGCTTTCCGGTTTTCTTGGTCAGAGACGGTTTGGGTTGGGAAGATTTGGCTCGAGTTGA
ACCGGCTAATGAGTTTCTCCGGGTTGGTAGCTCATGATTGTGCTCGTTCGTATACGTTAT
GGTGAACTTTTCCTGGTTCTGAGGATTTCTCTCAACTTGTTTTCTTGCTAGACACCCCTT
TGAGCTGCTACACATGTAATAACTCCTTGGGTAAGGAGATCCTTTGATGGGTTTCTGCCC
GTATTTACGCCACGCCCATGCGTCCGACAACAGATTTTCTTCTTTCACTTGCTCAACAAC
TCTCTTCTGTTGGTTCTTCTTGCTCTTCTTCGATTTGGACTCTGTGATTCTGATATGATC
AACTCTTGATCCGTTAGATAGAAGACAGCCATGTGTTCGTTGTTTCTTATCATCTTGTAA
ACTCCTTGAATCTTCGGGAACAGAGACGGAGCTCGTGAGGATAGTTTGAGAAGAGAAAGG
ATAAAAAGGTTTGTAGAATTCACCGAGTTCATCTAAACCGGTTGTCTCAATCTCCGGTTC
GTAGAAACTAGCCGTCTCAAATGGGAGGCAAAACCCGCCGGAGCTTTCTCCGGAGCCAGA
GTAGCCTCTCACGATTGCTTCCAAGTCTCCTTCGTCCATATAAGCCACCTCACCCATATC
ACTCTTTCCTCTTCGAGATTTTATTTCCTCTTTTATCTTATTTTTTCTTTGACGAGAGAA
TGCCTTTTGGGCAACATCAGTTTATATAAAGAGGGAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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G
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GCCCATGCGTCCGACAACAGATTTTCTTCTTTCACTTGCTCAACAACTCTCTTCTGTTGG
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TCTTTGACCC

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GCCGTCTCAAATGGGAGGCAAAACCCGCCGGAGCTTTCTCCGGAGCCAGAGTAGCCTCTC
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CTTCGAGATTTTATTTCCTCTTTTATCTTATTTTTTCTTTGACGAGAGAATGCCTTTTGG
GCAACATCAGTTTATATAAAGAGGGAAAAAA

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DS 



AS 1 4

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ACTTTGGGGTTACTATTTTTATTATATACAGTGAAAAAAGAATATGATCCATATTTGTGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD48TF U 1
AF RR4AM96TF U 1
AF RR4AM96JQ C 873
AF RR4AD48JQ C 624
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BS 743 822 RR4AM96TF
BS 823 823 RR4AD48JQ
BS 824 833 RR4AM96TF
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CGCTCACAAACGCTCGTAGCAAAGAGGATATAAAGAGATGGAACTTTGTTCGTGGTTTTG
CTGACAGCATATGTTGGACTCTTTTGTCTCAGCAAGACAAGACAGTTGTCTGGAAAAAGA
CGGTCAAAACAAAATGTTACAGTTCAAGGAAGCCTGGGGTGGGACCTTCTGTGTGTAGCA
AAGGGCACGACGTTGAGTCTCCTTATTACAGGCCGCTTCAGATGTGTCTTGGTGGAACAC
GTAGCCGGAGGTGGATTCCCATTGAAGGCAGGACAAAATGGCCTACCCGGTCTAACATGA
ACAAGACTGAACTTTCACAATATGGTCTTCACCCGGAGGAGGTTGGAGAAGATGCAGCGA
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G

QA 1 481 1 481
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ATATACAGTGAAAAAAGAATATGATCCATATTTGTGAAGATAATGTTTTATTGAAATATA
AGTTAA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 5

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TCTTGAGAAACCCATTTACTACCCTCACTCTCGTAGTAATCACTCTGGTCATCAATAACC
GTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 

AF RR4F933JQ U 1
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RD RR4F933JQ 695 0 0
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GTC

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GTC

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TCTTCGTTTAACAGTACCTTACGGCCGACTAAATCAAATGTCATAACCACTTTGCTCTTT
TTGGCTCGTTCAGCTTCTTCAATCTCCTCACGCTTCTTCCTCAAAAGCTCTTTCTCCTCT
TGAGAAACCCATTTACTACCCTCACTCTCGTAGTAATCACTCTGGTCATCAATAACCGTT
GTC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 2 5

CO CL2044Contig1 700 2 4 U
GGATGAATTATTGTAAATAACTGCATTAAAATCATAACATTTATTTTGTAAAGAAAATAA
CAATATTTAATTTTAAAAGGATGAATTACTGAATAGTGGATTTGAAAATGTGAAAATTAA
GACCATTTTCATGAAGTCGTTTTGTTCCTCCTTTCACTATGAGTTATTACTGCTTTGGAA
GATCACCAGTAGCTTCAAAGCTCACAACAGAGTCATCAATAGTTTCTTCTAGTGACCTAA
ACTTCCACCCAAGTTTCTCCAACTTCTCTGAACTTATTCGAAGTACATTCTCATTCACTT
GCTTCTCCTTTCTCTCACTGAAACTTTTAGGGAACTTGCGTTTAGGATACATATTCATCA
GCTTCTTCATAAGATCATTGTTGTGAAGTGAATGAAAATTGCAAATGTATCTTCCTTTTG
CTTCTTGATTTTCATACACCAACAAAAGCGCATCAGCAACATCACGCACATCCACAAGAT
AGAGTTGGTCACTCAATAAGGATATCACACCTCCTTTTATAAAGTTTAGAAGTCCCAAGC
TACTAGAGTTAAGCGTGGACTGAAGCCTAGGGCCTATCACGACCGAGGGACAGACCGTAA
CAACATCAGCCAAGCTTGTCCTGCTCCACTCTATAGCTTCACGTTCCATTAATGCTTTGG
CAAGAAAGTAATACGACCAATAACCCTCACGTGAGTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD34JQ U 1
AF RR4FA57JQ U 19
BS 1 351 RR4GD34JQ
BS 352 352 RR4FA57JQ
BS 353 395 RR4GD34JQ
BS 396 700 RR4FA57JQ

RD RR4GD34JQ 395 0 0
GGATGAATTATTGTAAATAACTGCATTAAAATCATAACATTTATTTTGTAAAGAAAATAA
CAATATTTAATTTTAAAAGGATGAATTACTGAATAGTGGATTTGAAAATGTGAAAATTAA
GACCATTTTCATGAAGTCGTTTTGTTCCTCCTTTCACTATGAGTTATTACTGCTTTGGAA
GATCACCAGTAGCTTCAAAGCTCACAACAGAGTCATCAATAGTTTCTTCTAGTGACCTAA
ACTTCCACCCAAGTTTCTCCAACTTCTCTGAACTTATTCGAAGTACATTCTCATTCACTT
GCTTCTCCTTTCTCTCACTGAAACTTTTAGGGAACTTGCGTTTAGGATACA*ATTCATCA
GCTTCTTCATAAGATCATTGTTGTGAAGTGAATGA

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4FA57JQ 682 0 0
AACTGCATTAAAATCATAACATTTATTTTGTAAAGAAAATAACAATATTTAATTTTAAAA
GGATGAATTACTGAATAGTGGATTTGAAAATGTGAAAATTAAGACCATTTTCATGAAGTC
GTTTTGTTCCTCCTTTCACTATGAGTTATTACTGCTTTGGAAGATCACCAGTAGCTTCAA
AGCTCACAACAGAGTCATCAATAGTTTCTTCTAGTGACCTAAACTTCCACCCAAGTTTCT
CCAACTTCTCTGAACTTATTCGAAGTACATTCTCATTCACTTGCTTCTCCTTTCTCTCAC
TGAAACTTTTAGGGAACTTGCGTTTAGGATACATATTCATCAGCTTCTTCATAAGATCAT
TGTTGTGAAGTGAATGAAAATTGCAAATGTATCTTCCTTTTGCTTCTTGATTTTCATACA
CCAACAAAAGCGCATCAGCAACATCACGCACATCCACAAGATAGAGTTGGTCACTCAATA
AGGATATCACACCTCCTTTTATAAAGTTTAGAAGTCCCAAGCTACTAGAGTTAAGCGTGG
ACTGAAGCCTAGGGCCTATCACGACCGAGGGACAGACCGTAACAACATCAGCCAAGCTTG
TCCTGCTCCACTCTATAGCTTCACGTTCCATTAATGCTTTGGCAAGAAAGTAATACGACC
AATAACCCTCACGTGAGTAAAG

QA 1 682 1 682
DS 



CO CL2044Contig2 779 3 8 U
GGACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCA
GAGGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCT
CTCCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCGAAAGAACGACCA
TTTGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCAAAGCAGATTTGTTTGA
CTATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTTCATATTGCTGGTCC
TGTGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTATACCAGCTCTCACTGG
CACCAAAAACGTTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATC
ATCAATTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAG
CTGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCT
TGCCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGT
TGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAG*CTTCAGTCCACGCTTAACTCTAG
TAGCTTGGGACTTCTAA*CTTTATAAAAGAGTGTGATATCCTTATTGAGTGAC*AACTCT
ATCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD34TF U 1
AF RR4C578TF U 80
AF RR4FA57TF U 2
BS 1 159 RR4GD34TF
BS 160 160 RR4C578TF
BS 161 484 RR4GD34TF
BS 485 485 RR4C578TF
BS 486 677 RR4GD34TF
BS 678 678 RR4C578TF
BS 679 771 RR4GD34TF
BS 772 779 RR4FA57TF

RD RR4GD34TF 773 0 0
GGACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCA
GAGGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCT
CTCCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCATGTGATCGAAAGAACGACCA
TTTGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCAAAGCAGATTTGTTTGA
CTATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTTCATATTGCTGGTCC
TGTGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTATACCAGCTCTCACTGG
CACCAAAAACGTTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATC
ATCAATTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAG
CTGCCGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCT
TGCCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGT
TGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAG*CTTCAGTCCACGCTTAACTCTAG
TAGCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGAGTGTGATATCCTTATTGAGTGAC*AACTCT
ATCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAA
AT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4C578TF 692 0 0
TCAGGAGGATATATTACTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCTCTCCCATGGCTACACTGTG
CATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCGAAAGAACGACCATTTGAAGAAACTGGATAAT
GCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCAAAGCAGATTTGTTTGACTATGAAGGTCTTTCTTCA
GCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTTCATATTGCTGGTCCTGTGCCTTTTGAGGATGTT
CCTCTCACAGAGGAACAACTGATTATACCAGCTCTCACTGGCACCAAAAACGTTCTAGAA
GCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATCATCAATTGCGGCGGTTGTT
TACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAGCTGCTGGTCAGACACTCAA
TACCTTTACTCACGTGGGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCTTGCCAAAACATTAATGGAA
CGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGTTGTTACGGTCTGTCCCTCG
GTCGTGATAGGCCCTAG*CTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTAGCTTGGGACTTCTAA*C
TTTATAAA*GAGTGTGATATCCTTATTGAGTGACCAACTCTATCTTGTGGATGTGCGTGA
TGT*GCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4FA57TF 778 0 0
GACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCAG
AGGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCTC
TCCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCGAAAGAACGACCAT
TTGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCAAAGCAGATTTGTTTGAC
TATGAAGGTCCTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTTCATATTGCTGGTCCT
GTGCCTTTTGGAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTATACCAGCTCTCACTGGC
ACCAAAAACGTTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATCA
TCAATTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAGC
TGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCTT
GCCAAAGCATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGTT
GTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGT
AGCTTGGGACTTCTAA*CTTTATAAAAGAGTGTGATATCCTTATTGAGTGAC*AACTCTA
TCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGAA

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

CO CL2045Contig1 1019 4 18 U
GGAACTCGGATCACCACATGACTCCATCTCCTCCTCCTCCTCCTTCCTTTCCGTTAACAC
AGAACCAATCTCCCCAACTCCTCATTGTCTCTCATCTCTTCGTTTAGATCCCAAAAAAA*
GGCAAAGACTTTGAGGGATTTAATTGATTGATGTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGAGT
TCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACGTCGAGAACGCATCATCGCAACGATGGC
ACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGGCAGATGAGCGAGTCTTCTATCTGCGCT
ACAGAGGACGAAGAAGAAGACGACGATTCCAAATTGCATTTGGGTCCTCAGTACACTATC
AAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAGAGCTTGAGGAAGTGGAAGGAACAGCTT
CTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACGCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATT
AGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGATATTGTACTTATGGTTCCGGAGAATGGG
AATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACG
TTTCACGTTAACAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGATGACC
GGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTGGAGCCA
TACAACCACGTGATGCCGGAAGAGATCACTCCTTCTGGCTTGTTTGCTCGAGGATCATAT
TCTGCAAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGC
TTCGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAAACTCGAGAACAAGTTATCCTGAGAT
GATGTGTTTTCAGTAGAAGTTTCGTTTGTTTCACTCCTTTTCATCGTTGAACATATTATT
GTGTTTTTTTTTTTAATTTCCTAATCATCATGGTAGAACAAGAGCGACATTTACTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 15 
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25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BY18TF U 68
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AF RR4GP42TF U 68
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CTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACGCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATT
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AATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACG
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TACAAC*ACGTGATGCCG
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DS 

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ACTTTGAGGGATTTAATTGATTGATGTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGAGTTCCAGAG
ACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACGTCGAGAACGCATCATCGCAACGATGGCACAGACG
ACGGGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGGCAGATGAGCGAGTCTTCTATCTGCGCTACAGAGG
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ATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAGAGCTTAAGGAAGTGGAAGGAACAGCTCCTTGGAA
GTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGG
CGATCGTATCCCCTGGAAGACCAGATATTGTACTCATGGTTCCGGAGAATGGGAATCCAA
AGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCACG
TTAACAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACTAATACTGTTTGGAAGACATGTGTTA
AAGTGGATAGAACAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAAC
CACGTGATG

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DS 

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CAGTACACTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAGAGCTTGAGGAAGTGG
AAGGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACGCTTGACCCTGAA
GTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGATATTGTACTTATGGTT
CCGGAGAATGGGAATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGT
TTGAAATTCACGTTTCACGTTAACAACAACATTGTCTCTGGTTTTAGGTACACCAATACT
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TTATCCTGAGATGATGTGTTTTCAGTAGAAGTTTCGTTTGTTTCACTCCTTTTCATCGTT
GAACATATTATTGTGTTTTTTTTTTTAATTTCCTAATCATCATGGTAGAACAAGAGCGAC
ATTTACTTCCT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 5

CO CL2046Contig1 1306 5 13 U
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GACAGTGTAGCACTTTTCTTCACCGGAGCTCTCGTAGCCGGCGGTATCTACTGGTTCCTC
TGCGTACTTGGACCAGCCGAGCGTAAAGGCAAACGAGCCTTGGATCTATCAGGCGGCTCC
ATCTCCGCTGAGAAAGTTCAAGACAACTACAAACAGTACTGGTCTTTCTTCCGCCGTCCC
AAAGAGATCGAAACCGCCGAGAAAGTCCCCGATTTTGTCGACACGTTCTACAACCTCGTC
ACCGACATCTACGAGTGGGGATGGGGACAGTCCTTCCACTTCTCCCCTTCCATCCGTGGC
AAATCCCACCGTGACGCCACGCGCCTCCACGAAGAGATGGCCGTAGATCTGATCCAAGTG
AAACCGGGCCAAAAGATCCTCGACGTCGGATGCGGCGTAGGAGGTCCGATGCGCGCGATT
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TCCGACATAGCCGAGACAGCGAAGAAGGTTGGGTTCGAAGTTGTCAAGGAGAAGGATCTG
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TCGATCTCAGTTTGTTTTAATTTTTGTTTTTTTATGGGCTTTTTAATCATGCTTGGTCAG
TC*TATGTACTCTTTTTAGATTTAAAACCGTGTTTCTTAATTTGGTATTACTGTTAAGTT
TTTCCTGAATAAGTGAATCTTGGAATCGAATTATCCGCCGGAAGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ57TF U 1
AF RR4GW84TF U 3
AF RR4GC94TF U 504
AF RR4GC94JQ C 568
AF RR4FJ57JQ C 1111
BS 1 252 RR4FJ57TF
BS 253 253 RR4GW84TF
BS 254 456 RR4FJ57TF
BS 457 515 RR4GW84TF
BS 516 516 RR4GC94TF
BS 517 595 RR4GW84TF
BS 596 596 RR4GC94TF
BS 597 635 RR4GW84TF
BS 636 636 RR4GC94TF
BS 637 689 RR4GW84TF
BS 690 1220 RR4GC94TF
BS 1221 1238 RR4GC94JQ
BS 1239 1306 RR4FJ57JQ

RD RR4FJ57TF 456 0 0
GGCTACCAGTAATAACGAGACCGTCTCTGCCTCTCTCTCTCTCCCTTAAAAAAAATAATG
GACAGTGTAGCACTTTTCTTCACCGGAGCTCTCGTAGCCGGCGGTATCTACTGGTTCCTC
TGCGTACTTGGACCAGCCGAGCGTAAAGGCAAACGAGCCTTGGATCTATCAGGCGGCTCC
ATCTCCGCTGAGAAAGTTCAAGACAACTACAAACAGTACTGGTCTTTCTTCCGCCGTCCC
AAAGAGATCGAAGCCGCCGAGAAAGTCCCCGATTTTGTCGACACGTTCTACAACCTCGTC
ACCGACATCTACGAGTGGGGATGGGGACAGTCCTTCCACTTCTCCCCTTCCATCCGTGGC
AAATCCCACCGTGACGCCACGCGCCTCCACGAAGAGATGGCCGTAGATCTGATCCAAGTG
AAACCGGGCCAAAAGATCCTCGACGTCGGATGCGGC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4GW84TF 687 0 0
GG
ACCAGTAATAACGAGACCGTCTCTGCCTCTCTCTCTC**CCTTAAAAAAAATAATGGACA
GTGTAGCACTTTTCTTCACCGGAGCTCTCGTAGCCGGCGGTATCTACTGGTTCCTCTGCG
TACTTGGACCAGCCGAGCGTAAAGGCAAACGAGCCTTGGATCTATCAGGCGGCTCCATCT
CCGCTGAGAAAGTTCAAGACAACTACAAACAGTACTGGTCTTTCTTCCGCCGTCCCAAAG
AGATCGAAACCGCCGAGAAAGTCCCCGATTTTGTCGACACGTTCTACAACCTCGTCACCG
ACATCTACGAGTGGGGATGGGGACAGTCCTTCCACTTCTCCCCTTCCATCCGTGGCAAAT
CCCACCGTGACGCCACGCGCCTCCACGAAGAGATGGCCGTAGATCTGATCCAAGTGAAAC
CGGGCCAAAAGATCCTCGACGTCGGATGCGGCGTAGGAGGTCCGATGCGCGCGATTGCAT
CTCACTCGCGAGCCAACGTCGTGGGGATCACTATCAACGAGTATCAAGTCAAGAGAGCGC
GTGACCACAACAGGAAAGCGGGACTCGACGCGCTCTGCGAGGTCGTGTGCGACAACTTCC
TCCAGATGCCGTTCGATGACAACACATTCGA*GGCGCGTACTCGATCGAAGCGACGTGTC
ACGCGCCGAAGCTTGAAGAAGTCTA

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DS 

RD RR4GC94TF 717 0 0
GGG
GGGGATCACGATCAACGAGTATCAAGTCAAGAGAGCGCGTGACCACAACAGGAAAGCGGG
ACTCGACGCGCTCTGCGAGGTCGTGTGCGGCAACTTCCTCCAGATGCCGTTCGATGACAA
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CTACGCGGAGATCTACAGAGTGTTGAAGCCCGGATCTCTCTACGTGTCGTACGAGTGGGT
CACGACCGATAAGTTCAACGCGGAGAATGAGGAACACGTGGAGGTCATCCAAGGGATCGA
GAGAGGAGACGCGCTTCCTGGGCTTAGGGCTTATTCCGACATAGCCGAGACAGCGAAGAA
GGTTGGGTTCGAAGTTGTCAAGGAGAAGGATCTGGCGGCTCCGCCTGCTGAGCCGTGGTG
GACTAGGCTTAAGATGGGTCGGCTCGCTTACTGGAGGAACCACATTGTGGTTCAGGTTTT
GTCTGCTGTCGGAGTTGCGCCTAAAGGAACCGTTGATGTTCACGAGATGTTGTTTAAGAC
CGCTGATTTCTTGTCCAGAGGAGGCGAAACTGAAATTTTCTCTCCGATGCATATGATTCT
CTGCCGGAAACCTATTTCTTAATAGGAGTATCTGTCGATCTCAGTTTGTTTTAATTTTTG
TTTTTTTATGGGCTTTTTAATCATGCTTGGTCAGTC*TATGTACTCTTTTTAGA

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DS 

RD RR4GC94JQ 671 0 0
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ACATTCGACGGCGCGTACTCGATCGAAGCGACGTGTCACGCGCCGAAGCTTGAAGAAGTC
TACGCGGAGATCTACAGAGTGTTGAAGCCCGGATCTCTCTACGTGTCGTACGAGTGGGTC
ACGACCGATAAGTTCAACGCGGAGAATGAGGAACACGTGGAGGTCATCCAAGGGATCGAG
AGAGGAGACGCGCTTCCTGGGCTTAGGGCTTATTCCGACATAGCCGAGACAGCGAAGAAG
GTTGGGTTCGAAGTTGTCAAGGAGAAGGATCTGGCGGCTCCGCCTGCTGAGCCGTGGTGG
ACTAGGCTTAAGATGGGTCGGCTCGCTTACTGGAGGAACCACATTGTGGTTCAGGTTTTG
TCTGCTGTCGGAGTTGCGCCTAAAGGAACCGTTGATGTTCACGAGATGTTGTTTAAGACC
GCTGATTTCTTGTCCAGAGGAGGCGAAACTGAAATTTTCTCTCCGATGCATATGATTCTC
TGCCGGAAACCTATTTCTTAATAGGAGTATCTGTCGATCTCAGTTTGTTTTAATTTTTGT
TTTTTTATGGGCTTTTTAATCATGCTTGGTCAGTC*TATGTACTCTTTTTAGATTTAAAA
CCGTGTTTCTT

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DS 

RD RR4FJ57JQ 196 0 0
CGGAAACCTATTTCTTAATAGGAGTATCTGTCGATCTCAGTTTGTTTTAATTTTTGTTTT
TTTATGGGCTTTTTAATCATGCTTGGTCAGTCCTATGTACTCTTTTTAGATTTAAAACCG
TGTTTCTTAATTTGGTATTACTGTTAAGTTTTTCCTGAATAAGTGAATCTTGGAATCGAA
TTATCCGCCGGAAGCT

QA 1 196 1 196
DS 



AS 1 4

CO CL2047Contig1 1111 4 3 U
GGACGCGTGACGAAATTAGAAGATAAGGTTGCTCACACTGCCTTCCCTCCTCCAAAATCA
AAATCATCCTCCTAGCAGCAACTGAGAGTGATAACCATGGCGACGAGCTCTCATCTTCTT
CTTCCTCCTCAGGCATTGCATACGACACGGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTCG
CCGTTTCTATCATGCGCACCTTCGATGAATCCTATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTG
ACTCACTCCAAATCTAGCTTCTCGCTCGATACTAAGGCGAGACGGGAGGTTCTCGTTAGA
GCAGAAGATAACCCTGAAGCTGAAGGTGAAGCTGAAGCTGTTGATGCTAACGCTGCTACG
GAGGATAATGTAGTAGAAGCTGATGAAGCCAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTC
GGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGACCT
GTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCTGAGAACAGA
CGTAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAAAACGCTGGCATACACACT
ACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCCTTATAC
TCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGATGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTT
TACTACCTTAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAACACCACCCCACTGT
GCTGTGTTTGACCCAACCAAAGTAGTAATCTTCCTTTGTGTTCTCTGTTCTTGTAAGAAT
TGTTCTTTCCTGTTTTTCTTTTGTTTAAGCTTGTAAGTCATGGCATGCACACTCTTCTGA
GAAAGTAAAATCAAGATTAGTCGAGATTCCGTTTGGCTGAATGTAGACCTGGTCCTTGTT
TCATTATGAAATGATATATGACCCTTTTAGGACTTGTTCTTGTTCTTGTTTTATTCTATT
TGGACTTAGTCACGATGAATCTTGATTTTTTGATTTTATGGAGGTGGAAAACAGCTTCGT
ATTATTTATATTATCCTAATTTTGTCTCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR78TF U 1
AF RR4B213TF U 64
AF RR4H594JQB C 743
AF RR4AR78JQ C 238
BS 1 832 RR4AR78TF
BS 833 856 RR4B213TF
BS 857 1111 RR4AR78JQ

RD RR4AR78TF 832 0 0
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GGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGACCT
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CGTAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAAAACGCTGGCATACACACT
ACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCCTTATAC
TCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGATGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTT
TACTACCTTAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAACACCACCCCACTGT
GCTGTGTTTGACCCAACCAAAGTAGTAATCTTCCTTTGTGTTCTCTGTTCTT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4B213TF 793 0 0
GG
ATCCTCCTAGCAGCAACTGAGGGTGATAACCATGGCGACGAGCTCTCATCTTCTTCTTCC
TCCTCAGGCATTGCATATGACACGGAC*CAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTCGCCGTT
TCTATCATGCGCACCTTCGATGAATCCTATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTGACTCA
CTCCAAATCTAGCTTCTCGCTCGATACTAAGGCGAGACGGGAGGTTCTCGTTAGAGCAGA
AGATAACCCTGAAGCTGAAGGTGAAGCTGAAGCTGTTGATGCTAACGCTGCTACGGAGGA
TAATGTAGTAGAAGCTGATGAAGCCAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTCGGAGA
CGTAATGGGGATACTGAGCCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGACCTGTTCC
TGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCTGAGAACAGACGTAG
GTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAAAACGCTGGCATACACACTACCAT
TCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCCTTATACTCTCC
CAACATCAAAGAGATAAAAGTGATGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTA
CCTTAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCCCCACTTTCAAGTGAACACCACCCCACTGTGCTGT
GTTTGACCCAACCCAAGTAGTAATCTTCCTTTGTGTTCTCTGTTCTTGTAAGAATTGTTC
TTTCCTGTTTT

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR4H594JQB 153 0 0
CCCGTCTCTTT
ACTTTCAAGTGAACACCACCCCACTGTGCTGTGTTTGACCCAACCAAGGTAGTAATCTTC
CTTTGTGTTCTCTGTTCTTGTAAGAATTGTTCTTTCCTGTTTTTCTTTTGTTTAAGCTTG
TAAGTCATGGCATGCACA
TTTT

QA 12 149 12 149
DS 

RD RR4AR78JQ 874 0 0
CTGACTCACTCCAAATCTAGCTTCTCGCTCGATACTAAGGCGAGACGGGAGGTTCTCGTT
AGAGCAGAAGATAACCCTGAAGCTGAAGGTGAAGCTGAAGCTGTTGATGCTAACGCTGCT
ACGGAGGATAATGTAGTAGAAGCTGATGAAGCCAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAG
CTCGGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGA
CCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCTGAGAAC
AGACGTAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAAAACGCTGGCATACAC
ACTACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCCTTA
TACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGATGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGG
CTTTACTACCTTAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAACACCACCCCAC
TGTGCTGTGTTTGACCCAACCAAGGTAGTAATCTTCCTTTGTGTTCTCTGTTCTTGTAAG
AATTGTTCTTTCCTGTTTTTCTTTTGTTTAAGCTTGTAAGTCATGGCATGCACACTCTTC
TGAGAAAGTAAAATCAAGATTAGTCGAGATTCCGTTTGGCTGAATGTAGACCTGGTCCTT
GTTTCATTATGAAATGATATATGACCCTTTTAGGACTTGTTCTTGTTCTTGTTTTATTCT
ATTTGGACTTAGTCACGATGAATCTTGATTTTTTGATTTTATGGAGGTGGAAAACAGCTT
CGTATTATTTATATTATCCTAATTTTGTCTCAGG

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 5

CO CL2048Contig1 433 5 8 U
GGATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAA*CACCCTAAACATTTATTTACAGAAAATT
GTTACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGT
TTTCATGAATGTGCAAACCTGAAAAAAACTACAGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACAT
AAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAG
AGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATT
TCAAATATTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCA
TGTGAGGAGCTAGTATTAAGTGTAAGAAAATTTTTTTTCCAAGAGCGCTCTCTCTCTATA
TCCCCTTATTATT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B517JQ C 1
AF RR4E265TF U 9
AF RR4B517TF U 1
AF RR4BQ11TF U 3
AF RR4A578TF U 3
BS 1 4 RR4B517JQ
BS 5 10 RR4B517TF
BS 11 31 RR4E265TF
BS 32 32 RR4B517TF
BS 33 157 RR4E265TF
BS 158 158 RR4B517TF
BS 159 381 RR4E265TF
BS 382 433 RR4A578TF

RD RR4B517JQ 383 0 0
GGATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAA*CACCCTAAACATTTATTTACAGAAAATT
GTTACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGT
TTTCATGAATGTGCAAACCTGAAAAAAACTACAGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACAT
AAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAG
AGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATT
TCAAATATTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCA
TGTGAGGAGCTAGTATTAAGT
AT

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR4E265TF 374 0 0
GG
ACTGAACATTTATCAAAAAAAACACCCTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTACAATGT
CAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGTTTTCATGAAT
GTGCAAACCTGAAAAAAACTACAGCAGTATGCCTCTCTAGACCACAACATAAAGATTGGT
GCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAATTTGTA
TCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATTTCAAATATTT
TCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCATGTGAGGAGC
TAGTATTAAGT
G

QA 3 373 3 373
DS 

RD RR4B517TF 383 0 0
GGAT
AAACACACTGAACATTTATCAAAAAAA*CACCCTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTA
CAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGTTTTC
ATGAATGTGCAAACCTGAAAAAAACTACAGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACATAAAG
ATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAA
TTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATTTCAA
ATATTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCATGTG
AGGAGCTAGTATTAAGT
AT

QA 5 381 5 381
DS 

RD RR4BQ11TF 398 0 0
GG
AAACACACTGAACATTTATCAAAAAAA*CACACTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTA
CAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTCA*CTAGTTTTC
ATGAATGTGCCAACCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACATAAAG
ATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAA
TTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATT*CAA
ATACTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCATGTG
AGGAGCTAGTATTAAGTGTAAGAAAATTTTTTTTCC

QA 3 398 3 398
DS 

RD RR4A578TF 431 0 0
GG
AAACACACTGAACATTTATCAAAAAAA*CACACTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTA
CAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTCA*CTAGTTTTC
ATGAATGTGCCAACCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACATAAAG
ATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAA
TTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATT*CAA
ATACTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCATGTG
AGGAGCTAGTATTAAGTGTAAGAAAATTTTTTTTCCAAGAGCGCTCTCTCTCTATATCCC
CTTATTATT

QA 3 431 3 431
DS 



AS 1 5

CO CL2049Contig1 823 5 10 U
GATCTTCAACTCACTTGCTTAAATGAATTTAAAACATATATAAACCTAAACCAATTAATA
AAACTCAAAGTTCATCAAGTATACTATGTCTCGTTTTTTTTTCTGCAATAAAATACATCA
CCAGTATACATTTTAAATCATATGGATATTATGCCGTATCACCGGCAAAACCTAGATGAA
GATCCAGCGGGTTAATGCTTCTCTTCGAATCAGAACGAGAAGTCAGATCTCTCTGGAACT
GAATCATGTTTTGTCTCGCACCGTACATCTTACCCATCTCACCATTTTGTTCACTAAAAT
CTTGAGAAGTGTCTTTATTACCAAAGCTAATCTGCGACGACATGGACGACCACTCCTCGT
TGAACAAACCCATCTGATTATTCAAATGCATGGAAGAGAACGCGCAATATGACGGCGTCT
TGTACTGTCTCTGAAATGACGTCGTTATGGGTTGTTGGTGGCTGGTGAGATAATAGCCGA
TGCTGGCTCGTCTAGCTTGAAGCTGAAGCCTCTTCTTCTTCAACCTCTCCTTCTTGTGAG
CGTTTTGGTGACCACCCAAGGCTTGAGAATTTGCAAACTCTTTGCCGCAGTATTGGCACT
CGAGTCTTTTCGTTGTGAACGACGTCGTCTTCTTCGTTGAAGAGCTTACGCTATCCGCCG
TCGTGACATCCGGGGAACGATTACCACCGCTGATGAGTTCGAAGCCGAACAGTTTTATGG
TCTTGTCGGAGGAAGAGCCTGAGGAGCTTTCGCCTGTACGAGACATTGTCGGAGATATAT
ATGTGTTTATGTATTCTGGTTGGTTTAATTAGCTTTAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4GR37JQ U 74
AF RR4GO71JQ U 1
AF RR4EI10JQ U 83
AF RR4GR37TF C 168
AF RR4GO71TF C 176
BS 1 101 RR4GO71JQ
BS 102 102 RR4GR37JQ
BS 103 237 RR4GO71JQ
BS 238 238 RR4GR37JQ
BS 239 695 RR4GO71JQ
BS 696 696 RR4EI10JQ
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BS 727 767 RR4EI10JQ
BS 768 818 RR4GR37TF
BS 819 823 RR4GO71TF

RD RR4GR37JQ 594 0 0
GC
CAAGTATACTATGTCTCGTTTTTTTTTCTGCAATAAAATACATCACCAGTATACATTTTA
AATCATATGGATATTATGCCGTATCACCGGCAAAACCTAGATGAAGGTCCAGCGGGTTAA
TGCTTCTCTTCGAATCAGAACGAGAAGTCAGATCTCTCTGGAACTGAATCATGTTTTGTC
TCGCACCGTACATCTTACCCATCTCACCATTTTGTTCACTAAAATCTTGAGAAGTGTCTT
TATTACCAAAGCTAATCTGCGACGACATGGACGACCACTCCTCGTTGAACAAACCCATCT
GATTATTCAAATGCATGGAAGAAAACGCGCAATATGACGGCGTCTTGTACTGTCTCTGAA
ATGACGTCGTTATGGGTTGTTGGTGGCTGGTGAGATAATAGCCGATGCTGGCTCGTCTAG
CTTGAAGCTGAAGCCTCTTCTTCTTCAACCTCTCCTTCTTGTGAGCGTTTTGGTGACCAC
CCAAGGCTTGAGAATTTGCAAACTCTTTGCCGCAGTATTGGCACTCGAGTCTTTTCGTTG
TGAACGACGTCGTCTTCTTCGTTGAAGAGCTTACGCTATCCGCCGTCGTGAC

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR4GO71JQ 726 0 0
GATCTTCAACTCACTTGCTTAAATGAATTTAAAACATATATAAACCTAAACCAATTAATA
AAACTCAAAGTTCATCAAGTATACTATGTCTCGTTTTTTTT*CTGCAATAAAATACATCA
CCAGTATACATTTTAAATCATATGGATATTATGCCGTATCACCGGCAAAACCTAGATGAA
GATCCAGCGGGTTAATGCTTCTCTTCGAATCAGAACGAGAAGTCAGATCTCTCTGGAGCT
GAATCATGTTTTGTCTCGCACCGTACATCTTACCCATCTCACCATTTTGTTCACTAAAAT
CTTGAGAAGTGTCTTTATTACCAAAGCTAATCTGCGACGACATGGACGACCACTCCTCGT
TGAACAAACCCATCTGATTATTCAAATGCATGGAAGAGAACGCGCAATATGACGGCGTCT
TGTACTGTCTCTGAAATGACGTCGTTATGGGTTGTTGGTGGCTGGTGAGATAATAGCCGA
TGCTGGCTCGTCTAGCTTGAAGCTGAAGCCTCTTCTTCTTCAACCTCTCCTTCTTGTGAG
CGTTTTGGTGACCACCCAAGGCTTGAGAATTTGCAAACTCTTTGCCGCAGTATTGGCACT
CGAGTCTTTTCGTTGTGAACGACGTCGTCTTCTTCGTTGAAGAGCTTACGCTATCCGCCG
TCGTGACATCCGGGGAACGATTACCACCGCTGATGGGTTCGAAGCCGAACAGTTTTATGG
TCTTGT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4EI10JQ 685 0 0
ACTATGTCTCGTTTTTTTTTCTGCAATAAAATACATCACCAGTATACATTTTAAATCATA
TGGATATTATGCCGTATCACCGGCAAAACCTAGATGAAGATCCAGCGGGTTAATGCTTCT
CTTCGAATCAAAACGAGAAGTCAGATCTCTCTGGAACTGAATCATGTTTTGTCTCGCACC
GTACATCTTACCCATCTCACCATTTTGTTCACTAAAATCTTGAGAAGTGTCTTTATTACC
AAAGCTAATCTGCGACGACATGGACGACCACTCCTCGTTGAACAAACCCATCTGATTATT
CAAATGCATGGAAGAGAACGCGCAATGTGACCGCGTCTTGTACTGTCTCTGAAATGACGT
CGTTATGGGTTGTTGGTGGCTGGTGAGATAATAGCCGATGCTGGCTCGTCTAGCTTGAAG
CTGAAGCCTCTTCTTCTTCAACCTCTCCTTCTTGTGAGCGTTTTGGTGACCACCCAAGGC
TTGAGAATTTGCAAACTCTTTGCCGCAGTATTGGCACTCGAGTCTTTTCGTTGTGAACGA
CGTCGTCTTCTTCGTTGAAGAGCTTACGCTATCCGCCGTCGTGACATCCGGGGAACGATT
ACCACCGCTGATGAGTTCGAAGCCGAACAGTTTTATGGTCTTGTCGGAGGAAGAGCCTGA
GGAGCTTTCGCCTGTACGAGACATT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GR37TF 653 0 0
AAAA
CTAGATGAAGGTCCAGCGGGTTAATGCTTCTCTTCGAATCAGAACGAGAAGTCAGATCTC
TCTGGAACTGAATCATGTTTTGTCTCGCACCGTACATCTTACCCATCTCACCATTTTGTT
CACTAAAATCTTGAGAAGTGTCTTTATTACCAAAGCTAATCTGCGACGACATGGACGACC
ACTCCTCGTTGAACAAACCCATCTGATTATTCAAATGCATGGAAGAGAACGCGCAATATG
ACGGCGTCTTGTACTGTCTCTGAAATGACGTCGTTATGGGTTGTTGGTGGCTGGTGAGAT
AATAGCCGATGCTGGCTCGTCTAGCTTGAAGCTGAAGCCTCTTCTTCTTCAACCTCTCCT
TCTTGTGAGCGTTTTGGTGACCACCCAAGGCTTGAGAATTTGCAAACTCTTTGCCGCAGT
ATTGGCACTCGAGTCTTTTCGTTGTGAACGACGTCGTCTTCTTCGTTGAAGAGCTTACGC
TATCCGCCGTCGTGACATCCGGGGAACGATTACCACCGCTGATGAGTTCGAAGCCGAACA
GTTTTATGGTCTTGTCGGAGGAAGAGCCTGAGGAGCTTTCGCCTGTACGAGACATTGTCG
GAGATATATATGTGTTTATGTATTCTGGTTGGTTTAATTAGCTTTAG
CC

QA 5 651 5 651
DS 

RD RR4GO71TF 648 0 0
ATGAAGATCCAGCGGGTTAATGCTTCTCTTCGAATCAGAACGAGAAGTCAGATCTCTCTG
GAGCTGAATCATGTTTTGTCTCGCACCGTACATCTTACCCATCTCACCATTTTGTTCACT
AAAATCTTGAGAAGTGTCTTTATTACCAAAGCTAATCTGCGACGACATGGACGACCACTC
CTCGTTGAACAAACCCATCTGATTATTCAAATGCATGGAAGAGAACGCGCAATATGACGG
CGTCTTGTACTGTCTCTGAAATGACGTCGTTATGGGTTGTTGGTGGCTGGTGAGATAATA
GCCGATGCTGGCTCGTCTAGCTTGAAGCTGAAGCCTCTTCTTCTTCAACCTCTCCTTCTT
GTGAGCGTTTTGGTGACCACCCAAGGCTTGAGAATTTGCAAACTCTTTGCCGCAGTATTG
GCACTCGAGTCTTTTCGTTGTGAACGACGTCGTCTTCTTCGTTGAAGAGCTTACGCTATC
CGCCGTCGTGACATCCGGGGAACGATTACCACCGCTGATGGGTTCGAAGCCGAACAGTTT
TATGGTCTTGTCGGAGGAAGAGCCTGAGGAGCTTTCGCCTGTACGAGACATTGTCGGAGA
TATATATGTGTTTATGTATTCTGGTTGGTTTAATTAGCTTTAGGATCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 5

CO CL2050Contig1 879 5 11 U
GGAAAACTTATTTCATACAATAGTTTAAAGGGGACTTCCTTAACATTCATAGATTTCAAC
TACGCACAAGCACCACCATTTTCAGTGAGTTTCATAGGAAAACACAGTTACTCTAGGAAC
ATCCATGTAACAACAAAGCCTGTATTGAGAGAGTTAGAATCTTCAACACAAAACTTTCAC
GTATCCAGGCAATTTATTTATACAGTAAATAATAAGGGTGGATGATCACCATAGAATGGT
ATAATGGGTTATACAACTCCGGAAAAAAA*CCGGAAATGTCAGTCTTTGTCGGTCTCAGA
TGAGGCAGACTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTGTTTGTTCTTCTCGATAGTGTT
ATGGTTATGAGAAAATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTAACTCCATCACC
CACCAAGATGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTTAATGTTTCTGTCCTCATCATC
GAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGTGTGTATCTTTTGAAAATGCTC
CGTCTTGTGACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGACAAACATGGACTTAATATTCAA
TTTGTCAATGAAAGTGTTGGCGATGTATGAAGTGGGAGATCTGGAAGCAATCGCCATTTG
AATTCCTTTCTCTTTCAGAGCACTCACTATACCCTTTGCTTGTGGATACAAAGACGGCAT
TTCTCGTTTAGAACGACATTCACAGTAGAAAGGCCAGAGAGTATAATCGAGATCGAAAAC
GACAAGTCTAGGAAGGATCTGAAACATTCCAATGATCTGCATCGCTTCATATCTAACCTT
TTCGTCCGCCATCTTTCTGGAATAACCGAGACGGACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F986JQ U 129
AF RR4EF90JQ U 1
AF RR4GI30JQ U 27
AF RR4F986TF C 128
AF RR4EF90TF C 145
BS 1 306 RR4EF90JQ
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BS 308 520 RR4EF90JQ
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BS 619 676 RR4EF90JQ
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BS 735 735 RR4F986TF
BS 736 787 RR4GI30JQ
BS 788 879 RR4F986TF

RD RR4F986JQ 496 0 0
AACAACAAAACCTGTATTGAGAGAGTTAGAATCTTCAACACAAAACTTTCACGTATCCAG
GCAATTTATTTATACAGTAAATAATAAGGGTGGATGATCACCATAAAATGGTATAATGGG
TTATACAACTCCGGAAAAAA**CCGGAAATGTCAGTCTTTGTCGGTCTCAGATGAGGCAA
ACTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTGTTTGTTCTTCTCGATAGTGTTATGGTTAT
GAGAAAATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTAACTCCATCCCCCACCAAGA
TGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTTAATGTTTCTGTCCTCATCATCGAAAAAGA
GCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGTGTGTATCTTTTGAAAATGCTCCGTCTTGT
GACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGACAAACATGGACTTAATATTCAATTTGTCAA
TGAAAGTGTTGGCGAT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4EF90JQ 676 0 0
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TACGCACAAGCACCACCATTTTCAGTGAGTTTCATAGGAAAACACAGTTACTCTAGGAAC
ATCCATGTAACAACAAAGCCTGTATTGAGAGAGTTAGAATCTTCAACACAAAACTTTCAC
GTATCCAGGCAATTTATTTATACAGTAAATAATAAGGGTGGATGATCACCATAGAATGGT
ATAATGGGTTATACAACTCCGGAAAAAAA*CCGGAAATGTCAGTCTTTGTCGGTCTCAGA
TGAGGCGGACTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTGTTTGTTCTTCTCGATAGTGTT
ATGGTTATGAGAAAATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTAACTCCATCACC
CACCAAGATGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTTAATGTTTCTGTCCTCATCATC
GAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGTGCGTATCTTTTGAAAATGCTC
CGTCTTGTGACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGACAAACATGGACTTAATATTCAA
TTTGTCAATGAAAGTGTCGGCGATGTATGAAGTGGGAGATCTGGAAGCAATCGCCATTTG
AATTCCTTTCTCTTTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4GI30JQ 761 0 0
G
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AGTTTCATAGGAAAACACAGTTACTCTAGGAACATCCATGTAACAACAAAGCCTGTATTG
AGAGAGTTAGAATCTTCAACACAAAACTTTCACGTATCCAGGCAATTTATTTATACAGTA
AATAATAAGGGTGGATGATCACCATAGAATGGTATAATGGGTTATACAACTCCGGAAAAA
AAACCGGAAATGTCAGTCTTTGTCGGTCTCAGATGAGGCAGACTTTCCGGAATACTTGTT
GCGCCAAACCTGTTTGTTCTTCTCGATAGTGTTATGGTTATGAGAAAATTCAGTAAGCCC
TTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTAACTCCATCACCCACCAAGATGCTTGTCACTCCCATTTT
AGAAACTGATTTAATGTTTCTGTCCTCATCATCGAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGCAC
CCCTGTCCTTGTGTGTATCTTTTGAAAATGCTCCGTCTTGTGACTCCAACTCGAGAATAT
TTCCTTGGCGACAAACATGGACTTAATATTCAATTTGTCAATGAAAGTGTTGGCGATGTC
TGAAGTGGGAGATCTGGAAGCAATCGCCATTTGAATTCCTCTCTCTTTCAGAGCACTCAC
TATACCCTTTGCTTGTGGATACAAAGACGGCATTTCTCGTTTAGAACCACATTCACAGTA
GAAAGGCCAGAGAGTATAATCGAGATCGAAAACGACAAGT

QA 2 761 2 761
DS 

RD RR4F986TF 752 0 0
T
AACAACAAAGCCTGTAT*GAGAGAGTTAGAATCTTCAACACAAAACTTTCACGTATCCAG
GCAATTTATTTATACAGTAAATAATAAGGGTGGATGATCACCATAGAATGGTATAATGGG
TTATACAACTCCGGAAAAAA**CCGGAAATGTCAGTCTTTGTCGGTCTCAGATGAGGCAG
ACTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTGTTTGTTCTTCTCGATAGTGTTATGGTTAT
GAGAAAATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTAACTCCATCACCCACCAAGA
TGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTTAATGTTTCTGTCCTCATCATCGAAGAAGA
GCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGTGTGTATCTTTTGAAAATGCTCCGTCTTGT
GACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGACAAACATGGACTTAATATTCAATTTGTCAA
TGAAAGTGTTGGCGATGTCTGAAGTGGGAGATCTGGAAGCAATCACCATTTGAATTCCTT
TCTCTTTCAGAGCACTCACTATACCCTTTGCTTGTGGATACAAAGACGGCATTTCTCGTT
TAGAACGACATTCACAGTAGAAAGGCCAGAGAGTATAATCGAGATCGAAAACGACAAGTC
TAGGAAGGATCTGAAACATTCCAATGATCTGCATCGCTTCATATCTAACCTTTTCGTCCG
CCATCTTTCTGGAATAACCGAGACGGACTCC

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR4EF90TF 716 0 0
A
TGAGAGAGTTAGAATCT*CAACACAAAACTTTCACGTATCCAGGCAATTTATTTATACAG
TAAATAATAAGGGTGGATGATCACCATAGAATGGTATAATGGGTTATACAACTCCGGAAA
AAAA*CCGGAAATGTCAGTCTTTGTCGGTCTCAGATGAGGCGGACTTTCCGGAATACTTG
TTGCGCCAAACCTGTTTGTTCTTCTCGATAGTGTTATGGTTATGAGAAAATTCAGTAAGC
CCTTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTAACTCCATCACCCACCAAGATGCTTGTCACTCCCATT
TTAGAAACTGATTTAATGTTTCTGTCCTCATCATCGAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGC
ACCCCTGTCCTTGTGCGTATCTTTTGAAAATGCTCCGTCTTGTGACTCCAACTCGAGAAT
ATTTCCTTGGCGACAAACATGGACTTAATATTCAATTTGTCAATGAAAGTGTCGGCGATG
TATGAAGTGGGAGATCTGGAAGCAATCGCCATTTGAATTCCTTTCTCTTTCAGAGCACTC
ACTATACCCTTTGCTTGTGGATACAAAGACGGCATTTCTCGTTTAGAACGACATTCACAG
TAGAAAGGCCAGAGAGTATAATCGAGATCGAAAACGACAAGTCTAGGAAGGATCTGAAAC
ATTCCAATGATCTGCATCGCTTCATCTCTAACCTTTTCGTCCGCCATCTTTCT
CC

QA 2 714 2 714
DS 



AS 2 5

CO CL2051Contig1 963 2 6 U
GGAGGGTCTACTCTGTCTCTCTCTCTCTCAACGAAGGAACTAATCTCTCTCTAGATTGTT
TTCCTTCCGGGGCTTGATAATGGCGAATCCAGCGCAATCAAAGGGATGGCTTAAGAACTT
TTCGTCGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCATCCTCCAGATCCCTCTCTTCAG
GGTACCATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCTCAGTTGAT
TTCTAGTGACGTCTTCCCCGTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGTGCTATTGT
CAATGGTCTTGCCACCAACATGACGTTTCCAAAGTGGGAGAATGTGTTGGATATTTACAA
TCTTACCAATGTCAAAGAAGCATCTGCTGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAGGTTCTTGC
AGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGGG
CATGTTTGGGTCATTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGCC
AGTGAATACGGACCCAGCTAGAACCGTGTATGTGTACCCGACCATGGTGATTGCGGTGAT
CTGCGCTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTCCTGCTCG
TCCCATTGCTAAACCTCTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAAGTGAGTTTTTTTTTG
AGACTTTTAGGGCTTGTGTCTTGTCTTTTTTTGCCAGTGCAAGGAATGAAAATGGCATTG
TCGTTGTGTTATATTCTCTCTCACTTACCTTGTGTGTTTTCGTTATTTTCTGGAACTCTG
CTCAGCTGTCAGTGTCTTTCAATATCAAACACATACACATTTTTTTAATTTAGTATGGTA
TCATGTCATCAGAGGAGGAGGTTCCAGTATAAGATCATAATGTTACTTGCAGTTTCATAA
TCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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10 10 10 

AF RR4E875TF U 1
AF RR4E875JQ C 232
BS 1 693 RR4E875TF
BS 694 694 RR4E875JQ
BS 695 718 RR4E875TF
BS 719 719 RR4E875JQ
BS 720 752 RR4E875TF
BS 753 963 RR4E875JQ

RD RR4E875TF 763 0 0
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TTCCTTCCGGGGCTTGATAATGGCGAATCCAGCGCAATCAAAGGGATGGCTTAAGAACTT
TTCGTCGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCATCCTCCAGATCCCTCTCTTCAG
GGTACCATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCTCAGTTGAT
TTCTAGTGACGTCTTCCCCGTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGTGCTATTGT
CAATGGTCTTGCCACCAACATGACGTTTCCAAAGTGGGAGAATGTGTTGGATATTTACAA
TCTTACCAATGTCAAAGAAGCATCTGCTGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAGGTTCTTGC
AGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGGG
CATGTTTGGGTCATTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGCC
AGTGAATACGGACCCAGCTAGAACCGTGTATGTGTACCCGACCATGGTGATTGCGGTGAT
CTGCGCTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTCCTGCTCG
TCCCATTGCTAAACCTCTCATGAGCTCTTCGAA*TCTAAGCTCAAGTGAGTTTTTTTT*G
AGACTTTTAGGGCTTGTGTCTTGTCTTTTTTT
GCAGTGCAAGG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4E875JQ 732 0 0
TCAGTTGATTTCTAGTGACGTCTTCCCCGTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGG
TGCTATTGTCAATGGTCTTGCCACCAACATGACGTTTCCAAAGTGGGAGAATGTGTTGGA
TATTTACAATCTTACCAATGTCAAAGAAGCATCTGCTGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGA
GGTTCTTGCAGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGG
TAGGATGGGCATGTTTGGGTCATTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTT
GAAGAAGCCAGTGAATACGGACCCAGCTAGAACCGTGTATGTGTACCCGACCATGGTGAT
TGCGGTGATCTGCGCTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGC
TCCTGCTCGTCCCATTGCTAAACCTCTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAAGTGAGT
TTTTTTTTGAGACTTTTAGGGCTTGTGTCTTGTCTTTTTTTGCCAGTGCAAGGAATGAAA
ATGGCATTGTCGTTGTGTTATATTCTCTCTCACTTACCTTGTGTGTTTTCGTTATTTTCT
GGAACTCTGCTCAGCTGTCAGTGTCTTTCAATATCAAACACATACACATTTTTTTAATTT
AGTATGGTATCATGTCATCAGAGGAGGAGGTTCCAGTATAAGATCATAATGTTACTTGCA
GTTTCATAATCG

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL2051Contig2 896 3 13 U
GGGTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACGAAGGAACTAAATCTCTCTCT
AGATTGTTTTCCTTCCGGGGCTTGATAATGGCGAATCCAGCGCAATCAAAGGGATGGCTT
AAGAACTTTTCGCCGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCACCCTCCAGATCCCT
CTCTTCAGGGTACCATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCT
CAGTTGATTTCTAGTGACGTCTTTCCTGTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGT
GCTATTGTCCATGGTCTTGCCACCGACATGACGTTTCCAACGTGGGAAAACGTCTTAGAT
ATTTACAATCTCACCAATGTCAAAGAAGCATCTGCAGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAG
GTTCTTGCAGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGT
AGGATGGGCATGTTTGGGTCGTTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTG
AAGAAGCCAGTTAATACCGACCCAGCTAGAACCGTTTATGTGTACCCTACCATGGTCATT
GCGGTGATCTGCGCTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCT
GCTCCTGCTCGTCCCATTGCCAAACCTCTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAAATGA
GTTTTTTTTTCGAGACTTTTAGGGCTTGTGTCTTGTCTTTTTTTTTTGCCAATGCAAGGA
ACGAAAATGGCATTGTCGTTGTGTTATATTCTCTCACTTACCTTTTGTGTGTTTTCGTTA
TTTTCTGGAACTCTGCTCAGCTGTCAGTGTCTTTCAATATCAAACACATAAACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES19TF U 1
AF RR4BL39TF U 28
AF RR4BL39JQ C 73
BS 1 65 RR4ES19TF
BS 66 67 RR4BL39TF
BS 68 132 RR4ES19TF
BS 133 133 RR4BL39TF
BS 134 166 RR4ES19TF
BS 167 167 RR4BL39TF
BS 168 340 RR4ES19TF
BS 341 341 RR4BL39TF
BS 342 485 RR4ES19TF
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BS 487 541 RR4ES19TF
BS 542 716 RR4BL39TF
BS 717 896 RR4BL39JQ

RD RR4ES19TF 541 0 0
GGGTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACGAAGGAACTAAATCTCTCTCT
AGATT**TTTCCTTCCGGGGCTTGATAATGGCGAATCCAGCGCAATCAAAGGGATGGCTT
AAGAACTTTTCGTCGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCATCCTCCAGATCCCT
CTCTTCAGGGTACCATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCT
CAGTTGATTTCTAGTGACGTCTTTCCTGTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGT
GCTATTGTCCATGGTCTTGCCACCGACATGACGTTTCCAAAGTGGGAAAACGTCTTAGAT
ATTTACAATCTCACCAATGTCAAAGAAGCATCTGCAGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAG
GTTCTTGCAGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGT
AGGATTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTG
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4BL39TF 690 0 0
CTCTCTCTCTACGAAGGAACTAAATCTCTCTCTAGATTGTTTTCCTTCCGGGGCTTGATA
ATGGCGAATCCAGCGCAATCAAAGGGATGGCTTAAGAACTTTTCGCCGATAGCTTCATGG
GTTTACTTCTTCTTGATCACCCTCCAGATCCCTCTCTTCAGGGTACCATGTAGATCTGGA
ATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCTCAGTTGATTTCTAGTGACGTCTTTCCT
GTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGTGCTATTGTCCATGGTCTTGCCACCGAC
ATGACGTTTCCAACGTGGGAAAACGTCTTAGATATTTACAATCTCACCAATGTCAAAGAA
GCATCTGCAGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAGGTTCTTGCAGGGAGCTACTTCTCTGTA
GCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGGGCATGTTTGGGTCGTTGCTG
CTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGCCAGTTAATACCGACCCAGCT
AGAACCGTTTATGTGTACCCTACCATGGTCATTGCGGTGATCTGCGCTTTCTCTATGATA
AATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTGCTCCTGCTCGTCCCATTGCCAAACCT
CTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAA
A

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4BL39JQ 824 0 0
C
TCCGGGGCTTGATAATGGCGA*TCCAGCGCAATCAAAGGGATGGCTTAAGAACTTT*CGC
CGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCACCCCCCAGATCCCTCTCTTCAGGGTAC
CATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCTCAGTTGATTTCTA
GTGACGTCTTTCCTGTTCCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGTGCTATTGTCCATG
GTCTTGCCACCGACATGACGTTTCCAACGTGGGAAAACGTTTTAGATATTTACAATCTCA
CCAATGTCAAAGAAGCATCTGCAGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAGGTTCTTGCAGGGA
GCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGGGCATGT
TTGGGTCGTTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGCCAGTTA
ATACCGACCCAGCTAGAACCGTTTATGTGTACCCTACCATGGTCATTGCGGTGATTTGCG
CTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTGCTCCTGCTCGTC
CCATTGCCAAACCTCTCATGAGCTTTTCGAAATTTAAGCTCAAATGAGTTTTTTTTTCGA
GACTTTTAGGGCTTGTGTCTTGTCTTTTTTTTTTGCCAATGCAAGGAACGAAAATGGCAT
TGTCGTTGTGTTATATTCTCTCACTTACCTTTTGTGTGTTTTCGTTATTTTCTGGAACTC
TGCTCAGCTGTCAGTGTCTTTCAATATCAAACACATAAACACG

QA 2 824 2 824
DS 



AS 2 4

CO CL2052Contig1 524 2 18 U
GGGTTCCTCAATGACGATTAAAATTTACTTGAAATTTTACAATGATCTACTAACAAATCT
GATTTTTAACAAAATAAGTTAATTTACAAAGTTTATAGACAATAATCATGCATGCACGCT
ATTAACTATTGAACATGCTTTCCAAAAAAAGAAAAAAAAAACTATTGAACTTATGAAAAA
GCTGGGGGGTGATGTAGGCTCGAGCTGACCCCATGATTCCATAAACAATTATGGATGGCT
GAAATTCAAAGTCCATCGTAGTAACCTCCAAAAGATATTTGAACTCTTACGAGAGGAACA
CCTTTCATGGCAAAAATTGCTTCACTGACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCCCTCATC
TTATTATCATCGGAGTAAATATGAAACCTAAGCTTGTGGTTCTTGTTCTTACAAACTTTG
ATGTCGTTGTGTCCGAGGAATAAAACACACACGGTAGCTGCAGCTGCTGCAACACCAAAA
GAGCATATTGCTCCGATCCCATTCAGACCAATCTTCCACAGATT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D645JQ U 1
AF RR4GG96JQ U 6
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BS 178 178 RR4GG96JQ
BS 179 185 RR4D645JQ
BS 186 186 RR4GG96JQ
BS 187 223 RR4D645JQ
BS 224 224 RR4GG96JQ
BS 225 226 RR4D645JQ
BS 227 227 RR4GG96JQ
BS 228 314 RR4D645JQ
BS 315 315 RR4GG96JQ
BS 316 380 RR4D645JQ
BS 381 381 RR4GG96JQ
BS 382 436 RR4D645JQ
BS 437 524 RR4GG96JQ

RD RR4D645JQ 439 0 0
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GATTTTTAACAAAATAAGTTAATTTACAAAGTTTATAGACAATAATCATGCATGCCCGCT
ATTAACTATTGAACATGCTTTCCAGAAAAAGAAAAAAAAAACTATTGAACTTATGAAGAA
GCTGGTGGGTGATGTAGGCTCGAGCTGACCCCATGATTCCATAGACGATTATGGATGGCT
GAAATTCAAAGTCCATCGTAGTAACCTCCAAAAGATATTTGAACTCTTACGAGAGGAACA
CCTTTCATGGCAAAGATTGCTTCACTGACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCCCTCATC
TTATTATCATCGGAGTAAATCTGAAACCTAAGCTTGTGGTTCTTGTTCTTACAAACTTTG
ATGTCGTTGTGTCCGA
AGA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4GG96JQ 519 0 0
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TTAACAAAATAATTTAATTTACAAAGTTTATAGACAATAATCATGCATGCACGCTATTAA
CTATTGAACATGCTTTCCAAAAAAA*AAAAAAAAAACTATTGAACTTATGAAAAAGCTGG
GGGGTGATGTAGGCTCGAGCTGACCCCATGATTCCATAAACAATTATGGATGGCTGAAAT
TCAAAGTCCATCGTAGTAACCTCCAAAAGATATTTGAGCTCTTACGAGAGGAACACCTTT
CATGGCAAAAATTGCTTCATTGACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCCCTCATCTTATT
ATCATCGGAGTAAATATGAAACCTAAGCTTGTGGTTCTTGTTCTTACAAACTTTGATGTC
GTTGTGTCCGAGGAATAAAACACACACGGTAGCTGCAGCTGCTGCAACACCAAAAGAGCA
TATTGCTCCGATCCCATTCAGACCAATCTTCCACAGATT

QA 1 519 1 519
DS 



CO CL2052Contig2 1070 2 6 U
CCTTAGTTGAAATTTTACGATGATATATTAACAAATCTGATTTTTAACAAAATAAGTTGA
TTTACAAAGTTTATAGACAATAATCATGCATGCACGCTATTAACTATTGAACTTATGCTT
TTCAAAAGAAAAAAAAAACTATTGAACTTATGAAGAAGCTGGGGGGTGATGTAGGCTCGA
GCTGACCCCATGATTCCATAGAGGATTATCGATGGCTGAGATTCAAAGTCCATCGTAGTA
ACCTCCAAAAGATATTTGAGCTCTTACGACAGGAACACCTTTCATGGCAAAGATTGCTTC
ATTGACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCCCTCATCTGCTTATTATCATCGGAGTAAAT
CTGGAACCTAAGCTTGTGGTTCTTGTTCTTACAAACTTTGATGTCGTTGTGTCCGAGGAA
TAAGACACACACGGTAGCTGCAGCTGCTGCAACACCAAAAGAGCATATTGCTCCGATCCC
ATTCAGACCAATCTTCCACAGATTAGCCTTCTCACCACCATGATCACTCCTCACATCGTC
ATCTTCTTTCTTCTCTCGCACGTCATCACTTCCTTCGGAATCAGAGGGTTTCGCAGCATC
GATCAAAGACACAGGACTCGTGATCCTCGCTGGTGGGTCCACTTTCATGTCGGCAAATTC
GGTTTCCTTCGTTTTATTGAAGGATACTGTTGGTGACAGAACAGAGTCCGTCAAAAGGGT
TTGTGTTGGATCAGGCTCATTAGGTATCTTCTTGTTCTCGTGATCCAACACGGGTTCCCA
AGCTATGGGAACTTGGAGGAGCTTTGTGGGGATCACTTTGGATCTTGGAGGAGACTCTAT
CTTGTGGAGAGGTTCTTGTTGAGCAGATGGACAGAGGAAGTAGTCCATCACCATGCCTCC
ATGATGATCCTCGTCGTGATCAAGATCCTTGAAGCTGTTCTTGGGACTGGGGAGTAACTC
CCATTCCTCAAGATCCATCTCTTCTTGAGCCGATCTCATTGGAGCCTCAGTCAGAATTTG
AGAAAGTGAGATCTTTTGAATTATTGGAGCCAAGTGGGGTTTGTGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
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AF RR4H334JQ U 1
AF RR4GG96TF C 577
BS 1 603 RR4H334JQ
BS 604 604 RR4GG96TF
BS 605 627 RR4H334JQ
BS 628 628 RR4GG96TF
BS 629 658 RR4H334JQ
BS 659 1070 RR4GG96TF

RD RR4H334JQ 658 0 0
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TTTACAAAGTTTATAGACAATAATCATGCATGCACGCTATTAACTATTGAACTTATGCTT
TTCAAAAGAAAAAAAAAACTATTGAACTTATGAAGAAGCTGGGGGGTGATGTAGGCTCGA
GCTGACCCCATGATTCCATAGAGGATTATCGATGGCTGAGATTCAAAGTCCATCGTAGTA
ACCTCCAAAAGATATTTGAGCTCTTACGACAGGAACACCTTTCATGGCAAAGATTGCTTC
ATTGACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCCCTCATCTGCTTATTATCATCGGAGTAAAT
CTGGAACCTAAGCTTGTGGTTCTTGTTCTTACAAACTTTGATGTCGTTGTGTCCGAGGAA
TAAGACACACACGGTAGCTGCAGCTGCTGCAACACCAAAAGAGCATATTGCTCCGATCCC
ATTCAGACCAATCTTCCACAGATTAGCCTTCTCACCACCATGATCACTCCTCACATCGTC
ATCTTCTTTCTTCTCTCGCACGTCATCACTTCCTTCGGAATCAGAGGGTTTCGCAGCATC
GATTAAAGACACAGGACTCGTGATCCTTGCTGGTGGGTCCACTTTCATGTCGGCAAAT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GG96TF 494 0 0
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GTCCACTTTCATGTCGGCAAATTCGGTTTCCTTCGTTTTATTGAAGGATACTGTTGGTGA
CAGAACAGAGTCCGTCAAAAGGGTTTGTGTTGGATCAGGCTCATTAGGTATCTTCTTGTT
CTCGTGATCCAACACGGGTTCCCAAGCTATGGGAACTTGGAGGAGCTTTGTGGGGATCAC
TTTGGATCTTGGAGGAGACTCTATCTTGTGGAGAGGTTCTTGTTGAGCAGATGGACAGAG
GAAGTAGTCCATCACCATGCCTCCATGATGATCCTCGTCGTGATCAAGATCCTTGAAGCT
GTTCTTGGGACTGGGGAGTAACTCCCATTCCTCAAGATCCATCTCTTCTTGAGCCGATCT
CATTGGAGCCTCAGTCAGAATTTGAGAAAGTGAGATCTTTTGAATTATTGGAGCCAAGTG
GGGTTTGTGTATCC

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 5

CO CL2053Contig1 940 5 16 U
GGCATAACAATACAACCATCTCTAGAAGTGAGGTAGCATAACAATACAACCATCTTTAAA
TTAAACTTAATTTATTTTCTTACTTTAATTACGAAAAATATGAAACATAATTCTACCAGT
TACAAAAAGAAAATCAAAATCGAACCAACTGCAACTGACCGATGCATATATCGTTTACAT
TTCTTCTTTTTTTT*GGTAAAATATCGTTTACTTTTTTCACCACTTCACCATTTATGTGG
AGTTGGAATTAGCTCAAGAGGAACTTTCTTGGCGATGACGAAAGCTCCAGCTTCTTCCAT
GTCTATGTCTTCAATGGTCATTCCATCAGGCAAACTCCAATCAAAGAAGTAGAGAACGTT
AAGTAAACCTAGTTCGACGATAGTTATCCCCGTGGCCATCCCAGGACAAATCCTGCGACC
AGCACCAAATGGCAACAACTCGTAATGTTGACCCTTATATTCGACAGGGCTATCGATAAA
TCTCTCGGGGATGAAATCATTAGGGTTTTCCCAACAATTGGGATCACGCCCTATTGCGTA
AGTGTTGATCTCGATCATTGTGTTTTTGGGAATGTTGTAGCCTTGAATCTTGATATCAGA
CATGGTCTCTCTTGGGAGTAAGAGAGGAGCTGGTGGGTGTAATCTAAATGTTTCTTGGAT
CACAAGTTTCAAGTAGTGAACCTTCTCTAGATCTTGTTCAGTGATTTTTTCTTTCTTGTC
ACCAAGGGTTACTCGGATCTCTTGTTGGAGTTTCTTCATCACTTTTGGGTGTCTAGTTAG
CTCTGTCATCGCCCATATCATGGTGATTGCTCCTGCGTTTACTCCTGCTAAAAACACATC
CGACATAACTCCTTTTAGATGATCATAGGCGACTTTAAACGAACCAAGTTTGCTTTCTTT
ATTGATCATATCCCACATGACACTAATGATGTCTGAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TTAAACTTAATTTATTTTCTTACTTTAATTACGAAAAATATGAAACATAATTCTACCAGT
TACAAAAAGAAAATCAAAATCGAACCAACTGCAACTGACCGATGCATATATCGTCTACAT
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AGTGTTGATCTCGATCATTGTGTTTTTGGGAATGTTGTAGCCTTGAATCTTGATATAAGA
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CACAAGTTTCAA

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CAAGGGTTACTCGGATCTCTTGTTGGAGTTTCTTCATCACTTTTGGGTGTCTAGTTAGCT
CT

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CAAAAAGAAAATCAAAATCGAACCAACTGCAACTGACCGATGCATATATCGTTTACATTT
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CTATGTCTTCAATGGTCATTCCATCAGGCAAACTCCAATCAAAGAAGTAGAGAACGTTAA
GTAAACCTAGTTCGACGATAGTTATCCCCGTGGCCATCCCAGGACAAATCCTGCGACCAG
CACCAAATGGCAACAACTCGTAATGTTGACCCTTATATTCGACAGGGATATCGATAAATC
TCTCGGGGATGAAATCATTAGGGTTTTCCCAACAATTGGGATCACGCCCTATTGCGTAAG
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TGGTCTCTCTTGGGAGTAAGAGAGGAGCTGGTGGGTGTAATCTAAATGTTTCTTGGATCA
CAAGTTTCAAGTAGTGAACCTTCTCTAGATCTTGTTCAGTGATTTTTTCTTTCTTGTCAC
CAAGGGTTACTCGGATCTCTTGTTGGAGTTTCTTCATCACTTTTGGGTGTCTAGTTAGCT
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DS 

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CATTGTGTTTTTGGGAATGTTGTAGCCTTGAATCTTGATATCAGACATGGTCTCTCTTGG
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TAGATGATCATAGGCGACTTTAAACGAACCAAGTTTGCTTTCTTTATTGATCATATCCCA
CATGACACTAATGATGTCTGAATGG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 5

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GATAAAATAGGCTGACGGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C623JQ U 3
AF RR4GF72JQ U 1
AF RR4FZ62JQ U 3
AF RR4FZ62TF C 135
AF RR4GF72TF C 666
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BS 152 152 RR4C623JQ
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BS 196 196 RR4C623JQ
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BS 200 228 RR4GF72JQ
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BS 230 569 RR4GF72JQ
BS 570 704 RR4FZ62JQ
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GAGTGGCCGCCAAGCAAATCCCACCTTGTGCAAGTCTCTTCTCCACAACAGGCAACCGAC
AGAGAAAATAGTCATCTCCTAAAGTAGTCCCTGGGGTAGCGTTTCTGTAAGCATACTTGC
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GAATCATGAGCGG

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DS 

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GTATGCTATCGACTACTTATTCTAGTTAAACTAAACTAAAACAAAAGCCATGGCACAAAA
CGTAATTAAACATTTTTTTGAGTTAATGAGCGAATAGAGTGTGACTGCATCATACTGAGC
ATCCCTTTTACTTAGCTTTCAAGCTCCAGCAAGCTTAGGTTTTGAAGAGAAGATACGGTT
AAGAGTGGCCGCCAAGCGAATCCCACCTTGTGCAAGTCTCTTCTCCACAACAGGCAACCG
AGAGAGAAAATAGTCATCTCCTAAAGTAGTCCCTGGGGTAGCGTTTCTGTAAGCATACTT
GCAAGCCAGACTTATGCTTTCAGATGCATACGAATTTGGACAGGCCGTTTGGTTAAGTTG
ACATGATTCCCACGACGGAACATCGTTTGACCAGCCATGCGTGAGATTGGCTTGAAGTGC
TTGAATCATGAGCGGAAGACTTTTATTGTAGTATGTTTTAAGAGCAGACTCAATTATCAT
GTTATCCCACACATGGTGCAAATTTGTTT

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DS 

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ATGCTATTGACTACTTATTCTAGTTAAACTAAACTAAAACAAAAGCCATGGCACAAAACG
TAATTAAACATTTTTT*GAGTTAATGAGCTAATAGAGTGTGACTGCATCATACTGAGCAT
CCCTTTTACTTAGTTTCCAAGCTCCAGCAAGCTTAGGTTTTGAAGAAAAGATACGGTTAA
GAGTGGCCGCCAAGCGAATCCCACCTTGTGCAAGTCTCTTCTCCACAACAGGCAACCGAG
AGAGAAAATAGTCATCTCCTAAAGTAGTCCCTGGGGTAGCGTTTCTGTAAGCATACTTGC
AAGCCAGACTTATGCTTTCAGATGCATACGAATTTGGACAGGCCGTTTGGTTAAGTTGAC
ATGATTCCCACGACGGAACATCGTTTGACCAGCCATGCGTGAGATTGGCTTGAAGTGCTT
GAATCATGAGCGGAAGACTTTTATTGTAGTATGTTTTAAGAGCAGACTCAATTATCATGT
TATCCCACACATGGTGCAAATTTGTTTTGCGACGATACCAACGGACTGTTATCGTGTTTC
CACCTTCATCTCCCAGGAAACCAACATGCAACGGCTGGTGAACATCTCCGATATAATGAG
ATAAGAACATGAGAGCCTCTGTCAAGTTATAGTGGACTATCC
CTCCGGGGAGTTTTTA

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GTTTCCA*GCTCCAGCAAGCTTAGGTTT*GAAGAAAAGATACGGTTAAGAGTGGCCGCCA
AGCGAATCCCACTTTGTGCAAGTCTCTTCTCCACAACAGGCAACCGAGAGAGAAAATAGT
CATCTCCTAAAGTAGTCCCTGGGGTAGCGTTTCTGTAAGCATACTTGCAAGCCAGACTTA
TGCTTTCAGATGCATACGAATTTGGACAGGCCGTTTGGTTAAGTTGACATGATTCCCACG
ACGGAACATCGTTTGACCAGCCATGCGTGAGATTGGCTTGAAGTGCTTGAATCATGAGCG
GAAGACTTTTATTGTAGTATGTTTTAAGAGCAGACTCAATTATCATGTTATCCCACACAT
GGTGCAAATTTGTTTTGCGACGATACCAACGGACTGTTATCGTGTTTCCACCTTCATCTC
CCAGGAAACCAACATGCAACGGCTGGTGAACATCTCCGATATAATGAGATAAGAACATGA
GAGCCTCTGTCAAGTTATAGTGGACTATCCTCCGGGAGTTTTTAGAAGCAGACATAAGCT
GCATCGTGTAATTAAAAATGGCTCCAGTCACACACCGGTCCTGATGCTTATGAGTATCAT
GGCAATCCCGACAATAGTGGTAGTTGCATCTGTAATCAGGAGTGTCAACAAAGTGTAAAG
GGCTAGTCCAACGCCATTGCCAATGGTGTTTAATCTCATCAGGCCATGAACAAACAGATG
C
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4GF72TF 615 0 0
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GAGTATCATGGCAATCCCGACAATAGTGGTAGTTGCATCTGTAATCAGGAGTGTCAACAA
AGTGTAAAGGGCTAGTCCAACGCCATTGCCAATGGTGTTTAATCTCATCAGGCCATGAAC
AAACAGATGCTAAGTCTCCTTCAGCTGATTCAGGTAACAGTCTCTTCACTGCAGCTACAG
TTTCTTCCTCAAAGTAGCTCTCTGCTATTTTGCAGACGGTGTAGTGGCCTTCTTTGCCCC
AACTCAAAGCTCCGTGGATGGGCTGTGTAAGCACGAGTACTCTCGCAAACCACACTCGCA
GCGACAGTTTCATTCTTCACAAAGTTTTGATCTTGCTCTTCCACAATTGGTTCACCTGCT
CGGCTCTGGAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTTAATTTAATTAAAAGGGGACAAAG
CCCGATAAGTAACCATACAAGCTCGAGGCCCAGATCACAACAAACTTAAACAAAAGATAA
AATAGGCTGACGGCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 5

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ACATTTATAGAGGTATATGATGTTTAACTCACAATTAATAGCATATTACAAGACACGAAT
GTTATCTACAGAGTAGTGAGCTTTCATGAGATGACTCCTCATTTATGTGCTTGAGCGACC
GACTAGTCTCTTAACCATAACATCGGATTGGATCGTTGCAACCTTTCTCAGCTGATTGTC
TGCGACCCATGCTACCGCCTTTACCCAGGTATTGCTGGTGGTATTCTTCTGCTCTGTAGA
ATTTCTTGGCGGGAAGTATCTCAGTAACAATCTTCTTGTTCAAGATCTTCTCCTGCTTCT
CCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCGGT
ACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCCAGA
AAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACATTCTTTAGGATCGTACTGAACTCTAACAACCT
CGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTGTGCACGAACCCAT
GGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCAGTC
CCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGTTGACCTGGCGAAGGAACGTCATCGT
CAGGTCCTTCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAAGTAGAACCGTACCCGA
GTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAGCGGTTTTGG
GGAAGGGACAAATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAGAGAGGGAATGTAGAGGTT
TAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGAAGAGGTGATGAGAGCTAGCATTATCGAAG
TGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTATTTCTCTCCAAGTTTGCA
CGAGATTGTTCTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E015JQ U 1
AF RR4DX70JQ U 1
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AF RR4E015TF C 358
AF RR4DX70TF C 415
BS 1 717 RR4DX70JQ
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RD RR4E015JQ 585 0 0
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CCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCGGT
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CGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGAT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4DX70JQ 717 0 0
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ACATTTATAGAGGTATATGATGTTTAACTCACAATTAATAGCATATTACAAGACACGAAT
GTTATCTACAGAGTAGTGAGCTTTCATGAGATGACTCCTCATTTATGTGCTTGAGCGACC
GACTAGTCTCTTAACCATAACATCGGATTGGATCGTTGCAACCTTTCTCAGCTGATTGTC
TGCGACCCATGCTACCGCCTTTACCCAGGTATTGCTGGTGGTATTCTTCTGCTCTGTAGA
ATTTCTTGGCGGGAAGTATCTCAGTAACAATCTTCTTGTTCAAGATCTTCTCCTGCTTCT
CCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCGGT
ACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCCAGA
AAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACATTCTTTAGGATCGTACTGAACTCTAACAACCT
CGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTGTGCACGAACCCAT
GGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCAGTC
CCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGTTGACCTGGCGAAGGAACGTCAT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4H842JQB 668 0 0
GTAAAACTAATACAGTATCACACATTTATAGAGGTATATGATGTTTAACTCACAATTAAT
AGCATATTACAAGACACGAATGTTATCTACAGAGTAGTGAGCTTTCATGAGATGACTCCT
CATTTATGTGCTTGAGCGACCGACTAGTCTCTTAACCATAACATCGGATTGGATCGTTGC
AACCTTTCTCAGCTGATTGTCTGCGACCCATGCTACCGCCTTTACCCAGGTATTGCTGGT
GGTATTCTTCTGCTCTGTAGAATTTCTTGGCGGGAAGTATCTCAGTAACAATCTTCTTGT
TCAAGATCTTCTCCTGCTTCTCCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGT
AGTAGTATATGCCTGACCGGTACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGG
TGGGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAAGTTCTCAAGGCTACACTCTTTAGGAT
CGTACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATA
TCGGATTGTGCACGAACCCATGGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTC
TCTGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAACATGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGAC
CTGGCGAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4E015TF 679 0 0
TCTCCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAGTAGTATATGC*TGACC
GGTACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCC
AGAAAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACATTCTTTAGGATCGTACTGAACTCTAACAA
CCTCGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTGTGCACGAACC
CATGGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCA
GTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGTTGACCTGGCGAAGGAACGTCAT
CGTCAGGTCCTTCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAAGTAGAACCGTACC
CGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAGCGGTTT
TGGGGAAGGGACAAATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAGAGAGGGAATGTAGAG
GTTTAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGAAGAGGTGATGAGAGCTAGCATTATCG
AAGTGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTATTTCTCTCCAAGTTT
GCACGAGATTGTTCTTTCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DX70TF 622 0 0
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TCCAGAAAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACATTCTTTAGGATCGTACTGAACTCTAA
CAACCTCGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTGTGCACGA
ACCCATGGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACT
CCAGTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGTTGACCTGGCGAAGGAACGT
CATCGTCAGGTCCTTCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAAGTAGAACCGT
ACCCGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAGCGG
TTTTGGGGAAGGGACAAATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAGAGAGGGAATGTA
GAGGTTTAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGAAGAGGTGATGAGAGCTAGCATTA
TCGAAGTGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTATTTCTCTCCAAG
TTTGCACGAGATTGTTCTTTCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2056Contig1 1260 4 13 U
GGGAGTGGTACTTTGTTGGGATCAGATTCAAAAAAAATCTCACACGACGAGAAAAGAGAA
AAATGGCGAATGAATCAGCACCTGGAATCGCCATTCTCGGAGCTGGGATCTTCGTCAAGA
CGCAGTACATTCCTCGCTTGGCTGAGATCTCCGATCTCCTCATCCTCAAAGCCATTTGGA
GCCGTACTGAGGAATCTGCAAAAGGAGCTGTGGAGGTAGCACGGAAGCATTTTCCCGGAG
TGATGTGCAAATGGGGAGATGAAGGATTGAATGAGATCATTCAAGATAGTTCCATTCTTG
GTGTTGCTGTTGTCATTGCTGGCCAAACCCAGGTTGAAATGTCACTGAAGATGCTCAAGG
CAGGAAAGCACGTCCTTCAAGAGAAGCCAGCTGCTGCTTCAATCGGTGAGATTGAAACTG
CAATGACAAGCTATAAAAATATTTCTGCTGATTCCCCATGCCGTCCAATCTGGGCTGTGG
CTGAAAATTATCGTTTTGAACCAGCTTTTGTTGAGTTGAAGAAACTGGTGGAAGAAATTG
GGGGTATGATGAACGTCCAACTTATTATTGAGGGATCAATGAACAGTTCCAATCCTTACT
TCTCAAGCTCCTGGAGACGAAATTTGGACGGTGGTTTCATCTTGGATATGGGTGTGCATT
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CTTACAGGTATTGTGAAGACATCAAGAACCACCAAAGAAGCATTGTTTGAATAAAATTTA
ATGGGGATTCAAACCGAAACTATTTGTAACCAACCCTTTATTATCCCGATCATTATTAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CGCA

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ACATTG

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TCTCAAGCTCCTGGAGACGAAATTTGGACGGTGGTTTCATCTTGGATATGGGTGTGCATT
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CCCATGTTGATAAGACTTTGCCTGCACCAGACAATATAACATCAAACTTTCAGCTAGAGA
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GAGTCGTAG
ACT

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AAGAATGCTAGTTGGATGTGAGGTAGCATCAGTCTCAGCCACCACTTCCCATGTTGATAA
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AGTTTACGGGGAAGGAGGGACGTCAAGGACCATCTTTTACCCGTTCAGTGGAGTTACTGA
AGAGCTAAAAGCATTTTTCAGTGACATTTCAGGGACTTCAAAGGAGCAAGAGCCTCGTCT
ATCATACGTGGAAGGTGCTCGGGACGTTGCTGTTCTTGAAGCAATGCTTGAATCTGGTGC
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CCGAAACTATTTGTAACCAACCCTTTATTATCCCGATCATTATTAAG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 4

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GGAAGCTCAGCAGAACCAACCATATACTCTGGATTCTTTGTGCATTCCCCAAGGACCGCC
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AATGAGTCCACGTGGATCCACTTGGTCGCTGACCATTTCTCTCCTTCGATCACGGGGCAT
CCACCGTGAAGGCTCAACGGGTCAGGGATTGCGTCAGGGTGGAGGTTGAAGAACAACAAA
GCATCCCCTTTCCTTGGTTTCACGGCGATTCCTTTCTTGGCACAATCAGAAAGGTCTTCT
TGGTTCTCAGATAGTACTCGGCGAGAAGGTATCTCGGCATGGGGGAAGACGGTTTCTCCA
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ATGTTGACTTTGTCATGAAAGTAGTCAAAGTGAGCATCGTATTTTTGACCGTGTTCGTAT
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TCTTCTATACCAGCAACAATGGGATCCTTTGCTTTGGGGATAAAGGTGCCAGAGCTGGTT
CGAACTTCGCTGAGCTTGCTCTCTCCACTATCATTATCAGCTACAGCTGATCTCTTGAGG
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GTGGAAGATTGAAGCAGGACGGAGAAAAATAATATAGCCAAGAACAAAAACGATACATTA
TGAGACATCGACATCGTTTTGTCGATCGGATCTAAGATTGAACGAGAGTCGGTGCAACGA
AG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

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TGAAGGCTCAACGGGTCAGGGATTGCGTCAGGGTGGAGGTTGAAAAACAACAAAGCATCC
CCTTTCCTTGGTTTCACGGCGATTCCTTTCTTGGCACAATCAGAAAGGTCTTCTTGGTTC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RR4A443JQ U 1
AF RR4A657JQ U 1
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TATGGCATCTCCGGTTGGTATGGCGACGGCGGCATAAACAAAACCGGTCTCTGCTGACTA
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GTTGCTGCATCTTCATTAATATCTTCAAGACCAGACACTGATTCC

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TACTGTGGACTATTAGGAGAATAGTAAGTTTGATTTGGACCAAGCTGCTGAGGTGTATTG
TTGTTATACATCATTGGATGTTGTTGTCCAGGGAATGCTGCTCCCATTCCGTATAAAATG
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TTCTTCTTCTTCCTCTTCATAACCCGAATCACCAAATCCC

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 3

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AATAGTTTTCAGAATAGAACACAGATACTCTAGCAGAAGAGTTTACTGAGAAAAAGAAAC
ACAGCAAAAAAGAAACAGAATACAGGGTCCATTATGTTGTGGATCATCCCCTCCCTATTC
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TTCCTCTACTTGTTCACGAAGCTTCTCACCAAATGCCGTTGTTGCTCCATCAGCGAAACA
ATCAATACGGGAAGCTATAGAGCATTTGTTTGCAAGATAACGAGCGATACGGCCCTTGTT
CTTAGCAGATGCTCGGCCAATGAAGGACGAATGGAAAATCAACCCATACTTGGGTGTGTT
TCCTCGCGTTTTAAGCGCCCTGAAAAGCGCCTTCTCGGCTCCGAGAATCTGGAGGGTAGA
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CATATCTCCAATAGAGGGCATCGAGGGCAGACTCGAAGGGATGAAAAGCGGTCAGCTGGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU21JQ U 1
AF RR4GE46JQ U 36
AF RR4GE46TF C 428
BS 1 220 RR4DU21JQ
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RD RR4DU21JQ 734 0 0
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AGATGGGCACTTGG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GE46JQ 752 0 0
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TCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTCTGATTTCTCATTCTCCTCTTCTGTCTCCATCTTCCTCT
TCTCTTTCTTCTTCTTTTTCTCTGACTTCTCCTCATCCACTGCCTCCTTCCCTTCCTCAT
CTTTGTTTTGCAGATTCTCTATCACCTCCTTCATTACATCTACGTTCTTGCGTGGAGCAA
CACCTTTGTCGTAAAAGTCTAGCCTTTCCTCTACTTGTTCACGAAGCTTCTCACCAAATG
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CGGCTCCGAGAATCTGGAGGGTAGAAGATGGGCACTTGGCAAGGTTAGTCAGACTTCCAG
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QA 1 752 1 752
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GTTTTAAGCGCCCTGAAAAGCGCCTTCTCGGCTCCGAGAATCTGGAGGGTAGAAGATGGG
CACTTGGCAAGGTTAGTCAGACTTCCAGCATGTGAAATGAGACGGGCACCGACCATATCT
CCAATAGAGGGCATCGAGGGCAGACTCGAAGGGATGAAAAGCGGTCAGCTGGACAACACG
ACCAAAGCGACTGAGGTCCGAGACTGAGCTCCGTACGGCCTCTGTGTTCTGTCCGATCTC
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AGCCATTCTTCGTTTCAGAGGAGAGACAAAAGCTAAAACCCTAAAAATGAAATGAATTAT
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AS 1 5

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AGTTTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGCGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGG
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TCTTGAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAAA*TTGGGATCTTTG
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CTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCCCTGTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTA
ACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 

AF RR4G491TF U 1
AF RR4BO44JQ C 394
AF RR4CI66JQ C 394
AF RR4BO44TF U 394
AF RR4CI66TF U 394
BS 1 467 RR4G491TF
BS 468 468 RR4BO44TF
BS 469 520 RR4G491TF
BS 521 521 RR4BO44TF
BS 522 541 RR4G491TF
BS 542 542 RR4BO44TF
BS 543 701 RR4G491TF
BS 702 706 RR4BO44TF

RD RR4G491TF 701 0 0
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CTTCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGACAAAGTCT
TAAGCCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTCAAGACTTGCAA
ATCCAAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCAT
AGTTTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGCGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGG
TGTGAATTTGACTGATCATTTTAATGGTCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTG
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TCTTGAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAAAATTGGGATCTTTG
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ACGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTCTTTCATGT
CTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCCCTGTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTA
ACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4BO44JQ 313 0 0
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GAAGTTT*CTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTATCTTT
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CTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACT
ACTTTTTAAGATC

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR4CI66JQ 313 0 0
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CTTCTTCAAAAAAA*TTGGGATCTTTGTGCTATATTATTATCCATTCAAAAACGTCAGAA
GAAGTTT*CTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTATCTTT
GATCGTTTTGTTGTTTTTCTTTCATGTCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCCCTGT
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ACTTTTTAAGATC

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR4BO44TF 313 0 0
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CTTCTTCAAAAAAA*TTGGGATCTTTGTGCTATATTATTATCCATTCAAAAACGTCAGAA
GAAGTTT*CTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTATCTTT
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ACTTTTTAAGATC

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR4CI66TF 313 0 0
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ACTTTTTAAGATC

QA 1 313 1 313
DS 



AS 1 5

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TATGCGACTACTGCAACGACAGCCCTTTTGATCAGATTCTAAGAGGTGGGATTTGAGTCA
TGCGGTACGTGGCCAAGTGTGTCATGGTTTTTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGT
GTGTCATGGTTTGTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGTGTGTCATGGTTTGTGTAA
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AAAAAGCCGGAAATATCTGAGGCTCACATGGTTTTTGATC


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BG79JQ C 1
AF RR4BG79TF U 1
AF RR4CP06JQ C 1
AF RR4C787TF U -5
AF RR4CP06TF U 1
BS 1 335 RR4BG79TF
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BS 337 564 RR4BG79TF
BS 565 580 RR4CP06TF

RD RR4BG79JQ 285 0 0
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AGGGGGCTAAAGGTGGAAGATGCATTTGGGGAGCTGCCGGGGCTG

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR4BG79TF 569 0 0
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TGCGGTACGTGGCCAAGTGTGTCATGGTTTTTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGT
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AAAAAGCCGGAAATATCTGAGGCT
AAAAC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4CP06JQ 580 0 0
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TGCCGGAGATAATAGCCCAGGATAGCGAGTGCCTGAAAGAATACGGTGGTGATGTGGGTT
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AGGGGGCTAAAGGTGGAAGATGCATTTGGGGAGCTGCCGGCGCTGGCGGTGTTAAATGCT
TATGCGACTACTGCAACGACAGCCCTTTTGATCAGATTCTAAGAGGTGGGATTTGAGTCA
TGCGGTACGTGGCCAAGTGTGTCATGGTTTTTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGT
GTGTCATGGTTTGTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGTGTGTCATGGTTTGTGTAA
TAATAAATGTGAAAGTGGCACAACTGTACAAGTAATAATGTAATAACGAGTATGTGAAAT
AAAAAGCCGGAAATATCTGAGGCTCACATGGTTTTTGATC

QA 1 580 1 580
DS 

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GGCTTCTGTGCGCCTCGGATTTTTCCGACGATTTGTTATACAAGATGCCGTGAGAACAAG
GGGGCTAAAGGTGGAAGATGCATTTGGGGAGCTGCCGGCGCTGGCGGTGTTAAATGCTTA
TGCGACTACTGCAACGACAGCCCTTTTGATCAGATTCTAAGAGGTGGGATTTGAGTCATG
CGGTAC*TGGCCAAGTGTGTCATGGTTTTTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGTGT
GTCATGGTTTGTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGTGTGTCATGGTTTGTGTAATA
ATAAATGTGAAAGTGGCACAACTGTACAAGTAATAATGTAATAACGAGTATGTGAAATAA
AAAGCCGGAAATATCTGAGGCT

QA 9 570 9 570
DS 

RD RR4CP06TF 580 0 0
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CAACAAAATCAGTTTCTTCTTTCACCCTCATTTTCATCCTCGTTTTGGTTATTTTTGAAG
TGCCGGAGATAATAGCCCAGGATAGCGAGTGCCTGAAAGAATACGGTGGTGATGTGGGTT
TTGGCTTCTGTGCGCCTCGGATTTTTCCGACGATTTGTTATACAAGATGCCGTGAGAACA
AGGGGGCTAAAGGTGGAAGATGCATTTGGGGAGCTGCCGGCGCTGGCGGTGTTAAATGCT
TATGCGACTACTGCAACGACAGCCCTTTTGATCAGATTCTAAGAGGTGGGATTTGAGTCA
TGCGGTACGTGGCCAAGTGTGTCATGGTTTTTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGT
GTGTCATGGTTTGTGTAATAATAAATGTGAAAGGGGCCAAGTGTGTCATGGTTTGTGTAA
TAATAAATGTGAAAGTGGCACAACTGTACAAGTAATAATGTAATAACGAGTATGTGAAAT
AAAAAGCCGGAAATATCTGAGGCTCACATGGTTTTTGATC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 5

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GTCCTCTACGTCACCATAGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGAC
GGCGTCGGTTTACTCGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTAC
TGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTG
GCACGCAAGGTGTCTCTGGTGAGAGCTGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCT
ATTTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCG
GAGCTAACACTGTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTCGGAGCTGAGATCATTG
GAGCTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGCGAAGCGCTCGTG
ACTCTCACATCCCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGGTTCGCTGTGTTCATGGTGCATT
TGGCTACTATCCCCATTACTGGAACTGGAATTAACCCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTG
TTATCTACAACAACGAGAAGGCATGGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCG
TGGGAGCACTAGCGGCAGCAGCTTACCATCAATACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAAG
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AGTGGAGGATTAAATGTTACTTTATTTGTTGCTTTTGTGTGTTATGAGAAAGAATTTAAG
TTGGTGGATGGATGATGTTAATTATGAAATGAGTCTATGCTTTCTTTCTTTCCTTTATTG
TTTTCGTTTAAAAGAAGAACCCACTTTGTTAGTTTTCAATAGTTTAGTTTTGGTGTGTCT
TGTGAATCATTTGGCTTATTATATCAGTTATCTTTTTATTTCTCACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GAGCTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGCGAAGCGCTCGTG
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TTATCTACAACAACGAGAAGGCATGGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCG
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CCTTGGCCTCATTCAGAA*CAGTGCTACAAACTGATGATGAAGTGTGAATTTACCCACTT
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GTTTCGTTTAAAGA

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ATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCGTGGGAGCACTAGCGGCAGCAGCTTACC
ATCAATACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAAGCCTTGGCCTCATTCAGAA*CAGTGCTA
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AATGAGTCTATGCTTTCTTTCTTTCCTTTATTGTTTTCGTTTAAAAGAAGAACCCACTTT
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TTATCTTTTTATTTCTCACATCC

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G
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GG
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GTTGGTGGATGGATGATGTTAATT**GAAATGAGTCTATGCTTTCTTTCTTTCCTTTATT
GTTTTCGTTTAAAAGAAAAACCCACTTTGTTAGTTTTCAATAGTTTAGTTT*GGTGTGTC
TTGTGAATCATTTGGCTTATTACATCAGTTATGTTTTTATT
TCTC

QA 3 283 3 283
DS 



AS 1 4

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AATTTACTGGATACTTTTACTTACATAGAAAATACCTTTAAACAGTAAAAAAAAACAAGC
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ATTGTTGCATTGGTGCAGCTAAAGCTGCAGACACGACCATGAGCGCCACGGTAGAATCTA
AAAAAAGGGAGGACATGGACACCAAGACTGTAACACATGGACTTGTGCTCCTCGTAGTTC
ACCTGAAGAAACTGCACATCAGGGTTCTGCTCTGCCAACTGACATATCTTAGGATGAAGA
GCCTTGCAGCCACCACAGCCAGGAGAGAAGAAGTCAACGACAACAAGCTTATCACCAGCG
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TTCAGCTTGAGAGAGGAGGAGGAGAAGCTCTTCCTCAGACCAAAACTCACCGGCGATGAC
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GAAGAGACGCAAACGAAAGAAGGAAAGTAAACTCTTTTTCTCTCTCACGGGAGACAAACG
TGTCCTCTCGGCAATCTTTAATCGCCACCCAAAGTTTCCGTTTTTTTTTTTTAATTTTTC
TTCCTCTTCTTCCACCC


BQ
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AF RR4EZ40JQ U 126
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AF RR4A859TF C 543
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RD RR4EZ41JQ 722 0 0
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AATTTACTGGATACTTTTACTTACATAGAAAATACCTTTAAACAGTAAAAAAAAACAAGC
CAAAGAGAGAAAAACATCCTAGCAAAACTCGAGAAACCATAAGAACTGGTCTTGCTCTAG
GAAAACCACATGAAACTGGTTTTTGCTCAGGGGAACCCGAAAAAAAAACTAAACCCCCAT
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CTAGTACTAATATCACGCAAACAACTGTACATATAATTGTTTACTGGCTCTCAAAACGGT
AATCATCTCCCTGCGGAGACCAATGTCTTT*CATCATTGGCGCTCATCGATGGATGAGGA
ACAGGGTTGGAAGCGGGCACGGGTGCTTCTTCCTCAACAGGTACAGCCTTGGGCGTGTAG
CTAAAGTCGAGTTCCTTGTTGGCTGCAAGTGCCACAAGCTCTTTCTCTTCAAGCCCTTTG
GTCGGTCGGAG*CTGCACCTATCTGGACTATGCTTCGCCAACGCATCTCTAAATTTCTTG
ATTGTTGCATTGGTGCAGCTAAAGCTGCAGACACGACCATGAGCGCCACGGTAGAATCTA
AAAAA*GGGAGGACATGGACACCAAGACTGTAACACATGGACTTGTGCTCCTCGTAGTTC
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4EZ40JQ 747 0 0
C
GAGAAAAACATCCTAGCAAAACTCGAGAAACCATAAGAACTGGTCTTGCTCTAGGAAAAC
CACATGAAACCGGTTTTTGCTCAGGGGAACCCGAAAAAAAAACTAAACCCCCATCAAACC
GGCTGCTCCGAGAACTTACAACTTTAGATACTGCAACATATGTATATCCAGTTGCTAGTA
CTAATATCACGCAAACAACTGTACATATAATTGTTTACTGGCTCTCAAAACGGTAATCAT
CTCCCTGCGGAGACCAATGTCTTTTCATCATTGGCGCTCATCGATGGATGAGGAACAGGG
TTGGAAGCGGGCACGGGTGCTTCTTCCTCAACAGGTACAGCCTTGGGCGTGTAGCTAAAG
TCGAGTTCCTTGTTGGCTGCAAGTGCCACAAGCTCTTTCTCTTCAAGCCCTTTGGTCGGT
CGGAGGCTGCACCTATCTGGACTATGCTTCGCCAACGCATCTCTAAATTTCTTGATTGTT
GCATTGGTGCAGCTAAAGCTGCAGACACGACCATGAGCGCCACGGTAGAATCTAAAAAAA
GGGAGGACATGGACACCAAGACTGTAACACATGGACTTGTGCTCCTCGTAGTTCACCTGA
AGAAACTGCACATCAGGGTTCTGCTCTGCCAACTGACATATCTTAGGATGAAGAGCCTTG
CAGCCACCACAGCCAGGAGAGAAGAAGTCAACGACAACAAGCTTATCACCAGCGTTGGTG
AGAGAGTCAACAAGGTCCTGAGCTGA

QA 2 747 2 747
DS 

RD RR4EZ40TF 743 0 0
ACATCCTAGCAAA*CTCGAGAAACCATAAGAACTG*TCT*GCTCTAGGAAAACCACATGA
AACCGGTTTT*GCTCAGGGGAACCCGAAAAAAAAACTAAACCCCCATCAAACCGGCTGCT
CCGAGAACTTACAACTTTAGATACTGCAACATATGTATATCCAGTTGCTAGTACTAATAT
CACGCAAACAACTGTACATATAATTGTTTACTGGCTCTCAGAACGGTAATCATCTCCCTG
CGGAGACCAATGTCTTTTCATCATTGGCGCTCATCGATGGATGAGGAACAGGGTTGGAAG
CGGGCACGGGTGCTTCTTCCTCAACAGGTACAGCCTTGGGCGTGTAGCTAAAGTCGAGTT
CCTTGTTGGCTGCAAGTGCCACAAGCTCTTTCTCTTCAAGCCCTTTGGTCGGTCGGAGGC
TGCACCTATCTGGACTATGCTTCGCCAACGCATCTCTAAATTTCTTGATTGTTGCATTGG
TGCAGCTAAAGCTGCAGACACGACCATGAGCGCCACGGTAGAATCTAAAAAAAGGGAGGA
CATGGACACCAAGACTGTAACACATGGACTTGTGCTCCTCGTAGTTCACCTGAAGAAACT
GCACATCAGGGTTCTGCTCTGCCAACTGACATATCTTAGGATGAAGAGCCTTGCAGCCAC
CACAGCCAGGAGAGAAGAAGTCAACGACAACAAGCTTATCACCAGCGTTGGTGAGAGAGT
CAACAAGGTCCTGAGCTGA
AGCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4A859TF 795 0 0
CGGTCGGAG
GCTGCACCTATCTGGACTATGCTTCGCCAACGCATCTCTAAATTTCTTGATTGTTGCATT
GGTGCAGCTAAAGCTGCAGACACGACCATGAGCGCCACGGTAGAATCGAAAAAAAGGGAG
GACATGGACACCAAGACTGTAACACATGGACTTGTGCTCTTCGTAGTTCACCTGAAGAAA
CTGCACATCAGGATTCTGCTCTGCCAACTGACATATCTTAGGATGAAGAGCCTTGCAGCC
ACCACAGCCAGGAGAGAAGAAATCAACGACAACAAGCTTATCACCAGCGTTGGTGAGAGA
GTCAACAAGCTCCTGAGCTGAAGAGATCTCTCTCATATTCTCTTTCAAACCCTTCTCCCA
CCATTTCTGTGGTGTCCCAATCCTCAGCGTTGTCTGAGCTGAGATGGATGATGATGATGA
CGATCTGAAGCTCCCTGTGAAGGTGGTCTGGAACAGAGTATGAGGCTTCTTCAGCTTGAG
AGAGGAGGAGGAGAAGCTCTTCCTCAGACCAAAACTCACCGGCGATGACAAAACGGAGTA
ATCATCTACATGATGATTCTTGTGATTATTCACGCAAGCTCCTCGGAAGATCAGATTCGT
TCTGCTAATTGCTGCTTCCGCCATAGTAATCAATCAGATTTAGAACGAAGAAGAGACGCA
AACGAAAGAAGGAAAGTAAACTCTTTTTCTCTCTCACGGGAGACAAACGTGTCCTCTCGG
CAATCTTTAATCGCCACCCAAAGTTTCCGTTTTTTTTTTTTAATTTTTCTTCCTCTTCTT
CCACCC

QA 10 795 10 795
DS 



AS 1 2

CO CL2064Contig1 1302 2 2 U
GGGACCGTTGGAATTCCTATTTGTTTTAGAAAGTACTGAAGACCCTGCTTATCATGCTGT
TTCCCGTCTCTTATCTATGCATCAGGATCATGTTGAAGCTAAGGTTGTTATTGCTGGTTT
AGCTACGACTTGCAGCCAGAAAATTCATAATCAGTTGATTGGAGCTGAGAAAATACACAA
AGATACCAAATATGTTTTATTCTTGGACGATGATGTTAGTCTGCATCCTGGAACAGTTGG
AGCTCTCACTGCTGAGATGGAGAAAAATCCAGAGATATTTATTCAAACTGGGTATCCTCT
AGACTTGCCCTCTGGAACTCTTGGAAGTTATTGCATCTATGAGTACCACATGCCTTGCTC
AATGGGATTTGCGACTGGTGGGAGAACATTCTTTTTATGGGGAGGGTGCATGATGATGCA
TGCTGATGATTTCAGACAAGATCGCTACGGTGTTGTCTCTGGCTTACGTGATGGTGGATA
CTCAGATGATATGACACTTGCCTCTCTAGCAGGTAACATTTGCTTCTGGATTCCCCTCTT
TTTTTTGCATGTCTAGTTGATCGTTTCTTCTTGTTTCCACTCACCTGTTTTCTCTCCAGG
TGCTCACAAGAGGCTCATTACATCTCCTCCAGTTGCTGTTTTCCCTCATCCTCTTGCAAG
TGATCTAAGTTTTGGACGGTACTGGAACTACTTGAGAAAGCAAACTTTTGTGCTAGAGTC
GTACATATCCAATGTTAACTGGATAATGAACAAGGTTTTGTTTGCCGTCCACTGTTATCT
ATCATGGGGTTTTGTTGCACCATATATCATGGCTGTCGTCCACATCACATCAGCTTTAAG
AATCTACTACATCAAGGGCTATCATCAACTTGAAGACACGACCACTGCTTCTTGTGGTAT
GTCTCTTGTTATCATGCTGGCAATCTGCACCTTCATCGAACTTCTTTCAATGTGGAATTT
GACAAGACGAGAAGTGATGCTATGCAATTTGTTATCCCCCGAGGCTCCCCGTCTCTCTCT
TGCACCTTACAACTGGGGACTTATATTCATAGCAATGCTCGTGGACAACTTTCTATACCC
GATCTCAGCATTCCGTTCTCACTTTTCTCAATCCATAAACTGGTCTGGAATTAGATACCA
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TGATTTAGGAGGGAAACACTTGTATGGTAAGAAGGGAGCCCCACAGAAAGCTTCCTTCTT
AAGCTCATTGGGAAGAAATTTTGCTCACTGGCGACAACCGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F204TF U 1
AF RR4CM23TF U 609
BS 1 742 RR4F204TF
BS 743 1302 RR4CM23TF

RD RR4F204TF 742 0 0
GGGACCGTTGGAATTCCTATTTGTTTTAGAAAGTACTGAAGACCCTGCTTATCATGCTGT
TTCCCGTCTCTTATCTATGCATCAGGATCATGTTGAAGCTAAGGTTGTTATTGCTGGTTT
AGCTACGACTTGCAGCCAGAAAATTCATAATCAGTTGATTGGAGCTGAGAAAATACACAA
AGATACCAAATATGTTTTATTCTTGGACGATGATGTTAGTCTGCATCCTGGAACAGTTGG
AGCTCTCACTGCTGAGATGGAGAAAAATCCAGAGATATTTATTCAAACTGGGTATCCTCT
AGACTTGCCCTCTGGAACTCTTGGAAGTTATTGCATCTATGAGTACCACATGCCTTGCTC
AATGGGATTTGCGACTGGTGGGAGAACATTCTTTTTATGGGGAGGGTGCATGATGATGCA
TGCTGATGATTTCAGACAAGATCGCTACGGTGTTGTCTCTGGCTTACGTGATGGTGGATA
CTCAGATGATATGACACTTGCCTCTCTAGCAGGTAACATTTGCTTCTGGATTCCCCTCTT
TTTTTTGCATGTCTAGTTGATCGTTTCTTCTTGTTTCCACTCACCTGTTTTCTCTCCAGG
TGCTCACAAGAGGCTCATTACATCTCCTCCAGTTGCTGTTTTCCCTCATCCTCTTGCAAG
TGATCTAAGTTTTGGACGGTACTGGAACTACTTGAGAAAGCAAACTTTTGTGCTAGAGTC
GTACATATCCAATGTTAACTGG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4CM23TF 694 0 0
G
GAGGCTCATTACATCTCCTCCAGTTGCTGTTTTCCCTCATCCTCTTGCAAGTGATCTAAG
TTTTGGACGGTACTGGAACTACTTGAGAAAGCAAACTTTTGTGCTAGAGTCGTACATATC
CAATGTTAACTGGATAATGAACAAGGTTTTGTTTGCCGTCCACTGTTATCTATCATGGGG
TTTTGTTGCACCATATATCATGGCTGTCGTCCACATCACATCAGCTTTAAGAATCTACTA
CATCAAGGGCTATCATCAACTTGAAGACACGACCACTGCTTCTTGTGGTATGTCTCTTGT
TATCATGCTGGCAATCTGCACCTTCATCGAACTTCTTTCAATGTGGAATTTGACAAGACG
AGAAGTGATGCTATGCAATTTGTTATCCCCCGAGGCTCCCCGTCTCTCTCTTGCACCTTA
CAACTGGGGACTTATATTCATAGCAATGCTCGTGGACAACTTTCTATACCCGATCTCAGC
ATTCCGTTCTCACTTTTCTCAATCCATAAACTGGTCTGGAATTAGATACCACTTGAGAAA
TGGAAAGGTTTTCAAGATTGAGAGAAGGAATGATATGGTACCAGCAAAGACTGATTTAGG
AGGGAAACACTTGTATGGTAAGAAGGGAGCCCCACAGAAAGCTTCCTTCTTAAGCTCATT
GGGAAGAAATTTTGCTCACTGGCGACAACCGAA

QA 2 694 2 694
DS 



AS 2 5

CO CL2065Contig1 1083 2 2 U
GTAAACATTGCAGCTTTCGCTGTGTCTGGCTACGCGTCCACGGAAGGCAGGCAGTGCAAG
CCTTTTAATCCTCTACTTGGTGAGACATATGAAGCTGATTATCCAGATAAAGGACTTCGT
TTCTTCTCCGAGAAGGTGAGTCATCATCCAATGATTGTTGCTTGCCACTGTGAGGGACAA
GGTTGGAATTTCTGGGGAGACTCAAATATCAAAGGGAAATTTTGGGGACGGTCCATTCAG
CTTGACCCAGTGGGTGTCTTGACACTGAAGTTTGATGATGGGGAGACGTATCAGTGGAGC
AAGGTTACCACTTCCATATACAACATCATCCTAGGGAAACTTTACTGTGATCATTATGGA
ACTATGCGCATCAAAGGCGGTGGCAATTACTCCTGCAGGTTGAAGTTCAAGGAGCAGTCA
GTCATAGATCGAAACCCTCGTCAGGTTCATGGGTTTGTGCAAGACAATAGAACTGGGGAG
AAAGTAGCTATATTGATAGGCAAATGGGATGAGGCAATGTACTATGCGTTGGGTGATCCG
ACGACAAAGCCAAAGGGATACGATCCAATGACTGAAGCTGTGTTACTGTGGGAAAGAGAC
AAATCTCCTACAAAAACAAGATACAATCTCTCCCCTTTTGCAATCTCTCTTAATGAGATA
ACTCCCGGGATGATGGACAAACTGCCTCCAACAGATTCAAGATTGAGACCTGACCAGAGA
CATTTGGAAAACGGGGAATACGAGGCTGCAAATGCTGAGAAACTGAGGCTTGAACAGCTG
CAGAGACAGGCAAGGAGGCTGCAGGAGAAAGGATGGAAACCGAGATGGTTTGAATAGATG
AAGAAGGGAATTATCGGTACTTAGTAGGTTACTGGGAAGCAAGAGAGAAGAAAGATTGGG
ATAAGATTACTGACATTTTCAAGAAGCAGCAACAGCGTAACAGTGTTTCATCTTCGTAAT
CATCTCATGTTTTTGTTCCTTTATTTGTTTTTTTTTTCTTTTAAATTAATATTATATTGA
AAAAGATCTTCACCATTCCCTCATTGTGCTTCTGTGAAAATTTGGCCAGAACCTTTGTTG
GTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4EW13TF U 1
AF RR4EW13JQ C 290
BS 1 730 RR4EW13TF
BS 731 1083 RR4EW13JQ

RD RR4EW13TF 731 0 0
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CATTTGGAAA
C

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4EW13JQ 794 0 0
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TGGGTGATCCGACGACAAAGCCAAAGGGATACGATCCAATGACTGAAGCTGTGTTACTGT
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TTAATGAGATAACTCCCGGGATGATGGACAAACTGCCTCCAACAGATTCAAGATTGAGAC
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TTGAATAGATGAAGAAGGGAATTATCGGTACTTAGTAGGTTACTGGGAAGCAAGAGAGAA
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TATTATATTGAAAAAGATCTTCACCATTCCCTCATTGTGCTTCTGTGAAAATTTGGCCAG
AACCTTTGTTGGTG

QA 1 794 1 794
DS 



CO CL2065Contig2 888 3 12 U
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FU45JQ U 1
AF RR4EY56JQ U 1
AF RR4FU45TF C 173
BS 1 507 RR4EY56JQ
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RD RR4FU45JQ 640 0 0
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TCGTATCCCTTTGACTTTGTCGTCGGATCACCCAAC
ACAT

QA 1 636 1 636
DS 

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AAGTACCGATAATTCCCTTCTTCATCTTTTTCAAACCATCTCGGTTTCCATCCTTTCTCC
TGCAGCCTCCTTGCCTGTCTCTGCAACTGTTCAAGTCTCAGTTTCTCAGCATTTGCTGCC
TCGTATTCACCGTTTTCCAAATGTCTCTGGTCAGGTCTCAATCTTGAATCTGTCGGAGGC
AGTTTGTCCATCATCCCAGGAGTTATCTCATTAAGAGAGATTGCAAAAGGGGAGAGATTG
TATCTTGTTTTTGTAGGAGATTTGTCTCTTTCCCACAGTAACACAGCTTCAGTCATTGGA
TCGTATCCCTTTGGCTTTGTCGTCGGATCACCCAACACATAGTACATTGCCTCATCCCAT
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CCACCGCCTTTGATACGCATAGTTCCATAGTGATCGCAGTAAAG
CTCCCGAGGATGATGTGT

QA 1 824 1 824
DS 

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GG
AACAAATAAAGGAACAAA*CATGAGAAGATTACGAAGATGAAACACTGTTGCGCTGTTGC
TGCTTCTTGAAAATGTCAGTAATCTTATCCCAATCTTTCTTCTCTCTTGCTTCCCAGTAA
CT**CTAAGTACCGATAATTCCCTTCTTCATCTTTTTCAAACCATCTCGGTTTCCATCCT
TTCTCCTGCAGCCTCCTTGCCTGTCTCTGCAACTGTTCAAGTCTCAGTTTCTCAGCATTT
GCTGCCTCGTATTCACCGTTTTCCAAATGTCTCTGGTCAGGTCTCAATCTTGAATCTGTC
GGAGGCAGTTTGTCCATCATCCCAGGAGTTATCCCATTAAGAGAGATTGCAAAAGGGGAG
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TCCCATTTTCCTATCAGGATAGCTACTTTCTCCCCAGTTCTATTGTCCTGCACAAACCCA
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ATGATGTTGTATATGGAAGTGGTAACCTTGCTCCACTGATACGTCTCCCCATCC

QA 3 716 3 716
DS 



AS 1 5

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TATCAAAATACAAACATAAAAATTACACATGTAATGAGAAACAAAAATTGAACAAGCAAA
AAGTTAAGAACAAAGCACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTACAATCTCCTCTTAATATCTA
ATCCCTTGAGCAACCTCAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATA
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CTGCTTGTGATAAACTCTTTGGATCCGAACAAAACTCCAGGGTCCACGTTTCCTTGAACC
GCTATGTTTCTTCCTAGCCTGTCCCTTCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTC
ACAACATCAACCCCAGTCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGACCTCCTGATCCACTTGCGTAC
AGTATCAGAGGTAGGTTTGGGTGAGTCTGTTTCACAGCTTCCACAATCTGTTTCAGGTAA
GGTAAGCTAAACTCCTCGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATT
TGCACAGCTTGAGCTCCACTATACGCTTGATAGCGTATGTAAGTGATCATTGAGGTTGTG
AACTTCTGGAGCAAAGAATGTAGAACCTTGGGTTGAGAGAAAGCTAGTTTTTTTATCTGT
GTGAAGTTCTTAGATGAGCCACCTTCAATAACATAGGAGGAGAGAGTGAATGGAGCTCCA
ACAAAGCCAAGAACAGCAGCTTCGTTGCCCACCTCGTTTCTCAATCTCTTGAGTGCTTCT
CCAACATAAGGAACAGATTCCTCCGGTACAAACTCTCTAACTTGATTCACGTCAGCAGCT
GACTGCGGCGGGCTGAAGATGATAGGACCTTTTCCTTTGACAATGTCGAAAGGTATGTTC
ATTCCAGACAAAGGAGTGAGAATGTCTGAGAACAGAATCACACCATCAGGCTTGAACACT
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AAAGGATACTTCTCACAGAGATTTTGATAACTCTTCATGTACCTCCCAGCTTGCCTCATA
AGCCAAACGGGAGGTCTATCAACAAGTTCACCTTTAACAGCTCTCAGAAGAAGAGGCTCG
GTGGTTGCAGAGACTTTCCGCTCAGTTACAGTGGTTCCCTCGAGGGAACAACGAATTGTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4DO02JQ U 15
AF RR4DZ32JQ U 1
AF RR4E306JQ U 15
AF RR4DZ32TF C 41
AF RR4DO02TF C 485
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QA 3 620 3 620
DS 

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GCTATGTTTCTTCCTAGCCTGTCCCTTCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTC
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GGTAAGCTAAACTCCTCGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATT
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QA 1 780 1 780
DS 

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GC
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TAAAAATTACACATGTAATGGGAAACAAAAATTGAACAAGCAAAAAGTTAAGAACAAAGC
ACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTACAATCTCCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAACCT
CAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCA
GAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTTTCTTCACAGTATCCTGAATCCTGCTTGTGATAAACT
CTTTGGATCCGAACAAAACTCCAGGGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCTA
GCCTGTCCCTTCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAG
TCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGACCTCCTGATCCACTTGCGTACAGTATCAGAGGTAGGT
TTGGGTGAGTCTGTTTCACAGCTTCCACAATCTGTTTCAGGTAAGGTAAGCTAAACTCCT
CGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATTTGCACAGCTTGAGCTC
CACTATACGCTTGATAGCGTATGTAAGTGATCATTGAGGTTGTGAACTTCTGGAGCAAAG
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AGCCACCTTCAATAACATAG*AGGAGAGAGT

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR4DZ32TF 778 0 0
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ACAAAA*TTGAACAAGCAAAAG**TAAGAACAA*GCACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTA
CAATCTCCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAAC*TCAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTT
CAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCAGAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTT
TCTTCACAGTATCCTGAATCCTGCTTGTGATAAACTCTTTGGATCCGAACAAAACTCCAG
GGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCTAGCCTGTCCCTTCCTTCAGCCATGT
CCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAGTCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGAC
CTCCTGATCCACTTGCGTACAGTATCAGAGGTAGGTTTGGGTGAGTCTGTTTCACAGCTT
CCACAATCTGTTTCAGGTAAGGTAAGCTAAACTCCTCGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAG
TAGCCCAAGAATCAAAGATTTGCACAGCTTGAGCTCCACTATCCGCTTGATAGCGTATGT
AAGTGATCATTGAGGTTGTGAACTTCTGGAGCAAAGAATGTAGAACCTTGGGTTGAGAGA
AAGCTAGTTTTTTTATCTGTGTGAAGTTCTTAGATGAGCCACCTTCAATAACATAGGAGG
AGAGAGTGAATGGAGCTCCAACAAAGCCAAGAACAGCAGCTTCGTTGCCCACCTCGT
C

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4DO02TF 778 0 0
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AGCTAAACTCCTCGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATTTGCA
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TCTGGAGCAAAGCATGTAGAACCTTGGGTTGAGAGAAAGCTAGTTTTTTTATCTGTGTGA
AGTTCTTAGATGAGCCACCTTCAATAACATAGGAGGAGAGAGTGAATGGAGCTCCAACAA
AGCCAAGAACAGCAGCTTCGTTGCCCACCTCGTTTCTCAATCTCTTGAGTGCTTCTCCAA
CATAAGGAACAGATTCCTCCGGTACAAACTCTCTAACTTGATTCACGTCAGCAGCTGACT
GCGGCGGGCTGAAGATGATAGGACCTTTTCCTTTGACAATGTCGAAAGGTATGTTCATTC
CAGACAAAGGAGTGAGAATGTCTGAGAACAGAATCACACCATCAGGCTTGAACACTTTCC
AGGGTTGAAGAGAGATCTCCACCACAAGATCTGCGTTCTCTGATCTGTCCCGGAATAAAG
GATACTTCTCACAGAGATTTTGATAACTCTTCATGTACCTCCCAGCTTGCCTCATAAGCC
AAACGGGAGGTCTATCAACAAGTTCACCTTTAACAGCTCTCAGAAGAAGAGGCTCGGTGG
TTGCAGAGACTTTCCGCTCAGTTACAGTGGTTCCCTCGAGGGAACAACGAATTGTTCC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

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CTCGAAGAATAAAATATAAAGACCTCGAATATTATTGTCTTCATAATACGAAAGATCAAT
TATTCAGCCGAGGAAAGAATAAAGTAATGGGGCGTGTGGATTACCTAGCGATGAAGTCCG
ACGACGTCGACACGGTTGCTTTGGTCAACTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCA
AGAAGCTCTTCAGAGATGTCTCGAAGCGTGGTGGATCAGCCTTTGGTGTTTCTTTCGTCA
AATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACAAATTGGAGAA
GCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTTCCTTAGCCTTCCCGGTGTGATTT
TCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCAGTTGTGCTCAGAC
TTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGC
TAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGTGGAACCTGGATTGGCTCTGTCA
TCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTCTCAGGTGGGTTCA
GGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCGAACACTCTAGGGATCATCCTTATTCTGG
TCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGACATTCCCTGTTCCATTTC
CCTCAAGTTGTATATGTCTTGTCTAATAAAATTCCCTAGTGCTCTGCTTCTCTTACATAC
CCTTATACTACTGTCTCAAGCTCAATCAATGTTCCATATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FL41TF U 1
AF RR4AC92TF U 108
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BS 776 799 RR4FL41TF
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GG
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AAATTGGAGAAGCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTACCTTAGCCTTCC
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DS 

RD RR4FL41JQ 635 0 0
CTTCGGA
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CATTTTCTAGCTCACCATATACGTGGAACCTGGATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTCATA
GGCTGTTACCTTTTTCAAGAACATATCCGAGTTTCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTCACG
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CTCAAGCTCAATCAATGTTCTATATTAG

QA 8 635 8 635
DS 



AS 1 5

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AAGTTCTCTACGAAACTTGATTTGGGTTGAATTTGGTGAAAAAGGGCCTATCTTGTGTTC
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GTAATACAATTCTTGAAGGATGTTTGTTTTTAAATATATATACAATACGTGCAGACACAC
AGTTTGAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD38JQ C 438
AF RR4CD38TF U 1
AF RR4GE58TF U 1
AF RR4GE58JQ C 299
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AAA

QA 1 213 1 213
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CATAGAC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4GE58JQ 633 0 0
TTTGTGGGAATAGAGAGAGAGAGATGGCAGGTGAAGATTGGATAGAACTCAAGTTTAGAC
TCGCAGATGGCACTGACATAGGTCCCACCAAGTACAATCAATCTATGACTGTTTCTTCTC
TCAAAGAGAAGATCATCTCTCAATGGCCTAAAGAGTCAGAAAACATTCCAAAGACTGTAA
ATGATGTGAAGCTCATCAATGCCGGGAAGATACTAGACAACAATAGGACACTTGCTGAAT
CCAGGCTTCCCGTTGGCGAACTTCCAGGAATGGTCATCACTATGCATGTTGTTTTTCGCC
CTCCTACTTTAGACAAAAAGAGCGAAAAACTGCAGAATGATCCTCCCATGAAGAATCGAT
GCGCACGCACCATTTTGTAGCTGCAAGTAAATTGGATCATATAGAGAGATTTTAATCCTT
CATGATAAAATAGCACTGGGTTGTGATGCTCCATGGAACAGCTGAGAAAGTTCCCTTACT
GGCATAGACGTGAAAAAAAAAGAAACAAAGGATCTTCACTACAGAACTTGTTTACATTTG
TGTGGTTGATAATTTATTTTTCATCTTTTCTTCATTGTTTATCCAAAGTGGCTCAAGAAA
ATGTAATACAATTCTTGAAGGATGTTTGTTTTT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4BE37TF 661 0 0
GG
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ACTGACATAGGTCCCACCAAGTACAATCAATCTATGACTGTTTCTTCTCTCAAAGAGAAG
ATCATCTCTCAATGGCCTAAAGAGTCAGAAAACATTCCAAAGACTGTAAATGATGTGAAG
CTCATCAATGCCGGGAAGATACTAGACAACAATAGGACACTTGCTGAATCCAGGCTTCCC
GTTGGCGAACTTCCAGGAATGGTCATCACTATGCATGTTGTTCTTCGCCCTCCTACTTTA
GACAAAAAGAGCGAAAAACTGCAGAATGATCCTCCCATGAAGAATCGATGCGCATGCACC
ATTTTCTAGCTGCAAGTAAATTGGATCATATAGAGAGATTTTAATCCTTCATGATAAAAT
AGCACTGGGTTGTGATGCTCCATGGAACAGCTGAGAAAGTTCCCTTACTGGCATAGACGT
GAAAAAAAAAGAAACAAAGGATCTTCACTACAGAACTTGTTTACATTTGTGTGGTTGATA
ATTTATTTTTCATCTTTTCTTCATTGTTTATCCAAAGTGGCTCAAGAAAATGTACTACAA
TTCTTGAAGGATGTTTGTTTTTAAATATATATACAATACGTGCAGACACACAGTTTGAA

QA 3 661 3 661
DS 



AS 1 4

CO CL2069Contig1 1119 4 12 U
GGGAAGGAAGAAGTCATTAGGCAAAAAAAATCTATTTCTCTCTCTCTCTCCCTTGTCGTC
GTCCTATCTCTGTGCGGTAATCGGGAAATGGGAACCCTAGGACGAGCTATTTACACTGTG
GGTAACTGGATCCGGGGCTCCGGAAAAGCTCTCGATCGTTTCGGCTCTCTTCTTCAAGGG
AGCCACCGCTTCGAAGAACACCTATCGAGGCATCGGACGTTGATGGATGTGTTTGATAAA
TCTCCATTGGTGGATAAGGATGCGTTCGTGGCTCCAAGTGCATCTGTTATTGGTGACGTT
CAAATAGGGAAAGGCTCCTCTATTTGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATGTGAATAAC
ATCAGTGTCGGATCAGGGACGAATATCCAAGATAATTCTCTTGTACATGTTGCAAAAACC
GATCTTGGTGGGAAGGTTTTACCTACTACGATTGGGGACAAGGTCACTGTAGGTCATAGT
GCTGTTATACATGGGTGTACTGTTGAGGATGAGGCATTTGTTGGCATGGGAGCTACACTA
CTTGATGGTGTGGTGGTTGAGAAGAATGCCATGGTTGCTGCTGGTTCTCTTGTCAAAGAG
AACACCCGTATTCCTTCTGGAGAGGTTTGGGCAGGGAATCCAGCAAAGTTTATGAGGAAG
TTAACAGATGAGGAGATAGCATATATCTCAAAGTCAGCAGAGAACTACATCAACCTTGCA
CACATTCATGCCGCAGAGAATTCAAAGTCATTTGATGAGATCGAGGTTGAGAGAGCGCTT
AGGAAGAAATATGCACGCAAGGATGAGGATTATGATTCGATGCTTGGGATTGTCCGTGAA
ACTCCGCCCGAGCTGATTCTTCCCGACAATGTCTTACCGGCGAAAACTACCACCAGGGTT
CCAACTACTCACTACTGATTCACCCTGTCTCAGCTTGTTTTTTGTTTTCTTGTGTTAAAT
CCTTTCAAGACAGGATTGGTTCTCTGTAGAGATTCGAGAGAGATACTATCTTTTGGTTTT
GCTTTTTATCCCGAGCAAGCCTGGGAATATCCTTTGCTCAATAATGCGGAAAGAACATGT
ACTGATGCATTATGGTTTATTGAAGTCATTTCTTCGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DP73TF U 37
AF RR4H237TF U 1
AF RR4H237JQ C 457
AF RR4DP73JQ C 588
BS 1 63 RR4H237TF
BS 64 64 RR4DP73TF
BS 65 656 RR4H237TF
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BS 747 760 RR4H237TF
BS 761 1119 RR4H237JQ

RD RR4DP73TF 342 0 0
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ACGAGCTATTTACACTGTGGGTAACTGGATCCGGGGCTCCGGAAAAGCTCTCGATCGTTT
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ATCTGTTATTGGTGACGTTCAAATAGGGAAAGGCTCCTCTATTTGGTATGGCTGTGTTCT
TCGAGGTGATGTGAGTAACATCAGTGTCGGATCAGGG

QA 6 342 6 342
DS 

RD RR4H237TF 760 0 0
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GTCGTATCTCTGTGCGGTAATCGGGAAATGGGAACCCTAGGACGAGCTATTTACACTGTG
GGTAACTGGATCCGGGGCTCCGGAAAAGCTCTCGATCGTTTCGGCTCTCTTCTTCAAGGG
AGCCACCGCTTCGAAGAACACCTATCGAGGCATCGGACGTTGATGGATGTGTTTGATAAA
TCTCCATTGGTGGATAAGGATGCGTTCGTGGCTCCAAGTGCATCTGTTATTGGTGACGTT
CAAATAGGGAAAGGCTCCTCTATTTGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATGTGAATAAC
ATCAGTGTCGGATCAGGGACGAATATCCAAGATAATTCTCTTGTACATGTTGCAAAAACC
GATCTTGGTGGGAAGGTTTTACCTACTACGATTGGGGACAAGGTCACTGTAGGTCATAGT
GCTGTTATACATGGGTGTACTGTTGAGGATGAGGCATTTGTTGGCATGGGAGCTACACTA
CTTGATGGTGTGGTGGTTGAGAAGAATGCCATGGTTGCTGCTGGTTCTCTTGTCAAAGAG
AACACCCGTATTCCTTCTGGAGAGGTTTGGGCAGGGAATCCAGCAAAGTTTATGAG*AAG
TTAACAGATGAG*AGATAGCATATATCTCAAAGTCAGCAGAGA*CTACATCAACCTTGCA
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QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4H237JQ 663 0 0
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TTTGTTGGCATGGGAGCTACACTACTTGATGGTGTGGTGGTTGAGAAGAATGCCATGGTT
GCTGCTGGTTCTCTTGTCAAAGAGAACACCCGTATTCCTTCTGGAGAGGTTTGGGCAGGG
AATCCAGCAAAGTTTATGAGGAAGTTAACAGATGAGGAGATAGCATATATCTCAAAGTCA
GCAGAGAACTACATCAACCTTGCACACATTCATGCCGCAGAGAATTCAAAGTCATTTGAT
GAGATCGAGGTTGAGAGAGCGCTTAGGAAGAAATATGCACGCAAGGATGAGGATTATGAT
TCGATGCTTGGGATTGTCCGTGAAACTCCGCCCGAGCTGATTCTTCCCGACAATGTCTTA
CCGGCGAAAACTACCACCAGGGTTCCAACTACTCACTACTGATTCACCCTGTCTCAGCTT
GTTTTTTGTTTTCTTGTGTTAAATCCTTTCAAGACAGGATTGGTTCTCTGTAGAGATTCG
AGAGAGATACTATCTTTTGGTTTTGCTTTTTATCCCGAGCAAGCCTGGGAATATCCTTTG
CTCAATAATGCGGAAAGAACATGTACTGATGCATTATGGTTTATTGAAGTCATTTCTTCG
AGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4DP73JQ 532 0 0
TCTTGTCAAAGAGAACACCCGTATTCCTTTTGGAGAG*TTTGGGCAGGGAATCCAGCAAA
GTTTATGAGGAAGTTAACAGATGAGGAGATAGCATATATTTCAAAGTCAGCAGAGAACTA
CATCAACCTTGCACACATTCATGCCGCAGAGAATTCAAAGTCATTTGATGAGATCGAGGT
TGAGAGAGCGCTTAGGAAGAAATATGCACGCAAGGATGAGGATTATGATTCGATGCTTGG
GATTGTCCGTGAAACTCCGCCCGAGCTGATTTTTCCCGACAATGTTTTACCGGGGAAAAC
TACCACCAGGGTTCCAACTACTCACTACTGATTCACCCTGTTTCAGCTTGTTTTTTGTTT
TTTTGTGTTAAATCCTTTCAAGACAGGATTGGTTTTCTGTAGAGATTCGAGAGAGATACT
ATTTTTTGGTTTTGCTTTTTATCCCGAGCAAGCCTGGGAATATCCTTTGCTCAATAATGC
GGAAAGAACATGTACTGTTGCATTATGGTTTATTGAAGTCATTTTTTCGAGT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 4

CO CL2070Contig1 1071 4 4 U
GACCAGTGAGGTACTTCTTGATTTGAACAGAAGTTTCAAACGTTGTTCATAGTTTTATTT
TTTACAGCTTTTTGAAACAGAAGCAGCAAAAGTTGGAAGTTTGAAATAATAATAAAAGAA
GTTGAGACCAGAATCAACATTTGAGAAAGAGGAAAAAGATGAGTCAAAAGCTTTTCGTGA
GAAAGACAGCAGAGAGTATATGTTCAAGAGAAGGCATAAGCTGGAGTGGTCTTGAAATCG
AGCTCCCATAGATCAAACGTGCCTTTCACGAAATTGTAGTGAGCTCCTCTGATTGCAAGC
GTGTTCTTCACCACTGCAGCTCTCACAAACGGGTACGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACA
TTCACAGCTTCCTTCTCACACATGTTGCACTGATCGTCGTAGCTTAGGTCTTGATTCTCT
TCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTTCACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTC
TGAGTTGGTGCAGCATCATCCTCAATGGACATGAGTCCCTTAATGCCACCACAACAGCTA
TGTCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATGTACAACTGCGTATTCAACGGCGGCT
CCAACTCCCGAATGTCTCTTCTGGTCGAAAGGTGGAACCATGTTAGCAATGTTTCTGACG
ACAAAGGCCTCACCAGGTTGGAAATTCAAAATGTGAGATGGACAAACTCGAGAATCCGAA
CAAGCGAATACCAGAAACTTTGGGCTCTGACCCTTGGCGAGATCACTGAAAAGAGCATCA
TTCTTCAGGTATTTTTCGGTTTTGAAGTGGGTGAAACCGGATTTGATGCGTTCAACGGCG
TCGTTGTTGGAGGAATCGAGCTCCTTGAGCTCCTGAGTCAACACTTTGATCTTCTCCGCG
GCGACGTTCCCCAGATCTGTTTTCTTACTGAGAAGATCGTTCAGTCCTTTAATGGCGGTT
TCGTACGATTCCGTGGCCATCTCGTCTTCTTCCTTTAGCGTGATGATAGGTTCAAAAAAG
CAGAGGATAAAATGTTCTTATGGAGGAATGTGAAATCACTTAATGATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV63JQ U 1
AF RR4EK88JQ U 20
AF RR4BM21JQ U 23
AF RR4EK88TF C 406
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BS 772 1071 RR4EK88TF

RD RR4EV63JQ 778 0 0
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AGCTCCCATAGATCAAACGTGCCTTTCACGAAATTGTAGTGAGCTCCTCTGATTGCAAGC
GTGTTCTTCACCACTGCAGCTCTCACAAACGGGTACGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACA
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TCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTTCACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTC
TGAGTTGGTGCAGCATCATCTTCAATGGACATGAGTCCCTTAATGCCACCACAACAGCTA
TGTCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATGTACAACTGCGTATTCAACGGCGGCT
CCAACTCCCGAATGTCTCTTCTGGTCGAAAGGTGGAACCATGTTAGCAATGTTTCTGACG
ACAAAGGCCTCACCAGGTTGGAAATTCAAAATGTGAGATGGACAAACTCGAGAATCCGAA
CAAGCGAATACCAGAAACTTTGGGCTCTGACCCTTGGCGAGATCACTGAAA
AGAGCAT

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DS 

RD RR4EK88JQ 760 0 0
GGTT
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TTTCACGAAATTGTAGTGAGCTCCTCTGATTGCAAGTGTGTTCTTCACTACCGCAGCTCT
CACAAACGGGTACGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACATTCACAGCTTCCTTCTCACACAT
GTTGCACTGATCGTCGTAGCCTAGGTCTTGATTCTCTTCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGG
TGCACCTATCTTCACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAGTTGGTGCAGCATCATCCTC
AATGGACATGAGTCCCTTAATGCCACCACAACAGCTATGTCCTATCACCACAATGTTCTC
CACCTTGAGATGTACAACTGCGTATTCAACGGCGGCTCCAACTCCCGAATGTCTCTTCTG
GTCGAAAGGTGGAACCATGTTAGCAATGTTTCTGACGACAAAGGCCTCACCAGGTTGGAA
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GCTCTGACCCTTGGCGAGATCACTGAAA
GAGCATCA

QA 5 752 5 752
DS 

RD RR4BM21JQ 756 0 0
G
TGAACAGAAGTTTCAAAAGTTGTTCATAGTTTTATTTTTTACAGCTTTTTGAAACAGAAG
CAGCAAAAGTTGGAAGTTTGAAATAATAATAAAAGAAGTTGAGACCAGAATCAACATTTG
AGAAAGAGGAAAAAGATGAGTCAAAAGCTTTTCGTGAGAAAGACAGCAGAAAGTATATGT
TCAAGAGAAGGCATAAGCTGGAGTGGTCTTGAAATCGAGCTCCCATAGATCAAACGTGCC
TTTCACGAAATTGTAGTGAGCTCCTCTGATTGCAAGCGTGTTCTTCACCACTGCAGCTCT
CACAAACGGGTACGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACATTCACAGCTTCCTTCTCACACAT
GT*GCACTGATCGTCGTAGCTTAGGTCTTGATTCTCTTCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGG
TGCACCTATCTTCACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAGTTGGTGCAGCATCATCTTC
AATGGACATGAGTCCCTTAATGCCACCACAACAGCTATGTCCTATCACCACAATGTTCTC
CACCTTGAGATGTACAACTGCGTATTCAACGGCGGCTCCAACTCCCGAATGTCTCTTCTG
GTCGAAAGGTGGAACCATGTTAGCAATGTTTCTGACGACAAAGGCCTCACCAGGTTGGAA
ATTCAAAATGTGAGATGGACAAACTCGAGAATCCGAACAAGCGAATACCAGAAACTTTGG
GCTCTGTCCCTTGGCGAGATCACTGAAA
AGAGCAT

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DS 

RD RR4EK88TF 666 0 0
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TCTATGAAGTCACTCTGAGTTGGTGCAGCATCATCCTCAATGGACATGAGTCCCTTAATG
CCACCACAACAGCTATGTCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATGTACAACTGCG
TATTCAACGGCGGCTCCAACTCCCGAATGTCTCTTCTGGTCGAAAGGTGGAACCATGTTA
GCAATGTTTCTGACGACAAAGGCCTCACCAGGTTGGAAATTCAAAATGTGAGATGGACAA
ACTCGAGAATCCGAACAAGCGAATACCAGAAACTTTGGGCTCTGACCCTTGGCGAGATCA
CTGAAAAGAGCATCATTCTTCAGGTATTTTTCGGTTTTGAAGTGGGTGAAACCGGATTTG
ATGCGTTCAACGGCGTCGTTGTTGGAGGAATCGAGCTCCTTGAGCTCCTGAGTCAACACT
TTGATCTTCTCCGCGGCGACGTTCCCCAGATCTGTTTTCTTACTGAGAAGATCGTTCAGT
CCTTTAATGGCGGTTTCGTACGATTCCGTGGCCATCTCGTCTTCTTCCTTTAGCGTGATG
ATAGGTTCAAAAAAGCAGAGGATAAAATGTTCTTATGGAGGAATGTGAAATCACTTAATG
ATCCCT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 5

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GAATAGAGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGTAAAGGAACTGT
AAGAAGGAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACAAACACGACCGACGACAAGAAGCTACAGAG
CACTCTCAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGGTATCGAAGAAGTTAACATCTTTAA
GGATGATTCTGTGATTCAGTTCCTTAACCCTAAAGTTCAAGCTTCGGTTGCTGCTAACAC
ATGGGCCGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAGTTGCAAGACATACTTCCACAGATTAT
CAGCCAACTTGGAACTGATAACTTGGACAACCTAAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCCAGAA
ACAGGCACCAGGTGGAGGAGCTGATGTTCCAGCGACTATCCAAGAAGAGGACGACGATGA
TGATGATGTCCCAGAACTTGTAGCGGGAGAGACTTTCGAGACTCCTGCTGCTAAAGCTAC
TGCCTCCTAAGTGAAGAAAGCTCACCAGCAAAACCCCTCACCATAAAAAAAAATGTTTGG
TGCTCGACCTTTTTTGAGCACCGTTCAGATTCTTGTTTTCTCTAGTCGTTACGAACAGAA
AGACTTGGTTTGGTTATCACTTGATGCGTTTTTGTCTTAACAGCAACTTTCCTTTTATTA
AGTGGTTAGATCGCTTCCTGCTTACGATCTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO22TF U 1
AF RR4CO22JQ C 32
BS 1 652 RR4CO22TF
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RD RR4CO22TF 770 0 0
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TGCTCGACCTTTTT*GAGCACCGTTCAGATTCTTGTTTTCTCTAGTCGT*ACGA*CAGAA
AGACTTGGTTTG**TATCACTTGATGCGTTTT
GTCTTACAGCACTTTCCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4CO22JQ 783 0 0
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ACTGTCCGCACTGGCGGTAAAGGAACTGTAAGAAGGAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACA
AACACGACCGACGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTCAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATT
CCCGGTATCGAAGAAGTTAACATCTTTAAGGATGATTCTGTGATTCAGTTCCTTAACCCT
AAAGTTCAAGCTTCGGTTGCTGCTAACACATGGGCCGTGAGCGGTACACCACAGACCAAA
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AACCCCTCACCATAAAAAAAAATGTTTGGTGCTCGACCTTTTTTGAGCACCGTTCAGATT
CTTGTTTTCTCTAGTCGTTACGAACAGAAAGACTTGGTTTTGTTATCACTTGATGCGTTT
TTGTCTTAACAGCAACTTTCCTTTTATTAAGTGGTTAGATCGCTTCCTGCTTACGATCTG
TTC

QA 1 783 1 783
DS 



CO CL2071Contig2 786 3 22 U
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TTATCTCTTCTTCTTATACCCAACGTAGGAAGAAGAACCCTAAAAATCGAATAACAAGAT
GAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGTAAAGGGACTGT
AAGAAGGAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACGAACACGACCGACGACAAGAAGCTACAGAT
CACCCTCAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGGTATCGAAGAAGTTAACATCTTTAA
GGATGATTCTGTGATTCAGTTCCTTAACCCTAAAGTTCAAGCTTCGGTTGCTGCTAACAC
ATGGGCCGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAGTTGCAAGACATACTTCCACAGATTAT
CAGCCAACTTGGAACTGATAACTTGGACAACCTAAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCCAGAA
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TGATG***TCCCAGAACTTGTAGCGGGAGAGACTTTCGAGACTCCTTCTGCTGAAGAAGC
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AAA*TGTTTGGTGCTCGACCTTTTTTGAGCACCGTTCAGATTCTTGTTTTCTCTAGTCGT
TACGAACAGAAAGACTTGGTTTTGTTATCACTTGATGCGTTTTGTCTTAACAGCAATTTT
CCTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4H363TF U 1
AF RR4GD33TF U 1
AF RR4H363JQ C 20
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BS 310 310 RR4H363TF
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BS 401 532 RR4GD33TF
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ACG

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GAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGTAAAGGGACTGT
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CACCCTCAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGGTATCGAAGAAGTTAACATCTT*AA
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ATGGGCCGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAGTTGCA*GACATACTTCCACAGATTAT
CAGCCAACTTGGAACTGATAACTTGGACAACCTAAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCCAGAA
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AAA*TGTTTGGTGCTCGACCTTTTTTGAGCACCGTTCAGATTCTTGCTTTCTCTAGTCGT
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GT

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AAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGTAAAGGGACTGTAAGAAGGAAGAAGAAGGCT
GTTCACAAGACGAACACGACCGACGACAAGAAGCTACAGATCACCCTCAAGAGAGTTGGA
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TTCCTTAACCCTAAAGTTCAAGCTTCGGTTGCTGCTAACACATGGGCCGTGAGCGGTACA
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AACTTGGACAACCTAAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCCAGAAACAGGCACCAGGTGGAGGA
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CTTTTTTGAGCACCGTTCAGATTCTTGTTTTCTCTAGTCGTTACGAACAGAAAGACTTGG
TTTTGTTATCACTTGATGCGTTTTGTCTTAACAGCAATTTTCCTTTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 5

CO CL2072Contig1 993 5 9 U
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AGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCGCCGAAGGGAGCTCTTGGTGGAG
CTATTGATACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTG
CTGCTCTTCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAGGAACTTAAGAAGCTTG
TGGTTGACACAACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAGGGAGGAAGCTTGGTTCCTC
TGGTGGGTATAGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTACAGTACAAGAATGTGAGGCCTG
ATTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTATGAGA
AGGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCCAGCT
CGGCTTTGTTTTTTTTCTTTATAAGGTTGTCTGAAACAAACTTACACCGTCTCTATTTGG
TCTTTGTGTTATAGCTCAAGCGAAACTGTGTGGTTGCATTAATACACGTTTAAAAAAACT
ACAGTAATTTGCAAAAATAAAGTTTTTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR65TF U 56
AF RR4GJ92TF U 1
AF RR4G004TF U 51
AF RR4GJ92JQ C 182
AF RR4BR65JQ C 333
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GG
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TTGTGGTTGACACAACCGCCAA

QA 3 564 3 564
DS 

RD RR4GJ92TF 728 0 0
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GCGGAGAACGAAAGCATTTCATTATCTATCAACAACAAATGGCGATTCGTTCTGTAGCGA
GTAGAAGAACCCTAGGCGGTCTAAAGGAGACGTCTTCGAGGCTTGTGGGATGGAGAGGGA
TCCAGACTTTCACGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCGCTGGAGCCGGCGATCA
GCGGCGAGATTATGCAGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAATTACA
ACAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCGGGCCGTTAACAACGGAGACGCTTCCACTGTCGTCA
AGCTCCATAACGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCACTCGATTTTCTGGA
AGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCGCCGAAGGGAGCTCTTGGTGGAG
CTATTGATACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTG
CTGCTCTTCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAGGAACTTAAGAAGCTTG
TGGTTGACACAACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAGGGAGGAAGCTTGGTTCCTC
TGGTGGGTATAGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTACAGTACAAGAATGTGAG*CCTG
ATTATCTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4G004TF 751 0 0
GACCGAA
GGAGCGGAGAACGAAAGCATTTCATTATCTATCAACAACAAATGGCGATTCGTTCTGTAG
CGAGTAGAAGAACCCTAGGCGGTCTAAAGGAGACGTCTTCGAGGCTTGTGGGATGGAGAG
GGATCCAGACTTTCACGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCGCTGGAGCCGGCGA
TCAGCGGCGAGATTATGCGGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAATT
ACAACAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCAGGCCGTTAACAACGGAGACGCTTCCACTGTCG
TCAAGCTCCATAACGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCACTCGATTTTCT
GGAAGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCGCCGAAGGGAGCTCTTGGTG
GAGCTATTGATACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTTCTGAAG
GTGCTGCTCTTCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAGGAACTTAAGAAGC
TTGTGGTTGACACAACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAGGGAGGAAGCTTGGTTC
CTCTGGTGTGTATAGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACCTACAGTACAAGAATGTGAGGC
CTGATTATCTGAAGAACGTCTGGAAG*TTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTATG
AGAAGGA*TGCTAGTGAGTTCGTT

QA 8 751 8 751
DS 

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CGGCGAGATTATGCAGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAATTACAA
CAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCGGGCCGTTAACAACGGAGACGCTTCCACTGTCGTCAA
GCTCCATAACGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCACTCGATTTTCTGGAA
GAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCGCCGAAGGGAGCTCTTGGTGGAGC
TATTGATACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTGC
TGCTCTTCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAGGAACTTAAGAAGCTTGT
GGTTGACACAACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAGGGAGGAAGCTTGGTTCCTCT
GGTGGGTATAGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTACAGTACAAGAATGTGAGGCCTGA
TTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTATGAGAA
GGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCCAGCTC
GGCTTTGTTTTTTTTCTTTATAAGGTTGTCTGAAACAAACTTACACCGTCTCTATTTGGT
CTTTGTGTTATAGCTCAAGCGAAACTGTGTGGTTGCATTAATACACGTTTAAAAAAACTA
CAGTAATTTGCAAAAATAAAGTTTTTTTTTGT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4BR65JQ 640 0 0
AACAACGGAGACGCTTCCACTGTCGTCAAGCTCCATAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGA
GGTCATGTGAACCACTCGATTTTCTGGAAGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGA
GAGCCGCCGAAGGGAGCTCTTGGTGGAGCTATTGATACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGT
TTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTGCTGCTCTTCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTC
GGTTTAGACAAGGAACTTAAGGAGCTTGTGGTTGACACAACCGCCAATCAGGATCCACTT
GTGACAAAGGGAGGAAGCTTGGTTCCTCTGGTGGGTATAGATGTTTGGGAGCACGCCTAC
TACTTACAGTACAAGAATGTGAGGCCTGATTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAAC
TGGAACTACGCAAACGAAGTTTATGAGAAGGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAA
CATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCCAGCTCGGCTTTGTTTTTTTTCTTTATAAGGTTGTCT
GAAACAAACTTACACCGTCTCTATTTGGTCTTTGTGTTATAGCTCAAGCGAAACTGTGTG
GTTGCATTAATACACGTTTAAAAAAACTCCAGTAATTTGC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 5

CO CL2073Contig1 1037 5 3 U
GTAATACGGATTTATATTATAGAAAGCTTAAAGAGCAATGTTTACAACTGAAGCAGAAAG
TCCCGGAGTCAAGTTCAACGGGAGAATGAAACTAAAAAACAATACATAACAACTAGAGAT
AAAACCATATAGGGGCGAGGCACGCTCAGCGAAATGAAGAAACCCAAAGAGAAGCTTCAC
TTTTGTTCCCATGGCGATTGTTCGAGAGAACAATGGATAGTCGAACACGACGTTGAAACA
CCTATAAGAAGAAACTGAAATGTTGACTGGCAAGAACTCTAGGTGAGAAGCTCTAGATCT
GTTGACAACATTGAGAGAACAAAGTCCTATTTGACTTGATTTGGTCCTATTTGACTTGAT
TTGGCGCTTAAACACGAACGATCAGCTTTAGACCCAACAAATCTTACCGAAGAGACTAGG
TGAATCTTTAACTCTAACTTCACCTCCGGAGAGGCGCTTCGGGAAATGAGGTTTGATGAC
ATAGCTGACGGTTTAGCTTGGTCCAAAACTCGGAACTCAACATTACCGTGTCGAGTCCAA
CAGGCTGTAACCAAAGACCTAAGCAGACAGTCATCACACTCATTCAACAAGAGTGTGTGT
GAGCAAATATCGGATAAGAGGTAAAAAGCTTTGGGGTGGATGGACCTCTGTGGAACGACT
CCTGTGTCAAGGTCGCTTAGTTGACTATGTGAAGAACCGTCGATGCTTGAGACGGCGTAA
TCTGATGGAAACACGGCGGTGATGGAGTTAGTAAATCTGGCGAGTCCACACTCTTGCACA
ATAGTTTCAGCGACGAGGATATCGGGAAAGCCACGAACTCGGCTTTGTGAAGAACCGTCG
ATGCTTGACGGCGTAGTGTGTTAGAGACGCAACAATGAAAACTTCGTGAGGAAATCTGGC
GAAACAACACTCTTGCACAATAGATCCGGCGGTAACTAAGAGACTGAGATCTAATTGATG
TAGCTTAGCTCCATAGAAACCTTGGTGGGTTGAAGCTGCCTCTTTGTCGGGTGCATAGTC
GATGGCATAAAGACCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C436JQ U 1
AF RR4D969JQ U 1
AF RR4CK11JQ U 1
AF RR4CK11TF C 351
AF RR4C436TF C 381
BS 1 707 RR4C436JQ
BS 708 814 RR4CK11JQ
BS 815 1037 RR4CK11TF

RD RR4C436JQ 707 0 0
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AAAACCATATAGGGGCGAGGCACGCTCAGCGAAATGAAGAAACCCAAAGAGAAGCTTCAC
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QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4D969JQ 750 0 0
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TCCCGGAGTCAAGTTCAACGGGAGAATGAAACTAAAAAACAATACATAACAACTAGAGAT
AAAACCATATAGGGGCGAGGCACGCTCAGCGAAATGAAGAAACCCAAAGAGAAGCTTCAC
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CCTATAAGAAGAAACTGAAATGTTGACTGGCAAGAACTCTAGGTGAGAAGCTCTAGATCT
GTTGACAACATTGAGAGAACAAAGTCCTATTTGACTTGATTTGGTCCTATTTGACTTGAT
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TGAATCTTTAACTCTAACTTCACCTCCGGAGAGGCGCTTCGGGAAATGAGGTTTGATGAC
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CAGGTTGTAACCAAAGACCTAAGCAGACAGTCATCACACTCATTCAACAAGAGTGTGTGT
GAGCAAATATCGGATAAGAGGTAAAAAGCTTTGGGGTGGATGGACCTCTGTGGAACGACT
CCTGTGTCAAGGTCGCTTAGTTGACTATGTGAAGAACCGTCGATGCCTGAGACGGCGTAA
TCTGATGGAAACACAGCGGTGATGGAGTTA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4CK11JQ 814 0 0
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TCCCGGAGTCAAGTTCAACGGGAGAATGAAACTAAAAAACAATACATAACAACTAGAGAT
AAAACCATATAGGGGCGAGGCACGCTCAGCGAAATGAAGAAACCCAAAGAGAAGCTTCAC
TTTTGTTCCCATGGCGATTGTTCGAGAGAACAATGGATAGTCGAACACGACGTTGAAACA
CCTATAAGAAGAAACTGAAATGTTGACTGGCAAGAACTCTAGGTGAGAAGCTCTAGATCT
GTTGACAACATTGAGAGAACAAAGTCCTATTTGACTTGATTTGGTCCTATTTGACTTGAT
TTGGCGCTTAAACACGAACGATCAGCTTTAGACCCAACAAATCTTACCGAAGAGACTAGG
TGAATCTTTAACTCTAACTTCACCTCCGGAGAGGCGCTTCGGGAAATGAGGTTTGATGAC
ATAGCTGACGGTTTAGCTTGGTCCAAAACTCGGAACTCAACATTACCGTGTCGAGTCCAA
CAGGCTGTAACCAAAGACCTAAGCAGACAGTCATCACACTCATTCAACAAGAGTGTGTGT
GAGCAAATATCGGATAAGAGGTAAAAAGCTTTGGGGTGGATGGACCTCTGTGGAACGACT
CCTGTGTCAAGGTCGCTTAGTTGACTATGTGAAGAACCGTCGATGCTTGAGACGGCGTAA
TCTGATGGAAACACGGCGGTGATGGAGTTAGTAAATCTGGCGAGTCCACACTCTTGCACA
ATAGTTTCAGCGACGAGGATATCGGGAAAGCCAC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4CK11TF 687 0 0
TTGACTTGATTTGGCGCTTAAACACGAACGATCAGCTTTAGACCCAACAAATCTTACCGA
AGAGACTAGGTGAATCTTTAACTCTAACTTCACCTCCGGAGAGGCGCTTCGGGAAATGAG
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TGGAACGACTCCTGTGTCAAGGTCGCTTAGTTGACTATGTGAAGAACCGTCGATGCTTGA
GACGGCGTAATCTGATGGAAACACGGCGGTGATGGAGTTAGTAAATCTGGCGAGTCCACA
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CTAATTGATGTAGCTTAGCTCCATAGAAACCTTGGTGGGTTGAAGCTGCCTCTTTGTCGG
GTGCATAGTCGATGGCATAAAGACCCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4C436TF 657 0 0
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CACCTCCGGAGAGGCGCTTCGGGAAATGAGGTTTGATGACATAGCTGACGGTTTAGCTTG
GTCCAAAACTCGGAACTCAACATTACCGTGTCGAGTCCAACAGGCTGTAACCAAAGACCT
AAGCAGACAGTCATCACACTCATTCAACAAGAGTGTGTGTGAGCAAATATCGGATAAGAG
GTAAAAAGCTTTGGGGTGGATGGACCTCTGTGGAACGACTCCTGTGTCAAGGTCGCTTAG
TTGACTATGTGAAGAACCGTCGATGCTTGAGACGGCGTAATCTGATGGAAACACGGCGGT
GATGGAGTTAGTAAATCTGGCGAGTCCACACTCTTGCACAATAGTTTCAGCGACGAGGAT
ATCGGGAAAGCCACGAACTCGGCTTTGTGAAGAACCGTCGATGCTTGACGGCGTAGTGTG
TTAGAGACGCAACAATGAAAACTTCGTGAGGAAATCTGGCGAAACAACACTCTTGCACAA
TAGATCCGGCGGTAACTAAGAGACTGAGATCTAATTGATGTAGCTTAGCTCCATAGAAAC
CTTGGTGGGTTGAAGCTGCCTCTTTGTCGGGTGCATAGTCGATGGCATAAAGACCCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 4

CO CL2074Contig1 1053 4 15 U
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AAAGAGACAATCATGGGTAAAGGTCCAGGACTCTACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGA
GATCTTTTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCA
ACCGGTGTTGCAATCACAACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTA
CTTACCCAAATCAAGAACAAGAACTTAACTGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCT
ATCCTTACCACTGTCACCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTGAAGGCTATCCTTAGCGCC
AAGGCGCCTGATCAGAAATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGT
ATCTGCACCAGCGTTGGACTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGA
ACCAGTGTGTTGGCTCTTGGTACCGATGTGTCCTTTGACACAGAATCTGGCAACTTCAAA
CATTTCAACGCCGGTGTGAGCTTCACCAAGGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAAT
GACAAAGGTGAGAAATTGAATGCATCGTACTACCACATTGTGAACCCCTTGAAGAACACA
GTGGTTGGAGCCGAGGTTACCCACAGCTTGAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGT
GCTCAGCACGCTCTGGACCCATTGACCACGGTTAAGACACGCGTAAACAATGCTGGTATA
GCCAACGCTCTGATCCAACACGAGTGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTCTGGAGAG
GTTGACTCTAAAGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCTCAAGCCT
TGAGTGAAAAGAACCTCCTCCAATGTCTTCCTAATCTTTTGGAACTAATCTCTGTCTGTT
TTTTTTTTTCCTTTAAAAATTGTTCATTTGTTTTCTTTTTTTACAAAATAAGAAGAAAAA
TAAAATACTATGAAAGGATCTTCTTTGAAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E543TF U 12
AF RR4DG53TF U 1
AF RR4BF52TF U 172
AF RR4DG53JQ C 298
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BS 786 802 RR4DG53TF
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GG
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AGGACTACCAAGGAGACCAGAAGCTCAGTATCACCACTTACTCTTCAACCGGGGTTGCAA
TCACAACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCA
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TCACCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTGAAGGCAATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATC
AGAAATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCAGCG
TTGGGTTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAATTTCTCCGGTGTGATTGGAACCAGTGTGTTGG
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CTTACCCAAATCAAGAACAAGAACTTAACTGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCT
ATCCTTACCACTGTCACCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTGAAGGCTATCCTTAGCGCC
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GACAAAGGTGAGAAATTGAATGCATCGTACTACCACATTGTGAACCCCTTGAAGAACACA
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GCCA*CGCTCTGATCCAACACG

QA 1 802 1 802
DS 

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G
ACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCACAACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGG
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ATTCTTCTATCCTTACCACTGTCACCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTGAAGGCTATCC
TTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCC
ACGCAGGTATCTGCACCAGCGTTGGACTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTG
TGATTGGAACCAGTGTGTTGGCTCTTGGTACCGATGTGTCCTTTGACACAGAATCTGGCA
ACTTCAAACATTTCAACGCCGGTGTGAGCTTCACCAAGGATGATTTGATTGCTTCTCTTA
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AGAACACAGTGGTTGGAGCCGAGGTTACCCACAGCTTGAAGAGCCAAGTGAACACGATAA
CCGTGGGTGCTCAGCACGCTCTGGACCCATTGACCACGGTTAAGACACGCGTAAACAATG
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CTGGAGAGGTTGACTCTAAAGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTC
TCAAGCCTTGAGTGAAAAGAACCTCCTCCAATGTCTTCCTAATCTTTTGGA*CTAATCTC
TGTCTGTTTT

QA 2 791 2 791
DS 

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GGTATCTGCACCAGCGTTGGACTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATT
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AAACATTTCAACGCCGGTGTGAGCTTCACCAAGGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTG
AATGACAAAGGTGAGAAATTGAATGCATCGTACTACCACATTGTGAACCCCTTGAAGAAC
ACAGTGGTTGGAGCCGAGGTTACCCACAGCTTGAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTG
GGTGCTCAGCACGCTCTGGACCCATTGACCACGGTTAAGACACGCGTAAACAATGCTGGT
ATAGCCAACGCTCTGATCCAACACGAGTGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTCTGGA
GAGGTTGACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCTCAAG
CCTTGAGTGAAAAGAACCTCCTCCAATGTCTTCCTAATCTTTTGGAACTAATCTCTGTCT
GTTTTTTTTTTTCCTTTAAAAATTGTTCATTTGTTTTCTTTTTTTACAAAATAAGAAGAA
AAATAAAATACTATGAAAGGATCTTCTTTGAAGATG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 5

CO CL2075Contig1 688 5 4 U
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TAATAATCACATTACAGAAAAGCTCCAGAAAGAAAGAAAGTTTATTATTTTTATGAAAGA
ATCTATTCGGTCCCTGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTT
CTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACAAACCATCCTGTGTACCCGAGACCAACA
AGCTCCATAACTTTAGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAAGAATGGAAGAT
AACCAAACAGCTACAATGGCTCCTCCTCCATAGATAACCACAGTTGTTTTGTTCTCAAGA
CCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTAAAGAGTTCGTTGGTGTCGATGGACGTTGAGGTC
TCGTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCAATTCAACCTTCTGTACACCGTTCCCTGAA
ACTAGCTTCAGGGGAACAGTGAAAGAAGATCGGCCTAAAGAGCGAGGAGGCAGCGGAGGA
AGGTAAGGAACGGCGGATAAGCGAGCGGAGACGGCCGGGACACGGGGAATCATCACTGCC
ACAGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATCGAACTGGTTCTTCTTCTTCTTCTGCTA
CTACTCTCGTCTTCTTCTTCTTCTCTCC


BQ
10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CO46TF C 1
AF RR4EQ24JQ U 5
AF RR4CO46JQ U 1
AF RR4GG51JQ U 2
AF RR4GG51TF C 2
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RD RR4CO46TF 585 0 0
G
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AATAATCACATTACAGAAAAGCTCCAGAAAGAAAGAAAGTTTATTATTTTTATGAAAGAA
TCTATTCGGTACCTGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTC
TGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACAAACCATCCTGTGTACCCGAGACCAACAA
GCTCCATAACTTTAGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAAGAATGGAAGATA
ACCAAACAGCTACAATGGCTCCTCCTCCATAGATAACCACAGTTGTTTTGTTCTCAAGAC
CATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTAAAGAGTTCGTTGGTGTCGATGGACGTTGAGGTCT
CGTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCAATTCAACCTTCTGTACACCGTTCCCTGAAA
CTAGCTTCAGGGGAACAGTGAAAGAAGATCGGCCTAAAGAGCGAGGAGGCAGCGGAGGAA
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QA 2 585 2 585
DS 

RD RR4EQ24JQ 620 0 0
CG
AAGATAATATTTTCGCACTGAAGAAGGTACACTGTTGAAAACAGAGACATTGTATAATAA
TCACATTACAGAAAAGCTCCAGAAAGAAAGAAAGTTTATTATTTTTATGAAAGAATCTAT
TCGGTCCCTGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTGCTT
GACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACAAACCATCCTGTGTACCCGAGACCAACAAGCTCC
ATAACTTTAGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAAGAATGGAAGATAACCAA
ACAGCTACAATGGCTCCTCCTCCATAGATAACCACAGTTGTTTTGTTCTCAAGACCATCC
CACTTTTCCTTCAAGTCTGTAAAGAGTTCGTTGGTGTCGATGGACGTTGAGGTCTCGTCT
GATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCAATTCAACCTTCTGCACACCGTTCCCTGAAACTAGC
TTCAGGGGAACAGTGAAAGAAGATCGGTCTAAAGAGCGAGGAGGCAGCGGAGGAAGGTAA
GGAACGGCGGATAAGCGAGCGGAGACGGCCGGGACACGGGGAATCATCACTGCCACAGAG
GACGAAGCTACTACTGTC

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR4CO46JQ 670 0 0
GGATCAAAGATAATATTTTCGCACTGAAGAAGGTACACTGTTGAAAACAGAGACATTGTA
TAATAATCACATTACAGAAAAGCTCCAGAAAGAAAGAAAGTTTATTATTTTTATGAAAGA
ATCTATTCGGTACCTGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTT
CTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACAAACCATCCTGTGTACCCGAGACCAACA
AGCTCCATAACTTTAGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAAGAATGGAAGAT
AACCAAACAGCTACAATGGCTCCTCCTCCATAGATAACCACAGTTGTTTTGTTCTCAAGA
CCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTAAAGAGTTCGTTGGTGTCGATGGACGTTGAGGTC
TCGTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCAATTCAACCTTCTGTACACCGTTCCCTGAA
ACTAGCTTCAGGGGAACAGTGAAAGAAGATCGGCCTAAAGAGCGAGGAGGCAGCGGAGGA
AGGTAAGGAACGGCGGATAAGCGAGCGGAGACGGCCGGGACACGGGGAATCATCACTGCC
ACAGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATCGAACTGGTTCTTCTTCTTCTTCTGCTA
CTACTCTC
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GG51JQ 687 0 0
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AATAATCACGTTACAGAAAAGCTCCAGAAAGAAAGAAAGTTTATTATTTTTATGAAAGAA
TCTATTCGGTCCCTGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTC
TGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACAAACCATCCTGTGTACCCGAGACCAACAA
GCTCCATAACTTTAGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAAGAATGGAAGATA
ACCAAACAGCTACAATGGCTCCTCCTCCATAGATAACCACAGTTGCTTTGTTCTCAAGAC
CATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTAAAGAGTTCGTTGGTGTCAATGGACGTTGAGGTCT
CGTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCAATTCAACCTTCTGTAAACCGTTCCCTGAAA
CTAGCTTCAGGGGAACAGTGAAAGAAGATCGGCCTAAAGAGCGAGGAGGCAGCGGAGGAA
GGTAAGGAACGGCGGATAAGCGAGCGGAGACGGCCGGGACACGGGGAATCATCACTGCCA
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TACTCTCGTCTTCTTCTTCTTCTCTCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4GG51TF 687 0 0
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AATAATCACGTTACAGAAAAGCTCCAGAAAGAAAGAAAGTTTATTATTTTTATGAAAGAA
TCTATTCGGTCCCTGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTC
TGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACAAACCATCCTGTGTACCCGAGACCAACAA
GCTCCATAACTTTAGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAAGAATGGAAGATA
ACCAAACAGCTACAATGGCTCCTCCTCCATAGATAACCACAGTTGCTTTGTTCTCAAGAC
CATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTAAAGAGTTCGTTGGTGTCAATGGACGTTGAGGTCT
CGTCTGATGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCAATTCAACCTTCTGTAAACCGTTCCCTGAAA
CTAGCTTCAGGGGAACAGTGAAAGAAGATCGGCCTAAAGAGCGAGGAGGCAGCGGAGGAA
GGTAAGGAACGGCGGATAAGCGAGCGGAGACGGCCGGGACACGGGGAATCATCACTGCCA
CAGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATCGAACTGGTTCTTCTTCTTCTTCTGCTAC
TACTCTCGTCTTCTTCTTCTTCTCTCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 5

CO CL2076Contig1 1237 5 10 U
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GACAACCAGGCGGCGACGTGACTTCGATTTTCGTCGTGTTTGGTGTTTCCATGGCTATCG
CCGCTTTGGTCATGTCCCCTTCATCGTTGGTCCACCAAGTTCCCGAAGGACACGTTGGAG
CGTATTGGAGAGGTGGTGCTCTTCTCAACAGCATTACAGAGCCTGGTTTTCATTTGAAGC
TGCCTTTCATTACCAACTACGAGCCTGTTCAAGTTACTCTCCAAACTGACCAAGTGAAGG
ATATACCATGTGGTACCAAAGGAGGTGTCATGATTACCTTTGAAAAGATTGAAGTTGTTA
ATCGTCTGCGTAAGGATTATGTCTATGACACTTTGCTCAACTACGGTGTCGACTATGATA
ACACATGGATTTACGACAAGATTCACCACGAGATCAACCAGTTCTGCAGCTCTCATTCCC
TTCAGCAAGTCTACATTGACATCTTTGACCAGATTGACGAGCGAATGAAAGATGCTCTTC
AGGCTGATTGCACACGTTATGCTCCAGGAATCGAGATTATTAGTGTGCGTGTCACTAAGC
CTAAAATTCCAGAGAGTGTGAGGCGCAACTTTGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGG
TCTTGATTGCTATTGAGAAACAAAGAGTTGCTGAGAAAGAGGCAGAGACAAAGAAGATAA
TGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAGAATGCCAATGTCAGTAAGATTCTGATGGAGCAGAAGC
TGACTGAGAAAGACAGTGCACGGAGAGAAGCTGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGATC
GTCAAAAGAGTCTTGCCGATGCAGATTACTACCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACA
AGTTGAAGCTCACTCCTGAATTTCTCGAACTTAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACA
CCAAAATGTCCTTTGGGGACAAGGTACCTAACATGGTGTTGGATCAAAGGCTGCTTGGGA
ACTTCCTCAGTCAATCGGTAGAAGACCAATCTAATGATGGAAACTTGGAAACGGCCACTG
ATTCGTAGATTATGTTCAGTCCCCCACCAAAAACAAAAATTTCCTTTTTGTTATGCTTGA
AGTTATGCAGCATAACCTAGTAGTGAAAACTTGGATGCTTCTCTTTTTCTGTCAATCATT
TTACTGCAATTTAATTCCTAATAATTATGCTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA03TF U 1
AF RR4BI70TF U 95
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AF RR4EA03JQ C 484
AF RR4H791JQB C 848
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BS 891 977 RR4H791TF
BS 978 1237 RR4EA03JQ

RD RR4EA03TF 773 0 0
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GACAACCAGGCGGCGACGTGACTTCGATTTTCGTCGTGTTTGGTGTTTCCATGGCTATCG
CCGCTTTGGTCATGTCCCCTTCATCGTTGGTCCACCAAGTTCCCGAAGGACACGTTGGAG
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TGCCTTTCATTACCAACTACGAGCCTGTTCAAGTTACTCTCCAAACTGACCAAGTGAAGG
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ATCGTCTGCGTAAGGATTATGTCTATGACACTTTGCTCAACTACGGTGTCGACTATGATA
ACACATGGATTTACGACAAGATTCACCACGAGATCAACCAGTTCTGCAGCTCTCATTCCC
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AGGCTGATTGCACACGTTATGCTCCAGGAATCGAGATTATTAGTGTGCGTGTCACTAAGC
CTAAAATTCCAGAGAGTGTGAGGCGCAACTTTGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGG
TCTTGATTGCTATTGAGAAACAAAGAGTTGCTGAGAAAGAG*CAGAGACAAAGAAGATA*
TGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAGA*TGCCAATGTCAGTAAGAT
CTGATGGAGC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4BI70TF 796 0 0
G
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CAAGTTCCCGAAGGACACGTTGGAGCGTATTGGAGAGGTGGTGCTCTTCTCAACAGCATT
ACAGAGCCTGGTTTTCATTTGAAGCTGCCTTTCATTACCAACTACGAGCCTGTTCAAGTT
ACTCTCCAAACTGACCAAGTGAAGGATATACCATGTGGTACCAAAGGAGGTGTCATGATT
ACCTTTGAAAAGATTGAAGTTGTTAATCGTCTGCGTAAGGATTATGTCTATGACACTTTG
CTCAACTACGGTGTCGACTATGATAACACATGGATTTACGACAAGATTCACCACGAGATC
AACCAGTTCTGCAGCTCTCATTCCCTTCAGCAAGTCTACATTGACATCTTTGACCAGATT
GACGAGCGAATGAAAGATGCTCTTCAGGCTGATTGCACACGTTATGCTCCAGGAATCGAG
ATTATTAGTGTGCGTGTCCCTAAGCCTAAAATTCCAGAGAGTGTGAGGCGCAACTTTGAG
CAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGGTCTTGATTGCTATTGAGAAACAAAGAGTTGCTGAG
AAAGAGGCAGAGACAAAGAAGATAATGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAGAATGCCAATGTT
AGTAAGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGACTGAGAAAGACAGTGCACGGAGAGAAGCTGAC
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GTACTGAAAGAAGCT

QA 2 796 2 796
DS 

RD RR4H791TF 655 0 0
G
GGTGTCATGATTACCTTTGAAAAAATTGAAGTTGTTAATCGTCTGCGTAAGGATTATGTC
TACGACACTTTGCTCAACTACGGTGTCGACTATGATAACACATGGATTTACGACAAGATT
CACCACGAGATCAACCAGTTCTGCAGCTCTCATTCCCTTCAGCAAGTCTACATTGACATC
TTTGACCAGATTGATGAACGGATGAAAGATGCTCTTCAGGCTGATTGCACACGTTATGCT
CCAGGAATCGAGATCATTAGTGTGCGTGTCACTAAGCCTAAAATTCCAGAGAGTGTAAGG
CGCAACTTTGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGGTCTTGATTGCTATTGAGAAACAA
AGAGTTGCTGAGAAAGAGGCAGAGACAAAGAAGATAATGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAG
AATGCCAATGTTAGTAAGATTCTGATGGATCGGAAGCTGACTGAGAAAGACAGTGCACGG
AGAGAAGCTGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGATCGTCAAAAGAGTCTTGCCGATGCA
GATTACTACCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACAAGTTGAAGCTCACTCCTGAATTT
CTCGAACTTAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACACCAAAATGTCCTTTGGG

QA 2 655 2 655
DS 

RD RR4EA03JQ 754 0 0
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CTGATTGCACACGTTATGCTCCAGGAATCGAGATTATTAGTGTGCGTGTCACTAAGCCTA
AAATTCCAGAGAGTGTGAGGCGCAACTTTGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGGTCT
TGATTGCTATTGAGAAACAAAGAGTTGCTGAGAAAGAGGCAGAGACAAAGAAGATAATGG
CCATTAGTGAAGCCGAGAAGAATGCCAATGTCAGTAAGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGA
CTGAGAAAGACAGTGCACGGAGAGAAGCTGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGATCGTC
AAAAGAGTCTTGCCGATGCAGATTACTACCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACAAGT
TGAAGCTCACTCCTGAATTTCTCGAACTTAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACACCA
AAATGTTCTTTGGGGACAAGGTACCTAACATGGTGTTGGATCAAAGGCTGCTTGGGAACT
TCCTCAGTCAATCGGTAGAAGACCAATCTAATGATGGAAACTTGGAAACGGCCACTGATT
CGTAGATTATGTTCAGTCCCCCACCAAAAACAAAAATTTCCTTTTTGTTATGCTTGAAGT
TATGCAGCATAACCTAGTAGTGAAAACTTGGATGCTTCTCTTTTTCTGTCAATCATTTTA
CTGCAATTTAATTCCTAATAATTATGCTTTTTGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4H791JQB 372 0 0
GAGTCTTGCCGATGCAGATTACTACCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACAAGTTGAA
GCTCACTCCTGAATTTCTCGAACTTAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACACCAAAAT
GTCCTTTGGGGACAAGGTACCTAACATGGTGTTGGATCAAAGGCTGCTTGGGAACTTCCT
CAGTCAATCGGTAGAAGACCAATCTAATGATGGAAACTTGGAAACGGCCACTGATTCGTA
GATTATGTTCAGTCCCCCACCAAAAACAAAAATTTCCTTTTTGTTATGCTTGAAGTTATG
CAGCATAACCTAGTAGTGAAAACTTGGATGCTTCTCTTTTTCTGTCAATCATTTTACTGC
AATTTAATTCCT

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 5

CO CL2077Contig1 1316 5 12 U
GGACACACATTTTGATTTTGTTATGCGACATGAAGTACTTGCGCTATATTCGTGTTGCTC
ATCGTTCTTGGACTAAGTGCTACCGACGGCTACGATTGCAAGATCGTCCAGTTTATATTT
GGGGACTCCTTGTCTGATGTAGGCAACAATAGGAACCTACCAAGGAGCTTAGCCCAGGCG
AATCTACCATTTTACGGTATAGATTTTGGCAATGGTTTGCCTAATGGAAGGTTCACTAAT
GGCCGAACTGTTTCAGACATTATAGGTGATAAAATTGGGTTACCAAGACCAGTAGCCTTT
TTGGATCCATCAATGAATGAAGATGTAATACTTGAAAATGGAGTGAACTATGCTTCAGGA
GGTGGTGGAATCTTGAATGAAACTGGTGGTTATTTCATACAAAGATTTTCTCTATGGAAG
CAAATAGAGTTATTCCAAGGGACACAAGATGTGATT*GTAGCAAAGATAGGGAAAAAAGA
AGCAGACAAATT*CTTCCAACAAGCTCGATACGTCGTCGCTTTAGGCAGCAATGACTTCA
TTAACAACTACTTGATGCCTGTCTATGGGGATTCTTGGAAGTACAATGATCAAACATTCG
TCGACTACTTAATGGAAACACTTGATTCTCAACTCAGGGTGTTGCACAGTTTGGGAGCGA
GGAAGCTAATGGTGTTTGGTTTAGGACCAATGGGTTGTATCCCACTTCAAAGAGCTTTAA
GCCTCGATGGTCAATGTCAAAACAAGGCTAGTAATCTTGCTAAGAGATTCAACAAAGCTG
CGGCCACAATGCTCCAAGATCTCGAAACCAAACTCCCAAATGCAAGTTACGAGTTTAGTG
AAGCCTATGACCTTGTCAACGACGTCATTACTAACCCACAGAAATACGGATTCGATAACT
CGGATTCGCCGTGTTGCTCGTTCTACAAAATCCGGCCGGCGCTGACATGTATTCCGGCGT
CGACGTTGTGTAAAGACAGAAGTAAGTATGTGTTTTGGGACGAGTATCATCCGACCGATA
AGGCCAACGAGCTAGTTGCTAATATTCTTATCAAAAGGTTTGATTTCATGCGTGCCGATG
ACGGTACTTCCACCGCTCCTGCTCCTTCCCCAGACGATAATTAACTGATCGACGTCTTAA
TTATATGCAATTTTCGGTTTATTTTTTATTTTGTTCATCATGTTGTGGAGAGTCCTCGTT
TCTCCTAAATTTTTAATTACAATTATTGTTTTGTGAAATAATGTTTTGTTTCTGTAAGAT
CTTCATATTTTGTTGTGTGTCTTATAATAGCAAAGATATCATCATATGTTGAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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GGGGACTCCTTGTCTGATGTAGGCAACAATAGGAACCTACCAAGGAGCTTAGCCCAGGCG
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G
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AGTGAAGCCTATGACCTTGTCAACGACGTCATTACTAACCCACAGAAATACGGATTCGAT
AACTCGGATTCGCCGTGTTGCTCGTTCTACAAAATCCGGC

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ATAACTCGGATTCGCCGTGTTGCTCGTTCTACAAAATCCGGCCGGCGCTGACATGTATTC
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GGCGCTGACATGTATTCCGGCGTCGACGTTGTGTAAAGACAGAAGTAAGTATGTGTTTTG
GGACGAGTATCATCCGACCGATAAGGCCAACGAGCTAGTTGCTAATATTCTTATCAAAAG
GTTTGATTTCATGCGTGCCGATGACGGTACTTCCACCGCTCCTGCTCCTTCCCCGGACGA
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ATAATGTTTTGTTTCTGTAATATCTTCATATTTTGTTGTGTGTCTTATAATAGCAAAGAT
ATCATCATATGTTGAGGTC

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DS 



AS 1 5

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TTCCTCCTTCGATTCGACAACCCTAATAAAACTGGGAGCTCTTTTTCTTTTTCTTCAAGT
AGCATTGTCTCATGCTCAGTTAAGCCCTTCCTTTTATGACAAAACATGTCCACAAGTAGT
TGACATTGTAACCAATACCATTGTGAATGCGCTAAGATCAGATCCTCGTATCGCAGCGAG
CATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTTAATGGATGTGATGCATCGATATTGTT
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TGGGTTCGATGCGATCGATAGAATGAAGGCTGCCGTGGAGAAAGCATGTCCTAAAACCGT
TTCATGTGCTGATTTGCTCACTATCGCGGCTCAACAGTCTGTCGTTTTGGCAGGAGGTCC
CTCATGGAAGGTTGCAAGTGGAAGAAGAGATAGCTTAAGAGGGTTTATGGATCTTGCTAA
TACAAACCTTCCAGCTCCATTCTTTAATCTAAAACAACTTAAGGATAGCTTCAAAAATGT
TGGACTGGATCGTCCTTCTGATCTGGTAGCTCTCTCCGGTGGTCACACTTTTGGGAAAAA
CCAATGTCGGTTCATAATGGACCGGCTATACAACTTCAGTGGTTCCGGTTCACCTGATCC
AACCCTTGATAAATCATACCTCAGTACGCTCAGGAAGCAATGTCCTCGCAATGGAAACCA
AAGTGTCCTGGTGGATTTCGATTTACGTACTCCGACACTCTTTGATAACAAATACTATGT
TAATCTTAAAGAAAACAAGGGTCTTATCCAGAGCGACCAAGAGTTGTTCTCTAGCCCTGA
TGCTTCAGACACTATCCCCTTAGCCCGAGCATATTCCGATGGTCAAGATAAATTTTTCAA
TGCCTTCACGGAGGCAATGAAAAGGATGGGAAACCTTTCACCTTTAACAGGAAAACAGGG
AGAAATTAGACTGAACTGTAGGGTGGTGAATTCCAAATCAAAGATCATGGATATGGTAGA
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TAAATGTTATCCAGATGTAACGTTTGAGATTTATGATAAATTCTTTAAATCTCGCTT


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AF RR4H069TF U 1
AF RR4BE10TF U 1
AF RR4AO54TF U 1
AF RR4AO54JQ C 270
AF RR4H069JQ C 636
BS 1 9 RR4AO54TF
BS 10 10 RR4H069TF
BS 11 753 RR4AO54TF
BS 754 754 RR4AO54JQ
BS 755 765 RR4AO54TF
BS 766 1017 RR4AO54JQ
BS 1018 1018 RR4H069JQ
BS 1019 1197 RR4AO54JQ

RD RR4H069TF 654 0 0
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TTCCTCCTT**ATTCGACAACCCTAATAAAACTGGGAGCTCTTTTTCTTTTTCTTCAAGT
AGCATTGTCTCATGCTCAGTTAAGCCCTTCCTTTTATGACAAAACATGTCCACAAGTAGT
TGACATTGTAACCAATACCATTGTGAATGCGCTAAGATCAGATCCTCGTATCGCAGCGAG
CATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTTAATGGATGTGATGCATCGATATTGTT
AGACAATACAACATCGTTTAGGACGGAGAGAGATGCGTTTGGGAACGCAAATTCAGCTCG
TGGGTTCGATGTGATCGATAGAATGAAGGCTGCCGTGGAGAAAGCATGTCCTAAAACCGT
TTCATGTGCTGATTTGCTCACTATCGCGGCTCAACAGTCTGTCGTTTTGGCAGGAGGTCC
CTCATGGAAGGTTGCAAGTGGAAGAAGAGATAGCTTAAGAGGGTTTATGGATCTTGCTAA
TACAAACCTTCCAGCTCCATTCTTTAATCTAAAACAACTTAAGGATAGCTTCAAAAATGT
TGGACTGGATCGTCCTTCTGATCTGGTAGCTCTCTCCGGTGGTCACACTTTTGG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BE10TF 704 0 0
GGACACAACTCAAACCTAACCAAATAATAGTTGTCGAGACCAAATAAAAATGCATTTCTC
TTCCTCCTTCGATTCGACAACCCTAATAAAACTGGGAGCTCTTTTTCTTTTTCTTCAAGT
AGCATTGTCTCATGCTCAGTTAAGCCCTTCCTTTTATGACAAAACATGTCCACAAGTAGT
TGACATTGTAACCAATACCATTGTGAATGCGCTAAGATCAGATCCTCGTATCGCAGCGAG
CATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTTAATGGATGTGATGCATCGATATTGTT
AGACAATACAACATCGTTTAGGACGGAGAAAGAT*CGTTTGGGAACGCAAATTCAGCTCG
TGGGTTCGATGTGATCGATAGAATTAAGGCTGCCGTGGAGAAAGCATGTCCTAAAACCGT
TTCATGTGCTGATTTGCTCACTATCGCGGCTCAACAGTCTGTCGTTTTGGCAGGAGGTCC
CTCATGGAAGGTTGCAAGTGGAAGAAGAGATAGCTTAAGAGGGTTTATGGATCTTGCTAA
TACAAACCTTCCAGCTCCATTCTTTAATCTAAAACAACTTAAGGATAGCTTCAAAAATGT
TGGACTGGATCGTCCTTCTGATCTGGTAGCTCTCTCCGGTGGTCACACTTTTGGGAAAAA
CCAATGTCGGTTCATAATGGACCGGCTATACAACTTCAGTGGTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4AO54TF 765 0 0
GGACACAACCCAAACCTAACCAAATAATAGTTGTCGAGACCAAATAAAAATGCATTTCTC
TTCCTCCTTCGATTCGACAACCCTAATAAAACTGGGAGCTCTTTTTCTTTTTCTTCAAGT
AGCATTGTCTCATGCTCAGTTAAGCCCTTCCTTTTATGACAAAACATGTCCACAAGTAGT
TGACATTGTAACCAATACCATTGTGAATGCGCTAAGATCAGATCCTCGTATCGCAGCGAG
CATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTTAATGGATGTGATGCATCGATATTGTT
AGACAATACAACATCGTTTAGGACGGAGAAAGATGCGTTTGGGAACGCAAATTCAGCTCG
TGGGTTCGATGCGATCGATAGAATGAAGGCTGCCGTGGAGAAAGCATGTCCTAAAACCGT
TTCATGTGCTGATTTGCTCACTATCGCGGCTCAACAGTCTGTCGTTTTGGCAGGAGGTCC
CTCATGGAAGGTTGCAAGTGGAAGAAGAGATAGCTTAAGAGGGTTTATGGATCTTGCTAA
TACAAACCTTCCAGCTCCATTCTTTAATCTAAAACAACTTAAGGATAGCTTCAAAAATGT
TGGACTGGATCGTCCTTCTGATCTGGTAGCTCTCTCCGGTGGTCACACTTTTGGGAAAAA
CCAATGTCGGTTCATAATGGACCGGCTATACAACTTCAGTGGTTCCGGTTCACCTGATCC
AACCCTTGATAAATCATACCTCAGTACGCTCAG*AAGCAATGTCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4AO54JQ 928 0 0
TTGTTAATGGATGTGATGCATCGATATTGTTAGACAATACAACATCGTTTAGGACGGAGA
AAGATGCGTTTGGGAACGCAAATTCAGCTCGTGGGTTCGATGCGATCGATAGAATGAAGG
CTGCCGTGGAGAAAGCATGTCCTAAAACCGTTTCATGTGCTGATTTGCTCACTATCGCGG
CTCAACAGTCTGTCGTTTTGGCAGGAGGTCCCTCATGGAAGGTTGCAAGTGGAAGAAGAG
ATAGCTTAAGAGGGTTTATGGATCTTGCTAATACAAACCTTCCAGCTCCATTCTTTAATC
TAAAACAACTTAAGGATAGCTTCAAAAATGTTGGACTGGATCGTCCTTCTGATCTGGTAG
CTCTCTCCGGTGGTCACACTTTTGGGAAAAACCAATGTCGGTTCATAATGGACCGGCTAT
ACAACTTCAGTGGTTCCGGTTCACCTGATCCAACCCTTGATAAATCATACCTCAGTACGC
TCAGGAAGCAATGTCCTCGCAATGGAAACCAAAGTGTCCTGGTGGATTTCGATTTACGTA
CTCCGACACTCTTTGATAACAAATACTATGTTAATCTTAAAGAAAACAAGGGTCTTATCC
AGAGCGACCAAGAGTTGTTCTCTAGCCCTGATGCTTCAGACACTATCCCCTTAGCCCGAG
CATATTCCGATGGTCAAGATAAATTTTTCAATGCCTTCACGGAGGCAATGAAAAGGATGG
GAAACCTTTCACCTTTAACAGGAAAACATGGAGAAATTAGACTGAACTGTAGGGTGGTGA
ATTCCAAATCAAAGATCATGGATATGGTAGATGATAATGACTTTGTCAGCTCGATTTGAG
GAACTATGTATTTCTCTCTATTAATAAGTGATAAATGTTATCCAGATGTAACGTTTGAGA
TTTATGATAAATTCTTTAAATCTCGCTT

QA 1 928 1 928
DS 

RD RR4H069JQ 539 0 0
CCGGTGGTCACACTTTTGGGAAAAACCAATGTCGGTTCATAATGGACCGGCTATACAACT
TCAGTGGTTCCGGTTCACCTGATCCAACCCTTGATAAATCATACCTCAGTACGCTCAGGA
AGCAATGTCCTCGCAATGGAAACCAAAGTGTCCTGGTGGATTTCGATTTACGTATTCCGA
CACTCTTTGATAACAAATACTATGTTAATCTTAAAGAAAACAAGGGTTTTATCCAGAGCG
ACCAAGAGTTGTTCTCTAGTCCTGATGCTTCAGACACTATCCCCTTAGTCCGAGCATATT
CCGATGGTCAAGATAAATTTTTCAATGCCTTCACGGAGGCAATGAAAAGGATGGGAAACC
TTTCACCTTTAACAGGAAAACAGGGAGAAATTAGACTGAACTGTAGGGTGGTGAATTCCA
AATCAAAGATCATGGATATGGTAGATGATAATGACTTTGTCAGCTCGATTTGAGGAACTA
TGTATTTCTCTCTATTAATAAGTGATAAATGTTATCCAGATGTAACGTTTGAGATTTAT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 5

CO CL2079Contig1 1218 5 5 U
GTGGAATAGAGTTGATAGATATATTTTGAAAAGGGTTCATTAGTCACTGAGAACAAAAAA
AAGTGTGTCTAAGATAGGAGGAGTGTATTACAAATCATACATAAGGTTCTTTTATCAGA*
****TGGGTTGGTCTTTGGGAACGATCTGATCCTTGATCCACATGTAGATCGGGATTAAC
ACAAACCAGGCAGCCGCTAGGGTACCCAAGAGGAAGCGTCCCAAGAAGGAGAAAGGATTG
TTTACAGGCTTCTCTACGTCCTCTTCCTTTGGTCCAAGCTGGAGAGGAGAGTCACCAGAG
GCAGGTTTGACACCGGTGACAGAGCATACCATGATAAGGCCGTGCCTGCGAACACCACGG
TACCACTTGGGGCCAATCCTCTTAAGCTGAACGTCCTTGAAACCAGCTTTGGTGAACCAC
TCAATGTACTCTTCCTCCTTGGGGAAAAGCATCCAGACGTCTGCAAAGAAGCGTGAAAGC
CAGAAGGTTGGGTG*ACAGGGCCAATGAGACATGCTTTCCCACCGATCTTGAGAACTCTG
TAGGCTTCCCTTATTCCCCTCTGCGGGTCAGGCCAGTACTCAATGCTTCCAGCAGAGACG
TATCTGTCGGCATAATCAGTACGAAAAGGGAGATCCTCTGCATCTCCTTCCACGATCGTG
CACTCCTTCAACGGCTCCTTCTGCTTCGCCTTGGCCAGCTGATGTGGCGACTGGTCCAGA
ATCGTCACGTTCTTAGCTTTCACCGTCTTGACGATGCCCAGCGTGGTGAAACCAGTCCCG
CCTCCGACGTCGACGACGCGCAAGTTGGGATTGTTCAGATCCGCCGGCTCGAGAGCGTCG
TCCCTCATATCCTCCGTCCAGTGGCCGGGATTGATGATGTGGTCGTACACGATGGACAGG
AACCTGTAGAACCAGTAGGCCTCCTTCTTGTGCTGAATGAACCTGGGCTGCGCAGATGGC
CTTGGCGCCGACACGCTGCTGCTGCATCTGGTTGCCACTGAGAGTCTCCGCGTCGTGGCG
GCGGCTGTGTTTGGGACCAAGCTCAGCGGAGGAATTGATCTCGCTTGGAGTTTGGAACCG
GTGAAACCTAATCCCTTGGGGAAGGTGATGGCACCGTTAAGCATGAAAGAAGCCATTGAT
GACGTAAGCCTACAATGCTTATCAGATCGGGTAGTTGGTAACAACGAAGCGGCTTATCAC
CAGTGAACACAAGCACTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT08JQ U 1
AF RR4BT08TF C 57
AF RR4GF19JQ U 69
AF RR4CH73JQ U 28
AF RR4GF19TF C 533
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AAGTGTGTCTAAGATAGGAGGAGTGTATTACAAATCATACATAAGGTTCTTTTATCAGA*
****TGGGTTGGTCTTTGGGAACGATCTGATCCTTGATCCACATGTAGATCGGGATTAAC
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C
C

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AGA*****TGGGTTGGTCTTTGGGAACGATCTGATCCTTGATCCACATGTAGATCGGGAT
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CGTGC
C

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GACACCGGTGACAGAGCATCCCATGATAAGGCCGTGCCTGCGAACACCACGGTACCACTT
GGGGCCAATCCTCTTAAGCTGAACGTCCTTGAAACCAGCTTTGGTGAACCACTCAAGGTA
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CAACGGCTCCTTCTGCTTCGCCTTGGCCAGCTGATGTGGCGACTGGTCC

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TGATCCTTGATCCACATGTAGATCGGGATTAACACAAACCAGGCAGCCGCTAGGGTACCC
AAGAGGAAGCGTCCCAAGAAGGAGAAAGGATTGTTTACAGGCTTCTCAACGTCCTCTTCC
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CCCATGATAAGGCCGTGCCTGCGAACACCACGGTACCACTTGGGGCCAATCCTCTTAAGC
TGAACGTCCTTGAAACCAGCTTTGGT*AACCACTCAATGTACTCTTCCTCCTTGGGGAAA
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AGACATGCTTTCCCACCGATCTTGAGAACTCTGTAGGCTTCCCTTATTCCCCTCTGCGGG
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GGGAGATCCTCTGCATCTCCTTCCACGATCGTGCACTCCTTCAACGGCTCCTTCTGCTTC
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CAGTCCCGCCTCCGACGTCGACGACGCGCAAGTTGGGATTGTTCAGATCCGCCGGCTCGA
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DS 



AS 1 5

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TCACCGTTTTATCCATAGAACCCGTCGCCAAAAGATTAGGTGCAGAAACGTTGTATGAGA
TGGAGGAGACTCCTTCGTCTTGGTCATGTGCTTGGATAGTGAAACTTGGCTTTAAAACAG
AATCTGAACCTGACTGTGCAGCGCGTATATCAAAACCTTTCACGGTTCCATCCTCAAGAC
TTACCACAAAGGAGTGTTCACAGTGGGGATCCCAAGCTAAGCTTTCGACATCAGACATCA
CAGACCATTTGAAACCCGAGTGCGAAGGTTGTCTTCCGTCTTTCAATACAACAGTCTGAT
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CCTTGGTGTGATGCTCCATGGTAATCTTACATGTTCCAGTAGCCACATCCCAAACCTTAA
CCTTTTTGTCGGCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 
30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS53JQ U 11
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AA
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TGT

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CAGACCATTTGAAACCCGAGTGCGAAGGTTGTCTTCCGTCTTTCAATACAACAGTCTGAT
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CCTTGGTGTGATGCTCCATGGTAATCTTACATGTTCCAGTAGCCACATCCCAAACCTTAA
CCTTTT

QA 1 906 1 906
DS 

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GATCAAACGAGCCACTAAGAAGCACTTCTGGAGCATAATGATTCCATGCAACTGCTTGAA
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TAACCTTTTTGT
CGGCAC

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DS 

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TGTGGGG*TTTTTCAAGATTGTTTGCCTCCATACTTGCGAGAGACATTAGCATCCAACAG
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CACTGAGAATGAAATGGAGAACACAGCTCCAGCTTTTGGTTTGTGTGAAGCAATGCATGA
AGGCTCATTGTTCGAAAGGTCCCAAAGTTTCACCGTTTTATCCATAGAACCCGTCGCCAA
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TTGGATAGTGAAACTTGGCTTTAAAACAGAATCTGAACCTGACTGTGCAGCGCGTATATC
AAAACCTTTCACGGTTCCATCCTCAAGACTTACCACAAAGGAGTGTTCACAGTGGGGATC
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TCTTCCGTCTTTCAATACAACAGTCTGATCAAACGAGCCACTAAGAAGCACTTCTGGAGC
ATAATGATTCCATGCAACTGCTTGAACCTCCTTGGTGTGATGCTCCATGGTAATCTTACA
TGTTCCAGTAGCCACATCCCAAACCTTAACCTTTTTGTCGGCAC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 4

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TATAAAATATAAGAGAACCCCCACAAGCATATAAAATTAAGACACACATGTTCAGTTACA
TTTATCATATCCAACACAATCACGTTCTTTATTTAAATCTGATTGATAAACGTAGAAAGT
CAACGACTAATAGATTATGGAATCTTAATACGGAATCTGATTGATAAAAGCTTGTTCATT
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AAACCGCACTCAGAGCTATTAAGTATAAGGATAAATTCCCACCAGTCTCTAATCCTAATT
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TTAGTGTATCATAAAACCCTTCCGCAAGTCGGTAATTACAAACATACACTCGAGCAGTAC
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ATGCCAAGGCCGCAACATACAACAGCAGCTGGAATAAACATCACCTAATCGCCTCAAATA
GATTCGGGGGTTTTTTTTTTTTTTTAGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F077JQ U 75
AF RR4BM49JQ U 1
AF RR4FW45JQ U 74
AF RR4FW45TF C 278
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CTACT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FW45JQ 660 0 0
A
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TTATGGAATCTTAATACGGAATCTGATTGATAAAAGCTTGTTCATTGCGATCTTTTACGA
GTCTGATGTCATCTGCATCAAGTTCGCAATATGTTCAGAGCGACCAAAACCGCACTCAGA
GCTATTAAGTATAAGGATAAATTCCCACCAGTCTCTAATCCTAATTCAAGATCATTAACA
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TGACGCTTCCAACAATCAACATCATCAGTAAGCATGAGTTTTTCTTTTCCATCAAAAGCA
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AACCCTTCCGCAAGTCGGTAATTACAAACATACACTCGAGCAGTACCATCATCCAAATAC
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QA 2 660 2 660
DS 

RD RR4FW45TF 773 0 0
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AACTGTTCCACGCACCACAACGATGGGGTTTTCTATCTCCTCATTTTCAAGACATTCCCC
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QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 5

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TCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4E577TF C 1
AF RR4DW27JQ U 9
AF RR4E577JQ U 9
AF RR4DW27TF C 9
AF RR4C546JQ U 128
BS 1 8 RR4E577TF
BS 9 656 RR4DW27JQ
BS 657 724 RR4C546JQ

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TCCTTCTTTGTCAGTGTTCTCCTCCGCCAAATACGGCGTCCATTATCATCCCTTTGAATC
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TCACCAATACGCAAAAACGAAGAGCAGGTGAAGGAAGAAGCCATGGCTATACTCCC

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TACAATTTTAACTCTTGCTAACAGTAGTATATCTCTTCAAGTGTAGTACTCCTTCAAGTA
GCCAGGACCAGGTTTGTAAGGATCAGACTCTGCATAAGCCTCGGGGCGATCAAACCCGAG
ATCGTTGACGCGGTTGCTCAGAACGTGAAAGATGGCTTTCTTGGTACCTCCGTATTCGTC
TCTGTTCTTCTCAACGTACTCGGTTGCTTCAGCTGCTACACTGTTGACGAACTCAAAGCG
GTTGTCCTCGCTCAAAAGCAAACGCTCGATGTCCATCGTCATTACCTTCCCAACTTCCTG
TATCTTCCTCACTTGCTCTTCCACAAAGGGAACTCTTTGTAGTTTGTAACGCAGCATATC
ATCCTTCTTTGTCAGTGTTCTCCTCCGCCAAATACGGCGTCCATTATCATCCCTTTGAAT
CCCGCAAGAAAACTGAGGATGGAATGTGAAGCTTGAAGCTCGTGAGTTCCCGCTTCTCGC
ATCACCAATACGCAAAAACGAAGAGCAGGTGAAGGAAGAAGCCATGGCTATACTCCC

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DS 



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AAAAACGACTCTCTTATGGTTCTCTGCTTCTTCACAACAAAGAAACGTTTATATATAAAA
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AACCTCTCGACCTTTGTGTTGATGATGACGACTGAAAGTGTTACCTCCCATCACCGAAAG
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TATCCAACCTGAAGCAAATAAAACGCAAACAACCGCTGATATTGTAACGGTGGAGATGAC
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CAAGAAGCCACCAGCAGCAGCGAGTGAAACCAAAAGAGAGATTATGATCGCATTGAATGT
CGCAGCTACGAAGAAGAGCGTGAAGACAACCAAAGCCATCGTCGTAACGAGAACTATCGT
TCCCGTAGTGATGACAAGCAGTGCACGAAGCGGGCTGCCTCGACGAGTCCACTGGAGAAC
GTCGCGTGAAGTTTTGCGAGAAGCTTCTCGAAGCTTCGGTCCATCCTCGGCGAATGAGTT
TCTTATTCGTTGAAGCAAAGGAGAAGAGGACCCGGTTTTGGAACCGGGAAACAGAATCGA
ACCGATCGCGATGCAGAGCAAGGAGTAGAGACTCTCCGAATCATCATCCTCCACAACCTC
CACGTAGTCCGTTTTGCGGCACCGTCCATCGTCTCTCCGTTGACGGTTTCTCCGGCATCA
TTGCCATTGCCACCGGCAACGTCTGCGTAGGATTTCTTCTCTGTTTCGTCGTGATCTTGC
GACATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI09JQ U 127
AF RR4GG12JQ U 1
AF RR4BI09TF C 118
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QA 1 338 1 338
DS 

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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BI09TF 792 0 0
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CGTTCCCGTAGTGATGACAAGCAGTGCACGAAGCGGGCTGCCTCGACGAGTCCACTGGAG
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GTTTCTTATTCGTTGAAGCAAAGGAGAAGAGGACCCGGTTTTGGAATCGGGAAACAGAAT
CGAACCGATCGCGATGCAGAGCAAGGAGTAGAGACTCTCCGAATCATCATCCTCCACAAC
CTCCACGTAGTCCGTTTTGCGGCACCGTCCATCGTCTCTCCGTTGACGGTTTCTCCGGCA
TCATTGCCATTGCCACCGGCAACGTCTGCGTAGGATTTCTTCTCTGTTTCGTCGTGATCT
TGCGACATTTCC

QA 1 792 1 792
DS 



CO CL2083Contig2 649 2 6 U
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GAAAATGTCGCAAGATCACGACGAAACAGAGAAGAAATCCTACGCAGACGCCGTCGGTGG
CGATGGCGATGATGCCGGAGAAACCGTCAACGGAGATGGTCGCCGCAAAACGGAGTACGT
GGAGGTTGTGAAGGATGATGATTCGGAGAGTCTCTACTCTTTGCTCTGCATCACGATCGG
TTCGATTCTGTTTCCCGGTTCCAAAACAGGGTCCTCTTCTCCTTTGCTTCAACGAATAAG
AAACTCATTCGCCGAGGATGGACCGAAGCTTCGAGAAGCTTCTCGCAAAACTTCACGCGA
CGTTCTCCAGTGGACTCGTCGAGGCAGCCCGCTTCGTGCACTGCTTGTCATCACTACGGG
AACGATAGTCCTCGTTACGACGATGGCTTTGGTTGTCTTCACGCTCTTCTTCGTAGCTGC
GACATTCAATGCGATCATAATCTCTCTTTTGGTTTCACTCGCTGCTGCTGGTGGCTTCTT
GGCGCTCTTCCTTCTCTCCTTGGCTGGTATTTACATCGGAGCCTTGTCCGTTGCCGCTTT
CGTCATCTCCACCGTTACAATATCAGCGGTTGTTTGCGTTTTATTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG12TF U 1
AF RR4DJ65TF U 25
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BS 96 550 RR4GG12TF
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BS 552 615 RR4GG12TF
BS 616 649 RR4DJ65TF

RD RR4GG12TF 615 0 0
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GAAAATGTCGCAAGATCACGACGAAACAGAGAAGGAATCCTACGCAGACGCCGTCGGTGG
CGATGGCGATGATGCCGGAGAAACCGTCAACGGAGATGGTCGCCGCAAAACGGAGTACGT
GGAGGTTGTGAAGGATGATGATTCGGAGAGTCTCTACTCTTTGCTCTGCATCACGATCGG
TTCGATTCTGTTTCCCGGTTCCAAAACAGGGTCCTCTTCTCCTTTGCTTCAACGAATAAG
AAACTCATTCGCCGAGGATGGACCGAAGCTTCGAGAAGCTTCTCGCAAAACTTCACGCGA
CGTTCTCCAGTGGACTCGTCGAGGCAGCCCGCTTCGTGCACTGCTTGTCATCACTACGGG
AACGATAGTCCTCGTTACGACGATGGCTTTGGTTGTCTTCACGCTCTTCTTCGTAGCTGC
GACATTCAATGCGATCATAATCTCTCTTTTGGTTTCACTCGCTGCTGCTGGTGGCTTCTT
GGCGCTCTTCTTTCTCTCCTTGGCTGGTATTTACATCGGAGCCTTGTCCGTTGCCGCTTT
CGTCATCTCCACCGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4DJ65TF 625 0 0
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AACAGAGAAGAAATCCTACGCAGACGCCGTCGGTGGCGATGGCGATGATGCCGGAGAAAC
CGTCAACGGAGATGGTCGCCGCAAAACGGAGTACGTGGAGGTTGTGAAGGATGATGATTC
GGAGAGTCTCTACTCTTTGCTCTGCATCACGATCGGTTCGATTCTGTTTCCCGGTTCCAA
AACAGGGTCCTCTTCTCCTTTGCTTCAACGAATAAGAAACTCATTCGCCGAGGATGGACC
GAAGCTTCGAGGAGCTTCTCGCAAAACTTCACGCGACGTTCTCCAGTGGACTCGTCGAGG
CAGCCCGCTTCGTGCACTGCTTGTCATCACTACGGGAACGATAGTTCTCGTTACGACGAT
GGCTTTGGTTGTCTTCACGCTCTTCTTCGTAGCTGCGACATTCAATGCGATCATAATCTC
TCTTTTGGTTTCACTCGCTGCTGCTGGTGGCTTCTTGGCGCTCTTCCTTCTCTCCTTGGC
TGGTATTTACATCGGAGCCTTGTCCGTTGCCGCTTTCGTCATCTCCACCGTTACAATATC
AGCGGTTGTTTGCGTTTTATTTGCT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 5

CO CL2084Contig1 969 5 15 U
GGATTGTTGTTTAGTCTATAGATCTCTAGCTTCTCTCGCGACAGCACAATTAAATCCTCT
GATTAGATTAGAGTCGGTGTGGATCGGATCGGAGCCGAATCGAATCGAATCGAGGATTTA
GGGTTTGAGAAAGAGAAAAATGGCGCAACAATCGCTGA*TCTACAGTTTCGTGGCTCGAG
GAACGGTGAT*CCTGGTGGAGTTCACTGATTTCAAAGGCAACTTCACCTCCATCGCTGCT
CAGTGCC*TCCAGAAGCTCCC*TTCCTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTC
ACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGATTCACGTATTGTGTTGTTGCGGTTGAATCTG
CTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTCTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGAT
ATGGTGGTGGTAAGGCTGCCACTGCTCAAGCGAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTA
AGCTGAAGGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTA
AGGTGAAGGCGCAGGTGTCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAGAAGGTTC
TTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGCTCACAGG
CACAAGATTTTAGGACAACAGGGACGCAGATGAGAAGAAAGATGTGGCTTCAAAACATGA
AGATAAAACTCATAGTCCTCGCCATCATTGTAGCGTTGATTCTCATAATTGTGCTCTCAG
TTTGCCACGGCTTCAAGTGTTAAGCTCCAAAAAATTCAAAAACTCGGATCTCTCTCACTC
GGTACATTGTACTACCTTTTTCTTTTATTGTTCTGTCATCATAATCATTCTAAATGTTTC
CGCTTGAATTGGTTTTGTATAGATAGACCATATATGTATGCTTCATATTTTGCTACATCG
CTTGCACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 

AF RR4GJ14TF U 1
AF RR4G842TF U 99
AF RR4G842JQ C 137
AF RR4AP43TF U 198
AF RR4GJ14JQ C 322
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BS 957 965 RR4AP43TF
BS 966 969 RR4GJ14JQ

RD RR4GJ14TF 656 0 0
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GATTAGATTAGAGTCGGTGTGGATCGGATCGGAGCCGAATCGAATCGAATCGAGGATTTA
GGGTTTGAGAAAGAGAAAAATGGCGCAACAATCGCTGA*TCTACAGTTTCGTGGCTCGAG
GAACGGTGAT*CCTGGTGGAGTTCACTGATTTCAAAGGCAACTTCACCTCCATCGCTGCT
CAGTGCC*TCCAGAAGCTCCC*TTCCTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTC
ACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGATTCACGTATTGTGTTGTTGCGGTTGAATCTG
CTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTCTTGGAGAGGGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGAT
ATGGTGGTGGTAAGGCTGCCACTGCTCAAGCGAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTA
AGCTGAAGGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTA
AGGTGAAGGCGCAGGTGTCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAGAAGGTTC
TTGACCGTGGTGAGAAA*TTGAGCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGCTCA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4G842TF 557 0 0
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ATCTACAGTTTCGTGGCTCGAGGAACGGTGATTCCTGGTGGAGTTCACTGATTTCAAAGG
CAACTTCACCTCCATCGCTGCTCAGTGCCCTCCAGAAGCTCCCCTTCCTCCAACAACAAG
TTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGATTCACGTAT
TGTGTTGTTGCGGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTCTTGGAGAGAGTG
AAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGTAAGGCTGCCACTGCTCAAGCGAACAGC
TTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAGGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCT
GATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCGCAGGTGTCTGAAGTTAAGGGTGTTATG
ATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTGGTGGACAAA
ACTGAGAACCTTCGCTC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4G842JQ 818 0 0
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TGGAGTTCACTGATTTCAAAGGCAACTTCACCTCCATCGCTGCTCAGTGCC*TCCAGAAG
CTCCC*TTCCTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCT
CGTCGAAGATGGATTCACGTATTGTGTTGTTGCGGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATTCC
GATGGCGTTCTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGTAAGGC
TGCCACTGCTCAAGCGAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTTTAAGCTGAAGGAGCACAT
GCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCGCAGGT
GTCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAA
AATTGAGCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGCTCACAGGCACAAGATTTTAGGAC
AACAGGGACGCAGATGAGAAGAAAGATGTGGCTTCAAAACATGAAGATAAAACTCATAGT
CCTCGCCATCATTGTAGCGTTGATTCTCATAATTGTGCTCTCAGTTTGCCACGGCTTCAA
GTGTTAAGCTCCAAAAAATTCAAAAACTCGGATCTCTCTCACTCGGTACATTGTACTACC
TTTTTCTTTTATTGTTCTGTCATCATAATCATTCTAAATGTTTCCGCTTGAATTGGTTTT
GTATAGATAGACCATATATGTATGCTTCATATTTTGCT

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AP43TF 768 0 0
GGAGTTCACTGATTTCAAAGGCAACTTCACCTCCATCGCTGCTCAGTGCC*TCCAGAAGC
TCCC*TTCCTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTC
GTCGAAGATGGATTCACGTATTGTGTTGTTGCGGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATTCCG
ATGGCGTTCTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGTAAGGCT
GCCACTGCTCAAGCGAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAGGAGCACATG
CAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCGCAGGTG
TCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAA
ATTGAGCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGCTCACAGGCACAAGATTTTAGGACA
ACAGGGACGCAGATGAGAAGAAAGATGTGGCTTCAAAACATGAAGATAAAACTCATAGTC
CTCGCCATCATTGTAGCGTTGATTCTCATAATTGTGCTCTCAGTTTGCCACGGCTTCAAG
TGTTAAGCTCCGAAAAATTCAAAAACTCGGATCTCTCTCACTCGGTACATTGTACTACCT
TTTTCTTTTATTGTTCTGTCATCATAATCATTCTAAATGTTTCCCCTTGAATTGGTTTTG
TATGGATAGACCATATATGTATGCTTCATATTTTGCTATATCGCTTGC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4GJ14JQ 648 0 0
AAGATGGATTCACGTATTGTGTTGTTGCGGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATTCCGATGG
CGTTCTTGGAGAGGGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGTAAGGCTGCCA
CTGCTCAAGCGAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAGGAGCACATGCAGT
ATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCGCAGGTGTCTG
AAGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTG
AGCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGCTCACAGGCACAAGATTTTAGGACAACAG
GGACGCAGATGAGAAGAAAGATGTGGCTTCAAAACATGAAGATAAAACTCATAGTCCTCG
CCATCATTGTAGCGTTGATTCTCATAATTGTGCTCTCAGTTTGCCACGGCTTCAAGTGTC
AAGCTCCAAAAAATTCAAAAACTCGGATCTCTCTCACTCGGTACATTGTACTACCTTTTT
CTTTTATTGTTCTGTCATCATAATCATTCTAAATGTTTCCGCTTGAATTGGTTTTGTATA
GATAGACCATATATGTATGCTTCATATTTTGCTACATCGCTTGCACCT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 5

CO CL2085Contig1 1178 5 17 U
AAACAAAACATAACCAATAAAACCGGACCACGATGATATAACAAGTCCAGACCCAGCTCT
ATTCAAAAGTCTGATCCACCACCATAAAGCACAACAAACAAGTCTTTCATTTAACTTTTA
CACATTATTTTTAAACATCAGAGATTCAGCCCTCATTCTCTTCACATCTTTTCCTTATTC
CTCATCGTCATC***ATCTTCCTTCTTCAGACGAGTCTCACCACCTTCCTTGATAATAGG
AAGCTTCATACCTCCAAACGGTGTATCAACATCCACGTTACCTTTAATAGTGTACCCAGT
TCCTTTACCACGTATCATATCCCAAAGCGCAGACCCAAAGTCCTTTGGCCTGAACGTGAT
CGGCACATTAATCAACCCACTTCCGTTTTTATCAAGCTTTACAGAGTCAGATATCTCAAC
TTTCCCAATACTCACATCAGCCAACCACACTTCACAGTCCAAGTCATTAACCCCC*AAAT
CAAAATCATTCAAGTTCTCAAGCCTCACGTGGAGTATCGCCACGGTCTCTTCCAGAGAAA
ACTTCTGGAACTTGATCTTCTCGATGTCAACATCAGGTTTCTTCGGGATGGGAATCTCTC
CACGTTTCTCCAACGGTAACGTGAGCCTCCCCAAGACAGGCACGTCGACGATGAGATCAA
CTTTGATCCTGTAAGGTATGATCATCCCGGGGTTAATGTCGTTGTAAGTGCTCTTGATGT
CGTCGTAGATCAGAGTCAGCGGTATCTTGACGGTTTCTTCTCCATGCGCCTTGATGGTTC
CAACGTCGGGGATCAGTCCAGAGACGAGTTTCCTCCCGTCACTGTCGATCAAGTAGTCGA
TGTCGATGAGAGGGATGGGAACTGGGTTAGGGTTCTTGACGAGCACGTCTACGACAATGT
CTGCTCTCTCGAGATTGATCTTGGGGATGTGGATGGCGGAGACGTCAGCCGTTGGCTTCC
CGAAACCAACGGTTCCCTGTATCTTCTCGCCAATGCCGTGAATGAAACCTTTGACATTGT
CTAGGAATCCACCCTTACCTTCTTCTTCTTCTTTTTCATCCTCCTTGTGAGCTCTGTCAA
CGATTTCGACTTTGTTCTCGGATGTAGACATACCTGGAGAGTTGGATGAATGTGAGCAAG
AGAGAGACAAGAGAGTGCTTTCAAGAGTTGTGTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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AF RR4CS70JQ U 12
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AF RR4EK80JQ U 40
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TAAACATCAAAGATTCCGCCCTCATTCTCTTCACATCTTTTCCTTATTCCTCATCGTCAT
C***ATCTTCCTTCTTCAGACGAGTCTCACCACCTTCCTTGATAATAGGAAGCTTCATAC
CTCCAAACGGTGTATCAACATCCACGTCACCTTTAATAGTGTACCCAGTTCCTTTACCAC
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TCAACCCACTTCCGTTTTTATCAAGCTTTACAGAGTCAAATATC

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CACATTATTTTTAAACATCAGAGATTCAGCCCTCATTCTCTTCACATCTTTTCCTTATTC
CTCATCGTCATC***ATCTTCCTTCTTCAGACGAGTCTCACCACCTTCCTTGATAATAGG
AAGCTTCATACCTCCAAACGGTGTATCAACATCCACGTTACCTTTAATAGTGTACCCAGT
TCCTTTACCACGTATCATATCCCAAAGCGCGGACCCAAAGTCCTTTGGCCTGAACGTGAT
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G
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TTAACCTCTTTTCCTTATTCCTCATCATCATCATAATCTTCCTTCTTCAGACGAGTCTCA
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CCTTTAATAGTGTACCCAGTTCCTTTACCACGTATCATATCCCGAAGCGCAGACCCAAAG
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CTTCGGGATGGGAATCTCTCCACGTTTCTCCAACGGTAACGTGAGCCTCCCCAAGACAGG
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GTGGTCC

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DS 



AS 1 5

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ATGGACGTTGGCGGAGGTGAAAGTGTGGCAACGCCAGTTCAACAGAAAGCACATGAGGCC
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ACAAAGGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTC
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TTTACTTCAAATAATTCTACGAATGAATTTGGCTTC


BQ
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30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D388TF U 1
AF RR4HB22TF U 154
AF RR4A561TF U 1
AF RR4D388JQ C 148
AF RR4A561JQ C 227
BS 1 82 RR4A561TF
BS 83 83 RR4D388TF
BS 84 192 RR4A561TF
BS 193 193 RR4D388TF
BS 194 797 RR4A561TF
BS 798 861 RR4D388JQ
BS 862 876 RR4A561JQ

RD RR4D388TF 647 0 0
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ATGGACGTTGGCGGAGGTGAAAGTGTGGCAACGCCAGTTCAACAGAAAGCACATGAGGCC
TGGAGTATTTACCAACACTACCTTGACAAGACTACTCCTCTTCCCACTTACAGGTGGATT
GGTACTGCTCTTTTTGCCCTTTCCTACTGTTTGAGGGTCTACTACCTTCAGGGCTTCTAC
ATCATCGCCTATGGTCTTGGTATCTACCTTCTCAATCTCCTCATTGGCTTCTTGTCCCCT
CTTGTTGATCCTGAGGCTTCTGGTGGGGCCTCTGATGGTCCTTCTCTTCCTACCAGAGGT
TCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCAATG
ACAAAGGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTC
TTCTGGCCTATCCTGCTTTGCCATTGGATCGTTCTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAG
ATCTCTCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGT
GGACGGAGTAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGACTGATCTGATGACCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4HB22TF 537 0 0
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AGGGTCTACTACCTTCAGGGCTTCTACATCATCGCCT**GGTCTTGGTATCTACCTTCTC
AATCTCCTCATTGGCTTCTTGTCCCCTCTTGTTGATCCTGAGGCTTCTGGTGGGACCTCT
GATGGTCCTTCTCTTCCTACCAGAGGTTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGTCTC
CCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCAATGACAAAGGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACT
TTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTCTTCTGGCCTATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTT
CTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCTCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCT
TTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGGAGCAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGAC
TGATCTGATGACCCTTGTTGTTAGAAAA*TCATTTTGGACTATTTTTTT
CCATTGAC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4A561TF 797 0 0
GGGCTCGGTTCTGTGGATAGAGAAGCAATCAGCTCTTTTTCATCATCATCATCTTCCGTT
ATGGACGTTGGCGGAGGTGAAATTGTGGCAACGCCAGTTCAACAGAAAGCACATGAGGCC
TGGAGGATTTACCAACACTACCTTGACAAGACTACTCCTCTTCCCACTTACAGGTGGATT
GGTACTGCTCTTGTTGCCCTTTCCTACTGTTTGAGGGTCTACTACCTTCAGGGCTTCTAC
ATCATCGCCTATGGTCTTGGTATCTACCTTCTCAATCTCCTCATTGGCTTCTTGTCCCCT
CTTGTTGATCCTGAGGCTTCTGGTGGGGCCTCTGATGGTCCTTCTCTTCCTACCAGAGGT
TCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCAATG
ACAAAGGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTC
TTCTGGCCTATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAG
ATCTCTCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGT
GGACGGAGTAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGACTGATCTGATGACCCTTGTTGTTAGAAA
AATCATTTTGGACTATTTTTTTTCCATTGACGGACAGATCTATGCAGCTACAGCCTACAG
GTAAGAATTAGATGGGTAAACACAAGAAAATGAGAAAACAGGATGAGATTCGAATTTGTT
CTTATTTTAGCTCGGAG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4D388JQ 714 0 0
AAGACT
ACTCCTCTTCCCACTTACAGGTGGATTGGTACTGCTCTTTTTGCCCTTTCCTACTGTTTG
AGGGTCTACTACCTTCAGGGCTTCTACATCATCGCCTATGGTCTTGGTATCTACCTTCTC
AATCTCCTCATTGGCTTCTTGTCCCCTCTTGTTGATCCTGAGGCTTCTGGTGGGGCCTCT
GATGGTCCTTCTCTTCCTACCAGAGGTTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGTCTC
CCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCAATGACAAAGGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACT
TTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTCTTCTGGCCTATCCTGCTTTGCCATTGGATCGTT
CTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCTCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCT
TTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGGAGTAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGAC
TGATCTGATGACCCTTGTTGTTAAAAAAATCATTTTGGACTATTTTTTTTCCATTGACGG
ACAGATCTATGCAGCTACAGCCTACAGGTAAGAATTAGATGGGTAAACACAAGAAAATGA
GAAAACAGGATGAGATTCGAATTTGTTCTTATTTTAGCTCGGAGAAAAATTGGTCCTTGT
ATGTATTACTACTATTTGTTTTGTTGCTTTACTTCAAATAATTCTACG

QA 7 714 7 714
DS 

RD RR4A561JQ 650 0 0
TTCAGGGCTTCTACATCATCGCCTATGGTCTTGGTATCTACCTTCTCAATCTCCTCATTG
GCTTCTTGTCCCCTCTTGTTGATCCTGAGGCTTCTGGTGGGGCCTCTGATGGTCCTTCTC
TTCCTACCAGAGGTTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGT
TCTGGTATTCAATGACAAAGGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGT
TTGACGTTCCTGTCTTCTGGCCTATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTTTTCTCA
CCATGAGACGCCAGATCTCTCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCA
AACAGAAATATGGTGGACGGAGTAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGACTGATCTGATGACC
CTTGTTGTTAGAAAAATCATTTTGGACTATTTTTTTTCCATTGACGGACAGATCTATGCA
GCTACAGCCTACAGGTAAGAATTAGATGGGTAAACACAAGAAAATGAGAAAACAGGATGA
GATTCGAATTTGTTCTTATTTTAGCTCGGAGAAAAATTGGTCCTTGTATGTATTACTACT
ATTTGTTTTGTTGCTTTACTTCAAATAATTCTACGAATGAATTTGGCTTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

CO CL2087Contig1 876 4 4 U
CACAAACAGCTCTTTAATAATAAGGCCCAAAAAAAACTGATTCAACGATTGCATCTCAAA
TCAGTTTCAGTACAAAGCAAACAAATCTTAATACTCTTTTGTTCTTCTGATAAATGTTAC
AGTGGCAACAGAGAGGAAGAAACACAATCTCACATTTGGATGGATCTTTTTTAGTGCTTT
GTGATACTTTCAAGGACTTGGAAGTAGTCAGGGAAAGTCTTCCTTGTGCAACCAGGATCC
TTGATGGTCACTGGAACATCAGCACAAGCTGCAAGAGAGAACGCCATTGCCATTCTATGA
TCATCATATGTATCAATCTCCGCAGGTTTCACCTTTGCTGGTGGAGTGATCACACAATAA
TCTGAACCCTCTTCCACTGTAGCTCCAAGCTTTCGAAGCTCAGTGCAAATGGCAATCATT
CTTTCTGTCTCCTTAACTCTCCAGCTAGCCACATCTCTAATGGTGGTTGGACCATCAGCA
AAGAGAGCAACAACTGCAAGAGTCATGGCTACATCAGGCATTTTGTTCATGTTGACATCA
ACAGCACGCAAGTGTCTCATTCCAAAAGCATCTCTTGACGGTCCAGTCACAGTCACACTG
TTCTCTGTCCACGACACTTTACATCCCATTTTCTCAAGAACCTCTGCGAATTTCACATCT
CCCTGCAGACTAGTTGTTCCACAGCCTTCAACAGTGACAGTTTCACCGGTAATGGCAGCA
CCAGCCAAGAAGTAGCTAGCACTCGAAGCATCACCTTCTACATAAGCATTACCAGGCGAC
TTGTATTTCTGACCACCCTTGACAAAGAAACGATCCCAGCTATCACTATGCTCAGCACTC
ACACCGTAACGCTCCATCAACTTCAACGTCATCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 10 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4FB19JQ U 66
AF RR4FM18JQ U 1
AF RR4BH45JQ U 20
AF RR4FB19TF C 65
BS 1 138 RR4FM18JQ
BS 139 139 RR4BH45JQ
BS 140 666 RR4FM18JQ
BS 667 876 RR4BH45JQ

RD RR4FB19JQ 332 0 0
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CAACAAAAAGGAAAAAACACAATCTCACATTTGGATGGATCTTTTTTAGTGCTTTGTGAT
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GGTCACTGGAACATCAGCACAAGCTGCAAAAAAAAACGCCATTGCCATTCTATGATCATC
ATATGTATCAATCTCCCCAGGTTTCACCTTTGCTGGGGGAGTGATCACACAATAATCTGA
ACCCTCTTCCACTGTAGCTCCAAGCTTTCGAA

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR4FM18JQ 666 0 0
CACAAACAGCTCTTTAATAATAAGGCCCAAAAAAAACTGATTCAACGATTGCATCTCAAA
TCAGTTTCAGTACAAAGCAAACAAATCTTAATACTCTTTTGTTCTTCTGATAAATGTTAC
AGTGGCAACAGAGAGGAAAAAACACAATCTCACATTTGGATGGATCTTTTTTAGTGCTTT
GTGATACTTTCAAGGACTTGGAAGTAGTCAGGGAAAGTCTTCCTTGTGCAACCAGGATCC
TTGATGGTCACTGGAACATCAGCACAAGCTGCAAGAGAGAACGCCATTGCCATTCTATGA
TCATCATATGTATCAATCTCCGCAGGTTTCACCTTTGCTGGTGGAGTGATCACACAATAA
TCTGAACCCTCTTCCACTGTAGCTCCAAGCTTTCGAAGCTCAGTGCAAATGGCAATCATT
CTTTCTGTCTCCTTAACTCTCCAGCTAGCCACATCTCTAATGGTGGTTGGACCATCAGCA
AAGAGAGCAACAACTGCAAGAGTCATGGCTACATCAGGCATTTTGTTCATGTTGACATCA
ACAGCACGCAAGTGTCTCATTCCAAAAGCATCTCTTGACGGTCCAGTCACAGTCACACTG
TTCTCTGTCCACGACACTTTACATCCCATTTTCTCAAGAACCTCTGCGAATTTCACATCT
CCCTGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4BH45JQ 857 0 0
ATAAGGCCCAGAAAAAACTGATTCAACGATTGCATCTCAAATCAGTTTCAGTACAAAGCA
AACAAATCTTAATACTCTTTTGTTCTTCTGATAAATGTTGCAGTGGCAACAGAGAGGAAG
AAACACAATCTCACATTTGGATGGATCTTTTTTAGTGCTTTGTGATACTTTCAAGGACTT
GGAAGTAGTCAGGGAAAGTCTTCCTTGTGCAACCAGGATCCTTGATGGTCACTGGAAC**
CAGCACAAGCTGCAAGAGAGAACGCCATTGCCATTCTATGATCATCATATGTATCAATCT
CCGCAGGTTTCACCTTTGCTGGTGGAGTGATCACACAATAATCTGAACCCTCTTCCACTG
TAGCTCCAAGCTTTCGAAGCTCAGTGCAAATGGCAATCATTCTTTCTGTCTCCTTAACTC
TCCAGCTAGCCACATCTCTAATGGTGGTTGGACCATCAGCAAAGAGAGCAACAACTGCAA
GAGTCATGGCTACATCAGGCATTTTGTTCATGTTGACATCAACAGCACGCAAGTGTCTCA
TTCCAAAAGCATCTCTTGACGGTCCAGTCACAGTCACACTGTTCTCTGTCCACGACACTT
TACATCCCATTTTCTCAAGAACCTCTGCGAATTTCGCATCTCCCTGCAGACTAGTTGTTC
CACAGCCTTCAACAGTGACAGTTTCACCGGTAATGGCAGCACCAGCCAAGAAGTAGCTAG
CACTCGAAGCATCACCTTCTACATAAGCATTACCAGGCGACTTGTATTTCTGACCACCCT
TGACAAAGAAACGATCCCAGCTATCACTATGCTCAGCACTCACACCGTAACGCTCCATCA
ACTTCAACGTCATCTCA

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR4FB19TF 811 0 0
G
TTCAGTACAAAGCAAACAAATCTTAATACTCTTT*GTTCT*CTGATAAATGTTACAGTG*
CAACAGAGAG*AAGAAACACAATCTCACATTTGGATGGATCTTTTT*AGTGCTTTGTGAT
ACTTTCAAGGACTTGGAAGTAGTCAGGGAAAGTCTTC*TTGTGCAACCAGGATCCTTGAT
GGTCACTGGAACATCAGCACAAGCTGCAAGAGAGAACGCCATTGCCATTCTATGATCATC
ATATGTATCAATCTCCGCAGGTTTCACCTTTGCTGGTGGAGTGATCACACAATAATCTGA
ACCCTCTTCCACTGTAGCTCCAAGCTTTCGAAGCTCAGTGCAAATGGCAATCATTCTTTC
TGTCTCCTTAACTCTCCAGCTAGCCACATCTCTAATGGTGGTTGGACCATCAGCAAAGAG
AGCAACAAATGCAAGAGTCATGGCTACATCAGGCATTTTGTTCATGTTGACATCAACAGC
ACGCAAGTGTCTAATTCCAAAAGCATCTCTTGACGGTCCAGTCACAGTCACACTGTTCTC
TGTCCACGACACTTTACATCCCATTTTCTCAAGAACCTCTGCGAATTTCACATCTCCCTG
CAGACTAGTTGTTCCACAGCCTTCAACAGTGACAGTTTCACCGGTAATGGCAGCACCAGC
CAAGAAGTAGCTAGCACTCGAAGCATCACCTTCTACATAAGCATTACCAGGCGACTTGTA
TTTCTGACCACCCTTGACAAAGAAACGATCCCAGCTATCACTATGCTCAGCACTCACACC
GTAACGCTCCATCAACTTCAACGTCATC
CC

QA 2 809 2 809
DS 



AS 2 5

CO CL2088Contig1 1125 3 7 U
GGAAAGATGAGATTACTTTTAAAAAGAGCCCATAATCAATTTCACAAAGGCCCAAAATTG
TAATACAATGAAAGAGAAACAGCTGAATTCAACAGAACCAAAGAAGATCGTGGTTCATAA
TATCACTCATAAGCATTTGACTTTTATATAAACCAAAAATGACAAAAAGAAAAGAAGGGA
GATAATAAGCAGACTCAAGAATCAGATTGAATCTCTGATCTTTTTTTTTGGTTAGAGTAG
TAAATATGATTTGATCAAGCAATGTAGTAGATGGAGTTAGGGAGCTTGAAGGTTCTCTTG
GGAACTGGGCAACCTGCAAAGCTGTTCCATTGTGCACCCATCACTCCCCAAACTCTGTAT
CCAAGACTTGTAAGCCATGTCCTCACATCTGCTTTGTATTGGCTCACGCTCTTCTTCTCT
TCCTCTTCTCCCCTGAGTAGAAGGTTAGACCAGCCGTGGTAACCAACTTCAATAAGGTTT
TCGACGGTGGCGGATCTGAGATACTCTTTACGAGAAGAGACCAAAAAGATTTTGAAGCCT
CTCTCTCTGATCTCGTGGAACAGCTTCACCATGCTTGGAACCGCTGGTGCCTTTCCCAAA
TTTTGCCATTCCTCGAACTTGGTCGTGTTTAGTTGCTCACCACCGAAGCATCCGTTGCTC
TTGTGGTAAGGAATGGTGGAGAGAAGAGTGTCATCAATGTCAAAGATCCAAGCATCCATG
CCATCACATTTCTTCTTCTCGCAACAAGTTTTTCCGAGGTATAGGATGGCTTCATCAACG
GCTCTCTCCACGTCATCCTCGTATTGAGATGACGTCACGTACTTTTGGACGAACCAGACG
CACTCTTGTGGCACCACCGTGAAGTCTCTGATGTTGTGAAGCTCCACGTTTACTCTCCAG
CTCTCGCAGTATCCGTTTAGGTTTGATACTTTCAAGGATCCTACGCCGTTTTGGCTGGTG
GTTGTGGTTGGCTTGCCTCCTTTGAGCTGGTTTAGGATGTTCCAGTCACGAGCTGAGACC
ATTGCGGTGAAGAAGCACGCGAGGGTTAGCGAGAGCAACAAAGATCTAGCCATGTCGATG
ATGAGTTGATCAAGTTGACCGATGGAGAAGATTTACTTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CF61JQ U 1
AF RR4DR01JQ U 65
AF RR4DR01TF C 437
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CCATCACATTTCTTCTTCTCGCAACAAGTTTTTC

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ATAAGCAGACTCAAGAATCAGATTGAATCTCTGATCTTTTTTTTTGGTTAGAGTAGTAAA
TATGATTTGATCAAGCAATGTAGTAGATGGAGTTAGGGAGCTTGAAGGTTCTCTTGGGAA
CTGGGCAACCTGCAAAGCTGTTCCATTGTGCACCCATCACTCCCCAAACTCTGTATCCAA
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CTTCTCCCCTGAGTAGAAGGTTAGACCAGCCGTGGTAACCAACTTCAATAAGGTTTTCGA
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CTCTGATCTCGTGGAACAGCTTCACCATGCTTGGAACCGCTGGTGCCTTTCCCAAATTTT
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CGTA

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TCTCGCAACAAGTTTTTCCGAGGTATAGGATGGCTTCATCAACGGCTCTCTCCACGTCAT
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ACGCGAGGGTTAGCGAGAGCAACAAAGATCTAGCCATGTCGATGATGAGTTGATCAAGTT
GACCGATGGAGAAGATTTACTTGTTTTCC

QA 1 689 1 689
DS 



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GCTTGGATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAAC
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GTG


BQ
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10 10 10 

AF RR4DU55TF U 1
AF RR4DU55JQ C 523
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BS 628 903 RR4DU55JQ

RD RR4DU55TF 627 0 0
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GAAGCCATCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGAT
GCTTGGATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAAC
GGATGCTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAAGAGAAGAAGAGCGTG
AGCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACATGGCTTACAAGTCTTGGATACAGAGTTTGGGGA
GTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4DU55JQ 381 0 0
GAAGAGAAGAAGAGCGTGAGCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACATGGCTTACAAGTTTT
GGATACAGAGTTTGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTTGCAGGTTGCCCAGTT
CCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCTAACTCCATTTACTACATTGCTTGATCAAATCATATT
TACTACTTTAACCAAAAAAAAAAGATCAGAGATTCAATTTGATTTTTGAGTTTGCTTATT
ATTTCCCTTTTTTTTTTTTTGTCATTTTTGGTTTATATAAAAGTCAAATGCTTATGAGTG
ATATTATGGACCCCGATTTTTTTTGGTTTTGTTGAATTCAGCTGTTTTTTTTTCATTGTA
TTACAATTTTGGGCCTTTGTG

QA 1 381 1 381
DS 



AS 1 5

CO CL2089Contig1 924 5 8 U
GTGCACTTCTGTTTAACACCATGACACTTGTGCAAATTACACATAACAAGATATTGTTTA
TCTGTTGTAGATAGTCATGTAGTATTTGTTATCTT*TGTAACAATATTGAATTCATTACC
AATCTACTATAACTTTATACCACTTGTACATAAGAATGAAGTATATATCAGTATGAACTT
AGTTAAAGCTGTCCTTATATCGGTTCGTCCTCCTGTTGGACACGACAGAGATTCGCTGAT
CCTGCAGCATGTTCATGTTTGGAGCTAAGAGTCTCGTGTACCGATCAAAATAGAGAAGCT
GCTTCATTAGAAGAGCAAACTCCCTCGGGAACTTCAGCCCATATGATTCGCTAACCCGCA
CCAGGTCAAGGAAAAGAGCATTCATCTGTCTCTCATCGACAACCACGTTAGCAGCAACAG
CAGTTCTGCCTGAACCTGTAGCCACTACTACCTCTGTATCTAGTTCCTGGATAGAAGAGA
ACATCTTTTCCAAGTCCCTTGCAAAAGCTTTGGCATCAACATCTATATTTGTGGCACCCA
TTTGAATCAAAGCTGAGGCC*ATGGATTCATATTCTTCAGTTGCAATGGACGCTAAAAAT
ACTTCCATGGCAGCCCATGTTTTGGGTGATATCCGACCAACAATGCCAAAATCAAGAAAC
CCAATCCGGCCATCACGCAACAACCATAAGTTCCCTGCATGTACATCAGCATGGAAACTT
TCACAA*GAAAGTAAACTTCCAAACC*AGACATTAAGGGCCGTAATAAGGCTGTTCTCCG
GACTGGAAAACAAGTGCACTTATAGAATCTAGATCAGTAAGAGGAACTCCGTATAGCCTC
TCCATTGTAAGTACACGCCGGCTGCTGCAGTGCTTATACACTCTTGGAGCAGTAGCTTGT
CCTGACAACCCCATGGTTTCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H338JQ U 37
AF RR4AA30JQ U 1
AF RR4EO66JQ U 32
AF RR4AF28JQ U 121
AF RR4AA30TF C 532
BS 1 137 RR4AA30JQ
BS 138 139 RR4H338JQ
BS 140 274 RR4AA30JQ
BS 275 275 RR4H338JQ
BS 276 765 RR4AA30JQ
BS 766 789 RR4AF28JQ
BS 790 790 RR4AA30TF
BS 791 924 RR4AF28JQ

RD RR4H338JQ 341 0 0
C
TACACATAACAAGATATTGTTTATCTGTTGTAGATAGTCATGTAGTATTTGTTATGTTAT
GTAACAATATTGAATTCATTACCAATCTACTATAACTTTATACCACTTGTACATAAGAAT
GAAGTATATATCAGTATGAACTTAGTTGAAGCTGTCCTTATATCGGTTCGTCCTCCTGTT
GGACACGACAGAGATTCGCTGATCCTGCAGCATGTTCATGTTTGGAGCTAATAGTCTCGT
GTACCGATCGAAATAGAGAAGCTGCTTCATTAGAAGTGCAAACTCCCTCGGGAACTTCAG
CCCATATGATTCGCTAACCCGCACCAGGTCAAGGAAAAGA

QA 2 341 2 341
DS 

RD RR4AA30JQ 765 0 0
GTGCACTTCTGTTTAACACCATGACACTTGTGCAAATTACACATAACAAGATATTGTTTA
TCTGTTGTAGATAGTCATGTAGTATTTGTTATCTT*TGTAACAATATTGAATTCATTACC
AATCTACTATAACTTTA**CCACTTGTACATAAGAATGAAGTATATATCAGTATGAACTT
AGTTAAAGCTGTCCTTATATCGGTTCGTCCTCCTGTTGGACACGACAGAGATTCGCTGAT
CCTGCAGCATGTTCATGTTTGGAGCTAAGAGTCTTGTGTACCGATCAAAATAGAGAAGCT
GCTTCATTAGAAGAGCAAACTCCCTCGGGAACTTCAGCCCATATGATTCGCTAACCCGCA
CCAGGTCAAGGAAAAGAGCATTCATCTGTCTCTCATCGACAACCACGTTAGCAGCAACAG
CAGTTCTGCCTGAACCTGTAGCCACTACTACCTCTGTATCTAGTTCCTGGATAGAAGAGA
ACATCTTTTCCAAGTCCCTTGCAAAAGCTTTGGCATCAACATCTATATTTGTGGCACCCA
TTTGAATCAAAGCTGAGGCC*ATGGATTCATATTCTTCAGTTGCAATGGACGCTAAAAAT
ACTTCCATGGCAGCCCATGTTTTGGGTGATATCCGACCAACAATGCCAAAATCAAGAAAC
CCAATCCGGCCATCACGCAACAACCATAAGTTCCCTGCATGTACATCAGCATGGAAACTT
TCACAA*GAAAGTAAACTTCCAAACC*AGACATTAAGGGCCGTAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4EO66JQ 691 0 0
GCAAAT
TACACATAACAAGATATTGTTTATCTGTTGTAGATAGTCATGTAGTATTTGTTATCTT*T
GTAACAATATTGAATTCATTACCAATCTACTATAACTTTA**CCACTTGTACATAAGAAT
GAAGTATATATCAGTATGAACTTAGTTAAAGCTGTCCTTATATCGGTTCGTCCTCCTGTT
GGACACGACAGAGATTCGCTGATCCTGCAGCATGTTCATGTTTGGAGCTAAGAGTCTTGT
GTACCGATCAAAATAGAGAAGCTGCTTCATTAGAAGAGCAAACTCCCTCGGGAACTTCAG
CCCATATGATTCGCTAACCCGCACCAGGTCAAGGAAAAGAGCATTCATCTGTCTCTCATC
GACAACCACGTTAGCAGCAACAGCAGTTCTGCCTGAACCTGTAGCCACTACTACCTCTGT
ATCTAGTTCCTGGATAGAAGAGAACATCTTTTCCAAGTCCCTTGCAAAAGCTTTGGCATC
AACATCTATATTTGTGGCACCCATTTGAATCAAAGCTGAGGCC*ATGGATTCATATTCTT
CAGTTGCAATGGACGCTAAAAATACTTCCATGGCAGCCCATGTTTTGGGTGATATCCGAC
CAACAATGCCAAAATCAAGAAACCCAATCCGGCCATCACGCAACAACCATAAGTTCCCTG
CATGTACATCAGCATGGAAACTTTC

QA 7 691 7 691
DS 

RD RR4AF28JQ 804 0 0
AATCTACTATAACTTTATACCACTTGTACATAAGAATGAAGTATATATCAGTATGAACTT
AGTTGAAGCTGTCCTTATATCGGTTCGTCCTCCTGTTGGACACGACAGAGATTCGCTGAT
CCTGCAGCATGTTCATGTTCGGAGCTAATAGTCTCGTGTACCGATCGAAATAGAGAAGCT
GCTTCATTAGAAGTGCAAACTCCCTCGGGAACTTCAGCCCATATGATTCGCTAACCCGCA
CCAGGTCAAGGAAAAGAGCATTCATCTGTCTCTCATCGACAACCACGTTAGCAGCAACAG
CAGTTCTGCCTGAACCTGTAGCCACTACTACCTCTGTATCTAGTTCCTGGATAGAAGAGA
ACATCTTTTCCAAGTCCCTTGCAAAAGCTTTGGCATCAACATCTATATTTGTGGCACCCA
TTTGAATCAAAGCTGAGGCC*ATGGATTCATATTCTTCAGTTGCAATGGACGCTAAAAAT
ACTTCCATGGCAGCCCATGTTTTGGGTGATATCCGACCAACAATGCCAAAATCAAGAAAC
CCAATCCGGCCATCACGCAACAACCATAAGTTCCCTGCATGTACATCAGCATGGAAACTT
TCACAA*GAAAGTAAACTTCCAAACC*AGACATTAAGGGCCGTAATAAGGCTGTTCTCCG
GACTGGAAA*CAAGTGCACTTATAGAATCTAGATCAGTAAGAGGAACTCCGTATAGCCTC
TCCATTGTAAGTACACGCCGGCTGCTGCAGTGCTTATACACTCTTGGAGCAGTAGCTTGT
CCTGACAACCCCATGGTTTCAAGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AA30TF 374 0 0
TGGCACCCATT*GAATCAAAGCTGAGGCCCATGGATTCATATTCT*CAGTTGCAATGGAC
GCTAAAAATACTTCCATGGCAGCCCATGTTTTGGGTGATATCCGACCAACAATGCCAAAA
TCAAGAAACCCAATCCGGCCATCACGCAACAACCATAAGTTCCCTGCATGTACATCAGCA
TGGAAACTTTCACAAAGAAAGTAAACTTCCAAACCCAGACATTAAGGGCCGTAATAAGGC
TGTTTTCTGGACTGGAAAACAAGTGCACTTATAGAATCTAGATCAGTAAGAGGAACTCCG
TATAGCCTCTCCATTGTAAGTACACGCCGGCTGCTGCAGTGCTTATACACTCTTGGAGCA
GTAGCTTGTCCTGA

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 5

CO CL2090Contig1 823 5 13 U
GGAAGACATCAAATTGATTTTCTTGGGGGAATTTAGTAACAATTTTAGAATAGCTTTATC
AATATATTGTTAACAAAATTTGAAACAAAAAAAAAGTTAACAAAAACAATCAATAAATAT
GTCAAACATAGAAAAACCTAAGAGATAACATGACGAAAAAAACCTCTTTCTAGTGAGCTC
CAGACTGGCATGTATTCGAACGGGGTTAATAAGCTTTTGGCATATCCAGGTTTTTTTATA
CATTTTTCATGCATCAATAACCGGGTTTCTTTCGAATGCAGATCAACCTAACCAGCTGAC
CTTCTGACCCTTTACCAAACGGTTGTCATATTTATCTTGATTTCCAACGAAGAAGACATG
AGGGCAAGTTTCAATCACTAAAGGCTCTCCATCGGTGAAAGGATAACAACCTCAGTCTTC
TTTCGGCAAATCAAGCTTGCTTTTCGCCTCTGAGTACTTGTCAAGGTCATTGATGTTCTT
ACCATAAGTTCCAAGAAATCTGATATCGTCCACATCAAATGAATGAGGATTTCTACATGA
TCTGAAGGTGTTATAAGGTGCTGATCGAGGGAAAAGTCAACTGACCGGTGGCTGTAGGAA
AAAAAATGGCCTTAAGATAATTTACTTGCAAACCTGTTGAGGTAATGCAAAGTTACTGGA
TCATTCACGCCTGAAATTATATCTACTGAAACTCCTGCATCTATCTAAAACAATCTATAA
ACAAAACAAAATTTGAACTTTCCTCAATAGAATTTGATAAGGCACAGGTGGATCTGGTTT
TAACTCATTTGGTTTAACGTGATATCAAGCTCTTTGATGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A330TFB C 1
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AF RR4AO87JQ U 35
AF RR4AO87TF C 142
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AATATATTGTTAACAAAATTTGAAACAAAAAAAA*GTTAAAAAAAACAATCAATAAATAT
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CTTCTGACCCTTTACCAAACGGTTGTCATATTTATCTTGATTTCCAACGAAGAAGACATG
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C

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GA
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AAAAAAAAAGTTAACAAAAACAATCAATAAATATGTCAAACATAGAAAAACCTAAGAGAT
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TAATAAGCTTTTGGCATATCCAGGTTTTTTTATACATTTTTCATGCATCAATAACCGGGT
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CTCCATCGGTGAAAGGATAACAACCTCAGTCTTCTTTCGGCAAATCAAGCTTGCTTTTCG
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DS 

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CGTAA
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AAACCTCTTTCTAGTGAGCTCCAGACTGGCATGTATTCGAACGGGGTTAATAAGCTTTTG
GCATATCCAGGTTTTTTTATACATTTTTCATGCATCAATAACCGGGTTTCTTTCGAATGC
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GGCC

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DS 

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CGGGTTTCTTTCGAATGCAGATCAACCTAACCAGCTGACCTTCTGACCCTTTACCAAACG
GTTGTCATATTTATCTTGATTTCCAACGAAGAAGACATGAGGGCAAGTTTCAATCACTAA
AGGCTCTCCATCGGTGAAAGGATAACAACCTCAGTCTTCTTTCGGCAAATCAAGCTTGCT
TTTCGCCTCTGAGTACTTGTCAAGGTCATTGATGTTCTTACCATAAGTTCCAAGAAATCT
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TGATCGAGGGAAAAGTCAACTGACCGGTGGCTGTAGGAAAAAAAATGGCCTTAAGATAAT
TTACTTGCAAACCTGTTGAGGTAATGCAAAGTTACTGGATCATTCACGCCTGAAATTATA
TCTACTGAAACTCCTGCATCTATCTAAAACAATCTATAAACAAAACAAAATTTGAACTTT
CCTCAATAGAATTTGATAAGGCACAGGTGGATCTGGTTTTAACTCATTTGGTTTAACGTG
ATATCAAGCTCTTTGATGGGCC

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DS 



AS 1 5

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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCTGTGCTCAGAGAGAGAAATG
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CGTTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCT
CTCTTAATCTCCTCACGTGACAACAATAGTTCTCAGCGATTCAGAGCCCTGCCTGAGACC
ATTGCCGTCAAACAGGACGACACGACTGCTGATGACGACAATCCTCCTGCGACCATCAAC
ACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATC
ATCCAAGACTTCGCTAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAG
AGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATCGAG
AACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCA
AAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTG
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GGTGCCAGAGTTGTGTACGATGGAGACACAGGGAAGTCGAGAGGTTATGGCTTT*GTATG
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GGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCTTGAAATAAC
ATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTTGAACTAGAAAAAATAAATATA
TTTTTGTATGTGTTTAAGGTTTGGTAGTAACTAATATAATCAGCACCAATCCAAATCCTT
CCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4DZ96TF U 1
AF RR4FI80TF U 83
AF RR4B726TF U 104
AF RR4DZ96JQ C 376
AF RR4FI80JQ C 309
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RD RR4DZ96TF 551 0 0
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ATCCAAGACTTCGCTAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAG
AGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAG
AACCTCGATGG

QA 1 551 1 551
DS 

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GG
TCTCTCTGTTTGTCTCTGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCC
TGCTTCAAACTCTACGATCAACCAACCCTCCTCCTTCGTTGCAACAAATCATCTAACCAA
ACACTTCTTAGATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTAATCTCCTCACGTGACAAC
AATAGTTCTCAGCGATTCAGAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACG
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CCTTACAATGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCTAACCCCGAG
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GGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTAT
CCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCA
TTAGCTGGAGCGTTTCGGGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTACGATGGA
GACACAGG
AAGTCGA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4B726TF 841 0 0
GGAG
AGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACTCTACGATCAACC
AACCCTCCTCCTTCGTTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAACTTGTC
GCCTCCAAAGCCTCTCTTAATCTCCTCACGTGACAACAATAGTTCTCAGCGATTCAGAGC
CCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACGACTGCTGATGACGACAATCCTCC
TGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGCAAC
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AGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAA
CGTCATCATCGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTT
TGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTT
TGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGGGAGTG
CGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTACGATGGAGACACAGGGAAGTCGAGAGGTTA
TGGCTTTTGTATGTTACTCCTCCAAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAGTCGCTGGATG
GGCTTGAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGG*AGGAAATACTGAT
ACCTTGAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCA
TTTGACTAG

QA 5 832 5 832
DS 

RD RR4DZ96JQ 633 0 0
GGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCT
AACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCC
TTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACT
GAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAA
CCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACT
TCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTG
TACGATGGAGACACAGGGAAGTCGAGAGGTTATGGCTTT*GTATGTTACTCCTCCCAAGC
TGAAATGGAAACCGCTCTTGAGTCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCG
AGTAAACCCGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCGTAAAATAACATTTTGAGATTTTCA
TCGTTAGAGATTATGTTTCAATTTGAACTA*AAAAAATCAATATATTTT*GTATGTGTTT
AAGGTTTGGTAGTAACTAATATAATCAGCACC
T

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4FI80JQ 715 0 0
CAAACAGGACGACACGACTGCTGATGACGACAATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCT
CTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATCATCCAAGA
CTTCGCTAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGG
GTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATCGAGAACCTCGA
TGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAA
CAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGAC
AGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGGGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAG
AGTTGTGTACGATGGAGACACAGGGAAGTCGAGAGGTTATGGCTTT*GTATGTTACTCCT
CCAAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAGTCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGTCGGG
CCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCTTGAAATAACATTTTGAG
ATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTTGAACTAGAAAAAATAAATATATTTTTGTA
TG*GTTTAAGGTTTGGTAGTAACTAATATAATCAGCACCAATCCAAATCCTTCCG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 5

CO CL2092Contig1 880 5 16 U
GGATCCTTCCGCCGAAGTCCCGCCGCATCACCAGCGAGTTCATCTGGCCGGATCCAAAAA
ATTCGAAGAAGAAGTCGAAGAAGCGATCCAGTTTCTTCGATCTGGACGAAGAATTCGAGG
CTGATTTCAAAGGGTTCAAGGATGATGATTATTCTTCTTTTGACTGTGAAGATGAAACCT
TCGCGGATGTGAAGAAGCCCTTTTTCTTCACTGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCCCGTC
CAACCACCTTTGCCACCACTGGTAAACGCTAGCTCTCAGTTCTGTGGAGTAGCGGAGATG
ATAGGACCTGTGGATTTTGAGAAGAGCGTTGATTACTGGCAACAAGACAAATGGAACGGA
CAGTTCCCGGTGAAGTGGCACACCATCAAAGACGTTCCAAACAGTCAGTTCCGCCACATT
ATATTGGAGAACAATGACAATAAGCCTGTGACGAACACTCGAGACACTCAAGAAGTGAAA
CTAGAAGGCATTGAGATGCTGAAGATTTTCAAGAACTACGATGCTGAGACTTCAATCTTG
GATGATTTTGGGTTTTATGAAGAGAGGGAGAAGATAATTCAAGAACGGAAGGCAAGAAGG
CAGCCAAGCTTGCCATCTACAGGAGAGTAGGAGAAAACGAACATAAACCCGCTGCTGCTG
CTGCATTGCAGACAGACTTTATCAAGAACATGTCTAAAAGTTTTGCTCAAGTCGTCCGCT
TGGAGGAGGGAAGTTTTACACTGTGTTATAAATTTCATGGTATTCAGTTTCCAGCTTCAT
AGATTTCACTGTTGTTATGTTTTAGGATTTTGTATCAATCGCTGAAAATTGTTGGGTTTT
GTGGTTTGTACAAACGCTAAGACTCTAATAGAGTACACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ29TF U 103
AF RR4CS60TF U 1
AF RR4CS60JQ C 55
AF RR4CZ29JQ C 103
AF RR4CE89TF U 82
BS 1 373 RR4CS60TF
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BS 375 698 RR4CS60TF
BS 699 699 RR4CE89TF
BS 700 709 RR4CS60TF
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BS 711 729 RR4CS60TF
BS 730 730 RR4CE89TF
BS 731 771 RR4CS60TF
BS 772 805 RR4CE89TF
BS 806 808 RR4CS60JQ
BS 809 817 RR4CE89TF
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BS 819 827 RR4CE89TF
BS 828 828 RR4CS60JQ
BS 829 880 RR4CE89TF

RD RR4CZ29TF 618 0 0
G
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CTGTGAAGATGAAACCTTCGCGGATGTGAAGAAGCCCTTTTTCTTCACTGCACCTACCAA
ACTCGTAGCTTCCCGTCCAACCACCTTTGCCACCACTGGTAAACGCTAGCTCTCAGTTCT
GTGGAGTAGCGGAGATGATAGGACCTGTGGATTTTGAGAAGAGCGTTGATTACTGGCAAC
AAGACAAATGGAACGGACAGTTCCCGGTGAAGTGGCACACCATCAAAGACGTTCCAAACA
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CTGAGACTTCAATCTTGGATGATTTTGGGTTTTATGAAGAGAGGGAGAAGATAATTCAAG
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TAAACCCGCTGCTGCTGCTGCATTGCAGACAGACTTTATCAAGA*CATGTCTAAAA*TTT
TGCTCA
GTCGCCGCTTG

QA 2 607 2 607
DS 

RD RR4CS60TF 773 0 0
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CTGATTTCAAAGGGTTCAAGGATGATGATTATTCTTCTTTTGACTGTGAAGATGAAACCT
TCGCGGATGTGAAGAAGCCCTTTTTCTTCACTGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCCCGTC
CAACCACCTTTGCCACCACTGGTAAACGCTAGCTCTCAGTTCTGTGGAGTAGCGGAGATG
ATAGGACCTGTGGATTTTGAGAAGAGCGTTGATTACTGGCAACAAGACAAATGGAACGGA
CAGTTCCCGGTGATGTGGCACACCATCAAAGACGTTCCAAACAGTCAGTTCCGCCACATT
ATATTGGAGAACAATGACAATAAGCCTGTGACGAACACTCGAGACACTCAAGAAGTGAAA
CTAGAAGGCATTGAGATGCTGAAGATTTTCAAGAACTACGATGCTGAGACTTCAATCTTG
GATGATTTTGGGTTTTATGAAGAGAGGGAGAAGATAATTCAAGAACGGAAGGCAAGAAGG
CAGCCAAGCTTGCCATCTACAGGAGAGTAGGAGAAAACGAACATAAACCCGCTGCTGCTG
CTGCATTGCAGACAGACTTTATCAAGAACATGTCTAAA*GTTTTGCTCA*GTCGTCCGCT
TGGAGGAGG*AAGTTTTACACTGTGTTATAAATTTCATGGTATTCAGTTTC
AG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4CS60JQ 799 0 0
CC
AAAAATTCGAAGAAGAAGTCGAAGAAGCGATCCAGTTTCTTCGATCTGGACGAAGAATTC
GAGGCTGATT*CAAAGGGTTCAAGGATGATGATTATTCTTCTTTTGACTGTGAAGATGAA
ACCTTCGCGGATGTGAAGAAGCCCTTTTTCTTCACTGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCC
CGTCCAACCACCTTTGCCACCACTGGTAAACGCTAGCTCTCAGTTCTGTGGAGTAGCGGA
GATGATAGGACCTGTGGATTTTGAGAAGAGCGTTGATTACTGGCAACAAGACAAATGGAA
CGGACAGTTCCCGGTGATGTGGCACACCATCAAAGACGTTCCAAACAGTCAGTTCCGCCA
CATTATATTGGAGAACAATGACAATAAGCCTGTGACGAACACTCGAGACACTCAAGAAGT
GAAACTAGAAGGCATTGAGATGCTGAAGATTTTCAAGAACTACGATGCTGAGACTTCAAT
CTTGGATGATTTTGGGTTTTATGAAGAGAGGGAGAAGATAATTCAAGAACGGAAGGCAAG
AAGGCAGCCAAGCTTGCCATCTACAGGAGAGTAGGAGAAAACGAACATAAACCCGCTGCT
GCTGCTGCATTGCAGACAGACTTTATCAAGAACATGTCTAAAAGTTTTGCTCAAGTCGTC
CGCTTGGAGGAGGGAAGTTTTACACTGTGTTATAAATTTCATGGTATTCAGTTTCCAGCT
TCATAGATTTCACTGTTGTTATGTTTTAGGATTTTGTATCAATCGCTGAAAATTGTTGGG
TTTTGTGGTTT
TGTTAC

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR4CZ29JQ 749 0 0
G
GGACGAAGAATTCGAGGCTGATT*CAAAGGGTTCAAGGATGATGATTATTCTTCTTTTGA
CTGTGAAGATGAAACCTTCGCGGATGTGAAGAAGCCCTTTTTCTTCACTGCACCTACCAA
ACTCGTAGCTTCCCGTCCAACCACCTTTGCCACCACTGGTAAACGCTAGCTCTCAGTTCT
GTGGAGTAGCGGAGATGATAGGACCTGTGGATTTTGAGAAGAGCGTTGATTACTGGCAAC
AAGACAAATGGAACGGACAGTTCCCGGTGAAGTGGCACACCATCAAAGACGTTCCAAACA
GTCAGTTCCGCCACATTATATTGGAGAACAATGACAATAAGCCTGTGACGAACACTCGAG
ACACTCAAGAAGTGAAACTAGAAGGCATTGAGATGCTGAAGATTTTCAAGAACTACGATG
CTGAGACTTCAATCTTGGATGATTTTGGGTTTTATGAAGAGAGGGAGAAGATAATTCAAG
AACGGAAGGCAAGAAGGCAGCCAAGCTTGCCATCTACAGGAGAGTAGGAGAAAACGAACA
TAAACCCGCTGCTGCTGCTGCATTGCAGACAGACTTTATCAAGAACATGTCTAAAAGTTT
TGCTCAAGTCGTCCGCTTGGAGGAGGGAAGTTTTACACTGTGTTATAAATTTCATGGTAT
TCAGTTTCCAGCTTCATAGATTTCACCGTTGTTATGTTTTAGGATTTTGTATCAATCGCT
GAAAATTGTTGGGTTTTGTGGTTT
TGTT

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR4CE89TF 799 0 0
G
GCGATCCAGTTTCTTCGATCTGGACGAAGAATTCGAGGCTGATTTCAAAGGGTTCAAGGA
TGATGATTATTCTTCTTTTGACTGTGAAGATGAAACCTTCGCGGATGTGAAGAAGCCCTT
TTTCTTCACTGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCCCGTCCAACCACCTTTGCCACCACTGG
TAAACGCTAGCTCTCAGTTCTGTGGAGTAGCGGAGATGATAGGACCTGTGGATTTTGAGA
AGAGCGTTGATTACTGGCAACAAGACAAATGGAACGGACAGTTCCCGGTGAAGTGGCACA
CCATCAAAGACGTTCCAAACAGTCAGTTCCGCCACATTATATTGGAGAACAATGACAATA
AGCCTGTGACGAACACTCGAGACACTCAAGAAGTGAAACTAGAAGGCATTGAGATGCTGA
AGATTTTCAAGAACTACGATGCTGAGACTTCAATCTTGGATGATTTTGGGTTTTATGAAG
AGAGGGAGAAGATAATTCAAGAACGGAAGGCAAGAAGGCAGCCAAGCTTGCCATCTACAG
GAGAGTAGGAGAAAACGAACATAAACCCGCTGCTGCTGCTGCATTGCAGACAGACTTTAT
CAAGAACATGTCTAAAAGTTTTGCTCAAGTCGTCCGCTTGGAGGAGGGAAGTTTTACACT
GTGTTATAAATTTCATGGTATTCAGTTTCCAGCTTCATAGATTTCACTGTTGTTATGTTT
TAGA**TTTGTATCA*TCGCTGAAA*TTGTTGGGTTTTGTGGTTTGTACAAACGCTAAGA
CTCTAATAGAGTACACCA

QA 2 799 2 799
DS 



AS 1 4

CO CL2093Contig1 1003 4 16 U
GCACCTAATATAAAAAAGAATGCATTTTCATTTAGATCACAATCTTTGAACGTTAGCAAA
AAAATGTGTTACCTACCACCAGTCTCTTGCTTGCTATATAGATATTCCACATTAAACGTT
ATATGAATCATTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACAT
CTACACTCTCAACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATG
GTTCACGAGGTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCC*TCTCTCTTCTTGG
ACAAGGCATCACTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGT
TTACTTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAA
GGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGT
TATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATGAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAA
TGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCT
CGAGAAAGTTGTTGGATTTTTTCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTA
CCGTTTCTCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGA
GGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTC
TGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCGCAGT
TTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATCATCTTGTTGCCCCAAAAAAAAGCACCT
AGCATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTATGCCGTTCTTAAGCGAGACATCGTGTTA
ATTGGTTATCTTTATAAAATGTTTAATGGCTCTCTTTATAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC76TF U 1
AF RR4EC92TF U 142
AF RR4ER39TF U 226
AF RR4EC92JQ C 297
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BS 288 291 RR4FC76TF
BS 292 292 RR4EC92TF
BS 293 507 RR4FC76TF
BS 508 508 RR4EC92TF
BS 509 579 RR4FC76TF
BS 580 580 RR4EC92TF
BS 581 703 RR4FC76TF
BS 704 817 RR4EC92TF
BS 818 837 RR4ER39TF
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BS 839 893 RR4ER39TF
BS 894 894 RR4EC92JQ
BS 895 958 RR4ER39TF
BS 959 1003 RR4EC92JQ

RD RR4FC76TF 703 0 0
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ATATGAATCATTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACAT
CTACACTCTCAACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATG
GTTCACGAGGTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCCTCTCCCTTCTTGG
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GGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGT
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QA 1 703 1 703
DS 

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CACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGTTCACGAGGTTCCTTTTCCT
CCACAGATCATCACTTCCAAGCCCC*TCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCACTGACATCGA
GATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACTTAGATCCATCAGATGT
TAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCGGCGATGACGA
CTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAAA
AGAAATGAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGGC
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TCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCTCAGCCAAAGATGG
CATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAA
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GTCCACCATCGTCTCC
TCGC

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DS 

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G
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*TCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCACTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTC
ACGGCCATAGGAGTTTACTTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAA
GGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGG
GAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGA
GTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAA
GAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTTCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCAT
TCTATCATTACTTACCGTTTCTCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACG
GAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAG
AAGTGGTACTTGTCTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGAT
TCTCTGTCCGCGGTTTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATCATCTTGTTGCCCC
AAAAAAA*GCACCTAGCATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTATGCCGTTCTTAAGC
GAGACATCGTGT
GTTGT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4EC92JQ 707 0 0
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GAGTTTACTTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCG
GAAAGGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGA
AAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATGAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAG
AGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCG
AGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTTCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTA
CTTACCGTTTCTCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAG
AAGAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACT
TGTCTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCG
CAGTTTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATCATCTTGTTGCCCCAAAAAAAAGC
ACCTAGCATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTATGCCGTTCTTAAGCGAGACATCGT
GTTAATTGGTTATCTTTATAAAATGTTTAATGGCTCTCTTTATAAGG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 5

CO CL2094Contig1 1110 5 11 U
GGACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCCCTTCGCTTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCC
ATCCAAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGCACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGG
TAAGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACAC
ACCCAAGTACCGTTTCGTCGTCCGGTTCACCAACAAAGACATCGTGGCCCAAATCGTGTC
CGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCTCACGAGTTGCCTCAGTA
TGGACTTACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTTTTGGC
TCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGAGGCCAC
TGGAGAAGACTTCTCCGTGGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGA
TGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCATT
GGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAAAGAAAA
CAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGCCACGTCTCAAACTA
CATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTT
GAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAGGAGCTGTACAAGAAGGTTCATGCAGCTAT
CCGTGCTGACCCCAACCCCAAGAAGACCGTGAAACCTGCCCCCAAGGCACACAAGAGGTA
CAACTTAAAGAAGTTGACCTACGAGGAAAGGAAGAATAAGTTGATCGAGAGAGTCAAGGC
ATTGAACGGAGCAGCAGGTGGTGATGATGATGATGAGGACGACGAAGAGTAAATCACCAC
AGCTTTTCGTTGCCTCGTAATGTTTAGCTGTTTACTTCTTAAGCTTATTATTGTCTCAGT
TTTTCTATCTTTCAGACCTAAACACTTGGTTTCTTTCACATTTCATTTGCGTTCGAGGAT
TTTGAATTTAAGGATACTTTTCTCTCTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4C316TF U 1
AF RR4BX45TF U 1
AF RR4BX45JQ C 355
AF RR4EL85TF U 681
AF RR4C316JQ C 360
BS 1 88 RR4BX45TF
BS 89 89 RR4C316TF
BS 90 743 RR4BX45TF
BS 744 744 RR4EL85TF
BS 745 760 RR4BX45TF
BS 761 761 RR4EL85TF
BS 762 765 RR4BX45TF
BS 766 977 RR4EL85TF
BS 978 978 RR4BX45JQ
BS 979 1106 RR4EL85TF
BS 1107 1110 RR4BX45JQ

RD RR4C316TF 283 0 0
GGACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCCCTTCGCTTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCC
ATCCAAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGCACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGG
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ACCCAAGTACCGTTTCGTCGTCCGGTTCACCAACAAAGACATCGTGGCCCAAATCGTGTC
CGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCT

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4BX45TF 765 0 0
GGACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCCCTTCGCTTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCC
ATCCAAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGG
TAAGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACAC
ACCCAAGTACCGTTTCGTCGTCCGGTTCACCAACAAAGACATCGTGGCCCAAATCGTGTC
CGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCTCACGAGTTGCCTCAGTA
TGGACTTACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTTTTGGC
TCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGAGGCCAC
TGGAGAAGACTTCTCCGTGGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGA
TGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCATT
GGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAAAGAAAA
CAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGCCACGTCTCAAACTA
CATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTT
GAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGA*GATGGAGGAGCTGTACGAGAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4BX45JQ 756 0 0
TTTGG
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CTGGAGAAGACTTCTCCGTGGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTG
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G
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TGATGATGATGATGAGGACGACGAAGAGTAAATCACCACAGCTTTTCGTTGCCTCGCAAT
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CTCTC
AC

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ATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCAT
TGGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAAAGAAA
ACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGCCACGTCTCAAACT
ACATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACT
TGAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAGGAGCTGTACAAGAAGGTTCATGCAGCTA
TCCGTGCTGACCCCAACCCCAAGAAGACCGTGAAACCTGCCCCCAAGGCACACAAGAGGT
ACAACTTAAAGAAGTTGACCTACGAGGAAAGGAAGAATAAGTTGATCGAGAGAGTCAAGG
CATTGAACGGAGCAGCAGGTGGTGATGATGATGATGAGGACGACGAAGAGTAAATCACCA
CAGCTTTTCGTTGCCTCGTAATGTTTAGCTGTTTACTTCTTAAGCTTATTATTGTCTCAG
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DS 



AS 1 3

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CCATGGAATCACTGCGCCAGAGGAATACGGAGGTCTAGGTCTTGGTTACTTGTATCACTG
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AAATGGCAACAAGATGTGGTGCACTAATGGTCCCTCTGCTGAAACACTGATTGTGTACGC
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CTTAGGGATCATGCAGGCATCCCTCGACATTGTACTTCCCTATATTCGCCAGAGAGAACA
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AGTTGACCCAAAGGATTGTGCCGGAACTATTCTTTGTGCAGCAGAAAGAGCAACACAGGT
TGCTTTACAGGCGATACAATGTTTAGGCGGAAACGGATACATCAACGAGTATGCAACGGG
ACGCCTTTTGAGAGATGCAAAGCTATATGAGATCGGTGCTGGTACAAGCGAGATCAGAAG
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TGTATCATGTAAAATGTCATCAGTAGTCTCTCAATAAGAAAGGTGGCTTC


BQ
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AF RR4F761TF U 1
AF RR4FY32TF U 359
AF RR4F761JQ C 789
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RD RR4F761TF 676 0 0
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AGATGCAGAGGCTTTTAGCCGCCAGATCGATTCTTGGTAACGCCGTCAAGACGCGGAGTA
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TTAAAGAAAGTGTGTCCAAGTTTGCACAAGATGTTATCGCTCCCCATGCCGAAAGAATCG
ATATAACAAATTCATTTCCAAAGGATGTAAACTTATGAAGCTAATGGGTGAGTTCAATCT
CCATGGAATCACTGCGCCAGAGGAATACGGAGGTCTAGGTCTTGGTTACTTGTATCACTG
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TTCCAACCTTTGCATCAATCAGTTGGTGCGGAATGGAAATACAGAACAAAAGCACAAATA
TTTGCCCAAGCTGATCAGTGGAGAGCATGTTGGTGCTCTTGCGATGAGTGAACCCAATGC
CGGTTCGGATGTTGTCAGCATGAAATGCAAGGCTGATAAAGTAGATGGTGGCTATATAAT
AAATGGCAACAAGATGTGGTGCACTAATGGTCCCTCTGCTGAAACACTGATTGTGTACGC
CAAAACTGATACAAAA

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DS 

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G
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ATTTGCCCAAGCTGATCAGTGGAGAGCATGTTGGTGCTCTTGCGATGAGTGAACCCAATG
CCGGTTCGGATGTTGTCAGCATGAAATGCAAGGCTGATAAAGTAGATGGTGGCTATATAA
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AGTTTGGTCGTCCTGTTGGGGAGTTCCAGTTTATACAGGGTAAAGTTGCTGACATGTACA
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AAAGTGA

QA 2 719 2 719
DS 

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AGTCTTCAAGGTCATACGTCTACTCTGTAGCTAGGGAGTGTGACAATGGGAAAGTTGACC
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AGGCGATACAATGTTTAGGCGGAAACGGATACATCAACGAGTATGCAACGGGACGCCTTT
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AAGGTGGTAACATAACCATGCGACATTGTCATTTTGTACAACAGTGCAAATATGTATCAT
GTAAAATGTCATCAGTAGTCTCTCAATAAGAAAGGTGGCTTC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 2 5

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CAATCAAAAGTAACAGTCAGTTTCACGCCACATCTCATGCCAATGATCCGCGGAATGCAA
TCTACTATATATGTGGAAATGGCTCCTGGAGTTAGAACAGAAGACTTACACCAGCAGCTA
AAATCGTCTTATGAGGATGAAGATTTGTCAAAGTGTTGG


BQ
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AF RR4EF19TF U 1
AF RR4EM44TF U 28
BS 1 636 RR4EF19TF
BS 637 699 RR4EM44TF

RD RR4EF19TF 636 0 0
GTGGATAGCGTCTTCCCTCACCTCAGAGCTCAAAAACTACCTAGATTGATCTCAGTAAAG
GATGCAGATTTCTCTACTGTGGATGCTGTCTTCTGCTGTTTGCCTCACGGAACAACTCAG
GAAATCATCAAAGGACTTCCCACCGCTTTGAAAATTGTTGATCTTTCTGCGGACTTCCGG
TTGCGTGATATCGCTGAATATGAAGAATGGTATGGTCAGCCACACAAGGCAGTTGAGTTA
CAGAAAGAAGTTGTGTATGGCTTAACAGAGTTACTAAGGGAAGACATCAGAAAGGCTCGC
CTTGTGGCTAATCCAGGCTGTTACCCCACTTCGGTTCAGCTTCCTCTTGTTCCTCTACTA
AAGGCAAATCTCATCAAATATGAGAACATTATCATCGACGCAAAGCCTGGTGTTAGTGGA
GCAGGACGTGGTGCTAAGGAGGCTAATCTTTACTCTGAGATAGCTGAAGGCATTTCTTCT
TATGGTGTTACAAGGCATCGCCATGTTCCTGAAATTGAACAATGGTTATCGGATGTTACA
CAATCAAAAGTAACAGTCAGTTTCACGCCACATCTCATGCCAATGATCCGCGGAATGCAA
TCTACTATATATGTGGAAATGGCTCCTGGAGTTAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4EM44TF 672 0 0
GCTCAAAAACTACCTAGATTGATCTCAGTAAAGGATGCAGATTTCTCTACTGTGGATGCT
GTCTTCTGCTGTTTGCCTCACGGAACAACTCAGGAAATCATCAAAGGACTTCCCACCGCT
TTGAAAATTGTTGATCTTTCTGCGGACTTCCGGTTGCGTGATATCGCTGAATATGAAGAA
TGGTATGGTCAGCCACACAAGGCAGTTGAGTTACAGAAAGAAGTTGTGTATGGCTTAACA
GAGTTACTAAGGGAAGACATCAGAAAGGCTCGCCTTGTGGCTAATCCAGGCTGTTACCCC
ACTTCGGTTCAGCTTCCTCTTGTTCCTCTACTAAAGGCAAATCTCATCAAATATGAGAAC
ATTATCATCGACGCAAAGCCTGGTGTTAGTGGAGCAGGACGTGGTGCTAAGGAGGCTAAT
CTTTACTCTGAGATAGCTGAAGGCATTTCTTCTTATGGTGTTACAAGGCATCGCCATGTT
CCTGAAATTGAACAATGGTTATCGGATGTTACACAATCAAAAGTAACAGTCAGTTTCACG
CCACATCTCATGCCAATGATCCGCGGAATGCAATCTACTATATATGTGGAAATGGCTCCT
GGAGTTAGAACAGAAGACTTACACCAGCAGCTAAAATCGTCTTATGAGGATGAAGATTTG
TCAAAGTGTTGG

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL2096Contig2 625 3 2 U
GGAACAAGGGTTATCGGATGTTACACAATCAAAAGTAACAGTTGGTTTCACGCCACATCT
CATGCCAATGATCCGCGGAATGCAATCTACTATATATGTGGAAATGGCTCCTGGAGTTAG
AACAGAAGACTTACACCAGCAGCTAAAATCGTCTTATAAGGATGAAGAATTTGTCAAAGT
GTTGGAGGAAGGAGTTGTTCCTCGGACACACAATGTTAGAGGATCAAACTATTGTTTCAT
GAATGTGTTCCCTGATCGTATACCTGGACGAGCTATCATAATCTCAGTGATTGATAATCT
TGTGAAAGGAGCTTCAGGGCAAGCGTTGCAGAATCTTAACATAATGTTGGGATTACCCGA
GACAACGGGACTCCTACACCAGCCTCTTTTCCCTTAAGGGGATGAGCTTTTTAAAGGGTG
AGAGCAACTTCTTGTCTTCTTTTGTGTCTAGAAGATTTCATCTGTCTTAAGTTGTTTGTT
TCGAGTCTTTTACTGCCGTCGTAACAGCAATATGGTTTGTTTTATGATTCACTATAAAGA
CTGAACCC**TCTTCTCTTACCATTATAGACTATTGGTTTTGTTTGTTTGTTAATTACGT
TACAGAACTTATATTGTTTGACCAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FO65TF U 1
AF RR4FW19TF U 1
AF RR4G496JQ C 32
BS 1 588 RR4FO65TF
BS 589 625 RR4G496JQ

RD RR4FO65TF 588 0 0
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CATGCCAATGATCCGCGGAATGCAATCTACTATATATGTGGAAATGGCTCCTGGAGTTAG
AACAGAAGACTTACACCAGCAGCTAAAATCGTCTTATAAGGATGAAGAATTTGTCAAAGT
GTTGGAGGAAGGAGTTGTTCCTCGGACACACAATGTTAGAGGATCAAACTATTGTTTCAT
GAATGTGTTCCCTGATCGTATACCTGGACGAGCTATCATAATCTCAGTGATTGATAATCT
TGTGAAAGGAGCTTCAGGGCAAGCGTTGCAGAATCTTAACATAATGTTGGGATTACCCGA
GACAACGGGACTCCTACACCAGCCTCTTTTCCCTTAAGGGGATGAGCTTTTTAAAGGGTG
AGAGCAACTTCTTGTCTTCTTTTGTGTCTAGAAGATTTCATCTGTCTTAAGTTGTTTGTT
TCGAGTCTTTTACTGCCGTCGTAACAGCAATATGGTTTGTTTTATGATTCACTATAAAGA
CTGAACCC**TCTTCTCTTACCATTATAGACTATTGGTTTTGTTTGTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4FW19TF 591 0 0
G
GAACAAGGGTTATCGGATGTTACACAATCAAAAGTAACAGTTGGTTTCACGCCACATCTC
ATGCCAATGATCCGCGGAATGCAATCTACTATATATGTGGAAATGGCTCCTGGAGTTAGA
ACAGAAGACTTACACCAGCAGCTAAAATCGTCTTATAAGGATGAAGAATTTGTCAAAGTG
TTGGAGGAAGGAGTTGTTCCTCGGACACACAATGTTAGAGGATCAAACTATTGTTTCATG
AATGTGTTCCCTGATCGTATACCTGGACGAGCTATCATAATCTCAGTGATTGATAATCTT
GTGAAAGGAGCTTCAGGGCAAGCGTTGCAGAATCTTAACATAATGTTGGGATTACCCGAG
ACAACGGGACTCCTACACCAGCCTCTTTTCCCTTAAGGGGATGAGCTTTTTAAAGGGTGA
GAGCAACTTCTTGTCTTCTTTTGTGTCTAGAAGATTTCATCTGTCTTAAGTTGTTTGTTT
CGAGTCTTTTACTGCCGTCGTAACAGCAATATGGTTTGTTTTATGATTCACTATAAAGAC
TGAACCC**TCTTCTCTTACCATTATAGACTATTGGTTTTGTTTGTT
TGT

QA 2 588 2 588
DS 

RD RR4G496JQ 594 0 0
AAAGTAACAGTCAGTTTCACGCCACATCTCATGCCAATGATCCGCGGAATGCAATCTACT
ATATATGTGGAAATGGCTCCTGGAGTTAGAACAGAAGACTTACACCAGCAGCTAAAATCG
TCTTATGAGGATGAAGAATTTGTCAAAGTGTTGGAGGAAGGAGTTGTTCCGCGGACACAC
AATGTTAGAGGATCAAACTATTGTTTCATGAATGTGTTCCCTGATCGTATACCTGGACGA
GCTATCATAATCTCAGTGATTGATAATCTTGTGAAAGGAGCTTCAGGGCAAGCGTTGCAG
AATCTTAACATAATGTTGGGATTATCCGAGACAACGGGACTCCTACACCAGCCTCTTTTC
CCTTAAGGTGATGAGCTTTTTAAAGGGTGTGAGCAACTTCTTGTCTTCTTTTGTGTCTAG
AAGATTTCATCTGTCTTAAGTTGTTTGTTTCGAGTCTTTTACTGCCGTCGTAACAGCAAT
ATGGTTTGTTTTATGATTCACTAGAAAGACTGAACCCCCTCTTCTCTTACCATTATAGAC
TACTGGTTTTGTTTGTTTGTTAATTACGTTACAGAACTTATATTGTTTGACCAA

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 4

CO CL2097Contig1 1236 4 11 U
GGACACAGTGTCGATCTTTACGAGGTTCGCTAGTTCGGACTCCCTTTTCTACCTCGTCCT
TCGCTCTCACCGTATTCTCCCTTCGATGGCAACCACCACCGTCGCAGCAGCTGCAACAAA
GCTCACCTCCTTGAGATCCACCAGGAACCTCGGCATCCGTGAGATCTGCCAGGTCCGCCA
ATGGTCTCCTCTTCAGTCCGCGATGCCTCGTCTCGGAATGCTCCGATGCGGATCGGGGCA
GTCTTTTGCAACATCCACCGTTGTGAAGGCTCAAGCGACAACAGCTGTTGAGCAAGCGAC
GGGTGAAGCTGTTCCGAAAGTGGAGTCTCCTGTGGTCGTTGTCACTGGTGCCTCCAGAGG
GATTGGTAAAGCTATTGCTCTTTCCTTGGGCAAAGCCGGCTGCAAGGTGTTGGTGAACTA
TGCTAGGTCAGCAAAGGAGGCTGAGGAAGTTTCTAAACAGATTGAAGCATATGGTGGCCA
GGCTATTACTTTTGGGGGTGATGTCTCAAAAGAAGCTGATGTGGAAGCCATGATGAAAAC
CGCTATTGATGCATGGGGAACCATTGATGTCGTCGTTAACAATGCAGGAATCACTCGAGA
TACCTTGTTGATTCGCATGAAGAAGTACCAATGGGATGAAGTGATTGATTTGAATCTCAC
TGGAGTGTTCCTCTGTACCCAGGCAGCAACAAAGATCATGATGAAGAAGAGAAAGGGAAG
AATCATCAACATAGCGTCAGTTGTTGGTCTCATTGGTAACATTGGTCAAGCAAACTATGC
TGCTGCTAAAGCTGGAGTTATTGGGTTCTCCAAGACTGCCCCCAGAGAGGGTGCGAGCAG
GAATATTAATGTCAATGTGGTTTGTCCTGGATTCATTGCATCTGACATGACTGCCAAGCT
TGGAGAAGACATGGAAAAGAAAATCTTGGGAACAATCCCATTAGGACGGTATGGACAACC
GGAAGATGTGGCTGGCTTGGTAGAATTCTTGGCTCTCAGTCCTGCAGCCAGTTACATTAC
CGGACAGTCATTCACCATTGATGGAGGTATTGCCATCTAGGCATTGAGGTTTTGTTAAAA
TTTGCTTTTGTGTTTTGGTAAAACAGACAAAAGTTGAGTTTATTCTGGCACTTGGTCGGA
TTTCTGTTCTGCGGATTCTGTTTGGAGAGAAATCTAAAACGCATTGCCTAAACTAATAAG
TTACGTAATATATATTTTTTTTCGTTTTGCTAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H387TF U 1
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AF RR4H387JQ C 640
AF RR4FB80TF U 846
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G
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BQ
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AF RR4FC49TF U 1
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AF RR4CZ44TF U 3
AF RR4CA90JQ C 33
AF RR4CZ44JQ C 40
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*TATCGTCTGTATATATCTCT*GTCACATATT

QA 3 754 3 754
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DS 

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AAGATGAAGATGACGAGATGGCAAAGCCTTTGAAGCCACGTAAAGTTGTGAGGTTTCAGT
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TTTAGAGTACTGTATATCTATCAAGTTATCGTCTGTATATATCTCTTGTCACATATTTAA
CAAGGTTTTGGGTTC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

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ATGCAGAATATGTTTGGAGGAAATTTCTGAAGAAGGAAGGCTGTGTGATAACAGCAGGCT
GGCCAGCATCAAATGAGCCAGATTTGGTTCTCAAGGGTGCTAACAAATATCTGCAGGATT
CCATCGTCTTAATGAGAAAGCTTCTGCAAAAACAGCTTTTAGGATCCAAGAAGGCTGCTA
AGAAAGGCGCTCAAGTAACGGCAGTGGCAGAAGAGAAGTTGAAGGGCCTTGTGTATGTGA
ATGAGGAATTTGATGGATGGAGAGCCCACTGCCTCCAGATTCTGCAAAGCAAATTTGACC
AGCAAACCCGTCGCTTTGCCCCTGATGCTGAGATACTTGCAGAACTGAGGGAGACATTGC
AGAAAGAGGGCCAAGCGGAAAACTTCAAACAAATTCAGAAGATTTGCATGCCTTTCCTTA
AATTCAAAAAGGACGAGGCTATAGCTATTGGTGGCCAGGCTCTGAATTTGAAGCTACCTT
TTGGAGAGATGGAAGTTCTTCAGAGTAACATGGACTTGATCAAGCGGCAGCTTGGTCTTG
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TATGCAAGGTGTTTTGGTGTTTTTTACGAGTCGGATTTTATATGCAACTGTTTTTGACTT
CTTTGCTGTGTTTTTACCCTTTTTGGTATTGTTTACTGTTTAGTAAGACTTTCTATTATT
TCTTATCAATGACCCTTGTTTCATTTCGCATATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D387TF U 1
AF RR4AO26TF U 94
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AF RR4D387JQ C 524
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GG
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AAGTTGAAGGGCCTTGTGTATGTGAATGAGGAATTTGATGGATGGAGAGCCCACTGCCTC
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GTCGTTGCTAGAGCT

QA 3 797 3 797
DS 

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TGCCTCCAGATTCTGCAAAGCAAATTTGATCAGCAAACCCGTCGCTTTGCCCCTGATGCT
GAGATACTTGCAGAACTGAGGGAGACATTGCAGAAAGAGGGCCAAGCGGAAAATTTCAAA
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CCTGGCAGTCCAACCGCAATCTTTGTCAACAGGGTTTGAAAAAGCGTGGGATATGCAACA
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GTCGGATTTTATATGCAACTGTTTTTGACTTCTTTGCTGTGTTTTTACCCTTTTTGGTAT
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ATATTC

QA 1 786 1 786
DS 

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GGGCCTTGTGTATGTGAATGAGGAATTTGATGGATGGAGAGCCCACTGCCTCCAGATTCT
GCAAAGCAAATTTGACCAGCAAACCCGTTGCTTTGCCCCTGATGCTGAGATACTTGCAGA
ACTGAGGGAGACATTGCAGAAAGAGGGCCAAGCGGAAAACTTCAAACAAATTCAGAAGAT
TTGCATGCCTTTCCTTAAATTCAAAAAGGACGAGGCTATAGCTATTGGTGGCCAGGCTCT
GAATTTGAAGCTACCTTTTGGAGAGATGGAAGTTCTTCAGAGTAACATGGACTTGATCAA
GCGGCAGCTTGGTCTTGAAGAGGTTGAGATCTATTCTGCGAGTGACCCTAATGTCGTTGC
TAGAGCTGGTCCACATGCTTCGCTCCTGAAGCAGAATCCTCCATCTCCTGGCAGTCCAAC
CGCAATCTTTGTCAACAGGGTTTGAAAAAGCGTGGGATATGCAACAACGACAAGTCAAGA
GGTCGAAAGGCTTGGCGTATGCAAGGTGTTTTGGTGTTTTTTACGAGTCGGATTTTATAT
GCAACTGTTTTTGACTTCTTTGCTGTGTTTTTACCCTTTTTGGTATTGTTTACTGTTTAG
TAAGACTTTCTATTATTTCTTATCAATGACCCTTGTTTCATTTCGC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 5

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GGAAGGCTCACACGTTCTCCAAAACGACTACGACTCACTAGACGTCCACGTCGGACAGTG
CTTTGCTGTTCTTGTAACCGCTGACCAAGAGGCTAAGAACTACTACATGGTTGCATCCAC
TAGGTTCCTCAAGAAAGAAGTGAGCACGGTTGGTGTCATGAGCTACGAAGGAAGCAATGT
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CAGATCTTTCAGGTGGAACTTAACCGCAAGCGCGGCCAGACCTAACCCTCAGGGATCTTA
CCATTACGGAAAGATCAACATCACCCGTACCATCAAGCTTGCCAACACCAAGAGTGTGGT
GAACGGAAAGGTTAGGTTTGGGTTTAACGGTGTGTCACACGTTGACACCGAGACTCCTTT
GAAGCTTGCTGAGTACTTTGAGATGTCCGAGAAGGTGTTCAAATACAATGTTATCAAGGA
CGAGCCAGAAGCCAAGATCACAACACTAACTGTTGAGCCTAATGTCCTCAACATCACTTT
CCGTACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAGTCCTTCCATTT
GGATGGTCACTCCTTCTTCGCAGTCGCTTCTGAGCCAGGAAGATGGACACCAGAGAAGAG
AAACAACTACAACTTGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTATCCCAAGTC
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ACTAAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCAACCTTTGCGGCATCGTCAAGGGCTT
GCCCTTACCTACACCCTACACTATTTAATTAAACTCGCTTCCACAAAGTTTTATGTATTT
ATAATTGAATATGTAAAATTCTAAACTTACCACAAGTGAGTGTATTATGTTACTAATTAA
CCCTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG15TF U 44
AF RR4BV85TF U 1
AF RR4AN04TF U 10
AF RR4DG15JQ C 352
AF RR4AN04JQ C 615
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BS 128 240 RR4BV85TF
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BS 790 876 RR4AN04TF
BS 877 1089 RR4DG15JQ

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GG
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CGAAGGAAGCAATGTTCAGCCTTCAAGTGAACTCCCCAAGGCTCCAGTTGGCTGGGCTTG
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GCAGTCCTTCCATTTGGATGGTCACTCCTTCTTCGCAGTCGCTTCTGAGCCAGGAAGATG
GACACCAGAGAAG

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DS 

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GGAAGGCTCACACGTTCTCCAAAACGACTACGACTCACTAGACGTCCACGTCGGACAGTG
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CCAGCCTTCAAGCGAACTCCCCAAGGCTCCAGTTGGCTGGGCTTGGTCTCTTAACCAGTA
CAGATCTTTCAGGTGGAACTTAACCGCAAGCGCGGCCAGACCTAACCCTCAGGGATCTTA
CCATTACGGAAAGATCAACATCACCCGTACCATCAAGCTTGCCAACACCAAGAGTGTGGT
GAACGGAAAGGTTAGGTTTGGGTTTAACGGTGTGTCACACGTTGACACCGAGACTCCTTT
GAAGCTTGCTGAGTACTTTGAGATGTCCGAGAAGGTGTTCAAATACAATGTTATCAAGGA
CGAGCCAGAAGCCAAGATCACAACACTAACTGTTGAGCCTAATGTCCTCAACATCACTTT
CCGTACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAGTCCTTCCATTT
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GTGGTCAGC
A

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G
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CACGTTCTCCAAAACGACTACGACTCACTAGACGTCCACGTCGGACAGTGCTTTGCTGTT
CTTGTAACCGCTGACCAAGAGGCTAAGAACTACTACATGGTTGCATCCACTAGGTTCCTC
AAGAAAGAAGTGAGCACGGTTGGTGTCATGAGCTACGAAGGAAGCAATGTTCAGCCTTCA
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AAGATCAACATCACCCGTACCATCAAGCTTGCCAACACCAAGAGTGTGGTGAACGGAAAG
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AACTTGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTATCCCAAGTCGTGGTCAGCC
ATTCTCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAACTGGGAGAAA
AGATACTTGGGACAGCAACTGTACGT

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DS 

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GAGTGTGGTGAACGGAAAGGTTAGGTTTGGGTTTAACGGTGTGTCACACGTTGACACCGA
GACTCCTTTGAAGCTTGCTGAGTACTTTGAGATGTCCGAGAAGGTGTTCAAATACAATGT
TATCAAGGACGAGCCAGAAGCCAAGATCACAACACTAACTGTTGAGCCTAATGTCCTCAA
CATCACTTTCCGTACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAGTC
CTTCCATTTGGATGGTCACTCCTTCTTCGCAGTCGCTTTTGAGCCAGGAAGATGGACACC
AGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTA
TCCCAAGTTGTGGTCAGCCATTCTCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAG
ATCAGAGAACTGGGAGAAAAGATACTTGGGACAGCAACTGTACGTCAGCGTTCTATCACC
TGAAAAATCACTAAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCAACCTTTGCGGCATCGT
CAAGGGCTTGCCCTTACCTACACCCTACACTATTTAATTAAACTCGCTTCCACAAAGTTT
TATGTATTTATAATTGAATATGTAAAATTCTAAACTTACCACAAGTGAGTGTATTATGTT
ACTAATTAACCCTTTCCT

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DS 

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AAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAGTCCTTCCATTTGGATGGTCACTCCT
TCTTCGCAGTCGCTTTTGAGCCAGGAAGATGGACACCAGAGAAGAGAAACAACTACAACT
TGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTATCCCAAGTCGTGGTCAGCCATTC
TCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAACTGGGAGAAAAGAT
ACTTGGGACAGCAACTGTACGTCGGCGTTCTATCACCTGAAAAATCACTAAGAGACGAGT
ACAGCATCCCACTCAACACCAACCTTTGGGGCATCGTCAAGGGCTTGCCCTTACCTACAC
CCTACACTATTTAATTAAACTCGCTTCCACAAAGTTTTATGTATTTATAATTGAATATGT
AAAATTCTAAACTTACCACAAGTGAGTGTATTATGTTACTAATTAACCC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 5

CO CL2101Contig1 1359 5 16 U
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CTGTAAGAACAATCCTACCATCGGTAGCTCTACTGATTCTCATCGCCGTATCAACGGCGG
ACAGTATCGGAGGATTCGACGAGTCAAACCCGATCCGTATGGTCTCCGACCGTCTACGAG
AAGTAGAGCAATCCGTTGTCGAGATCTTAGGACAAACACGCCACGCTCTCTCCTTCGCTC
GGTTCACTCACCGGTACGGGAAAAGGTACGAGAACAAGGAGGAGACGAAGCTCAGGTTCT
CGATATTCAAGGAGAGTCTGGATTTGATCAGATCCACTAATAAGAAAGGCTTGTCTTACA
AACTCGGTGTCAATCAGTTTGCTGATATGACGTGGCAAGAGTTTCAAAGAACCAGGCTTG
GTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGAACCCACAAACTCACGGAAGCAGCTC
TTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTATTGTTAGCCCAGTCAAAGACCAGGGAG
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CATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTCA
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GTGGCCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATT
CAGCTGAAAACGTCGGTGTACAGGTCCTTGACTCTGTCAACATTACTCTGGGTGCTGAAG
ATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTACGACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATAC
ACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTTTACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAA
TGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTGGTTATGGAATTGAAGACGGTGTTCCATATT
GGCTTATCAAAAACTCATGGGGAGCAGATTGGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAA
TGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGGCATGTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATG
ATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTGATTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGAT
TAAGACATTACTTGAAAGTCACTTGGGAGTGCATAGTGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACA
TAAAG*TCTGCTCATATGTACAAAATGATGCATAAACTACAGACGATCAACTTTATAATG
TATCCATGTTAAATTTAAGGACACAAATTTATTCGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FL86TF U 1
AF RR4C583TF U 108
AF RR4CN05TF U 577
AF RR4C583JQ C 688
AF RR4FL86JQ C 690
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BS 287 301 RR4FL86TF
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BS 303 732 RR4FL86TF
BS 733 984 RR4CN05TF
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BS 1047 1047 RR4C583JQ
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BS 1105 1105 RR4C583JQ
BS 1106 1284 RR4CN05TF
BS 1285 1285 RR4C583JQ
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BS 1359 1359 RR4FL86JQ

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CATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTCA
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GTGGCCTCGACA

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DS 

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GACCGTCTACGAGAAGTAGAGCAATCCGTTGTCGAGATCTTAGGACAAACACGCCACGCT
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AAGCTCAGGTTCTCGATATTCAAGGAGAGTCTGGATTTGATCAGATCCACTAATAAGAAA
GGCTTGTCTTACAAACTCGGTGTCAATCAGTTTGCTGATATGACGTGGCAAGAGTTTCAA
AGAACCAGGCTTGGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGAACCCACAAACTC
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GCTTACCATCAAGCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGT
GCCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGCAACGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGAATAC
ATCAAATCCAACGGTGGCCTCGACA
C

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DS 

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TTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGCAACGGTGGCCTTCCTTCCCAAG
CCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACACCG
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TAAGCATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTTTACAGCG
ATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGTGGTTGGTTATG
GAATTGAAGACGGTGTTCCATATTGGCTTATCAAAAACTCATGGGGAGCATATTGGGGTG
ACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGTGGCATGTGCAT
CGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATGATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTGATTACAA
TCATGTTCCCCATATATATTGGATTAAGACATTACTTGAAAGTCACTTGGGAGTGCATAG
TGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACATAAAG*TCTGCTCATATGTACAAA*TGATGCATAAA
CTACAGACGATCAACTTTATA
TG

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DS 

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CT
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TACACCGGTGTAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGACAACGTCGGTGTACAAGTCCTT
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CGACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTT
TACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTT
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TGGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGGCA
TGTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATGATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTG
ATTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGATTAAGACATTACTTGAAAGTCACTTTGGAG
TGCATAGTGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACATAAGG*TCTGCTCATATGTACAAAATGAT
GCATAAACTACAGACGATCAACTTTATAATGTATCCATGTTAAATTTAAGGACACAAATT
TATTCGGAC

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR4FL86JQ 670 0 0
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TACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAAAACGTTGGTGTACAGGTCCTT
GACTCTGTCAACATTACTCTGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTA
CGACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACTAGAGCGGAGTT
TACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTT
GGTTATGGAATTGAAGACGGTGTTCCATATTGGCTTATCAAAAACTCATGGGGAGCAGAT
TGGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGGCA
TGTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATGATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTG
ATTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGATTATGACATTACTTGAAAGTCACTTGGGAG
TGCATAGTGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACATAAAGGTCTGCTCATATGTACAAAATGAT
GCATAAACTACAGACGATCAACTTTATAATGTATCCATGTTAAATTTAAGGACACAAATT
TATTCGGACC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 5

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TTGTCTTGCCAGACACGCCAAACTCAATGCTCGAGAGAGGCAAGTATGAACAAGCGAGAG
CGATGTTACAAAAGATCCGTGGAGCTGATAACGTCGACGAGGAGTTTCAAGATCTTTGTG
ATGCTTGTGAGGCTGCTAAAAAAGTGGAACACCCTTGGAAGAACCTTTTCCTACAAGCTA
AATACAGACCTGCTCTTGCTTTCTGTTCTGCCATACCTTTCTTCCAGCAGTTCACTGGTA
TCAATGTGATCATGTTCTACGCTCCTGTTCTCTTTAAAACTCTCGGTTTCGCTGATGATG
CCTCGCTCATCTCTGCGGTCATCACCGGTGTGGTGAACGTTGTCTCTACCCTTGTCTCCA
TCTATGCGGTTGACAGGTATGGAAGAAGGATTCTCTTCCTTGAAGGAGGCATTCAAATGA
TCATTTGCCAGATCATTGTTGGTACCTTGATTGGCTTGAAGTTTGGTACAACAGGATCAG
GGACCTTGACACCTGCAACAGCAAATTGGGTCCTAGCTTTCATATGTATATACGTTGCAG
GATTTGCATGGTCATGGGGTCCATTGGGATGGTTAGTACCAAGTGAGATCTGTCCGTTGG
AAATCAGACCAGCGGGACAAGCCGTCAACGTTTCTGTCAACATGTTCTTCACTTTCCTCA
TTGGACAATTCTTTTTAACGATGCTTTGTCACATGAAGTTTGGTCTCTTCTACTTCTTTG
GAGGTATGGTCCTGATCATGACCGTCTTCATCTACTTCTTGCTGCCGGAGACAAAAGGGG
TTCCTATTGAAGAAATGGGAAGAGTGTGGAAGCAGCATCCCTTCTGGAAACGTTACATCC
CAGATGATGCTGTTATTGGAGGAAGTGAAGGGACTTCTGTCAAGGAGGTTTGAGATTTTC
AAGAAAAGTCTAGGCACTGGTTTTGCTTAGCCACTTGTATTTGGTTGCTGAATAAGCCAA
CACGATGTGAGAATCTCAGGCCGAGAGGACAAGAAGAAGAAGAAAGGAAACTGTTAAAAA
AAAGTTTTAATGTTGAATTCTTTTACTTGATTTCATTCCAATAAAAGCAGAATTTTTCT


BQ
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25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AE82TF U 1
AF RR4AH57TF U 1
AF RR4AH57JQ C 329
AF RR4AE82JQ C 334
AF RR4G946TF U 484
BS 1 721 RR4AE82TF
BS 722 814 RR4AH57TF
BS 815 821 RR4G946TF
BS 822 822 RR4AH57JQ
BS 823 929 RR4G946TF
BS 930 931 RR4AH57JQ
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BS 949 949 RR4AH57JQ
BS 950 951 RR4G946TF
BS 952 952 RR4AH57JQ
BS 953 1082 RR4G946TF
BS 1083 1083 RR4AH57JQ
BS 1084 1121 RR4G946TF
BS 1122 1139 RR4AH57JQ

RD RR4AE82TF 721 0 0
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TTGTCTTGCCAGACACGCCAAACTCAATGCTCGAGAGAGGCAAGTATGAACAAGCGAGAG
CGATGTTACAAAAGATCCGTGGAGCTGATAACGTCGACGAGGAGTTTCAAGATCTTTGTG
ATGCTTGTGAGGCTGCTAAAAAAGTGGAACACCCTTGGAAGAACCTTTTCCTACAAGCTA
AATACAGACCTGCTCTTGCTTTCTGTTCTGCCATACCTTTCTTCCAGCAGTTCACTGGTA
TCAATGTGATCATGTTCTACGCTCCTGTTCTCTTTAAAACTCTCGGTTTCGCTGATGATG
CCTCGCTCATCTCTGCGGTCATCACCGGTGTGGTGAACGTTGTCTCTACCCTTGTCTCCA
TCTATGCGGTTGACAGGTATGGAAGAAGGATTCTCTTCCTTGAAGGAGGCATTCAAATGA
TCATTTGCCAGATCATTGTTGGTACCTTGATTGGCTTGAAGTTTGGTACAACAGGATCAG
GGACCTTGACACCTGCAACAGCAAATTGGGTCCTAGCTTTCATATGTATATACGTTGCAG
GATTTGCATGGTCATGGGGTCCATTGGGATGGTTAGTACCAAGTGAGATCTGTCCGTTGG
AAATCAGACCAGCGGGACAAGCCGTCAACGTTTCTGTCAACATGTTCTTCACTTTCCTCA
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AH57TF 814 0 0
GATGGAGAGTGTCATTAGGTCTAGCTGCTGTTCCAGCAGTTGTGATGGTCATAGGATCTT
TTGTCTTGCCAGACACGCCAAACTCAATGCTCGAGAGAGGCAAGTATGAACAAGCGAGAG
CGATGTTACAAAAGATCCGTGGAGCTGATAACGTCGACGAGGAGTTTCAAGATCTTTGTG
ATGCTTGTGAGGCTGCTAAAAAAGTGGAACACCCTTGGAAGAACCTTTTCCTACAAGCTA
AATACAGACCTGCTCTTGCTTTCTGTTCTGCCATACCTTTCTTCCAGCAGTTCACTGGTA
TCAATGTGATCATGTTCTACGCTCCTGTTCTCTTTAAAACTCTCGGTTTCGCTGATGATG
CCTCGCTCATCTCTGCGGTCATCACCGGTGTGGTGAACGTTGTCTCTACCCTTGTCTCCA
TCTATGCGGTTGACAGGTATGGAAGAAGGATTCTCTTCCTTGAAGGAGGCATTCAAATGA
TCATTTGCCAGATCATTGTTGGTACCTTGATTGGCTTGAAGTTTGGTACAACAGGATCAG
GGACCTTGACACCTGCAACAGCAAATTGGGTCCTAGCTTTCATATGTATATACGTTGCAG
GATTTGCATGGTCATGGGGTCCATTGGGATGGTTAGTACCAAGTGAGATCTGTCCGTTGG
AAATCAGACCAGCGGGACAAGCCGTCAACGTTTCTGTCAACATGTTCTTCACTTTCCTCA
TTGGACAATTCTTTTTAACGATGCTTTGTCACATGAAGTTTGGTCTCTTCTACTTCTTTG
GAGGTATGGTCCTGATCATGACCGTCTTCATCTA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4AH57JQ 811 0 0
TCTCT
TTAAAACTCTCGGTTTCGCTGATGATGCCTCGCTCATCTCTGCGGTCATCACCGGTGTGG
TGAACGTTGTCTCTACCCTTGTCTCCATCTATGCGGTTGACAGGTATGGAAGAAGGATTC
TCTTCCTTGAAGGAGGCATTCAAATGATCATTTGCCAGATCATTGTTGGTACCTTGATTG
GCTTGAAGTTTGGTACAACAGGATCAGGGACCTTGACACCTGCAACAGCAAATTGGGTCC
TAGCTTTCATATGTATATACGTTGCAGGATTTGCATGGTCATGGGGTCCATTGGGATGGT
TAGTACCAAGTGAGATCTGTCCGTTGGAAATCAGACCAGCGGGACAAGCCGTCAACGTTT
CTGTCAACATGTTCTTCACTTTCCTCATTGGACAATTCTTTTTAACGATGCTTTGTCACA
TGAAGTTTGGTCTCTTCTACTTCTTTGGAGGTATGGTCCTGATCATGACCGTCTTCATCT
ACTTCTTGCTGCCGGAGACAAAAGGGGTTCCTATTGAAGAAATGGGAAGAGTGTGGAAGC
AGCATCCCTTCTGGAAACGTTACATCCCAGATGATGCTGTTATTGGAGGAAGTGAAGGGA
CTTCTGTCAAGGAGGTTTGAGATTTTCAAGAAAAGTCTAGGCACTGGTTTTGCTTAGCCA
CTTGTATTTGGTTGCTGAATAAGCCAACACGATGTGAGAATCTCAGGCCGAGAGGACAAG
AAGAAGAAGAAAGGAAACTGTTAAAAAAAAGTTTTAATGTTGAATTCTTTTACTTGATTT
CATTCCAATAAAAGCAGAATTTTTCT

QA 6 811 6 811
DS 

RD RR4AE82JQ 806 0 0
TTAAAACTCTCGGTTTCGCTGATGATGCCTCGCTCATCTCTGCGGTCATCACCGGTGTGG
TGAACGTTGTCTCTACCCTTGTCTCCATCTATGCGGTTGACAGGTATGGAAGAAGGATTC
TCTTCCTTGAAGGAGGCATTCAAATGATCATTTGCCAGATCATTGTTGGTACCTTGATTG
GCTTGAAGTTTGGTACAACAGGATCAGGGACCTTGACACCTGCAACAGCAAATTGGGTCC
TAGCTTTCATATGTATATACGTTGCAGGATTTGCATGGTCATGGGGTCCATTGGGATGGT
TAGTACCAAGTGAGATCTGTCCGTTGGAAATCAGACCAGCGGGACAAGCCGTCAACGTTT
CTGTCAACATGTTCTTCACTTTCCTCATTGGACAATTCTTTTTAACGATGCTTTGTCACA
TGAAGTTTGGTCTCTTCTACTTCTTTGGAGGTATGGTCCTGATCATGACCGTCTTCATCT
ACTTCTTGCTGCCGGAGACAAAAGGGGTTCCTATTGAAGAAATGGGAAGAGTGTGGAAGC
AGCATCCCTTCTGGAAACGTTACATCCCAGATGATGCTGTTATTGGAGGAAGTGAAGGGA
CTTCTGTCAAGGAGGTTTGAGATTTTCAAGAAAAGTCTAGGCACTGGTTTTGCTTAGCCA
CTTGTATTTGGTTGCTGAATAAGCCAACACGATGTGAGAATCTCAGGCCGAGAGGACAAG
AAGAAGAAGAAAGGAAACTGTTAAAAAAAAGTTTTAATGTTGAATTCTTTTACTTGATTT
CATTCCAATAAAAGCAGAATTTTTCT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4G946TF 638 0 0
TTTGCCAGATCATTGTTGGTACCTTTATTGGCTTGAAGTTTGGTACCACAGGATCAGGGA
CCTTGACACCTGCAACAGCAAATTGGGTCCTAGCTTTCATATGTATATG*GTTGCAGGAT
TTGCATGGTCATGGGGTCCATTGGGATGGTTAGTACCAAGTGAGATCTGTCCGTTGGAAA
TCAGACCAGCGGGACAAGCCGTCAACGTTTCTGTCAACATGTTCTTCACTTTCCTCATTG
GACAATTCTTTTTAACGATGCTTTGTCACATGAAGTTTGGTCTCTTCTACTTCTTTGGAG
GTATGGTCCTGATCATGACCGTCTTCATCTACTTCTTGTTGCCGGAGACAAAAGGGGTTC
CTATTGAAGAAATGGGAAGAGTGTGGAAGCAGCATCCCTTCTGGAAACGTTACATCCCAG
ATGATGCTGTTATTGGAGGAAGTGAACAGACTTCTGTCAAGGAGGCTTAAGATTTTCAAG
AAAAGTCTAGGCACTGGTTTTGCTTAGCCACTTGTATTTGGTTGCTGAATAAGCCAACAC
GATGTGAGAATCTCAGGCCGAGAGGACAAGAAGAAGAAGAAAGGAAACTGTTAAAAAAA*
GTTTTAATGTTGAATTCTTTTACTTGATTTCATTCCAA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 4

CO CL2103Contig1 657 4 16 U
GGGCCTAATTCGTAGTTCGTCAGAAGCTGAAGAACCTCCTGCGACGGCGAAAGAGACGGA
AGCAAAAATCTCGGATCAGCCATGAATGCACCGGACCGATACGAGCGATTCGTTGTTCCT
GAAGGCACTAAAAAGGTTTCTTATGAGAGGGACACGAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTC
ACGATTGAGAGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGCCCGCATGCAACTTCACAGCGAC
GAGAATGTTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTC
AGGATTCACACCACAAGCCAGTCTTCCCCGATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGAC
CTTGACAAGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCCAATTTGAGGCAGAGGTGGCCAGGTTCTCG
AGTCCCTACTAAGGAGCTCAGAGTTCTCAATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTACT
CGCAGCACCAACCAGAAGACTTATAATGAGCTTGTTGCTACTTGCTTTTCTAAATTAGGA
ACAAATTTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGTGCACCATTCCGGCTGCTAAGA
AGTACTATTTGAAATACCTCGTCTTATATCCATCTTATCTACGAAAACGTTTTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4FF88TF U 1
AF RR4AE48JQ C 5
AF RR4FF88JQ C 89
AF RR4AE48TF U 5
BS 1 21 RR4FF88TF
BS 22 22 RR4AE48TF
BS 23 57 RR4FF88TF
BS 58 58 RR4AE48TF
BS 59 68 RR4FF88TF
BS 69 69 RR4AE48TF
BS 70 72 RR4FF88TF
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BS 74 93 RR4FF88TF
BS 94 94 RR4AE48TF
BS 95 319 RR4FF88TF
BS 320 320 RR4AE48TF
BS 321 353 RR4FF88TF
BS 354 354 RR4AE48TF
BS 355 586 RR4FF88TF
BS 587 657 RR4AE48TF

RD RR4FF88TF 586 0 0
GGGCCTAATTCGTAGTTCGTCGGAAGCTGAAGAACCTCCTGCGACGGCGAAAGAGACCGA
AGCAAAAACCTCCGATCAGCCATGAATGCACCGTACCGATACGAGCGATTCGTTGTTCCT
GAAGGCACTAAAAAGGTTTCTTATGAGAGGGACACGAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTC
ACGATTGAGAGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGCCCGCATGCAACTTCACAGCGAC
GAGAATGTTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTC
AGGATTCACACCACAAGCCGGTCTTCCCCGATGCAAGCATACAATCAGGCTATTAATGAC
CTTGACAAGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCCAATTTGAGGCAGAGGTGGCCAGGTTCTCG
AGTCCCTACTAAGGAGCTCAGAGTTCTCAATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTACT
CGCAGCACCAACCAGAAGACTTATAATGAGCTTGTTGCTACTTGCTTTTCTAAATTAGGA
ACAAATTTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGTGCACCAT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4AE48JQ 650 0 0
GG
AATTCGTAGTTCGTCAGAAGCTGAAGAACCTCCTGCGACGGCGAAAGAGACGGAAGCAAA
AATCTCGGATCAGCCATGAATGCACCGGACCGATACGAGCGATTCGTTGTTCCTGAAGGC
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GTTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAGGATT
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AAGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCTAATTTGAGGCAGAGGTGGCCAGGTTCTCGAGTCCC
TACTAAGGAGCTCAGAGTTCTCAATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTACTCGCAGC
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TTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGTGCACCATTCCGGCTGCTAAGAAGTACT
ATTTGAAATACCTCGTCTTATATCCATCTTATCTACGAAAACGTTTTA

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR4FF88JQ 531 0 0
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GGGACACGAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTCACGATTGAGAGAGAAGATCATACCATTG
GAAACATCGCCCGCATGCAACTTCACAGCGACGAGAATGTTTTGTTTGCTGGGTACCAAC
TTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAGGATTCACACCACAAGCCGGTCTTCCC
CGATGCAAGCATACAATCAGGCTATTAATGACCTTGACAAGGAGCTTGACTTTCTCAAGA
GCCAATTTGAGGCAGAGGTGGCCAGGTTCTCGAGTCCCTACTAAGGAGCTCAGAGTTCTC
AATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTACTCGCAGCACCAACCAGAAGACTTATAATG
AGCTTGTTGCTACTTGCTTTTTTAAATTAGGAACAAATTTTCATGTTATTTGTTTTAACT
CTATGTTTTGTGCACCATTCCGGCTGCTAAGAAGTACTATTTGAAATACC
C

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4AE48TF 653 0 0
GG
AATTCGTAGTTCGTCAGAAGCTGAAGAACCTCCTGCGACGGCGAAAGAGACGGAAGCAAA
AATCTCGGATCAGCCATGAATGCACCGGACCGATACGAGCGATTCGTTGTTCCTGAAGGC
ACTAAAAAGGTTTCTTATGAGAGGGACACGAATATCATCAACGCTGCTTCCTTCACGATT
GAGAGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGTCCGCATGCAACTTCACAGCGACGAGAAT
GTTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAGGATT
CACACCACAAGCCAGTCTTCCCCGATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGACCTTGAC
AAGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCTAATTTGAGGCAGAGGTGGCCAGGTTCTCGAGTCCC
TACTAAGGAGCTCAGAGTTCTCAATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTACTCGCAGC
ACCAACCAGAAGACTTATAATGAGCTTGTTGCTATTTGCTTTTCTAAATTAGGAACAAAT
TTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGTGCACCATTCCGGCTGCTAAGAAGTACT
ATTTGAAATACCTCGTCTTATATCCATCTTATCTACGAAAACGTTTTAAAG

QA 3 653 3 653
DS 



AS 1 5

CO CL2104Contig1 645 5 4 U
GGTCCACTTTCATTTCGTGACTCTCATCCAAATCCCTAAATCTCGAGAGCTCGACGGAGA
TGGCACTGAGAACTGCAGTCCTTCGTCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGT
CTCAAATTGGGTTCCTTGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCA
AGCAGGATGTCGTCGACAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAG
CTAAGGTGACTCCTGAAGTTCATTTCCAAAAGGATTTGGGATTAGATAGTTTGGACACTG
TGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTG
ACAAGATCGACTCTTGCCCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCT
GATCTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCT
TGAAAATGAGATTTTGCAAATAAATTGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCAT
AAAATAAACTATTTTGGCTTTTGAGTGTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACA
ATCTGTCTTTTATGCAAAAATAAAAAATAAAATCAAATATTCTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EP68TF U 24
AF RR4D926JQ C 1
AF RR4F701JQ C 24
AF RR4F701TF U 24
AF RR4D926TF U 1
BS 1 25 RR4D926TF
BS 26 523 RR4EP68TF
BS 524 615 RR4F701TF
BS 616 645 RR4D926TF

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GG
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CCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGCAGGATGTCGTCGACAGAGTTCT
CGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTAAGGTGACTCCTGAAGTTCATTT
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CATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGATCTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTT
GTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTGCAAATAAAT
TGGAGCATATTCTTGTGA

QA 3 500 3 500
DS 

RD RR4D926JQ 645 0 0
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AGCAAGATGTCGTCGACAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAG
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TGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTG
ACAAGATCGACTCTTGCCCTCCTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCT
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TGAAAATGAGATTTTGCAAATAAATTGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCAT
AAAATAAACTATTTTGGCTTTTGAGTGTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACA
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DS 

RD RR4F701JQ 578 0 0
GG
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CCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGCAGGATGTCGTCGACAGAGTTCT
CGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTAAGGTGACTCCTGAAGTTCATTT
CCAAAAGGATTTGGGATTAGATAGTTTGGACACTGTGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGA
GGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTGACAAGATCGACTCTTGCCCTCTTGC
CATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGATCTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTT
GTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTGCAAATAAAT
TGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAAATAAACTATTTTGGCTTTTGAG
TGTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACAA

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR4F701TF 594 0 0
GG
ATCCAAATCCCTAAATCTCGAGAGCTCGACGGAGATGGCACTGAGAACTGCAGTCCTTCG
TCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGTCTCAAATTGGGTTCCTTGGTTCGAT
CCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGCAGGATGTCGTCGACAGAGTTCT
CGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTAAGGTGACTCCTGAAGTTCATTT
CCAAAAGGATTTGGGATTAGATAGTTTGGACACTGTGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGA
GGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTGACAAGATCGACTCTTGCCCTCTTGC
CATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGATCTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTT
GTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTGCAAATAAAT
TGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAAATAAACTATTTTGGCTTTTGAG
TGTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACAATCTGTCTTTTATGC
GA

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR4D926TF 645 0 0
GGTCCACTTTCATTTCGTGACTCTCATCCAAATCCCTAAATCTCGAGAGCTCGACGGAGA
TGGCACTGAGAACTGCAGTCCTTCGTCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGT
CTCAAATTGGGTTCCTTGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCA
AGCAAGATGTCGTCGACAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAG
CTAAGGTGACTCCTGAAGTTCATTTCCAAAAGGATTTGGGGTTAGATAGTTTGGACACTG
TGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTG
ACAAGATCGACTCTTGCCCTCCTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCT
GATCTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCT
TGAAAATGAGATTTTGCAAATAAATTGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCAT
AAAATAAACTATTTTGGCTTTTGAGTGTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACA
ATCTGTCTTTTATGCAAAAATAAAAAATAAAATCAAATATTCTTT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 5

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GGGGGGGACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCT**ATTTTCAAACCCTAC
GAGAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGCGGATAC
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GGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCG
TCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGCTGG
TGGACAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGA
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TCCAAGGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGA
TGCCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGATGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATATAGG
ACGCTGCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTG
TTTTAAATGGTTTTTCTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAATG
AGAGATTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGCTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE48TF U 1
AF RR4CF33TF U 6
AF RR4BR24TF U 6
AF RR4BR24JQ C 73
AF RR4CF32TF U 6
BS 1 159 RR4CE48TF
BS 160 160 RR4BR24TF
BS 161 243 RR4CE48TF
BS 244 693 RR4BR24TF
BS 694 700 RR4CF32TF

RD RR4CE48TF 243 0 0
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CAAGAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAAGCAAGCAAAGCGGCGGCTAA
GGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCG
TCA

QA 1 243 1 243
DS 

RD RR4CF33TF 643 0 0
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AAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACAACC
GCAAAGTTGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAA
AGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATGCCG
ATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGATGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATATAGGACGCT
GCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGTTTTA
AATGGTTTTTCTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BR24TF 692 0 0
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GCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATC
CTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGTCAGA
CTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGCTGGTGGAC
AAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACAACC
GCAAAGTTGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAA
GGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATGCCG
ATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGATGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATATAGGACGCT
GCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGTTTTA
AATGGTTTTTCTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAATGAGAGA
TTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGC
CAAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4BR24JQ 622 0 0
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GAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACAACCGCAAAGT
TGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAGGGAGGA
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GAGTGATGAGGAGGAAGATGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATATAGGACGCTGCAAGGA
TCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGTTTTAAATGGTT
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CTCAATATTAAACCATTTAGC
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4CF32TF 695 0 0
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ATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGCGGATACCAAGA
GCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATC
CTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGTCAGA
CTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGCTGGTGGAC
AAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACAACC
GCAAAGTTGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAA
AGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATGCCG
ATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGATGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATATAGGACGCT
GCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGTTTTA
AATGGTTTTTCTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAATGAGAGA
TTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGCTAAAAAA

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 5

CO CL2106Contig1 763 5 5 U
GGAAAGACAACACAAGCTAAATGTTTCTATCCAAACTTTTCAGACATCATTCAAATCAAT
TAACTAATCTTCTGTTTTGTTTTTTTTACACGAATTGCAGAAACACAAACAGATTGACAC
TAAAGAACCAAACCTATAAGTATAATGAAAATAAGTATCGATAAGTTAGACACGCGTGAT
TTATAAGAGATAATCATCATCAGAGATATCAGTTAATTTCATATGATATTAGCATCATTG
CTATATTCTCACATCAACAACTTTAAGACTGACATCTTTTTATTACATTGCAAACTCCAC
AACCAATCACTTCTTGAGGCTTCCTCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGAGGATTCAGGAGC
GGCAAGCGCCTCGTGGAGATTCTTGGGCTCCTCGTAAGGCAGCTTAGGATGCTTCGACTC
GTGATGGATCTGCATCGTCTTCAGATCCGGCGCCGTGATCTTGCAGTGCGGACACTCGTA
CTTCGCGTGACCTCCCTTCTCCTTCCCCGTCCTGTCCGCGAGCCCCGCCTTTCCTCCGCC
TCTGTTGGTCAACGCTGCGTCGGCTTTCGCCTGCAGCTCCTTCGCCGTGTGCTTCTTCGG
CTTCGCCTTGCCGGTCATCGTCGATTTGGGCGGATACGAGAGGATCCGAAAGGGGGAGGG
GTGAGAAGATGAAAACCCTAATTTCTTTGATTGGAGAAACAGGGAATTGGGGGCGACGGA
CGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATTTATCTTTGTTTAGAGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CC66TF U 1
AF RR4E049TF C 130
AF RR4E049JQ U 139
AF RR4CJ51JQ U 205
AF RR4CJ51TF C 338
BS 1 608 RR4CC66TF
BS 609 609 RR4E049JQ
BS 610 638 RR4CC66TF
BS 639 714 RR4E049JQ
BS 715 763 RR4CJ51JQ

RD RR4CC66TF 638 0 0
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TAACTAATCTTCTGTTTTGTTTTTTTTACACGAATTGCAGAAACACAAACAGATTGACAC
TAAAGAACCAAACCTATAAGTATAATGAAAATAAGTATCGATAAGTTAGACACGCGTGAT
TTATAAGAGATAATCATCATCAGAGATATCAGTTAATTTCATATGATATTAGCATCATTG
CTATATTCTCACATCAACAACTTTAAGACTGACATCTTTTTATTACATTGCAAACTCCAC
AACCAATCACTTCTTGAGGCTTCCTCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGAGGATTCAGGAGC
GGCAAGCGCCTCGTGGAGATTCTTGGGCTCCTCGTAAGGCAGCTTAGGATGCTTCGACTC
GTGATGGATCTGCATCGTCTTCAGATCCGGCGCCGTGATCTTGCAGTGCGGACACTCGTA
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TCTGTTGGTCAACGCTGCGTCGGCTTTCGCCTGCAGCTCCTTCGCCGTGTGCTTCTTCGG
CTTCGCCT*GCCGGTCATCGTCGATTTGGGCGGATACG

QA 1 638 1 638
DS 

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AGTATAATGAAAATAAGTATCGATAAGTTAGACACGCGTGATTTATAAGAGATAATCATC
ATCAGAGATATCAGTTAATTTCATATGATATTAGCATCATTGCTATATTCTCACATCAAC
AACTTTAAGACTGACATCTTTTTATTACATTGCAAACTCCACAACCAATCACTTCTTGAG
GCTTCCTCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGAGGATTCAGGAGCGGCAAGCGCCTCGTGGAG
ATTCTTGGGCTCCTCGTAAGGCAGCTTAGGATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATCGT
CTTCAGATCCGGCGCCGTGATCTTGCAGTGCGGACACTCGTACTTCGCGTGACCTCCCTT
CTCCTTCCCCGTCCTGTCCGCGAGCCCCGCCTTTCCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCTGC
GTCGGCTTTCGCCTGCAGCTCCTTCGCCGTGTGCTTCTTCGGCTTCGCCTTGCCGGTCAT
CGTCGATTTGGGCGGATACGAGAGGATCCGAAAGGGGGAGGGGTGAGAAGATGAAAACCC
TAATTTCTTTGATTGGAGAAACAGGGAATTGGGGGC
CC

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DS 

RD RR4E049JQ 578 0 0
AGTATAATGAAAATAAGTATCGATAAGTTAGACACGCGTGATTTATAAGAGATAATCATC
ATCAGAGATATCAGTTAATTTCATATGATATTAGCATCATTGCTATATTCTCACATCAAC
AACTTTAAGACTGACATCTTTTTATTACATTGCAAACTCCACAACCAATCACTTCTTGAG
GCTTCCTCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGAGGATTCAGGAGCGGCAAGCGCCTCGTGGAG
ATTCTTGGGCTCCTCGTAAGGCAGCTTAGGATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATCGT
CTTCAGATCCGGCGCCGTGATCTTGCAGTGCGGACACTCGTACTTCGCGTGACCTCCCTT
CTCCTTCCCCGTCCTGTCCGCGAGCCCCGCCTTTCCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCTGC
GTCGGCTTTCGCCTGCAGCTCCTTCGCCGTGTGCTTCTTCGGCTTCGCCTTGCCGGTCAT
CGTCGATTTGGGCGGATACGAGAGGATCCGAAAGGGGGAGGGGTGAGAAGATGAAAACCC
TAATTTCTTTGATTGGAGAAACAGGGAATTGGGGGC
CC

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DS 

RD RR4CJ51JQ 559 0 0
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AAGACTGACATCTTTTTATTACATTGCAAACTCCACAACCAATCACTTCTTGAGGCTTCC
TCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGAGGATTCAGGAGCGGCAAGCGCCTCGTGGAGATTCTT
GGGCTCCTCGTAAGGCAGCTTAGGATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATCGTCTTCAG
ATCCGGCGCCGTGATCTTGCAGTGCGGACACTCGTACTTCGCGTGACCTCCCTTCTCCTT
CCCCGTCCTGTCCGCGAGCCCCGCCTTTCCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCTGCGTCGGC
TTTCGCCTGCAGCTCCTTCGCCGTGTGCTTCTTCGGCTTCGCCTTGCCGGTCATCGTCGA
TTTGGGCGGATACGAGAGGATCCGAAAGGGGGAGGGGTGAGAAGATGAAAACCCTAATTT
CTTTGATTGGAGAAACAGGGAATTGGGGGCGACGGACGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATT
TATCTTTGTTTAGAGTATC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4CJ51TF 426 0 0
GTTTAGGTTGGAGGA
TCAGGAGCGGCAAGCGCCTCGTGGAGAT*CTTGGGCTCCTCGTAAGGCAGCTTAGGATGC
TTCGACTCGTGA*GGATCTGCATCGTCTTCAGATCCGGCGCCGTGATCTTGCAGTGCGG*
CACTCGTACTTCGCGTG*CCTCCCTTCTCCTTCCCCGTCCTGTCCGCGAGCCCCGCCTTT
CCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCTGCGTCGGCTTTCGCCTGCAGCTCCTTCGCCGTGTGC
TTCTTCGGCTTCGCCTTGCCGGTCATCGTCGATTTGGGCGGATACGAGAGGATCCGAAAG
GGGGAGGGGTGAGAAGATGAAAACCCTAATTTCTTTGATTGGAGAAACAGGGAATTGGGG
GCGACGGACGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATTTATCTTTGTTTAGAGTATC

QA 16 426 16 426
DS 



AS 1 3

CO CL2107Contig1 855 3 15 U
GGGCAAGCTAACATCTTTTGTTTCTTCAATCCTGAGCTCTTCTTCTTCGTTCCTGAGACT
TTTTCGCTATACAACTTGTGAAGATGTTCTCGGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGA
ATGCAACTCCAACAGAATGCGATGAGCAAGTTGCTCAGGCTCTGTTTGATCTGGAGAACA
CCAACCAGGAGTTGAAGAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGG
ACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCATTCAGACTGAGGAAAGCTT
TCCGCAAGATTCATCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATG
TTATCTTTGTTGCGACAAGAAGGATCATGCGTCCACCTAAGAAGGGTGCTGCTGTGCAGA
GGCCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCAATGCTCGAGGATGTCGCTTACC
CTGCTGAGATTGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTTGATGGTTCCAAGATCATGAAGG
TCTATTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACTGAGTACAAGCTCGAGACTATGATGGGTG
TGTACCGGAAACTTACTGGAAAGGATGTCACTTTCGAGTACCCTGTTGAAGCTTGAAGAC
GTTGATGATGCTGAAGAATCTCATCAGGATAGAGAAGAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTTG
GTGGTGTTTTAGGATGATGTAAACTCTGTTTTGATTCAGTTCTCCTTATTCACAATCTTC
ATATTACAAAAAGACTAAAAAGTTTCTGTGCTTTATCAATTTTTAAACCTATTTTAAAGT
TTAGGTTTCATTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ68TF U 1
AF RR4EN12TF U 13
AF RR4EN12JQ C 275
BS 1 125 RR4EJ68TF
BS 126 126 RR4EN12TF
BS 127 415 RR4EJ68TF
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BS 688 688 RR4EN12JQ
BS 689 730 RR4EN12TF
BS 731 855 RR4EN12JQ

RD RR4EJ68TF 559 0 0
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ATGCAGCTCCAACAGAATGCGATGAGCAAGTTGCTCAGGCTCTGTTTGATCTGGAGAACA
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ACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCATTCAGACTGAGGAAAGCTT
TCCGCAAGATTCATCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATG
TTATCTTTGTTGCGACAAGAAGGATCATGCGTCCACCTAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGA
GGCCACGCAACAGAACGCTAACCTCTGTTCATGAAGCAATGCTCGAGGATGTCGCTTACC
CTGCTGAGATTGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTTGATGGTTCCAAGATCATGAAAG
TCTATTTGGAGGCCAAGGA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4EN12TF 718 0 0
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GACTTGTGAAGATGTTCTCGGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCCACTCCAA
CAGAATGCGATGAGCAAGTTGCTCAGGCTCTGTTTGATCTGGAGAACACCAACCAGGAGT
TGAAGAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTCTGGAA
ACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCATTCAGACTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATTC
ATCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATCTTTGTTG
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GGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCAATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTG
TTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTTGATGGTTCCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGG
CCAAGGAAAGGAACAACACTGAGTACAAGCTCGAGACTATGATGGGTGTGTACCGGAAAC
TTACTGGAAAGGATGTCACTTTCGAGTACCCTGTTGAAGCTTGAAGACGTTGATGATGCT
GAAGAATCTCATCAG*ATAGAGAAGAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTTGGTGGTGTTTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EN12JQ 581 0 0
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CGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATCTTTGTTGCGACAAGAAGGATCATGCGTCC
ACCTAAGAAGGGTGCTGCTGTGCAGAGGCCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGA
AGCAATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAACGTACTCGTTACCG
TCTTGATGGTTCCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACTGA
GTACAAGCTCGAGACTATGATGGGTGTGTACCGGAAACTTACTGGAAAGGATGTCACTTT
CGAGTACCCTGTTGAAGCTTGAAGACGTTGATGATGCTGAAGAATCTCATCAGGATAGAG
AAGAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTTGGTGGTGTTTTAGGATGATGTAAACTCTGTTTTGA
TTCAGTTCTCCTTATTCACAATCTTCATATTACAAAAAGACTAAAAAGTTTCTGTGCTTT
ATCAATTTTTAAACCTATTTTAAAGTTTAGGTTTCATTCCT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 4

CO CL2108Contig1 1043 4 8 U
GGGACATCGATGGATGATTGGAAACGACGACTCACGCATTTCGAAACGTTTGGAGAAATT
TCTCTTGAGAGACTAATCAGACCTTTCTTCTTGACCAGTTTCGATGGCAGAGGGAAGCGC
CGCTTCGCGTTACGTGAAATTGAGGAAAGGGCAGGCTCCTGTGGAAGATATCACCCCCGG
CGAACTCAACCAGCCCATTGATGTTCCTCAGTTGAACGTTCGCAAGTGCCCTGAATGTAT
GCAAGTTCTTCCTGAAACCTATGAACCTCCTTCTGATGAAAACTGGACCACTGGCATTTT
TGCTTGCGCTGAAGACCCCGACAGCTGTAGGACTGGTCTCTTTTGCCCCTGTGTACTCTA
TGGGCGTAACATCGAAGCCGTGAGGGAAGAGATTCCCTGGACTCAACCATGTGTGTGCCA
TGCTGCCTGTGTTGAGGGAGGAATGGCACTTGCAGCCGTAACCGCACTCTTTAGTGGCTA
CATTGATCCTCAAACAACAGTCGTCATATGCGAAGGCCTCTTCTTTGCGTGGTGGATGTG
TGGAATCTACTCAGGCTTGTTCCGCCAAGAACTCCAGAAGAAGTATCATCTCAAGAATGC
GCCGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTGGTGCGCTCTGTGTCAAGAACA
CAGGGAGATGAGGAATCATCTTTCTGATGCAGATGCTTCGTCTTCAACTACTATGGATCC
TCCTCCAGTTCAAGCAATGAACACCGAAGGGAACAAAGACGCTTCATTTTTTTTTTCGTC
ATCATCGTCTCCATCATCTGCCAAAAGCCAACACAATGATCTCGAGATGGTCCCTCTTTA
GAAAACATTCCTTGTCATTTTTGCTACGTAGCTGTCAACGTTTTTGTGCAGAGAAGTTTT
CTTACCAGCTGATTATGTTGGTTTTACAGATTCAAGTTTGTCCTAAGAACAAGTTCATTA
GTATTTTTTTTACCTTTTACTGAACTTAACGTCTGAGGTCATTGAATGTCTTTGGATATG
GAAGTAAATTATTTATTTTAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C127TF U 1
AF RR4BU69TF U 1
AF RR4C127JQ C 521
AF RR4BU69JQ C 514
BS 1 681 RR4BU69TF
BS 682 682 RR4BU69JQ
BS 683 706 RR4BU69TF
BS 707 707 RR4BU69JQ
BS 708 736 RR4BU69TF
BS 737 737 RR4BU69JQ
BS 738 747 RR4BU69TF
BS 748 1043 RR4BU69JQ

RD RR4C127TF 284 0 0
GGGACATCGATGGATGATTGGAAACGACGACTCACGCATTTCGAAACGTTTGGAGAAATT
TCTCTTGAGAGACTAATCAGACCTTTCTTCTTGACCAGTTTCGATGGCAGAGGGAAGCGC
CGCTTCGCGTTACGTGAAATTGAGGAAAGGGCAGGCTCCTGTGGAAGATATCACCCCCGG
CGAACTCAACCAGCCCATTGATGTTCCTCAGTTGAACGTTCGCAAGTGCCCTGAATGTAT
GCAAGTTCTTCCTGAAACCTATGAACCTCCTTCTGATGAAAACT

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4BU69TF 747 0 0
GGGACATCGATGGATGATTGGAAACGACGACTCACGCATTTCGAAACGTTTGGAGAAATT
TCTCTTGAGAGACTAATCAGACCTTTCTTCTTGACCAGTTTCGATGGCAGAGGGAAGCGC
CGCTTCGCGTTACGTGAAATTGAGGAAAGGGCAGGCTCCTGTGGAAGATATCACCCCCGG
CGAACTCAACCAGCCCATTGATGTTCCTCAGTTGAACGTTCGCAAGTGCCCTGAATGTAT
GCAAGTTCTTCCTGAAACCTATGAACCTCCTTCTGATGAAAACTGGACCACTGGCATTTT
TGCTTGCGCTGAAGACCCCGACAGCTGTAGGACTGGTCTCTTTTGCCCCTGTGTACTCTA
TGGGCGTAACATCGAAGCCGTGAGGGAAGAGATTCCCTGGACTCAACCATGTGTGTGCCA
TGCTGCCTGTGTTGAGGGAGGAATGGCACTTGCAGCCGTAACCGCACTCTTTAGTGGCTA
CATTGATCCTCAAACAACAGTCGTCATATGCGAAGGCCTCTTCTTTGCGTGGTGGATGTG
TGGAATCTACTCAGGCTTGTTCCGCCAAGAACTCCAGAAGAAGTATCATCTCAAGAATGC
GCCGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTGGTGCGCTCTGTGTCAAGAACA
CAGGGAGATGAGGAATCATCTCTCTGATGCAGATGCTTCGTCTTCA*CTACTATGGATCC
TCCTCCAGTTCAAGCA*TGAACACCGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4C127JQ 262 0 0
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AAGTATCATTTCAAGAATGCGCCGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTGG
TGCGCTCTGTGTCAAGAACACAGGGAGATGAGGAATCATCTTTTTGATGCAGATGCTTCG
TCTTCAACTACTATGGATCCTCCTCCAGTTCAAGCAATGAACACCGAAGGGAACAAAGAC
GCTTCATTTTTTTTTTCGTCAT

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DS 

RD RR4BU69JQ 530 0 0
AGGCCTT
TTCTTTGCGTGGTGGATGTGTGGAATCTATTCAGGCTTGTTCCGCCAAGAACTCCAGAAG
AAGTATCATCTCAAGAATGCGCCGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTGG
TGCGCTCTGTGTCAAGAACACAGGGAGATGAGGAATCATCTTTCTGATGCAGATGCTTCG
TCTTCAACTACTATGGATCCTCCTCCAGTTCAAGCAATGAACACCGAAGGGAACAAAGAC
GCTTCATTTTTTTTTTCGTCATCATCGTCTCCATCATCTGCCAAAAGCCAACACAATGAT
CTCGAGATGGTCCCTCTTTAGAAAACATTCCTTGTCATTTTTGCTACGTAGCTGTCAACG
TTTTTGTGCAGAGAAGTTTTCTTACCAGCTGATTATGTTGGTTTTACAGATTCAAGTTTG
TCCTAAGAACAAGTTCATTAGTATTTTTTTTACCTTTTACTGAACTTAACGTCTGAGGTC
ATTGAATGTCTTTGGATATGGAAGTAAATTATTTATTTTAGCC

QA 8 530 8 530
DS 



AS 1 4

CO CL2109Contig1 1069 4 20 U
GTAAAAAAGGAAGACACTTTATTATTTTTTTTCTGAAAATAACCAAAAGTACATGACTAA
AGAACCTAAAATAAGAAAAAAAAGCCCTAATGGGAAGAGGGACCCAAATAAGAGTTAGTA
GATCTTGACGTGGCAAGTGCAGCGAAGTAGAGGAAGGAAGTAGCGATCGTCGTAGAAGAC
CAAAATGACATCAGAACACTCATTTCTCATGTTGACGAAAATGTTGCAGCATTGGTCACT
TACACGAAATCTCCCTGTGTAGTAACTTAGCTCTATCTGTTGCTTACATACTGCAGACGG
CCCAAATTCGGCCATGCAGTTAATGAAATGTACCCACGGATTCCAATTCTGATAATGAGG
CCATGGAGTTGATGGCGTTGTTGGCTCTTTTGGAGGAGATTGTGCTGGGATTGATTCGTG
TGGCGGTGGTGGAGAGGGAATGATCAGAGTGGAGGTTTTAGGAAGTGGGGGAGACTGATT
TGGAGTCAGAGATGATGGGTTAGGAGGTGGAGGAGACTTTTTTAGAGCTGGACGCGGAGG
TGGTGGTGTAGGTGATGGCGGAGACTTTTT*AGGAGTCGGTTGAGGGGATGGTTTATAAG
GCGGAGGAGACTTTTTT*GGAGCTGGAGGCGGAGGTGAGGGTTTAGGAGGCGGAGGTGAT
TGTTTAGGAGGTGGAAGAGATGGGTTAGGAGGTGGAGGAGACTTCTTTGGAGTTGGACGT
GGAGGTGAGGGTTTAAGTGGTGGCGGAGCCGTCTTAGGAGCCGTGGGAGATGACGGAGTT
GTTGGCTCTCGTGAGGGTGGTTGAGGAGGTGAAGGGTAACTAATAGAAATGGCGGCTCCA
GATCCGTTGTTATGGGTACATTTCCATACTTTGGAATCTCCGAAATTGAATTTACCAGCG
TATAAGTGGGGTTGTGGTTGGCCGGCATTCATCAGGTACTCCTCATTAGAGACTTCTGAA
GGTTTTGGCCAAACTCCCATCGCTGTGGACGGTGGAACAATGACATAGAGGAGAGCTACG
ACGACGATAATGAGGCTTTTCATTGTTGACTGTGTGCGAAATGAATTCC


BQ
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AF RR4G703JQ U 32
AF RR4GF42JQ U 1
AF RR4B514TF C 259
AF RR4G703TF C 487
BS 1 110 RR4GF42JQ
BS 111 111 RR4G703JQ
BS 112 330 RR4GF42JQ
BS 331 332 RR4G703JQ
BS 333 396 RR4GF42JQ
BS 397 397 RR4G703JQ
BS 398 535 RR4GF42JQ
BS 536 536 RR4B514TF
BS 537 542 RR4GF42JQ
BS 543 543 RR4B514TF
BS 544 570 RR4GF42JQ
BS 571 571 RR4B514TF
BS 572 581 RR4GF42JQ
BS 582 582 RR4B514TF
BS 583 617 RR4GF42JQ
BS 618 618 RR4B514TF
BS 619 642 RR4GF42JQ
BS 643 757 RR4B514TF
BS 758 759 RR4G703TF
BS 760 1069 RR4B514TF

RD RR4G703JQ 490 0 0
CTGA
AAAATAACCAAAAGTACATGACTAAAGAACCTAAAATAAGAAATAAA*GCCCTAATGG*A
AGAGGGACCCAAATAAGAGTTAGTAGATCTTGACGTGGCAAGTGCAGCGAAGTAGGGGAA
GGAAGTAGCGATCGTCGTAGAAGCCCAAAATGACATCAGAACACTCATTTCTCATGTTGA
CGAAAATGTTGCAGCATTGGTCAGTTACACGAAATCTCCCTGTGTAGTAACTTAGCTCTA
TCTGTTGCTTACATACTGCAGACGGCCCATATTCGGCCATGCAGTTAATGAGATGTACCC
ACGGATTCCAATTCTGATAATGAGGCCATGGAGTTGATGGCGTTGTTGGCTCTTTTGGAG
GAGATTGTGCTGGGATTGATTCGTGTGGCGGTGGTGGAGAGGGAATGATCAGAGTGGAGG
TTTTAAGAAGTGGGGGAGACTGATTTGGAGTCAGAGATGATGGGTTAGGAGGTGGAGGAG
ACTTTT

QA 5 490 5 490
DS 

RD RR4GF42JQ 642 0 0
GTAAAAAAGGAAGACACTTTATTATTTTTTTTCTGAAAATAACCAAAAGTACATGACTAA
AGAACCTAAAATAAGAAAAAAAAGCCCTAATGGGAAGAGGGACCCAAATAGGAGTTAGTA
GATCTTGACGTGGCAAGTGCAGCGAAGTAGAGGAAGGAAGTAGCGATCGTCGTAGAAGAC
CAAAATGACATCAGAACACTCATTTCTCATGTTGACGAAAATGTTGCAGCATTGGTCACT
TACACGAAATCTCCCTGTGTAGTAACTTAGCTCTATCTGTTGCTTACATACTGCAGACGG
CCCAAATTCGGCCATGCAGTTAATGAAATGCCCCCACGGATTCCAATTCTGATAATGAGG
CCATGGAGTTGATGGCGTTGTTGGCTCTTTTGGAGGGGATTGTGCTGGGATTGATTCGTG
TGGCGGTGGTGGAGAGGGAATGATCAGAGTGGAGGTTTTAGGAAGTGGGGGAGACTGATT
TGGAGTCAGAGATGATGGGTTAGGAGGTGGAGGAGACTTTTTTAGAGCTGGACGCAGAGG
TGATGGTGTAGGTGATGGCGGAGACTTTTTTAGGAGTCGGTGGAGGGGATGGTTTATAAG
GCGGAGGAGACTTTTTTTGGAGCTGGAGGCGGAGGTGAGGGT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4B514TF 811 0 0
GTAGTAACTTAGCTCTATCTGTTGCTTACATACTGCAGACGGCCCAAATTCGGCCATGCA
GTTAATGAAATGTACCCACGGATTCCAATTCTGATAATGAGGCCATGGAGTTGATGGCGT
TGTTGGCTCTTTTGGAGGAGATTGTGCTGGGATTGATTCGTGTGGCGGTGGTGGAGAGGG
AATGATCAGAGTGGAGGTTTTAGGAAGTGGGGGAGACTGATTTGGAGTCAGAGATGATGG
GTTAGGAGGTGGAGGAGACTTTTTTAGAGCTGGACGCGGAGGTGGTGGTGTAGGTGATGG
CGGAGACTTTTT*AGGAGTCGGTTGAGGGGATGGTTTATAAGGCGGAGGAGACTTTTTT*
GGAGCTGGAGGCGGAGGTGAGGGTTTAGGAGGCGGAGGTGATTGTTTAGGAGGTGGAAGA
GATGGGTTAGGAGGTGGAGGAGACTTCTTTGGAGTTGGACGTGGAGGTGAGGGTTTAAGT
GGTGGCGGAGCCGTCTTAG**GCCGTGGGAGATGACGGAGTTGTTGGCTCTCGTGAGGGT
GGTTGAGGAGGTGAAGGGTAACTAATAGAAATGGCGGCTCCAGATCCGTTGTTATGGGTA
CATTTCCATACTTTGGAATCTCCGAAATTGAATTTACCAGCGTATAAGTGGGGTTGTGGT
TGGCCGGCATTCATCAGGTACTCCTCATTAGAGACTTCTGAAGGTTTTGGCCAAACTCCC
ATCGCTGTGGACGGTGGAACAATGACATAGAGGAGAGCTACGACGACGATAATGAGGCTT
TTCATTGTTGACTGTGTGCGAAATGAATTCC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4G703TF 583 0 0
CAGAGATGATGGGTTAGGAGGTGGAGGAGACTTTTTTAGAGCTGGACGCGGAGGTGGTGG
TGTAGGTGATGGCGGAGACTTTTT*AGGAGTCGGTTGAGGGGATGGTTTATAAGGCGGAG
GAGACTTTTTT*GGAGCTGGAGGCGGAGGTGAGGGTTTAGGAGGCGGAGGTGATTGTTTA
GGAGGTGGAAGAGATGGGTTAGGAGGTGGAGGAGACTTCTTTGGAGTTGGACGTGGAGGT
GAGGGTTTAAGTGGTGGCGGAGCCGTCTTAGGAGCCGTGGGAGATGACGGAGTTGTTGGC
TTTCGTGAGGGTGGTTGAGGAGGTGAAGGGTAACTAATAGAAATGGCGGCTCCAGATCCG
TTGTTATGGGTACATTTCCATACTTTGGAATCTCCGAAATTGAATTTACCAGCGTATAAG
TGGGGTTGTGGTTGGCCGGCATTCATCAGGTACTCCTCATTAGAGACTTCTGAAGGTTTT
GGCCAAACTCCCATCGCTGTGGACGGTGGAACAATGACATAGAGGAGAGCTACGACGACG
ATAATGAGGCTTTTCATTGTTGACTGTGTGCGAAATGAATTCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL2110Contig1 1085 2 2 U
TTTTTGGGTACTGTATCTCGCGAGGTTTTACAGAGATCTCTGTCTTAACATGGATTCGAT
GGTGACTCAAAAGACTGTTTTGGCTGTGACGGATGATGTGGTGTTGCCTGTTAGCTCTGT
TCTGACCATAATTAAGGAACTCGCAAAAGAAGGGATTGAGCGTTGTGATCCTTTGATCAT
TACTCAAGCTTCCACAATAAATCAGGTTCCTTTGGATGCTTCCTCAGTGGACTTGGTTCT
AGCCGTTTCCAGAACATCTGATTTTCCAAGTGACAAAATCTATAGCGAGTTCTCAAGAGT
TCTGAAGCCTGGTGGTTCTGTTTTTGTCTGCACGAACTCGGAGGGTGAAACTATAGAATT
GCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACCTTGGCTGGTTTTCTGGAGCCACAGTCCCTTGA
TTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTCAGCTTAGCCGTTGGGATTAAGGCAAACAAACC
TACTTGGAAGATTGGTTCATCATTTGCTCCCAAGAAGCCTGCAAAAGCTCTCCCGAAGGT
TAATCTAGGCGATGCCTTGGATCTTATTGATGATCTTATTGATGAGGACTCTCTCTTAAC
AGAGGAGGACCTCAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGTGAGACCACTAAGAA
AGCTTGCAAGAATTGTGTCTGTGGTAGAGCTGAGATAGAGGAGAAAGCTGTGAAGTTAGG
ACTCACCGAGGATCAAATCGAGAATCCACAGTCAGCATGTGGCAGCTGTGGACTCGGTGA
TGCCTTTCGCTGCGGTACATGCCCTTACAAGGGTCTCCCACCTTTCAAACTAGGCGAGAA
GGTAACCCTATCTCAAAACTTCCTTGAAGCTGACATATAAGCCTGTGCAAAGGTTTTCAT
GCGTGCTTGTTTCTCTCACCGAAGCCAAAACCTTTTGTTAAACACAGAGTAGTTTGATCA
CTTTGTGTCGTCTCTATATTTTCTTTGTTGGTACTTTTGTTTCTCGGCTTTTGAAATGGT
CTTAGTAGACAAGTGTTGCTCACAATACACATTATAACCTTGATATCAATGAAGAACAGC
TTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4G943TF U 1
AF RR4G943JQ C 329
BS 1 696 RR4G943TF
BS 697 1085 RR4G943JQ

RD RR4G943TF 696 0 0
TTTTTGGGTACTGTATCTCGCGAGGTTTTACAGAGATCTCTGTCTTAACATGGATTCGAT
GGTGACTCAAAAGACTGTTTTGGCTGTGACGGATGATGTGGTGTTGCCTGTTAGCTCTGT
TCTGACCATAATTAAGGAACTCGCAAAAGAAGGGATTGAGCGTTGTGATCCTTTGATCAT
TACTCAAGCTTCCACAATAAATCAGGTTCCTTTGGATGCTTCCTCAGTGGACTTGGTTCT
AGCCGTTTCCAGAACATCTGATTTTCCAAGTGACAAAATCTATAGCGAGTTCTCAAGAGT
TCTGAAGCCTGGTGGTTCTGTTTTTGTCTGCACGAACTCGGAGGGTGAAACTATAGAATT
GCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACCTTGGCTGGTTTTCTGGAGCCACAGTCCCTTGA
TTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTCAGCTTAGCCGTTGGGATTAAGGCAAACAAACC
TACTTGGAAGATTGGTTCATCATTTGCTCCCAAGAAGCCTGCAAAAGCTCTCCCGAAGGT
TAATCTAGGCGATGCCTTGGATCTTATTGATGATCTTATTGATGAGGACTCTCTCTTAAC
AGAGGAGGACCTCAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGTGAGACCACTAAGAA
AGCTTGCAAGAATTGTGTCTGTGGTAGAGCTGAGAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4G943JQ 757 0 0
TGCACGAACTCGGAGGGT
GAAACTATAGAATTGCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACCTTGGCTGGTTTTCTGGAG
CCACAGTCCCTTGATTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTCAGCTTAGCCGTTGGGATT
AAGGCAAACAAACCTACTTGGAAGATTGGTTCATCATTTGCTCCCAAGAAGCCTGCAAAA
GCTCTCCCGAAGGTTAATCTAGGCGATGCCTTGGATCTTATTGATGATCTTATTGATGAG
GACTCTCTCTTAACAGAGGAGGACCTCAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGT
GAGACCACTAAGAAAGCTTGCAAGAATTGTGTCTGTGGTAGAGCTGAGATAGAGGAGAAA
GCTGTGAAGTTAGGACTCACCGAGGATCAAATCGAGAATCCACAGTCAGCATGTGGCAGC
TGTGGACTCGGTGATGCCTTTCGCTGCGGTACATGCCCTTACAAGGGTCTCCCACCTTTC
AAACTAGGCGAGAAGGTAACCCTATCTCAAAACTTCCTTGAAGCTGACATATAAGCCTGT
GCAAAGGTTTTCATGCGTGCTTGTTTCTCTCACCGAAGCCAAAACCTTTTGTTAAACACA
GAGTAGTTTGATCACTTTGTGTCGTCTCTATATTTTCTTTGTTGGTACTTTTGTTTCTCG
GCTTTTGAAATGGTCTTAGTAGACAAGTGTTGCTCACAATACACATTATAACCTTGATAT
CAATGAAGAACAGCTTTTC

QA 19 757 19 757
DS 



AS 1 3

CO CL2111Contig1 877 3 6 U
CACAAAAAGAGGAGGTTGATTATAGTTATTTATATAAAACTTACAAGAACATCCAGAGCA
ATAACTTTATTGTTTATAGAAATGCGAAATCTCTATCTTTTATATAAAAGCAAAAGATTA
TTCATTTGAAACGCAGAGGAAGACAAAGACAACTCTCTTTACACAAATTGTATTTTCATG
ATTTCTTTTTCCTGTTTAGTAAAATCATTACAAATCCCAAATACCTGAAAAAACTATAAT
CCATCTTCATGTCCTCACAAGAGGCAGAAATTAATGCTGCACTCAGTGACCATTGGACGG
CCTGAACTCAGTGTAGCCATTAGTCCCTGAAGAAAAACTCTGATTCCAAGAGTCCAAACC
AAAGTATGTGTTACGGTATGATGCTGTGTCTTCCATGTTACTACTATTCCTCATAGCTAG
TAAAGACAAGTCCATGTTTGCCATTTGCCACTGCGTCTCTCCATATGGTCCACGTGGCAT
GTAGTGGAATCCTTCATCTCCAAAACTCCTGGACCTGCCACTGGACAATAACTCACCTGA
TATGCCTAAATCACCACCATGGTAAGAATATTGACCGTTGAACAGCTGGGGTTGAGAATT
GTATATGCTTCCATTATACACCATATTGCTGCAGTTTTCATCTTCCAGCAGGTCGTTGAT
GATGTCGAGGTGAGGGAACTCGTCGGTCATCAAGCTTTGTGCTTGTTGTCGCGCCATCTC
AGTATCAGTATGGTTCAGAGAACTGTTGCTAGTCACAGCGGGTGTGTAACGATTGTTCAT
ACCGGTATGTACAGAATTTAAACTCCTTGATTGAAAGAGCCCATCCTGACTGAGAGGGAA
GCTCGACTGATAAGCCGGTGTTTGTGTGTAAGATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU80JQ U 104
AF RR4E157JQ U 1
AF RR4GO27JQ U 106
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GTAA
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AAAAAACTATAATCCATCTTCATGTCCTCACAAGAGGCAGAAATTAATGCTGCACTCAGT
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ATAACTTTATTGTTTATAGAAATGCGAAATCTCTATCTTTTATATAAAAGCAAAAGATTA
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ATTTCTTTTTCCTGTTTAGTAAAATCATTACAAATCCCAAATACCTGAAAAAACTATAAT
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GTATATGCTTCCATTATACACCATATTGCTGCAGTTTTCATCTTCCAGCAGGTCGTTGAT
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DS 

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AG
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AAAAAACTATAATCCATCTTCATGTCCTCACAAGAGGCAGAAATTAATGCTGCACTCAGT
GACCATTGGACGGCCTGAACCCAGTGTAGCCATTAGTCCCTGAAGAAAAACTCTGATTCC
AAGAGTCCAAACCAAAGTATGTGTTACGGTATGATGCTGTGTCTTCCATGTTACTACTAT
TCCTCATAGCTAGTAAAGACAAGTCCATGTTTGCCATTTGCCACTGCGTCTCTCCATATG
GTCCACGTGGCGTGTAGTGGAATCCTTCATCTCCAAAACTCCTGGACCTGCCACTGGACA
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GGGGTTGAAAATTGGATATGATTCCATTATACACCATATTGCTGCAGTTTTCATCTTCCA
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QA 3 772 3 772
DS 



AS 1 5

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TGTACATACGAGCCAAGAGTTTAGAATATTTTGTGATCTTAGGTGTTAGATAAAGCCTGT
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AATAGACTAATGGTTCTGTTATAGATCTTTGGGCATGTGATCAGCCTGTGATTATTGTAA
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GCATGTATAAAGATTTTTTGTTTGTTTCTTTCTTTTGATTCTTGAACATGGTTCATATTA
AATGCAGAGGGGAAAGATAGAGACGAGAGAAGAACGTTGTTGATCTTGACTCTTGATGGA
ACTTGAATCATGTGAATGTCCTTTTCCGTTTATTAACTATTTCTAGGATAATATCATATA
TATAATTTTCGTAAAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C073TF U 1
AF RR4C085TF U 426
AF RR4C132TF U 1
AF RR4C132JQ C 529
AF RR4C073JQ C 1154
BS 1 595 RR4C073TF
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RD RR4C073TF 595 0 0
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TCAGAGGTTAAAGCAAATGGATCCAATTAATCTAGAAACGGTATGTGGCAATCGTCATCT
GGCTCAAGAGTCAAAAGAACATTATCTTAATTTTGTCGCTTGACAATGTTCTTTGTTCAT
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TATGATTGCTCTGTTTTTTTTATACAGCGGAGGTTCATATCATCATACAAAGGTGAATAG
AGAGACTAGGTTAGGTACAATGAGGAGCGAGAGAGGAAGTGAACACTGCTACTCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4C085TF 202 0 0
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TTGCTCTGTGTTTTTTATACAGCGGAGGTTCATATCATCATACAAAGGTGAATAGAGAGA
CTAGGTTAGGTACAATGAGGAGCGAGAGAGGAAGTGAACACTGCTACTCTCTTTCTCTTC
ACGTGTCGAACTCTCATTGACC

QA 1 202 1 202
DS 

RD RR4C132TF 698 0 0
GGCAGCACTACTAGTACTAGTATTAGAGATAATGGGCAGAGGACGAGAACCGTTACGCAG
ACGGACGACCATAAGGGTACAATGATCCTCTGTTTCTCTGCAATATATACTCTGATTACG
GATTTTTGTCTGCAATATGTTGTGCTGATTACTGTGTTTGTGTACAGTGATGATGCCGAA
TTTCGCTCAAGTGTACAGCTTTATAGGAAGTGTATTTGATCCACAAACAACTGGTCATGT
TCAGAGGTTAAAGCAAATGGATCCAATTAATCTAGAAACGGTATGTGGCAATCGTCATCT
GGCTCAAGAGTCAAAAGAACATTATCTTAATTTTGTCGCTTGACAATGTTCTTTGTTCAT
TAGGTCCTCTTATTGATGAGAAACTTGTCTGTAAACCTGACAAGCCCCGAGTTTGAAGAA
CAAGTAAGTGTTACTCCTCGCTTCAGATTGTTTGTTATATCTTCATTTTTGGCTTACGGG
TATGATTGCTCTGTTTTTTTTATACAGCGGAGGTTCATATCATCATACAAAGGTGAATAG
AGAGACTAGGTTAGGTACAATGAGGAGCGAGAGAGGAAGTGAACACTGCTACTCTCTTTC
TCTTCACGTGTCGAACTCTCATTGACCGGTACTGGACCAAATGAGTGAGGCGGTTGTACT
TGTACATACGAGCCA*GAGTTTAGAATATTTTGTGATC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4C132JQ 804 0 0
CAAAGGTG
ATAGAGAGACTAGGTTAGGTACAATGAGGAGCGAGAGAGGAAGTGAACACTGCTACTCTC
TTTCTCTTCACGTGTCGAACTCTCATTGACCGGTACTGGACCAAATGAGTGAGGCGGTTG
TACTTGTACATACGAGCCAAGAGTTTAGAATATTTTGTGATCTTAGGTGTTAGATAAAGC
CTGTGTAGAAAGATGTAATAGATATAGCATGTGTTTTATAATATCCAGTCGCTACTCGTT
TAAGTTTTTTTTTTTTTATCTTTAAATATATATGGAATGGACTATGACGATCCTGGTTTT
TCAAGGCTCTGAAGGCTGAACACTCTTGGTCATGTGTCTTTATGTTTCACGTTACTGTTA
TAAATGGGATTAACCTACTAAAACATATCAAAGAATAACTGAATTAAAATGGGCTGTGTA
GAAAAGGGTTTAACGCCCAAAAGCACAGGGAAGACCTCAGGGAACTTACGCGCATTCAAC
AACGAATAGACTAATGGTTCTGTTATAGATCTTTGGGCATGTGATCAGCCTGTGATTATT
GTAATACTCCATGTGTTATGATTCTCTGTCTCTTAATGCTGGTAAAGAAATGCATGCACT
CTTCGCATGTATAAAGATTTTTTGTTTGTTTCTTTCTTTTGATTCTTGAACATGGTTCAT
ATTAAATGCAGAGGGGAAAGATAGAGACGAGAGAAGAACGTTGTTGATCTTGACTCTTGA
TGGAACTTGAATCATGTGAATGTCCTTTTCCGTTTATTAACTATTTCTAGGATAATATCA
TATATATAATTTTCGT

QA 9 804 9 804
DS 

RD RR4C073JQ 186 0 0
TTTTTTGTTTGTTTCTTTCTTTTGATTCTTGAACATGGTTCATATTAAATGCAGAGGGGA
AAGATAGAGACGAGAGAAGAACGTTGTTGATCTTGACTCTTGATGGAACTTGAATCATGT
GAATGTCCTTTTCCGTTTATTAACTATTTCTAGGATAATATCATATATATAATTTTCGTA
AAAAAA

QA 1 186 1 186
DS 



AS 1 4

CO CL2113Contig1 689 4 10 U
GGAGAGACAAGAGGAAAGTAAAAAGAGAATCTGGTGGGGAGAGAGAGGATTGATTGATTG
AATATCATCAAATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTA
AAACAATTCATTTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAG
ACTTTGCTAAACCTACTGACAAAATATCATACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTG
GAGTTATCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTCTTTAGCG
TCAATGTTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGTTCGTAAAATCAAAAACGATT
TTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAAA*CAAGAA
GATGAAAACATCAAAGGAAAGATGGGATGTCATCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCT
AGTTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTCAAGGGTCGATTTACTACG
AAATAAGTTCATCTTTTTAATACCCATAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTA
TGGGAACTTTGTTTCAGTGAGCTTCTCCTGCGGCTGTGATAAGTACCTTATAAGCTCTTC
TTCCCTTTCTATACAATAACAGTCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H631TF U 1
AF RR4CN47JQ C 31
AF RR4CN47TF U 113
AF RR4EW31TF U 187
BS 1 182 RR4H631TF
BS 183 183 RR4CN47TF
BS 184 207 RR4H631TF
BS 208 208 RR4CN47TF
BS 209 339 RR4H631TF
BS 340 340 RR4CN47TF
BS 341 538 RR4H631TF
BS 539 539 RR4CN47TF
BS 540 650 RR4H631TF
BS 651 689 RR4EW31TF

RD RR4H631TF 650 0 0
GGAGAGACAAGAGGAAAGTAAAAAGAGAATCTGGTGGGGAGAGAGAGGATTGATTGATTG
AATATCATCAAATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTA
AAACAATTCATTTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAG
ACATTGCTAAACCTACTGACAAAATAT*ATACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTG
GAGTTATCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTCTTTAGCG
TCAATGTTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGCTCGTAAAATCAAAAACGATT
TTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAAA*CAAGAA
GATGAAAACATCAAAGGAAAGATGGGATGTCATCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCT
AGTTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTCAAGGGTCGATTTACTATG
AAATAAGTTCATCTTTTTAATACCCATAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTA
TGGGAACTTTGTTTCAGTGAGCTTCTCCTGCGGCTGTGATAAGTACCTTA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4CN47JQ 585 0 0
GG
GGTGGGGAGAGAGAGGATTGATTGATTGAATATCATCAAATGGCGACATCGAGGCTTCAA
GCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTAAAACAATTCATTTCTGGGCGCCAACGTTCAAG
TGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAGACTTTGCTAAACCTACTGACAAAATATCATAC
CCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTGGAGTTATCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATC
ACTCCCAAAAACTGGAACCTCTTTAGCGTCAATGTTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTAC
CAGCTTGTTCGTAAAATCAAAAACGATTTTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCCAAA
GAATGATTACGACGAAAAAAA*CAAGAAGATGAAAACATCAAAGGAAAGATGGGATGTCA
TCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCTAGTTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATT
CTCAGATCTCAAGGGTCGATTTACTACGAAATAAGTTCATCTTTTTAATACCCATAAACG
CTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTATGGGAACTTTGTTTC

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR4CN47TF 503 0 0
CGGTCCTAAAACAATTCATTTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAA
CATTGCAGACTTTGCTAAACCTACTGACAAAATATCATACCCTCAACAGATTGCTGTTAC
ATGCACTGGAGTTATCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCT
CTTTAGCGTCAATGTTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGTTCGTAAAATCAA
AAACGATTTTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAA
A*CAAGAAGATGAAAACATCAAAGGAAAGATGGGATGTCATCTCCATATTGCTTGTGTTT
GAAAATCTAGTTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTCAAGGGTCGAT
TTACTACGAAATAAGTTCATCTTTTTAATACCCATAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGC
GGTATCTATGGGAACTTTGTTTC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4EW31TF 503 0 0
CTAAACCTACTGACAAAATATCATACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTGGAGTTA
TCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTCTTTAGCGTCAATG
TTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGCTCGTAAAATCAAAAACGATTTTGCAT
CTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAAAACAAGAAGATGAA
AACATCAAAGGAAAGATGGGATGTCATCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCTAGTTTC
ATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTCAAGGGTCGATTTACTATGAAATAA
GTTCATCTTTTTAATACCCCTAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTATGGGAA
CTTTGTTTCAGTGAGCTTCTCCTGCGGCTGTGATAAGTACCTTATAAGCTCTTCTTCCCT
TTCTATACAATAACAGTCTTCTC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 2 5

CO CL2114Contig1 393 3 3 U
GGGTTCTCGCGGCTTTAGCTTAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGATA
TTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAA
GCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCT
TTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGTGTGTGCAAG
ACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGATGATCAATCTTCTTTGCCGTTTTATATTTGTCCTA
GAAGAATATGCTTTGTGTCCTCGTTAAATTAAACCTAGACTTTTCAGTATGCTCCAGTGT
GACTGTTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D021JQ C 1
AF RR4D021TF U 1
AF RR4AO31TF U 7
BS 1 8 RR4D021JQ
BS 9 387 RR4D021TF
BS 388 393 RR4AO31TF

RD RR4D021JQ 387 0 0
GGGTTCTCGCGGCTTTAGCTTAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGATA
TTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAA
GCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCT
TTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGTGTGTGCAAG
ACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGATGATCAATCTTCTTTGCCGTTTTATATTTGTCCTA
GAAGAATATGCTTTGTGTCCTCGTTAAATTAAACCTAGACTTTTCAGTATGCTCCAGTGT
GACTGTTTATGAATTGATTCAGTTTTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4D021TF 387 0 0
GGGTTCTC
GCGGCTTTAGCTTAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGATATTAAGGAC
TTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGAC
ATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAA
GAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGTGTGTGCAAGACCTTTGA
AGATGAAGATGCCTTGATGATCAATCTTCTTTGCCGTTTTATATTTGTCCTAGAAGAATA
TGCTTTGTGTCCTCGTTAAATTAAACCTAGACTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGTTT
ATGAATTGATTCAGTTTTT

QA 9 387 9 387
DS 

RD RR4AO31TF 387 0 0
GG
GCGGCTTTAGCTTAAACAACAGGTCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGATATTAAGGAC
TTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGAC
ATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAA
GAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGTGTGTGCAAGACCTTTGA
AGATGAAGATGCCTTGATGATCAATCTTCTTTGCCGTTTTATATTTGTCCTAGAAGAATA
TGCTTTGTGTCCTCGTTAAATTAAACCTAGACTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGTTT
ATGAATTGATTCAGTTTTTAATATC

QA 3 387 3 387
DS 



CO CL2114Contig2 379 2 1 U
GGAACAGATCCGACAATTCCTAAGCAAATCCACGATATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCG
AGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAG
GTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAG
CTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTT
GGTGATCAATCTTCTGTGCCATTTTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCT
CGTAGTGAAATTAAACCTAGAGTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGAT
TCAGTTTTTAATATCAGAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DE35TF U 1
AF RR4DJ89TF U 1
BS 1 379 RR4DE35TF

RD RR4DE35TF 379 0 0
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AGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAG
GTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAG
CTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTT
GGTGATCAATCTTCTGTGCCATTTTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCT
CGTAGTGAAATTAAACCTAGAGTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGAT
TCAGTTTTTAATATCAGAT

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR4DJ89TF 379 0 0
GG
AACAGATCCGACAATTCCTAAGCAAATCCACGATATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAG
GAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGT
CAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCT
TAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGG
TGATCAATCTTCTGTGCCATTTTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCTCG
TAGTGAAATTAAACCTAGAGTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTC
AGTTTTTAATATC
AGAT

QA 3 375 3 375
DS 



AS 1 5

CO CL2115Contig1 1181 5 11 U
GGGATCTTTCTCTCGTAAACCCAATCATATAATTTTATTTTCCGTGAAAATGCATTTGAT
CTCTCCTTATTCTACGTCCACTTGGACAATCTTAGTCACATTGGCATGTCTTATGCTTCG
TGCGTCTTTGTCCGATGCTCAACTTACCCCTACCTTCTACGACAGTTCATGTCCAAACGT
CACTAACATCGTACGAGAAACCATTGCCAACGAGCTAAGATCGGACCCTCGTATCGCCGC
GAGCATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTCAATGGTTGTGACGCATCTATCTT
GTTAGACAACACGACATCATTCCGAACAGAGAAAGATGCAGCTGGAAACGCGAACTCGGC
TCGGGGGTTTCCTGTGATTGATAGAATGAAAGCCGCAGTGGAGAGGGCATGCCCGAGAAC
CGTTTCATGCGCAGATATGCTCACCATCGCAGCTCAACAATCGGTCACTTTGGCAGGAGG
TCCTTCATGGAGGGTTCCTTTGGGGAGAAGATACAGCTTACAAGCGTTTCTGAATCTATC
TAATGCAAATCTGCCAGCTCCATTCTTCACACTTCCACAACTTAAAGCCAGCTTTAGAAA
AGTTGGCCTCGACCGTCCTTCTGATCTCGTTGCTCTCTCCGGGGGTCACACATTTGGTAA
AAATCAATGCCGGTTCATTATGGACAGATTATACAACTTCAGCAACACCGGTTTACCCGA
TCCTACCCTCAACACTACTTACCTCCAAACTCTTCGTGGACTATGTCCCCGTACTGGTAA
CCTAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTACGTACGCCTACTGTTTTCGACAATAAGTACTA
TGTGAATCTCAAAGAACAGAAAGGTTTTATTCAGAGCGACCAGGAGTTGTTCTCTAGCCC
TAATGCTACTGACACAATCCCCTTGGTTAGAGCATATGCTGATGGCACACAAACATTTTT
CGATGCGTTTGTGGAGGCGATGAATAGGATGGGAAACATTACACCTCTTACGGGAACTCA
AGGACAGATTAGGTTGAACTGTAGGGTGGTGAATTCCAACTCTCTACTTCATGATGTTGT
TGATATCGTTGATTTTGTTAGCTCTATGTGAGAATAGTGACTCAATATGTGGCTATCAAA
AAGTATATGTATTAATAAATAAAGCTCTCTCAAGGTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4D949TF U 1
AF RR4CP68TF U 63
AF RR4CP68JQ C 434
AF RR4D949JQ C 506
AF RR4EQ56TF U 710
BS 1 318 RR4D949TF
BS 319 621 RR4CP68TF
BS 622 709 RR4CP68JQ
BS 710 865 RR4EQ56TF
BS 866 866 RR4CP68JQ
BS 867 957 RR4EQ56TF
BS 958 958 RR4CP68JQ
BS 959 1004 RR4EQ56TF
BS 1005 1005 RR4CP68JQ
BS 1006 1177 RR4EQ56TF
BS 1178 1181 RR4CP68JQ

RD RR4D949TF 318 0 0
GGGATCTTTCTCTCGTAAACCCAATCATATAATTTTATTTTCCGTGAAAATGCATTTGAT
CTCTCCTTATTCTACGTCCACTTGGACAATCTTAGTCACATTGGCATGTCTTATGCTTCG
TGCGTCTTTGTCCGATGCTCAACTTACCCCTACCTTCTACGACAGTTCATGTCCAAACGT
CACTAACATCGTACGAGAAACCATTGCCAACGAGCTAAGATCGGACCCTCGTATCGCCGC
GAGCATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTCAATGGTTGTGACGCATCTATCTT
GTTAGACAACACGACATC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4CP68TF 559 0 0
CTCCTTATTCTACGTCCACTTGGACAATCTTAGTCACATTGGCATGTCTTATGCTTCGTG
CGTCTTTGTCCGATGCTCAACTTACCCCTACCTTCTACGACAGTTCATGTCCAAACGTCA
CTAACATCGTACGAGAAACCATTGTCAACGAGCTAAGATCGGACCCTCGTATCGCCGCGA
GCATCCTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTTGTCAATGGTTGTGACGCATCTATCTTGT
TAGACAACACGACATCATTCCGAACAGAGAAAGATGCAGCTGGAAACGCGAACTCGGCTC
GGGGGTTTCCTGTGATTGATAGAATGAAAGCCGCAGTGGAGAGGGCATGCCCGAGAACCG
TTTCATGCGCAGATATGCTCACCATCGCAGCTCAACAATCGGTCACTTTGGCAGGAGGTC
CTTCATGGAGGGTTCCTTTGGGGAGAAGATACAGCTTACAAGCGTTTCTGAATCTATCTA
ATGCAAATCTGCCAGCTCCATTCTTCACACTTCCACAACTTAAAGCCAGCTTTAGAAAAG
TTGGCCTCGACCGTCCTTC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4CP68JQ 748 0 0
GATATGCTCACCATCGCAGCTCAACAATCGGTCACTTTGGCAGGAGGTCCTTCATGGAGG
GTTCCTTTGGGGAGAAGATACAGCTTACAAGCGTTTCTGAATCTATCTAATGCAAATCTG
CCAGCTCCATTCTTCACACTTCCACAACTTAAAGCCAGCTTTAGAAAAGTTGGCCTCGAC
CGTCCTTCTGATCTCGTTGCTCTCTCCGGGGGTCACACATTTGGTAAAAATCAATGCCGG
TTCATTATGGACAGATTATACAACTTCAGCAACACCGGTTTACCCGATCCTACCCTCAAC
ACTACTTACCTCCAAACTTTTCGTGGACTGTGTCCCCGTACTGGTAACCTAAGTGCCTTG
GTGGATTTTGATCTACGTACGCCTACTGTTTTCGACAATAAGTACTATGTGAATCTCAAA
GAACAGAAAGGTTTTATTCAGAGCGACCAGGAGTTGTTCTCTAGCCCTAATGCTACTGAC
ACAATCCCCTTGGTTAGAGCATATGCTGATGGCACACAAACATTTTTCGATGCGTTTGTG
GAGGCGATGAATAGGGTGGGAAACATTACACCTCTTACGGGAACTCAAGGACAGATTAGG
TTGAACTGTAGGGTGGTGAATTCCAACTCTCTACTTCATGATGTTGTTGATATCGTTGAT
TTTGTTAGCTCTATGTGAGAATAGTGACTCAATATGTGGCTATCAAAAAGTATATGTATT
AATAAATAAAGCTCTCTCAAGGTGCTAC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4D949JQ 676 0 0
AGAAGAGACAGCTTACAAGCGTTTCTGAATCTATCTAATGCAAATCTGCCAGCTCCATTC
TTCACACTTCCACAACTTAAAGCCAGCTTTAGAAAAGTTGGCCTCGACCGTCCTTCTGAT
CTCGTTGCTCTCTCCGGGGGTCACACATTTGGTAAAAATCAATGCCGGTTCATTATGGAC
AGATTATACAACTTCAGCAACACCGGTTTACCCGATCCTACCCTCAACACTACTTACCTC
CAAACTCTTCGTGGACTATGTCCCCGTACTGGTAACCTAAGTGCCTTGGTGGATTTTGAT
CTACGTACGCCTACTGTTTTCGACAATAAGTACTATGTGAATCTCAAAGAACAGAAAGGT
TTTATTCAGAGCGACCAGGAGTTGTTCTCTAGCCCTAATGCTACTGACACAATCCCCTTG
GTTAGAGCATATGCTGATGGCACACAAACATTTTTCGATGCGTTTGTGGGGGCGATGAAT
AGGATGGGAAACATTACACCTCTTACGGGAACTCAAGGACAGATTAGGTTGAACTGTAGG
GTGGTGAATTCCAACTCTCTACTTCATGATGTTGTCGATATCGTTGATTTTGTTAGCTCT
ATGTGAGAATAGTGACTCAATATGTGGCTATCAAAAAGTATATGTATTAATAAATAAAGC
TCTCTCAAGGTG
TTAC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4EQ56TF 472 0 0
GGTTTACCCGATCCTACCCTCAACACTACTTACCTCCAAACTCTTCGTGGACTATGTCCC
CGTACTGGTAACCTAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTACGTACGCCTACTGTTTTCGAC
AATAAGTACTATGTGAATCTCAAAGAACAGAAAGGTCTTATTCAGAGCGACCAGGAGTTG
TTCTCTAGCCCTAATGCTACTGACACAATCCCCTTGGTTAGAGCATATGCTGATGGCACA
CAAACATTCTTCGATGCGTTTGTGGAGGCGATGAATAGGATGGGAAACATTACACTTCTT
ACGGGAACTCAAGGACAGATTAGGTTGAACTGTAGGGTGGTGAATTCCAACTCTCTACTT
CATGATGTTGTTGATATCGTTGATTTTGTTAGCTCTATGTGAGAATAGTGACTCAATATG
TGGCTATCAAAAAGTATATGTATTAATAAATAAAGCTCTCTCAAGGTG
TTAC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 4

CO CL2116Contig1 971 4 26 U
GCAGATCATCAAGGACATGAGGGAGTTTAAGGAGAATAACAAAGTGGATAAGCTGGTTGT
CTTGTGGACAGCCAACACGGAGCGTTACAGCGATGTGGTTGTAGGGCTTAACGATACGAT
GGAGAATCTGTTGGCTTCTGTTGAGAAGAACGAGTCCGAGATCTCTCCTTCTACGCTTTA
TGCTATAGCTTGTGTTCTTGAAGGGATTCCTTTTATTAATGGGAGTCCTCAGAACACGTT
TGTTCCTGGACTCATCGAGCTGGCTATATCGAAGAACTGTTTGATCGGTGGGGATGATTT
CAAGAGTGGTCAGACTAAGATGAAGTCTGTTCTGGTCGATTTCCTCGTCGGAGCTGGCAT
CAAGCCTACTTCGATTGTGAACTATAATCATTTGGGAAACAATGACGGCATGAACCTCTC
AGCGCCGCAGACTTTCAGATCAAAGGAGATCTCGAAGAGCAATGTGGTAGACGACATGGT
GGCTAGTAACGGCATACTCTTTGAGCCTGGTGAACATCCTGACCATGTTGTTGTCATCAA
GTATGTACCTTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCTCCGAGATATT
CATGGG*AGGGAAGAACACAATTGTTATGCATAACACCTGTGAGGATTCTCTTTTGGCGG
CTCCAATCATCTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATCCAATTCAAAG
CCGAAGGAGAGGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTCAGTTACCTCA
CAAAAGCACCTCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGG
CTATGTTGGAGAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCACCAGAGAACAACATGATCT
TGGAGTACAAGTGACAAGGAAGAAATAAAAGCAGAGGGACCTGAGACGCTTGTTATATTT
TTAATGCTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FF41TF U 1
AF RR4FF41JQ C 214
AF RR4EX83TF U 230
AF RR4EX83JQ C 251
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TGTTCCTGGACTCATCGAGCTGGCTATATCGAAGAACTGTTTGATCGGTGGGGATGATTT
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CAAGCCTGCTTCGATTGTGAGCTATAATCATTTGGGAAACAATGACGGCATGAACCTCTC
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GGCTAGTAACGGCATACTCTTTGAGCCTGGTGAACATCCTGACCATGTTGTTGTCATCAA
GTATGTACCTTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCTCCGAGATATT
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CAAAAGCACCTCTTGT

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*AAGAGCAATGTGGTAGACGACATGGTGGCTAGTAACGGCATACTCTTTGAGCCTGGTGA
ACATCCTGACCATGTTGTTGTCATCAAGTATGTACCTTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGC
TATGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGG*AGGGAAGAACACAATTGTTATGCATA
ACACCTGTGAGGATTCTCTTTTGGCGGCTCCAATCATCTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTG
AACTCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCCGAAGGAGAGGGGAAGTTCCACTCTTTCCACC
CAGTAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACCTCTTGTACCACCCGGGACGCCAG
TGGTGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGGCTATGTTGGAGAACATCCTCAGGGCCTGCGTTG
GGCTTGCACCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAAGTGA
C

QA 1 701 1 701
DS 

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G
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GGGATGATTTCAAGAGTGGTCAGACTAAGATGAAGTCTGTTCTGGTCGATTTCCTCGTCG
GAGCTGGCATCAAGCCTACTTCGATTGTGAACTATAATCATTTGGGAAACAATGACGGCA
TGAACCTCTCAGCGCCGCAGACTTTCAGATCAAAGGAGATCTCGAAGAGCAATGTGGTAG
ACGACATGGTGGCTAGTAACGGCATACTCTTTGAGCCTGGTGAACATCCTGACCATGTTG
TTGTCATCAAGTATGTACCTTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCT
CCGAGATATTCATGGG*AGGGAAGAACACAATTGTTATGCATAACACCTGTGAGGATTCT
CTTTTGGCGGCTCCAATCATCTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATC
CAATTCAAAGCCGAAGGAGAGGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTC
AGTTACCTCACAAAAGCACCTCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATCT
AAGCAGAGGGCTATGTTGGAGAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCACCAGAGAAC
AACATGATCTTGGAGTACAAGTGACAAGGAAGAAATAAAAGCAGAGGGACCTGAGACGCT
TGTTATATTTTTAATGCTTCA

QA 2 742 2 742
DS 

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TCGATTGTGAACTATAATCATTTGGGAAACAATGACGGCATGAACCTCTCAGCGCCGCAG
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GGCATACTCTTTGAGCCTGGTGAACATCCTGACCATGTTGTTGTCATCAAGTATGTACCT
TATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGG*AGG
GAAGAACACAATTGTTATGCATAACACCTGTGAGGATTCTCTTTTGGCGGCTCCAATCAT
CTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCCGAAGGAGA
GGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACC
TCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATTTAAGCAGAGGGCTATGTTGGA
GAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCACCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAA
GTGACAAGGAAGAAATAAAAGCAGAGGGACCTGAGACGCTTGTTATATTTTTAATGCTTC
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 5

CO CL2117Contig1 916 5 3 U
AAGTGCAATGAGTATGTCTAGAGACACTTTTGGATAGAAGTTTACATTACACAACAATGT
TTCCATCTTAAAACACTCTCGCAGGTACACCCATGTGTTGTTTCTTCTTTTCTGTAGTGA
ATTTGCATTGAGTGATACAGAACTGGGAGAGAAGAGAAATGGAAGTTCATATAATGTATT
AATTATTGA*GCCTCCTAAAGACGAACAATGATCCTCTAGAGCCTATTCCCAACCTAAGT
TTCTCATCAACGTACGTGATCCGAAGCTTCACTTCGCTTTCGAAACCGTATTTAAACTCC
AACGATCCCACCTTTAGTTCCGGAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAGC
ACGTTCAGCTTCCCTGTCAAAGAGACATCTCCATCGAGAAAACCAAGAGCAGTGAAGGAA
ACTCTGTTCCTCACGGTATCAGGAGAATCAATACCTTGGATCATCTCTTTAGTTCTGAAG
AAGAGTCGGCCTATCACACTTCTGTAGCCTCCACCAGGAGAGGTCGGTCTAGAACAGTAA
ACCACGTCCCAATCTCCGAAAATGAGAGGGCATTTAACAGGCTCGCTCACACAATACTTC
TGAAGCTCCCCAGCTACTTGTGCCACTTCCTTGTGTTCCTCAGGGGTGAGTGTCACACCT
CCATCGCTGTTCGCAACCTTAGAGAGGAGGGATGAAATGAGATCATCAGGGCCAGTACGG
ATCTCAACACTAGGCGATGAAACGGAGGTTACCGTGAGTCGCAGCCTTCTACTTCTGCTC
CGTGAATTGGCCTTATACGGGAGGGAGTACTGGAGAGGAAGGTTCGAGCGCTTCAAGGAA
TGAATCTGAGTCCGTTGTTCGGAGAAGGACGACGCAATCGTAAGGGAAGAAGCAGCCGTA
GCCATTGTTGCTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB70JQ U 31
AF RR4FM38JQ U 1
AF RR4FM38TF C 1
AF RR4FF36JQ U 153
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A
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AAGAGAAATGGAAGTTCATATAGTGTATTAATTATTGACGCCTCCTAAAGACGAACAATG
ATCCTCTAGAGCCTATTCCCAA****AGTTTCTCATCAACGTACGTGA

QA 2 229 2 229
DS 

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ATTTGCATTGAGTGATACAGAACTGGGAGAGAAGAGAAATGGAAGTTCATATAATGTATT
AATTATTGA*GCCTCCTAAAGACGAACAATGATCCTCTAGAGCCTATTCCCAACCTAAGT
TTCTCATCAACGTACGTGATCCGAAGCTTCACTTCGCTTTCGAAACCGTATTTAAACTCC
AACGATCCCACCTTTAGTTCCGGAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAGC
ACGTTCAGCTTCCCTGTCAAAGAGACATCTCCATCGAGAAAACCAAGAGCAGTGAAGGAA
ACTCTGTTCCTCACGGTATCAGGAGAATCAATACCTTGGATCATCTCTTTAGTTCTGAAG
AAGAGTCGGCCTATCACACTTCTGTAGCCTCCACCAGGAGAGGTCGGTCTAGAACAGTAA
ACCACGTCCCAATCTCC
C

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4FM38TF 558 0 0
AAGTGCAATGAGTATGTCTAGAGACACTTTTGGATAGAAGTTTACATTACACAACAATGT
TTCCATCTTAAAACACTCTCGCAGGTACACCCATGTGTTGTTTCTTCTTTTCTGTAGTGA
ATTTGCATTGAGTGATACAGAACTGGGAGAGAAGAGAAATGGAAGTTCATATAATGTATT
AATTATTGA*GCCTCCTAAAGACGAACAATGATCCTCTAGAGCCTATTCCCAACCTAAGT
TTCTCATCAACGTACGTGATCCGAAGCTTCACTTCGCTTTCGAAACCGTATTTAAACTCC
AACGATCCCACCTTTAGTTCCGGAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAGC
ACGTTCAGCTTCCCTGTCAAAGAGACATCTCCATCGAGAAAACCAAGAGCAGTGAAGGAA
ACTCTGTTCCTCACGGTATCAGGAGAATCAATACCTTGGATCATCTCTTTAGTTCTGAAG
AAGAGTCGGCCTATCACACTTCTGTAGCCTCCACCAGGAGAGGTCGGTCTAGAACAGTAA
ACCACGTCCCAATCTCC
C

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4FF36JQ 667 0 0
G
GAGAAATGGAAGTTCATATAATGTATTAATTATTGACGCCTCCTAAAGACGAACAATGAT
CCTCTAGAGCCTATTCCCAACCTAAGTTTCTCATCAACGTACGTGATCCGAAGCTTCACT
TCGCTTTCGAAACCGTATTTAAACTCCAACGATCCCACCTTTAGTTCCGGAGGCTCGAAT
ATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAGCACGTTCAGCTTCCCTGTCAAAGAGACATCTCCA
TCGAGAAAACCAAGAGCAGTGAAGGAAACTCTGTTCCTCACGGTATCAGGAGAATCAATA
CCTTGGATCATCTCTTTAGTTCTGAAGAAGAGTCGGCCTATCACACTTCTGTAGCCTCCA
CCAGGAGAGGTCGGTCTAGAACAGTAAACCACGTCCCAATCTCCGAAAATGAGAGGGCAT
TTAACAGGCTCGCTCACACAATACTTCTGAAGCTCCCCAGCTACTTGTGCCACTTCCTTG
TGTTCCTCAGGGGTGAGTGTCACACCTCCATCGCTGTTCGCAACCTTAGAGAGGAGGGAT
GAAATGAGATCATCAGGGCCAGTACGGATCTCAACACTAGGCGATGAAACGGAGGTTACC
GTGAGTCGCAGCCTTCTACTTCTGCTCCGTGAATTGGCCTTATACGGGAGGGAGTACTGG
AGAGGA

QA 2 667 2 667
DS 

RD RR4FF36TF 678 0 0
GTTTCTCATCAACGTACGTGATCCGAAGCTTCACTTCGCTTTCGAAACCGTATTTAAACT
CCAACGATCCCACCTTTAGTTCCGGAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCA
GCACGTTCAGCTTCCCTGTCAAAGAGACATCTCCATCGAGAAAACCAAGAGCAGTGAAGG
AAACTCTGTTCCTCACGGTATCAGGAGAATCAATACCTTGGATCATCTCTTTAGTTCTGA
AGAAGAGTCGGCCTATCACACTTCTGTAGCCTCCACCAGGAGAGGTCGGTCTAGAACAGT
AAACCACGTCCCAATCTCCGAAAATGAGAGGGCATTTAACAGGCTCGCTCACACAATACT
TCTGAAGCTCCCCAGCTACTTGTGCCACTTCCTTGTGTTCCTCAGGGGTGAGTGTCACAC
CTCCATCGCTGTTCGCAACCTTAGAGAGGAGGGATGAAATGAGATCATCAGGGCCAGTAC
GGATCTCAACACTAGGCGATGAAACGGAGGTTACCGTGAGTCGCAGCCTTCTACTTCTGC
TCCGTGAATTGGCCTTATACGGGAGGGAGTACTGGAGAGGAAGGTTCGAGCGCTTCAAGG
AATGAATCTGAGTCCGTTGTTCGGAGAAGGACGACGCAATCGTAAGGGAAGAAGCAGCCG
TAGCCATTGTTGCTCTCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 5

CO CL2118Contig1 741 5 5 U
AGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGGGAAGGAATATCT
TGACCCAGTTCTGGGGAATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGATCCTTGGTTAAAAAGT
GGCAGACTTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACTCTAAGGC
TTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTACGCTC
AATCGAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCACGATCAAGGAAGCCT
CCTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATCGGAAAGGATA
TTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGA
TCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAG
CAGAGGATGTCGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTCGAGGAACCAACTG
AGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGGTTTTTGAAGAAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTT
TCATCTAAAACTTTTTAGTATCTTTATTGTTTTGTCCTCTCTTCACACTCGTTTGATTCC
CCAGCTTCTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTTAGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAAT
TTATGCAAAACGATTTTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FJ85TF U 438
AF RR4GN49JQ C 1
AF RR4GN49TF U 1
AF RR4FN50JQ C 64
AF RR4FN50TF U 64
BS 1 122 RR4GN49TF
BS 123 123 RR4FN50TF
BS 124 285 RR4GN49TF
BS 286 286 RR4FN50TF
BS 287 741 RR4GN49TF

RD RR4FJ85TF 256 0 0
GG
CGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGATTACACAGCAGAGGATGTCGGTGTGAA
GGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTCGAGGAACCAACTGAGATTATTGGAGCTTAAGA
GAGGGTTTTTGAAGAAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTTTCATCTAAAACTTTTTAGT
ATCTTTGTTGTTTTGTCCTCTCTTCACACTCGTTTGATTCCCCAGCTTCTTTTTGGTGTA
TTGATGACTTTTTT

QA 3 256 3 256
DS 

RD RR4GN49JQ 741 0 0
AGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGGGAAGGAATATCT
TGACCCAGTTCTGGGGAATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGATCCTTGGTTAAAAAGT
GGTAGACTTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACTCTAAGGC
TTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTACGCTC
AATCGAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCCT
CCTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATCGGAAAGGATA
TTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGA
TCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAG
CAGAGGATGTCGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTCGAGGAACCAACTG
AGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGGTTTTTGAAGAAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTT
TCATCTAAAACTTTTTAGTATCTTTATTGTTTTGTCCTCTCTTCACACTCGTTTGATTCC
CCAGCTTCTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTTAGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAAT
TTATGCAAAACGATTTTTCTC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GN49TF 741 0 0
AGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGGGAAGGAATATCT
TGACCCAGTTCTGGGGAATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGATCCTTGGTTAAAAAGT
GGTAGACTTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACTCTAAGGC
TTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTACGCTC
AATCGAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCCT
CCTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATCGGAAAGGATA
TTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGA
TCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAG
CAGAGGATGTCGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTCGAGGAACCAACTG
AGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGGTTTTTGAAGAAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTT
TCATCTAAAACTTTTTAGTATCTTTATTGTTTTGTCCTCTCTTCACACTCGTTTGATTCC
CCAGCTTCTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTTAGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAAT
TTATGCAAAACGATTTTTCTC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4FN50JQ 678 0 0
AGGG
GTTCTGGGGAATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGATCCTTGGTTAAAAAGTGGCAGAC
TTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACTCTAAGGCTTTTCTG
CATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGTTACGCTCAATCGAG
CCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCACGATCAAGGAAGCCTCCTCTTG
TGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATCGGAAAGGATATTGAGAA
GGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAA
GGCTCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCAGAGGA
TGTCGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTCGAGGAACCAACTGAGATTAT
TGGAGCTTAAGAGAGGGTTTTTGAAGAAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTTTCATCTA
AAACTTTTTAGTATCTTTATTGTTTTGTCCTCTCTTCACACTCGTTTGATTCCCCAGCTT
CTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTTAGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAATTTATGCA
AAACGATTTTTCTC

QA 5 678 5 678
DS 

RD RR4FN50TF 678 0 0
AGGG
GTTCTGGGGAATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGATCCTTGGTTAAAAAGTGGCAGAC
TTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACTCTAAGGCTTTTCTG
CATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTACGCTCAATCGAG
CCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCACGATCAAGGAAGCCTCCTCTTG
TGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATCGGAAAGGATATTGAGAA
GGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAA
GGCTCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCAGAGGA
TGTCGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTCGAGGAACCAACTGAGATTAT
TGGAGCTTAAGAGAGGGTTTTTGAAGAAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTTTCATCTA
AAACTTTTTAGTATCTTTATTGTTTTGTCCTCTCTTCACACTCGTTTGATTCCCCAGCTT
CTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTTAGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAATTTATGCA
AAACGATTTTTCTC

QA 5 678 5 678
DS 



AS 1 5

CO CL2119Contig1 1429 5 28 U
GGATCTCCTCCTCTTACGTAACCCTAGCGAATCTCTGCTAGATCTATCTTGATTCCATTT
TCAAATCGCCCTTGAAATCGGGACGCAAGGTGTGTGGGATTGATTCTTACTAGTCAGAGA
GAGATAGAGAGTAATGGATTTGGATCAATGGATTTCGAAGGTCAAAGACGGTCAGCATCT
CTCCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTC
GAACGTTCAGCCTGTCAACAGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACATCCATGGCCAGTTTCA
TGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACTAACTACATTTTTAT
GGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATTCTTTTGCTTCT
TAAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGCT
AACGCAGGTATATGGTTTCTATGACGAATGCCAGAGGAAGTATGGTAACGCCAATGCGTG
GCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCTATTATAGATGGCACAGT
TCTATGTGTTCATGGCGGCCTGTCACCTGATGTCCGAACAATTGATCAGATAAGACTGGT
CGATCGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCCCTTTTGCGATCTTATGTGGAGCGATCC
TGAGGACATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGTTGGCTTTTCGGATCCAG
GGTCACCACTGAGTTTAACCATATCAACAAGCTTGATCTAGTATGCCGTGCACACCAGCT
GGTCCAAGAAGGTCTGAAGTACATGTTCCAAGATAAAGGCCTTGTAACTGTATGGTCTGC
GCCTAATTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTAGCTTCTATATTGAGTTTCGATGACAACAT
GGAAAAATCAGTGAAGTACTTCACAGAGACGGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAG
GACTGGAGTTCCATATTTCTTATGATGATTACGCTATATTATATTTGTGCCTCCTTACAT
TGCTGTGATGATGATGATGAAGCCATTGCTGCTACCATTGGCAATATGTTCAGTCTCACA
AGGTGTTATTATGTAGATATATAATATTATCTACTAATGGGTTTCATTTACTTCCATTAT
CTATGTCCTCTACGCAAAACATTTTTTCCCTTGTGAAATTCAGAAAAGGTGAACACTTTG
GTAATAGTTTGTAGTGGTTTTGAGTCTACTCGTGGATTCTCTCTATTTGTTTTTGTTTTT
GTTTTCCCACAATCTTTTCTTCTGTATTTGTTCACTTACAATGTGTTTCCTTAACTCTTT
TGCTGTTGTTAAAATGACATTAATTCTATAATAATTCCTATTTGAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS85TF U 1
AF RR4D520TF U 1
AF RR4AL34TF U 44
AF RR4D520JQ C 644
AF RR4AL34JQ C 667
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BS 1304 1429 RR4AL34JQ

RD RR4FS85TF 720 0 0
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CTCCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTC
GAACGTTCAGCCTGTCAACAGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACATCCATGGCCAGTTTCA
TGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACTAACTACATTTTTAT
GGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATTCTTTTGCTTCT
TAAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGCT
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GCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCTATTATAGATGGCACAGT
TCTATGTGTTCATGGCGGCCTGTCACCTGATGCCCGAACAATTGATCTGATAAGACTGGT
CGATCGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCCCTTTTGCGATCTTATGTGGAGCGATCC

QA 1 720 1 720
DS 

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TCAAATCGCCCTTGAAATCGGGACGCAAGGTGTGTGGGATTGATTCTTACTAGTCAGAGA
GAGATAGAGAGTAATGGATTCGGATCAATGGATTTCGAAGGTCAAAGACGGTCAGCATCT
CTCCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTC
GAACGTTCAGCCTGTCAACAGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACATCCATGGCCAGTTTCA
TGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACTAACTACATTTTTAT
GGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACATCCTTGAAGTCTTCACTATTCTTTTGCTTCT
TAAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGCT
AACGCAGGTATATGGTTTCTATGACGAATGCCAGAGGAAGTATGGTAACGCCAATGCGTG
GCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCTATTATAGATGGCACAGT
TCTATGTGTTCATGGCGGCCTGTCACCTGATGTCCGAACAATTGATCAGATAAGACTGGT
CGATCGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCC*TTTTGCGATCTTATGTGGAGCGATCC
TGAG*ACAT*GAAACATGGGCTGTTAGTC*ACGTGGAGCTGGTTGGCTTT*CGGATC*AG
GGTCAC*ACTGAGTTAA**CATATCAACA*GCTTGATCTAGTATGC
GTGCCACCAGCTGGTCA

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DS 

RD RR4AL34TF 804 0 0
GG
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CTTACTAGTCAGAGAGAGATAGAGAGTAATGGATTTGGATCAATGGATTTCGAAGGTCAA
AGACGGTCAGCATCTCTCCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGAT
TCTGATTGAGGAGTCGAACGTTCAGCCTGTCAACAGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACAT
CCATGGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACAC
TAACTACATTTTTATGGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCAC
TACTCTTTTGCTTCTTAAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCA
TGAAAGTAGGCAGCTAACGCAGGTATATGGTTTCTATGACGAATGCCAGAGGAAGTATGG
TAACGCCAATGCGTGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCTAT
TATAGATGGCACAGTTCTATGTGTTCATGGCGGCCTGTCACCTGATGTCCGAACAATTGA
TCAGATAAGACTGGTCGATCGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCCCTTTTGCGATCT
TATGTGGAACGATCCTGAGGACATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGTTG
GCTTTTCGGATCCAGGGTCACCACTGAGTTTAACCATATCAACAAGCTTGATCTAGTATG
CCGTGCACACCAGCTGGTCCAA

QA 3 804 3 804
DS 

RD RR4D520JQ 661 0 0
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CTTATGTGGAGCGATCCTGAGGACATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGT
TGGCTTTTCGGATCCAGGGTCACCACTGAGTTTAACCATATCAACAAGCTTGATCTAGTA
TGCCGTGCACACCAGCTGGTCCAAGAAGGTCTGAAGTACATGTTCCAAGATAAAGGCCTT
GTAACTGTATGGTCTGCGCCTAATTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTAGCTTCTATATTG
AGTTTCGATGACAACATGGAAAAATCAGTGAAGTACTTCACAGAGACGGAAGAGAACAAT
CAAATGAGAGGGCCAAGGACTGGAGTTCCATATTTCTTATGATGATTACGCTATATTATA
TTTGTGCCTCCTTACATTGCTGTGATGATGATGATGAAGCCATTGCTGCTACCATTGGCA
ATATGTTCAGTCTCACAAGGTGTTATTATGTAGATATATAATATTATCTACTAATGGGTT
TCATTTACTTCCATTATCTATGTCCTCTACGCAAAACATTTTTTCCCTTGTGAAATTCAG
AAAAGGTGAACACTTTGGTAATAGTTTGTAGTGGTTTTGAGTCTACTCGTGGATTCTCTC
C

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DS 

RD RR4AL34JQ 763 0 0
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CATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGTTGGCTTTTCGGATCCAGGGTCAC
CACTGAGTTTAACCATATCAACAAGCTTGATCTAGTATGCCGTGCACACCAGCTGGTCCA
AGAAGGTCTGAAGTACATGTTCCAAGATAAAGGCCTTGTAACTGTATGGTCTGCGCCTAA
TTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTAGCTTCTATATTGAGTTTCGATGACAACATGGAAAA
ATCAGTGAAGTACTTCACAGAGACGGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAGGACTGG
AGTTCCATATTTCTTATGATGATTACGCTATATTATATTTGTGCCTCCTTACATTGCTGT
GATGATGATGATGAAGCCATTGCTGCTACCATTGGCAATATGTTCAGTCTCACAAGGTGT
TATTATGTAGATATATAATATTATCTACTAATGGGTTTCATTTACTTCCATTATCTATGT
CCTCTACGCAAAACATTTTTTCCCTTGTGAAATTCAGAAAAGGTGAACACTTTGGTAATA
GTTTGTAGTGGTTTTGAGTCTACTCGTGGATTCTCTCTATTTGTTTTTGTTTTTGTTTTC
CCACAATCTTTTCTTCTGTATTTGTTCACTTACAATGTGTTTCCTTAACTCTTTTGCTGT
TGTTAAAATGACATTAATTCTATAATAATTCCTATTTGAATCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

CO CL2120Contig1 708 4 8 U
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AGATAAGCTGAAGCTAAAAGGATGGGTCAAGGAGAAGAAGACAAAAGCAAAGGCTTCGCT
GATGAAGCAGGTACCCAGCATCATCAATACGGTACGTTTCAAGGTGTTTCCAATTATCCT
CCTCCGCGCCCGCAGAACTCTCCTCCGGTCACTGGATTCCCTCAACCCTCTGCTCCACCT
GGAGTCTACGATCCACCCGCTCCTCATTACGCCCACGGGTATCAAACTGTTCCAGTATAT
GGTATTGCTGAAGGAAGACCTGTGCATGTGCGACAACGCCGCCTTCCTTGCTGTGGAATT
GGTCTTGGATGGTTCCTGTTCATAGTTGGGTTTTTCCTTGGAGCAATCCCTTGGTACGTT
GGAATGTTCATCATGATAGTTGGAAGGAGGATCGACCACAGGGAGAAGCCAGGATACATT
GCTTGCACCATCGCTGCTATTCTTGCAACGATTGCTGTGGTTCTTGGTGTAACTAAAGGA
GCAGAAGACTGGTGATCATTTCAGTCTGTTGTGGTCAAGTCAGAACGTTTGTATAGGTGT
CGACAAACATTTGGTCTTGTATTATTATATATTCGTGGTGCTTGGAAAAAAA*GATGTAA
ACTTAACAAA*GATTCGAGTTATTTTTATTTGCAGAAAATAGATTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL51TF U 1
AF RR4BQ79TF U 1
AF RR4C425TF U 1
AF RR4C383TF U 5
BS 1 66 RR4BQ79TF
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BS 68 68 RR4BQ79TF
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RD RR4GL51TF 653 0 0
ATCTCC
ATCTCGATTCGAGTCAGAGAGAAAGAGAGAGAGCGATCGAGACGAAAAGGAAGAAGATAA
GCTGAAGCTAAAAGGATGGGTCAAGGAGAAGAAGACAAAAGCAAGGGCTTCGCTGATGAA
GCAGGTACCCAGCATCATCAATACGGTACGTTTCAAGGTGTTTCCAATTATCCTCCTCCG
CGCCCGCAGAACTCTCCTCCGGTCACTGGATTCCCTCAACCCTCTGCTCCACCTGGAGTC
TACGATCCACCCGCTCCTCATTACGCCCACGGGTATCAAACTGTTCCAGTATATGGTATT
GCTGAAGGAAGACCTGTGCATGTGCGACAACGCCGCCTTCCTTGCTGTGGAATTGGTCTT
GGATGGTTCCTGTTCATAGTTGGGTTTTTCCTTGGAGCAATCCCTTGGTACGTTGGAATG
TTCATCATGATAGTTGGAAGGAGGATCGACCACAGGGAGAAGCCAGGATACATTGCTTGC
ACCATCGCTGCTATTCTTGCAACGATTGCTGTGGTTCTTGGTGTAACTAAAGGAGCAGAA
GACTGGTGATCATTTCAGTCTGTTGTGGTCAAGTCAGAACGTTTGTATAGGTGTCGACAA
ACATTTGGTCTTGTATTATTATATATTCGTGGTGCTTGGAAAAAAA
A

QA 7 652 7 652
DS 

RD RR4BQ79TF 689 0 0
ATCTCCATCTCGATTCGAGTCAGAGAGAAAGAGAGAGAGCGATCGAGACGAAAAGGAAGA
AGATAATC*GAAGCTAAAAGGATGGGTCAAGGAGAAGAAGACAAAAGCAAAGGCTTCGCT
GATGAAGCAGGTACCCAGCATCATCAATACGGTACGTTTCAAGTTGTTTCCAATTATCCT
CCTCCGCGCCCGCAGAACTCTCCTCCGGTCACTGGATTCCCTCAACCCTCTGCTCCACCT
GGAGTCTACGATCCACCCGCTCCTCATTACGCCCACGGGTATCAAACTGTTCCAGTATAT
GGTATTGCTGAAGGAAGACCTGTGCATGTGCGACAACGCCGCCTTCCTTGCTGTGGAATT
GGTCTTGGATGGTTCCTGTTCATAGTTGGGTTTTTCCTTGGAGCAATCCCTTGGTACGTT
GGAATGTTCATCATGATAGTTGGAAGGAGGATCGACCACAGGGAGAAGCCAGGATACATT
GCTTGCACCATCGCTGCTATTCTTGCAACGATTGCTGTGGTTCTTGGTGTAACTAAAGGA
GCAGAAGACTGGTGATCATTTCAGTCTGTTGTGGTCAAGTCAGAACGTTTGTATAGGTGT
CGACAAACATTTGGTCTTGTATTATTATATATTCGTGGTGCTTGGAAAAAAA*GATGTAA
ACTTAACAAA*GATTCGAGTTATTT
TATT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4C425TF 685 0 0
ATCTCC
ATCTCGATTCGAGTCAGAGAGAAAGAGAGAGAGCGATCGAGACGAAAAGGAAGAAGATAA
TC*GAAGCTAAAAGGATGGGTCAAGGAGAAGAAGACAAAAGCAAAGGCTTCGCTGATGAA
GCAGGTACCCAGCATCATCAATACGGTACGTTTCAAGTTGTTTCCAATTATCCTCCTCCG
CGCCCGCAGAACTCTCCTCCGGTCACTGGATTCCCTCAACCCTCTGCTCCACCTGGAGTC
TACGATCCACCCGCTCCTCATTACGCCCACGGGTATCAAACTGTTCCAGTATATGGTATT
GCTGAAGGAAGACCTGTGCATGTGCGACAACGCCGCCTTCCTTGCTGTGGAATTGGTCTT
GGATGGTTCCTGTTCATAGTTGGGTTTTTCCTTGGAGCAATCCCTTGGTACGTTGGAATG
TTCATCATGATAGTTGGAAGGAGGATCGACCACAGGGAGAAGCCAGGATACATTGCTTGC
ACCATCGCTGCTATTCTTGCAACGATTGCTGTGGTTCTTGGTGTAACTAAAGGAGCAGAA
GACTGGTGATCATTTCAGTCTGTTGTGGTCAAGTCAGAACGTTTGTATAGGTGTCGACAA
ACATTTGGTCTTGTATTATTATATATTCGTGGTGCTTGGAAAAAAA*GATGTAAACTTAA
CAAA*GATTCGAGTTATTT

QA 7 685 7 685
DS 

RD RR4C383TF 704 0 0
GG
ATCTCGATTCGAGCCAGAGAGAAAGAGAGAGAGCGATCGAGACGAAAAGGAAGAAGATAA
GCTGAAGCTAAAAGGGTGGGTCAAGGAGAAGAAGACAAAAGCAAAGGCTTCGCTGATGAA
GCAGGTACCCAGCATCATCAATACGGTACGTTTCAAGGTGTTTCCAATTATCCTCCTCCG
CGCCCGCAGAACTCTCCTCCGGTCACTGGATTCCCTCAACCCTCTGCTCCACCTGGAGTC
TACGATCCACCCGCTCCTCATTACGCCCACGGGTATCAAACTGTTCCAGTATATGGTATT
GCTGAAGGAAGACCTGTACATGTGCGACAACGCCGCCTTCCTTGCTGTGGAATTGGTCTT
GGATGGTTCCTGTTCATAGTTGGGTTTTTCCTTGGAGCAATCCCTTGGTACGTTGGAATG
TTCATCATGATAGTTGGAAGGAGGATCGACCACAGGGAGAAGCCAGGATACATTGCTTGC
ACCATCGCTGCTATTCTTGCAACGATTGCTGTGGTTCTTGGTGTAACTAAAGGAGCAGAA
GACTGGTGATCATTTCAGTCTGTTGTGGTCAAGTCAGAACGTTTGTATAGGTGTCGACAA
ACATTTGGTCTTGTATTATTATATATTCGTGGTGCTTGGAAAAAAAAGATGTAAACTTAA
CAAAAGATTCGAGTTATTTTTATTTGCAGAAAATAGATTAAA

QA 3 704 3 704
DS 



AS 2 5

CO CL2121Contig1 762 3 3 U
GGAGGTAGACAATCACTTGCTCTTCTCTATTCCATCACCATCATTTTAATCTCAACACCA
CTCTCTTCTTTCATCCGTCACCGTAAGAACATGAGCAGAACGGAGTCAGTGGGCTTGACC
AGAGGACGAATGTTGCAGTCAAGTAGTTGCAATCGCCTTATGAACTGTTCTGAGTCCTTC
AAGAGGGACAATGTGATTAGCAACGGTGGTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGC
AAGAAATCAAAGAGTTTTAAGGAAGGAGAAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCT
CCTGGGAGTATAGCCGCCGTGAGGAGGGAGCAAGTGGCTGCACAGCAAGCCCTAAGGAGA
CTGAAGATTGCTCATTATGGCAGATCCAAATCAACCCTAACTAATTTCAACTCATCCAAA
GTTGTCCCTCTTATTCACCCTCAACCTCATCCTCAAAGATGCAGCTTCCTTACCCCTACT
TCTGATCCTGTTTACGTTGCCTACCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCTGTCCATGATGAC
AAGACTTTGTTCGAGCTGCTAACCCTCAGTGGCGCACAAGTAGGTTCTGACTGGACGTCA
ACCTTGAGAAAACGCCATGACTTTAAGAAGGCGTTTATGGAGTTTGAGGCAGAAGCGGTT
GCCGAACTTAACGAGAAAGAGATGAATGCAATAAGCATCGAATACAAATAGAGATGAGTA
AAGTGAGAGGTGCTGTAGAGATGCTACAAAGATCATAGAGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC88TF U 27
AF RR4CC52TF U 1
AF RR4CE32TF U 1
BS 1 685 RR4CC52TF
BS 686 686 RR4CE32TF
BS 687 762 RR4CC52TF

RD RR4DC88TF 600 0 0
GG
ATTCCATCACCATCATTTTAATCTCAACACTACTCTCTTCTTTCATCCGTCACCGTAAGA
ACATGAGCAGAACGGAGTCAGTGGGCTTGACCAGAGGACGAATGTTGCAGTCAAGTAGTT
GCAATCGCCTTATGAACTGTTCTGAGTCCTTCAAGAGGGACAATGTGATTAGCAACGGTG
GTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGCAAGAAATCAAAGAGTTTTAAGGAAGGAG
AAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCTCCTGGGAGTATAGCCGCCGTGAGGAGGG
AGCAAGTGGCTGCACAGCAAGCCCTAAGGAGACTGAAGATTGCTCATTATGGCAGATCCA
AATCAACCCTAACTAATTTCAACTCATCCAAAGTTGTCCCTCTTATTCACCCTCAACCTC
ATCCTCAAAGATGCAGCTTCCTTACCCCTACTTCTGATCCTGTTTACGTTGCCTACCATG
ATGAAGAATGGGGAGTCCCTGTCCATGATGACAAGACTTTGTTCGAGCTGCTAACCCTCA
GTGGCGCACAAGTAGGTTCTGACTGGACGTCAACCTTGAGAAAACGCCATGACTTTAA

QA 3 600 3 600
DS 

RD RR4CC52TF 762 0 0
GGAGGTAGACAATCACTTGCTCTTCTCTATTCCATCACCATCATTTTAATCTCAACACCA
CTCTCTTCTTTCATCCGTCACCGTAAGAACATGAGCAGAACGGAGTCAGTGGGCTTGACC
AGAGGACGAATGTTGCAGTCAAGTAGTTGCAATCGCCTTATGAACTGTTCTGAGTCCTTC
AAGAGGGACAATGTGATTAGCAACGGTGGTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGC
AAGAAATCAAAGAGTTTTAAGGAAGGAGAAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCT
CCTGGGAGTATAGCCGCCGTGAGGAGGGAGCAAGTGGCTGCACAGCAAGCCCTAAGGAGA
CTGAAGATTGCTCATTATGGCAGATCCAAATCAACCCTAACTAATTTCAACTCATCCAAA
GTTGTCCCTCTTATTCACCCTCAACCTCATCCTCAAAGATGCAGCTTCCTTACCCCTACT
TCTGATCCTGTTTACGTTGCCTACCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCTGTCCATGATGAC
AAGACTTTGTTCGAGCTGCTAACCCTCAGTGGCGCACAAGTAGGTTCTGACTGGACGTCA
ACCTTGAGAAAACGCCATGACTTTAAGAAGGCGTTTATGGAGTTTGAGGCAGAAGCGGTT
GCCGAACTTAACGAGAAAGAGATGA*TGCAATAAGCATCGAATACAAATAGAGATGAGTA
AAGTGAGAGGTGCTGTAGAGATGCTACAAAGATCATAGAGTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4CE32TF 746 0 0
GGAGGTAGACAATCACTTGCTCTTCTCTATTCCATCACCATCATTTTAATCTCAACACCA
CTCTCTTCTTTCATCCGTCACCGTAAGAACATGAGCAGAACGGAGTCAGTGGGCTTGACC
AGAGGACGAATGTTGCAGTCAAGTAGTTGCAATCGCCTTATGAACTGTTCTGAGTCCTTC
AAGAGGGACAATGTGATTAGCAACGGTGGTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGC
AAGAAATCAAAGAGTTTTAAGGAAGGAGAAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCT
CCTGGGAGTATAGCCGCCGTGAGGAGGGAGCAAGTGGCTGCACAGCAAGCCCTAAGGAGA
CTGAAGATTGCTCATTATGGCAGATCCAAATCAACCCTAACTAATTTCAACTCATCCAAA
GTTGTCCCTCTTATTCACCCTCAACCTCATCCTCAAAGATGCAGCTTCCTTACCCCTACT
TCTGATCCTGTTTACGTTGCCTACCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCTGTCCATGATGAC
AAGACTTTGTTCGAGCTGCTAACCCTCAGTGGCGCACAAGTAGGTTCTGACTGGACGTCA
ACCTTGAGAAAACGCCATGACTTTAAGAAGGCGTTTATGGAGTTTGAGGCAGAAGCGGTT
GCCGAACTTAACGAGAAAGAGATGAATGCAATAAGCATCGAATACAAATAGAGATGAGTA
AAGTGAGAG*TGCTGTAGAGA
TGCTA

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL2121Contig2 675 2 8 U
ATTACTATTTCAAACTGTCACACGACACATACATGAGAAAAGCCTTATACATGTGATTAG
AAGAAAAAAAACTCACACAGAAGCAAAAGAAAAAAAAACAAATTTAACCAGCTGGATTAT
CTTACATTGCCAAATTAAAAGAACATTCAACCATTTTCTTCTACACCTACATCTGTTGTG
CACAAATCATACGAAAGTTAAAAAAACACTTTCAATTAAGTAAAGAAATAGAAAATAAAA
ACAAAAATTAAGGATTAGTAGTGAGGAGAGTGCAAGGAATGTGACGGTAACAAGTGAGCA
AGTAGTCATTGGTTAAACCAGCGGCTTGCATGAAGGAGTGAACAACCGTGGGACCCACGA
ACCGGAAGCCACGACGGACCATGTCTTTGCTTATGCTCTCCGACTTCGATGTCTTAACAG
GAATCTTGTGGCCTAGCTTGTAGTTCGTGGAGATGGGCTTGTTGTTCACAAAACCCCAAA
GGTATCTCTCTAGTGACCCGAACGTTTTCTTGACCTCTATGAACTTTGTAGCATTCTCTA
CAGCACCTCTCACTTTACTCATCTCTATTTTGTATTCGATGCTTATTTGCATTCATCTCT
TTCTCGTTAAGTTCGGCAACCGCTTCTGCCTCAAACTCCATAAACGCCTTCTTAAAGTCA
TGGCGTTTTTCTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC88JQ U 1
AF RR4CE32JQ U 509
BS 1 522 RR4DC88JQ
BS 523 523 RR4CE32JQ
BS 524 587 RR4DC88JQ
BS 588 588 RR4CE32JQ
BS 589 613 RR4DC88JQ
BS 614 614 RR4CE32JQ
BS 615 669 RR4DC88JQ
BS 670 675 RR4CE32JQ

RD RR4DC88JQ 670 0 0
ATTACTATTTCAAACTGTCACACGACACATACATGAGAAAAGCCTTATACATGTGATTAG
AAGAAAAAAAACTCACACAGAAGCAAAAGAAAAAAAAACAAATTTAACCAGCTGGATTAT
CTTACATTGCCAAATTAAAAGAACATTCAACCATTTTCTTCTACACCTACATCTGTTGTG
CACAAATCATACGAAAGTTAAAAAAACACTTTCAATTAAGTAAAGAAATAGAAAATAAAA
ACAAAAATTAAGGATTAGTAGTGAGGAGAGTGCAAGGAATGTGACGGTAACAAGTGAGCA
AGTAGTCATTGGTTAAACCAGCGGCTTGCATGAAGGAGTGAACAACCGTGGGACCCACGA
ACCGGAAGCCACGACGGACCATGTCTTTGCTTATGCTCTCCGACTTCGATGTCTTAACAG
GAATCTTGTGGCCTAGCTTGTAGTTCGTGGAGATGGGCTTGTTGTTCACAAAACCCCAAA
GGTATCTCTCTAGTGACCCGAACGTTTTCTTGACCTCTATGATCTTTGTAGCATTCTCTA
CAGCACCTCTCACTTTACTCATCTCTATTTTGTATTCGATGCTTATT*GCATTCATCTCT
TTCTCGTTAAGTTTGGCAACCGCTTCTGCCTCAAACTCCATAAACGCCTTCTTAAAGTCA
TGGCGTTTT
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4CE32JQ 167 0 0
CTTGAC
CTCTATGAACTTTGTAGCATTCTCTACAGCACCTCTCACTTTACTCATCTCTATTTTGTA
TTCGATGCTTATTTGCATTCATCTCTTTCTCGTTAAGTTCGGCAACCGCTTCTGCCTCAA
ACTCCATAAACGCCTTCTTAAAGTCATGGCGTTTTTCTCAA

QA 7 167 7 167
DS 



AS 1 5

CO CL2122Contig1 1714 5 23 U
GGACCACTAGGGTTTCTCTTCAACCGCTCCTTCTCTTCTCATCTCTCCCTCTCATCTCTC
GCAGAGGACGGCTACGAAAGATGCTGGGAGGATTGCTGGGTTGGAAGTTCTTCGTATTAT
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TCTTGTCTTTGATCTTGGTGGTGGTACCTTTGATGTCTCAGTGCTTGAGGTTGGTGATGG
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GACACCCCTATCCATTGGTTTGGAAACACTTGGCGGTGTTATGACCAAGATTATTCCAAG
GAACTCAACTCTGCCTACTTCTAAGTCAGAAGTCTTCTCCACTGCTGCTGATGGACAGAC
AAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTTGTCCGGGATAACAAGTCTCT
TGGCAGCTTCCGTCTAGATGGCATCCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGT
CAAATTTGACATCGATGCCAATGGTATTCTATCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACCGG
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TGAGAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTGAAAGA
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AGTGATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGG
TCCTTCCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCTGATTCAACCGGGAAAGATGGCGATGA
TGTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATT
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TGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGTTATTGCCTTC
TTTTGGAACTATAAATAAGGATATTTTTCAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4AG73TF U 1
AF RR4C930TF U 514
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TCTTGTCTTTGATCTTGGTGGTGGTACCTTTGATGTCTCAGTGCTTGAGGTTGGTGATGG
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TGCTGCGGTTC

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DS 

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G
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T
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GACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATAT
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AAATG

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CGAAGATGCTTCATCAGCTGATTCAACCGGGAAAGATGGCGATGATGTGATTGACGCTGA
CTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAA
ACACA*TGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTT
TTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGTTATTGCCTTCTTTTGGAACTATAAA
TAAGGATATTTTTC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 5

CO CL2123Contig1 838 5 15 U
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GGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGTGTGTTG
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GAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTCGGCTTTGGTTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAG
CTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTTTATGGAT
CAAGATCATCACCACCACCATACTTCTTCCCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATAGCTAGC
TGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTTTGG
GCACAAGCTGTGGCATGCACCGTAAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTTTGAAGCATTC
AAATGGGTGAGAGAAAGAAGACGATGAAACAACATAATTGCTGCATGCAGGAATGATGTC
TCTTTATATTAGGCTGTTCTCTTTCAGCTTTTTATTTTTGAGACTGACCTGCTTGAAAGA
AACACCCATTTGTTGTTGTATGAGCTATGTTCAGGGATGTATAAAAAAGCTTAGAGATTT
TGCTAGGAAAATGTCTTGTAATGCTTTTTTTTAATAATAAAGATTTAATTCTTATTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AH95TF U 1
AF RR4D543TF U 1
AF RR4CK29TF U 1
AF RR4CK29JQ C 36
AF RR4D543JQ C 186
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BS 769 780 RR4CK29TF
BS 781 838 RR4CK29JQ

RD RR4AH95TF 668 0 0
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TCTTTATA

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DS 

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CTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTTTATGGAT
CAAGATCATCACCACCACCATACTTCTTCCCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATAGCTAGC
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TCTTTATA

QA 1 668 1 668
DS 

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CAAGATCATCACCACCACCATACTTCTTCCCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATAGCTAGC
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GCTAGAAATGTC

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AATAAAGATTTAATTCTTATTAC

QA 1 803 1 803
DS 

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AGCTGTGGCATGCACCGTAAGATTATGCACTCGAGATTTGGATTTTGAAGCATTCAAATG
GGTGAGAGAAAGAAGACGATGAAACA***TAGTTGCTGCATGCAGGAATGATGTCTCTTT
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CCATTTGTTGTTGTATGAGCTATGTTCAGGGATGTATAAAAAAGCTTAGAGATTTTGCTA
GGAAA*TGTCTTGTAATGCTTTTTTTTAATAATAAAGATTTAATTCTTATTAC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 5

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TCTCATCTGAAAGCCGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCATTTGAAA
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AACACTGTGGCTGATGATGGAAGCCTCGAGGAGGTGACAGAGACGTTACTAGATTTGTAT
TATGAATGCCTTGAGGGCAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTAACTAGTTCTCAG
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AAGCCAGAAGCTATGCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACGGTAGTTCCA
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TATCAACAGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTATTACTTAAATAAATACTATTTTGATTGTTAC
TCTTTTAACTTTTTAAACAACATCAGAAGGTTGTGTTACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX59TF U 1
AF RR4FL49TF U 10
AF RR4BX59JQ C 58
AF RR4A449TF U 169
AF RR4FL49JQ C 335
BS 1 547 RR4BX59TF
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BS 549 670 RR4BX59TF
BS 671 804 RR4A449TF
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RD RR4BX59TF 670 0 0
GGAGCTTCACTAGAGAAGAAACAATCACTTCCTTTTACTCCGCCGATCCCCACCTGCTTC
GCTCACCGTCTCGCCGGCGTTTCACAGAGAGAAGGAGGAAGAAGAATGGATTCGAGACCC
AGTGGACCAGCGATGTTGACGGCGGAGGAGCAAGCCGTTTTAAACGAAGGAATCGGTTTG
ATACTTTCACGGTGGACTGCCATGAGAGCCGCCGTAGATAACGGCTGGGGCGGCCGAGAT
TCTCATCTGAAAGCCGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCATTTGAAA
GATCCAACGATGGGTTTTGATGGGTTAGCTGATATTCTAGAGAATGGTCTTCATGAGCTT
AACACTGTGGCTGATGATGGAAGCCTCGAGGAGGTGACAGAGACGTTACTAGATTTGTAT
TATGAATGCCTTGAGGGCAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTAACTAGTTCTCAG
ACTAGTGCAAGAGTTGTCAAGGTTTCAAACGGTAACGATGAGGATGATGAGGAAAGCGAT
GATGAAA*TGAGGAGGATACAGACATGATGGTGGATGCATCTGAGCAATCTTCAAACCTG
AAGCCAGAAGCTATGCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACGGTAGTTCCA
AGTAGAAAAA

QA 1 670 1 670
DS 

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GG
AGAGAAGAAACAATCACTTCCTTTTACTCCGCCGATCCCCACCTGCTTCGCTCACCGTCT
CGCCGGCGTTTCACAGAGAGAAGGAGGAAGAAGAATGGATTCTAGACCCAGTGGACCAGC
GATGTTGACGGCGGAGGAGCAAGCCGTTTTAAACGAAGGAATCGGTTTGATACTTTCACG
GTGGACTGCCATGAGAGCCGCCGTAGATAACGGCTGGGGCGGCCGAGATTCTCATCTGAA
AGCCGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCGTTTGAAAGATCCAACGAT
GGGTTTTGATGGGTTAGCTGATATTCTAGAGAATGGTCTTCATGAGCTTAACACTGTGGC
TGATGATGTAAGCCTCGAGGAGGTGACAGAGACGTTACTAGATTTGTATTATGAATGCCT
TGAGGGCAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTAACTAGTTCTCAGACTAGTGCAAG
AGTTGTCAAGGTTTCAAACGGTAACGATGAGGATGATGAGGAAAGCGATGATGAAAATGA
GGAGGATACAGACATGATGGTGGATGCATCTGAGCAATCTTCAAACCTGAAGCCAGAAGC
TATGCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACGGTAGTTCCAAGTA

QA 3 655 3 655
DS 

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CCCAGTGGACCAGCGATGTTGACGGCGGAGGAGCAAGCCGTTTTAAACGAAGGAATCGGT
TTGATACTTTCACGGTGGACTGCCATGAGAGCCGCCGTAGATAACGGCTGGGGCGGCCGA
GATTCTCATCTGAAAGCCGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCATTTG
AAAGATCCAACGATGGGTTTTGATGGGTTAGCTGATATTCTAGAGAATGGTCTTCATGAG
CTTAACACTGTGGCTGATGATGGAAGCCTCGAGGAGGTGACAGAGACGTTACTAGATTTG
TATTATGAATGCCTTGAGGGCAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTAACTAGTTCT
CAGACTAGTGCAAGAGTTGTCAAGGTTTCAAACGGTAACGATGAGGATGATGAGGAAAGC
GATGATGAAA*TGAGGAGGATACAGACATGATGGTGGATGCATTTGAGCAATCTTCAAAC
CTGAAGCCAGAAGCTATGCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACGGTAGTT
CCAAGTAGAAAAAACAAGGGCAAGAGGAACTAAACGGTTTTAGGTTCCAATGGTGTTGTG
TAATATCAACAGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTATTACTTAAATAAATACTATTTTGATTGT
TACTCTTTTAAC
G

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4A449TF 636 0 0
GGAATCGGTTTGATACTTTCACGGTGGACTGCCATGAGAGCCGCCGTAGATAACGGCTGG
GGCGGCCGAGATTCTCATCTGAAAGCCGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTC
ATCCATTTGAAAGATCCAACGATGGGTTTTGATGGGTTAGCTGATATTCTAGAGAATGGT
CTTCATGAGCTTAACACTGTGGCTGATGATGGAAGCCTCGAGGAGGTGACAGAGACGTTA
CTAGATTTGTATTATGAATGCCTTGAGGGCAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTA
ACTAGTTCTCAGACTAGTGCAAGAGTTGTCAAGGTTTCAAACGGTAACGATGAGGATGAT
GAGGAAAGCGATGATGAAAATGAGGAGGATACAGACATGATGGTGGATGCATCTGAGCAA
TCTTCAAACCTGAAGCCAGAAGCTATGCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGG
ACGGTAGTTCCAAGTAGAAAAAACAAGGGCAAGAGGAACTAAACGGTTTTAGGTTCCAAT
GGTGTTGTGTAATATCAACAGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTATTACTTAAATAAATACTAT
TTTGATTGTTACTCTTTTAACTTTTTAAACAACATC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FL49JQ 489 0 0
TTCTAGAGAATGGTCTTCATGAGCTTAACACTGTGGCTGATGATGTAAGCCTCGAGGAGG
TGACAGAGACGTTACTAGATTTGTATTATGAATGCCTTGAGGGCAACTACCAAAGGGTTG
AGACACTGAGGGTAATTAGTTTTCAGACTAGTGCAAGAGTTGTCAAGGTTTCAAACGGTA
ACGATGAGGATGATGAGGAAAGCGATGATGAAAATGAGGAGGATACAGACATGATGGTGG
ATGCATTTGAGCAATTTTCAAACCTGAAGCCAGAAGTTATGCCGGTTGATGAACCAAAAG
CTGATGATGGCTGGACGGTAGTTCCAAGTAGAAAAAACAAGGGCAAGAGGAATTAAACGG
TTTTAGGTTCCAATGGTGTTGTGTAATATCAACAGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTATTACT
TAAATAAATATTATTTTGATTGTTACTCTTTTAACTTTTTAAACAACATCAGAAGGTTGT
GTTACTGCC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 5

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AGAATCATCGGAGAAAGACATGTCAATGACTGGAGGAGACAAACTGATACTAAAAGGGCT
AAAGTTCTACGGTTACCATGGAGCGATTCCAGAAGAGAAGACTTTAGGGCAGATGTTTCT
CGTTGACATTGATGCGTGGGTGAGTCTTAGAAAGGCTGGTGAATCAGACAACTTGGATGA
CACTATCAGCTATGTTGACATTTTCAGCATAGCTAAAGAAATTGTAGAAGGGTCACCAAG
AAACCTTCTGGAGACAGTCGCGGAACTCATCGCGTCCAGAACGCTTGAAACGTTTCCTCG
TATAACCGCTGTTCGGGTGAAGGTATCGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGACTACTAT
CGATTACTTAGGGGTTGAGATTTTCCGACAGCAAAAGCATTGATTCAATGAACCGAATCC
TCTGTCGTTACAAAGAGAATGGTATCCAAGAAATTATGATATTCGTTTCAAAACAAAACT
TCAAAACTTTTAGGAATTTGAAGAATTAAATAATGATATTTCTTTCGTATT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 

AF RR4A343JQ C 1
AF RR4A343TF U 1
AF RR4A343JQD C 1
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AF RR4EZ79TF U 12
BS 1 645 RR4A343TF
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RD RR4A343JQ 648 0 0
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CACTATCAGCTATGTTGACATTTTCAGCATAGCTAAAGAAATTGTAGAAGGGTCACCAAG
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TATAACCGCTGTTCGGGTGAAGGTATCGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGACTACTAT
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4A343TF 649 0 0
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AGAATCATCGGAGAAAGACATGTCAATGACTGGAGGAGACAAACTGATACTAAAAGGGCT
AAAGTTCTACGGTTACCATGGAGCGATTCCAGAAGAGAAGACTTTAGGGCAGATGTTTCT
CGTTGACATTGATGCGTGGGTGAGTCTTAGAAAGGCTGGTGAATCAGACAACTTGGATGA
CACTATCAGCTATGTTGACATTTTCAGCATAGCTAAAGAAATTGTAGAAGGGTCACCAAG
AAACCTTCTGGAGACAGTCGCGGAACTCATCGCGTCCAGAACGCTTGAAACGTTTCCTCG
TATAACCGCTGTTCGGGTGAAGGTATCGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGACTACTAT
CGATTACTTAGGGGTTGAGATTTTCCGACAGCAAAAGCATTGATTCAATGAACCGAATCC
TCTGTCGTTACAAAGAGAATGGTATCCAAGAAATTATGATATTCGTTTCAAAACAAAACT
TCAAAACTTTTAGGAATTTGAAGAATTAAATAATGATATTTCTTT
TCGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4A343JQD 648 0 0
GGCTCTGTCTCTCACACTCACTCATCTAATCTCAAAATCTGTTACCGCGAACGGAGGAGA
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AGAATCATCGGAGAAAGACATGTCAATGACTGGAGGAGACAAACTGATACTAAAAGGGCT
AAAGTTCTACGGTTACCATGGAGCGATTCCAGAAGAGAAGACTTTAGGGCAGATGTTTCT
CGTTGACATTGATGCGTGGGTGAGTCTTAGAAAGGCTGGTGAATCAGACAACTTGGATGA
CACTATCAGCTATGTTGACATTTTCAGCATAGCTAAAGAAATTGTAGAAGGGTCACCAAG
AAACCTTCTGGAGACAGTCGCGGAACTCATCGCGTCCAGAACGCTTGAAACGTTTCCTCG
TATAACCGCTGTTCGGGTGAAGGTATCGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGACTACTAT
CGATTACTTAGGGGTTGAGATTTTCCGACAGCAAAAGCATTGATTCAATGAACCGAATCC
TCTGTCGTTACAAAGAGAATGGTATCCAAGAAATTATGATATTCGTTTCAAAACAAAACT
TCAAAACTTTTAGGAATTTGAAGAATTAAATAATGATATTTCTTTCGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4A343TFB 648 0 0
GGCTCTGTCTCTCACACTCACTCATCTAATCTCAAAATCTGTTACCGCGAACGGAGGAGA
GATGTACAGCTCACTTGAAACGACGGCTCTGGCTACGTTGTCACCGCGAGTTATTGGAAG
AGAATCATCGGAGAAAGACATGTCAATGACTGGAGGAGACAAACTGATACTAAAAGGGCT
AAAGTTCTACGGTTACCATGGAGCGATTCCAGAAGAGAAGACTTTAGGGCAGATGTTTCT
CGTTGACATTGATGCGTGGGTGAGTCTTAGAAAGGCTGGTGAATCAGACAACTTGGATGA
CACTATCAGCTATGTTGACATTTTCAGCATAGCTAAAGAAATTGTAGAAGGGTCACCAAG
AAACCTTCTGGAGACAGTCGCGGAACTCATCGCGTCCAGAACGCTTGAAACGTTTCCTCG
TATAACCGCTGTTCGGGTGAAGGTATCGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGACTACTAT
CGATTACTTAGGGGTTGAGATTTTCCGACAGCAAAAGCATTGATTCAATGAACCGAATCC
TCTGTCGTTACAAAGAGAATGGTATCCAAGAAATTATGATATTCGTTTCAAAACAAAACT
TCAAAACTTTTAGGAATTTGAAGAATTAAATAATGATATTTCTTTCGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EZ79TF 640 0 0
GG
ACACTCACTCATCTAATCTCAAAATCTGTTACCGCGAACGGAGGAGAGATGTACAGCTCA
CTTGAAACGACGGCTCTGGCTACGTTGTCACCGCGAGTTATTGGAAGAGAATCATCGGAG
AAAGACATGTCAATGACTGGAGGAGACAAACTGATACTAAAAGGGCTAAAGTTCTACGGT
TACCATGGAGCGATTCCAGAAGAGAAGACTTTAGGGCAGATGTTTCTCGTTGACATTGAT
GCGTGGGTGAGTCTTAGAAAGGCTGGTGAATCAGACAACTTGGATGACACTATCAGCTAT
GTTGACATTTTCAGCATAGCTAAAGAAATTGTAGAAGGGTCACCAAGAAACCTTCTGGAG
ACAGTCGCGGAACTCATCGCGTCCAGAACGCTTGAAACGTTTCCTCGTATAACCGCTGTT
CGGGTGAAGGTATCGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGACTACTATCGATTACTTAGGG
GTCGAGATTTTCCGACAGCAAAAGCATTGATTCAATGAACCGAATCCTCTGTCGTTACAA
AGAGAATGGTATCCAAGAAATTATGATATTCGTTTCAAAACAAAACTTCAAAACTTTTAG
GAATTTGAAGAATTAAATAATGATATTTCTTTCGTATT

QA 3 640 3 640
DS 



AS 1 5

CO CL2126Contig1 1066 5 9 U
AGAGCAAACATAAGAAGCTTTATACCATCATTCCAAAGTAGATTTTACAGAAGTTTTGTG
TTATTAAAGCGAAAATTCATAGAAACGAAGGAGAAGAAAGACAAAGAAACAAAAGAACCA
GAACCATCGCTAACCAAGATCCGGTTCACATCAAACCAAACAACAACAAACTACCAAACC
CCTCCAAATCAATTGAGTGGCTGAAACTCCACAGGCTTG*CCGTCTCAGTCTTCTCCTCG
CTGAAGATCTTCGAGATCCTCTCTGTCGGAACCAATGGCATGTACGATGAGACCCTGTAC
CCTTTCTCAGCAGCCTTCACCACCGTGTCATTGTACTTCTCGGAGCAGAAAGCGGCCGTC
GGCACAGCGACTTGAGCAAGCCTTGGGAACAGAGGAAGCTGGTTCAGCTTCTTCCAAGCC
GAAACGGCGCACTGCTCTGCTTTTGGCTCGTAGCTCGCGTACAGCTCCTTAGCTGCAGGC
TCGTACTTGGTGTAGACGGATTTCGCCATCCCGGAGGCGGTTTCCACGACCCCAGCGCGT
CGAACCTCAGAGGCGAGGGCACGGGCCACTACGGGTGCGATCTGAGCGGCTGAGATGGCG
TGGGCAGAGACTTGTTTGACCACTGGTGGGACACGGCGGTCGAGTTCAGTCACTGACATG
TCAACCTTCTGGTCCATGTATTTGAGAACCTCGACGGGGACGTCGTGGTACTTCTGGTAG
ACAGGACCGACGACAGTCTTGACAGCTCCTTCAACGGATTCAACACCTGGCTTCAAAGGA
CCAGACTTGTCCTTCGCCTTTGCGTAGATAAGAGCAAAGCGTAGCACTGCTTCCACAGCG
GCAGCTTGCACGAACTCCAAGTACTTCAACCTCTCTTTCTCCTCCTTAGTCATATCGACT
TTCGGCTGATTGAGATCTGTTTGAGTCATGATCGCTGGGCTTATCGTTGTGCAAAGAGGA
TATATCGAAGAAGCGTTCGTTCGAAGCGAAGAAGATTCTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTTT
AAATTGAGTTGTGACGAAGAAAACGATGTATAATTGGATGGTGATC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV41JQ U 2
AF RR4CG85JQ U 2
AF RR4AZ72JQ U 1
AF RR4CG85TF C 223
AF RR4AZ72TF C 321
BS 1 219 RR4AZ72JQ
BS 220 220 RR4CG85JQ
BS 221 347 RR4AZ72JQ
BS 348 348 RR4CG85JQ
BS 349 552 RR4AZ72JQ
BS 553 553 RR4CG85JQ
BS 554 794 RR4AZ72JQ
BS 795 858 RR4CG85TF
BS 859 1066 RR4AZ72TF

RD RR4CV41JQ 595 0 0
GG
GCAAACATAAGAAGCTTTATACCATCATTCCAAAGTAGATTTTACAGAAGTTTTGTGTTA
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CCAAATCAATTGAGTGGCTGAAACTCCACAGGCTTG*CCGTCTCAGTCTTCTCCTCGCTG
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ACCTCAGAGGCGAGGGCACGGGCCACTACGGGTGCGATCTGAGCGGCTGA
AAT

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR4CG85JQ 769 0 0
GG
GCAAACATAAGAAGCTTTATACCATCATTCCAAAGTAGATTTTACAGAAGTTTTGTGTTA
TTAAAGCGAAAATTCATAGAAACGAAGGAGAAGAAAGACAAAGAAACAAAAGAACCAGAA
CCATCGCTAACCAAGATCCGGTTCACATCAAACCAAACAACAACAAACTACCAAACCCCT
CCAAATCAATTGAGTGGCTGAAACTCCACAGGCTTG*CCGTCTCAGTCTTCTCCTCGCTG
AAGATCTTCGAGATCCTCTCTGTCGGAACCAATGGCATGTACGATGAGACCCTGTACCCT
TTCTCAGCAGCCTTCACCACCGTGTCATTGTACTTCTCGGAGCAGAAAGCGGCCGTCGGC
ACAGCGACTTGAGCAAGCCTTGGGAACAGAGGAAGCTGGTTCAGCTTCTTCCAAGCCGAA
ACGGCGCACTGCTCTGCTTTTGGCTCGTAGCTCGCGTACAGCTCCTTAGCTGCAGGCTCG
TACTTGGTGTAGACGGATTTCGCCATCCCGGAGGCGGTTTCCACGACCCCAGCGCGTCGA
ACCTCAGAGGCGAGGGCACGGGCCACTACGGGTGCGATCTGAGCGGCTGAGATGGCGTGG
GCAGAGACTTGTTTGACCACTGGTGGGACACGGCGGTCGAGTTCAGTCACTGACATGTCA
ACCTTCTGGTCCATGTATTTGAGAACCTCGACGGGGACGTCGTGGTACTTCTGGTAGACA
GGACCGACGACAGTCTTGACAGCTCCTTCAACGGATTCA
CACCTGGC

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR4AZ72JQ 794 0 0
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TTATTAAAGCGAAAATTCATAGAAACGAAGGAGAAGAAAGACAAAGAAACAAAAGAACCA
GAACCATCGCTAACCAAGATCCGGTTCACATCAAACCAAACAACAACAAACTACCAAACC
CCTCCAAATCAATTGAGTGGCTGAAACTCCACAGGCTTGGCCGTCTCAGTCTTCTCCTCG
CTGAAGATCTTCGAGATCCTCTCTGTCGGAACCAATGGCATGTACGATGAGACCCTGTAC
CCTTTCTCAGCAGCCTTCACCACCGTGTCATTGTACTTCTCGGAGCAAAAAGCGGCCGTC
GGCACAGCGACTTGAGCAAGCCTTGGGAACAGAGGAAGCTGGTTCAGCTTCTTCCAAGCC
GAAACGGCGCACTGCTCTGCTTTTGGCTCGTAGCTCGCGTACAGCTCCTTAGCTGCAGGC
TCGTACTTGGTGTAGACGGATTTCGCCATCCCGGAGGCGGTTTCCACGACCCCAGCGCGT
CGAACCTCAGAGACGAGGGCACGGGCCACTACGGGTGCGATCTGAGCGGCTGAGATGGCG
TGGGCAGAGACTTGTTTGACCACTGGTGGGACACGGCGGTCGAGTTCAGTCACTGACATG
TCAACCTTCTGGTCCATGTATTTGAGAACCTCGACGGGGACGTCGTGGTACTTCTGGTAG
ACAGGACCGACGACAGTCTTGACAGCTCCTTCAACGGATTCAACACCTGGCTTCAAAGGA
CCAGACTTGTCCTT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4CG85TF 636 0 0
GTCTCAGTCTTCTCCTCGCTGAAGATCTTCGAGATCCTCTCTGTCGGAACCAATGGCATG
TACGATGAGACCCTGTACCCTTTCTCAGCAGCCTTCACCACCGTGTCATTGTACTTCTCG
GAGCAGAAAGCGGCCGTCGGCACAGCGACTTGAGCAAGCCTTGGGAACAGAGGAAGCTGG
TTCAGCTTCTTCCAAGCCGAAACGGCGCACTGCTCTGCTTTTGGCTCGTAGCTCGCGTAC
AGCTCCTTAGCTGCAGGCTCGTACTTGGTGTAGACGGATTTCGCCATCCCGGAGGCGGTT
TCCACGACCCCAGCGCGTCGAACCTCAGAGGCGAGGGCACGGGCCACTACGGGTGCGATC
TGAGCGGCTGAGATGGCGTGGGCAGAGACTTGTTTGACCACTGGTGGGACACGGCGGTCG
AGTTCAGTCACTGACATGTCAACCTTCTGGTCCATGTATTTGAGAACCTCGACGGGGACG
TCGTGGTACTTCTGGTAGACAGGACCGACGACAGTCTTGACAGCTCCTTCAACGGATTCA
ACACCTGGCTTCAAAGGACCAGACTTGTCCTTCGCCTTTGCGTAGATAAGAGCAAAGCGT
AGCACTGCTTCCACAGCGGCAGCTTGCACGAACTCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4AZ72TF 746 0 0
CACCGTGTCATTGTACTTCTCGGAGCAGAAAGCGGCCGTCGGCACAGCGACTTGAGCAAG
CCTTGGGAACAGAGGAAGCTGGTTCAGCTTCTTCCAAGCCGAAACGGCGCACTGCTCTGC
TTTTGGCTCGTAGCTCGCGTACAGCTCCTTAGCTGCAGGCTCGTACTTGGTGTAGACGGA
TTTCGCCATCCCGGAGGCGGTTTCCACGACCCCAGCGCGTCGAACCTCAGAGACGAGGGC
ACGGGCCACTACGGGTGCGATCTGAGCGGCTGAGATGGCGTGGGCAGAGACTTGTTTGAC
CACTGGTGGGACACGGCGGTCGAGTTCAGTCACTGACATGTCAACCTTCTGGTCCATGTA
TTTGAGAACCTCGACGGGGACGTCGTGGTACTTCTGGTAGACAGGACCGACGACAGTCTT
GACAGCTCCTTCAACGGATTCAACACCTGGCTTCAAAGGACCAGACTTGTCCTTCGCCTT
TGCGTAGATAAGAGCAAAGCGTAGCACTGCTTCCACAGCGGCAGCTTGCACGAACTCCAA
GTACTTCAACCTCTCTTTCTCCTCCTTAGTCATATCGACTTTCGGCTGATTGAGATCTGT
TTGAGTCATGATCGCTGGGCTTATCGTTGTGCAAAGAGGATATATCGAAGAAGCGTTCGT
TCGAAGCGAAGAAGATTCTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTTTAAATTGAGTTGTGACGAAGA
AAACGATGTATAATTGGATGGTGATC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 5

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CTTGCAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAA
AAGATTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACA
GGCCATGAAAGTGTATGGAAATTCTTAGTCAGTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTA
TTATGTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTATAATCAATTAAGTAATCAAGAAACATGTA
TAAATAAGAATATCAACATTAAAGATATGAGAAAAAGTCTTTCAAAATTATAATGAT


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F036JQ C 1
AF RR4F036TF U 1
AF RR4B382JQ C 3
AF RR4CX93TF U 3
AF RR4B382TF U 3
BS 1 4 RR4F036JQ
BS 5 295 RR4F036TF
BS 296 367 RR4CX93TF
BS 368 368 RR4B382TF
BS 369 386 RR4CX93TF
BS 387 387 RR4B382TF
BS 388 500 RR4CX93TF
BS 501 537 RR4B382TF

RD RR4F036JQ 295 0 0
GGATAATCATTCCATGTTAATTTAAAACACGAAAATAACAAGAAAATAAAAAGAAACAAA
TGGCCATCAGTTCAAATGTTATTATGTTTGCCGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTT
CAACAGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCGAATCATTATTGTAAGAAAACACGAA
GCAAATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGT
CTTGCAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTTTAATACTTCCAAAGACGAC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR4F036TF 295 0 0
GGAT
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ATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCTTG
CAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGAC

QA 5 295 5 295
DS 

RD RR4B382JQ 535 0 0
GG
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CATCAGTTCAAATGTTATTATGTTTGCCGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTTCAAC
AGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCGAATCATTATTGTAAGAAAACACGAAGCAA
ATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCTTG
CAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAAAAGA
TTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACAGGCC
ATGAAAGTGTATGGAAATTCTTAGTCAGTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTATTAT
GTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTATAATCAATTAAGTAATCAAGAAACATGTATAAA
TAAGAATATCAACATTAAAGATATGAGAAAAAGTCTTTCAAAATTATAATGAT

QA 3 535 3 535
DS 

RD RR4CX93TF 498 0 0
GG
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CATCAGTTCAAATGTTATTATGTTTGCCGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTTCAAC
AGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCGAATCATTATTGTAAGAAAACACGAAGCAA
ATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCTTG
CAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAAAAGA
TTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACAGGCC
ATGGAAGTGTATGGAAATTCTTCGTCAGTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTATTAT
GTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTATAATCAATTAAGTAATCAAGAAACATGTATAAA
TAAGAATATCAACATT

QA 3 498 3 498
DS 

RD RR4B382TF 535 0 0
GG
AATCATTCCATGCTAATTTAAAACACGAAAATAACAAGAAAATAAAAAGAAACAAATGGC
CATCAGTTCAAATGTTATTATGTTTGCCGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTTCAAC
AGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCGAATCATTATTGTAAGAAAACACGAAGCAA
ATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCTTG
CAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAAAAGA
TTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACAGGCC
ATGAAAGTGTATGGAAATTCTTAGTCAGTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTATTAT
GTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTATAATCAATTAAGTAATCAAGAAACATGTATAAA
TAAGAATATCAACATTAAAGATATGAGAAAAAGTCTTTCAAAATTATAATGAT

QA 3 535 3 535
DS 



AS 1 4

CO CL2128Contig1 1102 4 29 U
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CTTGTCATGGCCAAGATTGGCATCAACCCAATCATGATGAGTGCTGGAGAGCTTGAGAGC
GGGAACGCAGGAGAGCCAGCCAAGCTTATCCGTCAAAGGTACCGTGAGGCAGCAGACCTG
ATCAGGAAAGGAAAGATGTGTTGTCTCTTCATCAACGATCTCGACGCTGGTGCTGGTCGT
ATGGGTGGTACCACTCAGTACACTGTCAACAACCAGATGGTTAACGCAACACTCATGAAC
ATCGCTGACAACCCCACCAACGTCCAGCTCCCAGGAATGTACAACAAGGAAGAAAACGCG
CGTGTCCCGATCATCGTCACCGGTAACGATTTCTCCACTCTCTACGCTCCTCTCATCCGT
GATGGACGTATGGAGAAGTTCTACTGGGCCCCGACCCGTGAGGACCGTATCGGTGTGTGC
AAGGGTATCTTCAGGACTGACAGTGTCAAGGATGAAGACATTGTCACGCTTGTTGACCAG
TTCCCTGGCCAATCCATCGATTTCTTTGGTGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGACGAA
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AGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTAC
GGTAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAATAC
CTTAACGAGGCCGCTTTGGGAGACGCAAACGCCGACGCTATTGGCCGTGGAACTTTCTTC
GGTTCCACATGAGGGAAAAGTGCACAGTAAAGTGAAGTTGCATGTTCCTGAAGGGTGTTA
ATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCAACGGCTAGAAGTGACTGATGGAACTTGTGTC
TACAACTTTTGAGCTTTCTCCTACTTATAATTAAATCTCCTGTTTTTTTTTTCTTTGTAA
TTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTTGTTTTTATGATTATGTGCAAACGTTCATATA
TTACAAGTTGCCCTTTTATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ52TF U 1
AF RR4G634TF U 251
AF RR4G634JQ C 390
AF RR4DO94TF U 762
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RD RR4DJ52TF 801 0 0
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CTTGTCATGGCCAAGATTGGCATCAACCCAATCATGATGAGTGCTGGAGAGCTTGAGAGC
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ATCAGGAAAGGAAAGATGTGTTGTCTCTTCATCAACGATCTCGACGCTGGTGCTGGTCGT
ATGGGTGGTACCACTCAGTACACTGTCAACAACCAGATGGTTAACGCAACACTCATGAAC
ATCGCTGACAACCCCACCAACGTCCAGCTCCCAGGAATGTACAACAAGGAAGGAAACGCG
CGTGTCCCGATCATCGTCACCGGTAACGATTTCTCCACTCTCTACGCTCCTCTCATCCGT
GACGGACGTATGGAGAAGTTCTACTGGGCCCCGACCCGTGAGGACCGTATCGGTGTGTGC
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TTCCCTGGCCAATCCATCGATTTCTTTGGCGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGATGAA
GTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCA
AGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTAC
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CTTAACGAGGCCGCTTTGGGA

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DS 

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G
CACTCAGTACACTGTCAACAACCAGATGGTTAACGCAACGCTCAT*AACATCGCTGACAA
CCCCACCAACGTCCAGCTCCCAGGAATGTACAACAAGGAAGAAAACGCGCGTGTCCCGAT
CATCGTCACCGGTAACGATTTCTCCACTCTCTACGCTCCTCTCATCCGTGATGGACGTAT
GGAGAAGTTCTACTGGGCCCCGACCCGTGAGGACCGTATCGGTGTGTGCAAGGGTATCTT
CAGGACTGACAGTGTCAAGGATGAAGACATTGTCACGCTTGTTGACCAGTTCCCTGGCCA
ATCCATCGATTTCTTTGGTGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGACGAAGTGAGGAAGTT
CGTCGAGGGACTTGGGGTGGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCC
TCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTACGGTAACATGCT
TGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGC
CGCTTTGGGAGACGCAAACGCCGACGCTATTGGCCGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATG
AGGGAAAAGTGCACAGTAAAGTGAAGTTGCATGTTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCG
GTCAAGAACTTTGATCCAACGGCTAGAAGTGACTGATGGAACTTGTGTCTACAACTTTTG
AGCTTTCTCCTACTTATAATTAAATCTCCTGTT

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR4G634JQ 686 0 0
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CCCGACCCGTGAGGACCGTATCGGTGTGTGCAAGGGTATCTTCAGGACTGACAGTGTCAA
GGATGAAGACATTGTCACGCTTGTTGACCAGTTCCCTGGCCAATCCATCGATTTCTTTGG
TGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGACGAAGTGAGGAAGTTCGTCGAGGGACTTGGGGT
GGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACC
AGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTACGGTAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAA
CGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGCCGCTTTGGGAGACGCAAA
CGCCGACGCTATTGGCCGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAAAGTGCACAGTA
AAGTGAAGTTGCATGTTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCA
ACGGCTAGAAGTGACTGATGGAACTTGTGTCTACAACTTTTGAGCTTTCTCCTACTTATA
ATTAAATCTCCTGTTTTTTTTTTCTTTGTAATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTT
GTTTTTATGATTATGTGCAAAC
ACCC

QA 1 682 1 682
DS 

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G
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GGCCGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAAAGTGCACAGTAA*GTGAATTCGCG
GGTTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCAACGGCTAGAAGTG
ACTGATGGAACTTGTGTCTACAACTTTTGAGCTTTATCCTACTTATAATTAAATCTCCTG
TTTTTTTT**CTTTGTAATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTT*GTTTTTATGATTA
TGTGCAAACGTTCATATATTACAAGTTGCCCTTTTATCAT

QA 2 341 2 341
DS 



AS 1 5

CO CL2129Contig1 761 5 12 U
GGGAGACAAAGCGACACCGTTTCAGCCAAAGGTAATACAAAATGTTGACCGGTTTTTTTA
AACACAAAGCATTGACCTGTTATTGATCAGTTTCGATCATTATACATACAAACAAGGGTA
TTAAAAGTTACAAAACAAACTTGATTTTTACATATGACTAGTTCAAGTTGACGATGCTTC
TTGTTTTTTTTGTTTCTCGGCTTTCTCTGCCTCTAACTTCCTCAGAGTACTCGAACTAAT
CTTATTCCCACTTGATCCATCAGAAACTATTTCCACAACCTCAATCCTGAGTTGGGAAAG
ACCTCTTTCTGCTCTTTTTCTGTTAACTGATAAGCCACCTGGTAACGCCTCTTTGCTGAC
AACAATAGCTTCCAATGCTTCATCGACGATTGAAGGACCATATGGATCGGTAATGGGTTC
GGTTTGCACAACCAACTCAGGTTTGATAGACTTGAGATAGGTCTGCACATTAAGCATCCT
TTCTTCAATGGGTTGTATCATCTCAGCAAATTGCTTGTTGTTCAACATGGGGCCATCACA
TACTCCCACCACTATTCGATCCCTCGCTAGCTCCGCCGCTGCCTTGAGGAAAGTGCGATG
ACCATCGTGTAATCGATCAAACGTACCACCTAGAACGACCGCACCGAACGAATCCGCTGT
CGAAACCTTCGTCTCCTCCGCTGCTGCCATTTGCCGTAGAAGAAAAGACCTCCTCTTCCA
CCAAATTACATGTCTTCTTCTCTTAGATTCACCAAACCCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H234JQ U 3
AF RR4D646JQ U 37
AF RR4D646TF C 81
AF RR4GV91JQ U 1
AF RR4GV91TF C 61
BS 1 139 RR4GV91JQ
BS 140 140 RR4D646JQ
BS 141 286 RR4GV91JQ
BS 287 287 RR4D646JQ
BS 288 347 RR4GV91JQ
BS 348 348 RR4D646JQ
BS 349 666 RR4GV91JQ
BS 667 667 RR4D646JQ
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BS 677 744 RR4GV91JQ
BS 745 761 RR4GV91TF

RD RR4H234JQ 108 0 0
GAGACAAAGCGACACCGTTTCAGCCAAAGGTAATACAAAATGTTGACCGGTTTTTTTAAA
CACAAAGCATTGACCTGTTATTGATCAGTTTCGATCATTATACATACA

QA 1 108 1 108
DS 

RD RR4D646JQ 679 0 0
C
CAAAATGTTGACCGGTTTTTTTAAACACAAAGCATTGACCTGTTATTGATCAGTTTCGAT
CATTATACATACAAACAAGGGTATTAAAAGTTACAAAACAAACTTGATTTTTACATATGA
CTAGTTCAAGTTGACGATGCTTCTTGTTTTTTTTGTTTCTCGGCTTTCTCTGCCTCTAAC
TTCCTCAGAGTACTCGAACTAATCTTATTCCCACTTGATCCATCAAAAACTATTTCCACA
ACCTCAATCCTGAGTTGGGAAAGACCTCTTTCTGCTCTTTTTCTGTTAACTGATAAGCCA
CCTGGTAACGCCTCTTTGCTGACAACAATAGCTTCCAATGCTTCATCGACGATTGAAGGA
CCATATGGATCGGTAATGGGTTCGGTTTGCACAACCAACTCAGGTTTGATAGACTTGAGA
TAGGTCTGCACATTAAGCATCCTTTCTTCAATGGGTTGTATCATCTCAGCAAATTGCTTG
TTGTTCAACATGGGGCCATCACATACTCCCACCACTATTCGATCCCTCGCTAGCTCCGCC
GCTGCCTTGAGGAAAGTGCGATGACCATCGTGTAATCGATCAAACGTACCACCTAGAACG
ACCGCACCGAACGAATCCGCTGTCGAAACCTTCGTCTCCTCCGCTGCTGCCATTTGCCGT
AGAAGAAAAGACCTCCTC

QA 2 679 2 679
DS 

RD RR4D646TF 635 0 0
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TTGATTTTTACATATGACTAGTTCAAGTTGACGATGCTTCTTGTTTTTTTTGTTTCTCGG
CTTTCTCTGCCTCTAACTTCCTCAGAGTACTCGAACTAATCTTATTCCCACTTGATCCAT
CAGAAACTATTTCCACAACCTCAATCCTGAGTTGGGAAAGACCTCTTTCTGCTCTTTTTC
TGTTAACTGATAAGCCACCTGGTAACGCCTCTTTGCTGACAACAATAGCTTCCAATGCTT
CATCGACGATTGAAGGACCATATGGATCGGTAATGGGTTCGGTTTGCACAACCAACTCAG
GTTTGATAGACTTGAGATAGGTCTGCACATTAAGCATCCTTTCTTCAATGGGTTGTATCA
TCTCAGCAAATTGCTTGTTGTTCAACATGGGGCCATCACATACTCCCACCACTATTCGAT
CCCTCGCTAGCTCCGCCGCTGCCTTGAGGAAAGTGCGATGACCATCGTGTAATCGATCAA
ACGTACCACCTAGAACGACCGCACCGAACGAATCCGCTGTCGAAACCTTCGTCTCCTCCG
CTGCTGCCATTTGCCGTAGAAGAAAAGACCTCCTC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4GV91JQ 744 0 0
GGGAGACAAAGCGACACCGTTTCAGCCAAAGGTAATACAAAATGTTGACCGGTTTTTTTA
AACACAAAGCATTGACCTGTTATTGATCAGTTTCGATCATTATACATACAAACAAGGGTA
TTAAAAGTTACAAAACAAAGTTGATTTTTACATATGACTAGTTCAAGTTGACGATGCTTC
TTGTTTTTTTTGTTTCTCGGCTTTCTCTGCCTCTAACTTCCTCAGAGTACTCGAACTAAT
CTTATTCCCACTTGATCCATCAGAAACTATTTCCACAACCTCAATCTTGAGTTGGGAAAG
ACCTCTTTCTGCTCTTTTTCTGTTAACTGATAAGCCACCTGGTAACGTCTCTTTGCTGAC
AACAATAGCTTCCAATGCTTCATCGACGATTGAAGGACCATATGGATCGGTAATGGGTTC
GGTTTGCACAACCAACTCAGGTTTGATAGACTTGAGATAGGTCTGCACATTAAGCATCCT
TTCTTCAATGGGTTGTATCATCTCAGCAAATTGCTTGTTGTTCAACATGGGGCCATCACA
TACTCCCACCACTATTCGATCCCTCGCTAGCTCCGCCGCTGCCTTGAGGAAAGTGCGATG
ACCATCGTGTAATCGATCAAACGTACCACCTAGAACGACCGCACCGAACGAATCCGCTGT
CGAAAC*TTCGTCTCTTCCGCTGCTGCCATTTGCCGTAGAAGAAAAGACCTCCTCTTCCA
CCAAATTACATGTCTTCTTCTCTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4GV91TF 701 0 0
AACACAAAGCATTGAC*TGTTATTGATCAGTTTCGATCATTATACATACAAACAAGGGTA
TTAAAAGTTACAAAACAAAGTTGATTTTTACATATGACTAGTTCAAGTTGACGATGCTTC
TTGTTTTTTTTGTTTCTCGGCTTTCTCTGCCTCTAACTTCCTCAGAGTACTCGAACTAAT
CTTATTCCCACTTGATCCATCAGAAACTATTTCCACAACCTCAATCTTGAGTTGGGAAAG
ACCTCTTTCTGCTCTTTTTCTGTTAACTGATAAGCCACCTGGTAACGTCTCTTTGCTGAC
AACAATAGCTTCCAATGCTTCATCGACGATTGAAGGACCATATGGATCGGTAATGGGTTC
GGTTTGCACAACCAACTCAGGTTTGATAGACTTGAGATAGGTCTGCACATTAAGCATCCT
TTCTTCAATGGGTTGTATCATCTCAGCAAATTGCTTGTTGTTCAACATGGGGCCATCACA
TACTCCCACCACTATTCGATCCCTCGCTAGCTCCGCCGCTGCCTTGAGGAAAGTGCGATG
ACCATCGTGTAATCGATCAAACGTACCACCTAGAACGACCGCACCGAACGAATCCGCTGT
CGAAAC*TTCGTCTCTTCCGCTGCTGCCATTTGCCGTAGAAGAAAAGACCTCCTCTTCCA
CCAAATTACATGTCTTCTTCTCTTAGATTCACCAAACCCCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

CO CL2130Contig1 859 4 11 U
GCCCTACCATTAGCCCATTGGCTATATCCATTGGACTATTTCTTTTGTCCACAAGATTCT
CTTATTCATTCAATAATTTGAGAAACACCACCAACAAATAATCGTACAAACGATAAACAT
GCGTTACATAGCTTTTACACAAAAGTCACTAGCATCCTCTGTTTTGGGAGAGAAACAGAG
GAGCTCAGGCTTTTAGCCGTAGCAGCGGATTGGGTCGGTGCAGCCTTTGGCACAGGACTG
CCCGAGGCCGAACCTTCCACCCTTGGACAGATACTGCTGCTGTTGCTCCTCGGCTCTGTA
GAATTTCTTAGCAGGCAAGATCTCAGTCATGATCTTCCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACG
TTCAAGTGACTCGCGGGCTAGTTTCTCCTGCTCGGGTGTGTAGTAGTATAGCCCTGATCG
GTATCGGGTTCCCACATCATTTCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGCCTAGACCA
GAACAAATCAAGGAGAGACTCAAAGGTGCAGTCTTTGGGATCGTACTGAACCCTAACGAC
CTCGGCATGTCCCGTGGTTTCAGAACAGACATCCTCGTACGAAGGATTGTGGGTGATCCC
TTGTGTGTATCCAACCTCTGTGTGAGTCACTCCTGGGAGCCTCTGAAACGCCAGCTCCAC
GCCCCAGAAACATCTCGCGGCGAATTGCGCAAAGTGATTTCCCGGCGCCGGAGAGTCATC
GTCGTTTCCCTGGGCGATCGGAGAAGGATCCATGCTTCTTTGCCCGCCTGATCCTAAACC
GAACCTGTTGAGTATGTTCATGGAGACTTTTTTCTAGAGGAGGAAGAGAGGACACGAGAT
GGAATTAGAATTTAGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H106JQ U 1
AF RR4H106TF C 1
AF RR4AI87JQ U 47
AF RR4AI87TF C 65
BS 1 379 RR4H106JQ
BS 380 380 RR4AI87JQ
BS 381 441 RR4H106JQ
BS 442 442 RR4AI87JQ
BS 443 458 RR4H106JQ
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BS 460 480 RR4H106JQ
BS 481 481 RR4AI87JQ
BS 482 567 RR4H106JQ
BS 568 712 RR4AI87JQ
BS 713 859 RR4AI87TF

RD RR4H106JQ 569 0 0
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CTTATTCATTCAATAATTTGAGAAACACCACCAACAAATAATCGTACAAACGATAAACAT
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CCCGAGGCCGAACCTTCCACCCTTGGACAGATACTGCTGCTGTTGCTCCTCGGCTCTGTA
GAATTTCTTAGCAGGCAAGATCTCAGTCATGATCTTCCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACG
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CTCGGCATGTCCCGTGGTTTCAGAACA
CC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4H106TF 569 0 0
GCCCTACCATTAGCCCATTGGCTATATCCATTGGACTATTTCTTTTGTCCACAAGATTCT
CTTATTCATTCAATAATTTGAGAAACACCACCAACAAATATTCGTACAAACGATAAACAT
GCGTTACATAGCTTTTACACAAAAGTCACTAGCATCCTCTGTTTTGGGAGAGAAACAGAG
GAGCTCAGGCTTTTAGCCGTAGCAGCGGATTGGGTCGGTGCAGCCTTTGGCACAGGACTG
CCCGAGGCCGAACCTTCCACCCTTGGACAGATACTGCTGCTGTTGCTCCTCGGCTCTGTA
GAATTTCTTAGCAGGCAAGATCTCAGTCATGATCTTCCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACG
TTCAAGTGACTCGCGGGCTGGTTTCTCCTGCTCGGGTGTGTAGTAGTATAGCCCTGATCG
GTATCGGGTTCCCACATCATT*CCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGCCTAGACCA
GAACAAATCAAGGAGAGACTCAAAGGTGCAGTCTTTGGGATCGTACTGAACCCTAACGAC
CTCGGCATGTCCCGTGGTTTCAGAACA
CC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4AI87JQ 666 0 0
GT
CCACAAGATTCTCTTATTCATTCAATAATTTGAGAAACACCACCAACAAATAATCGTACA
AACGATAAACATGCGTTACATAGCTTTTACACAAAAGTCACTAGCATCCTCTGTTTTGGG
AGAGGAACAGAGGAGCTCAGGCTTTTAGCCGTAGCAGCGGATTGGGTCGGTGCAGCCTTT
GGCACAGGACTGCCCGAGGCCGAACCTTCCACCCTTGGACAGATACTGCTGCTGTTGCTC
CTCGGCTCTGTAAAATTTCTTAGCAGGCAAGATCTCAGTCATGATCTTCCTCTCCATTTT
TTCCTGGTGACGTTCAAGTGACTCGCGGGCTAGTTTCTCCTGCTCGGGTGTGTAGTAGTA
TAGCCCTGATCGGTATCGGGTTCCCACATCATTTCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATC
ATGCCTAGACCAGAACAAATCAAGGAGAGACTCAAAGGTGCAGTCTTTGGGATCGTACTG
AACCCTAACGACCTCGGCATGTCCCGTGGTTTCAGAACAGACATCCTCGTACGAAGGATT
GTGGGTGATCCCTTGTGTGTATCCAACCTCTGTGTGAGTCACTCCTGGGAGCCTCTGAAA
CGCCAGCTCCACGCCCCAGAAACATCTCGCGGCGAATTGCGCAAAGTGATTTCCCGGCGC
CGGA

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR4AI87TF 795 0 0
TTCATTCAATAATTTGAGAAACACCACCAACAAATAATCGTACAAACGATAAACATGCGT
TACATAGCTTTTACACAAAAGTCACTAGCATCCTCTGTTTTGGGAGAGGAACAGAGGAGC
TCAGGCTTTTAGCCGTAGCAGCGGATTGGGTCGGTGCAGCCTTTGGCACAGGACTGCCCG
AGGCCGAACCTTCCACCCTTGGACAGATACTGCTGCTGTTGCTCCTCGGCTCTGTAGAAT
TTCTTAGCAGGCAAGATCTCAGTCATGATCTTCCTCTCCATTTTTTCCTGGTGACGTTCA
AGTGACTCGCGGGCTAGTTTCTCCTGCTCGGGTGTGTAGTAGTATAGCCCTGATCGGTAT
CGGGTTCCCACATCATTTCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGCCTAGACCAGAAC
AAATCAAGGAGAGACTCAAAGGTGCAGTCTTTGGGATCGTACTGAACCCTAACGACCTCG
GCATGTCCCGTGGTTTCAGAACAGACATCCTCGTACGAAGGATTGTGGGTGATCCCTTGT
GTGTATCCAACCTCTGTGTGAGTCACTCCTGGGAGCCTCTGAAACGCCAGCTCCACGCCC
CAGAAACATCTCGCGGCGAATTGCGCAAAGTGATTTCCCGGCGCCGGAGAGTCATCGTCG
TTTCCCTGGGCGATCGGAGAAGGATCCATGCTTCTTTGCCCGCCTGATCCTAAACCGAAC
CTGTTGAGTATGTTCATGGAGACTTTTTTCTAGAGGAGGAAGAGAGGACACGAGATGGAA
TTAGAATTTAGACCC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL2131Contig1 1216 2 2 U
GAAGAAAAAAGGTCTCAAGAAGTCTGGTGCCAGTGGTCCCAGAGCAGGTGAAGGAGGGTA
TGGGTACTTATGTGAACCTTGGTGGTGGGCTGGGATGATAACCATGATTGTTGGGGAGAT
AGCAAACTTTGCAGCCTATGCATTTGCACCTGCTATTCTGGTGACACCTCTGGGAGCGCT
AAGTATAATTTTCAGTTCAGTGCTTGCACATTTTATATTACAAGAGAAGTTGCATATGTT
TGGTATACTTGGCTGCGTCCTCTGTGTTGTTGGATCCACAACGATCGTCTTACATGCACC
TCACGAGCAGGACATTGAATCAGTCAAGCAAGTATGGTCCCTTGCTACCGAACCAGGTTT
CCTTGCGTACACTGCTCTGGTGTTAGTTGTGGTACTTGCTCTGATCTTCTATTACGAGCC
GCGTTATGGGAAGACGCATATGATAGTATACGTTGGGATTTGCTCACTAATGGGTTCTCT
TACTGTTATGAGTGTTAAAGCTGTGGCCATCGCCATAAAGCTGACATTTTCCGGGATGAA
CCAGTTCAAGTACTTCCACGCATGGATCTTCATCATAGTAGTGACCATATGTTGCCTTTT
GCAAATCAACTACTTGAACAAGGCTTTAGATAATTTCAACACCGCAGTCATATCTCCAGT
GTACTACGTAATGTTTACAACATTCACCATCTTAGCTAGTATGATCATGTTCAAGGACTG
GGCTTCTCAGAGCGGATTGCAAATTGCCACCGAGCTATGTGGCTTTGTGACCATTTTATC
AGGAACCTTTCTTCTCCACAAGACAAAAGACATGGGAAACAGTGCCAGCATACGTGGCAC
CACGGCCCAGTCTCCTAGAGAGACTCCTGTGTTCATCAACTCAGGTTCCACTCGCAGTAC
CAATTCCAATATTTAGGCTTTTGATTCTACAATTCTACGGCTAATATGGTAGGTCATCTG
ACGGCTTTGAACGAGTCCACGTAAGTAACAAAAGGCCTCAAAGAGAGCTTTCTTGGGGGT
GGCGATTTTTTTTTTTTAAAGAACAGAGGAAATGGGGTTTTGAAGGTATACTCTGTTTTA
GAGGAGGGGAAGGTTTTGAGCATGATTTGTTAGAGACATTATTTGATTTATTGCTTAATG
TTCTTTTTATTTAATTTTTGTTTATCATACTATGAGATATATGAAATTATTCAACAAAAA
GTTATTCGTTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GM86JQ C 646
BS 1 746 RR4GM86TF
BS 747 1216 RR4GM86JQ

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AGCAAACTTTGCAGCCTATGCATTTGCACCTGCTATTCTGGTGACACCTCTGGGAGCGCT
AAGTATAATTTTCAGTTCAGTGCTTGCACATTTTATATTACAAGAGAAGTTGCATATGTT
TGGTATACTTGGCTGCGTCCTCTGTGTTGTTGGATCCACAACGATCGTCTTACATGCACC
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CCTTGCGTACACTGCTCTGGTGTTAGTTGTGGTACTTGCTCTGATCTTCTATTACGAGCC
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GGCTTCTCAGAGCGGATTGCAAATTG

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DS 

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TGTGACCATTTTATCAGGAACCTTTCTTCTCCACAAGACAAAAGACATGGGAAACAGTGC
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TTCCACTCGCAGTACCAATTCCAATATTTAGGCTTTTGATTCTACAATTCTACGGCTAAT
ATGGTAGGTCATCTGACGGCTTTGAACGAGTCCACGTAAGTAACAAAAGGCCTCAAAGAG
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ATTATTCAACAAAAAGTTATTCGTTTTGATT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 4

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AGTATGTATAGCAAACCTATGAAGAGAAGCAAAAACCAAAGGATCTCTAGCATCTTCCAA
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AGCTGATTCCGTGCACGTGTCACATCATCGTCTGAAACTCGGCCGGCCAACCCGGTTATC
TCACGCATGATAGCATATGATAAATCATCTAAGCAATCAGCCTTAGCAACTGCGTACACG
CAGAAAAGGCCAGTATCCTTGTAGTTGGTGTTGAATGCCATTATGCTTTCTGCTATTTCA
TTAATGGCAACCCTCTGGGTCAGGGCAGAACCCATGTGTTTGCCACCACCAACATTTTTG
TTCCATGAACCCAACATGGTTTGCATAACCATAAGAGCAACGGAATCTGGATCTGCCCAA
GATGCTCCTTCAAAGGCAACAGCAAATTGTGCAAGGGGTAGGTCGTCATCAATCATTAGA
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TCCACCTCTTGCATTTCCCTGAGGATGACATCACGCTCGCGGTTAATCCTCTGCTCCTCG
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ATATGCTCTAGAAAATGAGCCGTCCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER46JQ U 1
AF RR4E582JQ U 10
AF RR4E582TF C 216
AF RR4CC80TF C 793
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BS 663 739 RR4ER46JQ
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TTATTATTTTACCACCGATGGGAAATTTATAAGATTACAGCAAAGGAAAACTCAAAATAA
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TTGTCCCAGATATACTTGTTGGCGACACGTCTAACCGTGTTGGCATCAACAGCATCGATC
CTTGCAAAGAGTTCAGCGGTTGGGATTCTTCTCCCATAGGTCAGCAGCTGACGACCAATA
TCTTCAGCAATTGGACTAGTTCCATCCATGTGAAGCAATAGCGACGATTTCAGCTGATTC
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ACCCTCTGGG
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TTGGATCGGACCAATGGCTGAGATTGCAAGGTCCTTGTCCCAGATATACTTGTTGGCGAC
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TCTTCTCCCATAGGTCAGCAGCTGACGACCAATATCTTCAGCAATTGGACTAGTTCCATC
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AACTCGGCCGGCCAACCCGGTTATCTCACGCATGATAGCATATGATAAATCATCTAAGCA
ATCAGCCTTAGCAACTGCGTACACGCAGAAAAGGCCAGTATCCTTGTAGTTGGTGTTGAA
TGCCATTATGCTTTCTGCTATTTCATTAATGGCAACCCTCTGGGTCAGGGCAGAACCCAT
GTGTTTGCCACCACCAACATTTTTGTTCCATGAACCCAACATGGTTTGCATAACCATAAG
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AACTAGCTGAGTA
C

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AAGGCAACAGCAAATTGTGCAAGGGGTAGGTCGTCCTCAATCATTCGAACCTCAGAGCCA
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TTGTTAAATAGCTTCTTCACTTGCCCAACAACTTCCTCATGCTTCACAGCTCCTGCCGCA
GCAATCACCATCCTGGAGGCTGTGTAATGAGTCTTAATGTAATTCTGAAGATCATTTCTG
GTGATAGACTTGATATTCTGAGCAGGTCCTAGAATAGTTCTTCCAAGAGGTGTGTATTGG
AAAGCAGTGGCGTGTAAATGGTCAAGAACAACTTCATCGGTTTGTCCCTCCACCTCTTGC
ATTTCCCTGAGGATGACATCACGCTCGCGGTTAATCCTCTGCTCCTCGAACTTAGAGTTC
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AAATGAGCCGTCCCC

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DS 



AS 1 5

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TCTCCATCTCTCGCATCATCTCCGGCTCGATCTCTCATCTCCTCCGATTTGGGTTTCGAT
CTCTCTCTTCTCCGACGCCGATCTCTCTCTTCTCTCAACTCGTCTTCATCGATCCATCGA
TCTCTCTCTCAGACTCTCTCATCTCCTCTCAAAGAGTCTCTCCATCGATCTCTCTCTCAT
CTCTCTCTCATCTCTCTCAGACCCTCTCGACGACCCACTCTTATCTCTCTCAGAGTCTCT
TCACGGAAGAGATAGAGATTGTTGCTCTCACTCTCTCAACCCTTTGAAGCTCTGAAGCTT
ATCTCCTCTGATTGTGAGAAAGTATGCATTTGAGAGGCCTGATGTACCAGCTGGCGAGCA
ATATGTTTTGAAGATAAATTATCCATTTAAGGATCCTGCACTTAAAGGCGAGTCTTTTTG
CGCTGTGCTCGGCTCTCACACCAGGTGCACTCTCATAGCTCTCTCCAGAGGTTCTTCTCA
GTCTCATCCTCCATCTAAAGTCATTATCCGAGAGGCTCCAAGTCAAGCATTAACAACTCA
AGACCATGTTGGTACCATGGAACTATAGCTGGTGGTGAGTCTTTGCTAGGAGAAGGAGAT
TGTACCTTTTGCTCAAGAACCTGGAGTTGCAGAGTACGCTACAGTTATGGAAAAGATTGT
GAGAGGGCTTAGTTTAAAGACATCATTTGGTGAACAAAGATTATGGTCGTTGTGTCCGTT
TGTGGTCGTTGTGTCCGTTTGTCCGTTTGATGATACTTACACTATAATGTGGTCGTTGTG
TCCGTTTGTAGAAGACGAGATTATGAACAGAGCATGATACATCTCTCAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DU90TF U 1
AF RR4E682TF U 1
AF RR4EL04TF U 4
AF RR4DU90JQ C 291
AF RR4E682JQ C 370
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TCTCTCTCTCAGACTCTCTCATCTCCTCTCAAAGAGTCTCTCCATCGATCTCTCTCTCAT
CTCTCTCTCATCTCTCTCAGACCCTCTCGACGACCCACTCTTATCTCTCTCAGAGTCTCT
TCACGGAAGAGATAGAGATTGTTGCTCTCACTCTCTCAACCCTTTGAAGCTCTGAAGCTT
ATCTCCTCTGATTGTGAGAAAGTATGCATTTGAGAGGCCTGATGTACCAGCTGGCGAGCA
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GTCTCATCCTCCATCTAAAGTCATTATCCGAGAGGCTCCAAGTCAAGCATTAACAACTCA
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DS 

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ACGCCGATCTCTCTCTTCTCTCAACTCGTCTTCATCGATCCATCGATCTCTCTCTCAGAC
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TAAAGACATCATTTGGTGAA
AAA

QA 15 754 15 754
DS 

RD RR4EL04TF 733 0 0
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TCTCTCTCTCTCTCTTCTCATCGACATCATACGCCGATCTCTCTCTTCTCCATCTCTCGC
ATCATCTCCGGCTCGATCTCTCATCTCCTCCGATTTGGGTTCCGATCTCTCTCTTCTCCG
ACGCCGATCTCTCTCTTCTCTCAACTCGTCTTCATCGATCCATCGATCTCTCTCTCAGAC
TCTCTCATCTCCTCTCAAAGAGTCTCTCCATCGATCTCTCTCTCATCTCTCTCTCATCTC
TCTCAGACCCTCTCGACGACCCACTCTTATCTCTCTCAGAGTCTCTTCACGGAAGAGATA
GAGATTGTTGCTCTCACTCTCTCAACCCTTTGAAGCTCTGAAGCTTATCTCCTCTGATTG
TGAGAAAGTATGCATTTGAGAGGCCTGATGTACCAGCTGGCGAGCAATATGTTTTGAAGA
TAAATTATCCATTTAAGGATCCTGCACTTAAAGGCGAGTCTTTTTGCGCTGTGCTCGGCT
CTCACACCAGGTGCACTCTCATAGCTCTCTCCAGAGGTTCTTCTCAGTCTCATCCTCCAT
CTAAAGTCATTATCCGAGAGGCTCCAAGTCAAGCATTAACAACTCAAGACCATGTTGGTA
CCATGGAACTATAGCTGGTGGTGAGTCTTTGCTAGGAGAA*GAGATTGTACCTTTTGCTC
A*GAACCTGGAGTTGCAGAGTACGCTACAGTTATGGAAAAGATTGTGAGAGGGCTTAGTT
TA

QA 12 733 12 733
DS 

RD RR4DU90JQ 603 0 0
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AGTCTTTTTGCGCTGTGCTCGGCTCTCACACCAGGTGCACTCTCATAGCTCTCTCCAGAG
GTTCTTCTCAGTCTCATCCTCCATCTAAAGTCATTATCCGAGAGGCTCCAAGTCAAGCAT
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AAAAGATTGTGAGAGGGCTTAGTTTAAAGACATCATTTGGTGAACAAAGATTATGGTCGT
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GGTCGTTGTGTCCGTTTGTAGAAGACGAGATTATGAACAGAGCATGATACATCTCTCAAT
TTT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4E682JQ 524 0 0
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CGGCTCTCACACCAGGTGCACTCTCATAGCTCTCTCCAGAGGTTCTTCTCAGTCTCATCC
TCCATCTAAAGTCATTATCCGAGAGGCTCCAAGTCAAGCATTAACAACTCAAGACCATGT
TGGTACCATGGAACTATAGCTGGTGGTGAGTCTTTGCTAGGAGAAGGAGATTGTACCTTT
TGCTCAAGAACCTGGAGTTGCAGAGTACGCTACAGTTATGGAAAAGATTGTGAGAGGGCT
TAGTTTAAAGACATCATTTGGTGAACAAAGATTATGGTCGTTGTGTCCGTTTGTGGTCGT
TGTGTCCGTTTGTCCGTTTGATGATACTTACACTATAATGTGGTCGTTGTGTCCGTTTGT
AGAAGACGAGATTATGAACAGAGCATGATACATCTCTCAATTTT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 4

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AAAATTAAAAGCGTATAGAGATTTGTGACTAGAAAACAAATGTCGTGTATCTCACTATCT
CAACTAAAACTGAAAACAAAAATTTTCTTAGAGATTGATGTAAAAAATCAAATCAAGTAC
TGAACTAACCGGGATCGGTTCGTCATGGGTCTTTCAAATTACTCACATTGGTAGCTTTTG
GTTTTGGATTTGTGGTTTCATCTTCACGGCTGAGTTCTGGGCTCCATCTACTTATCGCTT
GCTCTTCCACTCTGTAGTTCTCCAAACACATAGGCAGGTTCACATCCTCTCTATTGGAGT
TACCACTGACATGGAGAGTCAACAACGTTTTGGCAACACTCCCGCTCAACCGAACAGCAC
AATGGATATCTGACCACACTCTTAACCGGTCACTATCACCAAACTGAACCAAAACAGAGT
ATTCAGAGTGGACAAGAGATGGATGGTGACGGTACGCCACAAAATCAACACCGTATTGCA
GCCCGGATTTCAATACCCAGTTCTTGGATCGTAAATGTAAATAAGCTTTGAAAAACACCG
GGAAGTTTGGTCTTTTTGATTTCATGTACATCCATGTGTCTACTTCGTTCTCCAAGAAAC
GACCTTGAAGGGTGAGTTTGATGCATTTGAGGATGTAGAGCAAATAGAAAGCTTCTTCAA
AGGACAAATGAATCCATTTCTTGTCTTTCTCAGCGGACAGGACGAGTCTGCCGAAACAAC
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GGGAACCGGATGACTCTGTTTTGGCTAGAGATAGCTGGAGCTCTGAGACTGATTTTGAAA
TAGGTTCTGCAAGAGCCTCTGCTTCTGCGCCTTTTGATTTCCATCTTGGCGCCATGGAAC
TAAGCTGATTTGTCGTGTCTGATGTCGGTTTAACTTCTCTATCAATCCGCCGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
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AF RR4GJ58JQ U 1
AF RR4GJ58TF C 191
AF RR4DU38JQ U 192
AF RR4DU38TF C 368
BS 1 598 RR4GJ58JQ
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BS 600 696 RR4GJ58JQ
BS 697 958 RR4DU38JQ

RD RR4GJ58JQ 696 0 0
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CAACTAAAACTGAAAACAAAAATTTTCTTAGAGATTGATGTAAAAAATCAAATCAAGTAC
TGAACTAACCGGGATCGGTTCGTCATGGGTCTTTCAAATTACTCACATTGGTAGCTTTTG
GTTTTGGATTTGTGGTTTCATCTTCACGGCTGAGTTCTGGGCTCCATCTACTTATCGCTT
GCTCTTCCACTCTGTAGTTCTCCAAACACATAGGCAGGTTCACATCCTCTCTATTGGAGT
TACCACTGACATGGAGAGTCAACAACGTTTTGGCAACACTCCCGCTCAACCGAACAGCAC
AATGGATATCTGACCACACTCTTAACCGGTCACTATCACCAAACTGAACCAAAACAGAGT
ATTCAGAGTGGACAAGAGATGGATGGTGACGGTACGCCACAAAATCAACACCGTATTGCA
GCCCGGATTTCAATACCCAGTTCTTGGATCGTAAATGTAAATAAGCTTTGAAAAACACCG
GGAAGTTTGGTCTTTTTGATTTCATGTACATCCATGTGTCTACTTCGTTCTCCAAGAAGC
GACCTTGAAGGGTGAGTTTGATGCATTTGAGGATGTAGAGCAAATAGAAAGCTTCTTCAA
AGGACAAATGAATCCATTTCTTGTCTTTCTCAGCGG

QA 1 696 1 696
DS 

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ATTGTGTTTCATC
TCACGGCTGAGTTCTGGGCTCCATCTACTTATCGCTTGCTCT*CCACTCTGTAGTTCTCC
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AACGTTTTGGCAACACTCCCGCTCAACCGAACAGCACAATGGATATCTGACCACACTCTT
AACCGGTCACTATCACCAAACTGAACCAAAACAGAGTATTCAGAGTGGACAAGAGATGGA
TGGTGACGGTACGCCACAAAATCAACACCGTATTGCAGCCCGGATTTCAATACCCAGTTC
TTGGATCGTAAATGTAAATAAGCTTTGAAAAACACCGGGAAGTTTGGTCTTTTTGATTTC
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TCTGGCTCAACGGCTAGAAGCACGTTGCAACTCGAGAGGGAACCGGATGACTCTGTTTTG
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GTCGGTTTAACTTCTCTATCAATCCGCCGC
CC

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DS 

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GTGGTTTCATCT
TCACGGCTGAGTTCTGGGCTCCATCTACTTATCGCTTGCTCTTCCACTCTGTAGTTCTCC
AAACACATAGGCAGGTTCACATCCTCTCCATTGGAGTTACCACTGACATGGAGAGTCAAC
AACGTTTTGGCAACACTCCCGCTCAACCGAACAGCACAATGGATATCTGACCACACTCTT
AACCGGTCACTATCACCAGACTGAACCAAAACAGAGTATTCAGAGTGGACAAGAGATGGA
TGGTGACGGTACGCCACAAAATCAACACCGTATTGCAGCCCGGATTTCAATACCCAGTTC
TTGGATCGTAAATGTAAATAAGCTTTGAAAAACACCGGGAAGTTTGGTCTTTTTGATTTC
ATGTACATCCATGTGTCTACTTCGTTCTCCAAGAAACGACCTTGAAGGGTGAGTTTGATG
CATTTGAGGATGTAGAGCAAATAGAAAGCTTCTTCAAAGGACAAATGAATCCATTTCTTG
TCTTTCTCAGCGGACAGGACGAGTCTGCCGAAACAACAGCGGCCGAGCAGCTTAGCTTGC
TCTGGCTCAACGGCTAGAAGCACGTTGCAACTCGAGAGGGAACCGGATGACTCTGTTTTG
GCTAGAGATAGCTGGAGCTCTGAGACTGATTTTGAAATAGGTTCTGCAAGAGCCTCTGCT
TCTGCGCCTTTTGATTTCCATCTTGGCGCCATGGAACTAAGCTGATTTGTCGTGTCTGAT
GTCGGTTTAACTTCTCTATCAATCCGCCGCGATCC

QA 13 767 13 767
DS 

RD RR4DU38TF 591 0 0
ATCTGACCACACTCTTAACCGGTCACTATCACCAGACTGAACCAAAACAGAGTATTCAGA
GTGGACAAGAGATGGATGGTGACGGTACGCCACAAAATCAACACCGTATTGCAGCCCGGA
TTTCAATACCCAGTTCTTGGATCGTAAATGTAAATAAGCTTTGAAAAACACCGGGAAGTT
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AAGGGTGAGTTTGATGCATTTGAGGATGTAGAGCAAATAGAAAGCTTCTTCAAAGGACAA
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GGATGACTCTGTTTTGGCTAGAGATAGCTGGAGCTCTGAGACTGATTTTGAAATAGGTTC
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ATTTGTCGTGTCTGATGTCGGTTTAACTTCTCTATCAATCCGCCGC
GATCC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 4

CO CL2135Contig1 1369 4 7 U
GGATTTTAGGAGATGCTCCAAGCCTTTTCTTTTGCTTTCTTCCAACGGATTTCTCAAGAC
TTCATCTTTAATGCAGGAAACACCAGCTACATCGATCCTTTGATGAATCTAGCAACATCT
GAGATCAAAGCTAGACTTGTTGAGAATTATCGTCGCTCAGTCTATGCTAAATCTGCTAAA
TCTCGGATCCGTGAATTAGCTAGCATTGAAGGACATCATGAGATGGAAGTGAGAAAGGAA
AGCGAAGCGAGTTGGTTTAAACAGCTAAGGACTTTAACAAAGAGATCGTTTGTGAACATG
TGCCGCGATATTGGGTACTACTGGTCAAGAATTGTGATCTACATTGTCGTATCCATCTGT
GTTGGGACCATCTTTTACGATGTGGGACACAGCTACACATCGATCTTGGCTCGGGTTTCT
TGTGGTGGATTCATTACTGGTTTCATGACTTTCATGTCCATTGGAGGGTTTCCTTCTTTC
ATTGAAGAGATGAAAGTGTTCTACAAAGAGAGACTGAGTGGTTACTACGGCGTTTCGGTT
TATATTATATCGAACTACGTCTCTTCTTTCCCGTTCTTGGTCGCGATTTCGGGCATCACG
GGGAGTATCACTTACAACATGGTGAAGTTCCGTCCAGGGTTCTCTCACTGGGCTTTCTTC
TGTCTCAACATATTCTTCTCTGTCTCGGTCATTGAGAGTCTCATGATGGTTGTTGCTTCT
CTCGTTCCAAACTTTTTGATGGGTCTCATTACCGGAGCTGGCATCATTGGAATCATCATG
ATGACTTCTGGATTCTTCCGTCTACTTCCAGATCTTCCAAAGATTTTCTGGCGATACCCA
ATTTCTTTCATGAGTTATGGTTCTTGGGCTATTCGGGGTGCATACAAGAACGATTTTCTT
GGACTAGAGTTTGAGCCTATGTTCGCGGGAGAACCCAAGATGACAGGAGAGGAAGTTATA
CAGAAAATATTTGGAGTTAAAGTCACACATTCCAAGTGGTGGGACTTAGCAGCGATTGTG
TTAATCCTTGTGTGTTACCGCATTCTCTTCTTCATAGTGTTGAAACTTAAGGAAAGAGCA
GAGCCAGCTTTGAAGGCGTTACAAGCAAAGAGAACGATGAGGAGTCTCAACAAGAGACCT
TCTTTTAGAAAAGTCCCATCTCTATCTTCCTTATCTTCAAGGAGACACCAAGCTCTACAT
TCACTTTCTTCTCAAGAAGGTCTTACTTCTCCAATCCATTAAAGACTACATATATATTTG
TATACACTTTGTGGCTTCGATTTGCTTTGCACATACAATAGTTTCAACATTATCTATATG
TATCAGCACCTGATGATTCTATGATCCAGCATTATTTTTTTCTTTCAGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D276TF U 1
AF RR4CS24TF U 459
AF RR4D155JQ C 695
AF RR4D276JQ C 814
BS 1 730 RR4D276TF
BS 731 874 RR4CS24TF
BS 875 875 RR4D155JQ
BS 876 982 RR4CS24TF
BS 983 983 RR4D155JQ
BS 984 1215 RR4CS24TF
BS 1216 1369 RR4D155JQ

RD RR4D276TF 735 0 0
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TTCATCTTTAATGCAGGAAACACCAGCTACATCGATCCTTTGATGAATCTAGCAACATCT
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TCTCGGATCCGTGAATTAGCTAGCATTGAAGGACATCATGAGATGGAAGTGAGAAAGGAA
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TGCCGCGATATTGGGTACTACTGGTCAAGAATTGTGATCTACATTGTCGTATCCATCTGT
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TATATTATATCGAACTACGTCTCTTCTTTCCCGTTCTTGGTCGCGATTTCGGGCATCACG
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TGTCTCAACATATTCTTCTCTGTCTCGGTCATTGAGAGTCTCATGATGGTTGTTGCTTCT
CTCGTTCCAA
CTTTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4CS24TF 757 0 0
G
ATTGGAGGGTTTCCTTCTTTCATTGAAGAGATGAAAGTGTTCTACAAAGAGAGGCTGAGT
GGTTACTACGGCGTTTCGGTTTATATTATATCGAACTACGTCTCTTCTTTCCCGTTCTTG
GTCGCGATTTCGGGCATCACGGGGAGTATCACTTACAACATGGTGAAGTTCCGTCCAGGG
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CTCATGATGGTTGTTGCTTCTCTCGTTCCAAACTTTTTGATGGGTCTCATTACCGGAGCT
GGCATCATTGGAATCATCATGATGACTTCTGGATTCTTCCGTCTACTTCCAGATCTTCCA
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GGGGTGCATACAAGAACGATTTTCTTGGACTAGAGTTTGAGCCTATGTTCGCGGGAGAAC
CCAAGATGACAGGAGAGGAAGTTATACAGAAAATATTTGGAGTTAAAGTCACACATTCCA
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TTTTTTTCTTTCAGT

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DS 

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CCCAAGATGACAGGAGAGGAAGTTATACAGAAAATATTTGGAGTTAAAGTCACACATTCC
AAGTGGTGGGACTTAGCAGCGATTGTGTTAATCCTTGTGTGTTACCGCATTCTCTTCTTC
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ACGATGAGGAGTCTCAACAAGAGACCTTCTTTTAGAAAAGTCCCATCTCTATCTTCCTTA
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ATCCATTAAAGACTACATATATATTTGTATACACTTTGTGGCTTCGATTTGCTTTGCACA
TACAATAGTTTCAACATTATCTATATGTATCAGCACCTGATGATTCTATGATCCAGCATT
ATTTTTTTCTTTCAGT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 5

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CCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTC
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CACTCTTGTGAACTTCCAAATGCAAACTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RR4DE56TF U 1
AF RR4FD65TF U 17
AF RR4DE56JQ C 20
AF RR4GV83TF U 17
AF RR4GV83JQ C 42
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GACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTAC
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GTTTTATCTATCTCTGCTATTATAAAAAAACAGACTTGTGGTTGGTTTTGTTTCTCTGGT
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CACTCTTGTGAAC
G

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FD65TF 677 0 0
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ATGCAAACTATTCT

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TTATAAAAAAACAGACTTGTGGTTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTACAATA
CATTCTTGTTTCTCTGCTTTTGA****ATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAAC
G

QA 1 654 1 654
DS 

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CTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGG
TCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAGGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACT
ATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTA
TTATAAAAATA**GACTTGTGGTTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAATA
CATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCC
AAAAAAA

QA 4 661 4 661
DS 

RD RR4GV83JQ 636 0 0
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GGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCCATGAAGAAGATTGA
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TGGAACGAGGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAA
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TTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAATACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTG
ATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAAC
TTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 5

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GCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTTGG
ATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATC
ATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGC
TGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCCGA
GTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGAAG
AAGAATTCGTTGGTTTATGTGAGTAACTTGTTTATTTTTTCAAAGATTAAGCAAAAAAAT
ACTTGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO35JQ C 59
AF RR4C818TF U 59
AF RR4GO35TF U 59
AF RR4D717TF U 1
AF RR4BZ06TF U 1
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BS 208 357 RR4BZ06TF
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BS 359 430 RR4BZ06TF
BS 431 431 RR4C818TF
BS 432 488 RR4BZ06TF

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GCTGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCC
GAGTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGA
A

QA 1 361 1 361
DS 

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TGGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTT
GGATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATA
TCATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACA
GCTGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCT
GAGTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATGTATGA
AGAAGAATTCGTTGGTTTATGTGAGTAACTTGTTTATTTTTTCAAAGATTAAGCAAAAAA
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4GO35TF 389 0 0
AATTTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTC
TGGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTT
GGATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATA
TCATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACA
GCTGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCC
GAGTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGA
AGAAGAATTCGTTGGTTTATGTGAGTAAC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4D717TF 436 0 0
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TTTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTG
GCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTTGG
ATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATC
ATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGC
TGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCTGA
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AAGAATTCGTTGGTTT

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DS 

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TTTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTG
GCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTTGG
ATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGCTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATC
ATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGC
TGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCTGA
GTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGAAG
AAGAATTCGTCGGTTTATGTGAGTAACTTGTTTATTTTTTCAAAGATTAAGCAAAAAAAT
ACTTGTTT

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 5

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ACAACTTTCATATCTTTAGGGAAAACAACCACATCTCCTTTCCCTATCTCAAAGACATCT
TCTTCTCTGTCGTATCCGTCAACGTTCACTTTGATCTTGCCTTCCACGAAATACATCGTC
TCTGTCTTCTTAAACGTCCATGGAAACTTGCTTGGACCACCTTCCCACTTGGGCCAAGAG
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TTGCCCATTGGATTTCGCAAACTCTGTTTACTGAAAGAGAAGTCGAAGTTTACAGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4A419JQ U 1
AF RR4A419TF C 1
AF RR4H934JQB U 20
AF RR4CL51JQ U 34
AF RR4CL51TF C 34
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BS 144 294 RR4A419JQ
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BS 670 718 RR4H934JQB

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TCTTCTCTGTCGTATCCGTCAACGTTCACTTTGATCTTGCCTTCCACGAAATACATCGTC
TCTGTCTTCTTAAACGTCCATGGAAACTTGCTTGGACCACCTTCCCACTTGGGCCAAGAG
GCGACGCCTAGTTGAGCAAGTTTGGAATCGGAAGG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4A419TF 718 0 0
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CATCAATACAAACACGTCCTAAATGATTTCCCGGTTTGCTTTCCGGTTCAGATTGGTAAT
AATAAATACTCCTATAAAAGAATAAGCTTTTCGGACACCATTAGATAAAGCTAGTTCCAA
ACTAAAAACCAGACATGCAACAAACTTAAACGACAAGGACACAACTTATCTTTCCACAGA
ATGAGGTTACACTAATCCTCTAAGTTATAGTGTTTCTTGACAGCTTCAGTTATC*CCCAA
ACAACTTTCATATCTTTAGGGAAAACAACCACATCTCCTTTCCCTATCTCAAAGACATCT
TCTTCTCTGTCGTATCCGTCAACGTTCACTTTGATCTTGCCTTCCACGAAATACATCGTC
TCTGTCTTCTTAAACGTCCATGGAAACTTGCTTGGACCACCTTCCCACTTGGGCCAAGAG
GCGACGCCTAGTTGAGCAAGTTTGGAATCGGAAGGTTGTCGGAGGATCTTGACTCCGTGA
ATCTCGATGGGAATTGAACCGGAGGGAGATACGATTGCTTCTTTAGGGTTTAGCTTGGTG
GTGATGATGGAAACGCAAACGCAGACAATCACGAGGAGGAGAGACAAAGTGAGCAAATGA
TTGCCCATTGGATTTCGCAAACTCTGTTTACTGAAAGAGAAGTCGAAGTTTAC
GGCCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4H934JQB 699 0 0
A
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AAATGATTTCCCGGTTTGCTTTCCGGTTCAGATTGGTAATAATAAATACTCCTATAAAAG
AACAAGCTTTTCGGACACCATTAGATAAAGCTAGTTCCAAACTAAAAACCAGACATGCAA
CAAACTTAAACGACAAGGACACAACTTATCTTTCCACAGAATGAGGTTACACTAATCCTC
TAAGTTATAGTGTTTCTTGACAGCTTCAGTTATCTCCCAAACAACTTTCATATCTTTAGG
GAAAACAACCACATCTCCTTTCCCTATCTCAAAGACATCTTCTTCTCTGTCGTATCCGTC
AACGTTCACTTTGATCTTGCCCTCCACGAAATACATCGTCTCTGTCTTCTTAAACGTCCA
TGGAAACTTGCTTGGACCACCTTCCCACTTGGGCCAAGAGGCGACGCCTAGTTGAGCAAG
TTTGGAATCGGAAGGTTGTCGGAGGATCTTGACTCCGTGAATCTCGATGGGAATTGAACC
GGAGGGAGATACGATTGCTTCTTTAGGGTTTAGCTTGGTGGTGATGATGGAAACGCAAAC
GCAGACAATCACGAGGAGGAGAGACAAAGTGAGCAAATGATTGCCCATCGGATTTCGCAA
ACTCTGTTTACTGAAAGAGAAGTCGAAGTTTACAGCCC

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR4CL51JQ 689 0 0
GG
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TCCTTTCCCTATCTCAAAGACATCTTCTTCTCTGTCGTATCCGTCAACGTTCACTTTGAT
CTTGCCTTCCACGAAATACATCGTCTCTGTCTTCTTAAACGTCCATGGAAACTTGCTTGG
ACCACCTTCCCACTTGGGCCAAGAGGCGACGCCTAGTTGAGCAAGTTTGGAATCGGAAGG
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TGCTTCTTTAGGGTTTAGCTTGGTGGTGATGATGGAAACGCAAACGCAGACAATCACGAG
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AGAGAAGTCGAAGTTTAC
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QA 3 680 3 680
DS 

RD RR4CL51TF 689 0 0
GG
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TTGCTTTCCGGTTCAGATTGGTAATAATAAATACTCCTATAAAAGAACAAGCTTTTCGGA
CACCATTAGATAAAGCTAGTTCCAAACTAAAAACCAGACATGCAACAAACTTAAACGACA
AGGACACAACTTATCTTTCCACAGAATGAGGTTACACTAATCCTCTAAGTTATAGTGTTT
CTTGACAGCTTCAGTTATCTCCCAAACAACTTTCATATCTTTAGGGAAAACAACCACATC
TCCTTTCCCTATCTCAAAGACATCTTCTTCTCTGTCGTATCCGTCAACGTTCACTTTGAT
CTTGCCTTCCACGAAATACATCGTCTCTGTCTTCTTAAACGTCCATGGAAACTTGCTTGG
ACCACCTTCCCACTTGGGCCAAGAGGCGACGCCTAGTTGAGCAAGTTTGGAATCGGAAGG
TTGTCGGAGGATCTTAACTCCGTGAATCTCGATGGGAATTGAACCGGAGGGAGATACGAT
TGCTTCTTTAGGGTTTAGCTTGGTGGTGATGATGGAAACGCAAACGCAGACAATCACGAG
GAGGAGAGACAAAGTGAGCAAATGATTGCCCATTGGATTTCGCAAACTCTGTTTACTGAA
AGAGAAGTCGAAGTTTAC
AGTAACTCC

QA 3 680 3 680
DS 



AS 2 5

CO CL2139Contig1 722 2 5 U
AAATAAACTCAAACTGTACATAGAGACATGTGTCCCACTCGCATGGACCATTACAAAATC
ACATAATAAATACATTCATAAACGTGCGAACAACTTTTTATGTTCGTTTGTTTGTGTAAC
CCATTCATACAGCAACGTTTCACCAAGTTTGTGTACCATCATCCTCGACAGGGTCTGTGT
TACAAGTCTTCAGCTTCTTCTCATCAAGATAGTGCTGATAGACAAACGAAAGGAAGCCCC
ATATAGCTAAAACGATGGAGAAATCTTCGATGCTTCCATCTTATCATGGAAAACTATCAC
AGCTATGACTGGCACTATAGGCAACCCCACGGCGGTTATGGAGTTGGAGAACACAGAGGA
CGACTCAAAGATCAAACCCACCAGACCAACAGTGTAGACTTGCCAAGAGATAGCTGCAGA
GGCCAAGGTCACAACATACGACACCTGCCCGAGTTTGTAGTTTCTCATCTCACTAGGCAA
AGTTCTCCACTCTCCACTCGCGAAAAGACCGATGAGAACAACACAGCTCGCGACTAGAGA
CTGGTAGATGGTCAAGTCCATGACTACTGACGATGTATGCTCCTTGAAAACCTTCCTGAA
GAGGAGTTGTATCAAAGATAGAAGCAGTCCTATCCCAGCTGAAGCACCTATGGTGCATAC
GAACCCTATCACGTACTGTACTCTAGAGACATTGGTTGTGTCTCGTGACTCGGTGTCAAC
CA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4C032JQ U 20
AF RR4GO80JQ U 1
BS 1 46 RR4GO80JQ
BS 47 47 RR4C032JQ
BS 48 68 RR4GO80JQ
BS 69 69 RR4C032JQ
BS 70 722 RR4GO80JQ

RD RR4C032JQ 139 0 0
ATAGAGACATGTGTCCCACTCGCATGGACCATTACAAAATCACATAATAAATACATTCAT
AAACGTGCGAACAACTTTTTATGTTCGTTTGTTTGTGTAACCCATTCATACAGCAACGTT
TCACCAAGTTTGTGTACCA

QA 1 139 1 139
DS 

RD RR4GO80JQ 722 0 0
AAATAAACTCAAACTGTACATAGAGACATGTGTCCCACTCGCATGGGCCATTACAAAATC
ACATAATAGATACATTCATAAACGTGCGAACAACTTTTTATGTTCGTTTGTTTGTGTAAC
CCATTCATACAGCAACGTTTCACCAAGTTTGTGTACCATCATCCTCGACAGGGTCTGTGT
TACAAGTCTTCAGCTTCTTCTCATCAAGATAGTGCTGATAGACAAACGAAAGGAAGCCCC
ATATAGCTAAAACGATGGAGAAATCTTCGATGCTTCCATCTTATCATGGAAAACTATCAC
AGCTATGACTGGCACTATAGGCAACCCCACGGCGGTTATGGAGTTGGAGAACACAGAGGA
CGACTCAAAGATCAAACCCACCAGACCAACAGTGTAGACTTGCCAAGAGATAGCTGCAGA
GGCCAAGGTCACAACATACGACACCTGCCCGAGTTTGTAGTTTCTCATCTCACTAGGCAA
AGTTCTCCACTCTCCACTCGCGAAAAGACCGATGAGAACAACACAGCTCGCGACTAGAGA
CTGGTAGATGGTCAAGTCCATGACTACTGACGATGTATGCTCCTTGAAAACCTTCCTGAA
GAGGAGTTGTATCAAAGATAGAAGCAGTCCTATCCCAGCTGAAGCACCTATGGTGCATAC
GAACCCTATCACGTACTGTACTCTAGAGACATTGGTTGTGTCTCGTGACTCGGTGTCAAC
CA

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL2139Contig2 705 3 4 U
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GCGAGAACTTAGAAGCAAACTTGATAGAGGCAACTGAATCATCATCATCATCAGTATCTC
AAACCAAGAACTATAAAAGGTGGATCCGTCTCTCCATCTACGTGTTCTTTGTCCTCTTCT
GCCAACCGCTTGCTACAATTCTAGGTAGACTGTACTACGAAAATGGTGGAGAGAGCACAT
ATGTGGTAACACTTCTCCCACTCATTGGCTTCCCTGTTCTGATCCTCTTCAACTTCTTTT
CAAACCTCAGACAACAACCAAAATCAACAGATACAGATTTCAACCAGTCCCCTTCCTTCA
CAACCCTTGTATCAGTATACATGTGCACTGGACTTCTACTGTCTGCTTACGCTTATCTCT
ATGCAATTGGTTTACTCTACTTACCTGTTTCCACTTTCTCCCTCATCTTAGCCTCGCAAT
TAGCATTCACTGCCTTCTTCTCTTACTTCCTTAACTCACAAAAGTTCACTCCCTTCATAG
TCAACTCTTTGTTTCTCCTCACCGTCTCCTCTGCCCTCCTCGTGGTTGACACCGAGTCAC
GAGACACAACCAATGTCTCTAGAGTACAGTACGTGATAGGGTTCGTATGCACCATAGGTG
CTTCAGCTGGGATAGGACTGCTTCTATCTCTGATACAACTCCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 0 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO80TF U 1
AF RR4GZ03TF U 1
AF RR4C032TF U 10
BS 1 652 RR4GO80TF
BS 653 655 RR4GZ03TF
BS 656 656 RR4C032TF
BS 657 705 RR4GZ03TF

RD RR4GO80TF 654 0 0
TTTTTCTTCTCACCTTTTAATTTCTCATGGACAGATCTCAAGAACTCTATGCCAATGGTG
GCGAGAACTTAGAAGCAAACTTGATAGAGGCAACTGAATCATCATCATCATCAGTATCTC
AAACCAAGAACTATAAAAGGTGGATCCGTCTCTCCATCTACGTGTTCTTTGTCCTCTTCT
GCCAACCGCTTGCTACAATTCTAGGTAGACTGTACTACGAAAATGGTGGAGAGAGCACAT
ATGTGGTAACACTTCTCCCACTCATTGGCTTCCCTGTTCTGATCCTCTTCAACTTCTTTT
CAAACCTCAGACAACAACCAAAATCAACAGATACAGATTTCAACCAGTCCCCTTCCTTCA
CAACCCTTGTATCAGTATACATGTGCACTGGACTTCTACTGTCTGCTTACGCTTATCTCT
ATGCAATTGGTTTACTCTACTTACCTGTTTCCACTTTCTCCCTCATCTTAGCCTCGCAAT
TAGCATTCACTGCCTTCTTCTCTTACTTCCTTAACTCACAAAAGTTCACTCCCTTCATAG
TCAACTCTTTGTTTCTCCTCACCGTCTCCTCTGCCCTCCTCGTGGTTGACACCGAGTCAC
GAGACACAACCAATGTCTCTAGAGTACAGTACGTGATAGGGTTCGTATGCAC
CA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4GZ03TF 705 0 0
TTTTTCTTCTCACCTTTTAATTTCTCATGGACAGATCTCAAGAACTCTATGCCAATGGTG
ACCAGAACTTAGAAGCAAACCTGATAGAGGCAACTGAATCATCATCATCATCAGTATCTC
AAACCAAGAACTATAAAAGGTGGATCCGTCTATCCATCTATGTGTTCTTCGTCCTCTTCT
GCCAACCGCTTGCTACAATTCTTGGTAGACTGTACTACGAAAATGGTGGGGAGAGCACAT
ACGTGGTAACACTTCTCCCACTCATTGGCTTCCCTGTTTTGATCCTCTTCAACTTCTTTT
CAAACCTCAGACAACAACCAAAATCAACAGATACAGATTTCAACCAGTCCCCTTCCTTCA
CAACCCTTGTATCGGTATACATGTGCACTGGACTTCTACTCTCTGCATACGCTTATCTCT
ATGCAATTGGTTTACTCTACTTACCTGTTTCCACCTTCTCCCTCATCTTAGCCTCGCAAT
TAGCCTTCACTGCCTTCTTCTCATACTTCCTTAACTCACAAAAGTTCACTCCCTTCATAG
TCAACTCTTTGTTTCTCCTTACCGTCTCCTCTGCCCTCCTCGTGGTCGACACCGAGTCGC
AAGACACAACCAATGTCTCTAGAGTACAGTACGTGATAGGGTTCGTATGCACCATCGGTG
CTTCAGCTGGGATAGGACTGCTTCTATCTCTGATACAACTCCTCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4C032TF 695 0 0
GG
ACCTTTTAATTTCTCATGGACAGATCTCAAGAACTCTATGCCAATGGTGGCGAGAACTTA
GAAGCAAACTTGATAGAGGCAACTGAATCATCATCATCATCAGTATCTCAAACCAAGAAC
TATAAAAGGTGGATCCGTCTCTCCATCTACGTGTTCTTTGTCCTCTTCTGCCAACCGCTT
GCTACAATTCTAGGTAGACTGTACTACGAAAATGGTGGAGAGAGCACATATGTGGTAACA
CTTCTCCCACTCATTGGCTTCCCTGTTCTGATCCTCTTCAACTTCTTTTCAAACCTCAGA
CAACAACCAAAATCAACAGATACAGATTTCAACCAGTCCCCTTCCTTCACAACCCTTGTA
TCAGTATACATGTGCACTGGACTCCTACTGTCTGCTTACGCTTATCTCTATGCAATTGGT
TTACTCTGCTTACCTGTTTCCACTTTCTCCCTCATCTTAGCCTCGCAATTAGCATTCACT
GCCTTCTTCTCTTACTTCCTTAACTCACAAAAGTTCACTCCCTTCATAGTCAACTCTTTG
TTTCTCCTCACCGTCTCCTCTGCCCTCCTCGTGGTTGACACCGAGTCACGAGACACAACC
AATGTCTCTAGAGTACAGTACGTGATAGGGT*CGTATGCAC*ATAG*TGCTTCAGCTGGG
ATAGGACTGCTTCTATCT
TGATACACTCTCTTC

QA 3 680 3 680
DS 



AS 1 4

CO CL2140Contig1 1289 4 6 U
GTTTTTGGTGGAGACTGCTCATAGATATCACCTGTGATTAGTTACTTGTACAACAATTAA
TCACTGGTTCTCATATCACTATTAAGAACATAAAGTAACAAATGAATCATATCTTTTTAA
CTATTACAACAAATGTAATGTGGTTTGAGAAGAGCCATCCATCTACATTGGAGGGAAATC
TGAGAGCTTTCCAACGATGTTTTGGTTGATTGATTGTTGTTTGAATCAAGGGGCGATGTC
CGAATGAGTTGGAAACTCAAGGCCTTGAAGTGAAGTTATGTTATTGAGATCGTCTTTAGA
GTACAACGGGAGAAGCCAAAACGCCTTCTTCTTCCCAAAAACCTGCTCGAAGTTTTTCTT
CTTTCCCAAGTCATATTTCCATCTGACATCTCCGTTCTTCTCATGAACCTCGACTGAAGT
AGTGTTTGTTGAGATAAGAGAGAGATGCATGACTACGAAACAGAGAAGGCTGAGAACGAA
CGCTAAGTTAAGAACGAAAGCCAGAACTAAGGATGCTAGTTGACCCGGAGAAGAGGAATG
CTTGATAGCTTGGCTGAAGAATTCAATGAAACTAGGAAGCAAGACTACAACGTCCAACAA
TGTCTCGAGAAACGTATACAACAGAAAGAGAAGGAAGAACTTGTAGCTACGCGCTCCGAC
ACAGTTAACAATCCAAACACAATGATGATCCATCTTGAGAACACATCTTTGACAGACAGA
ACAATGATGGCAGCGAGGTGGCTTAACATTCCTGCATTTCGGACAGTAACCAAAAGCTCC
TCCCTCTGTCGAAGCACCAGCCTCCAAACTATCAGCACCAAGCTCTCTTCTGAAATGCTC
AGGAACAGAACCTGGGTCCGTAAACACTACAGTGAAGTAGCTCCACAACAGCATTATCAA
CAAGAAGTGGAAGACCAAGATGATTAAGAAGGCGAGAGCTGAGAGAGCTCTATGGTTGTT
TTCGATTAAGATCGGCCACCAAGTGTTGACGACGACGGCGTAGTAAGATACGGCGACGAA
GGCGAGGACGAGAAGGATCATGAAGTAGCCGAGGACTTTCAGACCGGAGCAGAACCGGAA
GAGGTTCATTTCCAGCCGGGTTAAAGGGATAATCGGGGTGGGTCTTCGGGTCCGAGCTGG
GAACAACCGGCGTAAGATATCCGGAGCCACGGTGGCTGAGAGAGGATTTTAATAAGGGAT
CGGAGTTTGCTTGGTTCGGAGGACGACGGTGGATTGATTCTATTCGTCGTCGTGTTGGTT
AGTCCTAACCGATTTGGAGTAAACTTCCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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CGAATGAGTTGGAAACTCAAGGCCTTGAAGTGAAGTTATGTTATTGAGATCGTCTTTAGA
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CTTTCCCAAGTCATATTTCCATCTGACATCTCCGTTCTTCTCATGAACCTCGACTGAAGT
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CC

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CTAACCGATTTGGAGTAAACTTCCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 5

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AACTACCTTGAACACGTAATCCACTTTTCCCGATGCGCCGCCGTATCCGCCTCCTCCGGC
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CTGTTAAACTCC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HB70JQB U 1
AF RR4BK18JQ U 2
AF RR4CV93TF C 277
AF RR4CV93JQ U 2
AF RR4BK18TF C 277
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BS 19 19 RR4BK18JQ
BS 20 268 RR4HB70JQB
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BS 439 516 RR4HB70JQB
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BS 852 852 RR4BK18TF
BS 853 861 RR4CV93JQ
BS 862 972 RR4BK18TF

RD RR4HB70JQB 783 0 0
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TCTATCGGTGTCTAATTGCACCATTGTTTAATGAACCAAGGAAGCAAGCAACACAAGCCA
GATTCCAAAAAGAATATACAATATGAAAGTAAGCATTCTCTATCATCATCATAGTTCAAA
GGGGGAGACGGGACAAATGAATTTTTGCTTTTGTAAACGATCACAGATCAAGCAGAACTA
CAACACGAGCTGGTCTTAGCGGGAATCTCCTGTCCAGGACCTGGGATGACAATCTTCTTA
CCAGCCAACGAACCAGGGTTATTCGACTCACCAGCAGATGAGAGACTCTTCTTGTTAACA
GTGTTGAAGATCTCTGTCATGAGAGTGTTGAAGGAGTTTTCGACATTGGTTGCGTTCAAA
GCAAAGGTCTCGAGGAAAAAAAGACCTTCCTTCTCAGCAAACTCTTTAGCGTCTTCGGTG
GGAATCGCTCTCTGATCTTCGAGATCAGACTTGTTATCAATGAGGATGATGACAATGTTC
TTATCAGCATGAGCTCGCAATTCTTCAAGCCAACGAGGG*ATGTGGTCAAAGGTCTCACG
CTTAGTAATATCATAAACAAGCATCGCACCAACTGCTCCTCTGTAGTATGCGCTCGTAAC
CGCTCTGTATCTTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCTTGACGCTCTTCTCTTC
AATGAGGAGCGTACGAGTCTGAAACTCGACACCGATGGTGGCTTTGGAGTC
CAAGCTGACTCC

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DS 

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CTATCGGTGTCTAATTGCACCATTGTTTAATGAACCAAGGAAGCAAGCAACACAAGCCAG
ATTCCAAAAAGAATATACAATATGAAAGTAAGCATTCTCTATCATCATCATAGTTCAAAG
GGGGAGACGGGACAAATGAATTTTTGCTTTTGTAAACGATCACAGATCAAGCAGAACTAC
AACACGAGCTGGTCTTAGCGGGAATCTACTGTCCAGGACCTGGGATGACAATCTTCTTAC
CAGCCAACGAACCAGGGTTATTCGACTCACCAGCAGATGAGAGACTCTTCTTATTAACAG
TGTTGAAGATCTCTGTCATGAGAGTGTTGAAGGAGTTTTCGACATTGGTTGCGTTCAAAG
CAGAGGTCTCAAGGAAGAAAAGACCTTCCTTCTCAGCAAACTCTTTAGCGTCTTCGGTGG
GAATCGCTCTCTGATCTTCGAGATCAGACTTGTTACCAATGAGGATGATGACAATGTTCT
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TTAGTAATATCATAAACAAGCATCGCACCAACTGCTCCTCTGTAGTATGCGCTCGTAACC
GCTCTGTATCTTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCTTGACGCTCTTCTCTTCA
A

QA 1 721 1 721
DS 

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GATGAGAGACTCTTCTTATTAACAGTGTTGAAGATCTCTGTCATGAGAGTGTTGAAGGAG
TTTTCGACATTGGTTGCGTTCAAAGCAGAGGTCTCAAGGAAGAAAAGACCTTCCTTCTCA
GCAAACTCTTTAGCGTCTTCGGTGGGAATCGCTCTCTGATCTTCGAGATCAGACTTGTTA
CCAATGAGGATGATGACAATGTTCTTATCAGCATGAGCTCGCAATTCTTCAAGCCAACGA
GGGGATGTGGTCAAAGGTCTCACGCTTAGTAATATCATAAACAAGCATCGCACCAACTGC
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CTGAGCCTTGACGCTCTTCTCTTCAATGAGGAGCGTACGAGTCTGAAACTCGACACCGAT
GGTGGCTTTGGAGTCCAAGCTGAACTCGTCTCTTGCGAATCGAGCTAGCAGCTGTGATTT
CCCAACTGCTGAATCTCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4CV93JQ 860 0 0
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CTATCGGTGTCTAATTGCACCATTGTTTAATGAACCAAGGAAGCAAGCAACACAAGCCAG
ATTCCAAAAAGAATATACAATATGAAAGTAAGCATTCTCTATCATCATCATAGTTCAAAG
GGGGAGACGGGACAAATGAATTTTTGCTTTTGTAAACGATCACAGATCAAGCAGAACTAC
AACACGAGCTGGTCTTAGCGGGAATCTACTGTCCAGGACCTGGGATGACAATCTTCTTAC
CAGCCAACGAACCAGGGTTATTCGACTCACCAGCAGATGAGAGACTCTTCTTATTAACAG
TGTTGAAGATCTCTGTCATGAGAGTGTTGAAGGAGTTTTCGACATTGGTTGCGTTCAAAG
CAGAGGTCTCAAGGAAGAAAAGACCTTCCTTCTCAGCAAACTCTTTAGCGTCTTCGGTGG
GAATCGCTCTCTGATCTTCGAGATCAGACTTGTTACCAATGAGGATGATGACAATGTTCT
TATCAGCATGAGCTCGCAATTCTTCAAGCCAACGAGGG*ATGTGGTCAAAGGTCTCACGC
TTAGTAATATCATAAACAAGCATCGCACCAACTGCTCCTCTGTAGTATGCGCTCGTAACC
GCTCTGTATCTTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCTTGACGCTCTTCTCTTCA
ATGAGGAGCGTACGAGTCTGAAACTCGACACCGATGGTGGCTTTGGAGTC*AAGCTGAAC
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*CTACCTTGA*CACGTAATC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4BK18TF 696 0 0
GGACCTGGGATGACAATCTTCTTACCAGCCAACGAACCAGGGTTATTCGACTCACCAGCA
GATGAGAGACTCTTCTTATTAACAGTGTTGAAGATCTCTGTCATGAGAGTGTTGAAGGAG
TTTTCGACATTGGTTGCGTTCAAAGCAGAGGTCTCAAGGAAGAAAAGACCTTCCTTCTCA
GCAAACTCTTTAGCGTCTTCGGTGGGAATCGCTCTCTGATCTTCGAGATCAGACTTGTTA
CCAATGAGGATGATGACAATGTTCTTATCAGCATGAGCTCGCAATTCTTCAAGCCAACGA
GGG*ATGTGGTCAAAGGTCTCACGCTTAGTAATATCATAAACAAGCATCGCACCAACTGC
TCCTCTGTAGTATGCGCTCGTAACCGCTCTGTATCTTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGAT
CTGAGCCTTGACGCTCTTCTCTTCAATGAGGAGCGTACGAGTCTGAAACTCGACACCGAT
GGTGGCTTTGGAGTCCAAGCTGAACTCGTCTCTTGCGAATCGAGCTAGCAGCTGTGATTT
CCCAACTGCTGAATCTCCGATCAGAACTACCTTGAACACGTAATCCACTTTTCCCGATGC
GCCGCCGTATCCGCCTCCTCCGGCCATTTTCTTCTTCGTCCTAGAAGCGGCGAATTGTTT
TCAAAGTTTTCTCTCTGTCTATAGCTGTTAAACTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 2 4

CO CL2142Contig1 1464 2 4 U
GGGTCCTAATTCCTATAAGCTTTACTCTCAATAAAGGCGCCTGACGAATCTCCACTGCCA
CACTGAAAGAAAGAAAGATCGCAAACACTTGAAGCCAAAATCTCCACCTAACCACGGAAG
CTCTCTCTACTTCATCATCATACATCTCTAATCCTATCCCGAGGACAAAGCATCTCTTCT
TCAAACCTTCCCTGCCACTCGTAGCTTCATCCCAGTCTTCGTGCTGGCTCTGTAATTCGC
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TACAAGCTCTCTTACACAACGACACACCAAGCGAAGGTGAAGAGAATCTCGGCGAAAGCA
ATGGGTTTGGCTTCTTTCCTAGAGACATCTTCTCTTTATCACAGGAAAAGATTGAGAGTG
TAATAGATGTGGAGTCATCTCTTGCACTTCCACAGGGTGCTGGGAACAGAGGTGGGCTTT
TTAGAACTCCCATATCTGGGGGAGTTCAGAATGCAACATCAGCTCATGCGTTGCCTAGGC
CTGCTTTGGCTGTAAGGAACTTGTTGGAGCAGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAGTGA
TGTCTAAAATGCACCACCGTAGGGAAGGTTACCCATTTGGGTCTTTGGTGGATTTTGCAC
CTGATCGTATGGGGCATCCAATCTTTTATTTTCACCGTTGGCCATCCACACACGAAATCT
ATTGGCTGAACCTAGATGCAGTCTCGTTGTTCAGATACCTGGATGGAGTGGCCTATCGAA
TGCAAGAGTGACATTATTTGGTGATGTCTACCCATTGTCAGAAGATGAACAAGAGTGGGC
ACATAAGCAATATATTGCAAAGCACCCGCACGGGCTTTCGGAGCAATGGGGAAACTTTCA
CTATTTTAGAATGCAGAACATAAGTGATATATATTTCATTGGAGGGTTTGGTACGGTCGC
GTGGGTTGATGTCAAAGAGTATGAGGCTTTACAGCCAGATAAGATCGCTGTTGATGGTGG
AGAGCACAACCTCAAGGAACTAAATGCCATCTTCTCAAAGCCGCTTAGAGAGCTACTGTC
TTCTGAATCAGAGGTAGACGACGCTGCTCTTATTTCTATAGATAGCAAAGGGATAGATGT
AAGGGTTCGTCAGGGTGCTCAGGCTGCCCTTTGAGGAAGGACATGGTGTTGAAACGCTAG
AAGAAGCTAAAGCTGCACTATGGAAGGTGATGGAGAAGGTGAAGCTAAACTATTTCCAGA
AATGACCAAAAGATCATGGAATTTGCAGAAATGACAAAACACCTTTAGAATGTTGTTTGT
TTCCTCTTTTTCTTGACTAAGGTTTTGTAGTTTCTCTATCTATTTGGCCCGCTCTTTTTT
TTTTAGTGTTACACAAATGGGGGTAAACACGATAATCTTGAAATAACAGGTTGAAATCTG
AGTTTAATAAGAAAGTTTGGGTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CQ72TF U 1
AF RR4CO32JQ C 687
BS 1 708 RR4CQ72TF
BS 709 709 RR4CO32JQ
BS 710 767 RR4CQ72TF
BS 768 1464 RR4CO32JQ

RD RR4CQ72TF 767 0 0
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CACTGAAAGAAAGAAAGATCGCAAACACTTGAAGCCAAAATCTCCACCTAACCACGGAAG
CTCTCTCTACTTCATCATCATACATCTCTAATCCTATCCCGAGGACAAAGCATCTCTTCT
TCAAACCTTCCCTGCCACTCGTAGCTTCATCCCAGTCTTCGTGCTGGCTCTGTAATTCGC
CACCAAAGCTTAGAATCCCCAAGCTGAGAATCAGAGATGGATCAAGCCACGGCCTTCGGA
TACAAGCTCTCTTACACAACGACACACCAAGCGAAGGTGAAGAGAATCTCGGCGAAAGCA
ATGGGTTTGGCTTCTTTCCTAGAGACATCTTCTCTTTATCACAGGAAAAGATTGAGAGTG
TAATAGATGTGGAGTCATCTCTTGCACTTCCACAGGGTGCTGGGAACAGAGGTGGGCTTT
TTAGAACTCCCATATCTGGGGGAGTTCAGAATGCAACATCAGCTCATGCGTTGCCTAGGC
CTGCTTTGGCTGTAAGGAACTTGTTGGAGCAGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAGTGA
TGTCTAAAATGCACCACCGTAGGGAAGGTTACCCATTTGGGTCTTTGGTGGATTTTGCAC
CTGATCGTATGGGGCATCCAATCTTTTATTTTCACCGTTGGCCATCCATACACGAAATCT
ATTGGCTGAACCTAGATGCAGTCTCGTTGTTCAGATACCTGGATGGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4CO32JQ 778 0 0
TTA
TTTCACCGTTGGCCATCCACACACGAAATCTATTGGCTGAACCTAGATGCAGTCTCGTTG
TTCAGATACCTGGATGGAGTGGCCTATCGAATGCAAGAGTGACATTATTTGGTGATGTCT
ACCCATTGTCAGAAGATGAACAAGAGTGGGCACATAAGCAATATATTGCAAAGCACCCGC
ACGGGCTTTCGGAGCAATGGGGAAACTTTCACTATTTTAGAATGCAGAACATAAGTGATA
TATATTTCATTGGAGGGTTTGGTACGGTCGCGTGGGTTGATGTCAAAGAGTATGAGGCTT
TACAGCCAGATAAGATCGCTGTTGATGGTGGAGAGCACAACCTCAAGGAACTAAATGCCA
TCTTCTCAAAGCCGCTTAGAGAGCTACTGTCTTCTGAATCAGAGGTAGACGACGCTGCTC
TTATTTCTATAGATAGCAAAGGGATAGATGTAAGGGTTCGTCAGGGTGCTCAGGCTGCCC
TTTGAGGAAGGACATGGTGTTGAAACGCTAGAAGAAGCTAAAGCTGCACTATGGAAGGTG
ATGGAGAAGGTGAAGCTAAACTATTTCCAGAAATGACCAAAAGATCATGGAATTTGCAGA
AATGACAAAACACCTTTAGAATGTTGTTTGTTTCCTCTTTTTCTTGACTAAGGTTTTGTA
GTTTCTCTATCTATTTGGCCCGCTCTTTTTTTTTTAGTGTTACACAAATGGGGGTAAACA
CGATAATCTTGAAATAACAGGTTGAAATCTGAGTTTAATAAGAAAGTTTGGGTCC

QA 4 778 4 778
DS 



CO CL2142Contig2 778 2 9 U
GGACCCAAACTTTCTTATTAAACTCAGATTTCAACCTGTTATTTCAAGATTATCGTGTTT
ACCCCCATTTGTGTAACACTAAAAAAAAAAGAGAGGGCCAAATAGGTAGAGAAACTACAA
AACCTTAGTCAAGAAAAAGAGGAAACAAACAACATTCTAAAGGTGTTTTGTCATTTCTGC
AAATTCCATGATCTTTTGGTCATTTCTGGAAATAGTTTAGCTTCACCTTCTCCATCACCT
TCCATAGTGCAGCTTTAGCTTCTTCTAGCGTTTCAACACCATGTCCTTCCTCAAAGGGCA
GCCTTTGTACGTTGAACTGGACACCCTGACGAACCCTTACATCTATCCCTTTGCTATCTA
TAGAGATGAGAGCAGCATCGTCTACCTCTGATTCAGAAGACAGTAGCTCTCTAAGCGGCT
TTGAAAAGATGGCATTTAGTTCCTTGAGGTTGTGCTCTCCACCATCAACAGCGATCTTAT
CTGGCTGTAAAGCCTCATACTCTTTGACATCAACCCACGCGACCGTACCAAACCCTCCAA
TGAAATATATATCACTTATGTTCTGCATTCTAAAATAGTGAAAGTTTCCCCATTGCTCCG
AAAGCCCGTGCGGGTGCTTTGCAATATATTGCTTATGTGCCCACTCCTGTTCATCTTCTG
ACAATGGGTAGACATCACCAAATAATGTCACTCTTGCATTCGATAGGCCACTCCATCCAG
GTATCTGAACAACGAGACTGCATCTAGGTTCAGCCAATAGATTTCGTGTATGGATGGC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HB02JQB U 1
AF RR4CQ72JQ U 2
BS 1 88 RR4HB02JQB
BS 89 90 RR4CQ72JQ
BS 91 320 RR4HB02JQB
BS 321 321 RR4CQ72JQ
BS 322 424 RR4HB02JQB
BS 425 425 RR4CQ72JQ
BS 426 496 RR4HB02JQB
BS 497 497 RR4CQ72JQ
BS 498 778 RR4HB02JQB

RD RR4HB02JQB 778 0 0
GGACCCAAACTTTCTTATTAAACTCAGATTTCAACCTGTTATTTCAAGATTATCGTGTTT
ACCCCCATTTGTGTAACACTAAAAAAAA**GAGAGGGCCAAATAGGTAGAGAAACTACAA
AACCTTAGTCAAGAAAAAGAGGAAACAAACAACATTCTAAAGGTGTTTTGTCATTTCTGC
AAATTCCATGATCTTTTGGTCATTTCTGGAAATAGTTTAGCTTCACCTTCTCCATCACCT
TCCATAGTGCAGCTTTAGCTTCTTCTAGCGTTTCAACACCATGTCCTTCCTCAAAGGGCA
GCCTTTGTACGTTGAACTGGGCACCCTGACGAACCCTTACATCTATCCCTTTGCTATCTA
TAGAGATGAGAGCAGCATCGTCTACCTCTGATTCAGAAGACAGTAGCTCTCTAAGCGGCT
TTGAGAAGATGGCATTTAGTTCCTTGAGGTTGTGCTCTCCACCATCAACAGCGATCTTAT
CTGGCTGTAAAGCCTCTTACTCTTTGACATCAACCCACGCGACCGTACCAAACCCTCCAA
TGAAATATATATCACTTATGTTCTGCATTCTAAAATAGTGAAAGTTTCCCCATTGCTCCG
AAAGCCCGTGCGGGTGCTTTGCAATATATTGCTTATGTGCCCACTCCTGTTCATCTTCTG
ACAATGGGTAGACATCACCAAATAATGTCACTCTTGCATTCGATAGGCCACTCCATCCAG
GTATCTGAACAACGAGACTGCATCTAGGTTCAGCCAATAGATTTCGTGTATGGATGGC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4CQ72JQ 760 0 0
GG
CCCAAACTTTCTTATTAAACTCAGATTTCAACCTGTTATTTCAAGATTATCGTGTTTACC
CCCATTTGTGTAACACTAAAAAAAAAAGAGAGGGCCAAATAGGTAGAGAAACTACAAAAC
CTTAGTCAAGAAAAAGAGGAAACAAACAACATTCTAAAGGTGTTTTGTCATTTCTGCAAA
TTCCATGATCTTTTGGTCATTTCTGGAAATAGTTTAGCTTCACCTTCTCCATCACCTTCC
ATAGTGCAGCTTTAGCTTCTTCTAGCGTTTCAACACCATGTCCTTCCTCAAAGGGCAGCC
TTTGTACGTTGAACTGGACACCCTGACGAACCCTTACATCTATCCCTTTGCTATCTATAG
AGATGAGAGCAGCATCGTCTACCTCTGATTCAGAAGACAGTAGCTCTCTAAGCGGCTTTG
AAAAGATGGCATTTAGTTCCTTGAGGTTGTGCTCTCCACCATCAACAGCGATCTTATCTG
GCTGTAAAGCCTCATACTCTTTGACATCAACCCACGCGACCGTACCAAACCCTCCAATGA
AATATATATCACTTATGTTCTGCATTCTAAAATAGTGAAAGTTTCCCCATTGCTCCGAAA
GCCCGTGCGGGTGCTTTGCAATATATTGCTTATGTGCCCACTCCTGTTCATCTTCTGACA
ATGGGTAGACATCACCAAATAATGTCACTCTTGCATTCGATAGGCCACTCCATCCAGGTA
TCTGAACAACGAGACTGCATCTAGGTTCAGCCAATAGA

QA 3 760 3 760
DS 



AS 1 5

CO CL2143Contig1 1057 5 3 U
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TTTTGGGGGTGATAGTGGAAAAGTTGACAGATAAGTCACCCTTACTGCCACTCTACAGAA
CCGGACATGAGATTTTCACCTCATACGGCTCCTCGTTCAATTCTTTCGAAGTCATTGGGT
CCCTTTCCTCGTTCGCGAATCTCCTCCCTTCTTCCACTCCGTCCCGAAGAGTAACTAGGA
TAAACTCGGTCACGTTTTCATGTTCCAATTGAACACTTTCTATTTTTGATTATTCTCAAA
GGATAAGATTTTTACCAAACATCTGCGGGTCCAATCACACGATCTTATAATAAGAACAAG
AGATCTTTCTCGATCAATCTCTTTGCCCCTCATTCTTCGAGAATCAGAAAGAGACTTTTT
CAAGTTTGAATTTGTTCATTTGGAATCTGGGTTCTTCTACTTCATTTTTATTTACTTATT
ATTTCTTTATTTTCCCTCTCTTTTCTTTATTTGATTTCTTTTTTTATTTTATTCCCTTCC
ATCATTCTTAAGTCCCATAGGTTTGATCCTATAGAATCTGACCCATGTTCTCATTGAGCG
AAGGGTACGAAATAAATTCAATCATATTTTTTTTTGATCAAAAAAAAATCACTATGTGAA
ATCTTCGTTTTTTTTTCTCTTTCTCTATCGCTTTCCCATAAGTACAGCAATTGTTGAATC
GATAGAGAACCTTTTCTTCTGTATCGATATGAATCCATTATGAATCGATATTATTACATT
CCAATTCCTTACCAATATCCCTCAAGGAAAATCCCGAATTGGATCCCAAATTGACGGGTT
AGTGTGAGCTTATCCATGCGGTTATGCACTCTTCGAATAGGAATTCATTTTCTGAAAGAT
CCTGGCTTTCGTGCTTTGGCGGGTCTCCGAGATCCTTTCGACGACCTATGTTGTGTTGTG
TTGAAGGGATATCTAGATGATCCGATCGATTGCGTAAAGCCCGCAGTAGCAACGGAACCG
GGGAAAGTATACATAAGTATACAGAAAAGACAGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E684JQ C 1
AF RR4E684TF U 1
AF RR4FP35JQ U 534
AF RR4FP35TF C 534
AF RR4C558JQ U 683
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CAAGTTTGAATTTGTTCATTTGGAATCTGGGTTCTTCTACTTCATTTTTATTTACTTATT
ATTTCTTTATTTTCCCTCTCTTTTCTTTATTTGATTTCTTTTTTTATTTTATTCCCTTCC
ATCATTCTTAAGTCCCATAGGTTTGATCCTATAGAATCTGACCCATGTTCTCATTGAGCG
AAGGGTACGAAATAAATTCAATCATATTTTTTTTTGATC

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TTTTGGGGGTGATAGTGGAAAAGTTGACAGATAAGTCACCCTTACTGCCACTCTACAGAA
CCGGACATGAGATTTTCACCTCATACGGCTCCTCGTTCAATTCTTTCGAAGTCATTGGGT
CCCTTTCCTCGTTCGCGAATCTCCTCCCTTCTTCCACTCCGTCCCGAAGAGTAACTAGGA
TAAACTCGGTCACGTTTTCATGTTCCAATTGAACACTTTCTATTTTTGATTATTCTCAAA
GGATAAGATTTTTACCAAACATCTGCGGGTCCAATCACACGATCTTATAATAAGAACAAG
AGATCTTTCTCGATCAATCTCTTTGCCCCTCATTCTTCGAGAATCAGAAAGAGACTTTTT
CAAGTTTGAATTTGTTCATTTGGAATCTGGGTTCTTCTACTTCATTTTTATTTACTTATT
ATTTCTTTATTTTCCCTCTCTTTTCTTTATTTGATTTCTTTTTTTATTTTATTCCCTTCC
ATCATTCTTAAGTCCCATAGGTTTGATCCTATAGAATCTGACCCATGTTCTCATTGAGCG
AAGGGTACGAAATAAATTCAATCATATTTTTTTTTGATC

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TTACATTCCAATTCCTTACCAATATCCCTCAAGGAAAATCCCGAATTGGATCCCAAATTG
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C

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RD RR4FP35TF 421 0 0
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TTGAGCGAAGGGTACGAAATAAATTCAATCATATTTTTTTTTGATCAAAAAAAAATCACT
ATGTGAAATCTTCGTTTTTTTTTCTCTTTCTCTATCGCTTTCCCATAAGTACAGCAATTG
TTGAATCGATAGAGAACCTTTTCTTCTGTATCGATATGAATCCATTATGAATCGATATTA
TTACATTCCAATTCCTTACCAATATCCCTCAAGGAAAATCCCGAATTGGATCCCAAATTG
ACGGGTTAGTGTGAGCTTATCCATGCGGTTATGCACTCTTCGAATAGGAATTCATTTTCT
GAAAGATCCTGGCTTTCGTGCTTTGGCGGGTCTCCGAGATCCTTTCGACGACCTATGTTG
C

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DS 

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ATCGATATGAATCCATTATGAATCGATATTATTACATTCCAATTCCTTACCAATATCCCT
CAAGGAAAATCCCGAATTGGATCCCAAATTGACGGGTTAGTGTGAGCTTATCCATGCGGT
TATGCACTCTTCGAATAGGAATTCATTTTCTGAAAGATCCTGGCTTTCGTGCTTTGGCGG
GTCTCCGAGATCCTTTCGACGACCTATGTTGTGTTGTGTTGAAGGGATATCTAGATGATC
CGATCGATTGCGTAAAGCCCGCAGTAGCAACGGAACCGGGGAAAGTATACATAAGTATAC
AGAAAAGACAGTTCC

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DS 



AS 1 4

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GTCCACCTCCTCCGCCAGTTAGCTGCAAAGCACAATGTAACAACAATAGTTGTGTTTGGA
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CCACCTTATGGTGGCAATTTCGTGAACCATAAATCCACCGGAAGATTATGTGATGGATTG
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CCAACCCTTACCCCAGCTGATCTACCTCGCGGTGCAAGTTTTGCCTCGGCTGGTTCCGGT
TATGACGATCTTACAGCTAATATATCCAACGTGTGGAGTTTCTCGACGCAAGCAACTTAC
TTTTTGCATTACAAAATTCACCTCAATAAATTGGTCGGACCTTTAGAGAGCGCAAAAATG
ATAAATAATGCGATATTTCTTATGAGTATGGGATCAAATGACTTTCTTCAAAATTACTTA
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AAATATATTTTTTGGGATGCAGTCCATCCAACACAAAGAATGTATCAAATCATTGTTAAA
AAAGCAATTGCATCTATTAGTGAAGAGTTTCTTGTTTAGAATATGTTGTATTTTCGCATT
ACTATCATCGTGTACGAATAATTTAAAGTTATGTCCCATAATGTAATAGACAAAGATTTA
AAGATATGTTATATACTTATCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN39TF U 1
AF RR4A682TF U 280
AF RR4H883JQB C 488
AF RR4EN39JQ C 561
BS 1 679 RR4EN39TF
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RD RR4EN39TF 763 0 0
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GTCCACCTCCTCCGCCAGTTAGCTGCAAAGCACAATGTAACAACAATAGTTGTGTTTGGA
GATTCTAGTGTTGATCCAGGAAACAATAATTTTCTTAACACCGATTTGAAAGGAAATTTT
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TTTTTGCATTACAAAATTCACCTCAATAAATTGGTCGGACCTTTAGAGAGCGCAAAAATG
ATAAATAATGCGATATTTCTTATGAGTATGGGATCAAATGACTTTCTTCAAAATTACTTA
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CGTATGCTTGACGACGCCA*GATGTTGCATAGACTTGGAGCTA

QA 1 763 1 763
DS 

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G
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CTATACCAGCTTTTCTTGATCCAACCCTTACCCCAGCTGATCTACCTCGCGGTGCAAGTT
TTGCCTCGGCTGGTTCCGGTTATGACGATCTTACAGCTAATATATCCAACGTGTGGAGTT
TCTCGACGCAAGCAACTTACTTTTTGCATTGCAAAATTCACCTCAATAAATTGGTCGGAC
CTTTAGAGAGCGCAAAAATGATAAATAATGCGATATTTCTTATGAGTATGGGATCAAATG
ACTTTCTTCAAAATTACTTAGTCGATTTTACTCGACAAAAGCAATTCACTGTTGAACAAT
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CTAGAAGGTTGGTCGTGGTAGGAGTTCCTCCCATGGGATGCATGCCCCTAATAAAATACC
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AAATCATCAAGAATCTCGAGCTTCTGCAATCTAAATTTGGTCTGAAAACTATATACGTCG
ATGCTTATTCCACCATCCAAGAAGCGATTAAAACCCCAAGAAAATTTGGTTTCCTAGAAG
CTTCAA

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR4H883JQB 790 0 0
GGAGATTCTAGTGTTG
ATCCAACGTGTGGAGTTTCTCGACGCAAGCAACTTACTTTTTGCATTACAAAATTCACCT
CAATAAATTGGTCGGACCTTTAGAGAGCGCAAAAATGATAAATAATGCGATATTTCTTAT
GAGTATGGGATCAAATGACTTTCTTCAAAATTACTTAGTCGATTTTACTCGACAAAAGCA
ATTCACTGTTGAACAATACATCGACTTTCTCTCCTCCCGTATGCTTGACGACGCCAAGAT
GTTGCATAGACTTGGAGCTAGAAGGTTGGTCGTGGTAGGAGTTCCTCCCATGGGATGCAT
GCCCCTAATAAAATACCTAAAAGGGCAGAAGACTTGCGTTGATCAATTAAACCAAATTGC
CTTTTCCTTCAACTCAAAAATCATCAAGAATCTCGAGCTTCTGCAATCTAAATTTGGTCT
GAAAACTATATACGTCGATGCTTATTCCACCATCCAAGAAGCGATTAAAACCCCAAGAAA
ATTTGGTTTCCTAGAAGCTTCAAAAGGATGTTGTGGAACTGGTACCTATGAATATGGAGA
GACATGTAAAGATATGAACGTATGCAAAGATCCTACCAAATATATTTTTTGGGATGCAGT
CCATCCAACACAAAGAATGTATCAAATCATTGTTAAAAAAGCAATTGCATCTATTAGTGA
AGAGTTTCTTGTTTAGAATATGTTGTATTTTCGCATTACTATCATCGTGTACGAATAATT
TAAAGTTATGTCCCATAATGTAATAGACAAAGATTTAAAGATATGTTATATACT

QA 17 790 17 790
DS 

RD RR4EN39JQ 724 0 0
CCTCAATAAATTGGTCGGACCTTTAGAGAGCGCAAAAATGATAAATAATGCGATATTTCT
TATGAGTATGGGATCAAATGACTTTCTTCAAAATTACTTAGTCGATTTTACTCGACAAAA
GCAATTCACTGTTGAACAATACATCGACTTTCTCTCCTCCCGTATGCTTGACGACGCCAA
GATGTTGCATAGACTTGGAGCTAGAAGGTTGGTCGTGGTAGGAGTTCCTCCCATGGGATG
CATGCCCCTAATAAAATACCTAAAAGGGCAGAAGACTTGCGTTGATCAATTAAACCAAAT
TGCCTTCTCCTTCAACTCAAAAATCATCAAGAATCTCGAGCTTCTGCAATCTAAATTTGG
TCTGAAAACTATATACGTCGATGCTTATTCCACCATCCAAGAAGCGATTAAAACCCCAAG
AAAATTTGGTTTCCTAGAAGCTTCAAAAGGATGTTGTGGAACTGGTACCTATGAATATGG
AGAGACATGTAAAGATATGAACGTATGCAAAGATCCTACCAAATATATTTTTTGGGATGC
AGTCCATCCAACACAAAGAATGTATCAAATCATTGTTAAAAAAGCAATTGCATCTATTAG
TGAAGAGTTTCTTGTTTAGAATATGTTGTATTTTCGCATTACTATCATCGTGTACGAATA
ATTTAAAGTTATGTCCCATAATGTAATAGACAAAGATTTAAAGATATGTTATATACTTAT
CTCT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL2145Contig1 909 3 3 U
GAAAGAAACCCGGACGTAGTCCGAGAAAGTCTCTAATTTAAGTGATGAATGATTATCAAG
CAAGGTAACTTAAGTCGTATGTCTAATTAAGCGGAACCAACAACCCAAAGTTAATCTGAA
ACACAGCTTTATTATAAGTGCGGATTATTTGGTTTCCGTTTCTATTTGGTTTCCGTTTCT
ATAACCAAATGAAACAAAACCACATATATTCATAAACGAGAAACACTCGATCGGCTTGGT
GAATTGGTCCAAAGCACCTGTGCATCAATTACAGAGAGATGCTCATCATCAAGCCTCTTC
CATGTCCTGATCGATTTCACATCTCCCCAGCTCCCTGTACCATTCTTGTTCAAATCAGCA
ACCACAAATCTCGCCCTCCTCTCCCACCCAACTTTACCATACGCATGGTATCCAATCCCA
CCCCCATAGCATAGATTCACACCTTTGAGTTCAACGCAAAAGTCGTTGATATGGTCATGA
CCCACAAACACTGATTTTACATCTCCTCTAGCTACCAACGTCGTGAAGAACCCTGAGTTT
TTGGTAGCTGAGCCTGTAGCTTCTTGTCTCACTCCTTGTTGAGGATTAGGCTCTTCATTG
TATTCCCTCTGGAGACGTTTCGAAGTCTGGTTATACCAGACCTGCTGAGAAGTTTTGATC
CAATCATAACCTTTTATGGAAGGAACACTAGAGTGATCTCCACTATCTAGAAAATAGAGA
TTGAGAAGAGATTTTTCCTGTAAACTCGACTCAGCAACTCCATGTATTTCGAGATTATAA
TTCCCAAACCCATCAATGTGAAAAGCCTCAGGAGGATTCACTTGAGACAGAGTGTTGGGA
AGCATCACTATATAAATCATGAGTTCTTGTCGGGACAACGTAGATTCTTGATCATGGTTT
CCCAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW25JQ U 1
AF RR4E244JQ U 113
AF RR4E244TF C 114
BS 1 266 RR4DW25JQ
BS 267 714 RR4E244JQ
BS 715 909 RR4E244TF

RD RR4DW25JQ 267 0 0
GAAAGAAACCCGGACGTAGTCCGAGAAAGTCTCTAATTTAAGTGATGAATGATTATCAAG
CAAGGTAACTTAAGTCGTATGTCTAATTAAGCGGAACCAACAACCCAAAGTTAATCTGAA
ACACAGCTTTATTATAAGTGCGGATTATTTGGTTTCCGTTTCTATTTGGTTTCCGTTTCT
ATAACCAAATGAAACAAAACCACATATATTCATAAACGAGAAACACTCGATCGGCTTGGT
GAATTGGTCCAAAGCACCTGTGCATC
C

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR4E244JQ 602 0 0
A
ATCTGAAACACAGCTTTATTATAAGTGCGGATTATTTGGTTTCCGTTTCTATTTGGTTTC
CGTTTCTATAACCAAATGAAACAAAACCACATATATTCATAAACGAGAAACACTCGATCG
GCTTGGTGAATTGGTCCAAAGCACCTGTGCATCAATTACAGAGAGATGCTCATCATCAAG
CCTCTTCCATGTCCTGATCGATTTCACATCTCCCCAGCTCCCTGTACCATTCTTGTTCAA
ATCAGCAACCACAAATCTCGCCCTCCTCTCCCACCCAACTTTACCATACGCATGGTATCC
AATCCCACCCCCATAGCATAGATTCACACCTTTGAGTTCAACGCAAAAGTCGTTGATATG
GTCATGACCCACAAACACTGATTTTACATCTCCTCTAGCTACCAACGTCGTGAAGAACCC
TGAGTTTTTGGTAGCTGAGCCTGTAGCTTCTTGTCTCACTCCTTGTTGAGGATTAGGCTC
TTCATTGTATTCCCTCTGGAGACGTTTCGAAGTCTGGTTATACCAGACCTGCTGAGAAGT
TTTGATCCAATCATAACCTTTTATGGAAGGAACACTAGAGTGATCTCCACTATCTAGAAA
A

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR4E244TF 796 0 0
ATCTGAAACACAGCTTTATTATA*GTGCGGATA**TTGGTTTCCGTTTCTATTTGGTT*C
CGTTTCTATAACCAAATGAAACAAAACCACATATATTCATAAACGAGAAACACTCGATCG
GCTTGGTGAATTGGTCCAAAGCACCTGTGCATCAATTACAGAGAGATGCTCATCATCAAG
CCTCTTCCATGTCCTGATCGATTTCACATCTCCCCAGCTCCCTGTACCATTCTTGTTCAA
ATCAGCAACCACAAATCTCGCCCTCCTCTCCCACCCAACTTTACCATACGCATGGTATCC
AATCCCACCCCCATAGCATAGATTCACACCTTTGAGTTCAACGCAAAAGTCGTTGATATG
GTCATGACCCACAAACACTGATTTTACATCTCCTCTAGCTACCAACGTCGTGAAGAACCC
TGAGTTTTTGGTAGCTGAGCCTGTAGCTTCTTGTCTCACTCCTTGTTGAGGATTAGGCTC
TTCATTGTATTCCCTCTGGAGACGTTTCGAAGTCTGGTTATACCAGACCTGCTGAGAAGT
TTTGATCCAATCATAACCTTTTATGGAAGGAACACTAGAGTGATCTCCACTATCTAGAAA
ATAGAGATTGAGAAGAGATTTTTCCTGTAAACTCGACTCAGCAACTCCATGTATTTCGAG
ATTATAATTCCCAAACCCATCAATGTGAAAAGCCTCAGGAGGATTCACTTGAGACAGAGT
GTTGGGAAGCATCACTATATAAATCATGAGTTCTTGTCGGGACAACGTAGATTCTTGATC
ATGGTTTCCCAAAACC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL2146Contig1 862 4 7 U
GCATGGAGGCGATTGATGCTGTGGACAATGGAGTTAATCGGTATGATACTGATCAGCCTC
CAAGATATGTGAACAACACACATTTGTCTTCGAGGGTTGGAAGATTGAATCTTGATTGGA
TTGACCCTGACCAGTCACAGGAGAAGGAGAATGAGGCTTTCCAGCTTGCCATGGCTCTTG
CTGGCAAAGAGTTCCTCGATAGTGTAAGATTTCATGCAAGATCGTGGTTACCGGCTCGAT
CAATCGTGATGCAGTGTCTTGAAGAAAGGTTCAAGACTGACCCAAGTGGCGAGATCATGG
AACTGAAAAATTTCTGCCCTTGGAAGCTTCATTTGTTCGAGCTTGAGCAAGAGATGAAGA
TCGAACCCCTCATCAAATACGTCATATATCAGGACGAGCGAGGAAAGCAGTGGAGAGTTC
AAGCAGTGGCGGTAGCACCAGACAGGTTTGAGAACCGAAAGGCTCTTCCTGAGCAATGGA
GAGGCCTTAGAGACGAGGAACTCTCCAAAGCTGCTGAGATCCCCGGTTGCGTTTTTGTCC
ACATGAGCGGCTTTATTGGGGGAAACCAGTCCTATGATGGCGCTTTGTCCATGGCTCGAA
CTGCCCTCACTCTCTAATTCAGTGCATCTTCTTTGGTACCAGAAGAATCCTTTGCCGATT
CTTAACCGATAGAGAGAGTTTAACAATGCTTCATTGTGTTGTACAATTTCTGTTTTCAAT
TGAGTGACCATTTCGTGATTTGTTTTGTCGGATCGAATCGTATTTCAATAGATTTTGAAT
TCTTGTTTCATAATTTGTAGAAGAATTATGAGTAGATGATTGTATGCCACACAGTTTTGT
TTAGTTATTATTTTTCCCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4ED62TF U 1
AF RR4DL15TF U 351
AF RR4ED62JQ C 146
AF RR4F765JQ C 146
BS 1 728 RR4ED62TF
BS 729 729 RR4DL15TF
BS 730 745 RR4ED62TF
BS 746 753 RR4DL15TF
BS 754 754 RR4ED62JQ
BS 755 789 RR4DL15TF
BS 790 862 RR4ED62JQ

RD RR4ED62TF 747 0 0
GCATGGAGGCGATTGATGCTGTGGACAATGGAGTTAATCGGTATGATACTGATCAGCCTC
CAAGATATGTGAACAACACACATTTGTCTTCGAGGGTTGGAAGATTGAATCTTGATTGGA
TTGACCCTGACCAGTCACAGGAGAAGGAGAATGAGGCTTTCCAGCTTGCCATGGCTCTTG
CTGGCAAAGAGTTCCTCGATAGTGTAAGATTTCATGCAAGATCGTGGTTACCGGCTCGAT
CAATCGTGATGCAGTGTCTTGAAGAAAGGTTCAAGACTGACCCAAGTGGCGAGATCATGG
AACTGAAAAATTTCTGCCCTTGGAAGCTTCATTTGTTCGAGCTTGAGCAAGAGATGAAGA
TCGAACCCCTCATCAAATACGTCATATATCAGGACGAGCGAGGAAAGCAGTGGAGAGTTC
AAGCAGTGGCGGTAGCACCAGACAGGTTTGAGAACCGAAAGGCTCTTCCTGAGCAATGGA
GAGGCCTTAGAGACGAGGAACTCTCCAAAGCTGCTGAGATCCCCGGTTGCGTTTTTGTCC
ACATGAGCGGCTTTATTGGGGGAAACCAGTCCTATGATGGCGCTTTGTCCATGGCTCGAA
CTGCCCTCACTCTCTAATTCAGTGCATCTTCTTTGGTACCAGAAGAATCCTTTGCCGATT
CTTAACCGATAGAGAGAGTTTAACAATGCTTCATTGTGTTGTACAATTTCTGTTTTCAAT
TGAGTGAC*ATTTCGTGATTTGTTT
GT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4DL15TF 440 0 0
GAGATGAAGATCGAACCCCTCATCAAATACGTCATATATCAGGACGAGCGAGGAAAGCAG
TGGAGAGTTCAAGCAGTGGCGGTAGCACCAGACAGGTTTGAGAACCGAAAGGCTCTTCCT
GAGCAATGGAGAGGCCTTAGAGACGAGGAACTCTCCAAAGCTGCTGAGATCCCCGGTTGC
GTTTTTGTCCACATGGGCGGCTTTATTAGGGGAAACCAGTCCTATGATGGCGCTCTGTCC
ATGGCTCGAACTGCCCTCACTCTCTAATCCAGTGCATCTTCTTTGGTACCAGAAGAATCC
TTTGCCGATTCTTAACCGATAGAGAGAGTTTAACAATTCTTCATTATGTTGTACGATTTC
TGTTTTCAATTGAGTGACCATTTCGTGATTTGTTTTGTCGGATGGAATCGTATTTCAATA
GATTTTGAATTCTTGTTTC
C

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4ED62JQ 717 0 0
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AAGATTTCATGCAAGATCGTGGTTACCGGCTCGATCAATCGTGATGCAGTGTCTTGAAGA
AAGGTTCAAGACTGACCCAAGTGGCGAGATCATGGAACTGAAAAATTTCTGCCCTTGGAA
GCTTCATTTGTTCGAGCTTGAGCAAGAGATGAAGATCGAACCCCTCATCAAATACGTCAT
ATATCAGGACGAGCGAGGAAAGCAGTGGAGAGTTCAAGCAGTGGCGGTAGCACCAGACAG
GTTTGAGAACCGAAAGGCTCTTCCTGAGCAATGGAGAGGCCTTAGAGACGAGGAACTCTC
CAAAGCTGCTGAGATCCCCGGTTGCGTTTTTGTCCACATGAGCGGCTTTATTGGGGGAAA
CCAGTCCTATGATGGCGCTTTGTCCATGGCTCGAACTGCCCTCACTCTCTAATTCAGTGC
ATCTTCTTTGGTACCAGAAGAATCCTTTGCCGATTCTTAACCGATAGAGAGAGTTTAACA
ATGCTTCATTGTGTTGTACAATTTCTGTTTTCAATTGAGTGACCATTTCGTGATTTGTTT
TGTCGGATCGAATCGTATTTCAATAGATTTTGAATTCTTGTTTCATAATTTGTAGAAGAA
TTATGAGTAGATGATTGTATGCCACACAGTTTTGTTTAGTTATTATTTTTCCCATAG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4F765JQ 717 0 0
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AAGATTTCATGCAAGATCGTGGTTACCGGCTCGATCAATCGTGATGCAGTGTCTTGAAGA
AAGGTTCAAGACTGACCCAAGTGGCGAGATCATGGAACTGAAAAATTTCTGCCCTTGGAA
GCTTCATTTGTTCGAGCTTGAGCAAGAGATGAAGATCGAACCCCTCATCAAATACGTCAT
ATATCAGGACGAGCGAGGAAAGCAGTGGAGAGTTCAAGCAGTGGCGGTAGCACCAGACAG
GTTTGAGAACCGAAAGGCTCTTCCTGAGCAATGGAGAGGCCTTAGAGACGAGGAACTCTC
CAAAGCTGCTGAGATCCCCGGTTGCGTTTTTGTCCACATGAGCGGCTTTATTGGGGGAAA
CCAGTCCTATGATGGCGCTTTGTCCATGGCTCGAACTGCCCTCACTCTCTAATTCAGTGC
ATCTTCTTTGGTACCAGAAGAATCCTTTGCCGATTTTTAACCGATAGAGAGAGTTTAACA
ATGCTTCATTGTGTTGTACAATTTCTGTTTTCAATTGAGTGACCATTTCGTGATTTGTTT
TGTCGGATCGAATCGTATTTCAATAGATTTTGAATTCTTGTTTCATAATTTGTAGAAGAA
TTATGAGTAGATGATTGTATGCCACACAGTTTTGTTTAGTTATTATTTTTCCCATAG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 5

CO CL2147Contig1 1318 5 19 U
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CGACAATGAGTTCTGGTGGAGGAGGAGGATCGTCGTCTGAGCCATCCGGTGTAAAGAAAA
CATCCAAGCGACCAAAATATTCAAGATTTACTCAGCAGGAACTTCCAGCTTGCAAGCCAA
TTCTTACTCCAAGCTGGGTGATCTTGACATTTCTTGCTGCTGGG*TTGTCTTCATTCCCC
TGGGAGTCATCTGCCTCTTTGCTTCTCAGGGAGTCGTTGAGATTGTTGATAGATATGACA
CAGACTGTGTTCCAGAATCTTCCAGGGCCAACAAGGTCGCGTATATACAGAGTGAAGGAA
ATAAAATGTGTAACAGAACAATAACGGTCACGAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTAT
ACTACCAACTCGAGAATTACTACCAAAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCCGAAACGATG
CACAACTAAGAAGTCCAAAAGCAGAGAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTGAGGATAATG
TGGTTGGACACCCGATTGTTCCATGTGGTCTTGTTGCTTGGAGTTTGTTCAATGATACTT
ATAAATTTTCAAGAAATAGCCAAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTCATGGAAGA
GTGACAGAGACAGCAAGTTTGGGAAAAATGTCTACCCTAAAAACTTTCAGACAGGTGCTC
CTATTGGTGGTGGAACTCTTGATGCCAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGAAGACCTGATAG
TGTGGATGCGAACCGCGGCCTTGCCAATATTTAGGAAGTTGTATGGGAAGATTGAAACGG
ACCTGAACACAGGGGATACCATAACGGTCTTGTTGGAGAACAACTACAACACTTACAGCT
TCAATGGTGAGAAGAAGCTAGTGCTATCAACAACTAGCTGGCTCGGTGGAAAGAACGACT
TCCTCGGGATTGCTTACCTTACTGTGGGAAGCATCTGCTTGTTCCTGGCTGTTACATTCT
CTGTATTGTATCTAGTTAAGCCAAGGCAACTCGGAGATCCCTCGTACCTTTCGTGGAACA
GAAGTCCTGGAGGTTGACACTTGACAGATTAATAGATTTTGGTCAAAGTTTTGTTCTATT
CACCGTGAAACGGCGTAGTTTTGAGCTGAGCTAGTAAAATAAATGAAGAGAAAATAGGGA
ATAAGAAGTATATAATAAGTACCTATATAATATAATTAAATGTTAACAACGTTTGAATTT
TTATCCATATAACAGTGGTAGTAAGATCATACTTGGTGTTTATGAGAAATAATGTGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN86TF U 1
AF RR4FJ07TF U 1
AF RR4G991TF U 50
AF RR4DR59TF U 385
AF RR4DR59JQ C 661
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RD RR4EN86TF 655 0 0
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TGGGAGTCATCTGCCTCTTTGCTTCTCAGGGAGTCGTTGAGATTGTTGATAGATATGACA
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ATAAAATGTGTAACAGAACAATAACGGTCACGAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTAT
ACTACCAACTCGAGAATTACTACCAAAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCCGAAACGATG
CACAACTAAGAAGTCCAAAAGCAGAGAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTGAGGATAATG
TGGTTGGACACCCGATTGTTCCATGTGGTCTTGTTGCTTGGAGTTTGTTCAATGATACTT
ATAAATTTTCAAGAAATAGCCAAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTC
ATG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4FJ07TF 709 0 0
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CGACAATGAGTTCTGGTGGAGGAGGAGGATCGTCGTCTGAGCCATCCGGTGTAAAGAAAA
CATCCAAGCGACCAAAATATTCAAGATTTACTCAGCAGGAACTTCCAGCTTGCAAGCCAA
TTCTTACTCCAAGCTGGGTGATCTTGACATTTCTTGCTGCTGGG*TTGTCTTCATTCCCC
TGGGAGTCATCTGCCTCTTTGCTTCTCAGGGAGTCGTTGAGATTGTTGATAGATATGACA
CAGACTGTGTTCCAGAATCTTCCAGGGCCAACAAGGTCGCGTATATACAGAGTGAAGGAA
ATAAAATGTGTAACAGAACAATAACGGTCACGAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTAT
ACTACCAACTCGAGAATTACTACCAAAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCCGAAACGATG
CACAACTAAGAAGTCCAAAAGCAGAGAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTGAGGATAATG
TGGTTGGACACCCGATTGTTCCATGTGGTCTTGTTGCTTGGAGTTTGTTCAATGATACTT
ATAAATTTTCAAGAAATAGCCAAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTCATGGAAG*
GTGACAGAGACAGCAAGTTTGGGAAAA*TGTCTACCCTAAAA
CTTTCAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4G991TF 777 0 0
GG
GATTTGGTTCGACAATGAGTTCTGGTGGAGGAGGA***TCGTCGTCTGAGCCTTCCGGTG
TAAAGAAAACATCCAAGCGACCAAAATATTCAAGATTTACTCAGCAGGAGCTTCCAGCTT
GCAAGCCAATTCTTACTCCAAGCTGGGTGATCTTGACATTCCTTGCTGCTGGGGTTGTCT
TCATTCCCCTGGGAGTCATATGCTTATTTGCTTCTCAGGGAGTCGTTGAGATTGTTGATA
GATATGACACAGACTGTGTTCCAGAATCTTCCAGGGCCAACAAGGTCGCGTATATACAGA
GTGAAGGAAATAAAATGTGTAACAGAACAATAACGGTCACGAAAACTATGAAGCATCCTA
TCTATGTATACTACCAACTCGAGAATTACTACCAAAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCC
GAAACGATGCACAACTAAGAAGTCCAAAAGCAGAGAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTG
AGGATAATGTGGTTAGACACCCGATTGTTCCATGTGGTCTTGTTGCTTGGAGTTTGTTCA
ATGATACTTATAAATTTTCAAGAAATAGCCAAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCT
CATGGAAGAGTGACAGAGACAGCAAGTTTGGGAAAAATGTCTACCCTAAAAACTTTCAGA
CAGGTTCTCCTATTGGTGGTGGAACTCTTGATGCCAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGA*G
ACCTGATAGTGTGGATGCGAACCGCGGCCTTGCCA*TATTTAGGA*GTTGTATGG

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR4DR59TF 695 0 0
G
GGTCACGAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTATACTACCAACTCGAGAATTACTACCA
AAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCCGAAACGATGCACAACTAAGAAGTCCAAAAGCAGA
GAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTGAGGATAATGTGGTTGGACACCCGATTGTTCCATG
TGGTCTTGTTGCTTGGAGTTTGCTCAATGATACTTATAAATTTTCAAGAAATAGCCAAGA
GCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTCTTGGAAGAGTGACAGAGACAGCAAGTTTGGGAA
AAATGTCTACCCTAAAAACTTTCAGACAGGTGCTCCTATTGGTGGTGGAACTCTTGATGC
CAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGAAGACCTGATAGTGTGGATGCGAACCGCGGCCTTGCC
AATATTTAGGAAGTTGTATGGGAAGATTGAAACGGACCTGAACACAGGGGATACCATAAC
GGTCTTGTTGGAGAACAACTACAACACTTACAGCTTCAATGGTGAGAAGAAGCTAGTGCT
ATCAACAACTAGCTGGCTCGGTGGAAAGAACGACTTCCTCGGGATTGCTTACCTTACTGT
GGGAAGCATCTGCTTGTTCCTGGCTGTTACATTCTCTGTATTGTATCTAGTTAAGCCAAG
*CAACTCGGAGATCCCTCGTACCTTTCGTG
AACA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4DR59JQ 658 0 0
GTGACAGAGACAGCAAGTTTGGGAAAAATGTCTACCCTAAAAACTTTCAGACAGGTGCTC
CTATTGGTGGTGGAACTCTTGATGCCAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGAAGACCTGATAG
TGTGGATGCGAACCGCGGCCTTGCCAATATTTAGGAAGTTGTATGGGAAGATTGAAACGG
ACCTGAACACAGGGGATACCATAACGGTCTTGTTGGAGAACAACTACAACACTTACAGCT
TCAATGGTGAGAAGAAGCTAGTGCTATCAACAACTAGCTGGCTCGGTGGAAGGAACGACT
TCCTCGGGATTGCTTACCTTACTGTGGGAAGCATCTGCTTGTTCCTGGCTGTTACATTCT
CTGTATTGTATCTAGTTAAGCCAAGGCAACTCGGAGATCCCTCGTACCTTTCGTGGAACA
GAAGTCCTGGAGGTTGACACTTGACAGATTAATAGATTTTGGTCAAAGTTTTGTTCTATT
CACCGTGAAACGGCGTAGTTTTGAGCTGAGCTAGTAAAATAAATGAAGAGAAAATAGGGA
ATAAGAAGTATATAATAAGTACCTATATAATATAATTAAATGTTAACAACGTTTGAATTT
TTATCCATATAACAGTGGTAGTAAGATCATACTTGGTGTTTATGAGAAATAATGTGAA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 4

CO CL2148Contig1 651 2 2 U
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ACAATAATACAAATAATTTTGAACTTCTTCAACATAGCTTCTTGTAATAAAACATAGTAA
AGAATAAGAATCAAAGCTTGGTACGAGGAGCAAGGTACTTAGTATGGCGACCTTGAGCAA
TAAGCTTACCAGTCTTCTTATTCCTCAGCTCAACACTCACAACTGCTACAGCTTTACCCA
CACGCAAAGCCTTTGACTCAATCTCTATCTCTTCGTCAAGTAAAGCAGCATCGAGGTAAG
AAACATTGATCTCCACCGACACTCCGGAGCTCGAAAGTCCGGTTGTGTAAATCACAGCCG
ATCCTATCAAGTCAACCAGAGTCGCCGTTGCTCCTCCGTGTAAGGAATTGCCTGCGTTCA
GGAGGTGAGGTTGGACTTTGATGGAGCAGATGATTCGACCTGGTTCGATGAGATCTACTT
TAATTCCTTTCGTCACGAATCTCTCGATGAATCTCTGTGGCAAATTCGCCACTTTCGATT
CCTTTTCCTCCTCATTCTTCACTCCTTCCAGATACTGCTTCACCGATTCGAGGCTCATGT
TTTTTCCCTTCCGCCTCTTTTTTTTTTTTTGAATTGGGAATTTGATTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 646 1 646
DS 



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BQ
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C

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AAACATAAACTTTTGATATAATTCGAAACTATTATCACCGGCC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 5

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FH49JQ U 123
AF RR4FH49TF C 123
AF RR4F703TF U 1
AF RR4FX35JQ U 72
AF RR4FX35TF C 72
BS 1 175 RR4F703TF
BS 176 176 RR4FX35JQ
BS 177 374 RR4F703TF
BS 375 375 RR4FX35JQ
BS 376 528 RR4F703TF
BS 529 530 RR4FX35JQ
BS 531 550 RR4F703TF
BS 551 551 RR4FX35JQ
BS 552 606 RR4F703TF
BS 607 647 RR4FX35JQ

RD RR4FH49JQ 382 0 0
CGACTTCCATGACCACCGTCCTGCTGTCTTAATCGACCAACACCCTTTGTGGGTTCTAGG
TTAGCGCGCAGTTGGGCACCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCTGC
TTACCAAAAATGGCCCACTTGGAGCTCTCGATTCCGTGGGATGGTCCAACAAAGCAGCCA
CCCCGTCCTACCTATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCGAGGGCGTTGCGCCCCCAATGCCTC
TAATCATTGGCTTTACCCGATAGAACTCGTTTCCGAGCTCCAGCTATCCTGAGGGAAACT
TCGGAGGGAACCAGCTACTAGATGGTTCGATTAGTCTTTCGCCCCTATACCCAAGTCAGA
CGAACGATTTGCACGTCAGT
CC

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4FH49TF 382 0 0
CGACTTCCATGACCACCGTCCTGCTGTCTTAATCGACCAACACCCTTTGTGGGTTCTAGG
TTAGCGCGCAGTTGGGCACCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCTGC
TTACCAAAAATGGCCCACTTGGAGCTCTCGATTCCGTGGGATGGTCCAACAAAGCAGCCA
CCCCGTCCTACCTATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCGAGGGCGTTGCGCCCCCAATGCCTC
TAATCATTGGCTTTACCCGATAGAACTCGTTTCCGAGCTCCAGCTATCCTGAGGGAAACT
TCGGAGGGAACCAGCTACTAGATGGTTCGATTAGTCTTTCGCCCCTATACCCAAGTCAGA
CGAACGATTTGCACGTCAGT
CC

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4F703TF 606 0 0
GCTACTCATCGAGGCCTGGCCCTTGCCCCGACGGCCGGGTATAGGTCGCGCGCTTCAGCG
CCATCCATTTTCGGGGCTAGTTGATTCGGCAGGTGAGTTGTTACACACTCCTTAGCGGAT
TTCGACTTCCATGACCACCGTCCTGCTGTCTTAATCGACCAACACCCTTTGTGGGCTCTA
GGTTAGCGCGCAGTTGGGCACCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCT
GCTTACCAAAAATGGCCCACTTGGAGCTCTCGATTCCGTGGGATGGCTCAACAAAGCAGC
CACCCCGTCCTACCTATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCGAGGGCGTTGCGCCCCCGATGCC
TCTAATCATTGGCTCTACCCGATAGAACTCGTTTCCGAGCTCCAGCTATCCTGAGGGAAA
CTTCGGAGGGAACCAGCTACTAGATGGTTCGATTAGTCTTTCGCCCCTATACCCAAGTCA
GACGAACGATTTGCACGTCAGTATCGCTGCGGGCCTCCACCAGAGTTTCCTCTGGCTTCG
CCCCGCTCAG*CATAGTTCACCATCTTTCGGGTCCCGACAGGCATGCTCACACTCGAACC
CTTCTC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4FX35JQ 576 0 0
CGGGGCTAGTTGATTCGGCAGGTGAGTTGTTACACACTCCTTAGCGGATTTCGACTTCCA
TGACCACCGTCCTGCTGTCTTAATCGACCAACACCCTTTGTGGGTTCTAGGTTAGCGCGC
AGTTGGGCACCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCTGCTTACCAAAA
ATGGCCCACTTGGAGCTCTCGATTCCGTGGGATGGCTCAACAAAGCAGCCACCCCGTCCT
ACCTATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCGAGGGCGTTGCGCCCCCGATGCCTCTAATCATTG
GCTTTACCCGATAGAACTCGTTTACGAGCTCCAGCTATCCTGAGGGAAACTTCGGAGGGA
ACCAGCTACTAGATGGTTCGATTAGTCTTTCGCCCCTATACCCAAGTCAGACGAACGATT
TGCACGTCAGTATCGCTGCGGGCCTCCACCAGAGTTT**TCTGGCTTCGCCCCGCTCAGG
CATAGTTCACCATCTTTCGGGTCCCGACAGGCATGCTCACACTCGAACCCTTCTCAGAAG
ATCAAGGTCGGTCGGTAGTGCACCCGTGAGGGATCC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4FX35TF 576 0 0
CGGGGCTAGTTGATTCGGCAGGTGAGTTGTTACACACTCCTTAGCGGATTTCGACTTCCA
TGACCACCGTCCTGCTGTCTTAATCGACCAACACCCTTTGTGGGTTCTAGGTTAGCGCGC
AGTTGGGCACCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCTGCTTACCAAAA
ATGGCCCACTTGGAGCTCTCGATTCCGTGGGATGGCTCAACAAAGCAGCCACCCCGTCCT
ACCTATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCGAGGGCGTTGCGCCCCCGATGCCTCTAATCATTG
GCTTTACCCGATAGAACTCGTTTACGAGCTCCAGCTATCCTGAGGGAAACTTCGGAGGGA
ACCAGCTACTAGATGGTTCGATTAGTCTTTCGCCCCTATACCCAAGTCAGACGAACGATT
TGCACGTCAGTATCGCTGCGGGCCTCCACCAGAGTTT**TCTGGCTTCGCCCCGCTCAGG
CATAGTTCACCATCTTTCGGGTCCCGACAGGCATGCTCACACTCGAACCCTTCTCAGAAG
ATCAAGGTCGGTCGGTAGTGCACCCGTGAGGGATCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 2 5

CO CL2150Contig1 945 3 7 U
ATACTGTGGAGCCAAAATTCATAAACCTCTAGTATGTGTTCTCTCCACTTCCTTATTACC
AAAGATGTAACTCAAAAACAATTTCACAATATTCATCACTTGTGATGTGTGTATCCTCAA
CAATTTAAGAGCTTGCTTTATGGTGAATAAAAGGAAGGAGCTGGGAGGAAAGGAAATGGT
GCAGCAAAAGCATAAGCCACAGGAGGCTGTGCAGGACGTCTCTTTCTTCTTTGAGTTTTT
ACTTCACCGGATACAGAGTTCGGTAAACCGGCTACTTCTAGGAGTGGTTGTTTGTCCTCA
TCATAAACGCGGTGTATAAGCAGACCAGACATGAAAACAGGAAGGAAGAAAAGACTGGCG
TGGAACATCTTCCTTGCTTTGTCCATGGTCCCGTGTCGGTAGAATGAAAACGCGGTAGCA
GCAATTGCCATTGTGAGAAGTGTTGATTCGAGACAAAACCAGCTCGATGTCAAACCCCAG
TCATAGGCAATGAAACCGAGTGGGACCATGTAAAAGCAGTTCCTAAGTGCCACTGCTGCT
ATCCTCTTCCCTGATGGATCAAACAGCGACAGCATCTTGTAACCTCCAGCAGCATAATCA
TTACGGCAAAGGTGTGCAAGGGCCATAAAATGAGGAATCTGCCAAAAATAAAGAGCAGCT
GGAAGAATCAACGAGTTGAGTGAGATCTGACCAGAAGCCGCAGCCCACCCAAGTAAAGGT
GGGATGGCACCAACAACAGCCCCAACCCAAGTATTCACAGGGTGAAGTTGCTTCAACGGA
GTATAAACAAACGCGTAAAGTACAAGATTCGCAGATGCAAGTCCAGCAGCCATCATATTA
CTTACTAGCCAACAAACAAGCACCAGAAGTACCAGCGATAGTAGCCCACGCAACAGCATG
GGGAACACCGATACGTCCTGAAGGCAACGGCCTTTTCATCGTCCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A013JQ U 1
AF RR4A013JQD U 1
AF RR4A013TFB C 119
BS 1 128 RR4A013JQ
BS 129 129 RR4A013JQD
BS 130 327 RR4A013JQ
BS 328 328 RR4A013JQD
BS 329 345 RR4A013JQ
BS 346 355 RR4A013JQD
BS 356 945 RR4A013TFB

RD RR4A013JQ 345 0 0
ATACTGTGGAGCCAAAATTCATAAACCTCTAGTATGTGTTCTCTCCACTTCCTTATTACC
AAAGATGTAACTCAAAAACAATTTCACAATATTCATCACTTGTGATGTGTGTATCCTCAA
CAATTTAAAAGCTTGCTTTATGGTGAATAAAAGGAAGGAGCTGGGAGGAAAGGAAATGGT
GCAGCAAAAGCATAAGCCACAGGAGGCTGTGCAGGACGTCTCTTTCTTCTTTGAGTTTTT
ACTTCACCGGATACAGAGTTCGGTAAACCGGCTACTTCTAGGAGTGGTTGTTTGTCCTCA
TCATAAACGCGGTGTATAAGCAGACCAAACATGAAAACAGGAAGG

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR4A013JQD 355 0 0
ATAC
TGTGGAGCCAAAATTCATAAACCTCTAGTATGTGTTCTCTCCACTTCCTTATTACCAAAG
ATGTAACTCAAAAACAATTTCACAATATTCATCACTTGTGATGTGTGTATCCTCAACAAT
TTAAGAGCTTGCTTTATGGTGAATAAAAGGAAGGAGCTGGGAGGAAAGGAAATGGTGCAG
CAAAAGCATAAGCCACAGGAGGCTGTGCAGGACGTCTCTTTCTTCTTTGAGTTTTTACTT
CACCGGATACAGAGTTCGGTAAACCGGCTACTTCTAGGAGTGGTTGTTTGTCCTCATCAT
AAACGCGGTGTATAAGCAGACCAGACATGAAAACAGGAAGGAAGAAAAGAC

QA 5 355 5 355
DS 

RD RR4A013TFB 827 0 0
AACAATTTAAGAGCTTGCTTTATGGTGAATAGAAGGAAGGAGCTGGGAGGAAAGGAAATG
GTGCAGCAGAAGCATAAGCCACAGGAGGCTGTGCAGGACGTCTCTTTCTTCTTTGAGTTT
TTACTTCACCGGATACAGAGTTCGGTAAACCGGCTACTTCTAGGAGTGGTTGTTTGTCCT
CATCATAGACGCGGTGTATAAGCAGACCAGACATGAAAACAGGAAGGAAGAGAAGACTGG
CGTGGAACATCTTCCTTGCTTTGTCCATGGTCCCGTGTCGGTAGAATGAAAACGCGGTAG
CAGCAATTGCCATTGTGAGAAGTGTTGATTCGAGACAAAACCAGCTCGATGTCAAACCCC
AGTCATAGGCAATGAAACCGAGTGGGACCATGTAAAAGCAGTTCCTAAGTGCCACTGCTG
CTATCCTCTTCCCTGATGGATCAAACAGCGACAGCATCTTGTAACCTCCAGCAGCATAAT
CATTACGGCAAAGGTGTGCAAGGGCCATAAAATGAGGAATCTGCCAAAAATAAAGAGCAG
CTGGAAGAATCAACGAGTTGAGTGAGATCTGACCAGAAGCCGCAGCCCACCCAAGTAAAG
GTGGGATGGCACCAACAACAGCCCCAACCCAAGTATTCACAGGGTGAAGTTGCTTCAACG
GAGTATAAACAAACGCGTAAAGTACAAGATTCGCAGATGCAAGTCCAGCAGCCATCATAT
TACTTACTAGCCAACAAACAAGCACCAGAAGTACCAGCGATAGTAGCCCACGCAACAGCA
TGGGGAACACCGATACGTCCTGAAGGCAACGGCCTTTTCATCGTCCC

QA 1 827 1 827
DS 



CO CL2150Contig2 995 2 2 U
GGATTTTCGAGATAAGCAATGATGCTAAGATGAAGAGGACGATGAAAAGGCCGTTGCCTT
CGGGACGTATCGGTGTTCCGCATGCTGTTGCGTTTGCTACTATCGCTGGTACTTCTGGTG
CTTGCTTGTTGGCTAGTAAGACTAATATGATGGCGGCTGGACTTGCATCTGCTAATCTTG
TTCTTTACGCGTTTGTTTATACTCCGTTGAAGCAACTTCACCCTATCAATACTTGGGTCG
GGGCTGTTGTTGGTGCCATCCCTCCTTTACTTGGGTGGGCTGCGGCTTCTGGTCAGATCT
CACTCAACTCGTTGATTCTTCCAGCTGCTCTTTATTTTTGGCAGATTCCTCATTTTATGG
CCCTTGCACACCTTTGCCGTAATGATTATGCAGCTGGAGGTTACAAGATGCTGTCGCTGT
TTGATCCTTCAGGGAAGAGGATAGCAGCAGTGGCTCTTAGGAACTGCTTTTACTTGGTCC
CACTCGGTTTCATTGCCTATGACTGGGGTTTGACATCGAGCTGGTTTTGTCTCGAATCAA
CACTTCTCACAATGGTAATCGCTGCTACCGCTTTTTCATTCTACAGACACGGGACCATGG
AGAAAGCGAGGAAGATGTTCCACGCCAGTCTTCTCTTCCTTCCTGTTTTCATGTCTGGTC
TGCTTATACACCGCGTCTATGATGAGGAAAAACAACCAGTCCTAGAAGTAGCCGGTTTAC
CGAACTCTGTAACTGATGAAGTGAAATCTCACAGAAGAAAGAAACGTGCTGCACAGCCTC
CTGTGGCTTATGCTTCTGCTGCACCATTTCCTTTCCTCCCAGCTCCTTCCTTCTATTCAC
CATAAAGCAAGCTCTTAAATTGTTGAGGATACACACATCACAAGTGATGAATATTGTGAA
ATTGTTTTTGAGTTACATCTTTGGTAATAAGGAAGTGGAGAGAACACATACTAGAGATTT
ATGTAATTTTGGATCCACAATATAATTTGTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FX49TF U 1
AF RR4FX49JQ C 266
BS 1 688 RR4FX49TF
BS 689 995 RR4FX49JQ

RD RR4FX49TF 694 0 0
GGATTTTCGAGATAAGCAATGATGCTAAGATGAAGAGGACGATGAAAAGGCCGTTGCCTT
CGGGACGTATCGGTGTTCCGCATGCTGTTGCGTTTGCTACTATCGCTGGTACTTCTGGTG
CTTGCTTGTTGGCTAGTAAGACTAATATGATGGCGGCTGGACTTGCATCTGCTAATCTTG
TTCTTTACGCGTTTGTTTATACTCCGTTGAAGCAACTTCACCCTATCAATACTTGGGTCG
GGGCTGTTGTTGGTGCCATCCCTCCTTTACTTGGGTGGGCTGCGGCTTCTGGTCAGATCT
CACTCAACTCGTTGATTCTTCCAGCTGCTCTTTATTTTTGGCAGATTCCTCATTTTATGG
CCCTTGCACACCTTTGCCGTAATGATTATGCAGCTGGAGGTTACAAGATGCTGTCGCTGT
TTGATCCTTCAGGGAAGAGGATAGCAGCAGTGGCTCTTAGGAACTGCTTTTACTTGGTCC
CACTCGGTTTCATTGCCTATGACTGGGGTTTGACATCGAGCTGGTTTTGTCTCGAATCAA
CACTTCTCACAATGGTAATCGCTGCTACCGCTTTTTCATTCTACAGACACGGGACCATGG
AGAAAGCGAGGAAGATGTTCCACGCCAGTCTTCTCTTCCTTCCTGTTTTCATGTCTGGTC
TGCTTATACACCGCGTCTATGATGAGGA
AAAAAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FX49JQ 730 0 0
TTTACTTGGGTGGGCTGCGGCTTCTGGTCAGATCTCACTCAACTCGTTGATTCTTCCAGC
TGCTCTTTATTTTTGGCAGATTCCTCATTTTATGGCCCTTGCACACCTTTGCCGTAATGA
TTATGCAGCTGGAGGTTACAAGATGCTGTCGCTGTTTGATCCTTCAGGGAAGAGGATAGC
AGCAGTGGCTCTTAGGAACTGCTTTTACTTGGTCCCACTCGGTTTCATTGCCTATGACTG
GGGTTTGACATCGAGCTGGTTTTGTCTCGAATCAACACTTCTCACAATGGTAATCGCTGC
TACCGCTTTTTCATTCTACAGACACGGGACCATGGAGAAAGCGAGGAAGATGTTCCACGC
CAGTCTTCTCTTCCTTCCTGTTTTCATGTCTGGTCTGCTTATACACCGCGTCTATGATGA
GGAAAAACAACCAGTCCTAGAAGTAGCCGGTTTACCGAACTCTGTAACTGATGAAGTGAA
ATCTCACAGAAGAAAGAAACGTGCTGCACAGCCTCCTGTGGCTTATGCTTCTGCTGCACC
ATTTCCTTTCCTCCCAGCTCCTTCCTTCTATTCACCATAAAGCAAGCTCTTAAATTGTTG
AGGATACACACATCACAAGTGATGAATATTGTGAAATTGTTTTTGAGTTACATCTTTGGT
AATAAGGAAGTGGAGAGAACACATACTAGAGATTTATGTAATTTTGGATCCACAATATAA
TTTGTTTTTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 2 5

CO CL2151Contig1 780 3 14 U
AGCATTAACTGAATATACATTACTCTTCCAAAATTTACAAAATCGACCTTTTAATAGTAA
ATAATATGCCACCAAGATCTTCCATTTATTTGGTGTTGCTCATCCAATTAAAAGAATATA
TAAATTTTGTTTTGTGGTAAAAAAAACACTTCATACATTTCATAAACACTCACTCAATAA
AAGCTGTTTTAATTTGTTTGTTAATCATAGTCTTGTATTTTAACTCAAGCATTCTTGTTT
TTCCAAGGCTTGAGAACGCCAACAACGATCACAGCAACAACAATGAAAAGGATGATGATT
GCAATACACATCCATTTTCTTGAGTTCTTCTGTAAGCTCTTTGCTCTTTGAAGAACCGTG
TTTCCCGATTGCACATGATCTACTGCACTTGACACCTGAGATTCTATGTTGTCAAGCATT
TCTCCTTGTGCATCAACCAAAACTGCCATATCCATGAAAATTTGTTGTAAGTCGAGAAGT
TTCTTTTCCAAGTCTCTGACAGCATCATGACGTTCTTGAATTTCCGCCAAGGTGTCCATC
AACTGTCCTCTTCCTTGTTCCTGAATCGCTTTCTGGAAAATCTGTTCGCTGTTACCAGTT
TCAATCAACTCATCAATTGTGTCTTCATCCGCTCGCTGTCCAGTTACTGTAAAAATACGC
CTATCAACAACCTCTCGATACTCTTGTTGGATGTTCTCTCTTAAAACCTGAAACTCGGCC
ATCTTGTCTTTTAACTTCTTCTTCAAGGAAAGTGTGGTTGCTGTTCTTGATCGATCCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH29JQ U 314
AF RR4H610JQB U 1
AF RR4HA26JQB U 135
BS 1 191 RR4H610JQB
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BS 193 286 RR4H610JQB
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BS 351 354 RR4H610JQB
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BS 356 578 RR4H610JQB
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BS 705 720 RR4H610JQB
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RD RR4EH29JQ 160 0 0
T
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ATGATCTACTGCACTTGACACCTGAGATTCTATGTTGTCAAGCATTTCTCCTTGTGCATC
AACCAAAACTGCCATATCCATGAAAATTTGTTGTAAGTC

QA 2 160 2 160
DS 

RD RR4H610JQB 720 0 0
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ATAATATGCCACCAAGATCTTCCATTTATTTGGTGTTGCTCATCCAATTAAAAGAATATA
TAAATTTTGTTTTGTGGTAAAAAAAACACTTCATACATTTCATAAACACTCACTCAATAA
AAGCTGTTTTAGTTTGTTTGTTAATCATAGTCTTGTATTTTAACTCAAGCATTCTTGTTT
TTCCAAGGCTTGAGAACGCCAACAACGATCACAGCAACAACAATGAGAAGGATGATGATT
GCAATACACATCCATTTTCTTGAGTTCTTCTGTAAGCTCTTTGCTCTTTAAAGAGCCGTG
TTTCCCGATTGCACATGATCTACTGCACTTGACACCTGAGATTCTATGTTGTCAAGCATT
TCTCCTTGTGCATCAACCAAAACTGCCATATCCATGAAAATTTGTTGTAAGTCGAGAAGT
TTCTTTTCCAAGTCTCTGACAGCATCATGACGTTCTTGAATTTCCGCCAAGGTGTCCATC
AACTGTCCTCTTCCTTGTTCCTGAATCGCTTTCTGGAAGATCTGTTCGCTGTTACCAGTT
TCAATCAACTCATCAATTGTGTCTTCATCCGCTCGCTGTCCAGTTACTGTAAAAATACGC
CTATCAACAACCTCTCGATACTCTTGTTGGATGTTCTCTCTTAGAACCTGAAACTCGGCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4HA26JQB 646 0 0
GGTA
AAAAAAAACACTTCATACATTTCATAAACACTCACTCAATAAAAGCTGTTTTAATTTGTT
TGTTAATCATAGTCTTGTATTTTAACTCAAGCATTCTTGTTTTTCCAAGGCTTGAGAACG
CCAACAACGATCACAGCAACAACAATGAAAAGGATGATGATTGCAATACACGTCCATTTT
CTTGAGTTCTTCTGTAAGCTCTTTGCTCTTTGAAGAACCGTGTTTCCCGATTGCACATGA
TCTACTGCACTTGACACCTGAGATTCTAAGTTGTCAAGCATTTCTCCTTGTGCATCAACC
AAAACTGCCATATCCATGAAAATTTGTTGTAAGTCGAGAAGTTTCTTTTCCAAGTCTCTG
ACAGCATCATGACGTTCTTGAATTTCCGCCAAGGTGTCCATCACCTGTCCTCTTCCTTGT
TCCTGAATCGCTTTCTGGAAAATCTGTTCGCTGTTACCAGTTTCAATCAACTCATCAATT
GTGTCTTCATCCGCTCGCTGTCCAGTTACTGTAAAAATACGCCTATCAACAACCTCTCGA
TACTCTTGTTGGATGTTCTCTCTTAAAACCTGAAACTCGGCCATCTTGTCTTTTAACTTC
TTCTTCAAGGAAAGTGTGGTTGCTGTTCTTGATCGATCCACA

QA 5 646 5 646
DS 



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CACTAAAAAACTGTCTCAAAAGGTCGACACTTTCCCGGCGTTTCCGGTTTAACATCTCGA
CACTCTTTCTCGCGCAGACCCCACGTCTCCTTCTCGCCTCGGCACAATCAAAGTCGTGTT
CTTTCCTTCGTTCTTGGTGTTAAACCAAACTTAAGTCTCTTGTACGATGAACGATCTTTT
AAAGGGTTCGTTTGAGCTTCCCCGGGGACAATCTTCTAGAGAAGGAGATGTCGAACTAGG
GGAACAAGTAGGAGATCAGGGATTAGATGATTTCTTCAAAAAGGTTCAAGATATTGACAA
ACAATATGAAAAGCTAAATAAGCTTCTTAAGAAACTTCAGGCTGCCCATGAGGAGTCCAA
GGCTGTAACCAAAGCTCCCGCCATGAAGGCAATAAAGAAGAAAATGGAAAAAGACGCTGA
TGAAGTCGGAAGTATTGCTCGTTTCATAAAAGGGAAACTCGAGGAGCTGGACAGAGAGAA
CTTGGCAAATAGACAAAAATCTGGGTGTGGGAAAGGATCTGGTGTGGATCGATCAAGAAC
AGCAACCACACTTTCCTTGAAGAAGAAGTTAAAAGACAAGATGGCCGAGTTTCAGTTCTA
AGAGAGAACATCCAACAAGAGTATCGAGAGGTTGTTGATAGGCGTATTTTTACAGTAACT
GGACAGCGAGCGGATGAGACACATTGATGAGTTGATTGAAACTGGTACAGCGACAGATCT
TCAGAAAGCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H610TF U 1
AF RR4HA26TF U 151
BS 1 169 RR4H610TF
BS 170 170 RR4HA26TF
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BS 186 186 RR4HA26TF
BS 187 734 RR4H610TF
BS 735 792 RR4HA26TF

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GGACAGCGAGCGGA

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DS 

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ATCTTCTAGAGAAGGAGATGTCGAACTAGGGGAACAAGTAGGAGATCAGGGATTAGATGA
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AATAAAGAAGAAAATGGAAAAAGACGTTGATGAAGTCGGAAGTATTGCTCGTTTCATAAA
AGGGAAACTCGAGGAGCTGGACAGAGAGTACTTGGCAAATAGACAAAAATCTGGGTGTGG
GAAAGGATCTGGTGTGGATCGATCAAGAACAGCAACCACACTTTCCTTGAAGAAGAAGTT
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GTTGATTGAAACTGGTACAGCGACAGATCTTCAGAAAGCGAT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 5

CO CL2152Contig1 1242 5 18 U
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TTTATACGAGCACGGTAAAAAAGAATCGGCGGTAGACGTCGGAGAACAGTTGTTCGTGAC
TATGATGAATCTGACGATGAACATGTTATGGGGAGGTTCGGTGAAAGCAGAGGATATGGA
GAGTGTTGGAACAGATTTTAAAGGAGTGATTTCTGAGATAACCAGCCTTTTGAGTGAGCC
TAATGTTTCGGATTTCTTTCCGTGGCTAGCGAGATTCGATCTTCAAGGGCTTGTGAAAAG
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AAGGCTACCAAGAAGAGATGATGATGATGATGGTGAATGCAAAGACTTTTTGCAATACTT
GATGAAGTTAAAAGATCAAGAAAGTGACTCGGAGGTTCCCATTACGGTTAACCATGTCAA
AGCCATACTTACGGATATGGTGGTTGGTGGCACAGACACATCTACGAACACGATAGAGTT
TGCTATGGCGGAACTAATAAACAATCCGAAGTTGATCAAGAGAGCGCAACAAGAGCTAGA
CGAAGTTGTAGGAAAACAAAACATTGTTGAAGAATCACACATCCCTAGACTTCCTTACAT
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TGTTAATGTTTGGTCCATTCAAAGAGACCCAAAAGTGTGGGAAAATCCAACTGAGTTTAT
TCCCGAGAGGTTTCTTGAAAATAAGTCTCATGATTTCACCGGAACTGATTATAGCTATTT
CCCCTTTGGATCTGGCCGGAGAATTTGCGCTGGTGTAGCACTTGCCGAGAGGATGGTTTT
ATACACTATCGCGACGCTATTACACTCGTTCGATTGGAAGATTCCAGAAGGACAAGTTTT
GGATTTGGAAGAAAAGTTTGGGATTGTCTTAAAGCTCAAGACCCCTCTTGTTGCCTTGCC
TGTTCCAAGATTGTTCGATCCAAATCTTTATCTATAAAGGCTAATGTTGTCATATTTGGT
AATTCATATATTACACCCCAAATTAATTTACTATCATAAAATAAGTTTTTGTAATGAAAA
CACTTATCAAGGTATTGACTATTGAGAATGACTTCCGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AI94TF U 1
AF RR4C287TF U 178
AF RR4DM72TF U 159
AF RR4C287JQ C 431
AF RR4DM72JQ C 455
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TTTATACGAGCACGGTAAAAAAGAATCGGCGGTAGACGTCGGAGAACAGTTGTTCGTGAC
TATGATGAATCTGACGATGAACATGTTATGGGGAGGTTCGGTGAAAGCAGAGGATATGGA
GAGTGTTGGAACAGATTTTAAAGGAGTGATTTCTGAGATAACCAGCCTTTTGAGTGAGCC
TAATGTTTCGGATTTCTT*CCGTGGCTAGCGAGATTCGATCTTCAAGGGCTTGTGAAAAG
GATGCATGTGTGTGCTCGAACACTTGACACGGTACTTGATCGAGCTATCAAACATATGCA
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GATGAAG

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DS 

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AAGGATGCATGTGTGTGCTCGAACACTTGACGCGGTACTTGATCGAGCTATCAAACATAT
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CTTTATGGAGTTAAAAGATCAAGAAAGTGACTCGGAGGTTCC

QA 1 282 1 282
DS 

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G
GGTGAAAGCAGAGGATATGGAGAGTGTTGGAACAGATTTTAAAGGAGTGATTTCTGAGAT
AACCAGCCTTTTGAGTGAGCCTAATGTTTCGGATTTCTTTCCGTGGCTAGCGAGATTCGA
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TCGAGCTATCAAACATATGCAAAGGCTACCAAGAAGAGATGATGATGATGATGGTGAATG
CAAAGACTTTTTGCAATACTTGATGAAGTTAAAAGATCAAGAAAGTGACTCGGAGGTTCC
CATTACGGTTAACCATGTCAAAGCCATACTTACGGATATGGTGGTTGGTGGCACAGACAC
ATCTACGAACACGATAGAGTTTGCTATGGCGGAACTAATAAACAATCCGAAGTTGATCAA
GAGAGCGCAACAAGAGCTAGACGAAGTTGTAGGAAAACAAAACATTGTTGAAGAATCACA
CATCCCTAGACTTCCTTACATACTTGCCATTATGAAAGAAACACTTAGACTTCACCCAAC
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CCCTAAAGACACCAAGAT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR4C287JQ 808 0 0
AAAGATCAAGAAAGTGACTCGGAG*TTCCCATTACGGCTAACCATGTCAAAGCCATACTT
ACGGATATGGTGGTTGGTGGCACAGACACATCTACGAACACGATAGAGTTTGCTATGGCG
GAACTAATAAACAATCCGAAGTTGATCAAGAGAGCGCAACAAGAGCTAGACGAAGTTGTA
GGAAAACAAAACATTGTTGAAGAATCACACATCCCTAGACTTCCTTACATACTTGCCATT
ATGAAAGAAACACTTAGACTTCACCCAACCCTTCCTTTGTTAGTCCCTCACTCTCCGGCT
GAAACGGCCATGGTAGGCGGCTACACTGTCCCTAAAGACACCAAGATCTTTGTTAATGTT
TGGTCCATTCAAAGAGACCCAAAAGTGTGGGAAAATCCAACTGAGTTTATTCCCGAGAGG
TTTCTTGAAAATAAGTCTCATGATTTCACCGGAACTGATTATAGCTATTTCCCTTTTGGA
TCTGGCCGGAGAATTTGCGCTGGTGTAGCACTTGCCGAGAGGATGGTTTTATACTCTATC
GCGACGCTATTACACTCGTTCGATTGGAAGATTCCAGAAGGACAAGTTTTGGATTTGGAA
GAAAAGTTTGGGATTGTCTTAAAGCTCAAGACCCCTCTTGTTGCCTTGCCTGTTCCAAGA
TTGTTCGATCCAAATCTTTATCTATAAAGGGTAATGTTGTCATATTTGGTAATTCATATA
TTACACCCCAAATTAATTTACTATCGTAAAATAAGTTTTTGTGATGAAAACACTTATCAA
GGTATTGACTATTGAGAATGACTTCCGT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4DM72JQ 788 0 0
GTTCCCATTACGGTTAACCATGTCAAAGCCATACTTACGGATATGGTGGTTGGTGGCACA
GACACATCTACGAACACGATAGAGTTTGCTATGGCGGAACTAATAAACAATCCGAAGTTG
ATCAAGAGAGCGCAACAAGAGCTAGACGAAGTTGTAGGAAAACAAAACATTGTTGAAGAA
TCACACATCCCTAGACTTCCTTACATACTTGCCATTATGAAAGAAACACTTAGACTTCAC
CCAACCCTTCCTTTGTTAGTCCCTCACTCTCCGGCTGAAACGGCCATGTTAGGCGGCTAC
ACTGTCCCTAAAGACACCAAGATCTTTGTTAATGTTTGGTCCATTCAAAGAGACCCAAAA
GTGTGGGAAAATCCAACTGAGTTTATTCCCGAGAGGTTTCTTGAAAATAAGTCTCATGGT
TTCACCGGAACTGATTATAGCTATTTCCCCTTTGGATCTGGCCGGAGAATTTGCGCTGGT
GTAGCACTTGCCGAGAGGATGGTTTTATACACTATCGCGACGCTATTACACTCGTTCGAT
TGGAAGATTCCAGAAGGACAAGTTTTGGATTTGGAAGAAAAGTTTGGGATTGTCTTAAAG
CTCAAGACCCCTCTTGTTGCCTTGCCTGTTCCAAGGTTGTTCGATCCAAATCTTTATCTA
TAAAGGCTAATGTTGTCATATTTGGTAATTCATATATTACACCCCAAATTAATTTACTAT
CATAAAATAAGTTTTTGTAATGAAAACACTTGTCAAGGTATTGACTATTGAGAATGACTT
CCGTTTTG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 5

CO CL2153Contig1 756 5 7 U
TGCTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATTACCAA
AATCCCATATAAGCACAATAATACAAAATCCACAAGATAACATATGGCACTATATCCTTT
TCACTAATCTCCACGATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAAA
AATGATACATAGAACATACTCTTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTA
GGGCATTGCTGAACTCGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTTCTCTTCCATTCCATGATTT
CTTTGAACGTCTTTATGAATTCCTTCATGTGTAGGCGTCTCCATTCCTCAAAATCCCATT
CTCCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTTGACAGTCATCTTCT
CAGAGTTGTCCTCTCGTACGACACCAACTGTCACTCTCTCATATTCATTACCCTCAACAG
TATCTAAATGCCCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAGTAACTTTCCATGAACTTCTC
CATCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCTCTTAAAGC
CAGGGAGTGTTACAGAGATGATTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGGCGACCTCAG
GCTCTTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATTGTGAAGCTGTGCACCCGAGCCACTCATTT
TTATTTTCTCTTCAGTTTTTTTTTTGCTTTATTTCC


BQ
10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B986TF C 1
AF RR4B986JQ U 2
AF RR4DN48JQ U 2
AF RR4BZ92TF C 1
AF RR4BZ92JQ U 2
BS 1 2 RR4B986TF
BS 3 156 RR4B986JQ
BS 157 157 RR4DN48JQ
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BS 680 744 RR4BZ92JQ
BS 745 745 RR4BZ92TF
BS 746 756 RR4BZ92JQ

RD RR4B986TF 693 0 0
TGCTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATTACCAA
AATCCCATATAAGCACAATAATACAAAATCCACAAGATAACATATGGCACTATATCCTTT
TCACTAATCTCCACGATACTATCAGTCTCTAGGTTT*ATTATACTCGGAATCTGGAGAAA
AATGATACATAGAACATACTCTTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTA
GGGCATTGCTGAACTCGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTTCTCTTCCATTCCATGATTT
CTTTGAACGTCTTTATGAATTCCTTCATGTGTAGGCGTCTCCATTCCTCAAAATCCCATT
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CAGAGTTGTCCTCTCGTACGACACCAACTGTCACTCTCTCATATTCATTACCCTCAACAG
TATCTAAATGCCCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAGTAACTTTCCATGAACTTCTC
CATCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCTCTTAAAGC
CAGGGAGTGTTACAGAGATGATTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGGCGACCTCAG
GCTCTTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATT
CC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4B986JQ 678 0 0
G
CTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATTACCAAAA
TCCCATATAAGCACAATAATACAAAATCCACAAGATAACATATGGCACTATATCCTTTTC
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TGATACATAGAACATACTCTTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTAGG
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TCTTGAAAGCTACCATA

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR4DN48JQ 671 0 0
G
CTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATTACCAAAA
TCCCATATAAGCACAATAATACAAAATCCACAAGATAACATATGGCACTATATCCTTTTC
ACTAATCTCCACGATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAAAAA
TGATACATAGAACATACTCTTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTAGG
GCATTGCTGAACTCGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTTCTCTTCCATTCCATGATTTCT
TTGAACGTCTTTATGAATTCCTTCATGTGTAGGCGTCTCCATTCCTCAAAATCCCATTCT
CCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTTGACAGTCATCTTCTCA
GAGTTGTCCTCTCGTACGACACCAACTGTCACTCTCTCATATTCATTACCCTCAACAGTA
TCTAAATGCCCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAGTAACTTTCCATGAACTTCTCCA
TCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCTCTTAAAGCCA
GGGAGTGTTACAGAGATGATTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGGCGACCTCAGGC
TCTTGAAAGC

QA 2 671 2 671
DS 

RD RR4BZ92TF 756 0 0
TA
CTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAGACCATACAAAATATAGATTACCAAAA
TCCCATATAAGCACAATAATACAAAATCCACAAGATAACATGTGGCACTATATCCTTTTC
ACTAATCTCCACGATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAAAAA
TGATACATAGAACATACTCTTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTAGG
GCATTGCTGAACTCGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTTCTCTTCCATTCCATGATTTCT
TTGAACGTCTTTATGAATTCCTTCATGTGTAGGCGTCTCCATTCCTCAAAATCCCATTCT
CCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTTGACAGTCATCTTCTCA
GAGTTGTCCTCTCGTACGACACCAACTGTCACTCTCTCATATTCATTACCCTCAACAGTA
TCTAAATGCCCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAGTAACTTTCCATGAACTTCTCCA
TCTTCAGACGGTGTAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCTCTTAAAGCCA
GGGAGCGTTACAGAGATGATTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGGCGACCTCAGGC
TCTTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATTGTGAAGCTGTGCACCCGAGCCACTCATTTTT
ATTTTCTCTTCAGTTTTTTTTTTGCTTTATTTCC

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR4BZ92JQ 755 0 0
A
CTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAGACCATACAAAATATAGATTACCAAAA
TCCCATATAAGCACAATAATACAAAATCCACAAGATAACATGTGGCACTATATCCTTTTC
ACTAATCTCCACGATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAAAAA
TGATACATAGAACATACTCTTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTAGG
GCATTGCTGAACTCGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTTCTCTTCCATTCCATGATTTCT
TTGAACGTCTTTATGAATTCCTTCATGTGTAGGCGTCTCCATTCCTCAAAATCCCATTCT
CCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTTGACAGTCATCTTCTCA
GAGTTGTCCTCTCGTACGACACCAACTGTCACTCTCTCATATTCATTACCCTCAACAGTA
TCTAAATGCCCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAGTAACTTTCCATGAACTTCTCCA
TCTTCAGACGGTGTAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCTCTTAAAGCCA
GGGAGCGTTACAGAGATGATTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGGCGACCTCAGGC
TCTTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATTGTGAAGCTGTGCACCCGAGCCACTCATTTTT
ATTTTCTCTTCAGTTTTTTTTT*GCTTTATTTCC

QA 2 755 2 755
DS 



AS 1 5

CO CL2154Contig1 1174 5 22 U
GCCACAAAAAGTCCAATAAGCTCCATAGTATTAAACGGTATTACAAGAGATATTCGACCA
CACCTTAGCAGCACTTGGCTCAAAAGTTACTCTTTCACTTTGCTTCCACCACTAAACGCA
GTTACAAGAAGAAAGCACAACCCATGAAGCATATAGCAAACTGCCTTTCTGTGCAGGACT
AAAGAGTCCTCAAAGGGAAACACATAATAATATCAATCTCTCAGGTTGAGATATTAATAA
AATATTTCACCTACGAGCAAGTCTCTGCCCTGCTCCAACCATTAAGGCCTTGCCGATAGC
ACTTGAATGAAGCCCACAAGCCAAAGCAACTCCTCCTACAGCGATCCATTTCCAATCTAC
ATTGAACTGCTCCTTTTGTCTCCTTGCCTTCTCCATGGCTTGTCCTCTCTCTTCTTCCTC
CTCCTCTACTCTCGATGTTTCCACCAAATCCATGTTCAGTTTTGTGGTGATTCCCGCCAT
TTGAGCGCTCCGTGACAGAGCCACCCCTGGCTTTCTAGCACTCTGATACGCCCTTAACCC
GGAATTGAGCTTTTTGACGGCTCCCCACATGCCATGACGGACTCCTAGCTTCGCTACGTC
TTTTGGGATTCCCATGTCTTCGCAGTGGACAAGAGAGACTTCACAAGCTGACATTTGTCC
ATCCCCTTTTCGAGATTCAACTGCTCTGATTATCCAGCTTGAGAAATAAAGCTCCACTCG
CCTTGGCTTATCACGCTTTGGTAGAGTTGGATACGGTACTCCCTTAGTGACAGCATAATA
CTTCTTTCCAGATTCCCATATTCTCCTACCAATGATGTACTCCCGGTCACTACAGAAAAA
CGGAAACTTTTTAATCCAGTGAACGATGGTTGTTCCTGTCTGAGTATCCTCTTCCAAAGT
CTTGAAGTAAGCAAGCATAGGATCCCATTTAGGTCGAAACTCATCGTCCCAGAAGAAATC
CCTAACAATCTCTGGAGTTGCATCCTCGAAAACAGTCCTACTCCGATAAACAACAGGACC
TGTCTGAGGCTCATGACGCCAGGCCTGGTAGCTCATGTTAGGAGTAGACTTATCCATAAT
AGACTGCCACTCCATATCTGCGTTCCCAGCTTCAAGCAGATGCAACAGATGCTCAAGATC
CTTCTCCGTCACAACATCCTTCTTTATTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB50JQ U 1
AF RR4EY25JQ U 9
AF RR4CB42JQ U 9
AF RR4EY25TF C 193
AF RR4DB50TF C 537
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DS 

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CG
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CGAGATTCAACTGCTCTGATTATCCAGCTTGAGAAATAAAGCTCCACTCGCCTTGGCTTA

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DS 

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CA
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GCACTTGGCTCAAAAGTTACTCTTTCACTTTGCTTCCACCACTAAACGCAGTTACAAGAA
GAAAGCACAACCCATGAAGCATATAGCAAACTGCCTTTCTGTGTAGGACTAAAGAGTCCT
CAAAGGGAAACACATAATAATATCAATCTCTCAGGTTGAGATATTAATAAAATATTTCAC
CTACGAGCAAGTCTCTGCCCTGCTCCAACCATTAAGGCCTTGCCGATAGCACTTGAATGA
AGCCCACAAGCCAAAGCAACTCCTCCTACAGCGATCCATTTCCAATCTACATTGAACTGC
TCCTTTTGTCTCCTTGCCTTCTCCATGGCTTGTCCTCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCTACT
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CGTGACAGAGCCACCCCTGGCTTTCTAGCACTCTGATACGCCCTTAACCCGGAATTGAGC
TTTTTGACGGCTCCCCACATGCCATGACGGACTCCTAGCTTCGCTACGTCTTTTGGGATT
CCCATGTCTTCGCAGTGGACAAGAGAGACTTCACAAGCTGACATTTGTCCATCCCCTTTT
CGAGATTCAACTGCTCTGATTATCCAGCTTGAGAAATAAAGCTCCACTCGCCTTGGCTTA
TCACGCTTTGGTAGAGTTGGATACGGTACTCCCTTAGTGACAGCATAATACTTC

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DS 

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AA
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ATGTTTCCACCAAATCCATGTTCAGTTTTGTGGTGATTCCCGCCATTTGAGCGCTCCGTG
ACAGAGCCACCCCTGGCTTTCTAGCACTCTGATACGCCCTTAACCCGGAATTGAGCTTTT
TGACGGCTCCCCACATGCCATGACGGACTCCTAGCTTCGCTACGTCTTTTGGGATTCCCA
TGTCTTCGCAGTGGACAAGAGAGACTTCACAAGCTGACATTTGTCCATCCCCTTTTCGAG
ATTCAACTGCTCTGATTATCCAGCTTGAGAAATAAAGCTCCACTCGCCTTGGCTTATCAC
GCTTTGGTAGAGTTGGATACGGTACTCCCTTAGTGACAGCATAATACTTCTTTCCAGATT
CCCATATTCTCCTACCAATGATGTAC
C

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DS 

RD RR4DB50TF 638 0 0
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AATACTTCTTTCCAGATTCCCATATTCTCCTACCAATGATGTACTCCCGGTCACTACAGA
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AAGTCTTGAAGTAAGCAAGCATAGGATCCCATTTAGGTCGAAACTCATCGTCCCAGAAGA
AATCCCTAACAATCTCTGGAGTTGCATCCTCGAAAACAGTCCTACTCCGATAAACAACAG
GACCTGTCTGAGGCTCATGACGCCAGGCCTGGTAGCTCATGTTAGGAGTAGACTTATCCA
TAATAGACTGCCACTCCATATCTGCGTTCCCAGCTTCAAGCAGATGCAACAGATGCTCAA
GATCCTTCTCCGTCACAACATCCTTCTTTATTTCTCTC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 5

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AATGCAGCAAACAACGACCGTCTCTCCAGCAAACGAACCGGACTATCATACTCTTTCGCT
TTTCCTGCGTCTATAACAAGAACACGATCACAGTCCATAACCGTTGGAATCCTATGAGCT
ATGCTGATGATGGTACACGACGAGAAGTCCTCCCTTATGATCTTCTGGATCATAGCATCA
GTCTGCGAATCAACTGACGCAGTTGCTTCATCCAAAAACAGAATCCGGCACCGTTTCAGC
ATAACCCTTCCCAAACACAGTAACTGTCTCTGACCAACACTCCAATTCTCACCACTATCC
GCCACGAGAGAATCAAGCTTCCCGGGCTTGGATGAAACAACCTCCTTAAGTTGACATCGC
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CACAAGTCTGAACAAGACCTGAATCAAAGTCGATTTACCACTTCCTGTTCTTCCAACCAC
ACCAACCTTCTCTCCTCCTTTGATGTCTATAGTAAGTCCCT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4A002TFB C 1
AF RR4A002JQD U 1
AF RR4A002TF C 6
AF RR4EH72JQ U 1
AF RR4A002JQ U 41
BS 1 810 RR4A002JQD
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CCTTCTCTCCTCCTTTGATGTCTAT
GGTAC

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DS 

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GGCCC
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TGCGTCTATAACAAGAACACGATCACAGTCCATAACCGTTGGAATCCTATGAGCTATGCT
GATGATGGTACACGACGAGAAGTCCTCCCTTATGATCTTCTGGATCATAGCATCAGTCTG
CGAATCAACTGACGCAGTTGCTTCATCCAAAAACAGAATCCGGCACCGTTTCAGCATAAC
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4B769TF U 1
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TTTGAGTTTAGTATCTATATGTGATTCTTGAT

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AGAGTTGTTTTGTG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR4FU91TF U 1
AF RR4FV57TF U 1
AF RR4C033JQ C 363
AF RR4C033TF U 2
AF RR4CU09JQ C 3
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BS 473 473 RR4C033TF
BS 474 553 RR4FU91TF
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TTACCACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGTGAGGATCACCACCACGACGGAGTGCATTTGAC
AAATGACCACGACGACCATTGTTACTGCTACGGTCGTTATTAAACTGCTGAAGGTTACTA
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TGTATGCATGTGTGAGCGTTGTTTTTTTATAAAATAAAATAAAATAGTACGTGGGACGAA
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DS 

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GGGT
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TTGTTTTGT
G

QA 5 553 5 553
DS 

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TATGCATGTGTGAGCGTTGTTTTTTTATAAAATAAAATAAAATAGTACGTAGGACGAAGC
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AGTTGTTTTGT

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DS 

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GGG
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GACCACGACGACCATTGTTACTGCTACGGTCGTTATTAAACTGCTGAAGGTTACTAATAA
TCTCGTATCGAAATTAAAAAAAATTATGTAAGCGTGGTGGTTTCGTTGAATTTAAGTGTA
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TTGTTTTGT

QA 4 552 4 552
DS 

RD RR4CU09JQ 552 0 0
GG
ATCACCCAAGTTTCTGAATACAGAAAGAAGCAATTAACTAAGAGTAAAGAAGAAACTAGA
GCTACAGAAATGGCAAAGACCATCAGTTCCATCTGCTTCACCACTCTTTTGCTCGTTGTC
TTATTCATTTCGGCTGAAATCCCAAAGAGCGAGGCGACTTGTACGAAGTATTTAGGCGAG
GCCATATTGGCGTACCCGTGTAAGGAAAGCTATTGTGAAGCCAAATGCGCTGAGCATTAC
CACGAGTCATGCAGAGGAGAGTGTGAGGATCACCACCACGACGGAGTGCATTTGACAAAT
GACCACGACGACCATTGTTACTGCTACGGTCGTTATTAAACTGCTGAAGGTTACTAATAA
TCTCGTATCGAAATTAAAAAAAATTATGTAAGCGTGGTGGTTTCGTTGAATTTAAGTGTA
TGCATGTGTGAGCGTTGTTTTTTTATAAAATAAAATAAAACAGTACGTAGGACGAAGCTA
GTGAGTTTGCTTCCCTCTACGTCTATGTTGTATGTTATTTTGATTTAAATAATAATAGAG
TTGTTTTGTG

QA 3 552 3 552
DS 



AS 1 5

CO CL2158Contig1 1080 5 11 U
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ACATAAAACAGCTCATTTCTCTATATTGATATCAACAACAAAATAAAACTTTCATATTTG
GGATTTGCCATGTTGTCAAAAAATGGCTTACAATAAAAATTAAATGGCTTATGTTTCGTA
AATGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCCACTTCTTCTTTGCTTCCAATGTAAAG
TGGAACCCTCTGATGTATCTCCGTCGGTTGGATATCTAGGACTCTCTGGTGTCCATCTGA
TCCTTTCCCTCCCGCTTGTTCAACAATGAAACTCATCGGTGCACACTCATACAACAGCCT
AAGCTTTCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCTCGAGGGTACCCGTAAATGCCACCGTACAACAA
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TAGGACGAATTCGCCATACATTGGGTCGAGTGTGAAGGCGAAAACGCCTTTGCCTAAAGT
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GGAGTTGTCTGGGAGACACTCCTGTCTGAGCAACCAGCTCGTCAGTGTCTGAAGCTCATA
CCCACTCTTCTTCTTCGCAGCCGGTTTAGTTTCCGCCGTAGCATCCGTCGCAACCGCCAT
ACACCTCACTCCAGTAGCATCATGATGGTTTTTCCCAGCTGCTACTCTTTTCCCGCTCAG
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AAGATGGGACGATGATGCTGTTCCGGCGGTTGCTGCCATTTTTCTGAGTTTGTGTTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E045JQ U 1
AF RR4DV58JQ U 1
AF RR4A311JQ U 61
AF RR4A311TF C 252
AF RR4A311TFB C 385
BS 1 400 RR4DV58JQ
BS 401 401 RR4A311JQ
BS 402 497 RR4DV58JQ
BS 498 498 RR4E045JQ
BS 499 510 RR4DV58JQ
BS 511 511 RR4A311JQ
BS 512 521 RR4DV58JQ
BS 522 522 RR4A311JQ
BS 523 609 RR4DV58JQ
BS 610 706 RR4A311JQ
BS 707 1080 RR4A311TF

RD RR4E045JQ 558 0 0
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GTTCCCTTCGTTGAATGA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4DV58JQ 609 0 0
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ACATAAAACAGCTCATTTCTCTATATTGATATCAACAACAAAATAAAACTTTCATATTTG
GGATTTGCCATGTTGTCAAAAAATGGCTTACAATAAAAATTAAATGGCTTATGTTTCGTA
AATGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCCACTTCTTCTTTGCTTCCAATGTAAAG
TGGAACCCTCTGATGTATCTCCGTCGGTTGGATATCTAGGACTCTCTGGTGTCCATCTGA
TCCTTTCCCTCCCGCTTGTTCAACAATGAAACTCATCGGTGCACACTCATACAACAGCCT
AAGCTTTCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCTCGAGGGTACCCGCAAATGCCACCGTACAACAA
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TGGACCAGGGTCCTTAAAATCATCAATGTACTTCTTTAGCTTCCCATCCCACATCTGGTA
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TAGGACGAA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4A311JQ 646 0 0
G
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GATTTGCCATGTTGTCAGAAAATGGCTTACAATAGAAATTAAATGGCTTATGTTTCGTAA
ATGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCCACTTCTTCTTTGCTTCCAATGTAGAGT
GGAACCCTCTGATGTATCTCCGTCGGTTGGATATCTAGGACTCTCTGGTGTCCATCTGAT
CCTTTCCCTCCCGCTTGTTCAACAATGAAACTCATCGGTGCACACTCATACAACAGCCTA
AGCTTTCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCTCGAGGGTACCCGTAAATGCCACCGTACAACAAA
GTCCTATGAAAATCTCCGACCAAACTTCCAATGTACCTTGCCGAGTAAGGCTTCCCACTT
GGACCAGGGTCCTTAAGATCATCAATGTAATTCTTTAGCTCCCCATCCCACATCTGGTAG
TTCCCTTCGTTGAATGAGTAGATTTTTCCGGCTTTTGGGATCTCAATGTTCTCTTGAGTT
AGGACGAATTCGCCATACATTGGGTCGAGTGTGAAGGCGAAAACGCCTTTGCCTAAAGTA
AGAACGAAGATGACTGAGCCTGAGTACATACAGTAGCCGGCTGCT

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR4A311TF 829 0 0
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AATCTCCGACCAAACTTCCAATGTACCTTGCCGAGTAAGGCTTCCCACTTGGACCAGGGT
CCTTAAGATCATCAATGTAATTCTTTAGCTCCCCATCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGT
TGAATGAGTAGATTTTTCCGGCTTTTGGGATCTCAATGTTCTCTTGAGTTAGGACGAATT
CGCCATACATTGGGTCGAGTGTGAAGGCGAAAACGCCTTTGCCTAAAGTAAGAACGAAGA
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CGTTTACTATACACCTTTCTTCTTCTGACCCGAGAGCGGAGGTGTCGTCGGAGTTGTCTG
GGAGACACTCCTGTCTGAGCAACCAGCTCGTCAGTGTCTGAAGCTCATACCCACTCTTCT
TCTTCGCAGCCGGTTTAGTTTCCGCCGTAGCATCCGTCGCAACCGCCATACACCTCACTC
CAGTAGCATCATGATGGTTTTTCCCAGCTGCTACTCTTTTCCCGCTCAGAGATGGGAAAA
GGATTCGTGGCTGAGGTGAGGCCGCCACATGGCGAGAGCTTGAGAGAAGAAGATGGGACG
ATGATGCTGTTCCGGCGGTTGCTGCCATTTTTCTGAGTTTGTGTTTTCC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4A311TFB 696 0 0
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ACTTCCAATGTACCTTGCCGAGTAAGGCTTCCCACTTGGACCAGGGTCCTTAAGATCATC
AATGTAATTCTTTAGCTCCCCATCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAATGAGTAGAT
TTTTCCGGCTTTTGGGATCTCAATGTTCTCTTGAGTTAGGACGAATTCGCCATACATTGG
GTCGAGTGTGAAGGCGAAAACGCCTTTGCCTAAAGTAAGAACGAAGATGACTGAGCCTGA
GTACATACAGTAGCCGGCTGCTAGCAAGTTGTTCCCTGGCTGGCACACGTTTACTATACA
CCTTTCTTCTTCTGACCCGAGAGCGGAGGTGTCGTCGGAGTTGTCTGGGAGACACTCCTG
TCTGAGCAACCAGCTCGTCAGTGTCTGAAGCTCATACCCACTCTTCTTCTTCGCAGCCGG
TTTAGTTTCCGCCGTAGCATCCGTCGCAACCGCCATACACCTCACTCCAGTAGCATCATG
ATGGTTTTTCCCAGCTGCTACTCTTTTCCCGCTCAGAGATGGGAAAAGGATTCGTGGCTG
AGGTGAGGCCGCCACATGGCGAGAGCTTGAGAGAAGAAGATGGGACGATGATGCTGTTCC
GGCGGTTGCTGCCATTTTTCTGAGTTTGTGTTTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

CO CL2159Contig1 1033 4 12 U
GCTACAAATCTATTCATTCTACAGAAAAATTTTTTGATATGTCTACAGGCCTAGAAAATT
TGTTAGTCTCTTGTTTTCTAGAACAATATAATATTCGGAGTATAGGGGAAATTCGACATA
GAAAATATTTGGATTCGAGAATTCTCAACTTTTGGTTTAGAAAAAAAGTAAATATTGAGC
CTGATACTAAGAGTAAAAAAAAA*TATATTAAGACTAAAGTTCAGAATTATCAAAGAATT
GATAAAATAACTAAGACGAGTCTTGCCAATCAAAAAATAAACTTTTTTGATTGGATGGGA
ATGAATGAAGAAATACTAAATCATCGTATAACAAATTTTGACTTTTTTTTCTTTCCAGAA
TTTTTCTTATTTTCTAGTACATATAAAATGAAACCGTGGGTCATACCAATTAAATTACTT
CTTTTCAATTTTAATGAAACAAAAAATGTGAATAAACAGATCACCCTAAAGAAAAAAGGT
TTTATATCATCAAACGAAAACAAATTCCTTCGGTTGTTTAATCTAAATAAAGAAGAAAAC
GAATCGGCAGGTCAAGAAGAGTTTGAATCAGATAAAGAAACAAAAATAAATATGGAATCA
GCTCTATCAAAGCAAGAAAAAAAA*TATTGAAGAAAATTATACAGAATCGAAGATAAAAA
AAG*TCAAAATAAAAAACAACCAAAAAGCAATACCGACGAGGAACTTGACTTATTTCTCA
AAAGGTATTCGCGTTTTCAATTTCGATGGAATTGTTTTAATCAAAAAATTATCAATAATA
TAAGAGTATACTGTCTCTTGATTAGACTAAAAAATCCAAACGAGATAACGATATCTTGTA
TTGAAAGAGGAGAGATGAGCCTAGATATTCTAATGATTGAGAGGAATTGCACTTTTTCAA
AATTAATGAAAAAAGGAATATTGATTGTTGAACCTGTTCGTTTGTCTGTAAAAAACGATG
GACAACTTATTATATATAGAACCATCGGGATTTCATTGGTTCATAAAAATAAACAAAAAA
TAAGTAAAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU38TF U 30
AF RR4B322TF U 1
AF RR4CU38JQ C 30
AF RR4B322JQ C 232
BS 1 83 RR4B322TF
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BS 655 808 RR4B322TF
BS 809 1033 RR4B322JQ

RD RR4CU38TF 691 0 0
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QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4B322TF 808 0 0
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CTTTTCAATTTTAATGAAACAAAAAATGTGAATAAACAGATCACCCTAAAGAAAAAAGGT
TTTATATCATCAAACGAAAACAAATTCCTTCGGTTGTTTAATCTAAATAAAGAAGAAAAC
GAATCGGCAGGTCAAGAAGAGTTTGAATCAGATAAAGAAACAAAAATAAATATGGAATCA
GCTCTATCAAAGCAAGAAAAAAA**TATTGAAGAAAATTATACAGAATCGAAGGTAAAAA
AAG*TCAAAATAAAAAACAACCAAAAAGCAATACCGACGAGGAACTTGACTTATTTCTCA
AAAGGTATTCGCGTTTTCAATTTCGATGGAATTGTTTTAATCAAAAAATTATCAATAATA
TAAGAGTATACTGTCTCTTGATTAGACT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4CU38JQ 779 0 0
TTTTTTGATATGTCTACAGGCCTAGAAAATTTGTTAGTCTCTTGTTTTCTAGAACAATAT
AATATTCGGAGTATAGGGGAAATTCGACATAGAAAATATTTGGATTCGAGAATTCTCAAC
TTTTGGTTTAGAAAAAAAGTAAATATTGAGCCTGATACTAAGAGTAAAAAAAAA*TATAT
TAAGACTAAAGTTCAGAATTATCAAAGAATTGATAAAATAACTAAGACGAGTCTTGCCAA
TCAAAAAATAAACTTTTTTGATTGGATGGGAATGAATGAAGAAATACTAAATCATCGTAT
AACAAATTTTGACTTTTTTTTCTTTCCAGAATTTTTCTTATTTTCTAGTACATATAAAAT
GAAACCGTGGGTCATACCAATTAAATTACTTCTTTTCAATTTTAATGAAACAAAAAATGT
GAATAAACAGATCACCCTAAAGAAAAAAGGTTTTATATCATCAAACGAAAACAAATTCCT
TCGGTTGTTTAATCTAAATAAAGAAGAAAACGAATCGGCAGGTCAAGAAGAGTTTGAATC
AGATAAAGAAACAAAAATAAATATGGAATCAGCTCTATCAAAGCAAGAAAAAAAAATATT
GGAGAAAATTATACAGAATCGAAGATAAAAAAAGGTCAAAATAAAAAACAACCAAAAAGC
AATACCGACGAGGAACTTGACTTATTTCTCAAAAGGTATTCGCGTTTTCAATTTCGATGG
AATTGTTTTAATCAAAAAATTATCAATAATATAAGAGTATACTGTCTCTTGATTAGACT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4B322JQ 802 0 0
CAAAGAATTGATAAAATAACTAAGACGAGTCTTGCCAATCAAAAAATAAACTTTTTTGAT
TGGATGGGAATGAATGAAGAAATACTAAATCATCGTATAACAAATTTTGACTTTTTTTTC
TTTCCAGAATTTTTCTTATTTTCTAGTACATATAAAATGAAACCGTGGGTCATACCAATT
AAATTACTTCTTTTCAATTTTAATGAAACAAAAAATGTGAATAAACAGATCACCCTAAAG
AAAAAAGGTTTTATATCATCAAACGAAAACAAATTCCTTCGGTTGTTTAATCTAAATAAA
GAAGAAAACGAATCGGCAGGTCAAGAAGAGTTTGAATCAGATAAAGAAACAAAAATAAAT
ATGGAATCAGCTCTATCAAAGCAAGAAAAAAA**TATTGAAGAAAATTATACAGAATCGA
AGGTAAAAAAAG*TCAAAATAAAAAACAACCAAAAAGCAATACCGACGAGGAACTTGACT
TATTTCTCAAAAGGTATTCGCGTTTTCAATTTCGATGGAATTGTTTTAATCAAAAAATTA
TCAATAATATAAGAGTATACTGTCTCTTGATTAGACTAAAAAATCCAAACGAGATAACGA
TATCTTGTATTGAAAGAGGAGAGATGAGCCTAGATATTCTAATGATTGAGAGGAATTGCA
CTTTTTCAAAATTAATGAAAAAAGGAATATTGATTGTTGAACCTGTTCGTTTGTCTGTAA
AAAACGATGGACAACTTATTATATATAGAACCATCGGGATTTCATTGGTTCATAAAAATA
AACAAAAAATAAGTAAAAGATC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 3

CO CL2160Contig1 733 3 30 U
GGGAGGTTTCTTCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTTTC
ACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCTACAGAGAAGGATGTGTAGCCCAAGATTT
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TGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGATCT
TTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGAA
CTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTCGAGC
AGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTTCATCCAGATCATTA
AGACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCACAACA
GTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAAGA
CCACCTACAAGGCCTCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAGGTCTCTGTTTGACTTCTCA
GGGCTAGTATCATTATGATTATCTTATCTGCTGTTTTTGGGTCTTCTTTTTTTTTTTTCT
CGGATATTTTTGTTTGTATTCATCAAACTAAATCACTTTTCTTGCTCATTAAAGAAAAAA
CAATTTACCTATG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4BP86TF U 26
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ATGAAAAAA

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DS 

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ACAGGATGAAGCTCTGGGCCACCAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTTCT
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TTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGAA
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CAATTTACCTATG

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DS 



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AAGGAGTATAAGCTGAATGATTACAGCTCATGGTTTCTAAAACAGCTTAACAACACGAAT
CACTGGAAAAGACTCAAGAGCTGTCTTGTTAAATCCGAGCAATGCAGGAAGCTCTCAAAG
AAATACAAGACCATCAAACAGTTGAAATCTGCAGAGTTAACCCCGATAGAAGCTGGATGC
TGTCGACCACCATCTGAGTGTGGTTATCCTGCGGTGAATGTTTCTTACTATGACTTGAGC
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CTTGTTGCAATGTTCAACGTGGTTCTGTTCCTTATCTTGTCAATGGTGTACTTTGTTGGG
TGCTGCGCGAGAAGGAATGCTGCTAGTTACCGGTCCAAAGCTTAGAAACTGAAGCTTTGC
ATGAGGAAGATTGGCTAGAGAAGGCACAAGAACAACCACTTCTCTTCATTCTTTTTAACT
CTTTGTAATCAATGAACTGAGACAGATGGAATTAATACATGAAAAATTTGATGGGAGTTT
TACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FI39TF U 1
AF RR4ED88TF U 444
AF RR4D673JQ C 533
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RD RR4FI39TF 593 0 0
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TCTTCTTCTTTTTTTTTTTTGAGCTTGTTCTTTTCCTTCCCTTAGTTTATGTTTCTCAAA
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AATAATGTTTTGTGTGGGTTGAAGCTATTGGCTGTGGCAGTGATAATATTTGGGGTGTGG
ATGAGTACACACAACGATGGATGCAGAAGGTCTCTTACGTTTCCTGTCTTAGCTCTCGGT
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DS 

RD RR4ED88TF 658 0 0
GATC
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DS 

RD RR4D673JQ 672 0 0
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ACACGAATCACTGGAAAAGACTCAAGAGCTGTCTTGTTAAATCCGAGCAATGCAGGAAGC
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CTGGATGCTGTCGACCACCATCTGAGTGTGGTTATCCTGCGGTGAATGTTTCTTACTATG
ACTTGAGCTTTCATTCAATAAGTTCTAACAAAGACTGTAAGCTTTACAAGAATTCGAGGA
CCGTCAAGTGCTACAACTGTGATTCTTGCAAAGCTGGAGTAGCTCAGTACATGAAAACCG
AGTGGAGACTTGTTGCAATGTTCAACGTGGTTCTGTTCCTTATCTTGTCAATGGTGTACT
TTGTTGGGTGCTGCGCGAGAAGGAATGCTGCTAGTTACCGGTCCAAAGCTTAGAAACTGA
AGCTTTGCATGAGGAAGATTGGCTAGAGAAGGCACAAGAACAACCACTTCTCTTCATTCT
TTTTAACTCTTTGTAATCAATGAACTGAGACAGATGGAATTAATACATGAAAAATTTGAT
GGGAGTTTTACC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 5

CO CL2162Contig1 855 5 8 U
AAAAAAATAGATTTATATTTAGTTTTGTAAAAAGATCATACAGCAAACTTTTTATATATG
CCAAAAATTGACAACATTAGTTTGCAAATATTTCAGAAACTTAATTACTAGTTTATCACA
CCACATTTTGTGTATGTGTGTGTATATGTATTCATTTATTTATTATATTTTGTATTGTGA
ACACAAAAAAACGAAACCGGATCACTGCTTTAAAATCATTCGCGACGGTGGATGTTCTCA
TCATCATCGTCCACAGCATCGGCGGCACTAGCTGCAAGATCAAGTAGCTTCTCCATCTGC
ACGGTCATTTCCTTGAGAGTGGTTGAAGCCTGGTCATTGTTTTTGGCAACTAATCCCTCC
ACGCGCTTCATCTGGTCGGTCGAAGACCTAACGTCGTAGTGAGCCGTGTCAGGGGATTGC
TTGAGCTTCAGGTTTGCGCTCTTGAGATCAGCCACCACGGCTAGATAGGCCTTGTGGTAC
TCGGCATACGCAGCCTGCACCGCTGGATCTTTCTTCGCCGTCTCGTCCAGGAAAGCCGCT
GTCTTCTCGGCGTGGGCGATGGTGAGCTCCATCACGGCCTCGGCGAGTGGGTTCAGGCCA
ATGGGAGCAGCCGTAGGGGGGTTGGTAGTCAATGTTTTAACGCAGTAATCTTGGTCGTGG
GAGCGATCGCAGATAGCATCAATGTATTTCATGTGAGGAGAGGCTGAAGCTGGAACTAGG
AGTAGTTGCAAGGTAATTGCCGCCGCGGCGAAAGTGGACAGAGCGGAGAACGTTGCCATT
TTTTATGCGTCGGAAGCTTTATTTTATTTTTCTCCTCTTTTTTTTCCGGTTGTTATTCAG
TTTTAAATATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F106JQ U 113
AF RR4FX93JQ U 1
AF RR4GV85JQ U 49
AF RR4GV85TF C 68
AF RR4FX93TF C 299
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BS 826 855 RR4GV85TF

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TATTGTGAACACAAAAAAACGAAACCGGATCACTGCTTTAAAATCATTCGCGACGGTGGA
TGTTCTCATCATCATCGTCCACAGCATCGGCGGCACTAGCTGCAAAATCAAGTAGCTTCT
CCATCTGCACGGTCATTTCCTTGAGAGTGGTTGAAGCCTGGTCATTGTTTTTGGCAACTA
ATCCCTCCACGCCCTTCATCTGGTCGGTCGAAGACCTAACGTCGTAGTGAGCCGTGTCAG
GGGATTGCTTGAGCTTCAGGTTTGCGCTCTTG

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DS 

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CCAAAAATTGACAACATTAGTTTGCAAATATTTCAGAAACTTAATTACTAGTTTATCACA
CCACATTTTGTGTGTGTGTGTGTATATGTATTCATTTATTTATTATATTTTGTATTGTGA
ACACAAAAAAACGAAACCGGATCACTGCTTTAAAATCATTCGCGACGGTGGATGTTCTCA
TCATCATCGTCCACAGCATCGGCGGCACTAGCTGCATGATCAAGTAGCTTCTCCATCTGC
ACGGTCATTTCCTTGAGAGTGGTTGAAGCCTGGTCATTGTTTTTGGCAACTAATCCCTCC
ACGCGCTTCATCTGGTCGGTCGAAGACCTAACGTCGTAGTGAGCCGTGTCAGGGGATTGC
TTGAGCTTCAGGTTTGCGCTCTTGAGATCAGCCACCACGGCTAGATAGGCCTTGTGGTAC
TCGGCATACGCAGCCTGCACCGCTGGATCTTTCTTCGCCGTCTCGTCCAGGAAAGCCGCT
GTCTTCTCGGCGTGGGCGATGGTGAGCTCCATCACGGCCTCGGCGAGTGGGTTCAGGCCA
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QA 1 643 1 643
DS 

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TAGTTTATCACACCACATTTTGTGTATGTGTGTGTATATGTATTCATTTATTTATTATAT
TTTGTATTGTGAACACAAAAAAACGAAACCGGATCACTGCTTTAAAATCATTCGCGACGG
TGGATGTTCTCATCATCATCGTCCACAGCATCGGCGGCACTAGCTGCAAGATCAAGTAGC
TTCTCCATCTGCACGGTCATTTCCTTGAGAGTGGTTGAAGCCTGGTCATTGTTTTTGGCA
ACTAATCCCTCCACGCGCTTCATCTGGTCGGTCGAAGACCTAACGTCGTAGTGAGCCGTG
TCAGGGGATTGCTTGAGCTTCAGGTTTGCGCTCTTGAGATCAGCCACCACGGCTAGATAG
GCCTTGTGGTACTCGGCATACGCAGCCTGCACCGCTGGATCTTTCTTCGCCGTCTCGTCC
AGGAAAGCCGCTGTCTTCTCGGCGTGGGCGATGGTGAGCTCCATCACGGCCTCGGCGAGT
GGGTTCAGGCCAATGGGAGCAGCCGTAGGGGGGTTGG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4GV85TF 788 0 0
TTGACAACATTAGTTTGCAAATATTTCAGAAACTTAATTACTAGTTTATCACACCACATT
TTGTGTATGTGTGTGTATATGTATTCATTTATTTATTATATTTTGTATTGTGAACACAAA
AAA*CGAAACCGGATCACTGCTTTAAAATCATTCGCGACGGTGGATGTTCTCATCATCAT
CGTCCACAGCATCGGCGGCACTAGCTGCAAGATCAAGTAGCTTCTCCATCTGCACGGTCA
TTTCCTTGAGAGTGGTTGAAGCCTGGTCATTGTTTTTGGCAACTAATCCCTCCACGCGCT
TCATCTGGTCGGTCGAAGACCTAACGTCGTAGTGAGCCGTGTCAGGGGATTGCTTGAGCT
TCAGGTTTGCGCTCTTGAGATCAGCCACCACGGCTAGATAGGCCTTGTGGTACTCGGCAT
ACGCAGCCTGCACCGCTGGATCTTTCTTCGCCGTCTCGTCCAGGAAAGCCGCTGTCTTCT
CGGCGTGGGCGATGGTGAGCTCCATCACGGCCTCGGCGAGTGGGTTCAGGCCAATGGGAG
CAGCCGTAGGGGGGTTGGTAGTCAATGTTTTAACGCAGTAATCTTGGTCGTGGGAGCGAT
CGCAGATAGCATCAATGTATTTCATGTGAGGAGAGGCTGAAGCTGGAACTAGGAGTAGTT
GCAAGGTAATTGCCGCCGCGGCGAAAGTGGACAGAGCGGAGAACGTTGCCATTTTTTATG
CGTCGGAAGCTTTATTTTATTTTTCTCCTCTTTTTTT*CCGGTTGTTATTCAGTTTTAAA
TATGTTCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4FX93TF 557 0 0
GCACGGTCATTTCCTTGAGAGTGGTTGAAGCCTGGTCATTGTTTTTGGCAACTAATCCCT
CCACGCGCTTCATCTGGTCGGTCGAAGACCTAACGTCGTAGTGAGCCGTGTCAGGGGATT
GCTTGAGCTTCAGGTTTGCGCTCTTGAGATCAGCCACCACGGCTAGATAGGCCTTGTGGT
ACTCGGCATACGCAGCCTGCACCGCTGGATCTTTCTTCGCCGTCTCGTCCAGGAAAGCCG
CTGTCTTCTCGGCGTGGGCGATGGTGAGCTCCATCACGGCCTCGGCGAGTGGGTTCAGGC
CAATGGGAGCAGCCGTAGGGGGGTTGGTAGTCAATGTTTTAACGCAGTAATCTTGGTCGT
GGGAGCGATCGCAGATAGCATCAATGTATTTCATGTGAGGAGAGGCTGAAGCTGGAACTA
GGAGTAGTTGCAAGGTAATTGCCGCCGCGGCGAAAGTGGACAGAGCGGAGAACGTTGCCA
TTTTTTATGCGTCG*AAGTTTTATTTTATTTTTCTCCTCTTTTTTTTCCGGTTGTTATTC
AGTTTTAAATATGTTCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 3

CO CL2163Contig1 1125 3 9 U
ACAAAAAAGTTGTAAACTATTACTAGAGAAAGCAAGGAAAGCTATAGCAGAGTTCGTTGA
AACCACTAGAGAATTTAAGTATTACAACACTTGATACCAAAAGATTTGATCTTCTTTTGT
CTTTTTGGAGCAGTTAACTCAAGTCGACATGTCTTGGAATTGCCACGGGTTGAATGCGAT
CGACTTAGGGTCCGTGCCATCTTCAGATTTATCAGCAGCTTCCCGGTGTTCCAAGTACTT
TCCATTGAACTGGTAAACCTCGAGATCACCCCATGGTGTAGGAGTGACCTCCTCTGTTAT
ATCAAACCATTTTGGAGTAAAGCTTTGGCCTTTCTCTTCACGGGTTCTCTTTTCAGCTCT
CTGTCTCTCCTCCATGCTGCTCTTCTCATAGCCGGATTTGGACATGTCACCCATCTCTAG
TGCGTATCTATCAGGGCGTAGCCTTGAATCAAACGGTAAGAGCTTCTTTGGAGCAGTGTC
GAAGCTATTGATCTTGTGAGCAAAGTGCGTGTACTGGTACTTGTCATCCTTTGGAGCATC
AGCGAGTTGCCAGACCTCTTTTAGTTCAGTGCCTGGGAGAGGTTCACCTTCACCATCACA
CTGCTGATAACTCATGGACTCGTTCCATTTACCGGTCATGAGTATCTTTGGCTCCTCAGA
GGCGTTATAGACATATCCGTCCACTTCATATCGACCAGATCCAAACCAGCCACATGGTTG
AAAGTAAAGCACGACTTTGTCACCAGTGGTCAGGTTGGTCATGATCATTTCCCCAGGAGA
ATCAACCCAAGTTCGTCCAAAGATTAGGTTGTGAACTTTGGTCAGAGGAGGCACCAAGTC
AAGAACCACTCCATCTCTTTTAAGTGTCACTCGTGTCCTTCCTACTGGGTAAACGTCAAT
GGAATTGCCAAGAAACTTTGTTTTCAGTTTTGATGTACAATCATAAGTGAAATGCTCATC
TTCAGCATGGCCAGCGCTCATTGGCGGGTGATGACTAACCTGTTCAGATATAAAGTTAAC
ACCATTGTAATTAGCCATCTCATAAGTCTCTCCGAGGATTGGATTAAACGGTTTCCAAGT
ACGTTGGAAAGCATAGTACACAGAGATAGCCCATGATGACGCACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
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25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT76JQ U 1
AF RR4B067JQ U 1
AF RR4EJ78TF C 556
BS 1 451 RR4AT76JQ
BS 452 452 RR4B067JQ
BS 453 661 RR4AT76JQ
BS 662 702 RR4B067JQ
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BS 704 750 RR4B067JQ
BS 751 751 RR4EJ78TF
BS 752 802 RR4B067JQ
BS 803 1125 RR4EJ78TF

RD RR4AT76JQ 661 0 0
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AACCACTAGAGAATTTAAGTATTACAACACTTGATACCAAAAGATTTGATCTTCTTTTGT
CTTTTTGGAGCAGTTAACTCAAGTCGACATGTCTTGGAATTGCCACGGGTTGAATGCGAT
CGACTTAGGGTCCGTGCCATCTTCAGATTTATCAGCAGCTTCCCGGTGTTCCAAGTACTT
TCCATTGAACTGGTAAACCTCGAGATCACCCCATGGTGTAGGAGTGACCTCCTCTGTTAT
ATCAAACCATTTTGGAGTAAAGCTTTGGCCTTTCTCTTCACGGGTTCTCTTTTCAGCTCT
CTGTCTCTCCTCCATGCTGCTCTTCTCATAGCCGGATTTGGACATGTCACCCATCTCTAG
TGCGTATCTATCAGGGCGTAGCCTTGAATCAGACGGTAAGAGCTTCTTTGGAGCAGTGTC
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AGCGAGTTGCCAGACCTCTTTTAGTTCAGTGCCTGGGAGAGGTTCACCTTCACCATCACA
CTGCTGATAACTCATGGACTCGTTCCATTTACCGGTCATGAGTATCTTTGGCTCCTCAGA
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4B067JQ 802 0 0
ACAAAAAAGTTGTAAACTATTACTAGAGAAAGCAAGGAAAGCTATAGCAGAGTTCGTTGA
AACCACTAGAGAATTTAAGTATTACAACACTTGATACCAAAAGATTTGATCTTCTTTTGT
CTTTTTGGAGCAGTTAACTCAAGTCGACATGTCTTGGAATTGCCACGGGTTGAATGCGAT
CGACTTAGGGTCCGTGCCATCTTCAGATTTATCAGCAGCTTCCCGGTGTTCCAAGTACTT
TCCATTGAACTGGTAAACCTCGAGATCACCCCATGGTGTAGGAGTGACCTCCTCTGTTAT
ATCAAACCATTTTGGAGTAAAGCTTTGGCCTTTCTCTTCACGGGTTCTCTTTTCAGCTCT
CTGTCTCTCCTCCATGCTGCTCTTCTCATAGCCGGATTTGGACATGTCACCCATCTCTAG
TGCGTATCTATCAGGGCGTAGCCTTGAATCAAACGGTAAGAGCTTCTTTGGAGCAGTGTC
GAAGCTATTGATCTTGTGAGCAAAGTGCGTGTACTGGTACTTGTCATCCTTTGGAGCATC
AGCGAGTTGCCAGACCTCTTTTAGTTCAGTGCCTGGGAGAGGTTCACCTTCACCATCACA
CTGCTGATAACTCATGGACTCGTTCCATTTACCGGTCATGAGTATCTTTGGCTCCTCAGA
GGCGTTATAGACATATCCGTCCACTTCATATCGACCAGATCCGAACCAGCCACATGGTTG
AAAGTAAAGCACGACTTTGTCACCAGTGGTGAGGTTGGTCATGATCATTTCCCCAGGAGA
ATCAACCCAAGTTCGTCCAAAG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4EJ78TF 570 0 0
ACTC
TTTAGTTCGGTGCCTGGGAGAGGTTCACCTTCACCGTCACACTGCTGATAGCTCATGGAC
TCGTTCCATTTACCAGTCATGAGTATCTTGGGCTCCTCAGAGGCGTTATAGACATATCCG
TCCACTTCATATCGACCAGATCCAAACCAGCCGCATGGTTGGAAGTAAAGCACGACTTTG
TCACCAGTGGTCAGGTTGGTCATGATCATTTCCCCAGGAGAATCCACCCAAGTTCGTCCA
AAGATTAGGTTGTGAACTTTGGTCAGAGGAGGCACCAAGTCAAGAACCACTCCATCTCTT
TTAAGTGTCACTCGTGTCCTTCCTACTGGGTAAACGTCAATGGAATTGCCAAGAAACTTT
GTTTTCAGTTTTGATGTACAATCATAAGTGAAATGCTCATCTTCAGCATGGCCAGCGCTC
ATTGGCGGGTGATGACTAACCTGTTCAGATATAAAGTTAACACCATTGTAATTAGCCATC
TCATAAGTCTCTCCGAGGATTGGATTAAACGGTTTCCAAGTACGTTGGAAAGCATAGTAC
ACAGAGATAGCCCATGATGACGCACC

QA 5 570 5 570
DS 



AS 1 4

CO CL2164Contig1 834 4 10 U
GGGTGAAGAAAGAAGAAAAATAAACCATTTGTTCTTTCTTTGGCTGAGCGGCAATGGCTG
AGGAGCAAAAGACAACTACGGTTGACGTGGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAGG
AACCAGCTCCTACTCCGGTGGAAGCTTCTAAAGACGTTACGGAGGAGAAAGTTCATAATC
CACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTAGAAAAACCCATTGAAGAGGCTA
CACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAA
AAGAGAAAAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTTAAAAGCAGAGA
ACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCA
TTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTG
AGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGG
TTGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGTCAAGCACAGAG
CCACTGGTATCGTTCCCAAGGCAACTTGTGGATGCTTCTAAGTTGTGTTCTCAAGCCATT
GGTCATTCATGTCTCTCTTTTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTTTGTTGTCTTG
TTTATATATTGGTGATCTTGTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCATGTGTGACTGCA
GTTTCACATATAATCTGTAAATTTTAACATGTTGATACTTGGATTGGCTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE50TF U 1
AF RR4DK72TF U 21
AF RR4EE50JQ C 247
AF RR4DK72JQ C 614
BS 1 186 RR4EE50TF
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BS 188 619 RR4EE50TF
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BS 621 681 RR4EE50TF
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BS 769 815 RR4EE50JQ
BS 816 834 RR4DK72JQ

RD RR4EE50TF 696 0 0
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AGGAGCAAAAGACAACTACGGTTGACGTGGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAGG
AACCAGCTCCTACTCCGGTGGAAGCTTCTAAAGACGTTACGGAGGAGAAAGTTCATAATC
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CACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAA
AAGAGAAAAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTTAAAAGCAGAGA
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TTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTG
AGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGG
TTGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGTCAAGCACAGAG
CCACTGGTATCGTTCCCAAAGCAACTTGTGGATGCTTCTAAGTTGTGTTCTCAAGCCATT
GGTCATTCATGTCTCTCTTTT*GGTGTTATTCTGCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4DK72TF 748 0 0
T
AAACCATTTGTTCTTTCTTTGGCTGAGCGGCAATGGCTGAGGAGCAAAAGACAACTACGG
TTGACGTGGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAGGAACCAGCTCCTACTCCGGTGG
AAGCTTCTAAAGACGTTACGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCA
AAGCTCTTGCCGTTGTAGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTG
GTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAAAAAACTTCATTCA
TCAAAGCACGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTAT
CTGATGTGCTTGCTTGGGATAACAGCCAAAAATCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAAGA
TAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACTAAGTGG
CTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGAGAGG
AGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGCCAAGCACAGAGCCACTGGTATCGTTCCCAAGG
CAACTTGTGGATGCTTCTAAGTTGTGTTCTCAAGCCATTGGTCATTCATGTCTCTCTTTT
TGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTTTGTTGTCTTGTTTATATATTGGTGATCTTGT
GTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCA

QA 2 748 2 748
DS 

RD RR4EE50JQ 570 0 0
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AAAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTTAAAAGCAGAGAACAAGG
CACAAAAGAAGGTTTTTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAG
CCCAATTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAA
TGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAG
CTAAAAGAGGAGAGGAGCTTTTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGTCAAGCACAGAGCCACTG
GTATCGTTCCCAAGGCAACTTGTGGATGCTTTTAAGTTGTGTTCTCAAGCCATTGGTCAT
TCATGTCTCTCTTTTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTTTGTTGTCTTGTTTATA
TATTGGTGATCTTGTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCATGTGTGACTGCAGTTTCA
CATATAATCTGTAAATTTTAACATGTTGA
C

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4DK72JQ 221 0 0
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TCTCTTTTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTTTGTTGTCTTGTTTATATATTGGT
GATCTTGTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCATGTGTGACTGCGGTTTCACATATAA
TCTGTAAATTTTAACATGTTGATACTTGGATTGGCTCCCCC

QA 1 221 1 221
DS 



AS 1 3

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GGGAAGAAGCGCGAGGTCGTTTTGGGTTGGGACTGATCAGATCAGGAGTAATCTCTCCAT
CATATCTTGTGGATGGTTCGGTCGAATGATTCTTTACGTTAACTACGTTGTTTCGCTTTT
CACTTCGTTGCTTTGGATCCTTCCCTTGGCTGAGATTCTAGTCAAGAGGAGTAACAATGC
TGGTGGGTTGGTTGGTAATGTAGGCTTCTCGAGTGGTGATTTCGGGAAGTTTCGTGTTTT
GTGTTTGTGGCTGTCGGGTTTGTTACAAGCTATGGCGGTTCGTCCTAACCTTCAGATGTT
TTTGAACGAAGCGGTGTTGTCTTGGTATCAGAGGTTACATGGGAGTAAGACTCCTGATTT
GGAGTTTAGCAGGGCGAAGATGTTTCTTCATAACCATTATTTGTGTCTCGTTGCTTTGCA
GTTTGTGGCGCCGTCGGTTCTTGTGATCGTCTTCCTCGGCTTGTCTCAGGTTGAACTAGG
GTCTTTTGCTGTTTCGAGGCTGGTGTGTGGTTCTTTGCCTTGCAGCAAGTTCGTGGGACG
AGTTGGTTTGTTGATGTCTTGGTGGGTTCTTTTTGTTTGGTCGGCTTTTGCTTCTGCAAG
TCTTGTTTTCTATCGACGTGGTGTTTTGTATGTTTCTTGAGATTGAAACAAAACGAAGAA
TCAGTTTTGCCG


BQ
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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G
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CGCGAGGTCGTTTTGGGTTGGGACTGATCAGATCAGGAGTAATCTCTCCATCATATCTTG
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GCTTTGGATCCTTCCCTTGGCTGAGATTCTAGTCAAGAGGAGTAACAATGCTGGTGGGTT
GGTTGGTAATGTAGGCTTCTCGAGTGGTGATTTCGGGAAGTTTCGTGTTTTGTGTTTGTG
GCTGTCGGGTTTGTTACAAGCTATGGCGGTTCGTCCTAACCTTCAGATGTTTTTGAACGA
AGCGGTGTTGTCTTGGTATCAGAGGTTACATGGGAGTAAGACTCCTGATTTGGAGTTTAG
CAGGGCGAAGATGTTTCTTCATAACCATTATTTGTGTCTCGTTGCTTTGCAGTTTGTGGC
GCCGTCGGTTCTTGTGATCGTCTTCCTCGGCTTGTCTCAGGTTGAACTAGGGTCTTTTGC
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GTTGATGTCTTGGTGGGTTCTTTTTGTTTGGTCGGCTTTTGCTTCTGCGAGTCTTGTTTT
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DS 



AS 1 5

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BQ
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AF RR4DH13JQ U 1
AF RR4EW33JQ U 1
AF RR4DH13TF C 2
AF RR4AA06JQ U 32
AF RR4AA06TF C 788
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CTTAATCCCTCCTCTCACTCTTTTCCGAAATCTGCATTGTAGTGTGAACTCGACTCAAGT
TTCTTGGCCTCGCTCAGCTTTCTCACCGCCTTCATGAAATCTTCCTGGATCACATAGTCC
CGCTCTGCTCGGATTGCAAACATTCCAGCCTCCGTGCATATGTTACGCAGATCAGCACCA
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CCAGCTGCATGGATCTTGAGGATATCCATTCTTGATTGCTCATTTGGCAAAGGGATCTCA
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GTCGCCATTATCATTTTCACCTTTCCGAGGTTGTCAAACCCATCAAGCTGGTTGAGTAAC
TCCATGAGTGTTCTTTGAATTTCACGATCAGCACTAGTTCCCTCGCTAAAACGACGCCCA
CCAATAGCATCGATTTCGTCCATGAAAATGA

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DS 

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GGTTGAAGCTT
TTAAAGTATTAAAAGGGAGTAAAAGCACACACTCCACAATCTCTGCTTCTCAGAAAAAAA
ATTAAAACAAAGTTTCACATTGCCAAAGTCAAAGAACAAACAATAATACGAAACTGCCAT
TCCATTGCACTGTCCTTTCTTT*ATCCCTAGCTCACACGACAAGAGTTTTTTAATCCCTC
CTCTCACTCTTTTCCGAAATCTGCATTGTAGTGTGAACTCGACTCAAGTTTCTTGGCCTC
GCTCAGCTTTCTCACCGCCTTCATGAAATCTTCCTGGATCACATAGTCCCGCTCTGCTCG
GATTGCAAACATTCCAGCCTCCGTGCATATGTTACGCAGATCAGCGCCATTGAAGCCCTC
TGCAAGTTTGACAATAGCCTCGTACTCAATTTCACCATGTTTGGCTATACCAGCTGCATG
GATCTTGAGGATATCCATTCTTGATTGCTCGTTTGGCAAAGGGATCTCAATCTTTCTATC
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CATTTTCACCTTTCCGAGGTTGTCAAACCCATCAAGCTGGTTGAGTAACTCCATGAGTGT
TCTTTGAATTTCACGATCAGCACTAGTTCCCTCGCTAAAACGACGCCCACCAATAGCATC
GATTT

QA 12 676 12 676
DS 

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TTAAAGTATTAAAAGGTAGTAAAAGCACACACTCCACAATCTCTGCTTCTCAGAAAAAAA
GT*AAAACAAAGTTTCACATTGCCAAAGTCAAAGAACAAACAATAATACGAAACTGCCAT
GCCATTGCACTGTCCTTTCTTTTATCCCTAGCTCACACGACAAGAGTTTCTTAATCCCTC
CTCTCACTCTTTTCCGAAATCTGCATTGTAGTGTGAACTCGACTCAAGTTTCTTGGCCTC
GCTCAGCTTTCTCACCGCCTTCATGAAATCTTCCTGGATCACATAGTCCCGCTCTGCTCG
GATTGCAAACATTCCAGCCTCCGTGCATATGTTACGCAGATCAGCACCATTGAAGCCCTC
TGCAAGTTTGACAATAGCCTCGTACTCAATTTCACCATGTTTGGCTATACCAGCTGCATG
GATCTTGAGGATATCCATTCTTGATTGCTCATTTGGCAAAGGGATCTCAATCTTTCTATC
TAATCTACCTGGACGGAGAAGCGCAGGATCAAGCACATCAGGCCTGTTCGTCGCCATTAT
CATTTTCACCTTTCCGAGGTTGTCAAACCCATCAAGCTGGTTGAGTAACTCCATGAGTGT
TCTTTGAATTTCACGATCAGCACTAGTTCCCTCGCTAAAACGACGCCCACCAATAGCATC
GATTTCGTCCATGAAAATGATACAAGGCTGGTGTTCACGGGCATAGTTAAACATCTCCCG
AATCAGCCTAGCACTTTCTCCAAT
C

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DS 

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CG
AAGCACACACTCCACAATCTCTGCTTCTCAAAAAAAAAGT*AAAACAAAGTTTCACATTG
CCAAAGTCAAAGAACAAACAATAATACGAAACTGCCATGCCATTGCACTGTCCTTTCTTT
TATCCCTAGCTCACACGACAAGAGTTTCTTAATCCCTCCTCTCACTCTTTTCCGAAATCT
GCATTGTAGTGTGAACTCGACTCAAGTTTCTTGGCCTCGCTCAGCTTTCTCACCGCCTTC
ATGAAATCTTCCTGGATCACATAGTCCCGCTCTGCTCGGATTGCAAACATTCCAGCCTCC
GTGCATATGTTACGCAAATCAGCACCATTGAAGCCCTCTGCAAGTTTGACAATAGCCTCG
TACTCAATTTCACCATGTTTGGCTATACCAGCTGCATGGATCTTGAGGATATCCATTCTT
GATTGCTCATTTGGCAAAGGGATCTCAATCTTTCTATCTAATCTACCTGGACGGAGAAGC
GCAGGATCAAGCACATCAGGCCTGTTCGTCGCCATTATCATTTTCACCTTTCCGAGGTTG
TCAAACCCATCAAGCTGGTTGAGTAACTCCATGAGTGTTCTTTGAATTTCACGATCAGCA
CTAGTTCCCTCGCTAAAACGACGCCCACCAATAGCATCGATTTCGTCCATGAAAATGATA
CAAGGCTGGTGTTCACGGGCATAGTTAAACATCTCCCGAATCAGCCTAGCACTTTCTCCA
ATGTATTTGTCTATGATTGCACTAGACACAACCTTCAAGAAGTTGGCATCGATGTTGCTG
GCAATAGCCCTAGCTAGCAGAGTTTTTTCCTGTCCCTGGAGGTCCATACAGAAAGACTCC

QA 3 842 3 842
DS 

RD RR4AA06TF 692 0 0
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CCTGGAGGTCCATACAGAAGGACTCCCTTAGGTGGCTTGATCCCAACTCGGAGGAAAAGT
TCAGGATTCATGAGAGGAAGCTCAATAGATTCCCTGAGTTCTCTGATTTGATCAACTAAA
CCTCCGACAGCAGAGTAGCTAATGTTGCCAGGGTCTTCGTGCAGCATGTTATACACAACG
GGATCGACTTCTCGGGGAAGGGCTCTCATTATGGTAAGTGTGGTCATATCAAGAACAACT
CGAGTTCCTGAAGTCAGCTTCTCCTTGTCCACTTTGCTACGGCAGCCTACCACATACCGA
GGACCACTGCTAGCTTTGACAATCAATCTTTCATTATCGAGAGGTCGAAGGACTTCGCCA
ATGATCTGGCCAACACTTTGAAGAGACTTGAGATCATCTTCAGTTTTGTTGAATTCCTTT
TTGGATCCTCTCAAGTTCTCCCTAGCTGTTCGAACTCGGGACTCGAGCTCCTTATGTTGG
AGGAGCTTTTTCCGGTAATCGGCAACTGCAGCGGTACGGCGTCTAGCGGCATCGTCTCCG
TCGCTCATCCTCTCTTTCTCAGTGCTCCTCTTCAGCTATTACTGTAAGATCTCAGATTTC
CGGAAAGCCTATGTTTTGTGTGTTTACTTTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 5

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GAAACCCTAATTCGGCGGCCGCCGCTTCTCGCGGTCGCCGGATCTAGTTCTTAAATTCGT
TGTGTGTTCTTGTACTCGTCTGTTTCTCTCCTTCTCCTTCTATTTAAGCTGTCACTTTCC
CTGTGTTCTGAAAATAGTTTGAAGTGCCCTTGTTTTCTCAGATCTGTTGAACTTTGGAGA
GATCTGGAAGTGTGAGAGGATGTATGTCGGTGATCTTTTCGACTGCGCCTTTAACGGCCT
CTGTCCGAGGCTCCAATCTAGGTAAAGTTTCAAGCTTTGGTGGTTCTCATGTTTTTCAGT
GGTTGTGTATTCAGCCTGTTCCGAGTGGGTTTGTGACAGCTTGGTAAGATTGAATCCGGT
TCTTGTCTCTGAGTTTTGAGAGTGTGGCTTAGTTGGTCTTTGATTTAGCATCGGTATAGC
AGTGACGTGGAGATGTGTGTTGAGCTGGTTAAGAGTCTGGTCTCTGTGATGAAGAAGGTT
CAAGGTTACCTTCTCATCTCCCAGCTTCGAATTGGTCTTCTTCTCCCTTTAATAAGTGAT
ATTCCTGGTCTGTTTTTGCTCTCTGTTTGCCCTCGGTGGCTTCCTTTGTGAAGCAATAGA
ATGAGGCTGAGGTGCAAAGGCTTCCAGATGAAGGTGCAGATGAGTTGGAGACTATTTCAG
TTGCTGGTTTTCCTGGTTTCTGCCTTGGTATAGGCGTAGTGTTTGGATGGTTGTCATCGT
GAACTTGTTGTAACTTGTGGTTCAGATGAGATCGTTGTGGTTCTGGTGTTGTCATCGTGA
GCATGTGGCTCAGATGAGGTCTCTGCTCTTCACAAAGAAGTACTCTACGTTGCGTGCTCT
TGTGCTTAGTTCATTGCATGATCTCCGGCTAGTCATAGTCTTTTCTAAGTCTTCTCTTGT
TTCTTTTGAGTGTTTGGCTATGAATTCTTTGAAGGGGTATTAGGATTTGTTTTATATTTC
AATGTTGGTTTGTTGCCCGTGTGTTTGGGCTCTAGCCCCCCTTGTTCCTGTTGGAGTTAA
GTTTCTGGGGATGGTTTTATGTTCAGTCTGCTGTAGTGTTCCTATCTTGTATCTTTGGTT
ATCAATGAAAATGAAAGTCAGACGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4B122TF U 1
AF RR4DV86TF U 1
AF RR4E514TF U 105
AF RR4DV86JQ C 352
AF RR4E514JQ C 434
BS 1 19 RR4B122TF
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BS 178 670 RR4B122TF
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BS 1058 1166 RR4DV86JQ

RD RR4B122TF 673 0 0
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GAAACCCTAATTCGGCGGCCGCCGCTTCTCGCGGTCGCCGGATCTAGTTCTTAAATTCGT
TGTGTGTTCTTGTACTCGTCTGTTTCTCTCCTTCTCCTTCTATTTAAGCTGTCACTATCC
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GATCTGGAAGTGTGAGAGGATGTATGTCGGTGATCTTTTCGACTGCGCCTTTAACGGCCT
CTGTCCGAGGCTCCAATCTAGGTAAAGTTTCAAGCTTTGGTGGTTCTCATGTTTTTCAGT
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TCTTGTCTCTGAGTTTTGAGAGTGTGGCTTAGTTGGTCTTTGATTTAGCATCGGTATAGC
AGTGACGTGGAGATGTGTGTTGAGCTGGTTAAGAGTCTGGTCTCTGTGATGAAGAAGGTT
CAAGGTTACCTTCTCATCTCCCAGCTTCGAATTGGTCTTCTTCTCCCTTTAATAAGTGAT
ATTCCTGGTCTGTTTTTGCTCTCTGTTTGCCCTCGGTGGCTTCCTTTGTGAAGCAATAGA
ATGAGGCTGA
CGT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4DV86TF 662 0 0
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GAAACCCTAATTCGGCGGCCGCCGCTTCTCGCGGTCGCCGGATCTAGTTCTTAAATTCGT
TGTGTGTTCTTGTACTCGTCTGTTTCTCTCCTTCTCCTTCTATTTAAGCTGTCACTTTCC
CTGTGTTCTGAAAATAGTTTGAAGTGCCCTTGTTTTCTCAGATCCGTTGAACTTTGGAGA
GATCTGGAAGTGTGAGAGGATGTATGTCGGTGATCTTTTCGACTGCGCCTTTAACGGCCT
CTGTCCGAGGCTCCAATCTAGGTAAAGTTTCAAGCTTTGGTGGTTCTCATGTTTTTCAGT
GGTTGTGTATTCAGCCTGTTCCGAGTGGGTTTGTGACAGCTTGGTAAGATTGAATCCGGT
TCTTGTCTCTGAGTTTTGGGAGTGTGGCTTAGTTGGTCTTTGATTTAGCATCGGTATAGC
AGTGACGTGGAGATGTGTGTTGAGCTGGTTAAGAGTCTGGTCTCTGTGATGAAGAAGGTT
CAAGGTTACCTTCTCATCTCCCAGCTTCGAATTGGTCTTCTTCTCCCTTTAATAAGTGAT
ATTCCTGGTCTGTTTTTGCTCTCTGTTTGCCCTCGGTGGCTTCCTTTGTGAAGCAATAGA
AT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4E514TF 581 0 0
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TAAGCTGTCACTTTCCCTGTGTTCTGAAAATAGTTTGAAGTGCCCTTGTTTTCTCAGATC
TGTTGAACTTTGGAGAGATCTGGAAGTGTGAGAGGATGTATGTCGGTGATCTTTTCGACT
GCGCCTTTAACGGCCTCTGTCCGAGGCTCCAATCTAGGTAAAGTTTCAAGCTTTGGTGGT
TCTCATGTTTTTCAGTGGTTGTGTATTCAGCCTGTTCCGAGTGGGTTTGTGACAGCTTGG
TAAGATTGAATCCGGTTCTTGTCTCTGAGTTTTGAGAGGGTGGCTTAGTTGGTCTTTGAT
TTAGCATCGGTATAGCAGTGACGTGGAGATGTGTGTTGAGCTGGTTAAGAGTCTGGTCTC
TGTGATGAAGAAGGTTCAAGGTTACCTTCTCATCTCCCAGCTTCGAATTGGTCTTCTTCT
CCCTTTAATAAGTGAT*TTCCTGGTCTGTTTTTGCTCTCTGTTTGCCCTCGGTGGCTTCC
TTTGTGAAGCAATAGAATGAGGCTGAG
TGCAAAGCTTCCAG

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DS 

RD RR4DV86JQ 815 0 0
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GAATCCGGTTCTTGTCTCTGAGTTTTGGGAGTGTGGCTTAGTTGGTCTTTGATTTAGCAT
CGGTATAGCAGTGACGTGGAGATGTGTGTTGAGCTGGTTAAGAGTCTGGTCTCTGTGATG
AAGAAGGTTCAAGGTTACCTTCTCATCTCCCAGCTTCGAATTGGTCTTCTTCTCCCTTTA
ATAAGTGATATTCCTGGTCTGTTTTTGCTCTCTGTTTGCCCTCGGTGGCTTCCTTTGTGA
AGCAATAGAATGAGGCTGAGGTGCAAAGGCTTCCAGATGAAGGTGCAGATGAGTTGGAGA
CTATTTCAGTTGCTGGTTTTCCTGGTTTCTGCCTTGGTATAGGCGTAGTGTTTGGATGGT
TGTCATCGTGAACTTGTTGTAACTTGTGGTTCAGATGAGATCGTTGTGGTTCTGGTGTTG
TCATCGTGAGCATGTGGCTCAGATGAGGTCTCTGCTCTTCACAAAGAAGTACTCTACGTT
GCGTGCTCTTGTGCTTAGTTCATTGCATGAT*TCCGGCTAGTCATAGTCTTTTCTAAGTC
TTCTCTTGTTTCTTTTGAGTGTTTGGCTATGAATTCTTTGAAGGGGTATTAGGATTTGTT
TTATATTTCAATGTTGGTTTGTTGCCCGTGTGTTTGGGCTCTAGCTCCCCTTGTTCCTGT
TGGAGTTAAGTTTCTGGGGATGGTTTTATGTTCAGTCTGCTGTAGTGTTCCTATCTTGTA
TCTTTGGTTATCAATGAAAATGAAAGTCAGACGGG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4E514JQ 730 0 0
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TCATCTCCCAGCTTCGAATTGGTCTTCTTCTCCCTTTAATAAGTGAT*TTCCTGGTCTGT
TTTTGCTCTCTGTTTGCCCTCGGTGGCTTCCTTTGTGAAGCAATAGAATGAGGCTGAGGT
GCAAAGGCTTCCAGATGAAGGTGCAGATGAGTTGGAGACTATTTCAGTTGCTGGTTTTTC
TGGTTTCTGCCTTGGTATAGGCGTAGTGTTTGGATGGTTGTCATCGTGAACTTGTTGTAA
CTTGTGGTTCAGATGAGATCGTTGTGGTTCTGGTGTTGTCATCGTGAGCATGTGGCTCAG
ATGAGGTCTCTGCTCTTCACAAAGAAGTACTCTACGTTGCGTGCTCTTGTGCTTAGTTCA
TTGCATGATCTCCGGCTAGTCATAGTCTTTTCTAAGTCTTCTCTTGTTTCTTTTGAGTGT
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TGCCCGTGTGTTTGGGCTCTAGCCCCCCTTGTTCCTGTTGGAGTTAAGTTTCTGGGGATG
GTTTTATGTTCAGTCTGCTGTAGTGTTCCTATCTTGTATCTTTGGTTATCAATGAAAATG
AAAGTCAGAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 5

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GCTGCCCATCTCAAGCGTTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAG
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TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCCTTCCGTAGGATC
TACGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGT
GTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAG
GGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATC
GCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCCTCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTT
TTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTC
CTCTCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTCCCCACTTTTCTGCTTCTTTTTTTTCTT
TAATTCTCAGCGACTTCTGGCTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTTCGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GZ50JQ C 1
AF RR4GZ50TF U 1
AF RR4D242TF U 37
AF RR4EA55TF U 1
AF RR4EA55JQ C 124
BS 1 56 RR4EA55TF
BS 57 57 RR4GZ50TF
BS 58 79 RR4EA55TF
BS 80 80 RR4GZ50TF
BS 81 82 RR4EA55TF
BS 83 83 RR4GZ50TF
BS 84 119 RR4EA55TF
BS 120 120 RR4GZ50TF
BS 121 185 RR4EA55TF
BS 186 186 RR4GZ50TF
BS 187 302 RR4EA55TF
BS 303 303 RR4GZ50TF
BS 304 460 RR4EA55TF
BS 461 461 RR4GZ50TF
BS 462 656 RR4EA55TF
BS 657 657 RR4EA55JQ
BS 658 712 RR4EA55TF

RD RR4GZ50JQ 635 0 0
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GCAACAATGACAGGCAAGATGGCGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTAC
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TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCTTTCCGCAGGATT
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GTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAG
GGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATC
GCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCCTCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTT
TTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTC
CTCTCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTCCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4GZ50TF 635 0 0
GGATAATCCAAAAGCACAAGCGCCGACGCCGAATCACAAGGAGGAGAAGGAGGAGAAGAA
GCAACAATGACAGGCAAGATGGCGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTAC
GCTGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGATTGAGTTACCAGCGTGGACAGACATAGTGAAG
ACTGGAAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCTGCA
TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCTTTCCGCAGGATC
TACGGAGGAATCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGT
GTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAG
GGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATC
GCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCCTCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTT
TTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTC
CTCTCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTCCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4D242TF 603 0 0
GGAC
GAGGAGAAGGAGGAGAAGAAGCAACAATGACAGGCAAGACGGTGAAGGATGTCTCTCCAC
ACGAGTTCGTCAAGGCTTACGCTGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAG
CGTGGACAGACATAGTGAAGACTGGAAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACT
GGTACTACATCAGAGCTGCATCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAG
TCGGTGCATTCCGTAGGATCTACGGAGGAAGCAAGAG******AAGCCGTCCACCTCATT
TCTGCAAGAGCAGTGGTGGTGTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACA
TTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCGGAGAGATCTTG
ACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCGGCAGAAGCCGTCTAAATCAAGATCCTCATCACAATTG
CTCCAGAGTTTTTGTGTGTTTTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAA
AACATTACTGGATGGAATTCCTCTCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTT
TTTTCCA

QA 5 596 5 596
DS 

RD RR4EA55TF 712 0 0
GGATAATCCAAAAGCACAAGCGCCGACGCCGAATCACAAGGAGGAGAAGGAGGAGAGGAA
GCAACAATGACAGGCAAGACGGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTAT
GCTGCCCATCTCAAGCGTTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAG
ACTGGTAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCTGCA
TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCCTTCCGTAGGATC
TATGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGT
GTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAG
GGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGGCCAAGTCGCTGGAAGGATC
GCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCCTCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTT
TTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTC
CTCTCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTCCCCACTTTTCTGCTTCTTTTTTT*CTT
TAATTCTCAGCGACTTCTGGCTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTTCGC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EA55JQ 589 0 0
GCCCATCTCAAGCGTTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAGACT
GGTAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCTGCATCC
ATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCCTTCCGTAGGATCTAT
GGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGTGTT
GCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGG
GGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGGCCAAGTCGCTGGAAGGATCGCA
GCAGAAGCCATTTAAATCAAGATCCTCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTTTTG
AGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTC
TCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTCCCCACTTTTCTGCTTCTTTTTTTTCTTTAA
TTTTCAGCGACTTCTGGCTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTTCGC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 5

CO CL2169Contig1 1020 3 8 U
CATAAAGATATTAAATGTTTATTACCATTAAATCAGCACAAACAAATTTAAACCAAGGGA
CCAAGTTTAAAAAAGAGTGTAGAAAAGTCCAAACAAGTAGCAAAGATATTTGAGTTAAAC
AAACACACATTCATCATCCTCACCATACCCAAATGTCATTAGAGGTGAGAGAGAGAGAGA
GAAAAGAGAGAGAGGCCTTTGTCGACTTTAAATTGTCTGCAGCTGAAAGAAGGAGATTCT
GATAATTGAACCTCCTAGAGAGGTCGCATGCTTGCAAACCAGTGCTTCCGCAGCTTCCTC
CTCGTCCTCAAACTGCACCAGAGCTTGCTTTTTCCCGTTCATCTCAAACACTTTGGTGTT
CAGTATGGCCCCATGCTCTTGGACGTGGTTCACCACTTCTTCCTCTGTCACGTCTTGCGG
AAGAGTGGACAAGTGAATCATCTTGGTAGGGGAGCAGCAATAGCGGTAGTTCTTTGCAGC
ATTGCGGTTGAAGCGGTTCAGGTTCGAGTTAACATAATCATGCGAGTCTGTGCCTGGTGT
TATATTTGGATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGCATCGCTCCCTT
GAGGAAATGAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATCTGGACAAGGGCGTGGTC
AGGTTTGTTTCGAAGAAGCTTTATCCTCACAATGTTCCCGTAAAGAGAAAAGAGATTGAA
CAGCTTATCCTCATCAACACTATCTGTATTAAGATTGGAGACAAGGATCGTACACCTATC
ATTTGTGCCAGTTATACCCGGAGGCAAGCCACCGCCAAAGGCAGTGATTGCTGAAGAAAC
ATCTTGCATCTGGAGAAGAGCCTGATTCTTTGCCCTGAGCATCACGAGCTTAGTTATGAC
ACCAAACGGTTGGAAAAGCTGAAGCAAATCATTTTCAGAAATCTCATGTCCAACATTACG
AACATGAATGACTTTGGATGATTCTGCCATTACCAACCTTGTCTGCGAGAGGTTAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D359JQ U 8
AF RR4GL79JQ U 1
AF RR4D359TF C 293
BS 1 102 RR4GL79JQ
BS 103 103 RR4D359JQ
BS 104 226 RR4GL79JQ
BS 227 227 RR4D359JQ
BS 228 305 RR4GL79JQ
BS 306 306 RR4D359JQ
BS 307 748 RR4GL79JQ
BS 749 1020 RR4D359TF

RD RR4D359JQ 640 0 0
C
TATTAAATGTTTATTACCATTAAATCAGCACAAACAAATTTAAACCAAGGGACCAAGTTT
AAAAAAGAGTGTAGAAAAGTCCAAACAAGTAGCAAAGATATTTGAGTTAAACAAACACAC
ATTCATCATCCTCACCATACCCAAATGTCATTAGAGGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAG
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CCCCATGCTCTTGGACGTGGTTCACCACTTCTTCCTCTGTCACGTCTTGCGGAAGAGTGG
ACAAGTGAATCATCTTGGTAGGGGAGCAGCAATAGCGGTAGTTCTTTGCAGCATTGCGGT
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GATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGCATCGCTCCCTTGAGGAAAT
GAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATCTGGA

QA 2 640 2 640
DS 

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GAAAAGAGAGAGAGGCCTTTGTCGACTTTAAATTGTCTGCAGCTGAGAGAAGGAGATTCT
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CAGTATGGCCCCATGCTCTTGGACGTGGTTCACCACTTCTTCCTCTGTCACGTCTTGCGG
AAGAGTGGACAAGTGAATCATCTTGGTAGGGGAGCAGCAATAGCGGTAGTTCTTTGCAGC
ATTGCGGTTGAAGCGGTTCAGGTTCGAGTTAACATAATCATGCGAGTCTGTGCCTGGTGT
TATATTTGGATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGCATCGCTCCCTT
GAGGAAATGAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATCTGGACAAGGGCGTGGTC
AGGTTTGTTTCGAAGAAGCTTTATCCTCACAATGTTCCCGTAAAGAGAAAAGAGATTGAA
CAGCTTATCCTCATCAACACTATCTGTA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4D359TF 728 0 0
AGC
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GGTGTTATATTTGGATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGCATCGCT
CCCTTGAGGAAATGAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATCTGGACAAGGGCG
TGGTCAGGTTTGTTTCGAAGAAGCTTTATCCTCACAATGTTCCCGTAAAGAGAAAAGAGA
TTGAACAGCTTATCCTCATCAACACTATCTGTATTAAGATTGGAGACAAGGATCGTACAC
CTATCATTTGTGCCAGTTATACCCGGAGGCAAGCCACCGCCAAAGGCAGTGATTGCTGAA
GAAACATCTTGCATCTGGAGAAGAGCCTGATTCTTTGCCCTGAGCATCACGAGCTTAGTT
ATGACACCAAACGGTTGGAAAAGCTGAAGCAAATCATTTTCAGAAATCTCATGTCCAACA
TTACGAACATGAATGACTTTGGATGATTCTGCCATTACCAACCTTGTCTGCGAGAGGTTA
GATCC

QA 4 728 4 728
DS 



CO CL2169Contig2 1185 2 4 U
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TAACCTCTCGCAGACAAGGTTGGTAATGGCAGAATCATCCAAAGTCATTCATGTTCGTAA
TGTTGGACATGAGATTTCTGAATTTTATTGTTCATCAGAATGATTTGCTTCAGCTTTTCC
AACCTTTTGGTGTCATAACTAAGCTCGTGATGCTCAGGGCAAAGAATCAGGCTCTTCTCC
AGATGCAAGATGTTTCTTCAGCAATCACTGCTCTTCAGTTCTTCACTACTGTCCAGCCAA
CCATAAGAGGAAGGAATGTGTATATCCAATTCTCGTCTCACCAAGAATTGACAACAGCCG
AGCAGAATATTCATGGACGTGAAGATGAGCCGAATCGTATTCTCTTGGTGACAGTCCATC
ACATGCTGTATCCAATCACCGTTGACGTCCTGCATCAAGTTTTTTCTCCCTATGGATTTG
TGGAGAAGATCGTCACTTTCCAGAAGTCTGCTGGTTCTCAAGCTCTTATACAGTATCAGG
CACAACAGTGTGCTGCCTCTGCTAGAACTTCTCTACAGGGTCGTAACATATATGACGGGT
GTTGTCAGTTGGATATCCAGTTCTCCAACCTTGAGGAGCTGCAAGTAAATTACAACAACG
ATCGATCTAGGGATTATACAAATCCAAACCTGCCATCAGAGCAAAAAGGCCGTTTACCTC
ACCCTGGCTATGGTGATGCAGGAGTGGCCTATCCTCAGGTGAGTAATGCTAAAAGCTCCA
TGATACACGGTTTTAGCAACGATTTTGTTCTCTTAAATCTCATGTATTTGCTGTTATTTA
GATGGCAAACACATCTGCGATTGCAGCTGCCTTTGGCGGTGGCTTGCCTCCGGGTATAAC
TGGCACAAATGATAGGTGTACAATCCTTGTCTCCAATCTTAATACAGATAGTGTTGATGA
GGATAAGCTGTTCAATCTCTTTTCTCTTTACGGGAACATTGTGAGGATAAAGCTTCTTCG
AAACAAACCTGACCATGCCCTTGTCCAGATGGGAGATGGTTTCCAAGCTGAACTTGCAGT
TCATTTCCTCAAGGGAGCGATGCTGTTTGGTAAGCGGCTAGAGGTGAACTACTCGAAGCA
TCCAAATATAACACCAGGCACAGACTCGCATGATTATGTTAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GL79TF U 1
AF RR4AY34TF U 380
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RD RR4GL79TF 666 0 0
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ATCGAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4AY34TF 806 0 0
G
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GCTAGAACTTCTCTACAGGGTCGTAACATATATGACGGGTGTTGTCAGTTGGATATCCAG
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AATCCAAACCTGCCATCAGAGCAAAAAGGCCGTTTACCTCACCCTGGCTATGGTGATGCA
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TTGCAGCTGCCTTTGGCGGTGGCTTGCCTCCGGGTATAACTGGCACAAATGATAGGTGTA
CAATCCTTGTCTCCAATCTTAATACAGATAGTGTTGATGAGGATAAGCTGTTCAATCTCT
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QA 2 806 2 806
DS 



AS 1 4

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TTAACAGGAATTGATATGTTAAATGCACAAATAATTGTGGACTCAACCTGTCTCATCTTC
ACAGGATTATTACAGAATCAGATTTTTGTTCTGCTAGAACATTTTTCCAACACCTTCTTT
TCTTGGGACGGATTCTTGAACATCCATCCGGCTCCAGTTTCCCATCATAGAAGCCATTTG
ATCAACTTTATCATACAGCCCAAGAAGCCCACCAGTGTGTATGAACAATATCTTCTTTCC
CTCCCAACTTTTGGGATCCTTAGTCATCTCATTTATCAAACCGTACGCAGCTTTCCCACT
GTAAACAGGATCAAGAATAACACTTGCTGCACTTGCTAGGTCCTTTAAAAACTTAAGCTC
CTCCGCAGTGTTCATGGCATAACCTTTTACCTTGGCATTGTGGATGGTAACAATATCACG
AGAGTTAACACCAGCTTGAAGTCCGTCCAGAAGACCTTGGACAAAGTCATAGAAGTAATC
AGGATCATCGCATACGGAGAAAGCATGAACCTTGGCTTTTAGTGTTCCCAACCAAGACCC
CAATGAGATACCAGCAATCGTACCACCGCTGCCACATGCCACCACAATATCATCAAACTT
CAGGTCATCGGTTCTACATTTTAGCTGCTCCTCAATTTCCCTTGCTGCTTCAATATAACC
CCAAGTTCCCAAAGAGTTGGATCCACCAACGGGAATAACATAAGGCTTTTTCCCTTCTTT
CTCCAGCTTCTCTTTCAGGGCACTAGTTAGAGCCTCACTCCCAATGGAGGAGTACTCTTC
CTTAGAGATGAGGTGAACGTTAGCTCCAACGAGACGCTCAACAAGGAGATTCCCAACTAA
CCCAGGATCTCCATCCGCAAGAAGCTTGGAGGTGCGGAGTATAAGATGAGTGTCGAGATT
GAGATAGTTAGAAGCGACGGTTGTGGCACGGCAGTGATTGCTCTGGATACCTCCGATGGT
GATGACGGTGTCGGCTTGTTGCTCCACGGCGTCGGCCATTAGGAACTCGAGTTTCCGGAC
TTTGTTTCCGCTCAGTTCCATCCCCGTGAAGTCATCACGCTTGATCCAGAGTTCAGTGCC
GTTGGGGAGATTTGGAATGTTCCATTGATGGATCGGTGTAGGACGGTGAGCGAGGGAGAA
GATGTGAGAAGGAAGCGGACGAAGATGTGAAGCCCAGGAAGGAGGAGAGTAAGGGCTTTT
TGTCAGAAATTCCGCCATCGATGTTGCAGACATTCTTCTCCTTGTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4FL87JQ U 17
AF RR4BF68JQ U 1
AF RR4BB92TF C 520
AF RR4BF68TF C 524
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RD RR4FL87JQ 675 0 0
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ATAACACTTGCTGCACTTGCTAGGTCCTTTAAAAACTTAAGCTCCTCCGCAGTGTTCATG
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TGAAGTCCGTCCAGAAGACCTTGGACAAAGTCATAGAAGTAATCAGGATCATCGCATACG
GAGAAAGCATGAACCTTGGCTTTTAGTGTTCCCAACCAAGACCCCAATGAGATACCAGCA
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DS 

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TTAACAGGGATTGATATGTTAAATGCACAAATAATTGTGGACTCAACCTGTCTCATCTTC
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TCTTGGGACGGATTCTTGAACATCCATCCGGCTCCAGTTTCCCATCATAGAAGCCATTTG
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CTCCCAACTTTTGGGATCCTTAGTCATCTCATTTATCAAACCGTACGCAGCTTTCCCACT
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CTCTGCAGTGTTCATGGCATAACCTTTTCCCTTGGCATTGTGGATGGTAACAATATCACG
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GACA
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DS 

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GCTGCTTCAATATAACCCCAAGTTCCCAAAGAGTTGGATCCACCAACGGGAATAACATAA
GGCTTTTTCCCTTCTTTCTCCAGCTTCTCTTTCAGGGCACTAGTTAGAGCCTCACTCCCA
ATGGAGGAGTACTCTTCCTTAGAGATGAGGTGAACGTTAGCTCCAACGAGACGCTCAACA
AGGAGATTCCCAACTAACCCAGGATCTCCATCCGCAAGAAGCTTGGAGGTGCGGAGTATA
AGATGAGTGTCGAGATTGAGATAGTTAGAAGCGACGGTTGTGGCACGGCAGTGATTGCTC
TGGATACCTCCGATGGTGATGACGGTGTCGGCTTGTTGCTCCACGGCGTCGGCCATTAGG
AACTCGAGTTTCCGGACTTTGTTTCCGCTCAGTTCCATCCCCGTGAAGTCATCACGCTTG
ATCCAGAGTTCAGTGCCGTTGGGGAGATTTGGAATGTTCCATTGATGGATCGGTGTAGGA
CGGTGAGCGAGGGAGAAGATGTGAGAAGGAAGCGGACGAAGATGTGAAGCCCAGGAAGGA
GGAGAGTAAGGGCTTTTTGTCAGAAATTCCGCCATCGATGTTGCAGACATTCTTCTCCTT
GTTCTT
CC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 3

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GAAAAACAAGATTTTTCATGAGTAATCATAGAGTGATACACTCTTGTCGTCGGAGATACT
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GACGGATGCACTACTTCCCCCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG93JQ U 40
AF RR4A715JQ U 1
AF RR4GG93TF C 40
BS 1 58 RR4A715JQ
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RD RR4GG93JQ 474 0 0
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TGCAGATAACAATGTTACAACTAGTGTTTACATAGAATCCTTGGAAAACAAGATGTGTCT
TGAAGAATGCATTAAAGAAAAGAAAAACAAGATTTTTCATGAGTAATCATAGAGTGATAC
ACTCTTGTCGTCGGAGATACTAGCGAGACGACCAGCACGGACACCGGTTCCACCAGGTGG
TCTAAACGCCACAGACCAAACCTGGTCATTATGGTTGCTCATTGTCTGAATAGCAGCTCT
CATCTTAAGATCCCACAGCCTCACAGTTCTATCACTCGAGCCAGTTGCTATAGCTCCACC
GTCTAGGCTAGCATCAACGCTCAGCACCCAGCTCGTATGCCCCGACATGGACCCCACCAG
AGTTTTCCCTTATGCATCATGCATGTTCACATGCCCATCATCTGATCC
AGAAAA

QA 1 468 1 468
DS 

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AAGCTCTCAAGCAAGGTTTGAAATCAACAAAAA*CCTCTTGCAGATAACAATGTTACAAC
TAGTGTTTACATAGAATCCTTGGAAAACAAGATGTGTCTTGAAGAATGCATTAAAGAAAA
GAAAAACAAGATTTTTCATGAGTAATCATAGAGTGATACACTCTTGTCGTCGGAGACACT
AGCGAGACGACG*GCACGGACACCGGTTCCACCAGGTGGTCTAAACGCCACAGACCAAAC
CTGGTCATTATGGTTGCTCATTGTCTGAATAGCAGCTCTCATCTTAAGATCCCACAGCCT
CACAGTTCTATCACTCGAGCCAGTTGCTATAGCTCCACCGTCCGGGCTAGCATCAACGCT
CAGCGCCCAGCTCGTATGCCCCGACATGGACCCCACCAGAGTTTTCCCTTCTGCATCATG
CATGTTCACATGGCCATCATCTGATCCAGAGAAGAGGACTCTCGGATCTACAGGTGAGAA
CACAAGGGACCTCACAGGCATGTTGTGTCCTTCAAGCTGGTGAAGAAGCTTAGAGCGATC
AACATCAAAGACGCAGACGGTGCCATCCATTGAACCACAAGCGAGGCGTTTCCCGTTGGG
AGACCAAGCCACGGAGAGAACGAACTTCTTGCTGCTGGTTTTATCAGAAGACTTTGG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4GG93TF 766 0 0
CGTTATCTCCAGTTTTATAGTAAGCTCTCAAGCAAAGTTTGAAATCAACAAAAA*CCTCT
TGCAGATAACAATGTTACAACTAGTGTTTACATAGAATCCTTGGAAAACAAGATGTGTCT
TGAAGAATGCATTAAAGAAAAGAAAAACAAGATTTTTCATGAGTAATCATAGAGTGATAC
ACTCTTGTCGTCGGAGATACTAGCGAGACGACCAGCACGGACACCGGTTCCACCAGGTGG
TCTAAACGCCACAGACCAAACCTGGTCATTATGGTTGCTCATTGTCTGAATAGCAGCTCT
CATCTTAAGATCCCACAGCCTCACAGTTCTATCACTCGAGCCAGTTGCTATAGCTCCACC
GTCTAGGCTAGCATCAACGCTCAGCACCCAGCTCGTATGCCCCGACATGGACCCCACCAG
AGTTTTCCCTTATGCATCATGCATGTTCACATGCCCATCATCTGATCCAGAGAAGAGGAC
TCTCGGATCTACAGGTGAGAACACAAGGGACCTCACAGGCATGTTGTGTCCTTCAAGCTG
GTGAAGAAGCTTAGAGCGATCAACATCAAAGACGCAGACGGTGCCATCCATCGAACCACA
AGCGAGGCGTTTCCCGTTGGGAGACCAAGCCACGGAGAGAACGAACTTCTTGCTGCTGGT
TTTATCAGAAGGCTTTGGTGCTTCAGGGCGTGGGATTGATAGAGTTGAGATTAGTCTCCA
GCTCGCAGTGTCCCAAAGCTTGACGGATGCACTACTTCCCCCTGCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 4

CO CL2172Contig1 1153 4 3 U
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CTCAACCTTCTCCCATCTCCAAACCTCTGCAAACCCATCGCCAAACGCGATTTCATCTCC
CCGAAACGAGACCCGTCCCGCCCAATCTCCCTCCGATGCTCCTCCGTCTCCACGCCGCCG
CTAACGGCGACGACCAATCACCATCTCTCCGTCGCGTCGAGCCACAAGCCCTTCCCGGCG
GAGGTTTCGAGGAGCATCATGGAGCTTTCCTCCGTCGGAACCCTCTCCACTCTGACCCAC
GACGGGTGGCCGCTCGGCGTCGGCGTTCGATTCGCCGTTGACGGTGACGGCACTCCTGTT
CTCTGCCTCAATCGCGCCTTGTCTCCTGACAAGAGGTCTGCTCTTCACGTTCAGTTGGAT
CAATGTGGACTGAGGACTCCTCAGTGTACGATTCAAGGTAGCATTGCTCGACCTGGTGAC
GACCATGTTGTAAAGCGTCTTAGTGCTGCATGGAGGAAAAAGTTTGGAGAACAAGTTGAG
GAAGACAGTTTATATGTTGTTGCTGTTGACCGTGTGCTTCAGATGGAAGACTTCATGGAG
GATGGAGTTTGGGTGGCGTCAGCAGATTATAAAAATGCAAGCCCTGATCCTCTTCGAGGT
GTTGCAGAAGACATTGTCAACCAGATTAACGCTAACAACATGGAAGACATTTTCCGTTTC
TGCAACGTATACGTTGATCTTGACTTTGTGGTTTCAGAGACAAAGATGATTTGGATGGAT
AGGCTTGGATTCGACCTCCGAGTGTGGTCTCCACGAGGTGTATACGATGTCAGGATTCCA
TTTCCAATGGAAGTGACAGATGAAAAAGGAGCCAAATCTTCGTTTAATGGAATGTCACAG
CTCGCTTGGGAAGTAGAGAAAAGTTATTGCCCTGCAGATTTCGACAAGGTTAAACTACTT
AAGCAAGTAGTTGGATCATCACACAAGGGAGGACAGTAGCCGTTTCATTAACTCGTTTTT
TTTGTTCACATTCTTTACCAGTGGATGCCAAAATATGGCATTGGTTTCTGTTGTATCTCT
TGGATTAGTATATTTTCTGAGTAATAGTGCTTGTACCCACCACTTGAAGTAAGATTTGTC
ATCTATTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4EZ24TF U 1
AF RR4EZ24JQ C 431
AF RR4AM16JQ C 562
AF RR4AM16TF U 562
BS 1 619 RR4EZ24TF
BS 620 1151 RR4AM16TF
BS 1152 1153 RR4AM16JQ

RD RR4EZ24TF 619 0 0
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GAGGTTTCGAGGAGCATCATGGAGCTTTCCTCCGTCGGAACCCTCTCCACTCTGACCCAC
GACGGGTGGCCGCTCGGCGTCGGCGTTCGATTCGCCGTTGACGGTGACGGCACTCCTGTT
CTCTGCCTCAATCGCGCCTTGTCTCCTGACAAGAGGTCTGCTCTTCACGTTCAGTTGGAT
CAATGTGGACTGAGGACTCCTCAGTGTACGATTCAAGGTAGCATTGCTCGACCTGGTGAC
GACCATGTTGTAAAGCGTCTTAGTGCTGCATGGAGGAAAAAGTTTGGAGAACAAGTTGAG
GAAGACAGTTTATATGTTGTTGCTGTTGACCGTGTGCTTCAGATGGAAGACTTCATGGAG
GATGGAGTTTGGGTGGCGT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4EZ24JQ 723 0 0
TGAGGACTCCTCAGTGTACGATTCAAGGTAGCATTGCTCGACCTGGTGACGACCATGTTG
TAAAGCGTCTTAGTGCTGCATGGAGGAAAAAGTTTGGAGAACAAGTTGAGGAAGACAGTT
TATATGTTGTTGCTGTTGACCGTGTGCTTCAGATGGAAGACTTCATGGAGGATGGAGTTT
GGGTGGCGTCAGCAGATTATAAAAATGCAAGCCCTGATCCTCTTCGAGGTGTTGCAGAAG
ACATTGTCAACCAGATTAACGCTAACAACATGGAAGACATTTTCCGTTTCTGCAACGTAT
ACGTTGATCTTGACTTTGTGGTTTCAGAGACAAAGATGATTTGGATGGATAGGCTTGGAT
TCGACCTCCGAGTGTGGTCTCCACGAGGTGTATACGATGTCAGGATTCCATTTCCAATGG
AAGTGACAGATGAAAAAGGAGCCAAATCTTCGTTTAATGGAATGTCACAGCTCGCTTGGG
AAGTAGAGAAAAGTTATTGCCCTGCAGATTTCGACAAGGTTAAACTACTTAAGCAAGTAG
TTGGATCATCACACAAGGGAGGACAGTAGCCGTTTCATTAACTCGTTTTTTTTGTTCACA
TTCTTTACCAGTGGATGCCAAAATATGGCATTGGTTTCTGTTGTATCTCTTGGATTAGTA
TATTTTCTGAGTAATAGTGCTTGTACCCCCCACTTGAAGTAAGATTTGTCATCTATTTTG
G
TT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AM16JQ 592 0 0
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GCAGATTATAAAAATGCAAGCCCTGATCCTCTTCGAGGTGTTGCAGAAGACATTGTCAAC
CAGATTAACGCTAACAACATGGAAGACATTTTCCGTTTCTGCAACGTATACGTTGATCTT
GACTTTGTGGTTTCAGAGACAAAGATGATTTGGATGGATAGGCTTGGATTCGACCTCCGA
GTGTGGTCTCCACGAGGTGTATACGATGTCAGGATTCCATTTCCAATGGAAGTGACAGAT
GAAAAAGGAGCCAAATCTTCGTTTAATGGAATGTCACAGCTCGCTTGGGAAGTAGAGAAA
AGTTATTGCCCTGCAGATTTCGACAAGGTTAAACTACTTAAGCAAGTAGTTGGATCATCA
CACAAGGGAGGACAGTAGCCGTTTCATTAACTCGTTTTTTTTGTTCACATTCTTTACCAG
TGGATGCCAAAATATGGCATTGGTTTCTGTTGTATCTCTTGGATTAGTATATTTTCTGAG
TAATAGTGCTTGTACCCACCACTTGAAGTAAGATTTGTCATCTATTTTGGCC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4AM16TF 592 0 0
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GCAGATTATAAAAATGCAAGCCCTGATCCTCTTCGAGGTGTTGCAGAAGACATTGTCAAC
CAGATTAACGCTAACAACATGGAAGACATTTTCCGTTTCTGCAACGTATACGTTGATCTT
GACTTTGTGGTTTCAGAGACAAAGATGATTTGGATGGATAGGCTTGGATTCGACCTCCGA
GTGTGGTCTCCACGAGGTGTATACGATGTCAGGATTCCATTTCCAATGGAAGTGACAGAT
GAAAAAGGAGCCAAATCTTCGTTTAATGGAATGTCACAGCTCGCTTGGGAAGTAGAGAAA
AGTTATTGCCCTGCAGATTTCGACAAGGTTAAACTACTTAAGCAAGTAGTTGGATCATCA
CACAAGGGAGGACAGTAGCCGTTTCATTAACTCGTTTTTTTTGTTCACATTCTTTACCAG
TGGATGCCAAAATATGGCATTGGTTTCTGTTGTATCTCTTGGATTAGTATATTTTCTGAG
TAATAGTGCTTGTACCCACCACTTGAAGTAAGATTTGTCATCTATTTTGG
CC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 2 5

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GGAAGCGACACCGTTTTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCACTGGTAGACTACGA
CGATTCTTCGTCCGACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTTCACAAGGAAGCTCTGCC
ACAACGACCGCAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAA
GGAAGAAAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAAC
GCTTACACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCG
GAAACGAGACTTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGG
AGCTTTGCCCCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCA
GCTCAAAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATAAGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACG
GCAAGAGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCA
ACCTATAGTGTTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTT
TCTTTCGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AZ04JQ C 1
AF RR4AZ04TF U 1
BS 1 10 RR4AZ04JQ
BS 11 632 RR4AZ04TF
BS 633 634 RR4AZ04JQ

RD RR4AZ04JQ 634 0 0
GGAAGCGACACCGTTTTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCACTGGTAGACTACGA
CGATTCTTCGTCCGACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTTCACAAGGAAGCTCTGCC
ACAACGACCGCAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAA
GGAAGAAAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAAC
GCTTACACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCG
GAAACGAGACTTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGG
AGCTTTGCCCCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCA
GCTCAAAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATAAGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACG
GCAAGAGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCA
ACCTATAGTGTTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTT
TCTTTCGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTGCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4AZ04TF 634 0 0
GGAAGCGACA
CCGTTTTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCACTGGTAGACTACGACGATTCTTCG
TCCGACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTTCACAAGGAAGCTCTGCCACAACGACCG
CAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAGGAAGAAAGT
GAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACGCTTACACAC
GTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGGAAACGAGAC
TTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGAGCTTTGCCC
CATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCAAAGGA
AGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATAAGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGGCAAGAGTCC
TCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCAACCTATAGTG
TTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTTCTTTCGTTT
ATTTATTACATGATTTCTGTTG
CC

QA 11 632 11 632
DS 



CO CL2173Contig2 672 3 7 U
GGGACGCCGTTTTGAGGAAGGTGGAGGAAGCAAGGTATGTCGCTGGTAGACTACGACGAT
TCTTCATCCGACAACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCA
CAACCACCGAAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAG
GAAGAAAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACG
CTTACACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGG
AAACGAGACTTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGA
GCTTTGCCCCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAG
CTCAAAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGGAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGG
CAAGAGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCAA
CCTATAGTGTTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTT
CTTTCGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTGTCTTTCTTTTACCTCAATTGATAACATGT
TTTTTTGGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DR11TF U 1
AF RR4DX24JQ C 4
AF RR4DX24TF U 4
BS 1 23 RR4DR11TF
BS 24 24 RR4DX24TF
BS 25 448 RR4DR11TF
BS 449 449 RR4DX24TF
BS 450 631 RR4DR11TF
BS 632 671 RR4DX24TF
BS 672 672 RR4DX24JQ

RD RR4DR11TF 632 0 0
GGGACGCCGTTTTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCGCTGGTAGACTACGACGAT
TCTTCATCCGACAACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCA
CAACCACCGAAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAG
GAAGAAAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACG
CTTACACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGG
AAACGAGACTTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGA
GCTTTGCCCCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAG
CTCAAAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGG
CAAGAGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCAA
CCTATAGTGTTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTT
CTTTCGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTG
T

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4DX24JQ 669 0 0
GGG
CCGTTTTGAGGAAGGTGGAGGAAGCAAGGTATGTCGCTGGTAGACTACGACGATTCTTCA
TCCGACAACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCACAACCA
CCGAAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAGGAAGAA
AGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACGCTTACA
CACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGGAAACGA
GACTTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGAGCTTTG
CCCCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCAAA
GGAAGGAGCAATGTTGCCACAGGAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGGCAAGAG
TCCTCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCAACCTATA
GTGTTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTTCTTTCG
TTTATTTATTACATGATTTCTGTTGTCTTTCTTTTACCTCAATTGATAACATGTTTTTTT
GGTTTG

QA 4 669 4 669
DS 

RD RR4DX24TF 668 0 0
GGG
CCGTTTTGAGGAAGGTGGAGGAAGCAAGGTATGTCGCTGGTAGACTACGACGATTCTTCA
TCCGACAACGACGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCACAACCA
CCGAAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAGGAAGAA
AGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACGCTTACA
CACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGGAAACGA
GACTTCAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGAGCTTTG
CCCCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCAAA
GGAAGGAGCAATGTTGCCACAGGAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGGCAAGAG
TCCTCCAAGGCAACATCTCCTAATAAGGATTAGTTTCTTCGATTTTGAATGCAACCTATA
GTGTTGGTATCTTAGTTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTTCTTTCG
TTTATTTATTACATGATTTCTGTTGTCTTTCTTTTACCTCAATTGATAACATGTTTTTTT
GGTTT

QA 4 668 4 668
DS 



AS 1 2

CO CL2174Contig1 963 2 6 U
GATTTGAAAGTAGAACTATTTCTTAAAATAGAAAGCGAACGAACACGATCCAAAGACGAC
AAAAGAGAAAGCTCAACATGTCTCGACTCAACAAAAATATCAAAATCCAGGAGTAGTGAA
AACAAACAGATCATAAGACTTGAGAATGGAAAAGAAGAAGACATCATCTAATTCATCCTC
CTGATAAGCTCATTGATGAAGTTCTCACGGTTACCAGCATCACCACCTTCAACGTAGTGA
TTCCTCTTCTTCTTCAGGCCACCGAGTGGTGCCTTGAGCTGGAACGGCCACAGGAAGTTG
TTAGCTTCCTTGAAATGAGGTCCAACTGTTAGAATCTCGTGGATCAAATCCTCAGTGCAG
ATGATCCCATGTTTACCCAAACCCTGCTCTACGATAGAGTTGTCAGTCAAAGCCACCCTC
TGGGAGTTGAGCTTTCCGTATCCTCTCTTGTAGATCAATTCCTTGACGCTCTTCAAGTTA
GGGAACCCGTAGGTCACATAGGGCTCAACACGACGAAGCATGTTCATTGTAGCCTTGTTG
ACTTTGAGAAAGACACCGTTAAATATCTGTCTCAAACGCAAGAGCTGAAGAATCTTCTTA
GTCTTTGGGTCAATGGCATTAATACCACGGATACGGATGATGAACAAGAGCTTAGCTTCA
GGATCAACATAGAAACCTCCTTTGAGCTTAGCCTCACGTTTCAACGAGATCAACTCCTTC
TCCTTCTCGGCGTACTCCTTGGCGTACTGCTCGGCCCTTTTGTAGATAAGCTTCCTGTTG
GCGGCGTTCGTCTTCTTGGCAGCTTCAGCGGTCTGCTTCTTCGCCAAAGCCCACTCCTCC
TCTCTCTTCCTCTTCTTCAGGACAGACTCCGGAACTACAACCTTTGATTCTGTCATTTCT
GATGGAGAAGAAACCGACACTCACCTCTCTGTTGAGTTCGAAGCAAACGGAGTTTCAAAG
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4GS08JQ U 1
AF RR4EU07TF C 467
BS 1 554 RR4GS08JQ
BS 555 555 RR4EU07TF
BS 556 617 RR4GS08JQ
BS 618 618 RR4EU07TF
BS 619 757 RR4GS08JQ
BS 758 963 RR4EU07TF

RD RR4GS08JQ 757 0 0
GATTTGAAAGTAGAACTATTTCTTAAAATAGAAAGCGAACGAACACGATCCAAAGACGAC
AAAAGAGAAAGCTCAACATGTCTCGACTCAACAAAAATATCAAAATCCAGGAGTAGTGAA
AACAAACAGATCATAAGACTTGAGAATGGAAAAGAAGAAGACATCATCTAATTCATCCTC
CTGATAAGCTCATTGATGAAGTTCTCACGGTTACCAGCATCACCACCTTCAACGTAGTGA
TTCCTCTTCTTCTTCAGGCCACCGAGTGGTGCCTTGAGCTGGAACGGCCACAGGAAGTTG
TTAGCTTCCTTGAAATGAGGTCCAACTGTTAGAATCTCGTGGATCAAATCCTCAGTGCAG
ATGATCCCATGTTTACCCAAACCCTGCTCTACGATAGAGTTGTCAGTCAAAGCCACCCTC
TGGGAGTTGAGCTTTCCGTATCCTCTCTTGTAGATCAATTCCTTGACGCTCTTCAAGTTA
GGGAACCCGTAGGTCACATAGGGCTCAACACGACGAAGCATGTTCATTGTAGCCTTGTTG
ACTTTGAGAAAGACGCCGTTAAATATCTGTCTCAAACGCAAGAGCTGAAGAATCTTCTTA
GTCTTTGGGTCAATGGCGTTAATACCACGGATACGGATGATGAACAAGAGCTTAGCTTCA
GGATCAACATAGAAACCTCCTTTGAGCTTAGCCTCACGTTTCAACGAGATCAACTCCTTC
TCCTTCTCGGCGTACTCCTTGGCGTACTGCTCGGCCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4EU07TF 497 0 0
CA
CTCTTCAAGTTAGGGAACCCGTAGGTCACATAGGGCTCAACACGACGAAGCATGTTCATT
GTAGCCTTGTTGACTTTGAGAAAGACACCGTTGAATATCTGTCTCAAACGCAAGAGCTGA
AGAATCTTCTTAGTCTTTGGGTCAATGGCATTAATACCACGGATACGGATGATGAACAAG
AGCTTGGCTTCAGGATCAACATAGAAACCTCCTTTGAGCTTAGCCTCACGTTTCAACGAG
ATCAACTCCTTCTCCTTCTCGGCGTACTCCTTGGCGTACTGCTCGGCCCTTTTGTAGATA
AGCTTCCTGTTGGCGGCGTTCGTCTTCTTGGCAGCTTCAGCGGTCTGCTTCTTCGCCAAA
GCCCACTCCTCCTCTCTCTTCCTCTTCTTCAGGACAGACTCCGGAACTACAACCTTTGAT
TCTGTCATTTCTGATGGAGAAGAAACCGACACTCACCTCTCTGTTGAGTTCGAAGCAAAC
GGAGTTTCAAAGACC

QA 3 497 3 497
DS 



AS 1 4

CO CL2175Contig1 810 4 17 U
GGTACACTTAAATTATTATTGTTTTTGTGTGGCTTCTCTCAAGTCTATTAGATTCATTTA
CATGGAAGAAACACAGAAGAAGCTTCCCGTGGAAAGAGAGACACTTGGTTTATGTTGACA
ACTTCACTCATATATCCATATGAGGACCACTTGGGGTAGGTTGGCTCTCCAATGGCATGT
ACTGCGCCATGATGCCTCTTATCTCCGCATCCATGTAAGTCCTGATCCTGTATTTGTAGA
CGGCATATCCAGCAAGACCTGCAACACCCACTCCGATTATAAGAAACCACAAAAAGCTCC
AGCTGAGCTTTGTAGTTCCAACTTTGTTTGAACCTATACACGTGTCGTGTTCACGCATGT
AGAGCAAA*CCATTCTTGCAGCTGCATT*CATAACTTCCCC*ATGTGTTTTTACATTTAC
AGTCTGCGCACTGGCAAACCGTTTTTTCTTTGCACTCGTCCACATCTTCACAGCTCTTTA
CTCCATCGCCCTTGAACCCAAGTGGGCATTTGCAACCATTTGAATGATCATCTACGCAAG
CAGAGTAAGTGTAGCTGCCTCGGGTTTCTCTCCAGCATCCTCCATTGTTGATACCACAAT
GCAAAGCTCCAGAGGCTCTGCAGTGAGTGTAACCGTCACCAGCAAATTTAATACCTTGAA
CAGTAGGGCACTCACACAATCTTCCCCTATATGTATCCCGGCATGCAGTTAAGTTGGAAG
CTCTGTCTTGCCAGCACCCACCATTGTCTTCCAAACATTCATTAGTATTTAAATCTTCAG
TTAGACATATAGCTGGTTCTGTTGACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX57JQ U 116
AF RR4A350JQ U 155
AF RR4AX57TF C 27
AF RR4A350JQD U 1
BS 1 100 RR4A350JQD
BS 101 101 RR4AX57TF
BS 102 157 RR4A350JQD
BS 158 158 RR4AX57JQ
BS 159 218 RR4A350JQD
BS 219 219 RR4AX57JQ
BS 220 223 RR4A350JQD
BS 224 224 RR4AX57JQ
BS 225 250 RR4A350JQD
BS 251 251 RR4AX57JQ
BS 252 326 RR4A350JQD
BS 327 327 RR4AX57JQ
BS 328 340 RR4A350JQD
BS 341 341 RR4AX57JQ
BS 342 384 RR4A350JQD
BS 385 385 RR4AX57JQ
BS 386 810 RR4A350JQD

RD RR4AX57JQ 299 0 0
TGACAACTTCACTCATATATCCATATGAGGACCACTTGGGGTAGGTTGGCTCTCCAATGG
CATGTACTGCGCCATGATGCCTCTTATCTCCGCATCCATGTAAGTCCTGAACCTGTATTT
GTAGACGGCATATCCAGCAAGACCTGCAACACCCACTCCGATTATAAGAAACCACAAAAA
GCTCCAGCTGAGCTTTGTAGTTCCAACTTTGTTTGAACCTATACACGTGTCGTGTTCACG
CATGTAGAGCAAA*CCATTCTTGCAGCTGCATTTCATAACTTCCCCCATGTGTTTTTAC

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4A350JQ 384 0 0
GGTG
GGTTGGCTCTCCAATGGCATGTACTGCGCCATGATGCCTCTTATCTCCGCATCCATGTAA
CTCCTTATCCTGTATTTGTAGACGGCATATCCGGCAAGACCTGCAACACCCACTCCGATT
ATAAGAAACCACAAAAAGCTCCAGCTGAGCTTTGTAGTTCCAACTTTGCTTGAACCTATA
CAAGTGTCGTGTTCACGCATGTAGAGCAAA*CCATTCTTGCAGCTGAATT*CATAACTTC
CCC*ATGTGTTTTTACATTTACAGTCTGCGCACTGGCAAACCGTTTTTTCTTTGCACTCG
TCCACATCTTCACAGCTCTTTACTCCATCGCCCTTGAACCCAAGTGGGCATTTGCAACCA
TTTGAATGATCATCTACGCA

QA 5 384 5 384
DS 

RD RR4AX57TF 645 0 0
GTGTGGCTTCTCTCAAGTCTATTAGATTCATTTACATGGAAGAAACACAGAAGAAGCTTC
CCGTGGAAAGAGAGACACTTGGTTTGTGTTGACAACTTCACTCATATATCCATATGAGGA
CCACTTGGGGTAGGTTGGCTCTCCAATGGCATGTACTGCGCCATGATGCCTCTTATCTCC
GCATCCATGTAAGTCCTGATCCTGTATTTGTAGACGGCATATCCAGCAAGACCTGCAACA
CCCACTCCGATTATAAGAAACCACAAAAAGCTCCAGCTGAGCTTTGTAGTTCCAACTTTG
TTTGAACCTATACACGTGTCGTGTTCACGCATGTAGAGCAAAACCATTCTTGCAGCTGCA
TT*CATAACTTCCCC*ATGTGTTTTTACATTTACAGTCTGCGCAATGGCAAACCTTTTTT
TCTTCGCACTCGTCCACATCTTCACAGCTCTTTACTCCATCGCCCTTGAACCCAAGTGGG
CATTTGCAACCATTTGAATGATCATCTACGCAAGCAGAGTAAGTGTAGCTGCCTCGGGTT
TCTCTCCAGCATCCTCCATTGTTGATACCACAATGCGAAGCTCCAGAGGCTCTGCAGTGA
GTGTAACCGTCACCAGCAAATTTAATACCTTGAACAGTAGGGCAC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4A350JQD 810 0 0
GGTACACTTAAATTATTATTGTTTTTGTGTGGCTTCTCTCAAGTCTATTAGATTCATTTA
CATGGAAGAAACACAGAAGAAGCTTCCCGTGGAAAGAGAGTCACTTGGTTTATGTTGACA
ACTTCACTCATATATCCATATGAGGACCACTTGGGGTGGGTTGGCTCTCCAATGGCATGT
ACTGCGCCATGATGCCTCTTATCTCCGCATCCATGTAACTCCTTATCCTGTATTTGTAGA
CGGCATATCCGGCAAGACCTGCAACACCCACTCCGATTATAAGAAACCACAAAAAGCTCC
AGCTGAGCTTTGTAGTTCCAACTTTGCTTGAACCTATACAAGTGTCGTGTTCACGCATGT
AGAGCAAA*CCATTCTTGCAGCTGAATT*CATAACTTCCCC*ATGTGTTTTTACATTTAC
AGTCTGCGCACTGGCAAACCGTTTTTTCTTTGCACTCGTCCACATCTTCACAGCTCTTTA
CTCCATCGCCCTTGAACCCAAGTGGGCATTTGCAACCATTTGAATGATCATCTACGCAAG
CAGAGTAAGTGTAGCTGCCTCGGGTTTCTCTCCAGCATCCTCCATTGTTGATACCACAAT
GCAAAGCTCCAGAGGCTCTGCAGTGAGTGTAACCGTCACCAGCAAATTTAATACCTTGAA
CAGTAGGGCACTCACACAATCTTCCCCTATATGTATCCCGGCATGCAGTTAAGTTGGAAG
CTCTGTCTTGCCAGCACCCACCATTGTCTTCCAAACATTCATTAGTATTTAAATCTTCAG
TTAGACATATAGCTGGTTCTGTTGACTCTT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 3

CO CL2176Contig1 809 3 2 U
GCTAAAAACCTGATCAGAAACATGCAACAAGTAGGAACAGATCCTCATCACACACGAAAA
ATAGTTTATAAAGAAAATACAATACTTCCTGAAAAGAGTGTGAATATAGATTCTTTTGGG
GGAAAACAAGAACCAAGAAAAAAAGTAGAAACAAAATCGATACACAACAGCACCATCATC
TCTTAGGGACTATCTTCGGCGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCTTCACCAGAAGCTGGT
TCTGGCTGTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGTGGTGCTTCCGGTTTA
GCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCCAATGCCTCAGCCTTC
CTTGTAACATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGAAGCACCTCCTGCTGC
TGCTGCTTCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTCAATACCTTTTGCTTC
TCTTCTAGTTCGATGTGGTCAAACTTGGAATCATTAGAGACCGCAGCCTCTCTGTAGCTG
TTAACACAGTGACCAAGCTGTCCAATGACTGTCTCTCTTTCCTGTGACTCCTTGTACCGC
AATTCAACTGGGTCACCCACCTTCTTGAGCTCCTCCAGCTTTGCAACGTAGACACCTTTA
GTCTCATCTTCTCCATCTTCATACAACCAGTCCTCCACTTCCTGCAGCCTCGCTAGGAAT
GCCTCCCTGTCTGACTCAGTCATGTATTCATGGTATTTGTCACTCAGTTTGTTTCGCATA
TCATAAACATAGGACTCAACAGCATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EM66JQ U 1
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AF RR4CU45JQ U 48
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BS 775 809 RR4CU45JQ

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GGAAAACAAGAACCAAGAAAAAAAGTAGAAACAAAATCGATACACAACAGCACCATCATC
TCTTAGGGACTATCTTCGGCGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCTTCACCAGAAGCTGGT
TCTGGCTGTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGTGGTGCTTCCGGTTTA
GCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCCAATGCCTCAGCCTTC
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AAGAACCAAGAAAAAAAGTAAAAACAAAATCGATACACAACAGCACCATCATCTCTTAGG
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GTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGTGGTGCTTCCGGTTTAACAACCG
GCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGACCAATGCCTCGGCCTTCCTTGTAA
CATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGAAGCACCTCCTGCTGCTGCTGCT
TCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTCAATACCTTTTGCTTCTCTTCTA
GTTCGATGTGGTCAAACTTGGAATAATTAAAGACCGCAACCTCTCTGTAGCTGTTAACAC
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CTGGGTCACCCACCTTCTTGAGCTCCTCCAGCTTTGCAACGTAGACACCTTTAGTCTCAT
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TGTCTGAC

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DS 

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ACG
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CACCATCATCTCTTAGGGACTATCTTCGGCGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCTTCACC
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TTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCCAATGC
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CTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTCAATAC
CTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCGATGTGGTCAAACTTGGAATCATTAGAGACCGCAGCCTC
TCTGTAGCTGTTAACACAGTGACCAAGCTGTCCAATGACTGTCTCTCTTTCCTGTGACTC
CTTGTATCGCAATTCAACTGGGTCACCCACCTTCTTGAGCTCCTCCAGCTTTGCAACGTA
GACACCTTTAGTCTCATCTTCTCCATCTTCATACAACCAGTCCTCCACTTCCTGCAGCCT
CGCTAGGAATGCCTCCCTGTCTGACTCAGTCATGTATTCATGGTATTTGTCACTCAGTTT
GTTTCGCATATCATAAACATAGGACTCAACAGCATTCTT

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DS 



AS 1 4

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AGCTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGCGCCGGTGGCGGTCTAGGTCACGC
ATCGCCAGATTCTCCGACACTCGACACGTCAGAGCAAGTTTACATCTCTTCTCTCGCCCT
CCTCAAGATGCTCAAGCACGGAAGAGCTGGAGTTCCTATGGAAGTGATGGGATTGATGCT
TGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGGGTTGTTGATGTTTTCGCTATGCCTCAGAG
TGGTACTGGTGTTAGCGTCGAAGCTGTTGATCATGTCTTCCAGACTAATATGCTCGACAT
GCTTAAACAGACTGGAAGACCTGAGATGGTGGTGGGTTGGTATCATTCACATCCTGGATT
TGGATGCTGGCTTTCTGGTGTTGATATTAATACTCAACAGAGTTTTGAAGCTTTGAACCA
GCGAGCCGTGGCGGTGGTGGTTGATCCCATTCAAAGTGTGAAGGGGAAAGTGGTCATTGA
TGCGTTCCGCTCGATAAACCCGCAGACCATTATGCTTGGGCAGGAACCTCGTCAAACAAC
GTCGAACCTTGGGCATCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTGATTCATGGACTGAACAG
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GACACTAGGCACCATGCTCGACACTGTTGTCTTCTAGAGAACTTGTTCACTTTACCAGCT
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TTTGTTTCTGTTGAATCAACTCTTTATGACTTATCTCCTAGCAAGCATCTGATAAGATTG
TATTGTACCAAGTGGTTTCGTTCTTTTCATCAAGGCTATGGATTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4H405TF U 1
AF RR4AM41TF U 9
AF RR4B070JQ C 394
AF RR4AM41JQ C 478
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AGCTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGCGCCGGTGGCGGTCTAGGTCACGC
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DS 

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GG
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QA 3 820 3 820
DS 

RD RR4B070JQ 797 0 0
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CTAGAGAGCTTGTTCACTTTACCAGCTAGGAGTACTCTGCTTCAGTCATTTTGGCTGGAA
AGTTAAGCTTCGTTCTTCTGCATCTCTTTTGTTTCTGTTGAATCAACTCTTTATGACTTA
TCTCCTAGCAAGC*TCTGATAAGATTGTATTGTACCAAGTGGTTTCGTTCTTTTCATCAA
GGCTATGGATTGATT
CC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4AM41JQ 714 0 0
CCAGCGAGCCGTGGCGGTGGTGGTTGATCCCATTCAAAGTGTGAAGGGGAAAGTGGTCAT
TGATGCGTTCCGCTCGATAAACCCGCAGACCATTATGCTTGGGCAGGAACCTCGTCAAAC
AACGTCGAACCTTGGGCATCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTGATTCATGGACTGAA
CAGACACTACTATTCAATAGCCATCAACTATAGGAAGAACGAGCTCGAGGAGAAGATGTT
ACTAAACCTCCACAAGAAGAAATGGACAGATGGTCTGACGCTAAGACGCTTTGACACCCA
CTCCAAGACAAACGAACAGACGGTTCAGGAAATGTTGAACTTGGCTGCTAAATATAACAA
GGCGGTACAAGAGGAGGACGAGTTGTCACCGGAAAAACTGGCGATCGTGAATGTGGGAAG
ACAGGACGCAAAGAAGCATCTGGAAGAACATGTTTCCAACTTGATGTCATCCAACATTGT
TCAGACACTAGGCACCATGCTCGACACTGTTGTCTTCTAGAGAACTTGTTCACTTTACCA
GCTAGGAGTACTCTGCTTCAGTCATTTTGGCTGGAAAGTTAAGCTTCGTTCTTCTGCATC
TCTTTTGTTTCTGTTGAATCAACTCTTTATGACTTATCTCCTAGCAAGCATCTGATAAGA
TTGTATTGTACCAAGTGGTTTCGTTCTTTTCATCGAGGCTATGGATTGATTTCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL2178Contig1 918 4 7 U
GGACGATTCTTCCGTTCAGAAGAGAGATTTATATATAAAGAAAAAGTCAGTTTCAATTGC
TTGTCTGTGTTTCGGTTCTGTCTGAACGGCCATTCATCATCATCGTCGTCTCCATTACTC
CATTAAACCTTTTTCTCGAATCATTACTTGCTTGTGAACGATGAGAAGCCAACAGAGAGA
TCAAGACTCGAGGGCTTTCTACGATCTCTCGGCTCTTGTCCTGAGCCTCCTCCGCTCTCC
TCCCGTCCCGATTTCTCTCCCCGATCATCATCATCACTTCCCGGATTCGCCGATGATGAT
GAGAAGTCCGCAGCATCGGCCGCTTTCGATGGCGCATATAACTCCCTCCGGATTCGCGTC
GCTGCTGCTGGGTATATCGGTGGCTCTGATGCTCTGTGGATCTGTGACTTTCTTCATCGG
CTTCCTCTTGCTGCCGTGGGTCCTGGCTCTCATCGTGGTTCTTTATGTTGCTGGGATCGT
GTCTCTCATTTCCATGGCTGGGAGGTCCATCCTCTCTTACCTCTTGACGCCGCCTCCTTC
TTTTTCATCCATGAAGGAGATTTCTGAATGGAAGCTGTTGTGAAGCGTGACGAACAAACT
TCTTGAAATGGCTCTCCTTTGTTAATCCGGAAGCAGAGGACAAAGAAGATGGATTAATTA
TATCAACGCAAAATCCAATTAGAGTTTTTCTATATATGTTCTTTTATCTGTATTTTGGGG
GGGGGGTGGGGATTATGTGTGGATATATTTGGGAGTTACTATAGATTTTTTTTTACTTTC
TAAAAAATATTTTCTATTTTATTGTTAGAGAAATGGGAAAAGCCTGAGTTTGTGCTTTTT
TCCATGGATGGTTTTATTGTTATGTGACATTATTTATTCTAGAAAAAATAATCATACAAA
AGATTATAGGATTTCGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CA30TF U 1
AF RR4CW48TF U 1
AF RR4DQ35JQ C 242
AF RR4GU26TF U 786
BS 1 688 RR4CA30TF
BS 689 689 RR4DQ35JQ
BS 690 704 RR4CA30TF
BS 705 785 RR4DQ35JQ
BS 786 878 RR4GU26TF
BS 879 879 RR4DQ35JQ
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RD RR4CA30TF 708 0 0
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ATCT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4CW48TF 683 0 0
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CATTAAACCTTTTTCTCGAATCATTACTTGCTTGTGAACGATGAGAAGCCAACAGAGAGA
TCAAGACTCGAGGGCTTTCTACGATCTCTCGGCTCTTGTCCTGAGCCTCCTCCGCTCTCC
TCCCGTCCCGATTTCTCTCCCCGATCATCATCATCACTTCCCGGATTCGCCGATGATGAT
GAGAAGTCCGCAGCATCGGCCGCTTTCGATGGCGCATATAACTCCCTCCGGATTCGCGTC
GCTGCTGCTGGGTATATCGGTGGCTCTGATGCTCTGTGGATCTGTGACTTTCTTCATCGG
CTTCCTCTTGCTGCCGTGGGTCCTGGCTCTCATCGTGGTTCTTTATGTTGCTGGGATCGT
GTCTCTCATTTCCATGGCTGGGAGGTCCATCCTCTCTTACCTCTTGACGCCGCCTCCTTC
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TCTTGAAATGGCTCTCCTTTGTTAATCCGGAAGCAGAGGACAAAGAAGATGGATTAATTA
TATCAACGCAAAATCCAATTAGA

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DS 

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CTTGAAATGGCTCTCCTTTGTTAATCCGGAAGCAGAGGACAAAGAAGATGGATTAATTAT
ATCAACGCAAAATCCAATTAGAGTTTTTCTATATATGTTCTTTTATCTGTATTTTGGGGG
GGGGGTGGGGATTATGTGTGGATATATTTGGGAGTTACTATAGATTTTTTTTTACTTTCT
AAAAAATATTTTCTATTTTATTGTTAGAGAAATGGGAAAAGCCTGAGTTTGTGCTTTTTT
CCATGGATGGTTTTATTGTTATGTGACATTATTTATTCTAGAAAAAATAATCATACAAAA
GATTATAG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GU26TF 133 0 0
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GGATGGTTTTATTGTTATGTGACATTATTTATTTTAGAAAAAATAATCATACAAAAGATT
ATAGGATTTCGAC

QA 1 133 1 133
DS 



AS 1 5

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GTGGAAGCAATCCATCACCACTGTGCTTGCTCAGGCAGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGT
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GATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACA
AGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAA*GGAGC
TGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAAAAACAAGAAGAAGGAACTTTTTGTCT
TTTGGAATTTACCCCAAAACAAAAACAAAAGGATCTAATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTT
TTCGGTAACATCTGACGAATAAAGATTATGTTCTCTTGTCTGTACTTTCTGTACTTTCTG
TACTTGAGTTGAGAGACCCCCAAATAAGCATTTGGGGTATGTTTGATTGTTGTATGGACA
AAATAATTATTTTCTTTTTGGGAATGGTAATGTATTTGCTGTTTGCTC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B309TF U 1
AF RR4B310TF U 1
AF RR4DK20TF U 240
AF RR4B309JQ C 395
AF RR4B310JQ C 395
BS 1 714 RR4B309TF
BS 715 715 RR4B310TF
BS 716 750 RR4B309TF
BS 751 756 RR4DK20TF
BS 757 757 RR4B309JQ
BS 758 839 RR4DK20TF
BS 840 840 RR4B309JQ
BS 841 918 RR4DK20TF
BS 919 919 RR4B309JQ
BS 920 981 RR4DK20TF
BS 982 1008 RR4B309JQ

RD RR4B309TF 750 0 0
GGGTTGAGCAATACTATGGCAAAAAGTTCGAGGCTCCCCGTGATTTGCCAGAGTGGGAGT
TCAAAAGCTATTTGGGATGGCACGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATG
TAGACAGTGGACGTTTGGTGGTAACATGAAGAAGACGCTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTA
CAAACTCGATGTTCGTATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGA
GTGGAAGCAATCCATCACCACTGTGCTTGCTCAGGCAGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGT
AGACCTTCTCAACCAAACCGCAATGGCTTGTCCGGCTTTTCCTTTATGCCCTCTAGCTAT
AACCGAGGCAGAGCGTGGGATTCCAAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAA
GGTTGGTCTTGAGTATGAGGAATCCGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATG
TGCTAGACCGTACATGGCTGAAGTGGGTCTAGTCGGAGATGGTCCCAACAGCTATCAGGT
TTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGATAGCGAGGGCGTTCATGGACAAGGTGAA
GATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACA
AGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAAAGGAGC
TGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4B310TF 750 0 0
GGGTTGAGCAATACTATGGCAAAAAGTTCGAGGCTCCCCGTGATTTGCCAGAGTGGGAGT
TCAAAAGCTATTTGGGATGGCACGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATG
TAGACAGTGGACGTTTGGTGGTAACATGAAGAAGACGCTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTA
CAAACTCGATGTTCGTATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGA
GTGGAAGCAATCCATCACCACTGTGCTTGCTCAGGCAGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGT
AGACCTTCTCAACCAAACCGCAATGGCTTGTCCGGCTTTTCCTTTATGCCCTCTAGCTAT
AACCGAGGCAGAGCGTGGGATTCCAAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAA
GGTTGGTCTTGAGTATGAGGAATCCGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATG
TGCTAGACCGTACATGGCTGAAGTGGGTCTAGTCGGAGATGGTCCCAACAGCTATCAGGT
TTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGATAGCGAGGGCGTTCATGGACAAGGTGAA
GATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACA
AGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAA*GGAGC
TGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4DK20TF 742 0 0
G
GTGGAAGCAATCCATCACCACTGTGCTTGCTCAGGCAGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGT
AGACCCTCTCAACCAAACCGCAATGGCT*GTCCGGCTTTTCCTTTATGCCCTCTAGCTAT
AACCGAGGCAGAGCGTGGGATTCCAAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAA
GGTTGGTCTTGAGTATGAGGAATCCGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATG
TGCTAGACCGTACATGGCTGAAGTGGGTCTAGTCGGAGATGGTCCCAACAGCTATCAGGT
TTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGATAGCGAGGGCGTTCATGGACAAGGTGAA
TATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTTAGCCATTGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACA
AGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAA*GGA*C
TGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAAAA*CAAGAAGAAGGAACTTTTTGTCT
TTTGGAATTTACCCCAAAACAAAAACAAAAGGATCTAATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTC
TTCGGTAACATCTGACGAATAAAGATTATGTTCTCTTGTCTGTACTTTCTGTACTTTCTG
TACTTGAGTTGAGAGACCACCAAATAAGCATTTGGGGTATGTTTGATTGTTGTATGGACA
AAATAATTATTTTCTTTTTGG

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR4B309JQ 614 0 0
AAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTATGAGGAATCCGTTGTGGTG
AGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCGTACATGGCTGAAGTGGGTCTAGTC
GGAGATGGTCCCAACAGCTATCAGGTTTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGATA
GCGAGGGCGTTCATGGACAAGGTGAAGATTCAAGACTTAGAGAAGGTTTTTGAGCCATTG
TTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGT
ATGGGATTTGAGAAACTCAA*GGAGCTGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAA
AAACAAGAAGAAGGAACTTTTTGTCTTTTGGAATTTACCCCAAAACAAAAACAAAAGGAT
TTAATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTTTTCGGTAACATCTGACGAATAAAGATTATGTTCT
CTTGTCTGTACTTTCTGTACTTTCTGTACTTGAGTTGAGAGACCCCCAAATAAGCATTTG
GGGTATGTTTGATTGTTGTATGGACAAAATAATTATTTTCTTTTTGGGAATGGTAATGTA
TTTGCTGTTTGCTC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4B310JQ 614 0 0
AAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTATGAGGAATCCGTTGTGGTG
AGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCGTACATGGCTGAAGTGGGTCTAGTC
GGAGATGGTCCCAACAGCTATCAGGTTTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGATA
GCGAGGGCGTTCATGGACAAGGTGAAGATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTG
TTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGT
ATGGGATTTGAGAAACTCAA*GGAGCTGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAA
AAACAAGAAGAAGGAACTTTTTGTCTTTTGGAATTTACCCCAAAACAAAAACAAAAGGAT
CTAATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTTTTCGGTAACATTTGACGAATAAAGATTATGTTCT
CTTGTCTGTACTTTCTGTACTTTCTGTACTTGAGTTGAGAGACCCCCAAATAAGCATTTG
GGGTATGTTTGATTGTTGTATGGACAAAATAATTATTTTCTTTTTGGGAATGGTAATGTA
TTTGCTGTTTGCTC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 5

CO CL2180Contig1 946 5 19 U
GGGTCTTCTTCAAGCTAATAACGAAAGTCGTCAGAAAACTCTCGTCTCCACAACGCTCTC
CCGATAAGACTCAACACCACCACTACTTTCTTCCTCGCTCCCTCTCCGCGATGTCAGAGC
ACCAGTCGGAAGAAATCCAGCAGATCGAGAAGCTCTACGAGTTCAGCGAGCGGCTCAACG
CCTCCAAGGACAAGTCCCAGAATGTAGAGGATTACGAGGGGATAATCAAGATGGCGAAGA
CGAGTATGAAGGCGAAGCAGCTTGCGTCGCAGTTGATCCCTCGCTACTTCAAGTTCTTCC
CCACTCTCTCTGACCAGGCTTTCGATGCTCATATGGACTGTATCGATGAGGAGAATCTTG
GGGTTCGGGTTCAAGCCATTCGTGGACTCCCACTCTTCTGCAAGGATACTCCAGATATTA
TATCCAAGATTGTTGATGTTCTTGGGCAACTTCTTAATTCTGAGGAAACTGTGGAGCGGG
ATGCTGTGCATAAGGCTCTGATGTCACTGATACGACAGGATCCAAAAGCATCTTTGACTG
CACTGTTTACGCATGCTGGAGTAACTCCAACTACGGACGATCAGATTCGTGAAAAGGTCT
TGAATTTCATCAGAGATAAGGTGTTTCCTCTTAAAGGGGAACTTTTAAAGCCTCAAGAGG
AAATGGAAAGACATATAACAGATTTGATCAAACAGAGCCTAGAAGATGTAACTGGAGGAG
AATTTAAAATGTTTATGGATT*CCTGACAAGTTTGAGTATATTTGGAGGGAAAGCTCCTC
AAGAAAGAATGCAAGAACTTGTGGAAATTATCGAAGGGCAGGCCGATTTGGACGCACAGT
TTGATGTATTGCATTGTAGAAATTTATTTAAGCTTGTTATGTCACATCATCCTGAAGATG
AAGTTAAATTTCCTGTTTCATGAAATGATAGTCCTTGTGCTGTGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H747TF U 15
AF RR4BO13TF U 1
AF RR4FG14TF U 1
AF RR4G243TF U 19
AF RR4H747JQB C 401
BS 1 164 RR4BO13TF
BS 165 167 RR4FG14TF
BS 168 180 RR4BO13TF
BS 181 181 RR4FG14TF
BS 182 211 RR4BO13TF
BS 212 212 RR4FG14TF
BS 213 359 RR4BO13TF
BS 360 360 RR4FG14TF
BS 361 568 RR4BO13TF
BS 569 569 RR4FG14TF
BS 570 728 RR4BO13TF
BS 729 729 RR4G243TF
BS 730 749 RR4FG14TF
BS 750 750 RR4G243TF
BS 751 786 RR4FG14TF
BS 787 788 RR4G243TF
BS 789 789 RR4H747JQB
BS 790 804 RR4G243TF
BS 805 946 RR4H747JQB

RD RR4H747TF 602 0 0
GGAAT
AACGAAAGTCGTCAGAAAACTCTCGTCTCCACAACGCTCTCCCGATAAGACTCAACACCA
CCACTACTTTCTTCCTCGCTCCCTCTCCGCGATGTCAGAGCACCAGTCGGAAGAAATCCA
GCAGATCGAGAAGCTCTACGAGTTCAGCGAGCGGCTCAACGCCTCCAAGGACAAGTCCCA
GAATGTAGAGGATTACGAGGGGATAATCAAGATGGCGAAGACGAGTATGAAGGCGAAGCA
GCTTGCGTCGCAGTTGATCCCTCGCTACTTCAAGTTCTTCCCCACTCTCTCTGACCAGGC
TTTCGATGCTCATATGGACTGTATCGATGAGGAGAATCTTGGGGTTCGGGTTCAAGCCAT
TCGTGGACTCCCACTCTTCTGCAAGGATACTCCAGATATTATATCCAAGATTGTTGATGT
TCTTGGGCAACTTCTTAATTCTGAGGAAACTGTGGAGCGGGATGCTGTGCATAAGGCTCT
GATGTCACTGATACGACAGGATCCAAAAGCATCTTTGACTGCACTGTTTACGCATGCTGG
AGTAACTCCAACTACGGACGATCAGATTCGTGAAAAGGTCTTGAATTTCATCAGAGA

QA 6 602 6 602
DS 

RD RR4BO13TF 736 0 0
GGGTCTTCTTCAAGCTAATAACGAAAGTCGTCAGAAAACTCTCGTCTCCACAACGCTCTC
CCGATAAGACTCAACACCACCACTACTTTCTTCCTCGCTCCCTCTCCGCGATGTCAGAGC
ACCAGTCGGAAGAAATCCAGCAGATCGAGAAGCTCTACGAGTTC***GAGCGGCTCAACG
TCTCCAAGGACAAGTCCCAGAATGTAGAGGACTACGAGGGGATAATCAAGATGGCGAAGA
CGAGTATGAAGGCGAAGCAGCTTGCGTCGCAGTTGATCCCTCGCTACTTCAAGTTCTTCC
CCACTCTCTCTGACCAGGCTTTCGATGCTCATATGGACTGTATCGATGAGGAGAATCTTT
GGGTTCGGGTTCAAGCCATTCGTGGACTCCCACTCTTCTGCAAGGATACTCCAGATATTA
TATCCAAGATTGTTGATGTTCTTGGGCAACTTCTTAATTCTGAGGAAACTGTGGAGCGGG
ATGCTGTGCATAAGGCTCTGATGTCACTGATACGACAGGATCCAAAAGCATCTTTGACTG
CACTGTTTACGCATGCTGGAGTAACTCCGACTACGGACGATCAGATTCGTGAAAAGGTCT
TGAATTTCATCAGAGATAAGGTGTTTCCTCTTAAAGGGGAACTTTTAAAGCCTCAAGAGG
AAATGGAAAGACATATAACAGATTTGATCAAACAGAGCCTAGAAGATGTAACTGGAGGAG
AATTTAAA
ATGTTTAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4FG14TF 788 0 0
GGGTCTTCTTCAAGCTAATAACGAAAGTCGTCAGAAAACTCTCGTCTCCACAACGCTCTC
CCGATAAGACTCAACACCACCACTACTTTCTTCCTCGCTCCCTCTCCGCGATGTCAGAGC
ACCAGTCGGAAGAAATCCAGCAGATCGAGAAGCTCTACGAGTTCAGCGAGCGGCTCAACG
CCTCCAAGGACAAGTCCCAGAATGTAGAGGATTACGAGGGGATAATCAAGATGGCGAAGA
CGAGTATGAAGGCGAAGCAGCTTGCGTCGCAGTTGATCCCTCGCTACTTCAAGTTCTTCC
CCACTCTCTCTGACCAGGCTTTCGATGCTCATATGGACTGTATCGATGAGGAGAATCTTG
GGGTTCGGGTTCAAGCCATTCGTGGACTCCCACTCTTCTGCAAGGATACTCCAGATATTA
TATCCAAGATTGTTGATGTTCTTGGGCAACTTCTTAATTCTGAGGAAACTGTGGAGCGGG
ATGCTGTGCATAAGGCTCTGATGTCACTGATACGACAGGATCCAAAAGCATCTTTGACTG
CACTGTTTACGCATGCTGGAGTAACTCCAACTACGGACGATCAGATTCGTGAAAAGGTCT
TGAATTTCATCAGAGATAAGGTGTTTCCTCTTAAAGGGGAACTTTTAAAGCCTCAAGAGG
AAATGGAAAGACATATAACAGATTTGATCAA*CAGAGCCTAGAAGACGTAACTGGAGGAG
AATTTAAA*TGTTTATGGATT*CCTGACA*GTTTGAGTATATTTGGAGGGAAAGCTCCTC
AAGAAA
AA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4G243TF 786 0 0
G
AACGAAAGTAGTCAGAAAACTCTCGTCTCCACAACGCTCTCCCGATAAGACTCAACACCA
CCACTACTTTCTTCCTCGCTCCCTCTCCGCGATGTCAGAGCACCAGTCGGAAGAAATCCA
GCAGATCGAGAATCTCTACGAGTTCAGCGAGCGGCTCAACGCCTCCAAGGACAAGTCCCA
GAATGTAGAGGATTACGAGGGGATAATCAAGATGGCGAAGACGAGTATGAAGGCGAAGCA
GCTTGCGTCGCAGTTGATCCCTCGCTACTTCAAGTTCTTCCCCACTCTCTCTGACCAGGC
TTTCGATGCTCATATGGACTGTATCGATTAGGAGAATCTTGGGGTTCGGGTTCAAGCCAT
TCGTGGACTCCCACTCTTCTGCAAGGATACTCCAGATATTATATCCAAGATTGTTGATGT
TCTTGGGCAACTTCTTAATTCTGAGGAAACTGTGGAGCGGGATGCTGTGCATAAGGCTCT
GATGTCACTGATACGACAGGATCCAAAAGCATCTTTGACTGCACTGTTTACGCATGCTGG
AGTAACTCCAACTACGGACGATCAGATTCGTGAAAAGGTCTTGAATTTCAT*AGAGATAA
GGTGTTTCCTCTTAAAGGGGAACTTTTAAAGCCTCAAGAGGAAATGGAAAGACATATAAC
AGATTTGATCAAACAGAGCCTAGAAGATGTAACTGGAGGAGAATTTAAAATGTTTATGGA
TT*CCTGACAAGTTTGAGTATATTTGGAGGGAAAGCTCCTCAAGAAAGA*TGCAAGAACT
TGTGG

QA 2 786 2 786
DS 

RD RR4H747JQB 546 0 0
CAAGGATACTCCAGATATTATATCCAAGATTGTTGATGTTCTTGGGCAACTTCTTAATTC
TGAGGAAACTGTGGAGCGGGATGCTGTGCATAAGGCTCTGATGTCACTGATACGACAGGA
TCCAAAAGCATCTTTGACTGCACTGTTTACGCATGCTGGAGTAACTCCAACTACGGACGA
TCAGATTCGTGAAAAGGTCTTGAATTTCATCAGAGATAAGGTGTTTCCTCTTAAAGGGGA
ACTTTTAAAGCCTCGAGAGGAAATGGAAAGACATATAACAGATTTGATCAAACAGAGCCT
AGAAGATGTAACTGGAGGAGAATTTAAAATGTTTATGGATTTCCTGACAAGTTTGAGTAT
ATTTGGAGGGAAAGCTCCTCAAGAAAGAATGCAAGAACTTGTGGAAATTATCGAAGGGCA
GGCCGATTTGGACGCACAGTTTGATGTATTGCATTGTAGAAATTTATTTAAGCTTGTTAT
GTCACATCATCCTGAAGATGAAGTTAAATTTCCTGTTTCATGAAATGATAGTCCTTGTGC
TGTGGT

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 5

CO CL2181Contig1 415 5 2 U
GGAACCATCAAACTATCAAGTTTAAATTCAAAAGAAGTAACAATATCACGAATAACAATA
TGTCGTCATCACAGTTTGCTATATTTTGCATAATCTTGATTGCTTTATTTCCTCTTCACG
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 10 

AF RR4B519JQ C 1
AF RR4B534JQ C 1
AF RR4B519TF U 1
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AF RR4GI85TF U 1
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GCAATAAAGGCGAAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTCTTCCTCCTGTGGGAGATGCATTTAAT
AGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAAGGCACC
CGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTAGCAAACAAGTATGGAGCTGATATCACAGTT
GTCGTCATAGACGAAGAAAAGAGAGAATCATCCTCGGAGCACGAGACTCAAGTCTCCAAC
ATCCGGTGGCATCTAGCACAAGGTGGTTTCCAGGAGTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTGGG
GAAGGGAAAAAGGCCACTGCGGTAATAGGAGAGGTGGCCGATGAACTGGGGACAGAGCTG
GTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGCCAATTTACTTGCTGAG
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GTTCTGTGTGTGGTTGTTTTTCCGTATCCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C122TF U 1
AF RR4DI87TF U 33
AF RR4C279TF U 321
AF RR4DI87JQ C 106
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BS 200 201 RR4DI87TF
BS 202 223 RR4C122TF
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BS 779 872 RR4DI87JQ

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TCGCGTCGAGTCCCAATGGCGACTCTTCACTCCCACGCCGCCGTTTCTGTTATCGCTACG
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GAAGGGAAA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4DI87TF 706 0 0
GG
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CTTGTACATCTACTCTCCATCTGCGATTTAAACCCCGCGAGCTCT**ATATTCCAAAACC
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TTCCTCCTGTGGGAGATGCATTTAATAGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATC
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ACAAGTATGGAGCTGATATCACAGTTGTCGTCATAGACGAAGAAAAGAGAGAATCATCCT
CGGAGCACGAGACTCAAGTCTCCAACATCCGGTGGCATCTAGCACAAGGTGGTTTCCAGG
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TCATCGACGCCAATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTAT
GAATCCAAATATTTGCTCGTCTTGTCCTTCCCAATCGTTTTTTT

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR4C279TF 458 0 0
GCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAAGGCACCCGACAGGCTGCTGCTACAAC
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TTTTT*ATGTAT*GTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACT

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DS 

RD RR4DI87JQ 767 0 0
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GGAGATGCATTTAATAGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTAT
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TTGGAGAGGCTTGGGGAAGGGAAAAAGGCCACTGCGGTAATAGGAGAGGTGGCCGATGAA
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AATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCAAATA
TTTGCTCGTCTTGTCCTTCCCAATCGTTTTTTTTCTTTTTTATGTATTGTCTGGGGAACG
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GTATTTATTATGATGGTTCTGTGTGTGGTTGTTTTTCCGTATCCGCC

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DS 



AS 1 4

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ATGTACACCAAAGCAAACCAATGATCTTCCATTTCATTCAATTTACAAACCACTAAAAAG
GCTTTTCTCATTAAAGTTTCTCCGGATTAGGAGTTAGACAGTCCTTCGGCCTGGGTCCGA
AAGTAATCATTAAACACTTCACTACTAAAACTATGAAACCATGGTATGGAGATGACAGGT
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TGACCATCATCATCAGGTGAAGTAGTAAAAGCTTCCCAAAGGGGACCCCAATATTCAACT
ATGTTGAACTCATCGACACTGGAATGGAAATAAACCCAAACAGGAGCTTCTTGTAACTCT
GGATGGTTGTTCAACAAGTTCCCATCTCCATGAACTATAGCCTTCAACACAACTGGTAAC
TCTTTGCAAAAGATGTAGTATCGAAACTTTGCGAATAAATCTAAAAGGATATGTCCACCG
CTGATATGACAGTGAACGTGAAGCGACATTTTGCCTTTCACTTGCTTCCACTCTGCTACC
ACTTCATCTCTGTATAGCTTATTTGCCCACCCTTGCAACTGAGAATAGTTAATGGAGTGA
GAGATAGCTAAAGTTAGTTTAGCAGTAATGTCACTGTGAGTGAGGGTGTAAGTTCTTGGG
AGCGTTGGTGGATGATGCTTCTTCTCATCAACCCCTACAAACAATACTGTCAACTTGGAT
GATTCGAAGATCGCTGGTCCAAACAATCTTGTCATGGGAACAATGCATTGGTTATTCTTC
CTCTTGATCTTCCATTCGAGACAAGGAGTGAGTTGCTCCGTTTGTCTGAATAACCAGGTT
TGAGCCTTGTCGGTAACAGTAGATTGGCCGACAAACTCCACATTTCAGAACTGAACACAG
AGAGAGAGACCCTTTTGCGAGGCTTGAGGAACCAGATCTCACACACGATACTCTAGCTGC
CTTCGTACAATGAAACCCAAATCGAAAGCTTGTGACTTTGAAAAAAACCAACTCGAGATT
TTCACTCTTCAGGTTCTTCTTTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 



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BQ
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BS 729 735 RR4GE70TF
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BS 805 805 RR4GU83TF
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BS 898 912 RR4GE70TF

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GTCATCTCTTGTGCCGGGTCCGTATGAATCGACCCTAAAGATGATATCGCCGTGACAGTC

QA 1 120 1 120
DS 

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AAAACAGTTTCTGTATATATCATAAAATTAGTTGACAAAATAAACTTGTAAAATATCACA
TATAGTCAACAAATTTATAGAGACAGGCTATATAATATGCAACGTAACAACTTTGTGTTT
TTACACATAATGATACACAAACAGCTTCAAATGTCCTCTACAAAAGGGTGCACCTGTTCA
TCACCAATCTCAACTGGATCATCACCGTTAATTTGGTCAAGCACAAGGACCAAACCCATC
GCGAAAGCGCCGTCGAAACCAGGTTTAATCTCTAGAGTGAACACATCACGTCCAAGCATC
ACGTTCGTTGACGCGTCCACTTTGCGTTTGATCTCAGCCACAGTTCGCTTCTTCGTGTCG
TATATGAAACAGCTTCGTTGCGAGAAGTCACCATCTATGGTGTACTCTTCTCCGGTTTCG
TCGTAAACCTCTACTTCCATCGTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACACTGAAG
ATCGGTTTCTGGCCATCTGATCTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGAAGAGTC
GGCCTCTTTCGTTTAACGGTGAGGAGACAGTTACCGGTGACGTCCATGAGGACAAACTCA
TCGTCATCTCTTGTGCCGGGTCCGTATGAATCGACCCTAAAGATGA

QA 1 646 1 646
DS 

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AGTTTCTGTATATATCATAAAATTAGTTGACAAAATAAACTTGTAAAATATCACATATAG
TCAACAAATTTATAGAGACAGGCTATATAATATGCAACGTAACAACTTTGTGTTTTTACA
CATAATGATACACAAACAGCTTCAAATGTCCTCTACAAAAGGGTGCACCTGTTCATCACC
AATCTCAACTGGATCATCACCGTTAATTTGGTCAAGCACAAGGACCAAACCCATCGCGAA
AGCGCCGTCGAAACCAGGTTTAATCTCTAGAGTGAACACATCACGTCCAAGCATCACGTT
CGTTGACGCGTCCACTTTGCGTTTGATCTCAGCCACAGTTCGCTTCTTCGTGTCGTATAT
GAAACAGCTTCGTTGCGAGAAGTCACCATCTATGGTGTACTCTTCTCCGGTTTCGTCGTA
AACCTCTACTTCCATCGTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACACTGAAGATCGG
TTTCTGGCCATCTGATCTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGAAGAGTCGGCCT
CTTTCGTTTAACGGTGAGGAGACAGTTACCGGTGACGTCCATGAGGACAAACTCATCGTC
ATCTCTTGTGCCGGGTCCGTATGAATCGACCCTAAAGATGATATCGCCGTGACAGTCGTA
GGCGGCGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4GE70TF 680 0 0
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ATCGCGAAAGCGCCGTCGAAACCAGGTTTAATCTCTAGAGTGAACACATCACGTCCAAGC
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TCGTATATGAGACAGCTTCGTTGCGAGAAGTCACCATCTATGGTGTACTCTTCTCCGGTT
TCGTCGTAAACCTCTACTTCCATCGTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACACTG
AAGATCGGTTTCTGGCCATCTGATCTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGAAGA
GTCGGCCTCTTTCGTTTAACGGTGAGGAGACAGTTACCGGTGACGTCCATGAGGACAAAC
TCATCGTCATCTCTTGTGCCGGGTCCGTATGAATCGACCCTAAAGATGATATCGCCGTGA
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GGTTTGTCTTCTTCGTAGAGAAAAGCTTTGTCGACCACAACTCTTTTTTCACCCATCTCT
TCAACTAATTCCATTCTTTTTTTCCTTTGGTGGAAGTTAGATTTTGTGGTTTGATTAACG
AATGGTTATGATATGGACCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GU83TF 680 0 0
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ATCGCGAAAGCGCCGTCGAAACCAGGTTTAATCTCTAGAGTGAACACATCACGTCCAAGC
ATCACGTTCGTTGACGCGTCCACTTTGCGTTTGATCTCAGCCACAGTTCGCTTCTTCGTG
TCGTATATGAGACAGCTTCGTTGCGAGAAGTCACCATCTATGGTGTACTCTTCTCCGGTT
TCGTCGTAAACCTCTACTTCCATCGTGCACCGTCCGATTATCGACGATCTCCGGACACTG
AAGATCGGTTTCTGGCCATCTGATCTCTCCCCGAGAAAACCTTCCCATCTCTGGTGAAGA
GTCGGCCTCTTTCGTTTAACGGTGAGGAGACAGTTACCGGTGACGTCCATGAGGACAAAC
TCATCGTCATCTCTTGTGCCGGGTCCGTATGAATCGACCCTAAAGATGATATCGCCGTGA
CAGTCGTAGGCGGCGAAACCATCACCGGTGTGGAACAGAGAGGTTTTGCAGACGGTAAGT
GGTTTGTCTTCTTCGTAGAGAAAAGCTTTGTCAACCACAACTCTTTTTTCACCCATCTCT
TCAACTAATTCCATTCTTTTTTTCCTTTGGTGGAAGTTAGATTTTGTGGTTTGATTAACG
AATGATTATGATATGGACCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 5

CO CL2185Contig1 889 5 42 U
ATAGTAAGTTCATAGAGTGCATACAATCATATCATGCCTTCCTTCATAAGTTCATATAGT
GTATATAATTTTGAAACCATCAACAAGGTACAGAGCACTCTGTTTCTTTGGATCCTTAAA
GCGCAAACACAACATTTTTGCTTTCTCGTCTCTTTATTTCAAAGCCAAAATGCTACAGTG
GTACAGTACAGTCTATATATATACTTACATAAAGCCTGCATCAGTTTAGATTGCAGCTTC
TGCGGACCCTTCAGGCTTCTCCACTTGCTTCTTCAGGAACTCCAGCACAGAGATACGTCG
TTGCTCGAGAGCAGCAAAATCTTCAGAGTCGAGTTTCAAAGATTCCAGCAGTTTCATGCC
TTCCTTGAAACCATCTGTGGCTGCATCTTCATTTTGCAGAGCCCTGTCTATATCTGCAAC
TTTGGCTAAGGAAACCGCCACATCCAGAATTTGTGAAGGAGCATTTGGGTGATGCTTCAT
TGCATCGCGTCTAACATTTAAAGCACGGCAGTAATACGACCTTGCAGCTTCTAGGTCTTG
GCCATAATACTTGAGATCTCCTATTTTATTGAGCGATACAGAAAGTGTGTGTGTAATCTC
CAAATCATCCATCGGCAGTTTCATAAGGAACTCAATACTCTCTTCGAAATGATTGACTGC
AGAGCTTGAGTCTCCCATTGCTCGGCTGCAGTCGCCGAGCATACCAAGGACTGCACCAAG
CTGTGAACATAACTCTGGTGTATTGCCCTCCCTCCTTAGTTGATCCCGAATGTCCTCGGT
ACACATCGCCAATCTTGACTTTGCACTTTCGTAGTTCTGAGCTTGGAATGCCCTCATAGC
TTGTTGCACCAAGAAAGACCTCTCTCATGGAAACATCAGCGTAAATCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F627JQ U 1
AF RR4EZ94JQ U 1
AF RR4E107TF C 135
AF RR4E659JQ U 46
AF RR4HA23JQB U 46
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BS 93 93 RR4E659JQ
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BS 174 174 RR4E659JQ
BS 175 212 RR4EZ94JQ
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BS 214 243 RR4EZ94JQ
BS 244 244 RR4E659JQ
BS 245 247 RR4EZ94JQ
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BS 250 276 RR4EZ94JQ
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BS 287 322 RR4EZ94JQ
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BS 731 744 RR4EZ94JQ
BS 745 745 RR4E659JQ
BS 746 756 RR4EZ94JQ
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BS 766 766 RR4E659JQ
BS 767 777 RR4EZ94JQ
BS 778 889 RR4E659JQ

RD RR4F627JQ 644 0 0
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TCTGGCTAAGGAAACCGCCACATCCAGAATTTGTGAAGGAGCATTTGGGTGATGCTTCAT
TGCATCGCGTCTAACATTTAAAGCACGGCAGTAATACGACCTTGCAGCTTCTAGGTCTTG
GCCATAATACTTGAGATCTCCTATTTTATTGAGCGATACAGAAAGTGTATGTGTAATCTC
CAAATCATCCATCGGCAGTTTCATAAGGAACTCAATACTCTCTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4EZ94JQ 788 0 0
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GTACAGTACAGTCTATATATATACTTACATAA*GCCTGCATCAGTTTAGATTGCAGCTTC
TGCAGACTGTTCAGGCTTCTCCACTTGCTTCTTCAGAAACTCCAGTACAGAGATACGTCG
TTGCTCGAGAGCAGCAAAATCTCCAGAGTCCAGTTTCAAAGATTCCAGTAGTTTCATGCC
TTCCTTGAAACCATCTGTGGCTGCCTCTTCATTTTGTAGAGCCCTGTCTATATCTGCAAC
TCTGGCTAAGGAAACCGCCACATCCAGAATTTGTGAAGGAGCATTTGGGTGATGCTTCAT
TGCATCGCGTCTAACATTTAAAGCACGGCAGTAATACGACCTTGCAGCTTCTAGGTCTTG
GCCATAATACTTGAGATCTCCTATTTTATTGAGCGATACAGAAAGTGTATGTGTAATCTC
CAAATCATCCATCGGCAGTTTCATAAGGAACTCAATACTCTCTTCGAAATGATTGACTGC
AGAGCTTGAGTCTCCCATTGCTCGGCTGCAGTCGCCGAGCATACCAAGGACTGCACCAAG
CTGCGAACACAACTCTGGTGTATTTCCCTCCCTCCTAAGTTGATCTCGAATGTCCTC
ACTACACATGG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4E107TF 638 0 0
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GCTTCTCCACTTGCTTCTTCAGGAACTCCAGCACAGAGATACGTCGTTGCTCGAGAGCAG
CAGAATCTTCAGAGTCGAGTTTCAAAGATTCCAGCAGTTTCATGCCTTCCTTGAAACCAT
CTGTGGCTGCATCTTCATTTTGCAGAGCCCTGTCTATATCTGCAACTTTGGCTAAGGAAA
CCGCCACATCCAGAATTTGTGAAGGAGCATTTGGGTGATGCTTCATTGCATCGCGTCTAA
CATTTAAAGCACGGCAGTAATACGACCTTGCAGCTTCTAGGTCTTGGCCATAATACTTGA
GATCTCCTATTTTATTGAGCGATACAGAAAGTGTGTGTGTAATCTCCAAATCATCCATCG
GCAGTTTCATAAGGAACTCAATACTCTCTTCGAAATGATTGACTGCAGAGCTTGAGTCTC
CCATTGCTCGGCTGCAGTCGCCGAGCATACCAAGGACTGCACCAAGCTGTGAACATAACT
CTGGTGTATTGCCCTCCCTCCTTAGTTGATCCCGAAT
C

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4E659JQ 844 0 0
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TCTGCGGACCCTTCAGGCTTCTCCACTTGCTTCTTCAGGAACTCCAGCACAGAGATACGT
CGTTGCTCGAGAGCAGCAAAATCTTCAGAGTCGAGTTTCAAAGATTCCAGCAGTTTCATG
CCTTCCTTGAAACCATCTGTGGCTGCATCTTCATTTTGCAGAGCCCTGTCTATATCTGCA
ACTTTGGCTAAGGGAACCGCCACATCCAGAATTTGTGAAGGAGCATTTGGGTGATGCTTC
ATTGCATCGCGTCTAACATTTAAAGCACGGCAGTAATACGACCTTGCAGCTTCTAGGTCT
TGGCCATAATACTTGAGATCTCCTATTTTATTGAGCGATACAGAAAGTGTGTGTGTAATC
TCCAAATCATCCATCGGCAGTTTCATAAGGAACTCAATACTCTCTTCGAAATGATTGACT
GCAGAGCTTGAGTCTCCCATTGCTCGGCTGCAGTCGCCGAGCATACCAAGGACTGCACCA
AGCTGTGAACATAACTCTGGTGTATTGCCCTCCCTCCTTAGTTGATCCCGAATGTCCTCG
GTACACATCGCCAATCTTGACTTTGCACTTTCGTAGTTCTGAGCTTGGAATGCCCTCATA
GCTTGTTGCACCAAGAAAGACCTCTCTCATGGAAACATCAGCGTAAATCAC

QA 14 844 14 844
DS 

RD RR4HA23JQB 802 0 0
AAGTTCATAGAGT
GTGTATATAATTTTGAAACCATCA*CAAGGTATAGAGCACTCTGTTTCTTTGGATCCTTA
AAGCGCAAACACAACATTTTTGCTTTCTCGTCTCTTTATTTCAAAGCCAAAATGCTACAG
TGGTACAGTACAGTCTATATATATACTTACATAAAGCCTGCATCAGTTTAAATTGCAGCT
TCTGCGGACCCTTCAGGCTTCTCCACTTGCTTCTTCAGGAACTCCAGCACAGAGATACGT
CGTTGCTCGAGAGCAGCAAAATCTTCAAAGTCGAGTTTCAAAGATTCCAGCAGTTTCATG
CCTTCCTTGAAACCATCTGTGGCTGCATCTTCATTTTGCAAAGCCCTGTCTATATCTGCA
ACTTTGGCTAAGGAAACCGCCACATCCAGAATTTGTGAAGGAGCATTTGGGTGATGCTTC
ATTGCATCGCGACTAACATTTAAAGCACGGCAGTAATACGACCTTGCAGCTTCTAGGTCT
TGGCCATAATACTTGAGATCTCCTATTTTATTGAGCGATACAGAAAGTGTGTGTGTAATC
TCCAAATCATCCATCGGCAGTTTCATAAGGAACTCAATACTCTCTTCGAAATGATTGACT
GCAGAGCTTGAGTCTCCCATTGCTCGGCTGCAGTCGCCGAGCATACCAAGGACTGCACCA
AGCTGTGAACATAACTCTGGTGTATTGCCCTCCCTCCATAGTTGATCCCGAATGTCCTCG
GTACACATCGCCAATCTTGACTTTGCACTTTCGTAGTTCTGAGCTTGGAATGCCCTCATA
GCTTGTTGC

QA 14 802 14 802
DS 



AS 1 5

CO CL2186Contig1 863 5 13 U
GGACAACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAGCAATCAAAATGAAGA
AACCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTTTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACG
GCAAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCA
TCCAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGT
TTTGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCT
TCGGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACA
TCCAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACTAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCG
ATGTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACGGACGGCTC
CAAACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCT
CATATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCA
CCAATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCATGAAGGTTGATGATGATGCTACTA
AGGCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACT
AGTGTCAAGATCATGTAATTTAAAAAGCCTGAGACTCGTCCATGGCTAAAAATAATGGGT
TGAGATAATACCCGCACGCATGTGTGTGTATGTGAACTTTGTTTGATTTAATAACAAATC
AAATAAATTTGTGGTTTTCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FI95TF U 6
AF RR4AA87TF U 1
AF RR4AM29TF U 1
AF RR4AA87JQ C 67
AF RR4FI95JQ C 678
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BS 839 856 RR4AA87JQ
BS 857 863 RR4FI95JQ

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GG
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TTTGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCT
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ATGTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACGGACGGCTC
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ATGA

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CACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTCGGAT
ATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACATCCAGT
TCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACTAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGATGTTT
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GAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACCAATG
ATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCATGAAGGTTGATGATGATGCTACTAAGGCTA
CTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACTAGTGTC
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ATTTGTGGTT
AAAT

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TCAGCG

QA 1 186 1 186
DS 



AS 1 5

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GAGTCATGGTATGTATATAACTACGTACTTTTCAATGTAATATATGCAATAATTTGTGGC
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TGAATATAAATTTGAGCCAGCAG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GR90TF U 5
AF RR4EH81JQ C 1
AF RR4EH81TF U 1
AF RR4FN55TF U 5
AF RR4GR90JQ C 193
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GG
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QA 3 636 3 636
DS 

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GTGATGAATCTGAAAGATAAGAACGGGTCGAGCCCTTACGCTATAGCAAAGCAGATAGAG
GAGAAATACAAACCTGTACTCCCTGAGAATTTCCGTAAAACACTTTCTCTGCAGCTTAAA
AACTCTGTTGCTAAAGGTAAGCTCGTGAAGATCAGAGCCTCTTACAAGCTCTCAGAGACC
ACCACGAGGACGACGAGGCAGCAGCAGCAGAAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAG
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AATAGTTGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGTTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAGGATAAT
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TGT

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DS 

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GGAGAT
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AGAAAACCCAAAACCGCCACTCATCCTCCATACTTTCAGATGATAAAAGAGGCTGTGATG
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AAAAAAA

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DS 

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GG
AAGCACAAACAAAACAATCTTATCCCGCAAGTGTTCCCTCTAATGGCGTGAGAGAAAATA
AACGAATCTCCAACGGTGAAGAAAACTCCTATGGCATCAAAAGAGAAACCAAAGAAGCTT
AGAAAACCCAAAACCGCCACTCATCCTCCATACTTTCAGATGATAAAAGAGGCTGTGATG
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GTTGCTAAAGGTAAGCTCGTGAAGATCAGAGCCTCTTACAAGCTCTCAGAGACCACCACG
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AGCAAGCCGCCAGAGATGGTGACGAAGAAGAAGAGGACAGCAAAGAATCCAAGACAGCTT
AAGTCGATCAAGTCTCCAGGTTCTAAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTCTTGATGGACA
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TGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGTTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAG*ATAATGAGTCA
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TAGCCCTACG

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CGACTGCGGAGAGACCTTACCTACGTTCTTGTGTTACTATGTTTGCAGTGAATATAAATT
TGAGCCAGCAG

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DS 



AS 1 4

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TGATCTAGTTTCTCAAGGCTGGCTCTACTGTGTCAGGAGAGGGCAGGGTAGAACGCATAA
GCTTCCACACTTTGATTGGACAGGGCCACTAAAGCAATATCTCATATCTCCCAAGCGTAT
TGTGCCTTCTGAGATTGAAAAACCTGACTGGGCTATTGATGGAACTCCGAAAATTGAACC
AAATAGCGAGCTACAGCATACTGTTGAGATTAAAACGCCGGAGCAAATTCAGAGAATGCG
CGAGACCTGTAAAATTGCCAGGGAGGTATTGGATGCAGCCGCTAGGGTGATTCGCCCTGG
TGTGACAACTGATGAGATTGATCGAGTGGTTCATGAAGCAACAATTGCACGAGGAGGATA
CCCATCACCCCTCAACTACTACTTCTTTCCAAAATCTTGCTGCACATCTGTTAATGAAGT
GATTTGTCATGGAATCCCAGATGCTAGGAAACTAGAAGATGGGGATATAGTGAATGTTGA
TGTAACAGTCTGTTATAAAGGTTGCCATGGTGACCTTAATGAGACATACTTTGTTGGAAA
TGTTGACGAAGCATCACGTCAACTGGTTAAGTGCACATATGAGTGCCTTGAGAAAGCCAT
AGCAATTGTTAAACCTGGAGTTAGATTCCGCTCCTAACATTCCACACTATGCAAGAAACA
AAGCAGTTGGAGTGATGAAAGCAGGCCAGACTTTCACAATCGAGCCAATGATCAACGCAG
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GCAGTGCTCAGTTTGAGCATACCCTCTTGGTAACGGAGACAGGTGTTGAGGTTTTAACGG
GGAGGCTTCCTTCATCACCAGACGTATTCCCTTGGCTTAAGAAGTGATTTTAAGTGTATG
GTTTGGTTCATAAACATTGGGATAATAGCGTGTCATCCTTTTTGCCCATTGAAGAAGACC
ATGTGTTGTTGTTACCTTTTTGTTTATGTAACTTTTTGCAGAAACAATTTGCGCCAGTGT
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4FD93TF U 1
AF RR4FD93JQ C 489
AF RR4EH75JQ C 738
AF RR4EH75TF U 738
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DS 

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CCTTCATCACCAGACGTATTCCCTTGGCTTAAGAAGTGATTTTAAGTGTATGGTTTGGTT
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G
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DS 

RD RR4EH75TF 404 0 0
G
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ATACCCTCTTGGTAACGGAGACAGGTGTTGAGGTTTTAACGGGGAGGCTTCCTTCATCAC
CAGACGTATTCCCTTGGCTTAAGAAGTGATTTTAAGTGTATGGTTTGGTTCATAAACATT
GGGATAATAGCGTGTCATCCTTTTTGCCCATTGAAGAAGACCATGTGTTGTTGTTACCTT
TTTGTTTATGTAACTTTTTGCAGAAACAATCTGCGCCAGTGTTTTGATTGAAATGTAAGG
AACCTACCTATATTTATTTATACTGAATTGAATGACAATTTTC

QA 2 404 2 404
DS 



AS 1 5

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AATATGAGCAACAAATGAATGAAAATAATAGATAAAACTCATTCAAGTTACAAAGACAAT
GGCCAAGTAACTTATTTCAAGAACCAATAATTTAAGTGCACACTGCAGGAGCACCTTGAG
GAAACCTTTTTTTATCGGTGCAATAGTTGTAGATCATGTACTTACTCTGTGCCCATTTCA
TTTTTTTCTGGCCTTCCGGGTCAACTTTTTGAGTGAACCATGGGGCATTCCCGGGGCAAA
ATGATTTTCCGTTAGCCCAAACACATCCTTCCACATTGTAGTTTCTGTAAAAGGCAGTGA
AAGGAGCTTTTGACCAATCTGTTTTCTCCAATCCTCCCCTTGTGGCCCAATGCTCGGCTT
CCCAAAGGCTTGCGTAGAGCCTCATTGGCTGGTTCTTCGGGAATGGAACTCCCATTGACT
CAGAGTTCTTGAACTCTCTAATAGGAATGCCATCAACTGTAAAAATAATCCTTTGGGGAT
TCCATGTGATACAGTAAGTGTGAAAGTTCTTTGTTGGGTCGAACCATAGATGAAACTGCT
GTTCTTTGTCTCCAGAGCCTCGTGTGTAAACATTAGTATGAAGAGTATACGGATGACCAC
TAATGTTTCCCAAGAACTCGAAATCGATCTCATCCCATGTAGTTCCGGGCGATTTAAGAT
AGAATGTTGTGACTGTACCAGCAGAGTTACCAGGGACAAGTTTCATTTGAACCTCAGCTT
TACCATATAGAAACTCCTGATGGGACTGAAACCCCGAACCAGAGGATTTGTCAAGCGAGA
GAGAAAGAAGCTTTCCATCTCTGTCACGAACCTTTCCTCGGCCATCACCCCAATGTATCT
GAACGTCTTTATGGAAGCTACCAGCATAGACAGCCACAGATTGTACTGCAAATAGAAAGA
GAACCAAGAATGCGAATCTTGTACCACAGGAAAGCTTCATTTTCTAATAGATTTCTGAGT
ACTATTGATATCTCAGCTGTGTTTGTTGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 10 30 10 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AN47JQ U 136
AF RR4DS92JQ U 1
AF RR4E677JQ U 1
AF RR4AN47TF C 352
AF RR4DS92TF C 422
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DS 

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AATATGAGCAACAAATGAATGAAAATAATAGATAAAACTCATTCAAGTTACAAAGACAAT
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TTTTTTTCTGGCCTTCCGGGTCAACTTTTTGAGTGAACCATGGGGCATTCCCGGGGCAAA
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CCCAAAGGCTTGCGTAGAGCCTCATTGGCTGGTTCTTCGGGAATGGAACTCCCATTGACT
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DS 

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AATATGAGCAACAAATGAATGAAAATAATAGATAAAACTCATTCAAGTTACAAAGACAAT
GGCCAAGTAACTTATTTCAAGAACCAATAATTTAAGTGCACACTGCAGGAGCACCTTGAG
GAAACCTTTTTTTATCGGTGCAATAGTTGTAGATCATGTACTTACTCTGTGCCCATTTCA
TTTTTTTCTGGCCTTCCGGGTCAACTTTTTGAGTGAACCATGGGGCATTCCCGGGGCAAA
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AAGGAGCTTTTGACCAATCTGTTTTCTCCAATCCTCCCCTTGTGGCCCAATGCTCGGCTT
CCCAAAGGCTTGCGTAGAGCCTCATTGGCTGGTTCTTCGGGAATGGAACTCCCATTGACT
CAGAGTTCTTGAACTCTCTAATAGGAATGCCATCAACTGTAAAAATAATCCTTTGGGGAT
TCCATGTGATACAGTAAGTGTGAAAGTTCTTTGTTGGGTCGAACCATAGATGAAACTGCT
GTTCTTTGTCTCCAGAGCCTCGTGTGTAAACATTAGTATGAAGAGTATACGGATGACCAC
TAATGTTTCCCAAGAACTCGAAATCGATCTCATCCCATGTAGTTCCGGGCGATTTAAGAT
AGAATGTTGTGACTGTACCAGCAGAGTTACCAGGGACAAGTTTCATTTGAACCTCAGCTT
TAC*ATATAGAAACTCCTGATGGGACTGAA
CCCCGA

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DS 

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TTTGGGGATTCCATGTGATACAGTAAGTGTGAAAGTTCTTTGTTGGGTCGAACCATAGAT
GAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCAGAGCCTCGTGTGTAAACATTAGTATGAAGAGTATACG
GATGACCACTAATGTTTCCCAAGAACTCGAAATCGATCTCATCCCATGTAGTTCCGGGCG
ATTTAAGATAGAATGTTGTGACTGTACCAGCAGAGTTACCAGGGACAAGTTTCATTTGAA
CCTCAGCTTTACCATATAGAAACTCCTGATGGGACTGAAACCCCGAACCAGAGGATTTGT
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ATAGAAAGAGAACCAAGAATGCGAATCTTGTACCACAGGAAAGCTTCATTTTCTAATAGA
TTTCTGAGTACTATTGATATCTCAGCTGTGTTTGTTGATCC

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CCATGTGATACAGTAAGTGTGAAAGTTCTTTGTTGGGTCGAACCATAGATGAAACTGCTG
TTCTTTGTCTCCAGAGCCTCGTGTGTAAACATTAGTATGAAGAGTATACGGATGACCACT
AATGTTTCCCAAGAACTCGAAATCGATCTCATCCCATGTAGTTCCGGGCGATTTAAGATA
GAATGTTGTGACTGTACCAGCAGAGTTACCAGGGACAAGTTTCATTTGAACCTCAGCTTT
ACCATATAGAAACTCCTGATGGGACTGAAACCCCGAACCAGAGGATTTGTCAAGCGAGAG
AGAAAGAAGCTTTCCATCTCTGTCACGAACCTTTCCTCGGCCATCACCCCAATGTATCTG
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AACCAAGAATGCGAATCTTGTACCACAGGGAAGCTTCATTTTCTAATAGATTTCTGAGTA
CTATTGATATCTCAGCTGTGTTTGTTGATCC

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DS 



AS 1 5

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AGATGGTAGCTACTTGATTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCATAAACCACCT
CATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAA
CATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATT
CCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGT
AGCTTTTTGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAG
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CTGCCATAATGGCCACCAAAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4D641JQ U 1
AF RR4G381JQ U 15
AF RR4BJ63TF C 3
AF RR4BJ63JQ U 15
AF RR4G381TF C 55
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BS 103 136 RR4D641JQ
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BS 480 480 RR4G381JQ
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RD RR4D641JQ 366 0 0
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AGATGG

QA 1 366 1 366
DS 

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CTCTATTAT
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AGTTTTGTAACCGACAGAGAGTATAGATAAAGAGTAACAGAAGATTTGTTTATTGTCTCT
TGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAACAACTTGAAGCTGCTTCTTGACTTTC
CTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTAGTATCTGTTGTTTCCAACAGCC
ACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAA
TAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATAGATGGTAGCTACTTGATTTGGT
GCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCATAAACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGG
ATGTCTGTTTTCTCTGTTGG*ATGAACCTGACACGAACATTCTGCAGCTGCAAATATCTA
TCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAA
TACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTTGGTACCTCTTCAGCA
AGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGC
ATTC

QA 10 669 10 669
DS 

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GATGAAA
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TCC

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DS 

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GACAGAGAATATCTGTCTTGTGCGAGATTGTTGGTGAAACACAAAAGCGGATTGAGAGTG
AATAGACTGCCATAATGGCCACCAAAGTC
CC

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DS 



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TCGATCTTAAATCGAAGCTGTATCGGTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAG
GAGCTGGTACTGTGAAGCTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAGATTCGTCTCGTTATGA
GGCAATCCAAAACTCTGAAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAACAGGGCATGTCTGTTC
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AGCTAAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTA
TGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCCT
CTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGACCGTGGAAGAGACAAAAACTGAGGAGAAAC
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AAGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGTTGCTCCCTCAACTTAAGATGCATCAA
TGTTTAAGCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTTTTGATGCATCCATCTCGAGTCT
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4D511JQ C 360
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TCGATCTTAAATCGAAGCTGTATCGGTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAG
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G
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GAGCTAAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTT
ATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCC
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GTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTATAGTTTTGAGTCCAAAGTGTGGGTGAGTG
ATATGAGAGATTAAGGTTGGTTATCACTTATCAGTAAGAATACATTGAATTCATTGT
C

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TTTGTTCATGGACTTGAGTCAGAAGTTTTCGTTTCTTTGAATTACAAAATTATACGG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 5

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GACTTAGATTTCATGAGTTGCTGAGCATCAGATGGAGATGGAAGTGCTGGAATAGCTCCT
TTCTGAGTTGTACACACAGCTCCACATGCATTTGCAAATGCAAGAGCTTCCTTTAGCTTT
CCTTCATCATCGAGTATGGAGCCATCTTTTCCCAAAGAGAAAAGAAATGCACCGACAAAA
GAATCACCAGCTCCAGTTGTATCGACTGTTTTCACAGAGTAACCAGGCACTCTCCCTTTG
AATTTCTTTGTGTAGTATCTACAACCTTTCTCTCCATCAGTTACAATAAGCAGCTTGAGC
TTGTCATGCATTAGAGACAAAACAACATCATCCTTCTCTGCATCTCCCCCAGTGAGGAGT
GTTACCTCGTCATCGCTTACCTTGATAATATCAGCCTCATTCCAGATGCTTTTAATGCCT
TCTATGGCAGCCTCAGTGGAAGGCCAAAGAGGCAACCGAACATTAGGGTCGTAAGAGAGT
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GAGATCAAGCTAATGGAACCGTAGTGGAAAATCTTGGCTTTCTTGATGAGATCCTTGTTG
AGTTCAGATTCTTTCAAGAGCATATCCGCACTAGGGTTCCTGTAAAACATGAACTCTCTT
ACGCCGTTCTTCTTTAGTGTCACAAAGGCCAATGCAGTCCTTGCATGGCTGTCGAAGCAA
ACTCCTTCGCTGTTCACACCGTTCTTCTTCAATATGTTGACAAGCATGTGTCCAAACTCA
TCATCACCAAACTTGCCAATGAAAGCTGATTTGCCACCGAGCTTGGAGATGGCACATGCA
ACGTTGGCTGGAGCACCACCAGGGGCTTTGAGAAAACCGGTGGACTCGGCCAAGGAAACA
CCAGAAGTGTCAGGGACAAAGTCGATAAGCATTTCTCCAAAGGAAACAATCAATGGAGTA
GCCATCTTTTGATGAAATGTTTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
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AF RR4H117JQ U 48
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BQ
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10 10 

AF RR4G617TF U 1
AF RR4H795JQB C 9
AF RR4H917TF U 47
AF RR4H917JQB C 9
AF RR4H795TF U 9
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BS 311 311 RR4H917TF
BS 312 343 RR4G617TF
BS 344 344 RR4H917TF
BS 345 352 RR4G617TF
BS 353 353 RR4H917TF
BS 354 379 RR4G617TF
BS 380 382 RR4H917TF
BS 383 415 RR4G617TF
BS 416 416 RR4H917TF
BS 417 478 RR4G617TF
BS 479 479 RR4H917TF
BS 480 524 RR4G617TF
BS 525 525 RR4H917TF
BS 526 532 RR4G617TF
BS 533 533 RR4H917TF
BS 534 577 RR4G617TF
BS 578 578 RR4H917TF
BS 579 630 RR4G617TF
BS 631 631 RR4H917TF
BS 632 654 RR4G617TF
BS 655 657 RR4H917TF
BS 658 665 RR4H795TF

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GGAGCAGAAGAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGG
TCTTCCTCAGTTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGGCCTGGAAAGGGTGGAAACAGAT
TCGTGAAGAACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACA
TCGACAGTAAATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCGGGTA
CTTGCCACTCTGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTCCACTTTG
TCAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCGCCTT
GCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAATA
CTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGG
CTTTCACTGGCGCTTAAAGAGTGTTTTGTTATGCTAGCTTATGTTTCTTGATAGACCTAA
ACTCTGTTGTTACCCTTTTATCTTGAAGTTCCAGATTTTAATGCACTGATTTTG

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DS 

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GGGG
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TTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTAAAT
GTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACTCGG
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AGAGGTA***GAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCA
AGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCA
ATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTTCTTTCGCGAAGAAGGCTTTCACTGGCG
CTTAAAGAGTGTTTTGTTATGCTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGTTA
CCCTTTTATCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTTGTTT

QA 5 649 5 649
DS 

RD RR4H917TF 611 0 0
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AAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAA
GGGTGGAAACAGATTCGTGAAGAACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCAT
TCAAGGAACCTACATCGACAGTAAATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCG
TATCTTAGCTGGTACTTGCCACTCGGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGAAA
CTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTA***GAAGAGGCATTCGAACATCCCTGC
TCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAG
GCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTTC
TTTCGCGAAGAAGGCTTTCACTGGCGCTTAAAGAGTGTTTTGTTATGCTAGTTTATGTTT
CTTGATAGACCTAAACTCTGTTGTTACCCTTTTATCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCAC
TGATTTTGTTT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4H917JQB 649 0 0
GGGG
AGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAAGAG
CAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGCT
CGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGAACA
TTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTAAAT
GTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACTCGG
CCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGAAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATC
AGAGGTA***GAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCA
AGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCA
ATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTTCTTTCGCGAAGAAGGCTTTCACTGGCG
CTTAAAGAGTGTTTTGTTATGCTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGTTA
CCCTTTTATCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTTGTTT

QA 5 649 5 649
DS 

RD RR4H795TF 657 0 0
GGGG
AGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAAGAG
CAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGCT
CGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGAACA
TTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTAAAT
GTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACTCGG
CCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGAAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATC
AGAGGTA***GAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCA
AGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCA
ATGTGTTGAAAGTGATACCAGCTGGTGCTTCTTCTTTCGCGAAGAAAGCTTTCACTGGCG
CTTAAAGAGTGTTTTGTTATGCTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGTTA
CCCTTTTATCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTTGTTTAAAAAAAA

QA 5 657 5 657
DS 



AS 1 5

CO CL2194Contig1 683 5 26 U
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CACACAAACCCGGTAGTAACAAAGACCAACAACAAGATATTGGTTCAAAAGCTTCAAATT
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GAAAAATTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATCCCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGC
ATTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAGATGCCAATGACCAATGCTTGATTCGTCTTCT
TGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATCACAGCTCCTGGCTCGCCTTGAA
TAACCATGTACTTGGCTCCACCCAGAAAGAGTCCGGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCT
CGAAGTCCTTTGTGATTCCTTTGATTTCTTCACTCTTCAACTGAGGGAAATTGGCGCTCT
GAGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAAAATAGCGGCGGCGGTGAGCTGGCTGCCTTCGA
CGTCGCACATGAGGTGGTCATCAACGTACGATTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTTTTTT
T*CTCCGGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTGAAAGACTTGTTGTCTACTTCTCTC
TCTTAACGTGAGCTTTTGATCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DP64JQ U 2
AF RR4DP64TF C 1
AF RR4CU46JQ U 23
AF RR4CW15JQ U 34
AF RR4CW15TF C 34
BS 1 1 RR4DP64TF
BS 2 34 RR4DP64JQ
BS 35 35 RR4CU46JQ
BS 36 58 RR4DP64JQ
BS 59 59 RR4CU46JQ
BS 60 95 RR4DP64JQ
BS 96 96 RR4CU46JQ
BS 97 143 RR4DP64JQ
BS 144 144 RR4CU46JQ
BS 145 165 RR4DP64JQ
BS 166 166 RR4CU46JQ
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BS 169 190 RR4DP64JQ
BS 191 191 RR4CU46JQ
BS 192 197 RR4DP64JQ
BS 198 198 RR4CU46JQ
BS 199 268 RR4DP64JQ
BS 269 269 RR4CU46JQ
BS 270 364 RR4DP64JQ
BS 365 365 RR4CU46JQ
BS 366 384 RR4DP64JQ
BS 385 385 RR4CU46JQ
BS 386 504 RR4DP64JQ
BS 505 629 RR4CU46JQ
BS 630 683 RR4CW15JQ

RD RR4DP64JQ 503 0 0
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AAAAATTTAAAGATCAAACTCGATGAGGTAATCCCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGCA
TTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAAATGCCAATGACCAATGCTTGATTCGTCTTCTT
GATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATCACAGCTCCTGGCTCGCCTTGAAT
AAC*ATGTACTTGGCTCCACCCAAAAAGAGTCCGGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCTC
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AGCCCAGACACTGCCGTCTTGGC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4DP64TF 640 0 0
TAAAAAAAACACAATGCATATGGAGGGATAAAAAGATGATCAAAATGCCATTACATAAGA
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GATTTGCGTTTTGATAGCATTACGATTCAATCACAATGAAAAGAAGAGAGTTTTGAAACT
GAGAAATTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATCCCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGC
ATTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAGATGCCAATGACCAATGCTTGATTCGTCTTCT
TGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATCACAGCTCCTGGCTCGCCTTGAA
TAAC*ATGTACTTGGCTCCACCCAGAAAGAGTCCGGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCT
CGAAGTCCTTTGTGATTCCTTTGATTTCTTCACTCTTCAACTGAGGGAAATTGGCGCTCT
GAGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGAATAGCGGCGGCGGTGAGCTGGCTGCCTTCGA
CGTCGCACATGAGGTGGTCATCAACGTACGATTGCCACGACATTTTCTTCTTCTTTTTTT
TTCTCCGGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTAAATGTCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4CU46JQ 624 0 0
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AGACCAACAACAAGATATTGGTTCAAAAGCTTCAAATTGATTTGCGTTTTGATAGCATTA
CGATTCAATCACAATGAAAAGAAGAGACTTTTGAAACTGAAAAATCTAGAGATCAGACTC
GATGAGGTAATCCCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGCATTGACCACCAGTCATGGGCTC
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CTTCTTGCCTCGGATCACAGCTCCTGGCTCACCTTGAATAACCATGTACTTGGCTCCACC
CAGAAAGAGTCCGGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCTCGAAGTCCTTTGTGATTCCTTT
GATTTCTTCACTCTTCAACTGAGGGAAATTGGCGCTCTGAGCCCAGACACTGCCGTCTTG
GCCGAAAATAGCGGCGGCGGTGAGCTGGCTGCCTTCGACGTCGCACATGAGGTGGTCATC
AACGTACGATTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTTTTTTT*CTCCGGTGGGTTTTTTTTTT
TTTTTTT
TTTTTTTTTTAATGTCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4CW15JQ 650 0 0
C
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AATGAAAAGAAGAGAGTTTTGAAACTGAAAAATTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATC
CCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGCATTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAGATGCC
AATGACCAATGCTTGATTCGTCTTCTTGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCG
GATCACAGCTCCTGGCTCGCCTTGAATAACCATGTACTTGGCTCCACCCAGAAAGAGTCC
GGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCTCGAAGTCCTTTGTGATTCCTTTGATTTCTTCACT
CTTCAACTGAGGGAAATTGGCGCTCTGAGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAAAATAGC
GGCGGCGGTGAGCTGGCTGCCTTCGACGTCGCACATGAGGTGGTCATCAACGTACGATTG
CCACGACATCTTCTTCTTCTTTTTTTT*CTCCGGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATG
TGAAAGACTTGTTGTCTACTTCTCTCTCTTAACGTGAGCTTTTGATCCC

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4CW15TF 650 0 0
C
GATGATCAAAATGCCATTACATAAGACACACAAACCCGGTAGTAACAAAGACCAACAACA
AGATATTGGTTCAAAAGCTTCAAATTGATTTGCGTTTTGATAGCATTACGATTCAATCAC
AATGAAAAGAAGAGAGTTTTGAAACTGAAAAATTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATC
CCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGCATTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAGATGCC
AATGACCAATGCTTGATTCGTTTTCTTGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCG
GATCACAGCTCCTGGCTCGCCTTGAATAACCATGTACTTGGCTCCACCCAGAAAGAGTCC
GGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCTCGAAGTCCTTTGTGATTCCTTTGATTTCTTCACT
CTTCAACTGAGGGAAATTGGCGCTCTGAGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGAATAGC
GGCGGCGGTGAGCTGGCTGCCTTCGACGTCGCACATGAGGTGGTCATCAACGTACGATTG
CCACGACATCTTCTTCTTCTTTTTTTT*CTCCGGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATG
TGAAAGACTTGTTGTCTACTTCTCTCTCTTAACGTGAGCTTTTGATCCC

QA 2 650 2 650
DS 



AS 1 4

CO CL2195Contig1 1060 4 15 U
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ACCATGAGATCCGCTAGAAAGGCTGTGGCTGCTAGAAAGGCTGTGGCTGCTAGAAAGGCT
GTGGCTGCTAGAAAGGCCTCTTTGGAGAAGTACAGATGCAAGCCCCGAGCTATGATTTCT
GTGGAGGGATACGACCCTTGTCTGCCTGAGGATGATCTCAAGAATGAATTGATTAATCAC
TTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTTAATGTTATTCTTCGCCAAGACCCTGATAGCCCTAAT
CTGGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCAGAAGAGAAGGCCTTGCAA
CTTAATGGAACTGACATTGGTGGATGTAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAA
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AGATTTTGGTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTC
GAGAGCGCTTTGACGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCACCCATGTTTTTGTCTCT
ACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCACGAAAAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCTG
GATCTTTGTGGAACTGAAGTGGGAGGTTCTAAAATAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAATC
TTTACTAACCGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTACTCTGTCCCAGCTCAT
ATGATTGAGTTTACCCGCGAGATCCAAGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGGCT
GCTTTTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGTCTAGAAAATCTCTCTCAAACATCTATCTTTGGTG
TTTAATAATTAAATAAATCGTGTGAGCTTGTACAATGCAACCTTGGGGATTTCTTACTTA
TGCGTACTGTCAGAGCTCATTATTATGTATGATGAGCCGTTTGTGTGTGTGTCTGGATGA
TAAACGTACTCTTAATAATTATTATCTTTTACTTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4GC33TF U 1
AF RR4DW08JQ C 300
AF RR4EW66TF U 405
AF RR4GC33JQ C 300
BS 1 643 RR4GC33TF
BS 644 644 RR4EW66TF
BS 645 687 RR4GC33TF
BS 688 688 RR4EW66TF
BS 689 693 RR4GC33TF
BS 694 694 RR4EW66TF
BS 695 729 RR4GC33TF
BS 730 730 RR4EW66TF
BS 731 736 RR4GC33TF
BS 737 737 RR4EW66TF
BS 738 748 RR4GC33TF
BS 749 782 RR4EW66TF
BS 783 783 RR4DW08JQ
BS 784 1056 RR4EW66TF
BS 1057 1060 RR4DW08JQ

RD RR4GC33TF 748 0 0
GGAAATCCCTAAAACTGGAAAAGTATCGTAAAGCGGCAGCTTAGGGTTATTGCCTCTTTC
ACCATGAGATCCGCTAGAAAGGCTGTGGCTGCTAGAAAGGCTGTGGCTGCTAGAAAGGCT
GTGGCTGCTAGAAAGGCCTCTTTGGAGAAGTACAGATGCAAGCCCCGAGCTATGATTTCT
GTGGAGGGATACGACCCTTGTCTGCCTGAGGATGATCTCAAGAATGAATTGATTAATCAC
TTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTTAATGTTATTCTTCGCCAAGACCCTGATAGCCCTAAT
CTGGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCAGAAGAGAAGGCCTTGCAA
CTTAATGGAACTGACATTGGTGGATGTAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAA
AGAGACGAGGAGGCAGACCTTTATAGAGCCTCTCTGGCTGACGAAATATATAATGACCGC
AGATTTTGGTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTC
GAGAGCGCTTTGACGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCACCCATGTTTTTGTCTCT
ACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCACGAAAAAGAAG*AGAAGCTAGGGCGCTG
GATCTTTGTGGAACTGAAGTGGGAGGT*CTAAA*TAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAATC
TTTACTAACTGTCCCC*TCCCGGCGGTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DW08JQ 761 0 0
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TACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCACGAAAAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCT
GGATCTTTGTGGAACTGAAGTGGGAGGTTCTAAAATAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAAT
CTTTACTAACCGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTACTCTGTCCCAGCTCA
TATGATTGAGTTTACCCGCGAGATCCAAGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGGC
TGCTTTTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGTCTAGAAAATCTCTCTCAAACATCTATCTTTGGT
GTTTAATAATTAAATAAATCGTGTGAGCTTTTACAATGCAACCTTGGGGATTTCTTACTT
ATGCGTACTGTCAGAGCTCATTATTATGTATGATGAGCCGTTTGTGTGTGTGTCTGGATG
ATAAACGTACTCTTAATAATTATTATCTTTTACTTTTATAC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EW66TF 653 0 0
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AATATATAATGACCGCAGATTTTGGTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCT
TCCTGCAGATGAAGTCGAGAGCGCTTTGACGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCAC
CCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCACGAAAAAGAAGG
AGAAGCTAGGGCGCTGGATCTTTGTGGAACTGAAGTGGGAGGTTCTAAAATAGCTGTTTG
TCGCTTAGCTACAATCTTTACCAACCGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTA
CTCTGTCCCAGCTCATATTATTGAGTTTACCCGCGAGATCCAAGACAAGGTCGCTGCTTT
TAAGAAGCAGAGGGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGTCTAGAAAATCTCTCTCAA
ACATCTATCTTTGGTGTTTAATAATTAAATAAATCGTGTGAGCTTGTACAATGCAACCTT
GGGGATTTCTTACTTATGCGTACTGTCAGAGCTCATTATTATGTATGATGAGCCGTTTGT
GTGTGTGTCTGGATGATAAACGTACTCTTAATAATTATTATCTTTTACTTTT
A

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4GC33JQ 757 0 0
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ACTTAATGGAACTGACATTGGTGGATGTAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGA
AAGAGACGAGGAGGCAGACCTTTATAGAGCCTCTCTGGCTGACGAAATATATAATGACCG
CAGATTTTGGTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGT
CGAGAGCGCTTTGACGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCACCCATGTTTTTGTCTC
TACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCACGAAAAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCT
GGATCTTTGTGGAACTGAAGTGGGAGGTTCTAAAATAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAAT
CTTTACTAACTGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTACTCTGTCCCAGCTCA
TATGATTGAGTTTACCCGCGAGATCCAAGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGGC
TGCTTTTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGTCTAGAAAATCTCTCTCAAACATCTATCTTTGGT
GTTTAATAATTAAATAAATCGTGTGAGCTTGTACAATGCAACCTTGGGGATTTCTTACTT
ATGCGTACTGTCAGAGCTCATTATTATGTATGATGAGCCGTTTGTGTGTGTGTCTGGATG
ATAAACGTACTCTTAATAATTATTATCTTTTACTTTT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 5

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GTTGTTGGATACGCCTATAAAGGGGGGTTTTGTGGTATTGGATACATGATTGGTGGCTTG
GCAACAAGCCCCGTCTCGAAGCAAGTTCAGGAAGATGACGAGCTTCTGACGGAAGAATTG
AAACGTTGGGATGAAAAAGATGCCAGGTTGGAAGCAAGGATAGCAAGAATGAAACAATAA
TTACCTTTGCGTGTCTCTTGGGTAATATCTAATTATGAAAGAATAATTGGTTGCAAATGT
TTGTGGAACAAAGTTGTTATTGTCTGTTATTGTCTTTGCAAGTGGTTGTGGAACAAAGTT
TTTATTGTCTTGTCTTTTATTCTAATCATCAACAACAACAGTCCTTGTAATGTTTCTTTC
TGCCTCGGCCGCTTTGTAATAGATTTTATTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR48JQ C 7
AF RR4CR48TF U 7
AF RR4EY29JQ C 1
AF RR4EY29TF U 1
AF RR4GD58TF U 10
BS 1 8 RR4EY29JQ
BS 9 378 RR4CR48TF
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BS 391 494 RR4CR48TF
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RD RR4CR48JQ 489 0 0
GG
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CTTGTC
C

QA 3 488 3 488
DS 

RD RR4CR48TF 489 0 0
GG
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CCCCGTCTCGAAGCAAGTTCAGGAAGATGACGAGCTTCTGACGGAAGAATTGAAACGTTG
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CTTGTC
C

QA 3 488 3 488
DS 

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TTTATTGTCTTGTCTTTTATTTTAATCATCAACAACAACAGTCCTTGTAATGTTTCTTTC
TGCCTCGGCCGCTTTGTAATAGATTTTATT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4EY29TF 570 0 0
GGCCCAAT
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GATGATGAGATTCCTGGGAAACACGTTGGCTAAGTCTTGTGGCAAGGGAAGGCTGCAGTG
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ATACGCCTATAAAGGGGGGTTTTGTGGTATTGGATACATGATTGGTGGCTTGGCAACAAG
CCCCGTCTCGAAGCAAGTTCAGGAAGATGACGAGCTTCTGACGGAAGAATTGAAACGTTG
GGATGAAAAAGATGCCAGGTTGGAAGCAAGGATAGCAAGAATGAAACAATAATTACCTTT
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CAAAGTTGTTATTGTCTGTTATTGTCTTTGCAAGTGGTTGTGGAACAAAGTTTTTATTGT
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CCGCTTTGTAATAGATTTTATT

QA 9 570 9 570
DS 

RD RR4GD58TF 569 0 0
GG
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GATGAGATTCCTGGGAAACACGTTGGCTAAGTCTTGTGGCAAGGGAAGGCTGCAGTGTCG
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CGCCTATAAAGGGGGGTTTTGTGGTATTGGATACATGATTGGTGGCTTGGCAACAAGCCC
CGTCTCGAAGCAAGTTCAGGAAGATGACGAGCTTCTGACGGAAGAATTGAAACGTTGGGA
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GTCTTTTATTCTAATCATCAACAACAACAGTCCTTGTAATGTTTCTTTCTGCCTCGGCCG
CTTTGTAATAGATTTTATTAAAAAAAA

QA 3 569 3 569
DS 



AS 1 5

CO CL2197Contig1 1060 5 19 U
GATGAGTATAAGAATTAATAAATAGAAGTGATGAGAAACAGTGGTGACATTCAGAATAAC
ATTGTGATATTAATCACAGAGATGAATTTTTGACATTACAGAATGGTAGAACTTCAAAAG
AAGTATGGAAAACAAAGCTTAGAATCTCGAATGCATTCATAAATGATACTTTCTGACACT
ACATGATTGAGAATATTGTATGGAACCCAGAAGAAAATGAGCTAATAGTTCGTTAGAATC
TCTGTAACAATTCAAATGAACTGAAAGAAACCTTTTGCTTGATTAGCATTCACACCCTGT
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AGGTTCATTCTTGAAAGCACTTTTGGTGATGCACTCGAAAGCTGCGTCTACATTGAATCC
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AATCGTAGCTTTGTACTGATTACTAAACTTGCGGTTCACAAACTGATTCATCAAAGATGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CG
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G
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TAGTTTATA

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QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 5

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TAAGACTTTTATTGAAAAGAAGTTATCTACTCACCAAGTTTTAGAACATGAAATTTGACA
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AAAGTTTAGTATCTCTTTTCTTCTTGAATCATTCAACACTGTATTAAACTTTCCCTTTAT
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TTTTCTCAGTTGATTTGCTGTCAGGATCGTCGCTGATCTCAATGAACCTCGAGAGTATAT
CATGCTTCATCTTGATGTTGTTGGAAGGAGATTTCTGTGACTCTAATATCTCTGCTTTCC
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AGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG87TF U 35
AF RR4BM84TF U 1
AF RR4F250TF U 35
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BS 566 685 RR4BM84TF
BS 686 753 RR4F250TF

RD RR4FG87TF 566 0 0
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TCGTCTTCAACGATGCCACCGTGGATCTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTTTGG
TGAAGAATCTCTACTTGTCTTGTGATCCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGATC
CCTCCGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGGAG
TGTCAAAAGTGGTAGAATCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGACTTGCTTTGGGGTA
TTGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCTAACTCCTTACTCACATTTTAAGATCC
TACACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGACTG
CCTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGTTCTCCTAAGAAGGGAGAGACTGTCCTCGTGTCAG
CTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4BM84TF 685 0 0
AAGAAACGAGAAACCACATACATACATTTGTCATTTGTCACCAAAACCTAAAGCAGGAGA
TATAGAATGGCACCCACAGGCGAAGCGTCGACCGTGAACAACAAGCAAGTCATATTGGGA
GACTACGTCACCGGCTTCCCCAAGGAATCAGACCTCGTCTTCAACGATGCCACCGTGGAT
CTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTCTGGTGAAGAATCTCTACTTGTCTTGTGAT
CCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGATCCCTCCGCTGCAGCCCTCGCTCTACCC
TACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGGAGTGTCAAAAGTGGTAGATTCAGGGCAC
CCTGATTACACAAAGGGAGACCTGCTTTGGGGTATTGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTT
ATTACTCCAACTACTTACTCACATTTTAAGATCCTACACACTGATGTTCCCTTTTCCTAC
TACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGACTGCTTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGT
TCTCCTAAGAAAGGATAGACTGTCTTCGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTC
GTGGGACAGCTCGCAAAGATTATGGGATGTTATGTCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAA
AAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4F250TF 719 0 0
GGGAGACAAAGAAGAAGAGAAGAAGATATAGAATGGCACCCACAGGCGAAGCGTCGACCG
TAAACAACAAGCAAGTCATATTTAGAGACTACGTCACCGGCTTCCCCAAGGAATCAGACC
TCGTCTTCAACGATGCCACCGTGGATCTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTTTGG
TGAAGAATCTCTACTTGTCTTGTGATCCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGATC
CCTCCGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGGAG
TGTCAAAAGTGGTAGAATCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGACTTGCTTTGGGGTA
TTGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCTAACTCCTTACTCACATTTTAAGATCC
TACACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGACTG
CCTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGTTCTCCTAAGAAGGGAGAGACTGTCCTCGTGTCAG
CTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTCGTGGGACAGCTCGCAAAGATTATGGGATGTTATG
TCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAG*TTGATCTTCTCAAGAATAAGTTTGGGTTTG
ATGAAGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTAACGCTGCCCTGAAAAGTGTTTCC

QA 1 719 1 719
DS 



CO CL2199Contig2 866 2 2 U
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TGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTCGTGTGACAGCTCGCAAAGATTATGGGATGTTATGT
CGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTAATCACACTTCACTTGTATACTCTTGCTGT
TGATCCAATGCTAACACATAGACTGACTTGTTACTGTCACCTTCTTTGTTTTTCTTCTGT
TGTAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGTTTGGGTTTGATGAAGCATTCAATTACAAAGAAG
AGAAAGACCTTAATGCTGCTCTGAAAAGGTGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATTTTGAG
AACGTAGGAGGCAAGATGCTAGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCCGTATC
GCGGTATGCGGAATGATCTCACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTA
GCGACCGTCATTTACAAGCGGGTTAAGCTTCATGGCTTTGTAGTCTCTGATTTCTATGAT
AAATACTCCAAGTTTCTGGAGTTCGTGCTTCCCTATATTAGAGAAGGGAAGATCACTTAC
GTTGAGGATGTAGCCCAAGGACTGGAGCAGGGGCCTTCTGCTTTGATTGGACTCTTCCAT
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TTGAGTTTGGTTATCAGCTGGAGATGGGTTAATTACGCTTTTGTTTTGGAAGTTTAAGTT
TCGCCTTAAGTACTTCACTTTCGTTATGTAATAAATTAACCCGTTTGTTTGTTGTATTAG
CCTATATTGAACTTGAAACTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F663TF U 1
AF RR4F663JQ C 193
BS 1 669 RR4F663TF
BS 670 866 RR4F663JQ

RD RR4F663TF 669 0 0
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TGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTCGTGTGACAGCTCGCAAAGATTATGGGATGTTATGT
CGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTAATCACACTTCACTTGTATACTCTTGCTGT
TGATCCAATGCTAACACATAGACTGACTTGTTACTGTCACCTTCTTTGTTTTTCTTCTGT
TGTAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGTTTGGGTTTGATGAAGCATTCAATTACAAAGAAG
AGAAAGACCTTAATGCTGCTCTGAAAAGGTGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATTTTGAG
AACGTAGGAGGCAAGATGCTAGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCCGTATC
GCGGTATGCGGAATGATCTCACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTA
GCGACCGTCATTTACAAGCGGGTTAAGCTTCATGGCTTTGTAGTCTCTGATTTCTATGAT
AAATACTCCAAGTTTCTGGAGTTCGTGCTTCCCTATATTAGAGAAGGGAAGATCACTTAC
GTTGAGGATGTAGCCCAAGGACTGGAGCAGGGGCCTTCTGCTTTGATTGGACTCTTCCAT
GGTAAGAAC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4F663JQ 674 0 0
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TTCTCAAGAATAAGTTTGGGTTTGATGAAGCATTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTA
ATGCTGTTCTGAAAAGGTGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATTTTGAGAACGTAGGAGGC
AAGATGCTAGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCCGTATCGCGGTATGCGGA
ATGATCTCACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTAGCGACCGTCATT
TACAAGCGGGTTAAGCTTCATGGCTTTGTAGTCTCTGATTTCTATGATAAATACTCCAAG
TTTCTGGAGTTCGTGCTTCCCTATATTAGAGAAGGGAAGATCACTTACGTTGAGGATGTA
GCCCAAGGACTGGAGCAGGGGCCTTCTGCTTTGATTGGACTCTTCCATGGTAAGAACGTC
GGCAAACAGCTCATTGTGGTGTCTCGTGAGTGATGATTGAGAGACGTTTTGAGTTTGGTT
ATCAGCTGGAGATGGGTTAATTACGCTTTTGTTTTGGAAGTTTAAGTTTCGCCTTAAGTA
CTTCACTTTCGTTATGTAATAAATTAACCCGTTTGTTTGTTGTATTAGCCTATATTGAAC
TTGAAACTTTTGTC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

CO CL2200Contig1 863 3 9 U
CGAGACGACGAGAGATTTTTATTTATATAATAAAAGGACTGCGATACATTGAACAGGCTA
AACCGGAAAGAAGATAAGCAAAAGACCAAGTATTGGTTTAACATACATACCGGTTAACCC
GATTTTAATTTATGAATATCACTTGTACTGGTAGATTTTGGTCTCGAATAACTGGTCCTC
CCTCCACCACTGGTGAATCCCATGAGCTTCTTTAAAATCTCTCGAAAAACTCTTGTTAAC
AGTTAAAACCGCCGTGGGAATAAGATGAACCGGTGCTTCTGTGTTCTTTCCTCCGCTCAC
AACATCCATCACCAAACCGCCCAACGAGTGCTGCGTTGCTAACCTCTCTACAAAACCGGC
TCCTATTTCCTCCATCTTGTTTCGGTGCTCGAAGTAACCGATAAACTCCGAGCACAAGTG
GTCCCCGGGATTGACGTAAAGCCGTGGAAACCAGTCGGACAAGGCGGCAAACGGGTCGGG
TGGTGCTGGTAATGCACGGTGGTGGTTTTGGCTGACTTGTTGGGTGGCTTTTTTGGCTAG
AGCAAGTCCAGCCGTGATCACACTACCTGCGATACGTATCCCGTGTTTGATCCTCTTATC
TTTGATTCTTTCGATAGGTGGAGACAAGAAAGGCGGATTAAAGGCGAAACACTCGGGAAA
AACACCGGTTCTAGCGACTGTTTTCCCGGCGAGCAAAGCCATGGAAGCACCAAGAGAATG
ACCAGCGAGCCAGACATTCGAACAACCAACCGAAGCCACCATGTTTCTCACAGCTTGCAT
AGCTATCCCAAACCGTGTGGTAGTGTGCAGGCGTTTTAATGATGTGGATGTCTAGCTCGA
TGTCGCGGGAGATGGAATCGGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV40JQ U 190
AF RR4GJ07JQ U 1
AF RR4DS12JQ U 1
BS 1 173 RR4DS12JQ
BS 174 174 RR4GJ07JQ
BS 175 545 RR4DS12JQ
BS 546 546 RR4GJ07JQ
BS 547 787 RR4DS12JQ
BS 788 788 RR4GJ07JQ
BS 789 791 RR4DS12JQ
BS 792 792 RR4GJ07JQ
BS 793 863 RR4DS12JQ

RD RR4BV40JQ 380 0 0
CTGGTGAATCCCATGAGCTTCTTTAAAATCTCTCGAAAAACTCTTGTTAACAGTTAAAAC
CGCCGTGGGAATAAAATGAACCGGTGCTTCTGTGTTCTTTCCTCCGCTCACAACATCCAT
CACCAAACCGCCCAACGAGTGCTGCGTTGCTAACCTCTCTACAAAACCGGCTCCTATTTC
CTCCATCTTGTTTCGGTGCTCGAAGTAACCGATAAACTCCGAGCACAAGTGGTCCCCGGG
ATTGACGTAAAGCCGTGGAAACCAGTCGGACAAGGCGGCAAACGGGTCGGGTGGTGCTGG
TAATGCACGGGGGTGGTTTTGGCTGACTTGTTGGGTGGCTTTTTTGGCTAGAGCAAGTCC
AGCCGTGATCACACTACCTG

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4GJ07JQ 806 0 0
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AACCGGAAAGAAGATAAGCAAAAGACCAAGTATTGGTTTAACATACATACCGGTTAACCC
GATTTTAATTTATGAATATCACTTGTACTGGTAGATTTTGGTCTCGAATATCTGGTCCTC
CCTCCACCACTGGTGAATCCCATGAGCTTCTTTAAAATCTCTCGAAAAACTCTTGTTAAC
AGTTAAAACCGCCGTGGGAATAAGATGAACCGGTGCTTCTGTGTTCTTTCCTCCGCTCAC
AACATCCATCACCAAACCGCCCAACGAGTGCTGCGTTGCTAACCTCTCTACAAAACCGGC
TCCTATTTCCTCCATCTTGTTTCGGTGCTCGAAGTAACCGATAAACTCCGAGCACAAGTG
GTCCCCGGGATTGACGTAAAGCCGTGGAAACCAGTCGGACAAGGCGGCAAACGGGTCGGG
TGGTGCTGGTAATGCACGGTGGTGGTTTTGGCTGACTTGTTGGGTGGCTTTTTTGGCTAG
AGCAAGTCCAGCCGTGATCACACTACCTGCGATACGTATCCCGTGTTTGATCCTCTTATC
TTTGATTCTTTCGATAGGTGGAGACAAGAAAGGCGGATTAAAGGCGAAACACTCGGGAAA
AACACCGGTTCTAGCGACTGTTTTCCCGGCGAGCAAAGCCATGGAAGCACCAAGAGAATG
ACCAGCGAGCCAGACATTCGAACAACCAACCGAAGCCACCATGTTTCTCACAGCTTGCAT
AGCTATCCCAAACCGTGTGGTAGTGT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4DS12JQ 863 0 0
CGAGACGACGAGAGATTTTTATTTATATAATAAAAGGACTGCGATACATTGAACAGGCTA
AACCGGAAAGAAGATAAGCAAAAGACCAAGTATTGGTTTAACATACATACCGGTTAACCC
GATTTTAATTTATGAATATCACTTGTACTGGTAGATTTTGGTCTCGAATAACTTGTCCTC
CCTCCACCACTGGTGAATCCCATGAGCTTCTTTAAAATCTCTCGAAAAACTCTTGTTAAC
AGTTAAAACCGCCGTGGGAATAAGATGAACCGGTGCTTCTGTGTTCTTTCCTCCGCTCAC
AACATCCATCACCAAACCGCCCAACGAGTGCTGCGTTGCTAACCTCTCTACAAAACCGGC
TCCTATTTCCTCCATCTTGTTTCGGTGCTCGAAGTAACCGATAAACTCCGAGCACAAGTG
GTCCCCGGGATTGACGTAAAGCCGTGGAAACCAGTCGGACAAGGCGGCAAACGGGTCGGG
TGGTGCTGGTAATGCACGGTGGTGGTTTTGGCTGACTTGTTGGGTGGCTTTTTTGGCTAG
AGCAAATCCAGCCGTGATCACACTACCTGCGATACGTATCCCGTGTTTGATCCTCTTATC
TTTGATTCTTTCGATAGGTGGAGACAAGAAAGGCGGATTAAAGGCGAAACACTCGGGAAA
AACACCGGTTCTAGCGACTGTTTTCCCGGCGAGCAAAGCCATGGAAGCACCAAGAGAATG
ACCAGCGAGCCAGACATTCGAACAACCAACCGAAGCCACCATGTTTCTCACAGCTTGCAT
AGCTATCTCAA*CCGTGTGGTAGTGTGCAGGCGTTTTAATGATGTGGATGTCTAGCTCGA
TGTCGCGGGAGATGGAATCGGCT

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 5

CO CL2201Contig1 785 5 2 U
CAACCTACTAAATACCAAACTTAAAATTGAGTTAAACGACTGTGAATTTCTGTTTCTCTA
TACATTAAGTTTCAAAGACCTCAAATAAATCATCGCGGAGAAACAGATTGAAAATAATGT
TTAGGAACAAGAATAAGCTTTGATACAACCACCTGAACTCACGAAAAAAAAATAACTTTC
ACTCGACATCTGCAAGAAGTATTCTCTTACCCAATGAACTTATAGTAAGCCCGCAAGCAT
AGCTCCTGGATCATCAGCTAAAGCCGCTGGGCTAGGCGGTTGAGCTACTGCTGCTGGTGC
TGGTGCTGCTGCTGGAACTAGAGCTCGAGATCCCATTGGCATAACAATTAGCTGTTCCTT
GATAAATTCTTTCAACTCAAATGTAAGGGTAGGATCTCCTGAGCCTACTGTCATTCGTAG
CTGGGTTCTGTCTGCTGGGTCTGTTTCAATTCTTGCCAAACAGAGCATGGCTCCTGTAGT
ATCAGAGTAAAAGGTTGTGCTTGCCACTAGATTATTAGGGTTCGGATCAAGCCCAGGGCG
TATCGTCACCCGGAAACTGTTGAACAAGTTCGCCATTTCCGGAAGTGCTAGAGGTCTTAC
ACCTCTTACAACTTCCTGAAGTTTCAAGGGTGGCCCTGAAAGTGCTCTCCATTGCGGGAA
GAACTCTTCAGTTGTCAATTGAAGAGGTTGAAGAAACTTATTTATAACTGCTGGGATGCG
CAGTTTGGCACCAACCACGATTGTACCAAGCTTGTAGGAGAAATCCAAAACCGCGACATC
TCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR4EL84JQ U 287
AF RR4EE36JQ U 14
AF RR4F149JQ U 1
AF RR4EL84TF C 33
AF RR4F149TF C 156
BS 1 637 RR4F149JQ
BS 638 785 RR4EL84TF

RD RR4EL84JQ 129 0 0
ACTGCTGCTGGTGCTGGTGCTGCTGCTGGAACTAAAGCTCGAAATCCCATTGGCATAACA
ATTAGCTGTTCCTTGATAAATTCTTTCAACTCAAATGTAAGGGTAGGATCTCCTGAACCT
ACTGTCATT

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR4EE36JQ 431 0 0
AT
CAAACTTAAAATTGAGTTAAACGACTGTGAATTTCTGTTTCTCTA**CATTAAGTTTCAA
AGACCTCAAATAAATCATCGCGGAAAAACAGATTGAAAATAATGTTTAGGAACAAGAATA
AGCTTTGATACAACCACCTGAACTCACGAAAAAAAAATAACTTTCACTCGACATCTGCAA
GAAGTATTCTCTTACCCAATGAACTTATAGTAAGCCCGCAAGCATAGCTCCTGGATCATC
AGCTAAAGCCGCTGGGCTAGGCGGTTGAGCTACTGCTGCTGGTGCTGGTGCTGCTGCTGG
AACTAGAGCTCGAGATCCCATTGGCATAACAATTAGCTGTTCCTTGATAAATTCTTTCAA
CTCAAATGTAAGGGTAGGATCTCCTGAGCCTACTGTCATTCGTAGCTGGGTTCTGTCTGC
TGGGTCTGT

QA 3 431 3 431
DS 

RD RR4F149JQ 637 0 0
CAACCTACTAAATACCAAACTTAAAATTGAGTTAAACGACTGTGAATTTCTGTTTCTCTA
TACATTAAGTTTCAAAGACCTCAAATAAATCATCGCGGAGAAACAGATTGAAAATAATGT
TTAGGAACAAGAATAAGCTTTGATACAACCACCTGAACTCACGAAAAAAAAATAACTTTC
ACTCGACATCTGCAAGAAGTATTCTCTTACCCAATGAACTTATAGTAAGCCCGCAAGCAT
AGCTCCTGGATCATCAGCTAAAGCCGCTGGGCTAGGCGGTTGAGCTACTGCTGCTGGTGC
TGGTGCTGCTGCTGGAACTAGAGCTCGAGATCCCATTGGCATAACAATTAGCTGTTCCTT
GATAAATTCTTTCAACTCAAATGTAAGGGTAGGATCTCCTGAGCCTACTGTCATTCGTAG
CTGGGTTCTGTCTGCTGGGTCTGTTTCAATTCTTGCCAAACAGAGCATGGCTCCTGTAGT
ATCAGAGTAAAAGGTTGTGCTTGCCACTAGATTATTAGGGTTCGGATCAAGCCCAGGGCG
TATCGTCACCCGGAAACTGTTGAACAAGTTCGCCATTTCCGGAAGTGCTAGAGGTCTTAC
ACCTCTTACAACTTCCTGAAGTTTCAAGGGTGGCCCT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4EL84TF 753 0 0
TAAACGACTGTGAATTTCTGTTTCTCTATACATTAAGTTTCAAAGACCTCAAATAAATCA
TCGCGGAGAAACAGATTGAAAATAATGTTTAGGAACAAGAATAAGCTTTGATACAACCAC
CTGAACTCACGAAAAAAAAATAACTTTCACTCGACATCTGCAAGAAGTATTCTCTTACCC
AATGAACTTATAGTAAGCCCGCAAGCATAGCTCCTGGATCATCAGCTAAAGCCGCTGGGC
TAGGCGGTTGAGCTACTGCTGCTGGTGCTGGTGCTGCTGCTGGAACTAGAGCTCGAGATC
CCATTGGCATAACAATTAGCTGTTCCTTGATAAATTCTTTCAACTCAAATGTAAGGGTAG
GATCTCCTGAGCCTACTGTCATTCGTAGCTGGGTTCTGTCTGCTGGGTCTGTTTCAATTC
TTGCCAAACAGAGCATGGCTCCTGTAGTATCAGAGTAAAAGGTTGTGCTTGCCACTAGAT
TATTAGGGTTCGGATCAAGCCCAGGGCGTATCGTCACCCGGAAACTGTTGAACAAGTTCG
CCATTTCCGGAAGTGCTAGAGGTCTTACACCTCTTACAACTTCCTGAAGTTTCAAGGGTG
GCCCTGAAAGTGCTCTCCATTGCGGGAAGAACTCTTCAGTTGTCAATTGAAGAGGTTGAA
GAAACTTATTTATAACTGCTGGGATGCGCAGTTTGGCACCAACCACGATTGTACCAAGCT
TGTAGGAGAAATCCAAAACCGCGACATCTCTGC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4F149TF 630 0 0
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GAACTTATAGTAAGCCCGCAAGCATAGCTCCTGGATCATCAGCTAAAGCCGCTGGGCTAG
GCGGTTGAGCTACTGCTGCTGGTGCTGGTGCTGCTGCTGGAACTAGAGCTCGAGATCCCA
TTGGCATAACAATTAGCTGTTCCTTGATAAATTCTTTCAACTCAAATGTAAGGGTAGGAT
CTCCTGAGCCTACTGTCATTCGTAGCTGGGTTCTGTCTGCTGGGTCTGTTTCAATTCTTG
CCAAACAGAGCATGGCTCCTGTAGTATCAGAGTAAAAGGTTGTGCTTGCCACTAGATTAT
TAGGGTTCGGATCAAGCCCAGGGCGTATCGTCACCCGGAAACTGTTGAACAAGTTCGCCA
TTTCCGGAAGTGCTAGAGGTCTTACACCTCTTACAACTTCCTGAAGTTTCAAGGGTGGCC
CTGAAAGTGCTCTCCATTGCGGGAAGAACTCTTCAGTTGTCAATTGAAGAGGTTGAAGAA
ACTTATTTATAACTGCTGGGATGCGCAGTTTGGCACCAACCACGATTGTACCAAGCTTGT
AGGAGAAATCCAAAACCGCGACATCTCTGC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 5

CO CL2202Contig1 1220 5 23 U
GCCAAATAATTATATAGAGCTTTAGATTGATCATAAAAAAGGAGATATATAACCTCAAGA
AAAAATTCAGTTGGTTGTGGACATAGTTCAAAAAAAGAAATGCTTTAGTTTGTCACATGA
ATCATATATGGTTCATAAGGTGTGACCATAAGCAAAGAATAA**TAACTTTTCACACATT
TGTAAGCCGCAACGCCTCCACGAACAACTCCTTGAGTGAAGCATTTGACGCCACAATTCT
CTGCGATGTGACGTCCAACTCTTTACCGGATGGATCAAAGATAAGTCCACCAGCTTCTCT
AACAATCACAATTCCAGCTGCAATGTCCCATGGACCGCCGAAACCGATTTCATAGAAGAT
GTCTCCCCTTCCACAAGCGACACCGCAGAGGTCCAGTGCGCACGAGCCACCCATCCTCAG
AGACCTAACCTTGGTTAGCAGACTGTGGATCCGGTTGGTAGCATCGTCTAATGTAGCTTT
ATCTCGCTTAGTGCCCGCCTCTGCTAGGAGCAAAGCGGTTACAAGCTCACTCTGAGTTGA
CACTTTGATTGGTTTTCCATTCAAGAAAGCTCCTTTCCCTTGGACACCGGTGAATAGCTC
ATCCATAATAGGATTATAGACAACGCCAACGACAGGGACTTTCCCAATGGTAAGGCCAAT
GGACACACAGACAAAAGGGAACCCGTGAACGAAATTAGTAGTTCCATCAAGAGGATCAAC
AATCCAAGCAGGCTCGTCTGTTAATTCAGTCACACCATTTGCAGCTGTTGTCTCTTCTCC
AACGAACTTGTGATTGGGAAAAAGGTGCTTGAGATGGTTAAAAACGAGTTCTTCACATCC
TTTATCAGTCTCTGTCAACAGATCCACCTGGCCTTTGTGTTCAACATGTTTGGTCTCGTA
AAAGCCTTTACGAATCACCTGTCCAGCTTTCTGAGCGGCATCAACGGCAGCAGACAAGAA
CTGATCTAGAGAACCATTTTCAGCCATTTTCGATGTGATTGGAGGAGGAGCGTGCGAGAA
GAATAACGCTTTGTGTGTTTCTGGATGATTCTGAGAAGACAGGAGAAGACACGAGAAAAA
TGTTAGTAGCGGTTTTTGTGGTTGCCCACAGAGCGAATATTCGGGGAATCTAATCCTTAA
CCAAGCTTTTCCATAAAAAGTTTTGTTCTTTCACATTATAGAGAGACTCGAATCTGTGGA
AATGCGATTACTCCCACCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 
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AF RR4E325JQ U 1
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AF RR4AH55JQ U 29
AF RR4AH55TF C 273
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AAAAATTCAGTTGGTTGTGGACATAGTTCAAAAAAAGAAATGCTTTAGTTTGTCACATGA
ATCATATATGGTTCATAAGGTGTGACCATAAGCAAAGAATAA**TAACTTTTCACACATT
TGTAAGCCGCAACGCCTCCACGAACAACTCCTTGAGTGAAGCATTTGACGCCACAATTCT
CTGCGATGTGACGTCCAACTCTTTACCGGATGGATCAAAGATAAGTCCACCAGCTTCTCT
AACAATCACAATTCCAGCTGCAATGTCCCATGGACCGCCGAAACCGATTTCATAGAAGAT
GTCTCCCCTTCCACAAGCGACACCGCAGAGGTCCAGTGCGCACGAGCCACCCATCCTCAG
AGACCTAACCTTGGTAAGTAGACTGTTGATCCGGTTGGTAGCATCGTCTAAGGTAGCTTT
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CACTTTGATTGGTTTTCCATTCAAGAAAGCTCCTTTCCCTTGGACACCGGTGAATAGCTC
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TAAGCAAAAAATAAAATAACTTTTCACACATTTGTAAGCCGCAACGCCTCCACGAACAAC
TCCTTGAGTGAAGCATTTGACGCCGCAATTCTCTGCGATGTGATGTCCAACTCTTTACCG
GATGGATCAAAAATAAGTCCACCAGCTTCTCTAACAATCACAATTCCAGCTGCAATGTCC
CATGGACCGCCGAAACCGATTTCATAAAAAATGTCTCCCCTTCCACAAGCGACACCGCAA
AGGTCCAGTGCGCACGAGCCACCCATCCTCAAAAACCTAACCTTGGTTAGCAAACTGTGG
ATCCGGTTGGTAGCATCGTCTAATGTAGCTTTATCTCGCTTAGTGCCCGCCTCTGCTAGG
AGCAAAGCGGTTACAAGCTCACTCTGAGTTGACACTTTGATTGGTTTTCCATTCAAGAAA
GCTCCTTTCCCTTGGACACCGGTGAATAGCTCATCCATAATCGGATTATAGACAACGCCA
ACGACAGGGACTTTCCCAATGGTAAGGCCAATGGACACACAGACAAAAGGGAACCCGTGA
ACGAAAT

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GGTTGGTAGCATCGTCTAATGTAGCTTTATCTCGCTTAGTGCCCGCCTCTGCTAGGAGCA
AAGCGGTTACAAGCTCACTCTGAGTTGACACTTTGATTGGTTTTCCATTCAAGAAAGCTC
CTTTCCCTTGGACACCGGTGAATAGCTCATCCATAATCGGATTATAGACAACGCCAACGA
CAGGGACTTTCCCAATGGTAAGGCCAATGGACACACAGACAAAAGGGAACCCGTGAACGA
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CACCATTTGCAGCTGTTGTCTCTTCTCCAACGAACTTGTGATTGGGAAAGAGGTGCTTGA
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CTTTGTGTTCAACATGTTTGGTCTCGTAAAAGCCTTTACGAATCACCTGTCCAGCTTTCT
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ATGTGATTGGAGGAGGAGCGTGTGAGAAGAATAACGTTTTGTGTGTTTCTGG
GTCC

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CATCAAGAGGATCAACGATCCAAGCAGGCTCGTCTGTTAATTCAGTCACACCATTTGCAG
CTGTTGTCTCTTCTCCAATGAACTTGTGATTGGGAAAAAGGTGCTTGAGATGGTTAAACA
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CATGTTTGGTCTCGTAAAAGCCTTTACGAATCACCTGTCCAGCTTTCTGAGCGGCATCAA
TGGCAGCAGACAAGAACTGATCTAGAGAACCATTTTCAGCCATTTTCGATGTGATTGGAG
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GAAGACACGAGAAAAATGTTAGTAGCGGTTTTTGTGGTTGCCCACAGAGCGAATATTCGG
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GACTCGAATCTGTGGAAATGCGATTACTCCCACCCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 4

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TCCCCAAAAAAAAAAAAGAGATGGAGGAAGCAGCGGCGCATCCTTACGTTCCGAGAGATC
TGAAACTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCATGTCAAGTATCCTCGCAGTCTACC
TCGGTGCTTCCCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCTACTCGGGAGGAAGAAACCGC
ATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCACCGGTCTCACTCACATGGTTCTCG
AGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTTTTCAAGGACAACACCTCTTGTTATCTCGCTG
AAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGGGATTCTAGATACGCGGGGAGAGATTCTGCAGTTA
TAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTCTTGAAGGCCCTGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATG
CTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTATGTGCTTCAGCTTGCCATTTCGCTAGGCCAGC
TCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGAAGGAGATAACTTTGCTACTA
ACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTGGCGCTAATGGATGGTGGGTTTTGATTCCTC
TCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTACAAGTCCCAACGGTGTGGAGACTA
AGATTAAGAAGAAAACCCGTTAGAATACAAAAAAAAAAAACTCTTTTACAAGATTCTAGT
TTTTTCATCTCTTCTTTCTGGCTTTGATGCTTGCTTGTTTTCTGTTTCCTCATTTTACCT
GAGAACATCATTAGACTGTTTCCCTTTGAC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA18TF U 1
AF RR4FA18JQ C 90
AF RR4A722TF U 48
AF RR4A722JQ C 109
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BS 60 190 RR4FA18TF
BS 191 191 RR4A722TF
BS 192 230 RR4FA18TF
BS 231 231 RR4A722TF
BS 232 385 RR4FA18TF
BS 386 386 RR4A722TF
BS 387 546 RR4FA18TF
BS 547 547 RR4A722TF
BS 548 589 RR4FA18TF
BS 590 590 RR4A722TF
BS 591 695 RR4FA18TF
BS 696 696 RR4A722TF
BS 697 724 RR4FA18TF
BS 725 725 RR4A722TF
BS 726 734 RR4FA18TF
BS 735 735 RR4A722TF
BS 736 744 RR4FA18TF
BS 745 821 RR4A722TF
BS 822 870 RR4A722JQ

RD RR4FA18TF 747 0 0
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TCCCCAAAAAAAAAAAAGAGATGGAGGAAGCAGCGGCGCATCCTTACGTTCCGAGAGATC
TGAAACTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCATGTCAAGTATCCTCGCAGTCTACC
TCGGTGCTTCTCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCTACTCGGGAGGGAGAAACCGC
ATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCACCGGTCTCACTCACATGGTTCTCG
AGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTTTTCAAGGACAACACCTCTTGTTATCTCGCTG
AAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGTGATTCTAGATACGCGGGGAGAGATTCTGCAGTTA
TAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTCTTGAAGGCCCTGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATG
CTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTATGTGCTTCAGCTTGCCATTTCGCTAGGCCAGC
TCTACGTATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGAAGGAGATAATTTTGCTACTA
ACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTGGCGCTAATGGATGGTGGGTTTTGATTCCTC
TCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTGCAAGTCCCAACGGTGTGGAGACTA
AGAT*AAGAAGAAA*CCCGTTAGA
TGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FA18JQ 659 0 0
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ATGTCCATGTCAAGTATCCTCGCAGTCTACCTCGGTGCTTCTCTCTTTGTCGTCACCTTC
GTCTGGTTTCTACTCGGGAGGGAGAAACCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGG
GCTTTCACCGGTCTCACTCACATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTT
TTCAAGGACAACACCTCTTGTTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGTGAT
TCTAGATACGCGGGGAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTCTT
GAAGGCCCTGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTAT
GTGCTTCAGCTTGCCATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGTATGTCTTGTCTATTTCATTACT
GCTTTCTTGGAAGGAGATAATTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATT
GGCGCTAATGGATGGTGGGTTTTGATTCCTCTCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAG
ATTTGTGCAAGTCCCAACGGTGTGGAGACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGTTAGA
ATGC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4A722TF 774 0 0
GG
ACCTCTCTCCATCCCCAAAAAAAAAAA*GAGATGGAGGAAGCAGCGGCGCATCCTTACGT
TCCGAGAGATCTGAAACTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCATGTCAAGTATCCT
CGCAGTCTACCTCGGTGCTTCCCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCTACTCGGGAG
GAAGAAACCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCACCGGTCTCACTCA
CATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTTTTCAAGGACAACACCTCTTG
TTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGGGATTCTAGATACGCGGGGAGAGA
TTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTCTTGAAGGCCCTGCTTCTCTTCT
TGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTATGTGCTTCAGCTTGCCATTTC
GCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGAAGGAGATAA
CTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTTTCGCTAATGGATGGTGGGT
TTTGATTCCTTTCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTACAAGTGCCAACGG
TGTGGAGACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGTTAGAATACAAAAAAAAAAAACTCTTTTAC
AAGATTCTAGTTTTTTCATCTCTTCTTTCTGGCTTTGATGCTTGCTTGTTTT

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR4A722JQ 762 0 0
TTCCGAGAGATCTGAAACTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCATGTCAAGTATCC
TCGCAGTCTACCTCGGTGCTTCCCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCTACTCGGGA
GGAAGAAACCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCACCGGTCTCACTC
ACATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTTTTCAAGGACAACACCTCTT
GTTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGGGATTCTAGATACGCGGGGAGAG
ATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTCTTGAAGGCCCTGCTTCTCTTC
TTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTATGTGCTTCAGCTTGCCATTT
CGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGAAGGAGATA
ACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTTTCGCTAATGGATGGTGGG
TTTTGATTCCTTTCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTACAAGTGCCAACG
GTGTGGAGACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGTTAGAATACAAAAAAAAAAAACTCTTTTA
CAAGATTCTAGTTTTTTCATCTCTTCTTTCTGGCTTTGATGCTTGCTTGTTTTCTGTTTC
CTCATTTTACCTGAGAACATCATTAGACTGTTTCCCTTTGAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 5

CO CL2204Contig1 840 5 6 U
AGATGGCCCACGCCAAATTTCATTTTTTTTATTACACAATAATTATTCTTTTGATGGTCA
CTTTTTTTTTTTTTACATCGCCTTTTGATGGTCACTTTTCTAGAACTTTGGAACTCTCTC
TCTCAGGACATGATGGATTTCTAATCTCGATGATCACAGTCAGTGATAATAAAAAAAGAA
AACACAGTACAAACTTTTTAATAGGTAAAAACGAATAGGGCTTTGGTTCAGCTCTGCGGC
AGCGGCATTGTGACTTATTAAGCAGCAAGTGGATTGGCGTGGATTGTAACACGGTTTAGC
CTTATCTCAGCAAGCGGCCTATCTCCCGCACCTGTTTGAGTCTTTTCCATAATGTCAAGC
ACTTCGAAGCCATGGATGACTTTGCCAAAGATGGTGTATAATCCATTGAGATGAGGTTGT
TTGGCATAGGTAAGGAAGAACTGGCTTCCATTTGTGTTTGGGCCACTGTTTGCCATCGAC
AGCATCCCTCTTGCATTGTGCTTAAGGGAGTCACGAATCTCGTCATTGAATTTCTTTCCC
CAGATGCTAGTTCCTCCTTTCCCTGTACCGGTTGGGTCTCCGCCTTGGATCATGAAGCCT
TTGATGTTCCTGTGAAAGATAGTCCCATCGTAATAGCCACTTGCACATAGCGCCAGAAAG
TTCTCGGCACTCTTTGGAACCTCGTCACAGAAGATCTCGCACTTTATATCCCCCAGATTC
GTGTGCAATGTTATTGACATCGACGCTGTGATGCTTGGAAACTAGCGGAGCTGAGTTGAT
TTCCTACCTCTTCCTTCTCTCGCGTCTATGCTGCTTTGTTTTTGTTCCAGATTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF30JQ U 123
AF RR4GQ10JQ U 124
AF RR4H992JQB U 1
AF RR4BF30TF C 123
AF RR4GQ10TF C 123
BS 1 354 RR4H992JQB
BS 355 355 RR4BF30JQ
BS 356 795 RR4H992JQB
BS 796 796 RR4BF30TF
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BS 818 840 RR4BF30TF

RD RR4BF30JQ 559 0 0
CCG
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CATTGTGACTTATTAAGCAGCAAGTGGATTGGCGTGGATTGTAACACGGTTTAGCCTTAT
CTCAGCAAGCGGCCTAACTCCCGCACCTGTTTGAGTCTTTTCCATAATGTCAAGCACTTC
GAAGCCATGGATGACTTTGCCAAAGATGGTGTATAATCCATTGAGATGAGGTTGTTTGGC
ATAGGTAAGGAAAAACTGGCTTCCATTTGTGTTTGGGCCACTGTTTGCCATCGACAGCAT
CCCTCTTGCATTGTGCTTAAGGGAGTCACGAATCTCGTCATTGAATTTCTTTCCCCAGAT
GCTAGTTCCTCCTTTCCCTGGACCGGTTGGGTCTCCGCCTTGGATCATGAAGCCTTTGAT
GTTCCTGTGAAAGATAGTCCCATCGTAATAGCCACTTGCACATAGCGCCAGAAAGTTCTC
GGCACTCTTTGGAACC

QA 4 559 4 559
DS 

RD RR4GQ10JQ 590 0 0
CC
GGACATGATGGATTTCTAATCTCGATGATCACAGTCAGTGATAATAAAAAAAGAAAACAC
AGTACAGACTTTTTAATAGGTAAAAACGAATAGGGCTTTGGTTCAGCTCTGCGGCAGCGG
CATTGTGACTTATTAAGCAGCAAGTGGATTGGCGTGGATTGTAACACGGTTTAGCCTTAT
CTCAGCAAGCGGCCTATCTCCCGCACCTGTTTGAGTCTTTTCCATAATGTCAAGCACTTC
GAAGCCATGGATGACTTTGCCAAAGATGGTGTATAATCCATTGAGATGAGGTTGTTTGGC
ATAGGTAAGGAAGAACTGGCTTCCATTTGTGTTTGGGCCACTGTTTGCCATCGACAGCAT
CCCTCTTGCATTGTGCTTAAGGGAGTCACGAATCTCGTCATTGAATTTCTTTCCCCAGAT
GCTAGTTCCTCCTTTCCCTGTACCGGTTGGGTCTCCGCCTTGGATCATGAAGCCTTTGAT
GTTCCTGTGAAAGATAGTCCCATCGTAATAGCCACTTGCACATAGCGCCAGAAAGTTCTC
GGCACTCTTTGGAACCTCGTCACAGAAGATCTCGCACTTTATAT
CCCC

QA 3 586 3 586
DS 

RD RR4H992JQB 820 0 0
AGATGGCCCACGCCAAATTTCATTTTTTTTATTACACAATAATTATTCTTTTGATGGTCA
CTTTTTTTTTTTTTACATCGCCTTTTGATGGTCACTTTTCTAGAACTTTGGAACTCTCTC
TCTCAGGACATGATGGATTTCTAATCTCGATGATCACAGTCAGTGATAATAAAAAAAGAA
AACACAGTACAAACTTTTTAATAGGTAAAAACGAATAGGGCTTTGGTTCAGCTCTGCGGC
AGCGGCATTGTGACTTATTAAGCAGCAAGTGGATTGGCGTGGATTGTAACACGGTTTAGC
CTTATCTCAGCAAGCGGCCTATCTCCCGCACCTGTTTGAGTCTTTTCCATAATGCCAAGC
ACTTCGAAGCCATGGATGACTTTGCCAAAGATGGTGTATAATCCATTGAGATGAGGTTGT
TTGGCATAGGTAAGGAAGAACTGGCTTCCATTTGTGTTTGGGCCACTGTTTGCCATCGAC
AGCATCCCTCTTGCATTGTGCTTAAGGGAGTCACGAATCTCGTCATTGAATTTCTTTCCC
CAGATGCTAGTTCCTCCTTTCCCTGTACCGGTTGGGTCTCCGCCTTGGATCATGAAGCCT
TTGATGTTCCTGTGAAAGATAGTCCCATCGTAATAGCCACTTGCACATAGCGCCAGAAAG
TTCTCGGCACTCTTTGGAACCTCGTCACAGAAGATCTCGCACTTTATATCCCCCAGATTC
GTGTGCAATGTTATTGACATCGACGCTGTGATGCTTGGAAACTAGCGGAGCTGAGTTGAT
TTCCTACCTCTTCCT*CTCTCGCGTCTATGCTGCTTT
GTT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4BF30TF 718 0 0
CCG
GGACATGATGGATTTCTAATCTCGATGATCACAGTCAGTGATAATAAAAAAAGAAAACAC
AGTACAAACTTTTTAATAGGTAAAAACGAATAGGGCTTTGGTTCAGCTCTGCGGCAGCGG
CATTGTGACTTATTAAGCAGCAAGTGGATTGGCGTGGATTGTAACACGGTTTAGCCTTAT
CTCAGCAAGCGGCCTAACTCCCGCACCTGTTTGAGTCTTTTCCATAATGTCAAGCACTTC
GAAGCCATGGATGACTTTGCCAAAGATGGTGTATAATCCATTGAGATGAGGTTGTTTGGC
ATAGGTAAGGAAGAACTGGCTTCCATTTGTGTTTGGGCCACTGTTTGCCATCGACAGCAT
CCCTCTTGCATTGTGCTTAAGGGAGTCACGAATCTCGTCATTGAATTTCTTTCCCCAGAT
GCTAGTTCCTCCTTTCCCTGGACCGGTTGGGTCTCCGCCTTGGATCATGAAGCCTTTGAT
GTTCCTGTGAAAGATAGTCCCATCGTAATAGCCACTTGCACATAGCGCCAGAAAGTTCTC
GGCACTCTTTGGAACCTCGTCACAGAAGATCTCGCACTTTATATACCCCAGATTCGTGTG
CAATGTTATTGACATCGACGCTGTGATGCTTGGAAACTAGCGGAGCTGAGTTGATTTCCT
ACCTCTTCCTTCTCTCGCGTCTATGCTGCTTTGTTTTTGTTCCAGATTTCTCTCC

QA 4 718 4 718
DS 

RD RR4GQ10TF 697 0 0
TCC
GGACATGATGGATTTCTAATCTCGATGATCACAGTCAGTGATAATAAAAAAAGAAAACAC
AGTACAGACTTTTTAATAGGTAAAAACGAATAGGGCTTTGGTTCAGCTCTGCGGCAGCGG
CATTGTGACTTATTAAGCAGCAAGTGGATTGGCGTGGATTGTAACACGGTTTAGCCTTAT
CTCAGCAAGCGGCCTATCTCCCGCACCTGTTTGAGTCTTTTCCATAATGTCAAGCACTTC
GAAGCCATGGATGACTTTGCCAAAGATGGTGTATAATCCATTGAGATGAGGTTGTTTGGC
ATAGGTAAGGAAGAACTGGCTTCCATTTGTGTTTGGGCCACTGTTTGCCATCGACAGCAT
CCCTCTTGCATTGTGCTTAAGGGAGTCACGAATCTCGTCATTGAATTTCTTTCCCCAGAT
GCTAGTTCCTCCTTTCCCTGTACCGGTTGGGTCTCCGCCTTGGATCATGAAGCCTTTGAT
GTTCCTGTGAAAGATAGTCCCATCGTAATAGCCACTTGCACATAGCGCCAGAAAGTTCTC
GGCACTCTTTGGAACCTCGTCACAGAAGATCTCGCACTTTATATCCCCCAGATTCGTGTG
CAATGTTATTGACATCGACGCTGTGATGCTTGGAAACTAGCGGAGCTGAGTTGATTTCCT
ACCTCTTCCTTCTCTCGCGTCTATGCTGCTTT
CC

QA 4 695 4 695
DS 



AS 1 3

CO CL2205Contig1 1125 3 10 U
GGCCACAGCTTTCTATCTCGCAGCCCTAAAACTCCTTTGCCTCTCTCTCTCGAATCTCTC
TTCCACCTTCAACATCAAATGGAATTCTGGGGAGCCGAGGTTAAGGCAGGGAAGCCACTT
AAAGTGGAACCCGAAGAGAACTGTCTCATCCACGTTTCACAGGCATCTCTTGATAAAGGG
AAGAAGGGTGAGACTGCCCTCTTGTACGTGACCGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGATTGGA
ACTCTTTCTCAGGATAACATCCCCCAGATCAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAGGAGTTT
GAGCTCTCCCACTCGTCAAAGGGAAGCGTCCACTTTATTGGATACAAGTCTCCCAACCTC
GATGAAGAGGAGGATTTCCCTTCTGATTCAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGTGGCGGTTCCC
GCAGCTTCCACTGTCTCCACTGTCACGACGACCAATGGAAGTGCTAAAGCAGCACCTGCT
TCGAGTGCTGTTACCATTGACTCGAAACCGAAGGCCAAGGTTCCTGAGGTGAAGCCTGAA
TCAGACGAGGATGATGATGACTCTGACGAGGAGGGTGATTCTGAAGATGATGAATCTGAT
TCTGAGAAAGGAATGGATGTTGATTCCGATGAT***GATGA***AGATGATTCTGAGGAG
GAAGAAGAGGATGATACCCCTAAGAAGCCTGAGCCAAGCAGCAACAAGAAGAGGCAGAAT
GAATCTGCAACACCTGTCTCTGCAAAGAAGGCTAAGCCCGCAGTAGCAGCTACCCCTCAG
AAATCAGAGGAGAAGAAGAAAGGAGGGCACACAGCTACACCACACCCAGCTAAAAAGGGT
GGAAAGAGTCCTATGAATGCTAACCAGAGCCCCAAATCTGGAGGTCAATCATCTGGTAGT
AACAAGGAGCCATTCAACTCAGGAGGCAAGCAGTTTGGTTCTAACAAGGGCAACAAGGGA
AAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGTGAAGTGAGGGGAGCAATGAGATGTTTTGGTTTTTAGT
AGATGTTCTTGGAGCAAAGACCGGCTTTCTTTTATGTTTTATCTCCTTGTGGGAAGTGCT
TTTATGTTAACGCAATTTTAATCTTATGGAATTCAGTATTTGAGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BW65TF U 3
AF RR4AA75TF U 1
AF RR4AA75JQ C 304
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GG
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QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 5

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GGGACG


BQ
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20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4E320JQ U 48
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AF RR4DT50JQ U 4
AF RR4E320TF C 245
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BS 839 848 RR4DT50JQ
BS 849 906 RR4E320TF

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GAAAACAAAACAGAAGAGACCAAGTCACAGAGAAAGGTTAACAAAAGATGGACATAAGCC
ATATTACGAATCCGCTCTTTGTTTTACGCCAATAAAAGGCTTTTTTATTGGTATGGCATG
TAACGCATTGGCCTTCTGAACCTAGGCGGCGCTTTCCCATATCCATAAGGAGAATACATA
TACGGAGACATGAAAGGTCTGCGGAACCGGTACCCCATGTACGGGTTGAATCGTCTACCA
CGGAACTGTTTCAATCCAGGAACGTTTGTTCTCTTAGGCAGCACCTTTAGTTGACGACCA
TGTAACTCTGATTCATTCAGTTGTAGAGCCTCTTGTATGGCTTCAACTTCCACAAACTCT
ACATAAGCAAATCCCTTTGGCTGCCCGAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACCCGATGGACA
GTCCCGCATGATTGGAAATGTTGCTGCACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAATCAACATTG

QA 1 540 1 540
DS 

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CTTATAAATACCAGTCAAGATTCCAAGTGTTTACGCGCCAAGTTATAGAAAACAAAACAG
AAGAGACCAAGTCACAGAGAAAGGTTAACAAAAGATGGACATAAGCCATATTACGAATCC
GCTCTTTGTTTTACGCCAATAAAAGGCTTTTTTATTGGTATGGCATGTAACGCATTGGCC
TTCTGAACCTAGGCGGCGCTTTCCCATATCCATAAGGAGAATACATATACGGAGACATGA
AAGGTCTGCGGAACCGGTACCCCATGTACGGGTTGAATCGTCTACCACGGAACTGTTTCA
ATCCAGGAACGTTTGTTCTCTTAGGCAGCACCTTTAGTTGACGACCATGTAACTCTGATT
CATTCAGTTGTAGAGCCTCTTGTATGGCTTCAACTTCCACAAACTCTACATAAGCAAATC
CCTTTGGCTGCCCGAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACCCGATGGACAGTCCCGCATGATT
GGAAATGTTGCTGCACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAG
ACCGAGCATCCACTTCCTCCTTGCCTGCTTGATTTGCTGCTATAGTAGCAGGATCTTGAG
CTCCCATCTCCTTCTCAACTTTGGCCTGCATCTCACGAAGA

QA 1 701 1 701
DS 

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ATAAATACCAGTCAAGATTCCAAGTGTTTACGCGCCAAGTTATAGAAAACAAAACAGAAG
AAACCAAGTCACAGAGAAAGGTTAACAAAAGATGGACATAAGCCATATTACGAATCCGCT
CTTTGTTTTACGCCAATAAAAGGCTTTTTTATTGGTATGGCATGTAACGCATTGGCCTTC
TGAACCTAGGCGGCGCTTTCCCATATCCATAAGGAGAATACATATACGGAGACATGAAAG
GTCTGCGGAACCGGTACCCCATGTACGGGTTGAATCGTCTACCACGGAACTGTTTCAATC
CAGGAACGTTTGTTCTCTTAGGCAGCACCTTTAGTTGACGACCATGTAACTCTGATTCAT
TCAGTTGTAGAGCCTCTTGTATGGCTTCAACTTCCACAAACTCTACATAAGCAAATCCCT
TTGGCTGCCCGAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACCCGATGGACAGTCCCGCATGATTGGA
AATGTTGCTGCACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAGACC
GAGCATCCACTTCCTCCTTGCCTGCTTGATTTGCTGCTATAGTAGCAGGATCTTGAGCTC
CCATCTCCTTCTCAACTTTGGCCTGCATCTCACGAAGAGCAGCAGCTTCATCCTCCATCT
CCTTCAACCGTTTCTTCATCTCATCCAACTCCTTAGCAGAATCCTCATCGGCAGCAGACA
TGTCCATATCAG*ATTATGAGCCTCCCCGTCACCATCA*TCTCTCCGACGTCGG*AATCT
CTCCC

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4E320TF 662 0 0
GAACCTAGGCGGCGCTTTCCCATATCCATAAGGAGAATACATATACGGAGACATGAAAGG
TCTGCGGAACCGGTACCCCATGTACGGGTTGAATCGTCTACCACGGAACTGTTTCAATCC
AGGAACGTTTGTTCTCTTAGGCAGCACCTTTAGTTGACGACCATGTAACTCTGATTCATT
CAGTTGTAGAGCCTCTTGTATGGCTTCAACTTCCACAAACTCTACATAAGCAAATCCCTT
TGGCTGCCCGAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACCCGATGGACAGTCCCGCATGATTGGAA
ATGTTGCTGCACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAGACCG
AGCATCCACTTCCTCCTTGCCTGCTTGATTTGCTGCTATAGTAGCAGGATCTTGAGCTCC
CATCTCCTTCTCAACTTTGGCCTGCATCTCACGAAGAGCAGCAGCTTCATCCTCCATCTC
CTTCAACCGTTTCTTCATCTCATCCAACTCCTTAGCAGAATCCTCATCGGCAGCAGACAT
GTCCATATCAGGATTATGAGCCTCCCCGTCACCATCAATCTCTCCGACGTCGGGAATCTC
TCCCCCGTAAACCTCGTGCTCCTCTTCCTCCATCGCTCTCCTCTCCTTCCCCGACCGGGA
CG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DT50TF 654 0 0
GCGGCGCTTTCCCATATCCATAAGGAGAATACATATACGGAGACATGAAAGGTCTGCGGA
ACCGGTACCCCATGTACGGGTTGAATCGTCTACCACGGAACTGTTTCAATCCAGGAACGT
TTGTTCTCTTAGGCAGCACCTTTAGTTGACGACCATGTAACTCTGATTCATTCAGTTGTA
GAGCCTCTTGTATGGCTTCAACTTCCACAAACTCTACATAAGCAAATCCCTTTGGCTGCC
CGAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACCCGATGGACAGTCCCGCATGATTGGAAATGTTGCT
GCACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAGACCGAGCATCCA
CTTCCTCCTTGCCTGCTTGATTTGCTGCTATAGTAGCAGGATCTTGAGCTCCCATCTCCT
TCTCAACTTTGGCCTGCATCTCACGAAGAGCAGCAGCTTCATCCTCCATCTCCTTCAACC
GTTTCTTCATCTCATCCAACTCCTTAGCAGAATCCTCATCGGCAGCAGACATGTCCATAT
CAGGATTATGAGCCTCCCCGTCACCATCAATCTCTCCGACGTCGGGAATCTCTCCCCCGT
AAACCTCGTGCTCCTCTTCCTCCATCGCTCTCCTCTCCTTCCCCGACCGGGACG

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 3

CO CL2207Contig1 1024 3 6 U
ATCCTTAAAAGATCCGAACCCGTATATACATACGCATGTATTAGTTTATACAGCGAATGT
TTTTAACTTCTTATGTTGAGAAAGAAAATGAATTAGACAATAAACCGAACAACACTCTTT
TCTCTTCTGTACATAAATATTTTATAAATTAAAGAAAAAGGACCAAAATCAGATAAAAAC
CAACAAAACTCTCCCCTTCTCTCTCTCGTCTCTTCTACATAAAGTAGCTCAAGGACGTCT
TCTTCCTTGACCCACCTTCTCCGTACAGCTCGTTCCACTGCTGAAGCTCGTTCATGTTCG
ATGAGTCCGTAGGCACACTCGCACAGACCTGTTCATGTGCAGCCTTGAAATCTGCCATTG
TCAGTGGACGTATGTCTGTGCAGCTATACAAAGGAGGCGTTGGACGGTTCTCTATCCTTT
GTTCTTAAACCGTCCCCAGTTTACCATGAACTCGTTCTTCATCTTACGCATAGCTTCATG
CTCCCCTGGATTCTCACGTCTTCCCAACATGCTATCAACCTCATCAACAAAAATGACACT
TGGAGCGATCTTGCTTGCTAAAGAGAAGACAGCTTTAACATACTTCTCTCCCTCGCCAAA
CCACTTTGAAGTAATGCTGGACATTGAGATATTGATGAAGTTTGCGCCAGCTTCAGTAGC
TACTGCCTTTGCCAGCATTGTCTTCCCAGTACCAGGTGGTCCAAACAACAGGATACCTTT
CGTAGGCTTAGTTAGCTGGCCTTTGTCAAATAACTCAGGTCTTTGAAGAGGGAGCATCAC
CAACTCCTTCAGTGTGTCTTTCACATTCTCCAGAGCCCCAATATCATCAAATGAAACGCC
TATATCGCTAGGGGGAATGACATCTGATAAGAGTTTTTTCTCAAATTCGTTCTCTGTCAC
AACATCCTTGGGGGATTTCTTGAGACTCTTGTTTTCGTCCTGAACTCCATGTAACATCTG
CAGGCCATATGTAATGCTTTCTGCTGAGATAACAAGCTTGTTGTCTTTGACTGTAGGTTC
TGCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4GH44JQ U 3
AF RR4BO94JQ U 1
AF RR4BO94TF C 278
BS 1 187 RR4BO94JQ
BS 188 188 RR4GH44JQ
BS 189 436 RR4BO94JQ
BS 437 437 RR4BO94TF
BS 438 567 RR4BO94JQ
BS 568 1024 RR4BO94TF

RD RR4GH44JQ 369 0 0
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TTAACTTCTTATGTTGAGAAAGAAAATGAATTAGACAATAAACCGAACAACACTCTTTTC
TCTTCTGTACATAAATATTTTATAAATTAAAGAAAAAGGACCAAAATCAGATAAAAACCA
ACAAAACTCTCCCCTTCTCTCTCTCGTCTCTTCTACATAAAGTAGCTCAAGGACGTCTTC
TTCCTTGACCCACCTTCTCCGTACAGCTCGTTCCACTGCTGAAGCTCGTTCATGTTCGAT
GAGTCCGTAGACACACTCGCACAGACCTGTTCATGTGCAGCCTTGAAATCTGCCATTGTC
AGTGGACGT

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4BO94JQ 567 0 0
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TTTTAACTTCTTATGTTGAGAAAGAAAATGAATTAGACAATAAACCGAACAACACTCTTT
TCTCTTCTGTACATAAATATTTTATAAATTAAAGAAAAAGGACCAAAATCAGATAAAAAC
CAACAAATCTCTCCCCTTCTCTCTCTCGTCTCTTCTACATAAAGTAGCTCAAGGACGTCT
TCTTCCTTGACCCACCTTCTCCGTACAGCTCGTTCCACTGCTGAAGCTCGTTCATGTTCG
ATGAGTCCGTAGGCACACTCGCACAGACCTGTTCATGTGCAGCCTTGAAATCTGCCATTG
TCAGTGGACGTATGTCTGTGCAGCTATACAAAGGAGGCGTTGGACGGTTCTCTATCCTTT
GTTCTTAAACCGTCCC*AGTTTACCATGAACTCGTTCTTCATCTTACGCATAGCTTCATG
CTCCCCTGGATTCTCACGTCTTCCCAACATGCTATCAACCTCATCAACAAAAATGACACT
TGGAGCGATCTTGCTTGCTAAAGAGAA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4BO94TF 747 0 0
CTGCTGAAGCTCGTTCATGTTCGATGAGTC*GTAGGCACACTCGCACAGACCTGTTCATG
TGCAGCCTTGAAATCTGCCATTGTCAGTGGACGTATGTCTGTGCAGCTATACAAAGGAGG
CGTTGGACGGTTCTCTATCCTTTGTTCTTAGACCGTCCCCAGTTTACCATGAACTCGTTC
TTCATCTTACGCATAGCTTCATGCTCCCCTGGATTCTCACGTCTTCCCAACATGCTATCA
ACCTCATCAACAAAAATGACACTTGGAGCGATCTTGCTTGCTAAAGAGAAGACAGCTTTA
ACATACTTCTCTCCCTCGCCAAACCACTTTGAAGTAATGCTGGACATTGAGATATTGATG
AAGTTTGCGCCAGCTTCAGTAGCTACTGCCTTTGCCAGCATTGTCTTCCCAGTACCAGGT
GGTCCAAACAACAGGATACCTTTCGTAGGCTTAGTTAGCTGGCCTTTGTCAAATAACTCA
GGTCTTTGAAGAGGGAGCATCACCAACTCCTTCAGTGTGTCTTTCACATTCTCCAGAGCC
CCAATATCATCAAATGAAACGCCTATATCGCTAGGGGGAATGACATCTGATAAGAGTTTT
TTCTCAAATTCGTTCTCTGTCACAACATCCTTGGGGGATTTCTTGAGACTCTTGTTTTCG
TCCTGAACTCCATGTAACATCTGCAGGCCATATGTAATGCTTTCTGCTGAGATAACAAGC
TTGTTGTCTTTGACTGTAGGTTCTGCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 4

CO CL2208Contig1 1327 4 15 U
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TGAGTGGTGAAAGAAAAAGAAAAAACTTAAAAGAGAAAATGAAGATGGTTCAAGGCTTTT
CCTGGAAACCCCATGGATTCTTATTTGCCCAGTTCCATTGATCTCTGCACATCTCATCCA
CTCCATACTGTGCCTTCCATCCAAGTTCTTTCTCAGCTCTCTCAGTTGAAGCATAAACAG
CTGTTGCATCTCCAGCTCTTCTTGGACACAGCTTCATTGGGATTTTCTTGCCAGAAGCTT
TTTCGAAAGCAGAAACCATTTCCAAGACAGAAGTTCCTTGACCAGTCCCAAGATTATAAG
CAGTACAACCAATCTTTGGATCATTAAACAGCTTGTTCAGCGCAGCGACATGTCCATCTG
CTAAATCCATCACATGGATATAGTCTCTGACCGCGCTACCATCCGGTGTAGGATAGTCAT
GTCCAAACACATTGAGCTCAGGTAACCTTCCAACCGCAACTTGCTGGATATAAGGCATGA
GATTGTTCGGTATGCCCTTTGGATCTTCTCCGATCCTCCCGCTCTCGTGAGCTCCAACAG
GATTGAAGTACCTCAGAAGAATTATCCTCCACTCTGGCTCTGCCGCGTGAATGTCTCTAG
CTATCTCTTCAAGATACAGCTTGGTGCGACCGTAAGGATTCATAGCCTGTAACTCAAAGT
CTTCCACACATGGGACTATCTCTGGTTGGCCATAAACTGTTGCCGACGAAGAAAACACCA
TCATTTTGCAGTTGTACTTTGCCATTGTCTCATAGAGATTGATAGTCCCAACTAAGTTGT
TGTCAAAGTAACGACGAGGGTTTGCAACACTTTCACCCACAGCTTTAAGACCAGCAAAGT
GAATCACAGCATCAAATCTCTGATTGGAGAAGAGTTTATCAATGTCTCCTTTGTTTCTCA
AATCACCCAGATGGAATTCAAGCTTGGAAGAGAGATCAGGACCAACAAGCTCACGAACCC
TATGAACAGCTTCAAGGACAGAGTTATCAAGATTGTCGATGATGGAAACCTTGAAGCCCC
GATTCAAAAGCTGAACAACAGTGTGCGTCCCAATGAACCCAGCACCACCAGTCACCAAAA
TGCACTGCTCCGCAGAAGAACCCATTGATCTTTTTCAGCAAATCAATCAAGGGGAGAGAG
GGAAAGTAAGAGTCTTTTTATTGATCTGTTGGGGTTATTGTGAGTAGATAAGAACGTAGC
CGTGAACGGAATAAAGGAAGAGGTTAAGATGGAGAAATCTCCTTTTTGATGGTTTCTTTT
ATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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DS 



AS 2 4

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BQ
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AF RR4FH42JQ U 2
AF RR4CQ87JQ U 1
BS 1 832 RR4CQ87JQ

RD RR4FH42JQ 784 0 0
GCCAATAGTTCCAAAGCTGATAAAAATAAAACTGAATGTATTACAATTTTTGCCATATAC
TAGAGCAAAAAAACTTAAAATTACAAAGAGAAAAGAGGTTGCCAACTTATATATATGATA
TAAGTACATGGACCTTGCCAAAATATATTAATTGGATAGAAAGAAGCTAGCCAAAATATA
CTATGCGGCTAATTACTTTTATTATTGATGATTATATATATGAAATTGCTTCATGAGGCA
AAGCAGCCAAGGTTGCAGTTGTAAACGGGTTCAAGAGATAAATCAAGGTCGTTTCTCCTC
ATTGCCATTGGATCATCTTCTTCTTGATATAGGCCACCCATGTTGAGAAAAGGAGATGGC
TGATGAGAGAGAATGTATGGATGCTGGATTTGATGCTGCTGCGGGGGCGGAGGCAAATTT
TGGCCATGGTTCTGCTGGTCCCATTGCTCTTGCTGTGCCCTAAGAACTTTTTCCCTCTCC
TTGATCTGTTTGGAAAGCATGCTGTTTTGTTCCTGTATCGCCTTCTCCTTTCTTTGGAGC
TCACTGACGGAGTCGTACATAAGTTGGTTTTTTCTAGATCGGATGTGCTTAAGAGCAGTG
TCAAGCTGCTGCTCCAGATTCTGGAGCTCTTTAGGGCTCATTGCTTGCAAGTCTTCCCCA
AGATAGTGCCTCTGGTTTCTCTCCAAAAGCTCAATCTTAGCCTTAAGCCTGTTATACTCC
ATTGACCAGTTCGTATTGACGTCTGACTCAGTGCAATAAGCTGTCTCTCGGCGTA
AGAGTACTC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4CQ87JQ 832 0 0
CGCCAATAGTTCCAAAGCTGATAAAAATAAAACTGAATGTATTACAATTTTTGCCATATA
CTAGAGCAAAAAAACTTAAAATTACAAAGAGAAAAGAGGTTGCCAACTTATATATATGAT
ATAAGTACATGGACCTTGCCAAAATATATTAATTGGATAGAAAGAAGCTAGCCAAAATAT
ACTATGCGGCTAATTACTTTTATTATTGATGATTATATATATGAAATTGCTTCATGAGGC
AAAGCAGCCAAGGTTGCAGTTGTAAACGGGTTCAAGAGATAAATCAAGGTCGTTTCTCCT
CATTGCCATTGGATCATCTTCTTCTTGATATAGGCCACCCATGTTGAGAAAAGGAGATGG
CTGATGAGAGAGAATGTATGGATGCTGGATTTGATGCTGCTGCGGGGGCGGAGGCAAATT
TTGGCCATGGTTCTGCTGGTCCCATTGCTCTTGCTGTGCCCTAAGAACTTTTTCCCTCTC
CTTGATCTGTTTGGAAAGCATGCTGTTTTGTTCCTGTATCGCCTTCTCCTTTCTTTGGAG
CTCACTGACGGAGTCGTACATAAGTTGGTTTTTTCTAGATCGGATGTGCTTAAGAGCAGT
GTCAAGCTGCTGCTCCAGATTCTGGAGCTCTTTAGGGCTCATTGCTTGCAAGTCTTCCCC
AAGATAGTGCCTCTGGTTTCTCTCCAAAAGCTCAATCTTAGCCTTAAGCCTGTTATACTC
CATTGACCAGTTCGTATTGACGTCTGACTCAGTGCAATAAGCTGTCTCTCGGCGTAGAGT
ACTCTCATAGCGTTCAAGTATCTTCTCATGCAAGATCAGTGGAGTATTCAAA

QA 1 832 1 832
DS 



CO CL2209Contig2 690 2 3 U
GGGAGACTCAAACACAAGTCTTATTATAAAGGAAATAAAGAAAACTTTCCTAATTGGATC
ATACCAAAGCCTGGGCTCTTCTTTATCTCTCTTCTCGTAGTTTCTTGTTTTGTTTGGTTC
TTTTAGAAGAAATAGTTTCTTAAAAAAGGGATCAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAACTG
AAGAGGATAGAGAACAAAATCAATAGACAAGTGACATTCTCCAAAAGAAGAGCTGGTCTT
TTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTTC
TCCCATAAGGGGAAACTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGCATGGAGAAGATACTTGAA
CGCTATGAGAGGTACTCTTACGCCGAGAGACAGCTTATTGCACCTGAGTCAGACGTCAAT
ACGAACTGGTCAATGGAGTATAACAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAAC
CAGAGGCACTATCTTGGGGAAGACTTGCAAGCAATGAGCCCTAAAGAGCTCCAGAATCTG
GAGCAGCAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGATCTAGAAAAAACCAACTTATGTAC
GACTCCGTCAGTGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGGCGATACAGGAACAAAACAGCATGCTT
TCCAAACAGATCAAAGAGAGGGAAAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH42TF U 1
AF RR4CQ87TF U 62
BS 1 197 RR4FH42TF
BS 198 198 RR4CQ87TF
BS 199 690 RR4FH42TF

RD RR4FH42TF 690 0 0
GGGAGACTCAAACACAAGTCTTATTATAAAGGAAATAAAGAAAACTTTCCTAATTGGATC
ATACCAAAGCCTGGGCTCTTCTTTATCTCTCTTCTCGTAGTTTCTTGTTTTGTTTGGTTC
TTTTAGAAGAAATAGTTTCTTAAAAAAGGGATCAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAACTG
AAGAGGATAGAGAACAAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCCAAAAGAAGAGCTGGTCTT
TTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTTC
TCCCATAAGGGGAAACTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGCATGGAGAAGATACTTGAA
CGCTATGAGAGGTACTCTTACGCCGAGAGACAGCTTATTGCACCTGAGTCAGACGTCAAT
ACGAACTGGTCAATGGAGTATAACAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAAC
CAGAGGCACTATCTTGGGGAAGACTTGCAAGCAATGAGCCCTAAAGAGCTCCAGAATCTG
GAGCAGCAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGATCTAGAAAAAACCAACTTATGTAC
GACTCCGTCAGTGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGGCGATACAGGAACAAAACAGCATGCTT
TCCAAACAGATCAAAGAGAGGGAAAAGTTC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4CQ87TF 600 0 0
TACCAAAGCCTGGGCTCTTCTTTATCTCTCTTCTCGTAGTTTCTTGTTTTGTTTGGTTCT
TTTAGAAGAAATAGTTTCTTAAAAAAGGGATCAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAACTGA
AGAGGATAGAGAACAAAATCAATAGACAAGTGACATTCTCCAAAAGAAGAGCTGGTCTTT
TCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTTCT
CCCATAAGGGGAAACTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGCATGGAGAAGATACTTGAAC
GCTATGAGAGGTACTCTTACGCCGAGAGACAGCTTATTGCACCTGAGTCAGACGTCAATA
CGAACTGGTCAATGGAGTATAACAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAACC
AGAGGCACTATCTTGGGGAAGACTTGCAAGCAATGAGCCCTAAAGAGCTCCAGAATCTGG
AGCAGCAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGATCTAGAAAAAACCAACTTATGTACG
ACTCCGTCAGTGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGGCGATACAGGAACAAAACAGCATGCTTT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 4

CO CL2210Contig1 903 4 6 U
GGACACTATCAGAAGAATCTGATCCCACCTTTCTTTGATTCTGAGGCCAAAAGTTAAGTC
AAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACCCCGTGTTTGGAAGGAATGAAGAATGTC
AAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGACCATCTTG
CCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAAC
ATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGCACAAGTACTTGTACACC
TTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCTAAGACTGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGT
CTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTAGTAGCA
CATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAA
TGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCCACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGG
AAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTT
TGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTG
GATGACCTGAAAGCTTCTTGAGCCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTTT
TTCAGAAAAAAAAATTGTCTGTTTTAAAGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGAC
TATCCAAAGAAACAGAATAATGTTCTCACTTTATATTATAAGTTTATATAAAAAAGACCA
AATACATGTTTAGACATGCATGTGTTTAATTAATAATAGTATTTGATGTTCTGTTGTGGT
CTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4AA01TF U 41
AF RR4ED86TF U 1
AF RR4DQ78JQ C 565
AF RR4ED86JQ C 186
BS 1 92 RR4ED86TF
BS 93 93 RR4AA01TF
BS 94 158 RR4ED86TF
BS 159 159 RR4AA01TF
BS 160 685 RR4ED86TF
BS 686 903 RR4ED86JQ

RD RR4AA01TF 283 0 0
GG
GAGGCCAAAAGTTAAGTCAAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACCCCGTGTTTG
GAAGGAATGAAGAATGTCAAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGAC
CTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAA
GCTGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCGGACAAG
TACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTC

QA 3 283 3 283
DS 

RD RR4ED86TF 685 0 0
GGACACTATCAGAAGAATCTGATCCCACCTTTCTTTGATTCTGAGGCCAAAAGTTAAGTC
AAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAATGAAGAATGTC
AAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTGGACCTCTGCAAGACCATCTTG
CCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAAC
ATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGCACAAGTACTTGTACACC
TTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCTAAGACTGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGT
CTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTAGTAGCA
CATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAA
TGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCCACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGG
AAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTT
TGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTG
GATGACCTGAAAGCTTCTTGAGCCA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4DQ78JQ 247 0 0
GGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTT
CAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGACCTGAAAGCTTCTTGAGCC
ATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTTTTTCAGAAAAAAAAATTGTCTGTTT
TAAAGTTTTTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATCCAAAGAAACAGAATAATGTT
CTCACTT

QA 1 247 1 247
DS 

RD RR4ED86JQ 718 0 0
TATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAACATATC
GAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGCACAAGTACTTGTACACCTTTGT
TCAAGGTGAAATTGAGTCTAAGACTGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCTTCT
CTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTAGTAGCACATCA
AGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCA
CGGATGGCTCGCCAGCTCCACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAA
GTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCAC
TGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGA
CCTGAAAGCTTCTTGAGCCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTTTTTCAG
AAAAAAAAATTGTCTGTTTTAAAGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATCC
AAAGAAACAGAATAATGTTCTCACTTTATATTATAAGTTTATATAAAAAAGACCAAATAC
ATGTTTAGACATGCATGTGTTTAATTAATAATAGTATTTGATGTTCTGTTGTGGTCTT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 4

CO CL2211Contig1 570 4 1 U
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CAAAGATACACTCTTTAACCCAGAGGCTAAGCAAGACGAATGTCCACGTCTCCTCCATAC
CCTCTCCCATTAAATCTTCATTACCCACTCCCCCTCGTATCATCAATCCTTCTTTTAGAG
TACCAGTGGAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTATTGCATCCT
CCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGCTGAATCCATGAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTA
TTTCAATGCCTTTATAACAGTATTTTCATCTTACAAACCAGTTTCCAGGATGAGAAAGTT
GTGTGGCTCTTTTCATCTCTCATTGAATCTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTA
TGCTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAG
TGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAAAGATTATACTCTAGTTTTCATTGAAATGTCTCATCT
TTTTACCATGAGTCGGTAGTTGTTGGGATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4F315JQ C 113
AF RR4F224TF U 1
AF RR4F315TF U 1
AF RR4F224JQ C 32
BS 1 570 RR4F224TF

RD RR4F315JQ 418 0 0
CTCCATACCCTTTCCCATTAAATTTTCATTACCCACTCCCCCTCGTATCATCAATCCTTT
TTTTAGAGTACCAGTGGAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTAT
TGCATCCTCCAGATTAGTGTCAAGTCTTTTTGCTGAATCCATGAGCTGGGGTTTAGTTCC
TCAAGGTATTTCAATGCCTTTATAACAGTATTTTCATCTTACAAACCAGTTTCCAGGATG
AGAAAGTTGTGTGGCTCTTTTCATCTCTCATTGAATTTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGAC
TGGTTTTATGCTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAG
GAATTGAGTGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAAAGATTATACTCTAGTTTTCATTGAAA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4F224TF 570 0 0
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CCTCTCCCATTAAATCTTCATTACCCACTCCCCCTCGTATCATCAATCCTTCTTTTAGAG
TACCAGTGGAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTATTGCATCCT
CCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGCTGAATCCATGAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTA
TTTCAATGCCTTTATAACAGTATTTTCATCTTACAAACCAGTTTCCAGGATGAGAAAGTT
GTGTGGCTCTTTTCATCTCTCATTGAATCTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTA
TGCTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAG
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TTTTACCATGAGTCGGTAGTTGTTGGGATT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4F315TF 570 0 0
GGGAAAATCAGCTTGTTCCGATGGCGTCTTCTTCTTCTTCGAAAGTGTGCAGATTATCAT
CAAAGATACACTCTTTAACCCAGAGGCTAAGCAAGACGAATGTCCACGTCTCCTCCATAC
CCTCTCCCATTAAATCTTCATTACCCACTCCCCCTCGTATCATCAATCCTTCTTTTAGAG
TACCAGTGGAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTATTGCATCCT
CCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGCTGAATCCATGAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTA
TTTCAATGCCTTTATAACAGTATTTTCATCTTACAAACCAGTTTCCAGGATGAGAAAGTT
GTGTGGCTCTTTTCATCTCTCATTGAATCTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTA
TGCTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAG
TGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAAAGATTATACTCTAGTTTTCATTGAAATGTCTCATCT
TTTTACCATGAGTCGGTAGTTGTTGGGATT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4F224JQ 539 0 0
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CAAGACGAATGTCCACGTCTCCTCCATACCCTCTCCCATTAAATCTTCATTACCCACTCC
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GTTTCCACTACACAGTGCTATTGCATCCTCCAGATTAGTGTCAAGTCTTTTTGCTGAATC
CATGAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATGCCTTTATAACAGTATTTTCATCT
TACAAACCAGTTTCCAGGATGAGAAAGTTGTGTGGCTCTTTTCATCTCTCATTGAATCTA
AAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTATGCTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTT
TTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAGTGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAAAGATTAT
ACTCTAGTTTTCATTGAAATGTCTCATCTTTTTACCATGAGTCGGTAGTTGTTGGGATT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 3

CO CL2212Contig1 942 3 8 U
GGCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCT
GAGGTGAAGAAATGAAACACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGC
AGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCTA
GACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTG
TGCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTG
AAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAA*GTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTG
ACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAA
CCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGC**GTGATT
CTACTGCCGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATCGTAC
GTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTT
ATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGGG
CTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGGATACCTTCTTGTTTAGGTTTTATCT
TGTCGTCGTTTGAATCTCTGGATTTTTGTGTATCAGACCTTTTTTTTTTTTTGCTTCGTC
AGTTTTTATCAGTACTTGCTTTTCTGGACTTTGGAAAAGATTATTTCACTTTTATCTCGT
ACTTCCTGGAAGTTAGTTTTTTTCTACAATCGATTATATTTCAGAGGATCTTTCTATGTT
CAGAAATATATATATAAATGACATTATTTTTTAATTAGTAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV25TF U 1
AF RR4AY93TF U 1
AF RR4AY93JQ C 155
BS 1 66 RR4AY93TF
BS 67 67 RR4CV25TF
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BS 77 77 RR4CV25TF
BS 78 711 RR4AY93TF
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BS 713 767 RR4AY93TF
BS 768 942 RR4AY93JQ

RD RR4CV25TF 638 0 0
GGCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCC*CAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCT
GAGGTGAAGAAATGAAACACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGC
AGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGA
GACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTG
TGCACGGTCAGACCCTAAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTG
AAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTG
ACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAA
CCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATT
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GTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTT
ATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4AY93TF 767 0 0
GGCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCT
GAGGTGGAGAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGC
AGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCTA
GACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTG
TGCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTG
AAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAA*GTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTG
ACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAA
CCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGC**GTGATT
CTACTGCCGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATCGTAC
GTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTT
ATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGGG
CTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGGATACCTTCTTGTTTAG*TTTTATCT
TGTCGTCGTTTGAATCTCTGGATTTTTGTGTATCAGACCTTTTTTTT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4AY93JQ 788 0 0
CAGGA
AAACCAGAAGAAGAGCTGCTAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCG
CTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGA
CTGGTAAAGGATTCACTCTTGAAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAA*GTTGGCAC
CAACCATTGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGT
CCAATGTCCAGAGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCGTGCCA
GGAAGGTCAAGGC**GTGATTCTACTGCCGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGG
GAGACTACATGCCTATCGTACGTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTG
AGATGAAATCGTTCAATGCTTATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATG
CAGGTGCTAGAGCCAAGAGGGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGGATAC
CTTCTTGTTTAGGTTTTATCTTGTCGTCGTTTGAATCTCTGGATTTTTGTGTATCAGACC
TTTTTTTTTTTTTGCTTCGTCAGTTTTTATCAGTACTTGCTTTTCTGGACTTTGGAAAAG
ATTATTTCACTTTTATCTCGTACTTCCTGGAAGTTAGTTTTTTTCTACAATCGATTATAT
TTCAGAGGATCTTTCTATGTTCAGAAATATATATATAAATGACATTATTTTTTAATTAGT
AAC

QA 6 788 6 788
DS 



AS 1 4

CO CL2213Contig1 827 4 18 U
GGGAACTCGAATCGCTTTGTCTCCGACCCGACGAAGCATCTCGCGATGAACGTAGACGAT
GACGGTACGGCGGGGGCATTGGCGCCGCCGACGAGAGTTAGGCATATCGGGAAGAGAGCT
CTAAAGAACAAAAGCGTCACCGTCTCTTTTGATGAGAAAGATCTCAAGGATTTTGTGACT
GGGTTTCACAAGAGGAAGAAGAAAAGAAGAAAGGAAGCTCAGAAGCAGCAGGAGGAATGT
CTGAGGCGGAAGCGTATCGAGGCTCGTAAGAAGAGGAAGTTGGAAGAGATGATGGTGGCG
GGTCTTGGTGAGGAAACTGAAGTTGGAGAAGGAGAAGCTGATGAGAAGGATGCAGCAGAG
AATGAAGAAGCAGAGCCTGATGCTTCAACATCTGGAACGACGATGTATGATACAGGGGAG
CTGAAAGTAACTGTGACAACAAGCGAGATATCTCGTGAGGAGGACGAGCCTGTTCGCAGG
GAGAAGACCCAATCAACAGAATCCGGTTCTACTGCCAAAGCTTCCACATCACAGCCGGCG
CCTTTGAGGAAACCCAAACCCTCGAAGAAGAACCGAAGGTCTAGCACCAAAACTATGAAG
AAAAGGGATAAGAAGAAAAAAGCAAGAGGGATCAAGAGCACGCGGTAGTTAAAGAGGGAT
TTGTGTTGTTTCTTTTGAAAACTCTCAAGCGTTTGATGCGGTTGAAATTGCGTGTTAACA
ATCAGATAATGTTTTGTCTTTTTAGTAACAAGAACTTAATCAAATCACATTATGTTTACG
AATCAGAGGAAACAATCAAAAGGGAGAGCTATATAAATTTCTGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA88TF U 155
AF RR4DA43JQ C 93
AF RR4DA43TF U 47
AF RR4AA88JQ C 1
BS 1 53 RR4AA88JQ
BS 54 62 RR4DA43TF
BS 63 63 RR4AA88JQ
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BS 67 67 RR4AA88JQ
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BS 155 233 RR4AA88TF
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BS 235 240 RR4AA88TF
BS 241 241 RR4DA43TF
BS 242 354 RR4AA88TF
BS 355 357 RR4DA43TF
BS 358 399 RR4AA88TF
BS 400 400 RR4DA43TF
BS 401 583 RR4AA88TF
BS 584 585 RR4DA43TF
BS 586 774 RR4AA88TF
BS 775 827 RR4AA88JQ

RD RR4AA88TF 623 0 0
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GGAAGTTGGAAGAGATGATGGTGGCGGGTCTTGGTGAGGAAACTGAAGTTGGAGAAGGAG
AAGCTGATGAGAAGGATGCA***GAGAATGAAGAAGCAGAGCCTGATGCTTCAACATCTG
GAACGGCGATGTATGATACAGGGGAGCTGAAAGTAACTGTGACAACAAGCGAGATATCTC
GTGAGGAGGACGAGCCTGTTCGCAGGGAGAAGACCCAATCAACAGAATCCGGTTCTACTG
CCAAAGCTTCCACATCACAGCCGGCGCCTTTGAGGAAACCCAAACCCTCGAAGAAGAACC
GAAGGTCTATTACCAAAACTATGAAGAAAAGGGATAAGAAGAAAAAAGCAAGAGGGATCA
AGAGCACGCGGTAGTTAAAGAGGGATTTGTGTTGTTTCTTTTGAAAACTCTCAAGCGTTT
GATGCGGTTGAAATTGCGTGTTAACAATCAGATAATGTTTTGTCTTTTTAGTAACAAGAA
CTTAATCAAATCACATTATG
TTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4DA43JQ 688 0 0
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TGAGAAAGATCTCAAGGATTTTGTGACTGGGTTTCACAAGAGGAAGAAGAAAAGGAGAAA
GGAAGCTCAGAAGCAGCAGGAGGAATGTCTGAGGCGGAAGCGTATCGAGGCTCGTAAGAA
GAGGAAGTTGGAAGAGATGATGGTGGCGGGTCTTGGTGAGGAAACTGAAGTTGGAGAAGG
AGAAGCTGATGAGAAGGATGCAGCAGAGAATGAAGAAGCAGAGCCTGATGCTTCAACATC
TGGAACGACGATGTATGATACAGGGGAGCTGAAAGTAACTGTGACAACAAGCGAGATATC
TCGTGAGGAGGACGAGCCTGTTCGCAGGGAGAAGACCCAATCAACAGAATCCGGTTCTAC
TGCCAAAGCTTCCACATCACAGCCGGCGCCTTTGAGGAAACCCAAACCCTCGAAGAAGAA
CCGAAGGTCTAGCACCAAAACTATGAAGAAAAGGGATAAGAAGAAAAAAGCAAGAGGGAT
CAAGAGCACGCGGTAGTTAAAGAGGGATTTGTGTTGTTTCTTTTGAAAATTCTCAAGCGT
TTGATGCGGTTGAAATTGCGTGTTAACAATCAGTTAATGTTTTGTCTTTTTAGTAACAAG
AACTTAATCAAATCACATTATG
TTTACG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4DA43TF 728 0 0
GGGACGC
AGACGATGAGGGTGCGGCGGGGGCATTGGCGCCGCCGACGAGAGTTAGGCATATCGGGAA
GAGAGCTCTAAAGAACAAAAGCGTCACCGTCTCTTTTGATGAGAAAGATCTCAAGGATTT
TGTGACTGGGTTTCACAAGAGGAAGAAGAAAAGGAGAAAGGAAGCTCAGAAGCAGCAGGA
GGAATGTCTGAGGCGGAAGCGTATCGAGGCTCGTAAGAAGAGGAAGTTGGAAGAGATGAT
GGTGGCGGGTCTTGGTGAGGAAACTGAAGTTGGAGAAGGAGAAGCTGATGAGAAGGATGC
AGCAGAGAATGAAGAAGCAGAGCCTGATGCTTCAACATCTGGAACGACGATGTATGATAC
AGGGGAGCTGAAAGTAACTGTGACAACAAGCGAGATATCTCGTGAGGAGGACGAGCCTGT
TCGCAGGGAGAAGACCCAATCAACAGAATCCGGTTCTACTGCCAAAGCTTCCACATCACA
GCCGGCGCCTTTGAGGAAACCCAAACCCTCGAAGAAGAACCGAAGGTCTAGCACCAAAAC
TATGAAGAAAAGGGATAAGAAGAAAAAAGCAAGAGGGATCAAGAGCACGCGGTAGTTAAA
GAGGGATTTGTGTTGTTTCTTTTGAAAATTCTCAAGCGTTTGATGCGGTTGAAATTGCGT
GTTAACAATCAGTTAATGTTTTGTCTTTTTAGTAACAAGAACTTAATCAAATCACATTAT
G

QA 8 728 8 728
DS 

RD RR4AA88JQ 827 0 0
GGGAACTCGAATCGCTTTGTCTCCGACCCGACGAAGCATCTCGCGATGAACGTAGACGAT
GACGGTACGTCGGGGGCATTGGCGCCGCCGACGAGAGCTAGACATATCGGGAAGAGAGCT
CTAAAGAACAAAT*CGTCACCGTCTCTTTTGATGAGAAAGATCTCAAGGATTTTGTGACT
GGGTTTCACAAGAGGAAGAAGAAAAGAAGAAAGGAAGCTCAGAAGCAGCAGGATGAATGT
TTGAGGCGGAAGCGTATCGAGGCTCGTAAGAAGAGGAAGTTGGAAGAGATGATGGTGGCG
GGTCTTGGTGAGGAAACTGAAGTTGGAGAAGGAGAAGCTGATGAGAAGGATGCA***GAG
AATGAAGAAGCAGAGCCTGATGCTTCAACATCTGGAACGGCGATGTATGATACAGGGGAG
CTGAAAGTAACTGTGACAACAAGCGAGATATCTCGTGAGGAGGACGAGCCTGTTCGCAGG
GAGAAGACCCAATCAACAGAATCCGGTTCTACTGCCAAAGCTTCCACATCACAGCCGGCG
CCTTTGAGGAAACCCAAACCCTCGAAGAAGAACCGAAGGTCTATTACCAAAACTATGAAG
AAAAGGGATAAGAAGAAAAAAGCAAGAGGGATCAAGAGCACGCGGTAGTTAAAGAGGGAT
TTGTGTTGTTTCTTTTGAAAACTCTCAAGCGTTTGATGCGGTTGAAATTGCGTGTTAACA
ATCAGATAATGTTTTGTCTTTTTAGTAACAAGAACTTAATCAAATCACATTATGTTTACG
AATCAGAGGAAACAATCAAAAGGGAGAGCTATATAAATTTCTGTACT

QA 1 827 1 827
DS 



AS 2 4

CO CL2214Contig1 820 2 2 U
CATTCATAAAATTCACTTTCTATAAAGATCCATAGACAAGTATAATTTAACTATACCTAT
AGAGTAAAGACCATTGTAATAACATAGAGTAACACACTAGCTATATTCCTTTTCTAACGA
CCTTGAACGTCGGTGAGGGTAACGTCATTAACAGAACTACCGGTTTCTCCACTGGGCCAA
TTACCTGAGCTGCCGCCGTTTTTGACGTTTCTCTTCCTTCCCACCGTAAACGCAGGATAA
TTCGGAGATGGAAGATCAATGGCGTTATGTCCCAACATGAACACAACGGAAGACATGTCT
GGTCTGTCTGAAGCGCTTTCTTGCACGCAAAGCAACCCAATGTGTACATACTTCATCACT
TCGCTCTCTTCGTAACTCTCTGCGTCCATTAACGTGTCTATGGTCTCTCTTGCTTCGCCT
TTTTCCCATAGACCCCAAATATGTCCGACTAGATTTGAATTCTCGTAGTAAATGACACTA
TTTTTCTTTCCGGTAATGATCTCTAAGATCAATATTCCAAAGCTGTAGACGTCAGATTTT
ATTGAGAACTGACCATCCATTGCATACTCTGGTGACATATATCCATATGTTCCAACAACT
CGGTTAGTGCTTCCTTCGATTTGGTTGCCTCCAAAGATTCTAGCCATGCCAAAGTCAGCA
ATCTTGGGGATCATCTCGTTGTCAAGAAGCACATTGCTGGCCTTGAGGTCCCTGTGGATG
ATCCTCAGTCTTGAATCTTGATGTAGATACAAGATTCCCCGAGCAATCCCTCGGATATCC
CCATTCGGTTGGCCAATCTAACTCCGCTATATGCTCCTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY31JQ U 1
AF RR4DY51JQ U 1
BS 1 776 RR4DY31JQ
BS 777 820 RR4DY51JQ

RD RR4DY31JQ 780 0 0
CATTCATAAAATTCACTTTCTATAAAGATCCATAGACAAGTATAATTTAACTATACCTAT
AGAGTAAAGACCATTGTAATAACATAGAGTAACACACTAGCTATATTCCTTTTCTAACGA
CCTTGAACGTCGGTGAGGGTAACGTCATTAACAGAACTACCGGTTTCTCCACTGGGCCAA
TTACCTGAGCTGCCGCCGTTTTTGACGTTTCTCTTCCTTCCCACCGTAAACGCAGGATAA
TTCGGAGATGGAAGATCAATGGCGTTATGTCCCAACATGAACACAACGGAAGACATGTCT
GGTCTGTCTGAAGCGCTTTCTTGCACGCAAAGCAACCCAATGTGTACATACTTCATCACT
TCGCTCTCTTCGTAACTCTCTGCGTCCATTAACGTGTCTATGGTCTCTCTTGCTTCGCCT
TTTTCCCATAGACCCCAAATATGTCCGACTAGATTTGAATTCTCGTAGTAAATGACACTA
TTTTTCTTTCCGGTAATGATCTCTAAGATCAATATTCCAAAGCTGTAGACGTCAGATTTT
ATTGAGAACTGACCATCCATTGCATACTCTGGTGACATATATCCATATGTTCCAACAACT
CGGTTAGTGCTTCCTTCGATTTGGTTGCCTCCAAAGATTCTAGCCATGCCAAAGTCAGCA
ATCTTGGGGATCATCTCGTTGTCAAGAAGCACATTGCTGGCCTTGAGGTCCCTGTGGATG
ATCCTCAGTCTTGAATCTTGATGTAGATACAAGATTCCCCGAGCAATCCCTCGGAT
TATC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4DY51JQ 820 0 0
CATTCATAAAATTCACTTTCTATAAAGATCCATAGACAAGTATAATTTAACTATACCTAT
AGAGTAAAGACCATTGTAATAACATAGAGTAACACACTAGCTATATTCCTTTTCTAACGA
CCTTGAACGTCGGTGAGGGTAACGTCATTAACAGAACTACCGGTTTCTCCACTGGGCCAA
TTACCTGAGCTGCCGCCGTTTTTGACGTTTCTCTTCCTTCCCACCGTAAACGCAGGATAA
TTCGGAGATGGAAGATCAATGGCGTTATGTCCCAACATGAACACAACGGAAGACATGTCT
GGTCTGTCTGAAGCGCTTTCTTGCACGCAAAGCAACCCAATGTGTACATACTTCATCACT
TCGCTCTCTTCGTAACTCTCTGCGTCCATTAACGTGTCTATGGTCTCTCTTGCTTCGCCT
TTTTCCCATAGACCCCAAATATGTCCGACTAGATTTGAATTCTCGTAGTAAATGACACTA
TTTTTCTTTCCGGTAATGATCTCTAAGATCAATATTCCAAAGCTGTAGACGTCAGATTTT
ATTGAGAACTGACCATCCATTGCATACTCTGGTGACATATATCCATATGTTCCAACAACT
CGGTTAGTGCTTCCTTCGATTTGGTTGCCTCCAAAGATTCTAGCCATGCCAAAGTCAGCA
ATCTTGGGGATCATCTCGTTGTCAAGAAGCACATTGCTGGCCTTGAGGTCCCTGTGGATG
ATCCTCAGTCTTGAATCTTGATGTAGATACAAGATTCCCCGAGCAATCCCTCGGATATCC
CCATTCGGTTGGCCAATCTAACTCCGCTATATGCTCCTCA

QA 1 820 1 820
DS 



CO CL2214Contig2 814 2 9 U
GGGAGACTTTTCTTAATTCTCATCAGTATGACTGTAGTGGTGATGTTTCTAATGATCATG
TTGTTCTGTTTCATAAGGAGGCGAAGACAAGCTAACAGGCATAAGAAACCTCCATCAACC
TTCGCCCCAAGCTCTTTTGATATTGAAGAGCCATTCGTATTAGAAGAGCTTGAGGATAAA
TCAAGAAAGGGGGAGTTGCCTCTCTTTGAGCTTAGCACAATCGCTGCAGCGACTAATAAC
TTCTCTTTTCAAAACAAGCTTGGAGCAGGTGGTTTTGGACCTGTTTACAAGGGCGTGTTA
GAAAATGGTATGGAGATAGCAGTAAAGAGGTTGTCAAAAAACTCAGGACAAGGAATGGAA
GAGTTCAAGAACGAGGTCAAGTTGATATCGAAGCTGCAGCATCGAAACCTCGTGAGGATC
TTAGGGTGTTGCGTCGAATCGGAAGAGAAGATGTTGGTATACGAATATTTACCAAACAAG
AGCTTAGACTGTTTCATATTCCGTGAGGAGCATATAGCGGAGTTAGATTGGCCAAACCGA
ATGGGGATAATCCGAGGGATTGCTCGGGGAATCTTGTATCTACATCAAGATTCAAGACTG
AGGATCATCCACAGGGACCTCAAGCCAGCAATGTGCTTCTTGACAACGAGATGATCCCCA
AGATTGCTGACTTTGGCATGGCTAGAATCTTTGGAGCACCAAATCGAAGAAGCACTAACC
GAGTTGTTGGAACATATGGATATATGTCACCAGAGTATGCAATGGATGGTCAGTCTCATA
AATCTGACGTCTACAGCTTTGGATATTGATCTTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY31TF U 1
AF RR4DY51TF U 1
BS 1 602 RR4DY31TF
BS 603 603 RR4DY51TF
BS 604 710 RR4DY31TF
BS 711 711 RR4DY51TF
BS 712 750 RR4DY31TF
BS 751 751 RR4DY51TF
BS 752 761 RR4DY31TF
BS 762 762 RR4DY51TF
BS 763 814 RR4DY31TF

RD RR4DY31TF 814 0 0
GGGAGACTTTTCTTAATTCTCATCAGTATGACTGTAGTGGTGATGTTTCTAATGATCATG
TTGTTCTGTTTCATAAGGAGGCGAAGACAAGCTAACAGGCATAAGAAACCTCCATCAACC
TTCGCCCCAAGCTCTTTTGATATTGAAGAGCCATTCGTATTAGAAGAGCTTGAGGATAAA
TCAAGAAAGGGGGAGTTGCCTCTCTTTGAGCTTAGCACAATCGCTGCAGCGACTAATAAC
TTCTCTTTTCAAAACAAGCTTGGAGCAGGTGGTTTTGGACCTGTTTACAAGGGCGTGTTA
GAAAATGGTATGGAGATAGCAGTAAAGAGGTTGTCAAAAAACTCAGGACAAGGAATGGAA
GAGTTCAAGAACGAGGTCAAGTTGATATCGAAGCTGCAGCATCGAAACCTCGTGAGGATC
TTAGGGTGTTGCGTCGAATCGGAAGAGAAGATGTTGGTATACGAATATTTACCAAACAAG
AGCTTAGACTGTTTCATATTCCGTGAGGAGCATATAGCGGAGTTAGATTGGCCAAACCGA
ATGGGGATAATCCGAGGGATTGCTCGGGGAATCTTGTATCTACATCAAGATTCAAGACTG
AG*ATCATCCACAGGGACCTCAAGCCAGCAATGTGCTTCTTGACAACGAGATGATCCCCA
AGATTGCTGACTTTGGCATGGCTAGAATCTTTGGAGCACCAAATCGAAGA*GCACTAACC
GAGTTGTTGGAACATATGGATATATGTCAC*AGAGTATGCA*TGGATGGTCAGTCTCATA
AATCTGACGTCTACAGCTTTGGATATTGATCTTA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4DY51TF 797 0 0
GGGAGACTTTTCTTAATTCTCATCAGTATGACTGTAGTGGTGATGTTTCTAATGATCATG
TTGTTCTGTTTCATAAGGAGGCGAAGACAAGCTAACAGGCATAAGAAACCTCCATCAACC
TTCGCCCCAAGCTCTTTTGATATTGAAGAGCCATTCGTATTAGAAGAGCTTGAGGATAAA
TCAAGAAAGGGGGAGTTGCCTCTCTTTGAGCTTAGCACAATCGCTGCAGCGACTAATAAC
TTCTCTTTTCAAAACAAGCTTGGAGCAGGTGGTTTTGGACCTGTTTACAAGGGCGTGTTA
GAAAATGGTATGGAGATAGCAGTAAAGAGGTTGTCAAAAAACTCAGGACAAGGAATGGAA
GAGTTCAAGAACGAGGTCAAGTTGATATCGAAGCTGCAGCATCGAAACCTCGTGAGGATC
TTAGGGTGTTGCGTCGAATCGGAAGAGAAGATGTTGGTATACGAATATTTACCAAACAAG
AGCTTAGACTGTTTCATATTCCGTGAGGAGCATATAGCGGAGTTAGATTGGCCAAACCGA
ATGGGGATAATCCGAGGGATTGCTCGGGGAATCTTGTATCTACATCAAGATTCAAGACTG
AGGATCATCCACAGGGACCTCAAGCCAGCAATGTGCTTCTTGACAACGAGATGATCCCCA
AGATTGCTGACTTTGGCATGGCTAGAATCTTTGGAGCACCAAATCGAAGAAGCACTAACC
GAGTTGTTGGAACATATGGATATATGTCACCAGAGTATGCAATGGATGGTCAGTCTCATA
AATCTGACGTCTACAGC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 4

CO CL2215Contig1 573 4 2 U
GGTGCAGCCGAGCAGGTATTGATAGGAAAGATCTCAACGGGTGCACAAAACGATCTAGAG
AAAGTGACAAAGATGACATACGCGCAAGTAGCCGTGTACGGTTTCAGCGACAAGGTCGGA
CTCCTCTCGTTTCCGCCGAGGGATGATGGATACGACTTCAACAAACCGTACAGCAACAAG
ACGGGCGCGATCATAGACGAGGAAGTGGGGGAATGGGTGGGGAGAGCTTACGAGAAGACG
GTGGAGCCGATAGAGACGCACAAGGAGAAAGTGGCTGAGATCGCCGAGCTTTTGCTGGAG
AAGGAAGTGCTGCATCAGGATGATCTTTTGAAAGTTTTGGGTGAGCGTCCGTTTAAACCG
GCCGAGGTTACTAACTATGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAGAGAGTGAGAAGGAAGAG
TCCTCCACAACGACTGGTGCACCTGTGGTGGATGAAGGAGCTCCACCGCCGCTTGAGCCG
CAGGTGGTTCCTACGTAGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTCCACCTGTTACGATTGTAA
ATTTTTTTATTAAGAATGCAATAAAACACAACT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4C573JQ C 1
AF RR4C573TF U 224
AF RR4CM37JQ C 1
AF RR4CM37TF U 1
BS 1 223 RR4CM37TF
BS 224 573 RR4C573TF

RD RR4C573JQ 573 0 0
GGTGCAGCCGAGCAGGTATTGATAGGAAAGATCTCAACGGGTGCACAAAACGATCTAGAG
AAAGTGACAAAGATGACATACGCGCAAGTAGCCGTGTACGGTTTCAGCGACAAGGTCGGA
CTCCTCTCGTTTCCGCCGAGGGATGATGGATACGACTTCAACAAACCGTACAGCAACAAG
ACGGGCGCGATCATAGACGAGGAAGTGGGGGAATGGGTGGGGAGAGCTTACGAGAAGACG
GTGGAGCCGATAGAGACGCACAAGGAGAAAGTGGCTGAGATCGCCGAGCTTTTGCTGGAG
AAGGAAGTGCTGCATCAGGATGATCTTTTGAAAGTTTTGGGTGAGCGTCCGTTTAAACCG
GCCGAGGTTACTAACTATGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAGAGAGTGAGAAGGAAGAG
TCCTCCACAACGACTGGTGCACCTGTGGTGGATGAAGGAGCTCCACCGCCGCTTGAGCCG
CAGGTGGTTCCTACGTAGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTCCACCTGTTACGATTGTAA
ATTTTTTTATTAAGAATGCAATAAAACACAACT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4C573TF 350 0 0
GAGCTTACGAGAAGACGGTGGAGCCGATAGAGACGCACAAGGAGAAAGTGGCTGAGATCG
CCGAGCTTTTGCTGGAGAAGGAAGTGCTGCATCAGGATGATCTTTTGAAAGTTTTGGGTG
AGCGTCCGTTTAAACCGGCCGAGGTTACTAACTATGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAG
AGAGTGAGAAGGAAGAGTCCTCCACAACGACTGGTGCACCTGTGGTGGATGAAGGAGCTC
CACCGCCGCTTGAGCCGCAGGTGGTTCCTACGTAGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTCC
ACCTGTTACGATTGTAAATTTTTTTATTAAGAATGCAATAAAACACAACT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4CM37JQ 573 0 0
GGTGCAGCCGAGCAGGTATTGATAGGAAAGATCTCAACGGGTGCACAAAACGATCTAGAG
AAAGTGACAAAGATGACATACGCGCAAGTAGCCGTGTACGGTTTCAGCGACAAGGTCGGA
CTCCTCTCGTTTCCGCCGAGGGATGATGGATACGACTTCAACAAACCGTACAGCAACAAG
ACGGGCGCGATCATAGACGAGGAAGTGGGGGAATGGGTGGGGAGAGCTTACGAGAAGACG
GTGGAGCCGATAGAGACGCACAAGGAGAAAGTGGCTGAGATCGCCGAGCTTTTGCTGGAG
AAGGAAGTGCTGCATCAGGATGATCTTTTGAAAGTTTTGGGTGAGCGTCCGTTTAAACCG
GCCGAGGTTACTAACTATGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAGAGAGTGAGAAGGAAGAG
TCCTCCACAACGACTGGTGCACCTGTGGTGGATGAAGGAGCTCCACCGCCGCTTGAGCCG
CAGGTGGTTCCTACGTAGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTCCACCTGTTACGATTGTAA
ATTTTTTTATTAAGAATGCAATAAAACACAACT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4CM37TF 573 0 0
GGTGCAGCCGAGCAGGTATTGATAGGAAAGATCTCAACGGGTGCACAAAACGATCTAGAG
AAAGTGACAAAGATGACATACGCGCAAGTAGCCGTGTACGGTTTCAGCGACAAGGTCGGA
CTCCTCTCGTTTCCGCCGAGGGATGATGGATACGACTTCAACAAACCGTACAGCAACAAG
ACGGGCGCGATCATAGACGAGGAAGTGGGGGAATGGGTGGGGAGAGCTTACGAGAAGACG
GTGGAGCCGATAGAGACGCACAAGGAGAAAGTGGCTGAGATCGCCGAGCTTTTGCTGGAG
AAGGAAGTGCTGCATCAGGATGATCTTTTGAAAGTTTTGGGTGAGCGTCCGTTTAAACCG
GCCGAGGTTACTAACTATGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAGAGAGTGAGAAGGAAGAG
TCCTCCACAACGACTGGTGCACCTGTGGTGGATGAAGGAGCTCCACCGCCGCTTGAGCCG
CAGGTGGTTCCTACGTAGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTTCCACCTGTTACGATTGTAA
ATTTTTTTATTAAGAATGCAATAAAACACAACT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 2 4

CO CL2216Contig1 672 2 6 U
GAAAAAAACGAATTTGGTCAAACATATGCATATACAAGATGTTGATCTGAAAGAAGGAGA
TATATATACAATATAAATTATTTCACTTCTATTGTATCCAACATGATGACATATCTTCAT
GATAAGGTTTGATCTTCTCTGTTCTGTGTAGGAAACAAAAGTGACTGCTCGGAATCACTT
ATTGTTTTGGTTGTATCTTCTCTCGATTTACCCCAAATCACAGTATAAAATCCAAAGCTC
AATATCACAGATCCAACCACACTCCCTAGGTGAAGTGCATCTCCAAGGAATATAGAAGCC
ATGGCGACTGCAATGGCAATAGACAAGGGCTTGAACAAGGATACATAGACCGGACCCTTC
AAATGCAGACCCCATGTGTGGATAACTGAGCCCAATGATGTATCAAAGAATCCCGAGTAT
ATGACTGCAACGAGCGAGACTCCCGGTTTAAGTTTCCAAGAATTGAAGTCTCTTTCTGCA
AATAGACATACTAGCGCTGAAATTAGCGTTGCACACATGTTGTAGAAGAGGACTACGCTT
ATTTCTTCAGGGTATATCTCCATGATCTGAGTCTGAAGAATATACCAGACTGAAAGAAGC
AAAAACTGCAAAGCTAGCAAAAGGCCTCCAATGATCCAACTTGGCTCAAATGAAGTAAAA
GATGCAGCAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP21JQ U 1
AF RR4F464JQ U 28
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BS 206 206 RR4F464JQ
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BS 370 527 RR4EP21JQ
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ATGACTGCAACGAGCGAGACTCCCGGTTTAAGTTTCCAAGAATTGAAGTCTCTTTCTGCA
AATAGACATACTAGCGCTGAAATTAGCGTTGCACACATGTTGTAGAA

QA 1 527 1 527
DS 

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TCTATTGTATCCAACATGATGACATATCTTCATGATAAGGTTTGATCTTCTCTGTTCTGT
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TTACCCCAAATCACAGTATAAAATCCAAAGCTCAATATCACTGATCCAACCACACTCCCT
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GGCTTGAACAAGGATACATAGACCGGACCCTTCAAATGCAGACCCCATGTGTGGATAACT
GAGCCCAATGATGTATCAAAGAATCCCGAGTATATGACTGCGACGAGCGAGACTCCCGGT
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TGAGTCTGAAGAATATACCAGACTGAAAGAAGCAAAAACTGCAAAGCTAGCAAAAGGCCT
CCAATGATCCAACTTGGCTCAAATGAAGTAAAAGATGCAGCAACA

QA 1 645 1 645
DS 



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CTTGGGCTCACCTCGCGTATAGCTGGTTGTAAAGGAATAGAATATAGTTCCCCAACTCTT
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TTGCTTCTTTCAGTCTGGTATATTCTTCAGACTCAGATCATGGAGATATACCCTGAGAAA
AAGCGTAGTCCTCTTCTACAACATGTGTGCACGCTATCTCAGCGCTAGTATGTCTTTTG


BQ
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AF RR4EP21TF U 1
AF RR4F464TF U 4
BS 1 29 RR4EP21TF
BS 30 30 RR4F464TF
BS 31 246 RR4EP21TF
BS 247 247 RR4F464TF
BS 248 714 RR4EP21TF
BS 715 779 RR4F464TF

RD RR4EP21TF 714 0 0
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CTTGGGCTCACCTCGCGTATAGCTGGTTGTAAAGGAATAGAATATAGTTCCCCAACTCTT
TCTTCTGCTATAAGCAACCTCACACCAGCTTTCACCTTCATGCTTGCCGTCTTCTTCAGG
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TCTATATCTGGTGCTCTGGTTATCGTTCTCTATAAAGGCCCAAAACTTCTTGTTGCTGCA
TCTTTTACTTCATTTGAGCCAAGTTGGATCATTGGAGGCCTTTTGCTAGCTTTGCAGTTT
TTGCTTCTTTCAGTCTGGTATATTCTTCAGACTCAGATCATGGAGATATACCCT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4F464TF 776 0 0
G
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ACCCTTATGTTGTTGCAACACTTGTCCTATTTACACTTTCCCTCATCTTTGGAAGGAAGA
GAAGATTACCTTCGCCCAAGTCTCCTCTCTTCTTCAAGATTTTCTTACTTACGCTTCTTG
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CTGCTATAAGCAACCTCACACCAGCTTTCACCTTCATGCTTGCCGTCTTCTTCAGGATGG
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TATCTGGTGCTCTGGTTATCGTTCTTTATAAAGGCCCAAAACTTCTTGTTGCTGCATCTT
TTACTTCATTTGAGCCAAGTTGGATCATTGGAGGCCTTTTGCTAGCTTTGCAGTTTTTGC
TTCTTTCAGTCTGGTATATTCTTCAGACTCAGATCATGGAGATATACCCTGAGAAAAAGC
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QA 2 776 2 776
DS 



AS 2 4

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CGGGTCCAGGTGCAGGAGCTCCAACCTCTGTAGCCATGACGGCGGTCATGGAGGCAGTAG
CGAAAAAAACTCCCCAAGCAATCTTCTTCATCTCCATTTTTAGTTGAAACCTGAAAGGTT
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GCAGGTCTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A371TFB C 1
AF RR4A371JQD U 212
BS 1 212 RR4A371TFB
BS 213 433 RR4A371JQD

RD RR4A371TFB 433 0 0
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AAGCATGTGTCTTCCGTCTTATTCACTTTGCCTGTCTAAACACGTACAAAATCAGACATG
GGCATCAATTTTTTTTTGTATAAAAGTAAATTTAGTTCAAGTAGTAGGTGAAGAGAGACA
CAAGGGAAGCTCCAACCAAAGAGCCAAGAGCTGGTACGGCTACGGAGGCTCCGCTTGCGG
CGGGTCCAGGTGCAGGAGCTCCAACCTCTGTAGCCATGACGGCGGTCATGGAGGCAGTAG
CGAAAAGAACTCCGCAAGCAATCTTCTTCATCTCCATTTTTAGTTGAGACCTGAAAGGTT
TTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGCTAGTTTTGTTACTTTTTGTTTATTTTTTCTT
GCAGGTCTCCCCT

QA 1 433 1 433
DS 

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T
GGTACGGCTACGGAGGCTCCCCTTGCGGCGGGTCCAGGTGCAGGAGCTCCAACCTCTGTA
GCCATGACGGCGGTCATGGAGGCAGTAGCGAAAAAAACTCCCCAAGCAATCTTCTTCATC
TCCATTTTTAGTTGAAACCTGAAAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGCTAG
TTTTGTTACTTTTTGTTTATTTTTTCTTGCAGGTCTCCCCT

QA 2 222 2 222
DS 



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GTATATCGTCTTCCGTCTTATTCACTTTGCCTGTCTAAACACGTACAAAATCAGACATGG
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TTTTTTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ82TF C 1
AF RR4DZ82JQ U 128
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GTATATCGTCTTCCGTCTTATTCACTTTGCCTGTCTAAACACGTACAAAATCAGACATGG
CCATCAATTTTTTTTGTATTAAAAGTAAATTTAGTTCAAGTAGTAGGTGAAGAGAGAAAC
AAGGGAAGCTCCAACCAAAGAGCCAAGAGCCGGTACGGCTACGGAGGCTCCGCTTGCGGC
GGGTCCAGGTGCAGGAGCTCCAACCTCTGTAGCCATGACGGCGGTCATGGAGGCAGCAGC
GAAAAGAACTCCGCAGGCAATCTTCTTCATCTCCATTTTTAGTTGAGACCTGAAAGGTTT
TTTTT
TTCTC

QA 1 365 1 365
DS 

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TTTTTTTTGTATTAAAAGTAAATTTAGTTCAAGTAGTAGGTGAAGAGAGAAACAAGGGAA
GCTCCAACCAAAGAGCCAAGAGCCGGTACGGCTACGGAGGCTCCGCTTGCGGCGGGTCCA
GGTGCAGGAGCTCCAACCTCTGTAGCCATGACGGCGGTCATGGAGGCAGCAGCGAAAAGA
ACTCCGCAGGCAATCTTCTTCATCTCCATTTTTAGTTGAAACCTGAAAGGTTTTTTTTTT
CTC

QA 1 243 1 243
DS 



AS 1 3

CO CL2218Contig1 990 3 17 U
GGAGTGGAACAAAGGCGAGCTCGAGAGTTTCTTGGTGGAGATCACTGCGGATATCTTCGG
GATCAAGGACGATAAGGGAGACGGGCATTTGGTTGACAAGGTTTTGGACAAAACCGGGAT
GAAAGGTACCGGGAAATGGACTGTCCAGCAAGCTGCTGAGCTCTCTGTTCCTTCTCCCAC
CATTGAGTCATCTCCTGACGCGAGGTTCCTCAGCGGGTTGAAAGACGAGCGTGTGGAAGC
AGCTAAAGTCTTTAAGGAAGGTGGATTTGGAGATGTCTTAACCGACCAAACCGTCGACAA
GAAACAGCTCATCGATGACGTGAGGAAGGCTCTCTACGCGTCGAAAATCTGCAGCTACGC
GCAAGGGATGAACCTAATCCGCGCCAAGAGCATGGAGAAAGGATGGGGCCTTAAGCTAGG
CGAGCTGGCGAGAATCTGGAAAGGAGGGTGCATCATCAGAGCGATCTTCTTGGACAGGAT
CAAGCAAGCTTACGACAGGAACGCAGAGCTGGCTAACCTCTTGGTGGATCTCGATTTTGC
GAAAGAGATCATCGAGAGACAGTCGGCTTGGAGGAGAGTTGTCTGCTTGAGTATCAACTC
GGGTATCAGCACGCCCGGTATGTCTGCTAGTCTGGCCTACTTTGATTCTTACAGGAGAGA
GAGGTTGCCAGCGAACCTTGTACAAGCTCAGAGAGACTACTTTGGTGCTCATACTTATGA
AAGGACTGATGTTGAAGGTTCTTTCCACACCGAGTGGTTCAAGATCGCAAGACAAACCAA
ATCCAACATGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGTCTCTCTCTTTCTCT
CCTTCAATAAAATATTTTTCACACCGAATCTGTTGTTTCCTCCATGTGTGAAATTACTGT
GGCCGATGTTATGGTTTGTATAAGTTTTTTCAAGTACTTTGGTTCTAATTGTTACTTTTA
TTTTAATTTGGTCTTTTCTTAATTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM45TF U 1
AF RR4G106TF U 115
AF RR4G106JQ C 241
BS 1 472 RR4GM45TF
BS 473 473 RR4G106TF
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GAGGTTGCCAGCGAACCTTGTACAAGCTCAGAGAGACTACTTTGGTGCTCATACTTATGA
AAG*ACTGATGTTGAAG*TTCTTTCCACACCGAGTGGTTCAAGATCGCA

QA 1 769 1 769
DS 

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G
GGGATGAAAGGTACCGGGAAATGGACTGTCCAGCAAGCTGCTGAGCTCTCTGTTCCTTCT
CCCACCATTGAGTCATCTCTTGACGCGAGGTTCCTCAGCGGGTTGAAAGACGAGCGTGTG
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CTAGGCGAGCTGGCGAGAATCTGGAAAGGAGGGTGCATCATCAGAGCGATCTTCTTGGAC
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TATGAAAGGACTGATGTTGAAGGTTCTTTCCACACCGAGTGGTTCAAGATCGCAAGACAA
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TCTCTCCTTCAATAAAATATTTT*CACACCGAATCTGTTGTTTCCTCCATGTGTGAAAT*
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QA 2 808 2 808
DS 

RD RR4G106JQ 750 0 0
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GAAACAGCTCATCGATGACGTGAGGAAGGCTCTCTACGCGTCGAAAATCTGCAGCTACGC
GCAAGGGATGAACCTAATCCGCGCCAAGAGCATGGAGAAAGGATGGGGCCTTAAGCTAGG
CGAGCTGGCGAGAATCTGGAAAGGAGGGTGCATCATCAGAGCGATCTTCTTGGACAGGAT
CAAGCAAGCTTACGACAGGAACGCAGAGCTGGCTAACCTCTTGGTGGATCTCGATTTTGC
GAAAGAGATCATCGAGAGACAGTCGGCTTGGAGGAGAGTTGTCTGCTTGAGTATCAACTC
GGGTATCAGCACGCCCGGTATGTCTGCTAGTCTGGCCTACTTTGATTCTTACAGGAGAGA
GAGGTTGCCAGCGAACCTTGTACAAGCTCAGAGAGACTACTTTGGTGCTCATACTTATGA
AAGGACTGATGTTGAAGGTTCTTTCCACACCGAGTGGTTCAAGATCGCAAGACAAACCAA
ATCCAACATGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGTCTCTCTCTTTCTCT
CCTTCAATAAAATATTTTTCACACCGAATCTGTTGTTTCCTCCATGTGTGAAATTACTGT
GGCCGATGTTATGGTTTGTATAAGTTTTTTCAAGTACTTTGGTTCTAATTGTTACTTTTA
TTTTAATTTGGTCTTTTCTTAATTTTTTAC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 2 4

CO CL2219Contig1 610 2 1 U
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CAATTCGTTTCCTAGGGTTTCAAAAGAGAGTAAGATCGAAATGGCGATGAGGAGAATCTA
CAGTGAGATCAAGGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTCCCCGCCTACATCAAATCGACGTTTTC
AGTCGAAACCGTGAAGACATCCGTGAGGAAAGGTCTCGATAACTACAACGACAAGTACAT
CCAGACGAGCTCCGTAGATCCTCTCCTTCATATCTGCTTCGGAGGCATGGCCTTCTCTTA
CCTCGTCGCTCTCCCCAACGAGCGCCGCCATCTCGAGCACCAGCAGCATGCTAAGGAGCA
CGGTGGCCATTGATAGATCTCGACGAATCTTTCTCTGATCCCTCCATGTGTTTTTAGATT
TTGCTTTGAAGTCTTTCTGCGATGGTGACCGACTCGAGATTGCGTCTTTATTGTTTTTTT
TTTTTTCTTGAATTTTCCTGGAAACTGTTGAAGGAAAGAAAGGTCCTTTTGGATTGCTCT
TGATAGAGGCAATAACTGAATCATGATGATATTGATGAATAAAAAAAACTGTTTATTTTT
TTTACGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DR19TF U 1
AF RR4DR19JQ C 46
BS 1 610 RR4DR19TF

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TTTTTTCTTGAATTTTCCTGGAAACTGTTGAAGGAAAGAAAGGTCCTTTTGGATTGCTCT
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TTTACGTTAG

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DS 

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GATGAGGAGAATTTACAGTGAGATCAAGGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTCCCCGCCTACAT
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CATGGCCTTTTCTTACCTCGTCGCTCTCCCCAACGAGCGCCGCCATCTCGAGCACCAGCA
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ATGTGTTTTTAGATTTTGCTTTGAAGTCTTTTTGCGATGGTGACCGACTCGAGATTGCGT
CTTTATTGTTTTTTTTTTTTTCTTGAATTTTCCTGGAAACTGTTGAAGGAAAGAAAGGTC
CTTTTGGATTGCTCTTGATAGAGGCAATAACTGAATCATGATGATATTGATGAATAAAAA
AAACTGTTTATTTTTTTTACGTTAG

QA 1 565 1 565
DS 



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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FQ89JQ C 1
AF RR4FQ89TF U 1
BS 1 1 RR4FQ89JQ
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QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4FQ89TF 583 0 0
T
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AAGAAGGTGAAGGAGCTCCCCGCCTACATCAAATCGACGTTTTCAGTCGAAACCGTGAAG
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TATGATGATATTGATGAATAAGAAAA
CCTTTTTTACGTGAGG

QA 2 567 2 567
DS 



AS 1 4

CO CL2220Contig1 796 4 12 U
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ATTTTCCATTTACTTCCAATAATCTACCCTCAGCTTGATCGCTAATGAAGTTTCTCTCAA
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ACTGTCATCACCTCGTCCATTACGCCCCCCGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCGA
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AL91JQ U 14
AF RR4CP50JQ U 31
AF RR4CP50TF C 282
AF RR4AL91TF C 1
BS 1 13 RR4AL91TF
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BS 652 796 RR4AL91TF

RD RR4AL91JQ 457 0 0
CAAGGGAAGAATAATTATGAAGAGAAAAATAGCATAACAATGACAAGTCAGTTCACTTAA
ACAATTCTCTTAAAACTATGATCTATATATTACACAGATGTGAAATAATTTTCCATTTAC
TTCCAATAATCTACCCTCAGCTTGATCGCTAATGAAGTTTCTCTCAAGGGTCTATGATTT
TCAAAAGAATTTTGGAGTCTTTGTTGTGTAAAAACTAGCTTGTACTCCTCATCAAAAACG
CTACCACGCATCCTAAAACAGCACCTGCTGCAACCTGGATAGGAGTGTGGCCGAACAGTT
CACGCAAGGGCTTAACTGTGGATAACGGATGCTCTGACGGAAACTCACAAACAATTTGAT
TCAGTAGCTCAGCTTGGCGACCAGCATGAAGCCTGACCCCAGAGGCATCATACATTACAA
CGCATGCTAAGACAAGAGCGATAGCAAAAGCGGGTGA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4CP50JQ 621 0 0
TGAAGAGAAAAATAGCATAACAATGACAAGTCAGTTCACTTAGACAATTCTCTTAAAACT
ATGATCTATATATTACACAGATGTGAAATAATTTTCCATTTACTTCCAATAATCTACCCT
CAGCTTGATCGCTGATGAAGTTTCTCTCAAGGGTCTATGATTTTCAAAAGAATTTTGGAG
TCTTTGTTGTGTAGAAACTAGCTTGTACTCCTCATCAAAAACGCTACCACGCATCCTAAA
ACAGCACCTGCTGCAACCTGGATAGGAGTGTGGCCGAACAGTTCACGCAAGGGTTTAACT
GTGGATAACGGATGCTCTGACGGAAACTCACAAACAATTTGATTCAGTAGCTCAGCTTGG
CGACCAGCATGAAGCCTGACCCCAGAGGCATCATACATTACAACGCATGCTAAGACAAGA
GAGATAGCAAAAGCGGGTGATCCAGCACCTTCCTCAAGGCCAATGGCAAGAGCTAAGGCA
GTGACAGTAGCAGAATGAGAGGAAGGCATTCCACCAGAACTAATCATCTTTTTAGAGTCC
CATCTCTTTTCTTTGTACCAATTAGTGAAGACTTTGAGGAACTGAGCGAGGGCGAATGCA
AGAAAAGCGGAGATGATCGGA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4CP50TF 402 0 0
TGCAACCTGGATAGGAGTGTGGCCGAGCAGTTCACGCAAGGGTTTAACTGTGGATAACGG
ATGCTCTGACGGAAACTCACAAACAATTTGATTCAGTAGCTCAGCTTGGCGACCAGCATG
AAGCCTGACCCCAGAGGCATCATACATTACAACGCATGCTAAGACAAGAGAGATAGCAAA
AGCGGGTGATCCAGCACCTTCCTCAAGGCCAATGGCAAGAGCTAAGGCAGTGACAGTAGC
AGAGTGAGAGGAAGGCATTCCACCAGAACTAATCATCTTTTTAGAGTCCCATCTCTTTTC
TTTGTACCAATTAGTGAAGACTTTGAGGAACTGAGCGAGGGCGAATGCAAGAAAAGCGGA
GATGATCGGAAGGTTGTGAGGAAACTGGTTCTGCGACGGAGG

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4AL91TF 796 0 0
AGAAAACACAAAACAAGGTAAGAATAATTATGAAGAGAAAAATAGCATAACAATGACAAG
TCAGTTCACTTAGACAATTCTCTTAAAACTATGATCTATATATTACACAGATGTGAAATA
ATTTTCCATTTACTTCCAATAATCTACCCTCAGCTTGATCGCTAATGAAGTTTCTCTCAA
GGGTCTATGATTTTCAAAAGAATTTTGGAGTCTTTGTTGTGTAGAAACTAGCTTGTACTC
CTCATCAAAAACGCTACCACGCATCCTAAAACAGCACCTGCTGCAACCTGGATAGGAGTG
TGGCCGAGCAGTTCACGCAAGGGCTTAACTGTGGATAACGGATGCTCTGACGGAAACTCA
CAAACAATTTGATTCAGTAGCTCAGCTTGGCGACCAGCATGAAGCCTGACCCCAGAGGCA
TCATACATTACAACGCATGCTAAGACAAGAGCGATAGCAAAAGCGGGTGATCCAGCACCT
TCCTCAAGGCCAATGGCAAGAGCTAAGGCAGTGACAGTAGCAGAGTGAGAGGAAGGCATT
CCATCAGAACTAATCATCTTTTTAGAGTCCCATCTCTTTTCTTTGTACCAATTAGTGAAG
ACTTTGAGGAACTGAGCGAGGGCGAATGCAAGAAAAGCGGAGATGATCGGAAGGTTGTGA
GGAAACTGGTTCTGCGACGGAGGAGATCCGTACAATGCCCTGTTTCCGCCGGCGTCCGCC
ACTGTCATCACCTCGTCCATTACGCCCCCCGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCGA
TTAATCAGAGAATTCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL2221Contig1 1151 4 12 U
GGAGGCCAAAGATGTTCACTTTCACCTCTCAACTGTACTCCAATGGTGGAAGAATCTCTC
TGCTCCACAAGAACCAAACCTCTCCGTCGAAAAAGCATCCCACTTTCTCCAGACCCTCGA
GAGTACAAGTCGTATCCGCCGTCCAGTTCCGACCTTGCATCGACATCCACAAGGGGAAAG
TGAAACAGATAGTTGGATCCACTCTAAGCGACTCGAAGGAAGAAGATGGTTCTCCGGTCC
TCGTAACCAACTTCGAATCAGACAAGTCGGCGGAAGAGTACGCGAAGATGTACAGAGAAG
ATGGGCTCACGGGTGGTCACGTGATCATGCTTGGAGCTGACCCTTTAAGCCAATCTGCAG
CGTTAGGAGCGTTACATGCTTATCCCGGCGGTTTGCAAGTTGGAGGTAGAATCAATGCAG
AGAATTACTTGAGTTATATAGAGGAAGGAGCAAGTCATGTCATTGTTACTTCGTATGTGT
TCAATAATGGGAAGCTTGATCTTGAAAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAGA
AAAGACTGATATTAGACCTTAGCTGCAGAAAGAAGGATGGAAGAAGATACGCCATCGTTA
CTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGTGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCATTGGAGTTTCTTG
GAGGGTTTGCAGATGAGTTTCTCGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGA
TCGATGAAGAGCTTGTTGCATTGCTTGGCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACGTATGCGG
GAGGCGTGACGGTGATGGATGATGTAGAGAGGATCAAAGAAGCTGGAAAGGGACGTGTGG
ATGTAACAGTAGGGAGTGCCTTGGACATTTTTGGGGGAAACCTACCTTACAAAGACGTTG
TCATTTGGCATCACAAGCAAGCAGCAGAACCATCCTCAACACTCCACTAAAGCCACCACC
CCCATTTTTTTCGATTTCGATGTGTTTCTTCAATAAAAAGCGAATATCATCAAAAGAGTA
ATTGGAGTTGTGATATACTTGCATGTCACGCTTCTCCACTGAAACAGAATAAAATTTGGA
TGATTCAGACATATATTTTGGAATGCCAATGCTCCATATATAAAATTTGAGGGCAAAGAG
CCAAGTAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H925TF U 1
AF RR4D124TF U 413
AF RR4BI22TF U 449
AF RR4D124JQ C 596
BS 1 426 RR4H925TF
BS 427 427 RR4D124TF
BS 428 705 RR4H925TF
BS 706 706 RR4D124TF
BS 707 727 RR4H925TF
BS 728 728 RR4D124TF
BS 729 750 RR4H925TF
BS 751 751 RR4D124TF
BS 752 763 RR4H925TF
BS 764 1045 RR4D124TF
BS 1046 1121 RR4BI22TF
BS 1122 1151 RR4D124JQ

RD RR4H925TF 779 0 0
GGAGGCCAAAGATGTTCACTTTCACCTCTCAACTGTACTCCAATGGTGGAAGAATCTCTC
TGCTCCACAAGAACCAAACCTCTCCGTCGAAAAAGCATCCCACTTTCTCCAGACCCTCGA
GAGTACAAGTCGTATCCGCCGTCCAGTTCCGACCTTGCATCGACATCCACAAGGGGAAAG
TGAAACAGATAGTTGGATCCACTCTAAGCGACTCGAAGGAAGAAGATGGTTCTCCGGTCC
TCGTAACCAACTTCGAATCAGACAAGTCGGCGGAAGAGTACGCGAAGATGTACAGAGAAG
ATGGGCTCACGGGTGGTCACGTGATCATGCTTGGAGCTGACCCTTTAAGCCAATCTGCAG
CGTTAGGAGCGTTACATGCTTATCCCGGCGGTTTGCAAGTTGGAGGTAGAATCAATGCAG
AGAATTGCTTGAGTTATATAGAGGAAGGAGCAAGTCATGTCATTGTTACTTCGTATGTGT
TCAATAATGGGAAGCTTGATCTTGAAAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAGA
AAAGACTGATATTAGACCTTAGCTGCAGAAAGAAGGATGGAAGAAGATACGCCATCGTTA
CTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGTGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCATTGGAGTTTCTTG
GAGGGTTTGCAGATGAGTTTCTCGTGCATGGTGTTGATGTTGAAG*AAAGAAGCTAGGGA
TCGATGA*GAGCTTGTTGCATTGCTTGGCA*CTATTCTCCGAT
CCAGTACGTATGCGGG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4D124TF 633 0 0
G
AATGCAGAGAATTACTTGAGTTATATAGAGGAAGGAGCAAGTCATGTCATTGTCACTTCG
TATGTGTTCAATAATGGGAAGCTTGATCTTGAAAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTT
GGGAAGAAAAGACTGATATTAGACCTTAGCTGCAGAAAGAAGGATGGAAGAAGATACGCC
ATCGTTACTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGTGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCATTGGAG
TTTCTTGGAGGGTTTGCAGATGAGTTTCTCGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAG
CTAGGGATCGATGAAGAGCTTGTTGCATTGCTTGGCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACG
TATGCGGGAGGCGTGACGGTGATGGATGATGTAGAGAGGATCAAAGAAGCTGGAAAGGGA
CGTGTGGATGTAACAGTAGGGAGTGCCTTGGACATTTTTGGGGGAAACCTACCTTACAAA
GACGTTGTCATTTGGCATCACAAGCAAGCAGCAGAACCATCCTCAACACTCCACTAAAGC
CACCACCCCCATTTTTTTCGATTTCGATGTGTTTCTTCAATAAAAAGCGAATATCATCAA
AAGAGTAATTGGAGTTGTGATATACTTGCATG

QA 2 633 2 633
DS 

RD RR4BI22TF 673 0 0
AGCAAGTCATGTCATTGTTACTTCGTATGTGTTCAATAATGGGAAGCTTGATCTTGAAAG
ACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAGAAAAGACTGATATTAGACCTTAGCTGCAG
AAAGAAGGATGGAAGAAGATACGCCATCGTTACTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGTGACGT
CTTGCTTGATG**GAATCATTGGAGTTTCTTGGAGGGTTTGCAGATGAGTTTCTCGTGCA
TGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGATCGATGAAGAGCTTGTTGCATTGCTTGG
CAACTATTCTCCGATTCCAGTAACGTATGCGGGAGGCGTGACGGTGATGGATGATGTAGA
GAGGATCAAAGAAGCTGGAAAGGGACGTGTGGATGTAACAGTAGGGAGTGCCTTGGACAT
TTTTGGGGGAAACCTACCTTACAGAGACGTTGTCATTTGGCATCACAAGCAAGCAGCAGA
ACCATCCTCAACACTCCACTAAAGCCACCACCCCCATTTTTTTCGATTTCGATGTGTTTC
TTCAATAAAAAGCGAATATCATCAAAAGAGTAATTGGAGTTGTGATATACTTGCATGTCA
CGCTTCTCCACTGAAACAGAATAAAATTTGGATGATTCAGACATATATTTTGGAATGCCA
ATGCTCCATATAT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4D124JQ 556 0 0
CGTTACTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGTGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCATTGGAGTT
TCTTGGAGGGTTTGCAGATGAGTTTCTCGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCT
AGGGATCGATGAAGAGCTTGTTGCATTGCTTGGCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACGTA
TGCGGGAGGCGTGACGGTGATGGATGATGTAGAGAGGATCAAAGAAGCTGGAAAGGGACG
TGTGGATGTAACAGTAGGGAGTGCCTTGGACATTTTTGGGGGAAACCTACCTTACAAAGA
CGTTGTCATTTGGCATCACAAGCAAGCAGCAGAACCATCCTCAACACTCCACTAAAGCCA
CCACCCCCATTTTTTTCGATTTCGATGTGTTTCTTCAATAAAAAGCGAATATCATCAAAA
GAGTAATTGGAGTTGTGATATACTTGCATGTCAGGCTTCTCCACTGAAACAGAATAAAAT
TTGGATGATTCAGACATATATTTTGGAATGCCAATGCTCCATATATAAAATTTGAGGGCA
AAGAGCCAAGTAAATC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 4

CO CL2222Contig1 1100 4 8 U
CAAGACAAAACACGAGGAGAGGATCGTTCCTGGAAAGAAAAAAAAATCTTTTTGCACTTT
TCCGACCAAACACTGAGAGAACCTTCCAATCGATGAATTAGTCAACTGATTCTCTCATAC
AGGAAAAAAAGTTTCTCATTGAATTTTTCTCCGTGCTTCTGGATTTTCTCAGGTCTCTTT
ATATCAAAAGGACAAGTGTTAGCTTCTGGTTTTTGCGGGAGGCAGAGGAGAGAGACATCT
TCGGTGGAATTAGCTTTCTGTTTGCTTGGAAACATGGGAGCTCTCTGCTGTTGCTTTCAA
GTTGATCTCTTTGAGAGTTATGCGAATCCAAACACTTCAATGTCGAGGAACTGTCCCTGC
CTTAACTGCTTCCTCCAGAGTTTCATGGGTTTGTATGCATCGATATTTAACAGAGTTGGT
ATGCATCCAATACCTTCAACTGTGGAAGCTTCCTCAGTGATGAATTCCACAACTTCATTT
GATGACTCATCTCTCTCTGATGTCTATCATTCTCCTCCCAGGCCCTTGCCTTACGATGCT
GATCCTAGGTACTTCCGTTTTGCTAAGGGATCAAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACCG
TTAAGAGGTGATACCGAAATGAGCTCTGAAATTTTGGGAGGTGGAGCCAAACGGAACAAG
TCTGGTTACGAAGATGGTTCGAAAGAAGCGTATTCGAAAGGTTCACCTACCAATGAAAAG
TCGAAGTTAGAGCTCTCTTATGCAGATTCGGATGATGAGGATGATATCTGTCCAACCTGC
CTTGATGATTACACGCCAGAGAATCCGAAGATAATCACCAAATGCACTCACCATTTCCAC
CTTAGCTGTATTTATGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACCTGCCCCGTCTGTGGAAAGGTG
ATGGCATTTGATGAAACTGGCTAAGAGGATAAAAAGTGGCAGTGAGTCTTTGCATGATAA
AATAATACAGAGATCACTTGTATATATAAATCTTCTGTCAAAGTTGTGAATATCCAGATG
CCTTTTACAGTAAATATGAGAGTGTGATTGCTCTTAGTTTATATCGACTCATTATTTATA
TACATTTTTTTCTTCAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C512TF U 1
AF RR4FR80TF U 144
AF RR4FR80JQ C 439
AF RR4C512JQ C 458
BS 1 684 RR4C512TF
BS 685 722 RR4FR80TF
BS 723 825 RR4FR80JQ
BS 826 826 RR4C512JQ
BS 827 853 RR4FR80JQ
BS 854 854 RR4C512JQ
BS 855 1052 RR4FR80JQ
BS 1053 1100 RR4C512JQ

RD RR4C512TF 684 0 0
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TCCGACCAAACACTGAGAGAACCTTCCAATCGATGAATTAGTCAACTGATTCTCTCATAC
AGGAAAAAAAGTTTCTCATTGAATTTTTCTCCGTGCTTCTGGATTTTCTCAGGTCTCTTT
ATATCAAAAGGACAAGTGTTAGCTTCTGGTTTTTGCGGGAGGCAGAGGAGAGAGACATCT
TCGGTGGAATTAGCTTTCTGTTTGCTTGGAAACATGGGAGCTCTCTGCTGTTGCTTTCAA
GTTGATCTCTTTGAGAGTTATGCGAATCCAAACACTTCAATGTCGAGGAACTGTCCCTGC
CTTAACTGCTTCCTCCAGAGTTTCATGGGTTTGTATGCATCGATATTTAACAGAGTTGGT
ATGCATCCAATACCTTCAACTGTGGAAGCTTCCTCAGTGATGAATTCCACAACTTCATTT
GATGACTCATCTCTCTCTGATGTCTATCATTCTCCTCCCAGGCCCTTGCCTTACGATGCT
GATCCTAGGTACTTCCGTTTTGCTAAGGGATCAAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACCG
TTAAGAGGTGATACCGAAATGAGCTCTGAAATTTTGGGAGGTGGAGCCAAACGGAACAAG
TCTGGTTACGAAGATGGTTCGAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4FR80TF 579 0 0
TTTTTCTCCGTGCTTCTGGATTTTCTCAGGTCTCTTTATATCAAAAGGACAAGTGTTAGC
TTCTGGTTTTTGCGGGAGGCAGAGGAGAGAGACATCTTCTGTGGAATTAGCTTTCTGTTT
GCTTGGAAACATGGGAGCTCTCTGCTGTTGCTTTCAAGTTGATCTCTTTGAGAGTTATGC
GAATCCAAACACTTCAATGTCGAGGAACTGTCCCTGCCTTAACTGCTTCCTCCAGAGTTT
CATGGGTTTGTATGCATCGATATTTAACAGAGTTGGTATGCATCCAATACCTTCAACTGT
GGAAGCTTCCTCAGTGATGAATTCCACAACTTCATTTGATGACTCATCTCTCTCTGATGT
CTATCATTCTCCTCCCAGGCCCTTGCCTTACGATGCTGATCCTAGGTACTTCCGTTTTGC
TAAGGGATCAAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACCGTTAAGAGGTGATACCGAAATGAG
CTCTGAAATTTTGGGAGGTGGAGCCAAACGGAACAAGTCTGGTTACGAAGATGGTTCGAA
AGAAGCGTATTCGAAAGGTTCACCTACCAATGAAAAGTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4FR80JQ 617 0 0
ACTGTGGAAGCTTCCTCAGTGATGAATTCCACAACTTCATTTGATGACTCATCTCTCTCT
GATGTCTATCATTCTCCTCCCAGGCCCTTGCCTTACGATGCTGATCCTAGGTACTTCCGT
TTTGCTAAGGGATCAAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACCGTTAAGAGGTGATACCGAA
ATGAGCTTTGAAATTTTGGGAGGTGGAGCCAAACGGAACAAGTCTGGTTACGAAGATGGT
TCGAAAGAAGCGTATTCGAAAGGTTCACCTACCAATGAAAAGTCGAAGTTAGAGCTCTCT
TATGCAGATTCGGATGATGAGGATGATATCTGTCCAACCTGCCTTGATGATTACACGCCA
GAGAATCCGAAGATAATCACCAAATGCTCTCACCATTTCCACCTTAGCTGTATTTTTGAA
TGGATGGAGAGAAGTGAAACCTGCCCCGTCTGTGGAAAGGTGATGGCATTTGATGAAACT
GGCTAAGAGGATAAAAAGTGGCAGTGAGTCTTTGCATGATAAAATAATACAGAGATCACT
TGTATATATAAATCTTCTGTCAAAGTTGTGAATATCCAGATGCCTTTTACAGTAAATATG
AGAGTGTGATTGCT
TTT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4C512JQ 643 0 0
TGATGAATTCCACAACTTCATTTGATGACTCATCTCTCTCTGATGTCTATCATTCTCCTC
CCAGGCCCTTGCCTTACGATGCTGATCCTAGGTACTTCCGTTTTGCTAAGGGATCAAGCC
ATTCGGGTGGAGAAACAGAACCGTTAAGAGGTGATACCGAAATGAGCTTTGAAATTTTGG
GAGGTGGAGCCAAACGGAACAAGTCTGGTTACGAAGATGGTTCGAAAGAAGCGTATTCGA
AAGGTTCACCCACCAATGAAAAGTCGAAGTTAGAGCTCTCTTATGCAGATTCGGATGATG
AGGATGATATCTGTCCAACCTGCCTTGATGATTACACGCCAGAGAATCCGAAGATAATCA
CCAAATGCACTCACCGTTTCCACCTTAGCTGTATTTATGAATGGATGGAGA*AAGTGAAA
CCTGCCCCGTCTGTGGAAAGGTGATGGCATTTGATGAAACTGGCTAAGAGGATAAAAAGT
GGCAGTGAGTCTTTGCATGATAAAATAATACAGAGATCACTTGTATATATAAATCTTCTG
TCAAAGTTGTGAATATCCAGATGCCTTTTACAGTAAATATGAGAGTGTGATTGCTCTTAG
TTTATATCGACTCATTATTTATATACATTTTTTTCTTCAATAA

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 4

CO CL2223Contig1 1272 4 3 U
GGACCACAGGCTGGTTATTATAACTCGATCATCTTCTTTTTCAGCTCGATGGAAAGAGAA
AAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAATCATCGCT
GAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAACGTTACCA
GGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAGCACCAAT
CAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTTTAAAGACCCA
TTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTGTGATGCCTATACACCGAAAGGAGATCCA
ATCCCGACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAATGTGAAGGCT
GAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGTCAAGTGG
CCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGCGGTG
GGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGTCTTTAC
GCTGGTTTAAGCATAGGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAG
ATCAGCCCTACTGTTGGTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACATACTC
GAGAGGATTACTGAGATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGG
GATTGGAACGGAGCAGCTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGA
GGATTAGACTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATT
GCTGCTTATGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATC
AACAAGTTCTCTTGGGGAGTGGCAGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACG
GAGAAAGAAGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTAT
CTTGTTACCTCCATGATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGT
TGCATATGTTCTTTTGTTTCTTCATGTTTCGGTTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTTTTT
ATTGCTAATAATTCATGGGATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTTATCCTGGTTCAGCTGT
TAGTCTTGAGGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB01TF U 1
AF RR4GS21TF U 487
AF RR4GB01JQ C 778
AF RR4AZ15JQ C 436
BS 1 583 RR4GB01TF
BS 584 1163 RR4GS21TF
BS 1164 1272 RR4AZ15JQ

RD RR4GB01TF 583 0 0
GGACCACAGGCTGGTTATTATAACTCGATCATCTTCTTTTTCAGCTCGATGGAAAGAGAA
AAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAATCATCGCT
GAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAACGTTACCA
GGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAGCACCAAT
CAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTTTAAAGACCCA
TTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTGTGATGCCTATACACCGAAAGGAGATCCA
ATCCCGACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAATGTGAAGGCT
GAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGTCAAGTGG
CCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGCGGTG
GGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4GS21TF 677 0 0
GGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGCGGTGGGTGCA
GACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGTCTTTACGCTGGT
TTAAGCATAGGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAGATCAGC
CCTACTGTTGGTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACATACTCGAGAGG
ATTACTGAGATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGGGATTGG
AACGGAGCAGCTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTA
GACTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGCT
TATGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATCAACAAG
TTCTCTTGGGGAGTGGCAGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACGGAGAAA
GAAGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTATCTTGTT
ACCTCCATGATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATA
TGTTCTTTTGTTTCTTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GB01JQ 433 0 0
GGGGATTGGAACGGAGCAGCTGTTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAA
GGAGGATTAGACTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACAC
ATTGCTGCTTATGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGAC
ATCAACAAGTTTTCTTGGGGAGTGGCAGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGAT
ACGGAGAAAGAAGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGACCTTCGCCTAATATGGATCCT
TATCTTGTTACCTCCATGATAGCTGAAACCCCCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGT
TGTTGCATATGTTCTTTTGTTTCTTCATGTTTCGGTTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTT
TTTATTGCTAATA

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4AZ15JQ 837 0 0
GGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGTCAAGTGGCCATTAGGTTGGCCC
ATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGCGGTGGGTGCAGACAAAGCC
TTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGTCTTTACGCTGGTTTAAGCATA
GGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTT
GGTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACATACTCGAGAGGATTACTGAG
ATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGGGATTGGAACGGAGCA
GCTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTAGACTTGATC
AAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGCTTATGGTGAA
GGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATCAACAAGTTCTCTTGG
GGAGTGGCAGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGGAGAGATACGGAGAAAGAAGGGAAA
GGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTATCTTGTTACCTCCATG
ATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATATGTTCTTTT
GTTTCTTCATGTTTCGGTTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTTTTTATTGCTAATAATTCA
TGGGATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTTATCCTGGTTCAGCTGTTAGTCTTGAGGC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 2 4

CO CL2224Contig1 715 2 3 U
GAAGGAATAAACAATAACATCTTGATAAATAATACAAAATCATAAAATATAAATTGAAAC
AATTTGATTGTTGATATATCTAATGGAAAGGGAAAAAAACGGTGATGACAATCATGCAAT
TTACCAACAGAGGATAAACAATGGTAACAACACATTAACTAACCAGTGTTGGTAACTCAA
AAACACTCATATGAAGATGCTTAGTAAAGTATTAACACAACATAGCTGAAAGAGACTCTT
CTTGCTGTTTTTTTCTCATTCCTACTACTTCCTCAAGTTCACTTCATGTTCTGCTGTTGT
TTAGCCGATGAATAGCACATTTGAATCCCATGGCCGAGTTTCAAAAGACTTCCCAACGAT
GCTTCTTTTGTCACTCACAGCTCCATCTTCTGTTTGGTACTCTGGAAAGTAATCAATGAA
TGTTTTTGTCCCCAACTCATTCACCCCATTGAACAAAAAATCTCTCAGCAACTCCTTTGC
CTTAGCTTCACCAATTAGTTTTCTAAGAAGACCATGTCCAGGAACCTTTTGTGCTCGCCA
TGTCAGGTACTTGTGCTGTGCTTCACGATTAGCTCTCACCTGAGATGGCTCCATCTCCTC
CTTCACTTGTATCGTCATCTCAAGCCATGCCTGATAGTAATCAAGAAACGCAGAGAACAA
CGCCTTGTGCTTCTCTTGGCTAGACGAGAATCTGGTCCACATCACCAAAGGTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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AF RR4FH47JQ U 56
AF RR4DL47JQ U 1
BS 1 455 RR4DL47JQ
BS 456 456 RR4FH47JQ
BS 457 715 RR4DL47JQ

RD RR4FH47JQ 405 0 0
GAAACAATTTGATTGTTGATATATCTAATGGAAAGGGAAAAAAACGGTGATGACAATCAT
GCAATTTACCAACAGAGGATAAACAATGGTAACAACACATTAACTAACCAGTGTTGGTAA
CTCAAAAACACTCATATGAAGATGCTTAGTAAAGTATTAACACAACATAGCTGAAAGAGA
CTCTTCTTGCTGTTTTTTTCTCATTCCTACTACTTCCTCAAGTTCACTTCATGTTCTGCT
GTTGTTTAGCCGATGAATAGCCCATTTGAATCCCATGGCCGAGTTTCAAAAGACTTCCCA
ACGATGCTTCTTTTGTCACTCACAGCTCCATCTTCTGTTTGGTACTCTGGAAAGTAATCA
ATGAATGTTTTTGTCCCCAACTCATTCACCCCATTGAACAAAAAA

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4DL47JQ 715 0 0
GAAGGAATAAACAATAACATCTTGATAAATAATACAAAATCATAAAATATAAATTGAAAC
AATTTGATTGTTGATATATCTAATGGAAAGGGAAAAAAACGGTGATGACAATCATGCAAT
TTACCAACAGAGGATAAACAATGGTAACAACACATTAACTAACCAGTGTTGGTAACTCAA
AAACACTCATATGAAGATGCTTAGTAAAGTATTAACACAACATAGCTGAAAGAGACTCTT
CTTGCTGTTTTTTTCTCATTCCTACTACTTCCTCAAGTTCACTTCATGTTCTGCTGTTGT
TTAGCCGATGAATAGCACATTTGAATCCCATGGCCGAGTTTCAAAAGACTTCCCAACGAT
GCTTCTTTTGTCACTCACAGCTCCATCTTCTGTTTGGTACTCTGGAAAGTAATCAATGAA
TGTTTTTGTCCCCAACTCATTCACCCCATTGAACAGAAAATCTCTCAGCAACTCCTTTGC
CTTAGCTTCACCAATTAGTTTTCTAAGAAGACCATGTCCAGGAACCTTTTGTGCTCGCCA
TGTCAGGTACTTGTGCTGTGCTTCACGATTAGCTCTCACCTGAGATGGCTCCATCTCCTC
CTTCACTTGTATCGTCATCTCAAGCCATGCCTGATAGTAATCAAGAAACGCAGAGAACAA
CGCCTTGTGCTTCTCTTGGCTAGACGAGAATCTGGTCCACATCACCAAAGGTGAA

QA 1 715 1 715
DS 



CO CL2224Contig2 770 2 2 U
CTCCAGGAGTTGAGCTTCGTTCTTGGTTAAGATATATTTAGTTTCAGTGAAGAACTGGAG
AGAGCTCAAGAAAGGGACAGAGGAAGGAGTCATCATATAGTTTCACTTATTCTTGTGTGT
GTTGAGTTTTGTAAATTAGCTTTTATCAAATGGAGTTAGGATCTTCAATTGGGCCGTGCT
TCAAGTCAGCAAACCCTCCTGTACTAACCTCTAGGAACACCAATCTCACGTTGAGAAGGA
GAAGTCAAAGATTCTCATTCAGCGTCTCTGCTGTTTCGTATAAGGACTTCGCCGAGTCTG
CTCTGCAAGAAACCAGGAAAAGGCTCGTTCTTGAGCCTTCACTTCTCCAGGAAAGGTACA
GTAGCATGACTGGACTTGATGGGAAAACCCAACTTGAAATGCTTGCTTTCAAGTCTCCAA
AGATTAGACTGTTGCGGAGCATGGCCATTGAGAACGAGACAATGCAGGTTTTTGACTTTG
CTGGTTTCATGGAGCCTGAGTATGACACACCTATATTCTGTGCTAACTTATTCACATCTG
CCAACACCAACATAGTGGTGCTGGACCTGAATCCTTTGCATCAGTCGACTGACCAGACAG
ATTACCAAGACAAGTATTACAAAAACATAATGTCCATATACCACAAATATGATGAGATTT
TCCCATGGGGAGGTAAACTAACTGGTGAATCCATAAAGTTTTTTTCACCTTTGGTGATGT
GGACCAGATTCTCGTCTAGCCAAGAGAAGCACAAGCGTTGTTCTCTGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH47TF U 1
AF RR4DL47TF U 10
BS 1 607 RR4FH47TF
BS 608 770 RR4DL47TF

RD RR4FH47TF 616 0 0
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AGAGCTCAAGAAAGGGACAGAGGAAGGAGTCATCATATAGTTTCACTTATTCTTGTGTGT
GTTGAGTTTTGTAAATTAGCTTTTATCAAATGGAGTTAGGATCTTCAATTGGGCCGTGCT
TCAAGTCAGCAAACCCTCCTGTACTAACCTCTAGGAACACCAATCTCACGTTGAGAAGGA
GAAGTCAAAGATTCTCATTCAGCGTCTCTGCTGTTTCGTATAAGGACTTCGCCGAGTCTG
CTCTGCAAGAAACCAGGAAAAGGCTCGTTCTTGAGCCTTCACTTCTCCAGGAAAGGTACA
GTAGCATGACTGGACTTGATGGGAAAACCCAACTTGAAATGCTTGCTTTCAAGTCTCCAA
AGATTAGACTGTTGCGGAGCATGGCCATTGAGAACGAGACAATGCAGGTTTTTGACTTTG
CTGGTTTCATGGAGCCTGAGTATGACACACCTATATTCTGTGCTAACTTATTCACATCTG
CCAACACCAACATAGTGGTGCTGGACCTGAATCCTTTGCATCAGTCGACTGACCAGACAG
ATTACCA
GACAGTATA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4DL47TF 761 0 0
GG
GAGCTTCGTTCTTGGTTAAGATATATTTAGTTTCAGTGAAGAACTGGAGAGAGCTCAAGA
AAGGGACAGAGGAAGGAGTCATCATATAGTTTCACTTATTCTTGTGTGTGTTGAGTTTTG
TAAATTAGCTTTTATCAAATGGAGTTAGGATCTTCAATTGGGCCGTGCTTCAAGTCAGCA
AACCCTCCTGTACTAACCTCTAGGAACACCAATCTCACGTTGAGAAGGAGAAGTCAAAGA
TTCTCATTCAGCGTCTCTGCTGTTTCGTATAAGGACTTCGCCGAGTCTGCTCTGCAAGAA
ACCAGGAAAAGGCTCGTTCTTGAGCCTTCACTTCTCCAGGAAAGGTACAGTAGCATGACT
GGACTTGATGGGAAAACCCAACTTGAAATGCTTGCTTTCAAGTCTCCAAAGATTAGACTG
TTGCGGAGCATGGCCATTGAGAACGAGACAATGCAGGTTTTTGACTTTGCTGGTTTCATG
GAGCCTGAGTATGACACACCTATATTCTGTGCTAACTTATTCACATCTGCCAACACCAAC
ATAGTGGTGCTGGACCTGAATCCTTTGCATCAGTCGACTGACCAGACAGATTACCAAGAC
AAGTATTACAAAAACATAATGTCCATATACCACAAATATGATGAGATTTTCCCATGGGGA
GGTAAACTAACTGGTGAATCCATAAAGTTTTTTTCACCTTTGGTGATGTGGACCAGATTC
TCGTCTAGCCAAGAGAAGCACAAGCGTTGTTCTCTGCGT

QA 3 761 3 761
DS 



AS 1 4

CO CL2225Contig1 1115 4 10 U
GGGAATCTAAACTTTTCTTCGATTATTATCAATCAATCAATCACCATGGAAGGAGAGGAG
ATGCTTGATTGGGAGCTCGTTCACGGCTCCGACACCGATTCGATCACATCGGAGATGGAA
TCAAGTGTAATCGATGACGGTATGATCGTCTCTGATCATTTCTCTGCCGATCAAAGCATA
GGTTCTGGTGATTCTCCTCGGGTCGATTACGGGTCGGAGTATCCGAATCCGGCGGGTTTG
GGTTTCGATCGGTTGGATGTTTATAAATCGGGTGATGATGCTGGTGTCGAAAACGAATTA
GGGTTTATCGCTGGTGAGGGCATGTCCGAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATCCAAGCT
GGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAGAGCCAA
GCTGGTGTTGAAGAACATATCGAGGATGCGAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGATCTT
CAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCAAAACTGACCAT
CTCCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAGCATATTGAGTCAGAGGGCAACGAACTG
GAGGTTTCTGATAGGGAAGCAGTTGAGGGAAGTGGAGGAGGGGATGTGGTGGCTGTGAGG
TCTGGTGATGAGAGTAAAAGTAGAGAGACTGTGTGGTGGAAGATGCCGTTTGTTCTTGTC
AAGTACTATGCACTTAGGATTGGTCCTGTTTGGTCTCTCTCCATGGCTGCAGCTGTGATG
GGTTTTGTTCTCTTGGGACGCAGACTCTATCATATGAAAAAGAAAGCTCAAAGGTTCCAT
CTCAAAGTTGCAATCGACGAGAAGAAGGTTTCGAGGGTGATGAGTCAGGCAGCTCGACTC
AATGAAGCATTCACAGAGGTAAGAAGGGTCCCAGTGATCCGCCCTGCTCTGCCATCCCCT
GGTGCATGGCCGGTTTTGAGCCTTAGGTGAGAGAAGCCGGTTATACTATGTCTCATAACG
TTATGTACCAAGAGTAGAGAGACACGTGCATGTGTGTACAGTGGCTCATCATGTTATGTA
CTAAAAAGAATAGAGATTCATGGTGTTTGTGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EM55TF U 1
AF RR4CL83TF U 148
AF RR4CL83JQ C 235
AF RR4EM55JQ C 434
BS 1 289 RR4EM55TF
BS 290 290 RR4CL83TF
BS 291 311 RR4EM55TF
BS 312 312 RR4CL83TF
BS 313 659 RR4EM55TF
BS 660 660 RR4CL83TF
BS 661 698 RR4EM55TF
BS 699 754 RR4CL83TF
BS 755 1103 RR4CL83JQ
BS 1104 1115 RR4EM55JQ

RD RR4EM55TF 698 0 0
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ATGCTTGATTGGGAGCTCGTTCACGGCTCCGACACCGATTCGATCACATCGGAGATGGAA
TCAAGTGTAATCGATGACGGTATGATCGTCTCTGATCATTTCTCTGCCGATCAAAGCATA
GGTTCTGGTGATTCTCCTCGGGTCGATTACGGGTCGGAGTATCCGAATCCGGCGGGTTTG
GGTTTCGATCGGTTGGATGTTTATAAATCGGGTGATGATGCTGGTGTCGGAAACGAATTA
GGGTTTATCGCCGGTGAGGGCATGTCCGAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATCCAAGCT
GGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAGAGCCAA
GCTGGTGTTGAAGAACATATCGAGGATGCGAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGATCTT
CAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCAAAACTGACCAT
CTCCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAGCATATTGAGTCAGAGGGCAACGAACTG
GAGGTTTCTGATAGGGAAGCAGTTGAGGGAAGTGGAGGAGGGGATGTGGTGGCTGTGAG*
TCTGGTGATGAGAGTAAAAGTAGAGAGACTGTGTGGTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4CL83TF 607 0 0
GTCTCTGATCATTTCTCTGCCGATCAAAGCATAGGTTCTGGTGATTCTCCTCGGGTCGAT
TACGGGTCGGAGTATCCGAATCCGGCGGGTTTGGGTTTCGATCGGTTGGATGTTTATAAA
TCGGGTGATGATGCTGGTGTCGAAAACGAATTAGGGTTTATCGCTGGTGAGGGCATGTCC
GAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTG
TCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATATCGAGGAT
GCGAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGATCTTCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAA
GAACATGTCGAGGATTTGTCCGAAACTGACCATCTCCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTT
GAAGAGCATATTGAGTCAGAGGGCAACGAACTGGAGGTTTCTGATAGGGAAGCAGTTGAG
GGAAGTGGAGGAGGGGATGTGGTGGCTGTGAGGTCTGGTGATGAGAGTAAAAGTAGAGAG
ACTGTGTGGTGGAAGATGCCGTTTGTTCTTGTCAAGTACTATGCACTTAGGATTGGTCCT
GTTTGGT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4CL83JQ 870 0 0
GGTTTGGGTTTCGATCGGTTGGATGTTTATAAATCGGGTGATGATGCTGGTGTCGAAAAC
GAATTAGGGTTTATCGCTGGTGAGGGCATGTCCGAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATC
CAAGCTGGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAG
AGCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATATCGAGGATGCGAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGAC
GATCTTCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCGAAACT
GACCATCTCCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGTGTTGAAGAGCATATTGAGTCAGAGGGCAAC
GAACTGGAGGTTTCTGATAGGGAAGCAGTTGAGGGAAGTGGAGGAGGGGATGTGGTGGCT
GTGAGGTCTGGTGATGAGAGTAAAAGTAGAGAGACTGTGTGGTGGAAGATGCCGTTTGTT
CTTGTCAAGTACTATGCACTTAGGATTGGTCCTGTTTGGTCTCTCTCCATGGCTGCAGCT
GTGATGGGTTTTGTTCTCTTGGGACGCAGACTCTATCATATGAAAAAGAAAGCTCAAAGG
TTCCATCTCAAAGTTGCAATCGACGAGAAGAAGGTTTCGAGGGTGATGAGTCAGGCAGCT
CGACTCAATGAAGCATTCACAGAGGTAAGAAGGGTCCCAGTGATCCGCCCTGCTCTGCCA
TCCCCTGGTGCATGGCCGGTTTTGAGCCTTAGGTGAGAGAAGCCGGTTATACTATGTCTC
ATAACGTTATGTACCAAGAGTAGAGAGACACGTGCATGTGTGTACAGTGGCTCATCATGT
TATGTACTAAAAAGAATAGAGATTCATGG
C

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR4EM55JQ 682 0 0
AACATATCGAGGATGCGAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGATCTTCAAGTTGAGAGCC
AAGCTGGTGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCAAAACTGACCATCTCCAAGTTGAGA
GCCAAGCTGGTGTTGAAGAGCATATTGAGTCAGAGGGCAACGAACTGGAGGTTTCTGATA
GGGAAGCAGTTGAGGGAAGTGGAGGAGGGGATGTGGTGGCTGTGAGGTCTGGTGATGAGA
GTAAAAGTAGAGAGACTGTGTGGTGGAAGATGCCGTTTGTTCTTGTCAAGTACTATGCAC
TTAGGATTGGTCCTGTTTGGTCTCTCTCCATGGCTGCAGCTGTGATGGGTTTTGTTCTCT
TGGGACGCAGACTCTATCATATGAAAAAGAAAGCTCAAAG*TTCCATCTCAAAGTTGCAA
TCGACGAGAAGAAGGTTTCGAGGGTGATGAGTCAGGCAGCTCGACTCAATGAAGCATTCA
CAGAGGTAAGAAGGGTCCCAGTGATCCGCCCTGCTCTGCCATCCCCTGGTGCATGGCCGG
TTTTGAGCCTTAGGTGAGAGAAGCCGGTTATACTATGTCTCATAACGTTATGTACCAAGA
GTAGAGAGACACGTGCATGTGTGTACAGTGGCTCATCATGTTATGTACTAAAAAGAATAG
AGATTCATGGTGTTTGTGATAC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

CO CL2226Contig1 1193 4 7 U
GGCAAGAAAATGGAGAGACCATGAGTTGGAACTCGTCGAAGTTGTGGCCGATCAGGTGGC
TGTGGCTCTTTCACACGCAGCGATTCTGGAGGAATCCATGCACGCTCGTGACCAGCTTAT
CGAGCAGAACTTTGCCTTAGACAAGGCTCGTCAAGAGGCAGAGATGGCAGTACATGCTCG
GAATGATTTCCTAGCTGTCGTGAACCACGAGATGAGGACACCCATGCATGCCATCATCTC
TCTCTCTTCTCTCCTTCTTGAGACCGAGCTATCTCCAGAGCAGAGAGTTATGATCGAGAC
TATGTTGAAAAGTAGCAATCTCGTGGCTACACTCATCAGCGACGTTCTGGATCTGTCGAG
ATTGGAAGATGGGAGCTTGCTCTTGGAAAATGAACCATTCAGTCTCCAAGCCATCTTTGA
AGAGGTCATCTCTCTGATAAAGCCAATCGCATCGGTGAAGAAACTGTCGACGAATCTGAT
CCTCTCGGCAGACTTGCCGGCTTATGCTATAGGTGATGAGAAACGTCTGATGCAAACTAT
TCTCAACATCATGGGAAACGCTGTGAAATTCACCAAGGAAGGCCACGTCTCCATAATAGC
TTCTATCATGAAACCTGAGTCCTTGAGAGAATTACCATCTCCAGACTTCTATCCAGTTCC
AAGTGACAATCACTTCTACCTATGCGTGCAGGTGAAGGACACAGGGTGTGGAATTCACAT
GCAAGACATTCCTTTTCTCTTCACCAAATTTGTGCAGCCTCGGACTGGAGCTCAGAGGAA
CCATTCTGGTGCAGGACTCGGTCTAGCTCTCTGCAAACGGTTCGTTGGGCTAATGGGAGG
ATGCATATGGATAGAAAGCGAAGGGATAGAGAAAGGGTGCACGGCTTCGTTCATAATAAA
GCTGGGTATCTGCAATGGTCCCAGCAGTAGCAGCGGTTCAATGGCGCTACGTCTTGCAGC
TAAATCACAAACAAGACCGTGGAACTGGTGATAACACATTACAGATGGATATGGTGACTT
CCATTGAGGAGAGCTTTTTTGGGGTAACTATCACACAGCAGGAAGAGAAAGGAGAATGTA
TATTATTATTATATACATGGCCGGAAGTGTTGAACTGATCTTTAACTTGTTTGATTTTTG
TTGGATGTAATTTGTAAATGAAAACACATACATATATATATATGTATGCCGAG


BQ
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AF RR4H110TF U 1
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AF RR4H110JQ C 354
AF RR4H242JQ C 428
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AAGTGACAATCACTTCTACCTATGCGT

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GAATGATTTCCTAGCTGTCGTGAACCACGAGATGAGGACACCCATGCATGCCATCATCTC
TCTCTCTTCTCTCCTTCTTGAGACCGAGCTATCTCCAGAGCAGAGAGTTATGATCGAGAC
TATGTTGAAAAGTAGCAATCTCGTGGCTACACTCATCAGCGACGTTCTGGATCTGTCGAG
ATTGGAAGATGGGAGCTTGCTCTTGGAAAATGAACCATTCAGTCTCCAAGCCATCTTTGA
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CCTCTCGGCAGACTTGCCGGCTTATGCTATAGGTGATGAGAAACGTCTGATGCAAACTAT
TCTCAACATCATGGGAAACGCTGTGAAATTCACCAAGGAAGGCCACGTCTCCATAATAGC
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ATGAAACCTGAGTCCTTGAGAGAATTACCATCTCCAGACTTCTATCCAGTTCCAAGTGAC
AATCACTTCTACCTATGCGTGCAGGTGAAGGACACAGGGTGTGGAATTCACATGCAAGAC
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TGGATAGAAAGCGAAGGGATAGAGAAAGGGTGCACGGCTTCGTTCATAATAAAGCTGGGT
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GGAGAGCTTTTTTGGGGTAACTATCACACAGCAGGAAGAGAAAGGAGAATGTATATTATT
ATTATATACATGGCCGGAAGTGTTGAACTGATCTTTAACTTGTTTGATTTTTGTTGGATG
TAATTTGTAAATGAAAACACATACATATATATATATGTATGCCGAG

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DS 



AS 1 4

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ACTACAATAAAACATGAATTAATCTCTCCAATAACGTTCTTTTTTATACAAAGAACATAT
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AATCTGTTTACAAATGGCTCGGCCTTCTTTTACCAGCATCGGTTCTTAACCTCTTCACCG
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GACTTCTAAAACCACGACCTACCATAGCTGGAGGTGAGACCGGGCTGCTTGAGCCAGCGG
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CTCCCCTTAGCATATACTGCACGTCAGATGCGAGTTCCATAACCCCTGTGAACTCTAGCC
TTTCTAACCGGTGATCAATCTCTCGCAGTTCCAATAGATTATTTACACCTCCAGCTGCAT
AACCAGTCTGAATTCTCTTCCACAAATTTGTCAGCATAGGCACAATCTGCTGACCTTCCT
TGTCGATTCTCCTTTGGAGTTTGCTAATGACCGTTTTGCACCGTTTCTGTATGTTGTGGG
ACATTCTTGCACCTGCACTTGAAGAGCCAATAGGACTAGTTCCATCCCATGTTTCTCTAG
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GCAGCTTGGAAGTATTAGCTACTTTCTTTGCAGGTAAACTCCTAAGTCTCGAGGATGAAT
CACTCTGTTCTTGTCTTGAACCATGTGAGTCAACAACTGTCCTCAATTTTGATCGATAGC
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TTTGACGGGGTCTTAGACGAATACTCCATCCGCTTTATTGTAGGTTGCAAAACCTGTTCT
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CCCGATGCTGCTATTTCCCCATCTTCTGTATCATCCACCATTCTTTTTGAGACAGAACCT
GGCCCCCGGCC


BQ
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G
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TAT
C

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AS 1 4

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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4D358JQ U 1
AF RR4D358TF C 152
AF RR4AL93JQ U 82
AF RR4AL93TF C 602
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BS 670 902 RR4AL93JQ
BS 903 1263 RR4AL93TF

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TTACTGAGACCAACAGAAGCTTTTCAGAACCAATGTTTAATTATACCAGCCCTATACCCC
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TAAATATAAAGAAATAAAACAAAAGACAAAGGAAAGGGAAACATATGTTTTTGTTCTGAC
TACACAACAGCAAATACAATGCAAAAGCATTTCTCTTGTGTTTTCTACTCTGATCATCTT
CTCCTCTACTTGTTGCGCTTTTATTGTTCGCATCTTCTCCTTCCAACTGCCCTACTTGTT
TCTCTTTTGACACCTTTAGAAGACATCCGGATTGAATCTTTGCGGCATCATAGAGTTGCC
GTGTTCCATTTGCTCCAGTTGCAATTTCAATGCGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGAC
CTTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTAAAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTC
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GATCAAGGCCTCCGCTTGTTGCTGCACTACCACACTCTCCTCTTGAAATTTTTTGGCAGC
TTCATCGTG

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DS 

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GAAAGGGAAACATATGTTTTTGTTCTGACTACACAACAGCAAATACAATGCAAAAGCATT
TCTCTTGTGTTTTCTACTCTGATCATCTTCTCCTCTACTTGTTGCGCTTTTATTGTTCGC
ATCTTCTCCTTCCAACTGCCCTACTTGTTTCTCTTTTGACACCTTTAGAAGACATCCGGA
TTGAATCTTTGCGGCATCATAGAGTTGCCGTGTTCCATTTGCTCCAGTTGCAATTTCAAT
GCGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGACCTTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTA
AAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTCCAAGGTCTTCTGCCGATCATGCTGGATAGCA
ACAGCACGCTTCAGCAATGTGTTGTCCTTGATCAAGGCCTCCGCTTGTTGCTGCACTACC
ACACTCTCCTCTTGAAATTTTTTGGCAGCTTCATCGTGAGCACGTGCGCTTAACGTCTTC
TCTAAAGCCTCGAGGACTCTTCCAGTACGGACTTTGGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGC
GTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCCAGTCATCAGCACTCGCTGGTGAAGCAGTCTCC
TTAATAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAGCAGA
CCC

QA 1 692 1 692
DS 

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C
TTCAGAACCAATGTTTAATTATACCAGCCCTATACCCCCACCAAACACACAAATTCTTGA
TATTCCCTCAGGATCATCACACAACCAGCACCAAAGTATAAATATAAAGAAATAAAACAA
AAGACAAAGGAAAGGGAAACATATGTTTTTGTTCTGACTACACAACAGCAAATACAATGC
AAAAGCATTTCTCTTGTGTTTTCTACTTTGATCATCTTCCCCTCTACTTGTTGCGCTTTT
ATTGTTCGCATCTTCTCCTTCCAACTGCCCTACTTGTTTCTCTTTTGACACCTTTAGAAG
ACATCCGGATTGAATCTTTGCGGCATCATAGAGTTGCCGTGTTCCATTTGCTCCAGTTGC
AATTTCAATGCGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGACCTTCTCCTGGTACTGAGGAATC
AGTTGCTTAAAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTCCAAGGTCTTCTGCCGATCATGC
TGGATAGCAACAGCACGCTTCAGCAATGTGTTGTCCTTGATCAAGGCCTCCGCTTGTTGC
TGCACTACCACACTCTCCTCTTGAAATTTTTTGGCAGCTTCATCGTGAGCACGTGCGCTT
AACGTCTTCTCTAAAGCCTCGAGGACTCTTCCAGTACGGACTTTGGCATCATCCGTGCCA
GTAGACTGCGTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCCAGTCATCAGCACTCGCTGGTGAA
GCAGTCTCCTTAATAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAGCAGAGACCAAAGCGTATAAGCTT
TTCATAGCAGCATTCAAGTCACTCCCATGTCCTTCCAACG

QA 2 821 2 821
DS 

RD RR4AL93TF 662 0 0
ATCAAGGCCTCCGCTTGTTGCTGCACTACCACACTCTCCTCTTGAAATTTTTTGGCAGCT
TCATCGTGAGCACGTGCGCTTAACGTCTTCTCTAAAGCCTCGAGGACTCTTCCAGTACGG
ACTTTGGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGCGTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCCAG
TCATCAGCACTCGCTGGTGAAGCAGTCTCCTTAATAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAGCA
GAGACCAAAGCGTATAAGCTTTTCATAGCAGCATTCAAGTCACTCCCATGTCCTTCCAAC
GCCTCCACAAGAACGGTGAGTTCAAGATGAGGAAAGGCGGTGCGAAGCTGATCGAGCGAT
GAGGAAGGAGAGGAGGAGGACCAGCTTGGAGGATTGGAAGGGGAATAGCATCTGAACCTC
TTCGAAGACGGAGGAGGAGAAGGAGTTTCTTCGAAGTAAGATCTCTTACTTCCGCAATAT
ACGGCAGACATGTCTGGGAAATTGACGGATGATACGATCCGAATGAGCCCTAAAATCTCA
ATTAAGTTAGGGTTTGGAGGAGGAAGGAGATGATTAGAGGCAAAGGCAATCCTCAGATCG
AGATTCGGGGGGGGGAGGAGCGTCCAAAGTTTTCCCTCTTATCAGGTTTTAGGTTTTTTG
AT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL2229Contig1 1323 4 2 U
GGGAAACTCCAGAACCTCTTTCCACAAACACTCCTCATCATTTCACACAAAACATCGTAC
TTATCGCCTCCCTCTCGCTCTCTCTCTCTTTGGATCCGCCATGCAAGCTCTTCACCCTTC
ATCCCTCCGCGCTTCTCCACCAAACCCACTCCTAAGACCCTCAAATCGCCAATCTCCTCA
CCACATCACCAATGCGAGACAACCCACGAGAAGACGCTCATTCATCTCCGCGTCATCCGC
CCCAAAACGCGAGACAGACCCGAAGAAACGGGTCGTAATCACCGGAATGGGTCTCGTCTC
CGTCTTCTGAAACGACGTCGACGCTTACTACGAGAAGCTGCTCTCCGGCGAGAGTGGAAT
CAGCTTGATTGATCGATTCGATGCCTCCAAGTTCCCCACTCGATTCGGTGGTCAGATCCG
TGGGTTTAGCTCTGAGGGTTACATCGATGGGAAGAACGAGCGTAGGCTTGATGATTGCTT
GAAGTACTGCATTGTTGCGGGCAAGAAGGCTCTTGAAAGTGCTGGTCTTGGTGGTGATAA
GCTCAACACGATTGATAAGCAGAAAGCTGGAGTACTAGTTGGGACTGGTATGGGTGGTTT
GACTGTGTTTTCAGACGGTGTTCAAGCTCTTATTGAGAAAGGTCACAGGAGGATTTCTCC
TTTCTTTATTCCTTATGCTATAACAAACATGGGTTCTGCTTTGTTGGCGATTGATCTCGG
TCTTATGGGTCCTAACTACTCGATTTCGACCGCTTGTGCCACTTCTAACTACTGCTTTTA
CGCTGCTGCGAACCACATTCGACGTGGTGAAGCTGATATGATGATTGCTGGTGGAACTGA
GGCTGCTATTATTCCTATTGGCTTGGGAGGTTTTGTTGCTTGTAGGGCTTTGTCACAGAG
AAATGATGACCCTCAAACCGCTTCAAGGCCATGGGATAAACAGAGAGATGGGTTTGTCAT
GGGTACTTTGATACGGTCGCAAACGAGAAGAAGCAGCATGAGGTGAATGTTGCCATATCA
AACTCGTTTGGTTTCGGTGGACATAACTCAGTCGTCGCTTTCTCTGCCTTCAAGCCTTGA
TTTCGTCAGACCCTTTAGATCCTCTGCTTCATCTGTTAGATCGCCACTATCTTCTTCTTT
GCAGCTTCTTGGTTCACAAGTTTGAGCTCTTGCTCTTGCTCTGGCGTTTTATGTTTCTTT
CAGCTTTTTGTTCTTATTGGTCATTGTTTTTTTTTGTCAACTCATATTGGCCATTGAGGT
GTTGAGAATCCAGATTTTGCTTGTCAATCTGTGTACGGAATGTTGTATCTTAGTTCGTTC
CAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR4C374TF U 1
AF RR4C385TF U 1
AF RR4C374JQ C 478
AF RR4C385JQ C 572
BS 1 597 RR4C374TF
BS 598 1323 RR4C374JQ

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TTATCGCCTCCCTCTCGCTCTCTCTCTCTTTGGATCCGCCATGCAAGCTCTTCACCCTTC
ATCCCTCCGCGCTTCTCCACCAAACCCACTCCTAAGACCCTCAAATCGCCAATCTCCTCA
CCACATCACCAATGCGAGACAACCCACGAGAAGACGCTCATTCATCTCCGCGTCATCCGC
CCCAAAACGCGAGACAGACCCGAAGAAACGGGTCGTAATCACCGGAATGGGTCTCGTCTC
CGTCTTCTGAAACGACGTCGACGCTTACTACGAGAAGCTGCTCTCCGGCGAGAGTGGAAT
CAGCTTGATTGATCGATTCGATGCCTCCAAGTTCCCCACTCGATTCGGTGGTCAGATCCG
TGGGTTTAGCTCTGAGGGTTACATCGATGGGAAGAACGAGCGTAGGCTTGATGATTGCTT
GAAGTACTGCATTGTTGCGGGCAAGAAGGCTCTTGAAAGTGCTGGTCTTGGTGGTGATAA
GCTCAACACGATTGATAAGCAGAAAGCTGGAGTACTAGTTGGGACTGGTATGGGTGG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4C385TF 597 0 0
GGGAAACTCCAGAACCTCTTTCCACAAACACTCCTCATCATTTCACACAAAACATCGTAC
TTATCGCCTCCCTCTCGCTCTCTCTCTCTTTGGATCCGCCATGCAAGCTCTTCACCCTTC
ATCCCTCCGCGCTTCTCCACCAAACCCACTCCTAAGACCCTCAAATCGCCAATCTCCTCA
CCACATCACCAATGCGAGACAACCCACGAGAAGACGCTCATTCATCTCCGCGTCATCCGC
CCCAAAACGCGAGACAGACCCGAAGAAACGGGTCGTAATCACCGGAATGGGTCTCGTCTC
CGTCTTCTGAAACGACGTCGACGCTTACTACGAGAAGCTGCTCTCCGGCGAGAGTGGAAT
CAGCTTGATTGATCGATTCGATGCCTCCAAGTTCCCCACTCGATTCGGTGGTCAGATCCG
TGGGTTTAGCTCTGAGGGTTACATCGATGGGAAGAACGAGCGTAGGCTTGATGATTGCTT
GAAGTACTGCATTGTTGCGGGCAAGAAGGCTCTTGAAAGTGCTGGTCTTGGTGGTGATAA
GCTCAACACGATTGATAAGCAGAAAGCTGGAGTACTAGTTGGGACTGGTATGGGTGG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4C374JQ 846 0 0
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TAAGCTCAACACGATTGATAAGCAGAAAGCTGGAGTACTAGTTGGGACTGGTATGGGTGG
TTTGACTGTGTTTTCAGACGGTGTTCAAGCTCTTATTGAGAAAGGTCACAGGAGGATTTC
TCCTTTCTTTATTCCTTATGCTATAACAAACATGGGTTCTGCTTTGTTGGCGATTGATCT
CGGTCTTATGGGTCCTAACTACTCGATTTCGACCGCTTGTGCCACTTCTAACTACTGCTT
TTACGCTGCTGCGAACCACATTCGACGTGGTGAAGCTGATATGATGATTGCTGGTGGAAC
TGAGGCTGCTATTATTCCTATTGGCTTGGGAGGTTTTGTTGCTTGTAGGGCTTTGTCACA
GAGAAATGATGACCCTCAAACCGCTTCAAGGCCATGGGATAAACAGAGAGATGGGTTTGT
CATGGGTACTTTGATACGGTCGCAAACGAGAAGAAGCAGCATGAGGTGAATGTTGCCATA
TCAAACTCGTTTGGTTTCGGTGGACATAACTCAGTCGTCGCTTTCTCTGCCTTCAAGCCT
TGATTTCGTCAGACCCTTTAGATCCTCTGCTTCATCTGTTAGATCGCCACTATCTTCTTC
TTTGCAGCTTCTTGGTTCACAAGTTTGAGCTCTTGCTCTTGCTCTGGCGTTTTATGTTTC
TTTCAGCTTTTTGTTCTTATTGGTCATTGTTTTTTTTTGTCAACTCATATTGGCCATTGA
GGTGTTGAGAATCCAGATTTTGCTTGTCAATCTGTGTACGGAATGTTGTATCTTAGTTCG
TTCCAT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4C385JQ 752 0 0
GTACTAGTTGGGACTGGTATGGGTGGTTTGACTGTGTTTTCAGACGGTGTTCAAGCTCTT
ATTGAGAAAGGTCACAGGAGGATTTCTCCTTTCTTTATTCCTTATGCTATAACAAACATG
GGTTCTGCTTTGTTGGCGATTGATCTCGGTCTTATGGGTCCTAACTACTCGATTTCGACC
GCTTGTGCCACTTCTAACTACTGCTTTTACGCTGCTGCGAACCACATTCGACGTGGTGAA
GCTGATATGATGATTGCTGGTGGAACTGAGGCTGCTATTATTCCTATTGGCTTGGGAGGT
TTTGTTGCTTGTAGGGCTTTGTCACAGAGAAATGATGACCCTCAAACCGCTTCAAGGCCA
TGGGATAAACAGAGAGATGGGTTTGTCATGGGTACTTTGATACGGTCGCAAACGAGAAGA
AGCAGCATGAGGTGAATGTTGCCATATCAAACTCGTTTGGTTTCGGTGGACATAACTCAG
TCGTCGCTTTCTCTGCCTTCAAGCCTTGATTTCGTCAGACCCTTTAGATCCTCTGCTTCA
TCTGTTAGATCGCCACTATCTTCTTCTTTGCAGCTTCTTGGTTCACAAGTTTGAGCTCTT
GCTCTTGCTCTGGCGTTTTATGTTTCTTTCAGCTTTTTGTTCTTATTGGTCATTGTTTTT
TTTTGTCAACTCATATTGGCCATTGAGGTGTTGAGAATCCAGATTTTGCTTGTCAATCTG
TGTACGGAATGTTGTATCTTAGTTCGTTCCAT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2230Contig1 1101 4 7 U
GGGCTGCAAGCGGGCCAGATTCATCTGAGGAAGATTCTGATGAGGAAAGTGAAGATGAAA
AGCCCGCACCAAAAGAGACCAAGACAGCCAAAAAGGATGGCAGTAGCGATGGCTCTGACT
CTGATGAGTCTGAAAGTGAAGAAGAGGAAGAAACCCCAAAGAAAAAGAGCTCTGATGTAG
AAATGGTGGATGCTGAAAAGCAACAGCCAAAGACACCATCAACTCCTGCCACAGGAGGAT
CAAAGACTCTCTTTGTTGCCAATCTCCCATTCCAAGTTGAAAAATCAGATGTTGAGGAAT
TCTTCAAGGGAGCTGGCCAGGTTGTTGATGTTAGATTTTGCCATGTCTAAAGATGATGGC
AGTTTCAGAGGTTTTGGCCATGTTGAGTTTGCTTCTGCCGGGGAAGCACAGAAGGCACTT
GAATTTCACGGGAGACCTTTGCTTGGTCGTCAACTTCGTCTTGATGTTGCTCAGGAGAGG
GGTGAAAGACCCGCTTACAACACTCCCCGAAGCGGAAACGGCGGTGGTGGTGGTGGGTCA
GAGGTTTTTGTGAAGGGATTTGACTCTTCCCTTCCTGTGAATGATATCAAGAGCGCCTTG
AGCGAACACTTTGCATCATGTGGTGAAATCACGAGGGTCTCTGTTCCCGTTGACCGTGAA
ACTGGTGGTGCCAGAGGAATTGCTTACCTTGAATTTAAAGAAGGCACAGAGAAGGCGTTT
GAACTTAATGGTAGTGAAATGGGAGGATGGAATCTCGTTGTTGATGAGCCTAGACCGAAG
GAGAACAATAGTGGTGGATTCAATAGTGGAAGGAGCAACTATGGCGGAGGAAGAGACAGT
GGTCGTGGCCGTGGTCGTGGCAGAGGAAGAGATAATTTCCGTGGTCGTGGCAGAGGAAGA
GAAAACGGTCGTGGAAGACCTAGTTTCACTCATTCAGAAGGTAAGAAGACTACCTTTAGC
GACGAGTAGAAACTTTGTAGAAGAGAATGCTCTTTTTGTTTTCAAGTCTTTAACTTATAC
ATTGCATCCTTTTTTATTGTTTTGGTTTTTTTTTTGTCTGAGAACCTTTAAATTTTTTTC
TTAATGTTATAAATTAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AS18TF U 1
AF RR4E479TF U 486
AF RR4AS18JQ C 285
AF RR4E479JQ C 486
BS 1 368 RR4AS18TF
BS 369 486 RR4AS18JQ
BS 487 936 RR4E479TF
BS 937 937 RR4AS18JQ
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BS 1056 1101 RR4AS18JQ

RD RR4AS18TF 368 0 0
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AGCCCGCACCAAAAGAGACCAAGACAGCCAAAAAGGATGGCAGTAGCGATGGCTCTGACT
CTGATGAGTCTGAAAGTGAAGAAGAGGAAGAAACCCCAAAGAAAAAGAGCTCTGATGTAG
AAATGGTGGATGCTGAAAAGCAACAGCCAAAGACACCATCAACTCCTGCCACAGGAGGAT
CAAAGACTCTCTTTGTTGCCAATCTCCCATTCCAAGTTGAAAAATCAGATGTTGAGGAAT
TCTTCAAGGGAGCTGGCCAGGTTGTTGATGTTAGATTTTGCCATGTCTAAAGATGATGGC
AGTTTCAG

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4E479TF 575 0 0
G
AGACCCGCTTACAACACTCCCCGAAGCGGAAACGGCGGTGGTGGTGGTGGGTCAGAGGTT
TTTGTGAAGGGATTTGACTCTTCCCTTCCTGTGAATGATATCAAGAGCGCCTTGAGCGAA
CACTTTGCATCATGTGGTGAAATCACGAGGGTCTCTGTTCCCGTTGACCGTGAAACTGGT
GGTGCCAGAGGAATTGCTTACCTTGAATTTAAAGAAGGCACAGAGAAGGCGTTTGAACTT
AATGGTAGTGAAATGGGAGGATGGAATCTCGTTGTTGATGAGCCTAGACCGAAGGAGAAC
AATAGTGGTGGATTCAATAGTGGAAGGAGCAACTATGGCGGAGGAAGAGACAGTGGTCGT
GGCCGTGGTCGTGGCAGAGGAAGAGATAATTTCCGTGGTCGTGGCAGAGGAAGAGAAAAC
GGTCGTGGAAGACCTAGTTTCACTCATTCACAAGGTAAGAAGACTACCTTTAGCGACGAG
TAGAAACTTTGTAGAAGAGAATGCTCTTTTTGTTTTCAAGTCTTTAACTTATACATTGCA
TCCTTTTTTATTGTTTTGGTTTTTTTTT
TGTCTG

QA 2 569 2 569
DS 

RD RR4AS18JQ 817 0 0
TCAGATGTTGAGGAATTCTTCAAGGGAGCTGGCCAGGTTGTTGATGTTAGATTT*GCCAT
GTCTAAAGATGATGGCAGTTTCAGAGGTTTTGGCCATGTTGAGTTTGCTTCTGCCGGGGA
AGCACAGAAGGCACTTGAATTTCACGGGAGACCTTTGCTTGGTCGTCAACTTCGTCTTGA
TGTTGCTCAGGAGAGGGGTGAAAGACCCGCTTACAACACTCCCCGAAGCGGAAACGGCGG
TGGTGGTGGTGGGTCAGAGGTTTTTGTGAAGGGATTTGACTCTTCCCTTCCTGTGAATGA
TATCAAGAGCACCTTGAGTGAACACTTTGCATCATGTGGTGAAATCACGAGGGTCTCTGT
TCCCGTTGACCGTGAAACTGGTGGTTCCAGAGGAATTGCTTACCTTGAATTTAAAGAAGG
CACAGAGAAGGCGTTTGAACTTAATGGTAGTGAAATGGGAGGATGGAATCTCGTTGTTGA
TGAGCCTAGACCGAAGGAGAACAATAGTGGTGGATTCAACAGTG*AAGGAGCAACTATGG
CGGAGGAAGAGACAGTGGTCGTGGCCGTGGTCGCGGCAGAGGAAGAGATAATTTCCGTGG
TCGTGGCAGAGGAAGAGAAAACGGTCGTGGAAGACCTAGTTTCACTCATTCAGAAGGTAA
GAAGACTACCTTTAGCGACGAGTAGAAACTTTGTAGAAGAGAATGCTCTTTTTGTTTTCA
AGTCTTTAACTTATACATTGCATCCTTTTTTATTGTTTTGGTTTTTTTTT*GTCTGAGAA
CCTTTAAATTTTTTTCTTAATGTTATAAATTAAGCCC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4E479JQ 616 0 0
G
AGACCCGCTTACAACACTCCCCGAAGCGGAAACGGCGGTGGTGGTGGTGGGTCAGAGGTT
TTTGTGAAGGGATTTGATTTTTCCCTTCCTGTGAATGATATCAAGAGCGCCTTGAGCGAA
CACTTTGCATCATGTGGTGAAATCACGAGGGTTTTTGTTCCCGTTGACCGTGAAACTGGT
GGTGCCAGAGGAATTGCTTACCTTGAATTTAAAGAAGGCACAGAGAAGGCGTTTGAACTT
AATGGTAGTGAAATGGGAGGATGGAATCTCGTTGTTGATGAGCCTAGACCGAAGGAGAAC
AATAGTGGTGGATTCAATAGTGGAAGGAGCAACTATGGCGGAGGAAGAGACAGTGGTCGT
GGCCGTGGTCGTGGCAGAGGAAGAGATAATTTCCGTGGTCGTGGCAGAGGAAGAGAAAAC
GGTCGTGGAAGACCTAGTTTCACTCATTCAGAAGGTAAGAAGACTACCTTTAGCGACGAG
TAGAAACTTTGTAGAAGAGAATGCTCTTTTTGTTTTCAAGTCTTTAACTTATACATTGCA
TCCTTTTTTATTGTTTTGGTTTTTTTTTTGTCTGAGAACCTTTAAATTTTTTTCTTAATG
TTATAAATTAAGCCC

QA 2 616 2 616
DS 



AS 2 4

CO CL2231Contig1 797 2 16 U
GAGGGGGTGGGAGGAGCTGTAGAATTGGCTCCTGGTTACTTAAAGTCGGTTTATGACATT
GTCCGCAAAGCTGGTGGTGTATGCATCGCCGATGAGGTCCAAACTGGATTTGGCCGCACA
GGAAGTCATTACTGGGGGTTCCAGACCCAAGATGTAGTACCCGACATAGTCACAATGGCA
AAGGGAATCGGAAATGGATTGCCATTAGGAGCTGTGGTGACTACACCAGAAATCGCTAGC
GTATTAGCTACAAAGATTCAGTTCAACACGTTTGGTGGGAACCCGGTCTGTTCAGCTGGT
GGACATACTGTTCTAAAGGTTATTGATAAGGAGAGACGCCAAACACACTGCGCAGAAGTT
GGCTCCCACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCTCCAGAAAAGACATGATATCATTGGAGAT
GTGAGAGGAAGAGGATTAATGGTTGGGATAGAGCTTGTGTCTGACAGGAAGGACAAGACA
CCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGAGCAACTTAGAGAATTGGGCATTCTCGTT
GGAAAAGGAGGACTTCATCGAATGTTTTCAGGATAAAGCCACCAATGTGTTTCACCAAAG
ACGACGCAGATTTCTTGGTAGATGCATTGGACTATTCAATCTCCAGGTTTTGAAGAAGGA
CGAAAGAAAGCGAATGAGAGTTTTAACCTTATGTCCTGTTCTAATGTTCCAATCCAACTC
TCTCACTCTTCCTTGTTCCTTTTGTAATAACACTCTCTTCATGTGATCTGAAAATTAAAT
AAATTAAGTATTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH45TF U 1
AF RR4C711JQ C 118
BS 1 131 RR4CH45TF
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BS 303 303 RR4C711JQ
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BS 355 437 RR4CH45TF
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BS 490 490 RR4C711JQ
BS 491 558 RR4CH45TF
BS 559 797 RR4C711JQ

RD RR4CH45TF 568 0 0
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GGAAAAGGAGGACTTCAT
GGGAATGTTT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4C711JQ 680 0 0
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AAGACGACGCAGATTTCTTGGTAGATGCATTGGACTATTCAATCTCCAGGTTTTGAAGAA
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AATAAATTAAGTATTCAAGC

QA 1 680 1 680
DS 



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TGTTCTGTTTTTCATCGTCTTTTTAATGTTCCAATCCAACTCTCTCACTCTTCCTCGTTC
CTTTTGTAATAACACTCTCTTCATGTGATTTGAAAATTAAATAAAATAAGTATTCAAGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D002JQ C 1
AF RR4D002TF U 1
BS 1 1 RR4D002JQ
BS 2 599 RR4D002TF

RD RR4D002JQ 599 0 0
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GAGACGCCAAACACACTGCGCTGAAGTTGGCTCCCACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCT
CCAGAAAAGACATGATATCATTGGAGATGTGAGAGGAAGAGGATTGATGGTTGGGATAGA
GCTTGTGTCTGACAGGAAGGACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGA
GCAACTTAGAGAATTGGGCATTCTCGTTGGAAAAGGAGGACTTCATGGGAATGTTTTCAG
GATAAAGCCACCAATGTGTTTCACCAAAGACGACGCAGATTTCTTGGTAGATGCATTGGA
CTATTCAATCTCCAGGTTGTGAAGAAGGACGAGAGAAAGCGAATGAGAGTTTTAACCTTA
TGTTCTGTTTTTCATCGTCTTTTTAATGTTCCAATCCAACTCTCTCACTCTTCCTCGTTC
CTTTTGTAATAACACTCTCTTCATGTGATTTGAAAATTAAATAAAATAAGTATTCAAGC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4D002TF 599 0 0
G
GTGGTGACTACACCAGAAATCGCTAGCGTATTAGCTACAAAGATTCAGTTCAACACGTTT
GGTGGGAACCCGGTCTGTTCAGCTGGTGGGCATGCTGCTCTAAAGGTTATTGATAAGGAG
AGACGCCAAACACACTGCGCTGAAGTTGGCTCCCACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCTC
CAGAAAAGACATGATATCATTGGAGATGTGAGAGGAAGAGGATTGATGGTTGGGATAGAG
CTTGTGTCTGACAGGAAGGACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGAG
CAACTTAGAGAATTGGGCATTCTCGTTGGAAAAGGAGGACTTCATGGGAATGTTTTCAGG
ATAAAGCCACCAATGTGTTTCACCAAAGACGACGCAGATTTCTTGGTAGATGCATTGGAC
TATTCAATCTCCAGGTTGTGAAGAAGGACGAGAGAAAGCGAATGAGAGTTTTAACCTTAT
GTTCTGTTTTTCATCGTCTTTTTAATGTTCCAATCCAACTCTCTCACTCTTCCTCGTTCC
TTTTGTAATAACACTCTCTTCATGTGATTTGAAAATTAAATAAAATAAGTATTCAAGC

QA 2 599 2 599
DS 



AS 1 4

CO CL2232Contig1 745 4 7 U
GGATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAAAAAAAAATAAGCAACCTTATTAGTTCTCTCG
AACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCGAG
AATCTTTTTTTTTTT*AATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACGT
TTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAA
CAAACGGCCAAAATCAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAA
GGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATG
CAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATC
CCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGAGAGAGAATTGTT
TATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCTT
GTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAATGAATGCTTGTAT
GCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAA
AATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTAATTTGTATGGAATTT
CAAGTTAAAAGAAAGTTATTTTCCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4CO06TF U 1
AF RR4FJ14TF U 1
AF RR4CO06JQ C 51
AF RR4FJ14JQ C 157
BS 1 614 RR4CO06TF
BS 615 615 RR4FJ14TF
BS 616 661 RR4CO06TF
BS 662 662 RR4FJ14TF
BS 663 676 RR4CO06TF
BS 677 743 RR4FJ14TF
BS 744 745 RR4CO06JQ

RD RR4CO06TF 679 0 0
GGATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAAAAAAAAATAAGCAACCTTATTAGTTCTCTCG
AACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCGAG
AATCTTTTTTTTTTT*AATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACGT
TTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAA
CAAACGGCCAAAATCAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAA
GGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATG
CAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATC
CCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGAGAGAGAATTGTT
TATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCTT
GTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAATGAATGCTTGTAT
GCGCTAAGTTTTCA*TCCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAA
A*TGATTTTTCTGTTT
CTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FJ14TF 744 0 0
GGATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAAAAAAAAATGAGCAACCTTATTAGTTCTCTCG
AACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCGAG
AGTCTTTTTTTTTTTTAATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTT**AAAACGT
TTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAA
CAAACGGCCAAAATTAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAA
GGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATG
CAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATC
CCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGAGAGAGAATTGTT
TATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCTT
GTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAATGAATGCTTGTAT
GCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAA
AATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTAATTTGTATGGAATTT
CAAGTTAAAAGAAAGTTATTTTC
T

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4CO06JQ 695 0 0
AGTTCTCTCGAACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAAT
TTTCTTCGAGAATCTTTTTTTTTTT*AATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTT
TCTAAAACGTTTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTT
ACATCGCAAACAAACGGCCAAAATCAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGT
TGGATCACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCC
GTTGTTCATGCAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCAC
CATCACGATCCCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGAGA
GAGAATTGTTTATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTA
TCATCCTCTTGTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAATGA
ATGCTTGTATGCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAAC
CCAAGAATAAAATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTAATTTG
TATGGAATTTCAAGTTAAAAGAAAGTTATTTTCCG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4FJ14JQ 588 0 0
TTCTTCATCATCTTT**AAAACGTTTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTG
AAAAGCTTCCATTTACATCGCAAACAAACGGCCAAAATTAAAGATGTTCCAAAAGGATGC
TTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTG
TATTTTAATCATCCGTTGTTCATGCAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTC
GATCAAAAGGGCACCATCACGATCCCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCT
TTGATTGATGGAGAGAGAATTGTTTATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGC
GGTCGTGACCAGTATCATCCTCTTGTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACG
AGGAGGATGAATGAATGCTTGTATGCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCC
AAAACTGGCCTAACCCAAGAATAAAATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTA
TTTTCTGTAATTTGTATGGAATTTCAAGTTAAAAGAAAGTTATTTTC
T

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 4

CO CL2233Contig1 609 4 3 U
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CAACCTCTTTCTTCTCCGCGAAGCTCGAGCTTGCCCCTGTTATCACAACACCAACACCAT
CGCTTGTCACCACCAACGCCGCCCGACAACCACCACGACCACAACGGGTTGGAAGAGTCA
TGGCGTGCATCCATGGAGATTGAAGACATATGTAATGGTCATCTCTTTCTTGAGCAGAGT
GGTCGTGACTCGTGAGCAGAGGAGATATCTCGCCCCTTCGGTGTAGAGCTTGCCTCTGTT
ATCACCGGTATCGAACTCGTCCTGCTCGCCATCAATGGTGCCGGAGATGGAGACAGAATG
GATTGGAGGAGGGAGGCAGCAACAGAGATATTAGATTTAGAGTTAATTAGGTCTAGATTT
TGATTAATTAGTTATTGGTTTAGTGTGTTCTGGTTTACTTATTT*CTTTTAATCTGGTTT
AGTTTT*GTAAAATTAGTTTTATTT*GTAAATTGATTTT*GATTAATAAAATAATTAAAT
TTTAATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 

AF RR4BW49JQ C 1
AF RR4BW49TF U 1
AF RR4BM66JQ C 13
AF RR4BM66TF U 54
BS 1 482 RR4BW49TF
BS 483 483 RR4BM66TF
BS 484 609 RR4BW49TF

RD RR4BW49JQ 609 0 0
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CCCTCCTCTCTTTTTCGTTGCTGGAGAAGCAAACCAGACCACAAAAAACCAGAACAAAAC
CAACCTCTTTCTTTTCCGCGAAGCTCGAGCTTGCCCCTGTTATCACAACACCAACACCAT
CGCTTGTCACCACCAACGCCGCCCGACAACCACCACGACCACAACGGGTTGGAAGAGTCA
TGGCGTGCATCCATGGAGATTGAAGACATATGTAATGGTCATCTCTTTCTTGAGCAGAGT
GGTCGTGACTCGTGAGCAGAGGAGATATCTCGCCCCTTCGGTGTAGAGCTTGCCTCTGTT
ATCACCGGTATCGAACTCGTCCTGCTCGCCATCAATGGTGCCGGAGATGGAGACAGAATG
GATTGGAGGAGGGAGGCAGCAACAGAGATATTAGATTTAGAGTTAATTAGGTCTAGATTT
TGGTTAATTAGTTATTGGTTTAGTGTGTTCTGGTTTACTTATTT*CTTTTAATCTGGTTT
AGTTTT*GTAAAATTAGTTTTATTT*GTAAATTGATTTT*GATTAATAAAATAATTAAAT
TTTAATTTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4BW49TF 609 0 0
GGAAGTCACAAAATATTTCAGATCTCTCCTCTTCGTCATCATTCCGTTTGTTCTTCACTC
CCCTCCTCTCTTCTTCGTTGCTGGAGAAGCAAACCAGACCACAAAAAACCAGAACAAAAC
CAACCTCTTTCTTCTCCGCGAAGCTCGAGCTTGCCCCTGTTATCACAACACCAACACCAT
CGCTTGTCACCACCAACGCCGCCCGACAACCACCACGACCACAACGGGTTGGAAGAGTCA
TGGCGTGCATCCATGGAGATTGAAGACATATGTAATGGTCATCTCTTTCTTGAGCAGAGT
GGTCGTGACTCGTGAGCAGAGGAGATATCTCGCCCCTTCGGTGTAGAGCTTGCCTCTGTT
ATCACCGGTATCGAACTCGTCCTGCTCGCCATCAATGGTGCCGGAGATGGAGACAGAATG
GATTGGAGGAGGGAGGCAGCAACAGAGATATTAGATTTAGAGTTAATTAGGTCTAGATTT
TGGTTAATTAGTTATTGGTTTAGTGTGTTCTGGTTTACTTATTT*CTTTTAATCTGGTTT
AGTTTT*GTAAAATTAGTTTTATTT*GTAAATTGATTTT*GATTAATAAAATAATTAAAT
TTTAATTTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4BM66JQ 597 0 0
GG
ATTTCAGATCTCTCCTCTTCGTCATCATTCCGTTTGTTCTTCACTCCCCTCCTCTCTTCT
TCGTTGCTGGAGAAGCAAACCAGACCACAAAAAACCAGAACAAAACCAACCTCTTTCTTC
TCCGCGAAGCTCGAGCTTGCCCCTGTTATCACAACACCAACACCATCGCTTGTCACCACC
AACGCCGCCCGACAACCACCACGACCACAACGGGTTGGAAGAGTCATGGCGTGCATCCAT
GGAGATTGAAGACATATGTAATGGTCATCTCTTTCTTGAGCAGAGTGGTCGTGACTCGTG
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ACTCGTCCTGCTCGCCATCAATGGTGCCGGAGATGGAGACAGAATGGATTGGAGGAGGGA
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TTGGTTTAGTGTGTTCTGGTTTACTTATTT*CTTTTAATCTGGTTTAGTTTT*GTAAAAT
TAGTTTTATTT*GTAAATTGATTTT*GATTAATAAAATAATTAAATTTTAATTTT

QA 3 597 3 597
DS 

RD RR4BM66TF 556 0 0
TTCACTCCCCTCCTCTCTTCTTCGTTGCTGGAGAAGCAAACCAGACCACAAAAAACCAGA
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ACACCATCGCTTGTCACCACCAACGCCGCCCGACAACCACCACGACCACAACGGGTTGGA
AGAGTCATGGCGTGCATCCATGGAGATTGAAGACATATGTAATGGTCATCTCTTTCTTGA
GCAGAGTGGTCGTGACTCGTGAGCAGAGGAGATGTCTCGCCCCTTCGGTGTAGAGCTTGC
CTCTGTTATCACCGGTATCGAACTCGTCCTGCTCGCCATCAATGGTGCCGGAGATGGAGA
CAGAATGGATTGGAGGAGGGAGGCAGCAACAGAGATATTAGATTTAGAGTTAATTAGGTC
TAGATTTTGATTAATTAGTTATTGGTTTAGTGTGTTCTGGTTTACTTATTTTCTTTTAAT
CTGGTTTAGTTTTTGTAAAATTAGTTTTATTTTGTAAATTGATTTTTGATTAATAAAATA
ATTAAATTTTAATTTT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 4

CO CL2234Contig1 1020 4 13 U
GTTGGTGAAACGTTTGAAACAGAGAGCAAGAATCAAGATTTGACCAAAAGCATTCAATGG
AGAGAGTGAATCAAACGTTCTTCTTATCTCATGGCTCTCCTACATTGAGCATTGACGATA
GCTTGGAAGCGAGACAGCTCTTCAAGTCATGGAAGGACAAAGTTTTGCCACAGAAACCCA
AATCGATCCTGATCATCTCCGCACATTGGGACACAAAAGTTCCAACCGTCAACACCGTTC
TCCGCAATTCCACAATCCACGACTTCTATGGCTTCCCTGATCCCATGTACAAGCTGAAAT
ATGAAGCACCAGGAGCTATTGAATTAGGGAAGAGAGTAAAAGAATTGTTAATGGGAGAAG
GAGGAATGACACGTGTTGATGAAGATAAGAACAGAGGACTTGATCATGGAGCTTGGGTTC
CTCTTATGTTGATGTATCCAGGGGCGGATATACCTATTTGCCAACTCTCTGTTCAATCAT
CTCAAAATGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTCCATTGAAAGACGAAG
GTGTTCTCATCATTGGATCAGGAAGTGCTACTCACAACTTGAGGAAGCTTGACTTTAATA
TTGCTAATGGCTCAGCTGTTCCTTGGGCTTTGGCTTTTGATCACTGGCTCAGAGATTCTC
TGCTTCAAGGAAGATATGGAGATGTAAATGATTGGGAAGAGAAAGCTCCAAATGCGAAAA
TGGCGCATCCATGGCCTGAGCATTTTTACCCGCTACACGTTGCATTGGGTGCAGCAGGAG
GTGATGCAAAGGCAGAGCAAATTCACACCAGTTGGCAGCTTGGTACTCTGTCTTATTCTT
CTTATAGCTTCACTACTCCCCTTTGAAAACATTTTCATGACTATCTCCTTCACTTGTCGT
GTGTGTCTACTTTTAATGTAAACCTGTCTATTTCATCTATCTTCAATAACTCAGATCCTT
GTATGCAAATAAAAAAAAACATCTTTGTGATATGCAATGACGAGAAGAAAACTAATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H921TF U 1
AF RR4CY42TF U 5
AF RR4DL04TF U 225
AF RR4H921JQB C 271
BS 1 137 RR4H921TF
BS 138 138 RR4CY42TF
BS 139 669 RR4H921TF
BS 670 670 RR4DL04TF
BS 671 719 RR4H921TF
BS 720 720 RR4DL04TF
BS 721 746 RR4H921TF
BS 747 747 RR4DL04TF
BS 748 758 RR4H921TF
BS 759 789 RR4DL04TF
BS 790 790 RR4H921JQB
BS 791 978 RR4DL04TF
BS 979 1020 RR4H921JQB

RD RR4H921TF 759 0 0
GTTGGTGAAACGTTTGAAACAGAGAGCAAGAATCAAGATTTGACCAAAAGCATTCAATGG
AGAGAGTGAATCAAACGTTCTTCTTATCTCATGGCTCTCCTACATTGAGCATTGACGATA
GCTTGGAAGCGAGACAGTTCTTCAAGTCATGGAAGGACAAAGTTTTGCCACAGAAACCCA
AATCGATCCTGATCATCTCCGCACATTGGGACACAAAAGTTCCAACCGTCAACACCGTTC
TCCGCAATTCCACAATCCACGACTTCTATGGCTTCCCTGATCCCATGTACAAGCTGAAAT
ATGAAGCACCAGGAGCTATTGAATTAGGGAAGAGAGTAAAAGAATTGTTAATGGGAGAAG
GAGGAATGACACGTGTTGATGAAGATAAGAACAGAGGACTTGATCATGGAGCTTGGGTTC
CTCTTATGTTGATGTATCCAGGGGCGGATATACCTATTTGCCAACTCTCTGTTCAATCAT
CTCAAAATGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTCCATTGAAAGACGAAG
GTGTTCTCATCATTGGATCAGGAAGTGCTACTCACAACTTGAGGAAGCTTGACTTTAATA
TTGCTAATGGCTCAGCTGTTCCTTGGGCTTTGGCTTTTGATCACTGGCTCAGAGATTCTC
TGCTTCAAG*AAGATATGGAGATGTAAATGATTGGGAAGAGAAAGCTCCAAATGCGAAA*
TGGCGCATCCATGGCCTGAGCATTTT*ACCCGCTACAC
G

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4CY42TF 760 0 0
GG
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TGAATCAAACGTTCTTCTTATCTCATGGCTCTCCTACATTGAGCATTGACGATAGCTTGG
AAGCGAGACAGCTCTTCAAGTCATGGAAGGACAAAGTTTTGCCACAGAAACCCAAATCGA
TCCTGATCATCTCCGCACATTGGGACACAAAAGTTCCAACCGTCAACACCGTTCTCCGCA
ATTCCACAATCCACGACTTCTATGGCTTCCCTGATCCCATGTACAAGCTGAAATATGAAG
CACCAGGAGCTATTGAATTAGGGAAGAGAGTAAAAGAATTGTTAATGGGAGAAGGAGGAA
TGACACGTGTTGATGAAGATAAGAACAGAGGACTTGATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTA
TGTTGATGTATCCAGTGGCGGATCTACCTATTTGCCAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAA
ATGGGACCTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTCCATTGAAAGACGAAGGTGTTC
TCATCATTGGATCAGGAAGTGCTACTCACAACTTGAGGAAGCTTGACTTTAATATTGCTA
ATGGCTCAGCTGTTCCTTGGGCTTTGGCTTTTGATCACTGGCTCAGAGATTCTCTGCTTC
AAG*AAGATATGGAGATGTAAATGATTGGGAAGAGAAAGCTCCAAATGCGAAA*TGGCGC
ATCCATGGCCTGAGCATTTT*ACCCGCTACAC
TTTGCA

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR4DL04TF 754 0 0
G
CCGTCAACACCGTTCTCCGCAATTCCACAATCCACGACTTCTATGGCTTCCCTGATCCCA
TGTACAAGCTGAAATATGAAGCACCAGGAGCTATTGAATTAGGGAAGAGAGTAAAAGAAT
TGTTAATGGGAGAAAGAGGAATGACACGTGTTGATGAAGATAAGAACAGAGGACTTGATC
ATGGAGCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATTCAGGGGCGGATATACCTATTTGCCAAC
TCTCTGTTCAGTCATCTCAAAATGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTC
CATTGAAAGACGAAGGTGTTCTCATCATTGGATCAGGAAGTGCTACTCACAACTTGAGGA
AGCTTGACTTTAATATTGCTAATGGCTCAGCTGTTCCTTGGGCTTTGGCTTTTGATCACT
GGCTCAGAGATTCTCTCCTTCAAGGAAGATATGGAGATGTAAATGATTGGGAAGTGAAAG
CTCCAAATGCGAAAATGGCGCATCCATGGCCTGAGCATTTTTACCCGCTACACGTTGCAT
TGGGTGCAGCAGGAGGTGATGCAA*GGCAGAGCAAATTCACACCAGTTGGCAGCTTGGTA
CTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACTACTCCCCTTTGAAAACATTTTCATGACTATC
TCCTTCACTTGTCGTGTGTGTCTACTTTTAATGTAAACCTGTCTATTTCATCTATCTTCA
ATAACTCAGATCCTTGTATGCAAATAAAAAAAA

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR4H921JQB 750 0 0
GGCTT
CCTGATCCCATGTACAAGCTGAAATATGAAGCACCAGGAGCTATTGAATTAGGGAAGAGA
GTAAAAGAATTGTTAATGGGAGAAGGAGGAATGACACGTGTTGATGAAGATAAGAACAGA
GGACTTGATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATCCAGGGGCGGATATACCT
ATTTGCCAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAAATGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAA
GCATTGGCTCCATTGAAAGACGAAGGTGTTCTCATCATTGGATCAGGAAGTGCTACTCAC
AACTTGAGGAAGCTTGACTTTAATATTGCTAATGGCTCAGCTGTTCCTTGGGCTTTGGCT
TTTGATCACTGGCTCAGAGATTCTCTGCTTCAAGGAAGATATGGAGATGTAAATGATTGG
GAAGAGAAAGCTCCAAATGCGAAAATGGCGCATCCATGGCCTGAGCATTTTTACCCGCTA
CACGTTGCATTGGGTGCAGCAGGAGGTGATGCAAAGGCAGAGCAAATTCACACGAGTTGG
CAGCTTGGTACTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACTACTCCCCTTTGAAAACATTTT
CATGACTATCTCCTTCACTTGTCGTGTGTGTCTACTTTTAATGTAAACTTGTCTATTTCA
TCTATCTTCAATAACTCAGATCCTTGTATGCAAATAAAAAAAAACATCTTTGTGATATGC
AATGACGAGAAGAAAACTAATTTGT

QA 6 750 6 750
DS 



AS 1 4

CO CL2235Contig1 875 4 11 U
GGCCGTTGAGACAGAACGTGCTGCGGAAGATATTGCATGACGTACCTTTGATGCACTCTG
TAGACGCAAAGAGAATGCTCCCAAATAATACGTTTGGTCTGAATCAAGATGACCCCTCGG
TTAAAAGAAAAGAGAACGAAAAGTTCAGCGTCCTAAGAACTATGGTTCCCACTGTCAACG
AGGTTGATAAAGAAGAGATACTGAACAACACAATCAAGTACTTGCAAGAACTAGAGGAAA
GAGTAGAAGAGCTAGAATCCTGTATGGGATCAGTTAATTTCGCAGAGAGAAAAAGAAAGA
GCCTTAACGACTCTGTGTTAATCGAGGAGACATCAGGGAACTACGATGACAGCACGAAGA
TCGATGGAAACTCAGGAGAAACCGAACAAGTCACAAGTTTCAGAGATGAGACACGTTTGA
GAGTTGAACTGAATGAAACAGATGTTGTGATGGAAGTAAGATGTTTTTACAGAGACTACA
TAGTTGCAGACATCATGGAAACTTTGAGCAAACTTCACATGGATGCTTTCTCTGTTAGAT
CTCACACACTTAATGGGTTCCTCACACTTAATCTCAAGGCAAAGCTGCGTGGAGCTGCAG
TTGCGTCAGTTGGGATGATTAAGCGAGAGCTGAGGAGAGTCATTGGTGAGAGTATATGAG
AATCACCTAATTAAGGGTTTCTTTAATGATTTTTGTAGTAACATTATTTTTCTTAAACTT
TTGATGAAATGTTTATTTTTGGACTTTGGTGAATCTTTAGTCCTTAAATTTACATGGCGT
TTTTCGAGTATTTTTTAATGTAATATTTGCCGAGATTGGCTGGATTTTTCGACATTGTCA
TCTTCTATTCTATAAGATAAGATATATACTTATGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CG07TF U 1
AF RR4H654TF U 1
AF RR4CG07JQ C 51
AF RR4H654JQB C 53
BS 1 148 RR4CG07TF
BS 149 149 RR4H654TF
BS 150 283 RR4CG07TF
BS 284 503 RR4H654TF
BS 504 504 RR4CG07JQ
BS 505 578 RR4H654TF
BS 579 579 RR4CG07JQ
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BS 635 635 RR4CG07JQ
BS 636 671 RR4H654TF
BS 672 875 RR4CG07JQ

RD RR4CG07TF 287 0 0
GGCCGTTGAGACAGAACGTGCTGCGGAAGATATTGCATGACGTACCTTTGATGCACTCTG
TAGACGCAAAGAGAATGCTCCCAAATAATACGTTTGGTCTGAATCAAGATGACCCCTCGG
TTAAAAGAAAAGAGAACGAAAAGTTCAGTGTCCTAAGAACTATGGTTCCCACTGTCAACG
AGGTTGATAAAGAAGAGATACTGAACAACACAATCAAGTACTTGCAAGAACTAGAGGAAA
GAGTAGAAGAGCTAGAATCCTGTATGGGATCAGTTAATTTCGC
GGAG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4H654TF 671 0 0
GGCCGTTGAGACAGAACGTGCTGCGGAAGATATTGCATGACGTACCTTTGATGCACTCTG
TAGACGCAAAGAGAATGCTCCCAAATAATACGTTTGGTCTGAATCAAGATGACCCCTCGG
TTAAAAGAAAAGAGAACGAAAAGTTCAGCGTCCTAAGAACTATGGTTCCCACTGTCAACG
AGGTTGATAAAGAAGAGATACTGAACAACACAATCAAGTACTTGCAAGAACTAGAGGAAA
GAGTAGAAGAGCTAGAATCCTGTATGGGATCAGTTAATTTCGCAGAGAGAAAAAGAAAGA
GCCTTAACGACTCTGTGTTAATCGAGGAGACATCAGGGAACTACGATGACAGCACGAAGA
TCGATGGAAACTCAGGAGAAACCGAACAAGTCACAAGTTTCAGAGATGAGACACGTTTGA
GAGTTGAACTGAATGAAACAGATGTTGTGATGGAAGTAAGATGTTTTTACAGAGACTACA
TAGTTGCAGACATCATGGAAACTCTGAGCAAACTTCACATGGATGCTTTCTCTGTTAGAT
CTCACACACTTAATGGGTTCCTCACACTTAATCTCAAG*CAAAGCTGCGTGGAGCTGCAG
TTGCGTCAGTTGGGATGATTAAGCGAGAGCTGAG*AGAGTCATTGGTGAGAGTATATGAG
AATCACCTAAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CG07JQ 825 0 0
AT
GCACTCTGTAGACGCAAAGAGAATGCTCCCAAATAATACGTTTGGTCTGA*TCAAGATGA
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AGAGGAAAGAGTAGAAGAGCTAGAATCCTGTATGGGATCAGTTAATTTCGCAGAGAGAAA
AAGAAAGAGCCTTAACGACTCTGTGTTAATCGAGGAGACATCAGGGAACTACGATGACAG
CACGAAGATCGATGGAAACTCAGGAGAAACCGAACAAGTCACAAGTTTCAGAGATGAGAC
ACGTTTGAGAGTTAAACTGAATGAAACAGATGTTGTGATGGAAGTAAGATGTTTTTACAG
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TGTTAGATCTCACACACTTAATGGGTTCCTCACACTTAATCTCAAGGCAAAGCTGCGTGG
AGCTGCAGTTGCGTCAGTTGGGATGATTAAGCGAGAGCTGAGGAGAGTCATTGGTGAGAG
TATATGAGAATCACCTAATTAAGGGTTTCTTTAATGATTTTTGTAGTAACATTATTTTTC
TTAAACTTTTGATGAAATGTTTATTTTTGGACTTTGGTGAATCTTTAGTCCTTAAATTTA
CATGGCGTTTTTCGAGTATTTTTTAATGTAATATTTGCCGAGATTGGCTGGATTTTTCGA
CATTGTCATCTTCTATTCTATAAGATAAGATATATACTTATGG

QA 3 825 3 825
DS 

RD RR4H654JQB 823 0 0
GCACTCTGTAGACGCAAAGAGAATGCTCCCAAATAATACGTTTGGTCTGAATCAAGATGA
CCCCTCGGTTAAAAGAAAAGAGAACGAAAAGTTCAGCGTCCTAAGAACTATGGTTCCCAC
TGTCAACGAGGTTGATAAAGAAGAGATACTGAACAACACAATCAAGTACTTGCAAGAACT
AGAGGAAAGAGTAGAAGAGCTAGAATCCTGTATGGGATCAGTTAATTTCGCAGAGAGAAA
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CACGAAGATCGATGGAAACTCAGGAGAAACCGAACAAGTCACAAGTTTCAGAGATGAGAC
ACGTTTGAGAGTTGAACTGAATGAAACAGATGTTGTGATGGAAGTAAGATGTTTTTACAG
AGACTACATAGTTGCAGACATCATGGAAACTTTGAGCAAACTTCACATGGATGCTTTCTC
TGTTAGATCTCACACACTTAATGGGTTCCTCACACTTAATCTCAAGGCAAAGCTGCGTGG
AGCTGCAGTTGCGTCAGTTGGGATGATTAAGCGAGAGCTGAGGAGAGTCATTGGTGAGAG
TATATGAGAATCACCTAATTAAGGGTTTCTTTAATGATTTTTGTAGTAACATTATTTTTC
TTAAACTTTTGATGAAATGTTTATTTTTGGACTTTGGTGAATCTTTAGTCCTTAAATTTA
CATGGCGTTTTTCGAGTATTTTTTAATGTAATATTTGCCGAGATTGGCTGGATTTTTCGA
CATTGTCATCTTCTATTCTATAAGATAAGATATATACTTATGG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 4

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ATCTCTGTTTCCACTACACAGTGCCATTGCATCTTCCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGT
TGAATCCATCAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATGCCTTTATGACAGTATTT
TCATCTTACAAACAAGTTTCCAGGATGAGAAAGTTGTGTGGCTCATCGAATCTAAAGGTC
CTGAATTCAAGACTGGTTTTATACTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTGTTCG
TGGGTTTATCAGGAATTGAGTGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAGAGATTGTACTCTTAGT
TTTCATTGAAATGTCTCATCTTTTACCTTG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4EU92TF U 1
AF RR4FG42JQ C 1
AF RR4FG42TF U 1
AF RR4EU92JQ C 67
BS 1 570 RR4EU92TF

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QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4FG42JQ 570 0 0
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ATCTCTGTTTCCACTACACAGTGCCATTGCATCTTCCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGT
TGAATCCATCAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATGCCTTTATGACAGTATTT
TCATCTTACAAACAAGTTTCCAGGATGAGAAAGTTGTGTGGCTCATCGAATCTAAAGGTC
CTGAATTCAAGACTGGTTTTATACTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTGTTCG
TGGGTTTATCAGGAATTGAGTGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAGAGATTGTACTCTTAGT
TTTCATTGAAATGTCTCATCTTTTACCTTG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4FG42TF 570 0 0
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ATCTCTGTTTCCACTACACAGTGCCATTGCATCTTCCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGT
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TTTCATTGAAATGTCTCATCTTTTACCTTG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4EU92JQ 504 0 0
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GTTTCCACTACACAGTGCCATTGCATCTTCCAGATTAGTGTCAAGTCTCTCTGTTGAATC
CATCAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATGCCTTTATGACAGTATTTTCATCT
TACAAACAAGTTTCCAGGATGAGAAAGTTGTGTGGCTCATCGAATCTAAAGGTCCTGAAT
TCAAGACTGGTTTTATACTCAAACTCTTATTTTGAGTTGTCTTTTTTTTGTTCGTGGGTT
TATCAGGAATTGAGTGATCAGTGTAATGTTGCTGGCAGAGATTGTACTCTTAGTTTTCAT
TGAAATGTCTCATCTTTTACCTTG

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 4

CO CL2237Contig1 1304 4 3 U
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CTCTCTTAGCCTTGAACTCTGAATCACTAAACTGCTATGAAAATAACCCACGAGGCCATC
CCTCAGATCTAAGAGTGTTCCATATTAGCAGCCCTTGCTCTCCATTCAAACAACCAAACA
CTGTCTCATGGGAAACAACACTCCTTAAAGACAAGGCTCGTCTCCAGTACTTGTCAAGCC
TCGCCGTAAAATCTTCGGTCCCAATCGCCTCGGGACGTGCCATCGTTCAGAGCCCGACTT
ATATCGTGAGGGCTAATATCGGGACACCAGCTCAGCCCATGCTCGTGGCTCTTGACACTA
GCAATGACGCTGCTTGGGTTCCTTGTTCTGGCTGTGTTGGCTGTGCTTCCTCTGTTCTCT
TTGACCCTTCCAAGTCAAACTCTTCCCGCACTCTTCAATGCGAAGCTCCTCAGTGTAAAC
AGGTATATAGTTAGTATCTATTTATTTCCCTTCAAATACATTAGATATACTGTACACGCC
TTTGTGGACGTAAAACAGATTTTTTTTCAAATCAGAACGAATCTTATAAAACTAATTTGA
TATTAAATAAATAAATATTCTTATAACTATAACGAATTTGATATTTAATATTCTAGTTTT
CCATATTCTTATAACGAATTAGCCAAATTTTTATAACTAAATTTGATATTAAATAAATAA
ATATTCAAAATGCATTTAGTTTTTGATACTCACTACTTTCTTTTGGAATAATAATCCCTA
ATAGGAGTACTCTTACTCAACTTTTACTGTAAAACGGAGTTTGCAGTAAGATATTTTGTA
ATCATATTATATTTTATATTCTATAATGGAAAATGAGATTACTCCATGTAAAAAGTGATA
TTAGTCTAAAGAATAATAATTTTATATTTACTCACGATTCCACTCAAATATAGAAGATGA
TTGGAATGATACACAACTTCATTATATAATTACACTATTTTGGAAAATAAATAATGTAAT
ACACTGGAATTGGAGATATGCTCTTGGGATAGGATTCTTATTCGAATTTTGTTTTCGCAA
AACAAGAAAACCAAACCGAAGGACCACTCATGTTGGACTCTAGTGTTGAATTTCGGCTTT
GTTATAACACCATCATCCAGAAGTCTACGATAGTCACGGGTTCTTAGACCATCAATATTG
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AAAGCCCCTATATAAGGGCTGCCCTTATGCATTTCATGACACAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AZ79TF U 1
AF RR4B206TF U 1
AF RR4AZ79JQ C 529
AF RR4B206JQ C 529
BS 1 781 RR4AZ79TF
BS 782 828 RR4B206TF
BS 829 1304 RR4AZ79JQ

RD RR4AZ79TF 781 0 0
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CTCTCTTAGCCTTGAACTCTGAATCACTAAACTGCTATGAAAATAACCCACGAGGCCATC
CCTCAGATCTAAGAGTGTTCCATATTAGCAGCCCTTGCTCTCCATTCAAACAACCAAACA
CTGTCTCATGGGAAACAACACTCCTTAAAGACAAGGCTCGTCTCCAGTACTTGTCAAGCC
TCGCCGTAAAATCTTCGGTCCCAATCGCCTCGGGACGTGCCATCGTTCAGAGCCCGACTT
ATATCGTGAGGGCTAATATCGGGACACCAGCTCAGCCCATGCTCGTGGCTCTTGACACTA
GCAATGACGCTGCTTGGGTTCCTTGTTCTGGCTGTGTTGGCTGTGCTTCCTCTGTTCTCT
TTGACCCTTCCAAGTCAAACTCTTCCCGCACTCTTCAATGCGAAGCTCCTCAGTGTAAAC
AGGTATATAGTTAGTATCTATTTATTTCCCTTCAAATACATTAGATATACTGTACACGCC
TTTGTGGACGTAAAACAGATTTTTTTTCAAATCAGAACGAATCTTATAAAACTAATTTGA
TATTAAATAAATAAATATTCTTATAACTATAACGAATTTGATATTTAATATTCTAGTTTT
CCATATTCTTATAACGAATTAGCCAAATTTTTATAACTAAATTTGATATTAAATAAATAA
ATATTCAAAATGCATTTAGTTTTTGATACTCACTACTTTCTTTTGGAATAATAATCCCTA
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4B206TF 840 0 0
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CTCTCTTAGCCTTGAACTCTGAATCACTAAACTGCTATGAAAATAACCCACGAGGCCATC
CCTCAGATCTAAGAGTGTTCCATATTAGCAGCCCTTGCTCTCCATTCAAACAACCAAACA
CTGTCTCATGGGAAACAACACTCCTTAAAGACAAGGCTCGTCTCCAGTACTTGTCAAGCC
TCGCCGTAAAATCTTCGGTCCCAATCGCCTCGGGACGTGCCATCGTTCAGAGCCCGACTT
ATATCGTGAGGGCTAATATCGGGACACCAGCTCAGCCCATGCTCGTGGCTCTTGACACTA
GCAATGACGCTGCTTGGGTTCCTTGTTCTGGCTGTGTTGGCTGTGCTTCCTCTGTTCTCT
TTGACCCTTCCAAGTCAAACTCTTCCCGCACTCTTCAATGCGAAGCTCCTCAGTGTAAAC
AGGTATATAGTTAGTATCTATTTATTTCCCTTCAAATACATTAGATATACTGTACACGCC
TTTGTGGACGTAAAACAGATTTTTTTTCAAATCAGAACGAATCTTATAAAACTAATTTGA
TATTAAATAAATAAATATTCTTATAACTATAACGAATTTGATATTTAATATTCTAGTTTT
CCATATTCTTATAACGAATTAGCCAAATTTTTATAACTAAATTTGATATTAAATAAATAA
ATATTCAAAATGCATTTAGTTTTTGATACTCACTACTTTCTTTTGGAATAATAATCCCTA
ATAGGAGTACTCTTACTCAACTTTTACTGTAAAACGGAGTTTGCAGTA
GATATTTGTAAT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4AZ79JQ 776 0 0
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AAACTAATTTGATATTAAATAAATAAATATTCTTATAACTATAACGAATTTGATATTTAA
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TTAAATAAATAAATATTCAAAATGCATTTAGTTTTTGATACTCACTACTTTCTTTTGGAA
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AGATATTTTGTAATCATATTATATTTTATATTCTATAATGGAAAATGAGATTACTCCATG
TAAAAAGTGATATTAGTCTAAAGAATAATAATTTTATATTTACTCACGATTCCACTCAAA
TATAGAAGATGATTGGAATGATACACAACTTCATTATATAATTACACTATTTTGGAAAAT
AAATAATGTAATACACTGGAATTGGAGATATGCTCTTGGGATAGGATTCTTATTCGAATT
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AATTTCGGCTTTGTTATAACACCATCATCCAGAAGTCTACGATAGTCACGGGTTCTTAGA
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GAAAATGGAAGAAAAGCCCCTATATAAGGGCTGCCCTTATGCATTTCATGACACAG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4B206JQ 776 0 0
ACTGTACACGCCTTTGTGGACGTAAAACAGATTTTTTTTCAAATCAGAACGAATCTTATA
AAACTAATTTGATATTAAATAAATAAATATTCTTATAACTATAACGAATTTGATATTTAA
TATTCTAGTTTTCCATATTCTTATAACGAATTAGCCAAATTTTTATAACTAAATTTGATA
TTAAATAAATAAATATTCAAAATGCATTTAGTTTTTGATACTCACTACTTTCTTTTGGAA
TAATAATCCCTAATAGGAGTACTCTTACTCAACTTTTACTGTAAAACGGAGTTTGCAGTA
AGATATTTTGTAATCATATTATATTTTATATTCTATAATGGAAAATGAGATTACTCCATG
TAAAAAGTGATATTAGTCTAAAGAATAATAATTTTATATTTACTCACGATTCCACTCAAA
TATAGAAGATGATTGGAATGATACACAACTTCATTATATAATTACACTATTTTGGAAAAT
AAATAATGTAATACACTGGAATTGGAGATATGCTCTTGGGATAGGATTCTTATTCGAATT
TTGTTTTCGCAAAACAAGAAAACCAAACCGAAGGACCACTCATGTTGGACTCTAGTGTTG
AATTTCGGCTTTGTTATAACACCATCATCCAGAAGTCTACGATAGTCACGGGTTCTTAGA
CCATCAATATTGGGAGGGCCTTAGGCCAGCCCTTAAGGGAAAAGGAGAGAGGATCAAGAA
GAAAATGGAAGAAAAGCCCCTATATAAGGGCTGCCCTTATGCATTTCATGACACAG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 4

CO CL2238Contig1 690 4 7 U
TTTTTTTTTGCATCACATACATCAACTAGAGTCAATGATAAAACTTATTAAAAACAAATG
TCTGAACCGTACATATCAAACACAAACTCAAATATGATAAACCGACGAAAACTAATGGCT
CGAAAAATAATGAAAGTAAATTACACGAACACGATGTTGACCAGTTTGATAATAATCTCA
AACGAGAAGCAAATGAGCTGCAATAAGGAACGAAAGTGCTACGACGTCGTTTCTTACATT
GAATGCTCCGGAATCTGGCGAGGACGTTGCGGGTGGCATAGGTCCCGGAGAAGGAGAAGA
ATCCATTCCTGGCATCATAGGTGGTGAAGCCATATCAGGGATTGTTTCTGGACTTGGGGC
CATAGGAGTTGGTGGGCTCATTGGGCTTGAAGATGGAGTCATGGACATAGGTGGTGTTGC
CATGGACATAGGTGGTGGTGCCATAGCCATAGGTGGAGGAGCAATAGGCATAGGCGGTGG
AGCCATAGGCATAGGTGGGGGAGTCATCATTGGCATAGGCGGTGGAGTCATCATTGGCAT
TGGAGAGCCGCCGCTAGGCATTGGCGGCATGGACATGGAGCCAGAAGGAGCCATCATGGG
AGATTGAGCTAAAGAGAAATGAACTAAAACCATAGACAATGTGAGCAAAAGGAAGGCTCC
TGAAGAGGCCATGGTTATGTGTGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4GX79JQ U 10
AF RR4GY18TF C 1
AF RR4GX79TF C 3
AF RR4GY18JQ U 10
BS 1 9 RR4GY18TF
BS 10 289 RR4GX79JQ
BS 290 290 RR4GY18JQ
BS 291 298 RR4GX79JQ
BS 299 299 RR4GY18JQ
BS 300 492 RR4GX79JQ
BS 493 690 RR4GY18JQ

RD RR4GX79JQ 483 0 0
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CAT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4GY18TF 690 0 0
TTTTTTTTTGCATCACATACATCAACTAGAGTCAATGATAAAACTTATTAAAAACAAATG
TCTGAACCGTACATATCAAACACAAACTCAAATATGATAAACCGACGAAAACTAATGGCT
CGAAAAATAATGAAAGTAAATTACACGAACACGATGTTGACCAGTTTGATAATAATCTCA
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GAATGCTCCGGAATCTGGCGAGGACGTTGCGGGTGGCATAGGTCCCGGAGAAGGAGAAGA
ATCCATTCCTGGCATCATAGGTGGTGAAGCCATATCAGGGATTGTTTCTGGACTTGGGGC
CATAGGAGTTGGTGGGCTCATTGGGCTTGAAGATGGAGTCATGGACATAGGTGGTGTTGC
CATGGACATAGGTGGTGGTGCCATAGCCATAGGTGGAGGAGCAATAGGCATAGGCGGTGG
AGCCATAGGCATAGGTGGGGGAGTCATCATTGGCATAGGCGGTGGAGTCATCATTGGCAT
TGGAGAGCCGCCGCTAGGCATTGGCGGCATGGACATGGAGCCAGAAGGAGCCATCATGGG
AGATTGAGCTAAAGAGAAATGAACTAAAACCATAGACAATGTGAGCAAAAGGAAGGCTCC
TGAAGAGGCCATGGTTATGTGTGTGTTTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4GX79TF 688 0 0
TTTTTTT
GCATCACATACATCAACTAGAGTCAATGATAAAACTTATTAAAAACAAATGTCTGAAC*G
TACATATCAAACACAAACTCAAATATGATAAACCGACGAAAACTAATGGCTCGAAAAATA
ATGAAAGTAAATTACACGAACACGATGTTGACCAGTTTGATAATAATCTCAAACGAGAAG
CAAATGAGCTGCAATAAGGAACGAAAGTGCTACGACGTCGTTTCTTACATTGAATGCTCC
GGAATCTGGCGAGGACGTTGCGGGTGGCATAGGTCCCGGAGAAGGAGAAGAATCCATTCC
TGGCATCATAGGTGGTGAAGCCATATCAGGGATTGTTTCTGGACTTGGGGCCATAGGAGT
TGGTGGGCTCATTGGGCTTGAAGATGGAGTCATGGACATAGGTGGTGTTGCCATGGACAT
AGGTGGTGGTGCCATAGCCATAGGTGGAGGAGCAATAGGCATAGGCGGTGGAGCCATAGG
CATAGGTGGGGGAGTCATCATTGGCATAGGCGGTGGAGTCATCATTGGCATTGGAGAGCC
GCCGCTAGGCATTGGCGGCATGGACATGGAGCCAGAAGGAGCCATCATGGGAGATTGAGC
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CATGGTTATGTGTGTGTTTCC

QA 8 688 8 688
DS 

RD RR4GY18JQ 681 0 0
GCATCACATACATCAACTAGAGTCAATGATAAAACTTATTAAAAACAAATGTCTGAACCG
TACATATCAAACACAAACTCAAATATGATAAACCGACGAAAACTAATGGCTCGAAAAATA
ATGAAAGTAAATTACACGAACACGATGTTGACCAGTTTGATAATAATCTCAAACGAGAAG
CAAATGAGCTGCAATAAGGAACGAAAGTGCTACGACGTCGTTTCTTACATTGAATGCTCC
GGAATCTGGCGAGGACGTTGCGGGTGGCATAGGTCCCGGAGAAGGAGAAGAATCCATTCC
TGGCATCATAGGTGGTGAAGCCATATCAGGGATTGTTTCTGGACTTGGGGCCATAGGAGT
TGGTGGGCTCATTGGGCTTGAAGATGGAGTCATGGACATAGGTGGTGTTGCCATGGACAT
AGGTGGTGGTGCCATAGCCATAGGTGGAGGAGCAATAGGCATAGGCGGTGGAGCCATAGG
CATAGGTGGGGGAGTCATCATTGGCATAGGCGGTGGAGTCATCATTGGCATTGGAGAGCC
GCCGCTAGGCATTGGCGGCATGGACATGGAGCCAGAAGGAGCCATCATGGGAGATTGAGC
TAAAGAGAAATGAACTAAAACCATAGACAATGTGAGCAAAAGGAAGGCTCCTGAAGAGGC
CATGGTTATGTGTGTGTTTCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL2239Contig1 1074 4 8 U
TTTTTCCTTGCACAAGAAACGAGCAAGAGACAAGTTCTGATTCTGGTCTCCAATGGCATC
CTCTTCTCTTGTTCGAATCGCCATCGTGGGAGACATCCATGGCTTCTGGGACCAAGATGA
AGATCGAAAGGCTCTTCAGCTACTACAGCCGCAATTGGTGCTCTTCACAGGTGATTTTGG
TGAGAGGGTGAATGTGCCTCTTGTGCGGAGCGTTGCTGCTCTTCCTTTCCCTAAAGCTGT
TATATTGGGCAATCATGATGCTTGGAGCACCGCCCAGGACTCGAAAGACAAAGATAGCGA
TGTTCTTATGCAACTTCATATCCTTGGTGATGAGCACGTAGGATATCAACGCAAGGACTT
CCCCTCACTTAGGCTCAGTGTTGTTGGTGGTCGCCCCTTTTCACATGGGGGTAATAAACT
GTTTCAGAAAAAA*CTGCTTGCCCAGAGGTATGGAGTTCGTAACTTGAATGCCAGTGCTG
GGAGTATTTGTCGAGCTGCACTTGGAACACCGAAAGATCATGGGGTTATAGTTCTTGCGC
ATAACGGGCCAACAGGTCTTGGTTCTCAGGCAGAGGATATATGTGGAAGAGACTGGTCTG
TCGAAGGCGGTGACCATGGTGATCCAGATCTAGAGCAGGCGTTACGCCAGTTGAAGGAGA
CGACGGAGTTGTCTGTTCCTTTAGTTGTGTTTGGACACATGCATAAGGAGCTTGACGGTG
GGAAAGGAAACCGAAAAATGCTTGTGCAAGATAGCGACAACAAGACTGTTTATCTGAACG
GTGCAATAGTCCCGAGGGTTAAAGAGACAAATGAAACACCGGCGGAGTCTGCGAGTGGCG
GCACAGTAAGAGCTTTTACATTGGTGGAGATTTTAGATGGAAAGATCAAGAAAGTAGTAG
AAAGTTGGGTACAAGTAACAGGAAATGTGGCCAAGGTTGTTGAGGAAATTACATTGTTCG
AGGATTCAACTTGATTTATCAGGGAAACTGTGTTGTTCTCTTGTGTTGTTCAATTGTCAG
CTCAACAATTATGCATCCTTTAATTCATTAATGATCAGTTTAATTTAACTATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4DL07TF U 1
AF RR4DW14TF U 1
AF RR4DL07JQ C 248
AF RR4DW14JQ C 394
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BS 113 117 RR4DL07TF
BS 118 118 RR4DW14TF
BS 119 602 RR4DL07TF
BS 603 629 RR4DL07JQ
BS 630 630 RR4DW14JQ
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RD RR4DL07TF 604 0 0
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CTCTTCTCTTGTTCGAATCGCCATCGTGGGAGACATCCATGGCTTCTGGGATCAAGA*GA
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TC
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4DW14TF 602 0 0
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CTCTTCTCTTGTTCGAATCGCCATCGTGGGAGACATCCATGGCTTCTGGGACCAAGATGA
AGATCGAAAGGCTCTTCAGCTACTACAGCCGCAATTGGTGCTCTTCACAGGTGATTTTGG
TGAGAGGGTGAATGTGCCTCTTGTGCGGAGCGTTGCTGCTCTTCCTTTCCCTAAAGCTGT
TATATTGGGCAATCATGATGCTTGGAGCACCGCCCAGGACTCGAAAGACAAAGATAGCGA
TGTTCTTATGCAACTTCATATCCTTGGTGATGAGCACGTAGGAT**CAACGCAAGGACTT
CCCCTCACTTAGGCTCAGTGTTGTTGGTGGTCGCCCCTTTTCACATGGGGGTAATAAACT
GTTTCAGAAAAAA*CTGCTTGCCCAGAGGTATGGAGTTCGTAACTTGAATGCCAGTGCTG
GGAGTATTTGTCGAGCTGCACTTGGAACACCGAAAGATCATGGGGTTATAGTTCTTGCGC
ATAACGGGCCAACAGGTCTTGGTTCTCACGCAGAGGATATATGTGGAAGAGACTGGTCTG
TC

QA 1 602 1 602
DS 

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ATGCAACTTCATATCCTTGGTGATGAGCACGTAGGATATCAACGCAAGGACTTCCCCTCA
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AAAAAA*CTGCTTGCCCAGAGGTATGGAGTTCGTAACTTGAATGCCAGTGCTGGGAGTAT
TTGTCGAGCTGCACTTGGAACACCGAAAGATCATGGGGTTATAGTTCTTGCGCATAACGG
GCCAACAGGTCTTGGTTCTCAGGCAGAGGATATATGTGGAAGAGACTGGTCTGTCGAAGG
CGGTGACCATGGTGATCCAGATTTAGAGCAGGCGTTACGCCAGTTGAAGGAGACGACGGA
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AGTCCCGAGGGTTAAAGAGACAAATGAAACACCGGCGGAGTCTGCGAGTGGCGGCACAGT
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ATTATGCATCCTTTAATTCATTAATGATCAGTTTAATTTAACTATGT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4DW14JQ 680 0 0
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GAGTTCGTAACTTGAATGCCAGTGCTGGGAGTATTTGTCGAGCTGCACTTGGAACACCGA
AAGATCATGGGGTTATAGTTCTTGCGCATAACGGGCCAACAGGTCTTGGTTCTCAGGCAG
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GCGACAACAAGACTGTTTATTTGAACGGTGCAATAGTCCCGAGGGTTAAAGAGACAAATG
AAACACCGGCGGAGTTTGCGAGTGGCGGCACAGTAAGAGCTTTTACATTGGTGGAGATTT
TAGATGGAAAGATCAAGAAAGTAGTAGAAAGTTGGGTACAAGTAACAGGAAATGTGGCCA
AGGTTGTTGAGGAAATTACATTGTTCGAGGATTCAACTTGATTTATCAGGGAAACTGTGT
TGTTCTCTTGTGTTGTTCAATTGTCAGCTCAACAATTATGCATCCTTTAATTCATTAATG
ATCAGTTTAATTTAACTATG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL2240Contig1 1125 4 19 U
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TAAAAAAATTGGGAATAACGGCAAAAATGTGATAAGGAGAAGGAAAGCAAAAATGTGGTC
GTCAAGCTTCTTAGCTGCTACCCATTTCTCTTCTCCTCCCAAGCTTTCTCCACTGTCATC
TTCTTCCTCCTCTTATCATCACAAGATCCAAACCTTCCTCTGTTTTACTCAAAATCCTTC
GTCCACTTTTGGCGTTAGTTTCAGCAAGAGACACTTGAATCTCTCGATTCTCACGCTCTT
GCTCAATGGTGGGTTCTTGTTGGATAAGGCTAAATCCATGGAAGAGTCAGGGGATCTTCA
AAGATACACTGATTTGAAAGATGGCTTCACGCTTCTTGTACCCTCTTCTTGGACTAAGGT
GGAGAAAGCAGGAGCCAATGTTCTGTTTGAAGAACCAGAGAAACGAAGCAACAACATTGG
AGTTGTGGTTAGTCCTGTCCGAATAAAGAGTCTTGAAGACTTTGGTACTCCTCAATTTGT
AGCTGATAATCTCATCAACGCAGAGAAGCGAAAGGAAAGCACAAAGGAAGCAGAAATTGT
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TAAAATTGACAGCACGAGAGGAGGGATCAAACGGGTTTTTTCAGCTGCGTTTGTGAGCTC
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AACTCGCCATCCAAATAATAGTATCTTTCTTGCAAGGCTCATTTGGTATTTCTGGGCTTA
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GACGGGACTAGTCGAACATGTTATGAATATTGTATGATGTCTATTATGGAATGTTCTAGA
TTTACTTGTTCTTTACTCCAAGTTATTAGACTTTGTCTCCAAGCTATGTAATCCTATATA
AGGAACTCATTACTCATGGAATAACATAACAATTCATTTATCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW18TF U 45
AF RR4EX04TF U 1
AF RR4EX04JQ C 254
AF RR4BW18JQ C 355
BS 1 196 RR4EX04TF
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BS 906 1053 RR4EX04JQ
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TTACTCAAAATCCTTCGTCCACTTTTGGCGTTAGTTTCAGCAAGAGACACTTGAATCTCT
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TGTATGAATTTGAGTATAAAATTGACAGCACGAGA
AGA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4EX04TF 797 0 0
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TAAAAAAATTGGGAATAACGGCAAAAATGTGATAAGGAGAAGGAAAGCAAAAATGTGGTC
GTCAAGCTTCTTAGCTGCTACCCATTTCTCTTCTCCTCCCAAGCTTTCTCCACTGTCATC
TTCTTCCTCCTCTTATTATCACAAGATCCAAACCTTCCTCTGTTTTACTCAAAATCCTTC
GTCCACTTTTGGCGTTAGTTTCAGCAAGAGACACTTGAATCTCTCGATTCTCACGCTCTT
GCTCAATGGTGGGTTCTTGTTGGATAAGGCTAAATCCATGGAAGAGTCAGGGGATCTTCA
AAGATACACTGATTTGAAAGATGGCTTCACGCTTCTTGTACCCTCTTCTTGGACTAAGGT
GGAGAAAGCAGGAGCCAATGTTCTGTTTGAAGAACCAGAGAAACGAAGCAACAACATTGG
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AGCTGATAATCTCATCAACGCAGAGAAGCGAAAGGAAAGCACAAAGGAAGCAGAAATTGT
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DS 



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BQ
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TCTTGGTGATTAAGTAATCAAAATCTGTTAATGTAAGCTTGACCAACTCATTAATCTCAG
GCAGCCAAGTGAGCTTCAGCTTTGTAGTCTTCACAGATCCTTGGAGATTCAAGACGCCAG
ATAACGCAGTGACACGACCCTCCTCGTCTTTAGTAACCTCTTTCACAATAGCATTTCCCC
AATCCATCAGAGTCACTTCCTCACCAACA

QA 3 571 3 571
DS 

RD RR4D056TF 712 0 0
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CACACAGGATCGATTATCTTCTTGTTAATAGACCAGAGCTTGTCCCATCCATCAAGTTCA
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TACGGACAATGCCTTGGACCGTAGGGAAGCGTGGATCATCCCAACCTCCGACCAAACCCT
GCTGAACAAACCAGAGAAGCTTCCTCTTACTCAAAAGAGTGTAAACAAGATTCAACCTAC
TGAACTCATAAATCTCAACCCTCCTCAACCCCATGTCCTCCAGAACCTTATAGTACTGAG
CATTCCGGTCGTGATACTCACTAGACCTAAGAGCATGCGTTATACCTTCGATAGAATCAA
CAAACGGGCAAGCAAAGTCATACGTTGGATATATCTTATACTTGTTCCCAATACGGTGAT
GTGGCATAGGGTTGCATCAGTAGTAAACAGGGTCACGCATAGCTTTGTTAGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL2242Contig1 1182 3 16 U
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ATTAAATTAAGGAAAATAACCACAGCCAAATTAAAAAGTAAAAACATGGGAAGGAAGGAA
ACACAAACACATCCAAGTCTGGTTCTGGCATGAAACTCAAAATCTGATGAACCCTTTGTC
TTGCAAACTCTCAACAGTCTCCTTTATGCTAACCTCCAATGGCACAAACTCAACCCCAAG
AAACTCTGCTTTCTCTTTTGACACTTTGTAGGTTGGAATAAATATCTTTTCATCTGCACA
CTTCTCAGGGAGTTGAAAATCAGGGTAAAGATCATGCAAAATGTTAACAACCTCAAAGTA
ATGAGCAACTCTCTCCACTAAACAGTATCTTCCATTAGCTTCTGGATTCTCAAACGCTTG
AATATGAACGTTTGCTACATCTTTAACGTTAACCCACCCGAATGTCGCATTAGGAAACGT
CTGTGCTCCTCTGATCAAGCTTAGTACTGCAGCAGCACTAGTGTTGAGCGTTGGCTGTAA
AAGAGGACCAATCACCATTGCTGCATTTATCGAAACCAGCTGCATATCGTTTTCTTTCGC
GAACTTCCACGCTGCATTTTCAGCTAATGTCTTGGAGAGTACATACCATAGCTTGGCAGC
TCTGCAATATTCAGGATCGGCGAACCAAGTTTCATCAACTATGGTATCGGGTGTTCGAGG
CATTCCATTGAAAGCAACAGCTGCTATAGATGAGGTTAAGACGACTCTCTTAACAGAGGG
AGTCTTCAAGCAAGTGCTTAGAACATTAATTGTTCCTTTCACTGCTGGATCAAGTAAATC
ACGACAGAGGATCTTTGACATCGTGATAGAATGGTGATGCAGTGTGGAAAACTCCTTGGC
AACCGTCGATTGCTGAGTCGAAGGAGCCTTCTTCTAACAAGTTTGCTTTGAATAATTGAA
GCCTTTCCTCTGCACCTTCTAACGCAAGTAAATGCTCTGTTTTCCTCGGATCATTTGGAT
CAGAACAGAGGCTTTAACGGTGTAGCCACGGAGAAGGAGAAGCTTGACGATCCACGAAGC
AATGTAACCTGAAGCTCCTGTCACACACACCGTCTTCTCTTCTTCGCTGCTCATTCTTCT
TTCAGATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTATGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 0 20 0 20 20 20 20 0 20 0 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ24JQ U 15
AF RR4DJ43JQ U 1
AF RR4AQ24TF C 595
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BS 855 1182 RR4AQ24TF

RD RR4AQ24JQ 700 0 0
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AATAACCACAGCCAAATTAAAAAGTAAAAACATGGGAAGGAAGGAAACACAAACACATCC
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CAGTCTCCTTTATGCTAACCTCCAATGGCACAAACTCAACCCCAAGAAACTCTGCTTTCT
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GATCGGCGAACCAAGTTTCATCAACTATGGTATCGGGTGT

QA 1 700 1 700
DS 

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ACACAAACACATCCAAGTCTGGTTCTGGCATGAAACTCAAAATCTGATGAACCCTTTGTC
TTGCAAACTCTCAACAGTCTCCTTTATGCTAACCTCCAATGGCACAAACTCAACCCCAAG
AGACTCTGCTTTCTCTTTTGACACTTTGTAGGTTGGAATAAATATCTTTTCATCTGCACA
CTTCTCAGGGAGTTGAAAATCAGGGTAAAGATCATGCAAAATGTTAACAACCTCAAAGTA
ATGAGCAACTCTCTCCACTAAACAGTATCTTCCATTAGCTTCTGGATTCTCAAACGCTTG
AATATGAACGTTTGCTACATCTTTAACGTTAACCCACCCGAATGTCGCATTAGGAAACGT
CTGTGCTCCTCTGATCAAGCTTAGTACTGCAGCAGCACTAGTGTTGAGCGTTGGCTGTAA
AAGAGGACCAATCACCATTGCTGCATTTATCGAAACCAGCTGCATATCGTTTTCTTTCGC
GAACTTCCACGCTGCATTTTCAGCTAATGTCTTGGAGAGTACATACCATAGCTTGGCAGC
TCTGCAATATTCAGGATCGGCGAACCAAGTTTCATCAATTATGGTATCGGGTGTTCGAGG
CATTCCATTGAAAGCAACAGCTGCTATAGATGAGGTTAAGACGACTCTCTTAACAGAGGG
AGTCTTCAAGCAAGTGCTTAGAACATTAATTGTTC*TTTCACTGCTGGATCATTTGGATC
ACGACAGAGGCTTT

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4AQ24TF 588 0 0
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GGCAGCTCTGCAATATTCAGGATCGGCGAACCAAGTTTCATCAACTATGGTATCGGGTGT
TCGAGGCATTCCATTGAAAGCAACAGCTGCTATAGATGAGGTTAAGACGACTCTCTTAAC
AGAGGGAGTCTTCAAGCAAGTGCTTAGAACATTAATTGTTCCTTTCACTGCTGGATCAAG
TAACTCA*GCCTGAGGATCTTTGACATCGTGATAGAATGGTGATGCAGTGTGGAAAACTC
CTTGGCAACCGTCGATTGCTGAGTCGAAGGAGCCTTCTTCTAACAAGTTTGCTTTGAATA
ATTGAAGCCTTTCCTCTGCACCTTCTAACGCAAGTAAATGCTCTGTTTTCCTCGGATCAT
TTGGATCAGAACAGAGGCTTTAACGGTGTAGCCACGGAGAAGGAGAAGCTTGACGATCCA
CGAAGCAATGTAACCTGAAGCTCCTGTCACACACACCGTCTTCTCTTCTTCGCTGCTCAT
TCTTCTTTCAGATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTATGTGTTTCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 4

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CTATCATCTCTCAAGAATGGGGAAAGGACCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAAG
CCAAAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATCACCACTTCCA
CTCCTGCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGACTCACTCCTGGGAG
ATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAACACCACTACCGATTTGAGAGTTTCCACTGACA
ATACCGTTTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTGCACCTGGATTGAAGTCCATCTTCA
GCTTCAGGGCCCCTGACCAAAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATATG
CCGGTATCAGCACAAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTA
TGGGTACCAATGTGTTGGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTT
TCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCC
TGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGTTCA
ACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTCAACACCATAACCG
TGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTGACCACTGTAAAGGCACGTGTGAACAGTGCCG
GGATAGCCAATGCACTCATTCAGCACCAGTGGACACCCAAATCCTTCTTCACCATCTCTG
GAGAAGTTGACACTAAGGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCCCTCTCTCTCA
AGCCTTGAAAATGAGAGCCAACTGATGAATATCCAACCAAAGCAAGTTTTTTCTGATGCG
GTGTACTGCTTGGTTTGGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAATCTTTTCCTCAGTTTCTT
ATCGGATTTGTAGAGCATAATAAATTTGGATTAATTGATCGTCTGTCTTGGTGATACGAT
GAAACTCTAAAGATCCTTTTCCTTTCTTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS95TF U 1
AF RR4F529TF U 6
AF RR4FS95JQ C 377
AF RR4F529JQ C 432
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DS 

RD RR4F529TF 525 0 0
GG
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CGGTGTTGCTATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGGCTCACTCCTGGGAGATGTTGC
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TTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTGCACCTGGATTGAAGTCCATCTTCAGCTTCAG
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CAGCACAAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATGGGTAC
CAATGTGTTGGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAA

QA 3 525 3 525
DS 

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GCTTGACCCCTTGACCACTGTGAAGGCACGTGTGAACAGTGCCGGGATAGCCAATGCACT
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GGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCCCTCTCTCTCAAGCCTTGAAAATGAGA
GCCAACTGATGAATATCCGACCAAAGCAAGTTTTTTTTGATGCGGTGTACTGCTTGGTTT
GGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAATCTTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGC
ATAATAAATTTGGATTAAT
CG

QA 1 679 1 679
DS 

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GTGTTGGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATC
AATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAA
GGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGTTCAACACCGCTGTT
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CATTCGCTTGACCCCTTGACCACTGTAAAGGCTCGTGTGAACAGTGCCGGGATAGCCAAT
GCACTCATTCAGCACCAGTGGACACCCAAATCCTTCTTCGCCATCTCTGGAGAAGTTGAC
ACTAAGGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCCCTCTCTCTCAAGCCTTGAAAA
TGAGAGCCAACTGATGAATATCCAACCAAAGCAAGTTTTTTCTGATGCGGTGTACTGCTT
GGTTTGGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAATCTTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGT
AGAGCATAATAAATTTGGATTAATTGATCGTCTGTCTTGGTGATACGATGAAACTCTAAA
GATCCTTTTCCTTTCTTTTTCTTCC

QA 1 685 1 685
DS 



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CTTCTTCGAGCTTGACAAAATCTAGGGTTTCGTCTCCAGATATTAGGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4CE88JQ U 1
AF RR4CE88TF C 1
AF RR4B621JQ U 25
AF RR4B621TF C 25
BS 1 221 RR4CE88JQ
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RD RR4CE88JQ 675 0 0
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CTTCTTCGAGCTT
CC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4CE88TF 675 0 0
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ACTCGTACTCTTGGATCACTTGTGGCTTCTCATTGATGATTTGAGCAAGTTGGGACTGGG
TAAGCTTCTTGTCAGTTCGTGCTTGCATAATGGCTTTCTTTAGCTCGGTAGGCACACGCT
CATGAGCGAGGTTCTCAGTGTCGTCATCAAGCCTCTTAGTGTTGAGAGATGTGCCGCTTG
ATGCTGCCTTGTTGGTTCCAGCATTGTATTTTCTGACGGATTCGATATCGGCGCCGGATC
GACGAGCGGCGTTGACGGTTTTCTCGTCGCGTTTGGCGGCGGAGTTAGGGGCTTTCTTGC
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CTTCTTCGAGCTT
CC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4B621JQ 687 0 0
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GGGTTTCGTCTCCAGATATTAGGTCCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4B621TF 687 0 0
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ATTGTTGTTCACCACACGTTGTTATGAAAAGTGAAACTGCGATTAAAGTTTTTCTATCTT
CAGGACTTGATGATGATAACTTCTTACCACGGAGTTTAGCTCCAAGTGCTCTCTCAAGCT
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GCTTCTCATTGATGATTTGAGCAAGTTGGGACTGGGTAAGCTTCTTGTCAGTTCGTGCTT
GCATAATGGCTTTCTTTAGCTCGGTAGGCACACGCTCATGAGCGAGGTTCTCAGTGTCGT
CATCAAGCCTCTTAGTGTTGAGAGATGTGCCGCTTGATGCTGCCTTGTTGGTTCCAGCAT
TGTATTTTCTGACGGATTCGATATCGGCGCCGGATCGACGAGCGGCGTTGACGGTTTTCT
CGTCGCGTTTGGCGGCGGAGTTAGGGGCTTTCTTGCGGATCACCACCGGCTCCCAATCTT
GTGTCAGCGGTCCAACTCCTGCCATGATTTCTTCTTCTTCTTCGAGCTTGACAAAATCTA
GGGTTTCGTCTCCAGATATTAGGTCCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 4

CO CL2245Contig1 673 4 1 U
GGTGAAACAAAAAAAGAAAAACAGAGAAGAAGAGAGAAGAAAGATGCCTCATGGAACTCT
TGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAAGGACTTGAGGACACAGATTTTCTGAACAGCATTGA
TCCTTATGTGCAATTCACTTGTCGGACTCAAGATCAGAAGAGCAATGTCGCATCAGGACA
AGGCACGACTCCAGAATGGAACGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACAACAGA
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BQ
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BS 1230 1231 RR4BY43JQ

RD RR4BY43TF 662 0 0
TTTTTTAGCATACTTGGCAACGATGATGGCCTTGTTGAAACCGACAAAGATAGCAGAGAG
TTTCTCTTTGGTTCCCTGGAGGCCCCTTTAGTCAACATGGAGACAAGTCTGAAAAACTAT
GAGCCCTCTGAAGAAGCTTTTGATGTTAACTCTGTGCCTAAGGAAGTCAAATCGCAGCCA
CTTGCAGAGAAGAAAGCCAAGGGTAAAAAGCCCACTGGTCTTGGTGCTCCACCACCTGCA
CCTGTGTCTGGGTTTGATGCATATGAAAGACTTCTATCATCTATTCCAGAGTTTGCTACC
TTTGGCAAACTTTTCAAGTCTTCTTCACCTGTGGAGCTAACTGAAGCAGAAACAGAATAC
TCAGTCAATGTTGTAAAGCATATCTTCGAGAGTCACGTTGTCTTTCAGTATAACTGTACA
AACACAGTACCAGAGCAATTGTTGGAGAGGGTCAATGTCATTGTAGATGCTTCAGAAGCA
GAGGAGTTCAGTGAACTATCTTCGAAGCCACTAAACTCGCTCCC*TTACGATTCTCCTGG
TCAGGCCTTTGTGGCGTTTGAGAAGCCAGAAGGAGTCCCCGCTGTTGGAAAGTTCTCAAA
CACATTGACTTTCGTTGTCAAGGAGGTTGACCCAAACACAGGTGAAGCAGAGGACGATGG
GT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4BY43JQ 782 0 0
GGTCAATGTCAT*GTAGATGCTTCAGAAGCAGAGGAGTTCAGTGAACTATCTTCGAAGCC
ACTAAACTCGCTCCCCTTACGATTCTCCTGGTCAGGCCTTTGTGGCGTTTGAGAAGCCAG
AAGGAGTCCCCGCTGTTGGAAAGTTCTCAAACACATTGACTTTCGTTGTCAAGGAGGTTG
ACCCAAACACAGGTGAAGCAGAGGACGATGGTGTGGAAGATGAGTACCAGCTCGCGGACC
TTGAGATTGTCCCTGCTGACTACATGGTGAACGTTGGTGTTTCAAATTTCAGGAATGCAT
GGGAGAACATGGACCCAGAGAACGAGCTTGAAGATGAGTATGGGCTTGGGCCAAGAGAGA
GCTTGGCCGAAGCAGTAAAAGCTGTAATTGATGTTCTTGGCATGCAGTCTTGTGAGGGGA
CGGAGACAGTTGCAAGTAACGCAAGGTCACACACAAGTTTACTGTCAGGTTTGTACATAG
GGAACGTGAAAGTCTTGGTGAAGGCGCAGTTTGGAATGGACGACAGAAAGGAAATTGCAA
TGAAACTGGCTGTTAGAGCAGATGATCAATCTGTCAGCGAAGCCATTCACGCCATTGTTT
CTGGCGGCTAAAAGTGTTCTTGCGACCGATCAAATACATTGAGAGTTTCATAACTATCCT
TTCATTCAGATTTGTTGGCAACGTTTTGCCCTTTTGGTCTTTTGATGGTGGTTCATTTTT
TCTCAACAGTTTTTGGATTTGCTATTGTTAACATTAGTATAAATATTCTTTGAATTATAG
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4CE04JQ 519 0 0
ATGGTGAACGTTGGTGTTTCAAATTTCAGGAATGCATGGGAGAACATGGACCCAGAGAAC
GAGCTTGAAGATTAGTATGGGCTTGGGCCAAGAGAGAGCTTGGCCGAAGCAGTAAAAGCT
GTAATTGATGTTATTGGCATGCAGTCTTGTGAGGGGACGGAGACAGTTGCAAGTAACGCA
AGGTCACACACAAGTTT*CTGTCAGGTTTGTACATAGGGAACGTGAAGGTCTTGGTGAAG
GCGCAGTTTGGAGTGGACAACAGAAAGGAAATTGCAATGAAACTGGCTGTTAGAGCAGAT
GATCAATCTGTCAGCGAAGCCATTCACGCCATTGCTTCTGGCGGCTAAAAGTGTTCTTGC
GACCGATCAAATACATTGAGAGTTTCATAACTATCCTTTCATTCAGATTTGTTGGCAACG
TTTTGCCCTTTTGGTCTTTTGATGGTGGTTCATTTTTTTTCAACAGTTTTTGGATTTGCT
ATTGTTAACATTAGTATAAATATTCTTTGAATTATAG
GC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR4CE04TF 604 0 0
G
GACCCAAACACAGGTGAAGCAGAGGACGATGGTGTGGAAGATGAGTACCAGCTCGAGGAC
CTTGAGATTGTCCCTGCTGACTACATGGTGAACGTTGGTGTTTCAAATTTCAGGAATGCA
TGGGAGAACATGGACCCAGAGAACGAGCTTGAAGATTAGTATGGGCTTGGGCCAAGAGAG
AGCTTGGCCGAAGCAGTAAAAGCTGTAATTGATGTTCTTGGCATGCAGTCTTGTGAGGGG
ACGGAGACAGTTGCAAGTAACGCAAGGTCACACACAAGTTT*CTGTCAGGTTTGTACATA
GGGAACGTGAAGGTCTTGGTGAAGGCGCAGTTTGGAGTGGACAACAGAAAGGAAATTGCA
ATGAAACTGGCTGTTAGAGCAGATGATCAATCTGTCAGCGAAGCCATTCACGCCATTGCT
TCTGGCGGCTAAAAGTGTTCTTGCGACCGATCAAATACATTGAGAGTTTCATAACTATCC
TTTCATTCAGATTTGTTGGCAACGTTTTGCCCTTTTGGTCTTTTGATGGTGGTTCATTTT
TTCTCAACAGTTTTTGGATTTGCTATTGTTAACATTAGTATAAATATTCTTTGAATTATA
G
GC

QA 2 602 2 602
DS 



AS 1 4

CO CL2247Contig1 946 4 8 U
GGAAGATGGACATCGTATAGAATCAACTTCTCTCTCCTCAATTTCTCTCTCGCTTCTATC
TAAAAGTTTACATCTTTGATCACCGTTTTACCGGCCGACGGGTGGGCTCCCATAGCCACC
GTCGGTCCGGTCTTGATTTTCGTTTCTCCGTTTGTATATCTTTCGGTCGGTTCAAAGTTT
CCTGTGTAGATCTAGATCTAGATTATCAGATCGGTTTTGTTAAAGATAGTTTGACGGTGG
TGGCTTCTCGGTGTTTCTGGGATGTTCGCTTGTTCCGTTCTTCTCTTATCTCTTGGCTTT
CTCTCGTGGTCTTCAGTATCCTGTATCTTACTCTATAGGATCTGATTTCTGTTGTGAGAT
TTGTCTCTCCGATCTGTTTACATGTTGATGGATGCCTCTTCTGGTGGATTTACTAAGGCT
TGTAAGGTTGTGCTTATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTCAGATTCAGTTTGCAATCTT
CACGGATCCGGCTCGTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCTTTCTGCATCTTGGCGTGGA
GTTTGGAGTGAAAAAAAATGGTCCTCCTCCTCCTCCTGGGATTATTGTACCTTTGCTTAC
TCATGGCTCGTCAGATGGTTTCGGAGCAGTATAATGAGAGGCAGGTCTCCCTTAATAAAT
CTCGTCGATGAATGTGCGCTTACTTCTTCCTTCTTGCCTTAGTGGTCCATTTGCTTGGGT
GTTTTACTTTTATGATCTAGATTTATTTTCAGTTTGTACTTTGAACTCTGTTACTTATGT
TTAGTTTTAGCTTCCAGAGATTTCAGTTAAATCTGCTGGCCTTTGTTTCCAGAGGATGAT
CTTGTATCCTACTGGCTTAGTTTCTAGGGGTGTTGTTTACTCGCTAGCTTTGGTGTCTTT
CCTTGTGTATTACTCTGTTTCTTCATCAATGAAAATAGTCAGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS08TF U 15
AF RR4EK91TF U 1
AF RR4EK91JQ C 277
AF RR4FS08JQ C 282
BS 1 189 RR4EK91TF
BS 190 190 RR4FS08TF
BS 191 573 RR4EK91TF
BS 574 576 RR4FS08TF
BS 577 587 RR4EK91TF
BS 588 589 RR4FS08TF
BS 590 732 RR4EK91TF
BS 733 946 RR4EK91JQ

RD RR4FS08TF 605 0 0
GG
ATAGAATCAACTTCTCTCTCCTCAATTTCTCTCTCGCTTCTATCTAAAAGTTTACATCTT
TGATCACCGTTTTACCGGCCGACGGGTGGGCTCCCATAGCCACCGTCGGTCCGGTCTTGA
TTTTCGTTTCTCCGTTTGTATATCTTTCGGTCGGTTCAAAGTTTCCTGTGTAGATCTAGA
TCTAGATTATCAGATCGGTTTTGTTAAAGATAGTTTGACGGTGGTGGCTTCTCGGTGTTT
CTGGGATGTTCGCTTGTTCCGTTCTTCTCTTATCTCTTGGCTTTCTCTCGTGGTCTTCAG
TATCCTGTATCTTACTCTATAGGATCTGATTTCTGTTGTGAGATTTGTCTCTCCGATCTG
TTTGCATGTTGATGGATGCCTCTTCTGGTGGATTTACTAAGGCTTGTAAGGTTGTGCTTA
TCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTCAGATTCAGTTTGCAATCTTCACGGATCCGGCTCGT
CTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCTTTCTGCATCTTGGCGTGGAGTTTGGAGTGAAAAAA
AATGGTCCTCCTCCTCCTCCTGGGATTATTGTACCTTTGCTTACTCATGGCTCGTCAGAT
GGT

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR4EK91TF 732 0 0
GGAAGATGGACATCGTATAGAATCAACTTCTCTCTCCTCAATTTCTCTCTCGCTTCTATC
TAAAAGTTTACATCTTTGATCACCGTTTTACCGGCCGACGGGTGGGCTCCCATAGCCACC
GTCGGTCCGGTCTTGATTTTCGTTTCTCCGTTTGTATATCTTTCGGTCGGTTCAAAGTTT
CCTGTGTAGGTCTAGATCTAGATTATCAGATCGGTTTTGTTAAAGATAGTTTGACGGTGG
TGGCTTCTCGGTGTTTCTGGGATGTTCGCTTGTTCCGTTCTTCTCTTATCTCTTGGCTTT
CTCTCGTGGTCTTCAGTATCCTGTATCTTACTCTATAGGATCTGATTTCTGTTGTGAGAT
TTGTCTCTCCGATCTGTTTACATGTTGATGGATGCCTCTTCTGGTGGATTTACTAAGGCT
TGTAAGGTTGTGCTTATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTCAGATTCAGTTTGCAATCTT
CACGGATCCGGCTCGTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCTTTCTGCATCTTGGCGTGGA
GTTTGGAGTGAAAAAAAATGGTCCTCCTCCTCC***TGGGATTATTG**CCTTTGCTTAC
TCATGGCTCGTCAGATGGTTTCGGAGCAGTATAATGAGAGGCAGGTCTCCCTTAATAAAT
CTCGTCGATGAATGTGCGCTTACTTCTTCCTTCTTGCCTTAGTGGTCCATTTGCTTGGGT
GTTTTACTTTTA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4EK91JQ 670 0 0
GTTCT
TCTCTTATCTCTTGGCTTTCTCTCGTGGTCTTCAGTATCCTGTATCTTACTCTATAGGAT
CTGATTTCTGTTGTGAGATTTGTCTCTCCGATCTGTTTACATGTTGATGGATGCCTCTTC
TGGTGGATTTACTAAGGCTTGTAAGGTTGTGCTTATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTC
AGATTCAGTTTGCAATCTTCACGGATCCGGCTCGTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCT
TTCTGCATCTTGGCGTGGAGTTTGGAGTGAAAAAAAATGGTCCTCCTCCTCC***TGGGA
TTATTG**CCTTTGCTTACTCATGGCTCGTCAGATGGTTTCGGAGCAGTATAATGAGAGG
CAGGTCTCCCTTAATAAATCTCGTCGATGAATGTGCGCTTACTTCTTCCTTCTTGCCTTA
GTGGTCCATTTGCTTGGGTGTTTTACTTTTATGATCTAGATTTATTTTCAGTTTGTACTT
TGAACTCTGTTACTTATGTTTAGTTTTAGCTTCCAGAGATTTCAGTTAAATCTGCTGGCC
TTTGTTTCCAGAGGATGATCTTGTATCCTACTGGCTTAGTTTCTAGGGGTGTTGTTTACT
CGCTAGCTTTGGTGTCTTTCCTTGTGTATTACTCTGTTTCTTCATCAATGAAAATAGTCA
GTGTT

QA 6 670 6 670
DS 

RD RR4FS08JQ 626 0 0
TCTCTTATCTCTTGGCTTTCTCTCGTGGTCTTCAGTATCCTGTATCTTACTCTATAGGAT
CTGATTTCTGTTGTGAGATTTGTCTCTCCGATCTGTTTGCATGTTGATGGATGCCTCTTC
TGGTGGATTTACTAAGGCTTGTAAGGTTGTGCTTATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTC
AGATTCAGTTTGCAATCTTCACGGATCCGGCTCGTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCT
TTCTGCATCTTGGCGTGGAGTTTGGAGTGAAAAAAAATGGTCCTCCTCCTCCTCCTGGGA
TTATTGTACCTTTGCTTACTCATGGCTCGTCAGATGGTTTCGGAGCAGTATAATGAGAGG
CAGGTCTCCCTTAATAAATCTCGTCGATGAATGTGCGCTTACTTCTTCCTTCTTGCCTTA
GTGGTCCATTTGCTTGGGTGTTTTACTTTTATGATCTAGATTTATTTTCAGTTTGTACTT
TGAACTCTGTTACTTATGTTTAGTTTTAGCTTCCAGAGATTTCAGTTAAATCTGCTGGCC
TTTGTTTCCAGAGGATGATCTTGTATCCTACTGGCTTAGTTTCTAGGGGTGTTGTTTACT
CGCTAGCTTTGGTGTCTTTCCTTGTG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 2 4

CO CL2248Contig1 777 2 6 U
GTCCTGAGAATTATTCACTTGCCTAGCCATAAAATGTTATGACATTCGGTGATACAAAGC
AATTGTGTTATTCCAAAACAACAAAAGATGTCCATAAAATAACACTACAGAAAACAAAAA
AAAACAAGTGAAGCAATGTCTAAACAAAATCTTGAGAAAACCGATCCCAAAAATGCAATT
CCCAAAGTTATCCGATCAATTCAAAACCGGTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCCCCCTCCC
ACTTTTAAATTTTAGCAAACACCCAGAAAGATGAAATGAAATGAAGCCTGGAAGTCCTCT
GTTTTTTTAGAAACAGATTCCCCCAAACGTGCAATGATCAATCCTCATGTTCATCATCGC
TTTCAGAATCGGATCTGACATCTTCGCTAAGCTTGCCTCGATCCTGTACTTGTTTCACAA
GCATCCGGTAAATTAAAACCCACCAGAATATATGAAGCACAAGCAGGCAAAACAAGAGAG
TGTTGAACATGTAGTAGTAGATCGGTCCTTCGATAGGATGCTTCTCCTTGTCCACAGTCA
TAATAATCTGATAGCTCGTGCTCCAAAGGATCCAGAAAGGATAGTAAATGAGACGTAGAA
CCACCCAAGACAAAGCAAAAAGCACAAACGAAAAGGCTGCTATACTCTCAAATCCGCTGT
ACTTAGACATCTTCCCAACTTCAAGGAACACATCGCTCGCGTCATGGAGTGCAAGAACAA
CAGAGCCAGCACGAGAGAATCTGCAGATGTAGGAGAGGACGATGAGGATAACAGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CP16JQ U 1
AF RR4FW94JQ U 18
BS 1 123 RR4CP16JQ
BS 124 124 RR4FW94JQ
BS 125 437 RR4CP16JQ
BS 438 438 RR4FW94JQ
BS 439 748 RR4CP16JQ
BS 749 777 RR4FW94JQ

RD RR4CP16JQ 748 0 0
GTCCTGAGAATTATTCACTTGCCTAGCCATAAAATGTTATGACATTCGGTGATACAAAGC
AATTGTGTTATTCCAAAACAACAAAAGATGTCCATAAAATAACACTACAGAAAACAAAAA
AAA*CAAGTGAAGCAATGTCTAAACAAAATCTTGAGAAAACCGATCCCAAAAATGCAATT
CCCAAAGTTATCCGATCAATTCAAAACCGGTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCCCCCTCCC
ACTTTTAAATTTTAGCAAACACCCAGAAAGATGAAATGAAATGAAGCCTGGAAGTCCTCT
GTTTTTTTAGAAACAGATTCCCCCAAACGTGCAATGATCAATCCTCATGTTCATCATCGC
TTTCAGAATCGGATCTGACATCTTCGCTAAGCTTGCCTCGATCCTGTACTTGTTTCACAA
GCATCCGGTAAATTAAA*CCCACCAGAATATATGAAGCACAAGCAGGCAAAACAAGAGAG
TGTTGAACATGTAGTAGTAGATCGGTCCTTCGATAGGATGCTTCTCCTTGTCCACAGTCA
TAATAATCTGATAGCTCGTGCTCCAAAGGATCCAGAAAGGATAGTAAATGAGACGTAGAA
CCACCCAAGACAAAGCAAAAAGCACAAACGAAAAGGCTGCTATACTCTCAAATCCGCTGT
ACTTAGACATCTTCCCAACTTCAAGGAACACATCGCTCGCGTCATGGAGTGCAAGAACAA
CAGAGCCAGCACGAGAGAATCTGCAGAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4FW94JQ 760 0 0
CTTGCCTAGCCATAAAATGTTATGACATTCGGTGATACAAAGCAATTGTGTTATTCCAAA
ACAACAAAAGATGTCCATAAAATAACACTACAGAAAACAAAAAAAAACGAGTGAAGCAAT
GTCTAAACAAAATCTTGAGAAAACCGATCCCAAAAATGCAATTCCCAAAGTTATCCGATC
AATTCAAAACCGGTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCCCCCTCCCACTTTTAAATTTTAGCA
AACACCCAGAAAGATGAAATGAAATGAAGCCTGGAAGTCCTCTGTTTTTTTAGAAACAGA
TTCCCCCAAACGTGCAATGATCAATCCTCATGTTCATCATCGCTTTCAGAATCGGATCTG
ACATCTTCGCTAAGCTTGCCTCGATCCTGTACTTGTTTCACAAGCATCCGGTAAATTAAA
ACCCACCAGAATATATGAAGCACAAGCAGGCAAAACAAGAGAGTGTTGAACATGTAGTAG
TAGATCGGTCCTTCGATAGGATGCTTCTCCTTGTCCACAGTCATAATAATCTGATAGCTC
GTGCTCCAGAGGATCCAGAAAGGATAGTAAATGAGACGTAGAACCACCCAAGACAAAGCA
AAAAGCACAAACGAAAAGGCTGCTATACTCTCAAATCCGCTGTACTTAGACATCTTCCCA
ACTTCGAGGAACACATCGCTCGCGTCATGGAGTGCAAGAACAACAGAGCCAGCACGAGAG
AATCTGCAGATGTAGGAGAGGACGATGAGGATAACAGTAG

QA 1 760 1 760
DS 



CO CL2248Contig2 826 2 8 U
GATCCTTCCGTTTCGTGAAGTAAAACAAACCTCTTCACTCTTTATCTCTCACAGCGACAA
ATCTCTCGAGACTAACTCTGATCCGATCAACAATCATTAGATCAAATCGAATTCGAGATC
GATCGCATTTGATCAAACTTTTCTCTCTCAATCAATCTGGTCAACCCCCCTCCGATGTGG
TCTTCGCTGACTTAAGAATCCGATTGAAGCAAAAGTCCGAAACTTTACCGAGATGGGTCT
GTTCGAATCGGTGAAATCGATCAATTGGGAGCACGAATCGTTCCCTACTTACGAGGATTT
CGTGTGGTTGCCTCTCTTCGCTGTCTTCTTCCCTTCCATACGCTTCCTTCTCGACAGATT
CGTCTTCGAGAAAGTGGGAAGGTTGTTTATTTACGGAAGGCAGAGTCCGAAAAAGAATAA
CAAGAAGACGAAAATCAGAAAATTCAAAGAATCGGCTTGGAAGTGTATCTACTACCTCTC
AGCTGAGGTGCTTGCTTTGTCTGTGACGTACAACGAGCCTTGGTTTACAGACACTCTCTA
CTTCTGGGTTGGTCCTGGAGATCAGATCTGGCCTAACCAACAGATGAAGATAAAGTTGAA
GTTTTTATATATGTATACAGCTGGGTTCTACACTTACTCTATATTCGCGTTGATCTTTTG
GGAAACAAGACGTTCTGACTTTGGTGTTTCCATGGGTCATCATATCACTACTGTTATCCT
CATCGTCCTCTCCTACATCTGCAGATTCTCTCGTGCTGGCTCTGTGGTTCTTGCACTCAT
GACGCGAGCGATGTGTTCTGAGTGGGAGATGTCTAGTACAGCGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FW94TF U 1
AF RR4CP16TF U 63
BS 1 226 RR4FW94TF
BS 227 227 RR4CP16TF
BS 228 238 RR4FW94TF
BS 239 239 RR4CP16TF
BS 240 765 RR4FW94TF
BS 766 766 RR4CP16TF
BS 767 793 RR4FW94TF
BS 794 826 RR4CP16TF

RD RR4FW94TF 793 0 0
GATCCTTCCGTTTCGTGAAGTAAAACAAACCTCTTCACTCTTTATCTCTCACAGCGACAA
ATCTCTCGAGACTAACTCTGATCCGATCAACAATCATTAGATCAAATCGAATTCGAGATC
GATCGCATTTGATCAAACTTTTCTCTCTCAATCAATCTGGTCAACCCCCCTCCGATGTGG
TCTTCGCTGACTTAAGAATCCGATTGAAGCAAAAGTCCGAAACTTTGCCGAGATGGGTTT
GTTCGAATCGGTGAAATCGATCAATTGGGAGCACGAATCGTTCCCTACTTACGAGGATTT
CGTGTGGTTGCCTCTCTTCGCTGTCTTCTTCCCTTCCATACGCTTCCTTCTCGACAGATT
CGTCTTCGAGAAAGTGGGAAGGTTGTTTATTTACGGAAGGCAGAGTCCGAAAAAGAATAA
CAAGAAGACGAAAATCAGAAAATTCAAAGAATCGGCTTGGAAGTGTATCTACTACCTCTC
AGCTGAGGTGCTTGCTTTGTCTGTGACGTACAACGAGCCTTGGTTTACAGACACTCTCTA
CTTCTGGGTTGGTCCTGGAGATCAGATCTGGCCTAACCAACAGATGAAGATAAAGTTGAA
GTTTTTATATATGTATACAGCTGGGTTCTACACTTACTCTATATTCGCGTTGATCTTTTG
GGAAACAAGACGTTCTGACTTTGGTGTTTCCATGGGTCATCATATCACTACTGTTATCCT
CATCGTCCTCTCCTACATCTGCAGATTCTCTCGTGCTGGCTCTGTTGTTCTTGCACTCAT
GACGCGAGCGATG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4CP16TF 764 0 0
CTCTCGAGACTAACTCTGATCCGATCAACAATCATTAGATCAAATCGAATTCGAGATCGA
TCGCATTTGATCAAACTTTTCTCTCTCAATCAATCTGGTCAACCCCCCTCCGATGTGGTC
TTCGCTGATTTAAGAATCCGATTGAAGCAAAAGTCCGAAACTTTACCGAGATGGGTCTGT
TCGAATCGGTGAAATCGATCAATTGGGAGCACGAATCGTTCCCTACTTACGAGGATTTCG
TGTGGTTGCCTCTCTTCGCTGTCTTCTTCCCTTCCATACGCTTCCTTCTCGACAGATTCG
TCTTCGAGAAAGTGGGAAGGTTGTTTATTTACGGAAGGCAGAGTCCGAAAAAGAATAACA
AGAAGACGAAAATCAGAAAATTCAAAGAATCGGCTTGGAAGTGTATCTACTACCTCTCAG
CTGAGGTGCTTGCTTTGTCTGTGACGTACAACGAGCCTTGGTTTACAGACACTCTCTACT
TCTGGGTTGGTCCTGGAGATCAGATCTGGCCTAACCAACAGATGAAGATAAAGTTGAAGT
TTTTATATATGTATACAGCTGGGTTCTACACTTACTCTATATTCGCGTTGATCTTTTGGG
AAACTAGACGTTCTGACTTTGGTGTTTCCATGGGTCATCATATCACTACTGT*ATCCTCA
TCGTC*TCTC*TACATCTGCAGAT*CTCTCGTGCTGGCTCTGTG**TCT*GCACTCATGA
CGCGAGCGATGTGTTCTGAGTGGGAGATGTCTAGTACAGCGGAT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 4

CO CL2249Contig1 977 4 11 U
GGGCAATGCAGAGTCATGTACTACTGGTTCAAAAGGGCTAAAGCCTCCGCTGGACCCGGA
TCCGAAATGGGCGGGTTTACCCGGATCTTGCACAACGGTAAACCCGATAAGTATATGGAT
GAGATTCCTACTTTCGTCGCCCAGCCTCTACCTTCTGGGATGGATCAGGGTTATGTTGTA
CTAAACAGACCATGGGCGTTTGTACAATGGCTTCAACAAACTGACATTAAAGAAGATTAT
GTTCTCATGTCGGAGCCTGATCATGTCATTGTGAAACCTATACCGAACCTTGCTAAAGAT
GGGTTCGGAGCTGCGTTTCCTTTCTTTTACATCGAACCGAAGAAGTATGAGAAGGTGTTG
AGGAAGTATTATCCTGAAGAGAGAGGACCTGTGACCAACATTGATCCTATAGGGAACTCT
CCTGTCATTGTCGGAAAGGAGGATTTGAAGAAGATTGCTCCTACTTAGATGAATGTTTCT
TTGGCTATGAAGAAGGATCCTGAAGCAGACAAGGCTTTTGGATGGGTTCTTGAAATGTAT
ACTTATGCGGTTTCATCTGCATTGCATGGTGTTAGCAATGTTCTACACAAAAACTTCATG
ATTCAGCCTCCATGGGATAAAGAGGTTGGTGACAAGTACATCATACACTACACTTATGGA
TGTGACTTTGATATGAAGGGTCACTTAACCTATGGGAAGGTTGGGGAATGGAGATTTGAC
AAAAGATCGTATATTAAGTCACCGCCACCAAAGAACCTTACAATGCCACCACCTGGTGTT
CCACAGAGTGTGGTAACGTTAGTGAAGATGGTGAATGAAGCCACGGCAAACCTTCCAGAC
TGGGGATCATAGATAGAGAGAGAGATAGAAACAGTTTACTTTGTGTCTTAATCTATCTAT
ATACGTTGTCTGTTTCGTTTGTAAATTATATAGCTTTTCAAACAAACCCCGATCTTAATC
AAATGATTAAACTTATT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F676TF U 1
AF RR4C476TF U 214
AF RR4F676JQ C 329
AF RR4C476JQ C 378
BS 1 723 RR4F676TF
BS 724 724 RR4C476TF
BS 725 744 RR4F676TF
BS 745 835 RR4C476TF
BS 836 836 RR4F676JQ
BS 837 888 RR4C476TF
BS 889 889 RR4F676JQ
BS 890 914 RR4C476TF
BS 915 915 RR4F676JQ
BS 916 926 RR4C476TF
BS 927 977 RR4F676JQ

RD RR4F676TF 744 0 0
GGGCAATGCAGAGTCATGTACTACTGGTTCAAAAGGGCTAAAGCCTCCGCTGGACCCGGA
TCCGAAATGGGCGGGTTTACCCGGATCTTGCACAACGGTAAACCCGATAAGTATATGGAT
GAGATTCCTACTTTCGTCGCCCAGCCTCTACCTTCTGGGATGGATCAGGGTTATGTTGTA
CTAAACAGACCATGGGCGTTTGTACAATGGCTTCAACAAACTGACATTAAAGAAGATTAT
GTTCTCATGTCGGAGCCTGATCATGTCATTGTGAAACCTATACCGAACCTTGCTAAAGAT
GGGTTCGGAGCTGCGTTTCCTTTCTTTTACATCGAACCGAAGAAGTATGAGAAGGTGTTG
AGGAAGTATTATCCTGAAGAGAGAGGACCTGTGACCAACATTGATCCTATAGGGAACTCT
CCTGTCATTGTCGGAAAGGAGGATTTGAAGAAGATTGCTCCTACTTAGATGAATGTTTCT
TTGGCTATGAAGAAGGATCCTGAAGCAGACAAGGCTTTTGGATGGGTTCTTGAAATGTAT
ACTTATGCGGTTTCATCTGCATTGCATGGTGTTAGCAATGTTCTACACAAAAACTTCATG
ATTCAGCCTCCATGGGATAAAGAGGTTGGTGACAAGTACATCATACACTACACTTATGGA
TGTGACTTTGATATGAAGGGTCACTTAACCTATGGGAAGGTTGGGGAATGGAGATTTGAC
AAA*GATCGTATATTAAGTCACCG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4C476TF 718 0 0
CAACAAACTGACATTAAAGAAGATTATGTTCTCATGTCGGAGCCTGATCATGTCATTGTG
AAACCTATACCGAACCTTGCTAAAGATGGGTTCGGAGCTGCGTTTCCTTTCTTTTACATC
GAACCGAAGAAGTATGAGAAGGTGTTGAGGAAGTATTATCCTGAAGAGAGAGGACCTGTG
ACCAACATTGATCCTATAGGGAACTCTCCTGTCATTGTCGGAAAGGAGGATTTGAAGAAG
ATTGCTCCTACTTGGATGAATGTTTCTTTGGCTATGAAGAAGGATCCTGAAGCAGACAAG
GCTTTTGGATGGGTTCTTGAAATGTATGCTTATGCGGTTTCATCTGCATTGCATGGTGTT
AGCAATGTTCTACACAAAAACTTCATGATTCAGCCTCCATGGGATAAAGAGGTTGGTGAC
AAGTACATCATACACTACACTTATGGATGTGACTTTGATATGAAGGGTCACTTAACCTAT
GGGAAGGTTGGGGAATGGAGATTTGACAAAAGATCGTATATTAAGTCACCGCCACCAAAG
AACCTTACAATGCCACCACCTGGTGTTCCACAGAGTGTGGTAACGTTAGTGAAGATGGTG
AATGAAGCCACGGCAAACCTTC*AGACTGGGGATCATAGATAGAGAGAGAGATAGAAACA
GTTTACTTTGTGTCT*AATCTATCTATATACGTTGTCTGTT*CGTTTGTAAAT
ATATA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4F676JQ 649 0 0
ACATCGAACCGAAGAAGTATGAGAAGGTGTTGAGGAAGTATTATCCTGAAGAGAGAGGAC
CTGTGACCAACATTGATCCTATAGGGAACTCTCCTGTCATTGTCGGAAAGGAGGATTTGA
AGAAGATTGCTCCTACTTAGATGAATGTTTCTTTGGCTATGAAGAAGGATCCTGAAGCAG
ACAAGGCTTTTGGATGGGTTCTTGAAATGTATACTTATGCGGTTTCATCTGCATTGCATG
GTGTTAGCAATGTTCTACACAAAAACTTCATGATTCAGCCTCCATGGGATAAAGAGGTTG
GTGACAAGTACATCATACACTACACTTATGGATGTGACTTTGATATGAAGGGTCACTTAA
CCTATGGGAAGGTTGGGGAATGGAGATTTGACAAAAGATCGTATATTAAGTCACCGCCAC
CAAAGAACCTTACAATGCCACCACCTGGTGTTCCACAGAGTGTGGTAACGTTAGTGAAGA
TGGTGAATGAAGCCACGGCAAACCTTCCAGACTGGGGATCATAGATAGAGAGAGAGATAG
AAACAGTTTACTTTGTGTCTTAATCTATCTATATACTTTGTCTGTTTCGTTTGTAAATTA
TATAGCTTTTCAAACAAACCCCGATCTTAATCAAATGATTAAACTTATT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4C476JQ 600 0 0
AGAGAGAGGACCTGTGACCAACATTGATCCTATAGGGAACTCTCCTGTCATTGTCGGAAA
GGAGGATTTGAAGAAGATTGCTCCTACTTGGATGAATGTTTCTTTGGCTATGAAGAAGGA
TCCTGAAGCAGACAAGGCTTTTGGATGGGTTCTTGAAATGTATGCTTATGCGGTTTCATC
TGCATTGCATGGTGTTAGCAATGTTTTACACAAAAACTTCATGATTCAGCCTCCATGGGA
TAAAGAGGTTGGTGACAAGTACATCATACACTACACTTATGGATGTGACTTTGATATGAA
GGGTCACTTAACCTATGGGAAGGTTGGGGAATGGAGATTTGACAAAAGATCGTATATTAA
GTCACCGCCACCAAAGAACCTTACAATGCCACCACCTGGTGTTCCACAGAGTGTGGTAAC
GTTAGTGAAGATGGTGAATGAAGCCACGGCAAACCTTCCAGACTGGGGATCATAGATAGA
GAGAGAGATAGAAACAGTTTACTTTGTGTCTTAATCTATCTATATACGTTGTCTGTTTCG
TTTGTAAATTATATAGCTTT*CGAACAAACCCCGATCTTAATCAAATGATTAAACTTATT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 4

CO CL2250Contig1 721 4 9 U
TCAGAAAGAGATTGAGGAAATGATAGTTTATAATCGAGATAAATTTCTGCTTCTCTGTGT
CTGAATTTGCATAATGTAATTGTAGCTAAAGCACATGAAGAACACTCAAATAACGAACAA
GAAACAGCCAAAAAAGTCTGAGCAAAACACTGGGGGAGGGGGAAGAAAGTAGAAAAACTA
ATAGCCACCCTTGAGATCGTTGACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCCCCAAGGT
CATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTAATTGT
CTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCCTTGAGCTCATCATTTTTCTTCTTCCTCAGCTTGAA
CTCCTCTGCGCACCTTGACTGCTGCACGTGTTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTAT
GATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCA
GACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCATT
CACCTTAACATCGACGTAGTCTCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAAT
TGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATG
ACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGAGTGGGACGCGAGAAGTGATAAACCTAAAATCGCCC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4F675JQ U 25
AF RR4F675TF C 31
AF RR4CE69JQ U 32
AF RR4CE69TF C 1
BS 1 31 RR4CE69TF
BS 32 232 RR4F675JQ
BS 233 233 RR4CE69JQ
BS 234 365 RR4F675JQ
BS 366 367 RR4CE69JQ
BS 368 408 RR4F675JQ
BS 409 409 RR4CE69JQ
BS 410 715 RR4F675JQ
BS 716 721 RR4CE69TF

RD RR4F675JQ 692 0 0
GGTTTAT
AATCGAGATAAATTTCTGCTTCTCTGTGTCTGAATTTGCATAATGTAATTGTAGCTAAAG
CACATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAAACAGCCAAAAAAGTCTGAGCAAAACACT
GGGGGAGGGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCCACCCTTGAGATCGTTGACGACATCG
TAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGT
CCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTAATTGTCTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCCTTGAGC
TCATCATTTTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCCT**GCGCACCTTGACTGCTGCACGTGT
TCCACACGCACATGAAGTCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCG
ACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTG
TGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCATTCACCTTAACATCGACGTAGTCTCCGACCTTG
AAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAAC
AGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGAGTGGGA
CGCGAGAAGTGATAAACCTAAAAT
C

QA 8 691 8 691
DS 

RD RR4F675TF 691 0 0
T
AATCGAGATAAATTTCTGCTTCTCTGTGTCTGAATTTGCATAATGTAATTGTAGCTAAAG
CACATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAAACAGCCAAAAAAGTCTGAGCAAAACACT
GGGGGAGGGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCCACCCTTGAGATCGTTGACGACATCG
TAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGT
CCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTAATTGTCTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCCTTGAGC
TCATCATTTTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCCT**GCGCACCTTGACTGCTGCACGTGT
TCCACACGCACATGAAGTCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCG
ACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTG
TGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCATTCACCTTAACATCGACGTAGTCTCCGACCTTG
AAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAAC
AGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGAGTGGGA
CGCGAGAAGTGATAAACCTAAAAT
CGCCCC

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4CE69JQ 684 0 0
AATCGAGATAAATTTCTGCTTCTCTGTGTCTGAATTTGCATAATGTAATTGTAGCTAAAG
CACATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAAACAGCCAAAAAAGTCTGAGCAAAACACT
GGGGGAGGGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCCACCCTTGGGATCGTTGACGACATCG
TAAGGGATAGGAGTGACAGTCCCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGT
CCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTAATTGTCTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCCTTGAGC
TCATCATTTTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCCTCTGCGCACCTTGACTGCTGCACGTGT
TCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCG
ACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTG
TGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCATTCACCTTAACATCGACGTAGTCTCCGACCTTG
AAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAAC
AGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGAGTGGGA
*GCGAGAAGTGATAAACCTAAAAT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4CE69TF 721 0 0
TCAGAAAGAGATTGAGGAAATGATAGTTTATAATCGAGATAAATTTCTGCTTCTCTGTGT
CTGAATTTGCATAATGTAATTGTAGCTAAAGCACATGAAGAACACTCAAATAACGAACAA
GAAACAGCCAAAAAAGTCTGAGCAAAACACTGGGGGAGGGGGAAGAAAGTAGAAAAACTA
ATAGCCACCCTTGGGATCGTTGACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCCCCAAGGT
CATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTAATTGT
CTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCCTTGAGCTCATCATTTTTCTTCTTCCTCAGCTTGAA
CTCCTCTGCGCACCTTGACTGCTGCACGTGTTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTAT
GATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCA
GACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCATT
CACCTTAACATCGACGTAGTCTCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAAT
TGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATG
ACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGAGTGGGA*GCGAGAAGTGATAAACCTAAAATCGCCC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 4

CO CL2251Contig1 1164 4 6 U
GAAGTGAAAACAAGTATGATTGTAAATTATATAGAGACATGTCTGTCAGTAACATTCATG
AACAAATGGACAAGTTCAACAGGGCAAAATATCCCATAGAAGAAACAAATAAGCTGAATA
TCATACCTCGCCGTCCCATAACTCTTCCACAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCGTGAGC
AAAGAAGGAAGCATTCAATAGCCTAGTCTGTTCAATATCGGAAAACTTGGCAAACAAGTC
ATTGGGTATAGACCAGTCAAAAACATCTAAGTTCTCTCTGATCCTGCCTTCATTGGTACT
TTTGGGAAGTACACTGTGACCCATTTGGAGCCCCCAACAGAGCACAACTTGAGCAGGAGA
TTTCCCAAGCTTTTCCGCAACCATATTCAGTATTGGGTTCTTCAGAACATCGCTCTTGAA
CCATCCTGGAGAACCCAATGGGAAGTATGCACTGAGGTGAACTCCATTGGATTTGCAAAA
CTCTCGTAGCTTAGCTTGTCGCCAAGAAGGACGACACTCGACCTGATTAACAGCAGGAGG
AACACGAGCCAGATCCAAGAGATTGCCTAGTTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACTCCTAT
GGCTCGTGCCTTACCCGAATCATAGAGTGCCTCCATCGATTTCCATGTGTTAGGAATATC
TACAGGCAAAAGGTTCTCTGGACTCACTCCAACAGCACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCA
GTGAATCAAATACAGGTCAACGTAGTCAAGCTGCAGACTCTGTATAGTTCTGTTTAGTGC
CTCTGGTGCATCTTGAGGGTCATGATCAGTACACCAGAGCTTGGAGGTGATGAACAACTC
CTCGCGTTTCACTACACCTTTTTCACACAATTTTTTTAAAGCTGTCCCAATCTCTTTTTC
GTTGCCATACAACTGAGCACAATCAATATGACGATAGCCGATCTTAACAGCAGCTGCTAC
GGCATCACCAACAACGCCAGGAGAGGCCTGCCATGTTCCAAGACCCACAGACGGGATCTT
AGCACCGGTGTTGAGCTCGAAGAATCTGAGAGCGTTCGACATTGTCAGAGATTTGGTGGT
TATGAGTTTAAGATCGCTGGTTTTGGTTTGACGCACACAGCATTCTTAAATGTGTTGGTG
AGAAGTGAGAGCTACAGAGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E827JQ U 6
AF RR4H411JQB U 1
AF RR4H411TF C 526
AF RR4E827TF C 526
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BS 286 286 RR4E827JQ
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BS 345 805 RR4H411JQB
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GTAGCTT

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DS 

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TTTCCCAAGCTTTTCCGCAACCATATTCAGTATTGGGTTCTTCAGAACATCGCTCTTGAA
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CTCTCGTAGCTTAGCTTGTCGCCAAGAAGGACGACACTCGACCTGATTAACAGCAGGAGG
AACACGAGCCAGATCCAAGAGATTGCCTAGTTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACTCCTAT
GGCTCGTGCCTTACCCGAATCATAGAGTGCCTCCATCGATTTCCATGTGTTAGGAATATC
TACAGGCAAAAGGTTCTCTGGACTCACTCCAACAGCACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCA
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CTCTGGTGCATCTTGAGGGTCATGA

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CC

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AGTTCTGTTTAGTGCCTCTGGTGCATCTTGAGGGTCATGATCAGTACACCAGAGCTTGGA
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CCCAATCTCTTTTTCGTTGCCATACAACTGAGCACAATCAATATGACGATAGCCGATCTT
AACAGCAGCTGCTACGGCATCACCAACAACGCCAGGAGAGGCCTGCCATGTTCCAAGACC
CACAGACGGGATCTTAGCACCGGTGTTGAGCTCGAAGAATCTGAGAGCGTTCGACATTGT
CAGAGATTTGGTGGTTATGAGTTTAAGATCGCTGGTTTTGGTTTGACGCACACAGCATTC
TTAAATGTGTTGGTGAGAAGTGAGAGCTACAGAGTAGCC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 4

CO CL2252Contig1 653 4 3 U
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GATATGATGTAACTGATAACTGTGGTTTGCCTATAAAATCAAATATTGTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AY66JQ C 1
AF RR4D655JQ C 48
AF RR4D655TF U 48
AF RR4AY66TF U 1
BS 1 49 RR4AY66TF
BS 50 644 RR4D655TF
BS 645 653 RR4AY66TF

RD RR4AY66JQ 653 0 0
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AAAGGAAAAAAGAATCGTAACAAGAAAGAATCAACATGGCGAGTTTATTAGATAAAGCAA
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TCGACCTTAAAGACGTGAACGGTGACTCCGTCGAGTACTTAGCCAAAGTGTCAGTCACCA
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TCGGGGATTTTACTATCCCTATTACCAGCAAGGGCGAAATCAAACTCCCTACTTTTAAAG
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GG
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GGACATGACGGTTCTTGATGTTCCGATGGTGGTACCGTATAGAATACTGCTCAACTTGGC
TCGAGACGTTGGTGCGGACTGGGACATTGACTATTTACTCGAAATAGGTCTCACCATTGA
TCTTCCTGTTGTCGGGGATTTTACTATCCCTATTACCAGCAAGGGCGAAATCAAACTCCC
TACTTTTAAAGACTTCTTCTGAATCAACTTTGCGCAATTGAAAAAAAAAATCAAATATCG
TTTGTAATGGTGATATGATGTAACTGATAACTGTGGTTTGCCTATAAAATCAAAT

QA 3 597 3 597
DS 

RD RR4D655TF 597 0 0
GG
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DS 

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TCGACCTTAAAGACGTGAACGGTGACTCCGTCGAGTACTTAGCCAAAGTGTCAGTCACCA
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GGGAAATTGGAAAGGGGAAGATACCGGACCCTGGTTCACTGAAAGCAAAGGACATGACGG
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DS 



AS 1 4

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GTTGACTTTAGTCAACGTTATCTATGTGGTTCGATCGCGACTTTAGTCAACGTTAATTCT
GTGGGGATGTACTTAGGGTTGTGTTGTATTACGTATGTTATTAGATTTGAACTTGTCTTA
AATCTGCTTGATTGGATCTTAGATTTTAGCGAAGATGACGACGAAGAGCTACCCAACTGT
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CGGAGCTAACAGTGGTATCCACATTGCTCTTAGGCTGTTGGAGCCCATCAGAGAGCAGTT
CCCTACCATCTCTTTCGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTGGTGGCTGTTGAGGTCAC
CGGTGGTCCTGAGATCCCTTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCGCAGCCACCACCAGA
GGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGATGTGACCACTTGAGGCAGGTGTTTATGAATCA
GATGGGTTTATCTGACATTGATATCGTCGCTTTATCTGGTGCCTACACTCTGGGAAGATG
CCACAGGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAA
CTCTTACTTCAAGGAGCTCTTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTCTTCTTCAGCTTGTCTCCGA
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AGAAGCGTTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCACACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGC
CGACGCTTAACCTGACATGTGTGTGGTGGCGGTCGGAGAGTTCGCATTACATTTGAACTT
CTTTCATTTGTTTGCTTAATGTACTCTTGGATTTGCGCAGCTTGTGTTTTTTTTGGGCGG
TGTTGTGATATTGATTCACATATGTTGCGCTTTTGGTGGTTAAAACATTCTAATAAACCA
GTTTCTCTCATTATAAACCGTCTGTTGCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AF85TF U 1
AF RR4EB75TF U 229
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G

QA 1 810 1 810
DS 

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DS 

RD RR4G149TF 711 0 0
G
GCATCAAGGACTGGTGGTCCTTTCGGAACGATGAGGTTTGATGCCGAGCAAGGTCACGGA
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GGTTTATCTGACATTGATATCGTCGCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCAC
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GCTTAACCTGACATGTGTGTGGTGGCGGTCGGAGAGTTCGCATTACATTTGAACTTCTTT
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GG

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR4EB75JQ 709 0 0
GC
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TGGCTGTTGAGGTCACCGGTGGTCCTGAGATCCCTTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGC
CGCAGCCACCACCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGATGTGACCACTTGAGGC
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CTCTTATTTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAGCTCTTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTCTTC
TTCAGCTTGTCTCCGACAAGGCTCTGTTGGATGATCCTGTGTTCCGTCCTCTTGTTGAGA
AATACGCTGCTGATGAAGAAGCGTTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCACACTTGAAGCTTT
CTGAGCTCGGGTTTGCCGACGCTTAACCTGACATGTGTGTGGTGGCGGTCGGAGAGTTCG
CATTACATTTGAACTTCTTTCATTTGTTTGCTTAATGTACTCTTGGATTTGCGTAGCTTG
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ACATTCTAATAAACCAGTTTCTCTCATTATAAACCGTCTGTTGCGCT

QA 3 709 3 709
DS 



AS 1 4

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TTATGGATTTGGAAACTCCGCCAATGTTGGATCCGCTGGAAACTTCCCTATTAGCCAACA
GTCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCTCAATACAAAGAGAGTAATCATCT
GTTGGCACTTCAACATCAGCAGCAACAGAACGAAAACTCGGCAATGTGGCATCACGGTCA
TGGCACTCGGACCATGTCAGGTGTCCCGGCTAACACATACTACAACCTCCAAGCACAACA
ACAACAGCAACTACAACAGACTCAGCAAGCTGCGGCAGGAGGGTATCGTCAAGCTCAGCA
GCAGCAACAACAGCGTTATGGATCACATGGCTACCCTAATTTCTATCAGTCCCAAATGTC
GCTCGAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGAGATGGTGCGGGAGCTCAGGTTGGTCTGCCCTC
AGATCAAACCCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTACTAAATGAAGAAAGGAGTGTGTTCTTC
TTTCGGTTATAGAGTGGGTTTTGTGTGGTGAGGCATGGATATGTTCTGAATGTATGTTAT
ATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACTTAGGTAACAGGCAATTCTGATTTCATCGA
TGCAAAACTTAT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BA12JQ C 1
AF RR4BB90JQ C 1
AF RR4BA12TF U 1
AF RR4BB90TF U 1
BS 1 672 RR4BA12TF

RD RR4BA12JQ 672 0 0
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TTATGGATTTGGAAACTCCGCCAATGTTGGATCCGCTGGAAACTTCCCTATTAGCCAACA
GTCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCTCAATACAAAGAGAGTAATCATCT
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ATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACTTAGGTAACAGGCAATTCTGATTTCATCGA
TGCAAAACTTAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BB90JQ 672 0 0
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TTATGGATTTGGAAACTCCGCCAATGTTGGATCCGCTGGAAACTTCCCTATTAGCCAACA
GTCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCTCAATACAAAGAGAGTAATCATCT
GTTGGCACTTCAACATCAGCAGCAACAGAACGAAAACTCGGCAATGTGGCATCACGGTCA
TGGCACTCGGACCATGTCAGGTGTCCCGGCTAACACATACTACAACCTCCAAGCACAACA
ACAACAGCAACTACAACAGACTCAGCAAGCTGCGGCAGGAGGGTATCGTCAAGCTCAGCA
GCAGCAACAACAGCGTTATGGATCACATGGCTACCCTAATTTCTATCAGTCCCAAATGTC
GCTCGAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGAGATGGTGCGGGAGCTCAGGTTGGTCTGCCCTC
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ATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACTTAGGTAACAGGCAATTCTGATTTCATCGA
TGCAAAACTTAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BA12TF 672 0 0
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ATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACTTAGGTAACAGGCAATTCTGATTTCATCGA
TGCAAAACTTAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BB90TF 672 0 0
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GTCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCTCAATACAAAGAGAGTAATCATCT
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ACAACAGCAACTACAACAGACTCAGCAAGCTGCGGCAGGAGGGTATCGTCAAGCTCAGCA
GCAGCAACAACAGCGTTATGGATCACATGGCTACCCTAATTTCTATCAGTCCCAAATGTC
GCTCGAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGAGATGGTGCGGGAGCTCAGGTTGGTCTGCCCTC
AGATCAAACCCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTACTAAATGAAGAAAGGAGTGTGTTCTTC
TTTCGGTTATAGAGTGGGTTTTGTGTGGTGAGGCATGGATATGTTCTGAATGTATGTTAT
ATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACTTAGGTAACAGGCAATTCTGATTTCATCGA
TGCAAAACTTAT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 4

CO CL2255Contig1 760 4 10 U
CACCCATCAGAAACTATGAAATTGCATGAGAAGACAATAAAATTCAGATATTCCCAACAC
TAACAAACAAAAAGCTAGAGAGAATCGAAAAACATTCTCAAGAGCCTTTAAACATAATAA
ACTAAAAAAAACAAACCCAAAGAAAGAGTTTACAAGCCTATTCTTGAGACAAATGAAAAG
AAGCAATCACAAGCGATATGGACGTAAGTTCACGGCAGCTTCAGTCCGGTAAGACATCTA
AAAGTTGTATCAACCACGGCCTCGACCTCCAACTTTGTTTCCACCCATCTTTCCAACTGA
GCC*ACCACGGCCTCGGCCTCTGGCAGCTCCATCGTCAATACCACGTCCCATGCCCTTTG
GACCTTCTCTTCCTCTTCCTCGTCCAACCCCTGGTGGTTTTCTATCTGTGCGGGTCTTCT
CTTCCTGTACTTTATCAATCACCTCATCTGGAACACGGAGGTACTTGATGGTGTTGCCAC
GGATATAGCATTCAGGCATTCGCCAAAACCTGTCTCCATCCTTTGAAGTACAGATGACTT
CACGGAGATGAATGTTCATCCATGTATCACAATTCACCAAGTGCCCATTATACGTCTCCC
CATTCTTCAGCTCTACAAGCATGGGATGACCTTGAGCAGTCTTGAGCAGCGAAAGAGGAA
GCATCTTCTCGAATCTAGGAAAATTGGAGATTTCAGCACGATCTGACTTCGTATTCCAGA
AACGAAGAGAGAGAGTGAGGAAGAAGAGAGAAGGGATCCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E630TF C 40
AF RR4D410JQ U 2
AF RR4E630JQ U 1
AF RR4D410TF C 2
BS 1 106 RR4E630JQ
BS 107 107 RR4D410JQ
BS 108 130 RR4E630JQ
BS 131 131 RR4D410JQ
BS 132 190 RR4E630JQ
BS 191 191 RR4D410JQ
BS 192 580 RR4E630JQ
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BS 582 753 RR4E630JQ
BS 754 760 RR4D410TF

RD RR4E630TF 320 0 0
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TCCACCCATCTTTCCAACTGAGCCCACCACGGCCTCGGCCTCTGGCAGCTCCATCGTCAA
TACCACGTCCCATGCCCTTT

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR4D410JQ 678 0 0
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AGCAATCACAAGCGATATGGACGTAAGTTCACGGCAGCTTCAGTCCGGTAAGACATCTAA
AAGTTGTATCAACCACGGCCTCGACCTCCAACTTTGTTTCCACCCATCTTTCCAACTGAG
CC*ACCACGGCCTCGGCCTCTGGCAGCTCCATCGTCAATACCACGTCCCATGCCCTTTGG
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ACGGAGATGAATGTTCATCCATGTATCACAATTCACCAAGTGCCCATTATACGTCTCCCC
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CATCTTCTCGAATCTAGG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4E630JQ 755 0 0
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ACTAAAAAAA*CAAACCCAAAGAAAGAGTTTACAAGCCTATTCTTGAGACAAATGAAAAG
AAGCAATCACGAGCGATATGGACGTAAGTTCACGGCAGCTTCAGTCCGGTAAGACATCTA
AAAGTTGTATCAACCACGGCCTCGACCTCCAACTTTGTTTCCACCCATCTTTCCAACTGA
GCC*ACCACGGCCTCGGCCTCTGGCAGCTCCATCGTCAATACCACGTCCCATGCCCTTTG
GACCTTCTCTTCCTCTTCCTCGTCCAACCCCTGGTGGTTTTCTATCTGTGCGGGTCTTCT
CTTCCTGTACTTTATCAATCACCTCATCTGGAACACGGAGGTACTTGATGGTGTTGCCAC
GGATATAGCATTCAGGCATTCGCCAAAACCTGTCTCCATCCTTTGAAGTACAGATGACTT
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CATTCTTCAGCTCTACAAGCATGGGATGACCTTGAGCAGTCTTGAGCAGCGAAAGAGGAA
GCATCTTCTCGAATCTAGGAAAATTGGAGATTTCAGCACGATCTGACTTCGTATTCCAGA
AACGAAGAGAGAGAGTGAGGAAGAAGAGAGAAG
CC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4D410TF 759 0 0
ACCCATCAGAAACTATGAAATTGCATGAGAAGACAATAAAATTCAGATATTCCCAACACT
AACAAACAAAAAGCTAGAGAGAATCGAAAAACATTCTCAAGAGCCTTTAAACATAATAAA
CTAAAAAAAACAAACCCAAAGAAAGAGTTTACAAGCCTATTCTTGAGACAAATGCAAAGA
AGCAATCACAAGCGATATGGACGTAAGTTCACGGCAGCTTCAGTCCGGTAAGACATCTAA
AAGTTGTATCAACCACGGCCTCGACCTCCAACTTTGTTTCCACCCATCTTTCCAACTGAG
CC*ACCACGGCCTCGGCCTCTGGCAGCTCCATCGTCAATACCACGTCCCATGCCCTTTGG
ACCTTCTCTTCCTCTTCCTCGTCCAACCCCTGGTGGTTTTCTATCTGTGCGGGTCTTCTC
TTCCTGTACTTTATCAATCACCTCATCTGGAACACGGAGGTACTTGATGGTGTTGCCACG
GATATAGCATTCAGGCATTCGCCAAAACCTGTCTCCATCCTTTGAAGTACAGATGACTTC
ACGGAGATGAATGTTCATCCATGTATCACAATTCACCAAGTGCCCATTATACGTCTCCCC
ATTCTTCAGCTCTACAAGCATGGGATGACCTTGAGCAGTCTTGAGCAGCGAAAGAGGAAG
CATCTTCTCGAATCTAGGAAAATTGGAGATTTCAGCACGATCTGACTTCGTATTCCAGAA
ACGAAGAGAGAGAGTGAGGAAGAAGAGAGAAGGGATCCC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 4

CO CL2256Contig1 666 2 1 U
GAAGTGATGCAGCTGCAGTTGCCAGCGCCAAAGCTGCAGAGATATATGGGTTGAACATAG
TTGCTGAAGATATCCAGGATGACACTGATAATGTGACAAGGTTTCTTATGCTCGCAAGGG
AACCCATTATCCCTGGAACTAACAGACTTTTCAAGACAAGTATAGTTTTCTCGTTAGAGG
AAGGGCCTGGAGTACTTTTCAAAGCACTTGCTGTGTTTGCCCTTAGGCAAATTAACCTCA
CAAAGATCGAAAGTCGCCCTTTAAGGCAAAACCCTCTTCGAGCATCTGGAGGGCTTAAAT
ACTTTGATTATCTTTTCTATGTGGACTTCGAAGCATCTATGGCTGATGAAGTTGCTCAAA
ATGCACTTCGGCATCTCGAGGAATTTGCTACCTTTTTGCGGGTACTGGGAAGCTACCCAG
TGGACACGACAATGCTCTAAGCATCTCCAATATGTTCGTGGCAGATGCAGAGGGTGTAGG
AGCCTAGCGCATAAGGTGAGCTCCGAGGGGTCACCGGTGCACATTACAAGAGATTCCTCT
TTTGTCTTCTTATTTTCTATAAAGTTTATCTTCAAAAATTTCTGATTCTCTTTTGCATCA
ACTCGTGTCTTGTTGAAAAGATAAAAGCTTTTGTTTTAGTAGAAGTAAAGAATAGTGAGG
TATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4G996TF U 1
AF RR4G996JQ C 178
BS 1 666 RR4G996TF

RD RR4G996TF 666 0 0
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AAGGGCCTGGAGTACTTTTCAAAGCACTTGCTGTGTTTGCCCTTAGGCAAATTAACCTCA
CAAAGATCGAAAGTCGCCCTTTAAGGCAAAACCCTCTTCGAGCATCTGGAGGGCTTAAAT
ACTTTGATTATCTTTTCTATGTGGACTTCGAAGCATCTATGGCTGATGAAGTTGCTCAAA
ATGCACTTCGGCATCTCGAGGAATTTGCTACCTTTTTGCGGGTACTGGGAAGCTACCCAG
TGGACACGACAATGCTCTAAGCATCTCCAATATGTTCGTGGCAGATGCAGAGGGTGTAGG
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TTTGTCTTCTTATTTTCTATAAAGTTTATCTTCAAAAATTTCTGATTCTCTTTTGCATCA
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TATCAG

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DS 

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AAAATGCACTTCGGCATCTCGAGGAATTTGCTACCTTTTTGCGGGTACTGGGAAGCTACC
CAGTGGACACGACAATGCTCTAAGCATCTCCAATATGTTCGTGGCAGATGCAGAGGGTGT
AGGAGCCTAGCGCATAAGGTGAGCTCCGAGGGGTCACCGGTGCACATTACAAGAGATTCC
TCTTTTGTCTTCTTATTTTCTATAAAGTTTATCTTCAAAAATTTCTGATTCTCTTTTGCA
TCAACTCGTGTCTTGTTGAAAAGATAAAAGCTTTTGTTTTAGTAGAAGTAAAGAATAGTG
AGGTATCAG

QA 1 489 1 489
DS 



CO CL2256Contig2 715 2 4 U
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AAGGTTTCTTATGCTCGCAAGGGAACCCATTATCCCTGGAACTAACAGACTTTTCAAGAC
AAGTATAGTTTTCTCGTTAGAGGAAGGGCCTGGAGTACTTTTCAAAGCACTTGCTGTGTT
TGCCCTTAGGCAAATTAACCTCACAAAGATCGAAAGTCGCCCTTTAAGGCAAAACCCTCT
TCGAGCATCTGGAGGGCTTAAATACTTTGATTATCTTTTCTATGTGGACTTCGAAGCATC
TATGGCTGATGAAGTTGCTCAAAATGCACCTCGGCATCTCGAGGAATTTGCTACCTTTTT
GCGGGTACTGGGAAGCTACCCAGTGGACACGACAATGCTCTAAGCATCTCCAATATGTTC
GTGGTAACTAAGCAGATGCAGAGGGTGTAGGAGCCTAGTGCATAAGGTGAGCTCCGAGGG
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CTTCAAAAATTTCTGATTCTCTTTTGCATCAACTCGTGTCTTGTTGAAAAGATAAAAGCT
TTTGTTTTAGTAGAAGTAAAGAATAGTGAGGTATCAGAAAACAGAAGGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GU51TF U 1
AF RR4GU51JQ C 131
BS 1 649 RR4GU51TF
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RD RR4GU51TF 684 0 0
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AAGGTTTCTTATGCTCGCAAGGGAACCCATTATCCCTGGAACTAACAGACTTTTCAAGAC
AAGTATAGTTTTCTCGTTAGAGGAAGGGCCTGGAGTACTTTTCAAAGCACTTGCTGTGTT
TGCCCTTAGGCAAATTAACCTCACAAAGATCGAAAGTCGCCCTTTAAGGCAAAACCCTCT
TCGAGCATCTGGAGGGCTTAAATACTTTGATTATCTTTTCTATGTGGACTTCGAAGCATC
TATGGCTGATGAAGTTGCTCAAAATGCACCTCGGCATCTCGAGGAATTTGCTACCTTTTT
GCGGGTACTGGGAAGCTACCCAGTGGACACGACAATGCTCTAAGCATCTCCAATATGTTC
GTGGTAACTAAGCAGATGCAGAGGGTGTAGGAGCCTAGTGCATAAGGTGAGCTCCGAGGG
GTCACCGGTGCACATTACAAGAGGTTCCTCTTTTGTCTTCTTATTTTCTATAAAGTTTAT
CTTCAAAAATTTCTGATTCTCTTTTGCATCAACTCGTGTCTTGTTGAAA*GATAAAAGCT
TTTGTTTTAGTAGAAGTAA
GAATA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4GU51JQ 585 0 0
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TTCTCGTTAGAGGAAGGGCCTGGAGTACTTTTCAAAGCACTTGCTGTGTTTGCCCTTAGG
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GGAGGGCTTAAATACTTTGATTATCTTTTCTATGTGGACTTCGAAGCATCTATGGCTGAT
GAAGTTGCTCAAAATGCACCTCGGCATCTCGAGGAATTTGCTACCTTTTTGCGGGTACTG
GGAAGCTACCCAGTGGACACGACAATGCTCTAAGCATCTCCAATATGTTCGTGGTAACTA
AGCAGATGCAGAGGGTGTAGGAGCCTAGTGCATAAGGTGAGCTCCGAGGGGTCACCGGTG
CACATTACAAGAGGTTCCTCTTTTGTCTTCTTATTTTCTATAAAGTTTATCTTCAAAAAT
TTCTGATTCTCTTTTGCATCAACTCGTGTCTTGTTGAAAAGATAAAAGCTTTTGTTTTAG
TAGAAGTAAAGAATAGTGAGGTATCAGAAAACAGAAGGAAAAAAA

QA 1 585 1 585
DS 



AS 2 4

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TTTAAAATCGAACTATCTCCCACTACGTAACTATTCATATCAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CV59JQ U 1
AF RR4CW43JQ U 256
BS 1 371 RR4CV59JQ
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RD RR4CV59JQ 466 0 0
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TAAAAGGCAAAAAATGATATTTTTGTTTATTGGACATAAAAAAGCTAGCAGTAAAAAAAA
AACGAAGCTTTGCCCTTATTCTGCCACAAATATTGTTTCTTAAACTTTGCAGTCAAAAGG
ATTGCTGCTAATCATATAACATTTCATTGATCAAGCAAAAAACATGCTCACTTGGGAAGG
CCAGTTTCTGGATCGAAAAAAGCTTGAGTTTGGTCGGGAAGCACGACAGGACCTCTTCCA
GGTTTAGTGCAAATAAAATAACTGACTTCCCCTTTTTGATCCTGTGATCCAATGTTGTCT
TTTATTTCAGGTGGAGGTTGCAAATTCTCTACACTGTTTGCTCCATCTAATCCTGCCTCC
TTTAGAATCGAACTATCTCCCACTACGTAACTATTCATATCAGTGT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4CW43JQ 210 0 0
AAAAAAA
CTTGAGTTTGGTCGGGAAGCACGACAGGACCTCTTCCAGGTTTAGTGCAAATAAAATAAC
TGACTTCCCCTTTTTGATCCTGTGATCCAATGTTGTCTTTTATTTCAGGGGGAGGTTGCA
AATTCTCTACACTGTTTGCTCCATCTAATCCTGCCTCCTTTAAAATCGAACTATCTCCCA
CTACGTAACTATTCATATCAGTG

QA 8 210 8 210
DS 



CO CL2257Contig2 661 2 6 U
GCACCCATATTTTACATGAATGACACCTCCCACAGAATAATTAGCTTGGTTGAAAAATGG
AATCGTTCTGAAGGCACACCACAGGTTGCTTACACATTTGATGCTGGCCCAAATGCTGTA
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CCCCCTAAGTCTGACACTGATATGAATAGTTACGTAGTGGGAGATAGTTCGATTCTAAAG
GAGGCAGGATTAGATGGAGCAAACAGTGTAGAGAATCTGCAACCTCCACCTGAAATAAAA
GACAACATTGGATCACAGGATCAAAAAGGCGAAGTCAGTTATTTTATCTGCACTAAACCT
GGAAGAGGGTCCTGTCGTGCTTCCCGACCAAACTCAAGCTCTTTCTCGATCCAGAAACTG
GCCTTCCCAAGTGAGCATGTTCTCTGCTTGATCAATGAAATGTTATATGATTAGCAGCAA
TCCTTTTGACTGCAAAGTTTAAGAAACAATATTTGTGGCAGAATAAGGGCAAAGCTTCGT
TTTTTCTCTACTGCTAGCTTTCTTATGTCCAATAAACAAAAATATCATCTTTTGCCTTTT
ACGTGAGTACATCTTCGTGCAACACTGCAACATATACCAAATATTGATATGCCTTGAATC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RR4CW43TF U 1
AF RR4CV59TF U 55
BS 1 368 RR4CW43TF
BS 369 369 RR4CV59TF
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BS 405 659 RR4CW43TF
BS 660 661 RR4CV59TF

RD RR4CW43TF 661 0 0
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CTGATTGCACGCAACAGAAAGGTAGCAGTTCAATTGCTCCAAGGGCTTCTCTACTATTTT
CCCCCTAAGTCTGACACTGATATGAATAGTTACGTAGTGGGAGATAGTTCGATTCTAAAG
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GACAACATTGGATCACAGGATCAAAAAGGCGAAGTCAGTTATTTTATCTGCACTAAACCT
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TTTTTCTCTACTGCTAGCTTTCTTATGTCCAATAAACAAAAATATCATCTTTTGCCTTTT
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CT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4CV59TF 607 0 0
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GCTGTACTGATTGCACGCAACAGAAAGGTAGCAGTTCAATTGCTCCAAGGGCTTCTCTAC
TATTTTCCCCCTAAGTCTGACACTGATATGAATAGTTACGTAGTGGGAGATAGTTCGATT
CTAAAGGAGGCAGGATTAGATGGAGCAAACAGTGTAGAGAATCTGCAACCTCCACCTGAA
ATAAAAGACAACATTGGATCACAGGATCAAAAAGGCGAAGTCAGTTATTTTATCTGCACT
AAACCTGGAAGAGGGTCCTGTCGTGCTTCCCGACCAAACTCAAGCTCTTTCTCGATCCAG
AAACTGGCCTTCCCAAGTGAGCATGTTCTCTGCTTGATCAATGAAATGTTATATGATTAG
CAGCAATCCTTTTGACTGCAAAGTTTAAGAAACAATATTTGTGGCAGAATAAGGGCAAAG
CTTCGTTTTTTCTCTACTGCTAGCTTTCTTATGTCCAATAAACAAAAATATCATCTTTTG
CCTTTTACGTGAGTACATCTTCGTGCAACACTGCAACATATACCAAATATTGATATGCCT
TGAATCT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

CO CL2258Contig1 1307 4 3 U
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AATTTCCAGCTCCCTTGTTAATGAATACCATTCACTTTTCTATTCAAGCGGTTTTATCAA
AGATGATAACTTGGTACTGGTCAGGAAGATTTCAACCTGATGTTCCCATATCATGGAGAG
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ATGAGTCACTGGTCTTCATATCGGTTACTTTTGCAACAATGTGCAAATCTGCAGCCCCAA
TATTTCTTCTTCTGTTTGCTTTTGCCTTCAGGTTGGAGTCTCCAAGCCTGAAGCTTTTTG
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AGTTTTGGGGCTTCGTTTTTGTCATGCTCGCTGTTGTCATGTCTGGTTTCCGTTGGTGTA
TGACCCAAGTTCTTTTGCAGAAAGAAACCTATGGCCTAAAAAATCCCTTCACATTTATGA
GTTACGTGGCACCAGTGATGGCTATAGTGACTGGTCTTCTTTCTCTCCTTCTGGATCCAT
GGAGTGAATTTAGAGACAACATATACTTTGATAGTGGAGCGCATTTTACTCGAACTTGTT
TCTTGATGCTTTTTTGGTGGAGCATTGGCTTTTTGCATGGTTTTAACTGAGTATATTCTT
GTTTCGGTTACTAGTGCTGTAACCGTCACAATAGCGGGGGTCGTTAAAGAGGCTGTCACC
ATAGTGGTTGCAGTGTTTTACTTCCATGACGAATTTACATGGCTAAAAGGTTTTGGTCTG
ATGATCATCATGGTTGGTGTCAGTTTGTTCAACTGGTACAAATATGAGAAACTACAAAAG
GGGCACAAAACAGAAGATGAGAAGCAGCTACAAGCTCCAAGTCAAACTGGAAAATATGTG
ATACTCGATGAGACGGATGATCAAGAAAATGGTCCGTAAGCATTATTTTTGTGTGTTGGC
CCTTACACCGTTCTCAGGTAACTCGTTTATATTGGGACATCATTGTATGTGGACCTTCCT
TGAGAAAACACTATAACACTTGAGAAATTTTGATGTTTCCTTGCCTTCAAAAGAGATGAG
AAGAACACAAGCCATTTTGAAGAGTTTAAATAAAATTTTCCCACTCT


BQ
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AF RR4A375TF U 596
AF RR4A375TFB U 1
AF RR4A375JQ C 497
AF RR4A375JQD C 497
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BS 869 1264 RR4A375JQ
BS 1265 1307 RR4A375JQD

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TCCATGGAGTGAATTTAGAGACAACATATACTTTGATAGTGGAGCGCATTT*ACTCGAAC
TTGTTTCTTGATGCTTTTTTG

QA 1 201 1 201
DS 

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ATACTTTCAGCACATTTTTGACTCTGTACAACAAAACTCTCTTAGGAGATGATTTGGGGA
AATTTCCAGCTCCCTTGTTAATGAATACCATTCACTTTTCTATTCAAGCGGTTTTATCAA
AGATGATAACTTGGTACTGGTCAGGAAGATTTCAACCTGATGTTCCCATATCATGGAGAG
ACTATTTCCTTAGAGTTGTACCAACAGCACTTGCAACTGCTTTGGATATAAACCTAAGTA
ATGAGTCACTGGTCTTCATATCGGTTACTTTTGCAACAATGTGCAAATCTGCAGCCCCAA
TATTTCTTCTTCTGTTTGCTTTTGCCTTCAGGTTGGAGTCTCCAAGCCTGAAGCTTTTTG
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AGTTTTGGGGCTTCGTTTTTGTCATGCTCGCTGTTGTCATGTCTGGTTTCCGTTGGTGTA
TGACCCAAGTTCTTTTGCAGAAAGAAACCTATGGCCTAAAAAATCCCTTCACATTTATGA
GTTACGTGGCACCAGTGATGGCTATAGTGACTGGTCTTCTTTCTCTCCTTCTGGATCCAT
GGAGTGAATTTAGAGACAACATATACTTTGATAGTGGAGCGCATTTTACTCGAACTTGTT
TCTTGATGCTTTTTTGGTGGAGCATTGGCTTTTTGCATGGTTTTAACTGAGTATATTCTT
GTTTCGGTTACTAGTGCTGTAACCGTCA

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR4A375JQ 768 0 0
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TTTTGTCATGCTCGCTGTTGTCATGTCTGGTTTCCGTTGGTGTATGACCCAAGTTCTTTT
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GTGGAGCATTGGCTTTTTGCATGGTTTTAACTGAGTATATTCTTGTTTCGGTTACTAGTG
CTGTAACCGTCACAATAGCGGGGGTCGTTAAAGAGGCTGTCACCATAGTGGTTGCAGTGT
TTTACTTCCATGACGAATTTACATGGCTAAAAGGTTTTGGTCTGATGATCATCATGGTTG
GTGTCAGTTTGTTCAACTGGTACAAATATGAGAAACTACAAAAGGGGCACAAAACAGAAG
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DS 

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GCAGAAAGAAACCTATGGCCTAAAAAATCCCTTCACATTTATGAGTTACGTGGCACCAGT
GATGGCTATAGTGACTGGTCTTCTTTCTCTCCTTCTGGATCCATGGAGTGAATTTAGAGA
CAACATATACTTTGATAGTGGAGCGCATTTTACTCGAACTTGTTTCTTGATGCTTTTTTG
GTGGAGCATTGGCTTTTTGCATGGTTTTAACTGAGTATATTCTTGTTTCGGTTACTAGTG
CTGTAACCGTCACAATAGCGGGGGTCGTTAAAGAGGCTGTCACCATAGTGGTTGCAGTGT
TTTACTTCCATGACGAATTTACATGGCTAAAAGGTTTTGGTCTGATGATCATCATGGTTG
GTGTCAGTTTGTTCAACTGGTACAAATATGAGAAACTACAAAAGGGGCACAAAACAGAAG
ATGAGAAGCAGCTACAAGCTCCAAGTCAAACTGGAAAATATGTGATACTCGATGAGACGG
ATGATCAAGAAAATGGTCCGTAAGCATTATTTTTGTGTGTTGGCCCTTACACCGTTCTCA
GGTAACTCGTTTATATTGGGACATCATTGTATGTGGACCTTCCTTGAGAAAACACTATAA
CACTTGAGAAATTTTGATGTTTCCTTGCCTTCAAAAGAGATGAGAAGAACACAAGCCATT
TTGAAGAGTTTAAATAAAATTTTCCCACTCT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 3

CO CL2259Contig1 955 3 3 U
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TATCATTTAAACTTTTATTATGAGCATTTTTATGCAATAATTAAAGAAACTAGAGCGCGA
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GGCTGCGTCAAAGACGTCGAAACAGTTAACCCAAACAGTGCCAGCTTTCAAAGCCCTGGA
CACTCTATTTGCAGTGTCCAGACTCTTTGTGAAAACCCCTGCGGCTAGCCCGTACCTCGT
CTCGTTAGCCCTCCTTATCACCTCATCCACATCCCTGAACTTCAAGATTGATTGGACCGG
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TTGGATGAAGTAACCTTTGTTACCAATCTGATCACCACCACATTCAAGAGTAGCATTGCT
TTCAACACCTGACCTTATGTACCTCATCACTTTCTCGAATTGCTTCGAATCAATCTGAGG
ACCCTGTTCAATGCCTTTCTTGAAAGGATCACCAACCACACGTTTCAATGCGCGTGCCTT
TGCTTTCTCAACAAACTCATCGTACACTTTCTCGTGAACATATGTCCGAGACCCAGCGCA
GCAACATTGCCCCTGGTTAAAGAAGAGAGCAAAGTGTGCAAGCTCTACAGCTTTATTGAT
ATCTGCATCTTCGAATACGATGAATGGTGATTTCCCTCCAAGTTCTAGTGTCACTGGCTT
GAGATTGCTGTTAGCAGCTAGACCCAGTACAACTTTGCCCGTATCAGTTGATCCTGTGAA
AGCAAGCTTGTCTACATCCATGTGACTCGCGAGGGAAGCACCTGCGGTTGGACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A573JQ U 1
AF RR4AL57JQ U 1
AF RR4A573TF C 170
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TGCTTT

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DS 

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CACTCTATTTGCAGTGTCCAGACTCTTTGTGAAAACCCCTGCGGCTAGCCCGTACCTCGT
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ACCCTGTTCAATGCCTTTCTTGAAAGGATCACCAACCACACGTTTCAATGCGCGTGCCTT
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DS 

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GACCCAGCGCAGCAACATTGCCCCTGGTTAAAGAAGAGAGCAAAGTGTGCAAGCTCTACA
GCTTTATTGATATCTGCATCTTCGAATACGATGAATGGTGATTTCCCTCCAAGTTCTAGT
GTCACTGGCTTGAGATTGCTGTTAGCAGCTAGACCCAGTACAACTTTGCCCGTATCAGTT
GATCCTGTGAAAGCAAGCTTGTCTACATCCATGTGACTCGCGAGGGAAGCACCTGCGGTT
GGACCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 4

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TCAATTACAGCTCTATCGTAACGGTCAGAATCACCCTAACCCTCATAATATGATGATTCA
CGAGATTGGTGAGAAGCAAGAAGATCTCACGTCGCTTGATTTGGGAATGGGACTTCCGGT
TAACACTAACCAAGGCAATACCATACCGTTTTTCAGTCCGGTTTCTGAAACACAGCAGCT
ACAACAACCTCAGCATATGTCTTATTGTAGTGAGGTTAATAACAACCATGACTACAATCC
CACTCCAGACTCATGTAAGGAAGTTAATAATCATAGTAACACTTCTTTGGCTTGGGTCAG
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AGCGAGACGAAGAACAATAACAGTGTGATGGCTATACAGTCTCAACTTGTTAATCTTCAG
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TTCCTCGAAATCATCGATGAGAGTCAATCTTTCACGGAAACGAAAGAAGTGTACGCTTCA
AGCTCTGGTGAATCTTCGAAGGAACCTATAGATGAAATAGGGGAGAAGGAGTTAAGGAGG
GCGGCAACTTGCTTTAGTCTCACGAGTGTGAATTGATACTCAATGTTGATCATGGGGACT
AATCTTTTTCTTCTTCAAATTTTGATTTGTCTTAATTGTGTTTTCAGTTATTATTGATCC
CAACGCCTTGTTTAAGCGTTGAACCTTTATTTCTAATAATTTTTGAATGTTTATTTATCA
TTGCTTCTTATGTTTTTTTTTCAATATTTATATTTGTCATTTAAATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 5 5 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4D677TF U 1
AF RR4D868TF U 1
AF RR4D868JQ C 180
AF RR4D677JQ C 508
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ACAACAACCTCAGCATATGTCTTATTGTAGTGAGGTTAATAACAACCATGACTACAATCC
CACTCCAGACTCATGTAAGGAAGTTAATAATCATAGTAACACTTCTTTGGCTTGGGTCAG
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ATCAACA

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TAGAAGCATCGTCAAAATACTCGAGAACCTCGACGAAGTTCAGAGACCAGAAGCCATGAA
ATCTATTATATTTCAGTCTTACGTCCGAGATCGTAACCCTGTCCACGGTTGCCTTGGAAT
CACGCAACAGCTTCAATACATGATATGGGTCGCCGAGGAAGAGCTCAAAGCCGTGAACTC
TCAATTACAGCTCTATCGTAACGGTCAGAATCACCCTAACCCTCATAATATGATGATTCA
CGAGATTGGTGAGAAGCAAGAAGATCTCACGTCGCTTGATTTGGGAATGGGACTTCCGGT
TAACACTAACCAAGGCAATACCATACCGTTTTTCAGTCCGGTTTCTGAAACACAGCAGCT
ACAACAACCTCAGCATATGTCTTATTGTAGTGAGGTTAATAACAACCATGACTACAATCC
CACTCCAGACTCATGTAAGGAAGTTAATAATCATAGTAACACTTCTTTGGCTTGGGTCAG
AATCAATTTCCTTATAATCATCATCATAACTATGGATTCATGAATCAAAACGAGCATTGT
AGCGAGACGAAGA*CAATAACAGTGTGATGGCTATACAGTCTCAACTTGTTAATCTTCAG
ATGGCATCGA*TCA**CAGAAGAAGAAGTTGATGTTCACAACTATGATGAAATCCATCA

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CTCAATTACAGCTCTATCGTAACGGTCAGAATCACC*TAACCCTCATAATATGATGAT*C
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TTAACACTAACCAAGGCAATACCATACCGTTTTTCAGTCCGGTTTCTGAAACACAGCAGC
TACAACAACCTCAGCATATGTCTTATTGTAGTGAGGTTAATAACAACCATGACTACAATC
CCACTCCAGACTCATGTAAGGAAGTTAATAATCATAGTAACACTTCTTTGGCTTGGGTCA
GAATCAATTTCCTTATAATCATCATCATAACTATGGATTCATGAATCAAAACGAGCATTG
TAGCGAGACGAAGAACAATAACAGTGTGATGGCTATACAGTCTCAACTTGTTAATCTTCA
GATGGCATCGAATCAACAAGAGGAAGAAGTTGATGTTCACAACTATGATGAAATCCATCA
GTTCCTCGAAATCATCGATGAGAGTCAATCTTTCACGGAAACGAAAGAAGTGTACGCTTC
AAGCTCTGGTGAATCTTCGAAGGAACCTATAGATGAAATAGGGGAGAAGGAGTTAAGGAG
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TAATCTTTTTCTTCTTCAAATTTTGATTTGTCTTAATTGTGTTTTCAGTTATTATTGATC
CCAACGCCTTGTTTAAGCGTTGAACCTTTATTTCTAATAATTTTTGAATGTTTATTTATC
ATTGCTTCTTATGTTTTTTTTTCAATATTTATATTTGTCATTTAAATT

QA 1 888 1 888
DS 

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TAATCATAGTAACACTTCTTTGGCTTGGGTCAGAATCAATTTCCTTATAATCATCATCAT
AACTATGGATTCATGAATCAAAACGAGCATTGTAGCGAGACGAAGAACAATAACAGTGTG
ATGGCTATACAGTCTCAACTTGTTAATCTTCAGATGGCATCGAATCAACAAGAGGAAGAA
GTTGATGTTCACAACTATGATGAAATCCATCAGTTCCTCGAAATCATCGATGAGAGTCAA
TCTTTCACGGAAACGAAAGAAGTGTACGCTTCAAGCTCTGGTGAATCTTCGAAGGAACCT
ATAGATGAAATAGGGGAGAAGGAGTTAAGGAGGGCGGCAACTTGCTTTAGTCTCACGAGT
GTGAATTGATACTCAATGTTGATCATGGGGACTAATCTTTTTCTTCTTCAAATTTTGATT
TGTCTTAATTGTGTTTTCAGTTATTATTGATCCCAACGCCTTGTTTAAGCGTTGAACCTT
TATTTCTAATAATTTTTGAATGTTTATTTATCATTGCTTCTTATGTTTTTTTTTCAATAT
TTATATTTGTCATTTAAATT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 4

CO CL2261Contig1 1303 4 6 U
GGAACATAACTATCTTTTCCATTTCTAGTTACTCTCTTCAATGTCATAAATAATCCAGTA
GTTCCATATTCAGCTAACAAAGCTTAAGAAGAAGAGCTTCAAGAGGAAGCACTCAATACA
CTACAATCAGAGCTCGAGAGAGAAAAAAGAGAGAAATGATGTGTAGCTTGAAAATGGTCT
CTCCACGGCCTCCAACGAATATATTCAGGAGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGCAGATAACAG
CGAATGGAGATGGGTTTCCAACATTTCTTCCGAAGGAGGTAAAAGACATAAAAGATCCAT
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TTAGAGGCTGTGTAATGAGTAGCTGTATCAAACCAAATGTTCAATCACCCGACAAAAGTC
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TGCTTGAGCAAGCTTGTCTTGAGACTTGGGCTATTGATGTTCTTGGTTGGGGCTTCTCCG
ATCTACAGAAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCTAAGCGACAGCATCTATTCGAGCTTT
GGAAAACATATATTAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGAGCAACAGTAG
CTGTTGATCTCACTGCTACTTACCCTGAAGCTGTTGATAGATTAGTTCTCATTAATGGAA
TGCGTATTCAGAAGGAACAGGTGCTCTTAAAGATTTACCAAAATCAATTGCTTACGCTGG
GGTTAAGTTGTTGAAGTCATTTCCTCTTCGCCTTTTGGCCAACGTGTTAGCCTTTTCATC
CCCCCTGTCAGAGAATATAGATTGGACTAATATTGGCCGGCTACATTGTCAAATGCCGTG
GTGGGAAGATGCGATGGTCAACTTTATGATTAGCGGAGGCTATAATGTTGCATCACATAT
CAAACTCATCAACCACAAGACGCTCATCGTATGCAGTGAGAATGATCAGATTGTTAGCAA
CCAACTTTCAGTTAAATTGTTGTGTGAGCTACAAAATGCGGTTTTCCGGGAAGTACCAGA
TTCCGGTCATCTTCCACATGTTGAGAGCCCTAAACAGTTTGTGAAGCTGATATCGGATTT
CTCCAGTGGAAAGCTTTAATTGATTCTAATATACTGTAACGATCTGCTTCAAGCTCATCA
AGGTCCTAAAGAGGGAGTTGTAAGTTTGTCACCTTATATTCTATGAAAGAAAAACACAAA
TAGATTAGTCTTTTTATTTACCTATATATGTGATTCATCGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FH59TF U 1
AF RR4EH61TF U 1
AF RR4EH61JQ C 530
AF RR4FH59JQ C 531
BS 1 734 RR4EH61TF
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RD RR4FH59TF 730 0 0
GGAACATAACTATCTTTTCCATTTCTAGTTACTCTCTTCAATGTCATAAATAATCCAGTA
GTTCCATATTCAGCTAACAAAGCTTAAGAAGAAGAGCTTCAAGAGGAAGCACTCAATACA
CTACAATCAGAGCTCGAGAGAGAAAAAAGAGAGAAATGATGTGTAGCTTGAAAATGGTCT
CTCCACGGCCTCCAACGAATATATTCAGGAGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGCAGATAACAG
CGAATGGAGATGGGTTTCCAACATTTCTTCCGAAGGAGGTAAAAGACATAAAAGATCCAT
TCGCAAGAGCTCTGGCTCAAAGGATTGTACGGATTCCTGTTCCTCTTCAGATGGGAAACT
TTAGAGGCTGTGTAATGAGTAGCTGTATCAAACCAAATGTTCAATCACCCGACAAAAGTC
CTGTCGTTCTTCTCCATTGTTTTGACAGTTCTTGTCTTGAATGGAGACGTGCGTATCCTC
TGCTTGAGCAAGCTTGTCTTGAGACTTGGGCTATTGATGTTCTTGGTTGGGGCTTCTCCG
ATCTACAGAAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCTAAGCGACAGCATCTATTCGAGCTTT
GGAAAACATATATTAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGAGCAACAGTAG
CTGTTGATCTCACTGCTACTTACCCTGAAGCTGTTGATAGATTAGTTCTCATTAATGGAA
TGCGTATTCA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4EH61TF 783 0 0
GGAACATAACTATCTTTTCCATTTCTAGTTACTCTCTTCAATGTCATAAATAATCCAGTA
GTTCCATATTCAGCTAACAAAGCTTAAGAAGAAGAGCTTCAAGAGGAAGCACTCAATACA
CTACAATCAGAGCTCGAGAGAGAAAAAAGAGAGAAATGATGTGTAGCTTGAAAATGGTCT
CTCCACGGCCTCCAACGAATATATTCAGGAGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGCAGATAACAG
CGAATGGAGATGGGTTTCCAACATTTCTTCCGAAGGAGGTAAAAGACATAAAAGATCCAT
TCGCAAGAGCTCTGGCTCAAAGGATTGTACGGATTCCTGTTCCTCTTCAGATGGGAAACT
TTAGAGGCTGTGTAATGAGTAGCTGTATCAAACCAAATGTTCAATCACCCGACAAAAGTC
CTGTCGTTCTTCTCCATTGTTTTGACAGTTCTTGTCTTGAATGGAGACGTGCGTATCCTC
TGCTTGAGCAAGCTTGTCTTGAGACTTGGGCTATTGATGTTCTTGGTTGGGGCTTCTCCG
ATCTACAGAAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCTAAGCGACAGCATCTATTCGAGCTTT
GGAAAACATATATTAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGAGCAACAGTAG
CTGTTGATCTCACTGCTACTTACCCTGAAGCTGTTGATAGATTAGTTCTCATTAATGGAA
TGCGTATTCAGAAG*AACAG*TGCTCTTAAAGATTTACCAAAATCAATTGCTTACGCTGG
GGT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4EH61JQ 774 0 0
G
GGCTTCTCCGATCTACAGAAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCTAAGCGACAGCATCTA
TTCGAGCTTTGGAAAACATATATTAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGA
GCAACAGTAGCTGTTGATCTCACTGCTACTTACCCTGAAGCTGTTGATAGATTAGTTCTC
ATTAATGGAATGCGTATTCAGAAGGAACAGGTGCTCTTAAAGATTTACCAAAATCAATTG
CTTACGCTGGGGTTAAGTTGTTGAAGTCATTTCCTCTTCGCCTTTTGGCCAACGTGTTAG
CCTTTTCATCCCCCCTGTCAGAGAATATAGATTGGACTAATATTGGCCGGCTACATTGTC
AAATGCCGTGGTGGGAAGATGCGATGGTCAACTTTATGATTAGCGGAGGCTATAATGTTG
CATCACATATCAAACTCATCAACCACAAGACGCTCATCGTATGCAGTGAGAATGATCAGA
TTGTTAGCAACCAACTTTCAGTTAAATTGTTGTGTGAGCTACAAAATGCGGTTTTCCGGG
AAGTACCAGATTCCGGTCATCTTCCACATGTTGAGAGCCCTAAACAGTTTGTGAAGCTGA
TATCGGATTTCTCCAGTGGAAAGCTTTAATTGATTCTAATATACTGTAACGATCTGCTTC
AAGCTCATCAAGGTCCTAAAGAGGGAGTTGTAAGTTTGTCACCTTATATTCTATGAAAGA
AAAACACAAATAGATTAGTCTTTTTATTTACCTATATATGTGATTCATCGTCC

QA 2 774 2 774
DS 

RD RR4FH59JQ 773 0 0
GGCTTCTCCGATCTACAGAAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCTAAGCGACAGCATCTA
TTCGAGCTTTGGAAAACATATATTAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGA
GCAACAGTAGCTGTTGATCTCACTGCTACTTACCCTGAAGCTGTTGATAGATTAGTTCTC
ATTAATGGAATGCGTATTCAGAAGGAACAGGTGCTCTTAAAGATTTACCAAAATCAATTG
CTTACGCTGGGGTTAAGTTGTTGAAGTCATTTCCTCTTCGCCTTTTGGCCAACGTGTTAG
CCTTTTCATCCCCCCTGTCAGAGAATATAGATTGGACTAATATTGGCCGGCTACATTGTC
AAATGCCGTGGTGGGAAGATGCGATGGTCAACTTTATGATTAGCGGAGGCTATAATGTTG
CATCACATATCAAACTCATCAACCACAAGACGCTCATCGTATGCAGTGAGAATGATCAGA
TTGTTAGCAACCAACTTTCAGTTAAATTGTTGTGTGAGCTACAAAATGCGGTTTTCCGGG
AAGTACCAGATTCCGGTCATCTTCCACATGTTGAGAGCCCTAAACAGTTTGTGAAGCTGA
TATCGGATTTCTCCAGTGGAAAGCTTTAATTGATTCTAATATACTGTAACGATCTGCTTC
AAGCTCATCAAGGTCCTAAAGAGGGAGTTGTAAGTTTGTCACCTTATATTCTATGAAAGA
AAAACACAAATAGATTAGTCTTTTTATTTACCTATATATGTGATTCATCGTCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 4

CO CL2262Contig1 933 4 2 U
GACTAGACCTTTGTTTCGTGTCTTCCAGGAGAAGAGTGTTACCGACCAGACCGAGCATTG
TGGCTTTGATGGAGAAGTGTATGATTAGCTTGTCAAAGACGAAACGTTTATGGGTTCATG
ACTTGCTCCAAGACATGGCAGAAGATATTATATGCGAAGGAAAATATGAGAGGCCATGGA
AACGTTTAATGCTGTGGGATTTTGAAGATATCAATCACGTTTTCTCCAACAATATGGTAA
ACAAAGATTTTTTCGCAAGCTTAATGTTCAAGAATAGCTTAACAAATTATTAATTTGTTT
TTATATTTATATTAGAAATATCTTGATGAATTATAAAATTAAATATATAAAAAATAAGCT
GGGGATATGCGTTGGTGCAGCTTGAGGGGTTCACTATCTCCATACAGGTTCCACAAGAGC
CATCATACACCGCGATGTGAAGTCTGCTAACATTCTCTTGGATGAGAATTTCATGGCTTG
GAGAACTTGGATTGTCTAAGATGGGTCCGTAGCTTGGCCAGACATGTACTATATGCGGGG
GATACCAGTCACTGATCCATATATTTCAAAAGAGAAAGTGAATTAATCAAATGTGCCACA
AAGTTGGTGAAGAAAGCGAAGATAGCAGAGATGATAGACCATTTTCTTGATGGGAAAGTA
AAGCTTGAAGAGATTAAGAAGTACTGTGAGTTAACAGAGAAATGTTTGGTCCAAAACATG
ATTGAGGGGCCAACAATGGGAAGTTATTGTGGAACCTAGAGTTTATGCTTCAGGTCCAAG
TGAAAGAAGATAAAACAGAAATAGTGAATGCTTATCTAAAGTCTAGCATTGTGGGCTCAA
CGGTGATTTTGTTGTGGATGGAATGGGATATATTAAACTATTAAATCATAAACTGTAAAA
TATTACATTTCAAAAAAAACTTAATAGTCGATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4HB17TF U 1
AF RR4H038TF U 1
AF RR4HB17JQB C 109
AF RR4H038JQ C 181
BS 1 731 RR4H038TF
BS 732 933 RR4HB17JQB

RD RR4HB17TF 671 0 0
GACTAGACCTTTGTTTCGTGTCTTCCAGGAGAAGAGTGTTACCGACCAGACCGAGCATTG
TGGCTTTGATGGAGAAGTGTATGATTAGCTTGTCAAAGACGAAACGTTTATGGGTTCATG
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AACGTTTAATGCTGTGGGATTTTGAAGATATCAATCACGTTTTCTCCAACAATATGGTAA
ACAAAGATTTTTTCGCAAGCTTAATGTTCAAGAATAGCTTAACAAATTATTAATTTGTTT
TTATATTTATATTAGAAATATCTTGATGAATTATAAAATTAAATATATAAAAAATAAGCT
GGGGATATGCGTTGGTGCAGCTTGAGGGGTTCACTATCTCCATACAGGTTCCACAAGAGC
CATCATACACCGCGATGTGAAGTCTGCTAACATTCTCTTGGATGAGAATTTCATGGCTTG
GAGAACTTGGATTGTCTAAGATGGGTCCGTAGCTTGGCCAGACATGTACTATATGCGGGG
GATACCAGTCACTGATCCATATATTTCAAAAGAGAAAGTGAATTAATCAAATGTGCCACA
AAGTTGGTGAAGAAAGCGAAGATAGCAGAGATGATAGACCATTTTCTTGATGGGAAAGTA
AAGCTTGAAGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4H038TF 731 0 0
GACTAGACCTTTGTTTCGTGTCTTCCAGGAGAAGAGTGTTACCGACCAGACCGAGCATTG
TGGCTTTGATGGAGAAGTGTATGATTAGCTTGTCAAAGACGAAACGTTTATGGGTTCATG
ACTTGCTCCAAGACATGGCAGAAGATATTATATGCGAAGGAAAATATGAGAGGCCATGGA
AACGTTTAATGCTGTGGGATTTTGAAGATATCAATCACGTTTTCTCCAACAATATGGTAA
ACAAAGATTTTTTCGCAAGCTTAATGTTCAAGAATAGCTTAACAAATTATTAATTTGTTT
TTATATTTATATTAGAAATATCTTGATGAATTATAAAATTAAATATATAAAAAATAAGCT
GGGGATATGCGTTGGTGCAGCTTGAGGGGTTCACTATCTCCATACAGGTTCCACAAGAGC
CATCATACACCGCGATGTGAAGTCTGCTAACATTCTCTTGGATGAGAATTTCATGGCTTG
GAGAACTTGGATTGTCTAAGATGGGTCCGTAGCTTGGCCAGACATGTACTATATGCGGGG
GATACCAGTCACTGATCCATATATTTCAAAAGAGAAAGTGAATTAATCAAATGTGCCACA
AAGTTGGTGAAGAAAGCGAAGATAGCAGAGATGATAGACCATTTTCTTGATGGGAAAGTA
AAGCTTGAAGAGATTAAGAAGTACTGTGAGTTAACAGAGAAATGTTTGGTCCAAAACATG
ATTGAGGGGCC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4HB17JQB 825 0 0
TATGGGTTCATGACTTGCTCCAAGACATGGCAGAAGATATTATATGCGAAGGAAAATATG
AGAGGCCATGGAAACGTTTAATGCTGTGGGATTTTGAAGATATCAATCACGTTTTCTCCA
ACAATATGGTAAACAAAGATTTTTTCGCAAGCTTAATGTTCAAGAATAGCTTAACAAATT
ATTAATTTGTTTTTATATTTATATTAGAAATATCTTGATGAATTATAAAATTAAATATAT
AAAAAATAAGCTGGGGATATGCGTTGGTGCAGCTTGAGGGGTTCACTATCTCCATACAGG
TTCCACAAGAGCCATCATACACCGCGATGTGAAGTCTGCTAACATTCTCTTGGATGAGAA
TTTCATGGCTTGGAGAACTTGGATTGTTTAAGATGGGTCCGTAGCTTGGCCAGACATGTA
CTATATGCGGGGGATACCAGTCACTGATCCATATATTTCAAAAGAGAAAGTGAATTAATC
AAATGTGCCACAAAGTTGGTGAAGAAAGCGAAGATAGCAGAGATGATAGACCATTTTCTT
GATGGGAAAGTAAAGCTTGAAGAGATTAAGAAGTACTGTGAGTTAACAGAGAAATGTTTG
GTCCAAAACATGATTGAGGGGCCAACAATGGGAAGTTATTGTGGAACCTAGAGTTTATGC
TTCAGGTCCAAGTGAAAGAAGATAAAACAGAAATAGTGAATGCTTATCTAAAGTCTAGCA
TTGTGGGCTCAACGGTGATTTTGTTGTGGATGGAATGGGATATATTAAACTATTAAATCA
TAAACTGTAAAATATTACATTTCAAAAAAAACTTAATAGTCGATC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4H038JQ 753 0 0
AACGTTTAATGCTGTGGGATTTTGAAGATATCAATCACGTTTTCTCCAACAATATGGTAA
ACAAAGATTTTTTCGCAAGCTTAATGTTCAAGAATAGCTTAACAAATTATTAATTTGTTT
TTATATTTATATTAGAAATATCTTGATGAATTATAAAATTAAATATATAAAAAATAAGCT
GGGGATATGCGTTGGTGCAGCTTGAGGGGTTCACTATCTCCATACAGGTTCCACAAGAGC
CATCATACACCGCGATGTGAAGTCTGCTAACATTCTCTTGGATGAGAATTTCATGGCTTG
GAGAACTTGGATTGTTTAAGATGGGTCCGTAGCTTGGCCAGACATGTACTATATGCGGGG
GATACCAGTCACTGATCCATATATTTCAAAAGAGAAAGTGAATTAATCAAATGTGCCACA
AAGTTGGTGAAGAAAGCGAAGATAGCAGAGATGATAGACCATTTTCTTGATGGGAAAGTA
AAGCTTGAAGAGATTAAGAAGTACTGTGAGTTAACAGAGAAATGTTTGGTCCAAAACATG
ATTGAGGGGCCAACAATGGGAAGTTATTGTGGAACCTAGAGTTTATGCTTCAGGTCCAAG
TGAAAGAAGATAAAACAGAAATAGTGAATGCTTATCTAAAGTCTAGCATTGTGGGCTCAA
CGGTGATTTTGTTGTGGATGGAATGGGATATATTAAACTATTAAATCATAAACTGTAAAA
TATTACATTTCAAAAAAAACTTAATAGTCGATC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 4

CO CL2263Contig1 637 4 14 U
GAAAGAATTGATTTGCGAGAACCAAAAAGAAGAAACGCCAAA*TGTCAAAACAAACTGAT
AAATAGTCTCAAAGCATTCAAAGGTACACATGACGAAATTATCTTTAAACCAAATGTAGA
AAGCATCTTCAAAAATTCTAGACAACCCTGAGACTGAAACTAGAATATAAAGATTTTTGA
GTTGCCAGCTTCTTGCAGTCTTTAAGCACGAGCAGCAGCAGGGGCACCACCAGCAGGGCG
AGCGGCCTGACCAGGTTGTCCAGGCTTGGGAGCATCCTCCTTGCGTCTGACAAAACGTGG
AGGTGGGGTACGAACCCTACGGTTGGTGCGGGAACGGACTCTCACGACGTGAGAGTGGAT
AGCACATGAGACACAGTACTGCGTCTTGGCATACAACTTCGGGAGAGTGTAACCATCGTA
GACACTGGCTTCTTGAACATCTCTGATGGCAGCCTGTTCAACGATGTTCCTGACGATGAA
CCTCTTGATCGCCTTATCCTTGGGACAGCATTTCCCGCAGTTGGAACACCTGATGGGGTT
CACATGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTTCCACCGTTCCTGCGCTTGAAAGTCATGTTGCA
GTGTGGAGAGTTAGAACAAAGCCTATTCGCGTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4GQ06TF C 1
AF RR4AS20JQ U 29
AF RR4GQ06JQ U 40
AF RR4AS20TF C 29
BS 1 28 RR4GQ06TF
BS 29 85 RR4AS20JQ
BS 86 86 RR4GQ06JQ
BS 87 106 RR4AS20JQ
BS 107 107 RR4GQ06JQ
BS 108 141 RR4AS20JQ
BS 142 142 RR4GQ06JQ
BS 143 153 RR4AS20JQ
BS 154 154 RR4GQ06JQ
BS 155 180 RR4AS20JQ
BS 181 181 RR4GQ06JQ
BS 182 420 RR4AS20JQ
BS 421 421 RR4GQ06JQ
BS 422 637 RR4AS20JQ

RD RR4GQ06TF 637 0 0
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AAATAGTCTCCAAGCATTCAAAGGTAGACATGACGAAATTATCTTTAAACCAAATGTAGA
AAGCATCTTCAAAAATTCTAGACAACCCTGAGACTGAAACTAGAATATAAAGATTTTTGA
GTTGCCAGCTTCTTGCAGTCTTTAAGCACGAGCAGCAGCAGGGGCACCACCAGCAGGGCG
AGCGGCCTGTCCAGGTTGTCCAGGCTTGGGAGCATCCTCCTTGCGTCTGACAAAACGTGG
AGGTGGGGTACGAACCCTACGGTTGGTGCGGGAACGGACTCTCACGACGTGAGAGTGGAT
AGCACATGAGACACAGTACTGCGTCTTGGCATACAACTTCGGGAGAGTGTAACCATCGTA
GACACTGGCTTCTTGAACATCTCTGATGGCAGCTTGTTCAACGATGTTCCTGACGATGAA
CCTCTTGATCGCCTTATCCTTGGGACAGCATTTCCCGCAGTTGGAACACCTGATGGGGTT
CACATGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTTCCACCGTTCCTGCGCTTGAAAGTCATGTTGCA
GTGTGGAGAGTTAGAACAAAGCCTATT*GCGTTTCTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4AS20JQ 609 0 0
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CATGACGAAATTATCTTTTAACCAAATGTAGAAAGCATCTTCAAAAATTCTAGGCAACCC
TGAGAGTGAAACTAGAATATAAAGATTTTTGATTTGCCAGCTTCTTGCAGTCTTTAAGCA
CGAGCAGCAGCAGGGGCACCACCAGCAGGGCGAGCGGCCTGACCAGGTTGTCCAGGCTTG
GGAGCATCCTCCTTGCGTCTGACAAAACGTGGAGGTGGGGTACGAACCCTACGGTTGGTG
CGGGAACGGACTCTCACGACGTGAGAGTGGATAGCACATGAGACACAGTACTGCGTCTTG
GCATACAACTTCGGGAGAGTGTAACCATCGTAAACACTGGCTTCTTGAACATCTCTGATG
GCAGCCTGTTCAACGATGTTCCTGACGATGAACCTCTTGATCGCCTTATCCTTGGGACAG
CATTTCCCGCAGTTGGAACACCTGATGGGGTTCACATGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTT
CCACCGTTCCTGCGCTTGAAAGTCATGTTGCAGTGTGGAGAGTTAGAACAAAGCCTATTC
GCGTTTCTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4GQ06JQ 598 0 0
AAA*TGTCAAAACAAACTGATAAATAGTCTCCAAGCATTCAAAGGTAGACATGACGAAAT
TATCTTTAAACCAAATGTAGAAAGCATCTTCAAAAATTCTAGACAACCCTGAGACTGAAA
CTAGAATATAAAGATTTTTGAGTTGCCAGCTTCTTGCAGTCTTTAAGCACGAGCAGCAGC
AGGGGCACCACCAGCAGGGCGAGCGGCCTGTCCAGGTTGTCCAGGCTTGGGAGCATCCTC
CTTGCGTCTGACAAAACGTGGAGGTGGGGTACGAACCCTACGGTTGGTGCGGGAACGGAC
TCTCACGACGTGAGAGTGGATAGCACATGAGACACAGTACTGCGTCTTGGCATACAACTT
CGGGAGAGTGTAACCATCGTAGACACTGGCTTCTTGAACATCTCTGATGGCAGCTTGTTC
AACGATGTTCCTGACGATGAACCTCTTGATCGCCTTATCCTTGGGACAGCATTTCCCGCA
GTTGGAACACCTGATGGGGTTCACATGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTTCCACCGTTCCT
GCGCTTGAAAGTCATGTTGCAGTGTGGAGAGTTAGAACAAAGCCTATT*GCGTTTCTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4AS20TF 609 0 0
GAAGAAACGCCAAAATGTCAAAACAAACTGATAAATAGTCTCAAAGCATTCAAAGGTCCA
CATGACGAAATTATCTTTTAACCAAATGTAGAAAGCATCTTCAAAAATTCTAGGCAACCC
TGAGAGTGAAACTAGAATATAAAGATTTTTGATTTGCCAGCTTCTTGCAGTCTTTAAGCA
CGAGCAGCAGCAGGGGCACCACCAGCAGGGCGAGCGGCCTGACCAGGTTGTCCAGGCTTG
GGAGCATCCTCCTTGCGTCTGACAAAACGTGGAGGTGGGGTACGAACCCTACGGTTGGTG
CGGGAACGGACTCTCACGACGTGAGAGTGGATAGCACATGAGACACAGTACTGCGTCTTG
GCATACAACTTCGGGAGAGTGTAACCATCGTAGACACTGGCTTCTTGAACATCTCTGATG
GCAGCCTGTTCAACGATGTTCCTGACGATGAACCTCTTGATCGCCTTATCCTTGGGACAG
CATTTCCCGCAGTTGGAACACCTGATGGGGTTCACATGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTT
CCACCGTTCCTGCGCTTGAAAGTCATGTTGCAGTGTGGAGAGTTAGAACAAAGCCTATTC
GCGTTTCTT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 4

CO CL2264Contig1 592 4 13 U
GGAAGGAAGAAGCTTCGTCGGCGCCTGAGACTGTTGAGAAAAAGCTCCGACAATGGCGTG
GATGCAAATAGTACAGAGCGCGAGATCTGTGCTAAGGACAACTCAACCTTCTTCGACTCC
AATACTCTCCAGATTCTATTCCAAATCCGCTCCTTACGCAGTGAAGGTTGGGATCCCTGA
GTTCTTGAGTGGGATTGGTGGAGGAGTTGAGAGCCACGTTGCCAAGCTTGAAACTGAGAT
TGGTGATCTTTCGAAACTGCTCGTGACTCGTACCCTCAAGCTCAAGAAGTGTGGCATCCC
TTGCAAACATAGGAAGCTGATACTGAAATATAGCCAGAAATACAGGCTGGGGCTTTGGAA
ACCTAGAGCTGACGCTATAAAGGCGTGATTGGATTGTTATTGTGACTCTCTGTAATGCGT
GTGGTTTTTGCTACTGAAATGAGTTGTTCTCAGAATGATCTTAGTAGGCATAGCAATGTT
GCCAATTACTTGAAACTCAGTACTTATTTTTCTGCATTCATGTACTTGTTATCTCCATGG
GTCTAGAAACAATAAAACCATACTTGACAATCCTAAAGCAATGTGTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G878JQ C 1
AF RR4G878TF U 1
AF RR4EH19JQ C 4
AF RR4EH19TF U 4
BS 1 4 RR4G878JQ
BS 5 80 RR4G878TF
BS 81 81 RR4EH19TF
BS 82 90 RR4G878TF
BS 91 91 RR4EH19TF
BS 92 556 RR4G878TF
BS 557 557 RR4EH19TF
BS 558 561 RR4G878TF
BS 562 562 RR4EH19TF
BS 563 573 RR4G878TF
BS 574 576 RR4EH19TF
BS 577 577 RR4EH19JQ
BS 578 592 RR4EH19TF

RD RR4G878JQ 573 0 0
GGAAGGAAGAAGCTTCGTCGGCGCCTGAGACTGTTGAGAAAAAGCTCCGACAATGGCGTG
GATGCAAATAGTACAGAGCGTGAGATCTGTTCTAAGGACAACTCAACCTTCTTCGACTCC
AATACTCTCCAGATTCTATTCCAAATCCGCTCCTTACGCAGTGAAGGTTGGGATCCCTGA
GTTCTTGAGTGGGATTGGTGGAGGAGTTGAGAGCCACGTTGCCAAGCTTGAAACTGAGAT
TGGTGATCTTTCGAAACTGCTCGTGACTCGTACCCTCAAGCTCAAGAAGTGTGGCATCCC
TTGCAAACATAGGAAGCTGATACTGAAATATAGCCAGAAATACAGGCTGGGGCTTTGGAA
ACCTAGAGCTGACGCTATAAAGGCGTGATTGGATTGTTATTGTGACTCTCTGTAATGCGT
GTGGTTTTTGCTACTGAAATGAGTTGTTCTCAGAATGATCTTAGTAGGCATAGCAATGTT
GCCAATTACTTGAAACTCAGTACTTATTTTTCTGCATTCATGTACTTGTTATCTCCATGG
GTCTAGAAACAATAAAGCCATGCTTGACAATCC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4G878TF 573 0 0
GGAA
GGAAGAAGCTTCGTCGGCGCCTGAGACTGTTGAGAAAAAGCTCCGACAATGGCGTGGATG
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CTCTCCAGATTCTATTCCAAATCCGCTCCTTACGCAGTGAAGGTTGGGATCCCTGAGTTC
TTGAGTGGGATTGGTGGAGGAGTTGAGAGCCACGTTGCCAAGCTTGAAACTGAGATTGGT
GATCTTTCGAAACTGCTCGTGACTCGTACCCTCAAGCTCAAGAAGTGTGGCATCCCTTGC
AAACATAGGAAGCTGATACTGAAATATAGCCAGAAATACAGGCTGGGGCTTTGGAAACCT
AGAGCTGACGCTATAAAGGCGTGATTGGATTGTTATTGTGACTCTCTGTAATGCGTGTGG
TTTTTGCTACTGAAATGAGTTGTTCTCAGAATGATCTTAGTAGGCATAGCAATGTTGCCA
ATTACTTGAAACTCAGTACTTATTTTTCTGCATTCATGTACTTGTTATCTCCATGGGTCT
AGAAACAATAAAGCCATGCTTGACAATCC

QA 5 573 5 573
DS 

RD RR4EH19JQ 589 0 0
G
GGAAGAAGCTTCGTCGGCGCCTGAGACTGTTGAGAAAAAGCTCCGATAATGGCGTGGATG
CAAATAGTACAGAGCGCGAGATCTGTGCTAAGGACAACTCAACCTTCTTCGACTCCAATA
CTCTCCAGATTCTATTCCAAATCCGCTCCTTACGCAGTGAAGGTTGGGATCCCTGAGTTC
TTGAGTGGGATTGGTGGAGGAGTTGAGAGCCACGTTGCCAAGCTTGAAGCTGAGATTGGT
GATCTTTCGAAACTGCTCGTGACTCGTACCCTCAAGCTCAAGAAGTGTGGCATCCCTTGC
AAACATAGGAAGCTGATACTGAAATATAGCCAGAAATACAGGCTGGGGCTTTGGAAACCT
AGAGCTGACGCTATAAAGGCGTGATTGGATTGTTATTGTGACTCTCTGTAATGCGTGTGG
TTTTTGCTACTGAAATGAGTTGTTCTCAGAATGATCTTAGTAGGCATAGCAATGTTGCCA
ATTACTTGAAACTCAGTACTTATTTTTCTGCATTCATGTACTTGTTATCTCCATGGGTCT
AGAAACAATAAAACCATACTTGACAATCCTAAAGCAATGTGTTTTTTG

QA 2 589 2 589
DS 

RD RR4EH19TF 589 0 0
G
GGAAGAAGCTTCGTCGGCGCCTGAGACTGTTGAGAAAAAGCTCCGATAATGGCGTGGATG
CAAATAGTACAGAGCGCGAGATCTGTGCTAAGGACAACTCAACCTTCTTCGACTCCAATA
CTCTCCAGATTCTATTCCAAATCCGCTCCTTACGCAGTGAAGGTTGGGATCCCTGAGTTC
TTGAGTGGGATTGGTGGAGGAGTTGAGAGCCACGTTGCCAAGCTTGAAGCTGAGATTGGT
GATCTTTCGAAACTGCTCGTGACTCGTACCCTCAAGCTCAAGAAGTGTGGCATCCCTTGC
AAACATAGGAAGCTGATACTGAAATATAGCCAGAAATACAGGCTGGGGCTTTGGAAACCT
AGAGCTGACGCTATAAAGGCGTGATTGGATTGTTATTGTGACTCTCTGTAATGCGTGTGG
TTTTTGCTACTGAAATGAGTTGTTCTCAGAATGATCTTAGTAGGCATAGCAATGTTGCCA
ATTACTTGAAACTCAGTACTTATTTTTCTGCATTCATGTACTTGTTATCTCCATGGGTCT
AGAAACAATAAAACCATACTTGACAATCCTAA*GCAATGTGTTTTTTG

QA 2 589 2 589
DS 



AS 1 4

CO CL2265Contig1 954 4 2 U
ATACTGGGTTAATATAAGTTTATAAAAAGTAGATCAAATTTTGTCAAAGTTTTCGACACA
ATACAGGATCATAGTTGCGTTAAGAAAGAAAAAAGAACATAACATTTAAATTTTGACGCA
GTTAAAGAGGATAAAGCCTAAAAGACTGAGCCTGAAGCTAGATCACCGTAAGGTCGAGCC
ACTTTGGTTCCGGCTTTCAATCAGCCTTTGCCAAACCATCTTTCCACAATGCAGAAGAGT
CAATGATGCCACCAGGTAAAGAAGAGGAACGCCAATCATACAACCTTCCGATGCGAAATT
CACCAATGTCAACATTCCAGCAGAAAGATGTATGACTGGAACTATAACTTGGTCTACTTT
GTTCCCTTTTGCATACCCTTCAAAAGCAATGACCATCGAGAATGTGTGGATCGTGACAAA
TGCAAGAGCAATGATTGCAGAGATGAGAAAGAATGGGACTTTCGAACATCTGTCGACATA
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CACACCATGACCTAAACCACCAGCGAGAGCAATCTGGAGCTTATCAGTGAGAAACAAGCG
GGGCCTAGAGATCCGATCCGCAAAGGAATCCAAGACATCTTCAAGCCTCATGTAAAGCTT
CCAGAAAAGAAAGCGAAGAGCTTCCTGGAAGCAAACAGAGGAGAGAACAAGCAAAGCATA
AGGCCACATCACATTGGCTTTCAGTGGGAGGAAAGGCCTCCACAGTCCCGACAAGACGAT
CAGACTCACTAGCCACACCAACGTACTGGAGAGAAGAGTGAGAATGAGGAAGGGCTTTCT
GGAGATGACGGAGACGAAGAGTGAAAGAGACGGTCCCAGAGCAAGAAGCGCGTACCCTAT
CCCCGCCGCGACCGTCATCACTTTCCGATGGGTCTCAAAGGATCTGAAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C303JQ U 22
AF RR4CG35JQ U 1
AF RR4CG35TF C 290
AF RR4C303TF C 674
BS 1 722 RR4CG35JQ
BS 723 954 RR4CG35TF

RD RR4C303JQ 585 0 0
ATAAAAAGTAGATCAAATTTTGTCAAAGTTTTCGACACAATACAGGATCATAGTTGCGTT
AAGAAAGAAAAAAGAACATAACATTTAAATTTTGACGCAGTTAAAGAGGATAAAGCCTAA
AAGACTGAGCCTGAAGCTAGATCACCGTAAGGTCGAGCCACTTTGGTTCCGGCTTTCAAT
CAGCCTTTGCCAAACCATCTTTCCACAATGCAGAAGAGTCAATGATGCCACCAGGTAAAG
AAGAGGAACGCCAATCATACAACCTTCCGATGCGAAATTCACCAATGTCAACATTCCAGC
AGAAAGATGTATGACTGGAACTATAACTTGGTCTACTTTGTTCCCTTTTGCATACCCTTC
AAAAGCAATGACCATCGAGAATGTGTGGATCGTGACAAATGCAAGAGCAATGATTGCAGA
GATGAAAAAGAATGGGACTTTCGAACATCTGTCGACATAGAACGTGGCTGGACCAAATGC
GGGAGTTAAGAGGCTCAAACAAAAGAAGACAGCATGAGCCACACCACGACCTAAACCACC
AGCGAGAGCAATCTGGAGCTTATCAGTGAGAAACAAGCGGGGCCT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4CG35JQ 723 0 0
ATACTGGGTTAATATAAGTTTATAAAAAGTAGATCAAATTTTGTCAAAGTTTTCGACACA
ATACAGGATCATAGTTGCGTTAAGAAAGAAAAAAGAACATAACATTTAAATTTTGACGCA
GTTAAAGAGGATAAAGCCTAAAAGACTGAGCCTGAAGCTAGATCACCGTAAGGTCGAGCC
ACTTTGGTTCCGGCTTTCAATCAGCCTTTGCCAAACCATCTTTCCACAATGCAGAAGAGT
CAATGATGCCACCAGGTAAAGAAGAGGAACGCCAATCATACAACCTTCCGATGCGAAATT
CACCAATGTCAACATTCCAGCAGAAAGATGTATGACTGGAACTATAACTTGGTCTACTTT
GTTCCCTTTTGCATACCCTTCAAAAGCAATGACCATCGAGAATGTGTGGATCGTGACAAA
TGCAAGAGCAATGATTGCAGAGATGAGAAAGAATGGGACTTTCGAACATCTGTCGACATA
GAACGTGGCTGGACCAAATGCGGGAGTTAAGAAGCTCAAACAAAAGAAGACAGCATGAGC
CACACCATGACCTAAACCACCAGCGAGAGCAATCTGGAGCTTATCAGTGAGAAACAAGCG
GGGCCTAGAGATCCGATCCGCAAAGGAATCCAAGACATCTTCAAGCCTCATGTAAAGCTT
CCAGAAAAGAAAGCGAAGAGCTTCCTGGAAGCAAACAGAGGAGAGAACAAGCAAAGCATA
AG
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CG35TF 665 0 0
GATGCGAAATTCACCAATGTCAACATTCCAGCAGAAAGATGTATGACTGGAACTATAACT
TGGTCTACTTTGTTCCCTTTTGCATACCCTTCAAAAGCAATGACCATCGAGAATGTGTGG
ATCGTGACAAATGCAAGAGCAATGATTGCAGAGATGAGAAAGAATGGGACTTTCGAACAT
CTGTCGACATAGAACGTGGCTGGACCAAATGCGGGAGTTAAGAAGCTCAAACAAAAGAAG
ACAGCATGAGCCACACCATGACCTAAACCACCAGCGAGAGCAATCTGGAGCTTATCAGTG
AGAAACAAGCGGGGCCTAGAGATCCGATCCGCAAAGGAATCCAAGACATCTTCAAGCCTC
ATGTAAAGCTTCCAGAAACGAAAGCGAAGAGCTTCCTGGAAGCAAACAGAGGAGAGAACA
AGCAAAGCATAAGGCCACATCACATTGGCTTTCAGTGGGAGGAAAGGCCTCCACAGTCCC
GACAAGACGATCAGACTCACTAGCCACACCAACGTACTGGAGAGAAGAGTGAGAATGAGG
AAGGGCTTTCTGGAGATGACGGAGACGAAGAGTGAAAGAGACGGTCCCAGAGCAAGAAGC
GCGTACCCTATCCCCGCCGCGACCGTCATCACTTTCCGATGGGTCTCAAAGGATCTGAAA
CTTCC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4C303TF 281 0 0
CGAAGAGCTTCCTGGAAGCAAACAGAGGAGAGAACAAGTAAAGCATAAGGCCACATCACA
TTGGCTTTCAGTGGGAGGAAAGGCCTCCACAGTCCCGACAAGACGATCAGACTCACTAGC
CACACCAACGTACTGGAGAGAAGAGTGAGAATGAGGAAGGGCTTTCTGGAGATGACGGAG
ACGAAGAGTGAAAGAGACGGTCCCAGAGCAAGAAGCGCGTACCCTATCCCCGCCGCGACC
GTCATCACTTTCCGATGGGTCTCAAAGGATCTGAAACTTCC

QA 1 281 1 281
DS 



AS 1 4

CO CL2266Contig1 575 4 4 U
GGGAGAGAGAGAGAGAAAGATAAGCTTTCCAAGAAGATGAAGAATGATAATACCAACTCA
GCAAGAAGCAATCTGGTGAAAGATGAACTGTTTCATGTGATTCACAAAGTCCCTTGTGGA
GATACTCCCTATGTCAAAGCCAAACATGCTCAGATTTGGGAAGGTCTTGGGAAAGAGAAG
TGGAGATCTGTCTGAAGATTGCGCAAGAGACAGGTGTTTTACTGGATCCAATGTATATTT
TAGCTGCTTGGGAGAGAGCAACAGAGCTTGTGTAGGAGGACGATAATTCGAGCATTGTAG
TGATGCTTCACATTGGAGGCACTCTTGGGATATTTGGTCTTGCTCAAAGATACAAATCTC
TATTCGCCAACTTGAATGATTAGGCTTTTTGTAGCATACCATTTCCAAGACTTGAATAGA
CATCAATCTAAACGTTCAGTTAAGATTTAGCTTAGTAATTATTAGGTTTTACGTGTTATA
CTGTATTTGACTATTTGCTTTTCCGATTTTGGAAGATTTTATTCAAATTTAGGATAGCTA
TCCTGAACAAGAATTGTTTT*AAGATTGTCTTGAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4GX85TF U 1
AF RR4GX85JQ C 1
AF RR4H016TF U 1
AF RR4H016JQ C 1
BS 1 520 RR4GX85TF
BS 521 560 RR4H016TF
BS 561 561 RR4GX85JQ
BS 562 575 RR4H016TF

RD RR4GX85TF 520 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAAAGATAAGCTTTCCAAGAAGATGAAGAATGATAATACCAACTCA
GCAAGAAGCAATCTGGTGAAAGATGAACTGTTTCATGTGATTCACAAAGTCCCTTGTGGA
GATACTCCCTATGTCAAAGCCAAACATGCTCAGATTTGGGAAGGTCTTGGGAAAGAGAAG
TGGAGATCTGTCTGAAGATTGCGCAAGAGACAGGTGTTTTACTGGATCCAATGTATATTT
TAGCTGCTTGGGAGAGAGCAACAGAGCTTGTGTAGGAGGACGATAATTCGAGCATTGTAG
TGATGCTTCACATTGGAGGCACTCTTGGGATATTTGGTCTTGCTCAAAGATACAAATCTC
TATTCGCCAACTTGAATGATTAGGCTTTTTGTAGCATACCATTTCCAAGACTTGAATAGA
CATCAATCTAAACGTTCAGTTAAGATTTAGCTTAGTAATTATTAGGTTTTACGTGTTATA
CTGTATTTGACTATTTGCTTTTCCGATTTTGGAAGATTTT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4GX85JQ 575 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAAAGATAAGCTTTCCAAGAAGATGAAGAATGATAATACCAACTCA
GCAAGAAGCAATCTGGTGAAAGATGAACTGTTTCATGTGATTCACAAAGTCCCTTGTGGA
GATACTCCCTATGTCAAAGCCAAACATGCTCAGATTTGGGAAGGTCTTGGGAAAGAGAAG
TGGAGATCTGTCTGAAGATTGCGCAAGAGACAGGTGTTTTACTGGATCCAATGTATATTT
TAGCTGCTTGGGAGAGAGCAACAGAGCTTGTGTAGGAGGACGATAATTCGAGCATTGTAG
TGATGCTTCACATTGGAGGCACTCTTGGGATATTTGGTCTTGCTCAAAGATACAAATCTC
TATTCGCCAACTTGAATGATTAGGCTTTTTGTAGCATACCATTTCCAAGACTTGAATAGA
CATCAATCTAAACGTTCAGTTAAGATTTAGCTTAGTAATTATTAGGTTTTACGTGTTATA
CTGTATTTGACTATTTGCTTTTCCGATTTTGGAAGATTTTATTCAAATTTAGGATAGCTA
TCCTGAACAAGAATTGTTTT*AAGATTGTCTTGAC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4H016TF 575 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAAAGATAAGCTTTCCAAGAAGATGAAGAATGATAATACCAACTCA
GCAAGAAGCAATCTGGTGAAAGATGAACTGTTTCATGTGATTCACAAAGTCCCTTGTGGA
GATACTCCCTATGTCAAAGCCAAACATGCTCAGATTTGGGAAGGTCTTGGGAAAGAGAAG
TGGAGATCTGTCTGAAGATTGCGCAAGAGACAGGTGTTTTACTGGATCCAATGTATATTT
TAGCTGCTTGGGAGAGAGCAACAGAGCTTGTGTAGGAGGACGATAATTCGAGCATTGTAG
TGATGCTTCACATTGGAGGCACTCTTGGGATATTTGGTCTTGCTCAAAGATACAAATCTC
TATTCGCCAACTTGAATGATTAGGCTTTTTGTAGCATACCATTTCCAAGACTTGAATAGA
CATCAATCTAAACGTTCAGTTAAGATTTAGCTTAGTAATTATTAGGTTTTACGTGTTATA
CTGTATTTGACTATTTGCTTTTCCGATTTTGGAAGATTTTATTCAAATTTAGGATAGCTA
TCCTGAACAAGAATTGTTTTTAAGATTGTCTTGAC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4H016JQ 575 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAAAGATAAGCTTTCCAAGAAGATGAAGAATGATAATACCAACTCA
GCAAGAAGCAATCTGGTGAAAGATGAACTGTTTCATGTGATTCACAAAGTCCCTTGTGGA
GATACTCCCTATGTCAAAGCCAAACATGCTCAGATTTGGGAAGGTCTTGGGAAAGAGAAG
TGGAGATCTGTCTGAAGATTGCGCAAGAGACAGGTGTTTTACTGGATCCAATGTATATTT
TAGCTGCTTGGGAGAGAGCAACAGAGCTTGTGTAGGAGGACGATAATTCGAGCATTGTAG
TGATGCTTCACATTGGAGGCACTCTTGGGATATTTGGTCTTGCTCAAAGATACAAATCTC
TATTCGCCAACTTGAATGATTAGGCTTTTTGTAGCATACCATTTCCAAGACTTGAATAGA
CATCAATCTAAACGTTCAGTTAAGATTTAGCTTAGTAATTATTAGGTTTTACGTGTTATA
CTGTATTTGACTATTTGCTTTTCCGATTTTGGAAGATTTTATTCAAATTTAGGATAGCTA
TCCTGAACAAGAATTGTTTT*AAGATTGTCTTGAC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 4

CO CL2267Contig1 1519 4 3 U
GGACACTAATTTCATTACCAAATGTATTGAAGAGTGGTTGAGTTACGTCTGCTAAATTGT
ACGCCTTTCTTTTACGAAGAACTTGGTCTCAACAAAGGCTATATAAAGTCTTTAAGTTGG
AATCATAAACAAGAGCATTCTTCTTCATTTCGCACAGGTAGATTGGTATCAAGATGGTGA
TGAGAATCGTGGATCTACGTTCAGACACCGTGACAAGACCCACCGACGCAATGCGCGAAG
CAATGGCTGGTGCAGAGGTGGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCAACGGCTCGACGTC
TCGAAGAGGATATGGCCAAGATGATGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTTCCATCTGGTA
CGATGGGGAATCTGATTTGCGTTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTC
TTGGGGACACTTGTCACATCCACGTGTACGAGAATGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCG
TGCATCCCAAGACGATCAAGAATGAAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTATAGAAG
GAGCCATTAGAGATCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCGACAAGGTTGATTTGTTTGG
AGAACACACATGCCAACTCTGGTGGGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAGAGTTG
GAGAGATTGCTAAGAGACATGGATTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTTTAATG
CTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCAGTCCATAGGCTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGG
TGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGAGCTCCGATAGGATCAGTAATCTTTGGTTCACAGAGTT
TCATAGAAAAGGCGAAAACATTAAGGAAGCCATTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCG
TCCTGTGTGCAGCCGCTTTGGTCGCACTCCAAGAGAACCTGCCGAAGCTACAATCTGACC
ACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGTGAACG
TTGAAGCCATGGAGACCAACATGATATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACTTACCG
CTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAACTCTT
CCCGGATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTGT
CTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGGCAAAC
CACAATGCTCTCTCTTTTTTAAATATTGTTTGTATAAGTTTTTAATTAAAAGTTCCAAGG
ACCGATCTATCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGTCATCCATTTTTATTATTGTATTT
TTGGTTTATATCTTGCTTACACATGCATAAGCCAAGATTGGACAAAGCTTGAAACAGACG
GGTACGACCAGAAACACAGAATGGATGAAACACACTCGCACACACTTGCAATTAAAAATG
ATTACTAGCTTTTTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTGGGGACACTTGTCACATCCACGTGTACGAGAATGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCG
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CTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCAGTC

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TGGATTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCACTTGGAGT
TCCAGTCCATAGGCTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCT
TGGAGCTCCGATAGGATCTGTAATCGTCGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAAC
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GGTCGCACTCCAAGAGAACCTCCCAAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTT
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TCTAACCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCTCGGATCAGAATGGTTAT
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TAAGTATTGTTTGTATAAGTTTTTAATTAAAAGTTGCAAGGACCGATCTATCTCTCAATG
AAATTGTCACCCTCATGTCATCCATTTT*ATTATTGTATTTTTGGTTT

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G
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AAGAGACATGGATTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCA
CTTGGAGTTCCAGTCCATAGGCTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCT
AAAGGTCTTGGAGCTCCGATAGGATCAGTAATCTTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAG
GCGAAAACATTAAGGAAGCCATTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCA
GCCGCTTTGGTCGCACTCCAAGAGAACCTGCCGAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACA
AAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATG
GAGACCAACATGATATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTC
CGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGA
ATGGTTATACACCACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTGTCTTGCTTGCAA
CAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGGCAAACCACAATGCTCT
CTCTTTTTTAAATATTGTTTGTATAAGTTTTTAATTAAAAGTTCCAAGGACCGATCTATC
TCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGTCATCCATTTTTATTATTGTATTTTTGGTTTATAT
CTTGCTTACACATGCA

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AAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGAGCTCCGATAGGATCA
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ATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGATATTCATGGATATG
GAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATT
CTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACA
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TGCCAAAACTAAATTGGCAAACCACAATGCTCTCTCTTTTTTAAATATTGTTTGTATAAG
TTTTTAATTAAAAGTTCCAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGTC
ATCCATTTTTATTATTGTATTTTTGGTTTATATCTTGCTTACACATGCATAAGCCAAGAT
TGGACAAAGCTTGAAACAGACGGGTACGACCAGAAACACAGAATGGATGAAACACACTCG
CACACACTTGCAATTAAAAATGATTACTAGCTTTTTCTTGC

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 4

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GAGAAGATTGTTGGTGAAAGATCTAGAAACTGGTGATGATGTTGAAGAGACTAGTCCTCC
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CGCCGGATCAGACCTCAAGAAGCTCAAATCCTCAAATTCTACTTCTTCCACCAAGAAACC
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CAAACTCTCTCCTCCTCCACAGAAGAAGAAAACACCACCATCCTCTTCAAAACCAGTGAC
CAAGCCCAAACCAGCAGAGAAAGCAATCAAACCATTCTGGCTAGACGACGAGGAAGACGA
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CCTAGAGAGAATCTCAACCACATCCAAAAGCTACATCAACAAAGCCAACAAAGAGATCAC
CAAGAACTTCAAACCTTACTTCGGCAACAAATACTCACCAACCATCGCCTCCGTAGTCTC
CTTCGTCTTCATCCTCGTCCCTCTCCTCTTAGTCTCCCTCGTCTTCAACCGTTTCAAAGC
CTACTTCTCCCTCCAGAAACTCCTCATCTTCATCCAAATCTACCTCTCCATCTACTTCTC
TATCCTCTGCCTCTCCTCGCTCGTCACCGGCATCGAGCCCCTCAAGTTCCTCTACGCCAC
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GGTACTGGGCTTGGCTCAGACGTTCGTGGGTTTCGCGGTGGGTTTGCATTATTACGTGGC
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TCTACTTCAATTGTATTTATAAATCAATCTATAAATGTGGAATAAAATTTCATAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4H903TF U 1
AF RR4H506TF U 10
AF RR4H506JQB C 604
AF RR4H903JQB C 645
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BS 244 563 RR4H903TF
BS 564 674 RR4H506TF
BS 675 675 RR4H903JQB
BS 676 684 RR4H506JQB
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BS 1249 1435 RR4H506JQB

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CGCCGGATCAGACCTCAAGAAGCTCAAATCCTCAAATTCTACTTCTTCCACCAAGAAACC
AGCAGATCTGTCCAAATCAAGCTCATCAAAGAACAAAACCACCACAAAACCCCAAAGCTC
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GCTC

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CAAGCTCATTAAACCAATCTCTTCTTCCACCAAGAACCAGACTAAACTCGCCAAGACTAC
TACGTCTTCCAAACTCAACTCCACCAAATCATCTTCCAACACGACCAAGGCCGCCGGATC
AGACCTCAAGAAGCTCAAATCCTCAAATTCTACTTCTTCCACCAAGAAACCAGCAGATCT
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TCCTCCTCCACAGAAGAAGAAAACACCACCATCCTCTTCAAAACCAGTGACCAAGCCCAA
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CAAAC
CTTACT

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DS 

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CGTCTTCATCCTCGTCCCTCTCCTCTTAGTCTCCCTCGTCTTCAACCGTTTCAAAGCCTA
CTTCTCCCTCCAGAAACTCCTCATCTTCATCCAAATCTACCTCTCCATCTACTTCTCTAT
CCTCTGCCTCTCCTCGCTCGTCACCGGCATCGAGCCTCTCAAGTTCCTCTACGCCACGTC
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GCTTCTCCTCATGTACCTTGTTCTCGTATTCTCGACTGATTGTGGTTTGGGCCTTAAGGT
ACTGGGCTTGGCTCAGACGTTCGTGGGTTTCGCGGTGGGTTTGCATTATTACGTGGCGGT
GTTTCATAGGGTGGTGCTGCGTCAGCCTCCGAAGACGAACTGGAAGGTGCACGGTGTTTA
TGCCACGTGTTTTCTTCTCATTTGTGTCTTGTCTAGTGCGGAGAGGAGGAAGAAAGAGTA
CTTGGAAGATGGCGGTGACGAAGGCAAGAAAAATTGAATTTTTT*GCTTTTTATATAGTA
CTCTTTTTTTCTCTCTCTCTTTTTTGTATTTTTATATTGAATTTCGATAAATTCGGCAAA
ATTTCGCTGAAAATGCAATAGAAGAACACATATGTGACTAGTGGAGGTTGGAGATTATCT
ACTTCAATTGTATTTATAAATCAATCTATAAATGTGGAATAAAATTTCATAT

QA 1 832 1 832
DS 

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TCAACCGTTTCAAAGCCTACTTCTCCCTCCAGAAACTCCTCATCTTCATCCAAATCTACC
TCTCCATCTACTTCTCTATCCTCTGCCTCTCCTCGCTCGTCACCGGCATCGAGCCCCTCA
AGTTCCTTTACGCCACGTCGAGCTCGACCTACGTCTGCCTGCAGATCATGCAGACCTTGG
GCTACGTCTTCTACCTCTTGCTTCTCCTCATGTACCTTGTTCTCGTATTCTCGACTGATT
GTGGTTTGGGCCTTAAGGTACTGGGCTTGGCTCAGACGTTCGTGGGTTTCGCGGTGGGTT
TGCATTATTACGTGGCGGTGTTTCATAGGGTGGTGCTGCGTCAGCCTCCGAAGACGAACT
GGAAGGTGCACGGTGTTTATGCCACGTGTTTTCTTCTCATTTGTGTCTTGTCTAGTGCGG
AGAGGAGGAAGAAAGAGTACTTGGAAGATGGCGGTGACGAAGGCAAGAAAAATTGAATTT
TTTTGCTTTTTATATAGTACTCTTTTTTTCTCTCTCTCTTTTTTGTATTTTTATATTGAA
TTTCGATAAATTCGGCAAAATTTCGCTGAAAATGCAATAGAAGAACACATATGTGACTAG
TGGAGGTTGGAGATTATCTACTTCAATTGTATTTATAAATCAATCTATAAATGTGGAATA
AAATTTCATAT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 2 4

CO CL2269Contig1 1346 2 2 U
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ATCTGGTTTGGTTTAGCCTTACTCGCGTTGCTTGTGGTGTCATCAGCCGTAGCAGACGAT
GTGGTTGTGTTGACGGATGATAGCTTCGAGAAGGAAGTTGGTAAAGATAAAGGAGCTCTT
GTCGAGTTTTACGCTCCCTGGTGTGGTCACTGCAAGAAACTTGCTCCAGAGTATGAAAAG
CTTGGGGCAAGCTTCAAGAAAGCTAAGTCTGTCTTGATTGCAAAGGTAGATTGTGATGTG
CATAAGAGCGTCTGCACTAAATATGGTGTTAGTGGTTATCCCACCATTCAGTGGTTTCCT
AAAGGCTCTCTTGAACCCCAAAAGTATGAAGGTGCACGCAATGCTGAAGCATTGGCTGAA
TATGTCAACAAGGAAGGAGGCACCAACGTGAAATTAGCTGTAGCTCCGCAAAATGTAGTT
GTGTTAACACCTGATAATTTCGAGGAGATTGTACTGGATCAGAACAAAGATGTCCTCGTC
GAGTTTTATGCCCCATGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGCTCCTGTGTATGAGAAGGTA
GCGACGGTGTTTAAACAGGAAGAAAGTGTAGTAATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACAC
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ATTAATGAGAAAGTTGGGACCAGCAGAGACAGTCAAGGGCAGCTTACTTCAAAGGCTGGT
ATAGTTGAAAGCTTAGATGCGTTGGTAAAGGAGCTAGTTGCAGCCAGTGAAGATGAGAAG
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TATGGGAAGCTTTACTCGAAACTCGCAAAGAGCTATATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCT
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AAGCCCTGAGAGTGTATAGGAGTCGACAGACTCTCTATATAAAAACTGATATAGTTTGTA
GAGTCGGTGTTTTGTGGACTTTTTTATGTCTGTTGTTATTTCTGTTTAGTTCCTCTATAC
ATTATCGACTTAGTTTTTGTTTTGTATGGATTCAGTTTCAGGCTTTTCACCAACCAAAGA
AAGAAATCAGAAAACCTGCGTTGCTT


BQ
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AF RR4DS90TF U 1
AF RR4DS90JQ C 502
BS 1 719 RR4DS90TF
BS 720 1346 RR4DS90JQ

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ATCTGGTTTGGTTTAGCCTTACTCGCGTTGCTTGTGGTGTCATCAGCCGTAGCAGACGAT
GTGGTTGTGTTGACGGATGATAGCTTCGAGAAGGAAGTTGGTAAAGATAAAGGAGCTCTT
GTCGAGTTTTACGCTCCCTGGTGTGGTCACTGCAAGAAACTTGCTCCAGAGTATGAAAAG
CTTGGGGCAAGCTTCAAGAAAGCTAAGTCTGTCTTGATTGCAAAGGTAGATTGTGATGTG
CATAAGAGCGTCTGCACTAAATATGGTGTTAGTGGTTATCCCACCATTCAGTGGTTTCCT
AAAGGCTCTCTTGAACCCCAAAAGTATGAAGGTGCACGCAATGCTGAAGCATTGGCTGAA
TATGTCAACAAGGAAGGAGGCACCAACGTGAAATTAGCTGTAGCTCCGCAAAATGTAGTT
GTGTTAACACCTGATAATTTCGAGGAGATTGTACTGGATCAGAACAAAGATGTCCTCGTC
GAGTTTTATGCCCCATGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGCTCCTGTGTATGAGAAGGTA
GCGACGGTGTTTAAACAGGAAGAAAGTGTAGTAATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACAC
AAAAGCCTCGGCGAGAAGTATGGAGTAAGTGGATTCCCAACACTAAAGTTCTACCCAAA
GACACAAAGC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4DS90JQ 845 0 0
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GGCCACTGCAAGTCCCTCGCTCCTGTGTATGAGAAGGTAGCGACGGTGTTTAAACAGGAA
GAAGGTGTAGTAATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCTCGGCGAGAAGTAT
GGAGTAAGTGGATTCCCAACACTAAAGTTCTACCCAAAAGACAACAAAGCCGGTCAAGAT
TATGAGGGTGGAAGAGACTTGGATGACTTTGTAAGCTTCATTAATGAGAAAGTTGGGACC
AGCAGAGACAGTCAAGGGCAGCTTACTTCAAAGGCTGGTATAGTTGAAAGCTTAGATGCG
TTGGTAAAGGAGCTAGTTGCAGCCAGTGAAGATGAGAAGAAGGCAATCTTGTCTCGCATC
GAAGAGGAAGCTAGTAACCTCAAGGGGTCCACAACAAGGTATGGGAAGCTTTACTCGAAA
CTCGCAAAGAGCTATATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCTACAAAAGAAGTGGAGCGGCTT
GGACGCGTCCTTGGCAAGTCGATAAGTCCGGTGAAAGCTGATGAATTAACTCTGAAGAGA
AATATCTTGAGCACGTTCGTTGCTTCAGCTTAAAAGGCAAAGCCCTGAGAGTGTATAGGA
GTCGACAGACTCTCTATATAAAAACTGATATAGTTTGTAGAGTCGGTGTTTTGTGGACTT
TTTTATGTCTGTTGTTATTTCTGTTTAGTTCCTCTATACATTATCGACTTAGTTTTTGTT
TTGTATGGATTCAGTTTCAGGCTTTTCACCAACCAAAGAAAGAAATCAGAAAACCTGCGT
TGCTT

QA 1 845 1 845
DS 



CO CL2269Contig2 821 2 2 U
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CCTGTGTATGAGAAGGTAGCGACGGTGTTTAAGCAGGAAGAAGGTGTAGTAATTGCCAAC
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GATGACTTTGTAAGCTTCATTAATGAGAAAGTTGGGACCAGCAGAGACAGTCAAGGGCAG
CTTACTTCAAAGGCTGGTATAGTTGAACGGTTAGATGCGTTGGTAAAGGAGCTAGTTGCA
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BQ
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AF RR4GG25TF U 1
AF RR4GG25JQ C 66
BS 1 737 RR4GG25TF
BS 738 821 RR4GG25JQ

RD RR4GG25TF 737 0 0
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GATGACTTTGTAAGCTTCATTAATGAGAAAGTTGGGACCAGCAGAGACAGTCAAGGGCAG
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GCCAGTGAAGATGAGAAGAAGGCAATCTTGTCTCGCATCGAAGAGGAAGCTAGTAACCTC
AAGGGGTCCACAACAAGGTATGGGAAGCTTTACTCGAAACTCGCAAAGAGCTATATAGAA
AAAGGTTCAGGCTATGCTACAAAAGAAGTCGAGCGGCTTGGACGCGTCCTTGGCAAGTCG
ATAAGTCCGGTGAAAGCTGATGAATTAACTCTCAAGAGAAATATCCTGAGCACGTTCGTT
GCTTCGTCGTAAAAGGCAAAGCCCTGAGAGTGTATAGGAGTCGACAGACTCTATATTAAA
CTGATACAGTTTGTAGAGTCGGTGTTTTGTGGACTTTTTACGTCTGTTGTTATTTCTGTT
TAGTTCCTCTATACATT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4GG25JQ 756 0 0
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TGCTGATTCACACAAAAGCCTCGGCGAGAAGTATGGAGTAAGTGGATTCCCAACACTAAA
GTTCTTCCCAAAAGACAACAAAGCCGGTCAAGACTATGAGGGTGGAAGAGACTTAGATGA
CTTTGTAAGCTTCATTAATGAGAAAGTTGGGACCAGCAGAGACAGTCAAGGGCAGCTTAC
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TGAAGATGAGAAGAAGGCAATCTTGTCTCGCATCGAAGAGGAAGCTAGTAACCTCAAGGG
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TTCAGGCTATGCTACAAAAGAAGTCGAGCGGCTTGGACGCGTCCTTGGCAAGTCGATAAG
TCCGGTGAAAGCTGATGAATTAACTCTCAAGAGAAATATCCTGAGCACGTTCGTTGCTTC
GTCGTAAAAGGCAAAGCCCTGAGAGTGTATAGGAGTCGACAGACTCTATATTAAACTGAT
ACAGTTTGTAGAGTCGGTGTTTTGTGGACTTTTTACGTCTGTTGTTATTTCTGTTTAGTT
CCTCTATACATTATCTATTTAGTTTTTGTTTTGTATGGATTCAGTTTCAGGCTTTTCACC
TACAAAAGAAAGAAATAAGAATATCTCTACTAGACG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL2270Contig1 1207 4 6 U
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CCACACTGAGCATTGATGATAAGTTAGAAGCAAGACAGTTCTTCCAATCATGGTCGGACA
AAGTCTTTCAACACAAACCCAAATCTATTTTAGTCATCTCTGCTCACTGGGACACCGAGT
TTCCATCCGTCAACACTGTTCCCCGCAACTCCACCATCCACGATTTCAATAACTTCCCTG
ATCCCATGTACAAGGTCTCTCTCTTCCTCTTTCTCACAAAAAAAACCCTAACTTTTGTAA
TCTTGATCCTCAAGTTTATCCTTCAAGAAATGCATCAATAGCTTTATGTTTTACCAACTT
GATTCTTGCAGCTTAAGTATGAAGCACCAGGAGCCGTTGAGCTGGCGAAAAGGGTTAGAG
AGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACTTG
ATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATCCTGAGGCAGATATACCGGTTTGTC
AACTCTCTGTTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGG
CTCCACTGAAAGAATAAGGCGTTCTTATCATTGGATCTGGAAGTGCCACTCATAACTTGA
AGAAGCTTGACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGATTTTGATC
ATTGGCTCAGAGACTCTCTCCTACAAGGAAGGTATGAAGATGTGAATGAGTGGGAAGAGA
AAGCTCCAAATGCGAAAATGGCACATCCATGGCCAGAGCATTTCTACCCATTACACGTTG
CAATCGGTGCAGCTGGTGATGACGCCAAGGCAGAGCAAATCCACACAAGCGGGCAACTTG
GGACTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACTTCTTCCCTTTGAAACATTTCATCTTTAC
CTCCTTTCACTTGCCGTGTGACTACGTTAATGTAAGCACTGTGTATTTCACCTATCTCTA
ATAATCCAAATCCTTCTATGCAAATACAGTCTCCTCTCTAATAATACATGTGAGAGACTT
GGGTTGAGATACTCTCAATAGAGGATGCTCTAATGTAGATTGGTTTCTGTATAATATGGG
ATTCCCTTTGATGTATGAAAATTCCTAAAATGTTGTGTATATGACTGACTAATTTGGGTT
TTGTGGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ22TF U 1
AF RR4FZ90TF U 8
AF RR4FZ90JQ C 325
AF RR4FQ22JQ C 429
BS 1 67 RR4FQ22TF
BS 68 68 RR4FZ90TF
BS 69 113 RR4FQ22TF
BS 114 738 RR4FZ90TF
BS 739 1039 RR4FZ90JQ
BS 1040 1207 RR4FQ22JQ

RD RR4FQ22TF 113 0 0
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CCACACTTAGCATTGATGATAAGTTAGAAGCAAGACAGTTCTTCCAATCATGG

QA 1 113 1 113
DS 

RD RR4FZ90TF 731 0 0
GG
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GCATTGATGATAAGTTAGAAGCAAGACAGTTCTTCCAATCATGGTCGGACAAAGTCTTTC
AACACAAACCCAAATCTATTTTAGTCATCTCTGCTCACTGGGACACCGAGTTTCCATCCG
TCAACACTGTTCCCCGCAACTCCACCATCCACGATTTCAATAACTTCCCTGATCCCATGT
ACAAGGTCTCTCTCTTCCTCTTTCTCACAAAAAAAACCCTAACTTTTGTAATCTTGATCC
TCAAGTTTATCCTTCAAGAAATGCATCAATAGCTTTATGTTTTACCAACTTGATTCTTGC
AGCTTAAGTATGAAGCACCAGGAGCCGTTGAGCTGGCGAAAAGGGTTAGAGAGTTGCTAA
TGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACTTGATCATGGAG
CTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATCCTGAGGCAGATATACCGGTTTGTCAACTCTCTG
TTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTCCACTGA
AAGAATAAGGCGTTCTTATCATTGGATCTGGAAGTGCCACTCATAACTTGAAGAAGCTTG
ACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGATTTTGATCATTGGCTCA
GAGACTCTC

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR4FZ90JQ 717 0 0
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CACCAGGAGCCGTTGAGCTGGCGAAAAGGGTTAGAGAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAA
TGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACTTGATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTA
TGTTGATGTATCCTGAGGCAGATATACCGGTTTGTCAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAA
CCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTCCACTGAAAGAATAAGGCGTTC
TTATCATTGGATCTGGAAGTGCCACTCATAACTTGAAGAAGCTTGACTTTAGTATCACTG
ATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGATTTTGATCATTGGCTCAGAGACTCTCTCCTAC
AAGGAAGGTATGAAGATGTGAATGAGTGGGAAGAGAAAGCTCCAAATGCGAAAATGGCAC
ATCCATGGCCAGAGCATTTCTACCCATTACACGTTGCAATCGGTGCAGCTGGTGATGACG
CCAAGGCAGAGCAAATCCACACAAGCGGGCAACTTGGGACTCTGTCTTATTCTTCTTATA
GCTTCACTTCTTCCCTTTGAAACATTTCATCTTTACCTCCTTTCACTTGCCGTGTGACTA
CGTTAATGTAAGCACTGTGTATTTCACCTATCTCTAATAATCCAAATCCTTCTAT
AC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4FQ22JQ 779 0 0
ATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACTTGATCATGGA
GCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATC*TGAGGCAGATATACCGGTTTGTCAACTCTCT
GTTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTGGCTCCACTG
AAAGAAGAAGGCGTTCTTATCATTGGATCTGGAAGTGCCACTCATAACTTGAAGAAGCTT
GACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGAGTTTGATCATTGGCTC
AGAGACTCTCTCCTACAAGGAAGGTATGAAGATGTGAATGAGTGGGAAGAGAAAGCTCCA
AATGCGAAAATGGCACATCCATGGCCAGAGCATTTCTACCCATTACACGTTGCAATCGGT
GCAGCTGGTGATGACGCCAAGGCAGAGCAAATCCACACAAGCGGGCAACTTGGGACTCTG
TCTTATTCTTCTTATAGCTTCACTTCTTCCCTTTGAAACATTTCATCTTTACCTCCTTTC
ACTTGCCGTGTGACTACGTTAATGTAAGCACTGTGTATTTCACCTATCTCTAATAATCCA
AATCCTTCTATGCAAATACAGTCTCCTCTCTAATAATACATGTGAGAGACTTGGGTTGAG
ATACTCTCAATAGAGGATGCTCTAATGTAGATTGGTTTCTGTATAATATGGGATTCCCTT
TGATGTATGAAAATTCCTAAAATGTTGTGTATATGACTGACTAATTTGGGTTTTGTGGC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 4

CO CL2271Contig1 722 4 5 U
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GAGCTAAAGAGCGGAGAGCTCTACAGAGGAAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAAC
TGCCAGCTCGAGGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGGTATCGCAGCTTGAGCAT
GTTTTCATTAGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCGGACATTCTTAAGCATGCT
CCAATGTTCAAGCGCTTAGATGCAAGAATCAAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGC
AGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGAAAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGA
GGAGCAGTACCACCTGTGAGGAGATGATTTAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCT
GCAAACAACGCCAGCCAGCGTCTCTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAGGTTCACTTGT
AGAAACCAAATGTCCTTCTCTAACAAGGAGGCAAACAAGAGAAGAAGAGAGAAGTCTAGA
TGCACTCTATTAGTTCTGTATTTTGAGATGTTAAGACGTTAAAACATTGACAAGTTTTCC
TTGATGTTTTTGCATTCTCCACTTTCTGGCAGTAGATGAAATAAACAACGTACCCAATTT
CC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 

AF RR4B602TF U 1
AF RR4B654TF U 1
AF RR4B654JQ C 90
AF RR4B602JQ C 25
BS 1 578 RR4B602TF
BS 579 630 RR4B654TF
BS 631 631 RR4B602JQ
BS 632 720 RR4B654TF
BS 721 722 RR4B602JQ

RD RR4B602TF 578 0 0
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CGAAGTCTGGGAATACCGGTGAAGCTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGACGGTG
GAGCTAAAGAGCGGAGAGCTCTACAGAGGAAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAAC
TGCCAGCTCGAGGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGGTATCGCAGCTTGAGCAT
GTTTTCATTAGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCGGACATTCTTAAGCATGCT
CCAATGTTCAAGCGCTTAGATGCAAGAATCAAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGC
AGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGAAAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGA
GGAGCAGTACCACCTGTGAGGAGATGATTTAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCT
GCAAACAACGCCAGCCAGCGTCTCTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAGGTTCACTTGT
AGAAACCAAATGTCCTTCTCTAACAAGGAGGCAAACAA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4B654TF 720 0 0
GGATCTGAATCGCGTTAGATCGGAAGGGTCGTAGTTAGTTAGGGTTTAGAAGAGATGAGC
CGAAGTCTGGGAATACCGGTGAAGCTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGACGGTG
GAGCTAAAGAGCGGAGAGCTCTACAGAGGAAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAAC
TGCCAGCTCGAGGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGGTATCGCAGCTTGAGCAT
GTTTTCATTAGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCGGACATTCTTAAGCATGCT
CCAATGTTCAAGCGCTTAGATGCAAGAATCAAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGC
AGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGAAAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGA
GGAGCAGTACCACCTGTGAGGAGATGATTTAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCT
GCAAACAACGCCAGCCAGCGTCTCTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAGGTTCACTTGT
AGAAACCAAATGTCCTTCTCTAACAAGGAGGCAAACAAGAGAAGAAGAGAGAAGTCTAGA
TGCACTCTATTAGTTCTGTATTTTGAGATGCTAAGACGTTAAAACATTGACAAGTTTTCC
TTGATGTTTTTGCATTCTCCACTTTCTGGCAGTAGATGAAATAAACAACGTACCCAATTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4B654JQ 633 0 0
CCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGACGGTGGAGCTAAAGAGCGGAGAGCTTTACAGAGG
AAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTGGAGGACATTACCTTTACCGC
TCAGGATGGTAAGGTATCGCAGCTTGAGCATGTTTTCATTAGAGGCAGCAAAGTCAGGTT
TATGGTCATACCGGACATTCTTAAGCATGCTCCAATGTTCAAGCGCTTAGATGCAAGAAT
CAAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGCAGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGAAAAGC
TCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGAGGAGCAGTACCACCTGTGAGGAGATGATT
TAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCTGCAAACAACGCCAGCCAGCGTCTCTTACG
TTTGTTGTGTATTGCTTTAAGGTTCACTTGTAGAAACCAAATGTCCTTCTCTAACAAGGA
GGCAAACAAGAGAAGAAGAGAGAAGTCTAGATGCACTCTATTAGTTCTGTATTTTGAGAT
GTTAAGACGTTAAAACATTGACAAGTTTTCCTTGATGTTTTTGCATTTTCCACTTTCTGG
CAGTAGATGAAATAAACAACGTACCCAATTT
CC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4B602JQ 698 0 0
AGGGTCGTAGTTAGTTAGGGTTTAGAAGAGATGAGCCGAAGTCTGGGAATACCGGTGAAG
CTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGACGGTGGAGCTAAAGAGCGGAGAGCTCTAC
AGAGGAAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGAGGACATTACCTTT
ACCGCTCAGGATGGTAAGGTATCGCAGCTTGAGCATGTTTTCATTAGAGGCAGCAAAGTC
AGGTTTATGGTCATACCGGACATTTTTAAGCATGCTCCAATGTTCAAGCGCTTAGATGCA
AGAATCAAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGCAGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGA
AAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGAGGAGCAGTACCACCTGTGAGGAGA
TGATTTAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCTGCAAACAACGCCAGCCAGCGTTTC
TTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAGGTTCACTTGTAGAAACCAAATGTCCTTCTCTAAC
AAGGAGGCAAACAAGAGAAGAAGAGAGAAGTCTAGATGCACTCTATTAGTTCTGTATTTT
GAGATGTTAAGACGTTAAAACATTGACAAGTTTTCCTTGATGTTTTTGCATTCTCCACTT
TCTGGCAGTAGATGAAATAAACAACGTACCCAATTTCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 4

CO CL2272Contig1 889 4 8 U
GGAACAAGAAGAAAAATCATCGAGAACCTCTCCTTTCTCTCTCATTTAACAGAGGAAGAA
GAAACCACTGGTTTGAGCTCCGACGACCGGCGCGTGGTTGCTCCGTTAGCACCACCGCCG
GTCCAGTTCTCTTTAATTTCTCTTCGATTGTAGGTTGTGTGTTTTTTTAGGTTTGTTTGT
GCGGATCTGAACAAGTGGATTTAAGTTGTTCTGGTGGAAACCTAGGTCTAGATCTTCAGA
CCGGATCTTGGAGTGGTGGTGGTGGTCGGTGGTAGCTTGCTCGAAGCCTTCTTCCGGCTT
TGTTCTGGCTTCCTTCTCCCGTCCTTGTCTTCCTCTCTTGTGGTCCTTGCGTCTGGTTTG
TGCGTTTCGTTTTTTGGTTCTTGTGGTGGATCCATCGTGGTAGGCAGGTTGTGCTTCCTT
GTTGCCTTTGGTTGCGACGGATGAATTCCGTTCGGTGTGGTGAATTTCCCGGCTCGTGGT
TCAAGGATTTGGGGCTTTGTCCCTTTGCACCTTTCCGTGGAGGCTTGTGAGGTAAACTGG
TTCCTCTTCCTCCTGGGTGGTTCTCTGTTGGTTCCTGTGGCTCGTCAGGGTTTGTTCCGG
AGCTGTTGAAAAAAGGACAAGAGTCTTCCCCTAATAAGTTTGTTTGTGGTGTGCGCTTAT
CTCCTTCCTCCTACCGCTTTTGATCCATTTGCTTGACCTTTGTTTGATGGTTTTAGGTTT
TCATTGGTCTGCCTTATAATTTTTGTTTGTTCAGGTTTTATTTTGGCTCCAGAGAATTCA
AGTAATTCTGCTGGCTCTTGACTCCAGAGAATTTAGATTTCTGCTGGCTATGTGTATGAA
ATATGTATCTCATCTCTGAATCTATCAATGAAAATCATCTTTTAGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GV74TF U 78
AF RR4H196TF U 1
AF RR4GV74JQ C 163
AF RR4H196JQ C 276
BS 1 584 RR4H196TF
BS 585 695 RR4GV74JQ
BS 696 696 RR4H196JQ
BS 697 787 RR4GV74JQ
BS 788 788 RR4H196JQ
BS 789 820 RR4GV74JQ
BS 821 821 RR4H196JQ
BS 822 889 RR4GV74JQ

RD RR4GV74TF 194 0 0
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TTCTCTTCGATTGTAGGTTGTGTGTTTTTTTAGGTTTGTTTGTGCGGATCTGAACAAGTG
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GGTGGTGGTCGGTG

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR4H196TF 584 0 0
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GAAACCACTGGTTTGAGCTCCGACGACCGGCGCGTGGTTGCTCCGTTAGCACCACCGCCG
GTCCAGTTCTCTTTAATTTCTCTTCGATTGTAGGTTGTGTGTTTTTTTAGGTTTGTTTGT
GCGGATCTGAACAAGTGGATTTAAGTTGTTCTGGTGGAAACCTAGGTCTAGATCTTCAGA
CCGGATCTTGGAGTGGTGGTGGTGGTCGGTGGTAGCTTGCTCGAAGCCTTCTTCCGGCTT
TGTTCTGGCTTCCTTCTCCCGTCCTTGTCTTCCTCTCTTGTGGTCCTTGCGTCTGGTTTG
TGCGTTTCGTTTTTTGGTTCTTGTGGTGGATCCATCGTGGTAGGCAGGTTGTGCTTCCTT
GTTGCCTTTGGTTGCGACGGATGAATTCCGTTCGGTGTGGTGAATTTCCCGGCTCGTGGT
TCAAGGATTTGGGGCTTTGTCCCTTTGCACCTTTCCGTGGAGGCTTGTGAGGTAAACTGG
TTCCTCTTCCTCCTGGGTGGTTCTCTGTTGGTTCCTGTGGCTCG

QA 1 584 1 584
DS 

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TAGGTCTAGATCTTCAGACCGGATCTTGGAGTGGTGGTGGTGGTCGGTGGTAGCTTGCTC
GAAGCCTTCTTCCGGCTTTGTTCTGGCTTCCTTCTCCCGTCCTTGTCTTCCTCTCTTGTG
GTCCTTGCGTCTGGTTCGTGCGTTTCGTTTTTTGGTTCTTGTGGTGGATCCATCGTGGTA
GGCAGGTTGTGCTTCCTTGTTGCCTTTGGTTGCGACGGATGAATTCCGTTCGGTGTGGTG
AATTTCCCGGCTCGTGGTTCAAGGATTTGGGGCTTTGTCCCTTTGCACCTTTCCGTGGAG
GCTTGTGAGGTAAACTGGTTCCTCTTCCTCCTGGGTGGTTCTCTGTTGGTTCCTGTGGCT
CGTCAGGGTTTGTTCCGGAGCTGTTGAAAAAAGGACAAGAGTCTTCCCCTAATAAGTTTG
TTTGTGGTGTGCGCTTATCTCCTTCCTCCTACCGCTTTTGATCCATTTGCTTGGCCTTTG
TTTGATGGTTTTAGGTTTTCATTGGTCTGCCTTATAATTTTTGTTTGTTCAGGTTTTATT
TTGGCTCCAGAGAATTCAAGTAATTTTGCTGGCTCTTGACTCCAGAGAATTTAGATTTTT
GCTGGCTATGTGTATGAAATATGTATCTCATCTCTGAATCTATCAATGAAAATCATCTTT
TAGTGCG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4H196JQ 614 0 0
CTTGCTCGAAGCCTTCTTCCGGCTTTGTTCTGGCTTCCTTCTCCCGTCCTTGTCTTCCTC
TCTTGTGGTCCTTGCGTCTGGTTTGTGCGTTTCGTTTTTTGGTTCTTGTGGTGGATCCAT
CGTGGTAGGCAGGTTGTGCTTCCTTGTTGCCTTTGGTTGCGACGGATGAATTCCGTTCGG
TGTGGTGAATTTCCCGGCTCGTGGTTCAAGGATTTGGGGCTTTGTCCCTTTGCACCTTTC
CGTGGAGGCTTGTGAGGTAAACTGGTTCCTCTTCCTCCTGGGTGGTTCTCTGTTGGTTCC
TGTGGCTCGTCAGGGTTTGTTCCGGAGCTGTTGAAAAAAGGACAAGAGTCTTCCCCTAAT
AAGTTTGTTTGTGGTGTGCGCTTATCTCCTTCCTCCTACCGCTTTTGATCCATTTGCTTG
ACCTTTGTTTGATGGTTTTAGGTTTTCATTGGTCTGCCTTATAATTTTTGTTTGTTCAGG
TTTTATTTTGGCTCCAGAGAATTCAAGTAATTCTGCTGGCTCTTGACTCCAGAGAATTTA
GATTTCTGCTGGCTATGTGTATGAAATATGTATCTCATCTCTGAATCTATCAATGAAAAT
CATCTTTTAGTG
TG

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL2273Contig1 710 4 2 U
GTAAAAGAACGCGTAGGACTCGCCGTAAAAGGTCATCATCCACTTTTGGTGATCCAAGAA
CTCCACCACTACTACCAGATGCAGAATGTCTGAAACAGGAGAGGAGAAATGGTCCGGTTT
GGTTCTCACTTGTTGCTTCGAATAATCAGGAACGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCAG
CAAACTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCTTTTATCCAAAAGTATCTCA
TGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAGGTAGAGATAAGATGTATGGGAGAGCCGG
TGATCCCAACGTTGCAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGCAAACAATAACTTCTA
AACATGAAAGAGTCACTGCATCGATAGGTTCCTCTGCAAAGGAGTTTGTAATGGTGCTAG
TTTATGCTCGAAAGCTCCCTGAATGCAGCAACTGAAGAACAACTGCTTAAGACTCTTATC
TTCAATGAATCATTTCTAGACCGAGAGGATTAAGAAGTGAAGTGCAGGGAGCAGTCGAAT
GTGTTGTGTAGTTTTTTTTTTTGAGCAACGTGTTGTGTAGTTTAGTAATTAAGTTATATG
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AAGAATATTCAAAATAGTTTCTACGAAGGAGATTGTGACCGTTTTGGACG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GA43TF U 1
AF RR4G375TF U 1
AF RR4GA43JQ C 1
AF RR4G375JQ C 227
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BS 684 710 RR4GA43JQ

RD RR4GA43TF 387 0 0
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GGTTCTCACTTGTTGCTTCGAATAATCAGGAACGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCAG
CAAACTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCTTTTATCCAAAAGTATCTCA
TGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAGGTAGAGATAAGATGTATGGGAGAGCCGG
TGATCCCAACGTTGCAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGCAAACAATAACTTCTA
AACATGAAAGA*TCACTGCATCGATAG

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4G375TF 683 0 0
GTAAAAGAACGCGTAGGACTCGCCGTAAAAGGTCATCATCCACTTTTGGTGATCCAAGAA
CTCCACCACTACTACCAGATGCAGAATGTCTGAAACAGGAGAGGAGAAATGGTCCGGTTT
GGTTCTCACTTGTTGCTTCGAATAATCAGGAACGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCAG
CAAACTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCTTTTATCCAAAAGTATCTCA
TGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAGGTAGAGATAAGATGTATGGGAGAGCCGG
TGATCCCAACGTTGCAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGCAAACAATAACTTCTA
AACATGAAAGAGTCACTGCATCGATAGGTTCCTCTGCAAAGGAGTTTGTAATGGTGCTAG
TTTATGCTCGAAAGCTCCCTGAATGCAGCAACTGAAGAACAACTGCTTAAGACTCTTATC
TTCAATGAATCATTTCTAGACCGAGAGGATTAAGAAGTGAAGTGCAGGGAGCAGTCGAAT
GTGTTGTGTAGTTTTTTTTTTTGAGCAACGTGTTGTGTAGTTTAGTAATTAAGTTATATG
AGTTTTTTCTTCTTTATAATTTTAAAATGAAATGATTGGTGAGACAGACTTTGTTTGTCT
AAGAATATTCAAAATAGTTTCTA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4GA43JQ 710 0 0
GTAAAAGAACGCGTAGGACTCGCCGTAAAAGGTCATCATCCACTTTTGGTGATCCAAGAA
CTCCACCACTACTACCAGATGCAGAATGTCTGAAACAGGAGAGGAGAAATGGTCCGGTTT
GGTTCTCACTTGTTGCTTCGAATAATCAGGAACGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCAG
CAAACTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCTTTTATCCAAAAGTATCTCA
TGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAGGTAGAGATAAGATGTATGGGAGAGCCGG
TGATCCCAACGTTGCAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGCAAACAATAACTTCTA
AACATGAAAGAGTCACTGCATCGATAGGTTCCTCTGCAAAGGAGTTTGTAATGGTGCTAG
TTTATGCTCGAAAGCTCCCTGAATGCAGCAACTGAAGAACAACTGCTTAAGACTCTTATC
TTCAATGAATCATTTCTAGACCGAGAGGATTAAGAAGTGAAGTGCAGGGAGCAGTCGAAT
GTGTTGTGTAGTTTTTTTTTTTGAGCAACGTGTTGTGTAGTTTAGTAATTAAGTTATATG
AGTTTTTTCTTCTTTATAATTTTAAAATGAAATGATTGGTGAGACAGACTTTGTTTGTCT
AAGAATATTCAAAATAGTTTCTACGAAGGAGATTGTGACCGTTTTGGACG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4G375JQ 484 0 0
CCAAAAGTATCTCATGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAGGTAGAGATAAGATG
TATGGGAGAGCCGGTGATCCCAACGTTGCAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGCA
AACAATAACTTCTAAACATGAAAGAGTCACTGCATCGATAGGTTCCTCTGCAAAGGAGTT
TGTAATGGTGCTAGTTTATGCTCGAAAGCTCCCTGAATGCAGCAACTGAAGAACAACTGC
TTAAGACTCTTATCTTCAATGAATCATTTCTAGACCGAGAGGATTAAGAAGTGAAGTGCA
GGGAGCAGTCGAATGTGTTGTGTAGTTTTTTTTTTTGAGCAACGTGTTGTGTAGTTTAGT
AATTAAGTTATATGAGTTTTTTCTTCTTTATAATTTTAAAATGAAATGATTGGTGAGACA
GACTTTGTTTGTCTAAGAATATTCAAAATAGTTTCTACGAAGGAGATTGTGACCGTTTTG
GACG

QA 1 484 1 484
DS 



AS 2 4

CO CL2274Contig1 894 2 2 U
GTCGTGGAGGGATTCCAGTATTGTTTCCGCAATACTCTAACATGGTCCACTTCCCTCACA
TGGGTTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAGTTGATGCTAATCCACCTCCTATACATTCACA
TCCTTCTTCTGGTGCTCACGTTGACCTCATCCTTAAATCATCCGAAGCTGATTTGAAGAT
CTGGCCTCATAAATTTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGACTTGAT
TTTGACACCTCGTATTAAAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCA
TCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGA
TTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAATTTATAACTTT
TAATTCACAGCTTGACAGGCTTTACTTAAGGACTCCAAATACGCTCAGAATCGTGGACCA
CAAGAAAAATAAGACAATCGTGGTACGCAAGGAAGGACAAGCTGATGCAGTGGTGTGGAA
TCCATGGGACAAGAAAGTGTCAGATTTGGGAGTTGAAGATTACAGAAGTTTTGTTGCTGT
AGAACCCGTTGCGGTCGAGAAACCGATCATATTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAAGCGAT
AGTCCACGTGTCTGTGGTTCCTTCTGGTTGCTCCAGGAAGTCATGCATTCCTCATAAATA
AAAACTTTTAAAAAATGCCGTTACAGAAAATACTATACGTTACAGAATCATATGTTGAAC
ACCGAGTCAGGATCCACACCTGACCTTACCAGTTTATTTGTTTCGTAATTTTCGTATTCT
TGGATCATGTTATCTACAATAATTGATATTTTCAATAATAATTTCAATTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ96TF U 1
AF RR4DJ96JQ C 272
BS 1 733 RR4DJ96TF
BS 734 894 RR4DJ96JQ

RD RR4DJ96TF 735 0 0
GTCGTGGAGGGATTCCAGTATTGTTTCCGCAATACTCTAACATGGTCCACTTCCCTCACA
TGGGTTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAGTTGATGCTAATCCACCTCCTATACATTCACA
TCCTTCTTCTGGTGCTCACGTTGACCTCATCCTTAAATCATCCGAAGCTGATTTGAAGAT
CTGGCCTCATAAATTTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGACTTGAT
TTTGACACCTCGTATTAAAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCA
TCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGA
TTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAATTTATAACTTT
TAATTCACAGCTTGACAGGCTTTACTTAAGGACTCCAAATACGCTCAGAATCGTGGACCA
CAAGAAAAATAAGACAATCGTGGTACGCAAGGAAGGACAAGCTGATGCAGTGGTGTGGAA
TCCATGGGACAAGAAAGTGTCAGATTTGGGAGTTGAAGATTACAGAAGTTTTGTTGCTGT
AGAACCCGTTGCGGTCGAGAAACCGATCATATTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAAGCGAT
AGTCCACGTGTCTGTGGTTCCTTCTGGTTGCTCCAGGAAGTCATGCATTCCTCATAAATA
AAAACTTTTAAAA
AA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4DJ96JQ 623 0 0
GAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCATCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTCAA
ATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGT
TTCACTGACCATGGCAAATTTATAACTTTTAATTCACAGCTTGACAGGCTTTACTTAAGG
ACTCCAAATACGCTCAGAATCGTGGACCACAAGAAAAATAAGACAATCGTGGTACGCAAG
GAAGGACAAGCTGATGCAGTGGTGTGGAATCCATGGGACAAGAAAGTGTCAGATTTGGGA
GTTGAAGATTACAGAAGTTTTGTTGCTGTAGAACCCGTTGCGGTCGAGAAACCGATCATA
TTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAAGCGATAGTCCACGTGTCTGTGGTTCCTTCTGGTTGC
TCCAGGAAGTCATGCATTCCTCATAAATAAAAACTTTTAAAAAATGCCGTTACAGAAAAT
ACTATACGTTACAGAATCATATGTTGAACACCGAGTCAGGATCCACACCTGACCTTACCA
GTTTATTTGTTTCGTAATTTTCGTATTCTTGGATCATGTTATCTACAATAATTGATATTT
TCAATAATAATTTCAATTTTAGC

QA 1 623 1 623
DS 



CO CL2274Contig2 821 2 2 U
AAAGGTTCTGGGAAATTGATGCTAATCCACCTCCTTTACACTCACATTCTTCTTCGGGTG
CTCACGTTGACCTCATCCTAAAATCATCCGAAGCTGATTTGAAGATCTGGCCTCATAAAT
TTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGACTTGATTTTGACACCTCGTA
TTAGAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCACCCCTATTTCTCTG
TTTCTGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCAAC
AAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAAGTTATAACTTTCAATTCACAGCTTG
ACAGGCTTTACTTAAGGACTCCAAATACGCTCAGAATCGTGGACCACAAGGAAAATAAGA
CAATCGTGGTACGCAAGCGAGGACAAGCTGATGCAGTGGTGTGGAATCCATGGGACAAGA
AAGTGTCAGATTTGGGAGTTGAAGATTACAGAAGTTTTGTTGCTGTCGAGCCCGTTGCGG
TCGAGAAACCGATCATATTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAAGCGATAGTCCATGTGTCTG
TGGTTCCTTCTGGTTGCTCCAGGAAGTCATGCATTCCTCATAAATAAAAACTTTTAAAAC
ATGTCGTTAAAGAAATACTATACGTTACAGAATCATATGTTGAACACCGAGTCGGGATCC
CCCCCTGACATTACCAGTGTATTTGTTTTGTAATTTTAGTATTCTTGGATCATGTTATCT
ACAATAACTGATATTTTCAATAATAATTTCAATTTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H950TF U 1
AF RR4H950JQB C 193
BS 1 370 RR4H950TF
BS 371 821 RR4H950JQB

RD RR4H950TF 370 0 0
AAAGGTTCTGGGAAATTGATGCTAATCCACCTCCTTTACACTCACATTCTTCTTCGGGTG
CTCACGTTGACCTCATCCTAAAATCATCCGAAGCTGATTTGAAGATCTGGCCTCATAAAT
TTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGACTTGATTTTGACACCTCGTA
TTAGAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCACCCCTATTTCTCTG
TTTCTGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCAAC
AAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAAGTTATAACTTTCAATTCACAGCTTG
ACAGGCTTTA

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR4H950JQB 629 0 0
ATGTA
GAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCACCCCTATTTCTCTGTTTCTGATATCAGTCAA
ATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGT
TTCACTGACCATGGCAAAGTTATAACTTTCAATTCACAGCTTGACAGGCTTTACTTAAGG
ACTCCAAATACGCTCAGAATCGTGGACCACAAGGAAAATAAGACAATCGTGGTACGCAAG
CGAGGACAAGCTGATGCAGTGGTGTGGAATCCATGGGACAAGAAAGTGTCAGATTTGGGA
GTTGAAGATTACAGAAGTTTTGTTGCTGTCGAGCCCGTTGCGGTCGAGAAACCGATCATA
TTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAAGCGATAGTCCATGTGTCTGTGGTTCCTTCTGGTTGC
TCCAGGAAGTCATGCATTCCTCATAAATAAAAACTTTTAAAACATGTCGTTAAAGAAATA
CTATACGTTACAGAATCATATGTTGAACACCGAGTCGGGATCCCCCCCTGACATTACCAG
TGTATTTGTTTTGTAATTTTAGTATTCTTGGATCATGTTATCTACAATAACTGATATTTT
CAATAATAATTTCAATTTTAGTCC

QA 6 629 6 629
DS 



AS 1 4

CO CL2275Contig1 602 4 4 U
GGATATCTCACAAAAAAAATGAATAATTTCATAGTGTTTTTGTTTGTTATTGCTATATGT
TTTGGATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTGTAGTATTCACGAACGAACTCGGTAAT
GGTAGTACTATTTTTCATGTCAAGTGTCAATCTTACAACCCATCCATTAATCATCCACAA
ATAGATATACAACCCGGCAAGAATCATATTTTCCGATTCGTCTCGGCTAAAGAAAGAACA
ACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTCGTCCTCGA
ATAAGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATAAATGTGGT
CAGTACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATCCTAATGAA
CCACTGGAGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCCTAAATGCT
ATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTAAATTGTAT
AAATAAATAAAGTACTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGTTTCC
GC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 

AF RR4F344JQ C 1
AF RR4FM65JQ C 64
AF RR4F344TF U 1
AF RR4FM65TF U 20
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ATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTAAATTGTAT
AAATAAATAAAGTACTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGTTTCC
GC

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DS 

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TATTATTGTACAGTTTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTCGTCCTCGAATA
AGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATAAATGTGGTCAG
TACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATCCTAATGAACCA
CTGGGGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCCTAAATGCTATA
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TAAATAAAGTGCTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGTTTCCG

QA 1 538 1 538
DS 

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GGTAGTACTATTTTTCATGTCAAGTGTCAATCTTACAACCCATCCATTAATCATCCACAA
ATAGATATACAACCCGGCAAGAATCATATTTTCCGATTCGTCTCGGCTAAAGAAAGAACA
ACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTCGTCCTCGA
ATAAGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATAAATGTGGT
CAGTACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCATAAGAAATCCTAATGAA
CCACTGGAGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCCTAAATGCT
ATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTAAATTGTAT
AAATAAATAAAGTACTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGTTTCC
G
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4FM65TF 582 0 0
G
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CGCAGAAAGTCGTGTAGTATTCACGAACGAACTCGGTAATGGTAGTACTATTTTTCATGT
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GAATCATATTTTCCGATTCGTCTCGGCTAAAGAAAGAACAACGTATTATTGTACAGTCTT
TTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTCGTCCTCGAATAAGACAGTTTCATGAACT
CGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATAAATGTGGTCAGTACCGTGAATGGAGTGC
CAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATCCTAATGAACCACTGGGGCATGCGCTTAA
ATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCCTAAATGCTATAACAATATTTATGTACGT
TGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTAAATTGTATAAATAAATAAAGTGCTACAG
TATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGTTTCCG

QA 2 582 2 582
DS 



AS 1 4

CO CL2276Contig1 1019 4 4 U
GGCGGCTTCTGCCGTCATGCTCTGCCTTGAGTCTTGGTATGCTCAGATTCTTGTTCTTCT
CGCTGGACTTCTTAAGAACCCTGAACTCGCTTTGGATTCTCTAGCTATCTGCATGTCAAT
CTCTGCAATCTCATTCATGGTCTCCGTTGGATTCAACGCAGCTGCAAGTGTGAGAGTTAG
TAATGAATTAGGCGCTGGAAACCCAAGATCAGCAGCATTTTCAACCGCAGTAACTACAGG
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CAGCTACGTTTTTACAGACAGTCCAGCGGTTGCTGAAGCTGTAGCCGAGCTCGCTCCTTA
CTTGGCTATTACCATAGTTCTAAATGGAGTTCAACCTGTTTTATCTGGTGTGCCGTTGGA
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CCTATTGGTTATGTTCTTGGTTTCACCTATGACATGGGAGCTAAGGGAATATGGACAGGA
ATGATTGGTGGTACACTCATGCAAACTATCATCTTGCTCGTTGTCACTTTCCGAACTGAT
TGGGATAAAGAGGTGGAGAAGGCTTCAAGACGATTGGACCAGTGGGAAGATACACAAGCG
CCTCTTCTTAAGCAGTAAACAAAAATGATTTTTTCAAAAAGAAAATTTATCTTGGGAGAG
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ATTGAGAAGTGAGAATGAAATGTTGAAATAAAAGACGATGTATTGTGTGTAAAAGCGAAT
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EU22TF U 1
AF RR4EZ13TF U 1
AF RR4EU22JQ C 315
AF RR4EZ13JQ C 409
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TGGGATAAAGAGGTGGAGAAGGCTTCAAGACGATTGGACCAGTGGGAAGATACACAAGCG
CCTCTTCTTAAGCAGTAAACAAAA
TG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EZ13TF 696 0 0
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CGCTGGACTTCTTAAGAACCCTGAACTCGCTTTGGATTCTCTAGCTATCTGCATGTCAAT
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TAATGAATTAGGCGCTGGAAACCCAAGATCAGCAGCATTTTCAACCGCAGTAACTACAGG
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CAGCTACGTTTTTACAGACAGTCCAGCGGTTGCTGAAGCTGTAGCCGAGCTCGCTCCTTA
CTTGGCTATTACCATAGTTCTAAATGGAGTTCAACCTGTTTTATCTGGTGTGCCGTTGGA
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CCTATTGGTTATGTTCTTGGTTTCACCTATGACATGGGAGCTAAGGGAATATGGACAGGA
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TGGGATAAAGAGGTGGAGAAAGCTTCAAGACGATTGGACCAGTGGGAAGATACACAAGCG
CCTCTTCTTAAGCAGTAAACAAAA*TGATTTTTTCA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4EU22JQ 705 0 0
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TCTTGGTTTCACCTATGACATGGGAGCTAAGGGAATATGGACAGGAATGATTGGTGGTAC
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TTAATATATTTTTTTCTTCTGGTCTTCTCCAAGTTGATTTAAAAGGGATTAAAACATCAT
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TAGAAGGAGCAAATCAAGTAATGAACCATTGGGTTTATAATACAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4EZ13JQ 611 0 0
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ATTGTGGGGATTCCTATTGGTTATGTTCTTGGTTTCACCTATGACATGGGAGCTAAGGGA
ATATGGACAGGAATGATTGGTGGTACACTCATGCAAACTATCATCTTGCTCGTTGTCACT
TTCCGAACTGATTGGGATAAAGAGGTGGAGAAGGCTTCAAGACGATTGGACCAGTGGGAA
GATACACAAGCGCCTCTTTTTAAGCAGTAAACAAAAATGATTTTTTCAAAAAGAAAATTT
ATCTTGGGAGAGATTTAGAGGTCAATTTAATATATTTTTTTCTTCTGGTCTTCTCCAAGT
TGATTTAAAAGGGATTAAAACATCATTAGTTAATCAAGAGATCTGTTGATTAATGAATTG
GAAAACCGATAGTTTTTTGCGGGGTTAGAGTGAAGAGAAGGGAGTCAATGTATATTCTTT
TGTAAGATGAATATTGAGAAGTGAGAATGAAATGTTGAAATAAAAGACGATGTATTGTGT
GTAAAAGCGAATTTGTTGTAACCGTTTAGAAGGAGCAAATCAAGTAATGAACCATTGGGT
TTATAATACAT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 2 4

CO CL2277Contig1 932 2 6 U
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CGTGAGCAGTGTTATTGAAGCATAGATTATTACATAAAACTCTGTTTTCATTAGGCTAAA
GATAGAACATTACACTATATGTGATGAAAAACGGCGTCGTAAGTAGAAGGCATGAGAGCA
ACCTGTTGATCTGATATAGTCATGCATGGCTACTACAATGGAGAACAAACAGAGCAGGAC
CATGAGATTCAACTTGAATCGTCACCGAATCTTTCGTCGGTCCAAAATCTTTGCCGCTCC
ATAACTCGTGGCCCTTACACGAACCTCCTTCAAGATGCGTCTTGTTCTCAAGAGCCTTGG
CAATGTCTGATATCTTGGCTGATACCGTCGTCTTCACCGGGTTCAAGTTGAAAAAGGCGA
CGTACACTTCTCCTCCTCTTCCCGTAGCAATCCAAGAACGAACACCACTGGAGCTAGCTT
CAGCTGCTTTCACTGGATTTAACACGGCGCAAAGACCAGAGTAACTGTTCTCTAGTGTTC
CGCTACTGTGAAGCTCCCACATCTGGTTTGCGTCTAGTTTGCAAGGTGATAACGCGCCGC
GGCTATACTCTTTGGAAGTGAGCTTTTGCCTTGAGGAAGCTCCTAAACAAGACTCTGCTT
TATCATTTGTTTGTAAATGAAGCTTACCTTGATAGAGCTGCTTGTGTTCTATCTCCTCAT
TGTAAGATATAAGAGCTTTTCTGTTGTATAAGCAAAAGGGCTTCTCTGGTTTCTCGGTTG
AGTATTGGTTCCTCCAACAGATTTTTCCACTGGACTTGTCTACAACTGACCATGTGTTGG
CTTTTGGTTCTTTGCAGCTAGTCAGACCAATGCATGTTTGGTTTTGAAGTTGTCGACTGT
TGGATGATGTGGATTTTCCTTGCCGCGGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FI62JQ U 1
AF RR4FV19JQ U 65
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BS 253 762 RR4FI62JQ
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CGCTACTGTGAAGCTCCCACATCTGGTTTGCGTCTAGTTTGCAAGGTGATAACGCGCCGC
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TATCATTTGTTTGTAAATGAAGCTTACCTTGATAGAGCTGCTTGTGTTCTATCTCCTCAT
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QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4FV19JQ 868 0 0
G
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TTGATCTGATATAGTCATGCATGGCTACTACAATGGAGAACAAACAGAGCAGGACCATGA
GATTCAACTTGAATCGTCACCGAATCTTTCGTCGGTCCAAAATCTTTGCCGCTCCATAAC
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TCTGATATCTTGGCTGATACCGTCGTCTTCACCGGGTTCAAGTTGAAAAAGGCGACGTAC
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***TTCACTGGATTTAACACGGCGCAAAGACCAGAGTAACTGTTCTCTAGTGTTCCGTTA
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TACTCTTTGGAAGTGAGCTTTTGCCTTGAGGAAGCTCCTAAACAAGACTCTGCTTTATCA
TTTGTTTGTAAATGAAGCTTACCTTGATAGAGCTGCTTGTGTTCTATCTCCTCATTGTAA
GATATAAGAGCTTTTCTGTTGTATAAGCAAAAGGGCTTCTCTGGTTTCTCGGTTGAGTAT
TGGTTCCTCCAACAGATTTTTCCACTGGACTTGTCTACAACTGACCATGTGTTGGCTTTT
GGTTCTTTGCAGCTAGTCAGACCAATGCATGTTTGGTTTTGAAGTTGTCGACTGTTGGAT
GATGTGGATTTTCCTTGCCGCGGTGAC

QA 2 868 2 868
DS 



CO CL2277Contig2 1303 2 6 U
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TGGGATTAGCACACAGGCTTATAACGCAAACACTCTTGTTATGGATAGTAGTGTTAAGGG
AGGAGGTGCTTATGAAGAATCCGGTAGGCAGTGGAGGGCGAAAGATATTGGGATGAAGGA
GAAGGCTTGTGTGTGGATGCCACATGGGTTCATGAGTGTGAATACTAAGTTAGGTGCTGG
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GAGTGTGACACCTACAATGGCTAAAGAAGTTAGTCAATTGGTTAACATGTACAGAATAAC
AGGTGATGATTGGGACACATGGAGAGACGTTGTGGCACATTTCGATATCTCGAGGGATCT
ATCTGCTTCTAGTATGATCGGTGCACGAGGGCTACAAGGAAAATCATGGCCTGATTTAGA
TATGTTACCTCTTGGATGGCTTACCGATCAAGGTTCGAACTTTGGACCTCATCGAGCTTG
TAATCTTACTATGGAAGAACAGAGGACACAGATGACATTGTGGTCTATAGCAAAGTCCCC
TCTCATGTTTGGAGGTGATGTGAGGAAGCTTGATGACGCTACTTATAATCCCATCACAAA
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CGCGGCAAGGAATAATCCACATCATCCAACAGTCGACAACTTCAAAACCAAACATGCATT
TGGTCTGACTAGCTGCAAAGAACCAAAAGCCAACACATGGTCAGTTGTAGACAAGTCCAG
TGGAAAAATCTGTTGGAGGAACCAATACTCAACCGAGAAACCAGAGAAGCCCTTTTGCTT
ATACAACAGAAAAGCTCTTATATCTTACAATGAGGAGATAGAACACAAGCAGCTCTATCA
AGGTAAGCTTCATTTACAAACAAATGATAAAGCAGAGTCTTGTTTAGGAGCTTCCTCAAG
CAAAAGCTCACTTCCAAAGAGTATAGCCGCGGCGCGTTATCACCTTGCAAACTAGACGCA
AACCAGATGTGGGAGCTTCACAGTAACGGACACTAGAGACAGTTACTCTGGTCTTTGCGC
GTGTTAATCCAGTGAAGCTGAGCTAGCTCCAGTGGTGTCGTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI62TF U 1
AF RR4FV19TF U 576
BS 1 642 RR4FI62TF
BS 643 643 RR4FV19TF
BS 644 659 RR4FI62TF
BS 660 660 RR4FV19TF
BS 661 775 RR4FI62TF
BS 776 1303 RR4FV19TF

RD RR4FI62TF 775 0 0
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GTGGGGAAGGATGCATCCTGATCCCGCTAGATGGCCTTCCTCTAAAGGCGGCAAAGGCTT
CACACAAGTCGCTGAGAAAGTTCATGGAATGGGTTTGAAGTTTGGGATTCATGTCATGGG
TGGGATTAGCACACAGGCTTATAACGCAAACACTCTTGTTATGGATAGTAGTGTTAAGGG
AGGAGGTGCTTATGAAGAATCCGGTAGGCAGTGGAGGGCGAAAGATATTGGGATGAAGGA
GAAGGCTTGTGTGTGGATGCCACATGGGTTCATGAGTGTGAATACTAAGTTAGGTGCTGG
AAAAGCCTTCTTGAGGTCGCTTTATCGGCTATACGCTGAATGGGGAGTTGATTTCAGGAC
GAGTGTGACACCTACAATGGCTAAAGAAGTTAGTCAATTGGTTAACATGTACAGAATAAC
AGGTGATGATTGGGACACATGGAGAGACGTTGTGGCACATTTCGATATCTCGAGGGATCT
ATCTGCTTCTAGTATGATCGGTGCACGAGGGCTACAAGGAAAATCATGGCCTGATTTAGA
TATGTTACCTCTTGGATGGCTTACCGATCAAGGTTCGAACTT*GGACCTCATCGAGCTTT
TAATCTTACTATGGAAGAACAGAGGACACAGATGACATTGTGGTCTATAGCAAAGTCCCC
TCTCATGTTTGGAGGTGATGTGAGGAAGCTTGATGACGCTACTTATAATCCCATC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4FV19TF 728 0 0
G
AGGAAAATCATGGCCTGATTTAGATATGTTACCTCTTGGATGGCTTACCGATCAAGGTTC
GAACTTTGGACCTCATCGAGCTTGTAATCTTACTATGGAAGAACAGAGGACACAGATGAC
ATTGTGGTCTATAGCAAAGTCCCCTCTCATGTTTGGAGGTGATGTGAGGAAGCTTGATGA
TGCTACTTATAATCTCATCACAAACCCTACTCTACTGGAAGTCAACTCTTATAGCTCTAA
CAACAAGGAGTTTCCTTACGTCACCGCGGCAAGGAATAATCCACATCATCCAACAGTCGA
CAACTTCAAAACCAAACATGCATTTGGTCTGACTAGCTGCAAAGAACCAAAAGCCAACAC
ATGGTCAGTTGTAGACAAGTCCAGTGGAAAAATCTGTTGGAGGAACCAATACTCAACCGA
GAAACCAGAGAAGCCCTTTTGCTTATACAACAGAAAAGCTCTTATATCTTACAATGAGGA
GATAGAACACAAGCAGCTCTATCAAGGTAAGCTTCATTTACAAACAAATGATAAAGCAGA
GTCTTGTTTAGGAGCTTCCTCAAGCAAAAGCTCACTTCCAAAGAGTATAGCCGCGGCGCG
TTATCACCTTGCAAACTAGACGCAAACCAGATGTGGGAGCTTCACAGTAACGGACACTAG
AGACAGTTACTCTGGTCTTTGCGCGTGTTAATCCAGTGAAGCTGAGCTAGCTCCAGTGGT
GTCGTCT

QA 2 728 2 728
DS 



AS 1 4

CO CL2278Contig1 1025 4 8 U
GGAGATAATAATCTCTATCGTGACGATGGATGAATACAAAGCGAAATCGAAGCCGAGCGA
GAGCTCAACCTCCACGGTCTGGCTAGCGAAGCACATGCTAACCGGAGAAGAAGCGGTGAT
GAAGTGCTTCCATCTCTCGAAGCTCAATCACAATCTCAGAACCTGTTTGGAAAACGAGCT
CGAGTTTCTTTCTTCGGTCCATCATCCCAACATCATCCGCCTCCTCCAAGTTCTCCAGGA
CAAGGATTTACTCGTCATGATTCTCGAGTATTGCGACGGTGGAACTTTATCATCTTACAT
TCAGCGTCACGGGAGAGTTGAAGAACATATCGCCAAGAGATTCATGAAGCAAATTGGAGC
TGGTTTAGAAATCATTCATGATAACCATATTATCCATAGGGATCTTAAACCGGAGAACAT
ATTAATAGCTGGATCAGGTGATGAATCTGTGTTGAAGATAGCTGATTTTAGTCTTTCAAG
AAAGCTGCTTCCGGGAAAGTATCTAGAGACGGTGTGTGGTTCTCCGTTTTACATGGCTCC
TGAAGTTCTTCAGTTCCAGAGATACAATGAAAAGGCTGACACGTGGAGTGTCGGAGCGAT
TCTGTTCGAGCTGCTTCATGGTTATCCACCTTTCGGTGGTAGGAACAATGTTCACGTTTT
AAGGAACATCAAGTCTAGTTTATCTCTTCCTTTCTCTCGGTCGATTGTTCAGCAGTTGCA
TCCAGATTGCATTGACGTGTGTTCAAGGCTGCTCTCTACTAACCCAGTTACTCGTCTCTC
ATTTGATGAATTCTACAAACACAAGTTCTTCAGTATCTGGTGATATCCCTGAGGTCAAAG
GAAGATGGAAATCCTATGTAATGTGTCAAATTATCTAGAAACCTCGGCTTGTGTTTACCT
CTCATAGATATAGTTTGATGATGTAATGTTTAATGAAAAGACTAGGGTTTATCCTTTCTG
GTAAATATCTCCTGAATGAGTATAAAAGACCCTTCTTTGATGATATGAGCAATATATATT
TCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
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25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4ES74TF U 1
AF RR4DT46TF U 36
AF RR4ES74JQ C 269
AF RR4DT46JQ C 542
BS 1 53 RR4ES74TF
BS 54 54 RR4DT46TF
BS 55 660 RR4ES74TF
BS 661 747 RR4DT46TF
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BS 749 779 RR4DT46TF
BS 780 954 RR4ES74JQ
BS 955 1025 RR4DT46JQ

RD RR4ES74TF 660 0 0
GGAGATAATAATCTCTATCGTGACGATGGATGAATACAAAGCGAAATCGAAGCTGAGCGA
GAGCTCAACCTCCACGGTCTGGCTAGCGAAGCACATGCTAACCGGAGAAGAAGCGGTGAT
GAAGTGCTTCCATCTCTCGAAGCTCAATCACAATCTCAGAACCTGTTTGGAAAACGAGCT
CGAGTTTCTTTCTTCGGTCCATCATCCCAACATCATCCGCCTCCTCCAAGTTCTCCAGGA
CAAGGATTTACTCGTCATGATTCTCGAGTATTGCGACGGTGGAACTTTATCATCTTACAT
TCAGCGTCACGGGAGAGTTGAAGAACATATCGCCAAGAGATTCATGAAGCAAATTGGAGC
TGGTTTAGAAATCATTCATGATAACCATATTATCCATAGGGATCTTAAACCGGAGAACAT
ATTAATAGCTGGATCAGGTGATGAATCTGTGTTGAAGATAGCTGATTTTAGTCTTTCAAG
AAAGCTGCTTCCGGGAAAGTATCTAGAGACGGTGTGTGGTTCTCCGTTTTACATGGCTCC
TGAAGTTCTTCAGTTCCAGAGATACAATGAAAAGGCTGACACGTGGAGTGTCGGAGCGAT
TCTGTTCGAGCTGCTTCATGGTTATCCACCTTTCGGTGGTAGGAACAATGTTCACGTTTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4DT46TF 744 0 0
GG
AAAGCGAAATCGAAGCCGAGCGAGAGCTCAACCTCCACGGTCTGGCTAGCGAAGCACATG
CTAACCGGAGAAGAAGCGGTGATGAAGTGCTTCCATCTCTCGAAGCTCAATCACAATCTC
AGAACCTGTTTGGAAAACGAGCTCGAGTTTCTTTCTTCGGTCCATCATCCCAACATCATC
CGCCTCCTCCAAGTTCTCCAGGACAAGGATTTACTCGTCATTATTCTCGAGTATTGCGAC
GGTGGAACTTTATCATCTTACATTCAGCGTCACGGGAGAGTTGAAGAACATATCGCCAAG
AGATTCATGAAGCAAATTGGAGCTGGTTTAGAAATCATTCATGATAACCATATTATCCAT
AGGGATCTTAAACCGGATAACATATTAATACC*GGATCAGGTGATGAATCTGTGTTGAAG
ATAGCTGATTTTAGTCTTTCAAGAAAGCTGCTTCCGGGAAAGTATCTAGAGACGGTGTGT
GGTTCTCCGTTTTACATGGCTCCTGAAGTTCTTCAGTTCCAGAGATACAATGAAAAGGCT
GACATGTGGAGTGTCGGAGCGATTCTGTTCGAGCTGCTTCATGGTTATCCACCTTTCGGT
GGTAGGAACAATGTTCACGTTTTAAGGAACATCAAGTCTAGTTTATCTCTTCCTTTCTCT
CGGTCGATTGTTCAGCAGTTGCATCCAGATTGCATTGACGTGTGTTCAAG*CTGCTCTCT
ACTAACCCAGTTACTCGTCTCT

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR4ES74JQ 686 0 0
TATTGCGACGGTGGAACTTTATCATCTTACATTCAGCGTCACGGGAGAGTTGAAGAACAT
ATCGCCAAGAGATTCATGAAGCAAATTGGAGCTGGTTTAGAAATCATTCATGATAACCAT
ATTATCCATAGGGATCTTAAACCGGAGAACATATTAATAGCTGGATCAGGTGATGAATCT
GTGTTGAAGATAGCTGATTTTAGTCTTTCAAGAAAGCTGCTTCCGGGAAAGTATCTAGAG
ACGGTGTGTGGTTCTCCGTTTTACATGGCTCCTGAAGTTCTTCAGTTCCAGAGATACAAT
GAAAAGGCTGACACGTGGAGTGTCGGAGCGATTCTGTTCGAGCTGCTTCATGGTTATCCA
CCTTTCGGTGGTAGGAACAATGTTCAGGTTTTAAGGAACATCAAGTCTAGTTTATCTCTT
CCTTTCTCTCGGTCGATTGTTCAGCAGTTGCATCCAGATTGCATTGACGTGTGTTCAAGG
CTGCTCTCTACTAACCCAGTTACTCGTCTCTCATTTGATGAATTCTACAAACACAAGTTC
TTCAGTATCTGGTGATATCCCTGAGGTCAAAGGAAGATGGAAATCCTATGTAATGTGTCA
AATTATCTAGAAACCTCGGCTTGTGTTTACCTCTCATAGATATAGTTTGATGATGTAATG
TTTAATGAAAAGACTAGGGTTTATCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DT46JQ 484 0 0
GAAGTTCTTCAGTTCCAGAGATACAATGAAAAGGCTGACATGTGGAGTGTCGGAGCGATT
CTGTTCGAGCTGCTTCATGGTTATCCACCTTTCGGTGGTAGGAACAATGTTCAGGTTTTA
AGGAACATCAAGTCTAGTTTATCTCTTCCTTTCTCTCGGTCGATTGTTCAGCAGTTGCAT
CCAGATTGCATTGACGTGTGTTCAAGGCTGCTCTCTACTAACCCAGTTACTCGTCTCTCA
TTTGATGAATTCTACAAACACAAGTTCTTCAGTATCTGGTGATATCCCTGAGGTCAAAGG
AAGATGGAAATCCTATGTAATGTGTCAAATTATCTAGAAACCTCGGCTTGTGTTTACCTC
TCATAGATATAGTTTGATGATGTAATGTTTAATGAAAAGACTAGGGTTTATCCTTTCTGG
TAAATATCTCCTGAATGAGTATAAAAGACCCTTCTTTGATGATATGAGCAATATATATTT
CACC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 3

CO CL2279Contig1 758 3 17 U
ACATAGACATGACATCACAGTAGCAAAAATTATTTATTGTAAAGATACGGCCAGGAAAAG
TCCGCCATTTAAACTGTAAACAAAAACAAAAATAAAAAAAAAGGACCACTGTAAGAAAGA
AAAGATCAAACTGGTTGGGTCTCTCTTATTCACCCAAAGATCTTTATTTTACAAGTCCAA
AAATATCGCTTGATCTTTTACAGCAAATGTTTGCTGCTTCAACAAAATTTGCTGCTTACG
GTGTCGTAGCTTGGAACAGACAACACCTCTCCGAAGGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAA
ATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAACGTAAGTCCGTCTACTGTCTTCAAG
AATTGCTCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGCT
GCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATTAAAATTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGA
TCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAAT
TCAATTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCCGGTG
TTGTTAAAGATGCTAGTGGATGCAGTGCATGACTGAACTTGCTGATATTCGTTTAGAATA
CGAAGATATAGCCATGAGTGCATTCCTTTTCCAGGGCCTCCAGCTGAGAATGAGCCGCCT
CCTCCCATGAGCATCTGGAGAACAGTGGAGGTGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4AA95JQ U 1
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AF RR4CC37JQ U 198
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RD RR4AA95JQ 508 0 0
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DS 

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AG
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DS 

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AACTTTTCCTCCAGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCAGC
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GAGAACAGT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 4

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CTTCTATTCTAAATCCTCTAAACTTAAACGTAAAGTTG


BQ
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AF RR4AY22TF U 1
AF RR4B083JQ C 360
AF RR4B083TF U 360
AF RR4BP38TF U 386
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G
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CTTCTATT
AAAT

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G
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CCACCGAGAACCGCCAAGTGAATGGTCTCTACAGAAACTCATCAGAGGAGTCTTCTGCAC
TTGAAAAGGTAAAAGAAGATGGGAGCATCTATGGGAGAGAATGTGTTGTGTTTCAGGATA
CGTGGTCCATGATGAGTCTACCTCCAGCTAGTCCATTTGACAATTTCCTCAAAGCAGCAG
GAGCTGGAAGATGATTCAGTTAACTCAGATGATGATATCAAGTCTCTCATGTAGAAAAAT
GTGTGTGTAGTACTAGTAGTGTGTAATCTTATCCTTGAGATATTGGGTTTGTACTTTGTA
CTCTCTAGCTAACTATCTAGGCTTAGAGTATGATGAATCGATGATGCTTCAGAACAGGCT
TGCAATGATTTAGATTCAGTTGTTGACTTGAAACTATTTGCTTTCTTATGTCAAAAGACT
CTTCTATT
AAAT

QA 2 669 2 669
DS 

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G
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ATCAGCATTGGCCAGCTTATGGAATCTGCCCTTGAGGTGGCTGGTCAAGTAGTTGTGTCA
TCTGTCTCCACTTCTCCGCTTCCTTACGACACAATGACAAACCGCTGCGAAACCTTTGGG
ACTGGGACAAGACAGAGGCTCTCAAGGTGGTTGGCCACCGAGAACCGCCAAGTGAATGGT
CTCTACAGAAACTCATCAGAGGAGTCTTCTGCACTTGAAAAGGTAAAAGAAGATGGGAGC
ATCTATGGGAGAGAATGTGGTGTGTTTCAGGATACGTGGTCCATGATGAGTCTACCTCCA
GCTAGTCCATTTGACAATTTCCTCAAAGCAGCAGGAGCTGGAAGATGATTCAGTTAACTC
AGATGATGATATCAAGTCTCTCATGTAGAAAAATGTGTGTGTAGTACTAGTAGTGTGTAA
TCTTATCCTTGAGATATTGGGTTTGTACTTTGTACTCTCTAGCTAACTATCTAGGCTTAG
AGTATGATGAATCGATGATGCTTCAAAACAGGCTTGTAATGATTTAGATTCAGTTGTTGA
CTTGAAACTATTTGCTTTCTTATGTCAAAAGACTCTTCTATTCTAAATCCTCTAAACTTA
AACGTAAAGTTG

QA 2 673 2 673
DS 



AS 1 2

CO CL2281Contig1 925 2 2 U
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AACTTCCTTCAGATACCTCTTGCATAGCTTCCTCATCTACAGCTTTTCCATGTCAAGATT
CTCTAAACAAGAGCCCAGAACAGAGTTTCAAAGATGAAGAAGCAGACGCTAACGAATCTA
GTCAAGAACTCAATCTCATCGACTGCATAGATAGCCAGAGTTACAACGGATCGACTACAT
CCACGGAACAAAAGCTTTTCTCATGCAACTACTGTCAAAGAACTTTCTATAGCTCACAAG
CACTTGGTGGTCACCAAAACGCACACAAGAGAGAGAGGACGTTGGCAAAAAGAGGGCAAC
GTATGGCAGCATCAGCCTCAGCTTTTGGACATCCTTACGGTTTCTCTCCAGTTCCTTTCC
ATGGACAATACAACAACAGGTCTTTGGGGATTCAAGCGCATTCGATGAGCCACAAGCTAA
GTTCTTATAACATGTTCGGTGGTCACTACGGTCATGTCAACTGGTCAAGACAACCTCTTG
ACCAACAACCAGCTATAGGTAAACTTTCTTCAATGGATAATTTTCATCATCATCAGCATC
AGCATCACATGATGATGATGATGGATTCTTCAGTAAATTCACGGTCCAATGACATGGCTA
GATCATCAAGCAACATAGGAAGGATTCTAGTAGGGTCGCCGCCTCTTGAACAATGGCAAG
GAGGAGTACTGTTAAGCACTAATCAGGAAGAGCAACAAAAGCTAGACTTATCACTTAAGC
TCTAAGATTACTTTTTCTTGATTCTTGCATTTAGTATCTTTTATTATGTTTTCATGTGAT
TGTTATCAATTTGTACTCTTATGTGTATACTTCTGTTTTAATGTACATATTTTCACATAT
CTACTTAGTTTGAGATTTGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP57TF U 1
AF RR4EP57JQ C 241
BS 1 639 RR4EP57TF
BS 640 925 RR4EP57JQ

RD RR4EP57TF 639 0 0
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QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4EP57JQ 685 0 0
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CACTTGGTGGTCACCAAAACGCACACAAGAGAGAGAGGACGTTGGCAAAAAGAGGGCAAC
GTATGGCAGCATCAGCCTCAGCTTTTGGACATCCTTACGGTTTCTCTCCAGTTCCTTTCC
ATGGACAATACAACAACAGGTCTTTGGGGATTCAAGCGCATTCGATGAGCCACAAGCTAA
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ACCAACAACCAGCTATAGGTAAACTTTCTTCAATGGATAATTTTCATCATCATCAGCATC
AGCATCACATGATGATGATGATGGATTTTTCAGTAAATTCACGGTCCAATGACATGGCTA
GATCATCAAGCAACATAGGAAGGATTCTAGTAGGGTCGCCGCCTCTTGAACAATGGCAAG
GAGGAGTACTGTTAAGCACTAATCAGGAAGAGCAACAAAAGCTAGACTTATCACTTAAGC
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TGTTATCAATTTGTACTCTTATGTGTATACTTCTGTTTTAATGTACATATTTTCACATAT
CTACTTAGTTTGAGATTTGTCGACT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 4

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GCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCGCTCCGAGTTGGTTGTGGCCACGTCAGGTG
TCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGTATGTAACTATGCTCCTAGGCCGATGGGTGATGA
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4BB24TF U 1
AF RR4BE06JQ C 1
AF RR4BE06TF U 1
AF RR4BB24JQ C 61
BS 1 769 RR4BB24TF

RD RR4BB24TF 769 0 0
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QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BE06JQ 769 0 0
GTCAGGGCATAATGCTCATCCCCAACCGGCAGCAACGTCAGGGCTTAATGCTCATCCTCA
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AGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGGACTTTAAACTAGCTGCCTTCGCACAGAACTACGC
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QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BE06TF 769 0 0
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GGCTCATCCCCAACCGGCAGCAACCTTAGGGCTTAACACCCTAGGTCGAACCAACTTAGA
CCCAATGTTTGATCTCAACCCGGCAGCAACTTTATTGGTTCACAATCAGGTTCGAGCCGA
AGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGGACTTTAAACTAGCTGCCTTCGCACAGAACTACGC
TAACGTACGATCCAAAGACTGTGCCCTACAGCATTCGAACGACGAAATGTACGGCGAGAA
TGTAGCTGCAGGGTGGCTCAAATCTAAGGAATCAATGAGCGGTCCGATCGCGGCTAAGTT
GTGGTATGGCGAGAAGAAATTCTACAATTATCAAACCAACAAATGTAGTGGTGTGTGCGG
GCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCGCTCCGAGTTGGTTGTGGCCACGTCAGGTG
TCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGTATGTAACTATGCTCCTAGGCCGATGGGTGATGA
GAACACACGTCCGTATTAATGAACTTTTGTTTTTAACTAAGACGAGTAGTTGTCTGATGT
AATAAAACTTAACATAATAAGTTACGTACTATAGATAAGACAAGACATTATAGTTTGGAG
ATGTCTGATCATGTAATAAAATTTAACATAATAAGTTCGTGTATGATAC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BB24JQ 709 0 0
ACCGGCAGCAAGGTCAGGGCTTAATGCTCATCCTCAACCGGCAGCAAGGTCAGGGCTTAA
GGCTCATCCCCAACCGGCAGCAACCTTAGGGCTTAACACCCTAGGTCGAACCAACTTAGA
CCCAATGTTTGATCTCAACCCGGCAGCAACTTTATTGGTTCACAATCAGGTTCGAGCCGA
AGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGGACTTTAAACTAGCTGCCTTCGCACAGAACTACGC
TAACGTACGATCCAAAGACTGTGCCCTACAGCATTCGAACGACGAAATGTACGGCGAGAA
TGTAGCTGCAGGGTGGCTCAAATCTAAGGAATCAATGAGCGGTCCGATCGCGGCTAAGTT
GTGGTATGGCGAGAAGAAATTCTACAATTATCAAACCAACAAATGTAGTGGTGTGTGCGG
GCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCGCTCCGAGTTGGTTGTGGCCACGTCAGGTG
TCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGTATGTAACTATGCTCCTAGGCCGATGGGTGATGA
GAACACACGTCCGTATTAATGAACTTTTGTTTTTAACTAAGACGAGTAGTTGTCTGATGT
AATAAAACTTAACATAATAAGTTACGTACTATAGATAAGACAAGACATTATAGTTTGGAG
ATGTCTGATCATGTAATAAAATTTAACATAATAAGTTCGTGTATGATAC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 3

CO CL2283Contig1 1237 3 19 U
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TCCAATGTCGAGAGAGAGAACCAGACGTGAACTACCTCCCGTTCAAGAGCATATTGATAA
ATTGAAGAAAGTGGTAGAGGAAGGCAATGGCTACGGAGCGTTGCAGATGTACAAATCCAT
CAGTGCCAGATATGTTACAGCTCAGAGATTCTCTGAAGCTCTTGAAATCCTCTTCTCTGG
GGCATGCGTTGAGCTAGAGCACGGCCTGGTGAATTGTGGGGCCGACCTTGCTATTTTGTT
TGTCGACACACTAGTTAAAGCCAAGTCACCTTGCAATGATGAATCTCTTGATCGTATCAG
GTGTATGTTCAAGTTGTTTCCTCGGGTTCCTGTACCTCCTCATTTGGTTGATGTGAGCGA
TGACGAAGATGTTCATAATCTTCAAGAATCTCTCGGGGAAGCTAGATCACGTGTTGATAA
CTTGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATCAAATGGTCTGCAGAGTTTGGAGGGCCAAGTAC
AGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTAGCTGATTATCTTTACACCGAGTGTCCTGAACT
TGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAGTTTGCATC
TATGCTGATCAACTTTATGGGAAGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCTTGCCATTGCACG
AGCAGTTCTTATGTATTTATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATATTCTGATGGATGA
GATTAAGAAACAAGCAGAGACCCTTTCAGAATCAGACCTTATCCAATTTATCACTTATCT
TCTGGAAACGTTGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTTTCAGTATGTTAAGAGCGAAATTTAG
GTCTTGCGTAGATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGATTGCAGAGAGGTT
TTACGGTGTTCAGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACATCTTCAAGATGAT
GGGCTAAAGGAAGAAGATAGAAGTTGCAACTTTCTTTCGTCATTTTGTTTTTGTATTTGG
CAAAGTTCTAATAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCTCTTATCCTCAAGTGG
GTAAGAGTTTTTGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATTCATCATATTACTATAT
CTTCAACATAAACGAGAAGGAAACTTTTCATTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA13TF U 1
AF RR4F381TF U 611
AF RR4FC41JQ C 406
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BS 427 427 RR4FC41JQ
BS 428 567 RR4FA13TF
BS 568 568 RR4FC41JQ
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BS 578 578 RR4FC41JQ
BS 579 671 RR4FA13TF
BS 672 672 RR4F381TF
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BS 739 774 RR4FA13TF
BS 775 1083 RR4F381TF
BS 1084 1084 RR4FC41JQ
BS 1085 1190 RR4F381TF
BS 1191 1237 RR4FC41JQ

RD RR4FA13TF 774 0 0
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TCCAATGTCGAGAGAGAGAACCAGACGTGAACTACCTCCCGTTCAAGAGCATATTGATAA
ATTGAAGAAAGTGGTAGAGGAAGGCAATGGCTACGGAGCGTTGCAGATGTACAAATCCAT
CAGTGCCAGATATGTTACAGCTCAGAGATTCTCTGAAGCTCTTGAAATCCTCTTCTCTGG
GGCATGCGTTGAGCTAGAGCACGGCCTGGTGAATTGTGGGGCCGACCTTGCTATTTTGTT
TGTCGACACACTAGTTAAAGCCAAGTCACCTTGCAATGATGAATCTCTTGATCGTATCAG
GTGTATGTTCAAGTTGTTTCCTCGGGTTCCTGTACCTCCTCATTTGGTTGATGTGAGCGA
TGACGAGGATGTTCATAATCTTCAAGAATCTCTCGGGGAAGCTAGATCACGTGTTGATAA
CTTGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATCAAATGGTCTGCAGAGTTTGGAGGGCCAAGTAC
AGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTGGCTGATTATTTTTACACCGAGTGTCCTGAACT
TGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAGTTTGCATC
TATGCTGATCA*CTTTATGGGGAGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCTTGCCATTGCACG
AGCTGTTCTTATGTATT*ATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATATTCTGAT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4F381TF 580 0 0
G
GAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAGTTTGCATCTATGCTGATCA
ACTTTATGGGAAGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCTTGCCATTGCACGAGCAGTTCTTA
TGTATTTATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATATTCTGATGGATGAGATTAAGAAAC
AAGCAGAGACCCTTTCAGAATCAGACCTTATCCAATTTATCACTTATCTTCTGGAAACGT
TGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTTTCAGTATGTTAAGAGCGAAATTTAGGTCTTGCGTAG
ATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGATTGCAGAGAGGTTTTACGGTGTTC
AGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACATCTTCAAGATGATGGGCTAAAGGA
AGAAGATAGAAGTTGCAACTTTCTTTCGTCATTTTGTTTTTGTATTTGGCAA*GTTCTAA
TAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCTCTTATCCTCAAGTGGGTAAGAGTTTT
TGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATTCATCAT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR4FC41JQ 832 0 0
TGG
TGATGTGAGCGATGACGAAGATGTTCATAATCT*CAAGAATCTCTCGGGGAAGCTAGATC
ACGTGTTGATAACTTGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATCAAATGGTCTGCAGAGTTTGG
AGGGCCAAGTACAGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTAGCTGATTATCTTTACACCGA
GTGTCCTGAACTTGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGA
GAAGTTTGCATCTATGCTGATCAACTTTATGGGAAGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCT
TGCCATTGCACGAGCAGTTCTTATGTATTTATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATAT
TCTGATGGATGAGATTAAGAAACAAGCAGAGACCCTTTCAGAATCAGCCCTTATCCAATT
TATCACTTATCTTCTGGAAACGTTGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTTTCAGTATGTTAAG
AGCGAAATTTAGGTCTTGCGTAGATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGAT
TGCAGAGAGGTTTTACGGTGTTCAGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACAT
CTTCAAGATGATGGGCTAAAGGAAGAAGATAGAAGTTGCAACTTTCTTTCGTCATTTTGT
TTTTGTATTTGGCAAAGTTCTAATAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCTCTT
ATCCTCAAGTGGGTAAGAGTTTTTGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATTCATC
ATATTACTATATCTTCAACATAAACGAGAAGGAAACTTTTCATTTCATC

QA 4 832 4 832
DS 



AS 1 4

CO CL2284Contig1 935 4 7 U
CTGATCGGTGATCGTTAGGTATCTAAAGTAAAGTCTCATCAGAGTTTAGATCTAAAACAC
ACAGGAACCGGAGAAGCTTACTTGGAACGACGGCTACCAGATTATCACCGGTCTTTATTT
GCGTGTCGTTGGTTCTCATTTCTGGACTCGGCCAGCTTGTGATCTGTAGTCAAGAAAAGG
GAAGGTACAACGACGTCGTAAGGATGAAGCTCGGTGCGTTTAGCGATTCTTCCAATAATC
AGAACGGTGGAGGAGATCAGATCGAGGATATAGCCCTCTTTGCTATTCAAGAACACAATA
AGCGAGAGAATGGTGTACTTGAGCTTGGTAGAGTATTGAAAGCAACAGAGCAGGTGGTTG
CTGGGAAACTCTACAGTCTAACTCTTGAAGTGTTAGAAGCTGGAGAGAAGAAGATTTATG
AAGCTAAAGTTTGGGTGAAGCCATGGATGAACTTCAAGCAGCTTCAGGAGTTCAAGAGTG
TTGTCCCTTCCTTCACTGTTTCCGACCTTGGCTTGAAATCAGATGGGAATGGATTTGAGT
GG*AGATCGGTATCAACAAATGACCCTGAGGTCCAAGAGGCAGCAAAACACGCCGTTAAG
TCGATTCAACAGAGATCAAACTCGCTGTTTCCTTATAAACTGATAGACATAATCCTAGCC
AGAGCAAAGGTGGTTGAAGACCGTGTGAAATTCGAGCTCCTTTTGAAGCTAGAGAAGGGA
AACAAAGCAGAGAAGCTCATGGTTGAAGTGATGAAGTACCAAAACGGCAAGTTTCACTAG
AGTTGTTGTTTGGACAGGTTGTGTCTCAGTCTGACTGAATAAAAAGACTGAATGTTGCGA
TAAAAAAAAACTATTTTGCCCTGTAAAAAATGGTTTGCTTGTAAGTAAATAAAAAAAAAC
ACTAAACATTGGAAAGAAAAAAGATGTTAATGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ53TF U 1
AF RR4DB01TF U 36
AF RR4AZ53JQ C 148
AF RR4DB01JQ C 291
BS 1 542 RR4AZ53TF
BS 543 543 RR4DB01TF
BS 544 665 RR4AZ53TF
BS 666 710 RR4DB01TF
BS 711 849 RR4AZ53JQ
BS 850 850 RR4DB01JQ
BS 851 935 RR4AZ53JQ

RD RR4AZ53TF 665 0 0
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ACAGGAACCGGAGAAGCTTACTTGGAACGACGGCTACCAGATTATCACCGGTCTTTATTT
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GAAGGTACAACGACGTCGTAAGGATGAAGCTCGGTGCGTTTAGCGATTCTTCCAATAATC
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AAGCTAAAGTTTGGGTGAAGCCATGGATGAACTTCAAGCAGCTTCAGGAGTTCAAGAGTG
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GGGAGATCGGTATCAACAAATGACCCTGAGGTCCAAGAGGCAGCAAAACACGCCGTTAAG
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AGAGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4DB01TF 675 0 0
GG
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*AGATTATCACCGGTCTTTATTTGCGTGTCGTTGGTTCTCATTTCTGGACTCGGCCAGCT
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GTTTAGCGATTCTTCCAATAATCAGAACGGTGGAGGAGATCAGATCGAGGATATAGCCCT
CTTTGCTATTCAAGAACACAATAAGCGAGAGAATGGTGTACTTGAGCTTGGTAGAGTATT
GAAAGCAACAGAGCAGGTGGTTGCTGGGAAACTCTACAGTCTAACTCTTGAAGTGTTAGA
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GCAGCTTCAGGAGTTCAAGAGTGTTGTCCCTTCCTTCACTGTTTCCGACCTTGGCTTGAA
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TCCTTTTGAAGCT

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DS 

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AGCTCGGTGCGTTTAGCGATTCTTCCAATAATCAGAACGGTGGAGGAGATCAGATCGAGG
ATATAGCCCTCTTTGCTATTCAAGAACACAATAAGCGAGAGAATGGTGTACTTGAGCTTG
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AAGTGTTAGAAGCTGGAGAGAAGAAGATTTATGAAGCTAAAGTTTGGGTGAAGCCATGGA
TGAACTTCAAGCAGCTTCAGGAGTTCAAGAGTGTTGTCCCTTCCTTCACTGTTTCCGACC
TTGGCTTGAAATCAGATGGGAATGGATTTGAGTGG*AGATCGGTATCAACAAATGACCCT
GAGGTCCAAGAGGCAGCAAAACACGCCGTTAAGTCGATTCAACAGAGATCAAACTCGCTG
TTTCCTTATAAACTGATAGACATAATCCTAGCCAGAGCAAAGGTGGTTGAAGACCGTGTG
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AGTCTGACTGAATAAAAAGACTGAATGTTGCGATAAAAAAAA*CTATTTTGCCCTGTAAA
AAATGGTTTGCTTGTAAGTAAATAAAAAAAAACACTAAACATTGGAAAGAAAAAAGATGT
TAATGTCT

QA 1 788 1 788
DS 

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CAGGTGGTTGCTGGGAAACTCTACAGTCTAACTCTTGAAGTGTTAGAAGCTGGAGAGAAG
AAGATTTATGAAGCTAAAGTTTGGGTGAAGCCATGGATGAACTTCAAGCAGCTTCAGGAG
TTCAAGAGTGTTGTCCCTTCCTTCACTGTTTCCGACCTTGGCTTGAAATCAGATGGGAAT
GGATTTGAGTGG*AGATCGGTATCAACAAATGACCCTGAGGTCCAAGAGGCAGCAAAACA
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AATCCTAGCCAGAGCAAAGGTGGTTGAAGACCGTGTGAAATTCGAGCTCCTTTTGAAGCT
AGAGAAGGGAAACAAAGCAGAGAAGCTCATGGTTGAAGTGATGAAGTACCAAAACGGCAA
GTTTCACTAGAGTTGTTGTTTGGACAGGTTGTGTCTCAGTCTGACTGAATAAAAAGACTG
AATGTTGTGATAAAAAAAAACTATTTTGCCCTGTAAAAAATGGTTTGCTTGTAAGTAAAT
AAAAAAAAACACTAAACATTGG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2285Contig1 905 4 5 U
GGAATAACTTGGTGGTTTTAAAGGGTTTTGTTGTGAGTGATGCTAATGATGAGGAGAAGG
TCTGCACGTTGGCTGAGTTGGTGCACTTGGAGAAGCTGAGGAAGCTGAGCATTACAATAA
ACAAAGGTGATTTTAGTGTAAGTGATCTGTTCCGGGCTGTTGAGGAATTCAAAAGTCTTG
AGAAGTTTAAAGTGGCTTGGGGAGGTATTAATGAACATAAGAAAGTTGAATCTGCTGGTG
GGGTAGTAAGAGGGCTCATAAGAACGTTGACAATGGTTTCTAAGGCCCCAGCATCCCTAG
AAGGAAAACTTCCCAAGCTTCCTGAGACACTGAGGAAACTGGACCTGCAGTGTTTTCCTG
ATCGGGAGCTTCCCACATGGCTTCAGCCACATAGACTTGG*TGGTCTGG*AGAAACTCTA
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GCTGAGGGAACTCTTTCCAAAGCTGGAGTTCTTGGACAAGTATCAGTCTCCTCAAGTTAG
TTTCTGCCCCTGCGATGGAATCGGAATCTGGCGTGATAAACCTCAAGTCTAAGCAACTCT
AGACAAAGAGTTCTCAGCTTTCACAAGTCTTCTTCGTTCTTATTGTTGTTGTGTTCTGCT
ATTGTGTTCTGTTCCTTTTCATTCTTATTGTTGTTGTCGTTGTGTTCTGCTCTTTTATTC
AAGAGCTCTCTGCTATTGTGTTCTGTTCCTTTTAGTTCTTATTGTTGTTGTGTGTATTTG
CTTCTCATTTCGTATTTGATGTATTACTGTTTTGCTTTTAAGTGCTGTTGTTTGTGAACC
GTTGT


BQ
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10 10 10 

AF RR4B526TF U 364
AF RR4EL31TF U 1
AF RR4B526JQ C 21
AF RR4EL31JQ C 107
BS 1 781 RR4EL31TF
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RD RR4B526TF 294 0 0
GGAGCTTC
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TCTTTCCAAAGCTGGAGTTCTTGGACAAGTATCA*TCTCCTCAAGTTAGTTTCTGCCCCT
GCGATGGAATCGGAATCTGGCGTGATAAACCTCA
GTCTAGCACTCT

QA 9 282 9 282
DS 

RD RR4EL31TF 793 0 0
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GGGTAGTAAGAGGGCTCATAAGAACGTTGACAATGGTTTCTAAGGCCCCAGCATCCCTAG
AAGGAAAACTTCCCAAGCTTCCTGAGACACTGAGGAAACTGGACCTGCAGTGTTTTCCTG
ATCGGGAGCTTCCCACATGGCTTCAGCCACATAGACTTGG*TGGTCTGG*AGAAACTCTA
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GCTGAGGGAACTCTTTCCAAAGCTGGAGTTCTTGGACAAGTATCAGTCTCCTCAAGTTAG
TTTCTGCCCCTGCGATGGAATCGGAATCTGGCGTGATAAACCTCAAGTCTAAGCAACTCT
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ATTGTGTTCTGTTCCTTTTCATTCTTATTGTTGTTGTCGTTGTGTTCTGCTCTTTTATTC
A*GAGCTCTCTGC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4B526JQ 876 0 0
AAGGGTTTTGTTGTGAGTGATGCTAATGATGAGGAGAAGGTCTGCACGTTGGCTGAGTTG
GTGCACTTGGAGAAGCTGAGGAAGCTGAGCATTACAATAAACAAAGGTGATTTTAGTGTA
AGTGATCTGTTCCGGGCTGTTGAGGAATTCAAAAGTCTTGAGAAGTTTAAAGTGGCTTGG
GGAGGTATTAATGAACATAAGAAAGTTGAATCTGCTGGTGGGGTAGTAAGAGGGCTCATA
AGAACGTTGACAATGGTTTCTAAGGCCCCAGCATCCCTAGAAGGAAAACTTCCCAAGCTT
CCTGAGACACTGAGGAAACTGGACCTGCAGTGTTTTCCTGATCGGGAGCTTCCCACATGG
CTTCAGCCACATAGACTTGG*TGGTCTGG*AGAAACTCTACATTAAAGGAGGAACTGAAC
TTACTGGGTTTAGAAAGTTTGAGCCTGAGGAGACAAAGGAGTGCAAAGTCGAGGTCTTGC
GTCTGAAATTTCTTCCCAGGTTCAAAGTGGAGTGGAGGGAGCTGAGGGAACTCTTTCCAA
AGCTGGAGTTCTTGGACAAGTATCAGTCTCCTCAAGTTAGTTTCTGCCCCTGCGATGGAA
TCGGAATCTGGCGTGATAAACCTCAAGTCTAAGCAACTCTAGACAAAGAGTTCTCAGCTT
TCACAAGTCTTCTTCGTTCTTATTGTTGTTGTGTTCTGTTATTGTGTTCTGTTCCTTTTC
ATTCTTATTGTTGTTGTTGTTGTGTTCTGCTCTTTTATTCAAGAGCTCTCTGCTATTGTG
TTCTGTTCCTTTTAGTTCTTATTGTTGTTGTGTGTATTTGCTTCTCATTTCGTATTTGAT
GTATTACTGTTTTGCTTTTAAGTGCTGTTGTTTGTG

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR4EL31JQ 799 0 0
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ATTCAAAAGTCTTGAGAAGTTTAAAGTGGCTTGGGGAGGTATTAATGAACATAAGAAAGT
TGAATCTGCTGGTGGGGTAGTAAGAGGGCTCATAAGAACGTTGACAATGGTTTCTAAGGC
CCCAGCATCCCTAGAAGGAAAACTTCCCAAGCTTCCTGAGACACTGAGGAAACTGGACCT
GCAGTGTTTTCCTGATCGGGAGCTTCCCACATGGCTTCAGCCACATAGACTTGG*TGGTC
TGG*AGAAACTCTACATTAAAGGAGGAACTGAACTTACTGGGTTTAGAAAGTTTGAGCCT
GAGGAGACAAAGGAGTGCAAAGTCGAGGTCTTGCGTCTGAAATTTCTTCCCAGGTTCAAA
GTGGAGTGGAGGGAGCTGAGGGAACTCTTTCCAAAGCTGGAGTTCTTGGACAAGTATCAG
TCTCCTCAAGTTAGTTTCTGCCCCTGCGATGGAATCGGAATCTGGCGTGATAAACCTCAA
GTCTAAGCAACTCTAGACAAAGAGTTCTCAGCTTTCACAAGTCTTCTTCGTTCTTATTGT
TGTTGTGTTCTGCTATTGTGTTCTGTTCCTTTTCATTCTTATTGTTGTTGTCGTTGTGTT
CTGCTCTTTTATTCAAGAGCTCTCTGCTATTGTGTTCTGTTCCTTTTAGTTCTTATTGTT
GTTGTGTGTATTTGCTTCTCATTTCGTATTTGATGTATTACTGTTTTGCTTTTAAGTGCT
GTTGTTTGTGAACCGTTGT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 4

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ATCTCTCTCTTTTACTTGGATCATTCGTGAATCTGTTTCTCCTTAGATCCAAACCATTTC
AATTTCATAAATTTTCGATTTTCGCGTTCCTGGTCTGTCAAGCCAGAAAAAGGGGATGGT
GGCGGTGAATGGGTACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACCGGATC
GAAGCATCCTGCTCCTCCGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTTGCA
ATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCCAGAGGA
AGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACAGGGAGCAAAGAGACTGTGTTTGAAGG
AACTGAGTACAGACTCTCACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAGAT
CAAGTTTGAGACTTGCTGCTTCCATCCTAATGTCGATCTCTATGGCAATATTTGCTTGGA
TATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTCTATTCA
AAGCCTTCTTGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCAAGCCGCTCAGCTTTG
GAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTAGAGAAGCTCTACAAACCGTTAAACGCATG
ATTCTGAAAAGCCTCTTGTCACTGCATTCAAATGATCATGTTACCTTTTTATTAAACTTT
GTAATCTCAATTCGTGCCAGTCTTAGCAATCAAAACTAGTAATATCTTCCATGCAACCAG
ATCAAAACTCTTTTTTTCCCAATCAATGGAAGTTCAAAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX15TF U 1
AF RR4GA67TF U 76
AF RR4BX15JQ C 138
AF RR4GA67JQ C 226
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RD RR4BX15TF 771 0 0
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ATTCTGAAAAGCCTCTTGTCACTGCATTCAAATGATCATGTTACCTTTT
AT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4GA67TF 764 0 0
GG
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ATTTTCGCGTTCCTGGTCTGTCAAGCCAGAAAAAGGGGATGGCGGCGGTGAATGGGTACC
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CACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTTGAGACTTGCT
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CAGTCTTAGCAATCAAA*CTAGTAATATCTTCCATGCA
CCAG

QA 3 760 3 760
DS 

RD RR4BX15JQ 746 0 0
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CGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTTGCAATCTGAACTAATGGGTT
TAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATATTTTGCT
GGAAAGGAACAATCACAGGGAGCAAAGAGACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTGCAGACTCT
CACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTTGAGACTTGCT
GCTTCCATCCTAATGTCGATCTCTATGGCAATATTTGCTTGGATATTCTTCAGGATAAAT
GGTCATCTGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTCTATTCAAAGCCTTCTTGGAGAAC
CGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCAAGCCGCTCAGCTTTGGAGCAACCAAGAAGAGT
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GTCACTGCATTCAAATGATCATGTTACCTTTTTATTAAACTTTGTAATCTCAATTCGTGC
CAGTCTTAGCAATCAAAACTAGTAATATCTTCCATGCAACCAGATCAAAACTCTTTTTTT
CCCGATCAATGGAAGTTCAAAAATGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4GA67JQ 650 0 0
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GGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACAGGGAGCAAAGA
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CAATATTTGCTTGGATATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCCTATGATGTGAGGACGAT
ATTACTCTCTATTCAAAGCCTTCTTGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCA
AGCCGCTCAGCTTTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTAGAGAAGCTCTACAA
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TTTTTATTAAACTTTGTAATCTCAATTCGTGCCAGTCTTAGCAATCAAAACTAGTAATAT
CTTCCATGCAACCAGATCAAAACTCTTTTTTTCCCAATCAATGGAAGTTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

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AATGGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGCTACTAATGCGAGGCGTATCGCTGT
TCCTAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTCCACGTTTCACCGACAAAGAGAACGTTTTCTTT
CACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGG
CGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTA
TCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCCCCTTCGAGGTGTCGAAGT
GGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAA
CACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAG
CATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACC
AAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGAGGGATG
GGCTAAGTTCACTGGAGGGTTTTTTTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTT
CCTTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAAAAATATGATC
TTTCACCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCACTGTTTTTTTTACTCTTGT
CTTCATCAAGATTCTTGAATCTCATGATGCTTAATGTACCATTTCAAAAAAAAAAATTGA
TGCTATTAGTATATTACTATGAATATTTTCTTAGCTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ67TF U 2
AF RR4DQ15TF U 1
AF RR4CJ67JQ C 127
AF RR4DQ15JQ C 345
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BS 343 514 RR4DQ15TF
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BS 516 621 RR4DQ15TF
BS 622 622 RR4CJ67JQ
BS 623 624 RR4DQ15TF
BS 625 625 RR4CJ67JQ
BS 626 700 RR4DQ15TF
BS 701 701 RR4CJ67JQ
BS 702 739 RR4DQ15TF
BS 740 740 RR4CJ67JQ
BS 741 756 RR4DQ15TF
BS 757 835 RR4CJ67JQ
BS 836 836 RR4DQ15JQ
BS 837 859 RR4CJ67JQ
BS 860 877 RR4DQ15JQ

RD RR4CJ67TF 559 0 0
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ACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGC
GATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTAT
CTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCCCCTTCGAGGTGTCGAAGTG
GGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAAC
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ATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAAGAGAGCCGTCGATTGCACCA
AGTTTGACTTTGACGGGGC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4DQ15TF 756 0 0
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AATGGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGCTACTAATGCGAGGCGTATCGCTGT
TCCTAAGGGCATCTCCGGCGCTCCCTTCCACGTTTCACCGACAAAGAGAACGTTTTCTTT
CACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGG
CGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTA
TCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTTCGAGGTGTCGAAGT
GGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAA
CACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAG
CATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCGAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACC
AAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGAGGGATG
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CCTTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGA*TGTACTTAAAAATATGATC
TTTCACCAATCTTCTCGAC*TTCAAATACTTTCTTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4CJ67JQ 735 0 0
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ATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCTCTC
CAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCCCCTTCGAGGTGTCGAAGTGGGTTT
GGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACACTGC
CTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTG
CCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAGTTT
GACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGAGGGATGGGCTAA
GTTCACTGGAGGGTTTTTTTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCT
TTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAAAAATATGATCTTTCAC
CAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCACTGTTTTTTTTACTCTTGTCTTCAT
CAAGATTCTTGAATCTCATGATGCTTAATGTACCATTTCAAAAAAAAAA*TTGATGCTAT
TAGTATATTACTA
CG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4DQ15JQ 533 0 0
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CAGGCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGC
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TGACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACGTTCTTGCCCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGT
ACTTAAAAATATGATCTTTCACCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCATTG
TTTTTTTTACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCATGATGCTTAATGTACCATTT
CAAAAAAAAAAATTGATGCTATTAGTATATTACTATGAATATTTTCTTAGCTC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 4

CO CL2288Contig1 1192 4 3 U
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ACTTCTTCCACCACCATCTTTCACGTTTCTAAAGGCTCCCTTCTGAATCGCCCATTTAAT
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CTAACAGAGAAATGATGCAACCCGTTGAAGCAAACAGTTTATTCTATAACAACAACCAGA
TCCGATACAACACTCTTCCAGCGACTGCGATGCCATTTAACCCTACCATGGAATGTCAAA
CTTCTACGTTTAATCCCATTTACAACATCTCACCTGTTGACGGTTTGGTTCATCAGTCCA
TGAAGTCAACGATCCATTCCGTTGATAGCTCCGTTACATTCAACAGTGACAATAATAATG
GCAACAACGTTAATTATCTTCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAAT
CGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAG
GACAAGACTTGTCTTCTAACATTCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATCTCTA
ATCATGTAGAGATAATGAGAATGGGGATCGAAGAGAAGAGAAAACAACAAGGTAGGAAGA
TAATGGAAGTTATTGAACAAGGGTTGATGAAGACACTTAGAGCCAAAGACGAAGAGATCA
ATCACATAGGCAAACTAAACCTCTTTCTTGAGGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTAGAGA
ATCAGTTATGGCGTGACATGGCACAGTCTAACGAAGCCACTGTAAACTCCCTAAGGTCCA
ATCTCCAACAAGTCCTCGCCGCTGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGTCTATGACTGCTG
ATGACGCGCAGTCTTGTTGCGGAAGCAACGACGAGGGTGATAGTACGATGATGCGCACGG
TTACAAGTACGATGTGTAGAAGCTGTGGGAAAGGAGAAGCAAGTGTGTTACTGTTACCAT
GCAGACACATGTGCTTATGCAGTGTGTGTGGTTCTTCGATTAACACATGTCCAATCTGTA
AATCTCCAAAGAACGCTAGTCTCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCAGTAAATTGTA
AATGTCCTAAAATAGTAAATAGTTGAAAACAGTATCAAAAATCCTGGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4EI33TF U 1
AF RR4DN70JQ C 501
AF RR4DN70TF U 501
AF RR4EI33JQ C 560
BS 1 643 RR4EI33TF
BS 644 1176 RR4DN70TF
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RD RR4EI33TF 646 0 0
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ACTTCTTCCACCACCATCTTTCACGTTTCTAAAGGCTCCCTTCTGAATCGCCCATTTAAT
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TGAAGTCAACGATCCATTCCGTTGATAGCTCCGTTACATTCAACAGTGACAATAATAATG
GCAACAACGTTAATTATCTTCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAAT
CGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAG
GACAAGACTTGTCTTCTAACATTCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATCTCTA
ATCATGTAGAGATAATGAGAATGGGGATCGAAGAGAAGAGAAA
CAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4DN70JQ 677 0 0
G
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GTTGAAAACAGTATC
G

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4DN70TF 677 0 0
G
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TGGGGATCGAAGAGAAGAGAAAACAACAAGGTAGGAAGATAATGGAAGTTATTGAACAAG
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TCTTTCTTGAGGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTAGAGAATCAGTTATGGCGTGACATGG
CACAGTCTAACGAAGCCACTGTAAACTCCCTAAGGTCCAATCTCCAACAAGTCCTCGCCG
CTGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGTCTATGACTGCTGATGACGCGCAGTCTTGTTGCG
GAAGCAACGACGAGGGTGATAGTACGATGATGCGCACGGTTACAAGTACGATGTGTAGAA
GCTGTGGGAAAGGAGAAGCAAGTGTGTTACTGTTACCATGCAGACACATGTGCTTATGCA
GTGTGTGTGGTTCTTCGATTAACACATGTCCAATCTGTAAATCTCCAAAGAACGCTAGTC
TCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCAGTAAATTGTAAATGTCCTAAAATAGTAAATA
GTTGAAAACAGTATC
G

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4EI33JQ 633 0 0
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AATGGGGATCGAAGAGAAGAGAAAACAACAAGGTAGGAAGATAATGGAAGTTATTTAACA
AGGGTTGATGAAGACACTTAGAGCCAAAGACGAAGAGATCAATCACATAGGCAAACTAAA
CCTCTTTCTTGAGGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTAGAGAATCAGTTATGGCGTGACAT
GGCACAGTCTAACGAAGCCACTGTAAACTCCCTAAGGTCCAATCTCCAACAAGTCCTCGC
CGCTGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGCCTACGACTGCTGATGACGCGCAGTCTTGTTG
CGGAAGCAACGACGAGGGTGATAGTACGATGATGCGCACGGTTACAAGTACGATGTGTAG
AAGCTGTGGGAAAGGAGAAGCAAGTGTGTTACTGTTACCATGCAGACACATGTGCTTATG
CAGTGTGTGTGGTTCTTCGATTAACACATGTCCAATCTGTAAATCTCCAAAGAACGCTAG
TCTCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCAGTAAATTGTAAATGTCCTAAAATAGTAAA
TAGTTGAAAACAGTATCAAAAATCCTGGTTTCT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

CO CL2289Contig1 861 4 6 U
GGAATCTCAAGCAGAGCCTCTCTGTCTCTGTCTCCGTCCCCTTCTTCAGTTTACACAGCA
CACATACAAACACTTTTGTATATATATATATAGTGAGTTAGAGTGGTTTTATCTGACCAA
AATTCATTGAACATGGCTGTTGTTGTAACCTCTAACGGGAATGGTCCGGCTTTTGAAGCC
AAGATGACTGTCTATGTCTTCGTCTGCGTTATGATTGCTGCTGTCGGCGGTTTGATCTTC
GGTTACGACATCGGGATTTCCGGTGGAGTGACGGCGATGGATGATTTCTTGAAGAAATTT
TTCCCTTCGGTGTGGGAGAGGAAGCAGCACGCTCATGAGAACAATTACTGCAAGTATAAT
AACCAGTACTTGCGACTATTCACATCGTCTCTTTACCTAGCCGCCCTCGTGGGCAGCTTC
TTGGCTTCAGCCGTATGTTCCAAACTTGGAAGGAAGCCCACTATGCAGTTTGCTTCTGTC
TTTTTCTTGATCGGTGTCGGGCTAGCCGCAGGAGCCGTTAACATCGTCATGTTGATCATT
GGAAGAATCATGCTTGGCTTGGGTGTAGGCTTTGGCAATCAGGCAGTGCCGCTCTTCCTA
TCAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAAAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATCA
TCAAGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGATATCATAAGTCTTTGTTGATTTATGTGTGTTT
T*GTTTTGTTTTTTCTTGTTAATGTTTGCAACTCTTTCGTTAGCTTCCTTTGTTTTGTGG
GAAGAACAAATACTAAGATAAGACCAGCTTGTTGATTCAGGTTAGGTGTTTTTATCAATG
AAATTCAATGAAAATTTTCTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AH04TF U 1
AF RR4AN46TF U 2
AF RR4AH04JQ C 45
AF RR4AN46JQ C 47
BS 1 721 RR4AH04TF
BS 722 722 RR4AN46TF
BS 723 789 RR4AH04TF
BS 790 790 RR4AN46TF
BS 791 820 RR4AH04TF
BS 821 861 RR4AH04JQ

RD RR4AH04TF 826 0 0
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AAGATGACTGTCTATGTCTTCGTCTGCGTTATGATTGCTGCTGTCGGCGGTTTGATCTTC
GGTTACGACATCGGGATTTCCGGTGGAGTGACGGCGATGGATGATTTCTTGAAGAAATTT
TTCCCTTCGGTGTGGGAGAGGAAGCAGCACGCTCATGAGAACAATTACTGCAAGTATAAT
AACCAGTACTTGCGACTATTCACATCGTCTCTTTACCTAGCCGCCCTCGTGGGCAGCTTC
TTGGCTTCAGCCGTATGTTCCAAACTTGGAAGGAAGCCCACTATGCAGTTTGCTTCTGTC
TTTTTCTTGATCGGTGTCGGGCTAGCCGCAGGAGCCGTTAACATCGTCATGTTGATCATT
GGAAGAATCATGCTTGGCTTGGGTGTAGGCTTTGGCAATCAGGCAGTGCCGCTCTTCCTA
TCAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAAAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATCA
TCAAGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGATATCATAAGTCTTTGTTGATTTATGTGTGTTT
TTGTTTTGTTTTTTCTTGTTAATGTTTGCAACTCTTTCGTTAGCTTCCTTTGTTTTGTGG
GAAGAACAA*TACTAAGATAAGACCAGCTTGTTGATTCAG
TTAGTG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4AN46TF 815 0 0
GAATCTCAAGCAGAGCCTCTCTGTCTCTGTCTCCGTCCCCTTCTTCAGTTTACACAGCAC
ACATACAAACACTTTTGTATATATATATATAGTGAGTTAGAGTGGTTTTATCTGACCAAA
ATTCATTGAACATGGCTGTTGTTGTAACCTCTAACGGGAATGGTCCGGCTTTTGAAGCCA
AGATGACTGTCTATGTCTTCGTCTGCGTTATGATTGCTGCTGTCGGCGGTTTGATCTTCG
GTTACGACATCGGGATTTCCGGTGGAGTGACGGCGATGGATGATTTCTTGAAGAAATTTT
TCCCTTCGGTGTGGGAGAGGAAGCAGCACGCTCATGAGAACAATTACTGCAAGTATAATA
ACCAGTACTTGCGACTATTCACATCGTCTCTTTACCTAGCCGCCCTCGTGGGCAGCTTCT
TGGCTTCAGCCGTATGTTCCAAACTTGGAAGGAAGCCCACTATGCAGTTTGCTTCTGTCT
TTTTCTTGATCGGTGTCGGGCTAGCCGCAGGAGCCGTTAACATCGTCATGTTGATCATTG
GAAGAATCATGCTTGGCTTGGGTGTAGGCTTTGGCAATCAGGCAGTGCCGCTCTTCCTAT
CAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAAAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATCAT
CAAGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGATATCATAAGTCTTTGTTGATTTATGTGTGTTTT
*GTTTTGTTTTTTCTTGTTAATGTTTGCAACTCTTTCGTTAGCTTCCTTTGTTTTGTGGG
AAGAACAAATACTAAGATAAGACCAGCTTGTTGAT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4AH04JQ 817 0 0
TT
CAGTTTACACAGCACACATACAAACACTTTTGTATATATATATATAGTGAGTTAGAGTGG
TTTTATCTGACCAAAATTCATTGAACATGGCTGTTGTTGTAACCTCTAACGGGAATGGTC
CGGCTTTTGAAGCCAAGATGACTGTCTATGTCTTCGTCTGCGTTATGATTGCTGCTGTCG
GCGGTTTGATCTTCGGTTACGACATCGGGATTTCCGGTGGAGTGACGGCGATGGATGATT
TCTTGAAGAAATTTTTCCCTTCGGTGTGGGAGAGGAAGCAGCACGCTCATGAGAACAATT
ACTGCAAGTATAATAACCAGTACTTGCGACTATTCACATCGTCTCTTTACCTAGCCGCCC
TCGTGGGCAGCTTCTTGGCTTCAGCCGTATGTTCCAAACTTGGAAGGAAGCCCACTATGC
AGTTTGCTTCTGTCTTTTTCTTGATCGGTGTCGGGCTAGCCGCAGGAGCCGTTAACATCG
TCATGTTGATCATTGGAAGAATCATGCTTGGCTTGGGTGTAGGCTTTGGCAATCAGGCAG
TGCCGCTCTTCCTATCAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAAAGGTATATGCTT
GCTGAGGATGATCATCAAGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGATATCATAAGTCTTTGTTG
ATTTATGTGTGTTTT*GTTTTGTTTTTTCTTGTTAATGTTTGCAACTCTTTCGTTAGCTT
CCTTTGTTTTGTGGGAAGAACAAATACTAAGATAAGACCAGCTTGTTGATTCAGGTTAGG
TGTTTTTATCAATGAAATTCAATGAAAATTTTCTC

QA 3 817 3 817
DS 

RD RR4AN46JQ 815 0 0
CAGTTTACACAGCACACATACAAACACTTTTGTATATATATATATAGTGAGTTAGAGTGG
TTTTATCTGACCAAAATTCATTGAACATGGCTGTTGTTGTAACCTCTAACGGGAATGGTC
CGGCTTTTGAAGCCAAGATGACTGTCTATGTCTTCGTCTGCGTTATGATTGCTGCTGTCG
GCGGTTTGATCTTCGGTTACGACATCGGGATTTCCGGTGGAGTGACGGCGATGGATGATT
TCTTGAAGAAATTTTTCCCTTCGGTGTGGGAGAGGAAGCAGCACGCTCATGAGAACAATT
ACTGCAAGTATAATAACCAGTACTTGCGACTATTCACATCGTCTCTTTACCTAGCCGCCC
TCGTGGGCAGCTTCTTGGCTTCAGCCGTATGTTCCAAACTTGGAAGGAAGCCCACTATGC
AGTTTGCTTCTGTCTTTTTCTTGATCGGTGTCGGGCTAGCCGCAGGAGCCGTTAACATCG
TCATGTTGATCATTGGAAGAATCATGCTTGGCTTGGGTGTAGGCTTTGGCAATCAGGCAG
TGCCGCTCTTCCTATCAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAAAGGTATATGCTT
GCTGAGGATGATCATCAAGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGATATCATAAGTCTTTGTTG
ATTTATGTGTGTTTT*GTTTTGTTTTTTCTTGTTAATGTTTGCAACTCTTTCGTTAGCTT
CCTTTGTTTTGTGGGAAGAACAAATACTAAGATAAGACCAGCTTGTTGATTCAGGTTAGG
TGTTTTTATCAATGAAATTCAATGAAAATTTTCTC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 2 4

CO CL2290Contig1 770 2 6 U
GGGAAGTTTGCAACATCAATTCTTCTATTTTTAAAGATTTTTGCTTTACAAAATCTAAAG
AAGAAGAAAGAAATCCTAATAGTCTAACATATATGGACAGATAAAAGTAGCCTCTCCAGT
TTTCTATCTTTATCCAAGCTGCCTGCAAATCTTCGAAGATTTGCTTGTATATAACAGAAA
AGTCGTCACTGGTTCTGAAGGTGACCTGTTTCAAGAAGCTTTGTTCAAGCAAACCCGAAA
CCTTCACTGGCTTCGTGAATGGCAAGCAGTAGGCGTTCCTGAAGCTGTTCCTTAAATGGA
TACTCAGGGAGGTCTAGTTGGTTAAAACATGTATGAGCTGATGGCAGCCGCTCTGGACCT
CCATATGCTTTGTGAATTTGTAATCTTTGAGGGCCAGATATACCTTGCAATGCCTTGAAA
CCTTCTAAAGGAACCTTTGATGTTCCGGTGACAAACTGAAAAAATCTAGCCATATCTTCT
TTGCTAAAAGCTTTAACGACCTCCCAGAACCAATGAATAACAGGGGATCCTGCCGCATAG
CTGGTGTACTCCGTATTGGCTTTAAGATCATCGAAATCAATCTCAGGCAATCCACTGATG
AGGAGCTCGAGCTCTTTATCATTAAAAATGGATACGAGCTCACGAGGTATCAACTCATTA
AAGCCTTCAAGGAAGGCGTTGATTTGAGGCCGAATCGCATTGGTAAGTATATGTCCGGCC
ACAGGTCAACATATTCATGTTTTGTGTCTTCTGTCACCCATATGTTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG50JQ U 1
AF RR4EC84JQ U 10
BS 1 266 RR4GG50JQ
BS 267 267 RR4EC84JQ
BS 268 571 RR4GG50JQ
BS 572 572 RR4EC84JQ
BS 573 591 RR4GG50JQ
BS 592 770 RR4EC84JQ

RD RR4GG50JQ 591 0 0
GGGAAGTTTGCAACATCAATTCTTCTATTTTTAAAGATTTTTGCTTTACAAAATCTAAAG
AAGAAGAAAGAAATCCTAATAGTCTAACATATATGGACAGATAAAAGTAGCCTCTCCAGT
TTTCTATCTTTATCCAAGCTGCCTGCAAATCTTCGAAGATTTGCTTGTATATAACAGAAA
AGTCGTCACTGGTTCTGAAGGTGACCTGTTTCAAGAAGCTTTGTTCAAGCAAACCCGAAA
CCTTCACTGGCTTCGTGAATGGCAAGTAGTAGGCGTTCCTGAAGCTGTTCCTTAAATGGA
TACTCAGGGAGGTCTAGTTGGTTAAAACATGTATGAGCTGATGGCAGCCGCTCTGGACCT
CCATATGCTTTGTGAATTTGTAATCTTTGAGGGCCAGATATACCTTGCAATGCCTTGAAA
CCTTCTAAAGGAACCTTTGATGTTCCGGTGACAAACTGAAAAAATCTAGCCATATCTTCT
TTGCTAAAAGCTTTAACGACCTCCCAGAACCAATGAATAACAGGGGATCCTGCCGCATAG
CTGGTGTACTCCGTATTGGCTTTAAGATCATTGAAATCAATCTCAGGCAAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4EC84JQ 761 0 0
GCAACATCAATTCTTCTATTTTTAAAGATTTTTGCTTTACAAAATCTAAAGAAGAAGAGA
GAAATCCTAATAGTCTAACATATATGGACAGATAAAAGTAGCCTCTCCAGTTTTCTATCT
TTATCCAAGCTGCCTGCAAATCTTCGAAGATTTGCTTGTATATAACAGAAAAGTCGTCAC
TGGTTCTGAAGGTGACCTGTTTCAAGAAGCTTTGTTCAAGCAAACCCGAAACCTTCACTG
GCTTCGTGAATGGCAAGCAGTAGGCGTTCCTGAAGCTGTTCCTTAAATGGATACTCAGGG
AGGTCTAGTTGGTTAAAACATGTATGAGCTGATGGCAGCCGCTCTGGACCTCCATATGCT
TTGTGAATTTGTAATCTTTGAGGGCCAGATATACCTTGCAATGCCTTGAAACCTTCTAAA
GGAACCTTTGATGTTCCGGTGACAAACTGAAGAAATCTAGCCATATCTTCTTTGCTAAAA
GCTTTAACGACCTCCCAGAACCAATGAATAACAGGGGATCCTGCCGCATAGCTGGTGTAC
TCCGTATTGGCTTTAAGATCATCGAAATCAATCTCAGGCAATCCACTGATGAGGAGCTCG
AGCTCTTTATCATTAAAAATGGATACGAGCTCACGAGGTATCAACTCATTAAAGCCTTCA
AGGAAGGCGTTGATTTGAGGCCGAATCGCATTGGTAAGTATATGTCCGGCCACAGGTCAA
CATATTCATGTTTTGTGTCTTCTGTCACCCATATGTTTCGT

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL2290Contig2 974 2 6 U
GTGTGTGAAGGTGACTTATCATGACATCGAGGCCGTGGATCCTGATTACTACAAGAATTT
GAAGTGGCTGTTAGAGAATGATGTGAATGACATACTCGATCTCACATTTAGTATGGACGC
AGATGAGGAAAAACACATTCTTTACGAAAAGACTGAGGTGACGGACTATGAGCTTAAACC
TGGAGGACGAAACATACGGGTGACAGAAGACACAAAACATGAATATGTTGACCTTGTGGC
CGGACATATACTTACCAATGCGATTCGGCCTCAAATCAACGCCTTCCTTGAAGGCTTTAA
TGAGTTGATACCTCGTGAGCTCGTATCCATTTTTAATGATAAAGAGCTCGAGCTCCTCAT
CAGTGGATTGCCTGAGATTGATTTCAATGATCTTAAAGCCAATACGGAGTACACCAGCTA
TGCGGCAGGATCCCCTGTTATTCATTGGTTCTGGGAGGTCGTTAAAGCTTTTAGCAAAGA
AGACATGGCTAGATTTCTTCAGTTTGTCACCGGAACATCAAAGGTTCCTTTAGAAGGTTT
CAAGGCATTGCAAGGTATATCTGGCCCTCAAAGATTACAAATCCACAAAGCATATGGAGG
TCCAGAGCGGCTGCCATCAGCTCATACATGTTTTAACCAACTAGACCTCCCTGAGTATCC
ATCTAAGGAACAGCTTCAGGAACGCCTACTACTTGCCATTCACGAAGCCAGTGAAGGTTT
CGGGTTTGCTTGAACAAAGCTTCTTGAAACAGGTCACCTTCAGAACCAGTGACGACTTCT
CTGTTATATACAAGCAAATTTCATTGGTTCCATGGCAGATCTTCGAAGATTTGCAGGCAG
CTTGGATAAAGATAGAAAACTGGAGAGGCTACTTTTATCTGTCCATATATGTTAGACTAT
TAGGATTTCTCTCTTCTTCTTTAGATTTTGTAAAGCAAAAATCTTTAAAAATAGAAGAAT
TGATGTTGCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG50TF U 1
AF RR4DG95JQ C 101
BS 1 483 RR4GG50TF
BS 484 484 RR4DG95JQ
BS 485 582 RR4GG50TF
BS 583 583 RR4DG95JQ
BS 584 704 RR4GG50TF
BS 705 974 RR4DG95JQ

RD RR4GG50TF 704 0 0
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GAAGTGGCTGTTAGAGAATGATGTGAATGACATACTCGATCTCACATTTAGTATGGACGC
AGATGAGGAAAAACACATTCTTTACGAAAAGACTGAGGTGACGGACTATGAGCTTAAACC
TGGAGGACGAAACATACGGGTGACAGAAGACACAAAACATGAATATGTTGACCTTGTGGC
CGGACATATACTTACCAATGCGATTCGGCCTCAAATCAACGCCTTCCTTGAAGGCTTTAA
TGAGTTGATACCTCGTGAGCTCGTATCCATTTTTAATGATAAAGAGCTCGAGCTCCTCAT
CAGTGGATTGCCTGAGATTGATTTCAATGATCTTAAAGCCAATACGGAGTACACCAGCTA
TGCGGCAGGATCCCCTGTTATTCATTGGTTCTGGGAGGTCGTTAAAGCTTTTAGCAAAGA
AGATATGGCTAGATTTCTTCAGTTTGTCACCGGAACATCAAAGGTTCCTTTAGAAGGTTT
CAAGGCATTGCAAGGTATATCTGGCCCTCAAAGATTACAAATTCACAAAGCATATGGAGG
TCCAGAGCGGCTGCCATCAGCTCATACATGTTTTAACCAACTAGACCTCCCTGAGTATCC
ATCTAAGGAACAGCTTCAGGAACGCCTACTACTTGCCATTCACG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4DG95JQ 874 0 0
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ACGGACTATGAGCTTAAACCTGGAGGACGAAACATACGGGTGACAGAAGACACAAAACAT
GAATATGTTGACCTTGTGGCCGGACATATACTTACCAATGCTATTCGGCCTCAAATCAAC
GCCTTCCTTGAAGGCTTTAATGAGTTGATACCTCGTGAGCTCGTATCCATTTTTAATGAT
AAAGAGCTCGAGCTCCTCATCAGTGGATTGCCTGAGATTGATTTCGATGATCTTAAAGCC
AATACGGAGTATACCAGCTATGCGGCAGGATCCCCTGTTATTCATTGGTTCTGGGAGGTC
GTTAAAGCTTTTAGCAAAGAAGACATGGCTAGATTTCTTCAGTTTGTCACCGGAACATCA
AAGGTTCCTTTAGAAGGTTTCAAGGCATTGCAAGGTATATCTGGCCCTCAAAGATTACAA
ATCCACAAAGCATATGGAGGTCCAGAGCGGCTGCCATCAGCTCATACATGTTTTAACCAA
CTAGACCTCCCTGAGTATCCATCTAAGGAACAGCTTCAGGAACGCCTGCTACTTGCCATT
CACGAAGCCAGTGAAGGTTTCGGGTTTGCTTGAACAAAGCTTCTTGAAACAGGTCACCTT
CAGAACCAGTGACGACTTCTCTGTTATATACAAGCAAATTTCATTGGTTCCATGGCAGAT
CTTCGAAGATTTGCAGGCAGCTTGGATAAAGATAGAAAACTGGAGAGGCTACTTTTATCT
GTCCATATATGTTAGACTATTAGGATTTCTCTCTTCTTCTTTAGATTTTGTAAAGCAAAA
ATCTTTAAAAATAGAAGAATTGATGTTGCAAACT

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 4

CO CL2291Contig1 518 4 3 U
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ACAAATAGGTTCTCATTGGAAAAGTTGATGGACGATTTGGCCAAGAAACATATGATTTCA
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TGGTCTAAGAAGCAGAGAGACTATTGGTCTTGGCGTAGTGACCAAGAGACCAGGAGGAGA
GAGCTGGACAAGAAGAGGAGACCCTCTCTGCGGTGGCTCTAACTAATTCGTCAAAAGCCA
TCTCTTCCTCAAAGATTGTGGTCAACATGTTCTTGAATGGTTCTCTCGTCGTCGCTGATA
TCAACTTAGCAGGAGCCACTTCGGTAATGAACCTAGTGGTCTCAACTGTTTCCATTTGTG
ATTGAGATCTTCTGAATGGAAAAGAAAGTGTGGGGAGAAGAAAGCTTCTTCGTTGGGCAT
GAAAACAAGAGATTGCAGATAAGATATTTTGTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H796JQB U 20
AF RR4GJ86TF C 1
AF RR4GJ86JQ U 12
AF RR4H796TF C 18
BS 1 20 RR4GJ86TF
BS 21 494 RR4GJ86JQ
BS 495 518 RR4GJ86TF

RD RR4H796JQB 120 0 0
G
GATGAAAATTTGAACAAACAACTCTTAATGCTGAGAGATTACAAATAGGTTCTCATTGGA
AAAGTTGATGGACGATTTGGCCAAGAAACATATGATTTCATTGGTCTTTCCTCTTATTG

QA 2 120 2 120
DS 

RD RR4GJ86TF 518 0 0
TTTTTTTTATTCAACCAGTAGATGAAAATTTGAACAAACAACTCTTAATGCTGAGAGATT
ACAAATAGGTTCTCATTGGAAAAGTTGATGGACGATTTGGCCAAGAAACATATGATTTCA
TTGGTCTTTCGTCTTATTGAAAAAAAGAGAGAATAAAATGCAATTTTAGGGTCGTTTAAA
TGGTCTAAGAAGCAGAGAGACTATTGGTCTTGGCGTAGTGACCAAGAGACCAGGAGGAGA
GAGCTGGACAAGAAGAGGAGACCCTCTCTGCGGTGGCTCTAACTAATTCGTCAAAAGCCA
TCTCTTCCTCAAAGATTGTGGTCAACATGTTCTTGAATGGTTCTCTCGTCGTCGCTGATA
TCAACTTAGCAGGAGCCACTTCGGTAATGAACCTAGTGGTCTCAACTGTTTCCATTTGTG
ATTGAGATCTTCTGAATGGAAAAGAAAGTGTGGGGAGAAGAAAGCTTCTTCGTTGGGCAT
GAAAACAAGAGATTGCAGATAAGATATTTTGTGAATCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4GJ86JQ 483 0 0
CAACCAGTA
GATGAAAATTTGAACAAACAACTCTTAATGCTGAGAGATTACAAATAGGTTCTCATTGGA
AAAGTTGATGGACGATTTGGCCAAGAAACATATGATTTCATTGGTCTTTCGTCTTATTGA
AAAAAAGAGAGAATAAAATGCAATTTTAGGGTCGTTTAAATGGTCTAAGAAGCAGAGAGA
CTATTGGTCTTGGCGTAGTGACCAAGAGACCAGGAGGAGAGAGCTGGACAAGAAGAGGAG
ACCCTCTCTGCGGTGGCTCTAACTAATTCGTCAAAAGCCATCTCTTCCTCAAAGATTGTG
GTCAACATGTTCTTGAATGGTTCTCTCGTCGTCGCTGATATCAACTTAGCAGGAGCCACT
TCGGTAATGAACCTAGTGGTCTCAACTGTTTCCATTTGTGATTGAGATCTTCTGAATGGA
AAAGAAAGTGTGGGGAGAAGAAAGCTTCTTCGTTGGGCATGAAAACAAGAGATT

QA 10 483 10 483
DS 

RD RR4H796TF 497 0 0
TTG
GATGAAAATTTGAACAAACAACTCTTAATGCTGAGAGATTACAAATAGGTTCTCATTGGA
AAAGTTGATGGACGATTTGGCCAAGAAACATATGATTTCATTGGTCTTTCGTCTTATTGA
AAAAAAGAGAGAATAAAATGCAATTTTAGGGTCGTTTAAATGGTCTAAGAAGCAGAGAGA
CTGTTGGTCTTGGCGTAGTGACCGAGAGACCAGGAGGAGAGAGCTGGACAAGAAGAGGAG
ACCCTCTCTGCGGTGGCTCTAACTAATTCGTCAAAAGCCATCTCTTCCTCAAAGATTGTG
GTCAACATGTTCTTGAATGGTTCTCTCGTCGTCGCTGATATCAACTTAGCAGGAGCCACC
TCGGTGATGAACCTAGTGGTCTCAACTGTTTCCATTTGTGATTGAGATCTTCTGAATGGA
AAAGAAAGTGTGGGGAGAAGAAAGCTTCTTCGTTGGGCATGAAAACAAGAGATTGCAGAT
AAGATATTTTGT
CC

QA 4 495 4 495
DS 



AS 1 2

CO CL2292Contig1 1104 2 4 U
TTCTGCAACAGAAGAGTGGTGTTGAAGGCTATCACAACTATATATAGCCACTTATGTCAT
TACATAAACACAATTCATTACATTCCGTACTAATATAATCCAAATCTCATTTTCATCATC
AAGAACCCACCACTTGAACGCTTAAAGATCCAGCTTGTTCTCATCATTAGATCAGAAGCA
TGCATCACTCAAAGCATCCAGCCAGGGATGTAACCGTTTCCTGGTTGGATCTGACCTTGA
GTCGTTACAGCCATTTGCTCTGAACACACTGGATGGTTGTACCCAATTTGCAAAGTGGAA
TCACATTCAAGAGACTGGAACAGTCCCTGAGATTGAGTCTGATGATGTCCATAGGCAACA
TTTTGCTGATCACCGCCTTCCCATGTCCCTCCTACGTGGTGACTTCTCATGCCTATCATA
TCTTCCAGCTTCATTGACAAAGCTCTATTGGCTTCAAGCAACATATGCTCTTTGCCTTGG
AGGTCAGTGAGCTGGTCAAGCATATACTGTGTCTTGATGCAGCGAACTTGCTTCAGAGAG
CCGTCTAGTTGACGCTCAAGCTGCTCTAGCTCTTTTGAGTTCAAAGGTCCAAGGTCTTCT
CCAAGTAAATTTCTCTGCTGAAGTTGCAGATTTTCATATCTACCTTTCAGCTTCAAATAC
TCTCTGTAGCTATTCTCGAGTTCTTTGGAGAAGACGATGAGAGAAACCTCAGCATCGCAG
AGAACAGAAAGCTCATAAGCTTTTTTCAGCAAACCGTTCCTACGCTTAGCAAACGTTACT
TGTCTGTTAATCTTGTTCTCTATCCTCTTTAGCTCTACTCTTCCCCTTCCCATTTTGATA
TGTAACCTTATTAGGGGATGTAAATGTTTATCTATATACAGACACACAAACACGAGCTGG
GTTTTGCTTTTTTTTTGGATGAAAGACCTTTTCTTTTTGAGAAAAAAAATCAAACCCTAG
ATTCCTCAAGAACAAGAAGAAGAAAGGAGTTAAGAGAAGAGAATATAAAGAGGAAACTTT
TGCTATCTTGTTTGGTTGTGATTTGATTGTGTAGTAGGGTTCTAGTTTCTTCTTTAGATC
ATTTTGAAAGGGGTTGTGTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP96JQ U 1
AF RR4DH21TF C 394
BS 1 436 RR4GP96JQ
BS 437 437 RR4DH21TF
BS 438 604 RR4GP96JQ
BS 605 1104 RR4DH21TF

RD RR4GP96JQ 604 0 0
TTCTGCAACAGAAGAGTGGTGTTGAAGGCTATCACAACTATATATAGCCACTTATGTCAT
TACATAAACACAATTCATTACATTCCGTACTAATATAATCCAAATCTCATTTTCATCATC
AAGAACCCACCACTTGAACGCTTAAAGATCCAGCTTGTTCTCATCATTAGATCAGAAGCA
TGCATCACTCAAAGCATCCAGCCAGGGATGTAACCGTTTCCTGGTTGGATCTGACCTTGA
GTCGTTACAGCCATTTGCTCTGAACACACTGGATGGTTGTACCCAATTTGCAAAGTGGAA
TCACATTCAAGAGACTGGAACAGTCCCTGAGATTGAGTCTGATGATGTCCATAGGCAACA
TTTTGCTGATCACCGCCTTCCCATGTCCCTCCTACGTGGTGACTTCTCATGCCTATCATA
TCTTCCAGCTTCATTGGCAAAGCTCTATTGGCTTCAAGCAACATATGCTCTTTGCCTTGG
AGGTCAGTGAGCTGGTCAAGCATATACTGTGTCTTGATGCAGCGAACTTGCTTCAGAGAG
CCGTCTAGTTGACGCTCAAGCTGCTCTAGCTCTTTTGAGTTCAAAGGTCCAAGGTCTTCT
CCAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4DH21TF 711 0 0
ACGTGGTGACTTCTCATGCCTATCATATCTTCCAGCTTCATTGACAAAGCTCTATTGGCT
TCAAGCAACATATGCTCTTTGC*TTGGAGGTCAGTGAGCTGGTCAAGCATATACTGTGTC
TTGATGCAGCGAACTTGCTTCAGAGAGCCGTCTAGTTGACGCTCAAGCTGCTCTAGCTCT
TTTGAGTTCAAAGGTCCAAGGTCTTCTCCAAGTAAATTTCTCTGCTGAAGTTGCAGATTT
TCATATCTACCTTTCAGCTTCAAATACTCTCTGTAGCTATTCTCGAGTTCTTTGGAGAAG
ACGATGAGAGAAACCTCAGCATCGCAGAGAACAGAAAGCTCATAAGCTTTTTTCAGCAAA
CCGTTCCTACGCTTAGCAAACGTTACTTGTCTGTTAATCTTGTTCTCTATCCTCTTTAGC
TCTACTCTTCCCCTTCCCATTTTGATATGTAACCTTATTAGGGGATGTAAATGTTTATCT
ATATACAGACACACAAACACGAGCTGGGTTTTGCTTTTTTTTTGGATGAAAGACCTTTTC
TTTTTGAGAAAAAAAATCAAACCCTAGATTCCTCAAGAACAAGAAGAAGAAAGGAGTTAA
GAGAAGAGAATATAAAGAGGAAACTTTTGCTATCTTGTTTGGTTGTGATTTGATTGTGTA
GTAGGGTTCTAGTTTCTTCTTTAGATCATTTTGAAAGGGGTTGTGTGTGTT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL2293Contig1 738 2 5 U
GCTATTATTATGTCTTACACAATATCACTGAATTAACTTTCCAACACAAAACATTGCAAT
CGTCACATAGTAATTTTGTAGTTTTAATAAGAACATATATCAATAGCAGAGTCCAGTTGA
TTTAGCTGGTTCACCAATATTCACATTGTAATAAACCTCCTTCACTCCTTCCCCTGCACC
ACAATGTCCTTTAGCAAAGCCTGCACCATCAGACACCTGGTTGTCGTGTCCATCACCAGC
AATAACAGTCGATGTTTCAGCAACTGTATTCGCAGCTAACGCTCTGAGACGGTAACGTTC
AGCTCTCGACCCAATCACCTGTCCCAAGATGGACGCTCCGATAGTCAACGCCATGGCTGC
TTTGGGCATGAGCACAGATTTCCTGAGCATAGCTATGAAAGGCACAGCAGCATGAACCGC
CACAAACCACGAAGGCGAAAACTTGACGGTGTGTTCCCTCCAAACACCGAGAGGCACGTT
TGCAGCCATCCCCATGAAAGCGATGGCAAGCATCTTTTCAGGTAAAGGCTGAGGGCGAAG
GCTTTTAACCAAAGGGGTCTTGGAAAGCGCAGCTCTTGCAGCTACTATAGGAGCTGGACA
TCTAAACTTCATACCAGGTGGTGGCTGTAATGCTTTCGCCACAAGAGGCATGACTTTGCT
TGCCGCTCTGTATGATTTCGCGATCGGACAGTTCCCGGTTTTTAACCACTCGTCGCCAAC
TGCCTCGTGCTTGGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F408JQ U 18
AF RR4CS25JQ U 1
BS 1 25 RR4CS25JQ
BS 26 26 RR4F408JQ
BS 27 500 RR4CS25JQ
BS 501 501 RR4F408JQ
BS 502 738 RR4CS25JQ

RD RR4F408JQ 695 0 0
CACAATATCACTGAATTAACTTTCCAACACAAAACATTGCAATCGTCACATAGTAATTTT
GTAGTTTTAATAAGAACATATATCAATAGCAGAGTCCAGTTGATTTAGCTGGTTCACCAA
TATTCACATTGTAATAAACCTCCTTCACTCCTTCCCCTGCACCACAATGTCCTTTAGCAA
AGCCTGCACCATCAGACACCTGGTTGTCGTGTCCATCACCAGCAATAACAGTCGATGTTT
CAGCAACTGTATTCGCAGCTAACGCTCTGAGACGGTAACGTTCAGCTCTCGACCCAATCA
CCTGTCCCAAGATGGACGCTCCGATAGTCAACGCCATGGCTGCTTTGGGCATGAGCACAG
ATTTCCTGAGCATAGCTATGAAAGGCACAGCAGCATGAACCGCCACAAACCACGAAGGCG
AAAACTTGACGGTGTGTTCCCTCCAAACACCGAGAGGCACGTTTGCAGCCATCCCCATGA
GAGCGATGGCAAGCATCTTTTCAGGTAAAGGCTGAGGGCGAAGGCTTTTAACCAAAGGGG
TCTTGGAAAGCGCAGCTCTTGCAGCTACTATAGGAGCTGGACATCTAAACTTCATACCAG
GTGGTGGCTGTAATGCTTTCGCCACAAGAGGCATGACTTTGCTTGCCGCTCTGTATGATT
TCGCGATCGGACAGTTCCCGGTTTTTAACCACTCG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4CS25JQ 738 0 0
GCTATTATTATGTCTTACACAATATTACTGAATTAACTTTCCAACACAAAACATTGCAAT
CGTCACATAGTAATTTTGTAGTTTTAATAAGAACATATATCAATAGCAGAGTCCAGTTGA
TTTAGCTGGTTCACCAATATTCACATTGTAATAAACCTCCTTCACTCCTTCCCCTGCACC
ACAATGTCCTTTAGCAAAGCCTGCACCATCAGACACCTGGTTGTCGTGTCCATCACCAGC
AATAACAGTCGATGTTTCAGCAACTGTATTCGCAGCTAACGCTCTGAGACGGTAACGTTC
AGCTCTCGACCCAATCACCTGTCCCAAGATGGACGCTCCGATAGTCAACGCCATGGCTGC
TTTGGGCATGAGCACAGATTTCCTGAGCATAGCTATGAAAGGCACAGCAGCATGAACCGC
CACAAACCACGAAGGCGAAAACTTGACGGTGTGTTCCCTCCAAACACCGAGAGGCACGTT
TGCAGCCATCCCCATGAAAGTGATGGCAAGCATCTTTTCAGGTAAAGGCTGAGGGCGAAG
GCTTTTAACCAAAGGGGTCTTGGAAAGCGCAGCTCTTGCAGCTACTATAGGAGCTGGACA
TCTAAACTTCATACCAGGTGGTGGCTGTAATGCTTTCGCCACAAGAGGCATGACTTTGCT
TGCCGCTCTGTATGATTTCGCGATCGGACAGTTCCCGGTTTTTAACCACTCGTCGCCAAC
TGCCTCGTGCTTGGATGA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

CO CL2294Contig1 815 4 5 U
GGACACGACAGAGAGGAAGCCGCCGCAAAAAAGAAAAAAACCCTAAAAAGATGGATGAAG
AAAGCAAGGTGAAGATCGAGAAAACGGTTCGAGAGATTCTGAACGAATCGGACATGACGG
AGATGACGGAGTTCAAGGTCCGTAATCTCGCTTCGGAGAGACTCGGCATCGATCTCTCAG
ACAAATCTCACAAGGCATTTGTACGCGGCATCGTCAAGTCATTCCTCGAAGAAGTGGAGT
CCAAACAACAACAAGACAAGGAAGATGAGGAGGAAGAACAAAGAGCTAAGGGAGACAAGG
AGTTGGACGATGACGGCGATCTCATCATTTGCCGGCTGTCGGATAAGAGGAGAGTGACGA
TTCAGGAGTTTAGAGGAAAGGCTTTGGTCTCTATCAGAGAGTATTACAAGAAAGATGGCA
AAGAGCTTCCTTCCTCTAAAGGAATAAGCTTAACAGATGAACAATGGTCAACGTTCAAGA
AAAATATTCCAGCCATCGAAAATGCTGTCAAGAAAATGGAATCGCGTGCCTGAACAACTT
GTGGGTTGATTCTGCTTTCAAAAAACATATGCAAGTGTCTTGTTGAATCAGTGGTGCAAA
TGTTATTATTGTCTTATGTAACTTGTTTTCTTTCTTCGGATTGGTCGTATTGTGTTTCTT
AGAGGACCCCTGGCAGACGAAGCCATTATCATTAGTAGTAGTATCCCATGTCGGTTTAAC
CGTTTCAACATAACCGAATTAGGACATGTATACACGACTCTTCCGGTCACCACTTTCGCT
TTCTAAATTCCGTTTCTTCTTTGCGGCGACCCCTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC58TF U 1
AF RR4DC43TF U 3
AF RR4FC58JQ C 132
AF RR4DC43JQ C 230
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TGTTATTATTGTCTTATG
G

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DS 

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GG
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GACGGAGTTCAAGGTCCGTAATCTCGCTTCGGAGAGACTCGGCATCGATCTCTCAGACAA
ATCTCACAAGGCATTTGTACGCGGCATCGTCAAGTCATTCCTCGAAGAAGTGGAGTCCAA
ACAACAACAAGACAAGGAAGATGAGGAGGAAGAACAAAGAGCTAAGGGAGACAAGGAGTT
GGACGATGACGGCGATCTCATCATTTGCCGGCTGTCGGATAAGAGGAGAGTGACGATTCA
GGAGTTTGGAGGAAAGGCTTTGGTCTCTATCAGAGAGTATTACAAGAAAGATGGCAAAGA
GCTTCCTTCCTCTAAAGGAATAAGCTTAACAGATGAACAGTGGTCAACGTTCAAGAAAAA
TATTCCAGCCATCGAAAATGCTGTCAAGAAAATGGAATCGCGTGTCTGAACAACTTGTGG
GTTGATTCTGCTTTCAAAAAACATATGCAAGTGTCTTGTTGAATCAGTGGTGCAAATGTT
ATTATTGTCTTATGTAACTTGTTTTCTTTCTTCGGATTGGTCGTATTGTGTTTCTT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR4FC58JQ 488 0 0
TTCAAGGTCCGTAATCTCGCTTCGGAGAGACTCGGCATCGATCTTTCAGACAAATCTCAC
AAGGCATTTGTACGCGGCATCGTCAAGTCATTCCTCGAAGAAGTGGAGTCCAAACAACAA
CAAGACAAGGAAGATGAGGATGAAGAACAAAGAGCTAAGGGAGACAAGGAGTTGGACGAT
GACGGCGATCTCATCATTTGCCGGCTGTCGGATAAGAGGAGAGTGACGATTCAGGAGTTT
AGAGGAAAGGCTTTGGTCTCTATCAGAGAGTATTACAAGAAAGATGGCAAAGAGCTTCCT
TCCTCTAAAGGAATAAGCTTAACAGATGAACAATGGTCAACGTTCAAGAAAAATATTCCA
GCCATCGAAAATGCTGTCAAGAAAATGGAATCGCGTGCCTGAACAACTTGTGGGTTGATT
CTGCTTTCAAAAAACATATGCAAGTGTCTTGTTGAATCAGTGGTGCAAATGTTATTATTG
TCTTATG
G

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DS 

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GAGAGTGACGATTCAGGAGTTTGGAGGAAAGGCTTTGGTCTCTATCAGAGAGTATTACAA
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AACGTTCAAGAAAAATATTCCAGCCATCGAAAATGCTGTCAAGAAAATGGAATCGCGTGT
CTGAACAACTTGTGGGTTGATTCTGCTTTCAAAAAACATATGCAAGTGTCTTGTTGAATC
AGTGGTGCAAATGTTATTATTGTCTTATGTAACTTGTTTTCTTTCTTCGGATTGGTCGTA
TTGTGTTTCTTAGAGGACCCCTGGCAGACGAAGCCATTATCATTAGTAGTAGTATCCCAT
GTCGGTTTAACCGTTTCAACATAACCGAATTAGGACATGTATACACGACTCTTCCGGTCA
CCACTTTCGCTTTCTAAATTCCGTTTCTTCTTTGCGGCGACCCCTG

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 4

CO CL2295Contig1 1124 4 7 U
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CTTCGAAGCAGCTCTCTCCTCTCCTCCTCGACTTGAAGTATCTGTTTCCCCATTCGTCGT
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CTTTTTGAAGACCGGTACTACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGATGGTGTGATACTAGG
CGCTGATACACGAGCAACTGAGGGACCTATCGTTGCTGATAAGAACTGCGAGAAGATTCA
CTACATGGCACCCAACATATATTGCTGTGGTGCTGGAACCACTGCTGATACTGAAGCTGT
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TGTCATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAAAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTC
AGCTGCTCTTGTCCTTGGTGGAGTGGATATCACCGGTCCTCATCTGCATACTATATACCC
TCATGGTTCAACTGACACTCTACCATTCGCAACAATGGGATCTGGTTCTCTTGCTGCTAT
GTCTGTCTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATCAAGCTGGT
CGCTGAAGCCATATGCTCGGGAATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACAT
CTGCGTGATCACAAAGGGTAACAAGGAATATCTCAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAG
AACCTATGTCAGCAGCAACGGCTATTCATTCACCAAGAAAACCGAGGTTCTTCGCACGAA
AATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAGATTACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAATA
AGTGAATCTCTCTCAAGTCTCTTTGCTTTTGTATTCATCTTTACCAAGATCAAAACTTAG
TGTGCGTGAGACATGTTAGTCTTGTCTTTTTTTACCAATGTGAAAGGATTATTCCGAATC
TTTTTTTTACCAATCTTAAAGGATTTCAACGGAATTAGACTTCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ89TF U 1
AF RR4EZ43TF U 2
AF RR4GJ89JQ C 329
AF RR4EZ43JQ C 392
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RD RR4GJ89TF 702 0 0
GGGGAAGGTTAATTGGGGAAGAAGAAAACACTCTTCTTCTATAATTCATCTGTTCTTGGG
CTTCGAAGCAGCTCTCTCCTCTCCTCCTCGACTTGAAGTATCTGTTTCCCCATTCGTCGT
CGTCGTCCAGATTGTAAGAATGACTCAATCATCCATAGATGTACCGGCAAAGGGAGGGTT
CAGCTTCGATCTGTGCAAGCGTAACAATATGCTTATCGAAAAGGGTCTTAAAGCTCCTTC
CTTTTTGAAGACCGGTACTACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGATGGTGTGATACTAGG
CGCTGATACACGAGCAACTGAGGGACCTATCGTTGCTGATAAGAACTGCGAGAAGATTCA
CTACATGGCACCCAACATATATTGCTGTGGTGCTGGAACCACTGCTGATACTGAAGCTGT
AACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGAGGTTGCATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCG
TGTCATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAAAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTC
AGCTGCTCTTGTCCTTGGTGGAGTGGATATCACCGGTCCTCATCTGCATACTATATACCC
TCATGGTTCAACTGACACTCTACCATTCGCAACAATGGGATCTGGTTCTCTTGCTGCTAT
GTCTGTCTTTGAG*CAAAGTACAAAGAAG*TCTAACTAGGGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4EZ43TF 685 0 0
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GTCGTCCAGATTGTAAGAATGACTCAATCATCCATAGATGTACCGGCAAAGGGAGGGTTC
AGCTTCGATCTGTGCAAGCGTAACAATATGCTTATCGAAAAGGGTCTTAAAGCTCCTTCC
TTTTTGAAGACCGGTACTACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGATGGTGTGATACTAGGC
GCTGATACACGAGCAACTGAGGGACCTATCGTTGCTGATAAGAACTGCGAGAAGATTCAC
TACATGGCACCCAACATATATTGCTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTGATACTGAAGCTGTA
ACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGAGGTTGCATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCGT
GTCATTACTGCCTTGACCCTTCTCAAAAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCA
GCTGCTCTTGTCCTTGGTGGAGTGTATATCACCGGTCCTCATCTGCATACTATATACCCT
CATGGTTCAACTGACACTCTACCATTCGCAACAATGGGATCTGGTTCTCTTGCTGCTATG
TCTGTCTTTGAG*CAAAGTACAAAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GJ89JQ 784 0 0
ATCGTTGCTGATAAGAACTGCGAGAAGAT*CACTACATGGCACCCAACATATATTGCTGT
GGTGCTGGAACCACTGCTGATACTGAAGCTGTAACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGAGG
TTGCATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCGTGTCATCACTGCCTTGACCCTTCTCAAA
AAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTTGTCCTTGGTGGAGTGGAT
ATCACCGGTCCTCATCTGCATACTATATACCCTCATGGTTCAACTGACACTCTACCATTC
GCAACAATGGGATCTGGTTCTCTTGCTGCTATGTCTGTCTTTGAGGCAAAGTACAAAGAA
GGTCTAACTAGGGATGAAGGAATCAAGCTGGTCGCTGAAGCCATATGCTCGGGAATATTC
AACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATCTGCGTGATCACAAAGGGTAACAAGGAA
TATCTCAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAACGGCTATTCA
TTCACCAAGAAAACCGAGGTTCTTCGCACGAAAATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAG
ATTACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAATAAGTGAATCTCTCTCAAGTCTCTTTGCTT
TTGTATTCATCTTTACCAAGATCAAAACTTAGTGTGCGTGAGACATGTTAGTCTTGTCTT
TTTTTACCAATGTGAAAGGATTATTCCGAATCTTTTTTTTACCAATCTTAAAGGATTTCA
ACGG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4EZ43JQ 733 0 0
GCTGGAACCGCTGCTGATACTGAAGCTGTAACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGAGGTTG
CATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCGTGTCATTACTGCCTTGACCCTTCTCAAAAAA
CACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTTGTCCTTGGTGGAGTGTATATC
ACCGGTCCTCATCTGCATACTATATACCCTCATGGTTCAACTGACACTTTACCATTCGCA
ACAATGGGATCTGGTTCTCTTGCTGCTATGTCTGTCTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGT
CTAACTAGGGATGAAGGAATCAAGCTGGTCGCTGAAGCCATATGCTCGGGAATATTCAAC
GACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATTTGCGTGATCACAAAGGGTAACAAGGAATAT
CTCAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGCAACGGCTATTCATTC
ACCAAGAAAACCGAGGTTCTTCGCACGAAAATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAGATT
ACAGAAGTGGGTGAAGCTATGGAAGAATAAGTGAATCTCTCTCAAGTCTCTTTGCTTTTG
TATTCATCTTTACCAAGATCAAAACTTAGTGTGCGTGAGACATGTTAGTCTTGTCTTTTT
TTACCAATGTGAAAGGATTATTCCGAATCTTTTTTTTACCAATCTTAAAGGATTTCAACG
GAATTAGACTTCG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL2296Contig1 923 4 7 U
GGCAAAACGGAATAAAAAAGTTGAATGCAGATGTTTTAATCAATGGTTGTTGTGAAATGT
TGAGGCTGTAAATTGTAATGGCTGCTTTTCAAACCCCCTTTGGCTTCTCTCCTTCTAAAT
ATTGTGTAGAGCTGATTGAGAAGCATACTTTATAAAGAACTATGTAATCTCTTATAATCT
GAATAATATAGACTATATTTTCCAATTTCGACGCACATTGAAGAGTTCATTCACTAACGT
AGTTCGGATTTTAGAAGAGTAACTACAAGAAAGAAAAAAAATCTTCTCTTGTTTCCAATT
TCCATCATAGTTTTTAGCACAAAACATATAAATGTTAGTGTTTGTATTCTAACACGTCGT
TCTATACCATCATAGTTTTTAGCATAAAACACAATAAATGCTAGTTTTAGATGGTTGTAG
ATTGCAAACTACGTACGTCGATATTTAGGGATAACATATTGATAGACATTTTTGTACTTG
TACCATTTTTTATTTCAGTAACATACTTTTTTATAATGTTTTTTTTTACAAAAAAAGTTA
CTCTTTTTTGGGCTGCACCTCTCATCTAATCCTCGTGTGAGAGGTGTAACCCACGGATGA
ACTCTCTCCCGAATATTCAAATGAGTCATAAACATGGATCCATATCCGTGTGACCACATA
TGAAACTAATAATCTCGCACTAGAAAAGAGTTGAACTCTGGCCTGAACCAACAAAGCACT
CTTCTTCTAGTGGAGACCACTAGACCACACAATGTGGTTACCTTTTTATAATGTCTCATA
TATATATATAACAACCATTTTATTAAATCAGATCGTAAACGAAGCATACCACCAACCATG
GTGGTGGAACACTAAAAATAACAGATAAACTTGATAAATCTAAAAGGAGAACTTGGGGAA
AAGCTTTAATTCGTCGGTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BD37JQ U 1
AF RR4BC62JQ U 74
AF RR4BC62TF C 116
AF RR4BD37TF C 116
BS 1 258 RR4BD37JQ
BS 259 259 RR4BC62JQ
BS 260 439 RR4BD37JQ
BS 440 440 RR4BC62JQ
BS 441 679 RR4BD37JQ
BS 680 714 RR4BC62JQ
BS 715 923 RR4BC62TF

RD RR4BD37JQ 679 0 0
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GAATAATATAGACTATATTTTCCAATTTCGACGCACATTGAAGAGTTCATTCACTAACGT
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TGAAACTAATAATCTCGCA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4BC62JQ 641 0 0
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GATTGAGAAGCATACTTTATAAAGAACTATGTAATCTCTTATAATCTGAATAATATAGAC
TATATTTTCCAATTTCGACGCACATTGAAGAGTTCATTCACTAACGTAGTTCGGATTTTA
GAAGAGTAACTACAAGAAAGAAAAAAAATCTTCTCTTGTTTCCAATTTCCATCATAGTTT
TTAGCACAAAACATATAAATGTTAGTGTTTGTATTCTAACACGTCGTTCTATACCATCAT
AGTTTTTAGCATAAAACACAATAAATGCTAGTTTTAGATGGTTGTAGATTGCAAACTACG
TACGTCGATATTTAGGGATAACATATTGATAGACATTTTTGTACTTGTACCATTTTTTAT
TTCAGTAACATACTTTTTTATAATGTTTTTTTTTACAAAAAAAGTTACTCTTTTTTGGGC
TGCACCTCTCATCTAATCCTCGTGTGAGAGGTGTAACCCACGGATGAACTCTCTCCCGAA
TATTCAAATGAGTCATAAACATGGATCCATATCCGTGTGACCACATATGAAACTAATAAT
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QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4BC62TF 808 0 0
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TGTAGATTGCAAACTACGTACGTCGATATTTAGGGATAACATATTGATAGACATTTTTGT
ACTTGTACCATTTTTTATTTCAGTAACATACTTTTTTATAATGTTTTTTTTTACAAAAAA
AGTTACTCTTTTTTGGGCTGCACCTCTCATCTAATCCTCGTGTGAGAGGTGTAACCCACG
GATGAACTCTCTCCCGAATATTCAAATGAGTCATAAACATGGATCCATATCCGTGTGACC
ACATATGAAACTAATAATCTCGCACTAGAAAAGAGTTGAACTCTGGCCTGAACCAACAAA
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TCATATATATATATAACAACCATTTTATTAAATCAGATCGTAAACGAAGCATACCACCAA
CCATGGTGGTGGAACACTAAAAATAACAGATAAACTTGATAAATCTAAAAGGAGAACTTG
GGGAAAAGCTTTAATTCGTCGGTCATGC

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DS 

RD RR4BD37TF 808 0 0
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AATCTGAATAATATAGACTATATTTTCCAATTTCGACGCACATTGAAGAGTTCATTCACT
AACGTAGTTCGGATTTTAGAAGAGTAACTACAAGAAAGAAAAAAAATCTTCTCTTGTTTC
CAATTTCCATCATAGTTTTTAGCACAAAACATATAAATGTTAGTGTTTGTATTCTAACAC
GTCGTTCTATACCATCATAGTTTTTAGCATAAAACACAATAAATGCTAGTTTTAGATGGT
TGTAGATTGCAAACTACGTACGTCGATATTTAGGGATAACATATTGATAGACATTTTTGT
ACTTGTACCATTTTTTATTTCAGTAACATACTTTTTTATAATGTTTTTTTTTACAAAAAA
AGTTACTCTTTTTTGGGCTGCACCTCTCATCTAATCCTCGTGTGAGAGGTGTAACCCACG
GATGAACTCTCTCCCGAATATTCAAATGAGTCATAAACATGGATCCATATCCGTGTGACC
ACATATGAAACTAATAATCTCGCACTAGAAAAGAGTTGAACTCTGGCCTGAACCAACAAA
GCACTCTTCTTCTAGTGGAGACCACTAGACCACACAATGTGGTTACCTTTTTATAATGTC
TCATATATATATATAACAACCATTTTATTAAATCAGATCGTAAACGAAGCATACCACCAA
CCATGGTGGTGGAACACTAAAAATAACAGATAAACTTGATAAATCTAAAAGGAGAACTTG
GGGAAAAGCTTTAATTCGTCGGTCATGC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 4

CO CL2297Contig1 686 4 2 U
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CAACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCAGCAGCAGCTAAGGCGTCTCCG
AGCTCAACCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCCAAGCATCCAGAAGA
AGAAGAAGATCAACGGTGGAAAGATCCACCAGAACCAATCTTGAAAAGACACAACCTTTA
GGGCTGGAGAAGAAGCAACTGAGACGAGCTTTGGTGACCGGTCTCTCCCTAGGTTTGATG
ATGGCTTTGGCATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCT
CTGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGC
ACGGGAGCTCTCTCCGCCGTGTTCGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCC
GCCGTTCTCATCGTGATCGTCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCG
GCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTG
TTCGTTCTCTCTTTCATTAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGT
TTCTGCATTAGTAATCTTTATTTGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4EC14TF U 1
AF RR4ED08TF U 1
AF RR4EC14JQ C 57
AF RR4ED08JQ C 65
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TTCTGCATTAGTAATCTTTATTTG

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CAACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCAGCAGCAGCTAAGGCGTCTCCG
AGCTCAACCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCCAAGCATCCAGAAGA
AGAAGAAGATCAACGGTGGAAAGATCCACCAGAACCAATCTTGAAAAGACACAACCTTTA
GGGCTGGAGAAGAAGCAACTGAGACGAGCTTTGGTGACCGGTCTCTCCCTAGGTTTGATG
ATGGCTTTGGCATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCT
CTGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGC
ACGGGAGCTCTCTCCGCCGTGTTCGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCC
GCCGTTCTCATCGTGATCGTCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCG
GCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTG
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TTCTGCATTAGTAATCTTTATTTG
AT

QA 1 684 1 684
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TCCGAGCTCAACCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCCAAGCATCCAG
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TTCCGCCGTTCTCATCGTGATCGTCTTAGGTGGAAGCTTTTACATCGTCTCCCAAGTCGT
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GAAGATCAACGGTGGAAAGATCCACCAGAACCAATCTTGAAAAGACACAACCTTTAGGGC
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TGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTGTTCG
TTCTCTCTTTCATTAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGTTTCT
GCATTAGTAATCTTTATTTG
AT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 4

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TTGGGTCACTGCAACTTCGAGTTCATTCCAAAAACTTTCTTCTCTCTTTTCCCTCCTCTC
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TACTCTCTATTCATGCCAATGTACGACTACATCTACGGGTCCAACGACAAGTGCAGTGAT
TCATTGTACGAATCATCATTGGAGAAAGAAGAAGAGAAGCCAGACGCAATTCATCTCACC
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TTCATACTAACTTCATTCTCTTCCCGAACCTTTGTCTTTGAGAGAAACCGCTTCCGTGAT
CTCACCATTCACTCCCACCTCCTTCCCAAGTTCTCCTCTCATTACATATCGCAGCAGTGT
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG18TF U 1
AF RR4E223TF U 592
AF RR4AG18JQ C 576
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RD RR4AG18TF 826 0 0
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TTGGGTCACTGCAACTTCGAGTTCATTCCAAAAACTTTCTTCTCTCTTTTCCCTCCTCTC
AAGTTCTTATGCTATACTCCTTCATTTCACTCCCTCCACCACACGCAATTCAGGACAAAC
TACTCTCTATTCATGCCAATGTACGACTACATCTACGGGTCCAACGACAAGTGCAGTGAT
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CTCACCATTCACTCCCACCTCCTTCCCAAGTTCTCCTCTCATTACATATCGCAGCAGTGT
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GAGGTGGTGGTCCATAGTATTCCCGTTGGCACGAGAGAAGTTCTCTTTCGAGGAAAAATC
ACAAAAGTTGCTCGTGCCATTGTCACTTCTCTTTGCCAAA
TGGCAT

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DS 

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G
GGGGTGTGAAAGTAATGGGTTTGGGGCTATTGAACCAGGGAGAAGAATTAAATGGCTACG
GAGAAATGTATTTAAGGAAGCACCCAAAGCTAAAGATAAGGATAGTAGACGGTAGCAGTC
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GAAAAATCACAAAAGTTGCTCGTGCCATTGTCACTTCTCTTTGCCAAAATGGCATCAAGG
TGATGATGTTATGTGAGGAAGAGCATTGCATGCTAGCCGGATATCT*GGCGGGCATTGTA
AAGAAAATCTGGTGCTCACAACCGATTACTCCCCAATGATTTGGTTGGTGGGAGATGGGC
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TTCCTCCTACTCAACTTCGAAATGACTGCTTTTACCATACCACTCCGGCTATGATCATCC
CTGACTCTGCTCAAAACATCGATTCTTGTGAGAACTGGCTGGGGAGGAGAGTGATGAGCG
CATGGAGAGTTGGTGGGAT

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR4AG18JQ 920 0 0
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AGAATTAAATGGCTACGGAGAAATGTATTTAAGGAAGCACCCAAAGCTAAAGATAAGGAT
AGTAGACGGTAGCAGTCTTGCAGCTGAGGTGGTGGTCCATAGTATTCCCGTTGGCACGAG
AGAAGTTCTCTTTCGAGGAAAAATCACAAAAGTTGCTCGTGCCATTGTCACTTCTCTTTG
CCAAAATGGCATCAAGGTGATGATGTTATGTGAGGAAGAGCATTGCATGCTAGCCGGATA
CCTTGGCGGGCATTGTAAAGAAAATCTGGTGCTCACAACCGATTACTCCCCAATGATTTG
GTTGGTGGGAGATGGGCTAAGCAAAGAAGAGCAGAAGATGGCAACAAAAGGAACTCGTTT
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GAGGAGAGTGATGAGCGCATGGAGAGTTGGTGGGATAGTACATGCGCTTGAAGGGTGGGA
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CGGATACTAGTAATCTATGAATTGAATGTTGTAACCGAGACGGAAAGACTTGTAAGAAAG
GAAACCGTAGCTTTTGGTGACTGGTTGCATTTGTCATCTCACTTGACCTCTTTTATTTAA
AAAAAATAATAATAAGCCTATGGATTTAGTTTGTTAAGGTCATTTATATTAATTAATGAT
TATTCTGTGTGGAAAGTTGG

QA 1 920 1 920
DS 

RD RR4AQ18TF 646 0 0
G
CATTGTCACTTCTCTTTGCCAAAATGGCATCAAGGTGATGATGTTATGTGAGGAAGAGCA
TTGCATGCTAGCCGGATATCTTGGCGGGCATTGTAAAGAAAATCTGGTGCTCACAACCGA
TTACTCCCCAATGATTTGGTTGGTGGGAGATGGGCTAAGCAAAGAAGAGCAGAAGATGGC
AACAAAAGGAACTCGTTTTCTTCCTTTCTCACAGTTTCCTCCTACTCAACTTCGAAATGA
CTGCTTTTACCATACCACTCCGGCTATGATCATCCCTGACTCTGCTCAAAACATCGATTC
TTGTGAGAACTGGCTGGGGAGGAGAGTGATGAGCGCATGGAGAGTTGGTGGGATAGTACA
TGCGCTTGAAGGGTGGGAGGAACACGAGTGCGGTCTTGATGGTCCAGTTGTTAACCCTCC
CAGAGTGTGGGAGGCTGCTCTTCGAAATGGTTTCAAACCTCTGGTCTTGCCATCTCTAGA
GACCAAAGGATCGAGCAACGGATACTAGTAATCTATGAATTGAATGTTGTAACCGAGACG
GAAAGACTTTTAAGAAAGGAAACCGTAGCTTTTGGTGACTGGTTGCATTTGTCATCTCAC
TTGACCTCTTTTATTTTTAAAAAATAATAATAAGCCTATGGATTT

QA 2 646 2 646
DS 



AS 1 4

CO CL2299Contig1 1057 4 7 U
GGACTTCTCACTCTATCTATCTCTCTCTATCTCAAAGTCCACTTGCTTTGTCTGTCCACT
TCATAAACTACTAGGTCCGTTTCCACATAGTTGTACGATCGATCATGGTAGTAGCGGAAA
CAGCGGAGGCCACGATGGTTTTCACGACGGAGGGACCTCGCATTTCTTTCTCCGCCGATC
TGTCGTCATCAGACAGCGAGGGAGACTACATCTGCATCAACCCGGACAATCTGCTTCCAC
AAGACAGAAGCTCGGTGAAAGTCACCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAACACACAAACTA
TGCTCACCGCCGCAGACGAGCTGTTCTCAGAGGGAAAGCTGCTTCCTTTCTGGCAGGTCA
AACACTCGGAGAAACTTCAAAACGTTACATTAAAAACAAAAGTCGTCGACGTGGAAGAAG
AAGCAGAAGAAGATCGTAAAGTGGTTAAAGAAGAGACAGTTAACAGCAACAGCACCAAGG
AGCAGGAGAGTAATAATAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTCTCCTC
GTCCACCAAACTGCACTGTTCTATGGAAAGAGCTTTTACGGCTGAAGAAACAGAGGACCA
CTAAGACTACGACCACGGTTTCTTCGACTAAGGCATCGACTCTCTCGCCGTCTTCATCTT
CGAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCCATCGGGGATGCTGTGAAAGAGGAGAGCGAGA
AGAAAGGGAAGAAAGGGTTAGAGAGGACGAGATCTGTGACTATGAGAATAAGACCCATGA
TTCATGTTCCTGTTTGTACCCCCTCTAAGCCTCCTCTCTTTCCTCTAAGGCTTCAGAGAA
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CGTCTTTGTATTATCAACCTTTCTTTTTGGTTAGGTTTTGTGATTAGATCAATGGATTGT
GTTTTTCTTGTTGAGCTTTTGTGATTGAGATCTGAGGTGTGACAGTGAATGTGAAGACAT
TTTCATACCCAGCACAATAAGAAATTCATCATTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW84TF U 1
AF RR4AD52TF U 162
AF RR4AD52JQ C 141
AF RR4AW84JQ C 304
BS 1 204 RR4AW84TF
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BS 823 930 RR4AD52TF
BS 931 1057 RR4AD52JQ

RD RR4AW84TF 822 0 0
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AAGCAGAAGAAGATCGTAAAGTGGTTAAAGAAGAGACAGTTAACAGCAACAGCACCAAGG
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CGAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCCATCGGGGATGCTGTGAAAGAGGAGAGCGAGA
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TTCATGTTCCTGTTTGTACCCCCTCTAAGCCTCCTCTCTTTC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AD52TF 770 0 0
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CTCTCGCCGTCTTCATCTTCGAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCCATCGGGGATGCT
GTGAAAGAGGAGAGCGAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGTTAGAGAGGACGAGATCTGTGACT
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G

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4AD52JQ 917 0 0
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GGAGACTACATCTGCATCAACCCGGACAATCTGCTTCCACAAGACAGAAGCTCGGTGAAA
GTCCCCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAACACACAAACTATGCTCACCGCCGCAGACGAG
CTGTTCTCAGAGGGAAAGCTGCTTCCTTTCTGGCAGGTCAAACACTCGGAGAAGCTTCAA
AACGTTACATTAAAAACAAAAGTCGTCGACGTGGAAGAAGAAGCAGAAGAAGATCGTAAA
GTGGTTAAAGAAGAGACAGTTAACAGCAACAGCACCAAGGAGCAGGAGAGTAATAATAAT
AACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTCTCCTCGTCCACCAAACTGCACTGTT
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TCTTCGACTAAGGCATCGACTCTCTCGCCGTCTTCATCTTCGAGCTCGACTTCGTCTTCT
TCGAGCTCCATCGGGGATGCTGTGAAAGAGGAGAGCGAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGTTA
GAGAGGACGAGATCTGTGACTATGAGAATAAGACCCATGATTCATGTTCCTGTTTGTACC
CCCTCTAAGCCTCCTCTCTTTCCTCTAAGGCTTCAGAGAAACAGAGCAGAGAAACGAACT
TGATGAATGGTTGTGATGAACATTGTTTTTTTTATCTATTCGTCTTTGTATTATCAACCT
TTCTTTTTGGTTAGGTTTTGTGATTAGATCAATGGATTGTGTTTTTCTTGTTGAGCTTTT
GTGATTGAGATCTGAGGTGTGACAGTGAATGTGAAGACATTTTCATACCCAGCACAATAA
GAAATTCATCATTGAAT

QA 1 917 1 917
DS 

RD RR4AW84JQ 727 0 0
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ACTCGGAGAAACTTCAAAACGTTACATTAAAAACAAAAGTCGTCGACGTGGAAGAAGAAG
CAGAAGAAGATCGTAAAGTGGTTAAAGAAGAGACAGTTAACAGCAACAGCACCAAGGAGC
AGGAGAGTAATAATAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTCTCCTCGTC
CACCAAACTGCACTGTTCTATGGAAAGAGCTTTTGCGGCTGAAGAAACAGAGGACCACTA
AGACTACGACCACGGTTTCTTCGACTAAGGCATCGACTCTCTCGCCGTCTTCATCTTCGA
GCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCCATCGGGGATGCTGTGAAAGAGGAGAGCGAGAAGA
AAGGGAAGAAAGGGTTAGAGAGGACGAGATCTGTGACTATGAGAATAAGACCCATGATTC
ATGTTCCTGTTTGTACCCCCTCTAAGCCTCCTCTCTTTCCTCTAAGGCTTCAGAGAAACA
GAGCAGAGAAACGAACTTGATGAATGGTTGTGATGAACATTGTTTTTTT*ATCTATTCGT
CTTTGTATTATCAACCTCTCTTTTTGGTTAGGTTTTGTGATTAGATCAATGGATTGTGTT
TTTCTTGTTGAGCTTTTGTGATTGAGATCTGAGGTGTGACAGTGAATGTGAAGACATTTT
CATACCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 4

CO CL2300Contig1 1439 4 17 U
GGAATCAGGGAGAAGGCATCACACGCCAATCTTGCGATTCAATCAGAAGAGAGATGCTTC
AGTGTATATTTCTCCTCTCCGATTCCGGAGAGGTAATGCTAGAGAAACAGCTTACTGGTC
ACAGCGTCGATCGATCCATATGCGCTTGGTTCTGGGATCAACCCGATTCCTTTAAGTCAC
TTCCAGTGATTGCGTCACCAACGCATTACCTTTTCCAAATCGTTCGTGATGGCATCACTT
TCTTAGCTTGCACTCAAGTTGAAATGCCACCACTCATGGCCATCGAGTTTCTTTGCAGAG
TAGCTGATGTTCTGTCTGATTACCTTGGTGGGCTTAACGAAGATCTCGTCAAGGACAATT
TCATCATTGTCTATGAGCTTTTGGATGAGATGATCGACAATGGTTTCCCCCTCACAACAG
AACCGAACATCCTGAGGGAAATGATAGCTCCACCGAATCTCGTCAGCAAAATGTTGAGTG
TTGTAACCGGAAATGCTTCCAACGTTAGTGACACGCTCCCTAGTGGAGCTGGCTCCTGTG
TCCCCTGGAGACCTACTGATCCAAAGTACTCCAGCAACGAAGTCTACGTCGACCTTGTTG
AAGAAATGGATGCAATCGTCAACAGGAATGGAGAATTGGTGAAATGCGAGGTTTATGGAG
AAGTCCAGATGAGTTCTCAGCTCACTGGTTTTCCAGATTTGACATTGTCTTTCGCAAACC
CTTCGGTTCTAGAAGACATGAGGTTTCACCCCTGTGTCCGCTTCAGACCTTGGGAGTCTC
ATCAAGTCCTCTCCTTTGTCCCTCCTGATGGACAGTTCAAGCTCATGAGTTACAGGGTGA
AGAAGCTGAAGAACACGCCTTTATATGTGAAGCCTCAGATAACGTCAGATTCCGGCACAT
GCCGAGTTAGTGTGTTGGTGGGGATCAGAAGCGACCCTGGAAAGACGATTGAGTCAATAA
CTTTGAGTTTCCAGCTTCCTCACTGTGTTTCATCGGCTGATCTCTCATCAAATCATGGAA
CTGTAACCATCCTTTCTAACAAGATATGTACATGGACAATAGGGAGAATCCCAAGTGACA
AGACTCCATGTTTGTCAGGGACGTTAGCGCTTGAAACGGGCTTATAGCGGCTTCATGTGT
ATCCGACATTCAAAGTTGGGTTCAAGATAATGGGGATTGCTCTTTTTGGCCTAAGAATCG
AGAAACTTGATCTTAAAACTATCCCTCCTCGTTTGTACAAAGGGTTTCGTGCTCAGACGC
GCGCTGGAGAGTTCGATGTCAGATTGTAGTTTTGTTGCTTTTCAGGTCAAAAGTTCTTGA
GACTTTTTTTTTTTCTGTTAATGGTTTGTGCCAAATTGTTTGGTATTTGTTTCAGAAAAA
GAACCGATATTTGTTCAGATTCCTTACGATATCAAAATGCGGAAATAAAAATGGTAATG


BQ
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TCTTAGCTTGCACTCAAGTTGAAATGCCACCACTCATGGCCATCGAGTTTCTTTGCAGAG
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GG
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AACCATCCTTTCTAACAAGATATGTACATGGACAATAGGGAGAATCCCAAGTGACAAGAC
TCCATGTTTGTCAGGGACGTTAGCGCTTGAAACGGGCTTATAGCGGCTTCATGTGTATCC
GACATTCAAAGTTGGGTTCAAGATAATGGGGATTGCTCTTTTTGGCCTAAGAATCGAGAA
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TTTTTTTTTTTTGTTAATGGTTTGTGCCAAATTGTTTGGTATTTGTTTCAGAAAAAGAAC
CGATATTTGTTCAGATTCCTTACGATATCAAAATGCGGAAATAAAAATGGTAATG

QA 1 715 1 715
DS 



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TGAGTATCATTCTAAGAACATACAAGAGATGGCTTGTAGGTTGGCGAACCCACCGGTTAA
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ACTTAAATGGGAAAAAAAAACTTAACTAAGG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BC29TF U 1
AF RR4BC48TF U 1
AF RR4BC48JQ C 71
AF RR4BC29JQ C 78
BS 1 699 RR4BC29TF
BS 700 700 RR4BC48TF
BS 701 779 RR4BC29TF
BS 780 780 RR4BC48TF
BS 781 793 RR4BC29TF
BS 794 871 RR4BC48JQ

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CAATTCTTGTCTC

QA 1 793 1 793
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CAGCCTCCGTCTCGAAGGTCAAAAGACCGCGGCGATCGAGATCTTGCAGCAGTTCAACTG
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CAAAGGGTTCCACATGTGCAAAGAGCTAGGGCTTGTTGATAGGATCCCTAGGCTTGTGTG
TGCTCAAGCTGCTAACGCGAACCCGCTTTACTTGCATTACAAGTCAGGGTTTGGTAAAGA
CTTTAACCCGATGAAAGCAGAGGCAACGTTTGCTTCCGCTATCCAGATCGGTGATCCTGT
TTCTATAGATAGAGCTGTGTATGCTTTGAAGATGTCTGATGGGATTGTTGAGGAAGCTAC
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TAATGATCGGACGGTTGTGGTGAGTACAGCTCATGGCTTGAAGTTCACGCAGAGTAAGAT
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CAATTCTTGTCTC
TA

QA 1 793 1 793
DS 

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AAACTTAACTAAGG

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DS 

RD RR4BC29JQ 794 0 0
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CGAACCCGCTTTACTTGCATTACAAGTCAGGGTTTGGTAAAGACTTTAACCCGATGAAAG
CAGAGGCAACGTTTGCTTCCGCTATCCAGATCGGTGATCCTGTTTCTATAGATAGAGCTG
TGTATGCTTTGAAGATGTCTGATGGGATTGTTGAGGAAGCTACGGAAGAGGAGCTGATGG
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AAATATGCTTTGGTTTGAACTTTGAAGTGTGTTTCTTGTGAAACAATTCTTGTCTCTAGG
GCATCTTTATGTCCCTATGATATTTGCTTGCTTAACTAGAGGAACTTAAATGGGAAAAAA
AAACTTAACTAAGG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 4

CO CL2302Contig1 1077 4 5 U
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CATTAATCTTCCTCCTTCTCCCCAAGCAAAGTCATCACTTCAACCAAAATGTCAAATTCG
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TTATCAAAATTGTATTGTATTCTATAGATTGCTACACTAATACATATACTTGTAACTTGT
TATATATGGTTTGTAAGTCACACTCTGCACGATCTAGTGGACAATTAAATAAGCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF24TF U 1
AF RR4D896TF U 13
AF RR4EF24JQ C 899
AF RR4D896JQ C 395
BS 1 462 RR4EF24TF
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BS 464 606 RR4EF24TF
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RD RR4EF24TF 606 0 0
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GTCGAAGAAATGATCAAATTTGTCCTGGAAAAATATTGCGAAGAAGGACGAACACCGAAA
CTCGAC

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DS 

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GGG
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TGCGTTTCTGATAAAAACCGTTCAAAACCGACTAATCAGGTCTTTGAGCGAAGCTTCTCC
GATTCCAGTCTCAATCGCCGTCGCGACGGAGATGGTACTTGCATGCGGCGATCCTCGCCG
TTGAGTGGCTTACAGACGGAAGAATCTGGTCAGATCGTCTACTTGCCAAGGATTCGCTCT
GAGGTTATGGCTTCTTCTCCGTCGTTGTTGGGCATATCTTCGCCGTCGTCTCAATTTCCG
ACCAATCAAGAGGAAAATAAAAGAGAAGCAACAAAAGTTGTAATCAACGTAGCAGTTGAA
GGAAGCCCTGGGCCTGTAAGAACTATGGTTAAATTGAGCTGCAATGTCGAAGAAATGATC
AAATTTGTCCTGGAAAAATATTGCGAAGAAAGACGAACACCGAAACTCGACAAAGGTGCT
GCCTATGAGTTGCATCAATCTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGAGAAAAA

QA 4 653 4 653
DS 

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GCGTGGCACATAATAATTAGCATATGTTGCTCCAGTCTCATAGAATAAGGTCGGTTTATT
ATTTATCAAAATTGTATTGTATTCTATAGATTGCTACACTAATACATATACTTGTAACTT

QA 1 120 1 120
DS 

RD RR4D896JQ 683 0 0
CGTCGTTGTTGGGCATATCTTCGCCGTCGTCTCAATTTCCGACCAATCAAGAGGAAAATA
AAAGAGAAGCAACAAAAGTTGTAATCAACGTAGCAGTTGAAGGAAGCCCTGGGCCTGTAA
GAACTATGGTTAAATTGAGCTGCAATGTCGAAGAAATGATCAAATTTGTCCTGGAAAAAT
ATTGCGAAGAAGGACGAACACCGAAACTCGACAAAGGTGCTGCCTATGAGTTGCATCAAT
CTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGAGAAAAAGGAAATAATCGGAGAAATAGGAAGTAGAA
GCTTCTATCTTAGAAAGGGAGCTCATGAAACCGGAGTTTCTTTGGCCGGAATAGCTCCGA
CGAGAACGAGTTTTATTCCGTCGTCTAATATTATCGAATCGTGTATCGCTCAGTTTATTG
GGAGAATGTTGAGGAGAACGAGAAAGTTATGGAACATATTGATATGTACGCAATGAGATT
TAACCAAAGTATGTACACTTTTGAGCGTGGCACATAATAATTAGCATATGTTGCTCCAGT
CTCATAGAATAAGGTCGGTTTATTATTTATCAAAATTGTATTGTATTCTATAGATTGCTA
CACTAATACATATACTTGTAACTTGTTATATATGGTTTGTAAGTCACACTCTGCACGATC
TAGTGGACAATTAAATAAGCAGT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2303Contig1 744 4 8 U
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TCTCCTCCGCTGCTATGGTTACCTCCCCGGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCG
GCTTGAAGTCTTCCTCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAGGCCAGCAATGACATTACCTCCA
TCGCTAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGA
AGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCG
ACTACCTTTTCCGAAACAAGTGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTG
TGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCTGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGA
AGCTTCCATTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCA
AAAAGGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCC
AATGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACA
AGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCT
TTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACAT
GTAATCTCTATATTGCATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ10TF U 1
AF RR4GI53JQ C 20
AF RR4DZ10JQ C 69
AF RR4DS07TF U 574
BS 1 308 RR4DZ10TF
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BS 310 600 RR4DZ10TF
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RD RR4DZ10TF 716 0 0
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AAAAGGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCC
AATGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACA
GGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTT*CT
TTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4GI53JQ 702 0 0
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AGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCTTA
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CACACCTGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGAAGCTTCCATTGTTCGGATG
CACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCTAACGC
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CTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCATAAATAATAT
CTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAG
ACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGA
ACATG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DZ10JQ 666 0 0
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ACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCGACTACCTT
TTCCGAAACAAGTGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTGTGTACCGT
GAGCACGGAAGCACACCTGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGAAGCTTCCA
TTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAG
TACCCTAACGCCTTCATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATC
AGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACAGGACATTC
ATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTT
TTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTC
TATATT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4DS07TF 171 0 0
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TCCATGTGTCCGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGG
ATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATTGCATTTTCTT

QA 1 171 1 171
DS 



AS 1 3

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GGTTATTCAAGCCATCTTCATGCTTGATACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCAT
GAGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCACTTCCCCGAGCTAGTGAAGATAGTAAATGACAA
CTACCTTTACGCCCGAGTCTCAAAGATGATTGAAGACAAGTCAAAGCTCTCTGAAGAGCA
CATCCCTATGCTTACTGAAGTCCTCGGGGATGAAGATAAGGCAAAAGAAGTCGTTGAAGC
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TGCTCAGAAAGTCATAGAGCTAGCTGATTACAGAAAGAAGCTCCACGATTACCTTGTTGC
TAAAATGAGCGACATTGCTCCAAACTTGGCGGCATTGATCGGAGATATGGTTGGTGCGAG
GCTGATCTCGCATGCTGGGAGTCTGACGAATCTCGCCAAGTGCCCCTCTTCAACTCTCCA
GATTCTTGGTGCTGAGAAGGCACTCTTCAGGGCGCTTAAAACACATGGGAACACGCCCAA
GTACGGTCTGATATTCCATTCCTCGTTCATTGGACGTGCGGCTGCTAAAAACAAGGGACG
TATTGCTCGTTACCTCGCAAACAAGTGTTCCATTGCTTCCCGAATTGATTGTTTCGCTGA
TAGCAGCACTACGGCTTTTGGTGAGAAACTTAGGGAACAAGTAGAGGAACGACTAGAATT
TTATGACAAAGGTGTTGCCCCACGTAAGAATGTGGATGTAATGAAAGAAGTGATGGAGAA
TCTTGACAAGAAAGATGAGGGAGAAGAGAAAGTGGTGGAGGCCTCTGAGAAGAAAAAGAA
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AAGAAAAAGAAGAAAAGCAAAGTAGTTGAAGAGGAAACGACAACAGATAATGGTCACAGC
AAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAACTAAGTCACAAGATGATGAATAGACCATGACAAGTTTT
TTCTTTTTGTAGTGTTGCATTTTTCTTTATCTGTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AU34TF U 1
AF RR4AU34JQ C 268
AF RR4AL65TF U 526
BS 1 721 RR4AU34TF
BS 722 722 RR4AL65TF
BS 723 749 RR4AU34TF
BS 750 750 RR4AL65TF
BS 751 772 RR4AU34TF
BS 773 773 RR4AL65TF
BS 774 799 RR4AU34TF
BS 800 800 RR4AL65TF
BS 801 811 RR4AU34TF
BS 812 824 RR4AL65TF
BS 825 825 RR4AU34JQ
BS 826 1362 RR4AL65TF

RD RR4AU34TF 815 0 0
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GAAACCCAAGTTCAGCTTAGGAGTCTCTGAGCCAAAGATTGGTTCTTGCATCTTTGAAGC
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GCATTTTGATAGGTTCATCAAGGACCTAAAGCCTGGTGATTTGGAGAAAGCACAACTTGG
ACTAGCTCACAGCTACAGCAGAGCAAAGGTGAAGTTCAATGTTAACCGTGTGGACAACAT
GGTTATTCAAGCCATCTTCATGCTTGATACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCAT
GAGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCACTTCCCCGAGCTAGTGAAGATAGTAAATGACAA
CTACCTTTACGCCCGAGTCTCAAAGATGATTGAAGACAAGTCAAAGCTCTCTGAAGAGCA
CATCCCTATGCTTACTGAAGTCCTCGGGGATGAAGATAAGGCAAAAGAAGTCGTTGAAGC
TGGAAAAGCATCTATGGGCCAGGATTTATCTCCACTTGATCTGATGAACGTCCAGACCTT
TGCTCAGAAAGTCATAGAGCTAGCTGATTACAGAAAGAAGCTCCACGATTACCTTGTTGC
TAAAATGAGCGACATTGCTCCAAACTTGGCGGCATTGATCGGAGATATGGTTGGTGCGAG
G*TGATCTCGCATGCTGGGAGTCTGACGA*TCTCGCCAAGTGCCCCTCTTCA*CTCTCCA
GATTCTTGGTGCTGAGAAG*CACTCTTCAGG
CGCT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4AU34JQ 865 0 0
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TACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCATGAGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCA
CTTCCCCGAGCTAGTGAAGATAGTAAATGACAACTACCTTTACGCCCGAGTCTCAAAGAT
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GGATGAAGATAAGGCAAAAGAAGTCGTTGAAGCTGGAAAAGCATCTATGGGCCAGGATTT
ATCTCCACTTGATCTGATGAACGTCCAGACCTTTGCTCAGAAAGTCATAGAGCTAGCTGA
TTACAGAAAGAAGCTCCACGATTACCTTGTTGCTAAAATGAGCGACATTGCTCCAAACTT
GGCGGCATTGATCGGAGATATGGTTGGTGCGAGGCTGATCTCGCATGCTGGGAGTCTGAC
GAATCTCGCCAAGTGCCCCTCTTCAACTCTCCAGATTCTTGGTGCTGAGAAGGCACTCTT
CAGGGCGCTTAAAACACATGGGAACACGCCCAAGTACGGTCTGATATTCCATTCCTCGTT
CATTGGACGTGCGGCTGCTAAAAACAAGGGACGTATTGCTCGTTACCTCGCAAACAAGTG
TTCCATTGCTTCCCGAATTGATTGTTTCGCTGATAGCAGCACTACGGCTTTTGGTGAGAA
ACTTAGGGAACAAGTAGAGGAACGACTAGAATTTTATGACAAAGGTGTTGCCCCACGTAA
GAATGTGGATGTAATGAAAGAAGTGATGGAGAATCTTGACAAGAAAGATGAGGGAGAAGA
GAAAGTGGTGGAGGCCTCTGAGAAG

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4AL65TF 837 0 0
G
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AACGTCCAGACCTTTGCTCAGAAAGTCATAGAGCTAGCTGATTACAGAAAGAAGCTCCAC
GATTACCTTGTTGCTAAAATGAGCGACATTGCTCCAAACTTGGCGGCGTTGATCGGAGAT
ATGGTTGGTGCAAGGCTGATCTCACATGCTGGGAGTCTGACGAATCTCGCCAAGTGCCCC
TCTTCAACTCTCCAGATTCTTGGCGCTGAGAAGGCACTCTTCAGGGCGCTTAAAACACGT
GGGAACACGCCCAAGTACGGTCTGATATTCCATTCCTCGTTCATTGGACGTGCGGCTGCT
AAAAACAAGGGACGTATTGCTCGTTACCTCGCAAACAAGTGTTCCATTGCTTCCCGAATT
GATTGTTTCGCTGATAGCAGCACTACGGCTTTTGGTGAGAAACTTAGGGAACAAGTAGAG
GAACGACTAGAATTTTATGACAAAGGTGTTGCCCCACGTAAGAATGTGGATGTAATGAAA
GAAGTGATGGAGAATCTTGACAAGAAAGATGAGGGAGAAGAGAAAGTGGTGGAGGCCTCT
GAGAAGAAAAAGAAGAAAGAGAAGAGAAAGGCAGAGGAGAAGGATGAGGAGGAAGTAGAA
GAAGAGTGAAATCAAAGAAAAAGAAGAAAAGCAAAGTAGTTGAAGAGGAAACGACAACAG
ATAATGGTCACAGCAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAACTAAGTCACAAGATGATGAATAGA
CCATGACAAGTTTTTTCTTTTTGTAGTGTTGCATTTTTCTTTATCTGTTTTTTTTT

QA 2 837 2 837
DS 



AS 1 3

CO CL2305Contig1 948 3 5 U
AGATCATAATCAACCATGGGATAATATAATGTGTAATGAAATTGTATTTAAAAGTTACAG
AGAAAGAGAATACCTGCAACATTTTTACACGAGAGATATAGGGTTTAAAGGGTGTTGAGC
CTCTTAAAGACGTAGGCCTTTGAAAAATACAAGTAAGAGGCTAAGCCAATGAAGCTGAAA
CAAGCAAGTAACCAGTAAAAGTAATCCAGATGAGCCTTGTTAAGGTTATTTGCGAACCAA
CTCACTTGACCAGATTGGCTCGTCACTTTATCAATAACTGATATCATGAAACTGCTGAGA
AAGCTACCAATACCGAATATGCTCAAGTACAGAGCCAATCCCACGCTTCTCAGCTCGCTC
GGGACCTGGTCGTAGAAGAACTCTTGAAGACCCACCATAGCAAAAACATCCGCGATACCA
AAGAGAACATACTGAGGAACTAACCACCATACACTCATCGGAACAGTAACTTCTGGTGAA
TCGATGAGCCCGTGATCCGCAGCGGTTTTAAGTCTTTTCATCTCCACTAGGGCGGCTATT
ACCATAGCAAGGAAAGAGAGGAATATCCCTGTGCCTATTCTCTGAAGCATGGTGATTCCG
CCTGGCTTATGTGTAAATGATCTCGCGATTGGGATGAGTACACGGTCGTACACTGGGATG
AAGATGACTATAGAGAGGCTGATGAAGGACTGGAGGGTAGCCGGAGAGATCTTGTAACTC
GGTGTGATTGATCTCTCCATTGTGGCTCCTTGTTTAGTGAAGAATGTTGGAGACTGCGCG
AACACAACCGCGTAAACCAAGCAAGTTAACCAGGTCGGAGCTAGCCTAAGTACTGATTTT
GCTTCCTCAAGTTCATCTAAACTACAACCATTCGTTCCGACCAGAGCTTTGTTGAGAAAA
CTAAACTGCTGCGACCTTGAATAAGAGATTAAACCAAGCCTCTCTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DP03JQ U 1
AF RR4E466JQ U 1
AF RR4E466TF C 371
BS 1 529 RR4DP03JQ
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BS 531 598 RR4DP03JQ
BS 599 669 RR4E466JQ
BS 670 948 RR4E466TF

RD RR4DP03JQ 598 0 0
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DS 

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CTCACTTGACCAGATTGGCTCGTCACTTTATCAATAACTGATATCATGAAACTGCTGAGA
AAGCTACCAATACCGAATATGCTCAAGTACAGAGCCAATCCCACGCTTCTCAGCTCGCTC
GGGACCTGGTCGTAAAAGAACTCTTGAAGACCCACCATAGCAAAAACATCCGCGATACCA
AAGAGAACATACTGAGGAACTAACCACCATACACTCATCGGAACAGTAACTTCTGGTGAA
TCGATGAGCCCGTGATCCGCAGCGGTTTTAAGTCTTTTCATCTCCACTAGGGCGGCTATT
ACCATAGCAAGGAAAGAGAGGAATATCCCTGTGCCTATTCTCTGAAGCATGGTGATTCCG
CCTGGCTTATGTGTAAATGATCTCGCGATTGGGATGAGTACACGGTCGTACACTGGGATG
AAGATGACT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4E466TF 578 0 0
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ACTGAGGAACTAACCACCATACACTCATCGGAACAGTAACTTCTGGTGAATCGATGAGCC
CGTGATCCGCAGCGGTTTTAAGTCTTTTCATCTCCACTAGGGCGGCTATTACCATAGCAA
GGAAAGAGAGGAATATCCCTGTGCCTATTCTCTGAAGCATGGTGATTCCGCCTGGCTTAT
GTGTAAATGATCTCGCGATTGGGATGAGTACACGGTCGTACACTGGGATGAAGATGACTA
TAGAGAGGCTGATGAAGGACTGGAGGGTAGCCGGAGAGATCTTGTAACTCGGTGTGATTG
ATCTCTCCATTGTGGCTCCTTGTTTAGTGAAGAATGTTGGAGACTGCGCGAACACAACCG
CGTAAACCAAGCAAGTTAACCAGGTCGGAGCTAGCCTAAGTACTGATTTTGCTTCCTCAA
GTTCATCTAAACTACAACCATTCGTTCCGACCAGAGCTTTGTTGAGAAAACTAAACTGCT
GCGACCTTGAATAAGAGATTAAACCAAGCCTCTCTTCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 4

CO CL2306Contig1 885 4 11 U
GGAGAGACCAAATTAAAAAAATGGGAGAGACAGAGGAAGTGAAACTGTTGGGAGTATGGT
TCAGTCCGTACGCCATAAGACCAAAGATCGCTCTTCGTCTCAAGTCAGTCGATTATGATT
ACTTTGAAGAAGATCTGTTCGGTTCCAAGAGTGAGCTTCTTCTCAAATCAAATCCGGTTC
ACAAGAAAGTCCCGGTTCTCATCCACAACAACAAACCGATTCTAGAGTCTCTCAACATCG
TTGAGTACATTGATGAGACATGGAGCGCATCTGGACCGTCCATACTTCCTTCACATCCCC
ATGATCGCGTTCAAGCCCGCTTCTGGTCTGCCTTCGTTGATGACAAGTGGTTTCCGGCTT
CGAAAGCGGCCGCAATCACCAAATCCGAAGAGGCAAAAGAAAAAGGCATGAAAGAAGTGG
AAGAAGGGTTATTGCAACTCGAGGAAGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGAAACCGTTTT
TCGGAGGTGAAGCGATCGGGTTTATGGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGGGTATCTTGA
AGGCTAGAGAGAAGCTTAAAGGAGAAAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTCCTTCACTTT
GTAAATGGGCGGACCAGTTCTTGTCTGATGATACTGTGAAGAATGTGGTACCGGAGATCG
ATAAAATGGCTGAGTTTCTAGGAGGGCTTGAGGTTAGAGCTCAATCAGCGGTTTCAAGAA
CTTGAGATCATCGTTGAAAAGCAAATGGACGTGTGTAATGTAAGTGCGAAAATAAGTGAA
AGGTCGAAGTGTTGTATTGAATGTATGCTAGTAATTTATACAATGCTGTGTATGGTTTAT
GGATAATGCTTTCAATAATTGAAAATGGCAGATTATTAGTCGTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4EH24TF U 2
AF RR4AJ94TF U 1
AF RR4EH24JQ C 202
AF RR4AJ94JQ C 326
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BS 304 309 RR4AJ94TF
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BS 318 743 RR4AJ94TF
BS 744 848 RR4EH24JQ
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CAGTCCGTACGCCATAAGACCAAAGATCGCTCTTCGTCTCAAGTCAGTCGATTATGATTA
CTTTGAAGAAGATCTGTTCGGTTCCAAGAGTGAGCTTCTTCTCAAATCAAATCCGGTTCA
CAAGAAAGTCCCGGTTCTCATCCACAACAACAAACCGATTCTAGAGTCTCTCAACATCGT
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TGATCGCGTTCAAGCCCGCTTCTGGTCTGCCTTCGTTGATGACAAGTGGTTTCCGGCTTT
GAAAGCGGCCGCAATCACCAAATCCGAAGAGGCAAAAGAAAAAGGCATGAAAGAAGTGGA
AGAAGGGTTATTGCAACTCGAGGAAGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGAAACCGTTTTT
CGGAGGTGAAGCGATCGGGTTTATGGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGGGTATCTTGAA
GGCTAGAGAGAAGCTTAAAGGAGAAAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTCCTTCACTTTG
TAA

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DS 

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TCAGTCCGTACGCCATAAGACCAAAGATCGCTCTTCGTCTCAAGTCAGTCGATTATGATT
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ACAAGAAAGTCCCGGTTCTCATCCACAACAACAAACCGATTCTAGAGTCTCTCAACATCG
TTGAGTACATTGATGAGACATGGAGCGCATCTGGACCGTCCATACTTCCTTCACATCCCC
ATTATCGCGCTCAAGCTCGCTTCTGGTCTGCCTTCGTTGATGACAAGTGGTTTCCGGCTT
CGAAAGCGGCCGCAATCACCAAATCCGAAGAGGCAAAAGAAAAAGGCATGAAAGAAGTGG
AAGAAGGGTTATTGCAACTCGAGGAAGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGAAACCGTTTT
TCGGAGGTGAAGCGATCGGGTTTATGGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGGGTATCTTGA
AGGCTAGAGAGAAGCTTAAAGGAGAAAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTCCTTCACTTT
GTAAATGGGCGGACCAGTTCTTGTCTGATGATACTGTGAAGAATGTGGTACCGGAGATCG
ATAAAATGGCTGAGTTTCTAGGAGGGCTTGAGGTTAGAGCTCAATCAGCGGTTTCAAGAA
CTTGAGATCATCGTTGAAAAGCA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4EH24JQ 647 0 0
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GGAGCGCATCTGGACCGTCCATACTTCCTTCACATCCCCATGATCGCGTTCAAGCCCGCT
TCTGGTCTGCCTTCGTTGATGACAAGTGGTTTCCGGCTTTGAAAGCGGCCGCAATCACCA
AATCCGAAGAGGCAAAAGAAAAAGGCATGAAAGAAGTGGAAGAAGGGTTATTGCAACTCG
AGGAAGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGAAACCGTTTTTCGGAGGTGAAGCGATCGGGT
TTATGGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGGGTATCTTGAAGGCTAGAGAGAAGCTTAAAG
GAGAAAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTCCTTCACTTTGTAAATGGGCGGACCAGTTCT
TGTCTGATGATACTGTGAAGAATGTGGTACCGGAGATCGATAAAATGGCTGAGTTTCTAG
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DS 

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CGAAGAGGCAAAAGAAAAAGGCATGAAAGAAGTGGAAGAAGGGTTATTGCAACTCGAGGA
AGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGAAACCGTTTTTCGGAGGTGAAGCGATCGGGTTTAT
GGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGGGTATCTTGAAGGCTAGAGAGAAGCTTAAAGGAGA
AAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTCCTTCACTTTGTAAATGGGCGGACCAGTTCTTGTC
TGATGATACTGTGAAGAATGTGGTACCGGAGATCGATAAAATGGCTGAGTTTCTAGGAGG
GCTTGAGGTTAGAGCTCAATCAGCGGTTTCAAGAACTTGAGATCATCGTTGAAAAGCAAA
TGGACGTGTGTAATGTAAGTGCGAAAATAAGTGAAAGGTCGAAGTGTTGTATTGAATGTA
TGCTAGTAATTTATACAATGCTGTGTATGGTTTATGGATAATGCTTTCAATAATTGAAAA
TGGCAGATTATTAGTCGTTC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 4

CO CL2307Contig1 1151 4 10 U
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AAAGGAAACTGCTTGGTGATGAAGAGATGTTGCATCGACGAGCTTTGTCCATGGCTATTC
ATCAAGCTCAGCTTTCTCAGAGATTCGATGGGTCCATTTCTAGACGTGTCGGGTCTACTA
GCTCCAGAAGACAAACTCTCTCTGACCCTTTTTCAAACAACAAGCAGGTACCTGATCTTG
TGGAGAGCTTGGCGGTTAAGAAACTCGTTCTTGTACATGGTGAAGGGTTTGGGGCTTGGT
GTTGGTACAAAACTGTTCTTCATTGGAAGAGTCTGGACTATCTCCTGTTACAGTTGACCT
TACTGGATCTGGATTTAGTATGGCTGACCCAAATAGTGTTTCCACTTTAGAAGAATATTC
AAAACCATTGATCGAGCTCCTTCAAAATCTCCCAGAGGAAGAAAAGGTGATTGTCGTAGG
TCACAGTACAGGAGGTGCATGTGTTTCATTTGCGTTAGAGCGGTTTCCTGAAAAAATCTC
AAAAGCTGTATTCATATGTGCCACTATGGTTTCTGATGGACAAAGACCCTTCGATGTCTT
TGCTGATCAGCTTGGTTCTGCAGAAAGGTTCATGAAAGAATCGCAGTTCTTGATCCATGG
AAATGGAAAGGACAAGCCCGCAACGGGGTTCAGTTTTGAGAAGCAACACATGAAAAGCTT
GTACTTCAATCAGTCACCCAATAAGGACATAGCATTGTCGATGATCTCAATGCGAGCAGT
ACCATTGGGTCCAATGATGGAGAAACTGTCGCTGAGCGCAGAAAGATATGGGAAAGGTCG
GAGATTCTATGTTCAGACGCTTGATGACTTGGCTCTCTCACCAGACGTTCAGGAGAAACT
TGTGAGAGATAATAGTCCGGAAGGAGTTTATAAGATCAAAGGAAGTGATCATTGTCCTTT
CTTCTCTAAACCTCAGTCTCTTCACAAGATCCTTCTTGAAATCGCTCAGATTCCTTAAAA
GAGAGTTAAATCTTTAATTCACTCGACCATGTATAATACTTTACATTTTTCAACTTATAA
ACTTCTGTATAATTCGTCTTACGTCGATACCAGACAAGATAGTTAATTATGTGCACACGA
TTTAAAGTGAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E625TF U 93
AF RR4EA07TF U 1
AF RR4E625JQ C 368
AF RR4EA07JQ C 514
BS 1 682 RR4EA07TF
BS 683 683 RR4E625JQ
BS 684 741 RR4EA07TF
BS 742 742 RR4E625JQ
BS 743 743 RR4EA07TF
BS 744 745 RR4E625JQ
BS 746 769 RR4EA07TF
BS 770 770 RR4E625JQ
BS 771 782 RR4EA07TF
BS 783 1151 RR4E625JQ

RD RR4E625TF 590 0 0
CATCGACGAGCTTTGTCCATGGCTATTCATCAAGCTCAGCTTTCTCAGAGATTCGATGGG
TCCATTTCTAGACGTGTCGGGTCTACTAGCTCCAGAAGACAAACTCTCTCTGACCCTTTT
TCAAACAACAAGCAGGTACCTGATCTTGTGGAGAGCTTGGCGGTTAAGAAACTCGTTCTT
GTACATGGTGAAGGGTTTGGGGCTTGGTGTTGGTACAAAACTGTTCTTCATTGGAAGAGT
CTGGACTATCTCCTGTTACAGTTGACCTTACTGGATCTGGATTTAGTATGGCTGACCCAA
ATAGTGTTTCCACTTTAGAAGAATATTCAAAACCATTGATCGAGCTCCTTCAAAATCTCC
CAGAGGAAGAAAAGGTGATTGTCGTAGGTCACAGTACAGGAGGTGCATGTGTTTCATTTG
CGTTAGAGCGGTTTCCTGAAAAAATCTCAAAAGCTGTATTCATATGTGCCACTATGGTTT
CTGATGGACAAAGACCCTTCGATGTCTTTGCTGATCAGCTTGGTTCTGCAGAAAGGTTCA
TGAAAGAATCGCAGTTCTTGATCCATGGAAATGGAAAGGACAAGCCCGCA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4EA07TF 785 0 0
GGAGAAGCAGTGGAGGAGGAGGAGGAGATGGGTCTAGAAGCAAGAGGGTAAGTCGTTCTC
AAAGGAAACTGCTTGGTGATGAAGAGATGTTGCATCGACGAGCTTTGTCCATGGCTATTC
ATCAAGCTCAGCTTTCTCAGAGATTCGATGGGTCCATTTCTAGACGTGTCGGGTCTACTA
GCTCCAGAAGACAAACTCTCTCTGACCCTTTTTCAAACAACAAGCAGGTACCTGATCTTG
TGGAGAGCTTGGCGGTTAAGAAACTCGTTCTTGTACATGGTGAAGGGTTTGGGGCTTGGT
GTTGGTACAAAACTGTTCTTCATTGGAAGAGTCTGGACTATCTCCTGTTACAGTTGACCT
TACTGGATCTGGATTTAGTATGGCTGACCCAAATAGTGTTTCCACTTTAGAAGAATATTC
AAAACCATTGATCGAGCTCCTTCAAAATCTCCCAGAGGAAGAAAAGGTGATTGTCGTAGG
TCACAGTACAGGAGGTGCATGTGTTTCATTTGCGTTAGAGCGGTTTCCTGAAAAAATCTC
AAAAGCTGTATTCATATGTGCCACTATGGTTTCTGATGGACAAAGACCCTTCGATGTCTT
TGCTGATCAGCTTGGTTCTGCAGAAAGGTTCATGAAAGAATCGCAGTTCTTGATCCATGG
AAATGGAAAGGACAAGCCCGCA*CGGGGTTCAGTTTTGAGAAGCAACACATGAAAAGCTT
GTACTTCAATCAGTCACCCAAAA**GACATAGCATTGTCGATGATCTCA*TGCGAGCAGT
AC
ATG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4E625JQ 784 0 0
TCTGGATTTAGTATGGCTGACCCAAATAGTGTTTCCACTTTAGAAGAATATTCAAAACCA
TTGATCGAGCTCCTTCAAAATCTCCCAGAGGAAGAAAAGGTGATTGTCGTAGGTCACAGT
ACAGGAGGTGCATGTGTTTCATTTGCGTTAGAGCGGTTTCCTGAAAAAATCTCAAAAGCT
GTATTCATATGTGCCACTATGGTTTCTGATGGACAAAGACCCTTCGATGTCTTTGCTGAT
CAGCTTGGTTCTGCAGAAAGGTTCATGAAAGAATCGCAGTTCTTGATCCATGGAAATGGA
AAGGACAAGCCCGCAACGGGGTTCAGTTTTGAGAAGCAACACATGAAAAGCTTGTACTTC
AATCAGTCACCCAATAAGGACATAGCATTGTCGATGATCTCAATGCGAGCAGTACCATTG
GGTCCAATGATGGAGAAACTGTCGCTGAGCGCAGAAAGATATGGGAAAGGTCGGAGATTC
TATGTTCAGACGCTTGATGACTTGGCTCTCTCACCAGACGTTCAGGAGAAACTTGTGAGA
GATAATAGTCCGGAAGGAGTTTATAAGATCAAAGGAAGTGATCATTGTCCTTTCTTCTCT
AAACCTCAGTCTCTTCACAAGATCCTTCTTGAAATCGCTCAGATTCCTTAAAAGAGAGTT
AAATCTTTAATTCACTCGACCATGTATAATACTTTACATTTTTCAACTTATAAACTTCTG
TATAATTCGTCTTACGTCGATACCAGACAAGATAGTTAATTATGTGCACACGATTTAAAG
TGAG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4EA07JQ 638 0 0
GTTAGAGCGGTTTCCTGAAAAAATCTCAAAAGCTGTATTCATATGTGCCACTATGGTTTC
TGATGGACAAAGACCCTTCGATGTCTTTGCTGATCAGCTTGGTTCTGCAGAAAGGTTCAT
GAAAGAATCGCAGTTCTTGATCCATGGAAATGGAAAGGACAAGCCCGCAACGGGGTTCAG
TTTTGAGAAGCAACACATGAAAAGCTTGTACTTCAATCAGTCACCCAATAAGGACATAGC
ATTGTCGATGATCTCAATGCGAGCAGTACCATTGGGTCCAATGATGGAGAAACTGTCGCT
GAGCGCAGAAAGATATGGGAAAGGTCGGAGATTCTATGTTCAGACGCTTGATGACTTGGC
TCTCTCACCAGACGTTCAGGAGAAACTTGTGAGAGATAATAGTCCGGAAGGAGTTTATAA
GATCAAAGGAAGTGATCATTGTCCTTTCTTCTCTAAACCTCAGTCTCTTCACAAGATCCT
TCTTGAAATCGCTCAGATTCCTTAAAAGAGAGTTAAATCTTTAATTCACTCGACCATGTA
TAATACTTTACATTTTTCAACTTATAAACTTCTGTATAATTCGTCTTACGTCGATACCAG
ACAAGATAGTTAATTATGTGCACACGATTTAAAGTGAG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 4

CO CL2308Contig1 616 4 2 U
GGGCAGGACCTACTTTAAGTAGGATAAATTGTATTTGTTCTAGAAACTACAATCATAATG
GATGGTTTTGCATCATTCATTCCTCCACCTATTATGAATACTAGTATTAATTAACAACAA
CATAAAGAGGAAATTTTGAGGAACCTCGAGAAAGCCTCTGCAAAAAAAAAAAAAGAGAAA
GTTTGATAACAAGTTCAAGCGGAAGAAGGATAGTGATCAAGGGTTATTTCGAGGTCATGA
AGCTGAGAGAGAACATATTCAAGCTTCTGGAAGCAGATCTCATTAGCTATCCTTGCATTG
TAGTCGCTTTTCTCAAAGGGACGGTACTCGCACGCGCTTTTGATCTCTTCCCTTAGTGTC
ACTTGAATATCCTTGATGGATTGCATGAACTCTCGGCAATGGCTGTTGACGAAATCTTTC
CTGGGGCCAGAAGGGCTCGACAGTTCTTCCATCACACCTCCAGCTATATCCAATACCCTT
ACCACTCTCCTCTCCACATTCTGGAGTCGCTGCAAAGAAGTATTCTGCGTCTGCGGATCC
ATCCACGATTTCTCTGAAACACAGTCGATGGCAGAGACAGGAGACGGTGAAATCGGATAA
TTAGACGGCGGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4G936JQ U 1
AF RR4G936TF C 1
AF RR4BO43TF C 5
AF RR4BO43JQ U 17
BS 1 504 RR4G936JQ
BS 505 616 RR4BO43JQ

RD RR4G936JQ 504 0 0
GGGCAGGACCTACTTTAAGTAGGATAAATTGTATTTGTTCTAGAAACTACAATCATAATG
GATGGTTTTGCATCATTCATTCCTCCACCTATTATGAATACTAGTATTAATTAACAACAA
CATAAAGAGGAAATTTTGAGGAACCTCGAGAAAGCCTCTGCAAAAAAAAAAAAAGAGAAA
GTTTGATAACAAGTTCAAGCGGAAGAAGGATAGTGATCAAGGGTTATTTCGAGGTCATGA
AGCTGAGAGAGAACATATTCAAGCTTCTGGAAGCAGATCTCATTAGCTATCCTTGCATTG
TAGTCGCTTTTCTCAAAGGGACGGTACTCGCACGCGCTTTTGATCTCTTCCCTTAGTGTC
ACTTGAATATCCTTGATGGATTGCATGAACTCTCGGCAATGGCTGTTGACGAAATCTTTC
CTGGGGCCAGAAGGGCTCGACAGTTCTTCCATCACACCTCCAGCTATATCCAATACCCTT
ACCACTCTCCTCTCCACATTCTGG

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4G936TF 613 0 0
GGGCAGGACCTAC
TTTAAGTAGGATAAATTGTATTTGTTCTAGAAACTACAATCATAATGGATGGTTTTGCAT
CATTCATTCCTCCACCTATTATGAATACTAGTATTAATTAACAACAACATAAAGAGGAAA
TTTTGAGGAACCTCGAGAAAGCCTCTGCAAAAAAAAAAAAAGAGAAAGTTTGATAACAAG
TTCAAGCGGAAGAAGGATAGTGATCAAGGGTTATTTCGAGGTCATGAAGCTGAGAGAGAA
CATATTCAAGCTTCTGGAAGCAGATCTCATTAGCTATCCTTGCATTGTAGTCGCTTTTCT
CAAAGGGACGGTACTCGCACGCGCTTTTGATCTCTTCCCTTAGTGTCACTTGAATATCCT
TGATGGATTGCATGAACTCTCGGCAATGGCTGTTGACGAAATCTTTCCTGGGGCCAGAAG
GGCTCGACAGTTCTTCCATCACACCTCCAGCTATATCCAATACCCTTACCACTCTCCTCT
CCACATTCTGGAGTCGCTGCAAAGAAGTATTCTGCGTCTGCGGATCCATCCACGATTTCT
CTGAAACACAGTCGATGGCAGAGACAGGAGACGGCGAAATCGGATAATTAGACGGCGG
CC

QA 14 611 14 611
DS 

RD RR4BO43TF 612 0 0
TTTTTCTTT
TTTAAGTAGGATAAATTGTATTTGTTCTAGAAACTACAATCATAATGGATGGTTTTGCAT
CATTCATTCCTCCACCTATTATGAATACTAGTATTAATTAACAACAACATAAAGAGGAAA
TTTTGAGGAACCTCGAGAAAGCCTCTGCAAAAAAAAAAA**GAGAAAGTTTGATAACAAG
TTCAAGCGGAAGAAGGATAGTGATCAAGGGTTATTTCGAGGTCATGAAGCTGAGAGAGAA
CATATTCAAGCTTCTGGAAGCAGATCTCATTAGCTATCCTTGCATTGTAGTCGCTTTTCT
CGAAGGGACGGTACTCGCACGCGCTTTTGATCTCTTCCCTTAGTGTCACTTGAATATCCT
TGATGGATTGCATGAACTCTCGGCAATGGCTGTTGACGAAATCTTTCCTGGGGCCAGAAG
GGCTCGACAGTTCTTCCATCACACCTCCAGCTATATCCAATACCCTTACCACTCTCCTCT
CCACATTCTGGAGTCGCTGCAAAGAAGTATTCTGCGTCTGCGGATCCATCCACGATTTCT
CTGAAACACAGTCGATGGCAGAGACAGGAGACGGTGAAATCGGATAATTAGACGGCGG
GATCC

QA 10 607 10 607
DS 

RD RR4BO43JQ 600 0 0
AAGTAGGATAAATTGTATTTGTTCTAGAAACTACAATCATAATGGATGGTTTTGCATCAT
TCATTCCTCCACCTATTATGAATACTAGTATTAATTAACAACAACATAAAGAGGAAATTT
TGAGGAACCTCGAGAAAGCCTCTGCAAAAAAAAAAA**GAAAAAGTTTGATAACAAGTTC
AAGCGGAAGAAGGATAGTGATCAAGGGTTATTTCGAGGTCATGAAGCTGAAAGAGAACAT
ATTCAAGCTTCTGGAAGCAGATCTCATTAGCTATCCTTGCATTGTAGTCGCTTTTCTCGA
AGGGACGGTACTCGCACGCGCTTTTGATCTCTTCCCTTAGTGTCACTTGAATATCCTTGA
TGGATTGCATGAACTCTCGGCAATGGCTGTTGACGAAATCTTTCCTGGGGCCAGAAGGGC
TCGACAGTTCTTCCATCACACCTCCAGCTATATCCAATACCCTTACCACTCTCCTCTCCA
CATTCTGGAGTCGCTGCAAAGAAGTATTCTGCGTCTGCGGATCCATCCACGATTTCTCTG
AAACACAGTCGATGGCAGAGACAGGAGACGGTGAAATCGGATAATTAGACGGCGGGATCC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL2309Contig1 708 3 2 U
GGGGCTTCTCCAACTTGTGCGCCCCCTCCTCTTCCATGGCTTCGAGAATTGCTGATTCTC
TATTCGCCTTCACGGGCCCACAACAATGTCTCCCTAGGGCTCCTCAAGTTGCTCCTGCTC
GTCTTTCTCCAGGTGTGTATGCTGTGAGACCTATTGATCTTCTGTTAAGAGGTCATGCGC
ATAGAAGGAGAACGTTCTTGGTTTCTGCAAAGAAAAGGGTTGGATGTATAAAAGCGGTGG
CTGCTCCAGCCGCACCTCCTTCAGCTGACAGTGCGGAAGAGAGGGAACAGTTAGCAGAAA
GCTATGGGTTCAAACAAATTGGACAAGATCTTCCTGATAATGTTACTTTAAAAGATATCA
TGGATACTCTTCCCAAAGAGGTGTTTGAGATTGATGATGTGAAGGCTTGGAAGTCTGTGT
TGGTATCTGTGACGTCC*TACGCTTTGGGGCTCTTCATGATTGCGAAAGCGCCTTGGTAT
ATGCTTCCGTTGGCTTGGGCTTGGACAGGAACTGCAGTTACAGGGTTCTTTGTGATAGGG
CATGATTGCGCTCATAAATCATTTTCAAAGAACAAATTGGTTGAAGACATTGTGGGTACT
CTAGCATTTCTACCTCTTGTATACCCGTATGAGCCATGGAGGTTTAAGCATGACCGCCAT
CACGCCAAAACCAACATGTTAGTTCATGACACAGCTTGGCAACCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN58TF U 409
AF RR4GQ22TF U 1
AF RR4FV14TF U 10
BS 1 696 RR4GQ22TF
BS 697 708 RR4FV14TF

RD RR4BN58TF 231 0 0
GAAGTCTGTGT
TTGGTATCTGTGACGTCCCTACGCTTTGGGGCTCTTCATGATTGCGAAAGCGCCTTGGTA
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GCATGATTGCGCTCATAAATCATTTTCAAAGAACAAATTGGTTGAAGACATTGTGG*TAC
TCTAGCATTTCTACCTCTTGTATACCCGTATGAGCCATGG

QA 12 231 12 231
DS 

RD RR4GQ22TF 696 0 0
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TATTCGCCTTCACGGGCCCACAACAATGTCTCCCTAGGGCTCCTCAAGTTGCTCCTGCTC
GTCTTTCTCCAGGTGTGTATGCTGTGAGACCTATTGATCTTCTGTTAAGAGGTCATGCGC
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CTGCTCCAGCCGCACCTCCTTCAGCTGACAGTGCGGAAGAGAGGGAACAGTTAGCAGAAA
GCTATGGGTTCAAACAAATTGGACAAGATCTTCCTGATAATGTTACTTTAAAAGATATCA
TGGATACTCTTCCCAAAGAGGTGTTTGAGATTGATGATGTGAAGGCTTGGAAGTCTGTGT
TGGTATCTGTGACGTCC*TACGCTTTGGGGCTCTTCATGATTGCGAAAGCGCCTTGGTAT
ATGCTTCCGTTGGCTTGGGCTTGGACAGGAACTGCAGTTACAGGGTTCTTTGTGATAGGG
CATGATTGCGCTCATAAATCATTTTCAAAGAACAAATTGGTTGAAGACATTGTGGGTACT
CTAGCATTTCTACCTCTTGTATACCCGTATGAGCCATGGAGGTTTAAGCATGACCGCCAT
CACGCCAAAACCAACATGTTAGTTCATGACACAGCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FV14TF 699 0 0
GG
AACTTGTGCGCCCCCTCCTCTTCCATGGCTTCGAGAATTGCTGATTCTCTATTCGCCTTC
ACGGGCCCACAACAATGTCTCCCTAGGGCTCCTCAAGTTGCTCCTGCTCGTCTTTCTCCA
GGTGTGTATGCTGTGAGACCTATTGATCTTCTGTTAAGAGGTCATGCGCATAGAAGGAGA
ACGTTCTTGGTTTCTGCAAAGAAAAGGGTTGGATGTATAAAAGCGGTGGCTGCTCCAGCC
GCACCTCCTTCAGCTGACAGTGCGGAAGAGAGGGAACAGTTAGCAGAAAGCTATGGGTTC
AAACAAATTGGACAAGATCTTCCTGATAATGTTACTTTAAAAGATATCATGGATACTCTT
CCCAAAGAGGTGTTTGAGATTGATGATGTGAAGGCTTGGAGGTCTGTGTTGGTATCTGTG
ACGTCC*TACGCTTTGGGGCTCTTCATGATTGCGAAAGCGCCTTGGTATATGCTTCCGTT
GGCTTGGGCTTGGACAGGAACTGCAGTTACAGGGTTCTTTGTGATAGGGCATGATTGCGC
TCATAAATCATCTTCAAAGAACAAATTGGTTGAAGACATTGTGGGTACTCTAGCATTTCT
ACCTCTTGTATACCCGTATGAGCCATGGAGGTTTAAGCATGACCGCCATCACGCCAAAAC
CAACATGTTAGTTCATGACACAGCTTGGCAACCAGTT

QA 3 699 3 699
DS 



AS 1 4

CO CL2310Contig1 1134 4 5 U
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GATTACACGATGACTGCTATTAATGTAACCACCGCAAAAGTCACTAATGCTAGTTGCAAA
ACTGATATATTGATTTCAATTAAACCAGAATTAGTTAATGATTGATAAAAACGTACAATC
GGTAACTCCGGCGGCGATAAAAACGTACAAACCACCTTCCTAACACCTGCAGCCGCAATC
TTCAAGCAACCTTCCTCCAGCCAGCGTTGTGATTCATTCTCAGCTCTCCACGTTCTCAAT
CGGTAACTCCGGCGGCGATAACTTACAAAAGCCTTGGGATTCTGGAATACGCGTCTTGAA
TCGCCATGGAACCAACCGATCCGAGACCACAACCACGACGGAGCAAGAAACTATCCAACT
CCACAAAACTCTGATCTAAACCTCTCCTCGTCTTCCCGCCGTCCCCAAACAGAATCGTCA
CCCGAGAATAAGAAAAATAAGATCAAAGCCTGCTTCTAAAAGATGTTTAAAAGGAGAGCA
TTTTTTTGTCGATAGAAGGAAGAGATAATAAGGGAATATATTTTGTTGGAATAAAAGAGA
AAAAAAACAGAATTTAATAAAAATCATAGGTTTAAAATATTTCAGTGGCAAAGAAAAAAA
AAAGAAGAACTCTCTCTGAGCGCAGCCTCCTTTTTTTCAGATCTGAGGTCTTCTCTGGCC
GGTTCTCTTCGCCGTGCTGTGAGAGGAGCTCCATACACTCTGCTTTCTAGTTTTAGTTTG
TTTGTAGTCTTTTGAGCCTCAACGGTGGTGGTTGGTTTTTGGAGTGTTTCTCCGACGACT
ATGGCTATGGCGTTTGGGATGGTCGAGCGGTGGTGTTCCCGTGTTGGGTACTGGTTTGTT
TCTCGGTGAGGTCGGTTTCTCGGTGAAGCTGATTGTAGATCCGAAGGGTAAGAGTCTGGT
TCGATGGTGGCGCCTTGCAGGTGGTTGGAGGACCTTCTTCTTCACCTTCTCACGGTTTGT
GGTTGAGTCTTGAGCTGTTAATTTTGTTTAGTCAAGTTGTTCGTGCTTGTGATGGGCTTG
TCGGTTTGTCTCTGTGACCAATGGTTTGGTTAGGAAATAGAACCTTCTCTAGTG


BQ
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30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F193JQ U 1
AF RR4F193TF C 1
AF RR4D580TF U 229
AF RR4D580JQ C 420
BS 1 546 RR4F193JQ
BS 547 547 RR4D580TF
BS 548 592 RR4F193JQ
BS 593 906 RR4D580TF
BS 907 1134 RR4D580JQ

RD RR4F193JQ 594 0 0
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TTTTTT*GTCGATAGAAGGAAGAGATAATAAGGGAATATATTTTGTTGGAAT
CC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4F193TF 594 0 0
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GATTACACGATGACTGCTATTAATGTAACCACCGCAGAAGTCACTAATGCTAGTTGCAAA
ACTGATATATTGATTTCAATTAAACCAGAATTAGTTAATGATTGATAAAAACGTACAATC
GGTAACTCCGGCGGCGATAAAAACGTACAAACCACCTTCCTAACACCTGCAGCCGCAATC
TTCAAGCAACCTTCCTCCAGCCAGCGTTGTGATTCATTCTCAGCTCTCCACGTTCTCAAT
CGGTAACTCCGGCGGCGATAACTTACAAAAGCCTTGGGATTCTGGAATACGCGTCTTGAA
TCGCCATGGAACCAACCGATCCGAGACCACAACCACGACGGAGCAAGAAACTATCCAACT
CCACAAAACTCTGATCTAAACCTCTCCTCGTCTTCCCGCCGTCCCCAAACAGAATCGTCA
CCCGAGAATAAGAAAAATAAGATCAAAGCCTGCTTCTAAAAGATGTTTAAAAGGAGAGCA
TTTTTT*GTCGATAGAAGGAAGAGATAATAAGGGAATATATTTTGTTGGAAT
CC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4D580TF 678 0 0
GGAA
CCGCAATCTTCAAGCAACCTTCCTCCAGCCAGTGTTGTGATTCATTCTCAGCTCTCCACG
TTCTCAATCGGTAACTCCGGCGGCGATAACTTACAAAAGCCTTGGGATTCTGGAATACGC
GTCTTGAATCGCCATGGAACCAACCGATCCGAGACCACAACCACGACGGAGCAAGAAACT
ATCCAACTCCACAAAACTCTGATCTAAACCTCTCCTCGTCTTCCCGCCGTCCCCAAACAG
AATCGTCACCCGAGAATAAGAAAAATAAGATCAAAGCCTGCTTCTAAAAGATGTTTAAAA
GGAGAGCATTTTTTTGTCGATAGAAGGAAGAGATAATAAGGGAATATATTTTGTTGGAAT
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GAAAAAAAAAAGAAGAACTCTCTCTGAGCGCAGCCTCCTTTTTTTCAGATCTGAGGTCTT
CTCTGGCCGGTTCTCTTCGCCGTGCTGTGAGAGGAGCTCCATACACTCTGCTTTCTAGTT
TTAGTTTGTTTGTAGTCTTTTGAGCCTCAACGGTGGTGGTTGGTTTTTGGAGTGTTTCTC
CGACGACTATGGCTATGGCGTTTGGGATGGTCGAGCGGTGGTGTTCCCGTGTTGGGTACT
GGTTTGTTTCTCGG

QA 5 678 5 678
DS 

RD RR4D580JQ 715 0 0
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ACCCGAGAATAAGAAAAATAAGATCAAAGCCTGCTTCTAAAAGATGTTTAAAAGGAGAGC
ATTTTTTTGTCGATAGAAGGAAGAGATAATAAGGGAATATATTTTGTTGGAATAAAAGAG
AAAAAAAACAGAATTTAATAAAAATCATAGGTTTAAAATATTTCAGTGGCAAAGAAAAAA
AAAAGAAGAACTCTCTCTGAGCGCAGCCTCCTTTTTTTCAGATCTGAGGTCTTCTCTGGC
CGGTTCTCTTCGCCGTGCTGTGAGAGGAGCTCCATACACTCTGCTTTCTAGTTTTAGTTT
GTTTGTAGTCTTTTGAGCCTCAACGGTGGTGGTTGGTTTT*GGAGTGTTTCTCCGACGAC
TATGGCTATGGCGTTTGGGATGGTCGAGCGGTGGTGTTCCCGTGTTGGGTACTGGTTTGT
TTCTCGGTGAGGTCGGTTTCTCGGTGAAGCTGATTGTAGATCCGAAGGGTAAGAGTCTGG
TTCGATGGTGGCGCCTTGCAGGTGGTTGGAGGACCTTCTTCTTCACCTTCTCACGGTTTG
TGGTTGAGTCTTGAGCTGTTAATTTTGTTTAGTCAAGTTGTTCGTGCTTGTGATGGGCTT
GTCGGTTTGTCTCTGTGACCAATGGTTTGGTTAGGAAATAGAACCTTCTCTAGTG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2311Contig1 1015 4 6 U
GGATATTACCACCCCCTACAACGAATTTCCGTAGCTTCCCCTCAAATTAGATCTCGGTGA
AAAAAAAAACTAGAGAAACTTGAGGACAATTGTTACGATCTCACCAAGTAAGGCGTTCTT
CTGTGGATAAAAAGTGGTTCAGAAAAAAAAAGATGAATCATTGCAACCTTCAGCAGAACG
CCTTCATGTCGTCCCCTGACGAATCCAGAGGATTTGTTGTTCCTGTCTCTTCTTGTGTTG
TTTGTCCTAAGCCTCGTCGCGTTAGCATTCTCTCCAACAACGCTATTCATCTGTTTAGAT
CATCACATCCTAGTCAGCCAGGAGCAGCTGATGTATGTGATTCTCAAGCCGGGGCAGATC
TTTTGGACATCATCCGTAGAAAGGAAGAAACATTATCTGGTGTAGCTTCATCGCCTCCAT
TTTTCCTCGGGTCTCCTCCAAGCAGAGTATCAAACCCATTAGCTCAAGATGCACGATTTG
GAGATGACAAATTCAACCCTGTCTCACCCTCGCTCTCACTCTCACCATTTCTCCCATCTC
CATCTCCATCATCATCTCGTGTCAAAGGAGGAAGTTGTGGTGGTCGAGTGAAGTTTGGGC
TCAAACCGGCAGCTGTTAGAGTTGAAGGATTCAACTGCTTTAACAGGGACCGCCAAAGCT
CAAACATATCTGCCATGGCTTAGAAGAGGAAAGAAGAAAGGAACAGAGATTCACAAAAGT
GTAAATAAAATTCTAGAATCAAGACTATAAATCTTTGAAGATCTGTTTACAACCCCAGTT
AAGGCTTTTTGACCCCAGTTTTCTTTAACTTTGAGGTCAATATTTGTGTATATATACCGT
AACAACAAAGATGTGTTTATTGAGTCTCGTTATAACATATTAAAACCAATTTGGAGTTTT
TTTGTTCCTTTTCTTTTCGTCTGTATAAAAGCTTGTATATTAACGTTTTTTTTTGTATGG
AGATTTTCAATTTTTGTAAAATGTAACTTCGATAAATATGAATGCTCTTTGTATT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CW08TF U 1
AF RR4BL23TF U 1
AF RR4CW08JQ C 562
AF RR4BL23JQ C 554
BS 1 750 RR4BL23TF
BS 751 802 RR4BL23JQ
BS 803 803 RR4CW08JQ
BS 804 865 RR4BL23JQ
BS 866 866 RR4CW08JQ
BS 867 1015 RR4BL23JQ

RD RR4CW08TF 684 0 0
GGATATTACCACCCCCTACAACGAATTTCCGTAGCTTCCCCTCAAATTAGATCTCGGTGA
AAAAAAAAACTAGAGAAACTTGAGGACAATTGTTACGATCTCACCAAGTAAGGCGTTCTT
CTGTGGATAAAAAGTGGTTCAGAAAAAAAAAGATGAATCATTGCAACCTTCAGCAGAACG
CCTTCATGTCGTCCCCTGACGAATCCAGAGGATTTGTTGTTCCTGTCTCTTCTTGTGTTG
TTTGTCCTAAGCCTCGTCGCGTTAGCATTCTCTCCAACAACGCTATTCATCTGTTTAGAT
CATCACATCCTAGTCAGCCAGGAGCAGCTGATGTATGTGATTCTCAAGCCGGGGCAGATC
TTTTGGACATCATCCGTAGAAAGGAAGAAACATTATCTGGTGTAGCTTCATCGCCTCCAT
TTTTCCTCGGGTCTCCTCCAAGCAGAGTATCAAACCCATTAGCTCAAGATGCACGATTTG
GAGATGACAAATTCAACCCTGTCTCACCCTCGCTCTCACTCTCACCATTTCTCCCATCTC
CATCTCCATCATCATCTCGTGTCAAAGGAGGAAGTTGTGGTGGTCGAGTGAAGTTTGGGC
TCAAACCGGCAGCTGTTAGAGTTGAAGGATTCAACTGCTTTAACAGG*ACCGCCAAAGCT
CAAACATATCTGCCATGGCTTAGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BL23TF 753 0 0
GGATATTACCACCCCCTACAACGAATTTCCGTAGCTTCCCCTCAAATTAGATCTCGGTGA
AAAAAAAAACTAGAGAAACTTGAGGACAATTGTTACGATCTCACCAAGTAAGGCGTTCTT
CTGTGGATAAAAAGTGGTTCAGAAAAAAAAAGATGAATCATTGCAACCTTCAGCAGAACG
CCTTCATGTCGTCCCCTGACGAATCCAGAGGATTTGTTGTTCCTGTCTCTTCTTGTGTTG
TTTGTCCTAAGCCTCGTCGCGTTAGCATTCTCTCCAACAACGCTATTCATCTGTTTAGAT
CATCACATCCTAGTCAGCCAGGAGCAGCTGATGTATGTGATTCTCAAGCCGGGGCAGATC
TTTTGGACATCATCCGTAGAAAGGAAGAAACATTATCTGGTGTAGCTTCATCGCCTCCAT
TTTTCCTCGGGTCTCCTCCAAGCAGAGTATCAAACCCATTAGCTCAAGATGCACGATTTG
GAGATGACAAATTCAACCCTGTCTCACCCTCGCTCTCACTCTCACCATTTCTCCCATCTC
CATCTCCATCATCATCTCGTGTCAAAGGAGGAAGTTGTGGTGGTCGAGTGAAGTTTGGGC
TCAAACCGGCAGCTGTTAGAGTTGAAGGATTCAACTGCTTTAACAGGGACCGCCAAAGCT
CAAACATATCTGCCATGGCTTAGAAGAGGAAAGAAGAAAGGAACAGAGATTCACAAAAGT
GTAAATAAAATTCTAGAATCAAGACTATAA
TCT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4CW08JQ 332 0 0
TCAAAGGAGGAAGTTGTGGTGGTCGAGTGAAGTTTGGGCTCAAACCGGCAGCTGTTAGAG
TTGAAGGATTCAACTGCTTTAACAGGGACCGCCAAAGCTCAAACATATTTGCCATGGCTT
AGAAGAGGAAAGAAGAAAGGAACAGAGATTCCCAAAAGTGTAAATAAAATTCTAGAATCA
AGACTATAAATTTTTGAAGATCTGTTTACAACCCCAGTTAAGGCTTTTTGACCCCAGTTT
TCTTTAACTTTGAGGTCAATATTTGTGTATATATACCGTAACAACAAAGATGTGTTTATT
GAGTCTCGTTATAACATATTAAAACCAATTTG

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR4BL23JQ 462 0 0
ATT
TCGTGTCAAAGGAGGAAGTTGTGGTGGTCGAGTGAAGTTTGGGCTCAAACCGGCAGCTGT
TAGAGTTGAAGGATTCAACTGCTTTAACAGGGACCGCCAAAGCTCAAACATTTTTGCCAT
GGCTTAGAAGAGGAAAGAAGAAAGGAACAGAGATTCACAAAAGTGTAAATAAAATTTTAG
AATCAAGACTATAAATCTTTGAAGATCTGTTTACAACCCCAGTTAAGGCTTTTTGACCCC
AGTTTTTTTTAACTTTGAGGTCAATATTTGTGTATATATACCGTAACAACAAAGATGTGT
TTATTGAGTTTCGTTATAACATATTAAAACCAATTTGGAGTTTTTTTGTTCCTTTTCTTT
TCGTCTGTATAAAAGCTTGTATATTAACGTTTTTTTTTGTATGGAGATTTTCAATTTTTG
TAAAATGTAACTTCGATAAATATGAATGCTCTTTGTATT

QA 4 462 4 462
DS 



AS 1 2

CO CL2312Contig1 785 2 1 U
GGGTTTCTATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGAGTCAAGAGATCCAGAC
GTGTGTATAAAAGGAATCAAATCGAAAAAAAAAATGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAAAGA
CTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATCGTT
GAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCCCTCGCAAACAGAGAAATGTG
GATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTTGGAATCGTTTGTCAT
GTCTCTAATGCTCGACATCGCCAGATTCTCGTCCAAAAGACAGTTCAAAGATATGGGAAG
ATAGATATTGTTGTGTGTAATGCAGCGGTGAATCCATCTACTGACCCAATCTTATCTACT
CAAGAATCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTCCTC
CAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTCATAACCTCCATTGCT
GCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAGCTCTTCTCGGC
CTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACGCAAGAGTGAACGCAGTAGCACCT
GGTGTTGTGCCGACACATTTTGCTTCTTTCATCACCCGGAACTCTGAAGTGAGAAGAGCC
AATGAGGAGAAACTCTGCTCAACAGCTGGGAAAACGGATGACATGGCCGCTGCAACCGCT
TTCTT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4FX36TF U 7
AF RR4DI42TF U 1
BS 1 785 RR4DI42TF

RD RR4FX36TF 599 0 0
GG
ATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGAGTCAAGAGATCCAGACGTGTGTAT
AAAAGGAATCAAATCGGAAAAAAAAATGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAAAGACTCCAAGG
TAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATCGTTGAGCGGCT
TGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGCAAACAGAGAAATGTGGATGAGGC
GGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTTGGAATCGTTTGTCATGTCTCTAA
TGCTCGACATCGCCAGATTCTCGTCCAAAAGACAGTTCAAAGATATGGGAAGATAGATAT
TGTTGTGTGTAATGCAGCGGTGAATCCATCTACTGACCCAATCTTATCTACTCAAGAATC
TGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTCCTCCAGGATAT
GGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTCATAACCTCCATTGCTGCGTTTCA
ACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAGCTCTTCTCGGCCTAAC

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR4DI42TF 785 0 0
GGGTTTCTATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGAGTCAAGAGATCCAGAC
GTGTGTATAAAAGGAATCAAATCGAAAAAAAAAATGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAAAGA
CTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATCGTT
GAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCCCTCGCAAACAGAGAAATGTG
GATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTTGGAATCGTTTGTCAT
GTCTCTAATGCTCGACATCGCCAGATTCTCGTCCAAAAGACAGTTCAAAGATATGGGAAG
ATAGATATTGTTGTGTGTAATGCAGCGGTGAATCCATCTACTGACCCAATCTTATCTACT
CAAGAATCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTCCTC
CAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTCATAACCTCCATTGCT
GCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAGCTCTTCTCGGC
CTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACGCAAGAGTGAACGCAGTAGCACCT
GGTGTTGTGCCGACACATTTTGCTTCTTTCATCACCCGGAACTCTGAAGTGAGAAGAGCC
AATGAGGAGAAACTCTGCTCAACAGCTGGGAAAACGGATGACATGGCCGCTGCAACCGCT
TTCTT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 4

CO CL2313Contig1 814 4 11 U
ACGAAATTCCAAGGAAACGATGAGGTGTTGTTTGCTTTGGGTGTTCTGTACAAAATACAT
ATAAAGACGTACATATACCAATGTCACAGGGTTTGAGCTAAAGCCAATGTCTAAAATAGT
TCTACCTTAAGCATAGAGACACCAAGAACTGAGAGAAGACTATAAATTCACTCACGACTG
CAGCTGGAGAGTGGATACCCAAAAATGGGACCACGTCAACATGGAGCCAGCTCTCAATGG
TCGATCCCACCACTGCACCTACCACTAGTCCTCCTGCCGTTACTGCAGCCGCTTTCCCTA
GCTTGACGTTTCTTTTGGACATGAAGTAGAGGGAAGCGCCAAAGCTGGTGGCCAATATAA
GTCCTGGCACATCAGCACGGGCATAAGAGTCTATGGAACTGCCGTTAACATAAGTCAGTG
CCATCATTGCTCCATAAACTCCGGCTTGAATTCCCAAATTGCTAGTGGATGGCATATCAA
CAGATACAGGTGGATTCTTCATCCACTGAGACACCCTCCCTGTACCCAGAGGGCTGGTGG
ATTTAACGTCGGCGTAGCGGATGTTGTTGCTTACAACTTTGCCTGCTCGGCGTTGGTTGA
GGCTCTAGGAGGAGGAGACGCCGCGCATCGCCGCCGCCGCGTAGGCAGGAGAATCGCCGA
GGAGCGCCACAGCTGCTGCTGAGTCTTTCCGGAAGGAAAGAAGAAAGAATTGAATTTGGT
CGGGAGATGGAGAGGAACATCGCTGATAAGGCGGTTTGGTCCGGCGGGGATAGCTGCGGC
TGCCATTGCTCTGTTCGTTTCGTCTTCACACACA


BQ
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AF RR4GX15JQ U 1
AF RR4GA44JQ U 47
AF RR4GX15TF C 677
AF RR4GA44TF C 130
BS 1 282 RR4GX15JQ
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BS 531 805 RR4GA44JQ
BS 806 814 RR4GA44TF

RD RR4GX15JQ 530 0 0
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DS 

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C
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TCACTCACGACTGCAGCTGGAGAGTGGATACCCAAAAATGGGACCACGTCAACATGGAGC
CAGCTCTCAATGGTCGATCCCACCACTGCACCTACCACTAGTCCTCCTGCCGTTACTGCA
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GTGGCCAATATAAGTCCTGGCACATCAGCACGGGCATAAGAGTCTATGGAACTGCCGTTA
ACATAAGTCAGTGCCATCATTGCTCCATAAACTCCGGCTTGAATTCCCAAATTGCTAGTG
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QA 2 759 2 759
DS 

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TGG
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TCGCTGATAAGGCGGTTTGGTCCGGCGGAGATAGCTGCGGCTGCCATTGCTCT
CC

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DS 

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AGTGGATACCCAAAAATGGGACCACGTCAACATGGAGCCAGCTCTCAATGGTCGATCCCA
CCACTGCACCTACCACTAGTCCTCCTGCCGTTACTGCAGCCGCTTTCCCTAGCTTGACGT
TTCTTTTGGACATGAAGTAGAGGGAAGCGCCAAAGCTGGTGGCCAATATAAGTCCTGGCA
CATCAGCACGGGCATAAGAGTCTATGGAACTGCCGTTAACATAAGTCAGTGCCATCATTG
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GTGGATTCTTCATCCACTGAGACACCCTCCCTGTACCCAGAGGGCTGGTGGATTTAACGT
CGGCGTAGCGGATGTTGTTGCTTACAACTTTGCCTGCTCGGCGTTGGTTGAGGCTCTAGG
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CAGCTGCTGCTGAGTCTTTCCGGAAGGAAAGAAGAAAGAATTGAATTTGGTCGGGAGATG
GAGAGGAACATCGCTGATAAGGCGGTTTGGTCCGGCGGGGATAGCTGCGGCTGCCATTGC
TCTGTTCGTTTCGTCTTCACACACA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 3

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GCTTCCTAAATCTTCAAATCCAGACGAGCCGAAAGATGAAAGTCCCTCCACAGCTCCTCC
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AGAAGAACGAGTGATAGAAGCGATGCAGAAGATAACATCCCACATCAAGAACCCTTCCAA
GTTCTCCAAAGCCTCAAAGCTTGCGATACGCCTGATTCAAGCTGGAAGCGTGAAGCCTGA
GACAAGCAGTTACTTCATTTGCGATGCTCGAAGCTGCAATGTCATCGAAAACTCCTTGTA
CAGATCGATTTGGTTAGAGCAGACTATCATGCTTTGTTCTCAGCTGCTCAGGATGTAGCC
CGAGTGCCTTAATAAAAGCCAGAAGAATCTGCTGACCATATGGACGATTAAAGCAGTTGT
GGCTAATGACCTCTTT*ACTGATGACAGCTTCATGTTTTCCAAGACTGGTACTCAAATAA
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CTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGGACAATGGAGAAGAGCAGACAACACAGGACGTGGATG
AAGCTGCTTCAGCGGGAGGTCAAGAGGATGCCGAGTCTGATCCCTTTGGGCTGGATGCAT
GGATCTCCAGTGGTGTGAAGAAAAATGGTAAAACAAAGATGACGAAAGAAGATACAGATG
CCTTGGAGAACAAGAAATTTCTCAGGTCAAAAAGAGAAGCTTTGATTACATGCCTGGAGA
TCGCTGCACGCCGTTACAGAGTTCCATGGTGCCAGACTGTTATAGACATACTGGTGAAAC
ATGCGTTTGAGAACGTGACGAGGTTCACATCACAGCAGAGACAAGCAGTGGAGAAACTAT
GGGCTTCGGTTAGAGAACAACACCTCCGTAGGAAGCAAGGCAAATCAGTGACGGGGAAAC
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GCGATCTGTTGGAGCCAACGGTGAACGCGTG


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B678TF U 1
AF RR4E808TF U 400
AF RR4BW28TF U 599
BS 1 435 RR4B678TF
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BS 437 465 RR4B678TF
BS 466 466 RR4E808TF
BS 467 645 RR4B678TF
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BS 708 807 RR4B678TF
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BS 838 981 RR4E808TF
BS 982 1291 RR4BW28TF

RD RR4B678TF 846 0 0
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TTGAGAGATGACGGACAATATCTTCGAAGGTCTACCTCCTCCGTCTTCTCAACAGCAAGT
GCTTCCTAAATCTTCAAATCCAGACGAGCCGAAAGATGAAAGTCCCTCCACAGCTCCTCC
GACTCTGGTTCTCAAGAGTTCCCTGAAGCGATCTAAACCGGCAGAATCTGCACCCCATGT
CTCAGCTCCTCCTGTTCTCAAGAGCGCTCTAAAGCGTTCAAAACCAGCAGAATCTACTCC
GGAACCAGAACCTGAAGCTCCTAAGAAGCGTCTACAGTTCAAGACATCGACAGATGCATC
AGAAGAACGAGTGATAGAAGCGATGCAGAAGATAACATCCCACATCAAGAACCCTTCCAA
GTTCTCCAAAGCCTCGAAGCTTGCGATACGCCTGATTCAAGCTGGTAGCGTGAAGCCTGA
GACAAGCAGTTACTTCATTTGCGATGCTCGAAGCTGCAATGTCATCGAAAACTCCTTGTA
CAGATCGATTTGGTTAGAGCAGACTATCATGCTTTGTTCTCAGCTGCTCAGGATGTAGCC
CGAGTGCCTTAATAAAAGCCAGAAGAATCTGCTGACCATATGGACTATTAAAGCAGTTGT
GGCTAATGACCTCTTTTACTGATGACAGCTTTATGTTTTCCAAGACCGGTACTCAAATAA
AGGAGGCTATATCTGATCTTCCAGTGGCAACTGAGGAAGATGATGCGGAAGAAGCAGCTG
CTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGGACAGTGGAGATGAGCAGACACCAGAGGACGTGG
CCGAAGCTG

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4E808TF 582 0 0
G
CACATCAAGAACCCTTCCAAGTTCTCCAAAGCCTCAAAGCTTGCGATACGCCTGATTCAA
GCTGGAAGCGTGAAGCCTGAGACAAGCAGTTACTTCATT*GCGATGCTCGAAGCTGCAAT
GTCGTCGAAAACTCCTTGTACAGATCGATT*GGTTAGAGCAGATTATCATGCTTTGTTCT
CAGCTGCTCAGGATGTCGCC*GAGTGCCTTAATAAAAGCCAGAAGAATCTGCTGACCATA
TGGACGATTAAAGCAGTTGTGGCTAATGACCTCTTT*ACTGATGACAGCTTCATGTTTTC
CAAGACTGGTACTCAAATAAAGGAGGCTATATCTGATCTTCCAGTGGCAACTGAGGAAGA
TGATGCGGAAGAAGCAGCTGCTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGGACAATGGAGAAGAGCA
GACAACACAGGACGTGGATGAAGCTGCTTCAGCGGGAGGTCAAGAGGATGCCGAGTCTGA
TCCCTTTGGGCTGGATGCATGGATCTCCAGTGGTGTGAAGAAAAATGGTAAAACAAAGAT
GACGAAAGAAGATACAGATGCCTTGGAGAACAAGAAATTTC

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR4BW28TF 693 0 0
G
CCGAGTGCCTTAATAAAATCCAGAAGAATCTGCTGACCATATGGACGATTAAAGCAGTTG
CGGCTAATGACCTCTTT*ACTGATGACAGCTTCATGTTTTCCAAGACTGGTACTCAAATA
AAGGAGGCTATATCTGATCTTCCAGTGGCAACTGAGGAAGATGATGCGGAAGAAGCAGCT
GCTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGGACAATGGAGAAGAGCAGACAACACAGGACGTGGAT
GAAGCTGCTTCAGCGGGAGGTCAAGAGGATGCCGAGTCTTATCCCTTTGGGCTGGATGCA
TGGATCTCCAGTGGTGTGAAGAAAAATGGTAAAACAAAGATGACGAAAGAAGATACAGAT
GCCTTGGAGAACAAGAAATTTCTCAGGTCAAAAAGAGAAGCTTTGATTACATGCCTGGAG
ATCGCTGCACGCCGTTACAGAGTTCCATGGTGCCAGACTGTTATAGACATACTGGTGAAA
CATGCGTTTGAGAACGTGACGAGGTTCACATCACAGCAGAGACAAGCAGTGGAGAAACTA
TGGGCTTCGGTTAGAGAACAACACCTCCGTAGGAAGCAAGGCAAATCAGTGACGGGGAAA
CTTGACGTGACTGCTTTCGAAAGTCTTCAGATAAATACGCCAACGAGAAGATGAGCATCC
GGCGATCTGTTGGAGCCAACGGTGAACGCGTG

QA 2 693 2 693
DS 



AS 1 2

CO CL2315Contig1 746 2 25 U
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AAAGAATCGTTACAACGATAAGAGATTCTAAAATCAACAAAGAAATCTGTTCTGTTCGAA
CTGATCATCCATCAAGACAGAAACTTTAGTTCCAATTCATTGTCCGAATCTCCCCTGATC
TCTCTGGTTTAAGCAAACTCCTCGTCTTCATCATCTTCCTCCTCTTCCTCGTACTCAGAA
TCAGACTCCTCCTCCTCCTCTCTTTCGGGTTGCATCAACGTACTCATATCAAAAGAAGCT
GGACCAGACTCAACTTCCTCTATATCTATAGTATCATAACTCATCCTCTGTTCGAACTTC
TCCTCTGAACAGTTCAGCATCCAAACCAACGAACATTTAATCCCCTTCTTGAACACCCTC
TTGTGCCTCGGCTTCACCGTCGACTCCAACCCGTAAGTAAAGAACGCAGGGAAGTCCACG
AGATCCTGAAGAGGTCTTCTCATCTCCTTAAAGAAGAACTCAAAGCTAAGCTTCATGATC
CCAATGTTCAAAGCCAGAACCTGAGGACACCCGATCACCATCTCCCTCGTCTGATCGATC
GAGAAGCCACACTCTTTAAGGAAAGCAATGTGCTTCAGCATAGGCGACTCGCTCAAGCTA
ACAAACTGCGGCATCCTCTCCACCAAAGAGCCGAGATCCTCAGGGTTTAGATCAATAGCC
GAAGAAAGCAGCTTCCTCTGCGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ80JQ U 21
AF RR4C079TF C 1
BS 1 34 RR4C079TF
BS 35 49 RR4CZ80JQ
BS 50 50 RR4C079TF
BS 51 104 RR4CZ80JQ
BS 105 105 RR4C079TF
BS 106 153 RR4CZ80JQ
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BS 288 288 RR4C079TF
BS 289 305 RR4CZ80JQ
BS 306 306 RR4C079TF
BS 307 384 RR4CZ80JQ
BS 385 385 RR4C079TF
BS 386 455 RR4CZ80JQ
BS 456 456 RR4C079TF
BS 457 511 RR4CZ80JQ
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BS 513 662 RR4CZ80JQ
BS 663 663 RR4C079TF
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BS 670 693 RR4CZ80JQ
BS 694 746 RR4C079TF

RD RR4CZ80JQ 673 0 0
TCTGAGTAGTAGTA
CATTGTGATGTTATCGACATGAACAAAAAGAATCGTTACAACGATAAGAGATTCTAAAAT
CAACAAAGAA*TCTGTTCTGTTCGAACTGATCATCCATCAAGACAGAAACTTTAGTTCCG
ATTCATTGTCCGAATCTCCCCTGATCTCTCTGGTTTAAGCAAACTCCTCGTCTTCATCAT
CTTCTTCCTCTTCCTCGTACTCAGAATCAGACTCCTCCTCCTCCTCTCTTTCGGGTTGCA
TCAACGTACTCATGTCAAAAGAAGCTGGACCGGACTCAACTTCCTCTATATCTATAGTAT
CATAACTCATCCTCTGTTCGAACTTCTCCTCTGAACAGTTCAGCATCCAAGCCAACGAAC
ATTTAATCCCCTTCTTGAACACCCTCTTGTGCCTCGGCTTCACCGTCGACTCCAACCCGT
ACGTAAAGAACGCAGGGAAGTCCACGAGATCCTGAAGAGGTCTTCTCATCTCCTTAAGGA
AGAACTCAAAGCTAAGCTTCATGATCCCAATGTTCAAAGCCAGAACCTGAGGACACCCGA
TCACCATCTCCCTCGTCTGATCGATCGAGAAGCCACACTCTTTAAGGAAAGCAATGTGCT
TCAGCATAGGCGACTCGCTCAAGCTAACTAACTGTGGCATCCTCTCCACCAAAGAGCCG

QA 15 673 15 673
DS 

RD RR4C079TF 746 0 0
TTTATAATTTAACTCCGATTCATGTCTGAATAGTCATTGTGATGT*ATCAACATGAACAA
AA*GAATCGTTACAACGATAAGAGATTCTAAA*TCAAGAAAGAAATCTGTTCTGTTCGAA
CTGATCATCCATCAAGACAGAAACTTTAGTTCCAATTCATTGTCCGAATCTCCCCTGATC
TCTCTGGTTTAAGCAAACTCCTCGTCTTCATCATCTTCCTCTTCTTCCTCGTACTCAGAA
TCAGACTCCTCCTCCTC***TCTTTCGGGTTGCATCAACGTACTCATATCAAAAGAAGCT
GGACCAGACTCAACTTCCTCTATATCTATAGTATCATAACTCATCCTCTGTTCGAACTTC
TCCTCTGAACAGTTCAGCATCCAAACCAACGAACATTTAATCCCCTTCTTGAACACCCTC
TTGTGCCTCGGCTTCACCGTCGACTCCAACCCGTAAGTAAAGAACGCAGGGAAGTCCACG
AGATCCTGAAGAGGTCTTCTCATCTCCTTTAAGAAGAACTCAAAGCTAAGCTTCATGATC
CCAATGTTCAAAGCCAGAACCTGAGGACACCCGATCACCATCTCCCTCGTCTGATCGATC
GAGAAGCCACACTCTTTAAGGAACGCAATGTGCTTCAGCATAGGCGACTCGCTCAAGCTA
ACAAACTGCGGCATCCTCTCCACCAAAGAGCCGAGATCCTCAGGGTTTAGATCAATAGCC
GAAGAAAGCAGCTTCCTCTGCGTCTC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL2316Contig1 1339 4 3 U
TGCTTTATCTTCTTCAGCTGCAATCTTCCACTCTCCTTCCCTAGTCCCTATCACCGGTCA
ACGGTCCTTCCCTTCCCCGACTCGAATCCGCTCCTCGCCTCGCGTCCTCAGAGGAATTCA
TAGCCGTGAGCTCCACCGTTTCCCTCAGAATGTTACAGCCGGCCGGTTCAATAGCTTCTC
GTGTAACTGCTTATCCGCCGTATCCACCACCACTCTCGATTACGAGTTCACAGATGGTGG
CAAAGAGGTGGAGTTGAGATTGAGGTTGAAGACAGGCGAGACGCTTTCTCCAAAGGATAT
ATCAGTGGACGCAGATGGAACGTCTTTAGCTGTTAAAGAGAAGCGTAACGGCTTACTCAT
CACGCTTCTTGAGACTAACCAGCTCTTTGACAAGATCATGCCCTCCGAAACCATATGGTA
CATAGATGAAGACCAGTTGGTTGTGAACATGAAGAAGGTGGATGGGGAGTTGAAGTGGCC
TGATGTTGTTGAGTCGTGGGAGTCTTTGACTGCTGGGATGATGCAGCTTCTTAAAGGGGC
GTCGATCTACGTTGTTGGGGATTCGACTGAGATTAACCAGAAAGTGTCTCGGGAGCTAGC
TGTTGGTCTTGGGTATAGTCCTCTAGACTCGATGGAGTTGCTGGAGAGCTTTTCTAAGCA
AACAATCGATTCTTGGATTCTTGCAGAAGGGGCGGATTCTGTAGCTGAAGCAGAGAGTTC
GGTGTTGGAAAGCTTAAGCAGCCATGTCCGTACTGTTGTCCCAACTTTGGGAGGTAAACA
TGGAGCTGCGGGAAGAGCTGATAAGTGGAGACATCTTTACTCTGGATTTACTGTATGGGT
ATCACAAACTGAAGCCACAGATGAAGAATCAGCTAAAGAAGAAGCGAGGCGAAACAACCA
AGAGAGGGAGATTGGGTATTCAAACGCAGACGTGGTGGTGAAGCTCCAAGGTTGGGACCC
AACGCATGCCAAGAGCGTGGCTCAGGCGTCGTTAAGTGCACTCAAGCAACTGATCATCTC
AGACAAGGGACTTCCAGGTAAGAAGAGTCTGTACATAAGGCTGGGTTGCCGTGGTGACTG
GCCCAATATAAAACCGCCGGGATGGGATCCGTCGTCTGACACAGGAGCTCATCCAAGTTT
CTCATAAAGTATTCTTTAAACGGTGCTCTTTTGTTCTCTCTCTCCCATAAAACCAAGCAA
CAAGCGTTGTTACTCTTGAAGAGTTAATCACTTTCATAGCCGTTGATAATTTGTGTAGAA
GTGTATTTGATGATTTGAGTTTTGACAATTGAGTTAAAAGCCAGTTTGATGAATAACAAA
GAACATAAGCTGTTGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CL63TF U 1
AF RR4AS84TF U 454
AF RR4B110TF U 454
AF RR4CL63JQ C 568
BS 1 684 RR4CL63TF
BS 685 1237 RR4AS84TF
BS 1238 1339 RR4CL63JQ

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CAAAGAGGTGGAGTTGAGATTGAGGTTGAAGACAGGCGAGACGCTTTCTCCAAAGGATAT
ATCAGTGGACGCAGATGGAACGTCTTTAGCTGTTAAAGAGAAGCGTAACGGCTTACTCAT
CACGCTTCTTGAGACTAACCAGCTCTTTGACAAGATCATGCCCTCCGAAACCATATGGTA
CATAGATGAAGACCAGTTGGTTGTGAACATGAAGAAGGTGGATGGGGAGTTGAAGTGGCC
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AACAATCGATTCTTGGATTCTTGC

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TCAT
AGCC

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TAACCAGAAAGTGTCTCGGGAGCTAGCTGTTGGTCTTGGGTATAGTCCTCTAGACTCGAT
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AAGTGCACTCAAGCAACTGATCATCTCAGACAAGGGACTTCCAGGTAAGAAGAGTCTGTA
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TCAT

QA 1 784 1 784
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CTTTTGTTCTCTCTCTCCCATAAAACCAAGCAACAAGCGTTGTTACTCTTGAAGAGTTAA
TCACTTTCATAGCCGTTGATAATTTGTGTAGAAGTGTATTTGATGATTTGAGTTTTGACA
ATTGAGTTAAAAGCCAGTTTGATGAATAACAAAGAACATAAGCTGTTGATCG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 4

CO CL2317Contig1 908 4 4 U
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AGTTGGGGGTTTTGATCCGATCCTGTAATAATGTCTGAATCTTACGTCGGATTCAGTAAA
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TTCTAGCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GZ11TF U 1
AF RR4GX11TF U 1
AF RR4GX11JQ C 201
AF RR4GZ11JQ C 230
BS 1 698 RR4GX11TF
BS 699 699 RR4GX11JQ
BS 700 756 RR4GX11TF
BS 757 908 RR4GX11JQ

RD RR4GZ11TF 589 0 0
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TAATCCGATTGGAAATGGATCTGATCTCTCCTCCGCATCGTTTCAAGGCTACGCCACTGA
GCGTGACGCTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTCAAACCATTGAG
CAAGAAGAAGAAAGAAGGGGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACGAGGATCTGCAT
TGCGATCCGTTCGTTCGACAACCCGGAGAAGGAAGCTTGGTGTCTTCCTCCCCACAGTCG
CTACGCCGCGATGCCCGACACGAGGACCTTGTACACGGTGCTTCGTTCCCCTCACGTCGA
CAAGAAGTCGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTTGTCATCAAGGC
TCAGAGCCATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGTATCCTCGGTGC
TCAGTACGAGCTTCAGTTCCATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4GX11TF 756 0 0
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ACTGAGCTCTTTTGATTCAGCTCTTTCCCGAAATTTCACCACCGGAGCGTCCGCGAAGCT
TAATCCGATTGGAAATGGATCTGATCTCTCCTCCGCATCGTTTCAAGGCTACGCCACTGA
GCGTGACGCTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTCAAACCATTGAG
CAAGAAGAAGAAAGAAGGGGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACGAGGATCTGCAT
TGCGATCCGTTCGTTCGACAACCCGGAGAAGGAAGCTTGGTGTCTTCCTCCCCACAGTCG
CTACGCCGCGATGCCCGACACGAGGACCTTGTACACGGTGCTTCGTTCCCCTCACGTCGA
CAAGAAGTCGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTTGTCATCAAGGC
TCAGAGCCATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGTATCCTCGGTGC
TCAGTACGAGCTTCAGTTCCATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCCGTGTTGGCCAG
CATCAACGGCTCCACCATTGGTGGTCAGTGAGACAAAGCTTAAAGAGATCGTTTTTGAGA
AGTTGGGGGTTTTGATCCGATCCTGTAATAATGTCTGA*TCTTACGTCGGATTCAGTAAA
GAATTCAGCTATACATCACAATTCTTAGCTTTTGTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4GX11JQ 708 0 0
ATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTCAAACCATTGAGCAAGAAGAAGAAAGAAGGGG
AAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACGAGGATCTGCATTGCGATCCGTTCGTTCGACA
ACCCGGAGAAGGAAGCTTGGTGTCTTCCTCCCCACAGTCGCTACGCCGCGATGCCCGACA
CGAGGACCTTGTACACGGTGCTTCGTTCCCCTCACGTCGACAAGAAGTCGAGGGAGCAGT
TCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTTGTCATCAAGGCTCAGAGCCATGAGCTTAACA
AGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGTATCCTCGGTGCTCAGTACGAGCTTCAGTTCC
ATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCCGTGTTGGCCAGCATCAACGGCTCCACCATTG
GTGGTCAGTGAGACAAAGCTTAAAGAGATCGTTTTTGAGAAGTTGGGGGTTTTGATCCGA
TCCTGTAATAATGTCTGAATCTTACGTCGGATTCAGTAAAGAATTCAGCTATACATCACA
ATTCTTAGCTTTTGTTCTTGTTTTTTTTTTCTTTTCAGTTACTGATGTTTCAAAGACATG
GTTTTTAGACTGAATTTTAGTGTCACGGTGCATTCAGGTTATGCCAATTCATTAGAGGCC
AGTAAGAAGATATGTTTTTGTTTGTTTATTAGAGGAATTTTTCTAGCG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4GZ11JQ 679 0 0
AAACCATTGAGCAAGAAGAAGAAAGAAGGGGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACG
AGGATCTGCATTGCGATCCGTTCGTTCGACAACCCGGAGAAGGAAGCTTGGTGTCTTCCT
CCCCACAGTCGCTACGCCGCGATGCCCGACACGAGGACCTTGTACACGGTGCTTCGTTCC
CCTCACGTCGACAAGAAGTCGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTT
GTCATCAAGGCTCAGAGCCATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGT
ATCCTCGGTGCTCAGTACGAGCTTCAGTTCCATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCC
GTGTTGGCCAGCATCAACGGCTCCACCATTGGTGGTCAGTGAGACAAAGCTTAAAGAGAT
CGTTTTTGAGAAGTTGGGGGTTTTGATCCGATCCTGTAATAATGTTTGAATCTTACGTCG
GATTCAGTAAAGAATTCAGCTATACATCACAATTCTTAGCTTTTGTTCTTGTTTTTTTTT
TCTTTTCAGTTACTGATGTTTCAAAGACATGGTTTTTAGACTGAATTTTAGTGTCACGGT
GCATTCAGGTTATGCCAATTCATTAGAGGCCAGTAAGAAGATATGTTTTTGTTTGTTTAT
TAGAGGAATTTTTCTAGCG

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL2318Contig1 716 3 10 U
GCTGTCTTAATCCTTGTGTTTTTGTTGTGTAATAATCCAATGAATGTGTTTTTACAAAGA
TGTATTTTGTCTTATAACAACAATCTACCTGAACTTTCTGATTGGTAAAGCTTTTCCGAA
TAACTTCTCAACCTCATTAGCTTCCATTTTGAGCTCATCCAAAAGCTCCATCTCCTCTCT
ACTCAACCCTCTCAAGAAATTCTCCTCGTCTTGCCTTAGCTCCTCGAACCCTTCGGCTAA
TCTCTGGAACAGAGTCATCTCAGTCTTACCGACTTTCTCCACTTCCTTCTCTACCTCCTC
CTCTATCTCTTCCACCTCTTTCACGATGATCTTCTCCCCTTCTTCCACAGTCTTCTCGAG
TCTCTCCACCAGAGGAGGTTCGGGACCGCAGGTGTTATCAGTTTTTATGAACGTGCTGAA
GTCTCTGCCTATGGTTTTAGCTGCTTTCTCAAGCTCCGGTACAATGCTGTTGGGTAAAGA
AGCGCTTCTTGTGTACACAACCGCACCTCCGTATCCATCCCAAGCATCGTTTCTACCACG
GTAGTACACGAAGATGTAGTCTTCAGGTTTGTTCTCTATCTTTGATGACAGTATATACCA
GTCGTCTTGATAGTGGAGGTACTCGTTGTCATGATTGTAGAAAACAGCAGGCTGGTTAGG
ATCTTGAACGAACTTCTGCACGGTTGACCTAGTGAAGAAACCACTGTCTGGTGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4F277JQ U 1
AF RR4CA47JQ U 3
AF RR4CA47TF C 36
BS 1 89 RR4F277JQ
BS 90 90 RR4CA47JQ
BS 91 214 RR4F277JQ
BS 215 215 RR4CA47JQ
BS 216 534 RR4F277JQ
BS 535 535 RR4CA47JQ
BS 536 537 RR4F277JQ
BS 538 538 RR4CA47JQ
BS 539 645 RR4F277JQ
BS 646 716 RR4CA47JQ

RD RR4F277JQ 645 0 0
GCTGTCTTAATCCTTGTGTTTTTGTTGTGTAATAATCCAATGAATGTGTTTTTACAAAGA
TGTATTTTGTCTTATAACAACAATCTACCCGAACTTTCTGATTGGTAAAGCTTTTCCGAA
TAACTTCTCAACCTCATTAGCTTCCATTTTGAGCTCATCCAAAAGCTCCATCTCCTCTCT
ACTCAACCCTCTCAAGAAATTCTCCTCGTCTTGCTTTAGCTCCTCGAACCCTTCGGCTAA
TCTCTGGAACAGAGTCATCTCAGTCTTACCGACTTTCTCCACTTCCTTCTCTACCTCCTC
CTCTATCTCTTCCACCTCTTTCACGATGATCTTCTCCCCTTCTTCCACAGTCTTCTCGAG
TCTCTCCACCAGAGGAGGTTCGGGACCGCAGGTGTTATCAGTTTTTATGAACGTGCTGAA
GTCTCTGCCTATGGTTTTAGCTGCTTTCTCAAGCTCCGGTACAATGCTGTTGGGTAAAGA
AGCGCTTCTTGTGTACACAACCGCACCTCCGTATCCATCCCAAGCATCGTTTCTCCCGCG
GTAGTACACGAAGATGTAGTCTTCAGGTTTGTTCTCTATCTTTGATGACAGTATATACCA
GTCGTCTTGATAGTGGAGGTACTCGTTGTCATGATTGTAGAAAAC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4CA47JQ 714 0 0
A
GTCTTAATCCTTGTGTTTTTGTTGTGTAATAATCCAATGAATGTGTTTTTACAAAGATGT
ATTTTGTCTTATAACAACAATCTACCTGAACTTTCTGATTGGTAAAGCTTTTCCGAATAA
CTTCTCAACCTCATTAGCTTCCATTTTGAGCTCATCCAAAAGCTCCATCTCCTCTCTACT
CAACCCTCTCAAGAAATTCTCCTCGTCTTGCCTTAGCTCCTCGAACCCTTCGGCTAATCT
CTGGAACAGAGTCATCTCAGTCTTACCGACTTTCTCCACTTCCTTCTCTACCTCCTCCTC
TATCTCTTCCACCTCTTTCACGATGATCTTCTCCCCTTCTTCCACAGTCTTCTCGAGTCT
CTCCACCAGAGGAGGTTCGGGACCGCAGGTGTTATCAGTTTTTATGAACGTGCTGAAGTC
TCTGCCTATGGTTTTAGCTGCTTTCTCAAGCTCCGGTACAATGCTGTTGGGTAAAGAAGC
GCTTCTTGTGTACACAACCGCACCTCCGTATCCATCCCAAGCATCGTTTCTACCACGGTA
GTACACGAAGATGTAGTCTTCAGGTTTGTTCTCTATCTTTGATGACAGTATATACCAGTC
GTCTTGATAGTGGAGGTACTCGTTGTCATGATTGTAGAAAACAGCAGGCTGGTTAGGATC
TTGAACGAACTTCTGCACGGTTGACCTAGTGAAGAAACCACTGTCTGGTGTCC

QA 2 714 2 714
DS 

RD RR4CA47TF 681 0 0
TCCAATGAATGTGTTTT*ACAAAGATGTATTTTGTCTTATAACAACAATCTACCTGAACT
TTCTGATTGGTAAAGCTTTTCCGAATAACTTCTCAACCTCATTAGCTTCCATTTTGAGCT
CATCCAAAAGCTCCATCTCCTCTCTACTCAACCCTCTCAAGAAATTCTCCTCGTCTTGCC
TTAGCTCCTCGAACCCTTCGGCTAATCTCTGGAACAGAGTCATCTCAGTCTTACCGACTT
TCTCCACTTCCTTCTCTACCTCCTCCTCTATCTCTTCCACCTCTTTCACGATGATCTTCT
CCCCTTCTTCCACAGTCTTCTCGAGTCTCTCCACCAGAGGAGGTTCGGGACCGCAGGTGT
TATCAGTTTTTATGAACGTGCTGAAGTCTCTGCCTATGGTTTTAGCTGCTTTCTCAAGCT
CCGGTACAATGCTGTTGGGTAAAGAAGCGCTTCTTGTGTACACAACCGCACCTCCGTATC
CATCCCAAGCATCGTTTCTACCACGGTAGTACACGAAGATGTAGTCTTCAGGTTTGTTCT
CTATCTTTGATGACAGTATATACCAGTCGTCTTGATAGTGGAGGTACTCGTTGTCATGAT
TGTAGAAAACAGCAGGCTGGTTAGGATCTTGAACGAACTTCTGCACGGTTGACCTAGTGA
AGAAACCACTGTCTGGTGTC
C

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL2319Contig1 1344 4 18 U
GGAGACAAGAAATTATATTGATCTAAGAGATTGTCACGGTTCTTACAAGATGTTTGCCAT
TGATATGGCTCTTTCTGCTTACTGCCTGTGCTGGAAGGACATTATACCCACTCCCTGGTA
AAGGAGGAAAAAGTGCTAAGCTGTCCATTCAGACTTCGCGTCCTTATAACATTGCACACA
GAGGTTCCAATGGAGAGATCCCTGAAGAAACTGCTGCTGCATACTTGAGAGCAATTGAAG
AGGGTGCAGACTTCATAGAAACAGATGTCTTATCAACCAAAGATGGTGTGCTTATCTGTT
TCCATGATTTCACCCTTCAAAACAAAACCAATGTTGCCAGCCACAAGGAGTTTGCTGATC
GTAATAGGACTTATGAAGTCCAAGGATCCAACATGACAGGCTTTTTCACTTTTGATTTTA
CACTCAAAGAACTAAAGAAACTAAGGACAAAGCAGAGATACTCTTTCCGCGACCAACAGT
ACAACGGAAAGTATCCTATCATTACATTTGAAGAGTTCATTACCATTGCTCGGGATGCTC
CAAGAGTTGTCGGTATATATCCTGAGATTAAGAATCCAGTTCTAATGAACCAGCATGTCA
AGTGGCCTGGTGGTAAGAGATTTGAGGATAAAGTGGTGGAGACACTTAAGAAGTATGGAT
ATGGAGGCTCATATTTGTCCAAGAAATGGCTGAAGAAACCATTGTTTATTCAGTCATTTG
CCCCATCTTCACTTGTCTACATATCAAACCTGACAGACTCGCCAAAAGTCTTACTAATAG
ACGACGTTACCGTGCTAACAGAAGACACTAACCAGACTTATGCGGAGATCACATCAGACG
TGTATTTCAATTACATCAAACAATATGTCGTCGGGATCGGACCTTGGAAGGACACAGTTG
TTCCAGTAAGCAACAATTACACGCAAGCCCCAACAGATTTGGTCAAAAGAGCTCATGCAC
ATAATCTACAGGTGCATCCATACACGTACAGGAATGAAAACGAGTTCTTACACTTTAACT
TCAGCCAAGATCCATATAAGGAATACGAGTACTGGATCAATGAAATTGGTGTTGACGGAC
TCTTCACCGACTTCACTGGTAGCCTCCATAACTACCAAGAATGGACATCTCCGTCGTTTG
AAACTTCCAAGTCTCCAAGAAAGCTCTTGAGTTAAATTGCTTCATTGGTCCTCCCTTATG
CAAAGGCTTGAAATACCACAGATGCGTCTTATAGATCAGATGTGTTTGCTTACTTCACAA
GATTATACATAAACGCCAAAAAATAACTATGTAAATCTCAGAGCATACTTCTATAATACC
AAGATGAAGGGAAATAATTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GE19TF U 61
AF RR4GE19JQ C 640
AF RR4FJ49JQ C 772
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TGATATGGCTCTTTCTGCTTACTGCCTGTGCTGGAAGGACATTATACCCACTCCCTGGTA
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AGTGGCCTGGTGGTAAGAGATTTGAGGATAAAGTGGTGGAGACACTTAAGAAGTATGGAT
AT

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DS 

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G
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AGGAGGAAAAAGTGCTAAGCTGTCCATTCAGACTTCGCGTCCTTATAACATTGCACACAG
AGGTTCCAATGGAGAGATCCCTGAAGAAACTGCTGCTGCATACTTGAGAGCAATTGAAGA
GGGTGCAGACTTCATAGAAACAGATGTCTTATCAACCAAAGATGGTGTGCTTATCTGTTT
CCATGATTTCACCCTTCAAAACAAAACCAATGTTGCCAGCCACAAGGAGTTTGCTGATCG
TAATAGGACTTATGAAGTCCAAGGATCCAACATGACAGGCTTTTTCACTTTTGATTTTAC
ACTCAAAGAACTAAAGAAACTAAGGACAAAGCAGAGATACTCTTTCCGCGACCAACAGTA
CAACGGAAAGTATCCTATCATTACATTTGAAGAGTTCATTACCATTGCTCGGGATGCTCC
AAGAGTTGTCGGTATATATCCTGAGATTAAGAATCCAGTTCTAATGAACCAGCATGTCAA
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TGGAGGCTCATATTTGTCCAAGAAATGGCTGA

QA 2 633 2 633
DS 

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GACCTTGGAAGGACACAGTTGTTCCAGTAAGCAACAATTACACGCAAGCCCCAACAGATT
TGGTCAAAAGAGCTCATGCACATAATTTACAGGTGCATCCATACACGTACAGGAATGAAA
ACGAGTTCTTACACTTTAACTTCAGCCAAGATCCATATAAGGAATACGAGTACTGGATCC
ATGAAATTGGTGTTGACGGACTCTTCACCGACTTCACTGGTAGCCTCCATAACTACCAAG
AATGGACATCTCCGTCGTTTGAAACTTCCAAGTCTCCAAGAAAGCTCTTGAGTTAAATTG
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AGAGCATACTTCTATAATACCAAGATGAAGG

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DS 

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CATCAGACGTGTATTTCAATTACATCAAACAATATGTCGTCGGGATCGGACCTTGGAAGG
ACACAGTTGTTCCAGTAAGCAACAATTACACGCAAGCCCCAACAGATTTGGTCAAAAGAG
CTCATGCACATAATCTACAGGTGCATCCATACACGTACAGGAATGAAAACGAGTTTTTAC
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TTGACGGACTCTTCACCGACTTCACTGGTAGCCTCCATAACTACCAAGAATGGACATTTC
CGTTGTTTGAAACTTCCAAGTCTCCAAGAAAGCTCTTGAGTTAAATTGCTTCATTGGTCC
TCCCTTATGCAAAGGCTTGAAATACCACAGATGCGTCTTATAGATCAGATGTGTTTGCTT
ACTTCACAAGATTATACATAAACGCCAAAAAATAACTATGTAAATCTCAGAGCATACTTC
TATAATACCAAGATGAAGGGAAATAATTTCTCG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 3

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GTCGCCAAATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGA
CAACACATCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACT
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GGTTCAGGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGAC
AAGACAAAGGTGCATCTCATTTACGCCAATGTCACATACGATGACATTCTCTTAAGGGAA
GAATTGGAGAGTCTTACAGCCAATTACCAGATCAATTCAAAATTTACTATGTTTTGAACC
AGCCTCCGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCAGGCTC
ATTGCCCTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACA
AGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTTT
GATTGATCCCAAAAAGATGGAACTATTTAGAAAAGAAAAAAAAACGTATTTCTTTGATCA
AATAATTTTTGTTACAATTTCACTGAGACTTGTGTCTTAATTGAGTGAGACTTGTATTTC
TGTTGTGTTATCCCATAGGAAGTTCCGGTTTGCTGATTAACGATTTGGTTAGGCATATTG
TCTTACATGTATCGGTTTGGTTTGATATCATATAAAGACTTGATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI37TF U 1
AF RR4CP09TF U 27
AF RR4CP09JQ C 372
BS 1 44 RR4FI37TF
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BS 565 650 RR4FI37TF
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RD RR4FI37TF 650 0 0
GGACACCACTCCAAAAATATTTGATTCTTTTCATTTGCAATTTGTGATTAAGAGCCAATG
GATACCGAGTTTCTTCGAACCCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGCGTCTTCGTCGCTTTC
GTCGCCGTCAGTGCCGGTGCTGCTTATTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGT
TTGGATCCAGAGAATTTCAAAGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAAT
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GGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGA
CCAAAGGGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGA
GGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGAC
AAGACAAAGGTGCATCTCATTTACGCCAATGTCACATACGATGACATTCT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4CP09TF 627 0 0
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TCGCCAGATTCTCTTGGGCGTCTTCGTTGCTTTCGTCGCCGTCAGTGCCGGTGCTGCTTA
TTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTAGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTT
CAAGCTTGTAAAGAAGCAGCAACTTAGTCACAATGTCGCCAAATTCGTTTTTGAACTCCC
TTCTTCTACTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCAGTTGCAGGGGAAAGGA
TGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACGTTAGATTCAGATCTTGG
ACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGGTGTCTCATCATTTCAGGGA
GATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGGGGAGGTTCAAGTATCAGCC
AGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTTCA
AGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTGCATCTCATTTACGC
CAATGTCACATACGATGACATTCT
CTT

QA 1 624 1 624
DS 

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TCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGGGGAG
GTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCAT
CACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGT
GCATTTCATTTACGCCAATGTCACATACGATGACATTCTCTTAAGGGAAGAATTGGAGAG
TCTTACAGCCAATTACCAGATCAATTCAAAATTTACTATGTTTTGAACCAGCCTCCGGAG
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CCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCT
GCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTTTGATTGATCCCA
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CCCATAGGAAGTTCCGGTTTGCTGATTAACGATTTGGTTAGGCATATTGTCTTACATGTA
TCGGTTTGGTTTGATATCATATAAAGACTTGATAGG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

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GGCCATAACATCTCCGTAAATTCGAAGCAACCAACGGAAACAGAGAGAAAAGCTCCACAA
AACGTTTCTCGGGCCTCTCTAATCATTGTTTTTTTCTTTCAAATCAAAAGTTTTCTCTGT
TTTTCTTTCTTAGAAAAAATTGTTTTCTTTTCGAAAAACAAATCAGAGAAAAGCCGCTTT
GTGTTTTCGATTTTACATTATTGTGTTTATTCTTTAGCTGGAAGGGTGTGTCTGAATAAC
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CCTAAAAAATCCCCACTTGTGTTGAGAATGGTCGTTCTCTTGTTTGTCATGGTATGTGCT
GTCTACATTTGCTCAATCTGTCTTAAGCAAATCGGTGTCGTTCCCAGTGCTGGTTTCTTG
AACGTTGAAGTGTTTGAGAGGCCTTGTCCTGAGCCTAACATCGAACCATGGGACATACCA
TATGTCCATTATCCTAAACCCAAGACATATAGCAGGGAGGAATGTTCGTGCAATCCGGTT
AGGTATTTTGCGATTCTCTCGATGCAGAGATCTGGTAGCGGCTGGTTTGAGACTTTACTA
AACAACCATACTAACATAAGCTCTAACGGGGAGATCTTTTCGGTTAAAGATAGGAGGGCT
AATGTGTCCACCATTTTCGAGACTTTGGACAAAGTGTATAATCTAGATTGGTTGAGTAGT
GCTTCTAAGAATGAGTGTACTTCTGCCGTTGGTTTGAAGTGGATGCTTAATCAGGGTCTA
ATGAAACACCATGAAAAGATAGTAGAATACTTCAAAACCATAGGCGTCTCTGCTATATTC
CTCTTTAGAAGAAACCTCTTGCGCCGGACAATTTCAGTTCTGGCCAATTCTTACGATAGG
GATGCTAAGCTATTGAACGGTACTCACAAGTCCCACACTCATTCCTCTAAAGAGGCTGAG
ATATTGGCGCGCTACAAACCAGTAATCAACACAACCCTTTTAATAGGTGATCTGAAGAAG
GTTCAAGAGATGACTACAAACGCACTTTCTTACTTCAATACCACTCGCCATATCTTCCTC
TATTACGAAGATGTTGTCAAGAACCGAACCAGACTAGGTGGTGTGCAAGAGTTTCTAAAG
GTGCCTAAACTCAATTTAAAGAGTCGGCAAGTGAAGATTCATCACTGTCCTTTGTCACAG
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CTAGTTGAAGATTACCGTAAGTGAATGAAACTAAGACTTAGGAGAGAGTGATGTACATAA
ATCTCTCTCAGAGAATGGTAAGACCATCATCAACTTGTAGGAAAGTTTTGCTAGTGCCAC
GAACAGGTTTTGCAAATCTTTTTAGTTTTCTGTCTTGAATCAAGTTGATAGATTTTATAT
TTGATTCATTCTTTTTTTATCAGGGAACTAAGAGAGTTTATTTTAATCGGAAAAGACGAC
CTGGTTCATCCTCTCTTTATTTGCTTATAATGATTAAATCATCTCGTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR81TF U 1
AF RR4H390TF U 299
AF RR4H390JQ C 816
BS 1 536 RR4BR81TF
BS 537 537 RR4H390TF
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BS 699 956 RR4H390TF
BS 957 1611 RR4H390JQ

RD RR4BR81TF 698 0 0
GGCCATAACATCTCCGTAAATTCGAAGCAACCAACGGAAACAGAGAGAAAAGCTCCACAA
AACGTTTCTCGGGCCTCTCTAATCATTGTTTTTTTCTTTCAAATCAAAAGTTTTCTCTGT
TTTTCTTTCTTAGAAAAAATTGTTTTCTTTTCGAAAAACAAATCAGAGAAAAGCCGCTTT
GTGTTTTCGATTTTACATTATTGTGTTTATTCTTTAGCTGGAAGGGTGTGTCTGAATAAC
TCATTGCCTTTCTCTTCTCTCTCCTTTCTAAATCTCTCTCCTTTCTCTCTCTAAACGGAA
GCAGCCATGGGCGACGAACACTCTCTCAGCAGCCCCAAGGATAGTTTTGTCTTCAAGCTC
CCTAAAAAATCCCCACTTGTGTTGAGAATGGTCGTTCTCTTGTTTGTCATGGTATGTGCT
GTCTACATTTGCTCAATCTGTCTTAAGCAAATCGGTGTCGTTCCCAGTGCTGGTTTCTTG
AACGTTGAAGTGTTTGAGAGGCCTTGTCCTGAGCCTAACATCGAACCATGGGACATTCCA
TATGTCCATTATCCTAAACCCAAGACATATAGCAGGGAGGAATGTTCGTGCAATCCGGTT
AGGTATTTTGCGATTCTCTCGATGCAGAGATCTGGTAGCGGCTGGTTTGAGACTTTACTA
AACAACCGTACTAACATAAGCTC*AACGGGGAGATCTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4H390TF 658 0 0
GG
GCAGCCATGGGCGACGAACACTCTCTCAGCAGTCCCAAGGATAGTTTTGTCTTCAAGCTC
CCTAAAAAATCCCCACTTGTGTTGAGAATGGTCGTTCTCTTGTTTGTGATGGTATGTGCT
GTCTACATTTGCTCAATCTGTCTTAAGCAAATCGGTGTCGTTCCC****CTGGTTTCTTG
AACGTTGAAGTGTTTGAGAGGCCTTGTCCTGAGCCTAACATCGAACCATGGGACATACCA
TATGTCCATTATCCTAAACCCAAGACATATAGCAGGGAGGAATGTTCGTGCAATCCGGTT
AGGTATTTTGCGATTCTCTCGATGCAGAGATCTGGTAGCGGCTGGTTTGAGACTTTACTA
AACAACCATACTAACATAAGCTCTAACGGGGAGATCTTTTCGGTTAAAGATAGGAGGGCT
AATGTGTCCACCATTTTCGAGACTTTGGACAAAGTGTATAATCTAGATTGGTTGAGTAGT
GCTTCTAAGAATGAGTGTACTTCTGCCGTTGGTTTGAAGTGGATGCTTAATCAGGGTCTA
ATGAAACACCATGAAAAGATAGTAGAATACTTCAAAACCATAGGCGTCTCTGCTATATTC
CTCTTTAGAAGAAACCTCTTGCGCCGGACAATTTCAGTTCTGGCCAATTCTTACGA

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR4H390JQ 796 0 0
GAAGTGGATGCTTAATCAGGGTCTAATGAAACACCATGAAAAGATAGTAGAATACTTCAA
AACCATAGGCGTCTCTGCTATATTCCTCTTTAGAAGAAACCTCTTGCGCCGGACAATTTC
AGTTCTGGCCAATTCTTACGATAGGGATGCTAAGCTATTGAACGGTACTCACAAGTCCCA
CACTCATTCCTCTAAAGAGGCTGAGATATTGGCGCGCTACAAACCAGTAATCAACACAAC
CCTTTTAATAGGTGATCTGAAGAAGGTTCAAGAGATGACTACAAACGCACTTTCTTACTT
CAATACCACTCGCCATATCTTCCTCTATTACGAAGATGTTGTCAAGAACCGAACCAGACT
AGGTGGTGTGCAAGAGTTTCTAAAGGTGCCTAAACTCAATTTAAAGAGTCGGCAAGTGAA
GATTCATCACTGTCCTTTGTCACAGCACGTGCAGAATTGGAACGAGGTTCAGACGACACT
GAAAGGGACAGATTATGAGAACTTTCTAGTTGAAGATTACCGTAAGTGAATGAAACTAAG
ACTTAGGAGAGAGTGATGTACATAAATCTCTCTCAGAGAATGGTAAGACCATCATCAACT
TGTAGGAAAGTTTTGCTAGTGCCACGAACAGGTTTTGCAAATCTTTTTAGTTTTCTGTCT
TGAATCAAGTTGATAGATTTTATATTTGATTCATTCTTTTTTTATCAGGGAACTAAGAGA
GTTTATTTTAATCGGAAAAGACGACCTGGTTCATCCTCTCTTTATTTGCTTATAATGATT
AAATCATCTCGTGATG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL2322Contig1 551 4 4 U
CGCAAATCTCAATTACATCGTATTTCATTGACTTATTATTCCATCTCGGAATTTTATTAC
AAAACAAAAGAAAAAACAAGATTACCTTAACTTAAAATCATCGTCAAGGCAGTAAAAGCC
GAACAATATTCTACGTAGAAGAAGACAACAACATAACACACACAAAACATATTGCTTATA
AATATTATAGTAAGACATGTCTCCCGCAGAGGCTATTCTCACCTTTTAGGCGTCGGACGT
GGAAGGAGCTGTGGCATCGTCAGTCGCGGGAGGAGCTGCGGCATCGTCGGACGCAGGGGG
AGCTGTGTCAGCGTCAGCCGGGGTAGGAGCTGTGGCATCCTCGGAGACTGATTTATCGTC
CTTTGATGAGTTAAGTTTGTTCGACAATGGCTTTAACACGAACTCCACCGCCAACCATGC
GACAGCCAAAGCTCCGACAACAACTGTCGTTGTTTGTTTCTTGCCTGAAGGTTTCTCCAG
TTTTGGAAAATGAATTTCTGGTGCTTTATCCATTGCTTCTTCTTCTTCCTCTTCACTTTG
AACGCTTCCCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EP92JQ U 1
AF RR4EP92TF C 1
AF RR4CF13JQ U 2
AF RR4CF13TF C 2
BS 1 130 RR4EP92JQ
BS 131 131 RR4CF13JQ
BS 132 192 RR4EP92JQ
BS 193 551 RR4CF13JQ

RD RR4EP92JQ 193 0 0
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AAAACAAAAGAAAAAACAAGATTACCTTAACTTAAAATCATCGTCAAGGCAGTAAAAGCC
GAACAATATTTTACGTAGAAGAAGACAACAACATAACACACACAAAACATATTGCTTATA
AATATTATAGTA
C

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR4EP92TF 193 0 0
C
GCAAATCTCAATTACATCGTATTTCATTGACTTATTATTCCATCTCGGAATTTTATTACA
AAACAAAAGAAAAAACAAGATTACCTTAACTTAAAATCATCGTCAAGGCAGTAAAAGCCG
AACAATATTTTACGTAGAAGAAGACAACAACATAACACACACAAAACATATTGCTTATAA
ATATTATAGTA
C

QA 2 192 2 192
DS 

RD RR4CF13JQ 550 0 0
GCAAATCTCAATTACATCGTATTTCATTGACTTATTATTCCATCTCGGAATTTTATTACA
AAACAAAAGAAAAAACAAGATTACCTTAACTTAAAATCATCGTCAAGGCAGTAAAAGCCG
AACAATATTCTACGTAGAAGAAGACAACAACATAACACACACAAAACATATTGCTTATAA
ATATTATAGTAAGACATGTCTCCCGCAGAGGCTATTCTCACCTTTTAGGCGTCGGACGTG
GAAGGAGCTGTGGCATCGTCAGTCGCGGGAGGAGCTGCGGCATCGTCGGACGCAGGGGGA
GCTGTGTCAGCGTCAGCCGGGGTAGGAGCTGTGGCATCCTCGGAGACTGATTTATCGTCC
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ACAGCCAAAGCTCCGACAACAACTGTCGTTGTTTGTTTCTTGCCTGAAGGTTTCTCCAGT
TTTGGAAAATGAATTTCTGGTGCTTTATCCATTGCTTCTTCTTCTTCCTCTTCACTTTGA
ACGCTTCCCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4CF13TF 550 0 0
GCAAATCTCAATTACATCGTATTTCATTGACTTATTATTCCATCTCGGAATTTTATTACA
AAACAAAAGAAAAAACAAGATTACCTTAACTTAAAATCATCGTCAAGGCAGTAAAAGCCG
AACAATATTCTACGTAGAAGAAGACAACAACATAACACACACAAAACATATTGCTTATAA
ATATTATAGTAAGACATGTCTCCCGCAGAGGCTATTCTCACCTTTTAGGCGTCGGACGTG
GAAGGAGCTGTGGCATCGTCAGTCGCGGGAGGAGCTGCGGCATCGTCGGACGCAGGGGGA
GCTGTGTCAGCGTCAGCCGGGGTAGGAGCTGTGGCATCCTCGGAGACTGATTTATCGTCC
TTTGATGAGTTAAGTTTGTTCGACAATGGCTTTAACACGAACTCCACCGCCAACCATGCG
ACAGCCAAAGCTCCGACAACAACTGTCGTTGTTTGTTTCTTGCCTGAAGGTTTCTCCAGT
TTTGGAAAATGAATTTCTGGTGCTTTATCCATTGCTTCTTCTTCTTCCTCTTCACTTTGA
ACGCTTCCCC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 4

CO CL2323Contig1 858 4 7 U
GACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTG
GAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTG
AGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACT
AGAGAGCTTTGTCGGAGAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGC
ATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCGGCTAATGGGGGACGTGCTA
TATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAG
CTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACAC
TGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGAG
TCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAG
GACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATATTTGTGGG
CGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTT
CGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGG
TTTTGTTTGTACCATCCTATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAACGCAAAGTGTGTGAT
TATTGGTTCGATTCTGCTGTGTTATTTTTCCCTTTAACTATGAAGGCACGTAATTTGATA
TGTGTGGGATACCTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ13TF U 1
AF RR4HB72TF U 371
AF RR4GD92JQ C 567
AF RR4EQ13JQ C 116
BS 1 591 RR4EQ13TF
BS 592 592 RR4HB72TF
BS 593 686 RR4EQ13TF
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BS 702 839 RR4HB72TF
BS 840 858 RR4EQ13JQ

RD RR4EQ13TF 702 0 0
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GAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTG
AGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACT
AGAGAGCTTTGTCGGAGAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGC
ATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCGGCTAATGGGGGACGTGCTA
TATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAG
CTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACAC
TGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGAG
TCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAG
GACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATGTTTGTGGG
CGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTT
CGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAA*CTCGATTGATTCAA
G

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4HB72TF 469 0 0
G
GAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATG
CGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTT
CGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGT
TATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATATTTGTGGGCGGTATGTTGG
TTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTA
CTAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTTGTA
CCATCCTATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAACGCAAAGTGTGTGATTATTGGTTCGA
TTCTGCTGTGTTATTTTTCCCTTTAACTATGAAGGCACGTAATTTGAT

QA 2 469 2 469
DS 

RD RR4GD92JQ 223 0 0
TTTT
TTGTTCATCAGACAAGGCGATATTTGTGGACGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTC
ATTGGAGAGATTTTTCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCATTTATTAATTTGTATCAAAACTC
GATTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTTGTACCATCCGATCGAGACCGGT
TGAATATGAAAAAAACGCAAAGTGTGTGATTATTGGTTC

QA 5 223 5 223
DS 

RD RR4EQ13JQ 743 0 0
AGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAA
AGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATA
AGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCGGCTAATGGGGGACG
TGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGG
AGAAGCTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGA
AACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGT
CCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTC
TAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATGTTT
GTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAG
GCGTTCGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAATTATGTTTTT
GTGGGTTTTGTTTGTACCATCCTATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAACGCAATGTGT
GTGATTATTGGTTCGATTCTGCTGTGTTATTTTTCCCTTTAACTATGAAGGCACGTAATT
TGATATGTGTGGGATACCTGTTC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL2324Contig1 1011 4 4 U
GAGAGAACGGTGTGTCACCTGAGACCGAGACTTACGACGGGTTGATTGAAGGGTACGGTA
AGCGGGGAATGTACGATGAGATTGTTTCGTGCGTGGAGAGAATGGAGTCTGAGGGGTGTT
TGCGTGACGGCGTTACTTGTAATCTACTCGTGCGCGAGTTTGCTAGAGGAGGGTTGCTTG
GGAGGATGGAGAGAATGTATCAGAGTTTGATGTCGAGGAAGATGACTCTGGAGCCTGTTA
CTTTGGTGTCGATGCTTGAAGCTTATGCGGAGTTTGGGGTGTTGGAGAAGATGGAGGAGA
CGTATGACAAGGTTATGAGGTTTGGGATCTGTCTGGATGAGGAGTTGGTTAGGAGGTTAG
TGTGTGTTTACATTGATAACCTCATGTTCTCGAGGCTCGATGATTTGGGTCGTGGCATTC
GGAGGAGTGATCTGGCTTGGTGTCTGAGGGGTCTATCCCATGCATGTCTTGTGAGTCGGA
AAGGTTTGGATTATGTTGTTAAAGAGATGAGCGAAGAAGCCGGGAGAGTTCCTTGGAGTA
CAAGTTTTGCTAATATCGTGCTGTTAGCTTACTCGAAGATGGGAGATTTCAGGAGCGTTG
AGCTGTTACTCTCCCAGCTACAGAGGAGGAGAGGTGTGAAACTTGATCTTGTGACTGTAG
GAATTGTCTTCGACTTGAGCGTGGGCGTGGCTGGGTTCGATGGTACTGCGGTTTTTATGA
GCTGGAAAAAGAGTGGGTTTCTTGATAAGCCTGTGGAGATGAAGACTGACCCATTGGTTC
ATGCTGCTTTTGGGGAAGGGCAGTTTCTTAGAAGCTGCAATGAAGTGATGAAGCAGTCTC
TTGAAGAATCAAAGTCATGGACTTATCAGTATCTATTAGAAGTTGTGGTTAAAAATCAGA
AAACTGAAACTTAAAGTATGTTAATTTCAGTGTGATGATTGCACAATTACTTCATTTGTG
TAAAGTGACTGACTACTGTTGATAACATATTTATTAACGCTTATTAAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4AM61TF U 1
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AF RR4AJ06JQ C 250
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G
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G
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TGGGGAAGGGCAGTTTCTTAGAAGCTGCAATGAAGTGATGAAGCAGTCTCTTGAAGAATC
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GACTACTGTTGATAACATATTTATTAACGCTTATTAAAACG

QA 2 762 2 762
DS 



AS 1 4

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CTCTAATCTCTAACTCAAATGAGAGAAAGAAGAAGAAAAAGAACAGAGTAGCCCCACCCC
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TCTTCCGTTTGTAGGCCTAAAGAGGTTCTCTTTTGTGTGTTTGTGCGTGTATGAGTTTGT
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AATACGTAGATGCTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AD10TF U 1
AF RR4AP55TF U 1
AF RR4AD10JQ C 536
AF RR4AP55JQ C 550
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BS 750 750 RR4AD10JQ
BS 751 759 RR4AP55TF
BS 760 1395 RR4AD10JQ

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TTGATTTGATTCATGGGCTTACTAGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGG
CCAGATAACGGCCTTGGCAAGCTTCGGAGACACCATACCTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCC
GTCAATGGTACGCCGTGTTTTTGCTGTCTTGAACCGGTGGTTGATCATTATTTCTAACTG
AAAATATAAAAATTAATAAATCTTTAACGTGAAAAAATATAGTATCAACGGCCTGAACTT
CGATCTGGTGTTCTTATAGATCAATCGGACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGTA
TCACCAGAGGATGCCGTGAAGGTAACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGATAC
CAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCACCGGCTGGTTCAACTCCACCGGTATCTCCTTTCTCT
GGTGAGTTTTATTAGTTACCACTTTGCTTCTGTTAATAATTTGGTTAGGTGAAATAGTAC
ACTCACTGATTACGTTTAAGGGTAGTTTCGTCCATACGGTAAAAAAAACTCTGATAGGAG
GAGTAGCATGTTGACACTGTGACTTATGTGATGCATGCAGCATGCTCCTTGATAAGATGA
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TAAATTTGTTGAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAATTAA

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DS 

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AGGAGGAGTAGCATGTTGACACTGTGACTTATGTGATGCATGCAGCATGCTCCTTGATAA
GATGAGATGTGTGACACAGTGAACTCCATCTATGATATCGTTGATTATTCTTGCCCCTTG
ACTGATAAATTTGTTGAATTTTTTTTTTTTTTTT*GAAAATTAAATTTGTTGAATTATGC
GAACCATATCTTGTCAAATGTTGTGATATATACGTAACATACTATTTTCGTGGCTGTTCA
TGTCCCCTTAAAAGACTTGGTCATAGATTTGGTATTTGGACTTTAAGACATGTTATGGTT
TGAAGTGAATGTATATATGAATTTTCGTACTAACGAACTTGGAACCTTTGGGAATGTTAA
CGGAGCAAACGCAGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGAAGGTCGACGTCGGACGC
GTTCGATAAGGGAGCAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCCT
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ACCCCAACACGCTTTCGTTTAGACGACACATCAAGTGGTCCTTCCTTGCATGCAGAGTTC
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TTTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTC
TGTATGTCATCTCGCTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGGAGTGATA
ATAAAAATACGTAGATGCTT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4AP55JQ 846 0 0
TTACGTTTAAGGGTAGTTTCGTCCATACGGTAAAAAAAACTCTGATAGGAGGAGTAGCAT
GTTGACACTGTGACTTATGTGATGCATGCAGCATGCTCCTTGATAAGATGAGATGTGTGA
CACAGTGAACTCCATCTATGATATCGTTGATTATTCTTGCCCCTTGACTGATAAATTTGT
TGAATTTTTTTTTTTTTTTT*GAAAATTAAATTTGTTGAATTATGCGAACCATATCTTGT
CAAATGTTGTGATATATACGTAACATACTATTTTCGTGGCTGTTCATGTCCCCTTAAAAG
ACTTGGTCATAGATTTGGTATTTGGACTTTAAGACATGTTATGGTTTGAAGTGAATGTAT
ATATGAATTTTCGTACTAACGAACTTGGAACCTTTGGGAATGTTAACGGAGCAAACGCAG
GAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGAAGGTCGACGTCGGACGCGTTCGATAAGGGAG
CAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCCTGTGATCTCTAATCT
CTAACTCAAATGAGAGAAAGAAGAAGAAAAAGAACAGAGTAGCCCCACCCCAACACGCTT
TCGTTTAGACGACACATCAAGTGGTCCTTCCTTGCATGCAGAGTTCGTGTTTCTTCCGTT
TGTAGGCCTAAAGAGGTTCTCTTTTGTGTGTTTGTGCGTGTATGAGTTTGTTCTCTGTGT
GTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTCTGTATGTCATCTCG
CTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGGAGTGATAATAAAAATACGTAG
ATGCTT

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 4

CO CL2326Contig1 951 4 9 U
GGGTAGGAAATAATATACAAAATCAAAGGTTAAGAAAAAAAAATGGGTGAGGAGAAGAAG
CAGCAGCACTTCGTGCTAGTACATGGTGCATGCCACGGCGCCTGGTGCTGGTACAAGGTT
AAGCCGCTTCTAGAGGCCGCCGGCCACCGCGTAACCGCCTTAGACCTTGCTGCTTCGGGT
ATAGACACAACCAGGTCTATCACTGAAATCTCCACATGCGAACAATACTCTGAGCCATTG
ATACAGCTAATCGCCTCATTACCAAGTGATGAGAAGGTTGTGCTCGTTGGTCATAGCTTC
GGAGGGTACAGCTTAGCAATGGCCATGGATAAGTTTCCAGACAAAATCTCTGTCTCAGTC
TTCGTGACTGCTTTCATGCCCGATACCAAACACTCACCATCGTTCGTCGTAGATAAGTTT
GCACGGGAGACGCCACCAGAAGCATGGTTGGGCTCGGAGTTAAAACCGTATGGCTCAGAC
AATTCCGGTGTGTCAATGTTTTTCAGCACTGAGTGCATGAAGCACGCTCTCTATCAACTT
TCTCCTGTTGAGGATATTGAGCTTGGATTGCTTCTAAAGAGGCCTGGATCATTGTTCATC
AACGATTTAACCAAGGTGGAGAACTTTTCGGACAGAGGGTATGGATCTGTTCATCGAGCT
TACATTGTGTACAAAGAGGACAAAATAATTACAAAAGAACTTCAATGGTGGATGATTGAT
AATTATCCGGCGAAAGTAGTGAAGGAGATGGAAGACACAGATCATATGCCAATGTTCAGC
AAGCCTCAGTTACTAAGTGACTATCTCTTGGAAATCGCGGAAAAGTTCTCTTAAATTATC
TTGTTATGAAAATGTATTTGGATACAAATAAGTGTTGTCCTGCAAATGGGTCTTTCTAAA
GATCAGGACTTTTATCGCGTTCAATGTTTGACATCTATTTAAAATAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CH02TF U 1
AF RR4CQ73TF U 60
AF RR4CQ73JQ C 162
AF RR4CH02JQ C 170
BS 1 301 RR4CH02TF
BS 302 302 RR4CQ73TF
BS 303 584 RR4CH02TF
BS 585 684 RR4CQ73TF
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BS 727 951 RR4CQ73JQ

RD RR4CH02TF 584 0 0
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CAGCAGCACTTCGTGCTAGTACATGGTGCATGCCACGGCGCCTGGTGCTGGTACAAGGTT
AAGCCGCTTCTAGAGGCCGCCGGCCACCGCGTAACCGCCTTAGACCTTGCTGCTTCGGGT
ATAGACACAACCAGGTCTATCACTGAAATCTCCACATGCGAACAATACTCTGAGCCATTG
ATACAGCTAATCGCCTCATTACCAAGTGATGAGAAGGTTGTGCTCGTTGGTCATAGCTTC
GCAGGGTACAGCTTAGCAATGGCCATGGATAAGTTTCCAGACAAAATCTCTGTCTCAGTC
TTCGTGACTGCTTTCATGCCCGATACCAAACACTCACCATCGTTCGTCGTAGATAAGTTT
GCACGGGAGACGCCACCAGAAGCATGGTTGGGCTCGGAGTTAAAACCGTATGGCTCAGAC
AATTCCGGTGTGTCAATGTTTTTCAGCACTGAGTGCATGAAGCACGCTCTCTATCAACTT
TCTCCTGTTGAGGATATTGAGCTTGGATTGCTTCTAAAGAGGCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4CQ73TF 667 0 0
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TAAGCCGCTTCTAGAGGCCGCCGGCCACCGCGTAACCGCCTTAGACCTTGCTGCTTCGGG
TATAGACACAACCAGGTCTATCACTGAAATCTCCACATGCGAACAATACTCTGAGCCATT
GATACAGCTAATCGCCTCATTACCAAGTGATGAGAAGGTTGTGCTCGTTGGTCATAGCTT
CGGAGGGTACAGCTTAGCAATGGCCATGGATAAGTTTCCAGACAAAATCTCTGTCTCAGT
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TGCACGGGAGACGCCACCAGAAGCATGGTTGGGCTCGGAGTTAAAACCGTATGGCTCAGA
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TTACATTGTGTACAAAGAGGACAAA*TAATTACAAA*GAACTTCAATGGTGGATGATTGA
TAATTAT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CQ73JQ 790 0 0
TAGA
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TACTCTGAGCCATTGATACAGCTAATCGCCTCATTACCAAGTGATGAGAAGGTTGTGCTC
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ATCTCTGTCTCAGTCTTCGTGACTGCTTTCATGCCCGATACCAAACACTCACCATCGTTC
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GGATCATTGTTCATCAACGATTTAACCAAGGTGGAGAACTTTTCGGACAGAGGGTATGGA
TCTGTTCATCGAGCTTACATTGTGTACAAAGAGGACAAAATAATTACAAAAGAACTTCAA
TGGTGGATGATTGATAATTATCCGGCGAAAGTAGTGAAGGAGATGGAAGACACAGATCAT
ATGCCAATGTTCAGCAAGCCTCAGTTACTAAGTGACTATCTCTTGGAAATCGCGGAAAAG
TTCTCTTAAATTATCTTGTTATGAAAATGTATTTGGATACAAATAAGTGTTGTCCTGCAA
ATGGGTCTTTCTAAAGATCAGGACTTTTATCGCGTTCAATGTTTGACATCTATTTAAAAT
AAACTT

QA 5 790 5 790
DS 

RD RR4CH02JQ 782 0 0
CTGCTTCGGGTATAGACACAACCAGGTCTATCACTGAAATCTCCACATGCGAACAATACT
CTGAGCCATTGATACAGCTAATCGCCTCATTACCAAGTGATGAGAAGGTTGTGCTCGTTG
GTCATAGCTTCGGAGGGTACAGCTTAGCAATGGCCATGGATAAGTTTCCAGACAAAATCT
CTGTCTCAGTCTTCGTGACTGCTTTCATGCCCGATACCAAACACTCACCATCGTTCGTCG
TAGATAAGTTTGCACGGGAGACGCCACCAGAAGCATGGTTGGGCTCGGAGTTAAAACCGT
ATGGCTCAGACAATTCCGGTGTGTCAATGTTTTTCAGCACTGAGTGCATGAAGCACGCTC
TCTATCAACTTTCTCCTGTTGAGGATATTGAGCTTGGATTGCTTCTAAAGAGGCCTGGAT
CATTGTTCATCAACGATTTAACCAAGGTGGAGAACTTTTCGGACAGAGGGTATGGATCTG
TTCATCGAGCTTACATTGTGTACAAAGAGGACAAAATAATTACAAAAGAACTTCAATGGT
GGATGATTGATAATTATCCGGCGAAAGTAGTGAAGGAGATGGAAGACACAGATCATATGC
CAATGTTCAGCAAGCCTCAGTTACTAAGTGACTATCTCTTGGAAATCGCGGAAAAGTTCT
CTTAAATTATCTTGTTATGAAAATGTATTTGGATACAAATAAGTGTTGTCCTGCAAATGG
GTCTTTCTAAAGATCAGGACTTTTATCGCGTTCAATGTTTGACATCTATTTAAAATAAAC
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL2327Contig1 996 4 2 U
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AAGGCTTCGAAACGCATCGTTAGTTCTCGTATCCGATAACGATTCCACAATCTCTGACAT
ACGTAAAGCTGTGACTCTGATGAAGAACATTGCTGTTCAGTTGGAGAAAGATAACCAAAC
TGAGAAGGTTAAAGGCCTTGAAAACTCTGTGGCTGAGCTGTTGGAATTGTATGGTGATTG
TGCTCATCGTTCCTCAGCAATTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGGGAACAGTT
AACTGACTTCAAAAAGTTGCTTGACGATGAGTTCACAAAGCTCAAGACTACAACTCCTTC
AGTGACAGAAAATCATAATTTGATGCGACAGTTCAGGGAAGCAGTTTGGAACGTTCATCA
TGCAGGTCAACCAATGCCTGGAGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTG
CCCTTTCCTAAACGTGAAATGCCCTGTAAGCGGGAAGCCTCTCACTGAACTAGCAGATCC
AGTTCGCAGTATGGATTGCAAGCACGTCTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAGC
CACCAATCCCAATGCGAAATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAACAACAA
AGTGGTTTGTGATCCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACA
ATCTAATAGAGACGAAGTGATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGACTAGAAGAG
ATCAAAACATACATCCCCTAGCAAAAGTTGAAACCCATATGTTTCATCAAGTTCGCAACA
TTCTAATTTATATTTTAATCTTATGTTAAAGTCCGCTACTTTTGGATGTAAATAGGCAGT
GTCGCCCTTTGATTCAACTGCTTTGTGTTGGCTAAGTTTGGCTTCTTTCTTTGAGGGAGC
TTATCTCATTTCGGTTTATATTAATCGGTTTGGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AQ07TF U 1
AF RR4AN55TF U 1
AF RR4AN55JQ C 201
AF RR4AQ07JQ C 335
BS 1 861 RR4AN55TF
BS 862 996 RR4AN55JQ

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QA 1 766 1 766
DS 

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ACGTAAAGCTGTGACTCTGATGAAGAACATTGCTGTTCAGTTGGAGAAAGATAACCAAAC
TGAGAAGGTTAAAGGCCTTGAAAACTCTGTGGCTGAGCTGTTGGAATTGTATGGTGATTG
TGCTCATCGTTCCTCAGCAATTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGGGAACAGTT
AACTGACTTCAAAAAGTTGCTTGACGATGAGTTCACAAAGCTCAAGACTACAACTCCTTC
AGTGACAGAAAATCATAATTTGATGCGACAGTTCAGGGAAGCAGTTTGGAACGTTCATCA
TGCAGGTCAACCAATGCCTGGAGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTG
CCCTTTCCTAAACGTGAAATGCCCTGTAAGCGGGAAGCCTCTCACTGAACTAGCAGATCC
AGTTCGCAGTATGGATTGCAAGCACGTCTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAGC
CACCAATCCCAATGCGAAATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAACAACAA
AGTGGTTTGTGATCCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACA
ATCTAATAGAGACGAAGTGATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGACTAGAAGAG
ATCAAAACATACATCCCCTAGCAAAAGTTGAAACCCATATGTTTCATCAAGTTCGCAACA
TTCTAATTTATATTTTAATCT

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR4AN55JQ 796 0 0
AAAACTCTGTGGCTGAGCTGTTGGAATTGTATGGTGATTGTGCTCATCGTTCCTCAGCAA
TTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGGGAACAGTTAACTGACTTCAAAAAGTTGC
TTGACGATGAGTTCACAAAGCTCAAGACTACAACTCCTTCAGTGACAGAAAATCATAATT
TGATGCGACAGTTCAGGGAAGCAGTTTGGAACGTTCATCATGCAGGTCAACCAATGCCTG
GAGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTGCCCTTTCCTAAACGTGAAAT
GCCCTGTAAGCGGGAAGCCTCTCACTGAACTAGCAGATCCAGTTCGCAGTATGGATTGCA
AGCACGTTTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAGCCACCAATCCCAATGCGAAAT
GTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAACAACAAAGTGGTTTGTGATCCAATGC
TCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACAATCTAATAGAGACGAAGTGA
TTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGACTAGAAGAGATCAAAACATACATCCCCTA
GCAAAAGTTGAAACCCATATGTTTCATCAAGTTCGCAACATTCTAATTTATATTTTAATC
TTATGTTAAAGTCCGCTACTTTTGGATGTAAATAGGCAGTGTCGCCCTTTGATTCAACTG
CTTTGTGTTGGCTAAGTTTGGCTTCTTTCTTTGAGGGAGCTTATCTCATTTCGGTTTATA
TTAATCGGTTTGGTTT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4AQ07JQ 662 0 0
ACAAAGCTCAAGACTACAACTCCTTCAGTGACAGAAAATCATAATTTGATGCGACAGTTC
AGGGAAGCAGTTTGGAACGTTCATCATGCAGGTCAACCAATGCCTGGAGACGACGAAGAG
GACATTGTCATGACCAGTACTCAGTGCCCTTTCCTAAACGTGAAATGCCCTGTAAGCGGG
AAGCCTCTCACTGAACTAGCAGATCCAGTTCGCAGTATGGATTGCAAGCACGTTTACGAC
AAAGCCTCAATCATGCATTACATAGCCACCAATCCCAATGCGAAATGTCCTATAGCTGGC
TGCCGAGGTAAACTGAAGAACAACAAAGTGGTTTGTGATCCAATGCTCAAGTTTGAAATC
GAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACAATCTAATAGAGACGAAGTGATTGAAGACTTCACA
AATGCAGACGATGAAGACTAGAAGAGATCAAAACATACATCCCCTAGCAAAAGTTGAAAC
CCATATGTTTCATCAAGTTCGCAACATTCTAATTTATATTTTAATCTTATGTTAAAGTCC
GCTACTTTTGGATGTAAATAGGCAGTGTCGCCCTTTGATTCAACTGCTTTGTGTTGGCTA
AGTTTGGCTTCTTTCTTTGAGGGAGCTTATCTCATTTCGGTTTATATTAATCGGTTTGGT
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL2328Contig1 1306 4 3 U
GTAAGGAAATGGATTTATTCAAGTATAGCCGACATTCCAATTTGATTTGCTAATAAAGAA
GACCGAATGGTTTACAACCCTTTTTAATGTACAAAGGAAGTTCATACCTATCCCTAAAAC
TTGTTTCTTCCACAGTGTTTATCCTTCACATGTTGTTGTTCCTTTATTGTATAGCCTGTT
TGCAAACACCCCTTCTAATCATGTTTCAGTAATATTTGTAATTCTTCCCCCACATTCATT
TGCCACTTGAAACACCTTCCCGTTGTATGGCAACCACAGGCTCGTTACATCTAAGACACC
TGAATGATGCTGATGAAGCGCAGCGGGTCCTTATACAGTAGTAACAGTACCTGTGCTGGC
AAGGTAGAGCAATAAACGGAATTGCAGGATCCACTTGGCAAATGGGGCAAGCAACTGTAT
CCTCTTTATTGTTTGAGGACCTTTCCTTGGCAAATGGACTAAGAATATTCTTTATAGCTG
AAGAGTTGAGCAGCGGAAGAAGCAACAAAAGCATTTCAGAAAATTCATTCCAGACAAGTT
GGCGATTCATGTACTCGAAGCTGACAGATCGGTTCATATGGGGACTATTATAGACAAGCC
TTGTTCTTAAAGCTTTTTCAATGAGGTTCCTATACCTTCCGGTATAAAGAAATGACAAGA
GGTTAAGAAAAGAAGCCGCTTTGTAGAAGCCTTCGATCCGTTGAATGAGGGTCCAGAGCC
GCCTAGCCAGTGGTCTCTGCTCAGAATCACCCCATCTACGGAAAGCAGAAAACGACTGCA
AACGGGAGAAGAGGTACTGACCACCAACAGAGGCAACACAGTACCAAATCTTTTGAGGAG
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CAGAAACTCGTTCATCTCTGTATCTAAGATTCATGAGAGCATTTCCAGGGGTAGGTTTGT
CAACCCAAATAGAGAATCTCCAAATTAGAAACTCTAGGAATGCATCTAGTTCTGGTTCGT
ACTGAAACATCATTCCTGGCTTAGCCAAAGTGAAAACCTTAACCAACTGTTCCTTCAACA
TGGCAGACATTTCAACATCTAGCCTTGCAGCGTCGAACTGATTTACTCTTGAGATTGCAA
CCGCTATAACTGATCGGTGGGAAGAGAGAAGCGATTGAGATTCGGGGAGTAAGCGTTCAT
GAGAACGAATCCAAGCATCGTCGGGAGGCGGAGGCGCCGTCATTGGCAAAGCTTGTTGAA
AGACCTGCGAACTGCCTGCCACCGTCTTATCCAATTTTCTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G837JQ U 1
AF RR4G269JQ U 5
AF RR4G837TF C 514
AF RR4G269TF C 623
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BS 686 738 RR4G269JQ
BS 739 1306 RR4G837TF

RD RR4G837JQ 685 0 0
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GACCGAATGGTTTACAACCCTTTTTAATGTACAAAGGAAGTTCATACCTATCCCTAAAAC
TTGTTTCTTCCACAGTGTTTATCCTTCACATGTTGTTGTTCCTTTATTGTATAGCCTGTT
TGCAAACACCCCTTCTAATCATGTTTCAGTAATATTTGTAATTCTTCCCCCACATTCATT
TGCCACTTGAAACACCTTCCCGTTGTATGGCAACCACAGGCTCGTTACATCTAAGACACC
TGAATGATGCTGATGAAGCGCAGCGGGTCCTTATACAGTAGTAACAGTACCTGTGCTGGC
AAGGTAGAGCAATAAACGGAATTGCAGGATCCACTTGGCAAATGGGGCAAGCAACTGTAT
CCTCTTTATTGTTTGAGGACCTTTCCTTGGCAAATGGACTAAGAATATTCTTTATAGCTG
AAGAGTTGAGCAGCGGAAGAAGCAACAAAAGCATTTCAGAAAATTCATTCCAGACAAGTT
GGCGATTCATGTACTCGAAGCTGACAGATCGGTTCATATGGGGACTATTATAGACAAGCC
TTGTTCTTAAAGCTTTTTCAATGAGGTTCCTATACCTTCCGGTATAAAGAAATGACAAGA
GGTTAAGAAAAGAAGCCGCTTTGTA

QA 1 685 1 685
DS 

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GGAAATGGATTTATTCAAGTATAGCCGACATTCCAATTTGATTTGCTAATAAAGAAGACC
GAATGGTTTACAACCCTTTTTAATGTACAAAGGAAGTT***ACCTATCCCTAAAACTTGT
TTCTTCCACAGTGTTTATCCTTCACATGTTGTTGTTCCTTTATTGTATAGCCTGTTTGCA
AACACCCCTTCTAATCATGTTTCAGTAATATTTGTAATTCTTCCCCCACATTCATTTGCC
ACTTGAAACACCTTCCCGTTGTATGGCAACCACAGGCTCGTTACATCTAAGACACCTGAA
TGATGCTGATGAAGCGCAGCGGGTCCTTATACAGTAGTAACAGTACCTGTGCTGGCAAGG
TAGAGCAATAAACGGAATTGCAGGATCCACTTGGCAAATGGGGCAAGCAACTGTATCCTC
TTTATTGTTTGAGGACCTTTCCTTGGCAAATGGACTAAGAATATTCTTTATAGCTGAAGA
GTTGAGCAGCGGAAGAAGCAACAAAAGCATTTCAGAAAATTCATTCCAGACAAGTTGGCG
ATTCATGTACTCGAAGCTGACAGATCGGTTCATATGGGGACTATTATAGACAAGCCTTGT
TCTTAAAGCTTTTTCAATGAGGTTCCTATACCTTCCGGTATAAAGAAATGACAAGAGGTT
AAGAAAAGAAGCCGCTTTGTAGAAGCCTTCGATCCGTTGAATGAGGGTCCAGAGCCGCCT
AGCCAGTGGTCTCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4G837TF 793 0 0
CATTTCAGAAAATCA
TCCAGACAAGT*GGCGATTCATGTACTCGAAGCTGACAGATCGGTTCATATGGGGACTAT
TATAGACAAGC*TTGTTCTTAAAGCTTTT*CAATGAGGTTCCTATACCTTCCGGTATAAA
GAAATGACAAGAGGTTAAGAAAAGAAGCCGCTTTGTAGAAGCCTTCGATCCGTTGAATGA
GGGTCCAGAGCCGCCTAGCCAGTGGTCTCTGCTCAGAATCACCCCATCTACGGAAAGCAG
AAAACGACTGCAAACGGGAGAAGAGGTACTGACCACCAACAGAGGCAACACAGTACCAAA
TCTTTTGAGGAGCAGAAAGGCCCGGGCCTTCGAGTCCTGTTCTGACTTTCCCAGAGAGTT
GGGGAGCAGCAGCAGAAACTCGTTCATCTCTGTATCTAAGATTCATGAGAGCATTTCCAG
GGGTAGGTTTGTCAACCCAAATAGAGAATCTCCAAATTAGAAACTCTAGGAATGCATCTA
GTTCTGGTTCGTACTGAAACATCATTCCTGGCTTAGCCAAAGTGAAAACCTTAACCAACT
GTTCCTTCAACATGGCAGACATTTCAACATCTAGCCTTGCAGCGTCGAACTGATTTACTC
TTGAGATTGCAACCGCTATAACTGATCGGTGGGAAGAGAGAAGCGATTGAGATTCGGGGA
GTAAGCGTTCATGAGAACGAATCCAAGCATCGTCGGGAGGCGGAGGCGCCGTCATTGGCA
AAGCTTGTTGAAAGACCTGCGAACTGCCTGCCACCGTCTTATCCAATTTTCTTCTCCC

QA 16 793 16 793
DS 

RD RR4G269TF 684 0 0
GAGGTTCCTATACCTTCCGGTATAAAGAAATGACAAGAGGTTAAGAAAAGAAGCCGCTTT
GTAGAAGCCTTCGATCCGTTGAATGAGGGTCCAGAGCCGCCTAGCCAGTGGTCTCTGCTC
AGAATCACCCCATCTACGGAAAGCAGAAAACGACTGCAAACGGGAGAAGAGGTACTGACC
ACCAACAGAGGCAACACAGTACCAAATCTTTTGAGGAGCAGAAAGGCCCGGGCCTTCGAG
TCCTGTTCTGACTTTCCCAGAGAGTTGGGGAGCAGCAGCAGAAACTCGTTCATCTCTGTA
TCTAAGATTCATGAGAGCATTTCCAGGGGTAGGTTTGTCAACCCAAATAGAGAATCTCCA
AATTAGAAACTCTAGGAATGCATCTAGTTCTGGTTCGTACTGAAACATCATTCCTGGCTT
AGCCAAAGTGAAAACCTTAACCAACTGTTCCTTCAACATGGCAGACATTTCAACATCTAG
CCTTGCAGCGTCGAACTGATTTACTCTTGAGATTGCAACCGCTATAACTGATCGGTGGGA
AGAGAGAAGCGATTGAGATTCGGGGAGTAAGCGTTCATGAGAACGAATCCAAGCATCGTC
GGGAGGCGGAGGCGCCGTCATTGGCAAAGCTTGTTGAAAGGCCTGCGAACTGCCTGCCAC
CGTCTTATCCAATTTTCTTCTCCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL2329Contig1 998 2 6 U
TTTTTCACTAGAACACACAAGATGGGTCTCAATGCCTCCCTTTATCTATTCTCCCTCACC
TTCTTACTCATATTTTTCTCTACAGCCACTACAGCAGACAACATCACACAAGCTTTTGAG
AAATACTCCAACTTCAGCACCATGAATGATCTCTTGATCAAAACCAAGCTCAATATACCC
ATAAGCAAATACCTGACCGTAACCTTACTTGCTGTTAGCAACGAAGCCATCAGCCCTATC
GTTAACAGATCCGACGTTGAGGTCAAGAACATCCTTATGAATCATGTCATTCTCGATTAC
TACGATGAGATCAAGTTTAAAGGGATGAAGGAGAAGAGCATAATGCTCACTACCTTATAC
CAAACAACCGGTTTAGGTGAAGAGATGAATGGTTTTCTCAACTGTACCAAATCCAAAGGC
AGAGTTTACTTTGGTTCAGGGGTGAAGGGTTCACCTTTAGTCGCTGAGTATGTCAAGGCT
CTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGGCTCCT
GGACTCAGCCTTGTTATTTTTCCACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCGGCTCCA
TCTCCTCCAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCA
GATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCAACAGAAACAACGGAGGTTGATTCTCCAGCT
CCTACTCCAAGCGCAGACAATGAAAAGATCGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGTCATCCTCT
TCTGCTTGTAAGGCAGGTTTAAGCTTTGTTGTTGTTCTCTTGCTACTATTGTTTGCTAGC
TTTGCTGGTTTCTAATTTTTGGAATTAGGTGATATGGTTTGATGACAATAATGGTAGATG
AGATTCAAAACATTTCTTCTGTAGCAAATAGAAAGATACCACCGTTTGAAGTGTAACATA
AACGCATGCAAAAGTGATGTTTGTCCTGTTGAATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW52TF U 1
AF RR4BW52JQ C 284
BS 1 690 RR4BW52TF
BS 691 691 RR4BW52JQ
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BS 698 723 RR4BW52TF
BS 724 998 RR4BW52JQ

RD RR4BW52TF 723 0 0
TTTTTCACTAGAACACACAAGATGGGTCTCAATGCCTCCCTTTATCTATTCTCCCTCACC
TTCTTACTCATATTTTTCTCTACAGCCACTACAGCAGACAACATCACACAAGCTTTTGAG
AAATACTCCAACTTCAGCACCATGAATGATCTCTTGATCAAAACCAAGCTCAATATACCC
ATAAGCAAATACCTGACCGTAACCTTACTTGCTGTTAGCAACGAAGCCATCAGCCCTATC
GTTAACAGATCCGACGTTGAGGTCAAGAACATCCTTATGAATCATGTCATTCTCGATTAC
TACGATGAGATCAAGTTTAAAGGGATGAAGGAGAAGAGCATAATGCTCACTACCTTATAC
CAAACAACCGGTTTAGGTGAAGAGATGAATGGTTTTCTCAACTGTACCAAATCCAAAGGC
AGAGTTTACTTTGGTTCAGGGGTGAAGGGTTCACCTTTAGTCGCTGAGTATGTCAAGGCT
CTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGGCTCCT
GGACTCAGCCTTGTTATTTTTCCACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCGGCTCCA
TCTCCTCCAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCA
GATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCA*CAGAACCAACGGAGGTTGATTCTCCAGCT
CCT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4BW52JQ 715 0 0
ATGTCATTCTCGATTACTACGATGAGATCAAGTTTAAAGGGATGAAGGAGAAGAGCATAA
TGCTCACTACCTTATACCAAACAACCGGTTTAGGTGAAGAGATGAATGGTTTTCTCAACT
GTACCAAATCCAAAGGCAGAGTTTACTTTGGTTCAGGGGTGAAGGGTTCACCTTTAGTCG
CTGAGTATGTCAAGGCTCTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTA
TGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTTTCCACCTCCACCACCACCTGCTC
CTCCGGCTCCGGCTCCATTTCCTCCAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTG
ATGATGACAATGCCTCAGATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCAACAGAAACAACGG
AGGTTGATTCTCCAGCTCCTACTCCAAGCGCAGACAATGAAAAGATCGAAGCTGCTGATA
AGGCTGGGTCATCCTCTTCTGCTTGTAAGGCAGGTTTAAGCTTTGTTGTTGTTCTCTTGC
TACTATTGTTTGCTAGCTTTGCTGGTTTCTAATTTTTGGAATTAGGTGATATGGTTTGAT
GACAATAATGGTAGATGAGATTCAAAACATTTCTTCTGTAGCAAATAGAAAGATACCACC
GTTTGAAGTGTAACATAAACGCATGCAAAAGTGATGTTTGTCCTGTTGAATTTGG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2330Contig1 1030 4 14 U
GATGCGTACGAAGCGTTGCCGTTTCCTTTCGAGAGCGTGGGGATGGGATCGGAAGGGGAG
CCGTTGAAGCTGGAGATGCCTAAAACGACGTCGTTCGAGGGGATCGTGAGGATGTTTAAG
TCGTGGTCGGCTGTTGTCACGGCGAAAGAGAAAGGTGGTGATTTGTTAACGGAGAGTTTG
GTCAGTGAGCTCGAGACTGCTTGGGGAGGATCTGACGTTATTCGTACTGTCGTTTACAAA
GCGTTTATGATCGCAGGAAAAGTTAGCGTTTGAATCCTCAAACGTTTTAAAATGCGTTTG
CGTCCACTTCTTACATAATAAAATGTTTAATAAAATATAACTCGCACGTAGAAATGAAAT
GACAAATGTGTGTTCTTTGACAAATCAAACAAAAAAATACACTATAATAACGTTCACATA
TATTAAAAACCTCTCATGTTCTGCAACAAAACCACTTAATTAAAAGAAGATAAACTATAA
TCACCTTTCCTTAACCATCATCTTCTTCCTTTAATCAATCTTAACTGAGGAATAGATGAG
TCTTGTGAACCAGAGACAAGCATAGAACCCTATGGTTCCTGTGAGAACGAAGAATGCGTA
AGATGCGATGAGCATGTACCCAAAGTAAAGCATCGCCGAGACCAGTTTGGTGATCTGAAG
CTTTGCGAAGAAGTAGAACGTGGCGTAAAGGAAGAGATAGAGAGCTGATGAGCCTGATGT
TAGGTAAGATCTCCACCACCAAAGGTAGTCCTCACTGCAGAGCTGGAAGTAGCAGAGTAC
TACTGTTATCTCAGCGCAAGTAACGATGAGGATTACAAAGACGAGGAAGAGGAACCCGAA
GATGTAGTAGAACTGGTTGAGCCAGATGGATGTGAGGATGAAGAAGAGCTCGATGAAGAC
TGCCCCAAAAGGTAGGATTCCTCCGATGAGGATTGAGAAAACCGGGTTCATGTACCAAGC
TTGCTCTGGGATTTGCCTTGGGATTTTGTTGGTTTTCACTGGGTCAGCAACCTCTGGTTT
CTTGGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA19TF U 1
AF RR4H282JQ U 386
AF RR4H282TF C 386
AF RR4CG84JQ U 322
BS 1 386 RR4BA19TF
BS 387 560 RR4CG84JQ
BS 561 561 RR4H282JQ
BS 562 639 RR4CG84JQ
BS 640 640 RR4H282JQ
BS 641 665 RR4CG84JQ
BS 666 666 RR4H282JQ
BS 667 675 RR4CG84JQ
BS 676 676 RR4H282JQ
BS 677 734 RR4CG84JQ
BS 735 735 RR4H282JQ
BS 736 802 RR4CG84JQ
BS 803 803 RR4H282JQ
BS 804 1030 RR4CG84JQ

RD RR4BA19TF 386 0 0
GATGCGTACGAAGCGTTGCCGTTTCCTTTCGAGAGCGTGGGGATGGGATCGGAAGGGGAG
CCGTTGAAGCTGGAGATGCCTAAAACGACGTCGTTCGAGGGGATCGTGAGGATGTTTAAG
TCGTGGTCGGCTGTTGTCACGGCGAAAGAGAAAGGTGGTGATTTGTTAACGGAGAGTTTG
GTCAGTGAGCTCGAGACTGCTTGGGGAGGATCTGACGTTATTCGTACTGTCGTTTACAAA
GCGTTTATGATCGCAGGAAAAGTTAGCGTTTGAATCCTCAAACGTTTTAAAATGCGTTTG
CGTCCACTTCTTACATAATAAAATGTTTAATAAAATATAACTCGCACGTAGAAATGAAAT
GACAAATGTGTGTTCTTTGACAAATC

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4H282JQ 567 0 0
CAAACAAAAAAATACACTATAATAACGTTCACATATATTAAAAACCTCTCATGTTCTGCA
ACAAAACCACTTAATTAAAAGAAGATAAACTATAATCACCTTTCCTTAACCATCATCTTC
TTCCTTTAATCAATCTTAACTGAGGAATAGATGAGTCTTGTGAACCAGAGACAAGCATAG
AACCCTATGGTTCCTGTGAGAACGAAGAATGCGTAAGATGCGATGAGCATGTACCCAAAG
TAAAGCATCGCCGAGACCAGTTTGGTGATCTGAAGCTTTGCGAAAAAGTAGAACGTGGCG
TAAAGGAAGAGATAGAGAGCTGATGAGCCTGATGTTAGGTAAGATCTCCACCACCAAAGG
TAGTCCTCACTGCAGAGCTGGAAGTAGCAAAGTACTACTGTTATCTCAGCGCAAGTAACG
ATGAGGATTACAAAGACGAGGAAGAGGAACCCGAAGATGTAGTAGAACTGGTTGAGCCAG
ATGGATGTGAGGATGAAGAAGAGCTCGATGAAGACTGCCCCAAAAGGTAGGATTCCTCCG
ATGAGGATTGAGAAAACCGGGTTCAT
C

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4H282TF 567 0 0
CAAACAAAAAAATACACTATAATAACGTTCACATATATTAAAAACCTCTCATGTTCTGCA
ACAAAACCACTTAATTAAAAGAAGATAAACTATAATCACCTTTCCTTAACCATCATCTTC
TTCCTTTAATCAATCTTAACTGAGGAATAGATGAGTCTTGTGAACCAGAGACAAGCATAG
AACCCTATGGTTCCTGTGAGAACGAAGAATGCGTAAGATGCGATGAGCATGTACCCAAAG
TAAAGCATCGCCGAGACCAGTTTGGTGATCTGAAGCTTTGCGAAGAAGTAGAACGTGGCG
TAGAGGAAGAGATAGAGAGCTGATGAGCCTGATGTTAGGTAAGATCTCCACCACCAAAGG
TAGTCCTCACTGCAGAGCTGGAAGTAGCAGAGTACTACTGTTATCTCAGCGCAAGTAACG
ATGAGGATTACAAAGACGAGGAAGAGGAACCCGAAGATGTAGTAGAACTGGTTGAGCCAG
ATGGATGTGAGGATGAAGAAGAGCTCGATGAAGACTGCCCCAAAAGGTAGGATTCCTCCG
ATGAGGATTGAGAAAACCGGGTTCAT
C

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4CG84JQ 709 0 0
ACTTCCC
AATAAAATATAACTCGCACGTAGAAATGAAATGACAAATGTGTGTTCTTTGACAAATCAA
ACAAAAAAATACACTATAATAACGTTCACATATATTAAAAACCTCTCATGTTCTGCAACA
AAACCACTTAATTAAAAGAAGATAAACTATAATCACCTTTCCTTAACCATCATCTTCTTC
CTTTAATCAATCTTAACTGAGGAATAGATGAGTCTTGTGAACCAGAGACAAGAATAGAAC
CCTATGGTTCCTGTGAGAACGAAGAATGCGTAAGATGCGATGAGCATGTACCCAAAGTAA
AGCATCGCCGAAACCAGTTTGGTGATCTGAAGCTTTGTGAAGAAGTAAAACGTGGCGTAA
AGGAAGAGATAGAGAGCTGATGAGCCTGATGTTAGGTAAGATCTCCGCCACCAAAGGTAG
TCCTCACTGCAGAGCTGGAAGTAGCAGAGTACTACTGTTATCTCAGCGCAAGTAGCGATG
AGGATTACAAAGACGAGGAAGAGGAACCCGAAGATGTAGTAGAACTGGTTGAGCCAGATG
GATGTGAGGATGAAGAAGAGCTCGATGAAGACTGCCCCAAAAGGTAGGATTCCTCCGATG
AGGATTGAGAAAACCGGGTTCATGTACCAAGCTTGCTCTGGGATTTGCCTTGGGATTTTG
TTGGTTTTCACTGGGTCAGCAACCTCTGGTTTCTTGGAACCC

QA 8 709 8 709
DS 



AS 1 4

CO CL2331Contig1 471 4 3 U
GGATTCACTTATCGTTTAAAACCTTCATCAAGACAAATTAACAACTCCTAGAGAAAATGT
CTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTT
GCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCCGGCGAGACCACCACCACCGAGACTCTTGTCC
TCGGCGTTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCGTCTCCG
AGAACGATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAA
GAAGAATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCC
GGTTGTTTTGCCGGCGACGTGAGCCTTGTTCTTCTGTGTGAGTGTGTGTTTATGGTCATA
AGATATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATAAACCAAAATTACT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4A142JQ C 1
AF RR4A142TF U 272
AF RR4A142JQD C 1
AF RR4A142TFB U 1
BS 1 271 RR4A142TFB
BS 272 470 RR4A142TF
BS 471 471 RR4A142JQ

RD RR4A142JQ 471 0 0
GGATTCACTTATCGTTTAAAACCTTCATCAAGACAAATTAACAACTCCTAGAGAAAATGT
CTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTT
GCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCCGGCGAGACCACCACCACCGAGACTCTTGTCC
TCGGCGTTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCGTCTCCG
AGAACGATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAA
GAAGAATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCC
GGTTGTTTTGCCGGCGACGTGAGCCTTGTTCTTCTGTGTGAGTGTGTGTTTATGGTCATA
AGATATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATAAACCAAAATTACT

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4A142TF 200 0 0
CAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAAGAAGAATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGA
TGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCCGGTTGTTTTGCCGGCGACGTGAGCCTTGTTC
TTCTGTGTGAGTGTGTGTTTATGGTCATAAGATATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACT
ATATATAAACCAAAATTAC
T

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR4A142JQD 470 0 0
GGATTCACTTATCGTTTAAAACCTTCATCAAGACAAATTAACAACTCCTAGAGAAAATGT
CTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTT
GCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCCGGCGAGACCACCACCACCGAGACTCTTGTCC
TCGGCGTTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCGTCTCCG
AGAACGATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAA
GAAGAATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCC
GGTTGTTTTGCCGGCGACGTGAGCCTTGTTCTTCTGTGTGAGTGTGTGTTTATGGTCATA
AGATATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATAAACCAAAATTAC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4A142TFB 471 0 0
GGATTCACTTATCGTTTAAAACCTTCATCAAGACAAATTAACAACTCCTAGAGAAAATGT
CTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTT
GCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCCGGCGAGACCACCACCACCGAGACTCTTGTCC
TCGGCGTTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCGTCTCCG
AGAACGATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAA
GAAGAATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCC
GGTTGTTTTGCCGGCGACGTGAGCCTTGTTCTTCTGTGTGAGTGTGTGTTTATGGTCATA
AGATATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATAAACCAAAATTAC
T

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 4

CO CL2332Contig1 911 4 2 U
GGATCCCTCACTTCGCTTCTTTGCCAAGCAACCCACCAAAGCCTCTCAGCTTCATTCTTC
TTCCTTCTCCTCAAGCAAACTCATATTAATTCACCAAAATGTCAGATTCAACTCACCGGA
GAAGAGTTCCGGCCCCTGTCGGAAACGGAGGTCGTAGCCTCAGGACGAAAGGGTCGACGT
CCCGCTACGTTTTTGACAAGCATCCCTCGAAATATACTAGTCAGGTTTTCGATCGAAGTT
TTTCAGATTCCAATCTCAATCGTCGCCGTGACGGAGACGGTAGCTGCATGCGGCGACCAT
CCTTGGCGATGAGCTGTTTACCGACGGAAGAATCAGACCCGATCGCCTACTTGCCAAGGA
AGTCCTGGACCTGTACGAACAATGGTTAAATTGAGTTGCAGCGTCGAAGAAACTATTAAA
CTCGTCCTGGACAAGTATTGCAAAGAAGGACGAACACCAAAACTCGATCAAGGCGCTGCT
TTTGAATT*GCATCATTCTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGATAAAAGAGAAATAATCGG
AGAAATAGGAAGTAGAAGCTTCTACCTTAGAAAGAGAGCTCATGAAACCGGAGTTTGTTT
CGCCGGGATCTCACCGGTGAGAACGAGTCTTATTCC*GTCGTCTAACTTGATTGAATCGT
GTATAGCTCAGTTTATTGGGAAAATCTTGAGGCGAACGAGAAAGTTATGGAACATATTGG
TATGTACGCAATGAGGTTTAACCATACTACACTATACTTTCGAGCGCGGCACATTATATT
TAGTTTGTGTTGCTCCCGATGATCTCATAGAGTAAGAACAGTTTATTATTTTATAAAACT
GTACTATATTTTCTTCATATAGATTGTTACATATGTATTTGTAAGTAAAAACCGGTATTG
GTTTGTAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B811TF U 1
AF RR4B568TF U 7
AF RR4B568JQ C 74
AF RR4B811JQ C 120
BS 1 809 RR4B811TF
BS 810 911 RR4B568JQ

RD RR4B811TF 809 0 0
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TTCCTTCTCCTCAAGCAAACTCATATTAATTCACCAAAATGTCAGATTCAACTCACCGGA
GAAGAGTTCCGGCCCCTGTCGGAAACGGAGGTCGTAGCCTCAGGACGAAAGGGTCGACGT
CCCGCTACGTTTTTGACAAGCATCCCTCGAAATATACTAGTCAGGTTTTCGATCGAAGTT
TTTCAGATTCCAATCTCAATCGTCGCCGTGACGGAGACGGTAGCTGCATGCGGCGACCAT
CCTTGGCGATGAGCTGTTTACCGACGGAAGAATCAGACCCGATCGCCTACTTGCCAAGGA
AGTCCTGGACCTGTACGAACAATGGTTAAATTGAGTTGCAGCGTCGAAGAAACTATTAAA
CTCGTCCTGGACAAGTATTGCAAAGAAGGACGAACACCAAAACTCGATCAAGGCGCTGCT
TTTGAATT*GCATCATTCTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGATAAAAGAGAAATAATCGG
AGAAATAGGAAGTAGAAGCTTCTACCTTAGAAAGAGAGCTCATGAAACCGGAGTTTGTTT
CGCCGGGATCTCACCGGTGAGAACGAGTCTTATTCC*GTCGTCTAACTTGATTGAATCGT
GTATAGCTCAGTTTATTGGGAAAATCTTGAGGCGAACGAGAAAGTTATGGAACATATTGG
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TAGTTTGTGTTGCTCCCGATGATCTCATA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4B568TF 807 0 0
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CTCCTCAAGCAAACTCATATTAATTCACCAAAATGTCAGATTCAACTCACCGGAGAAGAG
TTCCGGCCCCTGTCGGAAACGGAGGTCGTAGCCTCAGGACGAAAGGGTCGACGTCCCGCT
ACGTTTTTGACAAGCATCCCTCGAAATATACTAGTCAGGTTTTCGATCGAAGTTTTTCAG
ATTCCAATCTCAATCGTCGCCGTGACGGAGACGGTAGCTGCATGCGGCGACCATCCTTGG
CGATGAGCTGTTTACCGACGGAAGAATCAGACCCGATCGCCTACTTGCCAAGGAAGTCCT
GGACCTGTACGAACAATGGTTAAATTGAGTTGCAGCGTCGAAGAAACTATTAAACTCGTC
CTGGACAAGTATTGCAAAGAAGGACGAACACCAAAACTCGATCAAGGCGCTGCTTTTGAA
TTTGCATCATTCTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGATAAAAGAGAAATAATCGGAGAAAT
AGGAAGTAGAAGCTTCTACCTTAGAAAGAGAGCTCATGAAACCGGAGTTTGTTTCGCCGG
GATCTCACCGGTGAGAACGAGTCTTATTCCCGTCGTCTAACTTGATTGAATCGTGTATAG
CTCAGTTTATTGGGAAAATCTTGAG*CGAACGAGAAAGTTATGGAACATATTGGTATGTA
CGCAATGAG*TTTAACCATACTACACTATACTTTCGAGCGCGGCACATTATATTTAGTTT
GTGTTGCTCCCGATGATCTCATA
GAGT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4B568JQ 838 0 0
AGCAAACTCATATTAATTCACCAAAATGTCAGATTCAACTCACCGGAGAAGAGTTCCGGC
CCCTGTCGGAAACGGAGGTCGTAGCCTCAGGACGAAAGGGTCGACGTCCCGCTACGTTTT
TGACAAGCATCCCTCGAAATATACTAGTCAGGTTTTCGATCGAAGTTTTTCAGATTCCAA
TCTCAATCGTCGCCGTGACGGAGACGGTAGCTGCATGCGGCGACCATCCTTGGCGATGAG
CTGTTTACCGACGGAAGAATCAGACCCGATCGCCTACTTGCCAAGGAAGTCCTGGACCTG
TACGAACAATGGTTAAATTGAGTTGCAGCGTCGAAGAAACTATTAAACTCGTCCTGGACA
AGTATTGCAAAGAAGGACGAACACCAAAACTCGATCAAGGCGCTGCTTTTGAATT*GCAT
CATTCTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGATAAAAGAGAAATAATCGGAGAAATAGGAAGT
AGAAGCTTCTACCTTAGAAAGAGAGCTCATGAAACCGGAGTTTGTTTCGCCGGGATCTCA
CCGGTGAGAACGAGTCTTATTCC*GTCGTCTAACTTGATTGAATCGTGTATAGCTCAGTT
TATTGGGAAAATCTTGAGGCGAACGAGAAAGTTATGGAACATATTGGTATGTACGCAATG
AGGTTTAACCATACTACACTATACTTTCGAGCGCGGCACATTATATTTAGTTTGTGTTGC
TCCCGATGATCTCATAGAGTAAGAACAGTTTATTATTTTATAAAACTGTACTATATTTTC
TTCATATAGATTGTTACATATGTATTTGTAAGTAAAAACCGGTATTGGTTTGTAACTC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4B811JQ 792 0 0
AGAAGAGTTCCGGCCCCTGTCGGAAACGGAGGTCGTAGCCTCAGGACGAAAGGGTCGACG
TCCCGCTACGTTTTTGACAAGCATCCCTCGAAATATACTAGTCAGGTTTTCGATCGAAGT
TTTTCAGATTCCAATCTCAATCGTCGCCGTGACGGAGACGGTAGCTGCATGCGGCGACCA
TCCTTGGCGATGAGCTGTTTACCGACGGAAGAATCAGACCCGATCGCCTACTTGCCAAGG
AAGTCCTGGACCTGTACGAACAATGGTTAAATTGAGTTGCAGCGTCGAAGAAACTATTAA
ACTCGTCCTGGACAAGTATTGCAAAGAAGGACGAACACCAAAACTCGATCAAGGCGCTGC
TTTTGAATT*GCATCATTCTCATTTCAGCATCCAGTGTTTGGATAAAAGAGAAATAATCG
GAGAAATAGGAAGTAGAAGCTTCTACCTTAGAAAGAGAGCTCATGAAACCGGAGTTTGTT
TCGCCGGGATCTCACCGGTGAGAACGAGTCTTATTCC*GTCGTCTAACTTGATTGAATCG
TGTATAGCTCAGTTTATTGGGAAAATCTTGAGGCGAACGAGAAAGTTATGGAACATATTG
GTATGTACGCAATGAGGTTTAACCATACTACACTATACTTTCGAGCGCGGCACATTATAT
TTAGTTTGTGTTGCTCCCGATGATCTCATAGAGTAAGAACAGTTTATTATTTTATAAAAC
TGTACTATATTTTCTTCATATAGATTGTTACATATGTATTTGTAAGTAAAAACCGGTATT
GGTTTGTAACTC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 2 4

CO CL2333Contig1 580 2 3 U
GGAGAGCGAAAGAGTGACCAGAGAGAGAAGAGAAGATTTAAGCTAAGCGATGGGTGTAGA
GAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGTCAAACCCGCTCCGGGTCAAACCGTCACTGT
CCACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTATCCCAGCAGTTTTGGAGTACCAAGGA
CGCTGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGA
TGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTA
CGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCGAACTCGGTTCTCGACTT
CGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCGCAACAAAAC
TTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTG
TTCAAAACAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGAGTACTTGTCTAAACTCGGTGGACA
ACGTTTTATCTTAAATAAAAGAGCCCGTTACTCTTGTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AH28JQ C 1
AF RR4AH28TF U 1
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BS 572 580 RR4AH28JQ

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GAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGTCAAACCCGCTCCGGGTCAAACCGTCACTGT
CCACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTATCCCAGCAGTTTTGGAGTACCAAGGA
CGCTGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGA
TGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTA
CGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCGAACTCGGTTCTCGACTT
CGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCGCAACAAAAC
TTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTG
TTCAAAACAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGAGTACTTGTCTAAACTCGGTGGACA
ACGTTTTATCTTAAATAAAAGAGCCCGTTACTCTTGTTCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4AH28TF 580 0 0
GG
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AGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGTCAAACCCGCTCCGGGTCAAACCGTCACTGTCC
ACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTATCCCAGCAGTTTTGGAGTACCAAGGACG
CTGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGATG
AAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACG
CATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCGAACTCGGTTCTCGACTTCG
AAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCGCAACAAAACTT
ATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTGTT
CAAAACAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGAGTACTTGTCTAAACTCGGTGGACAAC
GTTTTATCTTAAATAAAAGAGCCCGTTAC
TCTTGTTCC

QA 3 571 3 571
DS 



CO CL2333Contig2 582 2 2 U
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CGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCGGGTC
AAACCGTCACTGTCCACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTATCCCAGCAGTTTT
GGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCA
TCAAAGGATGGGACGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGT
GCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCCAAACT
CTGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTGCTCAGTGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAA
AGCGCAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGGTAACCCTTTTATGTTCATCGCTT
CGGGGATCTTTGTTCAAACAACACTATGTGATGTCACTCTTGTCAGTGCTTGTCTAAACT
CGGTGGACAACGTTTTATCTTAAATAAAAGACCCCGTTACGC


BQ
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AF RR4DY56JQ C 1
AF RR4DY56TF U 1
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QA 1 582 1 582
DS 

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CGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCGGGTC
AAACCGTCACTGTCCACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTATCCCAGCAGTTTT
GGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCA
TCAAAGGATGGGACGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGT
GCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCCAAACT
CTGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTGCTCAGTGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAA
AGCGCAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGGTAACCCTTTTATGTTCATCGCTT
CGGGGATCTTTGTTCAAACAACACTATGTGATGTCACTCTTGTCAGTGCTTGTCTAAACT
CGGTGGACAACGTTTTATCTTAAATAAAAGACCCCGTTAC
GC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

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ACTAAGAAGGGAAAGCTCAGATACTATCCGTACAACATTAACTGGAACTATGGGTTGCTT
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AATGATCCAGTTGATGTTGTTGAGATTGGTGAAACCCAAAGGAAGATAGGGGAAGTTCTA
AAAATCAAGCCTTTAGCTGCTTTAGCTATGATTGATGAAGGAGAGCTAGACTGGAAGATC
GCTGCCATCTCATTGGATGACCCAAAAGCTCATCTTGTGAATGATGTTGATGATGTTGAG
AAGCATTTTCCTGGTACATTAACAGCTATTAAAGACTGGTTTAGAGACTACAAGATCCCA
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AACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4D169TF U 1
AF RR4BL81JQ C 120
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BS 727 844 RR4BL81JQ

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TCTTTT
CTTTCAAAAGG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4BL81JQ 725 0 0
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AAAAATCAAGCCTTTAGCTGCTTTAGCTATGATTGATGAAGGAGAGCTAGACTGGAAGAT
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AGATGGAAAGCCTGCTAACAGGTTCGGTCTTGGAGACAAACCAGCAAACAAAGACTATGC
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TGAGAAATAATAAAAATACATTATTGTAAAAATTTATATTTTGGAAATTATTAAACGAAG
GAACC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 4

CO CL2335Contig1 599 4 2 U
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AGTCCCAGCCATAGTAACATTGACACTAAAGAGGTTCCAGTTTGGGAGTAATAACATGTT
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CGCCCAAAAATGAACTCTGATAAAAACAACAGTTGAAGAAAATACCAATAACCTTCTTCG
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4CI58TF C 1
AF RR4CA43JQ U 10
AF RR4CA43TF C 10
AF RR4CI58JQ U 10
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BS 10 599 RR4CA43JQ

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TGATAGTTTGAAGGTGTTTCAAACTTCTTGCTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCC
AGTCCCAGCCATAGTAACATTGACACTAAAGAGGTTCCAGTTTGGGAGTAATAACATGTT
GTAACGAGACCAAATAATTCCAGTTCATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTT
GTCAGTAGGTTTAGCAAAGTCTGCAATGTTAGCAATGCTGATTCCCCACTTGAACGTTGG
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CGCCGTCGAGAGAGAGAGAGATCGTCGATGGGAAGGAAGGATAACGTCCC

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DS 

RD RR4CA43TF 590 0 0
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GAAGGTGTTTCAAACTTCTTGCTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGC
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CCAAATAATTCCAGTTCATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGG
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CGCCGTCGAGAGAGAGAGAGATCGTCGATGGGAAGGAAGGATAACGTCCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4CI58JQ 590 0 0
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GAAGGTGTTTCAAACTTCTTGCTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGC
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CCAAATAATTCCAGTTCATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGG
TTTAGCAAAGTCTGCAATGTTAGCAATGCTGATTCCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAAAA
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CGTGAATTGTCTCTAGTGTCATCGGCGGCGTGAACAATGCTGGCTCGTTCGTCGTCTCTT
CGCCGTCGAGAGAGAGAGAGATCGTCGATGGGAAGGAAGGATAACGTCCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 4

CO CL2336Contig1 1312 4 7 U
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AGACTAGGGGTACGTATGGTTGATCAGTTTGAGTTTGTCAAGGTTAGAGAGGCGATCACT
GAGTCCTTTGTTGTAAGGGATCACCGTGGAGAATTGTATAGAAAGCATCATCCTCCTTCT
CTGTTCGATGAAGTGTGGAGATTGGAGAAGATAGGGAAAGATGGAGCATTTCACAAACGA
CTGAACTATTCACATATAAACACTGTCAAAGATTTTCTTACACATTTTCATCTAAACTCT
CCAAAACTCGGCAAATTCTTGGTACTGGTATGTCTTCAAAGATGTGGGAAATTACTTTGG
ACCATGCTAGATCTTGTGTTCTTGATAATAGCGTCCACGTGTACCAACCTCATGGCTTTC
AGAAGGAAACTGCTGTTGTCTTCAATGTAGTGGCTCAGGTGCTTGGACTGCTCGTGGATT
TTCAGTATGTTCCTGCTGAGAAGTTATCTGAGATTGAAAAGGCTCAAGCAGAGGAGATGG
TAGTTGCTGCATTGAGTCATATAAACGAAGTAATCTCTTATGATGATGAGTCTTCCATGA
TGAGGAACTTTCTCAACGTCCAGTCTTCTTCTCAAACCAGCGTTGGTGGGATTGATTACT
CCGGTTTGAGTCTGACCAGCTTGGACGGTTATGGTTTTGTGCCGAACCTTCACAGCACAG
CAGAAGGTGGTAGTAGTGGCCATGTTGACATGGACGTTACTCCACAGGGTTTATACGACG
AGTTCAATCTCTGGAACTGCTCTCAGATTCTTGGCTTGGAAGAACCGCAGTCCGATTTGC
AGAGTGCGCTTGAGGGGTTCATGTCGGAGAAGAATGTTGTGGTCGTCGGTAAGGCACACA
GCAGAAGATGGACAAAGCTTTTTAGTGTCTCCAAGTGGCTCTCTGTGTTCAAGAATGTTA
CAGTTAGGAAAAATCTGAAGTGAAAGTTAGTTACAAAGCAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAA
AAGAAACGACTCGCCCTGGACAGATTCGTGTGTGTATATATACAGCTTTGTGAATGTTGG
GGTTTATGATCGTCCAGAGGCGTTCCAAAGTGTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTATTGTTCT
ACTTTGGTTTGTTGCTCTTTCCATCTTTGTGTTGAAGATGTGAATATGTTAGAGAAAGCT
TCATTTTTGGTTGAAGGCTTCAAAAACAGGGTCTTTTGTGTGATCTGTTTGTCAGAAAGT
ACTTCAAGAAGTAGAGAGATACATATCCAGTTTTGGATATTAGTTCCTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA31TF U 1
AF RR4C013TF U 657
AF RR4HA31JQB C 525
AF RR4C013JQ C 1154
BS 1 636 RR4HA31TF
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BS 938 1221 RR4HA31JQB
BS 1222 1312 RR4C013JQ

RD RR4HA31TF 636 0 0
GGTGTTATGGATGAAGTTTCGCTTACCGATAACTCTAGCTGGACTAGGAGCAGGAAGTTC
AGACTAGGGGTACGTATGGTTGATCAGTTTGAGTTTGTCAAGGTTAGAGAGGCGATCACT
GAGTCCTTTGTTGTAAGGGATCACCGTGGAGAATTGTATAGAAAGCATCATCCTCCTTCT
CTGTTCGATGAAGTGTGGAGATTGGAGAAGATAGGGAAAGATGGAGCATTTCACAAACGA
CTGAACTATTCACATATAAACACTGTCAAAGATTTTCTTACACATTTTCATCTAAACTCT
CCAAAACTCGGCAAATTCTTGGTACTGGTATGTCTTCAAAGATGTGGGAAATTACTTTGG
ACCATGCTAGATCTTGTGTTCTTGATAATAGCGTCCACGTGTACCAACCTCATGGCTTTC
AGAAGGAAACTGCTGTTGTCTTCAATGTAGTGGCTCAGGTGCTTGGACTGCTCGTGGATT
TTCAGTATGTTCCTGCTGAGAAGTTATCTGAGATTGAAAAGGCTCAAGCAGAGGAGATGG
TAGTTGCTGCATTGAGTCATATAAACGAAGTAATCTCTTATGATGATGAGTCTTCCATGA
TGAGGAACTTTCTCAACGTCCAGTCTTCTTCTCAAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4C013TF 281 0 0
G
ACTCCGGTTTGAGTCTGACCAGCTTGGACGGTTATGGTTTTGTGCCGAACCTTCACAGCA
CAGCAGAAGGTGGTAGTAGTGGCCATGTTGACATGGACGTTACTCCACAGGGTTTATACG
ACGAGTTCAATCTCTGGAACTGCTCTCAGATTCTTGGCTTGGAAGAACCGCAGTCCGATT
TGCAGAGTGCGCTTGAGGGGTTCATGTCGGAGAAGAATGTTGTGGTCGTCGGTAAGGCGC
ACAGCAGAAGATGGACAAAGCTTTTTAGTGTCTCCAAGTG

QA 2 281 2 281
DS 

RD RR4HA31JQB 697 0 0
CAAGCAGAGGAGATGGTAGTTGCTGCATTGAGTCATATAAACGAAGTAATCTCTTATGAT
GATGAGTCTTCCATGATGAGGAACTTTCTCAACGTCCAGTCTTCTTCTCAAACCAGCGTT
GGTGGGATTGATTACTCCGGTTTGAGTCTGACCAGCTTGGACGGTTATGGTTTTGTGCCG
AACCTTCACAGCACAGCAGAAGGTGGTAGTAGTGGCCATGTTGACATGGACTTTACTCCA
CAGGGTTTATACGACGAGTTCAATCTCTGGAACTGCTCTCTGATTCTTGGCTTGGAAGAA
CCGCAGTCCGATTTGCAGAGTGCGCTTGAGGGGTTCATGTCGGAGAAGAATGTTGTGGTC
GTCGGTAAGGCACACAGCAGAAGATGGACAAAGCTTTTTAGTGTCTCCAAGTGGCTCTCT
GTGTTCAAGAATGTTACAGTTAGGAAAAATCTGAAGTGAAAGTTAGTTACAAAGCAAAAA
AAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACGACTCGCCCTGGACAGATTCGTGTGTGTATATATACA
GCTTTGTGAATGTTGGGGTTTATGATCGTCCAGAGGCGTTCCAAAGTGTTCTTTTTCTTC
TTCTTCTTATTGTTCTACTTTGGTTTGTTGCTCTTTCCATCTTTGTGTTGAAGATGTGAA
TATGTTAGAGAAAGCTTCATTTTTGGTTGAAGGCTTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4C013JQ 159 0 0
GCTCTTTCCATCTTTGTGTTGAAGATGTGAATATGTTAGAGAAAGCTTCATTTTTGGTTG
AAGGCTTCAAAAACAGGGTCTTTTGTGTGATCTGTTTGTCAGAAAGTACTTCAAGAAGTA
GAGAGATACATATCCAGTTTTGGATATTAGTTCCTTGTT

QA 1 159 1 159
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2338Contig1 979 4 7 U
GGACTCATTTGTCTTTCTTCTTCCATTCCGCGCCGCGCGCTCTATCTCACTTCCTCTCAA
AGTAAGCTTCTTCGGTCTTCCTCGTATACTTCCGTCTCGAAACGAGAAATGGCTGAATCC
AAGGTGGTGGTTCCAGAGTCTGCGCTAAAGAAGATCAAGAGGGAGGAGGAATGGGCATTG
GCTAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTGTTGAGACCAGGAAGCTTATC
TTCAAAAGAGCTGAGCAATATGCTAAAGAATACGCCGAGAAGGACAATGAGTTGATCCGT
TAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTGACCCTGAGGCTAAATTGCTCTT
TATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAAAAACCAAGAAGATTCTTCAGCT
CTTGCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAA
CATGTTGCGTCGTGTTGAACCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGTGTTAA
GGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCACTCACTGA
CAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTCGAGGATCTGAT
CCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTT
CCAGTTGAAGGCACCACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTCGAAGGTGG
TGATGCTGGAAACAGAGAGAATTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGGATGAACTGATGAAT
GCCTCCCTTTTTTCTCTTCCCCATTTCATAGTTTTGTTTTGGATCTGAGTCGTGTTTTGT
TTTGACCGTGTGATCTTAGTCGAATATAGGCTTTGATTAATAAACTTTGTTTTTGCTTTC
TATAGTCAATGCTGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D904TF U 1
AF RR4D321JQ C 624
AF RR4D321TF U 624
AF RR4D904JQ C 154
BS 1 694 RR4D904TF
BS 695 695 RR4D321TF
BS 696 730 RR4D904TF
BS 731 731 RR4D321TF
BS 732 740 RR4D904TF
BS 741 960 RR4D321TF
BS 961 979 RR4D904JQ

RD RR4D904TF 749 0 0
GGACTCATTTGTCTTTCTTCTTCCATTCCGCGCCGCGCGCTCTATCTCACTTCCTCTCAA
AGTAAGCTTCTTCGGTCTTCCTCGTATACTTCCGTCTCGAAACGAGAAATGGCTGAATCC
AAGGTGGTGGTTCCAGAGTCTGCGCTAAAGAAGATCAAGAGGGAGGAGGAATGGGCATTG
GCTAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTGTTGAGACCAGGAAGCTTATC
TTCAAAAGAGCTGAGCAATATGCTAAAGAATACGCCGAGAAGGACAATGAGTTGATCCGT
TAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTGACCCTGAGGCTAAATTGCTCTT
TATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAAAAACCAAGAAGATTCTTCAGCT
CTTGCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAA
CATGTTGCGTCGTGTTGAACCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGTGTTAA
GGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCACTCACTGA
CAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTCGAGGATCTGAT
CCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAG*AAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTT
CCAGTTGAAG*CACCACTCG
TGGCCTTAG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4D321JQ 337 0 0
G
AGGAAAGCACAACATCATCTGCGTCGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACC
TCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTTCCAGTTGAAGGCACCACTCGGTGG
CCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTCGAAGGTGGTGATGCTGGAAACAGAGAGAATTT
CATCAACGAGCTTGTCAGGAGGATGAACTGATGAATGCCTCCCTTTTTTCTCTTCCCCAT
TTCATAGTTTTGTTTTGGATCTGAGTCGTGTTTTGTTTTGACCGTGTGATCTTAGTCGAA
TATAGGCTTTGATTAATAAACTTTGTTTTTGCTTTC

QA 2 337 2 337
DS 

RD RR4D321TF 337 0 0
G
AGGAAAGCACAACATCATCTGCGTCGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACC
TCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTTCCAGTTGAAGGCACCACTCGGTGG
CCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTCGAAGGTGGTGATGCTGGAAACAGAGAGAATTT
CATCAACGAGCTTGTCAGGAGGATGAACTGATGAATGCCTCCCTTTTTTCTCTTCCCCAT
TTCATAGTTTTGTTTTGGATCTGAGTCGTGTTTTGTTTTGACCGTGTGATCTTAGTCGAA
TATAGGCTTTGATTAATAAACTTTGTTTTTGCTTTC

QA 2 337 2 337
DS 

RD RR4D904JQ 826 0 0
ATCAAGAGGGAGGAGGAATGGGCATTGGCTAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAG
AAGAGTGTTGAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTGAGCAATATGCTAAAGAATAC
GCCGAGAAGGACAATGAGTTGATCCGTTAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTA
TGTTGACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGA
CCCAAAAACCAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTT
CCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGTTGAACCTTACGTGACTTA
CGGGTACCCAAACTTGAAGAGTGTTAAGGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCT
GAACCACCAGAGGATAGCACTCACTGACAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCA
CAACATCATCTGCGTCGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAA
GGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTTCCAGTTGAAGGCACCACTCGGTGGCCTTAAGAA
GAAGAGAAACCACTACGTCGAAGGTGGTGATGCTGGAAACAGAGAGAATTTCATCAACGA
GCTTGTCAGGAGGATGAACTGATGAATGCCTCCCTTTTTTCTCTTCCCCATTTCATAGTT
TTGTTTTGGATCTGAGTCGTGTTTTGTTTTGACCGTGTGATCTTAGTCGAATATAGGCTT
TGATTAATAAACTTTGTTTTTGCTTTCTATAGTCAATGCTGATCAC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 4

CO CL2339Contig1 642 4 7 U
GGGTTATCTCAACAACCACTGTCTAAAGCCACTGGTTTTGCAACTCTGTTTTTTTTGTCT
AAAGAAACAAGAAGAAGAAGATGCCCACTTTGAATCTATTCACGAACATACCAGTCGACG
CTGTCACATGCTCCGACATCCTCAAGGACGCTACTAAGGCCGTCGCTAAGATCATCGGCA
AACCTGAATCCTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCTGGTA
CCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGGCGTGA
ATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCT
CCCGCTTTTACATCAAGTTCTACGATTCCCCACGACCCTTCTTTGGATTCAACGGATCAA
CTTTCTGAACACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGAGAATTCAACTTCCTAAT
GAAATTATTGTTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGATTCTTGAGCTTGGTTTATAA
TATGGTACTTCCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTTCATATTGTCTTCTGTGACT
AGTTACTATTTCTGATGTGATCTTATTACTAGCAAATTTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT71JQ C 1
AF RR4G477TF U 9
AF RR4AT71TF U 1
AF RR4F301TF U 55
BS 1 10 RR4AT71TF
BS 11 62 RR4G477TF
BS 63 63 RR4AT71TF
BS 64 156 RR4G477TF
BS 157 157 RR4AT71TF
BS 158 582 RR4G477TF
BS 583 642 RR4F301TF

RD RR4AT71JQ 582 0 0
GGGTTATCTCAACAACCACTGTCTAAAGCCACTGGTTTTGCAACTCTGTTTTTTTTGTCT
AAAGAAACAAGAAGAAGAAGATGCCCACTTTGAATCTATTCACGAACATACCAGTCGACG
CTGTCACATGCTCCGACATCCTCAAGGACGCTACTAAGGCCGTCGCTAAGATCATCGGCA
AACCTGAATCCTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCTGGTA
CCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGGCGTGA
ATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCT
CCCGCTTTTACATCAAGTTCTACGATTCCCCACGACCCTTCTTTGGATTCAACGGATCAA
CTTTCTGAACACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGAGAATTCAACTTCCTAAT
GAAATTATTGTTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGATTCTTGAGCTTGGTTTATAA
TATGGTACTTCCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4G477TF 574 0 0
GG
AACAACCACTGTCTAAAGCCACTGGTTTTGCAACTCTGTTTTTTTTGTCTAAGGAAACAA
GAAGAAGAAGATGCCCACTTTGAATCTATTCACGAACATACCAGTCGACGCTGTCACATG
CTCCGACATCCTCAAGGACGCTACTAGGGCCGTCGCTAAGATCATCGGCAAACCTGAATC
CTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCTGGTACCGAGGAACC
TGCTGCTTATGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGGCGTGAATGGGAAGCT
TAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCTCCCGCTTTTA
CATCAAGTTCTACGATTCCCCACGACCCTTCTTTGGATTCAACGGATCAACTTTCTGAAC
ACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGAGAATTCAACTTCCTAATGAAATTATTG
TTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGATTCTTGAGCTTGGTTTATAATATGGTACTT
CCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTTC

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR4AT71TF 582 0 0
GGGTTATCTCAACAACCACTGTCTAAAGCCACTGGTTTTGCAACTCTGTTTTTTTTGTCT
AAAGAAACAAGAAGAAGAAGATGCCCACTTTGAATCTATTCACGAACATACCAGTCGACG
CTGTCACATGCTCCGACATCCTCAAGGACGCTACTAAGGCCGTCGCTAAGATCATCGGCA
AACCTGAATCCTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCTGGTA
CCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGGCGTGA
ATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCT
CCCGCTTTTACATCAAGTTCTACGATTCCCCACGACCCTTCTTTGGATTCAACGGATCAA
CTTTCTGAACACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGAGAATTCAACTTCCTAAT
GAAATTATTGTTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGATTCTTGAGCTTGGTTTATAA
TATGGTACTTCCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4F301TF 588 0 0
GG
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GACGCTGTCACATGCTCCGACATCCTCAAGGACGCTACTAAGGCCGTCGCTAAGATCATC
GGCAAACCTGAATCCTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCT
GGTACCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGTC
GTGAATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGAT
AGCTCCCGCTTTTACATCAAGTTCTACGATTCCCCACGACCCTTCTTTGGATTCAACGGA
TCAACTTTCTGAACACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGAGAATTCAACTTCC
TAATGAAATTATTGTTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGATTCTTGAGCTTGGTTT
ATAATATGGTACTTCCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTTCATATTGTCTTCTGT
GACTAGTTACTATTTCTGATGTGATCTTATTACTAGCAAATTTTAG

QA 3 588 3 588
DS 



AS 1 4

CO CL2340Contig1 1345 4 19 U
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GGTCTTCGAGATGGGGTTTCTGAGGAGAGTAAAAAGCAACCTTCAGAGAAGTTGGACCAG
TTGGTGAAGAAATTGCAGGTGGAGCAAATAAGGTTGACAGGGATCGAGCTTTCACTTAGA
AAGGAGGTTGAAGCAATGAAGCTTGAAACTGACTCTCTTCGCCAAGAGAATGTCTGTCTG
CTGAATCGATTGAAAGGAAATGGGGAAGAGATGGACGTTACAAGGCTTAAGCTAGAGAAT
GAGTTGAAGATGCGTATATGCTACTTGCAAGACCAAGGACTGCCAATGCTAAATGAGAGC
AACCACCTGTGTTACAAGTTACTGAAGTTCATCAAAGGGAAGCTAACTCAGTTTCCAGAA
ACCTCTCAGTCTCAGGATACGGGTTCAGTGAAAGATGGACTAAGCGAGCAGTTTATGATT
GAATCTGAAATGAAAGTCCATGGAATAAGGCGTGGAACTGAAAACCTGAAGAGGAGTTTG
CAAACAGTAACCAGTGTGGTGGCTTCAAATTCTGAATCATCTTGTTCAAGTACTGGTAGG
CCTAAGGAACAAAGAAACCAATCAGTTGAAGAAAACCTTCGAGCAGAACTGAGAGCTGAG
ACCCTAATCACAAGTTTATTACGGGAGAAACTGTACCCCAAGGAACAAGAAATTGAACAG
CTGCAAGCAGAAGTAGCAGCAGCAGTACGAGGCAATGAGATTCTGAGATGCGAGGTTCAA
AACACTTTAGATAACCTATCAGTGAAGACTCACGATGTAAAGGACCTCAAGCTCCAGATG
TTGAAGAAAGAAGAAAACATAAACCGGCTTGAGTTAAATCTCCAGGAAGCCGCGAAAGAC
ATAACGAGCTTGAAAACAGTGTTACCAAAAGTTTTTGATGAAAGAGACCAAATATGGAGG
GAGTTAAGACAATGCTGTGAGAAGAACATGCTGTTGGGCTCAGAGAACGAGACGTTGAGA
GAGACTATAGATAGATTGGAGGAGAAAGTGTTAGAGAAAGAAGGAGAGATCACAATACTA
CAAGACACAATAGGAAGCAAGCGTCTCAACATCTTCTCAAGTCCTGATTTCTAGTATCAC
TTTTCTGTTGTGTTCAGGGATCTGTTTTACACTTGTATCATCATTTTCGATGATGATGAT
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CTATTGCCTTTTGGATTTGCATATCTCAAAGATACAAGAAACGCGCCCAGTGAAATATTA
TATCAAAGATTTGTTTTTTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB05TF U 1
AF RR4BT36TF U 435
AF RR4BL43JQ C 654
AF RR4BT36JQ C 621
BS 1 731 RR4CB05TF
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BS 733 761 RR4CB05TF
BS 762 762 RR4BT36TF
BS 763 793 RR4CB05TF
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BS 795 822 RR4CB05TF
BS 823 825 RR4BT36TF
BS 826 845 RR4CB05TF
BS 846 934 RR4BT36TF
BS 935 935 RR4BT36JQ
BS 936 1093 RR4BT36TF
BS 1094 1094 RR4BT36JQ
BS 1095 1158 RR4BT36TF
BS 1159 1159 RR4BT36JQ
BS 1160 1218 RR4BT36TF
BS 1219 1219 RR4BT36JQ
BS 1220 1228 RR4BT36TF
BS 1229 1345 RR4BT36JQ

RD RR4CB05TF 846 0 0
GTGCACAAATCTGTTGCAAAGTTTCTGAGAACCTGCAAAGAACAAGAGAAGACAATCGAG
GGTCTTCGAGATGGGGTTTCTGAGGAGAGTAAAAAGCAACCTTCAGAGAAGTTGGACCAG
TTGGTGAAGAAATTGCAGGTGGAGCAAATAAGGTTGACAGGGATCGAGCTTTCACTTAGA
AAGGAGGTTGAAGCAATGAAGCTTGAAACTGACTCTCTTCGCCAAGAGAATGTCTGTCTG
CTGAATCGATTGAAAGGAAATGGGGAAGAGATGGACGTTACAAGGCTTAAGCTAGAGAAT
GAGTTGAAGATGCGTATATGCTACTTGCAAGACCAAGGACTGCCAATGCTAAATGAGAGC
AACCACCTGTGTTACAAGTTACTGAAGTTCATCAAAGGGAAGCTAACTCAGTTTCCAGAA
ACCTCTCAGTCTCAGGATACGGGTTCAGTGAAAGATGGACTAAGCGAGCAGTTTATGATT
GAATCTGAAATGAAAGTCCATGGAATAAGGCGTGGAACTGAAAACCTGAAGAGGAGTTTG
CAAACAGTAACCAGTGTGGTGGCTTCAAATTCTGAATCATCTTGTTCAAGTACTGGTAGG
CCTAAGGAACAAAGAAACCAATCAGTTGAAGAAAACCTTCGAGCAGAACTGAGAGCTGAG
ACCCTAATCACAAGTTTATTACGGGAGAAACTGTACCCCAAGGAACAAGAAATTGAACAG
CTGCAAGCAGA*GTAGCAGCAGCAGTACGAGGCAATGAGAT*CTGAGATGCGAGGTTCAA
AACACTTTAGATA*CCTATCAGTGAAGACTCACGATGTAAAGA**CTCAAGCTCCAGATG
TTGAA
A

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4BT36TF 794 0 0
GGATACGGGTTCAGTGAAAGATGGACTAAGCGAGCAGTTTATGATTGAATCTGAAATGAA
AGTCCATGGAATAAGGCGTGGAACTGAAAACCTGAAGAGGAGTTTGCAAACAGTAACCAG
TGTGGTGGCTTCAAATTCTGAATCATCTTGTTCAAGTACTGGTAGGCCTAAGGAACAAAG
AAACCAATCAGTTGAAGAAAACCTTCGAGCAGAACTGAGAGCTGAGACCCTAATCACAAG
TTTATTACGGGAGAAACTGTACTCCAAGGAACAAGAAATTGAACAGCTGCAAGCAGAAGT
AGCAGCAGCAGTACGAGGCAATGAGATTCTGAGATGCGAGGTTCAAAACACTTTAGATAA
CCTATCAGTGAAGACTCACGATGTAAAGGACCTCAAGCTCCAGATGTTGAAGAAAGAAGA
AAACATAAACCGGCTTGAGTTAAATCTCCAGGAAGCCGCGAAAGACATAACGAGCTTGAA
AACAGTGTTACCAAAAGTTTCTGATGAAAGAGACCAAATATGGAGGGAGTTAAGACAATG
CTGTGAGAAGAACATGCTGTTGGGCTCAGAGAACGAGACGTTGAGAGAGACTATAGATAG
ATTGGAGGAGAAAGTGTTAGAGAAAGAAGGAGAGATCACAATACTACAAGACACAATAG*
AAGCAAGCGTCTCAACATCTTCTCAAGTCCTGATTTCTAGTATCACTTTTCTGTTGTGTT
CAGG*ATCTGTTTTACACTTGTATCATCATTTTCGATGATGATGATTAGTCATTCTTTGG
GGTT*ATTCATATA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4BL43JQ 584 0 0
AGCTGAGACCCTAATCACAAGTTTATTACGGGAGAAACTGTACCCCAAGGAACAAGAAAT
TGAACAGCTGCAAGCAGAAGTAGCAGCAGCAGTACGAGGCAATGAGATTCTGAGATGCGA
GGTTCAAAACACTTTAGATAACCTATCAGTGAAGACTCACGATGTAAAGGACCTCAAGCT
CCAGATGTTGAAGAAAGAAGAAAACATAAACCGGCTTGAGTTAAATCTCCAGGAAGCCGC
GAAAGACATAACGAGCTTGAAAACAGTGTTACCAAAAGTTTTTGATGAAAGAGACCAAAT
ATGGAGGGAGTTAAGACAATGCTGTGAGAAGAACATGCTGTTGG*CTCAGAGAACGAGAC
GTTGAGAGAGACTATAGATAGATTGGAGGAGAAAGTGTTAGAGAAAGAAGGAGAGATCAC
AATACTACAAGACACAATAGGAAGCAAGCGTCTCAACATCTTCTCAAGTCCTGATTTCTA
GTATTACTTTTTTGTTGTGTTCAGGGATCTGTTTTACACTTGTATCATCATTTTCGATGA
TGAT***TAGTCATTCTTTGGGGTTTATTCATATATGATTTGTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4BT36JQ 725 0 0
ATCAGTTGAAGAAAACCTTCGAGCAGAACTGAGAGCTGAGACCCTAATCACAAGTTTATT
ACGGGAGAAACTGTACTCCAAGGAACAAGAAATTGAACAGCTGCAAGCAGAAGTAGCAGC
AGCAGTACGAGGCAATGAGATTTTGAGATGCGAGGTTCAAAACACTTTAGATAACCTATC
AGTGAAGACTCACGATGTAAAGGACCTCAAGCTCCAGATGTTGAAGAAAGAAGAAAACAT
AAACCGGCTTGAGTTAAATTTCCAGGAAGCCGCGAAAGACATAACGAGCTTGAAAACAGT
GTTACCAAAAGTTTTTGATGAAAGAGACCAAATATGGAGGGAGTTAAGACAATGCTGTGA
GAAGAACATGCTGTTGGGCTCAGAGAACGAGACGTTGAGAGAGACTATAGATAGATTGGA
GGAGAAAGTGTTAGAGAAAGAAGGAGAGATCACAATACTACAAGACACAATAGGAAGCAA
GCGTCTCAACATCTTCTCAAGTCCTGATTTCTAGTATCACTTTTCTGTTGTGTTCAGGGA
TCTGTTTTACACTTGTATCATCATTTTCGATGATGATGATTAGTCATTCTTTGGGGTTTA
TTCATATATGATTTGTTCATTTTTTTTCTTTTTGCTTTTGCTATTGCCTTTTGGATTTGC
ATATCTCAAAGATACAAGAAACGCGCCCAGTGAAATATTATATCAAAGATTTGTTTTTTT
TATAT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 4

CO CL2341Contig1 693 4 4 U
AAGCAAACTGCGAAGATTTTATAAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCCA
CCAAACCCCAAATTACATAATTAAAACTTAAAAGGAAAAAAGCTAAGAGATTCTCTACAT
ATGCATTCACCAATCTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTAAG
CCTTCTTGGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGCTTCCTCGGTCGACTTAGCAGACT
TCTTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGCAACACACCACCGTGAGCGATCGTGACAC
CACTCAGAAGCTTCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGA
TGATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCCGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCGGCTG
CGAGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAACTCCACCTCCGAGTCTCTGTGCGT
ACCGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGACCGGCTTTGA
TCGATTTCGAAACCGATTTGGTTTTTGGACCGCCGGCTTTCCTTCCTCCGAATGCCTTCT
TCACTTTTCCGGTGGTTTCCATCGCGGCGAAGATCGATTTAGACGAGTGAGATGATTCTA
ATGCAGTGGAAGAGGTTATGAGATTTGTGATCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4H813JQB U 1
AF RR4H813TF C 13
AF RR4B507JQ U 3
AF RR4B507TF C 3
BS 1 21 RR4H813JQB
BS 22 22 RR4B507JQ
BS 23 692 RR4H813JQB
BS 693 693 RR4B507JQ

RD RR4H813JQB 692 0 0
AAGCAAACTGCGAAGATTTTA*AAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCCA
CCAAACCCCAAATTACATAATTAAAACTTAAAAGGAAAAAAGCTAAGAGATTCTCTACAT
ATGCATTCACCAATCTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTAAG
CCTTCTTGGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGCTTCCTCGGTCGACTTAGCAGACT
TCTTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGCAACACACCACCGTGAGCGATCGTGACAC
CACTCAGAAGCTTCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGA
TGATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCCGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCGGCTG
CGAGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAACTCCACCTCCGAGTCTCTGTGCGT
ACCGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGACCGGCTTTGA
TCGATTTCGAAACCGATTTGGTTTTTGGACCGCCGGCTTTCCTTCCTCCGAATGCCTTCT
TCACTTTTCCGGTGGTTTCCATCGCGGCGAAGATCGATTTAGACGAGTGAGATGATTCTA
ATGCAGTGGAAGAGGTTATGAGATTTGTGATC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4H813TF 680 0 0
AAGATTTTA*AAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCCACCAAACCCCAAA
TTACATAATTAAAACTTAAAAGGAAAAAAGCTAAGAGATTCTCTACATATGCATTCACCA
ATCTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTAAGCCTTCTTGGGAG
ACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGCTTCCTCGGTCGACTTAGCAGACTTCTTAGGCAGCA
AAACAGAGTTGATGTTAGGCAACACACCACCGTGAGCGATCGTGACACCACTCAGAAGCT
TCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGATGATCCTCGACT
TCTTGTTGTCTCTCGCCGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCGGCTGCGAGGTACTCGA
GAACGGCGGCCATGTAAACCGGAACTCCACCTCCGAGTCTCTGTGCGTACCGTCCCTTCT
TCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGACCGGCTTTGATCGATTTCGAAA
CCGATTTGGTTTTTGGACCGCCGGCTTTCCTTCCTCCGAATGCCTTCTTCACTTTTCCGG
TGGTTTCCATCGCGGCGAAGATCGATTTAGACGAGTGAGATGATTCTAATGCAGTGGAAG
AGGTTATGAGATTTGTGATC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4B507JQ 691 0 0
GCAAACTGCGAAGATTTTATAAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCCACC
AAACCCCAAATTACATAATTAAAACTTAAAAGGAAAAAAGCTAAGAGATTCTCTACATAT
GCATTCACCAATCTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTAAGCC
TTCTTGGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGCTTCCTCGGTCGACTTAGTAGACTTC
TTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGCAACACGCCACCGTGAGCGATCGTGACACCA
CTCAGAAGCTTCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGATG
ATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCCGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCGGCTGCG
AGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCTCCGAGTCTCTGTGCGTAC
CGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGACCGGCTTTGATC
GATTTCGAAACCGATTTGGTTTTTGGACCGCCGGCTTTCCTTCCTCCGAATGCCTTCTTC
ACTTTTCCGGTGGTTTCCATCGCGGCGAAGATCGATTTA*ACGAGTGAGATGATTCTAAT
GCAGTGGAAGAGGTTATGAGATTTGTGATCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4B507TF 691 0 0
GCAAACTGCGAAGATTTTATAAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCCACC
AAACCCCAAATTACATAATTAAAACTTAAAAGGAAAAAAGCTAAGAGATTCTCTACATAT
GCATTCACCAATCTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTAAGCC
TTCTTGGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGCTTCCTCGGTCGACTTAGTAGACTTC
TTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGCAACACGCCACCGTGAGCGATCGTGACACCA
CTCAGAAGCTTCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGATG
ATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCCGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCGGCTGCG
AGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCTCCGAGTCTCTGTGCGTAC
CGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGACCGGCTTTGATC
GATTTCGAAACCGATTTGGTTTTTGGACCGCCGGCTTTCCTTCCTCCGAATGCCTTCTTC
ACTTTTCCGGTGGTTTCCATCGCGGCGAAGATCGATTTA*ACGAGTGAGATGATTCTAAT
GCAGTGGAAGAGGTTATGAGATTTGTGATC
C

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL2342Contig1 621 4 22 U
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TTAGCATGTGCCACTGTTGCAATAATATCTCATAAGTTTAACACTGAAACTTCAAACATG
AGATCGGACACCTTACTCTCACACACAAAAGAAACTGCAAGAAGTAAAGCAGGTACTGAA
TCGATCAAAGAGGATATCGGGAAAGCAATTCCCTAGTTGCAGCAACTGCATCGCCTTTGT
GCTCCCTTAGTGTTCTCTCCACCACATTCTTCTCCAGCTCGAGTTCGTTTACAATGAGCT
CAACATCTGCAGCATTGATCTTAACAGAAGCCAGTTCCTTCTCCCTCAATCTCTTAGCAT
TCAGATCAGCCTCCCTAGAAGCAACAATCGAAGCCATAGCCGATTGAACACGATTAGAAT
CGAGCTGGCGATCCTCGACGCGATCGGTAAGCTTGTCTAAAGCTTTGCTTTGTTGCTGTA
AGTCCTTTGAATCAACCATTATCTCCGCTCCAGCTTCTTCTCCTCCCTCCATTGCTTCTA
CCTCTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTTTCGGTG
AATCAAGACTCCGGCTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GW50TF C 1
AF RR4GW50JQ U 260
AF RR4BP77JQ U 31
AF RR4BP77TF C 31
BS 1 30 RR4GW50TF
BS 31 261 RR4BP77JQ
BS 262 326 RR4GW50JQ
BS 327 327 RR4BP77JQ
BS 328 341 RR4GW50JQ
BS 342 342 RR4BP77JQ
BS 343 363 RR4GW50JQ
BS 364 364 RR4BP77JQ
BS 365 371 RR4GW50JQ
BS 372 372 RR4BP77JQ
BS 373 377 RR4GW50JQ
BS 378 378 RR4BP77JQ
BS 379 383 RR4GW50JQ
BS 384 384 RR4BP77JQ
BS 385 411 RR4GW50JQ
BS 412 412 RR4BP77JQ
BS 413 416 RR4GW50JQ
BS 417 417 RR4BP77JQ
BS 418 439 RR4GW50JQ
BS 440 440 RR4BP77JQ
BS 441 497 RR4GW50JQ
BS 498 621 RR4BP77JQ

RD RR4GW50TF 535 0 0
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TTAGCATGTGCCACTGTTGCAATAATATCTCATAAGTTTAACACTGAAACTTCAAACATG
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TCGATCAAAGAGGATATCGGGAAAGCAATTCCCTAGTTGCAGCAACTGCATCGCCTTTGT
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CAACATCTGCAGCATTGATCTTAACAGAAGCCAGTTCCTTCTCCCTCAATCTCTTAGCAT
TCAGATCAGCCTCCCTAGAAGCACCAATCGAAGCCATAGCCGATTGAACACGATTAGAAT
CGAGCTGGCGATCCTCGACGCGATCGGTAAGCTTGTCTAAAGCTTTGCTTTGTTGCTGTA
AGTCCTTTGAATCAACCATTATCTCCGCTCCAGCTTCTTCTCATCCCTCCATTGC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4GW50JQ 238 0 0
CC
CCACATTCTTCTCCAGCTCGAGTTCGTTTACAATGAGCTCAACATCTGCAGCATTGATCT
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CACCAATCGAAGCCATAGCCGATTGAACACAATTAAAATCGAGCTGGCGATCCTCGACCC
GATCGGTAAGCTTGTCTAAAGCTTTGCTTTGTTGCTGTAAGTCCTTTGAATCAACC

QA 3 238 3 238
DS 

RD RR4BP77JQ 591 0 0
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GCTTGTCTAAAGCTTTGCTTTGTTGCTGTAAGTCCTTTGAATCAACCATTATCTCCGCTC
CAGCTTCTTCTCCTCCCTCCATTGCTTCTACCTCTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTTTCGGTGAATCAAGACTCCGGCTATCCC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4BP77TF 591 0 0
AATGTTAAAACTTAATATTTTTGTTTTGCTTTAGCATGTGCCACTGTTGCAATAATATCT
CATAAGTTTAACACTGAAACTTCAAACATGAGATCGGACACCTTACTCTCACACACAAAA
GAAACTGCAAGAAGTAAAGCAGGTACTGAATCGATCAAAGAGGATATCGGGAAAGCAATT
CCCTAGTTGCAGCAACTGCATCGCCTTTGTGCTCCCTTAGTGTTCTCTCCACCACATTCT
TCTCCAGCTCGAGTTCGTTTACAATGAGCTCAACATCTGCAGCATTGATCTTAACAGAAG
CCAGTTCCTTCTCCCTCAATCTCTTAGCATTCAGATCAGCCTCCCTAGAAGCAACAATCG
AAGCCATAGCCGATTGAACACGATTAGAATCGAGCTGGCGATCCTCGACGCGATCGGTAA
GCTTGTCTAAAGCTTTGCTTTGTTGCTGTAAGTCCTTTGAATCAACCATTATCTCCGCTC
CAGCTTCTTCTCCTCCCTCCATTGCTTCTACCTCTTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTTTCGGTGAATCAAGACTCCGGCTATCCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 4

CO CL2343Contig1 502 4 6 U
GCAGTTCCCATCTGGAACATACAGTCTCTTCTTCCGTATCCAGCTCGGCAAAACATCAAA
GAGACTCGGAAGGAGAATGTGCAACTCCGAGCACGTTCACGGATGGGACATAAAGCCCGT
TAGGTTCCAGCTGGCAACTTCAGACAACCAACAAGCTGTTTCGCTGCGTTATCTGAACAA
CAACCCTGGACACTGGAGTCACTATCACGTCGGGGATTTCAAAGTGGTGAATCCAAATAT
ATCGACAGGTGTCAAGTTCTCGATGACTCAAATTGATTGCACTCACACGAAAGGTGGCCT
GTGCATAGACTCTGTTCTTATAGTACCTAAAGAAAATGCAAGAAAGGTCGTTGAATCAGA
ATAGTTACTTTTTTTTTGTAGATATGGAGTGAGATTGTTGTAAATGGTGAGAAGACTTTT
TTTTCCTTGTACACATGGTTGGGTTGTCTCTGGTTTTGTCTGTAGTTACAGTGATTGTAA
GAGACTAAAGGTATTGAACTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DD43JQ C 1
AF RR4F977JQ C 54
AF RR4F977TF U 54
AF RR4DD43TF U 1
BS 1 54 RR4DD43TF
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BS 76 76 RR4DD43TF
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BS 416 416 RR4DD43TF
BS 417 502 RR4F977TF

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GCAGTTCCCATCTGGAACATACAGTCTCTTCTTCCGTATCCAGCTCGGCAAAACATCAAA
GAGACTCGGAAGGAGAATGTGCAACTCCGAGCACGTTCACGGATGGGACATAAAGCCCGT
TAGGTTCCAGCTGGCAACTTCAGACAACCAACAAGCTGTTTCGCTGCGTTATCTGAACAA
CAACCCTGGACACTGGAGTCACTATCACGTCGGGGATTTCAAAGTGGTGAATCCAAATAT
ATCGACAGTTGTCAAGTTCTCGATGACTCAAATTGATTGCACTCACACGAAAGGTGGCCT
GTGCATAGACTCTGTTCTTATAGTACCTAAAGAAAATGCAAGAAAGGTCGTTGAATCAGA
ATAGTTACTTTTTTTTTGTAGATATGGAGTGAGATTGTTGTAAATGGTGAGAAGACTTTT
TTTTCCTTGTACACATGGTTGGGTTGTCTCTGGTTTTGTCTGTAGTTACAGTGATTGTAA
GAGACTAAAGGTATTGAACTTG

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4F977JQ 449 0 0
G
ATCAAAGAGACTCGGAAGGAGGATGTGCAACTCCGAGCACGTTCACGGATGGGACATAAA
GCCCGTTAGGTTCCAGCTGGCAACTTCAGACAACCAACAAGCTGTTTCGCTGCGTTATCT
GAACAACAACCCTGGACACTGGAGTCACTATCACGTCGGGGATTTCAAAGTGGTGAATCC
AAATATATCGACAGGTGTCAAGTTCTCGATGACTCAAATTGATTGCACTCACACGAAAGG
TGGCCTGTGCATAGACTCTGTTCTTATAGTACCTAAAGAAAATGCAAGAAAGGTCGTTGA
ATCAGAATAGTTACTTTTTTTTTGTAGATATGGAGTGAGATTGTTGTAAATGGTGAGAAG
ATTTTTTTTTCCTTGTACACATGGTTGGGTTGTCTCTGGTTTTGTCTGTAGTTACAGTGA
TTGTAAGAGACTAAAGGTATTGAACTTG

QA 2 449 2 449
DS 

RD RR4F977TF 449 0 0
G
ATCAAAGAGACTCGGAAGGAGGATGTGCAACTCCGAGCACGTTCACGGATGGGACATAAA
GCCCGTTAGGTTCCAGCTGGCAACTTCAGACAACCAACAAGCTGTTTCGCTGCGTTATCT
GAACAACAACCCTGGACACTGGAGTCACTATCACGTCGGGGATTTCAAAGTGGTGAATCC
AAATATATCGACAGGTGTCAAGTTCTCGATGACTCAAATTGATTGCACTCACACGAAAGG
TGGCCTGTGCATAGACTCTGTTCTTATAGTACCTAAAGAAAATGCAAGAAAGGTCGTTGA
ATCAGAATAGTTACTTTTTTTTTGTAGATATGGAGTGAGATTGTTGTAAATGGTGAGAAG
ATTTTTTTTTCCTTGTACACATGGTTGGGTTGTCTCTGGTTTTGTCTGTAGTTACAGTGA
TTGTAAGAGACTAAAGGTATTGAACTTG

QA 2 449 2 449
DS 

RD RR4DD43TF 502 0 0
GCAGTTCCCATCTGGAACATACAGTCTCTTCTTCCGTATCCAGCTCGGCAAAACATCAAA
GAGACTCGGAAGGAGAATGTGCAACTCCGAGCACGTTCACGGATGGGACATAAAGCCCGT
TAGGTTCCAGCTGGCAACTTCAGACAACCAACAAGCTGTTTCGCTGCGTTATCTGAACAA
CAACCCTGGACACTGGAGTCACTATCACGTCGGGGATTTCAAAGTGGTGAATCCAAATAT
ATCGACAGTTGTCAAGTTCTCGATGACTCAAATTGATTGCACTCACACGAAAGGTGGCCT
GTGCATAGACTCTGTTCTTATAGTACCTAAAGAAAATGCAAGAAAGGTCGTTGAATCAGA
ATAGTTACTTTTTTTTTGTAGATATGGAGTGAGATTGTTGTAAATGGTGAGAAGACTTTT
TTTTCCTTGTACACATGGTTGGGTTGTCTCTGGTTTTGTCTGTAGTTACAGTGATTGTAA
GAGACTAAAGGTATTGAACTTG

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 3

CO CL2344Contig1 786 3 1 U
GTTCTCTTGTGCTCATTTTACAATCCGCTTAAAAGATCAAAGCTTAGTGGATTCACATTA
CACCTATAATACCAAATATTGTTACGAAAATTAATATTAAAAGACGGAAAATATTTTATG
TTTTCCGCAGGGTTCAAGTCCTAGTAGTAGAGCAACGAAGAGCTTCCTGCTCTATTCATC
GG*ACATCTTTTTCCCAGCCAAATCATCAACCGTAAGACTAAGAGGATCCATGGATCCTT
TCTTGAATTCATCCCCACGAGCAGCTAGAAGCTCCTCCACGCTCCCCGGTTCTCCAAACC
AGCCAAGACGGTCTGCAATCAGATGCAGATTATCACACCCCTCGCATCGCACCACCACAA
CGCCCTTCTCGTATGATTCTCGGCTCGCCATCTTCATGGACCTCGTCTCGCATACCTTGC
AGGTGAACACCATCATGAAGTCGTGCCTCGGGTTTATTTTCAACTGGGACTTGTATTTCA
CAATCAGTTCCTCGGAGGCCGTTGCAGGGGGAGTGGAAGGAGCTTTGGAGAGTTCAGCAA
CGGAGTTTGAAGACTTGGTTACTGCAGCAGCTTCACTAGCCTCACGGGATCCACAGAACT
GCCTATGAAGTAATCCCACATACGCATGATCTCTGTTGAAGAGTGACTTCGATTGTGAAA
GCTTACCTGCTTTGAACAGAGGAAGCCGAGGTGGTTGGTTAGTGAGGTAGAGAGATAAGG
CGCGTCTCAGACTAAGAAACCTAGCGGCCATCGACGAGACCTGGTTGTAATCTTCGGCGA
CGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4D186JQ U 25
AF RR4B763TF C 3
AF RR4B763JQ U 1
BS 1 786 RR4B763JQ

RD RR4D186JQ 507 0 0
CCGCTTAAAAGATCAAAGCTTAGTGGATTCACATTACACCTATAATACCAAATATTGTTA
CGAAAATTAATATTAAAAGACAGAAAATATTTTATGTTTTCCGCAGGGTTCAAGTCCTAG
TAGTAGAGCAACGAAGAGCTTCTTGCTCTATCCATCGG*ACATCTTTTTCCCAGCCAAAT
CATCAACCGTAAGACTAAGAGAATCCATGGATCCTTTCTTGAATTCATCCCCACGAGCAG
CTAGAAGCTCCTCCACGCTCCCCGGTTCTCCAAACCAGCCAAGACGGTCTGCAATCAGAT
GCAGATTATCACACCCCTCGCATCGCACCACCACAACGCCCTTCTCGTATGATTCTCGGC
TCGCCATCTTCATGGACCTCGTCTCGCATACCTTGCAGGTGGACACCATCATGAAGTCGT
GC*TCGGGTTTATTTTCAACTGGGACTTGTATTTCACAATCAGTTCCTCGGAGGCCGTTG
CAGGGGGAGTGGAAGGAGCTTTGGAGA

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4B763TF 584 0 0
GTCTC
TGTGCTCATTTTACAATCCGCTTAAAAGATCAAAGCTTAGTGGATTCACATTACACCTAT
AATACCAAATATTGTTACGAAAATTAATATTAAAAGACGGAAAATATTTTATGTTTTCCG
CAGGGTTCAAGTC*TAGTAGTAGAGCAACGAAGAGCTTC*TGCTCTATTCATCGGGACAT
CTTTTTCCCAGCCAAATCATCAACCGTAAGACTAAGAGGATCCATGGATCCTTTCTTGAA
TTCATCCCCACGAGCAGCTAGAAGCTCCTCCACGCTCCCCGGTTCTCCAAACCAGCCAAG
ACGGTCTGCAATCAGATGCAGATTATCACACCCCTCGCATCGCACCACCACAACGCCCTT
CTCGTATGATTCTCGGCTCGCCATCTTCATGGACCTCGTCTCGCATACCTTGCAGGTGAA
CACCATCATGAAGTCGTGCCTCGGGTTTATTTTCAACTGGGACTTGTATTTCACAATCAG
TTCCTCGGAGGCCGTTGCAGGGGGAGTGGAAGGAGCTTTGGAGAGTTCAGCAACGGAGTT
TGAAGACTTGGTTACTGCAGCAGCTTCACTAGCCTCACG

QA 6 584 6 584
DS 

RD RR4B763JQ 786 0 0
GTTCTCTTGTGCTCATTTTACAATCCGCTTAAAAGATCAAAGCTTAGTGGATTCACATTA
CACCTATAATACCAAATATTGTTACGAAAATTAATATTAAAAGACGGAAAATATTTTATG
TTTTCCGCAGGGTTCAAGTCCTAGTAGTAGAGCAACGAAGAGCTTCCTGCTCTATTCATC
GG*ACATCTTTTTCCCAGCCAAATCATCAACCGTAAGACTAAGAGGATCCATGGATCCTT
TCTTGAATTCATCCCCACGAGCAGCTAGAAGCTCCTCCACGCTCCCCGGTTCTCCAAACC
AGCCAAGACGGTCTGCAATCAGATGCAGATTATCACACCCCTCGCATCGCACCACCACAA
CGCCCTTCTCGTATGATTCTCGGCTCGCCATCTTCATGGACCTCGTCTCGCATACCTTGC
AGGTGAACACCATCATGAAGTCGTGCCTCGGGTTTATTTTCAACTGGGACTTGTATTTCA
CAATCAGTTCCTCGGAGGCCGTTGCAGGGGGAGTGGAAGGAGCTTTGGAGAGTTCAGCAA
CGGAGTTTGAAGACTTGGTTACTGCAGCAGCTTCACTAGCCTCACGGGATCCACAGAACT
GCCTATGAAGTAATCCCACATACGCATGATCTCTGTTGAAGAGTGACTTCGATTGTGAAA
GCTTACCTGCTTTGAACAGAGGAAGCCGAGGTGGTTGGTTAGTGAGGTAGAGAGATAAGG
CGCGTCTCAGACTAAGAAACCTAGCGGCCATCGACGAGACCTGGTTGTAATCTTCGGCGA
CGACCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 4

CO CL2345Contig1 905 4 12 U
GGGGAGAACGGAGAGAAGGCGAAAGAAATGGTGGCGTTGAAGCTCCAGAAGCGTATCGCA
GCCTCAGTGCTCAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCAAACGAAGGCAACGAC
ATCGCCATGGCCAACTCTCGCCAAAACATAAGGAGGCTTGTGAACGATGGATTCATCATC
AAGAAGCCAACAAAGATCCACTCACGCTCCAGAGCACGACGCATGAAGATCGCAAAGATG
AAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAGGTTGCCGACT
AAAGTGCTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTGTTGAGGCGTCTCTTGAAGAAGTACCGTGAG
TCTAAGAAGATTGACAGGCACATGTACCATGACATGTACATGAAGGTGAAGGGAAACGTT
TTCAAGAACAAGCGTGTGTTGATGGAGAGTATTCATAAGTCGAAGGCTGAGAAGGCTAGG
GAGAAGACTCTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGTAGAGAG
AGGAAGCATGCTCGTAGAGAGGAGAGACTTGCCATGGGTCCTGGAGGAAATGTACCTGCC
GCCGCACCACCTGCATAAACTGCAGAGGTCCCAGCGAAAAGGTCGAAGAAGTGAGAAGAA
GAATAAGCTTTGTTCTTTAGTGATTTCTTCTTTAGCAGATAATTTTGG****GTTTTTTT
TTTTGTGATTTAGCTTCCTGTCAAAACAGTTTATCTGCGACAAGTTTGAGAGTCTTCTTC
TTTAGTGCTGTCAGCAGTTCGCTGTGTTTTAGTCTTTTAAATACTTTTTTATTTCCTATC
ATCTCAGTAATATGTCCTTTAACGACTTACCTGGTTTTTATCTAAAGAGAAACTATTATT
AGAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4CZ59TF U 1
AF RR4H026TF U 1
AF RR4H026JQ C 51
AF RR4CZ59JQ C 159
BS 1 195 RR4CZ59TF
BS 196 196 RR4H026TF
BS 197 226 RR4CZ59TF
BS 227 685 RR4H026TF
BS 686 686 RR4H026JQ
BS 687 723 RR4H026TF
BS 724 724 RR4H026JQ
BS 725 740 RR4H026TF
BS 741 787 RR4H026JQ
BS 788 788 RR4CZ59JQ
BS 789 851 RR4H026JQ
BS 852 905 RR4CZ59JQ

RD RR4CZ59TF 226 0 0
GGGGAGAACGGAGAGAAGGCGAAAGAAATGGTGGCGTTGAAGCTCCAGAAGCGTATCGCA
GCCTCAGTGCTCAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCAAACGAAGGCAACGAC
ATCGCCATGGCCAACTCTCGCCAAAACATAAGGAGGCTTGTGAACGATGGATTCATCATC
AAGAAGCCAACAAAG*TCCACTCACGCTCCAGAGCACGACGCATGA

QA 1 226 1 226
DS 

RD RR4H026TF 740 0 0
GGGGAGAACGGAGCGAAGGCGAAAGAAATGGTGGCGTTGAAGCTCCAGAAGCGTATCGCA
GCCTCAGTGCTCAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCAAACGAAGGCAACGAC
ATCGCCATGGCCAACTCTCGCCAAAACATAAGGAGGCTTGTGAACGATGGATTCATCATC
AAGAAGCCAACAAAGATCCACTCACGCTCCAGAGCACGACGCATGAAGATCGCAAAGATG
AAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAGGTTGCCGACT
AAAGTGCTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTGTTGAGGCGTCTCTTGAAGAAGTACCGTGAG
TCTAAGAAGATTGACAGGCACATGTACCATGACATGTACATGAAGGTGAAGGGAAACGTT
TTCAAGAACAAGCGTGTGTTGATGGAGAGTATTCATAAGTCGAAGGCTGAGAAGGCTAGG
GAGAAGACTCTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGTAGAGAG
AGGAAGCATGCTCGTAGAGAGGAGAGACTTGCCATGGGTCCTGGAGGAAATGTACCTGCC
GCCGCACCACCTGCATAAACTGCAGAGGTCCCAGCGAAAAGGTCGAAGAAGTGAGAAGAA
GAATAAGCTTTGTTCTTTAGTGATT*CTTCTTTAGCAGATAATTTTGG****GTTTTTTT
TTT*GTGATTTAGCTTCCTG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4H026JQ 802 0 0
GCGTATCGCAGCCTCAGTGCTCAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCAAACGA
AGGCAACGACATCGCCATGGCCAACTCTCGCCAAAACATAAGGAGGCTTGTGAACGATGG
ATTCATCATCAAGAAGCCAACAAAGATCCACTCACGCTCCAGAGCACGACGCATGAAGAT
CGCAAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAG
GTTGCCGACTAAAGTGCTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTGTTGAGGCGTCTCTTGAAGAA
GTACCGTGAGTCTAAGAAGATTGACAGGCACATGTACCATGACATGTACATGAAGGTGAA
GGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTGTTGATGGAGAGTATTCATAAGTCGAAGGCTGA
GAAGGCTAGGGAGAAGACTCTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGC
TAGTAGAGAGAGGAAGCATGCTCGTAGAGAGGAGAGACTTGCCATGGGTCCTGGAGGAAA
TGTACCTGCCGCCGCACCACCTGCATAAACTGCAGAGGTCCCAGCGAAAAGGTCGAAGAA
GTGAGAAGAAGAATAAGCTTTGTTCTTTAGTGATTTCTTCTTTAGCAGATAATTTTGG**
**GTTTTTTTTTTTGTGATTTAGCTTCCTGTCAAAACAGTTTATCTGCGACAAGTTTGAG
AGTCTTCTTCTTTAGTGTTGTCAGCAGTTCGCTGTGTTTTAGTCTTTTAAATACTTTTTT
ATTTCCTATCATCTCAGTAAT
G

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4CZ59JQ 747 0 0
TGTGAACGATGGATTCATCATCAAGAAGCCAACAAAGATCCACTCACGCTCCAGAGCACG
ACGCATGAAGATCGCAAATATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTAC
CAGGGAGGCGAGGTTGCCGACTAAAGTGCTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTGTTGAGGCG
TCTCTTGAAGAAGTACCGTGAGTCTAAGAAGATTGACAGGCACATGTACCATGACATGTA
CATGAAGGTGAAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTGTTGATGGAGAGTATTCATAA
GTCGAAGGCTGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTCTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGC
TAAGAACAAGGCTAGTAGAGAGAGGAAGCATGCTCGTAGAGAGGAGAGACTTGCCATGGG
TCCTGGAGGAAATGTACCTGCCGCCGCACCACCTGCATAAACTGCAGAGGTCCCAGCGAA
AAGGTCGAAGAAGTGAGAAGAAGAATAAGCTTTGTTCTTTAGTGATTTCTTCTTTAGCAG
ATAATTTTGGAACGGTTTTTTTTTTTGTGATTTAGCTTCCTGTCAAAACAGTTTATTTGC
GACAAGTTTGAGAGTCTTCTTCTTTAGTGCTGTCAGCAGTTCGCTGTGTTTTAGTCTTTT
AAATACTTTTTTATTTCCTATCATCTCAGTAATATGTCCTTTAACGACTTACCTGGTTTT
TATCTAAAGAGAAACTATTATTAGAGC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL2346Contig1 1032 2 2 U
GGGGTACGAAATGGCTTAGGTATTGCTCAAACTAGTAACAAGAAAGCCTATCATATCGAG
AAAAACCTAATCTCTTTTCTCTGGCGGCCGCCGCCTCGTGCGGTCGCCGGAAACCAACCG
TTTGTTTTCTTTATTCTTCTTATATTTTTTTCTTTTCTCAGTTATCCTTTTCTATTCTTT
GTTTGCGTTTTGTGGTCGTGGTGAGATCTTTTTGATCATTCTTGGGTCAGATCTTGTAGC
TTACGAGCAGATTCAATGATTTTCGACGGGTATTACGTCGTGTGGCCCCCTGTGTGCTTG
TCTACTCGGTTCTCTATATGGATTTCTAACCAGAGTTTTTAAGAGTTTCTGGCTTCTGGT
GGAACGACGGTCTTGTCGTTAAGTTCTGGATCCTTGTGAAGCGACGGTATTGGTGTTTTG
TTGATTTGCTTGACCTTCTCGACGTTTCGGTGACAGGTTGTTTTTCTCTCCTGTTGAATT
TGTAGCTACTGTTAGGCTATCGTAGGTCAGAATTGGTGGGAATTTTCTTATAGAAACGGA
TCCCCAAAATCTGAGTTTTTCTCAAGCCGCTATTGTGGATAAAAGAAGAGCTAGTTTCAA
GGATCTGAGCTTATGCTTTAACAATTTGGCCTCTTATTTTGGATCTCATATTGATGGAAT
ACATGCGACATAACCAACCGTATTATCTTTATGGACTCCCTTGTTCATGCTCATGATTCT
ATCTTGTATCAATCGCTTTACTCCCACTTGCAAAATAGAGTGGAAGCGGTAAGAGATCAG
TCCTCTGGCTCGTTATGTTCCCCTTGGCTGCAACAACTACTCAGTGAAGAAGCTGGCCAG
TAAGGCTTACCCCTTGAGAAATCGTACAAAAACCAGTTTGTTGGTTGGTACTATCTCAAT
CTTTGGCTTATCTATATGCTTTTTGAGTCCTTAGTGTCACCTACTGGTGATTTCTTTTAG
TTCATTTAGTGTTTTTTTTTTAAACTCATTGTATGAACTTTGTCTTTTTATGGCTTGAAA
CTAAACAGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP84TF U 1
AF RR4DP84JQ C 556
BS 1 759 RR4DP84TF
BS 760 1032 RR4DP84JQ

RD RR4DP84TF 759 0 0
GGGGTACGAAATGGCTTAGGTATTGCTCAAACTAGTAACAAGAAAGCCTATCATATCGAG
AAAAACCTAATCTCTTTTCTCTGGCGGCCGCCGCCTCGTGCGGTCGCCGGAAACCAACCG
TTTGTTTTCTTTATTCTTCTTATATTTTTTTCTTTTCTCAGTTATCCTTTTCTATTCTTT
GTTTGCGTTTTGTGGTCGTGGTGAGATCTTTTTGATCATTCTTGGGTCAGATCTTGTAGC
TTACGAGCAGATTCAATGATTTTCGACGGGTATTACGTCGTGTGGCCCCCTGTGTGCTTG
TCTACTCGGTTCTCTATATGGATTTCTAACCAGAGTTTTTAAGAGTTTCTGGCTTCTGGT
GGAACGACGGTCTTGTCGTTAAGTTCTGGATCCTTGTGAAGCGACGGTATTGGTGTTTTG
TTGATTTGCTTGACCTTCTCGACGTTTCGGTGACAGGTTGTTTTTCTCTCCTGTTGAATT
TGTAGCTACTGTTAGGCTATCGTAGGTCAGAATTGGTGGGAATTTTCTTATAGAAACGGA
TCCCCAAAATCTGAGTTTTTCTCAAGCCGCTATTGTGGATAAAAGAAGAGCTAGTTTCAA
GGATCTGAGCTTATGCTTTAACAATTTGGCCTCTTATTTTGGATCTCATATTGATGGAAT
ACATGCGACATAACCAACCGTATTATCTTTATGGACTCCCTTGTTCATGCTCATGATTCT
ATCTTGTATCAATCGCTTTACTCCCACTTGCAAAATAGA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4DP84JQ 477 0 0
TTTTTCTCAAGCCGCTATTGTGGATAAAAGAAGAGCTAGTTTCAAGGATCTGAGCTTATG
CTTTAACAATTTGGCCTCTTATTTTGGATCTCATATTGATGGAATACATGCGACATAACC
AACCGTATTATCTTTATGGACTCCCTTGTTCATGCTCATGATTCTATCTTGTATCAATCG
CTTTACTCCCACTTGCAAAATAGAGTGGAAGCGGTAAGAGATCAGTCCTCTGGCTCGTTA
TGTTCCCCTTGGCTGCAACAACTACTCAGTGAAGAAGCTGGCCAGTAAGGCTTACCCCTT
GAGAAATCGTACAAAAACCAGTTTGTTGGTTGGTACTATCTCAATCTTTGGCTTATCTAT
ATGCTTTTTGAGTCCTTAGTGTCACCTACTGGTGATTTCTTTTAGTTCATTTAGTGTTTT
TTTTTTAAACTCATTGTATGAACTTTGTCTTTTTATGGCTTGAAACTAAACAGTGTT

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 4

CO CL2347Contig1 820 4 3 U
GAAACGATAACAGGTAACAACCCTGGATCAGACTGATCTAATTAAACCGAACCTTGTTCT
TGTGAGTTACTACATCTGAAATGTCTTTATTACATCGAATCAGAGCCTGCCTGAATAACA
ATACTTTACATGAATAAAAGCTGGTGCCGGAATCACCTGGTTTTGGTTAAACATCTATCT
CGAATTGTTGGTTGTTTGATGAGTCTATGACGCTGCACCGTAACTGACTGTGCCTACTAC
GTTCCGGTGTGCTGCTACTGCAACCGCTGCGGCTCCAGCTGGACCAAACTGTGTTTGTGC
TTGCAACAGATCAATGGCCATATGCGTGTTGTTGTTGTTACTTGATTGGTCAATCTTGGG
GTGCTGTGACTGGAAATAAGGGTTTGGGCGGTTCATAATAGTATCGACGTTTGGTTGGTT
AGTCCTAGCAGGTGGTTGCGGCACGGTGTGATTGTATTGCGGTTTGGGCTGAGAAGAAGC
TTTATCAGGTGTGCTCATCATGGTGTTTGATTTGAAATAACAGTGAGGAGATGATACTGT
GCTTCTGAAATAAGCTTCTTTGAGGTTCCTGCCATTCTCATAAGATGCAGATGGTCTACC
AGATGGTGGTGGTACTCTTGGTGGAGGTCCTGCTCCATTTCTTGAAGGCTGCTCGAAATG
AACACGTCTGCTCTCCGTTGCACGCAAGTTGGGTTGGCTAGTGGAATGGACTACACTTGA
GTGAACTGTAGACCGAGGAAGTGAGACGTGCTTCCTCTCTGGAGGTATAACCGGCCCATT
TCTACTGCTATTCTCCTCTAAGTAATTGAACTGCTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
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30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TTACTACATCTGAAATGTCTTTATTACATCGAATCAGAGCCTGCCTGAATAACAATACTT
TACATGAATAAAAGCTGGTGCCGGAATCACCTGGTTTTGGTTAAACATCTATCTCGAATT
GTTGGTTGTTTGATGAGTCTATGACGCTGCACCGTAACTGACTGTGCCTACTACGTTCCG
GTGTGCTGCTACTGCAACCGCTGCGGCTCCAGCTGGACCAAACTGTGTTTGTGATTGCAA
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TCTGCTCTCCGTTGCACACAAGTTGGGTTGGCTAGTGGAATGGACTACACTTGAGTGAAC
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GCTATTCTCCTCTA

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GGTG
CGGAATCACCTGGTTTTGGTTAAACATCTATCTCGAATTGTAGGTTGTTTGATGAGTCTA
TGACGCTGCACCGTAACTGACTGTGCCTACTACGTTCCGGTGTGCTGCTACTGCAACCGC
TGCGGCTCCAGCTGGACCAAACTGTGTTTGTGCTTGCAACAGATCAATGGCCATATGCGT
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GTGCTTCCTCTCTGGAGGTATGACCGGCCCATTTCTACTGCTATTCTCCTCTAAGTAATT
GAACTGCTTCCTC

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CGCATTTGGAATGAACTCAATCGGGTATGCAGCACGTGTGTTCTCTGTAACAGATTTATC
AGAATAGTCCACTTCTCTAGTGTGCTCATCAAACACAACATTTTCTAAAACTC


BQ
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30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4EJ77TF C 133
AF RR4DL45JQ U 146
AF RR4DL45TF C 200
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C

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AGCTTCAACAGAGTCTCCTTATGTGCTTTCTTATCAAACCACGAGTTGACAGGATCCAAG
ATCTCAGATGGTATCCCTTCGATCTCAGTTGGGATTTCAAACCCAAAGATATCAGTTTTC
TTGTAGTTGGCCTTCAAAAGGCTACCTGAATGGATTGCATCAATGATCTTCCTAGTATAT
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TGCAACATTATGAAAGCTGCACCAAAGCATGCTGAGAATGTTGCTGTTGGTTCCTTGATC
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ACGTTCTTAGGGTGTGGACCAACGCAAGGTATTTTCGCATTTGGAATGAACTCAATCGGG
TATGCAGCACGTGTGTTCTCTGTAACAGATTTATCAGAATAGTCCACTTCTCTAGTGTGC
TCATCAAACACAACATTTTCTAAAACTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DL45TF 694 0 0
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CCTCCCAGCTTCAACAGAGTCTCCTTATGTGCTTTCTTATCAGACCACGAGTTGACAGGA
TCCAAGATCTCAGATGGTATCCCTTCGATCTCAGTTGGGATTTCAAACCCAAAGATATCA
GTTTTCTTGTAGTTGGCCTTCAAAAGGCTACCTGAATGGATTGCATCAATGATCTTCCTA
GTATATGCCAGCTTGATCCTGTTTCCAACACCATAGCTGCCACCAGACCAACCAGTGTTA
ACGAGCCATCCGGTAGCACCTTGTGACTTCATCTTCTCAGCTAGCATAGCTGCATACTTT
GTTGGATGCAACATTATGAAAGCTGCACCAAAGCATGCTGAGAATGTTGCTGTTGGTTCC
TTGATCCCATCCTCTGTTCCAGCAACCAGAGCAGTGTAACCACTGATGAAGTGGTACATG
GTCTGCGCCAGGTTCAGCTTGCTCACAGGTGGGAGAACACCAAAGGCATCACAAGCCAGA
AGTATCACGTTCTTAGGGTGTGGACCAACGCAAGGTATTTTCGCATTTGGAATGAACTCA
ATCGGGTATGCAGCACGTGTGTTCTCTGTAACAGATTTATCAGAATAGTCCACTTCTCTA
GTGTGCTCATCAAACACAACATTTTCTAAAACTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 3

CO CL2349Contig1 703 3 3 U
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TGGCTAAACAGTGTGACTTTTGGAATAAGAGACACAATTCTCCAATCTAAAGTCACGACT
CTTACACACACCTTTTGATACAACATGATAACTTACTTAATAACTAAAGAACTCAATTAC
AAAATAACAACTTATTCGAAGATTTTCAAATATCTTCCAAACACCGTTCCAAAGAGAGGA
AGTAGTTATTGCGGCAGATATTATAAGAGGAATGAAGACCAACCGTAACTTAGAGTTGGA
GAGATGATAGCAACGATTGGTTGATGTTTTCAGATCCTGAGCTGGTGTAACCTAGGAATG
GTGATCTCATTTGAACTGAAGATCTCTGAGATCTCGGTCATGGAACAGTCTCTATACTTG
CGAGGGTTATCTTCTGAGAGGAGCTCTTTGATGGGTCCATATACACGAGGATTCACCTTC
TTGAACGTGGTGAAGAAATATGGCACTGAAACCCTCGGTACAGAAGCAGTATGCGCTAGC
ACCCTATGCTCCGCGCTTATGAACATGTCATTGGTTATGAACTGTAGAAGATCTCCAATG
TTAACGACAAAACATCCAGGGACAGGAGGAACATCAAACCAGGCATCGTCATGGAGAACT
TGAAGCCCTCCTATATTGTCTTGAAGAAGAACGGTGAGAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C148JQ U 2
AF RR4C148TF C 90
AF RR4A475JQ U 1
BS 1 189 RR4A475JQ
BS 190 190 RR4C148JQ
BS 191 703 RR4A475JQ

RD RR4C148JQ 564 0 0
CTGAAACTTATTA
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GACTTTTGGAATAAGAGACACAATTCTCCAATCTAAAGTCACGACTCTTACACACACCTT
TTGATACAACATGATAACTTACTTAATAACTAAAGAACTCAATTACAAAATAACAACTTA
TTCGAAGATTTTCAAATATCTTCCAAACACCGTTCCAAAGAGAGGAAGTAGTTATTGCGG
CAGATATTATAAGAGGAATGAAGACCAACCGTAACTTAGAGTTGGAGAGATGATAGCAAC
GATTGGTTGATGTTTTCAGATCCTGAGCTGGTGTAACCTAGGAATGGTGATCTCATTTGA
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TGAGAGGAGCTCTTTGATGGGTCCATATACACGAGGATTCACCTTCTTGAACGTGGTGAA
GAAATATGGCACTGAAACCCTCGGTACAGAAGCAGTATGCGCTAGCACCCTATGCTCCGC
GCTTATGAAC
C

QA 14 563 14 563
DS 

RD RR4C148TF 476 0 0
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AACTTACTTAATAACTAAAGAACTCAATTACAAAATAACAACTTATTCGAAGATTTTCAA
ATATCTTCCAAACACCGTTCCAAAGAGAGGAAGTAGTTATTGCGGCAGATATTATAAGAG
GAATGAAGACCAACCGTAACTTAGAGTTGGAGAGATGATAGCAACGATTGGTTGATGTTT
TCAGATCCTGAGCTGGTGTAACCTAGGAATGGTGATCTCATTTGAACTGAAGATCTCTGA
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GATGGGTCCATATACACGAGGATTCACCTTCTTGAACGTGGTGAAGAAATATGGCACTGA
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C

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4A475JQ 703 0 0
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TGGCTAAACAGTGTGACTTTTGGAATAAGAGACACAATTCTCCAATCTAAAGTCACGACT
CTTACACACACCTTTTGATACAACATGATAACTTACTTAATAACTAAAGAACTCAATTAC
AAAATAACACCTTATTCGAAGATTTTCAAATATCTTCCAAACACCGTTCCAAAGAGAGGA
AGTAGTTATTGCGGCAGATATTATAAGAGGAATGAAGACCAACCGTAACTTAGAGTTGGA
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GTGATCTCATTTGAACTGAAGATCTCTGAGATCTCGGTCATGGAACAGTCTCTATACTTG
CGAGGGTTATCTTCTGAGAGGAGCTCTTTGATGGGTCCATATACACGAGGATTCACCTTC
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ACCCTATGCTCCGCGCTTATGAACATGTCATTGGTTATGAACTGTAGAAGATCTCCAATG
TTAACGACAAAACATCCAGGGACAGGAGGAACATCAAACCAGGCATCGTCATGGAGAACT
TGAAGCCCTCCTATATTGTCTTGAAGAAGAACGGTGAGAAAAG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL2350Contig1 1152 4 11 U
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TGACATAGGTGGCCGGCGGCGATCTTGGTCGTCGGTCACCCCCACCTTTGTTTGTGTTTT
GTTTTTTGATGTATCATATTCAGTCTCCGGATTGACTCTTCTTCCGCTCAGTCGGATCCT
TTTCTTCCCTCGGGGATTTTAACTTTTCTTTTATTTTCTTCGTTCGGCGAATTAGTCTTT
TTGTTGTGCTTGTCGATTCAGTCAGAGTGTATGTTCGTGGTTTTCTTATTCTCTTATTCT
CTGTTTTGGATCGACCAAAAAGTTCCAATCTTTATGATTGGAGTTGAGAGTCTCTCTGTG
TTTACATATCCTAATCCGACTGATCTCTATTCAATTGGAATCATTTTTCTTGACTGGAGC
CCTGTTCTTTTAGAAGACGCTGCGTCAATGGCTTGCGGCCAAATATATAACTGTTTTTTT
CGTCACTTATCTGGAGAGTAACACCGGCGACGGTACTTTT*GCCTATCAATAATAATCGC
AGCAATCATCTAACTGCCGCTACTTTTAACAGCGTCACAAAACAATTCCGGAAACCTTCG
CGAAACTAATCGCAGCGTGAACTTGATTAATTTCCATCATCCTTTTGTTTATTTTGTTGT
TTAGTTTTTGGCCGCAAGCGGCTGCGTCCGCGTCGTCCAAAAGAACAGAGCTTGGGTAAT
TTCGTACTGACTAGTACCCGCAATCTATTGGGCGGGGCATCTTCGAGTTGTATACCGAAG
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AGAGAGACTTCTCGTTGGTATTGGGGTTTCTTTCAGAGGCTGATCGACGGAGATAGACGG
AACCGAGGAGGGAAAATTAGCAAAGTCGTGGTGGAGACGCTCATCCAAGGCTGAAATTAC
CGCTTCATCTGCAGAGGACACGTGTTGATACGCCTGGATCAAGTTGCTTCAATCACTCGA
CGCGTGGCCTTTAAGTAGATATCTTTCTCGAGTTTTCCATTATATCTCTCTGTTTATTGG
ATCTCTTTTGTATTTATATGTATCCCAATACTCTTTGCAGCCCATTGGGCTTTTAATGAA
AAAAATGTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR76TF U 44
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AF RR4G781JQ C 418
AF RR4CR76JQ C 483
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BS 697 980 RR4G781JQ
BS 981 981 RR4CR76JQ
BS 982 1138 RR4G781JQ
BS 1139 1139 RR4CR76JQ
BS 1140 1144 RR4G781JQ
BS 1145 1152 RR4CR76JQ

RD RR4CR76TF 598 0 0
CTTTCAATACAAAACTTTGACATAGGTGGCCGGCGGCGATCTTGGTCGTCGGTCACCCCC
ACCTTTGTTTGTGTTTTGTTTTTTGATGTATCATATTCAGTCTCCGGATTGACTCTTCTT
CCGCTCAGTCGGATCCTTTTCTTCCCTCGGGGATTTTAACTTTTCTTTTATTTTCTTCGT
TCGGCGAATTAGTCTTTTTGTTGTGCTTGTCGATTCAGTCAGAGTGTATGTTCGTGGTTT
TCTTATTCTCTTATTCTCTGTTTTGGATCGACCAAAAAGTTCCAATCTTTATGATTGGAG
TTGAGAGTCTCTCTGTGTTTACATATCCTAATCCGACTGATCTCTATTCAATTGGAATCA
TTTTTCTTGACTGGAGCCCTGTTCTTTTAGAAGACGCTGCGTCAATGGCTTGCGGCCAAA
TATATAACTGTTTTTTTCGTCACTTATCTGGAGAGTAACACCGGCGACGGTACTTTTTGC
CTATCAATAATAATCGCAGCAATCATCTAACTGCCGCTACTTTTAACAGCGTCACAAAAC
AATTCCGGAAACCTTCGCGAAACTAATCGCAGCGTGAACTTGATTAATTTCCATCATC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4G781TF 696 0 0
GGATTCTCTCTCTAGAATTCGTTCTAACCTCTTTCTAGAAAAACTTTCAATACAAAACTT
TGACATAGGTGGCCGGCGGCGATCTTGGTCGTCGGTCACCCCCACCTTTGTTTGTGTTTT
GTTTTTTGATGTATCATATTCAGTCTCCGGATTGACTCTTCTTCCGCTCAGTCGGATCCT
TTTCTTCCCTCGGGGATTTTAACTTTTCTTTTATTTTCTTCGTTCGGCGAATTAGTCTTT
TTGTTGTGCTTGTCGATTCAGTCAGAGTGTATGTTCGTGGTTTTCTTATTCTCTTATTCT
CTGTTTTGGATCGACCAAAAAGTTCCAATCTTTATGATTGGAGTTGAGAGTCTCTCTGTG
TTTACATATCCTAATCCGACTGATCTCTATTTCATTGGAATCATTTTTCTTGACTGGAGC
CCTGTTCTTTTAGAAGACGCTGCGTCAATGGCTTGCGGCCAAATATATAACTGTTTTTTT
CGTCACTTATCTGGAGAGTAACACCGGCGACGGTACTTTT*GCCTATCAATAATAATCGC
AGCAATCATCTAACTGCCGCTACTTTTAACAGCGTCACAAAACAATTCCGGAAACCTTCG
CGAAACTAATCGCAGCGTGAACTTGATTAATTTCCATCATCCTTTTGTTTATTTTGTTGT
TTAGTTTT*GGCCGCAAGCGGCTGCGTCCGCGTCGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4G781JQ 734 0 0
AGCCCTGTTCTTTTAGAAGACGCTGCGTCAATGGCTTGCGGCCAAATATATAACTGTTTT
TTTCGTCACTTATCTGGAGAGTAACACCGGCGACGGTACTTTT*GCCTATCAATAATAAT
CGCAGCAATCATCTAACTGCCGCTACTTTTAACAGCGTCACAAAACAATTCCGGAAACCT
TCGCGAAACTAATCGCAGCGTGAACTTGATTAATTTCCATCATCCTTTTGTTTATTTTGT
TGTTTAGTTTTTGGCCGCAAGCGGCTGCGTCCGCGTCGTCCAAAAGAACAGAGCTTGGGT
AATTTCGTACTGACTAGTACCCGCAATCTATTGGGCGGGGCATCTTCGAGTTGTATACCG
AAGATACAGGTACGCTCCAATCGAAGGTGATGAAGATTGAAGATGGGAAAGGGAGGCGAC
TGTAGAGAGACTTCTCGTTGGTATTGGGGTTTCTTTCAGAGGCTGATCGACGGAGATAGA
CGGAACCGAGGAGGGAAAATTAGCAAAGTCGTGGTGGAGACGCTCATCCAAGGCTGAAAT
TACCGCTTCATCTGCAGAGGACATGTGTTGATACGCCTGGATCAAGTTGCTTCAATCACT
CGACGCGTGGCCTTTAAGTAGATATCTTTCTCGAGTTTTCCATTATATCTCTCTGTTTAT
TGGATCTCTTTTGTATTTATATGTATCCCAATACTCTTTGCAGCCCATTGGGCTTTTAAT
GGAAAAA
TGTTGAC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4CR76JQ 670 0 0
TCACTTATCTGGAGAGTAACACCGGCGACGGTACTTTT*GCCTATCAATAATAATCGCAG
CAATCATCTAACTGCCGCTACTTTTAACAGCGTCACAAAACAATTCCGGAAACCTTCGCG
AAACTAATCGCAGCGTGAACTTGATTAATTTCCATCATCCTTTTGTTTATTTTGTTGTTT
AGTTTTTGGCCGCAAGCGGCTGCGTCCGCGTCGTCCAAAAGAACAGAGCTTGGGTAATTT
CGTACTGACTAGTACCCGCAATCTATTGGGCGGGGCATCTTCGAGTTGTATACCGAAGAT
ACAGGTACGCTCCAATCGAAGGTGATGAAGATTGAAGATGGGAAAGGGAGGCGACTGTAG
AGAGACTTCTCGTTGGTATTGGGGTTTCTTTCAGAGGCTGATTGACGGAGATAGACGGAA
CCGAGGAGGGAAAATTAGCAAAGTCGTGGTGGAGACGCTCATCCAAGGCTGAAATTATCG
CTTCATCTGCAGAGGACACGTGTTGATACGCCTGGATCAAGTTGCTTCAATCACTCGACG
CGTGGCCTTTAAGTAGATATCTTTCTCGAGTTTTCCATTATATCTCTCTGTTTATTGGAT
CTCTTTTGTATTTATATGTATCCCAATACTCTTTGCAGCCCATTGGGCTTTTAATGAAAA
AAATGTTGAC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL2351Contig1 574 4 10 U
GGGAGAATACGTAAGTCACAAATTTGTTTCACAGCGAACTATTCTCCTGCGCCTAGCCGT
CGTGTTCTCTCGCTTCGTCGTCTGTTTGATTTAGATCGAGTTTTGAGGGATAAGAAGTAA
TAATGTCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCCGTAGTAGCCTACG
TCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGATTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTATTA
CTAACAAGGCATGGGGTGTTGCTACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGCTG
GTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTG
AATAACTGCAATCCCCTTCCTATCTCTCTCTCATTTGGATACAAGATATTTGCTCTCTAT
GTTGGCCCCCTTTATCTTTTGATTTGAGGATCCGCTATTTTCTCAGTAATAATTTGTGGG
GATTGATGGATTGGATGGAATACACATTATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGATTTTGA
CGATAATATTAAATTGAGCCAACAAGACTTGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BA71TF U 1
AF RR4AY28JQ C 47
AF RR4CS03TF U 73
AF RR4AY28TF U 47
BS 1 125 RR4BA71TF
BS 126 126 RR4CS03TF
BS 127 142 RR4BA71TF
BS 143 143 RR4CS03TF
BS 144 241 RR4BA71TF
BS 242 242 RR4CS03TF
BS 243 516 RR4BA71TF
BS 517 517 RR4CS03TF
BS 518 561 RR4BA71TF
BS 562 574 RR4CS03TF

RD RR4BA71TF 561 0 0
GGGAGAATACGTAAGTCACAAATTTGTTTCACAGCGAACTATTCTCCTGCGCCTAGCCGT
CGTGTTCTCTCGCTTCGTCGTCTGTTTGATTTAGATCGAGTTTTGAGGGATAAGAAGTAA
TAATGCCAAGAGGCAAATACATGGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCCGTAGTAGCCTACG
TCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGATTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTATTA
CCAACAAGGCATGGGGTGTTGCTACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGCTG
GTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTG
AATAACTGCAATCCCCTTCCTATCTCTCTCTCATTTGGATACAAGATATTTGCTCTCTAT
GTTGGCCCCCTTTATCTTTTGATTTGAGGATCCGCTATTTTCTCAGTAATAATTTGTGGG
GATTGATGGATTGGATGGAATACACATTATTCATTC*AATCTTTTCTTTGTTGATTTTGA
CGATAATATTAAATTGAGCCA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4AY28JQ 528 0 0
GG
GCGCCTAGCCGTCGTGTTCTCTCGCTTCGTCGTCTGTTTGATTTAGATCGAGTTTTGAGG
GATAAGAAGTAATAATGTCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCCG
TAGTAGCCTACGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGATTTTCGGAGGTTCTACAC
CGGGAACTATTACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCTACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGC
CAAGAACTGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCA
AGTCACGCCCTGAATAACTGCAATCCCCTTCCTATCTCTCTCTCATTTGGATACAAGATA
TTTGCTCTCTATGTTGGCCCCCTTTATCTTTTGATTTGAGGATCCGCTATTTTCTCAGTA
ATAATTTGTGGGGATTGATGGATTGGATGGAATACACATTATTCATTCCAATCTTTTCTT
TGTTGATTTTGACGATAATATTAAATTGAGCCAACAAGACTTGAGA

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR4CS03TF 502 0 0
CTTCGTCGTCTGTTTGATTTAGATCGAGTTTTGAGGGATAAGAAGTAATAATGTCAAGAG
GCAAATACATAGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCCGTAGTAGCCTACGTCTGTGACAAAG
TCATCTCTGATGATAAGATTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTATTACTAACAAGGCAT
GGGGTGTTGCTACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGCTGGTCCTCCCGTCG
TCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGTCCTGAATAACTGCAAT
CCCCTTCCTATCTCTCTCTCATTTGGATACAAGATATTTGCTCTCTATGTTGGCCCCCTT
TATCTTTTGATTTGAGGATCCGCTATTTTCTCAGTAATAATTTGTGGGGATTGATGGATT
GGATGGAATACACATTATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGATTTTGACGATAATATTAA
ATTGAGCCAACAAGACTTGAGA

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4AY28TF 528 0 0
GG
GCGCCTAGCCGTCGTGTTCTCTCGCTTCGTCGTCTGTTTGATTTAGATCGAGTTTTGAGG
GATAAGAAGTAATAATGTCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCCG
TAGTAGCCTACGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGATTTTCGGAGGTTCTACAC
CGGGAACTATTACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCTACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGC
CAAGAACTGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCA
AGTCACGCCCTGAATAACTGCAATCCCCTTCCTATCTCTCTCTCATTTGGATACAAGATA
TTTGCTCTCTATGTTGGCCCCCTTTATCTTTTGATTTGAGGATCCGCTATTTTCTCAGTA
ATAATTTGTGGGGATTGATGGATTGGATGGAATACACATTATTCATTCCAATCTTTTCTT
TGTTGATTTTGACGATAATATTAAATTGAGCCAACAAGACTTGAGA

QA 3 528 3 528
DS 



AS 1 3

CO CL2352Contig1 937 3 3 U
GCAACAGTGACTATATTAGATGGTAAATATATGAAAACTTATGCGGTAAACCAAAATAAA
AATCTACCAAACTTATGTTTACACCACTTAAATATAATATGAAACTGATTAAAAATAAAG
ACGAAGGAATTACACAAATACTTCTGCAAATAGAAGAAATGATGAATACAGATCTCACTG
ATTACACAATGCCCTCATATTCACTTATTCTTCTACCCTCCTCCTATGATATATCCCTCG
ACACTCATTCCTCAATACTAAATAAAATTATCATCACACACTATTACAATTTAAAAATAA
AACCAGAAAGAAGGAATGAAAAAGACATTCTGTAAACTAATTCCTGACAACTTTAACTAA
AGTACCCCATGTGAGAAAGAACAAAAGATCATCGAAGTAAAAATATAGTAAATAAGGAGT
TTAAAAGGTGAAAAAGAGGAGAAAAACCAATAATTCCATGATCTCTTTTAACCTTTTTCA
CCACGAAGATCCTCCTGTATTAGTGAACATCCCACTCCAATATGTATTATTACCATGACT
CTTGTCTTGGGCTGTGCTCGAAAGCTCTTTCATGTCTGAAAAGGGGAACAAAACCCTACT
TGCTCCATTCATGTCATCAGCATGATTATTATCTTCAGGTCTTTGGTTACTGTTGATGGT
GTTATTTCCAATCCCTTGATAATGATCAATGGAGAACGAAAGGTTATTGTTACTCTGTTT
GTAATCAACCATTGTTGGAAACCCTAAAGATGAGTAAATGACTGAGTTTGAATCCAACAT
TTGGCCAGGCAAGAACGTGCTCATTCCTCTTGAAGAGACTCCATTGGATCTTAGAAGCTC
GAGAGCTGAGACAGGAGATGATGAAGCATAGATTGAAGATGATGTATTGTTGTTCTCGAT
CTTGGGCATATGAAGAAACTGAGACATACCATGATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM23JQ U 1
AF RR4CZ71JQ U 1
AF RR4BM23TF C 353
BS 1 752 RR4BM23JQ
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RD RR4BM23JQ 752 0 0
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ACACTCATTCCTCAATACTAAATAAAATTATCATCACACACTATTACAATTTAAAAATAA
AACCAGAAAGAAGGAATGAAAAAGACATTCTGTAAACTAATTCCTGACAACTTTAACTAA
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TTAAAAGGTGAAAAAGAGGAGAAAAACCAATAATTCCATGATCTCTTTTAACCTTTTTCA
CCACGAAGATCCTCCTGTATTAGTGAACATCCCACTCCAATATGTATTATTACCATGACT
CTTGTCTTGGGCTGTGCTCGAAAGCTCTTTCATGTCTGAAAAGGGGAACAAAACCCTACT
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GTTATTTCCAATCCCTTGATAATGATCAATGGAGAACGAAAGGTTATTGTTACTCTGTTT
GTAATCAACCATTGTTGGAAACCCTAAAGATG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4CZ71JQ 778 0 0
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AATCTACCAAACTTATGTTTACACCACTTAAATATAATATGAAACTGATTAAAAATAAAG
ACGAAGGAATTACACAAATACTTCTGCAAATAGAAGAAATGATGAATACAGATCTCACTG
ATTACACAATGCCCTCATATTCACTTATTCTTCTACCCTCCTCCTATGATATATCCCTCG
ACACTCATTCCTCAATACTAAATAAAATTATCATCACACACTATTACAATTTAAAAATAA
AACCAGAAAGAAGGAATGAAAAAGACATTCTGTAAACTAATTCCTGACAACTTTAACTAA
AGTACCCCATGTGAGAAAGAACAAAAGATCATCGAAGTAAAAATATAGTAAATAAGGAGT
TTAAAAGGTGAAAAAGAGGAAAAAAACCAATAATTCCATGATCTCTTTTAACCTTTTTCA
CCACGAAGATCCTCCTGTATTAGTGAACATCCCACTCCAATATGTATTATTACCATGACT
CTTGTCTTGGGCTGTGCTCGAAAGCTCTTTCATGTCTGAAAAGGGGAACAAAACCCTACT
TGCTCCATTCATGTCATCAGCATGATTATTATCTTCAGGTCTTTGGTTACTGTTGATGGT
GTTATTTCCAATCCCTTGATAATGATCAATGGAGAACGAAAGGTTATTGTTACTCTGTTT
GTAATCAACCATTGTTGGAAACCCTAAAGATGAGTAAATGACTGAGTTTGAATCCA
CA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4BM23TF 585 0 0
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TAAGGAGTTTAAAAGGTGAAAAAGAGGAGAAAAACCAATAATTCCATGATCTCTTTTAAC
CTTTTTCACCACGAAGATCCTCCTGTATTAGTGAACATCCCACTCCAATATGTATTATTA
CCATGACTCTTGTCTTGGGCTGTGCTCGAAAGCTCTTTCATGTCTGAAAAGGGGAACAAA
ACCCTACTTGCTCCATTCATGTCATCAGCATGATTATTATCTTCAGGTCTTTGGTTACTG
TTGATGGTGTTATTTCCAATCCCTTGATAATGATCAATGGAGAACGAAAGGTTATTGTTA
CTCTGTTTGTAATCAACCATTGTTGGAAACCCTAAAGATGAGTAAATGACTGAGTTTGAA
TCCAACATTTGGCCAGGCAAGAACGTGCTCATTCCTCTTGAAGAGACTCCATTGGATCTT
AGAAGCTCGAGAGCTGAGACAGGAGATGATGAAGCATAGATTGAAGATGATGTATTGTTG
TTCTCGATCTTGGGCATATGAAGAAACTGAGACATACCATGATGC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

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CTTTCAAAGCAAATCTATCCTTCTACTTCTCGGAAGAGTTGGGTCCTCTCTTCTTACCGA
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TAGGTTTCTTCTTCTTATCTTGTTTCGCTACCTTCGGAGTCTGCCCTCTCACCTTACCGG
CACGTGCCAATGACCCGTGAACTTTGCCCATGGCTGGTTCGCTTTTCTGCGTTTTCTTCC
GACGGCTGCAATAAGCTGCTTAATCTCAGTTCCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GD71TF C 1
AF RR4HA03JQB U -1
AF RR4HA03TF C -1
AF RR4GD71JQ U 1
BS 1 9 RR4GD71TF
BS 10 50 RR4HA03JQB
BS 51 51 RR4GD71JQ
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BS 143 387 RR4HA03JQB
BS 388 398 RR4GD71JQ

RD RR4GD71TF 398 0 0
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CTTTCAA*GCAAATTTATCCTTCTACTTCTCGGAAGAGTTGGGTCCTCTCTTCTTACCGA
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TGGGTTTCTTCTTCTTATCTTGTTTCGCTACCTTCGGAGTCTGCCCTCTCACCTTACCGG
CACGTGCCAATGACCCGTGAACTTTGCCCATGGCTGGTTCGCTTTTCTGCGTTTTCTTCC
GACGGCTGCAATAAGCTGCTTAATCTCAGTTCCTCCCC

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR4HA03JQB 391 0 0
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TCTTCTTATCTTGTTTCGCTACCTTCGGAGTCTGCCCTCTCACCTTACCGGCACGTGCCA
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AATAAGCTGCTTAATCTC
CC

QA 12 389 12 389
DS 

RD RR4HA03TF 391 0 0
GTAAAGTAAAT
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CAAATCTATCCT*CTACTTCTCGGAAGAGTTGGGTCCTCTCTTCTTACCGAAACCAACAA
CGGCGGTAACGAAACGGCGATTGTGCTGAAGACGCTTGTGAGCACGTCCTCTAGGTTTCT
TCTTCTTATCTTGTTTCGCTACCTTCGGAGTCTGCCCTCTCACCTTACCGGCACGTGCCA
ATGACCCGTGAACTTTGCCCATGGCTGGTTCGCTTTTCTGCGTTTTCTTCCGACGGCTGC
AATAAGCTGCTTAATCTC
CC

QA 12 389 12 389
DS 

RD RR4GD71JQ 398 0 0
GGGGGAAAC
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TCTTCTTATCTTGTTTCGCTACCTTCGGAGTCTGCCCTCTCACCTTACCGGCACGTGCCA
ATGACCCGTGAACTTTGCCCATGGCTGGTTCGCTTTTCTGCGTTTTCTTCCGACGGCTGC
AATAAGCTGCTTAATCTCAGTTCCTCCCC

QA 10 398 10 398
DS 



AS 1 4

CO CL2354Contig1 1055 4 7 U
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TCTCTCCTTATGTGCACGCCCCAGAGTGTGGCCTCCAGAGAGAGCTACAATGTCTTTATC
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CTTCTCGTCATAAGTTCCTGCGTCATGCCATGCAAGACGGAGCATAATGGGAGCACAGTT
TCTGGAAGAGATGAGAGCTCGAAGGTCTCTACGAGACTTCTCTAGCTCTTTGAGGTACTC
TGCATCGACGACATTCACTGCCATTTTGTCAGGACTTTGAAAGAGCAAATGAAGAATAAT
AGAATTAATGAATTGACTCTTAACGAGGAACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CO39JQ U 1
AF RR4AJ27JQ U 63
AF RR4CO39TF C 319
AF RR4AJ27TF C 374
BS 1 111 RR4CO39JQ
BS 112 112 RR4AJ27JQ
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BS 584 753 RR4CO39JQ
BS 754 831 RR4AJ27JQ
BS 832 1055 RR4CO39TF

RD RR4CO39JQ 753 0 0
GTCGGTATGATTTTCTTATAAAGGTAAACAAACATCTCATGAATCATTTTTTTTATTTTA
TTGCATTCATTCAGCTTAACATTTGTACTTTTTTTTTTGTTAGCCTTTTTT*CCGCAACT
GTGAAACTTCCTCCTCAGTCCTCACTTGCCTATTCTCCTTGCTTCGTAGCATATGGTGAA
GATGACAGCAGCTGCAAATACAGCGATTCCAACTGCCTGCTGCCTTAATGTTGCAGGAGT
TTTTCTTGGCAAATTGCATCCTAGTTCTGAGAGTTTCTTATGTGAGAAAGCATAATCTCT
GAAGAACACATCCTCGTCCTTTGCATACATCTTAACATAAGGTTCGAACTTGGGATCGCC
AAGTAGAGTCTTGTCGGTTTTAAGTTGCAGCAGTTCTGGAGTTTCCCCGTTTAGAAGCTC
TATGAAATAAGAGTTGTCAAACTTGAGTGGATCTCGCGTCCAAGGACCTTCGAAATCTGA
TCTCTCCTTATGTGCACGCCCCAGAGTGTGGCCTCCAGAGAGAGCTACAATGTCTTTATC
CGATAGACCCATACGAGAGAAGAGAGTTCTTAGATGTGAGGCTCCTTGATTCGGATCAGG
AAGATCTCCTTCATCTGCTGACTCAGCATCATTACGGCCTGGAGTAAATGGGATTGTAGG
GCCACCGGTAACTTCCACTGCAACAACTCCTGCGAGCTGGTAAAGGTCTGCGTAAGAGAC
TCGTGGATGCTTAGCTTTTACTTCCTCGCAGAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4AJ27JQ 769 0 0
GCATTCATTCAGCTTAACATTTGTACTTTTTTTTT*GTTAGCCTTTTTTTCCGCAACTGT
GAAACTTCCTCCTCAGTCCTCACTTGCCTATTCTCCTTGCTTCGTAGCATATGGTGAAGA
TGACAGCAGCTGCAAATACAGCGATTCCAACTGCCTGCTGCCTTAATGTTGCAGGAGTTT
T*CTTGGCAAATTGCATCCTAGTTCTGAGAGTTTCTTATGTGAGAAAGCATAATCTCTGA
AGAACACATCCTCGTCCTTTGCATACATCTTAACATAAGGTTCGAACTTGGGATCGCCAA
GTAAAGCCTTGTCGGTTTTAAGTTGCAGCAGTTCTGGAGTTTCCCCGTTTAGAAGCTCTA
TGAAATAAGAGTTGTCAAACTTGAGTGGATCTCGCGTCCAAGGACCTTCGAAATCTGATC
TCTCCTTATGTGCACGCCCCAAAGTGTGGCCTCCAGAGAGAGCTACAATGTCTTTATCCG
ATAGACCCATACGAGAGAAGAGAGTTCTTAGATGTGAGGCCCCTTGATTCGGATCAGGAA
GATCTCCTTCATCTGCTGACTCAGCATCATTACGGCCTGGAGTAAATGGGATTGTAGGGC
CACCGGTAACTTCCACTGCAACAACTCCTGCGAGCTGGTAAAGGTCTGCGTAAGAGACTC
GTGGATGCTTAGCTTTTACTTCCTCGCAGAAGGCGACTGCTTTCTCGAGACCTTTGTTAT
GAGGGCGGTTTAGCTCGTCCTTGAACCTAATTGATCCATTGGGGCCTCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4CO39TF 737 0 0
CTTTGCATACATCTTAACATAAGGTTCGAACTTGGGATCGCCAAGTAGAGTCTTGTCGGT
TTTAAGTTGCAGCAGTTCTGGAGTTTCCCCGTTTAGAAGCTCTATGAAATAAGAGTTGTC
AAACTTGAGTGGATCTCGCGTCCAAGGACCTTCGAAATCTGATCTCTCCTTATGTGCACG
CCCCAGAGTGTGGCCTCCAGAGAGAGCTACAATGTCTTTATCCGATAGACCCATACGAGA
GAAGAGAGTTCTTAGATGTGAGGCTCCTTGATTCGGATCAGGAAGATCTCCTTCATCTGC
TGACTCAGCATCATTACGGCCTGGAGTAAATGGGATTGTAGGGCCACCGGTAACTTCCAC
TGCAACAACTCCTGCGAGCTGGTAAAGGTCTGCGTAAGAGACTCGTGGATGCTTAGCTTT
TACTTCCTCGCAGAAGGCGACTGCTTTCTCGAGACCTTTGTTATGAGGGCGGTTTAGCTC
GTCCTTGAACCTAATTGATCCATTGGGGCCTCCACTTTTCTTCTTCTCGTCATAAGTTCC
TGCGTCATGCCATGCAAGACGGAGCATAATGGGAGCACAGTTTCTGGAAGAGATGAGAGC
TCGAAGGTCTCTACGAGACTTCTCTAGCTCTTTGAGGTACTCTGCATCGACGACATTCAC
TGCCATTTTGTCAGGACTTTGAAAGAGCAAATGAAGAATAATAGAATTAATGAATTGACT
CTTAACGAGGAACATCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AJ27TF 682 0 0
TCGGTTTTAAGTTGCAGCAGTTCTGGAGTTTCCCCGTTTAGAAGCTCTATGAAATAAGAG
TTGTCAAACTTGAGTGGATCTCGCGTCCAAGGACCTTCGAAATCTGATCTCTCCTTATGT
GCACGCCCCAGAGTGTGGCCTCCAGAGAGAGCTACAATGTCTTTATCCGATAGACCCATA
CGAGAGAAGAGAGTTCTTAGATGTGAGGCCCCTTGATTCGGATCAGGAAGATCTCCTTCA
TCTGCTGACTCAGCATCATTACGGCCTGGAGTAAATGGGATTGTAGGGCCACCGGTAACT
TCCACTGCAACAACTCCTGCGAGCTGGTAAAGGTCTGCGTAAGAGACTCGTGGATGCTTA
GCTTTTACTTCCTCGCAGAAGGCGACTGCTTTCTCGAGACCTTTGTTATGAGGGCGGTTT
AGCTCGTCCTTGAACCTAATTGATCCATTGGGGCCTCCACTTTTCTTCTTCTCGTCATAA
GTTCCTGCGTCATGCCATGCAAGACGGAGCATAATGGGAGCACAGTTTCTGGAAGAGATG
AGAGCTCGAAGGTCTCTACGAGACTTCTCTAGCTCTTTGAGGTACTCTGCATCGACGACA
TTCACTGCCATTTTGTCAGGACTTTGAAAGAGCAAATGAAGAATAATAGAATTAATGAAT
TGACTCTTAACGAGGAACATCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

CO CL2355Contig1 625 4 8 U
GGTAAACAAATCAATGGATTTAGAACTGGTAAACGAAATAAGAAGACAGAAATACATTGG
CTCAAAGATTGTGAAGCTCTTGTTTGTGCTCATGTGATTCAAACAAATAACTAAACGGTA
TGTGTTCTTGTTTGAAAGAGAACAAGAAAGGAGAGACATGTTCATAATAACTAGGCATTA
ATGGAAGAAATGTCTACTTTCCGAGGGACTTGGACAACGTTCTTGTTACCAGGGAAGGAG
TTGCGGGAGACGTCAACGAGTGCTTTGAAGCTGTAAGGTTCGTGCATAGACAACTCAGAG
AGGACTTTACGGTTCAGCTGGATGTTCTCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAG
TTCACACCGTGCTGACGAGAGCCGGCGTTGATACGCTCGATCCAGAGACCTCGCATCTCA
CGTTTCTTGTTGCGCCTGTCTCTGTAAGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTC
GCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCTCTTCCCCTGAATCCCTTTGCTAGCTTGAAGATCTCC
TTCTTGTTCATCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTT
CCTTGTCTCTCTCACTGTTTAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G602TF C 1
AF RR4EH92JQ U 17
AF RR4EH92TF C 85
AF RR4G602JQ U 50
BS 1 18 RR4G602TF
BS 19 88 RR4EH92JQ
BS 89 89 RR4G602JQ
BS 90 207 RR4EH92JQ
BS 208 208 RR4G602JQ
BS 209 434 RR4EH92JQ
BS 435 435 RR4G602JQ
BS 436 625 RR4EH92JQ

RD RR4G602TF 618 0 0
GGTAAACAAATCAATGGATTTAGAACTGGTAAACGAAATAAGAAGACAGAAATACATTGG
CTCAAAGATTGTGAAGCTCTTGTTTGTGCTCATGTGATTCAAACAAATAACTAAACGGTA
TGTGTTCTTGTTTGAAAGAGAACAAGAAAGGAGAGACATGTTCATAATAACTAGGCATTA
ATGGAAGAAATGTCTACTTTCCGAGGGACTTGGACAACGTTCTTGTTACCAGGGAAGGAG
TTGCGGGAGACGTCAACGAGTGCTTTGAAGCTGTAAGGTTCGTGCATAGACAACTCAGAG
AGGACTTTACGGTTCAGCTGGATGTTCTCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAG
TTCACACCGTGCTGACGAGAGCCGGCGTTGATACGCTCGATCCAGAGACCTCGCATCTCA
CGTTTCTTGTTGCGCCTGTCTCTGTAAGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTC
GCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCTCTTCCCCTGAATCCCTTTGCTAGCTTGAAGATCTCC
TTCTTGTTCATCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTT
CCTTGTCTCTCTCACT
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4EH92JQ 609 0 0
GG
TTTAGAACTGGTAAACGAAATAAGAAGACAGAAATACATTGGCTCAAAGATTGTGAAGCT
CTTGTTTGTGTTCATGTGATTCAAACAAATAACTAAACGGTATGTGTTCTTGTTTGAAAG
AGAACAAGAAAGGAGAGACATGTTCATAATAACTAGGCATTAATGGAAGAAATGTCTACT
TTCCGAGGGGCTTGGACAACGTTCTTGTTACCAGGGAAGGAGTTGCGGGAGACGTCAACG
AGTGCTTTGAAGCTGTAAGGTTCGTGCATAGACAACTCAGAGAGGACTTTACGGTTCAGC
TGGATGTTCTCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAGTTCACACCGTGCTGACGA
GAGCCGGCGTTGATACGCTCGATCCAGAGACCTCGCATCTCACGTTTCTTGTTGCGTCTG
TCTCTGTAAGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGCAGTTC
TTCGCTCTTCCCCTGAATCCCTTTGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATCTCTCTT
CCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTTGTCTCTCTCACTGT
TTAACCC

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR4EH92TF 541 0 0
TGTGTTCATGTGATTCAAACAAATAACTAAACGGTATGTGTTCTTGTT*GAAAGAGAACA
AGAAAGGAGAGACATGTTCATAATAACTAGGCATTAATGGAAGAAATGTCTACTTTCCGA
GGGGCTTGGACAACGTTCTTGTTACCAGGGAAGGAGTTGCGGGAGACGTCAACGAGTGCT
TTGAAGCTGTAAGGTTCGTGCATAGACAACTCAGAGAGGACTTTACGGTTCAGCTGGATG
TTCTCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAGTTCACACCGTGCTGACGAGAGCCG
GCGTTGATACGCTCGATCCAGAGACCTCGCATCTCACGTTTCTTGTTGCGTCTGTCTCTG
TAAGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCT
CTTCCCCTGAATCCCTTTGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATCTCTCTTCCTCTT
CCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTTGTCTCTCTCACT
GTTTAACCC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4G602JQ 569 0 0
AAATACATTGGCTCAAAGATTGTGAAGCTCTTGTTTGTGCTCATGTGATTCAAACAAATA
ACTAAACGGTATGTGTTCTTGTTTGAAAGAGAACAAGAAAGGAGAGACATGTTCATAATA
ACTAGGCATTAATGGAAGAAATGTCTACTTTCCGAGGGACTTGGACAACGTTCTTGTTAC
CAGGGAAGGAGTTGCGGGAGACGTCAACGAGTGCTTTGAAGCTGTAAGGTTCGTGCATAG
ACAACTCAGAGAGGACTTTACGGTTCAGCTGGATGTTCTCCTTCATCAGTCCGTGGATAA
AGTTACCGTAGTTCACACCGTGCTGACGAGAGCCGGCGTTGATACGCTCGATCCAGAGAC
CTCGCATCTCACGTTTCTTGTTGCGCCTGTCTCTGTAAGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCA
CTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCTCTTCCCCTGAATCCCTTTGCTAGCT
TGAAGATCTCCTTCTTGTTCATCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTC
CTCTTCCTCTTCCTTGTCTCTCTCACT
CC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 4

CO CL2356Contig1 590 4 23 U
GGATGACACTTTCCTTTGGTTCACGGCTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGGGAG
CGAAGACTACGGCTACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACCGAT
TCGAAACCGAAGATCACGAAGCCTTCATCGCCTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAGCAA
TGGATCTGGTCCACACCTACGTCCCTTCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTCTCC
TCTGCGTCGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCTGCT
CCTACGTTTCCGACACGTTTCTTTCTAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACGCAG
AGGATCTTAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTT*AACATTGTTGTTAAGCTT
TGTGTTTTCAATATCAGTTGTTGGTTGGTGTAATCAAGATCTGTCGGAGACAGATGTACT
AGAAACTGTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATTTGACAAAATAATCGTTGATTGAT
TGTAATGAAATATTTGGCAGACAGTTGAAACACTTCATGAAATTTTCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G694TF U 1
AF RR4AT89JQ C 3
AF RR4GE72TF U 3
AF RR4AT89TF U 3
BS 1 66 RR4G694TF
BS 67 67 RR4GE72TF
BS 68 73 RR4G694TF
BS 74 74 RR4GE72TF
BS 75 104 RR4G694TF
BS 105 105 RR4GE72TF
BS 106 150 RR4G694TF
BS 151 151 RR4AT89TF
BS 152 323 RR4G694TF
BS 324 324 RR4AT89TF
BS 325 391 RR4G694TF
BS 392 393 RR4GE72TF
BS 394 401 RR4G694TF
BS 402 402 RR4GE72TF
BS 403 404 RR4G694TF
BS 405 405 RR4GE72TF
BS 406 432 RR4G694TF
BS 433 433 RR4AT89TF
BS 434 447 RR4G694TF
BS 448 448 RR4GE72TF
BS 449 546 RR4G694TF
BS 547 568 RR4GE72TF
BS 569 590 RR4AT89TF

RD RR4G694TF 546 0 0
GGATGACACTTTCCTTTGGTTCACGGCTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGGGAG
CGAAGATTACGGCGACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACTCGGGGAAACACCGAT
TCGAAACCGAAGATCACGAAGCCTTCATCGACTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAGCAA
TGGATCTGGTCCACACCTACGTCCCTTCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTCTCC
TCTGCGTCGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCTGCT
CCTACGTTTCCGACACGTTTCTTCCTAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACGCAG
AGGATCTTAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACGGTCGTTTTTTAAAATTGTTGTTAAGCTT
TGTGTTTTCAATGTCAGTTGTTGGTTG*TGTAATCAAGATCTGTCGGAGACAGATGTACT
AGAAACTGTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATTTGACAAAATAATCGTTGATTGAT
TGTAAT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4AT89JQ 588 0 0
GGGAA
ACTTTCCTTTGGTTCACGGCTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGGGAGCGAAGAC
TACGGCTACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACCGATTCGAAAC
CGAAGATCACGAAGCCTTCATCGCCTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAGCAATGGATCT
GGTCCACACCTACGTCCCTTCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTCTCCTCTGCGT
CGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCTGCTCCTACGT
TTCCGACACGTTTCTTTCTAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACGCAGAGGATCT
TAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTT*AACATTGTTGTTAAGCTTTGTGTTT
TCAATATCAGTTGTTGGTTGGTGTAATCAAGATCTGTCGGAGACAGATGTACTAGAAACT
GTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATTTGACAAAATAATCGTTGATTGATTGTAATG
AAATATTTGGCAGACAGTTGAAACACTTCATGAAATTTTCGCT

QA 6 588 6 588
DS 

RD RR4GE72TF 566 0 0
GGGAA
ACTTTCCTTTGGTTCACGGCTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGGGAGCGAAGAC
TACGGCTACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACCGATTCGAAAC
CGAAGATCACGAAGCCTTCATCGACTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAGCAATGGATCT
GGTCCACACCTACGTCCCTTCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTCTCCTCTGCGT
CGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCTGCTCCTACGT
TTCCGACACGTTTCTTCCTAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACGCAGAGGATCT
TAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTT*AACATTGTTGTTAAGCTTTGTGTTT
TCAATGTCAGTTGTTGGTTGGTGTAATCAAGATCTGTCGGAGACAGATGTACTAGAAACT
GTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATTTGACAAAATAATCGTTGATTGATTGTAATG
AAATATTTGGCAGACAGTTGA

QA 6 566 6 566
DS 

RD RR4AT89TF 588 0 0
GGGAA
ACTTTCCTTTGGTTCACGGCTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGGGAGCGAAGAC
TACGGCTACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACCGATTCGAAAC
CGAAGATCACGAAGCCTTCATCGCCTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAGCAATGGATCT
GGTCCACACCTACGTCCCTTCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTCTCCTCTGCGT
CGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCTGCTCCTACGT
TTCCGACACGTTTCTTTCTAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACGCAGAGGATCT
TAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTT*AACATTGTTGTTAAGCTTTGTGTTT
TCAATATCAGTTGTTGGTTGGTGTAATCAAGATCTGTCGGAGACAGATGTACTAGAAACT
GTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATTTGACAAAATAATCGTTGATTGATTGTAATG
AAATATTTGGCAGACAGTTGAAACACTTCATGAAATTTTCGCT

QA 6 588 6 588
DS 



AS 2 4

CO CL2357Contig1 874 2 8 U
GGATTGCCGGTGTTGACTTTGATCAGATCGGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCG
ATCTCCATTTTGTCGTGTGTATCCTTACTCTCCCTAGTCAAAGCTCTTTCTAACGAACCA
GAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTTCCAGACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTTC
TATCCCACGGTTGCGCCAAAGACGGTGGATCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGA
TACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGATAAAGGTTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTG
GCGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGAGGAGCAAAGGAAAGAAGCTGAGAAGACTATT
GTTGGAGAGTTCGGTGATGTCAAGCATGTCAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAA
GATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTCGATGCTTCTTGGTGATGCTCCTCATCTTGAT
CGTCAGTACTCTGTGTTTGGTAAAGTGACTAAAGGTGATGAAACATTGAGGACGCTAGAA
GAAGTTCCTACTCGCCGCGAGGGGATTTTTGTAATGCCGACGGAGAGGATCACAATTTTT
GTCGACATACTACTACGACACTAAGATGGGAGAGCTGTGAAGAGGAGAGCTCTGTCCTGA
AAAGAAGGCTTGAAGCATCTTTTGTTGAGGTCGAAAGACAGAGAATGAAGTGCTTCCCGT
GAAACTGTGTTGTTAATGACTTTTTTTCTAAGTAAAGAACTGTTCATAAACAGAGCCTAA
AACAAAGTTAAAGCCGACATCTTTGTTTCATTTGGTGTAAGTGTAACTCACGATTCTAAG
ACACATATTCATTAGTTTTTGAGTCTAAGCCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI58TF U 1
AF RR4BI58JQ C 98
BS 1 667 RR4BI58TF
BS 668 668 RR4BI58JQ
BS 669 689 RR4BI58TF
BS 690 690 RR4BI58JQ
BS 691 781 RR4BI58TF
BS 782 782 RR4BI58JQ
BS 783 798 RR4BI58TF
BS 799 874 RR4BI58JQ

RD RR4BI58TF 798 0 0
GGATTGCCGGTGTTGACTTTGATCAGATCGGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCG
ATCTCCATTTTGTCGTGTGTATCCTTACTCTCCCTAGTCAAAGCTCTTTCTAACGAACCA
GAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTTCCAGACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTTC
TATCCCACGGTTGCGCCAAAGACGGTGGATCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGA
TACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGATAAAGGTTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTG
GCGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGAGGAGCAAAGGAAAGAAGCTGAGAAGACTATT
GTTGGAGAGTTCGGTGATGTCAAGCATGTCAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAA
GATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTCGATGCTTCTTGGTGATGCTCCTCATCTTGAT
CGTCAGTACTCTGTGTTTGGTAAAGTGACTAAAGGTGATGAAACATTGAGGACGCTAGAA
GAAGTTCCTACTCGCCGCGAGGGGATTTTTGTAATGCCGACGGAGAGGATCACAATTTTT
GTCGACATACTACTACGACACTAAGATGGGAGAGCTGTGAAGAGGAGAGCTCTGTCCTGA
AAAGAAG*CTTGAAGCATCTTTTGTTGAG*TCGAAAGACAGAGAATGAAGTGCTTCCCGT
GAAACTGTGTTGTTAATGACTTTTTTTCTAAGTAAAGAACTGTTCATAAACAGAGCCTAA
A*CAAAGTTAAAGCCGAC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4BI58JQ 777 0 0
TCAAAGCTCTTTCTAACGAACCAGAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTTCCAGACTAGTT
ATGGGGATATCGAGTTTGGGTTCTATCCCACGGTTGCGCCAAAGACGGTGGATCACATCT
TCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGATACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGATAAAGGTT
TTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTGGCGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGAGGAGCAAA
GGAAAGAAGCTGAGAAGACTATTGTTGGAGAGTTCGGTGATGTCAAGCATGTCAGAGGCA
CTCTTTCCATGGGAAGATATGAAGATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTCGATGCTTC
TTGGTGATGCTCCTCATCTTGATCGTCAGTACTCTGTGTTTGGTAAAGTGACTAAAGGTG
ATGAAACATTGAGGACGCTAGAAGAAGTTCCTACTCGCCGCGAGGGGATTTTTGTAATGC
CGACGGAGAGGATCACAATTTT*GTCGACATACTACTACGACACTAAGATGG*AGAGCTG
TGAAGAGGAGAGCTCTGTCCTGAAAAGAAGGCTTGAAGCATCTTTTGTTGAGGTCGAAAG
ACAGAGAATGAAGTGCTTCCCGTGAAACTGTGTTGTTAATGACTTTTTTTCTAAGTAAAG
AACTGTTCATAAACAGAGCCTAAAACAAAGTTAAAGCCGACATCTTTGTTTCATTTGGTG
TAAGTGTAACTCACGATTCTAAGACACATATTCATTAGTTTTTGAGTCTAAGCCGCC

QA 1 777 1 777
DS 



CO CL2357Contig2 729 2 6 U
GGATAGCCGGTGTTGACTTTGATCAGATCGGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCG
ATCTTCATATTGGCGTGTGTATCCCTACTCTCCCTAGTCAAAGCTCTTCCTAGCGAACCA
GAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTTCCAGACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTCC
TATCCCACGGTTGCGCCAAAGACAGTGGATCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGA
TACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGATAAAGGCTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTG
GCGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGAGGAGCAAAGGAAAGAAGCCGAGAAGACTATT
GTTGGAGAGTTCAGTGATGTCAAGCATGTAAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAA
GATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTCAATGCTTCTTGGTGACGCTCCCCATCTTGAT
CGTCAGTACGCAGTGTTCGGCAAAGTAACTAAAGGTGATGAAACATTGAGGAAGCTAGAA
GAAGTTCCTACTCGCCGTGAGGGGATCTTTGTAATGCCGACGGAGAGGATCACGATTTTG
TCGACATACTACTACGACACTAAGATGTAGAGCTGTGAAGTGGAGAGATCTGTCCTGAAA
GAAGCTTGAAGCATCTTTTGTTGAGTCGAAGACAGAGATGAGTGCTTCCCGTGAACTATG
TTATGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY46TF U 1
AF RR4CD59TF U 30
BS 1 84 RR4EY46TF
BS 85 85 RR4CD59TF
BS 86 268 RR4EY46TF
BS 269 269 RR4CD59TF
BS 270 578 RR4EY46TF
BS 579 729 RR4CD59TF

RD RR4EY46TF 578 0 0
GGATAGCCGGTGTTGACTTTGATCAGATCGGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCG
ATCTTCATATTGGCGTGTGTATCCTTACTCTCCCTAGTCAAAGCTCTTCCTAGCGAACCA
GAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTTCCAGACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTCC
TATCCCACGGTTGCGCCAAAGACAGTGGATCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGA
TACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGGTAAAGGCTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTG
GCGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGAGGAGCAAAGGAAAGAAGCCGAGAAGACTATT
GTTGGAGAGTTCAGTGATGTCAAGCATGTAAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAA
GATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTCAATGCTTCTTGGTGACGCTCCCCATCTTGAT
CGTCAGTACGCAGTGTTCGGCAAAGTAACTAAAGGTGATGAAACATTGAGGAAGCTAGAA
GAAGTTCCTACTCGCCGTGAGGGGATCTTTGTAATGCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4CD59TF 700 0 0
GGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCGATCTTCATATTGGCGTGTGTATCCCTACT
CTCCCTAGTCAAAGCTCTTCCTAGCGAACCATAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTTCCA
GACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTTCTATCCCACGGTTGCGCCAAAGACAGTGGA
TCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGATACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGA
TAAAGGCTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTGGCGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGA
GGAGCAAAGGAAAGAAGCCGAGAAGACTATTGTTGGAGAGTTCAGTGATGTCAAGCATGT
AAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAAGATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTC
AATGCTTCTTGGTGACGCTCCTCATCTTGATCGTCAGTACGCAGTGTTCGGCAAAGTAAC
TAAAGGTGATGAAACATTGAGGAAGCTAGAAGAAGTTCCTACTCGCCGTGAGGGGATCTT
TGTAATGCCGACGGAGAGGATCACGATTTTGTCGACATACTACTACGACACTAAGATGTA
GAGCTGTGAAGTGGAGAGATCTGTCCTGAAAGAAGCTTGAAGCATCTTTTGTTGAGTCGA
AGACAGAGATGAGTGCTTCCCGTGAACTATGTTATGACAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 2 4

CO CL2358Contig1 268 2 5 U
GTGCTTTCTTTTATGAATGAATATAAAAGGGGCTTGCTCTCTAATGCTTCTTGAGAGCGT
TCATCTTGTCCCTGAGGGAATAAAGTTTGGCTCTTCTCACTCTCTTCTTGTCCAACACCT
TAATCTCCCTCAGGTTTGGCGAATACAAGGGAAACATGGATTCCACACCGACTCCCGCAA
CAAGCCTTCTAATCCTAAAAGTAAAGTTAAAACCAGCATTACCCCTTGCTATCACAATTC
CTTTCACGATTGAAACACGCCTCTTGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A014JQD U 1
AF RR4A014JQ U 134
BS 1 203 RR4A014JQD
BS 204 204 RR4A014JQ
BS 205 253 RR4A014JQD
BS 254 254 RR4A014JQ
BS 255 268 RR4A014JQD

RD RR4A014JQD 268 0 0
GTGCTTTCTTTTATGAATGAATATAAAAGGGGCTTGCTCTCTAATGCTTCTTGAGAGCGT
TCATCTTGTCCCTGAGGGAATAAAGTTTGGCTCTTCTCACTCTCTTCTTGTCCAACACCT
TAATCTCCCTCAGGTTTGGCGAATACAAGGGAAACATGGATTCCACACCGACTCCCGCAA
CAAGCCTTCTAATCCTAAAAGTAGAGTTAAAACCAGCATTACCCCTTGCTATCACAATTC
CTTTCACGATTGAGACACGCCTCTTGTT

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR4A014JQ 135 0 0
GTTTGGCGAATACAAGGGAAACATGGATTCCACACCGACTCCCGCAACAAGCCTTCTAAT
CCTAAAAGTAAAGTTAAAACCAGCATTACCCCTTGCTATCACAATTCCTTTCACGATTGA
AACACGCCTCTTGTT

QA 1 135 1 135
DS 



CO CL2358Contig2 844 2 8 U
GGGAGCTCAAACTCCGTCAACCTCTGGAGTAATTTGAAGGCCTTAATTAGATCGTCTCCT
CCTCTTTGTCGGAGAAAATGCAATCGATCCGTAGTAGCAGTACAAGGCTGCTGCTTCAGA
GGAACCACCGTTTCTCTATCTCCAACACTCTTCTTCTCCCTTTCACTTCGTCTTCTTCTC
CAAGCTGGTCTGGTAATGTATCGTCGAGGAGTTTCGATTCTTCCCATTCCACCAGAGCTT
TCGGTTCACCAGCGACGTATCTCATTAGCTCCTTGACAAAGCCTCTTTCTTCCCCCTCCT
CCGCACTACCTGAACATAACTTTACGTATTATTCATCGAGATGCTTTTCCACCGTTGGAG
ATTATGTTCCTCAAGGATTCTCCGTCTCAGCTCCTGATTCGCCTCCACGAATCAAGTTCA
AGCGGCTTGATAAAACCGCCAAGCATATCATGCAGATTGTAGACAAAGAGGCAGTTGAGG
AAGTGAGAACTCGTAGAGAGATACAAGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAGCTTAAAG
TGGAAGTGCCTGAGAACAAGAGGCGTGTCTCAATCGTGAAAGGAATTGTGATAGCAAGGC
GTAATGCTGGTCTTAACTCTACTTTTAGGATTAGAAAGCTTGTTGCTGGAGTCGGTGTCG
AATCCATGTTTCCCTTGTATTCGCCAAACCTGAGGGAGATTAAAGTGTTGGACAAGAAGA
GAGTGAGAAGAGCCAAACTTTATTACCTCAGGACAAGATGAACGCTCTCAAGAGCATTAG
AGAGCAAGCACCTTTTATATTCATTCATAAAGAAGCACTCTACTCTCTTCAACAAAGTGC
TTAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4A014TF U 1
AF RR4A014TFB U 1
BS 1 14 RR4A014TF
BS 15 15 RR4A014TFB
BS 16 628 RR4A014TF
BS 629 629 RR4A014TFB
BS 630 654 RR4A014TF
BS 655 655 RR4A014TFB
BS 656 695 RR4A014TF
BS 696 844 RR4A014TFB

RD RR4A014TF 699 0 0
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CCTCTTTGTCGGAGAAAATGCAATCGATCCGTAGTAGCAGTACAAGGCTGCTGCTTCAGA
GGAACCACCGTTTCTCTATCTCCAACACTCTTCTTCTCCCTTTCACTTCGTCTTCTTCTC
CAAGCTGGTCTGGTAATGTATCGTCGAGGAGTTTCGATTCTTCCCATTCCACCAGAGCTT
TCGGTTCACCAGCGACGTATCTCATTAGCTCCTTGACAAAGCCTCTTTCTTCCCCCTCCT
CCGCACTACCTGAACATAACTTTACGTATTATTCATCGAGATGCTTTTCCACCGTTGGAG
ATTATGTTCCTCAAGGATTCTCCGTCTCAGCTCCTGATTCGCCTCCACGAATCAAGTTCA
AGCGGCTTGATAAAACCGCCAAGCATATCATGCAGATTGTAGACAAAGAGGCAGTTGAGG
AAGTGAGAACTCGTAGAGAGATACAAGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAGCTTAAAG
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AATCCATGTTTCCCTTGTATTCGCCAAACCTGAGG
AGAT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4A014TFB 844 0 0
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CCTCTTTGTCGGAGAAAATGCAATCGATCCGTAGTAGCAGTACAAGGCTGCTGCTTCAGA
GGAACCACCGTTTCTCTATCTCCAACACTCTTCTTCTCCCTTTCACTTCGTCTTCTTCTC
CAAGCTGGTCTGGTAATGTATCGTCGAGGAGTTTCGATTCTTCCCATTCCACCAGAGCTT
TCGGTTCACCAGCGACGTATCTCATTAGCTCCTTGACAAAGCCTCTTTCTTCCCCCTCCT
CCGCACTACCTGAACATAACTTTACGTATTATTCATCGAGATGCTTTTCCACCGTTGGAG
ATTATGTTCCTCAAGGATTCTCCGTCTCAGCTCCTGATTCGCCTCCACGAATCAAGTTCA
AGCGGCTTGATAAAACCGCCAAGCATATCATGCAGATTGTAGACAAAGAGGCAGTTGAGG
AAGTGAGAACTCGTAGAGAGATACAAGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAGCTTAAAG
TGGAAGTGCCTGAGAACAAGAGGCGTGTCTCAATCGTGAAAGGAATTGTGATAGCAAGGC
GTAATGCTGGTCTTAACTCTACTTTTAGGATTAGAAGGCTTGTTGCTGGAGTCGGTGTCG
AATCCATGTTTCCCTTGTATTCGCCAAACCTGAGGGAGATTAAAGTGTTGGACAAGAAGA
GAGTGAGAAGAGCCAAACTTTATTACCTCAGGACAAGATGAACGCTCTCAAGAGCATTAG
AGAGCAAGCACCTTTTATATTCATTCATAAAGAAGCACTCTACTCTCTTCAACAAAGTGC
TTAA

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL2359Contig1 850 2 4 U
GAAGAAGGGGGAATATACATCGATCATTCACGGTAAATATAATCATGAGGAGACCATTGC
AACCGCATCTTTTGCAGGGAAGTACATCATTGTAAAGAACATGAAAGAGGCGAATTACGT
GTGTGATTACATTCTTGGTGGTGAACTCGATGGATCTAGCTCCACAAAAGAGGAATTCAC
GAGAAATTCAAATATGCTGTGTCAAAGGGTTTTGACCCTGACAATGACCTTATCAAAGTT
GGTATTGCAAACCAAACTACAATGCTCAAGGGAGAAACAGAGGAGATTGGAAAACTAATT
GAGAGGACAATGATGCGAAAGTATGGAGTGGAAAACGTAAATGGACATTTCATCAGCTTC
AACACTATATGCGACGCTACTCAAGAAAGGCAAGATGCGATCTATGAGCTAGTGGAAGAG
AAGATAGACCTCATGCTAGTGGTAGGTGGGTGGAACTCAAGTAACACTTCTCACCTTCAG
GAGATCTCAGAGGTCCGTGGAATCCCATCTTACTGGATTGACAGTGAGCAACGGATAGGT
CCTGGGAACAAAATAGCTTATAAGCTCCACTACGGAGAGCTGGTGGAGAAGGAGAACTTT
CTTCCAAAGGGGCCAATAACCATCGGTGTGACATCAGGGGCATCAACTCCAGACAAGGTC
GTGGAAGATGTTTTGGTGAAGGTGTTTGATATTAAACGTGAAGAGTTGTTGCAGCTGGCT
TGATCCAGTCTTGTGGTTATAGACTCGATTTTTATGATGAATTTCAATAAACAAGAAGTC
GATAATAAGAATAACTTTTTTATTAATTTCTTGAGGAAAATAACTCAAAATTTCAAGCTT
TCAATTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD03TF U 1
AF RR4AD03JQ C 604
BS 1 638 RR4AD03TF
BS 639 639 RR4AD03JQ
BS 640 698 RR4AD03TF
BS 699 850 RR4AD03JQ

RD RR4AD03TF 698 0 0
GAAGAAGGGGGAATATACATCGATCATTCACGGTAAATATAATCATGAGGAGACCATTGC
AACCGCATCTTTTGCAGGGAAGTACATCATTGTAAAGAACATGAAAGAGGCGAATTACGT
GTGTGATTACATTCTTGGTGGTGAACTCGATGGATCTAGCTCCACAAAAGAGGAATTCAC
GAGAAATTCAAATATGCTGTGTCAAAGGGTTTTGACCCTGACAATGACCTTATCAAAGTT
GGTATTGCAAACCAAACTACAATGCTCAAGGGAGAAACAGAGGAGATTGGAAAACTAATT
GAGAGGACAATGATGCGAAAGTATGGAGTGGAAAACGTAAATGGACATTTCATCAGCTTC
AACACTATATGCGACGCTACTCAAGAAAGGCAAGATGCGATCTATGAGCTAGTGGAAGAG
AAGATAGACCTCATGCTAGTGGTAGGTGGGTGGAACTCAAGTAACACTTCTCACCTTCAG
GAGATCTCAGAGGTCCGTGGAATCCCATCTTACTGGATTGACAGTGAGCAACGGATAGGT
CCTGGGAACAAAATAGCTTATAAGCTCCACTACGGAGAGCTGGTGGAGAAGGAGAACTTT
CTTCCAAAGGGGCCAATAACCATCGGTGTGACATCAGGTGCATCAACTCCAGACAAGGTC
GTGGAAGATGTTTTGGTGAAGGTGTTTGATATTAAACG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AD03JQ 247 0 0
CCAAAGGGGCCAATAACCATCGGTGTGACATCAGGGGCATCAACTCCAGACAAGGTCGTG
GAAGATGTTTTGGTGAAGGTGTTTGATATTAAACGTGAAGAGTTGTTGCAGCTGGCTTGA
TCCAGTCTTGTGGTTATAGACTCGATTTTTATGATGAATTTCAATAAACAAGAAGTCGAT
AATAAGAATAACTTTTTTATTAATTTCTTGAGGAAAATAACTCAAAATTTCAAGCTTTCA
ATTTTTT

QA 1 247 1 247
DS 



AS 1 3

CO CL2360Contig1 730 3 2 U
GAGAACAGCGTGGAAGAGAAAGGTTCAGCAGATGAAACCTACACACCAGACTCAATTGCA
CTGATTCAAGTGTCTGGAACTGGAGTTCATAATCAGAAGGCACTGCAAGTTGAACCGGTG
GCAACATCTTTAAACTCGTATGAGTGCTTCCTTCTGCAATCTGGTACTTCCATGTTCCTT
TGGCATGGAAATCAAAGTGCGCATGAACTGATGGAACTAGCCGCTAAAGTTGCTGAACTC
TTGAAGCCTGGGATGACTCTCAAGCATGCCAAAGAAGGAACAGAGAGTTCAACCTTTTGG
TTTGCACTTGGAGGAAAGCAGAACTTCACCAGCAAGAAGGCAGCATCTGAGACTGTCAGG
GATCCTCACTTATACTCATTTTCTTTCAACAGAGGAAAGTTTCAGGTTGATGAGATCCAC
AACTTTGCTCAAGATGACCTCTTGACAGAGGACATATATTTGCTTGACACTCATGCTGAA
GTTTTTGTCTGGGTTGGTCAATGTGTGGACCCCAAGGAAAAGCAAACTGTGTTTGAGATT
GGCCAAAAATATGTAGAGCGTGCTGGATCCTTGGAAGGCTTGTCTCCTAAAGTTCCACTG
TACAAAATCACTGAAGGGAACGAACCATGCTTCTTCACAAGTTACTTTTCTTGGGATTCT
ACTAAAGCTATTGTGCAAGAAACTCATTCCAGAGAAGCAGCTTTGTTATTTGGCACTCAC
ACGCTGTGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN14TF U 1
AF RR4FV74TF U 280
AF RR4DN18TF U 1
BS 1 677 RR4DN14TF
BS 678 730 RR4DN18TF

RD RR4DN14TF 677 0 0
GAGAACAGCGTGGAAGAGAAAGGTTCAGCAGATGAAACCTACACACCAGACTCAATTGCA
CTGATTCAAGTGTCTGGAACTGGAGTTCATAATCAGAAGGCACTGCAAGTTGAACCGGTG
GCAACATCTTTAAACTCGTATGAGTGCTTCCTTCTGCAATCTGGTACTTCCATGTTCCTT
TGGCATGGAAATCAAAGTGCGCATGAACTGATGGAACTAGCCGCTAAAGTTGCTGAACTC
TTGAAGCCTGGGATGACTCTCAAGCATGCCAAAGAAGGAACAGAGAGTTCAACCTTTTGG
TTTGCACTTGGAGGAAAGCAGAACTTCACCAGCAAGAAGGCAGCATCTGAGACTGTCAGG
GATCCTCACTTATACTCATTTTCTTTCAACAGAGGAAAGTTTCAGGTTGATGAGATCCAC
AACTTTGCTCAAGATGACCTCTTGACAGAGGACATATATTTGCTTGACACTCATGCTGAA
GTTTTTGTCTGGGTTGGTCAATGTGTGGACCCCAAGGAAAAGCAAACTGTGTTTGAGATT
GGCCAAAAATATGTAGAGCGTGCTGGATCCTTGGAAGGCTTGTCTCCTAAAGTTCCACTG
TACAAAATCACTGAAGGGAACGAACCATGCTTCTTCACAAGTTACTTTTCTTGGGATTCT
ACTAAAGCTATTGTGCA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4FV74TF 406 0 0
AG
AGAGAGTTCAACCTTTTGGTTTGCACTTGGAGGAAAGCAGAACTTCACCAGCAAGAAGGC
AGCATCTGAGACTGTCAGGGATCCTCACTTATACTCATTTTCTTTCAACAGAGGAAAGTT
TCAGGTTGATGAGATCCACAACTTTGCTCAAGATGACCTCTTGACAGAGGACATATATTT
GCTTGACACTCATGCTGAAGTTTTTGTCTGGGTTGGTCAATGTGTGGACCCCAAGGAAAA
GCAAACTGTGTTTGAGATTGGCCAAAAATATGTAGAGCGTGCTGGATCCTTGGAAGGCTT
GTCTCCTAAAGTTCCACTGTACAAAATCACTGAAGGGAACGAACCATGCTTCTTCACAAG
TTACTTTTCTTGGGATTCTACTAAAGCTATTGTGCAAG
GAAACT

QA 3 400 3 400
DS 

RD RR4DN18TF 730 0 0
GAGAACAGCGTGGAAGAGAAAGGTTCAGCAGATGAAACCTACACACCAGACTCAATTGCA
CTGATTCAAGTGTCTGGAACTGGAGTTCATAATCAGAAGGCACTGCAAGTTGAACCGGTG
GCAACATCTTTAAACTCGTATGAGTGCTTCCTTCTGCAATCTGGTACTTCCATGTTCCTT
TGGCATGGAAATCAAAGTGCGCATGAACTGATGGAACTAGCCGCTAAAGTTGCTGAACTC
TTGAAGCCTGGGATGACTCTCAAGCATGCCAAAGAAGGAACAGAGAGTTCAACCTTTTGG
TTTGCACTTGGAGGAAAGCAGAACTTCACCAGCAAGAAGGCAGCATCTGAGACTGTCAGG
GATCCTCACTTATACTCATTTTCTTTCAACAGAGGAAAGTTTCAGGTTGATGAGATCCAC
AACTTTGCTCAAGATGACCTCTTGACAGAGGACATATATTTGCTTGACACTCATGCTGAA
GTTTTTGTCTGGGTTGGTCAATGTGTGGACCCCAAGGAAAAGCAAACTGTGTTTGAGATT
GGCCAAAAATATGTAGAGCGTGCTGGATCCTTGGAAGGCTTGTCTCCTAAAGTTCCACTG
TACAAAATCACTGAAGGGAACGAACCATGCTTCTTCACAAGTTACTTTTCTTGGGATTCT
ACTAAAGCTATTGTGCAAGAAACTCATTCCAGAGAAGCAGCTTTGTTATTTGGCACTCAC
ACGCTGTGGA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 4

CO CL2361Contig1 1046 4 3 U
GGTAGATTAATATTGATTTCAGATGAGAACTTACACAAAGCCGGCTGGGAATACATTCCC
ACCGGAACCAAGAGCCGGCAAGGACCTAGATCCCTCCAGAGTTAAGTACAAACAAACCAA
CAAACTACTACCTTATAAACAACATAAGGTTAGCTTTAGTACAGGTAAAGCCAAAGACAG
ACAGAGCTCAGGAGCAGAATACTCAACCTCGACCTCAACAACAAGCCAAGCCTACAGGGC
GATACCTCCAAACCAATTAAACCCGCTTGAAAGGAGGCCAACTGAAGCACACATTGCGAA
CATCACCAAAACATAGAATGAATCTAGAGAAGTTAAAAACCTTAACCGTTGCTGTAACAC
CCTTCAATTCCAACTAAGACTCGCCATTGGACCTTGATTGGGCTCTCCACTCGTCTTATA
TGTAGCGCCACATACTTCTCACCACCTCAGCCAAGCCTAGAAAAGCTTTCCGAAGTCTCT
TTATTAAAACAGCCGGTAGCCGGAGATTAACTACTCCAAATCCACGAAACATATAACAAC
AAAGTGGCAATCTACAATCCAAGAGAGCAAAAGCTCCCCTGTCCCAACCATAAACAACGC
CTTTAAATCTTTCAAACTAACAGGTGAGCTCACCGGAGGTCAAAGCTCTGTCCCTCGAGA
CCCACACGCACGTTCAAAGCAAACCGGAAGCCAAGACTGAAAATAGCTTCGACGAAGACT
GACTCAATCCGTAAAAGCCGACTCCACTGAGAGTCACCACAACACACCGCCACGCCAAAG
CTCCAGAAACACCATGATCTCCATTGCCGCAGACCCTCTTCACGAGCGCAAACGAGAGAG
AGCGAGAGGCGACACACCAGAACTACCAGCAAAGCGACAGAGGAGTGGATCACCAGAAAA
GCAAAGAGAGAAGACATAACAAAGGCAAAGGGGGCTTCCGGTACCGGACGCACGCTCACG
CGCCGCCGGACCAGAGCCAGGTCTCAGATCTGTTTTTGAGCTTGGAAAGAGAGAGAAGAG
GGAGAAGATGATCTTATCTCAAGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GM05JQ U 1
AF RR4FX37JQ U 40
AF RR4FX37TF C 351
AF RR4GM05TF C 461
BS 1 704 RR4GM05JQ
BS 705 753 RR4FX37JQ
BS 754 1046 RR4FX37TF

RD RR4GM05JQ 704 0 0
GGTAGATTAATATTGATTTCAGATGAGAACTTACACAAAGCCGGCTGGGAATACATTCCC
ACCGGAACCAAGAGCCGGCAAGGACCTAGATCCCTCCAGAGTTAAGTACAAACAAACCAA
CAAACTACTACCTTATAAACAACATAAGGTTAGCTTTAGTACAGGTAAAGCCAAAGACAG
ACAGAGCTCAGGAGCAGAATACTCAACCTCGACCTCAACAACAAGCCAAGCCTACAGGGC
GATACCTCCAAACCAATTAAACCCGCTTGAAAGGAGGCCAACTGAAGCACACATTGCGAA
CATCACCAAAACATAGAATGAATCTAGAGAAGTTAAAAACCTTAACCGTTGCTGTAACAC
CCTTCAATTCCAACTAAGACTCGCCATTGGACCTTGATTGGGCTCTCCACTCGTCTTATA
TGTAGCGCCACATACTTCTCACCACCTCAGCCAAGCCTAGAAAAGCTTTCCGAAGTCTCT
TTATTAAAACAGCCGGTAGCCGGAGATTAACTACTCCAAATCCACGAAACATATAACAAC
AAAGTGGCAATCTACAATCCAAGAGAGCAAAAGCTCCCCTGTCCCAACCATAAACAACGC
CTTTAAATCTTTCAAACTAACAGGTGAGCTCACCGGAGGTCAAAGCTCTGTCCCTCGAGA
CCCACACGCACGTTCAAAGCAAACCGGAAGCCAAGACTGAAAAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4FX37JQ 714 0 0
GCCGGCTGGGAATACATTCCCACCGGAACCAAGAGCCGGCAAGGACCTAGATCCCTCCAG
AGTTAAGTACAAACAAACCAACAAACTACTACCTTATAAACAACATAAGGTTAGCTTTAG
TACAGGTAAAGCCAAAGACAGACAGAGCTCAGGGGCAGAATACTCAACCTCGACCTCAAC
AACAAGCCAAGCCTACAGGGCGATACCTCCAAACCAATTAAACCCGCTTGAAAGGAGGCC
AACTGAAGCACACATTGCGAACATCACCAAAACATAGAATGAATCTAGAGAAGTTAAAAA
CCTTAACCGTTGCTGTAACACCCTTCAATTCCAACTAAGACTCGCCATTGGACCTTGATT
GGGCTCTCCACTCGTCTTATATGTAGCGCCACATACTTCTCACCACCTCAGCCAAGCCTA
GAAAAGCTTTCCGAAGTCTCTTTATTAAAACAGCCGGTAGCCGGAGATTAACTACTCCAA
ATCCACGAAACATATAACAACAAAGTGGCAATCTACAATCCAAGAGAGCAAAAGCTCCCC
TGTCCCAACCATAAACAACGCCTTTAAATCTTTCAAACTAACAGGTGAGCTCACCGGAGG
TCAAAGCTCTGTCCCTCGAGACCCACACGCACGTTCAAAGCAAACCGGAAGCCAAGACTG
AAAATAGCTTCGACGAAGACTGACTCAATCCGTAAAAGCCGACTCCACTGAGAG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FX37TF 696 0 0
GCTGTAACACC*TTCAATTCCAACTAAGACTCGCCATTGGACCTTGATTGGGCTCTCCAC
TCGTCTTATATGTAGCGCCACATACTTCTCACCACCTCAGCCAAGCCTAGAAAAGCTTTC
CGAAGTCTCTTTATTAAAACAGCCGGTAGCCGGAGATTAACTACTCCAAATCCACGAAAC
ATATAACAACAAAGTGGCAATCTACAATCCAAGAGAGCAAAAGCTCCCCTGTCCCAACCA
TAAACAACGCCTTTAAATCTTTCAAACTAACAGGTGAGCTCACCGGAGGTCAAAGCTCTG
TCCCTCGAGACCCACACGCACGTTCAAAGCAAACCGGAAGCCAAGACTGAAAATAGCTTC
GACGAAGACTGACTCAATCCGTAAAAGCCGACTCCACTGAGAGTCACCACAACACACCGC
CACGCCAAAGCTCCAGAAACACCATGATCTCCATTGCCGCAGACCCTCTTCACGAGCGCA
AACGAGAGAGAGCGAGAGGCGACACACCAGAACTACCAGCAAAGCGACAGAGGAGTGGAT
CACCAGAAAAGCAAAGAGAGAAGACATAACAAAGGCAAAGGGGGCTTCCGGTACCGGACG
CACGCTCACGCGCCGCCGGACCAGAGCCAGGTCTCAGATCTGTTTTTGAGCTTGGAAAGA
GAGAGAAGAGGGAGAAGATGATCTTATCTCAAGTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4GM05TF 586 0 0
AAAAGCTTTCCGAAGTCTCTTTATTAAAACAGCCGGTAGCCGGAGATTAACTACTCCAAA
TCCACGAAACATATAACAACAAAGTGGCAATCTACAATCCAAGAGAGCAAAAGCTCCCCT
GTCCCAACCATAAACAACGCCTTTAAATCTTTCAAACTAACAGGTGAGCTCACCGGAGGT
CAAAGCTCTGTCCCTCGAGACCCACACGCACGTTCAAAGCAAACCGGAAGCCAAGACTGA
AAATAGCTTCGACGAAGACTGACTCAATCCGTAAAAGCCGACTCCACTGAGAGTCACCAC
AACACACCGCCACGCCAAAGCTCCAGAAACACCATGATCTCCATTGCCGCAGACCCTCTT
CACGAGCGCAAACGAGAGAGAGCGAGAGGCGACACACCAGAACTACCAGCAAAGCGACAG
AGGAGTGGATCACCAGAAAAGCAAAGAGAGAAGACATAACAAAGGCAAAGGGGGCTTCCG
GTACCGGACGCACGCTCACGCGCCGCCGGACCAGAGCCAGGTCTCAGATCTGTTTTTGAG
CTTGGAAAGAGAGAGAAGAGGGAGAAGATGATCTTATCTCAAGTCC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 4

CO CL2362Contig1 587 4 1 U
GGATTCAACAAGTTAAAAAAAATTAACTCGGATCATCGATCTCAAACGCTTCTCGTTTCG
TTTCATCTTAATTATCGTAGCCATGTCTCAGACTGTGGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATG
CCAAGACTGCGTTGGTGCCGTCAACAGAGTCTTGGGCAAAATGGAAGGGGTTGAGTCATT
TGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGAAAGTGAAAGGTAATGTTGAGCCTGAAGCAGT
TTTTCAAACAGTTTCAAAGACGGGAAAGAAGAATTCTTACTGGCCTGTGGAGTCTGAGGT
TGAGTGTAAAGCTGAGGCCGAACCTAAGGCTGAGGTCGTGACGACTGAGACTAATACTGA
GGCTGAGACTAAGACGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAAGCCTGATATTGAACCAATACT
CGCAGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAGTACTCAAGATTACAATGAGGCTTCT
TATCTGTATTTGGAATGCTACTTATTATCTCTGGATTGTATTGTTGTAAGAACTAAGAAA
TTTGTAATTTCTCTGAGTACCTAATACAGTATGTTTCAACTTTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4EI63JQ C 1
AF RR4EI63TF U 1
AF RR4E073JQ C 65
AF RR4E073TF U 83
BS 1 587 RR4EI63TF

RD RR4EI63JQ 587 0 0
GGATTCAACAAGTTAAAAAAAATTAACTCGGATCATCGATCTCAAACGCTTCTCGTTTCG
TTTCATCTTAATTATCGTAGCCATGTCTCAGACTGTGGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATG
CCAAGACTGCGTTGGTGCCGTCAACAGAGTCTTGGGCAAAATGGAAGGGGTTGAGTCATT
TGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGAAAGTGAAAGGTAATGTTGAGCCTGAAGCAGT
TTTTCAAACAGTTTCAAAGACGGGAAAGAAGAATTCTTACTGGCCTGTGGAGTCTGAGGT
TGAGTGTAAAGCTGAGGCCGAACCTAAGGCTGAGGTCGTGACGACTGAGACTAATACTGA
GGCTGAGACTAAGACGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAAGCCTGATATTGAACCAATACT
CGCAGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAGTACTCAAGATTACAATGAGGCTTCT
TATCTGTATTTGGAATGCTACTTATTATCTCTGGATTGTATTGTTGTAAGAACTAAGAAA
TTTGTAATTTCTCTGAGTACCTAATACAGTATGTTTCAACTTTTGAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EI63TF 587 0 0
GGATTCAACAAGTTAAAAAAAATTAACTCGGATCATCGATCTCAAACGCTTCTCGTTTCG
TTTCATCTTAATTATCGTAGCCATGTCTCAGACTGTGGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATG
CCAAGACTGCGTTGGTGCCGTCAACAGAGTCTTGGGCAAAATGGAAGGGGTTGAGTCATT
TGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGAAAGTGAAAGGTAATGTTGAGCCTGAAGCAGT
TTTTCAAACAGTTTCAAAGACGGGAAAGAAGAATTCTTACTGGCCTGTGGAGTCTGAGGT
TGAGTGTAAAGCTGAGGCCGAACCTAAGGCTGAGGTCGTGACGACTGAGACTAATACTGA
GGCTGAGACTAAGACGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAAGCCTGATATTGAACCAATACT
CGCAGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAGTACTCAAGATTACAATGAGGCTTCT
TATCTGTATTTGGAATGCTACTTATTATCTCTGGATTGTATTGTTGTAAGAACTAAGAAA
TTTGTAATTTCTCTGAGTACCTAATACAGTATGTTTCAACTTTTGAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4E073JQ 523 0 0
GGAAACATCTTA
GTAGCCATGTCTCAGACTGTGGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCCAAGACTGCGTTGGT
GCCGTCAACAGAGTCTTGGGCAAAATGGAAGGGGTTGAGTCATTTGACATTGATATAAAG
GAGCAAAAGGTGAAAGTGAAAGGTAATGTTGAGCCTGAAGCAGTTTTTCAAACAGTTTCA
AAGACGGGAAAGAAGAATTCTTACTGGCCTGTGGAGTCTGAGGTTGAGTGTAAAGCTGAG
GCCGAACCTAAGGCTGAGGTCGTGACGACTGAGACTAATACTGAGGCTGAGACTAAGACG
ACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAAGCCTGATATTGAACCAATACTCGCAGAAGCTGAGACT
AAGCCATCACAAGTTTAAGTACTCAAGATTACAATGAGGCTTCTTATCTGTATTTGGAAT
GCTACTTATTATCTCTGGATTGTATTGTTGTAAGAACTAAGAAATTTGTAATTTCTCTGA
GTACCTAATACAGTATGTTTCAACTTTTGAT

QA 13 523 13 523
DS 

RD RR4E073TF 505 0 0
ATGTCTCAAACTGTGGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCCAAGACTGCGTTGGTGCCGTC
AACAGAGTCTTGGGCAAAATGGAAGGGGTTGAGTCATTTGACATTGATATAAAGGAGCAA
AAGGTGAAAGTGAAAGGTAATGTTGAGCCTGAAGCAGTTTTTCAAACAGTTTCAAAGACG
GGAAAGAAGAATTCTTACTGGCCTGTGGAGTCTGAGGTTGAGTGTAAAGCTGAGGCCGAA
CCTAAGGCTGAGGTCGTGACGACTGAGACTAATACTGAGGCTGAGACTAAGACGACTGAG
GCTAAGGTTGATGCAAAGCCTGATATTGAACCAATACTCGCAGAAGCTGAGACTAAGCCA
TCACAAGTTTAAGTACTCAAGATTACAATGAGGCTTCTTATCTGTATTTGGAATGCTACT
TATTATCTCTGGATTGTATTGTTGTAAGAACTAAGAAATTTGTAATTTCTCTGAGTACCT
AATACAGTATGTTTCAACTTTTGAT

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 4

CO CL2363Contig1 1074 4 9 U
GGACAGCCTGGGAAACGCTTCACCGAGCAAGCAGCAAAGTTCTATGTAGCGGAGGTTCTC
CTTGCAATGGAGTATCTACACATGCTTGGGATCATATACCGTGATCTGAAGCCTGAGAAT
GTTCTTGTGAGAGATGATGGACACGTGATGCTTTCGGATTTTGATCTCTCCTTGAGATGT
ACCGTTAGCCTCTCTATAGTCAGATCAACCAATCCTGGATCCGAAGGTTTGTCAAAGAAC
TCAGTTTCTTGCTCTCAGCAACCCGCTTGCATCCAACAGCCATCCTGCATCTCAATGGCT
CCAACCTCTTGCTTCGGTCCTCGGTTCTTCTCATCCAAGTCTAAGAAGGACAAGAAGGCA
AAGACAGATAACGGAAACCACCAAGTAACTCCCTTACCAGAGCTCGTTGCTGAGCCGACA
AGCGCCCGTTCCATGTCATTTGTGGGGACGCACGAGTACTTGGCTCCAGAGATCATCAAA
GGCGAAGGGCATGGAAGCGCGGTTGACTGGTGGACTTTTGGGATCTTTCTTTATGAGTTG
TTGTTTGGTAAAACACCGTTTAAAGGCTCAGGGAATAGAGCAACGCTGTTCAATGTAGTT
GGTCAGCCTCTGAGGTTCCCTGAGTCTCCGGTTGTTAGCTTTGCGGCTAGAGATTTGATA
AGGAGTTTGCTTGTGAAAGAGCCACAGCATAGGTTAGCTTACAAGCGTGGAGCAACAGAG
ATGAAACAACATCCTTTCTTTGAAGGAGTGAATTGGGCTCTGGTTCGGTGTGCCACTCCA
CCTGAAGTTCCTAAGCCTGTTGATCTTGAACCGGTGAAACATGCTCCTGCTACACCTGCT
TCTGCTGCATCCACAAGCGTGAGATCTGACCAGAGCAATTATCTTGAGTTTGATTTCTTC
TGAACTATTTGGATGATTCTCTTATTGTTTCTTGTTTAGTTTATTTGAAACATGTGTTCT
TTCTTTTGTCTGGACAAGCTCTGAGATTTGTATCATTCTTCAAATATCTGAGACAGTTTC
TGTACTATCTTCTTAAGCTTTAATGTTAAGACCCACGAACCATTAAGAATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B060TF U 1
AF RR4DJ22TF U 263
AF RR4B060JQ C 297
AF RR4DJ22JQ C 341
BS 1 275 RR4B060TF
BS 276 276 RR4DJ22TF
BS 277 293 RR4B060TF
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BS 295 454 RR4B060TF
BS 455 455 RR4DJ22TF
BS 456 690 RR4B060TF
BS 691 894 RR4DJ22TF
BS 895 1074 RR4B060JQ

RD RR4B060TF 690 0 0
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CTTGCAATGGAGTATCTACACATGCTTGGGATCATATACCGTGATCTGAAGCCTGAGAAT
GTTCTTGTGAGAGATGATGGACACGTGATGCTTTCGGATTTTGATCTCTCCTTGAGATGT
ACCGTTAGCCTCTCTATAGTCAGATCAACCAATCCTGGATCCGAAGGTTTGTCAAAGAAC
TCAGTTTCTTGCTCTCAGCAACCCGCTTGCATCCAGCAGCCATCCTGCATCTCGATGGCT
CCAACCTCTTGCTTCGGTCCTCGGTTCTTCTCATCCAAGTCTAAGAAGGACAAGAAGGCA
AAGACAGATAACGGAAACCACCAAGTAACTCCCTTACCAGAGCTCGTTGCTGAGCCGACA
AGCGCCCGTTCCATGTCATTTGTGGGGACGCACGGGTACTTGGCTCCAGAGATCATCAAA
GGCGAAGGGCATGGAAGCGCGGTTGACTGGTGGACTTTTGGGATCTTTCTTTATGAGTTG
TTGTTTGGTAAAACACCGTTTAAAGGCTCAGGGAATAGAGCAACGCTGTTCAATGTAGTT
GGTCAGCCTCTGAGGTTCCCTGAGTCTCCGGTTGTTAGCTTTGCGGCTAGAGATTTGATA
AGGAGTTTGCTTGTGAAAGAGCCACAGCAT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4DJ22TF 632 0 0
G
CGCTTGCATCCAACAGCCATCCTGCATCTCAATGGCTCCAACCTCTTGCTTCGGTCCTCG
GTTCTTCTCATCCAAGTCTAAGAAGGACAAGAAGGCAAAGACAGATAACGGAAACCACCA
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GGGGACGCACGAGTACTTGGCTCCAGAGATCATCAAAGGCGAAGGGCATGGAAGCGCGGT
TGACTGGTGGACTTTTGGGATCTTTCTTTATGAGTTGTTGTTTGGTAAAACACCGTTTAA
AGGCTCAGGGAATAGAGCAACGCTGTTCAATGTAGTTGGTCAGCCTCTGAGGTTCCCTGA
GTCTCCGGTTGTTAGCTTTGCGGCTAGAGATTTGATAAGGAGTTTGCTTGTGAAAGAGCC
ACAGCATAGGTTAGCTTACAAGCGTGGAGCAACAGAGATGAAACAACATCCTTTCTTTGA
AGGAGTGAATTGGGCTCTGGTTCGGTGTGCCACTCCACCTGAAGTTCCTAAGCCTGTTGA
TCTTGAACCGGTGAAACATGCTCCTGCTACACCTGCTTCTGCTGCATCCACAAGCGTGAG
ATCTGACCAGAGCAATTATCTTGAGTTTGAT

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR4B060JQ 778 0 0
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GGCAAAGACAGATAACGGAAACCACCAAGTAACTCCCTTACCAGAGCTCGTTGCTGAGCC
GACAAGCGCCCGTTCCATGTCATTTGTGGGGACGCACGGGTACTTGGCTCCAGAGATCAT
CAAAGGCGAAGGGCATGGAAGCGCGGTTGACTGGTGGACTTTTGGGATCTTTCTTTATGA
GTTGTTGTTTGGTAAAACACCGTTTAAAGGCTCAGGGAATAGAGCAACGCTGTTCAATGT
AGTTGGTCAGCCTCTGAGGTTCCCTGAGTCTCCGGTTGTTAGCTTTGCGGCTAGAGATTT
GATAAGGAGTTTGCTTGTGAAAGAGCCACAGCATAGGTTAGCTTACAAGCGTGGAGCAAC
AGAGATGAAACAACATCCTTTCTTTGAAGGAGTGAATTGGGCTCTGGTTCGGTGTGCCAC
TCCACCTGAAGTTCCTAAGCCTGTTGATCTTGAACCGGTGAAACATGCTCCTGCTACACC
TGCTTCTGCTGCATCCACAAGCGTGAGATCTGACCAGAGCAATTATCTTGAGTTTGATTT
CTTCTGAACTATTTGGATGATTCTCTTATTGTTTCTTGTTTAGTTTATTTGAAACATGTG
TTCTTTCTTTTGTCTGGACAAGCTCTGAGATTTGTATCATTCTTCAAATATCTGAGACAG
TTTCTGTACTATCTTCTTAAGCTTTAATGTTAAGACCCACGAACCATTAAGAATCCCC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4DJ22JQ 683 0 0
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AGCTCGTTGCTGAGCCGACAAGCGCCCGTTCCATGTCATTTGTGGGGACGCACGAGTACT
TGGCTCCAGAGATCATCAAAGGCGAAGGGCATGGAAGCGCGGTTGACTGGTGGACTTTTG
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ACAAGCGTGGAGCAACAGAGATGAAACAACATCCTTTCTTTGAAGGAGTGAATTGGGCTC
TGGTTCGGTGTGCCACTCCACCTGAAGTTCCTAAGCCTGTTGATCTTGAACCGGTGAAAC
ATGCTCCTGCTACACCTGCTTCTGCTGCATCCACAAGCGTGAGATCTGACCAGAGCAATT
ATCTTGAGTTTGATTTCTTCTGAACTATTTGGATGATTCTCTTATTGTTTCTTGTTTAGT
TTATTTGAAACATGTGTTCTTTCTTTTGTCTGGACAAGCTCTGAGATTTGTATCATTCTT
CAAATATCTGAGACAGTTTCTG
C

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

CO CL2364Contig1 696 4 14 U
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TCTTTGGAGGAAGGATGCAGATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAG
AAGTTGAGAGCAGCGATACCATCGACAATGTCAAATCCAAAATCCAGGATAAAGAGGGGA
TACCACCAGATCAACAGAGGCTAATCTTTGCTGGGAAACAGCTAGAGGATGGCCGAACAC
TCGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTG
GCACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACCGGCAAAGAGATCGAGATTGATATCGAACCTA
CCGACACTATCGATCGCATCAAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCC
AACAAAGGCTCATCTACGCTGGAAAACAGCTAGCTGACGACAAAACGGCAAAAGACTACA
ACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTTCATCTGGTCCTTACTCTTAGAGGTGGTGGTTTTGGTC
TTCTCTGAGAAGTTAGCTCTTTTTTCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAAT
TTGGATTACTATGGGGTTTGGATCAGTTTACCAATAATCTCTCCAATATCGGATCAAAAA
TAATATTTATTTGGATTTGGTTACTTTTGACAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ15JQ C 1
AF RR4FZ15TF U 1
AF RR4E864TF U 19
AF RR4E864JQ C 305
BS 1 370 RR4FZ15TF
BS 371 371 RR4E864TF
BS 372 421 RR4FZ15TF
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BS 645 645 RR4E864TF
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BS 661 682 RR4FZ15TF
BS 683 696 RR4E864TF

RD RR4FZ15JQ 682 0 0
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TCTTTGGAGGAAGGATGCAGATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAG
AAGTTGAGAGCAGCGATACCATCGACAATGTCAAATCCAAAATCCAGGATAAAGAGGGGA
TACCACCAGATCAACAGAGGCTAATCTTTGCTGGGAAACAGCTAGAGGATGGCCGAACAC
TCGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTG
GCACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACCGGCAAAGAGATCGAGATTGATATCGAACCTA
CCGACACTATTGATCGCATCAAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCC
AGCAAAGGCTCATCTACGCTGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACA
ACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTTCATCTGGTCCTTACTCTTAGAGGTGGTTGTTTTGGTC
TTCTCTGAGAAGTTAGCTCTTTTTTCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAAT
TTGGATTACTATGGGGTTTGGATCAGTTTACCAATAATCTCTCCGATATCGGATCAAAAA
TAATATTTATTTGGATTTGGTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4FZ15TF 682 0 0
GGACTTTGACTTTGAGTCGTGAATCAGAGGCAGAGACAAATAGAGAGAGAAATCAAGAAA
TCTTTGGAGGAAGGATGCAGATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAG
AAGTTGAGAGCAGCGATACCATCGACAATGTCAAATCCAAAATCCAGGATAAAGAGGGGA
TACCACCAGATCAACAGAGGCTAATCTTTGCTGGGAAACAGCTAGAGGATGGCCGAACAC
TCGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTG
GCACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACCGGCAAAGAGATCGAGATTGATATCGAACCTA
CCGACACTATTGATCGCATCAAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCC
AGCAAAGGCTCATCTACGCTGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACA
ACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTTCATCTGGTCCTTACTCTTAGAGGTGGTTGTTTTGGTC
TTCTCTGAGAAGTTAGCTCTTTTTTCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAAT
TTGGATTACTATGGGGTTTGGATCAGTTTACCAATAATCTCTCCGATATCGGATCAAAA*
TAATATTTATTTGGATTTGGTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4E864TF 678 0 0
GG
GAATCAGAGGCAGAGACAGTTAGAGAGAGAAATAAAGAAATCTTTGGAGGAAGGATGCAG
ATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTCGAAGTTGAGAGCAGCGATACC
ATCGACAATGTCAAATCCAAAATCCAGGATAAAGAGGGGATACCACCAGATCAACAGAGG
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AAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAG
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AAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACAAAGGCTCATCTACGCT
GGAAAACAGCTAGCTGACGACAAAACGGCGAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGTT
CTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGAGGTGGTGGTTTTGGTCTTCTCTGATAAGTTAGCTCT
TTTTTCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAATTTGGATTACTATGGGGTTTG
GATCAGTTTACCAATAATCTCTCCAATATCGGATCAAAAATAATATTTATTTGGATTTGG
TTACTTTTGACAAAAA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR4E864JQ 387 0 0
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CACTATCGATCGCATCAAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACA
AAGGCTCATTTACGCTGGAAAACAGCTAGCTGACGACAAAACGGCGAAAGACTACAACAT
CGAGGGAGGCTCTGTTCTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGAGGTGGTGGTTTTGGTCTTTT
CTGATAAGTTAGCTCTTTTTTCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAATTTGG
ATTACTATGGGGTTTGGATCAGTTTACCAATAATCTCTCCAATATCGGATCAAAAATAAT
ATTTATTTGGATTTGGTTACTTTTGAC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 2 4

CO CL2365Contig1 781 2 21 U
GGAAATCAAAGGTTTAAAAAGTGTATTGATGGGATGATTCATATGACTAGTCTCATAAAG
TTTGCATTACTACAAAATGTGTGTCAATGTCTCACTTTCAAAAAAAAAAAAAAACAAGAT
ATTTTTTGGTGCCGGTCGATATATGTCTGGAGAAGTCTAGCCTCAGGTTCCTCCCTTCTT
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GTGCCCACTTCCTGATCAAAGCCTGACGGTTCAAATCTTTAGCCTTGCCAGCATATATAC
GAAATTCAAATGTTAGCCGGCTCGACATCTCGCTCACCTGGTCCAGCTTTTCACCAACAC
CTAGGACTTCCTGCACATTCCTCGTCATTATCTGATGAACCTCATAAAGCTCATCATTCA
GCTTAAAGATATTCCGTTGCGTACGAATGTCTTGGTACAGCTTCTTCGTTTTCTGTATGA
ATGTATCAAACTTAATAAAGGCATAAGGTCAAGCAGCTGTCTCAATGTTAGGCCCATTAA
CACGTTCAAACTCGTTCCTGAGGTCTTCCAGGTACTGGAAAGCCAGCTTCTTAGGGTAAG
AGCGGTCACACATCGTCAAGTAGCAAACACGTCCTTCTATGATGTAATGGAAAACATAGG
GACCAGTCTCAACGGACATTCTCGAAGCTTCGTTGTGACCTCTGGAGAGATTCTTAAACA
GAGCCTTGACCTGTTGCTTGTACATGTCGGAATCAGGCAAGTCACGTCCATCGTCAAGAC
C


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 

AF RR4GS79JQ U 154
AF RR4BK81JQ U 1
BS 1 170 RR4BK81JQ
BS 171 171 RR4GS79JQ
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BS 174 223 RR4BK81JQ
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BS 539 539 RR4GS79JQ
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BS 614 614 RR4GS79JQ
BS 615 781 RR4BK81JQ

RD RR4GS79JQ 624 0 0
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ACACGACTCCAAGCACGATGGCAACTGGTGCCCACTTCCTGATCAAAGCCTGACGGTTCA
AATCTTTAGCCTTGCCAGCATATATACGAAATTCAAATGTTAGTCGGCTCGACATCTCGC
TCACCTGGTCCAGCTTTTCACCAACACCTAGGACTTCCTGCACATTCCTCGTCATTATCT
GATGAACCTCATAGAGTTCATCATTCAGCTTAAAGATATTCCGTTGCGTACGAGTGTCTT
GGTACAGCTTCTTCGTTTTCTGTATGAATGTATCAAACTTAATAAAGGCATAAGGTCGAG
CAGCTGTCTCAATGTTAGGCCCATTAACACGTTCAAACTCGTTCCTGAGGTCTTCCAGGT
ACTGGAAAGCCAGTTTCTTAGGGTAAGAGCGGTCACACATCGTCAAGTAGCAAACACGTC
CTTCTATGATGTAATGGAAAACATAGGGGCCAGTCTCAACGGACATTCTCGAAGCTTCGT
TGTGACCTCTGGAGAGATTCTTAAACAGAGCCTTGACCTGTTGCTTGTACATGTCGGAAT
CAGGCAAGTCACGTCCATCGTCAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4BK81JQ 781 0 0
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TTTGCATTACTACAAAATGTGTGTCAATGTCTCACTTTCAAAAAAAAAAAAAAACAAGAT
ATTTTTTGGTGCCGGTCGATATATGTCTGGAGAAGTCTAGCCTCAGGTTCTTTCCTTCTT
ACCAAAGCTTGTTCTTAACCCAAAAAAAAAGGAACACGACTCCTAACACAATCGCAACTG
GTGCCCACTTCCTGATCAAAGCCTGACGGTTCAAATCTTTAGCCTTGTCAGCATATATAC
GAAATTCAAATGTTAGCCGGCTCGACATCTCGCTCACCTGGTCTAGCTTTTCACCAACAC
CTAGGACTTCCTGCACATTCCTCGTCATTATCTGATGGACCTCATAAAGCTCATCATTCA
GCTTAAAGATATTCCGTTGCGTACGAATGTCTTGGTACAGCTTCTTCGTTTTCTGTATGA
ATGTATCAAACTTAATAAAGGCATAAGGTCAAGCAGCTGTCTCAATGTTAGGCCCGTTGA
CACGTTCAAACTCGTTCCTGAGGTCTTCCAGGTACTGGAACGCCAGCTTCTTAGGGTAAG
AGCGGTCACACATTGTCAAGTAGCAAACACGTCCTTCTATGATGTAATGGAAAACATAGG
GACCAGTCTCAACGGACATTCTCGAAGCTTCGTTGTGACCTCTGGAGAGATTCTTAAACA
GAGCCTTGACCTGTTGCTTGTACATGTCGGAATCAGGCAAGTCACGTCCATCGTCAAGAC
C

QA 1 781 1 781
DS 



CO CL2365Contig2 716 2 19 U
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TATTGGAGAAGAAGGGAAGGGAGTAAGGTCTAATCAAGATGGTGAAGATGACATTGATAG
CTCGTGTTACCGACGGCTTGCCTCTAGCCGAAGGTCTTGACGATGGACGTGACTTGCCTG
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GACGTGTTTGCTACTTGACAATGTGTGACCGCTCTTACCCTAAGAAACTGGCGTTCCAGT
ACCTGGAAGACCTCAGGAACGAGTTTGAACGTGTCAACGGGCCTAACATTGAGACAGCTG
CTCGACCTTATGCCTTTATTAAGTTTGATACATTCATACAGAAAACGAAGAAGCTGTACC
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GCGAGATGTCGAGCCGACTAACATCTGAATCTCGTATATATGCTGACAAGCTAAAGATTT
GAACCGTCAGCTTTGATCAGAAGTGGGCACAGTTGCATCGTGCTTGGAGTCGTGTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GS79TF U 1
AF RR4DP58TF U 6
BS 1 40 RR4GS79TF
BS 41 44 RR4DP58TF
BS 45 55 RR4GS79TF
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BS 354 394 RR4GS79TF
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BS 536 536 RR4DP58TF
BS 537 589 RR4GS79TF
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BS 591 645 RR4GS79TF
BS 646 646 RR4DP58TF
BS 647 716 RR4GS79TF

RD RR4GS79TF 716 0 0
TCCTCCTGGTTCTCAGATCCTCAAATCGAGAAGAACCATT****CAGTGAGCTTTGTTGT
TATTGGAGAAGAAGGGAAGGGAGTAAGGTCTAATCAAGATGGTGAAGATGACATTGATAG
CTCGTGTTACCGACGGCTTGCCTCTAGCCGAAGGTCTTGACGATGGACGTGACTTGCCTG
ATTCCGACATGTACAAGCAACAGGTCAAGGCTCTGTTTAAGAATCTCTCCAGAGGTCACA
ACGAAGCTTCGAGAATGTCCGTTGAGACTGGCCCCTATGTTTTCCATTACATCATAGAAG
GACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCTAAGAAACTGGCTTTCCAGT
ACCTGGAAGACCTCAGGAACGAGTTTGAACGTGTTAATGGGCCTAACATTGAGACAGCTG
CTCGACCTTATGCCTTTATTAAGTTTGATACATTCATACAGAAAACGAAGAAGCTGTACC
AAGACACTCGTACGCAACGGAATATCTCTAAGCTGAATGATGAACTCTATGAGGTTCATC
AGATAATGACGAGGAATGTGCAGGAAGTCCTAGGTGTTGGTGAAAAGCTGGACCAGGTGA
GCGAGATGTCGAGCCGACTAACATCTGAATCTCGTATATATGCTGGCAAGCTAAAGATTT
GAACCGTCAGCTTTGATCAGAAGTGGGCACAGTTGCATCGTGCTTGGAGTCGTGTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DP58TF 663 0 0
GGTC
TTCTCAGATCCTCAAATCGAGAAGAACCATTCATTCAGTGAGTTTTATTGTTATTGGAGA
AGAAGGGAAGGGAGTAAGGTCTAATCAAGATGGTGAAGATGACATTGATAGCTCGTGTTA
CCGACGGCTTGCCTCTAGCCGAAGGTCTTGACGATGGACGTGACTTGCCTGATTCCGACA
TGTACAAGCAACAGGTCAAGGCTCTGTTTAAGAATCTCTCCAGAGGTCACAACGAAGCTT
CGAGAATGTCCGTTGAGACTGGTCCCTATGTTTTCCATTACATCATAGAAGGACGTGTTT
GCTACTTGACAATGTGTGACCGCTCTTACCCTAAGAAGCTGGCGTTCCAGTACCTGGAAG
ACCTCAGGAACGAGTTTGAACGTGTCAACGGGCCTAACATTGAGACAGCTGCTCGACCTT
ATGCCTTTATTAAGTTTGATACATTCGTACAGAAAACGAAGAAGCTGTACCAAGACACTC
GTACGCAACGGAATATCTCTAAGCTGAATGATGAGCTCTATGAGGTCCATCAGATAATGA
CGAGGAATGTGCAGGAAGTCCTAGGTGTTGGTGAAAAGCTAGACCAGGTGAGCGAGATGT
CGAGCCGGCTAACATCTGAATCTCGTATATATGCTGACAAGCTAAAGATTTGAACCGTC

QA 5 663 5 663
DS 



AS 1 3

CO CL2366Contig1 1086 3 5 U
GATAAAACGTCTTAGTTTCATTTAGATCCGATCCTTAGCAGCAAAATGAACAATTTGGTA
CATGTTTCGAAGGTACAAAGAGGGAGATAGAGATTAGAACTTTGGAAGAACCTATAAGAT
GAAAAGAGTAAGAAAACTCAAGTGTGATCGTCTGCGTTCAGAGAAGTAACGAAGATCACT
ATGCCAACTAACAAATCCTCCTTATAGCTGTGAAAACTGTAGGATACAACAGAAGAGAGA
GAAGAAACCGGAGATGAACATTCGAAAATTTGCCGAGTTTTCTAACGAATTCTTCAAGAG
TCTTGTGCAGAGTCATCATCGGCATTGGCTGTTTGGTCACCAGGAAGACCAAATATTCGT
AGGTTACGGTCCATGGAACCAACTGCAACGTATTGTGCATCTGGACCAAACTTCACACAT
GTAGCTTTACCAGTGCCGGAGAGATCAGGGAGTGTCTTAATAAGGTTCCATTCAGCTTTC
ACACTCGCCGTCTGGTATAGCCTGATATCTGATGCAGCAACTCCAAGATAAGGTCCGCTA
GGGTCAAACTCCACAGAGTTTGCATCTGCGGATAAGAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTG
CGCAGGTCCCACAACCTAACACCATCCTCGGCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCA
GAGAAAGATATAGAGGTAACTTCACCGGTGTGTCCATCAAACCTCGCCACATTTGCCTGA
CTCTTAACATCCCAAATCTTAACAAAAGATTGAGAAGTACCGGTTCCGAGAATAAGACCA
TCAGGATGAAAAGCAGCAGCCGTGTAATCCACCCTCTCAGAATCATCCGATACCTTTGCA
AGGCATAAGCCAGAGGAAAGATCGTAGAAGCACCATGTACTGTCAAGAGATGCCGACACG
AAGTATTTATTTGTGGCATGCACAGTTACAGCTCGCACCTCTGCAGAATGATCATTCAAT
GTATGCCCACAAGCATAATTCCTATCCCCAGAATCCCGCCAGATACGGACTGTCTTGTCA
GCCGAAGCAGTTAAAACAAGATCACTGTCACCTACGAATTTTAAACTTGTAACCTTTTTC
GAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK24JQ U 1
AF RR4BQ05JQ U 96
AF RR4FK24TF C 427
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BS 697 702 RR4BQ05JQ
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BS 839 1086 RR4FK24TF

RD RR4FK24JQ 696 0 0
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CATGTTTCGAAGGTACAAAGAGGGAGATAGAGATTAGAACTTTGGAAGAACCTATAAGAT
GAAAAGAGTAAGAAAACTCAAGTGTGATCGTCTGCGTTCAGAGAAGTAACGAAGATCACT
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GTAGCTTTACCAGTGCCGGAGAGATCAGGGAGTGTCTTAATAAGGTTCCATTCAGCTTTC
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GGGTCAAACTCCACAGAGTTTGCATCTGCGGATAAGAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTG
CGCAGGTCCCACAACCTAACACCATCCTCGGCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCA
GAGAAAGATATAGAGGTAACTTCACCGGTGTGTCCA

QA 1 696 1 696
DS 

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GTTCAGAGAAGTAACGAAGATCACTATGCCAACTAACAAATCCTCCTTATAGCTGTGAAA
ACTGTAGGATACAACAGAAGAGAGAGAAGAAACCGGAGATGAACATTCGAAAATTTGCCG
AGTTTTCT**CGAATTCTTCAAGAGTCTTGTGCAGAGTCATCATCGGCATTGGCTGTTTG
GTCACCAGGAAGACCAAATATTCGTAGGTTACGGTCCATGGAACCAACTGCAACGTATTG
TGCATCTGGACCAAACTTCACACATGTAGCTTTACCAGTGCCGGAAAGATCAGGGAGTGT
CTTAATAAGGTTCCATTCAGCTTTCACACTCGCCGTCTGGTATAGCCTGATATCTGATGC
AGCAACTCCAAGATAAGATCCGCTAGGGTCAAACTCCACAGAGTTTGCATCTGCGGATAA
GAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTGCGCAGGTCCCACAACCTAACACCATCCTCGGCAGC
AGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCAGAGAAAGATATAGAGGTAACTTCACCGGTGTGTCC
ATCAAACTTCGCCACATTTGCCTGACTCTTAACATCCCAAATCTTAACAAAAGATTGAGA
AGTACCGGTTCCGAGAATAAGACCATCAGGATGAAAAGCAGCAGCCGTGTAATCCACCCT
CTCAGAATCATCCGATACCTTTG

QA 1 743 1 743
DS 

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AACTCCACAGAGTTTGCATCTGCGGATAAGAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTGCGCAGG
TCCCACAACCTAACACCATCCTCGGCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCAGAGAAA
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ACATCCCAAATCTTAACAACAGATTGAGAAGTACCGGTTCCGAGAATAAGACCATCAGGA
TGAAAAGCAGCAGCCGTGTAATCCACCCTCTCAGAATCATCCGATACCTTTGCAAGGCAT
AAGCCAGAGGAAAGATCGTAGAAGCACCATGTACTGTCAAGAGATGCCGACACGAAGTAT
TTATTTGTGGCATGCACAGTTACAGCTCGCACCTCTGCAGAATGATCATTCAATGTATGC
CCACAAGCATAATTCCTATCCCCAGAATCCCGCCAGATACGGACTGTCTTGTCAGCCGAA
GCAGTTAAAACAAGATCACTGTCACCTACGAATTTTAAACTTGTAACCTTTTTCGAGTGC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 4

CO CL2367Contig1 906 4 6 U
GCATAAATTGTTCATTTGATTTTCCAATCGTATAATGTCATTTCTGTAACATAATACATG
TCTATCTTAATTTTTGGTATACCAACAGTAAACAGGTTATTGAGACACTACGAATCTCTC
TTATACACACACATTATGAATAGTAGTAGATTAATATTTAAGCCACAAGCAACTTCTGGA
TGTCTTTCTCAATTTGTAAAGGCGAAGTCGTGGGAGGGTATCTCTGGAAGACGTTGCCCT
TTTTGTCAACCAAGAATTTCTCAAAGTTCCACTTGACGAGATCACCCAAGAATCCACCAG
ACTTTGATTTCAAGAACTGGTAGATTGGAGCAGTGCTCGGTCCATTCACATCAACCTTGT
CGAATATAGGGAAATCAGCTTTGAACCTGGTACACACGAATCGCTTGATATCCGGGTTTG
ATTCCGGTTCCTGACCTCCAAATTGATTGCAAGGGAAAGCTAAAATCTCAAATCCTTGGT
TCCTGTATTTATCGTACAACTGTGAAAGCTCTGTGTAGTTTGATGATGTCAAACCACATT
TTGAAGCAACGTTAACGATCAACAGAGGTTTTCCTTTGAATATGTCTAGGGAAACATCCT
TCCCACTTATGTCCTTTACAGTGAAATCATGAACAGTCTTCTCTTCAGTAGCTCTTGCAC
ACACACTCAAATTTCTTGATTTGAATTGAAACCCATGGTTATTCCAAGATTTCAAGGAAA
CACCATTTTTCAGATTTCGAGAATTTGATCTTCGCTTAGGGACGAGAAAAGCAGAACAAG
TTGGAGGTGGGTTAGGTTTGGTTGCAGCGAAACCGCCGAAGACTGAAGAGAATGGTGCGT
AAGAGGAAGAAGCCATTACAAAAAAAAAAAACAGAATATGCGTGTATGTAGACCACGAGT
TTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED28JQ U 1
AF RR4BZ35JQ U 24
AF RR4ED28TF C 243
AF RR4BZ35TF C 246
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RD RR4ED28JQ 644 0 0
GCATAAATTGTTCATTTGATTTTCCAATCGTATAATGTCATTTCTGTAACATAATACATG
TCTATCTTAATTTTTGGTATACCAACAGTAAACAGGTTATTGAGACACTACGAATCTCTC
TTATACACACACATTATGAATAGTAGTAGATTAATATTTAAGCCACAAGCAACTTCTGGA
TGTCTTTCTCAATTTGTAAAGGCGAAGTCGTGGGAGGGTATCTCTGGAAGACGTTGCCCT
TTTTGTCAACCAAGAATTTCTCAAAGTTCCACTTGACGAGATCACCCAAGAATCCACCAG
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CGAATATAGGGAACTCAGCTTTGAACCTGGTACACACGAATCGCTTGATATCCGGGTTTG
ATTCCGGTTCCTGACCTCCAAATTGATTGCAAGGGAAAGCTAAAATCTCAAATCCTTGGT
TCCTGTATTTATCGTACAACTGTGAAAGCTCTGTGTAGTTTGATGATGTCAAACCACATT
TTGAAGCAACGTTAACGATCAACAGAGGTTTTCCTTTGAATATGTCTAGGGAAACATCCT
TCCCACTTATGTCCTTTACAGTGAAATCATGAACAGTCTTCTCT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4BZ35JQ 732 0 0
CCAATCGTATAATGTCATTTCTGTAACATAATACATGTCTATCTTAATTTTTGGTATACC
AACAGTAAACAGGTTATTGAGACACTACGAATCTCTCTTATACACACACATTATGAATAG
TAGTAGATTAATATTTAAGCCACAAGCAACTTCTGGATGTCTTTCTCAATTTGTAAAGGC
GAAGTCGTGGGAGGGTATCTCTGGAAGACGTTGCCCTTTTTGTCAACCAAGAATTTCTCA
AAGTTCCACTTGATGAGATCACCCAAGAATCCACCAGACTTTGATTTCAAGAACTGGTAG
ATTGGAGCAGTGCTCGGTCCATTCACATCAACCTTGTCGAATATAGGGAAATCAGCTTTT
AATCTGGTACACACGAATCGCTTGATATCCGGGTTTGATTCCGGTTCTTGACCTCCAAAT
TGATTGCAAGGGAAAGCTAAAATCTCAAATCCTTGGTTCCTGTATTTATCGTACAACTGT
GAAAGCTCTGTGTAGTTTGATGATGTCAAACCACATTTTGAAGCAACGTTAACGATCAAC
AGAGGTTT*CCTTTGAATATGTCTAGGGAAACATCCTTCCCACTTATGTCCTTTACAGTG
AAATCATGAACAGTCTTCTCTTCAGTAGCTCTTGCACACACACTCAAATTTCTTGATTTG
AATTGAAACCCATGGTTATTCCAAGATTTCAAGGAAACACCATTTTTCAGATTTCGAGAA
TTTGATCTTCGC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4ED28TF 617 0 0
TTT
TCAACCAAGAATTTCTCAAAGTTCCACTTGACGAGATCACCCAAGAATCCACCAGACTTT
GATTTCAAGAACTGGTAGATTGGAGCAGTGCTCGGTCCATTCACATCAACCTTGTCGAAT
ATAGGGAACTCAGCTTTGAACCTGGTACACACGAATCGCTTGATATCCGGGTTTGATTCC
GGTTCCTGACCTCCAAATTGATTGCAAGGGAAAGCTAAAATCTCAAATCCTTGGTTCCTG
TATTTATCGTACAACTGTGAAAGCTCTGTGTAGTTTGATGATGTCAAACCACATTTTGAA
GCAACGTTAACGATCAACAGAGGTTTTCCTTTGAATATGTCTAGGGAAACATCCTTCCCA
CTTATGTCCTTTACAGTGAAATCATGAACAGTCTTCTCTTCAGTAGCTCTTGCACACACA
CTCAAATTTCTTGATTTGAATTGAAACCCATGGTTATTCCAAGATTTCAAGGAAACACCA
TTTTTCAGATTTCGAGAATTTGATCTTCGCTTAGGGACGAGAAAAGCAGAACAAGTTGGA
GGTGGGTTAGGTTTGGTTGCAGCGAAACCGCCGAAGACTGAAGAGAATGGTGCGTAAGAG
GAAGAAGCCATTAC

QA 4 617 4 617
DS 

RD RR4BZ35TF 661 0 0
TCAACCAAGAATTTCTCAAAGTTCCACTTGATGAGATCACCCAAGAATCCACCAGACTTT
GATTTCAAGAACTGGTAGATTGGAGCAGTGCTCGGTCCATTCACATCAACCTTGTCGAAT
ATAGGGAAATCAGCTTTTAATCTGGTACACACGAATCGCTTGATATCCGGGTTTGATTCC
GGTTCTTGACCTCCAAATTGATTGCAAGGGAAAGCTAAAATCTCAAATCCTTGGTTCCTG
TATTTATCGTACAACTGTGAAAGCTCTGTGTAGTTTGATGATGTCAAACCACATTTTGAA
GCAACGTTAACGATCAACAGAGGTTT*CCTTTGAATATGTCTAGGGAAACATCCTTCCCA
CTTATGTCCTTTACAGTGAAATCATGAACAGTCTTCTCTTCAGTAGCTCTTGCACACACA
CTCAAATTTCTTGATTTGAATTGAAACCCATGGTTATTCCAAGATTTCAAGGAAACACCA
TTTTTCAGATTTCGAGAATTTGATCTTCGCTTAGGGACGAGAAAAGCAGAACAAGTTGGA
GGTGGGTTAGGTTTGGTTGCAGCGAAACCGCTGAAGACTGAAGAGAATGGTGCGTAAGAG
GAAGAAGCCATTACAAAAAAAAAAAACAGAATATGCGTGTATGTAGACCACGAGTTTTTC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 4

CO CL2368Contig1 772 4 10 U
GGATCCTCCACTACTACACTTGTTTACTCTCTTGAGCGGCACTCGGAATCAGGAAACCCT
TTTGCTTTGCTTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGT
ACCATCGAGTTTGACGGTGCTTCAAGAGGAAACCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTT
CTCCGTGCTCCAGATAACACTGTGATATACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGGGTTGCTACA
AACAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGC
TTTACAAATGTGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAA
TGGGCAACCCGAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGT
CAGTTTAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCCGATGCT
CAAGCTAACCGTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGC
CGCCATGGAAGAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGTTTTCTTGTTTTTGG
GATCATGTCTTTTTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCCCTCT
CTCTCTTTTGCTTTGTCCCACGGCATGTTGACTTCCCAAGAACATGTCTATGTCGTCTAG
TACTTTATTCTATTCAATAATTTTCCAAATATAATACTGCTTTTTTAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL91TF U 5
AF RR4CV79TF U 1
AF RR4CV79JQ C 63
AF RR4CL91JQ C 168
BS 1 461 RR4CV79TF
BS 462 462 RR4CL91TF
BS 463 616 RR4CV79TF
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BS 702 702 RR4CV79JQ
BS 703 729 RR4CV79TF
BS 730 772 RR4CV79JQ

RD RR4CL91TF 691 0 0
G
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TTTGCTTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGTACCAT
CGAGTTTGACGGTGCTTCAAGAGGAAACCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTTCTCCG
TGCTCCAGATAACACTGTGATATACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGGGTTGCTACAAACAA
CGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGCTTTAC
AAATGTGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAATGGGC
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TAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCCGATGCTCAAGC
TAACCGTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGCCGCCA
TGGAAGAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGTTTTCTTGTTTTTGGGATCA
TGTCTTTTTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCCCTCTCTCTC
TTTTGCTTTGTCCCACGGCATGTTGACTTC

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4CV79TF 734 0 0
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TTTGCTTTGCTTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGT
ACCATCGAGTTTGACGGTGCTTCAAGAGGAAACCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTT
CTCCGTGCTCCAGATAACACTGTGATATACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGGGTTGCTACA
AACAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGC
TTTACAAATGTGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAA
TGGGCAACCCGAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGT
CAGTTTAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTTAATTCAGCGGCCGATGCT
CAAGCTAACCGTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGC
CGCCATGGAAGAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGTTTTCTTGTTTTTGG
GATCATGTCTTTTTTT*AGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCTCTCT
CTCTCTTTTGCTTTGTCCCACGGCATGTTGACTTCCCAAGA*CATGTCTATGTCGTCTAG
TACTTTATT
TATTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4CV79JQ 710 0 0
TGCTTTGCTTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGTAC
CATCGAGTTTGACGGTGCTTCAAGAGGAAACCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTTCT
CCGTGCTCCAGATAACACTGTGATATACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGGGTTGCTACAAA
CAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGCTT
TACAAATGTGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAATG
GGCAACCCGAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGTCA
GTTTAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTTAATTCAGCGGCCGATGCTCA
AGCTAACCGTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGCCG
CCATGGAAGAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGTTTTCTTGTTTTTGGGA
TCATGTCTTTTTTT*AGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCTCTCTCT
CTCTTTTGCTTTGTCCCACGGCATGTTGACTTCCCAAGAACATGTCTATGTCGTCTAGTA
CTTTATTCTATTCAATAATTTTCCAAATATAATACTGCTTTTTTAATCCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4CL91JQ 579 0 0
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GGGGGTTGCTACAAACAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGC
TCTTAACCAAGGCTTTACAAATGTGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCA
GGTTCGAGGTGAATGGGCAACCCGAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACA
GGAGCTTATGAGTCAGTTTAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTC
AGCGGCCGATGCTCAAGCTAACCGTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGA
TAATGCAGGCGGCCGCCATGGAAGAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGTT
TTCTTGTTTTTGGGATCATGTCTTTTTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGA
TGCTCTTCCCTCTCTCTCTTTTGCTTTGTCCCACGGCATGTTGACTTCCCAAGAACATGT
TTATGTCGTATAGTACTTTATTCTATTCAATAATTTTCC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

CO CL2369Contig1 1322 4 8 U
GGATTTCTGGCGGGGGAGGAGCGATCTCGACTTGTTCTTTTGACCTCTGGTAAGATTGTT
CGACGACGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTTTGGTGGCTCTAT
CTGCGATTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGC
ATCTCCAGCGAGCTAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGGTGATGTCTGCGA
AGGATCCAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAGA
AGAAAGTTGAGCATGCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGGCAGTTAGTGTCTT
CTGATGTTTCTTCGAAAATGAATTCGGACCCTGCCCTTGTTAACACATTGAATAGTCTGT
TTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGGA
TGGAGAATTTACTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATGTAGGAGTCAGCA
ATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCTGAAACTATCTGACT
TGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAGGAAAGAAGGAGAAACTG
ACTTGGTTGTGCTCTGTTCTGAGGGTTCCGAATCAATTAGTGAATCCGGCCACTCACATT
CAGAGCGTGAAAGCATTTCGGAACTTGTTAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATACA
CAGCTCTTTATGTTTCTGATCCTTATTGGTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTC
TAGCTGAAAGCGCTACAGGAAACAGCAGCGTTGGTGTTTCCACAACCTGTGATGAACTCT
GCAAATTTAAGTCATCACTTTTGGAGGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCC
TCATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCCGGTATCGATACACCAACTAGATTCGAGACGCCTC
AAGATTCTTGAGCAGTTGACTTCTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTTTGCT
TGTGGACGGGTCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAGAGGTATCTCAATGTCGA
TTGTTACATCTGAAAAACAAAAATGGATATGCGATAAAAAAAAGCCCCTTGTAACATTTA
TTCATCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTTAACGTTATAAATAAATTAATAATGGAGAACGAGT
AGAAAAAAACCAGAGAGAGGCTGGAAGAAGAACTATATTCTTTTATAAAGTTTGTTATAT
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 
10 10 

AF RR4CE09TF U 1
AF RR4ER68TF U 42
AF RR4ER68JQ C 569
AF RR4CE09JQ C 484
BS 1 246 RR4CE09TF
BS 247 247 RR4ER68TF
BS 248 643 RR4CE09TF
BS 644 1015 RR4CE09JQ
BS 1016 1016 RR4ER68JQ
BS 1017 1313 RR4CE09JQ
BS 1314 1314 RR4ER68JQ
BS 1315 1322 RR4CE09JQ

RD RR4CE09TF 647 0 0
GGATTTCTGGCGGGGGAGGAGCGATCTCGACTTGTTCTTTTGACCTCTGGTAAGATTGTT
CGACGACGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTTTGGTGGCTCTAT
CTGCGATTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGC
ATCTCCAGCGAGCTAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGGTGATGTCTGCGA
AGGATCTAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAGA
AGAAAGTTGAGCATGCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGGCAGTTAGTGTCTT
CTGATGTTTCTTCGAAAATGAATTCGGACCCTGCCCTTGTTAACACATTGAATAGTCTGT
TTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGGA
TGGAGAATTTACTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATGTAGGAGTCAGCA
ATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCTGAAACTATCTGACT
TGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAG
AAAG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4ER68TF 596 0 0
GACCTCTGGTAAGATTGTTCGACGACGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTG
GCGTTTTTGGTGGCTCTATCTGCGATTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCT
GCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCCAGCGAGCTAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAAC
TATCAGGTGATGTCTGCGAAGGATCCAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCT
AACTTTCTGTGCTCGGAGAAGAAAGTTGAGCATGCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATC
GGCAGGCAGTTAGTGTCTTCTGATGTTTCTTCGAAAATGAATTCGGACCCTGCCCTTGTT
TACACATTGAATAGTCTGTTTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCT
GCGCCAGAGGAAGAAAGGATGGAGAATTTACTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCT
AACAATGTAGGAGTCAGCAATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACA
GTTCTGAAACTATCTGACTTGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4ER68JQ 753 0 0
TGAAGATGGAACAGTTCTGAAACTATCTGACTTGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGC
TAGAAGAGAAACAAGGAAAGAAGGAGAAACTGACTTGGTTGTGCTCTGTTCTGAGGGTTC
CGAATCAATTAGTGAATCCGGCCACTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATTTCGGAACTTGT
TAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATACACAGCTCTTTATGTTTCTGATCCTTATTG
GTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAAAGCGCTACAGGAAACAGCAG
CGTTGGTGTTTCCACAACCTGTGGTGAACTCTGCAAATTTAAGTCATCACTTTTGGAGGG
CATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCCTCATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCCGG
TATCGATACACCAACTAGATTCGAGACGCCTCAAGATTCTTGAGCAGTTGACTTCTAAAA
GAGTCATCCCCCCCTTTTGCTTTGCTTTTGCTTGTGGACGGGTCTTTTCTTCTGCATAGT
GCGTATGGTGAAAAGAGGTATCTCAATGTCGATTGTTACATCTGAAAAACAAAAATGGAT
ATGCGATAAATAAAAGCCCCTTGTAACATTTATTCATCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTTAA
CGTTATAAATAAATTAATAATGGAGAACGAGTAGAAAAAAACCAGAGAGAGGCTGGAAGA
AGAACTATATTCTTTTATAAAGTTTGTTATA
CT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4CE09JQ 839 0 0
GAGAA
TTACTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATGTAGGAGTCAGCAATATTGTC
TTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCTGAAACTATCTGACTTGCAGTCT
TTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAGGAAAGAAGGAGAAACTGACTTGGTT
GTGCTCTGTTCTGAGGGTTCCGAATCAATTAGTGAATCCGGCCACTCACATTCAGAGCGT
GAAAGCATTTCGGAACTTGTTAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATACACAGCTCTT
TATGTTTCTGATCCTTATTGGTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAA
AGCGCTACAGGAAACAGCAGCGTTGGTGTTTCCACAACCTGTGATGAACTCTGCAAATTT
AAGTCATCACTTTTGGAGGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCCTCATCAGT
GGACTTTGTTGTATGGCCGGTATCGATACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCT
TGAGCAGTTGACTTCTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTTTGCTTGTGGACG
GGTCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAGAGGTATCTCAATGTCGATTGTTACA
TCTGAAAAACAAAAATGGATATGCGATAAAAAAAAGCCCCTTGTAACATTTATTCATCTT
GTTTGTGAGTCTTTCCTTAACGTTATAAATAAATTAATAATGGAGAACGAGTAGAAAAAA
ACCAGAGAGAGGCTGGAAGAAGAACTATATTCTTTTATAAAGTTTTTTATATTC

QA 6 839 6 839
DS 



AS 2 4

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TTTCTTTCAACAAATCTACAAACCCAATAATTTTACAAAAAAATTTAAAAAAAACTGTTT
CCCTCTGAAAGGGGTAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 

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BS 31 137 RR4BN31JQ

RD RR4BN31JQ 137 0 0
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TTTCTTTCAACAAATCTACAAACCCAATAATTTTACAAAAAAATTTAAAAAAAACTGTTT
CCCTCTGAAAGGGGTAT

QA 1 137 1 137
DS 

RD RR4BO48JQ 137 0 0
CA
AACCAATACTCTTTCTTTCTAAAAAAAGTTGAACTCCCAAGTTGACACCAAACAGCTCTT
TCTTTCAACAAATCTACAAACCCAATAATTTTACAAAAAAATTTAAAAAAAACTGTTTCT
CTCTGAAAGGTGTAT

QA 3 137 3 137
DS 



CO CL2370Contig2 251 2 2 U
GAAAAAAGCTAGGCCTGTCATATCTTGAAAAAAAAATCTCTACACATTGGCTTATATATC
ACACACCTTTGCATCTTGTACTCCTACACATTGGCTTTATGTATCCTATCATCCCCTGGA
CACTTGTTAGCTAGCTGTTAAAAATCTGCCCCAAAACCTTAGGAACAAAAAATGTCAAAA
AATTCTAACCAATACTCTTTCTTTCTAAAAAAAGTTGAACTCGCAAGTTGCCACCAAATA
GCTCTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN58JQ U 1
AF RR4GF84JQ U 18
BS 1 213 RR4GN58JQ
BS 214 251 RR4GF84JQ

RD RR4GN58JQ 213 0 0
GAAAAAAGCTAGGCCTGTCATATCTTGAAAAAAAAATCTCTACACATTGGCTTATATATC
ACACACCTTTGCATCTTGTACTCCTACACATTGGCTTTATGTATCCTATCATCCCCTGGA
CACTTGTTAGCTAGCTGTTAAAAATCTGCCCCAAAACCTTAGGAACAAAAAATGTCAAAA
AATTCTAACCAATACTCTTTCTTTCTAAAAAAA

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR4GF84JQ 234 0 0
TCATATCTTGAGAAAAAAATCTCTACACATTGGCTTATATATCACACACCTTTGCATCTT
GTACTCCTACACATTGGCTTTATGTATCCTATCATCCGCTGGACACTTGTTAGCTAGCTG
TTAAAAATCTGCCCCAAAACCTTAGGAACAAAAAATGTCAAAAAATTCTAACCAATACTC
TTTCTTTCTAAAAAAAGTTGAACTCGCAAGTTGCCACCAAATAGCTCTTTCTTT

QA 1 234 1 234
DS 



AS 1 2

CO CL2371Contig1 748 2 7 U
GGACAGTGCCCTCTAGAAAATATGTCTTCAGCTTATTGTCCCTCCCTCCCCGTGGCGGTT
TCCGTCGCATCCACCGTTTCCTCCTCCCCTACCTCTAACTCGTTATTCTCCTCCCACTCA
AACTCCAAACTCTTCTATCGCATCACGCCAAAACCCTTCAAACTCGTCGCCAAATGCCCT
ACTCCTCTGTTCCTCCATCCAAACACACGTCGCCACCGCCTCCTCTGCGCCGCCGAAGAC
GAAATCCCGCCGTCATCCGAAGAAGAAGACTACGAAGAAGAAAACGAAGAAGGGGAGAAG
AAGGGGAAGAAGACGCAGATGGGACACAGACTACTACGCAAGCGAGCGTTGAGGAAGGGA
GGCTGTACGTTGGGAACTTGCCTTACACAATCACTTCTTCTGAGCTCTCTCAACTCTTTG
GAGAAGCTGGTAACGTCGTCGATGTTCAGATTGTGTACGATAAAGTCACCGACAGAAGCA
GAGGGTTTGGGTTCGTGACCATGGGAACCATTGAAGAAGCTAAGGAAGCGATTCAGATGT
TCAACAGCTCCCAAATCGGTGGACGGACGGTGAAAGTGAACTTTCCGGAGGTGCCTAGAG
GCGGAGAGAGAGAAGTGATGAGGACTAAGATTCGTGATAGTAACGGGAGTTATGTTGACA
GTCCTCACAAGATCTATGCGGGAAACCTTGGTTGGAATCTAACCTCGCAAGGTCTTAAAG
ATGCGTTTGGGGATCAGACTGGTGTGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE49TF U 1
AF RR4AI48TF U 1
BS 1 86 RR4AI48TF
BS 87 87 RR4GE49TF
BS 88 293 RR4AI48TF
BS 294 295 RR4GE49TF
BS 296 562 RR4AI48TF
BS 563 563 RR4GE49TF
BS 564 748 RR4AI48TF

RD RR4GE49TF 687 0 0
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ACTCCTCTGTTCCTCCATCCAAACACACGTCGCCACCGCCTCCTCTGCGCCGCCGAAGAC
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GGCTGTACGTTGGGAACTTGCCTTACACAATCACTTCTTCTGAGCTCTCTCAACTCTTTG
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GTCCTCACAAGATCTA
TGCGGGAAACC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AI48TF 748 0 0
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TCCGTCGCATCCACCGTTTCCTCCTCTCCTACCTCTAACTCGTTATTCTCCTCCCACTCA
AACTCCAAACTCTTCTATCGCATCACGCCAAAACCCTTCAAACTCGTCGCCAAATGCCCT
ACTCCTCTGTTCCTCCATCCAAACACACGTCGCCACCGCCTCCTCTGCGCCGCCGAAGAC
GAAATCCCGCCGTCATCCGAAGAAGAAGACTACGAAGAAGAAAACGAAGAAGG**AGAAG
AAGGGGAAGAAGACGCAGATGGGACACAGACTACTACGCAAGCGAGCGTTGAGGAAGGGA
GGCTGTACGTTGGGAACTTGCCTTACACAATCACTTCTTCTGAGCTCTCTCAACTCTTTG
GAGAAGCTGGTAACGTCGTCGATGTTCAGATTGTGTACGATAAAGTCACCGACAGAAGCA
GAGGGTTTGGGTTCGTGACCATGGGAACCATTGAAGAAGCTAAGGAAGCGATTCAGATGT
TCAACAGCTCCCAAATCGGTGGTCGGACGGTGAAAGTGAACTTTCCGGAGGTGCCTAGAG
GCGGAGAGAGAGAAGTGATGAGGACTAAGATTCGTGATAGTAACGGGAGTTATGTTGACA
GTCCTCACAAGATCTATGCGGGAAACCTTGGTTGGAATCTAACCTCGCAAGGTCTTAAAG
ATGCGTTTGGGGATCAGACTGGTGTGCT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL2372Contig1 944 4 4 U
GGCTCCAACCATGAAACGAATCTCCTTGTGTACGAGTACATGCCCAACGGTAGCCTCGGA
GAGGTCCTCCACGGAAAGAAAGGAGGTCATTTGCATTGGGACACACATTACAAGATTGCA
CTTGAAGCGGCCAAGGGTCTTTGCTATCTCCACCATGACTGTTCACCTCTGATCGTCCAC
AGAGATGTCAAATCCAACAACATCCTCCTAGACTCCAGCTTTGAAGCTCATGTCGCTGAC
TTTGGTCTTGCCAAGTTCTTACAAGACTCTGGTACTTCTGAGTGTATGTCTGCTATTGCC
GGCTCCTACGGCTACATCGCTCCAGAGTATGCGTATACATTAAAGGTAGATGAGAAGAGC
GATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTTCTTCTGGAACTCATCACCGGAAGGAAACCCGTGGGA
GAGTTCGGAGACGGCGTGGACATCGTTCAGTGGGTACGAAGCATGACGGATTCGAACAAA
GAATGTGTGCTCAAAGTTATCGATCATAGACTCTCTTCCGTACCCGTCCACGAAGTAACG
CACGTCTTCTACGTTGCGATGCTTTGCGTTGAAGAACAGGCGGTGGCAAGGCCGACGATG
AGGGAAGTCGTTCAGATCCTCACCGAGGTCCCGAAGATCCCTCTTTCGAAGCAGCAGGCG
GTGGAATCAGACGCGACGGAGAAATCTCCGGGAGTAAATGAATCGTAGCCGGATCTCCTC
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AGGCAAAGAGATGGTGTTTAATCACGTGTTTAATTCCTAAAGGCAACTATGAGTTTAAGC
AACTCTTGAAGTTTGTCGTTTTTTTCTGCCCATAAATTCGAGTTGCATTATTTTGATAGA
AATTTTGACGTTAGGCTGGTGAGTTCTTGTTCTCAATTTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK34TF U 164
AF RR4B168TF U 1
AF RR4B168JQ C 97
AF RR4CK34JQ C 175
BS 1 735 RR4B168TF
BS 736 767 RR4B168JQ
BS 768 768 RR4CK34JQ
BS 769 944 RR4B168JQ

RD RR4CK34TF 414 0 0
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GTATGTCTGCTATTGCCGGCTCCTACGGCTACATCGCTCCAGAGTATGCGTATACATTAA
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TGACGGATTCGAACAAAGAATGTGTGCTCAAAGTTATCGATCATAGACTCTCTTCCGTAC
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QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4B168TF 735 0 0
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CTTGAAGCGGCCAAGGGTCTTTGCTATCTCCACCATGACTGTTCACCTCTGATCGTCCAC
AGAGATGTCAAATCCAACAACATCCTCCTAGACTCCAGCTTTGAAGCTCATGTCGCTGAC
TTTGGTCTTGCCAAGTTCTTACAAGACTCTGGTACTTCTGAGTGTATGTCTGCTATTGCC
GGCTCCTACGGCTACATCGCTCCAGAGTATGCGTATACATTAAAGGTAGATGAGAAGAGC
GATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTTCTTCTGGAACTCATCACCGGAAGGAAACCCGTGGGA
GAGTTCGGAGACGGCGTGGACATCGTTCAGTGGGTACGAAGCATGACGGATTCGAACAAA
GAATGTGTGCTCAAAGTTATCGATCATAGACTCTCTTCCGTACCCGTCCACGAAGTAACG
CACGTCTTCTACGTTGCGATGCTTTGCGTTGAAGAACAGGCGGTGGCAAGGCCGACGATG
AGGGAAGTCGTTCAGATCCTCACCGAGGTCCCGAAGATCCCTCTTTCGAAGCAGCAGGCG
GTGGAATCAGACGCGACGGAGAAATCTCCGGGAGTAAATGAATCGTAGCCGGATCTCCTC
AGTAGTTAAGACTTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4B168JQ 848 0 0
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AGCTTTGAAGCTCATGTCGCTGACTTTGGTCTTGCCAAGTTCTTACAAGACTCTGGTACT
TCTGAGTGTATGTCTGCTATTGCCGGCTCCTACGGCTACATCGCTCCAGAGTATGCGTAT
ACATTAAAGGTAGATGAGAAGAGCGATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTTCTTCTGGAACTC
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CGAAGCATGACGGATTCGAACAAAGAATGTGTGCTCAAAGTTATCGATCATAGACTCTCT
TCCGTACCCGTCCACGAAGTAACGCACGTCTTCTACGTTGCGATGCTTTGCGTTGAAGAA
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AATGAATCGTAGCCGGATCTCCTCAGTAGTTAAGACTTTCCAAACGACGGGTTTAAGTTC
ATCGAGGGGCAGACTCGTCTTTTAAGGCAAAGAGATGGTGTTTAATCACGTGTTTAATTC
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TTCGAGTTGCATTATTTTGATAGAAATTTTGACGTTAGGCTGGTGAGTTCTTGTTCTCAA
TTTGGTTC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR4CK34JQ 739 0 0
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GCTGACTTTGGTCTTGCCAAGTTCTTACAAGACTCTGGTACTTCTGAGTGTATGTCTGCT
ATTGCCGGCTCCTACGGCTACATCGCTCCAGAGTATGCGTATACATTAAAGGTAGATGAG
AAGAGCGATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTTCTTCTGGAACTCATCACCGGAAGGAAACCC
GTGGGAGAGTTCGGAGACGGCGTGGACATCGTTCAGTGGGTACGAAGCATGACGGATTCG
AACAAAGAATGTGTGCTCAAAGTTATCGATCATAGACTCTCTTCCGTACCCGTCCACGAA
GTAACGCACGTCTTTTACGTTGCGATGCTTTGCGTTGAAGAACAGGCGGTGGCAAGGCCG
ACGATGAGGGAAGTCGTTCAGATCCTCACCGAGGTCCCGAAGATCCCTCTTTCGAAGCAG
CAGGCGGTGGAATCAGACGCGACGGAGAAATCTCCGGGAGTAAATGAATCGTAGCCGGAT
CTCCTCAGTAGTTAAGACTTTCCAAACGACGGGTTTAAGTTCATCGAGGGGCAAACTCGT
CTTTTAAGGCAAAGAGATGGTGTTTAATCACGTGTTTAATTCCTAAAGGCAACTATGAGT
TTAAGCAACTCTTGAAGTTTGTCGTTTTTTTCTGCCCATAAATTCGAGTTGCATTATTTT
GATAGAAATTTTGACGTT
G

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

CO CL2373Contig1 1512 4 4 U
ATAGGAAAATGGTAACTTGATATATTTTATTTAGTAGGGACTGTAGGGTACAGAAACAAT
CTTGTTTAGCATAGACACTATCATAAATCATATTCATTGTCTATTGCATGAATCCAATTG
TTCCATCTCTATTCCTTTTCAACCATTATTTTCCTCCCATGATAGTTAGCAATCTATCCT
ACAATTGATCTTGAAACATAGTGGACAACATCTGAAACTGGTGAACGTTCCGACTCTTCC
AAGCAAACCACCTGTGTCCATATTGTACAGTTAGACTGTTTCTACAAACGTTCTTCTTTG
TTCTCCTTGATTGTTACTAGAAACCACTTCATGAGCAACACCATCCTTCCCATTTCTGCT
TAGTTCCAACTTTGGTTGTGTTGATTCACCATCTACGTGTGGCGTGGAAGGATATTCATA
ATCTTTGCCTTTTCCCCA*ATCACAAGGTAGAGTCCTGCACATATAACCACCGCACCAAG
AACCCTTCCCAAGTACATCTGCTCGGCAAAGATGACAGTCGACATAATCGCCACTATGAT
CATGCAAAGAGGACTAAACGCTGTTACAAACACAGGACCTCTAGTTTTCATCACCATTCC
TCCAACATAGTACGCAATCGCGGAGCACACTATCCCACTGTATGCAGCTGTAAGAAGTTC
AGTGTCCCAACCAATGGCCCAGGCTCCAGGGTTACCTTTCTCCATCACTAATGCCACGGC
AGTTCCTTCTATTGTTCCCATTAGGCATATCCATGCTGTGAGCGAGAGTTCTGCTTGGTA
AGTTCTCAACGTGACAGCTTGGAGAATCATGAAACATGCATAGCTAAAACAACCAATAGT
GACCAGAACTGCGCCTTTGATGGCACTATGAATATCAGTCCCAGTTGTGTTTGGTGCAGA
GACTCCTTTGGTCCAGAAAAGGTCAAGAACCGGACCTTTTACAAGAGTCATGATCATAGC
TCCTCCTACTGTAGCCAATGTCCCAATTATCTTACCCGCGCTCCTGATGCAACGTAGGTT
CACTCTTTCAAGCCCAAATAAATAGGCAAGGACGAAAGTGATTGCAGGTAGGACATTGTA
CATGGCGGTTGCAAATGTAGCTGTGGTGTATTTCATCCCTAAGTAGTATAAGTTCTGATC
GATCACTGGCTCAAGTAGTCCAAGAAGTGTTATCTTGCCAAATATCATCGACGTCATCTT
TGGTCGCACCTTCTTGTCAAAATAGAAGGCGAACGGCGCCATAACCACGGTAGCAACCGC
ATGACGGTAAACAACAAGGACATAGTTGCTCATGCCTTTGTTTAGGACAGCTTTGGAGAG
AATGTCCATTCCTGCTAACCCTACTTGCAACAATACCACTGAAATAAATGGCCTTGCCTT
CTCCATACAATCTCTCTTCTTTACTTCCTCCATCTTAATAACCTAAATCAACAATCTCCC
TATTACTCTCTTTTGATTATGTTTAGAAGCAGTAGCAATAGAGATGTGGAGAGGTTTGTT
TTCAATTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ20JQ U 1
AF RR4AQ71JQ U 11
AF RR4BZ20TF C 158
AF RR4AQ71TF C 702
BS 1 706 RR4BZ20JQ
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BS 741 815 RR4BZ20TF
BS 816 1512 RR4AQ71TF

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CTTGTTTAGCATAGACACTATCATAAATCATATTCATTGTCTATTGCATGAATCCAATTG
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ACAATTGATCTTGAAACATAGTGGACAACATCTGAAACTGGTGAACGTTCCGACTCTTCC
AAGCAAACCACCTGTGTCCATATTGTACAGTTAGACTGTTTCTACAAACGTTCTTCTTTG
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TAGTTCCAACTTTGGTTGTGTTGATTCACCATCTACGTGTGGCGTGGAAGGATATTCATA
ATCTTTGCCTTTTCCCCA*ATCACAAGGTAGAGTCCTGCACATATAACCACCGCACCAAG
AACCCTTCCCAAGTACATCTGCTCGGCAAAGATGACAGTCGACATAATCGCCACTATGAT
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TCCAACATAGTACGCAATCGCGGAGCACACTATCCCACTGTATGCAGCTGTAAGAAGTTC
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ATAGACACTATCATAAATCATATTCATTGTCTATTGCATGAATCCAATTGTTCCATCTCT
ATTCCTTTTCAACCATTATTTTCCTCCCATGATAGTTAGCAATCTATCCTACAATTGATC
TTGAAACATAGTGGACAACATCTGAAACTGGTGAACGTTCCGACTCTTCCAAGCAAACCA
CCTGTGTCCACATTGTACAGTTAGACTGTTTCTACAAACGTTCTTCTTTGTTCTCCTTGA
TTGTTACTAGAAACCACTTCATGAGCAACACCATCCTTCCCATTTCTGCTTAGTTCCAAC
TTTGGTTGTGTTGATTCACCATCTACGTGTGGCGTGGAAGGATATTCATAATCTTTGCCT
TTTCCCCATATCACAAGGTAGGGTCCTGCACATATAACCACCGCACCAAGAACCCTTCCC
AAGTACATCTGCTCAGCAAAGATGACAGTCGACATAATCGCCACTATGATCATGCAAAGA
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TACGCAATCGCGGAGCACACTATCCCACTGTATGCAGCTGTAAGAAGTTCAGTGTCCCAA
CCAATGGCCCAGGCTCCAGGGTTACCTTTCTCCATCACTAATGCCACGGCAGTTCCTTCT
ATTGTTCCCA

QA 1 730 1 730
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GTTTCTACAAACGTTCTTCTTTGTTCTCCTTGATTGTTACTAGAAACCACTTCATGAGCA
ACACCATCCTTCCCATTTCTGCTTAGTTCCAACTTTGGTTGTGTTGATTCACCATCTACG
TGTGGCGTGGAAGGATATTCATAATCTTTGCCTTTTCCCCA*ATCACAAGGTAGAGTCCT
GCACATATAACCACCGCACCAAGAACCCTTCCCAAGTACATCTGCTCGGCAAAGATGACA
GTCGACATAATCGCCACTATGATCATGCAAAGAGGACTAAACGCTGTTACAAACACAGGA
CCTCTAGTTTTCATCACCATTCCTCCAACATAGTACGCAATCGCGGAGCACACTATCCCA
CTGTATGCAGCTGTAAGAAGTTCAGTGTCCCAACCAATGGCCCAGGCTCCAGGGTTACCT
TTCTCCATCACTAATGCCACGGCAGTTCCTTCTATTGTTCCCATTAGGCATATCCATGCT
GTGAGCGAGAGTTCTGCTTGGTAAGTTCTCAACGTGACAGCTTGGAGAATCATGAAAC
C

QA 1 658 1 658
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CCATCACTAATGCCACGGCAGTTCCTTCTATTGTTCCCATTAGGCATATCCATGCTGTGA
GCGAGAGTTCTGCTTGGTAAGTTCTCAACGTGACAGCTTGGAGAATCATGAAACATGCAT
AGCTAAAACAACCAATAGTGACCAGAACTGCGCCTTTGATGGCACTATGAATATCAGTCC
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TCCTGATGCAACGTAGGTTCACTCTTTCAAGCCCAAATAAATAGGCAAGGACGAAAGTGA
TTGCAGGTAGGACATTGTACATGGCGGTTGCAAATGTAGCTGTGGTGTATTTCATCCCTA
AGTAGTATAAGTTCTGATCGATCACTGGCTCAAGTAGTCCAAGAAGTGTTATCTTGCCAA
ATATCATCGACGTCATCTTTGGTCGCACCTTCTTGTCAAAATAGAAGGCGAACGGCGCCA
TAACCACGGTAGCAACCGCATGACGGTAAACAACAAGGACATAGTTGCTCATGCCTTTGT
TTAGGACAGCTTTGGAGAGAATGTCCATTCCTGCTAACCCTACTTGCAACAATACCACTG
AAATAAATGGCCTTGCCTTCTCCATACAATCTCTCTTCTTTACTTCCTCCATCTTAATAA
CCTAAATCAACAATCTCCCTATTACTCTCTTTTGATTATGTTTAGAAGCAGTAGCAATAG
AGATGTGGAGAGGTTTGTTTTCAATTGAATC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 3

CO CL2374Contig1 821 3 7 U
GCTAAAGATCTGCTTGAAGGAACATCTGCTTGAGTTCTAAAATGAATACAGAACAAATGA
ATTATTTTTAACACATAGAACTCTCCACCTCCATGATGATTATTGACCCTTGAATCTTTC
CCAGAAGGTGGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATAGAGATGACAAC
CAAAAAGACACCAAGCTGCCACCACTTCCTTCTTAGAGATCTTATGAATCCGAACTTGCA
AGATCTACAATCATAGCACAACACGCTCCAATCGTTCCTCCACAACTCACAGTCGCTTAG
TATTCGGCCCATCCCACCATACAGCACATCCGTCTCCAACGGTGGGCCCTCGTCTTTTCT
TATATACCAAAACGTCGCGTTTAACGCATCCATGTTACATGTCTCCGGCGGCATACAACA
TCCATTCTTTATTGGTGGCATTTTTCTTCTATTGTAAGGTTTCTCTTCAGGAGATTGGTA
AAAAAGCTCGTTGCATGCTCCTTTATCGTAGACACACAATTTGATATTGTTCCAGTTCAC
ATCATCCATCACTTTGAGGTTAAACCACCTCCCAGTCGCCGGGAACCGCCTGCTCTGCAT
CTCATTGACTCCTGCGTACGCCAAACCGATGAACATCATCAGCAAAAGAATCACCACCAT
CACCACGAGTGCCGGCATCGGAAACTTCCTTCGGAGAAACAGAGCCGCATTGCTGACTAC
GAACACGGCGAGTAGACCAACGCTAGCGAGTGTCTGAACACGTGACAGACCGAGGATGTC
TTCGCATTCGTAGCTGCGCATGTAGAGGAGCCAGACAGCGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE28JQ U 10
AF RR4DE28TF C 10
AF RR4CI38JQ U 1
BS 1 327 RR4CI38JQ
BS 328 328 RR4DE28JQ
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BS 363 404 RR4CI38JQ
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AACACATAGAACTCTCCACCTCCATGATGATTATTGACCCTTGAATCTTTCCCAGAAGGT
GGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATAGAGATGACAACCAAAAAGAC
ACCAAGCTGCCACCACTTCCTTCTTAGAGATCTTATGAATCCGAACTTGCAAGATCTACA
ATCATAGCACAACACGCTCCAATCGTTCCTCCACAACTCACAGTCGCTTAGTATTCGGCC
CATCCCACCATACAGCACATCCGTCTCCAACGGTGGGCCCTCGTCTTTTCTTATATACCA
AAACGTCGCGTTTAACGCATCCATGTTACATGTCTCCGGCGGCATACAACATCCATTCTT
TATTGGTGGCATTTTTCTTCTATTGTAAGGTTTCTC
C

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4DE28TF 457 0 0
CTGCTTGAAGGAACATCTGCTTGAGTTCTAAAATGAATACAGAACAAATGAATTATTTTT
AACACATAGAACTCTCCACCTCCATGATGATTATTGACCCTTGAATCTTTCCCAGAAGGT
GGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATAGAGATGACAACCAAAAAGAC
ACCAAGCTGCCACCACTTCCTTCTTAGAGATCTTATGAATCCGAACTTGCAAGATCTACA
ATCATAGCACAACACGCTCCAATCGTTCCTCCACAACTCACAGTCGCTTAGTATTCGGCC
CATCCCACCATACAGCACATCCGTCTCCAACGGTGGGCCCTCGTCTTTTCTTATATACCA
AAACGTCGCGTTTAACGCATCCATGTTACATGTCTCCGGCGGCATACAACATCCATTCTT
TATTGGTGGCATTTTTCTTCTATTGTAAGGTTTCTC
C

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4CI38JQ 821 0 0
GCTAAAGATCTGCTTGAAGGAACATCTGCTTGAGTTCTAAAATGAATACAGAACAAATGA
ATTATTTTTAACACATAGAACTCTCCACCTCCATGATGATTATTGACCCTTGAATCTTTC
CCAGAAGGTGGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATAGAGATGACAAC
CAAAAAGACACCAAGCTGCCACCACTTCCTTCTTAGAGATCTTATGAATCCGAACTTGCA
AGATCTACAATCATAGCACAACACGCTCCAATCGTTCCTCCACAACTCACAGTCGCTTAG
TATTCGGCCCATCCCACCATACAGCACCTCCGTCTCCAACGGTGGGCCCTCGTCTTTTCT
TCTATACCAAAACGTCGCGTTTAACGCATCCATGTTACATGTCTGCGGCGGCATACAACA
TCCATTCTTTATTGGTGGCATTTTTCTTCTATTGTAAGGTTTCTCTTCAGGAGATTGGTA
AAAAAGCTCGTTGCATGCTCCTTTATCGTAGACACACAATTTGATATTGTTCCAGTTCAC
ATCATCCATCACTTTGAGGTTAAACCACCTCCCAGTCGCCGGGAACCGCCTGCTCTGCAT
CTCATTGACTCCTGCGTACGCCAAACCGATGAACATCATCAGCAAAAGAATCACCACCAT
CACCACGAGTGCCGGCATCGGAAACTTCCTTCGGAGAAACAGAGCCGCATTGCTGACTAC
GAACACGGCGAGTAGACCAACGCTAGCGAGTGTCTGAACACGTGACAGACCGAGGATGTC
TTCGCATTCGTAGCTGCGCATGTAGAGGAGCCAGACAGCGT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 4

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GGAACACCAAGAAAACAAACGGCTCTGTTCTCTCTCTTGCCAAGAAAATTTTGAACCCAC
CTCGGGAACATCTTCTCAACTTTACAAAAGACAATGATCTCTTCAGTTAAACCAACTCCA
TCATCCTTCTCCGCCACCTCCACTGGCGTCAGACGGTCATTTCCGACGAAGCCCCAGTTT
TCTCCTATACACATAATCAGAAGCTGCCATAACCAAATATTCATCAACTCCAACGTCTCC
TATCAAAAGCCTCTCCACATTTCATCTACCCAGAACTTTTCTAGCTTCAAGCGTGAGGTC
AGAGTCGAAGCCTACGAGGCAGATCGGTCTCGTCCGCTCGACATCAACATCGAGCTTCCA
GACGAACAATCAGCGCAGAAGCTGAAAATAGGAATCTACTTCGCGACTTGGTGGGCACTC
AACGTTGTCTTCAACATCTACAACAAGAAAGTCCTCAACGCTTTTCCTTACCCGTGGCTA
ACTTCGACCTTGTCTCTCGCTTGTGGCTCTCTCATGATGCTCGTTTCTTGGGCCACTAGA
ATCGCCGAAGCTCCTAAAACTGATCTCGATTTCTGGAAAACTCTGTTCCCGGTTGCTGTG
GCGCACACAATCGGACATGTGGCAGCAACAGTGAGTATGTCGAAAGTAGCAGTGTCCTTC
ACACACATCATCAAAAGTGGTGAACCAGCTTTCAGTGTCTTGGTCTCTAGATTCTTCTTG
GGAGAGACTTTCCCTCTTCCAGTTTATCTCTCTCTCTTACCCATCATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4BF19TF U 146
AF RR4GQ03TF U 1
AF RR4AY50TF U 4
AF RR4B289TF U 4
BS 1 188 RR4GQ03TF
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BS 739 766 RR4AY50TF
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RD RR4BF19TF 317 0 0
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AGAAAGTCCTCAACGCT

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR4GQ03TF 738 0 0
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CTCGGGAACATCTTCTCAACTTTACAAAAGACAATGATCTCTTCAGTTAAACCAACTCCA
TCATCCTTCTCCGCCACCTCCACTGGCGTCAGACGGTCATTTCCGACGAAGCCCCAGTTT
TCTCCTATGCACATCATCAGAAGCTGCCATAACCAAATATTCATCAACTCCAACGTCTCC
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AGAGTCGAAGCCTACGAGGCAGATCTGTCTCGTCCGCTCGACATCAACATCGAGCTTCCA
GACGAACAATCAGCGCAGAAGCTGAAAATAGGAATCTACTTCGCGACTTGGTGGGCACTC
AACGTTGTCTTCAACATCTACAACAAGAAAGTCCTCAACGCTTTTCCTTACCCGTGGCTA
ACTTCGACCTTGTCTCTCGCTTGTGGCTCTCTCATGATGCTCGTTTCTTGGGCCACTAGA
ATCGCCGAAGCTCCTAAAACTGATCTCGATTTCTGGAAAACTCTGTTCCCGGTCGCTGTG
GCGCACACAATCGGACATGTGGCAGCAACAGTGAGTATGTCGAAAGTAGCAGTGTCCTTC
ACACACATCATCAAAAGTGGTGA*CCAGCTTTCAGTGTCTTGGTCTCAAGATTCTTCTTG
GGAGAGACTTACCCTCTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4AY50TF 763 0 0
GG
ACCAAGAAAACAAACGGCTCTGTTCTCTCTCTTGCCAAGAAAATTTTGAACCCACCTCGG
GAACATCTTCTCAACTTTACAAAAGACAATGATCTCTTCAGTTAAACCAACTCCATCATC
CTTCTCCGCCACCTCCACTGGCGTCAGACGGTCATTTCCGACGAAGCTCCAGTTTTCTCC
TTTACACGTAATCAGAAGCTGCCATAACCAAATCTTCATCAACTCCAACGTCTCCTATCA
AAAGCCTCTCCACATTTCATCTACCCAGAACTTTTCTAGCTTCAAGCGTGAGGTCAGAGT
CGAAGCCTACGAGGCAGATCGGTCTCGTCCGCTCGACATCAACATCGAGCTTCCAGACGA
ACAATCAGCGCAGAAGCTGAAAATAGGAATCTACTTCGCTACTTGGTGGGCACTCAACGT
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GACCTTGTCTCTCGCTTGTGGCTCTCTCATGATGCTCGTTTCTTGGGCCACTAGAATCGC
CGAAGCTCCTAAAACTGATCTCGATTTCTGGAAAACTCTGTTCCCGGTTGCTGTGGCGCA
CACAATCGGACATGTGGCAGCAACAGTGAGTATGTCGAAAGTAGCAGTGTCCTTCACACA
CATCATCAAAAGTGGTGAACCAGCTTTCAGTGTCTTGGTCTCTAGATTCTTCTTGGGAGA
GACTTTCCCTCTTCCAGTTTATCTCTCTCTCTTACCCATCA

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR4B289TF 765 0 0
GG
ACCAAGAAAACAAACGGCTCTGTTCTCTCTCTTGCCAAGAAAATTTTGAACCCACCTCGG
GAACATCTTCTCAACTTTACAAAAGACAATGATCTCTTCAGTTAAACCAACTCCATCATC
CTTCTCCGCCACCTCCACTGGCGTCAGACGGTCATTTCCGACGAAGCTCCAGTTTTCTCC
TTTACACGTAATCAGAAGCTGCCATAACCAAATCTTCATCAACTCCAACGTCTCCTATCA
AAAGCCTCTCCACATTTCATCTACCCAGAACTTTTCTAGCTTCAAGCGTGAGGTCAGAGT
CGAAGCCTACGAGGCAGATCGGTCTCGTCCGCTCGACATCAACATCGAGCTTCCAGACGA
ACAATCAGCGCAGAAGCTGAAAATAGGAATCTACTTCGCTACTTGGTGGGCACTCAACGT
TGTCTTCAACATCTACAACAAGAAAGTCCTCAACGCTTTTCCTTACCCGTGGCTAACTTC
GACCTTGTCTCTCGCTTGTGGCTCTCTCATGATGCTCGTTTCTTGGGCCACTAGAATCGC
CGAAGCTCCTAAAACTGATCTCGATTTCTGGAAAACTCTGTTCCCGGTTGCTGTGGCGCA
CACAATCGGACATGTGGCAGCAACAGTGAGTATGTCGAAAGTAGCAGTGTCCTTCACACA
CATCATCAAAAGTGGTGAACCAGCTTTCAGTGTCTTGGTCTCTAGATTCTTCTTGGGAGA
GACTTTCCCTCTTCCAGTTTATCTCTCTCTCTTACCCATCATC

QA 3 765 3 765
DS 



AS 1 4

CO CL2376Contig1 781 4 12 U
GGGAGCCTCTGAATGTGCTTTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCCGTTCATTTTATC
TTCTCTCCTCCTTATCACTTGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAA
AACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGC
TGCTACTGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGT
GTACCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTC
CAAGCTCCAGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGA
GCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAAT
ACCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTA
ACTACCCGACGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACG
TACCTCCTCCGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGT
TCTCGTTCTTGATTTGTTTTGGGTGAATGATGAGAA*GGATCATGTTTTACTACTACTTT
TACCTTTTTTAACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGCTGACAATTTGTAATTAACATC
ATAATTACTCTTTGTTAAGAATCTAGATATGAACAAAAAGTAAATTTATAACTTTTTCTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EZ02TF U 1
AF RR4EZ02JQ C 139
AF RR4AH20JQ C 104
AF RR4AH20TF U 104
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BS 320 636 RR4EZ02TF
BS 637 637 RR4AH20TF
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BS 670 670 RR4AH20TF
BS 671 737 RR4EZ02TF
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BS 759 759 RR4AH20TF
BS 760 769 RR4EZ02TF
BS 770 781 RR4AH20TF

RD RR4EZ02TF 770 0 0
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AACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGC
TGCTACTGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGT
GTACCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTC
CAAGCTCCAGCGGCGG***TGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGA
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TACCTTTTT*AACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGCTGACAATTTGTAATTAACATC
ATAATTACTCTTTGTTA*GAATCTAGATATGAACAAAA*GTAAATTTAT
A

QA 1 769 1 769
DS 

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*TGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCT
CTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAG
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CGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGGGAGATT
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TACTACTTTTTTACTTTCTGCTGACAATTTGTAATTAACATCATAATTACTCTTTGTTAA
GAATCTAGATATGAACAAAAAGTAAATTTAT

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DS 

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GG
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CTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTT
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CTGCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTC
CGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCAT
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DS 

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CGCCCCCTACTCCTCCAAGCTCCAGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTC
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CGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCAT
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TTATAACTTTTTCTTG

QA 3 678 3 678
DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4G156JQ C 1
AF RR4GE60JQ C 1
AF RR4G156TF U 1
AF RR4GE60TF U 1
BS 1 338 RR4G156TF

RD RR4G156JQ 338 0 0
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QA 1 338 1 338
DS 

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QA 1 338 1 338
DS 

RD RR4G156TF 338 0 0
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TGAATTTAATGTATGATCTAAATATTAAAAAATTTATATTTATAGTTATGGATATGAATT
TTTTACTCTTATTTTTTTTTATTGTAGTTAAGAAACAAAGTAATTTTTGTAAGTACTATT
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QA 1 338 1 338
DS 

RD RR4GE60TF 338 0 0
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TGAATTTAATGTATGATCTAAATATTAAAAAATTTATATTTATAGTTATGGATATGAATT
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TTTAATATGTTGTTGTTGTTAATATACAAACTTTTCTT

QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 2

CO CL2378Contig1 902 2 8 U
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AAATGGGTGAAGAAAGTAGAAGAAGATGATGACTGTTTCGACGACGAGGTTTACCCAAAT
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TCAGTTGGCAGCTTGGAGAGAAGTAACAATAGCCTATTTTCTTCTTCTCCATCTCAGGAG
CTTCAGTCTTGATTAGGGTTTTCTTAGTCTCTCGAGTTTGCTTGAGGATTACGTCATCTC
CCATGGTGTCTGCAATCAAATCAATCTAGCTATCCACTACTCTGACTTCGGCTTTTGCAA
CCATTGTCGGAAAAGTGTTTTTTTCTTTCTTTTGGGTATAGATGAGAGGAGGATAATAAT
AGACTTCCAAAATAATGATTAAAGTGTTCTAATTAAAATAAAAAGATTAAAGTGTTCATT
GT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4CQ57TF U 1
AF RR4CQ57JQ C 162
BS 1 677 RR4CQ57TF
BS 678 678 RR4CQ57JQ
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BS 764 902 RR4CQ57JQ

RD RR4CQ57TF 763 0 0
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TCAAACAAAGAACTACACTTGAGCCTTGCGATGCTCGACATCGAGGATAATGACTCTATT
TCAGTTGGCAGCTTGGAGAGAAGTAACAATAGCCTATTTTCTTCTTCTCCATCTCAGGAG
CTTCAGTCTTGATTAGG*TTTTCTTAGTCTCTCGAGTTTGCTTGAGGAT*ACGTCATCTC
CCATGGTGTCTGCAATCAAATCA*TCTAGCTATCCACTACTCT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4CQ57JQ 741 0 0
G
TACTTCATGTACTGAAAGGTCAGCAACAAAGTTGATGTTTATGCCTTTGGAGTAGTTTTG
CTTGAACTCATATCAGGAAGAACTACTATTTCTTCTGATAGCCCAAGAGGACAGGAGAGT
CTGGTCATGTGGGCAAAACCAGTTATAGAAAAAGGTGCTGCAAAAGAGCTCTTGGATCCG
AACATTTTAGGGAATCTCGATGAGGCTCAGTTTCAGAAAATGGTTCTTGCTGCTAAATAT
TGTCTTACAAGAGCAGCTACTCATCGTCTCAATATCAGAGAGATACTCAAGCTGCTAAAA
GGAGAAGATGAAGTAGAGAAATGGGTGAAGAAAGTAGAAGAAGATGATGACTGTTTCGAC
GACGAGGTTTACCCAAATTCAAACAAAGAACTACACTTGAGCCTTGCGATGCTCGACATC
GAGGATAATGACTCTATTTCAGTTGGCAGCTTGGAGAGAAGTAACAATAGCCTATTTTCT
TCTTCTCCATCTCAGGAGCTTCAGTCTTGATTAGGGTTTTCTTAGTCTCTCGAGTTTGCT
TGAGGATTACGTCATCTCCCATGGTGTCTGCAATCAAATCAATCTAGCTATCCACTACTC
TGACTTCGGCTTTTGCAACCATTGTCGGAAAAGTGTTTTTTTCTTTCTTTTGGGTATAGA
TGAGAGGAGGATAATAATAGACTTCCAAAATAATGATTAAAGTGTTCTAATTAAAATAAA
AAGATTAAAGTGTTCATTGT

QA 2 741 2 741
DS 



AS 1 4

CO CL2379Contig1 933 4 6 U
GGAAAGTGAGTCACAAGAACTACGACATAAAACCGAACCCAATTCAATTCTCCTTTTTTC
AGACCAAACACAAAGGAGAACATTAATGGAAGACGTACGGAAGATCGTGGTGGTTGTAGA
AGATAAAGAAGCGGCGAGGACGGCGTTGCAATGGGCACTTCATAACCTCCTCCGTCAAGG
TGACATCATAGTCCTACTCCACGTTATCTCTCCTCCGCCGCGCAAGAAGAAATCTACGGC
GGCGCGTCTCCTCCGCCGCCACGGATACCATCTCGCCCTCTCTTTCCGTGAAATCTGCGA
CGCTTTCTTCAACACGAACACGGAGATCATTGTGAGAGAAGGAGACGAAGATGGAAGGAC
GATAGCTGAAGTGGTGAAAGAGATTGGTGCTTCGACGCTTCTCGTGGGTCTCCATCAGAA
CAGCTTTCTTTACAGATGGTCAATGAGTGGGATTGATGTAACTAGAAACTTGGGCTGCAA
AGTGATCGCTATAAAGCAGCCTTTGGCGGAAGAGTCGCCGCCGGGAAAACTGAAGGGACG
CGTGACCTCACATACGACTGCGACATCAGATAGCTTAACTAACTTTGACTTCTCTCAAAT
CGAAATTTCTGGATTACAGGTTCCTGAGATTCGGACACCTAAAGTGCCATACAGATTATG
TCCGAGTCCTCGTGCGATACTATGGAGATCAAGACCACGGAGATCTAAAGCCCGATACGT
CGTCGCTTCATAGTCTAAGATTTTTATTCCAAACAATAGGAAAGAAACAAAACTCCACCC
TCAATTTTTGTGTCAAAGAAAGAAACAAATTTTACTCCATACCAAAAATTATTTGTTTTC
AACTAACTATACAGACTCACTGGCTAGATACTTTTCCCCAATTACATCACAATCTAAACA
TTTTTGACAGAATAATAATCGACTGATTAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C859TF U 1
AF RR4DC05TF U 77
AF RR4DC05JQ C 105
AF RR4C859JQ C 313
BS 1 181 RR4C859TF
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RD RR4C859TF 740 0 0
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AGATAAAGAAGCGGCGAGGACGGCGTTGCAATGGGCACTTCATAACCTCCTCCGTCAAGG
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GGCGCGTCTCCTCCGCCGCCACGGATACCATCTCGCCCTCTCTTTCCGTGAAATCTGCGA
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CAGCTTTCTTTACAGATGGTCAATGAGTGGGATTGATGTAACTAGAAACTTGGGCTGCAA
AGTGATCGCTATAAAGCAGCCTTTGGCGGAAGAGTCGCCGCCGGGAAAACTGAAGGGACG
CGTGACCTCACATACGACTGCGACATCAGATAGCTTAACTAACTTTGACTTCTCTCAAAT
CGAAATTTCTGGATTACAGGTTCCTGAGATTCGGACACCTAAAGTGCCATACAGATTATG
TCCGAGTCCTCGTGCGATACTATGGAGATCAAGACCACGGAGATCTAAAGCCCGATACGT
CGTCGCTTCATAGTCTAAGA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4DC05TF 705 0 0
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AGGACGGCGTTGCAATGGGCACTTCATAACCTCCTCCGTCAAGGTGACATCATAGTCCTA
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TGGTCAATGAGTGGGATTGATGTAACTAGAAACTTGGGCTGCAAAGTGATCGCTATAAAG
CAGCCTTTGGCGGAAGAGTCGCCGCCGGGAAAACTGAAGGGACGCGTGACCTCACATACG
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ATACTATGGAGATCAAGACCACGGAGATCTAAAGCCCGATACGTCGTCGCTTCATAGTCT
AAGATTTTTATTCCAAACAATAGGAAAGAAACAAAACTCCACCCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4DC05JQ 715 0 0
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ACCTCCTCCGTCAAGGTGACATCATAGTCCTACTCCACGTTATCTCTCCTCCGCCGCGCA
AGAAGAAATCTACGGCGGCGCGTCTCCTCCGCCGCCACGGATACCATCTCGCCCTCTCTT
TCCGTGAAATCTGCGACGCTTTCTTCAACACGATCACGGAGATCATTGTGAGAGAAGGAG
ACGAAGATGGAAGGACGATAGCTGAAGTGGTGAAAGAGATTGGTGCTTCGACGCTTCTCG
TGGGTCTCCATCAGAACAGCTTTCTTTACAGATGGTCAATGAGTGGGATTGATGTAACTA
GAAACTTGGGCTGCAAAGTGATCGCTATAAAGCAGCCTTTGGCGGAAGAGTCGCCGCCGG
GAAAACTGAAGGGACGCGTGACCTCACATACGACTGCGACATCAGATAGCTTAACTAACT
TTGGCTTCTCTCAAATCGAAATTTCTGGATTACAGGTTCCTGAGATTCGGACACCTAAAG
TGCCATACAGATTATGTCCGAGTCCTCGTGCGATACTATGGAGATCAAGACCACGGAGAT
CTAAAGCCCGATACGTCGTCGCTTCATAGTCTAAGATTTTTATTCCAAACAATAGGAAAG
AAACAAAACTCCACCCTCAATTTTTGTGTCAAAGAAAGAAACAAATTTTACTCC
C

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4C859JQ 621 0 0
CACGAACACGGAGATCATTGTGAGAGAAGGAGACGAAGATGGAAGGACGATAGCTGAAGT
GGTGAAAGAGATTGGTGCTTCGACGCTTCTCGTGGGTCTCCATCAGAACAGCTTTCTTTA
CAGATGGTCAATGAGTGGGATTGATGTAACTAGAAACTTGGGCTGCAAAGTGATCGCTAT
AAAGCAGCCTTTGGCGGAAGAGTCGCCGCCGGGAAAACTGAAGGGACGCGTGACCTCACA
TACGACTGCGACATCAGATAGCTTAACTAACTTTGACTTCTCTCAAATCGAAATTTCTGG
ATTACAGGTTCCTGAGATTCGGACACCTAAAGTGCCATACAGATTATGTCCGAGTCCTCG
TGCGATACTATGGAGATCAAGACCACGGAGATCTAAAGCCCGATACGTCGTCGCTTCATA
GTCTAAGATTTTTATTCCAAACAATAGGAAAGAAACAAAACTCCACCCTCAATTTTTGTG
TCAAAGAAAGAAACAAATTTTACTCCATACCAAAAATTATTTGTTTTCAACTAACTATAC
AGACTCACTGGCTAGATACTTTTCCCCAATTACATCACAATCTAAACATTTTTGACAGAA
TAATAATCGACTGATTAGAGC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 4

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CGAGTTCAAAGATCAGTTTATTCATATAACATCCCCCCTCCTTTTGATAAAACAGCAGAT
AACAAGTATGAGATCATTAAAAAAAA*GGTAGAATGCCATAAGCATCCCCCTGATTCAAC
ATGATAGATTAGGGGGTAGAGTAGCAAATCATCGTCTTAAACAAACATAAAAGATAGATA
AATTTTCAGGAAAGTTACTTCTTTAAGCTCCCCCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGACTCG
GCTACAGGAGCTAAAACAGCATGGAGATTCACGAGCTTGGATTCTTCATAAGGGATCTTA
GAATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATGGTCTTGAGATCCGGAGCTGTGATTTTGCAG
TGAGGACACTCGAACTTAGCGTGACCACCTTTCTCTTTCCCGGTCCGATCGGCTATTCCC
GCCTTTCCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCAGCATCGATCTTGGCTTGAATCTCCTTAGCT
GTATGCTTCTTTGGCTTCGCCTTACCAGTCATCTTCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGCGAC
TAAGGGAGAAGCCCTAGCCCGAACCCTAGTTGTGTTCCACTTCTGACCAAGACAACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4H093JQ U 1
AF RR4H093TF C 1
AF RR4FQ24JQ U 24
AF RR4FQ24TF C 98
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BS 38 38 RR4FQ24JQ
BS 39 300 RR4H093JQ
BS 301 301 RR4FQ24JQ
BS 302 598 RR4H093JQ

RD RR4H093JQ 598 0 0
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AACAAGTATGAGATCATTAAAAAAAA*GGTAGAATGCCATAAGCATCCCCCTGATTCAAC
ATGATAGATTAGGGGGTAGAGTAGCAAATCATCGTCTTAAACAAACATAAAAGATAGATA
AATTTTCAGGAAAGTTACTTCTTTAAGCTCCCCCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGACTCG
GCTACAGGAGCTAAAACAGCATGGAGATTCACGAGCTTGGATTCTTCATAAGGGATCTTA
AAATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATGGTCTTGAGATCCGGAGCTGTGATTTTGCAG
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GCCTTTCCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCAGCATCGATCTTGGCTTGAATCTCCTTAGCT
GTATGCTTCTTTGGCTTCGCCTTACCAGTCATCTTCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGCGAC
TAAGGGAGAAGCCCTAGCCCGAACCCTAGTTGTGTTCCACTTCTGACCAAGACAACCC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4H093TF 598 0 0
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AACAAGTATGAGATCATTAAAAAAAA*GGTAGAATGCCATAAGCATCCCCCTGATTCAAC
ATGATAGATTAGGGGGTAGAGTAGCAAATCATCGTCTTAAACAAACATAAAAGATAGATA
AATTTTCAGGAAAGTTACTTCTTTAAGCTCCCCCTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGACTCG
GCTACAGGAGCTAAAACAGCATGGAGATTCACGAGCTTGGATTCTTCATAAGGGATCTTA
GAATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATGGTCTTGAGATCCGGAGCTGTGATTTTGCAG
TGAGGACACTCGAACTTAGCGTGACCACCTTTCTCTTTCCCGGTCCGATCGGCTATTCCC
GCCTTTCCTCCGCCTCTGTTGGTCAACGCAGCATCGATCTTGGCTTGAATCTCCTTAGCT
GTATGCTTCTTTGGCTTCGCCTTACCAGTCATCTTCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGCGAC
TAAGGGAGAAGCCCTAGCCCGAACCCTAGTTGTGTTCCACTTCTGACCAAGACAACCC

QA 1 598 1 598
DS 

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CGTATAACAT
CCCCCTCCTTTTGATAAAACAGCAGATAACAAGTATGAGATCATTAAAAAAAAAGGTAGA
ATGCCATAAGCATCCCCCTGATTCAACATGATAGATTAGGGGGTAGAGTAGCAAATCATC
GTCTTAAACAAACATAAAAGATGGATAAATTTTCAGGAAAGTTACTTCTTTAAGCTCCCC
CTGATTCCAGGTTTAGGTTTGGACTCGGCTACAGGAGCTAAAACAGCATGGAGATTCACG
AGCTTGGATTCTTCATAAGGGATCTTAGGATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATGGTC
TTGAGATCCGGAGCTGTGATTTTGCAGTGAGGACACTCGAACTTAGCGTGACCACCTTTC
TCTTTCCCGGTCCGATCGGCTATTCCCGCCTTTCCTC*GCCTCTGTTGGTCAACGCAGCA
TCGATCTTGGCTTGAATCTCCTTAGCTGTATGCTTCTTTGGCTTCGCCTTACCAGTCATC
TTCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGCGACTAAGGGAGAAGCCCTAGCCCGAACCCTAGTTGT
GTTCCACTTCTGACCAAGACAACCC

QA 11 575 11 575
DS 

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TTCCAGGTTTAGGTTTGGACTCGGCTACAGGAGCTAAAACAGCATGGAGATTCACGAGCT
TGGATTCTTCATAAGGGATCTTAGGATGCTTCGACTCGTGATGGATCTGCATGGTCTTGA
GATCCGGAGCTGTGATTTTGCAGTGAGGACACTCGAACTTAGCGTGACCACCTTTCTCTT
TCCCGGTCCGATCGGCTATTCCCGCCTTTCCTC*GCCTCTGTTGGTCAACGCAGCATCGA
TCTTGGCTTGAATCTCCTTAGCTGTATGCTTCTTTGGCTTCGCCTTACCAGTCATCTTCG
GTGGCAGTGGTGGTGGCGGCGACTAAGGGAGAAGCCCTAGCCCGAACCCTAGTTGTGTTC
CACTTCTGACCAAGACAACCC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 4

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TATCAGGCAATCGATAAGAGCTTAGGGAGAGGGAGGTTTGAATCTAGAGCAAGCAAGGAT
GGATTTCGTAAAGAGTCTAGATACAGACATGTCGTTAGCCATTCTTTCATGTCTAGATGA
CCCATCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCTCGCTCCTGGCGACACTTTGTGATTAA
GCAGAGTTTCTCCAAGAACCTTTGCTTGAAGTTGTTCCCCGAACTAACTAGTGTGGATCG
TATACTAGAGGAGGAAACAACAATCAATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATACAACAAG
AAGAAGAAGAGAGCACAGGGTTTATGCTTTATTAGCTAAAGGATGCACATCCTCTCCTAT
CCAAAGCTGTATCGCCAATGCCATCGCGGCGTCTTCTACTGATCGTCTCCCAGCAGAGAG
CATCTCTAACACACTCGACGAAAGAGATAGAGTTGGTCGCACACCTTCCTACTGGTCTAG
TGCAGGACACCACAACCCTTCGGTTCCCGAGACACTTCTTTACCAGTTGAAGGCTGACTT
GTGTCTCGTTACTCAACTCTGCATCCACCCTTTCCAAGTTTATTATTATCCCGGTAGACC
GATATGCTCTTCACATTATGTTCGTTTTCGGTTGGGTCACCTCAATAACCATTCACAAGA
TAAAAACAACTATGTATGGGCTTACACTTCACCACAGTTTGCCCTGGCTCAGGAAAATCG
ATTGCAGAACTTTAACTTCCAGAGCCCGTTCTTTGCATTGGTGGGTATTTGCTAGTCGAG
TTTCTTGGTCGAGTTCAGATATGTGACGCTGATGATTTATACTACATATGTGTGACGCAT
GTCAAAGCGATGGGAAGATCATTAGCAAAATCTTTCCGGGTGGTGGATCGGGATGAGTCG
TCAGGGAAGTTTGGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACGAAAAATGAATGACAAG
GAAGAAGAGGCGGGGCCAAGTGAGTTTAGGACGATGAGAAACCGACGCCTTGAACAGCTC
GTGGACTTCCTGCACAGGCATCCTACGGACTTCGTCCAGTACGCGTCGTCTGATTATCAT
GAATCAGATGAGGAGGAGGAGGTTTAGTGTGTGAATGGAGTGAGTGAGGTGCTATTTATT
TAGCTATTGTGGGCTTTGCTTCTGTTTTTAAAAGAATCAAGAGATTCACTGTGAGCAAAT
AAACTTAAAAGACAGTTTACATGAGAGTATGTGACTTGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GL24TF U 1
AF RR4GA70TF U 1
AF RR4GA70JQ C 600
AF RR4GL24JQ C 651
BS 1 692 RR4GA70TF
BS 693 693 RR4GA70JQ
BS 694 713 RR4GA70TF
BS 714 1301 RR4GA70JQ

RD RR4GL24TF 588 0 0
GGGTGAAGGAATCCGTTAAACTTATTAGTCGTCTTCGAACGTACCAATTCAACTGCCTCT
TATCAGGCAATCGATAAGAGCTTAGGGAGAGGGAGGTTTGAATCTAGAGCAAGCAAGGAT
GGATTTCGTAAAGAGTCTAGATACAGACATGTCGTTAGCCATTCTTTCATGTCTAGATGA
CCCATCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCTCGCTCCTGGCGACACTTTGTGATTAA
GCAGAGTTTCTCCAAGAACCTTTGCTTGAAGTTGTTCCCCGAACTAACTAGTGTGGATCG
TATACTAGAGGAGGAAACAACAATCAATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATACAACAAG
AAGAAGAAGAGAGCACAGGGTTTATGCTTTATTAGCTAAAGGATGCACATCCTCTCCTAT
CCAAAGCTGTATCGCCAATGCCATCGCGGCGTCTTCTACTGATCGTCTCCCAGCAGAGAG
CATCTCTAACACACTCGACGAAAGAGATAGAGTTGGTCGCACACCTTCCTACTGGTCTAG
TGCAGGACACCACAACCCTTCGGTTCCCGAGACACTTCTTTACCAGTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4GA70TF 713 0 0
GGGTGAAGGAATCCGTTAAACTTATTAGTCGTCTTCGAACGTACCAATTCAACTGCCTCT
TATCAGGCAATCGATAAGAGCTTAGGGAGAGGGAGGTTTGAATCTAGAGCAAGCAAGGAT
GGATTTCGTAAAGAGTCTAGATACAGACATGTCGTTAGCCATTCTTTCATGTCTAGATGA
CCCATCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCTCGCTCCTGGCGACACTTTGTGATTAA
GCAGAGTTTCTCCAAGAACCTTTGCTTGAAGTTGTTCCCCGAACTAACTAGTGTGGATCG
TATACTAGAGGAGGAAACAACAATCAATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATACAACAAG
AAGAAGAAGAGAGCACAGGGTTTATGCTTTATTAGCTAAAGGATGCACATCCTCTCCTAT
CCAAAGCTGTATCGCCAATGCCATCGCGGCGTCTTCTACTGATCGTCTCCCAGCAGAGAG
CATCTCTAACACACTCGACGAAAGAGATAGAGTTGGTCGCACACCTTCCTACTGGTCTAG
TGCAGGACACCACAACCCTTCGGTTCCCGAGACACTTCTTTACCAGTTGAAGGCTGACTT
GTGTCTCGTTACTCAACTCTGCATCCACCCTTTCCAAGTTTATTATTATCCCGGTAGACC
GATATGCTCTTCACATTATGTTCGTTTTCGGT*GGGTCACCTCAATAACCATT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4GA70JQ 702 0 0
TGTGTCTCGTTACTCAACTCTGCATCCACCCTTTCCAAGTTTATTATTATCCCGGTAGAC
CGATATGCTCTTCACATTATGTTCGTTTTCGGTTGGGTCACCTCAATAACCATTCACAAG
ATAAAAACAACTATGTATGGGCTTACACTTCACCACAGTTTGCCCTGGCTCAGGAAAATC
GATTGCAGAACTTTAACTTCCAGAGCCCGTTCTTTGCATTGGTGGGTATTTGCTAGTCGA
GTTTCTTGGTCGAGTTCAGATATGTGACGCTGATGATTTATACTACATATGTGTGACGCA
TGTCAAAGCGATGGGAAGATCATTAGCAAAATCTTTCCGGGTGGTGGATCGGGATGAGTC
GTCAGGGAAGTTTGGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACGAAAAATGAATGACAA
GGAAGAAGAGGCGGGGCCAAGTGAGTTTAGGACGATGAGAAACCGACGCCTTGAACAGCT
CGTGGACTTCCTGCACAGGCATCCTACGGACTTCGTCCAGTACGCGTCGTCTGATTATCA
TGAATCAGATGAGGAGGAGGAGGTTTAGTGTGTGAATGGAGTGAGTGAGGTGCTATTTAT
TTAGCTATTGTGGGCTTTGCTTCTGTTTTTAAAAGAATCAAGAGATTCACTGTGAGCAAA
TAAACTTAAAAGACAGTTTACATGAGAGTATGTGACTTGACC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4GL24JQ 651 0 0
CCGGTAGACCGATATGCTCTTCACATTATGTTCGTTTTCGGTTGGGTCACCTCAATAACC
ATTCACAAGATAAAAACAACTATGTATGGGCTTACACTTCACCACAGTTTGCCCTGGCTC
AGGAAAATCGATTGCAGAACTTTAACTTCCAGAGCCCGTTCTTTGCATTGGTGGGTATTT
GCTAGTCGAGTTTCTTGGTCGAGTTCAGATATGTGACGCTGATGATTTATACTACATATG
TGTGACGCATGTCAAAGCGATGGGAAGATCATTAGCAAAATCTTTCCGGGTGGTGGATCG
GGATGAGTCGTCAGGGAAGTTTGGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACGAAAAAT
GAATGACAAGGAAGAAGAGGCGGGGCCAAGTGAGTTTAGGACGATGAGAAACCGACGCCT
TGAACAGCTCGTGGACTTCCTGCACAGGCATCCTACGGACTTCGTCCAGTACGCGTCGTC
TGATTATCATGAATCAGATGAGGAGGAGGAGGTTTAGTGTGTGAATGGAGTGAGTGAGGT
GCTATTTATTTAGCTATTGTGGGCTTTGCTTCTGTTTTTAAAAGAATCAAGAGATTCACT
GTGAGCAAATAAACTTAAAAGACAGTTTACATGAGAGTATGTGACTTGACC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 4

CO CL2382Contig1 599 4 13 U
ATGGCAGCACCTTTCACGTTGAGGAAGATCGAAGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTGACT
GAAGCTCGCCGCCGTGTTTTCGATTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATC
ATGGACATTTATAATCTACAAGACGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTCT
GCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCTTCTATTC
AAAGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATT
GGTCAATACGTGGTGGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAG
TCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCT
CTACTGGCTATGTCATACTACCAAGTTCTTGCATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTG
TATTTTCGACTTTAGGAAGAAGTCTTCTTCCTGAGAATAATTTGTATGAATTTCGCCAAA
CCTCTCTTTAAGTTGTAGCTGTGACAGTGTTTGCTGTGCAAATATTGCTATGATTCCCA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AZ35TF U 1
AF RR4A251TF U 5
AF RR4B202TF U 216
AF RR4A251TFB U 5
BS 1 31 RR4AZ35TF
BS 32 32 RR4A251TF
BS 33 436 RR4AZ35TF
BS 437 437 RR4A251TF
BS 438 451 RR4AZ35TF
BS 452 452 RR4A251TF
BS 453 500 RR4AZ35TF
BS 501 501 RR4A251TF
BS 502 578 RR4AZ35TF
BS 579 581 RR4A251TF
BS 582 582 RR4A251TFB
BS 583 597 RR4A251TF
BS 598 599 RR4A251TFB

RD RR4AZ35TF 579 0 0
ATGGCAGCACCTTTCACGTTGAGGAAGATCGGAGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTGACT
GAAGCTCGCCGCCGTGTTTTCGATTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATC
ATGGACATTTATAATCTACAAGACGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTCT
GCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCTTCTATTC
AAAGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATT
GGTCAATACGTGGTGGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAG
TCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCT
CTACTGGCTATGTCATGCTACCAAGTTCTTGTATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTG
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CCTCTCTTTAAGTTGTAGCTGTGACAGTGTTTGCTGTG
G

QA 1 578 1 578
DS 

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CTCGCCGCCGTGTTTTCGATTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATCATGG
ACATTTATAATCTACAAGACGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTCTGCTC
AGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCTTCTATTCAAAG
GAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATTGGTC
AATACGTGGTGGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTG
ATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCTCTAC
TGGCTATGTCATACTACCAAGTTCTTGCATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTGTATT
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TCTTTAAGTTGTAGCTGTGACAGTGTTTGCTGTGCAA*TATTGCTATGATTCC
A

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DS 

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TACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTA
CTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCTCTACTGGCTATGTCATGCTACCAAGTTCTTGTATA
AGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTGTATTTTCGACTTTAGGAAGA*GTCTTCTTCCTGAG
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GTG
GG

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DS 

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CAGCACCTTTCACGTTGAGGAAGATCGAAGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTGACTGAAG
CTCGCCGCCGTGTTTTCGATTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATCATGG
ACATTTATAATCTACAAGACGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTCTGCTC
AGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCTTCTATTCAAAG
GAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATTGGTC
AATACGTGGTGGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTG
ATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCTCTAC
TGGCTATGTCATACTACCAAGTTCTTGCATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTGTATT
TTCGACTTTAGGAAGAAGTCTTCTTCCTGAGAATAATTTGTATGAATTTCGCCAAACCTC
TCTTTAAGTTGTAGCTGTGACAGTGTTTGCTGTGCAAATATTGCTATGATTCCCA

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 4

CO CL2383Contig1 622 4 4 U
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ATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCATTGTCTACCTACCTCAGGA
CCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGC
CTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTGTCG
GTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTG
TGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGATGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGAACG
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AAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCC
CTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAG
TGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTCTT
CAATCAAGAACATGATTTTAGT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4D440TF U 1
AF RR4FX91JQ C 1
AF RR4FX91TF U 1
AF RR4D440JQ C 29
BS 1 339 RR4D440TF
BS 340 340 RR4FX91TF
BS 341 620 RR4D440TF
BS 621 622 RR4D440JQ

RD RR4D440TF 622 0 0
TTTTTACTTGTAGCAAGAAAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTAGAACAAGAG
ATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCATTGTCTACCTACCTCAGGA
CCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGC
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AAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCC
CTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAG
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CAATCAAGAACATGATTTTA
GT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4FX91JQ 621 0 0
TTTTTACTTGTAGCAAGAAAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTAGAACAAGAG
ATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCATTGTCTACCTACCTCAGGA
CCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGC
CTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTGTCG
GTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTG
TGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGATGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGAACG
ATGAGCTCAAGGCTGCGGCCAAAGCCAAAGGTGAGACAATAAGCACCAAGAGGCAGCCTA
AAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCC
CTTACGGTGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAG
TGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTCTT
CAATCAAGAACATGATTTTA
T

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4FX91TF 621 0 0
TTTTTACTTGTAGCAAGAAAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTAGAACAAGAG
ATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCATTGTCTACCTACCTCAGGA
CCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGC
CTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTGTCG
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CTTACGGTGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAG
TGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTCTT
CAATCAAGAACATGATTTTA
T

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4D440JQ 594 0 0
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GGGTACAATTCCATTGTCTACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGT
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CAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGATGCGC
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AGGTGAGACAATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGA
GGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGG
AGGCTATTAGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAGTGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCA
TATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTCTTCAATCAAGAACATGATTTTAGT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 4

CO CL2384Contig1 1011 4 7 U
GGACGACAGCGGTTTCCGTCTGAAATCTCCCCCGAAGCTTGTTGGTAGGTGGAAGAAGAA
GGAAGGATGACATCGGATGATGCTAAAGATGTGAAGAAAGAGGAGGCTGACGAAGACAAC
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TCAGCTTCGAGGAAATTGAACAAGGACAACAATGATGATGATGATAACAAACCCATCAAG
TTATCTGGGTCCCGCCCAAAGCCAGTTAAGAAGAAGGAGATTGACGAAGAAGAGGACGAT
GACAAACCTCTTTCCAAGAGGAAGGATTCATCTGCTGGCGGCGTCTCAAAGGAGAAAGAG
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CAAGTTCCAACTAGCGAAATGGCTAAGATTTGGATGATGGAGTCAGGGTTGCTTCCAGCT
GCAGAGGCAAAGAAAGTTCTTGAGAAGAAGTTGCAAAAGACCGGAAAGCTCAGCTCTCCT
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GCCGAGAAGAAGGAAGTAAAAAAACCGTCGCCTGAAGCTTTGTCAGGCAAAAAGAAAGGA
AATGATTCGAAACCAACCACGAAGAAGCGGAAGAAGGATTCTGATGATGATGATGATGAT
GATTTCATTGTTAGCAGTCTCTCTAATAAGAAGGCAAGAGCCAAGTAGAGTTGGAATTTT
AAAAATACTCAGAAATCTCGTCCTGTGATTTGAAACTCTATCTAATTGTGTTTTAGGACT
TAAGTTGTCTCTTGAGTCGAATTCGATAAAAGTAATGGCAGATTTGTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G194JQ C 313
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TCAGCTTCGAGGAAATTGAACAAGGACAACAATGATGATGATGATAACAAACCCATCAAG
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GACAAACCTCTTTCCAAGAGGAAGGATTCATCTGCTGGCGGCGTCTCAAAGGAGAAAGAG
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T
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AGCGAAATGGCTAAGATTTGGATGATGGAGTCAGGGTTGCTTCCAGCTGCAGAGGCAAAG
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TGAGTCGAATTCGATAAAAGTAATGGCAGATTTGTTTCT

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DS 



AS 1 4

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A


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4GT94TF U 1
AF RR4FB54TF U 396
AF RR4GT94JQ C 660
AF RR4FB54JQ C 688
BS 1 657 RR4GT94TF
BS 658 658 RR4FB54TF
BS 659 695 RR4GT94TF
BS 696 1053 RR4FB54TF
BS 1054 1115 RR4GT94JQ
BS 1116 1116 RR4FB54JQ
BS 1117 1248 RR4GT94JQ
BS 1249 1249 RR4FB54JQ
BS 1250 1378 RR4GT94JQ
BS 1379 1381 RR4FB54JQ

RD RR4GT94TF 695 0 0
GGAGACCCAAGATTTGGATCTCAAGTCTTAACAATTAAAAGAGAGAGAGCAATGGGAAGC
ATCGATGCAACAGAGTTGGGTTTAGAGAAGGAACCAAATCCGGGGAAGGCTACAATTCTT
GCAATTGGAAAAGCCTTTCCTCAGCAGCTAGTAATGCAAGAGTACTTGGTTGATGGCTAC
TTTAAAACTACTAATTGTGATGACCCTGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGTCTCTGCAAG
ACAACGACTGTGAGGACAAGGTATGTTGTCATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCA
GAATTAGCCATTGAAGGAGGATCCACCGTGAAGCAGCGTCTAGACATATGCAACGACGCT
GTAACCGAAATGGCAGTGGAGGCTTCTAGAGTCTGCATCAAGAACTGGGGCCGTTCTATC
TCCGACATAACTCACCTTGTCTATGTCTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGCGAC
CTCTACTTAGCCAAAGGGCTTGGTCTAAGCCCCGAGACACACCGTGTCCTGCTCTATTTC
GTGGGATGCTCTGGTGGCGTTGCCGGTCTCCGTGTAGCGAAAGACATAGCCGAGAACAAT
CCGGGGAGTAGAGTCTTGCTCGCCACCTCTGAGACGACTATCATTGGGTTCAAACCTTCG
AGTGCTGATAGACCGTATGATCTTGTTGGGGTCGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4FB54TF 658 0 0
G
ATCAAGAACTGGGGCCGTTCTATCTCCGACATAACTCACCTTGTCTATGTCTCTTCAAGC
GAAGCTCGTCTCCCTGGTGGCGACCTCTACTTAGCCAAAGGGCTTGGTCTAAGCCCCGAG
ACACACCGTGTCCTGCTCTATTTCGTGGGATGCTCTGGTGGCGTTGCCGGTCTCCGTGTA
GCGAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGGAGTAGAGTCTTGCTCGCCACCTCTGAGACG
ACTATCATTGGGTTCAAACCTCCGAGTGCTGATAGACCGTATGATCTTGTTGGGGTCGCA
TTGTTTGGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCGGATCCGATCCAGATCCGATTCATGAG
AAGCCTCTCTT*GAGCTCCACACAGCAATTCAGAACTTCCTTCCTGACACGGAGAAGACG
ATAGATGGGAAGCTAACGGAACAAGGGATAAACTTCACGCTGTCTAGAGAGCTTCCACAG
ATAATAGAAGACAACGTGGAGGGTTTCTGCAAGAGACTAATAGGAAAAGCTGGACTGGCT
AATAAAGACTATAACCAAATGTTCTGGGCGGTTCATCCAGGTGGACCCGCCATCTTGAAC
CGAATGGAAAAGCGGCTTAACCTGTCGCCTGAGAAGCTGAGTCCAAGCAGGAGAGCT

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR4GT94JQ 719 0 0
GAGTGCTGATAGACCGTATGATCTTGTTGGGGTCGCATTGTTTGGTGATGGAGCCGGAGC
TATGATCATCGGATCCGATCCAGATCCGATTCATGAGAAGCCTCTCTTTGAGCTCCACAC
AGCAATTCAGAACTTCCTTCCTGACACGGAGAAGACGATAGATGGGAAGCTAACGGAACA
AGGGATAAACTTCACGCTGTCTAGAGAGCTTCCACAGATAATAGAAGACAACGTGGAGGG
TTTCTGCAAGAGACTAATAGGAAAAGCTGGACTGGCTAATAAAGACTATAACCAAATGTT
CTGGGCGGTTCATCCAGGTGGACCCGCCATCTTGAACCGAATGGAAAAGCGGCTTAACCT
GTCGCCTGAGAAGCTGAGTCCAAGCAGGAGAGCTCTAATGGACTATGGCAACGCAAGTAG
CAACTCGATCGTTTATGTGTTGGAGTATATGTTGGATGAGAGCAGGAAAGCCAGGAACAT
GAATGAAGGTGGAAACGAGTGGGGTCTGATTCTTGCTTTTGGACCTGGTGTTACATTTGA
AGGCATCGTTGCTCGAAACCTTGACGTTTGAGCGAAAAAGTAATGGGGGGTTTTGGTATT
ACCTTGAAGCTCAAGAAATGGGGTTTGGTGATAACTAAGGGCTCAAGAAAAAATCGTCTT
CTGTTATACAGTCATTACACCAGAGAGAAAATCATATATAATAATAAGACTTGGAAGCT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FB54JQ 694 0 0
GGGGTCGCATTGTTTGGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCGGATCCGATCCAGATCCG
ATTCATGAGAAGCCTCTCTT*GAGCTCCACACAGCAATTCAGAACTTCCTTCCTGACACG
GAGAAGACGATAGATGGGAAGCTAACGGAACAAGGGATAAACTTCACGCTGTCTAGAGAG
CTTCCACAGATAATAGAAGACAACGTGGAGGGTTTCTGCAAGAGACTAATAGGAAAAGCT
GGACTGGCTAATAAAGACTATAACCAAATGTTCTGGGCGGTTCATCCAGGTGGACCCGCC
ATCTTGAACCGAATGGAAAAGCGGCTTAACCTGTCGCCTGAGAAGCTGAGTCCAAGCAGG
AGAGCTCTAATGGACTATGGCAACGCAAGTAGCAACTCGATCGTTTATGTGTTGGAGTAT
ATGTTGGAGGAGAGCAGGAAAGCCAGGAACATGAATGAAGGTGGAAACGAGTGGGGTCTG
ATTCTTGCTTTTGGACCTGGTGTTACATTTGAAGGCATCGTTGCTCGAAACCTTGACGTT
TGAGCGAAAAAGTAATGGGGGATTTTGGTATTACCTTGAAGCTCAAGAAATGGGGTTTGG
TGATAACTAAGGGCTCAAGAAAAAATCGTCTTCTGTTATACAGTCATTACACCAGAGAGA
AAATCATATATAATAATAAGACTTGGAAGCTAAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 4

CO CL2386Contig1 593 4 12 U
GGGTCCAGTTATTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGGTGTCGGTCACAG
TCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGACTCCAGAAGAGT
TCAGCCAGGGACATGCCTCTGGCACTATCAACGTTCCTTACTTGAACCGAGGGATGTCAA
AGAATCCCAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCGATGAAGTCGTTG
TTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTCTTGCTGCTGGTT
TCACCGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTA
CACAAGACTGATGATGATGACCCACCACTCACCACCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTTT
GATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATTAACCACTTTCTCTCTTCC
ATTGTGTGCTTGCTCATAATACAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGG*TGTTGTG
TTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4F511JQ C 1
AF RR4F511TF U 1
AF RR4C655JQ C 3
AF RR4C655TF U 53
BS 1 11 RR4F511JQ
BS 12 226 RR4F511TF
BS 227 227 RR4C655TF
BS 228 272 RR4F511TF
BS 273 273 RR4C655TF
BS 274 277 RR4F511TF
BS 278 279 RR4C655TF
BS 280 312 RR4F511TF
BS 313 313 RR4C655TF
BS 314 365 RR4F511TF
BS 366 366 RR4C655TF
BS 367 593 RR4F511TF

RD RR4F511JQ 593 0 0
GGGTCCAGTTATTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGGTGTCGGTCACAG
TCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGACTCCAGAAGAGT
TCAGCCAGGGACATGCCTCTGGCACTATCAACGTTCCTTACTTGAACCGAGGGATGTCAA
AGAATCCCAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCTGATGAAGTCGTTG
TTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAATCCACGTTTGAGCTTCTTGCTGCTGGTT
TCACCGGAGTCAGAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTA
CACAATACTGATGATGATGACCCACCACTCACCACCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTTT
GATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATTAACCACTTTCTCTCTTCC
ATTGTGTGCTTGCTCATAATACAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGG*TGTTGTG
TTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTGAG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4F511TF 593 0 0
GGGTCCAGTTA
TTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGGTGTCGGTCACAGTCGCCCACGAA
CTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGACTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGA
CATGCCTCTGGCACTATCAACGTTCCTTACTTGAACCGAGGGATGTCAAAGAATCCCAAC
TTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCTGATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAG
AGCGGGGGTAGATCTTTGAAATCCACGTCTGAGCTTCTTGCTGCTGGTTTCACCGGAGTC
AGAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTACACAATACTGA
TGATGATGACCCACCACTCACCACCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTTTGATAATAAATA
CATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATTAACCACTTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTT
GCTCATAATACAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGG*TGTTGTGTTAATTGCATC
GATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTGAG

QA 12 593 12 593
DS 

RD RR4C655JQ 591 0 0
GGAGTCCAG
TTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGGTGTCGGTCACAGTCGCCCACGAA
CTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGACTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGA
CATGCCTCTGGCGCTATCAACGTTCCTTACTTGGACCGAGGGATGTCAAAGAATCCTAAC
TTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCGATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAG
AGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTCTTGCTGCTGGTTTCACGGGAGTC
AAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTACACAAGACTGA
TGATGATGACCCACCACTC*CCACCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTTTGATAATAAATA
CATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATTAACCACTTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTT
GC*********AGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGG*TGTTGTGTTAATTGCATC
GATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTGAG

QA 10 591 10 591
DS 

RD RR4C655TF 541 0 0
GGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGACTCC
AGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGGCGCTATCAACGTTCCTTACTTGGACCGAGG
GATGTCAAAGAATCCTAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCGATGA
AGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTCTTGC
TGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAATGG
TCTTCCTACACAAGACTGATGATGATGACCCACCACTC*CCACCATAATGTCTTTTGTCT
TTTTTTTTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATTAACCACTTTC
TCTCTTCCATTGTGTGCTTGC*********AGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGG
GTGTTGTGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTGA
G

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 4

CO CL2387Contig1 965 4 12 U
GGGAGAGAGAGTGTCTTTTCTAGCCTATCTATCTCTTCTGCAATTCTTAGGGTTTATAAG
TCAAGTCACAGTCCTCTTCTCTTATCCTCAAGAAATGGCGGCGACACAACTCACAGCATC
ACCAGTGACCGTGTCAGCCAGGAGCTTAGCCTCACTGGATGGTATCAGAGCTTCGAGTGT
CATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGGACCCTTAAGCAGAGTCAGTTCCGTTCTTTGGT
TGTCAGGGCTGCTTCTGTCGTTGCTCCTAAGTATACTTCAATTAAGCCACTGGGAGATAG
AGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATC
CACTGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTAGGTGAAGGAAGAACTAT
TGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTA
CGCTGGAACTGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACAT
TGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGACATCAAGGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTT
CATTAAGGTTGCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACTAC
CAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGA
AGGTAAGGTTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAGCACAGTTCTCTACTCCAAGTATGC
TGGTAACGACTTCAAGGGCAAGGATGGTTCAAACTACATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGT
GATGGCTATCCTTTCTTAGTTTATATCTTTCTTTGTAACTTGCAAATTTGTATCCCAATT
GAGGAATTTTTTTCATAGACGGCATGATCATAATCTGAAATAAAGACTTGAATTTGAAAC
TTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DX35TF U 1
AF RR4AP11TF U 21
AF RR4DX35JQ C 251
AF RR4AP11JQ C 217
BS 1 222 RR4DX35TF
BS 223 223 RR4AP11TF
BS 224 718 RR4DX35TF
BS 719 765 RR4AP11JQ
BS 766 766 RR4DX35JQ
BS 767 854 RR4AP11JQ
BS 855 855 RR4DX35JQ
BS 856 901 RR4AP11JQ
BS 902 902 RR4DX35JQ
BS 903 934 RR4AP11JQ
BS 935 935 RR4DX35JQ
BS 936 965 RR4AP11JQ

RD RR4DX35TF 721 0 0
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TCAAGTCACAGTCCTCTTCTCTTATCCTCAAGAAATGGCGGCGACACAACTCACAGCATC
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CATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGGACCCTTAAGCAGAGCCAGTTCCGTTCTTTGGT
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AGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATC
CACTGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTAGGTGAAGGAAGAACTAT
TGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTA
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TGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGACATCAAGGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTT
CATTAAGGTTGCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACTAC
CAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAG
AAG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4AP11TF 704 0 0
GGAT
CTATCTATCTCTTCTGCAATTCTTAGGGTTTATAAGTCAAGTCACAGTCCTCTTCTCTTA
TCCTCAAGAAATGGCGGCGACACAACTCACAGCATCACCAGTGACCGTGTCAGCCAGGAG
CTTAGCCTCACTGGATGGTCTCAGAGCTTCGAGTGTCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACC
AGGGACCCTTA*GCAGAGTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGGGCTGCTTCTGTCGTTGC
TCCTAAGTATACTTCAATTAAGCCACTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGC
AGAGGAAAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACTGCTCAATCAAAGCCTCAAGG
AGGTGAAGTCATTGCTGTAGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCAC
TATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCTGGAACTGAGGTGGAGTTCAA
CGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGA
CATCAAGGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAGGCAGAGGA
GAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCAC
GGTGATAGCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAG
GAAGGT

QA 5 698 5 698
DS 

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AAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACTGCTCAA
TCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTAGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACC
AAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCTGGAACT
GAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTT
CTTGAGACAGAGGACATCAAGGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTT
GCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAG
CCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTT
CAGCCACTATCGATATCGACTGGAAGCACAGTTCTCTACTCCAAGTATGCTGGTAACGAC
TTCAAGGGCAAGGATGGTTCAAACTACATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATC
CTTTCTTAGTTTATATCTTTCTTTGTAACTTGCAAATTTGTATCCCAATTGAGGAATTTT
TTTCATAGACGGCATGATCATAATCTGAAATAAAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4AP11JQ 749 0 0
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TTCAATTAAGCCACTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAC
TATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACTGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCAT
TGCTGTAGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGG
AGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCTGGAACTGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCA
TCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTTTTCTTGAGACAGAGGACATCAAGGATCT
CAAGCCCTTGAATGACCGTGTTTTCATTAAGGTTGCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGG
AGGGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGT
TGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAG
CACAGTTCTTTACTCCAAGTATGCTGGTAACGACTTCAAGGGCAAGGATGGTTCAAACTA
CATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATCCTTTTTTAGTTTATATCTTTCTTTGT
AACTTGCAAATTTGTATCCCAATTGTGGAATTTTTTTCATAGACGGCATGATCATAATTT
GAAATAAAGACTTGAATTTGAAACTTAAG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

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AATAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTC
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AATCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAAGGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATA
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AGATGATCAAACTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTATTGTTATTTATTTAGTCTGTTAT
TGGTTTTATAATTGATTTTAACCCAATGATGTTA**ATCAAATAAATATAAATATCTTTG
TTCCCT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4E163TF U 1
AF RR4EV75JQ C 2
AF RR4EV75TF U 2
AF RR4GB76TF U 431
BS 1 491 RR4E163TF
BS 492 492 RR4EV75TF
BS 493 590 RR4E163TF
BS 591 606 RR4GB76TF

RD RR4E163TF 596 0 0
GGCAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATTGAACTCCTAT
CCAGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAGATAAAAAATAATTAGT
AATAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTC
TTGGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGGTGATCTTAATGGT
GGAGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTGGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTC
AATCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAAGGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATA
CAGATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACA
GGCTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGGTTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTG
AGATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTATTGTTATTTATTTAGTCTGTTAT
TGGTTTTATAATTGATTTTAACCCAATGATGTTA**ATCAAATAAATATA
AAAAAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4EV75JQ 556 0 0
GG
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AATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTTG
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TTCTAACTTGGAGAACAACTATTGGTTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAGA
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TTTTATAATTGATT

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR4EV75TF 589 0 0
GG
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GGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAGATAAAAAATAATTAGTAAT
AATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTTG
GCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGGTGATCTTAATGGTGGA
GATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTGGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAAT
CATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAAGGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAG
ATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGC
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TGATCAAACTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTATTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGG
TTTTATAATTGATTCTAACCCAATGATGTTA**ATCAAATAAATATA

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR4GB76TF 176 0 0
G
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TTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTTCCCT

QA 2 176 2 176
DS 



AS 1 2

CO CL2389Contig1 1142 2 2 U
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GAGTCTCTCGATTCCTCCGTCTCACCCGTTCTCATTCCCGGCGTCCATGTCTTCCATTGC
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TTTATATTTGATCCTGTAAAATGGCCGAGACACCAAGTGGGTGAAGATTTTCAAGCTATT
GCGCAAAGATACGGTGCCATGAACTCGGTTGTTCGTGTTCCTTCTATAGATCCCAAGTAT
AAGATTGCTCTTCTTCTTTCTAAACAGGATCATTGTCTGGTTGAGATGTTGCATAGATGG
CAAGACGGAAAACTACCTGTTGATATAACCTGTGTCATAAGTAATCATGAGAGAGCTTCA
AACACTCACGTTATGCGTTTTCTCGAGAGGCATGGCATTCCGTATCATTATGTAGCCACA
ACAAAAGATAATAAACGAGAAGATGAGATTTTGGAATTGGTCAAAGACACTGACTTCTTA
GTTCTCGCTAGATACATGCAGATTCTATCTGGTGACTTCTTGAAAGGTTATGGAAAGGAT
GTAATCAACATCCACCATGGTCTCTTGCCATCATTCAAGGGCGGATATCCAGCCAAACAG
GCGTTTGATGCAGGTGTGAAGCTGATTGGAGCAACTAGTCACTTTGTTACAGAGGAACTT
GATGCAGGGCCTATCATTGAACAAATGGTTGAGAGTGTTTCCCACCGGGACAATCTAAGG
AGCTTTGTCCAGAAATCTGAGGACCTCGAGAAAAAATGCCTCACAAAAGCTATAAAGTCA
TACTGCGAACTACGGGTGCTACCTTATGGAACAAACAAGACTGTTGTATTCTAATAGAAC
AAAGCAAAGACTACTTGTTGTATGAATTAACTCAAAAGAAGGTTATAACAATTCTCTTGC
AG


BQ
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10 10 

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A
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AAGGGTTACATTGTCAATATTAAAAGTAGTTGCTATAGTAACATTTATACTACTATTGAT
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RD RR4DX37JQ 278 0 0
AACCAACTACTTCGTCTGAACCCAAACAAGATCTACATAAAAATTCCACATTTTCTGCCC
CCCCTTCTTCATTTACCTTCAGGGGGCAAAGGAAAAAGCTCAAGGGTTACATTGTCAATA
TTAAAAGTAGTTGCTATAGTAACATTTATACTACTATTGATGTTTCTTCTGCTCTCTATC
TTCAAATTCTCAAATCCCCAGCTCCTACATGTCCTCTTGTACTCATTCTCTTCAACCAAC
TCCTTCATCACCAATGATTCTCTCTTGAGGTCAGG
GGA

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR4GR92JQ 757 0 0
AATTCATAATTAAGAATACATTGCAAAAGACATCTACACAGGATACGTCAGACTCGCAGA
TTACAAGGGAATTCTTATATAGATTCTGAATTTAGAAACTTATTTATCATATATATAATT
ATTATTTTGAATATCTAGAAACCAACTACTTCGTCTGAACCCAAACAAGATCTACATAAG
AATTCCACATTTTCTGCCTCGCCTTCTTCATTTACCTTCAGGGTGCAAAGGAAAAAGCTC
AAGGGTTACATTGTCAATATTAAAAGTAGTTGCTATAGTAGCATTTATACTACTATTGAT
GTTTCTTCTGCTCTCTATCTTCAAATTCTCAAATCCCCAGCTCCTACATGTCCTCTTGTA
CTCATTCTCTTCAACCAACTCCTTCATCACCAATGATTCTCTCTTGAGGTCAGGTGAAGA
CGATGTTCTTGTCTTCATTGTTACACTTGCATTAGAGACACTAGTTGTACTGAGGCTCCC
TTGGCAACCTAAACTGATGAGGTTGTTCCTCTTCTGCTTCTGTCTCTCCCGGGCTTTGTG
GTTCTGAAACCAGTAGAACACATTCTTCCCTTCGATTTTTCCGTATTTACCGAGTTGAGA
AGTGATGTGCTCGATCTGTTGCGCGTTAGGAGTGCGCATTCCACCTTTGTACAAGATCTC
AAGTATTCCTATCTGTTCTTGAGTCGGGTTCCACCTTGTCCCTCCAGGGTGCATCTCCAC
TTGAGAAAAGTCTCGTTTGTGTTCAAGAGAGTAATCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GR92TF 706 0 0
CTGCTCTCTATCT*CAAATTCTCAA*TCCCCAGCTC*TACATGTC*TCT*GTACTCAT*C
TCTTCAACCAACTCCTTCATCACCAATGATTCTCTCTTGAGGTCAGGTGAAGACGATGTT
CTTGTCTTCATTGTTACACTTGCATTAGAGACACTAGTTGTACTGAGGCTCCCTTGGCAA
CCTAAACTGATGAGGTTGTTCCTCTTCTGCTTCTGTCTCTCCCGGGCTTTGTGGTTCTGA
AACCAGTAGAACACATTCTTCCCTTCGATTTTTCCGTATTTACCGAGTTGAGAAGTGATG
TGCTCGATCTGTTGCGCGTTAGGAGTGCGCATTCCACCTTTGTACAAGATCTCAAGTATT
CCTATCTGTTCTTGAGTCGGGTTCCACCTTGTCCCTCCAGGGTGCATCTCCACTTGAGAA
AAGTCTCGTTTGTGTTCAAGAGAGTAATCAGATTTTGTTGGATCGGCTTGATCAGGTTTT
ATGAAGCTCTTGAGATCGAAAGTGGCGGAGGTGACGCCCGAGGAAGAAGAAGGCGGGGAG
GAAGGGCTAACGGAGAGCTTAGGGGCCAGAGGACGGAAGCGTTTGCAGCTAAGACTAAAG
GATGATGGCGACTCTTGTTGCTCCCACGACGAAAACCCATTGGAAAACTCATGAACCTTC
ATTTCTAATTTTCTATATATTTATTTAACAAATGTGGTCTCGTCCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

CO CL2391Contig1 794 4 6 U
GGAAAATATTCGTTGTTGAAGATACATCGATATATACAATCTCGATCTCTCTTCTTTCTG
TCCGTCTCTCTCTACCATGGCTAGGGTTTTTCCTCAAGCAGGCGTTTCTTCACCATACAT
GAGTACGGAGAGAGAGACTTTCACGGTTTGGATGAAGTCTCTTGTTTATCAAACCAATGG
TCTAACGGTTTACAATTCCAATGGAGAGATTACGTACCGGGTCGAAAACTATGACAAATC
TAGCAATGAAGTGCACATCATGGATCTCCATGGAAATATTCTTTTCACCATCCGCAAAAA
GAAATTATGGCTCTTTGGGAGTTGGTGTGTGTATAAAGAATGTGGGACGCTGTCAAGCAC
TGAGGAAGTGAAACCTTTTGTCAAGATCAAAAGGTCTTGTAGTAGAGATGGAGATTGGGA
AGTTCGAGATGAGACCAATGAAGTCTTTTGGATTTTAACATTCGACCCCAAATTTATTTT
TCAGATAACAGACGTCCATGGAAACATCGTTGCAAAGGTAAAGCCAAAACAATCATCAAA
TGGAGTTATATTGGGGGAAGATGTGTTAACTTTGGAGGTGAAGCCACGTATCGATCATTC
ACTCGTTGTAACACTTGTCACGGTATATGGATTGATTAAAGGAATAGTTTAATTTTTGTT
TGAATTTCATAGAGAATTTTATATACAAGATAGTAATTTTTCCAACCATGTTTGTGCTGT
GGGAGATGTAAATATTGTCATTTTTGCGAGCCTTGATTTTTTTGCTTTGTTTATATTTGC
TAATGGTTTTAATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DY81TF U 1
AF RR4E065TF U 1
AF RR4E065JQ C 95
AF RR4DY81JQ C 97
BS 1 577 RR4DY81TF
BS 578 578 RR4E065JQ
BS 579 643 RR4E065TF
BS 644 644 RR4E065JQ
BS 645 667 RR4E065TF
BS 668 794 RR4E065JQ

RD RR4DY81TF 581 0 0
GGAAAATATTCGTTGTTGAAGATACATCGATATATACAATCTCGATCTCTCTTCTTTCTG
TCCGTCTCTCTCTACCATGGCTAGGGTTTTTCCTCAAGCAGGCGTTTCTTCACCATACAT
GAGTACGGAGAGAGAGACTTTCACGGTTTGGATGAAGTCTCTTGTTTATCAAACCAATGG
TCTAACGGTTTACAATTCCAATGGAGAGATTACGTACCGGGTCGAAAACTATGACAAATC
TAGCAATGAAGTGCACATCATGGATCTCCATGGAAATATTCTTTTCACCATCCGCAAAAA
GAAATTATGGCTCTTTGGGAGTTGGTGTGTGTATAAAGAATGTGGGACGCTGTCAAGCAC
TGAGGAAGTGAAACCTTTTGTCAAGATCAAAAGGTCTTGTAGTAGAGATGGAGATTGGGA
AGTTCGAGATGAGACCAATGAAGTCTTTTGGATTTTAACATTCGACCCCAAATTTATTTT
TCAGATAACAGACGTCCATGGAAACATCGTTGCAAAGGTAAAGCCAAAACAATCATCAAA
TGGAGTTATATTGGGGGAAGATGTGTTAACTTTGGAG
GTGA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4E065TF 667 0 0
GGAAAATATTCGTTGTTGAAGATACATCGATATATACAATCTCGATCTCTCTTCTTTCTG
TCCGTCTCTCTCTACCATGGCTAGGGTTTTTCCTCAAGCAGGCGTTTCTTCACCATACAT
GAGTACGGAGAGAGAGACTTTCACGGTTTGGATGAAGTCTCTTGTTTATCAAACCAATGG
TCTAACGGTTTACAATTCCAATGGAGAGATTACGTACCGGGTCGAAAACTATGACAAATC
TAGCAATGAAGTGCACATCATGGATCTCCATGGAAATATTCTTTTCACCATCCGCAAAAA
GAAATTATGGCTCTTTGGGAGTTGGTGTGTGTATAAAGAATGTGGGACGCTGTCAAGCAC
TGAGGAAGTGAAACCTTTTGTCAAGATCAAAAGGTCTTGTAGTAGAGATGGAGATTGGGA
AGTTCGAGATGAGACCAATGAAGTCTTTTGGATTTTAACATTCGACCCCAAATTTATTTT
TCAGATAACAGACGTCCATGGAAACATCGTTGCAAAGGTAAAGCCAAAACAATCATCAAA
TGGAGTTATATTGGGGGAAGATGTGTTAACTTTGGAG*TGAAGCCACGTATCGATCATTC
ACTCGTTGTAACACTTGTCACGGTATATGGATTGATTAAAGGA*TAGTTTAATTTTTGTT
TGAATTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4E065JQ 700 0 0
CA
AGCAGGCGTTTCTTCACCATACATGAGTACGGAGAGAGAGACTTTCACGGTTTGGATGAA
GTCTCTTGTTTATCAAACCAATGGTCTAACGGTTTACAATTCCAATGGAGAGATTACGTA
CCGGGTCGAAAACTATGACAAATCTAGCAATGAAGTGCACATCATGGATCTCCATGGAAA
TATTCTTTTCACCATCCGCAAAAAGAAATTATGGCTCTTTGGGAGTTGGTGTGTGTATAA
AGAATGTGGGACGCTGTCAAGCACTGAGGAAGTGAAACCTTTTGTCAAGATCAAAAGGTC
TTGTAGTAGAGATGGAGATTGGGAAGTTCGAGATGAGACCAATGAAGTCTTTTGGATTTT
AACATTCGACCCCAAATTTATTTTTCAGATAACAGACGTCCATGGAAACATCGTTGCAAA
GGTAAAGCCAAAACAATCATCAAATGGAGTTATATTGGGGGAAGATGTGTTAACTTTGGA
GGTGAAGCCACGTATCGATCATTCACTCGTTGTAACACTTGTCACGGTATATGGATTGAT
TAAAGGAATAGTTTAATTTTTGTTTGAATTTCATAGAGAATTTTATATACAAGATAGTAA
TTTTTCCAACCATGTTTGTGCTGTGGGAGATGTAAATATTGTCATTTTTGCGAGCCTTGA
TTTTTTTGCTTTGTTTATATTTGCTAATGGTTTTAATT

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR4DY81JQ 698 0 0
AGCAGGCGTTTCTTCACCATACATGAGTACGGAGAGAGAGACTTTCACGGTTTGGATGAA
GTCTCTTGTTTATCAAACCAATGGTCTAACGGTTTACAATTCCAATGGAGAGATTACGTA
CCGGGTCGAAAACTATGACAAATCTAGCAATGAAGTGCACATCATGGATCTCCATGGAAA
TATTCTTTTCACCATCCGCAAAAAGAAATTATGGCTCTTTGGGAGTTGGTGTGTGTATAA
AGAATGTGGGACGCTGTCAAGCACTGAGGAAGTGAAACCTTTTGTCAAGATCAAAAGGTC
TTGTAGTAGAGATGGAGATTGGGAAGTTCGAGATGAGACCAATGAAGTCTTTTGGATTTT
AACATTCGACCCCAAATTTATTTTTCAGATAACAGACGTCCATGGAAACATCGTTGCAAA
GGTAAAGCCAAAACAATCATCAAATGGAGTTATATTGGGGGAAGATGTGTTAACTTTGGA
GGTGAAGCCACGTATCGATCATTCACTCGTTGTAACACTTGTCACGGTATATGGATTGAT
TAAAGGAATAGTTTAATTTTTGTTTGAATTTCATAGAGAATTTTATATACAAGATAGTAA
TTTTTCCAACCATGTTTGTGCTGTGGGAGATGTAAATATTGTCATTTTTGCGAGCCTTGA
TTTTTTTGCTTTGTTTATATTTGCTAATGGTTTTAATT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL2392Contig1 701 3 4 U
GTAAATGAGGTTTCATTCAATGTTATTCTGAATTTTCCAAGCACCAAAAGTTTCAGGAGA
AGAATAGCAATCCGTGGATACAGACACTACTAAAACAACTAGGACAAAGACAGTAATAGC
TTCTTGACACATTAAAAGAAAATGACTGAAAAAAAGATATGGAAACAACAAACACAAAGC
CTTATGGTTTTAACTTTCATTGAGAGGTGATTTATACTAAAATTACTTCTTGGCTTCCAC
GAGCTCTTCAATGAGTTCAGCAGCTTGCTCCACAGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTC
CGCCATTTCGATATCAAACGCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACCGTGTCGAGAGA
ATCTGCTCCAAGATCAGCAAACTTGGTGTCCGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGTGA
TAGTTGCTTCTTGACAATCTCAGACACTTTCGCTACCGTCTCTGGTTTGGCCGCGCAAGA
AACTGAGAGGCGAGTGGGGATTGAACGGCTTAGGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTACCAA
AGCTGGCTTCTGGAAACTAATCCTCGATGGTGTTGCCAGAGAAGTGGCTTGCATGGAGAC
AGAGGCGCGGAAAGTGGTAGCCATTGTCGTTGTTCACGAGAGAGATCTGCTCGAGAGAGA
GAGAGAGATGGGAAAGATGGCGGAGTGTACAAAGAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DD21JQ U 1
AF RR4GL40JQ U 28
AF RR4GL40TF C 29
BS 1 309 RR4DD21JQ
BS 310 310 RR4GL40JQ
BS 311 441 RR4DD21JQ
BS 442 701 RR4GL40JQ

RD RR4DD21JQ 441 0 0
GTAAATGAGGTTTCATTCAATGTTATTCTGAATTTTCCAAGCACCAAAAGTTTCAGGAGA
AGAATAGCAATCCGTGGATACAGACACTACTAAAACAACTAGGACAAAGACAGTAATAGC
TTCTTGACACATTAAAAGAAAATGACTGAAAAAAAGATATGGAAACAACAAACACAAAGC
CTTATGGTTTTAACTTTCATTGAGAGGTGATTTATACTAAAATTACTTCTTGGCTTCCAC
GAGCTCTTCAATGAGTTCAGCAGCTTGCTCCACAGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTC
CGCCATTTCAATATCAAACGCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACCGTGTCGAGAGA
ATCTGCTCCAAGATCAGCAAACTTGGTGTCCGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGTGA
TAGTTGCTTCTTGACAATCTC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4GL40JQ 674 0 0
CTGAAT
TTTCCAAGCACCAAAAGTTTCAGGAGAAGAATAGCAATCCGTGGATACAGACACTACTAA
AACAACTAGGACAAAGACAGTAATAGCTTCTTGACACATTAAAAGAAAATGACTGAAAAA
AAGATATGGAAACAACAAACACAAAGCCTTATGGTTTTAACTTTCATTGAGAGGTGATTT
ATACTAAAATTACTTCTTGGCTTCCACGAGCTCTTCAATGAGTTCAGCAGCTTGCTCCAC
AGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTCGATATCAAACGCTTCCTCTAAACC
CATCACTATCTCAACCGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCAGCAAACTTGGTGTCCGC
AACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGTGATAGTTGCTTCTTGACAATCTCAGACACTTTCGC
TACCGTCTCTGGTTTGGCCGCGCAAGAAACTGAGAGGCGAGTGGGGATTGAACGGCTTAG
GTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTACCAAAGCTGGCTTCTGGAAACTAATCCTCGATGGTGT
TGCCAGAGAAGTGGCTTGCATGGAGACAGAGGCGCGGAAAGTGGTAGCCATTGTCGTTGT
TCACGAGAGAGATCTGCTCGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAAAGATGGCGGAGTGTACAAA
GAGCGTCC

QA 7 674 7 674
DS 

RD RR4GL40TF 673 0 0
CTGAA
TTTCCAAGCACCAAAAGTTTCAGGAGAAGAATAGCAATCCGTGGATACAGACACTACTAA
AACAACTAGGACAAAGACAGTAATAGCTTCTTGACACATTAAAAGAAAATGACTGAAAAA
AAGATATGGAAACAACAAACACAAAGCCTTATGGTTTTAACTTTCATTGAGAGGTGATTT
ATACTAAAATTACTTCTTGGCTTCCACGAGCTCTTCAATGAGTTCAGCAGCTTGCTCCAC
AGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTCGATATCAAACGCTTCCTCTAAACC
CATCACTATCTCAACCGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCAGCAAACTTGGTGTCCGC
AACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGTGATAGTTGCTTCTTGACAATCTCAGACACTTTCGC
TACCGTCTCTGGTTTGGCCGCGCAAGAGACTGAGAGGCGAGTGGGGATTGAACGGCTTAG
GTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTACCAAAGCTGGCTTCTGGAAACTAATCCTCGATGGTGT
TGCCAGAGAAGTGGCTTGCATGGAGACAGAGGCGCGGAAAGTGGTAGCCATTGTCGTTGT
TCACGAGAGAGATCTGCTCGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAAAGATGGCGGAGTGTACAAA
GAGCGTCC

QA 6 673 6 673
DS 



AS 1 4

CO CL2393Contig1 577 4 5 U
GGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGATACCCTACACCTCGTCCACGCCGTCTCA
AGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACGAGCCAAGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTT
GAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTGGCTCGTGTTGTTGAAGGGGACGCTGGT
AAAGTAATCTGCAAGGAAGCAGAGATATTGAAGCCTGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGA
GGCCGGGGCTTAGTGAGGAGTGTGCTACAAGGGAGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCATAAT
TGCAAATCCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTC
AGTTGGACAAAATCTGGAGATCCTAAACCCTGAAGAAAATAGCTCTCCAGTCTCTTTGTA
CCTTTTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGTTTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCA
AGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCA
AGTTTTGTTTATAAAAAATAAAACATTTGTTATGTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4B819JQ C 1
AF RR4CU17TF U 359
AF RR4B819TF U 1
AF RR4BA07TF U 248
BS 1 364 RR4B819TF
BS 365 441 RR4CU17TF
BS 442 442 RR4B819TF
BS 443 576 RR4CU17TF
BS 577 577 RR4BA07TF

RD RR4B819JQ 576 0 0
GGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGATACCCTACACCTCGTCCACGCCGTCTCA
AGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACGAGCCAAGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTT
GAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTGGCTCGTGTTGTTGAAGGGGACGCTGGT
AAAGTAATCTGCAAGGAAGCAGAGATATTGAAGCCTGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGA
GGCCGGGGCTTAGTGAGGAGTGTGCTACAAGGGAGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCATAAT
TGCAAATCCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTC
AGTTGGACAAAATCTGGAGATCCTAAACCCTGAAGAAAATAGCTCTCCAGTCTCTTTGTA
CCTTTTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGTTTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCA
AGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCA
AGTTTTGTTTATAAAAAATAAAACATTTGTTATGTG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4CU17TF 218 0 0
CAGTTC
GGACAAAATCTGGAGATCCTAAACCCTGAAGAAAATAGCTCTCCAGTCTCTTTGTACCTT
TTATCTTTCTCATTGTAATTGCAGTCCTTGTTTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCAAGTA
ATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCAAGTT
TTGTTTATAAAAAATAAAACATTTGTTATGTG

QA 7 218 7 218
DS 

RD RR4B819TF 576 0 0
GGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGATACCCTACACCTCGTCCACGCCGTCTCA
AGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACGAGCCAAGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTT
GAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTGGCTCGTGTTGTTGAAGGGGACGCTGGT
AAAGTAATCTGCAAGGAAGCAGAGATATTGAAGCCTGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGA
GGCCGGGGCTTAGTGAGGAGTGTGCTACAAGGGAGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCATAAT
TGCAAATCCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTC
AGTTGGACAAAATCTGGAGATCCTAAACCCTGAAGAAAATAGCTCTCCAGTCTCTTTGTA
CCTTTTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGTTTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCA
AGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCA
AGTTTTGTTTATAAAAAATAAAACATTTGTTATGTG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4BA07TF 330 0 0
GCTTAGTGAGGAGTGTGCTACAAGGGAGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCATAATTGCAAAT
CCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTCAGTTGGA
CAAAATCTGGAGATCCTAAACCCTGAAGAAAATAGCTCTCCAGTCTCTTTGTACCTTTTA
TCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGTTTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCAAGTAATT
GTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCAAGTTTTG
TTTATAAAAAATAAAACATTTGTTATGTGT

QA 1 330 1 330
DS 



AS 2 4

CO CL2394Contig1 832 2 6 U
AGACCGAAGAAGAGATTTTTCTCATTTACGATGAACATTCCCGGTTCTCTCAGACAATTC
CAAAGTGAAAGATGGTACAACAACGGACTTGATGAGAAACCAAACCAAAAACAATATAAT
TTGGAAATGTCCAAAACGTGTGTGTGTGTAAGTCTTTGTTCATTAGTCATATAGACCATC
TTGTTCCCAAATCTCCACTAAAAAATCCACCATCTCATTGAGAGGAATGGGTTGGGGAAA
CAACTTGTTGCTCCCAAGCAAATTATCATATGACGCTGCGTTCCAATTTATCTTGGCTCC
TTGACTGCGTTCCGGTGAGTTACTAGCTCTTTCCTTCCCCACCCAACGCTCCCTTGTCTG
ATTCCAAAGAAGAAGACCTTGGTTTACAAACTCAGGAGGGGCACTTAAGTTTCTAGCAGC
AGAGTGAGAATCAAAAGTGTGGTTGGATGATGATAAGCTCCCCCCCTGAGAAGGGAAGGT
GATGTTGTCCATATCAACTGTGCTTGTTGACAAGAAATCTTCAGAGACGCCGCCGCCGCC
GCTCGGATGTTTCTTTTGTGGTACGGAATTAAAAGGTGGCCGAGGATCCTTTAGAGTTTG
AGTTGCTCTGTAGCAATCCACACAGCCACTGCTCCCATCGATTTATTAACACAGGAACTC
CAACAAGAGACCTGCAAGCTCGTGACTTTCAATGATAAAACACCTTAATATGATGGAAAT
CTACTTGGTTAGAAAAATAAAGTCGTTTCCTCTTTCTGAAATCTGCAGCTTCTTCACGAA
TAAGAAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGTTCCTCCTCTGCCCTGCCTTTACGTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C992JQ U 1
AF RR4GJ53JQ U 1
BS 1 146 RR4C992JQ
BS 147 148 RR4GJ53JQ
BS 149 579 RR4C992JQ
BS 580 580 RR4GJ53JQ
BS 581 737 RR4C992JQ
BS 738 832 RR4GJ53JQ

RD RR4C992JQ 737 0 0
AGACCGAAGAAGAGATTTTTCTCATTTACGATGAACATTCCCGGTTCTCTCAGACAATTC
CAAAGTGAAAGATGGTACAACAACGGACTTGATGAGAAACCAAACCAAAAACAATATAAT
TTGGAAATGTCCAAAACGTGTGTGTG**TAAGTCTTTGTTCATTAGTCATATAGACCATC
TTGTTCCCAAATCTCCACTAAAAAATCCACCATCTCATTGAGAGGAATGGGTTGGGGAAA
CAACTTGTTGCTCCCAAGCAAATTATCATATGACGCTGCGTTCCAATTTATCTTGGCTCC
TTGACTGCGTTCCGGTGAGTTACTAGCTCTTTCCTTCCCCACCCAACGCTCCCTTGTCTG
ATTCCAAAGAAGAAGACCTTGGTTTACAAACTCAGGAGGGGCACTTAAGTTTCTAGCAGC
AGAGTGAGAATCAAAAGTGTGGTTGGATGATGATAAGCTCCCCCCCTGAGAAGGGAAGGT
GATGTTGTCCATATCAACTGTGCTTGTTGACAAGAAATCTTCAGAGACGCCGCCGCCGCC
GCTCGGATGTTTCTTTTGTGGTACGGAATTAAAAGGTGGTCGAGGATCCTTTAGAGTTTG
AGTTGCTCTGTAGCAATCCACACAGCCACTGCTCCCATCGATTTATTAACACAGGAACTC
CAACAAGAGACCTGCAAGCTCGTGACTTTCAATGATAAAACACCTTAATATGATGGAAAT
CTACTTGGTTAGAAAAA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4GJ53JQ 832 0 0
G
GACCGAAGAAGAGATTTTTCTCATTTACGATGAACATTCCCGGTTTTCTCAGACAATTCC
AAAGTGAAAGATGGTACAACAACGGACTTGATGAGAAACCAAACCAAAAACAATATAATT
TGGAAATGTCCAAAACGTGTGTGTGTGTAAGTCTTTGTTCATTAGTCATATAGACCATCT
TGTTCCCAAATCTCCACTAGAAAATCCACCATCTCATTGAGAGGAATGGGTTGGGGAAAC
AACTTGTTGCTCCCAAGCAAATTATCATATGATGCTGCGTTCCAATTTATCTTGGCTCCT
TGATTGCGTTCCGGTGAGTTACTAGCTCTTTCCTTCCCCACCCAACGCTCCCTTGTCTGA
TTCCAAAGAAGAAGACCTTGGTTTACAAACTCAGGAGGGGCACTTAAGTTTCTAGCAGCA
GAGTGAGAATCAAAAGTGTGGTTGGATGATGATAAGCTCCCCCCCTGAGAAGGGAAGGTG
ATGTTGTCCATATCAACTGTGCTTGTTGACAAGAAATCTTCAGAGACGCCGCCGCCGCCG
CTCGGATGTTTCTTTTGTGGTACGGAATTAAAAGGTGGCCGAGGATCCTTTAGAGTTTGA
GTTGCTCTGTAGCAATCCACACAGCCAC*****CCATCGATTTATTAACACAGGAACTCC
AACAAGAGATCTGCAAGCTCGTGACTTTCAATGATAAAACACCTTAATATGATGGAAATC
TACTTGGTTAGAAAAATAAAGTCGTTTCCTCTTTCTGAAATCTGCAGCTTCTTCACGAAT
AAGAAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGTTCCTCCTCTGCCCTGCCTTTACGTTT

QA 2 832 2 832
DS 



CO CL2394Contig2 796 2 11 U
GGCTGGTCAAGCAATCATATCAAAGCGAAAGTGAAAACGTAAAGGGCAGGGCAGAGGAGG
AACCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTATTCGTGAAGAAGCTGCAGATTTTCAGAAAG
AGGAAACGACTTTATTTTTCTAACCAAGTAGATTTCCATCATATTAAGGTGTTTTATCAT
TGAAAGTCACGAGCTTGCAGATCTCTTGTTGGAGTTCCTGTGTTAATAAATCGATGGGAG
CAGTGGCTGTGTGGATTGCTACAGAGCAACTCAAACTCTAAAGGATCCTCGACCACCTTT
TAATTCCGTACCACAAAAGAAACATCCGAGCGGCGGCGGCGGCGTCTCTGAAGATTTCTT
GTCAACAAGCACAGTTGATATGGACAACATCACCTTCCCTTCTCAGGGGGGGAGCTTATC
ATCATCCAACCACACTTTTGATTCTCACTCTGCTGCTAGAAACTTAAGTGCCCCTCCTGA
GTTTGTAAACCAAGGTCTTCTTCTTTGGAATCAGACAAGGGAGCGTTGGGTGGGGAAGGA
AAGAGCTAGTAACTCACCGGAACGCAATCAAGGAGCCAAGATAAATTGGAACGCAGCATC
ATATGATAATTTGCTTGGGAGCAACAAGTTGTTTCCCCAACCCATTCCTCTCAATGAGAT
GGTGGATTTTCTAGTGGAGATTTGGGAACAAGATGGTCTATATGACTAATGAACAAAGAC
TTACACACACACGTTTTGGACATTCCAATTATATTGTTTTTGGTTTGGTTTCTCATCAAG
TCCGTTGTTGTACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ53TF U 19
AF RR4C992TF U 1
BS 1 84 RR4C992TF
BS 85 87 RR4GJ53TF
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TTCTTCTTATTCGTGAAGAAGCTGCAGATTTTCAGAAAGAGGAAACGACTTTATTTTTCT
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TTGGGAACAAGATGGTCTATATGACTAATGAACAAAGACTTACACACACAC
ACGTT

QA 4 714 4 714
DS 

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GTCAACAAGCACAGTTGATATGGACAACATCACCTTCCCTTCTCAGGGGGGGAGCTTATC
ATCATCCAACCACACTTTTGATTCTCACTCTGCTGCTAGAAACTTAAGTGCCCCTCCTGA
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GGTGGATTTTCTAGTGGAGATTTGGGAACAAGATGGTCTATATGACTAATGAACAAAGAC
TTACACACACACGTTTTGGACATTCCAATTATATTGTTTTTGGTTTGGTTTCTCATCAAG
TCCGTTGTTGTACATC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4EH10TF U 1
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RD RR4EH10TF 723 0 0
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GAAAGCTCTGCAAGCCACAAAGGTTGAGGAAAGGAAAGTTGATACCAAAGTGTTTGAGTC
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ATCTTTGGGCAAATGAAGACCCCTCCTTGTCCTTCAGCATTTATCTATCTATCTCTCTAC
TGTCTTAGTTTAATTTTGTTCTTAATTCTATCATTTTTGTTACACTTTTTCTACAGAACA
AGT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4C293JQ 735 0 0
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AGTGAACGGAGGAGCTCTTGCTCCGGCAATCGGAGACAGTGCTCAGTTCCCATCTTTGGG
CAAATGAAGACCCCTCCTTGTCCTTCAGCATTTATCTATCTATCTCTCTACTGTCTTAGT
TTAATTTTGTTCTTAATTCTATCATTTTTGTTACACTTTTTCTACAGAACAAGTTTGAGT
GCTTTTTTAGTTACG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

CO CL2396Contig1 897 4 11 U
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TCTCGCTTCGCTAGGGTTATGGCAGAAAGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAA
CGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCAGCACCAGCC
GACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACTGAGCATTGGTAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGA
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TGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACT
GGACGCACTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTCCCTCATCCTAGGAAACAA
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CTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAACCTAGTGGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGT
TTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAATATGGGTTATGACGAAGGCTTCAAATGGCTCTCTCA
GTACATCAAGTAACTACTAAGCCGCCAAGACTCCAACAACCACATGGCCTTGTTATTGCT
AAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTTTTCATGTTTTGTAAGAAAT
GTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCTTTGTAGTGATTTTTTTTTTAA
ATAACATTACATGTTTCGTAATTTATACTATTAAATAAGGTAAAAATGTTTGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP35TF U 1
AF RR4CJ43TF U 115
AF RR4AE18TF U 18
AF RR4AE18JQ C 18
BS 1 207 RR4AP35TF
BS 208 208 RR4CJ43TF
BS 209 461 RR4AP35TF
BS 462 462 RR4AE18TF
BS 463 624 RR4AP35TF
BS 625 625 RR4AE18TF
BS 626 635 RR4AP35TF
BS 636 636 RR4AE18TF
BS 637 762 RR4AP35TF
BS 763 832 RR4CJ43TF
BS 833 897 RR4AE18JQ

RD RR4AP35TF 762 0 0
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GTACATCAAGTAACTACTAAGCCGCCAAGACTCCAACAACCACATGGCCTTGTTATTGCT
AAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4CJ43TF 718 0 0
G
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DS 

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TGTT

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CTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCA
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AGAGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCACTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCA
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AGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAACCTAG
TGGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAATATGGGTT
ATGACGAAGGCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAGCCGCCAAGACT
CCAACAACCACATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCTCTTGT
CTTGCTTTTTTCATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTT
TGTTTCTTTGTAGTGATTTTTTTTTTAAATAACATTACATGTTTCGTAATTTATACTATT
AAATAAGGTAAAAATGTTTGGTTTT

QA 16 880 16 880
DS 



AS 2 4

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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM27TF C 1
AF RR4CM27JQ U 1
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BS 6 778 RR4CM27JQ

RD RR4CM27TF 778 0 0
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TGCGGAATGCTTTCCTCAATCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGCCTTGCGGTTGCCAG
AAACATCCATCTGAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCT
GGTTGGTGTTTTCAAGGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTTGGTG
CAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATTCAGAT
AAAACGTCAAAGAACCCTAGAAGGTGGTGGTGAAAAGGTTTACGGCTTGCTT
GAGCTC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CM27JQ 778 0 0
CCAGC
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ACACCGACCATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTGTTCCTTTCCTTGGGCTCCAAAAAC
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GGGTAAGCAACATCCTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGT
CTCTGAACAGCAAAGCCCTTCTTCGGTGGACGCATGATTCTTCTAGTGGCAACAAAGATA
ACATCTTTGCCACTGAACTTCTTCTCGAGCTCTCTGACAAGACGAGGATGGATCTTGCGG
AATGCTTTCCTCAATCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGCCTTGCGGTTGCCAGAAACA
TCCATCTGAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCTGGTTG
GTGTTTTCAAGGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTTGGTGCAACA
CCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATTCAGATAAAAC
GTCAAAGAACCCTAGAAGGTGGTGGTGAAAAGGTTTACGGCTTGCTTGAGCTC

QA 6 778 6 778
DS 



CO CL2397Contig2 796 2 2 U
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AAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCCACATTAACCAAGCTGTTCA
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AGCTTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTCGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGCAA
AGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCCCCTAAGAAAGGCTCTGCTGT
TCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCTATGCTTGAGGATGTTGC
TTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGTACCAAGATCAT
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CGGTGTGTACAGGAAACTTACAGGGAGAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCACAGAATC
TTGAAGAGATGAATGATCGTTCTATTCTTTGTTTTTTTTTTGTCGACTAGAGAGCTTTTG
ATTCTGTTTTGTTTCCGAGTACAAGTTACTTCCTGTTTTCGTCAAAATTCTGGTTAACAA
AACCTTTCTTCTGTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TTGAAGAGATGAATGAT

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DS 

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ACGTG
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GCAAGATCCATCCTCGTCTCGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGATGTTA
TCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCCCCTAAGAAAGGCTTTGCTGTTCAGAGAC
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TTGTTTCCGAGTACAAGTTACTTCCTGTTTTCGTCAAAATTCTGGTTAACAAAACCTTTC
TTCTGTTG

QA 6 733 6 733
DS 



AS 1 3

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CTTTTTTGGCTATCTGCGCGATCGATTACTGTCCGAAAGGTTGAAACTTTTTGTTGTGTA
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TTTCCTTCAGCAGCCTAACCTCCTCGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATAT
TCATGGACAGTACTCAGATCTACTGAGGCTGTTTGAGTACGGAGGCTTCCCTCCCACAGC
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TCTCCTCCTAGCCTACAAAATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTAAGAGGCAACCA
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CGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTTACGGATTCTTTTAACTGCCTCCCGGTGGCTGCTGTGAT
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CACGTTTGGGCCTGACAAAGTTGCTGAGTTTCTTATCAAGAATGATATGGATCTCATCTG
TCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGGTATGAGTTCTTTGCAGATAGACAGCTTGTTAC
TATATTCTCAGCTCCAAACTACTGTGGTGAATTCGACAATGCTGGTGCGATGATGAGTGT
TGATGAGAGTTTGATGTGCTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCGGATAGGAGGCCCCGGTT
CTTATGATCGAAAAGAGTTAGAACCTGGCGGGAGAGACATTTGAAGCTCCCTGAGTGTTC
AGAGGCCAAAAAAAAGAAAGAAAGTCTAAATGTTATATTATCATCATCTTATTTGAACTC
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CTCGGTGGTATATACACGACTATACTCTTGTCTCC


BQ
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GACAGAAGGGTGTTGTTTTGGATCGTGTTCTTTTCGAATGGCGCAGGGAAGCATGGACCC
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T

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GATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTAAA

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DS 

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GCTCTGGAAAGTGTTTACGGATTCTTTTAACTGCCTCCCGGTGGCTGCTGTGATAGACGA
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CTCAGCTCCAAACTACTGTGGTGAATTCGACAATGCTGGTGCGATGATGAGTGTTGATGA
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CAAAAAAAAGAAAGAAAGTCTAAATGTTATATTATCATCATCTTATTTGAACTCTTACCA
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TTAGACAGTAACAAAATAATGTCTGCAAATTTTTTATTATTCATCAACCAACTCCTCGGT
GGTATATACACGACTATACTCTTGTCTCC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 4

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GTCGCCTATGTTCTTCAAGGATCTGGAACGGCGGGGATTGTACTCCCTGAGCAGGAGGAG
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CCCAGGGACGGGGACCGTGAAGGGTTTGTGTTGAACTGCTTGGAAGCTCCTCTTGATGCT
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GTTGTTGGTGCTGATGGGAAGAGGGTTCTCGAGACTCACATCAAGGCTGGTTCTCTCTCC
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AAGGCATTGTCTCCGGAGGTTTTGCAGGCGGCGTTTAAGGTTGATCCTGAGGTGGAACAG
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 

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AF RR4GO92JQ C 532
AF RR4GD94JQ C 746
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CCCAGGGACGGGGACCGTGA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4GO92TF 659 0 0
G
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TTGAACACTAAGAACCTTCCTCTGGTTGGGGAGGTTGGGTTTGGTGCTGATCTTGTTCGG
ATCGACGCGCATTCCATGTGTTCGCCAGGCTTCTCTTGTGACTCGGCCCTTCAGGTGACT
TACATTGTTGCCGGGAGTGGGAGAGTCCAGGTTGTTGGTGCTGATGGGAAGAGGGTTCTC
GAGACTCACATCAAGGCTGGTTCTCTCTCCATTGTTCCGAGGTTCTTTGTGGTTCCGAAG
ATTGCTGATCCTGAGGGCATGTCTTGGTTCTCCATTGTGACTACTCCCGATCCGATCTTC
ACGCATTTGGCTGGGAGGACATCGGTTTGGAAGGCATTGTCTCCGGAGGTTTTGCAGGCG
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QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4GO92JQ 795 0 0
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CTTGATGCTGACATCAAGGACGGTGGGAGAGTTGTGGTGTTGAACACTAAGAACCTTCCT
CTGGTTGGGGAGGTTGGGTTTGGTGCTGATCTTGTTCGGATCGACGCGCATTCCATGTGT
TCGCCAGGCTTCTCTTGTGACTCGGCCCTTCAGGTGACTTACATTGTTGCCGGGAGTGGG
AGAGTCCAGGTTGTTGGTGCTGATGGGAAGAGGGTTCTCGAGACTCACATCAAGGCTGGT
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TCTTGGTTCTCCATTGTGACTACTCCCGATCCGATCTTCACGCATTTGGCTGGGAGGACA
TCGGTTTGGAAGGCATTGTCTCCGGAGGTTTTGCAGGCGGCGTTTAAGGTTGATCCTGAG
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TGAATACGGCGAAGAGATGAGAACAAGAACCAGCTTTGTCTTTAGTCGTTGTGTTTTTCC
CCTGTTTTCTCTTTGCTTGTGACTCACGGAAGCACTTAGGGTTTGCTTCTGTTTGTGTTT
TATCCTGGACCGGTTCTTGTTCTCTTTGTTGATCTTTACGCTTTGTTATTGAAATAAAAC
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C

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4GD94JQ 581 0 0
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TGACTTACATTGTTGCCGGGAGTGGGAGAGTCCAGGTTGTTGGTGCTGATGGGAAGAGGG
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CGAAGATTGCTGATCCTGAGGGCATGTCTTGGTTCTCCATTGTGACTACTCCCGATCCGA
TCTTCACGCATTTGGCTGGGAGGACATCGGTTTGGAAGGCATTGTCTCCGGAGGTTTTGC
AGGCGGCGTTTGAGGTTGATCCTGAGGTGGAACAGTCCTTCCGTTCAAAGAGAACTTCCG
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CTTAGGGTTTGCTTCTGTTTGTGTTTTATCCTGGACCGGTTCTTGTTCTCTTTGTTGATC
TTTACGCTTTGTTATTGAAATAAAACACTTTCAACATTACT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 4

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GCCAATTGACTTAACCGGTATTGGAGTTCCTGAAGATGGACAGAAGATGATCTCAGAGCT
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TGGCGTGTCGCTGCTTCAACCAACGGTTCAGAATCATCAAGAACATCTTCAGTTCCAAGG
AAACATGGTGGAAGGAAGCTTCTTTGAAGACTTGAACATACCAAACAGAGTCAACAACAA
CAACAACGGTAGCAACCAAGCGTTCTTCCAAGGGAACAACAACACTAGCAACCACCAAAC
GTTTTTCCAAGGGAACAACAACAATGGGTTCAAGTACGACACTGCACACACCAACAACAG
CTTCGAAGCTGCGCATAACAACAGTAGCAGCAACAGGTTTCAGCTTGTGTTTGATTCTCC
ACCGTTTGATATGGCCTCATTCGATTACAGAGATGATATGTCAATGCCGGGAACGATGGA
TGCTATGCAGCAGCAGAAGCAGCAAGATGTATCCATATGGTTCTAAGTCTTGGGGGAATA
GATTTCAACTCCTCTTTATTTTTATCTCTTGTGTTCTTCTTACATTCACTCTCTACAATG
TAATATTTTT*CTGGGTCTGTCTCTCTGTCTCCTCGCTTGTAATGTGTTTGTAAGAGTCT
CTGAAACTCTGTTACTGTGTGTGTCTTGTTCTCGCCCTGGCGAAACTCTCTTGTCGTCGG
CTTCTTTTAGTTTATACACCCCATACTCGGGG*ACGAACATAATGTAAGTTTTCATATTT
TATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4A656TF U 1
AF RR4DN66TF U 104
AF RR4CV96JQ C 141
AF RR4A656JQ C 141
BS 1 670 RR4A656TF
BS 671 671 RR4DN66TF
BS 672 806 RR4A656TF
BS 807 838 RR4DN66TF
BS 839 847 RR4A656JQ

RD RR4A656TF 806 0 0
GAACGAAGTTAAACCTGTCGTTGGCTTCTCTCAGCCAAGGCCAGTGAACTCGGTTTCCCA
GCCAATTGACTTAACCGGTATTGGAGTTCCTGAAGATGGACAGAAGATGATCTCAGAGCT
CATGTCCATGTACGACAGAAACGTCCAGAGCAACCAAAACCAAACTGTCATGGAGAATCA
TGGCGTGTCGCTGCTTCAACCAACGGTTCAGAATCATCAAGAACATCTTCAGTTCCAAGG
AAACATGGTGGAAGGAAGCTTCTTTGAAGACTTGAACATACCAAACAGAGTCAACAACAA
CAACAACGGTAGCAACCAAGCGTTCTTCCAAGGGAACAACAACACTAGCAACCACCAAAC
GTTTTTCCAAGGGAACAACAACAATGGGTTCAAGTACGACACTGCACACACCAACAACAG
CTTCGAAGCTGCGCATAACAACAGTAGCAGCAACAGGTTTCAGCTTGTGTTTGATTCTCC
ACCGTTTGATATGGCCTCATTCGATTACAGAGATGATATGTCAATGCCGGGAACGATGGA
TGCTATGCAGCAGCAGAAGCAGCAAGATGTATCCATATGGTTCTAAGTCTTGGGGGAATA
GATTTCAACTCCTCTTTATTTTTATCTCTTGTGTTCTTCTTACATTCACTCTCTACAATG
TAATATTTTTTCTGGGTCTGTCTCTCTGTCTCCTCGCTTGTAATGTGTTTGTAAGAGTCT
CTGAAACTCTGTTACTGTGTGTGTCTTGTTCTCGCCCTGGCGAAACTCTCTTGTCGTCGG
CTTCTTTTAGTTTATACACCCCATAC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4DN66TF 735 0 0
G
AGATGATCTCAGAGCTCATGTCCATGTACGACAGAAACGTCCAGAGCAACCAAAACCAAA
CTGTCATGGAGAATCATGGCGTGTCGCTGCTTCAACCAACGGTTCAGAATCATCAAGAAC
ATCTTCAGTTCCAAGGAAACATGGTGGAAGGAAGCTTCTTTGAAGACTTGAACATACCAA
ACAGAGTCAACAACAACAACAACGGTAGCAACCAAGCGTTCTTCCAAGGGAACAACAACA
CTAGCAACCACCAAACTTTTTTCCAAGGGAACAACAACAATGGGTTCAAGTACGACACTG
CACACACCAACAACAGCTTCGAAGCTGCGCATAACAACAGTAGCAGCAACAGGTTTCAGC
TTGTGTTAGATTCTCCACCGTTTTATATGGCCTCATTCGATTACAGAGATGATATGTCAA
TGCCGGGAACGATGGATGCTATGCAGCAGCAGAAGCAGCAAGATGTATCCATATGGTTCT
AAGTCTTGGGGGAATAGATTTCAACTCCTCTTTATTTTTATCTCTTGTGTTCTTCTTACA
TTCACTCTCTACAATGTAATATTTTT*CTGGGTCTGTCTCTCTGTCTCCTCGCTTGTAAT
GTGTTTGTAAGAGTCTCTGAAACTCTGTTACTGTGTGTGTCTTGTTCTCGCCCTGGCGAA
ACTCTCTTGTCGTCG*CTTCTTTTAGTTTATACACCCCATACTCGGGG*ACGAACATAAT
GTAAGTTTTCATAT

QA 2 735 2 735
DS 

RD RR4CV96JQ 690 0 0
ACGTCCAGAGCAACCAAAACCAAACTGTCATGGAGAATCATGGCGTGTCGCTGCTTCAAC
CAACGGTTCAGAATCATCAAGAACATCTTCAGTTCCAAGGAAACATGGTGGAAGGAAGCT
TCTTTGAAGACTTGAACATACCAAACAGAGTCAACAACAACAACAACGGTAGCAACCAAG
CGTTCTTCCAAGGGAACAACAACACTAGCAACCACCAAACGTTTTTCCAAGGGAACAACA
ACAATGGGTTCAAGTACGACACTGCACACACCAACAACAGCTTTGAAGCTGCGCATAACA
ACAGTAGCAGCAACAGGTTTCAGCTTGTGTTTGATTCTCCACCGTTTGATATGGCCTCAT
TCGATTACAGAGATGATATGTCAATGCCGGGAACGATGGATGCTATGCAGCAGCAGAAGC
AGCAAGATGTATCCATATGGTTTTAAGTCTTGGGGGAATAGATTTCAACTCCTCTTTATT
TTTATCTCTTGTGTTCTTCTTACATTCACTCTTTACAATGTAATATTTTT*CTGGGTCTG
TCTCTCTGTCTCCTCGCTTGTAATGTGTTTGTAAGAGTTTTTGAAACTCTGTTACTGTGT
GTGTCTTGTTCTCGCCCTGGCGAAACTCTCTTGTCGTCGGCTTCTTTTAGTTTATACACC
CCATACTCGGGG*ACGAACATAATGTAAGT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4A656JQ 707 0 0
ACGTCCAGAGCAACCAAAACCAAACTGTCATGGAGAATCATGGCGTGTCGCTGCTTCAAC
CAACGGTTCAGAATCATCAAGAACATCTTCAGTTCCAAGGAAACATGGTGGAAGGAAGCT
TCTTTGAAGACTTGAACATACCAAACAGAGTCAACAACAACAACAACGGTAGCAACCAAG
CGTTCTTCCAAGGGAACAACAACACTAGCAACCACCAAACGTTTTTCCAAGGGAACAACA
ACAATGGGTTCAAGTACGACACTGCACACACCAACAACAGCTTCGAAGCTGCGCATAACA
ACAGTAGCAGCAACAGGTTTCAGCTTGTGTTTGATTCTCCACCGTTTGATATGGCCTCAT
TCGATTACAGAGATGATATGTCAATGCCGGGAACGATGGATGCTATGCAGCAGCAGAAGC
AGCAAGATGTATCCATATGGTTCTAAGTCTTGGGGGAATAGATTTCAACTCCTCTTTATT
TTTATCTCTTGTGTTCTTCTTACATTCACTCTCTACAATGTAATATTTTT*CTGGGTCTG
TCTCTCTGTCTCCTCGCTTGTAATGTGTTTGTAAGAGTCTCTGAAACTCTGTTACTGTGT
GTGTCTTGTTCTCGCCCTGGCGAAACTCTCTTGTCGTCGGCTTCTTTTAGTTTATACACC
CCATACTCGGGGGACGAACATAATGTAAGTTTTCATATTTTATAAAT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 4

CO CL2401Contig1 594 2 3 U
GGAGCGTTTCGTCTCCCGCTCGCTACCCGCCGATTCTCCAACTCGTCGCCGCGGATTAGC
TTGCAGCGTTCCACGATCTGTATCGGTCATCTCCGTCGGATCGCAACAGCTTCCTCCATG
AGCCAACTAACCAGCGAAACCGATGCCTCCCGTAACGACGAGAACTCTGCGGAAAAACCA
GACGACGTGGTGGTGCAGTACGTGGTGCTTCGACGAGATCTGATCGACTCGTGGCCACTC
GGGAGCGTGGTGACGCAGGGATGCCACGCGTCAGTTGCGGCGATATGGTCGTTCAGAGAC
GATCCGGTTACGCTTCAGTACTGTGATCCGCAGCACATTGACTCTATGCACAAGGTCACT
CTTGAAGTTAAAGGAGAAACTCAGATGATGAATTTATCAGAGAAGTTGAAGTCAGGAGGA
ATCTCTCATAAGCTATGGATGGAGCAGCCTGAGAATATTCCGACTTGCATAGCTACAAAG
CCTTATCTCAAATCTCAAGTCTCTCCTTTCTTCAAGAAGCTCAAACTTTGCAAGTGATTC
TTCTCCATTTTAATTATATAAAAGAATCTGAATGAGTTGAATGAGTTAATCTCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP44JQ C 1
AF RR4AP44TF U 1
BS 1 3 RR4AP44JQ
BS 4 578 RR4AP44TF
BS 579 594 RR4AP44JQ

RD RR4AP44JQ 594 0 0
GGAGCGTTTCGTCTCCCGCTCGCTACCCGCCGATTCTCCAACTCGTCGCCGCGGATTAGC
TTGCAGCGTTCCACGATCTGTATCGGTCATCTCCGTCGGATCGCAACAGCTTCCTCCATG
AGCCAACTAACCAGCGAAACCGATGCCTCCCGTAACGACGAGAACTCTGCGGAAAAACCA
GACGACGTGGTGGTGCAGTACGTGGTGCTTCGACGAGATCTGATCGACTCGTGGCCACTC
GGGAGCGTGGTGACGCAGGGATGCCACGCGTCAGTTGCGGCGATATGGTCGTTCAGAGAC
GATCCGGTTACGCTTCAGTACTGTGATCCGCAGCACATTGACTCTATGCACAAGGTCACT
CTTGAAGTTAAAGGAGAAACTCAGATGATGAATTTATCAGAGAAGTTGAAGTCAGGAGGA
ATCTCTCATAAGCTATGGATGGAGCAGCCTGAGAATATTCCGACTTGCATAGCTACAAAG
CCTTATCTCAAATCTCAAGTCTCTCCTTTCTTCAAGAAGCTCAAACTTTGCAAGTGATTC
TTCTCCATTTTAATTATATAAAAGAATCTGAATGAGTTGAATGAGTTAATCTCT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4AP44TF 594 0 0
GGA
GCGTTTCGTCTCCCGCTCGCTACCCGCCGATTCTCCAACTCGTCGCCGCGGATTAGCTTG
CAGCGTTCCACGATCTGTATCGGTCATCTCCGTCGGATCGCAACAGCTTCCTCCATGAGC
CAACTAACCAGCGAAACCGATGCCTCCCGTAACGACGAGAACTCTGCGGAAAAACCAGAC
GACGTGGTGGTGCAGTACGTGGTGCTTCGACGAGATCTGATCGACTCGTGGCCACTCGGG
AGCGTGGTGACGCAGGGATGCCACGCGTCAGTTGCGGCGATATGGTCGTTCAGAGACGAT
CCGGTTACGCTTCAGTACTGTGATCCGCAGCACATTGACTCTATGCACAAGGTCACTCTT
GAAGTTAAAGGAGAAACTCAGATGATGAATTTATCAGAGAAGTTGAAGTCAGGAGGAATC
TCTCATAAGCTATGGATGGAGCAGCCTGAGAATATTCCGACTTGCATAGCTACAAAGCCT
TATCTCAAATCTCAAGTCTCTCCTTTCTTCAAGAAGCTCAAACTTTGCAAGTGATTCTTC
TCCATTTTAATTATATAAAAGAATCTGAATGAGTT
GAATGAGTTAATCTCT

QA 4 578 4 578
DS 



CO CL2401Contig2 614 2 2 U
GGATGGCCTTCTCAGCCGTCGCCTCCGCTGCGTTTCGTCTCCCGCTCGTTACCCGCCGAT
TCTCCAACTCGTCGCGGCGGATCAGCTTGCAGCGTTCCACGATCTGTATCGGTCGTCTCC
GTCGGATCGCAACAGCTTCCTCAATGAGCCAACTAACCAGCGAAACCGATGCCTCCCGTA
ACGACGAGAACTCTGCGGAGAAACCAGACGACGTGGTGGTGCAGTACGTGGTGCTTCGAC
GAGATCTGATCGACTCGTGGCCACTCGGGAGCGTGGTGAGCAGGGATGCCACGCGTCAGT
TGCGGCGATCTGGTCGTTCAGAGACGATCCGGTTACGCTTCAGTACTGTGATCCGCAGCA
CATTGACTCTATGCACAAGTCACTCTTGAAGTTAAAGGAGAAACTCAGATGATGAATTTA
TCAGAGAAGTTGAAGTCAGGAGGAATCTCTCATAAGCTATGGATGGAGCAGCCTGAGAAC
ATCCCCACTTGTATTGCTACAAAGCCTTATCTCAAATCTCAAGTCTCTCCTTTCTTCAAG
AAGCTCAAACTTTGCAAGTGATTCTTCTCCATTTTATTATATAAAAGAATATGAATGAGT
TAAATCTCTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ25TF U 1
AF RR4BQ25JQ C 92
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BS 602 614 RR4BQ25JQ

RD RR4BQ25TF 612 0 0
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TCTCCAACTCGTCGCGGCGGATCAGCTTGCAGCGTTCCACGATCTGTATCGGTCGTCTCC
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ACGACGAGAACTCTGCGGAGAAACCAGACGACGTGGTGGTGCAGTACGTGGTGCTTCGAC
GAGATCTGATCGACTCGTGGCCACTCGGGAGCGTGGTGAGCAGGGATGCCACGCGTCAGT
TGCGGCGATCTGGTCGTTCAGAGACGATCCGGTTACGCTTCAGTACTGTGATCCGCAGCA
CATTGACTCTATGCACAAGTCACTCTTGAAGTTAAAGGAGAAACTCAGATGATGAATTTA
TCAGAGAAGTTGAAGTCAGGAGGAATCTCTCATAAGCTATGGATGGAGCAGCCTGAGAAC
ATCCCCACTTGTATTGCTACAAAGCCTTATCTCAAATCTCAAGTCTCTCCTTTCTTCAAG
AAGCTCAAACTTTGCAAGTGATTCTTCTCCATTTTATTATATAAAAGAATATGAATGAGT
T
AAATCTCTTTT

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4BQ25JQ 523 0 0
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ACTAACCAGCGAAACCGATGCCTCCCGTAACGACGAGAACTTTGCGGAGAAACCAGACGA
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CGTGGTGAGCAGGGATGCCACGCGTCAGTTGCGGCGATCTGGTCGTTCAGAGACGATCCG
GTTACGCTTCAGTACTGTGATCCGCAGCACATTGACTTTATGCACAAGTCACTCTTGAAG
TTAAAGGAGAAACTCAGATGATGAATTTATCAGAGAAGTTGAAGTCAGGAGGAATTTTTC
ATAAGCTATGGATGGAGCAGCCTGAGAACATCCCCACTTGTATTGCTACAAAGCCTTATC
TCAAATCTCAAGTCTTTCCTTTTTTCAAGAAGCTCAAACTTTGCAAGTGATTTTTTTCCA
TTTTATTATATAAAAGAATATGAATGAGTTAAATCTCTTTTTG

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

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AAATTGGACCAGTTTCAAGATACTCTGTACAAAGGCATAATAACAAACCCTAAAAAGAAC
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TCTAAAAACAAACCCCTTTATTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCTGTTG
AAAAGTGAACTTGCTCTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCAACCA
TTCCAGCATATTGATCACCATTGGCGTATCATCGAGATAGTACTTGGCCTTGCTCGGTTT
CTGACCCACCGTGCACGCAAACACCTCTGCAAAAGCGATTGGGGAAACATCTTGGTGCTT
CACTATGCTATCAAACATGTCTTCATCTGACCTGTCATCACCAATGCACAACAGAAAGTC
CGGTCTCTTCCCTTTGCTGTTCCTCATTGTCGCAATCAAATGCTCCACCACCTTCCCTTT
GCTTACTCCCTGAGGTTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAGGCTC
GTTGGCGAGCACGCTCTCTAGATGATCAAGAAGCTCTTTAGCTTGCCAAGAACCGAAAGA
AGGGTCAGCTTCTTGGTGATGCCACACCATTGCACTCTCTTTCTCCTCTATGAATGGTCC
ATCAGTTGCTTCTGTGTAGTGTTTCATCACTGGTTCAGCTATCTTCTTCCACCCTAAATC
GGTGGGCAGTACACTTGTCTCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI29JQ U 1
AF RR4GN57JQ U 66
BS 1 638 RR4FI29JQ
BS 639 804 RR4GN57JQ

RD RR4FI29JQ 638 0 0
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AAATTGGACCAGTTTCAAGATACTCTGTACAAAGGCATAATAACAAACCCTAAAAAGAAC
CCTTTCATGATATCAAATCCTACCATCCTTCCTTTTTTTTTAATATCACAACATGAAATC
TCTAAAAACAAACCCCTTTATTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCTGTTG
AAAAGTGAACTTGCTCTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCAACCA
TTCCAGCATATTGATCACCATTGGCGTATCATCGAGATAGTACTTGGCCTTGCTCGGTTT
CTGACCCACCGTGCACGCAAACACCTCTGCAAAAGCGATTGGGGAAACATCTTGGTGCTT
CACTATGCTATCAAACATGTCTTCATCTGACCTGTCATCACCAATGCACAACAGAAAGTC
CGGTCTCTTCCCTTTGCTGTTCCTCATTGTCGCAATCAAATGCTCCACCACCTTCCCTTT
GCTTACTCCCTGAGGTTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAGGCTC
GTTGGCGAGCACGCTCTCTAGATGATCAAGAAGCTCTT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4GN57JQ 739 0 0
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AAACAAACCCCTTTATTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCTGTTGAAAAG
TGAACTTGCTCTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCAACCATTCCA
GCATATTGATCACCATTGGCGTATCATCGAGATAGTACTTGGCCTTGCTCGGTTTCTGAC
CCACCGTGCACGCAAACACCTCTGCAAAAGCGATTGGGGAAACATCTTGGTGCTTCACTA
TGCTATCAAACATGTCTTCATCTGACCTGTCATCACCAATGCACAACAGAAAGTCCGGTC
TCTTCCCTTTGCTGTTCCTCATTGTCGCTATCAAATGCTCCACCACCTTCCCTTTGCTTA
CTCCCTGAGGTTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAGGCTCGTTGG
CGAGCACGCTCTCTAGATGATCAAGAAGCTCTTTAGCTTGCCAAGAACCGAAAGAAGGGT
CAGCTTCTTGGTGATGCCACACCATTGCACTCTCTTTCTCCTCTATGAATGGTCCATCAG
TTGCTTCTGTGTAGTGTTTCATCACTGGTTCAGCTATCTTCTTCCACCCTAAATCGGTGG
GCAGTACACTTGTCTCCCA

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL2403Contig1 1016 4 26 U
GGCTACGAGTCCTTGGAAGTGTGGGTGAGCCCATCAATCCGAGTGCATGGAGATGGTTCT
TCAATCTAGTTGGTGATTCAAGGTGTCCCATTTCAGATACATGGTGGCAAACTGAAACTG
GTGGCCTCATGATAACGCCGTTGCCAGGTGCTTGGCCACAGAAGCCTGGTTCAACTACTT
TCCCTTTCTTTGGTGTTCAGCCTGTCATAGTTGATGAAAAAGGCGATGAAATCGAAGGCG
AGTGTAGTGGTTATCTTTGTGTGAAAGGATCATGGCCCGGGGCGTTTCGAACTTTGTTTG
GGGATCATGAAAGATATGAAACCACATATTTCAAACCTTTTGCTGGATACTATTTTAGTG
GTGATGGTTGCAGCAGAGACAAGGATGGTTACTACTGGCTTACAGGAAGGGTTGATGATG
TTATCAACGTCAGTGGCCACCGCATTGGAACTGCTGAAGTGGAATCTGCTCTGGCTTCGC
ATCCCCAATGTGCAGAGGCAGCTGTTGTAGGTGTAGAACATGAGGTGAAAGGACAAGGTA
TCTATGCGTTTGTCACTCTTGTGGAGGGTGTTCCTTACAGCGAAGAGCTTCGGAAAAGTC
TTATAATCATGGTTCGAAACCAGATTGGGGCATTTGCAGCACCGGACAGAATACATTGGG
CACCAGGGTTGCCAAAGACGAGAAGTGGAAAGATAATGAGGAGAATCCTGAGAAAGATCG
CTTCAAGGCAATTAGAAGAGCTTGGAGATATTAGCACACTCGCAGATCCTAGTGTTGTTG
ATCAGCTTATCGCACTTGCCGATGTGTGAAAGTATCTCATTTTTCTCTCTCCATGAATGT
AACCATTTCAACATGTGCATGAGAGTTTTGGCATCTATGTTTATTAGAGGGAGGAGTGTT
TTGAAAAAAAAAACAAAAACTGAAACAAGATTGTGCTTCTTGTGAAGAATAAAGCGAGCA
GACAATTTGGTAACATTCATTGAGAGGACTCCATGAATAAATGATTTTTTGGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4DH28TF U 36
AF RR4FY63TF U 1
AF RR4DH28JQ C 225
AF RR4FY63JQ C 240
BS 1 173 RR4FY63TF
BS 174 174 RR4DH28TF
BS 175 446 RR4FY63TF
BS 447 447 RR4DH28TF
BS 448 700 RR4FY63TF
BS 701 701 RR4DH28TF
BS 702 704 RR4FY63TF
BS 705 705 RR4DH28TF
BS 706 714 RR4FY63TF
BS 715 715 RR4DH28TF
BS 716 725 RR4FY63TF
BS 726 726 RR4DH28TF
BS 727 727 RR4FY63TF
BS 728 728 RR4DH28JQ
BS 729 730 RR4FY63TF
BS 731 731 RR4DH28TF
BS 732 751 RR4FY63TF
BS 752 752 RR4DH28JQ
BS 753 768 RR4FY63TF
BS 769 769 RR4DH28JQ
BS 770 787 RR4FY63TF
BS 788 815 RR4DH28JQ
BS 816 816 RR4FY63JQ
BS 817 874 RR4DH28JQ
BS 875 875 RR4FY63JQ
BS 876 1016 RR4DH28JQ

RD RR4DH28TF 715 0 0
G
ATCCGAGTGCATGGAGATGGTTCTTCAATCTAGTTGGTGATTCAAGGTGTCCCATTTCAG
A*ACATGGTGGCAAACTGAAACTGGTGGCTTCATGATAACGCCGTTGCCAGGTGCTTGGC
CACAGAAGCCTGGTTCAACTACTTTCCCTTTCTTTGGTGTTCAGCCTGTCATAGTTGATG
AAAAAGGCGATGAAATCGAAGGCGAGTGTAGTGGTTATCTTTGTGTGAAAGGATCATGGC
CCGGGGCGTTTCGAACTTTGTTTGGGGATCATGAAAGATATGAAACCACATATTTCAAAC
CTTTTGCTGGATACTATTTTAGTGGTGATGGTTGCAGCAGAGACAAGGATGGTTACTACT
GGCTTACAGGAAGGGTTGATGATGTTATCAACGTCAGTGGCCACCGCATTGGAACTGCTG
AAGTGGAATCTGCTCTGGCTTCGCATCCCCAATGTGCAGAGGCAGCTGTTGTAGGTGTAG
AACATGAGGTGAAAGGACAAGGTATCTATGCGTTTGTCACTCTTGTGGAGGGTGTTCCTT
ACAGCGAAGAGCTTCGGAAAAGTCTTATAATCATGGTTCGAAACCAGATTGGGGCATTTG
CAGCACCGGACAGAATACATTGGGCACCAGGGTTGCCAAAGACGAGAAGTGGAAAGATAA
TGAGGAGAATCCTGAGAAAGATCGCTTCAAG*CAATTAGAAGAGCTTGGAGATA

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR4FY63TF 787 0 0
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TCAATCTAGTTGGTGATTCAAGGTGTCCCATTTCAGATACATGGTGGCAAACTGAAACTG
GTGGCCTCATGATAACGCCGTTGCCAGGTGCTTGGCCACAGAAGCCTGGTTCAGCTACTT
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GGGATCATGAAAGATATGAAACCACATATTTCAAACCTTTTGCTGGATACTATTTTAGTG
GTGATGGTTGCAGCAGAGACAAGGATGGTTACTACTGGCTTACAGGAAGGGTTGATGATG
TTATCAACGTCAGTGGCCACCGCATTTGAACTGCTGAAGTGGAATCTGCTCTGGCTTCGC
ATCCCCAATGTGCAGAGGCAGCTGTTGTAGGTGTAGAACATGAGGTGAAAGGACAAGGTA
TCTATGCGTTTGTCACTCTTGTGGAGGGTGTTCCTTACAGCGAAGAGCTTCGGAAAAGTC
TTATAATCATGGTTCGAAACCAGATTGGGGCATTTGCAGCACCGGACAGAATACATTGGG
CACCAGGGTTGCCAAAGACGAGAAGTGGAAAGATAATGAG*AGA*TCCTGAGAA*GATCG
CTTCACG*CA*TTAGAAGAGCTTGGAGATAT*AGCACACTCGCAGATC*TAGTGTTGTTG
ATCAGCT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4DH28JQ 792 0 0
GATGAAATCGAAGGCGAGTGTAGTGGTTATCTTTGTGTGAAAGGATCATGGCCCGGGGCG
TTTCGAACTTTGTTTGGGGATCATGAAAGATATGAAACCACATATTTCAAACCTTTTGCT
GGATACTATTTTAGTGGTGATGGTTGCAGCAGAGACAAGGATGGTTACTACTGGCTTACA
GGAAGGGTTGATGATGTTATCAACGTCAGTGGCCACCGCATTGGAACTGCTGAAGTGGAA
TCTGCTCTGGCTTCGCATCCCCAATGTGCAGAGGCAGCTGTTGTAGGTGTAGAACATGAG
GTGAAAGGACAAGGTATTTATGCGTTTGTCACTCTTGTGGAGGGTGTTCCTTACAGCGAA
GAGCTTCGGAAAAGTTTTATAATCATGGTTCGAAACCAGATTGGGGCATTTGCAGCACCG
GACAGAATACATTGGGCACCAGGGTTGCCAAAGACGAGAAGTGGAAAGATAATGAGGAGA
ATCCTGAGAAAGATCGCTTCAAGGCAATTAGAAGAGCTTGGAGATATTAGCACACTCGCA
GATCCTAGTGTTGTTGATCAGCTTATCGCACTTGCCGATGTGTGAAAGTATTTCATTTTT
CTCTCTCCATGAATGTAACCATTTCAACATGTGCATGAGAGTTTTGGCATTTATGTTTAT
TAGAGGGAGGAGTGTTTTGAAAAAAAAAACAAAAACTGAAACAAGATTGTGCTTCTTGTG
AAGAATAAAGCGAGCAGACAATTTGGTAACATTCATTGAGAGGACTCCATGAATAAATGA
TTTTTTGGTGTG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4FY63JQ 776 0 0
GAGTGTAGTGGTTATCTTTGTGTGAAAGGATCATGGCCCGGGGCGTTTCGAACTTTGTTT
GGGGATCATGAAAGATATGAAACCACATATTTCAAACCTTTTGCTGGATACTATTTTAGT
GGTGATGGTTGCAGCAGAGACAAGGATGGTTACTACTGGCTTACAGGAAGGGTTGATGAT
GTTATCAACGTCAGTGGCCACCGCATTTGAACTGCTGAAGTGGAATCTGCTCTGGCTTCG
CATCCCCAATGTGCAGAGGCAGCTGTTGTAGGTGTAGAACATGAGGTGAAAGGACAAGGT
ATCTATGCGTTTGTCACTCTTGTGGAGGGTGTTCCTTACAGCGAAGAGCTTCGGAAAAGT
CTTATAATCATGGTTCGAAACCAGATTGGGGCATTTGCAGCACCGGACAGAATACATTGG
GCACCAGGGTTGCCAAAGACGAGAAGTGGAAAGATAATGAGGAGAATCCTGAGAAAGATC
GCTTCAAGGCAATTAGAAGAGCTTGGAGATATTAGCACACTCGCAGATCCTAGTGTTGTT
GATCAGCTTATTGCACTTGCCGATGTGTGAAAGTATCTCATTTTTCTCTCTCCATGAATG
TAACCATTTCAACATGTGCATGAGAGTTTTGGCATCTATGTTTATTAGAGGGAGGAGTGT
TTTGAAAAAAAAAACAAAAACTGAAACAAGATTGTGCTTCTTGTGAAGAATAAAGCGGGC
AGACAATTTGGTAACATTCATTGAGAGGACTCCATGAATAAATGATTTTTTGGTG
C

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL2404Contig1 749 2 17 U
GGAGAAAGGCACTTTCGAGCTCTCTTGAATGGCTTCTCTAGATTCTCATGTGCTGATGAG
CTTCTTTTTAATATCTAGTCTTTTAGTCACTGCCGTGAGCTCGGAAACCAAGTGTCTGAA
CTTCAAGTCAATCATTAGTTTCGGTGATTCAATTGCCGATACAGGAAACTTGATCAGTCT
CTCTACTCCAAACGAACTTCCTGAACCCGCGTTTCCGCCGTACGGAGAAACCTTCTTCCA
CCATCCAACCGGACGTTACTCGGACGGCCGCCTCATCATCGACTTCATTGCTGAGTTCTT
AGGGCTTCCACACGTGCCTCCTTTCTACGGATCTAATAATGGAAACTTTGAGAAAGGAGT
AAACTTCGCCGTGAGAGGAGCGACGGCACTGGAATGTTCAGTTCTTGAGGAGAGAGGGAT
TCATTGTCCTCCTAAAAACAAAAGTTTAGGAGTTCAGCTAAAGAACTTCAAAGAGAGTCT
ACCAAGCCTATGTGGCTCGCCATCAGATAGTTGTATAAATATGATTGGAAATGCTTTGAT
TCTTGTTGGAGAGATTGGAGGGAATGATTATAATTATCCCTTCTTCGGCCACAAAAACAT
TGAGGAAGTCAAAGAGCTCGTTCCCCTTGTGATCTCTACTATTTCTTCAACAATCACGGA
GCTAGTCGATATGGGAGGAAGAACATTCCTAGTTCCAGGAAATTTCCGCTCGGATGCTCA
GTATCTATTTAACATTATATCAACATCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM03TF U 15
AF RR4FV16TF U 1
BS 1 228 RR4FV16TF
BS 229 229 RR4FM03TF
BS 230 252 RR4FV16TF
BS 253 253 RR4FM03TF
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BS 325 325 RR4FM03TF
BS 326 369 RR4FV16TF
BS 370 370 RR4FM03TF
BS 371 382 RR4FV16TF
BS 383 384 RR4FM03TF
BS 385 468 RR4FV16TF
BS 469 469 RR4FM03TF
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BS 518 518 RR4FM03TF
BS 519 610 RR4FV16TF
BS 611 611 RR4FM03TF
BS 612 749 RR4FV16TF

RD RR4FM03TF 687 0 0
GG
GAGCTCTCTTGAATGGCTTCTCTAGATTCTCATGTGCTGGTGAGCTTCTTTTTAATATCT
AGTCTTTTAGTCACTGCCGTGAGCTCGGAAACCAAGTGTCTGAACTTCAAGTCAATCATT
AGTTTCGGTGATTCAATTGCCGATACAGGAAACTTGATCGGTCTCTCTACTCCAAACGAA
CTTCCTGAGTCCGCGTTTCCGCCTTCCGGAGAAACTTTCTTCCACCATCCAACCGGACGT
TACTCTGACGGCCGCCTCATCATCGACTTCATTGCTGAGTTCTTAGGGCTTCCACACGTG
CCTCCTTTCTATGGATCTAATAATGGAAACTTTGAGAAAGGAGTAAACTTCGCCGTGGGA
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TCGCCATCAG***GTTGTATAAATATGATTGGAAATGCTTTGATTCTTGTTGGAGAGATT
GGAGGGAATGATTATAATTATCCCTTCTTCGGCCACAAAAACATTGAGGAAGTCAAAGAG
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GGAAGAACATTCCTAGTTCCAGGA
G

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR4FV16TF 749 0 0
GGAGAAAGGCACTTTCGAGCTCTCTTGAATGGCTTCTCTAGATTCTCATGTGCTGATGAG
CTTCTTTTTAATATCTAGTCTTTTAGTCACTGCCGTGAGCTCGGAAACCAAGTGTCTGAA
CTTCAAGTCAATCATTAGTTTCGGTGATTCAATTGCCGATACAGGAAACTTGATCAGTCT
CTCTACTCCAAACGAACTTCCTGAACCCGCGTTTCCGCCGTACGGAGAGACCTTCTTCCA
CCATCCAACCGGCCGTTACTCGGACGGCCGCCTCATCATCGACTTCATTGCTGAGTTCTT
AGGGCTTCCACACGTGCCTCCTTTTTACGGATCTAATAATGGAAACTTTGAGAAAGGAGT
AAACTTCGCTGTGAGAGGAGCG**GGCACTGGAATGTTCAGTTCTTGAGGAGAGAGGGAT
TCATTGTCCTCCTAAAAACAAAAGTTTAGGAGTTCAGCTAAAGAACTTTAAAGAGAGTCT
ACCAAGCCTATGTGGCTCGCCATCAGATAGTTGTATAGATATGATTGGAAATGCTTTGAT
TCTTGTTGGAGAGATTGGAGGGAATGATTATAATTATCCCTTCTTCGGCCACAAAAACAT
TGAGGAAGTCGAAGAGCTCGTTCCCCTTGTGATCTCTACTATTTCTTCAACAATCACGGA
GCTAGTCGATATGGGAGGAAGAACATTCCTAGTTCCAGGAAATTTCCGCTCGGATGCTCA
GTATCTATTTAACATTATATCAACATCAA

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

CO CL2405Contig1 919 3 4 U
GGAATCATCAATCAGCCAACAATGGTATCTTCTCTATCCTTTCATTCAACCTCCACCGTC
AACGGTGGCCGTTCCACCTTCCGGCGTAATAATCGTCGTCGATTCCAAGCAACTGGAGTG
AGCTGCAGAGGACAGAATCCTCCTAGTAACGAGTCGTCTCAGACAACAAGTAAAGGAGGA
GGCGAGCCGCCGGAGAATGTTCTGA**AAAATCGCTTGGTACGGATCAGAGCTACTCGGA
ATCGCTGCTTCCGCTTTCAGATCTCCGCCCTCTCCTCCTCCTAATAATACAAGGGCTGTC
CCTGACTACGAGATTCCGGTCGATTGTTCGGGACGAGCCGTTCGTGTAGCTGTCGTGGAC
TTTATTAAACAAGACTTCAAGCGGTCGTATTTCGTGACAGGGGACTTGACGGCGGCGGTT
TACGAGGACAAGTGTGAGTTCGCTGATCCTGCTGGTTCCTTCAAGGGTCTTGCTCGTTTC
AAAAGGAATTGTACTAACTTCGGATCTCTCATTGAGAAATCCAATATGAAGCTCATGAAA
TGGGAGAACTTCGAGGAGAAAGGAGTTGGGCATTGGAAATTTAGCTGTGTCATGTCGTTT
CCATGGAAACCCATTCTCTCAGCTACTGGATACACTGAGTATTACTTCGACGCAGAGTCC
GGGAAAATATGCAGACATGTGGAGCATTGGAATGTGCCTAAGATTGCTCTGTTCAAGCAA
CTACTGAGACCTAGCCGTGGACTTATGGGGACACAAAACTAGCAGGAGGAGGAGGATGAT
GAATGTTGCTGATGTCACTTTTTTTTTAGATTTTACATGTTTAGTAAATATATATTAAAT
TCCACTTCTGAAACTAATATGGATTCTGTACTACTGTGCGTTTGTAATTAATCTATTGAG
AAGGCATATGCATTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ15TF U 1
AF RR4GJ95TF U 4
AF RR4DJ15JQ C 92
BS 1 666 RR4DJ15TF
BS 667 667 RR4DJ15JQ
BS 668 696 RR4DJ15TF
BS 697 919 RR4DJ15JQ

RD RR4DJ15TF 696 0 0
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AACGGTGGCCGTTCCACCTTCCGGCGTAATAATCGTCGTCGATTCCAAGCAACTGGAGTG
AGCTGCAGAGGACAGAATCCTCCTAGTAACGAGTCGTCTCAGACAACAAGTAAAGGAGGA
GGCGAGCCGCCGGAGAATGTTCTGA**AAAATCGCTTGGTACGGATCAGAGCTACTCGGA
ATCGCTGCTTCCGCTTTCAGATCTCCGCCCTCTCCTCCTCCTAATAATACAAGGGCTGTC
CCTGACTACGAGATTCCGGTCGATTGTTCGGGACGAGCCGTTCGTGTAGCTGTCGTGGAC
TTTATTAAACAAGACTTCAAGCGGTCGTATTTCGTGACAGGGGACTTGACGGCGGCGGTT
TACGAGGACAAGTGTGAGTTCGCTGATCCTGCTGGTTCCTTCAAGGGTCTTGCTCGTTTC
AAAAGGAATTGTACTAACTTCGGATCTCTCATTGAGAAATCCAATATGAAGCTCATGAAA
TGGGAGAACTTCGAGGAGAAAGGAGTTGGGCATTGGAAATTTAGCTGTGTCATGTCGTTT
CCATGGAAACCCATTCTCTCAGCTACTGGATACACTGAGTATTACTTCGACGCAGAGTCC
GGGAAA*TATGCAGACATGTGGAGCATTGGAATGTG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4GJ95TF 659 0 0
GGA
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GGCCGTTCCACCTTCCGGCGTAATAATCGTCGTCGATTCCAAGCAACTGGAGTGAGCTGC
AGAGGACAGAATCCTCCTAGTAACGAATC***TCAGACAACAAGTAGAGGAGGAGGCGAG
CCGCCGGAGAATGTTCTACTCAAAATCGCTTGGTACGGATCAGAGCTGCTCGGAATCGCT
GCTTCCGCTTTCAGATCTCCGCCCTCTCCTCCTCCTAATAATACAAGGGCTGTCCCTGAC
TACGAGATTCCGGTCGATTGTTCGGGACGAGCCGTTCGTGTTGCTGTCGTGGACTTTATT
AAACAAGACTTCAAGCGGTCGTATTTCGTGACAGGGGACTTGACGCCGGCGGTTTACGAG
GACAAGTGTGAGTTCGCTGATCCTGCTGGTTCCTTCAAGGGTCTTGCTCGTTTCAAAAGG
AATTGTACTAACTTCGGATCTCTCATTGAGAAATCCAATATGAAGCTCATGAAATGGGAG
AACTTCGAGGATAAAGGAGTTGGGCATTGGAAATTTAGCTGTGTCATGTCCTTTCCATGG
AAACCCATTCTCTCAGCTACTGGTTACACTGAGTATTACTTCGACGCAGAGTCCGG

QA 4 659 4 659
DS 

RD RR4DJ15JQ 828 0 0
ATCGTCGTCGATTCCAAGCAACTGGAGTGAGCTGCAGAGGACAGAATCCTCCTAGTAACG
AGTCGTCTCAGACAACAAGTAAAGGAGGAGGCGAGCCGCCGGAGAATGTTCTGA**AAAA
TCGCTTGGTACGGATCAGAGCTACTCGGAATCGCTGCTTCCGCTTTCAGATCTCCGCCCT
CTCCTCCTCCTAATAATACAAGGGCTGTCCCTGACTACGAGATTCCGGTCGATTGTTCGG
GACGAGCCGTTCGTGTAGCTGTCGTGGACTTTATTAAACAAGACTTCAAGCGGTCGTATT
TCGTGACAGGGGACTTGACGGCGGCGGTTTACGAGGACAAGTGTGAGTTCGCTGATCCTG
CTGGTTCCTTCAAGGGTCTTGCTCGTTTCAAAAGGAATTGTACTAACTTCGGATCTCTCA
TTGAGAAATCCAATATGAAGCTCATGAAATGGGAGAACTTCGAGGAGAAAGGAGTTGGGC
ATTGGAAATTTAGCTGTGTCATGTCGTTTCCATGGAAACCCATTCTTTCAGCTACTGGAT
ACACTGAGTATTACTTCGACGCAGAGTCCGGGAAAATATGCAGACATGTGGAGCATTGGA
ATGTGCCTAAGATTGCTCTGTTCAAGCAACTACTGAGACCTAGCCGTGGACTTATGGGGA
CACAAAACTAGCAGGAGGAGGAGGATGATGAATGTTGCTGATGTCACTTTTTTTTTAGAT
TTTACATGTTTAGTAAATATATATTAAATTCCACTTCTGAAACTAATATGGATTCTGTAC
TACTGTGCGTTTGTAATTAATCTATTGAGAAGGCATATGCATTTGCCC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 4

CO CL2406Contig1 870 4 9 U
GATAGAACAAAGTTTAAGTACTACTTAGTAAGTAAGAATTCCACACCATGGCTTCCAACT
TTGAGCTTTCAGAAAGAAGCAGCCCAAAACAACAAAGAATCAGTCCAAGAGCAGAGAAGG
AGGAAGTGGACTACATGCAGAGAGCTCAGTGGCTAAGAGCTGCCTTGCTCGGAGCCAACG
ATGGTCTGGTCACAGTCGCGTCGCCCATGATGGGTGTTGGTTCTATCAAAGAAGACGTTA
AAGCAATGTTGCTTGTTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTG
GAGAGTTTGTGTCTGTCTGCACACAAAGGGATATTGAAACTGCTCAGATGAAGAGAGCTA
TTGAGACTAAGACATCACTATCAGCAATCGACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAGC
GGCTACCAAATCCAGGACAAGCAGCGTTGGCATCAGCGTTAGCATTTTCAGTGGGAGCAA
CAATGCCGCTTCTTGCAGCTGCATTCATAGAGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAG
CGATCGTGGCCACCCTGGCATTATAGGTGTTTGGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAAGA
CAAGTGTGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTA
CCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAATCTAGACACTCTTTCGGT
GATCATCTTGTTTTCATGCATCTCAATTAACAATGTTTGTTGTGTTTGTATCATATAAGC
CCACTATCTCACCTCAACTATGTATGGAATGATTAATACATCAAGTGCACAACAAACACC
AAAAAGGTTAAATAAATGGTCTTGTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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AF RR4FD96TF U 1
AF RR4C302TF U 307
AF RR4C302JQ C 44
AF RR4FD96JQ C 196
BS 1 365 RR4FD96TF
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RD RR4FD96TF 737 0 0
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AAGCAATGTTGCTTGTTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTG
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CGATCGTGGCCACCCTGGCATTATAGGTGTTTGGAGTGACCTGTGCGGTTCTGGGAAAGA
CAAGTGTGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTA
CCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAATCTAGACACTCTTTCGGT
GATCATCTTGTTT
TCAT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4C302TF 438 0 0
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CAAATCCAGGACAAGCAGCGTTGGCATCAGCGTTAGCATTTTCAGTGGGAGCAACAATGC
CGCTTCTTGCAGCTGTATTCATAGAGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATCG
TGGCCACCCTGGCATTATTGGTGTTTGGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTG
TGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTG
GTCTTAC*AAGTTCATTGGTTCCGA*GCCATGCAA*TCTAGACACTCTTTCG*TGATCAT
CTTGTTT
CATGCATCTCA

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4C302JQ 806 0 0
CACCATGGCTTCCAACTTTGAGCTTTCAGAAAGAAGCAGCCCAAAACAACAAAGAATCAG
TCCAAGAGCAGAGAAGGAGGAAGTGGACTACATGCAGAGAGCTCAGTGGCTAAGAGCTGC
CTTGCTCGGAGCCAACGATGGTCTGGTCACAGTCGCGTCGCTCATGATGGGTGTTGGTTC
TATCAAAGAAGACGTTAAAGCAATGTTGCTTGTTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGC
GTGCAGTATGGCCATTGGAGAGTTTGTGTCTGTCTGCACACAAAGGGATATTGAAACTGC
TCAGATGAAGAGAGCTATTGAGACTAAGACATCACTATCAGCAATCGACGAACAAGATGA
GGAGGAGAAGAAAGAGCGGCTACCAAATCCAGGACAAGCAGCGTTGGCATCAGCGTTAGC
ATTTTCAGTGGGAGCAACAATGCCGCTTCTTGCAGCTGTATTCATAGAGAATCATAAGGT
AAGAATGGCGGTGGTAGCGATCGTGGCCACCCTGGCATTATTGGTGTTTGGAGTGACCGG
TGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTGTGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTG
GATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAAT
CTAGACACTCTTTCGGTGATCATCTTGTTTTCATGCATCTCAATTAACAATGTTTGTTGT
GTTTGTATCATATAATCCCACTATCTCACCTCAACTATGTATGGAATGATTAATACATCA
AGTGCACAACAAACACCAAAAAGGTT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4FD96JQ 675 0 0
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TTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTGGAGAGTTTGTGTCTG
TCTGCACACAAAGGGATATTGAAACTGCTCAGATGAAGAGAGCTATTGAGGCTAAGACAT
CACTATCAGCAATCGACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAGCGGCTACCAAATCCAG
GACAAGCAGCGTTGGCATCAGCGTTAGCATTTTCAGTGGGAGCAACAATGCCGCTTCTTG
CAGCTGCATTCATAGAGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATCGTGGCCACCC
TGGCATTATAGGTGTTTGGAGTGACCTGTGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTGTGTTCAAGT
CAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTTACCA
AGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAATCTAGACACTCTTTCGGTGATCATCTTGTTTTC
ATGCATCTCAATTAATAATGTTTGTTGTGTTTGTATCATATAAGCCCACTATCTCACCTC
AACTATGTATGGAATGATTAATACATCAAGTGCACAACAAACACCAAAAAGGTTAAATAA
ATGGTCTTGTTAATC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

CO CL2407Contig1 895 4 15 U
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AATCTCTTGAAATGACGGACATAGTAACGCCTGGAGATGTACTTGGGAATGTGGCTGAGT
TTAAAGCCGGCAAAGGAGCTTACGTCAACGACAACACAATCTACGCTTCCCTCACTGGAT
CTCGTCGGATTGTTTCCTCTCTTCCCGACTCTCCTGACCAGAGAGCTATTGTGGAAGTTA
CGGGTCACAAGGCACATGGGCTTATTCCTGAGCCTGGTTCTGTTGTCTTAGCAAGGGTGA
CTAAAGTTATGGCTAGAATGGCTTCTGTTGATATCTTGTGTGTTGGTCCCAAGTCCGTTC
GTGAAAAATTTGCTGGCATAATCAGGCAACAAGATGTAAGAGCAACAGAGATTGACAAAG
TTGATATGCATCAGTCTTTCCGTCCTAGTGACATTGTTAGAGCCATGGTTCTGTCCCTTG
GTGACTCACGGGCTTACTATTTGTCAACTGCTAAGAACGAGCTTGGCGTGGTCTCAGCGG
AGAGTGCTGCTGGTGAAACCATGGTTCCGATTAGCTGGACAGAGATGCAATGCCCTTTGT
CGGGACAAACTGAGCCAAGAAAAGTTGCCAAGGTTGGCTAGTTGGAATACAAGATGATAT
TTGGCTTCCCTCAAAGTTTTTTTGATAATGGTGTCTACAACATGAACGACTTATGAGATT
GATACAATTTTGAGCTTTTTTTAACATCCTCGTACTTGAGACTGTGATGTTTAGTTATCA
AGTTGTAGAGAAAAGAGCAGAGCAACTTACCCTTGTTCGCATATATATGGATACACTCGC
ATGTTGTTAAACTCGGAAGAATATTTTATAACTTAAGATACACTCGCATGTTGTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV94TF U 114
AF RR4BU60TF U 1
AF RR4AQ26TF U 3
AF RR4CV94JQ C 282
BS 1 45 RR4BU60TF
BS 46 46 RR4AQ26TF
BS 47 198 RR4BU60TF
BS 199 199 RR4CV94TF
BS 200 268 RR4BU60TF
BS 269 269 RR4CV94TF
BS 270 282 RR4BU60TF
BS 283 283 RR4CV94TF
BS 284 353 RR4BU60TF
BS 354 354 RR4CV94TF
BS 355 643 RR4BU60TF
BS 644 673 RR4AQ26TF
BS 674 674 RR4CV94JQ
BS 675 785 RR4AQ26TF
BS 786 895 RR4CV94JQ

RD RR4CV94TF 255 0 0
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AGGGTGACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCTTCTGTTGATATCTTGTGTGTTGGTCCCAAG
TCCGTTCGTGAAAAA

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4BU60TF 643 0 0
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CGGGTCACAAGGCACATGGGCTTATTCCCGAGCCTGGTTCTGCTGTCTTAGCAAGGGTGA
CTAAAGTTATGGCTAGAATGGCTTCTGTTGATATCTTGTGTGTTGGTCCCAAGGCCGTTC
GTGAAAAATTTGCTGGCATAATCAGGCAACAAGATGTAAGAGCAACAGAGATTGACAAAG
TTGATATGCATCAGTCTTTCCGTCCTAGTGACATTGTTAGAGCCATGGTTCTGTCCCTTG
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QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4AQ26TF 783 0 0
GG
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TCTTGAAATGACGGACATAGTAACGCCTGGAGATGTACTTGGGAATGTGGCTGAGTTTAA
AGCCAGCAAAGGAGCTTACGTCAACGACAAAACAATCTACGCTTCCCTCACTGGATCTCG
TCGGATTGTTTCTTCTCTTCCCGACTCTCCTGACCAGAGAGCTATTGTGGAAGTTACGGG
TCACAAGGCACATGGGCTTATTCCTGAGCCTGGTTCTGTTGTCTTAGCTAGGGTGACTAA
AGTTATGGCTAGAATGGCTTCTGTTGATATCTTGTGTGTTGGTCCCAAGGCCGTTCGTGA
AAAATTTGCTGGCATAATCAGGCAACAAGATGTACGAGCAACAGAGATTGACAAAGTTGA
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CTCACGGGCTTACTATTTGTCAACTGCTAAGAACGAGCTTGGCGTGGTCTCAGCGGAGAG
TGCTGCTGGTGAAACCATGGTTCCGATTAGCTGGACAGAGATGCAATGCCCTTTGTCGGG
ACAAACTGAGCCAAGAAAAGTTGCCAAGGTTGGCTAGTTGGAATACAAGATGATATTTGG
CTTCCCTCATAGTTTTTTTGATAATGGTGTCTACAACATGAACGACTTATGAGATTGATA
CAATTTTGAGCTTTTTTTAACATCCTCGTACTTGAGACTGTGATGTTTAGTTATCAAGTT
G

QA 3 783 3 783
DS 

RD RR4CV94JQ 614 0 0
GT
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TGGCGTGGTTTCAGCGGAGAGTGCTGCTGGTGAAACCATGGTTCCGATTAGCTGGACAGA
TATGCAATGCCCTTTGTCGGGACAAACTGAGCCAAGAAAAGTTGCCAAGGTTGGCTAGTT
GGAATACAAGATGATATTTGGCTTCCCTCAAGTTTTTTTTGATAATGGTGTTTACAACAT
GAACGACTTATGAGATTGATACAATTTTGAGCTTTTTTTAACATCCTTGTACTTGAGACT
GTGATGTTTAGTTATCAAGTTGTAGAGAAAAGAGCAGAGCAACTTACCCTTGTTCGCATA
TATATGGATACACTCGCATGTTGTTAAACTCGGAAGAATATTTTATAACTTAAGATACAC
TCGCATGTTGTT

QA 3 614 3 614
DS 



AS 1 2

CO CL2408Contig1 1028 2 6 U
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TGGATACCTTGCCATCTGAGTATGACTCTAGGGTTAAAGCCATGGAGGTTGATGAGAAAC
CTACTGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTTGAGAAGCAGATCCAAGAGCTTGTAGAGG
CTATTGTGCTCCCCATGACGCACAAGGAACGTTTTGAGAAATTGGGTGTTCGTCCACCAA
AGGGAGTGCTCTTGTATGGTCCTCCAGGGACTGGTAAAACTTTAATGGCTCGTGCTTTTG
CAGCACAGACCAATGCCACCTTCCTCAAATTGGCAGGCCCTCAATTGGTCCAGATGTTCG
TTGGAGATGGAGCAAAACTTGTCCGTGATGCCTTTCAACTAGCAAAAGAGAAAGCTCCAT
GCATTATCTTCATAGATGAGATCGATGCTATTGGTACAAAGCGTTTTGACAGTGAAGTAA
GCGGAAACAGGGAAGTGCAGAGGACTATGTTGGAGCTACTCAATCAGCTTGATGGATTCA
GTAGCGATGAGCGTATTAAGGTGATTGCAGCCACTAACCGTGCAGATATTCTGGACCCGG
CACTCATGCGTTCTGGTCGGCTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACATCCAACCGAAGAAG
CAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACACCCTGACGTCAACT
TTGAGGAGCTTGCAAGATCGACCGATGATTTCAATGGTGCTCAGCTGAAAGCAGTTTGTG
TAGAGGCTGGCATGTTAGCTCTTCGTCGCGATGCCGCAGAGGTGAACCATGAGGACTTCA
ATGAAGGTATCATCCAAGTCCAGGCCAAGAAGAAAGCAAGCTTGAACTACTACGCCTAAT
CTCTCGCTTTGTCTTGTTTCTTTCAAGCAGTTTTACATTCCGATTGGGATATTTTTCAAA
TTTAGTTGTGTTCATCTTCTTTTCCTGAAAAAGTGGAATTTAATATGGATACACTACAGT
TTCACGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D173TF U 1
AF RR4D173JQ C 379
BS 1 753 RR4D173TF
BS 754 754 RR4D173JQ
BS 755 785 RR4D173TF
BS 786 786 RR4D173JQ
BS 787 800 RR4D173TF
BS 801 1028 RR4D173JQ

RD RR4D173TF 802 0 0
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TGGATACCTTGCCATCTGAGTATGACTCTAGGGTTAAAGCCATGGAGGTTGATGAGAAAC
CTACTGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTTGAGAAGCAGATCCAAGAGCTTGTAGAGG
CTATTGTGCTCCCCATGACGCACAAGGAACGTTTTGAGAAATTGGGTGTTCGTCCACCAA
AGGGAGTGCTCTTGTATGGTCCTCCAGGGACTGGTAAAACTTTAATGGCTCGTGCTTTTG
CAGCACAGACCAATGCCACCTTCCTCAAATTGGCAGGCCCTCAATTGGTCCAGATGTTCG
TTGGAGATGGAGCAAAACTTGTCCGTGATGCCTTTCAACTAGCAAAAGAGAAAGCTCCAT
GCATTATCTTCATAGATGAGATCGATGCTATTGGTACAAAGCGTTTTGACAGTGAAGTAA
GCGGAAACAGGGAAGTGCAGAGGACTATGTTGGAGCTACTCAATCAGCTTGATGGATTCA
GTAGCGATGAGCGTATTAAGGTGATTGCAGCCACTAACCGTGCAGATATTCTGGACCCGG
CACTCATGCGTTCTGGTCGGCTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACATCCAACCGAAGAAG
CAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACACCCTGACGTCAACT
TTGAGGAGCTTGCAAGATCGACCGATGATTTCA*TGGTGCTCAGCTGAAAGCAGTTTGTG
TAGAG*CTGGCATGTTAGCT
CT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4D173JQ 650 0 0
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AGATCGATGCTATTGGTACAAAGCGTTTTGACAGTGAAGTAAGCGGAAACAGGGAAGTGC
AGAGGACTATGTTGGAGCTACTCAATCAGCTTGATGGATTCAGTAGCGATGAGCGTATTA
AGGTGATTGCAGCCACTAACCGTGCAGATATTCTGGACCCGGCACTCATGCGTTCTGGTC
GGCTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACATCCAACCGAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGC
AGATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACACCCTGACGTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGAT
CGACCGATGATTTCAATGGTGCTCAGCTGAAAGCAGTTTGTGTAGAGGCTGGCATGTTAG
CTCTTCGTCGCGATGCCGCAGAGGTGAACCATGAGGACTTCAATGAAGGTATCATCCAAG
TCCAGGCCAAGAAGAAAGCAAGCTTGAACTACTACGCCTAATCTCTCGCTTTGTCTTGTT
TCTTTCAAGCAGTTTTACATTCCGATTGGGATATTTTTCAAATTTAGTTGTGTTCATCTT
CTTTTCCTGAAAAAGTGGAATTTAATATGGATACACTACAGTTTCACGCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

CO CL2409Contig1 459 4 2 U
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CGTGTTTCGGAATTTTGGAGAAGGTTCCACCAACTTTAGACTGTTGGACACGACGGGGAT
GTCTCTTCTCCGACCAGACGGGCATCCGGGACCGTACAGGCATCCGAATCCTTTTGCTGG
AGTGAAAGATAAGAGCAGTGTTCAGAATGATTGTCTGCATTGGTGCTTACCCGGTCCGAT
TGATTCATGGAATGATGTTATGGTGGAGACCATACTTAACCGGTAACGGTTTAGTAAATG
TTCATTGGACTGGTAAATGTACAACGGTATTATTTGTAGTTAGTTCCGGTTTATAGCCAT
CCCCACTTGTTCGAGTATATGCTATTTGTATATTTTTAGTTTTGTAATGGTCTTAAACGA
ATAATGTAGCAATGTTATAAATGAAAATTTGTTTTTCTG


BQ
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AF RR4B378JQ C 1
AF RR4B378TF U 1
AF RR4B747TF U 253
AF RR4BG09TF U 253
BS 1 441 RR4B378TF
BS 442 459 RR4B747TF

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GTCTCTTCTCCGACCAGACGGGCATCCGGGACCGTACAGGCATCCGAATCCTTTTGCTGG
AGTGAAAGATAAGAGCAGTGTTCAGAATGATTGTCTGCATTGGTGCTTACCCGGTCCGAT
TGATTCATGGAATGATGTTATGGTGGAGACCATACTTAACCGGTAACGGTTTAGTAAATG
TTCATTGGACTGGTAAATGTACAACGGTATTATTTGTAGTTAGTTCCGGTTTATAGCCAT
CCCCACTTGTTCGAGTATATGCTATTTGTATATTTTTAGTTTTGTAATGGTCTTAAACGA
ATAATGTAGCAATGTTATAAA
AG

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DS 

RD RR4B378TF 443 0 0
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CGTGTTTCGGAATTTTGGAGAAGGTTCCACCAACTTTAGACTGTTGGACACGACGGGGAT
GTCTCTTCTCCGACCAGACGGGCATCCGGGACCGTACAGGCATCCGAATCCTTTTGCTGG
AGTGAAAGATAAGAGCAGTGTTCAGAATGATTGTCTGCATTGGTGCTTACCCGGTCCGAT
TGATTCATGGAATGATGTTATGGTGGAGACCATACTTAACCGGTAACGGTTTAGTAAATG
TTCATTGGACTGGTAAATGTACAACGGTATTATTTGTAGTTAGTTCCGGTTTATAGCCAT
CCCCACTTGTTCGAGTATATGCTATTTGTATATTTTTAGTTTTGTAATGGTCTTAAACGA
ATAATGTAGCAATGTTATAAA
AG

QA 1 441 1 441
DS 

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G
GATGTTATGGTGGAGACCATACTTAACCGGTAACGGTTTAGTAAATGTTCATTGGACTGG
TAAATGTACAACGGTATTATTTGTAGTTAGTTCCGGTTTATAGCCATCCCCACTTGTTCG
AGTATATGCTATTTGTATATTTTTAGTTTTGTAATGGTCTTAAACGAATAATGTAGCAAT
GTTATAAATGAAAATTTGTTTTTCTG

QA 2 207 2 207
DS 

RD RR4BG09TF 207 0 0
G
GATGTTATGGTGGAGACCATACTTAACCGGTAACGGTTTAGTAAATGTTCATTGGACTGG
TAAATGTACAACGGTATTATTTGTAGTTAGTTCCGGTTTATAGCCATCCCCACTTGTTCG
AGTATATGCTATTTGTATATTTTTAGTTTTGTAATGGTCTTAAACGAATAATGTAGCAAT
GTTATAAATGAAAATTTGTTTTTCTG

QA 2 207 2 207
DS 



AS 1 3

CO CL2410Contig1 1054 3 3 U
ATAAACTGAAAATTATTCGTGTATAGAAGAAAGTAAAAAGAAATACATTCATCGAAATAC
ACACCCAACGATGTGAAAACATTACATGATTAATGGTTACTATAGTACACCATTGATTTA
TTCTGTCACAAAATCGAAAGGTGTTCATAATTTATTCATAAAAGCATAACACCCCATTTA
TTTATTAATATAGCATATAAAAGACTTAGGCTTACATAAGAACCCATTAGTTGACACCAT
TCAAATTTTTGAGTCGAGCTTTGTTGAAACCATTGACACCTTTGAGTGGAGTTTCACCTA
AACCGGAGTGGCGGTCACAAAAGCTCTTCAATCGATCAAATGCATACTCCAAAGTGGGAG
TATCCATGTCAATAGAATGCCTCACCCAGTTCTTCAGAGTAAAAGCAATCCCTGGTAAAA
GGACAAGGTTTTCTTCGGTAGCTAATTTTTCACAGAAGTCTTCATCATCTTCAATGTCCA
CAAAGGATGATAAGTTCAGCTCTGTCCAAAGGAAGGTGCATGCTTCAGGTATCATATAGC
AGGTGAGGGAAGGTATGCTCATGAGCTTATGATATGCAAGATCGGTTTTATCTTTCAGAA
AGATCTGCCTCCTATGGAAGAACTCTTTATCAGTTTTCTCCAAGATGGTGGGAATGGCCG
CCTGGATAACAGTTGGTGGTTTAGAATTTAGATCAAGGAACTGTTTTATAGCAGCTAAAA
CATTTTTGGATTTAAAGACACCATCTAGATCGTGCAGCGCGATCCAGCCAGTTCGCCATC
CAGGGACAGACCATCCCTTCGATATGGACCCGAGTGTAACCACCGGTACAATGGACGAAA
ATTTTCCCATGGGAACAAAGGGATTACTCCGAAACACCGACCAACGAAAAACTTCGTCAG
AAACAACCATTATCCCGAGTTCTCGAGCCAACAGAGCGAGCTGCTTGAGATGAGCATCAG
AGTAGGTGTTCCCGTTAGGATTGTGCGGGTTGATAATAAATATTGCAAATGTGTTCTCAT
CCACTGCCGCTCGGACGCTGTCAAGTCAATCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A557JQ U 1
AF RR4BG16JQ U 35
AF RR4A557TF C 284
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TTTATTAATATAGCATATAAAAGACTTAGGCTTACATAAGAACCCATTAGTTGACACCAT
TCAAATTTTTGAGTCGAGCTTTGTTGAAACCATTGACACCTTTGAGTGGAGTTTCACCTA
AACCGGAGTGGCGGTCACAAAAGCTCTTCAATCGATCAAATGCATACTCCAAAGTGGGAG
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AGATCTGCCTCCTATGGAAGAACTCTTTATCAGTTTTCTCCAAGATGGTGGGAATGGCCG
CCTGGATAACAGTTGGTGGTTTAGAATTTAGATCAAGGAACTGTTTTATAGCAGCTAAAA
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CAGGGACAGACC

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DS 

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GG
AAAGAAATACATTCATCGAAATACACCCCCAACGATGTGAAAACATTACATGATTAATGG
TTACTATAGTACACCATTGATTTATTCTGTCACAAACTCGAAAGGTGTTCATAATTTATT
CATAAAAGCATAACACCCCATTTATTTATTAATATAGCATATAAAAGACTTAGGCTTACA
TAAGAACCCATTAGTTGACACCATTCAAATTTTTGAGTCGAGCTTTGTTGAAACCATTGA
CACCTTTGAGTGGAGTTTCACCTAAACCGGAGTGGCGGTCACAAAAGCTCTTCAATCGAT
CAAATGCATCCTCCAAAGTGGGAGTATCCATGTCAATAGAATGCCTCACCCAGTTCTTCA
GAGTAAAAGCAATCCCTGGTAAAAGGACAAGGTTTTCCTCGGTAGCTAATTTTTCACAGA
AGTCTTCATCATCTTCAATGTCCACAAAGGATGATAAGTTCAGCTCTGTCCAAAGGAAGG
TGCATGCTTCAGGTATCATATAGCAGGTGAGGGAAGGTATGCTCATGAGCTTATGATATG
CAAGATCGGTTTTATCTTTCAGAAAGATCTGCCTCCTATGGAAGAACTCTTTATCAGTTT
TCTCCAAGATGGTGGGAATGGCCGCCTGGATAACAGTTGGTGGTTTAGAATTTAGATCAA
GGAACTGTTTTATAGCAGCTAAAACATTTTTGGATTTAAAGACACCATCTAGATCGTGCA
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TAACCACCGGTACAATGGACGAAAATTTTCCCATGGGAACAAAGGGATTACTCCGAAACA
CCGACCAACG

QA 3 852 3 852
DS 

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ATACTCCAAAGTGGGAGTATCCATGTCAATAGAATGCCTCACCCAGTTCTTCAGAGTAAA
AGCAATCCCTGGTAAAAGGACAAGGTTTTCTTCGGTAGCTAATTTTTCACAGAAGTCTTC
ATCATCTTCAATGTCCACAAAGGATGATAAGTTCAGCTCTGTCCAAAGGAAGGTGCATGC
TTCAGGTATCATATAGCAGGTGAGGGAAGGTATGCTCATGAGCTTATGATATGCAAGATC
GGTTTTATCTTTCAGAAAGATCTGCCTCCTATGGAAGAACTCTTTATCAGTTTTCTCCAA
GATGGTGGGAATGGCCGCCTGGATAACAGTTGGTGGTTTAGAATTTAGATCAAGGAACTG
TTTTATAGCAGCTAAAACATTTTTGGATTTAAAGACACCATCTAGATCGTGCAGCGCGAT
CCAGCCAGTTCGCCATCCAGGGACAGACCATCCCTTCGATATGGACCCGAGTGTAACCAC
CGGTACAATGGACGAAAATTTTCCCATGGGAACAAAGGGATTACTCCGAAACACCGGCCA
ACGAAAAACTTCGTCAGAAACAACCATTATCCCGAGTTCTCGAGCCAACAGAGCGAGCTG
CTTGAGATGAGCATCAGAGTAGGTGTTCCCGTTAGGATTGTGCGGGTTGATAATAAATAT
TGCAAATGTGTTCTCATCCACTGCCGCTCGGACGCTGTCAAGTCAATCTCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 3

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CATGCAAACATTATATATTCTACATTTTGATATATTATGCTCTTTGTACATTGAGATAGG
CGGCGTTGATGTGTCACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCCGGAGGTAAGTT
CAAGACCGATTGTTCAACCTCTTCGAAAGGAACGAAGACGAAAGGAGTCATACCCCTCTT
GTGCGAGACGGCAGGTATATCGGGATTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAATTCTCAACTAC
CCCAAGAATGTCCTCCTCTGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCACTCGTCACTAG
TGACAGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAACCTTAAACGGAT
CCTTAAGACAGTAGGGCGTGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCCTCGATCTTGTCATCTGA
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GTATTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGAAATCTGCCAGAAGG
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GGATCTAAGAAGCCACATTTTCCTCCATGATCCATCGTATTTAGACTGCAAGATCCTATA
GTTTTCGATAACCCCAGCAGTCTGCCAAGCTTTCAAGCACGCGTTACGCCAGAAGACAGG
GTTTCGAACCGTGTACCTCCACTTTCTGCAGACGCAAGCTGCTCTTCCTAAGTCATAAGG
CAACATCCGAGCAAATACCTCGAAAAGAAGCTCATCGGGCAAGGAACGATGAATCAAAGC
AGGATCAAATTGTGGTTTACTGCTTGTGCTTCCGAATGGTGCAACGGGCCGTACATGGAC
TCCATAGAGATCAAGCCAAGGTCTCTTTGTAATAAAGTATTGAACAGTCCTCAGCCGTAA
CGCAGATTCAAGCTCAGATGGTATGTTGAGAGCATCTGAAGTCATGGGAAATTGATAGAG
AATTGAGATGTTCCGAATGAAAAAGTCGAGAGCGGTTTCGTAGCCGCGCGCCTCTGTTAC
CGGAAAATTAAAAACAAGACGATAAGATTAAGACCAGAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTCTTTTTTTACGTGTTGTCTAGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BP59JQ U 1
AF RR4E044JQ U 1
AF RR4BP59TF C 643
BS 1 159 RR4BP59JQ
BS 160 160 RR4E044JQ
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BS 593 758 RR4BP59JQ
BS 759 1347 RR4BP59TF

RD RR4BP59JQ 758 0 0
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GTATTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGAAATCTGCCAGAAGG
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CGCAATTCCAGCTCGAATGTAAGTGTTCCTACTCACAT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4E044JQ 762 0 0
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ACAGCAGCAACAAACAGACATGCTAGTAGTGTTGTTGTTGTCATAATAAATCAAATAAAA
CATGCAAACATTATATATTCTACATTTTGATATATTATGCTCTTTGTACATTGAGATAGG
CGGCGTTGATGTGTCACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCCGGAGGTAAGTT
CAAGACCGATTGTTCAACCTCTTCGAAAGGAACGAAGACGAAAGGAGTCATACCCCTCTT
GTGCGAGACGGCAGGTATATCGGGATTGTGAGTTTCATCGTCTCTCTAATTCTCAACTAC
CCCAAGAATGTCCTCTTCTGTGTTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCACTCGTCACTAG
TGACAGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAACCTTAAACGGAT
CCTTAAGACAGTAGGGCGTGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCTTCGATCTTGTCATCTGA
CATAGACAATGTATAAGTGCCTCTGTAAAGACCGTCTGTTTTAGAAGACTTAAAGTTCAT
GTATTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGGAATCTGCCAGAAGG
GTAGAATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGATTTGTAATCTTCCACTC
CGCAATTCCAGCTCGAATGTAAGTGTTCCTACTCACAT
AAAT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4BP59TF 705 0 0
AAGA
AATCTGCCAGAAGGGTAGAATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGATTT
GTAATCTTCCACTCCGCAATTCCAGCTCGAATGTAAGTGTTCCTACTCACATAAATACCA
TCAGTACGAACTCTGGATCTAAGAAGCCACATTTTCCTCCATGATCCATCGTATTTAGAC
TGCAAGATCCTATAGTTTTCGATAACCCCAGCAGTCTGCCAAGCTTTCAAGCACGCGTTA
CGCCAGAAGACAGGGTTTCGAACCGTGTACCTCCACTTTCTGCAGACGCAAGCTGCTCTT
CCTAAGTCATAAGGCAACATCCGAGCAAATACCTCGAAAAGAAGCTCATCGGGCAAGGAA
CGATGAATCAAAGCAGGATCAAATTGTGGTTTACTGCTTGTGCTTCCGAATGGTGCAACG
GGCCGTACATGGACTCCATAGAGATCAAGCCAAGGTCTCTTTGTAATAAAGTATTGAACA
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GGAAATTGATAGAGAATTGAGATGTTCCGAATGAAAAAGTCGAGAGCGGTTTCGTAGCCG
CGCGCCTCTGTTACCGGAAAATTAAAAACAAGACGATAAGATTAAGACCAGAGACTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTACGTGTTGTCTAGCC

QA 5 705 5 705
DS 



AS 1 4

CO CL2412Contig1 961 4 7 U
GATGCAACACACGTTTCGCGCTCCTACACGCACCTTCTGGATCCACCTTCGTCTTCTCCT
TCGCAGGCGAGAAAGGTTTCATTTTTCAGCTGCAGGTTGATATTCTGGTCAGAGGGGTGG
ACTAATCGGTTTCTAGATTCTCTCTAGATTCCTCTCCATTCAGCACAATGGAGAAAAGAG
ACGAGGATCTGAAGAAGGCACAGATGCTGGACGCTCGAGCCAGGAACATCAGCCACAATG
TTCGCTGCACTGAGTGTGGGAGTCAGTCCATTGAAGACTCACAGGCAGATGTCGCTATTC
TCCTCAGACAGTTGATTCGTGATGAGATAGGAGCTGGAAAAACCGACAAAGAGATCTACA
GTAAGCTCGAGGATGAGTTTGGGGAGACGGTGCTTTATGCCCCCAAATTTGATATGCAGA
CCGCTGCGTTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGCTGGAGGTACTGCAGCAGGGTTGGTTT
ATAGTAAGCACAGGCAAAGGACAAACGTACACATCATGGCGTTGGACCTTATTAGAGGTG
TTTCGTTGACTCCAAAAGAGAGAGTTACCATTCTCGATGTTCTTATTCCACCTCCCCCTC
CTCCTCAGGGAGTTGCTTCCCGGTTGAGGAGGTTGCTAAACCGGTAGTTGCCCTGTCTCC
TTAGCTCTCTGCTGTTTTTGAGTCAGATATTATCGTCTTAGCCACTCGCAATAAAAAAAG
CAATGTGGAGCATGGAGTGGGTACCACGACGTTGACTATCTATGAGAAACTGATGGTTTG
CATCTTTTACTAGCAGTTTTCTTACTTATAATGTTGAAAATGGATTCTTTCATAGGAATT
TCTTGGTATATTATATGAAGCATAGTTGAACGTGTGATTTGTTTGATATTTTCTATGGAA
CTGAAAACAGAGTGTGGTTGTGCTGTTATATTCATTCCGGCACATAGACAGCTTTCTTTA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4GZ78TF U 1
AF RR4BR85JQ C 274
AF RR4BR85TF U 274
AF RR4GZ78JQ C 359
BS 1 316 RR4GZ78TF
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BS 947 961 RR4GZ78JQ

RD RR4GZ78TF 617 0 0
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TCGCAGGCGAGAAAGGTTTCATTTTTCAGCTGCAGGTTGATATTCTGGTCAGAGGGGTGG
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ACGAGGATCTGAAGAAGGCACAGATGCTGGACGCTCGAGCCAGGAACATCAGCCACAATG
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CCGCTGCGTTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGCTGGAGGTACTGCAGCAGGGTTGGTTT
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CTCCTCAGG
AGTTGCTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4BR85JQ 677 0 0
G
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TGGAAAAACCGACAAAGAGATCTACAGTAAGCTCGAGGATGAGTTTGGGGAGACGGTGCT
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CGATGTTCTTATTCCACCTCCCCCTCCTCCTCAGGGAGTTGCTTCCCGGTTGAGGAGGTT
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GTCTTAGCCACTCGCAATAAAAAAAGCAATGTGGAGCATGGAGTGGGTACCACGACGTTG
ACTATCTATGAGAAACTGATGGTTTGCATCTTTTACTAGCAGTTTTCTTACTTATAATGT
TGAAAATGGATTCTTTCATAGGAATTTCTTGGTATATTATATGAAGCATAGTTGAACGTG
TGATTTGTTTGATATTTTCTATGGAACTGAAAACAGAGTGTGGTTGTGCTGTTATATTCA
TTCCGGCACATA
GACG

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DS 

RD RR4BR85TF 673 0 0
G
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TGGAAAAACCGACAAAGAGATCTACAGTAAGCTCGAGGATGAGTTTGGGGAGACGGTGCT
TTATGCCCCCAAATTTGATATGCAGACCGCTGCGTTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGC
TGGAGGTACTGCAGCAGGGTTGGTTTATAGTAAGCACAGGCAAAGGACAAACGTACACAT
CATGGCGTTGGACCTTATTAGAGGTGTTTCGTTGACTCCAAAAGAGAGAGTTACCATTCT
CGATGTTCTTATTCCACCTCCCCCTCCTCCTCAGGGAGTTGCTTCCCGGTTGAGGAGGTT
GCTAAACCGGTAGTTGCCCTGTCTCCTTAGCTCTCTGCTGTTTTTGAGTCAGATATTATC
GTCTTAGCCACTCGCAATAAAAAAAGCAATGTGGAGCATGGAGTGGGTACCACGACGTTG
ACTATCTATGAGAAACTGATGGTTTGCATCTTTTACTAGCAGTTTTCTTACTTATAATGT
TGAAAATGGATTCTTTCATAGGAATTTCTTGGTATATTATATGAAGCATAGTTGAACGTG
TGATTTGTTTGATATTTTCTATGGAACTGAAAACAGAGTGTGGTTGTGCTGTTATATTCA
TTCCGGCACATA

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR4GZ78JQ 603 0 0
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GACCGCTGCGTTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGCTGGAGGTACTGCAGCAGGGTTGGT
TTATAGTAAGCACAGGCAAAGGACAAACGTACACATCATGGCGTTGGACCTTATTAGAGG
TGTTTCGTTGACTCCAAAAGAGAGAGTTACCATTCTCGATGTTCTTATTCCACCTCCCCC
TCCTCCTCAGGGAGTTGCTTCCCGGTTGAGGAGATTGCTAAACCGGTAGTTGCCCTGTCT
CCTTAGCTTTCTGCTGTTTTTGAGTCAGATATTATTGTCTTAGCCACTCGCAATAAAAAA
AGCAATTTGGAGCATGGAGTGGGTACCACGACGTTGACTATCTATGAGAAACTGATGGTT
TGCATCTTTTACTAGCAGTTTTCTTACTTATAATGTTGAAAATGGATTCTTTCATAGGAA
TTTCTTGGTATATTATATGAAGCATAGTTGAACGTGTGATTTGTTTGATATTTTCTATGG
AACTGAAAACAGAGTGTGGTTGTGCTGTTATATTCATTCCGGCACATAGACAGCTTTCTT
TAC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 4

CO CL2413Contig1 841 4 6 U
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CCCATGAATCAGACAATACTATTCTATTTCCTATGCTTGTATTGCTTTTATTTACTTTGT
TTATTGGAGCCATAGGAATTCCTTTCAATCAAGAAGGAATAGACTTTGATATATTATCAA
AATTATTAACGCAGTCGATAAACCTTTTGCATACCAATTCAGAAAATTTTGTAGATTGGT
ATGAATTTTTGAAAAATGCAATTTTTTCAGTCAGTATAGCTTTGTTTGGAATATTTATAG
CATACTGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTAAATTAAATTTAACCTTACTTAATTCAT
TTCAAAAGTGGAGTTCTAAAAGAATTAGGTGGGAAAAACCAATCAATTTTGTATATAATT
GGTCATATAATCGTGGTTACATAGATACTTTTTTAAAAAAATCTTTAACTGAAAGTATAA
GAAAATTAGCAAAACAAACGAATTTTTTTGATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATG
GAGTAGGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATAGGTGGAAGTCGCA
TCTCTTCTTATCTGTTCTTGTATTTGTGCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTT
TTTTTTATTTTGAAAAATTCTAAATTCGAATTTTCTTTATTTCCATCTCGATTTTCAGAA
ACTGTTTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCATCATCCTTATTAATTTTGTCT
TTTCCATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTTTGTCCAGATCCTCCCTTTCTTCC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 

AF RR4AM73TF U 1
AF RR4DO53JQ C 246
AF RR4DO53TF U 246
AF RR4AM73JQ C 122
BS 1 664 RR4AM73TF
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RD RR4AM73TF 839 0 0
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CCCATGAATCAGACAATACTATTCTATTTCCTATGCTTGTATTGCTTTTATTTACTTTGT
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AATTATTAACGCAGTCGATAAACCTTTTGCATACCAATTCAGAAAATTTTGTAGATTGGT
ATGAATTTTTGAAAAATGCAATTTTTTCAGTCAGTATAGCTTTGTTTGGAATATTTATAG
CATACTGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTAAATTAAATTTAACCTTACTTAATTCAT
TTCAAAAGTGGAGTTCTAAAAGAATTAGGTGGGAAAAACCAATCAATTTTGTATATAATT
GGTCATATAATCGTGGTTACATAGATACTTTTTTAAAAAAATCTTTAACTGAAAGTATAA
GAAAATTAGCAAAACAAACGAATTTTTTTGATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATG
GAGTAGGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATAGGTGGAAGTCGCA
TCTCTTCTTATCTGTTCTTGTATTTGTGCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTT
TTTT**ATTTTGAAAAATTCTAAATTCGAATTTTCTTTATTTCCATCTCGATTTTCAGAA
ACTGTTTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCATCATCCTTATTAATTTTGTCT
TTTCCATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTT*GTCCAGATCCTCCCTTTCTTC

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4DO53JQ 596 0 0
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TGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTAAATTAAATTTAACCTTACTTAATTCATTTCAA
AAGTGGAGTTCTAAAAGAATTAGGTGGGAAAAACCAATCAATTTTGTATATAATTGGTCA
TATAATCGTGGTTACATAGATACTTTTTTAAAAAAATCTTTAACTGAAAGTATAAGAAAA
TTAGCAAAACAAACGAATTTTTT*GATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATGGAGTA
GGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATGGGTGGAAGTCGCATCTCT
TCTTATCTGTTCTTGTATTTGTGCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTTTTTTT
TATTTTGAAAAATTCTAAATTCGAATTTTCTTTATTTCCATCTCGATTTTCAGAAACTGT
TTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCATCATCCTTATTAATTTTGTCTTTTCC
ATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTTTGTCCAGATCCTCCCTTTCTTC
CC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4DO53TF 596 0 0
TTTTTGAAAAATGCAATTTTTTCAGTCAGTATAGCTTTGTTTGGAATATTTATAGCATAC
TGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTAAATTAAATTTAACCTTACTTAATTCATTTCAA
AAGTGGAGTTCTAAAAGAATTAGGTGGGAAAAACCAATCAATTTTGTATATAATTGGTCA
TATAATCGTGGTTACATAGATACTTTTTTAAAAAAATCTTTAACTGAAAGTATAAGAAAA
TTAGCAAAACAAACGAATTTTTT*GATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATGGAGTA
GGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATGGGTGGAAGTCGCATCTCT
TCTTATCTGTTCTTGTATTTGTGCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTTTTTTT
TATTTTGAAAAATTCTAAATTCGAATTTTCTTTATTTCCATCTCGATTTTCAGAAACTGT
TTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCATCATCCTTATTAATTTTGTCTTTTCC
ATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTTTGTCCAGATCCTCCCTTTCTTC
CC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4AM73JQ 720 0 0
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ATTATTAACGCAGTCGATAAACCTTTTGCATACCAATTCAGAAAATTTTGTAGATTGGTA
TGAATTTTTGAAAAATGCAATTTTTTCAGTCAGTATAGCTTTGTTTGGAATATTTATAGC
ATACTGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTAAATTAAATTTAACCTTACTTAATTCATT
TCAAAAGTGGAGTTTTAAAAGAATTAGGTGGGAAAAACCAATCAATTTTGTATATAATTG
GTCATATAATCGTGGTTACATAGATACTTTTTTAAAAAAATCTTTAACTGAAAGTATAAG
AAAATTAGCAAAACAAACGAATTTTTTTGATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATGG
AGTAGGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATAGGTGGAAGTCGCAT
CTCTTCTTATCTGTTCTTGTATTTGTGCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTTT
TTT**ATTTTGAAAAATTCTAAATTCGAATTTTCTTTATTTCCATCTCGATTTTCAGAAA
CTGTTTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCATCATCCTTATTAATTTTGTCTT
TTCCATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTTTGTCCAGATCCTCCCTTTCTTCCG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

CO CL2414Contig1 684 4 7 U
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TTGATGATTTGGACGTTTATGAGTGGTGACTTGGAGAAGACAATTAGCTTTCCTTACCTC
TTTTCTCCTGGTTTCTTGGTTGTGTTACTCTGCTCGTGTGTGCTGGCTTTCTTCTTAAAC
TACAGCATTTTTCTTAACACCACTCTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATTTGCGGCAAT
ATGAAGGATTTGTTTACGGTTGGGCTAGGCTGGATGGTCTTTGGTGGTCTCCCATTCGAC
CTGATGAATGTGATTGGGCAGTTTCTTGGTTTCTTAGGCTCTGGTTTATATGCATATTAT
AAGATCATTGGGAAGTAACTACTACTCCATAACTAAAGAAGAGCTAATAAAATAACAGGA
GTGTCCATCATAAAGGGAAAGCCTTAAGTTCAAGGAGAAGTTGTTAGACCATTAATTTTC
AGCTTTGGCTGTTTTGCAGGTGAATTAGAAGAAGAGTAGTATTAATAATGTGAGGCTTGA
TTTTTTCGAACTTGTGTTTACTCAACAAGGCCAACTGTTTTTTTTTCTCTCTCACTTTGG
G*ACTACTTATTTACTCTTTTCTTGTTTCTTTTTTTTTT*GTATATAAATCACAGACAAG
TATGACTTCAGTTTTCTTGGAATC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A289TF U 193
AF RR4A289JQ C 1
AF RR4A289TFB U 1
AF RR4A289JQD C 1
BS 1 192 RR4A289TFB
BS 193 292 RR4A289TF
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BS 640 640 RR4A289JQ
BS 641 684 RR4A289TFB

RD RR4A289TF 100 0 0
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QA 1 100 1 100
DS 

RD RR4A289JQ 684 0 0
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TACAGCATTTTTCTTAACACCACTCTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATTTGCGGCAAT
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QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4A289TFB 684 0 0
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TTTTCTCCTGGTTTCTTGGTTGTGTTACTCTGCTCGTGTGTGCTGGCTTTCTTCTTAAAC
TACAGCATTTTTCTTAACACCACTCTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATTTGCGGCAAT
ATGAAGGATTTGTTTACGGTTGGGCTAGGCTGGATGGTCTTTGGTGGTCTCCCATTCGAC
CTGATGAATGTGATTGGGCAGTTTCTTGGTTTCTTAGGCTCTGGTTTATATGCATATTAT
AAGATCATTGGGAAGTAACTACTACTCCATAACTAAAGAAGAGCTAATAAAATAACAGGA
GTGTCCATCATAAAGGGAAAGCCTTAAGTTCAAGGAGAAGTTGTTAGACCATTAATTTTC
AGCTTTGGCTGTTTTGCAGGTGAATTAGAAGAAGAGTAGTATTAATAATGTGAGGCTTGA
TTTTTTCGAACTTGTGTTTACTCAACAAGGCCAACTGTTTTTTTTTCTCTCTCACTTTGG
GGACTACTTATTTACTCTTTTCTTGTTTCTTTTTTTTTTTGTATATAAATCACAGACAAG
TATGACTTCAGTTTTCTTGGAATC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4A289JQD 684 0 0
GCAAGTGGCTTGAATAGCTTTGGCCTTATGTGGTGCAATGGTATTATATGCGGACCCATA
TTGATGATTTGGACGTTTATGAGTGGTGACTTGGAGAAGACAATTAGCTTTCCTTACCTC
TTTTCTCCTGGTTTCTTGGTTGTGTTACTCTGCTCGTGTGTGCTGGCTTTCTTCTTAAAC
TACAGCATTTTTCTTAACACCACTCTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATTTGCGGCAAT
ATGAAGGATTTGTTTACGGTTGGGCTAGGCTGGATGGTCTTTGGTGGTCTCCCATTCGAC
CTGATGAATGTGATTGGGCAGTTTCTTGGTTTCTTAGGCTCTGGTTTATATGCATATTAT
AAGATCATTGGGAAGTAACTACTACTCCATAACTAAAGAAGAGCTAATAAAATAACAGGA
GTGTCCATCATAAAGGGAAAGCCTTAAGTTCAAGGAGAAGTTGTTAGACCATTAATTTTC
AGCTTTGGCTGTTTTGCAGGTGAATTAGAAGAAGAGTAGTATTAATAATGTGAGGCTTGA
TTTTTTCGAACTTGTGTTTACTCAACAAGGCCAACTGTTTTTTTTTCTCTCTCACTTTGG
G*ACTACTTATTTACTCTTTTCTTGTTTCTTTTTTTTTT*GTATATAAATCACAGACAAG
TATGACTTCAGTTTTCTTGGAATC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 4

CO CL2415Contig1 1310 4 4 U
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CCTGTATTCAGAGAAGCCCCAGCTTTCAGGAACGGTGATCAATGCGGGAACCATGAGGCT
GACCACATTCACATCGCCATGACGCTCGACACAAACTACCTCCGTGGAACAGTGGCTGCT
GTCTTGTCTCTCCTTCAACATTCCACTTGTCCTGAAAACCTCTCTTTTCATTTCCTCTCC
CTTGCTCATTTCGAAAATGACCTATTCACCAGCATCAAATCCACCTTTCCTTACCTCAAC
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CTACCATTTGGGATCATTACCTCCGTTTCTGCTTATATTCGCGGGTGATATAAAAGCCGT
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ACTAGATTCGAGGAAGCCTTGTAGTGTGGATCATCTATGGGCTCCGTATGATCTTTACTG
TTCATCAAGACATTCGTTAGAAGAGTAGAGGCAAAAAAAAAGCAAAACAAGATGGCACAT
ATATTATATAATACTAGGAGAGGAGAAGGTACAAGAAGTTTTTTTAGCGATCAAAGAGAG
TGAAATTTTTATTTGTAATTTTTGTAACACACACTCTTAATGCAAAAAGACGTTGTGCAT
GTGGCATTGACCTCAGTAGTGAAATGATATTATCATCATTATCATTTTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A174TF U 1
AF RR4A174TFB U 1
AF RR4A174JQD C 441
AF RR4A174JQ C 611
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BS 722 800 RR4A174TF
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CCTGTATTCAGAGAAGCCCCAGCTTTCAGGAACGGTGATCAATGCGGGAACCATGAGGCT
GACCACATTCACATCGCCATGACGCTCGACACAAACTACCTCCGTGGAACAGTGGCTGCT
GTCTTGTCTCTCCTTCAACATTCCACTTGTCCTGAAAACCTCTCTTTTCATTTCCTCTCC
CTTGCTCATTTCGAAAATGACCTATTCACCAGCATCAAATCCACCTTTCCTTACCTCAAC
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AGCATTGACCGGATCATATACCTAGACTCGGACCTAGTCGTGGTAGACGACATAGAGAAG
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AGGGAAACGACCGTGTTATTTCAACACGGGCGTGATGGTCGTGGACGTTGGTAAATGGAG
GAGAGGAATGTATACACAAA
G

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DS 

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ACCTCCACAAAGGCAGTTCGTGTTGGAGTCATTCTCCACAAGCCTTCTGCTCCAACCCTT
CCTGTATTCAGAGAAGCCCCAGCTTTCAGGAACGGTGATCAATGCGGGAACCATGAGGCT
GACCACATTCACATCGCCATGACGCTCGACACAAACTACCTCCGTGGAACAGTGGCTGCT
GTCTTGTCTCTCCTTCAACATTCCACTTGTCCTGAAAACCTCTCTTTTCATTTCCTCTCC
CTTGCTCATTTCGAAAATGACCTATTCACCAGCATCAAATCCACCTTTCCTTACCTCAAC
TTCAAGATTTATCAGTTTGATCCAAGCCTAGTCCGAAGCAAAATCTCAAAATCCATCAGG
GAAGCCCTAGACCAGCCTCTAAACTACGCGAGAATCTACCTCGCGGATATCATTCCCACC
AGCATTGACCGGATCATATACCTAGACTCGGACCTAGTCGTGGTAGACGACATAGAGAAG
CTATGGCATGTTGAGATGGAAGGTAAAGTCGTGGCGGCTCCAGAGTACTGCCAGGCAAAC
TTTACGTATTGTTTCACAAAAGCTTTCTGGTCGGACCCGGAACTAGTCAAAGTACTTGAA
*GGGAAACGACCGTGTTATTTCAACACGGGCGTGATGGTCGTGGACGTTGGTAAATGGAG
GAGAGG

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AGCTTTCTGGTCGGACCCGGAACTAGTCAAAGTACTTGAA*GGGAAACGACCGTGTTATT
TCAACACGGGCGTGATGGTCGTGGACGTTGGTAAATGGAGGAGAGGAATGTATACACAAA
AGGTAGAAGAGTGGATGACGGTTCAGAAGCAGAGGAGGATCTACCATTTGGGATCATTAC
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GTCTTCTTCATTGGAGTGGGAAAGGGAAGCCATGGTTGAGACTAGATTCGAGGAAGCCTT
GTAGTGTGGATCATCTATGGGCTCCGTATGATCTTTACTGTTCATCAAGACATTCGTTAG
AAGAGTAGAGGCAAAAAAAAAGCAAAACAAGATGGCACATATATTATATAATACTAGGAG
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TTTGTAACACACACTCTTAATGCAAAAAGACGTTGTGCATGTGGCATTGACCTCAGTAGT
GAAATGATATTATCATCATTATCATTTTAT

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DS 

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GTTTCACAAAAGCTTTCTGGTCGGACCCGGAACTAGTCAAAGTACTTGAA*GGGAAACGA
CCGTGTTATTTCAACACGGGCGTGATGGTCGTGGACGTTGGTAAATGGAGGAGAGGAATG
TATACACAAAAGGTAGAAGAGTGGATGACGGTTCAGAAGCAGAGGAGGATCTACCATTTG
GGATCATTACCTCCGTTTCTGCTTATATTCGCGGGTGATATAAAAGCCGTTGATCATCGG
TGGAACCAGCATGGGCTCGGAGGGGACAACTTCGAAGGGAAGTGTAGAACGTTGCATCCT
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AGGAAGCCTTGTAGTGTGGATCATTTATGGGCTCCGTATGATCTTTACTGTTCATCAAGA
CATTCGTTAGAAGAGTAGAGGCAAAAAAAAAGCAAAACAAGATGGCACATATATTATATA
ATACTAGGAGAGGAGAAGGTACAAGAAGTTTTTTTAGCGATCAAAGAGAGTGAAATTTTT
ATTTGTAATTTTTGTAACACACACTCTTAATGCAAAAAGACGTTGTGCATGTGGCATTGA
CCTCAGTAGTGAAATGATATTATCATCATTATCATTTTAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 3

CO CL2416Contig1 1182 3 2 U
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GTAGGGTTGAGTTTATATTTTATAGGGTTGGCTGAGTTCGAAAACCTATATGGGATCATG
GTTAGGGCTACATGTATATTTATATTAGAGATGTTTCCTAAACTATATAGATACAAATAT
ATGCGAATAGATTATACAATAAATTATTCAATATTAACAATGATATTTACGATCTCCTAG
ATCCTTCTATAGAACATAGGATCATATGCGATCAAAGCCGACGTCCAAATCGTCTTTCCC
TGCACTGGTACGAAACCAGGGCCTCTAGCAACTTGTCTTCATTAAAATCAGGCCAAAGGA
CCGGTGAGAAGAAGAGCTCCGTATAAGCGAGCTGCCACAAGAAGAAGTTACTAATCCTCT
GTTCTCCACTTGTCCTAATCAATAGATCGGGACTTGGGAACTCAGCACACTTTGTCACAA
GCTCTCCCTCGAAAAGCGTCTCGTCCACGTCTTCCTCACTGATCAAACCTTGTTGTGATT
TCTTCATAAGATTCTTGCAGGCTTGCAAGATGTCGAATCTCCCGCTGTAATCTATGGCCA
AGATGAGATGCTTCTTCTTGTAGCTCTTCGTAGATTCCTTTAGCTCTTTAATTGTCTTGA
GGAGAGATTCCGGGATCTTTTCAAGATTCCCAATAACAGAAACTCGGATCTCCTCTCTTT
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CGACCTTTTGTCTTCCCCAATTCTCAGTGGAGAAAGCAAAAGCTGACACTGTTTCTATCC
CTAGTTTGAAGCAGAGATCAGCGAACTCTAAAAGCCGTTTGGCTCCTGCCTCGTGGCCTT
GTAACGTCAGCAATCCGCCCCGTTCGGCCCATCTCCTGTTTCCGTCCATTATCACTGCCA
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CATAAGTTCCCTCGTCACGTTTCTCGTTCCTCTCTTCCTCATCATCGTGCCGAGAAGTTA
TGAGCTTAATGAATCCGAGGATATTTTTGAAGGATATAGGCACACTTAGACGCCAAGAGA
TGATGAGCCCAGGGATGAGAATAAGAGCAAGACCAGTAAAAA


BQ
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CF17JQ U 1
AF RR4CL10JQ U 1
AF RR4CL10TF C 470
BS 1 752 RR4CF17JQ
BS 753 1182 RR4CL10TF

RD RR4CF17JQ 752 0 0
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TCTTCATAAGATTCTTGCAGGCTTGCAAGATGTCGAATCTCCCGCTGTAATCTATGGCCA
AGATGAGATGCTTCTTCTTGTAGCTCTTCGTAGATTCCTTTAGCTCTTTAATTGTCTTGA
GGAGAGATTCCGGGATCTTTTCAAGATTCCCAATAACAGAAACTCGGATCTCCTCTCTTT
TGAAATATTGTAACTTTGAGCTGAGGTATCTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4CL10JQ 757 0 0
CAGTCCTAATCCAACATTTCATGCATATACTATTAGGGTTAACATAGAGTTAGGGTTGAA
GTAGGGTTGAGTTTATATTTTATAGGGTTGGCTGAGTTCGAAAACCTATATGGGATCATG
GTTAGGGCTACATGTATATTTATATTAGAGATGTTTCCTAAACTATATAGATACAAATAT
ATGCGAATAGATTATACAATAAATTATTCAATATTAACAATGATATTTACGATCTCCTAG
ATCCTTCTATAGAACATAGGATCATATGCGATCAAAGCCGACGTCCAAATCGTCTTTCCC
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CCGGTGAGAAGAAGAGCTCCGTATAAGCGAGCTGCCACAAGAAGAAGTTACTAATCCTCT
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GCTCTCCCTCGAAAAGCGTCTCGTCCACGTCTTCCTCACTGATCAAACCTTGTTGTGATT
TCTTCATAAGATTCTTGCAGGCTTGCAAGATGTCGAATCTCCCGCTGTAATCTATGGCCA
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GGAGAGATTCCGGGATCTTTTCAAGATTCCCAATAACAGAAACTCGGATCTCCTCTCTTT
TGAAATATTGTAACTTTGAGCTGAGGTATCTT
TCGAA

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DS 

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TTGTTGTGATT*CTTCATAAGAT*CTTGCAGGCTTGCAAGATGTCGAATCTCCCGCTGTA
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GCAATTAACTTCGACCTTTTGTCTTCCCCAATTCTCAGTGGAGAAAGCAAAAGCTGACAC
TGTTTCTATCCCTAGTTTGAAGCAGAGATCAGCGAACTCTAAAAGCCGTTTGGCTCCTGC
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TCCCACGTTCACATAAGTTCCCTCGTCACGTTTCTCGTTCCTCTCTTCCTCATCATCGTG
CCGAGAAGTTATGAGCTTAATGAATCCGAGGATATTTTTGAAGGATATAGGCACACTTAG
ACGCCAAGAGATGATGAGCCCAGGGATGAGAATAAGAGCAAGACCAGTAAAAA

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

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CTTCTTGCTTCTCCTCACTCTCGTCCACTCCACTTTCTCTTCCTTAGCTCCAACCGACCA
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AACTTGGGACTTCACAACCCCTGACCCTTGCTCCACCTTCTCAGGCCTCACTTGCACATC
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GTTCCATCTAGACATAAAGATGAACCAACTCTCCGGCCAACTCCCACCTGCTTTCCCGGT
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CATCAACGCCACGTCATCGCTAACGTTACCTCAAGGCTCCACTGTTGATCTGAGCCATAA
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GAAAACGCTCTTCTTGCAGCATAACTACTTGACCAGATTCCCGTGGAACTCTGGTTTTGA
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CGGTTTGTCCACGTGTCCGATAGAAGTTGCGCCTCTGCTCTCAAGGCCTGCTATACAATG
TTCTCGTTTTTACAATCACAGCTCCACTGGTTAAAGATCAGTTTCTCTTTTTTTTTGTCT
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TTTATGGAATTATATACTATTATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GD09TF U 1
AF RR4C029TF U 434
AF RR4BQ28TF U 434
AF RR4GD09JQ C 921
BS 1 481 RR4GD09TF
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BS 525 527 RR4GD09TF
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BS 529 682 RR4GD09TF
BS 683 1151 RR4BQ28TF
BS 1152 1152 RR4GD09JQ
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BS 1166 1183 RR4BQ28TF
BS 1184 1408 RR4GD09JQ

RD RR4GD09TF 682 0 0
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CTTCTTGCTTCTCCTCACTCTCGTCCACTCCACTTTCTCTTCCTTAGCTCCAACCGACCA
AGTTGCTCTTGAATCAATCAGAAACTCATTAACTGACATGCCCGGTTCAGCTTTCTTTGC
AACTTGGGACTTCACAACCCCTGACCCTTGCTCCACCTTCTCAGGCCTCACTTGCACATC
TCTCGGCCGTGTCTCCGCCTTATCTCTTGGTCCTAACCTCTCCGGCTCCCTATCACCTTC
CATCTCCAACCTAACCCATTTGACCCAATTCGTTCTCTACCCCGGTTTAGTCACCGGACC
TCTCCCTCCTCGGTTCGATACCCTCCCTCTCCTTCGAGCCATTTCCTTAACCAGAAACCG
CTTAACCGGTCCTATACCAAACTCTCTCTCATCTCTCTCATACCTCCACACTCTAGACCT
CAGCTATAACCAACTCTCAGGCTCTCTCCCTCACTTTCTCACAACACTTCCTCGACTCAA
AGTCCTCGTCTTAGCCTCAAACCGTTTCTCCGACAACGTGAAACCCGTCTCTAGCCCTTT
GTTCCATCTAGACATAAAGATGAACCAACTCTCCGGCCAACTCCCACCTGCTTTCCCGGT
CTCTCTCCGGTACTTATCTCTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4C029TF 690 0 0
G
TACCAAACTCTCTCTCATCTCTCTCATACCTCCACACTCTAGACCTCGGCTATAACCAAT
TCTCAGGCTCTCTCCCTCACTTTCTCACAGCACGTCCTCGACTCAAAGTCCTCGTCTTAG
CCTCAAACCGTTTCTCCGACAACGTGAAACCCGTCTCTAGCCCTTTGTTCCATCTAGACA
TAAAGATGAACCAACTCTCCGGCCAACTCCCACCTGCTTTCCCGGTCTCTCTCCGGTACT
TATCTCTCGCCGGAAACTCAATCTCCGGCACAATCACCCCCTTGGAGCCACTCACAGACC
TTCAATACATCGATCTCAGCATGAACCAGTTCACCGGCGCAATCCCGCAATCACTCTTTG
GCTCCACAACCTCATCAACGTTCTTGCAACGAAACAACTTCACATCCATCAACGCCACGT
CATCGCTAACGTTACCTCAAGGCTCCACTGTTGATCTGAGCCATAACTCAATCTCCGGAG
AGTTACCTCCTTCCCTCGCCGGAGCAGAGTCTCTGTTTCTGAACAACAACCGTTTCACAG
GAAACATCCCAGAGGAATACGTAGAGAGCTTGATCAACGGTACGACGAAAACGCTCTTCT
TGCAGCATAACTACTTGACCAGATTCCCGTGGAACTCTGGTTTTGA*CTGCCAGACTCTG
TTTCGCTCTGTTTGTCGTATA
CTGTATGG

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR4BQ28TF 767 0 0
G
TACCAAACTCTCTCTCATCTCTCTCATACCTCCACACTCTAGACCTCGGCTATAACCAAT
TCTCAGGCTCTCTCCCTCACTTTCTCACAGCACGTCCTCGACTCAAAGTCCTCGTCTTAG
CCTCAAACCGTTTCTCCGACAACGTGAAACCCGTCTCTAGCCCTTTGTTCCATCTAGACA
TAAAGATGAACCAACTCTCCGGCCAACTCCCACCTGCTTTCCCGGTCTCTCTCCGGTACT
TATCTCTCGCCGGAAACTCAATCTCCGGCACAATCACCCCCTTGGAGCCACTCACAGACC
TTCAATACATCGATCTCAGCATGAACCAGTTCACCGGCGCAATCCCGCAATCACTCTTTG
GCTCCACAACCTCATCAACGTTCTTGCAACGAAACAACTTCACATCCATCAACGCCACGT
CATCGCTAACGTTACCTCAAGGCTCCACTGTTGATCTGAGCCATAACTCAATCTCCGGAG
AGTTACCTCCTTCCCTCGCCGGAGCAGAGTCTCTGTTTCTGAACAACAACCGTTTCACAG
GAAACATCCCAGAGGAATACGTAGAGAGCTTGATCAACGGTACGACGAAAACGCTCTTCT
TGCAGCATAACTACTTGACCAGATTCCCGTGGAACTCTGGTTTTGAACTGCCAGACTCTG
TTTCGCTCTGTTTGTCGTATAACTGTATGGATACGGATCCAGTCGTCGGTTTGTCCATGT
GTCCGATAGA*GTTGCGCCTCTGCTCTCA
GCTGCTATACATGTCTC

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR4GD09JQ 488 0 0
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TCCCAGAGGAATACGTAGAGAGCTTGATCAACGGTACGACGAAAACGCTCTTCTTGCAGC
ATAACTACTTGACCAGATTCCCGTGGAACTCTGGTTTTGAACTGCCAGACTCTGTTTCGC
TCTGTTTGTCGTATAACTGTATGGATACGGATCCAGTCGTCGGTTTGTCCACGTGTCCGA
TAGAAGTTGCGCCTCTGCTCTCAAGGCCTGCTATACAATGTTCTCGTTTTTACAATCACA
GCTCCACTGGTTAAAGATCAGTTTCTCTTTTTTTTTGTCTGTTTGTTTGGGAAGAAAATT
GCCAAAAGTGACATTTTAGAAATTGAACCGTTGTGTCTGGTAGTGTTTTCTTATATAAAA
ATCTTAAGTGTGGTCCTCACTTGTAAATTAGATTGTAGTGTTTATGGAATTATATACTAT
TATTTTAC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 4

CO CL2418Contig1 673 4 3 U
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AAGGATTTTTCTGATGGTAGAGAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGGTATGGATCCAAAT
GTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCCTCCTCAGA
TATCAGCGTCTCATCCGGTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGGTTTCTATC
TGGAGATCCGATTCCGATCAGCCGCCACCACGGCTTGGGGTTCTCCGTAGTTCAGTCTAA
TCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGTACCAGCTGAAACAAGGAGAGT
GACGAGAACAGAGGAAGAAGAAAGTTCTTCTTCTGATGAAGACTCGAGTAGTAGTATTTT
GTATCATCCCTGCAATCTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTAAAGTGTTTTGGGCT
TGACCGGAGTACAGTAGAAACTGATGATTCTCCGAGACCAGAATCTAAGAAACAGAGGTG
ATCCCAAGTTCTTGTGAATATAGAAGAACAACATACACGTTTCTAATATGAGTTCATTCG
TAGTAAATTGAGTTAGGAGAGGATTAAGAAACTTGTAAAGTTTATACTATGGAAAGGTTA
TATTGTTGGGGTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GY61TF U 1
AF RR4GZ27TF U 1
AF RR4GY61JQ C 1
AF RR4GZ27JQ C 1
BS 1 439 RR4GY61TF
BS 440 655 RR4GZ27TF
BS 656 673 RR4GY61JQ

RD RR4GY61TF 439 0 0
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AAGGATTTTTCTGATGGTAGAGAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGGTATGGATCCAAAT
GTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCCTCCTCAGA
TATCAGCGTCTCATCCGGTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGGTTTCTATC
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TCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGTACCAGCTGAAACAAGGAGAGT
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GTATCATCCCTGCAATCTG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4GZ27TF 655 0 0
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AAGGATTTTTCTGATGGTAGAGAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGGTATGGATCCAAAT
GTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCCTCCTCAGA
TATCAGCGTCTCATCCGGTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGGTTTCTATC
TGGAGATCCGATTCCGATCAGCCGCCACCACGGCTTGGGGTTCTCCGTAGTTCAGTCTAA
TCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGTACCAGCTGAAACAAGGAGAGT
GACGAGAACAGAGGAAGAAGAAAGTTCTTCTTCTGATGAAGACTCGAGTAGTAGTATTTT
GTATCATCCCTGCAATCTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTAAAGTGTTTTGGGCT
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ATCCCAAGTTCTTGTGAATATAGAAGAACAACATACACGTTTCTAATATGAGTTCATTCG
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QA 1 655 1 655
DS 

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AAGGATTTTTCTGATGGTAGAGAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGGTATGGATCCAAAT
GTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCCTCCTCAGA
TATCAGCGTCTCATCCGGTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGGTTTCTATC
TGGAGATCCGATTCCGATCAGCCGCCACCACGGCTTGGGGTTCTCCGTAGTTCAGTCTAA
TCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGTACCAGCTGAAACAAGGAGAGT
GACGAGAACAGAGGAAGAAGAAAGTTCTTCTTCTGATGAAGACTCGAGTAGTAGTATTTT
GTATCATCCCTGCAATCTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTAAAGTGTTTTGGGCT
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TATTGTTGGGGTT

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DS 

RD RR4GZ27JQ 673 0 0
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AAGGATTTTTCTGATGGTAGAGAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGGTATGGATCCAAAT
GTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCCTCCTCAGA
TATCAGCGTCTCATCCGGTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGGTTTCTATC
TGGAGATCCGATTCCGATCAGCCGCCACCACGGCTTGGGGTTCTCCGTAGTTCAGTCTAA
TCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGTACCAGCTGAAACAAGGAGAGT
GACGAGAACAGAGGAAGAAGAAAGTTCTTCTTCTGATGAAGACTCGAGTAGTAGTATTTT
GTATCATCCCTGCAATCTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTAAAGTGTTTTGGGCT
TGACCGGAGTACAGTAGAAACTGATGATTCTCCGAGACCAGAATCTAAGAAACAGAGGTG
ATCCCAAGTTCTTGTGAATATAGAAGAACAACATACACGTTTCTAATATGAGTTCATTCG
TAGTAAATTGAGTTAGGAGAGGATTAAGAAACTTGTAAAGTTTATACTATGGAAAGGTTA
TATTGTTGGGGTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 4

CO CL2419Contig1 702 4 12 U
TTTTGTAATCTCCTCGCCAGAGGAGAAAGAAGCAATATGATTAAACAGCATCAATTACAC
AATTCAATAAACCCAATTGTTCAGCTTTAGAGATCCAAAACAGCTTTGCTTTTATTCAGA
AAGAGACAGAAACAAAACAACAAATCACTCACTCAAAGAGCATTAACCAAAAAGCTCTCA
CATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCGAGTCCAGTTCTTTTGACCC
GGGTTCAAGGCATGCCCTTTAGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAATTC
TCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGAATCAACAGCTCATCTCCAGTGTGA
TCAGTGATGAAATGAAGCCAGCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGA
TCCTTGGATGCGTACTCTACCCACCTGTGTCTACCGCACTGAGTATCGCCCAGCTTCTGG
TAGTATTTGTTACCGAACTTGTCCACACCAATAAGCGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTG
GTTTGCAAGAGGTTTCCATCTGGCAGGCATCTCAGAAAGCCTTCTTCTCGGATCATCCTG
AGGAAACCTCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGCCTCCAACGCACTCTTCGCCACCGTCAAT
GCCATCGCTCTCCTCTCTGTCTCGATCGTTCGATGTCGGACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC58JQ U 5
AF RR4GC58TF C 1
AF RR4EZ71JQ U 38
AF RR4EZ71TF C 38
BS 1 4 RR4GC58TF
BS 5 38 RR4GC58JQ
BS 39 172 RR4EZ71JQ
BS 173 173 RR4GC58JQ
BS 174 248 RR4EZ71JQ
BS 249 249 RR4GC58JQ
BS 250 317 RR4EZ71JQ
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BS 319 341 RR4EZ71JQ
BS 342 342 RR4GC58JQ
BS 343 683 RR4EZ71JQ
BS 684 702 RR4GC58TF

RD RR4GC58JQ 609 0 0
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GACTGAAACAAAACAATAAATCACTCACTCAGAGAGCATTAACCAAAAAGCTCTCACATT
CTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCGAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGT
TCAAGGTATGCCCTTTAGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCCT
TATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAG
TGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCT
TGGATGCGTACTCTACCCACCTGTGTCTACCGCACTGAGTATCGCCCAGCTTCTGGTAGT
ATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAATAAGCGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTGGTTT
GCAAGAGGTTTCCATCTGGCAGGCATCTCAGGAAGCCTTCTTCTCGGATCATCCTGAGGA
AGCCTCCGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4GC58TF 702 0 0
TTTTGTAATCTCCTCGCCAGAGGAGAAAGAAGCAATATGATTAAACAGCATCAATTACAC
AATTCAATAAACCCAATTGTTCAGCTTTAGAGATCCAAAACAGCTTTGCTTTTATTCA*A
AAGAGACTGAAACAAAACAATAAATCACTCACTCAGAGAGCATTAACCAAAAAGCTCTCA
CATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCGAGTCCAGTTCTTTTGCCCC
GGGTTCAAGGTATGCCCTTTAGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTC
TCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGA
TCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGA
TCCTTGGATGCGTACTCTACCCACCTGTGTCTACCGCACTGAGTATCGCCCAGCTTCTGG
TAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAATAAGCGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTG
GTTTGCAAGAGGTTTCCATCTGGCAGGCATCTCAGGAAGCCTTCTTCTCGGATCATCCTG
AGGAAGCCTCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGCCTCCATCGCACTCTTCGCCACCGTCAAT
GCCATCGCTCTCCTCTCTGTCTCGATCGTTCGATGTCGGACC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4EZ71JQ 659 0 0
A
GATTAAACAGCATCAATTACACAATTCAATAAACCCAATTGTTCAGCTTTAGAGATCCAA
AACAGCTTTGCTTTTATTCAGAAAGAGACAGAAACAAAACAACAAATCACTCACTCAAAG
AGCATTAACCAAAA*GCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTA
CCGAGTCCAGTTCTTTTGACCCGGGTTCAATGCATGCCCTTTAGAATGGTAAATGTATGC
ATCACCTTCTCCAGAGAAATTCTCCTTATGCTCAATCCCGTACCTTTTTGGTTTCTGAAT
CAATAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCAGCCGTGCCATTCGGCTGG
TACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCACCTGTGTCTACCGCA
CTGAGTATCGCCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCCACACCAATAAGCGT
TGCTCCTATGTTGTGTATTTTGGTTTGCAAGAGGTTTCCATCTGGCAGGCATCTCAGAAA
GCCTTCTTCTCGGATCATCCTGAGGAAACCTCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGCCTCCAA
CGCACTCTTCGCCACCGTCAATGCCATCGCTCTCCTCTCTGTCTC
TCTCGATCGATCC

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR4EZ71TF 659 0 0
A
GATTAAACAGCATCAATTACACAATTCAATAAACCCAATTGTTCAGCTTTAGAGATCCAA
AACAGCTTTGCTTTTATTCAGAAAGAGACAGAAACAAAACAACAAATCACTCACTCAAAG
AGCATTAACCAAAA*GCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTA
CCGAGTCCAGTTCTTTTGACCCGGGTTCAATGCATGCCCTTTAGAATGGTAAATGTATGC
ATCACCTTCTCCAGAGAAATTCTCCTTATGCTCAATCCCGTACCTTTTTGGTTTCTGAAT
CAATAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCAGCCGTGCCATTCGGCTGG
TACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCACCTGTGTCTACCGCA
CTGAGTATCGCCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCCACACCAATAAGCGT
TGCTCCTATGTTGTGTATTTTGGTTTGCAAGAGGTTTCCATCTGGCAGGCATCTCAGAAA
GCCTTCTTCTCGGATCATCCTGAGGAAACCTCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGCCTCCAA
CGCACTCTTCGCCACCGTCAATGCCATCGCTCTCCTCTCTGTCTC
TCTCGATCGATCC

QA 2 646 2 646
DS 



AS 1 4

CO CL2420Contig1 926 4 9 U
GAAACCGTAAACTTATGTCAGAAAACTCCATAACCATCCCAGACCACGTCGAGAAGTTTG
TTGAGGAGCTTGAAGAAAGCGCAAAGACGGGAGTCATTGTAGCCTACAGTGGCCAATTAG
TAGGTGTGGTGGGAGTCGCTGATCCGCTAAAGCGAGAAGCCAATGTTGTTGTGGAAGGTC
TACTTAGAATGGGTGTTCGACCTATAATGGTTACAGGTGATAACTGGAGAACAGCAAGAG
CAGTCGCCAAAGAGGTTGGTATTGAAGACGTGAGAGCGGAAGTAATGCCAGCAGGAAAAG
CTGAAGTGATCCGTTCACTGCAAAAAGACGGAAGCACGGTGGCCATGGTTGGAGATGGAA
TCAATGACTCTCCAGCTCTAGCCGCTGCTGACGTGGGAATGGCCATTGGTGCAGGGACTG
ATGTAGCAATAGAAGCAGCTGATTACGTTCTGATGAGAAACAACTTAGAAGATGTTATTA
CAGCCATTGATCTCTCTCGCAAAACATTAACACGAATCAGGTTAAACTACGTTTTCGCCA
TGGCTTACAATGTAGTGTCGATACCGATAGCAGCAGGAGTGTTCTTCCCGATCCTGAGGG
TGCAGCTGCCGCCGTGGGCCGCAGGAGCGTGCATGGCGCTCTCATCGGTGAGTGTTGTTT
GCTCCTCTTTGCTTCTTAGAAGATACAAGAAGCCGAGACTTACCACTATTTTGGAGATTA
CCAAGGAGTAAAGCCTTTTTCTTTCTCTTTCTTAATTGGAGTGATTTACTTTTGTTTTGG
TTTGTTGTTTGTAATCGATCATGTAACGACACGATAAAAAAAATGGTCTTGAGAGATGTT
TCTTATCTGTATGTAAGAGATTTTCTCGGCCTTTGTGTAAAAAAAGTGGCGTCCTTTCTT
GTGATCGATTGATGTGCAATGGCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF72TF U 100
AF RR4EO62TF U 1
AF RR4EO62JQ C 181
AF RR4CF72JQ C 735
BS 1 624 RR4EO62TF
BS 625 625 RR4EO62JQ
BS 626 725 RR4EO62TF
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BS 739 744 RR4EO62JQ
BS 745 745 RR4CF72JQ
BS 746 876 RR4EO62JQ
BS 877 926 RR4CF72JQ

RD RR4CF72TF 189 0 0
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GTTGTGGAAGGTCTACTTAGAATGGGTGTTCGACCTATAATGGTTACATGTGATAACTGG
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C

QA 9 189 9 189
DS 

RD RR4EO62TF 738 0 0
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DS 

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CTGAAGTGATCCGTTCACTGCAAAAAGACGGAAGCACGGTGGCCATGGTTGGAGATGGAA
TCAATGACTCTCCAGCTCTAGCCGCTGCTGACGTGGGAATGGCCATTGGTGCAGGGACTG
ATGTAGCAATAGAAGCAGCTGATTACGTTCTGATGAGAAACAACTTAGAAGATGTTATTA
CAGCCATTGATCTCTCTCGCAAAACATTAACACGAATCAGGTTAAACTACGTTTTCGCCA
TGGCTTACAATGTAGTGTCGATACCGATAGCAGCAGGAGTGTTCTTCCCGATCCTGAGGG
TGCAGCTGCCGCCGTGGGCCGCAGGAGCGTGCATGGCGCTCTCATCGGTGAGTGTTGTTT
GCTCCTCTTTGCTTCTTAGAAGATACAAGAAGCCGAGACTTACCACTATTTTGGAGATTA
CCAAGGAGTAAAGCCTTTTTCTTTTTCTTTCTTAATTGGAGTGATTTACTTTTGTTTTGG
TTTGTTGTTTGTAATCGATCATGTAACGACACGATAAAAAAAATGGTCTTGAGAGATGTT
TCTTATCTGTATGTAAGAGATTTTCTCGGCCTTTGT
TGC

QA 1 696 1 696
DS 

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T
TTTTTCTTTCTCTTTCTTAATTGGAGTGATTTACTTTTGTTTTGGTTTGTTGTTTGTAAT
CGATCATGTAACGACACGATAAAAAAA*TGGTCTTGAGAGATGTTTCTTATCTGTATGTA
AGAGATTTTCTCGGCCTTTGTGTAAAAAAAGTGGCGTCCTTTCTTGTGATCGATTGATGT
GCAATGGCCCA

QA 2 192 2 192
DS 



AS 1 4

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TTGATTTAGGGTTCGTTTGTTTTGAGAGTTGTGCTTTGTTCCGCGGATCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB29TF C 2
AF RR4EY85JQ U 1
AF RR4EY85TF C 102
AF RR4AB29JQ U 2
BS 1 367 RR4EY85JQ
BS 368 368 RR4AB29JQ
BS 369 692 RR4EY85JQ
BS 693 710 RR4AB29JQ

RD RR4AB29TF 648 0 0
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EY85JQ 693 0 0
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CTCAAGCACCGTTCGTCTTCACACGCTTCTCCTTGTAGTCTTTCACAGCTGCCTTGATAG
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TCTGACCGGTCTTCTCATCCACCTTGATTTGCAGCTTCATGACATCACCGCAGGCGGGAG
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GATTGTCGTAGTGGTCGATGACGTTCTCATGGTACGATCGGAAGATACCGACGGACCACG
GCGTTAATTGGCGTGACGTGAGCCCAAGAGTCTTCTTCGCAGCTTGCCTGATCATCATCG
TTGATTTAGGGTTCGTTTGTTTTGAGAGTTGT
C

QA 1 692 1 692
DS 

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AAAGATCCGACGTTTCGGGGATTGTCGTAGTGGTCGATGACGTTCTCATGGTACGATCGG
AAGATACCGACGGACCACGGCGTTAATTGGCGTGACGTGAGCCCAAGAGTCTTCTTCGCA
GCTTGCCTGATCATCATCGTTGATTTAGGGTTCGTTTGTTTTGAGAGTTGT
C

QA 1 591 1 591
DS 

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TTCAAACTTGAACCTTAAGAGAACATACGATATAGGTCCTCTTTTACACCTCCCCTGTTC
TCAAGCACCGTTCGTCTTCACACGCTTCTCCTTGTAGTCTTTCACAGCTGCCTTGATTGC
GTCCTCCGCCAACATACTGCAGTGGAGCTTCACTGGTGGCAGAGAGAGATGCTTCGCGAT
TTCAGTGTTCTTGATGGTCAGGACCTCCTCCATAGCTTTGCCTTTCACCCATTCAGTGGC
GACAGACGAAGAGGCGATGGCGGAGCCACAACCGAAGGTCTTGAAGCGAGCATCGACGAT
CTGACCGGTCTTCTCATCCACCTTGATTTGCAGCTTCATGACATCACCGCAGGCGGGAGC
TCCGACGAGACCCGTACCGACGGGGGGATCGTTCTTATCGAAAGATCCGACGTTTCGGGG
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TGATTTAGGGTTCGTTTGTTTTGAGAGTTGTGCTTTGTTCCGCGGATCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 2 4

CO CL2422Contig1 753 2 14 U
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CACTTTCCCTCAGTCATCCAAAAGTAGAGAATTCGATAGCGAACTTAAGAAAAAAGGAGG
ATGGATGATAAGTTTGATCACTAGTTGTAGAGATCATCATCATCTGCAGCAGCAACTGCA
GACGTGGCAAAAGGATCAGCTACTCCAGTGGTTGCACCTGAACCAGTATTAGTCTCGAAC
CCGAACTCAGAACCAAACCCTCTAGACTGCTGCAGCGTCTGAGCAAAGGCTTGGTACTTC
CTGATGTCTGCATCACTCACACTCCTGCGTGCATACTTCATCGACTCCTCAAAGTGTGCA
GCTTCGATCTCTGATACTTCATCCACTCCATCTTCCTCCATTGCCTCTGGGTTCAAGCTC
CTCCCCTTCTCCCTCTCAATGTCATTCTCGATGTTTTCTCTAATTGCATATTTGCAAGCC
CTCTGGCAAATCTCAGTGATATCAGCACCACTGAATCCCTGTGTGTACTTAGCGAGAGCA
TTGATGTCTACATCTTTAGCAACAGGAGATTTCCTCAAGCATGCCTTGAAGATATTGAGA
CGAGAATCCTCGTCTGGCAAAGGAATGTAAATGAGCTGGTCGAGCCTTCCTGGACGGAGA
AGAGCAGAATCGATAATGTCGGGTCTGTTGGTCGCTCCGATAATGAAGACAGTCTTCTTG
GCGTTCATTCCATCCATCTCTGTCAAAAGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A510JQ U 1
AF RR4BV20JQ U 7
BS 1 34 RR4A510JQ
BS 35 37 RR4BV20JQ
BS 38 424 RR4A510JQ
BS 425 425 RR4BV20JQ
BS 426 434 RR4A510JQ
BS 435 435 RR4BV20JQ
BS 436 602 RR4A510JQ
BS 603 603 RR4BV20JQ
BS 604 617 RR4A510JQ
BS 618 618 RR4BV20JQ
BS 619 623 RR4A510JQ
BS 624 624 RR4BV20JQ
BS 625 663 RR4A510JQ
BS 664 753 RR4BV20JQ

RD RR4A510JQ 663 0 0
GTCAAACATAAACGATTCTGATTAACTTAAAAAA***AACACAAGGAAAAGTATCAGTAT
CACTTTCCCTCAGTCATCCAAAAGTAGAGAATTCGATAGCGAACTTAAGAAAAAAGGAGG
ATGGATGATAAGTTTGATCACTAGTTGTAGAGATCATCATCATCTGCAGCAGCAACTGCA
GACGTGGCAAAAGGATCAGCTACTCCAGTGGTTGCACCTGAACCAGTATTAGTCTCGAAC
CCGAACTCAGAACCAAACCCTCTAGACTGCTGCAGCGTCTGAGCAAAGGCTTGGTACTTC
CTGATGTCTGCATCACTCACACTCCTGCGTGCATACTTCATCGACTCCTCAAAGTGTGCA
GCTTCGATCTCTGATACTTCATCCACTCCATCTTCCTCCATTGCCTCTGGGTTCAAGCTC
CTCCTCTTCTCCCTTTCAATGTCATTCTCGATGTTTTCTCTAATTGCATATTTGCAAGCC
CTCTGGCAAATCTCAGTGATATCAGCACCACTGAATCCCTGTGTGTACTTAGCGAGAGCA
TTGATGTCTACATCTTTAGCAACAGGAGATTTCCTCAAGCATGCCTTGAAGATATTGAGA
CGTGAATCCTCGTCTGGTAAAGGGATGTAAATGAGCTGGTCGAGCCTTCCTGGACGGAGA
AGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4BV20JQ 747 0 0
CATAAACGATTCTGATTAACTTAAAAAAAAAAACACAAGGAAAAGTATCAGTATCACTTT
CCCTCAGTCATCCAAAAGTAGAGAATTCGATAGCGAACTTAAGAAAAAAGGAGGATGGAT
GATAAGTTTGATCACTAGTTGTAGAGATCATCATCATCTGCAGCAGCAGCTGCAGACGTG
GCAAAAGGATCAGCTACTCCAGTGGTTGCACCTGAACCAGTATTAGTCTCGAACCTGAAC
TCAGAACCAAACCCTCTAGACTGCTGCAGCGTCTGAGCAAAGGCTTGGTACTTCCTGATG
TCTGCATCACTCACACTCCTGCGTGCATACTTCATCGACTCCTCAAAGTGTGCAGCTTTG
ATCTCTGATACTTCATCCACTCCATCTTCCTCCATTGCCTCTGGGTTCAAGCTCCTCCCC
TTCTCCCTCTCAATGTCCTTCTCGATGTTTTCTCTAATTGCATATTTGCAAGCCCTCTGG
CAAATCTCAGTGATATCAGCACCACTGAATCCCTGTGTGTACTTAGCGAGAGCATTGATG
TCTACATCTTTAGCAACAGGAGATTTCCTCAAGCATGCCTTGAAGATATTGAGGCGAGAA
TCCTCGTCTGGCAGTGGAATGTAAATGAGCTGGTCGAGCCTTCCTGGACGGAGAAGAGCA
GAATCGATAATGTCGGGTCTGTTGGTCGCTCCGATAATGAAGACAGTCTTCTTGGCGTTC
ATTCCATCCATCTCTGTCAAAAGCTGG

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL2422Contig2 798 2 9 U
GGCGCCAAGCAAACTTCATCAGTGTCAAAGGTCCCGAGCTTCTCACTATGTGGTTTGGAG
AGAGTGAAGCCAATGTCCGTGAAATCTTTGACAAGGCTCGTCAGTCTGCTCCATGTGTTC
TCTTCTTTGATGAGCTCGACTCCATTGCGACTCAGAGAGGAGGTGGAGGCGGAGGTGATG
CTGGCGGTGCAGCGGATAGAGTCCTGAACCAGCTTTTGACAGAGATGGATGGAATGAACG
CCAAGAAAACCGTCTTCATCATCGGAGCGACCAACAGACCCGACATTATTGATTCTGCTC
TTCTCCGTCCAGGAAGGCTCGACCAGCTCATTTACATCCCTTTACCAGACGAGGATTCAC
GTCTCAATATCTTCAAGGCATGCTTGAGGAAATCTCCTGTTGCTAAAGATGTAGACATCA
ATGCTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTGCTGATATCACTGAGATTTGCCAGA
GGGCTTGCAAATATGCAATTAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAAAGGGAGAAGAGGA
GGAGCTTGAACCCAGAGGCAATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTATCAGAGATCAAAG
CTGCACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCACGCAGGAGTGTGAGTGATGCAGACATCA
GGAAGTACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTCTGAGTTCG
GGTTCGAGACTAATACTGGTTCAGTGCAACCACTGGAGTAGCTGATCCTTTTGCCACGTC
TGCAGTTGCTGCTGCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E285TF U 63
AF RR4A510TF U 1
BS 1 93 RR4A510TF
BS 94 94 RR4E285TF
BS 95 177 RR4A510TF
BS 178 178 RR4E285TF
BS 179 517 RR4A510TF
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BS 519 596 RR4A510TF
BS 597 597 RR4E285TF
BS 598 798 RR4A510TF

RD RR4E285TF 596 0 0
G
GTGAAGCCAATGTCCGTGAAATCTTTGACAAGGCTCGTCAGTCTGCTCCATGTGTTCTCT
TCTTTGATGAGCTCGACTCCATTGCGACTCAGAGAGGAGGTGGAGGCGGAGGTGATGCTG
GCGGTGCGGCGGATAGAGTCCTGAACCAGCTTTTGACAGAGATGGATGGAATGAACGCCA
AGAAAACCGTCTTCATCATCGGAGCGACCAACAGACCCGACATTATTGATTCTGCTCTTC
TCCGTCCAGGAAGGCTCGACCAGCTCATTTACATCCCTTTACCAGACGAGGATTCACGTC
TCAATATCTTCAAGGCATGCTTGAGGAAATCTCCTGTTGCTAAAGATGTAGACATCAATG
CTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTGCTGATATCACTGAGATTTGCCAGAGGG
CTTGCAAATATGCAATTAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAAAGGGAGAAGAGGAGGA
GCTTGAACCCAGAGGCAATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTATCAGAGATCAAAGCTG
CACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCACGCAGGAGTGTGAGTGATGCAGACAT

QA 2 596 2 596
DS 

RD RR4A510TF 798 0 0
GGCGCCAAGCAAACTTCATCAGTGTCAAAGGTCCCGAGCTTCTCACTATGTGGTTTGGAG
AGAGTGAAGCCAATGTCCGTGAAATCTTTGACA*GGCTCGTCAGTCTGCTCCATGTGTTC
TCTTCTTTGATGAGCTCGACTCCATTGCGACTCAGAGAGGAGGTGGAGGCGGAGGTGGTG
CTGGCGGTGCAGCGGATAGAGTCCTGAACCAGCTTTTGACAGAGATGGATGGAATGAACG
CCAAGAAAACCGTCTTCATCATCGGAGCGACCAACAGACCCGACATTATTGATTCTGCTC
TTCTCCGTCCAGGAAGGCTCGACCAGCTCATTTACATCCCTTTACCAGACGAGGATTCAC
GTCTCAATATCTTCAAGGCATGCTTGAGGAAATCTCCTGTTGCTAAAGATGTAGACATCA
ATGCTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTGCTGATATCACTGAGATTTGCCAGA
GGGCTTGCAAATATGCAATTAGAGAAAACATCGAGAATGACATTGAAAGGGAGAAGAGGA
GGAGCTTGAACCCAGAGGCAATGGAGGAAGATGGAGTGGATGAAGTATCAGAGATCGAAG
CTGCACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCACGCAGGAGTGTGAGTGATGCAGACATCA
GGAAGTACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTCTGAGTTCG
GGTTCGAGACTAATACTGGTTCAGTGCAACCACTGGAGTAGCTGATCCTTTTGCCACGTC
TGCAGTTGCTGCTGCAGA

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

CO CL2423Contig1 1162 3 27 U
GGATCTCACTTGCCTTCACTCGCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAATCTAAAACCT
TATACAGCTTTTCTTGCTTTCCCGAGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAACCAG
CTTAAGGATGCTGAACCATTCTTCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTGATCGAATCCGAGGAA
CATATTCTTCGAATGGCAAAACACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTACCACTG
GTTTTCAAGTCGAGTTTTGATAAAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCT
GGCATGGCTGAGGGTCTCAAGATTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCAATT
GTAACTGATGTCCACGAGGCGTATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATT
CAGATACCAGCATTCTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGA
AAAATTATCAATATTAAGAAAGGACAGTTCTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCT
GAGAAGATCAGGCTGGCTGGGAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGATT
GGATACAATGATTTGATAGTAGATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGT
CCTGTTGTTGCTGATATAACCCATGCACTCCAACAACCTGCAGGCAAAAAGTTGGAAGGT
GGTGGTGTTGCTAGTGGAGGCCTTCGGGAGTTAATACCCTGCATTGCCAGAACAGCTGTA
GCCGTTGGCGTCGATGGAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTT
GATGGTCCAACCCAATGGCCTTTGCGTCATCTAGAAGAACTCCTAGAGGAGCTCATCACG
ATTGCTAGGGTCACAAAAGGAAAGCAGCGGTTCCAGATCGATCTCACACCTTACCGCGAC
TAGGATTGAAGGTGTAGTAATCTCGAGGTGAGTGTCCCAAATGGGCGTATATGAAATATG
ACGCCAAATCCTGGAGACCTCATTGCGGTTGCATCCTCTCCGTAAAGGATATCTATTTTC
TAAGAGCAAAGAATGTTATTTATTTTTGATTTCTCCAAACTTTGAACATATATATAGGCT
TCTATTCAAAATTTCTTCTGAC


BQ
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0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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AF RR4FR83TF U 1
AF RR4CG16TF U 16
AF RR4CG16JQ C 385
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QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CE37TF U 1
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AF RR4CE37JQ C 1
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ACTTACATATCGGGATCTTGAGTTAAAA*CACTTGTGCAACAGAGAACAGTATCGTCATT
GTGGGGGAGTGCCTTGTTCAATCTTCAAAGGTTCGTGGAGAGATTCGTAGGGAACGTTAC
AGGCTTTTGTAAGAAGTTGCGTTTGATATTG*CAGTTAGGACATACAAATCACACAAA
GATTGT

QA 1 598 1 598
DS 

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GCTATATCCCTTTCTGTGGACGCACTGGGAATGGGGATTCTTTCAAATCTTAAGTTGTGG
GGAGATAAGCGCAAGCAAATCCATTTCTCTCAAACTGAAAAGGATGAGCTTAGGAGAAGG
AAGGTGCTATGGGCATTGTACCTCATGAGAGATCCATTCTTCACCAAGTACACAAGGCAG
AAGCTGGAAAGCTCTCAGAAGAAGGTTGAACCAGTTCCATTGATCGGCTTCTTCACAGAG
AAAGTTGTGGATCTTTTGGTGGGAGCTCAGTCACGTTACACTTACATATCGGGATCTTGA
GTTAAAA*CACTTGTGCAACAGAGAACAGTATCGTCATTGTGGGGGAGTGCCTTGTTCAA
TCTTCAAAGGTTCGTGGAGAGATTCGTAGGGAACGTTACAGGCTTTTGTAAGAAGTTGCG
TTTGATATTG*CAGTTAGGACATACAAATCACACAAA*GATTGTAGTTTTGATGATGAGC
TGTTTGATGTCTAAACAATGGACCCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4CE37JQ 681 0 0
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GGTGAGGTTCTTTACATTACGAGACCGCTCATTTACGTTCTCTTCATCAGAAGATATGGA
ATCAGGTCTTGGATTCCTTGGGCTATATCCCTTTCTGTGGACGCACTGGAGATGGGGATT
CTTTCAAATCTTAAGTTGTGGGGAGATAAGCGCAAGCAAATCCATTTCTCTCAAACTGAA
AAGGATGAGCTTAGGAGAAGGAAGGTGCTATGGGCATTGTACCTCATGAGAGATCCATTT
TTCACCAAGTACACAAGGCGGAAGCTGGAAAGCTCTCAGAAGAAGGTTGAACCAGTTCCA
TTGATCGGCTTCTTCACAGAGAAAGTTGTGGATCTTTTGGTGGGAGCTCAGTCACGTTAC
ACTTACATATCGGGATCTTGAGTTAAAA*CACTTGTGCAACAGAGAACAGTATCGTCATT
GTGGGGGAGTGCCTTGTTCAATCTTCAAAGGTTCGTGGAGAGATTCGTAGGGAACGTTAC
AGGCTTTTGTAAGAAGTTGCGTTTGATATTG*CAGTTAGGACATACAAATCACACAAA*G
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AAACAAAGCATCTACGTTGTC

QA 1 681 1 681
DS 

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CGAGCTTAGGAGAAGGAAGGTGCTATGGGCATTGTACCTCATGAGAGATCCATTCTTCAC
CAAGTACACTAGGCAGAAGCTGGAAAGCTCTCAGAAGAAGGTTGAACCAGTTCCATTGAT
CGGCTTCTTCACAGAGAAAGTTGTGGATCTTTTGGTGGGAGCTCAGTCACGTTACACTTA
CATATCGGGATCTTGAGTTAAAAACACTTGTGCAACAGAGAACAGTATCGTCATTGTGGG
**AGTGCCTTGTTCAATCTTCAAAGGTTCGTGGAGAGATTCGTAGGGAACGTTACAGGCT
TTTGTAAGAAGTTGCGTTTGATATTTACAGTTAGGACATACAAATCACACAAAAGATTGT
AGTTT*GATGATGAGCTGTTTGATGTCTAAACAATGGACCCCATACAAAGAAATGAAACA
AAGCATCTACGTTGTC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 4

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GACCATCATTTCCTGTCACTAAAAACTCTCTCTCCCCAGACATTCTCTCCTCCAATCTCG
CTGTTACGCACTGTGCATCCAACAACAACAACAACCACCAAAGCTTTTGATCTCATCTGA
TCTGATAAGATGGCGAGCATCAGCAACGAGCCGGAGCGTGAGCACAGAGACGAAGAAGAG
TCCGGAGCCAACGAGGACGAAGACACCGGCGCTCAGGTCGCTCCCATCATCAAACTCGAA
GAAGTCGCCGTCACCACCGGTGAAGAAAACGAAGATACCATCCTCGATCTGAAATCGAAG
TTGTATAGGTTCGATAAAGATGGGAGTCAGTGGAAGGAGAGAGGAGCTGGGACTGTCAAG
TTCCTGAAGCATAAGGAGACTGGGAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTC
AAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGCTGGGAAT
GACAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGATTTCTCCGATGGGGAGTTGAAGGATGAGCTT
TTCTGTATCCGCTTTGCCAATGTTGAGAACTGCAAAGCATTCATGCAAAAGTTCAAGGAA
GTTGCTGAATCTGAAGAAGAGAAAGAGGAGAGTAAAGACGCTTCTGAGGCTGCTGGTCTT
CTTGAGAAGTTAACAGTGGAAGAGAAGAACACGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGGAAGAG
AAACCAGTGGAGAAGGTAGAGAAAGCTGTTGAAGAAAAGAAAACCGAGGAGACTGTCCCC
TCAGCGTAAGATGCATATGCCTTGTACAACAAACACACAAGGCTACTTAATTTACAGCCT
CATATGTTTTAAATCCATCAGAGACTTGGCTTTCTTTTCTTTTTTTCTTGAAATTGATAC
ATGTTTTGTCAGTGTCATCATGTTTACTTGCTGAGTCTATATGAGATTCTGGGGTTGTTT
TTGGGATTCGTTTTGGGGAAAGAATATATCCCTTTGTTTTGATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A536TF U 1
AF RR4CB46TF U 21
AF RR4CB46JQ C 157
AF RR4A536JQ C 239
BS 1 146 RR4A536TF
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BS 148 184 RR4A536TF
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BS 977 1001 RR4CB46JQ
BS 1002 1008 RR4A536JQ

RD RR4A536TF 725 0 0
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AAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGCTGGGAAT
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TTCTGTATCCGCTTTGCCAATGTTGAGAACTGCAAAGCATTCATGCAAAAGTTCAAGGAA
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CTTGAGAAGTTAACAGTGGAAGAGAAGAACACGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGGAAGAG
AAACC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4CB46TF 828 0 0
GG
AAACTCTCTCTCCCCAGACATTCTCTCCTCCAATCTCGCTGTTACGCACTGTGCATCCAA
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ACACCGGCGCTCAGGTCGCTCCCATCATCAAACTCGAAGAAGTCGCCGTCACCACCGGTG
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GGAGTCAGTGGAAGGAGAGAGGAGCTGGGACTGTCAAGTTCCTGAAGCATAAGGAGACTG
GGAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCATCTCG
TTACGTCGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGCTGGGAATGACAAGTCTTGTGTGTGGCACG
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TTGAGAACTGCAAAGCATTCATGCAAAAGTTCAAGGAAGTTGCTGAATCTGAAGAAGAGA
AAGAGGAGAGTAAAGACGCTTCTGAGGCTGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTAACAGTGGAAG
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AAGCTGTTGAAGAAA**GAAACCGAGGAGACTGTCCC*TCAGCGTA*GATGCATATGCCT
TGTACAC**AACACACAAG*CTACTTAATT*ACAGCCTCATATGTT

QA 3 828 3 828
DS 

RD RR4CB46JQ 847 0 0
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*TCGCTCCCATCATCAAACTCGAAGAAGTCGCCGTCACCACCGGTGAAGAAAACGAAGAT
ACCATCCTCGATCTGAAATCGAAGTTGTATAGGTTCGATAAAGATGGGAGTCAGTGGAAG
GAGAGAGGAGCTGGGACTGTCAAGTTCCTGAAGCATAAGGAGACTGGGAAGATTCGTCTC
GTTATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGGGATG
AGTGTTCAGGAACACGCTGGGAATGACAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGATTTCTCC
GATGGGGAGTTGAAGGATGAGCTTTTCTGTATCCGCTTTGCTAATGTTGAGAACTGCAAA
GCATTCATGCAAAAGTTCAAGGAAGTTGCTGAATCTGAAGAAGAGAAAGAGGAGAGTAAA
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GAGGAGGAGGAGAAGAAGGAAGAGAAACCAGTGGAGAAGGTAGAGAAAGCTGTTGAAGAA
AAGAAAACCGAGGAGACTGTCCCCTCAGCGTAAGATGCATATGCCTTGTACAACAAACAC
ACAAGGCTACTTAATTTACAGCCTCATATGTTTTAAATCCATCAGAGGCTTGGCTTTCTT
TTCTTTTTTTCTTGAAATTGATACATGTTTTGTCAGTGTCATCATGTTTACTTGCTGAGT
CTATATGAGATTCTGGGGTTGTTTTTGGGATTCGTTTTGTGGAAAGAATATATCCCTTTG
TTTTG
CG

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4A536JQ 770 0 0
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AGTTGTATAGGTTCGATAAAGATGGGAGTCAGTGGAAGGAGAGAGGAGCTGGGACTGTCA
AGTTCCTTAAGCATAAGGAGACTGGGAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTC
TCAAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGCTGGGA
ATGACAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGATTTCTCCGATGGGGAGTTGAAGGATGAGC
TTTTCTGTATCCGCTTTGCCAATGTTGAGAACTGCAAAGCATTCATGCAAAAGTTCAAGG
AAGTTGCTGAATCTGAAGAAGAGAAAGAGGAGAGTAAAGACGCTTCTGAGGCTGCTGGTC
TTCTTGAGAAGTTAACAGTGGAAGAGAAGAACACGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGGAAG
AGAAACCAGTGGAGAAGGTAGAGAAAGCTGTTGAAGAAAAGAAAACCGAGGAGACTGTCC
CCTCAGCGTAAGATGCATATGCCTTGTACAACAAACACACAAGGCTACTTAATTTACAGC
CTCATATGTTTTAAATCCATCAGAGACTTGGCTTTCTTTTCTTTTTTTCTTGAAATTGAT
ACATGTTTTGTCAGTGTCATCATGTTTACTTGCTGAGTCTATATGAGATTCTGGGGTTGT
TTTTGGGATTCGTTTTGGGGAAAGAATATATCCCTTTGTTTTGATTTTCC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 4

CO CL2426Contig1 577 4 8 U
TAAATCATATCATTGTCAGACAATCAGAAAACAACTTATAGCATTTAACTTATAGTTATA
AAGGATACTAAGGGATATCTTACAACAACAATCCACAGGTTCCATTAACTGTGAACTATT
AAGAAAGAGAAGAAAAAAAAACTGAAAGTGAACTCAAGAAGCCATGAGCTTTGGACCATT
GTCGGGCATTCCCATCCCAGCAGCCAAATCAGCATCGAGTTGTGAGTGTAGCGCAGGTCC
ATTCATTAACTTCACACGCTTCTTGTGTTTCTTAGTCTTAAAATGATCATCTCGCACAGA
CGCATTAGAGAAGTACCGATCGCAGTGTAGGCAGTAGAACTGGCCCATTCCAGGCAGATC
CTCGCTAAGCTCCAAAGGCTTTGTCTCCGTCTCTGGTTTGCGCAGCTCAGTGTACACTAA
ATCGTCGCCTTTGACTTCGAATTTGTCACGACGAGCTGTTTTGTGGGACAATCGCCCCTT
CTTCACCTTTCTTGTCGGGCATCTCCCCATCCTTTATATACTCGATTTAGAGTATAAACC
ACACGAGTAGAAGCTGGAGACGACGATGCGGAACCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4CJ86JQ U 1
AF RR4CJ86TF C 1
AF RR4AB10JQ U 25
AF RR4AB10TF C 25
BS 1 229 RR4CJ86JQ
BS 230 230 RR4AB10JQ
BS 231 357 RR4CJ86JQ
BS 358 359 RR4AB10JQ
BS 360 476 RR4CJ86JQ
BS 477 477 RR4AB10JQ
BS 478 573 RR4CJ86JQ
BS 574 577 RR4AB10JQ

RD RR4CJ86JQ 576 0 0
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AAGAAAGAGAAGAAAAAAAAACTGAAAGTGAACTCAAGAAGCCATGAGCTTTGGACCATT
GTCGGGCATTCCCATCCCAGCAGCCAAATCAGCATCGAGTTGTGAGTGTGGCGCAGGTCC
ATTCATTAACTTCACACGCTTCTTGTGTTTCTTAGTCTTAAAATGATCATCTCGCACAGA
CGCATTAGAGAAGTACCGATCGCAGTGTAGGCAGTAGAACTGGCCCATTCCAGGCAGG*C
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ATCGTCGCCTTTGACTTCGAATTTGTCACGACGAGCTGTTTTGTGGGACAATCGCCTCTT
CTTCACCTTTCTTGTCGGGCATCTCCCCATCCTTTATATACTCGATTTAGAGTATAAACC
ACACGAGTAGAAGCTGGAGACGACGATGCGGAA
GCC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4CJ86TF 576 0 0
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AAGGATACTAAGGGATATCTTACAACAACAATCCACAGGTTCCATTAACTGTGAACTATT
AAGAAAGAGAAGAAAAAAAAACTGAAAGTGAACTCAAGAAGCCATGAGCTTTGGACCATT
GTCGGGCATTCCCATCCCAGCAGCCAAATCAGCATCGAGTTGTGAGTGTGGCGCAGGTCC
ATTCATTAACTTCACACGCTTCTTGTGTTTCTTAGTCTTAAAATGATCATCTCGCACAGA
CGCATTAGAGAAGTACCGATCGCAGTGTAGGCAGTAGAACTGGCCCATTCCAGGCAGG*C
CTCGCTAAGCTCCAAAGGCTTTGTCTCCGTCTCTGGTTTGCGCAGCTCAGTGTACACTAA
ATCGTCGCCTTTGACTTCGAATTTGTCACGACGAGCTGTTTTGTGGGACAATCGCCTCTT
CTTCACCTTTCTTGTCGGGCATCTCCCCATCCTTTATATACTCGATTTAGAGTATAAACC
ACACGAGTAGAAGCTGGAGACGACGATGCGGAA
GCC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4AB10JQ 553 0 0
CC
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AACAATCCACAGGTTCCATTAACTGTGAACTATTAAGAAAGAGAAGAAAAAAAAACTGAA
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GTAGGCAGTAGAACTGGCCCATTCCAGGCAGATCCTCGCTAAGCTCCAAAGGCTTTGTCT
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CCATCCTTTATATACTCGATTTAGAGTATAAACCACACGAGTAGAAGCTGGAGACGACGA
TGCGGAACCCC

QA 3 553 3 553
DS 

RD RR4AB10TF 553 0 0
CC
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AACAATCCACAGGTTCCATTAACTGTGAACTATTAAGAAAGAGAAGAAAAAAAAACTGAA
AGTGAACTCAAGAAGCCATGAGCTTTGGACCATTGTCGGGCATTCCCATCCCAGCAGCCA
AATCAGCATCGAGTTGTGAGTGTAGCGCAGGTCCATTCATTAACTTCACACGCTTCTTGT
GTTTCTTAGTCTTAAAATGATCATCTCGCACAGACGCATTAGAGAAGTACCGATCGCAGT
GTAGGCAGTAGAACTGGCCCATTCCAGGCAGATCCTCGCTAAGCTCCAAAGGCTTTGTCT
CCGTCTCTGGTTTGCGCAGCTCAGTGTACACTAAATCGTCGCCTTTGACTTCGAATTTGT
CACGACGAGCTGTTTTGTGGGACAATCGCCCCTTCTTCACCTTTCTTGTCGGGCATCTCC
CCATCCTTTATATACTCGATTTAGAGTATAAACCACACGAGTAGAAGCTGGAGACGACGA
TGCGGAA
CCCC

QA 3 549 3 549
DS 



AS 2 4

CO CL2427Contig1 907 2 2 U
GGACCAATCATTAGATTTGGCACTGTTAACTTATTCTTTCTTACCAAGAAGCAGCCATGG
AAGCCAAGGTAGCAAGCAAGCATCACAGCTCTATTTTAGTTCCATCTGTTCAAGGGATGG
TGAAGGAGAAGCTGATCAAGAAGGTTCCTGCGAGGTATGTACGGTCTGATCTAGACAAAG
CTGAGATGTCCTGTGACTCTGGTCTAAAACCTGAGATCCCAGTCATTGACATGAGCCGCT
TATGTTCTCCAACCACCATGGTTTCTGAGATTGAAAATCTTGACTTGGCTTGCAAAGAAT
GGGGATTTTTCCAGCTTGTAAACCACGGAGTGGACTCAGTCTTCTTGGACAAATTCAAGT
CAGAGATTCAAGATTTCTTCAACCTTCCCGTGGAAGAGAAGAAGAAGCTGTGGCAAAAAC
CTGGAGACATGGAAGGGTTTGGACAGGCTTTTGTGGTTTCAGAAGAGCAGAAACTCGATT
GGGCAGACATGTTCCACCTCACAGTGCAACCTGCTAGGTTACGCAAGCCTCACGTGTTCC
CGAAGATACCTCTTCCCCTTAGAGATACACTGGAGACGTATTCGGCTGAACTTAAAAGCA
TAGCTAAGATCTTGTTTGCTAAAATGGCGATAGGACTGAAGATCAACCCTGAAGAGATGG
AAAAGCTGTTTGATGATGATTTAGGACAGATAATGAGGATGAATTACTACCCTCCTTGTC
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TCTCCTAATGCTTTCGTTGTCAATGTTGGAGACATGATAGAGATTGTTACAAATGGGACG
TACCGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ80TF U 1
AF RR4B308TF U 1
BS 1 682 RR4AZ80TF
BS 683 907 RR4B308TF

RD RR4AZ80TF 682 0 0
GGACCAATCATTAGATTTGGCACTGTTAACTTATTCTTTCTTACCAAGAAGCAGCCATGG
AAGCCAAGGTAGCAAGCAAGCATCACAGCTCTATTTTAGTTCCATCTGTTCAAGGGATGG
TGAAGGAGAAGCTGATCAAGAAGGTTCCTGCGAGGTATGTACGGTCTGATCTAGACAAAG
CTGAGATGTCCTGTGACTCTGGTCTAAAACCTGAGATCCCAGTCATTGACATGAGCCGCT
TATGTTCTCCAACCACCATGGTTTCTGAGATTGAAAATCTTGACTTGGCTTGCAAAGAAT
GGGGATTTTTCCAGCTTGTAAACCACGGAGTGGACTCAGTCTTCTTGGACAAATTCAAGT
CAGAGATTCAAGATTTCTTCAACCTTCCCGTGGAAGAGAAGAAGAAGCTGTGGCAAAAAC
CTGGAGACATGGAAGGGTTTGGACAGGCTTTTGTGGTTTCAGAAGAGCAGAAACTCGATT
GGGCAGACATGTTCCACCTCACAGTGCAACCTGCTAGGTTACGCAAGCCTCACGTGTTCC
CGAAGATACCTCTTCCCCTTAGAGATACACTGGAGACGTATTCGGCTGAACTTAAAAGCA
TAGCTAAGATCTTGTTTGCTAAAATGGCGATAGGACTGAAGATCAACCCTGAAGAGATGG
AAAAGCTGTTTGATGATGATTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4B308TF 907 0 0
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AAGCCAAGGTAGCAAGCAAGCATCACAGCTCTATTTTAGTTCCATCTGTTCAAGGGATGG
TGAAGGAGAAGCTGATCAAGAAGGTTCCTGCGAGGTATGTACGGTCTGATCTAGACAAAG
CTGAGATGTCCTGTGACTCTGGTCTAAAACCTGAGATCCCAGTCATTGACATGAGCCGCT
TATGTTCTCCAACCACCATGGTTTCTGAGATTGAAAATCTTGACTTGGCTTGCAAAGAAT
GGGGATTTTTCCAGCTTGTAAACCACGGAGTGGACTCAGTCTTCTTGGACAAATTCAAGT
CAGAGATTCAAGATTTCTTCAACCTTCCCGTGGAAGAGAAGAAGAAGCTGTGGCAAAAAC
CTGGAGACATGGAAGGGTTTGGACAGGCTTTTGTGGTTTCAGAAGAGCAGAAACTCGATT
GGGCAGACATGTTCCACCTCACAGTGCAACCTGCTAGGTTACGCAAGCCTCACGTGTTCC
CGAAGATACCTCTTCCCCTTAGAGATACACTGGAGACGTATTCGGCTGAACTTAAAAGCA
TAGCTAAGATCTTGTTTGCTAAAATGGCGATAGGACTGAAGATCAACCCTGAAGAGATGG
AAAAGCTGTTTGATGATGATTTAGGACAGATAATGAGGATGAATTACTACCCTCCTTGTC
CAGAGCCCGACCAGGTTATTGGTCTGACTCCACATTCAGATTCTACAGGAGTCACCATCC
TTCTGCAGTTAATGAAGTCGAAGTCTCCAAATCAGAGACGGCAGTGGGTTTCGGTCAAAC
TCTCCTAATGCTTTCGTTGTCAATGTTGGAGACATGATAGAGATTGTTACAAATGGGACG
TACCGAA

QA 1 907 1 907
DS 



CO CL2427Contig2 854 2 5 U
CTTTAAAAGAAGGATAGTCTTATTAATTCTCTGCAAGGAACCAGACAAGAGAACACATAC
TATTGTATATATATATAGTACAATAAGAAAGGTGAGAGATGGGTCATGGGTCTTTAGATT
CTCATAACATCAAGGTAAGCTTTTCCACCAAGCTCACGAGAGAACAAGCCTTTGAAGTAC
TCATCAGTGGTCATGCTTCTGAAAAACGAAGCCTTATGCCTCTCCACGAGACTTCTCAGC
GGACCAACTTCTTTGCCCGTTCCCATATTGTGAAACGCCCCTATAGAAATCCTCTCCTTC
TCTGAGTTCACAACCCCACGATGCTCTATACTTCGGTACGTCCCATTTGTAACAATCTCT
ATCATGTCTCCAACATTGACAACGAAAGCATTAGGGAGAGGTTTGACCGAAACCCACTTG
CCGTTCTTCTTGATTTGGAGACCTTCGACTTCATTAACCTGCAGAAGGATGGTGACTCCT
GTAGAATCTGAATGTGGAGTCAGACCAATAACCTGGTCGGGCTCTGGACAAGGAGGGTAG
TAATTCATCCCTCATTATCTGTCCTAAATCATCATCAAACAGCTTTTCCATCTCTTCAGG
GTTGATCTTCAGTCCTATCGCCATTTTAGCAAACAAGATCTTAGCTATGCTTTTAAGTTC
AGCCGAATACGTCTCCAGTGTATCTCTAAGGGGAAGAGGTATCTTCGGGAACACGTGAGG
CTTGCGTAACCTAGCAGGTTGCACTGTGAGGTGGAACATGTCTGCCCAATCGAGTTTCTG
CTCTTCTGAAACCACAAAAGCCTGTCCAAACCCTTCCATGTCTCCAGGTTTTTGCCACAG
CTTCTTCTTCTCTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ80JQ U 3
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RD RR4AZ80JQ 600 0 0
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ACCAACTTCTTTGCCCGTTCCCATATTGTGAAACGCCCCTATAGAAATCCTCTCCTTCTC
TGAGTTCACAACCCCACGATGCTCTATACTTCGGTACGTCCCATTTGTAACAATCTCTAT
CATGTCTCCAACATTGACAACGAAAGCATTAGGGAGAGGTTTGACCGAAACCCACTTGCC
GTTCTTCTTGATTTGGAGACCTTCGACTTCATTAACCTGCAGAAGGATGGTGACTCCTGT
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ATTCATCCCTCATTATCTGTCCTAAATCATCATCAAACAGCTTTTCCATCTCTTCAGGGT

QA 1 600 1 600
DS 

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CTCATAACATCAAGGTAAGCTTTTCCACCAAGCTCACGAGAGAACAAGCCTTTGAAGTAC
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TAATTCATCC*TCATTATCTGTCCTAAATCATCATCAAACAGCTTTTCCATCTCTTCAGG
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AGCCGAATACGTCTCCAGTGTATCTCTAAGGGGAAGAGGTATCTTCGGGAACACGTGAGG
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CTCTTCTGAAACCACAAAAGCCTGTCCAAACCCTTCCATGTCTCCAGGTTTTTGCCACAG
CTTCTTCTTCTCTT

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 4

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AAGCTAACCTCCGATGCCGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCAC
GCGTTTGCCTTGTTTGTTGGTGTTTCCATTGCGGCTAACATCTCTGGTGGTCACCTTAAC
CCTGCCGCGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATTACTGGTTTCTTA
TACTGGACCGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTATGTTACC
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AGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATAAAAAGATGTAAA
TATACTTTCCACTTTATATGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DD51TF U 24
AF RR4F134TF U 1
AF RR4DD51JQ C 362
AF RR4F134JQ C 253
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RD RR4DD51TF 424 0 0
G
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TCGTTCAGTGTCGCATCTCTAAAGGCTTACTTGTCTGAGTTTATTGCAACTCTTATCTTT
GTATTCGCTGGCGTTGGCTCAACTATCGCTTTTGGCAAGCTAACCTCTGATGCCGCCTTG
GACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCACGCGTTTGCCTTGTTTGTTGGTGTT
TCCATTGCGGCTAACATCTCTGGTGGTCACCTTAACCCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCC
GTTGGAGGAAACATAACACTGATTACTGGTTTCTTATACTGGACCGCTCAGTGTCTTGGC
TCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTATGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCAC
GGA

QA 2 424 2 424
DS 

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GAGTTTATTGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGCGTTGGCTCAGCTATCGCTTTTGGC
AAGCTAACCTCCGATGCCGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCAC
GCGTTTGCCTTGTTTGTTGGTGTTTCCATTGCGGCTAACATCTCTGGTGGTCACCTTAAC
CCTGCCGCGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATTACTGGTTTCTTA
TACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTATGTTACC
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GTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGAT
CCAAAGAAGGGATCGCTTGGAACCATCGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATTGTTGGTGCC
AACATCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCAAGGTCGTTCGGA
CCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTATTGGGTGGGTCCAC

QA 1 715 1 715
DS 

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ACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCGCTTGAAGGTATCG
TGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTGCACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATC
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CAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTATTGGGTGGGTCCACTCGTTG
GGGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGGTGATGTGTCCATTGGTTCTTACCAAGAAGTTT
AAACCCGCGAGATCCAAGTTTGGTTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTGGCTTTGAT
TTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATGCATGTAGA
GAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATAAAAAGATGT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4F134JQ 731 0 0
TTTGTTGGTGTTTCCATTGCGGCTAACATCTCTGGTGGTCACCTTAACCCTGCCGCGACT
CTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATTACTGGTTTCTTATACTGGATCGCT
CAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTATGTTACCAACGGCGAGAGC
GTACCAACCCACGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCGCTTGAAGGTATTGTGATGGAGATC
GTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCAAAGAAGGGA
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GCTGGACTCATCTACGGTGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGAAGTTTAAACCCGCGAG
ATCCGAGTTTGGTTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTGGCTTTGATTTTGTGTTTGA
TTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATGCATGTAGAGAAAAAGTTGT
CTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATAAAAAGATGTAAATATACTTTCCAC
TTTATATGGCT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 4

CO CL2429Contig1 830 4 3 U
GGACAAGTCTAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTT
TTAGACAGAGAGAGAGAAAAAAATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGTGGTACT
GGCCATTGTAGTGGCGGTGCCTGAAGTAACTGCGAAGAAGTACACAGTCGGCGAGAACAA
GTTTTGGAACCCCAACATCAACTATACCATTTGGGCTCAGG*AAAGCATTTCTACCTCGG
AGACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGGAACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGAC
CGACTACGAAAACTGTAACGCCGACCATCCTCTCGTAAACTGGACGCGTGGAGCTGGGAG
AGACATTGTCACTCTCAACGTGACCAAACATTACTATCTTCTCGACGGAAAGGGTGGCTG
TTACGGCGGCATGAAGCTCGCTGTTAAAGTCGAGAAGCTTCCTCCTCCACCGAAAGCGGC
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GTTTGCTCTTTTCTCTGTTTCCCCGGTGTGGGACGCCATCTTAAGGATGTGGTAAATGAC
CAATGCTCGGTCCGAGTCGGACCTCTTTAGTTGGAATCCATTTTCGAGTTTAAAGAAACA
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TTGTAATGTTGGATTGTTGGTTTTTAATCTTTTGTTTTGTATGTCTCTTTGAAATCAATT
GTTGAAAAAATGTTGTATTTTGATTTACTTGAGATTGATTACATTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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ACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAAAACTGTAACGCCGACCATCCTCTCG
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ATCTACTCGACGGAAGGGGTGGCTGTTACGGCGGCATGAAGCTCGCTGTTAAAGTCGAGA
AGCTTCCTCCTCCACCGAAAGCGGCACCTGTCAAGAGCATTGGTTCAGTTTCCATGGCCA
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ATCCATTTTCGAGTTTAAAGAAACATCAAATTCTTTT

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G
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CGGTGTTGATTGCGGCAGTGGTACTGGCCATTGTAGTGGCGGTGCCTGAAGTAACTGCGA
AGAAGTACACAGTCGGCGAGAACAAGTTTTGGAACCCCAACATCAACTATACCATTTGGG
CTCAGGGAAAGCATTTCTACCTCGGAGACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGGAACCAAC
ACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAAAACTGTAACGCCGACCATCCTCTCG
TAAACTGGACGCGTGGAGCTGGGAGAGATATTGTCACTCTCAACGTGACCAAACATTGCT
ATCTACTCGACGGAAGGGGTGGCTGTTACGGCGGCATGAAGCTCGCTGTTAAAGTCGAGA
AGCTTCCTCCTCCACCGAAAGCGGCACCTGTCAAGAGCATTGGTTCAGTTTCCATGGCCA
CTGGTGTTGCTCAGTTCGTTATCCCGTTTGCTCTTTTCTCTGTTTCCACGGTGTGGGACG
CCATCTTAAGGATGTGGTAAATGACCAATGCTCGGTCCGAGTCGGACCTCTTTAGTTGGA
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TTTGTATGTCTCTTTGAAATC

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TTTTGGAACCCCAACATCAACTATACCATTTGGGCTCAGG*AAAGCATTTCTACCTCGGA
GACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGGAACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACC
GACTACGAAAACTGTAACGCCGACCATCCTTTCGTAAACTGGACGCGTGGAGCTGGGAGA
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AATGCTCGGTCCGAGTCGGACCTCTTTAGTTGGAATCCATTTTCGAGTTTAAAGAAACAT
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TTGAAAAAATGTTGTATTTTGATTTACTTGAGATTGATTACATTTAATT

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DS 



AS 1 3

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TTTTGCCGATCTCTTTTGGGAGACTGTATCCATCAAGAATACCAAATGTTACAACACAGA
GCCAGTAAATCTTATAAGCTATCGCCAGAATGTATATTCCAAAATGGTTATTTTCAAGTG
CTATATGTATGCTATGCATCATAGGCAATGGTGATAACTGATAACCATATCTGACCTTAA
AAGAAATACATGATCTGTGTTAAAAACTGTCTTTATGGCTTATAATTGATGACAGCGCAT
TGTTGCTATTAACTGGTGGAGCTAGCTTTTGCCGGGAGCAAAGCCTCTTGCTTTCCTTTG
ACAAAGACTGCGAGTTCTTCAGGTGCGACCACCATACTTAACCACTTGTGCAAATCTTCA
CCTTCTACTTTCTCTTTCTCTTCAAGTTGAGCGCCAAGTCCTTCCAATACATCTAGATTA
GCACGTACAACAAAGAGTGCAACATCGAGAGCAGATTGTAACAGATTTGTCACTTCTCTT
TGAACAAGATCAACTAGTTTCCCCTTATCTCCACCCCATGGTGAGCCTCCTGATTCGTCA
ATCCCACCACCAGAAAGTGTGGAGACAGACACAGGTCCGATTTTCTGGTTGAGACCATAT
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ATGTAAACCCCAATGCTCCTCCTGTTCTTGGCAATATACTTAATTTCTCTACACGTGGCT
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CGACCACACCCTTCTCACTGCCTTTTAATCTTGCAGTTTTCTTCTCTATGCCTGCTATTG
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CAAATCTCCCAGGGCGACGCAGAGCCGGGTCTAAGACATCAGCACGATTTGTTGCTCCAA
GAACGATAACTGCAGAATTGCTGTCAAAACCC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EU66JQ U 1
AF RR4EX29JQ U 46
AF RR4AS82TF C 646
BS 1 239 RR4EU66JQ
BS 240 240 RR4EX29JQ
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BS 734 764 RR4EX29JQ
BS 765 1352 RR4AS82TF

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CTATATGTATGCTATGCATCATAGGCAATGGTGATAACTGATAACCATATCTGACCTTAG
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CCTTCTACTTTCTCTTTCTCTTCAAGTTGAGCGCCAAGTCCTTCCAATACATCTAGATTA
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TGAACAAGATCAACTAGTTTCCCCTTATCTCCACCCCATGGTGAGCCTCCTGATTCGTCA
ATCCCACCACCAGAAAGTGTGGAGACAGACACAGGTCCGATTTTCTGGTTGAGACCATAT
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GATACCCGCCCC
GAGT

QA 1 732 1 732
DS 

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ATGTTACAACACAGGGCCAGTAAATCTTATAAGCTATCGCCAGAATGTATATTCCAAAAT
GGTTATTTTCAAGTGCTATATGTATGCTATGCATCATAGGCAATGGTGATAACTGATAAC
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TCTTGCTTTCCTTTGACAAAGACTGCGAGTTCTTCAGGTGCGACCACCATACTTAACCAC
TTGTGCAAATCTTCACCTTCTACTTTCTCTTTCTCTTCAAGTTGAGCGCCAAGTCCTTCC
AATACATCTAGATTAGCACGTACAACAAAGAGTGCAACATCGAGAGCAGATTGTAACAGA
TTTGTCACTTCTCTTTGAACAAGATCAACTAGTTTCCCCTTATCTCCACCCCATGGTGAG
CCTCCTGATTTGTCAATCCCACCACCAGAAAGTGTGGAGACAGACACAGGTCCGATTTTC
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QA 1 719 1 719
DS 

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TG
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TCTACACGTGGCTGTCCAGTAAGAAGTTTTGCAACAGCAGTACCAACCACTGCATGCCCA
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TTTGTTGCTCCAAGAACGATAACTGCAGAATTGCTGTCAAAACCC

QA 3 707 3 707
DS 



AS 1 4

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GCTTATTGCTGCTGCTCAAAAACACGAATATAATGTAATTAGATGTCCATACTACAAACT
CACAAGCCACAACACATGAATAAATAAATCCAGAACAAATCTAATCTTTAATGGTTACAA
ATGCATCACAGCTACTTTCATTATTAGTACTTCTCGTCTTGGTGCTTTGTGCTTTGTGCT
TTGAGAATCACTGTGTGGATCGTCAGAGAGGTAAAAGCAGAAGTACCAAGAGTAGAGAGA
CGTAACATAAAACAAACACCATTAGGCTAGTGGTTATACACATATACACATATGCTTGGT
ACCTCATGCTCTTAGCGTCCTGTTTTTGGACGTTTCATTGCGTTTGAATTGAATGGAGAG
ACACTACCACC*GCTTGGACCTGGACTGTTTTCTCTCAAGTTGTTCGAGTTCAGCAAAGC
AAGCTCTCGTAGTTGCTGTCTCTTGATGTAGTCCCGTGACTAATCCACAGGTTTTACTAA
CTCCTCGATGATCTCTTGGGCATGTCGCAGCTTTATATCGACAATATCAGCAGGAAGATC
AGCCTCAATGAGGATATGGAGCTGCTCATTGAGATGCTCATAGCCAGGCTTCCCTTTCAG
TTTCTCTTCTTTGTCAGGGTCCTTAATTGATCCTTTACCTCTAATAAACACACGGCAACC
CGTAGTTGCTTCCACACGCTTCAACGAGTTCCCTCTAGGCCCCAGAAGCCTTCCAACAAA
ATTGAAGTTAGGAAATGTATCAACTGGAAGATCTAAACGCAAGATACGCTTGACTGTGTA
TGCGCTTGGGCTAGCAGGTGCACCTTGCCACTCCATTGCCATTCCATGAGGACCAACCAT
TCTCTCTGGTGGAAGACCATTCCAACCACCACCATATCCAGTACCAGGAACATTAGACAT
ATGATTTGGTGAAGCCATTGGACTAGGGCTCCGATGCCTCAACCGATCAAAATCAGTAAA
CCCTTGGTTTGACATCATTCCACTAACCCGGAAAATCTCTTGGTTTAAGAGACGGCTACA
TATGGGCAAGACTTGCATGAAAGGTCCAAGCTTTTGATGCTCAGCTAGCAACTGAGTTAG
GTATTGACTGTCAACATCGGAGGGGGTTCGAATCTGGGGAGAAGCGGCTCTAGAAGGTGA
GTAGCTGGGATTATATAGACCAGACATGGGTAGAGGAGGGTTTTTGCTGCTCTCTACTGT
CTTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4AM20JQ U 2
AF RR4BA55JQ U 1
AF RR4BA55TF C 324
AF RR4AM20TF C 307
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BS 638 790 RR4BA55JQ
BS 791 1206 RR4AM20TF

RD RR4AM20JQ 702 0 0
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TGAGAATCACTGTGTGGATCGTCAGAGAGGTAAAAGCAGAAGTACCAAGAGTAGAGAGAC
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CCTCATGCTCTTAGCGTCCTGTTTTTGGACGTTTCATTGCGTTTGAATTGAATGGAGAGA
CACTACCACC*GCTTGGACCTGGACTGTTTTCTCTCAAGTTGTTCGAGTTCAGCAAAGCA
AGCTCTCGTAGTTGCTGTCTCTTGATGTAGTCCTGTGACTCATCCACAGGTTTTACTAAC
TCCTCGATGATCTCTTGGGCATGTCGCAGCTTTATATCGACAATATCAGCAGGAAGATCA
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TTCTCTTCTTTGTCAGGGTCCTTAATTGATCCTTTACCTCTAATAAACACACGGCAACCC
GTAGTTGCTTCCACACGCTTCAACGAGTTCCCTCTAGGCCCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BA55JQ 790 0 0
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CACAAGTCACAACACATGAATAAATAAATCCAGAACAAATCTAATCTTTAATGGTTACAA
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TTGAGAATCACTGTGTGGATCGTCAGAGAGGTAAAAGCAGAAGTACCAAGAGTAGAGAGA
CGTAACATAAAACAAACACCATTAGGCTAGTGGTTATACACATATACACATATGCTTGGT
ACCTCATGCTCTTAGCGTCCTGTTTTTGGACGTTTCATTGCGTTTGAATTGAATGGAGAG
ACACTACCACC*GCTTGGACCTGGACTGTTTTCTCTCAAGTTGTTCGAGTTCAGCAAAGC
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CTCCTCGATGATCTCTTGGGCATGTCGCAGCTTTATATCGACAATATCAGCAGGAAGATC
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TTTCTCTTCTTTGTCAGGGTCCTTAATTGATCCTTTCCCTCTAATAAACACACGGCAACC
CGTAGTTGCTTCCACACGCTTCAACGAGTTCCCTCTAGGCCCCAGAAGCCTTCCAACAAA
ATTGAAGTTAGGAAATGTATCAACTGGAAGATCTAAACGCAAGATACGCTTGACTGTGTA
TGCGCTTGGG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4BA55TF 807 0 0
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GACTGTTTTCTCTCAAGTTGTTCGAGTTCAGCAAAGCAAGCTCTCGTAGTTGCTGTCTCT
TGATGTAGTCCCGTGACTAATCCACAGGTTTTACTAACTCCTCGATGATCTCTTGGGCAT
GTCGCAGCTTTATATCGACAATATCAGCAGGAAGATCAGCCTCAATGAGGATATGGAGCT
GCTCATTGAGATGCTCATAGCCAGGCTTCCCTTTCAGTTTCTCTTCTTTGTCAGGGTCCT
TAATTGATCCTTTCCCTCTAATAAACACACGGCAACCCGTAGTTGCTTCCACACGCTTCA
ACGAGTTCCCTCTAGGCCCCAGAAGCCTTCCAACAAAATTGAAGTTAGGAAATGTATCAA
CTGGAAGATCTAAACGCAAGATACGCTTGACTGTGTATGCGCTTGGGCTAGCAGGTGCAC
CTTGCCACTCCATTGCCATTCCATGAGGACCAACCATTCTCTCTGGTGGAAGACCATTCC
AACCACCACCATATCCAGTACCAGGAACATTAGACATATGATTTGGTGAAGCCATTGGAC
TAGGGCTCCGATGCCTCAACCGATCAAAATCAGTAAACCCTTGGTTTGACATCATTCCAC
TAACCCGGAAAATCTCTTGGTTTAAGAGACGGCTACATATGGGCAAGACTTGCATGAAGG
GTCCAAGCTTTTGATGCTCAGCTAGCAACTGAGTTAGGTATTGACTGTCAACATCGGAGG
GGGTTCGAATCTGGGGAGAAGCGGCTC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4AM20TF 900 0 0
TCATGCTCTAGCGTCTG
TTTTGGACGTTTCATTGCGTTTGAATTGAATGGAGAGACACTACCACCCGCTTGGACCTG
GACTGTTTTCTCTCAAGTTGTTCGAGTTCAGCAAAGCAAGCTCTCGTAGTTGCTGTCTCT
TGATGTAGTCCTGTGACTCATCCACAGGTTTTACTAACTCCTCGATGATCTCTTGGGCAT
GTCGCAGCTTTATATCGACAATATCAGCAGGAAGATCAGCCTCAATGAGGATATGGAGCT
GCTCATTGAGATGCTCATAGCCAGGCTTCCCTTTCAGTTTCTCTTCTTTGTCAGGGTCCT
TAATTGATCCTTTACCTCTAATAAACACACGGCAACCCGTAGTTGCTTCCACACGCTTCA
ACGAGTTCCCTCTAGGCCCCAGAAGCCTTCCAACAAAATTGAAGTTAGGAAATGTATCAA
CTGGAAGATCTAAACGCAAGATACGCTTGACTGGGTATGCGCTTGGGCTAGCAGGTGCAC
CTTGCCACTCCATTGCCATTCCATGAGGACCAACCATTCTCTCTGGTGGAAGACCATTCC
AACCACCACCATATCCAGTACCAGGAACATTAGACATATGATTTGGTGAAGCCATTGGAC
TAGGGCTCCGATGCCTCAACCGATCAAAATCAGTAAACCCTTGGTTTGACATCATTCCAC
TAACCCGGAAAATCTCTTGGTTTAAGAGACGGCTACATATGGGCAAGACTTGCATGAAAG
GTCCAAGCTTTTGATGCTCAGCTAGCAACTGAGTTAGGTATTGACTGTCAACATCGGAGG
GGGTTCGAATCTGGGGAGAAGCGGCTCTAGAAGGTGAGTAGCTGGGATTATATAGACCAG
ACATGGGTAGAGGAGGGTTTTTGCTGCTCTCTACTGTCTTCCC

QA 18 900 18 900
DS 



AS 1 4

CO CL2432Contig1 602 4 2 U
GGACCTTATCCAGAAACTAAACTTCAAATGACTGTCTGAAGGCGAAATCCTTCTGTACCA
AGAAGATGTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAG
TTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATCAAACACGGTGGAGACCAAGAACA
GAGTCTCTCTCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAGAGCAGCGATTGTGAAGG
CAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAACCGCCTA
AGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGCTAAAGAAAAGCTGCTGCTGGAAC
AGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTAAGGAGGAAACGTCTGGTTCGTA
AGCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGATAGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATG
TCTAGAGATGACTCTCTTCCCTGTCTCAACTTTTCTTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCC
GGAATTTGAAATGTAGACATTTGTTTTGGATTAAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTTACT
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 

AF RR4EA71TF U 1
AF RR4GR44JQ C 36
AF RR4GR44TF U 36
AF RR4EA71JQ C 10
BS 1 600 RR4EA71TF
BS 601 602 RR4EA71JQ

RD RR4EA71TF 602 0 0
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AGAAGATGTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAG
TTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATCAAACACGGTGGAGACCAAGAACA
GAGTCTCTCTCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAGAGCAGCGATTGTGAAGG
CAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAACCGCCTA
AGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGCTAAAGAAAAGCTGCTGCTGGAAC
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AGCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGATAGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATG
TCTAGAGATGACTCTCTTCCCTGTCTCAACTTTTCTTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCC
GGAATTTGAAATGTAGACATTTGTTTTGGATTAAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTTACT
CG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4GR44JQ 566 0 0
GG
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TCTCTTTCCTCCAAGGCTTCAAGTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATC
AAACACGGTGGAGACCAAGAACAGAGTTTTTTTCAGTGGGTACAGCTTGAGCATCAGCAA
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CGAGAGCAGTGAGGAACCGCCTAAGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGC
TAAAGAAAAGCTGCTGCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCT
AAGGAGGAAACGTTTGGTTTGTAAGCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGATGGCCCCCTTC
CAAGATGAGGAAGCTCAAGAATGTCTAGAGATGACTTTTTTCCCTGTTTCAACTTTTCTT
GTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATTTGAAATGTAGACATTTGTTTTGGATTAAATT
TCAAGCTGAGAGAGTTCTTTACT
T

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4GR44TF 566 0 0
GG
GAAGGCGAAATCCTTCTGTACCAAGAAGATGTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCC
TCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAGTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATC
AAACACGGTGGAGACCAAGAACAGAGTCTCTCTCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAA
TGGAAGAGCAGCGATTGTGAAGGCAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCC
CGAGAGCAGTGAGGAACCGCCTAAGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGC
TAAAGAAAAGCTGCTGCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCT
AAGGAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGATGGCCACCTTC
CAAGATGAGGAAGCTCAAGAATGTCTAGAGATGACTCTCTTCCCTGTCTCAACTTTTCTT
GTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATTTGAAATGTAGACATTTGTTTTGGATTAAATC
TCAAGCTGAGAGAGTTCTTTACT
T

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4EA71JQ 593 0 0
CCAGAAACTAAACTTCAAATGACTGTCTGAAGGCGAAATCCTTCTGTACCAAGAAGATGT
CTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAGTTTCGTCTT
TCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATCAAACACGGTGGAGACCAAGAACAGAGTCTCTC
TCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAGAGCAGCGATTGTGAAGGCAGCTGCTT
CTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAACCGCCTAAGACTGTTG
ACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGCTAAAGAAAAGCTGCTGCTGGAACAGAGGATGA
AGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTAAGGAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGT
TGAGGAAGAAGGGTCGATAGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTCTAGAGAT
GACTCTCTTCCCTGTCTCAACTTTTCTTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATTTGA
AATGTAGACATTTGTTTTGGATTAAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTTACTCG

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 4

CO CL2433Contig1 583 4 13 U
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GTAGTCCTCGTTTTTTCCGTCTTGCACTAAATATATTTCCGCTGCTTAAATCAAACTTCT
GACGTCTTATCATCATGGGTTTGAAGGAGGACTTCGAGGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGA
AGCTCACAACGAGCCCCTCGAACGAGGACTTGCTCATCCTTTACGGACTCTACAAGCAAG
CCACTGTCGGACCAGTCACCACCAGTCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCA
AGTGGGATGCTTGGAAAGCTGTTGAAGGTAAATCGACTGACGAAGCAATGAGTGACTACA
TCACTAAGGTGAAGCAACTCCTTGAAGCAGAGGCTGCCTCGGCTTCAACTTGATGAATAT
TTACATAAATGATTCATCCTCTGTTTGCAGTGGTTCAATATTTACATAAATGATTCATTT
TTAAGACTTGTTCTTCTTGCTTCTTGTGTTTCTATCGTTTATGAATCTTTTATTTTACTT
TGTGAACTTGATCTTGATTTAAAATGTCATATGGTTTGGACAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4B666TF U 222
AF RR4B666JQ C 1
AF RR4B785JQ C 1
AF RR4B785TF U 1
BS 1 26 RR4B785TF
BS 27 27 RR4B666JQ
BS 28 71 RR4B785TF
BS 72 72 RR4B666JQ
BS 73 74 RR4B785TF
BS 75 75 RR4B666JQ
BS 76 220 RR4B785TF
BS 221 221 RR4B666JQ
BS 222 444 RR4B785TF
BS 445 445 RR4B666JQ
BS 446 479 RR4B785TF
BS 480 480 RR4B666JQ
BS 481 583 RR4B785TF

RD RR4B666TF 155 0 0
TACGGACTCTACAAGCAAGCCACTGTCGGACCAGTCACCACCAGTCGTCCTGGAATGTTC
AGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAAGCTGTTGAAGGTAAATCGACTGAC
GAAGCAATGAGTGACTACATCACTAAGGTGAAGCA

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR4B666JQ 583 0 0
GGTCATTAAAAACATATTCGAGAGTGGGAGTGTGTAGCCAATATATAAGACCCAGCACGC
GTAGTCCTCGTTTTTTCCGTCTTGCACTAAATATATTTCCGCTGCTTAAATCAAACTTCT
GACGTCTTATCATCATGGGTTTGAAGGAGGACTTCGAGGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGA
AGCTCACAACGAGCCCCTCGAACGAGGACTTGCTCATCCTTTACGGACTTTACAAGCAAG
CCACTGTCGGACCAGTCACCCCCAGTCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCA
AGTGGGATGCTTGGAAAGCTGTTGAAGGTAAATCGACTGACGAAGCAATGAGTGACTACA
TCACTAAGGTGAAGCAACTCCTTGAAGCAGAGGCTGCCTCGGCTTCAACTTGATGAATAT
TTACATAAATGATTCATCCTCTGTTTGCAGTGGTTCAATATTTACATAAATGATTCATTT
TTAAGACTTGTTTTTCTTGCTTCTTGTGTTTCTATCGTTTATGAATCTTTTATTTTACTT
TGTGAACTTGATCTTGATTTAAAATGTCATATGGTTTGGACAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4B785JQ 583 0 0
GGTCATTAAAAACATATTCGAGAGTGGGAGTGTGTAGCCAATATATAAGACCCAGCACGC
GTAGTCCTCGTTTTTTCCGTCTTGCACTAAATATATTTCCGCTGCTTAAATCAAACTTCT
GACGTCTTATCATCATGGGTTTGAAGGAGGACTTCGAGGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGA
AGCTCACAACGAGCCCCTCGAACGAGGACTTGCTCATCCTTTACGGACTTTACAAGCAAG
CCACTGTCGGACCAGTCACCCCCAGTCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCA
AGTGGGATGCTTGGAAAGCTGTTGAAGGTAAATCGACTGACGAAGCAATGAGTGACTACA
TCACTAAGGTGAAGCAACTCCTTGAAGCAGAGGCTGCCTCGGCTTCAACTTGATGAATAT
TTACATAAATGATTCATCCTCTGTTTGCAGTGGTTCAATATTTACATAAATGATTCATTT
TTAAGACTTGTTCTTCTTGCTTCTTGTGTTTCTATCGTTTATGAATCTTTTATTTTACTT
TGTGAACTTGATCTTGATTTAAAATGTCATATGGTTTGGACAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4B785TF 583 0 0
GGTCATTAAAAACATATTCGAGAGTGCGAGTGTGTAGCCAATATATAAGACCCAGCACGC
GTAGTCCTCGTCTTCTCCGTCTTGCACTAAATATATTTCCGCTGCTTAAATCAAACTTCT
GACGTCTTATCATCATGGGTTTGAAGGAGGACTTCGAGGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGA
AGCTCACAACGAGCCCCTCGAACGAGGACTTGCTCATCCTCTACGGACTCTACAAGCAAG
CCACTGTCGGACCAGTCACCACCAGTCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCA
AGTGGGATGCTTGGAAAGCTGTTGAAGGTAAATCGACTGACGAAGCAATGAGTGACTACA
TCACTAAGGTGAAGCAACTCCTTGAAGCAGAGGCTGCCTCGGCTTCAACTTGATGAATAT
TTACATAAATGATTCATCCTCTGTCTGCAGTGGTTCAATATTTACATAAATGATTCATTC
TTAAGACTTGTTCTTCTTGCTTCTTGTGTTTCTATCGTTTATGAATCTTTTATTTTACTT
TGTGAACTTGATCTTGATTTAAAATGTCATATGGTTTGGACAT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

CO CL2434Contig1 1189 4 18 U
GGACTTGTTAACATTCCTACAAACTGTAGCCAAGAAGACCATTCATTCCTTTTGTGCTAT
GATTATCATGTGAGATGAATGAGATATCTCTTACTAGCTTATTCTTTGTTCTGTAATAAG
ATTTAGAAAGAAAAGATGGGTAGATCACCGTGCTGTGACAAGATGGGTTTGAAGAAAGGA
CCATGGACATCATAAGAAGATCAGAAACTTTTGGCTTATATTGAAGAACATGGGCATGGA
AGTTGGCGTTCACTGCCTGAGAAAGCTGGTCTCCATAGATGCGGCAAAAGTTGTAGACTC
AGATGGACTAACTACCTAAGACCAGACATCAAAAGAGGCAAATTCAACTTGCAAGAAGAA
CAAACCATTATTCAACTCCACGCTCTCTTAGGAAACAGGTGGTCGGCGATAGCGACTCAT
TTGCCAAAGAGAACAGACAACGAGATAAAGAACTGCTGGAACACGCACTTGAAGAAACGG
TTAGTTAAAATGGGGATAGATCCAGTGACTCATAAACCCAAAAACGAGACTCCTCTGTCT
TCTTCTCTCGGTGGTTTATCAAAGAACGCAGCCACACTTAGCCACATGGCTCAATGGGAA
AGTGCTAGGCTTGAAGCTGAAGCAAGGCTAGCTAGAGAGTCAAAGCTTCTTCTTTACCAA
ACCAAAGTATCATCATCATCATCTTCTCATCATCATCAGCAGCAGCTTGAATCTCCGACA
TCTACAGTGTCATTCTCGGAAGCGAAGACAGAGTTCGTCGGATCATCATCATCATCAACG
TGTCTAAATATGATCAAAGAAGCTGAAAACGATGGGATCAGTTCAACGATTCACGAGTTC
CAAGGAGTCGAAGAAGGGCTCACGGGTCTCTTGCTAGGTGGCGGTGATTCGCTTGGCCGG
AGTTTCTCAACCGATAAAAATGAGACGGCTGGCGAGACTAGTGGTGACTGTAACAACGGT
TACTATGAGGACAACAAGAACTATTTGGACAGCATTTTCAGCTTTGTGGATCCTTCGCCG
TCCGATTCAGCTCCTTTGTTCTGAATCAAGGGCTGATATCTCTCTAGAGGAATGTTTTGG
ATTCTTTTTTTCTTTTGTCAACGAATGTTTTGGATTCTTTTAGTTCTTAATTTGTGGGAT
GTGTAAACTCTCTGATTAGATAAAAAAGTTTTTTAATCTGTTTTTTTTT


BQ
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TCTTCTTCTCTCGGTGGTTTATCAAAGAACGCAGCCACACTTAGCCACATGGCTCAATGG
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TGTTTGTT

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TCAACCGATAAAAATGAGACTGCTGGCGAGACTAGTGGTGACTGTAACAACGGTTACTAT
GAGGACAACAAGAACTATTTGGACAGCATTTTCAGCTTTGTGGATCCTTCGCCGTCCGAT
TCAGCTCCTTTGTTTTGAATCAAGGGCTGATATCTCTCTAGAGGAATGTTTTGGATTCTT
TTTTTCTTTTGTCAACGAATGTTTTGGATTCTTTTAGTTCTTAATTTGTGGGATGTGTAA
ACTCTCTGATTAGATAAAAAAGTTTTTTAATCTGTTTTTTTTT

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DS 



AS 1 4

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TTTCAGTAATTTGACTGATGTAATATGATGAAACATAAACAACGAAGAGAAGTGCCACAC
AAATAAATCACAACAATATTAAAGAGTCTTTGTGCTAATGGTTGCACAACACTCAGCTCT
GATGACTGAACTTAAACAAATGCACTTCTTAATGCCCAGCGTCCACATTTTCACTTGTCT
GTGTTGTGCTCTCTTTTCTCATCTGATAACATTCCATCAGTTTCGGATGCTGGCTCTCTG
TCGTATTTATGATGCCTTCTCCTTCGCATTGCTCCATCACCCTCACTTGAAGACTCTCCC
CATCGACCCCTTTTGTGTCGCCTTCTCTTTCCGCTATCCTCTGAGTCGCTGGACGAGGCT
GCACTCCTGTTGTGCCTGTGATATTTCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTTTCTCTTCCTCG
CTATCGCTTGAAGTAACCACCTCATTAGGCCTGTGATGCTTTGCATGTCTTCTTGTGGCA
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TTTAGTCTTCTCGGAATGGTCTTCCAACAGATCTGTCTTCAATTTTTCTTTTTAATC


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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW73JQ U 1
AF RR4AQ56JQ U 18
AF RR4FW73TF C 185
AF RR4AQ56TF C 440
BS 1 176 RR4FW73JQ
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BS 178 634 RR4FW73JQ
BS 635 728 RR4AQ56JQ
BS 729 830 RR4FW73TF
BS 831 1197 RR4AQ56TF

RD RR4FW73JQ 634 0 0
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TTTCAGTAATTTGACTGATGTAATATGATGAAACATAAACAACGAAGAGAAGTGCCACAC
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GATGACTGAACTTAAACAAATGCACTTCTTAATGCCCAGCGTCCACATTTTCACTTGTCT
GTGTTGTGCTCTCTTTTCTCATCTGATAACATTCCATCAGTTTCGGATGCTGGCTCTCTG
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CATCGACCCCTTTTGTGTCGCCTTCTCTTTCCGCTATCCTCTGAGTCGCTGGACGAGGCT
GCACTCCTGTTGTGCCTGTGATATTTCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTTTCTCTTCCTCG
CTATCGCTTGAAGTAACCACCTCATTAGGCCTGTGATGCTTTGCATGTCTTCTTGTGGCA
CCTTCCGCATTGTCATCATCAGAAGTCTGCCTTGAGCTATGCGACTTGTGCCTCCGGTGG
TGCCTTATCTTCATCCTGTGCTCGTCCTCTGACC

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ATGTAATATGATGAAACATAAACAACGAAGAGAAGTGCCACACAAGTAAATCACAACAAT
ATTAAAGAGTCTTTGTGCTAATGGTTGCACAACGCTCAGCTCTGATGACTGAACTTAAAC
AAATGCACTTCTTAATGCCCAGCGTCCACATTTTCACTTGTCTGTGTTGTGCTCTCTTTT
CTCATCTGATAACATTCCATCAGTTTCGGATGCTGGCTCTCTGTCGTGTTTATGATGCCT
TCTCCTTCGCATTGCTCCATCATCCTCACTTGAAGACTCTCCCCATCGACCCCTTTTGTG
TCGCCTTCTCTTTCCGCTATCCTCTGAGTCGCTGGACGAGGCTGCACTCCTGTTGTGCCT
GTGATATTTCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTTTCTCTTCCTCGCTATCGCTTGAAGTAAC
CACCTCATTAGGCCTGTGATGCTTTGCATGTCTTCTTGTGGCACCTTCCGCATTGTCATC
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GTGCTCGTCCTCTGACCCGCCGCTTTCGTACTCATCACTGCTACTTGAGGACCTTCTCTT
ATGCCTCCTGGATTTCCTGTCTTTCCTCCTGTCGCTGTCATCTGAATCAGA

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DS 

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TGTGCTCTCTTTTCTCATCTGATAACATTCCATCAGTTTCGGATGCTGGCTCTCTGTCGT
ATTTATGATGCCTTCTCCTTCGCATTGCTCCATCACCCTCACTTGAAGACTCTCCCCATC
GACCCCTTTTGTGTCGCCTTCTCTTTCCGCTATCCTCTGAGTCGCTGGACGAGGCTGCAC
TCCTGTTGTGCCTGTGATATTTCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTTTCTCTTCCTCGCTAT
CGCTTGAAGTAACCACCTCATTAGGCCTGTGATGCTTTGCATGTCTTCTTGTGGCACCTT
CCGCATTGTCATCATCAGAAGTCTGCCTTGAGCTATGCGACTTGTGCCTCCGGTGGTGCC
TTATCTTCATCCTGTGCTCGTCCTCTGACCCGCCGCTTTCGTACTCATCACTGCTACTTG
AGGACCTTCTCTTATGCCTCCTGGATTTCCTGTCTTTCCTCCTGTCGCTGTCATCTGAAT
CAGAGTGTGCATGCCTCCGGTGCTTACTGTGAGTTCTCCTTGACTTTCTTCTCACCTCGG
GGCTACTATCACTTTCAGAGCTCGATTCAGACGCATCCCTGTGTCT
C

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4AQ56TF 758 0 0
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CCTCATTAGGCCTGTGATGCTTTGCATGTCTTCTTGTGGCACCTTCCGCATTGTCATCAT
CAGAAGTCTGCCTTGAGCTATGCGACTTGTGCCTCCGGTGGTGCCTTGTCTTCATCCTGT
GCTCGTCCTCTGACCCGCCGCTTTCGTACTCATCACTGCTACTTGAGGACCTTCTCTTAT
GCCTCCTGGATTTCCTGTCTTTCCTCCTGTCGCTGTCATCTGAATCAGAGTGTGCATGCC
TCCGGTGCTTACTGTGAGTTCTCCTTGACTTTCTTCTCACCTCGGGGCTACTATCACTTT
CAGAGCTCGATTCAGACGCATCCCTGTGTCTTCGCTTCTTTGACTTCTTCTCTTTGGTTT
CAGCAGCCTTGGCAGCCGCCTCTAGCTTCTGCTCCCATTTCAGAGGAGCTTCCTTCTTCG
CAAGAATCTGTCGTTTCTTCTCTTCCACCATCTGCATGAACTTCTTGGAGTCCATTTGGA
TTCAAAAACCAGCTGAAAATCTGATGCGAGTAAAAGGTGTAAGATTAGCCCAAGAAGAGA
GGCAAGACAGAGCCTCCTGCGAAAGACAAACCACAATCGATAACGAATCGTAAGGAAAGG
AAGAGAGAGAGGAGGAGAAGACAACCGCCTAGGGCTTCGCTTTTAGTCTTCTCGGAATGG
TCTTCCAACAGATCTGTCTTCAATTTTTCTTTTTAATC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL2436Contig1 1000 4 6 U
AAGAATGGGTCGTGGAAAAATAGAGATCAAGAGGATCGAGAATGCAAATAGCAGGCAAGT
TACTTTCTCTAAGAGGCGTGCTGGTTTGCTCAAGAAGGCTCATGAGCTCTCTGTTCTTTG
CGACTCTGAGGTTGCCGTCATTGTCTTCTCCAAGTCCGGCAAGCTCTTCGAGTTCTCAAG
TACTAAGTGCATGAAGAAAACGCTTTTGAGGTACAGCAACTACAACCCTTCTTCAGATGC
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AAGGAGTGAGATCTCAAAGCTTCAAGAGAAACATTTACAAATGCAAGGTAAGGGCTTGAA
TGCTCTGTGCTTGAAAGAGCTGCAACACCTTGAACAACAACTAAATCTCTCGTTGATATC
TGTGAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAACTTGAAGAATCACGGCTCAAGGA
ACAGCGGGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGACAGGTTCAAGAACTCAGAAGTTT
TCTCCCGTCCATCAACAAAAACAATGTTCCATCCTACATCACATGCTTCGCTATAGATCC
CAAAAACTCCCTTGTAAACAACTCTGGCTTGGACGACACTAACTACAGACTCCAGAAGAC
CAATTCAGACACAACACTTCAATTGGGGTTGCCGGGAGAAGCACAGGCTAGAAGGAGGAG
TGAAGGAAGCAGAGAGAGCCCATCAAGTGATTCAGCAACAACGAGCACCACCAACTGCAC
AAAGGATCACCTGAAAACGAAAGCCAATGGTTCTCCGTTTAGCCACAGAGAAATATGGGA
GTGATGCACATAATGTTTCCTCTGTAGCAAGTATCCCATCATTTTTCAAAACCAATGTTA
CTAGAAAAGAATCCAATGTATCTCATCTCCCATTCTAGTCTCTAACTCTAACCTCACTCT
TTGTCCCTTTTTTTTTGATTAACTTGCTATCTTGTCTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FD75TF U 1
AF RR4EI80TF U 1
AF RR4EI80JQ C 410
AF RR4FD75JQ C 410
BS 1 544 RR4EI80TF
BS 545 812 RR4EI80JQ
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BS 935 935 RR4FD75JQ
BS 936 1000 RR4EI80JQ

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QA 1 273 1 273
DS 

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TGCTCTGTGCTTGAAAGAGCTGCAACACCTTGAACAACAACTAAATCTCTCGTTGATATC
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TCTC
TCGT

QA 1 544 1 544
DS 

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ACCAACTGCACAAAGGATCACCTGAAAACGAAAGCCAATGGTTTTCCGTTTAGCCACAGA
GAAATATGGGAGTGATGCACATAATGTTTCCTCTGTAGCAAGTATCCCATCATTTTTCAA
AACCAATGTTACTAGAAAAGAATCCAATGTATCTCATCTCCCATTTTAGTCTCTAACTCT
AACCTCACTCTTTGTCCCTTTTTTTTTGATTAACTTGCTATCTTGTCTCTC

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DS 

RD RR4FD75JQ 591 0 0
TCGTTGATATCTGTGAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAACTTGAAGAATCA
CGGCTCAAGGAACAGCGGGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGACAGGTTCAAGAA
CTCAGAAGTTTTCTCCCGTCCATCAACAAAAACAATGTTCCATCCTACATCACATGCTTC
GCTATAGATCCCAAAAACTCCCTTGTAAACAACTTTGGCTTGGACGACACTAACTACAGA
CTCCAGAAGACCAATTCAGACACAACACTTCAATTGGGGTTGCCGGGAGAAGCACAGGCT
AGAAGGAGGAGTGAAGGAAGCAGAGAGAGCCCATCAAGTGATTCAGCAACAACGAGCACC
ACCAACTGCACAAAGGATCACCTGAAAACGAAAGCCAATGGTTCTCCGTTTAGCCACAGA
GAAATATGGGAGTGATGCACATAATGTTTCCTCTGTAGCAAGTATCCCATCATTTTTCAA
AACCAATGTTACTAGAAAAGAATCCAATGTATCTCATCTCCCATTCTAGTCTCTAACTCT
AACCTCACTCTTTGTCCCTTTTTTTTTGATTAACTTGCTATCTTGTCTCTC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 4

CO CL2437Contig1 862 4 18 U
GGAGGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACAGAGAGAATCA
AAACAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTGA
TAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCTTGTGGGCAA
TCAAGGCCAAAAATGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGGTCCAAGCTT
CCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAACA
GACGCAAGCCTAATCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCA
TTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTCTCTTCTGGTT
TGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGT
CCTATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTTGAGAAGTTCG
ATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCT
TTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAA
CCGTGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCG
GCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGAT***TT
CATATCCCTTTTGTTTCAAGAATATCTGTGTTTCCCCCTGAGAGATTTTGGTCATCTTTT
ATAAAAACGTTATTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK27TF U 1
AF RR4AZ19TF U 2
AF RR4BA48TF U 1
AF RR4CK27JQ C 240
BS 1 8 RR4BA48TF
BS 9 9 RR4CK27TF
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BS 245 245 RR4CK27TF
BS 246 313 RR4BA48TF
BS 314 314 RR4CK27TF
BS 315 382 RR4BA48TF
BS 383 383 RR4CK27TF
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BS 482 482 RR4CK27TF
BS 483 500 RR4BA48TF
BS 501 501 RR4CK27TF
BS 502 516 RR4BA48TF
BS 517 517 RR4CK27TF
BS 518 844 RR4BA48TF
BS 845 862 RR4CK27JQ

RD RR4CK27TF 804 0 0
GGA
GGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACAGAGAGAATCAAAA
CAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTGATAA
GGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCTTGTGGGCAATCA
AGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGCCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAATCTTCCG
TTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAACAGAC
GCAAGCCTAATCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATTC
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TTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCT
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TGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCA*GACTTACCTCGGCG
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ATCCCTTT
GTTCACATATCTG

QA 4 791 4 791
DS 

RD RR4AZ19TF 812 0 0
GG
GGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACAGAGAGAATCAAAA
CAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTGATAA
GGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCTTGTGGGCAATCA
AGGCCAAAAATGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGGTCCAAGCTTCCG
TCGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAACAGAC
GCAAGCCTAAGCCTGCCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATTC
TTGCCGGTAGATTCAAGGGTAAGAGAGTTGTCTTCCTCAAGCAGCTCTCTTCTGGTTTGC
TTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCGT
ATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTTGAGAAGTTCGATG
ACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCTTTG
AAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGGAAACCG
TGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCG
CCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGAT***TTCAT
ATCCCTTTTGTTTCAAGAATATCTGTGTTT

QA 3 812 3 812
DS 

RD RR4BA48TF 844 0 0
GGAGGGGTCGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACAGAGAGAATCA
AAACAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTGA
TAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCTTGTGGGCAA
TCAAGGCCAAAAATGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGGTCCAAGCTT
CCGTCGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAACA
GACGCAAGCCTAAGCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCA
TTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGTAAGAGAGTTGTCTTCCTCAAGCAGCTCTCTTCTGGTT
TGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGT
CGTATGTGATTGGAACCTCC*CAAAGGTTGACATTT*TGGAGTCAACGTTGAGAAGTTCG
ATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCT
TTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAA
CCGTGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCG
GCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGAT***TT
CATATCCCTTTTGTTTCAAGAATATCTGTGTTTCCCCCTGAGAGATTTTGGTCATCTTTT
ATAA

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR4CK27JQ 623 0 0
TCCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAAC
AGACGCAAGCCTAATCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATC
ATTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTTTTTTTTGGT
TTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAG
TCCTATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTTTGGAGTCAACGTTGAGAAGTTC
GATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTT
TTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAA
ACCGTGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTC
GGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTTTAGAAGATT
TCATATCCCTTTTGTTTCAACAATATCTGTGTTTCCCCCTGAGAGATTTTGGTCATCTTT
TATAAAAACGTTATTTTTTTTTT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

CO CL2438Contig1 673 3 22 U
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GCTCATCCGCGGCGTGTTTTCAGTGTTGAGCAGTAGAGCTGAGAACGTAAGCAACTTTCT
GGAGATTGATTCATTGTTTGGTCCGGATTCTCGGCTTGTGTACAAACACTATGCTACTCT
CTACTTCGTGCTTGTTTTTGATGGATCAGAGAATGAGCTTGCTATGCTTGATCTCATTCA
ACTTCTTGTTGAAACTCTGGACAAATGCTTCAGCAATGTTTGTGAACTCGACATTGTGTT
CAACTACAGCAAGATGCACACAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTACTGGA
AACTAGGTCCGATGAAGTCATCAAGGCTGTTGAAGTAATATCCAAATTAGAAGCTGCCTC
TAACTCCATTTCACTTGTCCCCAAGTCTGTTTCCGGCTGGCGAGGAGGAGGCCGATAGCT
TCAAGACATGCCTGAACCGTGACAGAGAACAAGTCAAGATTCCAAACTATGTTAAAAATG
TTTTTTTTTT*CTTTCAGGTCTCCAAAAGTTTAGTTCATCACTCTTTGTAATTCGTTTCT
TCCTTTTTAGTGTTTTGTTTATATGATAGTATATTGTTTCCTCCGTTTGCTTGAAAATGC
GACTCATTGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FO57TF U 1
AF RR4EO58JQ C 80
AF RR4EO58TF U 80
BS 1 97 RR4FO57TF
BS 98 98 RR4EO58TF
BS 99 133 RR4FO57TF
BS 134 134 RR4EO58TF
BS 135 135 RR4FO57TF
BS 136 136 RR4EO58TF
BS 137 140 RR4FO57TF
BS 141 141 RR4EO58TF
BS 142 241 RR4FO57TF
BS 242 242 RR4EO58TF
BS 243 311 RR4FO57TF
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BS 396 396 RR4EO58TF
BS 397 415 RR4FO57TF
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BS 630 673 RR4EO58TF

RD RR4FO57TF 631 0 0
GCAAGGCAAGCCACGTGTAGCCAAATTTTACGACTTCTTGGCTGTAGAGAAGCAACAAGA
GCTCATCCGCGGCGTGTTTTCAGTGTTGAGCAGTAGACCTGAGAACGTAAGCAACTTTCT
GGAGATTGATTCACTATTTGTTCCGGATTCTCGGCTTGTGTACAAACACTATGCTACTCT
CTACTTCGTGCTTGTTTTTGATGGATCAGAGAATGAGCTTGCTATGCTTGATCTCATTCA
AGTTCTTGTTGAAACTCTGGACAAATGCTTCAGCAATGTTTGTGAACTCGACATTGTGTT
CAACTACAGCAGGATGCACACAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTACTGGA
AACTAGGTCCGATGAAGTCATCAAGTCTGTTGAAGAAATATCCAAATTAGAAGCTACCTC
TAACTCCATTTCACTTGTCCCCAAGTCTGTTTCCGGCTGGCGAGGAGGAGGCCGATAGCT
TCAAGACATGCCTGAACCGTGACAGAGAACAAGTCAAGATTCCAAACTATGTTAAAAATG
TTTTTTTTTTTCTTTCAGGTCTCCAAAAGTTTAGTTCATCACTCTTTGTAATTCGTTTCT
TCCTTTTTAGTGTTTTGTTTATATGATAG
AA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4EO58JQ 594 0 0
G
CAGTGTTGAGCAGTAGAGCTGAGAACGTAAGCAACTTTCTGGAGATTGATTCATTGTTTG
GTCCGGATTCTCGGCTTGTGTACAAACACTATGCTACTCTCTACTTCGTGCTTGTTTTTG
ATGGATCAGAGAATGAGCTTGCTATGCTTGATCTCATTCAACTTCTTGTTGAAACTCTGG
ACAAATGCTTCAGCAATGTTTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACA
CAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTACTGGAAACTAGGTCCGATGAAGTCA
TCAAGGCTGTTGAAGTAATATCCAAATTAGAAGCTGCCTCTAACTCCATTTCACTTGTCC
CCAAGTCTGTTTCCGGCTGGCGAGGAGGAGGCCGATAGCTTCAAGACATGCCTGAACCGT
GACAGAGAACAAGTCAAGATTCCAAACTATGTTAAAAATGTTTTTTTTTT*CTTTCAGGT
CTCCAAAAGTTTAGTTCATCACTCTTTGTAATTCGTTTCTTCCTTTTTAGTGTTTTGTTT
ATATGATAGTATATTGTTTCCTCCGTTTGCTTGAAAATGCGACTCATTGCACC

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR4EO58TF 594 0 0
G
CAGTGTTGAGCAGTAGAGCTGAGAACGTAAGCAACTTTCTGGAGATTGATTCATTGTTTG
GTCCGGATTCTCGGCTTGTGTACAAACACTATGCTACTCTCTACTTCGTGCTTGTTTTTG
ATGGATCAGAGAATGAGCTTGCTATGCTTGATCTCATTCAACTTCTTGTTGAAACTCTGG
ACAAATGCTTCAGCAATGTTTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACA
CAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTACTGGAAACTAGGTCCGATGAAGTCA
TCAAGGCTGTTGAAGTAATATCCAAATTAGAAGCTGCCTCTAACTCCATTTCACTTGTCC
CCAAGTCTGTTTCCGGCTGGCGAGGAGGAGGCCGATAGCTTCAAGACATGCCTGAACCGT
GACAGAGAACAAGTCAAGATTCCAAACTATGTTAAAAATGTTTTTTTTTT*CTTTCAGGT
CTCCAAAAGTTTAGTTCATCACTCTTTGTAATTCGTTTCTTCCTTTTTAGTGTTTTGTTT
ATATGATAGTATATTGTTTCCTCCGTTTGCTTGAAAATGCGACTCATTGCACC

QA 2 594 2 594
DS 



AS 1 4

CO CL2439Contig1 1102 4 2 U
GGGTCGTCTCAATTTCTTCCTCACTTCGTTCTTCACGTCTCGAGAAAAATGGGAAGCCAA
CAAGCAGCGGTTTCGTTCCTCTCCAACCTAGCGAAGGCGGCTTTCGGCCTTGGAACGGCG
GCGACGGTGCTGAACACGTCGCTGTACACCGTTGACGGCGGAGAGAGAGCTGTGATCTTC
GATCGATTCAGAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGGACTCACTTCCTGATCCCG
ATTCTGCAGAAGCCCCACATCTTCGACATCCGCACGAAGCCTCACACGTTCTCTTCCATC
TCCGGTACGAAGGATCTTCAGATGGTCAATCTCACCCTCCGTGTTCTCTCTCGCCCTGAG
GTTGTGCGTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTTAGAGTACGACGAGAAGGTTCTTC
CTTCGATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTCGCACAGTTCAACGCTGACCAGCTCC
TCACCGAGCGTCCTCACGTCTCGGCGCTTGTCCGCGAATCGCTGATCAAACGTGCCAAAG
ACTTCAACATTGTGCTCGACGATGTCGCCATCACGCACTTGTCGTACGGTTACGAGTTCT
CGAAGGCTGTTGAGCAGAAACAGGTGGCGCAGCAGGAGGCGGAGAGGTCTAAGTTTGTGG
TGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGGGCTGCGGTTATAAGAGCTGAAGGTGAGAGCGAAG
CTGCGCAGCTGATTTCTGACGCTACGGCTAAAGCTGGGATGGGGCTTATCGAGCTTAGGA
GGATTGAGGCTTCGAGGGAGGTTGCAGCTACGCTTGCTAGGTCTCCTAATGTGGCTTACT
TGCCCGGTGGGCAGAGCATGCTCTTTTCTCTGAACCGTTGATCAGAACTAAATGGTTATG
GGGAACATCTACGATGTTTTAGTGATTAAGTTGTGAATCTGGATTTAATGAAATGGTGAA
ATGCTCTTTGGTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTTGGCCAA
AATGCTCTTTGAATTATATAACACTTTCGTTGTTTGAGATCTATCTTTTTCAATAAATAA
ACACAAGACTGTCTCAATTCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GQ08TF U 1
AF RR4GP72TF U 1
AF RR4GQ08JQ C 248
AF RR4GP72JQ C 423
BS 1 509 RR4GP72TF
BS 510 1102 RR4GQ08JQ

RD RR4GQ08TF 245 0 0
GGGTCGTCTCAATTTCTTCCTCACTTCGTTCTTCACGTCTCGAGAAAAATGGGAAGCCAA
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GCGACGGTGCTGAACACGTCGCTGTACACCGTTGACGGCGGAGAGAGAGCTGTGATCTTC
GATCGATTCAGAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGGACTCACTTCCTGATCCCG
ATTCT

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR4GP72TF 509 0 0
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CAAGCAGCGGTTTCGTTCCTCTCCAACCTAGCGAAGGCGGCTTTCGGCCTTGGAACGGCG
GCGACGGTGCTGAACACGTCGCTGTACACCGTTGACGGCGGAGAGAGAGCTGTGATCTTC
GATCGATTCAGAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGGACTCACTTCCTGATCCCG
ATTCTGCAGAAGCCCCACATCTTCGACATCCGCACGAAGCCTCACACGTTCTCTTCCATC
TCCGGTACGAAGGATCTTCAGATGGTCAATCTCACCCTCCGTGTTCTCTCTCGCCCTGAG
GTTGTGCGTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTTAGAGTACGACGAGAAGGTTCTTC
CTTCGATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTCGCACAGTTCAACGCTGACCAGCTCC
TCACCGAGCGTCCTCACGTCTCGGCGCTT

QA 1 509 1 509
DS 

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CGAAGGATCTTCAGATGGTCAATCTCACCCTCCGTGTTCTCTCTCGCCCTGAGGTTGTGC
GTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTTAGAGTACGACGAGAAGGTTCTTCCTTCGAT
TGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTCGCACAGTTCAACGCTGACCAGCTCCTCACCGA
GCGTCCTCACGTCTCGGCGCTTGTCCGCGAATCGCTGATCAAACGTGCCAAAGACTTCAA
CATTGTGCTCGACGATGTCGCCATCACGCACTTGTCGTACGGTTACGAGTTCTCGAAGGC
TGTTGAGCAGAAACAGGTGGCGCAGCAGGAGGCGGAGAGGTCTAAGTTTGTGGTGATGAA
GGCTGATCAGGAGAGGAGGGCTGCGGTTATAAGAGCTGAAGGTGAGAGCGAAGCTGCGCA
GCTGATTTCTGACGCTACGGCTAAAGCTGGGATGGGGCTTATCGAGCTTAGGAGGATTGA
GGCTTCGAGGGAGGTTGCAGCTACGCTTGCTAGGTCTCCTAATGTGGCTTACTTGCCCGG
TGGGCAGAGCATGCTCTTTTCTCTGAACCGTTGATCAGAACTAAATGGTTATGGGGAACA
TCTACGATGTTTTAGTGATTAAGTTGTGAATCTGGATTTAATGAAATGGTGAAATGCTCT
TTGGTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTTGGCCAAAATGCTC
TTTGAATTATATAACACTTTCGTTGTTTGAGATCTATCTTTTTCAATAAATAAACACAAG
ACTGTCTCAATTCAC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4GP72JQ 680 0 0
TCGATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTCGCACAGTTCAACGCTGACCAGCTCCTC
ACCGAGCGTCCTCACGTCTCGGCGCTTGTCCGCGAATCGCTGATCAAACGTGCCAAAGAC
TTCAACATTGTGCTCGACGATGTCGCCATCACGCACTTGTCGTACGGTTACGAGTTCTCG
AAGGCTGTTGAGCAGAAACAGGTGGCGCAGCAGGAGGCGGAGAGGTCTAAGTTTGTGGTG
ATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGGGCTGCGGTTATAAGAGCTGAAGGTGAGAGCGAAGCT
GCGCAGCTGATTTCTGACGCTACGGCTAAAGCTGGGATGGGGCTTATCGAGCTTAGGAGG
ATTGAGGCTTCGAGGGAGGTTGCAGCTACGCTTGCTAGGTCTCCTAATGTGGCTTACTTG
CCCGGTGGGCAGAGCATGCTCTTTTCTCTGAACCGTTGATCAGAACTAAATGGTTATGGG
GAACATCTACGATGTTTTAGTGATTAAGTTGTGAATCTGGATTTAATGAAATGGTGAAAT
GCTCTTTGGTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTTGGCCAAAA
TGCTCTTTGAATTATATAACACTTTCGTTGTTTGAGATCTATCTTTTTCAATAAATAAAC
ACAAGACTGTCTCAATTCAC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL2440Contig1 686 4 2 U
TTTTTTCCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCATAAAAATGTCTCACAGAACC
ACTGTGACTGTGTACTTAGTGTTAATATAGTAAGAAAATATTTATTGGAATACAAAATTC
CATTTAGACAAAAATAATAAAATTTGGTTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTA
TTTTACAAGTCTCAAAACATTGTTGATTTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTCAACAAAAC
TTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGTC
AAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCTTTCAACGTAAGTTCGTCT
ACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGCCA
ATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATCAGAACTGCAGATTTTGTGGCT
GCCTTGGCGCGATCTAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTCT
TTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCAGCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCCA
AACAGTCCAGTGTTGTCAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATAT
TCGTTCAGAATACGGAGATATAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4HB15JQB U 87
AF RR4HB15TF C 87
AF RR4E340TF C 1
AF RR4E340JQ U 7
BS 1 6 RR4E340TF
BS 7 686 RR4E340JQ

RD RR4HB15JQB 530 0 0
G
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TCCAAATTCATCAAAACTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCTAAATGCTTCTGG
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GCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAGTCCAGTGTT
CC

QA 2 528 2 528
DS 

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G
TAGTAAGAAAATATTTATTGGAATACAAAATTCCATTTAGACAAAAATAATAAAATTTGG
TTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTATTTTACAAGTCTCAAAACATTGTTGAT
TTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTCAACAAAACTTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGA
ACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTG
AAATCTGTAATGTCTTTCAACGTAAGTTCGTCTACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGT
TTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGAT
TCCAAATTCATCAGAACTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCTAGATGCTTCTGG
TTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTCTTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCA
GCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAGTCCAGTGTT
CC

QA 2 528 2 528
DS 

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TTTTTTCCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCATAAAAATGTCTCACAGAACC
ACTGTGACTGTGTACTTAGTGTTAATATAGTAAGAAAATATTTATTGGAATACAAAATTC
CATTTAGACAAAAATAATAAAATTTGGTTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTA
TTTTACAAGTCTCAAAACATTGTTGATTTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTCAACAAAAC
TTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGTC
AAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCTTTCAACGTAAGTTCGTCT
ACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGCCA
ATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATCAGAACTGCAGATTTTGTGGCT
GCCTTGGCGCGATCTAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTCT
TTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCAGCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCCA
AACAGTCCAGTGTTGTCAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATAT
TCGTTCAGAATACGGAGATATAGCCC

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DS 

RD RR4E340JQ 680 0 0
CCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCATAAAAATGTCTCACAGAACCACTGTG
ACTGTGTACTTAGTGTTAATATAGTAAGAAAATATTTATTGGAATACAAAATTCCATTTA
GACAAAAATAATAAAATTTGGTTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTATTTTAC
AAGTCTCAAAACATTGTTGATTTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTCAACAAAACTTGCTG
CTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGTCAAAGGC
TTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCTTTCAACGTAAGTTCGTCTACTGTC
TTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCT
TCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATCAGAACTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTG
GCGCGATCTAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTCTTTAGCT
GCTAATTCAATTGCTTTTGCAGCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAGT
CCAGTGTTGTCAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATATTCGTTC
AGAATACGGAGATATAGCCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

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GAGGAAACCAGTGGATATGACTCAGCCACCAGGTCAAGAGAACTTAGTTTCGTGGACTAG
GTCTCTTCTCACGAGCAGAGAAGGGCTTGAAGCTATTATAGACCAGTCTTTAGGACAACC
C*GAGATTCCGTTCGATAGCATAGCTAAAGTCGCTGCGATAGCTTCGATGTGCGTTCAAC
CTGAAGTATCGCACCGTCCTTTCATGGGAGAGGTAGTGCAAGCTTTGAAACTTGTGTGCA
ACGAATGCGACGAAGCTAAGGAGCTCAACTCTGTAGCTTCGCTTACTCAAGATGAGAATC
GAGCCGAGAGCTCTTGTGGTGGAGAAGGCTCGGGGAGGATGGCTAGGTATCCGTTGCTAC
CGAGTTATGACTCTGAGCCTGACACGGAGAGAGGGATTTCTGTGTCGGAGATGTTCACTG
GTTCAGGGAGGTTAGAGAGACAGTCTAACTCGGGTCCCTTGGCTTCAGGTCGAGGCAAGA
GGTTCTGGCAGAAGATGAGGAGGTTGTCGACGGGAAGCTTGAGCGAGCACGGGTCAGCAT
CGCTCATGTTACGATCTGGTTCGCGTTGAAAGATCGTTTCCGGTTACAGAACATTGGGGG
CTT*CTGATTTGCCGTAAGTTAAGAAAGGAAAAGGAAAGAGAGTGTCTCTTGTGATACAA
GCAAGCAACTCTTTACCTTCTGGATACCGGTTAAGGAACAGATTGGAAGAGATCATTCCC
GGTTAATTAGTCATATTTGTATCTTAGACGAAACAAGAGATTCTGTTTGATCTTAATTTC
AATGTACATATCACGTTAAAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G565TF U 1
AF RR4GB31TF U 88
AF RR4G565JQ C 152
AF RR4FP27JQ C 155
BS 1 641 RR4G565TF
BS 642 642 RR4GB31TF
BS 643 684 RR4G565TF
BS 685 694 RR4GB31TF
BS 695 695 RR4G565JQ
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BS 738 753 RR4GB31TF
BS 754 865 RR4G565JQ

RD RR4G565TF 684 0 0
GCTTTTGGTGAAGAGTGGTGTGTACAGCTACGGAGTTGTGCTTCTGGAGCTACTCACGGG
GAGGAAACCAGTGGATATGACTCAGCCACCAGGTCAAGAGAACTTAGTTTCGTGGACTAG
GTCTCTTCTCACGAGCAGAGAAGGGCTTGAAGCTATTATAGACCAGTCTTTAGGACAACC
C*GAGATTCCGTTCGATAGCATAGCTAAAGTCGCTGCGATAGCTTCGATGTGCGTTCAAC
CTGAAGTATCGCACCGTCCTTTCATGGGAGAGGTAGTGCAAGCTTTGAAACTTGTGTGCA
ACGAATGCGACGAAGCTAAGGAGCTCAACTCTGTAGCTTCGCTTACTCAAGATGAGAATC
GAGCCGAGAGCTCTTGTGGTGGAGAAGGCTCGGGGAGGATGGCTAGGTATCCGTTGCTAC
CGAGTTATGACTCTGAGCCTGACACGGAGAGAGGGATTTCTGTGTCGGAGATGTTCACTG
GTTCAGGGAGGTTAGAGAGACAGTCTAACTCGGGTCCCTTGGCTTCAGGTCGAGGCAAGA
GGTTCTGGCAGAAGATGAGGAGGTTGTCGACGGGAAGCTTGAGCGAGCACGGGTCAGCAT
CGCTCATGTTACGATCTGGTTCGCGTTGAAAGATCGTTTCCCGTTACAGAACATTGGGGG
CTT*CTGATTTGCCGTAAGTTAAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4GB31TF 668 0 0
ACCAGGTCAAGAGAACTTAGTTTCGTGGACTAGGTCTCTTCTCACGAGCAGAGAAGGGCT
TGAAGCTATTATAGACCAGTCTTTAGGACAACCC*GAGATTCCGTTCGATAGCATAGCTA
AAGTCGCTGCGATAGCTTCGATGTGCGTTCAACCTGAAGTATCGCACCGTCCTTTCATGG
GAGAGGTAGTGCAAGCTTTGAAACTTGTGTGCAACGAATGCGACGAAGCTAAGGAGCTCA
ACTCTGTAGCTTCGCTTACTCAAGATGAGAATCGAGCCGAGAGCTCTTGTGGTGGAGAAG
GCTCGGGGAGGATGGCTAGGTATCCGTTGCTACCGAGTTATGACTCTGAGCCTGACACGG
AGAGAGGGATTTCTGTGTCGGAGATGTTCACTGGTTCAGGGAGGTTAGAGAGACAGTCTA
ACTCGGGTCCCTTGGCTTCAGGTCGAGGCAAGAGGTTCTGGCAGAAGATGAGGAGGTTGT
CGACGGGAAGCTTGAGCGAGCTCGGGTCAGCATCGCTCATGTTACGATCTGGTTCGCGTT
GAAAGATCGTTTCCGGTTACAGAACATTGGGGGGTTTCTGATTTGCCGTAAGTTAAGAAA
GGAAAAG*AAAGAGAGTGTCTCTTGTGATACAAGCAAGCAACTCTTTAC*TTCTGGATAC
CGGTTA
GG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4G565JQ 714 0 0
GCT
ATTATAGACCAGTCTTTAGGACAACCCCGAGATTCCGTTCGATAGCATAGCTAAAGTCGC
TGCGATAGCTTCGATGTGCGTTCAACCTGAAGTATCGCACCGTCCTTTCATGGGAGAGGT
AGTGCAAGCTTTGAAACTTGTGTGCAACGAATGCGACGAAGCTAAGGAGCTCAACTCTGT
AGCTTCGCTTACTCAAGATGAGAATCGAGCCGAGAGCTCTTGTGGTGGAGAAGGCTCGGG
GAGGATGGCTAGGTATCCGTTGCTACCGAGTTATGACTCTGAGCCTGACACGGAGAGAGG
GATTTCTGTGTCGGAGATGTTCACTGGTTCAGGGAGGTTAGAGAGACAGTCTAACTCGGG
TCCCTTGGCTTCAGGTCGAGGCAAGAGGTTCTGGCAGAAGATGAGGAGGTTGTCGACGGG
AAGCTTGAGCGAGCACGGGTCAGCATCGCTCATGTTACGATCTGGTTCGCGTTGAAAGAT
CGTTTCCGGTTACAGAACATTGGGGGCTT*CTGATTTGCCGTAAGTTAAGAAAGGAAAAG
GAAAGAGAGTGTCTCTTGTGATACAAGCAAGCAACTCTTTACCTTCTGGATACCGGTTAA
GGAACAGATTGGAAGAGATCATTCCCGGTTAATTAGTCATATTTGTATCTTAGACGAAAC
AAGAGATTCTGTTTGATCTTAATTTCAATGTACATATCACGTTAAAGGCCC

QA 4 714 4 714
DS 

RD RR4FP27JQ 711 0 0
ATTATAGACCAGTCTTTAGGACAACCC*GAGATTCCGTTCGATAGCATAGCTAAAGTCGC
TGCGATAGCTTCGATGTGCGTTCAACCTGAAGTATCGCACCGTCCTTTCATGGGAGAGGT
AGTGCAAGCTTTGAAACTTGTGTGCAACGAATGCGACGAAGCTAAGGAGCTCAACTCTGT
AGCTTCGCTTACTCAAGATGAGAATCGAGCCGAGAGCTCTTGTGGTGGAGAAGGCTCGGG
GAGGATGGCTAGGTATCCGTTGCTACCGAGTTATGACTCTGAGCCTGACACGGAGAGAGG
GATTTCTGTGTCGGAGATGTTCACTGGTTCAGGGAGGTTAGAGAGACAGTCTAACTCGGG
TCCCTTGGCTTCAGGTCGAGGCAAGAGGTTCTGGTAGAAGATGAGGAGGTTGTCGACGGG
AAGCTTGAGCGAGCACGGGTCAGCATCGCTCATGTTACGATCTGGTTCGCGTTGAAAGAT
CGTTTCCGGTTACAGAACATTGGGGGTTT*CTGATTTGCCGTAAGTTAAGAAAGGAAAAG
GAAAGAGAGTGTCTCTTGTGATACAAGCAAGCAACTCTTTACCTTCTGGATACCGGTTAA
GGAACAGATTGGAAGAGATCATTCCCGGTTAATTAGTCATATTTGTATCTTAGACGAAAC
AAGAGATTCTGTTTGATCTTAATTTCAATGTACATATCACGTTAAAGGCCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 4

CO CL2442Contig1 939 4 5 U
GCTGATATTTGGACGAACTTGGGTTGACTCACCAGGAGAAATGGTCATGACTAATCTAAC
CACCGGAGACAAAGTTGTTCTTTATTTCCAACCATGTGGTTGGTTCGGTTCTGGTCGCTA
TGAAGTGGATGGATACGTTTACAGCGCAGACGAAGAACCTAAGATCATGATGACGGGAAA
ATGGAATGAGAAAATCGGCTACCAACCTTGTGATACTGAGGGAGAACCCCTTCCTGGCAC
TGAGCTTAAAGAGGTGTGGCATGTGGCTGATGTTCCCAAGAATGACAAGTTTCAGTACAC
GCACTTTGCTCACAAGATAAACAGCTTCGACACAGCTCCTTCCAAGCTCTTGGCTTCAGA
CTCACGTCTCCGTCCCGATAGATATGCCCTTGAGCAGGGTGACCCTTCTAAAGCTGGTTC
CGAGAAGCACAGCCTTGAGGAGAGACAAAGGGCAGAAAAGAGGACACGAGAGACAAAGGG
ACAGAAGTTCACACCAAGATGGTTCGATCTAACGGATGAGATCACATTTACGCCATGGGG
AGATATTGAGATATACCAATACAACGGGAAGTACAATGAACACCGAGATACAGCACCGAG
CTCGAGCAGTGAAGTGGACCTCAAATCGATCGAGTTTAATCCTTGGCAATATGGAAATGT
ATCAAGCGAATGAGGCAGCAGCGGTTCATAATTTAAATATATGACATCGACATAATACTC
GATGGATGGTGTGGTTCCATGGACTCGTGAAGATGAGTTCAAAGTTGTTTTATACTTTTG
ATTACGTAGTTTGAGTGGTGAAACATAAGATTGTGTTTATGTCTTATTGTATGTATCTTT
GTTCCATCTCGATTCAAAAGTAATCATGTTTGTTATGCTTATACTTTTTTTTAGAGATGT
GGTCTTCTCTTTATTCCATTTAAAGTTTCCATTTCGAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AV25TF U 1
AF RR4AW43TF U 1
AF RR4AW43JQ C 63
AF RR4AV25JQ C 244
BS 1 393 RR4AV25TF
BS 394 527 RR4AW43TF
BS 528 528 RR4AW43JQ
BS 529 849 RR4AW43TF
BS 850 939 RR4AW43JQ

RD RR4AV25TF 396 0 0
GCTGATATTTGGACGAACTTGGGTTGACTCACCAGGAGAAATGGTCATGACTAATCTAAC
CACCGGAGACAAAGTTGTTCTTTATTTCCAACCATGTGGTTGGTTCGGTTCTGGTCGCTA
TGAAGTGGATGGATACGTTTACAGCGCAGACGAAGAACCTAAGATCATGATGACGGGAAA
ATGGAATGAGAAAATCGGCTACCAACCTTGTGATACTGAGGGAGAACCCCTTCCTGGCAC
TGAGCTTAAAGAGGTGTGGCATGTGGCTGATGTTCCCAAGAATGACAAGTTTCAGTACAC
GCACTTTGCTCACAAGATAAACAGCTTCGACACAGCTCCTTCCAAGCTCTTGGCTTCAGA
CTCACGTCTCCGTCCCGATAGATATGCCCTTGA
ACA

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR4AW43TF 849 0 0
GCTGATATTTGGACGAACTTGGGTTGACTCACCAGGAGAAATGGTCATGACTAATCTAAC
CACCGGAGACAAAGTTGTTCTTTATTTCCAACCATGTGGTTGGTTCGGTTCTGGTCGCTA
TGAAGTGGATGGATACGTTTACAGCGCAGACGAAGAACCTAAGATCATGATGACGGGAAA
ATGGAATGAGAAAATCGGCTACCAACCTTGTGATACTGAGGGAGAACCCCTTCCTGGCAC
TGAGCTTAAAGAGGTGTGGCATGTGGCTGATGTTCCCAAGAATGACAAGTTTCAGTACAC
GCACTTTGCTCACAAGATAAACAGCTTCGACACAGCTCCTTCCAAGCTCTTGGCTTCAGA
CTCACGTCTCCGTCCCGATAGATATGCCCTTGAGCAGGGTGACCCTTCTAAAGCTGGTTC
CGAGAAGCACAGCCTTGAGGAGAGACAAAGGGCAGAAAAGAGGACACGAGAGACAAAGGG
ACAGAAGTTCACACCAAGATGGTTCGATCTAACGGATGAGATCACATCTACGCCATGGGG
AGATATTGAGATATACCAATACAACGGGAAGTACAATGAACACCGAGATACAGCACCGAG
CTCGAGCAGTGAAGTGGACCTCAAATCGATCGAGTTTAATCCTTGGCAATATGGAAATGT
ATCAAGCGAATGAGGCAGCAGCGGTTCATAATTTAAATATATGACATCGACATAATACTC
GATGGATGGTGTGGTTCCATGGACTCGTGAAGATGAGTTCAAAGTTGTTTTATACTTTTG
ATTACGTAGTTTGAGTGGTGAAACATAAGATTGTGTTTATGTCTTATTGTATGTATCTTT
GTTCCATCT

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR4AW43JQ 877 0 0
A
CGGAGACAAAGTTGTTCTTTATTTCCAACCATGTGGTTGGTTCGGTTCTGGTCGCTATGA
AGTGGATGGATACGTTTACAGCGCAGACGAAGAACCTAAGATCATGATGACGGGAAAATG
GAATGAGAAAATCGGCTACCAACCTTGTGATACTGAGGGAGAACCCCTTCCTGGCACTGA
GCTTAAAGAGGTGTGGCATGTGGCTGATGTTCCCAAGAATGACAAGTTTCAGTACACGCA
CTTTGCTCACAAGATAAACAGCTTCGACACAGCTCCTTCCAAGCTCTTGGCTTCAGACTC
ACGTCTCCGTCCCGATAGATATGCCCTTGAGCAGGGTGACCCTTCTAAAGCTGGTTCCGA
GAAGCACAGCCTTGAGGAGAGACAAAGGGCAGAAAAGAGGACACGAGAGACAAAGGGACA
GAAGTTCACACCAAGATGGTTCGATCTAACGGATGAGATCACATTTACGCCATGGGGAGA
TATTGAGATATACCAATACAACGGGAAGTACAATGAACACCGAGATACAGCACCGAGCTC
GAGCAGTGAAGTGGACCTCAAATCGATCGAGTTTAATCCTTGGCAATATGGAAATGTATC
AAGCGAATGAGGCAGCAGCGGTTCATAATTTAAATATATGACATCGACATAATACTCGAT
GGATGGTGTGGTTCCATGGACTCGTGAAGATGAGTTCAAAGTTGTTTTATACTTTTGATT
ACGTAGTTTGAGTGGTGAAACATAAGATTGTGTTTATGTCTTATTGTATGTATCTTTGTT
CCATCTCGATTCAAAAGTAATCATGTTTGTTATGCTTATACTTTTTTTTAGAGATGTGGT
CTTCTCTTTATTCCATTTAAAGTTTCCATTTCGAGC

QA 2 877 2 877
DS 

RD RR4AV25JQ 696 0 0
GCTTAAAGAGGTGTGGCATGTGGCTGATGTTCCCAAGAATGACAAGTTTCAGTACACGCA
CTTTGCTCACAAGATAAACAGCTTCGACACAGCTCCTTCCAAGCTCTTGGCTTCAGACTC
ACGTCTCCGTCCCGATAGATATGCCCTTGAGCAGGGTGACCCTTCTAAAGCTGGTTCCGA
GAAGCACAGCCTTGAGGAGAGACAAAGGGCAGAAAAGAGGACACGAGAGACAAAGGGACA
GAAGTTCACACCAAGATGGTTCGATCTAACGGATGAGATCACATTTACGCCATGGGGAGA
TATTGAGATATACCAATACAACGGGAAGTACAATGAACACCGAGATACAGCACCGAGCTC
GAGCAGTGAAGTGGACCTCAAATCGATCGAGTTTAATCCTTGGCAATATGGAAATGTATC
AAGCGAATGAGGCAGCAGCGGTTCATAATTTAAATATATGACATCGACATAATACTCGAT
GGATGGTGTGGTTCCATGGACTCGTGAAGATGAGTTCAAAGTTGTTTTATACTTTTGATT
ACGTAGTTTGAGTGGTGAAACATAAGATTGTGTTTATGTCTTATTGTATGTATCTTTGTT
CCATCTCGATTCAAAAGTAATCATGTTTGTTATGCTTATACTTTTTTTTAGAGATGTGGT
CTTCTCTTTATTCCATTTAAAGTTTCCATTTCGAGC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 2 4

CO CL2443Contig1 285 2 2 U
GGAAGAAAGAGAGTAGTGTTTAGTTACAAACCTATCTCGACGAGTATTTTTTTTTTTGAA
GTTACTTCCTAAAGAACATTATAAATTCTCCAGAAAACCCTAACAGAAGATAGTAGTAGC
AAATATAACACACGACGATTATAAAAAATATAAATTACATTCAACCATCACAAAACCTAA
ACGTAGAGTTAAAACACTCAGAGAATGGTGTCTCTGGCCCCAAAGAAGCTTTTTTTTTGG
TTCCTGTCTTAGATTCAAAGTCAGTGTATAGAATCTATGTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS06TF C 1
AF RR4BS06JQ U 11
BS 1 10 RR4BS06TF
BS 11 285 RR4BS06JQ

RD RR4BS06TF 221 0 0
GGAAGAAAGAGAGTAGTGTTTAGTTACAAACCTATCTCGACGAGTATTTTTTTTTTTGAA
GTTACTTCCTAAAGAACATTATAAATTCTCCAGAAAACCCTAACAGAAGATAGTAGTAGC
AAATATAACACACGACGATTATAAAAAATATAAATTACATTCAACCATCACAAAACCTAA
ACGTAGAGTTAAAACACTCAGAGAATGGT
GTCTCTGGCCCC

QA 1 209 1 209
DS 

RD RR4BS06JQ 275 0 0
GAGTAGTGTTTAGTTACAAACCTATCTCGACGAGTATTTTTTTTTTTGAAGTTACTTCCT
AAAGAACATTATAAATTCTCCAGAAAACCCTAACAGAAGATAGTAGTAGCAAATATAACA
CACGACGATTATAAAAAATATAAATTACATTCAACCATCACAAAACCTAAACGTAGAGTT
AAAACACTCAGAGAATGGTGTCTCTGGCCCCAAAGAAGCTTTTTTTTTGGTTCCTGTCTT
AGATTCAAAGTCAGTGTATAGAATCTATGTTCTTC

QA 1 275 1 275
DS 



CO CL2443Contig2 522 2 1 U
GTGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGATTGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAG
CCGTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAAGCATTC
AACGAAAAGAACAGGGAGAAGGTGCAGCTCATCACCAAGCTTATGGAGCTGGTGGGAGAG
AGTGAAAAGGTGAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCTGAGCAAGAATATAGATTCTATACAC
TGACTTTGAATCCAAGACGAGAACCAAAAGAAAGCTTCTTGGGGGCCAGAGACCATTCTC
TGAGTGTTTTAACTCTACGTTTAGGTTTTGTGATGGTTGAATGTAATTTATATTTTTATA
ATCGTCGTGTGTTATATTTGCTACTGCTATCTTCTTCTGTTAGGGTTTTCTGGAGAATTT
ATAATGTTCTTTAGGAAGTAACTTCAAAAAAAAATACTCATCGAGATAGGTTTGTAACTA
AACACTACTCTCTTTCTTTCTTTGAATCCTCTTTCTCTTAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D831JQ C 1
AF RR4D831TF U 1
BS 1 522 RR4D831TF

RD RR4D831JQ 522 0 0
GTGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGATTGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAG
CCGTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAAGCATTC
AACGAAAAGAACAGGGAGAAGGTGCAGCTCATCACCAAGCTTATGGAGCTGGTGGGAGAG
AGTGAAAAGGTGAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCTGAGCAAGAATATAGATTCTATACAC
TGACTTTGAATCCAAGACGAGAACCAAAAGAAAGCTTCTTGGGGGCCAGAGACCATTCTC
TGAGTGTTTTAACTCTACGTTTAGGTTTTGTGATGGTTGAATGTAATTTATATTTTTATA
ATCGTCGTGTGTTATATTTGCTACTGCTATCTTCTTCTGTTAGGGTTTTCTGGAGAATTT
ATAATGTTCTTTAGGAAGTAACTTCAAAAAAAAATACTCATCGAGATAGGTTTGTAACTA
AACACTACTCTCTTTCTTTCTTTGAATCCTCTTTCTCTTAGC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4D831TF 522 0 0
GTGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGATTGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAG
CCGTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAAGCATTC
AACGAAAAGAACAGGGAGAAGGTGCAGCTCATCACCAAGCTTATGGAGCTGGTGGGAGAG
AGTGAAAAGGTGAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCTGAGCAAGAATATAGATTCTATACAC
TGACTTTGAATCCAAGACGAGAACCAAAAGAAAGCTTCTTGGGGGCCAGAGACCATTCTC
TGAGTGTTTTAACTCTACGTTTAGGTTTTGTGATGGTTGAATGTAATTTATATTTTTATA
ATCGTCGTGTGTTATATTTGCTACTGCTATCTTCTTCTGTTAGGGTTTTCTGGAGAATTT
ATAATGTTCTTTAGGAAGTAACTTCAAAAAAAAATACTCATCGAGATAGGTTTGTAACTA
AACACTACTCTCTTTCTTTCTTTGAATCCTCTTTCTCTTAGC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 4

CO CL2444Contig1 607 4 6 U
GGATCATTTCTATTAATTCTCTTACACATATATCAAACCCTGTAAAAGAAAAAAAATTGT
TTTCGTTTTTATTCGATATCGTGAAGATGGGATCAAGTCAAAGCATGGGAGGTTCAAAGA
GAAGGGCGTCGAGTAGGGGACTTGGAGCTGTTCTTAAATAACAAAGAGCTAAGCTTTACA
TCATTCGAATATGTGTCGTCATGCTTCTTTGTTGGAACGATTGATTTCTCTGCTGATATA
CTCTCGTATCATTTTGATCAAGATCGTTCTGTATAAAAGGGATTTGTTGGCTGGATATAG
GACTCACCATGATGTTTCGAGCTTAAGCGGGTCGGTTCGGATCCTAGTCTGGTGCCAGAT
TGTGGAGTAGTTAAATGATTTTAAGGTTAGGTGTCTCTACTGGTTAGCAGAGTCGTGTTC
TTTTGGAGCAATATTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAA
TAGCTTTTGGCTTTGTTCAATGACATTCGAAATATAAAAAAAAATATACGGTTAATGTAA
AAATGGTCGTTCCCATGTATCTCTGCTCTATCTCTTCTTCTTGGGTTAATTAAAGTTTTG
AAATCCC


BQ
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30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G885TF U 35
AF RR4A780TF U 4
AF RR4D102TF U 17
AF RR4G885JQ C 1
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GG
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AAATGGTCGTTCCCATGTATCTCTGCTCTATCTCTTCTTCTTGGGTTAATTAAAGTTTTG
AAATCCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

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ATATTCCAAGAGTCTCGCCACTGGTTCAACGCACGGTGGATTTTTCTCCAAGCCGAGGGA
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF58JQ U 1
AF RR4AF58TF C 1
AF RR4AB85JQ U 10
AF RR4AB85TF C 159
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C

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AAAACAGAGGAAATAGAGGATGTATTGAAGTATCCTGTAACAGAGATGAGACCACACAAA
AGCTTACACCAAACTACGGCAAGCCTCGACTTTAGCTGCTTGCGCGGCCAACAGAGATTC
GCTAACACTCTTTATCACAGCATCCAAGACTGCTTTCTTGAACCGATCATCTTCCATTTT
CATTAGAATCTCTTCCACCGTCCCAAAATCCGATGCATTGGCCATAACCAAACTCCCAAG
GATCTCCCCAAAGTTGTTTGGTGCCTTTGGCAGATCGATCCCAATGTCATCGAGCATAGA
CCCGTAAAGCAGACAACCACTCCCGATGTCTTTAGGAGCTAGAACGTTCTTGGAGACCAA
ATATTCCAAGAGTCTCGCCACTGGTTCAACGCACGGTGGATTTTTCTCCAAGCCGAGGGA
GATAGCTTCCTTGACAAGCTCCGGATGGTAAGCTGGGGC
C

QA 1 579 1 579
DS 

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G
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TCTGAGTAAAATGAAGTAGCCATAGGAGAAGCTGTCTCTTGTGGCTGTGGTTGCGACTGG
GGCTTCTCCACAGCTGGTTTGCTTG

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AAGGAAGGGGTTTCGGCTGTCCGACACCAGTACCTTGTAAAAGGGCACTTGGTCTTCCAG
CCAAGAGACCTCCACTACCCTGAGGTAGGAGCCTTGAATTAACGGACGGTGACTTGTTGA
TAGCGGGAGACTGAACG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

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TTGCCATCGTGAGCTTTGCTTCGTCGTTTGCTCCAACTCCCAAGCGTCGCCC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4AM70TF C 2
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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EB39TF U 50
AF RR4AP77TF U 154
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GG
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QA 3 777 3 777
DS 



AS 1 4

CO CL2448Contig1 1363 4 5 U
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BQ
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AF RR4AR34JQ U 15
AF RR4AR34TF C 584
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QA 1 681 1 681
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C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AR34TF 780 0 0
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TCTTCTCCGTTGATCTTTCCTTTCATTTTACTAATCTCTTGGAGAAGAGAATCATTATCG
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QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H612JQB U 1
AF RR4GV29JQ U 72
AF RR4H612TF C 287
AF RR4GV29TF C 761
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BS 968 1329 RR4GV29TF

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TCCTCTTGGAGACAAACCATAAACAATAGCAAAAGCAATTAAACATAATAAATCTTCATA
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GTCGGATAGCTGAAATTTAGTCACAAGTGACGTTGAGAGACAACCCTCACCAACAAGAAA
AACCGAAGTGATCTTGATTGCACCTTCTGGCCCCGTACAGACCGCTACGCAAGGTAACAA
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AGAATGGAGACATGATTGTAGGATTCTGTCCTCGACCAAGGAGGATGATGAAAACGATAA
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AATTGATTGACTCACGATGTGTTGCAGGTTTCTGGATTTTGGTAGATTGATAACTGGGCT
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TGTTGACT

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TCTTGATTGCACCTTCTGGCCCCGTACAGACCGCTACGCAAGGTAACAAACCGGTGAGTA
AGCTGAAACAATAACTCAGAAAAGGATCCGAAAGAACATCCCCGTTCATAGAATGGAGAC
ATGATTGTAGGATTCTGTCCTCGACCAAGGAGGATGATGAAAACGATAACAGATCCGGTG
AATCCACCGAAAACTGCTTCCTAAGTGCGTGATATTGCAATAAGCTCAGAATAAAGACTT
CAATGAATCCATCGAAGCTCTTTAACTTAACCATAGAAACCAAAACCGAAATTGATTGAC
TCACGATGTGTTGCAGGTTTCTGGATTTTGGTAGATTGATAACTGGGCTGGTAGCTTCAG
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TGGCAAGGGACGTTGTGGATCTGGAGAACGAGTCGGAAGCGGCGAGGAGATCCCCGGTTG
AAAGACAAAGAGCAGTGGTCGGTGGGTTGCAGAGCTCCCCAGAACAAGCTAAATGGCCAT
CGA

QA 1 723 1 723
DS 

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ACATCCCCGTTCATAGAATGGAGACATGATTGTAGGATTCTGTCCTCGACCAAGGAGGAT
GATGAAAACGATAACAGATCCGGTGAATCCACCGAAAACTGCTTCCTAAGTGCGTGATAT
TGCAATAAGCTCAGAATAAAGACTTCAATGAATCCATCGAAGCTCTTTAACTTAACCATA
GAAACCAAAACCGAAATTGATTGACTCACGATGTGTTGCAGGTTTCTGGATTTTGGTAGA
TTGATAACTGGGCTGGTAGCTTCAGCCAAAGTATTGGGCCAGGCCCGTGAAGATTTGAAT
CTTGGTCCAATAGCTGTTGACTCATTGGCAAGGGACGTTGTGGATCTGGAGAACGAGTCG
GAAGCGGCGAGGAGATCCCCGGTTGAAAGACAAAGAGCAGTGGTCGGTGGGTTGCAGAGC
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AAGGTGAGACTATTAAGCGGACAAAACGACCTTATCAAGCTTTGAAGAAACAGATCTGGT
CGCCGGAATGGAATCCCATCT
C

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DS 

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TCACCATAACAGGTTTTGCCGGACTTCCAAGCAAGACTGGAGAGAAGATAACTTAACGGG
GTGGAGAAGGTGAGACTATTAAGCGGACAAAACGACCTTATCAAGCTTTGAAGAAACAGA
TCTGGTTGCCGGAATGGAATCCCATCTACATCGGTCGCCAGATTAACGCAAGATGTTAAG
AGAAGGTGTGGTTGCCGTCGTTTACGGTGTGGGTCTTCAGACAGACGCTTCATCGCTGAG
GTTGAGTTAAATAGGTTTATAGATCTGAAGAGCGGAGGAGAGCAGACATGGAGGATGAAA
AGATGGAAAGAGCTATTGTCCGAGACAATTATCCAGGAGTTCCTCGGAGAAGAGTTCCAT
TCTGGTGAACTCCGACCAACAGTACGAGACCACGGAGATCTCTACCGGTAGTGTTGACAG
TAGATCCAGAGCAGCAAAATTGAAAGAAACCATAAGAGATACGGGGCAGAAGTGAATTAA
AGATGTAGTCGTGACTAGGGGAGATTGGC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 4

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ATATTCACAGCAATTTTCTCTTTTCTCATATCGCCTGTGTTGGTGACCCAAAGGCAAAGG
GAAAATATACGAAAATTTTACAACACAACAGGTTTAAAGTGCATCATAACATGAGAACAG
AACCACCCAATCCCGAAAAGAAATCCAATAAACCAAAAGAGATGAGAGTATACTCTGCTC
ACAAGAAACTTTATTTTGTTAGCCCTGATCAAACCCACTTATCAGATCATGCACAAACGG
ACGACGGTTGATGGTACATCCCAGCTGCACCGTTGGTAAGTCGCTTCTTCCTCCTCCTCT
TCGCCACAATCACAAATCCTTCACCTCCATCCGTCTCACTTTCCTTCGCTGCACTGTCCT
CTTCTCTTCCGTAAACTATCTCCGTTACTGTACTATCCTTTACAGACGTATCTTCTAACT
CATCTTTAGGCTTGTTTACCTTCTTCCGAGCAGCTACAACCTCCTTGTGGGATGAATTTA
CCATGACGCTAAGGATCTGTCTCGCCAGCTCTTCCTTCTTCAAAACAGCTGCGTTTTTCT
CAACCTCTTGGCTACTGCTGGAGTCAACGGATACACTCGCATGTTGAGAGCTATTCAGCA
CGGATCTCCTCGGAACAAACTCTGGTGCATCCGGATTCATGGTTTTTGGCATCCCAATTC
CATTTGAGTAAGTAGCACCACCATAATATGGTGGTGAATGAAGTCCAGTTCCGGAAATAG
ATTCTGCAACCAGACTATGCGGATCAGTAACCAAGAAACTTCCAGGGTTGTAAGGCTCTG
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CTGATTCTTGTTTTTCACAAGGAACCTCTGTGCCCTCCTCCACTGGCAAATCTAACATTA
CAGCATCAGACTTGCTTTCTTCTCCAGTCGATGAACTTGATGAGATCGTATATCTGAGTT
TCAGTTCTTTCCAAATTCAGTTCTAATTTTTCTAACATCGGCTTCAGAACGGTACCTGGT
GGTGCCAGAGCAACCTCTTTGTATGAGAGAGACTTTGAAACCAAAGTAGTAGTACTGGTG
GTAACCGCAGCAGAACTAGGAGACTTTAGTTGTGGCTTAATTGCATTTGTTGTACTCACA
TCTATCTCTGTATTCTTCAGAGCCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AR76JQ U 1
AF RR4AL55JQ U 25
AF RR4AR76TF C 598
AF RR4AL55TF C 607
BS 1 830 RR4AR76JQ
BS 831 865 RR4AL55JQ
BS 866 1286 RR4AR76TF

RD RR4AR76JQ 830 0 0
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ATATTCACAGCAATTTTCTCTTTTCTCATATCGCCTGTGTTGGTGACCCAAAGGCAAAGG
GAAAATATACGAAAATTTTACAACACAACAGGTTTAAAGTGCATCATAACATGAGAACAG
AACCACCCAATCCCGAAAAGAAATCCAATAAACCAAAAGAGATGAGAGTATACTCTGCTC
ACAAGAAACTTTATTTTGTTAGCCCTGATCAAACCCACTTATCAGATCATGCACAAACGG
ACGACGGTTGATGGTACATCCCAGCTGCACCGTTGGTAAGTCGCTTCTTCCTCCTCCTCT
TCGCCACAATCACAAATCCTTCACCTCCATCCGTCTCACTTTCCTTCGCTGCACTGTCCT
CTTCTCTTCCGTAAACTATCTCCGTTACTGTACTATCCTTTACAGACGTATCTTCTAACT
CATCTTTAGGCTTGTTTACCTTCTTCCGAGCAGCTACAACCTCCTTGTGGGATGAATTTA
CCATGACGCTAAGGATCTGTCTCGCCAGCTCTTCCTTCTTCAAAACAGCTGCGTTTTTCT
CAACCTCTTGGCTACTGCTGGAGTCAACGGATACACTCGCATGTTGAGAGCTATTCAGCA
CGGATCTCCTCGGAACAAACTCTGGTGCATCCGGATTCATGGTTTTTGGCATCCCAATTC
CATTTGAGTAAGTAGCACCACCATAATATGGTGGTGAATGAAGTCCAGTTCCGGAAATAG
ATTCTGCAACCAGACTATGCGGATCAGTAACCAAGAAACTTCCAGGGTTG

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4AL55JQ 841 0 0
AGACATGTGTGAATGAATGCCAGTTACATTTTAGTAATATTCACAGCAATTTTCTCTTTT
CTCATATCGCCTGTGTTGGTGACCCAAAGGCAAAGGGAAAATATACGAAAATTTTACAAC
ACAACAGGTTTAAAGTGCATCATAACATGAGAACAGAACCACCCAATCCCGAAAAGAAAT
CCAATAAACCAAAAGAGATGAGAGTATACTCTGCTCACAAGAAACTTTATTTTGTTAGCC
CTGATCAAACCCACTTATCAGATCATGCACAAACGGACGACGGTTGATGGTACATCCCAG
CTGCACCGTTGGTAAGTCGCTTCTTCCTCCTCCTCTTCGCCACAATCACAAATCCTTCAC
CTCCATCCGTCTCACTTTCCTTCGCTGCACTGTCCTCTTCTCTTCCGTAAACTATCTCCG
TTACTGTACTATCCTTTACAGACGTATCTTCTAACTCATCTTTAGGCTTGTTTACCTTCT
TCCGAGCAGCTACAACCTCCTTGTGGGATGAATTTACCATGACGCTAAGGATCTGTCTCG
CCAGCTCTTCCTTCTTCAAAACAGCTGCGTTTTTCTCAACCTCTTGGCTACTGCTGGAGT
CAACGGATACACTCGCATGTTGAGAGCTATTCAGCACGGATCTCCTCGGAACAAACTCTG
GTGCATCCGGATTCATGGTTTTTGGCATCCCAATTCCATTTGAGTAAGTAGCACCACCAT
AATATGGTGGTGAATGAAGTCCAGTTCCGGAAATAGATTCTGCAACCAGACTATGCGGAT
CAGTAACCAAGAAACTTCCAGGGTTGTAAGGCTCTGCAGCGGCCGACAGCTTTCTCCTGC
T

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4AR76TF 689 0 0
TCTCAACCTCTTGGCTACTGCTGGAGTCAACGGATACACTCGCATGTTGAGAGCTATTCA
GCACGGATCTCCTCGGAACAAACTCTGGTGCATCCGGATTCATGGTTTTTGGCATCCCAA
TTCCATTTGAGTAAGTAGCACCACCATAATATGGTGGTGAATGAAGTCCAGTTCCGGAAA
TAGATTCTGCAACCAGACTATGCGGATCAGTAACCAAGAAACTTCCAGGGTTGTAAGGCT
CTGCAGCGGCCGACAGCTTTCTCCTGCTGATAATATCACAAGCCTTTTGCTCACGACAGG
ACCCTCCTAGATCCCCTTCAGACTCTGACGTTAGATTTTCTACTGACTCAGCAACACTTT
CTTCTGATTCTTGTTTTTCACAAGGAACCTCTGTGCCCTCCTCCACTGGCAAATCTAACA
TTACAGCATCAGACTTGCTTTCTTCTCCAGTCGATGAACTTGATGAGATCGTATATCTGA
GTTTCAGTTCTTTCCAAATTCAGTTCTAATTTTTCTAACATCGGCTTCAGAACGGTACCT
GGTGGTGCCAGAGCAACCTCTTTGTATGAGAGAGACTTTGAAACCAAAGTAGTAGTACTG
GTGGTAACCGCAGCAGAACTAGGAGACTTTAGTTGTGGCTTAATTGCATTTGTTGTACTC
ACATCTATCTCTGTATTCTTCAGAGCCCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4AL55TF 680 0 0
CTTGGCTACTGCTGGAGTCAACGGATACACTCGCATGTTGAGAGCTATTCAGCACGGATC
TCCTCGGAACAAACTCTGGTGCATCCGGATTCATGGTTTTTGGCATCCCAATTCCATTTG
AGTAAGTAGCACCACCATAATATGGTGGTGAATGAAGTCCAGTTCCGGAAATAGATTCTG
CAACCAGACTATGCGGATCAGTAACCAAGAAACTTCCAGGGTTGTAAGGCTCTGCAGCGG
CCGACAGCTTTCTCCTGCTGATAATATCACAAGCCTTTTGCTCACGACAGGACCCTCCTA
GATCCCCTTCAGACTCTGACGTTAGATTTTCTACTGACTCAGCAACACTTTCTTCTGATT
CTTGTTTTTCACAAGGAACCTCTGTGCCCTCCTCCACTGGCAAATCTAACATTACAGCAT
CAGACTTGCTTTCTTCTCCAGTCGATGAACTTGATGAGATCGTATATCTGAGTTTCAGTT
CTTTCCAAATTCAGTTCTAATTTTTCTAACATCGGCTTCAGAACGGTACCTGGTGGTGCC
AGAGCAACCTCTTTGTATGAGAGAGACTTTGAAACCAAAGTAGTAGTACTGGTGGTAACC
GCAGCAGAACTAGGAGACTTTAGTTGTGGCTTAATTGCATTTGTTGTACTCACATCTATC
TCTGTATTCTTCAGAGCCCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 3

CO CL2451Contig1 803 3 6 U
GGAAGTTCATCACAGATGTTGGGTCTACTATTAACAATGATCCAGAAATAGGCGACCTGC
TCAAGGTTATCTTTGTTCCTGATTACAATGTCAGTGTTGCTGAATTGCTCATTCCAGCTA
GTGAGCTTTCTCAGCACATCAGTACCGCTGGGATGGAAGCGAGTGGGACAAGCAACATGA
AGTTTTCTATGAACGGTTGCATTTTGATAGGAACCTTGGATGGGGCTAACGTCGAGATTA
GAGAAGAAGTTGGCGAAGAAAACTTCTTCCTCTTCGGTGCCAAAGCTGATGAGATAGTGA
ACCTCAGGAAAGAGAGGGCAGAGGGAAAGTTTGTTCCGGATCCTATTTTTGAAGAAGTCA
AACGATACGTTAGAAGCGGTGTCTTTGGCTCAAACTATGATGAACTAATTGGCTCTTTAG
AAGGAAATGAGGGATTTGGACGAGCTGATTACTTCCTCGTTGGCAAAGACTTTCCTAGTT
ACGTTGAATGCCAAGAAAAAGTTGACGAGGCATACCGAGACCAGAAAAAATGGACGAGAA
TGTCAATCTTGAACACAGCAGGTTCGTTCAAGTTTAGCAGTGACCGGACCATCCACGAAT
ATGCCAAAGGCATATGGAATATTAAGCAAGTTGAACTTCCATGAGCCTTTTACCATTTAA
GAACTTTTTTGAATGTCTCTTCAATGAATGTCTCATACCAAGTTAAGTGTATCCAGTTAA
AATAAGGAAATCATGTGTAGTGGACATGCGAGACAATGAATGTACGAAATAAGTTTCAGA
CAAGCAAGCTGGTTACTCTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H325TF U 1
AF RR4BT88JQ C 171
AF RR4BT88TF U 171
BS 1 511 RR4H325TF
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BS 567 604 RR4H325TF
BS 605 803 RR4BT88TF

RD RR4H325TF 607 0 0
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TCAAGGTTATCTTTGTTCCTGATTACAATGTCAGTGTTGCTGAATTGCTCATTCCAGCTA
GTGAGCTTTCTCAGCACATCAGTACCGCTGGGATGGAAGCGAGTGGGACAAGCAACATGA
AGTTTTCTATGAACGGTTGCATTTTGATAGGAACCTTGGATGGGGCTAACGTCGAGATTA
GAGAAGAAGTTGGCGAAGAAAACTTCTTCCTCTTCGGTGCCAAAGCTGATGAGATAGTGA
ACCTCAGGAAAGAGAGGGCAGAGGGAAAGTTTGTTCCGGATCCTATTTTTGAAGAAGTCA
AACGATACGTTAGAAGCGGTGTCTTTGGCTCAAACTATGATGAACTAATTGGCTCTTTAG
AAGGAAATGAGGGATTTGGACGAGCTGATTACTTCCTCGTTGGCAAAGACTTTCCTAGTT
ACGTTGAATGCCAAGAAAAAGTTGACGAGGCTTACCGAGACCAGAAAAAATGGACGAGAA
TGTCAATCTTGAACACAGCAGGTTCATTCAAGTTTAGCAGTGACCGGACCATCCACGAAT
ATGC
TAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4BT88JQ 633 0 0
G
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TTCCTAGTTACGTTGAATGCCAAGAAAAAGTTGACGAGGCATACCGAGACCAGAAAAAAT
GGACGAGAATGTCAATCTTGAACACAGCAGGTTCGTTCAAGTTTAGCAGTGACCGGACCA
TCCACGAATATGCCAAAGGCATATGGAATATTAAGCAAGTTGAACTTCCATGAGCCTTTT
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TCCAGTTAAAATAAGGAAATCATGTGTAGTGGACATGCGAGACAATGAATGTACGAAATA
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DS 

RD RR4BT88TF 633 0 0
G
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TCGAGATTAGAGAAGAAGTTGGCGAAGAAAACTTCTTCCTCTTCGGTGCCAAAGCTGATG
AGATAGTGAACCTCAGGAAAGAGAGGGCAGAGGGAAAGTTTGTTCCGGATCCTATTTTTG
AAGAAGTCAAACGATACGTTAGAAGCGGTGTCTTTGGCTCAAACTATGATGAACTAATTG
GCTCTTTAGAAGGAAATGAGGGATTTGGACGAGCTGATTACTTCCTCGTTGGCAAAGACT
TTCCTAGTTACGTTGAATGCCAAGAAAAAGTTGACGAGGCATACCGAGACCAGAAAAAAT
GGACGAGAATGTCAATCTTGAACACAGCAGGTTCGTTCAAGTTTAGCAGTGACCGGACCA
TCCACGAATATGCCAAAGGCATATGGAATATTAAGCAAGTTGAACTTCCATGAGCCTTTT
ACCATTTAAGAACTTTTTTGAATGTCTCTTCAATGAATGTCTCATACCAAGTTAAGTGTA
TCCAGTTAAAATAAGGAAATCATGTGTAGTGGACATGCGAGACAATGAATGTACGAAATA
AGTTTCAGACAAGCAAGCTGGTTACTCTCTTC

QA 2 633 2 633
DS 



AS 1 4

CO CL2452Contig1 1051 4 4 U
GATGAAAACGCGGTATTTTATTTAAAAAGGTAGCTTCTGCAAGAACATGAACTAAAACTA
CTGAAAATGTTTTTTAAAGCATTGCTTCTAGAGAAGAGCTCATCTCTCCCTCCTTACATA
AAGAAATCTTATTTGTTGAAACTAAAACATTAGAGTTTCTTCAATAACGGTTTGTCCTCT
CTACAGAGGAGGGAACCATGTGATTATAACCGGGCTACGAACCTTATGCGTCGCACTCTT
CCATAAAAGACCACCAAACTCAGGCCTTTTCATCCGCAGCTTCGTCCTGAAAGTAACAGC
GTAGGAAAGCTTCTGGTGTTTCGCAGTGAAATTGAGTGTCTTTGGCTGGACTGTGACGGT
TGCGCCTTTGAAAGGAGAGACAGAGACCTTGTAGCTTGAAACGTGAGGACCAACATTGGT
CACGGTTCTTCTAAGTGTCATAGCTTTAACAAGTGTGTTCTCTGGGAACAAAGCTGAAAT
CGCAGGGTAGTTCAAGTTTCCAGGGTTATTACCGGCAAGGCTGTGTTTGCAAGATCTGTT
CGAATGCTTTGTGAAGACCTTGAGCTGCGAAGGACTCAGCTCTTGAGTGCAGAGGAAATC
AAAATACTCCTGAGGTCCAATGTCGTAGACAAGACCAGGATCTATAGCTTTCAAAGGATC
TATATGTCCAGCACCGTGATCATAAGGCGACGAAGGTTCTTCTCCCGCTGCATCCGTAAG
AGGCTTCAGCATGTTGTCGTGAACGTAAGCCGTCGTCATGAGAGCTGATTTCACCGCTGC
GGGACTCCAATCCGGATGCCTCGATCTGATCAAAGCAGCCACACCGCTCACGTGAGGACA
CGACATGGAAGTCCCCGACAGTATATTGAACTTAACCCTCCTTTTGTCAGACGACAAACT
CGATGGCGCCATGTCTCCAGACCAAGCCGCGAGAATGTTCACTCCCGGAGCTAGCAAGTC
CGGTTTCAAGATCTCCAGGGAGAGAAAGTTGGGTCCTCTCGAAGAGAATGCTGCTACAAC
AGGAGACGGTTTGATTCCAACTCTTGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4EC62JQ U 70
AF RR4EI19JQ U 1
AF RR4EC62TF C 312
AF RR4EI19TF C 341
BS 1 787 RR4EI19JQ
BS 788 979 RR4EC62TF
BS 980 980 RR4EI19TF
BS 981 1051 RR4EC62TF

RD RR4EC62JQ 592 0 0
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TATT*GTTGAAACTAAAACATTAGAGTTTCTTCAATAACGGTTTGTCCTCTCTACAGAGG
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QA 1 592 1 592
DS 

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CGAATGCTTTGTGAAGACCTTGAGCTGCGAAGGACTCAGCTCTTGAGTGCAGAGGAAATC
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TATATGTCCAGCACCGTGATCATAAGGCGACGAAGGTTCTTCTCCCGCTGCATCCGTAAG
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GGGACTC

QA 1 787 1 787
DS 

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TCAAGTTTCCAGGGTTATTACCGGCAAGGCTGTGTTTGCAAGATCTGTTCGAATGCTTTG
TGAAGACCTTGAGCTGCGAAGGACTCAGCTCTTGAGTGCAGAGGAAATCAAAATACTCCT
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CACCGTGATCATAAGGCGACGAAGGTTCTTCTCCCGCTGCATCCGCAAGAGGCTTCAGCA
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CCGGATGCCTCGATCTGATCAAAGCAGCCACACCGCTCACGTGAGGACACGACATGGAAG
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TGATTCCAACTCTTGTCCCC

QA 1 740 1 740
DS 

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C
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CTTGAGTGCAGAGGAAATCAAAATACTCCTGAGGTCCAATGTCGTAGACAAGACCAGGAT
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CTCCCGCTGCATCCGTAAGAGGCTTCAGCATGTTGTCGTGAACGTAAGCCGTCGTCATGA
GAGCTGATTTCACCGCTGCGGGACTCCAATCCGGATGCCTCGATCTGATCAAAGCAGCCA
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AAGAGAATGCTGCTACAACAGGAGACGGTTTGATTCCAACTCTTGTCC

QA 2 709 2 709
DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4BZ67JQ C 1
AF RR4BZ67TF U 1
AF RR4AM59JQ C 20
AF RR4AM59TF U 20
BS 1 679 RR4BZ67TF
BS 680 682 RR4AM59JQ

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CC

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GACAATGATCCCGGGGAAAGGTCGACCTTTAACTCTTGAAGATTCCGAGGCTGGAGAACA
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TGCAAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAGTAGCTGAGCGTCTATTGTTCTATCTTCTGATTC
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AGTTGCTATGTTCTGAAAC
CC

QA 1 679 1 679
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GG
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AACATGTGTGACTTTGATTGAGACTTTTACTCCTCCTGGTGGCAGGGGTTCTTGTCATCT
TGTTCAGAAGTGTAAGTTCTGTGGAAGGGAAGGGAATGTGACAATGATCCCGGGGAAAGG
TCGACCTTTAACTCTTGAAGATTCCGAGGCTGGAGAACATGCTCCTCTTATGGTCTTTGA
CTGTCGAGGATATGAGCCCATCGATTTCGGGTTTGGCGGATTTTGGAAAGCTCAAGCTGA
ATCTGGAACTAAGTTTGATGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACGGAGTATGA
TGAGAAGGGCGAGTGCCCGGTTATGATATCAAACTTCCGTGCAAGCTTCACCGTCACCAA
GTAAAGTAGCTGAGCGTCTATTGTTCTATCTTCTGATTCTCTCTGCACACTTAGGTGTAT
GTAAAAACTATGAGAAGATTGTTACTCAAGTTCTAATAAAGTTGCTATGTTCTGAAACTT
G

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR4AM59TF 663 0 0
GG
GAAGCAGAAGAAGAAGGAGAATCGTCTTTGAGAAGGAGAGATGGTGAACTATGTGCTTAA
AATAACGGCAGATCTCGAGAATCTCACTAATCTCCAGCCTTCCGGTGGCTGCGACGATCC
CAACTTCCCTTACCTCTTCAAGTTGAAATGTGAAAGATGCGGAGAGGTGACTCAGAAGGA
AACATGTGTGACTTTGATTGAGACTTTTACTCCTCCTGGTGGCAGGGGTTCTTGTCATCT
TGTTCAGAAGTGTAAGTTCTGTGGAAGGGAAGGGAATGTGACAATGATCCCGGGGAAAGG
TCGACCTTTAACTCTTGAAGATTCCGAGGCTGGAGAACATGCTCCTCTTATGGTCTTTGA
CTGTCGAGGATATGAGCCCATCGATTTCGGGTTTGGCGGATTTTGGAAAGCTCAAGCTGA
ATCTGGAACTAAGTTTGATGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACGGAGTATGA
TGAGAAGGGCGAGTGCCCGGTTATGATATCAAACTTCCGTGCAAGCTTCACCGTCACCAA
GTAAAGTAGCTGAGCGTCTATTGTTCTATCTTCTGATTCTCTCTGCACACTTAGGTGTAT
GTAAAAACTATGAGAAGATTGTTACTCAAGTTCTAATAAAGTTGCTATGTTCTGAAAC
TTG

QA 3 660 3 660
DS 



AS 1 4

CO CL2454Contig1 813 4 5 U
GGACCACACTCTGCGTTCTCGAGAGCATTTGAATCTCCGAAGAGACCTAGAGATCTGATC
CGATCCGCCATGGAAGAAGAGAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAATGTTAAGAAGGTC
AATCTACTCGACCACAACTCCATCAAGCACATGCTCGACGAGTCCGTCTCCGATATCGTA
ACGAGCCGTGGGTACAAGGAGGACGTGAGGTTGAGCAACATGAAGCTGATCTTAGGGACG
GTTATCATCGCGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTCCCCGAGAACAGG
GATTTTCTGATTGGATGCATTGCATTGTATGTAGTGCTGAATGGGGTGATGCAGCTGATT
ATGTACACCAAGGAGAAGAATGCTATATTGTTCACCTATCCTCTTGAGGGATCATTCACC
AGCACTGGCTTGGTTGTATCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTGATGAGTACACTCTCACC
ATCGACAGTGCTGATCCAAAATCAATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAGTTTACCAAAAGT
GTCACCCAATGGTTCACGAAAGAGGGAGTTCTTGTTGAGGATTTGTTCTGGAAAGACGTG
GAAGCATTAGTCAAGGACTATGCAAAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATAT
ATTATTGAAGAAACTATGTTTTCGTTTTTTAGATAATTAAACGACTTTTGTTTAGAGATG
ACATAAAATATTCCAGATAATATTACTCGAGTTTTGTTGTTATAAACAAAGTTTTCGAAA
TAATCTGAGATTTTAATAAAGGCTTTCATCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4ED34JQ C 495
AF RR4ED34TF U 1
AF RR4AL47TF U 1
AF RR4AL47JQ C 44
BS 1 580 RR4AL47TF
BS 581 581 RR4ED34TF
BS 582 801 RR4AL47TF
BS 802 802 RR4AL47JQ
BS 803 813 RR4AL47TF

RD RR4ED34JQ 161 0 0
TCCAAAATCAATTTCAGGGGGGAAGTCAGTCCAGTTTACCAAAAGTGTCACCCAATGGTT
CACGAAAGAGGGAGTTTTTGTTGAGGATTTGTTTTGGAAAGACGTGGAAGCATTAGTCAA
GGATTATGCAAAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGAT

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR4ED34TF 759 0 0
GGACCACACTCTGCGTTCTCGAGAGCATTTGAATCTCCGAAGAGACCTAGAGATCTGATC
CGATCCGCCATGGAAGAAGAGAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAATGTTAAGAAGGTC
AATCTACTCGACCACAACTCCATCAAGCACATGCTCGACGAGTCCGTCTCCGATATCGTA
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GTTATCATCGCGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTCCCCGAGAACAGG
GATTTTCTGATTGGATGCATTGCATTGTATGTAGTGCTGAATGGGGTGATGCAGCTTATT
ATGTACACCAAGGAGAAGAATGCTATATTGTTCACCTATCCTCTTGAGGGATCATTCACC
AGCACTGGCTTGGTTGTATCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTGATGAGTACACTCTCACC
ATCGACAGTGCTGATCCAAAATCAATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAGTTTACCAAAAGT
GTCACCCAATGGTTCACGAAAGAGGGAGTTCTTGTTGAGGATTTGTTCTGGAAAGACGTG
GAAGCATTAGTCAAGGACTATGCAAAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATAT
ATTATTGAAGAAACTATGTTTTCGTTTTTTAGATAATTAAACGACTTTTGTTTAGAGATG
ACATAAA*TATTCCAGATA*TATTACTCGAGTTT
GTTGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AL47TF 813 0 0
GGACCACACTCTGCGTTCTCGAGAGCATTTGAATCTCCGAAGAGACCTAGAGATCTGATC
CGATCCGCCATGGAAGAAGAGAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAATGTTAAGAAGGTC
AATCTACTCGACCACAACTCCATCAAGCACATGCTCGACGAGTCCGTCTCCGATATCGTA
ACGAGCCGTGGGTACAAGGAGGACGTGAGGTTGAGCAACATGAAGCTGATCTTAGGGACG
GTTATCATCGCGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTCCCCGAGAACAGG
GATTTTCTGATTGGATGCATTGCATTGTATGTAGTGCTGAATGGGGTGATGCAGCTGATT
ATGTACACCAAGGAGAAGAATGCTATATTGTTCACCTATCCTCTTGAGGGATCATTCACC
AGCACTGGCTTGGTTGTATCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTGATGAGTACACTCTCACC
ATCGACAGTGCTGATCCAAAATCAATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAGTTTACCAAAAGT
GTCACCCAATGGTTCACGAAAGAGGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTCTGGAAAGACGTG
GAAGCATTAGTCAAGGACTATGCAAAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATAT
ATTATTGAAGAAACTATGTTTTCGTTTTTTAGATAATTAAACGACTTTTGTTTAGAGATG
ACATAAAATATTCCAGATAATATTACTCGAGTTTTGTTGTTATAAACAAAGTTTTCGAAA
TAATCTGAGATTTTAATAAAG*CTTTCATCTCC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4AL47JQ 770 0 0
GACCTAGAGATCTGATCCGATCCGCCATGGAAGAAGAGAAGAAGGTAGAATCGACGAACA
AGAATGTTAAGAAGGTCAATCTACTCGACCACAACTCCATCAAGCACATGCTCGACGAGT
CCGTCTCCGATATCGTAACGAGCCGTGGGTACAAGGAGGACGTGAGGTTGAGCAACATGA
AGCTGATCTTAGGGACGGTTATCATCGCGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGA
AGTTCCCCGAGAACAGGGATTTTCTGATTGGATGCATTGCATTGTATGTAGTGCTGAATG
GGGTGATGCAGCTGATTATGTACACCAAGGAGAAGAATGCTATATTGTTCACCTATCCTC
TTGAGGGATCATTCACCAGCACTGGCTTGGTTGTATCTTCAAAGCTGCCGAGGTTCTCTG
ATGAGTACACTCTCACCATCGACAGTGCTGATCCAAAATCAATTTCAGCTGGGAAGTCAG
TCCAGTTTACCAAAAGTGTCACCCAATGGTTCACGAAAGAGGGAGTTCTTGTTGAGGGTT
TGTTCTGGAAAGACGTGGAAGCATTAGTCAAGGACTATGCAAAAGAAGAACCAAAGAAGA
AGAAATGATGATTATATATTATTGAAGAAACTATGTTTTCGTTTTTTAGATAATTAAACG
ACTTTTGTTTAGAGATGACATAAAATATTCCAGATAATATTACTCGAGTTTTGTTGTTAT
AAACAAAGTTTTCGAAATAATCTGAGATTTTAATAAAGGCTTTCATCTCC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 4

CO CL2455Contig1 683 4 2 U
GGAGAGAAAATTCCGACAAACTTCGGCAAAACCAACGGTGACTCTCCGGCGATGAAGTAA
CTACGGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGGAGCAGGAGAAAACAACACATAGTG
AGGAAACAAACGGTTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCTGGTTAGGCTCCAAACTCGA
GCAAGAGCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCCACATTCTCTCCACGCACGA
TGCGTCTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGACCAACACCGTTCCCATATG
AGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGGATCTCTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAA
GACAATGACAAGATCCTAGAGGTCAGTTCAGGGACAGTATTACTACTACACAGCGGCTGC
AGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTATTCTTCTTCATATCTCAGTTC
TGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAATCAGAGAGTCCACATACAAGT
ACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTGACTAGATCGATCCTACGGTAC
AGATCTCGTAGTACCAACAGGCTTGGGGGTCCACATTTGTCTGGTTAAAGAACTTCAATA
ATTTGTAGTGATGTCACGTGGTG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4AU53JQ C 1
AF RR4AU53TF U 1
AF RR4B245TF U 1
AF RR4B245JQ C 1
BS 1 681 RR4AU53TF
BS 682 683 RR4AU53JQ

RD RR4AU53JQ 683 0 0
GGAGAGAAAATTCCGACAAACTTCGGCAAAACCAACGGTGACTCTCCGGCGATGAAGTAA
CTACGGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGGAGCAGGAGAAAACAACACATAGTG
AGGAAACAAACGGTTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCTGGTTAGGCTCCAAACTCGA
GCAAGAGCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCCACATTCTCTCCACGCACGA
TGCGTTTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGACCAACACCGTTCCCATATG
AGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGGATCTCTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAA
GACAATGACAAGATCCTAGAGGTCAGTTCAGGGACAGTATTACTACTACACAGCGGCTGC
AGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTATTTTTCTTCATATCTCAGTTC
TGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAATCAGAGAGTCCACATACAAGT
ACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTGACTAGATCGATCCTACGGTAC
AGATCTCGTAGTACCAACAGGCTTGGGGGTCCACATTTGTCTGGTTAAAGAACTTCAATA
ATTTGTAGTGATGTCACGTGGTG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4AU53TF 683 0 0
GGAGAGAAAATTCCGACAAACTTCGGCAAAACCAACGGTGACTCTCCGGCGATGAAGTAA
CTACGGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGGAGCAGGAGAAAACAACACATAGTG
AGGAAACAAACGGTTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCTGGTTAGGCTCCAAACTCGA
GCAAGAGCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCCACATTCTCTCCACGCACGA
TGCGTCTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGACCAACACCGTTCCCATATG
AGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGGATCTCTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAA
GACAATGACAAGATCCTAGAGGTCAGTTCAGGGACAGTATTACTACTACACAGCGGCTGC
AGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTATTCTTCTTCATATCTCAGTTC
TGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAATCAGAGAGTCCACATACAAGT
ACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTGACTAGATCGATCCTACGGTAC
AGATCTCGTAGTACCAACAGGCTTGGGGGTCCACATTTGTCTGGTTAAAGAACTTCAATA
ATTTGTAGTGATGTCACGTGG
TG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4B245TF 681 0 0
GGAGAGAAAATTCCGACAAACTTCGGCAAAACCAACGGTGACTCTCCGGCGATGAAGTAA
CTACGGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGGAGCAGGAGAAAACAACACATAGTG
AGGAAACAAACGGTTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCTGGTTAGGCTCCAAACTCGA
GCAAGAGCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCCACATTCTCTCCACGCACGA
TGCGTCTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGACCAACACCGTTCCCATATG
AGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGGATCTCTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAA
GACAATGACAAGATCCTAGAGGTCAGTTCAGGGACAGTATTACTACTACACAGCGGCTGC
AGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTATTCTTCTTCATATCTCAGTTC
TGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAATCAGAGAGTCCACATACAAGT
ACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTGACTAGATCGATCCTACGGTAC
AGATCTCGTAGTACCAACAGGCTTGGGGGTCCACATTTGTCTGGTTAAAGAACTTCAATA
ATTTGTAGTGATGTCACGTGG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4B245JQ 683 0 0
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CTACGGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGGAGCAGGAGAAAACAACACATAGTG
AGGAAACAAACGGTTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCTGGTTAGGCTCCAAACTCGA
GCAAGAGCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCCACATTCTCTCCACGCACGA
TGCGTTTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGACCAACACCGTTCCCATATG
AGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGGATCTTTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAA
GACAATGACAAGATCCTAGAGGTCAGTTCAGGGACAGTATTACTACTACACAGCGGCTGC
AGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTATTTTTCTTCATATCTCAGTTC
TGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAATCAGAGAGTCCACATACAAGT
ACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTGACTAGATCGATCCTACGGTAC
AGATCTCGTAGTACCAACAGGCTTGGGGGTCCACATTTGTCTGGTTAAAGAACTTCAATA
ATTTGTAGTGATGTCACGTGG
TG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL2456Contig1 674 4 1 U
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TCAGAAAAGAGAGAATCCATGGCTCCCAAAGCAGCAGAGAAGAAGCCCGCTGAGAAGAAG
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AGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCGGCGAGT
CTTCAAAGCTCGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTTCCCGTGAGATCCAGACGG
CGGTGAGACTCGTCTTGCCTGGAGAGCTGGCGAAGCACGCCGTCTCGGAGGGTACCAAGG
CGGTTACCAAGTTCACGAGCTCCTGAACTTTGATTTAGTTTTCTTTTTTTTAAAAAAAAA
TCTGGATTCTGGATTAGGGTTTGTAGAATTTCATTTCTTGCGATTGTAATCTCTATCTTT
TTTTTTGTAAGTACGTTTGAAATCTACGTTGAATCATTGTGTCCTCATCACTCTTAATGA
AGTTTTTATCTGCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BG40JQ C 1
AF RR4BJ57JQ C 1
AF RR4BG40TF U 1
AF RR4BJ57TF U 1
BS 1 674 RR4BG40TF

RD RR4BG40JQ 674 0 0
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AGTTTTTATCTGCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4BJ57JQ 674 0 0
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TCAGAAAAGAGAGAATCCATGGCTCCCAAAGCAGCAGAGAAGAAGCCCGCTGAGAAGAAG
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AGTTTTTATCTGCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4BG40TF 674 0 0
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QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4BJ57TF 674 0 0
GGACACCAAGCAAGAATCCAAATCAAATTCGACTTTTACATTACTCGATCTCTAGAAAAC
TCAGAAAAGAGAGAATCCATGGCTCCCAAAGCAGCAGAGAAGAAGCCCGCTGAGAAGAAG
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ACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAGGTTCACCCGGACATCGGGATCTCGAGCA
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AGTTTTTATCTGCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 2 4

CO CL2457Contig1 871 2 4 U
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AAGGAAATATAGTTTGATTTGATATCCCGTGACAAATCGTAGGAATGGCGATAACGGCGA
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TTTCACACGAGGCGATGGACGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGATGA
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GTAATATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAATTTCTAAGAACTTATGTTTTTTCATCGTT
ATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT62TF U 1
AF RR4FT62JQ C 241
BS 1 636 RR4FT62TF
BS 637 637 RR4FT62JQ
BS 638 676 RR4FT62TF
BS 677 871 RR4FT62JQ

RD RR4FT62TF 680 0 0
GGATTTTGCTCGAACATAACTGTTGAGAGATCTGGGGAGGTGTGGAACAAACAAATGAAG
AAGGAAATATAGTTTGATTTGATATCCCGTGACAAATCGTAGGAATGGCGATAACGGCGA
CTAGATTGGTATCTCTGACTCTCTTGTGGGTAGTCGTCTCTTCGTCACTCTTGCTCTCAT
CCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGTCAATGAGAAGACTGCTGATCCTAT
GGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGATCAA
TGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAAGATAGTTCCTAAAACCGC
AGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAATATGGGGAAACCACT
TTATTTCAAAGGAAGCAGTTTCCACAGGATCATTCCTAGTTTCATGATTCAAGGTGGAGA
TTTCACACGAGGCGATGGACGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGATGA
GAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCGGGACCAGA
CTCCAACGGTTCACAGTTCTTCATCACAACCGTCAC*ACAAATTGGTTGGACGGACATCA
CGTTGTGTTTGGGAAG
TATT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FT62JQ 631 0 0
GGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGATCAA
TGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAAGATAGTTCCTAAAACCGC
AGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAATATGGGGAAACCACT
TTATTTCAAAGGAAGCAGTTTCCACAGGATCATTCCTAGTTTCATGATTCAAGGTGGAGA
TTTCACACGAGGCGATGGACGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGATGA
GAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCGGGACCAGA
CTCCAACGGTTCACAGTTCTTCATCACAACCGTCACCACAAATTGGTTGGACGGACATCA
CGTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTTAGGCATGGAAGTAGTGCGGAAGATCGAAGCGCAAGG
ACAAAGCAGTGGAGAGCCCAAAGGAAAAGTTATCATTTTGGACAGTGGAGAAGTTTCTTT
GTAATATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAATTTCTAAGAACTTATGTTTTTTCATCGTT
ATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTACACT

QA 1 631 1 631
DS 



CO CL2457Contig2 833 2 2 U
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TGGCGATAACGGCGACTAGATTGGTATCTCTGACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCG
TCACACTTGCTCTCATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGTCAATGAGA
AGACTGCTGATCCTATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACT
TTGATATTCAGATCAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAAGA
TAGTTCCTAAAACCGCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGTAGCCAAGAGAGAAAGG
AGTTGGGAACATGGGGAAACCACTTTATTTCAAAGGAAGTAGCTTCCACAGGATCACTCC
TAGCTTCATGATTCAAGGTGGAGATTTCACACGAGGTGATGGGAGAGGTGGAGAGTCCAT
CTATGGCGATAAGTTTGCAGATGAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTT
ATCAATGGCAAACTCGGGACCAGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTCATCACTACCGTCAC
CACAAATTGGTTGGACGGACATCACGTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTCAGGCATGGAAGT
AGTGCGGAAGATCGAAGCTCAAGGACAAAGCAGTGGAGAGCCCAAAGGAAAAGTTGTCAT
TTTGGACAGTGGAGAAGTTTCTTTGTAATTATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAACTTC
TAAGAACTTAATGTTTTTCATCGTTATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H423TF U 1
AF RR4H423JQB C 1
BS 1 578 RR4H423TF
BS 579 833 RR4H423JQB

RD RR4H423TF 578 0 0
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ATCAATGGCAAACTCGGGACCAGACTCCAACGGTTCAC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4H423JQB 833 0 0
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TGGCGATAACGGCGACTAGATTGGTATCTCTGACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCG
TCACACTTGCTCTCATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGTCAATGAGA
AGACTGCTGATCCTATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACT
TTGATATTCAGATCAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAAGA
TAGTTCCTAAAACCGCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGTAGCCAAGAGAGAAAGG
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TAGCTTCATGATTCAAGGTGGAGATTTCACACGAGGTGATGGGAGAGGTGGAGAGTCCAT
CTATGGCGATAAGTTTGCAGATGAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTT
ATCAATGGCAAACTCGGGACCAGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTCATCACTACCGTCAC
CACAAATTGGTTGGACGGACATCACGTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTCAGGCATGGAAGT
AGTGCGGAAGATCGAAGCTCAAGGACAAAGCAGTGGAGAGCCCAAAGGAAAAGTTGTCAT
TTTGGACAGTGGAGAAGTTTCTTTGTAATTATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAACTTC
TAAGAACTTAATGTTTTTCATCGTTATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTAC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 4

CO CL2458Contig1 939 4 9 U
GGATACCTGACGCTTATGTCAACTGAAACTGGCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACTCT
CTTAACGGACACCACAGTAACGGCGTCGCATTTGACGGAACCGTCCCATCAATGGAGAGC
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CCCGCAAGGTCTGAGCCGTTCGATATTGGGTTTGTGGCCACGCGCTCACTGAACCGCGTC
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ATGCAAACGACCTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACCATC
TCGGCGTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTC
CCTCAGGAGTTTTTAGGATCAGGAGTCGATTTTCCAGTGGGAAACGTCTCATTCTTCCTC
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AGGTCGAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAATGTGTTACAATCCATCAGGCTGCTC
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GACTCATTGGCCGGGAAGTATGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATTTAGGCAATGGT
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GTTGAACTTGAGCATATTAAATTTAGTTGAAGTCAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4GV81TF U 1
AF RR4GV81JQ C 132
AF RR4DN35JQ C 398
AF RR4DN35TF U 398
BS 1 644 RR4GV81TF
BS 645 645 RR4DN35TF
BS 646 660 RR4GV81TF
BS 661 661 RR4DN35TF
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BS 710 934 RR4DN35TF
BS 935 939 RR4DN35JQ

RD RR4GV81TF 709 0 0
GGATACCTGACGCTTATGTCAACTGAAACTGGCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACTCT
CTTAACGGACACCACAGTAACGGCGTCGCATTTGACGGAACCGTCCCATCAATGGAGAGC
ACTGTTAAGAAAACAGACGACGGCTACGCCAGCGGAGGAGGAGGAGGGAAAAGCAAGGCG
TCTTTTATGACATGGACGGCGCGTGATGTTATCTACGTGGCGAGAGTCCATTGGATACCG
TGTTTGTTCGCGGTCGGAGTTCTGTTCTTCATGGGCGTGGAGTATACGCTTCAGATGATT
CCCGCAAGGTCTGAGCCGTTCGATATTGGGTTTGTGGCCACGCGCTCACTGAACCGCGTC
TTGGCAAATTCACCGGATCTTAACACCGTTTTAGCCGCACTAAACACGGTATTCGTAGCG
ATGCAAACGACCTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACCATC
TCGGCGTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTC
CCTCAGGAGTTTTTAGGATCAGGAGTCGATTTTCCAGTGGGAAACGTCTCATTCTTCCTC
TTCTACTCGGGCCACGTCGCTGGTTCGATGATAGCATCCTTGGATATGAGGAGAATGCAA
CGGTCGAGACTAGCGATGCTTTTTGATATCCTCAATGTGTTACAATCCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4GV81JQ 803 0 0
AACAGACGACGGCTACGCCAGCGGAGGAGGAGGAGGGAAAAGCAAGGCGTCTTTTATGAC
ATGGACGGCGCGTGATGTTATCTACGTGGCGAGAGTCCATTGGATACCGTGTTTGTTCGC
GGTCGGAGTTCTGTTCTTCATGGGCGTGGAGTATACGCTTCAGATGATTCCCGCAAGGTC
TGAGCCGTTCGATATTGGGTTTGTGGCCACGCGCTCACTGAACCGCGTCTTGGCAAATTC
ACCGGATCTTAACACCGTTTTAGCCGCACTAAACACGGTATTCGTAGCGATGCAAACGAC
CTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACCATCTCGGCGTGCTT
CATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGAGTT
TTTAGGATCAGGAGTCGATTTTCCAGTGGGAAACGTCTCATTCTTCCTCTTCTACTCGGG
CCACGTCGCTGGTTCGATGATAGCATCCTTGGATATGAGGAGAATGCAACGGTCGAGACT
AGCGATGCTTTTTGATATCCTCAATGTGTTACAATCCATCAGGCTGCTCGGGACGAGAGG
ACATTACACTATCGATCTTGCGGTCGGAGTTGGTGCTGGGATTCTCTTTGACTCACTGGC
CGGGAAGTACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATTTAGGCAATGGTTTTAGTTTGGT
TTCCAAAGATTCGCCAGTAATTTAATTTTGTTTTCTTTTGAAATGTTTAGTTGAACTTGA
ACATATTAAATTTAGTTGAAGTC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4DN35JQ 542 0 0
G
ACTAAACACGGTATTCGTAGCGATGCAAACTACCTATATTGTATGGACATGGTTGATGGA
AGGAAGACCGCGAGCCACCATCTCGGCGTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGTATTCTTGG
TTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGAGTTTTTAGGATCAGGAGTCGATTTTCCAGT
GGGAAACGTCTCATTCTTCCTCTTCTACTCGGGTCACGTCGCTGGTTCGATGATAGCATC
TTTGGACATGAGGAGAATGCAAAGGTTGAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAATGT
GTTACAATCCATCAGGCTGCTCGGGACGAGAGGACATTACACTATCGATCTTGCGGTCGG
AGTTGGTGCTGGGATTCTCTTTGACTCATTGGCCGGGAAGTATGAAGAGATGATGAGCAA
GAGACACAATTTAGGCAATGGTTTTAGTTTAATTTCCAAAGATTCGCCAGTAAATTAATT
**GTTTTCTTTTGAAGTGTTTAGTTGAACTTGAGCATATTAAATTTAGTTGAAGTCAGAC
T

QA 2 542 2 542
DS 

RD RR4DN35TF 542 0 0
G
ACTAAACACGGTATTCGTAGCGATGCAAACTACCTATATTGTATGGACATGGTTGATGGA
AGGAAGACCGCGAGCCACCATCTCGGCGTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGTATTCTTGG
TTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGAGTTTTTAGGATCAGGAGTCGATTTTCCAGT
GGGAAACGTCTCATTCTTCCTCTTCTACTCGGGTCACGTCGCTGGTTCGATGATAGCATC
TTTGGACATGAGGAGAATGCAAAGGTTGAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAATGT
GTTACAATCCATCAGGCTGCTCGGGACGAGAGGACATTACACTATCGATCTTGCGGTCGG
AGTTGGTGCTGGGATTCTCTTTGACTCATTGGCCGGGAAGTATGAAGAGATGATGAGCAA
GAGACACAATTTAGGCAATGGTTTTAGTTTAATTTCCAAAGATTCGCCAGTAAATTAATT
**GTTTTCTTTTGAAGTGTTTAGTTGAACTTGAGCATATTAAATTTAGTTGAAGTC
AGACT

QA 2 537 2 537
DS 



AS 1 4

CO CL2459Contig1 1130 4 10 U
TTTTTCTCACTTCTTTAAGCCTTTAATCATATACTTCGATCAGCTTTAGCTTGTCCAGCT
CTGCTTCTTCGATCACAGCAATGGCACAGGCCTCGGTGAGATTGAAGCTTGTGTGTAGCA
ACGATGGATTATCGTTCGGTGAGTATTCGAGAGACCAATTTCGTCAAGGCCTCTACACGA
CGGTTGGATCGCCGTTGATTCCCGTGCGCAGGAGCCGATTAAAGCTCGACGAGTTTCGAG
CGAGAGTTTCTTCGTCTTACTCGTTTTCTTCGAACAGAAAGAAAACTAGGGATCTCGATG
ATAACGCTGAGAAGAATCGAGAAGACGACGACGCCGCAGATGATTGGAACTTGTACGGAG
ATGATAGTGAGTTGGAGACGGATGATTTATCTTGCTTCAGATGCTTGGTTCTTGATATTT
CATACAGGCCGGTGAATGTTGTTTGCTGGAAGCGCGCAATCTGTCTGGAGTACATGGATA
AGGCCGATGTTCTGGAGTATTATGATCAGACTGTTGATTCTCCTACTGGTTCATTCTACA
TACCTGCTGTATTAAGGGTTCCACATCTGCTTCAGGTTGTTAAAAGAAGAAGAGTGAAAA
ATTC*CTGAGTCGGAAAAACATTTTACTGCGAGACGACTACACTTGTCAATATTGTACTT
CCCGTGAAAACTTGACCATTGATCATGTTATCCCCATTTCTCGAGGTGGTGAATGGACTT
GGCAAAATCTGGTAGCTGCATGTTCAAGATGCAACTCAAAGAAAGGTCACAGGACAGTAG
AGGAAGCACACATGAAGTTACTCAAGTCTCCAAAGGAACCAAAAGAGTACGACATTGTTG
CCATACCATTAACAAATGCTGCTATAAGGATGCTGAGATCGAGTAAGGGAATGCCAGAAG
AATGGCGTGAGTATCTGGCAAAGGCCTCACACGAGCCTTAGCAGTTTCTCTCAGGAATCA
ATTGTGTAAAGCGGTCCAATCTCAGTAAATACAGAAAGCAGTGGGCTCGATTGCATTTGT
AGATTCATCTAATGTAGCTTCGAAAGTTCAGGTGGTTGTGTCGGACTTGTGGTTTGAGTA
AGCATTCAGATGTATATGATACGTAAATAATGACACCATGTTCAAGCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ40TF U 1
AF RR4AW10TF U 73
AF RR4DZ40JQ C 282
AF RR4AW10JQ C 400
BS 1 571 RR4DZ40TF
BS 572 867 RR4AW10TF
BS 868 868 RR4DZ40JQ
BS 869 888 RR4AW10TF
BS 889 889 RR4DZ40JQ
BS 890 898 RR4AW10TF
BS 899 1002 RR4DZ40JQ
BS 1003 1003 RR4AW10JQ
BS 1004 1104 RR4DZ40JQ
BS 1105 1130 RR4AW10JQ

RD RR4DZ40TF 571 0 0
TTTTTCTCACTTCTTTAAGCCTTTAATCATATACTTCGATCAGCTTTAGCTTGTCCAGCT
CTGCTTCTTCGATCACAGCAATGGCACAGGCCTCGGTGAGATTGAAGCTTGTGTGTAGCA
ACGATGGATTATCGTTCGGTGAGTATTCGAGAGACCAATTTCGTCAAGGCCTCTACACGA
CGGTTGGATCGCCGTTGATTCCCGTGCGCAGGAGCCGATTAAAGCTCGACGAGTTTCGAG
CGAGAGTTTCTTCGTCTTACTCGTTTTCTTCGAACAGAAAGAAAACTAGGGATCTCGATG
ATAACGCTGAGAAGAATCGAGAAGACGACGACGCCGCAGATGATTGGAACTTGTACGGAG
ATGATAGTGAGTTGGAGACGGATGATTTATCTTGCTTCAGATGCTTGGTTCTTGATATTT
CATACAGGCCGGTGAATGTTGTTTGCTGGAAGCGCGCAATCTGTCTGGAGTACATGGATA
AGGCCGATGTTCTGGAGTATTATGATCAGACTGTTGATTCTCCTACTGGTTCATTCTACA
TACCTGCTGTATTAAGGGTTCCACATCTGCT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4AW10TF 826 0 0
GG
ACAGCAATGGCACATGCCTCGGTGAGATTGAAGCTTGTGTGTAGCAACGATGGATTATCG
TTCGGTGAGTATTCGAGAGACCAATTTCGTCAAGGCCTCTACACGACGGTTGGATCGCCG
TTGATTCCCGTGCGCAGGAGCCGATTAAAGCTCGACGAGTTTCGAGCGAGAGTTTCTTCG
TCTTACTCGTTTTCTTCGAACAGAAAGAAAACTAGGGATCTCGATGATAACGCTGAGAAG
AATCGAGAAGACGACGACGCCGCAGATGATTGGAACTTGTACGGAGATGATAGTGAGTTG
GAGACGGATGATTTATCTTGCTTCAGAGGCTTGGTTCTTGATATTTCATACAGGCCGGTG
AATTTTGTTTGCTGGAAGCGCGCAATCTGTCTGGAGTACATGGATAAGGCCGATGTTCTG
GAGTATTATGATCAGACTGTTGATTCTCCTACTGGTTCATTCTACATACCTGCTGTATTA
AGGGTTCCACATCTGCTTCAGGTTGTTAAAAGAAGAAGAGTGAAAAATTC*CTGAGTCGG
AAAAACATTTTACTGCGAGACGACTACACTTGTCAATATTGTACTTCCCGTGAAAACTTG
ACCATTGATCATGTTATCCCCATTTCTCGAGGTGGTGAATGGACTTGGCAAAATCTGGTA
GCTGCATGTTCAAGATGCAACTCAAAGAAAGGTCACAGGACAGTAGAGGAAGCACACATG
AAGTTACTCAAGTCTCCAAAGGAACCAAAAGAGTACGACATTGTTGCCATACCATTAACA
AATGCTGCTATAACGATGCTGAGATCGAGTAAGG*AATGCCAGA

QA 3 826 3 826
DS 

RD RR4DZ40JQ 823 0 0
AAAACTAGGGATCTCGATGATAACGCTGAGAAGAATCGAGAAGACGACGACGCCGCAGAT
GATTGGAACTTGTACGGAGATGATAGTGAGTTGGAGACGGATGATTTATCTTGCTTCAGA
TGCTTGGTTCTTGATATTTCATACAGGCCGGTGAATGTTGTTTGCTGGAAGCGCGCAATC
TGTCTGGAGTACATGGATAAGGCCGATGTTCTGGAGTATTATGATCAGACTGTTGATTCT
CCTACTGGTTCATTCTACATACCTGCTGTATTAAGGGTTCCACATCTGCTTCAGGTTGTT
AAAAGAAGAAGAGTGAAAAATTCACTGAGTCGGAAAAACATTTTACTGCGAGACGACTAC
ACTTGTCAATATTGTACTTCCCGTGAAAACTTGACCATTGATCATGTTATCCCCATTTCT
CGAGGTGGTGAATGGACTTGGCAAAATCCGGTAGCTGCATGTTCAAGATGCAACTCAAAG
AAAGGTCACAGGACAGTAGAGGAAGCACACATGAAGTTACTCAAGTCTCCAAAGGAACCA
AAAGAGTACGACATTGTTGCCATACCATTAACAAATGCTGCTATAAGGATGCTGAGATCG
AGTAAGGGAATGCCAGAAGAATGGCGTGAGTATCTGGCAAAGGCCTCACACGAGCCTTAG
CAGTTTCTCTCAGGAATCAATTGTGTAAAGCGGTCCAATCTCAGTAAATACAGAAAGCAG
TTGGCTCGATTGCATTTGTAGATTCATCTAATGTAGCTTCGAAAGTTCAGGTGGTTGTGT
CGGACTTGTGGTTTGAGTAAGCATTCAGATGTATATGATACGT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4AW10JQ 731 0 0
GAG
GCTTGGTTCTTGATATTTCATACAGGCCGGTGAATTTTGTTTGCTGGAAGCGCGCAATCT
GTCTGGAGTACATGGATAAGGCCGATGTTCTGGAGTATTATGATCAGACTGTTGATTCTC
CTACTGGTTCATTCTACATACCTGCTGTATTAAGGGTTCCACATCTGCTTCAGGTTGTTA
AAAGAAGAAGAGTGAAAAATTC*CTGAGTCGGAAAAACATTTTACTGCGAGACGACTACA
CTTGTCAATATTGTACTTCCCGTGAAAACTTGACCATTGATCATGTTATCCCCATTTCTC
GAGGTGGTGAATGGACTTGGCAAAATCTGGTAGCTGCATGTTCAAGATGCAACTCAAAGA
AAGGTCACAGGACAGTAGAGGAAGCACACATGAAGTTACTCAAGTCTCCAAAGGAACCAA
AAGAGTACGACATTGTTGCCATACCATTAACAAATGCTGCTATAAGGATGCTGAGATCGA
GTAAGGGAATGCCAGAAGAATGGCGTGAGTATCTGGCAAAGGCCTCACACGAGCCTTAGC
AGTTTCTCTCAGGAATCAATTGTGTAAAGCGGTCCAATCTCAGTAAATACAGAAAGCAGT
GGGCTCGATTGCATTTGTAGATTCATCTAATGTAGCTTCGAAAGTTCATGTGGTTGTGTC
GGACTTGTGGTTTGAGTAAGCATTCAGATGTATATGATACGTAAATAATGACACCATGTT
CAAGCACG

QA 4 731 4 731
DS 



AS 1 2

CO CL2460Contig1 839 2 2 U
CTGACCACGAAGCTCTGGAAAGCAGGAAGCCGTAAACCTTTTTTTTTTCCACCTTCTAGT
GTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCACA
AGGATAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGATC
TGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTG
TGTAAGTACTCTCTTTTTAAAAGCCTGCCATCTTAATTTTATCTTAAATTCTTTTTCCTT
TCTGTGCAGTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATT
CAGACTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAA
GTTCAGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAA
AGGCTCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCT
TGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGG
CACCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCT
TGAGACAATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTTACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCC
AGTCGCTGAAGCTTGAGGAGATACAATGTTGTTTTAATTCTTCTTTTTTGTCGGATAGTT
TTGGTTCTGTTTGAGAGTAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTTCTTGTTAAAGTTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB52TF U 1
AF RR4FB52JQ C 43
BS 1 678 RR4FB52TF
BS 679 839 RR4FB52JQ

RD RR4FB52TF 685 0 0
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GTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCACA
AGGATAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGATC
TGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTG
TGTAAGTACTCTCTTTTTAAAAGCCTGCCATCTTAATTTTATCTTAAATTCTTTTTCCTT
TCTGTGCAGTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATT
CAGACTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAA
GTTCAGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAA
AGGCTCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCT
TGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGG
CACCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCT
TGAGACAATGGTTGGTGT
GTACAGG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FB52JQ 797 0 0
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CTCAGAACAAGATCCACAAGGATAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTG
CTCAGGCTTTCTTTGATCTGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATC
TCTACATTAACCAAGCTGTGTAAGTACTCTCTTTTTAAAAGCCTGCCATCTTAATTTTAT
CTTAAATTCTTTTTCCTTTCTGTGCAGTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGT
TGTGATTTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGT
CAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAAT
CATGCGTCCTCCTAAGAAAGGTTCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTC
CGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTAC
CAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAA
TAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTTACAGGGAAAGA
TGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCGCTGAAGCTTGAGGAGATACAATGTTGTTTTAATTCTT
CTTTTTTGTCGGATAGTTTTGGTTCTGTTTGAGAGTAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTT
CTTGTTAAAGTTGCTCC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 4

CO CL2461Contig1 708 4 14 U
TTTTTTTTTGGCACATCAAATTCCAGATCGAGCCTGGCCATATATTACCACATAGTGTAA
ACAATGATTCTAAAAACATACATCAAAGTTTCAAGACAAAATCTTCTAATCTTGTTTGAT
AAAAACTGACTTAACCTCAAAATGATGTTTCATACATCAGAGTTAAAAAACTTATTATAA
CAAGCAAATCCCAAGTCTATCACCCAAGTTCTCCGCAAACCAAAATGCAAAAGAAGCATA
GAGAAAGAAAAAGAAAGATTATTTCGACTTCTTTCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTC
GATGTACATGATGCCTTTTCCCTTGTAAACTTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACTGTGGC
AGCAAACTGATGCACCCTGTCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCAAATTGTTCTTGAA
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AAGGTATAAGAAACGGCCAGCTTCCTCAGCTCTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATCTT
CAAGAACCTAAAGAACTTGGCTTCCATCTTCCCGTGTTGTTCTGCTTGCCACAAGAGTTA
CCTGTCTTGATTTCCAGCGAAAAGAAAAGAGGACTAATGTGGCGGTGCTTGTTGTTCGCC
GGCGGATCCAGACCACTACCTAACTCCTCCGGCCTTTAAAACCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FD61JQ U 10
AF RR4FD61TF C 1
AF RR4GA01JQ U 92
AF RR4GA01TF C 92
BS 1 9 RR4FD61TF
BS 10 91 RR4FD61JQ
BS 92 264 RR4GA01JQ
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BS 624 669 RR4GA01JQ
BS 670 708 RR4FD61TF

RD RR4FD61JQ 636 0 0
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CCCAAGTCTATCACCCAAGTTCTCCGCAAACCAAAATGCAAAAGAAGCATAGAGAAAGAA
AAAGAAAGATTATTTCGACTTCTTTCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTCGATGTACAT
GATGCCTTTTCCCTTGTAAACTTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACTGTGGCAGCAAACTG
ATGCACCCTGTCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCAAATTGTTCTTGAAACAGAAGAC
ACGAACAGCCGGAGGAACCGCGAGCTGAACTTCGTGACTGTAACCCAGCTTAAGGTATAA
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AAAGAACTTGGCTTCCATCTTCCCGTGTTGTTCTGCTTGCCACAAGAGTTACCTGTCTTG
ATTTCCAGCGAAAAGAAAAGAGGAC
GGTGCTTGTTG

QA 1 625 1 625
DS 

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AAAAACTGACTTAACCTCAAAATGATGTTTCATACATCAGAGTTAAAAAACTTATTATAA
CAAGCAAATCCCAAGTCTATCACCCAAGTTCTCCGCAAACCAAAATGCAAAAGAAGCATA
GAGAAAGAAAAAGAAAGATTATTTCGACTTCTTTCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTC
GATGTACATGATGCCTTTTCCCTTGTAAACTTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACTGTGGC
AGCAAACTGATGCACCCTGTCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCAAATTGTTCTTGAA
ACAGAAGACACGAACAGCCGGAGGAACCGCGAGCTGAACTTCGTGACTGTAACCCAGCTT
AAGGTATAAGAAACGGCCAGCTTCCTCAGCTCTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATCTT
CAAGAACCTAAAGAACTTGGCTTCCATCTTCCCGTGTTGTTCTGCTTGCCACAAGAGTTA
CCTGTCTTGATTTCCAGCGAAAAGAAAAGAGGAC*********GGTGCTTGTTGTTCGCC
GGCGGATCCAGACCACTACCTAACTCCTCCGGCCTTTAAAACCTTCTT

QA 1 708 1 708
DS 

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CCGTGTTTTTCTGCTTGCCACAAGAGTTACCTGTCTTGATTTCCAGCGAAATGAAAAGAG
GACTAATGTGGCGGTGCTTGTTGTTCGCCGGCGGATCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4GA01TF 578 0 0
CAAGACAAAATCTTCTAATCTTGTTTGATAAAAACTGACTTAACCTCAAAATGATGTTTC
ATACATCAGAGTTAAAAAACTTATTATAACAAGCAAATCCCAAGTCTATCACCCAAGTTC
TCCGCAAACCAAAATGCAAAAGAAGCATAGAGAAAGAAAAAGAAAGATTATTTGGACTTC
TTTCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTCGATGTACATGATGCCTTTTCCCTTGTAAACT
TCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACTGTGGCAGCAAACTGATGCACCCTGTCCTTGTCGATC
CCGGTGCAGCAAACCACATTGTTCTTGAAACAGAAGACACGAACAGCCGGAGGAACCGCG
AGTTCAACTTCGTGACTGTAACCCAGCTTAAGGTATAAGAAACGGCCAGCTTCCTCAGCT
CTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATCTTCAAGAACCTAAAGAACTTGGCTTCCATCTTC
CCGTGTTTTTCTGCTTGCCACAAGAGTTACCTGTCTTGATTTCCAGCGAAATGAAAAGAG
GACTAATGTGGCGGTGCTTGTTGTTCGCCGGCGGATCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 4

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GGGGGATCGGATCATTCATCAGCGTCTTCGTCTTTCGCTGTCATCCGTCTTCGAATTACG
AAATCATGATACATTTCGTGCTTCTAGTTAGCCGCCAAGGAAAAGTTAGGCTCACCAAAT
GGTACTCGCCTTACACTCAGAAGGAAAGATCTAAGGTTATACGTGAGCTCAGTGGAGTGA
TTCTGAATCGAGGTCCAAAGCTCTGCAATTTCGTCGAGTGGAGAGGCTACAAAGTCGTCT
ACAAAAGATACGCGAGCCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATAACGAGCTAG
AGGTCCTTGAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAATTGTGT
GTGAACTCGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTACATATTGGATGAACTTTTGA
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ATCAAATGGTGGAAGCGGCAAAAGAGGAAGCTGGTTCCATAAGCAATATCATCGCTCAGG
CTACTAGATAGTTTCTTTCACTCTTCTACTTGCGTCTTCCATACATGTGTTCCTGCGCCC
CTGGCTGCTAAGTTAAATGTTCTGACAATCTTTTTTTTTTTTAAATCTCCTAATGACTGA
AGAAGTGTGAATATGTTTTTGATCGAATAAGTGTTTTTTTTTTTATAAATTTAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV12TF U 1
AF RR4AR84TF U 16
AF RR4AW42TF U 1
AF RR4AR84JQ C 54
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BS 300 354 RR4AV12TF
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CGA

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DS 

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GG
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TTTGAT

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ACAAAAGATACGCGAGCCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATAACGAGCTGG
AGGTCCTTGAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAAGTGTGT
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CGA

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DS 

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AC

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DS 



AS 1 4

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TTCTTTGTCTTCGTTGTCAACTTGGACATTAACCCTTATAACAGTGGGATGCCTTATGCT
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TAAAGTGACTACCATCGTCCGGGGAATCATCGTCAACGAGCTAAGATCGGATCCTCGTAT
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TCTTTCTAATAACAATCTTCCTGCTCCATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTT
CAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCCGGGGGTCACACTTT
TGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGG*ACAGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTT
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AGTTCTTCAATGCGTTTATAAAGGCGATGGATAGAATGGGAAACATTACCCCTCTCACAG
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ATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAGCTCTATGTAATAATAGTTGGCTCAATATATGT
GGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATAATAAAACGCTCTCCTAATCTTGTTTAAGGA
T


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D291TF U 1
AF RR4B787TF U 1
AF RR4GO76JQ C 430
AF RR4B787JQ C 357
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G

QA 1 832 1 832
DS 

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GATCTTGCTAGACAACACAACATCATTTCGAACAGAAAAAGATGCCGCGCCAAATGCAAA
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TGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGGGACAGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTT
TACCCGACCCTACCCTCAACACTACTTATCTCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTA
ATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTGATCTACGTACACCGACAGTTTTTGACA*CA
AATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTC

QA 1 866 1 866
DS 

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TTCATGGAGGGTTCCTTTGGGAAGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAA
TAACAATCTTCCTGCTCCATTCTTCACGCTTCCCCAACTTGAAGCCAGTTTCAGCAATGT
CGGGCTTAACCTTCCTTCTGATCTCGATGCCCTTTCCGGGGGTCACACTTTTGGTAAAAA
CCAATGCCGGTTTATTATGG*ACAGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTTTACCCGACC
CTACCCTCAACACTACTTATCTCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAATGGTAACC
AGAGCGTTCTAGTGGATTTTGATCTACGTACACCGACGGTTTTTGACAACAAATATTATG
TGAATCTGAAAGAGCTCAAAGGACTTATCCAAACCGATCAAGAGCTGTTCTCAAGCCCCA
ATGCCACTGATACTATCCCCTTGGTGAGAGAATACGCTGATGGCACACAAAAGTTCTTCA
ATGCGTTTATAAAGGCGATGGATAGAATGGGAAACATTACCCCTCTCACAGGATCTCAGG
GACAGATCAGACAAAACTGTAGGGTGGTGAACTCCAACTCTCTGCTCCATGATGTTGTTG
AAATCGTCGACTTTGTCAGCTCTATGTAATAATAGTTGGCTCAATATATGTGGCAACTAA
TATGTAAG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4B787JQ 845 0 0
CAAACTCGGCTCGAGGATTTCCAGTGGTTGACAGAATGAAAACAGCAGTGGAGGCACAAT
GTCCGGGGACTGTTTCATGTGCAGATATTCTAACTATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATC
TGGCAGGAGGTCCTTCATGGAGGGTTCCTTTGGGAAGACGAGATGGCCTACAAGCTTTCT
TTAATCTTTCTAATAACAATCTTCCTGCTCCATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCA
GTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCCGGGGGTCACA
CTTTTGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGG*ACAGGCTATACAACTTCACCAACACT
GGTTTACCCGACCCTACCCTCAACACTACTTATCTCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCT
CGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTGATCTACGTACACCGACAGTTTTTGAC
AACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCTAAGGACTTATCCAAACCGATCAAGAGCTG
TTCTCAAGCCCCAATGCCACTGATACTATCCCCTTGGTGAGAGAATACGCTGATGGCACA
CAAAAGTTCTTCAATGCGTTTATAAAGGCGATGGGTAGAATGGGAAACATTACCCCTCTC
ACAGGATCTCAGGGACAGATCAGACAAAACTGTAGGGTGGTGAACTCCAACTCTCTGCTC
CATGATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAGCTCTATGTAATAATAGTTGGCTCAATAT
ATGTGGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATAATAAAACGCTCTCCTAATCTTGTTTA
AGGAT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 3

CO CL2464Contig1 964 3 7 U
GTGCTTTTCTTATGGCATGGATCTTCAGACTTGAAAAGGTTAACATCAAGAAAATACACA
GCCAAGCCAAGATTCTAGGGACAGTTGTGACAGTTGGTGGAGCAATGCTTATGACTGTTG
TGAAAGGACCTTTAGTTCCATTGCCTTGGGCTAATCCTAACGATAGTCATCAAGATTCAT
CTAATCCCGGTGTCACACCAGATCTTACAAAAGGCGCACTCCTCATTGCTATCGGTTGCA
TCTGTTGGGCCGGTTTTGTCAATCTCCAAGCAATCACGCTTAAATCGTACCCGGTGGAGC
TATCCTTGACAGCTTACATATGCTTAATGGGGTCTATTGAAGGCACTATTGTGGCACTTT
TTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGCTTGGGCTATTCAACTGGATTCAAAATTGCTAGCCG
CTGTTTATGGTGGAGTAATATGTTCAGGTGTTGGTTACTACGTTCAAGGAGTAATAATGA
AAACTAGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCCTTCAATCCACTAAGCATGGTCATTGTTGCGA
TTTTGGGTTCTATTATTCTTGCTGAGGTTATGTACCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAATAG
TGATAGTTCTTGGGCTCTATTCGGTTTTGTGGGGCAAAAGCAAAGACGAACCATCTAATT
CGTTTTCAGACATGGACACAGAGCTCCCACGTAGTACTCCACAAGTTGTGACATTCTCGT
TGAAAGCAAACACAGAAATGGACATCAAGGATGCAAGTGTCGTGATCTAAAGGGCTAACA
CCAGTGAATCAGTCTAAAATAAAACAAAGCACTAACGGCGATTTTAAAAATATAATAAAC
GAAAACAATGAGTCCGATTTCCAAATACGGGATCGGTACTGATTGGTAGAGTCAAGAGTT
TGTATTGCTAATTGGCTTTGTTAAATTTTGTATCCGACTATAATATATGAAATGTTTTTG
CAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4CR84TF U 1
AF RR4GC80TF U 25
AF RR4CR84JQ C 155
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BS 731 748 RR4GC80TF
BS 749 964 RR4CR84JQ

RD RR4CR84TF 631 0 0
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GCCAAGCCAAGATTCTAGGGACAGTTGTGACAGTTGGTGGAGCAATGCTTATGACTGTTG
TGAAAGGACCTTTAGTTCCATTGCCTTGTGCTAATCCTAACGATAGTCATCAAGATTCAT
CTAATCCCGGTGTCACACCAGATCTTACAAAAGGCGCACTCCTCATTGCTATCGGTTGCA
TCTGTTGGGCCGGTTTTGTCAATCTCCAAGCAATCACGCTTAAATCGTACCCGGTGGAGC
TATCCTTGACAGCTTACATATGCTTAATGGGGTCTATTGAAGGCACTATTGTGGCACTTT
TTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGCTTGGGCTATTCAACTGGATTCAAAATTGCTAGCCG
CTGTTTATGGTGGAGTAATATGTTCAGGTGTTGGTTACTACGTTCAAGGAGTAATAATGA
AAACTAGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCCTTCAATCCACTAAGCATGGTCATTGTTGCGA
TTTTGGGTTCTATTATTCTTGCTGAGGTTATGTACCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAATAG
TGATAGTTCTTGGGCTCTATTCGGTTTTGTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4GC80TF 724 0 0
G
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TGTGACAGTTGGTGGAGCAATGCTTATGACTGTTGTGAAAGGACCTTTAGTTCCATTGCC
TTGGGCTAATCCTAACGATAGTCATCAAGATTCATCTAATCCCGGTGTCACACCAGATCT
TACAAAAGGCGCACTCCTCATTGCTATCAGTTGCATCTGTTGGGCCGGTTTTGTCAATCT
CCAAGCAATCACGCTTAAATCGTACCCGGTGGAGCTATCCTTGACAGCTTACATATGCTT
AATGGGGTCTATTGAAGGCACTATTGTGGCACTTTTTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGC
TTGGGCTATTCAACTGGATTCAAAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGAGTAATATGTTC
AGGTGTTGGTTACTACGTTCAAGGAGTAATAATGAAAACTAGAGGACCGGTGTTTGTGAC
TGCCTTCAATCCACTAAGCATGGTCATTGTTGCGATTTTGGGTTCTATTATTCTTGCTGA
GGTTATGTACCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAATAGTGATAGTTCTTGGGCTCTATTCGGT
TTTGTGGGGCAAAAGCAAAGACGAACCATCTAATTCGTTTTCAGACATGGACACAGAGCT
CCCACGTAGTACTCCACAAGTTGTGACATTCTCGTTGAAAGCAA*CACAGAAATGGACAT
CAA

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR4CR84JQ 810 0 0
TCCTAACGATAGTCATCAAGATTCATCTAATCCCGGTGTCACACCAGATCTTACAAAAGG
CGCACTCCTCATTGCTATCGGTTGCATCTGTTGGGCCGGTTTTGTCAATCTCCAAGCAAT
CACGCTTAAATCGTACCCGGTGGAGCTATCCTTGACAGCTTACATATGCTTAATGGGGTC
TATTGAAGGCACTATTGTGGCACTTTTTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGCTTGGGCTAT
TCAACTGGATTCAAAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGAGTAATATGTTCAGGTGTTGG
TTACTACGTTCAAGGAGTAATAATGAAAACTAGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCCTTCAA
TCCACTAAGCATGGTCATTGTTGCGATTTTGGGTTCTATTATTCTTGCTGAGGTTATGTA
CCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAATAGTGATAGTTCTTGGGCTCTATTCGGTTTTGTGGGG
CAAAAGCAAAGACGAACCATCTAATTCGTTTTCAGACATGGACACAGAGCTCCCACGTAG
TACTCCACAAGTTGTGACATTCTCGTTGAAAGCAAACACAGAAATGGACATCAAGGATGC
AAGTGTCGTGATCTAAAGGGCTAACACCAGTGAATCAGTCTAAAATAAAACAAAGCACTA
ACGGCGATTTTAAAAATATAATAAACGAAAACAATGAGTCCGATTTCCAAATACGGGATC
GGTACTGATTGGTAGAGTCAAGAGTTTGTATTGCTAATTGGCTTTGTTAAATTTTGTATC
CGACTATAATATATGAAATGTTTTTGCAGT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 4

CO CL2465Contig1 579 4 3 U
GAGACCAGTGAGTTCTCCTCGTGACCCGAGAACGAGGAAATTCGACCAAAAGGACGTGAG
AAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAGATCCGAAACCCAGAGGCGAAACTGGCGTGATAATAA
TGATGTCAAGAGCACAAGACAGCAGCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATC
ACCAGAGACACGGCGGAAACCAGTTCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCA
CCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCCTCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCCTAAATC
CGGAACAGGAAGCAGCAGTTTTAACACGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACCGTTCTC
TCGGTTGGTAGGATCGACAACAACGAAACCAAAGCATATTAATGGCTACTGAGAGACATT
GTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATTGGTTTTAGTTCCGACTAATTGGGTCTTTTAAGTTCT
CGAGCACATCTCATGGTATACTACTTTGTGGGAATGGTATGTGGGAGATTTGAATGTGAT
ATGGTTTCCCTTTAAGAATGGGGTTGGATTACATAACCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A029TF U 115
AF RR4A029JQ C 1
AF RR4A029JQD C 1
AF RR4A029TFB U 1
BS 1 114 RR4A029TFB
BS 115 368 RR4A029TF
BS 369 579 RR4A029TFB

RD RR4A029TF 257 0 0
TAATAATGATGTCAAGAGCACAAGACAGCAGCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCA
TCCATCACCAGAGACACGGCGGAAACCAGTTCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAAC
AGGGCACCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCCTCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCC
TAAATCCGGAACAGGAAGCAGCAGTTTTAACACGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACC
GTTCTCTCGGTTGG
GTA

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR4A029JQ 579 0 0
GAGACCAGTGAGTTCTCCTCGTGACCCGAGAACGAGGAAATTCGACCAAAAGGACGTGAG
AAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAGATCCGAAACCCAGAGGCGAAACTGGCGTGATAATAA
TGATGTCAAGAGCACAAGACAGCAGCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATC
ACCAGAGACACGGCGGAAACCAGTTCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCA
CCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCCTCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCCTAAATC
CGGAACAGGAAGCAGCAGTTTTAACACGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACCGTTCTC
TCGGTTGGTAGGATCGACAACAACGAAACCAAAGCATATTAATGGCTACTGAGAGACATT
GTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATTGGTTTTAGTTCCGACTAATTGGGTCTTTTAAGTTCT
CGAGCACATCTCATGGTATACTACTTTGTGGGAATGGTATGTGGGAGATTTGAATGTGAT
ATGGTTTCCCTTTAAGAATGGGGTTGGATTACATAACCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4A029JQD 579 0 0
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AAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAGATCCGAAACCCAGAGGCGAAACTGGCGTGATAATAA
TGATGTCAAGAGCACAAGACAGCAGCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATC
ACCAGAGACACGGCGGAAACCAGTTCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCA
CCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCCTCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCCTAAATC
CGGAACAGGAAGCAGCAGTTTTAACACGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACCGTTCTC
TCGGTTGGTAGGATCGACAACAACGAAACCAAAGCATATTAATGGCTACTGAGAGACATT
GTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATTGGTTTTAGTTCCGACTAATTGGGTCTTTTAAGTTCT
CGAGCACATCTCATGGTATACTACTTTGTGGGAATGGTATGTGGGAGATTTGAATGTGAT
ATGGTTTCCCTTTAAGAATGGGGTTGGATTACATAACCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4A029TFB 579 0 0
GAGACCAGTGAGTTCTCCTCGTGACCCGAGAACGAGGAAATTCGACCAAAAGGACGTGAG
AAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAGATCCGAAACCCAGAGGCGAAACTGGCGTGATAATAA
TGATGTCAAGAGCACAAGACAGCAGCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATC
ACCAGAGACACGGCGGAAACCAGTTCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCA
CCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCCTCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCCTAAATC
CGGAACAGGAAGCAGCAGTTTTAACACGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACCGTTCTC
TCGGTTGGTAGGATCGACAACAACGAAACCAAAGCATATTAATGGCTACTGAGAGACATT
GTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATTGGTTTTAGTTCCGACTAATTGGGTCTTTTAAGTTCT
CGAGCACATCTCATGGTATACTACTTTGTGGGAATGGTATGTGGGAGATTTGAATGTGAT
ATGGTTTCCCTTTAAGAATGGGGTTGGATTACATAACCC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

CO CL2466Contig1 593 4 1 U
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TAAGCCATCAAGTAAGTTCCTCACCAGGGCTCCAATTAGGGTTTAGATTCGTAATCTCTA
GTCTGTCCTTTTGATCGATTTGGTCCTTTTGATTCGTTTTTTCAGAGGTAGTGAATGATG
ACGACGAGGTTTCGTTTGAATCTTTTTTTGTATATGTTTTAAAACTCAGATTCACGGATA
AGCAGAAGATGAAAAACAGCAGGAGACGGAGAGAAGAGGCGGAAGCAGAAGAATCAGCAA
ATACGGAGAAGTTTCAAAGATGGAGGTTGTGGCGGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAAGCA
GTGCGGAGGAGGCGAAGCAGTTGGCGATTTTTTTTTTAGATCTAGTTTCTAAACCCGGTT
TGTATGTAAACCGGTTTAATTTGTAAACCAAAATTGTAATCTGGTTTAATTTA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DX60TF U 1
AF RR4E893JQ C 1
AF RR4E893TF U 1
AF RR4DX60JQ C 49
BS 1 593 RR4DX60TF

RD RR4DX60TF 593 0 0
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TAAGCCATCAAGTAAGTTCCTCACCAGGGCTCCAATTAGGGTTTAGATTCGTAATCTCTA
GTCTGTCCTTTTGATCGATTTGGTCCTTTTGATTCGTTTTTTCAGAGGTAGTGAATGATG
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AGCAGAAGATGAAAAACAGCAGGAGACGGAGAGAAGAGGCGGAAGCAGAAGAATCAGCAA
ATACGGAGAAGTTTCAAAGATGGAGGTTGTGGCGGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAAGCA
GTGCGGAGGAGGCGAAGCAGTTGGCGATTTTTTTTTTAGATCTAGTTTCTAAACCCGGTT
TGTATGTAAACCGGTTTAATTTGTAAACCAAAATTGTAATCTGGTTTAATTTA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4E893JQ 593 0 0
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TCATTGATTCATGTCTCAAGCCCAAGCGAATCTCCAATCAAAACAGAATCTGACATCGAC
TAAGCCATCAAGTAAGTTCCTCACCAGGGCTCCAATTAGGGTTTAGATTCGTAATCTCTA
GTCTGTCCTTTTGATCGATTTGGTCCTTTTGATTCGTTTTTTCAGAGGTAGTGAATGATG
ACGACGAGGTTTCGTTTGAATCTTTTTTTGTATATGTTTTAAAACTCAGATTCACGGATA
AGCAGAAGATGAAAAACAGCAGGAGACGGAGAGAAGAGGCGGAAGCAGAAGAATCAGCAA
ATACGGAGAAGTTTCAAAGATGGAGGTTGTGGCGGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAAGCA
GTGCGGAGGAGGCGAAGCAGTTGGCGATTTTTTTTTTAGATCTAGTTTCTAAACCCGGTT
TGTATGTAAACCGGTTTAATTTGTAAACCAAAATTGTAATCTGGTTTAATTTA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4E893TF 593 0 0
GGATCTCCTACTTGTCGTAAACCTGAAAAAAAAATCAAAGCTCTTTTCTTCTTCTCTGGA
ATAAACCCTAAGAAACCCAGAAAAATTCTCCATCTTTTACGAAGAACTTCACTTCTCACC
TCATTGATTCATGTCTCAAGCCCAAGCGAATCTCCAATCAAAACAGAATCTGACATCGAC
TAAGCCATCAAGTAAGTTCCTCACCAGGGCTCCAATTAGGGTTTAGATTCGTAATCTCTA
GTCTGTCCTTTTGATCGATTTGGTCCTTTTGATTCGTTTTTTCAGAGGTAGTGAATGATG
ACGACGAGGTTTCGTTTGAATCTTTTTTTGTATATGTTTTAAAACTCAGATTCACGGATA
AGCAGAAGATGAAAAACAGCAGGAGACGGAGAGAAGAGGCGGAAGCAGAAGAATCAGCAA
ATACGGAGAAGTTTCAAAGATGGAGGTTGTGGCGGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAAGCA
GTGCGGAGGAGGCGAAGCAGTTGGCGATTTTTTTTTTAGATCTAGTTTCTAAACCCGGTT
TGTATGTAAACCGGTTTAATTTGTAAACCAAAATTGTAATCTGGTTTAATTTA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4DX60JQ 545 0 0
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TCACTTCTCACCTCATTGATTCATGTCTCAAGCCCAAGCGAATCTCCAATCAAAACAGAA
TCTGACATCGACTAAGCCATCAAGTAAGTTCCTCACCAGGGCTCCAATTAGGGTTTAGAT
TCGTAATCTCTAGTCTGTCCTTTTGATCGATTTGGTCCTTTTGATTCGTTTTTTCAGAGG
TAGTGAATGATGACGACGAGGTTTCGTTTGAATCTTTTTTTGTATATGTTTTAAAACTCA
GATTCACGGATAAGCAGAAGATGAAAAACAGCAGGAGACGGAGAGAAGAGGCGGAAGCAG
AAGAATCAGCAAATACGGAGAAGTTTCAAAGATGGAGGTTGTGGCGGCGGAGGAGGCAGA
GCGGAGGAAGCAGTGCGGAGGAGGCGAAGCAGTTGGCGATTTTTTTTTTAGATCTAGTTT
CTAAACCCGGTTTGTATGTAAACCGGTTTAATTTGTAAACCAAAATTGTAATCTGGTTTA
ATTTA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 4

CO CL2467Contig1 1003 4 4 U
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AGGAAAGTGATCGTATATGCTTTGTTCATATTCAAGAGGTCGTTGAAGATGCAGAGACGT
TAGAAATCAGTCTTACTTCATAGAGATCGTCACTTTCTCCTTTACCGACTTCTGCAGTGA
TGTTTGGTCCAAAGAAGGAAGTAAATTTCGCCTGTCTTTTTTCGAAATCTGACAACTCGA
GAGCTTCGGCCTCGAATACAAGGACCAGGCAGTAACGACCATCGGTCATGACCTCTTCCT
TTATCATCGTTAAGATAGGTGCACTACGTCTTGGTATTCCTCCGCCCAATCCATACTGAA
AGATCCGTTTTAGTGCTTCTTCCAAATGTTGTTCATCTCCATAACGGTATCTCGTCACAT
CATTTCTAACCTGGGTTAAAATAGGAGTAGCAGAGCTCTCCCTAAGCTTCACCGCATCTG
CATAACTCAAGCAAGGAACTGGCTTGAGTTCTGCGTACTTGAGAGCCATACCAATAATAG
CAAGTGGAAATCCATAAGTGAGCATAATAGCAGACCACTCAGATCCAGGAAGGATGTTAA
AGTACGCCCCGAAACCGTAAGAGAGGAGCGAGACACCGAGACCTAGCCCAATAACACCAA
ATGAAATCTTGGCTAGAGTGAATTCATCGTCAGGGATCAAAGTTTTATCAGCGGAAGACA
CCACGGAAGGAGAGGAGCTCGTGGAGTCAGCAGCTCTTGCCACGAAACCGAGCCTCCTCA
GAGTCTCTCGTTTCAGCTTCGTCTCCGGGACGTAGAGGAGCCATCTCTTCTGTGAAGACG
AAACGCCGACGGGTAGATTCTCATGGCGACGGTCGTAGAGACCTCCTGATCGCTGGTTGT
TTTGGCGACGGAGATGGAACGGTAAGACAGTGGCTGCCGATAAGGATCCCATTTCTCCTC
CTCTTCTCTCTGTACCTGTGGGAAGAGAGTAATATGAGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL04JQ U 13
AF RR4CM49JQ U 1
AF RR4CL04TF C 297
AF RR4CM49TF C 298
BS 1 842 RR4CM49JQ
BS 843 843 RR4CL04TF
BS 844 852 RR4CM49JQ
BS 853 1003 RR4CL04TF

RD RR4CL04JQ 792 0 0
CTGAAC
TTTTATACATATGATGATGATTATACAAAGTTGATATACAAGAGGAAAGTGATCGTATAT
GCTTTGTTCATATTCAAGAGGTCGTTGAAGATGCAGAGACGTTAGAAATCAGTCTTACTT
CATAGAGATCGTCACTTTCTCCTTTACCGACTTCTGCAGTGATGTTTGGTCCAAAGAAGG
AAGTAAATTTCGCCTGTCTTTTTTCGAAATCTGACAACTCGAGAGCTTTGGCCTCGAATA
CAAGGACCAGGCAGTAACGACCATCGGTCATGACCTCTTCCTTTATCATCGTTAAGATAG
GTGCACTACGTCTTGGTATTCCTCCGCCCAATCCATACTGAAAGATCCGTTTTAGTGCTT
CTTCCAAATGTTGTTCATCTCCATAACGGTATCTCGTCACATCATTTCTAACCTGGGTTA
AAATAGGAGTAGCAGAGCTCTCCCTAAGCTTCACCGCATCTGCATAACTCAAGCAAGGAA
CTGGCTTGAGTTCTGCGTACTTGAGAGCCATACCAATAATAGCAAGTGGAAATCCATAAG
TGAGCATAATAGCAGACCACTCAGATCCAGGAAGGATGTTAAAGTACGCCCCGAAACCGT
AAGAGAGGGGCGAGACACCGAGACCTAGCCCAATAACACCAAATGAAATCTTGGCTAGAG
TGAATTCATCGTCAGGGATCAAAGTTTTATCAGCGGAAGACACCACGGAAGGAGAGGAGC
TCGTGGAGTCAGCAGCTCTTGCCACGAAACCGAGCCTCCTCAGAGTCTCTCGTTTCAGCT
TCGTCT

QA 7 792 7 792
DS 

RD RR4CM49JQ 853 0 0
AGAAGAGATATCTGAACTTTTTATACATATGATGATGATTATACAAAGTTGATATACAAG
AGGAAAGTGATCGTATATGCTTTGTTCATATTCAAGAGGTCGTTGAAGATGCAGAGACGT
TAGAAATCAGTCTTACTTCATAGAGATCGTCACTTTCTCCTTTACCGACTTCTGCAGTGA
TGTTTGGTCCAAAGAAGGAAGTAAATTTCGCCTGTCTTTTTTCGAAATCTGACAACTCGA
GAGCTTCGGCCTCGAATACAAGGACCAGGCAGTAACGACCATCGGTCATGACCTCTTCCT
TTATCATCGTTAAGATAGGTGCACTACGTCTTGGTATTCCTCCGCCCAATCCATACTGAA
AGATCCGTTTTAGTGCTTCTTCCAAATGTTGTTCATCTCCATAACGGTATCTCGTCACAT
CATTTCTAACCTGGGTTAAAATAGGAGTAGCAGAGCTCTCCCTAAGCTTCACCGCATCTG
CATAACTCAAGCAAGGAACTGGCTTGAGTTCTGCGTACTTGAGAGCCATACCAATAATAG
CAAGTGGAAATCCATAAGTGAGCATAATAGCAGACCACTCAGATCCAGGAAGGATGTTAA
AGTACGCCCCGAAACCGTAAGAGAGGAGCGAGACACCGAGACCTAGCCCAATAACACCAA
ATGAAATCTTGGCTAGAGTGAATTCATCGTCAGGGATCAAAGTTTTATCAGCGGAAGACA
CCACGGAAGGAGAGGAGCTCGTGGAGTCAGCAGCTCTTGCCACGAAACCGAGCCTCCTCA
GAGTCTCTCGTTTCAGCTTCGTCTCCGGGACGTAGAGGAGCCATCTCTTCTGTGAAGACG
AA*CGCCGACGG
T

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4CL04TF 707 0 0
T
CCTTTATCATCGTTAAGATAGGTGCACTACGTCTTGGTAT*CCTCCGCCCAATCCATACT
GAAAGATCCGTTTTAGTGCTTCTTCCAAATGTTGTTCATCTCCATAACGGTATCTCGTCA
CATCATTTCTAACCTGGGTTAAAATAGGAGTAGCAGAGCTCTCCCTAAGCTTCACCGCAT
CTGCATAACTCAAGCAAGGAACTGGCTTGAGTTCTGCGTACTTGAGAGCCATACCAATAA
TAGCAAGTGGAAATCCATAAGTGAGCATAATAGCAGACCACTCAGATCCAGGAAGGATGT
TAAAGTACGCCCCGAAACCGTAAGAGAGGGGCGAGACACCGAGACCTAGCCCAATAACAC
CAAATGAAATCTTGGCTAGAGTGAATTCATCGTCAGGGATCAAAGTTTTATCAGCGGAAG
ACACCACGGAAGGAGAGGAGCTCGTGGAGTCAGCAGCTCTTGCCACGAAACCGAGCCTCC
TCAGAGTCTCTCGTTTCAGCTTCGTCTCCGGGACGTAGAGGAGCCATCTCTTCTGTGAAG
ACGAAACGCCGACGGGTAGATTCTCATGGCGACGGTCGTAGAGACCTCCTGATCGCTGGT
TGTTTTGGCGACGGAGATGGAACGGTAAGACAGTGGCTGCCGATAAGGATCCCATTTCTC
CTCCTCTTCTCTCTGTACCTGTGGGAAGAGAGTAATATGAGGCTCC

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR4CM49TF 680 0 0
CCTTTATCATCGTTAAGATAGGTGCACTACGTCTTGGTAT*CCTCCGCCCAATCCATACT
GAAAGATCCGTTTTAGTGCTTCTTCCAAATGTTGTTCATCTCCATAACGGTATCTCGTCA
CATCATTTCTAACCTGGGTTAAAATAGGAGTAGCAGAGCTCTCCCTAAGCTTCACCGCAT
CTGCATAACTCAAGCAAGGAACTGGCTTGAGTTCTGCGTACTTGAGAGCCATACCAATAA
TAGCAAGTGGAAATCCATAAGTGAGCATAATAGCAGACCACTCAGATCCAGGAAGGATGT
TAAAGTACGCCCCGAAACCGTAAGAGAGGAGCGAGACACCGAGACCTAGCCCAATAACAC
CAAATGAAATCTTGGCTAGAGTGAATTCATCGTCAGGGATCAAAGTTTTATCAGCGGAAG
ACACCACGGAAGGAGAGGAGCTCGTGGAGTCAGCAGCTCTTGCCACGAAACCGAGCCTCC
TCAGAGTCTCTCGTTTCAGCTTCGTCTCCGGGACGTAGAGGAGCCATCTCTTCTGTGAAG
ACGAAACGCCGACGGGTAGATTCTCATGGCGACGGTCGTAGAGACCTCCTGATCGCTGGT
TGTTTTGGCGACGGAGATGGAACGGTAAGACAGTGGCTGCCGATAAGGATCCCATTTCTC
CTCCTCTTCTCTCTGTACCT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL2468Contig1 1327 2 10 U
AAGACGGACGAGTCAAAGCAGAGCAGAGCAGTGAGGGAACAAGCATGGCAGCTTTATCAT
CATCCTCTCTGTTTTTCTCATCCAAAACAGCTATTCCGATCAACAATCTCCTCATCCCGC
CGTCTCTCCACCGCTTCTCTCTTCCCTCTTCATCCTCTTCCTTGTCCTCTCTCTCTTTTT
CTTCTTCTGCTTCTCTCTTCACCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTC
AGGGATTCACCGTGAAGGCTGAGAAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCG
GTCACGCCGTCATTGGCTTTTACTCTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACACCGTCA
CCATCATGACTGTCGGAGAAGAATCTTCTGACAAAATGAAGAAACCTCCCTTCAGCCGTT
TCTCCGAAATTGTTAGCGGCGGAGGAAAGACAGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGA
CTGTGGTCGGAGGTGAAACATTTGACGTTGTTCTTGACAACAATGGAAAGGATTTGGATA
CCGTCAGGCCAGTGGTGGATTGGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAA
GCAGCGCAGGGATCTACAAGTCCACCGAAGAACCTCCTCACGTTGAAGGGGACGCAGTGA
AAGGCGACGCAGGTCACGTTGGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCAACTGGG
CCTCCTTTCGACCACAGTACATGATCGACTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGT
TCTTCGACAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAGCTAA
CCAACATATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACCCTG
AGGCTGCCTCCTGCAACATCTTCAACTGCGTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTA
TGGCCAAGCTCTGTGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACCCTA
AAGCCATTGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCGG
AACCAAGAGCAGCAAAGGATATATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATC
TCAAGGAGAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGTTTG
AATTAGATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTA
TCTTCCTCTGTAAGCTACCCATATGTACTCTCTTTTTTTTTCCCTCGGCTCATATGATAT
GATGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV34TF U 1
AF RR4GV34JQ C 546
BS 1 631 RR4GV34TF
BS 632 632 RR4GV34JQ
BS 633 650 RR4GV34TF
BS 651 651 RR4GV34JQ
BS 652 661 RR4GV34TF
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BS 663 672 RR4GV34TF
BS 673 673 RR4GV34JQ
BS 674 720 RR4GV34TF
BS 721 1327 RR4GV34JQ

RD RR4GV34TF 720 0 0
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CATCCTCTCTGTTTTTCTCATCCAAAACAGCTATTCCGATCAACAATCTCCTCATCCCGC
CGTCTCTCCACCGCTTCTCTCTTCCCTCTTCATCCTCTTCCTTGTCCTCTCTCTCTTTTT
CTTCTTCTGCTTCTCTCTTCACCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTC
AGGGATTCACCGTGAAGGCTGAGAAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCG
GTCACGCCGTCATTGGCTTTTACTCTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACACCGTCA
CCATCATGACTGTCGGAGAAGAATCTTCTGACAAAATGAAGAAACCTCCCTTCAGCCGTT
TCTCCGAAATTGTTAGCGGCGGAGGAAAGACAGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGA
CTGTGGTCGGAGGTGAAACATTTGACGTTGTTCTTGACAACAATGGAAAGGATTTGGATA
CCGTCAGGCCAGTGGTGGATTGGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAA
GCAGCGCAGGGATCTACAAGTCCACCGAAGACCCTCCTCACGTTGAAGGG*ACGCAGTGA
A*GGCGACGCAG*TCACGTTGGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCAACTGGG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GV34JQ 782 0 0
AGGCCAGTGGTGGATTGGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGC
GCAGGGATCTACAAGTCCACCGAAGAACCTCCTCACGTTGAAGGGGACGCAGTGAAAGGC
GACGCAGGTCACGTTGGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCAACTGGGCCTCC
TTTCGACCACAGTACATGATCGACTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGTTCTTC
GACAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAGCTAACCAAC
ATATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACCCTGAGGCT
GCCTCCTGCAACATCTTCAACTGCGTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTATGGCC
AAGCTCTGTGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACCCTAAAGCC
ATTGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCGGAACCA
AGAGCAGCAAAGGATATATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATCTCAAG
GAGAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGTTTGAATTA
GATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTATCTTC
CTCTGTAAGCTACCCATATGTACTCTCTTTTTTTTTCCCTCGGCTCATATGATATGATGA
AC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 2 4

CO CL2469Contig1 828 2 10 U
GGGAGCTTCAAGAGCGCCAACAACACTGTACAACATTCTTGAACAAAGAAAATGATCTAC
CCTTCAAACATCAACCCTAATTTCAAAGATTTCGGTGAAACTTTCAAATTCGATGATTAT
GATGATGACGCTTTTCAGATGATCATGGAAGGAATCAGCCTCGGGGATCACTCGCCCACT
TTGAGTTGGACTTCATCAGAGAAACTACTGGCTACAGAAGTCACAAGCCCGCTTCAATCA
AGCCTAGCTACCTCACCTATTAGCCTTGAAATATCAGAGGACAAAGATGAGAGCAAGAAG
AGGAAAAGACGCAAAGATGATCAGGTTATTCACGTGTTTAAAACGAAATCAATTAAAGAA
ATTGCTTTAGATGACGGATACAAATGGAGGAAATACGGCAAGAAACCAATAAGGGGTAAT
CCATTTCCGAGGCATTATCATAAGTGTTCGAACCCCAATTGCATCGTGAAGAAGAAGATC
GAGAGAGATACGAGCAATCCGGAATATGTATTGACAACCTATGAAGGAAGACATAACCAC
CCAAGCCCTTCTGTGGTTTATTGCGATTCAGACGACTTTGATCTTACCTTTCACAACACT
TTGTCTTTCCAGACACATACTATTAGTTATTCACATTCAGCTCCATGACCGCACTTACAA
GTTTGTGAGTGTAGATGTGTATATAGTATATATCATCATCGTAATCACGCATCACATGTA
TCCGCATACGCATTGTTGTATCGGTTTTTAATGTACTTAATTGGGGTGGTGGGATGGAAA
TCATTTTGTATGCGAGGTTATGATAGTAGTTTTTGTATATATTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D856TF U 1
AF RR4D856JQ C 83
BS 1 659 RR4D856TF
BS 660 660 RR4D856JQ
BS 661 703 RR4D856TF
BS 704 704 RR4D856JQ
BS 705 748 RR4D856TF
BS 749 750 RR4D856JQ
BS 751 776 RR4D856TF
BS 777 777 RR4D856JQ
BS 778 790 RR4D856TF
BS 791 828 RR4D856JQ

RD RR4D856TF 790 0 0
GGGAGCTTCAAGAGCGCCAACAACACTGTACAACATTCTTGAACAAAGAAAATGATCTAC
CCTTCAAACATCAACCCTAATTTCAAAGATTTCGGTGAAACTTTCAAATTCGATGATTAT
GATGATGACGCTTTTCAGATGATCATGGAAGGAATCAGCCTCGGGGATCACTCGCCCACT
TTGAGTTGGACTTCATCAGAGAAACTACTGGCTACAGAAGTCACAAGCCCGCTTCAATCA
AGCCTAGCTACCTCACCTATTAGCCTTGAAATATCAGAGGACAAAGATGAGAGCAAGAAG
AGGAAAAGACGCAAAGATGATCAGGTTATTCACGTGTTTAAAACGAAATCAATTAAAGAA
ATTGCTTTAGATGACGGATACAAATGGAGGAAATACGGCAAGAAACCAATAAGGGGTAAT
CCATTTCCGAGGCATTATCATAAGTGTTCGAACCCCAATTGCATCGTGAAGAAGAAGATC
GAGAGAGATACGAGCAATCCGGAATATGTATTGACAACCTATGAAGGAAGACATAACCAC
CCAAGCCCTTCTGTGGTTTATTGCGATTCAGACGACTTTGATCTTACCTTTCACAACACT
TTGTCTTTCCAGACACATACTATTAGTTATTCACATTCAGCTCCATGACCGCACTTACA*
GTTTGTGAGTGTAGATGTGTATATAGTATATATCATCATCGTA*TCACGCATCACATGTA
TCCGCATACGCATTGTTGTATCGGTTTT**ATGTACTTAATTGGGGTGGTGGGATG*AAA
TCATTTTGTA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4D856JQ 746 0 0
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TCATGGAAGGAATCAGCCTCGGGGATCACTCGCCCACTTTGAGTTGGACTTCATCAGAGA
AACTACTGGCTACAGAAGTCACAAGCCCGCTTCAATCAAGCCTAGCTACCTCACCTATTA
GCCTTGAAATATCAGAGGACAAAGATGAGAGCAAGAAGAGGAAAAGACGCAAAGATGATC
AGGTTATTCACGTGTTTAAAACGAAATCAATTAAAGAAATTGCTTTAGATGACGGATACA
AATGGAGGAAATACGGCAAGAAACCAATAAGGGGTAATCCATTTCCGAGGCATTATCATA
AGTGTTCGAACCCCAATTGCATCGTGAAGAAGAAGATCGAGAGAGATACGAGCAATCCGG
AATATGTATTGACAACCTATGAAGGAAGACATAACCACCCAAGCCCTTCTGTGGTTTATT
GCGATTCAGACGACTTTGATCTTACCTTTCACAACACTTTGTCTTTCCAGACACATACTA
TTAGTTATTCACATTCAGCTCCATGACCGCACTTACAAGTTTGTGAGTGTAGATGTGTAT
ATAGTATATATCATCATCGTAATCACGCATCACATGTATCCGCATACGCATTGTTGTATC
GGTTTTTAATGTACTTAATTGGGGTGGTGTGATGGAAATCATTTTGTATGCGAGGTTATG
ATAGTAGTTTTTGTATATATTTAACC

QA 1 746 1 746
DS 



CO CL2469Contig2 507 2 7 U
GGGGTTATTCACGTGTTTAAAACGAAATCAATTAAAGAAATTGCTTTAGATGACGGATAC
AAATGGAGGAAATACGGCAAGAAACCAATAAGGGGTAATCCATTTCCGAGGCATTATCAT
AAGTGTTCGAACCCCAATTGCATCGTGAAGAAGAAAATCGAGAGAGATACGAGCAATCCG
TAATATGTATTGACAACCTATGAAGGAAGACATAACCACCCAAGCCCTTCTGTGGTTTAT
TGCGATTCAGACGACTTTGATCTTACCTCTCTCAACACTTTGTCTTTCCAGACACATACT
TATTCACATTCAACTCCATGACCACACTTACAAGTTTGTGAATGTAGATGTGTATATAGT
ATATATCATCATCGTAATGACGCATCACATGTATCCGCATATGCATTGTTGTATCGGTTT
TTAATGTACTTAATTGGGGTGGTGTGATGGAAATCATTTTGTATGCGAGGTATGATAGTA
GTTTTTGTATATATTTAACTAATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H959TF U 130
AF RR4H959JQB C 1
BS 1 129 RR4H959JQB
BS 130 336 RR4H959TF
BS 337 337 RR4H959JQB
BS 338 349 RR4H959TF
BS 350 350 RR4H959JQB
BS 351 406 RR4H959TF
BS 407 507 RR4H959JQB

RD RR4H959TF 285 0 0
AACCCCAATTGCATCGTGAAGAAGAAAATCGAGAGAGATACGAGCAATCCGTAATATGTA
TTGACAACCTATGAAGGAAGACATAACCACCCAAGCCCTTCTGTGGTTTATTGCGATTCA
GACGACTTTGATCTTACCTCTCTCAACACTTTGTCTTTCCAGACACATACTTATTCACAT
TCAACTCCATGACCACACTTACAAGTT*GTGAATGTAGAT*TGTATATAGTATATATCAT
CATCGTAATGACGCATCACATGTATCCGCATATGCAT
GTTGTATC

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR4H959JQB 507 0 0
GGGGTTATTCACGTGTTTAAAACGAAATCAATTAAAGAAATTGCTTTAGATGACGGATAC
AAATGGAGGAAATACGGCAAGAAACCAATAAGGGGTAATCCATTTCCGAGGCATTATCAT
AAGTGTTCGAACCCCAATTGCATCGTGAAGAAGAAAATCGAGAGAGATACGAGCAATCCG
TAATATGTATTGACAACCTATGAAGGAAGACATAACCACCCAAGCCCTTCTGTGGTTTAT
TGCGATTCAGACGACTTTGATCTTACCTCTCTCAACACTTTGTCTTTCCAGACACATACT
TATTCACATTCAACTCCATGACCACACTTACAAGTTTGTGAATGTAGATGTGTATATAGT
ATATATCATCATCGTAATGACGCATCACATGTATCCGCATATGCATTGTTGTATCGGTTT
TTAATGTACTTAATTGGGGTGGTGTGATGGAAATCATTTTGTATGCGAGGTATGATAGTA
GTTTTTGTATATATTTAACTAATTTGT

QA 1 507 1 507
DS 



AS 2 4

CO CL2470Contig1 500 2 2 U
GGACCAAAACAACAGCTGCTAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCAAACACTATCCCTC
AAGCTCTCAAGAGAATCAAACTCCAAAGATGAGCAGTTTCTACGAGCATTACGAGTTCCC
ATACGATTCCAACCAGGTTCATCATCTCTACGATCATAACTTTTATGATAACAATCAACA
TCAGCAGTTTGGTTTTGATCCAATGAGTTATAATAATAGTTATAATAACTGGAATGGATC
TGAGTACGAGTATGAGTATGAGACAGCCTCTCCATCTGTTGCTTACTCTGTCTCCACCTT
GTCTGAGCCGAAGCACTTGTTCTATGATCCGAGTTACTACACAACAACAACAACCTACGA
GTCTCCTCCTCAGTTCAGTATCTACTGCAATGTTCAAGGCTTCAACGAGCCGGAGTTCGA
AGAGTACGATCCCACGCCGTACGGCGGTGGCTATGATATCGTTGCGACATACGGGAAACC
TCTTCCTCCGTCGATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C140TF U 1
AF RR4C365TF U 231
BS 1 281 RR4C140TF
BS 282 500 RR4C365TF

RD RR4C140TF 281 0 0
GGACCAAAACAACAGCTGCTAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCAAACACTATCCCTC
AAGCTCTCAAGAGAATCAAACTCCAAAGATGAGCAGTTTCTACGAGCATTACGAGTTCCC
ATACGATTCCAACCAGGTTCATCATCTCTACGATCATAACTTTTATGATAACAATCAACA
TCAGCAGTTTGGTTTTGATCCAATGAGTTATAATAATAGTTATAATAACTGGAATGGATC
TGAGTACGAGTATGAGTATGAGACAGCCTCTCCATCTGTTG

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4C365TF 270 0 0
GGAATGGATCTGAGTACGAGTATGAGTATGAGACAGCCTCTCCATCTGTTGCTTACTCTG
TCTCCACCTTGTCTGAGCCGAAGCACTTGTTCTATGATCCGAGTTACTACACAACAACAA
CAACCTACGAGTCTCCTCCTCAGTTCAGTATCTACTGCAATGTTCAAGGCTTCAACGAGC
CGGAGTTCGAAGAGTACGATCCCACGCCGTACGGCGGTGGCTATGATATCGTTGCGACAT
ACGGGAAACCTCTTCCTCCGTCGATAAAAA

QA 1 270 1 270
DS 



CO CL2470Contig2 837 2 3 U
GTAACATTTATATTGATCGATCAACCTGGAATATCTTTTCATAAGAACGTTGGACCAACC
ATACAAGAAAGATCATCATTGTATATACTAAAACGAATCAGCTTCATCAATAATAAAAAA
AAATATTGCTCTCACCACATAACTTTGACACATCTGATGATCGTGACAATTCCAGTTAAC
ACCTCAGATAACCATAAGAGGAGATCTCAAACTGTCTTCTTCCAACACCATCCTCATAAC
CATACGGATACGAATCCCCGAAAAGGTAGTCTGAAGTCGTCTTCCACGGATCAAAATCTG
TGCTCTCCCAGCAAGTAACTTCAGCCGCACGATTCTCATCCTCCTGGCGTCTTTTGTTAC
GTAAGATACAAGGAAAATAGCCTCCGAATATAACCTCACAGAGATCCGTCGCTTCTAAGC
CGTAACCAGACGGAACATACAGAGCTTTCACTTCAACTTCGTCTACAGTTTCATTGTTTG
AACTGGGATCTTCCTCTTCCTCTTCATCCTCTTCCTCTGCCTCTTCTTGATGATCATGTT
CTTCTTCTTCTTTAATGGTTTCTAACGGTTTAGCTTCCTCTAACGGCTCAAAGAAAGTCA
CATGTTTCTTGACAGCTTTCTTTTCTTCACCACCACCATAGATTCCAAGAGGAACAGGAG
CGATGATCTCCGGAGGAGAAGGAGGTTTACCTTGATCAGCGGTTGAAGAAGGGTAACAAG
TTTTTATCGACGGAGGAAGAGGTTTCCCGTATGTCGCAACGATATCATAGCCACCGCCGT
ACGGCGTGGGATCGTACTCTTCGACTCCGGCTCGTTGAGCCTTGAACATTGCAGTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CN41JQ U 1
AF RR4C365JQ U 1
BS 1 208 RR4C365JQ
BS 209 209 RR4CN41JQ
BS 210 837 RR4C365JQ

RD RR4CN41JQ 694 0 0
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ACCTCAGATAACCATAAGAGGAGATCTCAAACTGTCTTCTTCCAACACCATCCTCATAAC
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CATGTTTCTTGACAGCTTTCTTTTCTTCACCACCACCATAGATTCCAAGAGGAACAGGAG
CGATGATCTCCGGAGGAGAAGGAGGTTTACCTTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4C365JQ 837 0 0
GTAACATTTATATTGATCGATCAACCTGGAATATCTTTTCATAAGAACGTTGGACCAACC
ATACAAGAAAGATCATCATTGTATATACTAAAACGAATCAGCTTCATCAATAATAAAAAA
AAATATTGCTCTCACCACATAACTTTGACACATCTGATGATCGTGACAATTCCAGTTAAC
ACCTCAGATAACCATAAGAGGAGATCTCGAACTGTCTTCTTCCAACACCATCCTCATAAC
CATACGGATACGAATCCCCGAAAAGGTAGTCTGAAGTCGTCTTCCACGGATCAAAATCTG
TGCTCTCCCAGCAAGTAACTTCAGCCGCACGATTCTCATCCTCCTGGCGTCTTTTGTTAC
GTAAGATACAAGGAAAATAGCCTCCGAATATAACCTCACAGAGATCCGTCGCTTCTAAGC
CGTAACCAGACGGAACATACAGAGCTTTCACTTCAACTTCGTCTACAGTTTCATTGTTTG
AACTGGGATCTTCCTCTTCCTCTTCATCCTCTTCCTCTGCCTCTTCTTGATGATCATGTT
CTTCTTCTTCTTTAATGGTTTCTAACGGTTTAGCTTCCTCTAACGGCTCAAAGAAAGTCA
CATGTTTCTTGACAGCTTTCTTTTCTTCACCACCACCATAGATTCCAAGAGGAACAGGAG
CGATGATCTCCGGAGGAGAAGGAGGTTTACCTTGATCAGCGGTTGAAGAAGGGTAACAAG
TTTTTATCGACGGAGGAAGAGGTTTCCCGTATGTCGCAACGATATCATAGCCACCGCCGT
ACGGCGTGGGATCGTACTCTTCGACTCCGGCTCGTTGAGCCTTGAACATTGCAGTAG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 3

CO CL2471Contig1 734 3 26 U
ACTATGATAAGCTAATGAGGGAAGTTAATTAATTATTAACTTAATCACTTCACCAGACAA
AAAAAAGGTAGTAGGTGAAAGGGCCCATAACAGATTCCGTTTCTTCCTTCATACCTTTTG
AGATTTGAATTTTTGTTTTCATCGGAGGAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTT
GGCAGAGGTTTCACAGCACACTACCGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGT
TTATGATGTGACAAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTC
TACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAGTTCGACTGCTAAAGC
TATGCTAGATGAGTACTATGTGGGTGATATTGATACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAA
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ACATTTGTTGTCTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AF60TF U 1
AF RR4B707JQ C 135
AF RR4B707TF U 135
BS 1 139 RR4AF60TF
BS 140 140 RR4B707TF
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BS 184 184 RR4B707TF
BS 185 336 RR4AF60TF
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BS 392 433 RR4AF60TF
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BS 497 517 RR4AF60TF
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BS 697 734 RR4B707TF

RD RR4AF60TF 696 0 0
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AAAAAAGGTAGTAGGTGAAAGGGCCCATAACAGATTCCGTTTCTTCCTTCATACCTTTTG
AGATTTGAATTTTTGTTTTGATCGGAGGAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTT
GGCGGAGGTTTCACAGCACACTACCGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGT
TTATGATGTGACAAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTC
TACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTCGGACACAGTTCCACTGCTAAAGC
TATGCTAGATGAGTACTATGTGGGCGATATCGATACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAA
GTTTGTTCCTCCTTCTACTCCTCCTAAGCAGACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGA
TTTTCTCGTTAAGATCCTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTCTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGG
TATCCGTTCTTACACCAAGACTCCTACTTCTTCTTGAAGACTCTATTGGGGTGGGTCTTT
GAGTGTTTTGCCCATTTATCTTATCTGCCTGTCTTGTAAAGACTTTCAGATATTATATTC
TTGTTCAGTCAAGTGGTTTCTGTTTATGTCTGAGAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4B707JQ 600 0 0
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*****CCTCCTAAGCAGACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTTGTTAAGA
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QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4B707TF 600 0 0
GTTTTCATCGGAGGAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTGGCAGAGGTTTCAC
AGCACACTACCGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTTTATGATGTGACAA
AGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAGGGAAAGACG
CGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCTATGCTAGATGAGT
ACTATGTGGGTGATATTGATACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAGTTTGTTCCTCCT*
*****CCTCCTAAGCAGACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTTGTTAAGA
TACTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGTTCTTACA
CCAAGACTCCTACTTCTTCTTGAAGATTCTATTGGGGTGGGTCTTTGAGTGTTTTGCCCA
TTTATCTTATCTGCCTGTCTTGTAAAGACTTTCAGATATTATATTCTTGTTCAGTCAAGT
GGTTTCTGTTTATGTCTGAGACCTTTTTTGATTAAAAAAATCAGCTACATTTGTTGTCTT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 2 4

CO CL2472Contig1 869 2 3 U
GTATAAATTCTATTTATTAATATATGAAATAACATAATAATAATAAAACTCTTATCAAGC
AACAATAATAGGATTCTGTAATCGTTTGATTTCTCTAAGTATCATAGTTGGTAACTTGCT
TTCTACCTACAGACTTGAGAGAGAGAGACCGGGTTGTTGTTTCGAGTGAACATTGCCAGA
ACCCTGGTCTACCCATGTTGAGATCAGGTGATGAGCTATGGCAGTTGGACCCGGGATGAA
CATAGGAGCGAGCTCACCGCTTTCCACATTGAAATCTGTCGATAGACTCTGGCTTCCCTC
CACACCTTTACACATCTGCTCTATCTTTGAAGCCGTTGTTCTTTGTGCTTCCTGTATTCT
GCAAACGCCACCGCTTTCTTCACTTCTTCTCTACTGTGCCATTGAGCATCTTCTAACTCT
TCCTTGTCTACGTTTATTTCAAGAGTCTTGGCGAAAGCAAAGAATCCCAGCATCAATTGG
CATGGCATGCTACTTGGTCCCACAGGCCAAGGCTGAAAGCTGTGATAGACAACTTCTCCT
ACTTCAATGCCAGTCTCTTCCCATGTTTCTCGCCTCACAGCCTCTTCTAAACTTTCCCCT
GGCTCAATAAACCCGGCTAAACAACTCCACATTCTCGGTACAAATCTAGCTTGTCTGCTC
AAAAGTGCACGATCATTCTCTCGATCAATAACTAACATTATAACCACCGGGTCAACCCGG
GGATAAACCCGCTTTTTGCAAGCCTCGTTAGAGCATTGTTTTCTTCTTCCAGCTTCCTTT
GTAACAGTTGAACCTCCACAAGATCCACAAAAGCGTGAGACTTTGTGCCACTCAAGCATG
CTCTCGCATGGCCTGCATAGCTAGCTCAT


BQ
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AF RR4E943JQ U 1
AF RR4DS44JQ U 1
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BS 297 297 RR4E943JQ
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DS 

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TTCTACCTACAGACTTGAGAGAGAGAGACCGGGTTGTTGTTTCGAGTGAACATTGCCAGA
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GCAAACGCCACCGCTTTCTTCACTTCTTCTCTACTGTGCCATTGAGCATCTTCTAACTCT
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CTCTCGCATGGCCTGCATAGCTAGCTCAT

QA 1 869 1 869
DS 



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BQ
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AF RR4DS44TF U 1
AF RR4E943TF U 1
BS 1 739 RR4DS44TF
BS 740 740 RR4E943TF
BS 741 771 RR4DS44TF
BS 772 807 RR4E943TF

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DS 

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TCTCTACACTCACGATGAACCTAAGAACCCACGCGTACGCAGGCAACCCTTTAAGATCCA
AAACCCCAAAATCCACGGACTCCTTCTCACCTTCCTCTGCTTTCGAATCCCTCAAAACCC
TAATCCCTTCAATCCCCAATCACCCCACGCCTTCCCCAGATTTCAAAGTCCTCCCCTTTA
GCAAAGGCCGCCCACTAGTCTTCTCCAGCGGCGGCGGAGAACTCGCTTGTGTATTTAGGA
CCCAAAGTGGAGGAAGATTTGGTGTATTGGGCTGTTGACGTGTCGTCTGAAGAAGAACAC
GGCGTCGTTTTGGAATTGGCGGATACGAAGCTCTGTTTCGTCGAGCTGAGAACGCTAATG
GTGGCTGCTGATTGGGAGGATCAACGCGCTATGGATGAGCTAGCTATTGCAGGCCATGCG
AGAGCATTGCTTGAGTGGCACAAAGTCTCACGCTTTTGTGGATCTTGTGGAGGTTCAACT
GTTACAAAGGAAGCTGGAAGAAGAAAACAATGCTCTAACGAGGCTTGCAAAAAGCGGGTT
TATCCCCGGGTTGACCCGGTGGTTATAATGTTAGTTATTGATCGAGAGAATGATCGTGCA
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QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 3

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TCTTGGGAGTAACAAGGGAGCAGCTGGGTGCAGTCTTAACGTTTCTTTGATCACAAGCTT
CAAGTACTGAAGCTTATCAACATCTTCTTCATTGATAGTTTGTTTGACTCTGATGCATGT
TCGGATCTCGTCTTGAGCCTTTTTCATCACCCGTGGGTTTCTAACGAGCTCTGCCATTGC
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CCTATGTCGTCCTGATACAACGTCCATAAACC


BQ
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AF RR4D766JQ U 1
AF RR4FB96JQ U 92
AF RR4FB96TF C 410
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DS 

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AGTTGAGCCATCATTTAGTGATGAAGAATTGGAAGAAGCTTAAGAGGAACTTTCTTAACA
ACGGTAATATTACCATCTTCTTCCATGTCCATGTATTTCCCCTCCTCAGGCAATCCCCAA
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CCAGGGCACATCCTCCGTCCAGAACCAAATGGTAACATCTCAAAGCTTTGTCCTTTGTAA
TCCACAGGATAATCAGCAAACCTCTCCGGGATAAACTCTTCTGGATCTTCCCAGTGTTTA
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CCTTGAATCTTGATTTGACTCATTGTTTCTCTTGGGAGTAACAAGGGAGCAGCTGGGTGC
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QA 1 774 1 774
DS 

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AACCTCTCCGGGATAAACTCTTCTGGATCTTCCCAGTGTTTAGGATCTCGTCCTATCGAC
CAAGTGTTAACCACTAGAAAGGTATTTGGCGGAATGTTGTAGCCTTGAATCTTGATTTGA
CTCATTGTTTCTCTTGGGAGTAACAAGGGAGCAGCTGGGTGCAGTCTTAACGTTTCTTTG
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TCTGCCATTGCCCAAATCATGGTGATGGCACTTGTGTCTACTCCAGCAAGATATATATTT
TGGATGATCCCTTTAAGATGATCAATGGTGAGGTTGAAAGATTCACCTTGTTCTTCTTTA
TGCATAGTATTTAAGAGCGAGTCAACTATATCAGGGCGATCTTGATTTGTTTTATCTTCA
GGGTTCTTCAAGTGATCATCAACTATATGATTCAGAAAAGTATCAACCTCGCCAAAAAGT
TTGTGAAGTCTCCTATGTCGTCCTGATACAACGTCCATAAACC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 4

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TGAAAAATTTCCGGAGGAAAGTTCCCCGGAGATCTCCCATGACGTCGAGAGCATAGCTTC
TACTCCGGCAACGGCCGTTGGAGATAGAAAACATGCCATGGCTGTGGCCACGGCAGCTGC
TACTGAAGCTGCTGTTGCAGCCGCCCAAGCTGCGGCTAAAGTCGTTCGTCTTGCCGGCTA
TAACCGCCTGACAATGGAAGATACTGCAGCAGTACTCATCCAATCGAACTACAGGGGATA
CTTGGCGAGACGAGCACTTCGTGCCTTAAAAGGACTAGTTAGGCTACAAGCATTGGTACG
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TGTCCAAGGCCGATTGAGAGCCAGAAGGCTCCAAGTGGCTCATGACCGGTTTAAGAAACA
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TTCTTCCAATGGGCCTGATAGAACTCAATTGGCTTGGAACTGGCTTGACCATTGGATGTC
TTCCCGACCATACACAGGCCGTCAAACCGTACCCGGTTCTAGTCCCGGTCCTGGTCACTA
CAATCCTCCTCCATATCCACCTTTCCCCACAGCCGCAGCAACCACGGCTGTTACCACCAC
ACCCGATGATGTATCGGAGAAAACGGTGGAAATGGACGTGACCACTCCTACTAGCCTCAA
GGACAGGATAATCGGTCTTATTGACCGACAGAATATAGACTTAGGAACATATAGACAAGC
CCATAAGCAACGTAAAAGCCCAACCCGTATACCAAGCTATATGGCTCCAACTGCATCTGC
AAAGGCTAAAGTTCGTGACCAAGGCACTACCGTCAAGCTTCAAAGTACTTCTTTTATGCC
AAACTGGAACTCGTCGACCAAACACGGTTCGATTAATGGGTCGGGTTGTGGTTCTTCAAG
TTCTTGTGGAGAAGTAACAACCGGTTATCCCGGTCTCAGGAGTCCTAACTCCAAAACGGA
CATCCGACGTAAGCCCGTTAGTCCTAGTCAAAGTCCTACCGGATACGGAAAGAGAGGCTG
GAGGCATGATCATTAGAAGAAGTATCTGAATCTTTTTTCTTTTTGGTTTCTTGGAATAAA
AACTTAACGTATATGTGGTTGCTTATCTAAATATATGTCTTATTCGATACAATTGTATAT
GACTTGAATAAACGAACATATTTTCTCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A395TFB U 1
AF RR4A395TF U 1
AF RR4A395JQ C 663
AF RR4A395JQD C 823
BS 1 793 RR4A395TF
BS 794 1468 RR4A395JQ

RD RR4A395TFB 681 0 0
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TGAAAAATTTCCGGAGGAAAGTTCCCCGGAGATCTCCCATGACGTCGAGAGCATAGCTTC
TACTCCGGCAACGGCCGTTGGAGATAGAAAACATGCCATGGCTGTGGCCACGGCAGCTGC
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CTTGGCGAGACGAGCACTTCGTGCCTTAAAAGGACTAGTTAGGCTACAAGCATTGGTACG
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TGTCCAAGGCCGATTGAGAGCCAGAAGGCTCCAAGTGGCTCATGACCGGTTTAAGAAACA
GTTTGAAGAAGAGGAGAGGCGATTTGGGATGGAAAAATCGAACAAAGGATCTGCGAATGT
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AACTCCAGGAAAGGAAAAAGAGAAGAGTCAAGGAATGATGGAAAGAGAGAGGGCTCTTGC
TTATGCATACACCTACCAGCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4A395TF 793 0 0
GGGCAACAACGACGCCGACAGGTGACAGCTGCAAAACGACACGCAAGAAGTCGTGTCTTT
TGAAAAATTTCCGGAGGAAAGTTCCCCGGAGATCTCCCATGACGTCGAGAGCATAGCTTC
TACTCCGGCAACGGCCGTTGGAGATAGAAAACATGCCATGGCTGTGGCCACGGCAGCTGC
TACTGAAGCTGCTGTTGCAGCCGCCCAAGCTGCGGCTAAAGTCGTTCGTCTTGCCGGCTA
TAACCGCCTGACAATGGAAGATACTGCAGCAGTACTCATCCAATCGAACTACAGGGGATA
CTTGGCGAGACGAGCACTTCGTGCCTTAAAAGGACTAGTTAGGCTACAAGCATTGGTACG
TGGTAACCATGTACGAAAACAGGCACAAATGACCATGAAATGTATGCAAGCTCTGGTTCG
TGTCCAAGGCCGATTGAGAGCCAGAAGGCTCCAAGTGGCTCATGACCGGTTTAAGAAACA
GTTTGAAGAAGAGGAGAGGCGATTTGGGATGGAAAAATCGAACAAAGGATCTGCGAATGT
CTAAACCGAACGAGAAAAACTGAACAAATTACACAAAGTGAACCGAACCAGCCTGTACCA
AACTCCAGGAAAGGAAAAAGAGAAGAGTCAAGGAATGATGGAAAGAGAGAGGGCTCTTGC
TTATGCATACACCTACCAGCGGCAAATTCAACACACAAATGATGGCGAGGCAATTAGATT
TTCTTCCAATGGGCCTGATAGAACTCAATTGGCTTGGAACTGGCTTGACCATTGGATGTC
TTCCCGACCATAC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4A395JQ 806 0 0
ATGCATACACCTACCAGCGGCAAATTCAACACACAAATGATGGCGAGGCAATTAGATTTT
CTTCCAATGGGCCTGATAGAACTCAATTGGCTTGGAACTGGCTTGACCATTGGATGTCTT
CCCGACCATACACAGGCCGTCAAACCGTACCCGGTTCTAGTCCCGGTCCTGGTCACTACA
ATCCTCCTCCATATCCACCTTTCCCCACAGCCGCAGCAACCACGGCTGTTACCACCACAC
CCGATGATGTATCGGAGAAAACGGTGGAAATGGACGTGACCACTCCTACTAGCCTCAAGG
ACAGGATAATCGGTCTTATTGACCGACAGAATATAGACTTAGGAACATATAGACAAGCCC
ATAAGCAACGTAAAAGCCCAACCCGTATACCAAGCTATATGGCTCCAACTGCATCTGCAA
AGGCTAAAGTTCGTGACCAAGGCACTACCGTCAAGCTTCAAAGTACTTCTTTTATGCCAA
ACTGGAACTCGTCGACCAAACACGGTTCGATTAATGGGTCGGGTTGTGGTTCTTCAAGTT
CTTGTGGAGAAGTAACAACCGGTTATCCCGGTCTCAGGAGTCCTAACTCCAAAACGGACA
TCCGACGTAAGCCCGTTAGTCCTAGTCAAAGTCCTACCGGATACGGAAAGAGAGGCTGGA
GGCATGATCATTAGAAGAAGTATCTGAATCTTTTTTCTTTTTGGTTTCTTGGAATAAAAA
CTTAACGTATATGTGGTTGCTTATCTAAATATATGTCTTATTCGATACAATTGTATATGA
CTTGAATAAACGAACATATTTTCTCT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4A395JQD 646 0 0
TCCCGGTCCTGGTCACTACAATCCTCCTCCATATCCACCTTTCCCCACAGCCGCAGCAAC
CACGGCTGTTACCACCACACCCGATGATGTATCGGAGAAAACGGTGGAAATGGACGTGAC
CACTCCTACTAGCCTCAAGGACAGGATAATCGGTCTTATTGACCGACAGAATATAGACTT
AGGAACATATAGACAAGCCCATAAGCAACGTAAAAGCCCAACCCGTATACCAAGCTATAT
GGCTCCAACTGCATCTGCAAAGGCTAAAGTTCGTGACCAAGGCACTACCGTCAAGCTTCA
AAGTACTTCTTTTATGCCAAACTGGAACTCGTCGACCAAACACGGTTCGATTAATGGGTC
GGGTTGTGGTTCTTCAAGTTCTTGTGGAGAAGTAACAACCGGTTATCCCGGTCTCAGGAG
TCCTAACTCCAAAACGGACATCCGACGTAAGCCCGTTAGTCCTAGTCAAAGTCCTACCGG
ATACGGAAAGAGAGGCTGGAGGCATGATCATTAGAAGAAGTATCTGAATCTTTTTTCTTT
TTGGTTTCTTGGAATAAAAACTTAACGTATATGTGGTTGCTTATCTAAATATATGTCTTA
TTCGATACAATTGTATATGACTTGAATAAACGAACATATTTTCTCT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL2475Contig1 905 4 2 U
GGTGATGAATCGATTTCTCATTATTGATTTACTTACTTAGTCCATTGTACAAGTTATTCA
AAGAGCATGAACAAAAGAGAGACTCACAAGATCAATGATTGATGAAACAGAGTGGGTTTT
TGTTTTTTGGAATTTCAAGCTCCGGAGTTAAGAGCAAGCTCTATTTCCTCAAGTGACCGT
CCTTTAGTCTCCACCACGTTTCCTGCAATGTAGATGACGGCAAGGACGCATACACCGGCG
AAACCCAAGTAGACACTGCTGATTCCGAATTTAGTCACAACGCTTAGGAAGTAGAGTCCA
ATCACAAAGTTTGATATCCAGTGCATGCCGAGAGAAAGAGCAACAGCTTTTGCTCTGATC
CGGGATGCAAATATCTCTGGAAGGAGAAGAGCCGGAACAGGGCCAGCACCAAGTGAGAAT
GACAGGACATACAAAACAGTTCCAACAACGGCAAGGGTTCCAGAATATGCAGCAAGAGCC
TTCCATGTGAAGGATAAAGAGAGCAAAAGCATCGACAAAGCCATTCCACCAAAGCTTGTG
AGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAAGGACGAAGCAACAGCAGTGCCAAAG
ACGTTTGATGCTCCAACGAGAGCACTGGCTGCAACATCAGATTGGATTCCGGCGCTACGG
AACACTGATGTAGAGTAGTACACCACTGCGTTTATCCCAGCTAACTGTTGAAACAAGAAG
AGAGCCGCACCTACGCTTACAACTTTCCAGTAGCGGCTGCTGAATAGATCAAACCATCCT
GCCTCTGGCTCAGAAGACCCTTGGCCAGAGGATGATAAGTCACGCACTAGTTCAACCACT
TTTTCTTTACCATACAGAGTTTTGATCGCCTTTTCAGCTTCAGAAACTTTTCCTTGCTGA
ACACC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4D282JQ U 4
AF RR4GC31JQ U 1
AF RR4GC31TF C 12
AF RR4D282TF C 269
BS 1 609 RR4GC31JQ
BS 610 905 RR4D282TF

RD RR4D282JQ 269 0 0
GG
TGAATCGATTTCTCATTATTGATTTACTTACTTAGTCCATTGTACAAGTTATTCAAAGAG
CATGAACAAAAGAGAGACTCACAAGATCAATGATTGATGAAACAGAGTGGGTTTTTGTTT
TTTGGAATTTCAAGCTCCGGAGTTAAGAGCAAGCTCTATTTCCTCAAGTGACCGTCCTTT
AGTCTCCACCACGTTTCCTGCAATGTAGATGACGGCAAGGACGCATACACCGGCGAAACC
CAAGTAGACACTGCTGATTCCGAATTT

QA 3 269 3 269
DS 

RD RR4GC31JQ 610 0 0
GGTGATGAATCGATTTCTCATTATTGATTTACTTACTTAGTCCATTGTACAAGTTATTCA
AAGAGCATGAACAAAAGAGAGACTCACAAGATCAATGATTGATGAAACAGAGTGGGTTTT
TGTTTTTTGGAATTTCAAGCTCCGGAGTTAAGAGCAAGCTCTATTTCCTCAAGTGACCGT
CCTTTAGTCTCCACCACGTTTCCTGCAATGTAGATGACGGCAAGGACGCATACACCGGCG
AAACCCAAGTAGACACTGCTGATTCCGAATTTAGTCACAACGCTTAGGAAGTAGAGTCCA
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CGGGATGCAAATATCTCTGGAAGGAGAAGAGCCGGAACAGGGCCAGCACCAAGTGAGAAT
GACAGGACATACAAAACAGTTCCAACAACGGCAAGGGTTCCAGAATATGCAGCAAGAGCC
TTCCATGTGAAGGATAAAGAGAGCAAAAGCATCGACAAAGCCATTCCACCAAAGCTTGTG
AGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAAGGACGAAGCAACAGCAGTGCCAAAG
ACGTTTGAT
C

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4GC31TF 599 0 0
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CAAAAGAGAGACTCACAAGATCAATGATTGATGAAACAGAGTGGGTTTTTGTTTTTTGGA
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CACCACGTTTCCTGCAATGTAGATGACGGCAAGGACGCATACACCGGCGAAACCCAAGTA
GACACTGCTGATTCCGAATTTAGTCACAACGCTTAGGAAGTAGAGTCCAATCACAAAGTT
TGATATCCAGTGCATGCCGAGAGAAAGAGCAACAGCTTTTGCTCTGATCCGGGATGCAAA
TATCTCTGGAAGGAGAAGAGCCGGAACAGGGCCAGCACCAAGTGAGAATGACAGGACATA
CAAAACAGTTCCAACAACGGCAAGGGTTCCAGAATATGCAGCAAGAGCCTTCCATGTGAA
GGATAAAGAGAGCAAAAGCATCGACAAAGCCATTCCACCAAAGCTTGTGAGTAGAAGACT
TTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAAGGACGAAGCAACAGCAGTGCCAAAGACGTTTGAT
C

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4D282TF 637 0 0
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CGAGAGAAAGAGCAACAGCTTTTGTTCTGATCCGGGATGCAAATATCTCTGGAAGTAGAA
GAGCCGGAACAGGGCCAGCACCAAGTGAGAATGACAGGACATACAAAACAGTTCCAACAA
CGGCAAGGGTTCCAGAATATGCAGCAAGAGCCTTCCATGTGAAGGATAAAGAGAGCAAAA
GCATCGACAAAGCCATTCCACCAAAGCTTGTGAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGT
CCATCAAGGACGAAGCAACAGCAGTGCCTAAGACGTTTGATGCTCCAACGAGAGCACTGG
CTGCAACATCAGATTGGATTCCGGCGCTACGGAACACTGATGTAGAGTAGTACACCACTG
CGTTTATCCCAGCTAACTGTTGAAACAAGAAGAGAGCCGCACCTACGCTTACAACTTTCC
AGTAGCGGCTGCTGAATAGATCAAACCATCCTGCCTCTGGCTCAGAAGACCCTTGGCCAG
AGGATGATAAGTCACGCACTAGTTCAACCACTTTTTCTTTACCATACAGAGTTTTGATCG
CCTTTTCAGCTTCAGAAACTTTTCCTTGCTGAACACC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 4

CO CL2476Contig1 918 4 13 U
CATCAAACATCAGTTGCTTTTAAGTCGAGGCAGTGAAATAGATATCTTCACTGACAAAGT
TTTGTCCCCACCCAAAACAAATCACACCCATTTACACAAAGTAAAAGAAAAAACAATGTC
TGTAGTTTTGTCAATCTTTTATGTTATCAAATATGATGTTTTACTTATACACACTATAGA
AGGAGGATAATTTGAAAGTCTAAAAAAGTTCAAGAAGAACCATGGAGCAAATGAGACAAT
GCCTTCTCAGTGTCGTTCTCGAACATGAAGAGAGCATCTGCAACAGCGTTCGTTGGGAAC
CCCATCTCCCTTATCGCACTGAACCCATTTGCAAATTCATGAACCTTTGTGGGATTACCA
CCATAGTTTGCAACAGCGATGTTGACAGCTTCTCGGTTTAGCCCAGCATATTTCATCACT
ACAGGATCTACACCCATTGAATGTGCGGGTGGTGGTTGTGCAAAGTTAGCCGGCGGCGGT
TGCGAAAAGTTAGCCGGTGGAGGAGGAGGA*GGAGGATGGTCGGACCCAAACTTGCTCCA
ATCCGGGTTATCCTTCTCTGCCTCAGCAAGAACCTTCCTTTCTAGTCCGAAATCGAACTG
AAAGCTGCTCCGAGGAACATCTCCAACTCGAGGCAACAACGGAGGCGGAGGAGTGATAAG
ATAGTCAGGCTTGAGAGTCACCTTGATTCCTAATCCAGATGAAGAGGGGTTGTTTTGAAA
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TCCGGGAGGACCGGTGTACATAGATGATGGAGAAGGAGATGGGTACATAGGGCGGCCGTA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AGGACCGGTGTACATAGATGATGGAGAAGGAGATGGGTACATAGGGCGGCCGTAGGAGGG
ACCTGACTTGTTCATGAAGTCGTAATCCATTGTCGTTAAAGGATTTGCTGAGAGGAG
CC

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DS 



AS 1 4

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AGAGACACAAGTCTTTGTTTGTTCAAAGACTAAAAAGGTAGAAAAGAGGAGAGTTTTTAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 
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BS 860 860 RR4EO30TF
BS 861 923 RR4FB83TF
BS 924 937 RR4EO30TF

RD RR4FB83JQ 588 0 0
GGAGAACAAAGATTAATATTGCATTGAAATTGTGCAAAGTCTTACAGAGTTGTGTATATA
AGAGACACAAGTCTTTGTTTGTTCAAAGACTAAAAAGGTAGAAAAGAGGAGAGTTTTTAG
AAAGCTTCAGGTCATCGGTCTATGGTCCTCTTGGTCCTGGCCAACCTTCTCCTTCTCGTC
CACTTTGTCTCAGGAGATGATGGAGAAGCCGCTCCTTCAGCTGGAGGGAGCTCACAAGGA
AGCGCCATAGCACTGCTGGTGAAGGCATTGAGAACAAGGAAGGCCAAAATGGGAGACAGA
TCCAATCCTCCGAGAGGCGGTATGACTCCTCTGAATAAGTTCAAGTATGGATCGCATAAA
GTGCTGAGGGGGCTGACAATGACAGGTGGAGCAGTGGGGAACCAGGTGGGTACTAGACGG
ACAACAAGAACGTTGCTATAAATGTTGAGGAAGTTTATCAACCCGTTAGCAACAACCAAT
CCAGCAACTGAATCTCCAGGCAGAACCGCTGCAAACCCGTGATTAGCCATCGCAAAACTC
ACCCTTGTAGTAGTGTTTCTCAAACGAACCTCGTCGCAAAGACCGCGA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4EO30JQ 456 0 0
TTTTTAAAAAGCTTCAGGTCATCGGTCTATGGTCCTCTTGGTCCTGGCCAACCTTCTCCT
TCTCGTCCACTTTGTCTCAGGAGATGATGGAGAAGCCGCTCCTTCAGCTGGAGGGAGCTC
ACAAGGAAGCGCCATAGCACTGCTGGTGAAGGCATTGAGAACAAGGAAGGCCAAAATGGG
AGACAGATCCAATCCTCCGAGAGGCGGTATGACTCCTCTGAATAAGTTCAAGTATGGATC
GCATAAAGTGCTGAGGGGGCTGACAATGACAGGTGGAGCAGTGGGGAACCAGGTGAGTAC
TAGACGGACAACAAGAACGTTGCTATAAATGTTGAGGAAGTTTATCAACCCGTTAGCAAC
AACCAATCCAGCAACTGAATCTCCAGGCAGAACCGCTGCAAACCCGTGATTAGCCATCGC
AAAACTCACCCTTGTAGTAGTGTTTCTCAAACGAAC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4FB83TF 707 0 0
AGCTGGAGGGAGCTCACAAGGAAGCGCCATAGCACTGCTGGTGAAGGCATTGAGAACAAG
GAAGGCCAAAATGGGAGACAGATCCAATCCTCCGAGAGGCGGTATGACTCCTCTGAATAA
GTTCAAGTATGGATCGCATAAAGTGCTGAGGGGGCTGACAATGACAGGTGGAGCAGTGGG
GAACCAGGTGGGTACTAGACGGACAACAAGAACGTTGCTATAAATGTTGAGGAAGTTTAT
CAACCCGTTAGCAACAACCAATCCAGCAACTGAATCTCCAGGCAGAACCGCTGCAAACCC
GTGATTAGCCATCGCAAAACTCACCCTTGTAGTAGTGTTTCTCAAACGAACCTCGTCGCA
AAGACCGCGAAGCTCGGAGGACAAGCGAACCGCTTCGTGGAACAAAGGGTTCCT**AGGC
GAGTGAATGGAAGAAGCCTGAGAATTTCTCAGTAACAGAGGCAAGAGAACGATGGAGGTC
TTGAATCAACTTGACGGAGTCTGAAACTGGTGGTTGAAGTAGCAGATTGGGTTTGTTCGG
ACGAGCGAGTTGTGTTTTTTGCGTAAATGCAGAGGATAGAGATACAAAAAAGTTCGGTAT
CGGTCCTGACGGAGACGGTTCGAGGCTTCTTTTGATAGCTGGTTCGTTCGCACTACCCGC
CTCCTCCATTGCAGGCTGCAGAGGTCTCTGAGATTTTTTTCGTAC
CC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4EO30TF 714 0 0
GCTGAGGGAGCTCACAG
AGCGCCATAGCACTGCTG*TGAAGGCATTGAGAACAAGGAAGGCCAAAATGGGAGACAGA
TCCAATCCTCCGAGAGGCGGTATGACTCCTCTGAATAAGTTCAAGTATGGATCGCATAAA
GTGCTGAGGGGGCTGACAATGACAGGTGGAGCAGTGGGGAACCAGGTGAGTACTAGACGG
ACAACAAGAACGTTGCTATAAATGTTGAGGAAGTTTATCAACCCGTTAGCAACAACCAAT
CCAGCAACTGAATCTCCAGGCAGAACCGCTGCAAACCCGTGATTAGCCATCGCAAAACTC
ACCCTTGTAGTAGTGTTTCTCAAACGAACCTCGTCGCAAAGACCGCGAAACTCGGAGGAC
AAGCGAACCGCTTCGTGGAACAAAGGGTTCCTATAGGCGAGTGAATGGAAGAAGCCTGAG
AATTTCTCAGTAACAGAGGCAAGAGAACGATGGAGGTCTTGAATCAACTTGACGGAGTCT
GAAACTGGTGGTTGAAGTAGCAGATTGGGTTTGTTCGGACGCGCGAGTTGTGTTTTTTGC
GTAAATGCAGAGGATAGAGATACAAAAAAGTTCGGTATCGGTCCTGACGGAGACGGTTCG
AGGCTTCTTTTGATAGCTGATTCGTTCGCACTACTCGCCTCCTCCATTGCAGGCTGCAGA
GGTCTCTGAGATTTTTTTCGTACAATTGAGAAGCTCC

QA 18 714 18 714
DS 



AS 1 4

CO CL2478Contig1 666 4 5 U
CTACGCTCTTTTCTTAATTTTAATTGAAGAAATAATTCGAAAATAAAACAGCAAGCACAA
AAATGAGTAATAACCCCC*AATAGAGACTGGTACGATTTAATTCAACATTTTGTTCGTTC
GGATTTGATTGTGTCATAGCTCTATAATTGAATTCGGTTTATCGTTGGATGAACTGCATT
GCTGATATTGACCCCAAAAAAAAAAACGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCA
GCGCACTGTAAAAATTGGATAGGTCCTACCTATAGTCATTGGGTCCTCCTAAAAAGATCT
ACTAAATTCGTCGAGTTGTTCCAAAGAATCAAAACGGCCTGTTATTAATGGAATGCCTTG
TCGGCTCTCTGTAAAATACTCGTTTGGGCGAGGGCTCCCAAACACGTCGTAAGCTAAACC
GGTGCTGACGAATAACCAGCCCGCAATGAATAGGGAAGGTATAGTAATGCTATGAATGAC
CCAGTATCGAATACTGGTAATAATATCAGCAAAAGAACGTTCTCCTGTGCTTCCAGACAT
ACTGAACTCCAGATATTCTCGTAGGGAATCGATTCTGTAAAAGATGAATCAGTAAACTCA
AATTCACTGAGATTACATCTTTGTGAGATCGTCAATAAAGTACCAAGGGTATTTTTAGAG
TCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 

AF RR4HA15TF C 2
AF RR4HA15JQB U 1
AF RR4CL55JQ U 22
AF RR4CL55TF C 22
BS 1 55 RR4HA15JQB
BS 56 56 RR4CL55JQ
BS 57 205 RR4HA15JQB
BS 206 206 RR4CL55JQ
BS 207 666 RR4HA15JQB

RD RR4HA15TF 596 0 0
CTACGCTC
TTTCTTAATTTTAATTGAAGAAATAATTCGAAAATAAAACAGCAAGTACAAAAATGAGTA
ATAACCCCC*AATAGAGACTGGTACGATTTAATTCAACATTTTGTTCGTTCGGATTTGAT
TGTGTCATAGCTCTATAATTGAATTCGGTTTATCGTTGGATGAACTGCATTGCTGATATT
GACCCCAAAAAAAAAA*CGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCAGCGCACTGT
AAAAATTGGATAGGTCCTACCTATAGTCATTGGGTCCTCCTAAAAAGATCTACTAAATTC
GTCGAGTTGTTCCAAAGAATCAAAACGGCCTGTTATTAATGGAATGCCTTGTCGGCTCTC
TGTAAAATACTCGTTTGGGCGAGGGCTCCCAAACACGTCGTAAGCTAAACCGGTGCTGAC
GAATAACCAGCCCGCAATGAATAGGGAAGGTATAGTAATGCTATGAATGACCCAGTATCG
AATACTGGTAATAATATCAGCAAAAGAACGTTCTCCTGTGCTTCCAGACATACTGAACTC
CAGATATTCTCGTAGGGAATCGATTCTGTAAAAGATGAATCAGTAAAC

QA 9 596 9 596
DS 

RD RR4HA15JQB 666 0 0
CTACGCTCTTTTCTTAATTTTAATTGAAGAAATAATTCGAAAATAAAACAGCAAGTACAA
AAATGAGTAATAACCCCC*AATAGAGACTGGTACGATTTAATTCAACATTTTGTTCGTTC
GGATTTGATTGTGTCATAGCTCTATAATTGAATTCGGTTTATCGTTGGATGAACTGCATT
GCTGATATTGACCCCAAAAAAAAAA*CGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCA
GCGCACTGTAAAAATTGGATAGGTCCTACCTATAGTCATTGGGTCCTCCTAAAAAGATCT
ACTAAATTCGTCGAGTTGTTCCAAAGAATCAAAACGGCCTGTTATTAATGGAATGCCTTG
TCGGCTCTCTGTAAAATACTCGTTTGGGCGAGGGCTCCCAAACACGTCGTAAGCTAAACC
GGTGCTGACGAATAACCAGCCCGCAATGAATAGGGAAGGTATAGTAATGCTATGAATGAC
CCAGTATCGAATACTGGTAATAATATCAGCAAAAGAACGTTCTCCTGTGCTTCCAGACAT
ACTGAACTCCAGATATTCTCGTAGGGAATCGATTCTGTAAAAGATGAATCAGTAAACTCA
AATTCACTGAGATTACATCTTTGTGAGATCGTCAATAAAGTACCAAGGGTATTTTTAGAG
TCTACC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4CL55JQ 645 0 0
AATTGAAGAAATAATTCGAAAATAAAACAGCAAGCACAAAAATGAGTAATAACCCCC*AA
TAGAGACTGGTACGATTTAATTCAACATTTTGTTCGTTCGGATTTGATTGTGTCATAGCT
CTATAATTGAATTCGGTTTATCGTTGGATGAACTGCATTGCTGATATTGACCCCAAAAAA
AAAAACGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCAGCGCACTGTAAAAATTGGATA
GGTCCTATCTATAGTCATTGGGTCCTCCTAAAAAGATCTACTAAATTCGTCGAGTTGTTC
CAAAAAATCAAAACGGCCTGTTATTAATGGAATGCCTTGTCGGCTCTCTGTAAAATACTC
GTTTGGGCGAGGGCTCCCAAACACGTCGTAAGCTAAACCGGTGCTGACGAATAACCAGCC
CGCAATGAATAGGGAAGGTATAGTAATGCTATGAATGACCCAGTATCGAATACTGGTAAT
AATATCAGCAAAAGAACGTTCTCCTGTGCTTCCAGACATACTGAACTCCAAATATTCTCG
TAGGGAATCGATTCTGTAAAAGATGAATCAGTAAACTCAAATTCACTGAGATTACATCTT
TGTGAGATCGTCAATAAAGTACCAAGGGTATTTTTAGAGTCTACC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4CL55TF 645 0 0
AATTGAAGAAATAATTCGAAAATAAAACAGCAAGCACAAAAATGAGTAATAACCCCCCAA
TAGAGACTGGTACGATTTAATTCAACATTTTGTTCGTTCGGATTTGATTGTGTCATAGCT
CTATAATTGAATTCGGTTTATCGTTGGATGAACTGCATTGCTGATATTGACCCCAAAAAA
AAAAACGGTAGGTACAGCTAGTCCATGAACAGCCAACCAGCGCACTGTAAAAATTGGATA
GGTCCTATCTATAGTCATTGGGTCCTCCTAAAAAGATCTACTAAATTCGTCGAGTTGTTC
CAAAGAATCAAAACGGCCTGTTATTAATGGAATGCCTTGTCGGCTCTCTGTAAAATACTC
GTTTGGGCGAGGGCTCCCAAACACGTCGTAAGCTAAACCGGTGCTGACGAATAACCAGCC
CGCAATGAATAGGGAAGGTATAGTAATGCTATGAATGACCCAGTATCGAATACTGGTAAT
AATATCAGCAAAAGAACGTTCTCCTGTGCTTCCAGACATACTGAACTCCAGATATTCTCG
TAGGGAATCGATTCTGTAAAAGATGAATCAGTAAACTCAAATTCACTGAGATTACATCTT
TGTGAGATCGTCAATAAAGTACCAAGGGTATTTTTAGAGTCTACC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 4

CO CL2479Contig1 757 4 5 U
GGGAGGACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTT
GCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGC
GGTGGAAGACGAATGTAAGCTGAAGTTTTTGGAGTTAAAAGCGAAAATAAACTATAGATT
CATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGA
GAACTACGACGATTTTTCCAATTCCCTACCGCCCAACGAGTGCCGCTACGCTGTCTATGA
CTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCATAGCATGGTC
ACCGGATTCATCGAGAGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCAAGCTCAAAGGACAGGTTCAA
GAGAGAACTGGATGGAATCCAGGTGGAGTTACAAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTT
CGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCATATTGCCTAATTTCTCATCATATATCC
ATAAATGATCCATCATGATCCATCATCAACAAATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAAC
TTTCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTTTGTTTATTTACATTTCAAACTGAC
ATGGGTTTCATACTTTGGCTTGAGAAAAGCCTAAAACCATGCAGTTCTCGTGTAGTAGCT
GCATACTCCGTTGGAAAATAAAATATATTACTTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C259TF U 1
AF RR4C271TF U 1
AF RR4C271JQ C 33
AF RR4C259JQ C 347
BS 1 636 RR4C259TF
BS 637 637 RR4C271JQ
BS 638 654 RR4C259TF
BS 655 687 RR4C271TF
BS 688 757 RR4C271JQ

RD RR4C259TF 659 0 0
GGGAGGACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTT
GCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGC
GGTGGAAGACGAATGTAAGCTGAAGTTTTTGGAGTTAAAAGCGAAAATAAACTATAGATT
CATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGA
GAACTACGACGATTTTTCCAATTCCCTACCGCCCAACGAGTGCCGCTACGCTGTCTATGA
CTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCATAGCATGGTC
ACCGGATTCATCGAGAGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCAAGCTCAAAGGACAGGTTCAA
GAGAGAACTGGATGGAATCCAGGTGGAGTTACAAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTT
CGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCATATTGCCTAATTTCTCATCATATATCC
ATAAATGATCCATCATGATCCATCATCAACAAATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAAC
TTTCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTT*GTTTATTTACATTTCAA
CTGAC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4C271TF 690 0 0
GGGAGGACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTT
GCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGC
GGTGGAAGACGAATGTAAGCTGAAGTTTTTGGAGTTAAAAGCGAAAATAAACTATAGATT
CATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGA
GAACTACGACGATTTTTCCAATTCCCTACCGCCCAACGAGTGCCGCTACGCTGTCTATGA
CTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCATAGCATGGTC
ACCGGATTCATCGAGAGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCAAGCTCAAAGGACAGGTTCAA
GAGAGAACTGGATGGAATCCAGGTGGAGTTACAAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTT
CGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCATATTGCCTAATTTCTCATCATATATCC
ATAAATGATCCATCATGATCCATCATCAACAAATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAAC
TTTCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTT*GTTTATTTACATTTCAAACTGAC
ATGGGTTTCATACTTTGGCTTGAGAAA
GCT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4C271JQ 725 0 0
AAAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTTGCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACG
CAATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAGCTGAAGTTTTTGG
AGTTAAAAGCGAAAATAAACTATAGATTCATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGG
TGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTTTCCAATTCCCTACCGC
CCAACGAGTGCCGCTACGCTGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGA
AGAGCAAGATCTTCTTCATAGCATGGTCACCGGATTCATCGAGAGTGAGGATGAAGATGG
TGTATGCAAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGAATCCAGGTGGAGTTAC
AAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTC
ATATTGCCTAATTTCTCATCATATATCCATAAATGATCCATCATGATCCATCATCAACAA
ATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAACTTTCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTT
TTTTTGTTTATTTACATTTCAAACTGACATGGGTTTCATACTTTGGCTTGAGAAAAGCCT
AAAACCATGCAGTTCTCGTGTAGTAGCTGCATACTCCGTTGGAAAATAAAATATATTACT
TTTCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4C259JQ 411 0 0
TTCATAGCATGGTCACCGGATTCATCGAGAGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCAAGCTCA
AAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGAATCCAGGTGGAGTTACAAGCCACAGACCCA
AGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCATATTGCCTAATTT
CTCATCATATATCCATAAATGATCCATCATGATCCATCATCAACAAATTAAAGAACTTCT
CCATGTTATGTAACTTTCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTTTGTTTATTTA
CATTTCAAACTGACATGGGTTTCATACTTTGGCTTGAGAAAAGCCTAAAACCATGCAGTT
CTCGTGTAGTAGCTGCATACTCCGTTGGAAAATAAAATATATTACTTTTCC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 4

CO CL2480Contig1 1358 4 11 U
GGGAAACTCGTTGGAAGAAAAAAAAAAAAAGATATTTGGGGAAACAAAACAAAAGGCGAA
ACCTTTTTTTCTGGTCTGAAGATCGAGAAAAGATTTTTGAAAATCAAATTTGGTTTCTTG
GGAGATCGATTTTATGTCCGAAACTTTCGTAAGATAAAAAGATCGATTGTTTAGCGATCG
GGCGTGGGTGTCTCTTTTGTAATAATGACGCAACAAGGGCAGGGAAGCATGGACCCTGCC
GTTCTCGACGACATCATTCGTCGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCTGGAACCAAA
CAGGTCATGCTCAACGAGTCTGAGATCCGTCAGCTTTGCATCGTCTCCAGAGAGATTTTC
CTCCAACAGCCTAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCAT
GGACAGTACTCAGATCTGTTGCGGCTATTTGAGTATGGAGGTTTTACCTCCTGCAGCTAA
CTATCTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGGAAGCAGAGTCTTGAAACCATATGTCT
TCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTGAGAGGCAACCACGA
GTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAACGCAGGTTCAGTGT
GAGGCTCTGGAAAGTGTTTACGGATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGA
CGACAAGATACTGTGTATGCACGGCGGCCTTTCTCCCGATTTGACCAACGTGGAGCAGAT
CAAGAACATTAAGCGGCCCACCGATGTTCCTGACTCTGGTTTGCTGTGCGATCTGCTTTG
GTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGG*ATGAATGACCGTGGGGTTTCTTACA
CTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGAACGATATGGATCTCATCTGTC
GTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATGAGTTCTTTGCGGATAGACAGCTTGTTACTA
TATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAATGCTGGTGCTATGATGAGTGTTG
ATGAGAGTTTAATGTGCTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCGGATCGGAGGCCTCGGTTCT
TGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAAAGACGAGAGAGAGACATTTGACGCTCCCTGAGG
CTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGGCAGGAAAAAAAATACACATTGTTTACATGTTAT
ATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAATTTCTTTTTCTCAAAACTTTATCATCTTCTTAT
TTTCTGACTCATATTAGACAGTAAACAAAAGTCTGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EH83TF U 1
AF RR4E902TF U 292
AF RR4EH83JQ C 639
AF RR4E902JQ C 692
BS 1 324 RR4EH83TF
BS 325 325 RR4E902TF
BS 326 647 RR4EH83TF
BS 648 874 RR4E902TF
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BS 973 1026 RR4E902TF
BS 1027 1358 RR4EH83JQ

RD RR4EH83TF 647 0 0
GGGAAACTCGTTGGAAGAAAAAAAAAAAAAGATATTTGGGGAAACAAAACAAAAGGCGAA
ACCTTTTTTTCTGGTCTGAAGATCGAGAAAAGATTTTTGAAAATCAAATTTGGTTTCTTG
GGAGATCGATTTTATGTCCGAAACTTTCGTAAGATAAAAAGATCGATTGTTTAGCGATCG
GGCGTGGGTGTCTCTTTTGTAATAATGACGCAACAAGGGCAGGGAAGCATGGACCCTGCC
GTTCTCGACGACATCATTCGTCGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCTGGAACCAAA
CAGGTCATGCTCAACGAGTCTGAGGTCCGTCAGCTTTGCATCGTCTCCAGAGAGATTTTC
CTCCAACAGCCTAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCAT
GGACAGTACTCAGATCTGTTGCGGCTATTTGAGTATGGAGGTTTTACCTCCTGCAGCTAA
CTATCTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGGAAGCAGAGTCTTGAAACCATATGTCT
TCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTGAGAGGCAACCACGA
GTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4E902TF 735 0 0
GGAACCAAACAGGTCATGCTCAACGAGTCTGAGATCCGTCAGCTTTGCATCGTCTCCAGA
GAGATTTTCCTCCAACAGCCTAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGT
GATATTCATGGACAGTACTCAGATCTGTTGCGGCTATTTGAGTATGGAGGTTT*ACCTCC
TGCAGCTAACTATCTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGGAAGCAGAGTCTTGAAAC
CATATGTCTTCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTGAGAGG
CAACCACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAACGCAG
GTTCAGTGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTTACGGATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGC
TGTGATAGACGACAAGATACTGTGTATGCACGGCGGCCTTTCTCCCGATTTGACCAACGT
GGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCCACCGATGTTCCTGACTCTGGTTTGCTGTGCGA
TCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGGGATGAATGACCGTGGGG
TTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGA*CGATATGGATC
TCATCTGTCGTGCCCACCAG*TTGTAGAGGATGGTTATGAGTTCTTTGCGGATAGACAGC
TTGTTACTATATTTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4EH83JQ 720 0 0
AATGCAAACGCAGGTTCAGTGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTTACGGATTCTTTCAACTGTC
TCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGACAAGATACTGTGCATGCACGGCGGCCTTTCTCCCG
ATTTGACCAACGTGGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCCACCGATGTTCCTGACTCTG
GTTTGCTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGG*ATG
AATGACCGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAG
AACGATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATGAGTTCTTT
GCGGATAGACAGCTTGTTACTATGTTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAAT
GCTGGTGCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGCTCTTTCCAAATTCTTAAGCCT
GCGGATCGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAAAGACGAGAGAG
AGACATTTGACGCTCCCTGAGGCTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGGCAGGAAAAAAA
ATACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAATTTCTTTTTCT
CAAAACTTTATCATCTTCTTATTTTCTGACTCATATTAGACAGTAAACAAAAGTCTGCAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4E902JQ 667 0 0
AACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGACAAGATACTGTGTATGCACGGCGGCCTT
TCTCCCGATTTGACCAACGTGGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCCACCGATGTTCCT
GACTCTGGTTTGCTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGG
GGG*ATGAATGACCGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTT
GATAAAGAACGATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATGA
GTTCTTTGCGGATAGACAGCTTGTTACTATATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATT
CGATAATGCTGGTGCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGCTCTTTCCAAATTCT
TAAGCCTGCGGATCGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAAAGAC
GAGAGAGAGACGTTTGACGCTCCCTGAGGCTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGGCAGG
AAAAAAAATACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAATTTC
TTTTTCTCAAAACTTTATCATCTTCTTATTTTCTGACTCATATTAGACAGTAAACAAAAG
TCTGCAA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 4

CO CL2481Contig1 1039 4 8 U
GGTCCTTAAGGTTTACCGTCAAACTCTTACGTATTATACATACCATGAAACGATTTAGTT
ATTTACATATGGCATACTTCTAACCGATGCAACTCCGAACACACAAAAAAACTAGACTGG
CTCCAAAGCCTCACAAAACCAAACACGAAATCCTAGGAGAGGCACAGAGTATTGAAGCTA
AATTACAAAAGCAGGTAGAGGTTTCTTCCTGATCAAAAAAGCTCTGTGCATAATCTCCCA
TAATAAATACTATGCAACCTAATTCAAGTAGCGATTGAAAAGCTACGGGTAGAGCATTGC
AATCAATGGTCTACACCATAAAAAGATATTTGAGATCATCAACTGTCAGTCTAGTGGCAG
AGCTTCCACCATGATCTTCACCATACGCAGATGCAATAATCTTCCTTTTCTCTTCCTGAA
GTGACAAGATTCTATCCTCAACGGTGCCTTTTATAGTAATGCGAGTTACACTAACTGGCC
GAGTTTGTCCAATACGATGAGCACGATCAATAGCTTGATCTTCCGTTGCCGGATTCCACC
AAAGATCCAAAAGAATAACATGACATGCAGCTACCATATTCAACCCAAGGTTTCCAGCTT
TTAGCGACACCAGCATCACCTCTACATCTAGATCATTGCAGAATTCTTTTACAGCTCTGT
CTCTTGCTGCTAGACTCATTGTACCATCTAATCTTCTGAATTCAATCCCATTTTCAAAAA
AACTCTGCTCAACCAAGTCGAGCATACCCGTCCACTGAGAGAATACTATCGTCTTTATCG
GCCCCTGGCTAGGTGAAGATGAGTTAAGAGTCGTTGGCTCTATAATGGTAACATCGTCGT
CATCGTCATGTGGCTGTGAGGAAGAAGAAGGCATTTGACCATGTTCGGAAAGGGACTTCA
GGATATCTAGGACAGCTTTGATTTTTGATGAACTAAACTCGCTTTTTTGGAAAACTGATT
TGTCCTGTGAAGAACTACAGCCTATATCATTGGTGATGCATTTTCGCAGGGAAGATTCAG
AGAAAACAACATCACGCCC


BQ
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TTTTGATGAACTAAACTCGCTTTTTT
TACCCTTTCTGTCACCC

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T*CTCTTCCTGAAGTGACAAGATTCTATCCTCAACGGTGC*TTTTATAGTAATGCGAGTT
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AGGTTTCCAGCTTTTAGCGACATCAGCATCACCTCTACATCTAGATCATTGCAGAATTCT
TTTACAGCTCTGTCTCTTGCTGCTAGACTCATTGTACCATCTAATCTTCTGAATTCAATC
CCATTTTCAAAAAAACTCTGCTCAACCAAGTCGAGCATACCCGTCCACTGAGAGAATACT
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TGGAAAACTGATTTGTCCTGTGAAGAACTACAGCCTATATCATTGGTGATGCATTTTCGC
AGGGAAGATTCAGAGAAAACAACATCACGCCC

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DS 



AS 1 3

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TCTCTCGAATAACCCTACATTGAAAAGATGGTGTTGATCGCGAATGAGGAAGAGATCCTC
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AAACAAGCCGACGCCGGAGATGATTATTCCGAAGGATTCGAAACAGCCAGCGAAGTGAAG
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H263TF U 1
AF RR4FX72TF U 349
AF RR4FX72JQ C 406
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BS 449 449 RR4FX72TF
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BS 476 476 RR4FX72TF
BS 477 500 RR4H263TF
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BS 506 506 RR4FX72TF
BS 507 526 RR4H263TF
BS 527 527 RR4FX72TF
BS 528 598 RR4H263TF
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AAACAAGCCGACGCCGGAGATGATTATTCCGAAGGATTCGAAACAGCCAGCGAAGTGAAG
TCAGCGGTGAGGAAGAAGACAGCGAAAACGACGCCGTAATGAACCACGAGGAAGCTCAGA
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CCTTGGTTCGC

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DS 

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G
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TGGTCTTTACGAAGACGCATTGTCCAAGTATATGCTTGCTTTAGAGCTTGTTCAGGTGTT
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ACTGGGTAAGTACGAAGAGACGATCAAGGAATGCACAAAAGCGTTAGAGCTGAATCCTAC
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TGCTGTTGCAGACTTAAAAAAGATCTCAGAACTTGATCCTTCAAATGATCAAGCTAGGAA
AGGGATTCGACGCCTTGAACCTCTCGCTGCAGAGAAGCGAGAAAAGATGAAAGAAGAGGC
TATAACTAAGCTGAAGGAGATGGGGAACCCAATCTTGGGTAATTTTGGAATGAGTATGGA
CAACTTCAAGGCTGTTAAAGATCCCAACACTGGCTCCTACTCTCTTTCTTTCCAAAACTA
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TTATGTTCTTGATGATGCATTGTTACTAAACTGATGGGCAATCTTTTTTGGATTTTAGTA
TAAATTCAAAACTCGATGCCTAGTTACAACAAAAAGAAAAAAA

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DS 

RD RR4FX72JQ 631 0 0
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TGTTTCCGGAATGCACAGAGCTTAGAGCCATATGCCATTTAAACAGAGGAGTGTGTTTAC
TTAAACTGGGTAAGTACGAAGAGACGATCAAGGAATGCACAAAAGCGTTAGAGCTGAATC
CTACTTACGCTAAGGCATTGGTTCGCAGGGCAGAAGCACACGAGAAGCTTGAACACTTTG
AAGATGCTGTTGCAGACTTAAAAAAGATCTCAGAACTTGATCCTTCAAATGATCAAGCTA
GGAAAGGGATTCGACGCCTTGAACCTCTCGCTGCAGAGAAGCGAGAAAAGATGAAAGAAG
AGGCTATAACTAAGCTGAAGGAGATGGGGAACCCAATCTTGGGTAATTTTGGAATGAGTA
TGGACAACTTCAAGGCTGTTAAAGATCCCAACACTGGCTCCTACTCTCTTTCTTTCCAAA
ACTAGTCACTATTTCACTGCGGTCTTAATGTTTTGCTTTCACTGTGGTTAAATTTTGCAA
TGTGTTATGTTCTTGATGATGCATTGTTACTAAACTGATGGGCAATCTTTTTTGGATTTT
AGTATAAATTCAAAACTCGATGCCTAGTTAC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

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TATATATATATATAGAGAAAAAGTATATTTGTTCCATTGTAATTGATTTTTCTGGAAGAG
AATGTTTCACTAAAAACACTATAAATCTCTGAACTTTGGCGTTTTGTTTATTGTGCTGCA
GCTTGACCGGCTAACTCTTTCCATTGCGTTTCGTTTCTGGATGGCTAAGACCCCTCAACA
AAGAGCAAAAGTTGATTTGGATACACATTATTCACAGGATTACCTAAAAGAACGCATAGG
CACCAACACAAGGCGGGATGTCTTATATGAGCAATATGTAAAAGGAATATCAGAAACTGG
AATGCAGTCAAAGGACGGGCTTGATGGACAACTCAACGCTTGTTGGTTACACAAGATCAC
AAAACCAGAGATTGAACGGATACGCTCTGCTGGGTTCCTTGTCTCAGTCATTCATGGAAG
ACATGATGTCATTGCTCAGATGTGTCACGCAAGAAGACTGGCACAGAGGCTGTATCCTGT
TGCTAGAATGGTTGATCTTCATGGAGGTCATCTTGTAAGCCACGAGAGAACAGAGGAGGT
TAATAAATCTCTTCTAGAGTTGATCAAAGCGTCAGGAGTGAAGAAAACAGCAACTGATTG
GACTAACCTCACCATGGAAGATCCTGGTTATTTCCAGAGGAGAATAGCAATTATTAGAAG
CTCATCAGAAGGCAAGAGTGCGGCTTCTCCCTCATATTTCATGGTGGAAAAGTTTCATCG
CTGTCTACTTTTCCTCTTCGGGCTTCTGGTTCTGGCTTATGAGTATGCAAGAAGAACATT
TAGGGTCGTGAAACCCGTCAAAGTTGGGCCTTTTCTTACATAACCAACAAACCTCCTCAC
ACGTCAATTCGTCCACTGCTTTGAACAAAGTTTTCATTCAGGCAACTATGCAGTGTTCTT
CAATGATCAAGCTGATAATTTTGATGCAAACATACGCTAGAGAAGGAGACACTGCTTTTA
CAAAGAGAGATTAATACAAAACTGTTGATATGTACTTATGCACTCATGTAGAGAGACAGA
CATTTGTTATATTCTATTTACATCGATCCAAATGAGGTACCATGTAAAGACAAGACTTCA
CCTCAACTAAGACTTCAAACGTTTCTGTGTACCTCCCTCCTATATTAATTAACATACAAG
TTTCTGAATAAGTATTGAATAACAAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BW71TF U 1
AF RR4BW83TF U 1
AF RR4BW83JQ C 465
AF RR4BW71JQ C 612
BS 1 632 RR4BW71TF
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RD RR4BW71TF 632 0 0
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TATATATATATATAGAGAAAAAGTATATTTGTTCCATTGTAATTGATTTTTCTGGAAGAG
AATGTTTCACTAAAAACACTATAAATCTCTGAACTTTGGCGTTTTGTTTATTGTGCTGCA
GCTTGACCGGCTAACTCTTTCCATTGCGTTTCGTTTCTGGATGGCTAAGACCCCTCAACA
AAGAGCAAAAGTTGATTTGGATACACATTATTCACAGGATTACCTAAAAGAACGCATAGG
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AATGCAGTCAAAGGACGGGCTTGATGGACAACTCAACGCTTGTTGGTTACACAAGATCAC
AAAACCAGAGATTGAACGGATACGCTCTGCTGGGTTCCTTGTCTCAGTCATTCATGGAAG
ACATGATGTCATTGCTCAGATGTGTCACGCAAGAAGACTGGCACAGAGGCTGTATCCTGT
TGCTAGAATGGTTGATCTTCATGGAGGTCATCTTGTAAGCCACGAGAGAACAGAGGAGGT
TAATAAATCTCTTCTAGAGTTGATCAAAGCGT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4BW83TF 700 0 0
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TATATATATATATAGAGAAAAAGTATATTTGTTCCATTGTAATTGATTTTTCTGGAAGAG
AATGTTTCACTAAAAACACTATAAATCTCTGAACTTTGGCGTTTTGTTTATTGTGCTGCA
GCTTGACCGGCTAACTCTTTCCATTGCGTTTCGTTTCTGGATGGCTAAGACCCCTCAACA
AAGAGCAAAAGTTGATTTGGATACACATTATTCACAGGATTACCTAAAAGAACGCATAGG
CACCAACACAAGGCGGGATGTCTTATATGAGCAATATGTAAAAGGAATATCAGAAACTGG
AATGCAGTCAAAGGACGGGCTTGATGGACAACTCAACGCTTGTTGGTTACACAAGATCAC
AAAACCAGAGATTGAACGGATACGCTCTGCTGGGTTCCTTGTCTCAGTCATTCATGGAAG
ACATGATGTCATTGCTCAGATGTGTCACGCAAGAAGACTGGCACAGAGGCTGTATCCTGT
TGCTAGAATGGTTGATCTTCATGGAGGTCATCTTGTAAGCCACGAGAGAACAGAGGAGGT
TAATAAATCTCTTCTAGAGTTGATCAAAGCGTCAG*AGTGAAGAAAACAGCAACTGATTG
GACTAACCTCACCATGGAAGATCCTGGTTATTTCCAGAGG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4BW83JQ 764 0 0
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AGAGGCTGTATCCTGTTGCTAGAATGGTTGATCTTCATGGAGGTCATCTTGTAAGCCACG
AGAGAACAGAGGAGGTTAATAAATCTCTTCTAGAGTTGATCAAAGCGTCAGGAGTGAAGA
AAACAGCAACTGATTGGACTAACCTCACCATGGAAGATCCTGGTTATTTCCAGAGGAGAA
TAGCAATTATTAGAAGCTCATCAGAAGGCAAGAGTGCGGCTTCTCCCTCATATTTCATGG
TGGAAAAGTTTCATCGCTGTCTACTTTTCCTCTTCGGGCTTCTGGTTCTGGCTTATGAGT
ATGCAAGAAGAACATTTAGGGTCGTGAAACCCGTCAAAGTTGGGCCTTTTCTTACATAAC
CAACAAACCTCCTCACACGTCAATTCGTCCACTGCTTTGAACAAAGTTTTCATTCAGGCA
ACTATGCAGTGTTCTTCAATGATCAAGCTGATAATTTTGATGCAAACATACGCTAGAGAA
GGAGACACTGCTTTTACAAAGAGAGATTAATACAAAACTGTTGATATGTACTTATGCACT
CATGTAGAGAGACAGACATTTGTTATATTCTATTTACATCGATCCAAATGAGGTACCATG
TAAAGACAAGACTTCACCTCAACTAAGACTTCAAACGTTTCTGTGTACCTCCCTCCTATA
TTAATTAACATACAAGTTTCTGAATAAGTATTGAATAACAAGCT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4BW71JQ 617 0 0
C
TCTAGAGTTGATCAAAGCGTCAGGAGTGAAGAAAACAGCAACTGATTGGACTAACCTCAC
CATGGAAGATCCTGGTTATTTCCAGAGGAGAATAGCAATTATTAGAAGCTCATCAGAAGG
CAAGAGTGCGGCTTCTCCCTCATATTTCATGGTGGAAAAGTTTCATCGCTGTCTACTTTT
CCTCTTCGGGCTTCTGGTTCTGGCTTATGAGTATGCAAGAAGAACATTTAGGGTCGTGAA
ACCCGTCAAAGTTGGGCCTTTTCTTACATAACCAACAAACCTCCTCACACGTCAATTCGT
CCACTGCTTTGAACAAAGTTTTCATTCAGGCAACTATGCAGTGTTCTTCAATGATCAAGC
TGATAATTTTGATGCAAACATACGCTAGAGAAGGAGACACTGCTTTTACAAAGAGAGATT
AATACAAAACTGTTGATATGTACTTATGCACTCATGTAGAGAGACAGACATTTGTTATAT
TCTATTTACATCGATCCAAATGAGGTACCATGTAAAGACAAGACTTCACCTCAACTAAGA
CTTCAAACGTTTCTGTGTACCTCCCTCCTATATTAATTAACATACAAGTTTCTGAATAAG
TATTGAATAACAAGCT

QA 2 617 2 617
DS 



AS 1 4

CO CL2484Contig1 563 4 4 U
TTTTTTATTAAAAAAAAAAAAAATACATCACCTTTCCTTTAAGATTATAAAACCATTATC
AATTCATTTCTGTCATATATGATGAAGAAAGCTCCCCAACTATCGTTTACAGTCTTAACT
ATCTTCATCATTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGCACAAGAAAGAAAAAAGATATGT
AATCAACGACATATCCCTTTAGCCAAAAATGGGCTGTGTGTTGAATCTGAATGCCAAGCT
AAGTGCGTTGAGAGACACGGAACTAATGGGAAGGGTACATGTTATGGGACAAAGGAAAAA
AACGATGTGACTTGCTTTTGCGGAACTCCTTGTTAACGTTCTGGTTAAGTAAGGTGAATA
AATATGATGCTAAATCATGATATCTTTGAAGTTTTTTTTACATTTTTGCTATATTGTTTT
TTCTTTAATAGAAAAAACTATAATATTTTTTATTGGGAGCCTTGTAATAAAGTATTGAAG
TTGACATATAATTATAAATAAAGTAAATGTTTGTTTTGGATTTGTTGCATTATTTATAAT
AATGAATAACATAAATGTGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FD41JQ C 1
AF RR4FD41TF U 1
AF RR4A731JQ C 11
AF RR4A731TF U 11
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AAGTGCGTTGAGAGACACGGAACTAATGGGAAGGGTACATGTTATGGGACAAAGGAAAAA
AACGATGTGACTTGCTTTTGCGGAACTCCTTGTTAACGTTCTGGTTAAGTAAGGTGAATA
AATATGATGCTAAATCATGATATCTTTGAAGTTTTTTTTACATTTTTGCTATATTGTTTT
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ATT
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CATATATGATGAAGAAAGCTCCCCAACTATCGTTTACAGTCTTAACTATCTTCATCATTC
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AATGTGAACC

QA 4 553 4 553
DS 



AS 1 4

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AACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCTTGTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAG
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GCAGTAGCCGCTGGTACACCAGCAACAGCGGTTCCTGAATCTTAAATTCAAGAATCATCT
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TATAAAAAAAAGTTTGATACATTCCTTTTGGAAAACATCAGTTTCAGTACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4DB54TF U 1
AF RR4DB54JQ C 97
AF RR4D928JQ C 219
AF RR4D928TF U 219
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DS 

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G
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TACG

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DS 

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G
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CCTGCAAAACCAGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACGAGGACTCCTAGCCGAGTTGCT
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AGTTTCAGTACGA

QA 2 674 2 674
DS 



AS 1 3

CO CL2486Contig1 1209 3 6 U
ATAATGTTTCACTCACTAAAACAGAGATTCGAAAATATCTATGACAAATAGAAGGGACAT
GGGAAAATAAAAAGCTCAAAACATAATTTCCATATGACAACGCTCAAAAAAACTAGAAAG
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CACCGGCCCTGAATTGATAAGTTGGCGTTTCACCGAGTAGTTGTCGAATATACCAGCAAG
CTGAGGGTCAATGGGTTCTCCATCCACCAGGTTTAGTCCCACCACGTTTCCTTTGTCATG
CTCACTCGTTAGTGAAATGATAACGTCTTGTGTATCAAGACCAGCATTTTCAGCTAGTGT
CTTCGGAACCACCAGAAGAGCGTTAGCAAAAGCTTCAACACCGAGCTGAGCTCGCCCTTT
AACGGTTTTCTTGACTTCATTGATCAAGTGCTGTCTTGCTGCAACTTCAAAAGCTCCAGC
TCCTAATACAACACACTCATCTTCCAATGTATTCTTAACTGATCTTAAACCATCACGGAC
AGCGTCCTTAATTTGAGCAATGGTGTGGTCGTTAGGCCCTTTAATGAGGATAGTACATGA
ATGAGGATTCTTCAATTGCTCCACAAATGTGTACTTCTCTTCCCCGAGAACGTGCTCATA
GACAAGTCCAGCCCAGCCAAGAGAGTCCGGGGTCAAGTCATCAACGGAGTTCACAGCTTC
TCCCCCACATGCCAGAACCAAACGTTCCATGTTCCTCCTCTTAGCTCTTCGGAGGGTAAT
TATCCCTTCTCTAGCAAGCAGATCCAATGAAGGTGGATCAATACCCTTCTGATTAATGAT
AACAAAGCTGTTATCATTACCAGCACAAACCTTATTCTTTAGCTCAATAATTTTCTTGAC
TCTTTCATCAACAGAACGTCGCTCTGCAGTAACCATGGCTTCCCTCTGTTCCGCATTCGA
GTAGAAAAATCCTGCATTAATTTCACTCTTCTCATACTCCAGAGACACATTGCAAGTAAG
GATGTGACAATTCTCTGCACGCCGCTTCATGTCAGGGTGTCTTGAACCATGATCCAGAAC
AAGCCCCTCAACCAATCGTGTGTCAACATCAAATTTATGGCGCATGTGCATTATCTCAAC
CATAAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A616JQ U 1
AF RR4CV17JQ U 1
AF RR4A616TF C 345
BS 1 34 RR4A616JQ
BS 35 35 RR4CV17JQ
BS 36 122 RR4A616JQ
BS 123 123 RR4CV17JQ
BS 124 826 RR4A616JQ
BS 827 1209 RR4A616TF

RD RR4A616JQ 826 0 0
ATAATGTTTCACTCACTAAAACAGAGATTCGAAA*TATCTATGACAAATAGAAGGGACAT
GGGAAAATAAAAAGCTCAAAACATAATTTCCATATGACAACGCTCAAAAAAACTAGAAAG
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CTTCCTCATATTCCTTCCAGCACGAATCACTTCATCCACTAATAGCAACTGCGAAGCTAT
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TCCTAATACAACACACTCATCTTCCAATGTATTCTTAACTGATCTTAAACCATCACGGAC
AGCGTCCTTAATTTGAGCAATGGTGTGGTCGTTAGGCCCTTTAATGAGGATAGTACATGA
ATGAGGATTCTTCAATTGCTCCACAAATGTGTACTTCTCTTCCCCGAGAACGTGCTCATA
GACAAGTCCAGCCCAGCCAAGAGAGTCCGGGGTCAAGTCATCAACGGAGTTCACAGCTTC
TCCCCCACATGCCAGAACCAAACGTTCCATGTTCCTCCTCTTAGCT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4CV17JQ 792 0 0
ATAATG
TTTCACTCACTAAAACAGAGATTCGAAAATATCTATGACAAATAGAAGGGACATGGGAAA
ATAAAAAGCTCAAAACATAATTTCCATATGACAACGCTCAAAAAA*CTAGAAAGAAAAAG
GGGAAACAAAAGCATAAGGTGAAAACAATAATCCATATAGTTTTATTAAGTAGGCTTCCT
CATATTCCTTCCAGCACGAATCACTTCATCCACTAATAGCAACTGCGAAGCTATCACCGG
CCCTGAATTGATAAGTTGGCGTTTCACCGAGTAGTTGTCGAATATACGAGCAAGCTGAGG
GTCAATGGGTTCTCCATCCACCAGGTTTAGTCCCACCACGTTTCCTTTGTCATGCTCACT
CGTAAGTGAAATGATAACGTCTTGTGTATCAAGACCAGCATTTTCAGCTAGTGTCTTCGG
AACCACCAGAAGAGCGTTAGCAAAAGCTTCAACACCGAGCTGAGCTCGCCCTTTAACGGT
TTTCTTGACTTCATTGATCAAGTGCTGTCTTGCTGCAACTTCAAAAACTCCAGCTCCTAA
TACAACACACTCATCTTCCAATGTATTCTTAACTGATCTTAAACCATCACGGACAGCGTC
CTTAATTTGAGCAATGGTGTGGTCGTTAGGCCCTTTAATGAGGATAGTACATGAATGAGG
ATTCTTCACTTGCTCCACAAATGTGTACTTCTCTTCCCCGAGAACGTGCTCATAGACAAG
TCCAGCCCAGCCAAGAGAGTCCGGGGTCAAGTCATCAACGGAGTTCACAGCTTCTCCCCC
ACATGC

QA 7 792 7 792
DS 

RD RR4A616TF 865 0 0
ACGTTTCC
TTGTCATGCTCACTCGTTAGTGAAATGATAACGTCT*GTGTATCAAGACCAGCATTTTCA
GCTAGTGTCTTCGGAACCACCAGAAGAGCGTTAGCAAAAGCTTCAACACCGAGCTGAGCT
CGCCCTTTAACGGTTTTCTTGACTTCATTGATCAAGTGCTGTCTTGCTGCAACTTCAAAA
GCTCCAGCTCCTAATACAACACACTCATCTTCCAATGTATTCTTAACTGATCTTAAACCA
TCACGGACAGCGTCCTTAATTTGAGCAATGGTGTGGTCGTTAGGCCCTTTAATGAGGATA
GTACATGAATGAGGATTCTTCAATTGCTCCACAAATGTGTACTTCTCTTCCCCGAGAACG
TGCTCATAGACAAGTCCAGCCCAGCCAAGAGAGTCCGGGGTCAAGTCATCAACGGAGTTC
ACAGCTTCTCCCCCACATGCCAGAACCAAACGTTCCATGTTCCTCCTCTTAGCTCTTCGG
AGGGTAATTATCCCTTCTCTAGCAAGCAGATCCAATGAAGGTGGATCAATACCCTTCTGA
TTAATGATAACAAAGCTGTTATCATTACCAGCACAAACCTTATTCTTTAGCTCAATAATT
TTCTTGACTCTTTCATCAACAGAACGTCGCTCTGCAGTAACCATGGCTTCCCTCTGTTCC
GCATTCGAGTAGAAAAATCCTGCATTAATTTCACTCTTCTCATACTCCAGAGACACATTG
CAAGTAAGGATGTGACAATTCTCTGCACGCCGCTTCATGTCAGGGTGTCTTGAACCATGA
TCCAGAACAAGCCCCTCAACCAATCGTGTGTCAACATCAAATTTATGGCGCATGTGCATT
ATCTCAACCATAAAGAC

QA 9 865 9 865
DS 



AS 1 4

CO CL2487Contig1 603 4 2 U
GGACTCATAAATTTCTCAAACTAAGAACTAAGAGCTTCACTTACACATCTTCTCTCTCAA
CGAAAGACATGGCAAAACTCATAACTTACCTTACCTTCTCTTCATCACCATTCTCTTCTC
TTTCATCTTTCTCACTATGTCAAAAGAAGCAGAGTACAATCCAGAAAGTTATGGAGCTGG
AAGTCTCAAATCATACCAATGTGGAGGGGAATGCACGAGGAGATGCAGCAACACCAAGTA
CCACAAGCCATGCATGTTCTTCTGCCAAAAGTGTTGTGCTAAATGTCTTTGTGTTCCTCC
AGGCACTTACGGCAACAAGCAAGTGTGTCCTTGCTACAACAACTGGAAGACTCAACAAGG
TGGACCAAAATGTCCTTGAAGAATTATAGAAAACACCAATCTATTTAATTAGTACCTTTC
TATAACTAATGATGGTATGTTTTCAAAGTGATGATTATGAAGTTAAGTTTAGTATTATGT
ATAATCAACGTCATACTTCTCATATAATTTTATGTACCTTTTATATTTGTATCTTGTAAT
ATTGTTGGGTCCCTATACAAAAAGTTTATGTACCTTCGAATTAAGAAATATATTTGTATC
TGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 

AF RR4GX08JQ C 1
AF RR4GX08TF U 1
AF RR4GQ33JQ C 114
AF RR4GQ33TF U 15
BS 1 560 RR4GX08TF
BS 561 603 RR4GQ33TF

RD RR4GX08JQ 560 0 0
GGACTCATAAATTTCTCAAACTAAGAACTAAGAGCTTCACTTACACATCTTCTCTCTCAA
CGAAAGACATGGCAAAACTCATAACTTACCTTACCTTCTCTTCATCACCATTCTCTTCTC
TTTCATCTTTCTCACTATGTCAAAAGAAGCAGAGTACAATCCAGAAAGTTATGGAGCTGG
AAGTCTCAAATCATACCAATGTGGAGGGGAATGCACGAGGAGATGCAGCAACACCAAGTA
CCACAAGCCATGCATGTTCTTCTGCCAAAAGTGTTGTGCTAAATGTCTTTGTGTTCCTCC
AGGCACTTACGGCAACAAGCAAGTGTGTCCTTGCTACAACAACTGGAAGACTCAACAAGG
TGGACCAAAATGTCCTTGAAGAATTATAGAAAACACCAATCTATTTAATTAGTACCTTTC
TATAACTAATGATGGTATGTTTTCAAAGTGATGATTATGAAGTTAAGTTTAGTATTATGT
ATAATCAACGTCATACTTCTCATATAATTTTATGTACCTTTTATATTTGTATCTTGTAAT
ATTGTTGGGTCCCTATACAA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4GX08TF 560 0 0
GGACTCATAAATTTCTCAAACTAAGAACTAAGAGCTTCACTTACACATCTTCTCTCTCAA
CGAAAGACATGGCAAAACTCATAACTTACCTTACCTTCTCTTCATCACCATTCTCTTCTC
TTTCATCTTTCTCACTATGTCAAAAGAAGCAGAGTACAATCCAGAAAGTTATGGAGCTGG
AAGTCTCAAATCATACCAATGTGGAGGGGAATGCACGAGGAGATGCAGCAACACCAAGTA
CCACAAGCCATGCATGTTCTTCTGCCAAAAGTGTTGTGCTAAATGTCTTTGTGTTCCTCC
AGGCACTTACGGCAACAAGCAAGTGTGTCCTTGCTACAACAACTGGAAGACTCAACAAGG
TGGACCAAAATGTCCTTGAAGAATTATAGAAAACACCAATCTATTTAATTAGTACCTTTC
TATAACTAATGATGGTATGTTTTCAAAGTGATGATTATGAAGTTAAGTTTAGTATTATGT
ATAATCAACGTCATACTTCTCATATAATTTTATGTACCTTTTATATTTGTATCTTGTAAT
ATTGTTGGGTCCCTATACAA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4GQ33JQ 450 0 0
TCTTCTCTTTCATCTTTCTCACTATGTCAAAAGAAGCAGAGTACAATCCAGAAAGTTATG
GAGCTGGAAGTCTCAAATCATACCAATGTGGAGGGGAATGCACGAGGAGATGCAGCAACA
CCAAGTACCACAAGCCATGCATGTTCTTCTGCCAAAAGTGTTGTGCTAAATGTCTTTGTG
TTCCTCCAGGCACTTACGGCAACAAGCAAGTGTGTCCTTGCTACAACAACTGGAAGACTC
AACAAGGTGGACCAAAATGTCCTTGAAGAATTATAGAAAACACCAATCTATTTAATTAGT
ACCTTTCTATAACTAATGATGGTATGTTTTCAAAGTGATGATTATGAAGTTAAGTTTAGT
ATTATGTATAATCAACGTCATACTTCTCATATAATTTTATGTACCTTTTATATTTGTATC
TTGTAATATTGTTGGGTCCCTATACAA
AAA

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4GQ33TF 589 0 0
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AAACTCATAACTTACCTTACCTTCTCTTCATCACCATTCTCTTCTCTTTCATCTTTCTCA
CTATGTCAAAAGAAGCAGAGTACAATCCAGAAAGTTATGGAGCTGGAAGTCTCAAATCAT
ACCAATGTGGAGGGGAATGCACGAGGAGATGCAGCAACACCAAGTACCACAAGCCATGCA
TGTTCTTCTGCCAAAAGTGTTGTGCTAAATGTCTTTGTGTTCCTCCAGGCACTTACGGCA
ACAAGCAAGTGTGTCCTTGCTACAACAACTGGAAGACTCAACAAGGTGGACCAAAATGTC
CTTGAAGAATTATAGAAAACACCAATCTATTTAATTAGTACCTTTCTATAACTAATGATG
GTATGTTTTCAAAGTGATGATTATGAAGTTAAGTTTAGTATTATGTATAATCAACGTCAT
ACTTCTCATATAATTTTATGTACCTTTTATATTTGTATCTTGTAATATTGTTGGGTCCCT
ATACAAAAAGTTTATGTACCTTCGAATTAAGAAATATATTTGTATCTGC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 3

CO CL2488Contig1 918 3 13 U
GGACAATCTGCAAATTGGAATATAATAAAATTTGGAGTAGCAGAGAGTAACAACCATACA
AACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAACATTCTTCCGCAACGGCCGAGAAGCAGC
ACCACCACCAAGCTCGTGTGTTCATTGAAAAACTCAACAACAACACAACAACCCTCATCA
TCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTCGCTCTTGCCCTATCTCTA
AACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTTCTCTCTCCTCATCTCAGCCTCTC
ACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTCAATGGAAAAATCAGA
CCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCTTCCTTCACA
TTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGGAACTGAAGGAAGCA
ATAGTGAAAACCCAGAAGAATCCCAAGTTTGTGGTTATTGAAGATAAACCAGAAGGGAGA
TATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGAGCAGAGATGTGATGGAGTTT
CTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACTAAGGTTACGTTTGTGTAT
CCATTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGGCAAGAGGAGAGGATGAAGAAGGTCATC
GATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTC
CCTTATAACAATTAGCTGCTGCTTCTTCTTTTTTGTCTTTAATTTATCACTTTAAAAGTT
CAGATACTGAAGAGAGACGGTATGAGTTTCTTTTGAGGATCAAAGAAAAGCTATGAATGA
GAGCCTACACAATTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN23TF U 1
AF RR4DN54TF U 63
AF RR4GM88TF U 217
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BS 68 68 RR4DN54TF
BS 69 121 RR4AN23TF
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BS 123 789 RR4AN23TF
BS 790 812 RR4DN54TF
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BS 852 871 RR4DN54TF
BS 872 918 RR4GM88TF

RD RR4AN23TF 789 0 0
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AACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTTCTCTCTCCTCATCTCAGCCTCTC
ACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTCAATGGAAAAATCAGA
CCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCTTCCTTCACA
TTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGGAACTGAAGGAAGCA
ATAGTGAAAACCCAGAAGAATCCCAAGTTTGTGGTTATTGAAGATAAACCAGAAGGGAGA
TATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGAGCAGAGATGTGATGGAGTTT
CTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACTAAGGTTACGTTTGTGTAT
CCATTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGGCAAGAGGAGAGGATGAAGAAGGTCATC
GATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTC
CCTTATAAC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4DN54TF 809 0 0
G
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ACCACCAAGCTCGTGTGTTCATTGAAAAACTCAACAACGACACAACAACCCTCATCATCC
TCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTCGCTCTTGCCCTCTCTCTAAAC
TCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTGGCCATTCCTTCTCTCTCCTCTTCTCAGCCTCTCACC
ACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTCAATGGAAAAATCAGACCT
TGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCTTCCTTCACATTT
CCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTGAAGGAAGCAATA
ACGAAAACCCAGAAGAATCCCAAGTTTGTGGTTATTGAAGATAAACCAGAAGGGAGATAT
TTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAAGATTTAACCAGAGCGGAGATGTGATGGAGTTTCTG
GTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACTAAGGTTACGTTTGTGTATCCT
TTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGACAAGAGGAGAGGATGAAGAAG*TCGTTGAT
GAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTCCCT
TATAACAATTAGCTGCTGCTTCTTCTTTT***TCTTTAATTTATCACTTTACAAGTTCAG
ATACTGA*GAGAGACGGTATGAGTTTCT

QA 2 809 2 809
DS 

RD RR4GM88TF 702 0 0
G
CTTTCGCTCTTGCCCTATCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTT
CTCTCTCCTCATCTCAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAATCAGACCG
GTCTTCTCAATGGAAAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGA
ACCCCACCTCTTCTTCCTTCACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATC
CAATCCAGGAACTGAAGGAAGCAATAGTGAAAACCCAGAAGAATCCCAAGTTTGTGGTTA
TTGAAGATAAACCAGAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACC
AGAGCAGAGATGTGATGGAGTTTCTG*TGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGG
CTACTAAGGTTACGTTTGTGTATCCATTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGGCAAG
AGGAGAGGATGAAGAAGGTCATCGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGG
AGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTCCCTTATAACAATTAGCTGCTTCTTTTTTTTTTTTGTT
TTTAATTTATCACTTTAAAAGT*CAGATACTGAAGAGAGACGGTATGAGTTTCTTTTGAG
GATCAAAGAAAAGCTATGAATGAGAGCCTACACAATTGATG

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 4

CO CL2489Contig1 1107 4 4 U
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CAGGAAGATTGGGAATGCGATGCATGATCTCTTCAAGAGAATGTGTTGGAGGGTTGTGGC
CAAACGAGACCAATCCGTTATATGGGGAAAACCGATATCCAACAGCTGTTACTTGAAGAG
GGGTTCAGGTGTCCAACCTCCGCTTTGTCCTTCTGGAGATGACCCAGATGCAACTTGGAA
CGTTTCCATGAAAGCTTGCATAACACCGTACTCAGTGCGGATGCATAAAGAAAGATGGAG
TGGGCTTGTTCCCTGGCCACGGAGACTGACAGCTCCTCCACCACGTCTTGAGGAAGTCGG
TGTCACTCCCGAGCAATTCCGTGAAGATACGGAAACATGGCGGTATAGAGTGATGGAGTA
CTGGAAACTGCTTAAACCAATGGTGCAAAAGAACTCCATAGGAAACGTGATGGACATGAG
CTCAAACCTCGGCGGTTTTGCAGCTGCTCTAAACGATAAAGATGTATGGGTAATGAACGT
CATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAGATCATCTACGACCGTGGCCTTATCGGAGC
CACTCATGATTGGTGTGAAGCCTTCGACACATACCCACGAACATTTGACCTTATCCACGC
GTGGAACACATTCACAGAAACCGAAGCACGTGGATGCAGCATCGAAGATCTGCTTATCGA
GATAGACAGGATACTACGGCCAGAAGGATTTGTCATAATTCGTGACTCATCAGAGAATAT
TAGCTACATCAAGAAGTATCTGACATTGTTGAAATGGGACAAATGGTTCACAGAGACGAC
TCCAAAAGGTGACTCTCTGTCGACCAAAGACGAGAGTGTTTTGATAGCCAGAAAGAAACT
TTGGAGCGTTGCGGCCATTTCAGAGTCGTGAAAGGTTTGCTTATCTTGCAAGCCATCTAT
CTACTTGATATGAGGAACTGTAAATTACAAAAAATTCATACGTAGTTATGATTTTGATTT
TGTTGTAGGAAAAATGCTAAATCTTCTTATTTTCGATTTTCTTGTCCCAATTTAAAATTA
TTTTCGCGAAAAGAATTTGCTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4E449TF U 1
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AF RR4CG68JQ C 471
AF RR4CG68TF U 471
BS 1 519 RR4E449TF
BS 520 520 RR4CG68TF
BS 521 599 RR4E449TF
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GGGTTCAGGTGTCCAACCTCCGCTTTGTCCTTCTGGAGATGACCCAGATGCAACTTGGAA
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TGGGCTTGTTCCCTGGCCACGGAGACTGACAGCTCCTCCACCACGTCTTGAGGAAGTCGG
TGTCACTCCCGAGCAATTCCGTGAAGATACGGAAACATGGCGGTATAGAGTGATGGAGTA
CTGGAAACTGCTTAAACCAATGGTGCAAAAGAACTCCATAGGAAACGTGATGGACATGAG
CTCAAACCTCGGCGGTTTTGCAGCTGCTCTAAACGATAAGGATGTATGGGTAATGAACGT
CATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAGATCATCTACGACCGTGGCCTTATCGGAG

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DS 

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GCGGATGCATAAAGAAAGATGGAGTGGGCTTGTTCCCTGGCCACGGAGACTGACAGCTCC
TCCACCACGTCTTGAGGAAGTCGGTGTCACTCCCGAGCAATTCCGTGAAGATACGGAAAC
ATGGCGGTATAGAGTGATGGAGTACTGGAAACTGCTTAAACCAATGGTGCAAAAGAACTC
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TAAGGATGTATGGGTAATGAACGTCATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAGATCAT
TTACGACCGTGGCCTTATCGGAGCCACTCATGATTGGTGTGAAGCCTTCGACACATACCC
ACGAACATTTGACCTTATCCACGCGTGGAACACATTCACAGAAACCGAAGCACGTGGATG
CAGCATCGAAGATCTGCTTATCGAGATAGACAGGATACTACGGCCAGAAGGATTTGTCAT
AATTCGTGACACATCAGAGAATATTAGCTACATCAAGAAGTATCTGACATTGTTGAAATG
GGACAAATGGTTCACAGAGACGACTCCAAAAGGTGACTCTCTGTCGACCAAAGACGAGAG
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TTGCTTATCTTGCAAGCCATCTATCTACTTGATATGAGGAACTGTAAATTACAAAAAATT
CATACGTAGTTATGATTTTGATTTTGTTGTAG

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DS 

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G
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AATGAACGTCATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAGATCATCTACGACCGTGGCCT
TATCGGAGCCACTCATGATTGGTGTGAAGCCTTCGACACATACCCACGAACATTTGACCT
TATCCACGCGTGGAACACATTCACAGAAACCGAAGCACGTGGATGCAGCATCGAAGATCT
GCTTATCGAGATAGACAGGATACTACGGCCAGAAGGATTTGTCATAATTCGTGACTCATC
AGAGAATATTAGCTACATCAAGAAGTATCTGACATTGTTGAAATGGGACAAATGGTTCAC
AGAGACGACTCCAAAAGGTGACTCTCTGTCGACCAAAGACGAGAGTGTTTTGATAGCCAG
AAAGAAACTTTGGAGCGTTGCGGCCATTTCAGAGTCGTGAAAGGTTTGCTTATCTTGCAA
GCCATCTATCTACTTGATATGAGGAACTGTAAATTACAAAAAATTCATACGTAGTTATGA
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TTAAAATTATTTTCGCGAAAAGAATTTGCTT

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DS 

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G
GGACATGAGCTCGAACCTCGGCGGTTTTGCAGCTGCTCTAAACGATAAAGATGTATGGGT
AATGAACGTCATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAGATCATCTACGACCGTGGCCT
TATCGGAGCCACTCATGATTGGTGTGAAGCCTTCGACACATACCCACGAACATTTGACCT
TATCCACGCGTGGAACACATTCACAGAAACCGAAGCACGTGGATGCAGCATCGAAGATCT
GCTTATCGAGATAGACAGGATACTACGGCCAGAAGGATTTGTCATAATTCGTGACTCATC
AGAGAATATTAGCTACATCAAGAAGTATCTGACATTGTTGAAATGGGACAAATGGTTCAC
AGAGACGACTCCAAAAGGTGACTCTCTGTCGACCAAAGACGAGAGTGTTTTGATAGCCAG
AAAGAAACTTTGGAGCGTTGCGGCCATTTCAGAGTCGTGAAAGGTTTGCTTATCTTGCAA
GCCATCTATCTACTTGATATGAGGAACTGTAAATTACAAAAAATTCATACGTAGTTATGA
TTTTGATTTTGTTGTAGGAAAAATGCTAAATCTTCTTATTTTCGATTTTCTTGTCCCAAT
TTAAAATTATTTTCGCGAAAAGAATTTGCTTAAAAA

QA 2 637 2 637
DS 



AS 1 4

CO CL2490Contig1 1080 4 14 U
GTGATAACACTGTGCTATAGGAAGCTCTCCTCCGCTTAGTAAAATTTTCTTTCACACACG
AACGAACGGAACATTCTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCGAGCATCGTTAATTCTCGAGG
TCAAACAGAAAAAGCTATTTAGAGTGATGGCAAGAAGGCAAGTAGGTTCGGCGAGGCGTG
TAGGGGATAGTGGAAGCTCCCCTTTCGCAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTC
CTCTCTTATCTATTTGCCTTGTACTCCTTGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCA
GTGGTCCAGGTATGTTTAAGAGTATCAGAGAGGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCAT
GCACATCTGAAGTTCAAAGAGCCATCCCTCTTCTCAAGACCGCTTACGGAGACAGCATGC
GAAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAGACATGTGCGGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAG
ATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGATGTAGAGGATGCAGACTCCAGCTGCA
AAAGTCTTTTGCGTAAAGGCTTGGTACGTGTCGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACC
GGGCGAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCGCCCAAGT
ATCTCAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGCTTCAGATGGTCTCCTTCTCTTTG
CAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCCAAGTTTGGAAGACCTG
CTAAAATGCGAAGCTCGTCGTGGTGGAACCGTTTCTTCTCACAGACGAATCTAGAGGAAA
ACGAAGCAGCGAGCAAGAAGTTCGAAAAAGCAGCTTCCAAGGTTTCATACACACCAGCTT
GTCAAGTATTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAAACATTATTGTTATTACTGGTCTTGAC
AAGCATCAGAAGACCAGTCTTATGTTATATGCCTTCTTCCCTCTTATAGAAAGAAACAGA
AAGTTCCACAGAGTTTGTAACACAGTCTCAACAATTTGATTCATAATTTTACTATTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4H482TF U 15
AF RR4GG36TF U 1
AF RR4GG36JQ C 469
AF RR4H482JQB C 471
BS 1 136 RR4GG36TF
BS 137 137 RR4H482TF
BS 138 198 RR4GG36TF
BS 199 199 RR4H482TF
BS 200 723 RR4GG36TF
BS 724 817 RR4GG36JQ
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BS 859 1080 RR4GG36JQ

RD RR4H482TF 685 0 0
GG
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TCGGATCTGAGATCTTTGGATCCGAGCATCGTTAATTCTCGAGGTCAAACAGAAAAATCT
ATTTAGAGTGATGGCAAGAAGGCAAGTAGGTTCGGCGAGGCGTGTAGGGGATAGTGGAAG
CTCCCCTTTCGTAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTCCTCTCTTATCTATTTG
CCTTGTACTCCTTGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTATGTT
TAAGAGTATCAGAGAGGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCTGAAGTTCA
AAGAGCCATCCCTCTTCTCAAGACCGCTTACGGAGACAGCATGCGAAAAGTCTTGCACGT
GGGTCCTGAGACATGTGCGGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAGATGAGACCGGAGCGTG
GGGTGTTGAACCGTACGATGTAGAGGATGCAGACTCCAGCTGCAAAAGTCTTTTGCGTAA
AGGCTTGGTACGTGTCGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGGCGAAGTCGTTTTC
TCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCGCCCAAGTATCTCAACAAGACCGT
TCCTGAACTTGCACGTGTTGCTT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR4GG36TF 723 0 0
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AACGAACGGAACATTCTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCGAGCATCGTTAATTCTCGAGG
TCAAACAGAAAAAGCTGTTTAGAGTGATGGCAAGAAGGCAAGTAGGTTCGGCGAGGCGTG
TAGGGGATAGTGGAAGCTTCCCTTTCGCAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTC
CTCTCTTATCTATTTGCCTTGTACTCCTTGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCA
GTGGTCCAGGTATGTTTAAGAGTATCAGAGAGGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCAT
GCACATCTGAAGTTCAAAGAGCCATCCCTCTTCTCAAGACCGCTTACGGAGACAGCATGC
GAAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAGACATGTGCGGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAG
ATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGATGTAGAGGATGCAGACTCCAGCTGCA
AAAGTCTTTTGCGTAAAGGCTTGGTACGTGTCGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACC
GGGCGAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCGCCCAAGT
ATCTCAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGCTTCAGATGGTCTCCTTCTCTTTG
CAG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4GG36JQ 612 0 0
TG
TTGAAGGAAGATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGATGTAGAGGATGCAGAC
TCCAGCTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCTTGGTACGTGTCGCTGACATCAAGTTCCCT
CTGCCTTACCGGGGGAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTC
TCGCCCAAGTATCTCAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGCTTCAGATGGTCTC
CTTCTCTTTGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCCAAGTTT
GGAAGACCTGCTAAAATGCGAAGCTCGTCGTGGTGGAACCGTTTCTTTTCATAGACGAAT
CTAGAGGAGAACGAAGCAGCGAGCA***AGTTCGAAAAAGCAGCTTCCAAGGTTTCATAC
ACACCAGCTTGTCAAGTATTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAAACATTATTGTTATTAC
TGGTCTTGACAAGCATCAGAAGACCAGTCTTATGTTATATGCCTTCTTCCCTCTTATAGA
AAGAAACAGAAAGTTCCACAGAGTTTGTAACACAGTCTCAACAATTTGATTCATAATTTT
ACTATTTAGT

QA 3 612 3 612
DS 

RD RR4H482JQB 607 0 0
TTGAAGGAAGATGAGACCGGAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGATGTAGAGGATGCAGAC
TCCAGCTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCTTGGTACGTGTCGCTGACATCAAGTTCCCT
CTGCCTTACCGGGCGAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTC
TCGCCCAAGTATCTCAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGCTTCAGATGGTCTC
CTTCTCTTTGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCCAAGTTT
GGAAGACCTGCTAAAATGCGAAGCTCGTCGTGGTGGAACCGTTTCTTCTCGCAGACGAAT
CTAGAGGAAAACGAAGCAGCGAGCAAGAAGTTCGAAAAAGCAGCTTCCAAGGTTTCATAC
ACACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAAACATTATTGTTATTAC
TGGTCTTGACAAGCATCAGAAGACCAGTCTTATGTTATATGCCTTCTTCCCTCTTATAGA
AAGAAACAGAAAGTTCCACAGAGTTTGTAACACAGTCTCAACAATTTGATTCATAATTTT
ACTATTT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 2 4

CO CL2491Contig1 760 2 1 U
GATAGGAGCTGTGAACACTATACTAAGGAGAGAAAGCGACGGAAAGTTGCTGGGTTACAA
CACCGATTGTATTGGCTCCATTTCTGCTATTGAAGATGGGCTTAGAAGGTCAAGTGATCC
AAGCAGTGTACCTTCTTCTACTTCTTCGCCGTTTGCTGGTAAAACAGTGGTGGTTATTGG
TGCTGGTGGAGCAGGTAAAGCACTTGCTTATGGTGCAAAAGAGAAGGGAGCCAAAGTTGT
TATTGCTAATAGAACTTACGAACGAGCAGTAGAACTCGCAGAAGCAATTGGAGGAAGAGC
GTTATCTCTCAAGGATTTAGATAACTTCCACCCAGAAGATGGCATGGTATTGGCCAACAC
AACGTCTATGGGGATGCAACCAAATGTTGATGAGACTCCCATTTCCAAGGATGCATTGAA
GCACTATGCACTAGTCTTTGATGCGGTTTATACTCCAAGAATCACAAGACTGTTAAGGGA
AGCAGAAGAATGCGGAGCCATAACAGTGTCAGGCTCAGAGATGTTTGTGAGGCAGGCTTA
CGAGCAGTTTGAGATTTTTACCGGTTTGCCTGCTCCAAAGGAACTCTACTGGCAAATCAT
GTCAAATTACTGAGACCTCTCTTGTGTGTGTGTATGTGTATCTTCTTCTTCCATGGAAAC
TCAATTCCAATAAACTTTTAAAAAAAAAATGCTATTTGTGTTCTCAGAGAAGACCCCTTT
GTGATGCCATAGCCTGGACTTCTCTCTGTGTTTTTATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B842TF U 403
AF RR4B833TF U 1
BS 1 760 RR4B833TF

RD RR4B842TF 111 0 0
TTCCAAGGATGCATTGAAGCACTATGCACTAGTCTTTGATGCGGTTTATACTCCAAGAAT
CACAAGACTGTTAAGGGAAGCAGAAGAATGCGGAGCCATAACAGTGTC
AGG

QA 1 108 1 108
DS 

RD RR4B833TF 760 0 0
GATAGGAGCTGTGAACACTATACTAAGGAGAGAAAGCGACGGAAAGTTGCTGGGTTACAA
CACCGATTGTATTGGCTCCATTTCTGCTATTGAAGATGGGCTTAGAAGGTCAAGTGATCC
AAGCAGTGTACCTTCTTCTACTTCTTCGCCGTTTGCTGGTAAAACAGTGGTGGTTATTGG
TGCTGGTGGAGCAGGTAAAGCACTTGCTTATGGTGCAAAAGAGAAGGGAGCCAAAGTTGT
TATTGCTAATAGAACTTACGAACGAGCAGTAGAACTCGCAGAAGCAATTGGAGGAAGAGC
GTTATCTCTCAAGGATTTAGATAACTTCCACCCAGAAGATGGCATGGTATTGGCCAACAC
AACGTCTATGGGGATGCAACCAAATGTTGATGAGACTCCCATTTCCAAGGATGCATTGAA
GCACTATGCACTAGTCTTTGATGCGGTTTATACTCCAAGAATCACAAGACTGTTAAGGGA
AGCAGAAGAATGCGGAGCCATAACAGTGTCAGGCTCAGAGATGTTTGTGAGGCAGGCTTA
CGAGCAGTTTGAGATTTTTACCGGTTTGCCTGCTCCAAAGGAACTCTACTGGCAAATCAT
GTCAAATTACTGAGACCTCTCTTGTGTGTGTGTATGTGTATCTTCTTCTTCCATGGAAAC
TCAATTCCAATAAACTTTTAAAAAAAAAATGCTATTTGTGTTCTCAGAGAAGACCCCTTT
GTGATGCCATAGCCTGGACTTCTCTCTGTGTTTTTATATA

QA 1 760 1 760
DS 



CO CL2491Contig2 881 2 2 U
GATCCTCTGATTTCGCTGGATTCAGCTGTACTATCCCTCACAAAGAAGCTGCGTTGAAAT
GTTGTGAGAGGTTGATCCATTGGCAAAGTCTATAGGAGCTGTGAACACTATACTAAAGAG
ACAAAGCGACGGAAAGTTGCTGGGTTACAACACGGATTGTATTGGTTCCATTTCTGCTAT
TGAGGATGGGCTTAGAAGGTCAATTGATCCTAGGAGTGTACCTTCTTCTTCTTCTTCTAC
TTCGCCGTTGGCTGGTAAAACAGTGGTGGTTATTGGTGCTGGTGGAGCAGGTAAAGCACT
TGCTTATGGTGCAAAAGAGAAGGGAGCCAAAGTTGTTATTGCTAATAGAACTTACGAACG
AGCAGTAGAACTCGCAGAAGCAATTGGAGGAAGAGCGTTATCTCTCAAGGATTTAGATAA
CTTCCACCCAGAAGATGGCATGGTATTGGCCAACACAACGTCTATGGGGATGCAACCAAA
TGTTGATGAGACTCCCATTTCCAAAGATGCATTGAAGCACTACGCACTAGTGTTTGATGC
GGTTTATACTCCAAGAATCACCAGACTGTTAAGGGAAGCAGAAGAATGCGGAGCAATAAC
AGTGTCGGGCTCAGAGATGTTTGTGAGGCAGGCTTACGAGCAGTTTGAGATTTTCACCGG
TTTGCCCGCTCCAAAGGAACTTTACTGGCAAATCATGTCAAAGTACTGAGACCTCGCTTT
TGTGTGTGTATGTGTATTTTCTTCTTCCATGGAAACTCAATTCCAATAATTTTTTTTTTA
AAAAAATGCTATTTGTGTTCCAGAGAAGACCCTTTGTGATACCATAGCCTGGACTTCTCT
CTGTATTTTTATATATACAAGCGATAAAACTTGTTGAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FL33TF U 1
AF RR4FL33JQ C 143
BS 1 197 RR4FL33TF
BS 198 881 RR4FL33JQ

RD RR4FL33TF 197 0 0
GATCCTCTGATTTCGCTGGATTCAGCTGTACTATCCCTCACAAAGAAGCTGCGTTGAAAT
GTTGTGAGAGGTTGATCCATTGGCAAAGTCTATAGGAGCTGTGAACACTATACTAAAGAG
ACAAAGCGACGGAAAGTTGCTGGGTTACAACACGGATTGTATTGGTTCCATTTCTGCTAT
TGAGGATGGGCTTAGAA

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR4FL33JQ 739 0 0
GGTTACAACACGGATTGTATTGGTTCCATTTCTGCTATTGAGGATGGGCTTAGAAGGTCA
ATTGATCCTAGGAGTGTACCTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCGCCGTTGGCTGGTAAAACA
GTGGTGGTTATTGGTGCTGGTGGAGCAGGTAAAGCACTTGCTTATGGTGCAAAAGAGAAG
GGAGCCAAAGTTGTTATTGCTAATAGAACTTACGAACGAGCAGTAGAACTCGCAGAAGCA
ATTGGAGGAAGAGCGTTATCTCTCAAGGATTTAGATAACTTCCACCCAGAAGATGGCATG
GTATTGGCCAACACAACGTCTATGGGGATGCAACCAAATGTTGATGAGACTCCCATTTCC
AAAGATGCATTGAAGCACTACGCACTAGTGTTTGATGCGGTTTATACTCCAAGAATCACC
AGACTGTTAAGGGAAGCAGAAGAATGCGGAGCAATAACAGTGTCGGGCTCAGAGATGTTT
GTGAGGCAGGCTTACGAGCAGTTTGAGATTTTCACCGGTTTGCCCGCTCCAAAGGAACTT
TACTGGCAAATCATGTCAAAGTACTGAGACCTCGCTTTTGTGTGTGTATGTGTATTTTCT
TCTTCCATGGAAACTCAATTCCAATAATTTTTTTTTTAAAAAAATGCTATTTGTGTTCCA
GAGAAGACCCTTTGTGATACCATAGCCTGGACTTCTCTCTGTATTTTTATATATACAAGC
GATAAAACTTGTTGAGTCG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL2492Contig1 1122 4 9 U
GGGAGCTTGAAGAGCCTAAGCTCGAAGATGTTCTTCGCAGAGCTGCAACACGAGACAACA
CAGTGATTCTAACGACTCTGAACGAAGCTTGGGCTGCTCCTGGCTCTGTCATCGACCTCT
TCTTCGAGAGTTTTCGAATCGGCGAAGGAACAGGCGTGCTTTTAAACCATCTGGTCATCG
TTGCTCTCGACGCTAAAGCTTACTCCCGTTGCCGACAGCTTCACAAGCATTGCTTCAGCC
TCGAAACGGAAGGTGTTGATTTCTCGGGCAAGGAGGCTTACTTCATGACTCGTTCTTACT
TGAAGATGATGTGGAGAAGAATCGACTTCTTGCGCTCTGTTCTTGAATTGGGTTACAACT
TTGTCTTCACGGATGCTGATGTGATGTGGTTCAGAAGCCCTTTTACGCGGTTTTACAAAT
ACGGTGACTTCCAGATTGCTTGTGACCATTACTTAGGAAGATCGAATGATTTAGAGAACA
GACCTAACGGAGGGTTTAGCTTTGTGAGGTCTAACAACAGGACTATACTCTTCTACAAGT
ACTGGTACGCTTCGCGGATCAGATACTCGGGGTACCACGACCAGTACGTTCTTAACTTCA
TCAAGAGGGAGCCTTTTCTTGTCCGGATTGGGCTTAGGATTAGGTTCTTGAACACTGCGT
ATTTCGTTGG*ACTCTGTGAACCAAGCAAAGATATGAATCTTGTTCGGACGATGCATGCG
AACTGCTGCTTTGGTTTGGATAGTAAGCTTCATGATCTTAGAATCATGCTTCAGGATTGG
AGAGACTTTATGGCTTTGCCACTTCATCTTAAGCAGGAGTCTGGTTTCTCTTGGAAAGTC
CCACAGAATTGCAGTCTTGATTCACTTCGGAGATATGATGAATCTATGTATGAAGAAGAG
AGCGAGCCACCTGGAGAATCCCAAGAGTGAAGTGTGAATGTGTTTACAAATGTATATAGA
GATTTGTTTTTGTTACATGGCAGAAGAAGAAAGATGGAATCAAGTTTTGTAAAAAAGTCA
TCGATTGTTCTCAAAGAGGAGGAACCCATAACGCAAATGTCTTGTTTGTTTGTTGTGCCA
AAAGAGCCCATTTTTCCTACTAATGAAGAGTACTTGTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AZ45TF U 103
AF RR4AZ45JQ C 561
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TGAAGATGATGTGGAGAAGAATCGACTTCTTGCGCTCTGTTCTTGAATTGGGTTACAACT
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TCAAGAGGGAGCCTTTTCTTGTCCGGATTGGGCTTAG*ATTAG*TTCTTGAACACTGCGT
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TAAACCATCTGGTCATCGTTGCTCTCGACGCTAAAGCTTACTCCCGTTGCCGACAGCTTC
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TCATGACTCGTTCTTACTTGAAGATGATGTGGAGAAGAATCGACTTCTTGCGCTCTGTTC
TTGAATTGGGTTACAACTTTGTCTTCACGGATGCTGATGTGATGTGGTTCAGAAGCCCTT
TTACGCGGTTTTACAAATACGGTGACTTCCAGATTGCTTGTGACCATTACTTAGGAAGAT
CGAATGATTTAGAGAACAGACCTAACGGAGGGTTTAGCTTTGTGAGGTCTAACAACAGGA
CTATACTCTTCTACAAGTACTGGTACGCTTCGCGGATCAGATACTCGGGGTACCACGACC
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GTCCGGATTGGGCTTAGGATTAGGTTCTTGAACACTGCGTATTTCGTTGG*ACTCTGTGA
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DS 

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TTTTACAAATACGGTGACTTCCAGATTGCTTGTGACCATTACTTAGGAAGATCGAATGAT
TTAGAGAACAGACCTAACGGAGGGTTTAGCTTTGTGAGGTCTAACAACAGGACTATACTC
TTCTACAAGTACTGGTACGCTTCGCGGATCAGATACTCGGGGTACCACGACCAGTACGTT
CTTAACTTCATCAAGAGGGACCCTTTTCTTGTCCGGATTGGGCTTAGGATTAGGTTCTTG
AACACTGCGTATTTCGTTGG*ACTCTGTGAACCAAGCAAAGATATGAATCTTGTTCGGAC
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TCAGGATTGGAGAGACTTTATGGCTTTGCCACTTCATCTTAAGCAGGAGTCTGGTTTCTC
TTGGAAAGTCCCACAGAATTGCAGTCTTGATTCACTTCGGAGATATGATGAATCTATGTA
TGAAGAAGAGAGCGAGCCACCTGGAGAATCCCAAGAGTGAAGTGTGAATGTGTTTACAAA
TGTATATAGAGATTTGTTTTTGTTACATGGCAGAAGAAGAAAGATGGAATCAAGTTTTGT
AAAAAAGTCATCGATTGTTCTCAAAGAGGAGGAACCCATAACGCAAATGTCTTGTTTGTT
TGTTGTGCCAAAAGAGCCCATTTTTCCTACTAATGAAGAGTACTTGTTCATC

QA 1 892 1 892
DS 



AS 1 4

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GGGGTAAGCAGCAGAGAGCAATACACGTCCAAGACTAGGCGGTGGTTATAACCCTTTTTA
AAGGGGCTCTTCTCTCCATCTCTCAGTCTCAAGACGTAAACCCTAGTGAACCCCCTCCAG
AAACATTTGCCGACTATAGGCCTAGCTTACTGAATCTCTTCTCTCTCCCCTCTCTATCAT
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CACAGTCTCAATGCTCAAGGAGAGAATCCTCTCCGAGTGGCCCAAAGACAAGAAGATTGT
TCCAAGAACAGCTAATGACATCAAGCTGATAAACGCTGGTAAGATTTTGGAGAATGGTAA
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TGTTGTCGTGCAACCCGCTCCAACAAAAGCAAGACCAGAGAAGAAAATTGAAGAGGAAGA
AGCCCCACAGAGAAGCTTTTGCTCATGTACCATTATGTGATAATGAGTTCATGTTATGTA
TTCATCAGAAGTTCAAAAGAAAGCTTCATCAGTGGCTTTATAAATCTGGGGCTATTGAAT
CTTTTTCTCTTGCATTGTGATGAAAACTCCTTACTTATATATATAGAAGAGTTCAATTTT
ACATTTAGAACTCTGCAACATGTTTTGTTGTATGGTTCTGTTCATCTTAAGACCTTTTTG
TCTCTACTAGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS34TF U 1
AF RR4GD79TF U 39
AF RR4GD79JQ C 520
AF RR4DS34JQ C 122
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BS 778 838 RR4DS34JQ
BS 839 840 RR4GD79JQ
BS 841 911 RR4DS34JQ

RD RR4DS34TF 653 0 0
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GGGGTAAGCAGCAGAGAGCAATACACGTCCAAGACTAGGCGGTGGTTATAACCCTTTTTA
AAGGGGCTCTTCTCTCCATCTCTCAGTCTCAAGACGTAAACCCTAGTGAACCCCCTCCAG
AAACATTTGCCGACTATAGGCCTAGCTTACTGAATCTCTTCTCTCTCCCCTCTCTATCAT
CTTAAGGAAAAGTTGTGTATAGCTTGAAGTCTCAATTTTGGGTGGATTAGTTCTGCTGAA
AGTTTCTGTTCCTTTGGGAGATAAAAAGAGAAATCAAATGCCGGAAGAAGATTTGGTGGA
ACTTAAATTCCGGTTATATGACGGTTCAGATGTTGGCCCGTTTCATTACTCTCCAACCGC
CACAGTCTCAATGCTCAAGGAGAGAATCCTCTCCGAGTGGCCCAAAGACAAGAAGATTGT
TCCAAGAACAGCTAATGACATCAAGCTGATAAACGCTGGTAAGATTTTGGAGAATGGTAA
AACTGTTGCACAGTGCAAAGCTCCATTTGATGATCTCCCTAAATCAGTCATCACAATGCA
TGTTGTCGTGCAACCCGCTCCAACAAAAGCAAGACCAGAGAAGAAAATTGAAG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4GD79TF 739 0 0
GG
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GGTGGTTATAACCCTTTTTAAAGGGGCTCTTCTCTCCATCTCTCAGTCTCAAGACGTAAA
CCCTAGTGAACCCCCTCCAGAAACATTTGCCGACTATAGGCCTAGCTTACTGAATCTCTT
CTCTCTCCCCTCTCTATCATCTTAAGGAAAAGTTGTGTATAGCTTGAAGTCTCAATTTTG
GGTGGATTAGTTCTGCTGAAAGTTTCTGTTCCTTTGGGAGATAAAAAGAGAAATCAAATG
CCGGAAGAAGATTTGGTGGAACTTAAATTCCGGTTATATGACGGTTCAGATGTTGGCCCG
TTTCATTACTCTCCAACCGCCACAGTCTCAATGCTCAAGGAGAGAATCCTCTCCGAGTGG
CCCAAAGACAAGAAGATTGTTCCAAGAACAGCTAATGACATCAAGCTGATAAACGCTGGT
AAGATTTTGGAGAATGGTAAAACTGTTGCACAGTGCAAAGCTCCATTTGATGATCTCCCT
AAATCAGTCATCACAATGCATGTTGTCGTGCAACCCGCTCCAACAAAAGCAAGACCAGAG
AAGAAAATTGAAGAGGAAGAAGCCCCACAGAGAAGCTTTTGCTCATGTACCATTATGTGA
TAATGAGTTCATGTTATGTATTCATCAGAAGTTCAAAAGAAAGCTTCATCAGTGGCTTTA
TAAATCTGGGGCTATTG

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR4GD79JQ 375 0 0
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TAAATCAGTCATCACAATGCATGTTGTCGTGCAACCCGCTCCAACAAAAGCAAGACCAGA
GAAGAAAATTGAAGAGGAAGAAGCCCCACAGAGAAGCTTTTGCTCATGTACCATTATGTG
ATAATGAGTTCATGTTATGTATTCATCAGAAGTTCAAAAGAAAGCTTCATCAGTGGCTTT
ATAAATCTGGGGCTATTGAATCTTTTTCTCTTGCATTGTGATGAAAACTCCTTACTTATA
TATATAGAAGAGTTCAATTTTACATTTAGAACTCTGCAACATGTTTTGTTGTATGGTTCT
GTTCATTTTAAGACC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR4DS34JQ 790 0 0
AA
GGGCTCTTCTCTCCATCTCTCAGTCTCAAGACGTAAACCCTAGTGAACCCCCTCCAGAAA
CATTTGCCGACTATAGGCCTAGCTTACTGAATCTCTTCTCTCTCCCCTCTCTATCATCTT
AAGGAAAAGTTGTGTATAGCTTGAAGTCTCAATTTTGGGTGGATTAGTTCTGCTGAAAGT
TTCTGTTCCTTTGGGAGATAAAAAGAGAAATCAAATGCCGGAAGAAGATTTGGTGGAACT
TAAATTCCGGTTATATGACGGTTCAGATGTTGGCCCGTTTCATTACTCTCCAACCGCCAC
AGTCTCAATGCTCAAGGAGAGAATCCTCTCCGAGTGGCCCAAAGACAAGAAGATTGTTCC
AAGAACAGCTAATGACATCAAGCTGATAAACGCTGGTAAGATTTTGGAGAATGGTAAAAC
TGTTGCACAGTGCAAAGCTCCATTTGATGATCTCCCTAAATCAGTCATCACAATGCATGT
TGTCGTGCAACCCGCTCCAACAAAAGCAAGACCAGAGAAGAAAATTGAAGAGGAAGAAGC
CCCACAGAGAAGCTTTTGCTCATGTACCATTATGTGATAATGAGTTCATGTTATGTATTC
ATCAGAAGTTCAAAAGAAAGCTTCATCAGTGGCTTTATAAATCTGGGGCTATTGAATCTT
TTTCTCTTGCATTGTGATGAAAACTCCTTACTTATATATATAGAAGAGTTCAATT**ACA
TTTAGAACTCTGCAACATGTTTTGTTGTATGGTTCTGTTCATCTTAAGACCTTTTTGTCT
CTACTAGC

QA 3 790 3 790
DS 



AS 2 4

CO CL2494Contig1 684 2 1 U
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TGGGGGTGAGGATGACGACGGTGGTTCACCAACAGGCGATTCTGGCGAGGACGACTCTGA
TGCTAGTGACGACGGCGGCGAAGGAGAGATAGAGAAATCTAACAAGAAGGAACCAAAGAA
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GCAAAAAGAGGAAGGTGAAAAGGAAGAAGGATCCTAATGCACCAAAGAAGGCAATGTCTG
GTTTCATGTACTTCTCCCAAATGGAGAGAGATAACATAAAGAAGACTAACCCAGGGATAG
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AAGAGCCGTATGAAGCTAAGGCACAAGTCGACAAGAAGCGATACTAGGATCAGATTAGTG
ATTACAAGAACCCTCAGCCAATGCTTGTAGACTCGGAAAACGACTCCGACAGTAACTGAA
CTCTTATGTATCCCAAAGACTCGAACATCTGAGATTTTACATGTTATCTTGTCTGCTCTG
CTTCATCTTAGTTTTTTTTTTTTCCGAGTGTAGTGATTCTACAACTGGCTGAAGTTCACA
AAGATACATGAGTGTTTGCTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BT48TF U 1
AF RR4BT48JQ C 15
BS 1 684 RR4BT48TF

RD RR4BT48TF 684 0 0
GCTTGAGCGTATCAGAAACCAAGCTGCTGATGAGAGTGACGAGGAGGACGAAGACTTTGT
TGGGGGTGAGGATGACGACGGTGGTTCACCAACAGGCGATTCTGGCGAGGACGACTCTGA
TGCTAGTGACGACGGCGGCGAAGGAGAGATAGAGAAATCTAACAAGAAGGAACCAAAGAA
AGAGACGAAAAGTTTGCCCCCAAAAAAAGAAAGCAGTAGCAGCAACAGAAGAAGGCAGTA
GCAAAAAGAGGAAGGTGAAAAGGAAGAAGGATCCTAATGCACCAAAGAAGGCAATGTCTG
GTTTCATGTACTTCTCCCAAATGGAGAGAGATAACATAAAGAAGACTAACCCAGGGATAG
GATTTGGAGAGGTGGCGAAGGCGCTTGGAGATAAGTGGCGCCAAATGTCTGCCGAGGAAA
AAGAGCCGTATGAAGCTAAGGCACAAGTCGACAAGAAGCGATACTAGGATCAGATTAGTG
ATTACAAGAACCCTCAGCCAATGCTTGTAGACTCGGAAAACGACTCCGACAGTAACTGAA
CTCTTATGTATCCCAAAGACTCGAACATCTGAGATTTTACATGTTATCTTGTCTGCTCTG
CTTCATCTTAGTTTTTTTTTTTTCCGAGTGTAGTGATTCTACAACTGGCTGAAGTTCACA
AAGATACATGAGTGTTTGCTCTTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BT48JQ 670 0 0
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TGCCCCCAAAAAAAGAAAGCAGTAGCAGCAACAGAAGAAGGCAGTAGCAAAAAGAGGAAG
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TCCCAAATGGAGAGAGATAACATAAAGAAGACTAACCCAGGGATAGGATTTGGAGAGGTG
GCGAAGGCGCTTGGAGATAAGTGGCGCCAAATGTCTGCCGAGGAAAAAGAGCCGTATGAA
GCTAAGGCACAAGTCGACAAGAAGCGATACTAGGATCAGATTAGTGATTACAAGAACCCT
CAGCCAATGCTTGTAGACTCGGAAAACGACTCCGACAGTAACTGAACTTTTATGTATCCC
AAAGACTCGAACATTTGAGATTTTACATGTTATCTTGTTTGCTTTGCTTCATCTTAGTTT
TTTTTTTTTCCGAGTGTAGTGATTCTACAACTGGCTGAAGTTCACAAAGATACATGAGTG
TTTGCTCTTT

QA 1 670 1 670
DS 



CO CL2494Contig2 638 2 2 U
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GCCCCCAAAAAAGAAAGCAGTAGCAGCAACAGAAGAAGGCAGTAGCAAAAAGAGGAAGGT
GAAAAGGAAGAAGGATCCTAATGCACCAAAGAAGGCAATGTCTGGTTTCATGTACTTCTC
CCAAATGGAAAGAGATAACATAAAGAAGACTAACCCAGGGATAGGATTTAGAGAGGTGGC
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GCCAATGCTTGTAGACTCGGAAAACGACTCCGACAGTAACTGAACTCTTATGTATCCCAA
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TTTTTTTTTTCCGAGTGTAGTGATTCTACAACTGGCTGAAGTTCACAAAGATACATGAGT
GTTTGCTCTTTAGGACTAGCTATAACCAGTTACTTATCTGCAAATTACACAATTTGTTCT
CGCTAAATCATAACATAATCGATTATAATTCTTTTCCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GM77JQ C 1
AF RR4GM77TF U 1
BS 1 1 RR4GM77JQ
BS 2 638 RR4GM77TF

RD RR4GM77JQ 638 0 0
GGGCGAAGGAGAGATAGAGAAATCTAACAAGAAGGAACCAAAGAAAGAGACGAAAAGTTT
GCCCCCAAAAAAGAAAGCAGTAGCAGCAACAGAAGAAGGCAGTAGCAAAAAGAGGAAGGT
GAAAAGGAAGAAGGATCCTAATGCACCAAAGAAGGCAATGTCTGGTTTCATGTACTTTTC
CCAAATGGAAAGAGATAACATAAAGAAGACTAACCCAGGGATAGGATTTAGAGAGGTGGC
GAAGGCGCTTGGAGATAAGTGGCGTCAAATGTCTGCCGAGGAAAAAGAGCCGTATGAAGC
TAAGGCACAAGTCGACAAGAAGCGATACGAGGATCAGATTAGTGATTACAAGAACCCTCA
GCCAATGCTTGTAGACTCGGAAAACGACTCCGACAGTAACTGAACTCTTATGTATCCCAA
AGACTCGAACATTTGAGATTTTACATGTTATCTTGTCTGCTCTGCTTCATCTTAGTTTTT
TTTTTTTTTTCCGAGTGTAGTGATTCTACAACTGGCTGAAGTTCACAAAGATACATGAGT
GTTTGCTCTTTAGGACTAGCTATAACCAGTTACTTATCTGCAAATTACACAATTTGTTCT
CGCTAAATCATAACATAATCGATTATAATTCTTTTCCT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4GM77TF 638 0 0
G
GGCGAAGGAGAGATAGAGAAATCTAACAAGAAGGAACCAAAGAAAGAGACGAAAAGTTTG
CCCCCAAAAAAGAAAGCAGTAGCAGCAACAGAAGAAGGCAGTAGCAAAAAGAGGAAGGTG
AAAAGGAAGAAGGATCCTAATGCACCAAAGAAGGCAATGTCTGGTTTCATGTACTTCTCC
CAAATGGAAAGAGATAACATAAAGAAGACTAACCCAGGGATAGGATTTAGAGAGGTGGCG
AAGGCGCTTGGAGATAAGTGGCGTCAAATGTCTGCCGAGGAAAAAGAGCCGTATGAAGCT
AAGGCACAAGTCGACAAGAAGCGATACGAGGATCAGATTAGTGATTACAAGAACCCTCAG
CCAATGCTTGTAGACTCGGAAAACGACTCCGACAGTAACTGAACTCTTATGTATCCCAAA
GACTCGAACATCTGAGATTTTACATGTTATCTTGTCTGCTCTGCTTCATCTTAGTTTTTT
TTTTTTTTTCCGAGTGTAGTGATTCTACAACTGGCTGAAGTTCACAAAGATACATGAGTG
TTTGCTCTTTAGGACTAGCTATAACCAGTTACTTATCTGCAAATTACACAATTTGTTCTC
GCTAAATCATAACATAATCGATTATAATTCTTTTCCT

QA 2 638 2 638
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2496Contig1 1167 4 7 U
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CTCCAGACCTTCAGATAACTGAAAAAGAAACAAGAAAGGAGAGCAAAAAGCACCCTTCTC
ATCTCACTTCAAAAGATACATACATAAATACATATATAGAAACAGAAGTTTCGAGTAGTT
TTACAGTGTGTGTCTACACTACAACAACATGATGTTGTCTCTCCCTGTACTCTTCTTCCT
CAATTGTGTTTCTTCTCTTACTTTTTTGTTCAGAAAGATGCAGCCAAGAGAGCATTTGGG
CCTTCTCCACACCTCCGATGAACATCCTTCATCCTATCCGCTGATCTACAAATCCCACTG
CAGCTCCAATCAAACGAGGCAACACACATGTTGCCTGCCTGTGCCTTCCACTCACAATCT
GTTGTACCACAACAGAGCCTACGGTCATCTACATGCTCCACATCCAATCCAAGAAACCAT
GATCCTAAAGAGACATCCTCATTCACATACTTGTGAAGTACGTTTTGGTTTATAGATATG
TAAGACGCAAGTTCCCTGGAAATAGCGTAGAGCTGACCAGTGGCATGGCGGAAGTACTTG
TTACCCTCTTCTCCAAACTTCCAGTACTCCGGTTCATGATATCTCACTCCTTTCTGAGCA
AGAACGGGTCCAGACTTCATACAGCCAATGTAGACTCGAGGCTTCATCCGGTATCTTGCT
AGTTCAGCTCCAAGAGTGGCTATATTTACATGCACATCATCATCTACTTTCACGTAGAAG
TCTGCATCCCACAATGCATAAGCCGTGGTAAAGTAAGATTTAGTCTTTGCTGACAGCTCC
AGGTAACCTTCAACGTGATCCAGCCTCAAGAAGTCTCCATGTTTACTTTCTTCAGCCTGA
ATCGCTCTATCAAGAATCCCACCAGGAGTGGCACTATGGCCTATTACAAACCGCATCACG
ATTCCTTTCTCTTCCTCGAGCTTCTTTCTATCCTCACCGGGAGGCGTCCAGGTAGCACGT
ACAGAATCCCTACGCTTTCTGCTGCTAAACGCAGTGTTCACACCAACGACATCAGATACT
TTCTTCTGGTGACGGTTTCAGGGAGTTTGAAATCATCAGACACTGGTGAACCATTCATGA
TTGACTCTTGCGCCGCTCTAGCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD54TF C 1
AF RR4BV28JQ U 230
AF RR4BT49JQ U 99
AF RR4DE43TF C 422
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TTACAGTGTGTGTCTACACTACAACAACATGATGTTGTCTCTCCCTGTACTCTTCTTCCT
CAATTGTGTTTCTTCTCTTACTTTTTTGTTCAGAAAGATGCAGCCAAGAGAGCATTTGGG
CCTTCTCCACACCTCCGATGAACATCCTTCATACTATCCGCTGATCTACAAATCCCACTG
CAGCTCCAATCAAACGAGGCAACACACATGTTGCCTGCCTGTGCCTTCCACTCACAATCT
GTTGTACCACAACAGAGCCTACGGTCATCTACATACTCCGCATTCAATCCAAGAAACCAT
GATCCTAAAGAGACATCCTCATTCACATACTCGTGAAGTACGTTTTGGTTTATAGATATG
TAAGACGCAAGTTCCCTGGAAATAGCGTAGAGCTGACCAGTGGCATGGCGGAAGTACTTG
TTACCCTCTTCTCCAAACTTCCAGTACTCCGGTTCATGATATCTCACTCCTTTCTGAGCA
AGTACGGGTCCAGACTTCAT
GC

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DS 

RD RR4BV28JQ 634 0 0
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GAGCATTTGGGCCTTCTCCACACCTCCGATGAACATCCTTCATCCTATCCGCTGATCTAC
AAATCCCACTGCAGCTCCAATCAAACGAGGCAACACACATGTTGCCTGCCTGTGCCTTCC
ACTCACAATCTGTTGTACCACAACAGAGCCTACGGTCATCTACATGCTCCACATCCAATC
CAAGAAACCATGATCCTAAAGAGACATCCTCATTCACATACTTGTGAAGTACGTTTTGGT
TTATAGATATGTAAGACGCAAGTTCCCTGGAAATAGCGTAAAGCTGACCAGTGGCATGGC
GGAAGTACTTGTTACCCTCTTCTCCAAACTTCCAGTACTCCGGTTCATGATATCTCACTC
CTTTCTGAGCAAGAACGGGTCCAGACTTCATACAGCCAATGTAGACTCGAGGCTTCATCC
GGTATCTTGCTAGTTCAGCTCCAAGAGTGGCTATATTTACATGCACATCATCATCTACTT
TCACGTAGAAGTCTGCATCCCACAATGCATAAGCCGTGGTAAAGTAAGATTTAGTCTTTG
CTGACAGCTCCAGGTAACCTTCAACGTGATCCAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4BT49JQ 818 0 0
GAGAGCAAAAAGCACCCTTCTCATCTCACTTCAAAAGATACATACATACATACATATATA
GAAACAGAAGTTTCGAGTAGTTTTACAGTGTGTGTCTACACTACAACAACATGATGTTGT
CTCTCCCTGTACTCTTCTTCCTCAATTGTGTTTCTTCTCTTACTTTTTTGTTCAGAAAGA
TGCAGCCAAGAGAGCATTTGGGCCTTCTCCACACCTCCGATGAACATCCTTCATCCTATC
CGCTGATCTACAAATCCCACTGCAGCTCCAATCAAACGAGGCAACACACATGTTGCCTGC
CTGTGCCTTCCACTCACAATCTGTTGTACCACAACAGAGCCTACGGTCATCTACATGCTC
CACATCCAATCCAAGAAACCATGATCCTAAAGAGACATCCTCATTCACATACTTGTGAAG
TACGTTTTGGTTTATAGATATGTAAGACGCAAGTTCCCTGGAAATAGCGTAGAGCTGACC
AGTGGCATGGCGGAAGTACTTGTTACCCTCTTCTCCAAACTTCCAGTACTCCGGTTCATG
ATATCTCACTCCTTTCTGAGCAAGAACGGGTCCAGACTTCATACAGCCAATGTAGACTCG
AGGCTTCATCCGGTATCTTGCTAGTTCAGCTCCAAGAGTGGCTATATTTACATGCACATC
ATCATCTACTTTCACGTAGAAGTCTGCATCCCACAATGCATAAGCCGTGGTAAAGTAAGA
TTTAGTCTTTGCTGACAGCTCCAGGTAACCTTCAACGTGATCCAGCCTCAAGAAGTCTCC
ATGTTTACTTTCTTCAGCCTGAATTGCTCTATCAAGAA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4DE43TF 746 0 0
G
TGTACCACAACAGAGC*TACGGTCATCTACATGCTCCACATCCAATCCAAGAAACCATGA
TCCTAAAGAGACATCCTCATTCACATACTTGTGAAGTACGTTTTGGTTTATAGATATGTA
AGACGCAAGTTCCCTGGAAATAGCGTAGAGCTGACCAGTGGCATGGCGGAAGTACTTGTT
ACCCTCTTCTCCAAACTTCCAGTACTCCGGTTCATGATATCTCACTCCTTTCTGAGCAAG
TACGGGTCCAGACTTCATGCAGCCAATGTAGACTCGAGGCTTCATCCGGTATCTTGCCAA
TTCAGCTCCAAGAGTGGCTATATTTACATGCACATCATCATCTACTTTCACGTAGAAGTC
TGCATCCCACAATGCATAGGCCGTGGTAAAGTAAGATTTAGTCTTAGCTGACAGCTCCAG
GTAACCTTCAACGTGATCCAGCCTCAAGAAGTCTCCATGTTTACTTTCTTCAGCCTGAAT
CGCTCTATCAAGAATCCCACCAGGAGTGGCACTATGGCCTATTACAAACCGCATCACGAT
TCCTTTCTCTTCCTCGAGCTTCTTTCTATCCTCACCGGGAGGCGTCCAGGTAGCACGTAC
AGAATCCCTACGCTTTCTGCTGCTAAACGCAGTGTTCACACCAACGACATCAGATACTTT
CTTCTGGTGACGGTTTCAGGGAGTTTGAAATCATCAGACACTGGTGAACCATTCATGATT
GACTCTTGCGCCGCTCTAGCAGCCC

QA 2 746 2 746
DS 



AS 2 4

CO CL2497Contig1 832 2 2 U
GGTATTTAATTAATCAATTACCTGAAATTGTAACTTTGTACATACTCTACTACCTCTAAG
AACAGATCAAAACACCTTATAGATGAAAATGATCATCGGAGAAGTTGATAACATGCTCTG
CTCCTTCCTCTGTTTAAGCTGGTAACCACCATCTGCGAGGCTCTTGATTCAATAGGATCA
TCTGTCTACTTTGAGAATGTTGTTCGTGACGTGTCCTCTTGTAACTGAATCTCTTTGAGG
ATCCGTTATCCATTGACCGTCCACGATGAATTTAATCTCATATGTACCAGGATACAACCA
CAGTAATGTTGACCAGCATTTCTGTTTCCCGGTTGACTTGGAAGTTTCAATCTCCAGACC
CACTCGGTGTTCCCAGCCATTGAAGCTGCCAGTAACCTCCACAACATTACCATCTCCGCA
AAATTCAATCTCAACCTCTTGCAATCCTGAGAGACTTTCCTCAGCTTCTTGCAACTCAAC
ATCCTTCTGTGAGACGAGCATTTGGGCCTTTTGTATCTCTGTTTCAGCTTTTCTTTGAAG
AACCGATAGAGACAGCTTTTCCTTTTCAATCTGCTCTTTTAACCTCGACAGCTCCAGCTC
TTTTTGACGCAGCATGAACCTCAGCCGAGTAATTTCAGCCTGATTTTCCCGTTTCATGTC
CTCATCATGTGAATCCTTGTCCAGTTCAGCATTCCCATGTCTTTGATCACTATTCCTTTT
AGAGTTATTAACTTGTGTCGCATGGGTAACCTCCTCATATGCTAGGGCGCTTCCATTTGG
CGCACACTCACACTTCTCTGACTGTACTCACCACCTTTGTTTGTTTCTTCAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DS72JQ U 1
AF RR4E750JQ U 1
BS 1 755 RR4DS72JQ
BS 756 832 RR4E750JQ

RD RR4DS72JQ 759 0 0
GGTATTTAATTAATCAATTACCTGAAATTGTAACTTTGTACATACTCTACTACCTCTAAG
AACAGATCAAAACACCTTATAGATGAAAATGATCATCGGAGAAGTTGATAACATGCTCTG
CTCCTTCCTCTGTTTAAGCTGGTAACCACCATCTGCGAGGCTCTTGATTCAATAGGATCA
TCTGTCTACTTTGAGAATGTTGTTCGTGACGTGTCCTCTTGTAACTGAATCTCTTTGAGG
ATCCGTTATCCATTGACCGTCCACGATGAATTTAATCTCATATGTACCAGGATACAACCA
CAGTAATGTTGACCAGCATTTCTGTTTCCCGGTTGACTTGGAAGTTTCAATCTCCAGACC
CACTCGGTGTTCCCAGCCATTGAAGCTGCCAGTAACCTCCACAACATTACCATCTCCGCA
AAATTCAATCTCAACCTCTTGCAATCCTGAGAGACTTTCCTCAGCTTCTTGCAACTCAAC
ATCCTTCTGTGAGACGAGCATTTGGGCCTTTTGTATCTCTGTTTCAGCTTTTCTTTGAAG
AACCGATAGAGACAGCTTTTCCTTTTCAATCTGCTCTTTTAACCTCGACAGCTCCAGCTC
TTTTTGACGCAGCATGAACCTCAGCCGAGTAATTTCAGCCTGATTTTCCCGTTTCATGTC
CTCATCATGTGAATCCTTGTCCAGTTCAGCATTCCCATGTCTTTGATCACTATTCCTTTT
AGAGTTATTAACTTGTGTCGCATGGGTAACCTCCT
CATA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4E750JQ 832 0 0
GG
TATTTAATTAATCAATTACCTGAAATTGTAACTTTGTACATACTCTACTACCTCTAAGAA
CAGATCAAAACACCTTATAGATGAAAATGATCATCGGAGAAGTTGATAACATGCTCTGCT
CCTTCCTCTGTTTAAGCTGGTAACCACCATCTGCGAGGCTCTTGATTCAATAGGATCATC
TGTCTACTTTGAGAATGTTGTTCGTGACGTGTCCTCTTGTAACTGAATCTCTTTGAGGAT
CCGTTATCCATTGACCGTCCACGATGAATTTAATCTCATATGTACCAGGATACAACCACA
GTAATGTTGACCAGCATTTCTGTTTCCCGGTTGACTTGGAAGTTTCAATCTCCAGACCCA
CTCGGTGTTCCCAGCCATTGAAGCTGCCAGTAACCTCCACAACATTACCATCTCCGCAAA
ATTCAATCTCAACCTCTTGCAATCCTGAGAGACTTTCCTCAGCTTCTTGCAACTCAACAT
CCTTCTGTGAGACGAGCATTTGGGCCTTTTGTATCTCTGTTTCAGCTTTTCTTTGAAGAA
CCGATAGAGACAGCTTTTCCTTTTCAATCTGCTCTTTTAACCTCGACAGCTCCAGCTCTT
TTTGACGCAGCATGAACCTCAGCCGAGTAATTTCAGCCTGATTTTCCCGTTTCATGTCCT
CATCATGTGAATCCTTGTCCAGTTCAGCATTCCCATGTCTTTGATCACTATTCCTTTTAG
AGTTATTAACTTGTGTCGCATGGGTAACCTCCTCATATGCTAGGGCGCTTCCATTTGGCG
CACACTCACACTTCTCTGACTGTACTCACCACCTTTGTTTGTTTCTTCAT

QA 3 832 3 832
DS 



CO CL2497Contig2 1081 2 2 U
GACCAAAAACGTTGTTGAAAGTGTTGCTACTGAATCCTTGTCTGGTGAGGACAACCCTTG
GCAAATGCAGAGAATTTTCAGAATCAGCAGATTGATCATATGGCTGAAAAACGTTCTGGC
GATTGTTTAGTTGCGCCTGATGATAAAGATTGGATGTTAGGACTTCCTTCCTCAACTTCA
AGCATAGAAGAAAAAAACAACCAGATTTATCCAGAACGGATACTTGGATACAGTTGATGA
TGATGATGAAAATGACAGACTCAATGAAGAAACAAACAAAGGTGGTGAGTACAGTCAGAG
AAGTGTGAGTATGGCGCCAAACGGAAGCGCCCTAGCATATGAGGAGGTTACCCATGCGAC
ACAAGTTAATAACTCTAAAAGGAATAGTGATCAAAGACATGGGAATGCTGAACTGGACAA
GGATTCACATGATGAGGACATGAAACGGGAAAATCAGGTTGAAATTACTCGGCTGAGGTT
CATGCTGCGTCAAAAAGAGCTGGAGCTGTCAAGGTTAAAAGAGCAGATTGAAAAGGAAAA
GCTGTCTCTATCTGTTCTTCAAAGAAAAGCTGAAACAGAGATACAAAAGGCCCAAATGCT
TGTCTCACAGAAGGATGTTGAATTGCAAGAAGCTGAGGAAAGTCTCTCAGGACTGCAAGA
GGTTGAGATTGAATATTGCGGAGATGGTAATGTTGTGGAGGTTACTGGCAGCTTCAATGG
CTGGGAACACCGAGCGGGACTGGAGCTTGAAACATCCAAGTCAACCGGGAAACAGAAATG
CTGGTCAACATTACTGTGGTTGTATCCTGGTACATATGAGATTAAATTCATCGTGGACGG
TCAATGGATAACCGATCCTCAAAGAGATTCAGTTACAAGAGGACACGTCACAAACAACAT
TCTCAAAGTAAATCAAGAGCCTCGCAGATGATGGTTACCAGCTTAAACAGAGGAAGGAGC
AGAGCATGTTATCAACTTCTCCGATGATCATTTTCATGTATAAGGTGTTTTGCTCTGTTC
TTAGAGGTGTTAGAGTATGTACAAAGTTACAATTTCAGATAATCGATTAAATAAATATCT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4DX12TF U 1
AF RR4DX12JQ C 342
BS 1 584 RR4DX12TF
BS 585 1081 RR4DX12JQ

RD RR4DX12TF 584 0 0
GACCAAAAACGTTGTTGAAAGTGTTGCTACTGAATCCTTGTCTGGTGAGGACAACCCTTG
GCAAATGCAGAGAATTTTCAGAATCAGCAGATTGATCATATGGCTGAAAAACGTTCTGGC
GATTGTTTAGTTGCGCCTGATGATAAAGATTGGATGTTAGGACTTCCTTCCTCAACTTCA
AGCATAGAAGAAAAAAACAACCAGATTTATCCAGAACGGATACTTGGATACAGTTGATGA
TGATGATGAAAATGACAGACTCAATGAAGAAACAAACAAAGGTGGTGAGTACAGTCAGAG
AAGTGTGAGTATGGCGCCAAACGGAAGCGCCCTAGCATATGAGGAGGTTACCCATGCGAC
ACAAGTTAATAACTCTAAAAGGAATAGTGATCAAAGACATGGGAATGCTGAACTGGACAA
GGATTCACATGATGAGGACATGAAACGGGAAAATCAGGTTGAAATTACTCGGCTGAGGTT
CATGCTGCGTCAAAAAGAGCTGGAGCTGTCAAGGTTAAAAGAGCAGATTGAAAAGGAAAA
GCTGTCTCTATCTGTTCTTCAAAGAAAAGCTGAAACAGAGATAC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4DX12JQ 740 0 0
AGGAGGTTACCCATGCGACACAAGTTAATAACTCTAAAAGGAATAGTGATCAAAGACATG
GGAATGCTGAACTGGACAAGGATTCACATGATGAGGACATGAAACGGGAAAATCAGGTTG
AAATTACTCGGCTGAGGTTCATGCTGCGTCAAAAAGAGCTGGAGCTGTCAAGGTTAAAAG
AGCAGATTGAAAAGGAAAAGCTGTCTCTATCTGTTCTTCAAAGAAAAGCTGAAACAGAGA
TACAAAAGGCCCAAATGCTTGTCTCACAGAAGGATGTTGAATTGCAAGAAGCTGAGGAAA
GTCTCTCAGGACTGCAAGAGGTTGAGATTGAATATTGCGGAGATGGTAATGTTGTGGAGG
TTACTGGCAGCTTCAATGGCTGGGAACACCGAGCGGGACTGGAGCTTGAAACATCCAAGT
CAACCGGGAAACAGAAATGCTGGTCAACATTACTGTGGTTGTATCCTGGTACATATGAGA
TTAAATTCATCGTGGACGGTCAATGGATAACCGATCCTCAAAGAGATTCAGTTACAAGAG
GACACGTCACAAACAACATTCTCAAAGTAAATCAAGAGCCTCGCAGATGATGGTTACCAG
CTTAAACAGAGGAAGGAGCAGAGCATGTTATCAACTTCTCCGATGATCATTTTCATGTAT
AAGGTGTTTTGCTCTGTTCTTAGAGGTGTTAGAGTATGTACAAAGTTACAATTTCAGATA
ATCGATTAAATAAATATCTG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL2498Contig1 954 3 7 U
GGAGACAAGAGCTCTGTTCTGTTCTCGCTCCTTGTCGATTGGTTTTATTCCTCGCCGAAA
AGCTAGCATTAGGGTTTCGATCATGGCGACTTGTACGGTGACGGAGTACTTGCGCCCTCC
GAAGAAGCGCAGGTTGGACATAGCCTCGGGAGAATCGAGATCCTCAGCGACACGTCCAAA
TCTCCAGTCTTTCAACTCGCGCGATGATGAGTGCATCCGACAGTACATCTCGTACTATTA
CCAGTTTCAAAAGAGCGAGGGTTTCGAGATTGAGTGGGATAAACTGGACTACCTGTTCGA
CACGATACCTATGATTGATCCATATCGTGCCAGTGAATATAAGACCAACGATGAAATAAT
CCGTGAAGGGACCTGTCTTGCCATTGCCCGACACAATTCCGACAAGGGAACTAGGCTTGT
TTACCTCGATCACGTTTCAGCAAGTTACAGGTGCTGTGCTGGTGTGCTTTACTATGTTAC
ATTCTAGGCCATGGATTTGGCTTCATCCAGTCCCCTGCCAAAACTTTATCAATCAAACTT
TCGCCGGTGTGGACCCACATTTTGTGAGGTTTATCTCTTCAGGCTTAAACCAACGGACCA
AGAGATTGCTACTGTTCAGGTGGATCCTCCTCCTCCATTGAATGAAGATATCCCAGAACG
ACCCACTGTATTGTTCACTGTAACGGGTCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTT
CACTAGGATTCCTGCTCAAGTGTCTCTCTCGTTGCCAGAATCATCCTCACCATCCCTTCT
TGTTACCTAACTACGCAAGTTTGTTGCACTCAGCCGTTTATGTGTGTTTTTTTTGGGATA
TATTAGTTTATCGCAAGTGTTTAACTGTATTAAAGTGACTGATGTCGTCTCATTCGTTGT
TATCGTTTTTCATGGCAAAGCTACGTTGAGAATTTTTTGATAAAAATTTTTTGG


BQ
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F525TF U 1
AF RR4FD43TF U 249
AF RR4F525JQ C 268
BS 1 342 RR4F525TF
BS 343 343 RR4FD43TF
BS 344 504 RR4F525TF
BS 505 834 RR4FD43TF
BS 835 835 RR4F525JQ
BS 836 928 RR4FD43TF
BS 929 954 RR4F525JQ

RD RR4F525TF 504 0 0
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AGCTAGCATTAGGGTTTCGATCATGGCGACTTGTACGGTGACGGAGTACTTGCGCCCTCC
GAAGAAGCGCAGGTTGGACATAGCCTCGGGAGAATCGAGATCCTCAGCGACACGTCCAAA
TCTCCAGTCTTTCAACTCGCGCGATGATGAGTGCATCCGACAGTACATCTCGTACTATTA
CCAGTTTCAAAAGAGCGAGGGTTTCGAGATTGAGTGGGATAAACTGGACTACCTGTTCGA
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TTACCTCGATCACGTTTCAGCAAGTTACAGGTGCTGTGCTGGTGTGCTTTACTATGTTAC
ATTCTAGGCCATGGATTTGGCTTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4FD43TF 680 0 0
G
AAAGAGCGAGGGTTTCGAGATTGAGTGGGATAAACTGGACTACCTGTTCGACACGGTACC
TATGATTGATCCATATCGTGCCAGTGAATATAAGACCAACGATGAAATAATCCGTGAAGG
GACCTGTCTTGCCATTGCCCGACACAATTCCGACAAGGGAACTAGGCTTGTTTTCCTCGA
TCACGTTTCAGCAAGTTACAGGTGCTGTGCTGGTGTGCTTTACTATGTTACATTCTGGGC
CATGGATTTGGCTTCATCCAGTCCCCTGCCAAAACTTTATCAATCAAACTTTCGCCGGTG
TGGACCCACATTTTGTGAGGTTTATCTCTTCAGGCTTAAACCAACGGACCAAGAGATTGC
TACTGTTCAGGTGGATCCTCCTCCTCCATTGAATGAAGATATCCCAGAACGACCCACTGT
ATTGTTCACTGTAACGGGTCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCACTAGGAT
TCCTGCTCAAGTGTCTCTCTCGTTGCCAGAATCATCCTCACCATCCCTTCTTGTTACCTA
ACTACGCAAGTTTGTTGCACTCAGCCGTTTATGTGTGTTTTTTTTTGGATATATTAGTTT
ATCGCAAGTGTTTAACTGTATTAAAGTGACTGATGTCGTCTCATTCGTTGTTATCGTTTT
TCATGGCAAAGCTACGTTG

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR4F525JQ 687 0 0
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TGCCAGTGAATATAAGACCAACGATGAAATAATCCGTGAAGGGACCTGTCTTGCCATTGC
CCGACACAATTCCGACAAGGGAACTAGGCTTGTTTACCTCGATCACGTTTCAGCAAGTTA
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CAGTCCCCTGCCAAAACTTTATCAATCAAACTTTCGCCGGTGTGGACCCACATTTTGTGA
GGTTTATCTCTTCAGGCTTAAACCAACGGACCAAGAGATTGCTGCTGTTCAGGTGGATCC
TCCTCCTCCATTGAATGAAGATATCCCAGAACGACCCACTGTATTGTTCACTGTAACGGG
TCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCACTAGGATTCCTGCTCAAGTGTCTCT
CTCGTTGCCAGAATCATCCTCACCATCCCTTCTTGTTACCTAACTACGCAAGTTTGTTGC
ACTCAGCCGTTTATGTGTGTTTTTTTTGG***ATATTAGTTTATCGCAAGTGTTTAACTG
TATTAAAGTGACTGATGTCGTCTCATTCGTTGTTATCGTTTTTCATGGCAAAGCTACGTT
GAGAATTTTTTGATAAAAATTTTTTGG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 4

CO CL2499Contig1 1115 4 2 U
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AAAAAAATGTCGTCCGGTTTAATCGGAAGATTGGTTAGAACCAAACCGTCGCGATTAGCC
ACATCATCGGCGAGGCTAATCCCATCGCGATTCTGCACGTCTTCCGCAACCGAACCGGAA
CCATCGAAACCATCCAAGTTCAAGACGTTCCAGATCTACCGATGGAACCCCGACAACCCT
AGCAAGCCCGAGCTCCAAGACTACAAGATCGATCTCAAAGCCTGCGGCCCGATGGTCCTC
GACGCTCTCATCAAGATCAAAAACGAGATGGATCCCTCCCTCACCTTCCGCCGCTCGTGC
CGAGAAGGGATCTGCGGCTCGTGCGCGATGAACATCGACGGG*TGCAACGGGCTCGCGTG
TCTGACGAAGATCGAAGGAGGCGACGGGGCCAAGGAGACGACCATCACTCCCTTGCCTCA
CATGTTCGTGATCAAGGATCTGGTGGTGGACATGACTAATTTTTACAATCAGTACAAGAG
TATAGAGCCGTGGCTGAAGAGGAAGAACCCGGCGTCTGAGCCTGGGAAGGAGATTCCGCA
GAGTAAGAAGGATAGGGCTAAGCTTGATGGGATGTATGAGTGTATCTTGTGTGCTTGTTG
TAGCACTTCTTGTCCTAGTTATTGGTGGAACCCTGAGTCTTACCTTGGCCCTGCCGCTTT
GCTACACGCCAACAGGTGGATAAGCGATAGTCGTGACGAGTACACTAAGGAAAGACTTGA
GGCTATTGACGATGAGTTCAAGCTTTACCGTTGCCATACGATCTTGAACTGTGCTCGTGC
TTGTCCTAAGGGTTTGGATCCGGGCAAACAGATCGCGCACATCAAGCAACTTCAGCGTTG
ATGTGTGTTATCTTTTAAAAAGCTAATAAGTCTACTTCACAAAGTCTTTGATTTTGGATT
TCATTCTTGTATTGTTGTTGCCGAATATTAGCAACCTGTGGAAAAACTCTTTTGGCTAGA
GTCTTGCCAAGTAGATGAGCTTTGTGATTGTATCTTGCTGAAAAACTCGAGACTCTTTTT
AAGTAATAAAACTGAAGTGAACTTAAATTTCATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4A495TF U 1
AF RR4A358TFB U 1
AF RR4A358JQD C 349
AF RR4A495JQ C 352
BS 1 738 RR4A358TFB
BS 739 1115 RR4A358JQD

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AAAAAAATGTCGTCCGGTTTAATCGGAAGATTGGTTAGAACCAAACCGTCGCGATTAGCC
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TAGCACTTCTTGTCCTAGTTATTG

QA 1 684 1 684
DS 

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AAAAAAATGTCGTCCGGTTTAATCGGAAGATTGGTTAGAACCAAACCGTCGCGATTAGCC
ACATCATCGGCGAGGCTAATCCCATCGCGATTCTGCACGTCTTCCGCAACCGAACCGGAA
CCATCGAAACCATCCAAGTTCAAGACGTTCCAGATCTACCGATGGAACCCCGACAACCCT
AGCAAGCCCGAGCTCCAAGACTACAAGATCGATCTCAAAGCCTGCGGCCCGATGGTCCTC
GACGCTCTCATCAAGATCAAAAACGAGATGGATCCCTCCCTCACCTTCCGCCGCTCGTGC
CGAGAAGGGATCTGCGGCTCGTGCGCGATGAACATCGACGGG*TGCAACGGGCTCGCGTG
TCTGACGAAGATCGAAGGAGGCGACGGGGCCAAGGAGACGACCATCACTCCCTTGCCTCA
CATGTTCGTGATCAAGGATCTGGTGGTGGACATGACTAATTTTTACAATCAGTACAAGAG
TATAGAGCCGTGGCTGAAGAGGAAGAACCCGGCGTCTGAGCCTGGGAAGGAGATTCCGCA
GAGTAAGAAGGATAGGGCTAAGCTTGATGGGATGTATGAGTGTATCTTGTGTGCTTGTTG
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GCTACACGCCAACAGGTG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4A358JQD 767 0 0
CGC
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GCTCGCGTGTCTGACGAAGATCGAAGGAGGCGACGGGGCCAAGGAGACGACCATCACTCC
CTTGCCTCACATGTTCGTGATCAAGGATCTGGTGGTGGACATGACTAATTTTTACAATCA
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GATTCCGCAGAGTAAGAAGGATAGGGCTAAGCTTGATGGGATGTATGAGTGTATCTTGTG
TGCTTGTTGTAGCACTTCTTGTCCTAGTTATTGGTGGAACCCTGAGTCTTACCTTGGCCC
TGCCGCTTTGCTACACGCCAACAGGTGGATAAGCGATAGTCGTGACGAGTACACTAAGGA
AAGACTTGAGGCTATTGACGATGAGTTCAAGCTTTACCGTTGCCATACGATCTTGAACTG
TGCTCGTGCTTGTCCTAAGGGTTTGGATCCGGGCAAACAGATCGCGCACATCAAGCAACT
TCAGCGTTGATGTGTGTTATCTTTTAAAAAGCTAATAAGTCTACTTCACAAAGTCTTTGA
TTTTGGATTTCATTCTTGTATTGTTGTTGCCGAATATTAGCAACCTGTGGAAAAACTCTT
TTGGCTAGAGTCTTGCCAAGTAGATGAGCTTTGTGATTGTATCTTGCTGAAAAACTCGAG
ACTCTTTTTAAGTAATAAAACTGAAGTGAACTTAAATTTCATCC

QA 4 767 4 767
DS 

RD RR4A495JQ 764 0 0
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TGCTTGTTGTAGCACTTCTTGTCCTAGTTATTGGTGGAACCCTGAGTCTTACCTTGGCCC
TGCCGCTTTGCTACACGCCAACAGGTGGATAAGCGATAGTCGTGACGAGTACACTAAGGA
AAGACTTGAGGCTATTGACGATGAGTTCAAGCTTTACCGTTGCCATACGATCTTGAACTG
TGCTCGTGCTTGTCCTAAGGGTTTGGATCCGGGCAAACAGATCGCGCACATCAAGCAACT
TCAGCGTTGATGTGTGTTATCTTTTAAAAAGCTAATAAGTCTACTTCACAAAGTCTTTGA
TTTTGGATTTCATTCTTGTATTGTTGTTGCCGAATATTAGCAACCTGTGGAAAAACTCTT
TTGGCTAGAGTCTTGCCAAGTAGATGAGCTTTGTGATTGTATCTTGCTGAAAAACTCGAG
ACTCTTTTTAAGTAATAAAACTGAAGTGAACTTAAATTTCATCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 3

CO CL2500Contig1 1135 3 22 U
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GGGCTACTTGGGTCAACATCTTCTTCAATCTTTCCCCGGAGATCGTTACGACGTCGCTTT
CACTCACCACTCTTGTCCCCTTCCCCCCCTCTTGCTCGACGCCTTCCCACATTTCCCATC
TTTTCATGTCGATCTCAAAACCGGTCTTGGTTTCAATTCCATCTCCCACCACTTCGGCCA
GCCGGACGTGGTCGTGAATTGTGCAGCTCTCTCTGTTCCTCGAGTTTGTGAGCAAGATCC
AGATTCCGCTACCTCCATCAACGTCCCTTCTTCCCTTGTTAACTGGTTGTCATCATCTTT
TCAGACAAAAAACAAAACCTTGTTGATTCATCTCTCTACTGATCAAGTTTATGAAGGTGT
CAAGTCTTTCTACAAGGAAGAAGACGAGACGCTTGCTGTAAACGTTTACGGGAAATCAAA
AGTTGCAGCAGAGCTTCTCATCAGAGATAAATGTCATAACTTTGCTATATTGAGGAGTAG
TATCATCTTTGGTCCTCACACTCTATCACCACTCCCTAAGAATCTCCCTGTTCAGTGGAT
GGATAGCGTCTTACAGAAGGGAGACACGGTAGATTTCTTCCACGATGAGTATCGTTGTCC
TATTTACGTTAAGGATCTCGTGAGGATCATCTTGAAGTTGATTGACAGATGGGTTCTCTC
AGATGATAAACAGATGTGGCTGGTTTTGAATGCTGGTGGACCGGACAGACTCTCTCGTGT
TCAAATGGCAGAAGTGGTTGCGCAAGTCAGAGGACATGATCTTTCCTTGATTAAACATGT
TTCTGCTTCATCGGTTGATCGAGGAGTGGTGTCACCAGCAGATATATCAATGGACATAAC
CAAACTGATTCAGACACTTGACATCTCCCCAACTTCTTTTAAAGATGGTGTTAGGTTAAC
GCTTCAGTCTGAATCTCGTTCCCATATCCTCTCGTAACATTGTTCCTTCTGTCATCCTTA
CCCACCACACTGCTTCTTTCTACAACATAAATGTTGGTTATGATACAACCAAATCTAATA
TGAAATAAGGATTGAAACGGTTCTGGTTTTATTATTTAGTTTTGTTTTACTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI07TF U 1
AF RR4DO93TF U 9
AF RR4DO93JQ C 459
BS 1 144 RR4FI07TF
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RD RR4FI07TF 735 0 0
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CACTCACCACTCTTGTCCCCTTCCGCCCCTCTTGCTCGACGCTTTCCCGCATTTCCCATC
TTTTCATGTCGATCTCAAAACCGGTCTTGGTTTCAATTCCATCTCCCACCACTTCGGCCA
GCCGGACGTGGTCGTGAATTGTGCAGCTCTCTCTGTTCTTCGAGTTTGTGAGCAAGATCC
AGATTCCGCTACCTCCATCAACGTCCCTTCTTCCCTTGTTAACTGGTTGTCATCATCTTT
TCAGACAAAAAACAAAACCTTGTTGATTCATCTCTCTACTGATCAAGTTTATGAAGGTGT
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AGTTGCAGCAGAGCTTCTCATCAGAGATAAATGTCATAACTTTGCTATATTGAGGAGTAG
TATCATCTTTGTTCCTCAAACTCTATCACCACTCCCTAAGAATCTCCCTGTTCAGTGGAT
GGATAGCGTCTTACAGAAGGGAGACACGGTAGATTTCTTCCACGATGAGTATCGTTGTCC
TATTTACGTTAAGGATCTCGTGAGCATCATCTTGATGTTGATTGACAGATGGGTTCTCTC
AGATGATA
AACAGAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4DO93TF 720 0 0
G
GAAGGGAAAAACAATGGAGAAGAAGACGAAAGTGGTGATTGTGGGAGGTACGGGCTACTT
GGGTCAGCATCTTCTTCAATCTTTCGCCGGAGATCGTTACGACGTCGCTTTCACTCACCA
CTCTTGTCCCCTTCCCCGCCTCTTGCTCGACTCCTTCCCACATTTCCCATCTTTTCATGT
CGATCTCAAAACCGGTCTTGGTTTCAATTCCATTTCCCACCACTTCGGCCAGCCGGACGT
GGTCGTGAATTGTGCAGCTCTCTCTGTTCCTCGAGTTTGTGAGCAAGATCCAGATTCCGC
TACCTCCATCAACGTCCCTTCTTCCCTTGTTAACTGGTTGTCATCATCTTTTCAGACAAA
AAACAAAACCTTGTTGATTCATCTCTCTACTGATCAAGTTTATGAAGGTGTCAAGTCTTT
CTACAAGGAAGAAGACGAGACGCTTGCTGTAAACGTTTACGGGAAATCAAAAGTTGCAGC
AGAGCTTCTCATCAGAGATAAATGTCATAACTTTGCTATATTGAGGAGTAGTATCATCTT
TGGTCCTCACACTCTATCACCACTCCCTAAGAATCTCCCTGTTCAGTGGATGGATAGCGT
CTTACAGAAGGGAGACACGGTAGATTTCTTCCACGATGAGTATCGTTGTCCTATTTACGT
TAAG*ATCTCGTGAGGATCATCTTGAAGTTGATTGACAGATGGGTTCTCTCAGATGATA

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR4DO93JQ 677 0 0
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ACTTTGCTATATTGAGGAGTAGTATCATCTTTGGTCCTCACACTCTATCACCACTCCCTA
AGAATCTCCCTGTTCAGTGGATGGATAGCGTCTTACAGAAGGGAGACACGGTAGATTTCT
TCCACGATGAGTATCGTTGTCCTATTTACGTTAAGGATCTCGTGAGGATCATCTTGAAGT
TGATTGACAGATGGGTTCTCTCAGATGATAAACAGATGTGGCTGGTTTTGAATGCTGGTG
GACCGGACAGACTCTCTCGTGTTCAAATGGCAGAAGTGGTTGCGCAAGTCAGAGGACATG
ATCTTTCCTTGATTAAACATGTTTCTGCTTCATCGGTTGATCGAGGAGTGGTGTCACCAG
CAGATATATCAATGGACATAACCAAACTGATTCAGACACTTGACATCTCCCCAACTTCTT
TTAAAGATGGTGTTAGGTTAACGCTTCAGTCTGAATCTCGTTCCCATATCCTCTCGTAAC
ATTGTTCCTTCTGTCATCCTTACCCACCACACTGCTTCTTTCTACAACATAAATGTTGGT
TATGATACAACCAAATCTAATATGAAATAAGGATTGAAACGGTTCTGGTTTTATTATTTA
GTTTTGTTTTACTGTTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL2501Contig1 1040 3 3 U
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AACCTTTTTGATAAATAGTGATTGATATATAATAAATATTTTGGTGGTTTGTTTACGGTC
GGAAGATTCGGATGGTTCTTGTGACTTGAAGACGACAAAAGGGACATCTAGCGACTGAAG
CTGAACATTCCCGACACAAGACATGTCCGCATGGTACAATGGTTATGTCCACTTCTTTGA
TCAGACATATCTTGCAAACCCACTGTGATTTCGCCGTCTCTGCTTCTTTCAGGGAAGCCT
CTGCTCTCTCCTGTTCGAGTATAAATGCTGCTTGAGAGTCTTTGAGTTCTTCTTGAAGGG
TTATGGTTCTCTGTAGTAAAGATTGATTCTCCAGTTCCATGTTGATTCCAGCTGCAGAGA
GCATCTCGTTGACCGCCTCAACTAATTCTTTAGCTGTGACTCGACCATATTGCGTTTCAT
TCACAGGCTGGCTAGAAGAACTTGCATTGTTAGTTCTGGAACTTTCTGAGTTCCCTTGAG
ATTTGTTATCAGATACTGCAGGGAGCACCTCGGGCAACAACGAGGGACCTTCATTTTCGA
TTGACGTGCCACGGAAGGAGAAAACTTGAGATGAAAGTAATAAACCAGTCTCTCCGGGTG
TCATTTCAACCTTAAATCTGTAAAGGGCTTGGCCTGCAGAAGGTCGAACATTCTCTGGGA
CTCTTCCGTATCTCAGTTTGTCTCCTTGTTGGATTTTCCAAGCAACAATCTCCCCTTTAT
AGAATGGTCTCAAAGGGTGAAGCTGTACTTGTACAGCATTCTGCGGCATTATCTCTTGGC
CAACAGTGCTATCAACAGCTGTGCCGATGTTGGTGAGAGCATGAGAGCATAGTCTTAGGC
AAGCGGAAATTTCAGTTTCAGATCCCTCAGGACATGAAAATAAAGATGCTATAGGCAAGG
AAGTTGGAAAGCCTAGAACCTCGCTCACCACTGTTGCCATGACATCCAGTAAAGAAATGT
ATCCAGGGGGTTCGGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT24JQ U 1
AF RR4CV01JQ U 158
AF RR4GT24TF C 279
BS 1 567 RR4GT24JQ
BS 568 597 RR4CV01JQ
BS 598 1040 RR4GT24TF

RD RR4GT24JQ 567 0 0
AGACACCAAGTATATACAAGCTGCCAATGAATCAGCAGAAACTGTTTCTACAGAGGACAA
AACCTTTTTGATAAATAGTGATTGATATATAATAAATATTTTGGTGGTTTGTTTACGGTC
GGAAGATTCGGATGGTTCTTGTGACTTGAAGACGACAAAAGGGACATCTAGCGACTGAAG
CTGAACATTCCCGACACAAGACATGTCCGCATGGTACAATGGTTATGTCCACTTCTTTGA
TCAGACATATCTTGCAAACCCACTGTGATTTCGCCGTCTCTGCTTCTTTCAGGGAAGCCT
CTGCTCTCTCCTGTTCGAGTATAAATGCTGCTTGAGAGTCTTTGAGTTCTTCTTGAAGGG
TTATGGTTCTCTGTAGTAAAGATTGATTCTCCAGTTCCATGTTGATTCCAGCTGCAGAGA
GCATCTCGTTGACCGCCTCAACTAATTCTTTAGCTGTGACTCGACCATATTGCGTTTCAT
TCACAGGCTGGCTAGAAGAACTTGCATTGTTAGTTCTGGAACTTTCTGAGTTCCCTTGAG
ATTTGTTATCAGATACTGCAGGGAGCA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4CV01JQ 440 0 0
AAAGGGACATCTAGCGACTGAAGCTGAACATTCCCGACACAAGACATGTCCGCATGGTAC
AATGGTTATGTCCACTTCTTTGATCAGACATATCTTGCAAACCCACTGTGATTTCGCCGT
CTCTGCTTCTTTCAGGGAGGCCTCTGCTCTCTCCTGTTCGAGTATAAATGCTGCTTGAGA
GTCTTTGAGTTCTTCTTGAAGGGTTATGGTTCTCTGTAGTAAAGATTGATTCTCCAGTTC
CATGTTGATTCCAGCTGCAGAGAGCATCTCGTTGACCGCCTCAACTAATTCTTTAGCTGT
GACTCGACCATATTGCGTTTCATTCACAGGCTGGCTAGAAGAACTTGCATTGTTAGTTCT
GGAACTTTCTGAGTTCCCTTGAGATTTGTTATCAGATACTGCAGGGAGCACCTCGGGCAA
CAACGAGGGACCTTCATTTT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4GT24TF 762 0 0
TCTGCTTCT
TTCAGG*AAGCCTCTGCTCTCTCCTGTTCGAGTATAAATGCTGCTTGAGAGTCTTTGAGT
TCTTCTTGAAGGGTTATGGTTCTCTGTAGTAAAGATTGATTCTCCAGTTCCATGTTGATT
CCAGCTGCAGAGAGCATCTCGTTGACCGCCTCAACTAATTCTTTAGCTGTGACTCGACCA
TATTGCGTTTCATTCACAGGCTGGCTAGAAGAACTTGCATTGTTAGTTCTGGAACTTTCT
GAGTTCCCTTGAGATTTGTTATCAGATACTGCAGGGAGCACCTCGGGCAACAACGAGGGA
CCTTCATTTTCGATTGACGTGCCACGGAAGGAGAAAACTTGAGATGAAAGTAATAAACCA
GTCTCTCCGGGTGTCATTTCAACCTTAAATCTGTAAAGGGCTTGGCCTGCAGAAGGTCGA
ACATTCTCTGGGACTCTTCCGTATCTCAGTTTGTCTCCTTGTTGGATTTTCCAAGCAACA
ATCTCCCCTTTATAGAATGGTCTCAAAGGGTGAAGCTGTACTTGTACAGCATTCTGCGGC
ATTATCTCTTGGCCAACAGTGCTATCAACAGCTGTGCCGATGTTGGTGAGAGCATGAGAG
CATAGTCTTAGGCAAGCGGAAATTTCAGTTTCAGATCCCTCAGGACATGAAAATAAAGAT
GCTATAGGCAAGGAAGTTGGAAAGCCTAGAACCTCGCTCACCACTGTTGCCATGACATCC
AGTAAAGAAATGTATCCAGGGGGTTCGGCAACC

QA 10 762 10 762
DS 



AS 1 4

CO CL2502Contig1 927 4 8 U
GAACTCATATATATTCCCCTTCCATGTATAACTATTTAATATATATAAAGTCTATCGACG
ACTCCTATTCTTCAATCTTTTGGCTTCTAAGAAGAAGAAACGAACGTGTTTAGGATATTT
CTCTTGAGAGTGAATTCATCAGCTTTCACCGGACTTATCGACTTGCTAAGGACGCGTCCA
AGCCGCTCAGCTTCTTTGGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATGTACTTCTTTGCGAGT
GACGCGTAAAGCTTTCCATACCTTGCTGTGGAGCCCTTAAGGTTACTAGCTTCCTCTTCG
ATGCGAGACAAGATTGCCTTCTTCTCATCTTCACTCGCTGCAACTAGCTCCTTTACCAAC
GCACCTAAGCTTTCAACTATACGAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTTACTGTCTCTGCTG
GTACCAACTTTCTCATTGATGAAACTTACAAAGTCATCTAAGTCCCTTCCACCGTTATAA
TCTTGACCGGCTTTGTTGTCCTTTGGGAAGAATTTCAATGTTGGGAATCCACTTACTCCA
TACTTCTCGCCAAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATGACTACACCTTCT
TCCTGCTTAAACACCGTTGCTACCTTTTCGTATGTAGGAGCGAGGGACTTGCAGTGGCCG
CACCAAGGGGCATAAAACTCGACCAAGACATCTTTGTTCTGATCCAGCACAATCGCATCG
AAGTTATCAGGTGTTAACACGACTACATTTTGTGGAACTGCAGCTAATTTGACGTTGGTA
CCTCCTTCCTTGTTGACAAATTCAGCCAAAGCTTCAGCATTGCGTGCACCCTCGTACTTT
TGAGGGTCAAGAGAGCCTTTAGGAAACCATTTAATGGTGGGATATCCACTAACATCATAC
TTAGTGCAGACAGTCTTATGTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4GA69JQ U 454
AF RR4GQ59JQ U 1
AF RR4DL41TF C 221
AF RR4DL62TF C 297
BS 1 337 RR4GQ59JQ
BS 338 338 RR4DL41TF
BS 339 382 RR4GQ59JQ
BS 383 383 RR4DL41TF
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BS 418 418 RR4DL41TF
BS 419 662 RR4GQ59JQ
BS 663 927 RR4DL41TF

RD RR4GA69JQ 178 0 0
TCATCTAAGTCCCTTCCACCGTTATAATCTTGACCGGCTTTGTTGTCCTTTGGGAAGAAT
TTCAATGTTGGGAATCCACTTACTCCATACTTCTCGCCAAGGCTTTTGTGTGCATCAGCA
TCCAAGTTGGCAATGACTACACCTTCTTCCTGCTTAAACACCGTTGCTACCTTTTCGT

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR4GQ59JQ 662 0 0
GAACTCATATATATTCCCCTTCCATGTATAACTATTTAATATATATAAAGTCTATCGACG
ACTCCTATTCTTCAATCTTTTGGCTTCTAAGAAGAAGAAACGAACGTGTTTAGGATATTT
CTCTTGAGAGTGAATTCATCAGCTTTCACCGGACTTATCGACTTGCTAAGGACGCGTCCA
AGCCGCTCAGCTTCTTTGGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATGTACTTCTTTGCGAGT
GACGCGTAAAGCTTTCCATACCTTGCTGTGGAGCCCTTAAGGTTACTAGCTTCCTCTTCG
ATGCGAGACAAGATTGCCTTCTTCTCATCTTCACTCGTTGCAACTAGCTCCTTTACCAAC
GCACCTAAGCTTTCAACTATACCAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTTACTGTCTCTGTTG
GTACCAACTTTCTCATTGATGAAACTTACAAAGTCATCTAAGTCCCTTCCACCGTTATAA
TCTTGACCGGCTTTGTTGTCCTTTGGGAAGAATTTCAATGTTGGGAATCCACTTACTCCA
TACTTCTCGCCAAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATGACTACACCTTCT
TCCTGCTTAAACACCGTTGCTACCTTTTCGTATGTAGGAGCGAGGGACTTGCAGTGGCCG
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DL41TF 707 0 0
CTATGTACTTCTTTGCGAGTGACGCGTAAAGCTTTCCATACCTTGCTGTGGAGCCTTTAA
GGTTACTAGCTTCCTCTTCGATGCGAGACAAGATTGCCTTCTTCTCATCTTCACTCGCTG
CAACTAGCTCCTTTACCAACGCACCTAAGCTTTCAACTATACGAGCCTTTGAAGTAAGCT
GCCCTTTACTGTCTCTGCTGGTACCAACTTTCTCATTGATGAAACTTACAAAGTCATCTA
AGTCCCTTCCACCGTTATAATCTTGACCGGCTTTGTTGTCCTTTGGGAAGAATTTCAATG
TTGGGAATCCACTTACTCCATACTTCTCGCCAAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGT
TGGCAATGACTACACCTTCTTCCTGCTTAAACACCGTTGCTACCTTTTCGTATGTAGGAG
CGAGGGACTTGCAGTGGCCGCACCAAGGGGCATAAAACTCGACCAAGACATCTTTGTTCT
GATCCAGCACAATCGCATCGAAGTTATCAGGTGTTAACACGACTACATTTTGTGGAACTG
CAGCTAATTTGACGTTGGTACCTCCTTCCTTGTTGACAAATTCAGCCAAAGCTTCAGCAT
TGCGTGCACCCTCGTACTTTTGAGGGTCAAGAGAGCCTTTAGGAAACCATTTAATGGTGG
GATATCCACTAACATCATACTTAGTGCAGACAGTCTTATGTTCATCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DL62TF 631 0 0
TTCGATGCGAGACAAGATTGCCTTCTTCTCATCTTCACTCGCTGCAACTAGCTCCTTTAC
CAACGCACCTAAGCTTTCAACTATACGAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTTACTGTCTCT
GCTGGTACCAACTTTCTCATTGATGAAACTTACAAAGTCATCTAAGTCCCTTCCACCGTT
ATAATCTTGACCGGCTTTGTTGTCCTTTGGGAAGAATTTCAATGTTGGGAATCCACTTAC
TCCATACTTCTCGCCAAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATGACTACACC
TTCTTCCTGCTTAAACACCGTTGCTACCTTTTCGTATGTAGGAGCGAGGGACTTGCAGTG
GCCGCACCAAGGGGCATAAAACTCGACCAAGACATCTTTGTTCTGATCCAGCACAATCGC
ATCGAAGTTATCAGGTGTTAACACGACTACATTTTGTGGAACTGCAGCTAATTTGACGTT
GGTACCTCCTTCCTTGTTGACAAATTCAGCCAAAGCTTCAGCATTGCGTGCACCCTCGTA
CTTTTGAGGGTCAAGAGAGCCTTTAGGAAACCATTTAATGGTGGGATATCCACTAACATC
ATACTTAGTGCAGACAGTCTTATGTTCATCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL2503Contig1 961 4 6 U
CGTACATTATTAATTTATTATGTCCATGGATAGCATGGACCAAAATACTTGTAAGTCAAT
AAACGAGGACCCCAAACATAGCAATTTGAATGAACTTTTTAAAAAGAGAGACATACAATC
ATCATATCGTCAATAATGCAAGACGTAACAGCTGTACTCAACAGTAGCATCTCCCGTCTT
TATATCCAACCACTTAGTCCTAGCCTCGACAAAACCTCTAGCGAACCGGAACAGTCCACT
TCCTCCAATCACCGGCATCTCCCTAACCTTAGTCAACACCGCGTTTCGACCAAGAATCGA
GATCGTACTTCCGTTATACTTACCTGTCTTGAACGCGAAGTTCATCACCATAAGCGCAGA
AGCATCGTGTTGCCCCGCACCAGCGTACATCCCTTGAGCCTGGCCTACCAAAGTCGAGTT
TACCGAGACATCTGTAGTTAAACGGTTATCGATCATAGTGACTGCTCCGAAGAATGATGA
GTTGGATAGAGGAGGTCGGAGCACGACCGAGCTAGGATTTGAGCCGCTTTGAATGTCATG
CCAGTAGACACGGAAGAAAGTGAGTTTCTCCTTACGGATTCCGAGGTGTTTCCGGTTAAC
GGTTTTGCCAAAGTGTTGGCCCTTTCCTGCGGAGACAACAGCTGCGAGAAGAATGATTAG
AGAGGTGATGCTGAGGATGAGGTTTGCCATTTGTGTGGATTGTGGTATGAGTTTTATGTC
TCGTTCATAATGTGTTTACATGTATTATATAGACTATTATTAAAGTACATGAAGATGGCT
TATATGTTAATATATTTGCCACAATAAAACATGGGTCAATATTTGAAAATTTTCTGCGCC
ATAAGTCGTATTCGCTGGCCGGATAAAAGTAAAGAGAATAAAAAGTCTTATTCTTCCTTT
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20 

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AT
CC

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ATCATAGTGACTGCTCCGAAGAATGATGAGTTGGATAGAGGAGGTCGGAGCACGACCGAG
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GAGACAACAGCTGCGAGAAGAATGATTAGAGAGGTGATGCTGAGGATGAGGTTTGCCATT
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GACTATTATTAAAGTACATGAAGATGGCTTATATGTTAATATATTTGCCACAATAAAACA
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GAAAAGATATTATAAAGTCGTTAAGTTGTT

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DS 



AS 1 4

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CCATCTCCAACATCTCTACAAACACTTTAACCAAATTAAAGGCTCTGATCTTCTTGGGGG
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G427TF U 1
AF RR4FK76TF U 3
AF RR4G427JQ C 345
AF RR4FK76JQ C 711
BS 1 38 RR4G427TF
BS 39 39 RR4FK76TF
BS 40 119 RR4G427TF
BS 120 120 RR4FK76TF
BS 121 333 RR4G427TF
BS 334 335 RR4FK76TF
BS 336 681 RR4G427TF
BS 682 1081 RR4G427JQ
BS 1082 1158 RR4FK76JQ

RD RR4G427TF 693 0 0
GGGCGCATCAACCAAAGCAAAGCAGAACAAAAAAAAAA*CTAAAACATCAAGAAAATGGC
TCATACTCTCGACCTCGAAGGCATCACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGAGTTGATGAGGT
AGCATTAATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGC
AAGCAAGAGTTTCTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGTCATGATCACTT
TGTCAAACATCTCAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTGGTGATGTGGTCGAT
GCATCCATGGGAGAGAGACGCAAGATTGGTGAA**AAGCCCTTAAGAAAGGAGATGAATC
TTACAACCTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAAGATCTCCTAGGGGCACG
CAAAGCTTACCACTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATTGCCTCTCACATCCA
TGGCCCGCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATAGATACGAAGGAAACAA
GGTGAAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTAGCTTCTTC
AGGAGAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCATACT
CCATCTCCAACATCTCTACAA
CACTTTAACAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4FK76TF 685 0 0
GG
GCATCAACCAAAGCAAAGCAGAACAAAAAAAAAAACTAAAACATCAAGAAAATGGCTCAT
ACTCTCGACCTCGAAGGCATCACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGAGTTGATGAGGGAGCA
TTAATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAGC
AAGAGTTTCTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGTCATGATCACTTTGTC
AAACATCTCAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTGGTGATGTGGTCGATGCAT
CCATGGGAGAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCCCTTAAGAAAGGAGATGAATCTTAC
AACCTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAAGATCTCCTAGGGGCACGCAAA
GCTTACCACTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATTGCCTCTCACATCCATGGC
CCGCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATAGATACGAAGGAAACAAGGTG
AAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTATGATTTTGGCCGAGGCTGTAGCTTCTTCAGGA
GAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACA*GAAGCATACTCCAT
CTCCAACATCTCTACAA
ACACTT

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR4G427JQ 737 0 0
AGAAAGGAGATGAATCTTACAACCTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAAG
ATCTCCTAGGGGCACGCAAAGCTTACCACTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACA
TTGCCTCTCACATCCATGGCCCGCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATA
GATACGAAGGAAACAAGGTGAAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCG
AGGCTGTAGCTTCTTCAGGAGAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGA
CGACAAGAAGCATACTCCATCTCCAACATCTCTACAAACACTTTAACCAAATTAAAGGCT
CTGATCTTCTTGGGGGTGCATCTGAGTCTTCGCTTATCAATGAAGCATTGCTTTGTTTGC
TCAAACCCTCTGTGTATTTCAGCAAGATTTTGAATGCGTCTTTGAACAAAGATGCGGACA
AGGGTACCAAGAAATGGTTGACAAGAGTGTTTGTTACTAGAGCAGATCATAGTGACATGA
AGGAGATAGCAGAAGAGTATAATCTGCTCTATGGAGAGCCTTTGGTCAAAACAATTCAAG
AGAAGATTAAAGGGAACTACAGAGATTTCTTGCTGACACTACTATCCAAATCGAATTAAT
TTCGGCTAAGAACGTATTGCCAAGACTTGTGGTTATTGAATATTTGGATTTCTTTTTCGA
TTTTATGTTTCTATTCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FK76JQ 448 0 0
TTCTTGGGGGTGCATCTGAGTCTTCGCTTATCAATGAAGCATTGCTTTGTTTGCTCAAAC
CCTCTGTGTATTTCAGCAAGATTTTGAATGCGTCTTTGAACAAAGATGCGGACAAGGGTA
CCAAGAAATGGTTGACAAGAGTGTTTGTTACTAGAGCAGATCATAGTGACATGAAGGAGA
TAGCAGAAGAGTATAATTTGCTCTATGGAGAGCCTTTGGTCAAAACAATTCAAGAGAAGA
TTAAAGGGAACTACAGAGATTTCTTGCTGACACTACTATCCAAATCGAATTAATTTCGGC
TAAGAACGTATTGCCAAGACTTGTGGTTATTGAATATTTGGATTTCTTTTTCGATTTTAT
GTTTCTATTCCAACATTTGCGTTTTCTATACCCTTTCTATCGTATCTGATAATAAAGTTA
CTGTCGCTGGTGTCTGGTGACATGATTC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL2505Contig1 821 2 2 U
GGCTCTCTCTCTCGCCGCAAAGACCTCTCCAGTGTCTTCCTCCTCCCAAAGAGCTTAGAG
AAAGATGGATCATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGA
GCTTCCCGTCTATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCGCGATTCCGCTGTAA
GGTCACTGTTTTCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCTACACTAAAAGCGGC
TGAACATGCTGCTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGT
TGTTGATCTTGCTTACAAGAACCTTTTACAAGAAATTGCGCAGAAAGAAAACTCTCTTTT
ACCAGTTTATGCTACTTCTACATCTGGTCCCTCGCATTCACCTACGTTCACCTCAACGGT
TGAGTTTGCGGGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAAATTGGCTGAAAT
GAATGCTGCCAAGGTTGCATTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATC
GCTTTCTTTGCCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACA
AGTGAGCCCTTCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTTA
AGTGTACGAAGATGAACTTGCAGACGTTCTTAATGCACAGTCAATAGTGTTAAGACACAA
ACATTGCTGCCTCGCCTGTGGCTACTCATCCTACTACGAGTCTACTCTTACGTCGCACCA
GCTACAATGCTATGGAGATGACGCTGATGCTGCTGACTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF24TF U 1
AF RR4FS27TF U 9
BS 1 644 RR4CF24TF
BS 645 821 RR4FS27TF

RD RR4CF24TF 644 0 0
GGCTCTCTCTCTCGCCGCAAAGACCTCTCCAGTGTCTTCCTCCTCCCAAAGAGCTTAGAG
AAAGATGGATCATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGA
GCTTCCCGTCTATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCGCGATTCCGCTGTAA
GGTCACTGTTTTCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCTACACTAAAAGCGGC
TGAACATGCTGCTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGT
TGTTGATCTTGCTTACAAGAACCTTTTACAAGAAATTGCGCAGAAAGAAAACTCTCTTTT
ACCAGTTTATGCTACTTCTACATCTGGTCCCTCGCATTCACCTACGTTCACCTCAACGGT
TGAGTTTGCGGGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAAATTGGCTGAAAT
GAATGCTGCCAAGGTTGCATTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATC
GCTTTCTTTGCCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACA
AGTGAGCCCTTCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4FS27TF 813 0 0
GG
CTCGCCGCAAAGACCTCTCCAGTGTCTTCCTCCTCCCAAAGAGCTTAGAGAAAGATGGAT
CATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGAGCTTCCCGTC
TATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCGCGATTCCGCTGTAAGGTCACTGTT
TTCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCTACACTAAAAGCGGCTGAACATGCT
GCTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTT
GCTTACAAGAACCTTTTACAAGAAATTGCGCAGAAAGAAAACTCTCTTTTACCAGTTTAT
GCTACTTCTACATCTGGTCCCTCGCATTCACCTACGTTCACCTCAACGGTTGAGTTTGCG
GGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAAATTGGCTGAAATGAATGCTGCC
AAGGTTGCATTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATCGCTTTCTTTG
CCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCT
TCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTTAAGTGTACGAA
GATGAACTTGCAGACGTTCTTAATGCACAGTCAATAGTGTTAAGACACAAACATTGCTGC
CTCGCCTGTGGCTACTCATCCTACTACGAGTCTACTCTTACGTCGCACCAGCTACAATGC
TATGGAGATGACGCTGATGCTGCTGACTTGT

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 4

CO CL2506Contig1 729 4 2 U
GGAATCTGTAGAAAACAGGTTCTAGCGGCGTCATCGTTCCACAATCTGTACGGACGACGT
CACAGGAGCTTTGTTCATTGGACAAGCGCTGCTATGTCGCAAGATAGTGCAATTGGTGAC
TCTGCTTCTTCTGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCCCTACAAGATTTATCAGCAAAAAAG
TGTGTCCCATGCAACGCTAAGGATCTACACCCCATGACTGAACAAAGTGCCCAAGAACTA
CTTCAGAAGGTTGCTGGATGGGATATGGCTAATGACAATGGCACATTAAAGCTGCATCGA
TCGTGGACGGTGAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATC
GCTGAATCAGAAGGTCATCACCCGGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATC
GACATATGGACACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCTAAG
ATCAATGAGCTCCAAGTGGAAGATCTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATG
TGTTGTTGGTTCACAAACTCTGTCAAACAAGCTTTAGATGTATGCAATATGAGAATAAAA
CGTGAGCTAGAGTGAAACATTTTGATGTTTCTTCAGCGTCTAGAGTTCTTGTAAAGCTGT
TTCTGTTCTTACAATCACAAAACGCACAAATAAGGCAGTTTGGAATCAAGTACCGTTTAT
TATAATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4E929TF U 2
AF RR4DU94TF U 1
AF RR4DU94JQ C 4
AF RR4E929JQ C 306
BS 1 654 RR4DU94TF
BS 655 729 RR4DU94JQ

RD RR4E929TF 159 0 0
GGAATCTGTA
AAAACAGGTTCTAGCGGCGTCATCGTTCCACAATCTGTACGGACGACGTCACAGGAGCTT
TGTTCATTGGACAAGCGCTGCTATGTCCCAAGATAGTGCAATTGGTGACTCTGCTTCTTC
TGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCC
TACA

QA 11 155 11 155
DS 

RD RR4DU94TF 654 0 0
GGAATCTGTAGAAAACAGGTTCTAGCGGCGTCATCGTTCCACAATCTGTACGGACGACGT
CACAGGAGCTTTGTTCATTGGACAAGCGCTGCTATGTCGCAAGATAGTGCAATTGGTGAC
TCTGCTTCTTCTGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCCCTACAAGATTTATCAGCAAAAAAG
TGTGTCCCATGCAACGCTAAGGATCTACACCCCATGACTGAACAAAGTGCCCAAGAACTA
CTTCAGAAGGTTGCTGGATGGGATATGGCTAATGACAATGGCACATTAAAGCTGCATCGA
TCGTGGACGGTGAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATC
GCTGAATCAGAAGGTCATCACCCGGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATC
GACATATGGACACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCTAAG
ATCAATGAGCTCCAAGTGGAAGATCTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATG
TGTTGTTGGTTCACAAACTCTGTCAAACAAGCTTTAGATGTATGCAATATGAGAATAAAA
CGTGAGCTAGAGTGAAACATTTTGATGTTTCTTCAGCGTCTAGAGTTCTTGTAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4DU94JQ 726 0 0
ATCTGTAG
AAAACAGGTTCTAGCGGCGTCATCGTTCCACAATCTGTACGGACGACGTCACAGGAGCTT
TGTTCATTGGACAAGCGCTGCTATGTCGCAAGATAGTGCAATTGGTGACTCTGCTTCTTC
TGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCCCTACAAGATTTATCAGCAAAAAAGTGTGTCCCATG
CAACGCTAAGGATCTACACCCCATGACTGAACAAAGTGCCCAAGAACTACTTCAGAAGGT
TGCTGGATGGGATATGGCTAATGACAATGGCACATTAAAGCTGCATCGATCGTGGACGGT
GAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATCGCTGAATCAGA
AGGTCATCACCCGGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATCGACATATGGAC
ACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCTAAGATCAATGAGCT
CCAAGTGGAAGATCTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATGTGTTGTTGGTT
CACAAACTCTGTCAAACAAGCTTTAGATGTATGCAATATGAGAATAAAACGTGAGCTAGA
GTGAAACATTTTGATGTTTCTTCAGCGTCTAGAGTTCTTGTAAAGCTGTTTCTGTTCTTA
CAATCACAAAACGCACAAATAAGGCAGTTTGGAATCAAGTACCGTTTATTATAATAGC

QA 9 726 9 726
DS 

RD RR4E929JQ 423 0 0
GACGGTGAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATCGCTGA
ATCAGAAGGTCATCACCCGGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATCGACAT
ATGGACACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCTAAGATCAA
TGAGCTCCAAGTGGAAGATTTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATGTGTTG
TTGGTTCACAAACTCTGTCAAACAAGCTTTAGATGTATGCAATATGAGAATAAAACGTGA
GCTAGAGTGAAACATTTTGATGTTTCTTCAGCGTCTAGAGTTCTTGTAAAGCTGTTTCTG
TTCTTACAATCACAAAACGCACAAATAAGGCAGTTTGGAATCAAGTACCGTTTATTATAA
TAG

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 4

CO CL2507Contig1 1145 4 17 U
GGAAAAGCTCAAAGATCTTCGTCGTCGTCGTCTCTATGTTCAACACATAATGATAAATCT
GCCGAGAGAACCAAATCAATAGCCACCACTCTGATTCCGCAGCTATAGTTAGCAATTTCT
TAGTCGCGAACTGCAAGCAATGCTTGGCTCAGAAGAAACTTCTCGAGAATTCGGAGATGC
AGTTAGTGCCTAGTGATGATGACCGGAACGAAGAACAGATTATTCTATTCGACGAATCCA
CATCCACCAACGAAATCGTAGCAGCGGAAAGAGGCGATCGTGTTGTAGAGGAAGAAGGAG
AGGTTTCTGAGATAGCTGAGAGTGATGATGATGAGGATGACGATAACGAAACTACGCATC
TCGTTGCTGCTGTAGATCAACCACAATGTCGAATTTGCCTTGACGTTGGAGGGGAAGATC
TGATTGGTCCCTGCAATTGTAAAGGTACTCAGAAGTACGTCCACAGATCTTGTCTCGATA
ACTGGCGCTCCACCAAGGAAGGATTTGCGTTTTCGCATTGTACAGAGTGTAGAGCTGTGT
TCAAACTCCGAGCCAATGTGCCTCCTGATAGGTGGTGGTTGAGATTGAGATTTCAGCTCC
TGGTTGCTAGAGATCATGCTTTCATTTTCATCACTGTCCAGATGGTAGTAGCGTTCTTGG
GGTTACTAGTTTACAAGTTCTACGGCGAAGAACTACGTGAGATGTTCGGTTATGAGGAAC
ATCCTTATGGCTTCTACACATTAGCTGTTTTGGCCATTGTCTTGGTAGGACTACTTTATG
GGTTCTTCATCGCAATTATATGTGGTCAAAGGATCAATGAGCGGCACTACCATGTTCTTG
CCAAACAAGAACTCACAAAGGAGTATATAGTGGAAGACCGAGACTGCAAGAATGTTCCTG
ATCTTGACCAGAGTCATGTAATGGAACTCAGAATGTTGGGGCTTTATTGAACATAGATAT
GAGAAAAGAGCTCGCCGGATCTATACTCTTCATTTCACCTGTAAATTATACTCTTCATTG
ATTCTAAGGTTGTTTCAACGATTCTGTTAAGTGGTTTTATGAAATTTATTTTATTTATAC
TCTTCATTTCAATGATTCTGATGAAACTGTGAGGTTTACACAGTAATGTATTGGATGATC
ATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 0 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4CM17TF U 1
AF RR4E232TF U 19
AF RR4E232JQ C 316
AF RR4CM17JQ C 422
BS 1 35 RR4CM17TF
BS 36 36 RR4E232TF
BS 37 61 RR4CM17TF
BS 62 62 RR4E232TF
BS 63 70 RR4CM17TF
BS 71 71 RR4E232TF
BS 72 360 RR4CM17TF
BS 361 361 RR4E232TF
BS 362 502 RR4CM17TF
BS 503 503 RR4E232TF
BS 504 684 RR4CM17TF
BS 685 685 RR4E232JQ
BS 686 710 RR4E232TF
BS 711 928 RR4E232JQ
BS 929 929 RR4CM17JQ
BS 930 1076 RR4E232JQ
BS 1077 1145 RR4CM17JQ

RD RR4CM17TF 688 0 0
GGAAAAGCTCAAAGATCTTCGTCGTCGTCGTCTCTGTGTTCAACACATAATGATAAATCT
GTCGAGAGAATCAAATCAATAGCCACCACTCTGATTCCGCAGCTATAGTTAGCAATTTCT
TAGTCGCGAACTGCAAGCAATGCTTGGCTCAGAAGAAACTTCTCGAGAATTCGGAGATGC
AGTTAGTGCCTAGTGATGATGACCGGAACGAAGAACAGATTATTCTATTCGACGAATCCA
CATCCACCAACGAAATCGTAGCAGCGGAAAGAGGCGATCGTGTTGTAGAGGAAGAAGGAG
AGGTTTCTGAGATAGCTGAGAGTGATGATGATGAGGATGACGATAACGAAACTACGCATC
CCGTTGCTGCTGTAGATCAACCACAATGTCGAATTTGCCTTGACGTTGGAGGGGAAGATC
TGATTGGTCCCTGCAATTGTAAAGGTACTCAGAAGTACGTCCACAGATCTTGTCTCGATA
ACTGGCGCTCCACCAAGGAAGGTTTTGCGTTTTCGCATTGTACAGAGTGTAGAGCTGTGT
TCAAACTCCGAGCCAATGTGCCTCCTGATAGGTGGTGGTTGAGATTGAGATTTCAGCTCC
TGGTTGCTAGAGATCATGCTTTCATTTTCATCACTGTCCAGATGGTAGTAGCGTTCTTGG
GGTTACTAGTTTACAAGTTCTACG
GCGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4E232TF 694 0 0
GG
GTCGTCGTCGTCTCTATGTTCAACACATAATGATAAATCTGCCGAGAGAACCAAATCAAT
AGCCACCACTCTGATTCGGCAGCTATAGTTAGCAATTTCTTAGTCGCGAACTGCAAGCAA
TGCTTGGCTTAGAAGAAACTTCTCGAGAATTCGGAGATGCAGTTAGTGCCTAGTGATGAT
GACCGGAACGAAGAACAGATTATTCTATTCGACGAATCCACATCCACCAACGAAATCGTA
GCAGCGGAAAGAGGCGATCGTGTTGTAGAGGAAG***GAGAGGTTTCTGAGATAGCTGAG
AGTGATGATGATGA******CGATAACGAAACTACGCATCTCGTTGCTGCTGTAGATCAA
CCACAATGTCGAATTTGCCTTGACGTTGGAGGGGAAGATCTGATTGGTCCGTGCAATTGT
AAAGGTACTCAGAAGTACGTGCACAGATCTTGTCTCGATAACTGGCGCTCCACCAAGGAA
GGATTTGCGTTTTCGCATTGTACAGAGTGTAGAGCTGTTTTCAAACTCCGAGCCAATGTG
CCTCCTGATAGGTGGTGGTTGAGATTGAGATTTCAGCTCCTGGTTGCTAGAGATCATGCT
TTCATTTTCATCACTGTCCAGATGGTAGTAGCGTTCTTGGGGTTACTAGTTTACAAGTTC
TACG*CGAAGAACTACGTGAGATGTTCGGT
AT

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR4E232JQ 761 0 0
AGATAGCTGAGAG
TGATGATGATGACGATAACGAAACTACGCATCTCGTTGCTGCTGTAGATCAACCACAATG
TCGAATTTGCCTTGACGTTGGAGGGGAAGATCTGATTGGTCCGTGCAATTGTAAAGGTAC
TCAGAAGTACGTGCACAGATCTTGTCTCGATAACTGGCGCTCCACCAAGGAAGGATTTGC
GTTTTCGCATTGTACAGAGTGTAGAGCTGTTTTCAAACTCCGAGCCAATGTGCCTCCTGA
TAGGTGGTGGTTGAGATTGAGATTTCAGCTCCTGGTTGCTAGAGATCATGCTTTCATTTT
CATCACTGTCCAGATGGTAGTAGCGTTCTTGGGGTTACTAGTTTACAAGTTTTACGGCGA
AGAACTACGTGAGATGTTCGGTTATGAGGAACATCCTTATGGCTTCTACACATTAGCTGT
TTTGGCCATTGTCTTGGTAGGACTACTTTATGGGTTCTTCATCGCAATTATATGTGGTCA
AAGGATCAATGAGCGGCACTACCATGTTCTTGCCAAACAAGAACTCACAAAGGAGTATAT
AGTGGAAGACCGAGACTGCAAGAATGTTCCTGATCTTGACCAGAGTCATGTAATGGAACT
TAGAATGTTGGGGCTTTATTGAACATAGATATGAGAAAAGAGCTCGCCGGATCTATACTC
TTCATTTCACCTGTAAATTATACTCTTCATTGATTCTAAGGTTGTTTCAACGATTCTGTT
AAGTGGTTTTATGAAATTTATTTTATTT

QA 14 761 14 761
DS 

RD RR4CM17JQ 724 0 0
GATTGGTCCCTGCAATTGTAAAGGTACTCAGAAGTACGTCCACAGATCTTGTCTCGATAA
CTGGCGCTCCACCAAGGAAGGTTTTGCGTTTTCGCATTGTACAGAGTGTAGAGCTGTGTT
CAAACTCCGAGCCAATGTGCCTCCTGATAGGTGGTGGTTGAGATTGAGATTTCAGCTCCT
GGTTGCTAGAGATCATGCTTTCATTTTCATCACTGTCCAGATGGTAGTAGCGTTCTTGGG
GTTACTAGTTTACAAGTTTTACGGCGAAGAACTACGTGAGATGTTCGGTTATGAGGAACA
TCCTTATGGCTTCTACACATTAGCTGTTTTGGCCATTGTCTTGGTAGGACTACTTTATGG
GTTCTTCATCGCAATTATATGTGGTCAAAGGATCAATGAGCGGCACTACCATGTTCTTGC
CAAACAAGAACTCACAAAGGAGTATATAGTGGAAGACCGAGACTGCAAGAATGTTCCTGA
TCTTGACCAGAGTCATGTAATGGAACTCAGAATGTTGGGGCTTTATTGAACATAGATATG
AGAAAAGAGCTCGCCGGATCTATACTCTTCATTTCACCTGTAAATTATACTCTTCATTGA
TTCTAAGGTTGTTTCAACGATTCTGTTAAGTGGTTTTATGAAATTTATTTTATTTATACT
CTTCATTTCAATGATTCTGATGAAACTGTGAGGTTTACACAGTAATGTATTGGATGATCA
TCCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 4

CO CL2508Contig1 906 4 3 U
GGACTTTTAGTCTTATAATAGATCTCTCGTTACTTCTAGGCGAGACAAAGCTCATTCATT
AATTTAAAATTCGACCGGATCGAGAGGATTTAGGGTTTGTGAAAAGAAATGGCGCAGCAG
CAGCAATCGTTGATCTACAGCTTCGTCGCTCGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACT
GATTTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAGCTCCCTTCTTCC
AACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGC
TTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTTTTG
GAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGATATATGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAG
CCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATG
GATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGAAGTTAAG
GGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTG
GTTGATAAAACCGAGAACCTTCGCTCTCAGGCACAAGACTTCAGAACAACGGGGACACAG
ATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATTAAGCTCATAGTTCTCGCCATCATC
GTCGCACTCATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCATGGCTTCAAGTGTTAGAAGCAC
AGAAAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTGAGATCTTTCTCACTCGGTCATCATATTGAT
TCTAATGTTACCGCTTGAATTGGTTTTGTATAGATAGACACATATATTTATGCTTCTTCA
TTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 

AF RR4E786TF U 1
AF RR4GI69TF U 97
AF RR4E786JQ C 124
AF RR4GI69JQ C 293
BS 1 625 RR4E786TF
BS 626 782 RR4GI69TF
BS 783 906 RR4E786JQ

RD RR4E786TF 626 0 0
GGACTTTTAGTCTTATAATAGATCTCTCGTTACTTCTAGGCGAGACAAAGCTCATTCATT
AATTTAAAATTCGACCGGATCGAGAGGATTTAGGGTTTGTGAAAAGAAATGGCGCAGCAG
CAGCAATCGTTGATCTACAGCTTCGTCGCTCGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACT
GATTTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAGCTCCCTTCTTCC
AACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGC
TTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTTTTG
GAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGATATATGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAG
CCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATG
GATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGAAGTTAAG
GGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTG
GTTGATAAAACCGAGAACCTTCGCT
C

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4GI69TF 686 0 0
GG
GTGAAAAGAAATGGCGCAGCAGCAGCAATCGTTGATCTACAGCTTCGTCGCTCGCGGGAC
GGTGATCCTCGTGGAGTTCACTGATTTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCCGCACAGTG
CCTCCAGAAGCTCCCTTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTT
CAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAG
GCAGATTCCGATGGCGTTTTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGATATATGGTGG
TGGAAAGGCTGCTACTGCTCAGCCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAA
AGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAA
GGCTCAAGTCTCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTTCTTGACCG
TGGTGAGAAAATTGAGCTTCTGGTTGATAAAACCGAGAACCTTCGCTCTCAGGCACAAGA
CTTCAGAACAACGGGGACACAGATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATTAA
GCTCATAGTTCTCGCCATCATCGTCGCACTCATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCA
TGGCTTCAAGTGTTAGAAGCACAG

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR4E786JQ 783 0 0
CAATCGTTGATCTACAGCTTCGTCGCTCGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACTGAT
TTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAGCTCCCTTCTTCCAAC
AACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTC
ACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTTTTGGAG
AGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGATATATGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAGCCT
AACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTTTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGAT
CATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGAAGTTAAGGGT
GTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTGGTT
GATAAAACCGAGAACCTTCGCTCTCAGGCACAAGACTTCAGAACAACGGGGACACAGATG
AGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATTAAGCTCATAGTTCTCGCCATCATCGTC
GCACTCATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCATGGCTTCAAGTGTTGGAAGCACAGA
AAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTGAGATCTTTCTCACTCGGTCATCATATTGATTCT
AATGTTACCGCTTGAATTGGTTTTGTATAGATAGACACATATATTTATGCTTCTTCATTT
GCG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4GI69JQ 614 0 0
AAGATGGCTTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCCGATGG
CGTTTTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGATATATGGTGGTGGAAAGGCTGCTA
CTGCTCAGCCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGT
ATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTG
AAGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTG
AGCTTCTGGTTGATAAAACCGAGAACCTTCGCTTTCAGGCACAAGACTTCAGAACAACGG
GGACACAGATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATTAAGCTCATAGTTCTCG
CCATCATCGTCGCACTCATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCATGGCTTCAAGTGTT
AGAAGCACAGAAAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTGAGATCTTTCTCACTCGGTCATC
ATATTGATTCTAATGTTACCGCTTGAATTGGTTTTGTATAGATAGACACATATATTTATG
CTTCTTCATTTGC
C

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 4

CO CL2509Contig1 888 4 3 U
GAGATTCTGACGATCCCAATTACACGCCGGGCGAGTTAATCTGCGGGATTACTGGTTGGG
AAGAATACAGTTTGCTTCGCAGCTCAAATGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTAGACG
ATGACATTCCACTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCGTATG
CAGGGTTCTATGAGATATGCTCTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCAGCTT
CAGGAGCAGTAGGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGCTACGTTGTTG
GGAGTGCTGGTAGCAAACAAAAGGTTGATCTTCTTAAAAACAAGCTTGGGTTTGATGAAG
CTTTTAACTACAAGGAAGAGGCTGATCTTGATGCTGCTTTGAAGAGGTATTTCCCGGAGG
GGATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGTGGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTTAACA
TGAAGGTCCGTGGAAGAATCGCTCTCTGTGGAATGGTGTCTTTACAAAGCCTCTCAAGCT
CATCACAAGGAATCAACAACCTGTACAACGCGATCCCCAAACGAGTAAGATTAGAAGGGT
TCTTGCAAAGCGATTACGTCCATATTTTCCCTCAATTTCTTGAACATGTCAAAGAATACT
ACAAGGAAGGGAAGATTGTGTACATCGAAGATATGTCAGAAGGCCTAGAGCTTGCTCCTG
CTGCACTTGTCGGGTTGTTTTCCGGGAAAAATGTTGGTAAACAGGTCGTTAGGGTTGCTA
ATGAGTGATTATTTTTGAAAGTATATTGCAGTGTCAGTAACACTGTTACGTTCAGAACAG
ACATTTTATGAATAAAGCGGGTGTTGTGCCTAACACTTCTTGCTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4C415TF U 1
AF RR4C415JQ C 37
AF RR4EJ07JQ C 640
AF RR4EJ07TF U 640
BS 1 698 RR4C415TF
BS 699 885 RR4EJ07TF
BS 886 888 RR4C415JQ

RD RR4C415TF 698 0 0
GAGATTCTGACGATCCCAATTACACGCCGGGCGAGTTAATCTGCGGGATTACTGGTTGGG
AAGAATACAGTTTGCTTCGCAGCTCAAATGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTAGACG
ATGACATTCCACTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCGTATG
CAGGGTTCTATGAGATATGCTCTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCAGCTT
CAGGAGCAGTAGGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGCTACGTTGTTG
GGAGTGCTGGTAGCAAACAAAAGGTTGATCTTCTTAAAAACAAGCTTGGGTTTGATGAAG
CTTTTAACTACAAGGAAGAGGCTGATCTTGATGCTGCTTTGAAGAGGTATTTCCCGGAGG
GGATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGTGGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTTAACA
TGAAGGTCCGTGGAAGAATCGCTCTCTGTGGAATGGTGTCTTTACAAAGCCTCTCAAGCT
CATCACAAGGAATCAACAACCTGTACAACGCGATCCCCAAACGAGTAAGATTAGAAGGGT
TCTTGCAAAGCGATTACGTCCATATTTTCCCTCAATTTCTTGAACATGTCAAAGAATACT
ACAAGGAAGGGAAGATTGTGTACATCGAAGATATGTCA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4C415JQ 852 0 0
TT
ATCTGCGGGAT*ACTGGTTGGGAAGAATACAGTTTGCTTCGCAGCTCAAATGAGTTACAG
T*GAGAAAGATTCAGCTAGACGATGACATTCCACTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGA
ATGGCTGGATTTACAGCGTATGCAGGGTTCTATGAGATATGCTCTCCGAAAAAAGGGGAG
AGTGTTTTTGTGTCTGCAGCTTCAGGAGCAGTAGGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAG
TTGCATGGCTGCTACGTTGTTGGGAGTGCTGGTAGCAAACAAAAGGTTGATCTTCTTAAA
AACAAGCTTGGGTTTGATGAAGCTTTTAACTACAAGGAAGAGGCTGATCTTGATGCTGCT
TTGAAGAGGTATTTCCCGGAGGGGATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGTGGATCCATG
CTTGATGCAGCGCTCCTTAACATGAAGGTCCGTGGAAGAATCGCTCTCTGTGGAATGGTG
TCTTTACAAAGCCTCTCAAGCTCATCACAAGGAATCAACAACCTGTACAACGCGATCCCC
AAACGAGTAAGATTAGAAGGGTTCTTGCAAAGCGATTACGTCCATATTTTCCCTCAATTT
CTTGAACATGTCAAAGAATACTACAAGGAAGGGAAGATTGTGTACATCGAAGATATGTCA
GAAGGCCTAGAGCTTGCTCCTGCTGCACTTGTCGGGTTGTTTTCCGGGAAAAATGTTGGT
AAACAGGTCGTTAGGGTTGCTAATGAGTGATTATTTTTGAAAGTATATTGCAGTGTCAGT
AACACTGTTACGTTCGGAACAGACATTTTATGAATAAAGCGGGTGTTGTGCCTAACACTT
CTTGCTGATC

QA 3 852 3 852
DS 

RD RR4EJ07JQ 246 0 0
G
TGAACATGTCAAAGAATACTACAAGGAAGGGAAGATTGTGTACATCGAAGATATGTCAGA
AGGCCTAGAGCTTGCTCCTGCTGCACTTGTGGGGTTGTTTTCCGGGAAAAATGTTGGTAA
ACAGGTCGTTAGGGTTGTTAATGAGTGATTATTTTTGAAAGTATATTGCAGTGTCAGTAA
CACTGTTACGTTCAGAACAGACATTTTATGAATAAAGCGGGTGTTGTGCCTAACACTTCT
TGCTG

QA 2 246 2 246
DS 

RD RR4EJ07TF 246 0 0
G
TGAACATGTCAAAGAATACTACAAGGAAGGGAAGATTGTGTACATCGAAGATATGTCAGA
AGGCCTAGAGCTTGCTCCTGCTGCACTTGTCGGGTTGTTTTCCGGGAAAAATGTTGGTAA
ACAGGTCGTTAGGGTTGCTAATGAGTGATTATTTTTGAAAGTATATTGCAGTGTCAGTAA
CACTGTTACGTTCAGAACAGACATTTTATGAATAAAGCGGGTGTTGTGCCTAACACTTCT
TGCTG

QA 2 246 2 246
DS 



AS 1 4

CO CL2510Contig1 898 4 19 U
GCCGCCATGCTAAGTACCGCCTCGAGCACATTGTCCGGACTCACAAGGCTGCCGACGACC
GCAGCTTCAGGAGTGTGTACCAGGAAGAAGATGAACAAGGATTCAAGGGATTAAAAATAA
GCAGAGACCTAATGGAAGTTGGAGGTGAAGCTCTCAAGACCAACATCACTACCTTAGGCC
CTCTCGTCCTACCCTTTCTCCGAGCAGCTTCTCTTCTTTGCCGCTTTGCTCCGTAGAACT
TTCTTACCCGCCGCCAAAACTACTACCACCTCCTCCTCCTCCTCCCCAGCAACTGCGAAA
ACCAACGGAGCCAAGT***CGTCGTCCTCTGATCTATCCAAGCCGTACATCCCGGACTAC
AAGCTCGCCTTCGAGCATTTCTGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGTGCTTGAGGAGCTT
CAGAAGAATCTAGGCTTGAGCGATGAGAACATGGAGGCTTCTAAGATGACTTTGCACAGG
TTTGGAAACACTTCTAGCAGTGGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCAAGGAG
AGTGTCCGTAGAGGCGATAGGGTTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCGGGTTTTAAGTGTAAC
AGTGTGGTTTGGAAGGCAATGAGGAAGGTGAAGAAGCCGGCGAGGAACAATCCTTGGGTG
GATTGCATTGACCGTTACCCTGCCGCTCTCTGATCATTTATTTTTATAAATTATTATTTC
TTCTAAAATTAAATCATCTAGTTATTCCAACCAAAGGAGAGACAATTTGGTTGGGCTCTC
TTCCTTGTTGTTTGCTGGTCATTCGTATCTAAGACTTCTATAAGGATGTTTCAAGTCCAA
TTCAGGTTCAATTTTTTGTTTGTGTTATATTCGGCCTCAGTAAACTTTGAAATTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 10 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DW90TF U 1
AF RR4G109TF U 17
AF RR4DW90JQ C 280
AF RR4BK43JQ C 322
BS 1 166 RR4DW90TF
BS 167 167 RR4G109TF
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BS 440 440 RR4DW90TF
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BS 634 634 RR4DW90JQ
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BS 758 794 RR4G109TF
BS 795 898 RR4DW90JQ

RD RR4DW90TF 582 0 0
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GCAGAGACCTAATGGAAGTTGGAGGTGAAGCTCTCAAGACCAACATTACTACCTTAGGCC
CTCTCGTCCTACCCTTTCTCCGAGCAGCTTCTCTTCTTTGCTGCTTTGCTCCGTAGAACT
TTCTTACCCGCTGCCAAAACTTCTACCACCTCCTCCTCCTCCTCCCCAGCAACTGCGAAA
ACCAACGGAGCCAAGT***CGTCGTCCTCTGATCTATCCAAGCCGTACATCCCGGACTAC
AAGCTCGCCTTCGAGCATTTCTGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGTGCTTGAGGAGCTT
CAGAAGAATCTAGGCTTGGGTGATGAGAACATGGAGGCTTCTAAGATGACTTTGCACAGG
TTTGGAAACACTTCTAGCAGTGGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCAAGGAG
AGTGTCCGTAGAGGCGATAGGGTTTGGCAGATTGCTTTTGGG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4G109TF 778 0 0
G
CGCCTCGAGCACATTGTCCGGACTCACAAGGCTGCCGACGACCGCAGCTTCAGGAGTGTG
TACCAGGAAGAAGATGAACAAGGATTCAAGGGATTAAAAATAAGCAGAGACCTAATGGAA
GTTGGAGGTGAAGCTCTCAAGACCAACATCACTACCTTAGGCCCTCTCGTCCTACC*TTT
CTCCGAGCAGCTTCTCTTCTTTGCCGCTTTGCTCCGTAGAACTTTCTTACCCGCCGCCAA
AACTACTACCACCTCCTCCTCCTCCCCC***GCAACTGCTAAAACCAACGGAGCCAAGTC
TTCGTCGTCCTCTGATCTATCCAAGCCGTACATCCCGGACTACAAGCTCGCCTTCGAGCA
TTTCTGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGTGCTTGAGGAGCTTCAGAAGAATCTAGGCTT
GAGCGATGAGAACATGGAGGCTTCTAAGATGACTTTGCACAGGTTTGGAAACACTTCTAG
CAGTGGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCACGGAGAGTGTCCGTAGAGGCGA
TAGGGTTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCGGGTTTTAAGTGTAACAGTGTGGTTTGGAAGGC
AATGAGGAAGGTGAAGGAGCCGGCGAGGAACAATCCTTGGGTGGATTGCATTGACCGTTA
CCCTGCCGCTCTCTGATCATTTATTTTTATAAATTATTATTTCTTCTAAAATTAAATCAT
CTAGTTATTCCAACCAAAG*AGAGACAATTTGGTTGGGCTCTCTTCCTTGTTGTTTG

QA 2 778 2 778
DS 

RD RR4DW90JQ 619 0 0
TCCTCCCCAGCAACTGCGAAAACCAACGGAGCCAAGT***CGTCGTCCTCTGATCTATCC
AAGCCGTACATCCCGGACTACAAGCTCGCCTTCGAGCATTTCTGCTTCCACGCGGCAAGC
AAAACAGTGCTTGAGGAGCTTCAGAAGAATCTAGGCTTGGGTGATGAGAACATGGAGGCT
TTTAAGATGACTTTGCACAGGTTTGGAAACACTTCTAGCAGTGGGATCTGGTACGAGCTT
GCTTACATGGAGGCCAAGGAGAGTGTCCGTAGAGGCGATAGGGTTTGGCAGATTGCTTTT
GGGTCAGGTTTCAAGTGTAACAGTGTGGTTTGGAAGGCAATGAGGAAGGTGAAGAAGCCG
GCGAGGAACAACCCTTGGGTGGATTGCATTGACCGTTACCCTGCCGCTCTCTGATCATTT
ATTTTTATAAATTATTATTTCTTCTAAAATTAAATCATCTAGTTATTCCAACCAAAGGAG
AGACAATTTGGTTGGGCTCTCTTCCTTGTTGTTTGCTGGTCATTCGTATCTAAGACTTCT
ATAAGGATGTTTCAAGTCCAATTCAGGTTCAATTTTTTGTTTGTGTTATATTCGGCCTCA
GTAAACTTTGAAATTATAC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BK43JQ 574 0 0
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TGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGTGCTTGAGGAGCTTCAGAAGAATCTAGGCTTGAGC
GATGAGAACATGGAGGCTTTTAAGATGACTTTGCACAGGTTTGGAAACACTTCTAGCAGT
GGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCAAGGAGAGTGTCCGTAGAGGCGATAGG
GTTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCGGGTTTTAAGTGTAACAGTGTGGTTTGGAAGGCAATG
AGGAAGGTGAAGAAGCCGGCGAGGAACAATCCTTGGGTGGATTGCATTGACCGTTACCCT
GCCGCTCTCTGATCATTTATTTTTATAAATTATTATTTCCTCTAAAATTAAATCATCTAG
TTATTCCAACCAAAGGAGAGACAATTTGGTTGGGCTCTCCTCCTTGTTGTTTGCTGGTCA
TTCGTATTTAAGACTTCTATAAGGATGTTTCAAGTCCAATTCAGGTTCAATTTTTTGTTT
GTGTTATATTCGGCCTCAGTAAACTTTGAAATT
C

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 4

CO CL2511Contig1 1416 4 3 U
GGATTTTCAACTAAGCTCTCGCTTTATCTCTCTTAATCTATCTACTGATGAAGATCAGGT
GCGACGTCTGCGATAAAGAAGAAGCCTCGGTGTTCTGCACCGCCGACGAAGCGTCTCTGT
GCGACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAACATCTCCGTT
TCTCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTTCTATCTGCGACATCTGTCAGG
AGAAGAAAGCTGTGTTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTATGCGCAGACTGTGATT
CATCGATCCACTCGGCCAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTCTCACAGGGG
TTAAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGACTCTCCTTTAAATAGTC
AAGATTGCTCTGTCCCTGCTCTCTCAAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCAGAGTCAGATCA
AGAGCTCCAAGATTCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGAT
CCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATT
TTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGGTATGTTGTTCTCTCTAATCAA
GAAATATCAACTTTGATTAGTCAAGATTTTATATTTATTAGTTGTAACTTCATTTCCTTT
GTTTATGTGATATCATATCATATCAGATCTAACTGTGATATAAATAGTAAGAAACTTTAT
AGATGTGAATAGATCTTTTCTACTTTTGAGATTTTTTTTTTCCTTTTCTGGTGGGTTTGC
TTTTGTGATTACAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATG
ACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATACAGTGTCACTTCCACCTAAGAATATGGGGATTT
GGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAGG
ACAACAATATTCAGTTTGGGATGTACAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTT
ATGCTCCAATACAAAACATGAAACAACAAGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGATGGTG
GCTTCACTGTCCCACAGATAACTACTACTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTCTAATA
AAAGGTCCAGATCCTTCTGGTAATCTACCTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTGGCC
TTTTTGGTCTTTCTTGATTTCTCTGAACTTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACTTGGTG
TATTTTGTAAATTTTGAGTGTGATTGCAAATGTTTTTTCTTATCCTCTATTGCAAGTTTT
CGTGTAATAAAAGCCCCGTGACTTATATTGTGAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DR26TF U 1
AF RR4DT90TF U 1
AF RR4DT90JQ C 642
AF RR4DR26JQ C 836
BS 1 763 RR4DR26TF
BS 764 788 RR4DT90TF
BS 789 1416 RR4DT90JQ

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GCGACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAACATCTCCGTT
TCTCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTTCTATCTGCGACATCTGTCAGG
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CATCGATCCACTCGGCCAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTCTCACAGGGG
TTAAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGACTCTCCTTTAAATAGTC
AAGATTGCTCTGTCCCTGCTCTCTCAAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCAGAGTCAGATCA
AGAGCTCCAAGATTCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGAT
CCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATT
TTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGGTATGTTGTTCTCTCTAATCAA
GAAATATCAACTTTGATTAGTCAAGATTTTATATTTATTAGTTGTAACTTCATTTCCTTT
GTTTATGTGATATCATATCATATCAGATCTAACTGTGATATAA
T

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DS 

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GCGACGTCTGCGATAAAGAAGAAGCCTCGGTGTTCTGCACCGCCGACGAAGCGTCTCTGT
GCGACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAACATCTCCGTT
TCTCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTTCTATCTGCGACATCTGTCAGG
AGAAGAAAGCTGTGTTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTATGCGCAGACTGTGATT
CATCGATCCACTCGGCCAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTCTCACAGGGG
TTAAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGACTCTCCTTTAAATAGTC
AAGATTGCTCTGTCCCTGCTCTCTCAAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCAGAGTCAGATCA
AGAGCTCCAAGATTCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGAT
CCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATT
TTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAG*TATGTTGTTCTCTCTAATCAA
GAAATATCAACTTTGATTAGTCAAGATTTTATATTTATTAGTTGTAACTTCATTTCCTTT
GTTTATGTGATATCATATCATATCAGATCTAACTGTGATATAAATAGTAAGAAACTTTAT
AGATGTGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4DT90JQ 775 0 0
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TTGTAACTTCATTTCCTTTGTTTATGTGATATCATATCATATCAGATCTAACTGTGATAT
AAATAGTAAGAAACTTTATAGATGTGAATAGATCTTTTCTACTTTTGAGATTTTTTTTTT
CCTTTTCTGGTGGGTTTGCTTTTGTGATTACAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCA
TATATGGAAGCAAAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATACAGTGTCACTTCCA
CCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTCCTTCTTCATACACA
AACCAGTACTTTTCTCAGGACAACAATATTCAGTTTGGGATGTACAACAACAAAGAAGCA
TCACATGGAGTAGAGACTTATGCTCCAATACAAAACATGAAACAACAAGGACAGAACAAG
AGATGGTATGATGATGGTGGCTTCACTGTCCCACAGATAACTACTACTTTTACTCATCCT
CCTCCTATTACTTCTAATAAAAGGTCCAGATCCTTCTGGTAATCTACCTGGTGTTTTCTG
TTTTGTTTGTTTGTTGGCCTTTTTGGTCTTTCTTGATTTCTCTGAACTTCGTTCTTTGTA
GAACTAGGTTTACTTGGTGTATTTTGTAAATTTTGAGTGTGATTGCAAATGTTTTTTCTT
ATCCTCTATTGCAAGTTTTCGTGTAATAAAAGCCCCGTGACTTATATTGTGAACC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4DR26JQ 581 0 0
TTTGCTTTTGTGATTACAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAA
AGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATACAGTGTCACTTCCACCTAAGAATATGGG
GATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTC
TCAGGACAACAATATTCAGTTTGGGATGTACAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGA
GACTTATGCTCCAATACAAAACATGAAACAACAAGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGA
TGGTGGCTTCACTGTCCCACAGATAACTACTACTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTC
TAATAAAAGGTCCAGATCCTTCTGGTAATCTACCTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGT
TGGCCTTTTTGGTCTTTCTTGATTTCTCTGAACTTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACT
TGGTGTATTTTGTAAATTTTGAGTGTGATTGCAAATGTTTTTTCTTATCCTCTATTGCAA
GTTTTCGTGTAATAAAAGCCCCGTGACTTATATTGTGAACC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL2512Contig1 1305 2 2 U
GGGAGTTTGAGGTGGTTCGCTCTGACCTCAGCTTCATCTCTTTTCTTTTCTTTTATTACA
ACGAGATCAATTATTTTCTTGACTGGTATAGGTTTTGATTGAGCTTTTGTCTAATAACTT
TTCTTTCTTCCTTTCCGAAATCTTTGACAAAATTTAGGGTTTTTTTCTAATCTATGATGT
AATGATTTCATATATTGAGTTCTTTTGGCTGAACTCATGATGTTTCCTTAGTTTGGAGTG
TATTAAAAGCTAATCTTTCTCTGTTTTTTTTTTGTATGGTTTAAGTTTTTCTTTACAGAT
CATCAGGTTTGGTTTCATATTCAGACGCTGAGATTTCAGATTCCGGAAAGATCTGGCTAT
TGATTGAGAGAGTGAACACACAAAAATGGACTACCCTGAAAGTTATCGGATAACGTTTAC
TGGAATCTTGGTTGCTTTTCTTGAATTAGCATTTGCTTATTGTCTATTATGTGTATCAGC
TTTGGTCTTTATTGCATCCAAGTTCTTACTCTATTTGCCTTGTCCCTCTTCTGGAATGCT
TGGGTACCACCAAAACATCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTCAG
AATCCAGAAGATGGCCGTTACAAGTAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGACCAAGAAGA
GAGAAAGAGTTGGGTTGGTAAAGATAAGAACTTGGAATTAATGAATAAGGTGAGATTGCT
TGAAGAAGCCGTTGAGGAAGAGAGGTTGGCTCGATCTGCTCTAATCGTGGAATTGGAGGA
AGAAAGAGCGGCTTCAGCGTCAGCAGCTGATGAAGCCATGGCTATGATTCTGAGGTTACA
AGCTGATAAAGCTTCACTTGAAATGGAAGGAAAGCAGTATGAGAGAATGATTGAGGAGAA
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GGAAAAGCATTTTCTTGAGAAGTAACTTGAGACTTACAAGCACATTGATGATGATGATGA
TGATGATCAAGAAGCGATTGTGTATGATGTTCATGTCATTGAGAATGATAATAATGCTAA
GAAGAAAGATGTTGACGCAGCAGAACACAAAGTAAGGGACTGTGATGATCAGATGAAGCA
AATGGATGACTTATTGAAGGACAGTGATTCATCAGCATAACCTTCTTAATAAGGGTTTTC
TGTTGGTTGTAATATCTTTGCTCTCTTGCTTACTCTGTTTTCTGTAATGTGGTTTGGGTG
GACTTTGTATAAATTTGTTAATATCAATGTAGAACTTTGTGGCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB94TF U 1
AF RR4BB94JQ C 384
BS 1 704 RR4BB94TF
BS 705 1305 RR4BB94JQ

RD RR4BB94TF 704 0 0
GGGAGTTTGAGGTGGTTCGCTCTGACCTCAGCTTCATCTCTTTTCTTTTCTTTTATTACA
ACGAGATCAATTATTTTCTTGACTGGTATAGGTTTTGATTGAGCTTTTGTCTAATAACTT
TTCTTTCTTCCTTTCCGAAATCTTTGACAAAATTTAGGGTTTTTTTCTAATCTATGATGT
AATGATTTCATATATTGAGTTCTTTTGGCTGAACTCATGATGTTTCCTTAGTTTGGAGTG
TATTAAAAGCTAATCTTTCTCTGTTTTTTTTTTGTATGGTTTAAGTTTTTCTTTACAGAT
CATCAGGTTTGGTTTCATATTCAGACGCTGAGATTTCAGATTCCGGAAAGATCTGGCTAT
TGATTGAGAGAGTGAACACACAAAAATGGACTACCCTGAAAGTTATCGGATAACGTTTAC
TGGAATCTTGGTTGCTTTTCTTGAATTAGCATTTGCTTATTGTCTATTATGTGTATCAGC
TTTGGTCTTTATTGCATCCAAGTTCTTACTCTATTTGCCTTGTCCCTCTTCTGGAATGCT
TGGGTACCACCAAAACATCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTCAG
AATCCAGAAGATGGCCGTTACAAGTAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGACCAAGAAGA
GAGAAAGAGTTGGGTTGGTAAAGATAAGAACTTGGAATTAATGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4BB94JQ 922 0 0
AAATGGACTACC*TGAAAGTTATCGGATA*CGTTTACTGGAATCTTGGTTGCTTTTCTTG
AATTAGCATTTGCTTATTGTCTATTATGTGTATCAGCTTTGGTCTTTATTGCATCCAAGT
TCTTACTCTATTTGCCTTGTCCCTCTTCTGGAATGCTTGGGTACCACCAAAACATCCATA
AACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTCAGAATCCAGAAGATGGCCGTTACAA
GTAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGACCAAGAAGAGAGAAAGAGTTGGGTTGGTAAAG
ATAAGAACTTGGAATTAATGAATAAGGTGAGATTGCTTGAAGAAGCCGTTGAGGAAGAGA
GGTTGGCTCGATCTGCTCTAATCGTGGAATTGGAGGAAGAAAGAGCGGCTTCAGCGTCAG
CAGCTGATGAAGCCATGGCTATGATTCTGAGGTTACAAGCTGATAAAGCTTCACTTGAAA
TGGAAGGAAAGCAGTATGAGAGAATGATTGAGGAGAAATTTGCATATGATGAGGAAGAGA
TGAATATTCTCAAGGAGATTTTATTCAAAAGGGAGAGGGAAAAGCATTTTCTTGAGAAGT
AACTTGAGACTTACAAGCACATTGATGATGATGATGATGATGATCAAGAAGCGATTGTGT
ATGATGTTCATGTCATTGAGAATGATAATAATGCTAAGAAGAAAGATGTTGACGCAGCAG
AACACAAAGTAAGGGACTGTGATGATCAGATGAAGCAAATGGATGACTTATTGAAGGACA
GTGATTCATCAGCATAACCTTCTTAATAAGGGTTTTCTGTTGGTTGTAATATCTTTGCTC
TCTTGCTTACTCTGTTTTCTGTAATGTGGTTTGGGTGGACTTTGTATAAATTTGTTAATA
TCAATGTAGAACTTTGTGGCAT

QA 1 922 1 922
DS 



AS 1 4

CO CL2513Contig1 1002 4 10 U
GGATCACCCATTCTCATAATAACTTCTCGTCAAACTTAAAAGCTTTACATTTACGGTTTC
AGATGACGAGTCCAGCGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTATGGACGGAATCAACA
CGGCTGTTACGACGGAGCCTGCTGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAGGAAGTGA
AGGCGGCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTGCGGCTGCGAAGAAGAAGTCTGTCTCAACTCATC
CTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTA
GCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCA
GGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGA
AAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGTTACGGAGA
AGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAAGAAGG
TTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCAAAGAAATCCGCGGCGGTTAAACCCAAGCCGAAGC
CCAAGGCAAGTGTTGCGGCGACCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGG
CGAAGACGGCTAAAACATCGACGGTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGA
AGAAGGCTACGAAGGCGGTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGC
CAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAG
GGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTGTATAATC
CGATCTTTCCTGTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTACTTGAGAACTATC
CTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCTCTTTTCAATGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C851TF U 1
AF RR4G608TF U 51
AF RR4C851JQ C 201
AF RR4G608JQ C 245
BS 1 657 RR4C851TF
BS 658 658 RR4G608TF
BS 659 668 RR4C851TF
BS 669 669 RR4G608TF
BS 670 683 RR4C851TF
BS 684 684 RR4G608TF
BS 685 702 RR4C851TF
BS 703 704 RR4C851JQ
BS 705 720 RR4C851TF
BS 721 1002 RR4C851JQ

RD RR4C851TF 727 0 0
GGATCACCCATTCTCATAATAACTTCTCGTCAAACTTAAAAGCTTTACATTTACGGTTTC
AGATGACGAGTCCAGCGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTATGGACGGAATCAACA
CGGCTGTTACGACGGAGCCTGCTGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAGGAAGTGA
AGGCGGCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTGCGGCTGCGAAGAAGAAGTCTGTCTCAACTCATC
CTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTA
GCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCA
GGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGA
AAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGTTACGGAGA
AGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAAGAAGG
TTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCAAAGAAATCCGCGGCGGTTAAACCCAAGCCGAAGC
CCAAGGCAAGTGTTGCGGCGACCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCA*GG
CGAAGACG*CTAAAACATCGACG*TGACATCTCCGAGTAAAA**GCGGCTGCAGCTAAGA
GACGCTA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4G608TF 651 0 0
GGT
CGGTTTCAGATGACGAGTCCAGCGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTATGGACGGA
ATCAACACGGCTGTTACGACGGAGCCTGCTGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAG
GAAGTGAAGGCGGCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTGCGGCTGCGAAGAAGAAGTCTGTCTCA
ACTCATCCTACTTACGAATAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACT
GGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCT
TCGTTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTG
AAGGTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTAAGCCGTC***TCCGAAGGCGGTT
ACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGG
AAGAAGGTTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCAAAGAAATCCGCGGCGGTTAAACCCAAG
CCGAAGCCCAAGGCAAGTGTTGCGGCGACCAAGAGGAAAGCTG***CTGCTGCTGCGAAG
CCCAAGGCGAAGACGGCTAAAACATCGACGGTGACATCTCCGAGTAAA

QA 4 651 4 651
DS 

RD RR4C851JQ 802 0 0
GCTGCTGCGGCTGCGAAGAAGAAGTCTGTCTCA*CTCATCCTACTTACGAAGAGATGATC
AAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAG
TTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAAC
CTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCG
TCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGTTACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACC
GCAGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAAGAAGGTTACCACCGCAGCAGCTTCG
AAATCAAAGAAATCCGCGGCGGTTAAACCCAAGCCGAAGCCCAAGGCAAGTGTTGCGGCG
ACCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCGAAGACGGCTAAAACATCG
ACGGTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGCGGTG
GCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCA
GCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTT
GTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTGTATAATCCGATCTTTCCTGTTGTTTGC
TATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTACTTGAGAACTATCCTTTGAATCATATATAATAG
CTTAATCTCTTTTCAATGTTCG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4G608JQ 744 0 0
TTACGAATAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTAGCCA
ATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAA
GCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGAAAGC
CTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTAAGCCGTC***TCCGAAGGCGGTTACGGAGAAGAA
GAAACCTGCAACCACCGCAGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAAGAAGGTTAC
CACCGCAGCAGCTTCGAAATCAAAGAAATCCGCGGCGGTTAAACCCAAGCCGAAGCCCAA
GGCAAGTGTTGCGGCGACCAAGAGGAAAGCTG***CTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCGAA
GACGGCTAAAACATCGACGGTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAA
GGCTACGAAGGCGGTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAA
GACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTT
TTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTGTATAATCCGAT
CTTTCCTGTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTACTTGAGAACTATCCTTT
GAATCATATATAATAGCTTAATCT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 4

CO CL2514Contig1 472 2 1 U
GATTAGCGCAAAGGCTTCTGTTTGGGAACACAAACTATGGAGACCTGAGGAAGTATTTAT
CAGGCTTTTTCGACACTACAATCGGAAACAAGAAAGAAAGCAAGAGTTACAAGGAGATTA
CAGAAACATTGGGAGTGGATGATCCTTCAGAGATTCTTTTTGTCACAGATGTTTATCAAG
AAGCTACTGCTGCAAAAGCTGCAGGTCTGGAGGCAGTTATATCGATTCGACCTGGTAACG
CTTCTCTTCCAGAGAGTCACGGGTTCAAGACTGTCACATCGTTCTCCCAAATTTAGAGAT
TCCTCTATATATGGTTCCTATGGTGTTGTATTTCACATGAGCACAGTTACCAAATAAAAT
AGACTTGGTAATAAATATAAATGTGGAGCTCAGCTTGACAAAGCTCAAATCCGATTAATT
TGTGTAATGAATAAAGTTCGGTTTATGCATGTGACAATGCTTGACAGGATTG


BQ
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AF RR4AL88TF U 1
AF RR4AL88JQ C 76
BS 1 472 RR4AL88TF

RD RR4AL88TF 472 0 0
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CAGGCTTTTTCGACACTACAATCGGAAACAAGAAAGAAAGCAAGAGTTACAAGGAGATTA
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AAGCTACTGCTGCAAAAGCTGCAGGTCTGGAGGCAGTTATATCGATTCGACCTGGTAACG
CTTCTCTTCCAGAGAGTCACGGGTTCAAGACTGTCACATCGTTCTCCCAAATTTAGAGAT
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AGACTTGGTAATAAATATAAATGTGGAGCTCAGCTTGACAAAGCTCAAATCCGATTAATT
TGTGTAATGAATAAAGTTCGGTTTATGCATGTGACAATGCTTGACAGGATTG

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR4AL88JQ 397 0 0
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TGGATGATCCTTCAGAGATTTTTTTTGTCACAGATGTTTATCAAGAAGCTACTGCTGCAA
AAGCTGCAGGTCTGGAGGCAGTTATATCGATTCGACCTGGTAACGCTTTTTTTCCAGAGA
GTCACGGGTTCAAGACTGTCACATCGTTTTCCCAAATTTAGAGATTCCTCTATATATGGT
TCCTATGGTGTTGTATTTCACATGAGCACAGTTACCAAATAAAATAGACTTGGTAATAAA
TATAAATGTGGAGCTCAGCTTGACAAAGCTCAAATCCGATTAATTTGTGTAATGAATAAA
GTTCGGTTTATGCATGTGACAATGCTTGACAGGATTG

QA 1 397 1 397
DS 



CO CL2514Contig2 1199 2 2 U
TATGACGAACTTGTTGTCCCAATCATAGAACACAGCTTATGAGAACGAGCTAACAGATTC
ACTCACCAAAGCTATAGAAGCCTATCCAAAAGCAACCGCAGTGTTGGTACGCAATCATGG
AGTCTACATTTGGGGTGATTCTTGGATCCATGCTAAGACACAGGCTGAATGTTACCACTA
TCTGTTCGATGCTGCCATCAAGCTTCATCAACTGGGTCTGGATGCTACCACACCAGACCA
TGGGCCTATTCGAAGTCCCACAAAATTCTCTGTAAAATCAGGAACTTCACAAAACCAAAC
AGAACCACCTCGGCGATGCATTGTTCTCGACATTGAAGGAACAACTACGCCCATAACATT
CGTCACAGATGTTCTCTTTCCCTATGCTCGTGAAAACGTTGGAAAGCATTTGAATTTGAC
GTACGACACAGCAGAAACACAAGAGGATATCAAGTTGTTGCGGTCTCAGGTTGAAGAAGA
CTTGAGAGAGGGTTTAGCCGGTGCTGTTCCTATACCTCATGCTGATGAAGGAAAAGAGAA
GGTCATTGCAGCTGTGGTCTCTAATGTAGAGGCAATGATCAAAGCCGATAGAAAGATCAC
TGCTTTAAAGGAATTGCAAGGTCACATATGGAGAACAGGTTTTGAATGTAATGAACTGAA
GTCTGTTGTTTTCGACGATGTAGCAGAGGCTTTAGAGAAATGGCATTCTTCAGGAATAAA
GGTTTACATATATTCTAGTGGTAGTCGATTAGCGCAAAGGCTTCTCTTTGGGAACACAAA
CTATGGATACCTGAGGAAGTATTTATCAGGCTTTTTCGACACTACAATCGGAAACAAGAA
AGAAAGCAAGAGTTACAAGGAGATTACAGAAACATTGGGAGTGGATGATCCTTCAGAGAT
TCTTTTTGTCACAGATGTTTATCAATAAGCTACTGCTGCAAAAGCTGCAGGTCTGGAGGC
AGTTATATCGATTCGACCTGGTAACGCTTCCCTTCCAGAGAGTCACGGGTTCAAGACTGT
CACATCGTTCTCCCAAATTTAGAGTTTCCTCTATGTATGTTTCCTATGGTGTTGTATTTG
ACATGAGCACAGTTACCAAATAAAATAGACTTGGTAATAATTATAAATGTTGAGCTCAGC
TTGACAAAGCTCATATCCGATTAATATGTGAAATGAATAAAGCTTGGTTTGGTTTGGTC


BQ
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AF RR4GX12TF U 1
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AGTCTACATTTGGGGTGATTCTTGGATCCATGCTAAGACACAGGCTGAATGTTACCACTA
TCTGTTCGATGCTGCCATCAAGCTTCATCAACTGGGTCTGGATGCTACCACACCAGACCA
TGGGCCTATTCGAAGTCCCACAAAATTCTCTGTAAAATCAGGAACTTCACAAAACCAAAC
AGAACCACCTCGGCGATGCATTGTTCTCGACATTGAAGGAACAACTACGCCCATAACATT
CGTCACAGATGTTCTCTTTCCCTATGCTCGTGAAAACGTTGGAAAGCATTTGAATTTGAC
GTACGACACAGCAGAAACACAAGAGGATATCAAGTTGTTGCGGTCTCAGGTTGAAGAAGA
CTTGAGAGAGGGTTTAGCCGGTGCTGTTCCTATACCTCATGCTGATGAAGGAAAAGAGAA

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DS 

RD RR4GX12JQ 793 0 0
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GATAGAAAGATCACTGCTTTAAAGGAATTGCAAGGTCACATATGGAGAACAGGTTTTGAA
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TCTTCAGGAATAAAGGTTTACATATATTCTAGTGGTAGTCGATTAGCGCAAAGGCTTCTC
TTTGGGAACACAAACTATGGATACCTGAGGAAGTATTTATCAGGCTTTTTCGACACTACA
ATCGGAAACAAGAAAGAAAGCAAGAGTTACAAGGAGATTACAGAAACATTGGGAGTGGAT
GATCCTTCAGAGATTCTTTTTGTCACAGATGTTTATCAATAAGCTACTGCTGCAAAAGCT
GCAGGTCTGGAGGCAGTTATATCGATTCGACCTGGTAACGCTTCCCTTCCAGAGAGTCAC
GGGTTCAAGACTGTCACATCGTTCTCCCAAATTTAGAGTTTCCTCTATGTATGTTTCCTA
TGGTGTTGTATTTGACATGAGCACAGTTACCAAATAAAATAGACTTGGTAATAATTATAA
ATGTTGAGCTCAGCTTGACAAAGCTCATATCCGATTAATATGTGAAATGAATAAAGCTTG
GTTTGGTTTGGTC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 3

CO CL2515Contig1 965 3 14 U
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GATTTCTCTTCGAAAAATTAAAATAATCCAGAGGGGGTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGA
TGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCGATGATGAAGCTGGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTG
GTGTCGCCATGATCCTCTACTCTGTTTGGCTCATCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGAT
CTCTCCCCTTCCCTTACCCTCATGATGATTACCCCCTTCCTTGGTACATTTATGCTTTTC
TTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCG
TTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAG
GTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATC
CAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTAAGTTCGTTGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGAT
GGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCCAGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCA
AAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATGACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTT
CACTCCTACATGATGCTCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGTTGGAGAACCCATTTATG
GACCCAAACCGGATTCCTGGACTGTTAGGATTAATGAAAGAGCCAACCGGTAAGAGAGAT
GGAGCCCAAGAGAAAGCTATGAGAAGCAAAGTAGCCAATAGTCACCTCTTTTAGTATATA
TTACTTGCTTTGCTTCTTTGTTGCATCTATTTATCTATCTATCTCTCACTCCAAAGTCCA
ACAAAACCACTATGTCTTGTAAAAAAAATATTGCACACACATATGGGGATGTACTTATGC
ATTTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4GI43TF U 48
AF RR4DX50TF U 1
AF RR4GI43JQ C 169
BS 1 96 RR4DX50TF
BS 97 97 RR4GI43TF
BS 98 247 RR4DX50TF
BS 248 248 RR4GI43TF
BS 249 269 RR4DX50TF
BS 270 270 RR4GI43TF
BS 271 285 RR4DX50TF
BS 286 286 RR4GI43TF
BS 287 574 RR4DX50TF
BS 575 575 RR4GI43JQ
BS 576 659 RR4DX50TF
BS 660 660 RR4GI43JQ
BS 661 706 RR4DX50TF
BS 707 965 RR4GI43JQ

RD RR4GI43TF 424 0 0
GGA
GGTTCATTTC*ATTTCTCTTC*AAAAATTAAAATAATCCAGAGGGGGTGGAGGTGGAGAG
ATGGTGAGGATGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCGATGATGAAGCTTGTGAATTCCCTTCTT
GGAATGGTTGGTGTCGCCATGATCCTCTACTCTGTTTGGCTCATCAGGCAATGGCAACAA
CAAACCGGATCTCTCCCCTTCCCTTACCCTCATGATGATTACCCCCTTCCTTGGTACATT
TATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCT
GCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATT
ATGATTCAAGGTGGTGTC*TTGCCGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTT
C

QA 4 424 4 424
DS 

RD RR4DX50TF 706 0 0
GGAGGGAGGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGTTCATTTC
GATTTCTCTTCGAAAAATTAAAATAATCCAGAGGGGTTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGA
TGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCGATGATGAAGCTGGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTG
GTGTCGCCATGATCCTCTACTCTGTTTGGCTCATCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGAT
CTCTCCCTTTCCCTTACCCTCATGATGATCACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTC
TTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCG
TTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAG
GTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATC
CAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTAAGTTCGTTGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGAT
GGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCCAGGGTGCTTCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCA
AAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATGACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTT*
CACTCCTACATGATGCTCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGTTGG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4GI43JQ 797 0 0
TTGGAATGGTTGGTGTCGCCATGATCCTCTACTCTGTTTGGCTCATCAGGCAATGGCAAC
AACAAACCGGATCTCTCCCCTTCCCTTACCCTCATGATGATTACCCCCTTCCTTGGTACA
TTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCG
CTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTTGCTTA
TTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACAGGACT
TTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTAAGTTCGTTGAGTCAAACTTCA
AGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCCAGGGTGCATCAGTTCTATTGG
CCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATGACAGTGACGATGAATATGATT
TGAGCACGGTTTCACTCCTACATGATGCTCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGTTGGAG
AACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTCCTGGACTGTTAGGATTAATGAAAGAGCCAACC
GGTAAGAGAGATGGAGCCCAAGAGAAAGCTATGAGAAGCAAAGTAGCCAATAGTCACCTC
TTTTAGTATATATTACTTGCTTTGCTTCTTTGTTGCATCTATTTATCTATCTATCTCTCA
CTCCAAAGTCCAACAAAACCACTATGTCTTGTAAAAAAAATATTGCACACACATATGGGG
ATGTACTTATGCATTTT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 3

CO CL2516Contig1 841 3 2 U
GAAATAAAGACCAAGAAATAGTTAAGAGAAGATGCACAGTATTATGCATAAACGATCCTG
AGATTCAGGATTCTTGATCAGACAAAAGTAAATTAAAAAGGAAAAAGAAACAATTGTACT
GGAGAGTATTTATTGGTAGAATACTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTTGA
CGAAATAGGGAAGGTCAAGAACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGATCC
CTCCGAAGAAGAACCCTCCCGTAAATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTCAG
GCTGCTTCTTCCGCCCAGTCAACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGA
ACGAAGAGATTCCGTAGATAGTGAGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGCGG
CTAAGGAGCCGGCGGAACCAGCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATG
GGCCCACTAAGAGGAAACCATGTGCCAAGCCCACTTCAACACCACGAAGGAGAGGGTTGA
CGGCGGTGCGGTAAGCCGGGAGGTTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGTTA
CAGGAGTCTCCAAACTTCCGATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACG
TTGGCTTGTCGGTCTGAGCAGCTCGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATATA
CGCCGAAAGAAGGGCCGGAGATTCCCTTAGGGACGGCTAGACGCCTAGCAATTGCAGCGG
AGGATAAGCTGCTCCTTAGCTGGCTCGCCATTGGAGATGCACTTGCTGCCATTGTTTTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4A886JQ U 1
AF RR4A886TF C 74
AF RR4GR25JQ U 76
BS 1 746 RR4A886JQ
BS 747 841 RR4GR25JQ

RD RR4A886JQ 746 0 0
GAAATAAAGACCAAGAAATAGTTAAGAGAAGATGCACAGTATTATGCATAAACGATCCTG
AGATTCAGGATTCTTGATCAGACAAAAGTAAATTAAAAAGGAAAAAGAAACAATTGTACT
GGAGAGTATTTATTGGTAGAATACTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTTGA
CGAAATAGGGAAGGTCAAGAACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGATCC
CTCCGAAGAAGAACCCTCCCGTAAATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTCAG
GCTGCTTCTTCCGCCCAGTCAACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGA
ACGAAGAGATTCCGTAGATAGTGAGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGCGG
CTAAGGAGCCGGCGGAACCAGCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATG
GGCCCACTAAGAGGAAACCATGTGCCAAGCCCACTTCAACACCACGAAGGAGAGGGTTGA
CGGCGGTGCGGTAAGCCGGGAGGTTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGTTA
CAGGAGTCTCCAAACTTCCGATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACG
TTGGCTTGTCGGTCTGAGCAGCTCGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATATA
CGCCGAAAGAAGGGCCGGAGATTCCC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4A886TF 766 0 0
TTGA
TCAGACAAAAGTAAATTAAAAAGGAAAAAGAAACAATTGTACTGGAGAGTATTTATTGGT
AGAATACTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTTGACGAAATAGGGAAGGTCA
AGAACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGATCCCTCCGAAGAAGAACCCT
CCCGTAAATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTCAGGCTGCTTCTTCCGCCCA
GTCAACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGAACGAAGAGATTCCGTAG
ATAGTGAGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGCGGCTAAGGAGCCGGCGGAA
CCAGCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATGGGCCCACTAAGAGGAAA
CCATGTGCCAAGCCCACTTCAACACCACGAAGGAGAGGGTTGACGGCGGTGCGGTAAGCC
GGGAGGTTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGTTACAGGAGTCTCCAAACTT
CCGATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACGTTGGCTTGTCGGTCTGA
GCAGCTCGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATATACGCCGAAAGAAGGGCCG
GAGATTCCCTTAGGGACGGCTAGACGCCTAGCAATTGCAGCGGAGGATAAGCTGCTCCTT
AGCTGGCTCGCCATTGGAGATGCACTTGCTGCCATTGTTTTT

QA 5 766 5 766
DS 

RD RR4GR25JQ 766 0 0
GG
TCAGACAAAAGTAAATTAAAAAGGAAAAAGAAACAATTGTACTGGAGAGTATTTATTGGT
AGAATACTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTTGACGAAATAGGGAAGGTCA
AGAACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGATCCCTCCGAAGAAGAACCCT
CCCGTAAATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTCAGGCTGCTTCTTCCGCCCA
GTCAACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGAACGAAGAGATTCCGTAG
ATAGTGAGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGCGGCTAAGGAGCCGGCGGAA
CCAGCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATGGGCCCACTAAGAGGAAA
CCATGTGCCAAGCCCACTTCGACACCACGAAGGAGAGGGTTGACGGCGGTGCGGTAAGCC
GGGAGGTTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGTTACAGGAGTCTCCAAACTT
CCGATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACGTTGGCTTGTCGGTCTGA
GCAGCTCGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATATACGCCGAAAGAAGGGCCG
GAGATTCCCTTAGGGACGGCTAGACGCCTAGCAATTGCAGCGGAGGATAAGCTGCTCCTT
AGCTGGCTCGCCATTGGAGATGCACTTGCTGCCATTGTTTTTCC

QA 3 766 3 766
DS 



AS 1 4

CO CL2517Contig1 1500 4 6 U
GCGGGGAAAGCAAAGTCTGATTCCTCACAATCTCAGATGAGCTCCGATCGGTGAGCGTGA
AACCTTAATCCCTCATCCGTAATCTGTCTTCACCTCACCGTTGGGATATGGATGGTAACA
AAGACGACGCGTTGAAATGCCTCAAAATCGGCAAGGACGCGATGGGAGCAGGGGACCGAT
CACGCGCCTCCAAGTTCCTCGAGAAAGCTCGTCGTCTCGATCCGTCTCTCCCGATCGACG
ATCTCCTCTCGGATCTGAACAAGCAGACGACGGCGGAGGCTTCCCCCGGATCTTAGTCGT
CGCCTAAGCCGCCGTCTCTTCGTCAACGCGTATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCATCCGCCG
CCGCGGGCGGATCTTCGTCGGCCTCTTTCACGGAGGAGCAGCGAGCGATCGTGAGGGAGA
TCAAGTCGAAGAAGGACTACTACGAGATCCTCGGACTGGGGAGAACCTGTTCAGTCGAAG
ACATGAGGAAAGCGTATCGGAAGCTCTCGCTCAAGGTTCATCCCGATAAGAACAAAGCTC
CCGGCTCCGAAGAAGCGTTCAAATCCGTCTCCAAGGCGTTCCAGTGCCTAAGCGATGACG
GCGCTAGGAGAAAGTACGACGTCTCCGGCTCCGACGAGCCTTCCTATCAATCGAGGAGAC
ATCATCAGCATCACAACAGCGGGTTCAACGGTTACTACGACGACGAGTTCGACGCCGACG
AGATCTTCAGAAGCTCCTTCGGCGCAGCAGGGATGGGTCCCGCCGCTACTCAGTTCCGAT
CATTCAACTTCGGTGGTGGTAATAGAGCGGCTAATCATCAGGCCTCTGATGCTACAGGGT
TCAACCCTCGCGTCCTCCTCCAGCTGCTTCCCGTGGTGTCCATACTGCTGCTCAACTTCT
TGCCGTCTCCTCAACCAATCTACTCGCTCTCCGCGTCGTACCAGTACGAGCACAAGTTCA
CCACGCATAGAGGGGTCAATTACTTTGTGAGATCAGCTAAGTTCGAGCAGGAGTACCCTA
TAAACAGCCTCGAGAGACAGAGGGTTGAGGCGCAGGTGGACAGAGATTACTTGTCTATAC
TGGGACAGAATTGTAGGTATGAGCTTCAGAGACAACAGTGGGGGTATGTTCGCGAGACGC
CTCATTGTGACATGATGAGGAGGTTTGATTCAGCTGCTGCTGCGTAAAACCCGCACTCCA
AGTTAGTATATTCAAACCTCTTAAAAAAGAAACTTTTGGTTTTGACCATTCAGATGTTAC
TTACTATTTTGTTGATGTCCCTCAGTGAGTTTGATTCCCCAAAGTCCCCAAACTTCTTAA
TATACATTGATTACTGGTTCTATGTATGATGTTTAGTACGAAACATTGTTCATGTGTGAT
TATTTCTATTCGGAATAAGACTTGTTTTTTGGCTCCTGCCCTGCAATTTTACATGTGTAA
AACTTATTGTTATTACATCAAACGTTTCCTGGTTAAATCATAGTGGATCGATCTTGTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GB38TF U 1
AF RR4G970TF U 75
AF RR4GB38JQ C 670
AF RR4G970JQ C 744
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ATCTCCTCTCGGATCTGAACAAGCAGACGACGGCGGAGGCTTCCCCCGGATCTTAGTCGT
CGCCTAAGCCGCCGTCTCTTCGTCAACGCGTATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCATCCGCCG
CCGCGGGCGGATCTTCGTCGGCCTCTTTCACGGAGGAGCAGCGAGCGATCGTGAGGGAGA
TCAAGTCGAAGAAGGACTACTACGAGATCCTCGGACTGGGGAGAACCTGTTCAGTCGAAG
ACATGAGGAAAGCGTATCGGAAGCTCTCGCTCAAGGTTCATCCCGATAAGAACAAAGCTC
CCGGCTCCGAAGAAGCGTTCAAATCCGTCTCCAAGGCGTTCCAGTGCCTAAGCGATGACG
GCGCTAGGAGAAAGTACGACGTCTCCGGCTCCGACGAGCCTTCCTATCAATCGAGGAGAC
ATCATCAGCATCACAACAGCGGGTTCAACGGTTACTACGACGACGAGT*CGACGCCGACG
AGATCTTCAGA*GCTC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4G970TF 653 0 0
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CTGAACAAGCAGACGACGGCGGAGGCTTCCCCCGGATCTTAGTCGTCGCCTAAGCCGCCG
TCTCTTCGTCAACGCGTATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCATCCGCCGCCGCGGGCGGATCT
TCGTCGGCCTCTTTCACGGAGGAGCAGCGAGCGATCGTGAGGGAGATCAAGTCGAAGAAG
GACTACTACGAGATCCTCGGACTGGGGAGAACCTGTTCAGTCGAAGACATGAGGAAAGCG
TATCGGAAGCTCTCGCTCAAGGTTCATCCCGATAAGAACAAAGCTCCCGGCTCCGAAGAA
GCGTTCAAATCCGTCTCCAAGGCGTTCCAGTGCCTAAGCGATGACGGCGCTAGGAGAAAG
TACGACGTCTCCGGCTCCGACGAGCCTTCCTATCAATCGAGGAGACATCATCAGCATCAC
AACAGCGGGTTCAACGGTTACTACGACGACGAGTTCGACGCCGACGAGATCTT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4GB38JQ 831 0 0
ATCACAACAGCGGGTTCAACGGTTACTACGACGACGAGTTCGACGCCGACGAGATCTTCA
GAAGCTTCTTCGGCGCAGCAGGGATGGGTCCCGCCGCTACTCAGTTCCGATCATTCAACT
TCGGTGGTGGTAATAGAGCGGCTAATCATCAGGCCTCTGATGCTACAGGGTTCAACCCTC
GCGTCCTCCTCCAGCTGCTTCCCGTGGTGTCCATACTGCTGCTCAACTTCTTGCCGTCTC
CTCAACCAATCTACTCGCTCTCCGCGTCGTACCAGTACGAGCACAAGTTCACCACGCATA
GAGGGGTCAATTACTTTGTGAGATCAGCTAAGTTCGAGCAGGAGTACCCTATAAACAGCC
TCGAGAGACAGAGGGTTGAGGCGCAGGTGGACAGAGATTACTTGTCTATACTGGGACAGA
ATTGTAGGTATGAGCTTCAGAGACAACAGTGGGGGTATGTTCGCGAGACGCCTCATTGTG
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ATTCAAACCTCTTAAAAAAGAAACTTTTGGTTTTGACCATTCAGATGTTACTTACTATTT
TGTTGATGTCCCTCAGTGAGTTTGATTCCCCAAAGTCCCCAAACTTCTTAATATACATTG
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TCGGAATAAGACTTGTTTTTTGGCTCCTGCCCTGCAATTTTACATGTGTAAAACTTATTG
TTATTACATCAAACGTTTCCTGGTTAAATCATAGTGGATCGATCTTGTAGG

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4G970JQ 757 0 0
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AGAGCGGCTAATCATCAGGCCTCTGATGCTACAGGGTTCAACCCTCGCGTCCTCCTCCAG
CTGCTTCCCGTGGTGTCCATACTGCTGCTCAACTTCTTGCCGTCTCCTCAACCAATCTAC
TCGCTCTCCGCGTCGTACCAGTACGAGCACAAGTTCACCACGCATAGAGGGGTCAATTAC
TTTGTGAGATCAGCTAAGTTCGAGCAGGAGTACCCTATAAACAGCCTCGAGAGACAGAGG
GTTGAGGCGCAGGTGGACAGAGATTACTTGTCTATACTGGGACAGAATTGTAGGTATGAG
CTTCAGAGACAACAGTGGGGGTATGTTCGCGAGACGCCTCATTGTGACATGATGAGGAGG
TTTGATTCAGCTGCTGCTGCGTAAAACCCGCACTCCAAGTTAGTATATTCAAACCTCTTA
AAAAAGAAACTTTTGGTTTTGACCATTCAGATGTTACTTACTATTTTGTTGATGTCCCTC
AGTGAGTTTGATTCCCCAAAGTCCCCAAACTTCTTAATATACATTGATTACTGGTTCTAT
GTATGATGTTTAGTACGAAACATTGTTCATGTGTGATTATTTCTATTCGGAATAAGACTT
GTTTTTTGGCTCCTGCCCTGCAATTTTACATGTGTAAAACTTATTGTTATTACATCAAAC
GTTTCCTGGTTAAATCATAGTGGATCGATCTTGTAGG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 4

CO CL2518Contig1 731 4 11 U
GGAAAATCAAAGGCAGGCGTATTTTAGCCGTCCGCCATTTCCATCGCTCTCTCTCTCGTT
TTCTCTGCTCATCACTATAACGACGGCCTCTCTTCTGCATCATCTGATCTGATTTCGATG
GCTGCACCACCTGCTAGGGCAAGAGCCGATTACGATTACCTCATCAAGCTTCTCCTTATC
GGTGACAGCGGTGTTGGTAAAAGTTGTTTGCTGTTGAGGTTCTCTGATGGCTCTTTCACC
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AACCGCATCAAGCTTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAACGTTTTCGAACCATCACC
ACTGCTTATTACCGAGGGGCAA*TGGGCATTTTGCTGGTCTATGATGTCACTGACGAGTC
ATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGATTCGTAACATCGAGCAGCACGCTTCGGATAATGT
CAACAAGATCTTGGTTGGGAACAAAGCCGATATGGACGAGAGCAAGAGGGCCGTACCAAA
AGCAAAGGGTCAAGCACTTGCTGATGAATACGGAATCAAGTTCTTTGAAACTAGTGCCAA
AACAAATTTAAATGTGGAGGAAGTTTTCTTCTCGATAGCAAAGGACATTAAGCAGAGACT
CGCAGATACTGACTCCAGGGCAGAGCCTTCGACGATTAG*ATCAGCCAAACAGACCAGCG
GCTGGAGCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 

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AF RR4G054TF U 32
AF RR4H618TF U 65
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CAGA

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AAGATAAGAACTATTGAGCTTGATGGCAAACGCATCAAGCTTCAGATTTGGGATACTGCT
GGTCAAGAACGTTTTCGAACCATCACCACTGCTTATTACAGAGGGGCAA*TGGGCATTTT
GCTGGTGTATGATGTCACAGACGAGTCATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGATTCGTAA
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CCACCTGCTAGGGCAAGAGCCGATTACGATTACCCCATCAAGCTTCTCCTTATCGGTGAC
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CAACAACATTAGGAACTGGATTCGTAACATCGAGCAGCACGCTTCGGATAATGTCAACAA
GAT*TTGGTTGGGAACAAAGCCGATATGGACGAGAGCAAGAGGGCCGTACCAAAAGCAAA
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TACTGACTCCAGGGCAGAGCCTTCGACGATTAG*ATCAGCCAAACAGACCAGCGGCTGGA
GCCCG

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DS 



AS 1 3

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GGCAAGCAAATCATTCATGTTTTAGTACTAACTGTAATTTAGGGGATCATTTTGATTCAG
GTTCCTCTTTTACAGCCAGATCTAAATCTATCTTACTCTTATTACAAATCATCTTGCAGT
TGCGTAACAAGTACATCGGTCTCATCATTTTCTTCTGCTGCATCAATAAGAGCTTGGTAA
GATTTGTCTTGAAGGTGCCCCGATTGCCCCAACAATTCCAAAACGGTCTCTTTACTAGTA
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CAATTGCTGGACCCTTGCGCAAAAAAAGCTTGTTTCAGACAAGCCAAAGCCTGTGTGATA
CTCCTCTTTCTGGTATGACCATCGGCTAGAATCTACCAAGTACCTGGGCTCGGCTTTCCC
CCCATTTCAATCATGTGGTCGAACAACCCTTCAGCCTTGTCCAGCTGGTCGTTTTTAACG
TACACATTCATAAGAAGGTTAGGTATCCTGGGGTCAAAAGAAGACTTGACAGGAAGCCAC
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CGATTACGACCAGTAATCCTGGCCTCAACCTTCCTCAGAGCATCCTCAGCTTTCTGGGAT
TCGCCCATCTTAATGTACATGGTGCTAAAAGTGGTCCAGTTGGGATTGATGGAAACATCA
GATTTCATCTGGTGATAGACAAGCTCCATTTGGTCAACGGAGGAGCAGGAGGAGAGCCAG
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TCGAGCTGGATGGCAGCATCACTTGCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ES96JQ U 1
AF RR4DK64JQ U 116
AF RR4DK64TF C 525
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GGCAAGCAAATCATTCATGTTTTAGTACTAACTGTAATTTAGGGGATCATTTTGATTCAG
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TGCGTAACAAGTACATCGGTCTCATCATTTTCTTCTGCTGCATCAATAAGAGCTTGGTAA
GATTTGTCTTGAAGGTGCCCCGATTGCCTCAACAATTCCAAAACGGTCTCTTTACTAGTA
ACATCCGACTCCTCTTCACAGAGCTTGAAGAAGCCTGAAAGCACCAACACCTTGGGCCTC
CAATTGCTGGACCCTTGCGCAGAAAAAGCTTGTTTCAGACAAGCCAAAGCCTGTGTGATA
CTCCTCTTTCTGGTATGACCATCGGCTAGAATCTACCAAGTACCTGGGCTCGGCTTTCCC
CCCATTTCAATCATGTGGTCGAACAACCCTTCAGCCTTGTCCAGCTGGTCGTTTTTAACG
TACACATTCATAAGAAGGTTAGGTATCCTGGGGTCAAAAGAAGACTTGACAGGAAGCCAC
TCCTCATATACCTTCTCGGCACCTTCAATATCTCCCATCCTCACCAAGGAGGAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4DK64JQ 797 0 0
TTCAGGTTCCTCTTTTACAGCCAGATCTAAATCTATCTTACTCTTATTACAAATCATCTT
GCAGTTGCGTAACAAGTACATCGGTCTCATCATTTTCTTCTGCTGCATCAATAAGAGCTT
GGTAAGATTTGTCTTGAAGGTGCCCCGATTGCCCCAACAATTCCAAAACGGTCTCTTTAC
TAGTAACATCCGACTCCTCTTCACAGAGCTTGAAGAAGCCTGAGAGCACCAACACCTTGG
GCCTCCAATTGCTGGACCCTTGCGCAAAAAAAGCTTGTTTCAGACAAGCCAAAGCCTGTG
TGATACTCCTCTTTCTGGTATGACCATCGGCTAGAATCTCCCAAGTACCTGGGCTCGGCT
TTCCCCCCATTTCAATCATGTGGTCGAACAACCCTTCAGCCTTGTCCAGCTGGTCGTTTT
TAACGTACACATTCATAAGAAGGTTAGGTATCCTGGGGTCAAAAGAAGACTTGACAGGAA
GCCACTCCTCATATACCTTCTCGGCACCTTCAATATCTCCCATCCTCACCAAGGAGGAGA
CGAGAGCATGGTATCCCAAATTGGGAATGCTGGGTACAACAGATTTGTAGACATTCCAAA
CCCGGAACAGCTCTTTCACGTTACCAAGGCTGCCGTACAAGCTCAAGAGGTAGTGATAAG
GGATACGATTACGACCAGTAATCCTGGCCTCAACCTTCCTCAGAGCATCCTCAGCTTTCT
GGGAT*CGCCCATCTTAATGTACATGGTGCTAAAAGTGGTCCAGTTGGGATTGATGGAAA
CATCAGATTTCATCTGG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4DK64TF 764 0 0
GCTGGTCG
TTTTAACGTACACAT*CATAAGAAGGTTAG*TATCCTGGGGTCAAA*GAAGACTTGACAG
GAAGCCACTCCTCATATAC*TTCTCGGCACTTTCAATATCTCCCATCCTCACCAAGGAGG
AGACGAGAGCATGGTATCCCAAATTGGGAATGCTGGGTACAACAGATTTGTAGACATTCC
AAACCCGGAACAGCTCTTTCACGTTACCAAGGCTGCCGTACAAGCTCAAGAGGTAGTGAT
AAGGGATACGATTACGACCAGTAATCCTGGCCTCAACCTTCCTCAGAGCATCCTCAGCTT
TCTGGGATTCGCCCATCTTAATGTACATGGTGCTAAAAGTGGTCCAGTTGGGATTGATGG
AAACATCAGATTTCATCTGGTGATAGACAAGCTCCATTTGGTCAACGGAGGAGCAGGAGG
AGAGCCAGATGTTGTAGGAGTGGATGTCGAGACGAATATCTTTCTGCTTCATCTCGAAGA
CCATAGCGTCAACTTTGTCGTACTCCCTAAGGTTCATGTAGAGAGTCATCATAACGTTGA
AGGGAAGAGGGTGAAGGGCGTAACCTTTCTGCCTCATAGTGTCGATTAAGGCTTCAGCTT
TGTCTCTGGACTTGGCCCGAACATAGGCATTGAGGAGGGAGCCATAGACTCTGCGGTCCT
TAAAGTTGTCAGGGAGAGTGAGGAAGAAGTCTTCGGCGTCTGAAATACCACGGACTTTGC
CGATGAGGTCGAGCTGGATGGCAGCATCACTTGCAC

QA 9 764 9 764
DS 



AS 2 4

CO CL2520Contig1 1293 2 2 U
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AATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACGACGACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAA
GGGAAAATCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACATTGCTCTGGCTACTCTTGGTGGTGGATC
CACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGTAGTCACATGTGCACTCACTATTCTCAC
GAGTTCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGTCCAAGCGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGT
TACCACCGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAAATGTGCGTTGTCTCTACTTGCATTGAC
AAGAATATGGAACAACGAAGGTGTTACTGACGACAATAGGTTAAGCACAACATATGACGA
AGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCAGCTTTGTATCTTTTCAAGAATCTCTTACAGTATTA
TATTTTTGCGTACGTAGACGCCCCAGGCTATCAGATATTGAAGAATCTGAACATCATAAG
TACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAAAAAGTTGAGTGAGATTCAGTGGGCGGG
CTTCATCTTATTGTGTTGTGGATGCACCACTGCTCAGTTGAATTCAAATTCTGATCGTGT
ACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCAATTATTATGGCTCTTTTAAGTGGTTT
CGCCGGAGTGTACACAGAGGCTATTATAAAGAAGCGACCTTCAAGGAATATAAATGTACA
AAACTTCTGGCTATATGTCTTTGGGATGGCTTTCAATGCTGTTGCTATAGTGATCCAAGA
TTTCGATGCAGTCGCTAATAAGGGATTCTTCCATGGTTACTCATTCATAACCGTACTCAT
GATTCTTAACCATGCTCTCAGTGGCATTGCTGTGTCAATGGTGATGAAATATGCAGACAA
TATCGTAAAGGTTTATTCAACATCAGTGGCAATGCTTCTCACTGCGGTTGTCTCTGTATT
CCTCTTCAACTTTCATCTCTCACTTGCCTTCTTTTTGGGCTCCACGGTTGTCTCTGTTTC
AGTATATTTGCACTCAGCCGGGAAGCTACGATAGTAAAAGAAAGATCTCTGAACTTTGTC
TGACAACAAAGATCCACCACTATTCTAGCACAGAGATAAAGCTTTTGAACAATTGCGATT
TTGTATTTCGTGTATATTTGATATACGTTACTGTCTGAAAGTTAAGCTATATTGTTGAAA
CATTGCATTTTATATATAAGATCATTCATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED26TF U 1
AF RR4ED26JQ C 634
BS 1 744 RR4ED26TF
BS 745 1293 RR4ED26JQ

RD RR4ED26TF 759 0 0
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AATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACGACGACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAA
GGGAAAATCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACATTGCTCTGGCTACTCTTGGTGGTGGATC
CACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGTAGTCACATGTGCACTCACTATTCTCAC
GAGTTCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGTCCAAGCGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGT
TACCACCGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAAATGTGCGTTGTCTCTACTTGCATTGAC
AAGAATATGGAACAACGAAGGTGTTACTGACGACAATAGGTTAAGCACAACATATGACGA
AGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCAGCTTTGTATCTTTTCAAGAATCTCTTACAGTATTA
TATTTTTGCGTACGTAGACGCCCCAGGCTATCAGATATTGAAGAATCTGAACATCATAAG
TACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAAAAAGTTGAGTGAGATTCAGTGGGCGGG
CTTCATCTTATTGTGTTGTGGATGCACCACTGCTCAGTTGAATTCAAATTCTGATCGTGT
ACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCAATTATTATGGCTCTTTTAAGTGGTTT
CGCCGGAGTGTACACAGAGGCTAT
ATAAAGAAGCGACCT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4ED26JQ 660 0 0
TCAGTTGAATTCAAATT
CTGATCGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCAATTATTATGGCTCTTT
TAAGTGGTTTCGCCGGAGTGTACACAGAGGCTATTATAAAGAAGCGACCTTCAAGGAATA
TAAATGTACAAAACTTCTGGCTATATGTCTTTGGGATGGCTTTCAATGCTGTTGCTATAG
TGATCCAAGATTTCGATGCAGTCGCTAATAAGGGATTCTTCCATGGTTACTCATTCATAA
CCGTACTCATGATTCTTAACCATGCTCTCAGTGGCATTGCTGTGTCAATGGTGATGAAAT
ATGCAGACAATATCGTAAAGGTTTATTCAACATCAGTGGCAATGCTTCTCACTGCGGTTG
TCTCTGTATTCCTCTTCAACTTTCATCTCTCACTTGCCTTCTTTTTGGGCTCCACGGTTG
TCTCTGTTTCAGTATATTTGCACTCAGCCGGGAAGCTACGATAGTAAAAGAAAGATCTCT
GAACTTTGTCTGACAACAAAGATCCACCACTATTCTAGCACAGAGATAAAGCTTTTGAAC
AATTGCGATTTTGTATTTCGTGTATATTTGATATACGTTACTGTCTGAAAGTTAAGCTAT
ATTGTTGAAACATTGCATTTTATATATAAGATCATTCATTCTC

QA 18 660 18 660
DS 



CO CL2520Contig2 1264 2 2 U
GGGAATCAACAAAATGGAATACCGCAAAATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACCACGA
CGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAAGGGAAAGTCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACAT
TGCTCTGGCTACTCTTGGTGGTGGATCCACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGT
AGTCACATGTGCACTCACTATTCTCACGAGTTCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGTCCAA
GCGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACGGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAA
ATGTGCCTTATCTCTGCTTGCATTGACAAGAATATGGAACAACGATGGTGTTACTGACGA
CAATAGGTTAAACACAACATATGACGAAGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCAGCTTTGTA
TCTTTTCAAGAATCTCTTACAGTATTATATTTTTGCATACGTAGACGCCCCAGGCTATCA
GACATTGAAGAACCTGAACATCATAAGTACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAA
AAAGCTGAGCGAGATTCAGTGGGCGGGCTTCATCCTGTTGTGTTGTGGATGCACCACTGC
TCAGTTGAACTCAAACCTGATCGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCA
ATTGTAATGGCTCTTTTAAGTGGTTTCGCCGGAGTGTACACAGAGGCTATTATTAAAAAG
CGGCCTTCAAGGAATATAAATGTACAGAACTTCTGGCTATATGTCTTTGGGATGGCTTTC
AATGCTGTTGCTATAGTGATCCAAGATTTCGATGCCGTTGCTAATAAGGGATTCTTCCAT
GGTTACTCATTCATCACAGTACTCATGATTCTTAACCATGCTCTCAGTGGCATTGCTGTG
TCAATGGTGATGAAATATGCAGACAATATCGTAAAGGTTTATTCAACATCAGTGGCAATG
CTTCTCACTGCGGTTGTCTCTGTATTCCTCTTCAATTTTCATCTCTCACTTGCCTTCTTT
TTGGGCTCAACGGTTGTCTCTGTTTCAGTATATTTGCACTCAGCCGGGAAGCTACGATAG
TAAAAGAAAGATCTCTGAACTTTGTCTGACAACAAAGATCCACCACTATTCTAGCACAGG
GGGACAAACTTTTGGACAATTGCGATTTTGTATTTCGTGTATATTTGATATACATTACTG
TCTGAAAGTGAAACTATATTGTTGAAACATTGCATTTTATATATAAGATCATTCATTCTT
TACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4H464TF U 1
AF RR4H464JQB C 592
BS 1 687 RR4H464TF
BS 688 1264 RR4H464JQB

RD RR4H464TF 687 0 0
GGGAATCAACAAAATGGAATACCGCAAAATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACCACGA
CGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAAGGGAAAGTCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACAT
TGCTCTGGCTACTCTTGGTGGTGGATCCACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGT
AGTCACATGTGCACTCACTATTCTCACGAGTTCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGTCCAA
GCGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACGGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAA
ATGTGCCTTATCTCTGCTTGCATTGACAAGAATATGGAACAACGATGGTGTTACTGACGA
CAATAGGTTAAACACAACATATGACGAAGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCAGCTTTGTA
TCTTTTCAAGAATCTCTTACAGTATTATATTTTTGCATACGTAGACGCCCCAGGCTATCA
GACATTGAAGAACCTGAACATCATAAGTACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAA
AAAGCTGAGCGAGATTCAGTGGGCGGGCTTCATCCTGTTGTGTTGTGGATGCACCACTGC
TCAGTTGAACTCAAACCTGATCGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCA
ATTGTAATGGCTCTTTTAAGTGGTTTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4H464JQB 673 0 0
CACCACTGCTCAGTTGAACTCAAACCTGATCGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGG
ATTATGGCAATTGTAATGGCTCTTTTAAGTGGTTTCGCCGGAGTGTACACAGAGGCTATT
ATTAAAAAGCGGCCTTCAAGGAATATAAATGTACAGAACTTCTGGCTATATGTCTTTGGG
ATGGCTTTCAATGCTGTTGCTATAGTGATCCAAGATTTCGATGCCGTTGCTAATAAGGGA
TTCTTCCATGGTTACTCATTCATCACAGTACTCATGATTCTTAACCATGCTCTCAGTGGC
ATTGCTGTGTCAATGGTGATGAAATATGCAGACAATATCGTAAAGGTTTATTCAACATCA
GTGGCAATGCTTCTCACTGCGGTTGTCTCTGTATTCCTCTTCAATTTTCATCTCTCACTT
GCCTTCTTTTTGGGCTCAACGGTTGTCTCTGTTTCAGTATATTTGCACTCAGCCGGGAAG
CTACGATAGTAAAAGAAAGATCTCTGAACTTTGTCTGACAACAAAGATCCACCACTATTC
TAGCACAGGGGGACAAACTTTTGGACAATTGCGATTTTGTATTTCGTGTATATTTGATAT
ACATTACTGTCTGAAAGTGAAACTATATTGTTGAAACATTGCATTTTATATATAAGATCA
TTCATTCTTTACC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 4

CO CL2521Contig1 650 4 2 U
TTTTTTTTATCATTTTTAATGCATATCATTGACGTCCAACCAAAGCCTGTCTGAACCAAA
AGCGATAAGAACTTAAGAAGTTGCAGAACATGGTGTTCTGTCATAACGCTTTAGAAGATC
CCAAAAAAAAAACACTCGAGTCATCTTCTACTAGACTTTACTGCCAAAAATTATACAAAC
TTTAAAAGCTAAGAAAGATCAGAGAGCGCCTTGTCGATATCCCCTGCGTGGTCCCGGAGA
GTGTTCCACTGATCCACGCTTAGAGAGATACCTTTCTTGCCGGGAAGAGTTTTGCCGTCC
TTGACATAGAACTCACGAATGTCAATCCAAATCTTGCCGTTCCAGTTCCTCACAGAGACT
CTCCTATTCTTAGATATAGTGCAGACGACGATGTCGTCAGACTCGTCGGAGGAGTCGGCT
GGCTTTGCGACTTTCTTAGCCGGGGCGTGGGTTTCAGATTCGTCATCTGTTGCTCGGACA
TCATTGTCTTTTCGTTTTCCTCTCCACGACATGTTCTCTACCAAATAACCTGTACAAAAA
GCTTCTCTTCAGACCAAAGTGAACTAGGACGGACTCACGAAAATCCTAGAAAAAATTGTT
GGAAGTAATAACACCGAGAAGTAAGGAGCAAGGAAGAAGTTGGGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4CY25JQ U 18
AF RR4CY25TF C 1
AF RR4CW37JQ U 18
AF RR4CW37TF C 18
BS 1 17 RR4CY25TF
BS 18 650 RR4CW37JQ

RD RR4CY25JQ 578 0 0
AATGCATATCATTGACGTCCAACCAAAGCCTGTCTGAACCAAAAGCGATAAGAACTTAAG
AAGTTGCAGAACATGGTGTTCTGTCATAACGCTTTAGAAGATCCCAAAAAAAAAACACTC
GAGTCATCTTCTACTAGACTTTACTGCCAAAAATTATACAAACTTTAAAAGCTAAAAAAG
ATCAGAAAGCGCCTTGTCGATATCCCCTGCGTGGTCCCGGAGAGTGTTCCACTGATCCAC
GCTTAGAGAGATACCTTTCTTGCCGGGAAGAGTTTTGCCGTCCTTGACATAAAACTCACG
AATGTCAATCCAAATCTTGCCGTTCCAGTTCCTCACAGAGACTCTCCTATTCTTAGATAT
AGTGCAGACGACGATGTCGTCAGACTCGTCGGAGGAGTCGGCTGGCTTTGCGACTTTCTT
AGCCGGGGCGTGGGTTTCAGATTCGTCATCTGTTGCTCGGACATCATTGTCTTTTCGTTT
TCCTCTCCACGACATGTTCTCTACCAAATAACCTGTACAAAAAGCTTCTCTTCAGACCAA
AGTGAACTAGGACGGACTCACGAAAATCCTAGAAAAAA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4CY25TF 650 0 0
TTTTTTTTATCATTTTTAATGCATATCATTGACGTCCAACCAAAGCCTGTCTGAACCAAA
AGCGATAAGAACTTAAGAAGTTGCAGAACATGGTGTTCTGTCATAACGCTTTAGAAGATC
CCAAAAAAAAAACACTCGAGTCATCTTCTACTAGACTTTACTGCCAAAAATTATACAAAC
TTTAAAAGCTAAGAAAGATCAGAGAGCGCCTTGTCGATATCCCCTGCGTGGTCCCGGAGA
GTGTTCCACTGATCCACGCTTAGAGAGATACCTTTCTTGCCGGGAAGAGTTTTGCCGTCC
TTGACATAGAACTCACGAATGTCAATCCAAATCTTGCCGTTCCAGTTCCTCACAGAGACT
CTCCTATTCTTAGATATAGTGCAGACGACGATGTCGTCAGACTCGTCGGAGGAGTCGGCT
GGCTTTGCGACTTTCTTAGCCGGGGCGTGGGTTTCAGATTCGTCATCTGTTGCTCGGACA
TCATTGTCTTTTCGTTTTCCTCTCCACGACATGTTCTCTACCAAATAACCTGTACAAAAA
GCTTCTCTTCAGACCAAAGTGAACTAGGACGGACTCACGAAAATCCTAGAAAAAATTGTT
GGAAGTAATAACACCGAGAAGTAAGGAGCAAGGAAGAAGTTGGGTTATCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4CW37JQ 633 0 0
AATGCATATCATTGACGTCCAACCAAAGCCTGTCTGAACCAAAAGCGATAAGAACTTAAG
AAGTTGCAGAACATGGTGTTCTGTCATAACGCTTTAGAAGATCCCAAAAAAAAAACACTC
GAGTCATCTTCTACTAGACTTTACTGCCAAAAATTATACAAACTTTAAAAGCTAAGAAAG
ATCAGAGAGCGCCTTGTCGATATCCCCTGCGTGGTCCCGGAGAGTGTTCCACTGATCCAC
GCTTAGAGAGATACCTTTCTTGCCGGGAAGAGTTTTGCCGTCCTTGACATAGAACTCACG
AATGTCAATCCAAATCTTGCCGTTCCAGTTCCTCACAGAGACTCTCCTATTCTTAGATAT
AGTGCAGACGACGATGTCGTCAGACTCGTCGGAGGAGTCGGCTGGCTTTGCGACTTTCTT
AGCCGGGGCGTGGGTTTCAGATTCGTCATCTGTTGCTCGGACATCATTGTCTTTTCGTTT
TCCTCTCCACGACATGTTCTCTACCAAATAACCTGTACAAAAAGCTTCTCTTCAGACCAA
AGTGAACTAGGACGGACTCACGAAAATCCTAGAAAAAATTGTTGGAAGTAATAACACCGA
GAAGTAAGGAGCAAGGAAGAAGTTGGGTTATCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4CW37TF 633 0 0
AATGCATATCATTGACGTCCAACCAAAGCCTGTCTGAACCAAAAGCGATAAGAACTTAAG
AAGTTGCAGAACATGGTGTTCTGTCATAACGCTTTAGAAGATCCCAAAAAAAAAACACTC
GAGTCATCTTCTACTAGACTTTACTGCCAAAAATTATACAAACTTTAAAAGCTAAGAAAG
ATCAGAGAGCGCCTTGTCGATATCCCCTGCGTGGTCCCGGAGAGTGTTCCACTGATCCAC
GCTTAGAGAGATACCTTTCTTGCCGGGAAGAGTTTTGCCGTCCTTGACATAGAACTCACG
AATGTCAATCCAAATCTTGCCGTTCCAGTTCCTCACAGAGACTCTCCTATTCTTAGATAT
AGTGCAGACGACGATGTCGTCAGACTCGTCGGAGGAGTCGGCTGGCTTTGCGACTTTCTT
AGCCGGGGCGTGGGTTTCAGATTCGTCATCTGTTGCTCGGACATCATTGTCTTTTCGTTT
TCCTCTCCACGACATGTTCTCTACCAAATAACCTGTACAAAAAGCTTCTCTTCAGACCAA
AGTGAACTAGGACGGACTCACGAAAATCCTAGAAAAAATTGTTGGAAGTAATAACACCGA
GAAGTAAGGAGCAAGGAAGAAGTTGGGTTATCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 3

CO CL2522Contig1 888 3 2 U
AAACCAAAGATAAGCCCTTTATATAGTTCTATACAAACAGTTCAATTATAGCTTTACAAG
TAGTACTAATTACCAGCACAAAAGCATCATAAAAAATACAGCAAAAGATACTATAGTGTA
TATCTTTTGTTGATTATTCAATATATCTTATTATATATCGGTAGAGCAACGAGTCCCTTG
TATTGAAGGTAATGGATCAGTGGTCATGTTCGGTCCAAAAGCAACGATTGCAACACAGTT
CACATTAAACCGGTTCGCACCAGAGACAAACGTCCCGATCTTCCACCTTAGCTTCCCGTC
CATCTTCATACCGATGATCACTTTACCGACTGCCCGATCACGAACGATTTGGTAGCCAAA
AGACTGAGCAACGGGTAGCTCATTCCCTTGAAGAAAGGCTGTCAAAAGATTGATTTCTTC
GTGGGATTGATAAAAAGGTGGTAGAGAAGCTTCGGATGTTATTTGTTGCCCTCTGTAAGC
TGCGTATACGAGTAGCTTGTCGTAGTAGATTCCAACTTTTTTGTTAGGGTTCTTGGAGAG
GAGAGTGAGCTGGATTGAAGAGTTGAGGAGATGAGTGGCGGAGGAGGAAAGGTTAAGGGT
GTAGATATCGGCTTCTGTGAGGGAGAACTCGGGTTTTGCGGGGATGGAGAGTAAGCCAGA
TGATGAAGATGATGAGGAGAAGGCCGCTGAAGAAAGTTGAGAGTGTGAAGAAGAGTTTCT
TGCGTCGACGGTTGTTGATGTTAATCCCTCCTTTCTTGGAGTAATGCTTTGGAGAAGTTT
CGGAGATTTGAGACATTTGGAGAGCTCGAGGGAAGATGAAGAAGGAAGTATGAAGAAAAA
AGGAGAGATGGTAAAGGGGTTAAATAAAGAGACAAGTGTTGAAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GK46JQ U 1
AF RR4FF32JQ U 61
AF RR4GK46TF C 80
BS 1 656 RR4GK46JQ
BS 657 888 RR4GK46TF

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CA

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GT

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DS 

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QA 1 809 1 809
DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4E146JQ C 1
AF RR4E920JQ C 143
AF RR4E146TF U 1
AF RR4E920TF U 1
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ACTCACCGGAACTGATGTTTCCGACACTCCACAACCAAAACAGGTAGTGAACCAACAAGA
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TTTTTACAATCATATCTAAACAAATATTACAT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 4

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TCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 

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AF RR4EF35TF C 178
AF RR4GQ53TF C 215
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ACACGGAATGAACAAGAACTTTATTAAAGAGACAAGAGAGCTTTAAAGATTCTTAAAACT
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CATCTCGCTTAAATTGCCATAATTTT

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DS 

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AGCTGCTTGTTCAGCTCCATGAGGGCTTTTCTGTTCACCCTCATGCGCATTGGCACAGTT
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AGACCCATCTCGTAAGCTTCTTTGTCAATGTCTATTGCAGTAATACGGCCATCTTGGGGT
AATGCGAGGGCCGTCATGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACACCGAGTTCTAGCGTGTTC
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ATCTCGCTTAAATTGCCATAATTTTGGACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCTTGAGTTC

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CCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCAAGGGCTTTACCATAGTTTGGTTTATCAGC
GTCCACAAATGCGAAATCATACTCTGGCTTTGGATTCTCGGTCAGTAACTTGTCTAAGGC
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TTCATGCTCTCTTGGATATGCCGATGTTTCAAAGATGTAATTTCTGAGTTCCTCGTTCTT
GAGAATTCCTTTGGACGGAATCAGATTCTCCATATCCTTTCCTTTCTTTTTCTTTTTCTT
TTGTCC

QA 1 726 1 726
DS 

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T*GGCACAGTTTCCTCTTCCTCGGCCACAAACCCAAACCACAATGTGTTATCAAAAGCTA
TTATTCCCCCTACCTTCACCAGCTTCATTAGTCTCTCAAGGGCTTTACCATAGTTTGGTT
TATCAGCGTCCACAAATGCGAAATCATACTCTGGCTTTGGATTCTCGGTCAGCAACTTGT
CTAAGGCCTGAAGACCATCAGATTGGATGAAGTTGATTTTGTGATCAACACCAGCGTTCT
TGATGAACTCTAGACCCATCTCGTAAGCTTCTTTGTCAATGTCTATTGCAGTAATACGGC
CATCTTGGGGTAATGCGAGGGCCGTCGTGAGCAACGAGTAGCCCGTGAAAACACCGAGTT
CTAGCGTGTTCTTGGCATTCATCATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAGTGCCCCTCATCAA
CCGGTACCTCCATCTCGCTTAAATTGCCATAATTTTGGACCGTAGCTTCTCGTAGTTTCT
TGAGTTCTTCATGCTCTCTTGGATATGCCGATGTTTCAAAGATGTAATTTCTGAGTTCCT
CGTTCTTGAGAATTCCTTTGGACGGAATCAGATTCTCCATATCCTTTCCTTTCTTTTTCT
TTTTCTTTTGTCC

QA 17 689 17 689
DS 



AS 1 4

CO CL2525Contig1 1170 4 5 U
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ATTGGGTCACTCGAGCATATTGCGACAAGGTTCTTCGCCTCTCTGGAGCAACACAAGATC
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CGGACGATGCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCGAGCATCAGCGATGTTCTAT
GCACAGCAACAGCAGAAGCACTGGCCATGGGGAAGTTCGTGGTGTGTGCAGACCATCCTT
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TGAACAAAGTGAAAGAAGCAATGTCGAAAGAGCCGTTACCACTCACTCCTGAGCAGATGT
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CAGTTCATTGCTTTTTCTTTAGATTTGTGTAAAGTAAACCACTACTACGTCTGTTATTGC
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GCTATTTTGTAGAGTATTAAATACAAAGCGTGTTTAATGCCATATGTAAAAAAAAATATT
CCCTTCAACATATAAATATAGCTTTGAAGG


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP09TF U 1
AF RR4FP09JQ C 98
AF RR4EF59TF U 350
AF RR4EF59JQ C 576
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ATTGGGTCACTCGAGCATATTGCGACAAGGTTCTTCGCCTCTCTGGAGCAACACAAGATC
TGCCAAAATCTGTTATATGCAATGTCCATGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGTG
AGAAAATTGCTGAAGAGAGGTCCCGTGGGGAAGAAGCTTTCTCAAAAGGCGCATACTTCT
TAGGGAAAATGGTGTGGGCTAAAGGATACAAAGAACTGATAGATCTGATGGCTAAACACA
AAAGCGACCTCGGGAGCTTCAATTTAGATGTGTACGGAAACGGTGAAGATGCGGTCGAGG
TCCAACGAGCAGCACAGAAACTGGATTTGAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCATG
CGGACGATGCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCGAGCATCAGCGATGTTCTAT
GCACAGCAACAGCAGAAGCACTGGCCATGGGGAAGTTCGTGGTGTGTGCAGACCATCCTT
CAAACGAGTTCTTCAGATCATTCCCAAACTGTCTGACTTACAAAACATCCGAAGACTTTG
TGAACAAAGTGAAAGAAGCAATGTCGAAAGAGCCGTTACCACTCACTCCTGAGCAGATGT
ACAATCTTTCTTGGGAAGCAGCCACACAGAGATTCATGGAGTATTCGGATCTCGATA*GA
TCTTAAACGATGAAAAT
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TTTCTCAAAAGGCGCATACTTCTTAGGGAAAATGGTGTGGGCTAAAGGATACAAAGAACT
GATAGATCTGATGGCTAAACACAAAAGCGACCTCGGGAGCTTCAATTTAGATGTGTACGG
AAACGGTGAAGATGCGGTCGAGGTCCAACGAGCAGCACAGAAACTGGATTTGAATCTCAA
TTTCCTCAAAGGAAGGGACCATGCGGACGATGCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAA
CCCGAGCATCAGCGATGTTCTATGCACAGCAACAGCAGAAGCACTGGCCATGGGGAAGTT
CGTGGTGTGTGCAGACCATCCTTCAAACGAGTTTTTCAGATCATTCCCAAACTGTTTGAC
TTACAAAACATCCGAAGACTTTGTGAACAAAGTGAAAGAAGCAATGTCGAAAGAGCCGTT
ACCACTCACTCCTGAGCAGATGTACAATCTTTCTTGGGAAGCAGCCACACAGAGATTCAT
GGAGTATTCGGATCTCGATAAGATCTTAAACGATGAAAAT
GGAGG

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DS 

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G
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AGGGACCATGCGGACGATGCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCGAGCATCAGC
GATGTTCTATGCACAGCAACCGCAGAAGCTCTGGCCATGGGGAAGTTCGTGGTGTGTGCA
GACCATCCTTCAAACGAGTTCTTCAGATCATTCCCAAACTGTCTGACTTACAAAACATCC
GAAGACTTTGTGAACAAAGTGAAAGAAGCAATGTCGAAAGAGCCGTTACCACTCACTCCT
GAGCAGATGTACAATCTTTCTTGGGAAGCAGCCACACAGAGATTCATGGAGTATTCGGAT
CTCGATAAGATCTTAAACGATGAAAATAGGAAAAAGGATGAGAAAATCAAGATCGGTTCC
GAGCTTTAACGAGGTAATAGATGGAGGACTGGCGTTCACACACTATGTTCTCACAGGGAA
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CTGTTATTGCTATGATAGCTGTT

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TTACCACTCACTCCTGAGCAGATGTACAATCTTTCTTGGGAAGCAGCCACACAGAGATTC
ATGGAGTATTCGGATCTCGATAAGATCTTAAACGATGAAAATAGGAAAAAGGATGAGAAA
ATCAAGATCGGTTCCGAGCTTTAACGAGGTAATAGATGGAGGACTGGCGTTCACACACTA
TGTTCTCACAGGGAATGATTTTTTGAGACTATGCAGTGGAGCAACACCACAAACAAAAGA
CTATGATAAGCAACATTGCAAGGATTTGAAGCTTGTTCCACCTCAAGTTCACAAGCCAGT
TTTCGGCTGGTAGAAGTTTTACCAGCAGTTCATTGCTTTTTCTTTAGATTTGTGTAAAGT
AAACCACTACTACGTCTGTTATTGCTATGATAGCTGTTGAAGGTCGTTTGTTAATAGATA
GGTAGTAGCGAATGTCATTTTGTGGGCTATTTTGTAGAGTATTAAATACAAAGCGTGTTT
AATGCCATATGTAAAAAAAAATATTCCCTTCAACATATAAATATAGCTTTGAAGG

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 4

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CACGTTCCTTTTTCCTCATCCAAACCTTTATCTATCTCTTCTTCAGCACCATCTCTTTAC
TGTATGGGTTGTCGAGATATTCTGCTGACTTTCTCCGTTGCTCTCTTACTCATCTCCCTG
TTCCAGATCTGGCTTTTCCGGGAAGGACAAGTCCGGGAACGGTCAGAAGACAGCCAGGTT
GGAAAAGACGGGAATACCCTCGCCTCTAAGAACAAGAAGGACGATGATGTTCAACGTCTC
TTCCAAAGGTACTTCAAGGATCTAAACGATAGCAACAGTCGCTTTGAAGATTCCTACAGA
CAGATCCCTAGCTCCCCAGATCGCCTCCACAACTAGCTAGTTCCTTAAGTTTTTTTTCTA
TTCTTTTATTTTCTTCCAACTTTTCGACTCTTATTGTCCAAATTATCCTTGTTTTTTATC
TCACTTGTTTTTTTTTTTTTGAATAATATGTAAAATTTATTCAGAAAAAATATTTGTTAC
AGTCAAGAGCTACTTGAAAACAGAGAGATTATAAAAAACAGAGTGTTTTTCTCTTAAGCT
CTAACGAGTTGTAAGCCAGACTTGAAGAATGGCTCCATACCGTCGGATTCGTTTTGAGAT
CAACAAGAGGCATTGATTTCTAATCTGTCTGTCGATGACTTTGATCATAGCAGAGGTCAG
TGTTGGTGGAGCACCATGACGACGGTTATTTCGTTCTCTCCAAACTGAGTAGAGAGTCAC
TTGGAAGCTATATCGCAAGAGATAGAGCTCTAACGTCGGAAAGGAGGGGTCTGATAAAAG
TGCAGTGACATCTTGCCATCGGGATGAAGATCGTGAGGGAAAGAGCTTGCAAGTCAGGTT
TAGCCAAATCTCCTTGGAGTATCTGCAATCAAAGAAAAGATGTTCTCTTGTTTCAAGTTG
GTGTTGACACAAGATGCATCCTGGATTTGTTACGTTTCCCCAGATGAGCATTCTGTCTCC
AGTGGAAAGACGGTTATGCATGGCAAGCCAAGACATGAAACTGTACTTTGGTGTTGAGAA
AGAGAACCACACGTTTTTGTGCCAGTTTACTTGCGGTTTTGCAGTCCGTAGAAGAGACCA
TGTTCTTCTTGTATCAAATTTGGCTTTAAAGATATCTGTGTTATGCTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FJ63TF U 1
AF RR4FA16TF U 1
AF RR4FA16JQ C 501
AF RR4FJ63JQ C 509
BS 1 714 RR4FA16TF
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CACGTTCCTTTTTCCTCATCCAAACCTTTATCTATCTCTTCTTCAGCACCATCTCTTTAC
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TTCCAAAGGTACTTCAAGGATCTAAACGATAGCAACAGTCGCTTTGAAGATTCCTACAGA
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TTCTTTTATTTTCTTCCAACTTTTCGACTCTTATTGTCCAAATTATCCTTGTTTTTTATC
TCACTTGTTTTTTTTTTTTTGAATAATATGTAAAATTTATTCAGAAAAAATATTTGTTAC
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CTAACGAGTTGTAAGCCAGACTTGAAGAATGGC

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DS 

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CACGTTCCTTTTTCCTCATCCAAACCTTTATCTATCTCTTCTTCAGCACCATCTCTTTAC
TGTATGGGTTGTCGAGATATTCTGCTGACTTTCTCCGTTGCTCTCTTACTCATCTCCCTG
TTCCAGATCTGGCTTTTCCGGGAAGGACAAGTCCGGGAACGGTCAGAAGACAGCCAGGTT
GGAAAAGACGGGAATACCCTCGCCTCTAAGAACAAGAAGGACGATGATGTTCAACGTCTC
TTCCAAAGGTACTTCAAGGATCTAAACGATAGCAACAGTCGCTTTGAAGATTCCTACAGA
CAGATCCCTAGCTCCCCAGATCGCCTCCACAACTAGCTAGTTCCTTAAGTTTTTTTTCTA
TTCTTTTATTTTCTTCCAACTTTTCGACTCTTATTGTCCAAATTATCCTTGTTTTTTATC
TCACTTGTTTTTTTTTTTTTGAATAATATGTAAAATTTATTCAGAAAAAATATTTGTTAC
AGTCAAGAGCTACTTGAAAACAGAGAGATTATAAAAAACAGAGTGTTTTTCTCTTAAGCT
CTAACGAGTTGTAAGCCAGACTTGAAGAATGGCTCCATACCGTCGGATTCGTTTTGAGAT
CAACAAGAGGCATTGATTTCTAATCTGTCTGTCGATGACTTTGATCATAGCAGAAGTCAG
TGTTGGTGGAGCACCATGAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4FA16JQ 690 0 0
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CAGAGAGATTATAAAAAACAGAGTGTTTTTCTCTTAAGCTCTAACGAGTTGTAAGCCAGA
CTTGAAGAATGGCTCCATACCGTCGGATTCGTTTTGAGATCAACAAGAGGCATTGATTTT
TAATCTGTCTGTCGATGACTTTGATCATAGCAGAGGTCAGTGTTGGTGGAGCACCATGAC
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GATAGAGCTCTAACGTCGGAAAGGAGGGGTTTGATAAAAGTGCAGTGACATCTTGCCATC
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ATCTGCAATCAAAGAAAAGATGTTCTCTTGTTTCAAGTTGGTGTTGACACAAGATGCATC
CTGGATTTGTTACGTTTCCCCAGATGAGCATTCTGTCTCCAGTGGAAAGACGGTTATGCA
TGGCAAGCCAAGACATGAAACTGTACTTTGGTGTTGAGAAAGAGAACCACACGTTTTTGT
GCCAGTTTACTTGCGGTTTTGCAGTCCGTAGAAGAGACCATGTTCTTCTTGTATCAAATT
TGGCTTTAAAGATATCTGTGTTATGCTTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4FJ63JQ 682 0 0
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TTATAAAAAACAGAGTGTTTTTCTCTTAAGCTCTAACGAGTTGTAAGCCAGACTTGAAGA
ATGGCTCCATACCGTCGGATTCGTTTTGAGATCAACAAGAGGCATTGATTTCTAATCTGT
CTGTCGATGACTTTGATCATAGCAGAGGTCAGTGTTGGTGGAGCACCATGACGACGGTTA
TTTCGTTCTCTCCAAACTGAGTAGAGAGTCACTTGGAAGCTATATCGCAAGAGATAGAGC
TCTAACGTCGGAAAGGAGGGGTCTGATAAAAGTGCAGTGACATCTTGCCATCGGGATGAA
GATCGTGAGGGAAAGAGCTTGCAAGTCAGGTTTAGCCAAATCTCCTTGGAGTATCTGCAA
TCAAAGAAAAGATGTTCTCTTGTTTCAAGTTGGTGTTGACACAAGATGCATCCTGGATTT
GTTACGTTTCCCCAGATGAGCATTCTGTCTCCAGTGGAAAGACGGTTATGCATGGCAAGC
CAAGACATGAAACTGTACTTTGGTGTTGAGAAAGAGAACCACACGTTTTTGTGCCAGTTT
ACTTGCGGTTTTGCAGTCCGTAGAAGAGACCATGTTCTTCTTGTATCAAATTTGGCTTTA
AAGATATCTGTGTTATGCTTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

CO CL2527Contig1 634 4 2 U
GAAAAGAAAAATGCTTTGCATACTATTTTATTGATTGAAAGGTGAATCTAAAATGTACAA
ATGAGTATGCTTATATAGGGCACGACCTTAGACAGAGACCAAACGGATATAAAAAAAAAG
GAAGGAAACAAAAATAAAGATAAGGCTGCAATGGTGCTGGTCATGATCGAAATAGAGCCG
TTGGAGTGATATCTTTGGGATTTTGTCTTGGCTTGAGTTTATTTGAATCTGGACGGTTTA
AGAGGATAAGATAACTTCTTTGGGACCTTCCTGGGAGCTTGATAAGTGCTGATCTCGTCC
ATAAATTGAAAGGAATATAGCTGTTGGAGTTTGAATGCTTGAGACTCCAAATAAGGCAAG
TGTGGCCATAAATACATCCTCTTGATCATGTGGGTTCTGGTGCATGGTAAGAACGTATCT
GACTCTCCTGGATACTTGTATTGGTCTCCTGAATGGTTAGATGTCTCTCCTGGTCGCCGT
AGCTTGGTTTGGGATTGATTGAACCGGTGAGACTTCAAATAAGGGTGCAGAACTGGTTTG
ACCGGGTTAGGGAAATGGGCCATAACTCCATAATTCCAGGGACTTTTCTCCTTATTCTTG
GCTGGTTGGAAAGCTAAGAGATCCACCTTGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4B115TF C 1
AF RR4B115JQ U 2
AF RR4B184JQ U 2
AF RR4B184TF C 2
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BS 8 634 RR4B115JQ

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DS 

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GGAAAGCTAAGAGATCCACCTTGAAGC

QA 7 633 7 633
DS 

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GAAAAG
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GGAAAGCTAAGAGATCCACCTTGAAGC

QA 7 633 7 633
DS 



AS 1 4

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CACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTTACTGCCGT
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CACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGC
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ACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGC
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TAATTATTTATAAACTACATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F104TF U 1
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AF RR4C290JQ C 139
AF RR4C290TF U 430
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CACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTTACTGCCGT
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CACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGC
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CTGCTT

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DS 

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GGAACCGAAGTTACTGCCGTGGTCCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAG
TCTAAGGAGCTTCTTATTTGGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGGAAGAGAAG
ATCACGTTTATGTCACCAACCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTCATAGTC
CCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACC
GAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAG
GCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTGATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAATTAAGAGATACC
GAAATCTTTTGATATGTACAACATTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCAT
CTATTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCT
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QA 1 702 1 702
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CAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCACTATCAGTGAGAT
CTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACGTTTATGTCACCAA**ACACTCTCCAGGACTTT
CCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAA
GGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGGCTGC
CAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTTGCT
GCTTCTACAATTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACAACATTGAGAGTTAAGAGT
TTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGT
AATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAATTATTTATAAACT

QA 1 658 1 658
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ACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAA
GGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTAATCAAG
CTTCTTGCTGCTTCTACAATTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACAACATTGAGA
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TTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAATTATTT
ATAAACT

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DS 



AS 1 4

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CCTCTGCCGGTAACTCAGCTTCCACAATGGTCAAGTTCTTTTTTTTTACCATCTGATCCT
TTAACTTTCAACTTTTGTAATTTGACCACAAAATTCTTGAATTTGCATATAAATCCTTTT
GGTTTCACCTTAAACTTCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCCTCTTGTCAGC
AAAATTCATATCCACATCCAAACTCATATCCACATCCAGTCTCTGCAAATCCCCTCGCAA
CTCCTCCACACACAGCTCCCCCGTATACCACTCCCCCATACACAACTCCCCTGAACACGC
TTCACCCATCCACAACTCCCATGTCCACAACTCCTCTGAACACACTTCACCCATCCACAA
CTCCCATTTCCTGAGTTAATTCAGAAGTTATGACGATCTCAAGCTTTCTTGCTCTCTCTC
TCTCTCTATCTATTGGAGGAAGATAGATTTGACTACACTTTTTGTGGATGTGGATACAAG
TTTATGGATAAATTTATGTATACAAAAGCTTGTTCACAACTTTTTATTTTTCTGTTCATG
TATTCTCCATTTTTTATGTCCATATCCACAATCTTCGTTTTGTTTTAATTTACAAATTAA
CTTTTTGGTTTGTTTAGCTTTGTTTTTCAAAAATTTTGTTTTTTCTTTCCTAGACTTGTA
CCCATTGGTTTAAAGTTATCAGTTTGTTTATCTTTGAGATTGTGGATACATTGGCTGGTG
TCCATATCCATAGTTTTTCAATATATTAAAGTTTATTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FO27TF U 15
AF RR4H156TF U 1
AF RR4H156JQ C 819
AF RR4FO27JQ C 480
BS 1 48 RR4H156TF
BS 49 49 RR4FO27TF
BS 50 288 RR4H156TF
BS 289 289 RR4FO27TF
BS 290 596 RR4H156TF
BS 597 597 RR4FO27TF
BS 598 724 RR4H156TF
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BS 726 734 RR4H156TF
BS 735 1121 RR4FO27JQ

RD RR4FO27TF 664 0 0
GG
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AGAAGAAGATGTAGTCTTCTAAAGCCTTGCCGCATCACTAACAATTTTTCTGGGGGATCT
GGAAAAAAAAA*TGCTAAGATCTTGAAGAAGTGTTCGAGGGGTTTTGACGACAAGTTTGT
GGCTGCGTTCCAAGGATTCAAGGATGATTCATATATCGATTCAGATGATTTCCTCACCGA
TTCAAAACTATTTGTGTTCACCACAACTCAAAAATCCATCATCTCCTCTGCCGGTAACTC
AGCTTCCACAATGGTCAAGTTCTTTTTTTTTACCATCTGATCCTTTAACTTTCAGCTTTT
GTAATTTGACCACAAAATTCTTGAATTTGCATATAAATCCTTTTGGTTT*ACCTTAAACT
TCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCCTCTTGTCAGCAAAATTCATATCCACA
TCCAAACTCATATCCACATCCAGTCTCTGCAAATCCCCTCGCAACTCCTCCACACACAGC
TCCCCCGTATACCACTCCCCCATACACAACTCCCCTGAACACGCTTCACCCATCCACAAC
TC

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR4H156TF 734 0 0
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AGAAAATTCAAATCTGTTTGAGAGCTATAGCTTCTGAGATTAGTTGTCTTTTCTGGCTGA
GAGAAGAATGGTGATGAGAAGAAGATGTAGTCTTCTAAAGCCTTGCCGCATCACTAACAA
TTTTTCTGGGGGATCTGGAAAAAAAAAATGCTAAGATCTTGAAGAAGTGTTCGAGGGGTT
TTGACGACAAGTTTGTGGCTGCGTTCCAAGGATTCAAGGATGATTCATGTATCGATTCAG
ATGATTTCCTCACCGATTCAAAACTATTTGTGTTCACCACAACTCAAAAATCCATCATCT
CCTCTGCCGGTAACTCAGCTTCCACAATGGTCAAGTTCTTTTTTTTTACCATCTGATCCT
TTAACTTTCAACTTTTGTAATTTGACCACAAAATTCTTGAATTTGCATATAAATCCTTTT
GGTTTCACCTTAAACTTCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCCTCTTGTCAGC
AAAATTCATATCCACATCCAAACTCATATCCACATCCAGTCTCTGCAAATCCCCTCACAA
CTCCTCCACACACAGCTCCCCCGTATACCACTCCCCCATACACAACTCCCCTGAACACGC
TTCACCCATCCACAACTCCCATGTCCACAACTCCTCTGAACACACTTCACCCATCCACAA
CTCC*ATTTCCTGA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4H156JQ 152 0 0
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TTTGTTTTAATTTACAAATTAACTTTTTGGTT

QA 1 152 1 152
DS 

RD RR4FO27JQ 642 0 0
TTGGTTT
ACCTTAAACTTCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCCTCTTGTCAGCAAAATT
CATATCCACATCCAAACTCATATCCACATCCAGTCTCTGCAAATCCCCTCGCAACTCCTC
CACACACAGCTCCCCCGTATACCACTCCCCCATACACAACTCCCCTGAACACGCTTCACC
CATCCACAACTCCCATGTCCACAACTCCTCTGAACACACTTCACCCATCCACAACTCCCA
TTTCCTGAGTTAATTCAGAAGTTATGACGATCTCAAGCTTTCTTGCTCTCTCTCTCTCTC
TATCTATTGGAGGAAGATAGATTTGACTACACTTTTTGTGGATGTGGATACAAGTTTATG
GATAAATTTATGTATACAAAAGCTTGTTCACAACTTTTTATTTTTCTGTTCATGTATTCT
CCATTTTTTATGTCCATATCCACAATCTTCGTTTTGTTTTAATTTACAAATTAACTTTTT
GGTTTGTTTAGCTTTGTTTTTCAAAAATTTTGTTTTTTCTTTCCTAGACTTGTACCCATT
GGTTTAAAGTTATCAGTTTGTTTATCTTTGAGATTGTGGATACATTGGCTGGTGTCCATA
TCCATAGTTTTTCAATATATTAAAGTTTATTGTTT

QA 8 642 8 642
DS 



AS 1 4

CO CL2530Contig1 1122 4 7 U
GGATTCTCTGAGAACTGAGAAGCAAATCGCAGCGGACGACGGTTCTCGGCGTGTATAGGC
GTCGCGGTTTACTTTCTGTTAACGATCGGCTTCTCCTCGGTTACCTGATCACTCCCTCTG
TCTACTCTCTCTATCTTCAATCATCAGTCCATCGCTGTCATCTCTCTTTCAAGCTTCTCT
GAGTGTGAGTTGGTCAACAGCAGGATACTGTAGCAATACTGAACAAGATGGATCATGAAA
ATGGATATGGTGTGGAAGTCACTGGGCTATCTCCAGCCGTTACTGAGAAAGATCTCATCG
ACTTCTTCTCCTTCTCTGGTGCAATCCAACATATTGATATTGTCAGGTCGGGTGAGCAAG
CGTGCACTGCGTATGTGATGTTCAAGGATTCTTACTCTCAGGAAACTGCCGTCTTACTCA
GTGGGGCAACCATATTGGAGCAGCGAGTTTGCATAACTCGTTGGGGACAGCATCACGAGG
AGTTTGACTTCTGGAACGCCACTCAGCGGGGTTTTGTAGATGACACAAACTCACATCCTC
ATCCCCAACGAGGCGAGTTCAACGCCGGAGAAGCAGTGACAAAAGCTCAAGAAGTGGTGA
AGTCAATGCTAGCCACCGGATTCGTGCTGGGCAAAGACGCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCT
TTGACGAATCCCACGGTGTATCGGCTGCAGCAGCGGCTAGAGTATCTCAACTAGACCAGA
GGATCGGTCTCACTGACAAAATATTTGCCGGAGTTGAAGCTGTCAGACTGACCGACCAGA
AGTACCAGGTTTCAGACAAAGCAAAATCAGCCGTCTCTGCTACAGGAAGAACCACGGCAG
CAGCTGCAACTATTGTTGTCAATAGCAGTTACTTCTCCAGCGGAGCTCTCTGGCTATCGG
GTGCGTTAGAGCGTGCGGCTAAGGCTGCATCTGATCTTGGTAGCCGTGGCTCAAGGCAGT
GATGTGAATAG*ATACGAACTGATCAGAATCATATACATGCATTTATAAAAAAAACTCCC
GGCTTCGTACTTGTGTGCACCACCATCCAATAATTAGTTTACCCAATGACCCCTGATTTG
ATTTGTATGCAAAAATGTTATAAGAAGGGTGAATCTCCTGAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX53TF U 1
AF RR4CM93TF U 389
AF RR4CM93JQ C 389
AF RR4FX53JQ C 943
BS 1 598 RR4FX53TF
BS 599 599 RR4CM93TF
BS 600 667 RR4FX53TF
BS 668 668 RR4CM93TF
BS 669 709 RR4FX53TF
BS 710 992 RR4CM93TF
BS 993 1122 RR4CM93JQ

RD RR4FX53TF 716 0 0
GGATTCTCTGAGAACTGAGAAGCAAATCGCAGCGGACGACGGTTCTCGGCGTGTATAGGC
GTCGCGGTTTACTTTCTGTTAACGATCGGCTTCTCCTCGGTTACCTGATCACTCCCTCTG
TCTACTCTCTCTATCTTCAATCATCAGTCCATCGCTGTCATCTCTCTTTCAAGCTTCTCT
GAGTGTGAGTTGGTCAACAGCAGGATACTGTAGCAATACTGAACAAGATGGATCATGAAA
ATGGATATGGTGTGGAAGTCACTGGGCTATCTCCAGCCGTTACTGAGAAAGATCTCATCG
ACTTCTTCTCCTTCTCTGGTGCAATCCAACATATTGATATTGTCAGGTCGGGTGAGCAAG
CGTGCACTGCGTATGTGATGTTCAAGGATTCTTACTCTCAGGAAACTGCCGTCTTACTCA
GTGGGGCAACCATATTGGAGCAGCGAGTTTGCATAACTCGTTGGGGACAGCATCACGAGG
AGTTTGACTTCTGGAACGCCACTCAGCGGGGTTTTGTAGATGACACAAACTCACATCCTC
ATCCCCAACGAGGCGAGTTCAACGCCGGAGAAGCAGTGACAAAAGCTCAAGAAGTGGTTA
AGTCAATGCTAGCCACCGGATTCGTGCTGGGCAAAGACGCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCT
TTGACGA*TCCCACGGTGTATCGGCTGCAGCAGCGGCTAGAGTATCTCA
CTAGACC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4CM93TF 604 0 0
G
TCTTACTCTCAGGAAACTGCCGTCTTACTCAGTGGGGCAACCATATTGGAGCAGCGAGTT
TGCATAACTCGTTGGGGACAGCATCACGAGGAGTTTGACTTCTGGAACGCCACTCAGCGG
GGTTTTGTAGATGACACAAACTCACATCCTCATCCCCAACGAGGCGAGTTCAACGCCGGA
GAAGCAGTGACAAAAGCTCAAGAAGTGGTGAAGTCAATGCTAGCCACCGGATTCGTGCTG
GGCAAAGACGCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCTTTGACGAATCCCACGGTGTATCGGCTGCA
GCAGCGGCTAGAGTATCTCAACTAGACCAGAGGATCGGTCTCACTGACAAAATATTTGCC
GGAGTTGAAGCTGTCAGACTGACCGACCAGAAGTACCAGGTTTCAGACAAAGCAAAATCA
GCCGTCTCTGCTACAGGAAGAACCACGGCAGCAGCTGCAACTATTGTTGTCAATAGCAGT
TACTTCTCCAGCGGAGCTCTCTGGCTATCGGGTGCGTTAGAGCGTGCGGCTAAGGCTGCA
TCTGATCTTGGTAGCCGTGGCTCAAGGCAGTGATGTGAATAG*ATACGAACTGATCAGAA
TCA

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR4CM93JQ 734 0 0
G
TCTTACTCTCAGGAAACTGCCGTCTTACTCAGTGGGGCAACCATATTGGAGCAGCGAGTT
TGCATAACTCGTTGGGGACAGCATCACGAGGAGTTTGACTTCTGGAACGCCACTCAGCGG
GGTTTTGTAGATGACACAAACTCACATCCTCATCCCCAACGAGGCGAGTTCAACGCCGGA
GAAGCAGTGACAAAAGCTCAAGAAGTGGTGAAGTCAATGCTAGCCACCGGATTCGTGCTG
GGCAAAGACGCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCTTTGACGAATCCCACGGTGTATCGGCTGCA
GCAGCGGCTAGAGTATCTCAACTAGACCAGAGGATCGGTCTCACTGACAAAATATTTGCC
GGAGTTGAAGCTGTCAGACTGACCGACCAGAAGTACCAGGTTTCAGACAAAGCAAAATCA
GCCGTTTCTGCTACAGGAAGAACCACGGCAGCAGCTGCAACTATTGTTGTCAATAGCAGT
TACTTCTCCAGCGGAGCTCTCTGGCTATCGGGTGCGTTAGAGCGTGCGGCTAAGGCTGCA
TCTGATCTTGGTAGCCGTGGCTCAAGGCAGTGATGTGAATAG*ATACGAACTGATCAGAA
TCATATACATGCATTTATAAAAAAAACTCCCGGCTTCGTACTTGTGTGCACCACCATCCA
ATAATTAGTTTACCCAATGACCCCTGATTTGATTTGTATGCAAAAATGTTATAAGAAGGG
TGAATCTCCTGAC

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR4FX53JQ 148 0 0
CCGTGGC
CTCAAGGCAGTGATGTGAATAGGATACGAACTGATCAGAATCATATACATGCATTTATAA
AAAAAACTCCCGGCTTCGTACTTGTGTGCACCACCATCCAATAATTAGTTTACCCAATGA
CCCCTGATTTGATTTGTAT
AC

QA 8 146 8 146
DS 



AS 1 3

CO CL2531Contig1 613 3 6 U
GAGATGAAAACATAAGCACTTGTCTCCTTTATTGCAAGACAAAAACTCCAACGAATGAAT
GTGTTTTCTCGGTATTGATCCCTCACACTCTCAGACAAAAGCATCGGTTTTAGTTTGTTC
GTTTCGTTATTGTCAACAAAAGAAGAAGAGGAGAAGAGATGAATGAAGCCCTTAAGCTGC
TGCCTCTTTGGAGATCCTCTCTGCTTTAGCAACCACCTCATCGATGCCACCAACCATGTA
AAAGGACTGTTCAGGAAGATCATCATACTTACCATCAAGTAAACCCTGGAAACTGTTGAT
GTTTTCCTTAAGGTCAACGTATTTTCCAGGGGCACCCGTGAAGATCTCAGCAACATGGAA
TGGCTGACTCAAGAATCTCTGAATCTTACGGGCACGTGCAACAGTCAGCTTGTCATCTTC
ACTTAGCTCATCCATTCCCAAAATGGCAATAATATCTTGCAAGTTCTTGTAGTTCTGTAG
CACTTTCTGCACACCACGAGCAGTGTTGTAGTGCTCCTCACCCAGAATGTGAGGCGAGAG
CATACGGGATGTTGAATCCAAAGGATCCACGGCAGGATAGATACCAAGCTCGGAAATCTG
TCTTGACAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4D264JQ U 1
AF RR4AE52JQ U 24
AF RR4AE52TF C 24
BS 1 119 RR4D264JQ
BS 120 120 RR4AE52JQ
BS 121 196 RR4D264JQ
BS 197 197 RR4AE52JQ
BS 198 585 RR4D264JQ
BS 586 613 RR4AE52JQ

RD RR4D264JQ 585 0 0
GAGATGAAAACATAAGCACTTGTCTCCTTTATTGCAAGACAAAAACTCCAACGAATGAAT
GTGTTTTCTCGGTATTGATCCCTCACACTCTCAGACAAAAGCATCGGTTTTAGTTTGTTT
GTTTCGTTATTGTCAACAAAAGAAGAAGAGGAGAAGAGATGAATGAAGCCCTTAAGCTGC
TGCCTCTTTGGAGATCTTCTCTGCTTTAGCAACCACCTCATCGATGCCACCAACCATGTA
AAAGGACTGTTCAGGAAGATCATCATACTTACCATCAAGTAAACCCTGGAAACTGTTGAT
GTTTTCCTTAAGGTCAACGTATTTTCCAGGGGCACCCGTGAAGATCTCAGCAACATGGAA
TGGCTGACTCAAGAATCTCTGAATCTTACGGGCACGTGCAACAGTCAGCTTGTCATCTTC
ACTTAGCTCATCCATTCCCAAAATGGCAATAATATCTTGCAAGTTCTTGTAGTTCTGTAG
CACTTTCTGCACACCACGAGCAGTGTTGTAGTGCTCCTCACCCAGAATGTGAGGCGAGAG
CATACGGGATGTTGAATCCAAAGGATCCACGGCAGGATAGATACC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4AE52JQ 590 0 0
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CACACTCTCAGACAAAAGCATCGGTTTTAGTTTGTTCGTTTCGTTATTGTCAACAAAAGA
AGAAGAGGAGAAGAGATGAATGAAGCCCTTAAGCTGCTGCCTCTTTGGAGATCCTCTCTG
CTTTAGCAACCACCTCATCGATGCCACCAACCATGTAAAAGGACTGTTCAGGAAGATCAT
CATACTTACCATCAAGTAAACCCTGGAAACTGTTGATGTTTTCCTTAAGGTCAACGTATT
TTCCAGGGGCACCCGTGAAGATCTCAGCAACATGGAATGGCTGACTCAAGAATCTCTGAA
TCTTACGGGCACGTGCAACAGTCAGCTTGTCATCTTCACTTAGCTCATCCATTCCCAAAA
TGGCAATAATATCTTGCAAGTTCTTGTAGTTCTGTAGCACTTTCTGCACACCACGAGCAG
TGTTGTAGTGCTCCTCACCCAGAATGTGAGGCGAGAGCATACGGGATGTTGAATCCAAAG
GATCCACGGCAGGATAGATACCAAGCTCGGAAATCTGTCTTGACAGCACC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4AE52TF 590 0 0
CTCCTTTATTGCAAGACAAAAACTCCAACGAATGAATGTGTTTTCTCGGTATTGATCCCT
CACACTCTCAGACAAAAGCATCGGTTTTAGTTTGTTCGTTTCGTTATTGTCAACAAAAGA
AGAAGAGGAGAAGAGATGAATGAAGCCCTTAAGCTGCTGCCTCTTTGGAGATCCTCTCTG
CTTTAGCAACCACCTCATCGATGCCACCAACCATGTAAAAGGACTGTTCAGGAAGATCAT
CATACTTACCATCAAGTAAACCCTGGAAACTGTTGATGTTTTCCTTAAGGTCAACGTATT
TTCCAGGGGCACCCGTGAAGATCTCAGCAACATGGAATGGCTGACTCAAGAATCTCTGAA
TCTTACGGGCACGTGCAACAGTCAGCTTGTCATCTTCACTTAGCTCATCCATTCCCAAAA
TGGCAATAATATCTTGCAAGTTCTTGTAGTTCTGTAGCACTTTCTGCACACCACGAGCAG
TGTTGTAGTGCTCCTCACCCAGAATGTGAGGCGAGAGCATACGGGATGTTGAATCCAAAG
GATCCACGGCAGGATAGATACCAAGCTCGGAAATCTGTCTTGACAGCAC
C

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 4

CO CL2532Contig1 932 4 4 U
GGGAGTCAAGAGTGGAACCCTTGGAAGCAGAAAACTCCAAGCGTTCTCCCCGGCCAGGAA
ACACTCGAGCAGGGAAAGACTATCAGGTTTCTGGTACCAACAGTGAGAAGCAAGAGAGGC
GTCCAAGAAACAAGGAGAGACCTGATCGTGTTGTGTGGACTCCTCGTCGCTCTGATGGGT
CCAGTATCAGCGAGGATCAACTGTCATCTTCAATAGCAAACAATGGAGAAGTGAAAGAAA
GGATGTTGTTGCAAAGATCTGGAGAAGTGGTGAACTCCTCTGGTGGACATTCTCTTGAGA
ATGGTTCTACAAGACATTCTGGTCGCCGTGTTGGAGCTCGCAATAGAAAAGAAGAGGGCT
TTGCGATGACTGGTGAGGGTAAATCATCCCGGAGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTG
GTGGTGGTGGTCCCAATTCACATGAGAAGCAAATGTGGATCCAAAAATCATCATCGGGTA
CTTGATATATTCACTTAACATATGGCCTTATAAATCAGCCAATTCCAATGGATTTTGTTC
TTGACGGGAATCTATAGATCTCAACCGAAATGGAGAGTAACACTATCAACACACTCTGGT
TTTTGAGGACTTATGGTCCAACGTCGTAAGTCGTAGTATTGCGCATAAAAGAGGCCCTTC
TCACAGTAGGAATCAGCTCAAGATTTATGGGTTTTGAGATAAGAAAGACTCGGTTGCTAC
TGTCTTTGAAGGCTTTTAGCGATTCATGGTACCTACATCCCTTTTAGGCTTGTGCTGTGT
GGATGAGAAGTGACAATTACAATGAAATAAGTGTATAGGGAGCAGGAAATACTTTATCGG
GTTTTATTTTGTGTTCCTGAACGTGATTTGCAGTATTTACCCTTAAATAGTTTGATTACT
GTGAAGTAAATTGCTTGCTGTTTTCCTAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B247TF U 1
AF RR4B164TF U 451
AF RR4B164JQ C 284
AF RR4B247JQ C 296
BS 1 425 RR4B247TF
BS 426 450 RR4B164JQ
BS 451 625 RR4B164TF
BS 626 932 RR4B164JQ

RD RR4B247TF 425 0 0
GGGAGTCAAGAGTGGAACCCTTGGAAGCAGAAAACTCCAAGCGTTCTCCCCGGCCAGGAA
ACACTCGAGCAGGGAAAGACTATCAGGTTTCTGGTACCAACAGTGAGAAGCAAGAGAGGC
GTCCAAGAAACAAGGAGAGACCTGATCGTGTTGTGTGGACTCCTCGTCGCTCTGATGGGT
CCAGTATCAGCGAGGATCAACTGTCATCTTCAATAGCAAACAATGGAGAAGTGAAAGAAA
GGATGTTGTTGCAAAGATCTGGAGAAGTGGTGAACTCCTCTGGTGGACATTCTCTTGAGA
ATGGTTCTACAAGACATTCTGGTCGCCGTGTTGGAGCTCGCAATAGAAAAGAAGAGGGCT
TTGCGATGACTGGTGAGGGTAAATCATCCCGGAGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTG
GTGGT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4B164TF 175 0 0
AAATGTGGATCCAAAAATCATCATCGGGTACTTGATATATTCACTTAACATATGGCCTTA
TAAATCAGCCAATTCCAATGGATTTTGTTCTTGACGGGAATCTATAGATCTCAACCGAAA
TGGAGAGTAACACTATCAACACACTCTGGTTTTTGAGGACTTATGGTCCAACGTC

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR4B164JQ 649 0 0
TGGACATTCTCTTGAGAATGGTTCTACAAGACATTCTGGTCGCCGTGTTGGAGCTCGCAA
TAGAAAAGAAGAGGGCTTTGCGATGACTGGTGAGGGTAAATCATCCCGGAGAGGAGGTGG
TGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTCCCAATTCACATGAGAAGCAAATGTGGATCCA
AAAATCATCATCGGGTACTTGATATATTCACTTAACATATGGCCTTATAAATCAGCCAAT
TCCAATGGATTTTGTTCTTGACGGGAATCTATAGATCTCAACCGAAATGGAGAGTAACAC
TATCAACACACTCTGGTTTTTGAGGACTTATGGTCCAACGTCGTAAGTCGTAGTATTGCG
CATAAAAGAGGCCCTTCTCACAGTAGGAATCAGCTCAAGATTTATGGGTTTTGAGATAAG
AAAGACTCGGTTGCTACTGTCTTTGAAGGCTTTTAGCGATTCATGGTACCTACATCCCTT
TTAGGCTTGTGCTGTGTGGATGAGAAGTGACAATTACAATGAAATAAGTGTATAGGGAGC
AGGAAATACTTTATCGGGTTTTATTTTGTGTTCCTGAACGTGATTTGCAGTATTTACCCT
TAAATAGTTTGATTACTGTGAAGTAAATTGCTTGCTGTTTTCCTAAAAT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4B247JQ 637 0 0
TGAGAATGGTTCTACAAGACATTCTGGTCGCCGTGTTGGAGCTCGCAATAGAAAAGAAGA
GGGCTTTGCGATGACTGGTGAGGGTAAATCATCCCGGAGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGG
TGGTGGTGGTGGTGGTCCCAATTCACATGAGAAGCAAATGTGGATCCAAAAATCATCATC
GGGTACTTGATATATTCACTTAACATATGGCCTTATAAATCAGCCAATTCCAATGGATTT
TGTTCTTGACGGGAATCTATAGATTTCAACCGAAATGGAGAGTAACACTATCAACACACT
CTGGTTTTTGAGGACTTATGGTCCAACGTCGTAAGTCGTAGTATTGCGCATAAAAGAGGC
CCTTCTCACAGTAGGAATCAGCTCAAGATTTATGGGTTTTGAGATAAGAAAGACTCGGTT
GCTACTGTCTTTGAAGGCTTTTAGCGATTCATGGTACCTACATCCCTTTTAGGCTTGTGC
TGTGTGGATGAGAAGTGACAATTACAATGAAATAAGTGTATAGGGAGCAGGAAATACTTT
ATCGGGTTTTATTTTGTGTTCCTGAACGTGATTTGCAGTATTTACCCTTAAATAGTTTGA
TTACTGTGAAGTAAATTGCTTGCTGTTTTCCTAAAAT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL2533Contig1 966 3 2 U
GGACCGAACCAAAACACAATCTCTCTCTCTCTCCTCTAATCTCTAACCTCTCTCTCTATC
ATCTCAATGGAGAACTCGCCCAGATACAGAGATGCTGCAACGAATCTGATTCCATCTCCT
CGATGCCACAACAACAGCAGCTGCAGTATGAACAGCAGCACTGAGAGCAACAAACCACCC
ATAACTCCGACCCGACACGTAACCACCAGATCCGAATCTGGAAACCCGTACCCAACCACT
TTCGTCCAAGCGGATACCTCCTCATTCAAACAAGTCGTCCAAATGCTAACCGGATCCTCC
GACAGACCCAAACAACACAACACCTCCTCTCTTAAACCCAACCCGGCCCATCAACCCGAC
CCGAGATCCTCCCC*TTCCCAATTCTCAATCCCTGCAATCAAAGCCGTAAACAAGAAACA
GTCTTCTTCCTCCTCAGGGTTCCGTCTCTACGAACGCCGTAACTCGATGAAGAATCTCAA
AATCAACCCGTTAGACCCGGTTTTCAACCCGGTTTTCTCGCCCCGGAAACCCGAGATCCT
CTCTCCAAGCATCCTCGATTTCCCGTCTCTCGTTTTAAGCCCGGTCACTCCTCTTATACC
CGACCCGTTTAATCGATCCGGGTCATCGAGTCAAAGCCCCGACGATGCTGAGGAGAAAGC
GATGAAAGAGAAAGGCTTTTATTTGCATCCGTTTCCGGGGACAACTCCGATGGATTCAGA
GCCTCGTCTTCTTCCTCTGTTTCCGGTTACTTCTCCTCGAGTCTCAGGTTTTTCCACAGA
TTTTAGTTCTTGAATGAAACCAAACTCTAATTTTTTTAAATATCATTTCCTTTGTGATTT
TTATTTATATATTATAAATGGGAATTGAGATGAATCCTGATGAGAATTTGTTATATATGA
GAGGTTATTGTAATGCTGAGATGATATGTTTGCCAAAAGCCAACTGATACTATTTGAAAT
TGTACT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DM85TF U 1
AF RR4EA70TF U 1
AF RR4GK41JQ C 301
BS 1 671 RR4DM85TF
BS 672 966 RR4GK41JQ

RD RR4DM85TF 671 0 0
GGACCGAACCAAAACACAATCTCTCTCTCTCTCCTCTAATCTCTAACCTCTCTCTCTATC
ATCTCAATGGAGAACTCGCCCAGATACAGAGATGCTGCAACGAATCTGATTCCATCTCCT
CGATGCCACAACAACAGCAGCTGCAGTATGAACAGCAGCACTGAGAGCAACAAACCACCC
ATAACTCCGACCCGACACGTAACCACCAGATCCGAATCTGGAAACCCGTACCCAACCACT
TTCGTCCAAGCGGATACCTCCTCATTCAAACAAGTCGTCCAAATGCTAACCGGATCCTCC
GACAGACCCAAACAACACAACACCTCCTCTCTTAAACCCAACCCGGCCCATCAACCCGAC
CCGAGATCCTCCCC*TTCCCAATTCTCAATCCCTGCAATCAAAGCCGTAAACAAGAAACA
GTCTTCTTCCTCCTCAGGGTTCCGTCTCTACGAACGCCGTAACTCGATGAAGAATCTCAA
AATCAACCCGTTAGACCCGGTTTTCAACCCGGTTTTCTCGCCCCGGAAACCCGAGATCCT
CTCTCCAAGCATCCTCGATTTCCCGTCTCTCGTTTTAAGCCCGGTCACTCCTCTTATACC
CGACCCGTTTAATCGATCCGGGTCATCGAGTCAAAGCCCCGACGATGCTGAGGAGAAAGC
GATGAAAGAGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4EA70TF 663 0 0
G
GACCGAACCAAAACACAATCTCTCTCTCTCTCCTCTAATCTCTAATCTCTCTCTCTATCA
TCTCAATGGAGAACTCGCCCAGATACAGAGATGCTGCAACGAATCTGATTCCATCTCCTC
GATGCCACAACAACAGCAGCTGCAGTATGAACAGCAGCACTGAGAGCAACAAACCACCCA
TAACTCCGACCCGACACGTAACCACCAGATCCGAATCTGGAAACCCGTACCCAACCACTT
TCGTCCAAGCGGATACCTCTTCATTCAAACAAGTCGTCCAGATGCTAACCGGATCCTCCG
ACAGACCCAAACAACACAACACCTCCTCTCTTAAACCCAACCCGGCCCATCAACCCGACC
CGAGATCCTCCCC*TTCCCAATTCTCAATCCCTGCAATCAAAGCCGTAAACAAGAAACAG
TCTTCTTCCTCCTCAGGGTTCCGTCTCTACGAACACCGTAACTCGATGAAGAATCTCAAA
ATCAACCCGTTAGACCCGGTTTTCAACCCGGTTTTCTCGCCCCGGAAACCCGAGATCCTC
TCTCCAAGCATCCTCGATTTCCCGTCTCTCGTTTTAAGCCCGGTCACTCCTCTTATACCC
GACCCGTTTAATCGATCCGGGTCATCGAGTCAAAGCCCCGACGATGCTGAG*AGAAAGCG
AT

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4GK41JQ 666 0 0
GACAGACCCAAACAACACAACACCTCCTCTCTTAAACCCAACCCGGCCCATCAACCCGAC
CCGAGATCCTCCCCCTTCCCAATTCTCAATCCCTGCAATCAAAGCCGTAAACAAGAAACA
GTCTTCTTCCTCCTCAGGGTTCCGTCTCTACGAACGCCGTAACTCGATGAAGAATCTCAA
AATCAACCCGTTAGACCCGGTTTTCAACCCGGTTTTCTCGCCCCGGAAACCCGAGATCCT
CTCTCCAAGCATCCTCGATTTCCCGTCTCTCGTTTTAAGCCCGGTCACTCCTCTTATACC
CGACCCGTTTAATCGATCCGGGTCATCGAGTCAAAGCCCCGACGATGCTGAGGAGAAAGC
GATGTAAGAGAAAGGCTTTTATTTGCATCCGTTTCCGGGGACAACTCCGATGGATTCAGA
GCCTCGTCTTCTTCCTCTGTTTCCGGTTACTTCTCCTCGAGTCTCAGGTTTTTCCACAGA
TTTTAGTTCTTGAATGAAACCAAACTCTAATTTTTTTAAATATCATTTCCTTTGTGATTT
TTATTTATATATTATAAATGGGAATTGAGATGAATCCTGATGAGAATTTGTTATATATGA
GAGGTTATTGTAATGCTGAGATGATATGTTTGCCAAAAGCCAACTGATACTATTTGAAAT
TGTACT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

CO CL2534Contig1 1197 4 5 U
GTCTCCTCAGCACGGTCATAGGCTCCTTCATAGGATACTTGGTGGTTCTCGTCTGCCGAC
CTCCTCCGGAGTTCACTAGAGTCACCATCGTCATGACTGCCTTCGGCAATACCGGGAACC
TCTTGCTGGCTATCGTCAGCTCAGTTTGTCACTCCAAGAACAACCCGTTCGGGCCGGGTT
GTCACTCGAGAGGGGTCTCTTACGTGTCGTTCGCTCAGTGGGTGGCTGTGATACTTGTGT
ACACCGTTGTGTATCATATGATGGAGCCGCCTCTGGAGTACTACGAGGTTGTTGAGGGTG
AAAGTGAGATAGAGGAGATCAACGTCGGTTCTAACGATGTTAGCAGGCCGCTTCTAGTCG
AAGCCGAGTGGCCGGGGATCGAGGAGAAAGAGACAGAACATTGCAAGACTCCGTTCATCG
CGAGAGTCTTCAATAGTATCTCGAGTTACTCGCAGAGTTCATTCCCTGAAGTTGTTGACT
TCATGGGTGTAACAGGAGGAGAGAGTTCGAGCCCGAGGTCGCTTCAGTGCTTAGCTGAGC
CGAGAGTTATAAGGAGGATGAGAGTCGTGGCTGAACAGACTCCAGTCAAACACATACTCC
AACCACCGACGATAGCTTCTCTACTCGCCATCGTCGTCGGATCAGTACCACAGCTGAAGA
AGATCGTTTTCGGTTACGAAGCTCCGCTCTCTTTCATTACCGATAGTTTGAACATTATGG
CTAGCGCCATGGTTCCTTCGGTGATGCTTGTACTCGGCGGTATGCTCTCCGAGGGACCGA
GAGAGTCAACTCTCGGGTTGCGTACGACGATTGGGATCACCGTTGCGAGACTCTTGGTGC
TTCCTCTAGTTGGGATAGGGATCGTGATGTCAGCTGATAAGCTTGGTCTTATTTCTCAGG
ATCCGATGTTTAAGTTTGTGCTGCTTTTGCAGTATTCGACTCCGAGTGCTATTTTGCTTG
GAGCTATAGCGAGTCTGAGGGGTTATGCGGTTAGAGAGGCCTCTGCGCTTCTGTTCTGGC
AGCATGTCTTTGCGTTGTTGTCTCTTACGTTCTATATTATCATCTTCTTCAAGCTCACCG
TTGATAATGTCCAAGGTATCCCATAAGATACAAAAGCTCTCTTGTAAACAGTGTGATGGA
TTGGTTTTTTCATCTGTGTGTGTTGGTGAATAAGGTGACCCCACTTGAAAACTCCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR53TF U 1
AF RR4E935TF U 1
AF RR4DR53JQ C 479
AF RR4E935JQ C 510
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BS 181 194 RR4DR53TF
BS 195 731 RR4E935TF
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GTCACTCGAGAGGG

QA 1 194 1 194
DS 

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TCTTGCTGGCTATCGTCAGCTCAGTTTGTCACTCCAAGAACAACCCGTTCGGGCCGGGTT
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ACACCGTTGTGTATCATATGATGGAGCCGCCTCTGGAGTACTACGAGGTTGTTGAGGGTG
AAAGTGAGATAGAGGAGATCAACGTCGGTTCTAACGATGTTAGCAGGCCGCTTCTAGTCG
AAGCCGAGTGGCCGGGGATCGAGGAGAAAGAGACAGAACATTGCAAGACTCCGTTCATCG
CGAGAGTCTTCAATAGTATCTCGAGTTACTCGCAGAGTTCATTCCCTGAAGTTGTTGACT
TCATGGGTGTAACAGGAGGAGAGAGTTCGAGCCCGAGGTCGCTTCAGTGCTTAGCTGAGC
CGAGAGTTATAAGGAGGATGAGAGTCGTGGCTGAACAGACTCCAGTCAAACACATACTCC
AACCACCGACGATAGCTTCTCTACTCGCCATCGTCGTCGGATCAGTACCACAGCTGAAGA
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CTAGCGCCATG

QA 1 731 1 731
DS 

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GCCGAGAGTTATAAGGAGGATGAGAGTCGTGGCTGAACAGACTCCAGTCAAACACATACT
CCAACCACCGACGATAGCTTCTCTACTCGCCATCGTCGTCGGATCAGTACCACAGCTGAA
GAAGATCGTTTTCGGTTACGAAGCTCCGCTCTCTTTCATTACCGATAGTTTGAACATTAT
GGCTAGCGCCATGGTTCCTTCGGTGATGCTTGTACTCGGCGGTATGCTCTCCGAGGGACC
GAGAGAGTCAACTCTCGGGTTGCGTACGACGATTGGGATCACCGTTGCGAGACTCTTGGT
GCTTCCTCTAGTTGGGATAGGGATCGTGATGTCAGCTGATAAGCTTGGTCTTATTTCTCA
GGATCCGATGTTTAAGTTTGTGCTGCTTTTGCAGTATTCGACTCCGAGTGCTATTTTGCT
TGGAGCTATAGCGAGTCTGAGGGGTTATGCGGTTAGAGAGGCCTCTGCGCTTCTGTTCTG
GCAGCATGTCTTTGCGTTGTTGTCTCTTACGTTCTATATTATCATCTTCTTCAAGCTCAC
CGTTGATAATGTCCAAGGTATCCCATAAGATACAAAAGCTCTCTTGTAAACAGTGTGATG
GATTGGTTTTTTCATCTGTGTGTGTTGGTGAATAAGGTGACCCCACTTGAAAACTCCTT

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DS 

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GCTGAACAGACTCCAGTCAAACACATACTCCAACCACCGACGATAGCTTCTCTACTCGCC
ATCGTCGTCGGATCAGTACCACAGCTGAAGAAGATCGTTTTCGGTTACGAAGCTCCGCTC
TCTTTCATTACCGATAGTTTGAACATTATGGCTAGCGCCATGGTTCCTTCGGTGATGCTT
GTACTCGGCGGTATGCTCTCCGAGGGACCGAGAGAGTCAACTCTCGGGTTGCGTACGACG
ATTGGGATCACCGTTGCGAGACTCTTGGTGCTTCCTCTAGTTGGGATAGGGATCGTGATG
TCAGCTGATAAGCTTGGTCTTATTTCTCAGGATCCGATGTTTAAGTTTGTGCTGCTTTTG
CAGTATTCGACTCCGAGTGCTATTTTGCTTGGAGCTATAGCGAGTCTGAGGGGTTATGCG
GTTAGAGAGGCCTCTGCGCTTCTGTTCTGGCAGCATGTCTTTGCGTTGTTGTCTCTTACG
TTCTATATTATCATCTTCTTCAAGCTCACCGTTGATAATGTCCAAGGTATCCCATAAGAT
ACAAAAGCTCTCTTGTAAACAGTGTGATGGATTGGTTTTTTCATCTGTGTGTGTTGGTGA
ATAAGGTGACCCCACTTGAAAA

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

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AAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCGTAACTTTGAATATT
TGTGAAAGCTCTGTTCTTTCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTG
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCAAAGAGTATTTGTGTTACTTTCCTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
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AF RR4C154JQ C 1
AF RR4DU15JQ C 1
AF RR4C154TF U 1
AF RR4DU15TF U 1
BS 1 54 RR4C154TF
BS 55 55 RR4DU15TF
BS 56 412 RR4C154TF

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AAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTTTAAGCTGTCGTAACTTTGAATATT
TGTGAAAGCTCTGTTCTTTTTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTG
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCAAAGAGTATTTGTGTTACTTTCCTCT

QA 1 412 1 412
DS 

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AACAGGCCGATCCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAATACCATCAGGTACAACGCA
AAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTTTAAGCTGTCGTAACTTTGAATATT
TGTGAAAGCTCTGTTCTTTTTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTG
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCAAAGAGTATTTGTGTT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4C154TF 412 0 0
GGAGATTTAGGGTTTCTCTCTGTTGTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCGCAGTGCTTC
AAGATGCCGTCGCACAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAAATGAGGCAG
AACAGGCCGATCCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAATACCATCAGGTACAACGCA
AAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCGTAACTTTGAATATT
TGTGAAAGCTCTGTTCTTTCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTG
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCAAAGAGTATTTGTGTTACTTTCCTCT

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4DU15TF 402 0 0
GGAGATTTAGGGTTTCTCTCTGTTGTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCGCAGGGCTTC
AAGATGCCGTCGCACAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAAATGAGGCAG
AACAGGCCGATCCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAATACCATCAGGTACAACGCA
AAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCGTAACTTTGAATATT
TGTGAAAGCTCTGTTCTTTCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTG
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCAAAGAGTATTTGTGTT

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 4

CO CL2536Contig1 633 4 2 U
TTTTTTTCCACATGAATATCATTGTTTATGTTCCTCAAACAACCCAAAAAAACCCCTAAA
ATGTCACAACAACAGAGGATGATCTACCAGGCAAGAATTTCTACAATTATAGCAAATACA
TTGCAAGAACCTGAGAGCTCTGCTCTCCATCTGAGGCAATCTCGGCGATGTTCCTTGTCT
TTAAGAAAATGGGATATGTTTAGCCCTTACTCTTGTTTCTTGAGTGTCGTGTCAGTACTT
GGGACTCCTGATGTCAGTTTCTTCACACTATCTTTGGCCTCTGCGACAAACGAAGCGTCT
GGCTTATGTTTATCTGCAGGTTCTTTCAGGGCCAGACAGATGTAGAACACAATCACTACA
TTGACTGATACCACAGCAAGAAATCCACTCACTAGTGTTAGAGAATGTGGAGACAATAAT
GTTGTTGAACCAGGAAGCAAATCATTGTTGAATCCGTATAGTATCAAAACAGGAAGAATC
CACATGAACACTGATGCAACTAGGAACTTCTGCATAACCCCAGCCATTGTGTACCACTAA
CAATCCACATCAAAAATCATCAAACCCAGAAATCAAAAGATGATCTAGTGGTAAAATGAA
CCTTTAAACCCCACAAAGTAAGCTAACGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DL03TF C 1
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AF RR4DL90JQ U 8
AF RR4DL90TF C 8
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GGGACTCCTGATGTCAGTTTCTTCACACTATCTTTGGCCTCTGCGACAAACGAAGCGTCT
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GTTGTTGAACCAGGAAGCAAATCATTGTTGAATCCGTATAGTATCAAAACAGGAAGAATC
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CCTTTAAACCCCACAAAGTAAGCTAACGAAAAA

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QA 1 626 1 626
DS 

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ACCCCACAAAGTAAGCTAACGAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 

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CTGATGTCAGTTTCTTCACACTATCTTTGGCCTCTGCGACAAACGAAGCGTCTGGCTTAT
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CATCAAAAATCATCAAACCCAGAAATCAAAAGATGATCTAGTGGTAAAATGAACCTTTAA
ACCCCACAAAGTAAGCTAACGAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 3

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CATTTCAATCCCTAAATGTAGCAAGGTTTCCCAGAAGACACTCAAGTCTTGCAGATTCCT
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ACTATTTATATTACTTAAAACGGATCTTTTGTTGGTGAGTTTGATCACATTTGACTCTCA
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TGTGTTGTTGCAGTTATCTGCTCCGAGCCTACTGGATTGTTGTACCCCATCTGCAGAGTA
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ACATTCTGTTCATTGCCTTCCCATCCTCCTCCTCCTCCCATATGATGGCTTCTCACACCA
ATCATATCATCCAGCTTCATCGCCAATGCTCTATTGGTTTCAAGCAACATTTGCTCTTTG
CTTTGAAGATCAGAGAGCTGATCAAGCATGTACTGTGTCTTGATGGAGCGAACTTGCTTG
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TCCTCCCCAAGAAGATTCCTTTGTTGGCGCTGAAGGCTCTCATACCTACCCTTAGGCTTC
AGATACTCTCTGTAGCTATTCTCAAGTTCTTTGGCAGGTTTGTTGTTGACTTCAATAGAA
CCATAACTGCATTTCTGGTACCGTTCCAGTGTCTTGATCATGTTAGAGGAGCTGCAAAAC
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GACAATTCGTAAGCTTTCTTCAACAATCCGTTCCTACGCTTCGCAAACGTTACTTGTCGG
TTGATCTTGTTCTCTATCCTCTTCAGCTCTACTCTTCCCCTTCCCATTTTTCTTTTTTTT
CCTCTTTTACACACTCAAATATATGGATATATGTGACGTTTATCTATATTCAGACACACA
CAAAAAACACGAGTTGGGTATCTCTTTTTTCTGAGGAAAGATCTGAATTTTTAAGGTCCG
GAGAAGTGAAGGAAAAAAAAGTAATTAACCCTAATTTCAAGAACAAGAAACCTGTAAGGA
AGAAGAAGAAAGAAAGAAACTTTAGAGTTTAGGGTTCTTGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FB50JQ U 1
AF RR4DX15JQ U 259
AF RR4FB50TF C 483
BS 1 393 RR4FB50JQ
BS 394 394 RR4DX15JQ
BS 395 553 RR4FB50JQ
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RD RR4FB50JQ 553 0 0
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TAGGACAATATACATAGCCACTTAATTATATAAATAAATCCAAGTCTTGTGTTCTATACT
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TGTGTTGTTGCAGTTATCTGCTCCGAGCCTACTGGATTGTTGTACCCCATCTGCAGAGTA
GGATTGCATTCAAGAGGCTGGAATAGTCCTTGAGACTGAGCTTGATGATGCTCGTACGAA
ACATTCTGTTCATTGCCTTCCCATCCTCCTCCTCCTCCCATATGATGGCTTCTCACACCA
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CTTTGAAGATCAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4DX15JQ 362 0 0
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TGCTCCGAGCCTACTGGATTGTTGTACCCCATCTGCAGAGTAGGATTGCATTCAAGAGGC
TGGAATAGTCCTTGAAACTGAGCTTGATGATGCTCGTACGAAACATTCTGTTCATTGCCT
TCCCATCCTCCTCCTCCTCCCATATGATGGCTTCTCACACCAATCATATCATCCAGCTTC
ATCGCCAATGCTCTATTGGTTTCAAGCAACATTTGCTCTTTGCTTTGAAGATCAGAGAGC
TGATCAAGCATGTACTGTGTCTTGATGGAGCGAACTTGCTTGAGAGAGCCATCTAGTTGA
CG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR4FB50TF 765 0 0
CATATCATCCAGCTTCATCGCCAATGCTCTATTG*TTTCAAGCAACATTTGCTCTT*GCT
TTGAAGATCAGAGAGCTGATCAAGCATGTACTGTGTCTTGATGGAGCGAACTTGCTTGAG
AGAGCCATCTAGTTGACGCTCAAGCTGCTCTAGTTCCTTTGAGTTGAGAGGTCCTAAATC
CTCCCCAAGAAGATTCCTTTGTTGGCGCTGAAGGCTCTCATACCTACCCTTAGGCTTCAG
ATACTCTCTGTAGCTATTCTCAAGTTCTTTGGCAGGTTTGTTGTTGACTTCAATAGAACC
ATAACTGCATTTCTGGTACCGTTCCAGTGTCTTGATCATGTTAGAGGAGCTGCAAAACTC
ATAGAGCTTGCCACGGTTGGAGAAGATGATGAGAGCCACCTCAGCATCGCAAAGAACAGA
CAATTCGTAAGCTTTCTTCAACAATCCGTTCCTACGCTTCGCAAACGTTACTTGTCGGTT
GATCTTGTTCTCTATCCTCTTCAGCTCTACTCTTCCCCTTCCCATTTTTCTTTTTTTTCC
TCTTTTACACACTCAAATATATGGATATATGTGACGTTTATCTATATTCAGACACACACA
AAAAACACGAGTTGGGTATCTCTTTTTTCTGAGGAAAGATCTGAATTTTTAAGGTCCGGA
GAAGTGAAGGAAAAAAAAGTAATTAACCCTAATTTCAAGAACAAGAAACCTGTAAGGAAG
AAGAAGAAAGAAAGAAACTTTAGAGTTTAGGGTTCTTGTTTTTCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 4

CO CL2538Contig1 629 4 18 U
GGGATCTCTCTCTCTCTCATTTCGCGTTTGTAACTCAGTGGAGAAGGAAATATCCAAATC
GATCCGTTTAAAAAAAAGGGATTTCGAATTTTTCCGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGC
GACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATATAGGTTT
AAGATGTATGTCTGAGGACGTCGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCTAACCCCGA
GAAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTGCGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCT
ACACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACGAA
CGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTG
AGAAGAATCACAGGCTATTGTCATGTTTTTTTAATTTGTAATCTCTTAATAAAGCAAAAT
GTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTCTACCACTTTTTTTGTTGTCATCACCATTTAT
TTTTTCCTCTCAAATGTTTTCAAAGACAAGGAAATGACTCTCACTGTTTGAAGGTGCTTT
AATCAGCGCAGAATGAATTTCCGGATAAA


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ33TF U 2
AF RR4F453JQ C 1
AF RR4F849TF U 2
AF RR4F453TF U 1
BS 1 1 RR4F453JQ
BS 2 41 RR4BJ33TF
BS 42 42 RR4F849TF
BS 43 76 RR4BJ33TF
BS 77 77 RR4F453TF
BS 78 196 RR4BJ33TF
BS 197 197 RR4F453TF
BS 198 439 RR4BJ33TF
BS 440 440 RR4F453TF
BS 441 496 RR4BJ33TF
BS 497 497 RR4F849TF
BS 498 512 RR4BJ33TF
BS 513 513 RR4F453TF
BS 514 594 RR4BJ33TF
BS 595 595 RR4F849TF
BS 596 596 RR4F453TF
BS 597 623 RR4F849TF
BS 624 629 RR4F453TF

RD RR4BJ33TF 593 0 0
GGATCTCTCTCTCTCTCATTTCGCGTTTGTAACTCAGTGGGGAAGGAAATATCCAAATCG
ATCCGTTTAAAAAAA*GGGATTTCGAATTTTTCCGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGCG
ACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATATAGGTTTA
AGATGTATGTCTGAGAACGTCGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCTAACCCCGAG
AAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTGCGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTA
CACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACGAAC
GAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTGA
GAAGAATCACAGGCTATTCTCATGTTTTTTTAATTTGTAATCTCTTAATAAAGCAAAATG
TTCATTTTTGAATGAACTTTACTCTCTCTACTACTTTTTTTGTTGTCATCACCATTTATT
TTTTCCTCTCAAATGTTTTCAAAGACAAGGAAATGACTCTCACTGTTTGAAGG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4F453JQ 626 0 0
GGGATCTCTCTCTCTCTCATTTCGCGTTTGTAACTCAGTGGAGAAGGAAATATCCAAATC
GATCCGTTTAAAAAAAAGGGATTTCGAATTTTTCCGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGC
GACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATATAGGTTT
AAGATGTATGTCTGAGGACGTCGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCTAACCCCGA
GAAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTGCGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCT
ACACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACGAA
CGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTG
AGAAGAATCACAGGCTATTGTCATGTTTTTTTAATTTGTAATCTCTTAATAAAGCAAAAT
GTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTCTACCACTTTTTTTGTTGTCATCACCATTTAT
TTTTTCCTCTCAAATGTTTTCAAAGACAAGGAAATGACTCTCACTGTTTGAAGGTGCTTT
AATCAGCGCAGAATGAATTTCCG
GAT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4F849TF 622 0 0
GGATCTCTCTCTCTCTCATTTCGCGTTTGTAACTCAGTGGAGAAGGAAGTATCCAAATCG
ATCCGTTTAAAAAAA*GGGATTTCGAATTTTTCCGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGCG
ACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATATAGGTTTA
AGATGTATGTCTGAGAACGTCGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCTAACCCCGAG
AAGTGTCTCGACCAGGGTCGTGACGTCACTCGCTGCGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTA
CACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACGAAC
GAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTGA
GAAGAATCACAGGCTATTCTCATGTTTTTTTAATTTGTAATCTCTTAATAAAGCAAAATG
TTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTCTACTACTTTTTTTGTTGTCATCACCATTTATT
TTTTCCTCTCAAATGTTTTCAAAGACAAGGAAATGACTCTCACTGTTTGAAGGTTCTTTA
ATCAGCGCAGAATGAATTTCCG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4F453TF 629 0 0
G
GGATCTCTCTCTCTCTCATTTCGCGTTTGTAACTCAGTGGAGAAGGAAATATCCAAATCG
ATCCGTTTAAAAAAAAGGGATTTCGAATTTTTCCGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGCG
ACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATATAGGTTTA
AGATGTATGTCTGAGGACGTCGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCTAACCCCGAG
AAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTGCGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTA
CACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACGAAC
GAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTGA
GAAGAATCACAGGCTATTGTCATGTTTTTTTAATTTGTAATCTCTTAATAAAGCAAAATG
TTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTCTACCACTTTTTTTGTTGTCATCACCATTTATT
TTTTCCTCTCAAATGTTTTCAAAGACAAGGAAATGACTCTCACTGTTTGAAGGTGCTTTA
ATCAGCGCAGAATGAATTTCCGGATAAA

QA 2 629 2 629
DS 



AS 1 4

CO CL2539Contig1 1004 4 11 U
GGATGCACCTGCGTTGCATGAGTCTGACATTGGACTCGCCATGGGAATAGCTGGAACAGA
GGTGGCGAAGGAGAACGCTGATGTGATCATAATGGACGACAACTTTGCAACGATTGTGAA
CGTGGCGAAATGGGGACGTGCTGTGTATATAAACATCCAGAAGTTTGTTCAGTTCCAGCT
CACTGTTAATGTTGTTGCGCTGATCATCAACTTTGTATCTGCTTGCATCACTGGATCTGC
ACCACTCACGGCGGTGCAGTTGCTTTGGGTGAACATGATCATGGACACGCTAGGTGCATT
GGCTCTAGCGACAGAACCTCCAAACGAAGGTTTGATGAAACGTCAACCAATCGGTAGAAC
CGCAAGCTTCATCACTAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGTCAAAGCATTTATCAGTT
GATCGTCCTCGGTGTTCTCAACTTTTATGGGAAGCAAATACTCAGCCTCAACGGTCCAGA
CTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTCAACTCCTTCGTCTTTTGCCAGGTGTTTAA
CGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAACGTGTTTGCAGGAATGTTCAGCAGTTG
GGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGGTTTCAAGTGATCATTGTTGAGTTGCT
TGGTGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTTTCTGCTCCGCATTGTGAT
TGGAGCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATGCATACCGGTTGAGTCCAACAG
TCATCATGACGGCTATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGACTCTGCCTGATCTGACCT
ACTTCCTTACTACGGTTGCTACATCCATTTTCTATATCGGATTCTTTTTCTACTTAGTGA
TCTGATTTCAATATGTATAAAATCTAACACGCACGCCAAGCGTTACTAGAAGATTTTTTT
TTTTTTGTTTGGATTGATTTCCTTTTTGATTTCTTAAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN29TF U 1
AF RR4F939TF U 69
AF RR4AN29JQ C 223
AF RR4D458TF U 396
BS 1 135 RR4AN29TF
BS 136 136 RR4F939TF
BS 137 216 RR4AN29TF
BS 217 217 RR4F939TF
BS 218 854 RR4AN29TF
BS 855 855 RR4F939TF
BS 856 856 RR4AN29TF
BS 857 857 RR4D458TF
BS 858 880 RR4AN29TF
BS 881 881 RR4AN29JQ
BS 882 1004 RR4D458TF

RD RR4AN29TF 884 0 0
GGATGCACCTGCGTTGCATGAGTCTGACATTGGACTCGCCATGGGAATAGCTGGAACAGA
GGTGGCGAAGGAGAACGCTGATGTGATCATAATGGACGACAACTTTGCAACGATTGTGAA
CGTGGCGAAATGGGGGCGTGCTGTGTATATAAACATCCAGAAGTTTGTTCAGTTCCAGCT
CACTGTTAATGTTGTTGCGCTGATCATCAACTTTGTGTCTGCTTGCATCACTGGATCTGC
ACCACTCACGGCGGTGCAGTTGCTTTGGGTGAACATGATCATGGACACGCTAGGTGCATT
GGCTCTAGCGACAGAACCTCCAAACGAAGGTTTGATGAAACGTCAACCAATCGGTAGAAC
CGCAAGCTTCATCACTAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGTCAAAGCATTTATCAGTT
GATCGTCCTCGGTGTTCTCAACTTTTATGGGAAGCAAATACTCAGCCTCAACGGTCCAGA
CTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTCAACTCCTTCGTCTTTTGCCAGGTGTTTAA
CGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAACGTGTTTGCAGGAATGTTCAGCAGTTG
GGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGGTTTCAAGTGATCATTGTTGAGTTGCT
TGGTGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTTTCTGCTCCGCATTGTGAT
TGGAGCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATGCATACCGGTTGAGTCCAACAG
TCATCATGACGGCTATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGACTCTGCCTGATCTGACCT
ACTTCCTTACTACGTT*GCTACATCCATTTTCTATATCGG
ATTC

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR4F939TF 795 0 0
G
GGAGAACGCTGATGTGATCATAATGGACGACAACTTTGCAACGATTGTGAACGTGGCGAA
ATGGGGACGTGCTGTGTATATAAACATCCAGAAGTTTGTTCAGTTCCAGCTTACTGTTAA
TGTTGTTGCGCTGATCATCAACTTTGTATCTGCTTGCATCACTGGATCTGCACCACTCAC
GGCGGTGCAGTTGCTTTGGGTGAACATGATCATGGACACGCTAGGTGCATTGGCTCTAGC
GACAGAACCTCCAAACGAAGGTTTGATGAAGCGTCAACCAATAGGTAGAACCGCAAGCTT
CATCACTAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGTCAAAGCATTTACCAGTTGATCGTCCT
CGGTGTTCTCAACTTTTATGGGAAGCAAATACTCAGCCTCAACGGTCCAGACTCAACAGC
CGTTCTCAACACCATCATCTTCAACTCCTTCGTCTTTTGCCAGGTGTTTAACGAGGTGAA
CAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAACGTGTTTGCAGGAATGTTCAGCAGTTGGGTGTTTGT
TGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGGTTTCAAGTGATCATTGTTGAGTTGCTTGGTGCATT
TGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTTTCTGCTCTGCATTGTGATTGGAGCCAT
AAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATGCATACCGGTTGAGTCCAACAGTCGTCATGA
CGGCTATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGACTCTGC*TGATCTGAC*TACTTCCTTA
CTACGGT
GCTACAT

QA 2 788 2 788
DS 

RD RR4AN29JQ 751 0 0
TTGCATCACTGGATCTGCACCACTCACGGCGGTGCAGTTGCTTTGGGTGAACATGATCAT
GGACACGCTAGGTGCATTGGCTCTAGCGACAGAACCTCCAAACGAAGGTTTGATGAAACG
TCAACCAATCGGTAGAACCGCAAGCTTCATCACTAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGG
TCAAAGCATTTATCAGTTGATCGTCCTCGGTGTTCTCAACTTTTATGGGAAGCAAATACT
CAGCCTCAACGGTCCAGACTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATTTTCAACTCCTTCGT
CTTTTGCCAGGTGTTTAACGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAACGTGTTTGC
AGGAATGTTCAGCAGTTGGGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGGTTTCAAGT
GATCATTGTTGAGTTGCTTGGTGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTT
TTTGCTCCGCATTGTGATTGGAGCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTTTTAAATGCAT
ACCGGTTGAGTCCAACAGTCATCATGACGGCTATGAGCTGCTTCCTTTTGGTCCATCTGA
CTCTGCCTGATTTGACCTACTTCCTTACTACGGTTGCTACATCCATTTTCTATATCGGAT
TCTTTTTCTACTTAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATTTAACACGCACGCCAAGCG
TTACTAGAAGATTTTTTTTTTTTT
TTGTTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4D458TF 609 0 0
G
CATTGGTCAAAGCATTTACCAGTTGATCGTCCTCGGTGTTCTCAACTTTTATGGGAAGCA
AATACTCAGCCTCAACGTTCCAGACTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTCAACTC
CTTCGTCTTTTGCCAGGTGTTTAACGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAACGT
GTTTGCAGGAATGTTCAGCAGTTGGGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGGTT
TCAAGTGATCATTGTTGAGTTGCTTGGTGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCA
ACATTTTCTGCTCTGCATTGTGATTGGAGCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAA
ATGCATACCGGTTGAGTCCAACAGTCATCATGACGGCTATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCC
ATCTGACTCTGCCTGATCTGACCTACTTCCTTACTACGGTTGCTACATCCATTTTCTATA
TCGGGTTCTTTTTCTACTTAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATCTAACACGCACGC
CAAGCGTTACTAGAAGATTTTTTTTTTTTTGTTTGGATTGATTTCCTTTTTGATTTCTTA
AAGAAAAA

QA 2 609 2 609
DS 



AS 1 2

CO CL2540Contig1 844 2 5 U
GTTTTCGAAAAGCTTTGCATTGCAAGATGTTATCCAAACTGTCAAACAACCGAGAGTTAA
CCAACTCGAATTAAACATACAAACCAGTCACAGGTTCATTACTGGTGGTGATAAGTGAAA
TCTAACTGGCCTAAGCTGATTTCGCTGTTTCACGAACAACGGCCAACTTAGCAAGAAGAC
CACATAGCTGGAGGTATGATCCAACTCCATCACAGATTCTCATATGAGCAAACCCAGTCT
CCTTCATGAACTCAAGTTTCAGATACTCAGCCATATCATAATTTTTTATTATACGGAAAA
GCGTTGTGATAATGTCGGTGGGAGAGTAGCCTAGATCGTATAGCTGCTTCATGCCGTGAC
AAGCATCGTCGAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGCGGGT
GAGGCTGGTCACAGACCTTGAAGACGTTTTCTCGATTGACAAAGCGGAACCCACTGAATG
TGGCTTGCAAGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATCGCCT
CAAGGCCTTCAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGGCCAA
GTATGTCCTGATCAGATAACCTAGAGAATCGAACTAAAGCGCATCTACTCTGGATAGGCT
CAATAATCTTGCCGGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTCTGAGTAGATCT
CAATCGTTCTCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGACGTCATGCTGTCAGCTTCATCAAGAA
TGACAACCTTATGGCGCCCAGGAGGAAGTGTGACTTTCTTCTGAGCAAACATCTTAATCT
TGTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DZ77JQ U 6
AF RR4AS55JQ U 1
BS 1 360 RR4AS55JQ
BS 361 361 RR4DZ77JQ
BS 362 441 RR4AS55JQ
BS 442 442 RR4DZ77JQ
BS 443 844 RR4AS55JQ

RD RR4DZ77JQ 818 0 0
CGAAAAGCTTTGCATTGCAAGATGTTATCCAAACTGTCAAACAACCGAGAGTTAACCAAC
TCGAATTAAACATACAAACCAGTCACAGGTTCATTACTGGTGGTGATAAGTGAAATCTAA
CTGGCCTAAGCTGATTTCGCTGTTTCACGAACAACGGCCAACTTAGCAAGAAGACCACAT
AGCTGGAGGTATGATCCAACTCCATCACAGATTCTCATATGAGCAAACCCAGTCTCCTTC
ATGAACTCAAGTTTCAGATACTCAGCCATATCATAATTTTTTATTATACGGAAAAGCGTT
GTGATAATGTCGGTGGGAGAGTAGCCTAGATCGTATAGCTGCTTCATGCCGTGACAAGCA
TCGTCGAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGCGGGTGAGGC
TGGTCACAGACCTTGAAGACGTTTTCTTGATTGACAAAGCGGGACCCACTGAATGTGGCT
TGCAAGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATCGCCTCAAGG
CCTTCAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGGCCAAGTATG
TCCTGATCAGATAACCTAGAGAATCGAACTAAAGCGCATCTACTCTGGATAGGCTCAATA
ATCTTGCCGGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTTTGAGTAGATCTCAATC
GTTCTCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGACGTCATGCTGTCAGCTTCATCAAGAATGACA
ACCTTATGGCGCCCAGGAGGAAGTGTGACTTTCTTCTG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AS55JQ 844 0 0
GTTTTCGAAAAGCTTTGCATTGCAAGATGTTATCCAAACTGTCAAACAACCGAGAGTTAA
CCAACTCGAATTAAACATACAAACCAGTCACAGGTTCATTACTGGTGGTGATAAGTGAAA
TCTAACTGGCCTAAGCTGATTTCGCTGTTTCACGAACAACGGCCAACTTAGCAAGAAGAC
CACATAGCTGGAGGTATGATCCAACTCCATCACAGATTCTCATATGAGCAAACCCAGTCT
CCTTCATGAACTCAAGTTTCAGATACTCAGCCATATCATAATTTTTTATTATACGGAAAA
GCGTTGTGATAATGTCGGTGGGAGAGTAGCCTAGATCGTATAGCTGCTTCATGCCGTGAC
GAGCATCGTCGAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGCGGGT
GAGGCTGGTCACAGACCTTGAGGACGTTTTCTCGATTGACAAAGCGGAACCCACTGAATG
TGGCTTGCAAGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATCGCCT
CAAGGCCTTCAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGGCCAA
GTATGTCCTGATCAGATAACCTAGAGAATCGAACTAAAGCGCATCTACTCTGGATAGGCT
CAATAATCTTGCCGGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTCTGAGTAGATCT
CAATCGTTCTCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGACGTCATGCTGTCAGCTTCATCAAGAA
TGACAACCTTATGGCGCCCAGGAGGAAGTGTGACTTTCTTCTGAGCAAACATCTTAATCT
TGTT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 4

CO CL2541Contig1 1090 4 11 U
GGAAATAATTAGCTATATATTTTTGATTAGGAAAATTGCAATAAAACAGAACCAAGAATT
CCCGCGTAAATAAAACAAAGCTCTCTCATCTTTAACCAACTCACTCATCAAACTAACAAA
AAAAAAACTAACAGATTTTCAACAGTAACAACGAAAAGGACACGTGAGTTTTCTCAAGAA
ATAGTTTTACCGAAAGCACATAGATTGAATTTTAATAGCCTCTTTTCTCCACTTCTCATG
GTGCCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGTTTGCCATC
TTCTGCAACGATATCCACTACGGTTCCCGTTTGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTT
CATGGCTTCAACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCTGCACTTTATCTCCAACCTTGATAAA
GGGTGGTTCGCCAGGTCCAGGACTACGGTAGAAAGTGCCCGCCATGGGGCTCTTAACAGT
AGGAAGCGACGATTTCGCTGGAGCAGGTGGAGGCAAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGC
TGGTGAGGCAGCAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGCCACAGACTGCACATAAGACGATTGGTT
TGGTTGCTGCTGCATCATAACATATTGTGCAGGGGACTCGGGTTGCGGCAAAGCTTCCTT
TTTCCGAATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGTTTCAACTGCAACTCGACGATGTCCCTCGA
ATCAACAAGCTTGACAAGAGTCGTTACTTGGGTGAGAAACTCAGAGATAGACTCTTCTGT
AGCTAAATCATTTGATGAAGAAGCTGGAGGAGCATTTGATGAGGCACTGCTAACAACCTG
GTTAGATTGGGCTTTCACCACAGGGTAGCTACTGCGACTAGGCTTGGAGAGAAAGCGGAG
CTTAGGCTTGGGGGAGAGACGGACGGAAACTCTGCGAGGGCGGGAGGTTGGTGGGAGAGG
TAAGTGTGATGATGTTTGGGTGACGACGGAAGCAGCCGGAGACGTGACGGAGAGCGAAGA
AGACGCCATTCTTCACTTCTTCTTGTTTGGTTGCAGATCGGGTTTAGGTCTCTCTCACTC
CAGCGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D731JQ U 25
AF RR4FX03JQ U 1
AF RR4FX03TF C 332
AF RR4D731TF C 395
BS 1 61 RR4FX03JQ
BS 62 63 RR4D731JQ
BS 64 77 RR4FX03JQ
BS 78 78 RR4D731JQ
BS 79 126 RR4FX03JQ
BS 127 127 RR4D731JQ
BS 128 155 RR4FX03JQ
BS 156 156 RR4D731JQ
BS 157 754 RR4FX03JQ
BS 755 1034 RR4FX03TF
BS 1035 1090 RR4D731TF

RD RR4D731JQ 402 0 0
GATTAGGAAAATTGCAATAAAACAGAACCAAGAATTCCCGCGTAAATAAAACAAAGCTCT
CTCATCTTTAACCAACTCACTCATCAAACTAACAAAAAAAAAACTAACAGATTTTCAACA
GTAACAACGAAAAGGACACGTGAGTTTTCTCAAGAAATAGTTTTACCGAAAGCACGTAGA
TTGAATTTTAATAGCCTCTTTTCTCCACTTCTCATGGTGCCGATTCTACGGTTGAACCAC
AAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGTTTGCCATCTTCTGCAACGATATCCACTACGGT
TCCCGTTTGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGATTCAACGATGCATAGAAC
TTGCCCCTTCTGCACTTTATCTCCAACCTTGATAAAGGGTGG

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4FX03JQ 754 0 0
GGAAATAATTAGCTATATATTTTTGATTAGGAAAATTGCAATAAAACAGAACCAAGAATT
CGTGCGTAAATAAAACAGAGCTCTCTCATCTTTAACCAACTCACTCATCAAACTAACAAA
AAAAAA*CTAACAGATTTTCAACAGTAACAACGAAGAGGACACGTGAGTTTTCTCAAGAA
ATAGTTTTACCGAAAGCACATAGATTGAATTTTAATAGCCTCTTTTCTCCACTTCTCATG
GTGCCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGTTTGCCATC
TTCTGCAACGATATCCACTACGGTTCCCGTTTGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTT
CATGGCTTCAACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCTGCACTTTATCTCCAACCTTGATAAA
GGGTGGTTCGCCAGGTCCAGGACTACGGTAGAAAGTGCCCGCCATGGGGCTCTTAACAGT
AGGAAGCGACGATTTCGCTGGAGCAGGTGGAGGCAAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGC
TGGTGAGGCAGCAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGCCACAGACTGCACATAAGACGATTGGTT
TGGTTGCTGCTGCATCATAACATATTGTGCAGGGGACTCGGGTTGCGGCAAAGCTTCCTT
TTTCCGAATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGTTTCAACTGCAACTCGACGATGTCCCTCGA
ATCAACAAGCTTGACAAGAGTCGTTACTTGGGTG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4FX03TF 705 0 0
TGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGCTTCAACGATGCATAGAACTTGCCCC
TTCTGCACTTTATCTCCAACCTTGATAAAGGGTGGTTCGCCAGGTCCAGGACTACGGTAG
AAAGTGCCCGCCATGGGGCTCTTAACAGTAGGAAGCGACGATTTCGCTGGAGCAGGTGGA
GGCAAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGCTGGTGAGGCAGCAGAAGGAGGAGGAGGAGGA
GCCACAGACTGCACATAAGACGATTGGTTTGGTTGCTGCTGCATCATAACATATTGTGCA
GGGGACTCGGGTTGCGGCAAAGCTTCCTTTTTCCGAATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGT
TTCAACTGCAACTCGACGATGTCCCTCGAATCAACAAGCTTGACAAGAGTCGTTACTTGG
GTGAGAAACTCAGAGATAGACTCTTCTGTAGCTAAATCATTTGATGAAGAAGCTGGAGGA
GCATTTGATGAGGCACTGCTAACAACCTGGTTAGATTGGGCTTTCACCACAGGGTAGCTA
CTGCGACTAGGCTTGGAGAGAAAGCGGAGCTTAGGCTTGGGGGAGAGACGGACGGAAACT
CTGCGAGGGCGGGAGGTTGGTGGGAGAGGTAAGTGTGATGATGTTTGGGTGACGACGGAA
GCAGCCGGAGACGTGACGGAGAGCGAAGAAGACGCCATTCTTC
CC

QA 1 703 1 703
DS 

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TGCACTTTATCTCCAAC*TTGATAAAGGGTGGTTCGCCAGGTCCAGGACTACGGTAGAAA
GTGCCCGCCATGGGGCTCTTAACAGTAGGAAGCGACGATTTCGATGGAGCAGGTGGAGGC
AAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGCTGGTGAGGCAGCAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGCC
ACAGACTGCACATAAGACGATTGGTTTGGCTGCTGCTGCATCATAACATATTGTGCAGGG
GACTCGGGTTGCGGCAAAGCTTCCTTTTTCCGAATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGTTTC
AACTGCAACTCGACGATGTCCCTCGAATCAACAAGCTTGACAAGAGTCGTTACTTGGGTG
AGAAACTCAGAGATAGACTCTTCTGTAGCTAAATCATTTGATGAAGAAGCTGGAGGAGCA
TTTGATGAGGCACTGCTAACAACCTGGTTAGATTGGGCTTTCACCACAGGGTAGCTACTG
CGACTAGGCTTGGAGAGAAAGCGGAGCTTAGGCTTGGGGGAGAGACGGACGGAAACTCTG
CGAGGGCGGGAGGTTGGTGGGAGAGGTAAGTGTGATGATGTTTGGGTGACGACGGAAGCA
GCCGGAGACGTGACGGAGAGCGAAGAAGACGCCATTCTTCACTTCTTCTTGTTTGGTTGC
AGATCGGGTTTAGGTCTCTCTCACTCCAGCGAGCCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

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GGACATCCACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAAAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGT
ATATTGCATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTCGTTCTCGTGCTTTCCGATATGGATACAGC
CATGGGTGAACCAAATCAGCTCCGCAACCGCAAACTTATTTCGTTCTCTCTCTCGAGATT
CGAGGAACAATTCCCGAAGCTGAAGGGATTGATTGAAAAGCGCGAATGGGTGAAAAAGCC
CCTGGACTTGTTGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGATTGCGACAAAAAAGA
CGACGCATGTAAAAGGTTATTGGAATTTGGAAAAGGCCAATGACTTGTTGAAGGCAAAAT
CCCCTCCATCGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCAAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTT
GATGAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATTTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAA
ATAAAAGATATTATGATGATATGTTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTAAGACTGCTTTAT
TTAAATTTCCTTATAAATTATATAATCCCTATGCATCCTCTCTAATGTTATGTAGCAGTG
TGAGTAAAGCATATTAACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CJ93JQ C 5
AF RR4CJ93TF U 5
AF RR4D106TF U 1
AF RR4D106JQ C 173
BS 1 621 RR4D106TF

RD RR4CJ93JQ 571 0 0
GG
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ACAATTCCCGAAGCTGAAGGGATTGATTGAAAAGCGCGAATGGGTGAAAAAGCCCCTGGA
CTTGTTGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGATTGCGACAAAAAAGACGACGC
ATGTAAAAGGTTATTGGAATTTGGAAAAGGCCAATGACTTGTTGAAGGCAAAATCCCCTC
CATTGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCAAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTTGATGAA
AAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATTTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAA
GATATTATGATGATATGTTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTAAGACTGCTTTATTTAAAT
TTCCTTATAAATTATATAATCCCTA
AAGG

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR4CJ93TF 571 0 0
GG
CCACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAAAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATATTG
CATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTCGTTCTCGTGCTTTCCGATATGGATACAGCCATGGG
TGAACCAAATCAGCTCCGCAACCGCAAACTTATTTCGTTCTCTCTCTCGAGATTCGAGGA
ACAATTCCCGAAGCTGAAGGGATTGATTGAAAAGCGCGAATGGGTGAAAAAGCCCCTGGA
CTTGTTGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGATTGCGACAAAAAAGACGACGC
ATGTAAAAGGTTATTGGAATTTGGAAAAGGCCAATGACTTGTTGAAGGCAAAATCCCCTC
CATTGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCAAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTTGATGAA
AAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATTTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAA
GATATTATGATGATATGTTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTAAGACTGCTTTATTTAAAT
TTCCTTATAAATTATATAATCCCTA
AAGG

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR4D106TF 621 0 0
GGACATCCACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAAAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGT
ATATTGCATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTCGTTCTCGTGCTTTCCGATATGGATACAGC
CATGGGTGAACCAAATCAGCTCCGCAACCGCAAACTTATTTCGTTCTCTCTCTCGAGATT
CGAGGAACAATTCCCGAAGCTGAAGGGATTGATTGAAAAGCGCGAATGGGTGAAAAAGCC
CCTGGACTTGTTGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGATTGCGACAAAAAAGA
CGACGCATGTAAAAGGTTATTGGAATTTGGAAAAGGCCAATGACTTGTTGAAGGCAAAAT
CCCCTCCATCGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCAAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTT
GATGAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATTTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAA
ATAAAAGATATTATGATGATATGTTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTAAGACTGCTTTAT
TTAAATTTCCTTATAAATTATATAATCCCTATGCATCCTCTCTAATGTTATGTAGCAGTG
TGAGTAAAGCATATTAACTGC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4D106JQ 449 0 0
TCGAGATTCGAGGAACAATTCCCGAAGCTGAAGGGATTGATTGAAAAGCGCGAATGGGTG
AAAAAGCCCCTGGACTTGTTGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGATTGCGAC
AAAAAAGACGACGCATGTAAAAGGTTATTGGAATTTGGAAAAGGCCAATGACTTGTTGAA
GGCAAAATCCCCTCCATCGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCAAAAAACATATGATTCCACA
AATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATTTAATTCTGAAAATTT
CTTGCAAAATAAAAGATATTATGATGATATGTTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTAAGAC
TGCTTTATTTAAATTTCCTTATAAATTATATAATCCCTATGCATCCTCTCTAATGTTATG
TAGCAGTGTGAGTAAAGCATATTAACTGC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 4

CO CL2543Contig1 802 4 2 U
GGATACTTAGCAAAAGCTAATTCTCTCAACCTCTCGGAAATTGCAGAGATGAAAATTGTC
TACCGTGGTGGTGCTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTC
TTGCTGCGATGTCTTGATCTTGAGCGTTTTGTGCTTTATGTTATAAAGGAGTTTGAACCT
TTGATACAAAAGCCTTACTCGATTGTGTATTTCCACTCTGCAGCATCTTTACAAGTCCAG
CCAGATTTAGGATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGAAAACACTAGCGTAAC
CTTCAGGCAATATATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAAGCAACAATCGTAGCAATG
CAGTTGTTCGTTGATAATGTGGTTTGGAAGAAAGTTGTATATGCGGACAGGCTTCTGCAG
CTGTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGAT
CTTGAAGTTAACGGAGGGAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACCAAGTATGTGTATCAA
CGGCCATGAATCAAAACCTCATCCCAAAAGTCTTGAAAAATATGATCAAGACAGTTTTTT
ACTTTATCCAGTCAATTGTATGATGTGTTGCTGCTTTTTGTGCAAATATTTGTTTATTCT
TTTATGTTTGATCTAAGTAAGACTTTTTCTTACCCTTTTTGTGTTTGATGCTGGGAGCAA
AATAAAACCCTCTCTTAGCTTTTGATGTATTCTAGTGTTTGAATCTTGTTAATAGTTACA
GCGAAAGACTTCTCTTTTCCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DV92TF U 1
AF RR4DO12TF U 1
AF RR4DV92JQ C 106
AF RR4DO12JQ C 147
BS 1 673 RR4DO12TF
BS 674 802 RR4DV92JQ

RD RR4DV92TF 623 0 0
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CCAGATTTAGGATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGAAAACACTAGCGTAAC
CTTCAGGCAATATATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAAGCAACAATCGTAGCAATG
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CTGTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGAT
CTTGAAGTTAACGGAGGGAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACCAAGTATGTGTATCAA
CGGCCATGAATCAAAACCTCATCCCAAAAGTCTTGAAAAATATGATCAAGACAGTTTTTT
ACTTTATCCAGTCAATTGTATGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4DO12TF 673 0 0
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TACCGTGGTGGTGCTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTC
TTGCTGCGATGTCTTGATCTTGAGCGTTTTGTGCTTTATGTTATAAAGGAGTTTGAACCT
TTGATACAAAAGCCTTACTCGATTGTGTATTTCCACTCTGCAGCATCTTTACAAGTCCAG
CCAGATTTAGGATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGAAAACACTAGCGTAAC
CTTCAGGCAATATATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAAGCAACAATCGTAGCAATG
CAGTTGTTCGTTGATAATGTGGTTTGGAAGAAAGTTGTATATGCGGACAGGCTTCTGCAG
CTGTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGAT
CTTGAAGTTAACGGAGGGAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACCAAGTATGTGTATCAA
CGGCCATGAATCAAAACCTCATCCCAAAAGTCTTGAAAAATATGATCAAGACAGTTTTTT
ACTTTATCCAGTCAATTGTATGATGTGTTGCTGCTTTTTGTGCAAATATTTGTTTATTCT
TTTATGTTTGATC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4DV92JQ 697 0 0
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TCTTTACAAGTCCAGCCAGATTTAGGATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGA
AAACACTAGCGTAACCTTCAGGCAATATATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAAGCA
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GACAGGCTTCTGCAGCTGTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTT
GTTTTCCAGCATGATCTTGAAGTTAACGGAGGGAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACC
AAGTATGTGTATCAACGGCCATGAATCAAAACCTCATCCCAAAAGTCTTGAAAAATATGA
TCAAGACAGTTTTTTACTTTATCCAGTCAATTGTATGATGTGTTGCTGCTTTTTGTGCAA
ATATTTGTTTATTCTTTTATGTTTGATCTAAGTAAGACTTTTTCTTACCCTTTTTGTGTT
TGATGCTGGGAGCAAAATAAAACCCTCTCTTAGCTTTTGATGTATTCTAGTGTTTGAATC
TTGTTAATAGTTACAGCGAAAGACTTCTCTTTTCCCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DO12JQ 656 0 0
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GTATTTCCACTCTGCAGCATCTTTACAAGTCCAGCCAGATTTAGGATGGATGAAAAGATT
ACAACAGATACTTGGTCGAAAACACTAGCGTAACCTTCAGGCAATATATGTTCTTCATCC
AACTTTCCACTTGAAAGCAACAATCGTAGCAATGCAGTTGTTCGTTGATAATGTGGTTTG
GAAGAAAGTTGTATATGCGGACAGGCTTCTGCAGCTGTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCA
GCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCTTGAAGTTAACGGAGGGAAAGGTCT
AATCGTTGACCCAAGAACCAAGTATGTGTATCAACGGCCATGAATCAAAACCTCATCCCA
AAAGTCTTGAAAAATATGATCAAGACAGTTTTTTACTTTATCCAGTCAATTGTATGATGT
GTTGCTGCTTTTTGTGCAAATATTTGTTTATTCTTTTATGTTTGATCTAAGTAAGACTTT
TTCTTACCCTTTTTGTGTTTGATGCTGGGAGCAAAATAAAACCCTCTCTTAGCTTTTGAT
GTATTCTAGTGTTTGAATCTTGTTAATAGTTACAGCGAAAGACTTCTCTTTTCCCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 4

CO CL2544Contig1 884 4 12 U
GGACCACATATTTTCTATATAAACGATCTTCGATGCTTCACCATGAACAACAAACAATTC
TTTTCTCTTATCAATCTAGCAAAAATGAATTCTTCTATAGCTCAAGAAGAGTCTAAGTTA
TTAGATACACCTGCAACTGACCCTTCTCCTGTAGCTCAAGAAGAGCCTCAGTTAGTAGAC
ACAGCTGCTATAGTCCCTTCTCCGATAGCACAGGAGCCTGACAACGATGTGCCAGCACCG
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AGGATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGGTCGGGTACACTCAAGGGATCTCACATAATCCT
ACATACAAGGTTGTCCGCACGAACAAAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTTCAGTAT
GATCCCAATGAGTGCAGCTATGAGACCCTGCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCC
ACCTCCTTGAATCGTCAGGGAGAGCTTGTGGGAGCTCAACACCGATCAGGGATATACTTC
TATACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAGTCTCTTGAGAATCAGCAGAAAAAGCTT
GAGGAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGTGAAGAAGTTCTACAAAGCCGAAGAATAC
CATCAGCATTACCTCGTCAAAGGTGGCATGTATGGCAATGCACAATCTCCTGCAAAGAGC
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AAAACAGAGGAGTGTTCTCTGTTTGTATGTATGTATGTTTGTGTTGTTGATTTGTAATTC
TCAGCTCATAATAAAGATGTGGAAATATTATTACAACTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ05TF U 1
AF RR4FT08TF U 51
AF RR4FT08JQ C 66
AF RR4FZ05JQ C 244
BS 1 327 RR4FZ05TF
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BS 520 520 RR4FT08TF
BS 521 682 RR4FZ05TF
BS 683 683 RR4FT08TF
BS 684 720 RR4FZ05TF
BS 721 726 RR4FT08TF
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BS 742 879 RR4FT08JQ
BS 880 884 RR4FZ05JQ

RD RR4FZ05TF 720 0 0
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TTTTCTCTTATCAATCTAGCAAAAATGAATTCTTCTATAGCTCAAGAAGAGTCTAAGTTA
TTAGATACACCTGCAACTGACCCTTCTCCTGTAGCTCAAGAAGAGCCTCAGTTAGTAGAC
ACAGCTGCTATAGTCCCTTCTCCGATAGCACAGGAGCCTGACAACGATGTGCCAGCACCG
GGAAGCCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGATGCTTCTGGGGACTGGAGCTTGCTTTCCAG
AGGATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGTTCGGGTACACTCAAGGGATCTCACATAATCCT
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GATCCCAATGAGTGCAGCTATGAGACCCTGCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCC
ACCTCCTTGAATCGTCAGGGAGAGCTTGTGGGAGCTCAATACCGATCAGGGATATACTTC
TATACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAGTCTCTTGAGAATCAGCAGAAAAAGCTT
GAGGAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGTGAAGAAGTTCTACAAAGCCGAAGAATAC
CATCAGCATTACCTCGTCAAAG*TGGCATGTATGGCAATGCACAATCTCCTGCAAAGAGC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4FT08TF 691 0 0
G
AAACAATTCTTTTCTCTTATCAATCTAGCAAAAATGAATTCTTCTATAGCTCAAGAAGAG
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TTAGTAGACACAGCTGCTATAGTCCCTTCTCCGATAGCACAGGAGCCTGACAACGATGTG
CCAGCACCGGGAAGCCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGATGCTTCTGGGGACTGGAGCTT
GCTTTCCAGAGGATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGGTCGGGTACACTCAAGGGATCTCA
CATAATCCTACATACAAGGTTGTCCGCACGAACAAAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGG
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ATATACTTCTATACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAGTCTCTTGAGAATCAGCAG
AAAAAGCTTGAGGAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGTGAAGAAGTTCTACAAAGCC
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GTAAAGAGCTGCAAG*ACCCTATCCGTTGC

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4FT08JQ 814 0 0
TCTCTTATCATCTAGC
AAAATGAATTCTTCTATAGCTCAAGAAGAGTCTAAGTTATTAGATACAC*TGCAACTGAC
CTTTCTCCTGTAGCTCAAGAAGAGCCTCAGTTAGTAGACACAGCTGCTATAGTCCCTTCT
CCGATAGCACAGGAGCCTGACAACGATGTGCCAGCACCGGGAAGCCAGTTTGCTGAGTTC
GCCGCTGGATGCTTCTGGGGACTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGGGTGATCGAG
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GAGACCCTGCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCTCCTTGAATCGTCAGGGA
GAGCTTGTGGGAGCTCAACACCGATCAGGGATATACTTCTATACACCAGAGCAAGAGAAG
CTAGCACGTGAGTCTCTTGAGAATCAGCAGAAAAAGCTTGAGGAGAAGATTGTGACTGAG
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TTTGTATGTATGTATGTTTGTGTTGTTGATTTGTAATTCTCAGCTCATAATAAAGATGTG
GAAATATTATTACAACTT

QA 17 814 17 814
DS 

RD RR4FZ05JQ 641 0 0
AGCCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGATGCTTCTGGGGACTGGAGCTTGCTTTCCAGAGG
ATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGTTCGGGTACACTCAAGGGATCTCACATAATCCTACA
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CCCAATGAGTGCAGCTATGAGACCCTGCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACC
TCCTTGAATCGTCAGGGAGAGCTTGTGGGAGCTCAATACCGATCAGGGATATACTTCTAT
ACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAGTCTCTTGAGAATCAGCAGAAAAAGCTTGAG
GAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGTGAAGAAGTTCTACAAAGCCGAAGAATACCAT
CAGCATTACCTCGTCAAAGGTGGCATGTATGGCAATGCACAATCTCCTGCAAAGAGCTGC
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ACAGAGGAGTGTTCTCTGTTTGTATGTATGTATGTTTGTGTTGTTGATTTGTAATTCTCA
GCTCATAATAAAGATGTGGAAATATTATTACAACTTCTTCC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 4

CO CL2545Contig1 1194 4 16 U
GGGAACTTGTTGTGTTAAATCATCTCTCTCAACAAAACAGAGAGAAAATCACTATAAATC
TTTAATTTTATTTGAAAAACCAATGGCGGATCGGATTAAAGGTCCATGGAGTCCTGAAGA
AGACGAGCAGCTTCGTAGGCTCGTTGTTAAATACGGTCCGAGAAACTGGACAGTGATTAG
CAAATCAATCCCCGGTAGATCGGGAAAATCGTGTCGGTTACGGTGGTGCAACCAGCTTTC
GCCGCAGGTCGAGCACCGGCCGTTCTCGGCGGAGGAAGACGAGACGATCGCGCGCGCGCA
CGCTCAGTTCGGTAACAAATGGGCCACGATAGCCCGTCTCCTCAACGGCCGTACGGACAA
CGCCGTGAAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAAGAGGAAATGCGGTGGTTTCGACCACCG
TTACGAGGCTCCGGCGGAGGGGGAGGAGGAGGAGGATCGAAGGCCGGCGAAGAGATCGGT
GAGCGACGGATGTCCACCAGTTGCTACTGGGCTTTATATGAGCCCAGGAAGCCCAACTGG
ATCTGATGTCAGCGATTCGAGTACGATACCGGTTCTGCACTCTGTTGGGCTTTTCAGGCC
CGTTCCACGTGCGGGTGGTGTCGCGCTGCCGCTTCCCATCGAAACGTCGTCGTCTTCTGG
TGACCCCGCGACTTCGCTGAGCTTGTCGCTTCCTGGTGCTGACGTCAGCGAGGAGTCAAA
CCGTAGTCACGAGTCAACTAATATCAACAACACTTGGAGCCGACAGAACAAAAAAACAGA
GTCGCTGTTACCATTTTCTGTCGGATTCCGAGGTGCGATTGAGGAAATGGGGAAGTCGTT
TGCTGGGAACGGCGGGGAGTTTATGGCGATGGTGCAGGAGATGATAAAGGCGGAGGTGAG
GAGTTACATGATGGAGATGCAGAGAAACCATAATGGGATGATTCCGATGAGTCAAATTGG
AGTCGGGAGAATCGAGTAGAAAAGGGAGAGTTTAGTAACTGTTACAATCAATATGTGAAA
CCAACCGCTATGGAAATCTGGAGGAAGAGAAGAAAAAACTCTCTGTTTCTCTTTCTCATT
TCAGATTAGACATTTAAGAATTTTGGGACTTAAGAAATGTATAGAGCGGAAGTCGAATGA
GCAAAATCTCGGTTCGTGAACCTAGAGTAATAAATAAAATTTTCAATCTCTACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E388TF U 1
AF RR4CB49TF U 1
AF RR4CB49JQ C 456
AF RR4E388JQ C 551
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BS 208 208 RR4E388TF
BS 209 316 RR4CB49TF
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BS 349 349 RR4E388TF
BS 350 425 RR4CB49TF
BS 426 426 RR4E388TF
BS 427 740 RR4CB49TF
BS 741 741 RR4CB49JQ
BS 742 768 RR4CB49TF
BS 769 851 RR4CB49JQ
BS 852 852 RR4E388JQ
BS 853 1194 RR4CB49JQ

RD RR4E388TF 651 0 0
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CGCCGTGAAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAAGAGGAAATGCGGTGGTTTCGACCACCG
TTACGAGGCTCCGGCGGAGG***AGGAGGAGGAGGATCGAAGGCCGGCGAAGAGATCGGT
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QA 1 651 1 651
DS 

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TTTAATTTTATTTGAAAAACCAATGGCGGATCGGATTAAAGGTCCATGGAGTCCTGAAGA
AGACGAGCAGCTTCGTAGGCTCGTTGTTAAGTACGGTCCGAGAAACTGGACAGTGATTAG
CAAATCAATCCCCGGTAGATCGGGAAAGTCGTGTCGGTTACGGTGGTGCAACCAGCTTTC
GCCGCAGGTCGAGCACCGGCCGTTCTCGGCGGAGGAAGACGAGACGATCGCGCGCGCGCA
CGCTCAGTTCGGTAACGAATGGGCCACGATAGCCCGTCTCCTCAACGGTCGTACGGACAA
CGCCGTGAAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAAGAGGAAATGCGGTGGTTTCGACCACCG
TTACGGGGCTCCGGCGGAGGGGGAGGAGGAGGAGGATCGAAGGCCGGCGAAGAGATCGGT
GAGCGACGGATGTCCACCAGTTGCTACTGGGCTTTATATGAGCCCAGGAAGCCCAACTGG
ATCTGATGTCAGCGATTCGAGTACGATACCGGTTCTGCACTCTGTTGGGCTTTTCAGGCC
CGTTCCACGTGCGGGTGGTGTCGCGCTGCCGCTTCCCATCGAAACGTCGTCGTCTTCTGG
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CCGTAGTCACGAGTCAACTA*TATCAACAACACTTGGAGCCGACAGAA

QA 1 768 1 768
DS 

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ATATGAGCCCAGGAAGCCCAACTGGATCTGATGTCAGCGATTCGAGTACGATACCGGTTC
TGCACTCTGTTGGGCTTTTCAGGCCCGTTCCACGTGCGGGTGGTGTCGCGCTGCCGCTTC
CCATCGAAACGTCGTCGTCTTCTGGTGACCCCGCGACTTCGCTGAGCTTGTCGCTTCCTG
GTGCTGACGTCAGCGAGGAGTCAAACCGTAGTCACGAGTCAACTAATATCAACAACACTT
GGAGCCGACAGAACAAAAAAACAGAGTCGCTGTTACCATTTTCTGTCGGATTCCGAGGTG
CGATTGAGGAAATGGGGAAGTCGTTTGCTGGGAACGTCGGGGAGTTTATGGCGATGGTGC
AGGAGATGATAAAGGCGGAGGTGAGGAGTTACATGATGGAGATGCAGAGAAACCATAATG
GGATGATTCCGATGAGTCAAATTGGAGTCGGGAGAATCGAGTAGAAAAGGGAGAGTTTAG
TAACTGTTACAATCAATATGTGAAACCAACCGCTATGGAAATCTGGAGGAAGAGAAGAAA
AAACTCTCTGTTTCTCTTTCTCATTTCAGATTAGACATTTAAGAATTTTGGGACTTAAGA
AATGTATAGAGCGGAAGTCGAATGAGCAAAATCTCGGTTCGTGAACCTAGAGTAATAAAT
AAAATTTTCAATCTCTACC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4E388JQ 638 0 0
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GCGGGTGGTGTCGCGCTGCCGCTTCCCGTCGAAACGTCGTCGTCTTCTGGTGACCCCGCG
ACTTCGCTGAGCTTGTCGCTTCCTGGTGCTGACGTCAGCGAGGAGTCAAACCGTAGTCAC
GAGTCAACTAATATCAACAACACTTGGAGCCGACAGAACAAAAAAACAGAGTCGCTGTTA
CCATTTTCTGTCGGATTCCGAGGTGCGATTGAGGAAATGGGGAAGTCGTTTGCTGGGAAC
GGCGGGGAGTT*ATGGCGATGGTGCAGGAGATGATAAAGGCGGAGGTGAGGAGTTACATG
ATGGATATGCATAGAAACCATAATGGGATGATTCCGATGAGTCAAGTTGGAGTCGGGAGA
ATCGAGTAGAAAAGGGAGAGTTTAGTAACTGTTACAATCAATATGTGAAACCAACCGCTA
TGGAAATCTGGAGGAAGAGAAGAAAAAACTCTTTGTTTCTCTTTCTCATTTGGGATTAGA
CATTTAAGAATTTTGGGACTTAAGAAATTTATAGAGCGGAAGTCGAATGAGCAAAATCTC
GGTTCGTGAACCTAGGGTAATAAATAAAATTTTCAA
CC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 4

CO CL2546Contig1 1438 4 7 U
GCATTGGGGAGTATGGTGATTTGTTGGTCAACAATGTAGGGATGCTTGGTATTGAAGATC
CAATAACGGTAACGGAATGTGATGCAGTGGACGTTGTTGAGGATGCCATTACTCGCCATA
ACTCTGATATGACTACAAAAGCGATGGCATTGGTTGCTCTACTGAAGCTTTCATCTCGAT
TTCCTTCTATGTCAGAGAGAATTAAAGATATAATTGTGAAGCAGAAAGGGAACCTTCTTC
TTGGAATGCAGCAGAGAGCTATTGAGTTCAATTCTATCGTTGACAGGCATAAAAGTATCA
GGTCTTCTCTGGTTGAGAGAATGCCAGTGCTAGATGAGGCGACCTTCAATGTGAGGAGGG
CTGGCTCTTTGCCTGCATCAGTTTCAACAATGGCCAAGCCTTCAGTTAGTATTCCAAATG
GTGTTTCTGCAGCTCCACTAGTGGATTTGCTGGACCTGGATTCTGACGATATTCTGGCTG
CACCTAGTAGTTCAGCTGGTGCAGATTTCCTTCAGGATCTTCTCGGTGTTGACTTAGGAT
CATCGTCAGCACAATCTGGTGCAACCCCAGCCCCTAAAGCCGGCACAGATCTGTTGCTGG
ATATTCTATCAATTGGGACGACACAAAACAGCACATCATCAGTTGATTTGTTATCAACAG
CCGACGTTAACAATAATCCTTCTACGGGGCTAGACACACTTTCTTCATCAGCTCCACCTC
AAATAGCAACTACCGCGTCTGCTGGTGGTATGTTTGATTTGTTAGATGGCCTTTCTCCAA
GCCCATCAAAGGAAGCAACCAATGGTCCGGCATATCCACCTATTGTTGCATACGAGAGCA
GCTCGTTGAGGATTGAGTTCACTTTCTCAAAGCCATCAGGGAACGCACAGACAACAAATG
TCCAGGCCACTTTTATTAATTTATCTCCCAATACTTTCACAGATTTTGTCTTCCAGGCTG
CTGTTCCAAAGTTCCTTCAGCTGCACTTGGATCCAGCTAGTAGTAACACACTCCCGGCAA
GCGGTAACATAACGCAGAATATGAGAGTCACTAACAGCCAACACGGGAAGAAATCTCTTG
TGATGCGCATGAGGGTTGGGTACAAAGTGAACGAAAAAGATGTATTGGAGGAAGGACAAA
TCAACAACTTCCCTCGCGGGTTGTGAGGCTGATTGTATTGTCAGAGCATAAGGACTTGGG
AGTATTTATTTTCATCATCCGGATTCAGAAACGAAAAACAAGGATAGGTCTTTGCCCAAT
GTCCGTTAGATGCAGCAGTGTCACATTTTACCCTTCCTATTTCTCTTTAAGAAAAATTCC
ATTGTTGAAACAAGAACTTATGGCTTTGTTTGGGATTTGAGGTTCTCCGTGTTTCTTTTT
GAACAAGACTTCCCATGTTTGGAATCAAAAGTGATCGAGGAAGCGCACAAGTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B065TF U 27
AF RR4B246TF U 1
AF RR4FR58TF U 299
AF RR4FR58JQ C 683
BS 1 733 RR4B246TF
BS 734 734 RR4FR58TF
BS 735 760 RR4B246TF
BS 761 761 RR4FR58TF
BS 762 787 RR4B246TF
BS 788 947 RR4FR58TF
BS 948 1438 RR4FR58JQ

RD RR4B065TF 656 0 0
GTCAACAATGTAGGGATGCTTGGTATTGAAGATCCAATAACGGTAACGGAATGTGATGCA
GTGGACGTTGTTGAGGATGCCATTACTCGCCATAACTCTGATATGACTACAAAAGCGATG
GCATTGGTTGCTCTACTGAAGCTTTCATCTCGATTTCCTTCTATGTCAGAGAGAATTAAA
GATATAATTGTGAAGCAGAAAGGGAACCTTCTTCTTGGAATGCAGCAGAGAGCTATTGAG
TTCAATTCTATCGTTGACAGGCATAAAAGTATCAGGTCTTCTCTGGTTGAGAGAATGCCA
GTGCTAGATGAGGCGACCTTCAATGTGAGGAGGGCTGGCTCTTTGCCTGCATCAGTTTCA
ACAATGGCCAAGCCTTCAGTTAGTATTCCAAATGGTGTTTCTGCAGCTCCACTAGTGGAT
TTGCTGGACCTGGATTCTGACGATATTCTGGCTGCACCTAGTAGTTCAGCTGGTGCAGAT
TTCCTTCAGGATCTTCTCGGTGTTGACTTAGGATCATCGTCAGCACAATCTGGTGCAACC
CCAGCCCCTAAAGCCGGCACAGATCTGTTGCTGGATATTCTATCAATTGGGACGACACAA
AACAGCACATCATCAGTTGATTTGTTATCAACAGCCGACGTTAACAATAATCCTTC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4B246TF 787 0 0
GCATTGGGGAGTATGGTGATTTGTTGGTCAACAATGTAGGGATGCTTGGTATTGAAGATC
CAATAACGGTAACGGAATGTGATGCAGTGGACGTTGTTGAGGATGCCATTACTCGCCATA
ACTCTGATATGACTACAAAAGCGATGGCATTGGTTGCTCTACTGAAGCTTTCATCTCGAT
TTCCTTCTATGTCAGAGAGAATTAAAGATATAATTGTGAAGCAGAAAGGGAACCTTCTTC
TTGGAATGCAGCAGAGAGCTATTGAGTTCAATTCTATCGTTGACAGGCATAAAAGTATCA
GGTCTTCTCTGGTTGAGAGAATGCCAGTGCTAGATGAGGCGACCTTCAATGTGAGGAGGG
CTGGCTCTTTGCCTGCATCAGTTTCAACAATGGCCAAGCCTTCAGTTAGTATTCCAAATG
GTGTTTCTGCAGCTCCACTAGTGGATTTGCTGGACCTGGATTCTGACGATATTCTGGCTG
CACCTAGTAGTTCAGCTGGTGCAGATTTCCTTCAGGATCTTCTCGGTGTTGACTTAGGAT
CATCGTCAGCACAATCTGGTGCAACCCCAGCCCCTAAAGCCGGCACAGATCTGTTGCTGG
ATATTCTATCAATTGGGACGACACAAAACAGCACATCATCAGTTGATTTGTTATCAACAG
CCGACGTTAACAATAATCCTTCTACGGGGCTAGACACACTTTCTTCATCAGCTCCACCTC
AAATAGCAACTACTGCGTCTGCTGGTGGTATGTTTGATTTATTAGATGGCCTTTCTCCAA
GCCCATC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4FR58TF 649 0 0
G
AGGTCTTCTCTGGTTGAGCGAATGCCAGTGCTAGATGAGGCTACCTTCAATGTGAGGAGG
GCTGGCTCTTTGCCTGCATCAGTTTCAACAATGGCCAAGCCTTCAGTCAGTATTCCAAAT
GGTGTTTCTGCAGCTCCACTAGTGGATTTGCTGGACCTGGATTCTGACGATATTCTGGCT
GCACCTAGTAGTTCAGCTGGTGCAGATTTCCTTCAGGATCTTCTCGGTGTTGACTTAGGA
TCATCGTCAGCACAATCTGGTGCAACCCCAGCCCCTAAAGCCGGCACAGATCTGTTGCTG
GATATTCTATCAATTGGGACGGCACAAAACAGCACATCATCAGTTGATTTGTTATCAACA
GCCGACGTTAACAATAATCCTTCTACGGGGCTAGACACACTTTCTTCATCAGCTCCACCT
CAAATAGCAACTACCGCGTCTGCTGGTGGTATGTTTGATTTGTTAGATGGCCTTTCTCCA
AGCCCATCAAAGGAAGCAACCAATGGTCCGGCATATCCACCTATTGTTGCATACGAGAGC
AGCTCGTTGAGGATTGAGTTCACTTTCTCAAAGCCATCAGGGAACGCACAGACAACAAAT
GTCCAGGCCACTTTTATTAATTTATCTCCCAATACTTTCACAGATTTT

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR4FR58JQ 756 0 0
TACGGGGCTAGACACACTTTCTTCATCAGCTCCACCTCAAATAGCAACTACCGCGTCTGC
TGGTGGTATGTTTGATTTGTTAGATGGCCTTTCTCCAAGCCCATCAAAGGAAGCAACCAA
TGGTCCGGCATATCCACCTATTGTTGCATACGAGAGCAGCTCGTTGAGGATTGAGTTCAC
TTTCTCAAAGCCATCAGGGAACGCACAGACAACAAATGTCCAGGCCACTTTTATTAATTT
ATCTCCCAATACTTTCACAGATTTTGTCTTCCAGGCTGCTGTTCCAAAGTTCCTTCAGCT
GCACTTGGATCCAGCTAGTAGTAACACACTCCCGGCAAGCGGTAACATAACGCAGAATAT
GAGAGTCACTAACAGCCAACACGGGAAGAAATCTCTTGTGATGCGCATGAGGGTTGGGTA
CAAAGTGAACGAAAAAGATGTATTGGAGGAAGGACAAATCAACAACTTCCCTCGCGGGTT
GTGAGGCTGATTGTATTGTCAGAGCATAAGGACTTGGGAGTATTTATTTTCATCATCCGG
ATTCAGAAACGAAAAACAAGGATAGGTCTTTGCCCAATGTCCGTTAGATGCAGCAGTGTC
ACATTTTACCCTTCCTATTTCTCTTTAAGAAAAATTCCATTGTTGAAACAAGAACTTATG
GCTTTGTTTGGGATTTGAGGTTCTCCGTGTTTCTTTTTGAACAAGACTTCCCATGTTTGG
AATCAAAAGTGATCGAGGAAGCGCACAAGTTTGTCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

CO CL2547Contig1 633 3 3 U
GGGACGCGCCTCCTTGTCCTCGCTTCGTCGTCTGTGAATCGATTCAGGTTAAGAAGTAGT
AATGTCACGAGCCACGTACATAGTCGGTGCCCTTGCGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACAT
CTGTGACAAAGTCATTTCTGATGATAAGATTTTCGGAGCACAGGCAGTACACCGGGAACT
ATAACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGGCATGGCCAAGAACC
GCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGC
CCTGAATAAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTCTATTTCGATATTAT
TTGCTCTTTTGTTGGCCTTTACCTGGCTCGGCTAATTTCTCTACCTGGCTGTAGTAATAA
TTTGTGGGGATGATACACATTGTTAAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTGTTTTTTT
TGTAACGTCTAATGATTTTGACAATAAAATAAAAATCAAGCCAACAAGACTTGGCAGCTA
TATTTCTTTTGCTTTTATCCAGAGATAGATGCATCCTGTTTAGTCAGAGAGGTTTGGGAT
ATTTATTGGTTTATCCAATTTGGAAATTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR93JQ C 1
AF RR4AY27TF U 6
AF RR4AX29TF U 6
BS 1 7 RR4AR93JQ
BS 8 609 RR4AY27TF
BS 610 633 RR4AR93JQ

RD RR4AR93JQ 633 0 0
GGGACGCGCCTCCTTGTCCTCGCTTCGTCGTCTGTGAATCGATTCAGGTTAAGGAGTAGT
AATGTCACGAGCCACGTACATAGTCGGTGCCCTTGCGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACGT
CTGTGACAAAGTCATTTCTGATGATAAGATTTTCGGAG*****GCAGTACACCGGGAACT
ATAACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGGCATGGCCAAGAACC
GCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGC
CCTGAATAAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTCTATTTCGATATTAT
TTGCTCTTTTGTTGGCCTTTACCTGGCTCGGCTAATTTCTCTACCAGGCTGTAGTAATAA
TTTGTGGGGATGATACACATTGTTAAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTGTTTTTTT
TGTAACGTCTAATGATTTTGACAATAAAATAAAA*TCAAGCCAACAAGACTTGGCAGCTA
TATTTCTTTTGCTTTTATCCAGAGATAGATGCATCCTGTTTAGTCAGAGAGGTTTGGGAT
ATTTATTGGTTTATCCAATTTGGAAATTTTTCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4AY27TF 606 0 0
GG
GCCTCCTTGTCCTCGCTTCGTCGTCTGTGAATCGATTCAGGTTAAGAAGTAGTAATGTCA
CGAGCCACGTACATAGTCGGTGCCCTTGCGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACATCTGTGAC
AAAGTCATTTCTGATGATAAGATTTTCGGAGCACAGGCAGTACACCGGGAACTATAACTA
ACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGGCATGGCCAAGAACCGCTGGTC
CTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAAT
AAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTCTATTTCGATATTATTTGCTCT
TTTGTTGGCCTTTACCTGGCTCGGCTAATTTCTCTACCTGGCTGTAGTAATAATTTGTGG
GGATGATACACATTGTTAAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTGTTTTTTTTGTAACG
TCTAATGATTTTGACAATAAAATAAAAATCAAGCCAACAAGACTTGGCAGCTATATTTCT
TTTGCTTTTATCCAGAGATAGATGCATCCTGTTTAGTCAGAGAGGTTTGGGATATTTATT
GG
TT

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR4AX29TF 604 0 0
GG
GCCTCCTTGTCCTCGCTTCGTCGTCTGTGAATCGATTCAGGTTAAGAAGTAGTAATGTCA
CGAGCCACGTACATAGTCGGTGCCCTTGCGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACATCTGTGAC
AAAGTCATTTCTGATGATAAGATTTTCGGAGCACAGGCAGTACACCGGGAACTATAACTA
ACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGGCATGGCCAAGAACCGCTGGTC
CTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAAT
AAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTCTATTTCGATATTATTTGCTCT
TTTGTTGGCCTTTACCTGGCTCGGCTAATTTCTCTACCTGGCTGTAGTAATAATTTGTGG
GGATGATACACATTGTTAAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTGTTTTTTTTGTAACG
TCTAATGATTTTGACAATAAAATAAAAATCAAGCCAACAAGACTTGGCAGCTATATTTCT
TTTGCTTTTATCCAGAGATAGATGCATCCTGTTTAGTCAGAGAGGTTTGGGATATTTATT
GG

QA 3 604 3 604
DS 



AS 1 4

CO CL2548Contig1 1030 4 9 U
GCCCTGAGCTAGCAACGGAGGGTTCCCCAACCATCAAACAGAGGCTTGAGATCGCAAACG
AGGCGGTTGTGCAGATGGCATATGAAGCGAGCTTGGCTTGCATCAAGGAATGGGGAAGGA
CGGTGGAAGATATCACTCATCTCGTCTATGTTTCATCCAGTGAGTTCCGTTTGCCCGGGG
GTGACCTTTACCTCTCGGCACAACTGGGCCTTAGCAACGAGGTGCAGAGGGTGTTGTTTT
ATTTTCTGGGATGCTACGGAGGTGTGAGTGGGATGCGCGTGGCCAAGGACATTGTTGAGA
ACAACCCAGGAAGCCGGGTGCTGCTCACCACCTCTGAGACTATGGTTCTTGGGTTCCGTC
CCCCCAACAAAGCTCGCCCTTACGACTTAGTCGGGGCTGCTCTCTTTGGAGACGGAGCAG
CTGCCCTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGTCAGAAAGTCCCTTCATGGAGCTTCACT
ATGCGCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGGGTGATTGACGGGCGGTTGTCAGAGG
AGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCTCAGAAGATCGAAGACAACATAGAGG
AGTTCTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTCTGGTTCATTGGAGTTGAATGACCTGT
TCTGGGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTGAACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGC
TGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCGTTGATGGATTATGGGAACGCAAGCA
GCAACACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAAGAGGTGAGCTTGAGAACAAAGGCAGAG
GTGGAGAAGAGTGGGGTTTAGGTTTAGCCTTCGGACCGGGAATTACGTTCGAGGGATTTT
TCATGAGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCCGATATATGTGATACAAAAATATTAAAG
TACATTTACGAAAAGTCTACATGAAACAATGAAGTTTGAAAAATATGCTTATGAATTTAA
TCTTTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT37TF U 1
AF RR4AG28TF U 305
AF RR4AG28JQ C 350
AF RR4BT37JQ C 399
BS 1 752 RR4BT37TF
BS 753 753 RR4AG28TF
BS 754 764 RR4BT37TF
BS 765 857 RR4AG28TF
BS 858 858 RR4AG28JQ
BS 859 899 RR4AG28TF
BS 900 900 RR4AG28JQ
BS 901 995 RR4AG28TF
BS 996 1030 RR4AG28JQ

RD RR4BT37TF 775 0 0
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AGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCTCAGAAGATCGAAGACAACATAGAGG
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TGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAG*CGTTGATGGAT
ATGGGACGCGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4AG28TF 694 0 0
G
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CTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGTCAGAAAGTCCCTTCATGGAGCTTCACTATGCG
CTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGGGTGATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGGC
ATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCTCAGAAGATCGAAGACAACATAGAGGAGTTC
TGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTCTGGTTCATTGGAGTTGAATGACCTGTTCTGG
GCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTGAACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAAA
CCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCGTTGATGGATTATGGGAACGCAAGCAGCAAC
ACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAAGAGGTGAGCTTGAGAACAAAGGCAGAGGTGGA
GAAGAGTGGGGTCTAGGTTTAGCCTTCGGACCGGGAATTACGTTCGAGGGATTTCTCATG
AGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCCGATATATGTGATACAAAAATATTAAAGTACAT
TTACGAAAAGTCTACATGAAACAATGAAGT
CTG

QA 2 691 2 691
DS 

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AGACGGAGCAGCTGCCCTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGTCAGAAAGTCCCTTCAT
GGAGCTTCACTATGCGCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGGGTGATTGACGGGCG
GTTGTCAGAGGAGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCTCAGAAGATCGAAGA
CAACATAGAGGAGTTTTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTTTGGTTCATTGGAGTT
GAATGACCTGTTTTGGGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTGAACGGGCTAGAGAC
GAAACTGAAGCTGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCGTTGATGGATTATGG
GAACGCAAGCAGCAACACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAAGAGGTGAGCTTGAGAA
CAAAGGCAGAGGTGGAGAAGAGTGGGGTTTAGGTTTAGCCTTCGGACCGGGAATTACGTT
CGAGGGATTTTTCATGAGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCCGATATATGTGATACAA
AAATATTAAAGTACATTTACGAAAAGTCTACATGAAACAATGAAGTTTGAAAAATATGCT
TATGAATTTAATCTTTTAACT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BT37JQ 624 0 0
GCTCTCTTTGGAGACGGAGCAGCTGCCCTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGTCAGAA
AGTCCCTTCATGGAGCTTCACTATGCGCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGGGTG
ATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCTCAG
AAGATCGAAGACAACATAGAGGAGTTTTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTTTGGT
TCATTGGAGTTGAATGACCTGTTTTGGGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTGAAC
GGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCGTTG
ATGGATTATGGGAACGCGAGCAGCAACACCATTTTTTACATAATGGACAAAGTAAGAGGT
GAGCTTGAGAACAAAGGCAGAGGTGGAGAAGAGTGGGGTTTAGGTTTAGCCTTCGGACCG
GGAATTACGTTCGAGGGATTTTTCATGAGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCCGATAT
ATGTGATACAAAAATATTAAAGTACATTTACGAAAAGTTTACATGAAACAATGAAGTTTG
AAAAATATGCTTATGAATTTAATC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 4

CO CL2549Contig1 644 4 4 U
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CAGCATCTCGCTGTTTGTCAACTCGTGTTTCTCTATAAATCCACCTTCTTGACATCATCT
TCTCTTCATCCAATCCTCACCATCTACATATCACTTCATTCCCTCTCCCCCTCCTGGCAA
ATCAATATGGCTAAATTCACAACCATCTTCATCATGGCTCTCCTTCTCTGCTCAACGCTA
ACCTACGCAGCCAGGTTGACTCCGACGACAATCACCGCCTCTTCTAGAGAAGACACCGTC
AAGGGAACCGAAGGAGATAATACTGAAGAAGAAAGCTGCAAAGGAGTTGGAGAAGAAGAA
TGTTTGATTAGGCGAACTCCTGTTGCTCACACCGATTACATTTACACTCAAAATCACAAA
CACTAAATTTATATTTTATGCTATAAATTATTAACTAGTTACCTTAGTAAACCCTATCAC
TGTAATTTCTGTTCTTTCTTAATTTTGTTATAGCTATTTGAATCTTTGTTATTCCTTCTT
TGAGAGTTATTACTTATTATTATTCACACTCCTTGTATAATTATGGATTTAGAACAACTT
TCAGTATTTTATTTTGTAAGGTTTATATTAAAAACATAAAGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GF39JQ C 1
AF RR4GF39TF U 1
AF RR4EK43JQ C 126
AF RR4EK43TF U 126
BS 1 156 RR4GF39TF
BS 157 157 RR4EK43TF
BS 158 604 RR4GF39TF
BS 605 644 RR4EK43TF

RD RR4GF39JQ 605 0 0
GGATGACGTCATAGAAGTAGTTAGCCTTTCCCTTTACAAGTTTCTATGGTTCACATTAGG
CAGCATCTCGCTGTTTGTCAACTCGTGTTTCTCTATAAATCCACCTTCTTGACATCATCT
TCTCTTCATCCAATCCTCACCATCTACATATCACTTTATTCCCTCTCCCCCTCCTGGCAA
ATCAATATGGCTAAATTCACAACCATCTTCATCATGGCTCTCCTTCTCTGCTCAACGCTA
ACCTACGCAGCCAGGTTGACTCCGACGACAATCACCGCCTCTTCTAGAGAAGACACCGTC
AAGGGAACCGAAGGAGATAATACTGAAGAAGAAAGCTGCAAAGGAGTTGGAGAAGAAGAA
TGTTTGATTAGGCGAACTCCTGTTGCTCACACCGATTACATTTACACTCAAAATCACAAA
CACTAAATTTATATTTTATGCTATAAATTATTAACTAGTTACCTTAGTAAACCCTATCAC
TGTAATTTCTGTTCTTTCTTAATTTTGTTATAGCTATTTGAATCTTTGTTATTCCTTCTT
TGAGAGTTATTACTTATTATTATTCACACTCCTTGTATAATTATGGATTTAGAACAACTT
TCAG
G

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4GF39TF 606 0 0
GGATGACGTCATAGAAGTAGTTAGCCTTTCCCTTTACAAGTTTCTATGGTTCACATTAGG
CAGCATCTCGCTGTTTGTCAACTCGTGTTTCTCTATAAATCCACCTTCTTGACATCATCT
TCTCTTCATCCAATCCTCACCATCTACATATCACTTTATTCCCTCTCCCCCTCCTGGCAA
ATCAATATGGCTAAATTCACAACCATCTTCATCATGGCTCTCCTTCTCTGCTCAACGCTA
ACCTACGCAGCCAGGTTGACTCCGACGACAATCACCGCCTCTTCTAGAGAAGACACCGTC
AAGGGAACCGAAGGAGATAATACTGAAGAAGAAAGCTGCAAAGGAGTTGGAGAAGAAGAA
TGTTTGATTAGGCGAACTCCTGTTGCTCACACCGATTACATTTACACTCAAAATCACAAA
CACTAAATTTATATTTTATGCTATAAATTATTAACTAGTTACCTTAGTAAACCCTATCAC
TGTAATTTCTGTTCTTTCTTAATTTTGTTATAGCTATTTGAATCTTTGTTATTCCTTCTT
TGAGAGTTATTACTTATTATTATTCACACTCCTTGTATAATTATGGATTTAGAACAACTT
TCAG
GA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4EK43JQ 519 0 0
GG
ATCCAATCCTCACCATCTACATATCACTTCATTCCCTCTCCCCCTCCTGGTAAATCAATA
TGGCTAAATTCACAACCATCTTCATCATGGCTCTCCTTCTCTGCTCAACGCTAACCTACG
CAGCCAGGTTGACTCCGACGACAATCACCGCCTCTTCTAGAGAAGACACCGTCAAGGGAA
CCGAAGGAGATAATACTGAAGAAGAAAGCTGCAAAGGAGTTGGAGAAGAAGAATGTTTGA
TTAGGCGAACTCTTGTTGCTCACACCGATTACATTTACACTCAAAATCACAAACACTAAA
TTTATATTTTATGCTATAAATTATTAACTAGTTACCTTAGTAAACCCTATCACTGTAATT
TCTGTTCTTTCTTAATTTTGTTATAGCTATTTGAATCTTTGTTATTCCTTCTTTGAGAGT
TATTACTTATTATTATTCACACTCCTTGTATAATTATGGATTTAGAACAACTTTCAGTAT
TTTATTTTGTAAGGTTTATATTAAAAACATAAAGTCG

QA 3 519 3 519
DS 

RD RR4EK43TF 519 0 0
GG
ATCCAATCCTCACCATCTACATATCACTTCATTCCCTCTCCCCCTCCTGGTAAATCAATA
TGGCTAAATTCACAACCATCTTCATCATGGCTCTCCTTCTCTGCTCAACGCTAACCTACG
CAGCCAGGTTGACTCCGACGACAATCACCGCCTCTTCTAGAGAAGACACCGTCAAGGGAA
CCGAAGGAGATAATACTGAAGAAGAAAGCTGCAAAGGAGTTGGAGAAGAAGAATGTTTGA
TTAGGCGAACTCTTGTTGCTCACACCGATTACATTTACACTCAAAATCACAAACACTAAA
TTTATATTTTATGCTATAAATTATTAACTAGTTACCTTAGTAAACCCTATCACTGTAATT
TCTGTTCTTTCTTAATTTTGTTATAGCTATTTGAATCTTTGTTATTCCTTCTTTGAGAGT
TATTACTTATTATTATTCACACTCCTTGTATAATTATGGATTTAGAACAACTTTCAGTAT
TTTATTTTGTAAGGTTTATATTAAAAACATAAAGTCG

QA 3 519 3 519
DS 



AS 2 4

CO CL2550Contig1 532 2 5 U
AGAAGATTGTTTGATTTTTTTTTTCCATGGATAAGATTCAACAAAACGTAAAGAGATGTC
TGTTCAAAAGACCACAAAAAGCTGAAAATTTTATGACATTGCGACATTCATTTGGATGAT
GTTCTTGTGTATGTGATCCAAACAAAGCAAAAATTAAACGTAGGTATCGATCAGAGACTT
CCTCATCTCATCGACAATGGAGCTGGGTTGGGCTTCCCTTAGCCTGAAGATGCTGTCAAT
AACAGAAAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGACCCGCAAAAAGCAGTCCAGTCATTCACCGT
CATACCAGCGCCTATGACTTCACTACCACGGTTCACGGTTCCTGCAACTAGAGGGACTTG
AAGAAGTGTTGATAGTTCGTCCAAGTCTTCCACTGAGGTGTGAGGATGGACAATGCCACC
TCTGTTGGACAAGGCACAGTAACTGCCCACAAAAATGTTGCCTGCAATGGTCTGGCGGAA
AACTTCAACGCCAAGAACATCCGCTATTATTTCCTCAGTTTCCTTGTCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C691JQ U 108
AF RR4G272JQ U 1
BS 1 223 RR4G272JQ
BS 224 224 RR4C691JQ
BS 225 246 RR4G272JQ
BS 247 247 RR4C691JQ
BS 248 532 RR4G272JQ

RD RR4C691JQ 276 0 0
TCATTTGGATGATGTTCTTGTGTATGTGATCCAAACAAAGCAAAAATTAAACGTAGGTAT
CGATCAGAGACTTCCTCATCTCATCGACAATGGAGCTGGGTTGGGCTTCCCTTAGCCTGA
AGATGCTGTCAATAACAGAAAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGACCCGCAAAAAGCAGTCC
AGTCATTCACCGTCATACCAGCGCCTATGACTTCACTACCACGGTTCACGGTTCCTGCAA
CTAGAGGGACTTGAAGAAGTGTTGATAGTTCGTCCA

QA 1 276 1 276
DS 

RD RR4G272JQ 532 0 0
AGAAGATTGTTTGATTTTTTTTTTCCATGGATAAGATTCAACAAAACGTAAAGAGATGTC
TGTTCAAAAGACCACAAAAAGCTGAAAATTTTATGACATTGCGACATTCATTTGGATGAT
GTTCTTGTGTATGTGATCCAAACAAAGCAAAAATTAAACGTAGGTATCGATCAGAGACTT
CCTCATCTCATCGACAATGGAGCTGGGTTGGGCTTCCCTTAGCTTGAAGATGCTGTCAAT
AACAGAGAGCTCTGTTGCGGTTGTGTCTGACCCGCAAAAAGCAGTCCAGTCATTCACCGT
CATACCAGCGCCTATGACTTCACTACCACGGTTCACGGTTCCTGCAACTAGAGGGACTTG
AAGAAGTGTTGATAGTTCGTCCAAGTCTTCCACTGAGGTGTGAGGATGGACAATGCCACC
TCTGTTGGACAAGGCACAGTAACTGCCCACAAAAATGTTGCCTGCAATGGTCTGGCGGAA
AACTTCAACGCCAAGAACATCCGCTATTATTTCCTCAGTTTCCTTGTCAAGA

QA 1 532 1 532
DS 



CO CL2550Contig2 740 2 2 U
GGGCCGCTTTGTCTCTCTGCCCCCTCCTCAATTCATTTCTCGTGTAAGTTAGCAAAGTTC
GTAGCTTTCTCTTCCTCAATGGCCACTCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGTGAAGTTGGT
GTCTTTTCGAAACTCACCAACGCCTATTGCTTAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTC
TACAGTGCTTTTGAGTCGGAGTTAGCTGATGTCATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGT
GGAACACGAATCATTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCAT
ACAACTACTGACCAAGAGCTTCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTCGTGGTC
CAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCAGCTCTTGGAAATTGCATTGCTTGCAATGACCATGTT
GCTCTTGCTCACACCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAAATAATAGCGGATGTTCTTGGC
GTTGAAGTTTTCCGCCAGACCATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTG
TCCAACAGAGGTGGCATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCA
ACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTCATAGGC
GCTGGTATGACGGTGAATGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAG
CTCTCTGTTATTGACAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4G272TF U 1
AF RR4C691TF U 14
BS 1 738 RR4G272TF
BS 739 740 RR4C691TF

RD RR4G272TF 738 0 0
GGGCCGCTTTGTCTCTCTGCCCCCTCCTCAATTCATTTCTCGTGTAAGTTAGCAAAGTTC
GTAGCTTTCTCTTCCTCAATGGCCACTCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGTGAAGTTGGT
GTCTTTTCGAAACTCACCAACGCCTATTGCTTAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTC
TACAGTGCTTTTGAGTCGGAGTTAGCTGATGTCATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGT
GGAACACGAATCATTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCAT
ACAACTACTGACCAAGAGCTTCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTCGTGGTC
CAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCAGCTCTTGGAAATTGCATTGCTTGCAATGACCATGTT
GCTCTTGCTCACACCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAAATAATAGCGGATGTTCTTGGC
GTTGAAGTTTTCCGCCAGACCATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTG
TCCAACAGAGGTGGCATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCA
ACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTCATAGGC
GCTGGTATGACGGTGAATGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAG
CTCTCTGTTATTGACAGC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4C691TF 727 0 0
TCTCTGCCTCCTCCTCAATTCATTTCTCGTGTAAGTTAGCAAAGTTCGTAGCTTTCTCTT
CCTCAATGGCCACTCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGTGAAGTTGGTGTCTTTTCGAAAC
TCACCAACGCCTATTGCTTAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTCTACAGTGCTTTTG
AGTCGGAGTTAGCTGATGTTATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGTGGAACACGAATCA
TTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCATACAACTACTGACC
AAGAGCTTCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTCGTGGTCCAGAGAATCGAGG
AATGTCTGTCAGCTCTTGGAAATTGCATTGCTTGCAATGACCATGTTGCTCTTGCTCACA
CCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAAATAATAGCGGATGTTCTTGGCGTTGAAGTTTTCC
GCCAGACCATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTGTCCAACAGAGGTG
GCATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCAACACTTCTTCAAG
TCCCTCTAGTTGCAG*AACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTCATAG*CGCTGGTATGACGG
TGA*TGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACA*CCGCA*CAGAGCTCTCTGTTATTG
ACAGCAT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 4

CO CL2551Contig1 795 4 5 U
AGGGACACACACCCACAAAGTTGCCCATCGAAAGGAAGAGACCTAGTAGTCATCATCTTC
GGCTATCTTACGAAGAAGAATGGCGTCGAGACCAGGTTTTCTCACGGACTGGCCATGGGC
ACCTCTTGGAAGCTTTAAGTACTTGGTGTTGGCGCCGCTTGTTATCGACAGCATCTACTC
GTACGCGGCACTGCGATATCACGATAAACTTTTGGTCGTGGCGCTAATGTTGTGGCGTAT
TGTTCATAGCCAGGCTTGGATAAGTTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACG
GATCGTGAACAAGTCCATAGAGTTTGAGCAAGTCGACAGAGAACGAACTTGGGACGATCA
GATCATCTTCAACACTCTTGTTGTTTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCC
CGTTCCCTTTTGGCGACTCGATGGCGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGGTCCTGT
TGAGTTCACCTACTACTGGTTTCACCGAGCCCTTCACCATCACTACCTCTATTCTCGATA
CCATTCACACCACCACTCCTCCATTGTCACCGAGCCGATAACTTGTACGTCCACATGTAA
ACTTATATATACTTCCTCCTAAAACAAATAAAACAGTATTCAAGGGTCTATAACTTTTCA
CAAGAATTAAAAATGTTCAGAACTCTAGTAAACTCTTGGTTTATGTTCGCTTTACTAATT
ATTTTTACTTTAGTTATTTATTTGAACATTACTACTTGAGGCTAAAATGATTTATAATAT
TTACGTTGAAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE16TF U 1
AF RR4AU17TF U 21
AF RR4AU17JQ C 47
AF RR4DE16JQ C 127
BS 1 93 RR4DE16TF
BS 94 94 RR4AU17TF
BS 95 474 RR4DE16TF
BS 475 788 RR4AU17TF
BS 789 795 RR4AU17JQ

RD RR4DE16TF 474 0 0
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GGCTATCTTACGAAGAAGAATGGCGTCGAGACCGGGTTTTCTCACGGACTGGCCATGGGC
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TGTTCATAGCCAGGCTTGGATAAGTTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACG
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GATCATCTTCAACACTCTTGTTGTTTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCC
CGTTCCCTTTTGGCGACTCGATGGCGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGG

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4AU17TF 775 0 0
GG
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GCGTCGAGACCAGGTTTTCTCACGGACTGGCCATGGGCACCTCTTGGAAGCTTTAAGTAC
TTGGTGTTGGCGCCGCTTGTTATCGACAGCATCTACTCGTACGCGGCACTGCGATATCAC
GATAAACTTTTGGTCGTGGCGCTAATGTTGTGGCGTATTGTTCATAGCCAGGCTTGGATA
AGTTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACGGATCGTGAACAAGTCCATAGAG
TTTGAGCAAGTCGACAGAGAACGAACTTGGGACGATCAGATCATCTTCAACACTCTTGTT
GTTTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCCCGTTCCCTTTTGGCGACTCGAT
GGCGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGGTCCTGTTGAGTTCACCTACTACTGGTTT
CACCGAGCCCTTCACCATCACTACCTCTATTCTCGATACCATTCACACCACCACTCCTCC
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CTCTAGTAAACTCTTGGTTTATGTTCGCTTTACTAATTATTTTTACTTTAGTTATTTATT
TGAACATTACTACTTGAGGCTAAAATGATTTATAATATTTACGTTG
AAAATTC

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR4AU17JQ 749 0 0
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GACTGGCCATGGGCACCTCTTGGAAGCTTTAAGTACTTGGTGTTGGCGCCGCTTGTTATC
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ATGTTGTGGCGTATTGTTCATAGCCAGGCTTGGATAAGTTTCTCCCGTTACCGAACTGCT
AAGGGGACCAAACGGATCGTGAACAAGTCCATAGAGTTTGAGCAAGTCGACAGAGAACGA
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CTCTATTCTCGATACCATTCACACCACCACTCCTCCATTGTCACCGAGCCGATAACTTGT
ACGTCCACATGTAAACTTATATATACTTCCTCCTAAAACAAATAAAACAGTATTCAAGGG
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ATGATTTATAATATTTACGTTGAAAATTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4DE16JQ 662 0 0
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GGCACTGCGATATCACGATAAACTTTTGGTCGTGGCGCTAATGTTGTGGCGTATTGTTCA
TAGCCAGGCTTGGATAAGTTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACGGATCGT
GAACAAGTCCATAGAGTTTGAGCAAGTCGACAGAGAACGAACTTGGGACGATCAGATCAT
CTTCAACACTCTTGTTGTTTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCCCGTTCC
CTTTTGGCGACTCGATGGCGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGGTCCTGTTGAGTT
CACCTACTACTGGTTTCACCGAGCCCTTCACCATCACTACCTCTATTCTCGATACCATTC
ACACCACCACTCCTCCATTGTCACCGAGCCGATAACTTGTACGTCCACATGTAAACTTAT
ATATACTTCCTCCTAAAACAAATAAAACAGTATTCAAGGGTCTATAACTTTTCACAAGAA
TTAAAAATGTTCAGAACTCTAGTAAACTCTTGGTTTATGTTCACTTTACTAATTATTTTT
ACTTTAGTTATTTATTTGAACATTACTACTTGAGGCTAAAATTATTTATAATATTTACGT
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

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ATGGAGTTTCCAACTTAAAGGTTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCCGTTGTTGAGCTATCAA
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BB75JQ C 1
AF RR4BZ63JQ C 13
AF RR4BZ63TF U 13
AF RR4BB75TF U 1
BS 1 14 RR4BB75TF
BS 15 355 RR4BZ63TF
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BS 676 704 RR4BB75TF

RD RR4BB75JQ 704 0 0
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AGCAAACAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTAGAGACTATACAAGGAG
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TCCAATTTTAATTGCAAGAATTACAATGTGCCATATTACAAAAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4BZ63JQ 663 0 0
GG
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C

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR4BZ63TF 663 0 0
GG
ATCGAGTGAAAGTGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAATGGCGTCGATTACAGCTT
CTTCTACTTTCCACTCCTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAACCTTTCTTCGACCCACCTCC
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GCTTTACGAAACAGAACAACCGCCTTGGGTTGAAGAAGCTTTCGTCCCTTGGCGAAGGAG
GAGTAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAACAGCAACAACAGCAGCAAGAGACTGTCT
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CAAGCAACAGGAGTGGCGTCA*GCTTGGTAGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTTAAGTTA
CAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCTAATTAATATCATCT
TTCTTCTCAAGCCCAACTTTTTGTGATTAAAGAAAACACATTAATGTCCAATTTTAATTG
C

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR4BB75TF 704 0 0
GACGCACAAACCTTATCGAGTTAAAGTGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAATGGC
GTCGATTACAGCTTCTTCTACTTTCCACTCCTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAACCTTTC
TTTGACCCACCTCCTTCCTCTCTACAAAAACCTCACCTTTCGAACCAAACCCATCGGAAA
CACCAGAGTTTGCAGCTTTACGAAACAGAACAACCGCCTTGGGTTGAAGAAGCTTTCGTC
CCTTGGCGAAGGAGGAGTAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCAGCAACAACAGCA
GCAAGAGACTGTCTCTGTCCCTGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTTCAGG
CTGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGG
ATGGAGTTTCCAACTTAAAGGTTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCCGTTGTTGAGCTATCAA
AGCAAACAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTAGAGACTATACAAGGAG
CTGGCTTTAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCT
AATTAATATCATCTTTCTTCTCAAGCCCAACTTTTTGTGATTAAAGAAAACACATTAATG
TCCAATTTTAATTGCAAGAATTACAATGTGCCATATTACAAAAG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 3

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TTAGGTTCCACTGTTCAAAAGAAGGAGAGGGAATACAAAGAAGCACTTGATACATTCAAT
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GAGAAATTGAGGTTGAAGAAGCTGGAGGAGCTGAGCAAGAGCATTGAAACCGTCTAAATG
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TACATTTTGTGAGATGTGTGTATTTTAAGATTGTGGGTGTTTTTTGTTAGTTTTGAAAAT
TCTTGGGGTTGGTTTGTAAAATTAACAAACTAGGGAGTGAATGTGAGATTATTAGGATAC
TGAAACTTTTCACATTGATTTTTTTTTTCTGTTCTTGCTTCTCTGTAATGTTTTTGTATT
TGTCTTTTTGAAGAATTTAATTTATTTTATTCC


BQ
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AF RR4AC95TF U 1
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GG
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TTTTTCTGTTCTTGCTTCTCTGTAATGTTTTTGTATTTGTCTTTTTGAAGAATTTAATTT
ATTTTATTCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

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GGTTCTTCTCTGCGTTATTTATCTACCACCTAAACTATGTTTTTCGATGGATACCATTAC
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TGCTTCGAATCAAACAAGGAAAAACAAATAATTTAATAAAGC


BQ
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FW77TF U 1
AF RR4FW77JQ C 450
AF RR4AI58JQ C 557
AF RR4AI58TF U 557
BS 1 660 RR4FW77TF
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BS 662 700 RR4FW77TF
BS 701 1182 RR4AI58TF

RD RR4FW77TF 710 0 0
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GGTTCTTCTCTGCGTTATTTATCTACCACCTAAACTATGTTTTTCGATGGATACCATTAC
CATGGAACCACCTTTGAGCAGAGTTACCGGTGCTATCCTGCATCTTTTATCGACAAGCCT
CAAATTGAAAGTGGTGACAAGATTATAATGCCACCATCAGCTCTTGACCGTCTCGCCTCT
TTGCATATTGACTATCCTATGCTGTTTGAGCTTCGTAATGCTGGAATCGAACGTGTTTCA
CACTGTGGAGTCCTTGAGTTCATTGCTGAAGAAGGCATGATTTACATGCCATATTGGATG
ATGCAGAATCTGCTGCTGCAAGAAGGAGACATTGTGAGAGTTAGAAATGTCACTCTTCCA
AAAGGAACCTATGTTAAACTACAGCCGCACACTACGGACTTCCTGGATATATCTAATCCG
AAAGCCATCTTGGAGACTGCTTTGAGGAACTACTCATGCCTAACCACTGGGGATAGCATC
CTGGTTCCATACAACAATAAGAAGTACTTTATAGATATAGTTGAGACAAAGCCTGCTAAT
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*AGCCTGAACGTCCCAAAACAGCACCTGCTGCAGCTAAGG
TCCGCAAAGC

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DS 

RD RR4FW77JQ 733 0 0
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CTACTCATGCCTAACCACTGGGGATAGCATCCTGGTTCCATACAACAATAAGAAGTACTT
TATAGATATAGTTGAGACAAAGCCTGCTAATGGAATCAGCATCATAGAAACAGACTGTGA
GGTTGATTTTGCACCTCCCCTTGATTACAAGGAGCCTGAACGTCCCAAAACAGCACCTGC
TGCAGCTAAGGGTCCGGCAAAAGCTGAGGAAGTTGTGCCTGAACCTGAACCAAAGTTCAA
CCCTTTCACGGGATCTGGAAGACGGTTAGATGGGAGACCTCTTTCCTATGAGCCGCCACC
AGCATCTTCTTCTTCTTCCTCTAGCTCAAAAGATAAACAGCCAGCTGTTGCTAATGGCAA
TGGACAGGCATCTGTAGCAAGTAGTAGCTCAGAGAAAGCTGCTCGACAGGCT*AAGGAAA
GCTTGTGTTTGGGGGCAACGCAAACCGTGCCCCAAAAGAAGCTCCAAAGGTTGGAGCTGG
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TGGGAAGAAGTATTCGTTGAGGGGTTGATCAAGGAACTGTCTCTGCTCAGTTTATTTTAT
GATCTGTTGTGTACTATATAAGTATTCGTTGTGCTTCGAATCAAACAAGGAAAAACAAAT
AATTTAATAAAGC

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DS 

RD RR4AI58JQ 626 0 0
G
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ACCAAAGTTCAACCCTTTCACGGGATCTGGAAGACGGTTAGATGGGAGACCTCTTTCCTA
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GGAAAAACAAATAATTTAATAAAGC

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DS 

RD RR4AI58TF 626 0 0
G
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AACAGACTGTGAGGTTGATTTTGCACCTCCCCTTGATTACAAGGAGCCTGAACGTCCCAA
AACAGCACCTGCTGCAGCTAAGGGTCCGGCAAAAGCTGAGGAAGTTGTGCCTGAACCTGA
ACCAAAGTTCAACCCTTTCACGGGATCTGGAAGACGGTTAGATGGGAGACCTCTTTCCTA
TGAGCCGCCACCAGCATCTTCTTCTTCTTCCTCTAGCTCAAAAGATAAACAGCCAGCTGT
TGCTAATGGCAATGGACAGGCATCTGTAGCAAGTAGTAGCTCAGAGAAAGCTGCTCGACA
GGCTCAAGGAAAGCTTGTGTTTGGGGGCAACGCAAACCGTGCCCCAAAAGAAGCTCCAAA
GGTTGGAGCTGGGAAAGAGACAAAACAAGAGGAAGAGGAGAAGAAGGAAGAGCCAAAGTT
CCAAGCTTTCACTGGGAAGAAGTATTCGTCGAGGGGTTGATCAAGGAACTGTCTCTGCTC
AGTTTATTTTATGATCTGTTGTGTACTATATAAGTATTCGTTGTGCTTCGAATCAAACAA
GGAAAAACAAATAATTTAATAAAGC

QA 2 626 2 626
DS 



AS 1 3

CO CL2555Contig1 1033 3 7 U
GGATCCCCTCGTAGTTTCAACACATTTCATAATCTTCTCTCTCCCTTCAAACGTTTTAGT
TCCAAAAAGAACTAAAACCCTAGAAGCAGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTCCTGG
TTACCTAATATAGTACGTGTTGCTAATCCTTATTAAGCAATATGATTAACTTTGAGGCAA
CGGAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGGGTGAGAATCACGTAGGAGCCATGACTGTGAAGAATA
ATGGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACTGTTGATCTCAAGTTGAATCTTTCATCGACGGCTG
TGGATTCAGTTTCTAAAGTTGATTTAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGG
CCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCGCCGGTACGATCTTTCCGGAAGAACGTCATGTCAT
GCCAAAAGCCAACCACCGGAGATGCCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTTCGGAAGCAGCG
GAGTTACCTCCTCTGCCTCCGCTTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGACG
GTGCACCGTACCTAAGAAAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCG
ACGCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATAGGCAATTATGGACCACAGGGAATGA
AAGATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCCAA
CTTATGAAGATAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTTTG
TTGATTCATGCAAACGCATAAGAATTATGAAGGGGTCAGATGCAAAAGGACTTGCTCCAA
GGGCTTTAGAAAAATGCAAGAACAGAAGCTGAGTGATTGCCCCAAAAAGGCAACAAAGAC
CGGTTAGATCCGGTTATATATTCAAACAGAGAAAAGCCAAACCGGCTCGAGTTACCGTTC
CGAGCAGAGAGTTTGTGTATAATAATAATAATATTTTGATGAATTACATTTTTAAATTTA
ACCCTTTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D349TF U 1
AF RR4B542TF U 143
AF RR4B542JQ C 156
BS 1 756 RR4D349TF
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BS 758 793 RR4D349TF
BS 794 794 RR4B542TF
BS 795 808 RR4D349TF
BS 809 820 RR4B542TF
BS 821 1033 RR4B542JQ

RD RR4D349TF 808 0 0
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TCCAAAAAGAACTAAAACCCTAGAAGCAGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTCCTGG
TTACCTAATATAGTACGTGTTGCTAATCCTTATTAAGCAATATGATTAACTTTGAGGCAA
CGGAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGGGTGAGAATCACGTAGGAGCCATGACTGTGAAGAATA
ATGGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACTGTTGATCTCAAGTTGAATCTTTCATCGACGGCTG
TGGATTCAGTTTCTAAAGTTGATTTAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGG
CCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCGCCGGTACGATCTTTCCGGAAGAACGTCATGTCAT
GCCAAAAGCCAACCACCGGAGATGCCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTTCGGAAGCAGCG
GAGTTACCTCCTCTGCCTCCGCTTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGACG
GTGCACCGTACCTAAGAAAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCG
ACGCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATAGGCAATTATGGACCACAGGGAATGA
AAGATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCCAA
CTTATGAAGATAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTAG*AGATGTACCATGGGAGATGTTTG
TTGATTCATGCAA*CGCATAAGAATTAT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4B542TF 678 0 0
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TTTAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCCAAGGCACAAGTTGTGGGATG
GCCGCCGGTACGATCTTTCCGGAAGAACGTCATGTCATGCCAAAAGCCAACCACCGGAGA
TGCCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTTCGGAAGCAGCGGAGTTACCTCCTCTGCCTCCGC
TTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGACGGTGCACCGTACCTAAGAAAAAT
TGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCGACGCCTTAAGCAAAATGTTCAG
CTCTTTTACCATAGGCAATTATGGACCACAGGGAATGAAAGATTTTATGAATGAGAGTAA
ATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCCAACTTATGAAGATAAAGATGGAGA
CTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTTTGTTGATTCATGCAAACGCATAAG
AATTATGAAGGGGTCAGA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4B542JQ 878 0 0
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AAGTTGAATCTTTCATCGACGGCTGTGGATTCAGTTTCTAAAGTTGATTTAGAGAATATG
AAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCGCCGGTACGA
TCTTTCCGGAAGAACGTCATGTCATGCCAAAAGCCAACCACCGGAGATGCCATCCAAGCA
GAGGAAAAGACTTTCGGAAGCAGCGGAGTTACCTCCTCTGCCTCCGCTTGTGCTACCGCA
GCTTACGTGAAGGTTAGCATGGACGGTGCACCGTACCTAAGAAAAATTGATTTGAAACTC
TACAAAACTTACCAAGATTTTTCCGACGCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATA
GGCAATTATGGACCACAGGGAATGAAAGATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTT
TTGAACGGATCAGATTACGTTCCAACTTATGAAGATAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTA
GGAGATGTACCATGGGAGATGTTTGTTGATTCATGCAAACGCATAAGAATTATGAAGGGG
TCAGATGCAAAAGGACTTGCTCCAAGGGCTTTAGAAAAATGCAAGAACAGAAGCTGAGTG
ATTGCCCCAAAAAGGCAACAAAGACCGGTTAGATCCGGTTATATATTCAAACAGAGAAAA
GCCAAACCGGCTCGAGTTACCGTTCCGAGCAGAGAGTTTGTGTATAATAATAATAATATT
TTGATGAATTACATTTTTAAATTTAACCCTTTTTTGTC

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 4

CO CL2556Contig1 1295 4 13 U
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TTGACCGGTTTGCCTTCCTGTTCAGGTATGTGAACCACCCTGAAGCTGTTGCTGCTGAGA
TAAATAAACATTGGGCTATCTTCAGAGTAATTTTTGATGCTCGTCCTTGGGACATGAGGA
CAATGGAAGCTCTATGCAGAGCATGCAAATACGCTGTACGTACATCTGGAAGATACATAA
TTAACACAATTGGGGAAATGCTGGCAAAAATTCAATTCCACTATCAGCAGCATCATCAGC
CATGCTTTCTCTATCTCTCCAGTGAAGTTATAAGATTTTTGGTTCAGACCCGTCTTGTGC
TGACTACTTGAAGAATCTGATTGAAACACTCTTTGCTCACACAACATGTCTAATGACAAG
TATCAAGGAAGTCACGGCTAGACCAGACATAGCTGATGATTGCTTTCTGTTGGCGTCGAG
ATGTCTTCGTTACTGTCCGCATTTATTTATTCCTTCTCCTATATTTTCCCCAATTGTAGA
TTGCGCAGTGATTGGAATGACGGTGCAGCACAGAGAGGCCTGCCACTCGATATTGACATT
TTTATCCGACATTTTTGACCTCGAGAAATCTGTGAATGAAGAGCAGTTCAAACGAATCAG
GGACAATGTCATTATCCCCCGGGGAGCTACAATCACCGGAATCTTGATTTCCTCATTAGC
AGGAGCACTTCCCAGTTCTCGTCTAGATACGGTAACATACGCGCTCCTAGCTCTGACCAG
AACATACGGGTTACAAGCAGTGGGTTGGGCTAAGGAAAGTGTTAGCCTGATACCTCGAAC
AGCTGTGACAGAGACCGAGTCTGCCAAGTTCTTACAAGCATTATCCGACGCTGCTTATGG
AGCAGATGTGAATTTTCTGATAGGATACGCAGAGGACCTTTCGGATGTTTGTCGCCGTAA
CCGTACTGTTCAAGAACTTGTTCAGGCAGCTTTGAAGCCTCTTGAGTTGAATCTGGTTGC
TCCTGTATCATAGAGAGATGGTGAAAACAAAGAAAGAAAGAAAAAGTGAGAAGGTCAATT
TTTACATAGACCCCTTTTGATGGTCTTTGTTCCAAAGGTTGAGAGATTTGATGTTTTCTG
TTCATAAAGATTTTTTTTTATTGTATTTCTTTCTGGTGTGAGCCGTTGTTCCATTGTTTG
GCCGGTTTATATCCAAAAGTGCGAAGAACCAAACAACTTCTTTCTATTTTTAAGTAAACC
GGGCGAGAGAAAACAGAAGAGAATCCTTTTCCTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4H526TF U 1
AF RR4H572TF U 1
AF RR4H572JQB C 599
AF RR4H526JQB C 742
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BS 662 662 RR4H572JQB
BS 663 716 RR4H572TF
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BS 861 861 RR4H526JQB
BS 862 870 RR4H572JQB
BS 871 871 RR4H526JQB
BS 872 916 RR4H572JQB
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BS 1174 1295 RR4H572JQB

RD RR4H526TF 656 0 0
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TATCAAGGAAGTCACGGCTAGACCAGACATAGCTGATGATTGCTTTCTGTTGGCGTCGAG
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QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4H572TF 716 0 0
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TTGACCGGTTTGCCTTCCTGTTCAGGTATGTGAACCACCCTGAAGCTGTTGCTGCTGAGA
TAAATAAACATTGGGCTATCTTCAGAGTAATTTTTGATGCTCGTCCTTGGGACATGAGGA
CAATGGAAGCTCTATGCAGAGCATGCAAATACGCTGTACGTACATCTGGAAGATACATAA
TTAACACAATTGGGGAAATGCTGGCAAAAATTCAATTCCACTATCAGCAGCATCATCAGC
CATGCTTTCTCTATCTCTCCAGTGAAGTTATAAGATTTTTGGTTCAGACCCGTCTTGTGC
TGACTACTTGAAGAATCTGATTGAAACACTCTTTGCTCACACAACATGTCTAATGACAAG
TATCAAGGAAGTCACGGCTAGACCAGACATAGCTGATGATTGCTTTCTGTTGGCGTCGAG
ATGTCTTCGTTACTGTCCGCATTTATTTATTCCTTCTCCTATATTTTCCCCAATTGTAGA
TTGCGCAGTGATTGGAATGACGGTGCAGCACAGAGAGGCCTGCCACTCGATATTGACATT
TTTATCCGACATTTTTGACCTCGAGAAATCTGTGAATGAAGAGCAGTTCAAACGAATCAG
G*ACAATGTCATTATCCCCCGGGGAGCTACAATCACCGGAATCTTGATTTCCTCAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4H572JQB 697 0 0
TTTTTATCCGACATTTTTGACCTCGAGAAATCTGTGAATGAAGAGCAGTTCAAACGAATC
AGGGACAATGTCATTATCCCCCGGGGAGCTACAATCACCGGAATCTTGATTTCCTCATTA
GCAGGAGCACTTCCCAGTTCTCGTCTAGATACGGTAACATACGCGCTCCTAGCTCTGACC
AGAACATACGGGTTACAAGCAGTGGGTTGGGCTAAGGAAAGTGTTAGCCTGATACCTCGA
ACAGCTGTGACAGAGACCGAGTTTGCCAAGTTTTTACAAGCATTATCCGACGCTGCTTAT
GGAGCAGATGTGAATTTTTTGATAGGATACGCAGAGGACCTTTCGGATGTTTGTCGCCGT
AACCGTACTGTTCAAGAACTTGTTCAGGCAGCTTTGAAGCCTCTTGAGTTGAATCTGGTT
GCTCCTGTATCATAGAGAGATGGTGAAAACAAAGAAAGAAAGAAAAAGTGAGAAGGTCAA
TTTTTACATAGACCCCTTTTGATGGTCTTTGTTCCAAAGGTTGAGAGATTTGATGTTTTC
TGTTCATAAAGATTTTTTTTTATTGTATTTCTTTTTGGTGTGAGCCGTTGTTCCATTGTT
TGGCCGGTTTATATCCAAAAGTGCGAAGAACCAAACAACTTCTTTCTATTTTTAAGTAAA
CCGGGCGAGAGAAAACAGAAGAGAATCCTTTTCCTAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4H526JQB 554 0 0
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GGGTTGGGCTAAGGAAAGTGTTAGCCTGATACCTCGAACAGCTGTGACAGAGACCGAGTC
TGCCAAGTTCTTACAAGCATTATCCGACGCTGCTTATGGAGCAGATGTGAATTTTCTGAT
AGGATACGCAGAGGACCTTTCGGATGTTTGTCGCCGTAACCGTACTGTTCAAGAACTTGT
TCAGGCAGCTTTGAAGCCTCTTGAGTTGAATCTGGTTGCTCCTGTATCATAGAGAGATGG
TGAAAACAAAGAAAGAAAGAAAAAGTGAGAAGGTCAATTTTTACATAGACCCCTTTTGAT
GGTCTTTGTTCCAAAGGTTGAGAGATTTGATGTTTTCTGTTCATAAAGATTTTTTTTTAT
TGTATTTCTTTCTGGTGTGAGCCGTTGTTCCATTGTTTGGCCGGTTTATATCCAAAAGTG
CGAAGAACCAAACAACTTCTTTCTATTTTTAAGTAAACCGGGCGAGAGAAAACAGAAGAG
AATCCTTTTCCTAG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 4

CO CL2557Contig1 1190 4 14 U
GGCGGTTCTGTATAAGTTCTTGGATTACTATAGTTCATTTGACTGGAGCAACTACTGCAT
CAGTGTGGGTGGTCCTGTGCCAATATCTAGCCTTCCAGAACTTGTTGCAGCTTCTCCAGA
AAATGGACACAAGTTATTGCTTGATGAGAAGTTTTTGAGAGACTGTGTAGAGTTATATTC
TACTACACCAACTAAGACTGTTGAGACAAAAGGTCTTCAGTTTCCTATCAGACATCTCAA
CATAGTTGATCCTCTTAAACACAGCAACAACCTTGGAAAAAGTGTTACAAAAGGAAATTT
CAAACGAATAATGCATGCTTTTACACTGGGAGCTAGAAAGCTCAGAGATGTTCTTTCACT
ACCTGGTGAAACCATGGGGTGGAGACTGGAGAAGTTCTTTTGGCAATTCTTTGGAGAGGA
ATGGTAAGGGCCAAAGACAAGATGTGAATGATCCGGTTACAGCGTTTGGTACTGGAAGGT
CAGAGCTATCTGAACTCGGTGGAGATTTTGAAGGTTACTTTGGTAGGCTTGTGTATGGTC
AGATGTATCATAGTCATAGGGATGCAAGTTCTTGGGATGTTGTCCGTCACCTTGTGAGTT
ACCGAGAGAACGAGTTTTATCTTAGAAGTCTTAGTGGATCAGCGTCAATGCAGTATTTGC
CATTGCAGTCTTTAACTAATGGAAAGAGGAGAGGAACAGGAACTTATATTCCTGACATGA
GTCAACAGAAATATTTTGACAAGTCCAGAGACTCTGGTAATGGAAACTCACGGACTCATC
ATTTAGAGTCTTTTTTTGCTGAGGCAAGAGAAGACAATGGAGCTAGTAGCTGCTGCGATC
TTTCTGGTCAAATGTTTACTTCTTGTACCAGTTTCAAAGGAGAAGAATGTGTCAAACCAG
AGACTTGTAGTAACCCAAAGAACCTTGTAGATACAAGCAGCACACTGAAAAAGGAAAATG
GCAAAGAAGGGGAGAGCAAATCATCACAAACGTTGAACGGTTCTTGACTTTAGTGATTGT
CACAGATTATCTTTGTTTGGTCTCTCTTTGGTATACCTTCAGGATAACTAGCTTTGTCTC
TATAAAAACCACATGAACAAACATTTAATTAGGATTCAAAAGATTCATCAGGAACTTGAT
TACTTTTTGTGGACCAATGTTTAATGAGAGACCTCTTCTTTGTTGCTGTT


BQ
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25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CQ45TF U 1
AF RR4CV70TF U 75
AF RR4CV70JQ C 434
AF RR4CQ45JQ C 483
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BS 790 790 RR4CQ45JQ
BS 791 1190 RR4CV70JQ

RD RR4CQ45TF 740 0 0
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CAGTGTGGGTGGTCCTGTGCCAATATCTAGCCTTCCAGAACTTGTTGCAGCTTCTCCAGA
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TACTACACCAACTAAGACTGTTGAGACAAAAGGTCTTCAGTTTCCTATCAGACATCTCAA
CATAGTTGATCCTCTTAAACACAGCAACAACCTTGGAAAAAGTGTTACAAAAGGAAATTT
CAAACGAATAATGCATGCTTTTACACTGGGAGCTAGAAAGCTCAGAGATGTTCTTTCACT
ACCTGGTGAAACCATGGGGTGGAGACTGGAGAAGTTCTTT*GGCAATTCTTTGGAGAGGA
ATGGTAAGGGCCAAAGACAAGATGTGAATGATCCGGTTACAGCGTTTGGTACTGGAAGGT
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AGATGTATCATAGTCATAGGGATGCAAGTTCTTGGGATGTTGTCCGTCACCTTGTGAGTT
ACCGAGAGAACGAGTTTTATCTTAGAAGTCTTAGTGGATCAGCGTCAATGCAGTATTTGC
CATTGCAGTCTTTAACTAATGGAAAGAGGAGAGGAACAG*AACTTATATTCCTGACATGA
GTCA
CAGAAATACTCTGACA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4CV70TF 681 0 0
CTGTGCCAATATCTAGCCTTCCAGAACTTGTTGCAGCTTCTCCAGAAAATGGACACAAGT
TATTGCTTGATGAGAAGTTTTTGAGAGACTGTGTAGAGTTATATTCTACTACACCAACTA
AGACTGTTGAGACAAAAGGTCTTCAGTTTCCTATCAGACATCTCAACATAGTTGATCCTC
TTAAACACAGCAACAACCTTGGAAAAAGTGTTACAAAAGGAAATTTCAAACGAATAATGC
ATGCTTTTACACTGGGAGCTAGAAAGCTCAGAGATGTTCTTTCACTACCTGGTGAAACCA
TGGGGTGGAGACTGGAGAAGTTCTTTTGGCAATTCTTTGGAGAGGAATGGTAAGGGCCAA
AGACAAGATGTGAATGATCCGGTTACAGCGTTTGGTACTGGAAGGTCAGAGCTATCTGAA
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CATAGGGATGCAAGTTCTTGGGATGTTGTCCGTCACCTTGTGAGTTACCGAGAGAACGAG
TTTTATCTTAGAAGTCTTAGTGGATCAGCGTCAATGCAGTATTTGCCATTGCAGTCTTTA
ACTAATGGAAAGAGGAGAGGAACAG*AACTTATATTCCTGACATGAGTCAACAGAAATAC
TCTGACAAGTCCAGAGACT
CT

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DS 

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ACTCGGTGGAGATTTTGAAGGTTACTTTGGTAGGCTTGTGTATGGTCAGATGTATCATAG
TCATAGGGATGCAAGTTCTTGGGATGTTGTCCGTCACCTTGTGAGTTACCGAGAGAACGA
GTTTTATCTTAGAAGTCTTAGTGGATCAGCGTCAATGCAGTATTTGCCATTGCAGTCTTT
AACTAATGGAAAGAGGAGAGGAACAGGAACTTATATTCCTGACATGAGTCAACAGAAATA
TTTTGACAAGTCCAGAGACTTTGGTAATGGAAACTCACGGACTCATCATTTAGAGTTTTT
TTTTGCTGAGGCAAGAGAAGACAATGGAGCTAGTAGCTGCTGCGATCTTTCTGGTCAAAT
GTTTACTTCTTGTACCAGTTTCAAAGGAGAAGAATGTGTCAAACCAGAGACTTGTAGTAA
CCCAAAGAACCTTGTAGATACAAGCAGCACACTGAAAAAGGAAAATGGCAAAGAAGGGGA
GAGCAAATCATCACAAACGTTGAACGGTTCTTGACTTTAGTGATTGTCACAGATTATCTT
TGTTTGGTCTCTCTTTGGTATACCTTCAGGATAACTAGCTTTGTCTCTATAAAAACCACA
TGAACAAACATTTAATTAGGATTCAAAAGATTCATCAGGAACTTGATTACTTTTTGTGGA
CCAATGTTTAATGAGAGACCTCTTCTTTGTTGCTGTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4CQ45JQ 708 0 0
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ATGTATCATAGTCATAGGGATGCAAGTTCTTGGGATGTTGTCCGTCACCTTGTGAGTTAC
CGAGAGAACGAGTTTTATCTTAGAAGTCTTAGTGGATCAGCGTCAATGCAGTATTTGCCA
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CAACAGAAATATTTTGACAAGTCCAGAGACTCTGGTAATGGAAACTCACGGACTCATCAT
TTAGAGTCTTTTTTTGCTGAGGCAAGAGAAGACAATGGAGCTAGTAGCTGCTGCGATCTT
TCTGGTCAAATGTTTACTTCTTGTACCAGTTTCAAAGGAGAAGAATGTGTCAAACCAGAG
ACTTGTAGTAACCCAAAGAACCTTGTAGATACAAGCAGCACACTGAAAAAGGAAAATGGC
AAAGAAGGGGAGAGCAAATCATCACAAACGTTGAACGGTTCTTGACTTTAGTGATTGTCA
CAGATTATCTTTGTTTGGTCTCTCTTTGGTATACCTTCAGGATAACTAGCTTTGTCTCTA
TAAAAACCACATGAACAAACATTTAATTAGGATTCAAAAGATTCATCAGGAACTTGATTA
CTTTTTGTGGACCAATGTTTAATGAGAGACCTTTTCTTTGTTGCTGTT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL2558Contig1 1119 4 11 U
GGACTCTCCAGTCACTTCCCTCTTTTGCAAATTCCCCCAGTCTCTGTTCCTCTTTGTTGA
CAAAAGAATCCTTTTTTCCTTTCCCGAAGACAGTTAACGCTCCATGTCGAAGCAGCACGC
GAACTGGTCTCCTTACGATAACAATGGAGGGTAAACGCATCGTGTCACCCTTTATTGAGC
ATCTAATTGAGCGTTTGCAATCTCTATTGAGCATCTGCAATCGCGATCTACTCCTGTGTA
TCGATCGCTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGATCAGAACATGTGTGGCCATCGCTGG
ATCGGATTACTGCGTGATCGCCGCAGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCAC
TCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAG
CTGATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTGAGAGACACATTTC
TTCTGGAAAAAAAGATAGAAAGGCTTTGGCGTAACAGTATCGTCTCCTTGTGTGTGTGTT
TGCAAATAGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAG
CTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGTCCTC
GGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTTTTCACGTACGACGCTGTTGGTTCGTAT
GAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCGACTCTGATTATGCCGTTTCTTGAT
AATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTCCTTCCTGCACAGGATGCTATCACGCCCCTT
TCGGAACCTGAAGCCGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGAT
ATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAAGACCGAA
GTCATGGACTTAAGGAAAGACTAAGCTGACTTTCCGCGCATATGAGTGTTGAGAACACAC
ACCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCCATATCAACTGTGTTTGACGTTTAAAACTGTTT
CCTTATCTTGTTAACAGTAACAAATTCTCGTTGTCTCAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 

AF RR4EF83TF U 1
AF RR4ED48TF U 1
AF RR4ED48JQ C 329
AF RR4EF83JQ C 412
BS 1 726 RR4ED48TF
BS 727 727 RR4ED48JQ
BS 728 748 RR4ED48TF
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BS 806 902 RR4ED48JQ
BS 903 903 RR4EF83JQ
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BS 1115 1115 RR4EF83JQ
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RD RR4EF83TF 657 0 0
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CAAAAGAATCCTTTTTTCCTTTCCCGAAGACAGTTAACGCTCCATGTCGAAGCAGCACGC
GAACTGGTCTCCTTACGATAACAATGGAGGGTAAACGCATCGTGTCACCCTTTATTGAGC
ATCTAATTGAGCGTTTGCAATCTCTATTGAGCATCTGCAATCGCGATCTACTCCTGTGTA
TCGATCGCTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGATCAGAACATGTGTGGCCATCGCTGG
ATCGGATTACTGCGTGATCGCCGCAGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCAC
TCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAG
CTGATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTGAGAGACACATTTC
TTCTGGAAAAAAAGATAGAAAGGCTTTGGCGTAACAGTATCGTCTCCTTGTGTGTGTGTT
TGCAAATAGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAG
CTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGTC

QA 1 657 1 657
DS 

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CAAAAGAATCCTTTTTTCCTTTCCCGAAGACAGTTAACGCTCCATGTCGAAGCAGCACGC
GAACTGGTCTCCTTACGATAACAATGGAGGGTAAACGCATCGTGTCACCCTTTATTGAGC
ATCTAATTGAGCGTTTGCAATCTCTATTGAGCATCTGCAATCGCGATCTACTCCTGTGTA
TCGATCGCTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGATCAGAACATGTGTGGCCATCGCTGG
ATCGGATTACTGCGTGATCGCCGCAGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCAC
TCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAG
CTGATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTGAGAGACACATTTC
TTCTGGAAAAAAAGATAGAAAGGCTTTGGCGTAACAGTATCGTCTCCTTGTGTGTGTGTT
TGCAAATAGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAG
CTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGTCCTC
GGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTTTTCACGTACGACGCTGTTGGTTCGTAT
GAGAAG*TTGGATACAGTGCTCAAGGCT
C

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4ED48JQ 791 0 0
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CAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTGATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTACT
TACATCAAGGCACTTGGTGAGAGACACATTTCTTCTGGAAAAAAAGATAGAAAGGCTTTG
GCGTAACAGTATCGTCTCCTTGTGTGTGTGTTTGCAAATAGGTTTATCAGCATCAGCATA
ACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGC
GCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGTCCTCGGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGT
GTGTTTTCACGTACGACGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCT
TTGGATCGACTCTGATTATGCCGTTTCTTGATAATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTTTTC
TCCTTCCTGCACAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCCGTTGACTTGGTGA
AGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATTTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCA
TGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAAGACCGAAGTCATGGACTTAAGGAAAGACTAAGCTG
ACTTTCCGCGCATATGAGTGTTGAGAACACACACCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCC
ATATCAACTGTGTTTGACGTTTAAAACTGTTTCCTTATCTTGTTAACAGTAACAAATTCT
CGTTGTTTCAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4EF83JQ 708 0 0
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ACACATTTCTTCTGGAAAAAAAGATAGAAAGGCTTTGGCGTAACAGTATCGTCTCCTTGT
GTGTGTGTTTGCAAATAGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCT
ATGGCTCAGCTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTT
AATGTCCTCGGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTTTTCACGTACGACGCTGTT
GGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCGACTCTGATTATGCCG
TTTCTTGATAATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTCCTTCCTGCACAGGATGCTATC
ACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCCGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACT
GAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATC
AAGACCGAAGTCATGGACTTAAGGAAAGACTAAGCTGACTTTCCGCGCATATGAGTGTTG
AGAACACACACCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCCATATCAACTGTGTTTGACGTTTA
AAACTGTTTCCTTATCTTGTTAACAGTAACAAATTCTCGTTGTCTCAG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL2559Contig1 1324 3 15 U
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ACTTAAGGTGACTTGTTTCAAAAGAAACCAGTTCACTAAAACATAACAGTAGAAAACAAA
GATAACACGAACACAACAGAAGCACGAAATACATATTCCTCCAGGGTCAACTCTTAAATT
CGGCTAATTCAGGGAGGGGTCAAGGAGTTAGCCACGTCGATCACGAACCTGTACCTAACA
TCAGAATTAGCAAGCCTCTCCATTGCAGTATTAATCTCATCCATCTTAATCAGCTCAATA
TCTGCCGTTATGTTATGCTTAGCGCAAAACTCAAGCATCTCTTGTGTCTCTTTCATCCCT
CCAATGTCACTTCCTCCCACCATTTTCCTTCCGAGAACAAGAGGGAAGATTGGCAGCTCA
AGAGGCTTCTCAGGTAAGCCTAATGTGACGAGCTTTCCATTGACTTTGAGTAAACCGAGT
AATGGAAACAGAGCATGTACTGCTGATACCGTATCGATAATATAGTCCATTGTTCCTATT
GCAGCCTTCATCTTCTGAGGATCAGATGAGACAAGGAATGAATCAGCACCAAGTTGATTA
ATGGCTTCGTCTTCTTTACTAGGAGAAGAGCTAATGACAGTGACTTTCAAACCAAAGGCT
TTACCTATCTTGACAGCAACATGACCAAGTCCACCAAGTCCAGCCACACCCAAATGCTTC
CCTGGCTCGGTCATACCATAATACTTCATTGGACTATACACAGTGATTCCAGCGCACAAC
AAGGGGGCACCAGAATCGCTAGGTAGTCCCTCGGAAAACTGCAGAACAAACCGTTGATCG
ACCACAATGGACTCTGAATATCCACCGTAGGTCTTGGTTCCATCGGATCCAATGGAGTTG
TAGGTGAAAGACATTTGGGGACAGTAGTTTTCAAGATCTTGGTTACAAGATTCGCAAGAC
TGGCAAGAACCAGTGATCACTCCTACTCCTACACGGTCTCCTTCTCTGAATTTAGTCACG
TTTTTGCCAACTTTTGTGGCTATTCCAACTATTTCATGCCCTGGAACTACTGGATAATAG
GAGAAACCCCAGTCGTTTTTGATGGTATGCAAATCAGTGTGGCACACTCCACAATACAAG
ATTTTCACTGTCACATCATTGTCACCATTGTCTCTTCTGGAGAAATGGAAAGGAGAGAGT
AGACCAGATTTGTCTTTGGCAGCCCAACCAAAGGCTTTGTTCGGATGCTCTGTCTCCGGA
GATTTCGCCATTTGTTTCTCTTTTGTCCGAGTGAGTGAGTGGAGATTGGGTTTATGTTGT
GTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4D552JQ U 1
AF RR4EY69JQ U 1
AF RR4EY69TF C 608
BS 1 37 RR4D552JQ
BS 38 38 RR4EY69JQ
BS 39 544 RR4D552JQ
BS 545 545 RR4EY69JQ
BS 546 773 RR4D552JQ
BS 774 786 RR4EY69JQ
BS 787 787 RR4EY69TF
BS 788 790 RR4EY69JQ
BS 791 791 RR4EY69TF
BS 792 817 RR4EY69JQ
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BS 847 847 RR4EY69TF
BS 848 857 RR4EY69JQ
BS 858 1324 RR4EY69TF

RD RR4D552JQ 779 0 0
CTCTAACCAGAAAGACTTTATTATATCATGAAAAGAATAACAGAGAGAAGTTCTCTGACA
ACTTAAGGTGACTTGTTTCAAAAGAAACCAGTTCACTAAAACATAACAGTAGAAAACAAA
GATAACACGAACACAACAGAAGCACGAAATACATATTCCTCCAGGGTCAACTCTTAAATT
CGGCTAATTCAGGGAGGGGTCAAGGAGTTAGCCACGTCGATCACGAACCTGTACCTAACA
TCAGAATTAGCAAGCCTCTCCATTGCAGTATTAATCTCATCCATCTTAATCAGCTCAATA
TCTGCCGTTATGTTATGCTTAGCGCAAAACTCAAGCATCTCTTGTGTCTCTTTCATCCCT
CCAATGTCACTTCCTCCCACCATTTTCCTTCCGAGAACAAGAGGGAAGATTGGCAGCTCA
AGAGGCTTCTCAGGTAAGCCTAATGTGACGAGCTTTCCATTGACTTTGAGTAAACCGAGT
AATGGAAACAGAGCATGTACTGCTGATACCGTATCGATAATATAGTCCATTGTTCCTATT
GCAGTCTTCATCTTCTGAGGATCAGATGAGACAAGGAATGAATCAGCACCAAGTTGATTA
ATGGCTTCGTCTTCTTTACTAGGAGAAGAGCTAATGACAGTGACTTTCAAACCAAAGGCT
TTACCTATCTTGACAGCAACATGACCAAGTCCACCAAGTCCAGCCACACCCAAATGCTTC
CCTGGCTCGGTCATACCATAATACTTCATTGGACTATACACAGTGATTCCAGC
ACAAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4EY69JQ 859 0 0
CTCTAACCAGAAAGACTTTATTATATCATGAAAAGAAAAACAGAGAGAAGTTCTCTGACA
ACTTAAGGTGACTTGTTTCAGAAGAAACCAGTTCACTAAAACATAACAGTAGAAAACAAA
GATAACACGAACACAACAGAAGCACGAAATACATATTCCTCCAGGGTCAACTCTTAGATT
CGGCTAATTCAGGGAGGGGTCAAGGAGTTAGCCACGTCGATCACGAACCTGTACCTAACA
TCAGACTTAGCAAGCCTCTCCATTGCAGTATTAATCTCATCCATCTTAATCAGCTCAATA
TCTGCCGTTATGTTATGCTTAGCGCAGAACTCAAGCATCTCTTGTGTCTCTTTCATCCCT
CCAATGTCACTTCCTCCCACCATTTTCCTTCCGAGAACAAGAGGGAAGATTGGCAGCTCA
AGAGGCTTCTCAGGTAAGCCTAATGTGACGAGCTTTCCATTGACTTTGAGTAAACCGAGT
AATGGAAACAGAGCATGTACTGCTGATACCGTATCGATAATATAGTCCATTGTTCCTATT
GCAGCCTTCATCTTCTGAGGATCAGATGAGACAAGGAATGAATCAGCACCAAGTTGATTA
ATGGCTTCGTCTTCTTTACTAGGAGAAGAGCTAATGACAGTGACTTTCAAACCAAAGGCT
TTACCTATCTTGACAGCAACATGACCAAGTCCACCAAGTCCAGCCACACCCAAATGCTTC
CCTGGCTCGGTCATACCATAATACTTCATTGGACTATACACAGTGATTCCAGCGCACAAC
AAGGGG*CAC*AGAATCGCTAGGTAGTCCCTCGGAAA*CTGCAGAACAAACCGTTGATCG
ACCACA*TGGACTCTGA
TA

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR4EY69TF 717 0 0
CGTCTTCTTTACTAGGAGAAGAGCTAATGACAGTGACTTTCAAACCAAAGGCTTTACCTA
TCTTGACAGCAACATGACCAAGTCCACCAAGTCCAGCCACACCCAAATGCTTCCCTGGCT
CGGTCATACCATAATACTTCATTGGACTATACACAGTGATTCCAGCGCACAACAAGGGGG
CACCAGAATCGCTAGGTAGTCCCTCGGAAAACTGCAGAACAAACCGTTGATCGACCACAA
TGGACTCTGAATATCCACCGTAGGTCTTGGTTCCATCGGATCCAATGGAGTTGTAGGTGA
AAGACATTTGGGGACAGTAGTTTTCAAGATCTTGGTTACAAGATTCGCAAGACTGGCAAG
AACCAGTGATCACTCCTACTCCTACACGGTCTCCTTCTCTGAATTTAGTCACGTTTTTGC
CAACTTTTGTGGCTATTCCAACTATTTCATGCCCTGGAACTACTGGATAATAGGAGAAAC
CCCAGTCGTTTTTGATGGTATGCAAATCAGTGTGGCACACTCCACAATACAAGATTTTCA
CTGTCACATCATTGTCACCATTGTCTCTTCTGGAGAAATGGAAAGGAGAGAGTAGACCAG
ATTTGTCTTTGGCAGCCCAACCAAAGGCTTTGTTCGGATGCTCTGTCTCCGGAGATTTCG
CCATTTGTTTCTCTTTTGTCCGAGTGAGTGAGTGGAGATTGGGTTTATGTTGTGTCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 4

CO CL2560Contig1 1045 4 10 U
TTTTTTTTAAAAAGAGGATCCAAACCAGAGAGAGAGTGCTATGGAAGGAGGAGCTGGTAT
CTACAACCCACGCACTGTCGAAGAAGTTTTCAGGGATTTCAAAGGCCGTAGAGCCGCCAT
TGTCAAAGCTCTCACCTCCGATGTTGCAGAGTTTTACCAGCAATGCGATCCTGAGAAGGA
GAATCTGTGCTTGTATGGGTTACCGAACGAACAATGGGAAGTGAACTTACCAGCAGAAGA
AGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCATTAACTTTGCAAGAGATGGGCTCTC
TGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAGTGACACTTGGTTGCTCTCTGTCTC
TTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGACAAATACGAGAGGAAACGCTTGTCCGATAT
GATCAATGGGGTTCCTACCATATTTGAAGTAGTCACTGGAAATATGAAAAAGCAAACAAA
GGATAAGTCCTCTGCTTCAAATCGAAATGGCAATCTATCCAAGTCGGATTCCAAAGTGAG
ATCTTCAGATGGCAAAAGCTCAAAGGCCATGCAGGCAAACAATGAGGAAGATGGATCAGA
GGAAGAGGATGAGGATGAACACGGGGAAACCCTTTGTGGTGCATGTGGAGACGGTGATGG
TACTGGTACTGATGATTTCTGGATCTGCTGTGACGTTTGTGAGGTATGGTTCCACGGGAA
GTGTGTGAAGATAACTCCAGCTAGAGCTGAGCATATCAAACAGTACAAGTGCCCTGCATG
TAGCAACAAAAGAGCACGATCTTAAATGTTCTATTTGTAGAGAGTGTAGCCTGTAGTAAG
AAACTCTTACTACCCTCATCTTTACTTGGCTAGTTCTTAGCTCTTTCTATCCCACCATAA
CAACTTAGCCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTGTATAATTAATTGGTTTGTTTCCAGAA
ACATATTTTCCAAGTCCATTAATCAAACTTGCTCATATGCAGTTAGCTTTTAAAACCATC
AGGACAGACGGTTTTGAGCACCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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AF RR4FZ76TF U 1
AF RR4C229TF U 36
AF RR4C229JQ C 496
AF RR4FZ76JQ C 281
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BS 650 864 RR4FZ76JQ
BS 865 865 RR4C229JQ
BS 866 875 RR4FZ76JQ
BS 876 876 RR4C229JQ
BS 877 972 RR4FZ76JQ
BS 973 973 RR4C229JQ
BS 974 989 RR4FZ76JQ
BS 990 990 RR4C229JQ
BS 991 1045 RR4FZ76JQ

RD RR4FZ76TF 649 0 0
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GAATCTGTGCTTGTATGGGTTACCGAACGAACAATGGGAAGTGAACTTACCAGCAGAAGA
AGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCATTAACTTTGCAAGAGATGGGCTCTC
TGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAGTGACACTTGGTTGCTCTCTGTCTC
TTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGACAAATACGAGAGGAAACGCTTGTCCGATAT
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GGAAGAGGATGAGGATGAACACGGGGAAACCCTTTGTGGTGCATGTGGA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4C229TF 614 0 0
GGGA
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AGTGAACTTACCAGCAGAAGAAGTGCCTCCGGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCATTAA
CTTTGCAAGAGATGGACTCTCTGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAGTGA
CACTTGGTTGCTCTCTGTCTCTTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGA**AATACGA
GAGGAAACGCTTGTTTGATATGATCAATGGGGTCCCTACCATATTTGAAGTAGTCACTGG
AAATATGAAAAAGCAAACAAAGGATAAGTCCTCTGCTTCAAATCGAAATGGCAATCTATC
CAAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGCTCACAGGCCATGCAGGCAAA
CAATGAGGAAGATGGATCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAACATGGGGAAACCCTTTGTGG
TGCCTGTGGA

QA 5 614 5 614
DS 

RD RR4C229JQ 505 0 0
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AAGCTCACAGGCCATGCAGGCAAACAATGAGGAAGATGGATCAGAGGAAGAGGATGAGGA
TGAACATGGGGAAACCCTTTGTGGTGCCTGTGGAGACGGTGATGGTACTGGTACTGATGA
TTTCTGGATCTGCTGTGACGTTTGTGAGGTATGGTTCCACGGGAAGTGTGTGAAGATAAC
TCCAGCTAGAGCTGAGCATATCAAACAGTACAAGTGCCCTGCATGTAGCAACAAAAGAGC
TCGATCTTAAATGTTCTATTTGTAGAGAGTGTAGCCTGTAGTAAGAAACTCTTACTACCC
TCATCTTTACTTGGCTAGTTCTTAGCTCTTTCTATCCCCCCATAACAACTTAGCCCCTAT
TTCTCATTTGAATTTGCTGTATAATTAATTGGTTTGTTTCCAGAAACATATTT*CCAAGT
TCATTAATCAAACTTGCTCATATGC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4FZ76JQ 765 0 0
TTTGCAAGAGATGGGCTCTCTGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAGTGAC
ACTTGGTTGCTCTCTGTCTCTTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGACAAATACGAG
AGGAAACGCTTGTCCGATATGATCAATGGGGTTCCTACCATATTTGAAGTAGTCACTGGA
AATATGAAAAAGCAAACAAAGGATAAGTCCTCTGCTTCAAATCGAAATGGCAATCTATCC
AAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGCTCAAAGGCCATGCAGGCAAAC
AATGAGGAAGATGGATCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAACACGGGGAAACCCTTTGTGGT
GCATGTGGAGACGGTGATGGTACTGGTACTGATGATTTCTGGATCTGCTGTGACGTTTGT
GAGGTATGGTTCCACGGGAAGTGTGTGAAGATAACTCCAGCTAGAGCTGAGCATATCAAA
CAGTACAAGTGCCCTGCATGTAGCAACAAAAGAGCACGATCTTAAATGTTCTATTTGTAG
AGAGTGTAGCCTGTAGTAAGAAACTCTTACTACCCTCATCTTTATTTGGCTAGTTTTTAG
CTCTTTCTATCCCACCATAACAACTTAGCCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTGTATAAT
TAATTGGTTTGTTTCCAGAAACATATTTTCCAGGTCCATTAATCAAACT*GCTCATATGC
AGTTAGCTTTTAAAACCATCAGGACAGACGGTTTTGAGCACCCGT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL2561Contig1 955 2 14 U
GCGTTCTTCTGGATTCTCCGGCGGAATATTTCCTAAAAGATTATTTATTTGTTGCCGGAG
ATATATTTTCAGATATTAGCTTTGGAGAAAGCAGAGATGATGAAACTTTTGCATCTGTTC
ATAACTTCATCGAAACCTGTTGTGGAGATTCTGCTGATAACAACCGTTGGATTCTATATG
GCTCTTGACGGAGTCAATCTTCTTGGTCAAGATGCTCGCAAATTTTTGAACAACATTGTC
TTCTATGCGTTTAGTCCTTCCCTTATTGGAAGCCGTTTAGCTAATAGTGTTACATATGAA
AGCTTGATGCAAATGTGGTTCATGCCGGTTAATGTTCTGCTCACATTCATCATTGGTTCG
TTCTTAGGCTGGATTGTTATTCTCATCACCAAGCCTCCTTCCCATCTTCGTGGTCTCATT
GTTGGTTGTTGTGCTGCTGGGAATCTGGGAAACATCCCACTAATCATTGTTCCAGCTCTT
TGTAAAGAGAAAGGAGGTCCATTTGGAGATCCAGAGAATTGTCACAAGTATGGAGTTGGT
TATGTTGCACTCTCCATGGCTATGGGAGCAGTTTACATATGGACTTACGTATACAATCTT
ATGCGGGTGCTATCAAACCCTCCCATTGAAACTCAACCTTCTATTGAATCCAACAGCTGC
AAAGTCCCACTGATCTCATCTAGAGAAGAAGAGACTAACCAAAAGGTTGGGAGGTGGGAC
AAAGTCAAGTTAAGAATGGTTTCACTGGCTGACAAAGTCAACTTAAGGACAATATTTGCT
CCATCAACTATTGCTGCGATGATCGCTCTTGTGGTCGGGCTCATTACTCCTATAAGGAAG
CTAATCATCGGCAACGGAGCTCCTCTAGGAGTACTTCAAGACTCTGCAACTTTAGTGGGA
GATGGAGCCATTCCTGCTATGACACTGATCATCGGAGGAACTTACTCAAAGCATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ19TF U 1
AF RR4CD44TF U 386
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BS 568 568 RR4CD44TF
BS 569 646 RR4CZ19TF
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BS 717 733 RR4CZ19TF
BS 734 955 RR4CD44TF

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ATGCGGGTGCTATCAAACCCTCCCATTGAAACTCAACCTTCTATTGGATCCAACAGCTGC
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AAAGTCAAGTTAA

QA 1 733 1 733
DS 

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G
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TGAAACTCAACCTTCTATTGAATCCAACAGCTGCAAAGTCCCACTGATCTCATCTAGAGA
AGAAGAGGCTAACCAAAAGGTTGGGAGGTGGGACAAAGTCAAGTTAAGAATGGTTTCACT
GGCTGACAAAGTCAACTTAAGGACAATATTTGCTCCATCAACTATTGCTGCGATGATCGC
TCTTGTGGTCGGGCTCATTACTCCTATAAGGAAGCTAATCATCGGCAACGGAGCTCCTCT
AGGAGTACTTCAAGACTCTGCAACTTTAGTGGGAGATGGAGCCATTCCTGCTATGACACT
GATCATCGGAGGAACTTACTCAAAGCATG

QA 2 570 2 570
DS 



AS 1 4

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TCCTCCAGACTTCCTCTTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTGACTTCTCCTCATCAACTGC
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GTTCTTACGTGGGG*CAACACCCTTGTCATAAAACTCCAGCCTTTCCTCTACCTGTTCCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CN36TF C 1
AF RR4CN36JQ U 10
AF RR4BI06JQ U 10
AF RR4BI06TF C 347
BS 1 10 RR4CN36TF
BS 11 15 RR4BI06JQ
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BS 886 1058 RR4BI06TF

RD RR4CN36TF 765 0 0
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TCCTCCAGACTTCCTCTTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCTGACTTCTCCTCATCAACTGC
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C

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4CN36JQ 756 0 0
A
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TCACCCTTTGCCTTCTTCTTCTTGCTTTTCTTTCCTGAGGCCTCCACTGTCTCCTTCACT
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C

QA 2 755 2 755
DS 

RD RR4BI06JQ 876 0 0
C
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AACAGAGTTTTACTAAGAAGAAGAAACAGAGCAAAAACATTTTAGCTTCAAACAAAAAGA
ACAATAGAATACATAATTGGTTTGTTATCTTGCCCCTATTCCTCACTCTTGGACTTCTTC
TTCTTCGATTTCTTCTTGCTCTGAGTCTGACCATCATCAGTCTCCTCCTCTCCTCCAGAC
TTCCTCTTCTCTTTCTTCTTCTTTTTCTCTGACTTCTCCTCATCAACTGCCTCCTCTTCT
TCACCCTTTGCCTTCTTCTTCTTGCTTTTCTTTCCTGAGGCCTCCACTGTCTCCTTCACT
TCCTCATCTTTGTTTTGGAGATTCTCTATCACCTCCTTCATTACATCCACGTTCTTACGT
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AGAATGGAAGATCAACCCATACTTGGGTGTGTTTCCACGTGTTTTAAGAACCCTGAAAAG
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AGGGGCAATGTCGCTCATCTTAGCGACAAGGTAATCATAGAGCTTCTTCCTGTAGTCAGC
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QA 2 876 2 876
DS 

RD RR4BI06TF 712 0 0
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CTCTACCTGTTCC*TAAGCTTCTCACCAAATGCTGTTGTTGCGACATCAGCAAAACAATC
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CTTTGACTTGTCTTCAATCATCTTTGAAACACGGGCGTAAAGATAATTGTCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 4

CO CL2563Contig1 1380 4 9 U
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GCGAACTCATGGCCTAAGTGTTTCATGGGTGTCAACATGCTCCTCAGCTTTTGTGAACTG
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TGAACGCAAGAAGGAGTGCATCAGACATGCCAGAGAGAGATTTTCGAGAGAGTCAACAGC
TACTACAAAGACTCTGCAGCAGAGTTGAAAGAAGAAAGAGCTTCACTATTGGAGGATTGG
CTTAACAGGAGACAAACTTTGGTAATCTCGGGGATGTGAGTGTGGTACAATCTTAGCTCC
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CGAGAAGCATGAGAGCTGGATCCTCCCATTTGAGGGTGGGAACCATGGCATACTGTCTGT
TAGCGTACCGTCTTTACAGATGGATAACACTCTGCATCCTGACATCAAAGACTGTGTCTT
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GATGTTGGTGCCATGGTTAATCCAAAACTATTTGGAGTGAACCTGTACTTAAACTCCACA
CTAGGGACTAGGTTCTTTTTCGACACCAACCTCCCTGAAATAACAGAGTTTGTCAGCAGT
TAAGAACAGAATACTCAAGTAGTAACAGAGATTCTCCGCATTGTGATGCTACCATACATA
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AATAGGTCTCAATTTTTAAATGTAAATTTGTTCTCTCTTTTTGAGGTGCCAAGTACCAAA
CTGCTGATTCTGGAACGCCTGTAATTTTAGAATACTTTGCTTATCTCCCTCTACTGTCAC


BQ
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AF RR4F436TF U 1
AF RR4FL89TF U 1
AF RR4F436JQ C 703
AF RR4FL89JQ C 719
BS 1 629 RR4F436TF
BS 630 734 RR4FL89TF
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BS 736 763 RR4FL89TF
BS 764 764 RR4F436JQ
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BS 793 808 RR4FL89TF
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CGAAGAAGCTCAAGAAGAGAAAACGAATCACCAGAGAAGATGGCTCTATAGAGATCTTCA
CGAGAAGCATGAGAGCTGGATCCTCCCATTTGAGGGTGGGAACCATGGCATACTGTCTGT
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AC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 2 4

CO CL2564Contig1 547 2 3 U
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TAAAAAACAATAAGGATATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATATTTGATA
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AACTATG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4BC82JQ C 1
AF RR4BC82TF U 1
BS 1 2 RR4BC82JQ
BS 3 544 RR4BC82TF
BS 545 547 RR4BC82JQ

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CTAATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGATGAAAATCAAAAAA
TAAAAAACAATAAGGATATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATATTTGATA
TGTTGTGCTCGTCTTCTTCCCTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTC
TTTGTATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAGATTTATT
AACTATG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4BC82TF 547 0 0
GG
ACTAACAAAACCATACTCAAGAACAAACAAAAAAGAGCTAAAAAAGTTTTCATTTGAAGA
AGAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACAAATCTCATCATAATCCTCGTTACCATCAT
CACCGGGACTCCACCAAGGAGTTTCGAGTTTCCTTTGCCGCTGAAGAACCTATCCATGTC
TTGGAGTGTGCAGATACGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTACAAAAGAAGTGGATGTTGAC
AAGGAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGGACGACGACT
AATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGATGAAAATCAAAAAATA
AAAAACAATAAGGATATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATATTTGATATG
TTGTGCTCGTCTTCTTCCCTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTCTT
TGTATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAGATTTATTAA
CT
ATG

QA 3 544 3 544
DS 



CO CL2564Contig2 556 2 1 U
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CATTTGAAGAAGAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACAATTCTCAGCATCATCCTCG
TTACCATCATCACCGGGACTCCGCCAAGGAGTTTCGAGTTACCTTTGCCGCTGAAGAACC
TATCCATGTCTTGGAGTGTACAGATTGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTACAAAAGAAGTG
GATGTTGACAAGGAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGG
ACGACGACTAATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGCTGAATAA
TTAAAAAATAAAAACAATAAGGACATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATA
TTTGATATGTTGTGCTCGTCTTCTTCCTTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTAC
TGTGGTCTTTGTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAG
TAAAATTTTATTAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EP33JQ C 1
AF RR4EP33TF U 1
BS 1 556 RR4EP33TF

RD RR4EP33JQ 556 0 0
GGGAATCACTAATCACTAACAAAACCATACTCAAGAACAAAAAAGAGCTAAAAGAGTTTT
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TTACCATCATCACCGGGACTCCGCCAAGGAGTTTCGAGTTACCTTTGCCGCTGAAGAACC
TATCCATGTCTTGGAGTGTACAGATTGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTACAAAAGAAGTG
GATGTTGACAAGGAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGG
ACGACGACTAATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGCTGAATAA
TTAAAAAATAAAAACAATAAGGACATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATA
TTTGATATGTTGTGCTCGTCTTCTTCCTTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTAC
TGTGGTCTTTGTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAG
TAAAATTTTATTAACT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4EP33TF 556 0 0
GGGAATCACTAATCACTAACAAAACCATACTCAAGAACAAAAAAGAGCTAAAAGAGTTTT
CATTTGAAGAAGAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACAATTCTCAGCATCATCCTCG
TTACCATCATCACCGGGACTCCGCCAAGGAGTTTCGAGTTACCTTTGCCGCTGAAGAACC
TATCCATGTCTTGGAGTGTACAGATTGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTACAAAAGAAGTG
GATGTTGACAAGGAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGG
ACGACGACTAATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGCTGAATAA
TTAAAAAATAAAAACAATAAGGACATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATA
TTTGATATGTTGTGCTCGTCTTCTTCCTTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTAC
TGTGGTCTTTGTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAG
TAAAATTTTATTAACT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 4

CO CL2565Contig1 897 4 2 U
GCAAACCGTGATTTTCAGACCAAATCGGTAAGAGATTCCTGGTTTGTGTCTTTTACGGTG
ATGGAGATGATGTCAGGAGGACGTACGTTCTCAATCGAGGTCTCGGAATACGGAAACGAT
CAGCCGGCGGCGACGGAGAAGGCTTCCTCCTCATCCTCTTACAGAGACACTGTGGACGAG
GATGAAGCCGGTTTGAGTCGAATCTGGCCAGGGAAGACGGTGGATTACTCGTCGGAAAGT
TCATCGTCGATCGGAAGTCCGGGAGACAGCGAGGAAGACGAAGAAAGTGAAGACGAAGAG
TTAGGGTTGTCTTCAATGAGCTCTCTAGAAGATTCCCTCCTCAGCAAAAGAGGGTTATCG
AATCACTACAAAGGGAAATCGAAATCGTTTGGGAACTTAGGAGAGATCGGGAGTGTTAAA
GAAGTACCAAAGCAAGGGAATCCATTGAACAAACGAAGAAGGTTACAGATCTGTAATAAG
TTAGCAAGAAGATCGTTCTACTCTTGGCAAAACCCTAAATCTATGCCTCTTTTTCCGGTC
AGCGAAGACCACGATGAGGAGGATGAAGAACTCAAATCTAGTGATGAAGAGCGAGGAGGA
GGAGGAGGTGTTTTTGTGAGGAAACCTTCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTCAGAGT
TGTTTTGCACTCTCGGATCTGCAGGAAGAAGAAGACGATGATGAGGATGATGAAGATGAT
CAATAATGCAAATCGTTTATCTTTTTTCTTTTCTTTTGTTCATAGTTCATTTTTTCTTTG
TTTTCTCTTAATTTCTTTTCGTCGCGCGAATTAATGTTCTTTATTTAATTCGGGAAATTA
GTTATATATTATGTCGACGGGAGAAAAGCAATGAACCACGTTAGTGTTTGATTCTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H710TF U 1
AF RR4GX46TF U 1
AF RR4GX46JQ C 52
AF RR4H710JQB C 149
BS 1 680 RR4GX46TF
BS 681 897 RR4GX46JQ

RD RR4H710TF 597 0 0
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ATGGAGATGATGTCAGGAGGACGTACGTTCTCAATCGAGGTCTCGGAATACGGAAACGAT
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QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4GX46TF 680 0 0
GCAAACCGTGATTTTCAGACCAAATCGGTAAGAGATTCCTGGTTTGTGTCTTTTACGGTG
ATGGAGATGATGTCAGGAGGACGTACGTTCTCAATCGAGGTCTCGGAATACGGAAACGAT
CAGCCGGCGGCGACGGAGAAGGCTTCCTCCTCATCCTCTTACAGAGACACTGTGGACGAG
GATGAAGCCGGTTTGAGTCGAATCTGGCCAGGGAAGACGGTGGATTACTCGTCGGAAAGT
TCATCGTCGATCGGAAGTCCGGGAGACAGCGAGGAAGACGAAGAAAGTGAAGACGAAGAG
TTAGGGTTGTCTTCAATGAGCTCTCTAGAAGATTCCCTCCTCAGCAAAAGAGGGTTATCG
AATCACTACAAAGGGAAATCGAAATCGTTTGGGAACTTAGGAGAGATCGGGAGTGTTAAA
GAAGTACCAAAGCAAGGGAATCCATTGAACAAACGAAGAAGGTTACAGATCTGTAATAAG
TTAGCAAGAAGATCGTTCTACTCTTGGCAAAACCCTAAATCTATGCCTCTTTTTCCGGTC
AGCGAAGACCACGATGAGGAGGATGAAGAACTCAAATCTAGTGATGAAGAGCGAGGAGGA
GGAGGAGGTGTTTTTGTGAGGAAACCTTCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTCAGAGT
TGTTTTGCACTCTCGGATCT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GX46JQ 846 0 0
TTTACGGTGATGGAGATGATGTCAGGAGGACGTACGTTCTCAATCGAGGTCTCGGAATAC
GGAAACGATCAGCCGGCGGCGACGGAGAAGGCTTCCTCCTCATCCTCTTACAGAGACACT
GTGGACGAGGATGAAGCCGGTTTGAGTCGAATCTGGCCAGGGAAGACGGTGGATTACTCG
TCGGAAAGTTCATCGTCGATCGGAAGTCCGGGAGACAGCGAGGAAGACGAAGAAAGTGAA
GACGAAGAGTTAGGGTTGTCTTCAATGAGCTCTCTAGAAGATTCCCTCCTCAGCAAAAGA
GGGTTATCGAATCACTACAAAGGGAAATCGAAATCGTTTGGGAACTTAGGAGAGATCGGG
AGTGTTAAAGAAGTACCAAAGCAAGGGAATCCATTGAACAAACGAAGAAGGTTACAGATC
TGTAATAAGTTAGCAAGAAGATCGTTCTACTCTTGGCAAAACCCTAAATCTATGCCTCTT
TTTCCGGTCAGCGAAGACCACGATGAGGAGGATGAAGAACTCAAATCTAGTGATGAAGAG
CGAGGAGGAGGAGGAGGTGTTTTTGTGAGGAAACCTTCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAG
TCTCAGAGTTGTTTTGCACTCTCGGATCTGCAGGAAGAAGAAGACGATGATGAGGATGAT
GAAGATGATCAATAATGCAAATCGTTTATCTTTTTTCTTTTCTTTTGTTCATAGTTCATT
TTTTCTTTGTTTTCTCTTAATTTCTTTTCGTCGCGCGAATTAATGTTCTTTATTTAATTC
GGGAAATTAGTTATATATTATGTCGACGGGAGAAAAGCAATGAACCACGTTAGTGTTTGA
TTCTTT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4H710JQB 749 0 0
CCTCATCCTCTTACAGAGACACTGTGGACGAGGATGAAGCCGGTTTGAGTCGAATCTGGC
CAGGGAAGACGGTGGATTACTCGTCGGAAAGTTCATCGTCGATCGGAAGTCCGGGAGACA
GCGAGGAAGACGAAGAAAGTGAAGACGAAGAGTTAGGGTTGTCTTCAATGAGCTCTCTAG
AAGATTCCCTCCTCAGCAAAAGAGGGTTATCGAATCACTACAAAGGGAAATCGAAATCGT
TTGGGAACTTAGGAGAGATCGGGAGTGTTAAAGAAGTACCAAAGCAAGGGAATCCATTGA
ACAAACGAAGAAGGTTACAGATCTGTAATAAGTTAGCAAGAAGATCGTTCTACTCTTGGC
AAAACCCTAAATCTATGCCTCTTTTTCCGGTCAGCGAAGACCACGATGAGGAGGATGAAG
AACTCAAATCTAGTGATGAAGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGTGTTTTTGTGAGGAAACCTT
CGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTCAGAGTTGTTTTGCACTCTCGGATCTGCAGGAAG
AAGAAGACGATGATGAGGATGATGAAGATGATCAATAATGCAAATCGTTTATCTTTTTTC
TTTTCTTTTGTTCATAGTTCATTTTTTCTTTGTTTTCTCTTAATTTCTTTTCGTCGCGCG
AATTAATGTTCTTTATTTAATTCGGGAAATTAGTTATATATTATGTCGACGGGAGAAAAG
CAATGAACCACGTTAGTGTTTGATTCTTT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

CO CL2566Contig1 913 4 21 U
GGAGACTCTTGTGTGACCCAACGACCAAGTTAAACGAAACACAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ACAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGATGAAACTTATTTGGTCACCGGAAACAGCATCAAAGGC
TTACATCGACACCGTTAAATCGTGCGAAAAACTTGGAACGCCAGGAGCCGCAGAGCTAGT
GGCAGCTATGGCGGCAGGATGGAACGCGACTCTAATCGTGGAAACATGGTCAGAAGGAGA
AACCATAGCCATAAGCGTAGGTTTAAACGTAGCAAGTCAACACACAAACGCAAGACACAT
TTGTATTGTTCCAAACGCAAGTTCAGAAGCCGCTTATCTCCAAGCCATGACACAACAATC
TTGCTCCACCTTGGCTGAAACAATTATTATGAACGAGGAAGAAGAAAACTCAGAGAAGGC
GATGCAGAAGCTACAAGGAATAGATTTCCTGGTAATTGATTGGGATCAAAAGGATTTTGC
AGCAAACGTTTTGAGAAACGCTGCGTTTGGTAGCAGAGGAGCGGTCGTGGTCTGCAGAAG
CGGGTACAGGAGAAGCACGTCTTGTTTCAGTTGGACAAAAACGTTTAGCGACCGGAACGT
TGTGAGAACGGTGACTCTTCCAGTTTCAGGTGGTCTAGAAATTGCTCATGTGGCTGCAGC
AAGTAGCTCTGGGAAGAGTGATAACATCAACAAGAGAAAATGGATCAAACATATTGATCA
AAGATCAGGAGAAGAACATGTTATTAGAAAGTAAAAATATATATTAAAAACTATAGAAAA
AGTGTGGAATGATATGTTTGATATCTGTATGAGAGGTGATTTGTACATAAAACAATTGTT
ATTGGAAGATTTGGTTTGGTTGTTGTGATACATTACATTTGATGATGAAAATAACAGTAC
TCATCTAGTTTAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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DS 



AS 1 2

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BQ
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TCTAACGAGATGGGAAACGCGAGTGTTGGTCGGTGGTTTTGCGACCA
GACC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CC81JQ 837 0 0
CG
AGGACTAAATGCTTTTATTAGGAAGAGAGA**TTCGATGTCTAAGAACCAAGACAGATGT
TTCTGCATCATTCATGTACAGTTTAAACACACATCTTGATTAACTCAACGACAAACACAA
AAAGGAAACTAAAGACTCCATTCATTTTATTATTACCAGAGAGCCATTCTTTGAGCGCTG
TTTTGTTCCTAAGATGACGAAAGCATGTCACCAGTCATCTTCTCTGCTTCTTCTCCTCGC
TCACCTGTCCGAACCCTAATGACATCTGACACAGGAAAAACGAATATTTTGCCATCACCG
ATCTCTCCTGTCCTTGCTCCATCTATTATGGTGTTGATTACAGACTCCACTTGTTCTTTC
TTGACAACGATCTCCATTTTAACTTTAGCGACAAACTTGTCTTCAGAGAACTCAGACCCA
CCATGTCTCTCCTTGGACCCACCTTGTGCACCAAACCCTCGGACATCAAAAACCGTAACA
CCTCTAATCCCGATTTTCAATAAAGCCGATGAAACATGCTGGATCCTCCATGGCCTGACA
ATTGCTTCAACCTTGTAAAACTTCGAGTCTGGAATATAATCGTAAGAGCTTTGGGCTCTA
ACGAGATGGGAAACGCGAGTGCTGGTCGGTGGTTTTGCGACCAAACCGAGGGAAGACGGT
GGGGAATGTCGGAATCCAGAAGAAATCGAGATGCAATCGGAGAATGAAATGTTGGTCTTT
GGATTGAAATGGAAACGTAGAGGAGTAGTGGAGATGGGTTTCGCGATTGAAGCGGCCGTG
ATTGATGAGAGAAGTAAAGTTACAGACGTGTGAAGAGTTTTCGCTCTTTTTACCC

QA 3 837 3 837
DS 



AS 1 4

CO CL2568Contig1 874 4 2 U
GCAAGGGTTTGTGACACAGTGAAAGATGGTGCCTGGAGGGTTTCGAATAGTAGACACCCG
CTGCTATGTCTGCTTCGGAACTGCCTCCCTCTCCTACCTCCCAATGTTAACTCTGATGAA
CCTGATTTTTATGAGTGGCAGCTTTCACCAACAGACTCTACTACAGGCTTTTCTTCTTGA
AAAACTTGGCTAAGACTTAACCCTCCCCTTTCCACCAGTTCCTTGGTTTACGGTGGTTTG
GTTCAAAGAAAAAGTCCCCAAGTACTCCTTCATCACTTGGCTCCTACTACGAGAGAGGTT
AGCAATAAGAGACAGACTGAGACATTGGGAAATGGTGGTTCCGTCTGCTGTGTTTGCTAT
GCGGAGTGACTGATGAGAGTATGCAGCATGTATTTTTCAATTGTTCTTATTCATCTGAAT
TATGGACAGCAGCCTTCGTGCATAGTGGAATCAATCCTCCCACAAATTTCTCCGATTTTG
CGAGTTGGATTATATCGGCTTCTTTCCCCAAGAAGGTTAGAGGTATAATCAAGCTCTTGT
TTCAAAGTGTGATCTATTTTCTTTGGAGAGAAAGGAACTCTAGATTATTTAATCAGTCGT
CCAAGCCTTCTCAAGTTTTACTAAGGAAATTCATCTTCAACTTCTAGCGAGACTCTTGGG
ATTGGACAGAGAACCACTCGGCAACCAACGAACAAGCCTCTCTACGACCGTACGGATTTC
ATCGGGAGATACAACTGATATTACAAGTTTCACATGCGTTTCATTCGATTTGTACAAGGA
TTAGCCTTTCCTTTTTCTGTTCTTTTCTTTATTTCCTGCACTATTTTGTAAAGAATGCTC
CTTTTGAGAAGGGAAAGTGAAATGGAAGTAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4C948TF U 1
AF RR4C948JQ C 171
AF RR4B128JQ C 246
AF RR4B128TF U 246
BS 1 620 RR4C948TF
BS 621 874 RR4B128TF

RD RR4C948TF 620 0 0
GCAAGGGTTTGTGACACAGTGAAAGATGGTGCCTGGAGGGTTTCGAATAGTAGACACCCG
CTGCTATGTCTGCTTCGGAACTGCCTCCCTCTCCTACCTCCCAATGTTAACTCTGATGAA
CCTGATTTTTATGAGTGGCAGCTTTCACCAACAGACTCTACTACAGGCTTTTCTTCTTGA
AAAACTTGGCTAAGACTTAACCCTCCCCTTTCCACCAGTTCCTTGGTTTACGGTGGTTTG
GTTCAAAGAAAAAGTCCCCAAGTACTCCTTCATCACTTGGCTCCTACTACGAGAGAGGTT
AGCAATAAGAGACAGACTGAGACATTGGGAAATGGTGGTTCCGTCTGCTGTGTTTGCTAT
GCGGAGTGACTGATGAGAGTATGCAGCATGTATTTTTCAATTGTTCTTATTCATCTGAAT
TATGGACAGCAGCCTTCGTGCATAGTGGAATCAATCCTCCCACAAATTTCTCCGATTTTG
CGAGTTGGATTATATCGGCTTCTTTCCCCAAGAAGGTTAGAGGTATAATCAAGCTCTTGT
TTCAAAGTGTGATCTATTTTCTTTGGAGAGAAAGGAACTCTAGATTATTTAATCAGTCGT
CCAAGCCTTCTCAAGTTTTA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4C948JQ 704 0 0
TTCTTCTTGAAAAACTTGGCTAAGACTTAACCCTCCCCTTTCCACCAGTTCCTTGGTTTA
CGGTGGTTTGGTTCAAAGAAAAAGTCCCCAAGTACTCCTTCATCACTTGGCTCCTACTAC
GAGAGAGGTTAGCAATAAGAGACAGACTGAGACATTGGGAAATGGTGGTTCCGTCTGCTG
TGTTTGCTATGCGGAGTGACTGATGAGAGTATGCAGCATGTATTTTTCAATTGTTCTTAT
TCATCTGAATTATGGACAGCAGCCTTCGTGCATAGTGGAATCAATCCTCCCACAAATTTC
TCCGATTTTGCGAGTTGGATTATATCGGCTTCTTTCCCCAAGAAGGTTAGAGGTATAATC
AAGCTCTTGTTTCAAAGTGTGATCTATTTTCTTTGGAGAGAAAGGAACTCTAGATTATTT
AATCAGTCGTCCAAGCCTTCTCAAGTTTTACTAAGGAAATTCATCTTCAACTTCTAGCGG
GACTCTTGGGATTGGACAGAGAACCACTCGGCAACCAACGAACAAGCCTCTCTACGACCG
TACGGATTTCATCGGGAGATACAACTGATATTACAAGTTTCACATGCGTTTCATTCGATT
TGTACAAGGATTAGCCTTTCCTTTTTCTGTTCTTTTCTTTATTTCCTGCACTATTTTGTA
AAGAATGCTCCTTTTGAGAAGGGAAAGTGAAATGGAAGTAATTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4B128JQ 629 0 0
G
AGAAAAAGTTCCCAAGTACTCCTTCATCACTTGGCTCCTACTACGAGAGAGGTTAGCAAT
AAGAGACAGACTGAGACATTGGGAAATGGTGGTTCCGTCTGCTGTGTTTGCTATGCGGAG
TGACTGATGAGAGTATGCAGCATGTATTTTTCAATTGTTCTTATTCATCTGAATTATGGA
CAGCAGCCTTCGTGCATAGTGGAATCAATCCTCCCACAAATTTCTCCGATTTTGCGAGTT
GGATTATATCGGCTTCTTTCCCCAAGAAGGTTAGAGGTATAATCAAGCTCTTGTTTCAAA
GTGTGATCTATTTTCTTTGGAGAGAAAGGAACTCTAGATTATTTAATCAGTCGTCCAAGC
CTTCTCAAGTTTTACTAAGGAAATTCATCTTCAACTTCTAGCGAGACTCTTGGGATTGGA
CAGAGAACCACTCGGCAACCAACGAACAAGCCTCTCTACGACCGTACGGATTTCATCGGG
AGATACAACTGATATTACAAGTTTCACATGCGTTTCATTCGATTTGTACAAGGATTAGCC
TTTCCTTTTTCTGTTCTTTTCTTTATTTCCTGCACTATTTTGTAAAGAATGCTCCTTTTG
AGAAGGGAAAGTGAAATGGAAGTAATTT

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR4B128TF 629 0 0
G
AGAAAAAGTTCCCAAGTACTCCTTCATCACTTGGCTCCTACTACGAGAGAGGTTAGCAAT
AAGAGACAGACTGAGACATTGGGAAATGGTGGTTCCGTCTGCTGTGTTTGCTATGCGGAG
TGACTGATGAGAGTATGCAGCATGTATTTTTCAATTGTTCTTATTCATCTGAATTATGGA
CAGCAGCCTTCGTGCATAGTGGAATCAATCCTCCCACAAATTTCTCCGATTTTGCGAGTT
GGATTATATCGGCTTCTTTCCCCAAGAAGGTTAGAGGTATAATCAAGCTCTTGTTTCAAA
GTGTGATCTATTTTCTTTGGAGAGAAAGGAACTCTAGATTATTTAATCAGTCGTCCAAGC
CTTCTCAAGTTTTACTAAGGAAATTCATCTTCAACTTCTAGCGAGACTCTTGGGATTGGA
CAGAGAACCACTCGGCAACCAACGAACAAGCCTCTCTACGACCGTACGGATTTCATCGGG
AGATACAACTGATATTACAAGTTTCACATGCGTTTCATTCGATTTGTACAAGGATTAGCC
TTTCCTTTTTCTGTTCTTTTCTTTATTTCCTGCACTATTTTGTAAAGAATGCTCCTTTTG
AGAAGGGAAAGTGAAATGGAAGTAATTT

QA 2 629 2 629
DS 



AS 1 3

CO CL2569Contig1 1301 3 7 U
ACTCACAAGAAAGGAGACTCTTTATTTAAGAAACAACTCTTTACTCTTTCAAACTCTTTA
CATATTCAAAGACTCGTATATATCAAAACAGGTCAATATTCCCATGACCACTAATGTGGA
TCATGGTTTCTTCTAGCTCATCTGTAATCAAGAATCTAGTTTAAAAAGAAAAAACCACCT
TTCACGAGAAGACGGGTCTCCCCGAAGTTTGAACAGTGGCTACTAACACCCAGAAGATGG
CACACAAGGCACCCACAATTGATAAGAGAAAAAACCCTCTATTTATGCTACGCTTCTTCT
TCGCTATTACGGCAGTATTCACTGGCGTTCCATTAGCCTTTCCACTGAACCTGATACGGC
TAAAGCTAGACATACGCACAAATGTCCGGTTAATAGGACCTTCACACGCAGAGGCTGGCG
TTGAAGGTATTGAATCCATGAATGCCCACAGAGCCGATGAGAATGGGCTCGTTCCACCAC
CACCATTGACGCCTTCTTGGTCTTGGGCATCATCTACACTCGTAGCAAGATTTGTGGAAC
CGGGGATCACACCTGATGAAGGTGACGCAAATGCTCCACAAATAACAGACTGCGGTTGAT
CAAAGAGGACAGCAGTCTGATTATCATCTTCAAGCCACAGGTCATCAGTGAACTGATTGA
GATTTGGGGCAGGATCCATGATGTTGTTCAGCTTGTTTTCAGAGGTCTGGTCCTGGAACT
GTTGATAAAGTGATTGCTATTCCTGGTCGGATGTGTTGTCGGCAAAGTTACCCAACGGAT
CTGCAGAAGGTTCCTGAAGAATAGGTTCCATATCCAAAGACATGGGAACGTCATGGAACA
ATTGGTCAAAGTCATTAAAGTCTCCATATTCACCGGGGTTCAAGAGCTGTGCAGGGTTGT
CAACTAAAGATAAAGAAGCTCCGAGATCAGGTGTCAGAAGGTCATACATTTCAATGTAGT
CCTCCTTCTCAAACACCAAAGGCGAGTTATTGGGAGCTGACGTGACGTCAATAGACTCAT
AACTCGACGGCATGTCGTTTGGAAAGAAGAAGTCTCCAGTTCCCTGAGGTTTAAGAAACT
CTCTAGCAGAAGTATTCACCAACGTGCTCTGCAAATCTTCTTCTCTGTTAACCTGAGGAA
TGTTGGCAAATGTTTGAGGAACCCCAGGTGCATATGGGATTCCACTGAGAATCTCCTCGA
GATCATCTAACTGAACATTTACAAGGCTAACATTATCCACACAACGAACCACAGGTTCCT
CTTCTTCATCAGCCCATTCTTCTTCTTGGAAAGGAGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G359JQ U 1
AF RR4AC38JQ U 28
AF RR4AC38TF C 496
BS 1 85 RR4G359JQ
BS 86 86 RR4AC38JQ
BS 87 270 RR4G359JQ
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BS 587 892 RR4AC38JQ
BS 893 1301 RR4AC38TF

RD RR4G359JQ 586 0 0
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TCATGGTTTCTTCTAGCTCATCTGTAATCAAGAATCTAGTTTAAAAAGAAAAAACCACCT
TTCACGAGAAGACGGGTCTCCCCGAAGTTTGAACAGTGGCTACTAACACCCAGAAGATGG
CACACAAGGCACCCACAATTGATAAGAGAAGAAACCCTCTATTTATGCTACGCTTCTTCT
TCGCTATTACGGCAGTATTCACTGGCGTTCCATTAGCCTTTCCACTGAACCTGATACGGC
TAAAGCTAGACATACGCACAAATGTCCGGTTAATAGGACCTTCACACGCAGAGGCTGGCG
TTGAAGGTATTGAATCCATGAATGCCCACAGAGCCGATGAGAATGGGCTCGTTCCACCAC
CACCATTGACGCCTTCTTGGTCTTGGGCATCATCTACACTCGTAGCAAGATTTGTGGAAC
CGGGGATCACACCTGATGAAGGTGACGCAAATGCTCCACAAATAAC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4AC38JQ 865 0 0
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ACAGGTCAATATTCCCATGACCACTAATGTGGATCATGGTTTCTTCTAGCTCATCTGTAA
TTAAGAATCTAGTTTAAAGA***AAAACCACCTTTCACGAGAAGACGGGTGTCCCCGAAG
TTTGAACCGTGGCTACTAGCACCCAGAAGATGGCACACAAGGCACCCACAATTGATAAGA
GAAAAAACCCTCTATTTATGCTACGCTTCTTCTTCGTTATTACGGCAGTATTCACTGGCG
TTCCATTAGCCTTTCCACTGAACCTGATACGGCTAAAGCTAGACATACGCACAAATGTCC
GGTTAATAGGACCTTCACACGCAGAGGCTGGCGTTGAAGGTATTGAATCCATGAATGCCC
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CATCATCTACACTCGTAGCAAGATTTGTGGAACCGGGGATCACACCTGATGAAGGTGACG
CAAATGCTCCACAAATAACAGACTGCGGTTGATCAAAGAGGACAGCAGTCTGATTATCAT
CTTCAAGCCACAGGTCATCAGTGAACTGATTGAGATTTGGGGCAGGATCCATGATGTTGT
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CCATATCCAAAGACATGGGAACGTCATGGAACAATTGGTCAAAGTCATTAAAGTCTCCAT
ATTCACCGGGGTTCAAGAGCTGTGC

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4AC38TF 806 0 0
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ATGAAGGTGACGCAAATGCTCCACAAATAACAGACTGCGGTTGATCAAAGAGGACAGCAG
TCTGATTATCATCTTCAAGCCACAGGTCATCAGTGAACTGATTGAGATTTGGGGCAGGAT
CCATGATGTTGTTCAGCTTGTTTTCAGAGGTCTGGTCCTGGAACTGTTGATAAAGTGATT
GCTATTCCTGGTCGGATGTGTTGTCGGCAAAGTTACCCAACGGATCTGCAGAAGGTTCCT
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TAAAGTCTCCATATTCACCGGGGTTCAAGAGCTGTGCAGGGTTGTCAACTAAAGATAAAG
AAGCTCCGAGATCAGGTGTCAGAAGGTCATACATTTCAATGTAGTCCTCCTTCTCAAACA
CCAAAGGCGAGTTATTGGGAGCTGACGTGACGTCAATAGACTCATAACTCGACGGCATGT
CGTTTGGAAAGAAGAAGTCTCCAGTTCCCTGAGGTTTAAGAAACTCTCTAGCAGAAGTAT
TCACCAACGTGCTCTGCAAATCTTCTTCTCTGTTAACCTGAGGAATGTTGGCAAATGTTT
GAGGAACCCCAGGTGCATATGGGATTCCACTGAGAATCTCCTCGAGATCATCTAACTGAA
CATTTACAAGGCTAACATTATCCACACAACGAACCACAGGTTCCTCTTCTTCATCAGCCC
ATTCTTCTTCTTGGAAAGGAGCACCC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 4

CO CL2570Contig1 778 4 4 U
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CTTCTCATGCGGTGGATCTCCACCTATAAAAAGGACAGTCTTAAACATTATTGTACTTCC
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GTTATATGTGGAGTTGGAATACTTTCATTTGTTTGAAGCTGCTAAAGGGGGATCGTTGGG
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TCGACAATGAGCCTGACCTCATGACCTATCCCGACATTGGCCAAGCTGTGTTTGATACCA
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BQ
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AF RR4AB15TF U 1
AF RR4A441JQ C 1
AF RR4A441TF U 1
AF RR4AB15JQ C 1
BS 1 686 RR4AB15TF
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BS 691 691 RR4A441JQ
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RD RR4AB15TF 686 0 0
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QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4A441JQ 778 0 0
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GTTATATGTGGAGTTGGAATACTTTCATTTGTTTGAAGCTGCTAAAGGGGGATCGTTGGG
CCACCACTGTTTATATATGGTTTGCGTTCTTTCTGCACTGGAATAATCCTTCGTTCTGCC
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QA 1 778 1 778
DS 

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QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4AB15JQ 778 0 0
GGGATTTTAGAGCTCCGATTCATCCAACCGGCAATGGAGGTCTTGAAGGTTGTGTGAGAC
GATTCTACGTGATGGATATCTGTGTCAATCTCTATTCATGTCGTTTCGTCTTCGATATAT
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TGAGATTCCAATGCCTCGCAATAGCTCATACGGGCGAACTGTTCTAAATGGATATGCAAT
GTTATATGTGGAGTTGGAATACTTTCATTTGTTTGAAGCTGCTAAAGGGGGATCGTTGGG
CCACCACTGTTTATATATGGTTTGCGTTCTTTCTGCACTGGAATAATCCTTCGTTCTGCC
TCGACAATGAGCCTGACCTCATGACCTATCCCGACATTGGCCAAGCTGTGTTTGATACCA
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TCACAGGTTATTCCCTAATTGCTCTGAGAAGTCAATAATAGAAAAAACATATGAATTC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

CO CL2571Contig1 806 4 9 U
AAAAACCGAGTTCGTCGTCAATCCGATAAACCGTCGTACAAATCTCTGATGAACGGATTC
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CGTGTACTGCTTTCCCCACTTAGTTCCAACATCGTACTTCGTACAGCATGCTGTTCCATT
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GACAGTAGTCCCGAACCAGAACTTGAACTATCAACGGCAACAATCCAAGATTCAGAATCT
GATCATGAATGACTAGTAAAACAACCAAACAAGTGTAGTCATCATAGCTTTGCAGCTTTT
TACAGCCTTATGTCGAATCACTATTACAATGAAAATGTCAAAACGATTGTATTTTGGTCA
CGTAAATCTCAAATAAGTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4CL09TF U 1
AF RR4BB27TF U 7
AF RR4CL09JQ C 9
AF RR4BB27JQ C 110
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BS 660 804 RR4BB27TF
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RD RR4CL09TF 659 0 0
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DS 

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GGG
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TGGCTCATTTACTGGGCAGCTTTTGGTTCTTTTAGTCTTGTTGAAGTGTTCACGGACAAG
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CTTCCCACCATTGATGGAGCAAAACAAATATATAACAACCACCTTCGCCCTTTCCTGATA
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GTTAGATCACACCAAGGAGAAATACAGTTTGTGCGATCAATGATCGTCAGAATCCTGGGA
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DS 

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A
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TGGCTCATTTACTGGGCAGCTTTTGGTTCTTTTAGTCTTGTTGAAGTGTTCACGGACAAG
CTCATTTCTTGGTTTCCGCTGTATTATCATGCAAAGTTTGCGTTCCTAGTCTGGCTTCAA
CTTCCCACCATTGATGGAGCAAAACAAATATATAACAACCACCTTCGCCCTTTCCTGATA
CAGCACCAAGCTAGACTGGATCAACTTGTTGATGGCGTTTACGGGGAGATGGTCAAGGTC
GTTAGATCACACCAAGGAGAAATACAGTTTGTGCGATCAATGATCGTCAGAATCCTGGGA
TCAGCCAGTGAAGTTACACCACCAAGCCAACAACCAGGAGAAGAAATCCCAGACAGTAGT
CCCGAACCAGAACTTGAACTATCAACGGCAACAATCCAAGATTCAGAATCTGATCATGAA
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ATGTCGAATCACTATTACAATGAAAATGTCAAAACGATTGTATTTTGGTCACGTAAATCT
CAAATAAGTTTTTTTTT

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR4BB27JQ 695 0 0
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GCTGTTCCATTGGCATAGGACTGCCAGTGTACTCCACTTTCAAGGCCATTGAGACTAGAG
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CGTTCCTAGTCTGACTTCAACTTCCCACCATTGATGGAGCAAAACAAATATATAACAACC
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ACGGGGAGATGGTCAAGGTCGTTAGATCACACCAAGGAGAAATACAGTTTGTGCGATCAA
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AAGAAATCCCAGACAGTAGTCCCGAACCAGAACTTGAACTATCAACGGCAACAATCCAAG
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TTGCAGCTTTTTACAGCCTTATGTCGAATCACTATTACAATGAAAATGTCAAAACGATTG
TATTTTGGTCACGTAAATCTCAAATAAGTTTTTTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

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ACTAAACACACCCCTCAACTCCACCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCAC
CATCACCATCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAA
CTTCTTCGACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGG
AAACATGCTGTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGA
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CGTCACTGCTTACTACTTGTCGTCGCAAGGGGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTT
TCTAGGGAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAA
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GTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTA
CTCCAGCCTGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTG
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TTCAGGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAACTGCAAACGGCAAA
GGAGCTCAATGCATATGGCAGGAGGAGGCTCAGATGGGTTCAGAAATACTTCATGATCTA
TAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTC
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CCTCTCTTTAAGTTATAAGATTTGTTTTGTTCTCTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCA
AGGCCAATAAAAGCTCCTTCCTGTGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA46TF U 1
AF RR4AK39JQ C 425
AF RR4AK39TF U 425
AF RR4AA46JQ C 358
BS 1 720 RR4AA46TF
BS 721 1052 RR4AK39TF
BS 1053 1108 RR4AA46JQ

RD RR4AA46TF 723 0 0
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CATCACCATCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAA
CTTCTTCGACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGG
AAACATGCTGTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGA
GTATCTATTCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTAGCCGGAAACTCAGCCGGCAC
CGTCACTGCTTACTACTTGTCGTCGCAAGGGGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTT
TCTAGGGAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAA
AGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTA
CTCTATTGTCTCGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGT
GTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTA
CTCCAGCCTGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTG
GTC

QA 1 720 1 720
DS 

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ATTGTCTCGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTC
AACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCC
AGCCTGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGATCC
AAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACTGCCTCTTCA
GGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAACTGCAAACGGCAAAGGAG
CTCAATGCATATGGCAGGAGGAGGCTCAGATGGGTTCAGAAATACTTCATGATCTATAAT
TATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGA
GTCTAAGGGAAAAACACTAAACATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTGTTGCAATTCCTC
TCTTTAAGTTATAAGATTTGTTTTGTTC
G

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4AK39TF 629 0 0
GGGAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGC
AACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCT
ATTGTCTCGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTC
AACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCC
AGCCTGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGATCC
AAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACTGCCTCTTCA
GGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAACTGCAAACGGCAAAGGAG
CTCAATGCATATGGCAGGAGGAGGCTCAGATGGGTTCAGAAATACTTCATGATCTATAAT
TATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGA
GTCTAAGGGAAAAACACTAAACATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTGTTGCAATTCCTC
TCTTTAAGTTATAAGATTTGTTTTGTTC
G

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4AA46JQ 751 0 0
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GTTTCTAGGGAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGG
GAAAGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACAC
TTACTCTATTGTCTCGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAG
AGTGTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGAT
CTACTCCAGCCTGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGA
CTGGTCCAAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACTGC
CTCTTCAGGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAACT*CAAACGGC
AAAGGAGCTCAATGCATATGGCAGGAGGAGGCTCAGATGGGTTCAGAAATACTTCATGAT
CTATAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAG
GTCAAGAGTCTAAGGGAAAAACACTAAACATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTGTTGCA
ATTCCTCTCTTTAATTTATAAGATTTGTTTTGTTCTCTGTTATTCTTCCGTTGTACATTC
TCAAGGCCAATAAAAGCTCCTTCCTGTGTTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

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AAAACTCAAATAATCAACAAAATCCTAAGCAAATCATTCAACGGTAGTAAAGAGGTAATC
AAAATGCAAATAGATAATCAAACTCGTCTTTCACAATCCCAAAACAGGAATCCACATTGC
TCTCCATACGAAACTAATAATACGCTGTTTTAAATATCAGATACGAAAATGCAACAACAA
AAACGCTTTCTTCCGACAAGAATTCCTTCAGAACCTGAGTTTGGTAAAGAACCACCTGTT
CTTCCCGGTCTTGAAACGCTCCTCGAGCTTAGCCTTGGCCTCCTTGAGAGCGGCGACCTT
CTTGTCCTTGGAAGAAAGAGCCTCGAGGGTCGCGACTTCCTTGAGGTCCACGTCAAGGGT
GTAACGCGTAGGCATCAGGTGCTGGTAGTTGACGACCTTGATGAAACACTTAACCCTAGA
TTTCTTGGCCGTCTTCTTCGCCGAGTCCTTGCGGATGACCTTGCTCGGGTACTTCTTGAG
TCCGGCCACGAGGCAGTGTCCGTAAGGGCGCTCGCGGTTTCCGTCGTCGAAGGAGCGGAT
GATCACGGCCTTCTTTCCGGCGTATCGGCCTTGGAGGAGGATCACTGCCTTGTTCTGCTT
CAGGAACTTCACCATTGTTGCTTCACTTGTTTCTCTAGATCCCTCTTCTTCGTCTTCTTC
GTTATCGCCGCTGAAAACCCTAGGTGGCGGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H734JQB U 1
AF RR4H734TF C 21
AF RR4GJ41JQ U 119
AF RR4GJ41TF C 119
BS 1 217 RR4H734JQB
BS 218 219 RR4GJ41JQ
BS 220 220 RR4H734TF
BS 221 270 RR4GJ41JQ
BS 271 271 RR4H734TF
BS 272 755 RR4GJ41JQ

RD RR4H734JQB 217 0 0
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AAAACTCAAATAATCAACAAAATCCTAAGCAAATCATTCAACGGTAGTAAAGAGGTAATC
AAAATGCAAATAGATAATCAAACTCGTCTTTCACAATCCCAAAACAGGAATCCACATTGC
TCTCCATACGAAACTAATAATACGCTGTTTTAAATAT

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR4H734TF 482 0 0
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AACTCCTTCAGAACCTGAGTTTGGTAAAGAAACACCTGTTCTTCCCGGTCTTGAAACGCT
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CCTCGAGGGTCGCGACTTCCTTGAGGTCCACGTCAAGGGTGTAACGCGTAGGCATCAGGT
GCTGGTAGTTGACGACCTTGATGAAACACTTAACCCTAGATTTCTTGGCCGTCTTCTTCG
CC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4GJ41JQ 637 0 0
CGT
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CTCCATACGAAACTAATAATACGCTGTTTTAAATATCAAATACGAAAATGCAACAACAAA
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TTATCGCCGCTGAAAACCCTAGGTGGCGGATTCC

QA 4 637 4 637
DS 

RD RR4GJ41TF 637 0 0
CGT
AAATGCAAATAGATAATCAAACTCGTCTTTCACAATCCCAAAACAGGAATCCACATTGCT
CTCCATACGAAACTAATAATACGCTGTTTTAAATATCAGATACGAAAATGCAACAACAAA
AACGCTTTCTTCCGACAAGAATTCCTTCAGAACCTGAGTTTGGTAAAGAACCACCTGTTC
TTCCCGGTCTTGAAACGCTCCTCGAGCTTAGCCTTGGCCTCCTTGAGAGCGGCGACCTTC
TTGTCCTTGGAAGAAAGAGCCTCGAGGGTCGCGACTTCCTTGAGGTCCACGTCAAGGGTG
TAACGCGTAGGCATCAGGTGCTGGTAGTTGACGACCTTGATGAAACACTTAACCCTAGAT
TTCTTGGCCGTCTTCTTCGCCGAGTCCTTGCGGATGACCTTGCTCGGGTACTTCTTGAGT
CCGGCCACGAGGCAGTGTCCGTAAGGGCGCTCGCGGTTTCCGTCGTCGAAGGAGCGGATG
ATCACGGCCTTCTTTCCGGCGTATCGGCCTTGGAGGAGGATCACTGCCTTGTTCTGCTTC
AGGAACTTCACCATTGTTGCTTCACTTGTTTCTCTAGATCCCTCTTCTTCGTCTTCTTCG
TTATCGCCGCTGAAAACCCTAGGTGGCGGATTCC

QA 4 637 4 637
DS 



AS 1 4

CO CL2574Contig1 670 4 6 U
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ACGAATAATCCCAGTTAACATAAAAGGGGAAGAAAACAAAGCAATAGTGAAACTGTTCTT
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TGATACATCTTCTAATCATCATCTTCCTCCTCTTCACTTGCGCCTTCGTTGACTTCAGAC
TTGGACTTGTCAGAGTCATCATCTCCAGCTGTGCTAGTTCCATTAGCCAATTTCATGTTG
TATTTTTGCATAGTCTTGGTATATTCACTCTTTTTAGTCTCTGCCTTGGCTACGAAAGGA
GCTTTGGCTTCATCAGTCATGGATTTCCATTTAGCTCCAGCAGCTTTACCAACAGCTCCG
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AAGAAAGCACTAGGAGGCCTCTTAGGCTTGTTAGGATCCTTGGCGGCTTTCTTTCCAGCT
TTCTTACCTCTCGTCTTCAATCTGTCATCAGTGCCCTTCGCTTGAGCTTTGGTTTCACCA
CCTTTCATCTCCGAGAGATCTGTGAACGTTAGGGTTTTTTTTTATTTTGACCAGAGAGAC
GACGATTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4EG08JQ U 1
AF RR4EG08TF C 1
AF RR4A116JQD U 19
AF RR4A116TFB C 19
BS 1 130 RR4EG08JQ
BS 131 131 RR4A116JQD
BS 132 366 RR4EG08JQ
BS 367 367 RR4A116JQD
BS 368 659 RR4EG08JQ
BS 660 670 RR4A116JQD

RD RR4EG08JQ 659 0 0
CGGTAGAGACGAAAATCAAGCTAAATCCAAAGTTGTGCACAACAAGTTGTAGTAGATAGT
ACGAATAATCCCAGTTAACATAAAAGGGGAAGAAAACAAAGCAATAGTGAAACTGTTCTT
CTCCCTAAAAGCTAGCAGCTAAAAACAATACAACAGAAGATACTCCATAAGACAAATCGA
TGATACATCTTCTAATCATCATCTTCCTCCTCTTCACTTGCGCCTTCGTTGACTTCAGAC
TTGGACTTGTCAGAGTCATCATCTCCAGCTGTGCTAGTTCCATTAGCCAATTTCATGTTG
TATTTTTGCATAGTCTTGGTATATTCACTCTTTTTAGTCTCTGCCTTGGCTACGAAAGGA
GCTTTGTCTTCATCAGTCATGGATTTCCATTTAGCTCCAGCAGCTTTACCAACAGCTCCG
ACGGATTTGTTGTCAGGGTTAGCTAGATTGAACTCCTTGCGGAATCCCTCCAGGAAGACG
AAGAAAGCACTAGGAGGCCTCTTAGGCTTGTTAGGATCCTTGGCGGCTTTCTTTCCAGCT
TTCTTACCTCTCGTCTTCAATCTGTCATCAGTGCCCTTCGCTTGAGCTTTGGTTTCACCA
CCTTTCATCTCCGAGAGATCTGTGAACGTTAGGGTTTTTTTTTATTTTGACCAGAGAGA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4EG08TF 670 0 0
CGGTAGAGACGAAAATCAAGCTAA*TCCAAAGTTGTGCACAACAAGTTGTAGTAGATAGT
ACGAATAATCCCAGTTAACATAAAAGGGGAAGAAAACAAAGCAATAGTGAAACTGTTCTT
CTCCCTAAAAGCTAGCAGCTAAAAACAATACAACAGAAGATACTCCATAAGACAAATCGA
TGATACATCTTCTAATCATCATCTTCCTCCTCTTCACTTGCGCCTTCGTTGACTTCAGAC
TTGGACTTGTCAGAGTCATCATCTCCAGCTGTGCTAGTTCCATTAGCCAATTTCATGTTG
TATTTTTGCATAGTCTTGGTATATTCACTCTTTTTAGTCTCTGCCTTGGCTACGAAAGGA
GCTTTGTCTTCATCAGTCATGGATTTCCATTTAGCTCCAGCAGCTTTACCAACAGCTCCG
ACGGATTTGTTGTCAGGGTTAGCTAGATTGAACTCCTTGCGGAATCCCTCCAGGAAGACG
AAGAAAGCACTAGGAGGCCTCTTAGGCTTGTTAGGATCCTTGGCGGCTTTCTTTCCAGCT
TTCTTACCTCTCGTCTTCAATCTGTCATCAGTGCCCTTCGCTTGAGCTTTGGTTTCACCA
CCTTTCATCTCCGAGAGATCTGTGAACGTTAGGGTTTTTTTTTATTTTGACCAGAGAGAC
GACGATTCCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4A116JQD 652 0 0
AGCTA
AATCCAAAGTTGTGCATAACAAGTTGTAGTAGATAGTACGAATAATCCCAGTTAACATAA
AAGGGGAAGAAAACAAAGCAATAGTGAAACTGTTCTTCTCCCTAAAAACTAGCAGCTAAA
AACAATACAACAGAAGATACTCCATAAGACAAATCGATGATACATCTTCTAATCATCATC
TTCCTCCTCTTCACTTGCGCCTTCGTTGACTTCAGACTTGGACTTGTCAGAGTCATCATC
TCCAGCTGTGCTAGTTCCATTAGCCAATTTCATGTTGTATTTTTGCATAGTCTTGGTATA
TTCACTCTTTTTAGTCTCTGCCTTGGCTACGAAAGGAGCTTTGGCTTCATCAGTCATGGA
TTTCCATTTAGCTCCAGCAGCTTTACCAACAGCTCCGACGGATTTGTTGTCAGGGTTAGC
TAGATTGAACTCCTTGCGGAATCCCTCCAGGAAGACGAAGAAAGCACTAGGAGGCCTCTT
AGGCTTGTTAGGATCCTTGGCGGCTTTCTTTCCAGCTTTCTTACCTCTCGTCTTCAATCT
GTCATCAGTGCCCTTCGCTTGAGCTTTGGTTTCACCACCTTTCATCTCCGAGAGATCTGT
GAACGTTAGGGTTTTTTTTTATTTTGGCCAGAGAGACGACGATTCCC

QA 6 652 6 652
DS 

RD RR4A116TFB 652 0 0
AGCTA
AATCCAAAGTTGTGCATAACAAGTTGTAGTAGATAGTACGAATAATCCCAGTTAACATAA
AAGGGGAAGAAAACAAAGCAATAGTGAAACTGTTCTTCTCCCTAAAAACTAGCAGCTAAA
AACAATACAACAGAAGATACTCCATAAGACAAATCGATGATACATCTTCTAATCATCATC
TTCCTCCTCTTCACTTGCGCCTTCGTTGACTTCAGACTTGGACTTGTCAGAGTCATCATC
TCCAGCTGTGCTAGTTCCATTAGCCAATTTCATGTTGTATTTTTGCATAGTCTTGGTATA
TTCACTCTTTTTAGTCTCTGCCTTGGCTACGAAAGGAGCTTTGGCTTCATCAGTCATGGA
TTTCCATTTAGCTCCAGCAGCTTTACCAACAGCTCCGACGGATTTGTTGTCAGGGTTAGC
TAGATTGAACTCCTTGCGGAATCCCTCCAGGAAGACGAAGAAAGCACTAGGAGGCCTCTT
AGGCTTGTTAGGATCCTTGGCGGCTTTCTTTCCAGCTTTCTTACCTCTCGTCTTCAATCT
GTCATCAGTGCCCTTCGCTTGAGCTTTGGTTTCACCACCTTTCATCTCCGAGAGATCTGT
GAACGTTAGGGTTTTTTTTTATTTTGGCCAGAGAGACGACGATTCCC

QA 6 652 6 652
DS 



AS 1 4

CO CL2575Contig1 823 4 17 U
GCTGAGCTAGCTTTCGCTGATCTTGAGGACGATATGAACTGCGCAGAGGCATACGTGAAA
TACATGTGCAAGTGGCTGCTTGAGAAGCGTTATGATGATATGGAACTGATGACTAAGAAC
TTCGACAAAGGCTGCATTGACAGGCTGAAACTCGTTGCCTCGACCCCGTTTGGTCGTCTA
ACATACACGGAAGCGATAAAGATACTTGAGGAAGCTGTCGCTAAAGGAAAGAAATTTGAT
AACGATGTGGAATGGGGTATCGACTTAGCATCTGAGCACGAAAGATACTTGACAGAGGTT
GTGTTTCAGAAGCCACTTATTGTCTACAACTACCCGAAAGGAATCAAAGCTTTCTACATG
AGACTTAACGACGATGGAAAGACAGTTGCTGCCATGGATGTCCTCGTTCCAAAGGTGGGA
GAACTCATT*GGTGGAAGCCAAAGAGAAGAACGTATTGACGTCATCATGGAAAGGCTGGA
GGAGATTGGTCTACCAGTGGAGCCATACGAGTGGTACTTGGACTTGAGACGTTACGGAAC
AGCGAAGCATTCAGGATTTGGACTTGGGTTCGAGCGTATGGTTCTTTTTGCTACAGGGAT
GGACAACATCAGAGACGTTATTCCCTTCCCTCGTTATCCTGGAAGAGCTGATCTTTGAGA
TCACCTCTGCACCAAAATTGC*AAACATACTTTTATTGCTTTATGTTGCTGGGTCCGGTT
TATATTACCGGTTTCGGTTTGCTATACTTTTTTAAAGTTTTTGCCTTGTAATGATTGAAA
TGTTACTTTATAGATCTACATATGGAACTGGTTTTGTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4CN59TF U 314
AF RR4CN59JQ C 1
AF RR4DX06JQ C 182
AF RR4DX06TF U 182
BS 1 182 RR4CN59JQ
BS 183 313 RR4DX06TF
BS 314 371 RR4CN59TF
BS 372 372 RR4DX06TF
BS 373 429 RR4CN59TF
BS 430 430 RR4DX06TF
BS 431 444 RR4CN59TF
BS 445 445 RR4DX06TF
BS 446 459 RR4CN59TF
BS 460 460 RR4DX06TF
BS 461 500 RR4CN59TF
BS 501 502 RR4DX06TF
BS 503 546 RR4CN59TF
BS 547 547 RR4DX06TF
BS 548 620 RR4CN59TF
BS 621 818 RR4DX06TF
BS 819 823 RR4CN59JQ

RD RR4CN59TF 307 0 0
CACTTATTGTCTACAACTACCCGAAAGGAATCAAAGCTTTCTACATGAGACTTAACGATG
ATGGAAAGACAGTTGCTGCCATGGATGTCCTCGTTCCAAAGGTGGGAGAACTCATTTGGT
GGAAGCCAAAGGGAAGAACGTATTGATGTCATCATGGAAAGGCTGGAGGAGATTGGTCTA
CCAGTGGTTCCATACGAGTGGTACTTGGACTTGAGACGTTACGGAACAGCGAA*CATTCA
GGATTTGGACTTGGGTTCGAGCGTATGGTTCTTTTTGCTACAGGGATGGACAACATCAGA
GACGTTA

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR4CN59JQ 823 0 0
GCTGAGCTAGCTTTCGCTGATCTTGAGGACGATATGAACTGCGCAGAGGCATACGTGAAA
TACATGTGCAAGTGGCTGCTTGAGAAGCGTTATGATGATATGGAACTGATGACTAAGAAC
TTCGACAAAGGCTGCATTGACAGGCTGAAACTCGTTGCCTCGACCCCGTTTGGTCGTCTA
ACATACACGGAAGCGATAAAGATACTTGAGGAAGCTGTGGCTAAAGGAAAGAAATTTGAT
AACGATGTGGAATGGGGTATCGACTTAGCATCTGAGCACGAAAGATACTTGACGGAGGTT
GTGTTTCAGAAGCCACTTATTGTCTACAACTACCCGAAAGGAATCAAAGCTTTCTACATG
AGACTTAACGATGATGGAAAGACAGTTGCTGCCATGGATGTCCTCGTTCCAAAGGTGGGA
GAACTCATT*GGTGGAAGCCAAAGGGAAGAACGTATTGATGTCATCATGGAAAGGCTGGA
GGAGATTGGTCTACCAGTGGATCCATACGAGTGGTACTTGGACTTGAGACGTTACGGAAC
AGCGAAGCATTCAGGATTTGGACTTGGGTTCGAGCGTATGGTTCTTTTTGCTACAGGGAT
GGACAACATCAGAGACGTTATTCCCTTCCCTCGCTATCCTGGAAGAGCTGATCTTTGAGA
TCACCTCTGCACCAAAATAGCGAAACACA*TTTTATTGTTTTATGTTGCTGGGTCCGGTT
TATATTACCGGTTTCGGTTTGCTATACTTTTT*AAAGTTTTTGCCGTGTAATGATTGAAA
TGTTACTTTATAGATCTACATATGGAACTGGTTTTGTTTGGTT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4DX06JQ 641 0 0
G
ATACACGGAAGCGATAAAGATACTTGAGGAAGCTGTCGCTAAAGGAAAGAAATTTGATAA
CGATGTGGAATGGGGTATCGACTTAGCATCTGAGCACGAAAGATACTTGACAGAGGTTGT
GTTTCAGAAGCCACTTATTGTCTACAACTACCCGAAAGGAATCAAAGCTTTCTACATGAG
ACTTAACGACGATGGAAAGACTGTTGCTGCCGTGGATGTCCTCGTTCCGAAGGTGGGAGA
ACTGATT*GGTGGAAGCCAAAGAGAAGAACGTATTGACGTCATCATGGAAAGGCTGGAGG
AGATTGGTCTACCAGTGGAGCCATACGAGTGGTACTTGGACTTGAGACGTTACGGAACAG
CGAAGCATTCAGGATTTGGACTTGGGTTCGAGCGTATGGTTCTTTTTGCTACAGGGATGG
ACAACATCAGAGACGTTATTCCCTTCCCTCGTTATCCTGGAAGAGCTGATCTTTGAGATC
ACCTCTGCACCAAAATTGC*AAACATACTTTTATTGCTTTATGTTGCTGGGTCCGGTTTA
TATTACCGGTTTCGGTTTGCTATACTTTTTTAAAGTTTTTGCCTTGTAATGATTGAAATG
TTACTTTATAGATCTACATATGGAACTGGTTTTGTT
GGGC

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR4DX06TF 641 0 0
G
ATACACGGAAGCGATAAAGATACTTGAGGAAGCTGTCGCTAAAGGAAAGAAATTTGATAA
CGATGTGGAATGGGGTATCGACTTAGCATCTGAGCACGAAAGATACTTGACAGAGGTTGT
GTTTCAGAAGCCACTTATTGTCTACAACTACCCGAAAGGAATCAAAGCTTTCTACATGAG
ACTTAACGACGATGGAAAGACTGTTGCTGCCGTGGATGTCCTCGTTCCGAAGGTGGGAGA
ACTGATT*GGTGGAAGCCAAAGAGAAGAACGTATTGACGTCATCATGGAAAGGCTGGAGG
AGATTGGTCTACCAGTGGAGCCATACGAGTGGTACTTGGACTTGAGACGTTACGGAACAG
CGAAGCATTCAGGATTTGGACTTGGGTTCGAGCGTATGGTTCTTTTTGCTACAGGGATGG
ACAACATCAGAGACGTTATTCCCTTCCCTCGTTATCCTGGAAGAGCTGATCTTTGAGATC
ACCTCTGCACCAAAATTGC*AAACATACTTTTATTGCTTTATGTTGCTGGGTCCGGTTTA
TATTACCGGTTTCGGTTTGCTATACTTTTTTAAAGTTTTTGCCTTGTAATGATTGAAATG
TTACTTTATAGATCTACATATGGAACTGGTTTTGTT
GGGC

QA 2 637 2 637
DS 



AS 1 4

CO CL2576Contig1 956 4 7 U
GCTGTTGTGTTCCAAGAACCTCGCTTTGTCGAGTACTTCCGCCTTGCTACACCGGAGCTA
GAGTATGGTCGTATGAACATCGGAAGCAGACCTTCGAAGAGGAAACCAAGCGGCGGCATT
GAGTCTCTCCGTGCCATTCCATGGATCTTTGCTTGGACTCAAACGAGATTCCATCTCCCT
GTGTGGCTTGGATTCGGAGGAGCCATCAGACACGTGATTGAAAAGGACGTCAAGAACCTA
CACATGCTTCAGGACATGTACAAACACTGGCCTTTCTTTAGAGTCACCATTGATCTGATC
GAGATGGTGTTTGCTAAAGGAGATCCAGGTATCGCTGCTTTGTACGATAAGCTTCTTGTC
TCAGAGGAGCTATGGCCTTTTGGTGACAGACTCAGAGCTAACTTCGAAGAAACCAAGAAA
CTCGTCCTCCAGACTGCTGGACACAAGGATCTACTTGAAGGAGACCCTTACTTGAAACAG
AGACTGAGACTTCGTAACTCTTACATCACCACACTCAATGTCTGTCAAGCTTACACACTG
AAGAGGATCCGTGACCCGAGCTACAATGTGACTCTACGACCTCACATCTCCAAGGAGATT
GCTGAATCCAGCAAAGAACTCATCGAGCTTAACCCGACGAGCGAGTACGCGCCTGGACTC
GAAGATACACCCATCTTGACCATGAAGGGTGTCGCTGCTGGTCTACAGAACACCGGTTGA
GTAAAAAAAAACAGAGATGAGCCTCTCTGTTTCTCCACAGTCTGCTTCTTTTTATCTACT
GATTCGAAAATAATAAATTATGCGGTTGGTTTGTATGTGAATCCACCGTCAAAATGTTGA
TCTTTGTGTACGATTTACTCTTTTGAGATCATGAACACATGCTCTGTTTTTTTTTCTCGA
ATGTATCAAAACAGAGCAAGGGAATCTTTTCTTGTTTGTTTGTCTTTTACTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B395TF U 1
AF RR4D457TF U 225
AF RR4B395JQ C 168
AF RR4D457JQ C 429
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BS 539 608 RR4B395TF
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BS 723 889 RR4D457TF
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RD RR4B395TF 722 0 0
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GAGTCTCTCCGTGCCATTCCATGGATCTTTGCTTGGACTCAAACGAGATTCCATCTCCCT
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GT

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DS 

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CCCTTTCTTGAAACAGAGACTGAGACTTCGTAACTCTTACATCACCACACTCAATGTCTG
TCAAGCTTACACACTGAAGAGGATCCGTGACCCGAGCTACAATGTGACTCTACGACCTCA
CATCTCCAAGGAGATTGCTGAATCCAGCAAAGAACTCATCGAGCTTAACCCGACGAGTGA
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CTTCTTTTTATCTACTGATTCGAAAATAATAAATTATGCGGTTGGTTTGTATGTGAATCC
ACCGTCAAAATGTTGATCTTTGTGTACGATTTACTCTTTTGAGATCATGAACACATGCTC
TGTTT

QA 1 665 1 665
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CGTCAAGAACCTACACATGCTTCAGGACATGTACAAACACTGGCCTTTCTTTAGAGTCAC
CATTGATCTGATCGAGATGGTGTTTGCTAAAGGAGATCCAGGTATCGCTGCTTTGTACGA
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TTACTTGAAACAGAGACTGAGACTTCGTAACTCTTACATCACCACACTCAATGTCTGTCA
AGCTTACACATTGAAGAGGATCCGTGACCCGAGCTACAATGTGACTCTACGACCTCACAT
CTCCAAGGAGATTGCTGAATCGAGCAAAGAACTCATCGAGCTTAACCCGACGAGCGAGTA
CGCGCCTGGACTCGAAGATACACCCATCTTGACCATGAAGGGTGTCGCTGCTGGTCTACA
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CTTTTTATCTACTGATTCGAAAATAATAAATTATGCGGTTGGTTTGTGTGTGAATCCACC
GTCAAAATGTTGATCTTTGTGTACGATTTACTCTTTTAAGATCATGAACACATGCTCTGT
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TACTTAACC

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DS 

RD RR4D457JQ 512 0 0
CCAGACTGCTGGACACAAGGATCTACTTGAAGGAGACCCTTTCTTGAAACAGAGACTGAG
ACTTCGTAACTCTTACATCACCACACTCAATGTCTGTCAAGCTTACACACTGAAGAGGAT
CCGTGACCCGAGCTACAATGTGACTTTACGACCTCACATCTCCAAGGAGATTGCTGAATC
CAGCAAAGAACTCATCGAGCTTAACCCGACGAGTGAGTACGCGCCTGGACTCGAAGATAC
ACTCATCTTGACCATGAAGGGTGTCGCTGCTGGTTTACAGAACACCGGTTGAGTAAAAAA
AAACAGAGATGAGCCTCTCTGTTTCTCCACAGTTTGCTTCTTTTTATCTACTGATTCGAA
AATAATAAATTATGCGGTTGGTTTGTATGTGAATCCACCGTCAAAATGTTGATCTTTGTG
TACGATTTACTCTTTTGAGATCATGAACACATGCTCTGTTTTTTTTTCTCGAATGTATCA
AAACAGAGCAAGGGAATCTTTTCTTGTTTGTT

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 4

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AACTACCTCAGCTGAGCTTGAGATCCATGGTATAAAACCTGAAGAGTTTTTAGAGGATAC
ACAGATATGGAGATCGGCACTCAAGAACTACTGGTCCTTGCTTACGCCTTTGATATTCTC
TGACCACCCGAAGAGACCCGGCGATGAAGACCCTCTCCCTCCATTCAACATGATACGTAA
TGTGATGGACATGAATGCTCGTTTCGGGAACTTAAACTCTGCTTTACTCGACCAAGGGAA
GTCCGCTTGGGTGATGAACGTTGTCCCAGTCAATGCACGTAACACTCTTCCGATCATACT
TGATCGTGGCTTCGCCGGTGTTCTACATGACTGGTGTGAACCGTTCCCAACGTATCCACG
AACGTATGACATGCTTCATGCCAATGAACTTCTCACGCTTCTTAGCGCAGAACGGTGCAG
CTTGATGGACTTGTTCTTGGAGATGGATCGGATTCTTCGGCCCGAGGGATGGGTTGTTCT
AAGCGACAAGGTGGGAGTAATAGAGATGGCACGTGCACTGGCGACACGAGTGCGGTGGGA
AGCACGAGTCATTGATCTTCAAGACTGTAGCGACCAAAGACTTCTTGTCTGTCAAAAACA
ATTTCTCAAGAAGTAACACGCATTCAAAAATATATATATAATTCTTCTTTCACACTACAC
ATAAACAAACACTCACTAGTCACTACTACTACACAGTATTTTCACGGGTAAGTTCTCTGT
AAAGAAGGAACTTGAAGAAGGTTTTGTAATGAGTGGAAGCTTTTAGCTTTGAGTAGAAGA
AAGAAAAAAAAAGTTAGATTCAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B030TF U 1
AF RR4B138TF U 1
AF RR4B138JQ C 38
AF RR4B030JQ C 112
BS 1 784 RR4B030TF
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AAAG

QA 1 784 1 784
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AACTACCTCAGCTGAGCTTGAGATCCATGGTATAAAACCTGAAGAGTTTTTAGAGGATAC
ACAGATATGGAGATCGGCACTCAAGAACTACTGGTCCTTGCTTACGCCTTTGATATTCTC
TGACCACCCGAAGAGACCCGGCGATGAAGACCCTCTCCCTCCATTCAACATGATACGTAA
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GTCCGCTTGGGTGATGAACGTTGTCCCAGTCAATGCACGTAACACTCTTCCGATCATACT
TGATCGTGGCTTCGCCGGTGTTCTACATGACTGGTGTGAACCGTTCCCAACGTATCCACG
AACGTATGACATGCTTCATGCCAATGAACTTCTCACGCTTCTTAGCGCAGAACGGTGCAG
CTTGATGGACTTGTTCTTGGAGATGGATCGGATTCTTCGGCCCGAGGGATGGGTTGTTCT
AAGCGACAAGGTGGGAGTAATAGAGATGGCACGTGCACTGGCGACACGAGTGCGGTGGGA
AGCACGAGTCATTGATCTTCAAGACTGTAGCGACCAAAGACTTCTTGTCTGTCAAAAACA
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ATAAACAAACACTCACTAGTCACTACTACTACACAGTATTTTCACGGGTAAGTTCTCTGT
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GAAGAAAA

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TCTGCTTTACTCGACCAAGGGAAGTCCGCTTGGGTGATGAACGTTGTCCCAGTCAATGCA
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DS 

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GCGGTGGGAAGCACGAGTCATTGATCTTCAAGACTGTAGCGACCAAAGACTTCTTGTCTG
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ACACTACACATAAACAAACACTCACTAGTCACTACTACTACACAGTATTTTCACGGGTAA
GTTCTCTGTAAAGAAGGAACTTGAAGAAGGTTTTGTAATGAGTGGAAGCTTTTAGCTTTG
AGTAGAAGAAAGAAAAAAAAAGTTAGATTCAAC

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DS 



AS 1 4

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TATCCATCTTCGTCGCAAGCTTTACGTGCCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGCT
GGAGTTAGATCCCCTGCTTCTTCTTCTTCATCATCGCTTCTGACTATTCGAAGCGCTGCA
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ATCAATGTGGAGATGTACAGGCTGATACGAGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCGTCGT
CTTGGATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCCGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTATCAAA
AGTGTAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGCAGGG
ACTATGAAGCCGACTCAGAATCTCCCTGAAGGCCAACAATCCAGGTCTCTCATAGCTGCT
TATGTTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAAGGAGGAATCTACACA
TGGAGCAAGGAAGGCCTTCCTATTGAATCTGAAGAAGACTAACTTCTCCTCTCAGTTCTT
ATATCCAGTTTTGTATCTCTGTCGAATTCAGGTAGTGGCATTTAGAGGGTTTGGCTTTTC
CAGAATGTGTTTTTAAAGTTTGTAAAACTTCAGACATTTACCAATGAAAAGCAAACCAGA
ATCCAGACAACTTTGATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4DW28JQ C 165
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TCTTAT

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AGC

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G
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GAAA
GC

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G
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CATCCTCCGGGAGCTATCAATGTGGAGATGTACAGGCTGATACGAGAATGGACGCCATGG
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TGTTCATCCGCAGGGACTATGAAGCCGACTCAGAATCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGG
TCTCTCATAGCTGCTTATGTTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAA
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GAAAAGCAAACCAGAATCCAGACAACTTTGATC

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DS 



AS 1 4

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AGCTTCATCTCTTACTCGTGGAACCAAGCTTCCTCCTCCATCCATGGGTACGATCCCTGA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F759TF U 1
AF RR4F225TF U 1
AF RR4F225JQ C 255
AF RR4F759JQ C 441
BS 1 728 RR4F225TF
BS 729 731 RR4F225JQ
BS 732 747 RR4F225TF
BS 748 1043 RR4F225JQ

RD RR4F759TF 628 0 0
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AGCTTCATCTCTTACTCGTGGAACCAAGCTTCCTCCTCCATCCATGGGTACGATCCCTGA
GATTGATTTGTCAAACCCGTTTTCTCATCGAGGTTGCCTCCTCGAGCGCTCTCTGGTGGG
TTTAACCGTTCCTTTGGGAATGAAGGCTCTGCTTCCTCTAAGCTTATCGCTAGGACCCAA
TCTGGTGGCTTAGATCAGTACAAAACCAAGGTATGGTGTTTATAATGAGTTATGTTCTCT
CTATGTTTCCGTTGCTGTTCTTGATTTTGGTGTGATGAGATGGATTTAAACAGGATGAAG
ATTCGTCAGCTAGTAGACGTCCTCCTAGCGCATCACATGAGTTTGCCTAAGTCTTTGTCA
GATATTGAGCAGTTACTCTCAGATTCTATCCCTTGTAAGATCAGAGCCAAGCTGGCTGCG
CCACTCATCCTCGGAGCATTGCTGAGAGAGTGAGAAGAACAAAGATCAGTGAAAGAATGA
GGAAGCTGCAAGACCTTGTTCCAAACATGGACACGCAAACAAACACAGCAGATATGTTGG
ATCTTGCGGTTCAGTACATCAAGGACCT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4F225TF 747 0 0
GGCAGCTGTAATGAAAAACATGGGAGGTTTTGGTGGAGGAGGTAATGTGATGAATACTGA
AGCTTCATCTCTTACTCGTGGAACCAAGCTTCCTCCTCCATCCATGGGTACGATCCCTGA
GATTGATTTGTCAAACCCGTTTTCTCATCGAGGTTGCCTCCTCGAGCGCTCTCTGGTGGG
TTTAACCGTTCCTTTGGGAATGAAGGCTCTGCTTCCTCTAAGCTTATCGCTAGGACCCAA
TCTGGTGGCTTAGATCAGTACAAAACCAAGGTATGGTGTTTATAATGAGTTATGTTCTCT
CTATGTTTCCGTTGCTGTTCTTGATTTTGGTGTGATGAGATGGATTTAAACAGGATGAAG
ATTCGTCAGCTAGTAGACGTCCTCCTAGCGCATCACATGAGTTTGCCTAAGTCTTTGTCA
GATATTGAGCAGTTACTCTCAGATTCTATCCCTTGTAAGATCAGAGCCAAGCTGGCTGCG
CCACTCATCCTCGGAGCATTGCTGAGAGAGTGAGAAGAACAAAGATCAGTGAAAGAATGA
GGAAGCTGCAAGACCTTGTTCCAAACATGGACACGCAAACAAACACAGCAGATATGTTGG
ATCTTGCGGTTCAGTACATCAAGGACCTGCAAGAACGAGTCAAGGGTCTGGAAGAGAGCC
GGGCAAGATGTAGATGCTCTTGTACTTGAAACTAGAAGCTGGAGTATGAGTGCGTCGTGC
CAGGCAGG**ATTGTGCATAGAAGTAT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4F225JQ 789 0 0
TCAGTACAAAACCAAGGTATGGTGTTTATAATGAGTTATGTTCTCTCTATGTTTCCGTTG
CTGTTCTTGATTTTGGTGTGATGAGATGGATTTAAACAGGATGAAGATTCGTCAGCTAGT
AGACGTCCTCCTAGCGCATCACATGAGTTTGCCTAAGTCTTTGTCAGATATTGAGCAGTT
ACTCTCAGATTCTATCCCTTGTAAGATCAGAGCCAAGCTGGCTGCGCCACTCATCCTCGG
AGCATTGCTGAGAGAGTGAGAAGAACAAAGATCAGTGAAAGAATGAGGAAGCTGCAAGAC
CTTGTTCCAAACATGGACACGCAAACAAACACAGCAGATATGTTGGATCTTGCGGTTCAG
TACATCAAGGACCTGCAAGAACGAGTCAAGGGTCTGGAAGAGAGCCGGGCAAGATGTAGA
TGCTCTTGTACTTGAAACTAGAAGCTGGAGTATGAGTGCGTCGTGCCAGGCAGGGATTTG
TGCATAGAAGTATCGGTTCGGTCTTTGGTGAAAGTCGAACATAGCGAAGTAGAGAAGAAA
TCATGAACAGAGCTATAACTCTGGTGGCTGATGGACAAAAGGGTTTTGTAAAGTTGCAAC
CTTTTTGGTTGGGGGGAAAGGGAGAAGTAAAGTTCATGTTATGGTTCGAACTCCAAAGCT
ATTGTATGTTGTTCTTACACCCAAAAACAAATGAAAAAAGCAGAAGAGAAGTGATGTACT
AGGATGAGAAGCTTCTTTTATTGTTAAGAATAATACTTCAGGGTAATTAATTTACTTTAT
TTTGTTAGG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4F759JQ 603 0 0
AGATTCTATCCCTTGTAAGATCAGAGCCAAGCTGGCTGCGCCACTCATCCTCGGAGCATT
GCTGAGAGAGTGAGAAGAACAAAGATCAGTGAAAGAATGAGGAAGCTGCAAGACCTTGTT
CCAAACATGGACACGCAAACAAACACAGCAGATATGTTGGATCTTGCGGTTCAGTACATC
AAGGACCTGCAAGAACGAGTCAAGGGTCTGGAAGAGAGCCGGGCAAGATGTAGATGCTCT
TGTACTTGAAACTAGAAGCTGGAGTATGAGTGCGTCGTGCCAGGCAGGGATTTGTGCATA
GAAGTATCGGTTCGGTCTTTGGTGAAAGTCGAACATAGCGAAGTAGAGAAGAAATCATGA
ACAGAGCTATAACTCTGGTGGCTGATGGACAAAAGGGTTTTGTAAAGTTGCAACCTTTTT
GGTTGGGGGGAAAGGGAGAAGTAAAGTTCATGTTATGGTTCGAACTCCAAAGCTATTGTA
TGTTGTTCTTACACCCAAAAACAAATGAAAAAAGCAGAAGAGAAGTGATGTACTAGGATG
AGAAGCTTCTTTTATTGTTAAGAATAATACTTCAGGGTAATTAATTTACTTTATTTTGTT
AGG

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL2580Contig1 1086 2 14 U
GACAGCACAACTACACAAAATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTGCCT
CTTAAGTTTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCTGTG
TTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCGATC
AGGCCCTTGCAGAAGCCCCGGTGGTGGTGGAACCCCTTCTCCCCCTGGTGGTGGATCAGT
TGGTAGCATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAACCAAGCCGGTGGTGGTTG
CGCCGGAAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCAAA
CTTTGCCAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGTTCATTTCACCCACGA
GACTGGACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGA
AAACAACAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCA
ACTATCATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGG
CCAGCCCGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTCTGTGGTTTTG
GATGAATAGCGTAAGACCGGTACTAAACAAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAA
CGGAATGGAATGTAACGGTGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTGGGTACTATAG
AGACTATTGTGGACAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAAGCTAT
TCGAAACAAGCACGCACACTTGCCGTGGGTAGTGATGGAGGAAGTTGAAGTTATGAAATA
ATAAATGAGATAATAAAGTTAGATCTCATGTATGCTCTTGGGTTGGGTCTTGGTGTTTCC
TGCGTCACAAGCAATAAGTAGTTGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTCTTATAAATGTA
CTATGGAGTGAATGCAACATTAATAAATGCCTAAGAAAGACAATTACCGTGTCTTCTTTT
TCGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4F608TF U 1
AF RR4F608JQ C 439
BS 1 642 RR4F608TF
BS 643 643 RR4F608JQ
BS 644 693 RR4F608TF
BS 694 694 RR4F608JQ
BS 695 719 RR4F608TF
BS 720 720 RR4F608JQ
BS 721 749 RR4F608TF
BS 750 750 RR4F608JQ
BS 751 758 RR4F608TF
BS 759 759 RR4F608JQ
BS 760 768 RR4F608TF
BS 769 769 RR4F608JQ
BS 770 809 RR4F608TF
BS 810 1086 RR4F608JQ

RD RR4F608TF 827 0 0
GACAGCACAACTACACAAAATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTGCCT
CTTAAGTTTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCTGTG
TTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCGATC
AGGCCCTTGCAGAAGCCCCGGTGGTGGTGGAACCCCTTCTCCCCCTGGTGGTGGATCAGT
TGGTAGCATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAACCAAGCCGGTGGTGGTTG
CGCCGGAAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCAAA
CTTTGCCAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGTTCATTTCACCCACGA
GACTGGACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGA
AAACAACAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCA
ACTATCATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGG
CCAGCCCGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAG*ACGGGTCTGTGGTTTTG
GATGAATAGCGTAAGACCGGTACTAAACAAAGG*TTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCA*
CGGAATGGAATGTAACGGTGGGAACTCAG*TGCGGTCA*TGCAAGGAT*GGGTACTATAG
AGACTATTGTGGACAGCTTGGTGTGGACC
TGGTCTACCTAGCTGCTA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4F608JQ 648 0 0
CATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGAAAACAACAGGCAGTACCC
ATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACTATCATGGAACTACAA
CTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCAGCCCGAGCTAGTGAG
TAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTCTGTGGTTTTGGATGAATAGCGTAAGACC
GGTACTAAACCAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAACGGAATGGAATGTAACGG
TGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTGGGTACTATAGAGACTATTGTGGACAGCT
TGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAAGCTATTCGAAACAAGCACGCACA
CTTGCCGTGGGTAGTGATGGAGGAAGTTGAAGTTATGAAATAATAAATGAGATAATAAAG
TTAGATCTCATGTATGCTCTTGGGTTGGGTCTTGGTGTTTCCTGCGTCACAAGCAATAAG
TAGTTGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTCTTATAAATGTACTATGGAGTGAATGCAAC
ATTAATAAATGCCTAAGAAAGACAATTACCGTGTCTTCTTTTTCGGAC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 2 4

CO CL2581Contig1 712 2 8 U
CCCTGTTTTAGTTTTATTCAACACCAACATCAAAGTTGTTATTAAAAGTAGATCAAAATC
TTATCAGATATACAGACACACACACACGTTGATATATATTTATATATGATATGACGTGAA
ATATATATAGAATAGGTCCATAAGTGCATATGGATTATCAAATGTTTTTATATCCCATAT
TAAATATTATACTTGGGACGAATTGCAACACCTTTGAGGAAGAGTCCTTTCTTCCAAACA
CCAGCCGCATGTTCATACATTGAGAAAGTGATCTCTCCGACGGAATCTCTCTCATGCTTG
AACTCTCCGACTTTAATATCGACCCATTTATACCTCGGTTGTTCCCTTAAACTCACTTTT
TTCTCATGTAAATTATTCTTACCGTTAGGCAACACTAGCTTCACGTTCACCGGTGTGTCC
CATCCGTAGGCAGGATCCTCTAGCTTCATCTGAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCAGGA
GTAAGATTACTTGTGTCGAATTTTCCCGTGATGTCAAGCCAACACACGTTTTTCAATTCC
GCAGCTTCTACACCTTTCTCGTTTGGTGAGTCGTTGGAAAGCCATGTCCAATAGTTTGGG
TCATCAGACCAAGTGATAGAGAGTTTCCTTGGAAAGATCATGAAGCAATTGCTGTTTTTG
TCGTCCACCCAATATTTGATAAGTTTTTTCAAGAGAACACCAGAGCGTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EL72JQ U 1
AF RR4H305JQ U 19
BS 1 108 RR4EL72JQ
BS 109 109 RR4H305JQ
BS 110 146 RR4EL72JQ
BS 147 147 RR4H305JQ
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BS 160 160 RR4H305JQ
BS 161 615 RR4EL72JQ
BS 616 712 RR4H305JQ

RD RR4EL72JQ 615 0 0
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TTATCAGATATACAGACACACACACACGTTGATATATATTTATATATGGTATGACGTGAA
ATATATATAGAATAGGTCCATAAGTGTATATGGATTATCCAATGTTTTTATATCCCATAT
TAAATATTATACTTGGGACGAATTGCAACACCTTTGAGGAAGAGTCCTTTCTTCCAAACA
CCAGCCGCATGTTCATACATTGAGAAAGTGATCTCTCCGACGGAATCTCTCTCATGCTTG
AACTCTCCGACTTTAATATCGACCCATTTATACCTCGGTTGTTCCCTTAAACTCACTTTT
TTCTCATGTAAATTATTCTTACCGTTAGGCAACACTAGCTTCACGTTCACCGGTGTGTCC
CATCCGTAGGCAGGATCCTCTAGCTTCATCTGAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCAGGA
GTAAGATTACTTGTGTCGAATTTTCCCGTGATGTCAAGCCAACACACGTTTTTCAATTCC
GCAGCTTCTACACCTTTCTCGTTTGGTGAGTCGTTGGAAAGCCATGTCCAATAGTTTGGG
TCATCAGACCAAGTG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4H305JQ 694 0 0
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CACACACACGTTGATATATATTTATATATGATATGACGTGAAATATATATAGAATAGGTC
CATAAGTGCATATGGATTATCAAATGTTTTTATATCCCATATTAAATATTATACTTGGGA
CGAATTGCAACACCTTTGAGGAAGAGTCCTTTCTTCCAAACACCAGCCGCATGTTCATAC
ATTGAGAAAGTGATCTCTCCGACGGAATCTCTCTCATGCTTGAACTCTCCGACTTTAATA
TCGACCCATTTATACCTCGGTTGTTCCCTTAAACTCACTTTTTTCTCATGTAAATTATTC
TTACCGTTAGGCAACACTAGCTTCACGTTCACCGGTGTGTCCCATCCGTAGGCAGGATCC
TCTAGCTTCATCTGAAAGACCACCTCGTACGTAATCCCAGGAGTAAGATTACTTGTGTCG
AATTTTCCCGTGATGTCAAGCCAACACACGTTTTTCAATTCCGCAGCTTCTACACCTTTC
TCGTTTGGTGAGTCGTTGGGAAGCCATGTCCAATAGTTTGGGTCATCAGACCAAGTGATA
GAGAGTTTCCTTGGAAAGATCATGAAGCAATTGCTGTTTTTGTCGTCCACCCAATATTTG
ATAAGTTTTTTCAAGAGAACACCAGAGCGTAGCT

QA 1 694 1 694
DS 



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GGGTAAACCGAGATACAACATCTAGAAAAACAAATTGTCAGAGCTTTTTCAGCAAAGATA
ATTTGCTCAAAGACAGTTTACAAAGAAGATGTCTACCATTCAGGAAAGGAGCGTACCGAT
TCAATCTCCGGTGGAAGATAAGGCGATGAAACCACTTAACTATGAGACGAAGAAACCACA
TAACTATGAGACCATTCTCAGAGACGCAGATCTTCCACTCCCCCCTTCCACCGAACAGCT
ACGCTCTGGTGTTCTCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGACAAAAACAGCAA
TTGCTTCATGATCTTTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGACCCAAACTATTG
GACATGGCTTCCCAACGACTCACCAAACGAGAAAGGTGTAGAAGCTGCGGAATTGAAAAA
CGTGTGTTGGCTTGACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTACTCCTGGGATTAC
GTACGAGGTGGTCTTTCAGATGAAGCTAGAGGATCCTGCCTACGGATGGGACACACCGGT
GAACGTGAAGCTAGTGTTGCCTAACGGTAAGAATAATTTACATGAGAAAAAAGTGAGTTT
AAGGGAACAACCGAGGTATAAATGGGTCGATATTAAAGTCGGAGAGTTCAAGCATGAGAG
AGATTCCGTCGAGAGATCACTTTCTCATGTATGACATGCGGCTGGTGTTTGGAGAAAGGA
CTCTTCCTCAAAGTGTTGCATTCGTCCCAAGTATATATTTATATGGGATATAAAACATTT
GATAATCATATGCACT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL72TF U 2
AF RR4H305TF U 1
BS 1 205 RR4H305TF
BS 206 206 RR4EL72TF
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RD RR4EL72TF 667 0 0
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AACTATGAGACCATTCTCAGAGACGCAGATCTTCCACTCCCCCCTTCCACCGAACAGCTA
CGCTCTGGTGTTCTCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGACAAAAACAGCAAT
TGCTTCATGATCTTTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGACCCAAACTATTGG
ACATGGCTTTCCAACGACTCACCAAACGAGAAAGGTGTAGAAGCTGCGGAATTGAAAAAC
GTGTGTTGGCTTGACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTACTCCTGGGATTACG
TACGAGGTGGTCTTTCAGATGAAGCTAGAGGATCCTGCCTACGGATGGGACACACCGGTG
AACGTGAAGCTAGTGTTGCCTAACGGTAAGAATAATTTACATGAGAAAAAAGTGAGTTTA
AGGGAACAACCGAGGTATAAATGGGTCGATATTAAAGTCGGAGAGTTCAAGCATGAGAGA
GATTCCG

QA 1 667 1 667
DS 

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ATTTGCTCAAAGACAGTTTACAAAGAAGATGTCTACCATTCAGGAAAGGAGCGTACCGAT
TCAATCTCCGGTGGAAGATAAGGCGATGAAACCACTTAACTATGAGACGAAGAAACCACA
TAACTATGAGACCATTCTCAGAGACTCAGATCTTCCACTCCCCCCTTCCACCGAACAGCT
ACGCTCTGGTGTTCTCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGACAAAAACAGCAA
TTGCTTCATGATCTTTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGACCCAAACTATTG
GACATGGCTTCCCAACGACTCACCAAACGAGAAAGGTGTAGAAGCTGCGGAATTGAAAAA
CGTGTGTTGGCTTGACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTACTCCTGGGATTAC
GTACGAGGTGGTCTTTCAGATGAAGCTAGAGGATCCTGCCTACGGATGGGACACACCGGT
GAACGTGAAGCTAGTGTTGCCTAACGGTAAGAATAATTTACATGAGAAAAAAGTGAGTTT
AAGGGAACAACCGAGGTATAAATGGGTCGATATTAAAGTCGGAGAGTTCAAGCATGAGAG
AGATTCCGTCGAGAGATCACTTTCTCATGTATGACATGCGGCTGGTGTTTGGAGAAAGGA
CTCTTCCTCAAAGTGTTGCATTCGTCCCAAGTATATATTTATATGGGATATAAAACATTT
GATAATCATATGCACT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

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AGGATAACTTCAAAACTCTTGCCTAAATAATCTATAAGAAAATGAAGATGATAATCCACA
TTTTCTTCATACTCTCCCTAGTTTCATCCATCTCTTTTGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTG
TAGCTGATCCCAAGGGTCCTCAAAGCCCATCAGGTTACTCTTGCAAGAACCCTGACCAAG
TCACCGAAAATGATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCA
TTAAAGCCGCGGTGACACCAGCATTCGCGCCTGCTTCCGCAGGCACCAATGGCCTTGGAG
CCTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCAGGTGGTGGTGTCATCCCTCTTCACACTCATCCTG
GTGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATCTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTG
CTAATAAGGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGC
TTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAA
GCTCATCCCCGGGACTTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAG
AACTCGTTGAAGCTACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAAGGGCGTGC
TTGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCGTTTTATTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTG
CGTTTATGCGTTTTTTTCGAGTTGGTTTAGCATTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGTCTT
TCTTTTTTTGTTGTTATTGTTCTCAATGTCTCATTTTATTATCTCTTTGGGTTAAATTTT
AATAAGTAATTGCATAGT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GP85TF U 2
AF RR4ES83TF U 1
AF RR4ES83JQ C 133
AF RR4GP85JQ C 210
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BS 278 335 RR4ES83TF
BS 336 336 RR4GP85TF
BS 337 475 RR4ES83TF
BS 476 476 RR4GP85TF
BS 477 698 RR4ES83TF
BS 699 699 RR4ES83JQ
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BS 737 737 RR4ES83JQ
BS 738 762 RR4ES83TF
BS 763 763 RR4ES83JQ
BS 764 778 RR4ES83TF
BS 779 858 RR4ES83JQ

RD RR4GP85TF 535 0 0
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AGCTGATCCCAAGGGTCCTCAAAGCCCATCAGGTTACTCTTGCAAGAACCCTGACCAAGT
CACCGAAAATGATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCAT
TAAAGCCGCGGTGACACCAGCATTCGCGCCTGCTTCCGCAGGCACCAATGGCCTTGGAGT
CTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCAGGTGGTGGTGTCATCCCTCTTCACACTCATCCTGG
TGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATCTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGC
TAATAAGGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCT
TCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4ES83TF 778 0 0
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TTTTCTTCATACTCTCCCTAGTTTCATCCATCTCTTTTGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTG
TAGCTGATCCCAAGGGTCCTCAAAGCCCATCAGGTTACTCTTGCAAGAACCCTGACCAAG
TCACCGAAAATGATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCA
TTAAAGCCGCGGTGACACCAGCATTCGCGCCTGCTTTCGCAGGCACCAATGGCCTTGGAG
CCTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCAGGTGGTGGTTTCATCCCTCTTCACACTCATCCTG
GTGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATCTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTG
CTAATAAGGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAGGGGC
TTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAA
GCTCATCCCCGGGACTTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAG
AACTCGTTGAAGCTACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAAGGGCGTGC
TTGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCGTTTTATTTT*CTAAGTTTTTGTGTGTGAGTG
CGTTTATGCGTTTTTT*CGAGTTGGTTTAGCATTCTGATTTT*ACCGTAATGGTTGTC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4ES83JQ 726 0 0
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ATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCATTAAAGCCGCGG
TGACACCAGCATTCGCGCCTGCTTTCGCAGGCACCAATGGCCTTGGAGCCTCGATGGCTC
GTCTTGACTTAGCAGGTGGTGGTTTCATCCCTCTTCACACTCATCCTGGTGCGTCTGAGG
TTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGCTAATAAGGTAT
ACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAGGGGCTTCTTCATTTTC
AGCTTAACTCTGGGAAAGGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCATCCCCGG
GACTTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAG
CTACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAAGGGCGTGCTTGGAGGAACTA
ACTAAGCTTCTCTTTCGTTTTATTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTGCGTTTATGCGTT
TTTTTCGAGTTGGTTTAGCATTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGTCTTTCTTTTTTTGTT
GTTATTGTTCTCAATGTCTCATTTTATTATCTCTTTGGGTTAAATTTTAATAAGTAATTG
CATAGT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4GP85JQ 649 0 0
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CCTGCTTCCGCAGGCACCAATGGCCTTGGAGTCTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCAGGT
GGTGGTGTCATCCCTCTTCACACTCATCCTGGTGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAA
GGAACCATCTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGCTAATAAGGTATACTTGAAGACTCTCCAG
AGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAA
GGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCATCCCCGGGACTTCAGATTCTACCA
TTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCTACCCCCTTCCTTAGT
GATGAACAAGTTAAGAAGCTTAAGGGCGTGCTTGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCG
TTTTATTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTGCGTTTATGCGTTTTTTTCGAGTTGGTTTA
GCATTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGTCTTTCTTTTTTTGTTGTTATTGTTCTCAATGT
CTCATTTTATTATCTCTTTGGGTTAAATTTTAATAAGTAATTGCATAG
C

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 3

CO CL2583Contig1 1214 3 4 U
GGATGGATAACAAAGCCACCAATCAAATGGCATCCCTGGACCACATTCTTCGTCTTCTTC
CTCTGCTCTTCATCATCATCATCTCTTCCTTACAAGTTTTGCCAGCTTCAGCCAAATCTT
CAGACAAACTAAAAACCGCCACTACCATCCGTAAAGTAAACCGCAAAGGACCTTACGTAG
GTCTCGTGACGGTCATTGGGACAGAAGAAAATGCTTTCCTAGCTAGTGTCAAATTCAGAC
CCGATCCTACTCACCCGTTCATTGATCTCTCTGGTAGACGTTTTCGGATAGGAAAAATTC
AGGGAAAGAAGGTTATGTATGTCAGATGTGGGAGAGGAATGGTGAACGCCGCAGCAGCAA
CGCAACAAATGATAGACATGTTCGATGTGAAGGGGATTGTGCATTTTGGGATTGCAGGAA
ATATAAACAACTCAATGTCCATAGGAGACGTGACCATTCCTAATCAAATCACTAATGCTG
GCTTGCGGGATTGGCTGAATCCAGACAAAATAGAGGGAGGTGACGATGAAGCGTACTTAG
ATATTGGGAACTACAATGTTCCACAAAGAGAAGGCAACAACAATATGTTAGGGAGTTTTA
GATATGGTAACGAGCAACTATATTCAGTCACTGGTCACATCAATTCACCTCAGAACGTGT
TTTGGATAAATACAACTAAAGAGTGGCTTCATCTTGCAGCTGATCTAGAGAAGATAGAGT
TGTTGCAGTGCGTGAATTCAACTTTGTGTCTTCCAGAGAAACCAAAACTGGTAGTTGGAT
TAAAGGCAGCCACTGCTAACATATTCGTGGATAATGCAGTCTACAGAGACTTCTTATACG
ATACATTTGAGGTTTCCTCCTCAGACATGGAGAGTTCTGCAGTGGCTATGACGTGCGTGT
CGAACGGGTACCCAGTAATTGTAATAAGGGGGTTATCAGATTTAGCTGGAGCACAAAGAG
GAACCAATGCTATTCGAAAGTTTGGATCTTTGGCTGCTGCTAACACTGCAAAAGCTGTTC
TAGAGTTCATCAAGAAGCTACCACCAAACTACAACTTTGAATCCTATCATGAGTGATTTA
ATCTGTAATCTTCTTTTATCAAATATAATTAGAGCTCATATAATTATCCACTAATCAGCT
TATTACATGCAACACTTGTTAATTTCAGCCACTCCCACTAGAATCACATATACTGTATAT
CTCTAGTTCATACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER72TF U 1
AF RR4B135TF U 1
AF RR4B135JQ C 467
BS 1 377 RR4B135TF
BS 378 378 RR4ER72TF
BS 379 783 RR4B135TF
BS 784 1214 RR4B135JQ

RD RR4ER72TF 668 0 0
GGAT
GGATAACAAAGCCACCAATCAAATGGCATCCCTGGACCACATTCTTCGTCTTCTTCCTCT
GCTCTTCATCATCATCATCTCTTCCTTACAAGTTTTGCCAGCTTCAGCCAAATCTTCAGA
CAAACTAAAAACCGCCACTACCATCCGTAAAGTAAACCGCAAAGGACCTTACGTAGGTCT
CGTGACGGTCATTGGGACAGAAGAAAATGCTTTCCTAGCTAGTGTCAAATTCAGACCCGA
TCC*ACTCACCCGTTCATTGATCTCTCTGGTAGACGTTTTCGGATAGGAAAAATTCAGGG
AAAGAAGGTTATGTATGTCAGATGTGGGAGAGGAATGGTGAACGCCGCAGCAGCAACGCA
ACAAATGATAGACATGTTCGATGTGAAGGGGATTGTGCATTTTGGGATTGCAGGAAATAT
AAACAACTCAATGTCCATAGGAGACGTGACCATTCCTAATCAAATCACTAATGCTGGCTT
GTGGGATTGGCTGAATCCAGACAAAATAGAGGGAGGTGACGATGAAGCGTACTTAGATAT
TGGGAACTACAATGTTCCACAAAGAGAAGGCAACAACAATATGTTAGGGAGTTTTAGATA
TGGTAACGAGCAACTATATTCAGTCACTGGTCACATCAATTCACCTCAGAACGTGTTTTG
GAT
A

QA 5 667 5 667
DS 

RD RR4B135TF 783 0 0
GGATGGATAACAAAGCCACCAATCAAATGGCATCCCTGGACCACATTCTTCGTCTTCTTC
CTCTGCTCTTCATCATCATCATCTCTTCCTTACAAGTTTTGCCAGCTTCAGCCAAATCTT
CAGACAAACTAAAAACCGCCACTACCATCCGTAAAGTAAACCGCAAAGGACCTTACGTAG
GTCTCGTGACGGTCATTGGGACAGAAGAAAATGCTTTCCTAGCTAGTGTCAAATTCAGAC
CCGATCCTACTCACCCGTTCATTGATCTCTCTGGTAGACGTTTTCGGATAGGAAAAATTC
AGGGAAAGAAGGTTATGTATGTCAGATGTGGGAGAGGAATGGTGAACGCCGCAGCAGCAA
CGCAACAAATGATAGACGTGTTCGATGTGAAGGGGATTGTGCATTTTGGGATTGCAGGAA
ATATAAACAACTCAATGTCCATAGGAGACGTGACCATTCCTAATCAAATCACTAATGCTG
GCTTGCGGGATTGGCTGAATCCAGACAAAATAGAGGGAGGTGACGATGAAGCGTACTTAG
ATATTGGGAACTACAATGTTCCACAAAGAGAAGGCAACAACAATATGTTAGGGAGTTTTA
GATATGGTAACGAGCAACTATATTCAGTCACTGGTCACATCAATTCACCTCAGAACGTGT
TTTGGATAAATACAACTAAAGAGTGGCTTCATCTTGCAGCTGATCTAGAGAAGATAGAGT
TGTTGCAGTGCGTGAATTCAACTTTGTGTCTTCCAGAGAAACCAAAACTGGTAGTTGGAT
TAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4B135JQ 748 0 0
AATCACTAATGCTGGCTTGCGGGATTGGCTGAATCCAGACAAAATAGAGGGAGGTGACGA
TGAAGCGTACTTAGATATTGGGAACTACAATGTTCCACAAAGAGAAGGCAACAACAATAT
GTTAGGGAGTTTTAGATATGGTAACGAGCAACTATATTCAGTCACTGGTCACATCAATTC
ACCTCAGAACGTGTTTTGGATAAATACAACTAAAGAGTGGCTTCATCTTGCAGCTGATCT
AGAGAAGATAGAGTTGTTGCAGTGCGTGAATTCAACTTTGTGTCTTCCAGAGAAACCAAA
ACTGGTAGTTGGATTAAAGGCAGCCACTGCTAACATATTCGTGGATAATGCAGTCTACAG
AGACTTCTTATACGATACATTTGAGGTTTCCTCCTCAGACATGGAGAGTTCTGCAGTGGC
TATGACGTGCGTGTCGAACGGGTACCCAGTAATTGTAATAAGGGGGTTATCAGATTTAGC
TGGAGCACAAAGAGGAACCAATGCTATTCGAAAGTTTGGATCTTTGGCTGCTGCTAACAC
TGCAAAAGCTGTTCTAGAGTTCATCAAGAAGCTACCACCAAACTACAACTTTGAATCCTA
TCATGAGTGATTTAATCTGTAATCTTCTTTTATCAAATATAATTAGAGCTCATATAATTA
TCCACTAATCAGCTTATTACATGCAACACTTGTTAATTTCAGCCACTCCCACTAGAATCA
CATATACTGTATATCTCTAGTTCATACC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL2584Contig1 880 4 16 U
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAGAAAAAAAAGAAGACACTAACTCTCTGTTCTTTTT
CTCGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTCTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCGC
CAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCACAGAC
GCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTCGCAGCTGGCCTTTTT*GTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCCCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTACGCG
TTTAACATCTCTCAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGAACGTGGATCTCTGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCG
GCTTACATTACTCTTGCCGGTCATTTTTCCGGTGAAGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTT
GTCCAGCGATGTGGTGTTGACGTTTAAGCAAAGGGATGATCATTATTCTTTACAAAGACT
AGAGTCTAGACTACGATTCCCGTGCTTTTATTTCTTTAGTTAACTGTAATGCTTATAAAT
GTTTTGTACTGCGTTTTTATGATGGAGATTAATGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM16TF U 1
AF RR4AO09TF U 7
AF RR4AO09JQ C 107
AF RR4FM16JQ C 389
BS 1 174 RR4FM16TF
BS 175 175 RR4AO09TF
BS 176 208 RR4FM16TF
BS 209 209 RR4AO09TF
BS 210 224 RR4FM16TF
BS 225 225 RR4AO09TF
BS 226 523 RR4FM16TF
BS 524 524 RR4AO09TF
BS 525 634 RR4FM16TF
BS 635 635 RR4AO09TF
BS 636 684 RR4FM16TF
BS 685 740 RR4AO09TF
BS 741 800 RR4AO09JQ
BS 801 801 RR4FM16JQ
BS 802 844 RR4AO09JQ
BS 845 880 RR4FM16JQ

RD RR4FM16TF 684 0 0
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAGAAAAAAAAGAAGACACTAACTCTCTGTTCTTTTT
CTCGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTCTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCGC
CAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGAC
GCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCCCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTACGCG
TTTAACATCTCTCAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGTACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGAACGTGGATCTCTGGAAAGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCG
GCTTACATTACTCTTGCCGGTCAT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4AO09TF 734 0 0
GG
CTGTCTCTTGATGTGAAGAAAAAAAAGAAGACACTAACTCTCTGTTCTTTTTCTCGAAAT
ACAACAAAAAGGTTAGCTCTCTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCGCCAAAAATG
ACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCACAGACGCATAGGA
GCGGCGGTGCTTGGCTTGCTCGCAGCTGGCCTTTTT*GTGGTTTTCTTGGTGTGGGCTAT
TCTTCACCCCCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTACGCGTTTAACAT
CTCTCAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGAAATCCTAA
TGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGCAACCAGCA
GGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTGACGTTATG
GTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCTGCTTTAAG
CCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGGGTTCGATG
GAAAGTGGGAACGTGGATCTCTGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCGGCTTACAT
TACTCTTGCCGGTCATTTTTCCGGTGAAGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTTGTCCAGCG
ATGTGGTGTTGA

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR4AO09JQ 738 0 0
CACTAAGAAACCGCCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGA
GAACATGCACAGACGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTCGCAGCTGGCCTTTTT*G
TGGTTTTCTTGGTGTGGGCTATTCTTCACCCCCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACG
CAACCATTTACGCGTTTAACATCTCTCAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCA
CTCTCTCTTCTCGAAATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTT
ACGCCTCCTACCGCAACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAG
GTCACCTTGATGTGACGTTATGGTCGCCGATTCTTTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCAC
CGTTCTTTTCGCCTGCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCA
AGATCGACGGTTGGGTTCGATGGAAAGTGGGAACGTGGATCTCTGGAAGGTACCGCCTAC
ATGTCAATTGTCCGGCTTACATTACTCTTGCCGGTCATTTTTCCGGTGAAGGTCCAGCTG
TTAAGTACCAGCTTGTCCAGCGATGTGGTGTTGACGTTTAAGCAAAGGGATGATCATTAT
TCTTTACAAAGACTAGAGTCTAGACTACGATTCCTGTGCTTTTATTTCTTTAGTTAACTG
TAATGCTTATAAATGTTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FM16JQ 492 0 0
ATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGCAACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTAC
TGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTGACGTTATGGTCGCCGATTCTTTACGGAA
CATCCGTGCCGGTGGTACCGTTCTTTTCGCCTGCTTTAAGCCAAGATTTAATGGCAGGGA
TGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGGGTTCGATGGAAAGTGGGAACGTGGATTT
CTGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCGGCTTACATTACTCTTGCCGGTCATTTTT
CCGGTGAAGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTTGTCCAGCGATGTGGTGTTGACGTTTAAG
CAAAGGGATGATCATTATTCTTTACAAAGACTAGAGTCTAGACTACGATTCCCGTGCTTT
TATTTCTTTAGTTAACTGTAATGCTTATAAATGTTTTGTACTGCGTTTTTATGATGGAGA
TTAATGTTTACC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 4

CO CL2585Contig1 645 4 5 U
GGAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTGCTAAAACATGGTGCTCGATGCTTATGCTTCG
TCGAACCCTAATATGGTTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGACGCTTGCTACAAG
GCAAGAGATGCTTTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCCACTGAGATC
GCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCTTTCCAGAACCGAGTTCGTCAAG
AACTGTCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAACAAGAGAGTC
CAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTCCCTCAGCCTTAC
ACTTTCAAGCCTTCTCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGAAGTGGAAGA
TGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTATCTT
TGCCGACTTTTTTTTTTATATCCCTTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTACAA
CATTGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTTGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTG
CTCACAATCTGCAAGCATTTAGTATTACAGTATACTGATATATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BU03JQ C 1
AF RR4BU03TF U 1
AF RR4BM82JQ C 18
AF RR4BM82TF U 18
BS 1 338 RR4BU03TF
BS 339 339 RR4BM82TF
BS 340 538 RR4BU03TF
BS 539 541 RR4BM82TF
BS 542 645 RR4BU03TF

RD RR4BU03JQ 645 0 0
GGAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTGCTAAAACATGGTGCTCGATGCTTATGCTTCG
TCGAACCCTAATATGGTTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGACGCTTGCTACAAG
GCAAGAGATGCTTTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCCACTGAGATC
GCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCTTTCCAGAACCGAGTTCGTCAAG
AACTGTCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAACAAGAGAGTC
CAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCTATGTCACTCCCTCAGCCTTAC
ACTTTCAAGCCTTCTCCTTTTTTTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGAAGTGGAAGA
TGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTATCTT
TGCCGACTTTTTTTTTTATATCCCTTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTAC**
*ATTGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTTGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTG
CTCACAATCTGCAAGCATTTAGTATTACAGTATACTGATATATAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4BU03TF 645 0 0
GGAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTGCTAAAACATGGTGCTCGATGCTTATGCTTCG
TCGAACCCTAATATGGTTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGACGCTTGCTACAAG
GCAAGAGATGCTTTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCCACTGAGATC
GCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCTTTCCAGAACCGAGTTCGTCAAG
AACTGTCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAACAAGAGAGTC
CAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCTATGTCACTCCCTCAGCCTTAC
ACTTTCAAGCCTTCTCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGAAGTGGAAGA
TGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTATCTT
TGCCGACTTTTTTTTTTATATCCCTTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTAC**
*ATTGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTTGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTG
CTCACAATCTGCAAGCATTTAGTATTACAGTATACTGATATATAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4BM82JQ 628 0 0
GG
ACCGTCGCTGCTAAAACATGGTGCTCGATGCTTATGCTTCGTCGAACCCTAATATGGTTC
ACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGACGCTTGCTACAAGGCAAGAGATGCTTTTTACA
CTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCCACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCT
ACCCTAAAGAGTGCAGCCTTTCCAGAACCGAGTTCGTCAAGAACTGTCGCTCCTCCTGGG
TGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAACAAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATG
GGGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTCCCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCTCCTT
CTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGGAGTGGAAGATGACTGAGTAATCCCTTTG
GTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTATCTTTGCCGACTTTTTTTTTTAT
ATCCCTTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTACAACATTGGAATAAAGGTGTTG
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GG
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CTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGGAGTGGAAGATGACTGAGTAATCCCTTTG
GTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTATCTTTGCCGACTTTTTTTTTTAT
ATCCCTTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTACAACATTGGAATAAAGGTGTTG
TGCTTTTGAAGGAACCTTGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATT
TAGTATTACAGTATACTGATATATAA

QA 3 628 3 628
DS 



AS 1 4

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AAGAAAAATGGATGGTCACACTGGTAAAGACATTGGTATGAAGAGAAGTGCTTCCGAGTT
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C*ATTTGCGAGAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTGTCAGCCAATAAACCTGAGGCAAAAA
GAGCGGCTCGCGGAACCGTGAGTGTATATACTGATGATCACTCTGATGAAGAAGATGCGG
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GGATGTACTCAAACAGGATATCAGCAAGGCGTTCAAGGCAAAGGAAGCAAGAACAGTTGG
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TCATAGACGCAACACAACAGTTTCGTACTGCTGGAACAAATAACAGAGTTCTCAAATCAG
ATGTTGAAACTCTGAGAGTCAAGGTGAAACTAGCTGAAGATTTGATAGCTAGAGGGTCCT
TCACTAGCAGCTTGAATCAGCTTCTGCAAACTCATTTAAGTCCACCACCATCACATTCCA
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AATCTCTGTTCCCTGGAATCACCATATCTGGACAGAACTCAAGCCCTGGACTTGGTAATG
TATCCAGCGAAGCTGTTAGCTGCGTCTCAGATATCTGGCCATAATTGTCTCTTTATTCAC
AATATGTAATTGATCACTCTGCAAGTTTCATGTATGTGTTTCACTATAGAACTAGAAACA
TATAAATGAAATCTACGTTTGGTTAATTAAACTCAAGTTTCGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EY71TF U 17
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AF RR4FW30JQ C 279
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RD RR4EY71TF 697 0 0
TTT
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CAAG*TGAAACTAGCTGAAGATTTGATAGCTAGA

QA 4 697 4 697
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AAGTTTCGTTTAC

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR4FW30JQ 789 0 0
T
TTTTCTTGATGCACAGTCCTCCCATTTGCGAGAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTGTCAG
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TCGTTTAC

QA 2 789 2 789
DS 



AS 1 4

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GAGTGGCAGTTCAGTGGCAGTGATGCGGCAGAGGAAGCCGCAGCGGCCTCCCTAGGCACT
TACACTTCTGAACTCTTTGCTCTATGCGATCCTCAAGGAAAGCCTATCTTGCCCCCACGA
AATTCGTCGCCAGAGTCAAGCCATACGGCCGAAAAGGCAGTTGTTAAAGCTGTCATCTGC
GGCAACGGAAACGCCTACGCCTCTAGCATTGGCCTCCCGGTCGCCAAAGATGCTGTGGCT
GAATATCTCAACCGAGATCTTGATAATAAGCTGACGGGAGATGATGTGTTTATGACTGTT
GGATGCAAACAAGCTATCGAGCTCGTGGTAGATATCCTGGCTAAGCCGGAAGCCAACATC
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GTTCGAAGGTGAAGTCATCCCCGAAAAAGAATTTGAGATTGATCTCGATAGCGTCAAAGA
GATGGCAGACAAGAACACGTTCGCGATCTTTATAATCAACCCTCATAATCCCAATGGGAA
CTACTACACTGAGCCTCATCTCGAGCAGCTTGCTAACTTGGCTCGAGAACTCGGGGTAAT
GGTTGTCTCAGACGAAGTATATAGATGGACCGTGTTTGGAAGTAATCCCTTTGTTCCAAT
GGGGAAATTCTCCTCGATTGTACCCGTTATTACACACGGCTCCATATCGAAAGGATGGAG
TGTCCCAGGATTGCGAACAGGCTGGCTCGCTATGCACGATCTAAACGGTGTCTTTAAATC
CACCAAGGTCTTAAAAGCTGCTAACGAATTTTTGGAGATAAATTTTAAACCACCAACTGT
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ACATTTTGTGGACATTGAAGACGATCAAGACTTTTACAATAAGCTTGCTAAGGAAGAAAA
CCTCGTCGTTTTACCAGGGATTGCATTTGGTCAGAAGAACTGGTTAAGGCATTCTATTGA
CATGGAGACATCGATATTGGAGGATGCATTTACAAGACTGAAATGCTTCTGTGAACGCCA
TAACTGAAGCGTAACTCAATGACGTCAATGGTGCAACTAAAGGGTTCCAAAAGCTAAGTC
TTTTTATATGCTATAATAATTAATGGGGTGGTTTGCTTTTATGAATAAATAATGAACACC
ATTCGAGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DJ12TF U 1
AF RR4DB31TF U 1
AF RR4DB31JQ C 694
AF RR4DJ12JQ C 887
BS 1 750 RR4DB31TF
BS 751 1193 RR4DB31JQ
BS 1194 1194 RR4DJ12JQ
BS 1195 1389 RR4DB31JQ

RD RR4DJ12TF 493 0 0
GGGATCCAAAAAACTACCTAAAGAAACAAAAGAAGAAATATGGCCAACAATGAATTCGTT
GAGTGGCAGTTCAGTGGCAGTGATGCGGCAGAGGAAGCCGCAGCGGCCTCCCTAGGCACT
TACACTTCTGAACTCTTTGCTCTATGCGATCCTCAAGGAAAGCCTATCTTGCCCCCACGA
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GGATGCAAACAAGCTATCGAGCTCGTGGTAGATATCCTGGCTAAGCCGGAAGCCAACATC
CTGATTCCTAGACCAGGTTTCCCTGCGGACTACGTCCGCTCTCTCTTCAAAAAACTCGAG
GTTCGAAGGTGAA

QA 1 493 1 493
DS 

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GGGATCCAAAAAACTACCTAAAGAAACAAAAGAAGAAATATGGCCAACAATGAATTCGTT
GAGTGGCAGTTCAGTGGCAGTGATGCGGCAGAGGAAGCCGCAGCGGCCTCCCTAGGCACT
TACACTTCTGAACTCTTTGCTCTATGCGATCCTCAAGGAAAGCCTATCTTGCCCCCACGA
AATTCGTCGCCAGAGTCAAGCCATACGGCCGAAAAGGCAGTTGTTAAAGCTGTCATCTGC
GGCAACGGAAACGCCTACGCCTCTAGCATTGGCCTCCCGGTCGCCAAAGATGCTGTGGCT
GAATATCTCAACCGAGATCTTGATAATAAGCTGACGGGAGATGATGTGTTTATGACTGTT
GGATGCAAACAAGCTATCGAGCTCGTGGTAGATATCCTGGCTAAGCCGGAAGCCAACATC
CTGATTCCTAGACCAGGTTTCCCTGCGGACTACGTCCGCTCTCTCTTCAAAAAACTCGAG
GTTCGAAGGTGAAGTCATCCCCGAAAAAGAATTTGAGATTGATCTCGATAGCGTCAAAGA
GATGGCAGACAAGAACACGTTCGCGATCTTTATAATCAACCCTCATAATCCCAATGGGAA
CTACTACACTGAGCCTCATCTCGAGCAGCTTGCTAACTTGGCTCGAGAACTCGGGGTAAT
GGTTGTCTCAGACGAAGTATATAGATGGACCGTGTTTGGAAGTAATCCCTTTGTTCCAAT
GGGGAAATTCTCCTCGATTGTACCCGTTAT

QA 1 750 1 750
DS 

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GTTTGGAAGTAATCCCTTTGTTCCAATGGGGAAATTCTCCTCGATTGTACCCGTTATTAC
ACACGGCTCCATATCGAAAGGATGGAGTGTCCCAGGATTGCGAACAGGCTGGCTCGCTAT
GCACGATCTAAACGGTGTCTTTAAATCCACCAAGGTCTTAAAAGCTGCTAACGAATTTTT
GGAGATAAATTTTAAACCACCAACTGTTATCCAGGCAGCTATTCCCACCATCTTGGAGAA
AACTCCTCAAGAATTCTTTGATAGGAGGCAGAGTTTTTTTAAAGACAAAGTTGATATTGC
ATATGCTAAGCTCAAGGAGATACCTACCCTCACCTGTTACATGAAACCTGAAGCATGCAC
CTTTTTATGGACCGAGCTAGACCCATCACATTTTGTGGACATTGAAGACGATCAAGACTT
TTACAATAAGCTTGCTAAGGAAGAAAACCTCGTCGTTTTACCAGGGATTGCATTTGGTCA
GAAGAACTGGTTAAGGCATTTTATTGACATGGAGACATCGATATTGGAGGATGCATTTAC
AAGACTGAAATGCTTCTGTGAACGCCATAACTGAAGCGTAACTCAATGACGTCAATGGTG
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TGCTTTTATGAATAAATAATGAACACCATTCGAGTG

QA 1 696 1 696
DS 

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AAGGAGATACCTACCCTCACCTGTTACATGAAACCTGAAGCATGCACCTTTTTATGGACC
GAGCTAGACCCATCACATTTTGTGGACATTGAAGACGATCAAGACTTTTACAATAAGCTT
GCTAAGGAAGAAAACCTCGTCGTTTTACCAGGGATTGCATTTGGTCAGAAGAACTGGTTA
AGGCATTCTATTGACATGGAGACATCGATATTGGAGGATGCATTTACAAGACTGAAATGC
TTCTGTGAACGCCATAACTGAAGCGTAACTCAATGACGTCAATGGTGCAACTAAAGGGTT
CCAAAAGCTAAGTCTTTTTATATGCTATAATAATTAATGGGGTGGTTTGCTTTTATGAAT
AAATAATGAACACCATTCGAGTG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 4

CO CL2588Contig1 679 4 8 U
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AAGATCAAAGTAGAGTTATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCACCATTCATGAGAGGTT
CAAAAGCTTCTTGATGTCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTGGGTAGTAACGTTC
AACAGCTTGACCATTCTTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACTGAATCTCGTCCCC
GAAGATTCCCCATTTACCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAGAAGCATTCTCTCCGTT
CACTTCAATCTTGTTGAAAATGGGGAACTCAGATTTGAAGCGTGTACAGACAAACTCTGT
AATTTGGGCAGTAGTTCCAGGTTCCTCTCCACCAAATTGATTACAAGGAAATGCTAGAAT
CTCCAGACCTTTGTCTTTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAGTGTAGTTAGAGTT
CGTCATCCCACATTCGGAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGTCTTTGTATTGACT
GAGTTCTAAGCTGTTTCCATTTGCATCCTCGATGCTTATATCGTAAACAGATTCTGGGTC
TTTCGTCGCCATAGAAGCACGAGAAATGAGAGAGAAGAGTGCTGCGAGTAGGACAGAAGA
AACAAAGCTAAAAGGCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BW14JQ U 1
AF RR4BW14TF C 8
AF RR4A781JQ U 17
AF RR4A781TF C 17
BS 1 62 RR4BW14JQ
BS 63 63 RR4A781JQ
BS 64 494 RR4BW14JQ
BS 495 495 RR4A781JQ
BS 496 570 RR4BW14JQ
BS 571 571 RR4A781JQ
BS 572 645 RR4BW14JQ
BS 646 679 RR4A781JQ

RD RR4BW14JQ 645 0 0
GAAAACAGAACAAATTCGAACCAAAGTCAAACTGATTTTGCTTTATTACATGACAAGTTC
AA*ATCAAAGTAGAGTTATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCACCATTCATGAGAGGTT
CAAAAGCTTCTTGATGTCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTGGGTAGTAACGTTC
AACAGCTTGACCATTCTTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACTGAATCTCGTCCCC
GAAGATTCCCCATTTACCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAGAAGCATTCTCTCCGTT
CACTTCAATCTTGTTGAAAATGGGGAACTCAGATTTGAAGCGTGTACAGACAAACTCTGT
AATTTGGGCAGTAGTTCCAGGTTCCTCTCCACCAAATTGATTACAAGGAAATGCTAGAAT
CTCCAGACCTTTGTCTTTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAGTGTAGTTAGAGTT
CGTCATCCCACATTTGGAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGTCTTTGTATTGACT
GAGTTCTAAGCTGTTTCCATTTGCATCCTCAATGCTTATATCGTAAACAGATTCTGGGTC
TTTCGTCGCCATAGAAGCACGAGAAATGAGAGAGAAGAGTGCTGC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4BW14TF 644 0 0
GAACAAATTCGAACCAAAGTCAAACTGATTTTGCTTTATTACATGACAAGTTCAA*ATCA
AAGTAGAGTTATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCACCATTCATGAGAGGTTCAGAAGC
TTCTTGATGTCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTGGGTAGTAACGTTCAACAGCT
TGACCATTCTTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACTGAATCTCGTCCCCGAAGATT
CCCCATTTACCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAGAAGCATTCTCTCCGTTCACTTCA
ATCTTGTTGAAAATGGGGAACTCAGATTTGAAGCGTGTACAGACAAACTCTGTAATTTGG
GCAGTAGTTCCAGGTTCCTCTCCACCAAATTGATTACAAGGAAATGCTAGAATCTCCAGA
CCTTTGTCTTTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAGTGTAGTTAGAGTTCGTCATC
CCACATTTGGAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGTCTTTGTATTGACTGAGTTCT
AAGCTGTTTCCATTTGCATCCTCGATGCTTATATCGTAAACAGATTCTGGGTCTTTCGTC
GCCATAGAAGCACGAGAAATGAGAGAGAAGAGTGCTGC
GAGTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4A781JQ 663 0 0
CGAACCAAAGTCAAACTGATTTTGCTTTATTACATGACAAGTTCAAGATCAAAGTAGAGT
TATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCCCCATTCATGAGAGGTTCAAAAGCTTCTTGATG
TCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTGGGTAGTAACGTTCAACAGCTTGACCATTC
TTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACTGAATCTCGTCCCCGAAGATTCCCCATTTG
CCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAGAAGCATTCTCTCCGTTCACTTCAATCTTGTTG
AAAATGGGGAACTCAGATTTGAAGTGTGTACAGACAAACTCTGTAATTTGGGCAGTAGTT
CCAGGTTCCTCTCCACCAAATTGATTACAAGGAAATGCTAGAATCTCCAGACCTTTGTCT
TTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAGTGTAGTTAGAGTTCGTCATCCCACATTCG
GAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGTCTTTGTATTGACTGAGTTCTAAGCTGTTT
CCATTTGCATCCTCGATGCTTATATCGTAAACAGATTCTGGGTCTTTCGTCGCCATAGAA
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ATG

QA 1 663 1 663
DS 

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TATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCCCCATTCATGAGAGGTTCAGAAGCTTCTTGATG
TCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTGGGTAGTAACGTTCAACAGCTTGACCATTC
TTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACTGAATCTCGTCCCCGAAGATTCCCCATTTG
CCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAGAAGCATTCTCTCCGTTCACTTCAATCTTGTTG
AAAATGGGGAACTCAGATTTGAAGTGTGTACAGACAAACTCTGTAATTTGGGCAGTAGTT
CCAGGTTCCTCTCCACCAAATTGATTACAAGGAAATGCTAGAATCTCCAGACCTTTGTCT
TTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAGTGTAGTTAGAGTTCGTCATCCCACATTCG
GAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGTCTTTGTATTGACTGAGTTCTAAGCTGTTT
CCATTTGCATCCTCGATGCTTATATCGTAAACAGATTCTGGGTCTTTCGTCGCCATAGAA
GCACGAGAAATGAGAGAGAAGAGTGCTGCGAGTAGGACAGAAGAAACAAAGCTAAAAGGC
ATG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 4

CO CL2589Contig1 955 4 6 U
GGACTCTCCAATCTCTTCCCTCTTTTGCAAATTCCCCCAGTCTCTGTTCCTCTGTTGACA
AAAGACTCCTTTTTTTTTTCTTCCCGGAAGACAGTTAACGCTCCATGACGAAGCAGCACG
CGAACTGGTCTCCTTACGACAATAATGGAGGAACATGCGTGGCCATCGCTGGATCGGATT
ACTGCGTCATCGCCGCCGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCACTCGCGATT
ACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTG
ATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATA
ACAAGCAGACGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGC
GCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGAATGGTAAAGGGT
GTGTGTTCACCTATGACGCTGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCT
CTGGATCCACTCTGATCATGCCGTTTCTTGATAACCAGCTCAAGAGTCCTAGTCCTCTTC
TGCTCCCTTCACAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTGA
AGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCA
TGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAAGACCGAAGTCATAGACTTAAGGAAAGACTAAGCTG
AATTTCCGCGCATATGAGTGTTGAGAACACACACCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCA
TCAACTGTGTTTGACGTCTAAAACTGTTTCCTTAGCTTGTTAACAACGTTGTCTCATTTA
TGAACACAACCCTCTTGATTAGCTACTACCGTGCTGGAGCATATTTGTTTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY36TF U 1
AF RR4BQ88TF U 71
AF RR4EY36JQ C 226
AF RR4BQ88JQ C 265
BS 1 367 RR4EY36TF
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BS 370 708 RR4EY36TF
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BS 920 955 RR4BQ88JQ

RD RR4EY36TF 708 0 0
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AAAGACTCCTTTTTTTTTTCTTCCCGGAAGACAGTTAACGCTCCATGACGAAGCAGCACG
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ACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTG
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AGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BQ88TF 656 0 0
TTTTTTTTTCTTCCCGGAAGACAGTTAACGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTC
TCCTTACGACAATAATGGAGGAACATGCGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTCAT
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GAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCC
TTACTACGCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTTACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCAC
CTATGACGCTGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCCAC
TCTGATCATGCCGTTTCTTGATAACCAGCTCAAGAGTCCTAGTCCTCTTCTGCTCCCTTC
ACAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTT
CGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4EY36JQ 695 0 0
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CTGGGTTCCAAGCTGATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTTT
ATCAGCATCAGCATAACAAGCA**CGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAACA
CGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACG
AGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCACCTATGACGCTGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGAT
ACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCCACTCTGATCATGCCGTTTCTTGATAACCAGCTCAAGA
GTCCTAGTCCTCTTCTGCTCCCTTCACAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAG
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ACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAAGACCGAAGTCATAGACTTAA
GGAAAGACTAAGCTGAATTTCCGCGCATATGAGTGTTGAGAACACACACCTTTGTTACTT
TGTCGTTGGTCATCATCAACTGTGTTTGACGTCTAAAACTGTTTCCTTAGCTTGTTAACA
ACGTTGTCTCATTTATGAACACAACCCTCTTGAT
C

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BQ88JQ 691 0 0
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TTACATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCTA
TGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTA
ATGTTCTTGGAGGGCTTTACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCACCTATGACGCTGTTG
GTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCCACTCTGATCATGCCGT
TTCTTGATAACCAGCTCAAGAGTCCTAGTCCTCTTCTGCTCCCTTCACAGGATGCTATCA
CGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTG
AGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCA
AGACCGAAGTCATAGACTTAAGGAAAGACTAAGCTGAATTTCCGCGCAT**GAGTGTTGA
GAACACACACCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCATCAACTGTGTTTGACGTCTAAAAC
TGTTTCCTTAGCTTGTTAACAACGTTGTCTCATTTATGAACACAACCCTCTTGATTAGCT
ACTACCGTGCTGGAGCATATTTGTTTGAGCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 4

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AGGAGCTCTGAGAAAACGATTTGCTGAGAGATAAGAGAGAGATGAGTTTTCAAGATTTAG
AAGCTGGAAGAGGGAGATCGAGGAAGACCAATGGTGGTGGTGGTGGTCGGCAAGATTCGA
CGCAAGCCGTGGCTTCGGGAATATTCCAGATCAATACCGGAGTTTCCACGTTTCAGCGTC
TCGTCAACACGCTCGGTACTCCCAGAGACACGCCTGAGCTCCGTGATAAGCTGCACAAGA
CACGGTTGCATATAGGGCAGCTTGTGAAGGACACGTCAGCTAAACTTAAAGAAGCTAGTG
AAACTGATCATCAAACTGGTGTCAATCCAAGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTTGCAA
AGGACTTTCAAGCTGTGTTGAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAACAAACTGCTGCTGAAAGAG
AAACTGCTTATGCTCCTTTGGTGCCTCCTTCTGCTCATCCCTCTAGCTATTCAGCGGGTG
GAGTAGATAATATCTCGGAACAGCGGGCGCAAGTTATGGAGTCGAAAAGGCAGGAGCTTG
TGTTGTTAGACAACGAGATTGCATTCAACGAGGCAGTGATCGAAGCAAGAGAGCAAGGGA
TACAAGAAATCCACAGTCAGATTGGCGAGGTTAACGAGATATTCAAAGATCTCGCGGTTC
TGGTTAACGATCAAGGAGTCATGATAGATGATATCGGTACTCACATTGACAACTCTCGAG
CTGCAACTTCACAAGGAAGGTCTCAGCTCGCTCAGGCCGCAAAAACACAAAGATCAAACT
CATCTCTGACATGCTTGCTCTTGGTGATATTTGGCATCGTACTCCTGATCGTGATAATCG
TACTCGCAGCTTGATTTTTGGAAACCAAGAACAAGTGGGTTTGAATGTGTTCATGGATCT
CAAAGCATCAATGAGTGAATTACTTGGTATATATTACGCAATTTGGATTCAAAACTTAGA
AGTTGGGTTTTGTATTGGTTTGGTTTGTTACGGTTGTAATATAGTGCGTGCGTGCGTGGT
TTTGTTGTGCAAACTGTGTTGGAGATGAGTGAAAGAATGTCTGTCCTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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CG

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AT
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TGC

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DS 



AS 1 4

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TGTCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4AF45TF U 1
AF RR4GL71TF U 51
AF RR4GL71JQ C 527
AF RR4AF45JQ C 433
BS 1 270 RR4AF45TF
BS 271 271 RR4GL71TF
BS 272 712 RR4AF45TF
BS 713 714 RR4GL71TF
BS 715 715 RR4AF45JQ
BS 716 766 RR4GL71TF
BS 767 767 RR4AF45JQ
BS 768 774 RR4GL71TF
BS 775 775 RR4AF45JQ
BS 776 818 RR4GL71TF
BS 819 1059 RR4AF45JQ
BS 1060 1060 RR4GL71JQ
BS 1061 1326 RR4AF45JQ

RD RR4AF45TF 712 0 0
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CGATTGTAGAATTGGAGAGTCGATCTCTGAGTTTGCTAAATCGCAGGGAGGGACGTTTAC
TGAGATTGAGGCGAAGTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCAAAGCCGAC
AAGATGACAAAACTCACGCTTACTAGGTGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTACTGAGTTG
TATGAGCAAGCAGCAAATGGCTTCAGGGCATCAAGCAAATATGAAAAAGCTAAAGTGGCT
CTCGAGAAAGCTTCCAAAGGACAAGAGATGCAATCTTCTCCCTGGGATGCTGCAAAGCAT
ATGGAGTCTGCTGCTGCCCTAGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAACGAAGTTGCTGATTTT
TATAGAAAGGCGTCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCT
CTTGGAAAGGCTGCTCGTGCGTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTATAC
ACCGATGCTTGTGAAA*TTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCCTTTGATCTGTA
CCGTGCTTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGATGCTGCAACCTTTTT
CTTAAGATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4GL71TF 768 0 0
GG
GGGAGCGGCGATTGTAGAATTGGAGAGTCGATCTCTGAGTTTGCTAAATCGCAGGGAGGG
ACGTTTACTGAGATTGAGGCGAAGTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCA
AAGCCGACAAGATGACAAAACTCACGCTTACTAGGTGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTA
CTGAGTTGTATGAGCAAGCAGCAAATGGCTTCAGGGCACCGAGCAAATATGAAAAAGCTA
AAGTGGCTCTCGAGAAAGCTTCCAAAGGACAAGAGATGCAATCTTCTCCCTGGGATGCTG
CAAAGCATATGGAGTCTGCTGCTGCCCTAGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAACGAAGTTG
CTGATTTTTATAGAAAGGCGTCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCAT
CAGATGCTCTTGGAAAGGCTGCTCGTGCGTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCC
AACTATACACCGATGCTTGTGAAA*TTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCCTTT
GATCTGTACCGTGCTTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCT*GAGAAGTTCACAGATGCTGCA
ACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGT
AACGCATATCTTAGTGCAATCATTGTATACCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAG*CTGAA
AA*TGCTACAACGATTGTTCTCAGATTGATGCTTTTCTGAAGAGTG

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR4GL71JQ 695 0 0
CCATCCAACTATACACCGATGCTTGTGAAAATTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATG
GCCTTTGATCTGTACCGTGCTTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCT*GAGAAGTTCACAGAT
GCTGCAACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGC
CAGTGTAAGGCATATCTTAGTGCAATCATTGTATACCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAG
GCTGAAAAATGCTACAACGATTGTTCTCAGATTGATGCTTTTCTGAAGAGTGATCAGAAC
CGAACTGCTAGCAGACTGCTCACAGCCTATAATGAAGGTGACATCGAAGAAATCAAGAAA
GTGGCGTGTTCAAGCACTGTCAACAATTTGGATCATGCGATCATCAAGTTGGCGAGAAAG
CTACCCACAGGAGATGTCACTGCAGTTGAGATGAATGCTGGTGATGATCTCGACGAGGAT
GATCTCACTTAAAGATTCTTCTCTTTGTACAGATTCAGATTCCTACACTTTGCCTATGTT
CAAGCCAAACTACTAAAACAAAGTTATCCTTTTAGTCCAAACCTTCGTTGCGTGAATGAA
TGATTGGCTATAAAGGCTCTGAGTTCAGATGTGTGCTTTGTTTCTCCACTAAATCCACAG
TGGGTTACCTCTTGAATGAACACTTGTCTTTTG
GC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4AF45JQ 894 0 0
TCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCTTGGAAAGGCT
GCTCGTGCGTTGGAAGAAGTCAAAC*TGAAGATGCCATCCAACTATACACCGATGCTTGT
GAAA*TTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCCTTTGATCTGTACCGTGCTTGTGC
TAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAAGATTGGG
TGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTAGTGCAAT
CATTGTATATCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAGGCTGAAAAATGCTACAACGATTGTTC
TCAGATTGATGCTTTTCTGAAGAGTGATCAGAACCGAACTGCTAGCAGACTGCTCACAGC
CTATAATGAAGGTGACATCGAAGAAATCAAGAAAGTGGCGTGTTCAAGCACTGTCAACAA
TTTGGATCATGCGATCATCAAGTTGGCGAGAAAGCTACCCACAGGAGATGTCACTGCAGT
TGAGATGAATGCTGGTGATGATCTCGACGAGGATGATCTCACTTAAAGATTCTTCTCTTT
GTACAGATTCAGATTCCTACACTTTGCTTATGTTCAAGCCAAACTACTAAAACAAAGTTA
TCCTTTTAGTCCAAACCTTCGTTGCGTGAATGAATGATTGGCTATAAAGGCTCTGAGTTC
AGATGTGTGCTTTGTTTCTCCACTAAATCCACAGTGGGTTACCTCTTGAATGAACACTTG
TCTTTTGTTAAATTCTTCTGCTCATACAGGTTAACACAGGCTGGTATATTTGTTCATTTA
ACAATAAATATGATACAGTTGTTTTTACCAAATTCCAATCTGTTTCTTTGTCCT

QA 1 894 1 894
DS 



AS 2 4

CO CL2592Contig1 859 2 8 U
GGCAACCAAAAGAGATTTTTCCAAATGAAAAATAACAAAAGTAGTAAGTGGGTGTGCCCA
CACTCTCTATCTTCGTGTGTCCCTCTCATCTTTTAAGATTACACAAACCAAAATAGAGAG
ATAATATTGTGAAAAGAGAGAGCACTATAGTTAATTCAAGAACACAAATTTCCAAAAAAA
AAAAATCAAGTTGGAATCCTGAGGATGAGCTTACTCTTCCTCACTGCCATACGTTTCTCT
TTATTCTTTCAAACAAAAATCCTAAGTTTTTTTATCATCATCATTTAGTCTTAGGCTTAG
GCTTCAGCTGCTGCTATGGCAGGGACTGGAGCAACACCACCGGTGGTTGGCAGGCCAACA
AACACTTTGAAGGCATCGTATAAACCCCACTGTGCTCCAGTCAATGTTCCTATCATCACA
ATTCTTAAAGGAAGTCCTCTTGTGAACAGTCCCACCATTCCTATCTTCTTCACCGCATCT
CCAACGGTTGCTCCCTTAGCGTTGTTGAGGAACGACACTAGATTATCTGCAGGATGGGAG
ACAATTGCACAAAACACTCCAGCAACATAACCTCCTGCAAAACTCACACCAAGTTGCAGA
CCTTTGCTGCACTCGTGTTTTGGGTTCGGGATTGCGTACTTGTAGATCATCTCAACAATG
GTCTCAAACGAAGCAAACTTCATCATCGTGTAAGGAATCTGACGTCCCCAAAGTGGAGCA
AGACCCTTGTACAAGCCTCCGTATCCTTCGGACTTGACAAACTTAGGAAACCCATCAGAC
ATCCCCCTGGCAAATCCAGGCTGCGTCTGAACACGGACCTTAACAGCTTCAACGGGCAGA
GTGCATATCGGCGATACCT


BQ
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AF RR4AC96JQ U 1
AF RR4DM26JQ U 101
BS 1 184 RR4AC96JQ
BS 185 185 RR4DM26JQ
BS 186 249 RR4AC96JQ
BS 250 250 RR4DM26JQ
BS 251 427 RR4AC96JQ
BS 428 428 RR4DM26JQ
BS 429 780 RR4AC96JQ
BS 781 859 RR4DM26JQ

RD RR4AC96JQ 780 0 0
GGCAACCAAAAGAGATTTTTCCAAATGAAAAATAACAAAAGTAGTAAGTGGGTGTGCCCA
CACTCTCTATCTTCGTGTGTCCCTCTCATCTTTTAAGATTACACAAACCAAAATAGAGAG
ATAATATTGTGAAAAGAGAGAGCACTATAGTTAATTCAAGAACACAAATTTCCAAAAAAA
AAAA*TCAAGTTGGAATCCTGAGGATGAGCTTACTCTTCCTCACTGCCATACGTTTCTCT
TTATTCTTTTAAACAAAAATCCTAAGTTTTTTTATCATCATCATTTAGTCTTAGGCTTAG
GCTTCAGCTGCTGCTATGGCAGGGACTGGAGCAACACCACCGGTGGTTGGCAGGCCAACA
AACACTTTGAAGGCATCGTATAAACCCCACTGTGCTCCAGTCAATGTTCCTATCATCACA
ATTCTTAGAGGAAGTCCTCTTGTGAACAGTCCCACCATTCCTATCTTCTTCACCGCATCT
CCAACGGTTGCTCCCTTAGCGTTGTTGAGGAACGACACTAGATTATCTGCAGGATGGGAG
ACAATTGCACAAAACACTCCAGCAACATAACCTCCTGCAAAACTCACACCAAGTTGCAGA
CCTTTGCTGCACTCGTGTTTTGGGTTCGGGATTGCGTACTTGTAGATCATCTCAACAATG
GTCTCAAACGAAGCAAACTTCATCATCGTGTAAGGAATCTGACGTCCCCAAAGTGGAGCA
AGACCCTTGTACAAGCCTCCGTATCCTTCGGACTTGACAAACTTAGGAAACCCATCAGAC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4DM26JQ 759 0 0
ACACAAACCAAAATAGAGAGATAATATTGTGAAAAGAGAGAGCACTATAGTTAATTCAAG
AACACAAATTTCCAAAAAAAAAAAATCAAGTTGGAATCCTGAGGATGAGCTTACTCTTCC
TCACTGCCATACGTTTCTCTTTATTCTTTCAAACAAAAATCCTAAGTTTTTTTATCATCA
TCATTTAGTCTTAGGCTTAGGCTTCAGCTGCTGCTATGGCAGGGACTGGAGCAACACCAC
CGGTGGTTGGCAGGCCAACAAACACTTTGAAGGCATCGTATAAACCCCACTGTGCTCCAG
TCAATGTTCCTATCATCACAATTCTTAAAGGAAGTCCTCTTGTGAACAGTCCCACCATTC
CTATCTTCTTCACCGCATCTCCAACGGTTGCTCCCTTAGCGTTGTTGAGGAACGACACTA
GATTATCTGCAGGATGGGAGACAATTGCACAAAACACTCCAGCAACATAACCTCCTGCAA
AACTCACACCAAGTTGCAGACCTTTGCTGCACTCGTGTTTTGGGTTCGGGATTGCGTACT
TGTAGATCATCTCAACAATGGTCTCAAACGAAGCAAACTTCATCATCGTGTAAGGAATCT
GACGTCCCCAAAGTGGAGCAAGACCCTTGTACAAGCCTCCGTATCCTTCGGACTTGACAA
ACTTAGGAAACCCATCAGACATCCCCCTGGCAAATCCAGGCTGCGTCTGAACACGGACCT
TAACAGCTTCAACGGGCAGAGTGCATATCGGCGATACCT

QA 1 759 1 759
DS 



CO CL2592Contig2 716 2 4 U
GGAATAAAGAGACGGACGAGATTCATGAGGTCATAGCAAAATATCATTTGGTCTTCTTTT
TCGGGCAGCGTGAGATCGGACATCGACAAAAAAAACACATTTGCGAATCTTATCTCCGTC
CGTCCTCCCGTCGCGATGGAAACGCCAAAGACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCC
TCATCCTCATCTCCGAGATCTCTTTTGAGCTCCAATCTGGAGAAGTCTCCTTCTCCGGCC
GCTCCGACGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGCGTCTCCGACGGAGCCAGGGAAG
GGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGGTGGAGTTCTCAGC
TGTGGTCTGACTCATATGACCGTTACACCTCTTGATCTCGTCAAGTGTAATATGCAGATT
GATCCGGCTAAGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTTGGGATTTTGCTGAAAGAGCAAGGA
GTCAAAGGCTTCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAGTGCTCAGGGTGCC
TGCAAGTTTGGATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTACTCTGATCTCGCTGGACCTGAG
TTCGCCGCCAAATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCCGCCTCTGCCGAGGTTATC
GCCGATATTGCACTCTGCCCGTTTGAAGCTGTTAAAGTCCGTGTTCAGACGCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AC96TF U 1
AF RR4DM26TF U 72
BS 1 277 RR4AC96TF
BS 278 278 RR4DM26TF
BS 279 679 RR4AC96TF
BS 680 716 RR4DM26TF

RD RR4AC96TF 679 0 0
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TCGGGCAGCGTGAGATCGGACATCGACAAAAAAAACACATTTGCGAATCTTATCTCCGTC
CGTCCTCCCGTCGCGATGGAAACGCCAAAGACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCC
TCATCCTCATCTCCGAGATCTCTTTTGAGCTCCAATCTGGAGAAGTCTCCTTCTCCGGCC
GCTCCGACGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGTGTCTCCGACGGAGCCAGGGAAG
GGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGGTGGAGTTCTCAGC
TGTGGTCTGACTCATATGACCGTTACACCTCTTGATCTCGTCAAGTGTAATATGCAGATT
GATCCGGCTAAGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTTGGGATTTTGCTGAAAGAGCAAGGA
GTCAAAGGCTTCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAGTGCTCAGGGTGCC
TGCAAGTTTGGATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTACTCTGATCTCGCTGGACCTGAG
TTCGCCGCCAAATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCCGCCTCTGCCGAGGTTATC
GCCGATATTGCACTCTGCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DM26TF 645 0 0
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CGCGATGGAAACGCCAAAGACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCTCATCCTCATC
TCCGAGATCTCTTTTGAGCTCCAATCTGGAGAAGTCTCCTTCTCCGGCCGCTCCGACGAT
GCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGCGTCTCCGACGGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGAT
GTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGGTGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTGAC
TCATATGACCGTTACACCTCTTGATCTCGTCAAGTGTAATATGCAGATTGATCCGGCTAA
GTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTTGGGATTTTGCTGAAAGAGCAAGGAGTCAAAGGCTT
CTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAGTGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTGG
ATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTACTCTGATCTCGCTGGACCTGAGTTCGCCGCCAA
ATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCCGCCTCTGCCGAGGTTATCGCCGATATTGC
ACTCTGCCCGTTTGAAGCTGTTAAAGTCCGTGTTCAGACGCAGCC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 4

CO CL2593Contig1 896 4 11 U
GGACTAAGAAACCACTAACAATGGCGTTATTGTTCTCCCCGCCAATCTTCATCCCAAAGA
ACTCGTCCCCTCTCCACTCCGCGAACCGCTTCTCTCTCCTCTCCGTCACTCGAGCCAATT
CCTCCTCCGACACTGGGATAACCTCTCCTCCTGCCACCGTCTCCGTGGACGTTAAAGAAC
CTCATACATCAACACCAGTTGTCAAGAAAGAAGAAGTCTCCTCCGCCGTGGAAGGTGAAG
AAGAGATGAAGACGACGGAGACTTTTACCAAATTCGAGGATGCGAGGTGGGTTAACGGAA
CATGGGATCTGAAACAGTTTGAGAAAGATGGGAAAACAGATTGGGATAACGTCATCGTTT
CTGAGGCCAAGAGAAGAAAATGGCTGGAAGAGAATCCAGAGACCACAAGTAACGACGAGC
CTGTGGTCTTCGATACGTCGGTAATCCCATGGTGGGCTTGGATGAAGAGATACCACTTAC
CCGAAGCTGAGCTCCTTAACGGTCGTGCTGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTG
TTGATAGTCTTACTGGAGTAGGACTTGTTGATCAAACGGGGAACTTCTTCTGTAAAACGC
TCTTGTTCGTGGCTGTGGCTGGAGTTCTCTTCATCCGCAAGAATGAGGATGTTGATAAGT
TGAATAAGTTGTTTGATGAGACGATGTTATATGATAAACAATGGCAAGCAGCTTGGAAAG
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TTTTTTTTGTTATATGATGATGTAATTAGGCACAAAGAGATAAGACTTTATAATATGAAG
AGAGTTTAAGGTGTCTTCTCAGTATATGGTTTTATATCCACATGTATTATGCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EA02TF U 1
AF RR4CV60TF U 3
AF RR4CV60JQ C 194
AF RR4EA02JQ C 537
BS 1 251 RR4EA02TF
BS 252 252 RR4CV60TF
BS 253 337 RR4EA02TF
BS 338 338 RR4CV60TF
BS 339 407 RR4EA02TF
BS 408 408 RR4CV60TF
BS 409 629 RR4EA02TF
BS 630 715 RR4CV60TF
BS 716 717 RR4CV60JQ
BS 718 741 RR4CV60TF
BS 742 896 RR4CV60JQ

RD RR4EA02TF 633 0 0
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ACTCGTCCCCTCTCCACTCCGCGAACCGCTTCTCTCTCCTCTCCGTCACTCGAGCCAATT
CCTCCTCCGACACTGGGATAACCTCTCCTCCTGCCACCGTCTCCGTGGACGTTAAAGAAC
CTCATACATCAACACCAGTTGTCAAGAAAGAAGAAGTCTCCTCCGCCGTGGAAGGTGAAG
AAGAGATGAAGGCGACGGAGACTTTTACCAAATTCGAGGATGCGAGGTGGGTTAACGGAA
CATGGGATCTGAAACAGTTTGAGAAAGATGGGAAAACGGATTGGGATAACGTCATCGTTT
CTGAGGCCAAGAGAAGAAAATGGCTGGAAGAGAATCCAGAGACCACAGGTAACGACGAGC
CTGTGGTCTTCGATACGTCGGTAATCCCATGGTGGGCTTGGATGAAGAGATACCACTTAC
CCGAAGCTGAGCTCCTTAACGGTCGTGCTGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTG
TTGATAGTCTTACTGGAGTAGGACTTGTTGATCAAACGGGGAACTTCTTCTGTAAAACGC
TCTTGTTCGTGGCTGTGGCTGGAGTTCTC
CTTC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4CV60TF 739 0 0
GGG
AAGAAACCACTAACAATGGCGTTATTGTTCTCCCCGCCAATCTTCATCCCAAAGAACTCG
TCCCCTCTCCACTCCGCGAACCGCTTCTTTCTCCTCTCCGTCACTCGAGCCAATTCCTCC
TCCGACACTGGGATAACCTCTCCTCCTGCCACCGTCTCCGTGGACGTTAAAGAACCTCAT
ACATCAACACCAGTTGTCAAGAAAGAAGAAGTCTCCTCCGCCGTGGAAGGTGAAGAAGAG
ATGAAGACGACGGAGACTTTTACCAAATTCGAGGATGCGAGGTGGGTTAACGGAACATGG
GATCTGAAACAGTTTGAGAAAGATGGGAAAACAGATTGGGATAACGTCATCGTTTCTGAG
GCCAAGAGAAGAAAATGGCTGGAAGAGAATCCAGAGACCACAAGTAACGACGAGCCTGTG
GTCTTCGATACGTCGGTAATCCCATGGTGGGCTTGGATGAAGAGATACCACTTACCCGAA
GCTGAGCTCCTTAACGGTCGTGCTGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGAT
AGTCTTACTGGAGTAGGACTTGTTGATCAAACGGGGAACTTCTTCTGTAAAACGCTCTTG
TTCGTGGCTGTGGCTGGGGTTCTCTTCATCCGCAAGAATGAGGATGTTGATAAGTTGAAT
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GAGGAGGACTCATCAA

QA 4 739 4 739
DS 

RD RR4CV60JQ 703 0 0
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GACGGAGACTTTTACCAAATTCGAGGATGCGAGGTGGGTTAACGGAACATGGGATCTGAA
ACAGTTTGAGAAAGATGGGAAAACAGATTGGGATAACGTCATCGTTTCTGAGGCCAAGAG
AAGAAAATGGCTGGAAGAGAATCCAGAGACCACAAGTAACGACGAGCCTGTGGTCTTCGA
TACGTCGGTAATCCCATGGTGGGCTTGGATGAAGAGATACCACTTACCCGAAGCTGAGCT
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TGGAGTAGGACTTGTTGATCAAACGGGGAACTTTTTCTGTAAAACGCTCTTGTTCGTGGC
TGTGGCTGGGGTTCTCTTCATCCGCAAGAATGAGGATGTTGATAAGTTGAATAAGTTGTT
TGATGAGACGATGTTATATGATAAACAATGGCAAGCAGCTTGGAAAGATGGTGAGGAGGA
CTCATCAAAGAAGTGAAAAGCGGAAACAGAGAGTCTTGCTTCTTCTCTTTTTTTTGTTAT
ATGATGATGTAATTAGGCACAAAGAGATAAGACTTTATAATATGAAGAGAGTTTAAGGTG
TCTTCTCAGTATATGGTTTTATATCCACATGTATTATGCCTTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4EA02JQ 321 0 0
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ACGCTCTTGTTCGTGGCTGTGGCTGGAGTTCTCTTCATCCGCAAGAATGAGGATGTTGAT
AAGTTGAAGAAGTTGTTTGATGAGACGATGTTATATGATAAACAATGGCAAGCAGCTTGG
AAAGATGGTGAGGAGGACTCATCAAAGAAGTGAAAAGCGGAAACAGGGAGTCTTGCTTTT
TCTCTTTTTTTTGTTATATGATGATGTAATTAGGCACAAAGAGATAAGACTTTATAATAT
GAAGAGAGTTTAAGGTGTCTT

QA 1 321 1 321
DS 



AS 0 0

AS 1 4

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CACACAGCTTCGTTAGTTCAAGCAGGTCGCCTAGGTTTGCAGCTAGTACTAGTACTTGCT
GGAGATTGGTTAACGGTTCATCTTGGGAGACAAAGGCTATTGGGAATAGTGATGGCAATG
ATAGTCCTCTCAAAGGAACAGATGATGGGTCTTTCTTTGATCATGTTGACGCGGAGATCA
CGCCAGAAACTGTTGATTTCTTCGTGAGTGACGCAGAAGGTGATCCTGATTGTCCTACTC
AGGGCTACTCCTCTATCGAACTCGCTCTTCAATCTCTACCCCAAGGCAAGTTTGTGATCG
TTGTTGACGATGAACACGGGGATGTTGAAGGGAACCTGATCATGTCGGCAACTCTAACTA
GTCCAAAAGACATAGCCTTTCTGATCAAGAATGGTTCCGGGATTGTCTCGGTTGGGATGA
AGAAAGAAGACCTCGAAAGATTAAACCTTACACTCATGTCACCTGAAATGGAAGACGAAG
ATTCCTCTGCACCAAACATATCACTCTTCTCTAATCGAAGTTCGTATCTTAAACTTTCCC
GAGAAAAAAAA*GATGTCAGGGAGAGGAAAGGGAGGAAAAGGATTAGGAAAGGGAGGAGC
CAAGAGGCATCGGAAAGTTCTCCGAGACAACATCCAAGGAATCACGAAACCAGCGATCCG
TCGTCTCGCGAGGAGAGGAGGTGTGAAGCGTATCAGCGGATTGATCTACGAAGGGACTCG
CGGCGTCCTCAAGATCTTTCTAGAGAACGTTATCCGCGACGCCGTTACATACACAGAGCA
CGCTCGCCGGAAAACAGTCACGGCCATGGACGTTGTGTACGCTCTCAAGAGGCAGGGAAG
AACTCTCTACGGATTCGGCGGCTGATTCGATTGTTTCTGTTTCACGATTTTGTAAAATGT
TTTTATCAGAATCAATGGGAATAATAATATGGCATCTTTTTTTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B235TF U 1
AF RR4AS40TF U 1
AF RR4AS40JQ C 215
AF RR4B235JQ C 436
BS 1 611 RR4AS40TF
BS 612 612 RR4AS40JQ
BS 613 666 RR4AS40TF
BS 667 667 RR4AS40JQ
BS 668 697 RR4AS40TF
BS 698 698 RR4AS40JQ
BS 699 740 RR4AS40TF
BS 741 741 RR4AS40JQ
BS 742 774 RR4AS40TF
BS 775 775 RR4AS40JQ
BS 776 806 RR4AS40TF
BS 807 807 RR4AS40JQ
BS 808 845 RR4AS40TF
BS 846 1005 RR4AS40JQ

RD RR4B235TF 603 0 0
GGATCGTTATTTTCATGTCTCAGTAGATGGATTCTGCTTTGTCTCCCCGCATCTTTTTCG
CACACAGCTTCGTTAGTTCAAGCAGGTCGCCTAGGTTTGCAGCTAGTACTAGTACTTGCT
GGAGATTGGTTAACGGTTCATCTTGGGAGACAAAGGCTATTGGGAATAGTGATGGCAATG
ATAGTCCTCTCAAAGGAACAGATGATGGGTCTTTCTTTGATCATGTTGACGCGGAGATCA
CGCCAGAAACTGTTGATTTCTTCGTGAGTGACGCAGAAGGTGATCCTGATTGTCCTACTC
AGGGCTACTCCTCTATCGAACTCGCTCTTCAATCTCTACCCCAAGGCAAGTTTGTGATCG
TTGTTGACGATGAACACGGGGATGTTGAAGGGAACCTGATCATGTCGGCAACTCTAACTA
GTCCAAAAGACATAGCCTTTCTGATCAAGAATGGTTCCGGGATTGTCTCGGTTGGGATGA
AGAAAGAAGACCTCGAAAGATTAAACCTTACACTCATGTCACCTGAAATGGAAGACGAAG
ATTCCTCTGCACCAAACATATCACTCTTCTCTAATCGAAGTTCGTATCTTAAACTTTCCC
GAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4AS40TF 845 0 0
GGATCGTTATTTTCATGTCTCAGTAGATGGATTCTGCTTTGTCTCCCCGCATCTTTTTCG
CACACAGCTTCGTTAGTTCAAGCAGGTCGCCTAGGTTTGCAGCTAGTACTAGTACTTGCT
GGAGATTGGTTAACGGTTCATCTTGGGAGACAAAGGCTATTGGGAATAGTGATGGCAATG
ATAGTCCTCTCAAAGGAACAGATGATGGGTCTTTCTTTGATCATGTTGACGCGGAGATCA
CGCCAGAAACTGTTGATTTCTTCGTGAGTGACGCAGAAGGTGATCCTGATTGTCCTACTC
AGGGCTACTCCTCTATCGAACTCGCTCTTCAATCTCTACCCCAAGGCAAGTTTGTGATCG
TTGTTGACGATGAACACGGGGATGTTGAAGGGAACCTGATCATGTCGGCAACTCTAACTA
GTCCAAAAGACATAGCCTTTCTGATCAAGAATGGTTCCGGGATTGTCTCGGTTGGGATGA
AGAAAGAAGACCTCGAAAGATTAAACCTTACACTCATGTCACCTGAAATGGAAGACGAAG
ATTCCTCTGCACCAAACATATCACTCTTCTCTAATCGAAGTTCGTATCTTAAACTTTCCC
GAGAAAAAAAAAGATGTCAGGGAGAGGAAAGGGAGGAAAAGGATTAGGAAAGGGAGGAGC
CAAGAG*CATCGGAAAGTTCTCCGAGACAACATCCAAAGAATCACGAAACCAGCGATCCG
TCGTCTCGCGAGGAGAGGAG*TGTGAAGCGTATCAGCGGATTGATCTACGAAGG*ACTCG
CGGCGTCCTCAAGATCTTTCTAGAGA*CGTTATCCGCGACGCCGTTACATACACAGAGCA
CGCTC

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4AS40JQ 791 0 0
CTTTGATCATGTTGACGCGGAGATCACGCCAGAAACTGTTGATTTCTTCGTGAGTGACGC
AGAAGGTGATCCTGATTGTCCTACTCAGGGCTACTCCTCTATCGAACTCGCTCTTCAATC
TCTACCCCAAGGCAAGTTTGTGATCGTTGTTGACGATGAACACGGGGATGTTGAAGGGAA
CCTGATCATGTCGGCAACTCTAACTAGTCCAAAAGACATAGCCTTTCTGATCAAGAATGG
TTCCGGGATTGTCTCGGTTGGGATGAAGAAAGAAGACCTCGAAAGATTAAACCTTACACT
CATGTCACCTGAAATGGAAGACGAAGATTCCTCTGCACCAAACATATCACTCTTCTCTAA
TCGAAGTTCGTATCTTAAACTTTCCCGAGAAAAAAAA*GATGTCAGGGAGAGGAAAGGGA
GGAAAAGGATTAGGAAAGGGAGGAGCCAAGAGGCATCGGAAAGTTCTCCGAGACAACATC
CAAGGAATCACGAAACCAGCGATCCGTCGTCTCGCGAGGAGAGGAGGTGTGAAGCGTATC
AGCGGATTGATCTACGAAGGGACTCGCGGCGTCCTCAAGATCTTTCTAGAGAACGTTATC
CGCGACGCCGTTACATACACAGAGCACGCTCGCCGGAAAACAGTCACGGCCATGGACGTT
GTGTACGCTCTCAAGAGGCAGGGAAGAACTCTCTACGGATTCGGCGGCTGATTCGATTGT
TTCTGTTTCACGATTTTGTAAAATGTTTTTATCAGAATCAATGGGAATAATAATATGGCA
TCTTTTTTTCC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4B235JQ 570 0 0
CCTTTCTGATCAAGAATGGTTCCGGGATTGTCTCGGTTGGGATGAAGAAAGAAGACCTCG
AAAGATTAAACCTTACACTCATGTCACCTGAAATGGAAGACGAAGATTCCTCTGCACCAA
ACATATCACTCTTCTTTAATCGAAGTTCGTATCTTAAACTTTCCCGAGAAAAAAAA*GAT
GTCAGGGAGAGGAAAGGGAGGAAAAGGATTAGGAAAGGGAGGAGCCAAGAGGCATCGGAA
AGTTTTCCGAGACAACATCCAAGGAATCACGAAACCAGCGATCCGTCGTCTCGCGAGGAG
AGGAGGTGTGAAGCGTATCAGCGGATTGATCTACGAAGGGACTCGCGGCGTCCTCAAGAT
CTTTCTAGAGAACGTTATCCGCGACGCCGTTACATACACAGAGCACGCTCGCCGGAAAAC
AGTCACGGCCATGGACGTTGTGTACGCTCTCAAGAGGCAGGGAAGAACTCTCTACGGATT
CGGCGGCTGATTCGATTGTTTCTGTTTCACGATTTTGTAAAATGTTTTTATCAGAATCAA
TGGGAATAATAATATGGCATCTTTTTTTCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 2 4

CO CL2596Contig1 739 2 14 U
GGCATTTGAACATACCATTTTCTCAATTTGCCAAAACAGACTCGACTTTTGCTAACTCTA
ATACAAAAAAAAAAAAAACAAATATTTATACCACCATTGGTCAATCAATCTGATCCCAAA
GAGACAAATTGTATATGTTCATGAAAAGTTGGGAAAATTGCTTAAAATGGGATTTGTCGT
CATCATCAGGAATGAGTTAACAGATTACATCTGAAAGAAGGTAGAGTTCACGTCTCCCCC
TTCTTTTTGATCCATCTGAAAAATTGGATTGAAAAGGTGTAAGTGACATAAAAATTTGAA
GCTGTTAAAGAAGCTTCAGTCCACCTGTCACTTCATCAACAACTTGGACTGGTCCGAAAA
TAGCCATAACTGTCCTTGAATTTGGAGCGATCTGAGTCCTTCCAGCATCGATGGTGATAT
GGGTAGGCAGTTTAAGGGATTTGGCTCTTTCCTGCAACTCAAGCATCTCATCCTCCCCCT
CGATTTTCACAACAACCTTTGGCTGTGCACATTCCTCCCAGCAGTCCAATGCTTTTGGAG
CTCGACGAACAAGCTTTTTGTATAAACCTAAAGTTGCATGACTGCATTGTGCAGCAATCT
TGCCTTTACCCATTTTAAGATCATTCCTCACTACCAAAACCATTTTGAAATCATCGAGGA
TATCAGCGAGTTTCTCAATCTCGAGAGGACTCTTTGGAATCAGTTTGGTATCATCTCCAT
CAACAGCAGCAGCCGCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB78JQ U 1
AF RR4D005JQ U 76
BS 1 403 RR4CB78JQ
BS 404 404 RR4D005JQ
BS 405 424 RR4CB78JQ
BS 425 425 RR4D005JQ
BS 426 451 RR4CB78JQ
BS 452 452 RR4D005JQ
BS 453 457 RR4CB78JQ
BS 458 458 RR4D005JQ
BS 459 460 RR4CB78JQ
BS 461 461 RR4D005JQ
BS 462 496 RR4CB78JQ
BS 497 497 RR4D005JQ
BS 498 588 RR4CB78JQ
BS 589 739 RR4D005JQ

RD RR4CB78JQ 588 0 0
GGCATTTGAACATACCATTTTCTCAATTTGCCAAAACAGACTCGACTTTTGCTAACTCTA
ATACAAAAAAAAAAAAAACAAATATTTATACCACCATTGGTCAATCAATCTGATCCCAAA
GAGACAAATTGTATATGTTCATGAAAAGTTGGGAAAATTGCTTAAAATGGGATTTGTCGT
CATCATCAGGAATGAGTTAACAGATTACATCTGAAAGAAGGTAGAGTTCACGTCTCCCCC
TTCTTTTTGATCCATCTGAAAAATTGGATTGAAAAGGTGTAAGTGACATAAAAATTTGAA
GCTGTTAAAGAAGCTTCAGTCCACCTGTCACTTCATCAACAACTTGGACTGGTCCGAAAA
TAGCCATAACTGTCCTTGAATTTGGAGCGATCTGAGTCCTTCCGGCATCGATGGTGATAT
GGGTTGGCAGTTTAAGGGATTTGGCTCTTTCTTGCAATTCTAGCATCTCATCCTCCCCCT
CGATTTTCACAACAACTTTTGGCTGTGCACATTCCTCCCAGCAGTCCAATGCTTTTGGAG
CTCGACGAACAAGCTTTTTGTATAAACCTAAAGTTGCATGACTGCATT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4D005JQ 664 0 0
AAACAAATATTTATACCACCATTGGTTAATCAATCTGATCCCAAAGAGACAAATTGTATA
TGTTCATGAAAAGTTGGGAAAATTGCTTAAAATGGGATTTGTCGTCATCATCAGGAATGA
GTTAACAGATTACATCTGAAAGAAGGTAGAGTTCACGTCTCCCCCTTCTTTTTGATCCAT
CTGAGAGATTGGATTGAAGAGGTGTAAGTGACATAAAAATTTGAAGCTGTTAAAGAAGCT
TCAGTCCACCTGTCACTTCATCAACAACTTGGACTGGTCCGAGAATAGCCATAACTGTCC
TTGAATTTGGAGCGATCTGAGTCCTTCCAGCATCGATGGTGATATGTGTAGGCAGTTTAA
GGGATTTGGCTCTTTCCTGCAACTCAAGCATCTCATCCTCGCCCTCGATTTTCACAACAA
CCTTTGGCTGTGCACATTCCTCCCAGCAGTCCAATGCTTTTGGAGCTCGACGAACAAGCT
TTTTGTATAAACCTAAAGTTGCATGACTGCATTGTGCAGCAATCTTGCCTTTACCCATTT
TAAGATCATTCCTCACTACCAAAACCATTTTGAAATCATCGAGGATATCAGCGAGTTTCT
CAATCTCGAGAGGACTCTTTGGAATCAGTTTGGTATCATCTCCATCAACAGCAGCAGCCG
CAAC

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL2596Contig2 732 2 17 U
TTTTTTTTTAATATCGAGAGAGAGAAAAAACCATCTTCATCGCCGTTCTCTCTCTCTCTC
AGGAACTGGATATTCGGTTGAGGATGGATTTGACGTGGTTGAGTGCTCTAATCGTTGGAG
CTGCACTTGGATTCTGCATTGGCACCACTCGTCGTTCCAAACATCATCCTTCTGTCGCGG
CGGCTGCTGTTGATGGAGATGATACCAAACTGATTCCAAAGAGTCCTCTCGAGATTGAGA
AACTCGCTGATATCCTCGATGATTTCAAAATGGTTTTGGTAGTGAGGAATGATCTTAAAA
TGGGTAAAGGCAAGATTGCTGCACAATGCAGTCATGCAACTTTAGGTTTATACAAAAAGC
TTGTTCGTCGAGCTCCAAAAGCATTGGACTGCTGGGAGGAATGTGCACAGCCAAAAGTTG
TTGTGAAAATCGAGGGCGAGGATGAGATGCTAGAATTGCAAGAAAGAGCCAAATCCCTTA
AACTGCCAACACATATCACCATCGATGCCGGAAGGACTCAGATCGCTCCAAATTCAAGGA
CAGTTATGGCTATTCTCGGACCAGTCCAAGTTGTTGATGAAGTGACAGGTGGACTGAAGC
TTCTTTAACAGCTTCAAATTTCTATGTCACTTACACCTCTTCAATCCAATCTCTCAGATG
GATCAAAAAGAAGGGGAGACGTGAACTCTACCTTCTCTCAGATGTATCTGTAACTCATTC
CTGATGATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
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AF RR4D005TF U 29
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TACCTTCTCTCAGATGTA
ATCTG

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CTGATGATGACG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

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TCTTGAATTCAGCTGCCTCGTCCTAACCCTGGTGAGGAGTTTACTTTCACCGAGCTTAAC
CAAACGAGCTGGACATTCAAAGATACTCCACATATTCTCGTTCCCATTGCAGAGGGATCA
GATGAGATTGAAACTATAGCCGTGGTAGATATCCTGAGGAGGGCAAAAGCAAATGTAGTG
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CATGGTTTACTCGAGCGTAAGAAGGCGACTACACACCCAGTGGTGAGCAACAGACTTTCG
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AAAAATGTCTAGTTATCTCTCCATTGAAGTTGAGACTTTGTAATAAGGGACTAATTTCAC
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BQ
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AF RR4FD90TF U 1
AF RR4BB49TF U 570
AF RR4FD90JQ C 752
AF RR4BB49JQ C 758
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GCTGAA

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DS 

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G
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TCATTCGACCTGATTATGTTGCCTGGTGGTCTTAACGGTGCTTCAAGATTGTCACGTTGC
GAGAAACTGGTGAACATGTCAAAGAAACAAGCTGAAACAAACAAACCATATGGAGGTATC
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ATCGTTGAGAAGTTTTACGGGCGTGAGAAAGCACTTCAACTCGCAAAGGCGATACCTGTT
TAAGTTCAAAGAATGAAGCGACACGTGAATAAAAATGTCTAGTTATCTCTCCATTGAAGT
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ACAAGTTTTTATTCAAG

QA 2 558 2 558
DS 

RD RR4FD90JQ 330 0 0
GCGCGT
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GGAATCTCATAACGAGCAGAGCTCCAGGGACTGCAATAGAGTGTGCGCTTACGATCGTTG
AGAAGTTTTACGGGCGTGAGAAAGCACTTCAGCTCGCAAAGGCGATACTTGTTTAAGTTC
AAAGAATGAAGTGACACGTGAATAAAAATGTCTAGTTATCTCTCCATTGAAGTTGAGACT
TTGTAATAAGGGACTAATTTCACC

QA 7 330 7 330
DS 

RD RR4BB49JQ 370 0 0
CGCCAGCTTACGTCTTTGAGCCTCATGGTTTACTCGAGCGTAAGAAGGCGACTACACACC
CAGTGGTGAGCAACAGACTTTCGGACCAGAGTCACGTTGATTTCAGGGTCGTCGTTGATG
GGAATCTCATAACGAGCAGAGCTCCAGGGACTGCAATAGATTGTGCGCTTACGATCGTTG
AGAAGTTTTACGGGCGTGAGAAAGCACTTCAACTCGCAAAGGCGATACCTGTTTAAGTTC
AAAGAATGAAGCGACACGTGAATAAAAATGTCTAGTTATCTCTCCATTGAAGTTGAGACT
TTGTAATAAGGGACTAATTTCACCATAGCGGCAACTTGTTCAAAATAATACTAACAAGTT
TTTATTCAAG

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 3

CO CL2598Contig1 951 3 2 U
GTAAGCATTACTTTATGTCACTTTATTGATGCACTGATGGATAATACACGATCCTTATTT
AGACAACGGTAAAGAAATAGAAAACAGTTAAAAGCTCAATATTTTTCATTTCATTCCATG
ATCAGAATTTGGTCTGTAGGCTCATGACAATCGTAGGATCCAACTGGAATGCTTTCCCAA
GAACATTTGGGTTTATCCGTGGGTTAGACCCAAACACGCTTTTAAAAACAGTGATGAAAC
CTGGGTTTTGGCTGTTAAAAGCAGTGAATGCAACTGCTGGACATTGTCCCACATTGACAT
GGAAATGGATGAATCCCACTGGAAACACAATCAGATCACCCTTGTTGAGTATTTTGGAAA
ATAAACGATTTCCGTCTTGGTCTGACGAGACAAAACCCGCGAAAAGCGTTCCTTCTTGGA
CAATCAAGAACTCGCTGGCACGTGGATGGGTGTGAGGTGGGATCAGCCCGTTTAGTGCAT
AATCTACACGAGCAAATGCTATGCCAAGGGTGTTGAGCCCAGGAAGGTTATCAGAAAAGA
CGGGTGTCACATTTGTTCCAACCGCATTAGTTGCGATTCTTTGCCTGTCAAGCCCTGTGA
AAAAGAAGTCGTCTACTGTGGCGAGCTTTGGGTCTTTGCAGAACTTTCCGTTAACAAACA
CACCATCGGCCGGGGTGTTTACGCCCACACAAAAGTCTTGAACGGGGCTTGGGTCAGAAG
CCATGGCTACTGGAAAGGTTAAAGCCAAGAGAGAAAAAATTGTGAGAAATATAAGACTCC
TCATTGGAATATACTTTTTGAATTAGATTTCTGTGTAAAGGTAAGCTGCTTATAAGACAC
TGAGCTTAATTTTATAGATGAGTGCATTGACTGTTCAAGTCTATAACCTACAAGAAGGTA
TCCAGAAATCAATCTTACTGGACAATCGAGGTATTTTAGAAAAAGAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H479JQB U 1
AF RR4H819JQB U 1
AF RR4H479TF C 377
BS 1 567 RR4H479JQB
BS 568 951 RR4H479TF

RD RR4H479JQB 567 0 0
GTAAGCATTACTTTATGTCACTTTATTGATGCACTGATGGATAATACACGATCCTTATTT
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GAACATTTGGGTTTATCCGTGGGTTAGACCCAAACACGCTTTTAAAAACAGTGATGAAAC
CTGGGTTTTGGCTGTTAAAAGCAGTGAATGCAACTGCTGGACATTGTCCCACATTGACAT
GGAAATGGATGAATCCCACTGGAAACACAATCAGATCACCCTTGTTGAGTATTTTGGAAA
ATAAACGATTTCCGTCTTGGTCTGACGAGACAAAACCCGCGAAAAGCGTTCCTTCTTGGA
CAATCAAGAACTCGCTGGCACGTGGATGGGTGTGAGGTGGGATCAGCCCGTTTAGTGCAT
AATCTACACGAGCAAATGCTATGCCAAGGGTGTTGAGCCCAGGAAGGTTATCAGAAAAGA
CGGGTGTCACATTTGTTCCAACCGCAT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4H819JQB 568 0 0
GTAAGCATTACTTTATGTCACTTTATTGATGCACTGATGGATAATACACGATCCTTATTT
AGACAACGGTAAAGAAATAGAAAACAGTTAAAAGCTCAATATTTTTCATTTCATTCCATG
ATCAGAATTTGGTCTGTAGGCTCATGACAATCGTAGGATCCAACTGGAATGCTTTTGCAA
GAACATTTGGGTTTATCCGTGGGTTAGACCCAAACACGCTTTTAAAAACAGTGATGAAAC
CTGGGTTTTGGCTGTTAAAAGCAGTGAATGCAACTGCTGGACATTGTCCCACATTGACAT
GGAAATGGATGAGTCCCACTGGAAACACAATCAGATCACCCTTGTTGAGTATTTTGGAAA
ATAGACGATTTCCGTCTTGGTCTGACGAGACAAAACCCGCGAAAAGCGTTCCTTCTTGGA
CAATCAAGAACTCGCTGGCACGTGGATGGGTGTGAGGTGGGATCAGCCCGTTTAGTGCAT
AATCTACACGAGCAAATGCTATGCCAAGGGTGTTGAGCCCAGGAAGGTTATCAGAAAAGA
CGGGTGTCACATTTGTTCCAACCGCAT
T

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4H479TF 575 0 0
TTGGTCTGACGAGACAAAACCCGCGAAAAGCGTTCCTTCTTGGACAATCAAGAACTCGCT
GGCACGTGGATGGGTGTGAGGTGGGATCAGCCCGTTTAGTGCATAATCTACACGAGCAAA
TGCTATGCCAAGGGTGTTGAGCCCAGGAAGGTTATCAGAAAAGACGGGTGTCACATTTGT
TCCAACCGCATTAGTTGCGATTCTTTGCCTGTCAAGCCCTGTGAAAAAGAAGTCGTCTAC
TGTGGCGAGCTTTGGGTCTTTGCAGAACTTTCCGTTAACAAACACACCATCGGCCGGGGT
GTTTACGCCCACACAAAAGTCTTGAACGGGGCTTGGGTCAGAAGCCATGGCTACTGGAAA
GGTTAAAGCCAAGAGAGAAAAAATTGTGAGAAATATAAGACTCCTCATTGGAATATACTT
TTTGAATTAGATTTCTGTGTAAAGGTAAGCTGCTTATAAGACACTGAGCTTAATTTTATA
GATGAGTGCATTGACTGTTCAAGTCTATAACCTACAAGAAGGTATCCAGAAATCAATCTT
ACTGGACAATCGAGGTATTTTAGAAAAAGAAAAAA

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL2599Contig1 836 2 1 U
AAAACAAACAAACAGATATATATATTGTAGAAATTGCAAACTGGGTCTTATTCGTTTTCT
ACACAGAAAGTTGGTTCTACAAGTTTAAGAAGATCCAGAGGAGAAACTTATAGCTCGTTC
TTGACCTTAGCATCCCCATTGGGTAACACACTTTGCGATTGCGCCTGCCGTTTTGCTTCA
GCGGCAGAAGCAGCACGGATCTCTCTGTACCTATCAACTTCATCAGGGAAAGTCTCTTCA
AGCTCCTCCAGAATATGTTTTCTCAAATCCTTAAAAGCATCAGTCTTGCCCTTTGTAACT
TGATTCCTGGCAACGCAGCTATTAATAACATCCCTTGTAAACTCATCCGGGTTCTTTCCA
TCATCAATCAAGCTAAGAACCTCCATGGGGACTTGAATGTTGCATTTCTCGGACAACTTA
GCCATGCTATTCAGCTCCGACACGAGAGAGTTGAGGCGCTGGAGGAGATGAAGCTGAGAA
GCGGGAGTGAAAGAAGAGACAGTAAGGTGTAACTGATGAAGGAGTCCCAAAGTCTTCTGA
ATAGAGTTTATGACTTGGTTCAGATTCTCCTTCGAATCTTCAGACGCGGTTGCAGTTCCA
TCATATCCCACCGTCGTCGTTGTACCATTGCTTCCACCAATCCCTGATGCGCTTGTGTTC
TGTGCTGGATCCATCACAGATGTATATGAGATATGGGTTTGGAGAAAAGACGGAGAGAGA
GAGGTAGCGACTCTTCGGATGAATTAGCGTTTCCTCCAGGGAAGTAAGTGCTTCAACCGT
GATCAGTAGTAACCTAATTTCTTATGAAGAGGGCACTGACGCAGGGAAGAGAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BT52JQ U 204
AF RR4DI52JQ U 1
BS 1 836 RR4DI52JQ

RD RR4BT52JQ 260 0 0
TCTGTACTTATCAACTTCATCAGGGAAAGTCTCTTCAAGCTCCTCCAGAATATGTTTTCT
CAAATCCTTAAAAGCATCAGTCTTGCCCTTTGTAACTTGATTCCTGGCAACGCAGCTATT
AATAACATCTCTTGTAAACTCATCCGGGTTCTTTCCATCATCAATCAAGCTAATAACCTC
CATGGGGACTTGAATGTTGCATTTCTCTGACAACTTAGCCATGCTATTCAGCTCCGACAC
GAGAGAGTTGAGGCGCTGGA

QA 1 260 1 260
DS 

RD RR4DI52JQ 836 0 0
AAAACAAACAAACAGATATATATATTGTAGAAATTGCAAACTGGGTCTTATTCGTTTTCT
ACACAGAAAGTTGGTTCTACAAGTTTAAGAAGATCCAGAGGAGAAACTTATAGCTCGTTC
TTGACCTTAGCATCCCCATTGGGTAACACACTTTGCGATTGCGCCTGCCGTTTTGCTTCA
GCGGCAGAAGCAGCACGGATCTCTCTGTACCTATCAACTTCATCAGGGAAAGTCTCTTCA
AGCTCCTCCAGAATATGTTTTCTCAAATCCTTAAAAGCATCAGTCTTGCCCTTTGTAACT
TGATTCCTGGCAACGCAGCTATTAATAACATCCCTTGTAAACTCATCCGGGTTCTTTCCA
TCATCAATCAAGCTAAGAACCTCCATGGGGACTTGAATGTTGCATTTCTCGGACAACTTA
GCCATGCTATTCAGCTCCGACACGAGAGAGTTGAGGCGCTGGAGGAGATGAAGCTGAGAA
GCGGGAGTGAAAGAAGAGACAGTAAGGTGTAACTGATGAAGGAGTCCCAAAGTCTTCTGA
ATAGAGTTTATGACTTGGTTCAGATTCTCCTTCGAATCTTCAGACGCGGTTGCAGTTCCA
TCATATCCCACCGTCGTCGTTGTACCATTGCTTCCACCAATCCCTGATGCGCTTGTGTTC
TGTGCTGGATCCATCACAGATGTATATGAGATATGGGTTTGGAGAAAAGACGGAGAGAGA
GAGGTAGCGACTCTTCGGATGAATTAGCGTTTCCTCCAGGGAAGTAAGTGCTTCAACCGT
GATCAGTAGTAACCTAATTTCTTATGAAGAGGGCACTGACGCAGGGAAGAGAAGAT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 4

CO CL2600Contig1 910 4 11 U
TTTTTTTTGTCTACAGAGAAAACCTAAGTTGCAACCATGGGTATTTCTCGTGACTCAATC
CACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAG
ATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGCTCTCCAGCAACAAGACGGTCAGAAGAATCCGT
GTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGACTCGATACCGGTAACTACTCCTGG
GGAAGTGAAGCTGTCACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGACGTTGTCTACAACGCCTCCAAC
AACGAGCTTGTCCGTACCAAGACACTCGTTAAGAGCGCCATTGTTCAGGTTGATCCCGCT
CCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTTTGGTCGCAAGAAGAAGAG
TGCTCCTGCTGCCGCTAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCTCCAGCTGCTGC
TGCTGCACCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCATGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGCCA
AGAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGACGGTTGTTGGC
CTGCATCTCCTCAAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTTGAAGGCAA
GGAGCTAGAATTCTACCAGAAGAAAATCCAAAAGAAGAAGGGCAAGGGTGCCGCTTAAAG
CTTGTTGTTGGCTTGAAAGCTTTATGTGTTACATGGGACATGTTTTGAGTTTTCAGTTTC
TAGTGTCTCTGAGATCCTATGTGTTGGATTAGCTTTTTGCTATATGGTATTTCGTAAACT
CTGTTCGTTACCCATGTTTCTCGCCTCTCGTATTTTTTGTTTAATTTAAAACGTCTTTGA
TGATTATGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN56TF U 1
AF RR4GC39TF U 1
AF RR4GC39JQ C 182
AF RR4FN56JQ C 191
BS 1 354 RR4FN56TF
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BS 356 402 RR4FN56TF
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BS 404 612 RR4FN56TF
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BS 614 656 RR4FN56TF
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BS 658 692 RR4FN56TF
BS 693 901 RR4GC39JQ
BS 902 910 RR4FN56JQ

RD RR4FN56TF 693 0 0
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CACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAG
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GTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGACTCGATACCGGTAACTACTCCTGG
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CCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTT*GGTCGCAAGAAGAAGAG
TGCTCCTGCTGCCGCTAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCTCCAGCTGCTGC
TGCTGCACCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCATGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGCCA
AGAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGACGGTTGTTGGC
CTGCATCTCCTCGAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTTGAAG*CAA
GGAGCTAGAATTCTACCAGAAGAAAATCCAAA
G

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GC39TF 677 0 0
TTTTTTTTGTCTACAGAGAAAACCTAAGTTGCAACCATGGGTATTTCTCGTGACTCAATC
CACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAG
ATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGCTCTCCAGCAACAAGACGGTCAGAAGAATCCGT
GTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGACTCGATACCGGTAACTACTCCTGG
GGAAGTGAATCTGTCACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGACGTTGTCTACAACGCCTCCAAC
AACGAGCTTGTCCGTACCAAGACACTCGTTAAGAGCGCCATTGTTCAGGTTGATCCCGC*
*CTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTTTGGTCGCAAGAAGAAGAG
TGCTCCTGCTGCCGCTAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCTCCAGCTGCTGC
TGCTGCACCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCATGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGCCA
AGAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGACGGTTGTTGGC
CTGCATCTCCTCAAG*CCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTTGAAG*CAA
GGAGCTAGAATTCTACC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GC39JQ 720 0 0
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GAAGTGAATCTGTCACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGACGTTGTCTACAACGCCTCCAACA
ACGAGCTTGTCCGTACCAAGACACTCGTTAAGAGCGCCATTGTTCAGGTTGATCCCGC**
CTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTTTGGTCGCAAGAAGAAGAGT
GCTCCTGCTGCCGCTAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCTCCAGCTGCTGCT
GCTGCACCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCATGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGCCAA
GAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGACGGTTGTTGGCC
TGCATCTCCTCAAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTTGAAGGCAAG
GAGCTAGAATTCTACCAGAAGAAAATCCAAAAGAAGAAGGGCAAGGGTGCCGCTTAAAGC
TTGTTGTTGGCTTGAAAGCTTTATGTGTTACATGGGACATGTTTTGAGTTTTCAGTTTCT
AGTGTCTCTGAGATCCTATGTGTTGGATTAGCTTTTTGCTATATGGTATTTCGTAAACTC
TGTTCGTTACCCATGTTTCTCGCCTCTCGTATTTTTTGTTTAATTTAAAACGTCTTTGAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4FN56JQ 720 0 0
GCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGACTCGATACCGGTAACTACTCCTGGGGAAGTGAAG
CTGTCACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGACGTTGTCTACAACGCCTCCAACAACGAGCTTG
TCCGTACCAAGACACTCGTTAAGAGCGCCATTGTTCAGGTTGATGCCGCTCCTTTCAAGC
AGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTT*GGTCGCAAGAAGAAGAGTGCTCCTGCT
GCCGCTAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCACCT
GAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCATGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGCCAAGAAGGTCGC
AGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGACGGTTGTTGGCCTGCATCTCC
TCGAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTTGAAGGCAAGGAGCTAGAA
TTCTACCAGAAGAAAATCCAAAAGAAGAAGGGCAAGGGTGCCGCTTAAAGCTTGTTGTTG
GCTTGAAAGCTTTATGTGTTACATGGGACATGTTTTGAGTTTTCAGTTTCTAGTGTCTCT
GAGATCCTATGTGTTGGATTAGCTTTTTGCTATATGGTATTTCGTAAACTCTGTTCGTTA
CCCATGTTTCTCGTCTCTCGTATTTTTTGTTTAATTTAAAACGTCTTTGATGATTATGAT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

CO CL2601Contig1 838 4 6 U
GGGTCCCGGGGAGGTGTGAGTTGATTGATGAGGAACAAGCTTTTGGTGTTATTGTGGATC
ATGCTAACACACCTGATGGTTTGTCAAGGCTACTTGATTCGGTTCGAGAGCTTAAGCCAA
GAAGAATCATTACTGTTATTGGTTGTCCGGGTGAGACTGAGAGAGGGAAAAGACCGGTTA
TGACGAAAATAGCTACTGAAAAGAGTGATGTGACGATGTTGACATCTGATAATCCAGGGA
ATGAAGATCCATTGGACATATTGGATGACATGTTGGCTGGGATTGGATGGACGATGCAAG
AGTATCTGAAACACGGAGAACATGATTACTATCCTCCATTGGCAAATGGTCATAGACTCT
TCCTTCACGACATTAGACGTGTAGCTGTGCGTTGTGCTGTTGCGATGGGTGAAGAAGGTG
ACATGGTTGTGGTAGCAGGGAAAGGCCATGAAGCGTATCAGCTTGAAGGTGATAAGAAAG
AGTTCTATGATGATCGAGAGGAATGTCGGGAAGCATTACAATACGTTGATGAGCTTCATC
AAGCTGGAATAGACACAAGCGAGTTCCCATGGAGGTTACCAGAGAGTCATTAATATCTCT
CTATGGTGAGATCATTAAACCATGAATCAGATTTACTTCCACCGCCAAGATAGATTTGCA
GAAAGCTCATGAATTCTGTACGAGAGACTTGGAGGTGTTTAACAACCCTTTGTGAGTCAT
CAGATAAGTGTAGGGGAGAGAAGAGATTCTAAAGGTGGAGGAAGATGTGTACAAATTTTT
GTTAGTGGTTGTTGCGTTTGTCTGTGTTGAGGGTTTAAGAGATGGCAGGTGTTTTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EN80TF U 1
AF RR4FL04TF U 1
AF RR4FL04JQ C 51
AF RR4EN80JQ C 87
BS 1 689 RR4EN80TF
BS 690 690 RR4FL04TF
BS 691 694 RR4EN80TF
BS 695 695 RR4FL04JQ
BS 696 741 RR4EN80TF
BS 742 838 RR4FL04JQ

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GGGTCCCGGGGAGGTGTGAGTTGATTGATGAGGAACAAGCTTTTGGTGTTATTGTGGATC
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ATGAAGATCCATTGGACATATTGGATGACATGTTGGCTGGGATTGGATGGACGATGCAAG
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TCCTTCACGACATTAGACGTGTAGCTGTGCGTTGTGCTGTTGCGATGGGTGAAGAAGGTG
ACATGGTTGTGGTAGCAGGGAAAGGCCATGAAGCGTATCAGCTTGAAGGTGATAAGAAAG
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AAGCTGGAATAGACACAAGCGAGTTCCCATGGAGGTTACCAGAGAGTCATTAATATCTCT
CTATGGTGAGATCATTAAACCATGAATCAGATTTACTTCCACCGCCAAGATAGATTTGCA
GAAAGCTCATGAATTCTGTACGAGAGACTGGGAG*TGTTTAACAACCCTTTGTGAGTCAT
CAGATAAGTGTAGGGGAGAGA
AGAGATTCTAAAGT

QA 1 741 1 741
DS 

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ATGCTAACACACCTGATGGTTTGTCAAGGCTACTTGATTCGGTTCGAGAGCTTAAGCCAA
GAAGAATCATTACTGTTATTGGTTGTCCGGGTGAGACTGAGAGAGGGAAAAGACCGGTTA
TGACGAAAATAGCTACTGAAAAGAGTGATGTGACGATGTTGACATCTGATAATCCAGGGA
ATGAAGATCCATTGGACATATTGGATGACATGTTGGCTGGGATTGGATGGACGATGCAAG
AGTATCTGAAACACGGAGAACATGATTACTATCCTCCATTGGCAAATGGTCATAGACTCT
TCCTTCACGACATTAGACGTGTAGCTGTGCGTTGTGCTGTTGCGATGGGTGAAGAAGGTG
ACATGGTTGTGGTAGCAGGGAAAGGCCATGAAGCGTATCAGCTTGAAGGTGATAAGAAAG
AGTTCTATGATGATCGAGAGGAATGTCGGGAAGCATTACAATACGTTGATGAGCTTCATC
AAGCTGGAATAGACACAAGCGAGTTCCCATGGAGGTTACCAGAGAGTCATTAATATCTCT
CTATGGTGAGATCATTAAACCATGAATCAGATTTACTTCCACCGCCAAGATAGATTTGCA
GAAAGCTCATGAATTCTGTACGAGAGACTTGGAG*TGTTTAACAACCCTTTGTGAGTCAT
CAGATAAGTGTAGGGGAGAGA
GAGATCT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4FL04JQ 788 0 0
TATTGT
GATCATGCTAACACAC*TGATGGTTTGTCAAGGCTACTTGATTCGGTTCGAGAGCTTAAG
CCAAGAAGAATCATTACTGTTATTGGTTGTCCGGGTGAGACTGAGAGAGGGAAAAGACCG
GTTATGACGAAAATAGCTACTGAAAAGAGTGATGTGACGATGTTGACATCTGATAATCCA
GGGAATGAAGATCCATTGGACATATTGGATGACATGTTGGCTGGGATTGGATGGACGATG
CAAGAGTATCTGAAACACGGAGAACATGATTACTATCCTCCATTGGCAAATGGTCATAGA
CTCTTCCTTCACGACATTAGACGTGTAGCTGTGCGTTGTGCTGTTGCGATGGGTGAAGAA
GGTGACATGGTTGTGGTAGCAGGGAAAGGCCATGAAGCGTATCAGCTTGAAGGTGATAAG
AAAGAGTTCTATGATGATCGAGAGGAATGTCGGGAAGCATTACAATACGTTGATGAGCTT
CATCAAGCTGGAATAGACACAAGCGAGTTCCCATGGAGGTTACCAGAGAGTCATTAATAT
CTCTCTATGGTGAGATCATTAAACCATGAATCAGATTTACTTCCACCGCCAAGATAGATT
TGCAGAAAGCTCATGAATTCTGTACGAGAGACTTGGAGGTGTTTAACAACCCTTTGTGAG
TCATCAGATAAGTGTAGGGGAGAGAAGAGATTCTAAAGGTGGAGGAAGATGTGTACAAAT
TTTTGTTAGTGGTTGTTGCGTTTGTCTGTGTTGAGGGTTTAAGAGATGGCAGGTGTTTTT
TC

QA 7 788 7 788
DS 

RD RR4EN80JQ 752 0 0
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CCGGGTGAGACTGAGAGAGGGAAAAGACCGGTTATGACGAAAATAGCTACTGAAAAGAGT
GATGTGACGATGTTGACATCTGATAATCCAGGGAATGAAGATCCATTGGACATATTGGAT
GACATGTTGGCTGGGATTGGATGGACGATGCAAGAGTATCTGAAACACGGAGAACATGAT
TACTATCCTCCATTGGCAAATGGTCATAGACTCTTCCTTCACGACATTAGACGTGTAGCT
GTGCGTTGTGCTGTTGCGATGGGTGAAGAAGGTGACATGGTTGTGGTAGCAGGGAAAGGC
CATGAAGCGTATCAGCTTGAAGGTGATAAGAAAGAGTTCTATGATGATCGAGAGGAATGT
CGGGAAGCATTACAATACGTTGATGAGCTTCATCAAGCTGGAATAGACACAAGCGAGTTC
CCATGGAGGTTACCAGAGAGTCATTAATATCTCTCTATGGTGAGATCATTAAACCATGAA
TCAGATTTACTTCCACCGCCAAGATAGATTTGCAGAAAGCTCATGAATTCTGTACGAGAG
ACTTGGAGGTGTTTAACAACCCTTTGTGAGTCATCAGATAAGTGTAGGGGAGAGAAGAGA
TTCTAAAGGTGGAGGAAGATGTGTACAAATTTTTGTTAGTGGTTGTTGCGTTTGTCTGTG
TTGAGGGTTTAAGAGATGGCAGGTGTTTTTTC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL2602Contig1 1168 3 21 U
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CAGCTGCGTCGACGAGATCCGTCGTTACGATCTCAGATTTGATACTCCGGCGACATGAGT
TCTCCGGGAGCGAGTATGATCACAAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGACTCGCTCTCGTG
CTTGTGGTCGGACACGTCTTGGTTCACTTCGTTCCCTCCACCGTCACGTACCTCGCTCCC
ATCCCAGCCAGGACTATTCCATTTGGGTGGAATCTGATTACAAGCGGCTATTTTGAACTC
TCACTATATGGTGTTGTCTTCAGCGTTGTTTCTCTCCTCTTTATGGGAAAGTTCCTTGAA
CCTGTCTGGGGTTCCAAGGAGTTCCTTAAGTTCATCTTCCTCGTCAACTTCCTTACCTAT
CTCTGCGTTTTCGTCACAGCCATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAATCTACCTA
TATATGCCCTTCGCAGGTTTTCATGGTGTCTTGGCAGGCCTTCTTGTCGGGATTAAGCAG
ATAATACCTGACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGTTGCCCTCTATT
ATGATTGTTTTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTAAACTCAGCAGCATACCTTCCC
ACTTTGATTTTTGGTACGTATATGGGCTGGTTATACCTCAGATACTTTCAGAGGAGGCCA
GAGACAAAGCTCAGAGGTGATCCGAGTGACGACTTTGCCTTCTCCACTTTCTTTCCTGAA
TTCCTCAGACCGATTATTGATCCTATAGCCTCAATATTTCACCGGATGCTTTGTGGACGA
TCAGATGCGACCAGCGAAGACCATGGTTATACTACTAGCGGTGCTCCATTACCCGGCTCT
GACTCTGCTGAAGCTTCCAGGAGGAGAGAAAGAGGAGCAAGAGCTCTAGAGGAGAGACTT
GCAACGGAAAGGTTAGTTCCTCCAAGGAACAAAGATGAGTTGCAGAGTGATGCTTTGGAT
AGCGTTTAAGTGGAGACTGCAACTAGTTTTGTTGAAGAAGTTGTGTGGGTTCTTTTTTTT
TTTCTGTTTGTTTATGAAATTGGCTTAATACAGACTGAACCGATCAGCTTCTCCGTAAAT
TCTTATGACAGCTAAAAAAAATTAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D582TF U 1
AF RR4EK67TF U 48
AF RR4EK67JQ C 490
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BS 757 1168 RR4EK67JQ

RD RR4D582TF 708 0 0
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TCTCCGGGAGCGAGTATGTTCACTAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGACTCGCTCTCGTG
CTTGTGGTCGGTCACGTCTTGGTTCACTTCGTTCCCTCCACCGTCACGTACCTCGCTCTC
ATCCCGGCGAGGACTATTCCATTTGGGTGGAATCTGATTACAAGCGGCTATTTTGAACTC
TCACTATATGGTGTTGTCTTCAGCGTTGTTTCTCTCCTCTTTATGGGAAAGTTCCTTGAA
CCTGTCTGGGGTTCCAAGGAGTTCCTTAAGTTCATCTTCCTCGTCAACTTCCTTACCTAT
CTCTGCGTTTTCGTCACAGCCATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAATCTACCTA
TATATGCCCTTCGCAGGTTTTCATGGTGTCTTGGCAGGCCTTCTTGTTGGGATTAAGCAG
ATAATACCTGACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGTTGCCCTCTATT
ATGCTAGTTTTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTAAACTCAGCAGCATACCTTCCC
ACTTTGATTTTTGGTACGTATATGGGCTGGTTATACCTCAG
TACTTGC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4EK67TF 709 0 0
GG
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GCGACATGAGTTCTCCGGGAGCGAGTATGATCACAAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGAC
TCGCTCTCGTGCTTGTGGTCGGACACGTCTTGGTTCACTTCGTTCCCTCCACCGTCACGT
ACCTCGCTCCCATCCTAGCCAGGACTATTCCATTTGGGTGGAATCTGATTACAAGCGGCT
ATTTTGAACTCTCAGTATATGGTGTTGTCTTCAGCGTTGTTTCTCTCCTCTTTATGGGAA
AGTTCCTTGAACCTGTCTGGGGTTCCAAGGAGTTCCTTAAGTTCATCTTCCTCGTCAACT
TCCTTACCTATCTCTGCGTTTTCGTCACAGCCATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCG
AAATCTACCTATATATGCCCTTCGCAGGTTTTCATGGTGTCTTGGCAGGCCTTCTTGTCG
GGATTAAGCAGATAATACCTGACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGT
TGCCCTCTATTATGATTGTTTTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTAAACTCAGCAG
CATACCTTCCCACTTTGATTTTTGGTACGTATATGGGCTGGTTATACCTCAGATACTTTC
AGAGGAGGCCAGAGACAAAGCTCAGAGGTGATCCGAGTGACGACTTT

QA 3 709 3 709
DS 

RD RR4EK67JQ 679 0 0
TTCGCAGGTTTTCATGGTGTCTTGGCAGGCCTTCTTGTCGGGATTAAGCAGATAATACCT
GACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGTTGCCCTCTATTATGATTGTT
TTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTAAACTCAGCAGCATACCTTCCCACTTTGATT
TTTGGTACGTATATGGGCTGGTTATACCTCAGATACTTTCAGAGGAGGCCAGAGACAAAG
CTCAGAGGTGATCCGAGTGACGACTTTGCCTTCTCCACTTTCTTTCCTGAATTCCTCAGA
CCGATTATTGATCCTATAGCCTCAATATTTCACCGGATGCTTTGTGGACGATCAGATGCG
ACCAGCGAAGACCATGGTTATACTACTAGCGGTGCTCCATTACCCGGCTCTGACTCTGCT
GAAGCTTCCAGGAGGAGAGAAAGAGGAGCAAGAGCTCTAGAGGAGAGACTTGCAACGGAA
AGGTTAGTTCCTCCAAGGAACAAAGATGAGTTGCAGAGTGATGCTTTGGATAGCGTTTAA
GTGGAGACTGCAACTAGTTTTGTTGAAGAAGTTGTGTGGGTTCTTTTTTTTTTTCTGTTT
GTTTATGAAATTGGCTTAATACAGACTGAACCGATCAGCTTCTCCGTAAATTCTTATGAC
AGCTAAAAAAAATTAGTGC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL2603Contig1 1635 3 7 U
CGTAACAAACCCTATAAAAGGGTTCAACGTTTATTATCATGACATCGATAGTAGTTTTTT
TAGTATTTGAAAATTAAACATCATACAAGAACAAAATAAGACAAGAATCCATATTGTGAA
CATGAAACAAAAGCCACATTACAACATCTCTAGAAAGCAGTGTGTCCGTAGAACAAAAGC
ACAAAGGTTCTTTTTATTTTATTACCACCGTAAACAAAATGAAAGACACAAACTCAAACC
TTGAGGACAAGCTTCTTTTTCTTTCTCTTCAATGGCTGGCTAATTTGAGAGTGTTGGCCT
TGTCTTGTAGTGTACCAAGCAGACTCTCGAAACTCTTTTTGAACGAGTCTACACCTTCTT
CTTCCAACTGTTCTCCCACTTTGTTCCAGTCTATTCCTAGCTTCTCCAGTGCACTGTAAA
TGCCTTCTGCTTCAGACACATTCGCATCTATGGTTCTCTTCACGGTTCCATGATCTATGA
ATGCTTCCAGTGCTTGATCAGGCATGGTTGACACAGTGTCAGGTCCAATGAGAGGAGCAA
CATATAAGGTGTCAGAGTAAGCTGGGTTCTTAACACTAGTCGATGCCCAGAGAAGCCTCT
GCTTCTTGGCACCTTTCTTCACCAGAGCCTCCCATCTTGGTCCTGAGAATTTTTTCTGGT
ACAGCTTGTATGCTAATGCAGCTTGAGCCACAGCTGCCTTGCCACGGAGGTCTAGTGCTT
CTGGGGTACCTATTTTCTCAAGCATCTTGTCCATGAGAGTATCCACTCTACTGACAAAGA
AGGATGCAACACTAGTAACTTTTGAGAGGTCATCAAGTCCAGAGGCCTCAAGCCCATCCA
AATATGCATCGATCACTGCCTCGTATCTAGCTATTGAGAATATAAGAGTGACATTGACGC
TTATTCCAGAAGCAATGACATCTCTGATGGAAGGAATGCAAGGAGCAGTAGCAGGGATCT
TAATGTAGACGTTACGACGGTTAACAACCTTGTGGAGATACTTAGCAGCTTCAACAGTGC
CATTGGTATCATCAGCAAGCCTAGGTGAGACTTCAACAGAAACATAACCATCCTCAGCTT
CTGTCTGGTCACAGATTGGCTCAAAGAGCTTGCAAGCATCCTGAATATCCTTCACCACGA
GTTCCCAGTAGGCGCTTTCAATGTCCCTTCCTGATTCCACAAGTGTCCTGAACTGATCAT
TATAAGCATTTGAAGTGGAGATGGCTTTCTGGAAGATCGCAGGGTTGCTGGTAACGCCAC
GGACACCACGGGCAATAAATGGAAGAAGATCAGTGACGGGACGGCAAAGATTGTCATACC
AAGGACTCTGACCTTCCTTCTCGTATAGATCGTGAAGAGTCGTTCTCTCGGCAGCACTTC
CGTTTCCACCAGAGGCTGAACACCTCACAAAGAGGGAAGATCTGGATGTTTGGTTGTAAC
GAAGGGAAAGATGAGAAGAAGAGGAAAGCTTAGCGTTCAAACTACGGAGGTTGACGAAAG
ATCTGGGTAGCACGGAGGAGGAAGAAGAAGATCTGGAGTTGGTGGAAGTGGCGGGTGTAA
GGTTTGCGAGATTGGAGATAGAAGCCATCTTTTTCCGTCAGGGGGAAAATAAGGAAAGTG
AAGTTCTTTCCTTCC


BQ
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AF RR4GR58JQ U 1
AF RR4EG39JQ U 658
AF RR4CD64TF C 912
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CTGGGGTACCTATTTTCTCAAGCATCTTGTCCATGAGAGT

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CGCTTATTCCAGAAGCAATGACATCTCTGATGGAAGGAATGCAAGGAGCAGTAGCAGGGA
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TGCCATTGGTATCATCAGCAAGCCTAGGTGAGACTTCAACAGAAACATAACCATCCTCAG
CTTCTGTCTGGTCATAGATTGGCTCAAAGAGCTTGCAAGCATCCTGAATATCCTTCACCA
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CATTATAAGCATTTGAAGTGGAGATGGCTTTCTGGAAGATCGCAGGGTTGCTGGTAACGC
CACGGACACCACGGGCAATAAATGGAAGA

QA 1 629 1 629
DS 

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TTACGACGGTTAACAAC*TTGTGGAGATACTTAGCAGCTTCAACAGTGCCATTGGTATCA
TCAGCAAGCCTAGGTGAGACTTCAACAGAGACATAACCATCCTCAGCTTCTGTCTGGTCA
CAGATTGGCTCAAAGAGCTTGCAAGCATCCTGAATATCCTTCACCACGAGTTCCCAGTAG
GCGCTTTCAATGTCCCTTCCTGATTCCACAAGTGTCCTGAACTGATCATTATAAGCATTT
GAAGTGGAGATGGCTTTCTGGAAGATCGCAGGGTTGCTGGTAACGCCACGGACACCACGG
GCAATAAATGGAAGAAGATCAGTGACGGGACGGCAAAGATTGTCATACCAAGGACTCTGA
CCTTCCTTCTCGTATAGATCGTGAAGAGTCGTTCTCTCGGCAGCACTTCCGTTTCCACCA
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TGAGAAGAAGAGGAAAGCTTAGCGTTCAAACTACGGAGGTTGACGAAAGATCTGGGTAGC
ACGGAGGAGGAAGAAGAAGATCTGGAGTTGGTGGAAGTGGCGGGTGTAAGGTTTGCGAGA
TTGGAGATAGAAGCCATCTTTTTCCGTCAGGGGGAAAATAAGGAAAGTGAAGTTCTTTCC
TTCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 4

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AATCAAATATTCACACACAGTCTGCGAAGAACATAGATTGAAAAGACAAAACTCTGGGAG
AAGAAGATTAGAGAAATGCTTAGTTTGAATTCGCTTCGTCTTCCATTCCCAAACCCTAGT
CCTCCCAACTCTTCTTCCTCGCCCTCGAGGAGATGCGTCTCCGCTTGCCCAATTCCGGTC
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CAACGAAATGCGTCTTGTTACCTCGATGAGAAATCTGAGTGCGAAGAAAAAGATAGAAAT
CTTGATGTATTGGTCGGCACATCGATAGCTCACCCGACAAAGAGAGTTCTTAAGCTCTTG
GCTGTATCTGCCCCGCTCGCATTGCTTGGAGCTGATCCAGCTTTTGCGGTGGTTTCTCCA
ATTCCGCAGTCATTTGTCACTTCTCTTGGAGACCTCGGAGACATTAGCTCAGGTTTTGCT
TCGGCGTTCTTGCTTATATTTTTCTCTGAACTTGGAGACAAGACTTTCTTCATTGCGGCC
CTTTTAGCAGCAAGGAACAACGCTGCTATTGTTTTCGCTGGGACTTTTGGCGCTCTTGGG
ATCATGACGATAATTTCTGTAGTGCTTGGAAGAACTTTCCACTATGTCGATGAAATTCTC
CCCTTCAGGTTTGGTGAGACGGATCTGCCTATAGATGATATTGCAACAGTTTGTCTTCTG
GTGTACTTCGGTGTTTCAACGTTAGCAGATGCTATCTCTGACGATGGACTTAAAGCTGAA
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GCAGCAGCCGCTAACACCATCATCAGCACTTTCGCATTGGTTTTTGTTGCCGAATGGGGT
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GCTGGAGCATTGGCGGGTCACGGTGCTGCGACTCTGCTTGCAGTTTTGGGAGGTTCTTTG
CTGGGAAACTTCTTGTCAGAGAAGGCAATAGCTTATGTCGGAGGAGTTTTGTTTCTCGTG
TTTGCTGCTGTGACAGTGTCTGAGATCATTACGTAAGTGAGATTAATAATAATATTTCTT
TTCCTCTTATTTGTTTGCGAATTTAAAATACAATTTTCCTGTTATTTGTAAATTTTTATC
ATTGTTTACTGTCCACTCTTTCTCTGCTAACTATACTGTGGATTCACAGTTTTCATGTGT
ACTATCAAGCATCGAC


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C

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FE69JQ U 1
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G
GTGAGGAAAGTTAATACTTTTATTTTCCATATACATCAGCTACATTTTTATTTTATGAAA
CCAGTTTCAGCCATGTAGTAAACTGTGCCATGCATCTAGTGCTTTTCACATGACTACATC
TTCTTCTCCTTAATGATTTTTCATGATCCATTATCTTATTTATTCAACCCATATTTAAAG
GTATAACTCTTGTGGCAGCTCTCGGCGAAACTAGTGCTTCCACTGGAGTCTTCATGACAC
AAAGTAATCCAGGAATCTCGCTCATGTCAATACTCTCCGGAAGAATAGGGGAACTCCACG
AAAAGCATTGCAACAAGTTCCCCATCACCAATGCCATCAGGTTCATGCTGAGCTGTGCAG
CTGGACACACTCTCCTCCCCGAGCCAAACGGAAGAACCCTGAAGTCTCGACCCTTGACAT
CAGTGTCCTCTAGTAAGAACCGCTCCGGTCTGAACTCCAAAGGGTTTATCCAGTTCACTG
GATCCCTTCCTATCTCCTTCACATGGACATAAACCGTGGTTCCTTTAAGAACCTTATACC
CACCTAACCACACCGTTTCACTTGCTTTGTGTGGAAGCATTGTTGGTGTTGACGGGT

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR4CT55JQ 652 0 0
AGTGAGGAAAGTTAATACTTTTATTTTCCATATACATCAGCTACATTTTTATTTTATGAA
ACCAGTTTCAGCCATGTAGTAAACTGTGCCATGCATCTAGTGCTTTTCACATGACTACAT
CTTCTTCTCCTTAATGATTTTTCATGATCCATTATCTTATTTATTCAACCCATATTTAAA
GGTATAACTCTTGTGGCAGCTCTCGGCGAAGCTAGTGCTTCCACTGGAGTCTTCATGACA
CAAAGTAATCCAGGAATCTCGCTCATGTCAATACTCTCCGGAGGAATAGGGGAACTCCAC
GAAAAGCATTGCAACAAGTTCCCCATCACCAATGCCATCAGGTTCATGCTGAGCTGTGCA
GCTGGACACACTCTCCTCCCCGAGCCAAACGGAAAAACCCTGAAGTCTCGACCCTTGACA
TCAGTGTCCTCTAGTAGGAACCGCTCCGGTCTGAACTCCAAAGGGTTTATCCAGTTCACT
GGATCCCTTCCTATCTCCTTCACGTGGACATAAACCGTGGTTCCTTTAGGAACCTTATAC
CCACCTAACCACACCGTTTCACTTGCTTTGTGTGGAAGCATTGTTGGTGTTGACGGGTGA
AGTCTCAGTGCCTCTTTGACCACGCATTGCAGATACGGCAGTTTTGGGATGT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4FE69JQ 720 0 0
A
GTGAGGAAAGTTAATACTTTTATTTTCCATATACATCAGCTACATTTTTATTTTATGAAA
CCAGTTTCAGCCATGTAGTAAACTGTGCCATGCATCTAGTGCTTTTCACATGACTACATC
TTCTTCTCCTTAATGATTTTTCATGATCCATTATCTTATTTATTCAACCCATATTTAAAG
GTATAACTCTTGTAGCAGCTCTCGGCGAAGCTAGTGCTTCCACTGGAGTCTTCATGACAC
AAAGTAATCCAGGAATCTCGCTCATGTCAATACTCTCCGGAGGAATAGGGGAACTCCACG
AGAAGCATTGCAACAAGTTCCCCATCACCAATGCCATCAGGTTCATGCTGAGCTGTGCAG
CTGGACACACTCTCCTCCCCGAGCCAAACGGAAGAACCCTGAAGTCTCGACCCTTGACAT
CAGTGTCCTCTAGTAGGAACCGCTCCGGTCTGAACTCCAAAGGGTTTATCCAGTTCACTG
GATCCCTTCCTATCTCCTTCACGTGGACATAAACCGTGGTTCCTTTAGGAACCTTATACC
CACCTAACCACACCGTTTCACTTGCTTTGTGTGGAAGCATTGTTGGTGTTGACGGGTGAA
GTCTCAGTGCCTCTTTGACCACGCATTGCAGATACGGCAGTTTTGGGATGTCTGCTTCAG
TCATTAGCCTTTCTGATCCGACCACGGCGTCGAGCTCCTGCTGCGCTTTTTCTTGCACG

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR4H620TF 649 0 0
TTCATGATCCATTATCTTATTTATTCAACCCATATTTAAAGGTATAACTCTTGTGGCAGC
TCTCGGCGAAGCTAGTGCTTCCACTGGAGTCTTCATGACACAAAGTAATCCAGGAATCTC
GCTCATGTCAATACTCTCCGGAGGAATAGGGGAACTCCACGAGAAGCATTGCAACAAGTT
CCCCATCACCAATGCCATCAGGTTCATGCTGAGCTGTGCAGCTGGACACACTCTCCTCCC
CGAGCCAAACGGAAGAACCCTGAAGTCTCGACCCTTGACATCAGTGTCCTCTAGTAGGAA
CCGCTCCGGTCTGAACTCCAAAGGGTTTATCCAGTTCACTGGATCCCTTCCTATCTCCTT
CACATGGACATAAACCGTGGTTCCTTTAGGAACCTTATACCCACCTAACCACACCGTTTC
ACTTGCTTTGTGTGGAAGCATTGTTGGTGTTGACGGGTGAAGTCTCAGTGCCTCTTTGAC
CACGCATTGCAGATACGGCAGTTTTGGGATGTCTGCTTCAGTCATTAGCCTTTCTGATCC
GACCACGGCGTCAAGCTCCTGCTGCGCTTTTTCTTGCACGGCAGGGCATCTGATCATCTC
TGCCATAGCCCATTCCAGGACAACAGCTGTCGTGTCTGAGCCTGCGGTG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 4

CO CL2606Contig1 742 4 1 U
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCCCAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTTGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTTGTCTCATGCTATCTCACATCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGCCAATGCCGACATTGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACTCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGGAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCTGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
ACTAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGAT
GAAGACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTTTTATAATTTTCCTGT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCGTCCTTCTTAATAATGA
TATCAGTGTTTTTATTTATTAAATTTGTGAATTGTTTCCATGGTTTATGCTTTTGGACTG
TTTTCTCTTAACCTACGTAAGA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H103TF U 3
AF RR4GK66TF U 427
AF RR4DC14TF U 2
AF RR4GA20TF U 1
BS 1 742 RR4GA20TF

RD RR4H103TF 311 0 0
GG
ATATCCAAACCTCATAAAAGCTCCCAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTTGCAATCCTTC
TTGCTATCATACTTGTCTCATGCTATCTCACATCTCTAGTCACAGTAAGTGATTTGGAGC
CAATGCCGACATTGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCTTACT
TTCACTCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGGAAA*GCCTTTCCGCCAC
TCCCTGCCGGCTACA*CCATTTCCACC*TGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTCACTA
AGTGCT
GTC

QA 3 308 3 308
DS 

RD RR4GK66TF 233 0 0
G
GTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTTAAGCTAC
ATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGGTTTTAGT
TAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTTTTATAATTTTCCTGTTTAATTA
TGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGTGTCCTTCTTAATAATG

QA 2 233 2 233
DS 

RD RR4DC14TF 645 0 0
GAC
ATATCCAAACCTCATAAAAGCTCCCAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTTGCAATCCTTC
TTGCTATCATACTTGTCTCATGCTATCTCACATCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTGGAGC
CAATGCCGACATTGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACTATTCCTACCCTTACT
TTCACTCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGGAAAAGCCTTTCCGCCAC
TCCCTGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTCACTA
AGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCTTTCT
TCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGATGAAG
ACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTTAAGC
TACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGGTTTT
AGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTTTTATAATTTTCCTGTTTAA
TTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTG
CGTC

QA 4 641 4 641
DS 

RD RR4GA20TF 742 0 0
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCCCAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTTGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTTGTCTCATGCTATCTCACATCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGCCAATGCCGACATTGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACTCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGGAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCTGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
ACTAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGAT
GAAGACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTTTTATAATTTTCCTGT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCGTCCTTCTTAATAATGA
TATCAGTGTTTTTATTTATTAAATTTGTGAATTGTTTCCATGGTTTATGCTTTTGGACTG
TTTTCTCTTAACCTACGTAAGA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 4

CO CL2607Contig1 947 4 19 U
GGAGAACGCTTTGTCTCCGTCACCGGCAGGTGAAATCGCGGGAAGAGTAGCGTCTCTTTA
CGTCTACCCTATCAAATCATGTCGAGGGATTTCTTTGTCTCAGGCTTCGCTCACTCCCAC
AGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGATTGTCAACTCCAAAGGAAGAGGACTGACTCA
AAGAGTGGAACCAAAGCTTTCCTTAATTGAAGTCGAAATGCCTAAACATGCGTTTGCACA
TGACTGGCTGCCCGACAACAACTCTAACATGTTGGTTAGAGCTCCTGGGATGGATGTACT
TAAGGTTTCGCTAGCCAAACCTGAGAAAATAGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGAGTGGTT
TGGCTCCGCACTTGATGAAGGAGAGGAAGCCTCTAACTGGTTTACAGATTTTGTTGGCAA
GCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGCCTCTGAGACAAGACCTGTGGATCCAAATTA
TGCTCCAGGTCACGTTGCCATGTTCTCAGATATGTACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGG
TTCCCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCAAGGAGCCTGTACCCATCAACCGATTCAGACC
CAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTGAAGACTTATGGACAGAGATCCTTAT
AGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGAAATTATGCTCCCGTTGCAAGGTACCGACGATAAA
TCAAGACACTGGAATTGGAGGTGAAGAGCCAATTGAGACTCTGAGGAGTTTCAGGTCAGA
CAAATTTTTACAACCACAGAAGAAACCACAGGGAAAGATATACTTTGGACAGAACATGGT
TTGGAAAGATGGGTTTGGGGATGGAATAGCAAAAAAAATTGAGATTGGTGATTCTGTTCT
TGTCCTTGGAAAACTCTCCTCTCCTACTGAAGCAGCAACTTGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ37TF U 1
AF RR4CK35TF U 16
AF RR4EQ37JQ C 457
AF RR4CK35JQ C 216
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BS 185 185 RR4CK35TF
BS 186 248 RR4EQ37TF
BS 249 250 RR4CK35TF
BS 251 395 RR4EQ37TF
BS 396 396 RR4CK35TF
BS 397 701 RR4EQ37TF
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BS 705 705 RR4CK35JQ
BS 706 723 RR4CK35TF
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BS 781 792 RR4CK35JQ
BS 793 793 RR4EQ37JQ
BS 794 947 RR4CK35JQ

RD RR4EQ37TF 701 0 0
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CGTCTATCCTATCAAATCATGTCGAGGGATTTCTTTGTCTCAGGCTTCGCTCACTCCCAC
AGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGATTGTCAACTCCAAAGGAAGAGGATTGACTCA
AAGATTGGAACCAAAGCTTTCCTTAATTGAAGTCGAAATGCCTAAACATGCGTTTGCACA
TGACTGGCACCCCGACAACAACTCTAACATGTTGGTTAGAGCTCCTGGGATGGATGTACT
TAAGGTTTCGCTAGCCAAACCTGAGAAAATAGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGAGTGGTT
TGGCTCCGCACTTGATGAAGGAGAGGAAGCCTCTAGCTGGTTTACAGATTTTGTTGGCAA
GCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGCCTCTGAGACAAGACCTGTGGATCCAAATTA
TGCTCCAGGTCACGTTGCCATGTTCTCAGATATGTACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGG
TTCCCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCAAGGAGCCTGTACCCATCAACCGATTCAGACC
CAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTGAAGACTTATGGACAGAGATCCTTAT
AGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGAAATTATGCTCCCGTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4CK35TF 715 0 0
TCCCTCGCCA
GCAGGTGAAATCGCGGGAAGAGTAGCGTCTCTTTACGTCTACCCTATCAAATCATGTCGA
GGGATTTCTTTGTCTCAGGCTTCGCTCACTCCCACAGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGG
TTGATTGTCAACTCTAAAGGAAGAGGACTGACTCAAAGAGTGGAACCAAAGCTTTCCTTA
ATTGAAGTCGAAATGCCTAAACATGCGTTTGCACATGACTGGCTGCCCGACAACAACTCT
AACATGTTGGTTAGAGCTCCTGGGATGGATGTACTTAAGGTTTCGCTAGCCAAACCTGAG
AAAATAGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGAGTGGTTTGGCTCCGCACTTGATGAAGGAGAG
GAAGCCTCTAACTGGTTTACAGATTTTGTTGGCAAGCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGAT
TCAGCCTCTGAGACAAGACCTGTGGATCCAAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCCATGTTC
TCAGATATGTACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGGTTCCCTTGATGCCCTGAATGAGCTT
CTCAAGGAGCCTGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAA
CCATTTGCTGAAGACTTATGGACAGAGATCCTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTGTG
ATATTATGCTCCCGTTGCAGGGTACCGACGATAAATCA
GACACTG

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DS 

RD RR4EQ37JQ 436 0 0
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CCCTTTCTTGCTTATATCACAGGGTTCCCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCAAGGAGCC
TGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTGA
AGACTTATGGACAGAGATCCTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGAAATTATGCTC
CCGTTGCAAGGTACCGACGATAAATCAAGACACTGGAATTGGAGGTGAAGAGCCAATTGA
GACTTTGAGGAGTTTCAGGTCAGACAAATTTTTACAACCACAGAAGAAGCCACAGGGAAA
GATATACTTTGGACAGAACATGGTTTGGAAAGATGGGTTTGGGGATGGAATAGCAAAAAA
AATTGAGATTGGTGAT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4CK35JQ 732 0 0
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TTAGAGCTCCTGGGATGGATGTACTTAAGGTTTCGCTAGCCAAACCTGAGAAAATAGCAG
ACGGTGTCTCAGTCTGGGAGTGGTTTGGCTCCGCACTTGATGAAGGAGAGGAAGCCTCTA
ACTGGTTTACAGATTTTGTTGGCAAGCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGCCTCTG
AGACAAGACCTGTGGATCCAAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCCATGTTTTCAGATATGT
ACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGGTTCCCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCAAGGAGC
CTGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTG
AAGACTTATGGACAGAGATCCTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGATATTATGCT
CCCGTTGCAAGGTACCGACGATAAATCAAGACACTGGAATTGGAGGTGAAGAGCCAATTG
AGACTCTGAGGAGTTTCAGGTCAGGCAAATTTTTACAGCCACAGAAGAAACCACAGGGAA
AGATATACTTTGGACAGAACATGGTTTGGAAAGATGGGTTTGGGGATGGAATAGCAAAAA
AAATTGAGATTGGTGATTCTGTTCTTGTCCTTGGAAAACTCTCCTCTCCTACTGAAGCAG
CAACTTGAAAGC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL2608Contig1 1218 4 5 U
GGGCAACCAATCTCAATTCACAAAAGAGAAAGAAGAAGAAGAAAAACTGAATTCTGATTG
AAGAAGAAGAAGAAGACGACTCGATTAGATACCGTTAGCTATTGGAGAAACTCGTTTTGA
TTCGTTTCTACCGAAAGGTTTTTGTTTGTATTATAACGATGTCGAGTCCTATGGAGTCCT
CTGAATTCGCCGCTACTCGGAGATTTTCAAGGAAGCCGAGCTTCTCGCAGACGTGTAGTC
GTTTGAGTCAGTATCTGAAGGAAAACGGTAGCTTTGGAGATCTCACCTTAGGGATGTCAT
GCAAGCCTGAGGTCAACGGCAACACACGTCAGCCCACAACAACCATGAGTCTATTCCCTT
GTGAGACTTCCAACGTGGATTATATTGCGGATGTTAAACCCAAGAATCTGTTTCCTAGGC
AACCAAGCTTTTCTTCTTCATCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGATGTTCCAAAAATGACAC
AGACTAATACTAGTACTAGATCTGTGAAACTAGAGCCTCAAACTGCACCGTTGACTATAT
TCTACGGCGGGCAAGTGATTGTGTTCGATGACTTTACTGCTGAGAAAGCCAAAGAAGTGA
TGGACTTAGCGAGCAATGGAACCCCTACTACCTTCACCGGTTTCACATCTAATCTCAACA
TCATCCAGAGTGTTGCCACTAGTAACTTAACCAAGAATCAAACAGAGATCAGAAGCAACA
TCGCTCCTATCCCAAACCAACTTCCTCATCTCATGAAAACCGCAACACAAGGGCCTATCC
AATCCTCCGCAACTGCAATGGCATGCGAACTTCCTATTGCTAGAAGAGCTTCACTCCACC
GGTTTCTAGCCAAGAGAAAAGACAGGGTTACGTCAAAGGCACCGTACCAATTAAACGATC
CATCCAAAGCGTCTTCAAAGCCTCAAACCGGAGAAAACACCACCTCTTGGCTTGGTTTAG
CAACTGAAATGTGAAGGGCATGGTTTAACCACCACAAACCGTACCGGGGGATATTCTTTT
GACGTTAGAAAACTTCATATATTTGTATGTATCTGTTTATGATTAGCGATCAATTCTTGT
TAGCTTCTGTCTTTCACTAGGGTATTGTATCATGATTGTCTTTACAAATCCCCTTTCTTT
GGGCCGTCTCAAAACTAGTCTCGTATGTTAGTGAGTTTGTAAGAACATTTTGTCGACGGT
AATGCTAGTTTTAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA15TF U 1
AF RR4GA15JQ C 540
AF RR4FX77JQ C 568
AF RR4FX77TF U 568
BS 1 735 RR4GA15TF
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BS 737 758 RR4GA15TF
BS 759 1208 RR4FX77TF
BS 1209 1218 RR4GA15JQ

RD RR4GA15TF 774 0 0
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TTCGTTTCTACCGAAAGGTTTTTGTTTGTATTATAACGATGTCGAGTCCTATGGAGTCCT
CTGAATTCGCCGCTACTCGGAGATTTTCAAGGAAGCCGAGCTTCTCGCAGACGTGTAGTC
GTTTGAGTCAGTATCTGAAGGAAAACGGTAGCTTTGGAGATCTCACCTTAGGGATGTCAT
GCAAGCCTGAGGTCAACGGCAACACACGTCAGCCCACAACAACCATGAGTCTATTCCCTT
GTGAGACTTCCAACGTGGATTATATTGCGGATGTTAAACCCAAGAATCTGTTTCCTAGGC
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AGACTAATACTAGTACTAGATCTGTGAAACTAGAGCCTCAAACTGCACCGTTGACTATAT
TCTACGGCGGGCAAGTGATTGTGTTCGATGACTTTACTGCTGAGAAAGCCAAAGAAGTGA
TGGACTTAGCGAGCAATGGAACCCCTACTACCTTCACCGGTTTCACATCTAATCTCAACA
TCATCCAGAGTGTTGCCACTAGTAACTTAACCAAGAATCAAACAGAGATCAGAAGCAACA
TCGCTCCTATCCCAA*CCAACTTCCTCATCTCATGAAA
CCGCACACAAGGGCTA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4GA15JQ 679 0 0
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ATGGACTTAGCGAGCAATGGAACCCCTACTACCTTCACCGGTTTCACATCTAATCTCAAC
ATCATCCAGAGTGTTGCCACTAGTAACTTAACCAAGAATCAAACAGAGATCAGAAGCAAC
ATCGCTCCTATCCCAAACCAACTTCCTCATTTCATGAAAACCGCAACACAAGGGCCTATC
CAATCCTCCGCAACTGCAATGGCATGCGAACTTCCTATTGCTAGAAGAGCTTCACTCCAC
CGGTTTCTAGCCAAGAGAAAAGACAGGGTTACGTCAAAGGCACCGTACCAATTAAACGAT
CCATCCAAAGCGTCTTCAAAGCCTCAAACCGGAGAAAACACCACCTCTTGGCTTGGTTTA
GCAACTGAAATGTGAAGGGCATGGTTTAACCACCACAAACCGTACCGGGGGATATTCTTT
TGACGTTAGAAAACTTCATATATTTGTATGTATCTGTTTATGATTAGCGATCAATTCTTG
TTAGCTTCTGTCTTTCACTAGGGTATTGTATCATGATTGTCTTTACAAATCCCCTTTCTT
TGGGCCGTCTCAAAACTAGTCTCGTATGTTAGTGAGTTTGTAAGAACATTTTGTCGACGG
TAATGCTAGTTTTAATTTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4FX77JQ 641 0 0
G
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TACCTTCACCGGTTTCACATCTAATCTCAACATCATCCAGAGTGTTGCCACTAGTAACTT
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TTTCATGAAAACCGCAACACAAGGGCCTATCCAATCCTCCGCAACTGCAATGGCATGCGA
ACTTCCTATTGCTAGAAGAGCTTCACTCCACCGGTTTCTAGCCAAGAGAAAAGACAGGGT
TACGTCAAAGGCACCGTACCAATTAAACGATCCATCCAAAGCGTCTTCAAAGCCTCAAAC
CGGAGAAAACACCACCTCTTGGCTTGGTTTAGCAACTGAAATGTGAAGGGCATGGTTTAA
CCACCACAAACCGTACCGGGGGATATTCTTTTGACGTTAGAAAACTTCATATATTTGTAT
GTATCTGTTTATGATTAGCGATCAATTCTTGTTAGCTTCTGTCTTTCACTAGGGTATTGT
ATCATGATTGTCTTTACAAATCCCCTTTCTTTGGGCCGTCTCAAAACTAGTCTCGTATGT
TAGTGAGTTTGTAAGAACATTTTGTCGACGGTAATGCTAG

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR4FX77TF 641 0 0
G
TGACTTTACTGCTGAGAAAGCCAAAGAAGTGATGGACTTAGCGAGCAATGGAACCCCTAC
TACCTTCACCGGTTTCACATCTAATCTCAACATCATCCAGAGTGTTGCCACTAGTAACTT
AACCAAGAATCAAACAGAGATCAGAAGCAACATCGCTCCTATCCCAAACCAACTTCCTCA
TCTCATGAAAACCGCAACACAAGGGCCTATCCAATCCTCCGCAACTGCAATGGCATGCGA
ACTTCCTATTGCTAGAAGAGCTTCACTCCACCGGTTTCTAGCCAAGAGAAAAGACAGGGT
TACGTCAAAGGCACCGTACCAATTAAACGATCCATCCAAAGCGTCTTCAAAGCCTCAAAC
CGGAGAAAACACCACCTCTTGGCTTGGTTTAGCAACTGAAATGTGAAGGGCATGGTTTAA
CCACCACAAACCGTACCGGGGGATATTCTTTTGACGTTAGAAAACTTCATATATTTGTAT
GTATCTGTTTATGATTAGCGATCAATTCTTGTTAGCTTCTGTCTTTCACTAGGGTATTGT
ATCATGATTGTCTTTACAAATCCCCTTTCTTTGGGCCGTCTCAAAACTAGTCTCGTATGT
TAGTGAGTTTGTAAGAACATTTTGTCGACGGTAATGCTAG

QA 2 641 2 641
DS 



AS 1 4

CO CL2609Contig1 679 4 4 U
AAAGGGCTAGTGGGCTAATAATAATCATCTGTTCAAATGCGCTAGCTTAATACCTGAAGA
GTAGTATCTTCAAGGTGACCATCAATACAATACTTGATCCATTAAAAGGTTTTCCTAAAG
AAAATGATAAACATTAAAGGAAATCCAAGCGTGACTGGTGTCCAAAGCACAAAGAGTTAA
AACAACAGACCACGAAAACTAAGCTGATTACAAAAGTCTTCTAGTTGGTGCATAGATAAG
GAAAAA*CACTGAGCTCCTCCTTAGTACGGATTCGAGAACTTGGCAACCTCTGCCTCGAA
TTGGGCCTTGAGAAAGTCAAGCTCCTTGTCAAGGTCATTGATAGCCTGATTGTATGCTTG
CATAGGAGAAGACTGGCTTGTGGTGTGAATCCTGACTATGATTTTGTACTTGAGAGGATG
AGGCAGTTGGTATCCTGCAAACAACACATTCTCGTCCCGGTGAAGCTGCATGCGGACGAT
GTTGCCAATGGTGTGGTCTTCTCTCTCAATCGTGAAGGAAGCAGCGTTAATGATCTTCGT
GTCCCTCTCGTACGAAACCTTCTTGGTGCCTTCTGGGACGACGAATCGTTCGTATCTGTC
GGGAGCATTCATGGCCGATCGTAAATTCTCGCTTAGGTATCACTCTCTCAGAGACTGTCG
CAGACGAACACCGAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN29JQ U 279
AF RR4C432TF C 96
AF RR4FN29TF C 1
AF RR4C432JQ U 96
BS 1 95 RR4FN29TF
BS 96 572 RR4C432JQ
BS 573 573 RR4FN29TF
BS 574 679 RR4C432JQ

RD RR4FN29JQ 198 0 0
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TGATAGCCTGATTGTATGCTTGCATAGGAAAAAACTGGCTTGTGGTGTGAATCCTGACTA
TGATTTTGTACTTGAGAGGATGAGGCAGTTGGTATCCTGCAAACAACACATTCTCGTCCC
GGTGAAGCTGCATGCGGA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR4C432TF 349 0 0
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GTCTTCTAGTTGGTGCATAGATAAGGAAAAAACACTGAGCTCCTCCTTAGTACGGATTCG
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CATTGATAGCCTGATTGTATGCTTGCATAGGAGAAGACTGGCTTGTGGTGTGAATCCTGA
CTATGATTTTGTACTTGAGAGGATGAGGCAGTTGGTATCCTGCAAACAA

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR4FN29TF 636 0 0
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GTAGTATCTTCAAGGTGACCATCAATACAATACTTGATCCATTAAAAGGTTT*CCTAAAG
AAAATGATAAACATTAAAGGAAATCCAAGCGTGACTGGTGTCCAAAGCACAAAGAGTTAA
AACAACAGACCACGAAAACTAAGCTGATTACAAAAGTCTTCTAGTTGGTGCATAGATAAG
GAAAAA*CACTGAGCTCCTCCTTAGTACGGATTCGAGAACTTGGCAACCTCTGCCTCGAA
TTGGGCCTTGAGAAAGTCAAGCTCCTTGTCAAGGTCATTGATAGCCTGATTGTATGCTTG
CATAGGAGAAGACTGGCTTGTGGTGTGAATCCTGACTATGATTTTGTACTTGAGAGGATG
AGGCAGTTGGTATCCTGCAAACAACACATTCTCGTCCCGGTGAAGCTGCATGCGGACGAT
GTTGCCAATGGTGTGGTCTTCTCTCTCAATCGTGAAGGAAGCAGCGTTAATGATCTTCGT
GTCCCTCTCGTACGAAACCTTCTTGGTGCCTTCTGGGACGACGAATCGTTCGTATCTGTC
GGGAGCATTCATGGCCGATCGTAAATTCTCGCTT
CC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4C432JQ 584 0 0
GATCCATTAAAAGGTTTTCCTAAAGAAAATGATAAACATTAAAGGAAATCCAAGCGTGAC
TGGTGTCCAAAGCACAAAGAGTTAAAACAACAGACCACGAAAACTAAGCTGATTACAAAA
GTCTTCTAGTTGGTGCATAGATAAGGAAAAA*CACTGAGCTCCTCCTTAGTACGGATTCG
AGAACTTGGCAACCTCTGCCTCGAATTGGGCCTTGAGAAAGTCAAGCTCCTTGTCAAGGT
CATTGATAGCCTGATTGTATGCTTGCATAGGAGAAGACTGGCTTGTGGTGTGAATCCTGA
CTATGATTTTGTACTTGAGAGGATGAGGCAGTTGGTATCCTGCAAACAACACATTCTCGT
CCCGGTGAAGCTGCATGCGGACGATGTTGCCAATGGTGTGGTCTTCTCTCTCAATCGTGA
AGGAAGCAGCGTTAATGATCTTCGTGTCCCTCTCGTACGAAACCTTCTTGGTGCCTT*TG
GGACGACGAATCGTTCGTATCTGTCGGGAGCATTCATGGCCGATCGTAAATTCTCGCTTA
GGTATCACTCTCTCAGAGACTGTCGCAGACGAACACCGAATTCC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 4

CO CL2610Contig1 645 4 2 U
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GAAAGAAGCAAATGGCTGCTTCTTTCACCCAGCCTTTTTTTTGTATACATTCTTATTCAA
GAGGCCTTTTTGTAGAGAGAACAGATTTTGATTTTTTTTGAAAAATACAGATTTAGAGGA
ATTCAAAGCTGCTCCATTTGATCATTCTTAGCTCTTGCTGTGAAACAATCTCTTCTCTTT
GACCATCACCTTTCTCTGCAACTCTCAGTTCCTGATAACTTCTTTGCAGAAGATCAAGAA
TCTCCACCTCTCTTGGGTAAGAAGTTACTATTGGACTCTCTGGGGGGCAACGAGGACCTT
CATCGTACCCTTCACATATAACCTCTCCGCTATCATCCGTGTAGCATATGATCCCTTGTA
CTGGATCTTCATATACAGTGTTCTTGGTGGAGTATCTTATTGGTTGAGGAACTGTGACTT
GCTTGACTTTAACTTGAACGTGACTCTGTTGAAGCATCAAAGTCTTTGATCTTACTGTCT
TTGGAACAAAACATTGTGTTTGAAGAGGTAGACAAAGTTTAGTTGAATATGCCATAGCCT
CTGTGAGTCTGTGTGTGTTTCTTTTTTCAGATGAAACTTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4D039TF C 1
AF RR4D039JQ U 6
AF RR4D533JQ U 6
AF RR4D533TF C 6
BS 1 5 RR4D039TF
BS 6 645 RR4D039JQ

RD RR4D039TF 645 0 0
TTTTTCGGAATCAAAATCCGGACATATATTCATGTTTGTGTTCTTACAAAAGAGATACAA
GAAAGAAGCAAATGGCTGCTTCTTTCACCCAGCCTTTTTTTTGTATACATTCTTATTCAA
GAGGCCTTTTTGTAGAGAGAACAGATTTTGATTTTTTTTGAAAAATACAGATTTAGAGGA
ATTCAAAGCTGCTCCATTTGATCATTCTTAGCTCTTGCTGTGAAACAATCTCTTCTCTTT
GACCATCACCTTTCTCTGCAACTCTCAGTTCCTGATAACTTCTTTGCAGAAGATCAAGAA
TCTCCACCTCTCTTGGGTAAGAAGTTACTATTGGACTCTCTGGGGGGCAACGAGGACCTT
CATCGTACCCTTCACATATAACCTCTCCGCTATCATCCGTGTAGCATATGATCCCTTGTA
CTGGATCTTCATATACAGTGTTCTTGGTGGAGTATCTTATTGGTTGAGGAACTGTGACTT
GCTTGACTTTAACTTGAACGTGACTCTGTTGAAGCATCAAAGTCTTTGATCTTACTGTCT
TTGGAACAAAACATTGTGTTTGAAGAGGTAGACAAAGTTTAGTTGAATATGCCATAGCCT
CTGTGAGTCTGTGTGTGTTTCTTTTTTCAGATGAAACTTTGATCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4D039JQ 640 0 0
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AAGCAAATGGCTGCTTCTTTCACCCAGCCTTTTTTTTGTATACATTCTTATTCAAGAGGC
CTTTTTGTAGAGAGAACAGATTTTGATTTTTTTTGAAAAATACAGATTTAGAGGAATTCA
AAGCTGCTCCATTTGATCATTCTTAGCTCTTGCTGTGAAACAATCTCTTCTCTTTGACCA
TCACCTTTCTCTGCAACTCTCAGTTCCTGATAACTTCTTTGCAGAAGATCAAGAATCTCC
ACCTCTCTTGGGTAAGAAGTTACTATTGGACTCTCTGGGGGGCAACGAGGACCTTCATCG
TACCCTTCACATATAACCTCTCCGCTATCATCCGTGTAGCATATGATCCCTTGTACTGGA
TCTTCATATACAGTGTTCTTGGTGGAGTATCTTATTGGTTGAGGAACTGTGACTTGCTTG
ACTTTAACTTGAACGTGACTCTGTTGAAGCATCAAAGTCTTTGATCTTACTGTCTTTGGA
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AGTCTGTGTGTGTTTCTTTTTTCAGATGAAACTTTGATCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4D533JQ 608 0 0
CGGAATCAAAATCCGGACATATATTCATGTTTGTGTTCTTACAAAAGAGATACAAGAAAG
AAGCAAATGGCTGCTTCTTTCACCCAGCCTTTTTTTTGTATACATTCTTATTCAAGAGGC
CTTTTTGTAGAGAGAACAGATTTTGATTTTTTTTGAAAAATACAGATTTAGAGGAATTCA
AAGCTGCTCCATTTGATCATTCTTAGCTCTTGCTGTGAAACAATCTCTTCTCTTTGACCA
TCACCTTTCTCTGCAACTCTCAGTTCCTGATAACTTCTTTGCAGAAGATCAAGAATCTCC
ACCTCTCTTGGGTAAGAAGTTACTATTGGACTCTCTGGGGGGCAACGAGGACCTTCATCG
TACCCTTCACATATAACCTCTCCGCTATCATCCGTGTAGCATATGATCCCTTGTACTGGA
TCTTCATATACAGTGTTCTTGGTGGAGTATCTTATTGGTTGAGGAACTGTGACTTGCTTG
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AGTCTGTG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4D533TF 640 0 0
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CTTTTTGTAGAGAGAACAGATTTTGATTTTTTTTGAAAAATACAGATTTAGAGGAATTCA
AAGCTGCTCCATTTGATCATTCTTAGCTCTTGCTGTGAAACAATCTCTTCTCTTTGACCA
TCACCTTTCTCTGCAACTCTCAGTTCCTGATAACTTCTTTGCAGAAGATCAAGAATCTCC
ACCTCTCTTGGGTAAGAAGTTACTATTGGACTCTCTGGGGGGCAACGAGGACCTTCATCG
TACCCTTCACATATAACCTCTCCGCTATCATCCGTGTAGCATATGATCCCTTGTACTGGA
TCTTCATATACAGTGTTCTTGGTGGAGTATCTTATTGGTTGAGGAACTGTGACTTGCTTG
ACTTTAACTTGAACGTGACTCTGTTGAAGCATCAAAGTCTTTGATCTTACTGTCTTTGGA
ACAAAACATTGTGTTTGAAGAGGTAGACAAAGTTTAGTTGAATATGCCATAGCCTCTGTG
AGTCTGTGTGTGTTTCTTTTTTCAGATGAAACTTTGATCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 4

CO CL2611Contig1 945 4 9 U
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TGTGGGGATGTCTTCAGCGCAAGATCCATTCTACATTGTTAAAGAAGAGATCCAAGATTC
TATTGATAAGTTGCAATCTACATTCCACAAATGGGAGCGTGTCTCTCCAGGAATGGGGGA
TTAAGTCCACGTCACCAAGGAGCTTCTTGCTAATTGTGGCAGCATTGAGTGGCAGGTAGA
TGAGCTGGAAAAAGCGGTGGCCGTTGCAGCTAAAGATCCTGCCTTGTATGGTATCGATGA
AGCTGAGCTTGAAAGACGCAGGAGATGGACTAGTAATGCTAGGACACAGGTGCGGAATGT
GAAGACTGGTGTGCTAGCTGGTAAGGGTAGTGCTGGAGCTGCTAATGCAATTGAAGTGCG
TCGAGAGCTAATGAGAATGCCAAACTCGAATGAAGCAAGTAGATACGATCAGTACGGAGG
AGGAAGAGAGGATGACGGTTTTGTACAGTCAGAATCAGATAGGCAAATGCTATTGATAAA
GCAACAAGACGAAGAATTGGATGAGCTGAGTAAAAGTGTAGAGAGGATTGGAGGAGTGGG
GCTTACTATACATGATGAACTCGTTGCACAGGAGAGGATAATAGATGAACTGGGAACGGA
GATGGACAGTACAAAGAACAGGCTAGACTTTGTACAGAAGAAAGTGGGG*ATGGTGATGA
AGAAAGCAGGGGCGAAAGGGCAGATGATGATGATATGTTTCTTGCTCGTCCTGTTCATTA
TCCTTTTCGTTCTCGTCTTCTTGACCTAAAACACCGGCGGAGTTATATCTTATAGAGATT
GGTCTTTTGATGTTAGTTTATATGATGTTTGTGGTGAAACAGAAAAGAACATCAAAAATT
ATGTTTGATTTTTTTGTTGAAGTCTATTGTATTGTATCTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE96TF U 1
AF RR4BX63TF U 118
AF RR4BX63JQ C 160
AF RR4DE96JQ C 287
BS 1 181 RR4DE96TF
BS 182 182 RR4BX63TF
BS 183 257 RR4DE96TF
BS 258 258 RR4BX63TF
BS 259 493 RR4DE96TF
BS 494 709 RR4BX63TF
BS 710 710 RR4BX63JQ
BS 711 815 RR4BX63TF
BS 816 945 RR4BX63JQ

RD RR4DE96TF 493 0 0
GGCCGATCAGCACCGCCTCTCGTTTCGATTGATCTCCTCCCTAACAGGTAGCGCAAACTT
TGTGGGGATGTCTTCAGCGCAAGATCCATTCTACATTGTTAAAGAAGAGATCCAAGATTC
TATTGATAAGTTGCAATCTACATTCCACAAATGGGAGCGTGTCTCTCCAGGAATGGGGGA
TCAAGTCCACGTCACCAAGGAGCTTCTTGCTAATTGTGGCAGCATTGAGTGGCAGGTAGA
TGAGCTGGAAAAAGCGGGGGCCGTTGCAGCTAAAGATCCTGCCTTGTATGGTATCGATGA
AGCTGAGCTTGAAAGACGCAGGAGATGGACTAGTAATGCTAGGACACAGGTGCGGAATGT
GAAGACTGGTGTGCTAGCTGGTAAGGGTAGTGCTGGAGCTGCTAATGCAATTGAAGTGCG
TCGAGAGCTAATGAGAATGCCAAACTCGAATGAAGCAAGTAGATACGATCAGTACGGAGG
AGGAAGAGAGGAT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4BX63TF 698 0 0
G
TCTATTGATAAGTTGCAATCTACATTCCACAAATGGGAGCGTGTCTCTCCAGGAATGGGG
GATTAAGTCCACGTCACCAAGGAGCTTCTTGCTAATTGTGGCAGCATTGAGTGGCAGGTA
GATGAGCTGGAAAAAGCGGTGGCCGTTGCAGCTAAAGATCCTGCCTTGTATGGTATCGAT
GAAGCTGAGCTTGAAAGACGCAGGAGATGGACTAGTAATGCTAGGACACAGGTGCGGAAT
GTGAAGACTGGTGTGCTAGCTGGTAAGGGTAGTGCTGGAGCTGCTAATGCAATTGAAGTG
CGTCGAGAGCTAATGAGAATGCCAAACTCGAATGAAGCAAGTAGATACGATCAGTACGGA
GGAGGAAGAGAGGATGACGGTTTTGTACAGTCAGAATCAGATAGGCAAATGCTATTGATA
AAGCAACAAGACGAAGAATTGGATGAGCTGAGTAAAAGTGTAGAGAGGATTGGAGGAGTG
GGGCTTACTATACATGATGAACTCGTTGCACAGGAGAGGATAATAGATGAACTGGGAACG
GAGATGGACAGTACAAAGAACAGGCTAGACTTTGTACAGAAGAAAGTGGGGGATGGTGAT
GAAGAAAGCAGGGGCGAAAGGGCAGATGATGATGATATGTTTCTTGCTCGTCCTGTTCAT
TATCCTTTTCGTTCTCGTCTTCTTGACCTAAAACACC

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4BX63JQ 786 0 0
TGTCTCTCCAGGAATGGGGGATTAAGTCCACGTCACCAAGGAGCT*CTTGCTAATTGTGG
CAGCATTGAGTGGCAGGTAGATGAGCTGGAAAAAGCGGTGGCCGTTGCAGCTAAAGATCC
TGCCTTGTATGGTATCGATGAAGCTGAGCTTGAAAGACGCAGGAGATGGACTAGTAATGC
TAGGACACAGGTGCGGAATGTGAAGACTGGTGTGCTAGCTGGTAAGGGTAGTGCTGGAGC
TGCTAATGCAATTGAAGTGCGTCGAGAGCTAATGAGAATGCCAAACTCGAATGAAGCAAG
TAGATACGATCAGTACGGAGGAGGAAGAGAGGATGACGGTTTTGTACAGTCAGAATCAGA
TAGGCAAATGCTATTGATAAAGCAACAAGACGAAGAATTGGATGAGCTGAGTAAAAGTGT
AGAGAGGATTGGAGGAGTGGGGCTTACTATACATGATGAACTCGTTGCACAGGAGAGGAT
AATAGATGAACTGGGAACGGAGATGGACAGTACAAAGAACAGGCTAGACTTTGTACAGAA
GAAAGTGGGG*ATGGTGATGAAGAAAGCAGGGGCGAAAGGGCAGATGATGATGATATGTT
TCTTGCTCGTCCTGTTCATTATCCTTTTCGTTCTCGTCTTCTTGACCTAAAACACCGGCG
GAGTTATATCTTATAGAGATTGGTCTTTTGATGTTAGTTTATATGATGTTTGTGGTGAAA
CAGAAAAGAACATCAAAAATTATGTTTGATTTTTTTGTTGAAGTCTATTGTATTGTATCT
TTCTTT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4DE96JQ 652 0 0
TATGGTATCGATGAAGCTGAGCTTGAAAGACGCAGGAGATGGACTAGTAATGCTAGGACA
CAGGTGCGGAATGTGAAGACTGGTGTGCTAGCTGGTAAGGGTAGTGCTGGAGCTGCTAAT
GCAATTGAAGTGCGTCGAGAGCTAATGAGAATGCCAAACTCGAATGAAGCAAGTAGATAC
GATCAGTACGGAGGAGGAAGAGAGGATGACGGTTTTGTACAGTCAGAATCAGATAGGCAA
ATGCTATTGATAAAGCAACAAGTCGAAGAATTGGATGAGCTGAGTAAAAGTGTAGAGAGG
ATTGGAGGAGTGGGGCTTACTATACATGATGAACTCGTTGCACAGGAGAGGATAATAGAT
GAACTGGGAACGGAGATGGACAGTATAAAGAACAGGCTAGACTTTGTACAGAAGAAAGTG
GGG*ATGGTGATGAAGAAAGCAGGGGCGAAAGGGCAGATGATGATGGTATGTTTCTTGCT
CGTCCTGTTCATTATCCTTTTCGTTCTCGTCTTCTTGACCTAAAACACCGGCGGAGTTAT
ATCTTATAGAGATTGGTCTTTTGATGTTAGTTTATATGATGTTTGTGGTGAAACAGAAAA
GAACATCAAAAATTATGTTTGATTTTTTTGTTGAAGTCTATTGTATTGTA
CC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL2612Contig1 704 2 4 U
AGATTGACGGTGTGTACAGAGTTGGAAGCATACAGAGCCAACCCACTGGTGGAGGAATCT
ACCTCGACACATCTGTTATGCAAACAGATTACAGAACCTTTATTGAGATTGTGTTCGAAA
ACGCTGAATCTATTGTCCAGAGCTGGCATCTTGATGGTTACTCTTTCTGGGTTGTTGGAA
TGGACGGTGGGCAATGGACTCCTGACAGTAGGAACGAGTACAACCTACGTGATGCAGTAG
CTCGCTGCACCGTTCAGGTGTATCCCAGTTCGTGGACGGCTATATACATTGCACTGGACA
ATGTAGGGATGTGGAATCTAAGGTCCGAGTTTTGGGCAAGGCAATACTTAGGACAACAGT
TCTATATGCGTGTCTACACAACTTCGACTTCGCTCAGGGACGAGTACCCAATCCCAATAA
ACGCTCTTCGATGCGGTAGAGCTAGCGGTCGTCGCACCAGACCGCTTTGAGCGGTGGAGA
GATAAAAGAGAGATGGTCAACTAAACCAGCTGATTCGTTCTCGACAACGAGTGTTTTCTT
GTTTTATTCATTCTTCATTATGCTAATGATGGAAGTGTTATGGGCCGAATCATTATATCA
GTTTGTAACGATCTCAGCTCGAGGTCTCAATTCTTATTCTTTCTTTTTATTAAAAAAAAA
CTCCAGAGAGGAACTTTATTTGATAATATTTACATAGTTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G822TF U 1
AF RR4G822JQ C 138
BS 1 659 RR4G822TF
BS 660 660 RR4G822JQ
BS 661 697 RR4G822TF
BS 698 704 RR4G822JQ

RD RR4G822TF 697 0 0
AGATTGACGGTGTGTACAGAGTTGGAAGCATACAGAGCCAACCCACTGGTGGAGGAATCT
ACCTCGACACATCTGTTATGCAAACAGATTACAGAACCTTTATTGAGATTGTGTTCGAAA
ACGCTGAATCTATTGTCCAGAGCTGGCATCTTGATGGTTACTCTTTCTGGGTTGTTGGAA
TGGACGGTGGGCAATGGACTCCTGACAGTAGGAACGAGTACAACCTACGTGATGCAGTAG
CTCGCTGCACCGTTCAGGTGTATCCCAGTTCGTGGACGGCTATATACATTGCACTGGACA
ATGTAGGGATGTGGAATCTAAGGTCCGAGTTTTGGGCAAGGCAATACTTAGGACAACAGT
TCTATATGCGTGTCTACACAACTTCGACTTCGCTCAGGGACGAGTACCCAATCCCAATAA
ACGCTCTTCGATGCGGTAGAGCTAGCGGTCGTCGCACCAGACCGCTTTGAGCGGTGGAGA
GATAAAAGAGAGATGGTCAACTAAACCAGCTGATTCGTTCTCGACAACGAGTGTTTTCTT
GTTTTATTCATTCTTCATTATGCTAATGATGGAAGTGTTATGGGCCGAATCATTATATCA
GTTTGTAACGATCTCAGCTCGAGGTCTCAATTCTTATTCTTTCTTTTTATTAAAAAAAA*
CTCCAGAGAGGAACTTTATTTGATAATATTTACATAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4G822JQ 567 0 0
CAGAGCTGGCATCTTGATGGTTACTCTTTCTGGGTTGTTGGAATGGACGGTGGGCAATGG
ACTCCTGACAGTAGGAACGAGTACAACCTACGTGATGCAGTAGCTCGCTGCACCGTTCAG
GTGTATCCCAGTTCGTGGACGGCTATATACATTGCACTGGACAATGTAGGGATGTGGAAT
TTAAGGTCCGAGTTTTGGGCAAGGCAATACTTAGGACAACAGTTCTATATGCGTGTCTAC
ACAACTTCGACTTCGCTCAGGGACGAGTACCCAATCCCAATAAACGCTTTTCGATGCGGT
AGAGCTAGCGGTCGTCGCACCAGACCGCTTTGAGCGGTGGAGAGATAAAAGAGAGATGGT
CAACTAAACCAGCTGATTCGTTCTCGACAACGAGTGTTTTCTTGTTTTATTCATTCTTCA
TTATGCTAATGATGGAAGTGTTATGGGCCGAATCATTATATCAGTTTGTAACGATCTCAG
CTCGAGGTCTCAATTCTTATTCTTTCTTTTTATTAAAAAAAAACTCCAGAGAGGAACTTT
ATTTGATAATATTTACATAGTTCTACC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 4

CO CL2613Contig1 986 4 6 U
GGCTTTCGACTCAGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAA
TGGCCCCGAAGAAAGGAGTGAAGTTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACC
CTCTGTTTGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTCGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGG
ATCTGACTCGCTACATCAAATAGCCCAAGTCAATCCGCCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCC
TTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCCCCGGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGA
ACCTTGCCACCCAGCTCTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCACCA
AGAAGGATCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGTAAGCCTTCTGAATCCA
AGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACA
AGGCCCAGCTTGTCGTCATTGCCCACGATGTTGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGC
CTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTG
GAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGG
ACAGGCTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAAGGCAACCTTCAACGACAAGTACG
AGGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGCATCATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGACAA
AGGCCAAGGAAAGGGTTCTTGCAAAAGAGGCTGCCCAAAGGATGAACTAAGAAGCATATC
TTTTCTTATTGTCTGTCATTTGCTGAGATTGTCGTAAAACTTGATAGACCTTCTTTTGTT
TAGCTGTTGGCATTCTTGTTTTCTTTTTTAATGGATGTTTTGAGCACTTTCTTCCATCTT
CTTGAAGCTTAATCATCTTTCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CI27TF U 5
AF RR4F410TF U 1
AF RR4CI27JQ C 246
AF RR4F410JQ C 368
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BS 700 714 RR4F410TF
BS 715 986 RR4CI27JQ

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GCG
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GAAGAAAGGAGTGAAGTTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTGTT
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TCGCTACATCAAATAGCCCAAGTCAATCCGCCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCCCCGGCTTTGAACCAGTTCACCA

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DS 

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TGGCCCCGAAGAAAGGAGTGAAGTTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACC
CTCTGTTTGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTCGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGG
ATCTGACTCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGCCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCC
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ACCTTGCCACCCAGCTCTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCACCA
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AGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACA
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GAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGG
ACAGGCTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAAG*CAACCTTCAACGACA
GTACGAGAGTA

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DS 

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GCCACCCAGCTCTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCACCAAGAAG
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CCCATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCC
CAGCTTGTCGTCATTGCCCACGATGTTTACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCT
CTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACG
GTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAG
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AAGGAAAGGGTTCTTGCAAAAGAGGCTGCCCAAAGGATGAACTAAGAAGCATATCTTTTC
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AGCTTAATCATCTTTCAGCCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4F410JQ 619 0 0
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CATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCA
GCTTGTCGTCATTGCCCACGATGTTGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
CGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAGGCT
AGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAAGGCAACCTTCAACGACAAGTACGAGGAGTA
CAGGAAGAAATGGGGAGGAGGCATCATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGACAAAGGCCAA
GGAAAGGGTTCTTGCAAAAGAGGCTGCCCAAAGGATGAACTAAGAAGCATATCTTTTCTT
ATTGTCTGTCATTTGCTGAGATTGTCGTAAAACTTGATAGACCTTCTTTTGTTTAGCTGT
TGGCATTCTTGTTTTCTTTTTTAATGGATGTTTTGAGCACTTTCTTCCATCTTCTTGAAG
CTTAATCATCTTTCAGCCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 3

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CTGTTATATGGAATAATAAACTAAAAGCTGATAACAATGCTTGAAAACCTGTGTTCGACA
AAATAAAATCCCAACACATAAACTTCAACAAAATTCATAAATCCAAATTCATCGAACAAC
GAAAATGATTTTCTTAGTTGAAAGGTCGAACTTCAAACAAAATCATTATGAAAAGATCAA
CTCTCATCCATTGCGTCGTTTGATTGCGTTGCAACCGAGTCCTCAAGTGCCTCAAGGAAT
GAGACAACTGTGAACTTATATTTACTTGGGTCAATACCGAACTGAGTCAAATCTATCTGT
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AACTCCAGTATATATTCATCCCTATAGTGACCCTCAGGTAAATGGGAAGACAATCGTTCT
TGTACCGGTAACATCTCAAGCAATGGCATAATCAACTCAGGCTTCAGGATATCCCCTAAT
ACTAGGCCTTCCTCTTCATCTCCAGGGATACCTACAGGACCAGAAGAGAGGTTGTTCAGA
ATTCTTTGCAAGTCTGCCAGCTTAACTGGTCCAGACGAAGATGACACATCACTCACCTCT
GTAGACACATTTGGTACAACCAAGTTTCCAGCTCTGGATGAAACATCGTCTTCTGCCATG
TCTTCCACATCCTCCGGCACAGCAACTGCATCTCCTTCACCAAACTCTAGTGGTTGATTA
GGGTACTGATTGACCGCAGAACATATATCTGCATCACCTTCAGCTCTCGGCTCCTGTATC
CATAAGAATAGCTTGCGGTCATCACTGTTGAACTTCAGAATGTACACCCTGTCTGATGAT
TGATTAACCTTTTCAAATAGAGCTTCATCAGGGAAAACGATTTGATCATCTTCCACTGCA
TTCTGGGTTCGATCAAGCCACTGGAAATGAACCAGTCCCTCCTCACCTCTAGCAATGCGG
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CGAAACTCAAGCATGATTTCCTGCATCACGGAGAAAGCTTCACTTGAACTCATATCACCA
CCGACTCTCTTTCTTCTTATCACGAGAAACTTCGCTAGGAATTTGATTTAGCTGAAAACC
TCTCTCGTTTTTTCTTTCGATTTGCTTCGTCTCTCTTGGGTTTTTAACCTTTCTTTTATC
TTAGGGTGTTCCTCGGATTCCTTCCTTCTTGTTTGTTTACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK86JQ U 17
AF RR4A750JQ U 1
AF RR4A750TF C 515
BS 1 428 RR4A750JQ
BS 429 429 RR4DK86JQ
BS 430 434 RR4A750JQ
BS 435 435 RR4DK86JQ
BS 436 867 RR4A750JQ
BS 868 1242 RR4A750TF

RD RR4DK86JQ 557 0 0
CT
AACTAAAAGCTGATAACAATGCTTGAAAACCTGTGTTTGACAAAATAAAATCCCAACACA
TAAACTTCAACAAAATTCATAAATCCAAATTCATCGAACAACGAAAATGATTTTCTTAGT
TGACAGGTCGAACTTCAAACAAAATCATTATGAAAAGATCAACTCTCATCCATTGCGTCG
TTTGATTGCGTTGCAACCGAGTCCTCAAGTGCCTCAAGGAATGAGACAACTGTGAACTTA
TATTTACTTGGGTCAATACCGAACTGAGTCAAATCTATCTGTCCTGTGCGAAGTACATAG
GTAAATGCATCTACTTGCTGACGAAAAGGAGGGCTCTGTAACAACTCCAGTATATCTTCA
TCCCTATAGTGACCCTCAGGTAAATGGGAAGACAATCGTTCTTGTACCGGTAACATCTCA
AGCAATGGCATAATCAACTCAGGCTTCAGGATATCCCCTAATACTAGGCCTTCCTCTTCA
TCTCCAGGGATACCTACAGGACCAGAAAAGAGGTTGTTCAAAATTCTTTGCAAGTCTGCC
AGCTTAACTGGTCCA

QA 3 557 3 557
DS 

RD RR4A750JQ 867 0 0
CTGTTATATGGAATAATAAACTAAAAGCTGATAACAATGCTTGAAAACCTGTGTTCGACA
AAATAAAATCCCAACACATAAACTTCAACAAAATTCATAAATCCAAATTCATCGAACAAC
GAAAATGATTTTCTTAGTTGAAAGGTCGAACTTCAAACAAAATCATTATGAAAAGATCAA
CTCTCATCCATTGCGTCGTTTGATTGCGTTGCAACCGAGTCCTCAAGTGCCTCAAGGAAT
GAGACAACTGTGAACTTATATTTACTTGGGTCAATACCGAACTGAGTCAAATCTATCTGT
CCTGTGCGAAGTACATAGGTAAATGCATCTACTTGCTGACGAAAAGGAGGGCTCTGTAAC
AACTCCAGTATATATTCATCCCTATAGTGACCCTCAGGTAAATGGGAAGACAATCGTTCT
TGTACCGG*AACATTTCAAGCAATGGCATAATCAACTCAGGCTTCAGGATATCCCCTAAT
ACTAGGCCTTCCTCTTCATCTCCAGGGATACCTACAGGACCAGAAGAGAGGTTGTTCAGA
ATTCTTTGCAAGTCTGCCAGCTTAACTGGTCCAGACGAAGATGACACATCACTCACCTCT
GTAGACACATTTGGTACAACCAAGTTTCCAGCTCTGGATGAAACATCGTCTTCTGCCATG
TCTTCCACATCCTCCGGCACAGCAACTGCATCTCCTTCACCAAACTCTAGTGGTTGATTA
GGGTACTGATTGACCGCAGAACATATATCTGCATCACCTTCAGCTCTCGGCTCCTGTATC
CATAAGAATAGCTTGCGGTCATCACTGTTGAACTTCAGAATGTACACCCTGTCTGATGAT
TGATTAACCTTTTCAAATAGAGCTTCA

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR4A750TF 728 0 0
CAGGACCAGAAGAGAGGTTGTTCAGAATTCTTTGCAAGTCTGCCAGCTTAACTGGTCCAG
ACGAAGATGACACATCACTCACCTCTGTAGACACATTTGGTACAACCAAGTTTCCAGCTC
TGGATGAAACATCGTCTTCTGCCATGTCTTCCACATCCTCCGGCACAGCAACTGCATCTC
CTTCACCAAACTCTAGTGGTTGATTAGGGTACTGATTGACCGCAGAACATATATCTGCAT
CACCTTCAGCTCTCGGCTCCTGTATCCATAAGAATAGCTTGCGGTCATCACTGTTGAACT
TCAGAATGTACACCCTGTCTGATGATTGATTAACCTTTTCAAATAGAGCTTCATCAGGGA
AAACGATTTGATCATCTTCCACTGCATTCTGGGTTCGATCAAGCCACTGGAAATGAACCA
GTCCCTCCTCACCTCTAGCAATGCGGACAAGTCCTTTTCGTGCATCAGGGACAACTCTTG
TTCCCTGCAAAGACATCTTACCAGCACGAAACTCAAGCATGATTTCCTGCATCACGGAGA
AAGCTTCACTTGAACTCATATCACCACCGACTCTCTTTCTTCTTATCACGAGAAACTTCG
CTAGGAATTTGATTTAGCTGAAAACCTCTCTCGTTTTTTCTTTCGATTTGCTTCGTCTCT
CTTGGGTTTTTAACCTTTCTTTTATCTTAGGGTGTTCCTCGGATTCCTTCCTTCTTGTTT
GTTTACCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 4

CO CL2615Contig1 857 4 15 U
CCATTTAAAACATTATTCGTTTGTTGAATCTTCATTGATAATATAAGCTACAAAATCCAG
CAACCAAGTCACAGCAACGCAATTCTTGCTACTTTCAAATATGTCTGAAATAAAAGTAAA
AGGGCAAGTGTAATAGACACCATAGAAGCAGCTGCGAGAGCTCAGAAGATTCTTTGTGGT
GGTCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAAAAGA
GAGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGAACATTCTGAAAGATGTGCTTCTCCTCCATGGAG
AGGTTACCAACAGCAACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCC
TTAGTTTCATTCACCTTCCCCTCCAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTG
CCTGCCTTGTTGAGTCCAGGACCGAGAAGACGAGGGATCTGCTTGATGACGGATTCAGAG
GCCAAGAAGGCGTGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGT
TTTTTCAGAGACTCCACGTCCATAGAGTCTAGCCCCATTTTCTCAGCCTCCTCGACGTGC
TGGGCGTCTCCGAGCACGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGGAATGTGGGGTAACTTGACG
GAACCACTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTTCAGACCAATCTGGAGCTCG
AGAGTCTCAACAAAGTTGCGTTTCTTCTCTTCTGATTTTCCTCGGATTACAGTTATGGCT
TCTTTAACAGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCTGATCC
TGGATGATGAGACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G888JQ U 1
AF RR4CN12JQ U 18
AF RR4G888TF C 60
AF RR4CN12TF C 91
BS 1 135 RR4G888JQ
BS 136 136 RR4CN12JQ
BS 137 144 RR4G888JQ
BS 145 145 RR4CN12JQ
BS 146 164 RR4G888JQ
BS 165 165 RR4CN12JQ
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BS 169 278 RR4G888JQ
BS 279 279 RR4CN12JQ
BS 280 314 RR4G888JQ
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BS 316 445 RR4G888JQ
BS 446 850 RR4CN12JQ
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RD RR4G888JQ 448 0 0
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AGGGCAAGTGTAATAAACACCATAAAAGCAGCTGCGAGAGCTCAAAAAATTCTTTGTGGT
GGTCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAAAAGA
GAGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGAACATTCTGAAA*ATGTGCTTCTCCTCCATGGAG
AGGTTACCAACAGCGACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCC
TTAGTTTCATTCACCTTCCCCTCCAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTG
CCTGCCTTGTTGAGTCCAGGACCGA
AAA

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR4CN12JQ 833 0 0
A
GTTTGTTGAATCTTCATTGATAATATAAGCTACAAAATCCAGCAACCAAGTCACAGCAAC
ACAATTCTTGCTACTTTCAAATATGTCTGAAATAAAAGTAAAAGGGCAAGTGTAATAGCC
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AGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAAAAGAGAGACGAGGAAGTTGACA
CTCATCTGAACATTCTGAAAGATGTGCTTCTCCTCCATGGAGAGGTTACCAACAGCAACA
CCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCCTTAGTTTCATTCACCTTC
CCCTCCAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTGCCTGCCTTGTTGAGTCCA
GGACCGAGAAGACGAGGGATCTGCTTGATGACGGATTCAGAGGCCAAGAAGGCGTGGTAC
TTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGTTTTTTCAGAGACTCCACG
TCCATAGAGTCTAGCCCCATTTTCTCAGCCTCCTCGACGTGCTGGGCGTCTCCGAGCACG
CAGATCTTCATCTTGGGACGGGGAATGTGGGGTAACTTGACGGAACCACTGAAACGCTTG
TCCTTTTGAGGGTCATAATTTTTCAGACCAATCTGGAGCTCGAGAGTCTCAACAAAGTTG
CGTTTCTTCTCTTCTGATTTTCCTCGGATTACAGTTATGGCTTCTTTAACAGCCTCACTC
TGAAGCTTACTCATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCTGATCCTGGATGATGA

QA 2 833 2 833
DS 

RD RR4G888TF 798 0 0
AGC
ACCAAGTCACAGCAACGCAATTCTTGCTACTTTCAAATATGTCTGAAATAAAAGTAAAAG
GGCAAGTGTAATAGACACCATAGAAGCAGCTGCGAGAGCTCAGAAGATTCTTTGTGGTGG
TCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAAAAGAGA
GACGAGGAAGTTGACACTCATCTGAACATTCTGAA*GATGTGCTTCTCCTCCATGGAGAG
GTTACCAACAGCGACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCCTT
AGTTTCATTCACCTTCCCCTCCAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTGCC
TGCCTTGTTGAGTCCAGGACCGAGAAGACGAGGGATCTGCTTGATGACGGATTCAGAGGC
CAAGAAGGCGTGGCACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGTTT
TTTCAGAGACTCCACGTCCATAGAGTCTAGCCCCATTTTCTCAGCCTCCTCGACGTGCTG
GGCGTCTCCGAGCATGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGGAATGTGGGGTAACTTGACGGA
ACCACTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTTCAGACCAATCTGGGGCTCGAG
AGTCTCAACAAAGTTGCGTCTCTTCTCTTCTGATTTTCCTCGGATTACAGTTATGGCTTC
TTTAACAGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCTGATCCTG
GATGATGA
GACGGCC

QA 4 791 4 791
DS 

RD RR4CN12TF 767 0 0
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GCTGCGAGAGCTCAGAAGATTCTTTGTGGTGGTCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACAC
CTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAAAAGAGAGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGAACA
TTCTGAAAGATGTGCTTCTCCTCCATGGAGAGGTTACCAACAGCAACACCCATACACAGA
ACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCCTTAGTTTCATTCACCTTCCCCTCCAGCGAT
TCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTGCCTGCCTTGTTGAGTCCAGGACCGAGAAGA
CGAGGGATCTGCTTGATGACGGATTCAGAGGCCAAGAAGGCGTGGTACTTCTTGGCAAGC
TTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGTTTTTTCAGAGACTCCACGTCCATAGAGTCT
AGCCCCATTTTCTCAGCCTCCTCGACGTGCTGGGCGTCTCCGAGCACGCAGATCTTCATC
TTGGGACGGGGAATGTGGGGTAACTTGACGGAACCACTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGG
TCATAATTTTTCAGACCAATCTGGAGCTCGAGAGTCTCAACAAAGTTGCGTTTCTTCTCT
TCTGATTTTCCTCGGATTACAGTTATGGCTTCTTTAACAGCCTCACTCTGAAGCTTACTC
ATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCTGATCCTGGATGATGAGACGGCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 4

CO CL2616Contig1 914 4 4 U
GGATTTACAACACATCAAATAAACAATAAACAAAGAAATCTCTTAACAACTTCTCCACGT
TCTCCCCACCGCCCCCGGAGAAACAAAAACCACCACCACCATGACCTCCAAAGACTGTGG
CTCCCACACTCACTCTCGCCGGAAACTAATCCGGCGAATAATATGGTCAGTAATCTTCGT
CCTCTTCATCATCTTACTCACAATCCTCCTCATTTGGGCAATCCTCCAGCCTTCAAAGCC
ACGTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAA
CCTCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTCTCTTCACGGAACCCTAACGACAAGATCGG
CATCTACTACGACCGTCTTGACGTCTACGCTACTTACCATAGCCAACAGATCACTTCCCG
AACATCGATCCCTCCTACGTATCAGGGACACAAAGAAGTCAACATATGGTCGCCGTTTGT
CTACGGCACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGCCGTCAGTCTTGGCGGCGATCAAGA
TAACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGTGACGGTAAAGTGAGGTGGAAAGTTGGGGC
GTTTATTACAGGGAAGTATCATCTTTACGTGAGGTGTCTTGCGTATATTAACTTCGGTAA
TAAAGCTGCCGGAGTTATTGTCGGAGATAACGCCGTTAAGTATACGCTTACGAGTAGCTG
TAGTGTTAGTGTCTAAAACGGCGACGGAGCGAAATTAGGTGAGCTAATTAACGACTCCAT
TATATATTATAGTCTTCTTAATTATCATAAGTGATGTGAATTGTACATTTTGCTTATACG
ATGGCAAATATTACAGATCCCCAATGTTGTGATGAGTTGTAAGAATTTAAATACGAATAC
TTTTTAAATAATAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G235TF U 1
AF RR4AL02TF U 1
AF RR4AL02JQ C 186
AF RR4G235JQ C 236
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BS 106 106 RR4G235TF
BS 107 754 RR4AL02TF
BS 755 914 RR4AL02JQ

RD RR4G235TF 516 0 0
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AACATCGATCCCTCCTACGTATCAGGGACACAATGAAGTCAACATATGGTCGCCGTTTGT
CTACGGCACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGC

QA 1 516 1 516
DS 

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TCTCCCCACCGCCCCCGGAGAAACAAAAACCACCACCACCATGACTTCCAAAGACTGTGG
CTCCCACACTCACTCTCGCCGGAAACTAATCCGGCGAATAATATGGTCAGTAATCTTCGT
CCTCTTCATCATCTTACTCACAATCCTCCTCATTTGGGCAATCCTCCAGCCTTCAAAGCC
ACGTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAA
CCTCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTCTCTTCACGGAACCCTAACGACAAGATCGG
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QA 1 754 1 754
DS 

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TCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAACCTCC
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AAATAATAG

QA 1 729 1 729
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ATACGGTGGCAAATATTACAGATCCCCGATGTTGTGATGAGTTGTAAGAATTTAAATACG
AATACTTTT
G

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

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AGTTCCAAATCAAGATAACGTTAAAAGAGTTTTTGAAGATT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DY54JQ C 1
AF RR4DY54TF U 1
AF RR4E984JQ C 21
AF RR4E984TF U 1
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BS 622 641 RR4E984TF

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QA 1 641 1 641
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QA 1 621 1 621
DS 

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QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4E984TF 641 0 0
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CTATCAATTTTCATCCTGAAGACGAGCAGACTCCTGCTGCTGATGCAGATCCTCCTCTTC
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TGCCTGATCCTTCTCCTCCTACTGAACAATCTGATGAACAACAGCCTGATTACAACTGTG
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AGTTCCAAATCAAGATAACGTTAAAAGAGTTTTTGAAGATT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 4

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AATTGCTATATATGAAACTGCTGGTATGCCGCATAATAAAATTGCTATATGTATTGTTTT
TGACC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 

AF RR4DP47JQ C 1
AF RR4DX74JQ C 1
AF RR4DP47TF U 1
AF RR4DX74TF U 1
BS 1 605 RR4DP47TF

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TGACC

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DS 

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TCCTTGTGTGCTGGCTGCTGAGTGAGTCTCCTGGAGCTTTCTTGCCTGATGATATAAGTG
ATACCAGGTTCAATCCGCCGGTGCATTACTGCCACGGGCTGGAGTGGGCGTACGAGGAGA
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TGACC

QA 1 605 1 605
DS 

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TGACC

QA 1 605 1 605
DS 

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TGACC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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TGATTCTAACAACTCAACAATATTCGTTGGGGGAGTTGGCCCTGATGTAACTGAAGAAGA
CCTCAGACAACCATTTACACAATTTGGCGAAGTCGTTTCAGTGAAGATCCCAGTAGGGAA
AGGATGTGGATTTGTCCAACTTTCTAACAGGAAGAGTGCTGATGATGCCATCCAGAGCTT
GAACGGGACAGTCATCGGCAAGAACACTGTCTGGCTCTCTTGGGGAAGAACTCCGAACAA
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CGCTAACAACGACCACGACTCCAACAACTATCCCGCCGAGACTACTTGAAGAGAACAAGA
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AAACTTGTAGTCGAAAAAAGAGAATTTTGTTAGATTTAATTTGGTTTTGATAGACTGAAA
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ATTTCGGCTTTAAAGTTAAAACCTTTATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ76TF U 1
AF RR4AQ76JQ C 54
BS 1 673 RR4AQ76TF
BS 674 812 RR4AQ76JQ

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CGGAGATGAGGAGGAGAGGTCGAGGGCTTTGACTGAGATGAATGGAGCTTTGTGTTGCAA
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TGATTCTAACAACTCAACAATATTCGTTGGGGGAGTTGGCCCTGATGTAACTGAAGAAGA
CCTCAGACAACCATTTACACAATTTGGCGAAGTCGTTTCAGTGAAGATCCCAGTAGGGAA
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GAACGGGACAGTCATCGGCAAGAACACTGTCTGGCTCTCTTGGGGAAGAACTCCGAACAA
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CGCTAACAACGACCACGACTCCAACAACTATCCCGCCGAGACTACTTGAAGAGAACAAGA
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AAACTTGTAGTCG

QA 1 673 1 673
DS 

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CTGATGGTGATTCTAACAACTCAACAATATTCGTTGGGGGAGTTGGCCCTGATGTAACTG
AAGAAGACCTCAGACAACCATTTACACAATTTGGCGAAGTCGTTTCAGTGAAGATCCCAG
TAGGGAAAGGATGTGGATTTGTCCAACTTTTTAACAGGAAGAGTGCTGATGATGCCATCC
AGAGCTTGAACGGGACAGTCATCGGCAAGAACACTGTCTGGCTTTCTTGGGGAAGAACTC
CGAACAAGCAGTGGAGAGGAGACAATGGAGGATATTCACGAGGACAAGGGTACAACAATG
GAGGGTACGCTAACAACGACCACGACTCCAACAACTATCCCGCCGAGACTACTTGAAGAG
AACAAGAGACTCAGAGTGATCATGGATCATAGTGGTTTAAGCCTTCTGTGATTCATCAAT
CAATGCTAAACTTGTAGTCGAAAAAAGAGAATTTTGTTAGATTTAATTTGGTTTTGATAG
ACTGAAAACATGTTGGTTACTGTTGTCTTTGTTTGAAGACTAACATAATGGTTATGCTCG
TTAGATCATTTCGGCTTTAAAGTTAAAACCTTTATTTCG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 4

CO CL2620Contig1 646 4 3 U
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TGCAAGACAGGGAAACCAAATATAAAGAGACCAATGGGAAAGTTGTACAATGCAAGAGTC
AACAACTCACATTAGAATTGTTTATTTAAGAAAAAAAAAGACATAGATTAATTATCTTCT
TTCAACTTAGTATTGTCGCTTGAATCACCACAATGATCAGTCTGTTTGGGTGCTGGGTAC
TTAATGGCATTGAGCTCGAGTTTGCGCAGAGCGGCTTTGCCCAAATCAACCCAACATGCA
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TCTTCCTCTTTCCAATCTGGAAGTCCTCTTTCCACTTCCCCTCTCCATTGGAATATCTCT
GATAACTCTCCCACTTCACCCACCATGGCTAAAAGGAGGTTCCTTGGGCTGTGATACTTC
TCCCAATCTCTAGCCTTTGCAAAATCATCCATCTTCTTACTCAGAGTTTCAAGAGAAACT
TTTTCCTTCTCTTCCCCCATGTCCATTTTACACAGAAACAAAACCCTTAAACACTCACTT
AGATATCTTATAGAAGGAGGAGATATCTAAGATTTATAGAAGAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR51JQ U 1
AF RR4DR51TF C 1
AF RR4C715JQ U 20
AF RR4C715TF C 20
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AGAT
CC

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DS 

RD RR4DR51TF 606 0 0
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AACAACTCACATTAGAATTGTTTATTTAAGAAAAAAAAAGACATAGATTAATTATCTTCT
TTCAACTTAGTATTGTCGCTTGAATCACCACAATGATCAGTCTGTTTGGGTGCTGGGTAC
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TCAGAAAGCCTCACCAGATACAACAACACATCTGATAATTCTTCTCCGAGATGCACTTTA
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AGAT
CC

QA 1 604 1 604
DS 

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C
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DS 

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C
ATAAAAAGTGAACGCTTATGTCAATCAATATCCAATTCAGTGCAAGACAGGGAAACCAAA
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TGAATCACCACAATGATCAGTCTGTTTGGGTGCTGGGTACTTAATGGCATTGAGCTCGAG
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CAACAACACATCTGATAATTCTTCTCCGAGATGCACTTTATCTTCCTCTTTCCAATCTGG
AAGTCCTCTTTCCACTTCCCCTCTCCATTGGAATATCTCTGATAACTCTCCCACTTCACC
CACCATGGCTAAAAGGAGGTTCCTTGGGCTGTGATACTTCTCCCAATCTCTAGCCTTTGC
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QA 2 627 2 627
DS 



AS 1 4

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CTCTTCAGCTTATCTTTTAAAAACCAGTCGCATATTTTTCCAGCATTCAACTCTTCTACT
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H589JQB U 10
AF RR4GY44JQ U 10
AF RR4H589TF C 1
AF RR4GY44TF C 10
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BS 117 154 RR4H589JQB
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AA
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GC

QA 3 544 3 544
DS 

RD RR4GY44JQ 534 0 0
AG
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GCTTGCTTGCCCACTCCTCCCTATAGTCTTGTCTATGTGAGGATTTAACATG

QA 3 534 3 534
DS 

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ACATTATTTGAGCTTGCTTGCCCACTCCTCGCTATAGTCTTGTCTATGTGAGGATTTAAC
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QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4GY44TF 644 0 0
AG
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TGGATGATCATACATACTTTTTGTGTCTTAAAATTTAATGATAAGAAAATATTAAAATGG
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ATCTTTTAAGAACCAGTCGCATATTTTTCCAGCATTCAACTCTTCTACTGAACATCCTTC
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TCTTCTCTCGGGCTTACTTTGATTGTCGGATTCTTCTTCGCCTGCACATGCTCTTACTAA
ACACAATCCCATATTTCTTCTTCTTCCTTGTGTTCTTGTCATGAATGTAACATTATTTGA
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QA 3 644 3 644
DS 



AS 1 3

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ATATGAACTTTTCATTTGCGTTGTAGTGTGAGATCATCAATAAAACTGTGCATTGAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F565TF U 1
AF RR4B148TF U 38
AF RR4B148JQ C 267
BS 1 621 RR4F565TF
BS 622 628 RR4B148TF
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BS 679 679 RR4B148TF
BS 680 685 RR4F565TF
BS 686 780 RR4B148TF

RD RR4F565TF 685 0 0
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ATATACTTGTTGTTGTTGTTCATCTTTGCACAACGAGTTGAATTTGCGGAATCAATCATC
CCTTCTCAAAGGCAGCACTAT*******AAACAATCACTTATGTATTATTAATGCTTTTC
TTCTATATATATTGTGTCCGAAAAA

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DS 

RD RR4B148TF 743 0 0
GG
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AATCCAAATCGTCGAAACCCTAATACATCTACATCAGGCTTTAGTATCCTTGTCGAGTTT
GCTCCCTTGTTTCAACAAAGGTTCATGTCAGATTTTGAAGTTCAAGTCCCCACTGCCTTT
GATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGCAGGAGCTGGAACAAAGGAATAC
GTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGACCACTGTCCAGGGCCTT
AAGAAAGAGTATAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTTAAGAAAGAGTTCTGCTGCAAT
GGCACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGTGATCAGAGG
AAGAACGTCTCTACTTTCCTTTTTCAGGCTGGTCTTGTGAAGAAGGATAACATCAAGATC
CATGGTTTTTGAGCAAACTCTATATACTTGTTGTTGTTGTTCATCTTTGCACAACGAGTT
GAATTTGCGGAATCAATCATCCCTTCTCAAAGGCAGCACTATAAAGTATAAACAATCACT
TATGTATTATTAATGCTTT*CTTCTATATATATTGTGTCAGAAAAAATTAAATGGTTTGC
TTATGAGCGGATATAACAAATATATGAACTTTTCATTTGCGTTGTAGTGTGAGATCATCA
ATAAAACTGTGCATTGAGTGC

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DS 

RD RR4B148JQ 488 0 0
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TGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTATAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTTAAGAAAGA
GTTTTGCTGCAATGGCACTGTTGTCCAGGATTTTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTTCA
AGGTGATCAGAGGAAGAACGTTTTTACTTTCCTTTTTCAGGCTGGTTTTGTGAAGAAGGA
TAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCAAACTTTATATACTTGTTGTTGTTGTTCATCTT
TGCACAACGAGTTGAATTTGGGGAATCAATCATCCCTTTTCAAAGGCAGCACTATAAAGT
ATAAACAATCACTTATGTATTATTAATGCTTTT*TTCTATATATATTGGGTCAGAAAAA*
TTAAATGGTTTGCTTATGAGGGGATATAACAAATATATGAACTTTTCATTTG
GGTTGTAGTGGGAGAT

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 4

CO CL2623Contig1 873 4 8 U
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ATCGATCCGTCTTTTAAGGACAAGAAGAAGATCGCAGGCACAAGCAAACCGATCATGTCG
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AACGTTGTAAACTCGGTGAAATCCACATCAACAACATCTGCAGCAGCGAGCTTGGTGAAA
GGTAAAGCCAAAAGAGAGAAGAAGGTTTATTCGTTAGCCGGACAAAAATATGATCCTCCT
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ACGCCATCATATTCTAGTAAACCGGAGAGTTCTCAAAGACCATCTGCGTCCAAGAACAAC
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ATCCTAAGCCCCAAGAGAAGGAAAGTGTAAACTGTGAAATTTTAAAAGACTCATTTCGTC
ATTTGGGAAAAATTATCCAATAGTGGATGATCAGATCAAGAACCTTTAGTTATTTCTTAG
TATTCATCGAATAAGTGACGGAAGATCGTTCATGTAAGATTCCTTATAACGTTGTTTGTG
TAGAAGCAAAGAAACATGACACACAGCTTTAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CP32TF U 1
AF RR4GV25TF U 1
AF RR4GV25JQ C 74
AF RR4CP32JQ C 156
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BS 462 541 RR4CP32TF
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A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4GV25TF 672 0 0
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CCCAGTTCGGTCAAGAGCGAGAAACGCGATGGATCTTCTTCTCTTGCTTCCAGAGTCAAG
ATCGATCCGTCTTTTAAGGACAAGAAGAAGATCGCAGGCACAAGCAAACCGATCATGTCG
GATACTAAACCCAGATCCTCTGCTTCCACCGTCACGGCCAAATCTGAGGCAAAGCCCAAG
AACGTTGTAAACTCGGTGAAATCCACATCAACAACATCTGCAGCAGCGAGCTTGGTGAAA
GGTAAAGCCAAAAGAGAGAAGAAGGTTTATTCGTTAGCCGGACAAAAATATGATCCTCCT
GAAGAGAGAGAGCCCTTGAGGATATTCTATGAGTCATTGTCGAAACAAATACCCGGAAGC
GAAATGGCAGAGTTCTGGCTGATGGAACATGGAATGTTGTCTCCGGAAAAGGCGAAGCGA
GCTCATGAGAAAAAGCTAAGAAAGATGAAGCAAATCCGAACGGGAACACCGGCTAAACCG
ACGCCATCATATTCTAGTAAACCGGAGAGTTCTCAAAGACCATCTGCGTCCAAGAACAAC
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ATCCTAAGCCC
A

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4GV25JQ 780 0 0
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QA 1 780 1 780
DS 

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ATCTGCAGCAGCGAGCTTGGTGAAAGGTAAAGCCAAAAGAGAGAAGAAGGTTTATTCGTT
AGCCGGACAAAAATATGATCCTCCTGAAGAGAGAGAGCCCTTGAGGATATTTTATGAGTC
ATTGTCGAAACAAATACCCGGAAGCGAAATGGCAGAGTTCTGGCTGATGGAACATGGAAT
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GAAATTTTAAAAGACTCATTTCGTCATTTGGGAAAAATTATCCAATAGTGGATGATCAGA
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AAGATTCCTTATAACGTTGTTTGTGTAGAAGCAAAGAAACATGACACACAGCTTTAGG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL2624Contig1 845 3 2 U
GGGGAGATCTCTTTCTCTATCTTCTCTACTTTTCTTTCTAGAGGACAACTGTGACATTTC
TTTGTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCACTTCTCCTTCTAGCCATGGCTG
GCCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGATACAGTGCTACAGA
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CTGATCCAAGTTACTCAGGATACACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCA
CCACCGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCAGCACCACATTTCCTG
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ATAGCACTGGGATTAACCCGGACTACTCCACGACAGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAAGA
ACTCGAGCACATTTCCCACCTGCCTTCTCTTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCT
CGATGCTCTAAGAATGTTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGTCTCAAG
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ATGGTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCGTCTCATGCTTTCAACTCTTATCTCTTTAGA
CTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RR4AR26JQ C 294
AF RR4AR26TF U 1
AF RR4CL48TF U 434
BS 1 793 RR4AR26TF
BS 794 845 RR4CL48TF

RD RR4AR26JQ 314 0 0
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ACTAACTTTGATCCAAGTTACTCAGGATACCCCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGT
GGTAGCACCCCCGTGACCCCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCCCCTCAACCAGCCCCCCA
TTTCCTGGTGGCAATGGCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTT
GGAAACAATAGCACTGGGATTAACCCGGACTACTCCCCGACAGACAGCAGCGCGTTTGCT
CTCAAGAACTCGAG

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR4AR26TF 793 0 0
GGGGAGATCTCTTTCTCTATCTTCTCTACTTTTCTTTCTAGAGGACAACTGTGACATTTC
TTTGTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCACTTCTCCTTCTAGCCATGGCTG
GCCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGATACAGTGCTACAGA
ACACCCTAGACTATGCCTGTGGCAATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAAGCAC
CTTGCTTTGACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAGCTATGCAGTCAATAGCTTCTTCC
AAAAGAAGCATCAAGCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTAACT
CTGATCCAAGTTACTCAGGATACACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCA
CCACCGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCAGCACCACATTTCCTG
GTGGCAATGGCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTTGGAAACA
ATAGCACTGGGATTAACCCGGACTACTCCACGACAGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAAGA
ACTCGAGCACATTTCCCACCTGCCTTCTCTTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCT
CGATGCTCTAAGAATGTTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGTCTCAAG
GACATTTGAGTCTAGCTTAGTGGTAAAATCTCTGCCTGTTTGTTTTGAGTCTCTTTCTTT
ATGGTATGTTCTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4CL48TF 412 0 0
AGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCGGCACCACATTTTCTGGTGGCAATGGCAA
CAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTTGGAAACAATAGCACTGGGAT
TAACCCGGACTACTCCACGACAGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAAGAACTCGAGCACATT
TCTCACCTGCCTTCTCTTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCTCGATGCTCTAAGA
ATGTTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGTCTCAAGGACATTTGAGTCT
AGCTTAGTGGTAAAATCTCTGCCTGTTTGTTTTGAGTCTCTTTCTTTATGGTATGTTCTT
GTTGTAAGAAGATTTCGTCTCATGCTTTCAACTCTTATCTCTTTAGACTGTT

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 4

CO CL2625Contig1 1046 4 7 U
CAGGTCCAACATCTTTTGCACCTATCATCGAAAGGGCCGTGACCATTGTGGAAGAAAGTG
GAGGCCAGTACCATGTTCTTCTCATTATCGCTGATGGACAGGTAACAAGAAGTGTTGATA
CAGAGAATGGGGCAGTGAGTCCACAAGAGCAGCAGACCATTGACGCCATTGTTAGAGCAA
GTGAGTATCCTTTGTTGATTGTTCTTGTTGGTGTTGGAGATGGCCCTTGGGACACTATGA
GACAGTTTGATGACAACATCCCCGCTCGTGCCTTTGACAATTTCCAGTTTGTGAATTTCA
CGG*ATATAATGTCAAAGAACGTTGATCCAGCAAGAAAAGAGGCAGAGTTTGCGCTTTCT
GCGTTGATGGAGATCCCATCTCAGTACAAAGCCACCCTTGAGCTAGGCTTACTAGGAAGG
AGAACTGGAAACTGTCCAAACAGGTTTGCGCTTCCACCACCAACTTATGCTACTCAGTCC
ATGCGCAACAACAGTCCAAGAACTTCTCGATCAACCAGCTTTCAGACCAGAACACCACAA
CCATATGATAATGGTGTTGCCGCCGCCGCCGCCACTGCACCACTTCCAAACACTCGCAAT
GATGGTCAGCTTTGTTCTATATGTCTAGTGATACCAAAGAACATGGCTTTCAATTGTGGT
CATCAGACTTGTTCTGATTGTGGGGAAGACCTCCATGTTTGTCCCATTTGCCGAAGCTCA
ATCTCGGTTCGTATCAAGCTTTATTAAGATAAAACTCTCTCAGGGGAGCTCGAGGTGATC
AGACATCTTTCAGAACACAGCTCGAGTGAGTTTTGGAACTAGTTCTCATCAATGGTTTGT
GGTGGAGATATGACCAGTGTCCTTGCTTGCATTTGTAGATAATTTTGTTCAGTTTTTGCA
TTCTCATTGCACATAAAAACACACTCTCTCTTGTATCGTCAGGGGAGAGACGTAAGTAAA
ATAAAGCATCTTTGATTCTGCTGCAACAGCCTCGTGTTGACAGACTTTTGTACATATGAA
TTCAATCCTTCTTCTCTGAAGAGTCT


BQ
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AF RR4A057TFB U 1
AF RR4A057TF U 378
AF RR4A057JQ C 270
AF RR4A057JQD C 264
BS 1 765 RR4A057TFB
BS 766 766 RR4A057JQD
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BS 796 823 RR4A057TF
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GAGGCCAGTACCATGTTCTTCTCATTATCGCTGATGGACAGGTAACAAGAAGTGTTGATA
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GTGAGTATCCTTTGTTGATTGTTCTTGTTGGTGTTGGAGATGGCCCTTGGGACACTATGA
GACAGTTTGATGACAACATCCCCGCTCGTGCCTTTGACAATTTCCAGTTTGTGAATTTCA
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GCGTTGATGGAGATCCCATCTCAGTACAAAGCCACCCTTGAGCTAGGCTTACTAGGAAGG
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CCATATGATAATGGTGTTGCCGCCGCCGCCGCCACTGCACCACTTCCAAACACTCGCAAT
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CATCAGACTTGTTCTGATTGTGGGGAAGACCTCCATGTTTGTCCCATTTGCCGAAGCTCA
ATCTCGGTTCGTATCAAGCTTTATTAAGATAAAACTCTCTCAGGG*AGCTCGAGGTGATC
AGACATCTTTC

QA 1 791 1 791
DS 

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AAACAGGGTTGCGCTTCCACCACCAACTTATGCTACTCAGTCCATGCGCAACAACAGTCC
AAGAACTTCTCGATCAACCAGCTTTCAGACCAGAACACCACAACCATATGATAATGGTGT
TGCCGCCGCCGCCGCCACTGCACCACTTCCAAACACTCGCAATGATGGTCAGCTTTGTTC
TATATGTCTAGTGATACCAAAGAACATGGCTTTCAATTGTGGTCATCAGACTTGTTCTGA
TTGTGGGGAAGACCTCCATGTTTGTCCCATTTGCCGAAGCTCAATCTCGGTTCGTATCAA
GCTTTATTAAGATAAA*CTCTCTCAGGGAGCCTCGAGGTGATCAGACATCTTTCAGA*CA
CAGCTCGAGTGAGTTTTGGAACTAGT
C

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4A057JQ 645 0 0
GCCTTTGACAATTTCCAGTTTGTGAATTTCACGGGATATAATGTCAAAGAACGTTGATCC
AGCAAGAAAAGAGGCAGAGTTTGCGCTTTCTGCGTTGATGGAGATCCCATCTCAGTACAA
AGCCACCCTTGAGCTAGGCTTACTAGGAAGGAGAACTGGAAACTGTCCAAACAGGTTTGC
GCTTCCACCACCAACTTATGCTACTCAGTCCATGCGCAACAACAGTCCAAGAACTTTTCG
ATCAACCAGCTTTCAGACCAGAACACCACAACCATATGATAATGGTGTTGCCGCCGCCGC
CGCCACTGCACCACTTCCAAACACTCGCAATGATGGTCAGCTTTGTTCTATATGTCTAGT
GATACCAAAGAACATGGCTTTCAATTGTGGTCATCAGACTTGTTCTGATTGTGGGGAAGA
CCTCCATGTTTGTCCCATTTGCCGAAGCTCAATCTCGGTTCGTATCAAGCTTTATTAAGA
TAAAACTCTCTCAGGGGAGCTCGAGGTGTTCAGACATCTTTCAGAACACAGCTCGAGTGA
GTTTTGGAACTAGTTTTCATCAATGGTTTGTGGTGGAGATATGACCAGTGTCCTTGCTTG
CATTTGTAGATAATTTTGTTCAGTTTTTGCATTCTCATTGCACAT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4A057JQD 783 0 0
GCTCGT
GCCTTTGACAATTTCCAGTTTGTGAATTTCACGG*ATATAATGTCAAAGAACGTTGATCC
AGCAAGAAAAGAGGCAGAGTTTGCGCTTTCTGCGTTGATGGAGATCCCATCTCAGTACAA
AGCCACCCTTGAGCTAGGCTTACTAGGAAGGAGAACTGGAAACTGTCCAAACAGGTTTGC
GCTTCCACCACCAACTTATGCTACTCAGTCCATGCGCAACAACAGTCCAAGAACTTCTCG
ATCAACCAGCTTTCAGACCAGAACACCACAACCATATGATAATGGTGTTGCCGCCGCCGC
CGCCACTGCACCACTTCCAAACACTCGCAATGATGGTCAGCTTTGTTCTATATGTCTAGT
GATACCAAAGAACATGGCTTTCAATTGTGGTCATCAGACTTGTTCTGATTGTGGGGAAGA
CCTCCATGTTTGTCCCATTTGCCGAAGCTCAATCTCGGTTCGTATCAAGCTTTATTAAGA
TAAAACTCTCTCAGGGGAGCTCGAGGTGATCAGACATCTTTCAGAACACAGCTCGAGTGA
GTTTTGGAACTAGTTCTCATCAATGGTTTGTGGTGGAGATATGACCAGTGTCCTTGCTTG
CATTTGTAGATAATTTTGTTCAGTTTTTGCATTCTCATTGCACATAAAAACACACTCTCT
CTTGTATCGTCAGGGGAGAGACGTAAGTAAAATAAAGCATCTTTGATTCTGCTGCAACAG
CCTCGTGTTGACAGACTTTTGTACATATGAATTCAATCCTTCTTCTCTGAAGAGTCT

QA 7 783 7 783
DS 



AS 1 4

CO CL2626Contig1 1007 4 11 U
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AGAAGAAAGTATCTCTCTTTTTTTGTTTTCTCCGAAGTCAGGTGAGAGAGAGAAGAAGAA
ACGTTTGAGTTCCGATGAGTTCTGGAGGAGGAGGAATCGTGGCGGGACCAACAGCAGCAT
CAGCAGCTCCTGCAAGCGGCGGTGGAAACGTGGAGTGGCACGTCAGACCACCCAACCCTA
AAAACCCAGTCGTCTTCTTCGACGTCTCTATTGGTGGTATCCCCGCCGGTCGTATCAAGA
TGGAGCTTTTCGCCGACATTGCCCCCAAAACTGCTGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTG
GTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAGCCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCA
TCAAGGATTTTATGATCCAAAGTGGTGATTTTCTTAAGAATGATGGGAGTGGATGCATGT
CAATCTATGGCCACCAGTTCCATGATGAGAATTTTACTGCCAAACATACTGGTCCTGGAT
TGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTG
CAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCACGTTGTCTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGT
TATTGGTGGTGCGGAAGATTGAGAACGTGGCTGTTGGACCAAACAACCGTCCTAAGCTTG
CTGTTGTTATTACAGAGTGTGGGGAGATGTGAGAAATGCTTTTAGCCATGAGATGACTTG
AAGAACATTGTCTTCTGAAGGAGGAATGTAGTGTGAGGCCAAAGCTTTAATTTATAGTTG
TAAACGTTACGCATATGTGACTTAAGCTTAAACATTTTGTCATTTAGTTTTCTTTTTCTT
TCACTTTGGTTGCTGGTCAACATTTCCGAAAGCAAAAGCCGCTTGTAAACTTTGGTTTTG
GAGATCATTCATTGTGAGTGAAAATGAGCTATTTTATATTCATAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CB91TF U 1
AF RR4GA30TF U 79
AF RR4CB91JQ C 247
AF RR4GA30JQ C 352
BS 1 103 RR4CB91TF
BS 104 104 RR4GA30TF
BS 105 436 RR4CB91TF
BS 437 437 RR4GA30TF
BS 438 628 RR4CB91TF
BS 629 629 RR4GA30TF
BS 630 697 RR4CB91TF
BS 698 796 RR4GA30TF
BS 797 919 RR4CB91JQ
BS 920 920 RR4GA30JQ
BS 921 1007 RR4CB91JQ

RD RR4CB91TF 697 0 0
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AGAAGAAAGTATCTCTCTTTTTTTGTTTTCTCCGAAGTCAGGTTAGAGAGAGAAGAAGAA
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GTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAGCCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCA
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CAATCTATGGCCACCAGTTCCATGATGAGAATTTTACTGCCAAACATACTGGTCCTGGAT
TGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTG
CAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGTCTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGT
TATTGGTGGTGCGGAAGATTGAGAACGTGGCTGTTGG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4GA30TF 718 0 0
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GCGGTGGAAACGTGGAGTGGCACGTCAGACCACCCAACCCTAAAAACCCAGTCGTCTTCT
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GGAAGCCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCATCAAGGATTTTATGATCC
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TTGAGAACGTGGCTGTTGGACCAAACAACCGTCCTAAGCTTGCTGTTGTTATTACAGAGT
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QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4CB91JQ 761 0 0
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ATGGCCACCAGTTCCATGATGAGAATTTTACTGCCAAACATACTGGTCCTGGATTGCTCT
CCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTGCAAAAT
GCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGTCTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGTTATTGG
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TGGTTGCTGGTCAGCATTTCCGAAAGCAAAAGCCGCTTGTAAACTTTGGTTTTGGAGATC
ATTCATTGTGAGTGAAAATGAGCTATTTTATATTCATAGCC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4GA30JQ 656 0 0
TCTGTACTGGTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAGCCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTC
ACAGAGTCATCAAGGATTTTATGATCCAAAGTGGTGATTTTCTTAAGAATGATGGGAGTG
GATGCATGTCAATCTATGGCCACCAGTTCCATGATGAGAATTTTACTGCCAAACATACTG
GTCCTGGATTGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCAGTTCTTCA
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GATGACTTGAAGAACATTGTCTTCTGAAGGAGGAATGTAGTGTGAGGCCAAAGCTTTAAT
TTATAGTTGTAAACGTTACGCATATGTGACTTAAGCTTAAACATTTTGTCATTTAGTTTT
CTTTTTCTTTCACTTTGGTTGCTGGTCAACATTTCCGAAAGCAAAAGCCGCTTGTAAACT
TTGGTTTTGGAGATCATTCATTGTGAGTGAAAATGAGCTATTTTATATTCATAGC
T

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 4

CO CL2627Contig1 446 4 2 U
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TTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGG
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CTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTT
TGTTTCAATGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCAAAT
TGAGTTCACGCCTTCGGATTTAATCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AY35JQ C 1
AF RR4AZ84JQ C 1
AF RR4AY35TF U 1
AF RR4AZ84TF U 1
BS 1 440 RR4AY35TF
BS 441 446 RR4AY35JQ

RD RR4AY35JQ 446 0 0
GGATCCTCACAAAAAGAAAAAAAAAAACCCTAACCTCATCGTTCCTCAGAGGCGATTTGA
TTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGG
TTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCCGGTAGTACTAAGAAGAAGGCCA
GACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGA
TTGATGATGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAAAATCATATGTGAATCTGTCTTTGTCCT
CTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTT
TGTTTCAATGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCAAAT
TGAGTTCACGCCTTCGGATTTAATCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4AZ84JQ 440 0 0
GGATCCTCACAAAAAGAAAAAAAAAAACCCTAACCTCATCGTTCCTCAGAGGCGATTTGA
TTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGG
TTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCCGGTAGTACTAAGAAGAAGGCCA
GACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGA
TTGATGATGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAAAATCATATGTGAATCTGTCTTTGTCCT
CTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTT
TGTTTCAATGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCAAAT
TGAGTTCACCCCTTCGGATT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4AY35TF 446 0 0
GGATCCTCACAAAAAGAAAAAAAAAAACCCTAACCTCATCGTTCCTCAGAGGCGATTTGA
TTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGG
TTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCCGGTAGTACTAAGAAGAAGGCCA
GACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGA
TTGATGATGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAAAATCATATGTGAATCTGTCTTTGTCCT
CTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTT
TGTTTCAATGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCAAAT
TGAGTTCACGCCTTCGGATT
TAATCC

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4AZ84TF 446 0 0
GGATCCTCACAAAAAGAAAAAAAAAAACCCTAACCTCATCGTTCCTCAGAGGCGATTTGA
TTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGG
TTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCCGGTAGTACTAAGAAGAAGGCCA
GACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATCTGCTGCGA
TTGATGATGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAAAATCATATGTGAATCTGTCTTTGTCCT
CTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTT
TGTTTCAATGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCAAAT
TGAGTTCACGCCTTCGGATT
TAATCC

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 3

CO CL2628Contig1 637 3 4 U
GGGAGTACAGGGTTGTGGGTTTTGCAGAGAATCGTGAATTAGGAGTGTTGATATTGTGGA
TTTGGCAGATTATCGTGAGTTGTGATCTCTACGTTAGATTTCTCAAAGGAGAAAAGAGAG
GAGGAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACAGCAACGCTGTGA
TAAACACGTGTCTTGGAGTATCGTTTGTGGTTCTGGGGCTGAGATCTGATAAACAGCAAA
AGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTGTCCAAGTCTAACAAGGATATGA
AAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACAACAGCTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGCTACTT
CCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAAGTCACCACCCAATCTG
GAGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCAGGATCATGGTTTGAGAGGATT
TTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAAACATCAAACTGTCTATTGTTGTGATTCTAAAATAA
GGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTCAAGGCTTTTCATTATTGGACCTATTGGTTG
AAAGTGAGACTTGCGTGAAGAATTGATGACTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN94TF U 1
AF RR4C106TF U 24
AF RR4C281TF U 24
BS 1 269 RR4EN94TF
BS 270 270 RR4C106TF
BS 271 578 RR4EN94TF
BS 579 637 RR4C106TF

RD RR4EN94TF 578 0 0
GGGAGTACAGGGTTGTGGGTTTTGCAGAGAATCGTGAATTAGGAGTGTTGATATTGTGGA
TTTGGCAGATTATCGTGAGTTGTGATCTCTACGTTAGATTTCTCAAAGGAGAAAAGAGAG
GAGGAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACAGCAACGCTGTGA
TAAACACGTGTCTTGGAGTATCGTTTGTGGTTCTGGGGCTGAGATCTGATAAACAGCAAA
AGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAAATTCGCTGTCCAAGTCTAACAAGGATATGA
AAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACAACAGCTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGCTACTT
CCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAAGTCACCACCCAATCTG
GAGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCAGGATCATGGTTTGAGAGGATT
TTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAAACATCAAACTGTCTATTGTTGTGATTCTAAAATAA
GGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTCAAGGCTTT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4C106TF 614 0 0
GG
AGAGAATCGTGAATTAGGAGTGTTGATATTGTGGATTTGGCAGATTATCGTGAGTTGTGA
TCTCTACGTTAGATTTCTCAAAGGAGAAAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCAAT
GCTGGTCTCGGAAGCAATGAACAGCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTGGAGTATCGTT
TGTGGTTCTGGGGCTGAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCA
GAAAGATTCGCTGTCCAAGTCTAACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACA
ACAGCTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGCTACTTCCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCT
TAAGGCCATCTATGGAGAAGTCACCACCCAATCTGGAGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAA
AGTGTCTACCCCCAGGATCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAA
ACATCAAACTGTCTATTGTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTG
TGGTCAAGGCTTTTCATTATTGGACCTATTGGTTGAAAGTGAGACTTGCGTGAAGAATTG
ATGACTGAAAAA

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR4C281TF 607 0 0
GG
AGAGAATCGTGAATTAGGAGTGTTGATATTGTGGATTTGGCAGATTATCGTGAGTTGTGA
TCTCTACGTTAGATTTCTCAAAGGAGAAAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCAAT
GCTGGTCTCGGAAGCAATGAACAGCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTGGAGTATCGTT
TGTGGTTCTGGGGCTGAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCA
GAAAGATTCGCTGTCCAAGTCTAACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACA
ACAGCTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGCTACTTCCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCT
TAAGGCCATCTATGGAGAAGTCACCACCCAATCTGGAGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAA
AGTGTCTACCCCCAGGATCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAA
ACATCAAACTGTCTATTGTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTG
TGGTCAAGGCTTTTCATTATTGGACCTATTGGTTGAAAGTGAGACTTGCGTGAAGAATTG
ATGAC

QA 3 607 3 607
DS 



AS 1 4

CO CL2629Contig1 875 4 3 U
GGACCACCTAAAAGTTGCACAATTTCATCCAGAGAGTGACAGATGGCTTCAATTCGCGTC
TTCTTCTCGCGAAAACTCCCAACTTTCGCTTCGGTTTTCTTCCAAACCCTAACTAGAAAC
CCTTCAACACATCGGATCTCCTTCCTAAATCTAAAACCCAACAACACTCTACGCTTCGTT
CCCCCGAAACCCTCCACGGTGTTCGTCGCCCAGTTCCACGACGGCAGGCCCAGGGGTCCT
CTCTGGAGAGGCAAGAAGCTGATCGGAAAAGAGGCCCTTTTCGTGATCCTGGGTCTCAAG
CGGCTGAAGGAAGACGACGAGAAGCTCGCGAAGTTTATAAAGACCCATGTTTTCAGATTG
TTGAAGCAGGAATGGTACCAACCGGATGTGTTTATGTACAAGGACCTTATAGTATCCTTA
GCCAAGAGTAAAAGAATGGATGAAGCAATGGGGCTATGGGAGAAAATGAAGCGAGAGAAC
CTCTTTCCTGATTCTCAGACTTACACTGAGGTTATCAGAGGGTTTCTCAGAGATGGATGT
CCCGCTGATGCCATGAATGTTTATGAAGACATGTTGAAGTCTCCTGATCCGCCAGAAGAG
TTGCCGTTTAGGGTTCTGTTGAAGGGGCTTTTGCCGCATCCGCTTTTGAGAAACAAAGTG
AAGAAAGACTTCGAGGAGTTGTTCCCTGAGAAACATGCTTATGATCCCCCTGAAGAGATT
TTTGGTAGTTGTTGAGTTTTGTATGCACAAAACACTCTAAACTCTTTCCATCTCAGTTTT
TTTTTGTTTTCACAAAAGTGTTCTCATAATTTGTGCTCTCTCCATTTATGAAGTTTCAAT
CGCCTTGGCACTTAAATAAGATCTTATTGATGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DT36TF U 1
AF RR4E510TF U 1
AF RR4E510JQ C 175
AF RR4DT36JQ C 267
BS 1 606 RR4DT36TF
BS 607 685 RR4E510TF
BS 686 875 RR4E510JQ

RD RR4DT36TF 606 0 0
GGACCACCTAAAAGTTGCACAATTTCATCCAGAGAGTGACAGATGGCTTCAATTCGCGTC
TTCTTCTCGCGAAAACTCCCAACTTTCGCTTCGGTTTTCTTCCAAACCCTAACTAGAAAC
CCTTCAACACATCGGATCTCCTTCCTAAATCTAAAACCCAACAACACTCTACGCTTCGTT
CCCCCGAAACCCTCCACGGTGTTCGTCGCCCAGTTCCACGACGGCAGGCCCAGGGGTCCT
CTCTGGAGAGGCAAGAAGCTGATCGGAAAAGAGGCCCTTTTCGTGATCCTGGGTCTCAAG
CGGCTGAAGGAAGACGACGAGAAGCTCGCGAAGTTTATAAAGACCCATGTTTTCAGATTG
TTGAAGCAGGAATGGTACCAACCGGATGTGTTTATGTACAAGGACCTTATAGTATCCTTA
GCCAAGAGTAAAAGAATGGATGAAGCAATGGGGCTATGGGAGAAAATGAAGCGAGAGAAC
CTCTTTCCTGATTCTCAGACTTACACTGAGGTTATCAGAGGGTTTCTCAGAGATGGATGT
CCCGCTGATGCCATGAATGTTTATGAAGACATGTTGAAGTCTCCTGATCCGCCAGAAGAG
TTGCCG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4E510TF 685 0 0
GGACCACCTAAAAGTTGCACAATTTCATCCAGAGAGTGACAGATGGCTTCAATTCGCGTC
TTCTTCTCGCGAAAACTCCCAACTTTCGCTTCGGTTTTCTTCCAAACCCTAACTAGAAAC
CCTTCAACACATCGGATCTCCTTCCTAAATCTAAAACCCAACAACACTCTACGCTTCGTT
CCCCCGAAACCCTCCACGGTGTTCGTCGCCCAGTTCCACGACGGCAGGCCCAGGGGTCCT
CTCTGGAGAGGCAAGAAGCTGATCGGAAAAGAGGCCCTTTTCGTGATCCTGGGTCTCAAG
CGGCTGAAGGAAGACGACGAGAAGCTCGCGAAGTTTATAAAGACCCATGTTTTCAGATTG
TTGAAGCAGGAATGGTACCAACCGGATGTGTTTATGTACAAGGACCTTATAGTATCCTTA
GCCAAGAGTAAAAGAATGGATGAAGCAATGGGGCTATGGGAGAAAATGAAGCGAGAGAAC
CTCTTTCCTGATTCTCAGACTTACACTGAGGTTATCAGAGGGTTTCTCAGAGATGGATGT
CCCGCTGATGCCATGAATGTTTATGAAGACATGTTGAAGTCTCCTGATCCGCCAGAAGAG
TTGCCGTTTAGGGTTCTGTTGAAGGGGCTTTTGCCGCATCCGCTTTTGAGAAACAAAGTG
AAGAAAGACTTCGAGGAGTTGTTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4E510JQ 701 0 0
TTCGTTCCCCCGAAACCCTCCACGGTGTTCGTCGCCCAGTTCCACGACGGCAGGCCCAGG
GGTCCTCTCTGGAGAGGCAAGAAGCTGATCGGAAAAGAGGCCCTTTTCGTGATCCTGGGT
CTCAAGCGGCTGAAGGAAGACGACGAGAAGCTCGCGAAGTTTATAAAGACCCATGTTTTC
AGATTGTTGAAGCAGGAATGGTACCAACCGGATGTGTTTATGTACAAGGACCTTATAGTA
TCCTTAGCCAAGAGTAAAAGAATGGATGAAGCAATGGGGCTATGGGAGAAAATGAAGCGA
GAGAACCTCTTTCCTGATTTTCAGACTTACACTGAGGTTATCAGAGGGTTTTTCAGAGAT
GGATGTCCCGCTGATGCCATGAATGTTTATGAAGACATGTTGAAGTCTCCTGATCCGCCA
GAAGAGTTGCCGTTTAGGGTTCTGTTGAAGGGGCTTTTGCCGCATCCGCTTTTGAGAAAC
AAAGTGAAGAAAGACTTCGAGGAGTTGTTCCCTGAGAAACATGCTTATGATCCCCCTGAA
GAGATTTTTGGTAGTTGTTGAGTTTTGTATGCACAAAACACTCTAAACTCTTTCCATCTC
AGTTTTTTTTTGTTTTCACAAAAGTGTTCTCATAATTTGTGCTCTCTCCATTTATGAAGT
TTCAATCGCCTTGGCACTTAAATAAGATCTTATTGATGACC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4DT36JQ 609 0 0
AAAAGAGGCCCTTTTCGTGATCCTGGGTCTCAAGCGGCTGAAGGAAGACGACGAGAAGCT
CGCGAAGTTTATAAAGACCCATGTTTTCAGATTGTTGAAGCAGGAATGGTACCAACCGGA
TGTGTTTATGTACAAGGACCTTATAGTATCCTTAGCCAAGAGTAAAAGAATGGATGAAGC
AATGGGGCTATGGGAGAAAATGAAGCGAGAGAACCTCTTTCCTGATTTTCAGACTTACAC
TGAGGTTATCAGAGGGTTTCTCAGAGATGGATGTCCCGCTGATGCCATGAATGTTTATGA
AGACATGTTGAAGTCTCCTGATCCGCCAGAAGAGTTGCCGTTTAGGGTTCTGTTGAAGGG
GCTTTTGCCGCATCCGCTTTTGAGAAACAAAGTGAAGAAAGACTTCGAGGAGTTGTTCCC
TGAGAAACATGCTTATGATCCCCCTGAAGAGATTTTTGGTAGTTGTTGAGTTTTGTATGC
ACAAAACACTCTAAACTCTTTCCATCTCAGTTTTTTTTTGTTTTCACAAAAGTGTTCTCA
TAATTTGTGCTCTCTCCATTTATGAAGTTTCAATCGCCTTGGCACTTAAATAAGATCTTA
TTGATGACC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 4

CO CL2630Contig1 818 4 9 U
CAGAAGATGACAACGTTCATACAAAAGCAGAGATACTGGCCTGCGCCAAGAAGATGCTAA
GGAAGAAGCAGAGAGAAGAGATGCTTGACGATGCTTATAACAAGTACATGTATGGCGACG
AAGGTTTTTTGCCCAAATGGTTTTTGGATGACAAGAAGCAGCACAGACAACCGATGAAAC
CCGTCACTAAAGAAGAAATCAATGCAATGAAAGCTCAGTTCAGAGAAATCAACGCTCGTC
CGGCCAAAAAGGTGGCGGAGGCCAAGGCACGGAAGAAGAGAGCCGCGGCGAAAAGATTGG
AGAAGGTGAGGAAGAAGGCAAATGTAATATCTGACACACCGGATATTGCCGACCGTTCTA
AGGACAAGATGATAGACAAGCTATACAAGAAAGCAGCTGAGCCGAGGAAGCCGAGGAAAG
AACTGGTTGTGTCAAAGAAAGGAGTTGGTGTTAAGGTTGGGAAAGGACAGAAGAGAGTGG
ATAGGAGGATGAAGAGTGACGCTAGGCAACGTGGAGGAGGCAAGCCCGGTAGGAAGGGGA
AGAAGAGTGCCGCTGGTAATAAATCAGGCCAGAAAAAACCGAGGGGTAAAAGACCCATGG
GCGGCGGGTAAGTCCTCAATGG*TTCGGTTGTGTCGCAAAAAGGAAGTTTTGTTACCGTG
TCCCATCGTAGTCTGATATATTTATTTTGAGTACACTTCTTGACTTTGTTTTTAAATTCT
TGAATCAGTACTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGAGTCCCAAGTTAACTTACTGGAACTCTTA
TCTTGTTTATGAAGAGGTACCGTAATGGTAGTGCTTTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H831TF U 141
AF RR4GP90TF U 3
AF RR4GP90JQ C 126
AF RR4H831JQB C 1
BS 1 2 RR4H831JQB
BS 3 140 RR4GP90TF
BS 141 152 RR4H831TF
BS 153 153 RR4GP90TF
BS 154 448 RR4H831TF
BS 449 622 RR4GP90TF
BS 623 623 RR4H831JQB
BS 624 708 RR4GP90TF
BS 709 818 RR4H831JQB

RD RR4H831TF 308 0 0
TTTTTGGATGACGAGAAGCAGCACAGACAACCGATGAAACCCGTCACTAAAGAAGAAATC
AATGCAATGAAAGCTCAGTTCAGAGAAATCAACGCTCGTCCGGCCAAAAAGGTGGCGGAG
GCCAAGGCACGGAAGAAGAGAGCCGCGGCGAAAAGATTGGAGAAGGTGAGGAAGAAGGCA
AATGTAATATCTGACACACCGGATATTGCCGACCGTTCTAAGGACAAGATGATAGACAAG
CTATACAAGAAAGCAGCTGAGCCGAGGAAGCCGAGGAAAGAACTGGTTGTGTCAAAGAAA
GGAGTTGG

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR4GP90TF 706 0 0
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AAGAAGCAGAGAGAAGAGATGCTTGACGATGCTTATAACAAGTACATGTATGGCGACGAA
GGTTTTTTGCCCAAATGGTTTTTGGATGACAAGAAGCAGCACAGACAACCGATGAAACCC
GTCACTAAAGAAGAAATCAATGCAATGAAAGCTCAGTTCAGAGAAATCAACGCTCGTCCG
GCCAAAAAGGTGGCGGAGGCCAAGGCACGGAAGAAGAGAGCCGCGGCGAAAAGATTGGAG
AAGGTGAGGAAGAAGGCAAATGTAATATCTGACACACCGGATATTGCCGACCGTTCTAAG
GACAAGATGATAGACAAGCTATACAAGAAAGCAGCTGAGCCGAGGAAGCCGAGGAAAGAA
CTGGTTGTGTCAAAGAAAGGAGTTGGTGTTAAGGTTGGGAAAGGACAGAAGAGAGTGGAT
AGGAGGATGAAGAGTGACGCTAGGCAACGTGGAGGAGGCAAGCCCGGTAGGAAGGGGAAG
AAGAGTGCCGCTGGTAATAAATCAGGCCAGAAAAAACCGAGGGGTAAAAGACCCATGGGC
GGCGGGTAAGTCCTCAATGGGTTCGGTTGTGTCGCAAAAAGGAAGTTTTGTTACCGTGTC
CCATCGTAGTCTGATATATTTATTTTGAGTACACTTCTTGACTTTG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4GP90JQ 649 0 0
TTTTTGCCCAAATGGTTTTTGGATGACAAGAAGCAGCACAGACAACCGATGAAACCCGTC
ACTAAAGAAGAAATCAATGCAATGAAAGCTCAGTTCAGAGAAATCAACGCTCGTCCGGCC
AAAAAGGTGGCGGAGGCCAAGGCACGGAAGAAGAGAGCCGCGGCGAAAAGATTGGAGAAG
GTGAGGAAGAAGGCAAATGTAATATCTGACACACCGGATATTGCCGACCGTTCTAAGGAC
AAGATGATAGACAAGCTATACAAGAAAGCAGCTGAGCCGAGGAAGCCGAGGAAAGAACTG
GTTGTGTCAAAGAAAGGAGTTGGTGTTAAGGTTGGGAAAGGACAGAAGAGAGTGGATAGG
AGGATGAAGAGTGACGCTAGGCAACGTGGAGGAGGCAAGCCCGGTAGGAAGGGGAAGAAG
AGTGCCGCTGGTAATAAATCAGGCCAGAAAAAACCGAGGGGTAAAAGACCCATGGGCGGC
GGGTAAGTCCTCAATGG*TTCGGTTGTGTCGCAAAAAGGAAGTTTTGTTACCGTGTCCCA
TCGTAGTCTGATATATTTATTTTGAGTACACTTCTTGACTTTGTTTTTAAATTCTTGAAT
CAGTACTTTGTGTTTTTTTTT****GAGTCCCAAGTTAACTTACTGGAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4H831JQB 818 0 0
CAGAAGATGGCAACGTTCATACAAAAGC*GAGAT*CTTGGCTGTGCCAAGAAGATGCTGA
GGAAGAAGCAGAGAGAAGAGATGCTTGACGATGCTTATAACAAGTACATGTATGGCGACG
AAGGTTTTTTGCCCAAATGGTTTTTGGATGACGAGAAGCAGCACAGACAACCGATGAAAC
CCGTCACTAAAGAAGAAATCAATGCAATGAAAGCTCAGTTCAGAGAAATCAACGCTCGTC
CGGCCAAAAAGGTGGCGGAGGCCAAGGCACGGAAGAAGAGAGCCGCGGCGAAAAGATTGG
AGAAGGTGAGGAAGAAGGCAAATGTAATTTTTGACACACCGGATATTGCCGACCGTTTTA
AGGACAAGATGATAGACAAGCTATACAAGAAAGCAGCTGAGCCGAGGAAGCCGAGGAAAG
AACTGGTTGTGTCAAAGAAAGGAGTTGGTGTTAAGGTTGGGAAAG*ACAGAAGAGAGTGG
ATAGGAGGATGAAGAGTGACGCTAGGCAACGTGGAGGAGGCAAGCCCGGTAGGAAGGGGA
AGAAGAGTGCCGCTGGTAATAAATCAGGCCAGAAAAAACCGAGGGGTAAAAGACCCATGG
GCGACGGGTAAGTCCTCAATGG*TTCGGTTGTGTCGCAAAAAGGAAGTTTTGTTACCGTG
TCCCATCGTAGTTTGATATATTTATTTTGAGTACACTTCTTGACTTTGTTTTTAAATTCT
TGAATCAGTACTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGAGTCCCAAGTTAACTTACTGGAACTCTTA
TCTTGTTTATGAAGAGGTACCGTAATGGTAGTGCTTTC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL2631Contig1 758 2 9 U
GCATGAATAGTGTTCTTTAGAAGTGGAAGAAAACGAGCAAAGTTACTAAAGTTGAAGTTA
ACAAAAATAAAACAGTTAGAAAACAACAAAAAGACACAAAGAAGTTTCTCTTTTAAACAG
AAGAAGAAGCTTCAAGTTTGGGAAGAAGAGCTCTCCAACCATCAGCGACACCATTTGCTA
AGCGAGCTTGTCCTTTAGCAAACTGATGAAACGCAACTCCCATCTCTTCTGTCTTCTCTT
CTTGGAACCTTACTATCTCCTCGTTCATTCTCTTCACTATCCTCTCAAACCTTATCGTTG
CTTCCTCACTTTCTGCTTTTATCTCTCTGTATTCCTTCTCAGATTCTCCTACTTTGTCAG
AACGTGTGAGCATGAGTTTGTCAAGGTTTATTTCCTTCAACTTTGTTGTTTCTGTCAATT
CACAATGTTGCCTGAACGCAGTGCCTCGTTCTGCTATTGTCGCCTTGATGGATTGCACAT
AACGAACATAGTCCTTCAACGGTTCATCAAAGTTCATCAAAACTTGTTGAGCCTCTTTCT
GGAGCTTAATCGATACCAGTTCAGATTTAGTTCCAAGATCAGAAAATGCTTTTCCTGTAG
GTTCACCCTCACAAGCCCCAAGAAGTTTTACAGCTTTGCCAAAATCCAACAGTGACTGAC
CCAGTTCTCTATGCCTCTTGACGAGGCGAAATGCATGCTTCTGAGCTTCAGCTAAGTGGT
TCTCAAGCTCGGAAACGTAGTGTTTAAGCTTCTCGTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G568JQ U 1
AF RR4AM38JQ U 1
BS 1 274 RR4AM38JQ
BS 275 275 RR4G568JQ
BS 276 307 RR4AM38JQ
BS 308 308 RR4G568JQ
BS 309 436 RR4AM38JQ
BS 437 437 RR4G568JQ
BS 438 530 RR4AM38JQ
BS 531 531 RR4G568JQ
BS 532 758 RR4AM38JQ

RD RR4G568JQ 607 0 0
GCATGAATAGTGTTCTTTAGAAGTGGAAGAAAACGAGCAAAGTTACTAAAGTTGAAGTTA
ACAAAAATAAAACAGTTAGAAAACAACAAAAAGACACAAAGAAGTTTTTCTTTTAAACAG
AAGAAGAAGCTTCAAGTTTGGGAAGAAGAGCTCTCCAACCATCAGCGACACCATTTGCTA
AGCGAGCTTGTCCTTTAGCAAACTGATGAAACGCAACTCCCATCTCTTCTGTCTTCTCTT
CTTGGAACCTTACTATCTCCTCGTTCATTCTCTTCACTATCCTCTCAAACCTTATCGTTG
CTTCCTCACTTTCTGCTTTTATCTCTCTGTATTCCTTCTCAGATTCTCCTACTTTGTCAG
AACGTGTGAGCATGAGTTTGTCAAGGTTTATTTCCTTCAACTTTGTTGTTTCTGTCAATT
CACAATGTTGCCTGAACGCAGTGCCTCGTTCTGCTATTGTCGCCTTGATGGATTGCACAT
AACGAACATAGTCCTTCAACGGTTCCTCAAAGTTCATCAAAACTTGTTGAGCCTCTTTCT
GGAGCTTAATCGATACCAGTTCAGATTTAGTTCCAAGATCAGAAAATGCTTTTCCTGTAG
GTTCACC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4AM38JQ 758 0 0
GCATGAATAGTGTTCTTTAGAAGTGGAAGAAAACGAGCAAAGTTACTAAAGTTGAAGTTA
ACAAAAATAAAACAGTTAGAAAACAACAAAAAGACACAAAGAAGTTTCTCTTTTAAACAG
AAGAAGAAGCTTCAAGTTTGGGAAGAAGAGCTCTCCAACCATCAGCGACACCATTTGCTA
AGCGAGCTTGTCCTTTAGCAAACTGATGAAACGCAACTCCCATCTCTTCTGTCTTCTCTT
CTTGGAACCTTACTATCTCCTCGTTCATTCTCTTTACTATCCTCTCAAACCTTATCGTTG
CTTCCTCGCTTTCTGCTTTTATCTCTCTGTATTCCTTCTCAGATTCTCCTACTTTGTCAG
AACGTGTGAGCATGAGTTTGTCAAGGTTTATTTCCTTCAACTTTGTTGTTTCTGTCAATT
CACAATGTTGCCTGAATGCAGTGCCTCGTTCTGCTATTGTCGCCTTGATGGATTGCACAT
AACGAACATAGTCCTTCAACGGTTCATCAAAGTTCATCAAAACTTGTTGATCCTCTTTCT
GGAGCTTAATCGATACCAGTTCAGATTTAGTTCCAAGATCAGAAAATGCTTTTCCTGTAG
GTTCACCCTCACAAGCCCCAAGAAGTTTTACAGCTTTGCCAAAATCCAACAGTGACTGAC
CCAGTTCTCTATGCCTCTTGACGAGGCGAAATGCATGCTTCTGAGCTTCAGCTAAGTGGT
TCTCAAGCTCGGAAACGTAGTGTTTAAGCTTCTCGTAT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL2632Contig1 665 4 36 U
GGGTTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAAAAAAACAATGGGGGAGAAGGAAGCAAAG
ATCTTCACTCTCTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGTTGGATCGTCATC
AATGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTG*AGATGAAGTT
CTCCTGTCTTCAACAGGCAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAG
AGCGCAAGAGAGATGATGGAACAATACTACGTTGGAGAGATTGATCCGACAACAATCCCG
AAGAAAACCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAAACCTCTGAG
TTCGTTATCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCCTTGCAATTCTCGGTTTGGCAGTTGGG
ATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATATAGAG
AGAGTTAGAGATAATAAGTTCTTTTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTCCC*TTTGTTC
CTATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGTATTGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTCGCA
TCTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATATAATTCATGTTGCG
AAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 5 30 5 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 

AF RR4E394TF U 15
AF RR4EJ61TF U 1
AF RR4DH70JQ C 20
AF RR4DH70TF U 20
BS 1 107 RR4EJ61TF
BS 108 108 RR4DH70TF
BS 109 169 RR4EJ61TF
BS 170 170 RR4DH70TF
BS 171 197 RR4EJ61TF
BS 198 198 RR4DH70TF
BS 199 245 RR4EJ61TF
BS 246 246 RR4DH70TF
BS 247 323 RR4EJ61TF
BS 324 324 RR4DH70TF
BS 325 346 RR4EJ61TF
BS 347 347 RR4E394TF
BS 348 350 RR4EJ61TF
BS 351 351 RR4DH70TF
BS 352 363 RR4EJ61TF
BS 364 364 RR4DH70TF
BS 365 398 RR4EJ61TF
BS 399 399 RR4DH70TF
BS 400 459 RR4EJ61TF
BS 460 460 RR4DH70TF
BS 461 467 RR4EJ61TF
BS 468 468 RR4DH70TF
BS 469 484 RR4EJ61TF
BS 485 486 RR4DH70TF
BS 487 487 RR4EJ61TF
BS 488 488 RR4DH70TF
BS 489 492 RR4EJ61TF
BS 493 494 RR4DH70TF
BS 495 499 RR4EJ61TF
BS 500 500 RR4DH70TF
BS 501 532 RR4EJ61TF
BS 533 533 RR4DH70TF
BS 534 595 RR4EJ61TF
BS 596 596 RR4DH70TF
BS 597 662 RR4EJ61TF
BS 663 665 RR4DH70JQ

RD RR4E394TF 627 0 0
GAGGTAAAGAAGCAA
AAAAAAAACAATGGGGGAGAAGGAAGCAAAGATCTTCACTCTCTCAGAAGTTTCAGAGCA
CAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAATGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTT
CCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCTCCTGTCTTCAACAGGTAAGGATGCAAC
GGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCGAGAGAGATGATGGAACAATACTA
CGTTGGAGAGATTGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAACCAAGTACACACCTCCGAAACA
GCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTTCATTATCAAGATCCTCCAGTTCCTCGT
TCCCCTTGCCATTCTCGGTTTGGTAGTTGGGATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTA
GTCTTCTTTTCCATATCTACTATATATAGAGAGAGAGAAAGATT*TAAGT*CTTTTGAGA
AGACAAATCTCGAAGTCTCTCCCCTTTGTTCCTATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGT
ATTGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGCCGCATCTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAATGCAG
CTTATATTGATC

QA 16 627 16 627
DS 

RD RR4EJ61TF 662 0 0
GGGTTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAAAAAAACAATGGGGGAGAAGGAAGCAAAG
ATCTTCACTCTCTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATC
AATGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTT
CTCCTGTCTTCAACAGGTAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAG
AGCGCGAGAGAGATGATGGAACAATACTACGTTGGAGAGATTGATCCGACAACAATCCCG
AAGAAAACCAAGTACACACCTCCGAAACAGCCTCACTACAACCAAGGCAAGACCTCTGAG
TTCATTATCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCCTTGCCATTCTCGGTTTGGCAGTTGGG
ATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTAGTCTTCTTTTCCATATCTACTATATATAGAG
AGAGAGAAAGATT*TAAGT*CTTTTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTCCCCTTTGTTC
CTATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGTATTGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGCCGCA
TCTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATATAATTCATGTTGCG
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DH70JQ 646 0 0
GGAAAGAAGC
AAAAAAAACAATGGGGGAGAAGGAAGCAAAGATCTTCACTCTCTCAGAAGTTTCAGAGCA
CAATCACGCTCATGACTGTTGGATCGTCATCAATGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTT
CCTTGAAGACCATCCAGGTG*AGATGAAGTTCTCCTGTCTTCAACAGGCAAGGATGCAAC
GGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCAAGAGAGATGATGGAACAATACTA
CGTTGGAGAGATTGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAACCAAGTACACACCTCCTAAACA
GCCTCACTACAACCAAGACAAAACCTCTGAGTTCGTTATCAAGATCCTCCAGTTCCTCGT
TCCCCTTGCAATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTA
GTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATATAGAGAGAGTTAGAGATAATAAGTTCTTTTGAGA
AGACAAATCTCGAAGTCTCTCCC*TTTGTTCCTATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGT
ATTGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTCGCATCTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAATGCAG
CTGATATTGATCTAATATAATTCATGTTGCGAAACC

QA 11 646 11 646
DS 

RD RR4DH70TF 646 0 0
GGAAAGAAGC
AAAAAAAACAATGGGGGAGAAGGAAGCAAAGATCTTCACTCTCTCAGAAGTTTCAGAGCA
CAATCACGCTCATGACTGTTGGATCGTCATCAATGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTT
CCTTGAAGACCATCCAGGTG*AGATGAAGTTCTCCTGTCTTCAACAGGCAAGGATGCAAC
GGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCAAGAGAGATGATGGAACAATACTA
CGTTGGAGAGATTGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAACCAAGTACACACCTCCTAAACA
GCCTCACTACAACCAAGACAAAACCTCTGAGTTCGTTATCAAGATCCTCCAGTTCCTCGT
TCCCCTTGCAATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTA
GTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATATAGAGAGAGTTAGAGATAATAAGTTCTTTTGAGA
AGACAAATCTCGAAGTCTCTCCC*TTTGTTCCTATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGT
ATTGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTCGCATCTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAATGCAG
CTGATATTGATCTAATATAATTCATGTTGCGAA
ACC

QA 11 643 11 643
DS 



AS 1 3

CO CL2633Contig1 771 3 4 U
GGCTCTCTCTCCGAGCGATTTCGAGAAGCAAAAGAAAAAAAAATGGTGTCAACACGTCTC
TTCACTCATCTCATCTTCGTCTTGTCAATCTCCGTCTCAGTCACCGAATCGAAACTCTTG
GAGCATCCTCACGCCGCTGAGTCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTGAGGACTAGT
TGTTCGTACACAGTGATCATCTCGACGAGCTGTTCGTCGTCGAGGTACACGCGCGATCAA
ACCAGCCTCGCTTTCGGCGATGCATACGGAAACCAGATATACGCACCAAGGCTTGACGAT
CCAGCTACAAAGACGTTCGAGCAATGTTCATCCGACACGTTCCAGATAAACGGACCATGC
ACTTACCAGATATGCTACGTCTATCTCTACAGGTCTGGTCCCGATGGTTGGATCCCTGAT
AGCGTTAAGATATCTACCCATGGCTCCAAAGTCGTCACCTTCCCGTATAACACGCTAGTC
CCTGAGAATATATGGTATGGTTTCAATTACTGCAACAGCGCCTCCGGTTCTAGTGTCCTC
GCCACTGGTCTCGGAAGGGTCGTGCTCGTGCTCATGGGGTTTGTTGTCGTCGGCTTGACA
TTGCTTTTGTAAGCTGGTTTGTGTGAATATATTAGGACTTATGCTGAATAAATGTGTGTA
CTGTTGTTGAAAAAATTTGGGTCAAGAGATGTCCTGTGTAATCTTATGATGAAGTTACTA
CTTGCTAATTTACAAAGTGTGTAGACTATTATTAACATAACGTATTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD50TF U 1
AF RR4DD50JQ C 40
AF RR4DW59TF U 141
BS 1 592 RR4DD50TF
BS 593 593 RR4DW59TF
BS 594 631 RR4DD50TF
BS 632 771 RR4DW59TF

RD RR4DD50TF 631 0 0
GGCTCTCTCTCCGAGCGATTTCGAGAAGCAAAAGAAAAAAAAATGGTGTCAACACGTCTC
TTCACTCATCTCATCTTCGTCTTGTCAATCTCCGTCTCAGTCACCGAATCGAAACTCTTG
GAGCATCCTCACGCCGCTGAGTCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTGAGGACTAGT
TGTTCGTACACAGTGATCATCTCGACGAGCTGTTCGTCGTCGAGGTACACGCGCGATCAA
ACCAGCCTCGCTTTCGGCGATGCATACGGAAACCAGATATACGCACCAAGGCTTGACGAT
CCAGCTACAAAGACGTTCGAGCAATGTTCATCCGACACGTTCCAGATAAACGGACCATGC
ACTTACCAGATATGCTACGTCTATCTCTACAGGTCTGGTCCCGATGGTTGGATCCCTGAT
AGCGTTAAGATATCTACCCATGGCTCCAAAGTCGTCACCTTCCCGTATAACACGCTAGTC
CCTGAGAATATATGGTATGGTTTCAATTACTGCAACAGCGCCTCCGGTTCTAGTGTCCTC
GCCACTGGTCTCGGAAGGGTCGTGCTCGTGCTCATGGGGTTTGTTGTCGTCG*CTTGACA
TTGCTTTTGTAAGCTGGTTTGTGTGAATATA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4DD50JQ 714 0 0
AAAATGGTGTCAACACGTCTCTTCACTCATCTCATCTTCGTCTTGTCAATCTCCGTCTCA
GTCACCGAATCGAAACTCTTGGAGCATCCTCACGCCGCTGAGTCTTTCAATGTCAGCCTC
ATCCAGAAATTGAGGACTAGTTGTTCGTACACAGTGATCATCTCGACGAGCTGTTCGTCG
TCGAGGTACACGCGCGATCAAACCAGCCTCGCTTTCGGCGATGCATACGGAAACCAGATA
TACGCACCAAGGCTTGACGATCCAGCTACAAAGACGTTCGAGCAATGTTCATCCGACACG
TTCCAGATAAACGGACCATGCACTTACCAGATATGCTACGTCTATCTCTACAGGTCTGGT
CCCGATGGTTGGATCCCTGATAGCGTTAAGATATCTACCCATGGCTCCAAAGTCGTCACC
TTCCCGTATAACACGCTAGTCCCTGAGAATATATGGTATGGTTTCAATTACTGCAACAGC
GCCTCCGGTTCTAGTGTCCTCGCCACTGGTCTCGGAAGGGTCGTGCTCGTGCTCATGGGG
TTTGTTGTCGTCGGCTTGACATTGCTTTTGTAAGCTGGTTTGTGTGAATATATTAGGACT
TATGCTGAATAAATGTGTGTACTGTTGTTGAAAAAATTTGGGTCAAGAGATGTCCTGTGT
AATCTTATGATGAAGTTACTACTTGCTAATTTACAAAGTGTGTAGACTATTATT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DW59TF 631 0 0
GTCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTGAGGACTAGTTGTTCGTACACAGTGATCAT
CTCGACGAGCTGTTCGTCGTCGAGGTACACGCGCGATCAAATCAGCCTCGCTTTCGGCGA
TGCATACGGAAACCAGATATACGCACCAAGGCTTGACGATCCAGCTACAAAGACGTTCGA
GCAATGTTCATCCGACACGTTCCAGATAAACGGACCATGCACTTACCAGATATGCTACGT
CTATCTCTACAGGTCTGGTCCCGATGGTTGGATCCCTGATAGCGTTAAGATATCTACCCA
TGGCTCCAAAGTCGTCACCTTCCCGTATAACACGCTAGTCCCTGAGAATATATGGTATGG
TTTCAATTACTGCAACAGCGCCTCCGGTTCTAGTGTCCTCGCCACTGGTCTCGGAAGGGT
CGTGCTCGTGCTCATGGGGTTTGTTGTCGTCGGTTTGACATTGCTTTTGTAAGCTGGTTT
GTGTGAATATATTAGGACTTATGCTGAATAAATGTGTGTACTGTTGTTGAAAAAATTTGG
GTCAAGAGATGTCCTGTGTAATCTTATGATGAAGTTACTACTTGCTAATTTACAAAGTGT
GTAGACTATTATTAACATAACGTATTCATTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL2634Contig1 1187 4 10 U
GGGAAGAAGAAGGAAGATAAAGGCTCCATACATATCCATGGCTCTTCTCTCTCCATCTTT
CTCCTCTCCCTGCTATCGTCTTCACAGGTGCAGAAGGAGCAACAGCATTTCGAGCAAGTA
TCGTCATGGAGGAGAATCAAGTGAGCTGATCATTTCTCCCTCTCGTGTTTCCACGAGATC
GGAGGGACTTTCTCGTAGGGATTTAGTGTTAATTGGTCTCTCTTCTCCCTTATCTACGCT
CTTGCCACTGTCGTCTTCTCCTGTCACTTTTGCTGCAGAAGACGAAGCAGTGAAAATGGG
TGGGGAAGAACCTAAAATGGGTTCTATGGTGGATGATCTCAATGCTTATTCTTATTCTTA
CCCACTCGAGCTTCCATCTGAGAAGCTTGCCTTCAAATGGGTTGAATCAAGAAAGCCTGA
ACGTTACTCTTCAGCTGCGCCACTCTCTCCTGATGCCCGTCTAAGGATTGTTTCTGAACG
ACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCCATTTCGATAGGTCCCCCTAACCCAAGCTT
CCTAACATCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTC
TGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGTCTAGAAGAAAGCTCGGTTCTTGA
TGCACATTCTACTGATATTGATGGGGAGCCTTACTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAA
ATCACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGATGTACAGACACTACATTTCTTCAACAGC
TGAACGGGATGGGTACTTATACACCATGAATGCCTCAACCCTTGGCAAGCAATGGGACAT
GATGGGACCGGTGTTAGAAAGAGCAGTTGAGTCCTTTAGGCTTCTTCCTCCTACTGATAG
TTATGTTCCTCCATTCAAGGATCCATGGAGGTTTTGGTGATACTTCCATCTACTGTACCT
CAAAGCTTTTCTTCATCAAAGCTGCTGCTTCTTCCTTTTGAAACTGTAGTTAAAAGTTTG
ATAGGAGAGGTTCAGAATCTTGATAGCCCTCTCACTCTCAGTTATGAAAGTTGTAGGGAC
TAGTCTTCCCCAACTTTGAAGATCTTGTTTACTGCCCAATGTATTGAGAGATGTATACTT
GCATGACTTCTAACTCATCCAAGGAATATATATGCATGTGTTCTTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G327TF U 1
AF RR4G847TF U 1
AF RR4G847JQ C 454
AF RR4G327JQ C 543
BS 1 720 RR4G327TF
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BS 722 733 RR4G327TF
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BS 751 770 RR4G327TF
BS 771 1187 RR4G847JQ

RD RR4G327TF 780 0 0
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CTCCTCTCCCTGCTATCGTCTTCACAGGTGCAGAAGGAGCAACAGCATTTCGAGCAAGTA
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GGAGGGACTTTCTCGTAGGGATTTAGTGTTAATTGGTCTCTCTTCTCCCTTATCTACGCT
CTTGCCACTGTCGTCTTCTCCTGTCACTTTTGCTGCAGAAGACGAAGCAGTGAAAATGGG
TGGGGAAGAACCTAAAATGGGTTCTATGGTGGATGATCTCAATGCTTATTCTTATTCTTA
CCCACTCGAGCTTCCATCTGAGAAGCTTGCCTTCAAATGGGTTGAATCAAGAAAGCCTGA
ACGTTACTCTTCAGCTGCGCCACTCTCTCCTGATGCCCGTCTAAGGATTGTTTCTGAACG
ACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCCATTTCGATAGGTCCCCCTAACCCAAGCTT
CCTAACATCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTC
TGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGTCTAGAAGAAAGCTCGGTTCTTGA
TGCACATTCTACTGATATTGATGGGGAGCCTTACTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAA
*TCACCTACCAAA*TCGCTGA*GCATCAA*GATGTACAGACACTACATTT
TTCACAGCTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4G847TF 745 0 0
GGGAAGAAGAAGGAAGATAAAGGCTCCATACATATCCATGGCTCTTCTCTCTCCATCTTT
CTCCTCTCCCTGCTATCGTCTTCACAGGTGCAGAAGGAGCAACAGCATTTCGAGCAAGTA
TCGTCATGGAGGAGAATCAAGTGAGCTGATCATTTCTCCCTCTCGTGTTTCCACGAGATC
GGAGGGACTTTCTCGTAGGGATTTAGTGTTAATTGGTCTCTCTTCTCCCTTATCTACGCT
CTTGCCACTGTCGTCTTCTCCTGTCACTTTTGCTGCAGAAGACGAAGCAGTGAAAATGGG
TGGGGAAGAACCTAAAATGGGTTCTATGGTGGATGATCTCAATGCTTATTCTTATTCTTA
CCCACTCGAGCTTCCATCTGAGAAGCTTGCCTTCAAATGGGTTGAATCAAGAAAGCCTGA
ACGTTACTCTTCAGCTGCGCCACTCTCTCCTGATGCCCGTCTAAGGATTGTTTCTGAACG
ACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCCATTTCGATAGGTCCCCCTAACCCAAGCTT
CCTAACATCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTC
TGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGTCTAGAAGAAAGCTCGGTTCTTGA
TGCACATTCTACTGATATTGATGGGGAGCCTTACTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAA
ATCACCTACCAAA
ATCGCTGAAGCA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4G847JQ 734 0 0
TGCCCGTCTAAGGATTGTTTCTGAACGACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCCAT
TTCGATAGGTCCCCCTAACCCAAGCTTCCTAACATCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGC
CAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCA
GCGTCTAGAAGAAAGCTCGGTTCTTGATGCACATTCTACTGATATTGATGGGGAGCCTTA
CTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAAATCACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGAT
GTACAGACACTACATTTCTTCAACAGCTGAACGGGATGGGTACTTATACACCATGAATGC
CTCAACCCTTGGCAAGCAATGGGACATGATGGGACCGGTGTTAGAAAGAGCAGTTGAGTC
CTTTAGGCTTCTTCCTCCTACTGATAGTTATGTTCCTCCATTCAAGGATCCATGGAGGTT
TTGGTGATACTTCCATCTACTGTACCTCAAAGCTTTTCTTCATCAAAGCTGCTGCTTCTT
CCTTTTGAAACTGTAGTTAAAAGTTTGATAGGAGAGGTTCAGAATCTTGATAGCCCTCTC
ACTCTCAGTTATGAAAGTTGTAGGGACTAGTCTTCCCCAACTTTGAAGATCTTGTTTACT
GCCCAATGTATTGAGAGATGTATACTTGCATGACTTCTAACTCATCCAAGGAATATATAT
GCATGTGTTCTTCG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4G327JQ 645 0 0
TAACATCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTG
ATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGTCTAGAAGAAAGCTCGGTTCTTGATG
CACATTCTACTGATATTGATGGGGAGCCTTACTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAAAT
CACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGATGTACAGACACTACATTTCTTCAACAGCTG
AACGGGATGGGTACTTATACACCATGAATGCCTCAACCCTTGGCAAGCAATGGGACATGA
TGGGACCGGTGTTAGAAAGAGCAGTTGAGTCCTTTAGGCTTCTTCCTCCTACTGATAGTT
ATGTTCCTCCATTCAAGGATCCATGGAGGTTTTGGTGATACTTCCATCTACTGTACCTCA
AAGCTTTTCTTCATCAAAGCTGCTGCTTCTTCCTTTTGAAACTGTAGTTAAAAGTTTGAT
AGGAGAGGTTCAGAATCTTGATAGCCCTCTCACTCTCAGTTATGAAAGTTGTAGGGACTA
GTCTTCCCCAACTTTGAAGATCTTGTTTACTGCCCAATGTATTGAGAGATGTATACTTGC
ATGACTTCTAACTCATCCAAGGAATATATATGCATGTGTTCTTCG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 4

CO CL2635Contig1 736 4 8 U
TTTTTGCGGAGACGCTAATCTCTTGTGTGTTGAATCTTTAAGCTTCTCTTGAATGGCGTC
TATTTTCAGACCTTCTGTTTCACTTGACCTACGACCAAAGGTGACCTGCACGAATCTCTC
CACTAAAGAACAACTTAAGTTTCAGAGCAAGAGTTTGAGAAAAGAGAAGCTCAACGTTAG
GTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCAAGCACCAGGGACTAGTGCGATTACAGAGCTTAACAA
CAAAACCGATTATGGAGTTGTAGGGGTTCACCATGTTGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGA
AAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGACTTGAGATCAACGAGGCGAGGCCACA
CGACAAGCTTCCCTACAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGTTCAGAGATGATTCATCTAAT
GGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACTGGTAGACCCGAGCACGGTGGCCGTGATCGGCA
TGCTTGTATCGCAATCCGGGATGTTTCAAATCTCAAAGAGATTTTGGATAAAGCTGGGAT
TGAGTATACGATGAGCAAGTCAGGGAGGCCAGCAATATTCACTCGTGATCCAGACACAAA
CGCTCTTGAGTTTACTCAAATTTGATTCTCTAGTTTCTCTTTTGGGTCTTCTAGTGTATG
GATGAATGGATGGATATAAGTTGTAGATACATACTTTATACTGCTCAAGTAGTCAAGTCT
TACCTCTACAGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ50TF U 23
AF RR4FG66TF U 1
AF RR4EJ50JQ C 81
AF RR4FG66JQ C 93
BS 1 343 RR4FG66TF
BS 344 344 RR4EJ50TF
BS 345 408 RR4FG66TF
BS 409 409 RR4EJ50TF
BS 410 500 RR4FG66TF
BS 501 501 RR4EJ50TF
BS 502 612 RR4FG66TF
BS 613 736 RR4EJ50JQ

RD RR4EJ50TF 512 0 0
GG
GTGTGTTGAATCTTTAAGCTTCTCTTGAATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCTGTTTCACT
TGACCTACGACCAAAGGTGACCTGCACGAATCTCTCCACTAAAGAACAACTTAAGTTTCA
GAGCAAGAGTTTGAGAAAAGAGAAGCTCAACGTTAGGTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCA
AGCACCAGGGACTAGTGCGATTACAGAGCTTAACAACAAAACCGATTATGGAGTTGTAGG
GGTTCACCATGTTGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGAAAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAA
CATTCTAGGACTTGAGATCAACGAGGCGAGGCCACACGACAAGCTTCCCTACAGAGGAGC
ATGGTTATGGGTAGGTTCAGAGATGATTCATCTATTGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATT
AACTGGTAGACCCGAGCACGGTGGCCGTGATCGGCATGCTTGTATCGCAATCCGGGATGT
TTCAAATCTCAAAGAGATTTTGGATAAAGC

QA 3 512 3 512
DS 

RD RR4FG66TF 627 0 0
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TATTTTCAGACCTTCTGTTTCACTTGACCTACGACCAAAGGTGACCTGCACGAATCTCTC
CACTAAAGAACAACTTAAGTTTCAGAGCAAGAGTTTGAGAAAAGAGAAGCTCAACGTTAG
GTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCAAGCACCAGGGACTAGTGCGATTACAGAGCTTAACAA
CAAAACCGATTATGGAGTTGTAGGGGTTCACCATGTTGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGA
AAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGACTTGAGATCGACGAGGCGAGGCCACA
CGACAAGCTTCCCTACAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGTTCAGAGATTATTCATCTAAT
GGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACTGGTAGACCCGAGCACGGTGGCCGTGATCGGCA
TGCTTGTATCGCAATCCGGGGTGTTTCAAATCTCAAAGAGATTTTGGATAAAGCTGGGAT
TGAGTATACGATGAGCAAGTCAGGGAGGCCAGCAATATTCACTCGTGATCCAGACACAAA
CGCTCTTGAGTT
ACTCAATTGATCTCT

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DS 

RD RR4EJ50JQ 656 0 0
CACTTGACCTACGACCAAAGGTGACCTGCACGAATCTCTCCACTAAAGAACAACTTAAGT
TTCAGAGCAAGAGTTTGAGAAAAGAGAAGCTCAACGTTAGGTTACGTGGCGTGAAAGCTA
ATCAAGCACCAGGGACTAGTGCGATTACAGAGCTTAACAACAAAACCGATTATGGAGTTG
TAGGGGTTCACCATGTTGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGAAAGGTCACTTGAGTTTTACC
AGAACATTCTAGGACTTGAGATCAACGAGGCGAGGCCACACGACAAGCTTCCCTACAGAG
GAGCATGGTTATGGGTAGGTTCAGAGATGATTCATCTATTGGAGCTTCCAAATCCTGATC
CATTAACTGGTAGACCCGAGCACGGTGGCCGTGATCGGCATGCTTGTATCGCAATCCGGG
ATGTTTCAAATCTCAAAGAGATTTTGGATAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGCAAGT
CGGGGAGGCCAGCAATATTCACTCGTGATCCAGACACAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAA
TTTGATTCTCTAGTTTCTCTTTTGGGTCTTCTAGTGTATGGATGAATGGATGGATATAAG
TTGTAGATACATACTTTATACTGCTCAAGTAGTCAAGTCTTACCTCTACAGTGTTC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4FG66JQ 631 0 0
GACCAAAGGTGACCTGCACGAATCTCTCCACTAAAGAACAACTTAAGTTTCAGAGCAAGA
GTTTGAGAAAAGAGAAGCTCAACGTTAGGTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCAAGCACCAG
GGACTAGTGCGATTACAGAGCTTAACAACAAAACCGATTATGGAGTTGTAGGGGTTCACC
ATGTTGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGAAAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAACATTCTAG
GACTTGAGATCGACGAGGCGAGGCCACACGACAAGCTTCCCTACAGAGGAGCATGGTTAT
GGGTAGGTTCAGAGATTATTCATCTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACTGGTA
GACCCGAGCACGGTGGCCGTGATCGGCATGCTTGTATCGCAATCCGGGGTGTTTCAAATC
TCAAAGAGATTTTGGATAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGCAAGTCAGGGAGGCCAG
CAATATTCACTCGTGATCCAGACACAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAATTTGATTCTCTA
GTTTCTCTTTTGGGTCTTCTAGTGTATGGATGAATGGATGGATATAAGTTGTAGATACAT
ACTTTATACTGCTCAAGTAGTCAAGTCTTAC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL2636Contig1 1034 4 3 U
CTTGTTGTTTGGTTGGAGTGATATATCAGAGTACTCTGTTCGTGGCGAGTCTTGGAGACT
CGCGTGTTGTTCTCGGGAAGAAGAGTAACTGCGGCGGTGGTGGGCTCTCTGCTATTCAGC
TTTCGGGTGAACACAATGCTAATAACGAGGATATTCGTTGGGAACTCAAGGACTTGCATC
CTGATGATCCGCAGGTCGTTGTGTTTAGGCATGGAGTTTGGAGAGTCAAGGGCATCATCC
AGGTTTCGAGATCTATAGGAGACATGTACATGAAACGGCCAGAGTTTAACAGGGAACCGA
TTGCTCAGAAGTTCAGGCTTGCAGAGCCAATGAAGAGACCTTTGATGTCTGCAACACCAA
CCATACTCTCTCATCCGCTGCACCCTAATGACTCTTTCCTCATCTTTGCGTCTGATGGTC
TTTGGGAGCATTTGAGTAACGAGAAAGCAGTTGAGATTGTTCATAGCCATCCTCGCGCTG
GAAGTGCAAAGAGACTGATAAAAGCGGCTCTTCAAGAGGCAGCGAGGAAAAGAGAGATGA
GGTATTCAGATCTAAGGAAGATTGACAAGAAAGTGAGACGCCATTTTCATGATGACATCA
CGGTTATAGTAGTGTTCTTGAGCCATGACCTCATCTCAAGAGGCCACACGAACACAACAA
CCCAAGACTCAGCACTCTCGGTCCGGAGTGCTCTTGAACACTGAGGAACATTAATTTACA
AAATGTTTTTTTTTATTTTCATCTTCTTACTTGGTTGGTTTATATGACACTTCTTCTGCC
TAGAAGGTAATAAAAAACACTGGGCAAATATCAAAATGTGGAAACGGCATCAGTACGTAA
TGAGTTGTGTTGTATTAAGCGGGGTATGTTTGGTTTCGTTTTCAAGTCTGCATAGTTCGT
TCTCTTTCTGGTGACTACTACTACTTTTCTTGTTTTCAGTCTATTCCGTTTCCTAGGAGA
AAAAAACTGCATGTCGTTTTTCTTATATGTTTATCCCATCTGACAAGCATGTGACAGTAT
GTCTGTAAAATTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV35TF U 1
AF RR4AX34TF U 1
AF RR4AX34JQ C 575
AF RR4AV35JQ C 415
BS 1 754 RR4AV35TF
BS 755 786 RR4AX34TF
BS 787 1034 RR4AV35JQ

RD RR4AV35TF 754 0 0
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CGCGTGTTGTTCTCGGGAAGAAGAGTAACTGCGGCGGTGGTGGGCTCTCTGCTATTCAGC
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CCATACTCTCTCATCCGCTGCACCCTAATGACTCTTTCCTCATCTTTGCGTCTGATGGTC
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GGTATTCAGATCTAAGGAAGATTGACAAGAAAGTGAGACGCCATTTTCATGATGACATCA
CGGTTATAGTAGTGTTCTTGAGCCATGACCTCATCTCAAGAGGCCACACGAACACAACAA
CCCAAGACTCAGCACTCTCGGTCCGGAGTGCTCTTGAACACTGAGGAACATTAATTTACA
AAATGTTTTTTTTTATTTTCATCTTCTTACTTGG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AX34TF 790 0 0
CTTGTTGTTTGGTTGGAGTGATATATCAGAGTACTCTGTTCGTGGCGAGTCTTGGAGACT
CGCGTGTTGTTCTCGGGAAGAAGAGTAACTGCGGCGGTGGTGGGCTCTCTGCTATTCAGC
TTTCGGGTGAACACAATGCTAATAACGAGGATATTCGTTGGGAACTCAAGGACTTGCATC
CTGATGATCCGCAGGTCGTTGTGTTTAGGCATGGAGTTTGGAGAGTCAAGGGCATCATCC
AGGTTTCGAGATCTATAGGAGACATGTACATGAAACGGCCAGAGTTTAACAGGGAACCGA
TTGCTCAGAAGTTCAGGCTTGCAGAGCCAATGAAGAGACCTTTGATGTCTGCAACACCAA
CCATACTCTCTCATCCGCTGCACCCTAATGACTCTTTCCTCATCTTTGCGTCTGATGGTC
TTTGGGAGCATTTGAGTAACGAGAAAGCAGTTGAGATTGTTCATAGCCATCCTCGCGCTG
GAAGTGCAAAGAGACTGATAAAAGCGGCTCTTCAAGAGGCAGCGAGGAAAAGAGAGATGA
GGTATTCAGATCTAAGGAAGATTGACAAGAAAGTGAGACGCCATTTTCATGATGACATCA
CGGTTATAGTAGTGTTCTTGAGCCATGACCTCATCTCAAGAGGCCACACGAACACAACAA
CCCAAGACTCAGCACTCTCGGTCCGGAGTGCTCTTGAACACTGAGGAACATTAATTTACA
AAATGTTTTTTTTTATTTTCATCTTCTTACTTGGTTGGTTTATATGACACTTCTTCTGCC
TAGAAG
TAAT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4AX34JQ 217 0 0
GAGACGCCATTTTCATGATGACATCACGGTTATAGTAGTGTTCTTGAGCCATGACCTCAT
CTCAAGAGGCCCCACGAACACAACAACCCAAGACTCAGCACTCTCGGTCCGGAGTGCTCT
TGAACACTGAGGAACATTAATTTACAAAATGTTTTTTTTTATTTTCTTCTTCTTACTTGG
TTGGTTTATATGACACTTCTTCTGCCTAGAAG
GTAAT

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR4AV35JQ 620 0 0
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GCGCTGGAAGTGCAAAGAGACTGATAAAAGCGGCTCTTCAAGAGGCAGCGAGGAAAAGAG
AGATGAGGTATTCAGATTTAAGGAAGATTGACAAGAAAGTGAGACGCCATTTTCATGATG
ACATCACGGTTATAGTAGTGTTCTTGAGCCATGACCTCATCTCAAGAGGCCACACGAACA
CAACAACCCAAGACTCAGCACTCTCGGTCCGGAGTGCTCTTGAACACTGAGGAACATTAA
TTTACAAAATGTTTTTTTTTATTTTCATCTTCTTACTTGGTTGGTTTATATGACACTTCT
TCTGCCTAGAAGGTAATAAAAAACACTGGGCAAATATCAAAATGTGGAAACGGCATCAGT
ACGTAATGAGTTGTGTTGTATTAAGCGGGGTATGTTTGGTTTCGTTTTCAAGTCTGCATA
GTTCGTTCTCTTTCTGGTGACTACTACTACTTTTCTTGTTTTCAGTCTATTCCGTTTCCT
AGGAGAAAAAAACTGCATGTCGTTTTTCTTATATGTTTATCCCATCTGACAAGCATGTGA
CAGTATGTCTGTAAAATTGA

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 4

CO CL2637Contig1 660 4 3 U
GGATTCATCTCCCAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAG
AGAATCGAACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCC
GTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGAT
CCAGCAGAGGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAG
CTACGAGAAGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCA
GGACAAGGAGCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCA
CTTCTTGGTTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAGA
TCCCCGATTCGAATTAGATCGTGTGATATCTTTCTTTCTATTTATATATGCGAATAATTG
GACGTGGTGTGTGTGATCACTAGGAAGTTTTTTTTTTTTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTG
GTGTGGGACATTTGACTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTGTTGTATTTTACA
TATCTTCGTTTAAGTTATTTCCTCAAGAAAGAATTGTTTATGAAATATCACGATTTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E312TF U 1
AF RR4E312JQ C 1
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AF RR4FA53TF U 12
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G

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G

QA 3 613 3 613
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL24JQ U 1
AF RR4BW29JQ U 1
AF RR4EH34JQ U 69
AF RR4FL24TF C 160
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TG

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QA 1 768 1 768
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QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

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GGTATATAATGATTGGTTGATTTCCTCCTAATCAGTATTCACTTTTTTTTTTGACCGATC
TTGTGTACGTTTCAATCCTTACGGGAGTTCCTTGTCTTCATCCACAAAGTAAGGATTGAA
TTGATTTATGACATGCTCGTAGACAGGTCTCTTGAAATATACAGCATGTTCAATCACTTG
TTCGGGTAGCATCCAGGACCACACCTTAAACTCTGGTTTTGCAGTACCATCTCCTAGGAG
ATTTATTTCTTCTTCCTTGCCAGTGAACTTGAAGAGAAACCATTTCTGAGCTTGGCCTTT
GTAACTTGTTCGCCATTTCCGATTAAGTTTGTCCTTCACATCCCGGGGGAAATCATAGGT
CAGCCAGTTTGGTATCTCGGCAATGAATTCAGCAGAGGTAACCCCTGTTTCTTCTCTGAG
CTCTCTAAAAGCAGCATTTCTAAGATCTTCTCCCTCATCAGCACCACCCTGAGGCATTTG
CCATGTATCCGGAACGTGAATCTTTGATGCAGTAAAAATCTTTCTACATGGACTAACGAG
ACAAATCCCAACATTTTTCCGGTAACCAACCGGCGGCGACTCGACTGTTCTCGCCGGCGG
CGATAAAGCTACGGACCGAACCACCGGAGGCTTTGAGGCAGAGAAGGGACGTTTCAGGTA
TGATAATTTGGAAGAGAACTCTACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4GS32TF C 1
AF RR4GS32JQ U 173
AF RR4GC95JQ U 3
AF RR4GC95TF C 169
BS 1 2 RR4GS32TF
BS 3 60 RR4GC95JQ
BS 61 61 RR4GS32TF
BS 62 126 RR4GC95JQ
BS 127 128 RR4GS32TF
BS 129 170 RR4GC95JQ
BS 171 172 RR4GS32TF
BS 173 179 RR4GC95JQ
BS 180 180 RR4GS32TF
BS 181 561 RR4GC95JQ
BS 562 805 RR4GC95TF

RD RR4GS32TF 451 0 0
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GGTATATAATGATTGGTTGATTTCCTCCTAATCAGTATTCACTTTTTTTTTTGACCGATC
TTGTGTACGTTTCAATCCTTACGGGAGTTCCTTGTCTTCATCCACAAAGTAAGGATTGAA
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QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4GS32JQ 342 0 0
GACCCATC
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TTCGGGTAGCATCCAGGACCACACCTTAAACTCTGGTTTTGCAGTACCATCTCCTAGGAG
ATTTATTTCTTCTTCCTTGCCAGTGAACTTGAAAAAAAACCATTTCTGAGCTTGGCCTTT
GTAACTTGTTCGCCATTTCCCATTCAGTTTGTCCTTCACATCCCGGGGGAAATCATAGGT
CAGCCAGTTTGGTATCTCGGCAATGAATTCAGCA

QA 9 342 9 342
DS 

RD RR4GC95JQ 559 0 0
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TATA**ATGATTGGTTGATTTCCTCCTAATCAGTATTCACTTTTTTTT**GACCGATTTT
GTGTACGTTTCAATCCTTACGGGAGTTCCTTGTCTTCATCCACAAAGTAAGGATTGAATT
GATTTATGACATGCTCGTAGACAGGTCTCTTGAAATATACAGCATGTTCAATCACTTGTT
CGGGTAGCATCCAGGACCACACCTTAAACTCTGGTTTTGCAGTACCATCTCCTAGGAGAT
TTATTTCTTCTTCCTTGCCAGTGAACTTGAAGAGAAACCATTTCTGAGCTTGGCCTTTGT
AACTTGTTCGCCATTTCCGATTAAGTTTGTCCTTCACATCCCGGGGGAAATCATAGGTCA
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CTCTAAAAGCAGCATTTCT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4GC95TF 637 0 0
TTTTGACCGATT
TTGTGTACGTTTCAATCCTTACGGGAGTTCCTTGTCTTCATCCACAAAGTAAGGATTGAA
TTGATTTATGACATGCTCGTAGACAGGTCTCTTGAAATATACAGCATGTTCAATCACTTG
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ATTTATTTCTTCTTCCTTGCCAGTGAACTTGAAGAGAAACCATTTCTGAGCTTGGCCTTT
GTAACTTGTTCGCCATTTCCGATTAAGTTTGTCCTTCACATCCCGGGGGAAATCATAGGT
CAGCCAGTTTGGTATCTCGGCAATGAATTCAGCAGAGGTAACCCCTGTTTCTTCTCTGAG
CTCTCTAAAAGCAGCATTTCTAAGATCTTCTCCCTCATCAGCACCACCCTGAGGCATTTG
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TGATAATTTGGAAGAGAACTCTACC

QA 13 637 13 637
DS 



AS 1 3

CO CL2640Contig1 1196 3 13 U
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AAAGTAAAACCCTATTTGTCTCCGTCTTTATCCCAATCTTCAGAAAGTCGTGAGCTTCTC
AGTCCTTTTGTTCTTGGGAGAATCGAATTATGTACAAGGAACGGAGTGGTGGCGGGTCGT
CGAGATCGGAGATCGTGGGTGGAGCAATTGATCGGAAACGAATCAACGACGCACTCAACA
AGAGACTAGAGAAGTCTTCGACATCCAGTTCTAAAGACAAACATCAGCTTCCAGATGTGG
AATCTGAAACGGATAGTGATGGTTCGGATGTGAGTGGATCGGAAGGTGATGATGATGATG
ATGATACATCTTGGATCTCGTGGTTTTGTAATCTGAGAGGGAATGATTTCTTCTGTGAAG
TCGATGAAGATTATATACAAGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCAAGTTCCTT
ACTATGAGTATGCGCTTGATCTCATCCTAGATGTCGAGTCTTCAAACAGTGAGATGTTTA
CAGAAGAACAGAATGAACTTGTGGAATCAGCTGCTGAAATGTTGTATGGTCTTATTCATG
TTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAATGGCTGAGAAGTTCAAGAAGTGTG
ATTTCGGGAGATGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACAATCTTGTCTACCAGTTGGACAAT
CTGACATACCGAGATCGAGTACTGTGAAGATATACTGCCCAAAATGCCAAGACATATCTT
ACCCTCGATCTAAATTCCAAGATATTGATGGAGCATACTTTGTAACCACGTTCCCTCATT
TGTTCTTGATGACTAACGGGAATTTGAAGCCTCAGAAACCGACTCAGAACTATGTCCCAA
GAATCTTTGGGTTTAAGGTACACAAACCATGATACTAGTGCCTCTGCGTTCTCTCAATGG
TGAAACATTGAGCAACTGAAGATAGCTGCGGCTTGGAGGGAGAGCATACCAATCAAATCA
TTGTATCGTAGACAGACGATCTGGACTCGGAAATGTAATGTTCCTTCGGTTGGATTTTTG
TTTTTTTTTTTCTTATTTCTGTGTTATTTATCTAGATATTGTTATCTTCTTCTCAGCATA
TTTTTCTCTAATTTCATGTATAACCTCAGGAATAGTTCAATTCAAAGGTTAACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG10TF U 1
AF RR4DH31TF U 366
AF RR4DH31JQ C 578
BS 1 421 RR4GG10TF
BS 422 422 RR4DH31TF
BS 423 505 RR4GG10TF
BS 506 506 RR4DH31TF
BS 507 697 RR4GG10TF
BS 698 1057 RR4DH31TF
BS 1058 1058 RR4DH31JQ
BS 1059 1070 RR4DH31TF
BS 1071 1071 RR4DH31JQ
BS 1072 1090 RR4DH31TF
BS 1091 1091 RR4DH31JQ
BS 1092 1136 RR4DH31TF
BS 1137 1196 RR4DH31JQ

RD RR4GG10TF 704 0 0
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AAAGTAAAACCCTATTTGTCTCCGTCTTTATCCCAATCTTCAGAAAGTCGTGAGCTTCTC
AGTCCTTTTGTTCTTGGGAGAATCGAATTATGTACAAGGAACGGAGTGGTGGCGGGTCGT
CGAGATCGGAGATCGTGGGTGGAGCAATTGATCGGAAACGAATCAACGACGCACTCAACA
AGAGACTAGAGAAGTCTTCGACATCCAGTTCTAAAGACAAACATCAGCTTCCAGATGTGG
AATCTGAAACGGATAGTGATGGTTCGGATGTGAGTGGATCGGAAGGTGATGATGATGATG
ATGATACATCTTGGATCTCGTGGTTTTGTAATCTGAGAGGGAATGATTTCTTCTGTGAAG
TGGATGAAGATTATATACAAGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCAAGTTCCTT
ACTATGAGTATGCGCTTGATCTCATTCTAGATGTCGAGTCTTCAAACAGTGAGATGTTTA
CAGAAGAACAGAATGAACTTGTGGAATCAGCTGCTGAAATGTTGTATGGTCTTATTCATG
TTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAATGGCTGAGAAGTTCAAGAAGTGTG
ATTTCGGGAGATGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACA
TCTTGTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DH31TF 771 0 0
ACCTCG
TGGATCTCGTGGTTTTGTAATTTGAGAGGGAATGATTTCTTCTGTGAAGTCGATGAAGAT
TATATACAAGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCAAGTTCCTTACTATGAGTAT
GCGCTTGATCTCATCCTAGATGTCGAGTCTTCAAACAGTGAGATGTTTACAGAAGAACAG
AATGAACTTGTGGAATCAGCTGCTGAAATGTTGTATGGTCTTATTCATGTTCGTTACATT
TTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAATGGCTGAGAAGTTCAAGAAGTGTGATTTCGGGAGA
TGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACAATCTTGTCTACCAGTTGGACAATCTGACATACCG
AGATCGAGTACTGTGAAGATATACTGCCCAAAATGCCAAGACATATCTTACCCTCGATCT
AAATTCCAAGATATTGATGGAGCATACTTTGTAACCACGTTCCCTCATTTGTTCTTGATG
ACTAACGGGAATTTGAAGCCTCAGAAACCGACTCAGAACTATGTCCCAAGAATCTTTGGG
TTTAAGGTACACAAACCATGATACTAGTGCCTCTGCGTTCTCTCAATGGTGAAACATTGA
GCAACTGAAGATAGCTGCGGCTTGGAGGGAGAGCATACCAATCAAATCATTGTATCGTAG
ACAGACGATCTGGACTCGGAAATGTA*TGTTCCTTCGGT*GGATTTTTGTTTTTTTTTT*
CTTATTTCTGTGTTATTTATCTAGATATTGTTATCTTCTTCTCAG

QA 7 771 7 771
DS 

RD RR4DH31JQ 619 0 0
AATGTTGTATGGTCTTATTCATGTTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAAT
GGCTGAGAAGTTCAAGAAGTGTGATTTCGGGAGATGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACA
ATCTTGTCTACCAGTTGGACAATCTGACATACCGAGATCGAGTACTGTGAAGATATACTG
CCCAAAATGCCAAGACATATCTTACCCTCGATCTAAATTCCAAGATATTGATGGAGCATA
CTTTGTAACCACGTTCCCTCATTTGTTCTTGATGACTAACGGGAATTTGAAGCCTCAGAA
ACCGACTCAGAACTATGTCCCAAGAATCTTTGGGTTTAAGGTACACAAACCATGATACTA
GTGCCTCTGCGTTCTCTCAATGGTGAAACATTGAGCAACTGAAGATAGCTGCGGCTTGGA
GGGAGAGCATACCAATCAAATCATTGTATCGTAGACAGACGATCTGGACTCGGAAATGTA
ATGTTCCTTCGGTTGGATTTTTGTTTTTTTTTTTCTTATTTCTGTGTTATTTATCTAGAT
ATTGTTATCTTCTTCTCAGCATATTTTTCTCTAATTTCATGTATAACCTCAGGAATAGTT
CAATTCAAAGGTTAACAGT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 4

CO CL2641Contig1 609 4 39 U
GGGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCAAGTCACA
GGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGTCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTAGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCG
AAGAAGTGGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGGTTCTCCACCC
ATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCGCTCAAGCTCCAAGAGG
AAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACTGATGTGA
TCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGATATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCG
GCGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGT
TCTGAGGAGAGTTTGTTTGGCTGTTGTTTTTATTTCTTCACTGTTAGGGACAACAGAGTT
GCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGGCTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGAC
TCTTTTTCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4FL67TF U 1
AF RR4GU94JQ C 1
AF RR4GU94TF U 1
AF RR4FO96TF U 373
BS 1 15 RR4FL67TF
BS 16 16 RR4GU94TF
BS 17 18 RR4FL67TF
BS 19 19 RR4GU94TF
BS 20 33 RR4FL67TF
BS 34 34 RR4GU94TF
BS 35 67 RR4FL67TF
BS 68 68 RR4GU94TF
BS 69 115 RR4FL67TF
BS 116 116 RR4GU94TF
BS 117 148 RR4FL67TF
BS 149 149 RR4GU94TF
BS 150 151 RR4FL67TF
BS 152 152 RR4GU94TF
BS 153 163 RR4FL67TF
BS 164 164 RR4GU94TF
BS 165 187 RR4FL67TF
BS 188 188 RR4GU94TF
BS 189 229 RR4FL67TF
BS 230 230 RR4GU94TF
BS 231 283 RR4FL67TF
BS 284 284 RR4GU94TF
BS 285 352 RR4FL67TF
BS 353 353 RR4GU94TF
BS 354 385 RR4FL67TF
BS 386 386 RR4GU94TF
BS 387 394 RR4FL67TF
BS 395 395 RR4GU94TF
BS 396 418 RR4FL67TF
BS 419 419 RR4GU94TF
BS 420 533 RR4FL67TF
BS 534 534 RR4GU94TF
BS 535 572 RR4FL67TF
BS 573 573 RR4GU94TF
BS 574 585 RR4FL67TF
BS 586 586 RR4GU94TF
BS 587 591 RR4FL67TF
BS 592 592 RR4GU94TF
BS 593 609 RR4FL67TF

RD RR4FL67TF 609 0 0
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GGTAAACCGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGCCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACGCTCGACTTCCACACGAACAAGAAGATCCTCG
AAGAAGTAGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTCTCCACCC
ATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGG
AAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACCGATGTGA
TCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCCTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCTG
GCGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGT
TCTGAGGAGAGTTTGTTTGGCTGTTGTTTTTATTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAGTT
GCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGACTTGTGTCTGAA*CTGAA*GTTAAGAC
TCTTTTTCT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4GU94JQ 609 0 0
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GGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGTCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTAGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCG
AAGAAGTGGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGGTTCTCCACCC
ATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCGCTCAAGCTCCAAGAGG
AAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACTGATGTGA
TCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGATATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCG
GCGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGT
TTTGAGGAGAGTTTGTTTGGCTGTTGTTTTTATTTCTTCACTGTTAGGGACAACAGAGTT
GCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGGCTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGAC
TCTTTTT
CT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4GU94TF 609 0 0
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GGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGTCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTAGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCG
AAGAAGTGGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGGTTCTCCACCC
ATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCGCTCAAGCTCCAAGAGG
AAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACTGATGTGA
TCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGATATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCG
GCGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGT
TCTGAGGAGAGTTTGTTTGGCTGTTGTTTTTATTTCTTCACTGTTAGGGACAACAGAGTT
GCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGGCTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGAC
TCTTTTT
CT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FO96TF 235 0 0
G
AGAGACTCTCGATATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCGGCGTCTCTATAGT
CGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGTTCTGAGGAGAGTT
TGTTTGGCTGTTGTTTTTATTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAGTTGCATTTCGAGTGT
TTATGTCTTTTGATTCTAGACTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGACTCTTTTT

QA 2 235 2 235
DS 



AS 1 3

CO CL2642Contig1 552 3 3 U
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GACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCC
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TACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGATTGGAACTCTTTTCAAG
TTTTGGTTCTCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTT
TTGTTAGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCTTTTC
AAACTTGCTACT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4GQ11JQ C 1
AF RR4GQ11TF U 1
AF RR4FD39TF U 4
BS 1 5 RR4GQ11JQ
BS 6 549 RR4GQ11TF
BS 550 552 RR4FD39TF

RD RR4GQ11JQ 549 0 0
GGGCAGCGGCTGAAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACAAGTGAA
GACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCC
TCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCACTGAT
CAGGGAAGTAGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGG
TAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAA
GCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTAC
TACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGATTGGAACTCTTTTCAAG
TTTTGGTTCTCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTT
TTGTTAGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCTTTTC
AAACTTGCT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4GQ11TF 549 0 0
GGGCA
GCGGCTGAAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACAAGTGAAGACTG
GTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTC
CTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCACTGATCAGGG
AAGTAGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAG
ACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAA
AGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTACTACTG
AGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGATTGGAACTCTTTTCAAGTTTTG
GTTCTCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTTTTGTT
AGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCTTTTCAAACT
TGCT

QA 6 549 6 549
DS 

RD RR4FD39TF 549 0 0
GG
GCGGCTGAAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACAAGTGAAGACTG
GTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTC
CTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCACTGATCAGGG
AAGTAGCTGGACTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTAAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAG
ACAAGAGGGCTCTTAAG*TTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAA
AGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTACTACTG
AGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGATTGGAACTCTTTTCAAGTTTTG
GTTCTCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTTTTGTT
AGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCTTTTCAAACT
TGCTACT

QA 3 549 3 549
DS 



AS 1 4

CO CL2643Contig1 898 4 12 U
CTGAAAAAAAAAAGTAAGAGTTTATTGCAACATTCTGATGGCCACTATCTAGCAGTAGAA
AAGGCTGTACAGAAAGAAGCAATAATATAACATGTTTTTCATAACATGTTTTTGAATCCA
ATACTCAATTTAGAAAACAGGACAGCCTTTAGCTATGATTCCAGGAGCCGTTGGGCAGGT
GGCAAGAGGGCAGTGGTCTACTTCAGTACCCCACCATTTGAGGTCATGTCCAGCATTCTG
CAATGCGAAGAACAAGAGCACTCCCATGAATGCAGTCCCTGCGTCCAGCGCCGCAGAGAG
CACGTAGTTATACTTCTGCCACCATCTCTTGTGGTAATTGAACACAAAGTAGTTGAAGAT
GGTCCCTGTGACCAGCCAG**AGCGATGTTGGTCGGAGTTGCCGGAGGCATCCCTGCAAA
CCCGTAGGAGATAACAGGAATGTTGATGAGAGGGATCCACTTCTTGTCAGGGAAGATCTT
GCT*ATCGCCCACACAGGAACAGGCAAGACAGCTCCGATGAGGAAGAGCCAGACAAGGTT
ACGGTACATGCCTCCTGCTCCAAACAGACGCTTCGGTCCTATCAGTCCCCAAATAACCGA
AGCATCAAAGGTCACTCTGTACTTGGGGCAAGTCCAGGGGCTATTAGGGTGGTCTCCTTC
AATGTCGCATATGTCTTGAATGCTCTCAAGCATCCACCATGCCACTCCCAAGTTCACCAC
ACCAGCGACCACAGTGCCAACAAGCTGAGCCGTGTACATGCGCCGCGGTGGGATCTTCAT
GTAATGGCCAAGCTTAAGGTCTGCCAAAAAGGAGAGAGCATGGACTGTGCTGATTCTTCC
ATAAATCTTGAAAATCAAGTTTGCAATAGGCTTTCCAGGTAGGATGTAACCAATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX87JQ U 64
AF RR4FN75JQ U 1
AF RR4E976JQ U 76
AF RR4DX87TF C 240
BS 1 77 RR4FN75JQ
BS 78 78 RR4DX87JQ
BS 79 379 RR4FN75JQ
BS 380 381 RR4DX87JQ
BS 382 455 RR4FN75JQ
BS 456 456 RR4DX87JQ
BS 457 475 RR4FN75JQ
BS 476 476 RR4DX87JQ
BS 477 483 RR4FN75JQ
BS 484 484 RR4DX87JQ
BS 485 735 RR4FN75JQ
BS 736 898 RR4DX87TF

RD RR4DX87JQ 580 0 0
GCTGTACAGAAAGAAGCAATAATATAACATGTTTTTCATAACATGTTTTTGAATCCAATA
CTCAATTTAGAAAACAGGACGGCCTTTAGCTATGATTCCAGGAGCCGTTGGGCAGGTGGC
AAGAGGGCAGTGGTCTACTTCAGTACCCCACCATTTGAGGTCATGTCCAGCATTCTGCAA
TGCGAAGAACAAGAGCACTCCCATGAATGCAGTCCCTGCGTCCAGCGCCGCAGAGAGCAC
GTAGTTATACTTCTGCCACCATCTCTTGTGGTAATTGAACACAAAGTAGTTGAAGATGGT
CCCTGTGACCAGCCAG**AGCGATGTTGGTCGGAGTTGCCGGAGGCATCCCTGCAAACCC
GTAGGAGATAACAGGAATGTTGATGAGAGGGATCCACTTCTTGTCAGGGAAGATCTTGCT
*ATCCCCCACACAGGAACAGGCAAGACAGCTCCGATGAGGAAGAGCCAGACAAGGTTACG
GTACATGCCTCCTGCTCCAAACAGACGCTTCGGTCCTATCAGTCCCCAAATAACCGAAGC
ATCAAAGGTCACTCTGTACTTGGGGCAAGTCCAGGGGCTA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4FN75JQ 737 0 0
CTGAAAAAAAAAAGTAAGAGTTTATTGCAACATTCTGATGGCCACTATCTAGCAGTAGAA
AAGGCTGTACAGAAAGAGGCAATAATATAACATGTTTTTCATAACATGTTTTTGAATCCA
ATACTCAATTTAGAAAACAGGACAGCCTTTAGCTATGATTCCAGGAGCCGTTGGGCAGGT
GGCAAGAGGGCAGTGGTCTACTTCAGTACCCCACCATTTGAGGTCATGTCCAGCATTCTG
CAATGCGAAGAACAAGAGCACTCCCATGAATGCAGTCCCTGCGTCCAGCGCCGCAGAGAG
CACGTAGTTATACTTCTGCCACCATCTCTTGTGGTAATTGAACACAAAGTAGTTGAAGAT
GGTCCCTGTGACCAGCCAGCTAGCGATGTTGGTCGGAGTTGCCGGAGGCATCCCTGCAAA
CCCGTAGGAGATAACAGGAATGTTGATGAGAGGGACCCACTTCTTGTCAGGGAAGGTCTT
GCTCATCGCCCACACAGGAACAGGCAAGACAGCTCCGATGAGGAAGAGCCAGACAAGGTT
ACGGTACATGCCTCCTGCTCCAAACAGACGCTTCGGTCCTATCAGTCCCCAAATAACCGA
AGCATCAAAGGTCACTCTGTACTTGGGGCAAGTCCAGGGGCTATTAGGGTGGTCTCCTTC
AATGTCGCATATGTCTTGAATGCTCTCAAGCATCCACCATGCCACTCCCAAGTTCACCAC
ACCAGCGACCACAGT
GC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4E976JQ 660 0 0
GGA
GCAATAATATAACATGTTTTTCATAACATGTTTTTGAATCCAATACTCAATTTAGAAAAC
AGGACAGCCTTTAGCTATGATTCCAGGAGCCGTTGGGCAGGTGGCAAGAGGGCAGTGGTC
TACTTCAGTACCCCACCATTTGAGGTCATGTCCAGCATTCTGCAATGCGAAGAACAAGAG
CACTCCCATGAATGCAGTCCCTGCGTCCAGCGCCGCAGAAAGCACGTAGTTATACTTCTG
CCACCATCTCTTGTGGTAATTGAACACAAAGTAGTTGAAGATGGTCCCTGTGACCAGCCA
GCTAGCGATGTTGGTCGGAGTTGCCGGAGGCATCCCTGCAAACCCGTAGGAGATAACAGG
AATGTTGATGAGAGGGATCCACTTCTTGTCAGGGAAGATCTTGCTCATCGCCCACACAGG
AACAGGCAAGACAGCTCCGATGAGGAAGAGCCAGACAAGGTTACGGTACATGCCTCCTGC
TCCAAACAGACGCTTCGGTCCTATCAGTCCCCAAATAACCGAAGCATCAAAGGTCACTCT
GTACTTGGGGCAAGTCCAGGGGCTATTAGGGTGGTCTCCTTCAATGTCGCATATGTCTTG
AATGCTCTCAAGCATCCACCATGCCACTCCCAAGTTCACCACACCAGCGACCACAGT

QA 4 660 4 660
DS 

RD RR4DX87TF 659 0 0
GCAATGCGAAGAACAAGAGCACTCCCATGAATGCAGTCCCTGCGTCCAGCGCCGCAGAGA
GCACGTAGTTATACTTCTGCCACCATCTCTTGTGGTAATTGAACACAAAGTAGTTGAAGA
TGGTCCCTGTGACCAGCCAG**AGCGATGTTGGTCGGAGTTGCCGGAGGCATCCCTGCAA
ACCCGTAGGAGATAACAGGAATGTTGATGAGAGGGATCCACTTCTTGTCAGGGAAGATCT
TGCT*ATCGCCCACACAGGAACAGGCAAGACAGCTCCGATGAGGAAGAGCCAGACAAGGT
TACGGTACATGCCTCCTGCTCCAAACAGACGCTTCGGTCCTATCAGTCCCCAAATAACCG
AAGCATCAAAGGTCACTCTGTACTTGGGGCAAGTCCAGGGGCTATTAGGGTGGTCTCCTT
CAATGTCGCATATGTCTTGAATGCTCTCAAGCATCCACCATGCCACTCCCAAGTTCACCA
CACCAGCGACCACAGTGCCAACAAGCTGAGCCGTGTACATGCGCCGCGGTGGGATCTTCA
TGTAATGGCCAAGCTTAAGGTCTGCCAAAAAGGAGAGAGCATGGACTGTGCTGATTCTTC
CATAAATCTTGAAAATCAAGTTTGCAATAGGCTTTCCAGGTAGGATGTAACCAATTATC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

CO CL2644Contig1 1071 3 26 U
CGATAAAAAGAGCATATAAAACTTTTAATTAACTTTTATCATTATTTGATTTCCACCAAC
CAAAACCTTACAACTCCTTACAATCTTCTTAACTAGACACATTACAAAGTTGTATGAATC
TACAATGATTATCCTTTTTAGAGAGCATTATTTAAATTTGCATATAGCCATTACATAAAG
AAAACCATATGTAATTTATATAAACACACTATCGATAAATAGAAGGAAAGTTAAGGAAAT
CAAGTAAGCAAAATGCTGGAGCTGTAGGTGGCTCCGGCGGTCCAGTCCGCAGGAAAAGCG
TTCTGAAATTCAACCCAGTTGAAACCGGCGCTTCCATAAACTAAAAACCTCAAAGAAAGA
AAGCCTCTAGGTGGATTCTGATAATCATGAACCGCTCCAAACACTCTTCTCATGCGTTTC
CACTCTTTGCAATCCTCCTGCCAAACTTCAACGGCGAGGATGTCGTTGACACCACCAACG
TACAAGATAAGGACGGCAAGATAATGAGGATTATAGCTTTTCTCATGGATCTTATACACC
AAGTTGGACCCTCCGTACCGGCAAGGGACCCTTTGGTACTCAACGTCGACCACACCAAAA
GAATAGAGCTGAAACTCTGTACCGGGTCGCGCCATACGTCCGTATGCCTTAGGGCTAAAA
ATGAAGTCCGTACCATCTCCTTCCCCATAGTCCGTAGCCACTACGTATACTCCTTCCTCA
TTGCAGTGTGGAGGTATTTCGCATCTCACCTGGTAACAAGCACCACAGCCAGCTCCACTT
TTCCATAGTCGCGATGAAACACCACTTACTTCACCATCATTGATATCTCTTCCAAATTCT
CCATATCCACATGCTCCCCGAGGATTTCCTTTGCAATCGGGGCTGCCATAGTAAGTAGCT
CTGGAGCTAACAAAGCCATCAGATAAACAAAGGAGAGGCAAAAGGACAATGACTTGAACA
AGCAGAAGAAGCAAAACGCGAGACTTCTTCATATTGTTATATGTAACTATTGCAAGACTG
TTTTAAAATTGGTTTGGGAAAATAGATCAGTGTTATAAAAGATATGTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR47JQ U 27
AF RR4CG64JQ U 1
AF RR4BR47TF C 462
BS 1 177 RR4CG64JQ
BS 178 178 RR4BR47JQ
BS 179 250 RR4CG64JQ
BS 251 251 RR4BR47JQ
BS 252 295 RR4CG64JQ
BS 296 296 RR4BR47JQ
BS 297 306 RR4CG64JQ
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BS 312 312 RR4BR47JQ
BS 313 322 RR4CG64JQ
BS 323 323 RR4BR47JQ
BS 324 338 RR4CG64JQ
BS 339 339 RR4BR47JQ
BS 340 356 RR4CG64JQ
BS 357 357 RR4BR47JQ
BS 358 360 RR4CG64JQ
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BS 362 583 RR4CG64JQ
BS 584 584 RR4BR47TF
BS 585 663 RR4CG64JQ
BS 664 664 RR4BR47TF
BS 665 763 RR4CG64JQ
BS 764 764 RR4BR47TF
BS 765 774 RR4CG64JQ
BS 775 1071 RR4BR47TF

RD RR4BR47JQ 441 0 0
AATTAACTTTTATCATTATTTGATTTCCACCAACCAAAACCTTACAACTCCTTACAATCT
TCTTAACTAGACACATTACAAAGTTGTATGAATCTACAATGATTATCCTTTTTAGAGAGC
ATTATTTAAATTTGCATATAGCCATTACATAAAGAAAACCATATGTATTTTATATAAACA
CACTATCGATAAATAGAAGGAAAGTTAAGGAAATCAAGTAAGCAAAATGCTGGAGCTGTA
GGTGGCTCCGGCGGTCCAGTCCGCAGGAAAAGCGTTCTGAAATTCAACCCAGTTGAAACC
GGCGCTTCCATAAACTAAAAACCTCAAAGAAAGAAAGCCTCTAGGTGGATTCTGATAATC
ATGAACCGCTCCAAACACTCTTCTCATGCGTTTCCACTCTTTGCAATCCTCCTGCCAAAC
TTCAACGGCGAGGATGTCGTT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4CG64JQ 774 0 0
CGATAAAAAGAGCATATAAAACTTTTAATTAACTTTTATCATTATTTGATTTCCACCAAC
CAAAACCTTACAACTCCTTACAATCTTCTTAACTAGACACATTACAAAGTTGTATGAATC
TACAATGATTATCCTTTTTAGAGAGCATTATTTAAATTTGCATATAGCCATTACATAGAG
AAAACCATATGTAATTTATATAAACACACTATCGATAAATAGAAGGAAAGTTAAGGAAAT
CAAGTAAGCAGAATGCTGGAGCTGTAGGTGGCTCCGGCGGTCCAGTCCGCAGGAAGAGCG
TTCTGAGATTCGACCCAGTTGAGACCGGCGCTTCCATAGACTAAAAACCTCAAAGAGAGA
GAGCCTCTAGGTGGATTCTGATAATCATGAACCGCTCCAAACACTCTTCTCATGCGTTTC
CACTCTTTGCAATCCTCCTGCCAAACTTCAACGGCGAGGATGTCGTTGACACCACCAACG
TACAAGATAAGGACGGCAAGATAATGAGGATTATAGCTTTTCTCATGGATCTTATACACC
AAGTTGGACCCTCCGTACCGGCAAGGGACCCTTTGGTACTCAATGTCGACCACACCAAAA
GAATAGAGCTGAAACTCTGTACCGGGTCGCGCCATACGTCCGTATGCCTTAGGGCTAAAA
ATGTAGTCCGTACCATCTCCTTCCCCATAGTCCGTAGCCACTACGTATACTCCTTCCTCA
TTGCAGTGTGGAGGTATTTCGCATCTCACCTGGTAACAAGCACTACAGCCAGCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4BR47TF 610 0 0
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CTCATGGATCTTATACACCAAGTTGTACCCTCCGTACCGGCAAGGGACCCTTTGGTACTC
AACGTCGACCACACCAAAAGAATAGAGCTGAAACTCTGTGCCGGGTCGCGCCATACGTCC
GTATGCCTTAGGGCTAAAAATGAAGTCCGTACCATCTCCTTCCCCATAGTCCGTAGCCAC
TACGTATACTCCTTCCTCATTGCAGTGTGGAGGTATTTTGCATCTCACCTGGTAACAAGC
ACCACAGCCAGCTCCACTTTTCCATAGTCGCGATGAAACACCACTTACTTCACCATCATT
GATATCTCTTCCAAATTCTCCATATCCACATGCTCCCCGAGGATTTCCTTTGCAATCGGG
GCTGCCATAGTAAGTAGCTCTGGAGCTAACAAAGCCATCAGATAAACAAAGGAGAGGCAA
AAGGACAATGACTTGAACAAGCAGAAGAAGCAAAACGCGAGACTTCTTCATATTGTTATA
TGTAACTATTGCAAGACTGTTTTAAAATTGGTTTGGGAAAATAGATCAGTGTTATAAAAG
ATATGTGATC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

CO CL2645Contig1 758 4 5 U
GGCATCCAAAACTTAAAAACTTTAACGTCAGAATCGAAAAAGATGAAAATCTTTAACCCA
TCCCAAAACCTAATCTTAGCCACAACCATTTTCCTACTGTCTATTGCTCCCCTAAGAGCC
CAAGACACGCGACAAGACTTCTTGGAAGCTCATAACCAAGCCCGAGCCGCGGTTGGGGTG
GGTCCTTTAAGGTGGGACGACAAGGTGGCTGTTTATGCCCGTAACCATGCGAACCAGCGT
AAAAGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGCCCTATGGAGAGAACATCGCT
TGGAGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGAACGAGCAATTT
GACTACGATTATAATTCAAACTCATGTGCTTGGAACAAAGTGTGCGGGCACTATACGCAG
GTTGTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTTAGCTGCAGCAATGGTAAC
ACCTTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGCGGCCTTACTAA
GAAACAAAAATTAAAACCCTCATTTCAATATGTTTCGAAATATATGTTATACACAACACA
TGTACTGTTTCTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTAATAATGATTGG
CTTGTCCGGTCCGGTTCTCTTTTGTACCATATATATACCTGGACTTTTATAATAGAATAA
TAAAATGCAATGCTACGGGCACTTGCTTTGTTTGCGAT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4G743TF U 2
AF RR4AE06JQ C 1
AF RR4G743JQ C 109
AF RR4AE06TF U 1
BS 1 3 RR4AE06JQ
BS 4 226 RR4AE06TF
BS 227 227 RR4G743TF
BS 228 755 RR4AE06TF
BS 756 758 RR4AE06JQ

RD RR4G743TF 655 0 0
GG
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CAAAACCTAATCTTAGCCACAACCATTTTCCCACTGTCTATTGCTCCCCTAAGAGCCCAA
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CCTTTAAGGTGGGACGACAAGGTGGCTGTTTATGCCCGTAACCATGCGAACCAGCGTAAA
AGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGCCCTATGGAGAGAACATCGCTTGG
AGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGAACGAGCAATTTGAC
TACGATTATAATTCAAACTCATGTGCTTGGAACAAAGTGTGCGGGCACTATACGCAGGTT
GTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTTAGCTGCAGCAATGGTAACACC
TTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGCGGCCTTACTAAGAA
ACAAAAATTAAAACCCTCATTTCAATATGTTTCGAAATATATGTTATACACAACACATGT
ACTGTTTCTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTAATA
TGAT

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR4AE06JQ 758 0 0
GGCATCCAAAACTTAAAAACTTTAACGTCAGAATCGAAAAAGATGAAAATCTTTAACCCA
TCCCAAAACCTAATCTTAGCCACAACCATTTTCCTACTGTCTATTGCTCCCCTAAGAGCC
CAAGACACGCGACAAGACTTCTTGGAAGCTCATAACCAAGCCCGAGCCGCGGTTGGGGTG
GGTCCTTTAAGGTGGGACGACAAGGTGGCTGTTTATGCCCGTAACCGTGCGAACCAGCGT
AAAAGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGCCCTATGGAGAGAACATCGCT
TGGAGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGAACGAGCAATTT
GACTACGATTATAATTCAAACTCATGTGCTTGGAACAAAGTGTGCGGGCACTATACGCAG
GTTGTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTTAGCTGCAGCAATGGTAAC
ACCTTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGCGGCCTTACTAA
GAAACAAAAATTAAAACCCTCATTTCAATATGTTTCGAAATATATGTTATACACAACACA
TGTACTGTTTTTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTAATAATGATTGG
CTTGTCCGGTCCGGTTCTCTTTTGTACCATATATATACCTGGACTTTTATAATAGAATAA
TAAAATGCAATGCTACGGGCACTTGCTTTGTTTGCGAT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4G743JQ 647 0 0
T
CCCTAAGAGCCCAAGACACGCGACAAGACTTCTTGGAAGCTCATAACCAAGCCCGAGCCG
CGGTTGGGGTGGGTCCTTTAAGGTGGGACGACAAGGTGGCTGTTTATGCCCGTAACCATG
CGAACCAGCGTAAAAGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGCCCTATGGAG
AGAACATCGCTTGGAGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGA
ACGAGCAATTTGACTACGATTATAATTCAAACTCATGTGCTTGGAACAAAGTGTGCGGGC
ACTATACGCAGGTTGTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTTAGCTGCA
GCAATGGTAACACCTTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGC
GGCCTTACTAAGAAACAAAAATTAAAACCCTCATTTCAATATGTTTCGAAATATATGTTA
TACACAACACATGTACTGTTTTTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTA
ATAATGATTGGCTTGTCCGGTCCGGTTCTCTTTTGTACCATATATATACCTG*ACTTTTA
TAATAGAATAATAAAATGCAATGCTACGGGCACTTGCTTTGTTTGC

QA 2 647 2 647
DS 

RD RR4AE06TF 757 0 0
GGC
ATCCAAAACTTAAAAACTTTAACGTCAGAATCGAAAAAGATGAAAATCTTTAACCCATCC
CAAAACCTAATCTTAGCCACAACCATTTTCCTACTGTCTATTGCTCCCCTAAGAGCCCAA
GACACGCGACAAGACTTCTTGGAAGCTCATAACCAAGCCCGAGCCGCGGTTGGGGTGGGT
CCTTTAAGGTGGGACGACAAGGTGGCTGTTTATGCCCGTAACCGTGCGAACCAGCGTAAA
AGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGCCCTATGGAGAGAACATCGCTTGG
AGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGAACGAGCAATTTGAC
TACGATTATAATTCAAACTCATGTGCTTGGAACAAAGTGTGCGGGCACTATACGCAGGTT
GTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTTAGCTGCAGCAATGGTAACACC
TTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGCGGCCTTACTAAGAA
ACAAAAATTAAAACCCTCATTTCAATATGTTTCGAAATATATGTTATACACAACACATGT
ACTGTTTCTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTAATAATGATTGGCTT
GTCCGGTCCGGTTCTCTTTTGTACCATATATATACCTGGACTTTTATAATAGAATAATAA
AATGCAATGCTACGGGCACTTGCTTTGTTTGC
GA

QA 4 755 4 755
DS 



AS 1 4

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CCGAGTACACTAGACTAGTCATATAATAGTGTGGAACAAATCAAACAAAACTTGAATGGA
AATCAGATGACAGTGACAACCTTTTTTACTTTTGGGATTTGTGTACTTACTAGTAATAAA
CATATGGCATAACATAATCAAACTGCGTACTATGATGTAATTGCACAAAAAGTTACTTTT
CTAATACTGTCCCCTCTCTTCTTCTATATAAGCCCCAACTTCTTCTCCTTCAATTTAACC
CCTAAAAACCCTTTGCTTCAAATCCCAACCAATCCAGCTACAATTCACTTCATAATAATA
TATATGTTGTTTCCTACGTGAAACGCTCTCTTCCGCTATCGTCACCTGCATTGCTTTTGC
GTTTGTTCTTCAAGACAGTGGAAGAAGAGGGATTGCTGTGCCAGTTCCTCTTTCTCTGAT
TGATGAACCAATTGTTTATCTGCTTTAGCTGCAAACCTGTCTCCTGCACCAACCTCGCCT
TATCTTCCTCAGTAGGGTAAGGCCATTTGGAATGAGATTGCCACCATGCTTTGAGAACAG
AGGTTGTGTCTCCTGGTAGCTTCCCAGCTCTTCTCTTCCTCAGTATCTCCTCTCTTATGT
CTACTATCTTCTCCTTGTAACCCTGTTTGAGTTCATGTTTGAGTTCTTGTCTAACACGTT
CCATCAAAGATCTCTCGCTCTCAGTAGGAATCAAAGGACCAAAACCCAAAACATCTAAGC
CTCCTCCATCGAACATATTAGCATCGCTCTCTACTTGTTCATCTTCATCGTCCGACATTG
TTGCTCCCATTCCTTCACCAGGAGACACTCCGGTTAAGCTTTGAAGAGACTGCTCAATCT
CCCAACAAGCCATCACAGCTTCCATCGCATGAACACGCACGTGCTGTTGAAGTTGCTCTT
TGAAAGAGCATAGAAGCAGAACATAATGCGCCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AACATAATGCG
TCATC

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH31JQ U 258
AF RR4DL26JQ U 1
AF RR4DL26TF C 63
AF RR4BH31TF C 194
BS 1 300 RR4DL26JQ
BS 301 301 RR4BH31JQ
BS 302 511 RR4DL26JQ
BS 512 512 RR4BH31JQ
BS 513 547 RR4DL26JQ
BS 548 548 RR4BH31JQ
BS 549 560 RR4DL26JQ
BS 561 561 RR4BH31JQ
BS 562 716 RR4DL26JQ
BS 717 863 RR4DL26TF
BS 864 1078 RR4BH31TF

RD RR4BH31JQ 378 0 0
CCACTAGTGTACCTAGCTTCAGCATATCGATGCTCACCTCGGGCAACTTAGCAGCTTCGA
GTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGGGTTTTGCAATATTTGAAAACCCCATAAAGTATCA
TTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGTAAATATCCTTAA
GAGCAAGACCATAAAGGAGCCAGACGACCGCACTGATGGTAAGTGTCAAGGAAAAGCTAA
ACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTTTTTATAACCGTTCTGATAATGCTAAGCGGCGCAG
CGAAAACGCAAACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAATCTTAGCACGTGTCGATC
CTTTTGCTAAGAATTGGC

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4DL26JQ 716 0 0
GCAATGAAAATTAAGTGATATATAAAGAAGAAGAGAATAATCATCTCAGGAAAATGTAAA
TCCCGAGAGAATTAATCATCGACTTCACACACTTAATAAACTTAGAAAAATACATGTGGA
TGATGATATAGGCATCTCAAATTCGAGTACAAAATCAATATATTTTCAAGCTCCATTTTC
AGCTTCAGCTTTCTTATCGTTGCATACACACATGCTCATCGGTCGCACGACTGTGATCGC
TGCTGGTTCAGGAGATGCCACTAGTGTACCTAGCTTCAGCATATCGATGCTCACCTCTGG
TAACTTAGCAGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAA
AACCACATAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGC
AACGTAGATATCCTTAAGAGCAAGACCATAAAGGAGCCAGACGACCGCACTGATGGTAAG
TGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCGCACTTTTTGTTTTTATAACCGTTCTGAT
AATGCTATGCGGCGCAGCGAGAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAAT
CTTAGCACGTGTCGATCCTTTTGCTAAGAATTGGCAGAGAAGGAGAATCACACAGAACCC
TCCAAAGTTCATTAGCAACAAGAGCTTCACCGTAAACATTCGTGCTTCTTTGGTGG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DL26TF 802 0 0
CCGAGAGAATTA*TCATCGACT*CACACACTTAATAAACT*AGAAAAATACATGTGGATG
ATGATATAGGCATCTCAAATTCGAGTACAAAATCAATATATTT*CAAGCTCCATTTTCAG
CTTCAGCTTTCTTATCGTTGCATACACACATGCTCATCGGTCGCACGACTGTGATCGCTG
CTGGTTCAGGAGATGCCACTAGTGTACCTAGCTTCAGCATATCGATGCTCACCTCTGGTA
ACTTAGCAGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAAAA
CCACATAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAA
CGTAGATATCCTTAAGAGCAAGACCATAAAGGAGCCAGACGACCGCACTGATGGTAAGTG
TCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCGCACTTTTTGTTTTTATAACCGTTCTGATAA
TGCTATGCGGCGCAGCGAGAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAATCT
TAGCACGTGTCGATCCTTTTGCTAAGAATTGGCAGAGAAGGAGAATCACACAGAACCCTC
CAAAGTTCATTAGCAACAAGAGCTTCACCGTAAACATTCGTGCTTCTTTGGTGGCGAAGG
CTACGAATATGGCGATGTAGATGGTCTCAATGACGCAACCAAAGGAGTTGATGGTGACGA
GAAGGAAGACATCTTTCTTCTGTGTAGCATAGTAGAGCCAAAGCATCGCGCTGAAGAGGG
CCACCACATACGGAAGAGATT
C

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4BH31TF 885 0 0
CTTATCG
TGCATACACACATGCTCATCG*TCGCACGACTGTGATCGCTGCTGGT*CAGGAGATGCCA
CTAGTGTACCTAGCTTCAGCATATCGATGCTCAC*TCTGGCAACTTAGCAGCTTCGAGTT
CTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAAAACCACATAAAGTATCATTT
GAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGCAACGTAGATATCCTTAAGAG
CAAGACCATAAAGGAGCCAGACGACCGCACTGATGGTAAGTGTCAAGGATAAGCTAAACG
GCATGTACTCCACACTTTTTGTTTTTATAACCGTTCTGATAATGCTAAGCGGCGCAGCGA
AAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAATCTTAGCACGTGTCGATCCTT
TTGCTAAGAATTGGCAGAGAAGGAGAATCACACAGAACCCTCCAAAGTTCATTAGCAACA
AGAGCTTCACCGTAAACATTCGTGCTTCTTTGGTGGCGAAGGCTACGAATATGGCGATGT
AGATGGTCTCAATGACGCAACCAAAGGAGTTGATGGTGACGAGAAGGAAGACATCTTTCT
TCTGTGTAGCATAGTAGAGCCAAAGCATCGCGCTGAAGAGGGCCACCACATACGGAAGAG
ATTGAAATCCTTCAGTGGTTTTCTTTTTACAAATCCTATAGAACGTTGGTACGGGGGAGA
GGAAAACAGCAAAGGAAATGAGGTTTCCGAGCAAGCCGAAGGCAAAGGCCCATGTGTTAT
GAGTGTTGAAGATAGCCATGGATGTAGATCTTTGTTTAGAGTTTAGGTTTTAGCTTTGTA
TATATGTCTTTCTCTTCAATCAAAAGCTGATGGCACCC

QA 8 885 8 885
DS 



AS 1 4

CO CL2649Contig1 714 4 2 U
GGATCTCATAATTCTATTTGACTCTTATATCTCTCTCTTTTTTGGTGTAGCCTCCATCTA
CTATTTTCTCTCTTTCTCTAGCAAATCAACAATCCTGTTAGATTCTTCTGTTTTTATCCG
TTTCATCCATTTGATTCTATCTATATCTCTAATTTTCTTCCCTCTCTTTATATTTATCTC
TGCGATTTAAGAGATTCAGATTCAAAGCCCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTAC
TGTTTTACCCTGCTGCCTATCAACGACTCCAAGGATCCGTAATGCCAATGGAATTTACTA
ATCGATGTATGTATCTCTCTGAGTTTCATTTCTTTCCGACATGATTTTTTTCTTTTTCAC
ATCCCAGTTTGGTTTATTTGATTTTATTTGATGTTAGATTTCTGATTCAGATCATTAGAT
GATGTTGATACAGCCACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGCGTTAAAGGCTTTCA
TCAAGAGTATATGAACAGCCAATGCCAATGATGATAATGAAAGTGTAGTCAAGGGTGGAA
GGAGAAGCTACGAATCTCGTTTGGCTGCTGCGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGCGTA
GGACAGTAGGAGACCAGTTTACCCTAGTTTGTTTTGGTTTGGTTTGTATTGTAATTGGTT
ATCTAATACTAGCTTATTTTTGTAACCAGTTAACCGATTGGTATGGGTTGTCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EZ85TF U 1
AF RR4ER60TF U 1
AF RR4EZ85JQ C 57
AF RR4ER60JQ C 62
BS 1 601 RR4ER60TF
BS 602 714 RR4EZ85JQ

RD RR4EZ85TF 527 0 0
GGATCTCATAATTCTATTTGACTCTTATATCTCTCTCTTTTTTGGTGTAGCCTCCATCTA
CTATTTTCTCTCTTTCTCTAGCAAATCAACAATCCTGTTAGATTCTTCTGTTTTTATCCG
TTTCATCCATTTGATTCTATCTATATCTCTAATTTTCTTCCCTCTCTTTATATTTATCTC
TGCGATTTAAGAGATTCAGATTCAAAGCCCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTAC
TGTTTTACCCTGCTGCCTATCAACGACTCCAAGGATCCGTAATGCCAATGGAATTTACTA
ATCGATGTATGTATCTCTCTGAGTTTCATTTCTTTCCGACATGATTTTTTTCTTTTTCAC
ATCCCAGTTTGGTTTATTTGATTTTATTTGATGTTAGATTTCTGATTCAGATCATTAGAT
GATGTTGATACAGCCACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGCGTTAAAGGCTTTCA
TCAAGAGTATATGAACAGCCAATGCCAATGATGATAATGAAAGTGTA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4ER60TF 604 0 0
GGATCTCATAATTCTATTTGACTCTTATATCTCTCTCTTTTTTGGTGTAGCCTCCATCTA
CTATTTTCTCTCTTTCTCTAGCAAATCAACAATCCTGTTAGATTCTTCTGTTTTTATCCG
TTTCATCCATTTGATTCTATCTATATCTCTAATTTTCTTCCCTCTCTTTATATTTATCTC
TGCGATTTAAGAGATTCAGATTCAAAGCCCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTAC
TGTTTTACCCTGCTGCCTATCAACGACTCCAAGGATCCGTAATGCCAATGGAATTTACTA
ATCGATGTATGTATCTCTCTGAGTTTCATTTCTTTCCGACATGATTTTTTTCTTTTTCAC
ATCCCAGTTTGGTTTATTTGATTTTATTTGATGTTAGATTTCTGATTCAGATCATTAGAT
GATGTTGATACAGCCACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGCGTTAAAGGCTTTCA
TCAAGAGTATATGAACAGCCAATGCCAATGATGATAATGAAAGTGTAGTCAAGGGTGGAA
GGAGAAGCTACGAATCTCGTTTGGCTGCTGCGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGCGTA
G
ACA

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4EZ85JQ 658 0 0
TCTAC
TATTTTCTCTCTTTCTCTAGCAAATCAACAATCCTGTTAGATTCTTCTGTTTTTATCCGT
TTCATCCATTTGATTCTATCTATATCTCTAATTTTCTTCCCTCTCTTTATATTTATCTCT
GCGATTTAAGAGATTCAGATTCAAAGCCCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTACT
GTTTTACCCTGCTGCCTATCAACGACTCCAAGGATCCGTAATGCCAATGGAATTTACTAA
TCGATGTATGTATCTCTTTGAGTTTCATTTCTTTCCGACATGATTTTTTTCTTTTTCACA
TCCCAGTTTGGTTTATTTGATTTTATTTGATGTTAGATTTCTGATTCAGATCATTAGATG
ATGTTGATACAGCCACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGCGTTAAAGGCTTTCAT
CAAGAGTATATGAACAGCCAATGCCAATGATGATAATGAAAGTGTAGTCAAGGGTGGAAG
GAGAAGCTACGAATCTCGTTTGGCTGCTGCGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGCGTAG
GACAGTAGGAGACCAGTTTACCCTAGTTTGTTTTGGTTTGGTTTGTATTGTAATTGGTTA
TCTAATACTAGCTTATTTTTGTAACCAGTTAACCGATTGGTATGGGTTGTCAA

QA 6 658 6 658
DS 

RD RR4ER60JQ 653 0 0
TATTTTCTCTCTTTCTCTAGCAAATCAACAATCCTGTTAGATTCTTCTGTTTTTATCCGT
TTCATCCATTTGATTCTATCTATATCTCTAATTTTCTTCCCTCTCTTTATATTTATCTCT
GCGATTTAAGAGATTCAGATTCAAAGCCCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTACT
GTTTTACCCTGCTGCCTATCAACGACTCCAAGGATCCGTAATGCCAATGGAATTTACTAA
TCGATGTATGTATCTCTCTGAGTTTCATTTCTTTCCGACATGATTTTTTTCTTTTTCACA
TCCCAGTTTGGTTTATTTGATTTTATTTGATGTTAGATTTCTGATTCAGATCATTAGATG
ATGTTGATACAGCCACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGCGTTAAAGGCTTTCAT
CAAGAGTATATGAACAGCCAATGCCAATGATGATAATGAAAGTGTAGTCAAGGGTGGAAG
GAGAAGCTACGAATCTCGTTTGGCTGCTGCGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGCGTAG
GACAGTAGGAGACCAGTTTACCCTAGTTTGTTTTGGTTTGGTTTGTATTGTAATTGGTTA
TCTAATACTAGCTTATTTTTGTAACCAGTTAACCGATTGGTATGGGTTGTCAA

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 3

CO CL2650Contig1 1503 3 24 U
GGACCAAACCTCAGTGAGAGAGTGAGAAAACAACGGAACCATGGCGGCTACGACGACTCC
TCATGGCTTTGCCTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGAATCAGGTTTTCACT
CGTCCGATGCTCCGCCTCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGGTATAGTGGAGAAGCC
GTGGAGTTCGTATAACGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTC
CTTCGGTGCTCCTGGAACCCGTGTCGCTGAATTGGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTA
TCAAGAGATTCTGACTGATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACA
AATCGGTAACACCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGG
TTTGGTCATAAGAAGTCTAAGCATCAGAACATCGAACTGGAGATGCAAGAAAACACTTGC
TGACTATCTAACCGAGAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAAC
TCGTCGACTAAGAGAAGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAAC
AGACGATGAGCTTCTCCAAATGTCCCGTTCTTGGGATATCGTAGGTATTGATCTAATAAG
TGATGTCTCCTGCAAGTCACCCTACGAGTGGGTCGACAAAACAGACTCTGAATGGGATTT
TAATACCAACACACGCGATGGGAAGTCCTACAGAGTTATAGCATACGATTTTGGAATCAA
GCATAACATCCTAAGACGCCTGTCCTCTTACGGATGCCAAATCACCGTTGTCCCGTCGAC
ATTTCCAGCTTCCGAGGCTCTTAAAATGAATCCAGACGGGATCTTGTTCAGCAACGGTCC
TGGAGACCCTTCTGCTGTTCCGTATGCTGTGGAGACGGTCAAGGAGCTTCTTGGTAAAGC
TCCTGTTTACGGGATCTGTATGGGCCATCAGCTGCTCGGACAAGCTTTTGGTGGTAAAAC
CTATAAGATGAAGTTTGGTCATCATGGAGGGAACCACCCAGTTCGTAATAACAGAACTGG
CCAGGTGGAGATCAGTGCTCAGAACCACAACTATGCGGTTGACCCGGCTTCACTTCCAGG
AGGGGTAGAAGTGACACATGTCAATCTCAATGATGGAAGCTGTGCGGGTCTGTCTTTCCC
GGCTATGAATGTCATGTCTCTACAGTACCACCCTGAAGCCTCCCCTGGACCTCACGACTC
TGACAACGCGTTTAGAGAGTTCATAGAGCTTATGAAGAGGTCGAAACAGAGCTCCTGAGA
TTAATGGGAAGCAACAAACAAGAACTGTTTTTTTGTTTTGTAGTACTATTTAATGTTTCA
ACCATATCGCACTTATGTTAAACCCAAGTGTTTTGTCAATGACAATGGAGTGATATTCTT
GTTCTGTCTGTGACTATGTGGAGGAATCATCCCACACCTCTTAAATAATTATGAATTTGT
AGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4ER80TF U 9
AF RR4AL78TF U 1
AF RR4AL78JQ C 723
BS 1 71 RR4AL78TF
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BS 108 243 RR4AL78TF
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BS 843 1503 RR4AL78JQ

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AGG
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CTGGAACCCGTGTTGCTGAATTGGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGATTC
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CCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAA
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GCAA*TCTCCCTACGAGTGGGTCGACAAA*CAGACTCTGAATGGGA

QA 4 709 4 709
DS 

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TCATGGCTTTGTCTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCACT
CGTCCGATGCTCCGCCTCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGGTATAGTGGAGAAGCC
GTGGAGTTCGTATAACGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTC
CTTTGGTGCTCCTGGAACCCGTGTCGCTGAATTGGTCTTTAACACCTCCTTGACAGGGTA
TCAAGAGATTCTGACTGATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACA
AATTGGTAACACCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAGTGCTTCCTTGCTGG
TTTGGTCATAAGAAGTCTAAGCATCAGTACATCGAACTGGAGATGCAAGAAGACACTTGC
TGACTATCTAACCGAGAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAAC
TCGTCGACTAAGAGAAGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAAC
GGACGATGAGCTTCTGCAAATGTCCCGTTCTTGGGATATCGTAGGTATTGATCTAATAAG
TGATGTCTCCTGCAAGTCACCCTACGAGTGGGTCGACAAAACAGACTCTGAATGGGATTT
TAATACCAACACACGCGATGGGAAGTCCTACAGAGTTATAGCATACGATTTTGGAATCAA
GCATAACATCCTAAGACGCCTGTCCTCTTACG*ATGCCAAATCACCGTTGTCCCGTCGAC
AT

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4AL78JQ 781 0 0
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ATAACATCCTAAGACGCCTGTCCTCTTACGGATGCCAAATCACCGTTGTCCCGTCGACAT
TTCCAGCTTCCGAGGCTCTTAAAATGAATCCAGACGGGATCTTGTTCAGCAACGGTCCTG
GAGACCCTTCTGCTGTTCCGTATGCTGTGGAGACGGTCAAGGAGCTTCTTGGTAAAGCTC
CTGTTTACGGGATCTGTATGGGCCATCAGCTGCTCGGACAAGCTTTTGGTGGTAAAACCT
ATAAGATGAAGTTTGGTCATCATGGAGGGAACCACCCAGTTCGTAATAACAGAACTGGCC
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GGGTAGAAGTGACACATGTCAATCTCAATGATGGAAGCTGTGCGGGTCTGTCTTTCCCGG
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AATGGGAAGCAACAAACAAGAACTGTTTTTTTGTTTTGTAGTACTATTTAATGTTTCAAC
CATATCGCACTTATGTTAAACCCAAGTGTTTTGTCAATGACAATGGAGTGATATTCTTGT
TCTGTCTGTGACTATGTGGAGGAATCATCCCACACCTCTTAAATAATTATGAATTTGTAG
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 4

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AGGTGAGCCCTAACCATGGAGAACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGA
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AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAG
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TCT


BQ
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10 10 10 

AF RR4CZ27JQ C 1
AF RR4CZ27TF U 1
AF RR4DI82JQ C 1
AF RR4AP20TF U 393
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AGGTGAGCCCTAACCATGGAGAACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGA
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AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTATTAATGTG
GC

QA 1 648 1 648
DS 

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GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAGAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCATCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTATATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTCGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAGGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTTGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGAACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGA
GGATCGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTATTAATGTG
GC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4DI82JQ 653 0 0
GGAAGTCTCAC*AGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCATCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTATATTCGGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTTTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTTGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGAACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATTTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTATTAATGTG
ACATT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4AP20TF 271 0 0
G
CGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGC
AGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTAAACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAAT
AAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTAAATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTG
TGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAGGACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAA
TAATGTATTAATGTGACATTTATCGGATCT

QA 2 271 2 271
DS 



AS 1 4

CO CL2652Contig1 754 4 9 U
GGAATCGACGACGATGATGCTCAGGCAAGCCGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGTCGCG
CCAATCGACCCCGTGGTCCGTCGGTATCTTCCGATCCTACCACGAGAACGTCATCGACCA
CTACGATAACCCCCGCAACGTCGGGTCTTTCGACAAGAACGATCCCAGCATCGGCACGGG
TCTCGTCGGAGCTCCCGCTTGCGGTGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATGAGAA
GACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTC
TTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCATCAA
GAACACCGAAATCGCCAAGCATCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTATACT
AGCCGAGGACGCCATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAACAAA
CGGTGCTGCAGCAGTAGCAGCAGCTGGAGAAACCGCGCAGGCTTGATTTTCCTCTGCTGA
TGTTTTTATACCATGACGTGTATATGATGGTACAAACAGGAGATGTGTAAGAGAAGACTA
CGTGCAACCTATGGTATAATCTCTGAAGGGTTAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAACTC
TGTTTGACAAATACATCTGAGATGTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGGTTTTCCTTCCT
TTGTGAGATTTATTATCTATTAAAGACAAGTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ90JQ C 1
AF RR4A825JQ C 5
AF RR4A825TF U 22
AF RR4GZ90TF U 1
BS 1 6 RR4GZ90JQ
BS 7 21 RR4GZ90TF
BS 22 241 RR4A825TF
BS 242 243 RR4GZ90TF
BS 244 712 RR4A825TF
BS 713 713 RR4GZ90TF
BS 714 741 RR4A825TF
BS 742 748 RR4GZ90TF
BS 749 754 RR4GZ90JQ

RD RR4GZ90JQ 754 0 0
GGAATCGACGACGATGATGCTCAGGCAAGCCGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGTCGCG
CCAATCGACCCCGTGGTCCGTCGGTATCTTCCGATCCTACCACGAGAACGTCATCGACCA
CTACGATAACCCCCGCAACGTCGGGTCTTTCGACAAGAACGATCCCAGCATCGGCACGGG
TCTCGTCGGAGCTCCCGCTTGCGGTGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATGAGAA
GACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTC
TTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCATCAA
GAACACCGAAATCGCCAAGCATCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTGTGCT
AGCCGAGGACGCCATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAACAAA
CGGTGCTGCAGCAGTAGCAGCAGCTGGAGAAACCGCGCAGGCTTGATTTTCCTCTGCTGA
TGTTTTTATACCATGACGTGTATATGATGGTACAAACAGGAGATGTGTAAGAGAAGACTA
CGTGCAACCTATGGTATAATCTCTGAAGGGTTAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAACTC
TGTTTGACAAATACATTTGAGATGTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGGTTTTCCTTCCT
TTGTGAGATTTATTATCTATTAAAGACAAGTCAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4A825JQ 737 0 0
GG
GACGACGATGATGCTCAGGCAAGCCGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGTCGCGCCAATC
GACCCCGTGGTCCGTCGGTATCTTCCGATCCTACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGA
TAACCCCCGCAACGTCGGGTCTTTCGACAAGAACGATCCCAGCATCGGCACGGGTCTCGT
CGGAGCTCCCGCTTGCGGTGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATGAGAAG**CGG
TCAGATCGTCGATGCTCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTCTTCGTC
TGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCATCAAGAACAC
CGAAATCGCCAAGCATCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTATACTAGCCGA
GGACGCCATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAACAAACGGTGC
TGCAGCAGTAGCAGCAGCTGGAGAAACCGCGCAGGCTTGATTTTCCTCTGCTGATGTTTT
TATACCATGACGTGTATATGATGGTACAAACAGGAGATGTGTAAGAGAAGACTACGTGCA
ACCTATGGTATAATCTCTGAAGGGTTAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAACTCTGTTTG
ACAAATACATCTGAGATGTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGGTTT*CCTTCCTTTGTGA
GATTTATTATCTATT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR4A825TF 720 0 0
CAGGCAAGCCGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGTCGCGCCAATCGACCCCGTGGTCCGT
CGGTATCTTCCGATCCTACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGATAACCCCCGCAACGT
CGGGTCTTTCGACAAGAACGATCCCAGCATCGGCACGGGTCTCGTCGGAGCTCCCGCTTG
CGGTGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATGAGAAG**CGGTCAGATCGTCGATGC
TCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATG
GGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCATCAAGAACACCGAAATCGCCAAGCA
TCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTATACTAGCCGAGGACGCCATCAAGGC
AGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAACAAACGGTGCTGCAGCAGTAGCAGC
AGCTGGAGAAACCGCGCAGGCTTGATTTTCCTCTGCTGATGTTTTTATACCATGACGTGT
ATATGATGGTACAAACAGGAGATGTGTAAGAGAAGACTACGTGCAACCTATGGTATAATC
TCTGAAGGGTTAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAACTCTGTTTGACAAATACATCTGAG
ATGTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGGTTT*CCTTCCTTTGTGAGATTTATTATCTATT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GZ90TF 753 0 0
GGAATC
GACGACGATGATGCTCAGGCAAGCCGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGTCGCGCCAATC
GACCCCGTGGTCCGTCGGTATCTTCCGATCCTACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGA
TAACCCCCGCAACGTCGGGTCTTTCGACAAGAACGATCCCAGCATCGGCACGGGTCTCGT
CGGAGCTCCCGCTTGCGGTGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATGAGAAGACCGG
TCAGATCGTCGATGCTCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTCTTCGTC
TGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCATCAAGAACAC
CGAAATCGCCAAGCATCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTGTGCTAGCCGA
GGACGCCATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAACAAACGGTGC
TGCAGCAGTAGCAGCAGCTGGAGAAACCGCGCAGGCTTGATTTTCCTCTGCTGATGTTTT
TATACCATGACGTGTATATGATGGTACAAACAGGAGATGTGTAAGAGAAGACTACGTGCA
ACCTATGGTATAATCTCTGAAGGGTTAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAACTCTGTTTG
ACAAATACATCTGAGATGTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGGTTTTCCTTCCTTTGTGA
GATT*ATTATCTATTAAAGACA
GTCAG

QA 7 748 7 748
DS 



AS 1 4

CO CL2653Contig1 750 4 4 U
GAAGAAGGTGCTTGAAGTAGCTGTTGAAAAGGGGATGCAGCATAGTCAGAAGATCACATT
CGATGGACAAGCAGACGAAGCGCCTGATACAGTCACTGGAGATATAGTGTTCGTCATACA
GCAGAAGGATCACCCAAAGTTCAAGAGAAAGGGAGATGATCTCTTCGTCGAGCACACCCT
CTCTCTAACCGAAGCTCTCTGCGGCTTCCAGTTTGTTTTGACTCATTTAGACAAAAGACA
GCTTCTCATCAAGTCCAGTCCCGGGGAGGTTGTGAAGCCAGACTCATACAGAGCGATAAG
CAACGAGGGAATGCCAATGTACCAAAGGCCGTTCATGAAGGGTAAGCTTTACATCCACTT
CACGGTCGAGTTTCCTGAATCGCTGACCCTGGACCAGACAAAGGCCATCGAAGCGGTTCT
GCCGAAGCCAAAGGCGGCTCTGAGCGACATGGAGATAGACGAGTGCGAGGAGACGACGCT
GCACGATGTGAACATGGAGGATGAGATGAGAAGGAAGGCTCAAGCGCAAAGAGAGGCTTA
TGATGACGATGATGATGAAGAAGGCCCGGGTGGTGCTCAGCGTGTGCAATGTGCTCAGCA
GTGATATATATTATCAACATGCGCACTTTGTAGTGATATTCAGCATTTGCGTTTTAAAAA
TTATACTATGTATTATTTTCGGGTCTTTGCTATTAGACTTTTGCCCGATTCTGTTGGAAG
AAGCTTGTCCTAATTCATTTTCTTGTCGCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU08JQ C 1
AF RR4E155JQ C 88
AF RR4DU08TF U 1
AF RR4E155TF U 1
BS 1 563 RR4DU08TF
BS 564 564 RR4E155TF
BS 565 743 RR4DU08TF
BS 744 750 RR4DU08JQ

RD RR4DU08JQ 750 0 0
GAAGAAGGTGCTTGAAGTAGCTGTTGAAAAGGGGATGCAGCATAGTCAGAAGATCACATT
CGATGGACAAGCAGACGAAGCGCCTGATACAGTCACTGGAGATATAGTGTTCGTCATACA
GCAGAAGGATCACCCAAAGTTCAAGAGAAAGGGAGATGATCTCTTCGTCGAGCACACCCT
CTCTCTAACCGAAGCTCTCTGCGGCTTCCAGTTTGTTTTGACTCATTTAGACAAAAGACA
GCTTCTCATCAAGTCCAGTCCCGGGGAGGTTGTGAAGCCAGACTCATACAGAGCGATAAG
CAACGAGGGAATGCCAATGTACCAAAGGCCGTTCATGAAGGGTAAGCTTTACATCCACTT
CACGGTCGAGTTTCCTGAATCGCTGACCCTGGACCAGACAAAGGCCATCGAAGCGGTTCT
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GCACGATGTGAACATGGAGGATGAGATGAGAAGGAAGGCTCAAGCGCAAAGAGAGGCTTA
TGATGACGATGATGATGAAGAAGGCCCGGGTGGTGCTCAGCGTGTGCAATGTGCTCAGCA
GTGATATATATTATCAACATGCGCACTTTGTAGTGATATTCAGCATTTGCGTTTTAAAAA
TTATACTATGTATTATTTTCGGGTCTTTGCTATTAGACTTTTGCCCGATTCTGTTGGAAG
AAGCTTGTCCTAATTCATTTTCTTGTCGCC

QA 1 750 1 750
DS 

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CCTGGACCAGACAAAGGCCATCGAAGCGGTTCTGCCGAAGCCAAAGGCGGCTCTGAGCGA
CATGGAGATAGACGAGTGCGAGGAGACGACGCTGCACGATGTGAACATGGAGGATGAGAT
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GGGTGGTGCTCAGCGTGTGCAATGTGCTCAGCAGTGATATATATTATCAACATGCGCACT
TTGTAGTGATATTCAGCATTTGCGTTTTAAAAATTATACTATGTATTATTTTCGGGTCTT
TGCTATTAGACTTTTGCCCGATTCTGTTGGAAGAAGCTTGTCCTAATTCATTTTCT
TGTCGCC

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DS 

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TGATGACGATGATGATGAAGAAG*CCCGGGTGGTGCTCAGCGTGTGCAATGTGCTCAGCA
GTGATATATATTATCAACATGCGCACTTTGTAGTGATATTCAGCATTTGCGTTTTAAAAA
TTATACTATGTATTATTTTCGGGTCTTTGCTATTAGACTTTTGCCCGATTCTGTTGGAAG
AAGCTTGTCCTAATTCATTTTCT
TG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4E155TF 749 0 0
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CACGGTCGAGTTTCCTGAATCGCTGACCCTGGACCAGACAAAGGCCATCGAAGCGGTTCT
GCCGAAGCCAAAGGCGGCTCTGAGCGACATGGAGATAGACGAGTGCGAGGAGACGACGCT
GCACGATGTGAACATGGAGGATGAGATGAGAAGGAAGGCTCAAGCGCAAAGAGAGGCTTA
TGATGACGATGATGATGAAGAAGGCCCGGGTGGTGCTCAGCGTGTGCAATGTGCTCAGCA
GTGATATATATTATCAACATGCGCACTTTGTAGTGATATTCAGCATTTGCGTTTTAAAA*
TTATACTATGTATTATTTTCGGGTCTTTGCTATTAGACTTTTGCCCGATTCTGTTGGAAG
AAGCTTGTCCTAATTCATTTTCT
GTCGCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL2654Contig1 961 4 20 U
GGATATCCCTCTCTTCTACACAAACATCACAGTCTTATAACGCTTATTTTACTGAGAAAC
AAGCATTAAAGAAGAGCAAAAAA*GTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTATCA
AAACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTATGC
GCTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTCAA
GGGAAATACAAACCGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATC
TCTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTC
ATAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTAT
GCTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGG
TACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGAC
AACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTAAAA
CCGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCG
CCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGGCGAATGTAACGATATATGGAATGGCTGAG
TGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAACAATTTCTAT
TTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTTTT
AGGTATGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTCTTAA
AAAAGCAATTTACAGAAAAAGTATGCGGATCTTTTCTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTAT
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ10TF U 1
AF RR4E591TF U 1
AF RR4BE16TF U 1
AF RR4E591JQ C 344
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BS 336 336 RR4DQ10TF
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BS 426 698 RR4BE16TF
BS 699 699 RR4E591JQ
BS 700 701 RR4BE16TF
BS 702 702 RR4E591JQ
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BS 808 835 RR4BE16TF
BS 836 961 RR4E591JQ

RD RR4DQ10TF 616 0 0
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CCGCGGTATTTCATCG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4E591TF 668 0 0
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AAGCATTAAAGAAGAGCAAAAAA*GTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTATCA
AAACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTATGC
GCTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTCAA
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TCTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTC
ATAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTAT
GCTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGG
TACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGAC
AACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTAAAA
CCGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCG
CCGTACTA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4BE16TF 835 0 0
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TCTCCTGAAAGTTTTGAAAGAGGTTACAACTCTACTCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTC
ATAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTAT
GCTACCGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGG
TACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGAC
AACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTAAAA
CCGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCG
CCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGGCGAATGTGACTATATATGGAATGGCTGAG
TGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAACAATTTCTAT
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QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4E591JQ 618 0 0
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AATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATA
AAGGTGGAATAATATGGTACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAG
GGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATC
TATATAACGATTTAAAACCGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTG
AAGCTAACCCGAAAGCGCCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGGTGAATGTAACGA
TATATGGAATGGCTGAGTGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAG
AACGAAATAATTTCTATTTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGG
GTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTATGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTA
AATATTTGAAGTCTTAAAAAAGCAATTTACAGAAAAAGTATGCGGATCTTTTCTTTTATG
AAAGTTTTAAATTTTATT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 4

CO CL2655Contig1 978 4 6 U
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CACTCAATTTTGGAACAAGCAACCATATGAGAAAACTTCTGTCACAAGAAAGGAAAGTAC
AAAACAACAACAAAAAGAACAGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCTCT
TAGCAATCGATCAAAAGGCAGTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAAAA
GGATTGATACGAACCCAAACAAGAGAAAACACAGAGGCAAGCAAGATAGACCAGAGAATA
ACAATGGTGGGTGTTCTGTTCTGTCTTCCCATAAGACCTTTAAGGAAAGGATAAAGATGA
AGAACAACCCAAAAGGCGAAGAATATCTTCCCAAACAAAGGTCCCCAAGCTTCATAGCCT
TTGTTTAAAGCATCAGAGAAGCCAGCAACGACTCCAACCAAGTTAATTACGAGAAGTGAT
GTTGGAGGGATCAAGAGTGTTGTCCATTTGACAATGTACAGCTCACCGAACTCCAAATCT
TCTGCGGTTTTCGATGTGACTGTGAAGTTTGTGTCAAGACCAGCAAGCATTTTGAGGAAG
CCTTGGAAGACAGCAAACAGATGAGCTGAGACACCTCCAATCACCCAAAACTGCTCGTTT
CTCCATAAGTCCTCAATGCTCACTCCACTCCATCTAAGCTCAAGGACGCTTGTTAAGATG
ATTGATATGAAGAGCCCAAGAAACAGCATGCTTGCAAGGTTTGATAGCGTTGGGATGATG
AATTTTCCTGTGAGAAGACAAATGGCGGGAAGAGTACAGTAAGCCACAAGGGGCAAGGAC
GTGAAGGGATAAACAATGGTGTTTATATAAGCCATTCTCTGAAGCCACTTGAGGCGGCCT
CCACTGCAACCATACCAGAGAGGACAATGCCTGCTAAGGAAGATCTCAACCGAGCCAAGA
GCCCAACGCAGAACCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C494JQ U 81
AF RR4BR16JQ U 1
AF RR4BX91JQ U 72
AF RR4BR16TF C 339
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AGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCTCTTAGCAATCGATCAAAAGGCA
GTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAAAAGGATTGATACGAACCCAAAC
AAGAGAAAACACAGAGGCAAGCAAGATAGACC

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR4BR16JQ 754 0 0
GGTTAGTTTAACATGTTGAAGTAACAGAAACATTAAAACCTAACTTGTGCAACAAGAACA
CACTCAATTTTGGAACAAGCAACCATATGAGAAAACTTCTGTCACAAGAAAGGAAAGTAC
AAAACAACAACAAAAAGAACAGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCTCT
TAGCAATCGATCAAAAGGCAGTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAAAA
GGATTGATACGAACCCAAACAAGAGAAAACACAGAAGCCAGCAAGATAGACCAGAGAATA
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TTGTTTAAAGCATCAGAGAAGCCAGCAACGACTCCAACCAAGTTAATTACGAGAAGTGAT
GTTGGAGGGATCAAGAGTGTTGTCCATTTGACAATGTACAGCTCACCGAACTCCAAATCT
TCTGCGGTTTTCGATGTGACTGTGAAGTTTGTGTCAAGACCAGCAAGCATTTTGAGGAAG
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CTCCATAAGTCCTCAATGCTCACTCCACTCCATCTAAGCTCAAGGACGCTTGTTAAGATG
ATTGATATGAAGAGCCCAAGAAACAGCATGCT
TG

QA 1 752 1 752
DS 

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GGAC
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AGAACAGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCTCTTAGCAATCGATCAAA
AGGCAGTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAAAAGGATTGATACGAACC
CAAACAAGAGAAAACACAGAGGCAAGCAAGATAGACCAGAGAATAACAATGGTGGGTGTT
CTGTTCTGTCTTCCCATAAGACCTTTAAGGAAAGGATAAAGATGAAGAACGACCCGAAAG
GCGAAGAATATCTTCCCAAACAAAGGTCCCCAAGCTTCATAGCCTTTGTTTAAAGCATCA
GAAAAGCCAGCAACGACTCCAACCAAGTTAATTATGAGAAGTGATGTTGGAGGGATCAAG
AGTGTTGTCCATTTGACAATGTACAGCTCACCGAACTCCAAATCTTCTGCGGTTTTCGAT
GTGACTGTGAAGTTTGTGTCAAGACCGGCAAGCATTTTGAGGAAGCCTTGGAAGACAGCA
AACAGATGAGCTGAGACACCTCCAATCACCCAAAACTGCTCGTTTCTCCATAAGTCCTCA
ATGCTCACTCCACTCCATCTAAGCTCAAGGACGCTTGTTAAGATGATTGATATGAAGAGC
CCAAGAAACAGCATGCT

QA 5 681 5 681
DS 

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AGGTCCCCAAGCTTCATAGCCTTTGTTTAAAGCATCAGAGAAGCCAGCAACGACTCCAAC
CAAGTTAATTACGAGAAGTGATGTTGGAGGGATCAAGAGTGTTGTCCATTTGACAATGTA
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AATCACCCAAAACTGCTCGTTTCTCCATAAGTCCTCAATGCTCACTCCACTCCATCTAAG
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GTTTGATAGCGTTGGGATGATGAATTTTCCTGTGAGAAGACAAATGGCGGGAAGAGTACA
GTAAGCCACAAGGGGCAAGGACGTGAAGGGATAAACAATGGTGTTTATATAAGCCATTCT
CTGAAGCCACTTGAGGCGGCCTCCACTGCAACCATACCAGAGAGGACAATGCCTGCTAAG
GAAGATCTCAACCGAGCCAAGAGCCCAACGCAGAACCTGC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 4

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CCACTTCTTCTCTTCCGCTTCCTACAGCCGCAGCAGATCAGAGATCTTCGCCGGCGATGG
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TTTTGGTTCAACTGCACCGAGAGATGATTGTACAAACACCCAAACTTGAGAAATCAATTA
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TTGGTGACAGCAAGGTCGTTGGAGGGTCTGCTTTTGGCTGGAACTTCGTCACCTATGGTG
GCACCGATGCTGTTTACTGTGGACTCTCCAAGGAAGAATACAGAACCTCTCACCCTATTA
TTCAAGCTGACGCAGAGTTAGAGGCTCAACACCACAACAACACCCAATTATAAAGGTTTT
TGTTGGCCTTCCTGCTGTTAATGTTGTTTGTTTAAATATTTACATGCACTGTTGGTGTCC
CGTACGTCCCATTATGTTGTATCAAAAACCAATGGGAGTAGCTTCTACTCTTACCATGAA
TGTTTAATTAGTACAATACTACAATGTTTAACG


BQ
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AF RR4CI71TF U 1
AF RR4CI71JQ C 86
BS 1 569 RR4CI71TF
BS 570 813 RR4CI71JQ

RD RR4CI71TF 569 0 0
TTTTTTTGAAAATGGAGAAATCGACCTCCACCGCAACTCCTCCTCCGCCTCCTCCTTCCG
CCACTTCTTCTCTTCCGCTTCCTACAGCCGCAGCAGATCAGAGATCTTCGCCGGCGATGG
ACTTGGATACTCCTCCGGTTCCGACTCGGCCACATGTAGGAGGAGCGCAGGTGGCTCCGT
CAGATCCGTCAGCAAGGGGAAGAAAGAGGGGGCTGGAAGGGAATCTCAAGATTGAGAACT
CCAACTACTACAAGATGCGTCTCCTTGTCAAGGATCTTCGCCCTCATGTTCTCGAGGTAC
TACGAACTCCCGACTTCAAAAACTGCAAGGCAGCATTCGAAATTCAAGAGAAGATGAAGC
TTTTGGTTCAACTGCACCGAGAGATGATTGTACAAACACCCAAACTTGAGAAATCAATTA
AGACCGAGTCCTTATCCAACGGAAAGGCACTCAATCAAACACCTGAGGCAAGCTCTGTTG
TTGGTGACAGCAAGGTCGTTGGAGGGTCTGCTTTTGGCTGGAACTTCGTCACCTATGGTG
GCACCGATGCTGTTTACTGTGGACTCTCC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4CI71JQ 728 0 0
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TGTCAAGGATCTTCGCCCTCATGTTCTCGAGGTACTACGAACTCCCGACTTCAAAAACTG
CAAGGCAGCATTCGAAATTCAAGAGAAGATGAAGCTTTTGGTTCAACTGCACCGAGAGAT
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GGCACTCAATCAAACACCTGAGGCAAGCTCTGTTGTTGGTGACAGCAAGGTCGTTGGAGG
GTCTGCTTTTGGCTGGAACTTCGTCACCTATGGTGGCACCGATGCTGTTTACTGTGGACT
CTCCAAGGAAGAATACAGAACCTCTCACCCTATTATTCAAGCTGACGCAGAGTTAGAGGC
TCAACACCACAACAACACCCAATTATAAAGGTTTTTGTTGGCCTTCCTGCTGTTAATGTT
GTTTGTTTAAATATTTACATGCACTGTTGGTGTCCCGTACGTCCCATTATGTTGTATCAA
AAACCAATGGGAGTAGCTTCTACTCTTACCATGAATGTTTAATTAGTACAATACTACAAT
GTTTAACG

QA 1 728 1 728
DS 



CO CL2656Contig2 783 2 2 U
ACCGCAACTCCTCCTCCGCCTCCTCCTTCCGCCACTTCTTCTCTTCCGCTTCCTACAGCC
GCACCAGATCAGAGATCTTCGCCGGCGATGGACTTGGATACTCCGCCGGTTCCGACTCGG
CCACATATAGGAGGAGCGCAGGTGGCTCCGTCAGATCCGTCGGCAAGGGGAAGAAAGAGG
GGGCTAGAAGGGAATCTCAAGATGGAGAACTCCAACTACTACAAGATGCGTCTCCTTGTC
AAAGATCTTTGCCCTCACTTTCTCGAGGTACTACGAACTCCCGACTTCAGAAACTGTAAG
GCAGCATTCGAAATTCAAGAGAAGATGAAGCTTTTGGTTCAACTGCACCGAGAGATGATT
GTACAAACACCCAAACTTGAGAAATCAATTAAGACCGAGTCCTTATCCAACGGAAAGGCA
CTAATCAAACACCTGAGGCAAGCTCTGTTGTTGGTGACAGCAAGGTCGTTGGAGGGTCTG
CTTTTGGCTGGAACTTCGTCACCTATGGTGGCACCGATGCTGTTTACTGTGGACTCTCCA
AGGAAGAATACAGAACCTCTCACCCTATTATTCAAGCTAACGCAGAGTTAGAGGCTCAAC
ACCACAACAACACCCAATTATAAAGGTTTTTGTTGGCCTTCCTGCTGTTAATGTTGTTTG
TTTAAATATTTACATGCACTGTTGGTGTCCCGTACGTCCCATTATGTTGTATCAACTGAA
AACCAATGGGAGCAGCTTCTACTCTTACCATGAATGTTTAATTAGTACAATACTACAATG
TTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CN46TF U 1
AF RR4CN46JQ C 221
BS 1 318 RR4CN46TF
BS 319 783 RR4CN46JQ

RD RR4CN46TF 318 0 0
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AAAGATCTTTGCCCTCACTTTCTCGAGGTACTACGAACTCCCGACTTCAGAAACTGTAAG
GCAGCATTCGAAATTCAA

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4CN46JQ 563 0 0
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AACTGCACCGAGAGATGATTGTACAAACACCCAAACTTGAGAAATCAATTAAGACCGAGT
CCTTATCCAACGGAAAGGCACTAATCAAACACCTGAGGCAAGCTCTGTTGTTGGTGACAG
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TGTTTACTGTGGACTCTCCAAGGAAGAATACAGAACCTCTCACCCTATTATTCAAGCTAA
CGCAGAGTTAGAGGCTCAACACCACAACAACACCCAATTATAAAGGTTTTTGTTGGCCTT
CCTGCTGTTAATGTTGTTTGTTTAAATATTTACATGCACTGTTGGTGTCCCGTACGTCCC
ATTATGTTGTATCAACTGAAAACCAATGGGAGCAGCTTCTACTCTTACCATGAATGTTTA
ATTAGTACAATACTACAATGTTT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 4

CO CL2657Contig1 1016 4 8 U
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CTTATAATACTATTATTACTGGAAGGAAAAGAGATAAGAGATAAGAGAGAAGAGGGTGAG
AGATGCAGATGAGTAGTAAGGTCACGATGTGTGTAGTGTTATCTCTTCTGGGTTTAATAA
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CCACCTCTGGTTCATTATGCTCTTATGAAAGAAGCACTGCTTTCACTCTCGGCTTGAATT
CAGCTGTCTTTCTAATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGTTGGAAGCGGTTGTTTCTGTC
GTAGAAAAGGTCCTTCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCATCTCCTTAGTCTGCTTCATCG
TTTCTTGGTTCACTTTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCTATCTGGAGCTGTACTCAACA
ATAACCACACCCTGGAGGCAACGTCTCCCGATCCCTACTCCTGCTACATTGTTAGGACGG
GCGTTTTCTCTACCGCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTATTGCGCTTGGGATTGCCTACT
ATCTATGTTTGAATTCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCACAAGGGCGGTGGCTAACCAAG
GAGGAGGGATAGCAATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAGAGTAGAAGATCCTGTCTTTG
TACATGACGATACTCACATGAGAAGACAGCTCACTTAAAAAAAATACAGAACAGGGCTTG
CTTGGTAAACAAGGTAGGTTTAGGAAGATATATTTAGATAAAAAGAAGGCTTTGTCTGAT
TTTTACCTACATTTTTGTATCTTTCTGATTTTTTCTTGTATGTGAGGGTATAAGATCATC
TCCAACTTATCTATATATTTTTCTTTGTAATATAAAATTATTTCATTCCACTTATATTTT
TCATCTAAAATATAAATTGCTATTTTTCTTTTATAAATAGAAAAATATCATTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B150TF U 1
AF RR4CV52TF U 133
AF RR4CV52JQ C 164
AF RR4B150JQ C 164
BS 1 359 RR4B150TF
BS 360 360 RR4CV52TF
BS 361 644 RR4B150TF
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BS 840 1016 RR4B150JQ

RD RR4B150TF 757 0 0
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CTTATAATACTATTATTACTGGAAGGAAAAGAGATAAGAGATAAGAGAGAAGAGGGTGAG
AGATGCAGATGAGTAGTAAGGTCACGATGTGTGTAGTGTTATCTCTTCTGGGTTTAATAA
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CCACCTCTGGTTCATTATGCTCTTATGAAAGAAGCACTGCTTTCACTCTCGGCTTGAATT
CAGCTGTCTTTCTAATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGTTGGAAGCGGTTGTTTCTGTT
GTAGAAAAGGTCCTTCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCATCTCCTTAGTCTGCTTCATCG
TTTCTTGGTTCACTTTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCTATCTGGAGCTGTACTCAACA
ATAACCACACCCTGGAGGCAACGTCTCCCGATCCCTACTCCTGCTACATTGTTAGGACGG
GCGTTTTCTCTACCGCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTATTGCGCTTGGGATTGCCTACT
ATCTATGTTTGAATTCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCACAAGGT*GGTGGCTAACCAAG
GAGGAGGGATAGCAATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAGAGTAGAAGATCCTGTCTTTG
TACATGACGATACTCACATGAGAAGACAGCTCACTTA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4CV52TF 631 0 0
GG
AGTAAGGTCACGATGTGTGTAGTGTTATCTCTTCTGGGTTTAATAACAGCTCTTACCGGC
TTTGCTGCTGAAGCTACCAAAACCAAGATAAATGAGGTCACTGTTACCACCTCTGGTTCA
TTATGCTCTTATGAAAGAAGCACTGCTTTCACTCTCGGCTTGAATTCAGCTGTCTTTCTA
ATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGTTGGAAGCGGTTGTTTCTGTCGTAGAAAAGGTCCT
TCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCATCTCCTTAGTCTGCTTCATCGTTTCTTGGTTCACT
TTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCTATCTGGAGCTGTACTCAACAATAACCACACCCTG
GAGGCAACTTCTCCCGATCCCTACTCTTGCTACATTGTTAGGACGGGCGTTTTCTCTACC
GCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTATTGCGCTTGGGATTGTCTACTATCTATGTTTGAAT
TCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCACAAGGGCGGTGGCTAACCAAGGAGGAGGGATAGCA
ATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAGAGTAGAAGATCCTGTCTTTGTACATGACGATACT
CACATGAGAAGACAGCTCACTTA
AAAAAA

QA 3 625 3 625
DS 

RD RR4CV52JQ 771 0 0
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AAATGAGGTCACTGTTACCACCTCTGGTTCATTATGCTCTTATGAAAGAAGCACTGCTTT
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AAGCGGTTGTTTCTGTCGTAGAAAAGGTCCTTCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCATCTC
CTTAGTCTGCTTCATCGTTTCTTGGTTCACTTTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCTATC
TGGAGCTGTACTCAACAATAACCACACCCTGGAGGCAACTTCTCCCGATCCCTACTCTTG
CTACATTGTTAGGACGGGCGTTTTCTCTACCGCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTATTGC
GCTTGGGATTGTCTACTATCTATGTTTGAATTCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCACAAG
GGCGGTGGCTAACCAAGGAGGAGGGATAGCAATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAGAGT
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AGAAGGCTTTGTCTGATTTTTACCTACATTTTTGTATCTTTCTGATTTTTTCTTGTATGT
GAGGGTATAAGATCATCTCCAACTTATCTATATATTTTTCTTTGTAATATA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4B150JQ 853 0 0
TCTTCTGGGTTTAATAACAGCTCTTACCGGCTTTGCTGCTGAAGCTACCAAAACCAAGAT
AAATGAGGTCACTGTTACCACCTCTGGTTCATTATGCTCTTATGAAAGAAGCACTGCTTT
CACTCTCGGCTTGAATTCAGCTGTCTTTCTAATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGTTGG
AAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCATCTC
CTTAGTCTGCTTCATCGTTTCTTGGTTCACTTTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCTATC
TGGAGCTGTACTCAACAATAACCACACCCTGGAGGCAACGTCTCCCGATCCCTACTCCTG
CTACATTGTTAGGACGGGCGTTTTCTCTACCGCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTATTGC
GCTTGGGATTGCCTACTATCTATGTTTGAATTCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCACAAG
GT*GGTGGCTAACCAAGGAGGAGGGATAGCAATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAGAGT
AGAAGATCCTGTCTTTGTACATGACGATACTCACATGAGAAGACAGCTCACTTAAAAAAA
ATACAGAACAGGGCTTGCTTGGTAAACAAGGTAGGTTTAGGAAGATATATTTAGATAAAA
AGAAGGCTTTGTCTGGTTTTTACCTACATTTTTGTATCTTTCTGATTTTTTCTTGTATGT
GAGGGTATAAGATCATCTCCAACTTATCTATATATTTTTCTTTGTAATATAAAATTATTT
CATTCCACTTATATTTTTCATCTAAAATATAAATTGCTATTTTTCTTTTATAAATAGAAA
AATATCATTTTCT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 4

CO CL2658Contig1 1173 4 3 U
GGAGGAGAGAAGAACTGTCGTTTCCCATTTCGAAACTCTCCTCTCCTCTCCACTCCTCTC
CTGTTGTTAGGTGAGAAGAACCCCACCCACCCCACATGGCGATTTACGTCAAGGCGTCTC
TCCAGCGGAACAGCAAGGCTGCGTGCTCTGAAATGTTATTCAACGTCGTTTAGGGAGGAG
AGGGACACCTTCCGATAAGTTAGTTGGGGGGATTGAATTATCTCATTTCCAATTCCCCAC
AATAGGCTTAGGCTAAGTTGGGGACACCAATGCTTTCTTGCTTGCTCTTTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGCCAGGTGTGGGGAGCACAGACGCAGAGATCACTGCAGAACTTCGAGA
TCGGTGGTGAGCGGGAGCGTATGCCCGAACCTATCGTCCGCGCTTTCGGCGTCTTGAAGA
AGTGCGCTGCCAAGGTAAACATGGAGTATGGACTTGATCCAACAATTGGGAAAGCGATAA
TGGAAGCAGCTCAGGAAGTAGCTGAGGGCAAACTCAATGATCATTTCCCCCCTTGTTGTT
TGGCAAACTGGTAGTGGCACTCAGAGAGAGTAACATGAATGCTAATGAGGTCATTGCTAA
CAGAGCAGCTCAGATTCTTGGTGGTGATAAATGTGTCCACCCTAATGACCATGTCATCTG
TTGCGTTTGTTAATTTTCTCGAACTTATTTCCTAATTCTGGGGCAGTCCTTCGAGTTCAA
AGATATTGTCAAAATCGGAAGAACTCACACTCAAGATGCTACTCCTTTGACCCTAGCACA
AGAATTCAGTGGCTATTCTACTCAAGTTAAGTATGGGCTTAATAGGGTCACATGCACTTT
ACCCCGCCTCTATCAGCTTGCACAAGGTGGAACTGCTGTTGGAACAGGATTAAACACCAA
GAAAGGGTTTGACGTAAAGATAGCTGCTGAAGTAGCCCAAGAAACAAACTTGCCCTTTGT
CACTGCAGAAAACAAGTTTGAAGCTCTGGTTAGCCCCTAAACGAGATAAGGGGCATGAGT
CCCTTATGCTTGTGACATCATTGAATCCGGTAAGTCTCCAGAGTAAGTTACATGTTTCCT
TTTACCAGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAAGCTTCATTCACTA
GTCTTCCTCTTGTTATTGAATCCTGAAACAATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A036TF U 1
AF RR4A036TFB U 1
AF RR4A036JQ C 397
AF RR4A036JQD C 432
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BS 711 1173 RR4A036JQ

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QA 1 160 1 160
DS 

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GTGTGTGTGTGTGCCAGGTGTGGGGAGCACAGACGCAGAGATCACTGCAGAACTTCGAGA
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TTGCGTTTGTTAATTTTCTCGAACTTATTTCCTAATTCTGGGGCAGTCCT

QA 1 710 1 710
DS 

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ATGATCATTTCCCCCCTTGTTGTTTGGCAAACTGGTAGTGGCACTCAGAGAGAGTAACAT
GAATGCTAATGAGGTCATTGCTAACAGAGCAGCTCAGATTCTTGGTGGTGATAAATGTGT
CCACCCTAATGACCATGTCATCTGTTGCGTTTGTTAATTTTCTCGAACTTATTTCCTAAT
TCTGGGGCAGTCCTTCGAGTTCAAAGATATTGTCAAAATCGGAAGAACTCACACTCAAGA
TGCTACTCCTTTGACCCTAGCACAAGAATTCAGTGGCTATTCTACTCAAGTTAAGTATGG
GCTTAATAGGGTCACATGCACTTTACCCCGCCTCTATCAGCTTGCACAAGGTGGAACTGC
TGTTGGAACAGGATTAAACACCAAGAAAGGGTTTGACGTAAAGATAGCTGCTGAAGTAGC
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QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4A036JQD 742 0 0
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AATTTTCTCGAACTTATTTCCTAATTCTGGGGCAGTCCTTCGAGTTCAAAGATATTGTCA
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GCTATTCTACTCAAGTTAAGTATGGGCTTAATAGGGTCACATGCACTTTACCCCGCCTCT
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GTGACATCATTGAATCCGGTAAGTCTCCAGAGTAAGTTACATGTTTCCTTTTACCAGAAA
ATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAAGCTTCATTCACTAGTCTTCCTCTT
GTTATTGAATCCTGAAACAATA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL2659Contig1 1286 3 4 U
AGCAATATCAATACATAAAAACAAAGAAAATGAACAAGAACAAGAAGGAAGTGAATATCG
AGACAAAGAAAGGGTCCACGATGGATGAGTGGCCTGAGCCAATCGTCCGTGTCCAGGCCT
TAGCCGAGAGCAACCTCTCCTCTCTCCCCGACCGCTACATCAAACCAGCATCTCAACGTC
CCACCACAGTAGAGGAGGCCTCTGCCGCGACCAACATCCCAATCATTGACCTTGAAGGAC
TCTTCTCGGAAGACGGGTCGCCAGATGAGGCCATCTTGGCTCAGATATCAGAGGCTTGCC
GTGAGTGGGGATTCTTCCAAGTGTTGAACCATGGTGTGAGGCCAGAGCTGATGGACGCGG
CTAGGGAGAATTGGAGAGAGTTTTTTCACTTGCCGGTTAATGAGAAGGAGACTTACAAAA
ACTCACCAAAAACTTATGAGGGCTATGGAAGCAGACTAGGAGTTGAGAAAGAAGCCATTC
TTGACTGGAGTGATTATTACTTTCTCCATCTTCTTCCTCCTCATTTGAAAGACTTCAACA
AGTGGCCTTCTTTTCCTCCCACCATTAGAGAAGTGATCGATGAGTATGGCAAGCAAGTAG
TGAACCTATGCGGGAGAATTATGAAGGTATTATCATTAAACTTAGGATTAAAGGAGGATA
AGTTTCAAGATGCGTTTGGTGGTGAAAACATTGGGGCGTGTTTGAGGGTTAATTATTATC
CAAAATGCCCTAGACCGGAGCTGGCTCTCGGTCTCTCCTCCCACTCTGATCCTGGCGGTA
TGACTATTCTCTTACCAGACGATCAGGTCTTCGGTCTTCAAGTCCGTAAAAATGACATGT
GGATCACCGTCAAGCCTCATCCTCATGCGTTCATCGTTAATATTGGTGATCAAATTCAGA
TACTAAGCAACTCAGTGTACAAGAGTGTGGAGCATAGAGTGATAGTGAACTCGGAGAAAG
AGAGAGTTTCGCTTGCTTTCTTCTACAATCCTAAAAGCGATATACCAATCCAACCATTAC
AAGAACTTGTAACCACTCATAATCCTCCTTTATATCCTCCCATGACCTTTGATCAATATA
GACTCTTTATCCGAACTCAAGGTCCACAAGGCAAATCTCATGTTGAATCTCTTGTTTCTC
CTCGTTAGTTTTTTTCTCTTCCTATAAAGAATATTAAATGTTTTGGTTTGTTTCATGAAA
TTTACATCTGACTTGTATGTGTACAATCTTTCAGGATCTGATTTACCTTCAAGTAAATAA
ATACTGAATGAGATATATTGTTATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E003TF U 1
AF RR4DS09TF U 1
AF RR4DS09JQ C 568
BS 1 626 RR4DS09TF
BS 627 627 RR4DS09JQ
BS 628 637 RR4DS09TF
BS 638 1286 RR4DS09JQ

RD RR4E003TF 360 0 0
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AGACAAAGAAAGGGTCCACGATGGATGAGTGGCCTGAGCCAATCGTCCGTGTCCAGGCCT
TAGCCGAGAGCAACCTCTCCTCTCTCCCCGACCGCTACATCAAACCAGCATCTCAACGTC
CCACCACAGTAGAGGAGGCCTCTGCCGCGACCAACATCCCAATCATTGACCTTGAAGGAC
TCTTCTCGGAAGACGGGTCGCCAGATGAGGCCATCTTGGCTCAGATATCAGAGGCTTGCC
GTGAGTGGGGATTCTTCCAAGTGTTGAACCATGGTGTGAGGCCAGAGCTGATGGACGCGG

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR4DS09TF 637 0 0
AGCAATATCAATACATAAAAACAAAGAAAATGAACAAGAACAAGAAGGAAGTGAATATCG
AGACAAAGAAAGGGTCCACGATGGATGAGTGGCCTGAGCCAATCGTCCGTGTCCAGGCCT
TAGCCGAGAGCAACCTCTCCTCTCTCCCCGACCGCTACATCAAACCAGCATCTCAACGTC
CCACCACAGTAGAGGAGGCCTCTGCCGCGACCAACATCCCAATCATTGACCTTGAAGGAC
TCTTCTCGGAAGACGGGTCGCCAGATGAGGCCATCTTGGCTCAGATATCAGAGGCTTGCC
GTGAGTGGGGATTCTTCCAAGTGTTGAACCATGGTGTGAGGCCAGAGCTGATGGACGCGG
CTAGGGAGAATTGGAGAGAGTTTTTTCACTTGCCGGTTAATGAGAAGGAGACTTACAAAA
ACTCACCAAAAACTTATGAGGGCTATGGAAGCAGACTAGGAGTTGAGAAAGAAGCCATTC
TTGACTGGAGTGATTATTACTTTCTCCATCTTCTTCCTCCTCATTTGAAAGACTTCAACA
AGTGGCCTTCTTTTCCTCCCACCATTAGAGAAGTGATCGATGAGTATGGCAAGCAAGTAG
TGAACCTATGCGGGAGAATTATGAAG*TATTATCATT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4DS09JQ 719 0 0
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TATTATCATTAAACTTAGGATTAAAGGAGGATAAGTTTCAAGATGCGTTTGGTGGTGAAA
ACATTGGGGCGTGTTTGAGGGTTAATTATTATCCAAAATGCCCTAGACCGGAGCTGGCTC
TCGGTCTCTCCTCCCACTCTGATCCTGGCGGTATGACTATTCTCTTACCAGACGATCAGG
TCTTCGGTCTTCAAGTCCGTAAAAATGACATGTGGATCACCGTCAAGCCTCATCCTCATG
CGTTCATCGTTAATATTGGTGATCAAATTCAGATACTAAGCAACTCAGTGTACAAGAGTG
TGGAGCATAGAGTGATAGTGAACTCGGAGAAAGAGAGAGTTTCGCTTGCTTTCTTCTACA
ATCCTAAAAGCGATATACCAATCCAACCATTACAAGAACTTGTAACCACTCATAATCCTC
CTTTATATCCTCCCATGACCTTTGATCAATATAGACTCTTTATCCGAACTCAAGGTCCAC
AAGGCAAATCTCATGTTGAATCTCTTGTTTCTCCTCGTTAGTTTTTTTCTCTTCCTATAA
AGAATATTAAATGTTTTGGTTTGTTTCATGAAATTTACATCTGACTTGTATGTGTACAAT
CTTTCAGGATCTGATTTACCTTCAAGTAAATAAATACTGAATGAGATATATTGTTATAC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 4

CO CL2660Contig1 642 4 10 U
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TCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCAGCTCCAATGGCCTCCG
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CCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGCTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCATGG
CTCGTACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAGCCT
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TCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGTATA
TCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGAGTA
ATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTTGTG
TGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTTTTATGTATA
CCTCCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTCCATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR4BH34JQ C 1
AF RR4DC87TF U 1
AF RR4BH34TF U 1
AF RR4C819TF U 449
BS 1 135 RR4DC87TF
BS 136 136 RR4BH34TF
BS 137 339 RR4DC87TF
BS 340 340 RR4BH34TF
BS 341 477 RR4DC87TF
BS 478 478 RR4BH34TF
BS 479 603 RR4DC87TF
BS 604 604 RR4BH34TF
BS 605 638 RR4DC87TF
BS 639 642 RR4C819TF

RD RR4BH34JQ 638 0 0
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TCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCAGCTCCAATGGCCTCCG
AGGCAGCAATCTCTTGCGGCGCTGTCGCGAGCAACTTAGGCCAATGTATTAACTACCTGA
CCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGCTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCATGG
CTCGTACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAGCCT
TGGGTTCCAGACTTAACCCAGGACGTGCTGCTCGTCTTCTTGGTGCTTGCCGTGTTAGGA
TCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGTATA
TCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGAGTA
ATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTTGTG
TGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTTTTATGTATA
CCTCCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4DC87TF 638 0 0
GGATCCAAACTCATTACTAACTTAAGCAAAAGAGATAAAGCTTAAAGATTATGGAGGGGC
TCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCAGCTCCAATGGCCTCCG
AGGCAGCAATCTCTT*CGGCGCTGTCGCGAGCAACTTAGGCCAATGTATTAACTACCTGA
CCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGCTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCATGG
CTCGTACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAGCCT
TGGGTTCCAGACTTAACCCAGGACGTGCTGCTCGTCTTCCTGGTGCTTGCCGTGTTAGGA
TCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGTATA
TCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGAATA
ATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTTGTG
TGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTTTTATGTATA
CCTTCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4BH34TF 638 0 0
GGATCCAAACTCATTACTAACTTAAGCAAAAGAGATAAAGCTTAAAGATTATGGAGGGGC
TCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCAGCTCCAATGGCCTCCG
AGGCAGCAATCTCTTGCGGCGCTGTCGCGAGCAACTTAGGCCAATGTATTAACTACCTGA
CCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGCTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCATGG
CTCGTACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAGCCT
TGGGTTCCAGACTTAACCCAGGACGTGCTGCTCGTCTTCTTGGTGCTTGCCGTGTTAGGA
TCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGTATA
TCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGAGTA
ATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTTGTG
TGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTTTTATGTATA
CCTCCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4C819TF 194 0 0
G
GTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGAATAATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATT
TTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTTGTGTGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTG
TCCATTTAACTCGTCGTCTGTTTTATGTATACCTCCAAT*ATATATGGAATTACGATATG
TATTGTTTCCATT

QA 2 194 2 194
DS 



AS 1 2

CO CL2661Contig1 1074 2 6 U
GGGTTTTGTTTTGGGGCGTGTTTCACCTTAACCAACGTCAGCTTCAACCGCCGGAGCCGC
CGTAAGGAAGGCTCTTCATCGGCCATAACATATTTTTGTGGTCTATAAAGCGTCGCCCTT
TCTTGCCTTTTCATACGGACTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGTTTTGATTTACTA
GAGATATCATGTCGCAGTGCGTAGACGGTTTTAGGCATGTATGCAACTCTTTGTTGCGGT
GTTTTGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAGACCCTGAACTACTTGCCA
GAGACACTGTTTTTGGCGTGAGTGAAATAGAGACCCTCTATGAGCTGTTTAAAAAAATCA
GCAGTGCTGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTGGCCTTATTTA
AGACAAATAAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGACACAAAG
CATAATGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCATCCAGAT
GCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCAGCTGTATGATCTTAAACAGCAAGGT
TTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACACTTGCTGAGTCAGGCATG
AACCTATCAGACGAAGTCATAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAGGAAGCTGATACA
AAACATGACGGGAGGATCGATAGGGAAGAGTGGAGGATCCTTGTTTTTAGGCATCCTTCG
CTTTTGAAAAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACTACTACGTTTCCGAGCTTT
GTGTTTCATTCGCAGGTGGAAGATACCTGAGAAAAGCATTTCTAGAGTCAGACAACTTTG
GCAGTTGTGTTTTGTGTGTTTCTGAGTGTATCCTGTTTATTTTGTTTCAGTCTGAAATCC
AGTTTCCCAAGAGTTTGTTGTTTCTTCTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAACTTTCAAGTTG
TATTCTTTTTTTTCTCTGTATCCTGCTGGTTTTGTTTATATATTCTATATGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT06TF U 1
AF RR4C579JQ C 358
BS 1 406 RR4DT06TF
BS 407 407 RR4C579JQ
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BS 435 435 RR4C579JQ
BS 436 611 RR4DT06TF
BS 612 1074 RR4C579JQ

RD RR4DT06TF 611 0 0
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TCTTGCCTTTTCATACGGACTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGTTTTGATTTACTA
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GTTTTGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAGACCCTGAACTACTTGCCA
GAGACACTGTTTTTGGCGTGAGTGAAATAGAGACCCTCTATGAGCTGTTTAAAAAAATCA
GCAGTGCTGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAGCTGGCCTTATTTA
AGACAAATAAAAAA*GAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGACACAAAG
CATAATGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCATCCAGAT
GCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCAGCTGTATGATCTTAAACAGCAAGGT
TTCATCGAGAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4C579JQ 717 0 0
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TTAAGACAAATAAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGACACA
AAGCATAGTGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCATCCA
GATGCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCATCTGTATGATCTTAAGCAGCAA
GGTTTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACACTTGCTGAGTCAGGC
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TCGCTTTTGAAAAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACTACTACGTTTCCGAGC
TTTGTGTTTCATTCGCAGGTGGAAGATACCTGAGAAAAGCATTTCTAGAGTCAGACAACT
TTGGCAGTTGTGTTTTGTGTGTTTCTGAGTGTATCCTGTTTATTTTGTTTCAGTCTGAAA
TCCAGTTTCCCAAGAGTTTGTTGTTTCTTCTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAACTTTCAAG
TTGTATTCTTTTTTTTCTCTGTATCCTGCTGGTTTTGTTTATATATTCTATATGATT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 4

CO CL2662Contig1 650 4 7 U
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ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATTGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATC
TCTGGACCAGTGGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTACGCT
ATTGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTTCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATC
TATGAATGATTCTATCTCGTGTCCGTTTTTTTTCCTTTTGTTATGAAACTCAAACATCTC
TCTGGCTTTGTTGCGTCTGCCTTCTTCTTTCATGGTATCTATGAAGACCGATCTTGCATC
TTCGTTTTGAATTGAATCTCATTTTAGCTATGGCAATCTCAGTTTGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AP21JQ C 1
AF RR4AP21TF U 1
AF RR4AO33JQ C 5
AF RR4AO33TF U 5
BS 1 6 RR4AP21JQ
BS 7 164 RR4AP21TF
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BS 166 356 RR4AP21TF
BS 357 357 RR4AO33TF
BS 358 640 RR4AP21TF
BS 641 650 RR4AO33TF

RD RR4AP21JQ 640 0 0
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ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATTGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGATCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATT
TCTGGACCAGTGGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATTGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTTCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATC
TATGAATGATTCTATCTCGTGTCCGTTTTTTTTCCTTTTGTTATGAAACTCAAACATCTC
TCTGGCTTTGTTGCGTCTGCCTTCTTCTTTCATGGTATCTATGAAGACCGATCTTGCATC
TTCGTTTTGAATTGAATCTCATTTTAGCTATGGCAATCTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4AP21TF 640 0 0
GGAGGT
ATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAAGATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATC
AAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATTGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAAG
GGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGATCGTCCTTTCGCTGAGAAACAC
TACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATCTCTGGA
CCAGTGGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAGATCATT
GGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCTATTGAC
ATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGCG
TTGTGGTTTCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTATGAA
TGATTCTATCTCGTGTCCGTTTTTTTTCCTTTTGTTATGAAACTCAAACATCTCTCTGGC
TTTGTTGCGTCTGCCTTCTTCTTTCATGGTATCTATGAAGACCGATCTTGCATCTTCGTT
TTGAATTGAATCTCATTTTAGCTATGGCAATCTC

QA 7 640 7 640
DS 

RD RR4AO33JQ 646 0 0
GG
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AAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATTGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAAG
GGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAGAAACAC
TACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATCTCTGGA
CCAGTGGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAGATCATT
GGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTACGCTATTGAC
ATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGCG
TTGTGGTTTCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTATGAA
TGATTCTATCTCGTGTCCGTTTTTTTTCCTTTTGTTATGAAACTCAAACATCTCTCTGGC
TTTGTTGCGTCTGCCTTCTTCTTTCATGGTATCTATGAAGACCGATCTTGCATCTTCGTT
TTGAATTGAATCTCATTTTAGCTATGGCAATCTCAGTTTGCATT

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR4AO33TF 646 0 0
GG
ATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAAGATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATC
AAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATTGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAAG
GGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAGAAACAC
TACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATCATCTCTGGA
CCAGTGGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAGATCATT
GGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTACGCTATTGAC
ATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTGCG
TTGTGGTTTCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTATGAA
TGATTCTATCTCGTGTCCGTTTTTTTTCCTTTTGTTATGAAACTCAAACATCTCTCTGGC
TTTGTTGCGTCTGCCTTCTTCTTTCATGGTATCTATGAAGACCGATCTTGCATCTTCGTT
TTGAATTGAATCTCATTTTAGCTATGGCAATCTCAGTTTGCATT

QA 3 646 3 646
DS 



AS 1 4

CO CL2663Contig1 831 4 2 U
GGACGAACAGAACTTCTTACATAAAAAAAAAACTGAGTATCTCTTCCCTAGCCAAAAATT
GTATAAACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACACACACA
ACATCTTCCTACTCTGCAACTACATCCTCTTAGGCTCCGCTTCAAGTTGCATCTTCCTCA
CAATCTCGCTCCGTCTCTTCCCTTCCCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCACACTC
TCACCATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGCAACCA
CAAGCGACAGATTGTACGGTGCATACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATATTCCAAG
GGGCAGTCTCTGTTCTTATATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAAATCGT
ATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGTAGTAA
TGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGACTATT
TGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCTCAAGG
ATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTTTTTTTT
GGTACTTTGGATACATTCTTTGGTTGATTTATATAAATTAGATGGCAAAAGCTATATATT
GTGTATGGTTTTGATGCTTGTTACTTGAGAGTTGTGTGATTTTGTCACGCTTAAATAAGA
TTAGTGTATATTTTAAATTAATGTATTTTGAAAAATACTCACTTCTTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DN34TF U 1
AF RR4DM38TF U 1
AF RR4DN34JQ C 75
AF RR4DM38JQ C 82
BS 1 704 RR4DM38TF
BS 705 831 RR4DN34JQ

RD RR4DN34TF 654 0 0
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ATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTT

QA 1 654 1 654
DS 

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GTATAAACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACACACACA
ACATCTTCCTACTCTGCAACTACATCCTCTTAGGCTCCGCTTCAAGTTGCATCTTCCTCA
CAATCTCGCTCCGTCTCTTCCCTTCCCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCACACTC
TCACCATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGCAACCA
CAAGCGACAGATTGTACGGTGCATACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATATTCCAAG
GGGCAGTCTCTGTTCTTATATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAAATCGT
ATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGTAGTAA
TGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGACTATT
TGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCTCAAGG
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QA 1 704 1 704
DS 

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TGTATTTTGAAAAATACTCACTTCTTCTCC

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DS 

RD RR4DM38JQ 750 0 0
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CTTCCCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCACACTCTCACCATCGCCACTGCTGTCA
CCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGCAACCACAAGCGACAGATTGTACGGTG
CATACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATATTCCAAGGGGCAGTCTCTGTTCTTATAT
TCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAAATCGTATGTTCTTGTAGAAGACGGAG
CGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGTAGTAATGTTCTGCTTAGAGTGGGTTG
TTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGACTATTTGGATGAGAGCGTTGTAGATG
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AACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTTTTTTTTGGTACTTTGGATACATTCTTT
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TACTTGAGAGTTGTGTGATTTTGTCACGCTTAAATAAGATTAGTGTATATTTTAAATTAA
TGTATTTTGAAAAATACTCACTTCTTCTCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

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GTTATTTAATTAAACAAAGATTATTGACAATTCCGAAGTAATTGCTTCTTGCTCTCTATG
CTTGGTTTTATTTTCTCTTGCTTGTTCTGAATATTCATCTAGTGAGAGATTGCAGTATAA
GACCTTTCTTACTTCTTAT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EN32JQ C 1
AF RR4FS92TF U 1
AF RR4EN32TF U 2
BS 1 1 RR4EN32JQ
BS 2 287 RR4FS92TF
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BS 289 294 RR4FS92TF
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BS 491 499 RR4EN32TF

RD RR4EN32JQ 499 0 0
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ATTCAAGCTAATAAATCAAGATGCAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTC
CTAGGAAATGCTCTGCTACTAACCGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGC
TCAACATTGGTCATTTAGATGCTGATGGCGTCTACACCGGGCAATTCACTACCTTTGCTC
TCTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTTGCAGA
AGAAGAAGGTCGAAGCCAAACAAATTTAAGATGCTCTTATTTAAGCTTTTTTTTTCTTTT
GTTATTTAATTAAACAAAGATTATTGACAATTCCGAAGTAATTGCTTCTTGCTCTCTATG
CTTGGTTTTATTTTCTCTTGCTTGTTCTGAATATTCATCTAGTGAGAGATTGCAGTATAA
GACCTTTCTTACTTCTTAT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4FS92TF 490 0 0
G
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QA 2 490 2 490
DS 

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TTCAAGCTAATAAATCAAGATGCAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCC
TAGGAAATGCTCTGCTACTAACCGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCT
CAACATTGGTCATTTAGATGCTGATGGCGTCTACACCGGGCAATTCACTACCTTTGCTCT
CTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTTGCAGAA
GAAGAAGGTCGAAGCCAAACAAATTTAAGATGCTCTTATTTAAGCTTTTTTTTTCTTTTG
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TTGGTTTTATTTTCTCTTGCTTGTTCTGAATATTCATCTAGTGAGAGATTGCAGTATAAG
ACCTTTCTTACTTCTTAT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 4

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TCTGGGGATGCAAGGACTGTGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCCTACACCATGAACACCG
CCAGTGCCGTCACCGTCAGAAGCACTATCAGGAGGTTGAGAGAGCAGATCGAGGGTTAAA
AACAATCTACTTTTTAATCACTTTTTGGGTTCTTCGTTCTTTTTGGAATTGTGTTTTGGA
GTACTATGCTTGTGTCTTTGATTCAAGACGTTGTTACATTTTACCGTGAATCAATGGTTT
ATTCGAGTTTGGTC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A173TF U 1
AF RR4A173TFB U 1
AF RR4A173JQ C 3
AF RR4A173JQD C 98
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BS 718 854 RR4A173JQ

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GC
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CTTCTTCTGAAAAGACCCGATCGGCTCGGGCTCAACCTGAGCGAGAACACAGCAGCTTAT
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TACCAGAATAACATGCCACAAATCGACGACGGCAACCAAGACATGGAGGAGAGTGATTCA
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TATGTGTTCTGCCGCCGCTCTCTCTTTGAACAATGCTATGAACTGCAACCAACGTTTCAA
CTTCTTCTGAAAAGACCCGATCGGCTCGGGCTCAACCTGAGCGAGAACACAGCAGCTTAT
ACAGATCGTGCGGTGGATGAAGTTGGAAATCCTTATTTTGTTCATGATGCTGAAGAGATG
GCACACATAGTTCACGACAGGGTGAACGAGTTCTACAAGGCACAAGGCGTGTATGAGCAA
TACCAGAATAACATGCCACAAATCGACGACGGCAACCAAGACATGGAGGAGAGTGATTCA
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TGGGGATGCAAGGACTGTGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCCTACACCATGAACACCGCC
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TCGAGTTTGGTC

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CCTGAGCGAGAACACAGCAGCTTATACAGATCGTGCGGTGGATGAAGTTGGAAATCCTTA
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ATTTTACCGTGAATCAATGGTTTATTCGAGTTTGGTC

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DS 



AS 1 4

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4D736TF U 2
AF RR4CG75TF U 1
AF RR4D736JQ C 71
AF RR4CG75JQ C 303
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GG
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GGTTTTTTAATTGGTGATTATTTTCTGTTGTACGTATTTCTCTTGGATTGTTTTAAACGG
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AAGTTTATACTTCTTTTGCTTCATTGTTCATCCATATCTGTTGTATTTGTTTCTTT
TGC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4CG75TF 735 0 0
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DS 

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TGCAGGCTTGGCTGACCTTGAGGCTGCGGTCTGTCTCTGTACCATGCTCAAAGCTAGCAT
TCTTGGCATCAACCTTAACCTTCCCATCAATCTGAGCGTACTCCTCAATGTTTGTAGTAG
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AATAAAAGTACCAATCGATGTTGTTGT
CTCAT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CG75JQ 460 0 0
TTTT
TCATTGCAGGCTTGGCTGACCTTGAGTTTGCGGTCTGTTTTTGTACCATGCTCAAAGCTA
GCATTTTTGGCATCAACCTTAACCTTCCCATCAATTTGAGGGTACTCCTCAATGTTTGTA
GTAGAAATGCTCCAAAGAATTTCCTATGGGCATAAGTTGAATACTTATTTAAAGCCAAAC
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GATTAATAAAAGTACCAATCGATGTTGTTGTTTTTT

QA 5 460 5 460
DS 



AS 1 3

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GAGTCCTTAGCGTTCAATCATATGTCAAAATGAATTGAATAATATTAAAAGAGTTACTGT
AGGTAAGGATTGGTCCGTAAATAAGGCATTTAAGGACTCAATCCTTATAGACGTGGCATG
TTGTCATTGGCTCTCTATCTCTCTCTCGTCTTCTCCGCTATCTCTCTCTTGTCTTCTCCG
CTCTGTTAATTTTCTCAGGAAAGTGTAGATTGAAGTTCTGGTATCTGAATCATGAAGTTC
GAGCTGGCGTCACCGTTGAAGAAGTCCGTTCCGCTTCCCCTGTTTCTGATCCTCCTCCTC
TCTATCCTCCCGTGTTAACCACCCCCGTCTCGTTACCCACTCCGGAAGCTATTGGCTACC
CGAGTGCACAGCAGGTCATGAGCTTCAAAGGTAAGCCCACTGACAAAAGGTTCGTACTTT
CAATATCATTGCTCTTGTTAGGATGCAAAGATTTCTACTTTCGATCATATATATGTTGAA
ATTATCTGCACTTCTTTCAGGCAGGTGCTTGATGAGATTGAGATAAGAGAGCTGCGCATT
GATCACATCGACCACCGTTGCTGTTGGGGAAGCCGTCCTGCTCGCACATGGAAGATCCGT
GCTGTCGCCTGCTCGTAACAACGTTTCTTTCCCCGGATAATATGGTTGCTACGAAGCTCT
TTGCGGAGAAGTCATGGCTGGATCAAGGAGTTGAATGAGAGCAATGATGATTGCATCACA
AAATGTTTGGTAGACTCGAATGGTGTTTTGGTTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATGATT
TAGATTGTTGTAGTATGGTAGTTGAAAGCATGAATACGTCAGTGGTCCATATGTAAGTAT
ACTTACTCTTGTGCTCTGTATATTACGTTGGAGTTGTTTAGATATCCTTGTTCATGTATC
TTTTTAATCCTTGAGCTTCATCGTTTCCTCTATTAACATTTACAGTACTTGTGTTGAGCA
GGAAGGTAATTTGAAGTACACTCTATATGGTGTGTTAGTTCATTATGGTGGAGTATTGAT
TCTGGTCACTACTACTGCTTTGTTCGCACTTCAAGTGGCATATGGTATTCCCTTGATGAT
AACAAGGTTATCCAAGTTAGTGAGAAGACTGTGTTCAACCAGAAAGCGTATAAGTTGATT
CGAGAGTAATGCATTGTTTTTTCTCAGATCAATGTAATGT


BQ
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AF RR4AI54TF U 1
AF RR4CS53TF U 752
AF RR4AI54JQ C 479
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TTGTCATTGGCTCTCTATCTCTCTCTCGTCTTCTCCGCTATCTCTCTCTTGTCTTCTCCG
CTCTGTTAATTTTCTCAGGAAAGTGTAGATTGAAGTTCTGGTATCTGAATCATGAAGTTC
GAGCTGGCGTCACCGTTGAAGAAGTCCGTTCCGCTTCCCCTGTTTCTGATCCTCCTCCTC
TCTATCCTCCCGTGTTAACCACCCCCGTCTCGTTACCCACTCCGGAAGCTATTGGCTACC
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GATCACATCGACCACCGTTGCTGTTGGGGAAGCCGTCCTGCTCGCACATGGAAGATCCGT
GCTGTCGCCTGCTCGTAACAACGTTTCTTTCCCCGGATAATATGGTTGCTACGAAGCTCT
TTGCGGAGAAGTCATGGCTGGATCA*GGAGTTGA*TGAGAGCA*TGATGATTGCATCACA
AA
TGTTTGTAGACTGA

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4CS53TF 117 0 0
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TGAATGAGAGCAATGATGATTGCATCACAAAATGTTTGGTA*ACTCGAATGGTGTTT

QA 1 117 1 117
DS 

RD RR4AI54JQ 822 0 0
CCCGAGTGCACAGCAGGTCATGAGCTTCAAAGGTAAGCCCACTGACAAAAGGTTCGTACT
TTCAATATCATTGCTCTTGTTAGGATGCAAAGATTTCTACTTTCGATCATATATATGTTG
AAATTATCTGCACTTCTTTCAGGCAGGTGCTTGATGAGATTGAGATAAGAGAGCTGCGCA
TTGATCACATCGACCACCGTTGCTGTTGGGGAAGCCGTCCTGCTCGCACATGGAAGATCC
GTGCTGTCGCCTGCTCGTAACAACGTTTCTTTCCCCGGATAATATGGTTGCTACGAAGCT
CTTTGCGGAGAAGTCATGGCTGGATCAAGGAGTTGAATGAGAGCAATGATGATTGCATCA
CAAAATGTTTGGTAGACTTGAATGGTGTTTTGGTTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATGA
TTTAGATTGTTGTAGTATGGTAGTTGAAAGCATGAATACGTCAGTGGTCCATATGTAAGT
ATACTTACTCTTGTGCTCTGTATATTACGTTGGAGTTGTTTAGATATCCTTGTTCATGTA
TCTTTTTAATCCTTGAGCTTCATCGTTTCCTCTATTAACATTTACAGTACTTGTGTTGAG
CAGGAAGGTAATTTGAAGTACACTCTATATGGTGTGTTAGTTCATTATGGTGGAGTATTG
ATTCTGGTCACTACTACTGCTTTGTTCGCACTTCAAGTGGCATATGGTATTCCCTTGATG
ATAACAAGGTTATCCAAGTTAGTGAGAAGACTGTGTTCAACCAGAAAGCGTATAAGTTGA
TTCGAGAGTAATGCATTGTTTTTTCTCAGATCAATGTAATGT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 3

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ACAAACTGAAGATAGCCGAATGGGGAGAGAAGCTGAAGACAGGAGGAGCTCAGATGAGCA
GACTAGTAAGCGACAAAGTCAAAGACATCCTCCAAGCTCCCACCTTGGAATCCAAAATGG
TCGACGAAGCCACTCTCGAGACTCTCGAGGATCCCAACTGGGGAATGAACATGAGGATAT
GCGCTCAGATCAACAACCGCGAGTTCAACGCCGCCGAGATCGTCAGAGCCGTCAAGAGGA
AGATCTCTGTTAACAAAAGCCCCGTGAGCCAGAGGCTGAGCCTTGAGCTTCTCGAGGCTT
GCGCTATGAACTGTGACAATAAGATATTATTCTCTGAAGTTGCTTCCGAGAGGGTTCTTG
ATGAGATGGCTTTGTTGGTCAAGAACGGTGAGGCTGATTCGGAGAATAGGAGCAGGGCTT
TTCAGCTTATTAGAGCTTGGGGACGGTCTCAAGATCTTACTTATCTTCCTGTTTTCCAGC
AGACGTATATGAGCTTGGAAGGAGAGAATGGTTTAAACACACGTAACGAGGACAATGCAA
TGGAGGGACAAGGCTCTTTGGGGTCTCTTATGCAACGGCCTGTTCCTGTTCCTCCACCTG
GTAGCTATCCGGTTCCTAATCAAGAAGAACAGTCTCGTGGAGGAGAGGATGATG***GTC
TTCTTGACTATAACTTTGGAAACTTATCTATCAAGGATAAGAAAGAACAGATTGAGATTA
CAAGGAACAGCCTCGAGTTGTTAGCTAGCATGTTGAACACTGAAGGGAAGCCAAATCACA
CGGAGGACGAGCTAACGGTAAGTTTGATGGAGAAATGCAAGCAATCACAGCCGTTGATTC
AAATGATTATAGAGAGCACAACAGACGATGAGACTGTCCTTTTTGAGGCTCTGCACGTGA
ACGATGAGCTCCAACGCGTTCTAGCTATTTACGAGAAGCCTGATGAAAGTGAGAAGAAAG
CTTCCACGGTGGTGGAACAAGAGTCATCGGGGAGCAAAGATGATGATCCTAAACCAACAG
AAGAAGAAGAAGGACGGTCTGTGAAACCAAAGGGCCATGTCGAACATTCAGAATCATCAG
ACAAAATAGTCAAAGAAGATAAGGAGGTGAAGATAGAACTCGGGTAATCTAGTGATGAAG
ATGAGAAATGAGCTATAGTCTATGTTTTGTCTCTTCAGAGCGGTTTGGGAAGATTTGTTG
TTTTTGATGCTTTCTTCTGTAATGTTGTGGAACCTCTTTGCGTTTATGTCGTGACATTTT
AGAAACCGTAGGTGATATGAATCTTCACCCGACACGATGGTATGTATCCCATATTCGTGG
TGCAGTATTTTTACACGAGGTGTTTTTGGTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CB06TF U 1
AF RR4AP42TF U 29
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GG
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TTGGTT

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DS 



AS 1 4

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GGATCACCATCTCGATCCGTCGTTGACCCTAAGCCTCTCCGGTGAGAGTTACATGACCAA
GACGGTTGAGATGACCGTTGCCGGCGCTGGGAGCCAAGTTTGTCGGCAGACTTCGTCTCA
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TATTTTCTTCAAATGTATTAGTGTTATAATATAATTTTGCTTGTAAAAATGAATGATATA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AL33TF U 1
AF RR4A555TF U 1
AF RR4AL33JQ C 432
AF RR4A555JQ C 625
BS 1 738 RR4A555TF
BS 739 739 RR4AL33JQ
BS 740 757 RR4A555TF
BS 758 758 RR4AL33JQ
BS 759 766 RR4A555TF
BS 767 767 RR4AL33JQ
BS 768 844 RR4A555TF
BS 845 1274 RR4AL33JQ

RD RR4AL33TF 743 0 0
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TCTTTGTCTTTTTCAGATGGGTCTTGATGATTCATGCAACACGGGTCTTGTTCTTGGTTT
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AACGGATGAGAATAGAA
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TCTTATCGTTGTTACTCTTAAGTTTTGTAGCTTTAATTATAAGAAGAGATTCGAAGATCA
TCTTTGTCTTTTTCAGATGGGTCTTGATGATTCATGCAACACGGGTCTTGTTCTTGGTTT
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GGATCACCATCTCGATCCGTCGTTGACCCTAAGCCTCTCCGGTGAGAGTTACATGACCAA
GACGGTTGAGATGACCGTTGCCGGCGCTGGGAGCCAAGTTTGTCGGCAGACTTCGTCTCA
TAGCGGAATCTCCTCTTTCTCGAGCGGAAGGGTAAAGAGAGAAAGAGATATCTGCGGCGA
AGAAGAGGCGGGGGAGACGACGGAGAGAGTGGTGTGTTCGAGAGTGATTGATGATCATGA
AGACGAAGAAGGTGTTAGTGCTCGTAAAAAGCTTAGACTCACTAAACAACAATCCGCTCT
TCTTGAAGAGAGCTTCAAACAACACAGCACTCTTAATCCCAAGCAAAAACAAGCTCTTGC
GAGACAGCTGAATCTAAGGCCTAGGCAAGTTGAAGTGTGGTTCCAAAACAGGAGAGCTAG
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ACTC

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DS 

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TTATAGTTTGTAATTATACTAGTACTTACTAATCCATCTCTTCTTTTGTTATTTTCTTCA
AATGTATTAGTGTTATAATATAATTTTGCTTGTAAAAATGAATGATATAATAAAATTTGT
GCT

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DS 

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GGATTGTGAGATTTTGAAGAAATGTTGTGATACTTTAACGGATGAGAATAGAAGGCTTCA
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GGCGGCGACTTTAACGATGTGCCCTTCTTGTGAGAGACTCGGCGGTGGTGGTGCTGGTGC
TGGAGGAGGCGGAGGTACGTTTGAGGTTGATGAAGGAACGGCGAAGGGAGCTTTCTCCAT
CGTCACAAAGCCTCGTTTCTACAACCCTTTCACTAGTCCTTCTGCAGCTTGTTAATTACC
TATTAATTAATTTGTTTTTCCACATCCAATTAGGAATTAGTTAGAAGTTAAATCCGGAAA
AAGTCCTGAGTTAAAATTTGGGGAATATTGGGGAATAGTCTTTATAGACAAGACTCTTCA
ACGATCCCACTTTATTTTTCGGTGGGATTGTTGGTTGATGAAGAAATTTATAGTTTGTAA
TTATACTAGTACTTACTAATCCATCTCTTCTTTTGTTATTTTCTTCAAATGTATTAGTGT
TATAATATAATTTTGCTTGTAAAAATGAATGATATAATAAAATTTGTGCT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 3

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AGCATCATCACAAGCATCCTAAAGAGAGAATAATAAACAGAGGTAAAACTAAAGTACACA
GAGACTCAAGAGAGGTTTTTTTAAAAAGACCCAAGAAAACACAGCAACCACATAACAACA
GATAATTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGAAAATAGATTTGTAAAACAACACTCAACCAC
TTAAAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTTCGAGAT
CCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCCGATCCAGACACTGTA
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CTCTTTGCTCATACGGTCAGCTATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGCACGAT
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TTCATGGATTCCAGGGGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCTGGAAGAGTACTTCAGGGCA
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TCTCTCGGTGAGAATCTTCATTAGAGAATCTGTGAGATCCCTACCCGCGAGATCCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX89TF C 1
AF RR4EX89JQ U 10
AF RR4AH67JQ U 10
BS 1 11 RR4EX89TF
BS 12 116 RR4AH67JQ
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BS 681 838 RR4AH67JQ

RD RR4EX89TF 773 0 0
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AGCATCATCACAAGCATC*TAAAGAGAGAATAATAAACAGAGGTAAAACTAAAGTACACA
GAGACTCAAGAGAGGTTTTTT*AAAAAGACCCAAGAAAACACAGCAACCACATAACAACA
GATAATTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGAAAATAGATTTGTAAAACAACACTCAACCAC
TTAGAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTTCGAGAT
CCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCCGATCCAGACACTGTA
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CTCTTTGCTCATACGGTCAGCTATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGCACGAT
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TTCATGGATTCCAGGGGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCTGGAAGAGTACTTCAGGGCA
ACGGAATCTCTCAGCTCCAATTGTGATGACTTATCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTC
CACTGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCGAGCTCTTGCTCGAAGTCGAGAGCGACATAAGC
AAGTTTCTCTTTGATGTCACGGACGATTTCTCGCTCGGCGGTAGTGGTGAAC
C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4EX89JQ 764 0 0
GG
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TTCCCATCTCAACTTCGGAAAATAGATTTGTAAAACAACACTCAACCACTTAAAAGCATT
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TGATGTCACGGACGATTTCTCGCTCGGCGGTAGTGGTGAAC
C

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR4AH67JQ 829 0 0
CA
CCAAATAGAATATGATATTCTTTTTTTGCTTAATAAGGACAAAAAAACCAGCATCATCAC
AAGCATCCTAAAGAGAGAATAATAAACAGAGGTAAAACTAAAGTAAACAGAGACTCAAGA
GAGGTTTTTTTAAAAAGACCCAAGAAAACACAGCAACCACATAACAACAGATAGTTTCAC
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GCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCGAGCGCCGTGATCTCTTTGCTCA
TACGGTCAGCTATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGCACGATGTTTCCATACA
GATCCTTCCTGATATCCACGTCACACTTCATGATAGAGTTGTAAGTCGTTTCATGGATTC
CAGGGGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCTGGAAGAGTACTTCAGGGCAACGGAATCTCT
CAGCTCCAATTGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACTGAAGAAC
TGCTCTTATCTGTCTCGAGCTCTTGCTCGAAGTCGAGAGCGACATAAGCAAGTTTCTCTT
TGATGTCACGGACGATTTCTCGCTCGGCGGTAGTGGTGAACATGTATCCTCTCTCGGTGA
GAATCTTCATTAGAGAATCTGTGAGATCCCTACCCGCGAGATCCAGA

QA 3 829 3 829
DS 



AS 1 4

CO CL2671Contig1 1289 4 9 U
ACTATAGATCAACAAATTTATTTTTTTCTTAAAAAACGAGAGCAGTGTCTTATACGACCA
CCATCTTGAAATGGGTCTAACTGTGTCACTTGAAGACACCGTAAGAACAGAGGCAAAGAG
CCACAGCAACGTTCACTTAGTTTTGGTTGATGGAATGTCTAAGCTAATGACTCGACAAGT
TGAGAATTTTGTGTCATCGGATATCTATGTTGGTGGTCTAAAATGGAACATCATTATGAC
CGCATATGAGGACTCCCTATACTTTGGTCTGATGATCAGGGACAGCAAGTGTATCGGTTC
TAATTGGAAAGTCAATTGCACCGTCAAACTTACCATATACTCTGATACTTCTTCACTCCT
TCATGGAAACCACCAGACTCCGGTTTGTTTCGAGGCAAACAATACTCATGTACTGATAAG
CATCCCACTCAATAGCCTGAAGGAGTCATATACTGTGAACGACAAATCGGTTTTCTCAGC
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GACAGCAGAAAGAATTAAACTGACGGAGGTGGAGAGTAACAAGTCTAAATTCACCTGGAA
GATTACTCGTTTTTCGTCCTTCACAGGTGAAAATAATTCATCGTACCAGTTCACGGTTGG
ACCACGGAGATGGTACCTAAGGATGTGCCCACAAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTC
GTTGTCTTTGTATTTGCATGCTTCCGATTACGTGACCAGTCCAAAGACAAATACGTTGGC
CGTCTTTAAACTGCGAGTGCTGGACCAACTCAAGCGCAATCACCATGAATTAGACCAGCA
GCTCTGGTTTGGCTCTGATGGCCATAAAGGAGAACCCAAGTTTTTGGCGCTGGACAAACT
GCACAAGCCTTCAAACGGATTTTTGGTGAACGATACGATATATATCGGTGTTGAGTTTAT
CTATGTCTCCACAACTGAGAATATGATCTGATTGGTATCAATTGATTGAATCAAGACCAC
AAGAATAAATAGCCTGGAGAGGAACTTATCACCTATTATATTATATACTACTTTGCATAT
CGTGGTGTGTTTCGATATACAAAATAAAATATCACCAAATCGGCTGCTTGTACTGTTTGG
GATGATAACATTCAACCGAATCTGATGTTATGTCTTATGTATTCCCATGAGGAGAAAGCT
GCTTTGTGTGTGTGCTTATGTAACTTTCTTTTGCAATATTTACGTATGTGTGTATATGTG
CCTGCTCACAGACCCATTTAAAATTTTCG


BQ
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G
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CGAACCATAGGGACAGCAGAAAGAATTAAACTGACGGAGGTGGAGAGTAACAAGTCTAAA
TTCACCTGGATGATTACTCGTTTTTCGTCCTTCACAGGTGAAAATAATTCATCGTACCAG
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AGACCACAAGAATAAATAGCCTGGAGAGGAACTTATCACCTATTATATTATATACTACTT
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ATATGTGCCTGCTCACAGACCCATTTAAAATTTTCG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

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GAGAACATGTGTACGTCGTTGTTGACTGCATTTGTTGTTCTCTCAATGGCTTGTTTAAAA
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AACGTCGTCCTCTTAGCCGTTTACTTCACATCGACTCGTCCTGTTTCCGGCGAGACTCAT
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AAAGATTGTTTGCTTCACAAGAATCTCGTAGATGGAAAAGAAGATGAATTTGAGCCAGGG
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AAAGACTGTGACATTAGCTTTGTAAGTCGGGAGGTCACTTGTTCTGTTTAAGAGTTTCTC
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ACCGAACACTAGAGCAAAT


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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E596JQ C 1
AF RR4E596TF U 1
AF RR4CV02TF U 116
AF RR4CV02JQ C 193
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T

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GAGAACATGTGTACGTCGTTGTTGACTGCATTTGTTGTTCTCTCAATGGCTTGTTTAAAA
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AACGTCGTCCTCTTAGCCGTTTACTTCACATCGACTCGTCCTGTTTCCGGCGAGACTCAT
CACGATTTCAAGACTCGTCGAGGAGGTACGCTGAGGATGATGCGAGGGAAGAAGAGTAAG
AAGGCCAAGAAGACAAGGGTAGTGGAGGAACCAGCTTGTTCCGTTGTCGTGGAGCCTAAG
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AAAGATTGTTTGCTTCACAAGAATCTCGTAGATGGAAAAGAAGATGAATTTGAGCCAGGG
AGGTTATCAAATGAGGAGCTGAACGAGAGAGTAGAGGCGTTCATCACAACGTTCAGACAA
CATTTGGTGCTCGATGCAAGAAGAGGTAGAGATAGAGAAACTAACCAGAAGATGAGAACA
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T

QA 1 746 1 746
DS 

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TAAAACATTTCTACTCTGTATCTTATTTGATCGGGCAATGGCGTTCTTTGGTGTTTCTAC
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A

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DS 

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TTAGCCGTTTACTTCACATCGACTCGTCCTGTTTCCGGCGAGACTCATCACGATTTCATG
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AACTGTATCGTGGAGGAGACAAAAAGGGTTTGTCCTGAAAAAGCTGTGAAAGATTGTTTG
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GAGTAGCTGAACGAGAGAGTAGAGGCGTTCATCACAACGTTCAGACAACATTTGGTGCTC
GATGCAAGAAGAGGTAGAGATAGAGAAACTAACCAGAAGATGAGAACAAAAGACTGTGAC
ATTAGCTTTGTAAGTCGGGAGGTCACTTGTTCTGTTTAAGAGTTTCTCTGCAATTTTTTT
TTGTAACTGATGTAATGTCATAAGAACACAAAGACTATTGAACAATGCAGCTTCAGTATC
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ATCGTCTGGAAATACGAGTATGGAAGAGTGATGATCATATCGTCTGACGACCATATGTAA
TATGACATCACTCTTGTTGAAACAAAAGGTTTGGAGACAATTAAAAATACCGAACACTAG
AGCAAAT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 4

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TGCTTTATTGGACAAAGATATACATGAATCAAAAGAATCAAACCCAACGTAACAAAATAA
GTAACAGAGCATTAACATAGAAGAAATGAAAAAGCAGAGGAACATAGAGAACATATATAG
AATAATTTTAAAGTCTATGCGCTTGTTGCACATTCCCGAGGGATTCCCTGTGGGAACCTC
TTACTATCCGTACAATAATTGTAGATCATGCAATTCTTCTGGACCCACCCGAGCCTAGCT
TGGCTCGTCGAATCCATTTGTTGAGTGTACCAATTAGAGGTTGCTCTCGTCGAGCTACAA
GACGACCTTCCGTTGGCATGAATACAACCATCACACTTAATTTTCCTGTAAGAAGCCACG
AAAGGAGCTTTGGACCAATCTGTTTTAACCAGACCGCCTCTAGTTGCCCAATCATCTGCG
TTCCACAAACTCGCGTACATCCTCATCGCCTTGCTCTTTGGAAACAAAACACCGAGCGGC
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TTCCAGAGGATTGAATAAGTGTGGAAGTTTGCGGTTGGGTCAAACCAGAGATGGAACTGT
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CTCATATTACCCAAGAACTCAAAATCAATCTCATCCCAAGCTGATCCTTCTGACTTCAGG
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TTTCCGAACAAATACTCTGCTTTGGACTGAAACAGA


BQ
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DG63JQ U 1
AF RR4GL89JQ U 163
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RD RR4DG63JQ 876 0 0
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TT*CCGAACAA*TACTCTGCTT*GGACTGAAACAGA

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR4GL89JQ 712 0 0
ACATGTATAT
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AAGCCACGAAAGGAGCTTTGGACCAATCTGTTTTAACCAGACCGCCTCTAGTTGCCCAAT
CATCTGCGTTCCACAAACTCGCGTACATCCTCATCGCCTTGCTCTTTGGAAACAAAACAC
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GGAACTGTTGTTCTTTGTCACCTTTACCTTGAGTGTAAACATTAGTATGTAAAGTATAAG
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ACTTCAGGTAGAAAGTTGTTACTGTTCCTGCCGAGTTACCGGGAACTAGCTTAATCTGCA
TATCGATCTTTCCGAACAAATACTCTGCTTTGGACTGAAA
AC

QA 11 710 11 710
DS 



CO CL2673Contig2 774 2 7 U
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CTCAGCTCTACTCGCGGCTGCGTTTTCAGCCTCGGCAGCTGACTTCAACAGCGACGTCAA
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CTTAGACAAGGCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAAGAT
CGATATGCAGATTAAGCTAGTTCCCGGTAACTCGGCAGGAACAGTAACAACTTTCTACCT
GAAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAAATTGATTTTGAGTTCTTAGGTAATATGAGTGG
AGATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAACAACA
GTTCCATCTCTGGTTTGACCCAACCGCAAACTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCC
TCAAAGAATCATATGGACCGTCGATAATACACCGATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGAGCC
GCTCGGTGTTTCGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTATGGAACGC
AGATGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTCCAAAGCTCCTTTCGT
GGCTTCTTACAGAAAATTAAGTGTGATGGGTGTATTCATGCCAACGGAAGTCGTCTTGTA
GCTCGACGAGACAACCTCTATTGGTACACTCACAATGGATTCGACGAGCCAACT


BQ
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AF RR4GL89TF U 1
AF RR4DG63TF U 1
BS 1 190 RR4DG63TF
BS 191 191 RR4GL89TF
BS 192 345 RR4DG63TF
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BS 347 505 RR4DG63TF
BS 506 506 RR4GL89TF
BS 507 774 RR4DG63TF

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GGCTTCTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4DG63TF 774 0 0
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CTCAGCTCTACTCGCGGCTGCGTTTTCAGCCTCGGCAGCTGACTTCAACAGCGACGTCAA
CGTAGCATGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAACGGCCAGCTTCTTACTCTCAC
CTTAGACAAGTCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAAGAT
CGATATGCAGATTAAGCTAGTTCCCGGTAACTCGGCAGGAACAGTAACAACTTTCTACCT
GAAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAAATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGG
AGATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAACAACA
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TCAAAGAATCATATGGACCGTCGATGATACACCGATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGAGCC
GCTCGGTGTTTCGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTATGGAACGC
AGATGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTCCAAAGCTCCTTTCGT
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GCTCGACGAGACAACCTCTATTGGTACACTCACAATGGATTCGACGAGCCAACT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 4

CO CL2674Contig1 1084 4 3 U
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AAGAGTCGTTAAGATCATTGAGATTGATGAAGTCAACTGGTTTGTGATGATCGAATACAC
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GTCC


BQ
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15 15 

AF RR4AZ68TF U 1
AF RR4B319TF U 1
AF RR4AZ68JQ C 285
AF RR4B319JQ C 419
BS 1 759 RR4AZ68TF
BS 760 774 RR4B319TF
BS 775 1084 RR4AZ68JQ

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QA 1 759 1 759
DS 

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GCTTATAATTTTGTCGAAAGTAAGAAGGTATGACGTCGAACAAAGGCAACAACGATGATT
TGTATGCTGTTCTTGGTCTGAACAAGGAATGTACCACCACCGAACTACGTACTGCTTATA
AGAAGCTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCGATGGGGAACTTGGAGTTTG
TAGACCAAGCAAAGAAGAAATTTCAGGCTATCCAAGAAGCCTACTCTGTTCTGTCCGACT
CCAACAA*GAGGTTCCTCTATGATGTTGGAGCTTATAATAGTGATGATGATGAAGCTGAC
CAAAACGGAATGGGTGATTTTTTAAATGAAA*TGGCTGCCATGATGAATCAATCCAAGCC
TAATGAGAATAATTCAGGAGACAGTTTCGAACAGCTACAGGATCTGTTTAACGAGATGTT
TCAAGGAGACCCTACAGCATTCCCACCCTCATCATCTTCAACTTTCACTTCGTCTTGTAG
CTTTGTCTTTGACACGAATGGTCAGCAGTCACCGTTTGAGACGAGCTCGATGATGGGGAG
AAGTGATCCTTTCGGATTTGACTCAAGATCTCACACTTTCTCTCTAGGGGTGGAACATCA
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TTCTCAAACGTCTAACAACTATGGAGTCTCCTCCACTTCATAGGCCCTTTTTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AZ68JQ 800 0 0
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TGAATCAATCCAAGCCTAATGAGAATAATTCAGGAGACAGTTTCGAACAGCTACAGGATC
TGTTTAACGAGATGTTTCAAGGAGACCCTACAGCATTCCCACCCTCATCATCTTCAACTT
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GCAGACGGAAGAACAATTCTCAAACGTCTAACAACTATGGAGTCTCCTCCACTTCATAGG
CCCTTTTTTTCAGAACCGTATCTTTTTGATTTGTCGACTAGTCACACACTCACACACAAG
AGGACTACTGGTTCTGGTCCTTCTCAACGGCGATGCCCATCACAAAAAAATTCTTAAAAG
CATTGTCGTCTGTAAACTATACATTTTCTCGAAGCTTCTTTTCTTTTTCCTCTCTCTAAT
TGTTGTCTCCTGAGCAAAGAGTCGTTAAGATCATTGAGATTGATGAAGTCAACTGGTTTG
TGATGATCGAATACACATCGTATGTCTCTTGATTCTTTCAGCATTTAATTAATACAAAAT
ACATTTTTTTTGCTTGGTCC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4B319JQ 666 0 0
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TTTCAAGGAGACCCTACAGCATTCCCACCCTCATCATCTTCAACTTTCACTTCGTCTTGT
AGCTTTGTCTTTGACACGAATGGTCAGCAGTCACCGTTTGAGACGAGCTCGATGATGGGG
AGAAGTGATCCTTTCGGATTTGACTCAAGATCTCACACTTTCTCTCTAGGGGTGGAACAT
CAGCAGGATTTCAAGAAAGGGACGAAGAACAATGGTGGAAGAAGAAGCAGACGGAAGAAC
AATTCTCAAACGTCTAACAACTATGGAGTCTCCTCCACTTCATAGGCCCTTTTTTTCAGA
ACCGTATCTTTTTGATTTGTCGACTAGTCACACACTCACACACAAGAGGACTACTGGTTC
TGGTCCTTCTCAACGGCGATGCCCATCACAAAAAAATTCTTAAAAGCATTGTCGTCTGTA
AACTATACATTTTCTCGAAGCTTCTTTTCTTTTTCCTCTCTCTAATTGTTGTCTCCTGAG
CAAAGAGTCGTTAAGATCATTGAGATTGATGAAGTCAACTGGTTTGTGATGATCGAATAC
ACATCGTATGTCTCTTGATTCTTTCAGCATTTAATTAATACAAAATACATTTTTTTTGCT
TGGTCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

CO CL2675Contig1 1318 4 3 U
GAATGGGCTATTAATCAGCTAACAACGTTACCATCATCAAACCTTTGGATTCCTTCAGTG
GCACTTTGTCTTCATCCAAAAGCTAGCAGATATGTGTTGTAATGAAATGAAAAACGAGGA
GAAAGTCAAAAGCTGGGAGTTCAAAATCCGAAAATTATTCTCAAACAACAAAACACAAAC
TATAAACACTGCTTTTCACCAGATGAGTAAGATGCTATGTAATACAACAATTTTGACAGA
GTTTTGTATTATTCAAGCAAACAAAGACATTCTTCCTTGCCTCCCAGGGATACCAAAGTG
TGAGGCAAGTGACAACTTGAGAGCTAAAAAATTTTAGCCGGAAAATATATTAAGAAAATT
TAAAAAAAAAAACAAAAACATATGGAGATCTTTAAAACACAGACAGTGTGTGACTTGTTG
TGCTTTTTTAAAAAAAATCATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAAAAGCTGTAT
GTTGGTACTTCCAGGTTGTACGGTGCCGGACCTTTCCTGATCCTTCCAAATATATCGTAA
TGCGATCCGTGACACGGGCAGAACCAACCTCCGTAATCACCAGCGTTAGGCAAAGGGATG
CATCCCAAGTGAGTGCAGACTCCAACCACCACTAACCATTCCGGATTCTTCACCCTCACC
GCATCTTCCTGTGGGTCTCTCAAAGTTCCAAGATCCACACTGTTGGCCAGCTTGATGTCA
TCCTCTGTTCTTCGCCTGATGAACACGGGCTTTCCACGCCACTTCACCGTCACAGTAGTT
CCCGGTTCGATGCTCCCAAGGTCGACCTCGAGAGATGCAAGTGCGAGGACATCTTTACTC
GCGGTCATGCTGACAATGAGCTTCAGAACGAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACAAAC
CTCCCGCCAGACAAGACGAAATAGGCGAAAGCACGCTTGCTAGGGTCTCCAGGCGGGTAA
CGCTCATGGTTATGGTCATCATACACAATCTTTGAGTTAGGTGTCTTGACAGCCTCCACG
GTGGCTGGGACTTCCGAAGCAAAACCTACCTCATTCCCTTGGGTGAGGACTTGAGAAGCG
AAACCTCTTATAAGGCTCCTGTGGTAAGAATTGAAAGACGAGAGATCAGCAGAGGGAACA
GATCTGGGGGCGGCGGAGAAAGATGAGTCGATTGTATGATCTCGGGACAGGACGAAGGTG
GTCGCAGTCGAAGATCTCTGCTGAACAGACAAAAGCCTCCTCCCTGCAACTCGCAGCATC
TTCTCTTCTTCAACGGGACGAATCTAGGGTTTAGAGATTGATGAATGAATGAGAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D347JQ C 1
AF RR4D347TF U 1
AF RR4CI20JQ U 234
AF RR4CI20TF C 765
BS 1 351 RR4D347TF
BS 352 995 RR4CI20JQ
BS 996 1318 RR4CI20TF

RD RR4D347JQ 351 0 0
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TATAAACACTGCTTTTCACCAGATGAGTAAGATGCTATGTAATACAACAATTTTGACAGA
GTTTTGTATTATTCAAGCAAACAAAGACATTCTTCCTTGCCTCCCAGGGATACCAAAGTG
TGAGGCAAGTGACAACTTGAGAGCTAAAAAATTTTAGCCGGAAAATATATT

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4D347TF 351 0 0
GAATGGGCTATTAATCAGCTAACAACGTTACCATCATCAAACCTTTGGATTCCTTCAGTG
GCACTTTGTCTTCATCCAAAAGCTAGCAGATATGTGTTGTAATGAAATGAAAAACGAGGA
GAAAGTCAAAAGCTGGGAGTTCAAAATCCGAAAATTATTCTCAAACAACAAAACACAAAC
TATAAACACTGCTTTTCACCAGATGAGTAAGATGCTATGTAATACAACAATTTTGACAGA
GTTTTGTATTATTCAAGCAAACAAAGACATTCTTCCTTGCCTCCCAGGGATACCAAAGTG
TGAGGCAAGTGACAACTTGAGAGCTAAAAAATTTTAGCCGGAAAATATATT

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4CI20JQ 762 0 0
C
GACAGAGTTTTGTATTATTCAAGCAAACAAAGACATTCTTCCTTGCCTCCCAGGGGTACC
AAAGTGTGAGGCAAGTGACAACTTGAGAGCTAAAAAATTTTAGCCGGAAAATATATTAAG
AAAATTTAAAAAAAAAAACAAAAACATATGGAGATCTTTAAAACACAGACAGTGTGTGAC
TTGTTGTGCTTTTTTAAAAAAAATCATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAAAAG
CTGTATGTTGGTACTTCCAGGTTGTACGGTGCCGGACCTTTCCTGATCCTTCCAAATATA
TCGTAATGCGATCCGTGACACGGGCAGAACCAACCTCCGTAATCACCAGCGTTAGGCAAA
GGGATGCATCCCAAGTGAGTGCAGACTCCAACCACCACTAACCATTCCGGATTCTTCACC
CTCACCGCATCTTCCTGTGGGTCTCTCAAAGTTCCAAGATCCACACTGTTGGCCAGCTTG
ATGTCATCCTCTGTTCTTCGCCTGATGAACACGGGCTTTCCACGCCACTTCACCGTCACA
GTAGTTCCCGGTTCGATGCTCCCAAGGTCGACCTCGAGAGATGCAAGTGCGAGGACATCT
TTACTCGCGGTCATGCTGACAATGAGCTTCAGAACGAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAG
ACAAACCTCCCGCCAGACAAGACGAAATAGGCGAAAGCACGCTTGCTAGGGTCTCCAGGC
GGGTAACGCTCATGGTTATGGTCATCATACACAATCTTTGA

QA 2 762 2 762
DS 

RD RR4CI20TF 554 0 0
CACCGTCACAGTAGTTCCCGGTTCGATGCTCCCAAGGTCGACCTCGAGAGATGCAAGTGC
GAGGACATCTTTACTCGCGGTCATGCTGACAATGAGCTTCAGAACGAGAAGGCGGAGAAC
AGAGGCGTAGACAAACCTCCCGCCAGACAAGACGAAATAGGCGAAAGCACGCTTGCTAGG
GTCTCCAGGCGGGTAACGCTCATGGTTATGGTCATCATACACAATCTTTGAGTTAGGTGT
CTTGACAGCCTCCACGGTGGCTGGGACTTCCGAAGCAAAACCTACCTCATTCCCTTGGGT
GAGGACTTGAGAAGCGAAACCTCTTATAAGGCTCCTGTGGTAAGAATTGAAAGACGAGAG
ATCAGCAGAGGGAACAGATCTGGGGGCGGCGGAGAAAGATGAGTCGATTGTATGATCTCG
GGACAGGACGAAGGTGGTCGCAGTCGAAGATCTCTGCTGAACAGACAAAAGCCTCCTCCC
TGCAACTCGCAGCATCTTCTCTTCTTCAACGGGACGAATCTAGGGTTTAGAGATTGATGA
ATGAATGAGAATCC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 2 4

CO CL2676Contig1 921 2 2 U
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TCTGGATCTCTCGTTGTCAAGAAGCTGTGGTACAGTAAGCAAGCCATATACCCAAAAGGA
TTCAAGAGCCGTGTTCAGTTCATAAACGTGCTTGATCCAACAAAACTAACTAACTACACC
TCAGAGGTTCTTGATGCAGGGCTTGCTGGTCCACTGTTCAGGGTCTCACTAGAAGAATGC
CCCAGCGAGAACTTCTCTAATGTATCAGCTGAGAAGTGCTGGCAAATGGTGATACAAAGG
CTCAAACTCGAAATCATCAAGAGATGTGATCAACCAGCTAGCTCCTTGACTGTTTTACAG
GCTCTGGAGAATATTGGACTTGAAATGTTTGGCTTTCTCTCACCGCATGTTATTCAGGCG
CTTGAGGCTCTTGATCCAAAGCATCAGCTGGAGGAGTATTGGAACCAAAAAACAGCGAAA
GTGTTTGGTGTTGAACTCACAAAGGAAGGAGAAAAGGATGATGATAAAGAGAAAGGAGGG
GCTTCAGATCCCTCTATGGACCGGGACACAAGGCTTCTGCGTGGACTGTTGAAGAAGGCG
ACACCAGAAGAGCTAGCAATGATGCATGGACTTCTATGTGGGGAGACACGCAACACCGAG
CTCCAGGAAGAGCTCTCCTCTTTGGTGGATAAGATGGAGAAAAGTCCTTGATGATGATGT
CATGAGCAAGCAGGCACACACTCTTTGAAGTTAAATTGTGTCGTTCCTGTGGTATGTGTT
CAGGCTCCAGTCGTTCTGCTGTGTTAGTAAAAGAGTATTCTAGAGAGGTCAACAAATGTA
GACAAAAAGGGTTGTAGGATTATTGAATGTACTCATGTACCATTGTTCCTCTATTTCATT
TGCTTGTACCAGCTTTAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CI88TF U 1
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GCTCTGGAGAATATTGGACTTGAAATGTTTGGCTTTCTCTCACCGCATGTTATTCAGGCG
CTTGAGGCTCTTGATCCAAAGCATCAGCTGGAGGAGTATTGGAACCAAAAAACAGCGAAA
GTGTTTGGTGTTGAACTCACAAAGGAAGGAGAAAAGGATGATGATAAAGAGAAAGGAGGG
GCTTCAGATCCCTCTATGGACCGGGA

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DS 

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TATGGACCGGGACACAAGGCTTCTGCGTGGACTGTTGAAGAAGGCGACACCAGAAGAGCT
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TCTGCTGTGTTAGTAAAAGAGTATTCTAGAGAGGTCAACAAATGTAGACAAAAAGGGTTG
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TTAATTG

QA 1 787 1 787
DS 



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CTTCAGATCCCTCTATGGACCGGGACACGAGGCTTCTGCGTGGACTGTTGAAGAAGGCGA
CACCGGAAGAGCTAGCAATGATGCATGGACTTCTATGTGGGGATACGCGCAACACCGAGC
TCCAGGAAGAGCTCTCCTCTTTGGTGGATAAGATGGAGAAAAGTCCTTGATGATGTCATG
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TTCAGGCTCCAGTCGTTCTGCTGTATTAGTAAAGAGTATTCTAGAGAGGTAAACAAATGT
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BQ
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AF RR4G651JQ C 1
AF RR4G651TF U 1
BS 1 1 RR4G651JQ
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TGTTTGGTGTTGAACTCACAAAGGAAGGAGAAAAGGATGATGATAAAGAGAAAGGAGGGG
CTTCAGATCCCTCTATGGACCGGGACACGAGGCTTCTGCGTGGACTGTTGAAGAAGGCGA
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TCCAGGAAGAGCTCTCCTCTTTGGTGGATAAGATGGAGAAAAGTCCTTGATGATGTCATG
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TTCAGGCTCCAGTCGTTCTGCTGTATTAGTAAAGAGTATTCTAGAGAGGTAAACAAATGT
AGACAAAAAAAGGGTTGTAGGATTATTGAATGTACTCATGTACCATTGTTCCTCTATTTC
ATTTGCTTGTACCAGCTTTAATTGAAGAAAAAAATGCTTCTGGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4G651TF 644 0 0
G
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TCTGGAGAATATTGGACTTGAAATGTTTGGATTTCTCTCACCGCATGTTATTCAGGCGCT
TGAGGCTCTTGATCCAAAGCATCAGTTAGAGGAGTACTGGAACCAAAAAACAGCGAAAGT
GTTTGGTGTTGAACTCACAAAGGAAGGAGAAAAGGATGATGATAAAGAGAAAGGAGGGGC
TTCAGATCCCTCTATGGACCGGGACACGAGGCTTCTGCGTGGACTGTTGAAGAAGGCGAC
ACCGGAAGAGCTAGCAATGATGCATGGACTTCTATGTGGGGATACGCGCAACACCGAGCT
CCAGGAAGAGCTCTCCTCTTTGGTGGATAAGATGGAGAAAAGTCCTTGATGATGTCATGA
GCAAGCAGGCAGGCACACACTCTTTGAAGTTAATGGTGTCATTGTTCCTTTGGTATGTGT
TCAGGCTCCAGTCGTTCTGCTGTATTAGTAAAGAGTATTCTAGAGAGGTAAACAAATGTA
GACAAAAAAAGGGTTGTAGGATTATTGAATGTACTCATGTACCATTGTTCCTCTATTTCA
TTTGCTTGTACCAGCTTTAATTGAAGAAAAAA*TGCTTCTGGC

QA 2 644 2 644
DS 



AS 1 4

CO CL2677Contig1 685 4 30 U
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AGCAACACAAGTAGGCTTGCTTAACGCTTCTTTGACACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGG
CCAGTTGTCTTGGTGTGTTGTCCACGAACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCAGACCACGA
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GGGATCTTGTACTGCTTCGGGTTAGCGACAATCGTCATAAGGTTGTCGATCTCAGCAGCA
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AATCGCCTCCCAATACCTTTGATAGAGGTAAGGGCAAACATTATCTTCTGCTTACCATCA
ACATTTGTGTTGAGCACACGGAGAATATGCTGAAACTCCTCATTTGCGACCAAAGACATT
GTGATTCGCAGAGATGAGATTCGTAAAAGAGGCAAGCCGTTCTTTCAAGCAGTGAGGATC
GCTGGAGAGTTGAACACAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GH75JQ U 9
AF RR4GH65JQ U 11
AF RR4GH75TF C 1
AF RR4GH65TF C 7
BS 1 13 RR4GH75TF
BS 14 64 RR4GH75JQ
BS 65 65 RR4GH65JQ
BS 66 67 RR4GH75JQ
BS 68 68 RR4GH65JQ
BS 69 97 RR4GH75JQ
BS 98 98 RR4GH65JQ
BS 99 108 RR4GH75JQ
BS 109 109 RR4GH65JQ
BS 110 214 RR4GH75JQ
BS 215 215 RR4GH65JQ
BS 216 232 RR4GH75JQ
BS 233 233 RR4GH65JQ
BS 234 302 RR4GH75JQ
BS 303 303 RR4GH65JQ
BS 304 398 RR4GH75JQ
BS 399 399 RR4GH65JQ
BS 400 420 RR4GH75JQ
BS 421 421 RR4GH65JQ
BS 422 467 RR4GH75JQ
BS 468 468 RR4GH65JQ
BS 469 484 RR4GH75JQ
BS 485 485 RR4GH65JQ
BS 486 503 RR4GH75JQ
BS 504 504 RR4GH65JQ
BS 505 606 RR4GH75JQ
BS 607 607 RR4GH65TF
BS 608 608 RR4GH75TF
BS 609 609 RR4GH65TF
BS 610 685 RR4GH75TF

RD RR4GH75JQ 602 0 0
AAAAT
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TCTTGAGACGTTCAAGGTCATCCCTGAGCTTCATGTCAAGGGCATTGGAAACAACTTGAG
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GCTTCGGGTTAGCGACAATCGTCATCAGGTTGTCGATCTCAGCAGCAAATAACTCACCAG
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TGGA

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DS 

RD RR4GH65JQ 601 0 0
GAT
TGAAAAGGTCTCAAAACTAGATTCAAAAGGTGTCTCACAAACTAGTTCGAAGAAGAAACA
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AGTACTTGCCGTCTTTGTAATCCTTCTGTCTGTTCAGGAACCAGTCTGGGATCTTGTACT
GCTTCGGGTTAGCGACAATCGTCATAAGGTTGTCGATCTCAGCAGCAGATAACTCACCAG
CCCTTTTGTTCATGTCGACATCAGCCTTCTTGCAGACGATGTTAGCCAATCGCCTCCCAA
TACCTTTGATAGAGGTAAGGGCAAACATTATCTTCTGCTTACCATCAACATTTGTGTTGA
GCACACGGAGAATATGCTGAAACTCCTCATTTGCGACCAAAGACATTGTGATT
CGCAG

QA 4 596 4 596
DS 

RD RR4GH75TF 685 0 0
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AGCAACACAAGTAGGCTTGCTTAACGCTTCTTTGACACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGG
CCAGTTGTCTTGGTGTGTTGTCCACGAACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCAGACCACGA
TGGTTCCTGATTTTCTTGAGACGTTCAAGGTCATCCCTGAGCTTCATGTCAAGGGCATTG
GAGACAACTTGAGAGTACTTGCCGTCTTTGTAATCCTTCTGTCTGTTCAGGAACCAGTCT
GGGATCTTGTACTGCTTCGGGTTAGCGACAATCGTCATCAGGTTGTCGATCTCAGCAGCA
GATAACTCACCAGCCCTTTTGTCCATGTCGACATCAGCCTTCTTGCAGACGATGTTAGCC
AATCGCCTCCCAATACCTTTGATGGAGGTAAGGGCAAACATTATCTTCTGCTTACCATCA
ACATTTGTGTTGAGCACACGGAGAATATGCTGAAACTCCTCATTTGCGACCAAAGACATT
GTGATTTGGAGAGATGAGATTCGTAAAAGAGGCAAGCCGTTCTTTCAAGCAGTGAGGATC
GCTGGAGAGTTGAACACAAGAAAAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GH65TF 679 0 0
TTTTGAT
TGAAAAGGTCTCAAAACTAGATTCAAAAGGTGTCTCACAAACTAGTTCGAAGAAGAAACA
TAAATTAAAATCGATTCTTGTGAAACATATCCAGTAAAGCAGTAACTAGCAACACAAGTA
GGCTTGCTTAACGCTTCTTTGACACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGGCCAGTTGTCTTGG
TGTGTTGTCCACGAACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCAGACCACGATGGTTCCTGATTT
TCTTGAGACGTTCAAGGTCATCCCTGAGCTTCATGTCAAGGGCATTGGAGACAACTTGAG
AGTACTTGCCGTCTTTGTAATCCTTCTGTCTGTTCAGGAACCAGTCTGGGATCTTGTACT
GCTTCGGGTTAGCGACAATCGTCATAAGGTTGTCGATCTCAGCAGCAGATAACTCACCAG
CCCTTTTGTTCATGTCGACATCAGCCTTCTTGCAGACGATGTTAGCCAATCGCCTCCCAA
TACCTTTGATAGAGGTAAGGGCAAACATTATCTTCTGCTTACCATCAACATTTGTGTTGA
GCACACGGAGAATATGCTGAAACTCCTCATTTGCGACCAAAGACATTGTGATTCGCAGAG
ATGAGATTCGTAAAAGAGGCAAGCCGT*CTTTCAAGCAGTGAGGATCGCTGGAGAGTTGA
ACACAAGAAAAA

QA 8 679 8 679
DS 



AS 1 4

CO CL2678Contig1 868 4 7 U
GGCTCTCTCTCCCTTCTTTCTAGAGCACAACCTTATCTTTTTAAATCTCCACCCCTCCCT
TCGCTGGCTTCTATAGTCGGTAGACGGTGAGGGGTGCCTCCCGTTTTCTTTTTGTTTTTA
TTTTCTCTCCTTACGCTTCTCTTCGCGGTTACTTTTCAGATCTGAGCAAATCTGGTGGCG
AGCTTAGCTCTTCCGGCGTGCATGTTTCGGTTTGGCATCTTCCGGTGATGGGGGCTCTTC
TGCGGTCCCGGATCTATGAGGATGGGTTCGGGTTCTCGCTTCCTCAGGGGCTCTCCATTT
TCTCGGCTGTTCTCCGGCTCTCCGTGGTTGTCGTGGTGTTTTATTTCAGGTGTAAGTGAG
GCGGTACTCTCTACGGTCTAGGCCGGTGTGGAGGTGTAGGTAGGGTTCTTTGGGGTGGAG
TTTACTATACCCACCGGTTCTGTCTAGTAAGACCCCGTTTTGGAGGACGACGGGGGTACT
TGAACGGAGGACTGGTGGTGGCTGCTCTCAGGCTAAGGTCTCAGGACCGATCTATTCTCT
CTCTCCAACCTCTACCCTCATGCTCCTTAAAGAGCACACCCTCTCATAGTGATTCTCTTG
TGATGCTCTCTGCATTTCTCTCGGTGGCGTGTGCATCATTACAGATCTAGGTGGTGGTTC
CTCGGCGGCCGTTTTTCTCTCTCCCGTGGTGGCGCAGCCAACTTGGTTTGGTTTGGAGCG
GGTGCTAGGGTTTCGTTCTGTTTGTGGGCCATTCTTTTGGGCTTATTTGTTTTTTTTGAA
TTGTAACCGGACCTTGTTGGGTCTTAGTGGGGTTTTTTATCTTTATTGTATTCTTTAAAA
AAAATCATAAATATGAAAACCCTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4DD39TF U 1
AF RR4CR35TF U 62
AF RR4CR35JQ C 135
AF RR4DD39JQ C 373
BS 1 424 RR4DD39TF
BS 425 675 RR4CR35TF
BS 676 676 RR4CR35JQ
BS 677 700 RR4CR35TF
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BS 702 724 RR4CR35TF
BS 725 868 RR4CR35JQ

RD RR4DD39TF 424 0 0
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TCGCTGGCTTCTATAGTCGGTAGACGGTGAGGGGTGCCTCCCGTTTTCTTTTTGTTTTTA
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AGCTTAGCTCTTCCGGCGTGCATGTTTCGGTTTGGCATCTTCCGGTGATGGGGGCTCTTC
TGCGGTCCCGGATCTATGAGGATGGGTTCGGGTTCTCGCTTCCTCAGGGGCTCTCCATTT
TCTCGGCTGTTCTCCGGCTCTCCGTGGTTGTCGTGGTGTTTTATTTCAGGTGTAAGTGAG
GCGGTACTCTCTACGGTCTAGGCCGGTGTGGAGGTGTAGGTAGGGTTCTTTGGGGTGGAG
TTTA

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4CR35TF 663 0 0
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TTTCTCTCCTTACGCTTCTCTTCGCGGTTACTTTTCAGATCTGAGCAAATCTGGTGGCGA
GCTTAGCTCTTCCGGCGTGCATGTTTCGGTTTGGCATCTTCCGGTGATGGGGGCTCTTCT
GCGGTCCCGGATCTATGAGGATGGGTTCGGGTTCTCGCTTCCTCAGGGGCTCTCCATTTT
CTCGGCTGTTCTCCGGCTCTCCGTGGTTGTCGTGGTGTTTTATTTCAGGTGTAAGTGAGG
CGGTACTCTCTACGGTCTAGGCCGGTGTGGAGGTGTAGGTAGGGTTCTTTGGGGTGGAGT
TTACTATACCCACCGGTTCTGTCTAGTAAGACCCCGTTTTGGAGGACGACGGGGGTACTT
GAACGGAGGACTGGTGGTGGCTGCTCTCAGGCTAAGGTCTCAGGACCGATCTATTCTCTC
TCTCCAACCTCTACCCTCATGCTCCTTAAAGAGCACACCCTCTCATAGTGATTCTCTTGT
GATGCTCTCTGCATTTCTCTCGGTGGCGTGTGCATCATTACAGATCTAGGTGGTGGTTCC
TCGGCGGCCGTTTT*CTCTCTCCCGTGGTGGCGCAGCCA*CTTGGTTTGGTTTGGAGCGG
GTG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CR35JQ 734 0 0
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GGCGTGCATGTTTCGGTTTGGCATCTTCCGGTGATGGGGGCTCTTCTGCGGTCCCGGATC
TATGAGGATGGGTTCGGGTTCTCGCTTCCTCAGGGGCTCTCCATTTTCTCGGCTGTTCTC
CGGCTCTCCGTGGTTGTCGTGGTGTTTTATTTCAGGTGTAAGTGAGGCGGTACTCTCTAC
GGTCTAGGCCGGTGTGGAGGTGTAGGTAGGGTTCTTTGGGGTGGAGTTTACTATACCCAC
CGGTTCTGTCTAGTAAGACCCCGTTTTGGAGGACGACGGGGGTACTTGAACGGAGGACTG
GTGGTGGCTGCTCTCAGGCTAAGGTCTCAGGACCGATCTATTCTCTCTCTCCAACCTCTA
CCCTCATGCTCCTTAAAGAGCACACCCTCTCATAGTGATTCTCTTGTGATGCTCTCTGCA
TTTCTCTCGGTGGCGTGTGCATCATTACAGATCTAGGTGGTGGTTCCTCGGCGGCCGTTT
TTCTCTCTCCCGTGGTGGCGCAGCCAACTTGGTTTGGTTTGGAGCGGGTGCTAGGGTTTC
GTTCTGTTTGTGGGCCATTCTTTTGGGCTTATTTGTTTTTTTTGAATTGTAACCGGACCT
TGTTGGGTCTTAGTGGGGTTTTTTATCTTTATTGTATTCTTTAAAAAAAATCATAAATAT
GAAAACCCTTTTAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4DD39JQ 494 0 0
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ACCGGTTCTGTCTAGTAAGACCCCGTTTTGGAGGACGACGGGGGTACTTGAACGGAGGAC
TGGTGGTGGCTGCTCTCAGGCTAAGGTCTCAGGACCGATCTATTCTCTCTCTCCAACCTC
TACCTTCATGCTCCTTAAAGAGCACACCCTCTCATAGTGATTCTCTTGTGATGCTCTCTG
CGTTTCTCTCGGTGGCGTGTGCATCATTACAGATCTAGGTGGTGGTTCCTCGGCGGCCGT
TTTTCTCTCTCCCGTGGTGGCGCAGCCAACTTGGTTTGGTTTGGAGCGGGTGCTAGGGTT
TCGTTCTGTTTGTGGGCCATTCTTTTGGGCTTATTTGTTTTTTTTGAATTGTAACCGGAC
CTTGTTGGGTCTTAGTGGGGTTTTTTATCTTTATTGTATTCTTTAAAAAAAATCATAAAT
ATGAAAACCCTTTT

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 3

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AAGGACCCATTATACAAATAAAACCCATTTGAAGTCTAATTGAAAATATGATAAGATAAA
TCTAAGAAATACTGGTGTCTTCCTCGTATCTTCAATCAGACTCCAGCGGTGGTTACGTGT
CGCACATAGGGAGAGGGTTGAATCGGTACCGGAAAAGAAACCGAACACTAATCGGTGCCG
GAACAGTAGATCCATCCCTAAGCTTGATTCCATTTGCTAGCTTCACTCCGTAATCGCCTA
TACCTTCAACTTGGATTTTCAACCTCTTCGCCGGATTTGGAACCTCCAAGAAGCTTCAAA
CGATTCATATTCAGCCTTTATCGAAACACTTGCATGAAAGGCAAGCTCCGATTCTTCTTA
AGCTGAACTAAATCGAGAAGACCAAACTTGCAAAACTCATATTTTATTCCAATAGAAGAC
TTTGCCTAATCTATAAAAGCAAAGATTGATTTCCTTGAGAATAAAAACAGAGGATGACCA
ACGGAAAGCTTAAACCCAGTGAAAACAATCGGAATTTAACTTGAAAAGAAAGAACAGAAG
TTTAAAACCAAATCCGGACTAAGACGGAAAATTATTATCCCCACCGGAAAATTATTATCC
GCACCAGAAAACTTATTATCCGCAAAACCGGAAGAGATTATCGATCTATAGATCGATTTA
TAACACAACAAAAGTATCTGATCTGTAGAAAGATCAGAATTTTAAACAAAAAAGCTTCAT
CTCTTCTCTTTCCCCGTGAAAGATTGTAGTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO67JQ U 1
AF RR4CT79JQ U 1
AF RR4CO67TF C 81
BS 1 755 RR4CO67JQ
BS 756 813 RR4CO67TF

RD RR4CO67JQ 755 0 0
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CGCACATAGGGAGAGGGTTGAATCGGTACCGGAAAAGAAACCGAACACTAATCGGTGCCG
GAACAGTAGATCCATCCCTAAGCTTGATTCCATTTGCTAGCTTCACTCCGTAATCGCCTA
TACCTTCAACTTGGATTTTCAACCTCTTCGCCGGATTTGGAACCTCCAAGAAGCTTCAAA
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AGCTGAACTAAATCGAGAAGACCAAACTTGCAAAACTCATATTTTATTCCAATAGAAGAC
TTTGCCTAATCTATAAAAGCAAAGATTGATTTCCTTGAGAATAAAAACAGAGGATGACCA
ACGGAAAGCTTAAACCCAGTGAAAACAATCGGAATTTAACTTGAAAAGAAAGAACAGAAG
TTTAAAACCAAATCCGGACTAAGACGGAAAATTATTATCCCCACCGGAAAATTATTATCC
GCACCAGAAAACTTATTATCCGCAAAACCGGAAGAGATTATCGATCTATAGATCGATTTA
TAACACAACAAAAGTATCTGATCTGTAGAAAGATC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4CT79JQ 758 0 0
GCCAACATTTATATTATTATAAAAGCCATGGGCCTCAGATGATACAAATGAGAAACAGGC
AAGGACCCATTATACAAATAAAACCCATTTGAAGTCTAATTGAAAATATGATAAGATAAA
TCTAAGAAATACTGGTGTCTTCCTCGTATCTTCAATCAGACTCCAGCGGTGGTTACGTGT
CGCACATAGGGAGAGGGTTGAATCGGTACCGGAAAAGAAACCGAACACTAATCGGTGCCG
GAACAGTAGATCCATCCCTAAGCTTGATTCCATTTGCTAGCTTCACTCCGTAATCGCCTA
TACCTTCAACTTGGATTTTCAACCTCTTCGCCGGATTTGGAACCTCCAAGAAGCTTCAAA
CGATTCATATTCAGCCTTTATCGAAACACTTGCATGAAAGGCAAGCTCCGATTCTTCTTA
AGCTGAACTAAATCGAGAAGACCAAACTTGCAAAACTCATATTTTATTCCAATAGAAGAC
TTTGCCTAATCTATAAAAGCAAAGATTGATTTCCTTGAGAATAAAAACAGAGGATGACCA
ACGGAAAGCTTAAACCCAGTGAAAACAATCGGAATTTAACTTGAAAAGAAAGAACAGAAG
TTTAAAACCAAATCCGGACTAAGACGGAAAATTATTATCCCCACCGGAAAATTATTATCC
GCACCAGAAAACTTATTATCCGCAAAACCGGAAGAGATTATCGATCTATAGATCGATTTA
TAACACAACAAAAGTATCTGATCTGTAGAAAGATC
AGA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4CO67TF 733 0 0
AAACCCATTTGAAGTCTA*TTGAAAATATGATAAGATAAATCTAAGAAATACTGGTGTCT
TCCTCGTATCTTCAATCAGACTCCAGCGGTG*TTACGTGTCGCACATAGGGAGAGGGTTG
AATCGGTACCGGAAAAGAAACCGAACACTAATCGGTGCCGGAACAGTAGATCCATCCCTA
AGCTTGATTCCATTTGCTAGCTTCACTCCGTAATCGCCTATACCTTCAACTTGGATTTTC
AACCTCTTCGCCGGATTTGGAACCTCCAAGAAGCTTCAAACGATTCATATTCAGCCTTTA
TCGAAACACTTGCATGAAAGGCAAGCTCCGATTCTTCTTAAGCTGAACTAAATCGAGAAG
ACCAAACTTGCAAAACTCATATTTTATTCCAATAGAAGACTTTGCCTAATCTATAAAAGC
AAAGATTGATTTCCTTGAGAATAAAAACAGAGGATGACCAACGGAAAGCTTAAACCCAGT
GAAAACAATCGGAATTTAACTTGAAAAGAAAGAACAGAAGTTTAAAACCAAATCCGGACT
AAGACGGAAAATTATTATCCCCACCGGAAAATTATTATCCGCACCAGAAAACTTATTATC
CGCAAAACCGGAAGAGATTATCGATCTATAGATCGATTTATAACACAACAAAAGTATCTG
ATCTGTAGAAAGATCAGAATTTTAAACAAAAAAGCTTCATCTCTTCTCTTTCCCCGTGAA
AGATTGTAGTGCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 3

CO CL2680Contig1 839 3 8 U
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TTGAAGTTGACAGCTTCATCGGTTAGGAAGTCACACAATCGTTCAGCCATGCCCCCCACT
TCCCACCTAGGACTCCATGGGTAGTCGGTGAGGAGGTTTAATTTTACCGGCTCGCTCAAT
TGGTTTAAATGCTGGCAACTTTGGAGCATTAGCGCTGGTTGCTGCTTTGGAAATTGAGTT
GGAAAGAAGAAGTGAACCACGAATGGAAATGGTCCCGAGGCAGCAAGGAACGATGCCTTA
CGGCAAAAGGTAGGATCCGCTTCAAGAGGTCTTCCAAGAAAAAGAGTCAATGCCTCAACA
AAACTCCTCCTTAAAGCAATTGCAGAAACAGCTTCCAGGATTTGTCTCTCAAGGGTTTCT
TCGAGATGGGGAAGATATTCAGCTAAGCACATCCCATCCATCCATGGAGGAAGTTTAACA
TCCTCAACAGAGAAAAGCGCTTTTAAATCAGAAGATGATACTAATTTCAGACGAGGTGAC
GAAGGTGCTGATTCATACTTTCGAAGAATCGGGTATACCACCTGAAGATAAATTTTCTGC
TCATTCTTCCAGGGGCACCCAACAACAAGTTTGTTTATGCTCATATCCATCACAAGAGGT
ACTGCAAACTTGACTTCCTCTGGCTTGTCAGCTCCTGAAGTCATTTGCATTTCAATTCCC
TTGCGAGTTATAACGGTACTAATTTCAAACTTGACACGATCATAATCAACTTGACCCACT
CGCTTTCGTTGGTAGGCCACATATTGATCCCTCAATCCTTGAATGAGAACAAGTAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AX32JQ U 63
AF RR4DQ41JQ U 1
AF RR4AX32TF C 131
BS 1 211 RR4DQ41JQ
BS 212 213 RR4AX32JQ
BS 214 248 RR4DQ41JQ
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BS 291 291 RR4AX32JQ
BS 292 439 RR4DQ41JQ
BS 440 839 RR4AX32TF

RD RR4AX32JQ 233 0 0
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CCACCTAGGACTCCATGGGTAGTCGGTGAGGAGGTTTAATTTTACCGGCTCGCTCAATTG
GTTTAAATGCTGGCAACTTTGGAGCATTAGCGCTGGTTGCTGCTTTGGAAATTGAGTTGG
AAAGAAGAAGTGAACCACGAATGGAAATGGTCCCGAGGCAGCAAGGAACGATG

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR4DQ41JQ 439 0 0
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TTGAAGTTGACAGCTTCATCGGTTAGGAAGTCACACAATCGTTCAGCCATGCCCCCCACT
TCCCACCTAGGACTCCATGGGTAGTCGGTGAGGAGGTTTAATTTTACCGGCTCGCTCAAT
TGGTTTAAATGCTGGCAACTTTGGAGCATTAAAGCTGGTTGCTGCTTTGGAAATTGAGTT
GGAAAGAAAAAGTGAACCACGAATGGAAATGGTCCCGAGGCAGCAAGGAAAGATGCCTTA
CGGCAAAAGGTAGGATCCGCTTCAAGAGGTCTTCCAAGAAAAAGAGTCAATGCCTCAACA
AAACTCCTCCTTAAAGCAATTGCAGAAACAGCTTCCAGGATTTGTCTCTCAAGGGTTTCT
TCGAGATGGGGAAGATATT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4AX32TF 709 0 0
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GCTGGCAACTTTGGAGCATTAGCGCTGGTTGCTGCTTTGGAAATTGAGTTGGAAAGAAGA
AGTGAACCACGAATGGAAATGGTCCCGAGGCAGCAAGGAACGATGCCTTACGGCAAAAGG
TAGGATCCGCTTCAAGAGGTCTTCCAAGAAAAAGAGTCAATGCCTCAACAAAACTCCTCC
TTAAAGCAATTGCTGAAACAGCTTCCAGGATTTGTCTCTCAAGGGTTTCTTCGAGATGGG
GAAGATATTCAGCTAAGCACATCCCATCCATCCATGGAGGAAGTTTAACATCCTCAACAG
AGAAAAGCGCTTTTAAATCAGAAGATGATACTAATTTCAGACGAGGTGACGAAGGTGCTG
ATTCATACTTTCGAAGAATCGGGTATACCACCTGAAGATAAATTTTCTGCTCATTCTTCC
AGGGGCACCCAACAACAAGTTTGTTTATGCTCATATCCATCACAAGAGGTACTGCAAACT
TGACTTCCTCTGGCTTGTCAGCTCCTGAAGTCATTTGCATTTCAATTCCCTTGCGAGTTA
TAACGGTACTAATTTCAAACTTGACACGATCATAATCAACTTGACCCACTCGCTTTCGTT
GGTAGGCCACATATTGATCCCTCAATCCTTGAATGAGAACAAGTAACAC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

CO CL2681Contig1 1226 4 13 U
GGCAGGCATCTTTAATGGGCTGAACAGTGAAGTTCATGTGTTTATAAGGCAAAAGAAGGT
TCTGAGGGGGTTTGATGAAGACGTTAGGGATTTTGTTGGAGAGCAGATGTCTTTAAGAGG
CATTGAGTTCCACACTGAGGAATCCCCTGAAGCCGTCATCAAAGCTGGTGATGGCTCGTT
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TCGCAAGCCTAATACAAAGAACTTAGGTTTGGAGAATGTTGGCGTAAAATTGGCGAAAAA
TGGAGCAATAGAGGTTGATGAATATTCAAGGACATCTGTTCCTTCCATCTATGCTGTTGG
GGACGTCACTGACCGTATCAATCTGACTCCAGTCGCCTTGATGGAGGGAATGGCTTTGGC
GAAAACCTTGTTCCAAAATGATCCAACAAAGCCTGATTACAGAGCTGTTCCCTGCGCCGT
TTTCTCCCAGCCACCTATTGGAACAGTTGGTCTAACCGAAGAGCAGGCCATAGAACAGTA
TGGAGACATCGATGTTTTCACATCAAACTTTAAGCCATTAAAGGCGACGCTTTCAGGACT
TCCAGACCGGGTGTTTATGAAACTCATCGTCTGTGCAAACACCAATAAAGTTCTAGGTGT
TCACATGTGTGGAGATGATTCACCCGAAATCATCCAGGGATTCGGTGTTGCAGTAAAGGC
TGGCTTAACTAAGGCTGATTTTGACGCTACAGTGGGTGTTCACCCTACAGCAGCTGAGGA
GTTTGTTACTATGAGGACTCCAACCAGGAAAATCCGCAGAGACTCCTCTGAGGGAAAGGC
AAGTCTTGAAGCTAAAACAGCTGTCTAGAGAAGGTTGCAAAGTAATTTGGATTTTACGAC
ATTGGAGCTCCTTGACAAGGAGAACATTATTCGTGAAGAAGAAGCTTTTTTGGTCATCGA
GTTCTCTAGCCAACGCTTTTAATTATTTATGTCGCGTGAGATGTCATTACCATCGTTCAT
ACTGTTTAATCGTGTAACCTACATGACCAAATTCCGATGAAAGGTTTTTAACTATATTTG
GGCAGTGAATTTTACGAGAGTTCCAAAACTGAAGGTTTTCAATTCTTCTTCCCTTTTTTT
TCGTTGTAGTGTTTGCTATATACGCTTCCAGTATCGCATTTTCGTGCTTGAATAAGTGAA
ACAGTTTCATATGTCGAGTGATGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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TGGAGACATCGATGTTTTCACATCAAACTTTAAGCCATTAAAGGCGACGCTTTCAGGACT
TCCAGACCGGGTGTTTATGAAACTCATCGTCTGTGCAAACACCAATAAAGTTCTAGGTGT
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TCTCCCAGCCACCTATTGGAACAGTTGGTCTGACCGAAGAGCAGGCCATAGAACAGTATG
GAGACATCGATGTTTTCACATCAAACTTCAAGCCATTAAAGGCGACGCTTTCAGGACTTC
CGGACCGAGTGTTTATGAAACTCATTGTCTGTGCAAACACCAATAAAGTTGTAGGTGTTC
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DS 

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TTGGAACAGTTGGTCTAACCGAAGAGCAGGCCATAGAACAGTATGGAGACATCGATGTTT
TCACATCAAACTTTAAGCCATTAAAGGCGACGCTTTCAGGACTTCCAGACCGGGTGTTTA
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ATATACGCTTCCAGTATCGCATTTTCGTGCTTGAATAAGTGAAACAGTTTCAT

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GG
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ACGACATTGGAGCTCCTTGACAAGGAGAACATTATTCGTGAAGAAGAAGCTTTTTTGGTC
ATCGAGTTCTCTAGCCAACGCTTTTAATTATTTATGTCGCGTGAGATGTCATTACCATCG
TTCATACTGTTTAATCGTGTAACCTACATGACCAAATTCCGATGAAAGGTTTTTAACTAT
ATTTGGGCAGTGAATTTTGCGAGAGTTCCAAAACTGAAGGTTTTCAATTCTTCTTCCCTT
TTTTTTCGTTGTAGTGTTTGCTGTATACGCTTCCAGTATCGCATTTTCGTGCTTGAATAA
GTGAA*CAGTTTCATATGTCGAGTGATGATT

QA 3 513 3 513
DS 



AS 1 4

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CGACGTGCGGCGGCTTAGACAGCGCTGGCGTCGGTTCCTTGTTGTGTGTACTGTTGATTT
TCAGGCTTTGTAGTTTATATTGGTTTAGATCTGAGATTCTCGCTGGCCCTCGTTTGATTT
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ACCAGATCTTATGATTTGCGTTGTTTGGCTTTTCATAGCCTGATTTCATTGGTCCTTGTA
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CAGTCTTTCTCTCCTATTGTGGTGGTTGCAATGATTTCTTGTCGGTTTGATCTGTTCTTA
ACTGTATCGTTGGTGGTTTCCGACGAGGCTTAGTTTCTTGTGGAGTTTGATGATGGCTTC
TATCTAGGGTAGAAATAAGACGTAAGTGCGTCGTAACCGTATCCGAAAGATGTGTGTAGA
TCGTGAAGCGGTTCTGCTTGTCGGGTTATGAAGTCTTGGTTCTTGGTTACTAGTGGAGTT
GCTAACGTTTGGCAGGCCATAGGCAGCAGCGTTAGGTCCGGGTTAAGAAGACTTGGAGTC
TGGGTTACTAGAAGTGGATGGGATCGTGGGGTTGGCCGAGGGCAGCCACGATTAATCCGA
ATCATTGCTTTCTGCTATGGAAAAGATAGAAGGCTTGAATTTGTCAAAGTCTCTGAGTAG
ATGAATGTCTTTTGTTCCTGTTTTAGTTGCGGATTTAGTATTCATCCGTTTGTTTAAATT
CTAACGTACCCCGGATGTGGGTTTTAGTTGCCTGTTTCTTTGGGTTCTTGGCTCTGGGGA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FD30TF U 1
AF RR4FX06TF U 1
AF RR4FX06JQ C 299
AF RR4FD30JQ C 302
BS 1 54 RR4FD30TF
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BS 56 315 RR4FD30TF
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BS 317 485 RR4FD30TF
BS 486 487 RR4FX06TF
BS 488 547 RR4FD30TF
BS 548 549 RR4FX06TF
BS 550 675 RR4FD30TF
BS 676 747 RR4FX06JQ
BS 748 748 RR4FD30JQ
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BS 829 829 RR4FD30JQ
BS 830 830 RR4FX06JQ
BS 831 831 RR4FD30JQ
BS 832 910 RR4FX06JQ
BS 911 911 RR4FD30JQ
BS 912 1019 RR4FX06JQ
BS 1020 1020 RR4FD30JQ

RD RR4FD30TF 689 0 0
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CGACGTGCGGCGGCTTAGACAGCGCTGGCGTCGGTTCCTTGTTGTGTGTACTGTTGATTT
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GTTGGGTTTGAAGTCTTAAGGGTAGACTTGCTTCGATTGATGAAGGTTTTCATTGGTTTG
ACCAGATCTTATGATTTGCGTTGTTTGGCTTTTCATAGCCTGATTTCATTGGTCCTTGTA
TGTTCTGTTTTGGGGTTTTGATCTTTCCTCTTCTCAACGAGTGTGTTTGTTGGATTTTAT
CTCTTCCTTTCTAGTCAGGTTAAGGAGTTCTCTATGATTTGTGTTTGACAGCTTCTCTTG
CAGTCTTTCTCTCCTATTGTGGTGGTTGCAATGATTTCTTGTCGGTTTGATCTGTTCTTA
ACTGT**CGTTGGTGGTTTCCGACGAGGCTTAGTTTCTTGTGGAGTTTGATGATGGCTTC
TATCTAGTTTAGAAATAAGACGTAAGTGCGTCGTAACCGTATCCGAAAGATGTGTGTAGA
TCGTGAAGCGGTTCTGCTTGTCGGGTTATGAAGTCTTGGTTCTTGGTTACTAGTGGAGTT
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DS 

RD RR4FX06TF 689 0 0
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CGACGTGCGGCGGCTTAGACAGCGCTGGCGTCGGTTTCTTGTTGTGTGTACTGTTGATTT
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GTTGGGTTTGAAGTCTTAAGGGTAGACTTGCTTCGATTGATGAAGGTTTTCATTGGTTTG
ACCAGATCTTATGATTTGCGTTGTTTGGCTTTTCATAGCCTGATTTCATTGGTCCTTGTA
TGTTCTGTTTTGGGGCTTTGATCTTTCCTCTTCTCAACGATTGTGTTTGTTGGATTTTAT
CTCTTCCTTTCTAGTCAGGTTAAGGAGTTCTCTATGATTTGTGTTTGACAGCTTCTCTTG
CAGTCTTTCTCTCCT**TGTGGTGGTTGCAATGATTTCTTGTCGGTTTGATCTGTTCTTA
ACTGTATCGTTGGTGGTTTCCGACGAGGCTTAGTTTCTTGTGGAGTTTGATGATGGCTTC
TATCTAGGGTAGAAATAAGACGTAAGTGCGTCGTAACCGTATCCGAAAGATGTGTGTAGA
TTGTGAAGCGGTTCTGCTTGTCGGGTTATGAAGTCTTGGTTCTTGGTTACTAGTGGAGTT
GCTAACGTTTGGCAG
CCATAGCAGCAGCG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4FX06JQ 722 0 0
TAT
GTTCTGTTTTGGGGCTTTGATCTTTCCTCTTCTCAACGATTGTGTTTGTTGGATTTTATC
TCTTCCTTTCTAGTCAGGTTAAGGAGTTCTCTATGATTTGTGTTTGACAGCTTCTCTTGC
AGTCTTTCTCTCCT**TGTGGTGGTTGCAATGATTTCTTGTCGGTTTGATCTGTTCTTAA
CTGTATCGTTGGTGGTTTCCGACGAGGCTTAGTTTCTTGTGGAGTTTGATGATGGCTTCT
ATCTAGGGTAGAAATAAGACGTAAGTGCGTCGTAACCGTATCCGAAAGATGTGTGTAGAT
TGTGAAGCGGTTCTGCTTGTCGGGTTATGAAGTCTTGGTTCTTGGTTACTAGTGGAGTTG
CTAACGTTTGGCAGGCCATAGGCAGCAGCGTTAGGTCCGGGTTAAGAAGACTTGGAGTCT
GGGTTACTAGAAGTGGATGGGATCGTTGGGTTGGCCGAGGGCAGCCACGATTAATCCGAA
TCATTGCTTTCTGCTATGGAAAAGATAGAAGGCTTGAATTTGTCAAATTTTCTGAGTAGA
TGAATGTCTTTTGTTCCTGTTTTAGTTGCGGATTTAGTATTCATCCGTTTGTTTAAATTC
TAACGTACCTCGGATGTGGGTTTTAGTTGCCTGTTTCTTTGGGTTCTTGGCTCTGGGGAT
GTCTTTTATCCGCCAGTTTATGTATCAAACTTTTCGTATGAATGAATTTTAATTTGAG
G

QA 4 721 4 721
DS 

RD RR4FD30JQ 719 0 0
GTTCTGTTTTGGGGTTTTGATCTTTCCTCTTCTCAACGAGTGTGTTTGTTGGATTTTATC
TCTTCCTTTCTAGTCAGGTTAAGGAGTTCTCTATGATTTGTGTTTGACAGCTTCTCTTGC
AGTCTTTCTCTCCTATTGTGGTGGTTGCAATGATTTCTTGTCGGTTTGATCTGTTCTTAA
CTGT**CGTTGGTGGTTTCCGACGAGGCTTAGTTTCTTGTGGAGTTTGATGATGGCTTCT
ATCTAGTTTAGAAATAAGACGTAAGTGCGTCGTAACCGTATCCGAAAGATGTGTGTAGAT
CGTGAAGCGGTTCTGCTTGTCGGGTTATGAAGTCTTGGTTCTTGGTTACTAGTGGAGTTG
CTAACGTTTGGCAGGCCATAGGCAGCAGCGTTAGGTCCGGGTTAAGAAGACTTGGAGTCT
GGGTTACTAGAAGTGGATGGGATCGTGGGGTTGGCCGAGGGCAGCCACGATTAATCCGAA
TCATTGCTTTCTGCTATGGAAAAGATAGAAGGCTTGAATTTGTCAAAGTCTCTGAGTAGA
TGAATGTCTTTTGTTCCTGTTTTAGTTGCGGATTTAGTATTCATCCGTTTGTTTAAATTC
TAACGTACCCCGGATGTGGGTTTTAGTTGCCTGTTTCTTTGGGTTCTTGGCTCTGGGGAT
GTCTTTTATCCGCCAGTTTATGTATCAAACTTTTCGTATGAATGAATTTTAATTTGAGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL2683Contig1 988 3 15 U
GTTGAGGGGGTACAATTGAAATCTCGTTTTGATTGAATCAACGACGGATGTAAATTGAAG
AACAGCGACCGGGACTTGCAACCGTGACGAGCACTCGTCTCTTCTCCTCCGTCGAGATCC
ACCGGACATGGCTGAGACGCTCTGGATCCCGAGGCTTCTTCTCATCACTCTCGTCGTCCT
CATCCCCTTCCGAGTTCACTCTCAGTGCGAGTTCAGATTCAGTCGACGCAACAAAGTCTT
TGATTTCAATTTAGCATCTTCGATTAAGAATTTTCCTCACGGTGCTCTCAGCGAAGATGG
GTTTTATAGAGTGGAAGCGAACAGTACCGTGCTATGGTTTCAGCTTTGTGACATGCTTAT
TTTCAATCATGATCCTCCTCGATGTGTTGGTTGCCAAGATTGTGGAGGTCCGTCACACTG
TGGAACATCGTGCAGTGCACTCTTGTCAGAAAATGTAAGAGGATATGATGTATGCAGTTC
CCTTGGGCATCCCTCAAGCTCAAAAGTTGATATTATTGATAAAGAAGATCCTGGCAAAGG
CGTCATTGTTAAGATGTTAGGTGGAAGCAGTAACCCAAATTGCTCACTTTCCGTTTCTGT
TATCTGCCAGAAAAATAAAGTTGATGGACCACTCACTCTAACGAAATCTGGTGTCTGTCA
TTATGCTACGGAGATGCGACATCCTTCTGGTTGTGCAGTAGCTATATCTGGCCATGGTAG
TGG*ATGGGGCTTGTTTAGTACCTTACTAATCATCATCTTATGTTTATTTGGAGCTTATC
TGCTGGGCGGTGCATTATATCGGTATTTCTCCCTTGGAATTCGTGGCATAGAAGTAATCC
CAAATTCTGATTTCTGGATCACTGTACCTCACAGAATACAGAGCTGCTTTGGTTCACTAT
TTCAGAGATTTGGGGGTTCAAGTCATGGCCACCAACAAGCCTCCTATTCGCGGGTCAACT
AGTGAGCAGTCCCCTGAGTCCTCTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS39TF U 1
AF RR4BF25TF U 66
AF RR4BS39JQ C 339
BS 1 296 RR4BS39TF
BS 297 297 RR4BF25TF
BS 298 316 RR4BS39TF
BS 317 317 RR4BF25TF
BS 318 640 RR4BS39TF
BS 641 641 RR4BF25TF
BS 642 723 RR4BS39TF
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BS 758 857 RR4BF25TF
BS 858 858 RR4BS39JQ
BS 859 886 RR4BF25TF
BS 887 887 RR4BS39JQ
BS 888 958 RR4BF25TF
BS 959 988 RR4BS39JQ

RD RR4BS39TF 759 0 0
GTTGAGGGGGTACAATTGAAATCTCGTTTTGATTGAATCAACGACGGATGTAAATTGAAG
AACAGCGACCGGGACTTGCAACCGTGACGAGCACTCGTCTCTTCTCCTCCGTCGAGATCC
ACCGGACATGGCTGAGACGCTCTGGATCCCGAGGCTTCTTCTCATCACTCTCGTCGTCCT
CATCCCCTTCCGAGTTCACTCTCAGTGCGAGTTCAGATTCAGTCGACGCAACAAAGTCTT
TGATTTCAATTTAGCATCTTCGATTAAGAATTTTCCTCACGGTGCTCTCAGCGAAGTTGG
GTTTTATAGAGTGGAATCGAACAGTACCGTGCTATGGTTTCAGCTTTGTGACATGCTTAT
TTTCAATCATGATCCTCCTCGATGTGTTGGTTGCCAAGATTGTGGAGGTCCGTCACACTG
TGGAACATCGTGCAGTGCACTCTTGTCAGAAAATGTAAGAGGATATGATGTATGCAGTTC
CCTTGGGCATCCCTCAAGCTCAAAAGTTGATATTATTGATAAAGAAGATCCTGGCAAAGG
CGTCATTGTTAAGATGTTAGGTGGAAGCAGTAACCCAAATTGCTCACTTTCCGTTTCTGT
TATCTGCCAGAAAAATAAAGTTGATGGACCACTCACTCTA*CGAAATCTGGTGTCTGTCA
TTATGCTACGGAGATGCGACATCCTTCTGGTTGTGCAGTAGCTATATCTGGCCATGGTAG
TGGGATGGGGCTTGTTTAGTACCTTACTAATCATCAT
CT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4BF25TF 896 0 0
GGGACCAGGAC
TGCAACCGTGACGAGCACTCGTCTCTTCTCCTCCGTCGAGATCCACCGGACATGGCTGAG
ACGCTCTGGATCCCGAGGCTTCTTCTCATCACTCTCGTCGTCCTCATCCCCTTCCGAGTT
CACTCTCAGTGCGAGTTCAGATTCAGTCGACGCAACAAAGTCTTTGATTTCAATTTAGCA
TCTTCGATTAAGAATTTTCCTCACGGTGCTCTCAGCGAAGATGGGTTTTATAGAGTGGAA
GCGAACAGTACCGTGCTATGGTTTCAGCTTTGTGACATGCTTATTTTCAATCATGATCCT
TCTCGATGTGTTGGTTGCCAAGATTGTGGAGGTCCGTCACACTGTGGAACATCGTGTAGT
GCACTCCTGTCAGAAAATGTAAGAGGATATGACGTATGCAGTTCCCTTGGGCATCCCTCA
AGCTCAAAAGTTGATATTATTGATAAAGAAGATCCTGGCAAAGGCGTCATTGTTAAGATG
TTAGGTGGAAGCAGTAACCCAAATTGCTCACTTTCCGTTTCTGTTATCTGCCAGAAAAAT
AAAGTTGATGGACCACTCACTCTAACGAAATCTGGTGTCTGTCATTATGCTACTGAGATG
CGACATCCTTCTGGTTGTGCAGTAGCTATATCTGGCCATGGTAGTGG*ATGGGGCTTGTT
TAGTACCTTACTAATCATCATCTTATGTTTATTTGGAGCTTATCTGCTGGGCGGTGCATT
ATATCGGTATTTCTCCCTTGGAATTCGTGGCATAGAAGTAATCCCAAATTCTGATTTCTG
GGTCACTGTACCTCACAGAATACAGAGCTGTTTTGGTTCACTATTTCAGAGATTTGGGGG
TTCAAGTCATGGCCACCAACAAGCCTCCTATTCGCGGGTCAA
CTA

QA 12 893 12 893
DS 

RD RR4BS39JQ 650 0 0
TTCAGCTTTGTGACATGCTTATTTTCAATCATGATCCTCCTCGATGTGTTGGTTGCCAAG
ATTGTGGAGGTCCGTCACACTGTGGAACATCGTGCAGTGCACTCTTGTCAGAAAATGTAA
GAGGATATGATGTATGCAGTTCCCTTGGGCATCCCTCAAGCTCAAAAGTTGATATTATTG
ATAAAGAAGATCCTGGCAAAGGCGTCATTGTTAAGATGTTAGGTGGAAGCAGTAACCCAA
ATTGCTCACTTTCCGTTTCTGTTATCTGCCAGAAAAATAAAGTTGATGGACCACTCACTC
TAACGAAATCTGGTGTCTGTCATTATGCTACGGAGATGCGACATCCTTCTGGTTGTGCAG
TAGCTATATCTGGCCATGGTAGTGG*ATGGGGCTTGTTTAGTACCTTACTAATCATCATC
TTATGTTTATTTGGAGCTTATCTGCTGGGTGGTTCATTATATCGGTATTTCTCCGTTGGA
ATTCGTGGCATAGAAGTAATCCCAAATTCTGATTTCTGGATCACTGTACCTCACAGAATA
CAGAGCTGCTTTGGTTCACTATTTCAGAGATTTGGGGGTTCAAGTCATGGCCACCAACAA
GCCTCCTATTCGCGGGTCAACTAGTGAGCAGTCCCCTGAGTCCTCTATGA

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 3

CO CL2684Contig1 967 3 3 U
TTTTTACCGGCGAGAGATGAGTATCGTCCGTAACGCGATCCGATCGAGTTTGAGCCTCCG
GACGTTGGATCCGGCGATCAGTCGTAGCTCTCTTCCATTTCTTCAGGAGTCGCGGGAATG
TCTATCTACCGTCACAGAGCAGCCTCCTCCTCCTTCCTCTCCGTTACCACCACCGCCTCC
GGGAGGTTCCACGGTTGAAGGAGGAGTAAAGAATCCTGCGGGAGAAGGGAAGTCGTATGG
GAAGTTTTCAGGCTTCTCGAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATGAACGTACTTGAAGG
ATGCAATGTGACACCTGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGTAACTTGAATCC
TTCTGGAGTTTATGTGCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGAT**TGCAATGCGGGCGAT
TGCAAAGAAGGGAAGGCTATATAGATTGGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGT
TGTTCCTTATGAAGGCAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGA
AGACATTGATAGGTTCTTATCTGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCAC
CATTCAAGGACTCGGAAGTCCTAAGAGGGTGGCACTGGTGCGTTTCACTTCACAGACCCA
GGCGATGAATGCATACATTACAAAGAACAGGAACTTCCTTCTTAACCAACGAATCACGTT
GCAAGTTCTGCAGTAATTTCTTAGTTGGTGTATTCCGATGGCAAGAAATCCTGTGTCTTT
CCTGTTTGGATGTTCTATGTCAGTTTGCTCCTCTGAGATTTTATCTGCAAACTCCATGGT
TCTGAAATTTAGTTGGTGTCTGTTTTCTCCGGTTCAGTTGGATGTTCACAAATAAAAAAA
AATCTTGGTGTCTAAGCAGATTACAGCTACTGCATGTGATTGTTTTTTGACCAACTTTGG
ATGCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4FO20TF U 1
AF RR4CL61TF U 378
AF RR4FO20JQ C 194
BS 1 624 RR4FO20TF
BS 625 877 RR4CL61TF
BS 878 967 RR4FO20JQ

RD RR4FO20TF 624 0 0
TTTTTACCGGCGAGAGATGAGTATCGTCCGTAACGCGATCCGATCGAGTTTGAGCCTCCG
GACGTTGGATCCGGCGATCAGTCGTAGCTCTCTTCCATTTCTTCAGGAGTCGCGGGAATG
TCTATCTACCGTCACAGAGCAGCCTCCTCCTCCTTCCTCTCCGTTACCACCACCGCCTCC
GGGAGGTTCCACGGTTGAAGGAGGAGTAAAGAATCCTGCGGGAGAAGGGAAGTCGTATGG
GAAGTTTTCAGGCTTCTCGAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATGAACGTACTTGAAGG
ATGCAATGTGACACCTGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGTAACTTGAATCC
TTCTGGAGTTTATGTGCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGAT**TGCAATGCGGGCGAT
TGCAAAGAAGGGAAGGCTATATAGATTGGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGT
TGTTCCTTATGAAGGCAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGA
AGACATTGATAGGTTCTTATCTGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCAC
CATTCAAGGACTCGGAAGTCCTAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4CL61TF 500 0 0
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TATATAGATTGGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGTTGTTCCTTATGAAGGCA
AAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGAAGACATTGATAGGTTCT
TATCTGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCACCATTCAAGGACTCGGAA
GTCCTAAGAGGGTGGCACTGGTGCGTTTCACTTCACAGACCCAGGCGATGAATGCATACA
TTACAAAGAACAGGAACTTCCTTCTTAACCAACGAATCACGTTGCAAGTTCTGCAGTAAT
TTCTTAGTTGGTGTATTCCGATGGCAAGAAATCCTGTGTCTTTCCTGTTTGGATGTTCTA
TGTCAGTTTGCTCCTCTGAGATTTTATCTGCAAACTCCATGGTTCTGAAATTTAGTTGGT
GTCTGTTTTCTCCGGTTCAG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4FO20JQ 774 0 0
GG
TGAAGGAGGAGTAAAGAATCCTGCGGGAGAAGGGAAGTCGTATGGGAAGTTTTCAGGCTT
CTCGAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATGAACGTACTTGAAGGATGCAATGTGACACC
TGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGTAACTTGAATCCTTCTGGAGTTTATGT
GCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGAT**TGCAATGCGGGCGATTGCAAAGAAGGGAAG
GCTATATAGATTGGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGTTGTTCCTTATGAAGG
CAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGAAGACATTGATAGGTT
CTTATCTGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCACCATTCAAGGACTCGG
AAGTCCTAAGAGGGTGGCACTGGTGCGTTTCACTTCACAGACCCAGGCGATGAATGCATA
CATTACAAAGAACAGGAACTTCCTTCTTAACCAACGAATCACGTTGCAAGTTCTGCAGTA
ATTTCTTAGTTGGTGTATTCCGATGGCAAGAAATCCTGTGTCTTTCCTGTTTGGATGTTC
TATGTCAGTTTGCTCCTCTGAGATTTTATCTGCAAACTCCATGGTTCTGAAATTTAGTTG
GTGTCTGTTTTCTCCGGTTCAGTTGGATGTTCACAAATAAAAAAAAATCTTGGTGTCTAA
GCAGATTACAGCTACTGCATGTGATTGTTTTTTGACCAACTTTGGATGCCCG

QA 3 774 3 774
DS 



AS 1 4

CO CL2685Contig1 647 4 1 U
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AAGAGAACAGGAAATCGACTTCTTCGGGGAGATCTCTGGAATATCGTTCAGCCCTGACAC
AGAGGCGCTCTTCATTGGAGTATGGGACCGCACTTACGGTAGCTTACTTGAGTATCATCG
GCGCAGGAACTATTCCTATCTCGATTCGTTTCTTTAAGCGAGGAGATATACACAACCCGT
TCAACAAATAAAAAAGAGCTCGTACAGCAACCGGTGAACACAATAGAAGCACCATAAACG
TGTTGTGCAAGTGCTAGTAGTTAGTGTCTTTTGTGTACTTTACCGGCTCATGTGTTGTAT
ACTTATGTCTGGTCTTCTAAAGCTTCAAACTCGTTCAAGATGTGTACAGAAAGAGCTAGC
TCTGTGGTGGGACAGACTAGTACTTGGTTATGGTGCTGAAGCTGGACCCTGGTTCTCTGT
TTGGTGGCTTGTGTGTCTTTTCTCTTCTTTGTATTTGTGATTGTTGTAGGAATTCGAGTG
TTAAAGGATACTTTTGAGTTGGTTCTGAGTTTAGAATGTGGGAGATGCTTTAACTAAACT
ATGTTATTTCTTGCTCGTTTCAATTCGATCAATTCGATCGTAGCCTG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4DY26JQ C 1
AF RR4E153JQ C 26
AF RR4DY26TF U 1
AF RR4E153TF U 1
BS 1 647 RR4DY26TF

RD RR4DY26JQ 647 0 0
CATGGCTATGGCTGAACCAGCCGACTTTGTCCATGTCTATGACGTCTCAAAGGGTTATGA
AAGAGAACAGGAAATCGACTTCTTCGGGGAGATCTCTGGAATATCGTTCAGCCCTGACAC
AGAGGCGCTCTTCATTGGAGTATGGGACCGCACTTACGGTAGCTTACTTGAGTATCATCG
GCGCAGGAACTATTCCTATCTCGATTCGTTTCTTTAAGCGAGGAGATATACACAACCCGT
TCAACAAATAAAAAAGAGCTCGTACAGCAACCGGTGAACACAATAGAAGCACCATAAACG
TGTTGTGCAAGTGCTAGTAGTTAGTGTCTTTTGTGTACTTTACCGGCTCATGTGTTGTAT
ACTTATGTCTGGTCTTCTAAAGCTTCAAACTCGTTCAAGATGTGTACAGAAAGAGCTAGC
TCTGTGGTGGGACAGACTAGTACTTGGTTATGGTGCTGAAGCTGGACCCTGGTTCTCTGT
TTGGTGGCTTGTGTGTCTTTTCTCTTCTTTGTATTTGTGATTGTTGTAGGAATTCGAGTG
TTAAAGGATACTTTTGAGTTGGTTCTGAGTTTAGAATGTGGGAGATGCTTTAACTAAACT
ATGTTATTTCTTGCTCGTTTCAATTCGATCAATTCGATCGTAGCCTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4E153JQ 622 0 0
TTTGTCCATGTCTATGACGTCTCAAAGGGTTATGAAAGAGAACAGGAAATCGACTTCTTC
GGGGAGATCTCTGGAATATCGTTCAGCCCTGACACAGAGGCGCTCTTCATTGGAGTATGG
GACCGCACTTACGGTAGCTTACTTGAGTATCATCGGCGCAGGAACTATTCCTATCTCGAT
TCGTTTCTTTAAGCGAGGAGATATACACAACCCGTTCAACAAATAAAAAAGAGCTCGTAC
AGCAACCGGTGAACACAATAGAAGCACCATAAACGTGTTGTGCAAGTGCTAGTAGTTAGT
GTCTTTTGTGTACTTTACCGGCTCATGTGTTGTATACTTATGTCTGGTCTTCTAAAGCTT
CAAACTCGTTCAAGATGTGTACAGAAAGAGCTAGCTCTGTGGTGGGACAGACTAGTACTT
GGTTATGGTGCTGAAGCTGGACCCTGGTTCTCTGTTTGGTGGCTTGTGTGTCTTTTCTCT
TCTTTGTATTTGTGATTGTTGTAGGAATTCGAGTGTTAAAGGATACTTTTGAGTTGGTTC
TGAGTTTAGAATGTGGGAGATGCTTTAACTAAACTATGTTATTTCTTGCTCGTTTCAATT
CGATCAATTCGATCGTAGCCTG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4DY26TF 647 0 0
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AAGAGAACAGGAAATCGACTTCTTCGGGGAGATCTCTGGAATATCGTTCAGCCCTGACAC
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GCGCAGGAACTATTCCTATCTCGATTCGTTTCTTTAAGCGAGGAGATATACACAACCCGT
TCAACAAATAAAAAAGAGCTCGTACAGCAACCGGTGAACACAATAGAAGCACCATAAACG
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ACTTATGTCTGGTCTTCTAAAGCTTCAAACTCGTTCAAGATGTGTACAGAAAGAGCTAGC
TCTGTGGTGGGACAGACTAGTACTTGGTTATGGTGCTGAAGCTGGACCCTGGTTCTCTGT
TTGGTGGCTTGTGTGTCTTTTCTCTTCTTTGTATTTGTGATTGTTGTAGGAATTCGAGTG
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ATGTTATTTCTTGCTCGTTTCAATTCGATCAATTCGATCGTAGCCTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4E153TF 647 0 0
CATGGCTATGGCTGAACCAGCCGACTTTGTCCATGTCTATGACGTCTCAAAGGGTTATGA
AAGAGAACAGGAAATCGACTTCTTCGGGGAGATCTCTGGAATATCGTTCAGCCCTGACAC
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GCGCAGGAACTATTCCTATCTCGATTCGTTTCTTTAAGCGAGGAGATATACACAACCCGT
TCAACAAATAAAAAAGAGCTCGTACAGCAACCGGTGAACACAATAGAAGCACCATAAACG
TGTTGTGCAAGTGCTAGTAGTTAGTGTCTTTTGTGTACTTTACCGGCTCATGTGTTGTAT
ACTTATGTCTGGTCTTCTAAAGCTTCAAACTCGTTCAAGATGTGTACAGAAAGAGCTAGC
TCTGTGGTGGGACAGACTAGTACTTGGTTATGGTGCTGAAGCTGGACCCTGGTTCTCTGT
TTGGTGGCTTGTGTGTCTTTTCTCTTCTTTGTATTTGTGATTGTTGTAGGAATTCGAGTG
TTAAAGGATACTTTTGAGTTGGTTCTGAGTTTAGAATGTGGGAGATGCTTTAACTAAACT
ATGTTATTTCTTGCTCGTTTCAATTCGATCAATTCGATCGTAGCCTG

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL2686Contig1 1186 4 9 U
GGCAGTCAGCAGACTTATCACTATCTCACCTTTGGATGGCTATGTGGTGGAATCCTTGAG
TATGCTTCTGGAAAGAAATTTCAAGAGATCCTTGAAGAATCCATCATCAAACCCCTAAAG
ATTGATGGAGAACTGTACGTTGGTATCCCCCCAGGTGTTGAATCTCGGCTTGCCACATTG
ACGCTGGACACGGACGAACTAAACAAGCTTCCGTCCGTTGCTAGTCAGCCTGAGCTTCCT
TCGACATTTCAGCCTGTGAAGATCTTTGAAATTGCAAGCAGCGTGCCAGTCTTATTTAAC
ACATTGAATGTGCGTAGAGCCACAATCCCTGCAGCTAATGGACATTGCTCGGCTCGTGCA
CTTGCTCGGTACTATGCAGCCTTAGCAGATGGCGGTCTAGTGCCACCGCCACATTCCTCT
TCATCCCTGCCACCACTTGGCAGCCACACCCACGTTCCGAAATTCTCATCGGTAAATGAC
GCAACGAAAAAGAGAAAGGGTAAGGAGATGGCAGCTACAGAGAAGCTTAAAACAAAAGAT
CATAAAGAGAAGAGGCTCTATGACGGCAGAGAGTCAAGTACAGAAAGTTTAGCCAGGCTA
GTCAATGATACTAGCAGTTCTACTGGCAAAACTGAGATCAGCAGCAATGATCAACAAGAT
GATATTCACAATATGTTTAGCAATTCAAAGATCCACGATGCTTTTATGGGCACTGGAGAC
TACAGTGGCTTAGTACTTCCTGATGGGAAGTTTGG*ACTTGGTTTTAAGCGCGTCACTTC
ACAAGATGGGTCTCTAGTTGGTTTTGGACATTCGGGGTTGGGAGGATCAACAGGTTTCTG
TGACATCGAAAACAGATTTTCCATTGCAATAACGCTTAACAAGATGTCTATGGGAGGTGT
TACGGCTAATATTGTCAGGCTGGTTTGCTCAGAGTTAAATATCCCCTTGCCTAAGGACTT
CTCTCTTTCAAGTGGTATGGATCCTGTAATCAACTAAGGCTGGTTTTCTATGTAAGTTTT
GTCTGCTCATGTTACAACATATAAAAGTGGTCCTTAGAATCACCTCAGATATATAGCTTA
TAGACATTGCTGGGAAATATAGTGTAATGATCAGTGGAATGTAATGTTATGTATTTAATA
CATTTTATACATACACATCTATAACCCAATATTCACATTTTCTGGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD19TF U 1
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AF RR4D742JQ C 493
AF RR4BD19JQ C 562
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RD RR4BD19TF 819 0 0
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CTTGCTCGGTACTATGCAGCCTTAGCAGATGGCGGTCTAGTGCCACCGCCACATTCCTCT
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TACAGTGGCTTAGTACTTCCTGATGGGAAGTTTGGGACTTGGTTTTAAGCGCGTCACTTC
ACAAGATGGGTCTCTAGTTGGTTTTGGACATTCGGG
TTT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4D742TF 665 0 0
G
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ATCAACAAGATGATATTCACAATATGTTTAGCAATTCAAAGATCCACGATGCTTTTATGG
GCACTGGAGACTACAGTGGCTTAGTACTTCCTGATGGGAAGTTTGG*ACTTGGTTTTAAG
CGCGTCACTTCACAAGATGGGTCTCTAGTTGGTTTTGGACATTCGGGGTTGGGAGGATCA
ACAGGTTTCTGTGACATCGAAAACAGATTTTCCATTGCAATAACGCTTAACAAGATGTCT
ATGGGAGGTGTTACGGCTAATATTGTCAGGCTGGTTTGCTCAGAGTTAAATATCCCCTTG
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TGTA

QA 2 665 2 665
DS 

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AGGCTCTATGACGGCAGAGAGTCAAGTACAGAAAGTTTAGCCAGGCTAGTCAATGATACT
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ATGTTTAGCAATTCAAAGATCCACGATGCTTTTATGGGCACTGGAGACTACAGTGGCTTA
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TCTAGTTGGTTTTGGACATTCGGGGTTGGGAGGATCAACAGGTTTCTGTGACATCGAAAA
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QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4BD19JQ 625 0 0
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AATTCAAAGATCCATGATGCTTTTATGGGCACTGGAGACTACAGTGGCTTAGTACTTCCT
GATGGGAAGTTTGG*ACTTGGTTTTAAGCGCGTCACTTCACAAGATGGGTCTCTAGTTGG
TTTTGGACATTCGGGGTTGGGAGGATCAACAGGTTTCTGTTACATCGAAAACAGATTTTC
CATTGCAATAACGCTCAACAAGATGTCTATGGGAGGTGTTACGGCTAATATTGTCAGGCT
GGTTTGCTCAGAGTTAAATATCCCCTTGCCTAAGGACTTCTCTCTTTCAAGTGGTATGGA
TCCTGTAATCAACTAAGGCTGGTTTTCTATGTAAGTTTTGTCTGCTCATGTTACAACATA
TAAAAGTGGTCCTTAGAATCACCTCAGATATATAGCTTATAGACATTGCTGGGAAATATA
GTGTAATGATCAGTGGAATGTAATGTTATGTATTTAATACATTTTATACATACACATCTA
TAACCCAATATTCACATTTTCTGGA

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 4

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GGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTGGAGGCTGATCTTTTCTTCAACGCTCCTTAC
CGCGAACGGTATCGTTTCAAGGCCTATGGTGATGACTGATGATTGATTCAGATGTAGAGT
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ATTTGTGTAACGCTTACATAAAGTAAACAGAGCATAAATCTATGTGCGGATGAAGAAATC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE65JQ C 7
AF RR4BE65TF U 7
AF RR4D185TF U 1
AF RR4D185JQ C 79
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BS 173 673 RR4D185TF
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RD RR4BE65JQ 640 0 0
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AACAAGATTGGATTAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCAGCCATGTCAAGTTTTATAATGGCC
ACACCGTTTCCAGGATCTCTCACTCAATGCAAGAAAACGAATAACATGTCCCTTCAGAGG
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ATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAAAACAATTTCTCT
C

QA 1 639 1 639
DS 

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AACAAGATTGGATTAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCAGCCATGTCAAGTTTTATAATGGCC
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CGGAAAGTGTCAGAGAGGCGGTTAGAGGAGCTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAG
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TTTAGAGCCCCCATGAATGTTT*ACACTTATGTGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTCTTATGG
ATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAAAACAATTTCTCT
C

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4D185TF 673 0 0
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CGGTGTAACAAGATTGGATTAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCCATGTCAAGTTTTATA
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GGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTGGAGGCTGATCTTTTCTTCAACGCTCCTTAC
CGCGAACGGTATCGTTTCAAGGCCTATGGTGATGACTGATGATTGATTCAGATGTAGAGT
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TTATGGATCTTTTTGGGGATGATAAAATAACAAAACAATTTCTCTTATTCTTCTTCAGAA
ATTTGTGTAACGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4D185JQ 642 0 0
TTAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCCATGTCAAGTTTTATAATGGCCACACCGTTTCCA
GGATCTCTCACTCAATGCAAGAAAACGAATAACCTGTCCCTTCAGAGAGCCTTTAAGGTA
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CAGAGACGGTTAGAGGAGCTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAGACTGGGAAATGC
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GTCGTCCCCGAAGGCAGCAAGAGGTTTATGCAGTTTTTGGCTGGAGATCTTGTTAGGTAC
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QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 4

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GCTTCCTGGTTTTGAAGGTCCTCTTCCTTTTGCGCTCGAGACTGGGTATGTGAGTGTTGG
TGAATCTGAGGATGTTGAGCTCTTTTACTACTTTGTGAAATCAGAGAGAAATCCAGAGAA
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CTTTGCAAACGGTCCTTTAGCTTTCAAAGGGGATGAGTATAATGGGACGTTACCTCCTCT
GGAGCTAACATCTTTTTCTTGGACAAAGGTGGCTAACATTTTATATTTGGAGTCTCCTGC
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GAATCCATTTTACGTTGGTGGAGATTCATATTCCGGGCACATTGTTCCCGGAGTTGTGCA
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TCTTGGAAACCCTATAACAAATCAAAAACTTGAATCTAATTACAAATTTCCATTTGCTCA
TCGGATGGGACTTATTTCAGATGAGCTCTTTGAGTCGCTTGGAAAAAGTTGTGGAGGAAT
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ATGTATCTCGGAGATATATGTAGAGCAGATTTTGTTACCAAACTGTCCAGTAGATTACGT
CTTAGCAGACATACCACAAACCTTACGAAACATCAAAACTGGTAGAAGGCGAATACTGAA
AGAGTTTTCAGGAAATGATATACCATCACTGCCTCCTCCTAGCTGCTTTACTTATAGGTA
TTTTCTGTCTGCTATTTGGGCAAACGATGAAAATGTACGCAGAGCTCTGGGCGCTAAGAT
GGATTTAGGAAAATGGAACCGATGCAACATCCAAAACATCCCATATACATTTGATATTGA
CAATGCCGTTCCATATCACGTGAATAATAGTCGTAAAGGCTTCTGCTCCCTCATCTACAG
TGGTGATCATGATATGATGGCACCTTACTCCTCAACGGAAGCATGGATCAGAGATCTCAA
CTATTCCATTGTTGATGACTGGAGACCTTGGATGATGAGTAGCTATCAAGTCGCTGGATA
TACAAGGACTTACGCTAATAAGATGACATTTGCAACCATCAAGGGAGGAGGACACACCGC
TGAGTATAATCCAGACCAATGCTCACTTATGTTTAAAAAATGGATTGATGGAAAACCTCT
CTGAAGTTTCTCACTCATTTCTCTCTCAAAAGCTTCTTGTCAATTGTCAAATCACAAAAC
TTGTTTTCATGTTACCATTTAAATTGTTCAAAAACATATCATAATAATGTCTTCATAAAT
AATAGTTCCGTTCAAGTTTCCAGTTTATATATTTTAAACACCCTGAATGCTACGTTGGGG
TTTCACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E138TF U 1
AF RR4E928TF U 1
AF RR4E928JQ C 1263
AF RR4E138JQ C 708
BS 1 639 RR4E138TF
BS 640 775 RR4E928TF
BS 776 776 RR4E138JQ
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BS 800 800 RR4E138JQ
BS 801 814 RR4E928TF
BS 815 1508 RR4E138JQ

RD RR4E138TF 639 0 0
GCTTCCTGGTTTTGAAGGTCCTCTTCCTTTTGCGCTCGAGACTGGGTATGTGAGTGTTGG
TGAATCTGAGGATGTTGAGCTCTTTTACTACTTTGTGAAATCAGAGAGAAATCCAGAGAA
AGATCCTCTCATGATTTGGCTTACCGGTGGGCCTGGATGCAGCTCCATTTGTGGACTACT
CTTTGCAAACGGTCCTTTAGCTTTCAAAGGGGATGAGTATAATGGGACGTTACCTCCTCT
GGAGCTAACATCTTTTTCTTGGACAAAGGTGGCTAACATTTTATATTTGGAGTCTCCTGC
TGGCTCTGGATATTCTTATGCCAAAACTCCGCGTGCTGCTGAGACGAGCGACACCAAACA
AATTCATCAAATCGACCAATTCCTTAGAAGATGGTTGGTGGATCACCCTGAGTTTATATC
GAATCCATTTTACGTTGGTGGAGATTCATATTCCGGGCACATTGTTCCCGGAGTTGTGCA
ACAGATTTCACTTGGAAATGAGAAAGGTCTCACACCTTTCATTAGTATTCAGGGATATGT
TCTTGGAAACCCTATAACAAATCAAAAACTTGAATCTAATTACAAATTTCCATTTGCTCA
TCGGATGGGACTTATTTCAGATGAGCTCTTTGAGTCGCT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4E928TF 814 0 0
GCTTCCTGGTTTTGAAGGTCCTCTTCCTTTTGCGCTCGAGACTGGGTATGTGAGTGTTGG
TGAATCTGAGGATGTTGAGCTCTTTTACTACTTTGTGAAATCAGAGAGAAATCCAGAGAA
AGATCCTCTCATGATTTGGCTTACCGGTGGGCCTGGATGCAGCTCCATTTGTGGACTACT
CTTTGCAAACGGTCCTTTAGCTTTCAAAGGGGATGAGTATAATGGGACGTTACCTCCTCT
GGAGCTAACATCTTTTTCTTGGACAAAGGTGGCTAACATTTTATATTTGGAGTCTCCTGC
TGGCTCTGGATATTCTTATGCCAAAACTCCGCGTGCTGCTGAGACGAGCGACACCAAACA
AATTCATCAAATCGACCAATTCCTTAGAAGATGGTTGGTGGATCACCCTGAGTTTATATC
GAATCCATTTTACGTTGGTGGAGATTCATATTCCGGGCACATTGTTCCCGGAGTTGTGCA
ACAGATTTCACTTGGAAATGAGAAAGGTCTCACACCTTTCATTAGTATTCAGGGATATGT
TCTTGGAAACCCTATAACAAATCAAAAACTTGAATCTAATTACAAATTTCCATTTGCTCA
TCGGATGGGACTTATTTCAGATGAGCTCTTTGAGTCGCTTGGAAAAAGTTGTGGAGGAAT
AAACATTAACGCAGACCCGAGTAATGCAAAATGCTTAAATGATCTTCAAGCTTATGATAA
ATGTATCTCGGAGATATATGTAGAGCAGATTTTGTTACCAAACTGTCCAGTAGAT*ACGT
CTTAGCAGACATACCACAA*CCTTACGAAACATC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4E928JQ 204 0 0
AGTATAATCCAGACCAATGCTCACTTATGTTTAAAAAATGGATTGATGGAAAACCTCTCT
GAAGTTTCTCACTCATTTCTCTCTCAAAAGCTTCTTGTCAATTGTCAAATCACAAAACTT
GTTTTCATGTTACCATTTAAATTGTTCAAAAACATATCATAATAATGTCTTCATAAATAA
TAGTTCCGTTCAAGTTTCCAGTTT

QA 1 204 1 204
DS 

RD RR4E138JQ 801 0 0
AAGCTTATGATAAATGTATCTCGGAGATATATGTAGAGCAGATTTTGTTACCAAACTGTC
CAGTAGATTACGTCTTAGCAGACATACCACAAACCTTACGAAACATCAAAACTGGTAGAA
GGCGAATACTGAAAGAGTTTTCAGGAAATGATATACCATCACTGCCTCCTCCTAGCTGCT
TTACTTATAGGTATTTTCTGTCTGCTATTTGGGCAAACGATGAAAATGTACGCAGAGCTC
TGGGCGCTAAGATGGATTTAGGAAAATGGAACCGATGCAACATCCAAAACATCCCATATA
CATTTGATATTGACAATGCCGTTCCATATCACGTGAATAATAGTCGTAAAGGCTTCTGCT
CCCTCATCTACAGTGGTGATCATGATATGATGGCACCTTACTCCTCAACGGAAGCATGGA
TCAGAGATCTCAACTATTCCATTGTTGATGACTGGAGACCTTGGATGATGAGTAGCTATC
AAGTCGCTGGATATACAAGGACTTACGCTAATAAGATGACATTTGCAACCATCAAGGGAG
GAGGACACACCGCTGAGTATAATCCAGACCAATGCTCACTTATGTTTAAAAAATGGATTG
ATGGAAAACCTCTCTGAAGTTTCTCACTCATTTCTCTCTCAAAAGCTTCTTGTCAATTGT
CAAATCACAAAACTTGTTTTCATGTTACCATTTAAATTGTTCAAAAACATATCATAATAA
TGTCTTCATAAATAATAGTTCCGTTCAAGTTTCCAGTTTATATATTTTAAACACCCTGAA
TGCTACGTTGGGGTTTCACCG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 3

CO CL2689Contig1 734 3 3 U
TTTTTTTTGCAAAGAGATATTACTTATATAAAACTTTAGCAGGTTCAAACAGAAACAGGA
AAAGTAAAAGAACTTATTCAAAGATCACCAGAGACATAAACATAGAAAGGACTTCCGATG
ACAGACTTAGAACATAAAAAGACAGATATGATAACTTATTAGATTGAATCAAAGAGAAAG
ATGTCATATGACCATCAGTTGGCGACTGGGATGGCGATTGGGAGGACATGGACTCCAATT
TGATGAAGCAGCTCATTGGCTTTTCCATGAAACCCAACGATCTTGCGGCCTTCCTCGTTG
ACTTTGAAAGGTTCGCCAGCTTCAAGACCAAAGGGATTGGATGTTCGTTTATTAGTCTCG
AACTTTAGCATGGTGATGACGGCAGAGCCACTCCCAAAGATTTTATCGACTGTGCCATGA
ACAACCGTGATGTATTCATTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGCAGAGTA
GGCTTTCCACGTTCATCTCCAACAACCACTTCAGAACCATTGACATATTCAAACTTAACC
GCTGATACACCATCATGGCCTTGACCTACATACACCTTTTTAACACCATGGTGAGCACCA
TCGTCCCATGCAGTCCCTTCATCACTACCAAGTGCCGGTAGCTTCTTGGCAGGGGTCAAC
GAGGTGGAACTAGTCAACGGAGCAAGTAAGCTCCAAGAGAATGGACATAGTCTCCGGCAA
ACCCATGAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D522JQ U 9
AF RR4D680JQ U 9
AF RR4D522TF C 1
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BS 9 648 RR4D522JQ
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AGAACATAAAAAGACAGATATGATAACTTATTAGATTGAATCAAAGAGAAAGATGTCATA
TGATCATCAGTTGGCGACTGGGATGGCGATTGGGAGGACATGGACTCCAATTTGATGAAG
CAGCTCATTGGCTTTTCCATGAAACCCAACGATCTTG**GCCTTCCTCTTTGACTTTGAA
AGGTTCGCCAGCTTCAAGACCAAAGGGATTGGATGTTCGTTTATTAGTCTCGAACTTTAG
CATGGTGATGACGGCAGAGTCACTCCCAAAGATTTTATCGACTGTGCCATGAACAACCGT
GATGTATTCATTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGCAGAGTAGGCTTTCC
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QA 1 640 1 640
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ATGTCATATGACCATCAGTTGGCGACTGGGATGGCGATTGGGAGGACATGGACTCCAATT
TGATGAAGCAGCTCATTGGCTTTTCCATGAAACCCAACGATCTTGCGGCCTTCCTCGTTG
ACTTTGAAAGGTTCGCCAGCTTCAAGACCAAAGGGATTGGATGTTCGTTTATTAGTCTCG
AACTTTAGCATGGTGATGACGGCAGAGCCACTCCCAAAGATTTTATCGACTGTGCCATGA
ACAACCGTGATGTATTCATTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGCAGAGTA
GGCTTTCCACGTTCATCTCCAACAACCACTTCAGAACCATTGACATATTCAAACTTAACC
GCTGATACACCATCATGGCCTTGACCTACATACACCTTTTTAACACCATGGTGAGCACCA
TCGTCCCATGCAGTCCCTTCATCACTACCAAGTGCCGGTAGCTTCTTGGCAGGGGTCAAC
GAGGTGGAACTAGTCAACGGAGCAAGTAAGCTCCAAGAGAATGGACATAGTCTCCGGCAA
ACCCATGAAAACCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4A284JQ C 1
AF RR4A284TF U 1
AF RR4A284TFB U 1
AF RR4A284JQD C 1
BS 1 407 RR4A284TF

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TTCACCTTTGTGCCTGGAAGTTTGAGAGATCCAAAAGGGAGTCAATTCGAAGTCAAAGTG
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GATAAAGTCAATGGAGAAGCTGTGATAGGAAAGTACCCTCTCTTACAAGCCGAGTAAGAA
GAGTTTGTGTATGAGAGTTGTTCAAGTTTTCCAACAACTAGTGGATCCATTGAAGGATCT
TTCACCTTTGTGCCTGGAAGTTTGAGAGATCCAAAAGGGAGTCAATTCGAAGTCAAAGTG
GAAGAGTTTCCTTTGAAGTTACCAGACTACATCTTCTAAACTCATCTACCGCCTTCAATG
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DS 

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TTCACCTTTGTGCCTGGAAGTTTGAGAGATCCAAAAGGGAGTCAATTCGAAGTCAAAGTG
GAAGAGTTTCCTTTGAAGTTACCAGACTACATCTTCTAAACTCATCTACCGCCTTCAATG
TTTGTTACTGTTTCATGCAGTGTGCAATGTACTTTGAGTTGAAGTGTGTTGAACAGTGAC
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DS 

RD RR4A284JQD 407 0 0
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TTCACCTTTGTGCCTGGAAGTTTGAGAGATCCAAAAGGGAGTCAATTCGAAGTCAAAGTG
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QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 4

CO CL2691Contig1 930 4 4 U
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GGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAAACAGAGCTGCGC
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TGATGAATGTTTTTCTTTATTGTATTTATGTGCCTGTGTATTCGCAGATATTATCCTACA
TATAGCCAAATAAGTCTCTGGAGTTCACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E391JQ C 6
AF RR4E391TF U 6
AF RR4AM65TF U 1
AF RR4AM65JQ C 88
BS 1 156 RR4AM65TF
BS 157 157 RR4E391TF
BS 158 747 RR4AM65TF
BS 748 930 RR4AM65JQ

RD RR4E391JQ 644 0 0
GG
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TCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGC
CGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGT
TCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAAACAGAGCTGCGCTACGAGG
CGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGC
AAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCC
TTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTC
CTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGT
ATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAACATTATCTAGCCGGAGAGTTTTAAGAAATGTT
TCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTA
CTGTTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTC
AAGGTC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR4E391TF 638 0 0
GG
AGAACGAAATGATTCGTTTAGTTCAAGTAGCGATTCTCTGTCTCTCCATCGCCGCCGTGA
TCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGC
CGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGT
TCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAAACAGAGCTGCGCTACGAGG
CGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGC
AAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCC
TTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTC
CTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGT
ATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAACATTATCTAGCCGGAGAGTTTTAAGAAATGTT
TCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTA
CTGTTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR4AM65TF 747 0 0
GGGAAACAGAACGAAATGATTCGTTTAGTTCAAGTAGCGATTCTCTGTCTCTCCATCGCC
GCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAAC
GGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGTAGTTCAACTTCGACGTCAAAACG
GGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAAACAGAGCTGCGC
TACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATA
TCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGC
TCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTC
GATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTATGTTG
TCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAACATTATCTAGCCGGAGAGTTTTAAG
AAATGTTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATA
CTTTGTACTGTTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAATGCTTCCC
ATTCCAGTTCTGTTTTCTGTATTGTATTTTTCAGATCGTGAGGGGGACTGAACCAAGAGA
ATCTGTGAGCGGAAGTAAGATGGGAAG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4AM65JQ 843 0 0
GACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAA
GGCGTGACGTAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGC
CCCTGCGATGCCAAGTACGAAACAGAGCTGCGCTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATA
AGCGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTT
CCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGT
GTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTT
CGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACT
GGGAGAAACATTATCTAGCCGGAGAGTTTTAAGAAATGTTTCATATACTATACCAGAAAG
ATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTTTTTTGGTCTCAAA
TCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAATGCTTCCCATTCCAGTTCTGTTTTCTGTATTGTAT
TTTTCAGATCGTGAGGGGGACTGAACCAAGAGAATCTGTGAGCGGAAGTAAGATGGGAAG
AAAAAAAAAAACATTATCTGGTTTGTTTGGAAAAGATGTTGAAGGACTGGTCCATATGTG
GTTGAAGTGATTGATGATAGCAGTGATGTGAGGTGATGAATGTTTTTCTTTATTGTATTT
ATGTGCCTGTGTATTCGCAGATATTATCCTACATATAGCCAAATAAGTCTCTGGAGTTCA
CAG

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 4

CO CL2692Contig1 779 4 14 U
GGAAGCATCGACTCTCCGTTTCAGCTCCGATTTGGAAGTGGTAGGAGGAGAACGTAAAAT
GGATAACATTGTGGACTCGTTGAACAAGGCTTACGAGAAGTTCGTTATCGCTTCAGCTGA
TGTTCTGGAGTCCAAGGAGAGTGCAGGCGGGGTAAAAGCTTCTCTAACCGATGCTGCGTT
GGAGAATTTCAAGGAGAAGTGGGAGCTGTTCCGTGTGGCTTGCGATCAAGCTGAGGAGTT
TGTGGAGTCGGTGAAGCAGAGGATTGGATCCGAGTGTTTGGTTGATGAGGCTACTGGTTT
AACAACAACAACAACAACAGGAGGTAATAATAACTCAGGCCAAACAACAGCGACTGTTGG
TGCTGCGACTGGTCTCCCTCCAATTAGTGCAGTGAGGCTGGAACAGATGAGTAGAGCGGT
TCGATGGCTTGTGCTTGAGCTGCAACGTGGGTCTGGTTCTGCGCATTCTTCTTCATCCGC
AGGGTTTGATCCTAGATTCTCCGAAGACTCGACTCAGTAGAGTGTGTCTACTTCAAACTA
CACACACACACACACCTTTTCAATTAGTTAGCAACATACTACTTTGTAAGCTACCTAATA
ACTGCAGCTGCTGCGTTGTTACTCTTTGAGTGTGTTATCATGGATATGCCTTCTCTTCTT
TTGGCCTAATGAGTCTATATTCTGACCAAGCAAGAAGCAACACTTGATTGTTGATGGGTT
TGATTTGTAGGACTTTTGAGTGTTTGTTCTGAATATCAAGTAAAAGAGACTGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX26TF U 1
AF RR4F695TF U 1
AF RR4F695JQ C 6
AF RR4AL42JQ C 1
BS 1 5 RR4AL42JQ
BS 6 94 RR4FX26TF
BS 95 95 RR4F695TF
BS 96 273 RR4FX26TF
BS 274 274 RR4F695TF
BS 275 316 RR4FX26TF
BS 317 319 RR4F695TF
BS 320 370 RR4FX26TF
BS 371 371 RR4F695TF
BS 372 552 RR4FX26TF
BS 553 554 RR4F695TF
BS 555 652 RR4FX26TF
BS 653 667 RR4F695TF
BS 668 779 RR4AL42JQ

RD RR4FX26TF 659 0 0
GGAAG
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ACATTGTGGACTCGTTGAACAAGGCTTACTAGAAGTTCGTTATCGCTTCAGCTGATGTTC
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ATTTCAAGGAGAAGTGGGAGCTGTTCCGTGTGGCTTGCGATCAAGCTGAGGAGTTTGTGG
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CAACAACAACA***GGAGGTAATAATAACTCAGGCCAAACAACAGCGACTGTTGGTGCTG
CGACTAGTCTCCCTCCAATTAGTGCAGTGAGGCTGGAACAGATGAGTAGAGCGGTTCGAT
GGCTTGTGCTTGAGCTGCAACGTGGGTCTGGTTCTGCGCATTCTTCTTCATCCGCAGGGT
TTGATCCTAGATTCTCCGAAGACTCGACTCAGTAGAGTGTGTCTACTTCAAACTACACAC
ACACACA**CCTTTTCAATTAGTTAGCAACATACTACTTTGTAAGCTACCTAATAACTGC
AGCTGCTGCGTTGTTACTCTTTGAGTGTGTTATCATGGATATGCCTT
CTCTTCT

QA 6 652 6 652
DS 

RD RR4F695TF 669 0 0
GGAAG
CATCGACTCTCCGTTTCAGCTCCGATTTGGAAGTGGTAGGAGGAGAACGTAAAATGGATA
ACATTGTGGACTCGTTGAACAAGGCTTACGAGAAGTTCGTTATCGCTTCAGCTGATGTTC
TGGAGTCCAAGGAGAGTGCAGGCGGGGTAAAAGCTTCTCTAACCGATGCTGCGTTGGAGA
ATTTCAAGGAGAAGTGGGAGCTGTTCCGTGTGGCTTGCGATCAAGCTGAGGAGTTTGTGG
AGTCGGTGAAGCAGAGGATTGGATCCGAGTGTTTGGTTGATGAGGCTACTGGTTTAACAA
CAACAACAACAACAGGAGGTAATAATAACTCAGGCCAAACAACAGCGACTGTTGGTGCTG
CGACTGGTCTCCCTCCAATTAGTGCAGTGAGGCTGGAACAGATGAGTAGAGCGGTTCGAT
GGCTTGTGCTTGAGCTGCAACGTGGGTCTGGTTCTGCGCATTCTTCTTCATCCGCAGGGT
TTGATCCTGGATTCTCCGAAGACTCGACTCAGTAGAGTGTGTCTACTTCAAACTACACAC
ACACACACACCTTTTCAATTAGTTAGCAACATACTACTTTGTAAGCTACCTAATAACTGC
AGCTGCTGCGTTGTTACTCTTTGAGTGTGTTATCATGGATATGCCTTCTCTTCTTTTGGC
CT
AA

QA 6 667 6 667
DS 

RD RR4F695JQ 662 0 0
CATCGACTCTCCGTTTCAGCTCCGATTTGGAAGTGGTAGGAGGAGAACGTAAAATGGATA
ACATTGTGGACTCGTTGAACAAGGCTTACGAGAAGTTCGTTATCGCTTCAGCTGATGTTC
TGGAGTCCAAGGAGAGTGCAGGCGGGGTAAAAGCTTCTCTAACCGATGCTGCGTTGGAGA
ATTTCAAGGAGAAGTGGGAGCTGTTCCGTGTGGCTTGCGATCAAGCTGAGGAGTTTGTGG
AGTCGGTGAAGCAGAGGATTGGATCCGAGTGTTTGGTTGATGAGGCTACTGGTTTAACAA
CAACAACAACAACAGGAGGTAATAATAACTCAGGCCAAACAACAGCGACTGTTGGTGCTG
CGACTGGTCTCCCTCCAATTAGTGCAGTGAGGCTGGAACAGATGAGTAGAGCGGTTCGAT
GGCTTGTGCTTGAGCTGCAACGTGGGTCTGGTTTTGCGCATTTTTTTTCATCCGCAGGGT
TTGATCCTGGATTTTCCGAAGACTCGACTCAGTAGAGTGTGTTTACTTCAAACTACACAC
ACACACACACCTTTTCAATTAGTTAGCAACATACTACTTTGTAAGCTACCTAATAACTGC
AGCTGCTGCGTTGTTACTCTTTGAGTGTGTTATCATGGATATGCCTTTTTTTCTTTTGGC
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4AL42JQ 779 0 0
GGAAGCATCGACTCTCCGTTTCAGCTCCGATTTGGAAGTGGTAGGAGGAGAACGTAAAAT
GGATAACATTGTGGACTCGTTGAACAAGGCTTACGAGAAGTTCGTTATCGCTTCAGCTGA
TGTTCTGGAGTCCAAGGAGAGTGCAGGCGGGGTAAAAGCTTCTCTAACCGATGCTGCGTT
GGAGAATTTCAAGGAGAAGTGGGAGCTGTTCCGTGTGGCTTGCGATCAAGCTGAGGAGTT
TGTGGAGTCGGTGAAGCAGAGGATTGGATCCGAGTGTTTGGTTGATGAGGCTACTGGTTT
AACAACAACAACAACAACAGGAGGTAATAATAACTCAGGCCAAACAACAGCGACTGTTGG
TGCTGCGACTGGTCTCCCTCCAATTAGTGCAGTGAGGCTGGAACAGATGAGTAGAGCGGT
TCGATGGCTTGCGCTTGAGCTGCAACGTGGGTCTGGTTCTGCGCATTCTTCTTCATCCGC
AGGGTTTGATCCTAGATTCTCCGAAGACTCGACTCAGTAGAGTGTGTCTACTTCAAACTA
CACACACACACA**CCTTTTCAATTAGTTAGCAACATACTACTTTGTAAGCTACCCAATA
ACTGCAGCTGCTGCGTTGTTACTCTTTGAGTGTGTTATCATGGATATGCCTTCTCTTCTT
TTGGCCTAATGAGTCTATATTCTGACCAAGCAAGAAGCAACACTTGATTGTTGATGGGTT
TGATTTGTAGGACTTTTGAGTGTTTGTTCTGAATATCAAGTAAAAGAGACTGTTTTATC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 4

CO CL2693Contig1 1099 4 8 U
TTTTTTTTTCTATATTTCAACGACACTTTCAAGTTTCAACCAACACTTGTTGGTCTTGTT
GTTGTTCAGTTTTGTTTTCGTTTCTTCTCTTTAGATCTCTTTCTTTAAAGTCTTATCCTT
TGGATTCTGATTCGATATCTTCTGTTTTGTTTTAGATTTTATCACTTTCTTCAGAATCTC
AGTCTTTTCTTCTGATCTGGGTTTTTCTTCTCTCTGTTAACTTTAGCTGTTTGGTTGCAG
AAACTTGTGAGTGTAGATCAGTTGAAACCCTAACAAAGATTAGAAAAGAGAAACCTTTTT
GTCTCATTCTGAGAAATGGGTTCACAGATTGTTAAGATGGATTGAAAAGAAACAACCTTT
TCACCTACAGGTTGCTTGTCTAGTTGCTTGAGGCTTTTTGGTTTGGTAGAGAACTGAACT
AGAGTTATGAGAAGAGGTAGAGGGAAAGGCAAGAGGCAGAATGCTACAACTAGAGAAGAT
CGTGGAAGCGGTGAAGAAGAAGAAGAAAAGATTCCAGCTTATAAGAGAAGAGGGAGGCCA
CAGAAGCCGGTGAAAGATGAAGCCGAAGGAGAAGAAGAGATCTTAGAGAAGGATGATGAT
ACAAATGGTTCAGTAACAAGTAAAGAAGATGTGACAGAGAATGGAAGGAAGAGGAAGAAA
GCAGTAGAGTCTAAAGAGAGCAATGTAACCGAAGAGGAGAACGTGTTAGGTTCAAAATCA
AGCACAGATGATTCAGTGAAGTCATCTTTGTCGATAGGGTTTAGACAAGTTGGGAGCAGA
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AAAAAAGAGCTTCTTAAAACTCTTTTGAAACCCGCCCTTTTGGGTTTTTTTATTGTTGAC
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TACTATTTAATTGCTATCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AA

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CATTGATTTCGTTTTTATGAAACTCTCCTCTCTTGTAAACTGAGTAGAGCCTAAAATACT
ATTTAATTGCTATCG

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DS 



AS 1 3

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TATCTCTCTACTGGTGCTGTTGCGGGTGAATTTAGATATGGCTGGAGTTGTTCGAATATC
TTCGACGTCGGTTCAGGCCATTCGCGTCTCTTCCTCCTTCACAACCACTCCAAACACTCT
AAAACCTCGCTCACCTCCAAATCTGAATTCCGACAAGAGAGTTCGTCAGCTCTCTTCATC
TCCCTCCTGCTCGTCTTCTCACTACACATCTTTAGGTCCCGCTAGCCACATCCCTCTTAA
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CTCATGTTCTCTTGCCAAGTTCCAGAAGATAAAAGATGCCATCCGACTACACAACACAGA
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TTCATTACTGCAACAGTCTCTGATTGGTCAAGCAAACACCTAGCTTTATAATCTCTGTAT
ATCTGTCACTTAATTTGGTATAAAAGAATTCTTCCTGCC


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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CGTCAAAGTGCTTCCTTA

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DS 

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CATCTCCCTCCTGCTCGTCTTCTCACTACACATCTTTAGGTCCCGCTAGCCACATCCCTC
TTAAACGATCCAAGAGCAAGGTGGTTCACGTCAAGGTAGATGAGAGTGTGGCGGAGACAG
AGCCACCGAAATGGTGGGAGAGGAATGCTGGACCAAACATGGTTGACATTCATTCCACTG
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TGAACGTCAAAGTGCTTCCTTATTTCCACTTTTACCGTGGAGCTGATGGCCAGCTCGAGT
CCTTCTCATGTTCTCTTGCCAAGTTCCAGAAGATAAAAGATGCCATCCGACTACACAACA
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TTGCAGAGCATTGTTCCCCAAGCTTTGCAAGACAGCGGTTGAACATCCGGATATATTGTT
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TCCTTATTTCCACTTTTACCGTGGAGCTGATGGCCAGCTCGAGTCCTTCTCATGTTCTCT
TGCCAAGTTCCAGAAGATAAAAGATGCCATCCGACTACACAACACAGATCGTTGCAGCAT
CGCTCCAGCCAAGGGACCTGAAGGGTTTACGTTGGAATCTTTATCCGTGCAGACGAATGC
AGCCAAACCAGCTGGATCAAGTTGAATTTGCAATACGTCTTAATTAGATTCATTACTGCA
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ATTTGGTATAAAAGAATTCTTCCTGCC

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DS 



AS 1 4

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TCCTCTTTTCTAAGTGTAGTCGATCAATCGACACACTACTCCACTTCTTCTGCAGTCAGT
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TGAATTCCGAAGGCAAATCCACCGAGTCCGGCGATCTTAACTCGAAAAAATCAAACATAC
CGGCCAATCCGGTGTCTCCTCAGCCGTGCCGAAAAGCTTTTGTTGTTATCTCAGATCCGA
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GCAGCTAAAACTCATGATTGTCTACATTGTATCTTCACATAACCATTTATTTCCATATCT
ACAGATGTAATATAGTGTTCATATAAATACACATCTCACAGAATATGTTCTTACAGTTCT
T*ACAGTTGTTGCAATTTGTTTATCTTGGTAAAATCCGAACGATCCAACTTGAGTAAACT
GATGCAAAAGAGAACCTCCTCCAGGCGGCTAGAAAAGCATATGTCGCTGCTCTAGGCTTC
ACAGTCCAATGCGACAAGTGGGCTATTCGACTCCTCTTGGGTGAAATTCCATAGCGATCC
ATCTTCACTCACAAAGAAATGGAGAAGGCTCTTAGGCCATATTTCGAACTTACCAATTTT
TCAGTCACGGCCAGTTGTATGTTGCTCTCTCACTTGATGATACGGAAGGCACAACAAGAA
AGTAAGGTGCTACTAACATTGTTTATACAGAGATAGTAATCTCAGGACAAGAAGCAGCTT
GGGAGACCAGTCCATTTCTTACCATTCTCTAACCCAACTAACTACTGACTGTCATCAAAA
AGTCCACCAAATATACACAGTTATTTCGTACAGCCAATGTGAGAACTGATTCAGAGACAA
ATGTCTCACCACTGCGTTTTTGGAGGCTCTCTTTCTGCGCATCTTAACCTTGGCGACTGG
TATCATTCCTCAGCTACTGCAAGTTTATCACATCTTAATCTGTCATATTTTATCTCTTGA
TGTTACTCTGTTTTATGAATGCCTTTCCATATTTAGAGTCAAAGCTATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AT46TF U 25
AF RR4AW04TF U 1
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AF RR4AT46JQ C 518
BS 1 859 RR4AW04TF
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TTCGTTTAGCCTTTCTTCTTCTATATTTCTTTATAATTCTTTTTTTCTCAGATTTCGGAT
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GTTAAGAAGAAGAGGTAAAGTAGGTTTGCAATATATGTGTTTTAGATATTGCAGTGCTTA
CGGCATTAGTGATTGGTTTCACTTTTAACCTGTGTTGCAGCTAAAACTCATGATTGTCTA
CATTGTATCTTCACATAACCATTTATTTCCATATCTACAGATGTAATATAGTGTTCATAT
AAATACACATCTCACAGAATATGTTCTTACAGTTCTTTACAGTTGTTGCAATTTGTTTAT
CTTGGTAAAATCCGAACGATCCAACTTGAGTAAACTGATGCAAAAGAGAACCTCCTCCAG
GCGGCTAGAAAAGCATATGTCGCTGCT

QA 1 747 1 747
DS 

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CATCCGAAATCAAACAATAATGAATTCGTTTAGCCTTTCTTCTTCTATATTTCTTTATAA
TTCTTTTTTTCTCAGATTTCGGATCAAAAGTTTCTAGACTCTCTCAAACGCATATCGTGA
TGAATTCCGAAGGCAAATCCACCGAGTCCGGCGATCTTAACTCGAAAAAATCAAACATAC
CGGCCAATCCGGTGTCTCCTCAGCCGTGCCGAAAAGCTTTTGTTGTTATCTCAGATCCGA
TTGTTGTAAGGCATGTCCTCTGAGAAAACACTAGGAGTCCTTGCTGAGTTCTTAGAGCCG
ATTTTGGAAAAAGGTTTGAAAAAAGTTAAGAAGAAGAGGTAAAGTAGGTTTGCAATATAT
GTGTTTTAGATATTGCAGTGCTTACGGCATTAGTGATTGGTTTCACTTTTAACCTGTGTT
GCAGCTAAAACTCATGATTGTCTACATTGTATCTTCACATAACCATTTATTTCCATATCT
ACAGATGTAATATAGTGTTCATATAAATACACATCTCACAGAATATGTTCTTACAGTTCT
T*ACAGTTGTTGCAATTTGTTTATCTTGGTAAAATCCGAACGATCCAACTTGAGTAAACT
GATGCAAAAGAGAACCTCCTCCAGGCGGCTAGAAAAGCATATGTCGCTGCTCTAGGCTTC
ACAGTCCAATGCGACAAGTGGGCTATTCGACTCCTCTTGGGTGAAATTCCATAGCGATCC
ATCTTCACTCACAAAGAAA

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR4AW04JQ 878 0 0
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GCAGTGCTTACGGCATTAGTGATTGGTTTCACTTTTAACCTGTGTTGCAGCTAAAACTCA
TGATTGTCTACATTGTATCTTCACATAACCATTTATTTCCATATCTACAGATGTAATATA
GTGTTCATATAAATACACATCTCACAGAATATGTTCTTACAGTTCTT*ACAGTTGTTGCA
ATTTGTTTATCTTGGTAAAATCCGAACGATCCAACTTGAGTAAACTGATGCAAAAGAGAA
CCTCCTCCAGGCGGCTAGAAAAGCATATGTCGCTGCTCTAGGCTTCACAGTCCAATGCGA
CAAGTGGGCTATTCGACTCCTCTTGGGTGAAATTCCATAGCGATCCATCTTCACTCACAA
AGAAATGGAGAAGGCTCTTAGGCCATATTTCGAACTTACCAATTTTTCAGTCACGGCCAG
TTGTATGTTGCTCTCTCACTTGATGATACGGAAGGCACAACAAGAAAGTAAGGTGCTACT
AACATTGTTTATACAGAGATAGTAATCTCAGGACAAGAAGCAGCTTGGGAGACCAGTCCA
TTTCTTACCATTCTCTAACCCAACTAACTACTGACTGTCATCAAAAAGTCCACCAAATAT
ACACAGTTATTTCGTACAGCCAATGTGAGAACTGATTCAGAGACAAATGTCTCACCACTG
CGTTTTTGGAGGCTCTCTTTCTGCGCATCTTAACCTTGGCGACTGGTATCATTCCTCAGC
TACTGCAAGTTTATCACATCTTAATCTGTCATATTTTATCTCTTGATGTTACTCTGTTTT
ATGAATGCCTTTCCATATTTAGAGTCAAAGCTATATGC

QA 1 878 1 878
DS 

RD RR4AT46JQ 795 0 0
TGGTTTCACTTTTAACCTGTGTTGCAGCTAAAACTCATGATTGTCTACATTGTATCTTCA
CATAACCATTTATTTCCATATCTACAGATGTAATATAGTGTTCATATAAATACACATCTC
ACAGAATATGTTCTTACAGTTCTT*ACAGTTGTTGCAATTTGTTTATCTTGGTAAAATCC
GAACGATCCAACTTGAGTAAACTGATGCAAAAGAGAACCTCCTCCAGGCGGCTAGAAAAG
CATATGTCGCTGCTCTAGGCTTCACAGTCCAATGCGACAAGTGGGCTATTCGACTCCTCT
TGGGTGAAATTCCATAGCGATCCATCTTCACTCACAAAGAAATGGAGAAGGCTCTTAGGC
CATATTTCGAACTTACCAATTTTTCAGTCACGGCCAGTTGTATGTTGCTCTCTCACTTGA
TGATACGGAAGGCACAACAAGAAAGTAAGGTGCTACTAACATTGTTTATACAGAGATAGT
AATCTCAGGACAAGAAGCAGCTTGGGAGACCAGTCCATTTCTTACCATTCTCTAACCCAA
CTAACTACTGACTGTCATCAAAAAGTCCACCAAATATACACAGTTATTTCGTACAGCCAA
TGTGAGAACTGATTCAGAGACAAATGTCTCACCACTGCGTTTTTGGAGGCTCTCTTTCTG
CGCATCTTAACCTTGGCGACTGGTATCATTCCTCAGCTACTGCAAGTTTATCACATCTTA
ATCTGTCATATTTTATCTCTTGATGTTACTCTGTTTTATGAATGCCTTTCCATATTTAGA
GTCAAAGCTATATGC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 4

CO CL2696Contig1 723 4 7 U
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GACGGAGAAGGAAGGAAGGGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTACT
ATGTGGGACACAAGGGGAAATTTGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGACG
GTAAGCTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGACCCGTAAGGAGG
TGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAGTGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGATAA
TGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGAGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGA
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CCTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCAGTCGTATGCTGTTTTTCT
TTTCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTATTGGAAATGGACACAACTGTT
TGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CO44TF U 1
AF RR4CX72TF U 1
AF RR4CX72JQ C 1
AF RR4CO44JQ C 1
BS 1 37 RR4CO44TF
BS 38 38 RR4CX72TF
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RD RR4CO44TF 588 0 0
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QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4CX72TF 660 0 0
TTTTTCTTTTTCTTTTGGGGGCTATTAAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGA
GACGGAGAAGGAAGGAAGGGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTACT
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CCTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCAGTCGTATGCTGTTTTTCT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4CX72JQ 648 0 0
TTTTTCTTTTTCTTTTGGGGGCTATTAAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGA
GACGGAGAAGGAAGGAAGGGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTACT
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CCTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCAGTCGTA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4CO44JQ 723 0 0
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GACGGAGAAGGAAGGAAGGGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTACT
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TGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAGTGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGGTAA
TGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGAGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGA
TCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCTTTCGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTGATG
TCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGACTTGA
AATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGATGAA
ACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATGGACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTGGCTCATG
CCTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCAGTCGTATGCTGTTTTTCT
TTTCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTATTGGAAATGGACACAACTGTT
TGT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2697Contig1 1338 4 3 U
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CAACCTCCCATATTCTGACCGTCCCGTCCTCTGATCCTGACGTGTATGACTCCCCACCTG
GCGAATACCTCACGCAGTGCACTGGTCCGTGGTGACCCTTGTTACACCCAATCTCTTCTC
CAGTCTGGAAATCAAACCTATGGACCCACATGTCTTCTCCTCCAGCAATGAAAGTGTTCC
CGTGTTTCGGTTCCAAGGATGCTGATTCAACGTTGCAAGGCATCTCATAGCTCTTGACCA
ATCCGAAATTAGTGGCGTCCCAAAACTTAACACTAGATCCATCAGCAGTAGTTATGTATC
GCCCATCCTGGCTTACTTCAGCACTAGTCACTGGGAACTTGGTTTCTAATGTTTGAACAA
TCTTGTCACTTCTTATGTCCCATAACCTAATGTCACCGGTATCTGTGCAAGAGCTCAGGA
TAGTATTATCACTGTGAAGCCATTCTACGGTTCTGATTGAAACAGGAGAGTTTCCAACTT
CTTTAGGAGGTGCGTCTGGCCTGTTCATATCGAATATCCGAAGAATCTTCTCCATTCCAC
CGGTGAGCAAAAGGTGAGTGTCCTCAGAGAAGGCACATGCGCGAACGATGTGCTTGTGTT
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AAGCAGAGGCAGCGCGCATAGCATGTTTATCAAGGCTGCAACTCCAAACTGCTCCTTTAT
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CTTTGCTGGCGCTGATGAGGAAGAATCCATCTGGAGTCACCGGACTGTAAGAAACGTAGA
CGACGGGACGAGAATGCCCGTGGCATACTAACGGAACCCCCATTATCTTCTCCTTTTGTC
CGTCTCTATTCACCGACAAGAGTGCCCCAGTGCTTTAGATCGGTAAGAATGTATTGAACC
TGCTCCCCCTTGAAGAGGATCACACCTTGGATTTTTTTTTTTAATTTGGAAAGACAAGTG
TGAGAGAAGAAGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G950JQ U 32
AF RR4GZ14JQ U 1
AF RR4GZ14TF C 553
AF RR4G950TF C 641
BS 1 761 RR4GZ14JQ
BS 762 1317 RR4GZ14TF
BS 1318 1338 RR4G950TF

RD RR4G950JQ 387 0 0
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ACTTGTAAGCCAAAAAAAAAATAAACTGGAAGGGATCATTCTCTTCTGCAACTATTAGTT
ATATCACAAAAGCTAAATACGTATTCATTTGGCTTCTGCAGCTTTCTCACTGATACGCAA
ACTTTCAGCTTTACGCACAACCTCCTCTGCCACAAGCTTCACGTTACCGCTCTGATCGCT
CTCCTTCTCCTCCTGGTTCACTGAACCAACAACCTCCCATATTCTGACCGTCCCGTCTTC
TGATCCTGACGTGTATGACTCCCCACCTGGCGAATACCTCACGCAGTGCACTGGTCCGTG
GTGACCCTTGTTACACCCAATCTCTTC

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4GZ14JQ 761 0 0
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GGAAGGAAAAAAAAAAGATAAAACAGGTCAAACTTGTAAGCCAAAAAAAAAATAAACTGG
AAGGGATCATTCTCTTCTGCAACTACTAGTTATATCACAAAAGCTAAATACGTATTCATT
TGGCTTCTGCAGCTTTCTCACTGATACGCAAACTTTCAGCTTTACGCACAACCTCCTCTG
CCACAAGCTTCACGTTACCGCTCTGATCGCTCTCCTTCTCCTCCTGGTTCACTGAACCAA
CAACCTCCCATATTCTGACCGTCCCGTCCTCTGATCCTGACGTGTATGACTCCCCACCTG
GCGAATACCTCACGCAGTGCACTGGTCCGTGGTGACCCTTGTTACACCCAATCTCTTCTC
CAGTCTGGAAATCAAACCTATGGACCCACATGTCTTCTCCTCCAGCAATGAAAGTGTTCC
CGTGTTTCGGTTCCAAGGATGCTGATTCAACGTTGCAAGGCATCTCATAGCTCTTGACCA
ATCCGAAATTAGTGGCGTCCCAAAACTTAACACTAGATCCATCAGCAGTAGTTATGTATC
GCCCATCCTGGCTTACTTCAGCACTAGTCACTGGGAACTTGGTTTCTAATGTTTGAACAA
TCTTGTCACTTCTTATGTCCCATAACCTAATGTCACCGGTATCTGTGCAAGAGCTCAGGA
TAGTATTATCACTGTGAAGCCATTCTACGGTTCTGATTGAA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4GZ14TF 772 0 0
TGGCGTCCCAAAACTTAACACTAGATCCATCAGCAGTAGT*ATGTATCGCCCATCCTGGC
TTACTTCAGCACTAGTCACTGGGAACTTGGTTTCTAATGTTTGAACAATCTTGTCACTTC
TTATGTCCCATAACCTAATGTCACCGGTATCTGTGCAAGAGCTCAGGATAGTATTATCAC
TGTGAAGCCATTCTACGGTTCTGATTGAAACAGGAGAGTTTCCAACTTCTTTAGGAGGTG
CGTCTGGCCTGTTCATATCGAATATCCGAAGAATCTTCTCCATTCCACCGGTGAGCAAAA
GGTGAGTGTCCTCAGAGAAGGCACATGCGCGAACGATGTGCTTGTGTTCAAAGGAGTGCA
ATTCATCTCCAGTCAATGCATTCCATATTTTCGCAGTGAAATCAGCAGAAGCAGAGGCAG
CGCGCATAGCATGTTTATCAAGGCTGCAACTCCAAACTGCTCCTTTATGTCCTTCAAAAG
TCCCTATCCAATCACCAGTCTCCCCATTCCTCAACATTGGGTTCGAATCTTTGCTGGCGC
TGATGAGGAAGAATCCATCTGGAGTCACCGGACTGTAAGAAACGTAGACGACGGGACGAG
AATGCCCGTGGCATACTAACGGAACCCCCATTATCTTCTCCTTTTGTCCGTCTCTATTCA
CCGACAAGAGTGCCCCAGTGCTTTAGATCGGTAAGAATGTATTGAACCTGCTCCCCCTTG
AAGAGGATCACACCTTGGATTTTTTTTTTTAATTTGGAAAGACAA
AGTGTCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4G950TF 698 0 0
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ATCTGTGCAAGAGCTCAGGATAGTATTATCACTGTGAAGCCATTCTACGGTTCTGATTGA
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AAGAATCTTCTCCATTCCACCGGTGAGCAAAAGGTGAGTGTCCTCAGAGAAGGCACATGC
GCGAACGATGTGCTTGTGTTCAAAGGAGTGCAATTCATCTCCAGTCAATGCATTCCATAT
TTTCGCAGTGAAATCAGCAGAAGCAGAGGCAGCGCGCATAGCATGTTTATCAAGGCTGCA
ACTCCAAACTGCTCCTTTATGTCCTTCAAAAGTCCCTATCCAATCACCAGTCTCCCCATT
CCTCAACATTGGGTTCGAATCTTTGCTGGCGCTGATGAGGAAGAATCCATCTGGAGTCAC
CGGACTGTAAGAAACGTCGACGACGGGACGAGAATGCCCGTGGCATACTAACGGAACCCC
CATTATCTTCTCCTTTTGTCTGTCTCTATTCACCGACAAGAGTGCCCCAGTGCTTTAGAT
CGGTAAGAATGTATTGAACCTGCTCCCCCTTGAAGAGGATCACACCTTGGATTTTTTTTT
**AATTTGGAAAGACAAGTGTGAGAGAAGAAGGAATCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 4

CO CL2698Contig1 768 4 6 U
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CATTTGCTCCTTTGGAGTCTCCGTTGATGACAAATGTGCTGCTTGCAACGCCGTCGCGGA
GGAACTGGAGTCACAGCTTTTGAAGGAAAAACCACGAAACCATCTTGATTTGAGAAACCG
ACTCAATTCTAAAGGCCAGCGTGAAGGAAAGGTTATTGATTATAGAATGAGTGACCTGAG
GGTGGTTGATTTGTTGGACGGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGT
GAAATCTAAAAATAGTGAATGGGTCAAAGTTGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACA
AGAAGCTAAAGCGCATGCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAAC
GGAAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAA
GGTTCTGTGTCAAACTTTAAGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGA
TGAGGACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAAATCTCTATCAC
TTCTTTTACCAACAAGGTCCCACTACAAAGACATTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTAGA
CACCTTTTTCAGCTTTTATGTTCCATCGATAATACAAAAAAAAAATAACCCTGAATTTTT
CTGAATATTTACATATCTATGCCACTGTAATGAAACTCTGTCGTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E973JQ C 291
AF RR4E973TF U 1
AF RR4A856TF U 16
AF RR4BF18TF U 18
BS 1 186 RR4E973TF
BS 187 187 RR4A856TF
BS 188 245 RR4E973TF
BS 246 248 RR4A856TF
BS 249 695 RR4E973TF
BS 696 768 RR4BF18TF

RD RR4E973JQ 347 0 0
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CAAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCATGCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGG
TGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAG
ATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACTTTAAGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAG
ATTCAGAAGATGAGGACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAAA
TCTCTATCACTTCTTTTACCAACAAGGTCCCACTACAAAGACATTTT

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4E973TF 697 0 0
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GGAACTGGAGTCACAGCTTTTGAAGGAAAAACCACGAAACCATCTTGATTTGAGAAACCG
ACTCAACTCTAAAGGCCAGCGTGAAGGAAAGGTTATTGATTATAGAATGAGTGACCTGAG
GGTGGA**ATTTGTTGGACGGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGT
GAAATCTAAAAATAGTGAATGGGTCAAAGTTGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACA
AGAAGCTAAAGCGCATGCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAAC
GGAAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAA
GGTTCTGTGTCAAACTTTAAGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGA
TGAGGACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAAATCTCTATCAC
TTCTTTTACCAACAAGGTCCCACTACAAAGACATTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTAGA
CACCTTTTTCAGCTTTTATGTTCCATCGATAATAC
AA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4A856TF 680 0 0
GGGA
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GGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGTGAA
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CCACTACAAAGACATTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTAGACACCTTTTTCAGCTTTTAT
GTTCCATCGATAATAC

QA 5 680 5 680
DS 

RD RR4BF18TF 751 0 0
GG
AGGATGGCGAAGCTGGTGTTCTTCACCGTAGTTGTTATCACCATTTGCTCCTTTGGAGTC
TCCGTTGATGACAAATGTGCTGCTTGCAACGCCGTCGCGGAGGAACTGGAGTCACAGCTT
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CGTGAAGGAAAGGTTATTGATTATAGAATGAGTGACCTGAGGGTGGTTGATTTGTTGGAC
GGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGTGAA
TGGGTCAAAGTTGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCATGCC
AATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTG*AGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTGAG
GTAATAAAGAATGGGTCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACTTTA
AGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAGGACGCCGATGACGAT
GCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAAATCTCTATCACTTCTTTTACCAACAAGGTC
CCACTACAAAGACATTTTCTACGACTCATTTGTAGCTTAGACACCTTTTTCAGCTTTTAT
GTTCCATCGATAATACAAAAAAAAAATAACCCTGAATTTTTCTGAATATTTACATATCTA
TGCCACTGTAATGAAACTCTGTCGTTTAG

QA 3 751 3 751
DS 



AS 1 3

CO CL2699Contig1 652 3 2 U
GGAAAGGAAGATGAGTATCTTATCAGAGAAAGCTGGTCATGATCTCTTTGTCTACGGCAG
TCTCCAGGATCCCCAAGTCGTTAGCGTGCTTCTTAATCGGGTCCCTGACCATGCCTCAGC
CGTACTCTCCGGCTTTCACAGGTTTAGAATCAAGAATCGTCTTTATCCAACCATTCTACC
GGACAGTACCGGAGAAGTCACCGGAAAGGTGCTAAAGGGCATAACAGATGATGAGCGTAA
GTTATTAGATGATTTTGAGGATGTTGAATATGACAGAAAGGCTGTTGAAGTTGTTCTTAC
GGATACTTCAGAGAAGCTACAAGTGGGAACTTATGTATGGAAGAACAAAGATGATCCTGA
TCTTTATGGAGAATGGGACTTTGAGGAATGGAAACGAGGTGACAGGGAGGCTTTCGTAAC
CGCCACAAAGAAGTTTATGGAAGAGAGGAAATTACCAGAAGCAAAGACTAGGATCGACAC
ATTCAAAACGTTCTTTAAGCAGGATGATGTTGAGGATGGGAGACCTCTGGATTCGTGATG
CTCTTTGGTTCTTATAGTGAGGCCATTGCTTCACCTTACATTTTAAATAAGACTTGTGGA
AAACATGATTGTGATAAAACTCAAGTGAAAATTCTAAGAGAGATTGGCTTGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B064JQ C 1
AF RR4B064TF U 1
AF RR4GV30TF U 72
BS 1 3 RR4B064JQ
BS 4 652 RR4B064TF

RD RR4B064JQ 652 0 0
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TCTCCAGGATCCCCAAGTCGTTAGCGTGCTTCTTAATCGGGTCCCTGACCATGCCTCAGC
CGTACTTTCCGGCTTTCACAGGTTTAGAATCAAGAATCGTCTTTATCCAACCATTCTACC
GGACAGTACCGGAGAAGTCACCGGAAAGGTGCTAAAGGGCATAACAGATGATGAGCGTAA
GTTATTAGATGATTTTGAGGATGTTGAATATGACAGAAAGGCTGTTGAAGTTGTTCTTAC
GGATACTTCAGAGAAGCTACAAGTGGGAACTTATGTATGGAAGAACAAAGATGATCCTGA
TCTTTATGGAGAATGGGACTTTGAGGAATGGAAACGAGGTGACAGGGAGGCTTTCGTAAC
CGCCACAAAGAAGTTTATGGAAGAGAGGAAATTACCAGAAGCAAAGACTAGGATCGACAC
ATTCAAAACGTTCTTTAAGCAGGATGATGTTGAGGATGGGAGACCTCTGGATTCGTGATG
CTCTTTGGTTCTTATAGTGAGGCCATTGCTTCACCTTACATTTTAAATAAGACTTGTGGA
AAACATGATTGTGATAAAACTCAAGTGAAAATTCTAAGAGAGATTGGCTTGC

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DS 

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GGA
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CAGTACCGGAGAAGTCACCGGAAAGGTGCTAAAGGGCATAACAGATGATGAGCGTAAGTT
ATTAGATGATTTTGAGGATGTTGAATATGACAGAAAGGCTGTTGAAGTTGTTCTTACGGA
TACTTCAGAGAAGCTACAAGTGGGAACTTATGTATGGAAGAACAAAGATGATCCTGATCT
TTATGGAGAATGGGACTTTGAGGAATGGAAACGAGGTGACAGGGAGGCTTTCGTAACCGC
CACAAAGAAGTTTATGGAAGAGAGGAAATTACCAGAAGCAAAGACTAGGATCGACACATT
CAAAACGTTCTTTAAGCAGGATGATGTTGAGGATGGGAGACCTCTGGATTCGTGATGCTC
TTTGGTTCTTATAGTGAGGCCATTGCTTCACCTTACATTTTAAATAAGACTTGTGGAAAA
CATGATTGTGATAAAACTCAAGTGAAAATTCTAAGAGAGATTGGCTTGC

QA 4 652 4 652
DS 

RD RR4GV30TF 554 0 0
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GCTTTCACAGGTTTAGAATCAAGAATCGTCTTTATCCAACCATTCTACCGGACAGTACCG
GAGAAGTCACCGGAGAGGTGCTAAAGGGCATAACAGATGATGAGCGTAAGTTATTAGATG
ATTTTGAGGATGTTGAATATGACAGAAAGGCTGTTGAAGTTGTTCTTACGGATACTTCAG
AGAAGCTACAAGTGGGAACTTATGTATGGAAGAACAAAGATGATCCTGATCTTTATGAAG
AATGGGACTTTGAGGAATGGAAACGAGGTGACAGGGAAGCTTTCGTAACCGCCACAAAGA
AGTTTATGGAAGAGAGGAAATTACCAGAAGCAAAGACTAGGATCGACACATTCAAAACGT
TCTTTAAGCAGGATGATATTGAGGATGGGAGACCTCTGGATTCGTGATGCTCTTTGGTTC
TTATAGTGAGGCCATTGCTTCACCCTACATTTTAAATAAGACTTGTGGAAAACATGATTG
TGATAAAACTCAAG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 4

CO CL2700Contig1 820 4 18 U
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GGTGAAGCCATAAGATCTCGGCTCAGTAACAGAGCCGACCCTTTCCTTGTCGTTTGCAGG
TGTTTCAGCTTCGTTACATCTCTCGTCGCTGTTCTCTGCGTTGTTGTTAATGTTCTCGCT
GCTGTTCGCTCCTTCCGCGATAGCCACGATATATTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCT
GTGTTGATCGCTTGTTTTGTGGTTCTCGCCGAGACGGAATGGGGATTTATCCTCAAGTTC
TCCAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGGCAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTGGCTGTGATG
ACAAGAGCTTTCCCTGACTATATGACTCAAAAGAAGGATCTCTTGCTTCTACAGAACATC
GCTAGCTACATGCTCCTCGCTTGTGGTCTTGTCTATTTCATATCAGGGATTCTATGCATT
GGTTTTCTAAAACGTGCTCGACAGAAGAAGGAAATCTCAAAAGAACAAGCTGTCAAGGAT
CTTCAGGAGATAGACCGACGCAGGGAAGAACTGGAACAGTTGCTCCTGGAGCATCGGAGT
AGAGACGATGTGTGAATGTCATGTCATCATCACAATTGTATTCAATTTACCAAAATTACT
AGTATTCAAACTCTGCTGGGATTGAGGATTTAAGATGTTTGTATGTGAAAAAAAAAAATC
TAGGCTTGAGTTCTTTAATTGCTCATTCATTGAGTTGTGGTGAACTTATATCTGTCATAT
TGAAGAGTGGATTTTATAAATTTGATCACAATCCAAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX93TF U 1
AF RR4BU73TF U 16
AF RR4BU73JQ C 59
AF RR4EX93JQ C 194
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GCTGTTCGCTCCTTCCGCGATAGCCACGATATATTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCT
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QA 1 642 1 642
DS 

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DS 

RD RR4BU73JQ 756 0 0
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CTAGTATTCAAACTCTGCTGGGATTGAGGATTTAAGATGTTTGTATGTGAAAAAAAAAA*
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QA 1 756 1 756
DS 

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AGTACTGGGCTGGCAGAGGAATGCTTCAGGTTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTTTCC
CTGACTATATGACTCAAAAGAAGGATTTCTTGCTTTTACAGAACATCGCTAGCTACATGC
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GAATGTCATGTCATCATCACAATTGTATTCAATTTACCAAAATTACTAGTATTCAAACTC
TGCTGGGATTGAGGATTTAAGATGTTTGTATGTGAAAAAAAAAAATCTAGGCTTGAGTTC
TTTAATTGCTCATTCATTGAGTTGTGGTGAACTTATATCTGTCATATTGAAGAGTGGATT
TTATAAATTTGATCACAATCCAAACGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 4

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AAGCCCATTCGAAAGTCCCATCCTTTCTTACCAAGTCAGTCCATCATCTTCCTCATTCCC
TAGCCCTTCTCGTGGTGACAACAACATCTCCACCATCTTCCCTTTCCTCAGGAACGGTGG
GATGATCCCTTCCTCTCTTCCTCCGCTCAGAATCTCAAACAGTGCTCCCGTCACTCCACC
TGTCTCATCTCCGACATCCAAACACCACCCCAAGCCGTTATTACCCGCTTGGGAGTCTTT
CACCAAACAGTCAATGGCCATTGCTGCTAAACAGTCTTTCAACTACCCGTTCTACGCGGT
CTCTGCACCGGCGAGTCCCACTCATCATCGCCAGTTCAATACTCCCCCGGCTACTATACC
TGAGTGCGACGAGTCTGATGCTTCCACTGTTGATTCTGGTCATTGGATAAGCTTTCAGAA
GTTCTCACAACAACAGCCATTCCTTGGTGGCGTCTCTGCAGTGCCGGCCTCTCCTACTTT
CAATCTAGCGAGACCGCCTGTGCCTCAGCAGTTATCTCCAAACGCTGCAGCGACACGAGA
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GAGGATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCTCACTCTTGGAAACGCTAAAGGTCA
TTAGTTGATCAAGAAGAAGGAAAAAAAAAGAAGAAGCCTTTGTGACAATGTTTGAGTGTT
AGTGTGTTGTTGAGTTATTGGGTTTTTGATTTCTTGTACCAGTGAGTTTGATTCAGAAGG
CATTATTTGTAGATAGAATGTTTCTAGTATGTTTCATTCCTTTTAGGTCTTCTTGTGAGA
CATTACAATTTTATTTTTTAAACTAGAATGTATCTCATTCAAACTTGAGATAATACCAAA
TGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DE80TF U 5
AF RR4G090TF U 1
AF RR4DE80JQ C 513
AF RR4G090JQ C 461
BS 1 400 RR4G090TF
BS 401 401 RR4DE80TF
BS 402 707 RR4G090TF
BS 708 708 RR4G090JQ
BS 709 716 RR4G090TF
BS 717 717 RR4G090JQ
BS 718 737 RR4G090TF
BS 738 748 RR4G090JQ
BS 749 749 RR4DE80JQ
BS 750 799 RR4G090JQ
BS 800 800 RR4DE80JQ
BS 801 808 RR4G090JQ
BS 809 809 RR4DE80JQ
BS 810 965 RR4G090JQ

RD RR4DE80TF 628 0 0
GGTGACGTGGC
TGGATCATCCTCACGAGCCACTCCTTACTCCTCTTCCTATAACCAAAGCCCATTCGAAAG
TCCCATCCTTTCTTACCAAGTCAGTCCATCATCTTCCTCATTCCCTAGCCCTTCTCGTGG
TGACAACAACATCTCCACCATCTTCCCTTTCCTCAGGAACGGTGGGATGATCCCTTCCTC
TCTTCCTCCGCTCAGAATCTCAAACAGTGCTCCCGTCACTCCACCTGTCTCATCTCCGAC
ATCCAAACACCACCCCAAGCCGTTATTACCCGCTTGGGAGTCTTTCACCAAACAGTCAAT
GGCCATTGCTGCTAAACAGTCTTTCAACTACCCGTTCTACGCGGTCTCTGCACCGGCGAG
TCCCATTCATCATCGCCAGTTCAATACTCCCCCGGCTACTATACCTGAGTGCGACGAGTC
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GCCATTCCTTGGTGGCGTCTCTGCAGTGCCGGCCTCTCCTACTTTCAATCTAGCGAGACC
GCCTGTGCCTCAGCAGTTATCTCCAAACGCTGCAGCGACACGAGAGATTGGTCAAAGCTC
GGAGTTTAAGTTCGAGA

QA 12 628 12 628
DS 

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AAGCCCATTCGAAAGTCCCATCCTTTCTTACCAAGTCAGTCCATCATCTTCCTCATTCCC
TAGCCCTTCTCGTGGTGACAACAACATCTCCACCATCTTCCCTTTCCTCAGGAACGGTGG
GATGATCCCTTCCTCTCTTCCTCCGCTCAGAATCTCAAACAGTGCTCCCGTCACTCCACC
TGTCTCATCTCCGACATCCAAACACCACCCCAAGCCGTTATTACCCGCTTGGGAGTCTTT
CACCAAACAGTCAATGGCCATTGCTGCTAAACAGTCTTTCAACTACCCGTTCTACGCGGT
CTCTGCACCGGCGAGTCCCACTCATCATCGCCAGTTCAATGCTCCCCCGGCTACTATACC
TGAGTGCGACGAGTCTGATGCTTCCACTGTTGATTCTGGTCATTGGATAAGCTTTCAGAA
GTTCTCACAACAACAGCCATTCCTTGGTGGCGTCTCTGCAGTGCCGGCCTCTCCTACTTT
CAATCTAGCGAGACCGCCTGTGCCTCAGCAGTTATCTCCAAACGCTGCAGCGACACGAGA
GATTGGTCAAAGCTCGGAGTTTAAGTTCGAGAACAGGCAAGTGAAGCCATGGGAAGGGGA
GAGGATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCTCACTCTTGGAA*CGCTAAAG*TCA
TTAGTTGATCAAGAAGA
GGAAA

QA 1 737 1 737
DS 

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TTTT
TGCAGTGCCGGCCTTTCCTACTTTCAATCTAGCGAGACCGCCTGTGCCTCAGCAGTTATC
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GCAAGTGAAGCCATGGGAAGGGGAGAGGATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCT
CACTCTTGGAAACGCTAAAGGTCATTAGTTGATCAAGAAGAAGGAAAAAAAAAGAAGAAG
CCTTTGTGACAATGTTTGAGTGTTAGTGTGTTGTTGAGTTATTGGGTTTTTGATTTCTTG
TACCAGTGAGTTTGATTCAGAAGGCATTATTTGTAGATAGAATGTTTCTAGTATGTTTCA
TTCCTTTT

QA 5 372 5 372
DS 

RD RR4G090JQ 505 0 0
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GTGCCGGCCTCTCCTACTTTCAATCTAGCGAGACCGCCTGTGCCTCAGCAGTTATCTCCA
AACGCTGCAGCGACACGAGAGATTGGTCAAAGCTCGGAGTTTAAGTTCGAGAACAGGCAA
GTGAAGCCATGGGAAGGGGAGAGGATCCATGATGTGGCTATGGAGGATCTTGAGCTCACT
CTTGGAAACGCTAAAGGTCATTAGTTGATCAAGAAGAAGGAAAAAAAA*GAAGAAGCCTT
TGTGACAATGTTTGAGTGTTAGTGTGTTGTTGAGTTATTTGGTTTTTGGTTTCTTGTACC
AGTGAGTTTGATTCAGAAGGCATTATTTGTAGATAGAATGTTTCTAGTATGTTTCATTCC
TTTTAGGTCTTCTTGTGAGACATTACAATTTTATTTTTTAAACTAGAATGTATCTCATTC
AAACTTGAGATAATACCAAATGATG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

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TCACAAGAACATGGAATACAAACACATACGCTCGTACAAAAGAAAACTACAAAACCCAAC
ATGATAATAGTACACTAAGTTTGCACCAGTCTCTGAACGAGATAAACCGTTGTTGCCCGC
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AGAAACCAGACTTTATAACCCGGCAAGAAATAACCACTCTTGGAACATATTTTCTTCCGG
ATACGGCTGCGACACAACTTCATGCGTTCAAGCAACGCCTCGATAAAAGCCTACAAAGAA
CACTCCAATCTCAAAAGATCTAGAGATAAACGAGGTCAAACCCGGTAACGACCACACCGA
AAACGGCAGAAGTTACGAACAGGAAAGCGTTCACACACTCATCACACACTTGAAAACACT
ACAAGCTTAGGACCAAAAATCAAAAGAGGGCTGATTAATTTCCTGATATAGAGGTCAAGA
ACCACATGACTATCTAGACTTCACTAAAAACACATAACTAAAAAACCCCTGATTCACTTG
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TTAACCACCACAAGAAATAACCACTCTTGGAACATATTTTCTTCCGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT78JQ U 1
AF RR4DA04JQ U 1
BS 1 760 RR4CT78JQ
BS 761 768 RR4DA04JQ

RD RR4CT78JQ 760 0 0
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TTAACCACCACAAGAAATAACCACTCTTGGAACATATTTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4DA04JQ 768 0 0
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CAAGATATCTCCAGAAACATAAGCCAAAAGATAGGCACCTAAAACCCACACCGGGGTGAT
TCACAAGAACATGGAATACAAACACATACGCTCGTACAAAAGAAAACTACAAAACCCAAC
ATGATAATAGTACACTAAGTTTGCACCAGTCTCTGAACGAGATAAACCGTTGTTGCCCGC
GGCACACCAAACGATAACATCAACTTCAACCAACTCCGATAGCAAACCTCTCCACCTCAA
AGAAACCAGACTTTATAACCCGGCAAGAAATAACCACTCTTGGAACATATTTTCTTCCGG
ATACGGCTGCGACACAACTTCATGCGTTCAAGCAACGCCTCGATAAAAGCCTACAAAGAA
CACTCCAATCTCAAAAGATCTAGAGATAAACGAGGTCAAACCCGGTAACGACCACACCGA
AGACGGCAGAAGTTACGAACAGGAAAGCGTTCACACACTCATCACACACTTGAAAACACT
ACAAGCTTAGGACCAAAAATCAAAAGAGGGCTGATTAATTTCCTGATATAGAGGTCAAGA
ACCACATGACTATCTAGACTTCACTAAAAACACATAACTAAAAAACCCCTGATTCACTTG
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TTAACCACCACAAGAAATAACCACTCTTGGAACATATTTTCTTCCGGA

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

CO CL2703Contig1 1349 4 8 U
GGAGGCTCGGTAGGACTTAGGTTCCTGCTGCAATGCTTTTAGAACAGAAACTGAGCATTC
GCCGGAGATAACTATCACCACCACATAGAGCTATATCAATGGCGGAACCTAGGAAGCTGA
GAGGCCACAAAGCGACCGCCACGTGTTGCACAGCTTCTCTTGAAAGGCCTGGACTTGTTG
TCACTTCCGGCGAGGATGGTTGCATTTGCTGGTTTGATTTGCGATGTAAAGATGTCCAGT
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TATGCAACGGAAGATCGTCTTTTCTTGCTTCTGCTGATGATTCTGGTGATGTCAAGATTA
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AGCTTGTTTTGTGGG*ATTTCTCAAAAGGTCGCTCACAAAAGATTATAGACTTCAGCTCT
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TCAGACAAGAATAACGATAACAGAGATCTCCTCCTCCATTTGAATATTGACCTGAACAAG
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TCACTTTGTTACTAGGCTTTATGGGGCCTCTATGAATAGACTCAAGTGGTTGCTTGATCC
ACAAGTTTGTTATTTTGTTACTTAAAACTGGTAAAAGTTTTACTCCACTATGCTGTAGTA
TGAGTATATAAGCATCACAAGACTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF39TF U 1
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AF RR4FY37JQ C 544
AF RR4AF39JQ C 517
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DS 

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GG
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CCACGTGTTGCACAGCTTCTCTTGAAAGGCCTGGACTTGTTGTCACTTCCGGCGAGGATG
GTTGCATTTGCTGGTTTGATTTGCGATGTAAAGATGTCCAGTTCACCATTGACGTTGGGA
CAGAACCAGTTCCATCTCTTTGTTTCAAGACAGGTAACGAGGACGTTCTCTATGCCTCTC
ATGGAAACGAAATCAAGTCTTTCGATGTTCATACGCTGAGTGCTGGTTCTTGGAAGCCAT
TAGAGAGTTACAGTTACAACAAAGATGAAGTTAACCAGGTAGTATGCAACGGAAGATCGT
CTTTTCTTGCTTCTGCTGATGATTCTGGTGATGTCAAGATTATCGACCTTGGTCAGAAGT
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QA 3 659 3 659
DS 

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TTGTTTTGTGGG*ATTTCTCAAAAGGTCGCTCACAAAAGATTATAGACTTCAGCTCTGAT
ACGCACAGTAGCTCAGGACAATGTTTAAACCCTGCGTTTGTTCACTCGATAGCAGTTCCG
GAAATGGACATGGTTGATAAGTTAGGCAAGATATGCGCTGTTGCTAGAGGTGATGGGATT
GTCGATTTGATCAATGTGGAATCAGAGCTTTCGAGAAGAGGAGCATCAAAAGGAAGCAGC
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CACAAGGCTGCTGTTTCTTGTGTAGCGTTTTCTCAGTTTCAGGGAAAAGGTGGATTCTTG
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AGTTTGTTATTTTGTTACTTAA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4AF39JQ 833 0 0
GAGCTGGTCATACAAGCATATGCAGTTCTGTGCAGTTCATTCCATGGAGACCTTGGGAAG
TTATTACCGGTGGACTTGATTCAAAGCTTGTTTTGTGGG*ATTTCTCAAAAGGTCGCTCA
CAAAAGATTATAGACTTCAGCTCTGATACGCACAGTAGCTCAGGACAATGTTTAAACCCT
GCGTTTGTTCACTCGATAGCAGTTCCGGAAATGGACATGGTTGATAAGTTAGGCAAGATA
TGCGCTGTTGCTAGAGGTGATGGGATTGCCGATTTGATCAATGTGGAATCAGAGCTTTCG
AGAAAAGGAGCATCAAAAGGAAGCAGCAGC***AGTAGTAACAACAATCTGGTCAAAAGG
GTTTGTTTAGATTACTCTGTTGGTGGACACAAGGCTGCTGTTTCTTGTGTAGCGTTTTCT
CAGTTTCAGGGAAAAGGTGGATTCTTGATCTCAGGTGGTAATGATAAGACAGTTAAAATC
TGGGATTGCGTTAGATGTCTTGATTCAGACAAGAATAACGATAACAGAGATCTCCTCCTC
CATTTGAATATTGACCTGAACAAGAAGGTGAATTGGCTATGCACGAATCAGTCTGATTCT
GAGAATCTTGTGGTCTGTGATACAACAAGAGTAGTCAAGGTTTACTCAATCTCTTGAGTC
TTTGACTTTATTGGCTCTCACTGTTCACTTTGTTACTAGGCTTTATGGGGCCTCTATGAA
TAGACTCAAGTGGTTGCTTGATCCACAAGTTTGTTATTTTGTTACTTAAAACTGGTAAAA
GTTTTACTCCACTATGCTGTAGTATGAGTATATAAGCATCACAAGACTTCTTC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 3

CO CL2704Contig1 831 3 2 U
ACAAACGCAACTTTGCTATTACTGTTAAAGTCCAATTATCCCCAGATTGATTGTCCCTGG
GTGTTTATTGAGCTTCTCTTCTTGGAAAATTAAATTGCACACAATTACAAAATATAACAA
CATGACAATTTCATATACCTACGGAAGGCTGAACCTCCTTCGTTTCTTGCTTCTTGTCTC
TCCATCATCAACTCTTGTCTAGATTCTTCTCCTTGTTGAGTTTTATCTACATCATCCTTT
ATTTCCTCCTCAACCCCATCATTTTCATCATCGCCAACTTCGTCCTCTTCACCCTCATCA
CGTCCAGATTCTTCTTTCTCCTCCAAAAGTTGTACACCACAAGCTTTCACCTTCCATTTC
TTATAAAAGAGTTTGAACTCAAACACAAGCTCGCTGAAAGTGGCGTCTTCGGCTTCAGAG
GAATCCTGGTCTAGATAAAAAGAATCTTCAAATGTATACAGATGGTCGTCACATCCATAT
AGATAAGACATGCCGCGCTTGTCTGATCCATATTGGAGTGAGGCCATTCTGGTTACCCCC
AAACCTACAAGACACACACATCAATAAATTCTCTTCATCTTCACCAAAGGGATCACTGAA
GCGCCAAGAAACACCCTCTCCATCATCCTCGAGATTAATATTGTCTCTTGACAGCAAGAT
GCAAGCTTTGAATGTAAGGGATGGAGGAAGAGGTTGTGGAGTCTGATTGATCGTTAGGGA
ATCTGAAGTAGCTCGGTAAGTGAAGTTTGCAGGCACTTCTATACCGGGTACAAGCGTAGA
TTCATCACTTTCAACTTCGTCACCATCATCATCATCATCATCATCACTTTC


BQ
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AF RR4BV05JQ U 1
AF RR4CL84JQ U 1
AF RR4CL84TF C 174
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BS 724 831 RR4CL84TF

RD RR4BV05JQ 723 0 0
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TCCATCATCAACTCTTGTCTAGATTCTTCTCCTTGTTGAGTTTTATCTACATCATCCTTT
ATTTCCTCCTCAACCCCATCATTTTCATCATCGCCAACTTCGTCCTCTTCACCCTCATCA
CGTCCAGATTCTTCTTTCTCCTCCAAAAGTTGTACACCACAAGCTTTCACCTTCCATTTC
TTATAAAAGAGTTTGAACTCAAACACAAGCTCGCTGAAAGTGGCGTCTTCGGCTTCAGAG
GAATCCTGGTCTAGATAAAAAGAATCTTCAAATGTATACAGATGGTCGTCACATCCATAT
AGATAAGACATGCCGCGCTTGTCTGATCCATATTGGAGTGAGGCCATTCTGGTTACCCCC
AAACCTACAAGACACACACATCAATAAATTCTCTTCATCTTCACCAAAGGGATCACTGAA
GCGCCAAGAAACACCCTCTCCATCATCCTCGAGATTAATATTGTCTCTTGACAGCAAGAT
GCAAGCTTTGAATGTAAGGGATGGAGGAAGAGGTTGTGGAGTCTGATTGATCGTTAGGGA
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CL84JQ 723 0 0
ACAAACGCAACTTTGCTATTACTGTTAAAGTCCAATTATCCCCAGATTGATTGTCCCTGG
GTGTTTATTGAGCTTCTCTTCTTGGAAAATTAAATTGCACACAATTACAAAATATAACAA
CATGACAATTTCATATACCTACGGAAGGCTGAACCTCCTTCGTTTCTTGCTTCTTGTCTC
TCCATCATCAACTCTTGTCTAGATTCTTCTCCTTGTTGAGTTTTATCTACATCATCCTTT
ATTTCCTCCTCAACCCCATCATTTTCATCATCGCCAACTTCGTCCTCTTCACCCTCATCA
CGTCCAGATTCTTCTTTCTCCTCCAAAAGTTGTACACCACAAGCTTTCACCTTCCATTTC
TTATAAAAGAGTTTGAACTCAAACACAAGCTCGCTGAAAGTGGCGTCTTCGGCTTCAGAG
GAATCCTGGTCTAGATAAAAAGAATCTTCAAATGTATACAGATGGTCGTCACATCCATAT
AGATAAAACATGCCGCGCTTGTCTGATCCATATTGGAGTGAGGCCATTCTGGTTACCCCC
AAACCTACAAGACACACACATCAATAAATTCTCTTCATCTTCACCAAAGGGATCACTGAA
GCGCCAAGAAACACCCTCTCCATCATCCTCGAGATTAATATTGTCTCTTGACAGCAAGAT
GCAAGCTTTGAATGTAAGGGATGGAGGAAGAGGTTGTGGAGTCTGATTGATCGTTAGGGA
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CL84TF 658 0 0
TTGTCTCTCCATCATCAACTCTTGTCTAGATTCTTCTCCTTGTTGAGTTTTATCTACATC
ATCCTTTATTTCCTCCTCAACCCCATCATTTTCATCATCGCCAACTTCGTCCTCTTCACC
CTCATCACGTCCAGATTCTTCTTTCTCCTCCAAAAGTTGTACACCACAAGCTTTCACCTT
CCATTTCTTATAAAAGAGTTTGAACTCAAACACAAGCTCGCTGAAAGTGGCGTCTTCGGC
TTCAGAGGAATCCTGGTCTAGATAAAAAGAATCTTCAAATGTATACAGATGGTCGTCACA
TCCATATAGATAAGACATGCCGCGCTTGTCTGATCCATATTGGAGTGAGGCCATTCTGGT
TACCCCCAAACCTACAAGACACACACATCAATAAATTCTCTTCATCTTCACCAAAGGGAT
CACTGAAGCGCCAAGAAACACCCTCTCCATCATCCTCGAGATTAATATTGTCTCTTGACA
GCAAGATGCAAGCTTTGAATGTAAGGGATGGAGGAAGAGGTTGTGGAGTCTGATTGATCG
TTAGGGAATCTGAAGTAGCTCGGTAAGTGAAGTTTGCAGGCACTTCTATACCGGGTACAA
GCGTAGATTCATCACTTTCAACTTCGTCACCATCATCATCATCATCATCATCACTTTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 4

CO CL2705Contig1 1806 4 4 U
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AAAATCAAACCTCTTGTCAAGATTTTCCAAAGACGAGTTCCGGTTAGACTCTAAACCAAC
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CAACAACAAATCCAACGGCGTTGCGACGACTGATCATGTTAACGGTAACGGTACGGTTGT
TCCAGTTGGTAAAGAGATTGTCAATATACATGAGGTTACCGCAACTCAACCAGTAAGCTC
TTTTTCCAAATGTTGTTTCCAGTAAATAATTAAATGTAATTTTGGTTTTTTACTGTTTTA
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TTTACATGCAATCTTTTCTTACACAATCTCATCTAGAGAGTGCTGTAATAATAGAAACTC
AGAATTTATTTATTTTTAAATCACCAATTAGAGTAATCTTGCACCTGATACTCTCTTGGA
GGGCTCCTTTAGCTTTTAAATAGCAGCTTCTTCAGGTAGATTCCTACTGTAAAAAGGAAG
CTCGAAGAGAAAGACTCTCTTGCACCATCCTGGTAAGTTCCCATACACTCCTCTCGGCAA
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TTTGTCAGCCGATGCCTCTAGTAAAGGTATGCCGCTGACGAAAAGAAGTAGCAAAGTGAG
AAAGACTGGTCCGAACACAACAAGATACTCAGCACCTTCTAGAACAGGCGATGCAGCCAC
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TTGATCAGCCGCAGCTTCAATCAAGAAACCGAAAACCCACATCGTCCAGCCGATAACATC
TGCGGGTTTAAGAGATCCTCCTCCACCATCATCACTTGAGTTAACGACGGTTAGAGGTAA
GCTCACGGTCCACACCCACACGGCCTGAAAAGTCCAGAAAACTATTAGTTTCACCAGATT
TTGACGCATTTCATCAAAGCGTCGATCTTCACCCCATTGCAGGATCCTCATTAGAAGAAA
TGTTCCCAAGCGAAGACCCCATACCACAACCAGCAAAGTCAAGACTATCTGGCGAAAATG
CCACGTGGATTTAAGAACAAGAGTCAGTAGAGCAAGTATAACGAAGTTTGTGCTTCCTGC
AAAGTCAGTGACTTGATCGATTTTGAAAAGAGCTGTGATTACAAAGAATATGAACTGGTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4H947TF U 1
AF RR4H947JQB C 76
AF RR4DH19JQ U 761
AF RR4DH19TF C 1040
BS 1 436 RR4H947TF
BS 437 760 RR4H947JQB
BS 761 1477 RR4DH19JQ
BS 1478 1806 RR4DH19TF

RD RR4H947TF 436 0 0
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AAAATCAAACCTCTTGTCAAGATTTTCCAAAGACGAGTTCCGGTTAGACTCTAAACCAAC
CATCGGAGTTGAGTTCGCATACAGGAACGTTCACGTCGGGGATAAGATCATCAAAGCTCA
GATTTGGGACACCGCAGGTCAAGAAAGATTTAGAGCAATTACGAGTTCATACTACCGTGG
AGCATTAGGGGCATTGCTGATATACGACATCACAAGAAGAACAACTTTCGTCAACACCAA
GAAATGGCTTTTCGAGCTCCGAGAGTTCGCCAATCCCGACACCGTCGTGGTCCTCGTCGG
CAACAAATCCGACCTCCGGCACTCTAGAGAAGTCGAAGAAGAGGAAGGTAAGAGTCTAGC
TGAGTCAGAAGGTCTT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4H947JQB 776 0 0
TGTCAAGA
TTTCCAAAGACGAGTTCCGGTTAGACTCTAAACCAACCATCGGAGTTGAGTTCGCATACA
GGAACGTTCACGTCGGGGATAAGATCATCAAAGCTCAGATTTGGGACACCGCAGGTCAAG
AAAGATTTAGAGCAATTACGAGTTCATACTACCGTGGAGCATTAGGGGCATTGCTGATAT
ACGACATCACAAGAAGAACAACTTTCGTCAACACCAAGAAATGGCTTTTCGAGCTCCGAG
AGTTCGCCAATCCCGACACCGTCGTGGTCCTCGTCGGCAACAAATCCGATCTCCGGCACT
CTAGAGAAGTCGAAGAAGAGGAAGGTAAGAGTCTAGCTGAGTCAGAAGGTCTTTGCTTCC
TCGAGACTTCGGCTTTAGAAAACGTCAACGTTGAAGAAGCTTTCCTCGTGATGATCAAAC
GTATACATGAGGTTGTAACTCAGAGGAACGCTTCGGACAACAACAAATCCAACGGCGTTG
CGACGACTGATCATGTTAACGGTAACGGTACGGTTGTTCCAGTTGGTAAAGAGATTGTCA
ATATACATGAGGTTACCGCAACTCAACCAGTAAGCTCTTTTTCCAAATGTTGTTTCCAGT
AAATAATTAAATGTAATTTTGGTTTTTTACTGTTTTAACTTGTGAACCGGTTCGGTCAAT
GATGTTTTCATTTGTTTGCTTTGGATGCTTTTTATTTTTTACATGCAATCTTTTCTTACA
CAATCTCATCTAGAGAGTGCTGTAATAATAGAAACTCAGAATTTATTT

QA 9 776 9 776
DS 

RD RR4DH19JQ 717 0 0
GCTTTGGATGCTTTTTATTTTTTACATGCAATCTTTTCTTACACAATCTCATCTAGAGAG
TGCTGTAATAATAGAAACTCAGAATTTATTTATTTTTAAATCACCAATTAGAGTAATCTT
GCACCTGATACTCTCTTGGAGGGCTCCTTTAGCTTTTAAATAGCAGCTTCTTCAGGTAGA
TTCCTACTGTAAAAAGGAAGCTCGAAGAGAAAGACTCTCTTGCACCATCCTGGTAAGTTC
CCATACACTCCTCTCGGCAAAAGAATCAGAGGACTTGTTCTCTTCTTATAGAATCGGTAA
GCTCCCAAGTGGCCATGCTTTTTGTCAGCCGATGCCTCTAGTAAAGGTATGCCGCTGACG
AAAAGAAGTAGCAAAGTGAGAAAGACTGGTCCGAACACAACAAGATACTCAGCACCTTCT
AGAACAGGCGATGCAGCCACAAAGATTCCCCACCACAGTAACATCTCACCAAAGTAGTTT
GGATGTCTTGAATACTTCCAAAGACCAGCATCACACCATTTTCCTCTGTTCTCTGGAGCG
TTTTTAAAAGAGAGCTTCTGTTGATCAGCCGCAGCTTCAATCAAGAAACCGAAAACCCAC
ATCGTCCAGCCGATAACATCTGCGGGTTTAAGAGATCCTCCTCCACCATCATCACTTGAG
TTAACGACGGTTAGAGGTAAGCTCACGGTCCACACCCACACGGCCTGAAAAGTCCAG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4DH19TF 767 0 0
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AGTAAAGGTATGCCGCTGACGAAAAGAAGTAGCAAAGTGAGAAAGACTGGTCCGAACACA
ACAAGATACTCAGCACCTTCTAGAACAGGCGATGCAGCCACAAAGATTCCCCACCACAGT
AACATCTCACCAAAGTAGTTTGGATGTCTTGAATACTTCCAAAGACCAGCATCACACCAT
TTTCCTCTGTTCTCTGGAGCGTTTTTAAAAGAGAGCTTCTGTTGATCAGCCGCAGCTTCA
ATCAAGAAACCGAAAACCCACATCGTCCAGCCGATAACATCTGCGGGTTTAAGAGATCCT
CCTCCACCATCATCACTTGAGTTAACGACGGTTAGAGGTAAGCTCACGGTCCACACCCAC
ACGGCCTGAAAAGTCCAGAAAACTATTAGTTTCACCAGATTTTGACGCATTTCATCAAAG
CGTCGATCTTCACCCCATTGCAGGATCCTCATTAGAAGAAATGTTCCCAAGCGAAGACCC
CATACCACAACCAGCAAAGTCAAGACTATCTGGCGAAAATGCCACGTGGATTTAAGAACA
AGAGTCAGTAGAGCAAGTATAACGAAGTTTGTGCTTCCTGCAAAGTCAGTGACTTGATCG
ATTTTGAAAAGAGCTGTGATTACAAAGAATATGAACTGGTAAACCACAGTGACAATGGCA
GTAAGAGACAGGAAATGCGAATCAAGAACCGTTCCCATTCTATCCCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 4

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AAAGGAGGATGCCTCTGAGTGCGACGATGGTGGGAGCTTTGCTGGGTCTCGGTACCCAGA
TGTACTCCAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGG
GTATGGGACTTGGTGCCGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTTAAGCTGAAGG
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AAGATCGGGATTAGTTATTGGGTGATCTTTAAAAGCTCCAGTAAAGAAGTATCTTCCGCT
GGATTCATCTCAAGTGCTCGTTCTTCCCTGTAAAAGCTTTGCATCTCCTTCTTTTTCTTT
GCTTAGAGCTTGCTCTCTTTTGCTTTGACACTGGAGTTCTTTTGACTCAGTTGTGGTTTT
CACAATCCAAATCACATGAATCTATGTGTACCTGGTTAATAATTTTGAATCAAACCTTTC
AATGCTTGAGTCTTAAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GC74JQ C 5
AF RR4GC74TF U 5
AF RR4GY14JQ C 1
AF RR4GY14TF U 1
BS 1 6 RR4GY14JQ
BS 7 196 RR4GC74TF
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BS 237 410 RR4GC74TF
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GG
AAAGAAAAAAATCACAAATTCAACAAATTTCAGAAGATCGAAAAAAAGAAGAAGAAAGGA
GGATGCCTCTGAGTGCGACGATGGTGGGAGCTTTGCTGGGTCTCGGTACCCAGATGTACT
CCAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGG
GACTTGGTGCTGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTTAAGCTTAAGGAAGATC
TCGAGGTCATGCTCGATAAGGCCAGAGCTGCCAATGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATC
GGGATTAGTTATTGGGTGATCTTTAAAAGCTCCAGTAAAGAAGTATCTTCCGCTGGATTC
ATCTCAAGTGCTCGTTCTTCCCTGTAAAAGCTTTGCATCTCCTTTTTTTTCTTTGCTTAG
AGCTTGCTCTCTTTTGCTTTGGCACTGGAGTTCTTTTGACTCAGTTGTGGTTTTCACAAT
CCAAATCACATGAATCTATGTGTACCTGGTTAATAATTTTGAATCAAACCTT
GC

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DS 

RD RR4GC74TF 536 0 0
GG
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GGATGCCTCTGAGTGCGACGATGGTGGGAGCTTTGCTGGGTCTCGGTACCCAGATGTACT
CCAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGG
GACTTGGTGCTGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTTAAGCTTAAGGAAGATC
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GGGATTAGTTATTGGGTGATCTTTAAAAGCTCCAGTAAAGAAGTATCTTCCGCTGGATTC
ATCTCAAGTGCTCGTTCTTCCCTGTAAAAGCTTTGCATCTCCTTTTTTTTCTTTGCTTAG
AGCTTGCTCTCTTTTGCTTTGGCACTGGAGTTCTTTTGACTCAGTTGTGGTTTTCACAAT
CCAAATCACATGAATCTATGTGTACCTGGTTAATAATTTTGAATCAAACCTT
GC

QA 3 534 3 534
DS 

RD RR4GY14JQ 560 0 0
GGGACTAAAGAAAAAAATCACAAATTCAACAAATTTCAGAAGATCGAAAAAA*GAAGAAG
AAAGGAGGATGCCTCTGAGT*CGACGATGGTGGGAGCTTTGCTGGGTCTCGGTACCCAGA
TGTACTCCAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGG
GTATGGGACTTGGTGCCGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTTAAGCTGAAGG
AAGATCTCGAGGTCATGCTCGATAAGGCCAGAGCTGCCAATGAGCGCCGTTACTTTGATG
AAGATCGGGATTAGTTATTGGGTGATCTTTAAAAGCTCCAGTAAAGAAGTATCTTCCGCT
GGATTCATCTCAAGTGCTCGTTCTTCCCTGTAAAAGCTTTGCATCTCCTTCTTTTTCTTT
GCTTATAGCTTGCTCTCTTTTGCTTTGACACTGGAGTTCTTTTGACTCAGTTGTGGTTTT
CACAATCCAAATCACATGAATCTATGTGTACCTGGTTAATAATTTTGAATCAAACCTTTC
AATGCTTGAGTCTTAAAGTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4GY14TF 560 0 0
GGGACT
AAAGAAAAAAATCACAAATTCAACAAATTTCAGAAGATCGAAAAAA*GAAGAAGAAAGGA
GGATGCCTCTGAGT*CGACGATGGTGGGAGCTTTGCTGGGTCTCGGTACCCAGATGTACT
CCAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGG
GACTTGGTGCCGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTTAAGCTGAAGGAAGATC
TCGAGGTCATGCTCGATAAGGCCAGAGCTGCCAATGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATC
GGGATTAGTTATTGGGTGATCTTTAAAAGCTCCAGTAAAGAAGTATCTTCCGCTGGATTC
ATCTCAAGTGCTCGTTCTTCCCTGTAAAAGCTTTGCATCTCCTTCTTTTTCTTTGCTTAT
AGCTTGCTCTCTTTTGCTTTGACACTGGAGTTCTTTTGACTCAGTTGTGGTTTTCACAAT
CCAAATCACATGAATCTATGTGTACCTGGTTAATAATTTTGAATCAAACCTTTCAATGCT
TGAGTCTTAAAGTT

QA 7 560 7 560
DS 



AS 1 4

CO CL2707Contig1 957 4 5 U
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ATTCCAAATCTTTCAGAGGATGAAAGTATGAGAGATCTTTTGTTTTTGGTGTAATATACT
TCGATCCTAGGATCGATTATCTATCTTCGTTTGGCGAATTTCGTTTTCGTTTAGACGATT
TTGATGTGCTCTTCAAACCAAATTCGATTTGTTCTTCATGTATTGTCATCTGTTTCGATT
TGGTTTGAACTAATAAAATTCCGATCTTGTTTAGATGCTTAATAGATCGGATCTTCTCAT
CTTCTCCTCTTTCGCTTGGTTCTTTCATATCCTGTTTGTTTTGAATAAGGATCTCTAGTT
TCATTGGTTATGCTTTGTCTTTTTTTCCGCTGGAATCAGTCTTTACTTATCCTTTATATG
GAGCATATAGTAGCTCTAGAGTAAAGCATCTAAGGTGGAAAAGAAGATTGAGATGATAGA
ATTATCTCGGGTGTTTTAAGAGAGATACAGCAGAATTGGCATCATTGTGATGGTCCAATA
AAGTGTCTCTTCAGAAATCAACTTGAGCTTTCTCTGGATCTATTCACTGATGGCGTTAGA
GTCTCTATTCAAAACAACAGTCGTTGGCGGAAGCTGGGAGTCAAGGTGTACAGTTTCCTT
TCAGATTGAGGTGACGAGCATATGCGAGAAACGATTTGGTGGAAAGATGGCGGCGAAGAT
CGGAGGTGAAGCATTCCGGCGACGGAGCAACTAGCTTCCTGCATGAAGAACGTGTGTCTA
TACACGTGTCTCTCTGGTGTCTATTTGCCGCTTGAATGGAAGAAATAAGAAGACAAAACT
GAGTCGATGAATCTCGTTTTTAATTAATCTGTAAACCTAAAGTTGTAGTTGGGCCTCTCT
GAAAATTCTGTACCCTTTCATATAGCCCATTGGGCTCTTAATGAAATTGAAGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG43TF U 1
AF RR4FF95TF U 126
AF RR4FF95JQ C 583
AF RR4CG43JQ C 213
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TTGATGTGCTCTTCAAACCAAATTCGATTTGTTCTTCATGTATTGTCATCTGTTTCGATT
TGGTTTGAACTAATAAAATTCCGATCTTGTTTAGATGCTT

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DS 

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G
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TGCTCTTCAAACCAAATTCGATTTGTTCTTCATGTATTGTCATCTGTTTCGATTTGGTTT
GAACTAATAAAATTCCGATCTTGTTTAGATGCTTAATAGATCGGATCTTCTCATCTTCTC
CTCTTTCGCTTGGTTCTTTCATATCCTGTTTGTTTTGAATAAGGATCTCTAGTTTCATTG
GTTATGCTTTGTCTTTTTTTCCGCTGGAATCAGTCTTTACTTATCCTTTATATGGAGCAT
ATAGTAGCTCTAGAGTAAAGCATCTAAGGTGGAAAAGAAGATTGAGATGATAGAATTATC
TCGGGTGTTTTAAGAGAGATACAGTAGAATTGGCATCATTGTGATGGTCCAATAAAGTGT
CTCTTCAGAAATCAACTTGAGCTTTCTCTGGATCTATTCACTGATGGCGTTAGAGTCTCT
ATTCAAAACAACAGTCGTTGGCGGAAGCTGGGAGTCAAGGTGTACAGTTTCCTTTCAGAT
TGAGGTGACGAGCATATGCGAGAAACGATTTGGTGGAAAGATGGCGGCGAAGATCGGAGG
TGAAGCATTCCGGCGACGGAGCAACTAGCTTCCTGCATGAAGAACGTGTGTCTATACACG
TGTCTCTCTGGTGTCTATTTGCCGCTTGAATGGAAGAAATAAGAAGACAAAACTGAGTCG
A

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DS 

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AAGGTGTACAGTTTCCTTTCAGATTGAGGTGACGAGCATATGCGAGAAACGATTTGGTGG
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ATGAAGAACGTGTGTCTATACACGTGTCTTTCTGGTGTCTATTTGCCGCTTGAATGGAAG
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TTGTAGTTGGGCC

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DS 

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GTC
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TTGTTTTGAATAAGGATCTCTAGTTTCATTGGTTATGCTTTGTCTTTTTTTCCGCTGGAA
TCAGTCTTTACTTATCCTTTATATGGAGCATATAGTAGCTCTAGAGTAAAGCATCTAAGG
TGGAAAAGAAGATTGAGATGATAGAATTATCTCGGGTGTTTTAAGAGAGATACAGCAGAA
TTGGCATCATTGTGATGGTCCAATAAAGTGTCTCTTCAGAAATCAACTTGAGCTTTCTCT
GGATCTATTCACTGATGGCGTTAGAGTCTCTATTCAAAACAACAGTCGTTGGCGGAAGCT
GGGAGTCAAGGTGTACAGTTTCCTTTCAGATTGAGGTGACGAGCATATGCGAGAAACGAT
TTGGTGGAAAGATGGCGGCGAAGATCGGAGGTGAAGCATTCCGGCGACGGAGCAACTAGC
TTCCTGCATGAAGAACGTGTGTCTATACACGTGTCTCTCTGGTGTCTATTTGCCGCTTGA
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TCTTAATGAAATTGAAGTTGGC

QA 4 745 4 745
DS 



AS 1 4

CO CL2708Contig1 1115 4 13 U
GGAAAGCCCAGTCGTATCATCCATTATCTTTTCTAAAAAAACAAAATGGCGATTGCTTTC
AAATCCAGCGTCTGCTTCCTCCACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCCACTCTTCT
CACGACTCCTCCCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCACCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCT
CCCACCCTCGGTCTCGCCGATACGTTCACCCAGCTCAAAAAAACAAGGCAAAGTAGCATT
CATACCATACATCACAGCTGGTGACCCAGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCATTGAAAGT
CCTTGACGCTTGCGGTTCCGACATTATCGAACTCGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGC
TGATGGACCTGTTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCAACCTTGA
TAACATACATGACATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTT
TACTTATTACAACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGA
TGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCTCTTGAAGAAACTGAGTTGCTGAG
AGAAGGAGCACTTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAAC
AGAGAGGATGAAGCGGATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAAT
AGGAGTGACCGGTGCACGTTCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGAAGGATAT
CAAAGAGGCAACAGACAAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGT
GAAACAGATAGCTGGATGGGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCT
TTTGGGAGATGCCAAGTCACCAACTGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCACAAAGTC
TCTCAAATCTGCTCTTCTTTGAAAACACAAAGAAAAAAATAACATTTGCAGACCGCTTCA
TTGATTGTGTTTTATTTTACTTCAGTAATGTATGAAAATGATGTTCCAAACTGTTGAGAC
ATTTCAAGTATAATGATAATTAAAAACTTTCGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 0 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CX51TF U 40
AF RR4EK20TF U 1
AF RR4CX51JQ C 373
AF RR4EK20JQ C 472
BS 1 121 RR4EK20TF
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BS 606 606 RR4CX51JQ
BS 607 671 RR4EK20TF
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BS 691 1115 RR4CX51JQ

RD RR4CX51TF 287 0 0
GGG
AAAATGGCGATTGCTTTCAAATCCGGCGTCTGCTTCCTCCACTCCCCAAAACCCCAAATC
GGAATCCGCCACTCTTCTCACGACTCCTCCCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCACCGCC
GCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCCTCGGTCTCGCCGATACGTTCACCCAGCTCAAAAAA
ACAGGGCAAAGTAGCATTCATACCGTACATCACAGCTGGTGACCCAGATCTCTCTACTAC
TGCTGAAGCATTGAAAGTCCTTGACGCTTGCGGTTCCGACATTA

QA 4 287 4 287
DS 

RD RR4EK20TF 690 0 0
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AAATCCAGCGTCTGCTTCCTCCACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCCACTCTTCT
CCCGACTCCTCCCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCACCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCT
CCCACCCTCGGTCTCGCCGATACGTTCACCCAGCTCAAAAAA*CAAGGCAAAGTAGCATT
CATACCATACATCACAGCTGGTGACCCAGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCATTGAAAGT
TCTTGACGCTTGCGGTTCCGACATTATCGAACTCGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGC
TGATGGACCTGTTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCAACCTTGA
TAACATACATGACATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTT
TACTTATTACAACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGA
TGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCTCTTGAAGAAACTGAGTTGCTGAG
AGAAG*AGCACTTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAAC
AGAGAGGATGAG*CGGATTGTTGAAGCATC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4CX51JQ 743 0 0
TATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTT*GGAGAAAGGAACCAACCTTGATAACATACTTGA
CATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTTTACTTATTACAA
CCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAGGAGATGTTGGTGTACA
GGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCTCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACT
TAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAA
TCGAATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAGGAGTGACCGG
TGCACGTTCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGAAGGATATCAAAGAGGCAAC
AGACAAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGAAACAGATAGC
TGGATGGGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCTTTTGGGAGATGC
CAAGTCACCAACTGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCACAAAGTCTCTCAAATCTGC
TCTTCTTTGAAAACACAAAGAAAAAAATAACATTTGCAGACCGCTTCATTGATTGTGTTT
TATTTTACTTCAGTAATGTATGAAAATGATGTTCCAAACTGTTGAGACATTTCAAGTATA
ATGATAATTAAAAACTTTCGGTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4EK20JQ 630 0 0
TTCGCTGTTTACTTATTACAACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAG
TATAAGAGATGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCTCTTGAAGAAACTGA
GTTGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAAC
CACACCAACAGAGAGGATGAAGCGGATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGT
GAGCTCAATAGGAGTGACCGGTGCACGTTCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTT
GAAGGATATCAAAGAGGCAACAGACAAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCC
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TGTTGAGACATTTCAAGTATAATGATAATT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 3

CO CL2709Contig1 956 3 2 U
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TATCATACATGTATAGGTTAGTAGTACAACCAAAAGATCAGCCTCTTCTCTGGTTTTGTT
TTTGGGATTTGAAGTACTTCAGAAGATTATGTGCCTTCTCTTTAGCTCTAGCTGTTCCTG
ATTTAGTAAGAGCCACAAGAGGTGGAATAGCTCCTTCTCTAATAATACTGTTACAGAACC
TCTGACTATGCATAGCAAGCTGCAAAAGCGCAGCGGTCGCATTCTCTTTCCCTCTCGCCG
AACCTAACTCCACCACTTCCACCAGCACCGGTATACCTCCTTCCTCTCCGATCGCAACCT
TCCCTTCTCTAACCGTCGCGAGATTCGCCAGCACGACCACAGCTTTCTCCACCATCCCAG
CCGCGGGATCCATCAGCTCGACCAAGTACTTAACCGCGCCAGCTTCGATCACTTTCGCCT
TGTTCTCGTGGTGTATCGAGAGGTTAAACAGAGCCGTTGCCGCGTCTTTCTTCCCTCTCA
AACTCCCGTGTCCCAAGAGATCAACAAGCGGCTCTATCGCTCCCGCTTCACCTACTTGGT
CTTGTTCTCTTCTATCACTGATAAGCTGAAGAGCGTCGCTGCCGAGTTCTCTTTGGCTTC
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TGACTTGTTGTTGTCGTTGATGGATAGGTTCAGCAAGCAAGTCACTGCGTCAGCTTGGAT
CCTCTCGTCCGTGGAGTAGAGAAGATCGACTAACGAGTCGATCGCACCGCACCTGGCGAT
GACGATGCGGTTGTCTGTGCTGTTTCTCGACAGTATCCTGACTCTAGCTGTTGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A815JQ U 1
AF RR4AH76JQ U 1
AF RR4A815TF C 180
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BS 860 956 RR4A815TF

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QA 1 859 1 859
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TATCATACATGTATAGGTTAGTAGTACAACCAAAAGATCAGCCTCTTCTCTGGTTTTGTT
TTTGGGATTTGAAGTACTTCAGAAGATTATGTGCCTTCTCTTTAGCTCTAGCTGTTCCTG
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TCTGACTATGCATAGCAAGCTGCAAAAGCGCAGCGGTCGCATTCTCTTTCCCTCTCGCCG
AACCTAACTCCACCACTTCCACCAGCACCGGTATACCTCCTTCCTCTCCGATCGCAACCT
TCCCTTCTCTAACCGTCGCGAGATTCGCCAGCACGACCACAGCTTTCTCCACCATCCCAG
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TGTTCTCGTGGTGTATCGAGAGGTTAAACAGAGCCGTTGCCGCGTCTTTCTTCCCTCTCA
AACTCCCGTGTCCCAAGAGATCAACAAGCGGCTCTATCGCTCCCGCTTCACCTACTTGGT
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TGACTTGTTGTTGTCGTTGATGGATAGGTTCAGCAAGCAAGTCACTGCGTCAGCTTGGAT
CCTCTCGTCCGTGGAGTAG
AGA

QA 1 859 1 859
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DS 



AS 1 4

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BY21TF U 1
AF RR4FW47TF U 23
AF RR4BY21JQ C 149
AF RR4FW47JQ C 174
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BS 654 661 RR4FW47TF
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BS 663 682 RR4FW47TF
BS 683 683 RR4BY21JQ
BS 684 730 RR4FW47TF
BS 731 731 RR4BY21JQ
BS 732 744 RR4FW47TF
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BS 769 775 RR4FW47JQ
BS 776 929 RR4BY21JQ

RD RR4BY21TF 657 0 0
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CTCGTCCGAGAAAAGCTCAGCTAAGAGGATCGTGATTCCGAACAGACACAACGAGAAGCT
CGTGGGCCTGCTTCACGAAACTGGGTCAAGAGAAGTTGTGATCATGTGCCATGGGTTTCA
ATCCAACAAGGATAACCAAACGATGAACAATGTGGCTGCTACTCTAGAGAAAGAAGGCAT
CACTGCTTTCCGTTTTGATTTCTCTGGGAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTTTCTATTATGG
TAACTATGACCATGAAGCTGATGATCTACGTTCTGTTGTCCAACACTTCTGTAACATGGA
TCGTGTGGTTCCTATTGTTCTCGGCCACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTATTCTATGC
CTCCAAGTATCACGATATCAGCAATGTAATCAATCTCTCTGGACGCTATGATCTGAAGAA
AGGCATTGCAGAGCGTCTTGGGGAAGATTATTTGGAAAGAATTAAGCAACAAGGGTTCAT
CGATGTTGAAGATGGTGGAAAGTCAGGGTACCGTGTTACTGAGGAGAGCTTAATGGAGAG
GTTGAACACTGATATGCATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAATAATGCAGG
GTTTT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4FW47TF 737 0 0
G
GAAGACTCAAATCTCACTGCAAGAATTTGAGAATGGACTCGTCTGAGAAAAGCTCAGCTA
AGAGGATCGTGATTCCGAACAGACACAACGAGAAGCTCGTGGGCCTGCTTCACGAAACTG
GGTCAAGAGAAGTTGTGATCTTGTGCCGTGGGTTTCAATCCAACAAGGATAACCAAACGA
TGAACAATGTGGCTGCTACTCTAGAGAAGGAAGGCATCACTGCTTTCCGTTTTGATTTCT
CTGGGAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTTTCTATTATGGTAACTATGACCATGAAGCTGATG
ATCTACGTTCTGTTGTCCAACACTTCTGTAACATGGATCGTGTGGTTCCTATTGTTCTCG
GCCACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTATTCTATGCCTCCAAGTATCACGATATCAGCA
ATGTAATCAATCTCTCTGGACGCTATGATCTGAAGAAAGGCATTGCAGAGCGTCTTGGGG
AAGATTATTTGGAAAGAATTAAGCAACAAGGGTTCATCGATGTTGAAGATGGTGGAAAGT
CAGGGTACCGTGTTACTGAGGAGAGCTTAATGGAGAGGTTGAACACTGATATGCATGAAG
CTTGCCTCAAGATTGACAAAGAATGCAGG*TTTTGACG*TTCATGGATCGGATGATGAG*
TAATACCCGTGGAAGATGCCAAGGAGTTTGCCAAGATCATACCGAAC*ACAAGCTGGAGA
T*GTGGAGGGAGCTGA

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR4BY21JQ 781 0 0
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AATGTGGCTGCTACTCTAGAGAAAGAAGGCATCACTGCTTTCCGTTTTGATTTCTCTGGG
AATGGAGAGAGTGAAGGCAGTTTCTATTATGGTAACTATGACCATGAAGCTGATGATCTA
CGTTCTGTTGTCCAACACTTCTGTAACATGGATCGTGTGGTTCCTATTGTTCTCGGCCAC
AGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTATTCTATGCCTCCAAGTATCACGATATCAGCAATGTA
ATCAATCTCTCTGGACGCTATGATCTGAAGAAAGGCATTGCAGAGCGTCTTGGGGAAGAT
TATTTGGAAAGAATTAAGCAACAAGGGTTCATCGATGTTGAAGATGGTGGAAAGTCAGGG
TACCGTGTTACTGAGGAGAGCTTAATGGAGAGGTTGAACACTGATATGCATGAAGCTTGC
CTCAAGATTGACAAATAATGCAGGGTTTTGACGGTTCATGGATCGGATGATGAGGTAATA
CCCGTGGAAGATGCCAAGGAGTTTGCCAAGATCATACCGAACCACAAGCTGGAGATTGTG
GAGGGAGCTGATCATTGTTA*******CATCAAAGCCAGTTGGTTGCAATAGTTACCGAG
TTCGTAAAGACAGTCATTGTGAAGAACAACTAGTCCTTTTTTCTATCTTGTTTCTTTGAG
AAAATGTTCAGGTTACATACTTCATTTTCTACACTCGGTAAAACAATAAAAGTCATCTTA
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4FW47JQ 756 0 0
GGTTTCAATCCAACAAGGATAACCAAACGATGAACAATGTGGCTGCTACTCTAGAGAAGG
AAGGCATCACTGCTTTCCGTTTTGATTTCTCTGGGAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTTTCT
ATTATGGTAACTATGACCATGAAGCTGATGATCTACGTTCTGTTGTCCAACACTTCTGTA
ACATGGATCGTGTGGTTCCTATTGTTCTCGGCCACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTAT
TCTATGCCTCCAAGTATCACGATATCAGCAATGTAATCAATCTCTCTGGACGCTATGATC
TGAAGAAAGGCATTGCAGAGCGTCTTGGGGAAGATTATTTGGAAAGAATTAAGCAACAAG
GGTTCATCGATGTTGAAGATGGTGGAAAGTCAGGGTACCGTGTTACTGAGGAGAGCTTAA
TGGAGAGGTTGAACACTGATATGCATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAAGAATGCAGGG
TTTTGACGGTTCATGGATCGGATGATGAGGTAATACCCGTGGAAGATGCCAAGGAGTTTG
CCAAGATCATACCGAACCACAAGCTGGAGATTGTGGAGGGAGCTGATCATTGTTATACCA
AACATCAAAGCCAGTTGGTTGCAATAGTTACCGAGTTCGTAAAGACAGTCATTGTGAAGA
ACAACTAGTCCTTTTTTCTATTTTGTTTCTTTGAGAAAATGTTCAGGTTACATACTTCAT
TTTCTACACTCGGTAAAACAATAAAAGTCATCTTAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL2711Contig1 1042 4 23 U
GGAATCCTCCTCCTCATAAGTTCCTCTCCGGCGGAAACCCTCAAAATCATCGATGGCAAG
TATGGGGAGAGCATTGTACAGCGTAGGATTCTGGATCCGGGAAACGGGTCAAGCACTTGA
TCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAACAGCTCTCCAGGCACCG
CACCCTTATGAATGTTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTCC
TAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGTCCATCTCGGACCAGCCTCTTCCATTTGGTATGGATG
TGTCTTGCGAGGAGATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAA
CTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGG
TGACAATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGAC
TTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGT
TGAGTCTGGAGCTCTTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAGG
GAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACTTC
GGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTACACAAAACTCAAAGAACTTGGA
CGACACTGATTTCAAGAAGCTCCTTTACAAGAAGAACGCACGGGATGCAGAATATGATTC
AGTACTCAGGTGATCTACTACCCAAAGCAGCTTGAGACTACTCTTTACGAAGACCAGAAA
TTCATTTCCTGCTTCTCCAATAAAGTTTTCTTGTAACATGAAAGAAAAAAAAAAGTTGGA
ACCTTTTCTTCTGATTGTTTTCTATAATAAAATTTGTTGGATCAGACATTTCTCGCATTG
AGGCTGACCTTCGGCTTTCACATGCTCAAATACAGCACTGCTTCTAATGGATATGTATGT
ATGGAAAATGCTCTTTAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ43TF U 1
AF RR4AR13TF U 60
AF RR4GJ43JQ C 195
AF RR4AR13JQ C 315
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BS 942 1042 RR4AR13JQ

RD RR4GJ43TF 730 0 0
GGAATCCTCCTCCTCATAAGTTCCTCTCCGGCGGAAACCCTCAAAATCATCGATGGCAAG
TATGGGGAGAGCATTGTACAGCGTGGGATTCTGGATCCGGGAAACGGGTCAAGCACTTGA
TCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAACAGCTCTCCAGGCACCG
CACCCTTATGAATGTTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTCC
TAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGTCCATCTCGGACCAGCCTCTTCCATTTGGTATGGATG
TGTCTTGCGAGGAGATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAA
CTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGG
TGACTATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGTC
TTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGT
TGAGTCTGGAGCTCTTGTTAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAGG
GAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACTTC
GGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTACACAAA*CTCAA*GAACTTGGA
CGACACTGAT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4AR13TF 693 0 0
GTATGGGGAGAGCATTGTACAGCGTAGGATTCTGGATCCGGGAAACTGGTCAAGCCCTTG
ATCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAGCAGCTCTCCAGGCACC
GCACCCTTATGAATGTTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTC
CTAGCGCTTCTCTCATTGGTAATGTCCATCTCGGACCTGCCTCTTCCATTTGGTATGGAT
GTGTCTTGCGTGGAGATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACA
ACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTG
GTGACAATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTT**ACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGA
CTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCG
TTGAGTCTGGAGCTCTTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAG
GGAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACTT
CGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTGCACAAAACTCAAAGAACTTGG
ACGACACTGATTTCAAGAAGCTCCTTTAC
AAGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4GJ43JQ 749 0 0
TTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCTTCTCTCA
TTGGCAATGTCCATCTCGGACCAGCCTCTTCCATTTGGTATGGATGTGTCTTGCGAGGAG
ATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACG
TTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGGTGACTATGTCACTA
TTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGTCTTACATTGGTGCTA
GTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGTTGAGTCTGGAGCTC
TTGTTAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGAT
TTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACTTCGGCTGCGGATTATT
CCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTACACAAAACTCAAAGAACTTGGACGACACTGATTTCA
AGAAGCTCCTTTACGAGAAGAACGCACGGGATGCAGAATATGATTCAGTACTCAGGTGAT
CTACTACCTAAAGCAGCTTGAGACTACTCTTTACGAAGACCAGAAATTCATTTCCTGCTT
CTCCAATAAAGTTTTCTTGTAA*ATGAAAGAAAAAAA**AGTTGGAACCTTTTCTTCTGA
TTGTTTTCTATAATAAAATTTGTTGGA
CC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4AR13JQ 728 0 0
ATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACG
TTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGGTGACAATGTCACTA
TTGGTAACAGTGCTGTT**ACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGACTTACATTGGTGCTA
GTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGTTGAGTCTGGAGCTC
TTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGAT
TTTTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTTTTCTTTACTTCGGCTGCGGATTATT
CCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTGCACAAAACTCAAAGAACTTGGACGACACTGATTTCA
AGAAGCTCCTTTACAAGAAGAACGCACGGGATGCAGAATATGATTCAGTACTCAGGTGAT
CTACTACCCAAAGCAGCTTGAGACTACTCTTTACGAAGACCAGAAATTCATTTCCTGCTT
TTCCAATAAAGTTTTCTTGTAACATGAAAGAAAAAAAAAAGTTGGAATCTTTTCTTCTGA
TTGTTTTCTATAATAAAATTTGTTGGATCAGACATTTCTCGCATTGAGGCTGACCTTCGG
CTTTCACATGCTCAAATACAGCACTGCTTCTAATGGATATGTATGTATGGAAAATGCTCT
TTAGTTTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 4

CO CL2712Contig1 812 4 5 U
GGGAACAAGCTAATTGGTTCTCATGTTATAAAGACTCATGTTATAGAGTCTTGCTTTAAC
TCTAGAACTGTTAAAATAAATCATGCTTTTTCTTTTTGTAACAAACATTTGATTTAGATT
TTACAAGCTCAATTTTGTATATATAAAAACTTGGTTTTGTCTGAGAAAAATGATATTTTA
CTAGCCAACAATGGAGTTTCAAGACTTTGTCGGGGACGAATATTCAGAAGGAATCTTTTG
CTCGAGCTTCCTTCATGTCGGTTCGACTAAATTACTCCTCCTTTACGAGATGTAATGATT
CGTCACCGTTAATAACCATCTTTACTTCTTCCACCCACGATCATGATGATTAATCATTCA
CTGCTTCTTATCTCTCTAGATTGTGGATCTCAACCTGTAAAAAGATTTGCAGGCTAGCCG
ATGTTCTTCAACCGTCAAGGTCTCTGATTTTGGAAAGCGAACACGGTGGAGAGCTGACGG
ATGTGGATATGCTCCTGCTAAGGTGATTCTGTTTTTAAACAGTTTATGAGCTAAGAACAG
GTATTTGATCATAAGAGTTGGCGTGTTTGGAGACGTTTGCAATGAAGAGAGATAAATGCG
CAAGAGAATGGATGCGGATTATGTTAAATATTATGAATCTTTGTGAATTGGATTTGTTAG
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BQ
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AS 1 4

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BQ
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AF RR4DD49TF U 1
AF RR4G677TF U 221
AF RR4G677JQ C 221
AF RR4DD49JQ C 454
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RD RR4DD49TF 490 0 0
TTTTTGCATATATTTCTCTTTAGTTTCTCCTTAGATCATCTAACTTTCTCACTCTCTCGC
AATGCATGATCTTCGATCTTGTACCAGTGTGGAGAGCTGAAATCGAGAAATCTTTTGTTT
CCCCCTGAGAGACTAAATCGAATTAGAAGAAGAAGAAGAAAGCTGTCGGTCTCGGTGGTT
GGCATTGGCTGGTGTTGACAAATGGAATAGAAGTAAAGTTGCAGAGGAATGCACTCAGTG
TCCTTGAAGCTCCTACTGGAAATGAAGATGACGATGATCTTGATTTCGAAAACACACTGA
GGAATGGTTCTGATATGATTGTTTCTTTTCCAGCATCTGAGGACACACTGAAGCCTCATA
AGTCGAAGCTAAGAAGGCAGAGATCATCTCGGTCATCCCACAAGACCCTGAGCAAGTCTT
TATCATCTGACTCCCAGTCTAAAAGCTCTGCTTTTACTCCCCCTCAGAACCTGAT***G
AAGGTTGATCT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4G677TF 672 0 0
GG
AGAGGAATGCACTCAGTGTCCTTGAAGCTCCTACTGGAAACGAAGTTGACGATGATCTTG
ATTTCGAAAACACACTGAGGAATGGTTCTGATATGATTGTTTCTTTTCCAGCATCTGAGG
ACACACTGAAGCCTCATAAGTCGAAGCTAAGAAGGCAGAGATCATCTCGGTCATCTCACA
AGACCCTGAGCAGGTCTTTATCATCTGACTCCCAGTCTAAAAGCTCTGCTTTTACTCCCC
CTCAGAACCTGAT***GGTTGATCTTAGCAAACTGGAGATGCCTGCTTTACTGAAATATT
GGCAACATTTCAACCTTGTGGATGCAATTCCAAATCCATCAAAGGAGCAACTAATTGACA
TTGTTCAGAAACACTTTATGTCTCAGAAAATGGATGAGCTTCAAGTTATTATGGGGTTTG
TCCAAGCTGCAAAGAGAGTGAAGAGAGCGTGCAAGTTGCAATCAAAAGAAGAGGCCAGAA
ACACTGATCTTAACTGCATCAGCTAAAAAGAAACAAGCCCTGACTTTTATAACACATCCT
GTAAGTACAGTGATGCCAAACTTGTTTAACCAATTTGTGGCTTGCTGCAGCTAGTTTTAG
CTCGTTCCTTCCGGAGATGTTTGGGTAAGGAGTAGAATGTTGTTTCTTCTTGCTTCTTTG
TTTAGCCGTG

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR4G677JQ 719 0 0
GG
AGAGGAATGCACTCAGTGTCCTTGAAGCTCCTACTGGAAACGAAGTTGACGATGATCTTG
ATTTCGAAAACACACTGAGGAATGGTTCTGATATGATTGTTTCTTTTCCAGCATCTGAGG
ACACACTGAAGCCTCATAAGTCGAAGCTAAGAAGGCAGAGATCATTTCGGTCATCTCACA
AGACCCTGAGCAGGTCTTTATCATCTGACTCCCAGTCTAAAAGCTCTGCTTTTACTCCCC
CTCAGAACCTGAT***GGTTGATCTTAGCAAACTGGAGATGCCTGCTTTACTGAAATATT
GGCAACATTTCAACCTTGTGGATGCAATTCCAAATCCATCAAAGGAGCAACTAATTGACA
TTGTTCAGAAACACTTTATGTCTCAGAAAATGGATGAGCTTCAAGTTATTATGGGGTTTG
TCCAAGCTGCAAAGAGAGTGAAGAGAGCGTGCAAGTTGCAATCAAAAGAAGAGGCCAGAA
ACACTGATCTTAACTGCATCAGCTAAAAAGAAACAAGCCCTGACTTTTATAACACATCCT
GTAAGTACAGTGATGCCAAACTTGTTTAACCAATTTGTGGCTTGCTGCAGCTAGTTTTAG
CTCGTTCCTTCCGGAGATGTTTGGGTAAGGAGTAGAATGTTGTTTCTTCTTGCTTCTTTG
TTTAGCCGTGTAAAAAAAACCACTAAATGACCCTGATTCCAAGAAACATGACTCTCT

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR4DD49JQ 556 0 0
TTACTCCCCCTCAGAACCTGATGAAGGTTGATCTTAGCAAACTGGAGATGCCTGCTTTAC
TGAAATATTGGCAACATTTCAACCTTGTGGATGCAATTCCAAATCCATCAAAGGAGCAAC
TAATTGACATTGTTCAGAAACACTTTATGTCTCAGAAAATGGATGAGCTTCAAGTTATTA
TGGGGTTTGTCCAAGCTGCAAAGAGAGTGAAGAGAGCGTGCAAGTTGCAATCAAAAGAAG
AGGCCAGAAACACCGATCTTAACTGCATCAGCTAAAAAGAAACAAGCCCTGACTTTTATA
ACACATCCTGTAAGTACAGTGATGCCAAACTTGTTTAACCAATTTGTGGCTTGCTGCAGC
TAGTTTTAGCTCGTTCCTTCCGGAGATGTTTGGGTAAGGAGTAGAATGTTGTTTCTTCTT
GCTTCTTTGTTTAGCCGTGTAAAAAAAACCACTAAACGACCCTGATTCCAAGAAACATGA
CTCTCTAAAGCTCCCAATTCAAATTAATCTATGTTCTGATATTTGGTTTGTTAGATTGTA
AATATGTTTTAATAGG

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 4

CO CL2714Contig1 611 4 1 U
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GTCATGGCTAACAGAAACGGCAAGACCAACGCTACATCATCATCACCACCGTCTCAAGCC
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GAAACTTCGCCTACTCAAGAAACTCCAAACAAGGCAGCTTCCTCATCTTCTTCATTTGTC
GCTGCTCTTCTTGGGGCAACTCTTGCTTCCACTCTATTCCTACGGTAAGAAGTTTTTCTT
TTGTCTTCTTTTCTCACTCTGTAAGGAGTCTTTTCCCATTCTCTTTTCACATGAGTTTGT
GTCCATTGGTGTTTGTTGTTTGATTTTTTTTTCCCATTTGACTCTTCGTTTTCTCACGTT
CTACTATGACGATGATCGTATTTGTACCACTAAAATGAACCGGATTTTCTTATAAAATGG
AAAGTTCAGCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A324JQ C 1
AF RR4A324TF U 1
AF RR4A324JQD C 1
AF RR4A324TFB U 1
BS 1 611 RR4A324TF

RD RR4A324JQ 611 0 0
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AAAGTTCAGCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4A324TF 611 0 0
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AAAGTTCAGCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4A324JQD 611 0 0
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AAAGTTCAGCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4A324TFB 611 0 0
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CCGGCTCCCTCAGGAGAATCCGCTCCTTCTCCGCCTATCACAAGCAACCTTGAGCCCCCA
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GCTGCTCTTCTTGGGGCAACTCTTGCTTCCACTCTATTCCTACGGTAAGAAGTTTTTCTT
TTGTCTTCTTTTCTCACTCTGTAAGGAGTCTTTTCCCATTCTCTTTTCACATGAGTTTGT
GTCCATTGGTGTTTGTTGTTTGATTTTTTTTTCCCATTTGACTCTTCGTTTTCTCACGTT
CTACTATGACGATGATCGTATTTGTACCACTAAAATGAACCGGATTTTCTTATAAAATGG
AAAGTTCAGCC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 4

CO CL2715Contig1 1030 4 4 U
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CTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGATGTCGTTGAGGTCGTGCTTAGCCCTCCAT
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ACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGA
ACTTGGACATCCCGCGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAAT
CAAACGAGTTTGTGGGAGACAAGGTTGCCTATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCG
CTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTGGTTCGACCATGGATGTTGTGGCTG
CCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATG
AACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAAGTCGCTAGCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTAC
ATGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAATAACGTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCC
GCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCG
ATGTTGATGGTTTCTTGG*TCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATC
AAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGAGTTTCACTAAGCGACATAGCTTCCTTT
TGCTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTAAAAAAAATGAATAAGTTGATACAGTATTATTG
TGATACTCTTTGGTTCACGTGTATGTTTTCTTGAGAAGGCAAACAATCATTTTTTTCACC
ATTTACATTTAGCTGTGAGCTTACAAAAAATCTCTCCCTTTGATGCTCTGTCCGTGTTCT
TTAACTTCCGGGCTTTTTAATTAAAAGGAAATTAAGTTATATACAGCCCGATCGAGGAAG
TGTTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4BG96TF U 1
AF RR4B435TF U 97
AF RR4B435JQ C 397
AF RR4BG96JQ C 397
BS 1 678 RR4BG96TF
BS 679 679 RR4B435TF
BS 680 806 RR4BG96TF
BS 807 1030 RR4B435JQ

RD RR4BG96TF 806 0 0
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ACTTGGACATCCCGCGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAAT
CAAACGAGTTTGTGGGAGACAAGGTTGCCTATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCG
CTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTGGTTCGACCATGGATGTTGTGGCTG
CCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATG
AACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAAGTCGCTAGCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTAC
ATGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAATAACGTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCC
GCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCG
ATGTTGATGGTTTCTTGGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATC
AAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGAGTTTCACTAAGCGACATAGCTTCCTTT
TGCTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATT

QA 1 806 1 806
DS 

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CTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTG
AAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCGCGGGTTATCCTTGGTCACTCTG
AAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTGGGAGACAAGGTTGCCTATGCAC
TTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTG
GTTCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCGAACT
GGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAAGTCGCTA
GCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTACATGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAATAACGTGA
GTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACT
GCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGG*TCGGTGGTGCTTCTCTA
AAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAAGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGAGTT
TCACTAAGCGACATAGCTTCCTTTTGCTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATT
TAA

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DS 

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GCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTACATGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAATAACGTGA
GTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACT
GCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTTTTGG*TCGGTGGTGCTTCTTTA
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TCATTAAGCGACATAGCTTCCTTTTGCTTTTTCCAGTTTCAACTTTGATTTAAAAAAAAT
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DS 

RD RR4BG96JQ 634 0 0
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GCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGG*TCGGTGGTGCTTCTCTA
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TCACTAAGCGACATAGCTTCCTTTTGCTTTTTCCAGTCTCAACTTTGATTTAAAAAAAAT
GAATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCACGTGTATGTTTTTTTGAGA
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CCTTTGATGCTCTGTCCGTGTTCTTTAACTTCCGGGCTTTTTAATTAAAAGGAAATTAAG
TTATATACAGCCCGATCGAGGAAGTGTTTTT
TTC

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DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AW15JQ C 1
AF RR4AW15TF U 1
AF RR4AW51TF U 1
AF RR4AW51JQ C 1
BS 1 600 RR4AW15TF

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DS 

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QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4AW51TF 600 0 0
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QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4AW51JQ 600 0 0
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QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 4

CO CL2717Contig1 949 4 9 U
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CTACGACATTCTTACCAATGCAAGCGTGGTTAAGAATAAGATCCCAGTCCTGCTTTGCTG
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AGAAATAGAGAAACTGAGGGTTTCGAGGAGTGCGGTTTCAACTGCTGACATAGCCAATGA
CTTTACTCTTGGGATTGAAGGAGAAGTGTTTTCCTTTTCGCATTGCTTAAACAAGGTCAC
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ATATGTTAAGCCATGAAGAGCTGAAATGTGTGAGCATTAAGCATACACTTAAAGTCTTTT
ATGTACATGAATTTAAGATTTGTGATAATATTGTCGGAGGATTTTGGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FS03TF U 1
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TGAGCGAAAAATGGAGAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATTGTGGGGGAGCAATGGTTGAA
TCAAGGAACTGAATTTGTTCAACAGATACCACAGGATCAGCTTTATGCTGCTGTTGGTGT
TATCCTATTAACTACCATCTTCTTGCTCTTCTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTAC
GAAGGCCAATACTGTACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGTGGCAAAACCGTTCTCTTCTA
TCAACTCCGAGATGGATCTTCTCATCAGGGTTCTGTAACGTCAATGGAACCTAACGAAGG
CACCTTTGTGCTCCACACTGAAAACACTAAGAAAACAAAACCTGTTCATCTTATTGATGT
TCCTGGGCACTCTCGGCTTAGATCTAAGCTAGAAGAGTACTTGCCACGAGCAGCCGCTAT
TGTGTTTGTAGTAGATGCACTTGAGTTCCTCCCTAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCT
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CTTTACTCTTGGGA

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AGAAACTGAGGGTTTCGAGGAGTGCGGTTTCAACTGCTGACATAGCCAATGACTTTACTC
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TCTGTAACGTCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTTGTGCTCCACACTGAAAACACTAAG
AAAACAAAACCTGTTCATCTTATTGATGTTCCTGGGCACTCTCGGCTTAGATCTAAGCTA
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CCTAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTCTTACCAATGCAAGCGTGGTT
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AAGGAGTTCATCCGCAAGCAGATGGAGAAAGAAATAGAGAAACTGAGGGTTTCGAGGAGT
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TCCTTTTCGCATTGCTTAAACAAGGTCACTGTCGCTGAAGCATCTGGACTAACTGGAGAA
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GAGCATTAAGCATACACTTAAAGTCTTTTATGTACATGAATTTAAGATTTGTGATAATAT
TGTCGGAGGATTTTGGAT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 4

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GGGATTGTGGAGCGGTTTGATTTGATATCGATCTGTGACAATGGTGGCTGCTGGTATCGA
CATGGATGAAGGAGCTCTCGAGATCGGAATGGAGTACAGAACTGTCTCAGGTGTTGCGGG
ACCCTTGGTCATCCTTGAAAAAGTGGAGGGTCCAAAGTACCAGGAGATTGTTAATATTCG
CTTAGGAGATGGATCTATGAGACGTGGTCAGGTCTTGGAGGTTGATGGCGAGAAAGCTGT
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AGGAGAGGTTTTGAAGACCCCTGTGTCACAAGACATGCTTGGCCGCATTTTTAACGGCTC
CGGAAAGCCAATTGATAATGGCCCTCCTATTTTGCCAGAGGCATACCTTGACATCTCGGG
AAGTTCAATCAACCCCAGTGAAAGAACCTACCCTGAAGAGATGATTCAGACTGGGATTTC
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CGCAGCTATGGGTGTGAACATGGAGACAGCTCAGTTCTTCAAGCGTGATTTTGAAGAAAA
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TGCTGCTCGAGAAGAAGTACCTGGAAGACGTGGATATCCGGGTTATATGTATACAGATCT
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CATCACCGAGGGTCAGATATACATTG


BQ
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AF RR4GJ15TF U 1
AF RR4GJ15JQ C 8
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ATCAACCCCAGTGAAAGAACCTACCCTGAAGAGATGATTCAGACTGGGATTTCTACCATT
GATGTCATGAACTCCATCGCTCGTGGACAGAAGATTCCTCTTTTCTCTGCTGCTGGTTTA
CCTCATAACG

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DS 

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ATGTCATGAACTCCATCGCTCGTGGACAGAAGATTCCTCTTTTCTCTGCTGCTGGTTTAC
CTCATAACGAAATCGCTGCTCAAATTTGTCGTCAGGCTGGTCTTGTTAAGCGGTTGGAAA
AGACTGAGAACCTAATTGAGGATCATGGAGAGGACAATTTTGCAATTGTCTTCGCAGCTA
TGGGTGTGAACATGGAGACAGCTCAGTTCTTCAAGCGTGATTTTGAAGATAATGGATCAA
TGGAAAGGGTTACCCTTTTCCTGAACCTGGCAAATGACCCGACCATCGAGAGAATTATCA
CTCCTCGAATTGCCCTGACAACCGCAGAGTATCTCGCTTATGAATGCGGGAAGCATGTGC
TTGTTATATTGACAGACATGAGTTCTTATGCAGATGCTCTTCGCGAGGTCTCTGCTGCTC
GAGAAGAAGTACCTGGAAGACGTGGAT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4EV84TF 627 0 0
G
TACCATTGATGTCATGAACTCCATCGCTCGTGGACAGAAGATTTCTCTTTTCTCTGCTGC
TGGTTTACCTCATAACGAAATCGCTGCTCAAATTTGTCGTCAGGCTGGTCTTGTTAAGCG
GTTGGAAAAGACTGAGAACCTAATTGAGGATCATGGAGAGGACAATTTTGCAATTGTCTT
CGCAGCTATGGGTGTGAACATGGAGACAGCTCAGTTCTTCAAGCGTGATTTTGAAGAAAA
TGGATCAATGGAAAGGGTTACCCTTTTCCTGAACCTGGCAAATGACCCGACCATCGAGAG
AATTATCACTCCTCGAATTGCCCTGACAACCGCAGAGTATCTCGCTTATGAATGCGGGAA
GCATGTGCTTGTTATATTGACAGACATGAGTTCTTATGCAGATGCTCTTCGTGAGGTCTC
TGCTGCTCGAGAGGAAGTACCTGGAAGACGTGGATATCCGGGTTATATGTATACAGATCT
TGCAACTATTTATGAGCGTGCAGGGCGTATTGAAGGAAGAAAGGGTTCCATCACCCAAAT
CCCTATCCTCACTATGCCCAATGATGACATCACTCACCCTACTCCGGATCTTACTGGTTA
CATCACCGAGGGTCAGATATACATTG

QA 2 627 2 627
DS 



AS 1 4

CO CL2719Contig1 828 4 12 U
GGGAAAAAGTGTCGTTGAACTCACAAACGGCTCTTCAGAGGATGGTAGAGAGATCTCAAT
CTCAAACGAAGAAGCTCCTGAAAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCT
CGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTTCACCGCCTGTTCCATACACTTGGCGCTGGAGT
GATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCA
TGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTCTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACA
GATAAAGTGTTCATGGGGAAACAAGCCAACTCCAATAGGCACAGCCTCAAACCCGCTTCC
ACCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAG
ACAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGTCAATGC
AGCTGGAGCAAGTGCAGCAGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCA
TCAGCAGCTCATGTACTATCAGTAATAAACTCTTGATGCCTTGGCGCTAAGATACCTTTT
CTCCTTTTTTTT*CCTTCTTAATTTCATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTT
CAGAGTCTCTTATGTATGTGTGTGTCTCATTTGAAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTC
TTGGTTTGTAACCTATGAGTCTTACTTGGCTTGTATGCCAAGCAATAAATAACGTTGAAT
AAAGGGGGTTGGGTTTGGGTTCAAATTCTTGGGTCTAGACATGTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN63TF U 1
AF RR4FN63JQ C 82
AF RR4C548JQ C 94
AF RR4D167TF U 16
BS 1 345 RR4FN63TF
BS 346 346 RR4D167TF
BS 347 420 RR4FN63TF
BS 421 421 RR4D167TF
BS 422 498 RR4FN63TF
BS 499 499 RR4D167TF
BS 500 545 RR4FN63TF
BS 546 546 RR4D167TF
BS 547 579 RR4FN63TF
BS 580 580 RR4D167TF
BS 581 592 RR4FN63TF
BS 593 828 RR4D167TF

RD RR4FN63TF 592 0 0
GGGAAAAAGTGTCGTTGAACTCACAAACGGCTCTTCAGAGGATGGTAGAGAGATCTCAAT
CTCAAACGAAGAAGCTCCTGAAAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCT
CGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTTCACCGCCTGTTCCATACACTTGGCGCTGGAGT
GATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCA
TGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTCTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACA
GATAAAGTGTTCATGGGGAAACAAGCCAACTCCAATAGGCACAGCTTCAAACCCGCTTCC
ACCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAG
GCAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGTCAATGC
AGCTGGAGCAAGTGCAGCGGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCA
TCAGCCGCTCATGTACTATCAGTAATAAACTCTTGATGCTTTGGCGCTAAGA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4FN63JQ 697 0 0
AAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACTCAGCT
TGATCTTCACCGCCTGTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGTGTCCA
GCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTTGCTAT
TCAAATGGGCAACTCTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAAA
CAAGCCAACTCCAATAGGCACAGCTTCAAACCCGCTTCCACCACCAGTGCCAGTGGCAGT
CCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGAT
GCACCCTCAGGCTCAGCATTCTTTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGCGGC
TATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCCGCTCATGTACTATCA
GTAATAAACTCTTGATGCTTTGGCGCTAAGATACCTTTTCTCCTTTTTTTT*CCTTCTTA
ATTTTATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTATGTGT
GTCTCTCATTTGAAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAGCCTATGAGTC
TTACTTGGCTTGTATGCCAAGCAATAAA
ATAACGTTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4C548JQ 685 0 0
GTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTTCACCG
CCTGTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGG
CTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAA
C*CTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAAACAAGCCAACTCC
AATAGGCACAGCCTCAAACCCGCTTCCGCCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTC
CCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGACAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGC
TCAGCATTCTTTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGCAGCTATGTACGATGG
TGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTATCAGTAATAAACTCT
TGGTGTCTTGGCGCTAAGATACCTTTTCTCCTTTTTTTTTCCTTCTTAATTTCATCACTT
TCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTATGTGTGTGTCTCATTTG
AAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAACCTATGAGTCTTACTTGGCTTG
TATGCCAAGCAATAAA
ATAACGTTG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4D167TF 813 0 0
G
GAACTTACAAACGGCTCTTCAGAGGATGGTAGAGAGATCTCAATCTCAAACGAAGAAGCT
CCTGAAAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACT
CAGCTTGATCTTCACCGCCTGTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGT
GTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTT
GCTATTCAAATGGGCAACTCTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGG
GGAAACAAGCCAACTCCAATAGGCACAGCCTCAAACCCGCTTCCGCCACCAGTGCCAGTG
GCAGTCCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGACAACTGGCTTTAGCC
AAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGAGCAAGTGCA
GCAGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTAC
TATCAGTAATAAACTCTTGGTGTCTTGGCGCTAAGATACCTTTTCTCCTTTTTTTT*CCT
TCTTAATTTCATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTA
TGTGTGTGTCTCATTTGAAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAACCTAT
GAGTCTTACTTGGCTTGTATGCCAAGCAATAAATAACGTTGAATAAAGGGGGTTGGGTTT
GGGTTCAAATTCTTGGGTCTAGACATGTGTTG

QA 2 813 2 813
DS 



AS 1 4

CO CL2720Contig1 1590 4 20 U
GGAATGGTGTTGTCATTCTGTTCTCTCTCTTTCTCTTTTCCACCACATTTCTTGTTTTCA
ATGGAGAACACGTACCTCAACATCCTTTCGTTTTGCTTCTCCAACACGATTTGTTGGTTA
CTCATACTTTCTTGGCTTGCAAGAAACATTATCCATACTAATGGAATAAGAAGAACATTA
GCATGGAGAAAGAAAACAAGAAAGAATAAGAAGAAGAATCCAGATGATGAAACCAAAATG
TCTCTGCTGGATTTACCTGACTTAACCTTAGACTGCATCTTGGAGAAGCTCTCTCCATCT
GAGCTATGTGTTATGACTTGTGTTTGCTCCGAGCTAAGAGATAAATGTGGGAGCGATCAT
ATTTGGGAGAAGCACATGGAGAAGAGATGGGGGAGAGTAATGGGTGATGCAGCGATTAAA
GAGTGGAAATCACATGTCGCCACGTTAATGTCATGTTTCAGAAACTCGAATAGAAGTAGT
AGAAATAACACACGACATTGGAGGTCGAGGCTTGCTGCCAATCTTAAACCTTTTTCATGG
TTAAAAACAAACCATGGTTGCCACACCAGAGGTTCGTCATCAGCTATTGATTCTGTCATG
TATTGCTACTGGACTCTTGAGAATGGCAAGTTCTGGTTTCCTGCTCAGGTCTACAACCGA
GAGAACGGACACGTTGGATTCATGATGTCGTGTTACGATGCTAAAGTCAGATACGATGCC
AAGACTGATACATTTCAAGCAAGATTCGGCGCATGGACGGCGTGCGGCGGAGGAAAACGT
GACGTGGCAGAGACTGAGACCGTCTCTAGTGGACACAGAGTCACGTGACCTACATGTCTC
TGATTGTCTGCAGGAACTTAGACCTGGTGACCATTTCGAGATCCAGTGGAGAAGAACTAA
AGAGTTCCCTTATGGCTGGTGGTTTGGAGTTGTGGGTCACCTTCAAAACTGTGGCGGAGA
AGAGAGCTGTCATTGCATCTCTGACGAGAATGTGGTGATGGAGTTTAGACAATTTAAACC
GGAGTCACCGTGGAAAACTACGGTGTTAAAGAGGAGGGAACACCGTGAGACGGGGAATGA
AGTCTGTGGTTTTTACGGCGGTGTTAAGAAGTTGGGTACAGAGGAAGAAGTTTCTACCTG
GAAGCGGTTGTGGCCTTCCCAAGTTTTAGATTAAAATTATACTCTTTCTTTTAGATTAAA
ACTATACTTTAAGAGTTAGATTCGTACTTTTATTTAGGGGAGTTTGCTTAAGAAATAGCA
AATCTCATTTAATTAATTTTGGAATTTCGACTTGATTGTAAACAAAAACACACTTAAAGA
AAAGTGTGTATATTGGCTCTGCTTCAAGAAAACGTAAACAGAAACAGACGACTAGCTGGC
AAGTGGCAAAAAAAGAACAAACAGACAGACAACTGGTTTTTTTTGTTTCACACTTTAAAC
CAGAGTGCTGGACTTTTAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGTAAGAGGTCTTACTTGTAATAT
TATTTAATTAGTTTATAGGCTGATAATTATTGGCCAATTACGAAATATTCAGGATTGTTT
GCTGATTTTTATTTTATTTTTCAGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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AGCAAGATTCGGCGCATGGACGGCGTGCGGCGGAGGAAAACGTGACGTGGCAGAGACTGA
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TCTCTGACGAGAA

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AGTGTTGGACTTTT

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ATACTCTTTCTTTTAGATTAAAACTATACTTTAAGAGTTAGATTCGTACTTTTATTTAGG
GGAGTTTGCTTAAGAAATAGCAAATCTCATTTAATTAATTTTGGAATTTCGACTTGATTG
TAAACAAAAACACACTTAAAGAAAAGTGTGTATATTGGTTCTGCTTCAAGAAAACGTAAA
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TTTTTTGTTTCACACTTTAAACCAGAGTGCTGGACTTTTAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAG
TAAGAGGTCTTACTTGTAATATTATTTAATTAGTTTATAGGCTGATAATTATTGGCCAAT
TACGAAATATTCAGGATTGTTTGCTGATTTTTATTTTATTTTTCAGTTATCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 4

CO CL2721Contig1 957 4 3 U
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TATCATTTCGGGAGGGAAAAGTATTTTTGACAACATGACCACTTTTCACACGGCGACGTT
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TAGAAAAGACCCGAACCAAAACACCGGTATGTCAATACATGCATCTAGGATTTTGGCGAC
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TACTGGACCCGGGTCGGCTCTTGCTCAACGTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATCAA
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GCCTTCAACAGGTGTTTCGTTCTTGGCCGGATTGAACATTTAGATAAGAAAATGAAATTG
CTTTCGTTTCCGATGCATTGTTTCATTCTTACGTCCTTATATATTAATGGACATATGATT
AATCCTATATATGTATGTTTTAACTTTTTAATTGCATTATATCCGAACATATTATCG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FA03TF U 1
AF RR4A283JQD C 150
AF RR4A283TFB U 150
AF RR4A283JQ C 209
BS 1 207 RR4FA03TF
BS 208 926 RR4A283TFB
BS 927 957 RR4A283JQD

RD RR4FA03TF 207 0 0
CCTCAAAGTCGGTAGGAAAAAAATTAATTTGATGTTCGTTGGAGATGGGAAGGGTAAAAC
TATCATTTCGGGAGGGAAAAGTATTTTTGACAACATGACCACTTTTCACACGGCGACGTT
TTTTGCCACTGGAGCTGGATTTATTGCAAGGGACATCACATTTGAAAATTGGGCTGGTCC
GGCGAAGCACCAGGCAGTCGCTCTCCG

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4A283JQD 808 0 0
GGGACATCACATTTGAAAATTGGGCTGGTCCGGCGAAGCACCAGGCAGTCGCTCTCCGCG
TCGGGGCTGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATATAATTGGTTATCAAGACACGCTCT
ATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAATGCGATATCTACGGTACAGTCGATTTCA
TCTTCGGTAATGCAGCCGTGGTGCTACAGAACTGTAGCATCTACGCACGCAAACCCATGG
ATTTTCAGAAAAACACGATTACAGCTCAGAATAGAAAAGACCCGAACCAAAACACCGGTA
TGTCAATACATGCATCTAGGATTTTGGCGACACCTGATCTCCAAGCCACCAACGGTACTT
TCCAGACGTTTCTAGGCCGGCCTTGGAAGCAATTCTCTAGGACGGTTTACATGTTATCGT
ATATCGAGAGACATGTACACACGAGAGGTTGGCTCGAGTGGAACACAAGTTCATTTGCTT
TAGATACTTTATATTACGGAGAGTATTTGAATACTGGACCCGGGTCGGCTCTTGCTCAAC
GTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATCAATTCGACGGCTGAGGCTAACCGTTTTACGG
TGGCGGAATTTATATACGGCTCGTCGTGGTTGCCTTCAACAGGTGTTTCGTTCTTGGCCG
GATTGAACATTTAGATAAGAAAATGAAATTGCTTTCGTTTCCGATGCATTGTTTCATTCT
TACGTCCTTATATATTAATGGACATATGATTAATCCTATATATGTATGTTTTAACTTTTT
AATTGCATTATATCCGAACATATTATCG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4A283TFB 777 0 0
GGGACATCACATTTGAAAATTGGGCTGGTCCGGCGAAGCACCAGGCAGTCGCTCTCCGCG
TCGGGGCTGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATATAATTGGTTATCAAGACACGCTCT
ATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAATGCGATATCTACGGTACAGTCGATTTCA
TCTTCGGTAATGCAGCCGTGGTGCTACAGAACTGTAGCATCTACGCACGCAAACCCATGG
ATTTTCAGAAAAACACGATTACAGCTCAGAATAGAAAAGACCCGAACCAAAACACCGGTA
TGTCAATACATGCATCTAGGATTTTGGCGACACCTGATCTCCAAGCCACCAACGGTACTT
TCCAGACGTTTCTAGGCCGGCCTTGGAAGCAATTCTCTAGGACGGTTTACATGTTATCGT
ATATCGAGAGACATGTACACACGAGAGGTTGGCTCGAGTGGAACACAAGTTCATTTGCTT
TAGATACTTTATATTACGGAGAGTATTTGAATACTGGACCCGGGTCGGCTCTTGCTCAAC
GTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATCAATTCGACGGCTGAGGCTAACCGTTTTACGG
TGGCGGAATTTATATACGGCTCGTCGTGGTTGCCTTCAACAGGTGTTTCGTTCTTGGCCG
GATTGAACATTTAGATAAGAAAATGAAATTGCTTTCGTTTCCGATGCATTGTTTCATTCT
TACGTCCTTATATATTAATGGACATATGATTAATCCTATATATGTATGTTTTAACTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4A283JQ 749 0 0
GTCGGGGCTGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATATAATTGGTTATCAAGACACGCTC
TATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAATGCGATATCTACGGTACAGTCGATTTC
ATCTTCGGTAATGCAGCCGTGGTGCTACAGAACTGTAGCATCTACGCACGCAAACCCATG
GATTTTCAGAAAAACACGATTACAGCTCAGAATAGAAAAGACCCGAACCAAAACACCGGT
ATGTCAATACATGCATTTAGGATTTTGGCGACACCTGATCTCCAAGCCACCAACGGTACT
TTCCAGACGTTTTTAGGCCGGCCTTGGAAGCAATTCTTTAGGACGGTTTACATGTTATCG
TATATCGAGAGACATGTACACACGAGAGGTTGGCTCGAGTGGAACACAAGTTCATTTGCT
TTAGATACTTTATATTACGGAGAGTATTTGAATACTGGACCCGGGTCGGCTCTTGCTCAA
CGTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATCAATTCGACGGCTGAGGCTAACCGTTTTACG
GTGGCGGAATTTATATACGGCTCGTCGTGGTTGCCTTCAACAGGTGTTTCGTTCTTGGCC
GGATTGAACATTTAGATAAGAAAATGAAATTGCTTTCGTTTCCGATGCATTGTTTCATTC
TTACGTCCTTATATATTAATGGACATATGATTAATCCTATATATGTATGTTTTAACTTTT
TAATTGCATTATATCCGAACATATTATCG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

CO CL2722Contig1 1133 4 17 U
GCCTGGACTAAGCTCGGATGAGGAGGCGCCGCCTTAACGTCACTTTGCTTCAGGTTACGG
CTTGGAGGAGGAGGACATAGGAACTCTTTTTTAATAGGAGCCATCGATCGTTCTATAAGT
TCCTCCGAACTCGCTTCATATACTGAGAACTGCTTCGTCGATTGAACCGTCTCCAATACA
GCCTTTGCATCTTCTTTAACACTTGTCTCCGCCGCGAGCTCAGCATCAGCTACTACGTCG
GACATGGCTAACAAGCTCCTTCGTCGCCACACACACACAAAAAA*TGAATTAAGAGTGCC
GATAATGTTTAGGGTTTTAGATATTTCTACAGACCCGATTGTATTCATATAAAGGCCTGG
CCCGTTAACTATAGTTTCATGATTAAAAAAATTGGAATTCATGGAATGCTTTTTATTAGG
CCTAAAATGAGGCCCGGCCTGTGAACTACAGTAGGGACGAATATAGAGATAAAAAAAGCA
GAGAATCTCTGTCTGAACCTCGATCTCTTGAGCCTCCTTCCATTACAAATATACCATGAA
TTGAAATTGTTTCTTCTATCTTTCTAAGATAAAATACTGTAAATGTAAAACTAGATCTTT
TCATATGTGTAATATACATAATTCAATAGACTTGGACATTGACAAAAAAAAATAGTTTGA
TTAGTTGATATGCAACTAAAAAAACTCTCCAATCCTTTGATCTAGCCAACACCTCAACAG
CCTGTCTACTCTATCCATTTGATTCAGGTTCTGCTGAGACTCTGTCTCCTGTCTTAACTG
GCTGATGTTAAGTTGCTGAAACATCTATGATGTGACTGAGCAAGATGAGAACAGGAAGAA
GGATTAGGGACAAGCCGTAGTAGATGATGATCCATTAGAGTCCGAAATGGCTCTTGCTGT
TAAATGTCCATTCAGAGACATCATAAGACTGGAGAGAATGAAGAATTGGTTAAAGTCATT
TGAGGTTAAACAAAATATGATAATCATTCACTAGACTCTGTTTTATTAATTACATAAACA
CAGAGACCAAGCCAAACCAATAGGTACTAACCATTTGCATCAACAAGAACTATGGACAAT
AAAATTAATAATGAACCTAAAATGTCAAAACCAAAACAAAAAGAGAGATTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B966TF U 1
AF RR4B518TF U 8
AF RR4B966JQ C 263
AF RR4B518JQ C 343
BS 1 747 RR4B966TF
BS 748 748 RR4B966JQ
BS 749 830 RR4B966TF
BS 831 831 RR4B966JQ
BS 832 836 RR4B518TF
BS 837 837 RR4B966JQ
BS 838 841 RR4B518TF
BS 842 842 RR4B966JQ
BS 843 852 RR4B518TF
BS 853 853 RR4B966JQ
BS 854 886 RR4B518TF
BS 887 887 RR4B966JQ
BS 888 898 RR4B518TF
BS 899 1019 RR4B966JQ
BS 1020 1020 RR4B518JQ
BS 1021 1025 RR4B966JQ
BS 1026 1133 RR4B518JQ

RD RR4B966TF 838 0 0
GCCTGGACTAAGCTCGGATGAGGAGGCGCCGCCTTAACGTCACTTTGCTTCAGGTTACGG
CTTGGAGGAGGAGGACATAGGAACTCTTTTTTAATAGGAGCCATCGATCGTTCTATAAGT
TCCTCCGAACTCGCTTCATATACTGAGAACTGCTTCGTCGATTGAACCGTCTCCAATACA
GCCTTTGCATCTTCTTTAACACTTGTCTCCGCCGCGAGCTCAGCATCAGCTACTACGTCG
GACATGGCTAACAAGCTCCTTCGTCGCCACACACACACAAAAAA*TGAATTAAGAGTGCC
GATAATGTTTAGGGTTTTAGATATTTCTACAGACCCGATTGTATTCATATAAAGGCCTGG
CCCGTTAACTATAGTTTCATGATTAAAAAAATTGGAATTCATGGAATGCTTTTTATTAGG
CCTAAAATGAGGCCCGGCCTGTGAACTACAGTAGGGACGAATATAGAGATAAAAAAAGCA
GAGAATCTCTGTCTGAACCTCGATCTCTTGAGCCTCCTTCCATTACAAATATACCATGAA
TTGAAATTGTTTCTTCTATCTTTCTAAGATAAAATACTGTAAATGTAAAACTAGATCTTT
TCATATGTGTAATATACATAATTCAATAGACTTGGACATTGACAAAAAAAAATAGTTTGA
TTAGTTGATATGCAACTAAAAAAACTCTCCAATCCTTTGATCTAGCCAACACCTCAACAG
CCTGTCTACTCTATCCATTTGATTCAG*TTCTGCTGAGACTCTGTCTCCTGTCTTAACTG
GCTGATGTTAAGTTGCTGAAACATCTATGATGTGACTGAGCAAGATGAGA
CAGGAAGA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4B518TF 891 0 0
CTAAGCTCGGATGAGGAGGCGCCGCCTTAACGTCACTTTGCTTCAGGTTACGGCTTGGAG
GAGGAGGACATAGGAACTCTTTTTTAATAGGAGCCATCGATCGTTCTATAAGTTCCTCCG
AACTCGCTTCATATACTGAGAACTGCTTCGTCGATTGAACCGTCTCCAATACAGCCTTTG
CATCTTCTTTAACACTTGTCTCCGCCGCGAGCTCAGCATCAGCTACTACGTCGGACATGG
CTAACAAGCTCCTTCGTCGCCACACACACACAAAAAA*TGAATTAAGAGTGCCGATAATG
TTTAGGGTTTTAGATATTTCTACAGACCCGATTGTATTCATATAAAGGCCTGGCCCGTTA
ACTATAGTTTCATGATTAAAAAAATTGGAATTCATGGAATGCTTTTTATTAGGCCTAAAA
TGAGGCCCGGCCTGTGAACTACAGTAGGGACGAATATAGAGATAAAAAAAGCAGAGAATC
TCTGTCTGAACCTCGATCTCTTGAGCCTCCTTCCATTACAAATATACCATGAATTGAAAT
TGTTTCTTCTATCTTTCTAAGATAAAATACTGTAAATGTAAAACTAGATCTTTTCATATG
TGTAATATACATAATTCAATAGACTTGGACATTGACAAAAAAAAATAGTTTGATTAGTTG
ATATGCAACTAAAAAAACTCTCCAATCCTTTGATCTAGCCAACACCTCAACAGCCTGTCT
ACTCTATCCATTTGATTCAG*TTCTGCTGAGACTCTGTCTCCTGTCTTAACTGGCTGATG
TTAAGTTGCTGAAACATCTATGATGTGACTGAGCA*GATGAGA*CAGGA*GAAG*ATTAG
GGACA*GCCGTAGTAGATGATGATCCATTAGAGTCCGAA*TGGCTCTTGCT

QA 1 891 1 891
DS 

RD RR4B966JQ 763 0 0
GTCGCCACACACACACAAAAAAATGAATTAAGAGTGCCGATAATGTTTAGGGTTTTAGAT
ATTTCTACAGACCCGATTGTATTCATATAAAGGCCTGGCCCGTTAACTATAGTTTCATGA
TTAAAAAAATTGGAATTCATGGAATGCTTTTTATTAGGCCTAAAATGAGGCCCGGCCTGT
GAACTACAGTAGGGACGAATATAGAGATAAAAAAAGCAGAGAATCTCTGTCTGAACCTCG
ATCTCTTGAGCCTCCTTCCATTACAAATATACCATGAATTGAAATTGTTTCTTCTATCTT
TCTAAGATAAAATACTGTAAATGTAAAACTAGATCTTTTCATATGTGTAATATACATAAT
TCAATAGACTTGGACATTGACAAAAAAAAATAGTTTGATTAGTTGATATGCAACTAAAAA
AACTCTCCAATCCTTTGATCTAGCCAACACCTCAACAGCCTGTCTACTCTATCCATTTGA
TTCAGGTTCTGCTGAGACTCTGTCTCCTGTCTTAACTGGCTGATGTTAAGTTGCTGAAAC
ATCTATGATGTGACTGAGCAAGATGAGAACAGGAAGAAGGATTAGGGACAAGCCGTAGTA
GATGATGATCCATTAGAGTCCGAAATGGCTCTTGCTGTTAAATGTCCATTCAGAGACATC
ATAAGACTGGAGAGAATGAAGAATTGGTTAAAGTCATTTGAGGTTAAACAAAATATGATA
ATCATTCACTAGACTCTGTTTTATTAATTACATAAACCCAGAG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4B518JQ 791 0 0
ATTCATATAAAGGCCTGGCCCGTTAACTATAGTTTCATGATTAAAAAAATTGGAATTCAT
GGAATGCTTTTTATTAGGCCTAAAATGAGGCCCGGCCTGTGAACTACAGTAGGGACGAAT
ATAGAGATAAAAAAAGCAGAGAATCTCTGTCTGAACCTCGATCTCTTGAGCCTCCTTCCA
TTACAAATATACCATGAATTGAAATTGTTTCTTCTATCTTTCTAAGATAAAATACTGTAA
ATGTAAAACTAGATCTTTTCATATGTGTAATATACATAATTCAATAGACTTGGACATTGA
CAAAAAAAAATAGTTTGATTAGTTGATATGCAACTAAAAAAACTCTCCAATCCTTTGATC
TAGCCAACACCTCAACAGCCTGTTTACTCTATCCATTTGATTCAGGTTTTGCTGAGACTC
TGTCTCCTGTCTTAACTGGCTGATGTTAAGTTGCTGAAACATTTATGATGTGACTGAGCA
AGATGAGAACAGGAAGAAGGATTAGGGACAAGCCGTAGTAGATGATGATCCATTAGAGTC
CGAAATGGCTCTTGCTGTTAAATGTCCATTCAGAGACATCATAAGACTGGAGAGAATGAA
GAATTGGTTAAAGTCATTTGAGGTTAAACAAAATATGATAATCATTCACTAGACTCTGTT
TTATTAATTACATAAACACAGAGACCAAGCCAAACCAATAGGTACTAACCATTTGCATCA
ACAAGAACTATGGACAATAAAATTAATAATGAACCTAAAATGTCAAAACCAAAACAAAAA
GAGAGATTTAG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 4

CO CL2723Contig1 1166 4 11 U
GGGATCCGACTACGTTGTGATTGCAATCCACGGGGGAATCTTGTTCATACATGCACTTCT
CAACAGTCTCCCTATCTCAGTCTTGTCTTTCATTGGACAGATTGCTGCTCTCTGGAACCT
ACTAGGTGTCTTGGTGCTCATGATTCTGATCCCTTTGGTCTCTACGGAAAGAGCAACGAC
TAAGTTTGTATTCACTCATTTCAATACCGACAATGAAGTCGGCATTACCAGTTACGTTTA
CATATTTGTCTTGGGGCTACTCATGGGCCAGTACACTATCACAGGGTATGATGCATCTGC
CCACATGACCGAGGAGACCATCGATGCAGACAAGAATGGGCCAAGAGGAATAATCAGTGC
AATTGGGATATCAATTCTATTTGTATGGGGTTATATATTGGGCATATGCTATACGGTCAC
AGACATACCTTACCTTCTGAGTGAGACTAATAACTCTGGTGGGTACGCCATTGCTGAGAT
CTTCTACTTAGCTTTCAAGAGCAGGTTTGGGAGTGGTACTGGAGGGATTGTGTGCTTAGG
CATTGTTGCGGTTGCTGTGTTTTTCTGTGGCATGAGCTCTGTCACCAGCAACTCCAGGAT
GGCTTATGCGTTTTCCAGAGATGGAGCAATGCCATTGTCTCACTTATGGCATAAAGTGAA
CAACAAAGAGGTTCCTATTAACGCGGTTTGGCTCTCTGTTTCAATATCATTCTGTATGGC
CCTCACCTCACTAGGGAGCATAGTGGCGTTCCAAGCGATGGTGTCGATAGCAACTATTGG
ACTGTACATAGCATACGCCATACCGATCCTTCTAAGAGTGACATTGTCACGCAAAACCTT
TGTGGCTGGACCATTCAGCCTTGGGAGGTACGGAATGGTGGTTGGGTGGGTGGCAGTCAT
ATGGGTTGCAACCATCTCCGTTCTCTCCTCACTTCCCGTTGCATATCCCATAACGGCCGA
GACACTCAACTACACTCCGGTGGCAGTCGCTGGTGTGTTGGCCATAATCCTCTCGTATTG
GTTTCTAAGTGCACGCCATTGGTTTACTGGACCGGTCTCCAACATTCTTGCCTGAAACAA
GTATATAATCTTGTGGGGTTGTTTCATGTTTGTTGCTCTCATTCATATAGTAAAGCATTC
TAGCTGTAACTTACCTCCTATATATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FP84TF U 1
AF RR4FQ82TF U 1
AF RR4FP84JQ C 436
AF RR4FQ82JQ C 484
BS 1 667 RR4FP84TF
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BS 674 703 RR4FQ82TF
BS 704 704 RR4FP84JQ
BS 705 726 RR4FQ82TF
BS 727 727 RR4FP84JQ
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BS 750 750 RR4FP84JQ
BS 751 772 RR4FQ82TF
BS 773 1166 RR4FP84JQ

RD RR4FP84TF 667 0 0
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CAACAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4FQ82TF 778 0 0
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CAACAGTCTCCCTATCTCAGTCTTGTCTTTCATTGGACAGATTGCTGCTCTCTGGAACCT
ACTAGGTGTCTTGGTGCTCATGATTCTGATCCCTTTGGTCTCTACGGAAAGAGCAACGAC
TAAGTTTGTATTCACTCATTTCAATACCGACAATGAAGTCGGCATTACCAGTTACGTTTA
CATATTTGTCTTGGGGCTACTCATGGGCCAGTACACTATCACAGGGTATGATGCATCTGC
CCACATGACCGAGGAGACCATCGATGCAGACAAGAATGGGCCAAGAGGAATAATCAGTGC
AATTGGGATATCAATTCTATTTGTATGGGGTTATATATTGGGCATATGCTATACGGTCAC
AGACATACCTTACCTTCTGAGTGAGACTAATAACTCTGGTGGGTACGCCATTGCTGAGAT
CTTCTACTTAGCTTTCAAGAGCAGGTTTGGGAGTGGTACTGGAGGGATTGTGTGCTTAGG
CATTGTTGCGGTTGCTGTGTTTTTCTGTGGCATGAGCTCTGTCACCAGCAACTCCAGGAT
GGCTTATGCGTTTTCCAGAGATGGAGCAATGCCATTGTCTCACTTATGGCATAAAGTGAA
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CTATTG

QA 1 772 1 772
DS 

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GAGCATAGTGGCGTTCCAAGCGATGGTGTCGATAGCAACTATTGGACTGTACATAGCATA
CGCCATACCGATCCTTCTAAGAGTGACATTGTCACGCAAAACCTTTGTGGCTGGACCATT
CAGCCTTGGGAGGTACGGAATGGTGGTTGGGTGGGTGGCAGTCATATGGGTTGCAACCAT
CTCCGTTCTCTCCTCACTTCCCGTTGCATATCCCATAACGGCCGAGACACTCAACTACAC
TCCGGTGGCAGTCGCTGGTGTGTTGGCCATAATCCTCTCGTATTGGTTTCTAAGTGCACG
CCATTGGTTTACTGGACCGGTCTCCAACATTCTTGCCTGAAACAAGTATATAATCTTGTG
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TCCTATATATA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4FQ82JQ 683 0 0
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CACCTCACTAGGGAGCATAGTGGCGTTCCAAGCGATGGTGTCGATAGCAACTATTGGACT
GTACATAGCATACGCCATACCGATCCTTCTAAGAGTGACATTGTCACGCAAAACCTTTGT
GGCTGGACCATTCAGCCTTGGGAGGTACGGAATGGTGGTTGGGTGGGTGGCAGTCATATG
GGTTGCAACCATCTCCGTTCTCTCCTCACTTCCCGTTGCATATCCCATAACGGCCGAGAC
ACTCAACTACACTCCGGTGGCAGTCGCTGGTGTGTTGGCCATAATCCTCTCGTATTGGTT
TCTAAGTGCACGCCATTGGTTTACTGGACCGGTCTCCAACATTCTTGCCTGAAACAAGTA
TATAATCTTGTGGGGTTGTTTCATGTTTGTTGCTCTCATTCATATAGTAAAGCATTCTAG
CTGTAACTTACCTCCTATATATA

QA 1 683 1 683
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2725Contig1 566 4 3 U
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CCAGGTCTCACAGTATCTCCCTTGATGAACATCTCAGGCCTCTCTTTGATCACATTTGTG
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GTCTTCGTAGTCACTAATTGCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO33JQ U 54
AF RR4G091JQ U 1
AF RR4G091TF C 1
AF RR4DO33TF C 6
BS 1 503 RR4G091JQ
BS 504 546 RR4G091TF
BS 547 566 RR4DO33TF

RD RR4DO33JQ 319 0 0
TAGTGTATTGAGATTTATGTGAAATCACATTTATCAGTAGTAAACAAACACATTAGTTGC
AGAGATTACATAACAGAAGTGAAGAACATAGATAGTTAAGAGGTTCTTGTGTGATGATCC
CCACAGCTATGATTACTGTTATCCACCGTGCAATGTGGAGATGAAAACGATAACATCTTT
GTCTTCAATTGTGGTCTCGAGCTGACCACTAAGCTCCCAATCACAGTCATTCACGAGCAC
AAAAACACCAGGTCTCACAGTATCTCCCTTGATGAACATCTCAGGCCTCTCTTTGATCAC
ATTTGTGCGAACCCACGAA

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4G091JQ 503 0 0
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TTGAGATTTATGTGAAATCACATTTATCAGTAGTAAACAAACACATTAGTTGCAGAGATT
ACATAACAGAAGTGAAGAACATAGATAGTTAAGAGGTTCTTGTGTGATGATCCCCACAGC
TATGATTACTGTTATCCACCGTGCAATGTGGAGATGAAAACGATAACATCTTTGTCTTCA
ATTGTGGTCTCGAGCTGACCACTAAGCTCCCAATCACAGTCATTCACGAGCACAAGAACA
CCAGGTCTCACAGTATCTCCCTTGATGAACATCTCAGGCCTCTCTTTGATCACATTTGTG
CGAACCCACGAAAGCAAATGCTTCATTGTTAACTCATCTGCTCCATGGGGCAAATCGACG
TTTACTTTATGGATCTTCTCAGAATCACAGAGCAGCTCTAAACCACCTCCGAATTCAAGA
GTTAGTTGCATCGTCGTCGATGA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4G091TF 549 0 0
GGTCT
CCCGAAATGTTTTACTCATATCAACTTAACGGGTCTGGTTGCCACAAATAGTGTATTGAG
ATTTATGTGAAATCACATTTATCAGTAGTAAACAAACACATTAGTTGCAGAGATTACATA
ACAGAAGTGAAGAACATAGATAGTTAAGAGGTTCTTGTGTGATGATCCCCACAGCTATGA
TTACTGTTATCCACCGTGCAATGTGGAGATGAAAACGATAACATCTTTGTCTTCAATTGT
GGTCTCGAGCTGACCACTAAGCTCCCAATCACAGTCATTCACGAGCACAAGAACACCAGG
TCTCACAGTATCTCCCTTGATGAACATCTCAGGCCTCTCTTTGATCACATTTGTGCGAAC
CCACGAAAGCAAATGCTTCATTGTTAACTCATCTGCTCCATGGGGCAAATCGACGTTTAC
TTTATGGATCTTCTCAGAATCACAGAGCAGCTCTAAACCACCTCCGAATTCAAGAGTTAG
TTGCATCGTCGTCGATGATCCCAATCAACAAACTCTAGCTCTGTCTAGGGTTTTCGTCTT
C
CCC

QA 6 546 6 546
DS 

RD RR4DO33TF 561 0 0
CCCGAAATGTTTTACTCATATCAACTTAACGGGTCTGGTTGCCACAAATAGTGTATTGAG
ATTTATGTGAAATCACATTTATCAGTAGTAAACAAACACATTAGTTGCAGAGATTACATA
ACAGAAGTGAAGAACATAGATAGTTAAGAGGTTCTTGTGTGATGATCCCCACAGCTATGA
TTACTGTTATCCACCGTGCAATGTGGAGATGAAAACGATAACATCTTTGTCTTCAATTGT
GGTCTCGAGCTGACCACTAAGCTCCCAATCACAGTCATTCACGAGCACAAGAACACCAGG
TCTCACAGTATCTCCCTTGATGAACATCTCAGGCCTCTCTTTGATCACATTTGTGCGAAC
CCACGAAAGCAAATGCTTCATTGTTAACTCATCTGCTCCATGGGGCAAATCGACGTTTAC
TTTATGGATCTTCTCAGAATCACAGAGCAGCTCTAAACCACCTCCGAATTCAAGAGTTAG
TTGCATCGTCGTCGATGATCCCAATCAACAAACTCTAGCTCTGTCTAGGGTTTTCGTCTT
CGTAGTCACTAATTGCAGCCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 4

CO CL2726Contig1 765 4 5 U
CCTAAAATCAAGTTTACTTAATAAGCTGGTTTTGAGGAAACAAACAACATTACGCTAAGA
AACAAGCTAACTCTCTTCTTGGTTTTCCCTTACTAGGAATCTCATCAACTTACTAATGAA
ACTTGAATTGTAAAAACTCTCGCAAGAATAGAACAAAATACATAGGTTTCAGATGAAAAA
GCGAGAGATTATTGTAGAGGGATTTGGAGTGCAGAGAATATGGCTTGGAGGAAGAGAGGA
TGAACCTCCTCTCCAGAGAACACCTCCGTCTTCAACTTCTCCATGTGAGGCCATATCTCG
TTCGCATATTGTCTTGTAAATGCCGTAAGATACCCAAGTGTCGTTAAGCACCACTGTTCT
CTCTCACCCATCTCAGACTTTTTCTTTGGGTTTCCATTTTCAGTGTCCACCTCCATAGCA
GATGAGTTTTCATCTTCAGGTTTTAGATCCTCCAACGATCTCGCTTTCGTTGCTTCTGGA
AGCCTTTCCTTCAGGACCGCGGAGAAACTCTGGAATAGCAGGAGCAGTAGAGCCTCTGTT
TCAGAGAGAGCTCTGTTAAGAAGAGCCTCTTTTGCCTCTAGGGATTCCCGAATAGACACC
TCTGCCTCCCCTGTCTTCTCCACCGTTGATCTCAAACGCTTCATCTTCCCTGGATTTTCA
CCAAGGACTGGCTCGCCCTCCACCAGGGAAAGTTTGCTCTCCGCAGCCTCCAGCTCTACT
AGTGCGTGTGCTGAAGCTTTCTCAGCAACCAAAACATTCTTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DF15JQ U 45
AF RR4DE27JQ U 58
AF RR4DA16JQ U 1
AF RR4DA16TF C 92
BS 1 375 RR4DA16JQ
BS 376 376 RR4DE27JQ
BS 377 420 RR4DA16JQ
BS 421 421 RR4DE27JQ
BS 422 765 RR4DA16JQ

RD RR4DF15JQ 314 0 0
CAACATTACGCTAAGAAACAAGCTAACTCTCTTCTTGGTTTTCCCTTACTAGGAATCTCA
TCAACTTACTAATGAAACTTGAATTGTAAAAACTCTCGCAAGAATAGAACAAAATACATA
GGTTTCAGATGAAAAAGCGAGAGATTATTGTAGAGGGATTTGGAGTGCAGAGAATATGGC
TTGGAGGAAGAGAGGATGAACCTCCTCTCCAGAGAACACCTCCGTCTTCAACTTCTCCAT
GTGAGGCCATATCTCGTTCGCATATTGTCTTGTAAATGCCGTAAGATACCCAAGTGTCGT
TAAGCACCACTGTT

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR4DE27JQ 368 0 0
G
GAAACAAGCTAACTCTCTTCTTGGTTTTCCCTTACTAGGAATCTCATCAACTTACTAATG
AAACTTGAATTGTAAAAACTCTCGCAAGAATAGAACAAAATACATAGGTTTCAGATGAAA
AAGCGAGAGATTATTGTAGAGGGATTTGGAGTGCAGAGAATATGGCTTGGAGGAAGAGAG
GATGAACCTCCTCTCCAGAAAACACCTCCGTCTTCAACTTCTCCATGTGAGGCCATATCT
CGTTCGCATATTGTCTTGTAAATGCCGTAAGATACCCAAGTGTCGTTAAGCACCACTGTT
CTCTCTCACCCATCTCAGACTTTTTCTTTGGGTTTCCATTTTCAGTGTCCACCTCCATAG
CAGATGA

QA 2 368 2 368
DS 

RD RR4DA16JQ 765 0 0
CCTAAAATCAAGTTTACTTAATAAGCTGGTTTTGAGGAAACAAACAACATTACGCTAAGA
AACAAGCTAACTCTCTTCTTGGTTTTCCCTTACTAGGAATCTCATCAACTTACTAATGAA
ACTTGAATTGTAAAAACTCTCGCAAGAATAGAACAAAATACATAGGTTTCAGATGAAAAA
GCGAGAGATTATTGTAGAGGGATTTGGAGTGCAGAGAATATGGCTTGGAGGAAGAGAGGA
TGAACCTCCTCTCCAGAGAACACCTCCGTCTTCAACTTCTCCATGTGAGGCCATATCTCG
TTCGCATATTGTCTTGTAAATGCCGTAAGATACCCAAGTGTCGTTAAGCACCACTGTTCT
CTCTCACCCATCTCAAACTTTTTCTTTGGGTTTCCATTTTCAGTGTCCACCTCCATAGCA
AATGAGTTTTCATCTTCAGGTTTTAGATCCTCCAACGATCTCGCTTTCGTTGCTTCTGGA
AGCCTTTCCTTCAGGACCGCGGAGAAACTCTGGAATAGCAGGAGCAGTAGAGCCTCTGTT
TCAGAGAGAGCTCTGTTAAGAAGAGCCTCTTTTGCCTCTAGGGATTCCCGAATAGACACC
TCTGCCTCCCCTGTCTTCTCCACCGTTGATCTCAAACGCTTCATCTTCCCTGGATTTTCA
CCAAGGACTGGCTCGCCCTCCACCAGGGAAAGTTTGCTCTCCGCAGCCTCCAGCTCTACT
AGTGCGTGTGCTGAAGCTTTCTCAGCAACCAAAACATTCTTCGTC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4DA16TF 674 0 0
ACTAGGAATCTCATCAACTTACTAATGAAACTTGAATTGTAAAAACTCTCGCAAGAATAG
AACAAAATACATAGGTTTCAGATGAAAAAGCGAGAGATTATTGTAGAGGGATTTGGAGTG
CAGAGAATATGGCTTGGAGGAAGAGAGGATGAACCTCCTCTCCAGAGAACACCTCCGTCT
TCAACTTCTCCATGTGAGGCCATATCTCGTTCGCATATTGTCTTGTAAATGCCGTAAGAT
ACCCAAGTGTCGTTAAGCACCACTGTTCTCTCTCACCCATCTCAGACTTTTTCTTTGGGT
TTCCATTTTCAGTGTCCACCTCCATAGCAGATGAGTTTTCATCTTCAGGTTTTAGATCCT
CCAACGATCTCGCTTTCGTTGCTTCTGGAAGCCTTTCCTTCAGGACCGCGGAGAAACTCT
GGAATAGCAGGAGCAGTAGAGCCTCTGTTTCAGAGAGAGCTCTGTTAAGAAGAGCCTCTT
TTGCCTCTAGGGATTCCCGAATAGACACCTCTGCCTCCCCTGTCTTCTCCACCGTTGATC
TCAAACGCTTCATCTTCCCTGGATTTTCACCAAGGACTGGCTCGCCCTCCACCAGGGAAA
GTTTGCTCTCCGCAGCCTCCAGCTCTACTAGTGCGTGTGCTGAAGCTTTCTCAGCAACCA
AAACATTCTTCGTC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

CO CL2727Contig1 726 4 11 U
GACACAGCTTCCAAACTAGCTAACAATGACAAAACTTTATTTAGCTCTCGTGATATCGTT
GGGTCTCCTACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAA
AACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTT
CCTTCATGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCA
GTCTGCACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGT
GACGCCAACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCC
TCCGGCAGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGC
AAGCAAAACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCAC
GAACAGTTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGAC
TTTGTTCTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGT
CGGTAATAATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGAT
CTTTCCAATGTGAGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGA
TGATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4H952JQB C 1
AF RR4EJ15TF U 7
AF RR4DH66JQ C 372
AF RR4DH66TF U 372
BS 1 8 RR4H952JQB
BS 9 17 RR4EJ15TF
BS 18 18 RR4H952JQB
BS 19 45 RR4EJ15TF
BS 46 46 RR4H952JQB
BS 47 180 RR4EJ15TF
BS 181 181 RR4H952JQB
BS 182 270 RR4EJ15TF
BS 271 271 RR4H952JQB
BS 272 680 RR4EJ15TF
BS 681 726 RR4DH66TF

RD RR4H952JQB 631 0 0
GACACAGCTTCCAAGCTAGCTAGCAATGACAAAACTTTATTTAGCTCTCGTGATATCGTT
GGGTCTCCTACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAA
AACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTT
CCTTCATGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCA
GTCTGCACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGT
GACGCCAACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCC
TCCGGCAGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGC
AAGCAAAGCCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCAC
GAACAGTTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGAC
TTTGTTCTGAAACTTTGTACTGCAAACATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGT
CGGTAATAATAACTAATCAGTTCGTTCCATT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4EJ15TF 680 0 0
GT
TTCCAAACTGGCTAACAATGACAAAACTTTATTTAGC*CTCGTGATATCGTTGGGTCTCC
TACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAAAACCAAGG
GTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTGCTTCATG
TTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAGTCTGCAC
ATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACTACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTGACGCCAA
CAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAG
AAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCAAGCAAAA
CCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACGAACAGTT
TTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACTTTGTTCT
GAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTCGGTAATA
ATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATCTTTCCAA
TGTGAGTTTCAA
TATTGA

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR4DH66JQ 355 0 0
G
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TAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACGAACAGTTTTCT
TCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACTTTGTTCTGAAA
CTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTCGGTAATAATAA
CTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATCTTTCCAATGTG
AGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGATGATCA

QA 2 355 2 355
DS 

RD RR4DH66TF 355 0 0
G
CACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCAAGCAAAACCAA
TAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACGAACAGTTTTCT
TCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACTTTGTTCTGAAA
CTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTCGGTAATAATAA
CTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATCTTTCCAATGTG
AGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGATGATCA

QA 2 355 2 355
DS 



AS 1 4

CO CL2728Contig1 755 4 14 U
TTTTTACTTATTTGTGACCATTTTATCTTGAAACAAAAGAACTACAGAGACAGAACGAGA
TTACATTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTACTACAAAACGTCTAT
AACAAACAATACAATGGCAAAATGGTAGTAAAAAGAATCATAAAACCCGATCCAGCTTAG
TACACCAAGCTTCTCTTTGTTTACACCAGAATCTCAACATGCCATCTGAACATTTCTTCC
TTTGTCACAGGTAGGTTCAACGTCACAAGCCCAACCTATGCATCGTAGTTGAACTCAGTC
TCGGTGCTATCAACGGCGCATCTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCA
CAACCTCTAACACCTAGAGATATCAGCGCTGCTGGAGAACAGTTCTCGCTGACCACTGAA
GAGGAATAAACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGAATAGCC
CCACTTGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATGCTTGCAGTGATT
TCCTTCAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTAGAGAGTGAGTGGGATT
GGGGCACCCTTTGGTAGTCTAACCGGCTCTCCTGATTTGTAAGCGTAGACTATTGAATCT
CCACTACAGTCTGGACCAGCCACTTCGGAGATGAGATCAGCATCCTCCGCACGGACCAAA
CCCGTGAGAGTACCAGGAGAAGTATGATGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS54JQ U 6
AF RR4CS87JQ U 6
AF RR4CS87TF C 6
AF RR4BS54TF C 1
BS 1 5 RR4BS54TF
BS 6 125 RR4BS54JQ
BS 126 126 RR4CS87JQ
BS 127 179 RR4BS54JQ
BS 180 180 RR4CS87JQ
BS 181 210 RR4BS54JQ
BS 211 211 RR4CS87JQ
BS 212 277 RR4BS54JQ
BS 278 278 RR4CS87JQ
BS 279 335 RR4BS54JQ
BS 336 336 RR4CS87JQ
BS 337 524 RR4BS54JQ
BS 525 589 RR4CS87JQ
BS 590 755 RR4BS54TF

RD RR4BS54JQ 519 0 0
ACTTATTTGTGACCATTTTATCTTGAAACAAAAGAACTACAGAGACAGAACGAGATTACA
TTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTACTACAAAACGTCTATAACAA
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CAAGCTTCTCTTTGTTTACACCAGAGTCTCAACATGCCATCTGAACATTTCTTCCTTTGT
CACAGGTAGGTTCAACGTCACAAGCCCAACCTCTGCATCGTAGTTGAACTCAGTCTCGGT
GCTATCAACGGCGCATCTCAGCGGACGCTGGGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCACAACC
TCTAACACCTAGAGATATCAGCGCTGCTGGAGAACAGTTCTCGCTGACCACTGAAGAGGA
ATAAACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGAATAGCCCCACT
TGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGA

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4CS87JQ 585 0 0
ACTTATTTGTGACCATTTTATCTTGAAACAAAAGAACTACAGAGACAGAACGAGATTACA
TTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTACTACAAAACGTCTATAACAA
ACAATACAATGGCAAAATGGTAGTAAAAAGAATCATAAAACCCGATCCAGCTTAGTACAC
CAAGCTTCTCTTTGTTTACACCAGAATCTCAACATGCCATCTGAACATTTCTTCCTTTGT
CGCAGGTAGGTTCAACGTCACAAGCCCAACCTATGCATCGTAGTTGAACTCAGTCTCGGT
GCTATCAACGGCGCATCTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCACAACC
TCTAACACCTAGAGATATCAGCGCTGCTGGAGAACGGTTCTCGCTGACCACTGAAGAGGA
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TGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATGCTTGCAGTGATTTCCTT
CAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTAGAGAG
C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4CS87TF 585 0 0
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TTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTACTACAAAACGTCTATAACAA
ACAATACAATGGCAAAATGGTAGTAAAAAGAATCATAAAACCCGATCCAGCTTAGTACAC
CAAGCTTCTCTTTGTTTACACCAGAATCTCAACATGCCATCTGAACATTTCTTCCTTTGT
CGCAGGTAGGTTCAACGTCACAAGCCCAACCTATGCATCGTAGTTGAACTCAGTCTCGGT
GCTATCAACGGCGCATCTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCACAACC
TCTAACACCTAGAGATATCAGCGCTGCTGGAGAACGGTTCTCGCTGACCACTGAAGAGGA
ATAAACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGAATAGCCCCACT
TGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATGCTTGCAGTGATTTCCTT
CAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTAGAGAG
C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4BS54TF 755 0 0
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TTACATTTA**TACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTACTACAAAACGTCTAT
AACAAGCAATACAATGGCAAAATGGTAGTAAAAAGAATCATAAAACCCGATCCAGCTTAG
TACACCAAGCTTCTCTTTGTTTACACCAGAGTCTCAACATGCCATCTGAACATTTCTTCC
TTTGTCACAGGTAGGTTCAACGTCACAAGCCCAACCTCTGCATCGTAGTTGAACTCAGTC
TCGGTGCTATCAACGGCGCATCTCAGCGGACGCTGGGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCA
CAACCTCTAACACCTAGAGATATCAGCGCTGCTGGAGAACAGTTCTCGCTGACCACTGAA
GAGGAATAAACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGAATAGCC
CCACTTGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATGCTTGCAGTGATT
TCCTTCAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTCGAGAGTGAGTGGGATT
GGGGCACCCTTTGGTAGTCTAACCGGCTCTCCTGATTTGTAAGCGTAGACTATTGAATCT
CCACTACAGTCTGGACCAGCCACTTCGGAGATGAGATCAGCATCCTCCGCACGGACCAAA
CCCGTGAGAGTACCAGGAGAAGTATGATGAATCCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 2 4

CO CL2729Contig1 753 2 2 U
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CGCCGCCCACAGCACCATTTCGGAAAGCCCCCAAAACCATCTAGGCCAGAGAATAGGCCT
GGCCATTTTTCGAGCCCAAATTCAGCCGTTTAGAGCCTCAAACAGGCTGCCGAATGTTAC
GGGCTGTGAACGAGATGCGATTCGCTGTTTCCGGGTGCTTTTGCAGTTTACTACATCAAA
TTTCATACATTTTGATGCATGGAAAAAGTCAAAAAAAAAAAAACTTCTGGGCTCCACGCA
AATCTACTCGTGCTCTCCGACGAAAAGGATATATGGAATCGCGAGTCATTAACTAACGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCCGGGAAGTCCTCGTGTTGCAACCCTTTT
TATTTTTTTTTCTTCATTTTGAAACGCGTCTCATCTTTAAAACCCCATAACTTTTTAACC
GTGAGGAACTACGCCGCCCACAGCACCATTTCGGAAAGCCCCCAAAACCATCTAGGCCAG
AGAATAGGCCTGGCCATTTTTCGAGCCCAAATTCAGCCGTTTAGAGCCTCAAACAGGCTG
CCCAATGTTACGGGCTGTGAACGAGATGCGATTCGCTGTTTCCGGGTGCTTTTGCAGTTT
ACTACATCAAATTTCATACATTTTGATGCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A582TF U 1
AF RR4A582JQ C 131
BS 1 652 RR4A582TF
BS 653 753 RR4A582JQ

RD RR4A582TF 652 0 0
CTTCATTTTGAAACGCGTCTCATCTTTAAAACCCCATAACTTTTTAACCGTGAGGAACTA
CGCCGCCCACAGCACCATTTCGGAAAGCCCCCAAAACCATCTAGGCCAGAGAATAGGCCT
GGCCATTTTTCGAGCCCAAATTCAGCCGTTTAGAGCCTCAAACAGGCTGCCGAATGTTAC
GGGCTGTGAACGAGATGCGATTCGCTGTTTCCGGGTGCTTTTGCAGTTTACTACATCAAA
TTTCATACATTTTGATGCATGGAAAAAGTCAAAAAAAAAAAAACTTCTGGGCTCCACGCA
AATCTACTCGTGCTCTCCGACGAAAAGGATATATGGAATCGCGAGTCATTAACTAACGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCCGGGAAGTCCTCGTGTTGCAACCCTTTT
TATTTTTTTTTCTTCATTTTGAAACGCGTCTCATCTTTAAAACCCCATAACTTTTTAACC
GTGAGGAACTACGCCGCCCACAGCACCATTTCGGAAAGCCCCCAAAACCATCTAGGCCAG
AGAATAGGCCTGGCCATTTTTCGAGCCCAAATTCAGCCGTTTAGAGCCTCAA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4A582JQ 623 0 0
CGAGCCCAAATTCAGCCGTTTAGAGCCTCAAACAGGCTGCCGAATGTTACGGGCTGTGAA
CGAGATGCGATTCGCTGTTTCCGGGTGCTTTTGCAGTTTACTACATCAAATTTCATACAT
TTTGATGCATGGAAAAAGTCAAAAAAAAAAAAACTTCTGGGCTCCACGCAAATCTACTCG
TGCTCTCCGACGAAAAGGATATATGGAATCGCGAGTCATTAACTAACGGGTGCGATCATA
CCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGT
AGTACTAGGATGGGTGACCTCCCGGGAAGTCCTCGTGTTGCAACCCTTTTTATTTTTTTT
TCTTCATTTTGAAACGCGTCTCATCTTTAAAACCCCATAACTTTTTAACCGTGAGGAACT
ACGCCGCCCACAGCACCATTTCGGAAAGCCCCCAAAACCATCTAGGCCAGAGAATAGGCC
TGGCCATTTTTCGAGCCCAAATTCAGCCGTTTAGAGCCTCAAACAGGCTGCCCAATGTTA
CGGGCTGTGAACGAGATGCGATTCGCTGTTTCCGGGTGCTTTTGCAGTTTACTACATCAA
ATTTCATACATTTTGATGCATGG

QA 1 623 1 623
DS 



CO CL2729Contig2 695 2 3 U
TTTCGTGCATCAAAATGTATGGAAATTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCACCCGGAAACAG
CGAATCGCATCTCGTTCGCAGCCTGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGC
TGTATTTGGGCTCGAAAAATCGTCGTGCCTATACACCGACCTAAATGGTTTTGGGGGCTT
TCCGAAATGGATCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTAAAAAGTTATGGGGTTTTAAA
GACGAAACGCGTTTCAAATTGAAAAAAAAAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCC
CGGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGA
TGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCC
ATATATCATTTTCGTCGGAAAGCCCGAGTAAATTTGCGTGGAGCCCACATGAATTTTTTT
TTTTAAATTTCCGTGCATCAAAATGTATGGAAATTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCACCC
GGAAACAGCGAATCGCATCTCGTTCGCAGCCTGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTC
TAAACGGCTGTATTTGGGCTCGAAAAATCGTCGTGCCTATACACCGACCTAGATGGTTTT
GGGGGCTTTCCGAAATGGATCTGTGGGCGGCGTAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX55JQ U 4
AF RR4EX55TF C 1
BS 1 5 RR4EX55TF
BS 6 622 RR4EX55JQ
BS 623 695 RR4EX55TF

RD RR4EX55JQ 624 0 0
CG
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CGCATCTCGTTCGCAGCCTGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGCTGTAT
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AATGGATCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTAAAAAGTTATGGGGTTTTAAAGACGA
AACGCGTTTCAAATTGAAAAAAAAAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCGGGA
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TCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCCATATA
TCATTTTCGTCGGAAAGCCCGAGTAAATTTGCGTGGAGCCCACATGAATTTTTTTTTTTA
AATTTCCGTGCATCAAAATGTATGGAAATTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCACCCGGAAA
CAGCGAATCGCATCTCGTTCGCAGCCTGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAAC
GGCTGTATTTGGGCTCG
AAAAA

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4EX55TF 695 0 0
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CGAATCGCATCTCGTTCGCAGCCTGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGC
TGTATTTGGGCTCGAAAAATCGTCGTGCCTATACACCGACCTAGATGGTTTTGGGGGCTT
TCCGAAATGGATCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTAAAAAGTTATGGGGTTTTAAA
GACGAGACGCGTTTCAAATTGAAAAAAAAAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCC
CGGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGA
TGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCC
ATATATCATTTTCGTCGGAGAGCCCGAGTAGATTTGCGTGGAGCCCACATGAATTTTTTT
TTTTAAATTTCCGTGCATCAAAATGTATGGAAATTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCACCC
GGAAACAGCGAATCGCATCTCGTTCGCAGCCTGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTC
TAAACGGCTGTATTTGGGCTCGAAAAATCGTCGTGCCTATACACCGACCTAGATGGTTTT
GGGGGCTTTCCGAAATGGATCTGTGGGCGGCGTAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

CO CL2730Contig1 557 3 9 U
GGGTACTTTCAATGCATATACTCAAATATTTAGGTGTCACTTTGTTTTGTAAGAAACAAG
CATCAACTTATATCAGGAAGGTCAATGAACCAAACAGAAACATTAGTTACACTAAAACAT
GTCTTTTCCTCCAAAGGGTATTTAACTGAATGAATGTAAGGCTGTTTTAAAAAAGACGGA
GAGACATTTTGAGTTTGTTCTGTTTCCATTTCGGAAGTGCATAGAACTTTGGTTTTGTCA
TTTCGAATCTTTCTTGGAACTCTTTCTCAGTTAAGTACGCCTCTCTTCTTGTTGCATCTA
TATCTGTCACTGGCTCCTGAGAATCAACTCTAAGCTGTTCGTACGAATATTCAAGTGACT
CTACACTAAGATCAACATTGATTCCTCCCAATGGATTCTCTCTAGATATGTCTGAGTTGG
AGCTTGTAGATCCATTGTTTGTATCCACTGAAAGAGATTCAGAGAAAAGCTTTTTGACAA
CTGGAGTGGAGTCAGTGCTGCTTTTTCTGTCTTCTGAAGTGCTCAGACTTGGAAACTTTT
CGCTGGAGCAAGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR82JQ U 325
AF RR4ES43JQ U 49
AF RR4GR82TF C 1
BS 1 48 RR4GR82TF
BS 49 139 RR4ES43JQ
BS 140 140 RR4GR82TF
BS 141 324 RR4ES43JQ
BS 325 344 RR4GR82JQ
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BS 456 557 RR4GR82TF

RD RR4GR82JQ 101 0 0
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CTCCCAATGGATTCTCTCTAGATATGTCTGAGTTGGAGCTT

QA 1 101 1 101
DS 

RD RR4ES43JQ 410 0 0
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ACACTAAAACATGTCTTTTCCTCCAAAGGGTCTTTAACTGAATGAATGTAAGGCTGTTTT
AAAAAAGACGGAGAGACATTTTGAGTTTGTTCTGTTTCCATTTCGGAAGTGCATAGAACT
TTGGTTTTGTCATTTCGAATCTTTCTTGGAACTCTTTCTCAGTTAAGTACGCCTCTCTTC
TTGTTGCATCTATATCTGTCACTGGCTCCTGAGAATCAACTCTAAGCTGTTCGTACGAAT
ATTCAAGTGACTCTACACTAAGATCAACATTGATTCCTCCCAATGGATTCTCTTTAGATA
TGTCTGAATTGGAGCTTGTAGATCCATTGTTTGTATCCACTGAAAGA
AAT

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR4GR82TF 557 0 0
GGGTACTTTCAATGCATATACTCAAATATTTAGGTGTCACTTTGTTTTGTAAGAAACAAG
CATCAACTTATATCAGGAAGGTCAATGAACCAAACAGAAACATTAGTTACACTAAAACAT
GTCTTTTCCTCCAAAGGGTATTTAACTGAATGAATGTAAGGCTGTTTTAGAAAAGACGGA
GAGACATTTTGAGTTTGTTCTGTTTCCATTTCGGAAGTGCATAGAACTTTGGTTTTGTCA
TTTCGAATCTTTCTTGGAACTCTTTCTCAGTTAAGTACGCCTCTCTTCTTGTTGCATCTA
TATCTGTCACTGGCTCCTGAGAATCAACTCTAAGCTGTTCGTACGAATATTCAAGTGACT
CTACACTAAGATCAACATTGATTCCTCCCAATGGATTCTCTCTAGATATGTCTGAGTTGG
AGCTTGTAGATCCATTGTTTGTATCCACTGAAAGAGATTCAGAGAAAAGCTTTTTGACAA
CTGGAGTGGAGTCAGTGCTGCTTTTTCTGTCTTCTGAAGTGCTCAGACTTGGAAACTTTT
CGCTGGAGCAAGATGAC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 4

CO CL2731Contig1 1218 4 5 U
AGCTGAAGCAATCTCATCCGTGCCTATTTTTTTTTTTCTCATCTGAATTTCATAGATAAC
ATTAGAAAGATACAAGGATGAAATACCGAAGCCGGCGGAACACATAAACCTCCCCGGAAG
CTAAACTCAAAAGACAGGGATCTGAAACCCAAACACACGGGTGACACATGAACAACTAAA
ACATAACCAAAATCCTAAACTCCTTCAGCAAACCTAGAAACAAATCAATACTAGATAAGA
AAAGGAAAGGCTTAAAAATCTGTGACTAGCTGGATTTCTTGCCATGAACTAAGCAAGATA
GCAAACAACGCAGTAAACTTCCAAGAAGAGCAAAAACTTCATTTGAACCCCAAGTTCACA
ATGACAACGCCAAAACCATCAAGACCTCATCTGAACCCCACTTGTTCACGATGACAACTA
CCGAACCACAACGCCTGCACCAGGCACAAACCCACGAAGAGACACCACCCGAGATATGCT
CCACCTCAACCCCACCTTCATCTGTAGATCTCCACGCCTCACCTCGTTATATTGCTTCAC
CATATGAAGCCATTGAGGAAAACAGAGACTAAAAGCCAGGAAGAACATTTAATCAAGGTG
CGAGAAAGGGAGCTTCGTAAACCCCGAGAGATAAAGAGAGGTAACCTGAAACCATCTTCT
TCTCAAGGACAGTGACCTTCACCTGCTCACAACACACACAACCACGACACTGCTATACCG
TTGCCGAATCAAGGATTAGTTAAGCCAAACCCAACATCCAAGAGAGATTCACCGGGTTCA
ACCCATTTAAACTGTCGCAAAACCAATCTAAACAGGCTGTGAAACAGCCACCACATCACA
GGAGAGTCACCAAGCTTGAAACTTTACTTTGATCAGGGACGCAAACGGAGACTGGACAAA
GGGGAACCCTTATACACCACCGAGAAAACCACTCCACGCCCACAGATCTATCAAAGGATC
ATCAGATCTGAGAAAACGAAGACTCTTCAAACTGATCTGAAGCAAGAAGGATAAAAGCAG
ACAACTTTAAAAGGGAAAAGAAGAAAGGATCTATGGGAAGAGATGGAACACAAGATTGTA
AGATTAGCTCCGGCGACCGCGAGAAGCGGCGGCCACCGGCCTTAGGATTCACACGAGAGA
GTTTTTCTATCGGCTGCGCTTTTATGCTCAAACTTTTTTTTTCTCATCCGTGCCTATTTA
TTTTCTTCTTTTTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CGGCTGCGCTTTTATGCTCAAACTTTTTTTTTCTCATCCGTGCCTATTTATTTTCTTCTT
TTTATTCC

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DS 



AS 1 4

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TTTTTCTTGGTCAGAAGGCAAAAGAAAGTTAATTTACTTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF67JQ U 10
AF RR4DL29JQ U 1
AF RR4DL29TF C 351
AF RR4DF67TF C 476
BS 1 122 RR4DL29JQ
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BS 754 1092 RR4DL29TF
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RD RR4DF67JQ 556 0 0
AG
AAATGCCAATTTTGTTATAAACTTGAGAATCCGGAATCTTTTGTCATGCCAAAAGACTAG
CAAAATCGTCTAAATGAAATTTGACCAATGGAAGGAAAAAGGAACTTAGTGCTTCCTTCA
ATGAACATCTCTTTTT*GGTGCTTGGTCACTGTGAAAGGGAAGAAACTTCTTTAAGAACC
TCTTGTGAGAGGTCATCTGGATTATACTCAACTCCAAAGCATCTCACAACCTCCATCTTC
GGATTCAACAAGTACATGTTATGAGAAGTATCAACGAGGTAATCATCTCCATCTTCTTGA
ACCTTCTTGAAATAAACACGATACTCCTGTGCCATTTGCCTCATTGCACTTGCTGATCCA
GTCAATCCAAGTATTCTATCATCAAATTCTTTCAAGTAAGCATGGAGATGAGAAGGCGTA
TCTCGTACAGGGTCAAGAGTAACAAAAACAGGCAGAATCTTCTGGTCATGATTAGACTCT
AGTTTATCAACAGCTCTGGAGATCATCTTAAGCTGGTCAGGTCCAACATCAGGGGAAAAC
GAGTATCCAAAGTA

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DS 

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CAAAAGACTAGCAAAATCGTCTAAATGAAATTTGACCAATGGAAGGAAAAAGGAACTTAG
TGTTTCCTTCAATGAACATCTCTTTTTTGGTGCTTGGTCACTGTGAAAGGGAAGAAACTT
CTTTAAGAACCTCTTGTGAGAGGTCATCTGGATTATACTCAACTCCAAAGCATCTCACAA
CCTCCATCTTCGGATTCAACAAGTACATGTTATGAGAAGTATCAACGAGGTAATCATCTC
CATCTTCTTGAACCTTCTTGAAATAAACACGATACTCCTGTGCCATTTGCCTCATTGCAC
TTGCTGATCCAGTCAATCCAAGTATTCTATCATCAAATTCTTTCAAGTAAGCATGGAGAT
GAGAAGGCGTATCTCGTACAGGGTCAAGAGTAACAAAAACAGGCAGAATCTTCTGGTCAT
GATTAGACTCTAGTTTATCAACAGCTCTGGAGATCATCTTAAGCTGGTCAGGTCCAACAT
CAGGGGAAAACGAGTATCCAAAGTAGAGGAGAACCCATTTATCACGCAAGTCTTTCTCAG
TTACAACCTTGTTCTGTGTGCTCATAAGCGTGAATGGACCTCCGATAATAGGACCTCTGA
CTGTTGTGTTAGAACCACAGCCACAACCGCTACTATTGCTGCTGCTTGGTTGACCTTTAG
GAACAGCTCTCCTTTCGTCGTTGTAGTGAAGAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4DL29TF 742 0 0
CCTCA
TGCACTTGCTGATCCAGTCAATCCAAGTATTCTATCATCAAAT*CTTTCAAGTAAGCATG
GAGATGAGAAGGCGTATCTCGTACAGG*TCAAGAGTA*CAAAAACAGGCAGAATCTTCTG
GTCATGATTAGACTCTAGTTTATCAACAGCTCTGGAGATCATCTTAAGCTGGTCAGGTCC
AACATCAGGGGAAAACGAGTATCCAAAGTAGAGGAGAACCCATTTATCACGCAAGTCTTT
CTCAGTTACAACCTTGTTCTGTGTGCTCATAAGCGTGAATGGACCTCCGATAATAGGACC
TCTGACTGTTGTGTTAGAACCACAGCCACAACCGCTACTATTGCTGCTGCTTGGTTGACC
TTTAGGAACAGCTCTCCTTTCGTCGTTGTAGTGAAGAAAGGCTAAGAATCCAGTAAACCC
AAGCGCAAGTGCTGGAGCAGCATAACGAGCACGGGAGCGAGAATGAGTCTGAGCTGTTCC
GACAGGCAACTGAGGTTTAAGATCTGTCCTTCCATGTGTCCCTCCCTGTCTTGTCGATTG
ACTGTAATTGAATGACTGAGTTCTTCTAGATGACCCTCGGAGAAAACTGGCCGCCTGATT
CGCACCTTGTTTGCAGGAAAGAAGAAGACGCCGAACAGCAAACATTTTTTTTTACTTTAT
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TTCCGAATTCGTCTACG

QA 6 742 6 742
DS 

RD RR4DF67TF 706 0 0
GTCATGATTAGACTCTAGTTTATCAACAGCTCTGGAGATCATCTTAAGCTGGTCAGGTCC
AACATCAGGGGAAAACGAGTATCCAAAGTAGAGGAGAACCCATTTATCACGCAAGTCTTT
CTCAGTTACAACTTTGTTCTGTGTGCTCATAAGCGTGAATGGACCTCCGATAATAGGACC
TCTGACTGTTGTGTTAGAACCACAGCCACAACCGCTACTATTGCTGCTGCTTGGTTGACC
TTTAGGAACAGCTCTCCTTTCGTCGTTGTAGTGAAGAAAGGCTAAGAATCCAGTAAACCC
AAGCGCAAGTGCTGGAGCAGCATAACGAGCACGGGAGCGAGAATGAGTCTGAGCTGTTCC
GACAGGCAACTGAGGTTTAAGATCTGTCCTTCCATGTGTCCCTCCCTGTCTTGTCGATTG
ACTGTAATTGAATGACTGAGTTCTTCTAGATGACCCTCGGAGAAAACTGGCCGCCTGATT
CGCACCTTGTTTGCAGGAAAGAAGAAGACGCCGAACAGCAAACATTTTTTTT*ACTTTAT
TTTCTTCTTATTGTCGGGAAATAATAAACATTCAAATCAAACCAAAGATTAGAGCCATTT
TTCCGAATTCGTCTACGAAACAAAAAAAGAAAAAAAATCACTACTTTTTCTCTTCCTGTC
GAATCTTTTTCTTGGTCAGAAGGCAAAAGAAAGTTAATTTACTTCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 3

CO CL2733Contig1 1189 3 12 U
AAGATAAAACATCATCATATATATTCACATAAAGTTTATTCACATAAAACTCTATTTCCC
TAATAACTAAAAGGGTAAAAGCTCAGTAAATAAACAAACATGAAGCAGACAAACACAAAC
AGAGAGAGACAAACATGTTTGATTAATTGCTTTTCTAACACTTAGAAGGCCTCTCATAAT
CAGGAGGCAAAGAAGGACAATTCTCATTCATGTTTGGATAAGGATCAATGGTGTTATAAC
CAGGCAACTCCATTCTGTATTCACCTAGAATCTGACAGAACTCAAGCTTCCCATTCTCTG
TGTTACACCAGCTCGGTAGCCTCGTCTGATTATCTTCAAACAGCCTCAGAGTGTACGAAT
CTCGAATAGTGAACTCAGTGACTTGAATGTGATCAGCAAGAGGACCAAACACACCAGCGG
CTTTGTACATTGCAAGGATGAAAGCAACACATGTAGTTGACTTCCCATCACTATAAACCC
ACTCATCCTGTTCAGGGATGGTCAGCAGCTCATCAAACGACATCCCACGCCTGGCGGTTT
CTTCAAGAATCCCATACAAATCAAGATCCTCAGTACCGAGACGTTTATTGAGCGCCTCGT
TCCACATATTCGCAGCGTAAGCAGGCTGCACACGAGTCCACATAGACATGACAGAAATAA
CCAAGTGAGCATCAAGGGGAGGAGGGTAGTTATCAGCTAGAGCGTCGATCCAGCTGAAGA
TCATGTTGTGATATCCATAAGGCTTCCCCAACATGCTCCGTGCATACTCCCACGCAGCTG
TGTTGTTGAACTCTCCTCGGACATCCGGATGCAGAGGAAGCAAAGCTACTTGTGGGTTTG
AGTTATCCTTCAACGTGAGAGCCCACCATTCATCCCAAGGAATCACAACAATGATCTCTT
CACCCTTCTCGTTCTCATGACCAGATTCACCAACCCAAAGCCTCCCCAAATCATCCTTCA
GACAAACAGCTGTATGACCAGCGAAAGCACCGGTCACCCATTTCTCCAGTGTCTCGAACC
CACCCCACCTTCCTAGACATTCGATCCGGTCTTTTCCGGGTCGGATCTCAAGTTGTGATT
TTGAGAGTTTTCTCCGAGATTTCTGGGGAATTTTGAGAGAGGGGGTTTAGGTTTGGTGTC
AAGGTTGAAGATGATGATCCATTATTGTGATTTCTCGCTGTCTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E749JQ U 23
AF RR4DI80JQ U 1
AF RR4DI80TF C 407
BS 1 37 RR4DI80JQ
BS 38 38 RR4E749JQ
BS 39 49 RR4DI80JQ
BS 50 50 RR4E749JQ
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BS 408 792 RR4DI80JQ
BS 793 1189 RR4DI80TF

RD RR4E749JQ 715 0 0
ATC
CACATAAAGTTTATTCACATAAAACTCTGTTTCCCTAATAACTAAAAGGGTAAAAGCTCA
GTAAATAAACAAACATGAAGCAGACAAACACAAACAGAGAGAGACAAACATGTTTGATTA
ATTGCTTTTCTAACACTTAGAAGGCCTCTCATAATCAGGAGGCAAAGAAGGACAATTCTC
ATTCATGTTTGGATAAGGATCAATGGTGTTATAACCAGGCAACTCCATTCTGTATTCTCC
TAGAATCTGACAGAACTCAAGCTTCCCTTTCTCTGTGTTACACCAGCTCGGTAGCCTCGT
CTGATTATCTTCAAACAGCCTCAGAGTGTATGCATCTCGAATAGTGAACTCAGTGACTTG
AATGTGATCAGCAAGAGGGCCAAATACACCAGCTGCTTTATACATTGCAAGGATGAAAGC
AACACATGTAGTTGACTTCCCGTCGCTATAAACCCACTCATCCTGTTCAGGGATGGTCAG
CAGCTCATCAAACGACATCCCACGCCTGGCGGTTTCTTCAAGAATCCCATACAAATCAAG
ATCCTCAGTACCGAGCCGTTTATTGAGCGCCTCGTTCCACATATTAGCAGCATACGCAGG
CTGCACACGAGTCCACATAGACATGACAGAAATAACCAAGTGAGCATCAAGGGGAGGGGG
GTAGTTATCACCTAGAGTGTC**TCCAGCTGAAGATCATGTTGTGATATCCA

QA 4 715 4 715
DS 

RD RR4DI80JQ 802 0 0
AAGATAAAACATCATCATATATATTCACATAAAGTTTGTTCACATAAAAGTCTATTTCCC
TAATAACTAAAAGGGTAAAAGCTCAGTAAATAAACAAACATGAAGCAGACAAACACAAAC
AGAGAGAGACAAACATGTTTGATTAATTGTTTTTCTAACACTTAGAAGGCCTCTCATAAT
CAGGAGGCAAAGAAGGACAATTCTCATTCATGTTTGGATAAGGATCAATGGTGTTATAAC
CAGGCAACTCCATTCTGTATTCACCTAGAATCTGACAGAACTCAAGCTTCCCATTCTCTG
TGTTACACCAGCTCGGTAGCCTCGTCTGATTATCTTCAAACAGCCTCAGAGTGTACGAAT
CTCGGATAGTGAACTCAGTGACTTGAATGTGATCAGCAAGAGGACCGAACACACCAGCGG
CTTTGTACATTGCAAGGATGAAAGCAACACATGTAGTTGACTTCCCATCACTATAAACCC
ACTCATCCTGTTCAGGGATGGTCAGCAGCTCATCAAACGACATCCCACGCCTGGCGGTTT
CTTCAAGAATCCCATACAAATCAAGATCCTCAGTACCGAGACGTTTATTGAGCGCCTCGT
TCCACATATTCGCAGCGTAAGCAGGCTGCACACGAGTCCACATAGACATGACAGAAATAA
CCAAGTGAGCATCAAGGGGAGGAGGGTAGTTATCAGCTAGAGCGTCGATCCAGCTGAAGA
TCATGTTGTGATATCCATAAGGCTTCCCCAACATGCTCCGTGCATACTCCCACGCAGCTG
TGTTGTTGAACT
CTCTCGGACA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4DI80TF 783 0 0
CGAC
ACACCAGCGGCTTTGTACAT*GCAAGGATGAAAGCAACACATGTAGTTGACTTCCCATCA
CTATAAACCCACTCATC*TGT*CAGGGATG*TCAGCAGCTCATCAAACGACATCCCACGC
CTGGCGGTTTCTTCAAGAATCCCATACAAATCAAGATCCTCAGTACCGAGACGTTTATTG
AGCGCCTCGTTCCACATATTCGCAGCGTAAGCAGGCTGCACACGAGTCCACATAGACATG
ACAGAAATAACCAAGTGAGCATCAAGGGGAGGAGGGTAGTTATCAGCTAGAGCGTCGATC
CAGCTGAAGATCATGTTGTGATATCCATAAGGCTTCCCCAACATGCTCCGTGCATACTCC
CACGCAGCTGTGTTGTTGAACTCTCCTCGGACATCCGGATGCAGAGGAAGCAAAGCTACT
TGTGGGTTTGAGTTATCCTTCAACGTGAGAGCCCACCATTCATCCCAAGGAATCACAACA
ATGATCTCTTCACCCTTCTCGTTCTCATGACCAGATTCACCAACCCAAAGCCTCCCCAAA
TCATCCTTCAGACAAACAGCTGTATGACCAGCGAAAGCACCGGTCACCCATTTCTCCAGT
GTCTCGAACCCACCCCACCTTCCTAGACATTCGATCCGGTCTTTTCCGGGTCGGATCTCA
AGTTGTGATTTTGAGAGTTTTCTCCGAGATTTCTGGGGAATTTTGAGAGAGGGGGTTTAG
GTTTGGTGTCAAGGTTGAAGATGATGATCCATTATTGTGATTTCTCGCTGTCTCTCTCC

QA 5 783 5 783
DS 



AS 1 4

CO CL2734Contig1 1339 4 12 U
GGATCGCTATAGACACATAACATACACCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTAATTAAAAGAATT
AAATAAAAACAACATTGGAGAGAAAGAAAGAAGAGAGGAACAAAATCAAAGGAAGGAAGG
AAGGAGAGGAAACCCAAAAGCTTCCTTTCTTCTTCATCATCATCTTAGATTCCAACTTCC
ATCCACCGATTGATTATTCATGGCTGAGTTGACTCAGGCGGAAGTTGTTTACTCTCGTCG
GTCGCTTCAACTGTGGAAGACTCTGGTGAACTGCCTGGCCTTCTTCTACCAGATCTTCCT
CCAGATCCTCCGCGCCGTCGGATACCATCCCCTCCTCTCTTCCTCCGCTTCCGATGGTTT
CAAACCCTTACGGAACATCGAACTGCTCGAAACGGCGTCGGATTCTCCCACCTCCGTGGA
AATCGAGTCCTCCTCAATCCAAGTCCAACACAGCCAGAGACTCAAGGTAGTTCTTGACTT
GGACGAGACGTTAGTCTGTGCATATGAGACTTCTACTCTACCTCCTGCTTTGCGTAATCA
AGCCATTGACGCTGGATTAAACTGGTTCGAGTTGGAGTGTTTCTCATCTGACAAGGAAGT
TAATGGGAAACCTAAGATCAATTACGTCACTGTCTTTGAACGTCCAGGACTGCACGAGTT
CTTAGAGCAACTTAGCCACTTTGCAGATCTTGTTCTCTTTACCGCTGGTCTTGAAGGGTA
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ACCTTCAACTGTCAGCACGCAATACCGAGATCATGTGAAGGATCTGTTAAGCACATCAAA
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AAATGGGATTCCATGTGTTGCGTTTTCCGCAGGGCAGCCAAATGACACTCAGCTTTTGGA
TGTTATACTTCCACTTCTCAAGCAACTTTCAGAGGAAGAAGATGTAAGACCGACACTTTA
TGATCGGTTCCACATGCCTGAATGGTTTGAGAAGCAAGGCATACCACCTTCGTGCTGGAA
CCCTTAGATACTAGTGGAAATATATATATATATATCAGAAACTCTTTGGTCCACAAAAAA
AGGCGAAGGACTGGGTTGGATCAGTAAACGTGAGGAGAAGGAAGACACAGAAGCTACCAT
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CATTCATGGTTTCATGTGATTTTCTGTAGCTTTCTTTGTACCATTGGTTAATAATCAAAG
CATTTTTATTTTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E944JQ C 766
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AAATAAAAACAACATTGGAGAGAAAGAAAGAAGAGAGGAACAAAATCAAAGGAAGGAAGG
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GTCGCTTCAACTGTGGAAGACTCTGGTGAACTGCCTGGCCTTCTTCTACCAGATCTTCCT
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AGCCATTGACGCTGGATTAAACTGGTTCGAGTTGGAGTGTTTCTCATCTGACAAGGAAGT
TAATGGGAAACCTAAGATCAATTACGTCACTGTCTTTGAACGTCCAGGACTGCACGAGTT
CTTAGAGCAACTTAGCCACTTTGCAGATCTTGTTCTCTTTACCGCTGGTCTTGAAGG*TA
TGCGAGAC*ACTTGTGGACAGGATTGATACCAGGAA*GTACTCACCAACCGACTTTATCG
ACCTTCA*CTGTCAGCACGCA

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DS 

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G
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CATCATCATCTTAGATTCCAACTTCCATCCACCGATTGATTATTCATGGCTGAGTTGACT
CAGGCGGAAGTTGTTTACTCTCGTCGGTCGCTTCAACTGTGGAAGACTCTGGTGAACTGC
CTGGCCTTCTTCTACCAGATCTTCCTCCAGATCCTCCGCGCCGTCGGATACCATCCCCTC
CTCTCTTCCTCCGCTTCCGATGGTTTCAAACCCTTACGGAACATCGAACTGCTCGAAACG
GCGTCGGATTCTCCCACCTCCGTGGAAATCGAGTCCTCCTCAATCCAAGTCCAACACAGC
CAGAGACTCAAGGTAGTTCTTGACTTGGACGAGATGTTAGTCTGTGCATATGAGGCTTCT
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GAGTGTTTCTCATCTGACAAGGAAGTTAATGGGAAACCTAAGATCAATTACGTCACTGTC
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AAAGTACTCACCAACCGACTTTATCGACCT

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GAACGTCCAGGACTGCACGAGTTCTTAGAGCAACTTAGCCACTTTGCAGATCTTGTTCTC
TTTACCGCTGGTCTTGAAGGGTATGCGAGACCACTTGTGGACAGGATTGATACCAGGAAA
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AAGGATCTGTTAAGCACATCAAAGAACATGTCAAGGACAGTGATTGTTGACAACAATCCT
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GGCATACCACCTTCGTGCTGGAACCCTTAGATACTAGTGGAAATATATATATATATATCA
GAAACTCTTTGGTCCACAAAAAAAGGCGAAGGACTGGGTTGGATCAGTAAACGTGAGGAG
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TTAAAAGATAAATATCTGTTACACATTCATGGTTTCATGTGATTTTCTGTAGCTTTCTTT
GTACCATTGGTTAATAATCAAAGCATTTTTATTTTTTTTTCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4E944JQ 567 0 0
CAACCGACTTTATCGACCTTCAACTGTCAGCACGCAATACCGAGATCATGTGAAGGATCT
GTTAAGCACATCAAAGAACATGTCAAGGACAGTGATTGTTGACAACAATCCTTTCAGCTT
TTTATTGCAACCATCAAATGGGATTCCATGTGTTGCGTTTTCCGCAGGGCAGCCAAATGA
CACTCAGCTTTTGGATGTTATACTTCCACTTCTCAAGCAACTTTCAGAGGAAGAAGATGT
AAGACCGACACTTTATGATCGGTTCCACATGCCTGAATGGTTTGAGAAGCAAGGCATACC
ACCTTCGTGCTGGAACCCTTAGATACTAGTGGAAATATATATATATAT**CAGAAACTCT
TTGGTCCACAAAAAAAGGCGAAGGACTGGGTTGGATCAGTAAACGTTAGGAGAAGGAAGA
CACAGAAGCTACCATTCCTATTATTGTTTATATTTTATGGTAGAGATTCCTTTTAAAAGA
TAAATATCTGTTACACATTCATGGTTTCATGTGATTTTCTGTAGCTTTCTTTGTACCATT
GGTTAATAATCAAAGCATTTTTATT
CT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 4

CO CL2735Contig1 1412 4 14 U
GACTACATGGTTGGCTCGCTTCAGAACAACGTGTCGGCTTCTGGATTATTACTGCCAGCA
ACGAGTTCCGTACTTGTGGGCCCGTCAAACAAGAACTCACTTCTCATACTGGACCCACCT
TACTTTCTATGTTTACAAGTACACACTATGCTGGAAAAGAAATCAACACAACTTACGCAA
GCGGTGAGCCGTGGAAGAAGATGTTTGGTCCTGTCTTTGTTTATCTCAACTCTGCCCCCT
CTCCCGATCTCATGTGGACCGATGCTAAACGACAGTTGGCTGCCGAGGTTAAAAGCTGGC
CTTATGAGTTCGTGAAGTCAGAAGATTACCCTCTTCGCCAACAAAGAGGAACAGTCCAGG
GTCAACTATCTGTCAAGGACAGTTTCAAAAGCAAGTCGAAGTTAAACGAAGAAATTGCTT
TTGTGGGTTTAGCATTACCTGGTGAAGTTGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGATATC
AATTTTGGACACAAGCAGACAAAACGGGGACGTTCACCATAGCGAATGTGAGACCTGGCA
CTTATAACCTCTTCGCATGGGTTGCCGGACATATTGGCGACTATAAATACGAGCGTGAAA
TTACAATTACACCAGGTAAGGAAATAAACGTAGGACCCTTAGTGTATGAGCCGCCAAGAA
GTGGTCCAACGTTGTGGGAGATCGGTGTACCGGATCGGAGCGCCGCAGAATTCAATATCC
CGGATCCGGACCCAGCCCTTATAACCAAACTATATGCTAATCACCCAAATGCTCCTGAAG
ACAGATTTAGACAATATGGTCTATGGGATCGTTACAGTGCAGTGTATCCTAAAGAAGATG
TTACTTTTACTGTTGGAGTGAGTGACTATAAAAAAGATTGGTTCTTTGCACATCTCAACA
GAAAAACTGGAGGAAAGAAACTTCAAGCAACGACATGGAAAATTGTTTTTAACTTAAAAG
AAGTGTCCCAAAATGGAAATTATACTTTTCGAATGGCTTTGGCTGCAGCCAACACTGCCG
ATATATTAGTTGAGGTTAACAAACCACCTAGCACCAAACCTATGTTCAGGACTGGGATGG
TAGGTCGGGATAACGCGATCGCTAGACATGGAATTCACGGGTTATACAGATTGTTCAATA
TAGGCGTTCAGACGAATTTGCTCAAGGTTGGTGACAATACGATTTATCTCACTCAAAACC
GGGTCACTAGTATTTTTGCAGGTGTTATGTATGATTATTTTCGATTGGAAGGTCCTTCAG
GAGCCAAACAATAATTTTTTAAATATAGATAAGTGAGTGATATGAGAGTTTATTTTTTTT
ATTTTTTTTAAATAAGAAGATTTGTTATTAATAATCAATAATTTTTGTAACCAGTGAAAT
AAATATTTTGACTATTACATGCTTCCAAAGTG


BQ
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AACTGGAGGAAAGAAACTTCAAGCAACGACATGG

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G
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QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 4

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AATGAATATTGGACACTGAGAGTAGTATTGTGATTTTATAGACAGAAAAAGAGATGGAAT
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ATTTAGATCTTCATCCCCATCGTGTTTCCTTTTCTTATCATGATGTTTCTTAGAGTGATC
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ATCCCTGTCCTTGTGTTTTTTATGTTTCCTGTCCTTATCTTTCGACTCACGTTTTGACTT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4F515JQ U 1
AF RR4F515TF C 1
AF RR4CY08JQ U 541
AF RR4CY08TF C 686
BS 1 617 RR4F515JQ
BS 618 1299 RR4CY08JQ
BS 1300 1300 RR4CY08TF

RD RR4F515JQ 618 0 0
AATCTTACATCCTTTATAGTGTTCTTTTTCAACAGTAATTGCATAACTAATTATTTTTAC
AATGAATATTGGACACTGAGAGTAGTATTGTGATTTTATAGACAGAAAAAGAGATGGAAT
AAACACTCCAAATATTAAAATGTTACAAAGCTGCCACCAAATCAAATGTAATACAAGTTC
TGCTTCTTTTCTTCACAAATTTCACCACCTTCAACGAATGAATTCACCGTTTTGAATTTT
TTTAACCTAATATGTAGTCTACAGTGAGTTGCAAAATCGCTTCTAAACCTCTTTCATGAC
ACCTACAAGATTCCAGAATACGAAACTGGGAATGCCTACCAATTTTAGCCACCAACCCTT
ATAGCACCCATCCCATCAAGCTTTGAGCTCCTATGCTTGTTTTTTGTGCCTATGAACGTC
ATTTAGATCTTCATCCCCATCGTGTTTCCTTTTCTTATCATGATGTTTCTTAGAGTGATC
ACCCGAATCATGGTGGCCATTTTTTTCCTTTTTTCTGTCTCGGTCCTTGTCCTTGTCTTT
ATCTTTGCTTCGGTCTTTATGCCTGTGCTTGTGCTTCTTATGCTCTCTATCTTTGTCCTT
ATCCCTGTCCTTGTGTT
C

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4F515TF 618 0 0
AATCTTACATCCTTTATAGTGTTCTTTT*CAACAGTAATTGCATAACTAATTATTTTTAC
AATGAATATTGGACACTGAGAGTAGTATTGTGATTTTATAGACAGAAAAAGAGATGGAAT
AAACACTCCAAATATTAAAATGTTACAAAGCTGCCACCAAATCAAATGTAATACAAGTTC
TGCTTCTTTTCTTCACAAATTTCACCACCTTCAACGAATGAATTCACCGTTTTGAATTTT
TTTAACCTAATATGTAGTCTACAGTGAGTTGCAAAATCGCTTCTAAACCTCTTTCATGAC
ACCTACAAGATTCCAGAATACGAAACTGGGAATGCCTACCAATTTTAGCCACCAACCCTT
ATAGCACCCATCCCATCAAGCTTTGAGCTCCTATGCTTGTTTTTTGTGCCTATGAACGTC
ATTTAGATCTTCATCCCCATCGTGTTTCCTTTTCTTATCATGATGTTTCTTAGAGTGATC
ACCCGAATCATGGTGGCCATTTTTTTCCTTTTTTCTGTCTCGGTCCTTGTCCTTGTCTTT
ATCTTTGCTTCGGTCTTTATGCCTGTGCTTGTGCTTCTTATGCTCTCTATCTTTGTCCTT
ATCCCTGTCCTTGTGTT
C

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4CY08JQ 759 0 0
ATCTTTGCTTCGGTCTTTATGCCTGTGCTTGTGCTTCTTATGCTCTCTATCTTTGTCCTT
ATCCCTGTCCTTGTGTTTTTTATGTTTCCTGTCCTTATCTTTCGACTCACGTTTTGACTT
TGGTGGAATTGTAGGAGCTCCCTTCTCTGCTAGAGGCAATTCAACAGGAGTCATATCATT
TAGCTGGAAAGCCTCCTTAAGCTCATCCACATCAAAAGGCTGGATGCGGGTATTACTCTC
CCGGATCTGTGACGTATTATTATTCTGAACAAGCTGGTCTAACTGCATCCCTTCTCCTTT
TCTAATCTCAGCGTCCCCAACCACGTCATGAAGATAGTGGGAATCCGATAGAGACGCGGA
AAGCGACCTTTTGCAAAAGAACTCATGGTGTTGCAGTAGTTTGTACTGAGATATAAGATC
CACGGCACCGCACAACTCTCTCGGACCTCCAAATTGGAGACGTTCAGGCTCCATCTTCTT
CTTTTAACGAGCAGCTCTGAATTGCTTTTGCATGATCACTCCGATATGTATCACGTAAGA
CAAGCCCCAGATCTCATGGAGAAATCAATCTAGCTAAAAGAGCTGTCTCTCCAGAAGCAA
GGAAAACGGGAGAAAGTGGTTGGTCCGATTTCCCGCGCAAATTTGATTGAGCAAAGTGAT
GGGAGAAAGAGAGAGGAGAGAGATCGAGAGAGAGATCGAGAGGGAGACTACTTCTTCTTC
CTTTAGGGTTTCTTCAGAGTTTCTGTTTCTTCTTAACCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4CY08TF 615 0 0
TCTGCTAGAGGCAATTCAACAGGAGTCATATCATTTAGCTGGAAAGCCTCTTTAAGCTCA
TCCACATCAAAAGGCTGGATGCGGGTATTACTCTCCCGGATCTGTGACGTATTATTATTC
TGAACAAGCTGGTCTAACTGCATCCCTTCTCCTTTTCTAATCTCAGCGTCCCCAACCACG
TCATGAAGATAGTGGGAATCCGATAGAGACGCGGAAAGCGACCTTTTGCAAAAGAACTCA
TGGTGTTGCAGTAGTTTGTACTGAGATATAAGATCCACGGCACCGCACAACTCTCTCGGA
CCTCCAAATTGGAGACGTTCAGGCTCCATCTTCTTCTTTTAACGAGCAGCTCTGAATTGC
TTTTGCATGATCACTCCGATATGTATCACGTAAGACAAGCCCCAGATCTCATGGAGAAAT
CAATCTAGCTAAAAGAGCTGTCTCTCCAGAAGCAAGGAAAACGGGAGAAAGTGGTTGGTC
CGATTTCCCGCGCAAATTTGATTGAGCAAAGTGATGGGAGAAAGAGAGAGGAGAGAGATC
GAGAGAGAGATCGAGAGGGAGACTACTTCTTCTTCCTTTAGGGTTTCTTCAGAGTTTCTG
TTTCTTCTTAACCCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL2737Contig1 705 2 3 U
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TGGCGAATCAGATTCCAGAGAGCAATCAACCGTCGAATACGCAGACCTACGGCTTTCCGA
TCTACGCAGCCGACTGGATCCCGGAAGAAACCGTCAGATCGAAAATCGACAAGGATCAGA
ACAACTCCGAAGATGACGGCAGCGAGTCTTCTTCTTCTCCGTCTTCGTCGACGACCTCCC
GGAGCTGCATCGTTTTGGCGGGAGGAGGCGGAGAGGGACGAAGCGGGATCGCTAACGTCG
TCTTAATCTGTCGTGTTGATCTCGACACCAAATCTCTGTCCGAACAACCTGTGGGTAGGA
TTGTGCTTGGTACTGATCTGCCCTACAGGATGGCTGTTCATCCTCGTGGAGGTGGTCTTG
TTTGCGCATTGCCTAACAGTTGCAAACGGTTTGATTGGGAGAACATTATGAGTCCAAGAG
AGGCTGGTGAAGATGGAGAGGAAGTGATTAAGGAATTGAAGGACGTGGGACAACAGTTAG
CTTTGGCGTTTAATCAGGAGGGGTCCGTGCTTGCTGCTGGTGGAGAGGATGGGACTTTGA
GGATTTTTGAATGGCCTAGTATGAAAACGTTACTTGATGAGTCTAAGCACATTCATCAGT
TAAAAACCTAACTTTCAGCGAAAGTGGTAAGTTTCTTGTGTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CF29TF U 1
AF RR4GY95TF U 13
BS 1 665 RR4CF29TF
BS 666 666 RR4GY95TF
BS 667 705 RR4CF29TF

RD RR4CF29TF 705 0 0
GGGTGTCTAGGAATCAGACAAGAAGACTTCACATTGAGCTAGCTCGAGAAGGGGAACAAA
TGGCGAATCAGATTCCAGAGAGCAATCAACCGTCGAATACGCAGACCTACGGCTTTCCGA
TCTACGCAGCCGACTGGATCCCGGAAGAAACCGTCAGATCGAAAATCGACAAGGATCAGA
ACAACTCCGAAGATGACGGCAGCGAGTCTTCTTCTTCTCCGTCTTCGTCGACGACCTCCC
GGAGCTGCATCGTTTTGGCGGGAGGAGGCGGAGAGGGACGAAGCGGGATCGCTAACGTCG
TCTTAATCTGTCGTGTTGATCTCGACACCAAATCTCTGTCCGAACAACCTGTGGGTAGGA
TTGTGCTTGGTACTGATCTGCCCTACAGGATGGCTGTTCATCCTCGTGGAGGTGGTCTTG
TTTGCGCATTGCCTAACAGTTGCAAACGGTTTGATTGGGAGAACATTATGAGTCCAAGAG
AGGCTGGTGAAGATGGAGAGGAAGTGATTAAGGAATTGAAGGACGTGGGACAACAGTTAG
CTTTGGCGTTTAATCAGGAGGGGTCCGTGCTTGCTGCTGGTGGAGAGGATGGGACTTTGA
GGATTTTTGAATGGCCTAGTATGAAAACGTTACTTGATGAGTCTAAGCACATTCATCAGT
TAAAA*CCTAACTTTCAGCGAAAGTGGTAAGTTTCTTGTGTCACT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GY95TF 691 0 0
GG
CAGACAAGAAGACTTCACATTGAGCTAGCTCGAGAAGGGGAACAAATGGCGAATCAGATT
CCAGAGAGCAATCAACCGTCGAATACGTAGACCTACGGCTTTCCGATCTACGCAGCCGAC
TGGATCCCGGAAGAAACCGTCAGATCGAAAATCGACAAGGATCAGAACAACTCCGAAGAT
GACGGCAGCGAGTCTTCTTCTTCTCCGTCTTCGTCGACGACCTCCCGGAGCTGCATCGTT
TTGGCGGGAGTAGGCGGAGAGGGACGAAGCGGGATCGCTAACGTCGTCTTAATCTGTCGT
GTTGATCTCGACACCAAATCTCTGTCCGAACAACCTGTGGGTAGGATTGTGCTTGGTACT
GATCTGCCTTACAGGATGGCTGTTCATCCTCGTGGAGGTGGTCTTGTTTGCGCATTGCCT
AACAGTTGCAAACGGTTTGATTGGGAGAACATTATGAGTCCAAGAGAGGCTGGTGAAGAT
GGAGAGGAAGTGATTAAGGAATTGAAGGACGTGGGACAACAGTTAGCTTTGGCGTTTAAT
CAGGAGGGGTCCGTGCTTGCTGCTGGTGGAGAGGATGGGACTTTGAGGATTTTTGAATGG
CCTAGTATGTAAACGTTACTTGATGAGTCTAAGCACATTCATTAGTTAAAAACCTAACTT
TCAGCGAAAGTGGTAAGTTTCTTGTGTCA

QA 3 691 3 691
DS 



AS 1 3

CO CL2738Contig1 960 3 4 U
GGATCTGCTTCACTCTCTCTAGAGCAACAATGGCTACGGCTGCTTCATCCTTTACTATCG
CATCATCCTTCTCCGAACCACGGACTCAGATCCGTTCCTCGAAGCGCTCGAGCCTCCCGA
TACTTCAATTCTCCATCCCGTATATGGCCAATTCACGGAGCAGGAGACTCGTCGTCAGCT
CCGTTTCAGCGCCCAACGTTGAGCTCCGTACCGGACCCGATGCTCTCATTTCATCTCTCC
TCTCTAAGGTTGCGAATAGTGATGGAGGTGTGACGCTTAGCCCGGAAGAACACAAGGAGG
TGGCACAAGTGGCTGGAGAGCTTCAAAAGTACTGTGTGAGCGAGCCTGTCAAATGCCCTC
TCATCTTCGGAGATTGGGATGTGGTGTACTGTTCTGTACCGACATCTCCAGGTGGAGGCT
ACAGAAGCGTGATAGGCCGCCTCTTCTTCAGAACCAATGAGATGATCCAAGGCATTGATT
CTCCTGACATCGTGAGGAACAGAGTTTCCTTTACTGCTTTGGGTTTTCTTGACGGAGACG
TCTCCTTGACAGGGAAGCTGAAAGTGTTGGACAGTGAGTGGGTTCAGGTGATATTCGAGC
CTCCGGAACTGAAGGTGGGATCTCTGGAGTTTAAATATGGGTTTGAAAGCGAAGTGAAGC
TTAGGATCACATACGTTGATGAGAAACTTAGATTGGGATTAGGCTCTAGAGGATCGTTGT
TTGTCTTTAGGAGGCGCCAATAATACATTTATATACTTCCATGTCTGTGCTCTGCCTCGC
CCATTTGTTTTTTTCCCGTTCTGCATCGGTCAATGCAATTCACTACAGAAAAGAAGAAAC
AACACATGTGTACCTGCGAGAGGGTGTAACGGCGTAATATCAGAAACGTGTTTTATTGAA
CTTTGTTGTAATGTAAACTTCGTTCCAAGAGTTGTCGAGTTGCTACCTACATGTTATTAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A112TFB U 1
AF RR4A112TF U 1
AF RR4EX34TF U 308
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BS 831 834 RR4A112TF
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CTCTGC

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CATCATCCTTCTCCGAACCACGGACTCAGATCCGTTCCTCGAAGCGCTCGAGCCTCCCGA
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CCGTTTCAGCGCCCAACGTTGAGCTCCGTACCGGACCCGATGCTCTCATTTCATCTCTCC
TCTCTAAGGTTGCGAATAGTGATGGAGGTGTGACGCTTAGCCCGGAAGAACACAAGGAGG
TGGCACAAGTGGCTGGAGAGCTTCAAAAGTACTGTGTGAGCGAGCCTGTCAAATGCCCTC
TCATCTTCGGAGATTGGGATGTGGTGTACTGTTCTGTACCGACATCTCCAGGTGGAGGCT
ACAGAAGCGTGATAGGCCGCCTCTTCTTCAGAACCAATGAGATGATCCAAGGCATTGATT
CTCCTGACATCGTGAGGAACAGAGTTTCCTTTACTGCTTTGGGTTTTCTTGACGGAGACG
TCTCCTTGACAGGGAAGCTGAAAGTGTTGGACAGTGAGTGGGTTCAGGTGATATTCGAGC
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CCATTTGTTTTTTTCCCGTTCTGCATCGGTCAATGCAATTCACTACAGAGAAGA
GAGAAACAACACGG

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DS 

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G
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TAATGTAAACTTCGTTCCAAGAGTTGTCGAGTTGCTACCTACATGTTATTAA

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 4

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ATATTGTGTACAATACAGAACAGATAAAGATGCGATATGTGATCCAAGTCAAATTTAACT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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AF RR4DR84TF U 1
AF RR4E770TF U 58
AF RR4E770JQ C 185
AF RR4DR84JQ C 460
BS 1 577 RR4DR84TF
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RD RR4DR84TF 674 0 0
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CACTGGTGCTAATGACGGTGTCCTGCTCCTCTGCGAGGTTGCTTTGGGAGACATGAATGA
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QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4E770TF 685 0 0
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QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4E770JQ 713 0 0
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CTGAATTCGGATTATAACGCGGATAAATTGCCTCCGGGGAAGCTAAGCACAAAAGGTGTA
GGGAGAACAGCACCAAACCCATCAGAGGCTAAGACACTAGAAGATGG*TGTTGTTGTTCC
ACTTGGCAAACCAGTGGATCATTCAAGCTCCAAGGGGGCATTATTGTACAACGAATATAT
TGTGTACAATACAGAACAGATAAAGATGCGATATGTGATCCAAGTCAAATTTAACTATAA
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DS 

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TGTTTATGCATTTTAATT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 3

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CCCGAATCGGTTTTGGTGCCTTCGTTGGAATCCACACTGGGAGTCTCCGTTACGGACGAG
AAGTTCTTTGCGCTCATCGTTACGGTTACTTTGATGTTTTCCTTCGTACGAGAGATTTTC
TTACAAAGAACAAGAGCTGTTTTCCC


BQ
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AF RR4BH62JQ U 1
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QA 1 741 1 741
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RD RR4BH62TF 775 0 0
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QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

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CATCTTGACCATCGACTTCCCGAAATCTGTTCCAAACCTCAATGATGGTCGGCGTAAGCC
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DD79JQ U 26
AF RR4G270JQ U 1
AF RR4G270TF C 553
AF RR4DD79TF C 581
BS 1 70 RR4G270JQ
BS 71 71 RR4DD79JQ
BS 72 72 RR4G270JQ
BS 73 73 RR4DD79JQ
BS 74 150 RR4G270JQ
BS 151 152 RR4DD79JQ
BS 153 252 RR4G270JQ
BS 253 253 RR4DD79JQ
BS 254 319 RR4G270JQ
BS 320 320 RR4DD79JQ
BS 321 755 RR4G270JQ
BS 756 1067 RR4G270TF
BS 1068 1068 RR4DD79TF
BS 1069 1239 RR4G270TF

RD RR4DD79JQ 367 0 0
ACAATTACAATCTTACACTTGAATATTCATAACGTAGCAATCAAAACCACAAGAAGATAT
AGCAAACTTATTGTATAAAACAAATGATTATTGATTAACCATCACAGATTAAAACCAAAC
CACACACTGATGTGCTTTCATATTCTTAATCAGTTGATCCTAGAGCAAACCCTACGAATC
TCCCCATCTGATCCTGTCTTAACGTCTATAAGACTCATCTTGACCATCGACTTCCCGAAC
TCTGTTCCAAACCTCAATGATGGTCGGCGTAAGCCTAATAACCGTTCTATGATGACTCGT
GTCTCGGGGTCCCTCCACAAGACTAGGTCGGATTGGAGTACCACACGGCTTGACCTCACG
TTCCTTA

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4G270JQ 755 0 0
TCATATAGTATAATACATTCATGTTACAATTACAATCTTACACTTGAATATTAATAACGT
AGCAATCAAA*CTACAAGAAGATATAGCAAACTTATCGTATAAAACAAATGATTATTGAT
TAACCATCACAGATTAAAACCAAACCACAC**TGATGTGCTTTCATATTCTTAATCAGTT
GATCCTAGAGCAAACCCTACGAATCTCCCCATCTGATCCTGTCTTAACGTCTATAAGACT
CATCTTGACCATTGACTTCCCGAAATCTGTTCCAAACCTCAATGATGGTCGGCGTAAGCC
TAATAACCGTTCTATGATGGCTCGTGTCTCGGGGTCCCTCCACAAGACTAGGTCGGATTG
GAGAACCACACGGCTTGACCTCACGTTCCTTAGGAACGATGTGTCAAACCTGCCAACACT
ACCAGCGTCTAAGTCGACTCGGGCTGATGCGTCTCCGGTTTGAGGGCATCGAGCCTGAAC
CAATGGTACGAACCTCGGATCGATTGATGGGTCTGGTTGTCCTGTGCTGTTGAAATTAAA
GAACCTGCCTCTCACCAAACCGCAACCCGCTGTTCCTATCGTGTGTCCGCCAACAAGAGT
TACAAGGTCTAGTGTGTTGAGAGTTTTAGCAGCGAAGTCTCGCTTCTGCTTGTCGACGGG
ATCGAATGGTCCGGGTAAGATCACGTCCGAGGCTTGCGAGATTCGGCCATCCAGACGTCC
CAATGGCACTCGCCACCCTTGTCCACCGGTCAAAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4G270TF 687 0 0
CACCAAACCGCAACCCGCTGTTCCTATCGTGTGTCCGCCAACAAGAGTTACAAGGTCTAG
TGTGTTGAGAGTTTTAGCAGCGAAGTCTCGCTTCTGCTTGTCGACGGGATCGAATGGTCC
GGGTAAGATCACGTCCGAGGCTTGCGAGATTCGGCCATCCAGACGTCCCAATGGCACTCG
CCACCCTTGTCCACCGGTCAAAACAACGGCTTCGCGTGCAGCAAGAGTGAGAATATCCGC
ACAAGAAACAGTTCTAGGACAAGCAGCCTCAAGCCTAGTCTTAGCTTCTTCAATAGCTTC
AAACCCTCTCAGTGAACGGTTTGGACCGGCTGTTCTCTCAGAGCTATTACCAGCGATGAG
AACTGACCCATCGCAGCCACGAACAAAGCAATCGTGAAAATGCATACGCAAAATCCCGGG
TGCATTAGCCGGGTTGGACCGGACATGTGCTCGAACCACCGATGCCACAATGGACTCTAC
GTTTCGGCATCTATTGCCATAATACCCAACACGTG*TCTTCGACCAACACCTCCACGGCT
CGAACCACGATTTCCTTGTGCAGTTACAGCTGCGACCAATACTAAAAAAGTTACTAGAAT
GAATAGTAAGTTATAACCACGACCCATTTTGTATTTTGTTTAGTAATGTATAAGAAAGTA
TTTGAGCTTTGTTTGTTGTGTGTGTCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4DD79TF 659 0 0
GTGTGTCCGCCAACAAGAGTTACGAGGTCTAATGTGTTGAGAGTTTTAGCAGAAAAGTCT
CGCTTCTGCTTGTCGACGGGGTCGAATGGTCCGGGCAAGATCACGTCCGAGGCTTGCGAG
ATTCGGCCATCCAGACGTCCCAATGGCACTCGCCACCCTTGTCCACCGGTCAAAACAACG
GCTTCGCGTGCAGCAAGGGTGAGAATATCCGCACAAGAAACAGTTCTAGGACAAGCAGCC
TCAAGCCTAGTCTTAGCTTCTTCAATAGCTTCAAACCCTCTCAGTGAACGGTTTGGACCG
GCTGTTCTCTCAGTGCTATTACCAGCGATGAGAACTGACCCATCGCAGCCACGAACAAAG
CAATCGTGAAAATGCATACGCAAAATCCCGGGTGCATTAGCCGGGTTGGACCGGACATGT
GCTCGAACCACCGATGCCACAATGGACTCTACGTTTCGGCATCTATTGCCATAATACCCA
ACACGTGGTCTTCGACCACCACCTCCACGGCTCGAACCACGATTTCCTTGTGCAGTTACA
GCTGCGACCAATACTAAAAAAGTTACTAGGATGAATAGTAAGTTATAACCACGACCCATT
TTGTATTTTGTTTAGTAATGTATAAGAAAGTATTTGAGCTTTGTTTGTTGTGTGTGTCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 2 4

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CAAACCTAAAACTTGGAAAGAAAACAAAAGTTGTCTACAAAGAGTCTATAACTGAAGTCT
TGTTCTGATTAGTGCATTAGGCGGTAAAGGACAGCCTCCCTACTACGCAAAAAATTCTTC
AGGGCAGTTCTTGTTGACATGCAGCTCTTTCACTTTCAAGTCCGAGCCAGTGATCTTCTC
TTCAGTTAGTTTGCTATCCTCACTAGTCAGCTCACCCACAATGTTTGCAGCTTCTTCATT
TACCATCTTTTCATCAAAGGAGCCTTTCAAGTTCTTGCCCTCCATCATCGAGTCTTCTTC
TACAAGGTCACTACCAGGTGTTTCCTTTCCGACATGTGAAACTTCTCCTGACTGTAGCTT
GTCTATGCTGATGGGACGGGGTTTCCTACTTGAGGCCTTGGTAGTAGAAGCAGAGTGACG
ACTTGAAAGTGTTTCATTAGGAGATGGCTCTCTTTTAAATAATGCTTCAGGCTTACTTTT
TCCACTGCCATTGTTCTTACTGCAAGGTACAAGTCCAGTAGGTGTTGAACAATGCATCTG
GTTTGCTACTCTCAATATGCTTGCCCCAATTCCAAAACTTGTTTTAGCCTTCTTTGGTGT
AATCATCTTCTGATCATTCTTGGGAGGAGACATTGGCGATCCTGAATCTTCTG


BQ
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AF RR4E275JQ U 1
AF RR4DU75JQ U 1
BS 1 713 RR4DU75JQ

RD RR4E275JQ 471 0 0
AGGGTTGTAACCTTTTTTCATACTTTTAAAGGTATTGGTTTACTCAAATATAATCAGATA
CAAACCTAAAACTTGGAAAGAAAACAAAAGTTGTCTACAAAGAGTCTATAACTGAAGTCT
TGTTCTGATTAGTGCATTAGGCGGTAAAGGACAGCCTCCCTACTACGCAAAAAATTCTTC
AGGGCAGTTCTTGTTGACATGCAGCTCTTTCACTTTCAAGTCCGAGCCAGTGATCTTCTC
TTCAGTTAGTTTGCTATCCTCACTAGTCAGCTCACCCACAATGTTTGCAGCTTCTTCATT
TACCATCTTTTCATCAAAGGAGCCTTTCAAGTTCTTGCCCTCCATCATCGAGTCTTCTTC
TACAAGGTCACTACCAGGTGTTTCCTTTCCGACATGTGAAACTTCTCCTGACTGTAGCTT
GTCTATGCTGATGGGACGGGGTTTCCTACTTGAGGCCTTGGTAGTAGAAGC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4DU75JQ 713 0 0
AGGGTTGTAACCTTTTTTCATACTTTTAAAGGTATTGGTTTACTCAAATATAATCAGATA
CAAACCTAAAACTTGGAAAGAAAACAAAAGTTGTCTACAAAGAGTCTATAACTGAAGTCT
TGTTCTGATTAGTGCATTAGGCGGTAAAGGACAGCCTCCCTACTACGCAAAAAATTCTTC
AGGGCAGTTCTTGTTGACATGCAGCTCTTTCACTTTCAAGTCCGAGCCAGTGATCTTCTC
TTCAGTTAGTTTGCTATCCTCACTAGTCAGCTCACCCACAATGTTTGCAGCTTCTTCATT
TACCATCTTTTCATCAAAGGAGCCTTTCAAGTTCTTGCCCTCCATCATCGAGTCTTCTTC
TACAAGGTCACTACCAGGTGTTTCCTTTCCGACATGTGAAACTTCTCCTGACTGTAGCTT
GTCTATGCTGATGGGACGGGGTTTCCTACTTGAGGCCTTGGTAGTAGAAGCAGAGTGACG
ACTTGAAAGTGTTTCATTAGGAGATGGCTCTCTTTTAAATAATGCTTCAGGCTTACTTTT
TCCACTGCCATTGTTCTTACTGCAAGGTACAAGTCCAGTAGGTGTTGAACAATGCATCTG
GTTTGCTACTCTCAATATGCTTGCCCCAATTCCAAAACTTGTTTTAGCCTTCTTTGGTGT
AATCATCTTCTGATCATTCTTGGGAGGAGACATTGGCGATCCTGAATCTTCTG

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL2742Contig2 805 2 4 U
GTGGCTTTTAGTCGCTGGAAAGGCTATACCGACCTCCCTGAGTTTGAGACACTTCAGGGA
TCAATAGAGTCTGCACCCAAGATATCTCCTGCGGATACTGAAGTGAAAGAGTCTGCTCCT
GAACTGAAAAAGAAAAAGAGTAAACAAGTGAAAGAGTCTTCTCCTGAAACGAAAAAGAGT
AAACAAGTGAAAGAGTCTGCTCCTGAACCGAAAAAGAGTAAACAAGTTTATACTAAAAGG
AGAAAGACAGAAGACAAAGATCATTGTAAACTTGATGATGGAGTCTTTGAGTATGAGGAC
ACTACTACTGTTGTAAAGAAAAAGGAGAAAACTTTGGCAGAGTTCATAGCTGAGAAACGG
TTAAGCAAAAGTCATGGGAAGAGATCACATGAAAAATCGGATACGAAGCAGGATGGTGAA
AAGAACAAACGCAAGGTTGTGCGTTCAAAACTTCCCAAGTCTTCTTCTGCAAAAAAAATG
AAGACAGAAGATTCAGGATCGCCAATGTCTCCTCCCAAGAATGATCAGAAGATGATTACA
CCAAAGAAGGCTAAAACAAGTTTTGGAATTGGGGCAAGCATATTGAGAGTAGCAAACCAG
ATGCATTGTTCAACACCTACTGGACTTGTACCTTGCAGTAAGAACAATGGCAGTGGAAAA
AGTAAGCCTGAAGCATTATCTAAAAGAGAGCCATCTCCTAATGAAACACTTTCAAGTCGT
CACTCTGCTTCTACTACCAAGCCTCAAGTAGGAAACCCCGTCCCATCAGCATAGACAGCT
ACAGTCAGAGAAGTTTCACATGTCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU75TF U 1
AF RR4E275TF U 1
BS 1 739 RR4DU75TF
BS 740 740 RR4E275TF
BS 741 787 RR4DU75TF
BS 788 805 RR4E275TF

RD RR4DU75TF 787 0 0
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CACTCTGCTTCTACTACCAGGCCTCAAGTAGGAAACCCCGTCCCATCAGCATAGACAGCT
ACAGTCA

QA 1 787 1 787
DS 

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TCAATAGAGTCTGCACCCAAGATATCTCCTGCGGATACTGAAGTGAAAGAGTCTGCTCCT
GAACTGAAAAAGAAAAAGAGTAAACAAGTGAAAGAGTCTTCTCCTGAAACGAAAAAGAGT
AAACAAGTGAAAGAGTCTGCTCCTGAACCGAAAAAGAGTAAACAAGTTTATACTAAAAGG
AGAAAGACAGAAGACAAAGATCATTGTAAACTTGATGATGGAGTCTTTGAGTATGAGGAC
ACTACTACTGTTGTAAAGAAAAAGGAGAAAACTTTGGCAGAGTTCATAGCTGAGAAACGG
TTAAGCAAAAGTCATGGGAAGAGATCACATGAAAAATCGGATACGAAGCAGGATGGTGAA
AAGAACAAACGCAAGGTTGTGCGTTCAAAACTTCCCAAGTCTTCTTCTGCAAAAAAAATG
AAGACAGAAGATTCAGGATCGCCAATGTCTCCTCCCAAGAATGATCAGAAGATGATTACA
CCAAAGAAGGCTAAAACAAGTTTTGGAATTGGGGCAAGCATATTGAGAGTAGCAAACCAG
ATGCATTGTTCAACACCTACTGGACTTGTACCTTGCAGTAAGAACAATGGCAGTGGAAAA
AGTAAGCCTGAAGCATTATCTAAAAGAGAGCCATCTCCTAATGAAACACTTTCAAGTCGT
CACTCTGCTTCTACTACCAAGCCTCAAGTAG*AAACCCCGTCC*ATCAGCATAGACAGCT
ACAGTCAGAGAAGTTTCACATGTCG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 4

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CCACAAGGCCAACGCAAGAGAAAGCAGCGAATGGAAGTTTCAAGTTCCTGTAAAACATAA
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ATACCGTGTTACCTACTACGGAAAGGGAAGAATGCCGGGATTTGGGGAGAAATGCACGCC
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TCTCTATGTACCTTTAATATCTAAGATTCAATCTATGTGTGTCAAATAATATAACAAGAT
TTATGAGAATTTGGGAGGCATCCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C193JQ C 24
AF RR4CF03TF U 1
AF RR4C193TF U 24
AF RR4CF03JQ C 61
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BS 88 89 RR4CF03TF
BS 90 90 RR4C193TF
BS 91 141 RR4CF03TF
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BS 143 208 RR4CF03TF
BS 209 209 RR4C193TF
BS 210 232 RR4CF03TF
BS 233 233 RR4C193TF
BS 234 569 RR4CF03TF
BS 570 570 RR4C193TF
BS 571 677 RR4CF03TF
BS 678 678 RR4CF03JQ
BS 679 687 RR4CF03TF

RD RR4C193JQ 596 0 0
GG
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QA 3 596 3 596
DS 

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AGGCTCAACCCTTTTCCCAAGTGACCTCCAGAGAAATGGAGTTGATACTGAGGAAGAGAT
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CAGAGGACAGTGTACCTTTGGACCGCGGTTGCAGGACGATGAAATCAAGCTTCTGTCTGA
GTTTGTAAAGCTCCAGGCTGACCAAGGTTGGCCAAACGTAGCTACTACCGATTAGCTAGT
TTTTTAACAAAGATTAGTAAAAGTTCAATGCAGTGAGAACATGCAGCATTACATTGTATG
TCTCTATGTACCTTTAATATCTAAGATTCAATCTATGTGTGTCAAATAATATAACAAGAT
TTATGAGAATTTGGGAG*CATCCTTGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4C193TF 644 0 0
GG
GCCTCTGCTCGCAGCTGCAACTTATTTTGTACCTCCCACAAGGCCAACGCAAGAGAAAGC
AGCGAATGGAAGTTTCAAGTTCCTGTAAAACATAAAGATTTGGAGTTTCTGATCAAAAGG
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TCTATTGGCCAAACTTTGGATATACAAAGAGGAGCAACACTGTTTAATAGAGCTTGTATT
GGCTGTCATGATACAGGTGGAAACATTATTCAACCAGGCTCAACCCTTTTCCCAAGTGAC
CTCCAGAGAAATGGAGTTGATACTGAGGAAGAGATATACCGTGTTACCTACTACGGAAAG
GGAAGAATGCCGGGATTTGGGGAGAAATGCACGCCCAGAGGACAGTGTACCTTTGGACCG
CGGTTGCAGGACGATGAAATCAAGCTTCTGTCTGAGTTTGTAAAGCTCCAGGCTGACCAA
GGTTGGCCAAACGTAGCTACTACCGATTAGCTAGTTTTTTAACAAAGATTAGTAAAAGTT
CAATACAGTGAGAACATGCAGCATTACATTGTATGTTTCTATGTACCTTTAATATCTAAG
ATTCAATCTATGTGTGTCAAATAATATAACAAGATTTATGA
C

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR4CF03JQ 627 0 0
CCACAAGGCCAACGCAAGAGAAAGCATCGGATGGAAGTTTCAAGTTCCTGTAAAACATAA
AGATTTGGAGTTTCTGATCAAGAGGTTTGCTCCTCCGCTCACGGCGGTTCTTCTCGCTGT
TTCACCAATCTGTAATCCTCCAGAATCTCTTGGCCAAACTTTGGATATACAAGGAGGAGC
AACACTGTTTAATAGAGCTTGTATTGGCTGTCATGATACAGGTGGAAACATTATTCAACC
AGGCTCAACCCTTTTCCCAAGTGACCTCCAGAGAAATGGAGTTGATACTGAGGAAGAGAT
ATACCGTGTTACCTACTACGGAAAGGGAAGAATGCCGGGATTTGGGGAGAAATGCACGCC
CAGAGGACAGTGTACCTTTGGACCGCGGTTGCAGGACGATGAAATCAAGCTTCTGTCTGA
GTTTGTAAAGCTCCAGGCTGACCAAGGTTGGCCAAACGTAGTTACTACCGATTAGCTAGT
TTTTTAACAAAGATTAGTAAAAGTTCAATGCAGTGAGAACATGCAGCATTACATTGTATG
TCTCTATGTACCTTTAATATTTAAGATTCAATCTATGTGTGTCAAATAATATAACAAGAT
TTATGAGAATTTGGGAGGCATCCTTGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 4

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AAAACTCTCAGGTCTCAAACAGCTCCAATAATGCATCTAAGGCATGTATATTGTAAAAAA
GGTAAATGAACACAATTCCAAAATTGTGATTTCGTTCTTCCCATCTTATTACTGGCTCCG
CACTTCACAAAGATTGCTTGAAGATCACATACCAATGGTCTTTTGGAACTTTGTAATCTG
GTTCAGGAAGATCCATGTCATCATGACGTGAGGGGCGATCCTGACGCAGTAAACAGGGAA
ACCTGTGTAAAATTTCAGAGGTCCTCCTGATTTCAAGGTTTGCATGGCACAGTCTAGCGA
ACCCGTGTATGGATATTTACCCTAAGCGTCTGGTTGCATTTTCTGGATCTGAGTTTTGAC
AAAGTCAAATGGAAGACTGCAAGCCGCAGCGCAGAATCCTGAAACAGCACTTGCTCCTAC
GACAGTGGAAGTCTCCCCAAGACCAAGGTTATCTCTCATGTATTCAGCACTTTGATCATA
AGAAGCAAGCATTCCCATGTTCAAAGCCATAGCTCTGACCACAGTGGGACCACAACCTTT
CCAAAGTGCTAAGACTCCTTCATCAGCGCTAATACGGTAAAGCGCATGGAAAGCATTGGT
ATAGTTCCTGCGCTGAGCTAACGGCAAGGTGTTATCAGCTTGCATTCTGATAGGCGCCAA
ATCAGCTGGACTACCAACGCAAGCACCAATTGCACCAGCTGTTAGACCACATAGAGCCTT
CTGATACAGAGGTAGTGGCTTCCCATCGTTAGCCTCACTTGCTTTTGCAGTCAGCATCTT
GAATGATCCAAGACGGGCAGTGGTGTAAGTTGCTTGCCTCAGCAAACCAGCAGATAATCC
CTTGTAGAAAGCACCGATACCTTCATTCTTCAACATGGTAGAGGTCACACTGGCTGCAGA
TCCCTGACCTAGTTGAATCCTCACCTTGATCATGTCGATCGGCTGGATAACGCAGGTAGC
GAGCATACCGGAGGTACCGCCATTGACGAAGGGCTTCACAGTGTTCCACACACCAATCGG
AGCTACTTTTTTCTCTTCCGCCATCCTCCTCCTTTTTTTTTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS88JQ U 1
AF RR4GS88TF C 1
AF RR4FF14JQ U 54
AF RR4FF14TF C 469
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C

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BQ
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AF RR4D907JQ U 1
AF RR4D907TF C 1
AF RR4D154JQ U 89
BS 1 612 RR4D907JQ
BS 613 717 RR4D154JQ

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C

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C

QA 1 612 1 612
DS 

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GGACA
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CTTTTAATGCTGCCGACAAATGCAAGAGCTTCGTCTAGGACACGGTAGCTCTCGCCGTGG
TGTTGAGCCAATCTCATAGCTAGT

QA 6 629 6 629
DS 



AS 1 4

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AAGATCAAAGAAATCGAAGATGAGATGGCAAGGACTCAGAAGAACAAAGCCACCGCTCAC
CACCTCGGTTTGTTAAAGGCCAAACTTGCCAAGCTACGAAGGGACCTTCTTGCACCACCT
ACTAAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGCGAAGGTTTTGATGTCACCAAAAGTGGTGATTCT
AGAGTTGGACTTGTTGGCTTTCCTTCCGTTGGTAAATCCACCCTCTTGAACAAGCTCACT
GGAACCTTTTCCGAGGTTGCTTCTTATGAGTTCACAACACTGACATGCATTCCCGGTGTT
ATTACATACCGTGGAGCTAAAATTCAGTTATTGGATCTTCCTGGTATTATTGAGGGTGCC
AAAGACGGAAAAGGTAGAGGACGACAGGTTATAAGTACTGCTAGGACTTGCAACTGCATC
ATAATAGTTCTTGATGCCATAAAGCCAATAACTCACAAGCGTCTCATTGAAAAGGAGCTT
GAAGGATTCGGAATTAGGTTGAACAAGGAGCCACCTAATCTCACATTCAGGAAAAAAGAC
AAAGGTGGTATCAATTTAACTTCCACAGTCACCTGCACGCACCTTGACCTCGACACTGTC
AAGGCCATATGCAGTGAGTACAGGATGCACAACGCCGATATCACTCTGCGCTACGATGCA
ACTGCTGATGACCTCATCGATGTCATTGAGGGCAGTCGCATCTATATGCCCTGTATCTAT
GCCGTCAACAAGATCGACCAAATCACTCTCGAGGAACTTGAAATTTTGGACAGACTTCCT
CATTACTGTCCTGTCAGTGCGCATCTGGAGTGGAATCTTGATGGTCTTCTCGATAAGATA
TGGGAATACTTGGATCTTACTAGAATCTACACCAAACCAAAGGCAATGAATCCGGATTAC
GATGACCCTGTCATCTTATCTTCCAAGA*GAGAACAGTTGAGGACTTCTGCATTCGGATT
CACAAAGACATGCTTAAGCAATTCAAGTACGCTTTAGTATGGGGTTCGAGTGCAAAACAT
AAGCCACAAAGAGTTGGAAGGGAGCACGAGCTCGAGGACGAGGATGTTGTTCAGATCGTT
AAAAAGATATGAGTTCGCCAGTAGTTCATGGAGAAGGCAAGAGACCAAAGCACAGCCCCA
TTATGTGATCTGTACACGTGGTAGAAGGTTAGGATCTTCTTTTGGATTCTCTGCTTATCT
TTTGGACTCCTTTTCTGTGTATTGTCATCATCAGATAAAACAAACTGTCTTCACTTTTTG
GGTTGTCTTGTTGGATAATCTTATCGTTTACCAATGACTATGAGTGTATGTCATGTGATG
AATGTTTTGTCGGAACACCTCCAAATTTTTTTTTTTAAAATACAGATATGGTTTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ59TF U 1
AF RR4F772TF U 545
AF RR4F772JQ C 654
AF RR4DZ59JQ C 719
BS 1 751 RR4DZ59TF
BS 752 752 RR4F772TF
BS 753 773 RR4DZ59TF
BS 774 1015 RR4F772TF
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BS 1017 1093 RR4F772TF
BS 1094 1230 RR4F772JQ
BS 1231 1231 RR4DZ59JQ
BS 1232 1288 RR4F772JQ
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BS 1290 1352 RR4F772JQ
BS 1353 1438 RR4DZ59JQ

RD RR4DZ59TF 773 0 0
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AAGATCAAAGAAATCGAAGATGAGATGGCAAGGACTCAGAAGAACAAAGCCACCGCTCAC
CACCTCGGTTTGTTAAAGGCCAAACTTGCCAAGCTACGAAGGGACCTTCTTGCACCACCT
ACTAAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGCGAAGGTTTTGATGTCACCAAAAGTGGTGATTCT
AGAGTTGGACTTGTTGGCTTTCCTTCCGTTGGTAAATCCACCCTCTTGAACAAGCTCACT
GGAACCTTTTCCGAGGTTGCTTCTTATGAGTTCACAACACTGACATGCATTCCCGGTGTT
ATTACATACCGTGGAGCTAAAATTCAGTTATTGGATCTTCCTGGTATTATTGAGGGTGCC
AAAGACGGAAAAGGTAGAGGACGACAGGTTATAAGTACTGCTAGGACTTGCAACTGCATC
ATAATAGTTCTTGATGCCATAAAGCCAATAACTCACAAGCGTCTCATTGAAAAGGAGCTT
GAAGGATTCGGAATTAGGTTGAACAAGGAGCCACCTAATCTCACATTCAGGAAAAAAGAC
AAAGGTGGTATCAATTTAACTTCCACAGTCACCTGCACGCACCTTGACCTCGACACTGTC
AAGGCCATATGCAGTGAGTACAGGATGCACAACGCCGATATCACTCTGCGCTACGATGCA
ACTGCTGATGACCTCATCGATGTCATTGAGG*CAGTCGCATCTATATGCCCTG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4F772TF 549 0 0
GGA
TCGGAATTAGGTTGAACAAGGAGCCACCTAATCTCACATTCAGGAAAAAAGACAAAGGTG
GTATCAATTTAACTTCCACAGTCACCTGCACGCACCTTGACCTCGACACTGTCAAGGCCA
TATGCAGTGAGTACAGGATGCACAACGCCGATATCACTCTGCGCTACGATGCAACTGCTG
ATGACCTCATCGATGTCATTGAGGGCAGTCGCATCTATATGCCCTGTATCTATGCCGTCA
ACAAGATCGACCAAATCACTCTCGAGGAACTTGAAATTTTGGACAGACTTCCTCATTACT
GTCCTGTCAGTGCGCATCTGGAGTGGAATCTTGATGGTCTTCTCGATAAGATATGGGAAT
ACTTGGATCTTACTAGAATCTACACCAAACCAAAGGCAATGAATCCGGATTACGATGACC
CTGTCATCTTATCTTCCAAGA*GAGAACAGTTGAGGACTTCTGCATTCAGATTCACAAAG
ACATGCTTAAGCAATTCAAGTACGCTTTAGTATGGGGTTCGAGTGCAAAACATAAGCCAC
AAAGAG

QA 4 549 4 549
DS 

RD RR4F772JQ 699 0 0
CACTGTCAAGGCCATATGCAGTGAGTACAGGATGCACAACGCCGATATCACTCTGCGCTA
CGATGCAACTGCTGATGACCTCATCGATGTCATTGAGGGCAGTCGCATCTATATGCCCTG
TATCTATGCCGTCAACAAGATCGACCAAATCACTCTCGAGGAACTTGAAATTTTGGACAG
ACTTCCTCATTACTGTCCTGTCAGTGCGCATCTGGAGTGGAATCTTGATGGTCTTCTCGA
TAAGATATGGGAATACTTGGATCTTACTAGAATCTACACCAAACCAAAGGCAATGAATCC
GGATTACGATGACCCTGTCATCTTATCTTCCAAGA*GAGAACAGTTGAGGACTTCTGCAT
TCGGATTCACAAAGACATGCTTAAGCAATTCAAGTACGCTTTAGTATGGGGTTCGAGTGC
AAAACATAAGCCACAAAGAGTTGGAAGGGAGCACGAGCTCGAGGACGAGGATGTTGTTCA
GATCGTTAAAAAGATATGAGTTCGCCAGTAGTTCATGGAGAAGGCAAGAGACCAAAGCAC
AGCCCCATTATGTGATCTGTACACGTGGTAGAAGGTTGGGATCTTCTTTTGGATTCTCTG
CTTATCTTTTGGACTCCTTTTCTGTGTATTGTCATTATCAGATAAAACAAACTGTCTTCA
CTTTTTGGGTTGTCTTGTTGGATAATCTTATCGTTTACC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4DZ59JQ 720 0 0
CAACTGCTGATGACCTCATCGATGTCATTGAGGGCAGTCGCATCTATATGCCCTGTATCT
ATGCTGTCAACAAGATCGACCAAATAACTCTCGAGGAACTTGAAATTTTGGACAGACTTC
CTCATTACTGTCCTGTCAGTGCGCATCTGGAGTGGAATCTTGATGGTCTTCTCGATAAGA
TATGGGAATACTTGGATCTTACTAGAATCTACACCAAACCAAAGGCAATGAATCCGGATT
ACGATGACCCTGTCATCTTATCTTCCAAGAAGAGAACAGTTGAGGACTTCTGCATTCGGA
TTCACAAAGACATGCTTAAGCAATTCAAGTACGCTTTAGTATGGGGTTCGAGTGCAAAAC
ATAAGCCACAAAGAGTTGGAAGGGAGCACGAGCTCGAGGACGAGGATGTTGTTCAGATCG
TTAAAAAGATATGAGTTCGCCAGTAGTTCATGGAGAAGGCAAGAGACCAAAGCACAGCCC
CATTATGTGATCTGTACACGTGGTAGAAGGTTAGGATCTTCTTTTGGATTCTCTGCTTAT
CTTTTGGACTCCTTTTCTGTGTATTGTCATCATCAGATAAAACAAACTGTCTTCACTTTT
TGGGTTGTCTTGTTGGATAATCTTATCGTTTACCAATGACTATGAGTGTATGTCATGTGA
TGAATGTTTTGTCGGAACACCTCCAAATTTTTTTTTTTAAAATACAGATATGGTTTTGCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

CO CL2747Contig1 1470 4 12 U
GGAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAACTAGGGTTTACGAAACAAACATAACTCGAAGAA
GAAGATCATGGCGACGAGAAGAGTTATTCCTCAACAACTTCGAGGTGATGATCCCGTCGT
CGCGGAAGCAAAGAACCGTCGCGCTCTCGGGGACATTGGAAACATCGCTTCTCTTCTTCC
CGGAGTCGAAGCCGGAAAAGTTAATCGGCCCTTGACCCGTAACTTCCGTCCCCAATTGCT
TGAAAACGCTAACAAAAAGCAAATCAATGTAGCCAAGAAACCAGAAGCGGTTCAAAGGAA
AGCAAGAGCTGTCGGTAAGCCTCCTCCGCAGCAGACTCATGAAGTGATTGTGATCAGTCC
TGATACTAACGAGGTTGCGAAAGCTAAACACTCGTCCAAGAAGAAAGTTACTTACACTTC
CGTTCTCAATGCTCGAAGCAAGGCTGCTGCTGCTTCCAAGACTCTTGATATCGATTCCGC
GGACAAAGACAATGACCTTGCTGCTGTGGAGTACGTTGAGGACATGTACTCTTTCTACAA
AGAGGTTGAGAATGAGAGCAAGGCTCAGATGTATATGCAGACACAGACTGAGATCAACGA
GAAGATGAGATCGATTCTTGTTGACTGGCTTGTAGACGTTCATGTCAAGTTTGATCTCTC
CCCTGAGACTCTTTACCTCACCATCAACATAATCGATCGGTTCCTGTCTCTCAAAACTAT
CCCGAGGAGAGAGCTACAGCTTCTAGGCGTTAGTGCTTTGCTCATTGCCTCCAAATACGA
AGAGATCTGGCCTCCTCAGGTGAATGATTTGGTGTATGTCACAGACAACACGTACCAGAG
CAAGCAGATTCTAGTGATGGAGAAAACCATTTTGGGATGTCTGGAGTGGTACCTGACAGT
TCCGACGCAGTATGTGTTCCTCGCGAGGTTTATCAAAGCTGCGGTTCCTGACCCGGAGAT
GGATAGCATGGTTCACTTCTTAGCTGAGTTGGGTCTGATGCACTACGACGCTTTGAAGTT
CCGCCCTTCGATGCTGGCCGCTTCAGCAGTGTACACCGCGAGATGCTGCTTGAACAAGAC
CCCGGCGTGGACTGAAACTCTCGAATTCCACACTGGTTACTCTGAACATGAGCTCATGGA
GTGCTCGAAGCTATTAGCATTCCTTCACTCAAGAGTTGGGGAGAGCAAGCTGAGAGCTGT
GTTCAAGAAGTATTCGAAAGCTGAAAGATGTGCTGTTGCTTTGGTCTCACCAGCAAAGTC
TGTTTTGTCTTCTACGCCTGCTCCTTGAAGACGTCTTTAAAGAATGTGTTTTTTAGATCT
CTCTCTGATCTTCTGGATGTGTGTGTAGTATATGTTTTCCTGCTGAGAATTTATGTCAGT
ATTAATGAATTCTTATTGTACTAGAATCATTTTGGTCTTCTATATGATATTTGAATTGGA
ATTCTTGATGATATAATAATATGTAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GG

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C

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CTAGAATCATTTTGGTCTTCTATATGATATTTGAATTGGAATTCTTGATGATATAATAAT
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AS 2 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4C887TF C 1
AF RR4C887JQ U 1
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GATC

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GG
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GATCCGCACGGCGACGATC

QA 3 681 3 681
DS 



CO CL2748Contig2 777 2 8 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FY46TF U 1
AF RR4FY46JQ C 135
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RD RR4FY46TF 766 0 0
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DS 

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QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E956TF U 1
AF RR4B633TF U 170
AF RR4B633JQ C 146
BS 1 203 RR4E956TF
BS 204 944 RR4B633TF
BS 945 999 RR4B633JQ

RD RR4E956TF 207 0 0
GGATCAAATCTCTACTCTGCAAAGTTTAAACCTTAAGCAATGGCTCTCTCTTCGCTCTCT
CCTCTCCCCATGAAGTCACTTGACACTACACGATCATCATCTCCTGTCTCCTCAAGGTCT
CTTTACCATCTTCCGAGATACCCTTTGAGGCTCTACAGCTAATCTCCCGTTCAAAACCAG
AACGAGATTCATCAAGTTCTAGA
GAAG

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR4B633TF 775 0 0
TTCAAAACCAGAACGAGATTCATCAAGTTCTAGATTGTTGCTCCGGTGGAGAATCGAAGA
CGTGGAAGAGGTTTTTATCTGGAGCATTAGCAGCGGCTGTGATAGTCTCGAGCTCAGGGT
TTCCAGCAATGGCAGATCTTAACAAGTTCGAGGCGGATATACGTGGCGAGTTTGGTATAG
GATCAGCTGCTCAGTTTGGTTCTGCTGATCTCAGCAAAACAGTTCACTCCAACGAAAATT
TCAGAAGAGCCAACTTCACTTCTGCAGATATGAGAGAGTCTGACTTCAGTGGTTCAACCT
TCAACGGCGCCTATCTTGAGAAAGCAGTTGCATACAAAGCTAACTTCTCAGGTGCTGATT
TGAGTGATACATTGATGGATCGGATGGTGCTAAACGAGGCAAATCTGACAAATGCAATTC
TTGTTCGTTCGGTTCTAACACGTAGTGACCTCGGTGGTGCCAAGATCGAAGGCGCTGACT
TTAGTGACGCTGTGATTGATCTTCTTCAAAAACAGGCTCTGTGTAAATACGCAAACGGGA
CAAACCCATTGACTGGAGTGAGCACAAGGAAGTCTCTTGGCTGTGGAAATAGTAGGAGAA
ATGCATATGGCTCCCCTTCGTCTCCTTTACTCAGTGCACCACCTCAACGTCTTCTCGGTC
GTGATGGATTCTGCGATGAGAAGACCGGTCTTTGTGACGCCTCGTAGTTTCAGTCCGTTA
AGATCATGTGTGTGGTTACAATGCAGATGTAATAACATTTGTTTCATAATATGTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4B633JQ 854 0 0
GAGGCG
TCTACAGCTAATCTCCCGTTCAAAACCAGAACGAGATTCATCAAGTTCTAGATTGTTGCT
CCGGTGGAGAATCGAAGACGTGGAAGAGGTTTTTATCTGGAGCATTAGCAGCGGCTGTGA
TAGTCTCGAGCTCAGGGTTTCCAGCAATGGCAGATCTTAACAAGTTCGAGGCGGATATAC
GTGGCGAGTTTGGTATAGGATCAGCTGCTCAGTTTGGTTCTGCTGATCTCAGCAAAACAG
TTCACTCCAACGAAAATTTCAGAAGAGCCAACTTCACTTCTGCAGATATGAGAGAGTCTG
ACTTCAGTGGTTCAACCTTCAACGGCGCCTATCTTGAGAAAGCAGTTGCATACAAAGCTA
ACTTCTCAGGTGCTGATTTGAGTGATACATTGATGGATCGGATGGTGCTAAACGAGGCAA
ATCTGACAAATGCAATTCTTGTTCGTTCGGTTCTAACACGTAGTGACCTCGGTGGTGCCA
AGATCGAAGGCGCTGACTTTAGTGACGCTGTGATTGATCTTCTTCAAAAACAGGCTCTGT
GTAAATACGCAAACGGGACAAACCCATTGACTGGAGTGAGCACAAGGAAGTCTCTTGGCT
GTGGAAATAGTAGGAGAAATGCATATGGCTCCCCTTCGTCTCCTTTACTCAGTGCACCAC
CTCAACGTCTTCTCGGTCGTGATGGATTCTGCGATGAGAAGACCGGTCTTTGTGACGCCT
CGTAGTTTCAGTCCGTTAAGATCATGTGTGTGGTTACAATGCAGATGTAATAACATTTGT
TTCATAATATGTTGTGTTACATTAGTCGTGTATTGTATGTTTTATAGTAGTGAATTGTAA
ATGACCGG

QA 7 854 7 854
DS 



AS 1 3

CO CL2750Contig1 844 3 12 U
CTAAACCCGACAAAAAAAAACTAGATTAGAAAAGTGAAACGACAGCGTTTGAAACAAATG
AGTCACACAATAAGATCTTTCTCCCAACATGAACCTTCACTTGTTGATTACAAAGACAAA
CTCAGAACCAAACATTAAACCAACTTCATTCAGCCCCAACAAATCCGGTCTCCACAACCG
GTTAAAATGGTCGGTGATGACCAGTGGGCAGAACGTTTTTTTGATAAGACCCGGAATTGC
CCGAGGCCCATCACAACTCTCTACAGACTTCTCTCTTACCTAACTGAAAACTACTCTAAG
CCAACAAAGTCTTCTGTTCAAACTAAACACACACATGCACACACAGCTTACATCTCTCTC
TCCCTCTCTGTATTGTTTGGTTATACATTTTTTTGTAGTCAAAAGAGCTCAAAGATCATC
TTTTAAGGCTTCCAACTGGTTACAGATGTCTCAGGGGAACATACCGCTTCAACAGTCAGC
CGTTTCAACACATTCGGACACGGATCTTTCCCGAAGTTACTGTTGGATATCGTCACTGCA
CATCTCGCTTT*CCCTACACACTTCCTCTCTAAGATAGCGTATGAGGTAGCTGCGTGACA
CTCTCCTTGCCGGTAACTCCCGCATTTTCCCAAAGGAGTCCCAAAGCTAGCAAACTTGAT
AGCTGAAATAGCTTGACCAGGACTACATTTCAAATGAACTTTCGGTCTACGAAACGTTTG
TCCTTTCCCGTAGCTTTCGATTTGCCAGTTCTTGATATTGGGATGGTATTCAGAGACTTC
AGCACAGACTCCAGAGACCGATCTTTTGACCAAAGAAACAGCTGATGGGTTTCCTCCGAG
CTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR4CE27JQ U 1
AF RR4DX64TF C 78
AF RR4DX64JQ U 81
BS 1 194 RR4CE27JQ
BS 195 195 RR4DX64JQ
BS 196 245 RR4CE27JQ
BS 246 246 RR4DX64JQ
BS 247 551 RR4CE27JQ
BS 552 552 RR4DX64JQ
BS 553 610 RR4CE27JQ
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BS 612 623 RR4CE27JQ
BS 624 833 RR4DX64JQ
BS 834 834 RR4DX64TF
BS 835 844 RR4DX64JQ

RD RR4CE27JQ 623 0 0
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CCGAGACCCATCACAACTCTCTACAGACTTCTCTCTTACCTAACTGAAAACTACTCTAAG
CCAACAAAGTCTTCTGTTCAAACTAAACACACACATGCACACACAGCTTACATCTCTCTC
TCCCTCTCTGTATTGTTTGGTTATACATTTTTTTGTAGTCAAAAGAGCTCAAAGATCATC
TTTTAAGGCTTCCAACTGGTTACAGATGTCTCAGGGGAACATACCGCTTCAACAGTCAGC
CGTTTCAACACATTCGGACACGGATCTTTCCCGAAGTTACTGTTGGATATCGTCACTGCA
CATCTCGCTTTTCCCTACACACTTCCTCTCTAAGATAGCGTATGAGGTAGCTGCGTGACA
CTCTCCTTGCTGGTAACTCCCGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4DX64TF 767 0 0
TTT
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CAACT*CATTCAGCCCCAACAAATCCGGTCTCCACAACCGGTTAAAATGGTCGGTGATGA
CCAGTGGGCAGAACGTTTTTTTGATAAGACCCGGAATTGCCCGAGGCCCATCACAACTCT
CTACAGACTTCTCTCTTACCTAACTGAAAACTACTCTAAGCCAACAAAGTCTTCTGTTCA
AACTAAACACACACATGCACACACAGCTTACATCTCTCTCTCCCTCTCTGTATTGTTTGG
TTATACATTTTTTTGTAGTCAAAAGAGCTCAAAGATCATCTTTTAAGGCTTCCAACTGGT
TACAGATGTCTCAGGGGAACATACCGCTTCAACAGTCAGCCGTTTCAACACATTCGGACA
CGGATCTTTCCCGAAGTTACTGTTGGATATCGTCACTGCACATCTCGCTTT*CCCTACAC
ACTTCCTCTCTAAGATAGCGTATGAGGTAGCTGCGTGACACTCTCCTTGCCGGTAACTCC
CGCATTTTCCCAAAGGAGTCCCAAAGCTAGCAAACTTGATAGCTGAAATAGCTTGACCAG
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TTTGCCAGTTCTTGATATTGGGATGGTATTCAGAGACTTCAGCACAGACTCCAGAGACCG
ATCTTTTGACCAAAGAAACAGCTGATGGGTTTCCTCCGAGCTCC

QA 4 767 4 767
DS 

RD RR4DX64JQ 764 0 0
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CAACTTCATTCAGCCCCAACAAATCCGGTCTCCACAACCGGTTAAAATGGTCGGTGATGA
CCAGTGGGCAGAACGTTTTTTTGATAAGACCCGGAATTGCCCGAGGCCCATCACAACTCT
CTACAGACTTCTCTCTTACCTAACTGAAAACTACTCTAAGCCAACAAAGTCTTCTGTTCA
AACTAAACACACACATGCACACACAGCTTACATCTCTCTCTCCCTCTCTGTATTGTTTGG
TTATACATTTTTTTGTAGTCAAAAGAGCTCAAAGATCATCTTTTAAGGCTTCCAACTGGT
TACAGATGTCTCAGGGGAACATACCGCTTCAACAGTCAGCCGTTTCAACACATTCGGACA
CGGATCTTTCCCGAAGTTACTGTTGGATATCGTCACTGCACATCTCGCTTT*CCCTACAC
ACTTCCTCTCTAAGATAGCGTATGAGGTAGCTGCGTGACACTCTCCTTGCCGGTAACTCC
CGCATTTTCCCAAAGGAGTCCCAAAGCTAGCAAACTTGATAGCTGAAATAGCTTGACCAG
GACTACATTTCAAATGAACTTTCGGTCTACGAAACGTTTGTCCTTTCCCGTAGCTTTCGA
TTTGCCAGTTCTTGATATTGGGATGGTATTCAGAGACTTCAGCACAGACTCCAGAGACCG
ATCTTTTGACCAAAGAAACAGCTGATGGGTTTC*TCCGAGCTCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 4

CO CL2751Contig1 670 4 10 U
TTTTTTTGGTTTTGATACACTCAGAATCATGAAAACTTAGAAATTTGGTACATCATCACA
AGTGTTATTTTTGAAATACGGAATACAACATATGAAACACATATGTATACGAATATTAAG
ACATCACAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAACAAGAAGCTCCACAAGAATGACAGAAGGAGG
GCTTGGTGATAGGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATATTTTAGTTGCTACTACC
ACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCACCTGGAGCTGAGTGAACCTTTGTAGA
AGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGACAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATTGTTAGC
AGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTTGTTTGGCAATATCAACAGGTTTTGGAGCAGC
GTTTTTAGAAGGAGGAGGAACTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGTTAACAGCTGGCTT
TGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTCCACCTGCACTAAC
TCCACGCCCCATTCTACCTCCCTTACTCCCTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAG
GATTGCTCACTGGATCGACAAGGTTGACGATCGGAGAGAGGATAAGAGTTTGTGAGAGAA
AGCAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH93JQ U 29
AF RR4AH93TF C 29
AF RR4G763JQ U 13
AF RR4G763TF C 1
BS 1 19 RR4G763TF
BS 20 29 RR4G763JQ
BS 30 403 RR4AH93JQ
BS 404 404 RR4G763JQ
BS 405 452 RR4AH93JQ
BS 453 455 RR4G763JQ
BS 456 556 RR4AH93JQ
BS 557 557 RR4G763JQ
BS 558 657 RR4AH93JQ
BS 658 670 RR4G763TF

RD RR4AH93JQ 636 0 0
G
TGAAAACTTAGAAATTTGGTACATCATCACAAGTGTTATTTTTGAAATACGGAATACAAC
ATATGAAACACATATGTATACGAATATTAAGACATCACAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAA
CAAGAAGCTCCACAAGAATGACAGAAGGAGGGCTTGGTGATAGGAAGATAGAGAGTGACA
CAGTTGTCCTCATATTTTAGTTGCTACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGC
CACCACCTGGAGCTGAGTGAACCTTTGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGACAGAGT
TCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATTGTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTT
GTTTGGCAATATCA*CAGGTTTTGGAGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAACTGGCTGAG
TTTT**TTGGGGCCTTGTTAACAGCTGGCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATC
CCAAAGAACTCTGTCCTCCACCTGCACTAACTCCACGCCCCATTCTATCTCCCTTACTCC
CTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGCTCACTGGATCGACAAGGTTGACG
ATCGGAGAGAGGATAAGAGTTTGTGAGA
AAAGCCC

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR4AH93TF 636 0 0
G
TGAAAACTTAGAAATTTGGTACATCATCACAAGTGTTATTTTTGAAATACGGAATACAAC
ATATGAAACACATATGTATACGAATATTAAGACATCACAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAA
CAAGAAGCTCCACAAGAATGACAGAAGGAGGGCTTGGTGATAGGAAGATAGAGAGTGACA
CAGTTGTCCTCATATTTTAGTTGCTACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGC
CACCACCTGGAGCTGAGTGAACCTTTGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGACAGAGT
TCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATTGTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTT
GTTTGGCAATATCA*CAGGTTTTGGAGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAACTGGCTGAG
TTTT**TTGGGGCCTTGTTAACAGCTGGCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATC
CCAAAGAACTCTGTCCTCCACCTGCACTAACTCCACGCCCCATTCTATCTCCCTTACTCC
CTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGCTCACTGGATCGACAAGGTTGACG
ATCGGAGAGAGGATAAGAGTTTGTGAGA
AAAGCCC

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR4G763JQ 627 0 0
GATACAC
CTCAGAATCATGAAAACTTAGAAATTTGGTACATCATCACAAGTGTTATTTTTGAAATAC
GGAATACAACATATGAAACACATATGTATACGAATATTAAGACATCACAGAGACAGTTTT
TGCCAGGGAACAAGAAGCTCCACAAGAATGACAGAAGGAGGGCTTGGTGATAGGAAGATA
GAGAGTGACACAGTTGTCCTCATATTTTAGTTGCTGCTACCACCACCAAAGAGGTAATTC
AGAGACGAGCCACCACCTGGAGCTGAGTGAACCTTTGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAG
TTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATTGTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCA
GCTGGGCCTTGTTTGGTAATATCAACAGGTTTTGGAGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGA
ACTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGTTAACAGCTGGCTTTGGAGCCTTTCCGCTCCCA
AAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTCCACCTGCACTAACTCCACGCCCCATTCTACCT
CCCTTACTCCCTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGCTCACTGGATCGAC
AAGGTTGATGATCGGAGAGA

QA 8 627 8 627
DS 

RD RR4G763TF 670 0 0
TTTTTTTGGTTTTGATACACTCAGAATCATGAAAACTTAGAAATTTGGTACATCATCACA
AGTGTTATTTTTGAAATACGGAATACAACATATGAAACACATATGTATACGAATATTAAG
ACATCACAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAACAAGAAGCTCCACAAGAATGACAGAAGGAGG
GCTTGGTGATAGGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATATTTTAGTTGCTGCTACC
ACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCACCTGGAGCTGAGTGAACCTTTGTAGA
AGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATTGTTAGC
AGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTTGTTTGGTAATATCAACAGGTTTTGGAGCAGC
GTTTTTAGAAGGAGGAGGAACTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGTTAACAGCTGGCTT
TGGAGCCTTTCCGCTCCCAAAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTCCACCTGCACTAAC
TCCACGCCCCATTCTACCTCCCTTACTCCCTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAG
GATTGCTCACTGGATCGACAAGGTTGATGATCGGAGAGAGGATAAGAGTTTGTGAGAGAA
AGCAAGATCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL2752Contig1 808 3 7 U
GGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCTTTCTACAACTGTAAA
TTCTACGGATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCATTTCTTCAAGGATTGT
TACGTCGAAGGGACATTCGATTTCATCCTCGGAAGTGGGACCTCTCTTTACTTGGGTACA
CAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAGAGTGATAACAGCGCATGCGGGAAAGACCGCA
GACGAGAAGACCGGATACTCTTTCGTGCAGTGCAAGGTGACTGGAGTTGGTCAAGGAATC
TATTTGGGTAGGGCATGGATGAGCCACCCTAAGGTTGTCTACGCCTACACCGAGATGACC
AGCGTAGTCAACCCATCTGGATGGCAAGAAAACAAGATAGCCGCACATGACAAGACCGTG
TTCTATGGAGAGTACAAGTGCGTAGGAGAAGGAGCACAGACAGACAAGAGAGTTCCATTT
ACACAAAAGATTGACACTACTGTAGCTAACCGTTTCCTTACCCTCGGCTACATTGAAGGA
TCCAAGTGGCTTCTCCCACCTCCCGCTGTTGCGGCTTCAATATGAATCTAGTTTAAAACT
AAAAACTATATACGTATATACTTATTCACCGAGAGAATGTATATCGGTGTATTTTTTGCT
ATTTGCGTTGGTTATATTTTTCCAAGAGTCCTCTCTTTTTAGATGAGACTTGCGTAATTT
TGGTTTCATTACGATAATTCATAACCCTTGTATCTTGTCCTAGGGGTCCCAGTTCCCTTT
AATTAATTATATATTATTATTATGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP48TF U 1
AF RR4F167TF U 89
AF RR4BP48JQ C 173
BS 1 147 RR4BP48TF
BS 148 148 RR4F167TF
BS 149 570 RR4BP48TF
BS 571 579 RR4F167TF
BS 580 580 RR4BP48JQ
BS 581 605 RR4F167TF
BS 606 808 RR4BP48JQ

RD RR4BP48TF 570 0 0
GGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCTTTCTACAACTGTAAA
TTCTACGGATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCATTTCTTCAAGGATTGT
TACGTCGAAGGGACATTCGATTTCATCTTCGGAAGTGGGACCTCTCTTTACTTGGGTACA
CAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAGAGTGATAACAGCGCATGCGGGAAAGACCGCA
GACGAGAAGACCGGATACTCTTTCGTGCAGTGCAAGGTGACTGGAGTTGGTCAAGGAATC
TATTTGGGTAGGGCATGGATGAGCCACCCTAAGGTTGTCTACGCCTACACCGAGATGACC
AGCGTAGTCAACCCATCTGGATGGCAAGAAAACAAGATAGCCGCACATGACAAGACCGTG
TTCTATGGAGAGTACAAGTGCGTAGGAGAAGGAGCACAGACAGACAAGAGAGTTCCATTT
ACACAAAAGATTGACACTACTGTAGCTAACCGTTTCCTTACCCTCGGCTACATTGAAGGA
TCCAAGTGGCTTCTCCCACCTCCCGCTGTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4F167TF 517 0 0
G
CGATACCGGAAACCATTTCTTCAAGGATTGTTACGTCGAAGGGACATTCGATTTCATCCT
CGGAAGTGGGACCTCTCTTTACTTGGGTACACAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAG
AGTGATAACAGCGCATGCGGGAAAGACCGCAGACGAGAAGACCGGATACTCTTTCGTGCA
TTGCAAGGTGACTGGAGTTGGTCAAGGAATCTATTTGGGTAGGGCATGGATGAGCCACCC
TAAGGTTGTCTACGCCTACACCGAGATGACCAGCGTTGTCAACCCATCTGGATGGCAAGA
AAACAAGATAGCCGCACATGACAAGACCGTGTTCTATGGAGAGTACAAGTGCGTAGGAGA
AGGAGCACAGACAGACAAGAGAGTTCCATTTACACAAAAGATTGACACTACTGTAGCTAA
CCGTTTCCTTACCCTCGGCTACATTGAAGGATCCAAGTGGCTTCTCCCACCTCCCGCTGT
TGCGGCTTCA*TATGAATCTAGTTTAAAACTAAAAA

QA 2 517 2 517
DS 

RD RR4BP48JQ 636 0 0
TGGGTACACAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAGAGTGATAACAGCGCATGCGGGAA
AGACCGCAGACGAGAAGACCGGATACTCTTTCGTGCAGTGCAAGGTGACTGGAGTTGGTC
AAGGAATCTATTTGGGTAGGGCATGGATGAGCCACCCTAAGGTTGTCTACGCCTACACCG
AGATGACCAGCGTAGTCAACCCATCTGGATGGCAAGAAAACAAGATAGCCGCACATGACA
AGACCGTGTTCTATGGAGAGTACAAGTGCGTAGGAGAAGGAGCACAGACAGACAAGAGAG
TTCCATTTACACAAAAGATTGACACTACTGTAGCTAACCGTTTCCTTACCCTCGGCTACA
TTGAAGGATCCAAGTGGCTTCTCCCACCTCCCGCTGTTGCGGCTTCAATATGAATCTAGT
TTAAAACTAAAAACTATATACGTATATACTTATTCACCGAGAGAATGTATATCGGTGTAT
TTTTTGCTATTTGCGTTGGTTATATTTTTCCAAGAGTCCTCTCTTTTTAGATGAGACTTG
CGTAATTTTGGTTTCATTACGATAATTCATAACCCTTGTATCTTGTCCTAGGGGTCCCAG
TTCCCTTTAATTAATTATATATTATTATTATGATGG

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 4

CO CL2753Contig1 1204 4 2 U
GGTCAGCACAGTACATAATACAGCATTTCGCCGCAGCAACGGGATGCAAGAAACTCGAGA
GAGGAATCAAAAACACTTTCGTAACTGGAAAAATTACGATGACTATGATGAGTGACCTCA
GTGGCTCAGCCACAGTTAATGCTTCGCCTGTGTCTCATAAGGGATGCTTCGTCATGTGGC
AAATGCTACCGGAAAAGTGGCTCATCGAGCTGGTTGGTGGCGGTCACAAGATTTCAGCCG
GAAGTGATGGAGAAATTGCTTGGCGTTATACACCATGGCTCGGTGATCACGCTGCTAAAG
GCGCTATACGGCCTTTACGACGTACGCTACAAGTAAGTATATATATTTTCGTCCTTATCA
AAAAGGTATATATTTTAGTTAATTTTTATTTTCATCAATATTTTATTTATTTAATTTATA
CATAAAATATTTTTCATAAACTTATATGTTTTGTGAGATTAGAGAGAAATATACAGTTTC
GTAAACATTTGATGAATTAACTTATATTAGTGTAAATATAAATACCAGAATAAGCTTTGT
TAATTCTTTAATTAGTTGATCTAACTAGAGATTATGGCAAATAATCTTCATATAGTTAAT
ACAATTTTTCCAAGATTTGAAGTATATAACAAATTTATCTAGTGAAAGCTGAAAAACATA
GTTGTATATTGATTTAATTTGCTTTATGCAAAAAAGAAGAAGAGTGTGTTGGATCTGACA
TTCTACTTTGGGAGATGCTTTCTTAGCTTTCTACTGAGATGAATATTTTTGCCTTAATCA
CGTGCTACTAATTGACTTTATCATGCGCTTAAAAAATGGAATGAAAGGTCGGAACTTGGG
AGAGAGATTCAAAGTTTATATATAGTTAATCCAAACTTTATACAATTATCAGATTTTAGG
GACAAAACATTATGTGTTAGTGGTCCCCTTTTTATGGTGCATACATCACTGTTAACAATA
ATTATTTGCATCATAATTGAAAACTAAACATCTCTATTGGTTTTTTATAATAATATCGAC
ACTAAAAATAAAGAGGGTTATTTGAACAAAAAAAAAATAAAGAGGGTTTATGTTTGCTCT
CATTCATGTGTATTGTCCCTCTATTTTGTAGTTTTCTGTTTTGTTGTTTGGTTGTGGTCC
AGTTCGGTTTGTAAGGACAACATCATTATAAATCTGGTTTTGAAAGAAATAATCAAACTA
ACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4A189TFB U 1
AF RR4A189TF U 558
AF RR4A189JQ C 716
AF RR4A189JQD C 625
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BS 811 1204 RR4A189JQD

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GAGGAATCAAAAACACTTTCGTAACTGGAAAAATTACGATGACTATGATGAGTGACCTCA
GTGGCTCAGCCACAGTTAATGCTTCGCCTGTGTCTCATAAGGGATGCTTCGTCATGTGGC
AAATGCTACCGGAAAAGTGGCTCATCGAGCTGGTTGGTGGCGGTCACAAGATTTCAGCCG
GAAGTGATGGAGAAATTGCTTGGCGTTATACACCATGGCTCGGTGATCACGCTGCTAAAG
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AAAAGGTATATATTTTAGTTAATTTTTATTTTCATCAATATTTTATTTATTTAATTTATA
CATAAAATATTTTTCATAAACTTATATGTTTTGTGAGATTAGAGAGAAATATACAGTTTC
GTAAACATTTGATGAATTAACTTATATTAGTGTAAATATAAATACCAGAATAAGCTTTGT
TAATTCTTTAATTAGTTGATCTAACTAGAGATTATGGCAAATAATCTTCATATAGTTAAT
ACAATTTTTCCAAGATTTGAAGTATATAACAAATTTATCTAGTGAAAGCTGAAAAACATA
GTTGTATATTGATTTAATTTGCTTTATGCAAAAAAGAAGAAGAGTGTGTTGGATCTGACA
TTCTACTTTGGGAGATGCTTTCTTAGCTTTCTACTGAGATGAATATTTTTGCCTTAATCA
CGTGCTACTAATTGACTTTATCATGCGCTT

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TGAAGTATATAACAAATTTATCTAGTGAAAGCTGAAAAACATAGTTGTATATTGATTTAA
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CTTTCTTAGCTTTCTACTGAGATGAATATTTT*GCCTTA*TCACGTGCTACTAATTGACT
TTATCATGCGCTT

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AATCACGTGCTACTAATTGACTTTATCATGCGCTTAAAAAATGGAATGAAAGGTCGGAAC
TTGGGAGAGAGATTCAAAGTTTATATATAGTTAATCCAAACTTTATACAATTATCAGATT
TTAGGGACAAAACATTATGTGTTAGTGGTCCCCTTTTTATGGTGCATACATCACTGTTAA
CAATAATTATTTGCATCATAATTGAAAACTAAACATCTCTATTGGTTTTTTATAATAATA
TCGACACTAAAAATAAAGAGGGTTATTTGAACAAAAAAAAAATAAAGAGGGTTTATGTTT
GCTCTCATTCATGTGTATTGTCCCTCTATTTTGTAGTTTTCTGTTTTGTTGTTTGGTTGT
GGTCCAGTTCGGTTTGTAAG

QA 1 440 1 440
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TATGCAAAAAAGAAGAAGAGTGTGTTGGATCTGACATTCTACTTTGGGAGATGCTTTCTT
AGCTTTCTACTGAGATGAATATTTTTGCCTTAATCACGTGCTACTAATTGACTTTATCAT
GCGCTTAAAAAATGGAATGAAAGGTCGGAACTTGGGAGAGAGATTCAAAGTTTATATATA
GTTAATCCAAACTTTATACAATTATCAGATTTTAGGGACAAAACATTATGTGTTAGTGGT
CCCCTTTTTATGGTGCATACATCACTGTTAACAATAATTATTTGCATCATAATTGAAAAC
TAAACATCTCTATTGGTTTTTTATAATAATATCGACACTAAAAATAAAGAGGGTTATTTG
AACAAAAAAAAAATAAAGAGGGTTTATGTTTGCTCTCATTCATGTGTATTGTCCCTCTAT
TTTGTAGTTTTCTGTTTTGTTGTTTGGTTGTGGTCCAGTTCGGTTTGTAAGGACAACATC
ATTATAAATCTGGTTTTGAAAGAAATAATCAAACTAACAT

QA 1 580 1 580
DS 



AS 2 4

CO CL2754Contig1 958 2 4 U
GCCGTCTCGCCTGCAACGCAACTCGCTACCCGGACCAATGCCTTTCTTCCCTCTCCGAAC
CGTTAGGGTTCCGTTTGAGAAGAAGAACGTCGTCTTCGTCGGAGACGGCATGGGCAAAAC
GGTCATTACGGGTTCCTTGAACGTCGGGATGCCTGGGATGACCACGTACAACACTGCAAC
TGTCGGAGTGGTAGGAGATGGATTCATGGCTCGTGATATAACCTTCCAAAATACGGCGAC
CAGACGCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACAGCGACTTTTCTCTGCTAGAGAACT
GTGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCACATGGACTTCGTCAGTTCTACAAAA
GCTGCCGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCGGAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAAG
ACTGCGAGATCCTTATTGCACCTCGTCAGGTTAACCCCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTG
TCACTGCACATGGGAGAATTGACCCGTCGCAGTCGACGGGGTTCGTGTTCTTGAATTGTT
TGATCAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGCTGTATAAAGCTAACCCTAAGGGGCATAAGA
ACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTACTCGAGGACTGTGTTTATAGGTTGCAATATGG
AGGCTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCGTGGAGCGGGGATTTCGCTCTTCAGACGC
TGTATTATGGAGAGTCCAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTCACAGAGGGTTTCGT
GGAGCAGTGAGATTCCAGACGAGCATGTTCATGTGTACTCGGTGGCTAACTTTATTCAAG
GCGATGAGTGGGCTTTGATGTCTGGTTGAATCAAATCACGACTAAAGGAAAAGCTGTATA
AGAAGTTTAACCATTGTACTTTAGTTGAGAAAATTTATAAATTGAAAGTTCAGAAACT


BQ
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AF RR4BY76TF U 1
AF RR4BY76JQ C 329
BS 1 591 RR4BY76TF
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BS 737 958 RR4BY76JQ

RD RR4BY76TF 741 0 0
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CGTTAGGGTTCCGTTTGAGAAGAAGAACGTCGTCTTCGTCGGAGACGGCATGGGCAAAAC
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TGTCGGAGTGGTAGGAGATGGATTCATGGCTCGTGATATAACCTTCCAAAATACGGCGAC
CAGACGCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACAGCGACTTTTCTCTGCTAGAGAACT
GTGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCACATGGACTTCGTCAGTTCTACAAAA
GCTGCCGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCGGAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAAG
ACTGCGAGATCCTTATTGCACCTCGTCAGGTTAACCCCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTG
TCACTGCACATGGGAGAATTGACCCGTCGCAGTCGACGGGGTTCGTGTTCTTGAATTGTT
TGATCAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGCTGTATAAAGCTAACCCTAAGGTGCATAAGA
ACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTACTCGAGGACTGTGTTTATAGGTTGCAATATGG
AGGCTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCGTGGAGCGGGGATTTCGCTCTTCAGACGC
TGTATTATGGAGAGTC
AAGAA

QA 1 736 1 736
DS 

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CATTTTCGGAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAAGACTGCGAGATCCTTATTGCACCTCGTCA
GGTTAACCCCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTGTCACTGCACATGGGAGAATTGACCCGTC
GCAGTCGACGGGGTTCGTGTTCTTGAATTGTTTGATCAACGGGACGGAGGAGTACATGAA
GCTGTATAAAGCTAACCCTAAGGGGCATAAGAACTTTTTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTA
CTCGAGGACTGTGTTTATAGGTTGCAATATGGAGGCTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCT
ACCGTGGAGCGGGGATTTCGCTTTTCAGACGCTGTATTATGGAGAGTCCAAGAACACGGG
TTTGGGATCAGATAGGTCACAGAGGGTTTCGTGGAGCAGTGAGATTCCAGACGAGCATGT
TCATGTGTACTCGGTGGCTAACTTTATTCAAGGCGATGAGTGGGCTTTGATGTCTGGTTG
AATCAAATCACGACTAAAGGAAAAGCTGTATAAGAAGTTTAACCATTGTACTTTAGTTGA
GAAAATTTATAAATTGAAAGTTCAGAAACT

QA 1 630 1 630
DS 



CO CL2754Contig2 894 2 2 U
GGGGGCAAAACGGTCATTACGGGTTCCTTGAACGTCGGGATGCCTGGGATGACCACGTAC
AACACTGCAACTGTCGGAGTGGTAGGAGATGGATTCATGGCTCGTGATATAACCTTCCAA
AACACGGCGGGACCAGACGCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACAGCGACTTTTCT
CTGCTCGAGAACTGTGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCACATGGACTTCGT
CAGTTCTACAAAAGCTGCCGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCGGAAACTCAGCT
TGCGTCTTCCAAGACTGCGAGATCCTCATCGCGCCGCGTCAAGTCAACCCCGAGAAGGGC
GAGAAAAACGCTGTCACTGCACATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCCACGGGGTTCGTG
TTCTTGAACTGTTTGATAAACGGGACCGAGGAGTACATGAAGCTGTACAAAGCTAACCCT
AAGGTGCATAAGAACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGATTACTCGAGGACTGTGTTTATA
GGTTGCAATATGGAGGCTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCATGGAGCGGGGATTTC
GCTCTACAGACGCTGTATTATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTCA
CAGAGGGTTTCGTGGAGCAGTGAGATACCGGAGGAGCATGTTCATGTCTACTCGTGGCTA
ACTTTATTCAAGGCGATGAGTGGGCTTTGATGTCTGGTTGAATCAACACGACTAAAGGAA
AAGCTGTATAAGAAGTTTAACCAGTGTACTTTAGTTGAGAAAATTTATAAGACGAACCAA
ACAATTCAAAAACTTGGCATTCACGCTAGTTATATAAATTGAAAGTTCATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC47TF U 1
AF RR4DC47JQ C 263
BS 1 652 RR4DC47TF
BS 653 894 RR4DC47JQ

RD RR4DC47TF 652 0 0
GGGGGCAAAACGGTCATTACGGGTTCCTTGAACGTCGGGATGCCTGGGATGACCACGTAC
AACACTGCAACTGTCGGAGTGGTAGGAGATGGATTCATGGCTCGTGATATAACCTTCCAA
AACACGGCGGGACCAGACGCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACAGCGACTTTTCT
CTGCTCGAGAACTGTGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCACATGGACTTCGT
CAGTTCTACAAAAGCTGCCGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCGGAAACTCAGCT
TGCGTCTTCCAAGACTGCGAGATCCTCATCGCGCCGCGTCAAGTCAACCCCGAGAAGGGC
GAGAAAAACGCTGTCACTGCACATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCCACGGGGTTCGTG
TTCTTGAACTGTTTGATAAACGGGACCGAGGAGTACATGAAGCTGTACAAAGCTAACCCT
AAGGTGCATAAGAACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGATTACTCGAGGACTGTGTTTATA
GGTTGCAATATGGAGGCTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCATGGAGCGGGGATTTC
GCTCTACAGACGCTGTATTATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4DC47JQ 632 0 0
TCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCGGAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAAGACTGCGAGA
TCCTCATCGCGCCGCGTCAAGTCAACCCCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTGTCACTGCAC
ATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCCACGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTTTGATAAACG
GGACCGAGGAGTACATGAAGCTGTACAAAGCTAACCCTAAGGTGCATAAGAACTTCTTGG
GGAGGCCGTGGAAAGATTACTCGAGGACTGTGTTTATAGGTTGCAATATGGAGGCTTTGA
TAACTCCTGATGGGTGGCTACCATGGAGCGGGGATTTCGCTCTACAGACGCTGTATTATG
GAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTCACAGAGGGTTTCGTGGAGCAGTG
AGATACCGGAGGAGCATGTTCATGTCTACTCGTGGCTAACTTTATTCAAGGCGATGAGTG
GGCTTTGATGTCTGGTTGAATCAACACGACTAAAGGAAAAGCTGTATAAGAAGTTTAACC
AGTGTACTTTAGTTGAGAAAATTTATAAGACGAACCAAACAATTCAAAAACTTGGCATTC
ACGCTAGTTATATAAATTGAAAGTTCATAATC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 4

CO CL2755Contig1 612 4 1 U
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TGCCTTACATCCAAAAAGTTCTTCAGCAGCCATTTTACACTACCGACTTGCTGTACAAGC
TGATCAAAGAATCAGAGGCGATGCTCGATTGCTTCTTCGAGGATCCAACGACGGTCTCTG
CTGATGCAACAACAGAGTCTGATGAGAGTAGTAGTGTCCAAGCAGAGCACAAGTTCATGG
AGAGCCTCCACATGAAAAGCACGATCGCTGCTTTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGCA
AAAGCTCTACCGTGAGCGTCTTCTCCCTGCCGCCGCTCCAGTTAAACGGGTTAGACAAGA
TTCCCTTGTTGGAGCAAGAAGCCAAATAGAGAGGGAAGGAGGGAGGCACTGCTCTTTCCA
CTTCTCTTACAGTAGAAAGCTAACATATTATAAAAGCCATACATTATCAATGTCTTTGGT
CCCTTTTTAAAAGTCCTTAGGAGTTGTAACTTTGTTACTGTGTTTGGTTTGTAGTAATTT
GATATAATATACCACTTTCAGATTTATCTATTACCTTTGAGTTCGACAAGTAAGATATCA
TCTTTCAAGTGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FP38JQ C 1
AF RR4FP38TF U 1
AF RR4FW41JQ C 1
AF RR4FW41TF U 1
BS 1 612 RR4FP38TF

RD RR4FP38JQ 612 0 0
GCACAGGATTGGTTAAGATACTGAAGAAGTACGACAAACGAACCGGTGATCTCATGCGCT
TGCCTTACATCCAAAAAGTTCTTCAGCAGCCATTTTACACTACCGACTTGCTGTACAAGC
TGATCAAAGAATCAGAGGCGATGCTCGATTGCTTCTTCGAGGATCCAACGACGGTTTCTG
CTGATGCAACAACAGAGTCTGATGAGAGTAGTAGTGTCCAAGCAGAGCACAAGTTCATGG
AGAGCCTCCACATGAAAAGCACGATCGCTGCTTTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGCA
AAAGCTCTACCGTGAGCGTCTTCTCCCTGCCGCCGCTCCAGTTAAACGGGTTAGACAAGA
TTCCCTTGTTGGAGCAAGAAGCCAAATAGAGAGGGAAGGAGGGAGGCACTGCTCTTTCCA
CTTTTCTTACAGTAGAAAGCTAACATATTATAAAAGCCATACATTATCAATGTCTTTGGT
CCCTTTTTAAAAGTCCTTAGGAGTTGTAACTTTGTTACTGTGTTTGGTTTGTAGTAATTT
GATATAATATACCACTTTCAGATTTATCTATTACCTTTGAGTTCGACAAGTAAGATATCA
TCTTTCAAGTGC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4FP38TF 612 0 0
GCACAGGATTGGTTAAGATACTGAAGAAGTACGACAAACGAACCGGTGATCTCATGCGCT
TGCCTTACATCCAAAAAGTTCTTCAGCAGCCATTTTACACTACCGACTTGCTGTACAAGC
TGATCAAAGAATCAGAGGCGATGCTCGATTGCTTCTTCGAGGATCCAACGACGGTCTCTG
CTGATGCAACAACAGAGTCTGATGAGAGTAGTAGTGTCCAAGCAGAGCACAAGTTCATGG
AGAGCCTCCACATGAAAAGCACGATCGCTGCTTTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGCA
AAAGCTCTACCGTGAGCGTCTTCTCCCTGCCGCCGCTCCAGTTAAACGGGTTAGACAAGA
TTCCCTTGTTGGAGCAAGAAGCCAAATAGAGAGGGAAGGAGGGAGGCACTGCTCTTTCCA
CTTCTCTTACAGTAGAAAGCTAACATATTATAAAAGCCATACATTATCAATGTCTTTGGT
CCCTTTTTAAAAGTCCTTAGGAGTTGTAACTTTGTTACTGTGTTTGGTTTGTAGTAATTT
GATATAATATACCACTTTCAGATTTATCTATTACCTTTGAGTTCGACAAGTAAGATATCA
TCTTTCAAGTGC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4FW41JQ 612 0 0
GCACAGGATTGGTTAAGATACTGAAGAAGTACGACAAACGAACCGGTGATCTCATGCGCT
TGCCTTACATCCAAAAAGTTCTTCAGCAGCCATTTTACACTACCGACTTGCTGTACAAGC
TGATCAAAGAATCAGAGGCGATGCTCGATTGCTTCTTCGAGGATCCAACGACGGTTTCTG
CTGATGCAACAACAGAGTCTGATGAGAGTAGTAGTGTCCAAGCAGAGCACAAGTTCATGG
AGAGCCTCCACATGAAAAGCACGATCGCTGCTTTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGCA
AAAGCTCTACCGTGAGCGTCTTCTCCCTGCCGCCGCTCCAGTTAAACGGGTTAGACAAGA
TTCCCTTGTTGGAGCAAGAAGCCAAATAGAGAGGGAAGGAGGGAGGCACTGCTCTTTCCA
CTTCTCTTACAGTAGAAAGCTAACATATTATAAAAGCCATACATTATCAATGTCTTTGGT
CCCTTTTTAAAAGTCCTTAGGAGTTGTAACTTTGTTACTGTGTTTGGTTTGTAGTAATTT
GATATAATATACCACTTTCAGATTTATCTATTACCTTTGAGTTCGACAAGTAAGATATCA
TCTTTCAAGTGC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4FW41TF 612 0 0
GCACAGGATTGGTTAAGATACTGAAGAAGTACGACAAACGAACCGGTGATCTCATGCGCT
TGCCTTACATCCAAAAAGTTCTTCAGCAGCCATTTTACACTACCGACTTGCTGTACAAGC
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CTGATGCAACAACAGAGTCTGATGAGAGTAGTAGTGTCCAAGCAGAGCACAAGTTCATGG
AGAGCCTCCACATGAAAAGCACGATCGCTGCTTTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGCA
AAAGCTCTACCGTGAGCGTCTTCTCCCTGCCGCCGCTCCAGTTAAACGGGTTAGACAAGA
TTCCCTTGTTGGAGCAAGAAGCCAAATAGAGAGGGAAGGAGGGAGGCACTGCTCTTTCCA
CTTCTCTTACAGTAGAAAGCTAACATATTATAAAAGCCATACATTATCAATGTCTTTGGT
CCCTTTTTAAAAGTCCTTAGGAGTTGTAACTTTGTTACTGTGTTTGGTTTGTAGTAATTT
GATATAATATACCACTTTCAGATTTATCTATTACCTTTGAGTTCGACAAGTAAGATATCA
TCTTTCAAGTGC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL2756Contig1 1209 4 9 U
GTGCTGACAGTTTGACTCACTGGGACATCACTTTCTGGAGTGAGAGGCTCCGTGAATCGA
AATACGATATTAATGATGAAGAATTGCGACCCTACTTCTCACTGCCAAAGGTTATGGATG
GGCTTTTTGGTTTAGCTAAGACCCTATTTGGAATTGATGTGGCGCCGGCGGATGGCGTAG
CTCCGGTCTGGAACAGCGACGTTAGGTTCTACTGCATCAAAGATTCTTCTGGAAATCCCA
CTGCTTATTTCTACTTTGATCCATACTCTCGTCCTTCAGAAAAGAGAGGCGGTGCTTGGA
TGGATGAAGTTTTTTTCCCGTAGCCGAGTCATGGCCCAGAAGGGTTCCTCCGTTCGGTTA
CCTGTTGCGCAAATGGTATGCAACCAAACTCCACCGGTTGGTGACAAGCCAAGCCTTATG
ACATTCCGTGAGGTAGAGACTGTATTCCATGAATTTGGCCATGCTCTGCAGCATATGCTT
ACGAAAGAAGACGAGGGGCTAGTTGCTGGTATCAGAAATATCGAGTGGGACGCAGTTGAA
TTACCTTCACAGTTTATGGAGAACTGGTGCTACCACAGGGATACCTTAATGAGCATTGCT
AAGCATTATCAAACAGGGGAATCTCTTCCTGAGAATGTGTACAAGAAGCTCCTGGCTGCA
AGAACATTCCGTGCAGGATCCCTTAGTCTTCGTCAGCTGAAGTTTGCTACAGTTGATCTG
GAGCTGCACACGAAATATGTGCCAGGTGGGACAGAGTCTATTTACGATGTTGATCAAAGG
GTGTCCATGAAGACACAAGTCATCCCTCCCCTTCCTGAGGATAGATTCCTCTGTAGCTTC
AGCCATATATTTGCAGGCGGTTATGCAGCTGGATATTACAGTTACAAGTGGGCGGAGGTT
TTGTCTGCGGATGCGTTTTCAGCTTTTGAAGATGCTGGATTAGATGACATCAAGGCCGTT
AAAGAGACAGGACAGAGATTCAGAAACACCATACTTGCTCTGGGAGGAGGAAAAGCGCCT
CTAAAAGTGTTTGTGGAGTTCAGAGGACGAGAACCTTCCCCAGAGCCTCTTTTCAGGCAC
AACGGACTCTTGGTTGCTTCTGCTTGAAACATATGTGTTCCCCTTAAACTGATCTCGTCT
CTACTCTAAACGTTTTTCTTGAATAGTCATCCTCGTACCTTGCTTTGTGGATTATTAAAT
GTCATCCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4D925TF U 1
AF RR4DH38TF U 1
AF RR4DH38JQ C 435
AF RR4D925JQ C 510
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BS 747 780 RR4DH38TF
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TTACCTTCACAGTTTATGGAGAACTGGTGCTACCACAGGGATACCTTAATGAGCATTGCT
AAGCATTATCAA

QA 1 612 1 612
DS 

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GGCTTTTTGGTTTAGCTAAGACCCTATTTGGAATTGATGTGGCGCCGGCGGATGGCGTAG
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CTGCTTATTTCTACTTTGATCCATACTCTCGTCCTTCAGAAAAGAGAGGCGGTGCTTGGA
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CCTGTTGCGCAAATGGTATGCAACCAAACTCCACCGGTTGGTGACAAGCCAAGCCTTATG
ACATTCCGTGAGGTAGAGACTGTATTCCATGAATTTGGCCATGCTCTGCAGCATATGCTT
ACGAAAGAAGACGAGGGGCTAGTTGCTGGTATCAGAAATATCGAGTGGGACGCAGTTGAA
TTACCTTCACAGTTTATGGAGAACTGGTGCTACCACAGGGATACCTTAATGAGCATTGCT
AAGCATTATCAAACAGGGGAATCTCTTCCTGAGAATGTGTACAAGAAGCTCCTGGCTGCA
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TGTCATGAAGACACA

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DS 

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TATGGAGAACTGGTGCTACCACAGGGATACCTTAATGAGCATTGCTAAGCATTATCAAAC
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AGGATCCCTTAGTCTTCGTCAGCTGAAGTTTGCTACAGTTGATCTGGAGCTGCACACGAA
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AGGCGGTTATGCAGCTGGATATTACAGTTACAAGTGGGCGGAGGTTTTGTCTGCGGATGC
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GAGATTCAGAAACACCATACTTGCTCTGGGAGGAGGAAAAGCGCCTCTAAAAGTGTTTGT
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TGCTTCTGCTTGAAACATATGTGTTCCCCTTAAACTGATCTCGTCTCTACTCTAAACGTT
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QA 1 775 1 775
DS 

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TGGATATTACAGTTACAAGTGGGCGGAGGTTTTGTCTGCGGATGCGTTTTCAGCTTTTGA
AGATGCTGGATTAGATGACATCAAGGCCGTTAAAGAGACAGGACAGAGATTCAGAAACAC
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AGAACCTTCCCCAGAGCCTCTTTTCAGGCACAACGGACTCTTGGTTGCTTCTGCTTGAAA
CATATGTGTTCCCCTTAAACTGATCTCGTCTCTACTCTAAACGTTTTTCTTGAATAGTCA
TCCTCGTACCTTGCTTTGTGGATTATTAAATGTCATCCAA

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

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GGACCACCGCCGGGAGTGTCTCTCTCTCCCTTCCTTTTGATCTATGTGTTTTTGAGTGCA
GAGCTAGAGGTTGCGAGTTTAGAACTGATTTTTTGTAGTTTTGTGGATTCGTTTTGTCTT
TCCGACGTCGTCCCCACTCTCGGTTTCAGGCTCATCTGAACGGAATGGAGTCTCGAGGTC
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TTCTTTCTGCAATGGTGGGTCCGTTCGCTCCTGGTGTTCTTCATTGTTGCGAACCATGGT
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TTTCATCTCGAATCTTCCCTCTACTTGTGTTTGAAATATCGTTTGGTGGTTCTTCTTGGT
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GTTTGAATAAACAGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BH04TF U 1
AF RR4B749TF U 54
AF RR4B749JQ C 232
AF RR4BH04JQ C 311
BS 1 83 RR4BH04TF
BS 84 84 RR4B749TF
BS 85 789 RR4BH04TF
BS 790 1098 RR4B749JQ

RD RR4BH04TF 800 0 0
GGACCACCGCCGGGAGTGTCTCTCTCTCCCTTCCTTTTGATCTATGTGTTTTTGAGTGCA
GAGCTAGAGGTTGCGAGTTTAGATCTGATTTTTTGTAGTTTTGTGGATTCGTTTTGTCTT
TCCGACGTCGTCCCCACTCTCGGTTTCAGGCTCATCTGAACGGAATGGAGTCTCGAGGTC
TGTATCTTCCTCGCGGTGATAGGTGAAGCTCGACGGGTGCAACCGGGTTGAGTCTCTTCA
GATCTCTATCCTGCTTTCTCATATCTTGTGGTTCGTGTTCTAGTCTTTCTGGCTTTGATT
TTCTTTCTGCAATGGTGGGTCCGTTCGCTCCTGGTGTTCTTCATTGTTGCGAACCATGGT
GAACCTGGTTATGGCTGTGGTGGTTCGTGGTATCTTTGTGTTTAATCGAGCCTTCTGACG
GGTTCACTGAGATGATGCCAGTCTTCATCGATGTGTTATGCCGGGTTTTGCTAATGTTTG
TTTCATCTCGAATCTTCCCTCTACTTGTGTTTGAAATATCGTTTGGTGGTTCTTCTTGGT
TCAAGCTTCTTCGACGGGTCTGGTGGTACTCTCGTTCTGCTCGCCACTTCGTGATAGGTC
CAATCCCTTCTTGGTTCATGCTTGTTCGATGTTATATGTCAACCACTGTTGTTGTAGGTT
AAATGAATTGCACTTGTGGCTTCACCGAGATCTCTGGTTATCTTGGGATTAGGGTTAAGC
AAGAGATTCATATTACCTTTTCTCTTGTCAGTTTGTGTTGGCCGTATAAGCAACTCTCTA
CTCGATGAA
ATATTCTCAAC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4B749TF 742 0 0
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TTGTCTTTCCGACGTCGTCCCCACTCTCGGTTTCAGGCTCATCTGAACGGAATGGAGTCT
CGAGGTCTGTATCTTCCTCGCGGTGATAGGTGAAGCTCGACGGGTGCAACCGGGTTGAGT
CTCTTCAGACCTCTATCCTGCTTTCTCATATCTTGTGGTTCGTGTTCTAGTCTTTCTGGC
TTTGATTTTCTTTCTGCAATGGTGGGTCCGTTCGCTCCTGGTGTTCTTCATTGTTGCGAA
CCATGGTGAACCTGGTTATGGCTGTGGTGGTTCGTGGTATCTTTGTGTTTAATCGAGCCT
TCTGACGGGTTCACTGAGATGATGCCAGTCTTCATCGATGTGTTATGCCGGGTTTTGCTA
ATGTTTGTTTCATCTCGAATCTTCCCTCTACTTGTGTTTGAAATATCGTTTGGTGGTTCT
TCTTGGTTCAAGCTTCTTCGACGGGTCTGGTGGTACTCTCGTTCTGCTCGCCACTTCGTG
ATAGGTCCAATCCCTTCTTGGTTCATGCTTGTTCGATGTTATATGTCAACCACTGTTGTT
GTAGGTTAAATGAATTGCACTTGTGGCTTCACCGAGATCTCTGGTTATCTTGGGATTAGG
GTTAAGCAAGAGATTCATATTACCTTTTCTCTTGTCAGTTTGTGTTGGCCGTATAAGCAA
CTCTCTACTCGATGAA
TATTCT

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DS 

RD RR4B749JQ 867 0 0
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GCTTTGATTTTCTTTCTGCAATGGTGGGTCCGTTCGCTCCTGGTGTTCTTCATTGTTGCG
AACCATGGTGAACCTGGTTATGGCTGTGGTGGTTCGTGGTATCTTTGTGTTTAATCGAGC
CTTCTGACGGGTTCACTGAGATGATGCCAGTCTTCATCGATGTGTTATGCCGGGTTTTGC
TAATGTTTGTTTCATCTCGAATCTTCCCTCTACTTGTGTTTGAAATATCGTTTGGTGGTT
CTTCTTGGTTCAAGCTTCTTCGACGGGTCTGGTGGTACTCTCGTTCTGCTCGCCACTTCG
TGATAGGTCCAATCCCTTCTTGGTTCATGCTTGTTCGATGTTATATGTCAACCACTGTTG
TTGTAGGTTAAATGAATTGCACTTGTGGCTTCACCGAGATCTCTGGTTATCTTGGGATTA
GGGTTAAGCAAGAGATTCATATTACCTTTTCTCTTGTCAGTTTGTGTTGGCCGTATAAGC
AACTCTCTACTCGATGAAATATTCTCAACCAAGGAATAGAGACCTTTGAAATTGTCTCAG
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TGTTGGTTGGATCTCTTTCTCATATGGATTGTTGTTTTCTGCTTGTTTAAGCTTTACTTA
TATCACCTACTGGTGAATGTCTATTACTCATGTTTTGAGTTTTTAATCTGGGAACTTTGT
TTCTCTCAAGTTTGAATAAACAGTGTC

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DS 

RD RR4BH04JQ 788 0 0
AATGGTGGGTCCGTTCGCTCCTGGTGTTCTTCATTGTTGCGAACCATGGTGAACCTGGTT
ATGGCTGTGGTGGTTCGTGGTATCTTTGTGTTTAATCGAGCCTTCTGACGGGTTCACTGA
GATGATGCCAGTCTTCATCGATGTGTTATGCCGGGTTTTGCTAATGTTTGTTTCATCTCG
AATCTTCCCTCTACTTGTGTTTGAAATATCGTTTGGTGGTTCTTCTTGGTTCAAGCTTCT
TCGACGGGTCTGGTGGTACTCTCGTTCTGCTCGCCACTTCGTGATAGGTCCAATCCCTTC
TTGGTTCATGCTTGTTCGATGTTATATGTCAACCACTGTTGTTGTAGGTTAAATGAATTG
CACTTGTGGCTTCACCGAGATCTCTGGTTATCTTGGGATTAGGGTTAAGCAAGAGATTCA
TATTACCTTTTCTCTTGTCAGTTTGTGTTGGCCGTATAAGCAACTCTCTACTCGATGAAA
TATTCTCAACCAAGGAATAGAGACCTTTGAAATTGTCTCAGTAGGTAAATTGGTAGTGTA
CTCTGCTGTGGAGATAGCAAGTAATGACTCCTTTGGTTACAACTTTGAGAAAGCTGGATT
TTAAGAAGATGTGCCATGGAATGGGTCCACAAAAACCAGTATGTTGGTTGGATCTCTTTC
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TCTATTACTCATGTTTTGAGTTTTTAATCTGGGAACTTTGTTTCTCTCAAGTTTGAATAA
ACAGTGTC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

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CTACGGCAGCTTTGACAGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
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TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
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AAGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCGAAGACATATAAATTTTCATG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BY70JQ C 1
AF RR4BY70TF U 1
AF RR4BY94JQ C 1
AF RR4BY94TF U 1
BS 1 580 RR4BY70TF
BS 581 581 RR4BY94TF
BS 582 599 RR4BY70TF

RD RR4BY70JQ 599 0 0
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CTACGGCAGCTTTGACAGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
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TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
AGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
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QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4BY70TF 599 0 0
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CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGG
CTACGGCAGCTTTGACAGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
AGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTT
AAGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCGA*GACATATAAATTTTCATG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4BY94JQ 599 0 0
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CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGT
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CTACGGCAGCTTTGACAGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
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TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
AGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTT
AAGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCGAAGACATATAAATTTTCATG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4BY94TF 599 0 0
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CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
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CTACGGCAGCTTTGACAGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
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TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
AGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTT
AAGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCGAAGACATATAAATTTTCATG

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 3

CO CL2759Contig1 821 3 3 U
AGGGGATCTCAAAAACTCTATATCGATCGGAAACTACTCAGACTCGTTTTTTTAAAAATC
AGATTGCTTAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAATTCCGACTATCAGAGATTTTATGCTCTC
CCATTCCACAACCGCTAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTGTCTCCACCCCATCCTCTTTCAC
ATTTGTCTCTTTCAAGAAATCTTGGTACTTACGTTGCATGGGCGTCCACCCTTGAATAAA
AAAAAGGCCTTCATCAGAGTTTCTGATTCCTTTTGTTGGTATAATTGTAAAGATGGTGTA
CAACAAGCAGATGAAAAACTCTAAATCGAAGATAAACAGGTTCCTCGTTAGCATCAGTTT
CGTAGGAAGTGCTGGACCGATTCGTTTTGTTGTCAAAGAAGATGAAACTGTATCAAATGT
GATTGAGTATGCTCTCAAATGCTACGCCCGCGAAGGCAGGCTTCCCCTTCTCGGATCAGA
TTCCAGCTTTTTCATTCTTTACTGTCCTTATTGTGCCGCTGAAGCATTCAGTCCGTGGGG
GAAAATCGGGTCAACCGGATCGAGGAACTTCGTTTTGTCGAAGAAGTCAGAAGCTCAAAG
CCTTGGAGACTCTGTGGGGACAACAATGAGGAAAATCTCTGGGAGGTGGAAGGCTTGGCT
CAACAGGTCTCTAGGCCTTGTGGATCATTCTCACTAATTAGATCATGCTTTTTGAATTTG
ATTTTTTACATTTTTGTTTTTTTGGTTCTTGTTTTCACTGGAATAGCCGTCACAACACTT
GTGGTTTCTTTTTTTGCCATAAAATTAATGAATTGAGACTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C758TF U 1
AF RR4EN78TF U 4
AF RR4C758JQ C 52
BS 1 605 RR4C758TF
BS 606 634 RR4EN78TF
BS 635 821 RR4C758JQ

RD RR4C758TF 608 0 0
AGGGGATCTCAAAAACTCTATATCGATCGGAAACTACTCAGACTCGTTTTTTTAAAAATC
AGATTGCTTAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAATTCCGACTATCAGAGATTTTATGCTCTC
CCATTCCACAACCGCTAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTGTCTCCACCCCATCCTCTTTCAC
ATTTGTCTCTTTCAAGAAATCTTGGTACTTACGTTGCATGGGCGTCCACCCTTGAATAAA
AAAAAGGCCTTCATCAGAGTTTCTGATTCCTTTTGTTGGTATAATTGTAAAGATGGTGTA
CAACAAGCAGATGAAAAACTCTAAATCGAAGATAAACAGGTTCCTCGTTAGCATCAGTTT
CGTAGGAAGTGCTGGACCGATTCGTTTTGTTGTCAAAGAAGATGAAACTGTATCAAATGT
GATTGAGTATGCTCTCAAATGCTACGCCCGCGAAGGCAGGCTTCCCCTTCTCGGATCAGA
TTCCAGCTTTTTCATTCTTTACTGTCCTTATTGTGCCGCTGAAGCATTCAGTCCGTGGGG
GAAAATCGGGTCAACCGGATCGAGGAACTTCGTTTTGTCGAAGAAGTCAGAAGCTCAAAG
CCTTG
GAG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4EN78TF 636 0 0
GGATCTCAAAAACTCTATATCGATCGGAAACTACTCAGACTCGTTTTTTTAAAAATCAGA
TTGCTTAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAATTCCGACTATCAGAGATTTTATGCTCTCCCA
TTCCACAACCGCTAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTGTCTCCACCCCATCTTCTTTCACATT
TGTCTCTTTCAAGAAATCTTGGTACTTACGTTGCATGGGCGTCCACCCTTGAATAAAAAA
AAGGCCTTCATCAGAGTTTCTGATTCCTTTTGTTGGTATAATTGTAAAGATGGTGTACAA
CAAGCAGATGAAAAACTCTAAATCGAAGATAAACAGGTTCCTCGTTAGCATCAGTTTCGT
AGGAAGTGCTGGACCGATTCGTTTTGTTGTCAAAGAAGATGAAACTGTATCAAATGTGAT
TGAGTATGCTCTCAAATGCTACGCCCGCGAAGGCAGGCTTCCCCTTCTCGGATCAGATTC
CAGCTTTTTCATTCTTTACTGTCCTTATTGTGCCGCTGAAGCATTCAGTCCGTGGGGGAA
AATCGGGTCAACCGGATCGAGGAACTTCGTTTTGTCGAAGAAGTCAGAAGCTCAAAGCCT
TGGAGACTCTGTGGGGACAACAATGAGGAAA
TCTCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4C758JQ 770 0 0
TTT
AAAATCAGATTGCTTAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAATTCCGACTATCAGAGATTTTAT
GCTCTCCCATTCCACAACCGCTAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTGTCTCCACCCCATCCTC
TTTCACATTTGTCTCTTTCAAGAAATCTTGGTACTTACGTTGCATGGGCGTCCACCCTTG
AATAAAAAAAAGGCCTTCATCAGAGTTTCTGATTCCTTTTGTTGGTATAATTGTAAAGAT
GGTGTACAACAAGCAGATGAAAAACTCTAAATCGAAGATAAACAGGTTCCTCGTTAGCAT
CAGTTTCGTAGGAAGTGCTGGACCGATTCGTTTTGTTGTCAAAGAAGATGAAACTGTATC
AAATGTGATTGAGTATGCTCTCAAATGCTACGCCCGCGAAGGCAGGCTTCCCCTTCTCGG
ATCAGATTCCAGCTTTTTCATTCTTTACTGTCCTTATTGTGCCGCTGAAGCATTCAGTCC
GTGGGGGAAAATCGGGTCAACCGGATCGAGGAACTTCGTTTTGTCGAAGAAGTCAGAAGC
TCAAAGCCTTGGAGACTCTGTGGGGACAACAATGAGGAAAATCTCTGGGAGGTGGAAGGC
TTGGCTCAACAGGTCTCTAGGCCTTGTGGATCATTCTCACTAATTAGATCATGCTTTTTG
AATTTGATTTTTTACATTTTTGTTTTTTTGGTTCTTGTTTTCACTGGAATAGCCGTCACA
ACACTTGTGGTTTCTTTTTTTGCCATAAAATTAATGAATTGAGACTC

QA 4 770 4 770
DS 



AS 1 3

CO CL2760Contig1 758 3 17 U
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ACAAAAAAGCCTCTGTTGTTGTATTTCCTCGGCTTTGGCTTATTTGTTGCCGCTGCACCT
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AAGAAGGAGTACTTGTACGGTAAGATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGCTGGAAACTCA
GCTGGAACCGTGACCGCCTACTACCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGATGAGATTGAC
TTTGAGTTCTTGGGAAATCTCACAGGACAGCCTTACACTATCCACACCAATGTCTTCACC
GGTGGTAAAGGTGACCGCGAGATGCAGTTCCGCCTCTGGTTCGATCCCACCGCTGATCTC
CACACATACACCGTCCACTGGGACCCTCTTAACATCATCTTCCTTGTGGATGGGATCCCA
ATTCGGGTGTTCAAGAACAACGAGAAGAACGGAGTGTTATACCCTACGTCCCAACCCATG
AGGATATACTCAAGCCTTTGGGAAGCTGATGACTGGGCCACGCAAGGCGGTCGCGTGAAG
ATCGACTGGAACAACGCACCATTCAGAGCACATTACAGGAACTTCGAAGACCAAAGCTCA
TGCAGCAGATATCAAACTTGACATGGGTGACTTGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD87TF U 1
AF RR4DV88TF U 5
AF RR4E463TF U 84
BS 1 117 RR4DD87TF
BS 118 118 RR4DV88TF
BS 119 158 RR4DD87TF
BS 159 159 RR4DV88TF
BS 160 209 RR4DD87TF
BS 210 210 RR4DV88TF
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BS 310 311 RR4DD87TF
BS 312 312 RR4DV88TF
BS 313 477 RR4DD87TF
BS 478 478 RR4DV88TF
BS 479 501 RR4DD87TF
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BS 503 566 RR4DD87TF
BS 567 695 RR4DV88TF
BS 696 758 RR4E463TF

RD RR4DD87TF 569 0 0
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ACAAAAAAGCCTCTGTTGTTGTATTTCCTCGGCTTTGGCTTATTTGTTGCCGCTGCATCT
GCCGGAAGCTTCTACGAGAGCTTTGATATCACTTGGGGGGATGGCCGTGCCGACATATTC
GAGAGTGGACAGCTTCTCACTTGCACTCTCGACAAGGTCTCCGGCTCAGGGTTTCAGTCC
AAGAAGGAGTACTTGTACGGTAAGATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGCTGGAAACTCA
GCTGGAACTGTAACCGCCTACTACCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGATGAGATTGAC
TTTGAGTTCTTGGGAAATCTCACAGGACAGCCTTACACTATCCACACCAATGTCTTCACC
GGTGGTAAAGGTGACCGCGAGATGCAGTTCCGCCTCTGGTTCGATCCCACCGCTGATTTC
CACACATACACCGTCCACTGGAACCCTCTTAACATCATCTTCCTTGTGGATGGGATCCCA
ATTCGGGTGTTCAAGAACAACGAGAA
AAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4DV88TF 691 0 0
GG
ATCGACCAACACTTATTTTCCACGGCAAGAAGCAAAAAAATGGCGGTTCCAGCAACAAAA
AAGCCTCTGTTGTTGTATTTCCTCGGCTTTGGCTTATTTGTTGCCGCTGCACCTGCCGGA
AGCTTCTACGAGAGCTTTGATATCACTTGGGGAGATGGCCGTGCCGACATATTCGAGAGT
GGACAGCTTCTCACTTGCACTCTTGACAAGGTCTCCGGCTCAGGGTTTCAGTCCAAGAAG
GAGTACTTGTACGGTAAGATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGCTGGAAACTCAGCTGGA
ACCGTGACCGCCTACTACCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGATGAGATTGACTTTGAG
TTCTTGGGAAATCTCACAGGACAGCCTTACACTATCCACACCAATGTCTTCACCGGTGGT
AAAGGTGACCGCGAGATGCAGTTCCGCCTCTGGTTCGATCCCACCGCTGATCTCCACACA
TACACCGTCCACTGGGACCCTCTTAACATCATCTTCCTTGTGGATGGGATCCCAATTCGG
GTGTTCAAGAACAACGAGAAGAACGGAGTGTTATACCCTACGTCCCAACCCATGAGGATA
TACTCAAGCCTTTGGGAAGCTGATGACTGGGCCACGCAAGGCGGTCGCGTGAAGATCGAC
TGGAACAACGCACCATTCAGAGCACATTA

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR4E463TF 675 0 0
TTTCCTCGGCTTTGGCTTATTTGTTGCCGCTGCACCTGCCGGAAGCTTCTACGAGAGCTT
TGATATCACTTGGGGAGATGGCCGTGCCGACATATTCGAGAGTGGACAGCTTCTCACTTG
CACTCTTGACAAGGTCTCCGGCTCAGGGTTTCAGTCCAAGAAGGAGTACTTGTACGGTAA
GATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGCTGGAAACTCAGCTGGAACCGTGACCGCCTACTA
CCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGATGAGATTGACTTTGAGTTCTTGGGAAATCTCAC
AGGACAGCCTTACACTATCCACACCAATGTCTTCACCGGTGGTAAAGGTGACCGCGAGAT
GCAGTTCCGCCTCTGGTTCGATCCCACCGCTGATCTCCACACATACACCGTCCACTGGGA
CCCTCTTAACATCATCTTCCTTGTGGATGGGATCCCAATTCGGGTGTTCAAGAACAACGA
GAAGAACGGAGTGTTATACCCTACGTCCCAACCCATGAGGATATACTCAAGCCTTTGGGA
AGCTGATGACTGGGCCACGCAAGGCGGTCGCGTGAAGATCGACTGGAACAACGCACCATT
CAGAGCACATTACAGGAACTTCGAAGACCAAAGCTCATGCAGCAGATATCAAACTTGACA
TGGGTGACTTGTGAC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

CO CL2761Contig1 1170 4 11 U
GGAGGACGAAACTTTATCCTTGCAGCTGCAGACATGACTCTACCTTCATCTCTCCTCACT
CAAGGAGTACCTTCTCTGCTATTCTCTTCTCCGAGTCAAGTCTCAGAAGCTGACTGTCGT
CTTGTGGTTACACCTGGAAAACGCTCTCTTGTTCGTTGCTTGGCTAAGAAGAAAATCAGT
TTTGTGGATCAAATCCTCGATTACATCGAAGGCGGTCCTAAGCTTAGGAAATGGTATGGA
GCGCCTGACCCTTTGCCTAAGGACGGATCTTCAAGTGGAGAAGACGATGAACCAGAGGAA
CAAGAAGAAGGCGATGGCGATGGAGACAAAGACACTGTTTTTGTAACTGACGGAGACAGT
GATGTTGGTCAGATGATTATACTGCAACTGATTGTGAAAGGAACTCGTGTTAAAGCACTT
GTGAAGGACAAACGAAAGGCTATGGAAGCCTTTGGAGCTTATGTTGAGTTGACGTCTGGA
GATGCAAGTGACGAGCGTTTCTTAAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTTGGTGCAATCATATCC
CCAACTGAGGGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTAAAACATGTAGTTCTC
TTGTCTCAGTTGCCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATTGAAGCTATGATGAATAGCAAA
GCAAAAAAACTGGCTGAGGGAGACGAGAAAGCAGTTATATCTTCCAGTGTCCCTTATACA
ATCATAAGAACAGGAAAGCTTGACAACAGTCCTGGAGGGAACCAAGGGTTCAACTTTATC
ACGGGTGCTGCAGCCAGCGGTAGCTTAAGCAAGGAAGACGCTGCACGTATATGTATTGAA
GCACTAAGCGTTATACCACCAACAGGATTGGTATTTGAGGTTTCAACTGGAGAGGAGGCT
GTTTCTGACTGGGAAGGACAGTTGATGAAACTGATGCAGAGACAGAGTCAAAACAAGTAA
AAAACTTTTGAAGTTGAGATGAACAGAACAGAACATTAGAGCTCATCATCATTGTCTATA
TCTAAAAAAACATCATTCTTCCAGCATACTTGATATGGGACTCTTAATACATATTTTTTT
CCTCCTATTGTTCTAATGAAAGTATTGTTTTCTTTTTCTGTAAGAAAAGCATGAGATCTT
ACCAAGGTATGAGGGCCCTACTTAGCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM73TF U 22
AF RR4A579TF U 1
AF RR4FM73JQ C 345
AF RR4A579JQ C 346
BS 1 36 RR4A579TF
BS 37 37 RR4FM73TF
BS 38 250 RR4A579TF
BS 251 251 RR4FM73TF
BS 252 283 RR4A579TF
BS 284 285 RR4FM73TF
BS 286 589 RR4A579TF
BS 590 590 RR4FM73TF
BS 591 763 RR4A579TF
BS 764 1084 RR4FM73JQ
BS 1085 1170 RR4A579JQ

RD RR4FM73TF 639 0 0
GG
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CTCTTCTCCGAGTCAAGTCTCAGAAGCTGACTGTCGTCTTGTGGTTACACCTGGAAAACG
CTCTCTTGTTCGTTGCTTGGCTAAGAAGAAAATCAGTTTTGTGGATCAAATCCTCGATTA
CATCGAAGGCGGTCCTAAGCTTAGGAAATGGTATGGAGCGCCTGACCCTTTGCCTAAGGA
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AAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTTGGTGCAATCATATCCCCAACTGAGGGTTTCTTATCAAA
TGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTAAAACATGTAGTTCTCTTGTCTCAGTTGTCTGTTTATGA
AAGCAGCGGTGGAATTGAAGCTATGATGAATAGCAAA

QA 3 639 3 639
DS 

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CAAGGAGTACCTTCTCTGCTATTCTCTTCTCCGAGTCAAGTCTCAGAAGCTGACTGTCGT
CTTGTGGTTACACCTGGAAAACGCTCTCTTGTTCGTTGCTTGGCTAAGAAGAAAATCAGT
TTTGTGGATCAAATCCTCGATTACATCGAAGGCGGTCCTAAGCTTAGGAAATGGTATGGA
GCGCCTGACCTTTTGCCTAAGGACGGATCTTCAAGTGGAGAAG**GATGAACCAGAGGAA
CAAGAAGAAGGCGATGGCGATGGAGACAAAGACACTGTTTTTGTAACTGACGGAGACAGT
GATGTTGGTCAGATGATTATACTGCAACTGATTGTGAAAGGAACTCGTGTTAAAGCACTT
GTGAAGGACAAACGAAAGGCTATGGAAGCCTTTGGAGCTTATGTTGAGTTGACGTCTGGA
GATGCAAGTGACGAGCGTTTCTTAAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTTGGTGCAATCATATCC
CCAACTGAGGGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTAAAACGTGTAGTTCTC
TTGTCTCAGTTGCCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATTGAAGCTATGATGAATAGCAAA
GCAAAAAAACTGGCTGAGGGAGACGAGAAAGCAGTTATATCTTCCAGTGTCCCTTATACA
ATCATAAGAACAGGAAAGCTTGACAACAGTCCTGGAGGGAACC

QA 1 763 1 763
DS 

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A
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GGTGCAATCATATCCCCAACTGAGGGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTA
AAACATGTAGTTCTCTTGTCTCAGTTGTCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATTGAAGCT
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AGTGTCCCTTATACAATCATAAGAACAGGAAAGCTTGACAACAGTCCTGGAGGGAACCAA
GGGTTCAACTTTATCACGGGTGCTGCAGCCAGCGGTAGCTTAAGCAAGGAAGACGCTGCA
CGTATATGTATTGAAGCACTAAGCGTTATACCACCAACAGGATTGGTATTTGAGGTTTCA
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AGTCAAAACAAGTAAAAAACTTTTGAAGTTGAGATGAACAGAACAGAACATTAGAGCTCA
TCATCATTGTCTATATCTAAAAAAACATCATTCTTCCAGCATACTTGATATGGGACTCTT
AATACATATTTTTTTCCTC

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR4A579JQ 825 0 0
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CGTGTTAAAGCACTTGTGAAGGACAAACGAAAGGCTATGGAAGCCTTTGGAGCTTATGTT
GAGTTGACGTCTGGAGATGCAAGTGACGAGCGTTTCTTAAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTT
GGTGCAATCATATCCCCAACTGAGGGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTA
AAACGTGTAGTTCTCTTGTCTCAGTTGCCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATTGAAGCT
ATGATGAATAGCAAAGCAAAAAAACTGGCTGAGGGAGACGAGAAAGCAGTTATATCTTCC
AGTGTCCCTTATACAATCATAAGAACAGGAAAGCTTGACAACAGTCCTGGAGGGAACCAA
GGGTTCAACTTTATCACGGGTGCTTCAGCCAGCGGTAGCTTAAGCAAGGAAGACGCTGCA
CGTATATGTATTGAAGCACTAAGCGTTATACCACCAACAGGATTGGTATTTGAGGTTTCA
ACTGGAGAGGAGGCTGTTTCTGACTGGGAAGGACAGTTGATGAAACTGATGCAGAGACAG
AGTCAAAACAAGTAAAAAACTTTTGAAGTTGAGATGAACAGAACAGAACATTAGAGCTCA
TCATCATTGTCTATATCTAAAAAAACATCATTCTTCCAGCATACTTGATATGGGACTCTT
AATACATATTTTTTTCCTCCTATTGTTCTAATGAAAGTATTGTTTTCTTTTTCTGTAAGA
AAAGCATGAGATCTTACCAAGGTATGAGGGCCCTACTTAGCTGTT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 4

CO CL2762Contig1 608 4 2 U
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CGCGATCAGGAGCGCGTTGCGCTGCGACTTCATGATCGACTTCTGGTGACGGAGGTGCTC
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CATGAGGAGGAAGAGGCAGAAAGGTATGATGGAGAGAAACGGTTTCAGGAGGTTGCGCGT
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GATTGCCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FV42TF C 1
AF RR4FV42JQ U 8
AF RR4FW75JQ U 8
AF RR4FW75TF C 8
BS 1 7 RR4FV42TF
BS 8 608 RR4FV42JQ

RD RR4FV42TF 608 0 0
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GAAACGAACCAAAAAGCTTTACTCCCTCTTCCTAAGCCTCTCAACCCTCTGGTTAAGCTG
CTCGATCCTCACGACGAGATTCGTGACGGAGTAGAGAATCCAGTAGAAAACCAGCGCCGA
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CATGAGGAGGAAGAGGCAGAAAGGTATGATGGAGAGAAACGGTTTCAGGAGGTTGCGCGT
GACGGCGATCAGCCCTTTGCGGAGGGCGTCGAGGCCAGGCATGGTTAGGAGGATGACCAT
GATCGCTTCCGCGGCCGCCGCGTAGCCTAAGACAACCCATTCGAGAGCCATTGGGACGGT
TTGAGATCTGTATTGAAGATTGAATTTTAGATCTGACTCGGGCGATGAGTTTCGATTTTC
GATTGCCC

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DS 

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CTCACGACGAGATTCGTGACGGAGTAGAGAATCCAGTAGAAAACCAGCGCCGACGCGATC
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AGGAAGAGGCAGAAAGGTATGATGGAGAGAAACGGTTTCAGGAGGTTGCGCGTGACGGCG
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TCCGCGGCCGCCGCGTAGCCTAAGACAACCCATTCGAGAGCCATTGGGACGGTTTGAGAT
CTGTATTGAAGATTGAATTTTAGATCTGACTCGGGCGATGAGTTTCGATTTTCGATTGCC
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4FW75JQ 601 0 0
GATTATCAAACTGTAAACAGATTCATCATACTAATCAAAGATAACAGAGCATAGATCCTT
ACAACCTCTCCACAAGATAAAAGCATACATTAAAAAACGAAAAAACGCAGAAAGAAACGA
ACCAAAAAGCTTTACTCCCTCTTCCTAAGCCTCTCAACCCTCTGGTTAAGCTGCTCGATC
CTCACGACGAGATTCGTGACGGAGTAGAGAATCCAGTAGAAAACCAGCGCCGACGCGATC
AGGAGCGCGTTGCGCTGCGACTTCATGATCGACTTCTGGTGACGGAGGTGCTCGGAAGGG
GTGCAGGAGTCGCCGTCGCAGGAAGGCCGGGTCTCGTACTTCCAGTAGATGTCCATGAGG
AGGAAGAGGCAGAAAGGTATGATGGAGAGAAACGGTTTCAGGAGGTTGCGCGTGACGGCG
ATCAGCCCTTTGCGGAGGGCGTCGAGGCCAGGCATGGTTAGGAGGATGACCATGATCGCT
TCCGCGGCCGCCGCGTAGCCTAAGACAACCCATTCGAGAGCCATTGGGACGGTTTGAGAT
CTGTATTGAAGATTGAATTTTAGATCTGACTCGGGCGATGAGTTTCGATTTTCGATTGCC
C

QA 1 601 1 601
DS 

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ACAACCTCTCCACAAGATAAAAGCATACATTAAAAAACGAAAAAACGCAGAAAGAAACGA
ACCAAAAAGCTTTACTCCCTCTTCCTAAGCCTCTCAACCCTCTGGTTAAGCTGCTCGATC
CTCACGACGAGATTCGTGACGGAGTAGAGAATCCAGTAGAAAACCAGCGCCGACGCGATC
AGGAGCGCGTTGCGCTGCGACTTCATGATCGACTTCTGGTGACGGAGGTGCTCGGAAGGG
GTGCAGGAGTCGCCGTCGCAGGAAGGCCGGGTCTCGTACTTCCAGTAGATGTCCATGAGG
AGGAAGAGGCAGAAAGGTATGATGGAGAGAAACGGTTTCAGGAGGTTGCGCGTGACGGCG
ATCAGCCCTTTGCGGAGGGCGTCGAGGCCAGGCATGGTTAGGAGGATGACCATGATCGCT
TCCGCGGCCGCCGCGTAGCCTAAGACAACCCATTCGAGAGCCATTGGGACGGTTTGAGAT
CTGTATTGAAGATTGAATTTTAGATCTGACTCGGGCGATGAGTTTCGATTTTCGATTGCC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 2 4

CO CL2763Contig1 866 2 7 U
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AAGTTTCAATGTTTTCGAAGAAACCTTAACCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACA
TGGATAAGAAGAAACCAAACAAACTAACCATTACATAAACTTTTAACATCCCTAAAATAC
TACTACCCAAGAAGGTGGACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACAAAAAACAA
GAGAACCGGACAGGTAAGTCAGTACAGTGCAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTA
TGGACAGTTCTCGTTTTTACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATT
GTTTCCAGGTTGAACATCATAACAGTTGGACTGCTCGGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGG
TGCCTTGAGGTTGTTTGAAGAATCAACCACTTGAATATTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCT
GAAGCCTTCTTCAGGGAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGC
TTGTGAGTTCACAACTTCCCCTCCCCATTCAATCATTGAAGCACTTTCTGTTAAGTAGGA
GAAGAAGAAAGATGGCCAGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTG
TCCCTCTTTTGGATCCTTCCAGATCAGAATGCTGATGCCATACTGCGAGTTACGGTAGCC
AGAGACCGGAGAGATACAAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGA
GCAAAGAAGATTGTAGCAGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAG
TCTTGTGTTATTGTCACCATACAGAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF46JQ U 1
AF RR4HA14JQB U 3
BS 1 165 RR4AF46JQ
BS 166 166 RR4HA14JQB
BS 167 605 RR4AF46JQ
BS 606 606 RR4HA14JQB
BS 607 737 RR4AF46JQ
BS 738 738 RR4HA14JQB
BS 739 866 RR4AF46JQ

RD RR4AF46JQ 866 0 0
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GTTTCCAGGTTGAACATCATAACAGTTGGACTGCTCGGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGG
TGCCTTGAGGTTGTTTGAAGAATCAACCACTTGAATATTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCT
GAAGCCTTCTTCAGGGAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGC
TTGTGAGTTCACAACTTCCCCTCCCCATTCAATCATTGAAGCACTTTCTGTTAAGTAGGA
GAAGAGGAAAGATGGCCAGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTG
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AGAGACCGGAGAGATACTAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGA
GCAAAGAAGATTGTAGCAGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAG
TCTTGTGTTATTGTCACCATACAGAT

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR4HA14JQB 844 0 0
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GTTTCAATGTTTTCGAAGAAACCTTAACCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATG
GATAAGAAGAAACCAAACAAACTAACCATTACATAAACTTTTAACATCCCTAAAATACTA
CTACCCAAGAAGGTGGACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACAAAAAACAAGA
GAACCGGACAGGTAAGTCAGTACAGTGCAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTATG
GACAGTTCTCGTTTTTACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGT
TTCCAGGTTGAACATCATAACAGTTGGACTGCTCGGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTG
CCTTGAGGTTGTTTGGAGAATCAACCACTTGAATATTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGA
AGCCTTCTTCAGGGAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTT
GTGAGTTCACAACTTCCCCTCCCCATTCAATCATTGAAGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGA
AGAAGAAAGATGGCCAGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTGTC
CCTCTTTTGGATCCTTCCAGATCAGAATGCTGATGTCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAG
AGACCGGAGAGATACAAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGC
AAAGAAGATTGTAGC***CAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAGTC
TTGT

QA 1 844 1 844
DS 



CO CL2763Contig2 971 2 4 U
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TATGTTGACGAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGGCGAAGCTTCTTTTCAGCGCTTTAA
AGGAATACAATGGGAGCGGGTAAGCATCTTAGGAGGGATAAGTTAGGTAGAGGTTTCTTA
GTGTGTTTATGTCTTTGGGGTTTCTTCTCTCTATCCTGCGCCGCAAGGTCCGGCGTATCT
AAGCAGAAGTTCGAAGTCAAGAAGCATCTGAACAGGTTGAACAAACCTGCCGCCAAGAGC
ATTCAGAGCCCAGATGGTGATATCATTGACTGTGTTCCTATCACAAAGCAACCAGCTTTT
GATCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAAGCCTAACTACCATCCTGAGGGA
CTCTTTGATGACAACAAAGTGTCTTCTACTAAATCTAAAGACAAGGAACCACATATCCCT
CAGTTATGGCATCGTTATGGCAAATGCGCTGAAGGAACCATTCCCATGAGGAGGACCAAA
GAGGACGATGTCTTGAGAGCAAGTTCTGTCAAAAGATATGGCAAGAAGAAGCATAGAACT
GTCCCTTTGCCTAAATCTGCTGAACCTGACCTCATCAACCAAAGTGGTCACCAGCATGCG
ATAGCTTATGTGGAAGGGGATAAGTACTATGGAGCTAAAGCGACTATTAATGTGTGGGAG
CCGAAGATACAGCAGCAGAACGAGTTCAGCTTGTCGCAGATATGGCTTCTTGGTGGCTCT
TTCGGACAAGATCTTAACAGCATCGAAACTGGTTGGCAGGTGAGCCCGGATCTGTATGGT
GACAATAACACAAGACTCTTCACTTACTGGACTAGTGATGCATATCAAGCTACTGGCTAC
AATCTTCTTTGCTCTGGTTTATTCAAATAAACAGTGACATAGCAATGGGAGCTTGTATCT
CTCCGGTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF46TF U 1
AF RR4HA14TF U 224
BS 1 807 RR4AF46TF
BS 808 808 RR4HA14TF
BS 809 815 RR4AF46TF
BS 816 971 RR4HA14TF

RD RR4AF46TF 815 0 0
GGGTTCAGAGCTCATCTCGTTCGTTAGGGTTTCTTTCTTTCTTCTAAAAGCTCCAGAGTG
TATGTTGACGAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGGCGAAGCTTCTTTTCAGCGCTTTAA
AGGAATACAATGGGAGCGGGTAAGCATCTTAGGAGGGATAAGTTAGGTAGAGGTTTCTTA
GTGTGTTTATGTCTTTGGGGTTTCTTCTCTCTATCCTGCGCCGCAAGGTCCGGCGTATCT
AAGCAGAAGTTCGAAGTCAAGAAGCATCTGAACAGGTTGAACAAACCTGCCGCCAAGAGC
ATTCAGAGCCCAGATGGTGATATCATTGACTGTGTTCCTATCACAAAGCAACCAGCTTTT
GATCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAAGCCTAACTACCATCCTGAGGGA
CTCTTTGATGACAACAAAGTGTCTTCTACTAAATCTAAAGACAAGGAACCACATATCCCT
CAGTTATGGCATCGTTATGGCAAATGCGCTGAAGGAACCATTCCCATGAGGAGGACCAAA
GAGGACGATGTCTTGAGAGCAAGTTCTGTCAAAAGATATGGCAAGAAGAAGCATAGAACT
GTCCCTTTGCCTAAATCTGCTGAACCTGACCTCATCAACCAAAGTGGTCACCAGCATGCG
ATAGCTTATGTGGAAGGGGATAAGTACTATGGAGCTAAAGCGACTATTAATGTGTGGGAG
CCGAAGATACAGCAGCAGAACGAGTTCAGCTTGTCGCAGATATGGCTTCTTGGTGGCTCT
TTCGGACAAGATCTTAACAGCATCGAAGCTGGTTG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4HA14TF 748 0 0
G
AAGGTCCGGCGTATCTAAGCAGAAGTTCGAAGTCAAGAAGCATCTGAACAGGTTGAACAA
ACCTGCCGCCAAGAGCATTCAGAGCCCAGATGGTGATATCATTGACTGTGTTCCTATCAC
AAAGCAACCAGCTTTTGATCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAAGCCTAA
CTACCATCCTGGGGGACTCTTTGATGACAACAAAGTGTCTTCTACTAAATCTAAAGACAA
GGAACCACATATCCCTCAGTTATGGCATCGTTATGGCAAATGCGCTGAAGGAACCATTCC
CATGAGGAGGACTAAAGAGGACGATGTCTTGAGAGCAAGTTCTGTCAAAAGATATGGCAA
GAAGAAGCATAGAACTGTCCCTTTGCCTAAATCTGCTGAACCTGACCTCATCAACCAAAG
TGGTCACCAGCATGCGATAGCTTATGTGGAAGGGGATAAGTACTATGGAGCTAAAGCGAC
TATTAATGTGTGGGAGCCGAAGATACAGCAGCAGAACGAGTTCAGCTTGTCGCAGATATG
GCTTCTTGGTGGCTCTTTCGGACAAGATCTTAACAGCATCGTAACTGGTTGGCAGGTGAG
CCCGGATCTGTATGGTGACAATAACACAAGACTCTTCACTTACTGGACTAGTGATGCATA
TCAAGCTACTGGCTACAATCTTCTTTGCTCTGGTTTATTCAAATAAACAGTGACATAGCA
ATGGGAGCTTGTATCTCTCCGGTCTCT

QA 2 748 2 748
DS 



AS 1 4

CO CL2764Contig1 601 4 1 U
GGACACAAACCACACTCACAGCTTAAACCTCACACGTCTTCATCTCTGTCTCCTCAGTCT
CCAAACAGTAGAAATGACGGTGAAGATCAGGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACC
CTTCTATCGTCTAGTCGCGGCGGATGACAAATCGAGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGT
TTTAGGGTTTTATGACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATT
CGACAGAATCGAGTACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGATTCAGTTGAAGACAT
GCTTTTCAGGGCCGGTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGG
ACAAAAATCCACCAACCACCATGTTTCTCCCATTACTGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTG
TTGGTGTAACCAGCAAAGAGCTAAGCTTTGTGTGTCTATCCTCAAGTTAAAGGTGTTTGA
TTTTGTTATGTTTGGTCTTTTGTTGTATCTGAACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCTATAT
GGGTTTGTAGCATACTATGAATTGGGCTTCGATTTCTTAAGTTGGATATAAGCCCATTAT
G


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 

AF RR4FE55TF U 1
AF RR4FM35JQ C 46
AF RR4FM35TF U 1
AF RR4FE55JQ C 130
BS 1 601 RR4FE55TF

RD RR4FE55TF 601 0 0
GGACACAAACCACACTCACAGCTTAAACCTCACACGTCTTCATCTCTGTCTCCTCAGTCT
CCAAACAGTAGAAATGACGGTGAAGATCAGGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACC
CTTCTATCGTCTAGTCGCGGCGGATGACAAATCGAGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGT
TTTAGGGTTTTATGACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATT
CGACAGAATCGAGTACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGATTCAGTTGAAGACAT
GCTTTTCAGGGCCGGTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGG
ACAAAAATCCACCAACCACCATGTTTCTCCCATTACTGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTG
TTGGTGTAACCAGCAAAGAGCTAAGCTTTGTGTGTCTATCCTCAAGTTAAAGGTGTTTGA
TTTTGTTATGTTTGGTCTTTTGTTGTATCTGAACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCTATAT
GGGTTTGTAGCATACTATGAATTGGGCTTCGATTTCTTAAGTTGGATATAAGCCCATTAT
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4FM35JQ 556 0 0
CTGTCTCCTCAGTCTCCAAACAGTAGAAATGACGGTGAAGATCAGGCTCGCGCGTTTCGG
TTGCAAACACCGACCCTTCTATCGTCTAGTCGCGGCGGATGACAAATCGAGGAGGGACGG
GAAACAAATCGAGGTTTTAGGGTTTTATGACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAG
AGTGAGCCTCAAATTCGACAGAATCGAGTACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGA
TTCAGTTGAAGACATGCTTTTCAGGGCCGGTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGT
TGGTTCCAAGAACGGACAAAAATCCACCAACCACCATGTTTCTCCCATTACTGGTGAGAT
CTTGAACTAGGTGTGTTGGTGTAACCAGCAAAGAGCTAAGCTTTGTGTGTCTATCCTCAA
GTTAAAGGTGTTTGATTTTGTTATGTTTGGTCTTTTGTTGTATCTGAACAAAGAAGTTTG
TTGAATTCTCTATATGGGTTTGTAGCATACTATGAATTGGGCTTCGATTTCTTAAGTTGG
ATATAAGCCCATTATG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4FM35TF 601 0 0
GGACACAAACCACACTCACAGCTTAAACCTCACACGTCTTCATCTCTGTCTCCTCAGTCT
CCAAACAGTAGAAATGACGGTGAAGATCAGGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACC
CTTCTATCGTCTAGTCGCGGCGGATGACAAATCGAGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGT
TTTAGGGTTTTATGACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATT
CGACAGAATCGAGTACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGATTCAGTTGAAGACAT
GCTTTTCAGGGCCGGTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGG
ACAAAAATCCACCAACCACCATGTTTCTCCCATTACTGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTG
TTGGTGTAACCAGCAAAGAGCTAAGCTTTGTGTGTCTATCCTCAAGTTAAAGGTGTTTGA
TTTTGTTATGTTTGGTCTTTTGTTGTATCTGAACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCTATAT
GGGTTTGTAGCATACTATGAATTGGGCTTCGATTTCTTAAGTTGGATATAAGCCCATTAT
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4FE55JQ 472 0 0
TCTAGTCGCGGCGGATGACAAATCGAGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGTTTTAGGGTT
TTATGACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATTCGACAGAAT
CGAGTACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGATTCAGTTGAAGACATGCTTTTCAG
GGCCGGTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGGACAAAAATC
CACCAACCACCATGTTTCTCCCATTACTGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTGTTGGTGTAA
CCAGCAAAGAGCTAAGCTTTGTGTGTCTATCCTCAAGTTAAAGGTGTTTGATTTTGTTAT
GTTTGGTCTTTTGTTGTATCTGAACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCTATATGGGTTTGTA
GCATACTATGAATTGGGCTTCGATTTCTTAAGTTGGATATAAGCCCATTATG

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 4

CO CL2765Contig1 1160 4 3 U
TCCCTTTACCAATTAGCTTTCCACGACGACGACGGAGAAAGCAAACTAAGTAACCTCACA
GAAAGTCTCCATCTTTCTTCTCCCGAACGATCGAATCGTTCTCGTGGATGCGATTATAAA
GAATCGTTCTTTTCGATCTCGCTTTAGATTCGATGGATGAGTCGTTCGCTAATCTACAGA
CGAGCCATTTGCTTGGTTCAGTTCCCGCTGTGATCAGCGATGACGACAAGAAGAGCACGA
ATGTGCACATAGCAAGTGTTAATGAAGCAGCAGGTCCTTCTGCAAACATGCAGATATTTC
CACCGCATCAAGGAAACAATGCAGCAAAGGGTTATCAAACTCTTCAGACCCCAACAGAAG
GACCTGAACAGCAGCAGGCATCAAACAACTGGAAGGGATACTTTAACGTCTACTCATACG
CCCAGTACTTCAACGTTGACACCGACGTTGTTTTGAACAGATTGATGAGTTCCTTGTACC
CCATCACTGGAGATTTTTTCAGCAAGATTGATGCCAACCCTGATTTGTATGGCCTTGTCT
GGATCTGCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCG
TGAAGAAACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTACATAAACTTGG
CAGCCTCTTTGATCTATGGCTATGCAATAATTGTGCCGGCGGCGTTTTATTTCTCGCTCC
GGTATATGGGGTCCAGAGCTGATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCT
TCGTTTTCGTTCCAGCCACTCTTCCATTGCTTATTCCAGTGGAGTTTCTGAGATGGGTGA
TTATACTCTTAGCTGGTGGTGCATCGTCTTGCTTTGTTGCCCTGAATCTACGGTCTTACC
TTGAGGCGAGCAATGATCTGACGCCTGTTGTGGCTGCAGCGTTTGGTCTGCAAATGGTTC
TGTCTATCTTCATCAAAGTCTGGTTCTTTCCTTAAGTGTCTCCACATCACACGATGAAAC
ATATATAATGTTTGTAAAAAACGTTTTAGATTTTGATGTGATGTGGTAGAACAATGAATT
TGTCATTACAAGAGAACAAAACCCACAAAGTAACATATACACTGAAGAACTGAATCATCG
GGATTCGTTTTGACTTGTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AA92TF U 1
AF RR4AA82TF U 2
AF RR4AA82JQ C 367
AF RR4AA92JQ C 561
BS 1 780 RR4AA92TF
BS 781 816 RR4AA82TF
BS 817 1160 RR4AA82JQ

RD RR4AA92TF 780 0 0
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GAATCGTTCTTTTCGATCTCGCTTTAGATTCGATGGATGAGTCGTTCGCTAATCTACAGA
CGAGCCATTTGCTTGGTTCAGTTCCCGCTGTGATCAGCGATGACGACAAGAAGAGCACGA
ATGTGCACATAGCAAGTGTTAATGAAGCAGCAGGTCCTTCTGCAAACATGCAGATATTTC
CACCGCATCAAGGAAACAATGCAGCAAAGGGTTATCAAACTCTTCAGACCCCAACAGAAG
GACCTGAACAGCAGCAGGCATCAAACAACTGGAAGGGATACTTTAACGTCTACTCATACG
CCCAGTACTTCAACGTTGACACCGACGTTGTTTTGAACAGATTGATGAGTTCCTTGTACC
CCATCACTGGAGATTTTTTCAGCAAGATTGATGCCAACCCTGATTTGTATGGCCTTGTCT
GGATCTGCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCG
TGAAGAAACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTACATAAACTTGG
CAGCCTCTTTGATCTATGGCTATGCAATAATTGTGCCGGCGGCGTTTTATTTCTCGCTCC
GGTATATGGGGTCCAGAGCTGATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AA82TF 815 0 0
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AAAGTCTCCATCTTTCTTCTCCCGAACGATCGAATCGTTCTCGTGGATGCGATTATAAAG
AATCGTTCTTTTCGATCTCGCTTTAGATTCGATGGATGAGTCGTTCGCTAATCTACAGAC
GAGCCATTTGCTTGGTTCAGTTCCCGCTGTGATCAGCGATGACGACAAGAAGAGCACGAA
TGTGCACATAGCAAGTGTTAATGAAGCAGCAGGTCCTTCTGCAAACATGCAGATATTTCC
ACCGCATCAAGGAAACAATGCAGCAAAGGGTTATCAAACTCTTCAGACCCCAACAGAAGG
ACCTGAACAGCAGCAGGCATCAAACAACTGGAAGGGATACTTTAACGTCTACTCATACGC
CCAGTACTTCAACGTTGACACCGACGTTGTTTTGAACAGATTGATGAGTTCCTTGTACCC
CATCACTGGAGATTTTTTCAGCAAGATTGATGCCAACCCTGATTTGTATGGCCTTGTCTG
GATCTGCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCGT
GAAGAAACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTACATAAACTTGGC
AGCCTCTTTGATCTATGGCTATGCAATAATTGTGCCGGCGGCGTTTTATTTCTCGCTCCG
GTATATGGGGTCCAGAGCTGATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCTT
CGTTTTCGTTCCAGCCACTCTTCCATTGCTTATTC

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4AA82JQ 794 0 0
AACAGCAGCAGGCATCAAACAACTGGAAGGGATACTTTAACGTCTACTCATACGCCCAGT
ACTTCAACGTTGACACCGACGTTGTTTTGAACAGATTGATGAGTTCCTTGTACCCCATCA
CTGGAGATTTTTTCAGCAAGATTGATGCCAACCCTGATTTGTATGGCCTTGTCTGGATCT
GCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCGTGAAGA
AACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTACATAAACTTGGCAGCCT
CTTTGATCTATGGCTATGCAATAATTGTGCCGGCGGCGTTTTATTTCTCGCTCCGGTATA
TGGGGTCCAGAGCTGATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCTTCGTTT
TCGTTCCAGCCACTCTTCCATTGCTTATTCCAGTGGAGTTTCTGAGATGGGTGATTATAC
TCTTAGCTGGTGGTGCATCGTCTTGCTTTGTTGCCCTGAATCTACGGTCTTACCTTGAGG
CGAGCAATGATCTGACGCCTGTTGTGGCTGCAGCGTTTGGTCTGCAAATGGTTCTGTCTA
TCTTCATCAAAGTCTGGTTCTTTCCTTAAGTGTCTCCACATCACACGATGAAACATATAT
AATGTTTGTAAAAAACGTTTTAGATTTTGATGTGATGTGGTAGAACAATGAATTTGTCAT
TACAAGAGAACAAAACCCACAAAGTAACATATACACTGAAGAACTGAATCATCGGGATTC
GTTTTGACTTGTTT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4AA92JQ 600 0 0
TTTGTGCTTTCCTCTCTTGGAAACTGTGCCACGTACCTCGTGAAGAAACGAACCGACAGT
GAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTACATAAACTTGGCAGCCTCTTTGATCTATGGC
TATGCAATAATTGTGCCGGCGGCGTTTTATTTCTCGCTCCGGTATATGGGGTCCAGAGCT
GATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCTTCGTTTTCGTTCCAGCCACT
CTTCCATTGCTTATTCCAGTGGAGTTTCTGAGATGGGTGATTATACTCTTAGCTGGTGGT
GCATCGTCTTGCTTTGTTGCCCTGAATCTACGGTCTTACCTTGAGGCGAGCAATGATTTG
ACGCCTGTTGTGGCTGCAGCGTTTGGTCTGCAAATGGTTCTGTCTATCTTCATCAAAGTC
TGGTTCTTTCCTTAAGTGTCTCCACATCACACGATGAAACATATTTAATGTTTGTAAAAA
ACGTTTTAGATTTTGATGTGATGTGGTAGAACAATGAATTTGTCATTACAAGAGAACAAA
ACCCACAAAGTAACATATACACTGAAGAACTGAATCATCGGGATTCGTTTTGACTTGTTT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 4

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ACAGTGATAGGAGGAAAGATAAGAGATCCAGAAGGCATAAGAGGAGGTCCTCAAGTTCAA
GCGATGAGTACGAAAGCGGGTCAGAGGACGAGCTCAGGGTGAAGACAAGGCACCACCGGA
GGCTGAAGTCGCATAGCTCAAGACAGACTTCTGACGATGACAATGCTGAAGATGGGAGAA
GAAGACATAAACATCACAGGCACGGTGAGGTGGTTACTTCAAGTGATAGCGAGGAAGAGA
GAGGAATAAGAAGACATGGGAGATATCACAGGCACAACAGAGGTTCAGCTGCCTCCAGCG
ACTCAGACTCGGAAGCTAGACGGAAGAATAGAAAGAGAAGGGAACATAAAAGGTATCGAT
GGGAAGAGTCTTCAAGTGAGGACGATGGAGCAACGCGAAGGAGAAGGCATAATTATAAAC
ATGACAGAGAGTCAGCAGCATCCGAAACTGATGGAAGGGTGTCAGATGAGAACAGAGAGC
ACAACAGCATAGACAAGTGAAAATGTGGACGGGCATTAAAAAAGTGAAGTTGTTTAATTC
TTACCATCATCAGAACTGAATGTTGTGTGCATCCAGTCAAAAACTATTGTGTTGAAATAC
TTGCGATACTCCCTTCATTGTTTATTTTTCATTTTACAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4FO85TF U 1
AF RR4GA96TF U 1
AF RR4FO85JQ C 186
AF RR4GA96JQ C 421
BS 1 643 RR4FO85TF
BS 644 700 RR4GA96TF

RD RR4FO85TF 643 0 0
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GCGATGAGTACGAAAGCGGGTCAGAGGACGAGCTCAGGGTGAAGACAAGGCACCACCGGA
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GAAGACATAAACATCACAGGCACGGTGAGGTGGTTACTTCAAGTGATAGCGAGGAAGAGA
GAGGAATAAGAAGACATGGGAGATATCACAGGCACAACAGAGGTTCAGCTGCCTCCAGCG
ACTCAGACTCGGAAGCTAGACGGAAGAATAGAAAGAGAAGGGAACATAAAAGGTATCGAT
GGGAAGAGTCTTCAAGTGAGGACGATGGAGCAACGCGAAGGAGAAGGCATAATTATAAAC
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ACAACAGCATAGACAAGTGAAAATGTGGACGGGCATTAAAAAAGTGAAGTTGTTTAATTC
TTACCATCATCAGAACTGAATGTTGTGTGCATCCAGTCAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4GA96TF 700 0 0
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ACAGTGATAGGAGGAAAGATAAGAGATCCAGAAGGCATAAGAGGAGGTCCTCAAGTTCAA
GCGATGAGTACGAAAGCGGGTCAGAGGACGAGCTCAGGGTGAAGACAAGGCACCACCGGA
GGCTGAAGTCGCATAGCTCAAGACAGACTTCTGACGATGACAATGCTGAAGATGGGAGAA
GAAGACATAAACATCACAGGCACGGTGAGGTGGTTACTTCAAGTGATAGCGAGGAAGAGA
GAGGAATAAGAAGACATGGGAGATATCACAGGCACAACAGAGGTTCAGCTGCCTCCAGCG
ACTCAGACTCGGAAGCTAGACGGAAGAATAGAAAGAGAAGGGAACATAAAAGGTATCGAT
GGGAAGAGTCTTCAAGTGAGGACGATGGAGCAACGCGAAGGAGAAGGCATAATTATAAAC
ATGACAGAGAGTCAGCAGCATCCGAAACTGATGGAAGGGTGTCAGATGAGAACAGAGAGC
ACAACAGCATAGACAAGTGAAAATGTGGACGGGCATTAAAAAAGTGAAGTTGTTTAATTC
TTACCATCATCAGAACTGAATGTTGTGTGCATCCAGTCAAAAACTATTGTGTTGAAATAC
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QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4FO85JQ 515 0 0
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GACTCGGAAGCTAGACGGAAGAATAGAAAGAGAAGGGAACATAAAAGGTATCGATGGGAA
GAGTCTTCAAGTGAGGACGATGGAGCAACGCGAAGGAGAAGGCATAATTATAAACATGAC
AGAGAGTCAGCAGCATCCGAAACTGATGGAAGGGTGTCAGATGAGAACAGAGAGCACAAC
AGCATAGACAAGTGAAAATGTGGACGGGCATTAAAAAAGTGAAGTTGTTTAATTCTTACC
ATCATCAGAACTGAATGTTGTGTGCATCCAGTCAAAAACTATTGTGTTGAAATACTTGCG
ATACTCCCTTCATTGTTTATTTTTCATTTTACAGC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4GA96JQ 280 0 0
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ATGACAGAGAGTCAGCAGCATCCGAAACTGATGGAAGGGTGTCAGATGAGAACAGAGAGC
ACAACAGCATAGACAAGTGAAAATGTGGACGGGCATTAAAAAAGTGAAGTTGTTTAATTT
TTACCATCATCAGAACTGAATGTTGTGTGCATCCAGTCAAAAACTATTGTGTTGAAATAC
TTGCGATACTCCCTTCATTGTTTATTTTTCATTTTACAGC

QA 1 280 1 280
DS 



AS 1 4

CO CL2767Contig1 1261 4 10 U
GGACACACACACATACAAGAAATAACAAACATGGAGAAACAAGTTTTTTTATCGCTATGT
CTCTTCCTCTTCATCCTCTCAATATCATCTTTTCTCCAAGAAACTGAAGCTCGAAAATAC
TCCTATAGACGTGCACCGATCACGAGGCTAGTCTCAAAATCTCTCTACGACTCAATCTTC
ATCCACAAGGAAAACAACGCATGCCCTGCAAAAGGTTTCTACCCCTACGAAGCATTCGTG
GAGGCTACAAGGTGGTTCCCAAAGTTCGGGAGCGTAGGAGGCACTATGACAAGGAGGCGT
GAAGTGGCTGCGTTTTTGGCGCAGATATCTCACGAGACAACAGGTGGTTGGGCCACGGCA
CCGGATGGACCGTACGCGTGGGGGCTGTGTTTTAAAGAGGAAGTGAGTCCACAGAGTAAT
TATTGTGATGCTTCAAATACGGAGTGGCCTTGTTTCCCTGGCAAATCTTATAAAGGAAGA
GGTCCCATTCAACTTTCTTGGAATTACAATTACGGTCAGGCGGGTCGAGCATTGGGTTTT
GACGGTTTACGTAACCCGGAAAGTGTAGCCAACAACTCCGTTTTAGCATTCAAAACAGCT
CTTTGGTTTTGGATGACCGAACAGACTCCTAAACCGTCTTGCCATGATGTCATGGTCAAC
CGGTACAGACCTACCAAAGCAGATATAGCAGCAAACCGGACCAGTGGTTTCGGTTTAACA
ACTAACATCATAAACGGCGGCTTAGAATGCGGGATTCCAGGAGATGGACGAGTCAATGAC
CGGGTCGGGTATTTCCAAAGATATGCTAAGTTGTTTGATGTCAACACAGGACCTTACTTA
GACTGCGAGAACCAGATGCCTTTCTCCTAGAATCCTATCATTGCAACTCTCTTTTTAATT
TTTACTATAAACTATACAATCTATGTATCAATAAAACTGAAGTTTAATACATTAAATAAA
ACTCTTTAATCTGAGGATGAGAGATATAAATGTTTTACATCATTTACTCATAGCAAAAAA
GATGTTTACATCATTTACTCGTAAGCGTACAGTGACAAGAAGATGTTAACCTCAGTAGCC
GTTTCATATGGGCCTTCTACACCTGCATGAACTGATTCCCCTCCGATGTCCAGCTTAGTA
AGTACCCAAGAGCTTGCCGGACAACTCAACTTTGATACCTGACCTGTCAAATAGCAAAAG
AGCCTCAGGAAACACTTGATTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGCTTTTTACCCTTTTTCTCTC
C


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4G567TF U 1
AF RR4BF71TF U 2
AF RR4BF71JQ C 246
AF RR4G567JQ C 667
BS 1 378 RR4G567TF
BS 379 379 RR4BF71TF
BS 380 481 RR4G567TF
BS 482 482 RR4BF71TF
BS 483 514 RR4G567TF
BS 515 846 RR4BF71TF
BS 847 1011 RR4BF71JQ
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BS 1013 1031 RR4BF71JQ
BS 1032 1261 RR4G567JQ

RD RR4G567TF 516 0 0
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CTCTTCCTCTTCATCCTCTCAATATCATCTTTTCTCCAAGAAACTGAAGCTCGAAAATAC
TCCTATAGACGTGCACCGATCACGAGGCTAGTCTCAAAATCTCTCTACGACTCAATCTTC
ATCCACAAGGAAAACAACGCATGCCCTGCAAAAGGTTTCTACCCCTACGAAGCATTCGTG
GAGGCTACAAGGTGGTTCCCAAAGTTCGGGAGCGTAGGAGGCACTATGACAAGGAGGCGT
GAAGTGGCTGCGTTTTTGGCGCAGATATCTCACGAGACAACAGGTGGTTGGGCCACGGCA
CCGGATGGACCGTACGCGGGGGGGCTGTGTTTTAAAGAGGAAGTGAGTCCACAGAGTAAT
TATTGTGATGCTTCAAATACGGAGTGGCCTTGTTTCCCTGGCAAATCTTATAAAGGAAGA
G*TCCCATTCAACTTTCTTGGAATTACAATTACG
TC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4BF71TF 845 0 0
GACACACACACATACAAGAAATAACAAACATGGAGAAACAAGTTTTTTTATCGCTATGTC
TCTTCCTCTTCATCCTCTCAATATCATCTTTTCTCCAAGAAACTGAAGCTCGAAAATACT
CCTATAGACGTGCACCGATCACGAGGCTAGTCTCAAAATCTCTCTACGACTCAATCTTCA
TCCACAAGGAAAACAACGCATGCCCTGCGAAAGGTTTCTACCCCTACGAAGCATTCGTGG
AGGCTACAAGGTGGTTCCCAAAGTTCGGGAGCGTAGGAGGCACTATGACAAGGAGGCGTG
AAGTGGCTGCGTTTTTGGCGCAGATATCTCACGAGACAACAGGTGGTTGGGCCACGGCAC
CGGATGGACCGTACGCGTGGGGGCTGTGTTTTAAAGAGGAAGTGAGTCCACAGAGTAATT
ATTGTGATGCTTCAAATACGGAGTGGCCTTGTTTCCCTGGCAAATCTTATAAAGGAAGAG
GTCCCATTCAACTTTCTTGGAATTACAATTACGGTCAGGCGGGTCGAGCATTGGGTTTTG
ACGGTTTACGTAACCCGGAAAGTGTAGCCAACAACTCCGTTTTAGCATTCAAAACAGCTC
TTTGGTTTTGGATGACCGAACAGACTCCTAAACCGTCTTGCCATGATGTCATGGTCAACC
GGTACAGACCTACCAAAGCAGATATAGCAGCAAACCGGACCAGTGGTTTCGGTTTAACAA
CTAACATCATAAACGGCGGCTTAGAATGCGGGATTCCAGGAGATGGACGAGTCAATGACC
GGGTCGGGTATTTCCAAAGATATGCTAAGTTGTTTGATGTCAACACAGGACCTTACTTAG
ACTGC

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DS 

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GGCTGCGTTTTTGGCGCAGATATCTCACGAGACAACAGGTGGTTGGGCCACGGCACCGGA
TGGACCGTACGCGTGGGGGCTGTGTTTTAAAGAGGAAGTGAGTCCACAGAGTAATTATTG
TGATGCTTCAAATACGGAGTGGCCTTGTTTCCCTGGCAAATCTTATAAAGGAAGAGGTCC
CATTCAACTTTCTTGGAATTACAATTACGGTCAGGCGGGTCGAGCATTGGGTTTTGACGG
TTTACGTAACCCGGAAAGTGTAGCCAACAACTCCGTTTTAGCATTCAAAACAGCTCTTTG
GTTTTGGATGACCGAACAGACTCCTAAACCGTCTTGCCATGATGTCATGGTCAACCGGTA
CAGACCTACCAAAGCAGATATAGCAGCAAACCGGACCAGTGGTTTCGGTTTAACAACTAA
CATCATAAACGGCGGCTTAGAATGCGGGATTCCAGGAGATGGACGAGTCAATGACCGGGT
CGGGTATTTCCAAAGATATGCTAAGTTGTTTGATGTCAACACAGGACCTTACTTAGACTG
CGAGAACCAGATGCCTTTCTCCTAGAATCCTATCATTGCAACTCTCTTTTTAATTTTTAC
TATAAACTATACAATCTATGTATCAATAAAACTGAAGTTTAATACATTAAATAAAACTCT
TTAATCTGAGGATGAGAGATATAAATGTTTTACATCATTTACTCATGGCAAAAAAGATGT
TTACAT
T

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4G567JQ 595 0 0
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ATCATAAACGGCGGCTTAGAATGCGGGATTCCAGGAGATGGAGGAGTCAATGACCGGGTC
GGGTATTTCCAAAGATATGTTAAGTTGTTTGATGTCAACACAGGCCCTTACTTAGACTGC
GAGAACCAGATGCCTTTTTCCTAGAATCCTATCATTGCAACTTTCTTTTTAATTTTTACT
ATAAACTATACAATCTATGTATCAATAAAACTGAAGTTTAATACATTAGATAAAACTCTT
TAATCTGAGGATGAGAGATATAAATGTTTTACATCATTTACTCATAGCAAAAAAGATGTT
TACATCATTTACTCGTAAGCGTACAGTGACAAGAAGATGTTAACCTCAGTAGCCGTTTCA
TATGGGCCTTCTACACCTGCATGAACTGATTCCCCTCCGATGTCCAGCTTAGTAAGTACC
CAAGAGCTTGCCGGACAACTCAACTTTGATACCTGACCTGTCAAATAGCAAAAGAGCCTC
AGGAAACACTTGATTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGCTTTTTACCCTTTTTCTCTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 4

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CTCCAGGAGTCATCATCATCACGAATCCATGATCATAATCAAGACAAAAAAACATAAATC
ATGAGCAAATTAATAACCATACTCGGGAATTTTATCCACACAAAAAAACAAAAACTGAAA
ATGAAGAGACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGACGCATCTAGAGGATGAATGAGGT
AAGTCAGCACCAACGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCC
CATCACTGGTCGGAGCAGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCGCTGGCGAGAGACG
AGATGACGGCGAAAACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGCCA
TCTCTCTCTCTCTGTTTCTTTTGATCCGACGAAAGAAAGAAGCTTGCCGGAGTATCTGCA
GAGGCGACGATACAGACCGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4E419JQ U 1
AF RR4E419TF C 1
AF RR4D660JQ U 17
AF RR4D660TF C 17
BS 1 537 RR4E419JQ

RD RR4E419JQ 537 0 0
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ATGAAGAGACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGACGCATCTAGAGGATGAATGAGGT
AAGTCAGCACCAACGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCC
CATCACTGGTCGGAGCAGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCGCTGGCGAGAGACG
AGATGACGGCGAAAACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGCCA
TCTCTCTCTCTCTGTTTCTTTTGATCCGACGAAAGAAAGAAGCTTGCCGGAGTATCTGCA
GAGGCGACGATACAGACCGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4E419TF 537 0 0
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CTCCAGGAGTCATCATCATCACGAATCCATGATCATAATCAAGACAAAAAAACATAAATC
ATGAGCAAATTAATAACCATACTCGGGAATTTTATCCACACAAAAAAACAAAAACTGAAA
ATGAAGAGACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGACGCATCTAGAGGATGAATGAGGT
AAGTCAGCACCAACGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCC
CATCACTGGTCGGAGCAGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCGCTGGCGAGAGACG
AGATGACGGCGAAAACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGCCA
TCTCTCTCTCTCTGTTTCTTTTGATCCGACGAAAGAAAGAAGCTTGCCGGAGTATCTGCA
GAGGCGACGATACAGACCGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC

QA 1 537 1 537
DS 

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QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4D660TF 521 0 0
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CCATACTCGGGAATTTTATCCACACAAAAAAACAAAAACTGAAAATGAAGAGACAAATCA
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CACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCATCACTGGTCGGAGC
AGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCGCTGGCGAGAGACGAGATGACGGCGAAAAC
AAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGCCATCTCTCTCTCTCTGTT
TCTTTTGATCCGACGAAAGAAAGAAGCTTGCCGGAGTATCTGCAGAGGCGACGATACAGA
CCGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 4

CO CL2769Contig1 603 4 4 U
GGAAACATAAATGGAGGGTCTAATTCCGTTTGTTTACCGAGCCGTCATGCAAATCCGTTA
TGGCCACGAGCGTTCTTCTTCTTATTACGTTCGTCTTCCGGGCGATTCAGGCCGGTTTGG
GAGAACCGGTTTGGAAGTGTCGGGGTTTGGATCTTCCTCTAATATGGCGTCGTCGAAGAC
CACGAGCACGAAGACCACGTTTTCTGTTTCCACTGGAGACCAGTCACCAGTTCATCGTCA
GGTTGTGATGTGATGCACACGGGCTCCAAAGGCAACGTGAAGATGCTCGCAAGGGAAAGG
GTTGGTTTGTAACGTTGTGATTACTGTTATAGGTAATAGGCTTAGTGATTGATATGTGTT
TATGAGATATAGACTCGGACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATTCGGGTGGGGAGATTAA
TTCTCTAAGCGTGGGCTTTTAACCCAAAGGGTAACCTCATGGTTTTTTTTTGTGTGCTTC
TGTGTTTCTATCAAGGAACTTTTAACTGTATAAAAATTATATGAATCTCTTGGTTTATTC
GTGAGAAACTACATGAATATCTTGGTTTATTCGTGAGAAATTATGTGATTGACTTTTTCT
TCG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR4DB38TF U 1
AF RR4DB38JQ C 76
AF RR4AP80JQ C 2
AF RR4AP80TF U 2
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GGTTGTGATGTGATGTACACGGGCTCCAAAGGCAACGTGAAGATGCTCGCAAGGGAAAGG
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TATGAGATATAGACTCGGACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATTCGGGTGGGGAGATTAA
TTCTCTAAGCGTGGGCTTTTAACCCAAAGGGTAACCTCATGGTTTTTTTTTGTGTGCTTC
TGTGTTTCTATCAAGGAACTTTTAACTGTATAAAAATTATATGAATCTCTTGGTTTATTC
GTGAGAAACTACATGAATATCTTGGTTTATTCGTGAG

QA 1 577 1 577
DS 

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CACGTTTTCTGTTTCCACTGGAGACCAGTCACCAGTTCATCGTCAGGTTGTGATGTGATG
TACACGGGCTCCAAAGGCAACGTGAAGATGCTCGCAAGGGAAAGGGTTGGTTTGTAACGT
TGTGATTACTGTTATAGGTAATAGGCTTAGTGATTGATATGTGTTTATGAGATATAGACT
CGGACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATTCGGGTGGGGAGATTAATTCTTTAAGCGTGGG
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AATATCTTGGTTTATTCGTGAG

QA 1 502 1 502
DS 

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CG

QA 1 602 1 602
DS 

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GGCCACGAGCGTTCTTCTTCTTATTACGTTCGTCTTCCGGGCGATTCAGGCCGGTTTGGG
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ACGAGCACGAAGACCACGTTTTCTGTTTCCACTGGAGACCAGTCACCAGTTCATCGTCAG
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ATGAGATATAGACTCGTACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATTCGGGTGGGGAGATTAAT
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CG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 4

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BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G525TF U 1
AF RR4A770JQ C 2
AF RR4A770TF U 2
AF RR4G525JQ C 162
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TGTCTTATATTGAGAATTGTC

QA 1 681 1 681
DS 

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G

QA 1 776 1 776
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TCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCCCGAACTCAAGGCGAAAAGG
ACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAA
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CGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATT
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CCAACTGAGATGGATC**GATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAGAATTAAACTTCT
TTGGCTCATATTCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCT
TCTTGCAACTGTGATAAAAAACCCAACTCCCCGTCACTCTATCCATCCGGTCTCTCTTTT
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CTTCATACG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4G525JQ 650 0 0
T
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TCCATCCGGTCTCTCTTTTGTCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGTTTTGCATCCTTTTG
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ATGCAAACTTCATACAAATCTCTACAAAAATTATTTTGTTTCAACTTGC

QA 2 650 2 650
DS 



AS 1 4

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AAACTCCTGTCAACAACTACGCCAGAGCTGAAGGACAAAACACCGGAAACTTCCTCACTG
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TCACTGGTGGCAAGTAAAACCAACATACATACATTCTGTGTGTTGTAATGCAAATTCGTA
TCCATTCTGTTTCTCTTCTCAAATTTTAAACTGTTTCATGTCATGATGGTTTCTTGTCAA
CCCTCGTTTTATCTTTGTAATATTCTGCTGAAAAAATGTTCATAGCATTTGAATCAAAGA
CAACACTTC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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CA
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BQ
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QA 1 836 1 836
DS 

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TCATTCTCTGGAATATTTTCCTCCCAATTGAAATCTACCTGTTTCTCTTTTCCAGCTCTC
ATAGCATCAATATCAATGATTACACCACTCACCCCTGCATTATTGATCAAGATATCGAGT
TTTCCAAATTTGTTTTTGACAAACTGGGCAAGA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4FG76TF 694 0 0
CTTTGCTCCAGTCTTTTATCTTAACCACGCCATCTT*GAACTCGTTGAGAAGTTTATCAA
TCACTTCCTCGAT*CTTTCCTCTGTTAGATTCTCTGCGTTGCTCAGAATCCCTTTGGCCC
ATTCGTTTAGTAGATTCTTTAGTTGACCCATGAAGGATGATACATTGATGATTCTAGGAG
AATCAGATAACTCCAAAAGGGGAATAAATGCCTCACACATTCTCTTTGGTCCATAGTAAT
TTATATTCAAGCATTCTTTAGCTAGGTTGTAGTCATTCTCTGGAATATTTTCCTCCCAAT
TGAAATCTACCTGTTTCTCTTTTCCAGCTCTCATAGCATCAATATCAATGATTACACCAC
TCACCCCTGCATTATTGATCAAGATATCGAGTTTTCCAAATTTGTTTTTGACAAAATGGG
CAAGAGATTTGATACTAGCAGGATCAGTGACATCAAGCTGATGAAAAACAAGGCTTTGAT
CAGAAACTCCAGTCTCTTGCCTCAGTGTCTCAACAGCATCAAGTCCTCTTTTCTCATCTC
TAGAGGTCAAAACAACTCTAATCGCGTAGCTTGCTAATTGTCTGCAGATCTCGTAGCCGA
TTCCCCTGTTTGCTCCAGTAACTACAGCATATCTTGGTGTTTCTTCTGTCATTTTTAACC
TTTTTCTTTCTATGTTTCATACAAACAGTTTC
CC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4C868TF 656 0 0
TCCTCTGTTAGAT*CTCTGCGTTGCTCAGAATCCCTTTGGCCCATTCGTTTAGTAGATTC
TTTAGTTGACCCATGAAGGATGATACATTGATGATTCTAGGAGAATCAGATAACTCCAAA
AGGGGAATAAATGCCTCACACATTCTCTTTGGTCCATAGTAATTTATATTCAAGCATTCT
TTAGCTAGGTTGTAGTCATTCTCTGGAATATTTTCCTCCCAATTGAAATCTACCTGTTTC
TCTTTTCCAGCTCTCATAGCATCAATATCAATGATTACACCACTCACCCCTGCATTATTG
ATCAAGATATCGAGTTTTCCAAATTTGTTTTTGACAAACTGGGCAAGAGATTTGATACTA
ACAGGATCAGTGACATCAAGCTGATGAAAAACAAGGCTTTGATCAGAAACTCCAGTCTCT
TGCCTCAGTGTCTCAACAGCATCAAGTCCTCTTTTCTCATCTCTAGAGGTCAAAACAACT
CTAATCGCGTAGCTTGCTAATTGTCTGCAGATCTCGTAGCCGATTCCCCTGTTTGCTCCA
GTAACTACAGCATATCTTGGTGTTTCTTCTGTCATTTTTAACCTTTTTCTTTCTATGTTT
CATACAAACAGTTTCAACTATTCAATTCCTCTTCTCAAACAACAAAACGTACCCCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 4

CO CL2773Contig1 711 4 21 U
GGGAGAAGAGAGAAAAGAAGAAACAAACAAAAAAAAATATGAAAATGGTCGGAAGGATCT
TTCTCCCTTTCCTCTCCATAGTCGTCACGGTGGTTATCGCTGGAAAAGCTCCACCACCAA
CATTCACGGAGACAGGCAAAGCCTTAGTTGAAAAACTCTGCGAGAAATCCGAAGACAAAG
CGTTTTGCATTTCAAGCCTAACCTCACGTCCTGAGTCAGAAACCGCAAACGCTCCAAAAC
TCGGCGTGATCGCGTTAAGCATCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTTTTACATCA
AATCGAAACTAAAACAAAGAAACCTCGAGCCAGCTTTGGAAGACACGCTCGACGATTGTT
CTAAGAATTACTTAGACTCAGTCGCGCAGCTAGACGACTCTCTCGCCGCTCTGCTCGCCA
ATGCGTACATCGACGTTGATATTTGGCTCAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTG
AAGACGCTTTGAGTGAACGTGCGGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACAAACT
TCTTGAAGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCTTAAATTTCAA
AACTTGTTACCGATTAATTTATTTTGGTTTGTTTGTTGTAATTTTTTTT*ATAAATGGCT
TCGTTGTGTTGTGGGTTAAATTAAACGGTATTTGAAAACTTGTATTTTGAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK03TF U 1
AF RR4BX36JQ C 1
AF RR4DK03JQ C 1
AF RR4BX36TF U 1
BS 1 16 RR4DK03TF
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BS 68 118 RR4DK03TF
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BS 120 196 RR4DK03TF
BS 197 197 RR4BX36TF
BS 198 228 RR4DK03TF
BS 229 229 RR4BX36TF
BS 230 241 RR4DK03TF
BS 242 242 RR4BX36TF
BS 243 349 RR4DK03TF
BS 350 350 RR4BX36TF
BS 351 397 RR4DK03TF
BS 398 398 RR4BX36TF
BS 399 644 RR4DK03TF
BS 645 677 RR4BX36TF
BS 678 711 RR4BX36JQ

RD RR4DK03TF 644 0 0
GGGAGAAGAGAGAAAA*AATAAACAAACAAAAAAAAATATGAAAATGGTCGGAAGGATCT
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AACTTGTTACCGATTAATTTATTTTGGTTTGTTTGTTGTAATTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4BX36JQ 711 0 0
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ATGCGTACATCGACGTTGATATTTGGCTCAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTG
AAGACGCTTTGAGTGAACGTGCTGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACGAACT
TCTTGAAGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCTTAAATTTCAA
AACTTGTTACCGATTAATTTATTTTGGTTTGTTTGTTGTAATTTTTTTT*ATAAATGGCT
TCGTTGTGTTGTGGGTTAAATTAAACGGTATTTGAAAACTTGTATTTTGAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DK03JQ 694 0 0
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CATTCACGGAGACAGGCAAAGCCTTAGTTGAAAAACTCTGCGAGAAATCCGAAGACAAAG
CGTTTTGCATTTCAAGTCTAACCTCACGTCCTGAGTCAGAAACCGCAAGCGCTCCAAAAC
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AATCGAAACTAAAACAAAGAAACCTCGAGCCAGCTTTGGAAGACACGCTGGACGATTGTT
CTAAGAATTACTTAGACTCAGTCGCGCAGCTAGACGATTCTCTCGCCGCTCTGCTCGCCA
ATGCGTACATCGACGTTGATATTTGGCTCAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTG
AAGACGCTTTGAGTGAACGTGCGGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACAAACT
TCTTGAAGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCTTAAATTTCAA
AACTTGTTACCGATTAATTTATTTTGGTTTGTTTGTTGTAATTTTTTTTTATAAATGGCT
TCGTTGTGTTGTGGGTTAAATTAAACGGTATTTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BX36TF 677 0 0
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TTCTCCCTTTCCTCTCCATCGTCGTCACGGTGGTTATCGCTGGAAAAGCTCCACCACCAA
CATTCACGGAGACAGGCAAAGCCTTAGTTGAAAAACTCTGCGAGAAATCCGAAGACAAAG
CGTTTTGCATTTCGAGCCTAACCTCACGTCCTGAGTCAGAAACCGCAAACGCTCCAAAAC
TCGGCGTGATCGCGTTGAGCATCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTTCTACATCA
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CTAAGAATTACTTAGACTCAGTCGCGCAGCTAGACGACTCTCTCGCCGCTCTGCTCGCCA
ATGCGTACATCGACGTTGATATTTGGCTCAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTG
AAGACGCTTTGAGTGAACGTGCTGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACGAACT
TCTTGAAGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCTTAAATTTCAA
AACTTGTTACCGATTAATTTATTTTGGTTTGTTTGTTGTAATTTTTTTT*ATAAATGGCT
TCGTTGTGTTGTGGGTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 4

CO CL2774Contig1 747 2 10 U
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AATTACATTCGAAACATACAAGAGGAAAGTCGAATTCACACTCTTTTTGCAGATTCTCCT
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TTTTATTCTTTTTACTTGATCCTACTTCCAAGAGCTTCCCGTCTTTACCTACCTGCTTCA
CTTTCATCTCATTCAAGCTAGCCGGTAACACACAGTTGCACATGAAACCTAAGCGAGCAA
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AATGATTACAGTTCCTTGTGATGAGGTGGTATTTACTCCCCTGATACTCATCTGCTAGCT
CCTCCATAACGCTTCCAACTTCTTTGG


BQ
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0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C521JQ U 1
AF RR4FJ40JQ U 1
BS 1 60 RR4C521JQ
BS 61 62 RR4FJ40JQ
BS 63 281 RR4C521JQ
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BS 283 603 RR4C521JQ
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BS 636 657 RR4C521JQ
BS 658 747 RR4FJ40JQ

RD RR4C521JQ 657 0 0
TTTTAATTGAATTTGATAACATTCAGAAAAGTAATTTGTACAAAAATTCAAAAAAAAAAA
**TTACATTCGAAACATACAAGAGGAAAGTCGAATTCACACTCTTTTTGCAGATTCTCCT
ATAACAATGATACACCAACCCAAAAGGGTTATTAACACTTGTGAATAACATACAAGGACC
CTCAATTCATATACAAATATATATAATTAGCTTTTCAAACAATGACAAAGAATCATGTTT
TCATGCGTATGCTTGGGTGTTTATCTCTAATCTTGAGCTCCCGATGCAACCATGAGAAGG
GAACTCGATATATTTGTTACTTCAAAGGACAAAAAGAAGCAAAACAAGGAGGATTACCGG
TTGATATTGATCTGGCATGTGAAGGCTTATTATTATTATTATTATTATTAGCTACCCTAG
AATCAAATGAAGAAGCTAAAGGACCCGATCTGCTTCCCGCCTTCTTTTTATTCTTCTTCT
TTTTATTCTTTTTACTTGATCCTACTTCCAAGAGCTTCCCGTCTTTACCTACCTGCTTCA
CTTTCATCTCATTCAAGCTAGCCGGTAACACACAGTTGCACATGAAACCTAAGCGAGCAA
GACGGTTGACCCAGTTAGGGATTGACTTTTGAGTTAGTTTTAAACAAACATCGTTGC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4FJ40JQ 747 0 0
TTTTAATTGAATTTGATAACATTCAGAAAAGTAATTTGTACAAATATTCAAAAAAAAAAA
AATTACATTCGAAACATACAAGAGGAAAGTCGAATTCACACTCTTTTTGCAGATTCTCCT
ATAACAATGATACACCAACCCAAAAGGGTTATTAACACTTGTGAATAACATACAAGGACC
CTCAATTCATATACAAATATATATAATTAGCTTTTCAAACAATGACAAAGAATCATGTTT
TCATGCGTATGCTTGGGTGTTTATCTCTAATCTTGAGCTCCAGATGCGACCATGAGAAGG
GGACTCGATATCTTTGTTACTTCAAAGGACAAAAAGAAGCAAAACAAGGAGGATTACCGG
TTGATATTGATCTGGCATGTGAAGGCTTATTATTATTATTATTATTA***GCTACCCTTG
AATCAAATGAAGAAGCTAAAGGACCCGATCTGCTTCCCGCCTTCTTTTTATTCTTCTTCT
TTTTATTCTTTTTACTTGATCCTACTTCCAAGAGCTTCCCGTCTTTACCTACCTGCTTCA
CTTTCATCTCATTCAAGCTAGCCGGTAACACACAGTTGCACATGAAACCTAAGCGAGCAA
GACAGTTGACCCAGTTAGGGATTGACTTTTGAGTAAGTTTTAAACAAACATCGTTGCAGA
AATGATTACAGTTCCTTGTGATGAGGTGGTATTTACTCCCCTGATACTCATCTGCTAGCT
CCTCCATAACGCTTCCAACTTCTTTGG

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL2774Contig2 873 2 8 U
GGGGGAAAATACGGTAACAACAAGAGAGGAGGAAGAAGACGAACGAACCCCTTGAACATT
CGAGAGTCTTCGCAATTCCGATTTCCTGATCGGATCCTTCCAATATATCGTCGATTATAC
GTTACTATCGATCTCTCTCTCTTTATCTTCGCGATGGAATGAGGAGGAGGGAGGCGACAA
AAAAAGAAGGATGATGTTTTGCAGAAACGTCTTCGTGAAACGGAAGAAGAAGAATCCAGG
ATCGGTGCCTGTTTATCTCAATGTTTACGATCTCACCCCAATGAATGTTTACGGTTACTG
GCTCGGAATCGTATCTATCACTCTGGTCTCCAAGTTCATGGGGTTGAGTATGGATACGGG
GCGCACGAGCATTCAAGCACAGGGATTTTCAAAGTGGAGCCAAAGAAGTGTCCTGGTTTC
ACCTTCAGGAAATCGATCCTGGTGGGTGAGACGGAGATGAAGCCCAAAGAAGTTGGAAGC
GTTATGGAGGAGCTAGCAGATGAGTATCAGGGGAGTAAATACCACCTCATCACAAGGAAC
TGTAATCATTTCTGCAACGATGTTTGTTTAAAACTAACTCAAAAGTCAATCCCTAACTGG
GTCAACCGTCTTGCTCGCTTAGGTTTCATGTGCAACTGTGTGTTACCGGCTAGCTTGAAT
GAGATGAAAGTGAAGCAGGTAGGTAAAGACGGGAAGCTCTTGGAAGTAGGATCAAGTAAA
AAGAATAAAAAGAAGAAGAATAAAAAGAAGGCGGGAAGCAGATCGGGTCCTTTAGCTTCT
TCATCTGATTCTAGGGTAGCTAATAATAATAATAATAATAATAAGCCTTCACATGCCAGA
TCAATATCAACCGGTAATCCTCCTGTCTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ40TF U 1
AF RR4C521TF U 440
BS 1 575 RR4FJ40TF
BS 576 576 RR4C521TF
BS 577 606 RR4FJ40TF
BS 607 607 RR4C521TF
BS 608 622 RR4FJ40TF
BS 623 623 RR4C521TF
BS 624 664 RR4FJ40TF
BS 665 873 RR4C521TF

RD RR4FJ40TF 664 0 0
GGGGGAAAATACGGTAACAACAAGAGAGGAGGAAGAAGACGAACGAACCCCTTGAACATT
CGAGAGTCTTCGCAATTCCGATTTCCTGATCGGATCCTTCCAATATATCGTCGATTATAC
GTTACTATCGATCTCTCTCTCTTTATCTTCGCGATGGAATGAGGAGGAGGGAGGCGACAA
AAAAAGAAGGATGATGTTTTGCAGAAACGTCTTCGTGAAACGGAAGAAGAAGAATCCAGG
ATCGGTGCCTGTTTATCTCAATGTTTACGATCTCACCCCAATGAATGTTTACGGTTACTG
GCTCGGAATCGTATCTATCACTCTGGTCTCCAAGTTCATGGGGTTGAGTATGGATACGGG
GCGCACGAGCATTCAAGCACAGGGATTTTCAAAGTGGAGCCAAAGAAGTGTCCTGGTTTC
ACCTTCAGGAAATCGATCCTGGTGGGTGAGACGGAGATGAAGCCCAAAGAAGTTGGAAGC
GTTATGGAGGAGCTAGCAGATGAGTATCAGGGGAGTAAATACCACCTCATCACAAGGAAC
TGTAATCATTTCTGCAACGATGTTTGTTTAAAACTTACTCAAAAGTCAATCCCTAACTGG
GTCAACTGTCTTGCTCGCTTAG*TTTCATGTGCAACTGTGTGTTACCGGCTAGCTTGAAT
GAGA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4C521TF 434 0 0
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ATGAGTATCAGGGGAGTAAATACCACCTCATCACACGGAACTGTAATCATTTCTGCAACG
ATGTTTGTTTAAAACTAACTCAAAAGTCAATCCCTAACTGGGTCAACCGTCTTGCTCGCT
TAGGTTTCATGTGCAACTGTGTGTTACCGGCTAGCTTGAATGAGATGAAAGTGAAGCAGG
TAGGTAAAGACGGGAAGCTCTTGGAAGTAGGATCAAGTAAAAAGAATAAAAAGAAGAAGA
ATAAAAAGAAGGCGGGAAGCAGATCGGGTCCTTTAGCTTCTTCATCTGATTCTAGGGTAG
CTAATAATAATAATAATAATAATAAGCCTTCACATGCCAGATCAATATCAACCGGTAATC
CTCCTGTCTGCTTC

QA 1 434 1 434
DS 



AS 2 4

CO CL2775Contig1 619 2 3 U
GAAACAAACAGAACACACTTCGATTATACAAACCCTGTTTTTTTCTTTTTGTGAAATGGC
ACTAGCGATCAACGTTTCTTCATCATCTTCTTCTGCGATCTCAACCTCTAGCTTCCCTTC
TTCGGACCTCAAAGTTTCAGCTCCACGGATCGGTTCGTTGAGGTTATCAGATCGTGTCAA
TGTCTCATCGGCGCCTCTGAGTCTATCCGGGAAACGATCGTCATCGGTGAAGCCTCTGAA
TGTTCAGTCATTCACAAAGGAGTCGTCTGTTCCTTCTCAAACAGCATCATCCATGGTGGC
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GACTGCTTCTCCTCTCGAGATCATGGACAAGGCTCTCGAGACATTCGGAAACGACATCGC
AATCGCCTTTAGTGGAGCAGAAGACGTTGCTCTCATCGAGTATGCTCATTTAACCGGAAG
ACCCTTCAGGGTTTTCAGTTTGGACACAGGGAGGTTGAACCCGGAAACGTACAGACTCTT
CGACACCGTGGAGAAGCACTACGGTATTAGGATCGAGTACATGTTTCCCGATGCTGTTGA
GGTCCAAGCTCTGGTTAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG49TF U 1
AF RR4H627TF U 1
BS 1 193 RR4DG49TF
BS 194 194 RR4H627TF
BS 195 619 RR4DG49TF

RD RR4DG49TF 619 0 0
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TGTCTCATCGGCGTCTCTGAGTCTATCCGGGAAACGATCGTCATCGGTGAAGCCTCTGAA
TGTTCAGTCATTCACAAAGGAGTCGTCTGTTCCTTCTCAAACAGCATCATCCATGGTGGC
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GACTGCTTCTCCTCTCGAGATCATGGACAAGGCTCTCGAGACATTCGGAAACGACATCGC
AATCGCCTTTAGTGGAGCAGAAGACGTTGCTCTCATCGAGTATGCTCATTTAACCGGAAG
ACCCTTCAGGGTTTTCAGTTTGGACACAGGGAGGTTGAACCCGGAAACGTACAGACTCTT
CGACACCGTGGAGAAGCACTACGGTATTAGGATCGAGTACATGTTTCCCGATGCTGTTGA
GGTCCAAGCTCTGGTTAGG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4H627TF 615 0 0
GAAACAAACAGAACACACTTCGATTATACAAACCCTGTTTTTTTCTTTTTGTGAAATGGC
ACTAGCGATCAACGTTTCTTCATCATCTTCTTCTGCGATCTCAACCTCTAGCTTCCCTTC
TTCGGACCTCAAAGTTTCAGCTCCACGGATCGGTTCGTTGAGGTTATCAGATCGTGTCAA
TGTCTCATCGGCGCCTCTGAGTCTATCCGGGAAACGATCGTCATCGGTGAAGCCTCTGAA
TGTTCAGTCATTCACAAAGGAGTCGTCTGTTCCTTCTCAAACAGCATCATCCATGGTGGC
TTCTGAGAAACTAGATGTGGTGGAAGTTGAAGACTTTGAGGAGCTAGCAAAGAGTCTAGA
GACTGCTTCTCCTCTCGAGATCATGGACAAGGCTCTCGAGACATTCGGAAACGACATCGC
AATCGCCTTTAGTGGAGCAGAAGACGTTGCTCTCATCGAGTATGCTCATTTAACCGGAAG
GCCCTTCAGGGTTTTCAGTTTGGACACAGGGAGGTTGAACCCGGAAACGTACAGACTCTT
CGACACCGTGGAGAAGCACTACGGTATTAGGATCGAGTACATGTTTCCCGATGCTGTTGA
GGTCCAAGCTCT
GGT

QA 1 612 1 612
DS 



CO CL2775Contig2 648 2 6 U
GAAACAAACAGAACACACTTCGATCATACAACCCTTTTTTTTTTTGTGAAATGGCACTAG
CGATCAACGTTTCTTCATCTTCTTCTTCTGCGATCTCAACCTCTAGCTTCCCTTCTTCAG
AGCTCAAAGTTTCAGCTCCACGGATCGGTTCGTTGAGGTTATCGGATCGTGTCAATGTCT
CATCGGCGTCTCTGAGTCTATCCGGGAAACGATCGTCATCGGTGAAGCCTCTGAATGTTC
AGTCATTCACAAAGGAGTCCTTTGTTCCTTCTCAAGCAGCATCATCCATGGTGGCTTCTG
AGAAACTAGATGTGGTTGAAGTGGAAGACTTTGAGGAGCTAGCAAAGAGTCTAGAGACTG
CTTCTCCTCTCGAGATCATGGACAAGGCTCTCGAGACATTCGGAAACGACATCGCAATCG
CCTTTAGTGGAGCAGAAGACGTTGCTCTCATCGAGTATGCTCATTTAACCGGAAGACCCT
TTAGAGTTTTCAGTTTAGACACAGGGAGGTTGAACCCCGAAACATACAGACTCTTCGACA
CCGTGGAGAAGCACTACGGTATCAGGATCGAGTACATGTTTCCCGATGCTGTTGAGGTCC
AAGCTCTTGTTAGGAACAAAGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGACGTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DI04TF U 1
AF RR4E847TF U 1
BS 1 269 RR4DI04TF
BS 270 270 RR4E847TF
BS 271 396 RR4DI04TF
BS 397 397 RR4E847TF
BS 398 607 RR4DI04TF
BS 608 648 RR4E847TF

RD RR4DI04TF 615 0 0
GAAACAAACAGAACACACTTCGATCATACAACCCTTTTTTTTTTTGTGAAATGGCACTAG
CGATCAACGTTTCTTCATCTTCTTCTTCTGCGATCTCAACCTCTAGCTTCCCTTCTTCAG
AGCTCAAAGTTTCAGCTCCACGGATCGGTTCGTTGAGGTTATCGGATCGTGTCAATGTCT
CATCGGCGTCTCTGAGTCTATCCGGGAAACGATCGTCATCGGTGAAGCCTCTGAATGTTC
AGTCATTCACAAAGGAGTCCTTTGTTCCT*CTCAAGCAGCATCATCCATGGTGGCTTCTG
AGAAACTAGATGTGGTTGAAGTGGAAGACTTTGAGGAGCTAGCAAAGAGTCTAGAGACTG
CTTCTCCTCTCGAGATCATGGACAAGGCTCTCGAGATATTCGGAAACGACATCGCAATCG
CCTTTAGTGGAGCAGAAGACGTTGCTCTCATCGAGTATGCTCATTTAACCGGAAGACCCT
TTAGAGTTTTCAGTTTAGACACAGGGAGGTTGAACCCCGAAACATACAGACTCTTCGACA
CCGTGGAGAAGCACTACGGTATCAGGATCGAGTACATGTTTCCCGATGCTGTTGAGGTCC
AAGCTCT
TGTTAGGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4E847TF 648 0 0
GAAACAAACAGAACACACTTCGATCATACAACCCTTTTTTTTTT*GTGAAATGGCACTAG
CGATCAACGTTTCTTCATCTTCTTCTTCTGCGATCTCAACCTCTAGCTTCCCTTCTTCAG
AGCTCAAAGTTTCAGCTCCACGGATCGGTTCGTTGAGGTTATCGGATCGTGTCAATGTCT
CATCGGCGTCTCTGAGTCTATCCGGGAAACGATCGTCATCGGTGAAGCCTCTGAATGTTC
AGTCATTCACAAAGGAGTCCTTTGTTCCTTCTCAAGCAGCATCATCCATGGTGGCTTCTG
AGAAACTAGATGTGGTTGAAGTGGAAGACTTTGAGGAGCTAGCAAAGAGTCTAGAGACTG
CTTCTCCTCTCGAGATCATGGACAAGGCTCTCGAGACATTCGGAAACGACATCGCAATCG
CCTTTAGTGGAGCAGAAGACGTTGCTCTCATCGAGTATGCTCATTTAACCGGAAGACCCT
TTAGAGTTTTCAGTTTAGACACAGGGAGGTTGAACCCCGAAACATACAGACTCTTCGACA
CCGTGGAGAAGCACTACGGTATCAGGATCGAGTACATGTTTCCCGATGCTGTTGAGGTCC
AAGCTCTTGTTAGGAACAAAGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGACGTCA

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 3

CO CL2776Contig1 907 3 8 U
GGCTGGAGAAGCTGGATTACAACAGGCCAATGGATTTGCTCCTCCAGCGGGTTATTCGCA
GTTTGAGCAGCCATCATACGGGCAAGGGGCCTCTTCTACCTGGAATAGTCAGCCTGCACA
GCATTTGCAGCAACCACAGCAGCCATCTTACGGTGCCCAAGACAGTATGGCATTTCCACC
TCCCCCATGGGAAGCTCAGCATCAAGACTTCAGTCCCACTGCAGAGTCAGGAAGTCCGTT
TTCTCCTCAAATGCATCCAACACAAGTTGGTTTCTCACATGGTCAACAATATCCTCAAAT
GCCCCAAAACAACAACAGTCCATATCCTCAAATGCCGCAAACCGGTATGTACATGCAACA
GCCAATGCCAAACCAAGCTAATCAGGCTCTAGGACAAGGCTATCCACCCCAACAACAACA
GCAGCAGCAGATGATGATGGCTCAGTTCTATGCCCAACAGCAACAACTACAGCAACAGCA
ACAAGCATATGGAAACCAGATGGGAGGAGGATATGGATACGGTTATAATCAACAGCAACA
AGGAAGCAGCCCATATTTGGAACAGCAAATGCATGGCATGTCCATCAGAGACCAGGCGTC
GCATCAGGCACCATCATCATCATCTTCTTATCTGCCTCCTATGAAACCTAAGAATAAACC
AGAGGATAAGCTATTTGGGGATCTAGTTGACATCTCCAAATTCAAGCCTAGTACAAAACC
GACTACCGGAAGAGCTGGTACCATGTGAAAGATCTACTCATGATTTATGATTATTCGTCT
CTCTGTATCTTTACTCAGCTAAATCTCTTTCTTCGTTTTTCAAGATTTGATCAATTGATT
AGACCCTCTTGTGAGATGCATACATACATATATGTTATCGTGTTCCTTGCTTATAAATTT
ACTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G033TF U 89
AF RR4EN95TF U 1
AF RR4G033JQ C 510
BS 1 155 RR4EN95TF
BS 156 156 RR4G033TF
BS 157 561 RR4EN95TF
BS 562 562 RR4G033JQ
BS 563 608 RR4EN95TF
BS 609 609 RR4G033JQ
BS 610 765 RR4EN95TF
BS 766 907 RR4G033JQ

RD RR4G033TF 109 0 0
GCCTCTTCTCCCTGGAATAGTCAGCCTGCACAGCATTTGCAGCAACCACAGCAGCCATCT
TACGGTGCCCAAGACAGTATGGCATTTCCACCTCCCCCATGGGAAGCTC

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR4EN95TF 765 0 0
GGCTGGAGAAGCTGGATTACAACAGGCCAATGGATTTGCTCCTCCAGCGGGTTATTCGCA
GTTTGAGCAGCCATCATACGGGCAAGGGGCCTCTTCTACCTGGAATAGTCAGCCTGCACA
GCATTTGCAGCAACCACAGCAGCCATCTTACGGTGGCCAAGACAGTATGGCATTTCCACC
TCCCCCATGGGAAGCTCAGCATCAAGACTTCAGTCCCACTGCAGAGTCAGGAAGTCCGTT
TTCTCCTCAAATGCATCCAACACAAGTTGGTTTCTCACATGGTCAACAATATCCTCAAAT
GCCCCAAAACAACAACAGTCCATATCCTCAAATGCCGCAAACCGGTATGTACATGCAACA
GCCAATGCCAAACCAAGCTAATCAGGCTCTAGGACAAGGCTATCCACCCCAACAACAACA
GCAGCAGCAGATGATGATGGCTCAGTTCTATGCCCAACAGCAACAACTACAGCAACAGCA
ACAAGCATATGGAAACCAGATGGGAGGAGGATATGGATACGGTTATAATCAACAGCAACA
AGGAAGCAGCCCATATTTGGAGCAGCAAATGCATGGCATGTCCATCAGAGACCAGGCGTC
GCATCAGGTACCATCATCATCATCTTCTTATCTGCCTCCTATGAAACCTAAGAATAAACC
AGAGGATAAGCTATTTGGGGATCTAGTTGACATCTCCAAATTCAAGCCTAGTACAAAACC
GACTACCGGAAGAGCTGGTACCATGTGAAAGATCTACTCATGATT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4G033JQ 398 0 0
GATATGGATACGGTTATAATCAACAGCAACAAGGAAGCAGCCCATATTTGGAACAGCAAA
TGCATGGCATGTCCATCAGAGACCATGCGTCGCATCAGGCACCATCATCATCATCTTTTT
ATCTGCCTCCTATGAAACCTAAGAATAAACCAGAGGATAAGCTATTTGGGGATCTAGTTG
ACATCTCCAAATTCAAGCCTAGTACAAAACCGACTTCCGGAAGAGCTGGTACCATGTGAA
AGATCTACTCATGATTTATGATTATTCGTCTCTCTGTATCTTTACTCAGCTAAATCTCTT
TCTTCGTTTTTCAAGATTTGATCAATTGATTAGACCCTCTTGTGAGATGCATACATACAT
ATATGTTATCGTGTTCCTTGCTTATAAATTTACTGGTG

QA 1 398 1 398
DS 



AS 1 2

CO CL2777Contig1 731 2 8 U
GGGAACAAGTCATACCTAAAGAGAACATAACAAAAAGATATTGAACTAGTTTTGAACTAG
TTAGTATAATGGAGTGGAGAGAGTGTTATTTAGATGTGATCTTGGTGCCGCCAGGGCTAA
TGGTATATGCTGCTTACCATATTTACTTGTGGTACAAGTTACGTACACAGCCTCTCACCA
CCACCATCGGTACCAACGCTAGAGCTCGCCGTTTCTGGGTCGCTTCCATCATCAAGGACA
ACGAGAAGAAGAACATCTTGGCCGTTCAAACGCTAAGAAACTGCATAATGGGATCAACAT
TAATGGCCACAACGTCGATCCTTCTCTCCGCGGGTCTAGCTGCCGTTATAAGCAGCACAT
ACGCAGTGAAGAAGCCTCTAAACGACGCCGTTTACGGAGCTCACGGGGAGTTCATGGTGG
CTCTCAAGTATGTCACGATTCTCACCATCTTCCTCTTCTCCTTCTTCTCTCACTCTCTCT
CGATCCGATTCATCAACCAAGTCAACATCCTCATCAACACTCCCTTTCCTCCGGAGGAGC
TGGAGGATGAGGAAATGATGATAACGCAGGAGGAGTACGTGGGGGAGTTGCTAGAGAGAG
GGTTTGTTTTGAACACGGTGGGGAACCGGTTGTTTTATGCGGCGTTGCCTTTGATGCTTT
GGATATTTGGACCGGTGCTTGTGTTCTTGTGTCGGTCATGATGGTTCCTCTTCTTTATAA
CCTCGATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GK16TF U 1
AF RR4CD56TF U 56
BS 1 454 RR4GK16TF
BS 455 455 RR4CD56TF
BS 456 624 RR4GK16TF
BS 625 625 RR4CD56TF
BS 626 694 RR4GK16TF
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BS 696 729 RR4GK16TF
BS 730 731 RR4CD56TF

RD RR4GK16TF 729 0 0
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TTAGTATAATGGAGTGGAGAGAGTGTTATTTAGATGTGATCTTGGTGCCGCCAGGGCTAA
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TAATGGCCACAACGTCGATCCTTCTCTCCGCGGGTCTAGCTGCCGTTATAAGCAGCACAT
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CTCTCAAGTATGTCACGATTCTCACCATCTTCCTTTTCTCCTTCTTCTCTCACTCTCTCT
CGATCCGATTCATCAACCAAGTCAACATCCTCATCAACACTCCCTTTCCTCCGGAGGAGC
TGGAGGATGAGGAAATGATGATAACGCAGGAGGAGTACGTGGGGGAGTTGCTAGAGAGAG
GGTTTGTTTTGAACACGGTGGGGAGCCGGTTGTTTTATGCGGCGTTGCCTTTGATGCTTT
GGATATTTGGACCGGTGCTTGTGTTCTTGTGTCG*TCATGATGGTTCCTCTTCTTTATAA
CCTCGATTT

QA 1 729 1 729
DS 

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GCTAATGGTATATGCTGCTTACCATATTTACTTGTGGTACAAGTTACGTACACAGCCTCT
CACCACCACCATCGGTACCAACGCTAGAGCTCGCCGTTTCTGGGTCGCTTCCATCATCAA
GGACAACGAGAAGAAGAACATCTTGGTCGTTCAAACGCTAAGAAACTGCATAATGGGATC
AACATTAATGGCCACAACGTCGATCCTTCTCTCCGCGGGTCTAGCTGCCGTTATAAGCAG
CACATACGCAGTGAAGAAGCCTCTAAACGACGCCGTTTACGGAGCTCACGGGGAGTTCAT
GGTGGCTCTCAAGTATGTCACGATTCTCACCATCTTCCTCTTCTCCTTCTTCTCTCACTC
TCTCTCGATCCGATTCATCAACCAAGTCAACATCCTCATCAACACTCCCTTTCCTCCGGA
GGAGCTGGAGGATGAGGAGATGATGATAACGCAGGAGGAGTACGTGGGGGAGTTGCTAGA
GAGAGGGTTTGTTTTGAACACG*TGGGGAACCGGTTGTTTTATGCGGCGTTGCCTTTGAT
GCTTTGGATATTTGGACCGGTGCTTGTGTTCTTGTGTCGGTCATGATGGTTCCTCTTCTT
*ATAACCTCGATTTTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 2 4

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CTCTGGCTATTCCTGCAGATACTTCGGTTACCTCGTGTCCAAAAAGAAGTACATTGTCTC
CATCGATGATGACTGTGTCCCCGCTAAGGATCCCAAGGGAGTTCTAGTGGATGCTGTCTC
TCAGCACGTGACCAACCTCGAGAACCCTGCCACGCCTCTCTTCTTCAATACCCTCTACGA
TCCTTACTGCGAGGGAGCTGATTTTGTGCGTGGGTACCCGTTCAGCCTTAGAAGTGGCGT
CCCCTGTGCTGCTTCCTGTGGACTTTGGCTTAACTTGGCTGATCTTGACGCTCCGACGCA
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GAGATGTTTGGTGTTGGGATGTGTCTGAACACATCTCTGACCATTTGGGTTACGTGTGAA
ACTGGTCTGCCTTATGTGTGAG


BQ
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AF RR4AZ32TF U 1
AF RR4B055TF U 1
BS 1 782 RR4AZ32TF
BS 783 862 RR4B055TF

RD RR4AZ32TF 789 0 0
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CAAAGCGATGTTGCCCGGTAAGTGGGATCAACATCGCTTTTAACCGTGAGTTGGTGGGAC
CAGCTTTGGTGCCTGCGCTTAGAATTGCTGGTGAAAGGGAAAGTGAGATGGGAAACGCTT
GA
GATGTTG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4B055TF 862 0 0
GGGGATCTATTCTATTCTGCTGCATTCTCTCCAGAAGATTTACCTAAAAATCTGTTGATA
TTCAAACATGTCGTCGTCTGAGATAAACAAGAACGAGGTTGACATTGTCATTGGCGCTCT
CAACGCTGACCTGACTAAGTTCCTCAACAGCTGGAAACCCTTTTTCTCCGGTTCCCATCT
CATCATCGTCAAAGGCCCTGAGCTCAAGGACGACCTCAACGTACCCGAAGGCTTTGATGT
GGACGTCTACTCCAAGCCCGACATTGAGAAAGTCGTGGGCGCTGCCAATGCCGCCATCTT
CTCTGGCTATTCCTGCAGATACTTCGGTTACCTCGTGTCCAAAAAGAAGTACATTGTCTC
CATCGATGATGACTGTGTCCCCGCTAAGGATCCCAAGGGAGTTCTAGTGGATGCTGTCTC
TCAGCACGTGACCAACCTCGAGAACCCTGCCACGCCTCTCTTCTTCAATACCCTCTACGA
TCCTTACTGCGAGGGAGCTGATTTTGTGCGTGGGTACCCGTTCAGCCTTAGAAGTGGCGT
CCCCTGTGCTGCTTCCTGTGGACTTTGGCTTAACTTGGCTGATCTTGACGCTCCGACGCA
AGCTCTCAAGACAGAGCAGAGGAACACTTCGTATGTTGATGCGGTCATGACCGTTCCCCT
CAAAGCGATGTTGCC*GGTAAGTGGGATCAACATCGCTTTTAACCGTGAGTTGGTGGGAC
CAGCTTTGGTGCCTGCGCTTAGAATTGCTGGTGAA*GGGAAAGTGAGATGGGAAACGCTT
GAGATGTTTGGTGTTGGGATGTGTCTGAACACATCTCTGACCATTTGGGTTACGTGTGAA
ACTGGTCTGCCTTATGTGTGAG

QA 1 862 1 862
DS 



CO CL2778Contig2 763 2 3 U
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GCTTGCGTCGGAGCGTCAAGATCAGCCAAGTTAAGCCAAAGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ32JQ U 103
AF RR4B055JQ U 1
BS 1 217 RR4B055JQ
BS 218 218 RR4AZ32JQ
BS 219 763 RR4B055JQ

RD RR4AZ32JQ 178 0 0
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TTAGAAATGATAAAAGGAACCTAACCTCGGGAGATATAGATTCAACTTTAGCCGCCCGAG
TTAACAGAGTTCCAGAGCTGGACCCACTTGACCATGGCATCAGCAGCTTGAGTGAAGG

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR4B055JQ 763 0 0
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GGTTTACATTATTGAAAGTCTCATAAAAAAAACATGCTTGTAATTAGATAAAAGGAGAAA
TAAACATGATGAAAAATCCCTGAAACATGGTATTAAATAAGTTTAGAAATGATAAAAGGA
ACCTAACCTCGGGAGATATAGATTCAACTTTAGCCGCTCGAGTTAACAGAGTTCCAGAGC
TGGACCCACTTGACCATGGCATCAGCAGCTTGAGTGAAGGCAGGGTCATCTGAACCCAAC
TGCTCTTTCACCGCTTTAGCAAGCTCAACCACACAATCTTCAACCTTAACCGCGGTCTCA
GGCAACTTCAAAGACTCGAAAAACGGAACACTCTTCTCCATCAGCTTCATTCCTTCCCAT
TTCTTCCTCAAACTCTCCACAGCATCTCCCTTCTCGTTCCTCCACACATAAGGGAGACCA
GTTTTCACACCGTAACCCAAATGGTCAGAGATGTGTTTCAGACACATCCCACACCAAACA
TCTTCAAGCGTTTCCCATCTCACTTTCCCTTCACCAGCAATTCTAAGCGCAGGCACCAAA
GCTGGTCCCACCAACTCACGGTTAAAAGCGATGTTGATCCCACTTACCGGCAACATCGCC
TTGAGGGGAACGGTCATGACCGCATCAACATACGAAGTGTTCCTCTGCTCTGTCTTGAGA
GCTTGCGTCGGAGCGTCAAGATCAGCCAAGTTAAGCCAAAGTC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL2779Contig1 854 2 13 U
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CTATGGACAAGGAGTCACCAGGGGACAGGACTTATCCGGCAAGGATTTTAGTGGCCAGAC
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GTTGTTAGGTGCTAGCTTCTTTGATGCAGACCTAACAGGTGCTGATTTATCCGAAACTGA
TCTCCGAGGTGCAGATTTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGCTAA
CTTGGAAGGAGCAACTGCTACCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACATTACAGGCGC
TGATTTCACTGATGTTCCTCTAAGAGATGATCAACGAGAATACCTTTGCAAAATCGCCGA
TGGGGTTAATGCCACCACTGGGAATGCCACACGGGACACATTGCTCTGCAACTGAACTTG
TCAAGTGTAAACCTTTGTATCGTTGGGGAGTCTTCTTCTTCCGAGTTTTTGTAAAGTTTT
TGCAGAGTGAGTGTGTATATAAATATGCTTACTATTCTCAAGCCCGTTAGACATTCAGAG
ATCATGTATGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH43TF U 19
AF RR4B034TF U 1
BS 1 56 RR4B034TF
BS 57 57 RR4CH43TF
BS 58 75 RR4B034TF
BS 76 76 RR4CH43TF
BS 77 121 RR4B034TF
BS 122 122 RR4CH43TF
BS 123 166 RR4B034TF
BS 167 169 RR4CH43TF
BS 170 438 RR4B034TF
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BS 440 451 RR4B034TF
BS 452 452 RR4CH43TF
BS 453 854 RR4B034TF

RD RR4CH43TF 574 0 0
GG
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TTTCCTGCAGCAACATCTCTCTAAAACCGTCTCTCTCTAAGCCTCTTTATTCTCGTTCTC
ACTGTCGTCTCATTCGTTGCTCACAGCAGGAAGGGAAAGGAGTGGTCAGTCCGTTGGTTT
GGTCATTAGGAGAAGAGGTTTCAAAGAGAAGTTTACTTGCACTTGTCTCTGCTTCTCTCT
TCTTTGTTGATCCTGCTCTTGCTTTTAAGGGTGGTGGTCCCTATGGACAAGGAGTCACCA
GGGGACAGGACTTATCCGGCAAGGATTTTAGTGGCCAGACTCTGATCAGACAGGACTTCA
AGACGTCAATCCTAAGGCAAGCCAATTTCAAGGGTGCTAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTCT
TTGATGCAGACCTAACAGGTGCTGATTTATCCGAAACTGATCTCCGAGGTGCAGATTTCT
CCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGCTAACTTGGAAG*AGCAACTGCTA
CCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACATT

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR4B034TF 854 0 0
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AATTCTCAGCAACGTCTCGTTTTCCTGCAGCAACATCTCTCTAAAACCGTCTCTCTCTAA
GTCTCTTTATTCTCGTTCTCACTGTCGTCTCATTCGCTGCTCACAG***GAAGGGAAAGG
AGTGGTCAGTCCGTTGGTTTGGTCATTAGGAGAAGAGGTTTCAAAGAGAAGTTTACTTGC
ACTTGTCTCTGCTTCTCTCTTCTTTGTTGATCCTGCTCTTGCTTTTAAGGGTGGAGGTCC
CTATGGACAAGGAGTCACCAGGGGACAGGACTTATCCGGCAAGGATTTTAGTGGCCAGAC
TCTGATCAGACAGGACTTCAAGACGTCAATCCTAAGGCAAGCCAATTTCAAGGGTGCTAA
GTTGTTAGGTGCTAGCTTTTTTGATGCAGACTTAACAGGTGCTGATTTATCCGAAACTGA
TCTCCGAGGTGCAGATTTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGCTAA
CTTGGAAGGAGCAACTGCTACCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACATTACAGGCGC
TGATTTCACTGATGTTCCTCTAAGAGATGATCAACGAGAATACCTTTGCAAAATCGCCGA
TGGGGTTAATGCCACCACTGGGAATGCCACACGGGACACATTGCTCTGCAACTGAACTTG
TCAAGTGTAAACCTTTGTATCGTTGGGGAGTCTTCTTCTTCCGAGTTTTTGTAAAGTTTT
TGCAGAGTGAGTGTGTATATAAATATGCTTACTATTCTCAAGCCCGTTAGACATTCAGAG
ATCATGTATGCTAC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 4

CO CL2780Contig1 612 4 16 U
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GTCAGCGTCTTCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGCCGGCCACCGGCCCTTCGTC
TTCAAGGAACTCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAG
AGCAGCCGACGAGGCCGCTGCAGAAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGT
GGCTCCGGCTGGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGG
GTCCAAGGTCAAGATCCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGT
GGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAA
TTACGCCAACATATCGACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTA
AAAAATGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATT
CTATCTGTCTGTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTAATTCTCGAGT
CAGAAAATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 0 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D301TF U 1
AF RR4D301JQ C 169
AF RR4BF66JQ C 14
AF RR4BF66TF U 14
BS 1 100 RR4D301TF
BS 101 101 RR4BF66TF
BS 102 195 RR4D301TF
BS 196 196 RR4BF66TF
BS 197 199 RR4D301TF
BS 200 200 RR4BF66TF
BS 201 333 RR4D301TF
BS 334 334 RR4BF66TF
BS 335 447 RR4D301TF
BS 448 448 RR4BF66TF
BS 449 450 RR4D301TF
BS 451 451 RR4BF66TF
BS 452 456 RR4D301TF
BS 457 457 RR4BF66TF
BS 458 589 RR4D301TF
BS 590 612 RR4BF66TF

RD RR4D301TF 590 0 0
GGACTCTTTCCTGTCGGAACAACAATACGAAGCAAAAAAAATCCCAGAGATGTCGATGAT
GTCAGCGTCTTCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGGCGGCCACCGGCCCTTCGTC
TTCAAGGAACTCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAG
AGCAGCCGACGAGGCGGCTTCAGAAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGT
GGCTCCGGCTGGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGG
GTCCAAGGTCAAGATCCTAAGGAGAGAATCCTATTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGT
GGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAA
TTACGCCAACATATCGACCAACAACTATGCGTTGGATGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTA
AAAAATGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATT
CTATCTGTCTGTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTT
G

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4D301JQ 379 0 0
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AGCAACTGCCGTGGCTCCGGCTGGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGG
CCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTCAAGATCCTAAGGAGAGAATCCTATTGGTTCAAGAACGT
TGGAGCAGTTGTGGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTT
CGCGAAAGTGAATTACGCCAACATTTCGACCAACAACTATGCGTTGGATGAGGTTGAAGA
AGTCAAAGCTTAAAAAATGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTTGGTTTAATGTTTA
TACCATTCTATTCTATCTG

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR4BF66JQ 599 0 0
GG
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GTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGCCGGCCACCGGCCCTTCGTCTTCAAGGAACTCAGT
GTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAGAGCAGCCGACGAGGC
CGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGTGGCTCCGGCTGGAGC
TGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTCAAGAT
CCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGATCAGGA
TCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAACATATC
GACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGAGCTGA
AAAACAATTGTGTGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATTCTATCTGTCTGTAAC
TCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTAATTCTCGAGTCAGAAAATAATT

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR4BF66TF 599 0 0
GG
GGAACAACAATACGAAGCAAAAAAAATCCCAGAGATGTCGATGATGTCAGCGTCTTCGGC
GTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGCCGGCCACCGGCCCTTCGTCTTCAAGGAACTCAGT
GTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAGAGCAGCCGACGAGGC
CGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGTGGCTCCGGCTGGAGC
TGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTCAAGAT
CCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGATCAGGA
TCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAACATATC
GACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGAGCTGA
AAAACAATTGTGTGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATTCTATCTGTCTGTAAC
TCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTAATTCTCGAGTCAGAAAATAATT

QA 3 599 3 599
DS 



AS 1 3

CO CL2781Contig1 869 3 4 U
CAAGATTAAAACTTGTGATCTTTTTTTTTTCTTATAAAAGGGTAAAATAGATTCGAAGAC
AAAGGGTACACACTAGATTATTTTAGTCACTTTCGAAATGAAAAATGAGGCCTACATCCA
CAAACCAAGAAGGCTCCTCATAAAACTTGTGAGCCAAAGCAGAGCATCAAGCAAAGAATG
AATGGGAGGGGGCTTAATCGAAGTCGAGAAACTCCATTCTCTTCCTCATTGTTCCTCTCA
GCTCACTCGCTTCCCTCTCCACTTTTTGCGCCCTTTTAATCTCGGTCTCTGAGACGCGAA
TCATATTTGGAGGAAGCTCCTCTCTCTCCGTGTCCAGGTCACCAATCAGAACAACATTCT
CTCCACGGATTACATAGAGGCCTAAAGGAATGTCGCAGTATTGCTCGCCAACAATTACCC
TCTCGCACGCACCTTCTAAAACCGCATTGGCAAATTGATCAAATGAACGGAGGGTTCCCA
TTAGCTTTCTACCATCTCTAAGGAGCACAAGTATCTTTCTATCGAGATAGCTAGCTAGTG
AAGTTGAAAGGTATATGTCTTCAGGACCAGCCCAAGATGACATCTCTCGAAATTGAAGAA
AAAAGTTTCGGTCTTTCTATAAAAACACAAACGATTCGGTGCTCTCAGAGATAGGAGGAA
AGAAAAAATCGAGATTAGGGTTTTTTTGATTGAGCAAAGGGTAAAGCTTAAAAGAAAGCG
ATATAAAAAGATCGGGACTTTCTACTCCAGATCGAAACACGGAGAAGGGTTTTGTCAAAG
AGAAAAAAATATAAAACCCAGATCCGATCGCGCTTTTGATGAGAAGATAGTTGGAGAAGA
GGCGATCGAAATCGACCACTGGTTCTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW76JQ U 263
AF RR4DA06JQ U 1
AF RR4DA06TF C 189
BS 1 348 RR4DA06JQ
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BS 350 764 RR4DA06JQ
BS 765 869 RR4DA06TF

RD RR4CW76JQ 342 0 0
TTTTTGCGCCCTTTTAATCTCGGTCTCTGAAACGCGAATCATATTTGGAGGAAGCTCCTC
TCTCTCCGTGTCCAGGTCACCAATCAGAACAACATTCTCTCCACGGATTACATAGAGGCC
TAAAGGAATGTCGCAGTATTGCTCGCCAACAATTACCCTCTCGCACGCACCTTCTAAAAC
CGCATTGGCAAATTGATCAAATGAACGGAGGGTTCCCATTAGCTTTCTACCATCTCTAAG
GAGCACAAGTATCTTTCTATCGAGATAGCTAGCTAGTGAAGTTGAAAGGTATATGTCTTC
AGGACCAGCCCAAGATGACATCTCTCGAAATTGAA
GAAAAAA

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR4DA06JQ 764 0 0
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AAAGGGTACACACTAGATTATTTTAGTCACTTTCGAAATGAAAAATGAGGCCTACATCCA
CAAACCAAGAAGGCTCCTCATAAAACTTGTGAGCCAAAGCAGAGCATCAAGCAAAGAATG
AATGGGAGGGGGCTTAATCGAAGTCGAGAAACTCCATTCTCTTCCTCATTGTTCCTCTCA
GCTCACTCGCTTCCCTCTCCACTTTTTGCGCCCTTTTAATCTCGGTCTCTGAGACGCGAA
TCATATTTGGAGGAAGCTCCTCTCTCTCCGTGTCCAGGTCACCAATCAAAACAACATTCT
CTCCACGGATTACATAGAGGCCTAAAGGAATGTCGCAGTATTGCTCGCCAACAATTACCC
TCTCGCACGCACCTTCTAAAACCGCATTGGCAAATTGATCAAATGAACGGAGGGTTCCCA
TTAGCTTTCTACCATCTCTAAGGAGCACAAGTATCTTTCTATCGAGATAGCTAGCTAGTG
AAGTTGAAAGGTATATGTCTTCAGGACCAGCCCAAGATGACATCTCTCGAAATTGAAGAA
AAAAGTTTCGGTCTTTCTATAAAAACACAAACGATTCGGTGCTCTCAGAGATAGGAGGAA
AGAAAAAATCGAGATTAGGGTTTTTTTGATTGAGCAAAGGGTAAAGCTTAAAAGAAAGCG
ATATAAAAAGATCGGGACTTTCTACTCCAGATCGAAACACGGAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4DA06TF 681 0 0
AGGGGCTT
ATCGAAGTCGAGAA*CTCCATTCTCT*CCTCATTGT*CCTCTCAGCTCACTCGCTTCCCT
CTCCACTTTTTGCGCCCTTTTAATCTCGGTCTCTGAGACGCGAATCATATTTGGAGGAAG
CTCCTCTCTCTCCGTGTCCAGGTCACCAATCAGAACAACATTCTCTCCACGGATTACATA
GAGGCCTAAAGGAATGTCGCAGTATTGCTCGCCAACAATTACCCTCTCGCACGCACCTTC
TAAAACCGCATTGGCAAATTGATCAAATGAACGGAGGGTTCCCATTAGCTTTCTACCATC
TCTAAGGAGCACAAGTATCTTTCTATCGAGATAGCTAGCTAGTGAAGTTGAAAGGTATAT
GTCTTCAGGACCAGCCCAAGATGACATCTCTCGAAATTGAAGAAAAAAGTTTCGGTCTTT
CTATAAAAACACAAACGATTCGGTGCTCTCAGAGATAGGAGGAAAGAAAAAATCGAGATT
AGGGTTTTTTTGATTGAGCAAAGGGTAAAGCTTAAAAGAAAGCGATATAAAAAGATCGGG
ACTTTCTACTCCAGATCGAAACACGGAGAAGGGTTTTGTCAAAGAGAAAAAAATATAAAA
CCCAGATCCGATCGCGCTTTTGATGAGAAGATAGTTGGAGAAGAGGCGATCGAAATCGAC
CACTGGTTCTTAA

QA 9 681 9 681
DS 



AS 1 4

CO CL2782Contig1 799 4 10 U
GGGAACATACCAAACAAACAAAAAATGGCTAAAGCCAGAGGATCTTGCTTCGCAATCGTT
ATTTTAGCGATTGCACATTTGCGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAACAGGAC
AAGGTCTCGAAGCTGCCCGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTC
GTTACAACGAATGAGAAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAA
GATCCTGCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTCCATCAGTT
GGGTTTGGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTT
TACCTTAACCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTT
GGAGTTGGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTACCAATGGTGATAAGAGA
ACTGCACAAGACTCGCTGATATTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGAAGTACAAA
GGAAGAGAGTTTTATATAGTCGGGGAGTGCTATGCAGGGCATTACATTCCTCAGCTGAGT
CAAGCCATTGTAAGACATAACCAAGCCTCTGGCCAAAACATTATTAATCTGAAAGGTACA
TGGTAGGAACGGGTTGATGGATGATCGCAAGACCAGCTCGGTCTTTACCAGTATATTGGA
CTTGGGTTTCATCTCCGACAACATACGCTTACTGAACTTCAGTGTGTTTGATCCTTATCC
TCTCTGAGCTGTATACGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK11TF U 1
AF RR4E401TF U 1
AF RR4DZ85TF U 1
AF RR4CZ65TF U 5
BS 1 81 RR4DZ85TF
BS 82 82 RR4FK11TF
BS 83 114 RR4DZ85TF
BS 115 115 RR4FK11TF
BS 116 293 RR4DZ85TF
BS 294 294 RR4FK11TF
BS 295 321 RR4DZ85TF
BS 322 322 RR4FK11TF
BS 323 651 RR4DZ85TF
BS 652 799 RR4CZ65TF

RD RR4FK11TF 457 0 0
GGGAAC
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GCGATTGCACATTTGCGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAACAGGACAAGGTC
TCGAAGCTGCCTGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTTGTTACA
ACGAATGA*AAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAAGATCCT
GCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGGTTT
GGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTT
AGCCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTT
GGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATT

QA 7 457 7 457
DS 

RD RR4E401TF 573 0 0
GGGAAC
ATACCAAACAAACAAAAAATGGCTAAAGCCAGAGGATCTTGCTTCGCAATCGTTATTTTA
GCGATTGCACATTTGTGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAAGAGGACAAGGTC
TCGAAGCTGCCCGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTCGTTACA
ACGAATGAGAAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAAGATCCT
GCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTCCGTCAGTTGGGTTT
GGTGAAGCAGAAGAGGTAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTT
AACCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTT
GGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTACCAATGGTGATAAGAGAACTGCA
CAAGACTCGCTGATATTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGAAGTACAAAGGAAGA
GAGTTTTATATAGTCGGGGAGTGCTAT

QA 7 573 7 573
DS 

RD RR4DZ85TF 651 0 0
GGGAACATACCAAACAAACAAAAAATGGCTAAAGCCAGAGGATCTTGCTTCGCAATCGTT
ATTTTAGCGATTGCACATTTGTGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAAGAGGAC
AAGGTCTCGAAGCTGCCCGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTC
GTTACAACGAATGAGAAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAA
GATCCTGCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTCCGTCAGTT
GGGTTTGGTGAAGCAGAAGAGGTAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTT
TACCTTAACCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTT
GGAGTTGGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTACCAATGGTGATAAGAGA
ACTGCACAAGACTCGCTGATATTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGAAGTACAAA
GGAAGAGAGTTTTATATAGTCGGGGAGTGCTATGCAGGGCATTACATTCCTCAGCTGAGT
CAAGCCATTGTAAGACATAACCAAGCCTCTGGCCAAAACATTATTAATCTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4CZ65TF 795 0 0
GG
ATACCAAACAAACAAAAAATGGCTAAAGCCAGAGGATCTTGCTTCGCAATCGTTATTTTA
GCGATTGCACATTTGCGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAACAGGACAAGGTC
TCGAAGCTGCCTGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTTGTTACA
ACGAATGAGAAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAAGATCCT
GCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGGTTT
GGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTT
AACCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTT
GGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTACCAATGGTGATAAGATAACTGCA
CAAGACTCGCTGATATTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGGAGTACAAAGGAAGA
GAGTTTTATATAGTCGGGGAGAGCTATGCAGGGCATTACATTCCTCAGCTGAGTCAAGCC
ATTGTAAGACATAACCAAGCCTCTGGCCAAA*CATTATTAATCTGAAAGGTACATGGTAG
GAACGGGTTGATGGATGATCGCAAGACCAGCTCGGTCTTTACCAGTATATTGGACTTGGG
TTTCATCTCCGACAACATACGCTTACTGAACTTCAGTGTGTTTGATCCTTATCCTCTCTG
AGCTGTATACGCT

QA 3 795 3 795
DS 



AS 1 4

CO CL2783Contig1 890 4 15 U
GCAGGTTCAATTCGATCAGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGCTCATCGGCAAGCCTGCTA
TCTTGCTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCAGC
TTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACGGGAGAAAAGAGCGCGGAGATGGTTACAG
ATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGG
AAACCGTCTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACT
ACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCA
GCCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATA
GAGCAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGGTGGTCTTTGGCTTC
TTGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGACTTTGACG
AAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCAGAGGAAG
AAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCAT
GGAACCGTGACAAAGCTGCTGACAATATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAAATTTGTGG
ATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCGATATGTAGGATGAA
GAGAAGGTGAATTGAGAGATTCGTTTTTTTTTGTTTTGTTTCAGTCTTTCTTTGTAAAGC
GCTTACTGCGTCTTGATACTGCATTACAAAGTATTGTATACATTCCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU22JQ C 499
AF RR4FN31TF U 1
AF RR4CX94TF U 61
AF RR4FN31JQ C 227
BS 1 100 RR4FN31TF
BS 101 101 RR4CX94TF
BS 102 163 RR4FN31TF
BS 164 164 RR4CX94TF
BS 165 166 RR4FN31TF
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BS 168 615 RR4FN31TF
BS 616 616 RR4CX94TF
BS 617 651 RR4FN31TF
BS 652 652 RR4CX94TF
BS 653 684 RR4FN31TF
BS 685 685 RR4CX94TF
BS 686 726 RR4FN31TF
BS 727 736 RR4CX94TF
BS 737 890 RR4FN31JQ

RD RR4CU22JQ 173 0 0
TTTTTT
TTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGT
TTGGCATTTTAGATGTTGGTTATCGCTCAGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTG
GGATTTTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGAC

QA 7 173 7 173
DS 

RD RR4FN31TF 726 0 0
GCAGGTTCAATTCGATCAGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGCTCATCGGCAAGCCTGCTA
TCTTGCTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGGATCCCCCTTAGCTCTCAGC
TTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACGGGAGAAAAGAGTGCTGAGATGGTTACAG
ATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGG
AAACCGTCTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACT
ACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCA
GCCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATA
GAGCAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGGTGGTCTTTGGCTTC
TTGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGACTTTGACG
AAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCAGAGGAAG
AAGCATGGGCAGCAG*AGGCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAG*CAAGTCAT
GGAACCGTGACAAAGCTGCTGACA*TATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAAATTTGTGG
ATGACA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4CX94TF 680 0 0
G
CTTGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCAGCT
TCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGCGGAGATGGTTACGGA
TGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGGA
AACCGTCTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACTA
CACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCAG
CCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTATTGGCAACCACACAATAG
AGCAGTTGCGAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGGTGGTCTTTGGCTTCT
TGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGACTTTGACGA
AGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCAGAGGAAGA
AGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTGAGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATG
GAACCGTGACAAAGCTGCTGACAATATCGCAGCTA*TCTGTACGCGGTCAAATTTGTGGA
TGACAAGAAAGGGTT
GTGC

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR4FN31JQ 664 0 0
AGCTGCTATTCAGGAAACCGTCTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAG
TGGTGCTAGTTACTACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATA
TGTTGCTGTTTCCAGCCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTG
GCAACCACACAATAGAGCAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGG
TGGTCTTTGGCTTCTTGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTC
AGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTA
TCGCTCAGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTGGGATTTTACTGAGAACAAGAAA
CGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTGCTGACAATATCGCAGCTAATCTGTACGC
GGTCAAATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCG
ATATGTAGGATGAAGAGAAGGTGAATTGAGAGATTCGTTTTTTTTTGTTTTGTTTCAGTC
TTTCTTTGTAAAGCGCTTACTGCGTCTTGATACTGCATTACAAAGTATTGTATACATTCC
CACC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 3

CO CL2784Contig1 802 3 3 U
ATTTTAAACCATCAGACATTAAAATCTGAAATAAGAGAAACATTTTTGTAACGATCCAAA
ACACTGAACGTCCTTTAAAAAATCCTAACGTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGA
CATTCCCTCTCAAATCTGAAGTGTAATTTAGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCT
TTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCCACCGGCTCCACGGCCAA
ACCCAGGCCTAGATCCAGCTCCAGGTCCCCTAAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCCC
CACTCTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCAC
CAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGGACGGTCACCCATGGGACGAC
CAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGGAGATTGAGGT
AAGTCCTCAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAA
ACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCAGAT
TCGGTACACCTTCCACCAAAGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAA
CTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGG
TTGCGATAGAGAAGACGATGGAGAAGGTGTCTGCGTGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCT
CTCTTTCTCCTTTCGCGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CC27JQ U 259
AF RR4CD96JQ U 1
AF RR4CD96TF C 197
BS 1 746 RR4CD96JQ
BS 747 747 RR4CD96TF
BS 748 802 RR4CD96JQ

RD RR4CC27JQ 336 0 0
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CTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTCCAT
CAAAACGAGGTGGGCCACGGGGACGGTCACCCATGGGACGACCAAAAGGCTTCTGTTGTT
TCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAAAAGGTAAATTGAGGTAAGTCCTAAAAAAGTCAA
TGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGAACGTACT
CCTTAAACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTT

QA 1 336 1 336
DS 

RD RR4CD96JQ 802 0 0
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ACACTGAACGTCCTTTAAAAAATCCTAACGTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGA
CATTCCCTCTCAAATCTGAAGTGTAATTTAGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCT
TTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCCACCGGCTCCACGGCCAA
ACCCAGGCCTAGATCCAGCTCCAGGTCCCCTAAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCCC
CACTCTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCAC
CAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGGACGGTCACCCATGGGACGAC
CAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGGAGATTGAGGT
AAGTCCTCAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAA
ACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCAGAT
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CTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGG
TTGCGATAGAGAAGACGATGGAGAAG*TGTCTGCGTGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCT
CTCTTTCTCCTTTCGCGTCCCT

QA 1 802 1 802
DS 

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TCC
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TCCAGGTCCCCTAAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCCCCACTCTTGTCACCAAACTC
TCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTCCATC
AGAACGAGGTGGGCCACGGGGACGGTCACCCATGGGACGACCAAGAGGCTTCTGTTGTTT
CTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGGAGATTGAGGTAAGTCCTCAGAAAGTCAAT
GCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGAACGTACTC
CTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCAGATTCGGTACACCTTCCACCAA
AGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCCTCTTGGAAGAGGTA
CTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTGCGATAGAGAAGACGAT
GGAGAAGGTGTCTGCGTGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCTCTCTTTCTCCTTTCGCGTC
CCT

QA 4 606 4 606
DS 



AS 1 4

CO CL2785Contig1 1522 4 14 U
GGGTAATGACAGACACCTGAAAAGCCTATTGAAAGGAAGACAATATATGGTAAAAAACAT
TGTAAGATTGGGAAGTAACCAGATGTAGAATCAACTTAAACATTATACCGAATGAAAGAC
TGACTCAATAAGACACTATAGAAAAAATCTTTGCTACTTCATGTGATAATTTATTTGCTC
TGAACCTTTGAAGCAAATTTCTCAATGTTAATATCTGTAGAGCCTCCTTCACTGAGTGAC
TTGACAGCCAAGTCTCTCCATTTCTTCGCATACTCCTTCACCTCTTTGCTCTTCTCTCCC
TCCATCACTTCCTTAATGCTAAACTCAATCTCCTCTCTCTTGGCAATCCCACTCTCATTG
TCTATCTTCACACGAACTCCAGCCTTCCGCACATCTTGTATGTACTTTGCGTCCATAGGT
TGATCGATCCATTGAGGCATAGCTACCATGGGAACCCCAATGGCTAATGCCTCCAGAGTT
GAATTCCAGCCACAGTGAGTCAAGAAACAACCGATGGCTTTGTTCGATAGAACTTCCAGC
TGAGGACTCCATTTCACGACCAATCTCTTGTCTTTATCCAGTGTCTCAAGAAACCCTGAT
GGCAGTTTTGCCTCCTCTGAACCTCTGACAACCCACAAGAAGCTGAAGTTGCTTACTGCT
GAAGCAAGTTCCTCCATCTGCACATTGTTCAGCTTAGCAATGCTACCGAATGCTACATAC
ACCACAGACCCTTGTGGCCTTGTGTTGAGCCAGCTAGTGCAGAAGGCAGCGTCTTCCGTA
TCAAAGAGATTTAGATCATAGTCTGTGTCTGATTTGATCCTTTGGTCTAAGTACATTGAT
GGAACAGTTGGACCAATTGTCAACACAGGACAAAATTTCGACAACAACTCCTTCTCATGA
AGCTCCAACTCTTGGAAGCTATTAACTAGTACGAAATCAGCCTTTTGAAAGTTTGTAAAC
TGTTGGAACACCATCTCAAGGTAAGCAGGGTAAGATCCAGGAGCAGATAAAAAAGAAGGC
AAATCTTGAAGCTCAAGAAAAGGCATCTCTTCGACGGGAAGCTTCAAGCTTCCACCGTTT
ATGTAAGAAAGATAGTAAACGTAGTTAACAGCACAAGACTGCGTAAAGAAAGGAGTTGCA
GCTAAACCAAACTCTCGGGCAACGTCGAGGGCCCAAGGCAAGAAAGAATCATAGAGGATA
CAAGTAATGGGGTTGTCACTTGTCTCGTGTTTGCGGATGATGTCTGCAATGGTTTTAGAG
CCAGAGGTTTTAAAGCTTTGGACATAGTCGTGGATGGAACCAGATGAGTCGAAGCCCTGG
TCGTAGCCATCGGAGATGGTGGCTATGGAGACTGGACCAGATGGGTCAGGTTTGATGGAG
TTGGAAATGAAAGTGGTGAGAGCGAGAGTGGTTTTGAGACCTTTAGAGATGAGTCGTTTA
GAGAATTGGTGGATTGGTGTTATGTGTCCTTGCACTGGATATGGCACTGCCAATACATGT
CCTCTCTTCTTTTCCATCTCTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC08JQ U 1
AF RR4DU83JQ U 47
AF RR4EC08TF C 745
AF RR4DU83TF C 776
BS 1 52 RR4EC08JQ
BS 53 53 RR4DU83JQ
BS 54 143 RR4EC08JQ
BS 144 144 RR4DU83JQ
BS 145 689 RR4EC08JQ
BS 690 817 RR4DU83JQ
BS 818 906 RR4EC08TF
BS 907 907 RR4DU83TF
BS 908 1256 RR4EC08TF
BS 1257 1257 RR4DU83TF
BS 1258 1298 RR4EC08TF
BS 1299 1299 RR4DU83TF
BS 1300 1388 RR4EC08TF
BS 1389 1522 RR4DU83TF

RD RR4EC08JQ 689 0 0
GGGTAATGACAGACACCTGAAAAGCCTATTGAAAGGAAGACAATATATGGTAGAAAACAT
TGTAAGATTGGGAAGTAACCAGATGTAGAATCAACTTAAACATTATACCGAATGAAAGAC
TGACTCAATAAGACACTATAGAAGAAATCTTTGCTACTTCATGTGATAATTTATTTGCTC
TGAACCTTTGAAGCAAATTTCTCAATGTTAATATCTGTAGAGCCTCCTTCACTGAGTGAC
TTGACAGCCAAGTCTCTCCATTTCTTCGCATACTCCTTCACCTCTTTGCTCTTCTCTCCC
TCCATCACTTCCTTAATGCTAAACTCAATCTCCTCTCTCTTGGCAATCCCACTCTCATTG
TCTATCTTCACACGAACTCCAGCCTTCCGCACATCTTGTATGTACTTTGCGTCCATAGGT
TGATCGATCCATTGAGGCATAGCTACCATGGGAACCCCAATGGCTAATGCCTCCAGAGTT
GAATTCCAGCCACAGTGAGTCAAGAAACAACCGATGGCTTTGTTCGATAGAACTTCCAGC
TGAGGACTCCATTTCACGACCAATCTCTTGTCTTTATCCAGTGTCTCAAGAAACCCTGAT
GGCAGTTTTGCCTCCTCTGAACCTCTGACAACCCACAAGAAGCTGAAGTTGCTTACTGCT
GAAGCAAGTTCCTCCATCTGCACATTGTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DU83JQ 771 0 0
ATGGTAAAAAACATTGTAAGATTGGGAAGTAACCAGATGTAGAATCAACTTAAACATTAT
ACCGAATGAAAGACTGACTCAATAAGACACTATAGAAAAAATCTTTGCTACTTCATGTGA
TAATTTATTTGCTCTGAACCTTTGAAGCAAATTTCTCAATGTTAATATCTGTAGAGCCTC
CTTCACTGAGTGACTTGACAGCCAAGTCTCTCCATTTCTTCGCATACTCCTTCACCTCTT
TGCTCTTCTCTCCCTCCATCACTTCCTTAATGCTAAACTCAATCTCCTCTCTCTTGGCAA
TCCCACTCTCATTGTCTATCTTCACACGAACTCCAGCCTTCCGCACATCTTGTATGTACT
TTGCGTCCATAGGTTGATCGATCCATTGAGGCATAGCTACCATGGGAACCCCAATGGCTA
ATGCCTCCAGAGTTGAATTCCAGCCACAGTGAGTCAAGAAACAACCGATGGCTTTGTTCG
ATAGAACTTCCAGCTGAGGACTCCATTTCACGACCAATCTCTTGTCTTTATCCAGTGTCT
CAAGAAACCCTGATGGCAGTTTTGCCTCCTCTGAACCTCTGACAACCCACAAGAAGCTGA
AGTTGCTTACTGCTGAAGCAAGTTCCTCCATCTGCACATTGTTCAGCTTAGCAATGCTAC
CGAATGCTACATACACCACAGACCCTTGTGGCCTTGTGTTGAGCCAGCTAGTGCAGAAGG
CAGCGTCTTCCGTATCAAAGAGATTTAGATCATAGTCTGTGTCTGATTTGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4EC08TF 646 0 0
TTGAGCCAGCTAGTGCAGAAGGCAGCGTCTTCCGTATCAAAGAGATTTAGATCATAGTCT
GTGTCTGATTTGATCCTTTGGTCTAAGTACATTGATGGAACAGTTGGACCAATTGTCAAC
ACAGGACAAAATTTCGACAACAACTCCTTCTCATGAAGCTCCGACTCTTGGAAGCTATTA
ACTAGTACGAAATCAGCCTTTTGAAAGTTTGTAAACTGTTGGAACACCATCTCAAGGTAA
GCAGGGTAAGATCCAGGAGCAGATAAAAAAGAAGGCAAATCTTGAAGCTCAAGAAAAGGC
ATCTCTTCGACGGGAAGCTTCAAGCTTCCACCGTTTATGTAAGAAAGATAGTAAACGTAG
TTAACAGCACAAGACTGCGTAAAGAAAGGAGTTGCAGCTAAACCAAACTCTCGGGCAACG
TCGAGGGCCCAAGGCAAGAAAGAATCATAGAGGATACAAGTAATGGGGTTGTCACTTGTC
TCGTGTTTGCGGATGATGTCTGCAATGGTTTTGGAGCCAGAGGTTTTAAAGCTTTGGACA
TAGTCGTGGATGGAGCCAGATGAGTCGAAGCCCTGGTCGTAGCCATCGGAGATGGTGGCT
ATGGAGACTGGACCAGATGGGTCAGGTTTGATGGAGTTGGAAAT
CT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4DU83TF 747 0 0
CCGTATCAAAGAGATTTAGATCATAGTCTGTGTCTGATTTGATCCTTTGGTCTAAGTACA
TTGATGGAACAGTTGGACCAATTGTCAACACAGGACAAAATTTCGACAACAACTCCTTCT
CATGAAGCTCCAACTCTTGGAAGCTATTAACTAGTACGAAATCAGCCTTTTGAAAGTTTG
TAAACTGTTGGAACACCATCTCAAGGTAAGCAGGGTAAGATCCAGGAGCAGATAAAAAAG
AAGGCAAATCTTGAAGCTCAAGAAAAGGCATCTCTTCGACGGGAAGCTTCAAGCTTCCAC
CGTTTATGTAAGAAAGATAGTAAACGTAGTTAACAGCACAAGACTGCGTAAAGAAAGGAG
TTGCAGCTAAACCAAACTCTCGGGCAACGTCGAGGGCCCAAGGCAAGAAAGAATCATAGA
GGATACAAGTAATGGGGTTGTCACTTGTCTCGTGTTTGCGGATGATGTCTGCAATGGTTT
TAGAGCCAGAGGTTTTAAAGCTTTGGACATAGTCGTGGATGGAACCAGATGAGTCGAAGC
CCTGGTCGTAGCCATCGGAGATGGTGGCTATGGAGACTGGACCAGATGGGTCAGGTTTGA
TGGAGTTGGAAATGAAAGTGGTGAGAGCGAGAGTGGTTTTGAGACCTTTAGAGATGAGTC
GTTTAGAGAATTGGTGGATTGGTGTTATGTGTCCTTGCACTGGATATGGCACTGCCAATA
CATGTCCTCTCTTCTTTTCCATCTCTC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 2 4

CO CL2786Contig1 741 2 2 U
AGTGAGATTGCTTTCTGTGGATCTAGTGGTTCCCTGGAAAGGATCGTCCTTCCTCCAGAC
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GTTCTGTCATTTGGAGAGTTAGGAGATGAACCATCATCACATTGCTCTTTTGAGAGGCGA
TTCTGCTTCAACGCTTCATTCATTGCTCGTACTGCCCTAACGATATCATCACCAATTTCA
GGAGTTATACTAATGCTTCTCCTCCTTACTCTCTTAGTTTCCAATTTTGCTCCTCCAACA
GATTTGGAGCTTGATGTGGCAATATCACCGGTGAAATCTTGTGCAAAGTTCCTGTCGCCA
CTTAATATGGACCTTGTACGTGTTCGGAAGGAAAGATGCTCGGGACTGGAACCAGCAGTT
CTCTGATCAGCAATGAACTTTCTCCGGTTCTGCCGCCAAAAATCATTAGCAATGTTTGAC
TCGCTCTTTGAGAAACTTAATTTTCTCTCTAGCATGGAGGCAGATCGTAACAGCATATTC
CTTGATGGTGGACCAGACATATTTCGAGGCCCTTCCAGTTTCCTATGAAACAGAAGACTT
TCATCTTTTCCTGCATTTTCAAGCTCTGGAAAACCAAACATGGGACTATTTGGCTCTAAA
GGTGAATCGAAAGAGTCGTTCTCTGCAGAATCACTTTCCCCTGCCGCTGAGATATGACTC
ATATATATTGCTTTGGTTGAT


BQ
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD10JQ U 1
AF RR4DH11JQ U 1
BS 1 601 RR4DD10JQ
BS 602 741 RR4DH11JQ

RD RR4DD10JQ 601 0 0
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TCGCTCTTTGAGAAACTTAATTTTCTCTCTAGCATGGAGGCAGATCGTAACAGCATATTC
CTTGATGGTGGACCAGACATATTTCGAGGCCCTTCCAGTTTCCTATGAAACAGAAGACTT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4DH11JQ 741 0 0
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GTTCTGTCATTTGGAGAGTTAGGAGATGAACCATCATCACATTGCTCTTTTGAGAGGCGA
TTCTGCTTCAACGCTTCATTCATTGCTCGTACTGCCCTAACGATATCATCACCAATTTCA
GGAGTTATACTAATGCTTCTCCTCCTTACTCTCTTAGTTTCCAATTTTGCTCCTCCAACA
GATTTGGAGCTTGATGTGGCAATATCACCGGTGAAATCTTGTGCAAAGTTCCTGTCGCCA
CTTAATATGGACCTTGTACGTGTTCGGAAGGAAAGATGCTCGGGACTGGAACCAGCAGTT
CTCTGATCAGCAATGAACTTTCTCCGGTTCTGCCGCCAAAAATCATTAGCAATGTTTGAC
TCGCTCTTTGAGAAACTTAATTTTCTCTCTAGCATGGAGGCAGATCGTAACAGCATATTC
CTTGATGGTGGACCAGACATATTTCGAGGCCCTTCCAGTTTCCTATGAAACAGAAGACTT
TCATCTTTTCCTGCATTTTCAAGCTCTGGAAAACCAAACATGGGACTATTTGGCTCTAAA
GGTGAATCGAAAGAGTCGTTCTCTGCAGAATCACTTTCCCCTGCCGCTGAGATATGACTC
ATATATATTGCTTTGGTTGAT

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL2786Contig2 650 2 1 U
GATACTAGGAAATGTGTAACATTGTTTGCTTGCCTTTTTCTCCGGGCTTTACAATAAACG
TCCAAAATGTTTTTTGATGCACGACGACCAAGCATTTGTTTGTTCCTTTTATTTATTTAT
TTTCAAGAAACCTTTGTTGAAATTTTTCTGGCAGGTGGAAAATGTTTATAAGCAATCTAC
TCTACATAGCCCGGCAAAAACTACACAATCTCTTGACAACTGTGGGATTCAACTGCTAGG
ACAGATTAAGAATCGTTCTTGTCGTCCTCGAGCTATCTTGTTCAAAGTTTTAGCTGATAC
GGTTGGCCTTCAAAGCAGGCTTGTAGTTGGTTTGTCAAGTGATGGAGCTGCTGAGAGTGT
AGACTCATACAAGCATATTTCTGTTACGGTTTTCCTTCATTCTGTGGAAATGCTGGTTGA
TCTAGTGAGGTCTCCTGGTCAGCTTATTCCTCTATCAACCAAAGCAATATATATGAGTCA
TATCTCAGCGGCAGGGGAAAGTGATTCTGCAGAGAACGACTCTTTCGATTCACCTTTAGA
GCCAAATAGTCCCATGTTTGGTTTTCCAGAGCTTGAAAATGCAGGAAAAGATGAAAGTCT
TCTGTTTCATATGAAACTGGAAAGGCCTCGAAATATGTCTGGTCCACCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DH11TF U 1
AF RR4DD10TF U 1
BS 1 650 RR4DD10TF

RD RR4DH11TF 540 0 0
GATACTAGGAAATGTGTAACATTGTTTGCTTGCCTTTTTCTCCGGGCTTTACAATAAACG
TCCAAAATGTTTTTTGATGCACGACGACCAAGCATTTGTTTGTTCCTTTTATTTATTTAT
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ACAGATTAAGAATCGTTCTTGTCGTCCTCGAGCTATCTTGTTCAAAGTTTTAGCTGATAC
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TCTAGTGAGGTCTCCTGGTCAGCTTATTCCTCTATCAACCAAAGCAATATATATGAGTCA
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QA 1 540 1 540
DS 

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TCCAAAATGTTTTTTGATGCACGACGACCAAGCATTTGTTTGTTCCTTTTATTTATTTAT
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TCTACATAGCCCGGCAAAAACTACACAATCTCTTGACAACTGTGGGATTCAACTGCTAGG
ACAGATTAAGAATCGTTCTTGTCGTCCTCGAGCTATCTTGTTCAAAGTTTTAGCTGATAC
GGTTGGCCTTCAAAGCAGGCTTGTAGTTGGTTTGTCAAGTGATGGAGCTGCTGAGAGTGT
AGACTCATACAAGCATATTTCTGTTACGGTTTTCCTTCATTCTGTGGAAATGCTGGTTGA
TCTAGTGAGGTCTCCTGGTCAGCTTATTCCTCTATCAACCAAAGCAATATATATGAGTCA
TATCTCAGCGGCAGGGGAAAGTGATTCTGCAGAGAACGACTCTTTCGATTCACCTTTAGA
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TCTGTTTCATATGAAACTGGAAAGGCCTCGAAATATGTCTGGTCCACCAT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

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ATGGTTGCCACTCGAACCTTCGTCGCTCTCTAAATGACAACAATGCGGAGGTTACGGCGT
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ATTTTTGAAAGGGCTCGATGAGGGATCACATATAAAAATTACACAAGCAAAACGCATGCC
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TCCAGTAATCGCGTCAGGGATGATGGTTTTATTGTCTGACATTCTCATTCTAAGCCGTCT
TCTCAAGCCTTTGGGCAACCTCGGTGATGAAAAAAAAGTCACAGAAGTTATGAAGTCCTT
CTATGTTCTACGCAAGCCAATGTCAGCAACAGTAAACACATTAGGGAATTCATTTTGGCA
AGTGCTAATTGCATCAACGGACGAAGCAAAAGAAGCGATGCGACAAGGCTGCTTTGATTA
CCTATCTAGTGGTGGGTTTCGCACGTCAGGCTTGATGGCTGTGTTTGGTGGCATGAACCC
TAGGCCACTTTCTCTCATCTATCATCTATCCGTTATTACTTTATCCTCCATTGGCCAACT
GCTCTCTCCGTTCCCAACTCCTCTTCGTGTTTGGCATAGCCTCAGACTTTTTGGTTTGTC
TTTGGAATTGTTGGTTCCTCATCTCAAGGCTGAAGGAATAGGTCAAATGTTGTCTCCAAC
AAATGCAGCGGCATATCGCAAAAGCTATATGGCTACAACCGTTGTCTAAACATTGATGAA
AACCACGATATATAGATGGGCACAAATCTTTGTGATTGTGGATTTGTTAAATAGTATTGC
AATATGTTACTGAAGTAACCTTTCCGTATCTACTTGTAAACGTAA*TAGGAAGAATATGC
ATGGGGTGACAATTATTTTGAATAAAACAATAAAGAAAATAATAACGAGTGGCCATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A693TF U 1
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AF RR4AG66TF U 460
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QA 1 719 1 719
DS 

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TTTGATTACCTATCTAGTGGTGGGTTTCGCACGTCAGGCTTGATGGCTGTGTTTGGTGGC
ATGAACCCTAGGCCACTTTCTCTCATCTATCATCTATCCGTTATTACTTTATCCTCCATT
GGCCAACTGCTCTCTCCGTTCCCAACTCCTCTTCGTGTTTGGCATAGCCTCAGACTTTTT
GGTTTGTCTTTGGAATTGTTGGTTCCTCATCTCAAGGCTGAAGGAATAGGTCAAATGTTG
TCTCCAACAAATGCAGCGGCATATCGCAAAAGCTATATGGCTACAACCGTTGTCTAAACA
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AGTATTTCAATATGTTACTGAAGAAACCTTTCCGTATCTACTTGTAAACGGAAATAGGAA
GAATATGCATGGGGTGACAATTATTTTGAATAAAACAATAAAGAAAATAATAACGAGTGG
CCATAAT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4AG66JQ 645 0 0
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GAAGTCCTTCTATGTTCTACGCAAGCCAATGTCAGCAACAGTAAACACATTAGGGAATTC
ATTTTGGCAAGTGCTAATTGCATCAACGGACGAAGCAAAAGAAGCGATGCGACAAGGCTG
CTTTGATTACCTATCTAGTGGTGGGTTTCGCACGTCAGGCTTGATGGCTGTGTTTGGTGG
CATGAACCCTAGGCCACTTTCTCTCATCTATCATCTATCCGTTATTACTTTATCCTCCAT
TGGCCAACTGCTCTCTCCGTTCCCAACTCCTCTTCGTGTTTGGCATAGCCTCAGACTTTT
TGGTTTGTCTTTGGAATTGTTGGTTCCTCATCTCAAGGCTGAAGGAATAGGTCAAATGTT
GTCTCCAACAAATGCAGCGGCATATCGCAAAAGCTATATGGCTACAACCGTTGTCTAAAC
ATTGATGAAAACCACGATATATAGATGGGCACAAATCTTTGTGATTGTGGATTTGTTAAA
TAGTATTGCAATATGTTACTGAAGTAACCTTTCCGTATCTACTTGTAAACGTAA*TAGGA
AGAATATGCATGGGGTGACAATTATTTTGAATAAAACAATAAAG
G

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4AG66TF 657 0 0
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CACAGAAGTTATGAAGTCCTTCTATGTTCTACGCAAGCCAATGTCAGCAACAGTAAACAC
ATTAGGGAATTCATTTTGGCAAGTGCTAATTGCATCAACGGACGAAGCAAAAGAAGCGAT
GCGACAAGGCTGCTTTGATTACCTATCTAGTGGTGGGTTTCGCACGTCAGGCTTGATGGC
TGTGTTTGGTGGCATGAACCCTAGGCCACTTTCTCTCATCTATCATCTATCCGTTATTAC
TTTATCCTCCATTGGCCAACTGCTCTCTCCGTTCCCAACTCCTCTTCGTGTTTGGCATAG
CCTCAGACTTTTTGGTTTGTCTTTGGAATTGTTGGTTCCTCATCTCAAGGCTGAAGGAAT
AGGTCAAATGTTGTCTCCAACAAATGCAGCGGCATATCGCAAAAGCTATATGGCTACAAC
CGTTGTCTAAACATTGATGAAAACCACGATATATAGATGGGCACAAATCTTTGTGATTGT
GGATTTGTTAAATAGTATTGCAATATGTTACTGAAGTAACCTTTCCGTATCTACTTGTAA
ACGTAA*TAGGAAGAATATGCATGGGGTGACAATTATTTTGAATAAAACAATAAAG
G

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 3

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TTCAAAGCAAACATTTCTTTTAGTAAAATCTTATCTTATTTACCTTACAATAAAGCAAAC
ATGAAAGACAATACAAGCTGGTCATGTTCTTGTTTTTCAGTAAAACTATGCTTGTTGTCC
CTTCTCTTTCTCACTGAGACACTCGTCGCCATAAAGCTACCGCCAAACTTGAAGTTTCCA
GCGCTAATAGCTTTCGGTGACTCCATTGTCGACACCGGAAATAATAACAATGTCAAAACC
GTAGTTAAGAGCGATTTTCAGCCTTACGGTATCAATTTCCAAGGCGGAGTTCCCACCGGG
AGATTTTGCGACGGACGAGTCCCCACCGATTTGATTGCCGAAGAATTGGGAATAAAATCA
GTTGTACCTGCATATCTCGATCCAAGCTTAAAGACTGAAGATATTTTAACCGGTGTATCA
TTTGCGTCGGGAGGTTCTGGTTACGATCCTTTAACACCCAAACTCGTGGCAGTAATATCA
TTAGAACAGCAATTAAAATATTTCGAGCAGTACATAGAGAAAGTGAAGAATATAGTTGGG
GAAGAAAGAAAAGGGTTCATATTAGCCAACAGCTTGTTCTTATTGGTCGCAGGCAGCGAC
GACATAGCCAACACTTACTACGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCGATTCGTAC
ACTACTTTTATGGCCAACTCTGCCACAGATTTTGTGAATAAACTATACGGATATGGAGTG
AGAAGAATAGCCGTGTTTGGTGCACCACCACTTGGTTGTGTACCATCACAGAGAACCTTA
GGAGGAGGTCTTGTGAGAGAATGTGCTGAGAATTACAACGAAGCAGCAAAGCTTTTTAAT
TCAAAGATCTCCACAAAATTGGATTTGTTGCATAAAAACCTACCGGGTATCAAACCGGTC
TACATTAATATCTATGACCCTCTTCTCGATATCATCCAGAGTCCTGCAAAATACGGATTT
GGAGTGTCTAATAAAGGATGCTGTGGAACTGGACTCGTAGAAGTTGCTGTCCTGTGCAAT
AAAATCACATCTTCTGTATGTTCCGACTTGTCTAGCCATGTGTTTTGGGACAGTTATCAT
CCCACAGAAAAAACTTACAAGGTGTTAATCTCACTGTTGATTAGCAAATTTATTGATCAG
TTTGTCTGAATATAAACTAAAGTTCTTGTATTTGCTCTAATAAAGGTTGTTTCATTTTGG
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4DS60TF U 1
AF RR4CQ53TF U 80
AF RR4CQ53JQ C 539
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DS 

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CATTCGTCGCCATAAAGCTACCGCCAAACTTGACGTTTCCAGCGCTAATAGCTTTCGGTG
ACTCCATTGTCGACACCGGAAATAATAACAATGTCAAAACCGTAGTTAAGAGCGATTTTC
AGCCTTACGGTATCAATTTCCAAGGCGGAGTTCCCACCGGGAGATTTTGCGACGGACGAG
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ATCCAAGCTTAAAGACTGAAGATCTTTTAACCGGTGTATCATTTGCGTCGGGAGGTTCTG
GTTACGATCCTTTAACACCCAGACTCGTGGCAGTAATATCATTAGAACAGCAATTAAAAT
ATTTCGAGCAGTACATAGAGAAAGTGAAGAATATAGTTGGGGAAGAAAGAAAAGGGTTCA
TATTAGCCAACAGCTTGTTCTTATTGGTCGCAGGCAGCGACGACATAGCCAACACTTACT
ACGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCGATTCGTACACTACTTTTATGGCCA*CT
CTGCCACAGATTTTGTGA*TAAACTATACGGATATGGAGTGAGAAGAATAGCCGTGTTTG
TGCACACCACTT

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DS 

RD RR4CQ53JQ 724 0 0
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ACGACATAGCCAACACTTACTACGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCGATTCGT
ACACTACTTTTATGGCCAACTCTGCCACAGATTTTGTGAATAAACTATACGGATATGGAG
TGAGAAGAATAGCCGTGTTTGGTGCACCACCACTTGGTTGTGTACCATCACAGAGAACCT
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ATTCAAAGATCTCCACAAAATTGGATTTGTTGCATAAAAACCTACCGGGTATCAAACCGG
TCTACATTAATATCTATGACCCTCTTCTCGATATCATCCAGAGTCCTGCAAAATACGGAT
TTGGAGTGTCTAATAAAGGATGCTGTGGAACTGGACTCGTAGAAGTTGCTGTCCTGTGCA
ATAAAATCACATCTTCTGTATGTTCCGACTTGTCTAGCCATGTGTTTTGGGACAGTTATC
ATCCCACAGAAAAAACTTACAAGGTGTTAATCTCACTGTTGATTAGCAAATTTATTGATC
AGTTTGTCTGAATATAAACTAAAGTTCTTGTATTTGCTCTAATAAAGGTTGTTTCATTTT
GGAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 4

CO CL2789Contig1 1363 4 14 U
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CTCGATGGTCCTCCAGGCACAACCGAAAGAGCTGTTATGGTTTCTGGAAAAGAAGAGCCC
GAATCATCTCTACCTCCTTCTATGGATGGCCTTCTGAGAGTCCACATGCGGATAGTTGAT
GGTCTGGATGGTGAAGCTTCTCAGGCTCCTCCGCCTACAAAGGTTTCCACAAGATTACTG
GTTCCAGCATCTCAGGCAGGAAGTTTGATTGGAAAACAGGGAGCTACAGTTAAAGCCATT
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CTTCAAGACGATAGGGTGGTTGAAGTTGTGGGGGAACCAACAAGCGTTCATAAATCCTTG
GAGCTGATTGCATCACATCTCAGAAAGTTTTTGGTTGATCGTAGCATCATTCCAGTCTTT
GAAAGTCAGATGCAAAAGCCAACTCGCCAGATGGATCATATGCCACCGCCACACCAGGCC
TGGGGTCCACCTCAAGGCCATGCCCCAAGTGGTGGTGGAGGTCCTGGCTATGGTCACAAC
CCACCTCCATATATGCAGCAACCACCTCCAAGACATGATAATTACTATCCTCCTCCTGAG
ATGCGTCAACCTCAAATGGAGAAACAGCCTCATCAAGGTATATCTGCTTATGGAAGGGAG
CCTCCTATGAATGTGCATGTATCAGCCGCCCAACCCATGGCCCCCCAGCAAGTTATGCAG
CAATTGCAGATTCAACTGTCTTACGCAGATGCAGTGATTGGGACATCAGGTTCAAACATA
AGCTACACTCGACGTCTTAGTGGAGCAACAGTAACCATTCAGGAAACCAGAGGAGTACCT
GGTGAAATGACCGTTGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTCCAAACCGCTATTCAGCTT
ATCCAGAACTTCATGGCTGAAGCTGGAGCGCCAGCACCAGCACAGCCGCAAACTGTAGCA
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ACGAACCCACCTGGAGGATACGCTACGGATTACAGCTCAGGCTATGGTTACTGATCAAGG
ATCATTATCAAGTTACTTTTGTTTAGAATGTTCTACTAGTGACAAGCAAGAGTGAGAGAA
CCCTAATCGAGTATATGTTTTTATAAGCGAGCACTCTGTTTCTTGAATCAGTTGTCATTT
GTTTTCCAGGCATGGTGTTATGTACCGTTCAGTATTTGTCTTTATGAATTTGAACTAGTA
GCCATATTTGTTCTTGAACGAAATTTCAAATCTTCAGTTTCAC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV96TF U 1
AF RR4GN89TF U 463
AF RR4GN89JQ C 544
AF RR4BV96JQ C 855
BS 1 683 RR4BV96TF
BS 684 684 RR4GN89TF
BS 685 697 RR4BV96TF
BS 698 698 RR4GN89TF
BS 699 710 RR4BV96TF
BS 711 1080 RR4GN89TF
BS 1081 1081 RR4GN89JQ
BS 1082 1120 RR4GN89TF
BS 1121 1121 RR4GN89JQ
BS 1122 1139 RR4GN89TF
BS 1140 1140 RR4GN89JQ
BS 1141 1157 RR4GN89TF
BS 1158 1251 RR4GN89JQ
BS 1252 1363 RR4BV96JQ

RD RR4BV96TF 710 0 0
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CTCGATGGTCCTCCAGGCACAACCGAAAGAGCTGTTATGGTTTCTGGAAAAGAAGAGCCC
GAATCATCTCTACCTCCTTCTATGGATGGCCTTCTGAGAGTCCACATGCGGATAGTTGAT
GGTCTGGATGGTGAAGCTTCTCAGGCTCCTCCGCCTACAAAGGTTTCCACAAGATTACTG
GTTCCAGCATCTCAGGCAGGAAGTTTGATTGGAAAACAGGGAGCTACAGTTAAAGCCATT
CAAGAAGCAGCTGGTTGTATAGTAAGAGTCCTCGGATCAGAGGATTTGCCTGTTTTTGCT
CTTCAAGACGATAGGGTGGTTGAAGTTGTGGGGGAACCAACAAGCGTTCATAAATCCTTG
GAGCTGATTGCATCACATCTCAGAAAGTTTTTGGTTGATCGTAGCATCATTCCAGTCTTT
GAAAGTCAGATGCAAAAGCCAACTCGCCAGATGGATCATATGCCACCGCCACACCAGGCC
TGGGGTCCACCTCAAGGCCATGCCCCAAGTGGTGGTGGAGGTCCTGGCTATGGTCACAAC
CCACCTCCATATATGCAGCAACCACCTCCAAGACATGATAATTACTATCCTCCTCCTGAG
ATGCGTCAACCTCAAATGGAGAA*CAGCCTCATCAAG*TATATCTGCTTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4GN89TF 695 0 0
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CCTGGCTATGGTCACAACCCACCTCCATATATGCAGCAACCACCTCCAAGACATGATAAT
TACTATCCTCCTCCTGAGATGCGTCAACCTCAAATGGAGAAACAGCCTCATCAAGGTATA
TCTGCTTATGGAAGGGAGCCTCCTATGAATGTGCATGTATCAGCCGCCCAACCCATGGCC
CCCCAGCAAGTTATGCAGCAATTGCAGATTCAACTGTCTTACGCAGATGCAGTGATTGGG
ACATCAGGTTCAAACATAAGCTACACTCGACGTCTTAGTGGAGCAACAGTAACCATTCAG
GAAACCAGAGGAGTACCTGGTGAAATGACCGTTGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTC
CAAACCGCTATTCAGCTTATCCAGAACTTCATGGCTGAAGCTGGAGCGCCAGCACCAGCA
CAGCCGCAAACTGTAGCACCAGAGCAGCAAGGCTATAACCCTTACGCAACTCATGGCTCA
GTTTATGCAGCGGCTCCA*CGAACCCACCTGGAGGATACGCTACGGATTACAGCTCAG*C
TATGGTTACTGATCAAG*ATCATTATCAAGTTACT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GN89JQ 708 0 0
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CCTCCATATATGCAGCAACCACCTCCAAGACATGATAATTACTATCCTCCTCCTGAGATG
CGTCAACCTCAAATGGAGAAACAGCCTCATCAAGGTATATCTGCTTATGGAAGGGAGCCT
CCTATGAATGTGCATGTATCAGCCGCCCAACCCATGGCCCCCCAGCAAGTTATGCAGCAA
TTGCAGATTCAACTGTCTTACGCAGATGCAGTGATTGGGACATCAGGTTCAAACATAAGC
TACACTCGACGTCTTAGTGGAGCAACAGTAACCATTCAGGAAACCAGAGGAGTACCTGGT
GAAATGACCGTTGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTCCAAACCGCTATTCAGCTTATC
CAGAACTTCATGGCTGAAGCTGGAGCGCCAGCACCAGCACAGCCGCAAACTGTAGCACCA
GAGCAGCAAGGCTATAACCCTTACGCAACTCATGGCTCAGTTTATGCAGCGGCTCCAACG
AACCCACCTGGAGGATACGCTACGGATTACAGCTCAGGCTATGGTTACTGATCAAGGATC
ATTATCAAGTTACTTTTGTTTAGAATGTTCTACTAGTGACAAGCAAGAGTGAGAGAACCC
TAATCGAGTATATGTTTTTATAAGCGAGCACTCTGTTTCTTGAATCAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BV96JQ 509 0 0
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TGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTCCAAACCGCTATTCAGCTTATCCAGAACTTCAT
GGCTGAAGCTGGAGCGCCAGCACCAGCACAGCCGCAAACTGTAGCACCAGAGCAGCAAGG
CTATAACCCTTACGCAACTCATGGCTCAGTTTATGCAGCGGCTCCAACGAACCCACCTGG
AGGATACGCTACGGATTACAGCTCAGGCTATGGTTACTGATCAAGGATCATTATCAAGTT
ACTTTTGTTTAGAATGTTTTACTAGTGACAAGCAAGAGTGAGAGAACCCTAATCGAGTAT
ATGTTTTTATAAGCGAGCACTCTGTTTCTTGAATCAGTTGTCATTTGTTTTCCAGGCATG
GTGTTATGTACCGTTCAGTATTTGTCTTTATGAATTTGAACTAGTAGCCATATTTGTTCT
TGAACGAAATTTCAAATCTTCAGTTTCAC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 2 4

CO CL2790Contig1 530 2 1 U
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ACAAGAGCCCTAGTTCGTGGCACGATGATCATTCCAGTTCGTTGCTTTACTTGTGGAAAG
GTGATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTACACCGAAGGG
GATGCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCAC
GTCGATCTTATTGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTCGAGAAATCTGATGCCAATTAA
AAGATTGCTATTACCAATAACAGATGAGCAAGAGCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAAT
GATGATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTTTTTAGGAACTTGGGTCTAGTTTGGATTGGC
CACAAGTAAAGCTCGAGCTCTCTTGTAGATTCGTCCTCTTTTGATGATTTGCTTTTGATA
ATCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGATCATAAATACATAAGATTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E151TF U 1
AF RR4E151JQ C 155
BS 1 530 RR4E151TF

RD RR4E151TF 530 0 0
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ACAAGAGCCCTAGTTCGTGGCACGATGATCATTCCAGTTCGTTGCTTTACTTGTGGAAAG
GTGATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTACACCGAAGGG
GATGCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCAC
GTCGATCTTATTGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTCGAGAAATCTGATGCCAATTAA
AAGATTGCTATTACCAATAACAGATGAGCAAGAGCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAAT
GATGATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTTTTTAGGAACTTGGGTCTAGTTTGGATTGGC
CACAAGTAAAGCTCGAGCTCTCTTGTAGATTCGTCCTCTTTTGATGATTTGCTTTTGATA
ATCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGATCATAAATACATAAGATTTTGC

QA 1 530 1 530
DS 

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CTCTCGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAGATTGCTATTACCAATAACAGATGAGCAAGAG
CAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAATGATGATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTTTTTA
GGAACTTGGGTCTAGTTTGGATTGGCCACAAGTAAAGCTCGAGCTCTCTTGTAGATTCGT
CCTCTTTTGATGATTTGCTTTTGATAATCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGATCATAA
ATACATAAGATTTTGC

QA 1 376 1 376
DS 



CO CL2790Contig2 539 2 1 U
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AGAGCTCTAGTTCGTGGCACGATGATCATTCCAGTTCGTTGCTTTACTTGTGGAAAGGTG
ATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTACACCGAAGGGGAT
GCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCACGTC
GATCTTATTGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTCGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAG
ATTGCTATTACCAATAACAGATGAGCAAGAGCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAATGAT
GATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTTTTTAGGAACTTTGGTCTAGTTTGGATTGGCCAC
AAGTAAAGCTCGAGCTATCTTGTAGATTCGTCCTCTGTTGATGATCTGCTTTTGATAATC
TAGTCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGAATATAAATACATATTTTACATTCCTAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EF34JQ C 1
AF RR4EF34TF U 1
BS 1 539 RR4EF34TF

RD RR4EF34JQ 539 0 0
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GATCTTATTGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTCGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAG
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GATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTTTTTAGGAACTTTGGTCTAGTTTGGATTGGCCAC
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QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4EF34TF 539 0 0
GGAACGCAAGAGCGAAAGAGAAAACCCTAAAAAATAAGAAATCGCAAGAGCGGCGACACA
AGAGCTCTAGTTCGTGGCACGATGATCATTCCAGTTCGTTGCTTTACTTGTGGAAAGGTG
ATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTACACCGAAGGGGAT
GCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCACGTC
GATCTTATTGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTCGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAG
ATTGCTATTACCAATAACAGATGAGCAAGAGCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAATGAT
GATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTTTTTAGGAACTTTGGTCTAGTTTGGATTGGCCAC
AAGTAAAGCTCGAGCTATCTTGTAGATTCGTCCTCTGTTGATGATCTGCTTTTGATAATC
TAGTCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGAATATAAATACATATTTTACATTCCTAACC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 4

CO CL2791Contig1 514 4 15 U
GAAACAACCATAAAAAGTTCCGACTGAAACTTCAGTTACAAACCCCATAACACTATTTGG
AACCATACATAGCCACACACGGATACAACATGTAGATAACAACAGGGGTAATAGCACCGG
CCAAACAACCGGCGAAATGAGCCATTATTTCATATAACCAAGACATAACATAACATTAGG
TTTACTGCAGAGTTTGGAGGTTGTTCATTTACAGGTGCAGTTGTCGCACTTGCAGTCAGA
TCCGCATTTGCAGCCATCATTCTCGGCGAAGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGTACTGGGA
GTTCATAGACGGAGCAACGCCGAGGATAAGAGTCTCGGTGGTGGTAGTCTCGCCTGAGAA
GCCCAAGTCTGGGTACATTTTGCAACCTTTGCAGCCATCGCACTTGCAGTCAGATCCGCA
GCTACAGTTTCCTCCACAGCAAGACATCGTCTCTAAGAAACTTTGAAGAAATCTAAAATG
TTAATTTTGCTTTGAGAGAGAGATACTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC74TF C 1
AF RR4FA96JQ U 4
AF RR4FX83JQ U 1
AF RR4FX83TF C 1
BS 1 5 RR4CC74TF
BS 6 72 RR4FA96JQ
BS 73 73 RR4FX83JQ
BS 74 282 RR4FA96JQ
BS 283 283 RR4FX83JQ
BS 284 291 RR4FA96JQ
BS 292 292 RR4FX83JQ
BS 293 297 RR4FA96JQ
BS 298 298 RR4FX83JQ
BS 299 406 RR4FA96JQ
BS 407 407 RR4FX83JQ
BS 408 450 RR4FA96JQ
BS 451 451 RR4FX83JQ
BS 452 507 RR4FA96JQ
BS 508 514 RR4CC74TF

RD RR4CC74TF 514 0 0
GAAACAACCATAAAAAGTTCCGACTGAAACTTCAGTTACAAACCCCATAACACTATTTGG
AACCATACATAGTCACACACGGATACAACATGTAGATAACAACAGGGGTAATAGCACCGG
CCAAACAACCGGCGAAATGAGCCATTATTTCATATAACCAAGACATAACATAACATTAGG
TTTACTGCAGAGTTTGGAGGTTGTTCATTTACAGGTGCAGTTGTCGCACTTGCAGTCAGA
TCCGCATTTGCAGCCATCATTCTCGGCGAAGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGTACTGGGA
GTTCATAGACGGAGCAACGCCGAGGATAAGAGTCTCGGTGGTGGTAGTCTCGCCTGAGAA
GCCCAAGTCTGGGTACATTTTGCAACCTTTGCAGCCATCGCACTTGCAGTCAGATCCGCA
GCTACAGTTTCCTCCACAGCAAGACATCGTCTCTAAGAAACTTTGAAGAAATCTAAAATG
TTAATTTTGCTTTGAGAGAGAGATACTGAGATCC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4FA96JQ 511 0 0
AC
AACCATAAAAAGTTCCGACTGAAACTTCAGTTACAAACCCCATAACACTATTTGGAACCA
TACATAGTCACACACGGATACAACATGTAGATAACAACAGGGGTAATAGCACCGGCCAAA
CAACCGGCGAAATGAGCCATTATTTCATATAACCAAGACATAACATAACATTAGGTTTAC
TGCAGAGTTTGGAGGTTGTTCATTTACAGGTGCAGTTGTCGCACTTGCAGTCAGATCCGC
ATTTGCAGCCATCATTCTCGGCGAAGAAAGTCTCGCCCGAAGCCTCATACTGAGAGTTCA
TAGACGGAGCAACGCCGAGGATAAGAGTCTCGGTGGTGGTAGTCTCGCCTGAGAAGCCCA
AGTCTGGGTACATTTTGCAACCTTTGCAGCCATCGCACTTGTAGTCAGATCCGCAGCTAC
AGTTTCCTCCACAGCAAGACATCGTTTCTAAGAAACTTTGAAGAAATCTAAAATGTTAAT
TTTGCTTTGAGAGAGAGATACT
GAGATCC

QA 3 504 3 504
DS 

RD RR4FX83JQ 509 0 0
GGAAA
AACCATAAAAAGTTCCGACTGAAACTTCAGTTACAAACCCCATAACACTGTTTGGAACCA
TACATAGCCACACACGGATACAACATGTAGATAACAACAGGGGTGATAGCACCGGCCAAA
CAACCGGCGAAATGAGCCATTATTTCATATAACCAAGACATAACATAACATTAGGTTTAC
TGCAGAGTTTGGAGGTTGTTCATTTACAGGTGCAGTTGTCGCACTTGCAGTCAGATCCGC
ATTTGCAGCCATCATTCTCGGCGAAAAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGTACTGGGAGTTCA
TAGACGGAGCAACGCCGAGGATAAGAGTCTCGGTGGGGGTAGTCTCGCCTGAGAAGCCCA
AGTCTGGGTACATTTTGCAACCTTTGCAGCCATCGCACTTGCAGTCAGATCCGCAGCTAC
AGTTTCCTCCACAGCAAGACATCGTCTCTAAGAAACTTTGAAGAAATCTAAAATGTTAAT
TTTGCTTTGAGAGAGAGATACT
CC

QA 6 507 6 507
DS 

RD RR4FX83TF 509 0 0
GGAAA
AACCATAAAAAGTTCCGACTGAAACTTCAGTTACAAACCCCATAACACTGTTTGGAACCA
TACATAGCCACACACGGATACAACATGTAGATAACAACAGGGGTGATAGCACCGGCCAAA
CAACCGGCGAAATGAGCCATTATTTCATATAACCAAGACATAACATAACATTAGGTTTAC
TGCAGAGTTTGGAGGTTGTTCATTTACAGGTGCAGTTGTCGCACTTGCAGTCAGATCCGC
ATTTGCAGCCATCATTCTCGGCGAAGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGTACTGGGAGTTCA
TAGACGGAGCAACGCCGAGGATAAGAGTCTCGGTGGTGGTAGTCTCGCCTGAGAAGCCCA
AGTCTGGGTACATTTTGCAACCTTTGCAGCCATCGCACTTGCAGTCAGATCCGCAGCTAC
AGTTTCCTCCACAGCAAGACATCGTCTCTAAGAAACTTTGAAGAAATCTAAAATGTTAAT
TTTGCTTTGAGAGAGAGATACT
CC

QA 6 507 6 507
DS 



AS 2 4

CO CL2792Contig1 751 2 22 U
GGTCAACAGTCCAAGCAAACTGATTCGTAAAGAGAATGTATAAAGACTGGTAAAAAAAAG
CGCTACGCTAATAATACTGATACACATTAATGTTACAACAAAACCAATCTCCCACTCCAC
CAATGGAAACTGGCTACAGCTTCACGGATCAGAACCTGTTTTGATGGTCTGATTCTGTCC
CTCTAGCAAGCTTATTTGTCGCCTAAGTTTAGCAATATGAGCTTGAACCTGTTGACGAGC
AGCCGCAAGCTGTAACAACTCATCGGCTTCAGAGAAGCTCGTGAACCATTGTCCCAAGCT
ATGATCTTTAGTATCACCTCTCTTCTTTTTCCCGTTATCATCAACTTGCATAGGAGCAGG
CAAGCTGTAACCAGAAGGCAATCTAGGAAACGTCAAAGCAGGGTGATTCTGAACCCTAGC
AAGAAAACTTTCAGAAGGATCAGGAAACACAATCTCGTCGTAGTGTTCGACAACCACAGG
CTTCTTCATCGTCAAAGGACCTGATTCATCTTCTGGGTATAACTTCAAGTGATGATATAA
ACTCAATGGCTTGTCACAGACGTCGCTGTGGAAATGCAATGTGATAGCAATCTCGAATTC
TCCCCAGCCAGATTCGGACACCTCGAAAGGAGGCTCCTCGATGACTCTTGTTGGGTTGTT
GAAACTAGAATGAAGCTGGAAGACGACTTTCTTGATTACAACACTGATGTCTTCGTTTGT
TGCCCCACGAACATATACAGCCCATTTGTGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B178JQ U 1
AF RR4CR22JQ U 2
BS 1 26 RR4B178JQ
BS 27 27 RR4CR22JQ
BS 28 41 RR4B178JQ
BS 42 42 RR4CR22JQ
BS 43 58 RR4B178JQ
BS 59 59 RR4CR22JQ
BS 60 73 RR4B178JQ
BS 74 74 RR4CR22JQ
BS 75 200 RR4B178JQ
BS 201 201 RR4CR22JQ
BS 202 342 RR4B178JQ
BS 343 343 RR4CR22JQ
BS 344 364 RR4B178JQ
BS 365 365 RR4CR22JQ
BS 366 450 RR4B178JQ
BS 451 451 RR4CR22JQ
BS 452 468 RR4B178JQ
BS 469 469 RR4CR22JQ
BS 470 489 RR4B178JQ
BS 490 490 RR4CR22JQ
BS 491 618 RR4B178JQ
BS 619 751 RR4CR22JQ

RD RR4B178JQ 618 0 0
GGTCAACAGTCCAAGCAAACTGATTCTTAAAGAGAATGTATCAAGACTGGTAAAAAAA*G
CGCTACGCTAATAGTACTGATACACATTAATGTTACAACAAAACCAATCTCCCACTCCAC
CAATGGAAACTGGCTACAGCTTCACGGATCAGAACCTGTTTTGATGGTCTGATTCTGTCC
CTCTAGCAAGCTTATTTGTCTCCTAAGTTTAGCAATATGAGCTTGAACCTGTTGACGAGC
AGCCGCAAGCTGTAACAACTCATCGGCTTCAGAGAAGCTCGTGAACCATTGTCCCAAGCT
ATGATCTTTAGTATCACCTCTCTTCTTTTTCCCGTTATCATCGACTTGCATAGGAGCAGG
CAAGTTGTAACCAGAAGGCAATCTAGGAAACGTCAAAGCAGGGTGATTCTGAACCCTAGC
AAGAAAACTTTCAGAAGGATCAGGAAACACGATCTCGTCGTAGTGTTCTACAACCACAGG
CTTCTTCATTGTCAAAGGACCTGATTCATCTTCTGGGTATAACTTCAAGTGATGATATAA
ACTCAATGGCTTGTCACAGACGTCGCTGTGGAAATGCAATGTGATAGCAATCTCGAATTC
TCCCCAGCCAGATTCGGA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4CR22JQ 750 0 0
GTCAACAGTCCGAGCAAACTGATTCGTAGAGAGAATGTATAAAGACTGGTAAAAAAAAGC
GCTACGCTAATAATACTGATACACATTAATGTTACAACAAAACCAATCTCCCACTCCACC
AGTGGAAACTGGCTACAGCTTCACGGATCAGAACCTGTTTTGATGGTCTGATTCTGTCCC
TCTAGCAAGCTTATTTGTCGCCTGAGTTTAGCAATATGAGCTTGAACCTGTTGACGAGCA
GCCGCAAGCTGTAACAACTCATCGGCTTCAGAGAAGCTCGTGAACCATTGTCCCAAGCTA
TGATCTTTAGTATCACCTCTCTTCTTTTTCCCGTTATCATCAACTTGCATAGGAGCAGGT
AAGCTGTAACCAGAGGGTAATCTAGGAAACGTCAAAGCAGGGTGATTCTGAACCCTAGCA
AGAAAACTTTCAGAAGGGTCAGGAAACACAATCTCGTCGTAGTGTTCGACAACCACAGGC
TTCTTCATCGTCAAAGGACCTGATTCATCTTCTGGGTATAACTTCAAGTGATGATATAAA
CTCAATGGCTTGTCACAGACGTCGCTGTGGAAATGCAATGTGATAGCAATCTCGAATTCT
CCCCAGCCAGATTCGGACACCTCGAAAGGAGGCTCCTCGATGACTCTTGTTGGGTTGTTG
AAACTAGAATGAAGCTGGAAGACGACTTTCTTGATTACAACACTGATGTCTTCGTTTGTT
GCCCCACGAACATATACAGCCCATTTGTGA

QA 1 750 1 750
DS 



CO CL2792Contig2 854 2 19 U
GGGGGTTTCTGTGAACCCATCGGAAAAATAAAAAAAAAAGGGAAAGAGAGAGAGAGAACC
AAACTGAGAGTTTCTCTACTGTTACGTTTTTCGACGCTTCCAACCTCTTAACTTTGTCCG
AATGAAATCATCAGTTACGCACAAGGAATGACGAGTAACTCGTCATCTAAGAAACAAGCT
CAAGATCCGCCTGAAACCTCCGAGCCCACTTTGAAATCCCTCAGAACCAAGATGACCAAA
TCCGACGAAAAGAAGAAGCTTAAAGACATTGAGATAAGCGTTCCACTTGTCTATGGTAAC
ATTGCTTTCTGGCTCGGCAAGAAGGCTAGCGAATACCAATCTCACAAATGGGCTGTATAT
GTTCGTGGGGCAACAAACGAAGACATCAGTGTTGTAATCAAGAAAGTCGTCTTCCAGCTT
CATTCTAGTTTCAACAACCCAACAAGAGCCATCGAGGAGCCTCCATTCGAGGTCTCCGAA
TCTGGCTGGGGAGAATTCGAGATTGCTATCACATTGCATTTCCACAGCGACGTCTGTGAC
AAGCCATTGAGTTTATATCATCACTTGAAGTTATACCCAGAAGATGAATCAGGTCCTTTG
ACAATGAAGAAGCCTGTGGTTGTAGAACACTACGACGAGATCGTGTTTCCTGATCCTTCT
GAAAGTTTTCTTGCTAGGGTTCAGAATCACCCTGCTTTGACGTTTCCTAGATTGCCTTCT
GGTTACAACTTGCCTGCTCCTATGCAAGTCGATGATAACGGGAAAAAGAAGAGAGTGATA
CTAAAGATCATAGCTTGGGACATGGTTCACGAGCTTCTCTGAGCCGATGAGTTGTTACAG
CTTGCGGCTGCTCG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR22TF U 3
AF RR4B178TF U 1
BS 1 38 RR4B178TF
BS 39 39 RR4CR22TF
BS 40 43 RR4B178TF
BS 44 44 RR4CR22TF
BS 45 85 RR4B178TF
BS 86 88 RR4CR22TF
BS 89 110 RR4B178TF
BS 111 111 RR4CR22TF
BS 112 157 RR4B178TF
BS 158 158 RR4CR22TF
BS 159 171 RR4B178TF
BS 172 172 RR4CR22TF
BS 173 173 RR4B178TF
BS 174 174 RR4CR22TF
BS 175 413 RR4B178TF
BS 414 414 RR4CR22TF
BS 415 440 RR4B178TF
BS 441 441 RR4CR22TF
BS 442 854 RR4B178TF

RD RR4CR22TF 587 0 0
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CGACGAAAAGAAGAAGCTTAAAGACATTGAGATAAGCGTTCCACTTGTCTATGGTAACAT
TGCTTTCTGGCTCGGCAAGAAGGCTATCGAATACCAATCTCACAAATGGGCTGTATATGT
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TGGCTGGGGAGAATTCGAGATTGCTATCACATTGCATTTCCACAGCGACGTCTGTGACAA
GCCATTGAGTTTATATCATCACTTGAAGTTATACCCAGAAGATGAAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4B178TF 854 0 0
GGGGGTTTCTGTGAACCCATCGGAAAAATAAAAAAAAA*GGGAGAGAGAGAGAGAGAACC
AAACTGAGAGTTTCTCTACTGTTAC***TTTCGACGCTTCCAACCTCTTACCTTTGTCCG
AATGAAATCATCAGTTACGCACAAGGAATGACGAGTAGCTCGTCATCTAAGGAGCAAGCT
CAAGATCCGCCTGAAACCTCCGAGCCCACTTTGAAATCCCTCAGAACCAAGATGACCAAA
TCCGACGAAAAGAAGAAGCTTAAAGACATTGAGATAAGCGTTCCACTTGTCTATGGTAAC
ATTGCTTTCTGGCTCGGCAAGAAGGCTAGCGAATACCAATCTCACAAATGGGCTGTATAT
GTTCGTGGGGCAACAAACGAAGACATCAGTGTTGTAATCAAGAAAGTCGTCTTTCAGCTT
CATTCTAGTTTCAACAACCCCACAAGAGCCATCGAGGAGCCTCCATTCGAGGTCTCCGAA
TCTGGCTGGGGAGAATTCGAGATTGCTATCACATTGCATTTCCACAGCGACGTCTGTGAC
AAGCCATTGAGTTTATATCATCACTTGAAGTTATACCCAGAAGATGAATCAGGTCCTTTG
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GAAAGTTTTCTTGCTAGGGTTCAGAATCACCCTGCTTTGACGTTTCCTAGATTGCCTTCT
GGTTACAACTTGCCTGCTCCTATGCAAGTCGATGATAACGGGAAAAAGAAGAGAGTGATA
CTAAAGATCATAGCTTGGGACATGGTTCACGAGCTTCTCTGAGCCGATGAGTTGTTACAG
CTTGCGGCTGCTCG

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 4

CO CL2793Contig1 668 4 3 U
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GTTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BQ73JQ C 16
AF RR4BQ73TF U 16
AF RR4GA95JQ C 1
AF RR4GA95TF U 1
BS 1 15 RR4GA95TF
BS 16 658 RR4BQ73TF
BS 659 668 RR4GA95TF

RD RR4BQ73JQ 643 0 0
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AACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATATCTATGATG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BQ73TF 643 0 0
ACAAAGAACAGAACCAGAGTTACACATATGGGGTCAATAAAGATTCCCAAAACCCTCAAC
GGGCACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGATGACTCACTCCCATGGA
TTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAGGCTTGCGTACAAATGC
TGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGATCAACACAAGGAATGG
TCCTTCGCCATGTCGCTATTCCACACATTTTTCTACTGCAACTTCCATACAGGATACGGA
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AAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACTTGAGACAGTGGAAGACCAAATTT
TTTAGTAACAAGTACGGTAACGAGAGGTGGAATGAGTATGTTGAACATGATGTCCTCCAG
AAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATGAAGATCGTAACAGCGT
CGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATTCGTGTTAATAAAACCGAAAAATATGATGTGT
AACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATATCTATGATG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4GA95JQ 668 0 0
GGGAGTGGGCAAAAAACAAAGAACAGAACCAGAGTTACACATATGGGGTCAATAAAGATT
CCCAAAACCCTCAACGGGCACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGATG
ACTCACTCCCATGGATTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAGG
CTTGCGTACAAATGCTGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGAT
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TGTGGGGACAGGGAGAAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACTTGAGACAG
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CATGATGTCCTCCAGAAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATGA
AGATCGTAACAGCGTCGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATTCGTGTTAATAAAACCG
AAAAATATGATGTGTAACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATATCTATGATGAT
GTTTTTTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GA95TF 668 0 0
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CCCAAAACCCTCAACGGGCACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGATG
ACTCACTCCCATGGATTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAGG
CTTGCGTACAAATGCTGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGAT
CAACACAAGGAATGGTCCTTCGCCATGTCGCTATTCCACACATTTTTCTACTGCAACTTC
CATACAGGATACGGACGTGTGGACAAGCAGCTAGTTGCGTCGTGGGAGATGAAAGAGCAG
TGTGGGGACAGGGAGAAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACTTGAGACAG
TGGAAGACCAAATTTTT*AGTAACAAGTACGGTAACGAGAGGTGGAATGAGTATGTTGAA
CATGATGTCCTCCAGAAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATGA
AGATCGTAACAGCGTCGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATTCGTGTTAATAAAACCG
AAAAATATGATGTGTAACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATATCTATGATGAT
GTTTTTTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 3

CO CL2794Contig1 1309 3 15 U
GAACCTCCTAAGCCATGAAAAGCCGCAAAGCCTTTTCTTTCTTCTTCATTTCTCATTGCT
TTCGACCAAGATCGATCGTAGAGAAGTCTACCTCGTAGACCTCTCTCTCAACTTGAACTC
CCATTTCTTCTTGCAAACATCAAATATGCGTCCCTCGGTGTTTGTTCTCTTCATTTGTCT
CGTTGTTGCACCAGCCGTATCGGCTGATGTAGCTATCTTGAGAACGGATTACTACCAAAA
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ACCAACAACTGCGGCAGGGACGCTCCGTCTCTTTTTCCACGATTGTTTCCTTGAAGGTTG
CGATGCGTCTGTTTTAATAGCCACCAACTCGTTTAACAAAGCCGAACGTGACGATGATCT
CAACGACTCCCTCCCAGGAGATGCTTTCGACATTGTCAACCGCATCAAGACAGCTTTAGA
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CCACGGGATGTTCATGAAAAACGGGTTTAGTCTACGTGAGATGGTAGCATTAAGTGGAGC
TCACACGATCGGATTTTCCCACTGCAAAGAGTTTAGTGACCGTCTCTATGGATCAAAAGC
CGATCAAGAAATCAATCCGCGATTCGCAACCGCTCTTAAAAAACTATGCAAAAACCACAC
AGTGGACGACACAATCGCGGCGTTTAACGACGTGATGACTCCAGGAAAATTCGATAACAT
GTACTTCAAGAGCCTAAAACGGGGACTAGGGTTGTTAGCTTCCGACTACCTTCTTATTAA
AGACAATAGCACGAAACCGTCCGCTGAGCTTTACGCAACCAACGAGAAAGCATTCTTTGA
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AGAAGTCAGACGTAGGTGCGACCACTTCAACAATCTCAACGTATAAGTAAACAAACATGC
ATGATCGTCTTTAAGGGCGATGCTAATAATAGTATTTACACTGAGGAGAACAAAGGTTTT
GTTAATTGGTATTATATGTTTTTAAGCTACGTATTATAAGCATAATTGTCTAACTGTTCA
AGATGCGATGTTTTCTGCTCATGAGAATGCAAATTGTTATATTAAAGCT


BQ
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G
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ACCGCATCAAGACAGCTTTAGAGTTGTCTTGTCCCGGTGTGGTGTCATGCGCTGATATTT
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AGATGGTAGCATTAAGTGGAGCTCACACGATCGGATTTTCCCACTGCAAAGAGTTTAGTG
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AAAA*CTATGCAAAAACCACACAGTGGACGACACAATCGCGGCGTTTAACGACGTGATGA
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CGGGGA

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AGTTTAGTGACCGTCTCTATGGATCAAAAGCCGATCAAGAAATCAATCCGCGATTCGCAA
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GGTTGTTAGCTTCCGACTACCTTCTTATTAAAGACAATAGCACGAAACCGTCCGCTGAGC
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CGTATTATAAGCATAATTGTCTAACTGTTCAAGATGCGATGTTTTCTGCTCATGAGAATG
CAAATTGTTATATTAAAGCT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL2795Contig1 799 3 2 U
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CATTAACAACATCACGGTTCTTAGAAATCAAACCAAGTTTACAACAAAGATAACCAATAG
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TCTCTAATAAATATGACTTGAAATCATATCTTCTCACCAGCCGAGTAGTTGGTAAGGAGG
AAGGAGGTGGCAGGTAGATTGGGTGATTTGTAGAATTGAAGTACATCGAAAAGCAGAGTC
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CAGATGATTCACCCATATTGGCTTCGCTACTAGGAACACGGATGCTTAACTTAAAGTTTT
TGCCACGTTCAATAATGCCGTCATTTTCATCAACTCTCTTTGATACTAGAATGCGACTGG
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ATCGGAAAATGGCAGCATGGAAAGAGGGTAAGAAGAAGAGTGATGCGAGGAGAAGAAGCA
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ACTTTTCCAGTTTGTGCCG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4CN16TF C 1
AF RR4CN16JQ U 3
AF RR4BU44JQ U 49
BS 1 7 RR4CN16TF
BS 8 799 RR4CN16JQ

RD RR4CN16TF 799 0 0
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TCTCTAATAAATATGACTTGAAATCATATCTTCTCACCAGCCGAGTAGTTGGTAAGGAGG
AAGGAGGTGGCAGGTAGATTGGGTGATTTGTAGAATTGAAGTACATCGAAAAGCAGAGTC
TTTTTTGTGGTACTGGCTTGTCATCATAGATCGGACGTTCATCAATCAGAGTTACCGAAA
CAGATGATTCACCCATATTGGCTTCGCTACTAGGAACACGGATGCTTAACTTAAAGTTTT
TGCCACGTTCAATAATGCCGTCATTTTCATCAACTCTCTTTGATACTAGAATGCGACTGG
TGTCATGACCGAGATATGTAGAATAAACGAACACGACCAGTTTTCCTCGGTATATAGTGG
CGCTTGAATTATTTGCGAAACCGAAAAACGTAATGGTTGGTTCGTCACCGCCACCAACCG
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TTGGCTGAAAGGGAGATATCGCCATGAATGATCAGCTCGTTGAACTTACGAGAGGTAAAG
ACTTTTCCAGTTTGTGCCG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4CN16JQ 797 0 0
AGGTA
AAAAGGTAGATATATCATATAACAAAACAAGCTGTTGGTTCAATACGAAAAACCATTAAC
AACATCACGGTTCTTAGAAATCAAACCAAGTTTACAACAAAGATAACCAATAGCATCGGC
CAGAGCTGGACAAGAAAACACACAGAAACAAATGCAAGTAGGGAGAGAGGCTCTCTCTAA
TAAATATGACTTGAAATCATATCTTCTCACCAGCCGAGTAGTTGGTAAGGAGGAAGGAGG
TGGCAGGTAGATTGGGTGATTTGTAGAATTGAAGTACATCGAAAAGCAGAGTCTTTTTTG
TGGTACTGGCTTGTCATCATAGATCGGACGTTCATCAATCAGAGTTACCGAAACAGATGA
TTCACCCATATTGGCTTCGCTACTAGGAACACGGATGCTTAACTTAAAGTTTTTGCCACG
TTCAATAATGCCGTCATTTTCATCAACTCTCTTTGATACTAGAATGCGACTGGTGTCATG
ACCGAGATATGTAGAATAAACGAACACGACCAGTTTTCCTCGGTATATAGTGGCGCTTGA
ATTATTTGCGAAACCGAAAAACGTAATGGTTGGTTCGTCACCGCCACCAACCGGGTTCGG
AGAGACATCGACACGAGTGACGTTACCGTAAACGTATCCTTCATCTTTGCAGTATCGGAA
AATGGCAGCATGGAAAGAGGGTAAGAAGAAGAGTGATGCGAGGAGAAGAAGCATTGGCTG
AAAGGGAGATATCGCCATGAATGATCAGCTCGTTGAACTTACGAGAGGTAAAGACTTTTC
CAGTTTGTGCCG

QA 6 797 6 797
DS 

RD RR4BU44JQ 751 0 0
AATACGAAAAAC*ATTAACAACATCACGGTTCTTAGAAATCAAACCAAGTTTACAACAAA
GATAACCAATAGCATCGGCCAGAGCTGGACAAGAAAACACACAGAAACAAATGCAAGTAG
GGAGAGAGGCTCTCTCTAATAAATATGACTTGAAATCATATCTTCTCACCAGCCGAGTAG
TTGGTAAGGAGGAAGGAGGTGGCAGGTAGATTGGGTGATTTGTAGAATTGAAGTACATCG
AAAAGCAGAGTCTTTTTTGTGGTACTGGCTTGTCATCATAGATCGGACGTTCATCAATCA
GAGTTACCGAAACAGATGATTCACCCATATTGGCTTCGCTACTAGGAACACGGATGCTTA
ACTTAAAGTTTTTGCCACGTTCAATAATGCCGTCATTTTCATCAACTCTCTTTGATACTA
GAATGCGACTGGTGTCATGACCGAGATATGTAGAATAAACGAACACGACCAGTTTTCCTC
GGTATATAGTGGCGCTTGAATTATTTGCGAAACCGAAAAACGTAATGGTTGGTTCGTCAC
CGCCACCAACCGGGTTCGGAGAGACATCGACACGAGTGACGTTACCGTAAACGTATCCTT
CATCTTTGCAGTATCGGAAAATGGCAGCATGGAAAGAGGGTAAGAAGAAGAGTGATGCGA
GGAGAAGAAGCATTGGCTGAAAGGGAGATATCGCCATGA*TGATCAGCTCGTTGA*CTTA
CGAGAGGTAAAGACTTTTCCAGTTTGTGCCG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

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GTACTATGAGAAGATTGAAGCTGTTTCTTCCAAAATAGCTGCTCAAGTCCCTGAAACAGA
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AGAACACATTGATAAACACAGAAAGCTTCAGGAGGATCTCACTGATGAAATGGTGGGACT
TGCGAGACAACTCAAGGAGCGTAGTCTGATGATAAGTCAATCTGTGGAAAATACAGAGAA
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GATCTTGGCCATGATCTGTGTCTTCATTATGGTCGTCTTGTTGATCCGTGTCACATAGAA
CATATGGTCCCGAGTGTAAACCAAGATTTATAAACAACTCATTTCAGTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GI57TF U 1
AF RR4GV48TF U 1
AF RR4GI57JQ C 36
AF RR4GV48JQ C 41
BS 1 667 RR4GI57TF
BS 668 668 RR4GV48TF
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QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4GV48TF 796 0 0
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GATGATGGGAATGAGCAAAACAGAGATCAATTTGCGGAGATTGCTTTCCGCTGCTCCTAA
TCAGCAAAATCAATCCAAGCTTATGCATTATGTAGCTACACTGAGGGAACAATTGGAACA
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GATATCTGATGAAAATTATCCAAAGGATTCTTCTACCAGCGAAAGCTCTCCTAAAATAGA
AGACGAGCCTCGAAGCCCCTCTTCTCCACAGCTCAGAAGAAGAATCGTGTCTACAAGCTC
CAAGGAGCAAAGTGTTGATTCTGGTCCTTCAAAGGCAGTAAAACTAGACACTGCAGCTAA
AGAACACATTGATAAACACAGAAAGCTTCAGGAGGATCTCACTGATGAAATGGTGGGACT
TGCGAGACAACTCAAGGAGCGTAGTCTGATGATAAGTCAATCTGTGGAAAATACAGAGAA
GATACTCGACTCTACTGAGGAGGCCATTGAGCAGAGCTTATCAAGCACAGGACACGCAAA
TGTAAGGGCGTCAAAGATATATTCAGAGAGTTCAAAGACGAGTTGTTTCCAGTGGCTATT
GATCTTGGCCATGATCTGTGTCTTCATTATGGTCGTCTTGTTGATCCGTGTCACATAGAA
CATATGGTCCCGAGTG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4GI57JQ 796 0 0
TCTTC
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QA 6 796 6 796
DS 

RD RR4GV48JQ 791 0 0
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ACGAAGGCTAAGGTGAATGAGTACTATGAGAAGATTGAAGCTGTTTCTTCCAAAATAGCT
GCTCAAGTCCCTGAAACAGAGATATCTGATGAAAATTATCCAAAGGATTCTTCTACCAGC
GAAAGCTCTCCTAAAATAGAAGACGAGCCTCGAAGCCCCTCTTCTCCACAGCTCAGAAGA
AGAATCGTGTCTACAAGCTCCAAGGAGCAAAGTGTTGATTCTGGTCCTTCAAAGGCAGTA
AAACTAGACACTGCAGCTAAAGAACACATTGATAAACACAGAAAGCTTCAGGAGGATCTC
ACTGATGAAATGGTGGGACTTGCGAGACAACTCAAGGAGCGTAGTCTGATGATAAGTCAA
TCTGTGGAAAATACAGAGAAGATACTCGACTCTACTGAGGAGGCCATTGAGCAGAGCTTA
TCAAGCACAGGACACGCAAATGTAAGGGCGTCAAAGATATATTCAGAGAGTTCAAAGACG
AGTTGTTTCCAGTGGCTATTGATCTTGGCCATGATCTGTGTCTTCATTATGGTCGTCTTG
TTGATCCGTGTCACATAGAACATATGGTCCCGAGTGTAAACCAAGATTTATAAACAACTC
ATTTCAGTCTC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 4

CO CL2797Contig1 892 4 16 U
AGCTAATCATATTCTTTAAGATGAAGAACAAGTTGGGGGAAAGATGATAGCACCGACCCT
CGAGTCTTGAGTGCTGAAATTGAAATTACACAAAGCTTGCTAGTTGCGACAGACCTACGC
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ATACAACAAGCTCCCGAAGCCAGTGAGGGAGATCAAGAACCTACTCCTTGAGCCAATCAA
GGCTGAAGCATTTTTCAGCTCCTTCAACTCGAAGTCCTGGAACCACCTTCTCGACATGCT
CCCAGATCCACAGAGTCTCTATATCGCATATTACATGGCGCAGAGAAGTCAATGAAACCG
CAGAGCTTGGTATGCTCGTTAAGCGGCATTCTCTCATGTCGATTTTCTCAAGTGTCCTTA
CCTTTCCTATCTCTTCCGGAAGAAAACTCAGGTTGACACATTGAGAGATGTCAAGGTACT
TTAGCCTCGGCAGCTCACAGATCTCTACAGGCAGAGTTTTAAGCTCTAGACAAGCGTATA
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GACAGTTTGTTATGCTGATAGAGTTGAGAGAGGTGATTCCACATACGGTCGCAGGTAGCT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BV31JQ U 23
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AF RR4BT59JQ U 53
AF RR4BT59TF C 226
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GAAA
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C

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GACATGCTCCCAGATCCACAGAGTCTCTATATCGCATATTACATGGCGCAGAGAAGTCAA
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CATCTT

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DS 

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CCTTCTCGACATGCTCCCAGATCCACAGAGTCTCTATATCGCATATTACATGGCGCAGAG
AAGTCAATGAAACCGCAGAGCTTGGTATGCTCGTTAAGCGGCATTCTCTCATGTCGATTT
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AGATGTCAAGGTACTTTAGCCTCGGCAGCTCACAGATCTCTACAGGCAGAGTTTTAAGCT
CTAGACAAGCGTATAGCCTCAGAAGTTGAAGTGCCTTTAGCTTGCTCAGATTCTTGGGCA
ACTCGTTGATGCGTGGACAGTTTGTTATGCTGATAGAGTTGAGAGAGGTGATTCCACATA
CGGTCGCAGGTAGCTCCACGAGATCATCACAGTGATCTATTGTGAGATCAGATAAGTTTG
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GAACCCTCTCAAGCCAGAGACTCTTGAGTTTGGCGAGATTGGTAAAGTTGGAGAAGTCAT
GAAGACC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 4

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CCTTGTACACGCCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGTTTCGGGTTTGGTTTGGTTT
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CGACCGAGATTTACCAGTGGCTAGGATTCAACATCGCTACTCAGACCGTTGCACGATATG
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TGCCTCCATTCCTGTAGAAGACTCATCGTTGTGATCTTCGTTCTTATCAGTTTAAAAGCT
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CACTTTTGTTTTGAGATGTTTTGTAAGTTTAGAAACTTGCTTCTTTAATCGTTTCTCACG
CAAAAAAAAA


BQ
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4C041TF U 274
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RD RR4FW46TF 725 0 0
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TGGGAGCACAAGTCTCGTACCGCACGCTCTTCTTCTTCGAGTACCTAGGCCCACTCTTGA
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TGATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTACTGGTGCTTTCACTACTTCAAACGCA
TCATGGAGACGTTCTTCGTCCACAGGTTCAGCCACGCAATTTCGCCGATAGGAAACGTGT
TCAGGAACTGTGCTTACTACTGGACCTTTGGTGCTTACATTGCTTACTACGTGAACCATC
CCTTGTACACGCCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGTTTCGGGTTTGGTTTGGTTT
GCCAAGTCGCGAACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGA*TCTCAGAGACCCTAGTGGAG
CTGGA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4C041TF 633 0 0
GG
TCCTTAACCGTAGTCTTCAAGGACTTGGGAGCACAAGTCTCGTACCGCACGCTCTTCTTC
TTCGAGTACCTAGGCCCACTCTTGATCTACCCGGTCTTCTACTACTTCCCTGTTTACAAA
TACCTCGGCTACGGAGAAGACCGTGTGATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTAC
TGGTGCTTTCACTACTTCAAACGCATCATGGAGACGTTCTTCGTCCACAGGTTCAGCCAC
GCAACTTCGCCGATAGGAAACGTGTTCAGGAACTGTGCTTACTACTGGACCTTTGGTGCT
TACATTGCTTACTACGTGAACCATCCCTTGTACACGCCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAG
ATTGGTTTCGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCGAACTTCTACTGTCACATTCTGTTG
AAGAATCTCAGAGACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTACCAGATCCCGCGTGGTTTCCTCTTC
AACATTGTCACGTGTGCTAATTACACGACCGAGATTTACCAGTGGCTAGGATTCAACATC
GCTACTCAGACCGTTGCACGATATGTTTTCTTAGCTGTTGCTGCTCTGAT*ATGACCAAC
TGGGCTCTTGGAAAGCACAGCCGTCTGAGAA

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR4FW46JQ 793 0 0
GCCCACTCTTGATCTACCCGGTCTTCTACTACTTCCCTGTTTACAAATACCTCGGCTACG
GAGAAGACCGTGTGATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTACTGGTGCTTTCACT
ACTTCAAACGCATCATGGAGACGTTCTTCGTCCACAGGTTCAGCCACGCAATTTCGCCGA
TAGGAAACGTGTTCAGGAACTGTGCTTACTACTGGACCTTTGGTGCTTACATTGCTTACT
ACGTGAACCATCCCTTGTACACGCCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGTTTCGGGT
TTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCGAACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGAATCTCAGAG
ACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTACCAGATCCCGCGTGGTTTCCTCTTCAACATTGTCACGT
GTGCTAATTACACGACCGAGATTTACCAGTGGCTAGGATTCAACATCGCTACTCAGACCG
TTGCAGGATATGTTTTCTTAGCTGTTGCTGCTCTGATTATGACCAACTGGGCTCTTGGAA
AGCACAGCCGTCTGAGAAAGATATTTGATGGGAAAGATGGGAAGCCAAAGTATCCAAGAA
GATGGGTGATATTGCCTCCATTCCTGTAGAAGACTCATCGTTGTGATCTTCGTTCTTATC
AGTTTAAAAGCTTTCTTAATAAGTTTGTAAAAGAGATTTGAAAGATGTTTGGTTTCCTCT
GTATTTTGTTATCACTTTTGTTTTGAGATGTTTTGTAAGTTTAGAAACTTGCTTCTTTAA
TCGTTTCTCACGC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4C041JQ 205 0 0
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ATCAGTTTAAAAGCTTTCTTAATAAGTTTGTAAAAGAGATTTGAAAGATGTTTGGTTTCC
TCTGTATTTTGTTATCACTTTTGTTTTGAGATGTTTTGTAAGTTTAGAAACTTGCTTCTT
TAATCGTTTCTCACGCAAAAAAAAA

QA 1 205 1 205
DS 



AS 1 4

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CTGTATAATCCGATTTGGGGAGGTCTTTGAGGCAAAGCTGCTTCTATGCCATATTGTAGA
GAAAATGGGCGAGTCTAAGGGGAATGGGAAAGTAGGAGGACGAGTGATTACAAATGTTAT
GTCTGCAAATTCTTACAACGTCTCCCTTAAGTTGTCTCCAGTTGTTTCTTTTTGGGATTG
TATTGTCCGCACCATGAGGTATTCCTATATACCTGAGTGGGTGTAGTACTAGTTCTTCAC
ATCCTTCCACCACAGCATCAGCGAGTTTTTTAGTTCAGTTATTTTTAGTTACAGTTATAG
ATATATATAGAAAGTGAGAGTGAAAGCTAGGATGGATTGCAAGCAAGTTCAGCCATTAGC
TAGGAAAGGGAAGAAGAAACACAACGGCAAAGATGAATTCGATCGTGTCAAACAAGCTGA
GAAGAAGAAGAGACGTCTCGAGAAAGCTCTCGCTACCTCTGCAGCCATCAGGGCTGAGCT
CGAAAAGAAGAAGCAGAGGAAGCTTGAAGAGCAACAGAGGTTAGATGACGAAGGTGCTGC
TATCGCAGAGGCTGTTGCTCTCCACGTCCTACTGGGCGAAGACTCTGATGATTCATCATC
TCGAGTCATGCTTGGCCAAGAAGAGTCTTGTTTCAAGATGGATCATCTGTTTAGAGGTGA
AAACTACGTTCCTCTTCAAAGCTGCGCTAGCTATGCGGTTCAAGGGATTGGGTTTGTCTC
CAACGGTTATGGATTAGGAGACAGTAGCTGGTCACCTTTCGTGAGGGAATCTTGGGATAG
CAACATGGGAATATCAGCTGATGATCTGATCGCTGCTCAGGCTGTCTCATCGCTAAGGAT
ATCTGAAAACACTGACAGGAATCCCTTTGTGCTTAAGGGGATGTTCCGAGGATGATAAAT
TGCCGTGATTCCAGATTTGATTGCTAAATTCAGCTTTTGTTATGATATAAGTTGCGAATA
ATGTTGTTTTATTTCGGGGTGAGTTTGATGTGTTGTTGTTTTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DQ26TF U 1
AF RR4E521TF U 1
AF RR4DQ26JQ C 347
AF RR4E521JQ C 355
BS 1 545 RR4DQ26TF
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BS 610 610 RR4DQ26JQ
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BS 770 780 RR4E521TF
BS 781 1066 RR4DQ26JQ

RD RR4DQ26TF 547 0 0
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CGAAA
GA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4E521TF 780 0 0
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CTGTATAATCCGATTTGGGGAGGTCTTTGAGGCAAAGCTGCTTCTATGCCATATTGTAGA
GAAAATGGGCGAGTCTAAGGGGAATGGGAAAGTAGGAGGACGAGTGATTACAAATGTTAT
GTCTGCAAATTCTTACAACGTCTCCCTTAAGTTGTCTCCAGTTGTTTCTTTTTGGGATTG
TATTGTCCGCACCATGAGGTATTCCTATATACCTGAGTGGGTGTAGTACTAGTTCTTCAC
ATCCTTCCACCACAGCATCAGCGAGTTTTTTAGTTCAGTTATTTTTAGTTACAGTTATAG
ATATATATAGAAAGTGAGAGTGAAAGCTAGGATGGATTGCAAGCAAGTTCAGCCATTAGC
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CGAAAAGAAGAAGCAGAGGAAGCTTGAAGAGCAACAGAGGTTAGATGACGAAGGTGCTGC
TATCGCAGAAGCTGTTGCTCTCCACGTCCTACTGGGCGAAGACTCTGATGATTCATCATC
TCGAGTCATGCTTGGCCAAGAAGAGTCTTGTTTCAAGATGGATCATCTGTTTAGAG*TGA
AA*CTACGTTCCTCTTCAA*GCTGCGCTAGCTATGCGGT*CAAGGGAT*GGGTTTGTCTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4DQ26JQ 720 0 0
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ATCAGGGCTGAGCTCGAAAAGAAGAAGCAGAGGAAGCTTGAAGAGCAACAGAGGTTAGAT
GACGAAGGTGCTGCTATCGCAGAGGCTGTTGCTCTCCACGTCCTACTGGGCGAAGACTCT
GATGATTCATCATCTCGAGTCATGCTTGGCCAAGAAGAGTCTTGTTTCAAGATGGATCAT
CTGTTTAGAGGTGAAAACTACGTTCCTCTTCAAAGCTGCGCTAGCTATGCGGTTCAAGGG
ATTGGGTTTGTCTCCAACGGTTATGGATTAGGAGACAGTAGCTGGTCACCTTTCGTGAGG
GAATCTTGGGATAGCAACATGGGAATATCAGCTGATGATCTGATCGCTGCTCAGGCTGTC
TCATCGCTAAGGATATCTGAAAACACTGACAGGAATCCCTTTGTGCTTAAGGGGATGTTC
CGAGGATGATAAATTGCCGTGATTCCAGATTTGATTGCTAAATTCAGCTTTTGTTATGAT
ATAAGTTGCGAATAATGTTGTTTTATTTCGGGGTGAGTTTGATGTGTTGTTGTTTTTTCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4E521JQ 712 0 0
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TGAGCTCGAAAAGAAGAAGCAGAGGAAGCTTGAAGAGCAACAGAGGTTAGATGACGAAGG
TGCTGCTATCGCAGAGGCTGTTGCTCTCCACGTCCTACTGGGCGAAGACTCTGATGATTC
ATCATCTCGAGTCATGCTTGGCCAAGAAGAGTCTTGTTTCAAGATGGATCATCTGTTTAG
AGGTGAAAACTACGTTCCTCTTCAAAGCTGCGCTAGCTATGCGGTTCAAGGGATTGGGTT
TGTCTCCAACGGTTATGGATTAGGAGACAGTAGCTGGTCACCTTTCGTGAGGGAATCTTG
GGATAGCAACATGGGAATATCAGCTGATGATCTGATCGCTGCTCAGGCTGTCTCATCGCT
AAGGATATCTGAAAACACTGACAGGAATCCCTTTGTGCTTAAGGGGATGTTCCGAGGATG
ATAAATTGCCGTGATTCCAGATTTGATTGCTAAATTCAGCTTTTGTTATGATATAAGTTG
CGAATAATGTTGTTTTATTTCGGGGTGAGTTTGATGTGTTGTTGTTTTTTCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

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ACAAAGACCATTAGAGTTAAGATGCTTTGCAACAATCTGAAGAGCCAAAAAAAACAACAA
CGCTGGACAAGATATTAAGCCAATTGTTTCAGATGTTTGATGCACTTAAAGCCATGACTT
TGCATTGTTCATTCAAAGCTAGAAGCTGAGCTTCTTTCTTGTCAAGAAGTGCCGTCAGCT
TCACATTCTCTTCCATCAGTTTCTGAACTTCAACCTCCTTTTGCGCCTTCTCCCCCTCTA
GATGTGTCGTCTTAGTCACCAACCGTTCAAAGAGCTCTTCGATGGTTTTGAATTGTCTCT
CGGAAGAAAGAAGTGTTTCTCTAACGCTGGTAAAAGTACTGACATAGCTTTTAAGAGACT
CAAACTCTCTCTTCACACGACAAAGCTCCTCTTCATTTTCAACAGCTTTTTCCCTCTGTC
TCATCGTCTCCTCAACTAGTTCCTCAATCCTTTCCCTCATTTCGCTCAGAACACCGTTAG
TCCCGTGAGCAAACCTCTCCATCTCCTGTAATTTCAAAGACAGATTCTCGATCTGGACTG
TCTTCCTACTAAGTTCCTCCTCTCCCAAAAGTGCCATCTCCTTCTGAACAGCCGTCTCGG
ACTCTGCTGCTGTAACTCTCCCAACAAGAGACTCCAGCACACCAGTAACCATCTCTATGG
ACTGGAGCATCTCGCTAGTATAAGCTCCATCCTCCTCACAAGAAGACGAAGAACCAAGAA
AGTCTAATCCTTTCAGTTCCACTTGAGGTAGATGATCAGGAATGGCCAAGAGTCTAGCTT
TTGATCTCAAATAGCGCAACATTACTGCAGTCGCTCTCACCCTACCGGAAAGAAGACCTA
ACTCCTTCCTGGCGTCTTCTTCTGAACTAAAGTCAAGGTAAGCCTTCTTGACATCCAAAA
GTTCAGCTTCTAAACTATCTACCTGAAACCGACGAGATTCCAATTCTTCCTTCCATATCT
CAGTGGCTTCTTCATCTCGTGCTGCTGCTATATTAGTATCTTCTTTACAAGCCATCACCG
GTCTCTTCAAGTCAGGACAAATACAGCTTTAGTTCCAAAAACAATTGGAGATCATGAGCT
TGGAGCTTGGTGATTGATTGATTGATTCGAGGAACGAATCACAGGCAAATTGGAAGTTGA
TTCTCCGAAAAGAGCGGGTGAGATGAAAGGTAGACGGAAGAAGACGATCTCTTACAAAAG
GACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F108JQ U 1
AF RR4GD68JQ U 37
AF RR4GD68TF C 570
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RD RR4F108JQ 602 0 0
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TC

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TTGATGCACTTAAAGCCATGACTTTGCATTGTTCATTCAAAGCTAGAAGCTGAGCTTCTT
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DS 

RD RR4GD68TF 698 0 0
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AAGTCAAGGTAAGCCTTCTTGACATCCAAAAGTTCAGCTTCTAAACTATCTACCTGAAAC
CGACGAGATTCCAATTCTTCCTTCCATATCTCAGTGGCTTCTTCATCTCGTGCTGCTGCT
ATATTAGTATCTTCTTTACAAGCCATCACCGGTCTCTTCAAGTCAGGACAAATACAGCTT
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GTAGACGGAAGAAGACGATCTCTTACAAAAGGACACCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

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CTCACCGAGGCACTTGTCGCTTCCGCCTCTTCTTGCTCCCCTTGCGTCTGCGACTGCTCC
TCCGTGCCTCTTCTCACCATCCCCAAAGGACTCAGCAATGGATCTTTTGGGGATTGTGCA
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TTTATATTACACGAAAGAATGTATTTTATGGATTTTGATTTATAGTATTGTCTTGTAGTT
TTCTGATGGAACAGATATTGAATGAAGCAAGCAATGTACCAAAACAACAATGTATTAATG
GATTTTGAACAAATTTTTATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CA95TF U 1
AF RR4BN47TF U 52
AF RR4BN47JQ C 301
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BS 580 586 RR4CA95TF
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RD RR4CA95TF 643 0 0
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ATGGAGACTTGTGAAGAAGCAAGAGAGAAGTCGGAGAAAGCACTTGTGGAGCAGAAGAAG
CTGACTTCTATGTGGGAACTCAGAGCTCGTCAAAA
GGGTGGAA

QA 1 635 1 635
DS 

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GG
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ATTTTTATTGC

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TAAAAAGGTTGTTGTAAGCAAACCATTGCGGCGTTCAGGCAGGAGACCAAAGCATGTTAC
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AAGACGTAGAGGCAGGCCTAAGAAAGCAAAACAAGAGATTTCCATGAGAAAGAAGAGAAC
AAAAAGAGCCTTAAGCTATTGGTTGAATGGACTGCTCTTATCGAGAAAACCTGGTGATGG
ACGGGTCGATAAGTTCCGGAGAGACAGATATTTTAAACCTATGGAGAACTCGGATTCTGA
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CATCTCTTGCGAAATGTGTAAAGAATGGTACCATGAAGATGCATGTGGGATCGACGAGAA
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CCTGTCCACATGAGATCTCTACTACACCTCCTGTCCCATCCTAAGCTGTGAATTGATAGA
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GATTTATTACATGATTTAAATTTACTCTTCAGAATGGAGTCAGTAAACAAGTTAATGTAT
GTAAAAGAATATGTTGAATCCATTTTCTATCGAAATCCGTTGGTACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A347TF U 1
AF RR4A347TFB U 1
AF RR4A347JQD C 362
AF RR4A347JQ C 382
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TAAAAAGGTTGTTGTAAGCAAACCATTGCGGCGTTCAGGCAGGAGACCAAAGCATGTTAC
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AAGACGTAGAGGCAGGCCTAAGAAAGCAAAACAAGAGATTTCCATGAGAAAGAAGAGAAC
AAAAAGAGCCTTAAGCTATTGGTTGAATGGACTGCTCTTATCGAGAAAACCTGGTGATGG
ACGGGTCGATAAGTTCCGGAGAGACAGATATTTTAAACCTATGGAGAACTCGGATTCTGA
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CATCTCTTGCGAAATGTGTAAAGAATGGTACCATGAAGATGCATGTGGGATCGACGAGAA
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ATATTCTT

QA 1 788 1 788
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ATCTCTTGCGAAATGTGTAAAGAATGGTACCATGAAGATGCATGTGGGATCGACGAGAAG
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RD RR4A347JQ 747 0 0
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*ATTCCGGTGCAATCTCTGTCGAGAACAGTTACCTCCTCCCTGTCCACATGAGATCTCTA
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ATTTTCTATCGAAATCCGTTGGTACCC

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DS 



AS 1 4

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TCTCCTCTTTAGTATAATCTAGGTTTTGTTCAGTTTCTCGGCTAGTTGGGCTAGGGTCTT
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GTGGGGCTTGTCTCTCCTGGTTCATCTCGTGACGCGCTTCAGAACGGTGGTCTGGGTCAG
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TCGCTGTAGAAGGGACTTTTGTGGTGGTAGCCGGTGCTTAGTCTTTTGTATTCTTATTGC
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CM08TF U 68
AF RR4F376TF U 1
AF RR4AV22TF U 167
AF RR4AZ86TF U 239
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BS 474 474 RR4CM08TF
BS 475 613 RR4F376TF
BS 614 614 RR4AV22TF
BS 615 630 RR4F376TF
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BS 632 656 RR4F376TF
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BS 688 688 RR4AV22TF
BS 689 692 RR4F376TF
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RD RR4CM08TF 540 0 0
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TCCCTATTGTGTCCTCTTCTTGTCTGTGGTCTTCGCTGGGGAAAGTTTCTCCAGCCCTCT
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TTTCGCTGACGTCGTC

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DS 

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G
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DS 

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CTCCA

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DS 



AS 0 0

AS 1 3

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BQ
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AF RR4FE48JQ U 1
AF RR4GN39JQ U 1
AF RR4GN39TF C 343
BS 1 61 RR4FE48JQ
BS 62 62 RR4GN39JQ
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RD RR4FE48JQ 590 0 0
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QA 1 590 1 590
DS 

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TTCTTGGTAGATCCCATATCCATTCTCTAGGAACATCGATGGGTTTGAGACTGGAATCAT
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GAT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4GN39TF 674 0 0
CCATCAGCGGTCGAGGTGCTCTGGTCTTGGGTTCGAATCCTCGTACACAGACGAATCCTC
TCCAGAAGCAGTACTGAATTTGTTCGGTCGACATACCTCTGAATATTGATGTTACCGATG
TCCCGAAGTAAACAGTTCTTCTTGGTAGATCCCATATCCATTCTCTAGGAACATCGATGG
GTTTGAGACTGGAATCATGGTCTACAAATAACTCGTTCACTTGAAAATATGTGCTATTAA
GGGGAAAGCTTCCCCTCATGGCAGTTCGACAAGGTATCAGAAGAGTTCCTCTAACTGTCT
GTGAATTCGCTTCCCTCACGCTGTTGCACTCTGAACAAGCCTCGTCAAAGCACATTTTGC
CAAACGCTTGCCCTCCACATTTCTGTCCAGGCTGCTGAGCCGAATTAGCCGTTTCCCCAG
GTGTCCAAATAGCTAAGAGATAAGGACTTGGGTCATCTGGTTCTCTTTTGTCCATACCAG
CAAGGAGACGATGTGAATCCGGGAGCCCGTACACATGGTGCTCTGTCCTGAGACGGCTAA
TGTTCTTTAGTTTGGGAGTTGGAATTGAAGTTGTGGATGGATCCAAAGCAACCAAAGCCT
TTGACATGTCACCTTCTTGGAGCTCCATGTTTCTCTTCATGTGTTCCTTAAGCGTCTTGC
CGAATTGCGTAATG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 2 4

CO CL2807Contig1 652 2 7 U
GCAAAACACAAACTGGTGACAGATTCAACATGAACACGAATTTTTAGCATTTACCATTTT
AAACGGAAAAAAAAAAAGACTAAAGCTGATTTCGACAAGAACTTAAGTATAATATAGTAT
AAGCAAGAAAGAACAAACATCATAATCGAGGGAAAAAAGTCACTCAGCTAGCCAGATGGT
TTGGAAAATTGTTGAACATACTGTGCCACATGTATGCTCTTGACAAAACCATCTCCAGTT
CTTGGTCTGTCCACGTTTGTGTTGGCAGGTGTTGCAGGAACATTACCATCTCTTGAAAGT
CCAGCTTCTTCAGCTCATCTGACCACGTCAAGAGAAAGCTAGCATATATATACACTAGGA
AGTCCGGCAATGCATCTCCTTCAGCAAGATATGTGTCCCATAGGCGGTTGATGAGACTGA
ACGGGATCTCACGTATCAGAAGACAGTTATACCACCGGAAAGCAAACTGAAGAAACTCTA
GTCCTTGTTCTTCCATGTGTCTTGCAACGGGTTCGTCAATACGCCTGACTAATTCCTTAA
GCTTAAACACAAGTCTCTGGATTCCAGGTTGCGCAAAAGTGTAATGATCTTGCATACCAT
CAAGTAGCTTTGTCAAGCACCAGTAACAATCCGCCCCTACATCTGAGACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G679JQ U 26
AF RR4E195JQ U 1
BS 1 74 RR4E195JQ
BS 75 77 RR4G679JQ
BS 78 185 RR4E195JQ
BS 186 186 RR4G679JQ
BS 187 227 RR4E195JQ
BS 228 228 RR4G679JQ
BS 229 652 RR4E195JQ

RD RR4G679JQ 301 0 0
CGAT
ATGAACACGAATTTTTAGCATTTACCATTTTAAACGGAAAAAAAAAAAGACTAAAGCTGA
TTTCGACAAGAACTTAAGTATAATATAGTATAAGCAAGAAAGAACAAACATCATAATCGA
GGGAAAAA*GTCACTCAGCTAGCCAGATGGTTTGGAAAATTGTTGAACATACTGTGCCAC
ATGTATGCTCTTGACAAAACCATCTCCAGTTCTTGGTCTGTCCACGTTTGTGTTGGCAGG
TGTTGCAGGAACATTACCATCTCTTGAAAGTCCAGCTTCTTCAGCTCATCTGACCAC

QA 5 301 5 301
DS 

RD RR4E195JQ 652 0 0
GCAAAACACAAACTGGTGACAGATTCAACATGAACACGAATTTTTAGCATTTACCATTTT
AAACGGAAAAAAAAG**GACTAAAGCTGATTTCGACAAGAACTTAAGTATAATATAGTAT
AAGCAAGAAAGAACAAACATCATAATCGAGGGAAAAAAGTCACTCAGCTAGCCAGATGGT
TTGGAGAATTGTTGAACATACTGTGCCACATGTATGCTCTTGACAAAGCCATCTCCAGTT
CTTGGTCTGTCCACGTTTGTGTTGGCAGGTGTTGCAGGAACATTACCATCTCTTGAAAGT
CCAGCTTCTTCAGCTCATCTGACCACGTCAAGAGAAAGCTAGCATATATATACACTAGGA
AGTCCGGCAATGCATCTCCTTCAGCAAGATATGTGTCCCATAGGCGGTTGATGAGACTGA
ACGGGATCTCACGTATCAGAAGACAGTTATACCACCGGAAAGCAAACTGAAGAAACTCTA
GTCCTTGTTCTTCCATGTGTCTTGCAACGGGTTCGTCAATACGCCTGACTAATTCCTTAA
GCTTAAACACAAGTCTCTGGATTCCAGGTTGCGCAAAAGTGTAATGATCTTGCATACCAT
CAAGTAGCTTTGTCAAGCACCAGTAACAATCCGCCCCTACATCTGAGACTTT

QA 1 652 1 652
DS 



CO CL2807Contig2 770 2 18 U
GTACGCGGGTAAGCTACGGTCAAACTCCTCTAGTGGGGAGCAGCTTGCCAAACAAGTCCA
AAACCTCAAGATAGGTGGTCGATCAAGCGATTACGCTAGAGTTATGAAGTTCAACAAAGT
TCTTTCCGAAACTACTGTCATTTTAGAGAAGCTGCGTGAACTAGCGTGGAGCGGTGTCCC
CCACTATATGCGCCCTGATGTCTGGCGCCTTCTCTTGGGATATGCACCACCTAATTCAGA
TAGACGGGAGGCTGTTCTGAGAAGAAAACGTCTTGAGTATCTTGAATCTGTTGGCCAGTT
TTATGACCTCCCAGACTCCGAACGTTCTGATGATGAGATCAATATGCTTCGCCAGATTAC
TGTTGACTGTCCAAGGACTGTACCAGACGTCAGTTTCTTTCAGCAAGCACAGGTCCAGAA
ATCATTAGAGCGTATTCTCTACACATGGGCCATTAGGCATCCAGCGAGTGGATATGTTCA
GGGAATAAATGATCTGGTCACTCCCTTTCTAGTTATATTCTTGTCAGAGTATTTAGAAGG
CGACGTAGAGAATTGGTCAATGTCCGATCTATCTGCTGCAAAAGTCTCAGATGTAGAGGC
GGATTGTTACTGGTGCTTAACAAAGCTACTTGATGGTATGCAAGATCATTACACTTTTGC
GCAACCTGGAATCCAGAGACTTGTGTTTAAGCTAAAGGAATTAGTCAGGCGTATTGACGA
ACCTGTTGCGAGACACATGGAAGAACAAGGACTAGAGTTTCTTCAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E195TF U 1
AF RR4G679TF U 83
BS 1 116 RR4E195TF
BS 117 117 RR4G679TF
BS 118 171 RR4E195TF
BS 172 172 RR4G679TF
BS 173 309 RR4E195TF
BS 310 310 RR4G679TF
BS 311 315 RR4E195TF
BS 316 316 RR4G679TF
BS 317 318 RR4E195TF
BS 319 319 RR4G679TF
BS 320 414 RR4E195TF
BS 415 415 RR4G679TF
BS 416 596 RR4E195TF
BS 597 597 RR4G679TF
BS 598 618 RR4E195TF
BS 619 619 RR4G679TF
BS 620 673 RR4E195TF
BS 674 770 RR4G679TF

RD RR4E195TF 673 0 0
GTACGCGGGTAAGCTACGGTCAAACTCCTCTAGTGGGGAGCAGCTTGCCAAACAAGTCCA
AAACCTCAAGATAGGTGGTCGATCAAGCGATTACGCTAGAGTTATGAAGTTCAACAGAGT
TCTTTCCGAAACTACTGTCATTTTAGAGAAGCTGCGTGAACTAGCGTGGAGTGGTGTCCC
CCACTATATGCGCCCTGATGTCTGGCGCCTTCTCTTGGGATATGCACCACCTAATTCAGA
TAGACGGGAGGCTGTTCTGAGAAGAAAACGTCTTGAGTATCTTGAATCTGTTGGCCAGTT
TTATGACCTTCCAGATTCTGAACGTTCTGATGATGAGATCAATATGCTTCGCCAGATTAC
TGTTGACTGTCCAAGGACTGTACCAGACGTCAGTTTCTTTCAGCAAGCACAGGTGCAGAA
ATCATTAGAGCGTATTCTCTACACATGGGCCATTAGGCATCCAGCGAGTGGATATGTTCA
GGGAATAAATGATCTGGTCACTCCCTTTCTAGTTATATTCTTGTCAGAGTATTTAGAAGG
CGACGTAGAGAATTGGTCAATGTCCGATCTATCTGCTGCAAAAGTCTCAGATGTAGGGGC
GGATTGTTACTGGTGCTTGACAAAGCTACTTGATGGTATGCAAGATCATTACACTTTTGC
GCAACCTGGAATC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4G679TF 688 0 0
G
CAAGCGATTACGCTAGAGTTATGAAGTTCAACAAAGTTCTTTCCGAAACTACTGTCATTT
TAGAGAAGCTGCGTGAACTAGCGTGGAGCGGTGTCCCCCACTATATGCGCCCTGATGTCT
GGCGCCTTCTCTTGGGATATGCACCACCTAATTCAGATAGACGGGAGGCTGTTCTGAGAA
GGAAACGTCTTGAGTATCTTGAATCTGTTGGCCAGTTTTATGACCTCCCGGACTCCGAAC
GTTCTGATGATGAGATCAATATGCTTCGCCAGATTGCTGTTGACTGTCCAAGGACTGTAC
CAGACGTCAGTTTCTTTCAGCAAGCACAGGTCCAGAAATCATTAGAGCGTATTCTCTACA
CATGGGCCATTAGGCATCCAGCGAGTGGATATGTTCAGGGAATAAATGATCTGGTCACTC
CCTTTCTAGTTATATTCTTGTCAGAGTATTTAGAAGGCGACGTAGAGAATTGGTCAATGT
CCGATCTATCTGCTGCAAAAGTCTCAGATGTAGAGGCGGATTGTTACTGGTGCTTAACAA
AGCTGCTTGATGGTATGCAAGATCATTACACTTTTGCGCAACCTGGAATCCAGAGACTTG
TGTTTAAGCTAAAGGAATTAGTCAGGCGTATTGACGAACCTGTTGCGAGACACATGGAAG
AACAAGGACTAGAGTTTCTTCAGTTTG

QA 2 688 2 688
DS 



AS 2 4

CO CL2808Contig1 765 2 2 U
GATCGAATTCATTGTCTACAAAATATAGAATACATATCAAATAGAGAACATTAAAATATA
ATAGATTGAAGCATTTTTAATAATTCTATCGAGAAAGTGTTAAATGTGGTATCATTATAA
AACACATATGTTATATAGGATAGCTTTTGTCACTTTCAGGATAGGTTTCCAGAAAAATAA
AATGAGTGTGTTTTCTTGCATAAGCCTGTTTTCGAAGAGAATCAAAAGCGTGTAAGGAAT
GTTAGACAATCCTTGTTCAGGATGACTATACTAAATTGGAACTTAATCTTCCAAAACAAA
AAAAAAACATAATCAAAATCTTTAAGAAAATTCATTGGCTATAGAAATCACCAAATAGAG
TTCATTGTCTACAAAATAGAGAACACATATCAAATAGAGAACATTAAAATAGAATAGCTT
GAAGCATTTTCAAAAAATTCTATCAAGAAAGTATTAAATGTGGTATCATTATAAAACACA
TATGTTATATAGGATAGCTTTTGGCACTTTCAGGATAAGTTTCCAGAAAAATAAAATGAG
TGTGTTTTCTTGCATAAGTCTGTTTTCGAAGAGAATCAAAAGCGTGTAAGGAATGTCAGA
CAATCCTTGTTCACGATGGCTATCATAAATGTGAACTTAATCTTCTAAAACAAAACAAAA
CATAATCAAAATCTATAAGAAAATCCATTGGCTATATAAATCACCAAATAGAGTTCATTT
TCTACAAATAGAGACACATATCAATAGAGACATTAAAATAAGATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW51TF U 1
AF RR4DW78TF U 1
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DS 

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AACACATATGTTATATAGGATAGCTTTTGTCACTTTCAGGATAGGTTTCCAGAAAAATAA
AATGAGTGTGTTTTCTTGCATAAGCCTGTTTTCGAAGAGAATCAAAAGCGTGTAAGGAAT
GTTAGACAATCCTTGTTCAGGATGACTATACTAAATTGGAACTTAATCTTCCAAAACAAA
AAAAAAACATAATCAAAATCTTTAAGAAAATTCATTGGCTATAGAAATCACCAAATAGAG
TTCATTGTCTACAAAATAGAGAACACATATCAAATAGAGAACATTAAAATAGAATAGCTT
GAAGCATTTTCAAAAAATTCTATCAAGAAAGTATTAAATGTGGTATCATTATAAAACACA
TATGTTATATAGGATAGCTTTTGGCACTTTCAGGATAAGTTTCCAGAAAAATAAAATGAG
TGTGTTTTCTTGCATAAGTCTGTTTTCGAAGAGAATCAAAAGCGTGTAAGGAATGTCAGA
CAATCCTTGTTCACGATGGCTATCATAAATGTGAACTTAATCTTCTAAAACAAAACAAAA
CATAATCAAAATCTATAAGAAAATCCATTGGCTATATAAATCACCAAATAGAGTTCATTT
TCTACAAATAGAGACACATATCAATAGAGACATTAAAATAAGATA

QA 1 765 1 765
DS 



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ATATAGCCAATGGATTTTCTTATAGATTTTGATTATGTTTTGTTTTTGTTTTAAAAGATT
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TTATCCTGAAAGTGCCAAAAGCTATCCTATATAACATATGTGTTTTATAATGATACCACA
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TCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DW78JQ U 1
AF RR4DW51JQ U 125
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BS 331 604 RR4DW51JQ

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ATATAGCCAATGGATTTTCTTATAGATTTT

QA 1 330 1 330
DS 

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AACC
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TTTCTTGATAGAATTTTTTGAAAATGCTTCAAGCTATTCTATTTTAATGTTCTCTA

QA 5 480 5 480
DS 



AS 1 4

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CCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGA
GTAAGTTTTTATGGTG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 5 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 10 10 10 10 

AF RR4G656TF U 1
AF RR4CX28JQ C 4
AF RR4CX28TF U 4
AF RR4F286TF U 4
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TCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGAAAAC
CATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTC
ACTATCTCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGT
GCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCG
GCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCCTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGC
ATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTCT
CCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGA
GTAAGTTTTT
AT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4CX28JQ 552 0 0
GG
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AATAATATCACAAAGATCAAAATGTTTTCATCACAGTTTGCTATTTTTTGGGTCATCCTG
ATTGCATTATTTCCTTTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGAAAACCATTT
TGCGCCCCAGTCAATTGGGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCACTAT
TTCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGGGCAAG
TAGGGTGCAAGGCATAAGTTATTTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCGGCTTT
TTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCATAAT
GTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTTTACACAATAGTTTAACCTATTTTTTTTCCTTT
TGTTTTGTTTTAATTTTTTTAAAAGAATATTTTTTTTGATTAATGACTAATAAGAGTAAG
TTTTT
TTGGT

QA 3 547 3 547
DS 

RD RR4CX28TF 552 0 0
GG
AACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTATCAT
AATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCATCCTG
ATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGAAAACCATTC
TGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCACTAT
CTCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTGCAAG
TAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCGGCTTT
CTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCATAAT
GTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTCTCCTTC
TGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGAGTAAG
TTTTTAT
GGT

QA 3 549 3 549
DS 

RD RR4F286TF 553 0 0
GG
AACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTATCAT
AATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCATCCCG
ATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACCATTC
TGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCACTAT
ATCTCCCCACGCAATACAACTATTTTCAAGAGCTTGGCAGAATGTAATGCTGGGTGCAAG
TAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTGCTTC
CTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCATAAT
GTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTCTCCTTC
TGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGAGTAAG
TTTTTATGGTG

QA 3 553 3 553
DS 



AS 1 4

CO CL2810Contig1 798 4 27 U
GGGAGCCGGTGACCGACCTCAACGAGAAGACGAGAGATCCTCCTCCTCCTCTTTCGAACC
GATTCGTTATTCTCTGCGTTCAGGAATCGAACTCCAGTTTATCCGATTTCAAAATCTCTT
TCGAGAAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAAGGGAAACCTACAGGCCAGCGACGATTCT
CAAGCGCAGCTGAGATACTTGCTGGCACTTCTGCTGCACGTCCTCGTTCATTCAAGCAGA
AAGAAGCGGAGTACGAAGAAGATGTGGAAGAGGAGGAGTCTGAGGAGGAATCTGAAGAAG
AATCCGAAGATGATTCTGATGTGAAGAAGAAAGGACATGAGGCTCTGATCCAAGTTGATA
ACCCTAACAGAGCAAAACCAAAGACTTTGAAAGCAAGAGACCTTGATGCAAGTAAAACCA
CTGAACTCTCGAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACA
TGAGATTACAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAAGCAAGAAAGGATTTGGATCGTTTGGCTC
TGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAAAAGCGTGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAG
ACGCGAAGAAAGTCGATGCTCGCAAATGAAAGAAAACTCCTCAGATGCGTTTGTCTTTAC
TTTGATCATTTTCGATTGGTAAACAGCTTCACCTTTTGTCTGTTTACTCATTATTGTGTG
GATCTTTATACATTTGAAAGTTATTAGCAATCCGGTTGAGAAAGCCATAAACAACATCAG
CTTGACTTGCTTACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP93TF U 1
AF RR4GX67TF U 20
AF RR4GX67JQ C 98
AF RR4EP93JQ C 216
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BS 753 798 RR4EP93JQ

RD RR4EP93TF 676 0 0
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TGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGTGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAG
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TTTGGTCGTTTTCGAT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4GX67TF 733 0 0
GAAA
GAGAAGACGAGAGATCCTCCTCCTCCTCTTTCGAATCGATTCGTTATTCTCTGCGTTCAG
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AAGTTCAAAGGGAAACCTACAGGCCAGCGACGATTCTCAAGCGCAGCTGAGATACTTGCT
GGCACTTCTGCTGCACGTCCTCGTTCATTCAAGCAGAAAGAAGCGGAGTATGAAGAAGAT
GTGGAAGAGGAGGAGTCTGAGGAGGAATCTGAAGAAGAATCCGAAGATGATTCTGATGTG
AAGAAGAAAGGACATGAGGCTCTGATCCAAGTTGATAACCCTAACAGAGCAAAACCAAAG
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GAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAGATTACAGGAGCAAGGCAAA
ACCGAACAAGCAAGAAAGGATTTGGATCGTTTGGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAA
GCTGCCAAAAAGCGTGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCGAAGAAAGTCGATGCTCGC
AAATGAAAGAAAACTCCTCAGATGCGTTTGTCTTTACTTTGATCATTTTCGATTGGTAAA
CAGCTTCACCTTTTGTCTGTT*ACTCATTATTGTGTGGATCTTTATACATTTGAAAGTTA
TTAGCAATC

QA 5 733 5 733
DS 

RD RR4GX67JQ 655 0 0
TTTTTTCCGATTTT
AAATCTCTTTCGAGAAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAAGGGAAACCTACAGGCCAGC
GACGATTCTCAAGCGCAGCTGAGATACTTGCTGGCACTTTTGCTGCACGTCCTCGTTCAT
TCAAGCAGAAAGAAGCGGAGTATGAAGAAGATGTGGAAGAGGAGGAGTCTGAGGAGGAAT
CTGAAGAAGAATCCGAAGATGATTTTGATGTGAAGAAGAAAGGACATGAGGCTCTGATCC
AAGTTGATAACCCTAACAGAGCAAAACCAAAGACTTTGAAAGCAAGAGACCTTGATGCAA
GTAAAACCACTGAACTCTCGAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATG
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GTTTGGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAAAAGCGTGAAGAGGAAAAAG
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TGTCTTTACTTTGATCATTTTCGATTGGTAAACAGCTTCACCTTTTGTCTGTTTACTCAT
TATTGTGTGGATCTTTATACATTTGAAAGTTATTAGCAATC

QA 15 655 15 655
DS 

RD RR4EP93JQ 583 0 0
GCG
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TCTGAGGAGGAATCTGAAGAAGAATCCGAAGATGATTCTGATGTTAAGAAGAAAGGACAT
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GACCTTGATGCAAGTAAAACCACTGAACTCTCGATGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAG
CAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAGATTACAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAAGCAAGA
AAGGATTTGGATCGTTTGGCTTTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGT
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CCTCAGATGCGTTTGTCTTTACTTTGGTCGTTTTCGATTGGTAAACAGGAAGACCTTTTG
TCTGTTTACTCAGTATTGTGTGGATCTTTATACATTTGAAAGTTATTAGCAATCCGGTTG
AGAAAGCCATAAACAACATCAGCTTGACTTGCTTACATTT

QA 4 583 4 583
DS 



AS 1 4

CO CL2811Contig1 1038 4 9 U
GGTAAAAATGCACAAGCTGTTTTTCCTTTATATAACAAACACAACCGACAATGATAGCAA
TAGATAAGTGTTCACAAGCATCACTTTACTAGGTTCTTACAGGACGGATTTCAATTCCTT
GAATGATCAAGCCACTCTTCCAATGGCCAAGCTTGGTCTCTAAAGCACTCATCTCAATTT
CATCACTACTCATTATATCTCCTCCACTGAAGAATTCCCCAAGCTCTATCTCCATCCACC
CATCTCTTCTCTCATGTGGCCTCCTTCGCCTCCTCCTCAAAGACAGCCCATCAACTCGCG
CATCAAAGTATATGAATCTTGTAGAAGCTTCATTTCCCACCACTCCAACTCCAGCTTCTA
TAGACACATCCTCAAAGCTGTTACAATGATTTACCTTCTTAAACACAATGTAAGCTGAGT
AACGAGTTCTTGGAGATAGGACTCCAGTATTGGTCCTGCCTCTAATCTCAAACCAACATA
AATCAAGAAGCTTCGCAACTCTTTTAAACCTAGCTTCAGGAAATGTAACCCATTCCCAAT
ACTGTGGAGTATCTCCCCACATGATTGAGATGTTCATCGCAGATAACATGATACACTTCT
TTCCACTGGCTTTGTCTAACCAAAAGCTCTTTGTACCATCGTCTATAAGAACAGACTCCC
CGCAAAACGCGAAGTAGAGCTCCTTCTTGGATGAGAAATGACGCGATGAAGGAACCAGAG
ATTCATACTCCGATGGAAGAAACTTATCCCATACAACATCTGACTTGGCCGCAGATTCAA
AGGCTTTGGAAACCGAAGCGACGACGCAAGCATCACGTGGACTTGTGAAGGAAACTATCT
TCGAAATGCAATCCTCCGGAAAGGAATCGAACGGCGACGACGAATCCGAAACGATCTCTC
GTCTGCGCTTGACGTGATTTTCACTCATCCTCGTAGCCTCCTCTAGAGAGAGAGAAGGGA
GATTCGACTTCTCTGACACTTTTTCCGACAAAACACTTATCCGCGTCGACGTGGAAGTTT
CGTAGAAATTCATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER70JQ U 1
AF RR4D595JQ U 30
AF RR4ER70TF C 275
AF RR4D595TF C 399
BS 1 188 RR4ER70JQ
BS 189 189 RR4D595JQ
BS 190 323 RR4ER70JQ
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BS 691 1002 RR4ER70TF
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RD RR4ER70JQ 690 0 0
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TAGATAAGTGTTCACAAGCATCACTTTACTAGGTTCTTACAGGACGGATTTCAATTCCTT
GAATGATCAAGCCACTCTTCCAATGGCCAAGCTTGGTCTCTAAAGCACTCATCTCAATTT
CATCACTATTCATTATATCTCCTCCACTGAAGAATTCCCCAAGCTCTATCTCCATCCACC
CATCTCTTCTCTCATGTGGCCTCCTTCGCCTCCTCCTCAAAGACAGCCCATCAACTCGCG
CATCAAAGTATATGAATCTTGTAAAAGCTTCATTTCCCACCACTCCAACTCCAGCTTCTA
TAGACACATCCTCAAAGCTGTTACAATGATTTACCTTCTTAAACACAATGTAAGCTGAGT
AACGAGTTCTTGGAGATAGGACTCCAGTATTGGTCCTGCCTCTAATCTCAAACCAACATA
AATCAAGAAGCTTCGCAACTCTTTTAAACCTAGCTTCAGGAAATGTAACCCATTCCCAAT
ACTGTGGAGTATCTCCCCACATGATTGAGATGTTCATCGCAGATAACATGATACACTTCT
TTCCACTGGCTTTGTCTAACCAAAAGCTCTTTGTACCATCGTCTATAAGAACAGACTCCT
CGCAAAACGCGAAGTAGAGCTCCTTCTTGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4D595JQ 643 0 0
ATATAACAAACACAACCGACAATGATAGCAATAGATAAGTGTTCACAAGCATCACTTTAC
TAGGTTCTTACAGGACGGATTTCAATTCCTTGAATGATCAAGCCACTCTTCCAATGGCCA
AGCTTGGTCTCTAAAGCACTCATCTCAATTTCATCACTACTCATTATATCTCCTCCACTG
AAGAATTCCCCAAGCTCTATCTCCATCCACCCATCTCTTCTCTCATGTGGTCTCCTTCGC
CTCCTCCTCAAAGACAGCCCATCAACTCGCGCATCAAAGTATATGAATCTTGTAGAAGCT
TCATTTCCCACCACTCCAACTCCAGCTTCTATAGACACATCCTCAAAGCTGTTACAATGA
TTTACCTTCTTAAACACAATGTAAGCTGAGTAACGAGTTCTTGGAGATAGGACTCCAGTA
TTGGTCCTGCCTCTAATCTCAAACCAACATAAATCAAGAAGCTTCGCAACTCTTTTAAAC
CTAGCTTCAGGAAATGTAACCCATTCCCAATACTGTGGAGTATCTCCCCACATGATTGAG
ATGTTCATCGCAGATAACATGATACACTTCTTTCCACTGGCTTTGTCTAACCAAAAGCTC
TTTGTACCATCGTCTATAAGAACAGACTCCCCGCAAAACGCGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4ER70TF 728 0 0
T
CTCAAAGACAGCCCATCAACTCGCGCATCAAAGTATATGAATCT*GTAGAAGCTTCATTT
CCCACCACTCCAACTCCAGCTTCTATAGACACATCCTCAAAGCTGTTACAATGATTTAC*
TTCTTAAACACAATGTAAGCTGAGTAACGAGTTCTTGGAGATAGGACTCCAGTATTGGTC
CTGCCTCTAATCTCAAACCAACATAAATCAAGAAGCTTCGCAACTCTTTTAAACCTAGCT
TCAGGAAATGTAACCCATTCCCAATACTGTGGAGTATCTCCCCACATGATTGAGATGTTC
ATCGCAGATAACATGATACACTTCTTTCCACTGGCTTTGTCTAACCAAAAGCTCTTTGTA
CCATCGTCTATAAGAACAGACTCCTCGCAAAACGCGAAGTAGAGCTCCTTCTTGGATGAG
AAATGACGCGATGAAGGAACCAGAGATTCATACTCCGATGGAAGAAACTTATCCCATACA
ACATCTGACTTGGCCGCAGATTCAAAGGCTTTGGAAACCGAAGCGACGACGCAAGCATCA
CGTGGACTTGTGAAGGAAACTATCTTCGAAATGCAATCCTCCGGAAAGGAATCGAACGGC
GACGACGAATCCGAAACGATCTCTCGTCTGCGCTTGACGTGATTTTCACTCATCCTCGTA
GCCTCCTCTAGAGAGAGAGAAGGGAGATTCGACTTCTCTGACACTTTTTCCGACAAAACA
CTTATCC

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR4D595TF 640 0 0
TTAAACACAATGTAAGCTGAGTAACGAGTTCTTGGAGATAGGACTCCAGTATTGGTCCTG
CCTCTAATCTCAAACCAACATAAATCAAGAAGCTTCGCAACTCTTTTAAACCTAGCTTCA
GGAAATGTAACCCATTCCCAATACTGTGGAGTATCTCCCCACATGATTGAGATGTTCATC
GCAGATAACATGATACACTTCTTTCCACTGGCTTTGTCTAACCAAAAGCTCTTTGTACCA
TCGTCTATAAGAACAGACTCCCCGCAAAACGCGAAGTA*AGCTCCTTCTTGGATGAGAAA
TGACGCGATGAAGGAACCAGAGATTCATACTCCGATGGAAGAAACTTATCCCATACAACA
TCTGACTTGGCCGCAGATTCAAAGGCTTTGGAAACCGAAGCGACGACGCAAGCATCACGT
GGACTTGTGAAGGAAACTATCTTCGAAATGCAATCCTCCGGAAAGGAATCGAACGGCGAC
GACGAATCCGAAACGATCTCTCGTCTGCGCTTGACGTGATTTTCACTCATCCTCGTAGCC
TCCTCTAGAGAGAGAGAAGGGAGATTCGACTTCTCTGACACTTTTTCCGACAAAACACTT
ATCCGCGTCGACGTGGAAGTTTCGTAGAAATTCATAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 4

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TCTCTGCTTTTCAATCTTCTTCACTTCGAGTCTCCAGGAAAATGAGCTAACAACACCATC
TAAAGAAGAAGGAGAGATGAGGATGGTGCCATTAATGGAGGAGAAGTTTATGGTGATGAA
TGAGACAAGAAGGAAGCTTGGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTACTTGTTGTGGAGG
TGCTAAAGGACTTTGCTTGCCTTCACCTTGTTGCTTTGCAATTAACTGCAATATCCCAAA
TAGACCCTTTGGTTATTGCTCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCTTTGGTTGCCACAT
CTGATATCTTTCACTGTGCAGAGAAAAAAAGTAAATCAACATCTTGATTTCATCTGCGAA
GTATGAAAGGGAAGATAATAAGGAGTGTGTGTTCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATT
TTTGTTCATAATTCTATATTCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTACTATCTCCAGCAAC
ATCATCATCCTCATTAATTTAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTATGATAAAGAAATTT
GGGTCTTTCATGGAGGATCTTGTTCACACTTCAAGCTAGATTTGTTTTTCTTTGCCTCTC
TTCAATCAATTTATGTATCTGTTTTTTTTTCCTTCTTCGGTTTACTCCAGTTTTTTTTCT
CATGGGTTAGTATTTTATCACCAGGATTGTACTTGTAGCATATTTTGGGAAGGGTCTTTT
TGTTTTGTTTTGTTAAGTTGGCAATTGGAACTGGAAGATTAATATGATGATGATGGTGTT
GATGGTAGTGATGTTGAAGCTGCCTGTTAAAGCTAAGTCTTTTGTGATGTGATATGTTAA
GATTATTAAGAAATGGATAAAGTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G276TF U 1
AF RR4G276JQ C 260
BS 1 634 RR4G276TF
BS 635 928 RR4G276JQ

RD RR4G276TF 638 0 0
ACAAAGAAAAAAAAAGATGAGTGGTTTAGAAGAATCGAAGGTCTATATTTTTTTGTGGCT
TCTCTGCTTTTCAATCTTCTTCACTTCGAGTCTCCAGGAAAATGAGCTAACAACACCATC
TAAAGAAGAAGGAGAGATGAGGATGGTGCCATTAATGGAGGAGAAGTTTATGGTGATGAA
TGAGACAAGAAGGAAGCTTGGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTACTTGTTGTGGAGG
TGCTAAAGGACTTTGCTTGCCTTCACCTTGTTGCTTTGCAATTAACTGCAATATCCCAAA
TAGACCCTTTGGTTATTGCTCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCTTTGGTTGCCACAT
CTGATATCTTTCACTGTGCAGAGAAAAAAAGTAAATCAACATCTTGATTTCATCTGCGAA
GTATGAAAGGGAAGATAATAAGGAGTGTGTGTTCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATT
TTTGTTCATAATTCTATATTCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTACTATCTCCAGCAAC
ATCATCATCCTCATTAATTTAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTATGATAAAGAAATTT
GGGTCTTTCATGGAGGATCTTGTTCACACTTCAA
GCTA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4G276JQ 669 0 0
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TCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCTTTGGTTGCCACATCTGATATCTTTCACTGTGC
AGAGAAAAAAAGTAAATCAACATCTTGATTTCATCTGCGAAGTATGAAAGGGAAGATAAT
AAGGAGTGTGTGTTCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATTTTTGTTCATAATTCTATAT
TCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTACTATCTCCAGCAACATCATCATCCTCATTAATT
TAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTATGATAAAGAAATTTGGGTCTTTCATGGAGGATC
TTGTTCACACTTCAAGCTAGATTTGTTTTTCTTTGCCTCTCTTCAATCAATTTATGTATC
TGTTTTTTTTTCCTTCTTCGGTTTACTCCAGTTTTTTTTCTCATGGGTTAGTATTTTATC
ACCAGGATTGTACTTGTAGCATATTTTGGGAAGGGTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTAAGTT
GGCAATTGGAACTGGAAGATTAATATGATGATGATGGTGTTGATGGTAGTGATGTTGAAG
CTGCCTGTTAAAGCTAAGTCTTTTGTGATGTGATATGTTAAGATTATTAAGAAATGGATA
AAGTTAAGG

QA 1 669 1 669
DS 



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GGAAGTCACTCACAAAATCCCTAAACCTCACAACTCTTTCACAAAGAAAAAAAAAAGATG
AGTGCTTTAGAAGAGTCGAAGGTCTATATTTTTTTGTGGCTTCTCTGCTTTTCAATCTTC
TTCACTTCGAGTCTCCAGGCAAATGAGCTAACAACACCATCTAAAGAAGAAGGAGAGATG
AGGATGGTGCCATTAATGGAGGAGAAGTTTATGGTGATGAATGAGACAAGAAGGAAGCTT
GGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTACTTGTTGTGGAGGTGCTAAAGGACTTTGCTTG
CCTTCACCTTGTTGCTTTGCAATTAACTGCAATATCCCAAATAGACCCTTCGGTTATTGC
TCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCTTTGGTTGCCACATCTAATATCTTTCACTTAAC
TCAGGTGCAGAGAAAAAAGTAAATCAACATCTTGATTTCATCTGCAAAGTGTGAAAGGGA
AGATAAGAAGAAATATGCGTTCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATTTTTGTTCATAAT
TCTATATCCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTACTATCTTCAGCAACATCATCATCCTC
ATTAATTTAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTATGATAAAGAAATTTGGGTCTTTCATG
GAGGATCTTGTTCACACTTCAAGCTAGATTTGTTTTTCTCTGTCTCTCTTCAATCAATTT
ATGTATCTGTTTTTTCTCCTTCTTCTGTTTACTCCAGTTTTTTTTTTCATGGGTTAGTAT
TTTATCACCAGGATTGTACTTGTAGCATATTTTGGGAAGGGTCTTTTTGTTTTGTTTTGT
TAAGTTGGCAATTGGAACTGGAAGATTAATATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H849TF U 1
AF RR4H849JQB C 141
BS 1 682 RR4H849TF
BS 683 875 RR4H849JQB

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GGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTACTTGTTGTGGAGGTGCTAAAGGACTTTGCTTG
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TCAGGTGCAGAGAAAAAAGTAAATCAACATCTTGATTTCATCTGCAAAGTGTGAAAGGGA
AGATAAGAAGAAATATGCGTTCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATTTTTGTTCATAAT
TCTATATCCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTACTATCTTCAGCAACATCATCATCCTC
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GAGGATCTTGTTCACACTTCAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4H849JQB 735 0 0
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TCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATTTTTGTTCATAATTCTATATCCAGCTTTCATTA
AATTTCATTACCTACTATCTTCAGCAACATCATCATCCTCATTAATTTAATATCTTCTTT
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AAGCTAGATTTGTTTTTCTCTGTCTCTCTTCAATCAATTTATGTATCTGTTTTTTCTCCT
TCTTCTGTTTACTCCAGTTTTTTTTTTCATGGGTTAGTATTTTATCACCAGGATTGTACT
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GAAGATTAATATGAT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 2 4

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BQ
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AF RR4CR14JQ U 1
AF RR4BP34JQ U 1
BS 1 738 RR4BP34JQ

RD RR4CR14JQ 616 0 0
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QA 1 616 1 616
DS 

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AAGTTAAACAACATCGACAGCGAGTATAAACTCTCTACCATCTTTCGTTACAATATGTCT
AGATCGTCGATCCACCAAAAAAAAAAACTCTAAATTATTTCACATGCATTTACTTTTACA
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QA 1 738 1 738
DS 



CO CL2813Contig2 838 2 2 U
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP34TF U 1
AF RR4CR14TF U 1
BS 1 642 RR4BP34TF
BS 643 838 RR4CR14TF

RD RR4BP34TF 642 0 0
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ATGAGAAGGGAGATGGTTGGGGTATGTTATGAACGTAAAATGGGTTTATATAATATAGTT
TGAAGAGTATGGAGAGGACGAGAAGACTATAATGTAAACTTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4CR14TF 838 0 0
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TCTGCCAGTTTCTTCTCGGATTCCGGCAGCAGCGGAAGCATAGTTAACTCCCCTTAGGAT
GTCTTCTCCTCTGGCGGCGGCATACGGTGTAATGTAGTTGTCAAAACCCAAGAGCTCAGC
TATTTTTGTGATTATCCAAAAGGAAACATAGTAGCACTTTAGTTTCTTGTTTCAAGAAAA
AAAAACAAAGGAAAAGAAAGTAAAATGTAGTTAGTTAAGACTTACTGATAACATCAACTG
TAGTTTTGCCATTGCTAAACCGACCAGTTGGACCGAGAGCGAAATCAATACCGTAAGGAA
AGTAATTAGCTCTAGCTAGTGAATTAAGCTGATTATTGTTGCCATTATCAACCAAAGAGT
CACCAAATATGAAGTAACACGGTGCAATTGGATCACTAGCAACCATGTTAATGGCCGTAG
ATACCATAATCAACGTCACCATTAAACACATTTTCGCCATCTCTCCCTATGAATTAGATT
ATGAGAAGGGAGATGGTTGGGGTATGTTATGAACGTAAAATGGGTTTATATAATATAGTT
TGAAGAGTATGGAGAGGACGAGAAGACTATAATGTAAACTTTCTAACGGTTGGAGGAGCA
TTAAATGTTCACGCGGCGAGGATGTGTGGATGTGTAAATGTAAAAGTAAATGCATGTGAA
ATAATTTAGAGTTTTTTTTTTGGGGATCGACGATCTAGACATATTGTACGAAAGATGGTA
GAGAGTTATACTCGCTGTCGATGTTGTTAACTTTCTTATTGTGACCACTTGTATGTGA

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 4

CO CL2814Contig1 1088 4 5 U
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TGCTCCTCCTTCTCCCATACTTCCGGCGTCCGTACTCCGCCGCACAAATATTCTCGAGAG
ACTGGGAACAAGTTAGCTAAATCTATTGGCTACTCCTCACATCATCTTATCTCCAAGATT
AAACTTTTGTCTACCAAGCCCAATGACCCTGAAAGCAAGGGACTCTTCTTACAAACACCA
TCTCCAACCCTGCAAAGTTTTGATAAGTTATCAGCTTTTGAGGGATTTGGGAGGCTCAAG
TTACCTGTGATGGCAGTGTTGTTGACAAACTCCCTTCTCATTGGTACTACACCTCTCCAA
GCCTTGTCTGCTGAGATATGCGAGCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCAACATGCCTCTTTTG
TTGCTTGTCGCCCTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCAGAGGAAAGGG
GAGTTACAGAGGCTGAACGAACAGCTACGACAGATCAACACAGCCCTAAGAAGACAAGCC
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GAGAGCGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGATCTCCAAGCTGAAGACGGGC
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GCTTCGCTGCAACGTCAAGGGAAGTATAGAGATGCCATACAGTATCACAACATGGTTCTA
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GCTCGGTTAGAGACGGACTGATTCATTCATCTGTATTGTCTTTTTGTCTGTTTGTTTGTG
TTCATGTCATATCACATAAAATGGATATCAGATTCCCTTTTATTAAATGTAATTTTGTTT
GTCATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF34TF U 1
AF RR4DI48JQ C 521
AF RR4DI48TF U 521
AF RR4AF34JQ C 412
BS 1 590 RR4AF34TF
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BS 730 1077 RR4DI48TF
BS 1078 1088 RR4AF34JQ

RD RR4AF34TF 729 0 0
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TGCTCCTCCTTCTCCCATACTTCCGGCGTCCGTACTCCGCCGCACAAATATTCTCGAGAG
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TCTCCAACCCTGCAAAGTTTTGATAAGTTATCAGCTTTTGAGGGATTTGGGAGGCTCAAG
TTACCTGTGATGGCAGTGTTGTTGACAAACTCCCTTCTCATTGGTACTACACCTCTCCAA
GCCTTGTCTGCTGAGATATGCGAGCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCAACATGCCTCTTTTG
TTGCTTGTCGCCCTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCAGAGGAAAGGG
GAGTTACAGAGGCTGAACGAACAGCTACGACAGATCAACACAGCCCTAAGAAGACAAGCC
AAAATCGAGTCTTACGCGCCAGGGTTAAGTTACGCACCGGTAGGAGCTAGGATCCCACCG
GAGAGCGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGATCTCCAAGCTGAAGACGGGC
AAGACCTTTCTGAGGAACCAAGAGCTAGAGAAAGCTTTTTCTGAGTTCAAGATTGCTTTG
GAGCTTGCC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4DI48JQ 568 0 0
G
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AGGAGCTAGAATCCCACCGGAGAGCGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGAT
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AGCTGCCAGAGGCTTAGGCGCTTCGCTGCAACGTCAAGGGAAGTATAGAGATGCCATACA
GTATCACAACATGGTTCTAGCCATCTCGAATAGGGAAGGAGAAGATTTTGGTAGCACTGA
AGCTTATGGAGCTATTGCAGATTGTTACACTGAGCTGGGAGATCTTGAGAAAGCTGGGAC
TTACTATGACACCTACATTGCTCGGTTAGAGACGGACTGATTCATTCATCTGTATTGTCT
TTTTGTCTGTTTGTTTGTGTTCATGTCATATCACATAAAATGGATATCAGATTCCCTTTT
ATTAAATGTAATTTTG
CTTTTATAATC

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR4DI48TF 568 0 0
G
AGCCCTAAGAAGACAAGCCAAAATCGAGTTTTACGCGCCAGGGTTAAGTTACGCACCGGT
AGGAGCTAGAATCCCACCGGAGAGCGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGAT
CTCCAAGCTGAAGACGGGCAAGACCTTTCTGAGGAACCAAGAGCTAGAGAAAGCTTTTTC
TGAGTTCAAGATTGCTTTGGAGCTTGCCCAGAGTCTCGGAGACCCCATCGAAGAGAAGAA
AGCTGCCAGAGGCTTAGGCGCTTCGCTGCAACGTCAAGGGAAGTATAGAGATGCCATACA
GTATCACAACATGGTTCTAGCCATCTCGAATAGGGAAGGAGAAGATTCTGGTAGCACTGA
AGCTTATGGAGCTATTGCAGATTGTTACACTGAGCTGGGAGATCTTGAGAAAGCTGGGAC
TTACTATGACACCTACATTGCTCGGTTAGAGACGGACTGATTCATTCATCTGTATTGTCT
TTTTGTCTGTTTGTTTGTGTTCATGTCATATCACATAAAATGGATATCAGATTCCCTTTT
ATTAAATGTAATTTTG
CTTTTATAATC

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR4AF34JQ 677 0 0
CCTCTTTTGTTGCTTGTCGCCCTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCAG
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ATGGTTCTAGCCATCTCGAATAGGGAAGGAGAAGATTCTGGTAGCACTGAAGCTTATGGA
GCTATTGCAGATTGTTACACTGAGCTGGGAGATCTTGAGAAAGCTGGGACTTACTATGAC
ACCTACATTGCTCGGTTAGAGACGGACTGATTCATTCATCTGTATTGTCTTTTTGTCTGT
TTGTTTGTGTTCATGTCATATCACATAAAATGGATATCAGATTCCCTTTTATTAAATGTA
ATTTTGTTTGTCATACG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 4

CO CL2815Contig1 1292 4 27 U
GGACGTCTCTCCACAATCCCCCAATCAAACAAACAAACACGATACAGAGAGACGGTGAAG
TAGAAAAGACTTATCGAGATATAGCTTCCAAGAATGTCGATGATGCTCACGGCGGTCAAA
ACCCCTTCCCTCTGCAACAACACCCTAAACCTGACAGCTTCACCGAGATTCCCACAACGT
GCCAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCCTACGGCGAGGATCCAAACACGCATC
CATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATCCTCATGCCTGGATGCTACGACGCTTTATCC
GCTGCCATCGTGCAGCAAACCGGATTCTCCGCCGGTTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCC
GCTTCTCTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCTAACACCACCGGAGATGGCTGCGACG
GCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCATTATTGCAGATGCTGATACTGGT
GGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTATAAAGGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGCT
GGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCTAAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAG
GTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACGAGACGCTATTGGAGAT
TCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTGCCACTTCTGCTAAATCAGGGCTT
GAAGACGCCATCGCTCGTGTCAATCTCTACATGGAGGCTGGCGCTGATGCTTCCTTTGTG
GAGGCGCCGAGAGACGATGATGAGCTCAAGGAAATAGGCAAACGCACAAAGGGTTTCAGA
GTCTGCAACATGATCGAAGGCGGAGTCACGCCGTTGCACACGCCTGAGGAGCTTAAAGAA
ATGGGGTTTCACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCACTTTACGCATCGGCTCGAGCACTA
GTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAGGTCACTTGGAAAAGATG
GCGACTTTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCGTGGTTTGAGCTCGAAGCT
CGTTATTTGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAATCTTGAAGAGGCTGCTGC
TGCGTACTAGAGAGCCATAAGGTTTTATCTTCTTTCAAATGTCTCTGAAGCTCTTCTGTT
TTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCAATAAGACAATAATGTAA
CTTTTGCAGTCGTATAAAAGTTCCTATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CZ04TF U 1
AF RR4FS28TF U 398
AF RR4CZ04JQ C 458
AF RR4FS28JQ C 709
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BS 1134 1154 RR4FS28TF
BS 1155 1239 RR4CZ04JQ
BS 1240 1240 RR4FS28JQ
BS 1241 1292 RR4CZ04JQ

RD RR4CZ04TF 766 0 0
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TAGAAAAGACTTATCGAGATATAGCTTCCAAGAATGTCGATGATGCTCACGGCGGTCAAA
ACCCCTTCCCTCTGCAACAACACCCTAAACCTGACAGCTTCACCGAGATTCCCACAACGT
GCCAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCCTACGGCGAGGATCCAAACACGCATC
CATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATCCTCATGCCTGGATGCTACGACGCTTTATCC
GCTGCCATCGTGCAGCAAACCGGATTCTCCGCCGGTTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCC
GCTTCTCTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCTAACACCACCGGAGATGGCTGCGACG
GCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCATTATTGCAGATGCTGATACTGGT
GGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTATAAAGGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGCT
GGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCTAAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAG
GTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACGAGACGCTATTGGAGAT
TCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGA*CAGACGCACGTGCCACTTCTGCTAA*TCAGG*CTT
GA*GACGCCATCGCTCGTGTCA*TCTCTACATGGAGGCTG
CGCTGA

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DS 

RD RR4FS28TF 757 0 0
G
ACCACCGGAGATGGCTGCGACGGCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCAT
TATTGCAGATGCTGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTGTAAAGGA
CTTGATCGCAACTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCTAAGAAATG
CGGTCATATGCGCGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATC
AGCACTAGACGCTATCGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTGC
CACTTCTGCTAAATCAGGGCTTGAAGACGCCATCGCTCGTGTCAATCTCTACATGGAGGC
TGGCGCTGATGCTTCCTTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGATGATGAGCTCAAGGAAATAGG
CAAACGCACAAAGGGTTTCAGAGTCTGCAACATGATCGAAGGCGGAGTCACGCCGTTGCA
CACGCCTGAGGAGCTTAAAGAAATGGGGTTTCACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCACT
CTACGCATCGGCTCGAGCACTAGTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCAC
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GTCGTGGTTTGAGCTCGAAGCTCGTTATTTGAACCTTAG*AACGCTCTTGGGACGACAAC
AAA*TCTTGA*GAG*CTGCTGCTGCGTACTAGAGAG

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR4CZ04JQ 835 0 0
TTATTGCAGATGCTGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTATAAAGG
ACTTGATCGCAGCTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCTAAGAAAT
GCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCAT
CAGCACGAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTG
CCACTTCTGCTAAATCAGGGCTTGAAGACGCCATCGCTCGTGTCAATCTCTACATGGAGG
CTGGCGCTGATGCTTCCTTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGATGATGAGCTCAAGGAAATAG
GCAAACGCACAAAGGGTTTCAGAGTCTGCAACATGACCGAAGGCGGAGTCACGCCGTTGC
ACACGCCTGAGGAGCTTAAAGAAATGGGGTTTCACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCAC
TTTACGCATCGGCTCGAGCACTAGTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCA
CGAGAGGTCACTTGGAAAAGATGGCGACTTTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAG
AGTCGTGGTTTGAGCTCGAAGCTCGTTATTCGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAA
CAAAATCTTGAAGAGGCTGCTGCTGCGTACTAGAGAGCCATAAGGTTTTATCTTCTTTCA
AATGTCTCTGAAGCTCTTCTGTTTTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTC
TCGTCAATAAGACAATAATGTAACTTTTGCAGTCGTATAAAAGTTCCTATTTCCC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4FS28JQ 583 0 0
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GCTTCCTTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGATGATGAGCTCAAGGAAATAGGCAAACGCACA
AAGGGTTTCAGAGTCTGCAACATGATCGAAGGCGGAGTCACGCCGTTGCACACGCCTGAG
GAGCTTAAAGAAATGGGGTTTCACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCACTTTACGCATCG
GCTCGAGCACTAGTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAGGTCAC
TTGGAAAAGATGGCGACTTTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCGTGGTTT
GAGCTCGAAGCTCGTTATTTGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAATCTTGA
AGAGGCTGCTGCTGCGTACTAGAGAGCCATAAGGTTTTATCTTCTTTCAAATGTCTCTGA
AGCTCTTCTGTTTTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCAATAAG
ACAATAATGTAACTTTTGCAGTCGTGTAAAAGTTCCTATTTCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

CO CL2816Contig1 1180 4 13 U
GGACAAATCCCAGAAGAGAAAAAAGAAGTCAATAAGATCGAACTCTTAAAAAATAAAATA
AAAATAAGATCGAACTCTTACTACAAATCTCTCAACGCTCTTTCTAAGCTTACATCAAGA
ATTAAGATCCAAGAAGATTCATCGTACACATCCATGGACCAGTACCCATCGTCTTTGGTC
GATACTTCTTTAGATCTCACTATAAGTGTTACTCGTATGCGAGTTGAAGAAGAATCCACG
ACAACTGCTCTGGTGGATGAATTAAACCGAATGAATGCTGAGAACAAGAAGCTCTCAGAA
ATGCTAACTTTAATGTGTGACAAGTACAACGTCTTGAGAAAACAGCTTATGGAATATGTT
AACAAGACCGAGAGAGACCAAGTCAGTCCTCCCAAGAAACGCAAATCTCCAACGAGAGAT
GACACAAATAGTTCGGCTGTGGTCGGTGGAGTGTCCGAGAGTAGCTCTACGGATCAAGAT
GATCAGTATCTGTGTAAGAAGCAAAGAGAAGAGACAGTTGCTAAGGATAAAGTCTCAAGG
GTTTATTACAAGACCGAAGCTTCAGACACTACCCTTGTTGTGAAAGATGGGTTTCAATGG
AGGAAATATGGACAGAAGGTGACTAGAGACAATCCTTCTCCAAGAGCTTACTTCAAATGT
GCTTGTGCTCCAAGCTGTACTGTCAAAAAGAAGGTTCAAAGAAGTGTGGAGGATCAGTCC
GTGTTAGTTGCAACTTATGAGGGGGAACATAACCATCCAATGCCGTCGCATATCGATTCA
AACAGTGGCCTAAACCGTTCTCTTGGTGGTCCAGCTGCTGCAGCCAACAGAAGTAGGAGC
TTGGCTGAGCCTGTGACTAGCATCGATTTGACTGAATCCAAGAATGTGACAAGCCCATCA
AGAATAGATTTTCCAGAAGTTCAGAAACTTCTGGTGGAGCAAATGGCCTCTTCCTTGACA
AAAGATCCTAACTTCACAGCAGCATTAGCAGCAGCTGTTACCGGTAGATTGCACCAACAG
AATCAGACTGATAAATAATTTAGTTTCAAATTCTGTTAGTGTCTTTTTAGATTGAACTTG
GCATATGAGAGAGAGAGAGAGTAGATCATATGATCACTTCCGATACTAAAAATGTAACAT
TGTAATCATTTTTCATGCAATCTCCAATACCTAGTTTGAC


BQ
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AF RR4BQ80TF U 1
AF RR4CN89TF U 73
AF RR4CN89JQ C 361
AF RR4BQ80JQ C 435
BS 1 614 RR4BQ80TF
BS 615 688 RR4CN89TF
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BS 690 693 RR4CN89TF
BS 694 694 RR4CN89JQ
BS 695 744 RR4CN89TF
BS 745 745 RR4CN89JQ
BS 746 751 RR4CN89TF
BS 752 752 RR4CN89JQ
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BS 760 760 RR4CN89JQ
BS 761 777 RR4CN89TF
BS 778 1180 RR4CN89JQ

RD RR4BQ80TF 614 0 0
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AAAATAAGATCGAACTCTTACTACAAATCTCTCAACGCTCTTTCTAAGCTTACATCAAGA
ATTAAGATCCAAGAAGATTCATCGTACACATCCATGGACCAGTACCCATCGTCTTTGGTC
GATACTTCTTTAGATCTCACTATAAGTGTTACTCGTATGCGAGTTGAAGAAGAATCCACG
ACAACTGCTCTGGTGGATGAATTAAACCGAATGAATGCTGAGAACAAGAAGCTCTCAGAA
ATGCTAACTTTAATGTGTGACAAGTACAACGTCTTGAGAAAACAGCTTATGGAATATGTT
AACAAGACCGAGAGAGACCAAGTCAGTCCTCCCAAGAAACGCAAATCTCCAACGAGAGAT
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GATCAGTATCTGTGTAAGAAGCAAAGAGAAGAGACAGTTGCTAAGGATAAAGTCTCAAGG
GTTTATTACAAGACCGAAGCTTCAGACACTACCCTTGTTGTGAAAGATGGGTTTCAATGG
AGGAAATATGGACA

QA 1 614 1 614
DS 

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GAAGATTCATCGTACACATCCATGGACCAGTACCCATCGTCTTTGGTCGATACTTCTTTA
GATCTCACTATAAGTGTTACTCGTATGCGAGTTGAAGAAGAATCCACGACAACTGCTCTG
GTGGATGAATTAAACCGAATGAATGCTGAGAACAAGAAGCTCTCAGAAATGCTAACTTTA
ATGTGTGACAAGTACAACGTCTTGAGAAAACAGCTTATGGAATATGTTAACAAGACCGAG
AGAGACCAAGTCAGTCCTCCCAAGAAACGCAAATCTCCAACGAGAGATGACACAAATAGT
TCGGCTGTGGTCGGTGGAGTGTCCGAGAGTAGCTCTACGGATCAAGATGATCAGTATCTG
TGTAAGAAGCAAAGAGAAGAGACAGTTGCTAAGGATAAAGTCTCAAGGGTTTATTACAAG
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CAGAAGGTGACTAGAGACAATCCTTCTCCAAGAGCTTACTTCAAATGTGCTTGTGCTCCA
AGCTGTACTGTCAAAA*GAAG*TTCAAAGAAGTGTGGAGGATCAGTCCGTGTTAGTTGCA
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CAACAGTG

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DS 

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GACACAAATAGTTCGGCTGTGGTCGGTGGAGTGTCCGAGAGTAGCTCTACGGATCAAGAT
GATCAGTATCTGTGTAAGAAGCAAAGAGAAGAGACAGTTGCTAAGGATAAAGTCTCAAGG
GTTTATTACAAGACCGAAGCTTCAGACACTACCCTTGTTGTGAAAGATGGGTTTCAATGG
AGGAAATATGGACAGAAGGTGACTAGAGACAATCCTTCTCCAAGAGCTTACTTCAAATGT
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GTGTTAGTTGCAACTTATGAGGGGGAACATAACCATCCAATGCCGTCGCATATCGATTCA
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TTGGCTGAGCCTGTGACTAGCATCGATTTGACTGAATCCAAGAATGTGACAAGCCCATCA
AGAATAGATTTTCCAGAAGTTCAGAAACTTCTGGTGGAGCAAATGGCCTCTTCCTTGACA
AAAGATCCTAACTTCACAGCAGCATTAGCAGCAGCTGTTACCGGTAGATTGCACCAACAG
AATCAGACTGATAAATAATTTAGTTTCAAATTCTGTTAGTGTCTTTTTAGATTGAACTTG
GCATATGAGAGAGAGAGAGAGTAGATCATATGATCACTTCCGATACTAAAAATGTAACAT
TGTAATCATTTTTCATGCAATCTCCAATACCTAGTTTGAC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4BQ80JQ 746 0 0
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TAAGAAGCAAAGAGAAGAGACAGTTGCTAAGGATAAAGTCTCAAGGGTTTATTACAAGAC
CGAAGCTTCAGACACTACCCTTGTTGTGAAAGATGGGTTTCAATGGAGGAAATATGGACA
GAAGGTGACTAGAGACAATCCTTCTCCAAGAGCTTACTTCAAATGTGCTTGTGCTCCAAG
CTGTACTGTCAAAAAGAAGGTTCAAAGAAGTGTGGAGGATCAGTCCGTGTTAGTTGCAAC
TTATGAGGGGGAACATAACCATCCAATGCCGTCGCATATCGATTCAAACAGTGGCCTAAA
CCGTTCTCTTGGTGGTCCAGCTGCTGCAGCCAACAGAAGTAGGAGCTTGGCTGAGCCTGT
GACTAGCATCGATTTGACTGAATCCAAGAATGTGACAAGCCCATCAAGAATAGATTTTCC
AGAAGTTCAGAAACTTCTGGTGGAGCAAATGGCCTCTTCCTTGACAAAAGATCCTAACTT
CACAGCAGCATTAGCAGCAGCTGTTACCGGTAGATTGCACCAACAGAATCAGACTGATAA
ATAATTTAGTTTCAAATTCTGTTAGTGTCTTTTTAGATTGAACTTGGCATATGAGAGAGA
GAGAGAGTAGATCATATGATCACTTCCGATACTAAAAATGTAACATTGTAATCATTTTTC
ATGCAATCTCCAATACCTAGTTTGAC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL2817Contig1 1017 4 9 U
ATACTAAACTGCCTTCACTTTCAATTATTTTTTCAGCCTTTGATCAAGTAAAAATAACAT
TTTGTTTTGAATAAGACGGAATGGTTCCAGACTAGAAAAACAGGGAACACAACTTTGAAA
TCAGGGTTAAGATTTTTACATCCAAGATGCTGCAGTATTTTTGGGAAACAGAGAAACCGA
GAACAAGAAGACAAACAAGAGTGTACTTTGCGTCATAAACCGTAAAGCCCATGTCTAAAA
AGAGCAGCAGTAGCTCGATGAAGCACTGCTTGTTTGTGCTGGGTTTTGTTTGAAGATGTT
CTTCTTCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTAGGCGTTTCCAAAATCTTAAGAAC
AAGCTCTTCGAAACATTGCTCAACGTTGACACGAGTCTTTGCACTACACTCGAGAAACAA
ACATCCGTACTCCCGAGCAAAGTCAATGCCTTCTTTTTTAGAGACAGCTCTTTCACTCTC
CTTGTCGACTTTATTGCCAACAAGCATCTTGATGCAATCCTGATTAGTGGAGTACAGGTC
GATTTCCTTGGCCCATATATCTGATAGATTTGTGAATGTGTCTCGTCGTGTCACATCATA
CACCATTATTATGCCCTGAGCTCCTCTGTAATATGAACTTGTTAGCGTCCTAAACCTCTC
TTGCCCAGCTGCATCCCAAATGGCAAGCTTGAGTTTCTTGTCTCCAATGGTAAGATACTT
AACCTTAAAATCCACACCGATAGTGGGAGAAAGATCATCAAAGGTATTAGATGTGAAACT
AAACAAGAGAGAGCTTTTCCCAACACCAGAATCTCCGATCAATAACACTTTGAACAAGTA
ATCAAATTCTGGCTGCCCCGACGACGATCCCATCGCAAAAAAAACAATCAAACAAACACA
CACAAACTTCGAATCGATGAGTAAACTTTCCTCGAGATCTGCGATAACAATGGCAAAGAT
ACAGACAGGGGAAAAAAAGCCGAAGAAAATCTCAGAAACAGGGAAAGAGAGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G578TF C 1
AF RR4CZ53JQ U 45
AF RR4F889JQ U 19
AF RR4CZ53TF C 458
BS 1 20 RR4G578TF
BS 21 261 RR4F889JQ
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RD RR4G578TF 100 0 0
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TTTGTTTTGAATAAGACGGAATGGTTCCAGACTAGAAAAA

QA 1 100 1 100
DS 

RD RR4CZ53JQ 660 0 0
CG
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ACACAACTTTGAAATCAGGGTTAAGATTTTTACATCCAAGATGCTGCAGTATTTTTGGGA
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TGTTTGAAGATGTTCTTCTTCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTAGGCGTTTCC
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GG
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CTTCAGCAGTAAGACTAGGCGTTTCCAAAATCTTAAGAACAAGCTCTTCGAAACATTGCT
CAACGTTGACACGAGTCTTTGCACTACACTCGAGAAACAAACATCCGTACTCCCGAGCAA
AGTCAATGCCTTCTTTTTTAGAGACAGCTCTTTCACTCTCCTTGTCGACTTTATTGCCAA
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TCCTGATTAGTGGAGTACAGGTCGATTTCCTTGGCCCATATATCTGATAGATTTGTGAAT
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TTGTCTCCAATGGTAAGATACTTAACCTTAAAATCCACACCGATAGTGGGAGAAAGATCA
TCAAAGGTATTAGATGTGAAACTAAACAAGAGAGAGCTTTTCCCAACACCAGAATCTCCG
ATCAATAACACTTTGAACAAGTAATCAAATTCTGGCTGCCCCGACGACGATCCCATCGCA
AAAAAAACAATCAAACAAACACACACAAACTTCGAATCGATGAGTAAACTTTCCTCGAGA
TCTGCGATAACAATGGCAAAGATACAGACAGGGGAAAAAAAGCCGAAGAAAATCTCAGAA
ACAGGGAAAGAGAGAGATCC

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DS 



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TCGAACCTCACGGTGGCTCCGGCGGCGACGAGGAAGGGATCGAAGAGTTTAGGGAGAGGA
TGATGTTGGATATCAGAACGGTGAAGGAGTCCATCTTTAGAGAACATGTGCTTGATTACA
AAGAAGATGATCACATGAGCGAGAGAGATGAACTAGAGCAGCCGAAGAAGGAGAGGGACA
GGGAGGTTTCTCCGACGGTGGAGGTTAAGCGGTGGAATTTTAGAAAGAGAAGAGGAGAGT
GTGAGGCTATGGAATTAGGGTTTGTGGAGGAGAAAGTGAATACGTCGTCGTCGATGAGGT
CCAGGTTCATCTCGACGCTGTCGAAGAAAGAGGTGGAAGATGATATGATGATGATGACGG
GTCAGTTACCACCGCGACGGCCCAAGAAACGTCCCAGAGCGGTTCAGAAGAAGATCAATT
TTCTGCATCCAGCTTTTTATTTTAGTGAAGAAGTTACTGAAGATATCTACTAGGTCTCGG
ATGCCGCCTAGATGGGAAGTGATGATGACTATGGATAGTTCTACTTGAGTTTTTTTTTTG
CCAACATGTGGAGTCTCTTGAAGTTGGAGTGTGCATCAGAAAGTTGAAGCCTAAGATGTT
TTTCTCAATTTTGTTTCTTTAGCTTTTTTTTTTATTTCCTTTAGTTTGGTTTTGGCTGAA
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TTCTTTCAGTAAATCAGCAACGAACAGCCTAAATCAATAATCAATGAGAGGATTTAACAT
CTTACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 

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AF RR4E267TF U 1
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GCA

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CGACGCTGTCGAAGAAAGAGGTGGAAGATGATATGATGATGATGACGGGTCAGTTACCAC
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CTTTTTATTTTAGTGAAGAAGTTACTGAAGATATCTACTAGGTCTCGGATGCCGCCTAGA
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ATCAGCAACGAACAGCCTAAATCAATAATCAATGAGAGGATTTAACATCTTACC

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DS 



AS 1 4

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GTATTGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTCAACTTGCCTTGGTAAATGTCCCT
ATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGG
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ATTTCTTCTCTGTTTTTCCCTTCAGTTACTACGATTTCCTTTGGGCCGTCCTCTTGGTAT
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GAACAGCAGAGAAGCATCAGGGCAAGAGAAAGAGAATGTGAAACTCTCTTCAATCATCTC
CTCAGAGATATGTCTATATTTATCCTTGTTTATGTTATCGCTCTATGTGCTTTTAGATTT
TTGTTCCTTTTACAAAAAGTTCAAATAATCTAGTTATGGTTTTTCCGACAATAGTTTAAT
TATAGTTTGGATAATTTAATTATGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV73TF U 3
AF RR4B172TF U 1
AF RR4GV73JQ C 87
AF RR4B172JQ C 111
BS 1 456 RR4B172TF
BS 457 457 RR4GV73TF
BS 458 697 RR4B172TF
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BS 699 708 RR4B172TF
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BS 710 741 RR4B172TF
BS 742 742 RR4GV73JQ
BS 743 797 RR4B172TF
BS 798 798 RR4B172JQ
BS 799 879 RR4GV73JQ
BS 880 925 RR4B172JQ

RD RR4GV73TF 736 0 0
GG
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ATAGATACAGTTTTACTCGTAGATGTCGCCGTCGTCGCCGTTGGTGAAGTCTTATCTCTT
CGCTTACAATTTTCTCCAAGCTTCGTCATGGACGATTTCGCTTCTGAGTATCATTAGCAG
CGTTTTGTCGAACAAGAGGATCAGTGGCGGTTACGCTGCCGCTGGATATTTGATAAGTGT
GATGCAAACTGCTGCTGTACTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATAGGAATTGTACCGAGCGG
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ACAGATCACTGAGGTCCAGGATTCGCCATGGCTGGCAATAACACTAGTAGCTTGGTGTAT
TGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTCAACTTGCCTTGGTAAATGTCCCTATTG
GCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGGGTGA
ATTGTTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCACATGTTAAAGAAAGGAACCTTTATGAGAATTT
CTTCTCTGTTTTTCCCTTCAGTTACTACGATTTCCTTTGGGCCGTCCTCTTGGTATACCC
GTTCCTTTGGTTGAAGCTGTATCTCCAGCTGTTCAAACAAAGAAAGTCTAAGCTTGGAAC
AGCAGAGAAGCATC

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR4B172TF 804 0 0
GGACGAACGAGCAGCCACTACTATTCGAGCTTCCGCCCGCCGGATTACAAATCGCCGATC
GTCTATAGATACAGTTTTACTCGTAGATGTCGCCGTCGTCGCCGTTGGTGAAGTCTTATC
TCTTCGCTTACAATTTTCTCCAAGCTTCGTCATGGACGATTTCGCTTCTGAGTATCATTA
GCAGCGTTTTGTCGAACAAGAGGATCAGTGGCGGTTACGCTGCCGCTGGATACTTGATAA
GTGTGATGCAAACTGCTGCTGTACTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATAGGAATTGTACCGA
GCGGTTTCTTGTCTCCTTTGATGCAATGGAGTGGAAGGACACACTTCATATTAGCCATTG
TTGGACAGATCACTGAGGTCCAGGATTCGCCATGGCTGGCAATAACACTAGTAGCTTGGT
GTATTGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTTAACTTGCCTTGGTAAATGTCCCT
ATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGG
GTGAATTGTTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCACATGTTAAAGAAAGGAACCTTTATGAGA
ATTTCTTCTCTGTTTTTCCCTTCAGTTACTACGATTTCCTTTGGGCCGTCCTCTTGGTAT
ACCCGTTCCTTTGGTTGAAGCTGTATCTCCAGCTGTTGAAACAAAGAA*GTCTAAGCTTG
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CTCAGAGATATGTCTAT
ATTATCC

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DS 

RD RR4GV73JQ 795 0 0
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CGTCGTCGCCGTTGGTGAAGTCTTATCTCTTCGCTTACAATTTTCTCCAAGCTTCGTCAT
GGACGATTTCGCTTCTGAGTATCATTAGCAGCGTTTTGTCGAACAAGAGGATCAGTGGCG
GTTACGCTGCCGCTGGATATTTGATAAGTGTGATGCAAACTGCTGCTGTACTTGAAGTTC
TTCACGGAGCCATAGGAATTGTACCGAGCGGTTTCTTGTCTCCTTTGATGCAATGGAGTG
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GGCTGGCAATAACACTAGTAGCTTGGTGTATTGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATG
CTTCAACTTGCCTTGGTAAATGTCCCTATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCA
TCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGGGTGAATTGTTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCAC
ATGTTAAAGAAAGGAACCTTTATGAGAATTTCTTCTCTGTTTTTCCCTTCAGTTACTACG
ATTTCCTTTGGGCCGTCCTCTTGGTATACCCGTTCCTTTGGTTGAAGCTGTATCTCCAGC
TGTTCAAACAAAGAAAGTCTAAGCTTGGAACAGCAGAGAAGCATCAGGGCAAGAGAAAGA
GAATGTGAAACTCTCTTCAATCATCTCCTCAGAGATATGTCTATCTTTATCCTTGTTTAT
GTTATCGCTCTATGTGCTTTTAGATTTTTGTTCCTTTTACAAAAAGTTCAAATAATCTAG
TTATGG
CT

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DS 

RD RR4B172JQ 815 0 0
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AGTATCATTAGCAGCGTTTTGTCGAACAAGAGGATCAGTGGCGGTTACGCTGCCGCTGGA
TACTTGATAAGTGTGATGCAAACTGCTGCTGTACTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATAGGA
ATTGTACCGAGCGGTTTCTTGTCTCCTTTGATGCAATGGAGTGGAAGGACACACTTCATA
TTAGCCATTGTTGGACAGATCACTGAGGTCCAGGATTCGCCATGGCTGGCAATAACACTA
GTAGCTTGGTGTATTGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTTAACTTGCCTTGGT
AAATGTCCCTATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCAACG
GGACTAGTGGGTGAATTGTTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCACATGTTAAAGAAAGGAAC
CTTTATGAGAATTTCTTCTCTGTTTTTCCCTTCAGTTACTACGATTTCCTTTGGGCCGTC
CTCTTGGTATACCCGTTCCTTTGGTTGAAGCTGTATCTCCAGCTGTTGAAACAAAGAA*G
TCTAAGCTTGGAACAGCAGAGAAGCATCAGGGCAAGAGAAAGAGAATGTGAAACTCTCTT
CAATCATCTCCTCAGAGATATGTCTATATTTATCCTTGTTTATGTTATCGCTCTATGTGC
TTTTAGATTTTTGTTCCTTTTACAAAAAGTTCAAATAATCTAGTTATGGTTTTTCCGACA
ATAGTTTAATTATAGTTTGGATAATTTAATTATGC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 3

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AATACTTTTATACAGTCTGTAATGTAAGACACACAAGCATTCTGATGTCCAAAGTCACCT
CCCACCAGAGACTATAGAATCAACCATCGAAGATCCACATGTAAACATGTCTACCTCACC
AATTCCACGGTGGATTCCCAGCCCATGAAATTCCAGTGGTGACAAATCTGGTAGCACTGC
ATCTCCGCTTAGATAATTTAACACTTGTCTCATACTTGGTCTAGCCTGTGGGTTGGAGTG
AGAGCACAACAAACCTAGTTTCAAAATCATTTCGACTTCTCTTTCATCACAGTTTGTCCC
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CAAGAGCAAGCCCCTCTCACCATTCTCGTTCTGAATCTGGATAGGACGTCTACCGCAAGC
TACTTCTAGTAGTAACAACCCCAAGGCAAAAATATCGGTAGCAGTAGTGGCACGTCCTGT
CCTGACGTGATCTGGGGATAGGTATCCCCATGTTCCAGCGACTCGGGTGGTGTGAGGGTC
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GTCTAACAATACGTTGCTTGCTTTGACATCACGGTGAATCACCACTTGTTCCCATTCCTC
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GAGGGTTACCTCAGGATTATTATACAAATACTTGTCTAAGCTTCCATTGGGCATGTATCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A113JQ U 1
AF RR4A113JQD U 1
AF RR4A113TF C 106
BS 1 251 RR4A113JQ
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RD RR4A113JQ 790 0 0
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CCTGACGTGATCTGGGGATAGGTATCCCCATGTTCCAGCGACTCGGGTGGTGTGAGGGTC
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QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4A113JQD 790 0 0
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AATACTTTTATACAGTCTGTAATGTAAGACACACAAGCATTCTGATGTCCAAAGTCACCT
CCCACCAGAGACTATAGAATCAACCATCGAAGATCCACATGTAAACATGTCTACCTCACC
AATTCCACGGTGGATTCCCAGCCCATGAAATTCCAGTGGTGACAAATCTGGTAGCACTGC
ATCTCCGCTTAGATAATTTAACACTTGTCTCATACTTGGTCTAGCCTGTGGGTTGGAGTG
AGAGCACAACAAACCTAGTTTCAAAATCATTTCGACTTCTCTTTCATCACAGTTTGTCCC
TAGATTCGGATCCCTAGCATCCAAAATGTTTCCGTCACTCCAAAACTCAAAAACCCAATC
CAAGAGCAAGCCCCTCTCACCATTCTCGTTCTGAATCTGGATAGGACGTCTACCGCAAGC
TACTTCTAGTAGTAACAACCCCAAGGCAAAAATATCGGTAGCAGTAGTGGCACGTCCTGT
CCTGACGTGATCTGGGGATAGGTATCCCCATGTTCCAGCGACTCGGGTGGTGTGAGGGTC
TGACCCATGACTGCACAATCGAGCCAAACCGAAATCCCCCAGTCTCGCGTTGTGCTCCGC
GTCTAACAATACGTTGCTTGCTTTGACATCACGGTGAATCACCACTTGTTCCCATTCCTC
GTGAAGGTAGAATAAGGCGGAGGCCACACCTTTTATGACTTTAATCCTTTGTCTCCAGTT
GAGGGTTACC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4A113TF 735 0 0
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ATCACAGTTTGTCCCTAGATTCGGATCCCTAGCATCCAAAATGTTTCCGTCACTCCAAAA
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AGTGGCACGTCCTGTCCTGACGTGATCTGGGGATAGGTATCCCCATGTTCCAGCGACTCG
GGTGGTGTGAGGGTCTGACCCATGACTGCACAATCGAGCCAAACCGAAATCCCCCAGTCT
CGCGTTGTGCTCCGCGTCTAACAATACGTTGCTTGCTTTGACATCACGGTGAATCACCAC
TTGTTCCCATTCCTCGTGAAGGTAGAATAAGGCGGAGGCCACACCTTTTATGACTTTAAT
CCTTTGTCTCCAGTTGAGGGTTACCTCAGGATTATTATACAAATACTTGTCTAAGCTTCC
ATTGGGCATGTATCG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

CO CL2821Contig1 684 4 9 U
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GACTAACCTCATCTATCTTCTTGATCTGAGATTACTGTTTCAGCAAATGGAAAACAAAAG
GAAACGAAGGTTGATAGATAACAACGAGTGTCAGTAGATATTACAACATACGGGCAATCT
CTAAAGAGGACTTGCATGGTTTTCGATACATATCAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTT
TTAGTGGACGCACGTTCATCTTCAACATCATCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCA
TATACCTCTTCTTCCTCCACTCCCTATTCTTGCTCAACATCGTCCTCCACAGTATTGACC
CTCTCGCACTCATCAATCCACTCGCTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTGATA
GTAGTGCTAAAGCTTTCCTCACAGATCCTACAAGTGGCAATACCAATCATCTCCTTCATA
TTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAAAAGGGACAACTAAAGACAGTGTCA
AGCTTGTCAATTCGCTTCGTTGTAGCAGGATTTGCCCTTGACTTCCTCTTCCCCATTGCT
TCCTCAAAACAAAAACTGTTATTGCACAAAGATCGACTCCTCGAGGAGCAGCGAAATACG
AAACCCTAGAAAGATGTCAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO50TF C 1
AF RR4BO50JQ U 9
AF RR4AX28JQ U 121
AF RR4AX28TF C 121
BS 1 8 RR4BO50TF
BS 9 548 RR4BO50JQ
BS 549 549 RR4AX28JQ
BS 550 569 RR4BO50JQ
BS 570 570 RR4AX28JQ
BS 571 636 RR4BO50JQ
BS 637 637 RR4AX28JQ
BS 638 675 RR4BO50JQ
BS 676 684 RR4AX28JQ

RD RR4BO50TF 677 0 0
TTTTTTTTAGATCTCAAACCTCC*TGATTAT*ATTTCTTGCTCTTGACGGTTCTAAACTT
GACTAACCTCATCTATCTTCTTGATCTGAGATTACTGTTTCAGCAAATGGAAAACAAAAG
GAAACGAAGGTTGATAGATAACAACGAGTGTCAGTAGATATTACAACATACGGGCAATCT
CTAAAGAGGACTTGCATGGTTTTCGATACATATCAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTT
TTAGTGGACGCACGTTCATCTTCAACATCATCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCA
TATACCTCTTCTTCCTCCACTCCCTATTCTTGCTCAACATCGTCCTCCACAGTATTGACC
CTCTCGCACTCATCAATCCACTCGCTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTGATA
GTAGTGCTAAAGCTTTCCTCACAGATCCTACAAGTGGCAATACCAATCATCTCCTTCATA
TTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAAAAGGGACAACTAAAGACAGTGTCA
AGCTTGTCCATTCGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTCTTCCCCATTGCT
TCCTCAAAACAAAAACTGTTATTGCACAAAGATCGATTCCTCGAGGAGCAGCGAAATACG
AAACCCTAGAAAGAT
CC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4BO50JQ 669 0 0
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TCATCTATCTTCTTGATCTGAGATTACTGTTTCAGCAAATGGAAAACAAAAGGAAACGAA
GGTTGATAGATAACAACGAGTGTCAGTAGATATTACAACATACGGGCAATCTCTAAAGAG
GACTTGCATGGTTTTCGATACATATCAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTAGTGGA
CGCACGTTCATCTTCAACATCATCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCATATACCTC
TTCTTCCTCCACTCCCTATTCTTGCTCAACATCGTCCTCCACAGTATTGACCCTCTCGCA
CTCATCAATCCACTCGCTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTGATAGTAGTGCT
AAAGCTTTCCTCACAGATCCTACAAGTGGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTG
GCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAAAAGGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTC
CATTCGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTCTTCCCCATTGCTTCCTCAAA
ACAAAAACTGTTATTGCACAAAGATCGATTCCTCGAGGAGCAGCGAAATACGAAACCCTA
GAAAGAT
CC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4AX28JQ 564 0 0
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CTAAAGAGGACTTGCATGGTTTTCGATACATATCAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTT
TTAGTGGACGCACGTTCATCTTCAACATCATCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCA
TATACCTCTTCTTCCTCCACTCCCTCTTCTTGCTCAACATCGTCCTCCACAGTATTGACC
CTCTCGCACTCATCAATCCACTCGCTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTGATA
GTAGTGCTAAAGCTTTCCTCACAGATCCTACAAGTGGCAATACCAATCATCTCCTTCATA
TTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAAAAGGGACAACTAAAGACAGTGTCA
AGCTTGTCAATTCGCTTCGTTGTAGCAGGATTTGCCCTTGACTTCCTCTTCCCCATTGCT
TCCTCAAAACAAAAACTGTTATTGCACAAAGATCGACTCCTCGAGGAGCAGCGAAATACG
AAACCCTAGAAAGATGTCAATTCC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4AX28TF 564 0 0
GAAACGAAGGTTGATAGATAACAACGAGTGTCAGTAGATATTACAACATACGGGCAATCT
CTAAAGAGGACTTGCATGGTTTTCGATACATATCAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTT
TTAGTGGACGCACGTTCATCTTCAACATCATCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCA
TATACCTCTTCTTCCTCCACTCCCTCTTCTTGCTCAACATCGTCCTCCACAGTATTGACC
CTCTCGCACTCATCAATCCACTCGCTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTGATA
GTAGTGCTAAAGCTTTCCTCACAGATCCTACAAGTGGCAATACCAATCATCTCCTTCATA
TTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAAAAGGGACAACTAAAGACAGTGTCA
AGCTTGTCAATTCGCTTCGTTGTAGCAGGATTTGCCCTTGACTTCCTCTTCCCCATTGCT
TCCTCAAAACAAAAACTGTTATTGCACAAAGATCGACTCCTCGAGGAGCAGCGAAATACG
AAACCCTAGAAAGAT
GTCAATTCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 4

CO CL2822Contig1 637 4 10 U
GTAAATGACTCAAACCATAATTAAAATAACCCAAATGTTGAGTTTTCTCCACGGTTTTTT
CTAGCGACAATCATTGCAACAAAACTAACATAACATAACTTTATAGTAATTAATTAATAG
GTTTTAGATTGTTGTTTACAAACCGTCTGGTTCAATTTTTTCAAACCGGCCGGTCCAACT
ACGAAAGATGAGGTTGATTTAATTAGCTCTGGTTCCGGCACCACCACCACTACCGTCGTG
TTCGTTATTTCCACCGTGAAACGCCGATGAAAAATTGGTGTTTATATCAGAATACATGGA
AACAACCTTAGAGATGTTTCCGTTGAGTTCTTGGATCAAAGCGACGTTCTTGGACATGTT
ATCTGCCATTCTTGATTGGTGATTGTCGTTGACCTGCTGGATCAGTGATCTGTTTCTGTC
CAAAACCGATTGCACTTGTCTGAAATTCCGATCTAGACTCTCCCACATCGCCGGATCTTC
TCCTCCTCCCTGCTCCGCCTCCTCTGCCACGTTCCTCCGTCTCTTCGTTTCGATGTTCCT
CTTCAAAAAAATGAATGATTTTTTCCAAACTAATTTTATCAACCGAAGAGGCGAAGATAT
CGATTTTGTGTTCTTCTTTTTTACGATTTTACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4CL76JQ U 1
AF RR4CL76TF C 1
AF RR4CA13JQ U 7
AF RR4CA13TF C 7
BS 1 126 RR4CL76JQ
BS 127 127 RR4CA13JQ
BS 128 289 RR4CL76JQ
BS 290 290 RR4CA13JQ
BS 291 310 RR4CL76JQ
BS 311 311 RR4CA13JQ
BS 312 545 RR4CL76JQ
BS 546 548 RR4CA13JQ
BS 549 594 RR4CL76JQ
BS 595 637 RR4CA13JQ

RD RR4CL76JQ 594 0 0
GTAAATGACTCAAACCATAATTAAAATAACCCAAATGTTGAGTTTTCTCCACGGTTTTTT
CTAGCGACAATCATTGCAACAAAACTAACATAACATAACTTTATAGTAATTAATTAATAG
GTTTTAAATTGTTGTTTACAAACCGTCTGGTTCAATTTTTTCAAACCGGCCGGTCCAACT
ACGAAAGATGAGGTTGATTTAATTAGCTCTGGTTCCGGCACCACCACCACTACCGTCGTG
TTCGTTATTTCCACCGTGAAACGCCGATGAAAAATTGGTGTTTATATCAAAATACATGGA
AACAACCTTAAAGATGTTTCCGTTGAGTTCTTGGATCAAAGCGACGTTCTTGGACATGTT
ATCTGCCATTCTTGATTGGTGATTGTCGTTGACCTGCTGGATCAGTGATCTGTTTCTGTC
CAAAACCGATTGCACTTGTCTGAAATTCCGATCTAGACTCTCCCACATCGCCGGATCTTC
TCCTCCTCCCTGCTCCGCCTCCTCTGCCACGTTCCTCCGTCTCTTCGTTTCGATGTTCCT
CTTCATTTAAATGAATGATTTTTTCCAAACTAATTTTATCAACCGAAGAGGCGA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4CL76TF 634 0 0
GTAAATGA
CTCAAACCATAATTAAAATAACCCAAATGTTGAGTTTTCTCCACGGTTTTTTCTAGCGAC
AATCATTGCAACAAAACTAACATAACATAACTTTATAGTAATTAATTAATAGGTTTTAGA
TTGTTGTTTACAAACCGTCTGGTTCAATTTTTTCAAACCGGCCGGTCCAACTACGAAAGA
TGAGGTTGATTTAATTAGCTCTGGTTCCGGCACCACCACCACTACCGTCGTGTTCGTTAT
TTCCACCGTGAAACGCCGATGAGAAATTGGTGTTTATATCAGAATACATGGAAACAACCT
TAGAGATGTTTCCGTTGAGTTCTTGGATCAAAGCGACGTTCTTGGACATGTTATCTGCCA
TTCTTGATTGGTGATTGTCGTTGACCTGCTGGATCAGTGATCTGTTTCTGTCCAAAACCG
ATTGCACTTGTCTGAAATTCCGATCTAGACTCTCCCACATCGCCGGATCTTCTCCTCCTC
CCTGCTCCGCCTCCTCTGCCACGTTCCTCCGTCTCTTCGTTTCGATGTTCCTCTTCATTT
AAATGAATGATTTTTTCCAAACTAATTTTATCAACCGAAGAGGCGAAGATATCGATTTTG
TGTTCTTCTTTTTTACGATTTTACGA

QA 9 634 9 634
DS 

RD RR4CA13JQ 631 0 0
GG
CTCAAACCATAATTAAAATAACCCAAATGTTGAGTTTTCTCCACGGTTTTTTCTAGCGAC
AATCATTGCAACAAAACTAACATAACATAACTTTATAGTAATTAATTAATAGGTTTTAGA
TTGTTGTTTACAAACCGTCTGGTTCAATTTTTTCAAACCGGCCGGTCCAACTACGAAAGA
TGAGGTTGATTTAATTAGCTCTGGTTCCGGCACCACCACCACTACCGTCGTGTTCGTTAT
TTCCACCGTGAAACGCCGATGAAAAATTGGTGTTTATATCAGAATACATGGAAACAACCT
TAGAGATGTTTCCGTTGAGTTCTTGGATCAAAGCGACGTTCTTGGACATGTTATCTGCCA
TTCTTGATTGGTGATTGTCGTTGACTTGCTGGATCAGTGATCTGTTTCTGTCCAAAACCG
ATTGCACTTGTCTGAAATTCCGATCTAGACTCTCCCACATCGCCGGATCTTCTCCTCCTC
CCTGCTCCGCCTCCTCTGCCACGTTCCTCCGTCTCTTCGTTTCGCTGTTCCTCTTCAAAA
AAATGAATGATTTTTTCCAAACTAATTTTATCAACCGAAGAGGCGAAGATATCGATTTTG
TGTTCTTCTTTTTTACGATTTTACGATCC

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR4CA13TF 631 0 0
GG
CTCAAACCATAATTAAAATAACCCAAATGTTGAGTTT*CTCCACGGTTTTTTCTAGCGAC
AATCATTGCAACAAAACTAACATAACATAACTTTATAGTAATTAATTAATAGGTTTTAGA
TTGTTGTTTACAAACCGTCTGGTTCAATTTTTTCAAACCGGCCGGTCCAACTACGAAAGA
TGAGGTTGATTTAATTAGCTCTGGTTCCGGCACCACCACCACTACCGTCGTGTTCGTTAT
TTCCACCGTGAAACGCCGATGAGAAATTGGTGTTTATATCAGAATACATGGAAACAACCT
TAGAGATGTTTCCGTTGAGTTCTTGGATCAAAGCGACGTTCTTGGACATGTTATCTGCCA
TTCTTGATTGGTGATTGTCGTTGACTTGCTGGATCAGTGATCTGTTTCTGTCCAAAACCG
ATTGCACTTGTCTGAAATTCCGATCTAGACTCTCCCACATCGCCGGATCTTCTCCTCCTC
CCTGCTCCGCCTCCTCTGCCACGTTCCTCCGTCTCTTCGTTTCGCTGTTCCTCTTCAAAA
AAATGAATGATTTTTTCCAAACTAATTTTATCAACCGAAGAGGCGAAGATATCGATTTTG
TGTTCTTCTTTTTTACGATTTTACGA
TCC

QA 3 628 3 628
DS 



AS 1 3

CO CL2823Contig1 920 3 2 U
GGGTGACAACTGTGAGATCCGAATTTAAGTGAAAAACGCATTCGATAGAGAGAGACGACA
ACATGGCGAAACAGGAAGAAGTCACGGTCCCGATCTTCTCATCCCTTGATCATGTCTACG
GCGAAGGATCTCAGCTCCAAGAAGCCAAGTCACGATTCGATGCTCTGAAATCCAAATTCA
ACCAGGTCTTCGATGCTTCTCCCCAGCTCTTCGCTCGCTCTCCCGGAAGAGTGAATCTGA
TCGGAGAGCACATTGACTATGAGGGATACTCTGTGTTACCGATGGCTATTCGTCAGGACA
CAATTGTCGCAATCAGGAAACGTGAGGGTTCAAATGAGTTGAGGATAGCAAACGTTAATG
AGAAGTACTCCATGTGTACTTATCCTGCTGATCCTCACCAGGAGATTGACTTGCAGAATC
ACAAGTGGGGTCATTACTTCATCTGCGCGTATAAAGGGTTCCATGAGTATGCAAAGTCAA
AAGGGGTGAATGTTGATTCACCTGTTGGACTTGATGTGGTTGTTGATGGCATTGTTCCTA
CAGGTTCTGGGTTGTCAAGTTCTGCTGCCTTTGTTTGCTCATCAACCATTGCTATTATGG
CCGTCTTTGGTGAGAACTTTGAAAAGAAAGAACTTGCACAGCTTACATGTGAATGTGAAC
ACCACATTGGAACACAATCTGGTGGCATGGACCAGGCAATCTCTAACATGGCTAAAACTG
GTTTTGCTGAGCTTATCGACTTCAACCCGGTCCGCGCAACCGATGCGAAGCTCCCTCATG
GTGGGAGTTTTGTGATCGCACACTCTCTTGCAGAGTCTCAGAAGGCGGTCACAGCTGCTA
CTAATTACAACAACAGGGTCGTTGAGTGTCGACTTGCTTCGATCATACTCGGCATTAAGC
TCGGAATGGAACCGAAAGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY56JQ C 1
AF RR4BY56TF U 1
AF RR4EE47TF U 293
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BS 384 920 RR4EE47TF

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GGGTGACAACTGTGAGATCCGAATTTAAGTGAAAAACGCATTCGATAGAGAGAGACGACA
ACATGGCGAAACAGGAAGAAGTCACGGTCCCGATCTTCTCATCCCTTGATCATGTCTACG
GCGAAGGATCTCAGCTCCAAGAAGCCAAGTCACGATTCGATGCTCTGAAATCCAAATTCA
ACCAGGTCTTCGATGCTTCTCCCCAGCTCTTCGCTCGCTCTCCCGGAAGAGTGAATCTGA
TCGGAGAGCACATTGACTATGAGGGATACTCTGTGTTACCGATGGCTATTCGTCAGGACA
CAATTGTCGCAATCAGGAAACGTGAGGGTTCAAATGAGTTGAGGATAGCAAACGTTAATG
AGAAGTACTCCATGTGTACTTAT

QA 1 383 1 383
DS 

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G
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CAGAATCACAAGTGGGGTCATTACTTCATCTGCGCGTATAAAGGGTTCCATGAGTATGCA
AAGTCAAAAGGGGTGAATGTTGATTCACCTGTTGGACTTGATGTGGTTGTTGATGGCATT
GTTCCTACAGGTTCTGGGTTGTCAAGTTCTGCTGCCTTTGTTTGCTCATCAACCATTGCT
ATTATGGCCGTCTTTGGTGAGAACTTTGAAAAGAAAGAACTTGCACAGCTTACATGTGAA
TGTGAACACCACATTGGAACACAATCTGGTGGCATGGACCAGGCAATCTCTAACATGGCT
AAAACTGGTTTTGCTGAGCTTATCGACTTCAACCCGGTCCGCGCAACCGATGCGAAGCTC
CCTCATGGTGGGAGTTTTGTGATCGCACACTCTCTTGCAGAGTCTCAGAAGGCGGTCACA
GCTGCTACTAATTACAACAACAGGGTCGTTGAGTGTCGACTTGCTTCGATCATACTCGGC
ATTAAGCTCGGAATGGAACCGAAAGAA

QA 2 628 2 628
DS 



AS 1 4

CO CL2824Contig1 1033 4 19 U
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TAAATTCACTCTGTTAACTCAATTCCCTTTCCGATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAAC
TATCAGTGGAAGCTCCTCGCAGCGTATCTAACTCTAACCTTAGCTTTGATTCACCTCGCG
GAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGAAGGAGCTTATCGGACCCAGAC
CATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCACGTCACC
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CTTGCACCTGAGCT*GGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAAC
ATCCAAGGAACTATACCTTCCGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTC
TACAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTC
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AACAAGAACTGGGAGGTGACCTTTGTAAGAAGAACACTTCACCACTTTTTATCAAATATC
ACAACTATTATTATGTACTGAGTATATATATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAAAAG
AGTCAGAATCTGTAATCCATCTGTCTCAGTTAAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTAC
TGTAATGATCGTGTGTTTGACACTTAGATGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTG
CCTTGTTTGCATT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO75TF U 3
AF RR4DJ26TF U 1
AF RR4EO75JQ C 163
AF RR4DJ26JQ C 438
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GG
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CACCTGAGCT*GGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAACATCC
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TACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTTCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAA
GCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCA

QA 3 652 3 652
DS 

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TAAATTCACTCTGTTAACTCAATTCCCTTTCCGATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAAC
TATCAGTGGGAGCTCCTCGCAGCGTATCTAACTCTAACCTTAGCTTTGATTCACCTCGCG
GAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGAAGGAGCTTATCGGACCCAGAC
CATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGTTTCCACGTCACC
TGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACAT
CTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAAC
ATCCAAGGTACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTC
TACAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTC
TTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATC
CCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGA
GGACCGTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGA*CAATTCGCG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EO75JQ 724 0 0
GCTTTGATTCACCTCGCGGAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGAAGG
AGCTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGT
ACCTGGTTCCACGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAAT
TCAAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGCT*GGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTG
GAGCTGTACAAGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCCGAACTTGCAAACCTGAAGAGC
CTCATCAGCTTGGATCTCTACAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGG
AAACTCAAGTCTCTGGTCTTTTTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTTCAATCCCT
AGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGT
GGAACCATCCCAACAGGAGGACCGTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAAT
TCGCGATTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTGA
AACATCATCTGAAAAAAAA*CAAGAACTGGGAGGTGACCTTTGTAAGAAGAACACTTCAC
CACTTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTACTGAGTATATATATAT
GTCCTAGTTGCCG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DJ26JQ 596 0 0
TTCT
GAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTCTACAACAACAATCTTACTGGG
AAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTTTTTGGTCTTTTTACGACTCAATGACAAC
CAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGAT
GTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCGTTTGAACACATTCCT
TTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGATTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGC
TACGACACCAACTGCAACTGAAACATCATCTGAAAAAAAAACAAGAACTGGGAGGTGACC
TTTGTAAGAAGAACACTTCACCACTTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTACTGA
GTATATATATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAAAAGAGTCAGAATCTGTAATCCATC
TGTCTCAGTTAAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTACTGTAATGATCGTGTGTTTGAC
ACTTAGATGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTGCCTTGTTTGCATT

QA 5 596 5 596
DS 



AS 1 4

CO CL2825Contig1 885 4 20 U
GGACGCCGATAACGTAGATACAACAATACATTACACCACAAGGAAGCTAAGTTCGGATCA
AATCAGTCTTATATTGCATCATGGATCCTGAAAGGGTACGTCCTTCAAGCGCTCATGATT
CTCCCTTCTTCACTACAAACTCTGGTGCTCCAGTCTGGAACAACAACGCCTCTTTGACTG
TTGGACCCAGAGGTCCAGTCCTTCTGGAAGACTATCATCTGATCGAGAAACTGGCCAACT
TTGACAGGGAAAGGATTCCTGAGAGGGTTGTTCATGCCAGAGGTGCCAGTGCTAAAGGTT
TCTTTGAAGTCACTCATGACATTTCAAACCTTTCTTGCGCTGATTTCCTTCGAGGCACCG
GTGTTCAGACTCCTGTCATTGCTCGTTTCTCGACTGTCATCCATGAGCGTGGCAGCCCCG
AGACTCTCATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGA
ACCCGGTTCGCCATGCTGAAAAATATCCTCAGAATCCTATTGCATGCGCTGGGAACCGTG
AGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAATAACTTCAAGCAGCCAGGGGAAAGATACAGATCCT
GGGATGCAGACAGGCAAGAGCGGTTCCTGAAGCGTTTTGTTGATGCACTTGCTGAGCCTC
GTGTGACCCACGAAATCCGCAGCATTTGGATCTCTAACTGGACTAAGGCAGACGAATCTC
TTGGACAGAAACTAGCCACTCGTCTTAAAGTGAGCCCAAACTTCTGATTTGTATCATGGC
TAAAGACTAAGTAAAGCCCCAGTAAACCCTAAACATGCTCCTCTTACGCTTTGGTCTCCA
AGTAATCTCTTTGGTAATAGATATACATTAAAATAAAACAGTGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CJ22TF U 1
AF RR4C981TF U 1
AF RR4C981JQ C 91
AF RR4CJ22JQ C 95
BS 1 707 RR4C981TF
BS 708 708 RR4C981JQ
BS 709 730 RR4C981TF
BS 731 731 RR4C981JQ
BS 732 748 RR4C981TF
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BS 750 759 RR4C981TF
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BS 771 783 RR4C981TF
BS 784 784 RR4C981JQ
BS 785 799 RR4C981TF
BS 800 800 RR4C981JQ
BS 801 805 RR4C981TF
BS 806 806 RR4C981JQ
BS 807 820 RR4C981TF
BS 821 821 RR4C981JQ
BS 822 841 RR4C981TF
BS 842 885 RR4C981JQ

RD RR4CJ22TF 702 0 0
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TTGACAGGGAAAGGATTCCTGAGAGGGTTGTTCATGCCAGAGGTGCCAGTGCTAAAGGTT
TCTTTGAAGTCACTCATGACATTTCAAACCTTTCTTGCGCTGATTTCCTTCGAGGCACCG
GTGTTCAGACTCCTGTCATTGCTCGTTTCTCGACTGTCATCCATGAGCGTGGCAGCCCCG
AGACTCTCATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGA
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AGAAGTGCATGATTGAGAAG*AGAATAACTTCAAGCAGCCAGGGGAAAGATACAGATCCT
GGGATGCAGACAGGCAAGAGCGGTTCCTGAAGCGTTTTGTTGATGCACTTGCTGAGCCTC
GTGTGACCCACGAAATCCGCAGCATT*GGATCTCTAACTGGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4C981TF 841 0 0
GGACGCCGATAACGTAGATACAACAATACATTACACCACAAGGAAGCTAAGTTCGGATCA
AATCAGTCTTATATTGCATCATGGATCCTGAAAGGGTACGTCCTTCAAGCGCTCATGATT
CTCCCTTCTTCACTACAAACTCTGGTGCTCCAGTCTGGAACAACAACGCCTCTTTGACTG
TTGGACCCAGAGGTCCAGTCCTTCTGGAAGACTATCATCTGATCGAGAAACTGGCCAACT
TTGACAGGGAAAGGATTCCTGAGAGGGTTGTTCATGCCAGAGGTGCCAGTGCTAAAGGTT
TCTTTGAAGTCACTCATGACATTTCAAACCTTTCTTGCGCTGATTTCCTTCGAGGCACCG
GTGTTCAGACTCCTGTCATTGCTCGTTTCTCGACTGTCATCCATGAGCGTGGCAGCCCCG
AGACTCTCATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGA
ACCCGGTTCGCCATGCTGAAAAATATCCTCAGAATCCTATTGCATGCGCTGGGAACCGTG
AGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAATAACTTCAAGCAGCCAGGGGAAAGATACAGATCCT
GGGATGCAGACAGGCAAGAGCGGTTCCTGAAGCGTTTTGTTGATGCACTTGCTGAGCCTC
GTGTGACCCACGAAATCCGCAGCATTTGGATCTCTAACTGGACTAAG*CAGACGAATCTC
TTGGACAGAA*CTAGCCACTCGTCTTAA*GTGAGCCCAA*CTTCTGATT*GTATCATGGC
TAA*GACTAAGTAAAGCCC*AGTAA*CCCTAAACATGCTC*TCTTACGCTTTGGTCTCCA
A

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4C981JQ 795 0 0
AAA
GGGTACGTC*TTCAAGCGCTCATGATTCTCC*TTCTTCACTACAAACTCTGGTGCTCCAG
TCTGGAACAACAACGCCTCTTTGACTGTTGGACCCAGAGGTCCAGTCCTTCTGGAAGACT
ATCATCTGATCGAGAAACTGGCCAACTTTGACAGGGAAAGGATTCCTGAGAGGGTTGTTC
ATGCCAGAGGTGCCAGTGCTAAAGGTTTCTTTGAAGTCACTCATGACATTTCAAACCTTT
CTTGCGCTGATTTCCTTCGAGGCACCGGTGTTCAGACTCCTGTCATTGCTCGTTTCTCGA
CTGTCATCCATGAGCGTGGCAGCCCCGAGACTTTCATGAACTTCATGCACAGAGATGAGG
AGGTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAACCCGGTTCGCCATGCTGAAAAATATCCTCAGA
ATCCTATTGCATGCGCTGGGAACCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAATAACTTCA
AGCAGCCAGGGGAAAGATACAGATCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGGTTCCTGAAGC
GTTTTGTTGATGCACTTGCTGAGCCTCGTGTGACCCACGAAATCCGCAGCATTTGGATCT
CTAACTGGACTAAGGCAGACGAATCTCTTGGACAGAAACTAGCCACTCGTCTTAAAGTGA
GCCCAAACTTCTGATTTGTATCATGGCTAAAGACTAAGTAAAGCCCCAGTAAACCCTAAA
CATGCTCCTCTTACGCTTTGGTCTCCAAGTAATCTCTTTGGTAATAGATATACATTAAAA
TAAAACAGTGAC

QA 4 795 4 795
DS 

RD RR4CJ22JQ 791 0 0
GGGTACGT
CTTCAAGCGCTCATGATTCTCC*TTCTTCACTACAAACTCTGGTGCTCCAGTCTGGAACA
ACAACGCCTCTTTGACTGTTGGACCCAGAGGTCCAGTCCTTCTGGAAGACTATCATCTGA
TCGAGAAACTGGCCAACTTTGACAGGGAAAGGATTCCTGAGAGGGTTGTTCATGCCAGAG
GTGCCAGTGCTAAAGGTTTCTTTGAAGTCACTCATGACATTTCAAACCTTTCTTGCGCTG
ATTTCCTTCGAGGCACCGGTGTTCAGACTCCTGTCATTGCTCGTTTCTCGACTGTCATCC
ATGAGCGTGGCAGCCCCGAGACTCTCATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTCAATT
ACTTCCCTTCAAGGTTGAACCCGGTTCGCCATGCTGAAAAATATCCTCAGAATCCTATTG
CATGCGCTGGGAACCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAATAACTTCAAGCAGCCAG
GGGAAAGATACAGATCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGGTTCCTGAAGCGTTTTGTTG
ATGCACTTGCTGAGCCTCGTGTGACCCACGAAATCCGCAGCATTTGGATCTCTAACTGGA
CTAAGGCAGACGAATCTCTTGGACAGAAACTAGCCACTCGTCTTAAAGTGAGCCCAAACT
TCTGATTTGTATCATGGCTAAAGACTAAGTAAAGCCCCAGTAAACCCTAAACATGCTCCT
CTTACGCTTTGGTCTCCAAGTAATCTCTTTGGTAATAGATATACATTAAAATAAAACAGT
GAC

QA 9 791 9 791
DS 



AS 1 3

CO CL2826Contig1 937 3 2 U
AGGGTTAAATAAGACCATATATTAATGTACTTGTTCAAAGTTCAAACTAAGCACTACTCT
ACATATCAGGGAACGAGAAGAACCACAATCCACATAATGTCGTAACTACAAGATAATTTC
TAATTTTCTACAATCTTCCAGTATTAGTCATCAAGCGTATAATACGAGACGCCGTCATGA
GTCAGTCTCTCTCATCATTTGAACATCTTGGACCACATGTAGAGAATAAAGAAGCAGAGG
AGAGCGAACAGAACCACGTGCATGACGTGGTTGTTTCCACTACGTATGATGCTCAAGTTC
AGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCAGCTTGCGCTCTCATCAACGTGACTTGCAGCTCA
TCTAAGAAGTTCTTCTGAAACTGGGCTTCTGACCCAATTTCTTTAGCAATATTTTTCAAT
TGCCTAACTTGGCCGTGGAGACCAGAGATCTCATCATCAAGGTCAGAGTGCATGGGATCG
ATCCGTAGCTGGATTTACTCTGAACCTGCACCCGTTCTAGTGCTAAGCCCATCTCCTGAT
CTGTACGGCGCGGCGCCGCCGTAGAGGGAACCACCCGCACCGCCTCTGTGAGCCATCGAC
GCCGATATCAAAGGAGAAAACAACCGTGAAATCGGTCTGCTGAAATATTTGAGACTCGGA
AAATTTGACAATGAGAAATTCAAATCAACAGTTAGGTTGCGAATTGCAATGGAGACAAAA
CGAGCTCGCGGGTTTTGTTCGGTTCAATCACCGTCGTTACACACGTGGCGCTCTTATAAT
GGTTGGTTATCGTCATGTGTTAAATCACTCTTTTAATTGATTGGCCTTATGAAACGGGCT
AATCCGAACCTATCAAAAGTAATAAAAACTTTGATGGGCTTTCTCTAACTTTGTTATTTT
CTGCGGTTGATGCCATGAACATCAACAATGGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV56JQ U 40
AF RR4FL81JQ U 1
AF RR4EV56TF C 312
BS 1 680 RR4FL81JQ
BS 681 937 RR4EV56TF

RD RR4EV56JQ 384 0 0
GTTCAAACTAAGCACTACTCTACATATCAGGGAACGAGAAGAACCACAATCCACATAATG
TCGTAACTACAAGATAATTTCTAATTTTCTACAATCTTCCAGTATTAGTCATCAAGCGTA
TAATACGAGACGCCGTCATGAGTCAGTCTCTCTCATCATTTGAACATCTTGGACCACATG
TAGAGAATAAAGAAGCAGAGGAGAGCGAACAGAACCACGTGCATGACGTGGTTGTTTCCA
CTACGTATGATGCTCAAGTTCAGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCAGCTTGCGCTCTC
ATCAACGTGACTTGCAGCTCATCTAAGAAGTTCTTCTGAAACTGGGCTTCTGACCCAATT
TCTTTAGCAATATTTTTCAATTGC

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4FL81JQ 680 0 0
AGGGTTAAATAAGACCATATATTAATGTACTTGTTCAAAGTTCAAACTAAGCACTACTCT
ACATATCAGGGAACGAGAAGAACCACAATCCACATAATGTCGTAACTACAAGATAATTTC
TAATTTTCTACAATCTTCCAGTATTAGTCATCAAGCGTATAATACGAGACGCCGTCATGA
GTCAGTCTCTCTCATCATTTGAACATCTTGGACCACATGTAGAGAATAAAGAAGCAGAGG
AGAGCGAACAGAACCACGTGCATGACGTGGTTGTTTCCACTACGTATGATGCTCAAGTTC
AGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCAGCTTGCGCTCTCATCAACGTGACTTGCAGCTCA
TCTAAGAAGTTCTTCTGAAACTGGGCTTCTGACCCAATTTCTTTAGCAATATTTTTCAAT
TGCCTAACTTGGCCGTGGAGACCAGAGATCTCATCATCAAGGTCAGAGTGCATGGGATCG
ATCCGTAGCTGGATTTACTCTGAACCTGCACCCGTTCTAGTGCTAAGCCCATCTCCTGAT
CTGTACGGCGCGGCGCCGCCGTAGAGGGAACCACCCGCACCGCCTCTGTGAGCCATCGAC
GCCGATATCAAAGGAGAAAACAACCGTGAAATCGGTCTGCTGAAATATTTGAGACTCGGA
AAATTTGACAATGAGAAATT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4EV56TF 626 0 0
TGTTG
TCTTCACCCCAGCTTGCGCTCTCATCAACGTGACTTGCAGCTCATCTAAGAAGTTCTTCT
GAAACTGGGCTTCTGACCCAATTTCTTTAGCAATATTTTTCAATTGCCTAACTTGGCCGT
GGAGACCAGAGATCTCATCATCAAGGTCAGAGTGCATGGGATCGATCCGTAGCTGGATTT
ACTCTGAACCTGCACCCGTTCTAGTGCTAAGCCCATCTCCTGATCTGTACGGCGCGGCGC
CGCCGTAGAGGGAACCACCCGCACCGCCTCTGTGAGCCATCGACGCCGATATCAAAGGAG
AAAACAACCGTGAAATCGGTCTGCTGAAATATTTGAGACTCGGAAAATTTGACAATGAGA
AATTCAAATCAACAGTTAGGTTGCGAATTGCAATGGAGACAAAACGAGCTCGCGGGTTTT
GTTCGGTTCAATCACCGTCGTTACACACGTGGCGCTCTTATAATGGTTGGTTATCGTCAT
GTGTTAAATCACTCTTTTAATTGATTGGCCTTATGAAACGGGCTAATCCGAACCTATCAA
AAGTAATAAAAACTTTGATGGGCTTTCTCTAACTTTGTTATTTTCTGCGGTTGATGCCAT
GAACATCAACAATGGACTTCC

QA 6 626 6 626
DS 



AS 1 4

CO CL2827Contig1 831 4 27 U
GGGAACTTCAACAATAATATTTATTGACAACAACCAACAATGGCAATTTCCATGATCCAT
CTTTTTGTTACCACCTTGCTCGTGGCCGCCCACACGGCCTTTGCCGAA**AAACATGCTC
CAAGATTTTTGTGTTGCTGATCTCAAGGGTGAGAAAGTCAACGGATACCCTTGCAAAGAC
CCAGCACAAGTAACACCAGAGGACTTCTACTACACAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACC
ACCAACACCACACTGGGCTCAGCCGTTACAAGTGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTC
AACACTTTGGGTGTCTCCATGTCTCGGGTCGACTACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCA
CATCTTCACCCCAGAGCTTCAGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCGTCGGA
TTCTTGACAACCACTGGAAAACTCATCTCCAGACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTG
TTCCCCAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAATGCCCCTGCTTCCGTGCTC
GCTGCTTTCGATAGTCAGAATTCGGGAGCTCAAGGTGCTGGACCGACTCTGTTTGGTGCT
AACCCTCCGATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGTT
CAGAAGGTTAAGGGTAAATTCCCAGCCAAGAAATAAATATAGGTTCCAGACCATACCCAT
AAATGCAACAATCATAGACAAATAATAAACATAAAAATGTAAACTACTAAAAAAGTGCTT
GTAAATATTTTTTAACAATGTTGGCCCATTCATTATAATAATATTGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF37TF U 1
AF RR4B968JQ C 15
AF RR4B968TF U 15
AF RR4EF37JQ C 209
BS 1 24 RR4EF37TF
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RD RR4EF37TF 650 0 0
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CCAGCACAAGTAACACCAGAGGACTTCTACTACACAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACC
ACCAACACCACATTGGGCTCAGCCGTTACAGGTGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGC*TC
AACACTTTGGGTGTCTCCATGTCTCGGGTCGACTACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCA
CATCTTCACCCCAGAGCTTCAGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTTTCTTTGTCGGA
TTCTTGACAACCACTGGAAAACTCATCTCCAGACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTG
TTCCCCAGAGCTCTCCTCCTTTTCCAGCAGAACCCTAACAATGCCCCTGCTTCCGTGCTC
GCTGCTTTCGATAGTCAGAATTCGGGAGCTCAAGGTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCT
AACCCTCCGATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCTATTTAGAACC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4B968JQ 793 0 0
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TCAGAATTCGGGAGCTCAAGGTGCTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCC
TGATGACTTGCTTGCTAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGTTCAGAAGGTTAAGGG
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ACAATGTTG
TAGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4B968TF 802 0 0
TAATATTTATTGACAACAACCAACAATGGCAATTTCCATGATCCATCTTTTTGTTACCAC
CTTGCTCGTGGCCGCCCACACGGCCTTTGCCGAA**AAACATGCTCCAAGATTTTTGTGT
TGCTGATCTCAAGGGTGAGAAAGTCAACGGATACCCTTGCAAAGACCCAGCACAAGTAAC
ACCAGAGGACTTCTACTACACAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACCACCAACACCACACT
GGGCTCAGCCGTTACAAGTGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTCAACACTTTGGGTGT
CTCCATGTCTCGGGTCGACTACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCAG
AGCTTCAGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCGTCGGATTCTTGACAACCAC
TGGAAAACTCATCTCCAGACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTGTTCCCCAGAGCTCT
CCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAATGCTCCTGCTTCCGTGCTCGCTGCTTTCGATAG
TCAGAATTCGGGAGCTCAAGGTGCTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCC
TGATGACTTGCTTGCTAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGTTCAGAAGGTTAAGGG
TAAATTCCCAGCCAAGAAATAAATATAGGTTCCAGACCATACCCATAAATGCAACAATCA
TAGACAAATAATAAACATAAAAATGTAAACTACTAAAAAAGTGCTTGTAAATATTTTTTA
ACAATGTTG
TAGACACTATTTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4EF37JQ 623 0 0
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TCGACTACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCAGAGCTTCAGAAGCCA
TATTCGTCCTCGAAGGACGTTTCTTTGTCGGATTCTTGACAACCACTGGAAAACTCATCT
CCAGACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTGTTCCCCAGAGCTCTCCTCCTTTTCCAGC
AGAACCCTAACAATGCCCCTGCTTCCGTGCTCGCTGCTTTCGATAGTCAGAATTCGGGAG
CTCAAGGTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCCTGATGACTTGCTTG
CCAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGTTCAGAAGGTTAAGGGTAAATTCCCAGCCA
AGAAATAAATATAGGTTTCAGAGCATACCCATAAATGCAACAATCATAGACAAATAATGA
ACATAAAAATGTAAACTACTAAAAAAGTGCTTGTAAATATTTTTTAACAATGTTGGCCCA
TTCATTATAATAATATTGGTTTC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 4

CO CL2828Contig1 1121 4 11 U
GGAGATATTTCAAGAACAAATATCCAAACAAATTATAGGGAGAGTTCTGGACCCTTCATC
CTGGAAAGATACCTAAAATGGCTGCGTCATTGGCATCTCTTTCCTACTCCACTAAAACCG
GAGCACAACCACAGTTCAACCGGTACCGCAGCCATCGTCTGCCGCCTCCGTCGTGCCTTT
TACCTCCCCCTCCCTCTATCGGTAAACATATCACGAGGTGTTCCCCGAGACAACGGTCTA
CGAAAAAACCTTCTGCGCTCGAAACCTCTGACGGCGCCGTTAACGTGAAGGTAGACGATG
ACGAAGAAGAAACGTGTGAGCTTGTTAACAGAACAGAAGTGTTAATTGACAGCGTCGAAG
CTCACCTGTTAACGGCGGTAAAGAATAACAACGGAACTGGATTGATTCTACTCTCTGATG
TCTTCGGCTTCCAAGATTCCTCCACCCGCGACTTCGCTTATCGCGTCGCTTGCAATGGCT
ACAATGTTCTTGTCCCGGATCTGTTCCGTGGAGATCCATGGTCGAAAAACCGAACAGAGT
CTGAATACGAGGAATGGAGAAGAGGACATGACCTGAACCGGATCCGAAACGACATAAGGA
CCTTGACCGAATGGATGGTTGATGAGTTTGCAGCGGCTGGGATATCCAAGAAGCTGGGAG
TGATAGGATTCTGTTTTGGGGGTGGACGCGTGGTGGACATTTTAGCCGCCGACAAGAACG
GTTACTTCAGCACCGGAATTTCTTTCTATGGCACGAGAATAGACTCTGTGGTGGCCGGAG
ACGTGAACGTCCCGGTCTTGTTCATCGCCGGGGACACAGACCCGCTTTGCCAACTGGAGG
GTTTGAAGGAAATTAAGGAGAAGACTGGTGATGGGTCAAAGGTTGTGGTGTTTGAAGGAA
GAGGCCACGGCTTCGTTCACCGGCCGGAAACACCGGAAGATGATAGAGACGCGGAGGAAG
CTTTTTCTGTCATGAGGAATTGGTTACATCAACATTTGCTGCGTGGGCACTAATGCTTTC
TCTGCTTTATGTACATCCCATTAAAATGAACTTCGGATTCTTGTAGACTCTGTGTGTCCG
GATTAAAAAAAAACTTAACTAATAACATAAATAAATTTTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GA

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GG
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TTTTACCTCCCCCTCCCTCTATCGGTAAACATATCACGAGGTGTTCCCCGAGACAACGGT
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ATGACGACGAAGAAACGTGTGAGCTTGTTAACAGAACAGAAGTGTTAATTGACAGCGTCG
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ATGTCTTCGGCTTCCAAGATTCCTCCACCCGCGATTTCGCTTATCGCGTCGCTTGCAATG
GCTACAATGTTCTTGTCCCGGATCTGTTCCGTGGAGATCCATGGTCGAAAAACCGAACAT
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GGACCTTGACCGAATGGATGGTTGATGAGTTTGCAGCGGCTGGGATATCCAAGAAGCTGG
GAGTGATAGGATTCTGTTTTGGGGGTGGACGCGTGGTGGACATTTTAGCCGCCGACA

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DS 

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CGCGACTTCGCTTATCGCGTCGCTTGCAATGGCTACAATGTTCTTGTCCCGGATCTGTTC
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TTTGCAGCGGCTGGGATATCCAAGAAGCTGGGAGTGATAGGATTCTGTTTTGGGGGTGGA
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TATGGCACGAGAATAGACTCTGTGGTGGCCGGAGACGTGAACGTCCCGGTCTTGTTCATC
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TGAACTTCGGATTCTTGTAGACTCTGTGTGTCCGGATTAAAAAAAT*CTTAACTAATAAC
GC

QA 1 720 1 720
DS 

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AGGAATGGAGAAGAGGACATGACCTGAACCGGATCCGAAACGACATAAGGACCTTGACCG
AATGGATGGTTGATGAGTTTGCAGCGGCTGGGATATCCAAGAAGCTGGGAGTGATAGGAT
TCTGTTTTGGGGGTGGACGCGTGGTGGACATTTTAGCCGCCGACAAGAACGGTTACTTCA
GCACCGGAATTTCTTTCTATGGCACGAGAATAGACTCTGTGGTGGCCGGAGACGTGAACG
TCCCGGTCTTGTTCATCGCCGGGGACACAGACCCGCTTTGCCAACTGGAGGGTTTGAAGG
AAATTAAGGAGAAGACTGGTGATGGGTCAAAGGTTGTGGTGTTTGAAGGAAGAGGCCACG
GCTTCGTTCACCGGCCGGAAACACCGGAAGATGATAGAGACGCGGAGGAAGCTTTTTCT*
*CATGAGGAATTGGTTACATCAACATTTGCTGCGTGGGCACTAATGCTTTCTCTGCTTTA
TGTACATCCCATTAAAATGAACTTCGGATTCTTGTAGACTCTGTGTGTCCGGATTAAAAA
AAAACTTAACTAATAACATAAATAAATTTTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

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CGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCCCTGAGATCCGAGTTCTCCGGCCCAAGATTCGATCCT
CACGTCACCGTCGTCGGAGCAACGAGTCTGACGGCAGACGAAGCGAAGAAGATGTTCGAA
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTGAAGAAGAAGAAGGACGTATACTCTGTGTGGGCATTGCCCGACGAGGAAACGGAACCG
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TTCTTCTACCAATGCGTTTTCTTGCTTCTCAAATCCACTCCAGAGGTAATGAAAGCTGGT
GAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAACACCTTACATGCCGCATCTGAGT
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TAAGAAGAAA*GACTTAAAGTTCGGTTCTG******TAATAAAAGGTCTCA*TATACTTT
ATG*TGTGTACCATCTCTTCTTGCTCATCGAATAAAAT
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QA 1 698 1 698
DS 

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GGG
GCGTCTGGATTGTAAAGTCAACTCACTCATCAATGGAAGAGGTGAAGAAGAAGAAGGACG
TATACTCTGTGTGGGCATTGCCCGACGAGGAAACGGAACCGCGATTTGTAAAGCTAATGG
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AAGCTTACACCGCCACCGTGGATCGCGTCTCCACCGGAACTTTCTTCTACCAATGCGTTT
TCTTGCTTCTCAAATCCACTCCAGAGGTAATGAAAGCTGGTGAACACTGTAAGAACCATT
TCAAGTGTTCCACTACAACACCTTACATGCCACATCTGAGTCTGCTTTACGCCGAGTTAG
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GTTCGGTTCTGAGTCTGTAATAAAAGGTCTCAATATACTTTTTTCTGTGTACCATCTCTT
CTTGCTCATCGAATAAAATCGCGATACTAATTCGC
CGCAT

QA 4 698 4 698
DS 

RD RR4C873TF 703 0 0
GGG
GCGTCTGGATTGTAAAGTCAACTCACTCATCAATGGAAGAGGTGAAGAAGAAGAAGGACG
TATACTCTGTGTGGGCATTGCCCGACGAGGAAACGGAACCGCGATTTGTAAAGCTAATGG
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AAGCTTACACCGCCACCGTGGATCGCGTCTCCACCGGAACTTTCTTCTACCAATGCGTTT
TCTTGCTTCTCAAATCCACTCCAGAGGTAATGAAAGCTGGTGAACACTGTAAGAACCATT
TCAAGTGTTCCACTACAACACCTTACATGCCACATCTGAGTCTGCTTTACGCCGAGTTAG
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GCCTGAGTTTCCGGTTAACCCGTCTCGCTCTCTGCAAAACCGATACGGAAGATAAGACTC
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GTTCGGTTCTGAGTCTGTAATAAAAGGTCTCAATATACTTTTTTCTGTGTACCATCTCTT
CTTGCTCATCGAATAAAATCGCGATACTAATTCGC
CGCAT

QA 4 698 4 698
DS 

RD RR4BD20TF 720 0 0
GGG
AACTCATTCATCAATGGAAGAGGTGAAGAAGAAGAAGGACGTATACTCTGTGTGGGCATT
GCCCGACGAGGAAACGGAACCGCGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCTCTGAGATCCGAGTT
CTCCGGCCCAAGATTCGATCCTCACGTCACCGTCGTCGGAGCCACGAGCCTGACGGCAGA
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AGATCGCGTCTCCACCGGAACTTTCTTCTACCAATGCGTTTTCTTGCTTCTCAAATCCAC
TCCAGAGGTAATGAAAGCTGGTGAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAAC
ACCTTACATGCCGCATCTGAGTCTGCTTTACGCCGAGTTAGATGAAGAAGGGAAGAAGAA
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CCGACTCGCTCTCTGCAAGACCGATACGGAAGATAAGACTCTCGAGTCATGGGAGAAAGT
GGCTGTATGCAATCTCAATCCTTAAGAAGAAAAGACTTAAAGTTCGGTTCTG******TA
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TACGATACTAATTCGCGGCAAACTTCATCAATTTCTCTAAAAGCGTCATTTGAAGTT

QA 4 720 4 720
DS 



AS 1 4

CO CL2830Contig1 1357 4 7 U
AAAGAATAACGGAGATAAGGCCTTGATTGATCAGCCCAAGGCCCGTTAAGTTATTTAACC
GTCCATATGATACCCAATGCTCGGTTTAAGATGGTTAGAACAGTGTGTCATCTGCGAAAC
AGAAAAAAAAAAAAAGGTAAAACAATTGGTTATTATTTTCAACCAGACATAACATGACAA
TCAAACATCCGCCAGCAACTCTTAAAAATTCTTGTCCTGACCACATTTTCTTTACTGAAT
CTTTACTGTCTCTCTTGCAACATCATCAGAGTCGCCGTGTGATGGCTTCAGCTAAAAAAA
AGTCTACTGGATAGGATGGTACTGAGCTGATACTCTCTTTGGAGGTAGCTTCCGGAGGAT
GAAGAGCACTAGTGCCGATGGAAGTACTTCTACCACAATATAGTAGATTAAGTTCAGAAC
TAGATGATCAAGAACATCCAGCGTTAGATCTCTGTCAAAAGCTGATACACCCACCACAAT
GCATCTTATGAGGAAGCAGGTGAAGCATATCGCTGTCACAGATCCAACCTCATGGAGCTT
CTTCCTTCTTCCTTTTGATTCAATAGGGAACCTTCTCAGCATAATAAACAATCTTCCTCC
GTAAAGCAAGAAGCCTAAAGCAGCGATGAAAGACACAACTGCCATAAATATCTTCCCAAC
TAGTTCCACAGTGCTGTTATCATCCACCCAGATGCATACCCAAATAACAACCTGAGCCAA
ATATACAGCCACGTTGACTGCAATATATGTTATCCGCAGTTTATCAGTTGGTAAACTTCT
TGCCTGGTGATATATCTCAGCCCAGAAGAGAACAAGCAGGGTGTATGCCGAGAAAAAGAG
GAGGCCCGGAAGATCCAATAATATCCAGCAAAGAGCCTTGGGATGCACGAGAAAGACTTG
ATGGTGAAATCCAAATAGAACCGCACGAACTCCATTGACGACAAAGTTCATAAGATGAAA
CACCTTCTGAGTGGTCCAGCCATACTCAGGCACTCTCATTTGGATCCTCACCAATTGGAC
GAGAGCGATGGCTGAGACAAGAGCATAAGCTCCACAGAGAGAGAAGAAGATCCCATCTTG
CCACTGAGTTGACTCGTTCACCTCGTCCCACCAATTCGTCGTAGCCGTCGCGAAGATTTG
TGCCATCTCCAACGGCATCGCCGCGCTCGAATCCGTCATCCTCCACCTCGTTTCTCTGCT
ACCTTTTCAGGGTGAGGATGGATTGCACACTCAATCCGCTGGAATCGAGGAAAAGGAACG
GTTTTTCAATCGGAATCCAGAAACCCTAATCGGCTCTGGAGAATCGGAGAGAGAGGCGAG
CAAAAGGGGGTGAGTTGTTTGAATATCTGCAAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM88JQ U 1
AF RR4BY08JQ U 93
AF RR4BY08TF C 667
AF RR4DM88TF C 715
BS 1 421 RR4DM88JQ
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RD RR4DM88JQ 654 0 0
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GTCCATATGATACCCAATGCTCGGTTTAAGATGGTTAGAACAGTGTGTCATCTGCGAAAC
AGAAAAAAAAAAAAAGGTAAAACAATTGGTTATTATTTTCAACCAGACATAACATGACAA
TCAAACATCCGCCAGCAACTCTTAAAAATTCTTGTCCTGACCACATTTTCTTTACTGAAT
CTTTACTGTCTCTCTTGCAACATCATCAGAGTCGCCGTGTGATGGCTTCAGCTAAAAAAA
AGTCTACTGGATAGGATGGTACTGAGCTGATACTCTCTTTGGAGGTAGCTTCCGGAGGAT
GAAGAGCACTAGTGCCGATGGAAGTACTTCTACCACAATATAGTAGATTAAGTTCAGAAC
TGGATGATCAAGAACATCCAGCGTTAGATCTCTGTCAAAAGCTGATACACCCACCACAAT
GCATCTTATGAGGAAGCAGGTGAAGCATATCGCTGTCACAGATCCAACCTCATGGAGCTT
CTTCCTTCTTCCTTTTGATTCAATAGGGAACCTTCTCAGCATAATAAACAATCTTCCTCC
GTAAAGCAAGAAGCCTAAAGCAGCGATGAAAGACACAACTGCCATAAATATCTT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BY08JQ 719 0 0
GGTTAGAACAGTGTGTCATCTGCGAAACAGAAAAAAAAAAAAAGGTAAAACAATTGGTTA
TTATTTTCAACCAGACATAACATGACAATCAAACATCCGCCAGCAACTCTTAAAAATTCT
TGTCCTGACCATATTTTCTTTACTGAATCTTTACTGTCTCTCTTGCAACATCATCAGAGT
CGCCGTGTGATGGCTTCAGCTAAAAAAAAGTCTACTGGATAGGATGGTACTGAGCTGATA
CTCTCTTTGGAGGTAGCTTCCGGAGGATGAAGAGCACTAGTGCCGATGGAAGTACTTCTA
CCACCATATAGTAGATTAAGTTCAGAACTAGATGATCAAGAACATCCAGCGTTAGATCTC
TGTCAAAAGCTGATACACCCACCACAATGCATCTTATGAGGAAGCAGGTGAAGCATATCG
CTGTCACAGATCCAACCTCATGGAGCTTCTTCCTTCTTCCTTTTGATTCAATAGGGAACC
TTCTCAGCATAATAAACAATCTTCCTCCGTAAAGCAAGAAGCCTAAAGCAGCGATGAAAG
ACACAACTGCCATAAATATCTTCCCAACTAGTTCCACAGTGCTGTTATCATTCACCCAGA
TGCATACCCAAATAACAACCTGAGCCAAATATACAGCCACGTTGACTGCAATATATGTTA
TCCGCAGTTTATCAGTTGGTAAACTTCTTGCCTGGTGATATATCTCAGCCCAGAAGAGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BY08TF 691 0 0
CACAGTGCTGTTATCATCCACCCAGATGCATACCCAAATAACAACGTGAGCCAAATATAC
AGCCACGTTGACTGCAATATATGTTATCCGCAGTTTATCAGTTGGTAAACTTCTTGCCTG
GTGATATATCTCAGCCCAGAAGAGAACAAGCAGGGTGTATGCCGAGAAAAAGAGGAGGCC
CGGAAGATCCAATAATATCCAGCAAAGAGCCTTGGGATGCACGAGAAAGACTTGATGGTG
AAATCCAAATAGAACCGCACGAACTCCATTGACGACAAAGTTCATAAGATGAAACACCTT
CTGAGTGGTCCAGCCATACTCAGGCACTCTCATTTGGATCCTCACCAATTGGACGAGAGC
GATGGCTGAGACAAGAGCATAAGCTCCACAGAGAGAGAAGAAGATCCCATCTTGCCACTG
AGTTGACTCGTTCACCTCGTCCCACCAATTCGTCGTAGCCGTCGCGAAGATTTGTGCCAT
CTCCAACGGCATCGCCGCGCTCGAATCCGTCATCCTCCACCTCGTTTCTCTGCTACCTTT
TCAGGGTGAGGATGGATTGCACACTCAATCCGCTGGAATCGAGGAAAAGGAACGGTTTTT
CAATCGGAATCCAGAAACCCTAATCGGCTCTGGAGAATCGGAGAGAGAGGCGAGCAAAAG
GGGGTGAGTTGTTTGAATATCTGCAAACCCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4DM88TF 624 0 0
AGCCAAATATACAGCCACGTTGACTGCAATATATGTTATCCGCAGTTTATCAGTTGGTAA
ACTTCTTGCCTGGTGATATATCTCAGCCCAGAAGAGAACAAGCAGGGTGTATGCCGAGAA
AAAGAGGAGGCCCGGAAGATCCAATAATATCCAGCAAAGAGCCTTGGGATGCACGAGAAA
GACTTGATGGTGAAATCCAAATAGAACCGCACGAACTCCATTGACGACAAAGTTCATAAG
ATGAAACACCTTCTGAGTGGTCCAGCCATACTCAGGCACTCTCATTTGGATCCTCACCAA
TTGGACGAGAGCGATGGCTGAGACAAGAGCATAAGCTCCACAGAGAGAGAAGAAGATCCC
ATCTTGCCACTGAGTTGACTCGTTCACCTCGTCCCACCAATTCGTCGTAGCCGTCGCGAA
GATTTGTGCCATCTCCAACGGCATCGCCGCGCTCGAATCCGTCATCCTCCACCTCGTTTC
TCTGCTACCTTTTCAGGGTGAGGATGGATTGCACACTCAATCCGCTGGAATCGAGGAAAA
GGAACGGTTTTTCAATCGGAATCCAGAAACCCTAATCGGCTCTGGAGAATCGGAGAGAGA
GGCGAGCAAAAGGGGGTGAGTT
CC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2831Contig1 724 4 2 U
GGGAACCAGGAAGGTACCCATGGTTGCTGAAAACACTTTATGGTCTTCTAATGTTACTTC
CTCAGCAAAGTGCGGCGTTTAGGATACTTGAGACGAGGCTCAAAACAGTCCCAACGTACT
CTATCAGTGGCGGTGGAGACCAAATACGCAGAGCATTTTCAGGAGTTTCTTTCTCTCAGT
ATATGCATCATCAACAGGACGGTGATGCAGAAGACTATAATATTAACAGTTCTCATCAGG
GAATCAACTTTGCTGCACGGTTACAACAATTTGAGAACGTGCAGAATCAGCATCATGACC
AGGCAAGGAATGAAGTGAACTACTCGTATAGCACTTCCTCTTCTTCTACATCAGAGGAGG
TGAGGACATCTAAAGAACAACAGAAACCATCACCTTCCTTGGCATCATCATCAGTTCCAG
AAAACGATCGACCTCCAGCAAGATCCTCAAGAAAAGGTTCTGGTCAATTACAGCTATAAA
CCCCCTGGTATAGACTCCACGGATCCATTGTCTCCTGTAAAGTTTTATATCTCCATCTCT
CTCTCTCTCTGTCGGGTGTTTTATTTACGACAGATTCGTCAGGCTACCCATTATTATGGT
ATTGAATTTGCTTCATTGTTGTTTTTTCTTAAAAAGGGGAGATTATTTGTTACCCTTTGT
GGATGGAAAAAAACAAGTCATCATGTGGTTTTGTGTTGTTTTTTTTTAAAGAAAGTGGAA
AACC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

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TCTT

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GG
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TGAATTTGCTTCATTGTTGTTTTT
CTT

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ATGCATCATCAACAGGACGGTGATGCAGAAGACTATAATATTAACAGTTCTCATCAGGGA
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AGGACATCTAAAGAACAACAGAAACCATCACCTTCCTTGGCATCATCATCAGTTCCAGAA
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TCCTGGTATAGACTCCACGGATCCATTGTCTCCTGTAAAGTTTTATATCTCTATCTCTCT
CTCTCT**GTCGGGTGTTTTATTTACGACAGATTCGTCAGGCTACCCATTATTATGGTAT
TGAATTTGCTTCATTGTTGTTTTTTCTTAAAAAGGGGAGATTATTTGTTACCCTTTGTGG
ATGGAAAAAAACAAGTCATCATGTGGTTTTGTGTTGTTTTTTTTTAAAGAAAGTGGAAAA
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

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TTCTTTGTCTGAATGAATATAGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TTTTGTAAGCGTTCTTGAGTTT
TAGCATTGGATC

QA 1 742 1 742
DS 

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AAAACCAGATCTCATGTTCTGGTTGAACTCTGAGAAGTCTCTTTACTTCTCTCTGGTCTC
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GCATGCAAGTCGATTGCTTTATTCCGGTGTTCATCGTTTCGTCTTCAAACTGACTCTCAG
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CTAGCTATGGCTGGTTCGGTTCGACTCGCTCTTTGTCTTTTACCCTGAGATTTGACCAGG
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GTCTGTTTTGAAGACTTTAATGATGATCTTGCTATGTTTTGTAAGCGTTCTTGAGTTT*A
GAATTGGATCCATCTTCCGCTTGTCTCTATTGTA

QA 6 759 6 759
DS 

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T
TTTTCTGTGTTTAGTTCTCTGTATTTAGATCTCAGCTTTTGGCGGTGTTTCATTTGATCA
TGTGTTGAAGTCTTAAAACCAGATCTCATGTTCTGGTTGAACTCTGAGAAGTCTCTTTAC
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TGGATCCATAACTTGCATGCAAGTCGATTGCTTTATTCCGGTGTTCATCGTTTCGTCTTC
AAACTGACTCTCAGCCTTAATTGTTCCATTGGATCCGTTCTAGGCTCGATCCATTTCTAG
TCTCATCCTTGTGACTAGCTATGGCTGGTTCGGTTCGACTCGCTCTTTGTCTTTTACCCT
GAGATTTGACCAGGATCTCGTCACTTCCGTTGCTTCTCGGCGTTCTGTGGTCGTTCTTAG
TCGACTTCGTCTTGCCGGAATAATATTTCCGGTCTTTGAAGCCCTGTGCTACCTTTGCTT
GTGCTATTCACTATAAGGGGAGTCAGTCATCTTCAAGGATTTGATGACCTTCTGTCTTTG
GCTTTCAAG*TTTTGTCTGTTTTGAAGACTTTAATGATGATCTTGCTATGTTTTGTA*GC
GTTCTTGAGTTT

QA 2 613 2 613
DS 

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AGCTGATCTC
TTTTCTGTGTTTAGTTCTCTGTATT*AGATCTCAGCTTTTGGCGGTGTTTCATTTGATCA
TGTGTTGAAGTCTTAAAACCAGATCTCATGTTCTGGTTGAACTCTGAGAAGTCTCTTTAC
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TGGATCCATAACTTGCATGCAAGTCGATTGCTTTATTCCGGTGTTCATCGTTTCGTCTTC
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TCTCATCCTTGTGACTAGCTATGGCTGGTTCGGTTCGACTCGCTCTTTGTCTTTTACCCT
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TCGACTTCGTCTTGCCGGAATAATATTTCCGGTCTTTGAAGCCCTGTGCTACCTTTGCTT
GTGCTATTCACTATAAGGGGAGTCAGTCATCTTCAAGGATTTGATGACCTTCTGTCTTTG
GCTTTCAAGGTTTTGTCTGTTTTGAAGACTTTAATGATGATCTTGCTATGTTTTGTAAGC
GTTCTTGAGTTTTAGAATTGGATCCATCTTCCGCTTGTCTCTATTGTAATGTGTTGTTTA
TGTCGTTTCCCTTTGTTAGGGCTTTACTTCTGGAAAACATGTAGTTTGTCCAGCTTTGTT
TCCAGCGTCACTTATGTGTGCTGCTGGCTTTGTATCTCACCCTTGTAGTTTTCTTTGTCT
GAATGAATATAGTGTTT

QA 11 807 11 807
DS 



AS 1 4

CO CL2833Contig1 1388 4 6 U
TATTATTATTAAGAATTAGATTCAGATACATATGCAAGAAGAAAATAAATCATAAATCGA
GAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACATGTCTGGTCACAAAAAGTG
TCATCCTTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAGATGA
AAACGATCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGT
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CCATTGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAGATTAGCGGTTT
CTTGATTTACTCTCTCATCAAGGAGAATCACTCCAACAATTCGGCCTTTGTGAGATGTCT
CCAACAGATCGAATAGCTTTGATAGTG**GCAAGCAGTACATCCATCCCTTGCTTGGCCA
TACCTTGTCCATACTCCTGTGCCAAAGCATCGATACCGCCAAAGCGTCCAACCGTTAACT
CAGCAGGTCTCTCAATACCATGAGCTAAATCCTCATGAAGAGTGACTACCCCTCTTATAT
TCTTATATAAAGCCAAAAGGTTCGATGCAAATTTTCTCTCTGCTTCCTTTTCCAAATGGA
ACTCCACCTTCGCACCACCAGACAGAGGGATACTAAGCAATCCAGTCAATGGTTCAACAG
AGCCAGCGACATATGATCCACCTAACCAAGATGCAAACTCATTCATGTCTTTGTCAGTCA
CATCAGATGAGGGTTCATTGACAGACATAACAGCCACTCCAGTTTCTGGAAGTTCAATAT
CAGCTTTTCCAGAATTGGAATTGATACTTCCTCTTATGGCATTGTCCAAGAAAGAATGAC
TAGGTAAGGTTTCCACAAGCGCATCATCAGCTCCAGCGATTTCTAGCACAAAAGCAGCAC
GAGGCCTCTCAAATGGATTAGGTTTTAGAATCTTGTTCAGCTTGGAGGAGCCATCAGGTG
TCAAACTAGATGGAGGTGCAAAACCCAACAAGGCAGACACTGCTGCAGATACTTCAGAGA
GAGACATGGGAAGCGCCTGCTCTGAAGGGGGACGAAGGTATTGGTTGTTGGATCCATCAA
CGAAGAAAACAGAACCACTGGCCTCTCCCCTGGAGTTGAAGGTGAGAAGCAGAGAGACGA
CGAATATGTACAAAGCTTGCATCTTTAGAACGAGGGAAAGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO04JQ U 1
AF RR4AQ32JQ U 67
AF RR4GO04TF C 283
AF RR4AQ32TF C 656
BS 1 659 RR4GO04JQ
BS 660 833 RR4AQ32JQ
BS 834 895 RR4GO04TF
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BS 897 1060 RR4GO04TF
BS 1061 1388 RR4AQ32TF

RD RR4GO04JQ 659 0 0
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GAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACATGTCTGGTCACAAAAAGTG
TCATCCTTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAGATGA
AAACGATCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGT
CTTAATCGAGCTTAACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAAAGGCATGTACATAA
GGAAGTACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAACCATGCAAGCG
TCAGCCTAACAAGTATAACTTGAGCGATAATGGCTGCACTTGGAACTCCCTCTACCTCAG
CCATTGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAGATTAGCGGTTT
CTTGATTTACTCTCTCATCAAGGAGAATCACTCCAACAATTCGGCCTTTGTGAGATGTCT
CCAACAGATCGAATAGCTTTGATAGTG**GCAAGCAGTACATCCATCCCTTGCTTGGCCA
TACCTTGTCCATACTCCTGTGCCAAAGCATCGATACCGCCAAAGCGTCCAACCGTTAAC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4AQ32JQ 767 0 0
AACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACATGTCTGGTCACAAAAAGTGTCATCC
TTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAGATGAAAACGA
TCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGTCTTAAT
CGAGCTTAACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAAAGGCATGTACATAAGGAAGT
ACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAACCATGCAAGCGTCAGCC
TAACAAGTATAACTTGAGCGATAATGGCTGCACTTGGAACTCCCTCTACCTCAGCCATTG
ACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAGATTAGCGGTTTCTTGAT
TTACTCTCTCATCAAGGAGAATCACTCCAACAATTTGGCCTTTGTGAGATGTCTCCAACA
GATCGAATAGCTTTGATAGTGTGGCAAGCAGTACATCCATCCCTTGCTTGGCCATACCTT
GTCCATACTCCTGTGCCAAAGCATCGATACCGCCAAAGCGTCCAACCGTTAACTCAGCAG
GTCTCTCAATACCATGAGCTAAATCCTCATGAAGAGTGACTACCCCTCTTATATTCTTAT
ATAAAGCCAAAAGGTTCGATGCAAATTTTCTCTCTGCTTCCTTTTCCAAATGGAACTCCA
CCTTCGCACCACCAGACAGAGGGATACTAAGCAATCCAGTCAATGGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4GO04TF 780 0 0
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CAGTTAACCATGCAAGCGTCAGC*TAACAAGTATAACTTGAGCGATAATGGCTGCACTTG
GAACTCCCTCTACCTCAGCCATTGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGC
TTAGGAGATTAGCGGTTTCTTGATTTACTCTCTCATCAAGGAGAATCACTCCAACAATTC
GGCCTTTGTGAGATGTCTCCAACAGATCGAATAGCTTTGATAGTG**GCAAGCAGTACAT
CCATCCCTTGCTTGGCCATACCTTGTCCATACTCCTGTGCCAAAGCATCGATACCGCCAA
AGCGTCCAACCGTTAACTCAGCAGGTCTCTCAATACCATGAGCTAAATCCTCATGAAGAG
TGACTACCCCTCTTATATTCTTATATAAAGCCAAAAGGTTCGATGCAAATTTTCTCTCTG
CTTCCTTTTCCAAATGGGACTCCACCTTCGCACCACCAGACAGAGGGATACTAAGCAATC
CAGTCAATGGTTCAACAGAGCCAGCGACATATGATCCACCTAACCAAGATGCAAACTCAT
TCATGTCTTTGTCGGTCACATCAGATGAGGGTTCATTGACAGACATAACAGCCACTCCAG
TTTCTGGAAGTTCAATATCAGCTTTTCCAGAATTGGAATTGATACTTCCTCTTATGGCAT
TGTCCAAGAAAGAATGACTAGGTAAGGTTTCCACAAGCGCATCATCAGCTCCAGCGAT
CC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4AQ32TF 733 0 0
TAACTCAGCAGGTCTCTCAATACCATGAGCTAAATCCTCATGAAGAGTGACTACCCCTCT
TATATTCTTATATAAAGCCAAAAGGTTCGATGCAAATTTTCTCTCTGCTTCCTTTTCCAA
ATGGAACTCCACCTTCGCACCACCAGACAGAGGGATACTAAGCAATCCAGTCAATGGTTC
AACAGAGCCAGCGACATATGATCCACCTAACCAAGATGCAAACTCATTCATGTCTTTGTC
AGTCACATCAGATGAGGGTTCATTGACAGACATAACAGCCACTCCAGTTTCTGGAAGTTC
AATATCAGCTTTTCCAGAATTGGAATTGATACTTCCTCTTATGGCATTGTCCAAGAAAGA
ATGACTAGGTAAGGTTTCCACAAGCGCATCATCAGCTCCAGCGATTTCTAGCACAAAAGC
AGCACGAGGCCTCTCAAATGGATTAGGTTTTAGAATCTTGTTCAGCTTGGAGGAGCCATC
AGGTGTCAAACTAGATGGAGGTGCAAAACCCAACAAGGCAGACACTGCTGCAGATACTTC
AGAGAGAGACATGGGAAGCGCCTGCTCTGAAGGGGGACGAAGGTATTGGTTGTTGGATCC
ATCAACGAAGAAAACAGAACCACTGGCCTCTCCCCTGGAGTTGAAGGTGAGAAGCAGAGA
GACGACGAATATGTACAAAGCTTGCATCTTTAGAACGAGGGAAAGGGGGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL2834Contig1 1238 4 4 U
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GAAGCTGAAAATGTCAAGCTAGCAAATCGGATTCTCGTGAAAAGCTAGCTATTTATGGCT
TCCGTTGCTTCTAAGCTCTATTCAGACGATGTCAGTCTTCTAGTGTTGTTGCTTGATACG
AACCCCTTATTCTGGAGCAATACATCCACTACATTCTCTCAGTTCCTCTCTCATGTGCTT
GCTTTTCTGAACGCGGTTTTGGGATTGAATCAGCTGAACCAAGTTGTTGTGATAGCTACT
GGGTACAGCTCGTGTGATTACATCTACGATTCGTCTTTGGCATCGAGTGTGAGCTCCGAG
AGCGGTGGTAGAACTGGAATGCCTGCTCTTTTTGGTTCTTTGCTTGAGAAGCTGGAAGAT
TTTATTGCCAAAGATGAGGAGCCTATCGAGGAGCGGCAGGAGCATGATGATGATGATAAT
AGAATAGCTTCTTCTCTCTTGTCACGATCACTCTCCATGGCTCTTTGCTATATACAGAGG
GTTTTCCGTTCTGGACATCTTCATCCCCAGCCTCGGATTTTATGCTTGCAAGGCTCCCCG
GATGGTCCGGAACAATATGTAGCTGTTATGAACTCTATCTTCTCAGCACAACGCCTAATG
GTGCCCATTGATTCTTGTTACATAGGTACACAGAACTCGGCATTTCTGCAGCAGGCATCT
TACATAACAGGCGGTGTACATCATGCACCTAAACAGTTGGATGGGCTGTTTCAGTTTCTA
ACGACAATCTTTGCCACTTATTTGCACACCCGGAGCTTTGCGCAGCTTCCTAAACCCGTA
GGCGTTGATTTTCGAGCATCGTGTTTTTGCCACAAGAAGACTATCGATATGGGGTATGTT
TGTTCGGTATGTCTGTCCATTTTTTGTGAGCATCACAAGAAATGTTCAACGTGCGGTTCT
GTTTTTGGTCAGTCAAAGCTTGATGGTGTTTCAACTGTGAGTGATAAGAAGAGAAAGGCT
CCTGATTCTTAAAAACATCTTTTACGCTGGAGCCACTTGCAAAGTTTGCTCAGTATTCAA
GCATCGTAGTCTTTGCGTTGATTTACAAGAATCTATGAACGAACACCAAATTGAAAATCA
ACTAAATTACAGTTTTGATCAAACCCTTAGTGCCTAGTGATTTTAGTTTATTTTTGCGAA
CCTTGGTAGTAAGGTAGTTCATGTTAGATTCTGGTTAG


BQ
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AF RR4DE13JQ C 643
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GGTGTTTCAACTGTGAGTGATAAGAAGAGAAAGGCTCCTGATTCTTAAAAACATCTTTTA
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G
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GCCTAGTGATTTTAGTTTATTTTTGCGAACCTTGGT

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TTAGTTTATTTTTGCGAACCTTGGTAGTAAGGTAGTTCATGTTAGATTCTGGTTAG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 4

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CTAGATATTGAAACACGAGATATAATATCGTTGCTTTAATACTTAAGTTGAATCATCCAA
AATTTCAAAATCATAAGAAGAAAGTAGAAAACTTATTGAATATTCGACTACTCCTAGATA
TAATCAAACTGGAACTCCTTTCACTTGTCCCTGCAGGTTGCTACTGAGTTGTAACTAAAA
GTTAGCCTTAAAATGATTATCCTCTTCTTCATCATCTTTTGGTGTTGTCTTGTAATAACA
AGCATAAAGTATAAGTTGTACTGCTCCTGATACTGTCCCTAGTCCATTTCCAATCAAAAT
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TATGAATGTTAGTATGGGAGATAGGAACAAGAACAGTGAGATGACATTGCCAAAAATGCC
GGCAATATTTCTCGCAACGGTCGCGCTAACCATTTTAATCGACAAGTAAGAACAAGAAAC
ACGAAACAAAGAACACAAGAGAGAGACGGAGAGATGCAATTTGATATGTTCC


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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

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AF RR4CQ60JQ U 26
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CC

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DS 



AS 1 4

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CTTATTTAAGAATAATCTTTACCAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB05TF U 39
AF RR4B904TF U 1
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GG
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QA 3 549 3 549
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CTG
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AATTTTCCGGAAGGGATGGCTGTATTTCTCGGATCAATTAA*GGGCATGCGAGTTGGTGT
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CAAAGGAATAATCTC

QA 4 798 4 798
DS 

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TCTACAGACGTGAAAAGAAGAAAGAAAAATGGAGACGAGGGAGGTAAGGACATGGTGAAG
AAGCATCGCCGCCAAGTCTTATACAGTGGAATTGTTACAGCTATTGGAATAAGCTTGCAC
AATTTTCCGGAAGGGATGGCTGTATTTCTCGGATCAATTAA*GGGCATGCGAGTTGGTGT
TAATCTGGCTTTGGCAATCGCTTTACATAACATTCCCGAGGGTGTTGCGGTTGCACTTCC
TATATATTTTGCAACAGAGAGCAAATGGCAGGCATTCAAATTGGCAACACTCTCTGGATT
AGCTGAGCCTCTAGGTGTTATTATCGTGGCTTATCTATTCCCTAGCAGCTTGAGTCCAGA
AATCCTTGAAGGATTGTTGGGAGCAGTTGGTGGAATCATGGCATTCCTAACTTTGCACGA
AATGCTCCCTTTGGCATTTGATTATGCTGGACAGAAACAAGCTGTAAAGGCTGTGTTTGT
CGGTATGGCTTGTATGTCTGCAAGTCTTTACTTTCTGGAGCTGAGTTTGCCTGATTCAAT
GACCTAGTAAGTAATGTCATGTGTGCAATAATTCCTCCTGAAAGACATGAATCAGTCTCT
GGAGTATAGTCTCTTTGTATCTGTGAAATCAATAGGATCTGTAAACAATTGTTTTTAATT
CAAAGGAATAATCTCTTTTTAACCTCTTATTTAAGAATAATCTTTACCAACC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 3

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CCCAACATTGTCAGTAGACTAGCCTAGAGACTGTAAACAACATAAAGGTACCATTTTCTA
TGGTTAATAATCAGCAAAAGCCAAGGCAAAAGAACAAAAAGCAAGCTTTGAGGTTTTAAT
ACATATCATCATACTGCTTGCAATATTCTCTACTCCATACTCCCTAATCCAAAAGATTCC
CATCAGCCTTTCTTTTCTCCACTGCCTTTTTTCCATTCCCATATGACTTTATAAGGCTGC
ATCGACCCTTCTGCAACATTCTCAACAGCCGAAGCTTCCCGTTTAAACACAGCTATCTGA
GAAGCAAACCCTGGCTCTATTTCACCAGACCCACCAACACCGCTGAACTCGACGCTGTAG
TTATGGCGTTCTGCGAGTTTAGTAGCCCAGTGGTTAAACTGTTCCCTTGTCCACTCGAAC
TTGTGGTCATGGTTCCTGAATTTAGGAAGCTGCGGCTCAGATTTGGTTTCTTCTTGAGTT
TCTGGGGTAGTAGACCGCTGGAGAATTGTGTTGTACTCGAAGTTCGGTGTTGAGACGATC
AGGAGCTTAGGGCGGAACAAGCTTAGAACCTTTTCACCAAACTCACAAGCTTGCTCTTCT
TCCATGTGTTCAATGACCTCCAAGCAAGTGCCAATGTCAATGTCAAACAGCCTGGAGTCA
AACTGGAGGATGGAACCATCATAAAGTGTCGCAGTGTTGACGTTGCAAGCTTCCTTGTTT
AGTTTTACATGTAGCATCTTAGCAGCACGGGCTAGACCCTTGGGTGAGATGTCAACGCCG
ATAATGGTTTGAAGTGTTGTTGGATAGTCAAGTAGAGAGTCTAATAAACTACCAGAACCG
CATCCAAAGTCAGCCAAAGTAGAAGCGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX62JQ U 1
AF RR4AQ58JQ U 1
AF RR4AQ58TF C 173
BS 1 800 RR4AQ58JQ
BS 801 928 RR4AQ58TF

RD RR4GX62JQ 707 0 0
GG
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TGGGGTAGTAGACCGCTGGAGAATTGTGTTGTACTCGAAGTTCGGTGTTGAGACGATCAG
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CATGTGTTCAATGACCTCCAAGCAAGTGCCAATGTCAATGTCAAA

QA 3 707 3 707
DS 

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TTGTGGTCATGGTTCCTGAATTTAGGAAGCTGCGGCTCAGATTTGGTTTCTTCTTGAGTT
TCTGGGGTAGTAGACCGCTGGAGAATTGTGTTGTACTCGAAGTTCGGTGTTGAGACGATC
AGGAGCTTAGGGCGGAACAAGCTTAGAACCTTTTCACCAAACTCACAAGCTTGCTCTTCT
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AGTTTTACATGTAGCATCTT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4AQ58TF 756 0 0
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GCTCTTCTTCCATGTGTTCAATGACCTCCAAGCAAGTGCCAATGTCAATGTCAAACAGCC
TGGAGTCAAACTGGAGGATGGAACCATCATAAAGTGTCGCAGTGTTGACGTTGCAAGCTT
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QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

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CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
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BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4EJ94JQ C 1
AF RR4G052JQ C 316
AF RR4G052TF U 2
AF RR4EJ94TF U 1
BS 1 3 RR4EJ94JQ
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RD RR4EJ94JQ 630 0 0
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CACATGCCTCCTCATCCTTGCGATCTACATTGCCACTCCAACAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAACGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATGATTCTGCTGCTATTT
TCTATTATATTACTTGAGTTTCTTATTATGTAACCATCCATTTCATATGGTAAATAAGTA
ATAACGGTAAGGAGCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTAAACGTAAAGTA
CCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4G052JQ 315 0 0
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CAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGAATAATCAAA
GTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATGATTCTGCTGCTATTTTCTACTATATGACTT
GAGTTTCTTATTATGTAACCATCCATTTCATATGGTAAATAAGTAATAACGATAAGGAGC
TCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTAAACGTAAAGTACCATCAGGAATAACA
CTTTGTCTTTCTCT
G

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR4G052TF 629 0 0
GG
AAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCAC
ATGCCTCCTCATCCTTGCGATCTACATTGCCACTCCAACAGAGTCGCACATAACGTGTGG
GACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCC
GTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCG
CCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAA
CACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAA
CGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATGATTCTGCTGCTATTTTCT
ACTATATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAACCATCCATTTCATATGGTAAATAAGTAATA
ACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTAAACGTAAAGTACCA
TCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCT
G

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR4EJ94TF 620 0 0
GGA
AAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCAC
ATGCCTCCTCATCCTTGCGATCTACATTGCCACTCCAACAGAGTCGCACATAACGTGTGG
GACAGTGTCAAGCACAACGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCC
GTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCG
CCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAA
CACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAA
CGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATGATTCTGCTGCTATTTTCT
ATTATATTACTTGAGTTTCTTATTATGTAACCATCCATTTCATATGGTAAATAAGTAATA
ACGGTAAGGAGCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTAAACGTAAAGTACCA
TCAGGAATAACACTTTG

QA 4 620 4 620
DS 



AS 1 4

CO CL2839Contig1 619 4 1 U
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TATGGGATCGTCCATTTGGTCTTTACTCTCAAAGGTGGAGGAGATGAATAAAATGGTGTC
AGAACTGGCTGTTGTAGTTACAAAAGAGAGTTCTATGCAAGGGAAATGCGAAGATCTTTT
GGCCTCAACTGCGATCATGCAGATAAAAGAGTGTAGCTTGAGGACTCATCTGATACAAAC
TAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAGATGCAGAGTAGGAGACTTCTTCATTGTTGCCATTAGG
CAAGCTTCCGTGGCCATAATTAACACACTTACGGTTCCACACGCTCACCACTGATGACTG
ATCTGTAAATTGCTCTTTGATACACCACATTTCTCTTAGAAGTATTTTTATTTACTTTCT
TTTTTGTTATGTAACATTAGCATAGGAACACAGCAAAAGGAAAAAGCAATTTATTTGTTC
CCATGTAAGCTCTGATGTGGGTTTTCTTAGGTGTTTTATTAGGTAGAGTCAATTTTATTA
GTATTAATTTATTTTGTTACAAATTACTTGCACTGTTTTGAAACCAACAAACCTATAAAT
TTATGTAACATTACATCGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BB82JQ C 1
AF RR4BF37JQ C 1
AF RR4BB82TF U 1
AF RR4BF37TF U 1
BS 1 619 RR4BB82TF

RD RR4BB82JQ 619 0 0
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TTATGTAACATTACATCGC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BF37JQ 619 0 0
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GGCCTCAACTGCGATCATGCAGATAAAAGAGTGTAGCTTGAGGACTCATCTGATACAAAC
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TTATGTAACATTACATCGC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BB82TF 619 0 0
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QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BF37TF 619 0 0
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GGCCTCAACTGCGATCATGCAGATAAAAGAGTGTAGCTTGAGGACTCATCTGATACAAAC
TAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAGATGCAGAGTAGGAGACTTCTTCATTGTTGCCATTAGG
CAAGCTTCCGTGGCCATAATTAACACACTTACGGTTCCACACGCTCACCACTGATGACTG
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TTTTTGTTATGTAACATTAGCATAGGAACACAGCAAAAGGAAAAAGCAATTTATTTGTTC
CCATGTAAGCTCTGATGTGGGTTTTCTTAGGTGTTTTATTAGGTAGAGTCAATTTTATTA
GTATTAATTTATTTTGTTACAAATTACTTGCACTGTTTTGAAACCAACAAACCTATAAAT
TTATGTAACATTACATCGC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 4

CO CL2840Contig1 1136 4 7 U
GGTTACTCACATCACATATCCACTGAACAACAAAAAGGATGGCCTCCGCGATTTTTCCAT
CGCTCAGGCTAAGGCCCATAGTCTCCTCCGCCACGTCACTATCCTCCTCATCTTCCTCCG
GCGATTTCAAACCCCGTCCCGCCGTCATTCTCCCGGGTTTAGGAAACAATTCAGGAGACT
ACAAGAAGCTGGAGCTAACATTGGGTGAGTATGGTGTTCCTTCAGTGGTTGCAGCTGTAT
CAAGGCTCGATTGGTTTAGAAATGCAGCCGGTTTGGTTGATCCTGCCTACTGGCGCGGTA
CTCTACGCCCTCGTCCTGTTCTTGATTGGTATTTGAAAAGAATAGATGATGCCGTCCGTG
AAGCCAATGAGTTATCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCGGCTGGAGGAT
GGCTTGCTAGAGTTTACATGGAAGAATACGGAAACGCTGATATCTCCTTGTTGCTGACAC
TTGGTACGCCTCACTTACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAG
GTCTTCTTTATTATGTCGAAGAGAATTGTGCAAAAGCTGTTTATACCCCTGAGCTGAGAT
ATGTCTGCATCGCCGGGAGATACATTTGTGGAGCTCCTTTAGTGGACAAGGCAGATGTGA
ACGTTGATTCTAATGTCACTGTTGGAATTGACGGTGGTGAAACCATCTCAGAGCTCGCTA
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TTGTAGGGCAAGGATACAAGCAGGTATGTGGGAGAGCTGATGTGTGGGGTGATGGAGTGG
TCCCTGAGGTTTCAGCTCATCTTGATGGTGCACTTAACGTTAGCTTCGACAGTGTTTACC
ATTCGCCTGTTGGTTCAGACGATGAAACCAGACCTTGGTATGGTTCACCGGTTATTGCAA
AAGAATGGATTCACCACCTCCTTGAGTGAGTTTTCAGGTTACTGTAAAAACATTCATCAG
AACTTCCTCAAGAACTTGTCATGTTCCAATTGTTTCTATCTCTTCACCCAAATATTCAAA
CTCTATTATGTATTTATATTTTCCCTTTTTGAACGATCCATCTCTGTCAAAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG18TF U 1
AF RR4B777TF U 7
AF RR4B777JQ C 292
AF RR4EG18JQ C 391
BS 1 553 RR4EG18TF
BS 554 555 RR4B777TF
BS 556 642 RR4EG18TF
BS 643 749 RR4B777TF
BS 750 890 RR4B777JQ
BS 891 891 RR4EG18JQ
BS 892 1136 RR4B777JQ

RD RR4EG18TF 642 0 0
GGTTACTCACATCACATATCCACTGAACAACAAAAAGGATGGCCTCCGCGATTTTTCCAT
CGCTCAGGCTAAGGCCCATAGTCTCCTCCGCCACGTCACTATCCTCCTCATCTTCCTCCG
GCGATTTCAAACCCCGTCCCGCCGTCATTCTCCCGGGTTTAGGAAACAATTCAGGAGACT
ACAAGAAGCTGGAGCTAACATTGGGTGAGTATGGTGTTCCTTCAGTGGTTGCAGCTGTAT
CAAGGCTCGATTGGTTTAGAAATGCAGCCGGTTTGGTTGATCCTGCCTACTGGCGCGGTA
CTCTACGCCCTCGTCCTGTTCTTGATTGGTATTTGAAAAGAATAGATGATGCCGTCCGTG
AAGCCAATGAGTTATCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCGGCTGGAGGAT
GGCTTGCTAGAGTTTACATGGAAGAATACGGAAACGCTGATATCTCCTTGTTGCTGACAC
TTGGTACGCCTCACTTACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAG
GTCTTCTTTATTA**TCGAAGAGAATTGTGCAAAAGCTGTTTATACCCCTGAGCTGAGAT
ATGTCTGCATCGCCGGGAGATACATTTGTGGAGCTCCTTTAG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4B777TF 743 0 0
GGG
CATCACATATCCACTGAACAACAAAAAGGATGGCCTCCGCGATTTTTCCATCGCTCAGGC
TAAGGCCCATAGTCTCCTCCGCCACGTCACTATCCTCCTCATCTTCCTCCGGCGATTTCA
AACCCCGTCCCGCCGTCATTCTCCCGGGTTTAGGAAACAATTCAGGAGACTACAAGAAGC
TGGAGCTAACATTGGGTGAGTATGGTGTTCCTTCAGTGGTTGCAGCTGTATCAAGGCTCG
ATTGGTTTAGAAATGCAGCCGGTTTGGTTGATCCTGCCTACTGGCGCGGTACTCTACGCC
CTCGTCCTGTTCTTGATTGGTATTTGAAAAGAATAGATGATGCCGTCCGTGAAGCCAATG
AGTTATCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCGGCTGGAGGATGGCTTGCTA
GAGTTTACATGGAAGAATACGGAAACGCTGATATCTCCTTGTTGCTGATACTTGGTACGC
CTCACTTACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAGGTCTTCTTT
ATTATGTCGAAGAGAATTGTGCAAAAGCTGTTTATACCCCTGAGCTGAGATATGTCTGCA
TCGCCGGGAGATACATTTGTGGAGCTCCTTTAGTGGACAAGGCAGATGTGAACGTTGATT
CTAATGTCACTGTTGGAATTGACGGTGGTGAAACCATCTCAGAGCTCGCTATAGCAAGCA
ACAAGACGGACGATTCACAG

QA 4 743 4 743
DS 

RD RR4B777JQ 845 0 0
GGCGCGGTACTCTACGCCCTCGTCCTGTTCTTGATTGGTATTTGAAAAGAATAGATGATG
CCGTCCGTGAAGCCAATGAGTTATCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCGG
CTGGAGGATGGCTTGCTAGAGTTTACATGGAAGAATACGGAAACGCTGATATCTCCTTGT
TGCTGATACTTGGTACGCCTCACTTACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGATC
AAACAAGAGGTCTTCTTTATTATGTCGAAGAGAATTGTGCAAAAGCTGTTTATACCCCTG
AGCTGAGATATGTCTGCATCGCCGGGAGATACATTTGTGGAGCTCCTTTAGTGGACAAGG
CAGATGTGAACGTTGATTCTAATGTCACTGTTGGAATTGACGGTGGTGAAACCATCTCAG
AGCTCGCTATAGCAAGCAACAAGACGGACGATTCACAGGTTTCTTCAGGGCCTAGTTTTC
GTGCTCGTTTTGTAGGGCAAGGATACAAGCAGGTATGTGGGAGAGCTGATGTGTGGGGTG
ATGGAGTGGTCCCTGAGGTTTCAGCTCATCTTGATGGTGCACTTAACGTTAGCTTCGACG
GTGTTTACCATTCGCCTGTTGGTTCAGACGATGAAACCAGACCTTGGTATGGTTCACCGG
TTATTGCAAAAGAATGGATTCACCACCTCCTTGAGTGAGTTTTCAGGTTACTGTAAAAAC
ATTCATCAGAACTTCCTCAAGAACTTGTCATGTTCCAATTGTTTCTATCTCTTCACCCAA
ATATTCAAACTCTATTATGTATTTATATTTTCCCTTTTTGAACGATCCATCTCTGTCAAA
ATGCC

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4EG18JQ 704 0 0
TGTCTTTGATTGGACACTCGGCTGGAGGATGGCTTGCTAGAGTTTACATGGAAGAATACG
GAAACGCTGATATCTCCTTGTTGCTGACACTTGGTACGCCTCACTTACCACCACCGAGAG
GACTATCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAGGTCTTCTTTATTA**TCGAAGAGAATTGTG
CAAAAGCTGTTTATACCCCTGAGCTGAGATATGTTTGCATCGCCGGGAGATACATTTGTG
GAGCTCCTTTAGTGGACAAGGCAGATGTGAACGTTGATTCTAATGTCACTGTTGGAATTG
ACGTTGGTGAAACCATCTCAGAGCTCGCTATAGCAAGCAACAAGACGGACGATTCACAGG
TTTCTTCAGGGCCTAGTTTTCGTGCTCGTTTTGTAGGGCAAGGATACAAGCAGGTATGTG
TGAGAGCTGATGTGTGGGGTGATGGAGTGGTCCCTGAGGTTTCAGCTCATCTTGATGGTG
CACTTAACGTTAGCTTCGACAGTGTTTACCATTCGCCTGTTGGTTCAGACGATGAAACCA
GACCTTGGTATGGTTCACCGGTTATTGCAAAAGAATGGATTCACCACCTCCTTGAGTGAG
TTTTCAGGTTACTGTAAAAACATTCATCAGAACTTCCTCAAGAACTTGTTATGTTCCAAT
TGTTTCTATCTCTTCACCCAAATATTCAAACTCTATTATGTATT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 3

CO CL2841Contig1 1037 3 2 U
GGGTTCACAGTTTCGGTGTTATCGACAATGAGTGGCTACGTTCCTTGTACGAGGACCGAG
CTAGGTGGGCTCCTGTTTATCTCATAGACACTTTCTTCGCTGGTCTCGCTACTTGTCGTC
TTGGAGAGACGTTGAGTCCGTTTTTCGAGAGGTACGTTCATAAACAAACACCGTTGAAAG
AGTTTCTCGATAAGTACGAGTTAGCTCTTCATAGGAAGCACAGGGAAGAGACTCTCGCCG
AGTTAGAGTCTCTCGCCTTGAGCACCACGGAGCTTAAAACGAAGTGTTCTTTCGAGACGC
AGCTCTCGAGAGTCTACACGAGAGACGTGTTCAGGAAGTTCCAAGTAGAGGTGGAAGAGA
TGTACTCGTGTTTCAGCACGACGCAGGTCCACGTGGACGGGCCTTTGGTGATCTTCCTCG
TGAAAGAACGTGTCCAAGGAGAATCCAACAGAAGAGAAGCCCGAGATTTCGAGGTTCTGT
ACAATAGATCGGTGGGTGAAGTACGGTGCATTTGCAGCTGCTTCAGCTTCTACGGATACT
TGTGCAGGCATGCTCTTTGTGTTCTCAACTTCAGTGGCGTTGAGGAGATCCCTCTGAGGT
ATGTTCTGCCACGGTGGAGAAAAGACTACAAACGTGTCCATGCATCTGATAATGGCTTTG
TGGATGGCGCGGACCGGGTTCAAAGGTTTGATCAGTTGTATAAAGGGGCTCTTGAGGTAG
TTGAAGAAGGAGCGGTTTCTTTGGATCGTTATAAAGTGGCGATGCAAGTTCTTGAACAGG
CTTTGGATAGAGTTCATAGTGTAGAACAAAAGCAAGTGTAGTGTTTATAGAAGAAGGGGT
TTGTGAAACTTGTATATCTGTATATAGAAAACTATTTTGTTCTTTCTTTTGTTGTAAGAG
AGCTGTAATAATAATATAAGCCAAGAGGCATGAAGCCACCAAAAAGTATAGATTTGTTGT
AACACTGAACTAGTTGCCTTTTAAGGTATTGAACATATCATGATTTTGTTAATATTGAGA
GTTAAGACTAAATGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP53TF U 1
AF RR4DT87TF U 1
AF RR4DP53JQ C 418
BS 1 681 RR4DP53TF
BS 682 1037 RR4DP53JQ

RD RR4DP53TF 681 0 0
GGGTTCACAGTTTCGGTGTTATCGACAATGAGTGGCTACGTTCCTTGTACGAGGACCGAG
CTAGGTGGGCTCCTGTTTATCTCATAGACACTTTCTTCGCTGGTCTCGCTACTTGTCGTC
TTGGAGAGACGTTGAGTCCGTTTTTCGAGAGGTACGTTCATAAACAAACACCGTTGAAAG
AGTTTCTCGATAAGTACGAGTTAGCTCTTCATAGGAAGCACAGGGAAGAGACTCTCGCCG
AGTTAGAGTCTCTCGCCTTGAGCACCACGGAGCTTAAAACGAAGTGTTCTTTCGAGACGC
AGCTCTCGAGAGTCTACACGAGAGACGTGTTCAGGAAGTTCCAAGTAGAGGTGGAAGAGA
TGTACTCGTGTTTCAGCACGACGCAGGTCCACGTGGACGGGCCTTTGGTGATCTTCCTCG
TGAAAGAACGTGTCCAAGGAGAATCCAACAGAAGAGAAGCCCGAGATTTCGAGGTTCTGT
ACAATAGATCGGTGGGTGAAGTACGGTGCATTTGCAGCTGCTTCAGCTTCTACGGATACT
TGTGCAGGCATGCTCTTTGTGTTCTCAACTTCAGTGGCGTTGAGGAGATCCCTCTGAGGT
ATGTTCTGCCACGGTGGAGAAAAGACTACAAACGTGTCCATGCATCTGATAATGGCTTTG
TGGATGGCGCGGACCGGGTTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4DT87TF 673 0 0
GGGTTCACAGTTTCGGTGTTATCGACAATGAGTGGCTACGTTCCTTGTACGAGGACCGAG
CTAGGTGGGCTCCTGTTTATCTCATAGACACTTTCTTCGCTGGTCTCGCTACTTGTCGTC
TTGGAGAGACGTTGAGTCCGTTTTTCGAGAGGTACGTTCATAAACAAACACCGTTGAAAG
AGTTTCTCGATAAGTACGAGTTAGCTCTTCATAGGAAGCACAGGGAAGAGACTCTCGCCG
AGTTAGAGTCTCTCGCCTTGAGCACCACGGAGCTTAAAACGAAGTGTTCTTTCGAGACGC
AGCTCTCGAGAGTCTACACGAGAGACGTGTTCAGGAAGTTCCAAGTAGAGGTGGAAGAGA
TGTACTCGTGTTTCAGCACGACGCAGGTCCACGTGGACGGGCCTTTGGTGATCTTCCTCG
TGAAAGAACGTGTCCAAGGAGAATCCAACAGAAGAGAAGCCCGAGATTTCGAGGTTCTGT
ACAATAGATCGGTGGGTGAAGTACGGTGCATTTGCAGCTGCTTCAGCTTCTACGGATACT
TGTGCAGGCATGCTCTTTGTGTTCTCAACTTCAGTGGCGTTGAGGAGATCCCTCTGAGGT
ATGTTCTGCCACGGTGGAGAAAAGACTACAAACGTGTCCATGCATCTGATAATGGCTTTG
TGGATGGCGCGGA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4DP53JQ 620 0 0
TCGTGAAAGAACGTGTCCAAGGAGAATCCAACAGAAGAGAAGCCCGAGATTTCGAGGTTC
TGTACAATAGATCGGTGGGTGAAGTACGGTGCATTTGCAGCTGCTTCAGCTTCTACGGAT
ACTTGTGCAGGCATGCTCTTTGTGTTCTCAACTTCAGTGGCGTTGAGGAGATCCCTCTGA
GGTATGTTCTGCCACGGTGGAGAAAAGACTACAAACGTGTCCATGCATCTGATAATGGCT
TTGTGGATGGCGCGGACCGGGTTCAAAGGTTTGATCAGTTGTATAAAGGGGCTCTTGAGG
TAGTTGAAGAAGGAGCGGTTTCTTTGGATCGTTATAAAGTGGCGATGCAAGTTCTTGAAC
AGGCTTTGGATAGAGTTCATAGTGTAGAACAAAAGCAAGTGTAGTGTTTATAGAAGAAGG
GGTTTGTGAAACTTGTATATCTGTATATAGAAAACTATTTTGTTCTTTCTTTTGTTGTAA
GAGAGCTGTAATAATAATATAAGCCAAGAGGCATGAAGCCACCAAAAAGTATAGATTTGT
TGTAACACTGAACTAGTTGCCTTTTAAGGTATTGAACATATCATGATTTTGTTAATATTG
AGAGTTAAGACTAAATGTTT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 3

CO CL2842Contig1 790 3 30 U
GGGTACACTTGGGATTAGGAGGATCGCTCCTGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGCCATGG
CTGCTGCTTTCACCTGTACCTCTCTTCCTCCGCTTCCTCTCCGTTGTTCAGAGACGAGAA
TCGCATCCTCACCATCGGCTTCACTCTCAGCTCGTCGGCTCTTCGCCGTGTCACCAGAAT
CAGGAGGATTGAGAATCCGTCTTTCTCAGTCGTTGACCTCGATTAAACCTAGGGTTCCTC
GATTACGAATAGGAGGCGGCGTCGTCTGCGAAGCTCAGGAAACTACTACCGACATAGTTT
CAATAGTCAACGACTCGACGTGGGATTCTCTAGTTCTCAAGGCAGACGGGCTTGTGCTTG
TCGACTTCTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCTCTTGTGAATGAGG
TAGCGCAACAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTAAACACCGACGACTCTCCTT
CAACCCCGTGCGAGTACAAAGTTAGAAACATCCCAACGATCGTGATCTTTGTCAACGGCG
AGAAGAAGGACGCTCTCATAGGTACAGTGCCCAAATCCGCACTCACATCTAGCATTGACA
AGTTCTTGCAATGAGATTGTGAGTCTGTATTGATCACACTCTCTCCCCCTCTGTTTCGTA
TTCTCATTCTCTCTGTTAACTTGCGCTTTCTCTATAGCTATCTGCTTCCGCTGTATCTTT
TCTTCATCACTGAACATCTAGACATGAATCAATAATACTATAATATAATATCTCAGGTTT
TTTATGTTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CA09TF U 1
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CAGGAGGATTGAGAATCCGTCTTTCTCAGTCGTTGACCTCGATTCAATCTAGGGTTCCTC
GATTACGAA***GAGGCGGCGTCGTCTGCGAAGCTCAGGAAACTGCTACCGACATAGTTT
CAATAGTCAACGACTCGACGTGGGATTCTCTAGTTCTCAAGGCAGACGGGCTTGTGCTTG
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TAGCGCAACAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTAAACACCGACGATTCTCCTT
CAACCCCGTGCGAGTACAAAGTTAGAAACATCCCAACGATCGTGATCTTTGTCAACGGCG
AGAAGAAGGACGCTCTCATAGGTACAGTGCCCAAATCCGCACTCACATCTAGCATTGACA
AGTTCTTGCAATGAGATTGTGAGTCTGTATTGATCACTCTCTCTCCCCCTCTTTTTCGTA
TTCTCATTCTCTCTGT*AACTTGCGCTTTCTCTATAGCTATCTGCTTCCGCTGTATCTTT
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CCGCACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGATTGTGAGTCTGTATTGATCA
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ACTATAATATAATATCTCAGGTTTTTTATGTTGG

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DS 



AS 1 4

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GATGTTGGACATCAATCTATTCCGAGAAGAGAAGGGGAACAACCCCGAGATCATCCGCGA
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ATATGCTGGTTACTCGTCCTGCTTTAGAAAAGAGGCTGGTTCCCACGGAAGAGATACACT
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AGCTGCAGACACCAAAGGCAAAAAGTCTAAAGCTTGATTGAATTTACTTGATTACTACAA
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TGGGGACTGACGTTGTGCTGTGTTACCTTCTTTATTCATCATCGGATTTTTTTTTCTTGG
C


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4E845TF U 1
AF RR4A757TF U 164
AF RR4A757JQ C 683
AF RR4E845JQ C 1082
BS 1 327 RR4E845TF
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BS 329 348 RR4E845TF
BS 349 349 RR4A757TF
BS 350 360 RR4E845TF
BS 361 361 RR4A757TF
BS 362 369 RR4E845TF
BS 370 370 RR4A757TF
BS 371 674 RR4E845TF
BS 675 988 RR4A757TF
BS 989 1561 RR4A757JQ

RD RR4E845TF 674 0 0
GGAACGCCGCTGATACTCCCATCTACAGTCGCAAAGAGATAATAAAGAGCGCACTTAAAC
GATGTTGGACATCAATCTATTCCGAGAAGAGAAGGGGAACAACCCCGAGATCATCCGCGA
ATCGCAACGCCGGAGATTCGCCAGCGTCGAAGTCGTCGACGAGATCATCAAGCTCGACAA
AGAATGGCGCCAACGTCAATTCGAAGTAGATAACTTCCGCAAGGAGTTCAACAAGCTGAA
CAAGCAAGTCGCCAAGCTCAAGATCTCTGGTGCTGATGCAAGCGAGGTGATTGAGCAAAC
GGAGAAGAACAAACGCGACGCTACTGAGAAGGAGGCTGAGGTTCGTGAGGCTTACGCTGC
TTTGAAGGCTAAGTTGGAGACTGTTGGCAATCTCGTCCACGACTCTGTTCCCGTTAGCAA
CGATGAGGCGAACAATGCTGTGACTAAAGTTTGGGGTGAGAAGCTTGTTGCTTCTCCTGG
TCTGAAGCTGAAAAACCACGTGGATCTCGTTGAGCTTCTTGACATTGCAGATACCAAGAG
AGGGGCTGAGATTGCTGGAGCAAGAGGTTTTTTCCTGAAAGGAGATGGTTTACTGCTTAA
CCAAGCTCTTATCAACTTTGGGCTGACCTTCTTGAAAAAGAGAGGTTTCACTGGACTGCA
GCCTCCGTTTTTCA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4A757TF 825 0 0
G
TCATCAAGCTCGACAAAGAATGGCGCCAGCGTCAATTCGAAGTAGATAACTTCCGCAAGG
AGTTCAACAAGCTGAACAAGCAAGTCGCCAAGCTCAAGATCTCTGGTGCTGATGCAAGCG
AGGTGATTGAGCAAACGGAGAAGAACAAACGCGACGCTACTGAAAAGGAGGCTGAGGTTC
GTGAAGCTTACGCTGCGTTGAAGGCCAAGTTGGAGACTGTTGGCAATCTCGTCCACGACT
CTGTTCCCGTTAGCAACGATGAGGCGAACAATGCTGTGACTAAAGTTTGGGGTGAGAAGC
TTGTTGCTTCTCCTGGTCTGAAGCTTAAAAACCATGTGGATCTCGTTGAGCTTCTTGACA
TTGCAGATACCAAGAGAGGGGCTGAGATTGCTGGAGCAAGAGGTTTTTTCCTGAAAGGAG
ATGGTTTACTGCTTAACCAAGCTCTTATCAACTTTGGGCTGACCTTCTTGAAAAAGAGAG
GTTTCACTGGACTGCAGCCTCCGTTTTTCATGAGGAAGGATGTCATGGCCAAGTGCGCAC
AATTGGCACAGTTCGATGAAGAGCTTTACAAGGTGACTGGTGAAGGTGATGATAAGTACC
TTATTGCAACTGCTGAGCAACCTCTCTGTGCTTACCATATTGATGAATGGATCCATCCGA
CGGAGGTTCCCAAAAGATATGCTGGTTACTCGTCCTGCTTTAGAAAAGAGGCTGGTTCCC
ACGGAAGAGATACACTCGGCATTTTCCGTGTTCACCAGTTTGAGAAGATTGAACAGTTCT
GCATCACGGGTCCTAACGAGAATCATTCGTGGGACATGCTTGAA

QA 2 825 2 825
DS 

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GGTGAAGGTGATGATAAGTACCTTATTGCAACTGCTGAGCAACCTCTCTGTGCTTACCAT
ATTGATGAATGGATCCATCCGACGGAGGTTCCCAAAAGATATGCTGGTTACTCGTCCTGC
TTTAGAAAAGAGGCTGGTTCCCACGGAAGAGATACACTCGGCATTTTCCGTGTTCACCAG
TTTGAGAAGATTGAACAGTTCTGCATCACGGGTCCTAACGAGAATCATTCGTGGGACATG
CTTGAAGAGATGATGAACAACTCTGAAGATTTTTACCAAGCGCTGAAACTTCCATACCAA
ATCGTTTCCATAGTCTCTGGGGCATTGAACGATGCAGCTGCAAAGAAGTACGACTTGGAA
GCTTGGTTTCCTTCGTCGGGGACTTACAGAGAGCTTGTGTCCTGCTCCAACTGCACAGAC
TACCAAGCTCGAAGACTTGAGATCAGATACGGTCAGAAGAAGAGCAATGAGCAGGCGAAG
CAGTACGTGCACATGCTGAACTCGACTCTCACCGCCACAGAGAGGACCATCTGCTGCATT
CTGGAGAACTACCAGCGCGAGGACGGTGTGGAGATCCCTGAGGTGTTGCAGCCATTTATG
GGCGGAGAGACGTTTTTGCCCTTCAAGGTTAAGCCAGTAGCTGCAGACACCAAAGGCAAA
AAGTCTAAAGCTTGATTGAATTTACTTGATTACTACAACTCTGATTGAAAAATTTCTATC
GTAATGTTGATTTCTTTAATTCTGTGGAACGTTTTTTTTGGGGACTGACGTTGTGCTGTG
TTACCTTCTTTATTCATCATCGGATTTTTTTTTCTTGGC

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR4E845JQ 480 0 0
GCAAAGAAGTACGACTTGGAAGCTTGGTTTCCTTCGTCGGGGACTTACAGAGAGCTTGTG
TCCTGCTCCAACTGCACAGACTACCAAGCTCGAAGACTTGAGATCAGATACGGTCAGAAG
AAGAGCAATGAGCAGGGGAAGCAGTACGTGCACATGCTGAACTCGACTCTCACCGCCACA
GAGAGGACCATCTGCTGCATTTTGGAGAACTACCAGCGCGAGGACGGTGTGGAGATCCCT
GAGGTGTTGCAGCCATTTATGGGCGGAGAGACGTTTTTGCCCTTCAAGGTTAAGCCAGTA
GCTGCAGACACCAAAGGCAAAAAGTCTAAAGCTTGATTGAATTTACTTGATTACTACAAC
TCTGATTGAAAAATTTCTATTGTAATGTTGTTTTCTTTAATTCTGTGGAACGTTTTTTTT
GGGGACTGACGTTGTGCTGTGTTACCTTCTTTATTCATCATCGGATTTTTTTTTCTTGGC

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DS 



AS 2 4

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AGTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTCCTAAATGACGCTCTTAAGAGCATGTATAATGC
AGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTT
CCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAG
GTCTGGTAAGATCGTTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAACAAGTGTGGAGTTATCAGTCC
TCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCG
ACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCATGGATCACGAAGAAGCCAG
GAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTTACTGAAGCAGCAGCTTCACACG
AGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTTCGCTGCTTTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAGA
TGCTTTAGACATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATTTCTGCTTTTGAGTTCGTCAGTCG
TCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTACGAACTAAAGTAGATTTCTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EE83TF U 1
AF RR4EE83JQ C 15
BS 1 649 RR4EE83TF
BS 650 651 RR4EE83JQ

RD RR4EE83TF 651 0 0
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AGTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTCCTAAATGACGCTCTTAAGAGCATGTATAATGC
AGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTT
CCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAG
GTCTGGTAAGATCGTTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAACAAGTGTGGAGTTATCAGTCC
TCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCG
ACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCATGGATCACGAAGAAGCCAG
GAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTTACTGAAGCAGCAGCTTCACACG
AGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTTCGCTGCTTTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAGA
TGCTTTAGACATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATTTCTGCTTTTGAGTTCGTCAGTCG
TCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTACGAACTAAAGTAGATTTCTTTGA
CC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4EE83JQ 637 0 0
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TGAGAATCAGTGTCCTAAATGACGCTCTTAAGAGCATGTATAATGCAGAGAAGAGGGGGA
AGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTCCTTATCGTCATGC
AAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCG
TTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAACAAGTGTGGAGTTATCAGTCCTCGTTTCGACGTTG
GTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCGCTCGTTTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACA
TTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCATGGATCACGAAGAAGCCAGGAGAAAGAATGTGG
GTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTTACTGAAGCAGCAGCTTCACACGAGTTCCTGTTATAT
CGGGTTGTATTTCGCTGCTTTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAGATGCTTTAGACATTT
AGGAGAGAAATAGACAACTTATTTCTGCTTTTGAGTTCGTCAGTCGTCATGCAACCGTGA
ATTTGTATTGTACGAACTAAAGTAGATTTCTTTGACC

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL2844Contig2 529 2 3 U
GTGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATAATCAAGTTCCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGT
TACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTTGTTGAGCTA
AATGGAAGGCTCAACAAGTGTGGTGTTATCAGCCCTCGTTTCGATGTTGGTGTTAAGGAG
ATCGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACA
ACCTCAGCTGGAATCATGGATCACGAAGAAGCCAGGAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTT
CTTGGCTTTTTTTACTGAAGCATCAGCTTCACACGAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATT
TCCCTGCTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAGATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATA
AACAACTTATTTCGGTTTTTGAGTTCGTCAGTCGTCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTA
CGAACTAAATTAGATTTCTTTGATCAACTCTAGTCCTGCCAAAAAAAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA50JQ C 1
AF RR4GA50TF U 1
BS 1 1 RR4GA50JQ
BS 2 520 RR4GA50TF
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AATGGAAGGCTCAACAAGTGTGGTGTTATCAGCCCTCGTTTCGATGTTGGTGTTAAGGAG
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ACCTCAGCTGGAATCATGGATCACGAAGAAGCCAGGAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTT
CTTGGCTTTTTTTACTGAAGCATCAGCTTCACACGAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATT
TCCCTGCTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAGATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATA
AACAACTTATTTCGGTTTTTGAGTTCGTCAGTCGTCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTA
CGAACTAAATTAGATTTCTTTGATCAACTCTAGTCCTGCCAAAAAAAAA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4GA50TF 520 0 0
G
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ACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTTGTTGAGCTAA
ATGGAAGGCTCAACAAGTGTGGTGTTATCAGCCCTCGTTTCGATGTTGGTGTTAAGGAGA
TCGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAA
CCTCAGCTGGAATCATGGATCACGAAGAAGCCAGGAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTC
TTGGCTTTTTTTACTGAAGCATCAGCTTCACACGAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTT
CCCTGCTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAGATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATAA
ACAACTTATTTCGGTTTTTGAGTTCGTCAGTCGTCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTAC
GAACTAAATTAGATTTCTTTGATCAACTCTAGTCCTGCC

QA 2 520 2 520
DS 



AS 1 4

CO CL2845Contig1 1156 4 5 U
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CATCACCATACATTAGGGATCTTGCTACTTTAGTGGTGGCGTATGGTATTAGTATCAACC
TTGTGGAAGTCACATGGAAATCAAAGCTTAAAGCTCAGTTCCCTAGCCCAAACGAGTACT
CGGCGTTTATGGGTGACTTCTCAACATGCACTGGTATTGCAACATTCACAATGATGCTTC
TCAGTCAATACGTATTCGATAAGTATGGCTGGGGAGTAGCTGCAAAGATCACCCCAACTG
TTCTGTTATTGACTGGCGTTGCCTTCTTCTCTCTGATACTGTTTGGCGGCCCATTCGCAC
CGCTTGTTGCCAAGCTTGGTATGACTCCGTTACTCGCAGCCGTCTATGTTGGTGCCCTCC
AGAATATCTTCAGCAAGAGTGCCAAGTACAGCTTGTTTGATCCTTGTAAAGAAATGGCTT
ACATCCCCTTGGACGAGGATACCAAGGTTAAAGGGAAAGCAGCAATTGATGTGGTTTGCA
ACCCGTTGGGGAAATCAGGGGGTGCTCTAATCCAACAGTTCATGATCTTATCATTTGGAT
CACTAGCAAATTCAACACCGTACCTAGGAATGATACTGTTGGTCATTGTCACTGCGTGGT
TAGCTGCAGCTAAGTCGCTGGAGGGACAGTTCAATGCGTTGAGGTCTGAAGAAGAGCTGG
AGAAGGAAATGGAGAGAGCTTCATCTGTGAAGATCCCTGTTGTGTCTCAAGAGGAAGATG
GTGGAAATGGTTTTCTTGGAGAATCTACTAGCAGTTGGCCTGAGAAATCAGCTCCCACCA
ACATATAAACAACAAAAGGGGTTTTTGATATTTGATTTTAGGAAGATGAAATCAAAAATA
AAGAGTTTGAGAGTGAGAAAAAGACTCTCAAACATTGGCTCTTTTGCACCACCACTCCAC
TCTTTTTTAGTCTTTAGTTTTCAGAACAATTCATTTTCATTTCAGTTTAGTCTTAAAGTT
CTAAGTTTCTTGTCATATGTATTGTTTTAATTATTCAAGTAGATGATTGATTACAATCCT
TATCTTGTCGCTCCGAACCTTCAAATAAAAATAAACAATACAGTACTTTACTTAATACAA
AACAACATAATGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ59TF U 1
AF RR4EJ59JQ C 405
AF RR4DT37TF U 359
AF RR4DT37JQ C 467
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CGGCGTTTATGGGTGACTTCTCAACATGCACTGGTATTGCAACATTCACAATGATGCTTC
TCAGTCAATACGTATTCGATAAGTATGGCTGGGGAGTAGCTGCAAAGATCACCCCAACTG
TTCTGTTATTGACTGGCGTTGCCTTCTTCTCTCTGATACTGTTTGGCGGCCCATTCGCAC
CGCTTGTTGCCAAGCTTGGTATGACTCCGTTACTCGCAGCCGTCTATGTTGGTGCCCTCC
AGAATATCTTCAGCAAGAGTGCCAAGTACAGCTTGTTTGATCCTTGTAAAGAAATGGCTT
ACATCCCCTTGGACGAGGATACCAAGGTTAAAGGGAAAGCAGCAATTGATGTGGTTTGCA
ACCCGTTGGGGAAATCAGGGGGTGCTCTAATCCAACAGTTCATGATCTTATCATTTGGAT
CACTAGCAAATTCAACACCGTACCTAGGAATGATACTGTTGGTCATTGTCACTGCGTGGT
TAGCTGCAGCTAAGTCGCTGGAGGGACAGTTCAATGCGTTGAGGT
CTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4EJ59JQ 674 0 0
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ATCTTATCATTTGGATCACTAGCAAATTCAACACCGTACCTAGGAATGATACTGTTGGTC
ATTGTCACTGCGTGGTTAGCTGCAGCTAAGTCGCTGGAGGGACAGTTCAATGCGTTGAGG
TCTGAAGAAGAGCTGGAGAAGGAAATGGAGAGAGCTTCATCTGTGAAGATCCCTGTTGTG
TCTCAAGAGGAAGATGGTGGGAACGGTTTTCTTGGAGAATCTACTAGCAGTTGGCCTGAG
AAATCAGCTCCCACCAACATATAAACAACAAAAGGGGTTTTTGATATTTGATTTTAGGAA
GATGAAATCAAAAATAAAGAGTTTGAGAGTGATAAAAAGACTCTCAAACATTGGCTCTTT
TGCACCACCACTCCACTCTTTTTTAGTCTTTAGTTTTCAGAACAATTCATTTTCATTTCA
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GATTGATTACAA
CC

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DS 

RD RR4DT37TF 738 0 0
G
CCGCTTGTTGCCAAGCTTGGTATGACTCCGTTACTCGCAGCTGTCTATGTTGGTGCCCTC
CAGAATATCTTCAGCAAGAGTGCCAAGTACAGCTTGTTTGATCCTTGTAAAGAAATGGCT
TACATCCCCTTGGATGAGGATACCAAGGTTAAAGGGAAAGCAGCAATTGATGTGGTTTGC
AACCCGTTGGGGAAATCAGGGGGTGCTCTAATCCAGCAGTTCATGATCTTATCATTTGGA
TCACTGGCAAATTCAACACCGTACCTAGGGATGATACTGTTGGTCATTGTCACTGCGTGG
TTAGCTGCAGCTAAGTCGCTGGAGGGACAGTTCAATGCGTTGAGGTCTGAAGAAGAGCTG
GAGAAGGAAATGGAGAGAGCTTCATCTGTGAAGATCCCTGTTGTGTCTCAAGAGGAAGAT
GGTGGAAATGGTTCTCTTGGAGAATCTACTAGCAGTTGGCCTGAGAAATCAGCTCCCACC
AACATATAAACAACAAAAGGGGTTTTTGATATTTGATTTTAGGAAGATGAAATCAAAAAT
AAAGAGTTTGAGAGTGAGAAAAAGACTCTCAAACATTGGCTCTTTTGCACCACCACTCCA
CTCTTTTTTAGTCTTTAGTTTTCAGAACAATTCATTTTCATTTCAGTTTAGTCTTAAAGT
TCTAAGTTTCTTGTCATATGTATTGTTTTAATTATTCAAGTAGATGATTGATTACAATCC
TTATCTTGTCGCTCCGA

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4DT37JQ 690 0 0
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TGATGTGGTTTGCAACCCGTTGGGGAAATCAGGGGGTGCTCTAATCCAGCAGTTCATGAT
CTTATCATTTGGATCACTGGCAAATTCAACACCGTACCTAGGGATGATACTGTTGGTCAT
TGTCACTGCGTGGTTAGCTGCAGCTAAGTCGCTGGAGGGACAGTTCAATGCGTTGAGGTT
TGAAGAAGAGCTGGAGAAGGAAATGGAGAGAGCTTCATCTGTGAAGATCCCTGTTGTGTC
TCAAGAGGAAGATGGTGGAAATGGTTTTCTTGGAGAATTTACTAGCAGTTGGCCTGAGAA
ATCAGCTCCCACCAACATATAAACAACAAAAGGGGTTTTTGATATTTGATTTTAGGAAGA
TGAAATCAAAAATAAAGAGTTTGAGAGTGAGAAAAAGACTCTCAAACATTGGCTCTTTTG
CACCACCACTCCACTCTTTTTTAGTCTTTAGTTTTCAGAACAATTCATTTTCATTTCAGT
TTAGTTTTAAAGTTCTAAGTTTCTTGTCATATGTATTGTTTTAATTATTCAAGTAGATGA
TTGATTACAATCCTTATCTTGTCGCTCCGAACCTTCAAATAAAAATAAACAATACAGTAC
TTTACTTAATACAAAACAACATAATGTTTG

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL2846Contig1 1059 3 2 U
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TCTTGTTTTTTCATTTCCACGTTTGGTCAAAAAAGCAAAGCACTACTTTTAGTCTATTCT
GCTAGCTACGAACAAAGAACATTCTTCAACAACACTATCCGCAAACAAGGATAAGATTAT
TCTCCTATGGCCCTTAGAAAATTCATCTATATATTCCATTCATAGTCTCCTCCATAGTTA
GGTGAAGCGTTGTTCGTACGGTTTGTCTCTTCTGGTTTGATGGAGTTCGCAAATGCGTGC
CAGCCTATAAGGTAAGGCAATACGAAATTGAAAGCAGAGACCAGAACAGTAAACTCTGCT
CTAGTGATTGGTATGTAAATGCTCTCATCAACATTCAACAGCTTGTTTTGAACACTTAGG
TTAAAGAAGTGGCCAGAACCATCAGGGAGAGGCTCAACTTTCAACACTTTCCTCACCTTA
CCTTCATCACTTTTCCCCTTGTTAGGATCATGGAAGAACTCACAAGACTCCCTTGGGCCT
AGGCTAACTAGAGTTCCAATCTCTGAAACCGACAATGAGAACACCTGTTTCTTGCTCCAA
TCGTATTGCCTTACACCAGCGGCAGGAGCAAACTGAAGCAGTAGAAACCCGTCTTTGGAC
AACTTGAAAGCTCCAGAGTCTAAAGACACAAACTCCGGTGCTCTTGGCTCCACAGTTAAC
GCAGCTTTCCCTTTGTATATCGAATGACCCACGTAAAACCTAGCAGGTCCTCCTTCACCG
TTCTGTGAAGAAGAAGAAGACGAGTCACCGAACCTCTGCTTCTCGAAGTAATCCGTCTGC
CGGGACTTCACCGAGAGATTCAACTTCCTCACCGGTTTCGAAGCTAGTCCATGTCGTTTC
ACGGCGAGACCGCCGCCGCCGCCGGGGACGAGTACTGAAGAAGACGAAGAGAGAAAGCGA
GGGCTAGCAAAAGGATTGTAACTTGCAGCCATCAGAGGAGAAGATAAGAGTTGCGACATC
GCTTTTGTTTTGTCTCCTCTGTGAAATTAAGACAGAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU80JQ U 24
AF RR4AT41JQ U 1
AF RR4AT41TF C 278
BS 1 824 RR4AT41JQ
BS 825 1059 RR4AT41TF

RD RR4GU80JQ 746 0 0
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TGGTCAAAAAAGCAAAGCACTACTTTTAGTCTATTCTGCTAGCTACGAACAAAGAACATT
CTTCAACAACACTATCCGCAAACAAGGATAAGATTATTCTCCTATGGCCCTTAGAAAATT
CATCTATCTATTCCATTCATAGTCTCCTCCATAGTTAGGTGAAGCGTTGTTCGTACGGTT
TGTCTCTTCTGGTTTGATGGAGTTCGCAAATGCGTGCCAGCCTATAAGGTAAGGCAATAC
GAAATTGAAAGCAGAGACCAGAACAGTAAACTCTGCTCTAGTGATTGGTATGTAAATGCT
CTCATCAACATTCAACAGCTTGTTTTGAACAATTAGGTTAAAGAAGTGGCCAGAACCATC
AGGGAGAGGCTCAACTTCCAACACTTTCCTCACCTTACCTTCATCACTTTTCCCCTTGTT
AGGATCATGGAAGAACTCACAAGGCTCCCTTGGGCCTAGGCTAACTAGAGTTCCAATCTC
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AGACACAAACTCCGGTGCTCTTGGCTCCACAGTTAACGCAGCTTTCCCTTCGTATATCGA
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DS 

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TCTTGTTTTTTCATTTCCACGTTTGGTCAAAAAAGCAAAGCACTACTTTTAGTCTATTCT
GCTAGCTACGAACAAAGAACATTCTTCAACAACACTATCCGCAAACAAGGATAAGATTAT
TCTCCTATGGCCCTTAGAAAATTCATCTATATATTCCATTCATAGTCTCCTCCATAGTTA
GGTGAAGCGTTGTTCGTACGGTTTGTCTCTTCTGGTTTGATGGAGTTCGCAAATGCGTGC
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CTAGTGATTGGTATGTAAATGCTCTCATCAACATTCAACAGCTTGTTTTGAACACTTAGG
TTAAAGAAGTGGCCAGAACCATCAGGGAGAGGCTCAACTTTCAACACTTTCCTCACCTTA
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AGGCTAACTAGAGTTCCAATCTCTGAAACCGACAATGAGAACACCTGTTTCTTGCTCCAA
TCGTATTGCCTTACACCAGCGGCAGGAGCAAACTGAAGCAGTAGAAACCCGTCTTTGGAC
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TTCTGTGAAGAAGAAGAAGACGAGTCACCGAACCTCTGCTTCTC

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AGAACACCTGTTTCTTGCTCCAATCGTATTGCCTTACACCAGCGGCAGGAGCAAACTGAA
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GTGCTCTTGGCTCCACAGTTAACGCAGCTTTCCCTTTGTATATCGAATGACCCACGTAAA
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GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

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ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAATGGACAAATCGGGAGTATT
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AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAACATCTCTCCATATT


BQ
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AF RR4FE38JQ C 1
AF RR4FE38TF U 1
AF RR4FK21JQ C 1
AF RR4FK21TF U 1
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RD RR4FE38JQ 476 0 0
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CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAACATCTCTCCATATT

QA 1 476 1 476
DS 

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GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
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QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4FK21JQ 476 0 0
GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAATGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAACATCTCTCCATATT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4FK21TF 476 0 0
GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAATGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAACATCTCTCCATATT

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 4

CO CL2848Contig1 1161 4 6 U
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TCAGTGCAAGAGCGTCTGAAGCTGTTACGAACATTCAACAAGCTAGCATATCAGATAGTT
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ATGTTAAATGGATGGAAACGCTCTTCCATTTCATTATCTCATCTTTCAAATCTGGGAGGT
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CATCGCATAAAGATCTGTCCACATTAGCTAAGGCAGCCTTTGAGCTGCTGAAGTGGCGGG
TTTTCCCAGGATCTCATCTACAAAAAGTCATCGAAGTTATTCTTTCTTCTGCTGATGACT
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CACAACGAATGTTAATTAACT


BQ
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AF RR4FJ29JQ C 382
AF RR4EJ37TF U 480
AF RR4EJ37JQ C 500
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ATGTTAAATGGATGGAAACGCTCTTCCATTTCATTATCTCATCTTTCAAATCTGGGAGGT
CTTCATATCTAGGAGATGTAATTGCGGGATTCCTTTACCCGGTGATATCCTTACAGGAAA
CATCGCATAAAGATCTGTCCACATTAGCTAAGGCAGCCTTTGAGCTGCTGAAGTGGCGGG
TTTTCCCAGGATCTCATCTACAAAAAGTCATCGAAGTTATTCTTTCTTCTGCTGATGACT
CTAACTGGCGGATAAGATCTTCAACCTTGACATATCTGAGATCGTTTATGTACAGGCATA
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GAGGAGATGAAGATTTTGCTGCCGATTTTCGTGATAGATCCTATGCAGAGGCAAACTCGA
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TACCGGATCACGTGACACTAC

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CAACCTTGACATATCTGAGATCGTTTATGTACAGGCATACTTTCTTACTTGCTCATGAGG
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GAGAACATGCTGCAGCAGTTCTAGCAGGTCTTATGAAAGGAGGAGATGAAGATTTTGCTG
CCGATTTTCGTGATAGATCCTATGCAGAGGCAAACTCGATCCAAAAGAAAAGAAACCGGA
GGAAATCAAGTTCAACTCAGTCCACAGCGGAGGTGCATGGAGCCGTTCTTGGTTTGGTAG
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TGGCTCGTTTCGCTGGTGAACCCACGCCTATAAAATCTACTGTGACTAAAGCAGTGGCTG
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AACTTGAGGTTTTGGCTGATACATCATCCTCGTCCTCGTACTTTGCTTGATTCTGTGTTG
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TACTCTTACATTTGTTATATACTATTTTTTATTTTATGCCCCAACAGATGTAATGAAAGA
CCTTAAAACCTTGGTTTCGGTTTAC

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DS 

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G
CTTTCTTACTTGCTCATGAGGAGAAACAGAAAATTTGGAAAACAGTGGAGAAACTCCTTG
TTGACAGCCAAGTAGAGGTACGAGAACATGCTGCAGCAGTTCTAGCAGGTCTTATGAAAG
GAGGAGATGAAGATTTTGCTGCCGATTTTCGTGATAGATCCTATGCAGAGGCAAACTCGA
TCCAAAAGAAAAGAAACCGGAGGAAATCAAGTTCAACTCAGTCCACAGCGGAGGTGCATG
GAGCCGTTCTTGGTTTGGTAGCTTCAGTTTTGTCTGCTCCTTATGACATGCCCAGCTGGT
TACCGGATCACGTGACACTACTGGCTCGTTTCGCTGGTGAACCCACGCCTATAAAATCTA
CTGTGACTAAAGCAGTGGCTGAGTTCAGGCGAACCCATGCAGATACATGGAACATCCAGA
AAGACTCCTTCACTGAAGAACAACTTGAGGTTTTGGCTGATACATCATCCTCGTCCTCGT
ACTTTGCTTGATTCTGTGTTGCAGAAATTCAGTTTGACAATAAGAATAATACTCTTTAGA
ATGAGCCAAATACATCTTTTGTACTCTTACATTTGTTATATACTATTTTTTATTTTATGC
CCCAACAGATGTAATGAAAGACCTTAAAACCTTGGTTTCGGTTTACAGCTTTACATACTC
CACAACGAATGTTAATTAACT

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR4EJ37JQ 662 0 0
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TGCCGATTTTCGTGATAGATCCTATGCAGAGGCAAACTCGATCCAAAAGAAAAGAAACCG
GAGGAAATCAAGTTCAACTCAGTCCACAGCGGAGGTGCATGGAGCCGTTCTTGGTTTGGT
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ACTGGCTCGTTTCGCTGGTGAACCCACGCCTATAAAATTTACTGTGACTAAAGCAGTGGC
TGAGTTCAGGCGAACCCATGCAGATACATGGAACATCCAGAAAGACTCCTTCACTGAAGA
ACAACTTGAGGTTTTGGCTGATACATCATCCTCGTCCTCGTACTTTGCTTGATTCTGTGT
TGCAGAAATTCAGTTTGACAATAAGAATAATACTCTTTAGAATGAGCCAAATACATCTTT
TGTACTCTTACATTTGTTATATACTATTTTTTATTTTATGCCCCAACAGATGTAATGAAA
GACCTTAAAACCTTGGTTTCGGTTTACAGCTTTACATACTCCACAACGAATGTTAATTAA
CT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

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GCTCGACTCGAACCGCCTCGTCCCCGGAAACGATTACCAGATCGACTGCGGAGACGGGAA
AAGAGTCCACGAGAGATCAGACATGGCTGAAGGGTTGCTCTTCTCTTGGGTGAGCGACGA
GGTCTTCAGAAAACCGACTTTCGCTAGGTTCTGCTCGTTGCTCGACAACTACAACCCGCA
CGAAGGTTACAAAGAAGTTGTCACCGAAGAAGAGAGGCAAGAGCAGGCGGCTTTCATCAA
GAGATCAGCAGAACCGCTGTTGTTAAGTACCTTCACAAGTACCTTGTGATCAAGGACGTT
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GGACGTGGAGGCACCTCTGGCTCCTCTTCTGCCTTTGAGCATGTCTTTGTAGGTGAGATC
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CCTGATTCAGAGACTCAGCTGCTAACGATCCAGTTCGAGTGGAACGGTGTTTTGAAATCA
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TGTTACCGACTTGGCAACAACCGTATTGGCTCAGCTTTCCCCATTGCAGAATCTTGATAA
CCTCTCTCTCTTTCTTGATGGGTCCTCAATCAAAAAAACATTACAAAATATCTATGCATT
GAGCAGTACTCTATTGAATTATTATTATTATTGTTGTCAGAGATCTTTCTGTCTACATGT
TAAGACTTAGAAATATCTTGCTTTGATATTTCCTTGGATATTTTATGTGAAACTATGTTT
TGTACTTTTATGAAAATGATTCAACATAAGAGGAGTTGGTTG


BQ
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AF RR4DG90TF U 1
AF RR4DG90JQ C 287
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BS 796 1002 RR4DG90JQ

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GGTCTTCAGAAAACCGACTTTCGCTAGGTTCTGCTCGTTGCTCGACAACTACAACCCGCA
CGAAGGTTACAAAGAAGTTGTCACCGAAGAAGAGAGGCAAGAGCAGGCGGCTTTCATCAA
GAGATCAGCAGAACCGCTGTTGTTAAGTACCTTCACAAGTACCTTGTGATCAAGGACGTT
GCTCCTGGGAGCTACCAAGAGTTCAAGAGAATGCTGACGAGTCTCTGGTTCGATCTCTAT
GGACGTGGAGGCACCTCTGGCTCCTCTTCTGCCTTTGAGCATGTCTTTGTAGGTGAGATC
AAACAGTGTGGCGGGGAACAAGTCTCTGGCTTCCATAACTGGCTTCAGTTCTACCTAGAG
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CCTGATTCAGAGACTCAGCTGCTAACGATCCAGTTCGAGTGGAACGGTGTTTTGAAATCA
GTGTCGAGTACACTAGTTGGAGTGAGTCCAGAGTTCGAGTTGGCTCTGTACACGATGTGT
TTCTTCATGGGAAGAGAAGACAACCACATTCAGTTGGGTCCATACAGTGTCAATGTCAAG
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CCTCTCTCTCTTTCT

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DS 

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T
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GTTCGATCTCTATGGACGTGGAGGCACCTCTGGCTCCTCTTCTGCCTTTGAGCATGTCTT
TGTAGGTGAGATCAAACAGTGTGGCGGGGAACAAGTCTCTGGCTTCCATAACTGGCTTCA
GTTCTACCTAGAGGAAGCCAAAGGATCAGTGGACTATCAAGGCTATATATTCCCCCGACG
TCGTGGTGAAATTCCTGATTCAGAGACTCAGCTGCTAACGATCCAGTTCGAGTGGAACGG
TGTTTTGAAATCAGTGTCGAGTACACTAGTTGGAGTGAGTCCAGAGTTCGAGTTGGCTCT
GTACACGATGTGTTTCTTCATGGGAAGAGAAGACAACCACATTCAGTTGGGTCCATACAG
TGTCAATGTCAAGTGTTACCGACTTGGCAACAACCGTATTGGCTCAGCTTTCCCCATTGC
AGAATCTTGATAACCTCTCTCTCTTTCTTGATGGGTCCTCAATCAAAAAAACATTACAAA
ATATCTATGCATTGAGCAGTACTCTATTGAATTATTATTATTATTGTTGTCAGAGATCTT
TCTGTCTACATGTTAAGACTTAGAAATATCTTGCTTTGATATTTCCTTGGATATTTTATG
TGAAACTATGTTTTGTACTTTTATGAAAATGATTCAACATAAGAGGAGTTGGTTG

QA 2 716 2 716
DS 



AS 1 4

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AGAGAGATTCTCAAGCCGGTTAGAGCCGCCGCTGGAGATTCAGCTGGGGAGACGAAAGAT
GGATTCCTCGGGAAGTATCCATGGCTTGTCACCGGATTCTTCTTCTTCATGTGGTACTTC
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TTTGTTTCGGCTGTTCACTTGTTCGTTGGTGTTGTCTACTGCTTAATTAGCTGGTCCGTG
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GTCTGTCACGCCATAGGCCATATCACTAACAACGTTTCCTTCGCAGCAGTCGCTGTCTCC
TTCACTCACACCATCAAAGCGCTGGAGCCATTCTTCAATGCATCTGCTTCTCAGTTCCTT
CTTGGACAATCAATCCCCATAACACTATGGTTGTCTTTAGCTCCTGTTGTACTCGGAGTT
TCAATGGCTTCTCTAACTGAGTTATCATTCAACTGGCTTGGTTTCATCAGCGCGATGATA
TCAAACATCTCTTTCACTTACCGAAGCATCTTCTCCAAGAAAGCCATGACTGATATGGAC
AGTACTAATGTGTACGCTTACATCTCCATCATTGCTCTCATCGTCTGCATTCCCCCTGCC
ATCATCGTTGAAGGGCCTCAGCTGTTGAAACACGGTTTCAGCGACGCGATTGCTAAAGTT
GGAATGACTAAATTCGTCTCTGATCTCTTTTGGGTTGGAATGTTTTACCATCTCTACAAT
CAGTTGGCTACTAATACCTTGGAGAGGGTTGCACCATTGACTCATGCTGTTGGAAACGTT
TTGAAACGTGTGTTTGTGATCGGGTTCTCCATCGTTATCTTCGGAAACAAGATATCGACG
CAGACAGGTATCGTAACTGGAATAGCCATT*GCTGGTGTTGCACTCTACTCTATCATTAA
GGCCAAGATCGAAGAAGATAAAAAGAAAGGAAAGACGGCGTAGAGAGCGGCGGTCAAAGG
TTGCATAAACAATTCTTCCGGTGGATAATATATTTATATAATAAAAAGAACCAAAATGCA
ATAGTATGTTGTATGGTACAATCAACCATTGTTTTCGAGTTTTTCTTCTCTCTTTCTTTT
AAATAAAATACTATATTGTTTTTCTCCCTCTTTTGTTTCCAATGGAGAACATTGTTACCA
TTTCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB46TF U 1
AF RR4AU42TF U 656
AF RR4AU42JQ C 585
AF RR4DB46JQ C 528
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AGAGAGATTCTCAAGCCGGTTAGAGCCGCCGCTGGAGATTCAGCTGGGGAGACGAAAGAT
GGATTCCTCGGGAAGTATCCATGGCTTGTCACCGGATTCTTCTTCTTCATGTGGTACTTC
TTGAACGTGATTTTCAACATCCTTAACAAGAAGATCTATAATTACTTCCCCTATCCCTAT
TTTGTTTCGGCTGTTCACTTGTTCGTTGGTGTTGTCTACTGCTTAATTAGCTGGTCCGTG
GGCCTTCCTAAACGTGCCCCAATTGACTCGAACCTCCTTAAGGTTTTGATACCAGTTGCA
GTCTGTCACGCCATAGGCCATATCACTAACAACGTTTCCTTCGCAGCAGTCGCTGTCTCC
TTCACTCACACCATCAAAGCGCTGGAGCCATTCTTCAATGCATCTGCTTCTCAGTTCCTT
CTTGGACAATCAATCCCCATAACACTATGGTTGTCTTTAGCTCCTGTTGTACTCGGAGTT
TCAATGGCTTCTCTAACTGAGTTATCATTCAACTGGCTTGGTTTCATCAGCGCGATGATA
TCAAACATCTCTTTCACTTACCGAAGCATCTTCTCCAAGAAAGCCATGACTGATATGGAC
AGTACTAATGTGTACGCTTACATCTCCATCATTGCTCTCATCGTCTGCATTC
TCTGCATCATCG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4AU42TF 573 0 0
TGGACAGTACTAATGTGTACGCTTACATCTCCATCATTGCTCTCATCGTCTGCATTCCCC
CTGCCATCATCGTTGAAGGGCCTCAGCTGTTGAAACACGGTTTCAGCGACGCGATTGCTA
AAGTTGGAATGACTAAATTCGTCTCTGATCTCTTTTGGGTTGGAATGTTTTACCATCTCT
ACAATCAGTTGGCTACTAATACCTTGGAGAGGGTTGCACCATTGACTCATGCTGTTGGAA
ACGTTTTGAAACGTGTGTTTGTGATCGGGTTCTCCATCGTTATCTTCGGAAACAAGATAT
CGACGCAGACAGGTATCGTAACTGGAATAGCCATTTGCTGGTGTTGCACTCTACTCTATC
ATTAAGGCCAAGATCGAAGAAGATAAAAAGAAAGGAAAGACGGCGTAGAGAGCGGCGGTC
AAAGGTTGCATAAACAATTCTTCCGGTGGATAATATATTTATATAATAAAAAGAACCAAA
ATGCAATAGTATGTTGTATGGTACAATCAACCATTGTTTTCGAGTTTTTCTTCTCTCTTT
CTTTTAAATAAAATACTATATTGTTTTT
TCTCC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4AU42JQ 643 0 0
G
ATCAGCGCGATGATATTAAACATCTCTTTCACTTACCGAAGCATCTTCTCCAAGAAAGCC
ATGACTGATATGGACAGTACTAATGTGTACGCTTACATCTCCATCATTGCTCTCATCGTC
TGCATTCCCCCTGCCATCATCGTTGAAGGGCCTCAGCTGTTGAAACACGGTTTCAGCGAC
GCGATTGCTAAAGTTGGAATGACTAAATTCGTCTCTGATCTCTTTTGGGTTGGAATGTTT
TACCATCTCTACAATCAGTTGGCTACTAATACCTTGGAGAGGGTTGCACCATTGACTCAT
GCTGTTGGAAACGTTTTGAAACGTGTGTTTGTGATCGGGTTCTCCATCGTTATCTTCGGA
AACAAGATATCGACGCAGACAGGTATCGTAACTGGAATAGCCATT*GCTGGTGTTGCACT
CTACTCTATCATTAAGGCCAAGATCGAAGAAGATAAAAAGAAAGGAAAGACGGCGTAGAG
AGCGGCGGTCAAAGGTTGCATAAACAATTCTTCCGGTGGATAATATATTTATATAATAAA
AAGAACCAAAATGCAATAGTATGTTGTATGGTACAATCAACCATTGTTTTCGAGTTTTTC
TTCTCTCTTTCTTTTAAATAAAATACTATATTGTTTTT
CTCC

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR4DB46JQ 741 0 0
TGTACTCGGAGTTTCAATGGCTTCTCTAACTGAGTTATCATTCAACTGGCTTGGTTTCAT
CAGCGCGATGATATCAAACATCTCTTTCACTTACCGAAGCATCTTCTCCAAGAAAGCCAT
GACTGATATGGACAGTACTAATGTGTACGCTTACATCTCCATCATTGCTCTCATCGTCTG
CATTCCTCCTGCCATCATCGTTGAAGGGCCTCAGCTGTTGAAACACGGTTTCAGCGACGC
GATTGCTAAAGTTGGAATGACTAAATTCGTCTCTGATCTCTTTTGGGTTGGAATGTTTTA
CCATCTCTACAATCAGTTGGCTACTAATACCTTGGAGAGGGTTGCACCATTGACTCATGC
TGTTGGAAACGTTTTGAAACGTGTGTTTGTGATCGGGTTCTCCATCGTTATCTTCGGAAA
CAAGATATCGACGCAGACAGGTATCGGAACTGGAATAGCCATT*GCTGGTGTTGCACTCT
ACTCTATCATTAAGGCCAAGATCGAAGAAGATAAAAAGAAAGGAAAGACGGCGTAGAGAG
CGGCGGTCAAAGGTTGCATAAACAATTCTTCCGGTGGATAATATATTTATATAATAAAAA
GAACCAAAATGCAATAGTATGTTATATGGTACAATCAACCATTGTTTTCGAGTTTTTCTT
CTCTCTTTCTTTTAAATAAAATACTATATTGTTTTTCTCCCTCTTTTGTTTCCAATGGAG
AACATTGTTACCATTTCTTCT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 4

CO CL2851Contig1 1118 4 14 U
GGACCCACACAAACATCCCTCTCTCTCTCTCAGATATCGTAAACACACACAAACAATTAA
CATTTGTCTCCCGTTGTGAATTGATGCAGCAGAGAGGCCGATCCGTAAACCGTAGATCAA
GAAGCTTCTCTAGATCCAGACTCGCCGTCGAAGGCCACTGAACACCACCATCTCTCTCTC
GCAAACACATCTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTATTCCCGACGAGACACCTTTTCCCCCA
CAATGGCAGCAGCATCGTACGAGGCAGAGCGTGATGTCCAGAAAGTGTTAGATGTTGGTT
GTGGCATTGGTGGAGGTGACTTCTACATGGCTGAGAACTTCGATGTTCATATCGTTGGTA
TCGATCTCTCAGTCAACATGATTTCGTTCGCACTGGAACGTGCTATTGGACTCAACTGCT
CGGTTGAGTTTGAGGTCGCGGATTGCACCACAAAACATTACCCGGAGAATTCGTTCGATG
TCATTTACAGCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGACAAACCAGCTTTGTTCAGGACTT
TCTTCAAGTGGCTTAAACCGGGAGGGAAAGTTCTCATCAGCGACTACTGTAAGAGCTCGG
AAACTCCATCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATCTCCATGATG
TTCAAGCTTATGGGCAGATGCTAAAAGACTCAGGCTTTAACGATGTGATCGCAGAAGACC
GTACTGATCAGTTTATGAAAGTCCTGAGACGTGAACTAGAGAGGGTGGAGAAAGAAAAAG
AAGAGTTCATCTCCGACTTCTCCAAAGAGGACTACGAGGACATAGTTGGAGGATGGAAGG
CAAAGCTGGAGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGAAGTGGGGACTTTTCATCGCCAACAAGA
ACTAATAATAACCTCTTTTTCTTTTTAAATGCGTGTTTTGCTTCTTCAATAATAAAAAAC
ATCATTTCCGTTTGGCAATGATGTTATGTGGACTTTGTGTGTTCTTTGTTTCTGTTTTCG
GTTAGATACATAAACCGAATTTCGTTTGGTTCAATCTTTGTTTCCTATCTCAATTTGTTT
TAAGAATAATTATAATTATAATATTTGGGATTTTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO77TF U 1
AF RR4AF86TF U 262
AF RR4DO77JQ C 359
AF RR4B754TF U 532
BS 1 350 RR4DO77TF
BS 351 351 RR4AF86TF
BS 352 693 RR4DO77TF
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BS 894 894 RR4B754TF
BS 895 1003 RR4AF86TF
BS 1004 1004 RR4DO77JQ
BS 1005 1118 RR4B754TF

RD RR4DO77TF 757 0 0
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GAAGCTTCTCTAGATCCAGACTCGCCGTCGAAGGCCACTGAACACCACCATCTCTCTCTC
GCAAACACATCTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTATTCCCGACGAGACACCTTTTCCCCCA
CAATGGCAGCAGCATCGTACGAGGCAGAGCGTGATGTCCAGAAAGTGTTAGATGTTGGTT
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TCGATCTCTCAGTCAACATGATTTCGTTCGCACTGGAACGTGCTATTGGACTCAACTGCT
CGGTTGAGTTTGAGGTCGCGGATTGCACCACAAAACATTACCCGGAGAATTCGTTCGATG
TCATTTACAGCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGACAAACCAGCTTTGTTCAGGACTT
TCTTCAAGTGGCTTAAACCGGGAGGGAAAGTTCTCATCAGCGACTACTGTAAGAGCTCGG
AAACTCCATCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATCTCCATGATG
TTCAAGCTTATGGGCAGATGCTAAAAGACTCAG*CTTTAACGATGTGATCGCAGA*GACC
GTACTGATCAGTTTATGAA
GTCTGAGACGTGACTAGA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AF86TF 755 0 0
GGGATCTGAAACCAGGA
CAGAAAGTGTTAGATGTTGGTTGTGGCATTGGTGGAGGTGACTTCTACATGGCTGAGAAC
TTCGATGTTCATATCGTTGGTATCGATCTCTCAGTCAACATGATTTCGTTCGCACTGGAA
CGTGTTATTGGACTCAACTGCTCGGTTGAGTTTGAGGTCGCGGATTGCACCACAAAACAT
TACCCGGAGAATTCGTTCGATGTCATTTACAGCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGAC
AAACCAGCTTTGTTCAGGACTTTCTTCAAGTGGCTTAAACCGGGAGGGAAAGTTCTCATC
AGCGACTACTGTAAGAGCTCGGAAACTCCATCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAG
AGAGGATATGATCTCCATGATGTTCAAGCTTATGGGCAGATGCTAAAAGACGCAGGCTTT
AACGATGTGATCGCAGAAGACCGTACTGATCAGTTTATGAAAGTCCTGAGACGTGAACTA
GAGAGGGTGGAGAAAGAAAAAGAAGAGTTCATCTCCGACTTCTCCAAAGAGGACTACGAG
GACATAGTTGGAGGATGGAAGGCAAAGTTGGAGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGAAGTGG
GGACTTTTCATCGCCGACAAGAACTAATAATAACCTCTTTTTCTTTTTAAATGCGTGTTT
TGCTTCTTCAATAATAAAAAACATCATTTCCGTTTGGCAATGATGTTATGTGGACTTTGT
GTGTT
GTTTGTTTCTGTT

QA 18 742 18 742
DS 

RD RR4DO77JQ 708 0 0
TATCGATCTCTCAGTCAACATGATTTCGTTCGCACTGGAACGTGCTATTGGACTCAACTG
CTCGGTTGAGTTTGAGGTCGCGGATTGCACCACAAAACATTACCCGGAGAATTCGTTCGA
TGTCATTTACAGCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGACAAACCAGCTTTGTTCAGGAC
TTTCTTCAAGTGGCTTAAACCGGGAGGGAAAGTTCTCATCAGCGACTACTGTAAGAGCTC
GGAAACTCCATCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATCTCCATGA
TGTTCAAGCTTATGGGCAGATGCTAAAAGACTCAGGCTTTAACGATGTGATCGCAGAAGA
CCGTACTGATCAGTTTATGAAAGTCCTGAGACGTGAACTAGAGAGGGTGGAGAAAGAAAA
AGAAGAGTTCATCTCCGACTTCTCCGAAGAGGACTACGAGGACATAGTTGGAGGATGGAA
GGCAAAGCTGGAGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGAAGTGGGGACTTTTCATCGCCAACAA
GAACTAATAATAACCTCTTTTTCTTTTTAAATGCGTGTTTTGCTTCTTCAATAATAAAAA
ACATCATTTCCGTTTGGCAATGATGTTATGTGGACTTTGTGTGTTCT**GTTTCTGTTTT
CGGTTAGATACATAAACCGAATTTCGTTTGGTTCAATCTTTGTTTCC
G

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4B754TF 587 0 0
TCAGGACTTTCTTCAAGTGGCTTAAACCGGGAGGGAAAGTTCTCATCAGCGACTACTGTA
AGAGCTCGGAAACTCCATCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATC
TCCATGATGTTCAAGCTTATGGGCAGATGCTAAAAGACGCAGGCTTTAACGATGTGATCG
CAGAAGACCGTACTGATCAGTTTATGAAAGTCCTGAGACGTGAACTAGAGAGGGTGGAGA
AAGAAAAAGAAGAGTTCATCTCCGACTTCTCCAAAGAGGACTACGAGGACATAGTTGGAG
GATGGAAGGCAAAGCTGGAGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGAAGTGGGGACTTTTCATCG
CCAACAAGAACTAATAATAACCTCTTTTTCTTTTTAAATGCGTGTTTTGCTTCTTCAATA
ATAAAAAACATCATTTCCGTTTGGCAATGATGTTATGTGGACTTTGTGTGTTGTTTGTTT
CTGTTTTCGGTTAGATACATAAACCGAATTTCGTTTGGTTCAATCTTTGTTTCCTATCTC
AATTTGTTTTAAGAATAATTATAATTATAATATTTGGGATTTTCAAT

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 4

CO CL2852Contig1 684 4 2 U
TTTTTTTTTCTGGCTTTGAAACTGTTCACAATCTCTCTCTTCAACTCTTCTTCAACTCGT
GAAAAGACCAGAGAGTTTTCTCCTGATCCCAAATCCGGAAGAAGCTTCCTCATGGCGCAG
ATCTACTCCCTCAACATACACAACTAAAGTACGTACACCTTCTCTCTCTCACTCTCTCTA
GAGAGGTTAAACTTGTGCAAGTTCTGATGATAGAATCTTTACATGATGTCACATGTTTTC
TTAATCTAGCAGTAAACGTCAGTCACCTGCAGAAGTTTTCACTCTTGTTGTACACTGATA
GATAAAATGTTCTCCACAGGGAATCTCAAGAGTTGATCATTTTGACTTTTTCAGGTAAAT
TAGATTTTACTTTTTCTTCCTCAGTAAAAAAAATCGTTTTTGTTTCCATGTAAAGATTCT
CAGCATGCAAAAAAAAACTTCCTTTCTTCTTATTTTTTTCCTAATAAAGTTTAAACCTTT
CCCTTTTCTTTCTCAGACTATTTTTCTTAAAGTGGTGATTTTTTTTGTTTCTTCTCATAA
GCACGCGAGAAGAAAAACCTTTTCTACTGTTTATCCTTTTTTAAAGTTTGATTTTTATTT
TTTGTTATTTACTGGTTGTCTCGCAGGAAACAGTAGGTGAAGGTAGTATTATAAAAGATA
GGTTTTTAAGAAATTGTAGTTTAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G259TF U 1
AF RR4GU02TF U 1
AF RR4GU02JQ C 1
AF RR4G259JQ C 63
BS 1 624 RR4G259TF
BS 625 684 RR4GU02JQ

RD RR4G259TF 631 0 0
TTTTTTTTTCTGGCTTTGAAACTGTTCACAATCTCTCTCTTCAACTCTTCTTCAACTCGT
GAAAAGACCAGAGAGTTTTCTCCTGATCCCAAATCCGGAAGAAGCTTCCTCATGGCGCAG
ATCTACTCCCTCAACATACACAACTAAAGTACGTACACCTTCTCTCTCTCACTCTCTCTA
GAGAGGTTAAACTTGTGCAAGTTCTGATGATAGAATCTTTACATGATGTCACATGTTTTC
TTAATCTAGCAGTAAACGTCAGTCACCTGCAGAAGTTTTCACTCTTGTTGTACACTGATA
GATAAAATGTTCTCCACAGGGAATCTCAAGAGTTGATCATTTTGACTTTTTCAGGTAAAT
TAGATTTTACTTTTTCTTCCTCAGTAAAAAAAATCGTTTTTGTTTCCATGTAAAGATTCT
CAGCATGCAAAAAAAAACTTCCTTTCTTCTTATTTTTTTCCTAATAAAGTTTAAACCTTT
CCCTTTTCTTTCTCAGACTATTTTTCTTAAAGTGGTGATTTTTTTTGTTTCTTCTCATAA
GCACGCGAGAAGAAAAACCTTTTCTACTGTTTATCCTTTTTTAAAGTTTGATTTTTATTT
TTTGTTATTTACTGGTTGTCTCGC
AGAAACA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4GU02TF 624 0 0
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GAAAAGACCAGAGAGTTTTCTCCTGATCCCAAATCCGGAAGAAGCTTCCTCATGGCGCAG
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GATAAAATGTTCTCCACAGGGAATCTCAAGAGTTGATCATTTTGACTTTTTCAGGTAAAT
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CAGCATGCAAAAAAAAACTTCCTTTCTTCTTATTTTTTTCCTAATAAAGTTTAAACCTTT
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GCACGCGAGAAGAAAAACCTTTTCTACTGTTTATCCTTTTTTAAAGTTTGATTTTTATTT
TTTGTTATTTACTGGTTGTCTCGC

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DS 

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GAAAAGACCAGAGAGTTTTCTCCTGATCCCAAATCCGGAAGAAGCTTCCTCATGGCGCAG
ATCTACTCCCTCAACATACACAACTAAAGTACGTACACCTTCTCTCTCTCACTCTCTCTA
GAGAGGTTAAACTTGTGCAAGTTCTGATGATAGAATCTTTACATGATGTCACATGTTTTC
TTAATCTAGCAGTAAACGTCAGTCACCTGCAGAAGTTTTCACTCTTGTTGTACACTGATA
GATAAAATGTTCTCCACAGGGAATCTCAAGAGTTGATCATTTTGACTTTTTCAGGTAAAT
TAGATTTTACTTTTTCTTCCTCAGTAAAAAAAATCGTTTTTGTTTCCATGTAAAGATTCT
CAGCATGCAAAAAAAAACTTCCTTTCTTCTTATTTTTTTCCTAATAAAGTTTAAACCTTT
CCCTTTTCTTTCTCAGACTATTTTTCTTAAAGTGGTGATTTTTTTTGTTTCTTCTCATAA
GCCCGCGAGAAGAAAAACCTTTTCTACTGTTTATCCTTTTTTAAAGTTTGATTTTTATTT
TTTGTTATTTACTGGTTGTCTCGCAGGAAACAGTAGGTGAAGGTAGTATTATAAAAGATA
GGTTTTTAAGAAATTGTAGTTTAG

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CTACTCCCTCAACATACACAACTAAAGTACGTACACCTTCTCTCTCTCACTCTCTCTAGA
GAGGTTAAACTTGTGCAAGTTCTGATGATAGAATCTTTACATGATGTCACATGTTTTCTT
AATCTAGCAGTAAACGTCAGTCACCTGCAGAAGTTTTCACTCTTGTTGTACACTGATAGA
TAAAATGTTCTCCACAGGGAATCTCAAGAGTTGATCATTTTGACTTTTTCAGGTAAATTA
GATTTTACTTTTTCTTCCTCAGTAAAAAAAATCGTTTTTGTTTCCATGTAAAGATTCTCA
GCATGCAAAAAAAAACTTCCTTTCTTCTTATTTTTTTCCTAATAAAGTTTAAACCTTTCC
CTTTTCTTTCTCAGACTATTTTTCTTAAAGTGGTGATTTTTTTTGTTTCTTCTCATAAGC
ACGCGAGAAGAAAAACCTTTTCTACTGTTTATCCTTTTTTAAAGTTTGATTTTTATTTTT
TGTTATTTACTGGTTGTCTCGCAGGAAACAGTAGGTGAAGGTAGTATTATAAAAGATAGG
TTTTTAAGAAATTGTAGTTTAG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2853Contig1 1165 4 4 U
GGGACACCTCAAGATCCAATCTCTCTTTCTCTCTCCCTTCTCCCCTCCGACAAAATCTCC
GATCACCGACAAAAATGGGCGCTGAGGCAAACGCATCCTTCAACTTCCTAATCTACGGCC
GAACCGGATGGATCGGCGGACTACTCGGCAAGCTCTGCGAGGCCCAGGGAATCTCCTACA
CTTACGGATCCGGTCGGCTCCAAGACCGTCAATCCATCGTCTCCGACATCGAGACCGTGA
AGCCTAGCCACGTGTTCAACGCCGCCGGAGTCACCGGACGTCCCAACGTCGACTGGTGCG
AGTCCCACAAGGTCGAGACCATCCGCACGAACGTCGCCGGGACCTTGACTCTCGCCGACA
TTTGCAGAGAGAAAGGACTCGTTCTGATCAACTACGCCACCGGTTGTATATTCGAGTACG
ATGCGGGTCATATTCTCGGGTCGGGTGTCGGATTCAAGGAGGAGGATACCCCTAACTTCA
CCGGGTCTTTCTACTCCAAGACCAAAGCTATGGTGGAGGAGCTGCTCAAGAACTATGAAA
ACGTATGCACGCTAAGAGTGCGGATGCCCATCTCTTCTGATCTATCAAACCCAAGAAACT
TCATCACCAAGATTGCTCGGTACGAGAAAGTCGTTGACATCCCAAACTCCATGACCATCC
TCGACGAGCTCCTTCCCATATCGATCGAGATGGCAAAGAGGAACTTAACCGGGATCTACA
ACTTCACAAACCCGGGTGTCGTGAGCCACAACGAGATCTTGGAGATGTACAGAGAGTACA
TTGACCCGAGCTTCACCTGGAAGAACTTCACGTTGGAGGAACAAGCTAAAGTGATTGTGG
CTCCAAGGAGTAACAACGAGCTCGATGCCACTAAGTTGAAGACTGAGTTCCCTGAGATGT
TGTCTATCAAAGAATCTCTGATCAAGTTTGTGTTTGAGCCAAACAAGAAGACTGGAGTTA
AAGCTTAAGATGCTGCCAAAGTGTGTTCTTTGTTAAGGTAACGGTCCTAAACACTAAAAA
CAAATATCAAACCAAAACAAAGTTGTTGGGGGTTTTTATAAATTTTAGTGTTTATGATGG
CCTAAAGAAATTGTTGTGTTTTTTTGTATTTTCTTGTTTCCTTCATCCAATGTTGTTGTA
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BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4E277TF U 2
AF RR4GP06TF U 1
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AF RR4E277JQ C 453
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RD RR4E277TF 654 0 0
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ATCACCGACAAAAATGGGCGCTGAGGCAAACGCATCCTTCAACTTCCTAATCTACGGCCG
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CGTATGCACGCTAAGAGTGCGGATGCCCATCTCTTCTGATCTATCAAACCCAAGAAACTT
CATCACCAAGATTGCTCGGTACGAGAAAGTCGTTGACATCCCAAACTCCATGAC

QA 1 654 1 654
DS 

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GATCACCGACAAAAATGGGCGCTGAGGCAAACGCATCCTTCAACTTCCTAATCTACGGCC
GAACCGGATGGATCGGCGGACTACTCGGCAAGCTCTGCGAGGCCCAGGGAATCTCCTACA
CTTACGGATCCGGTCGGCTCCAAGACCGTCAATCCATCGTCTCCGACATCGAGACCGTGA
AGCCTAGCCACGTGTTCAACGCCGCCGGAGTCACCGGACGTCCCAACGTCGACTGGTGCG
AGTCCCACAAGGTCGAGACCATCCGCACGAACGTCGCCGGGACCTTGACTCTCGCCGACA
TTTGCAGAGAGAAAGGACTCGTTCTGATCAACTACGCCACCGGTTGTATATTCGAGTACG
ATGCGGGTCATATTCTCGGGTCGGGTGTCGGATTCAAGGAGGAGGATACCCCTAACTTCA
CCGGGTCTTTCTACTCCAAGACCAAAGCTATGGTGGAGGAGCTGCTCAAGAACTATGAAA
ACGTATGCACGCTAAGAGTGCGGATGCCCATCTCTTCTGATCTATCAAACCCAAGAAACT
TCATCACCAAGATTGCTCGGTACGAGAAAGTCGTTGACATCCCAAACTCCATGACCATCC
TCGACGAGCTCCTTCCCATATCGATCGAGATGGCAAAGAGGA
CTTAAC

QA 1 702 1 702
DS 

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GATGCGGGTCATATTCTCGGGTCGGGTGTCGGATTCAAGGAGGAGGATACCCCTAACTTC
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AACGTATGCACGCTAAGAGTGCGGATGCCCATCTCTTCTGATCTATCAAACCCAAGAAAC
TTCATCACCAAGATTGCTCGGTACGAGAAAGTCGTTGACATCCCAAACTCCATGACCATC
CTCGACGAGCTCCTTCCCATATCGATCGAGATGGCAAAGAGGAACTTAACCGGGATCTAC
AACTTCA*AAACCCGGGTGTCGTGAGCCACAACGAGATCTTGGAGATGTACAGAGAGTAC
ATTGACCCGAGCTTCACCTGGAAGAACTTCACGTTGGAGGAACAAGCTAAAGTGATTGTG
GCTCCAAGGAGTAACAACGAGCTCGATGCCACTAAGTTGAAGACTGAGTTCCCTGAGATG
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ATTGTTTAAATAAACCTTTTTGTTAC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4E277JQ 708 0 0
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GTGGAGGAGCTGCTCAAGAACTATGAAAACGTATGCACGCTAAGAGTGCGGATGCCCATC
TCTTCTGATCTATCAAACCCAAGAAACTTCATCACCAAGATTGCTCGGTACGAGAAAGTC
GTTGACATCCCAAACTCCATGACCATCCTCGACGAGCTCCTTCCCATATCGATCGAGATG
GCAAAGAGGAACTTAACCGGGATCTACAACTTCACAAACCCGGGTGTCGTGAGCCACAAC
GAGATCTTGGAGATGTACAGAGATTACATTGACCCGAGCTTCACCTGGAAGAACTTCACG
TTGGAGGAACAAGCTAAAGTGATTGTGGCTCCAAGGAGTAACAACGAGCTCGATGCCACT
AAGTTGAAGACTGAGTTCCCTGAGATGTTGTCTATCAAAGAATCTCTGATCAAGTTTGTG
TTTGAGCCAAACAAGAAGACTGGAGTTAAAGCTTAAGATGCTGCCAAAGTGTGTTCTTTG
TTAAGGTAACGGTCCTAAACACTAAAAACAAATATCAAACCAAAACAAAGTTGTTGGGGG
TTTTTATAAATTTTAGTGTTTATGATGGCCTAAAGAAATTGTTGTGTTTTTTTGTATTTT
CTTGTTTCCTTCATCCAATGTTGTTGTATTGTTTAAATAAACCTTTTT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

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ACATGCCATGGAAATTGAGTTATGATTTGATGAATTACAATTTAATGTACAACACAGTTA
TTACAATTTCTTTCCATGTAACACAAACAAAAGCAATATAATAATTTTTTAATTCAAAAG
AATTAAAATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGTCACGCCAGTCCAAGAACAAG
AGAGCAGCTGCATAGTGAGACAAGGCACCCAACAAAACAAACACATGGAAGATCTGATGG
CTATGCCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAG
AACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTC
CTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAAAGC
CCCATGGAGGCGAAAAGCAGAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAAAGTGAGGGA
GTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACA
TACCAACGTGGAGCGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGATGTGATGATC
ATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGTTAAGATCTTTGGAGTGG
CAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCTGCTAAGAAT
ACAAAGAATGGCCATCTTGTTACATCCCCTGTACTCTTTGCATCCACGGGGAAGAACTTA
TCGTGATGAATAACGTTGGCGACAGTAAGTGCCACAAATAAGATGAAACCTAGTAAATGT
GTCCAAACGTTGAGGGACTCATTGTGGAAACTGAAGACGCTGAAGAAAGCATCTCTAAAG
GACCAATCAGCTATGTAATAATTCAATATAAATTCGTTATCCTTCATGTAATCTGGAAGC
TCGCTAAACGACATTAACTGACGTCGTCTTGTTGTCTTCTGCGGTTTCTTCTTCACGGTT
TCGTCTCCATCTTGACCATCTCCAGGGACGATCTTGCTCTTGCATTTGCTGTTACCGCAC
GTCACCGTCTCTGCTTCGTCTTTCTGATCATCTTGGTCCATATGAGACCTAATGTTGATT
ATTTAAGACAATAACACTTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGAAGTAGAAGAGGGGTGT
G


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

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TTACAATTTCTTTCCATGTAACACAAACAAAAGCAATATAATAATTTTTTAATTCAAAAG
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CTATGCCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAG
AACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTC
CTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAAAGC
CCCATGGAGGCGAAAAGCAGAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAAAGTGAGGGA
GTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACA
TACCAACGTGGAGCGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGATGTGATGATC
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ACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCTGCTAAGAATACAAAGAATGGCCA
TCTTGTTACATCCCCTGTACTCTTTGCATCCACGGGGAAGAACTTATCGTGATGAATAAC
GTTGGCGACAGTAAGTGCCACAAATAAGATGAAACCTAGTAAATGTGTCCAAACGTTGAG
GGACTCATTGTGGAAACTGAAGACGCTGAAGAAAGCATCTCTAAAGGACCAATCAGCTCT
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TAACTGACGTCGTCTTGTTGTCTTCTGCGGTTTCTTCTTCACGGTTTCGTCTCCATCTTG
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CACTTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGAAGTAGAAGAGGGGT
CC

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CACGGGGAAGAACTTATCGTGATGAATAACGTTGGCGACAGTAAGTGCCACAAATAAGAT
GAAACCTAGTAAATGTGTCCAAACGTTGAGGGACTCATTGTGGAAACTGAAGACGCTGAA
GAAAGCATCTCTAATGGACCAATCAGCTATGTAATAATTCAATATAAATTCGTTATCCTT
CATGTAATCTGGAAGCTCGCTAAACGACATTAACTGACGTCGTCTTGTTGTCTTCTGCGG
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TTTGCTGTTACCGCACGTCACCGTCTCTGCTTCGTCTTTCTGATCATCTTGGTCCATATG
AGACCTAATGTTGATTATTTAAGACAATAACACTTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGA
AGTAGAAGAGGGGTGTG

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DS 



AS 1 2

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TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATTACACTTCTGCGTCTCTATCTCTCTATCTGAAGC
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CATCTCTATTTGGTGCTTTGTTTTTGAATCAATCTCTTTTCCCTAAACTCTTTTTTTTCT
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TGTCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD01TF U 1
AF RR4CD01JQ C 346
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BS 748 767 RR4CD01TF
BS 768 1026 RR4CD01JQ

RD RR4CD01TF 767 0 0
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CTTCACTGATGTTGCCAAACATACCTCCATAGATGTGTTTCCTCTTCTTGGTAAGGAGTC
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CGTCAAGTCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGATGCTCGTCGATGCCCAACTCAACTGTCA
GAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACAGATTCCTACCAGTCTTGCGT
TGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACGGTGCTGAGTCGGATGTACATATTCAAAAG*T
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ACCAACGAACAG*TGGAGAAGATACA*GCGTGCTGCTTCATTTGATT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4CD01JQ 681 0 0
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CCAACTCAACTGTCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACAGATTC
CTACCAGTCTTGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACGGTGCTGAGTCGGATGT
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CTACCTGACATTGAGAGTGAGGCTAATAAACGGAGACAACAGCTTCAATCATATGTAGTT
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AACTCTTTTTTTTCTGTTACAATAATGTTGATAAAGCCAACACTTCCTCTGTGAATAACA
CTTGCGAATGCTTATTGTCTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 2 4

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB64JQ U 1
AF RR4DY63JQ U 1
BS 1 271 RR4DY63JQ
BS 272 272 RR4EB64JQ
BS 273 717 RR4DY63JQ

RD RR4EB64JQ 537 0 0
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4DY63JQ 717 0 0
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QA 1 717 1 717
DS 



CO CL2856Contig2 754 2 2 U
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GTGAGAAGCTAGACTAGCTGCAGATTGTTATATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DY63TF U 1
AF RR4EB64TF U 1
BS 1 625 RR4DY63TF
BS 626 754 RR4EB64TF

RD RR4DY63TF 625 0 0
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TCTAGCCTTGATCCGTCTAGCTCTT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4EB64TF 754 0 0
GATAGAGCTGTGAAGCTAATGTCTGAACAAAACGGTGACGCTGCTCTGGAGGAAATCAAC
CGGATCTTGGGGTTTAAGCTCGCGTTGGAGTGCTTGGAGATCAGGTTCTGTCTTTACCTC
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TCTAGCCTTGATCCGTCTAGCTCTTCAACTGTTGTTTCTCTTCTTGAAGACGCTCTCAAA
TGCCCTCTGATAGTTGCGGAAAGGCAGGCTCTAACAATCTTGGGAGTGTCTATGTGGACT
GTGAGAAGCTAGACTAGCTGCAGATTGTTATATA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

CO CL2857Contig1 592 4 14 U
GCTGTGGATCAAGCAACTCTGCTCGTTGTCCTTTTCAAGCTCTGGGCCAACACTTGATAG
GAATGAAACTGTCGACTAATAATGACGGCGGACGAGACTGCATT*GTTGCCTCTCATCCA
TCAAGTGGATT*GTCATT*CACCTTGACTT*GGGTAAATAACTCAACTGGTGAAGAAGAA
GATGAGCTGCTCTACAAGGTTGAGTCATT*GGGGACGTTTCAGAGAGTTGTGCCTGAATG
GATGAGAGATGTTATCAAGTTTAGCACAAGTATGATTCCTGTCTTCTTCGAAAGAGTCTC
TCGGGTCATTAAGCCTCGGGATTGATCGGTATCTACATCTGCCTCCCTTAACTTCGGCCA
TCATCTTTGAATGGCTTCTTACTTCTTAGTTTGGTGTTTCTCAGTAGGTCAAAAAGGTTG
GGAAGTTACATGTGTCTATAGAAATGTTTGTGTCCCTCTTTAGCTTTGCCGTTGGTTATG
AAGACTTAATTGTATTCTTTTCGATGTGTCAAGATGTTTAATTGTCCTTTTCTCTCTTGT
AAGTTCCCTTACTATTTGATCTTAATGTGTATTTTGTGTGATTCAACACTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4BD50TF U 37
AF RR4DQ23JQ C 1
AF RR4DQ23TF U 1
AF RR4BD50JQ C 23
BS 1 36 RR4DQ23TF
BS 37 104 RR4BD50TF
BS 105 105 RR4DQ23TF
BS 106 131 RR4BD50TF
BS 132 132 RR4DQ23TF
BS 133 138 RR4BD50TF
BS 139 139 RR4DQ23TF
BS 140 150 RR4BD50TF
BS 151 151 RR4DQ23TF
BS 152 209 RR4BD50TF
BS 210 210 RR4DQ23TF
BS 211 403 RR4BD50TF
BS 404 591 RR4DQ23TF
BS 592 592 RR4BD50JQ

RD RR4BD50TF 367 0 0
AAGCTCTGGGCCAACACTTGATAGGAATGAAACTGTCGACTAATAATGACGGCGGACGAG
ACTGCATTTGTTGCCTCTCATCCATCAAGTGGATTTGTCATTTCACCTTGACTTTGGGTA
AATAACTCAACTGGTGAAGAAGAAGATGAGCTGCTCTACAAGGTTGAGTCATTTGGGGAC
GTTTCAGAGAGTTGTGCCTGAATGGATGAGAGATGTTATCAAGTTTAGCACAAGTATGAT
TCCTGTCTTCTTCGAAAGAGTCTCTCGGGTCATTAAGCCTCGGGATTGATCGGTATCTAC
ATCTGCCTCCCTTAACTTCGGCCATCATCTTTGAATGGCTTCTTACTTCTTAGTTTGGTG
TTTCTCA

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4DQ23JQ 592 0 0
GCTGTGGATCAAGCAACTCTGCTCGTTGTCCTTTTCAAGCTCTGGGCCAACACTTGATAG
GAATGAAACTGTCGACTAATAATGACGGCGGACGAGACTGCATT*GTTGCCTCTCATCCA
TCAAGTGGATT*GTCATT*CACCTTGACTT*GGGTAAATAACTCAACTGGTGAAGAAGAA
GATGAGCTGCTCTACAAGGTTGAGTCATT*GGGGACGTTTCAGAGAGTTGTGCCTGAATG
GATGAGAGATGTTATCAAGTTTAGCACAAGTATGATTCCTGTCTTCTTCGAAAGAGTCTC
TCGGGTCATTAAGCCTCGGGATTGATCGGTATCTACATCTGCCTCCCTTAACTTCGGCCA
TCATCTTTGAATGGCTTCTTACTTCTTAGTTTGGTGTTTCTCAGTAGGTCAAAAAGGTTG
GGAAGTTACATGTGTCTATAGAAATGTTTGTGTCCCTCTTTAGCTTTGCCGTTGGTTATG
AAGACTTAATTGTATTCTTTTCGATGTGTCAAGATGTTTAATTGTCCTTTTCTCTCTTGT
AAGTTCCCTTACTATTTGATCTTAATGTGTATTTTGTGTGATTCAACACTT
G

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4DQ23TF 592 0 0
GCTGTGGATCAAGCAACTCTGCTCGTTGTCCTTTTCAAGCTCTGGGCCAACACTTGATAG
GAATGAAACTGTCGACTAATAATGACGGCGGACGAGACTGCATT*GTTGCCTCTCATCCA
TCAAGTGGATT*GTCATT*CACCTTGACTT*GGGTAAATAACTCAACTGGTGAAGAAGAA
GATGAGCTGCTCTACAAGGTTGAGTCATT*GGGGACGTTTCAGAGAGTTGTGCCTGAATG
GATGAGAGATGTTATCAAGTTTAGCACAAGTATGATTCCTGTCTTCTTCGAAAGAGTCTC
TCGGGTCATTAAGCCTCGGGATTGATCGGTATCTACATCTGCCTCCCTTAACTTCGGCCA
TCATCTTTGAATGGCTTCTTACTTCTTAGTTTGGTGTTTCTCAGTAGGTCAAAAAGGTTG
GGAAGTTACATGTGTCTATAGAAATGTTTGTGTCCCTCTTTAGCTTTGCCGTTGGTTATG
AAGACTTAATTGTATTCTTTTCGATGTGTCAAGATGTTTAATTGTCCTTTTCTCTCTTGT
AAGTTCCCTTACTATTTGATCTTAATGTGTATTTTGTGTGATTCAACACTT
G

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4BD50JQ 570 0 0
TCGTTGTCCATTTCAAGCTTTGGGCCAACACTTGATAGGAATGAAACTGTCGACTAATAA
TGACGGCGGACGAGACTGCATT*GTTGCCTTTCATCCATCAAGTGGATT*GTCATT*CAC
CTTGACTT*GGGTAAATAACTCAACTGGTGAAGAAGAAGATGAGCTGCTTTACAAGGTTG
AGTCATT*GGGGACGTTTCAGAGAGTTGTGCCTGAATGGATGAGAGATGTTATCAAGTTT
AGCACAAGTATGATTCCTGTTTTTTTCGAAAGAGTCTCTCGGGTCATTAAGCCTCGGGAT
TGATCGGTATTTACATCTGCCTCCCTTAACTTCGGCCATCATCTTTGAATGGCTTCTTAC
TTTTTAGTTTGGTGTTTCTCAGTAGGTCAAAAAGGTTGGGAAGTTACATGTGTCTATAGA
AATGTTTGTGTCCCTCTTTAGCTTTGCCGTTGGTTATGAAGACTTAATTGTATTCTTTTC
GATGTGTCAAGATGTTTAATTGTCCTTTTTTTTCTTGTAAGTTCCCTTACTATTTGATCT
TAATGTGCATTTTGTGTGATTCAACACTTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 4

CO CL2858Contig1 1065 4 21 U
GGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCAGTTACTGCTGAGCCGGTTGAGGCTGTTTTTGAGT
CCCGGATATCCATATGAAGAAATTCTCAGAACCTTCCATAATCAGACCAGCATAGTCATG
TGCTCATACCTGCCTTATTTCAACAAATTTAACAGAACC*AGTGGAGGTTTGATAGAGTT
AAATCATGGAGACCCACAGCCTCTGCAGTATGCTGCAAATGCAGCCTTCTTAGCGACATT
GTACAGTGACTATCTTGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATTTCTA
TTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCGAGGACTCAGATTGATTATATACTCGGTAAAAA
CCCTCGGAAAATGAGTTATCTGGTGGGTTTTGGCACAAAATACCCGAAACGCGTGCATCA
TCGAGGAGCTTCGATTCCCAAGAACAAAGTCAAATATAACTGCAAAGGAGGATGGAAATG
GAGAGACAGCAAGAAACCAAACCCAAACACCATTGAAGGAGCCATGGTTGCTGGTCCTGA
CAAGCGCGATGGGTTCCGCGATGTCCGGACCAACTACAACTACACTGAACCGACTCTTGC
AGGAAATGCTGGTCTGGTCGCAGCTCTCGTGGCATTGTCTGGTGAAGAAGAGGCAACTGG
TACTATAGACAAAAATACTATCTTCTCAGCCGTTCCTCCGTTGTTCCCTACTCCACCTCC
CCCACCAGCACCATGGAAACCTTAA***GAAAGCTAAAACCTGTGTGATTATGTCCCTGC
TGCCAGAAAATGAAAGAGGTAGAGACCAGAAGATTAGATGTGGTGCCTTGTGTGATACGC
ACAAGTCAACCATAATCAGCTAAGCATTTCATGTGGCCTTTACTAGATACGAACCCAATC
TGGGTAGCTTACCACGAGCAATTTTTAAATTTTCTTTTTCGGGGTTGTTCTTTTGAGATA
TACATATATGTATGCATTTTACTCTGTATATGTTCGATTCCACTTGTATTCGTTGATTTT
AAACTATGTTTTTAGTGGGAGTGTGATAAAAAAGGAATTATGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU90TF U 1
AF RR4AB14TF U 57
AF RR4AB14JQ C 139
AF RR4AQ62JQ C 378
BS 1 62 RR4AU90TF
BS 63 63 RR4AB14TF
BS 64 339 RR4AU90TF
BS 340 340 RR4AB14TF
BS 341 345 RR4AU90TF
BS 346 346 RR4AB14TF
BS 347 361 RR4AU90TF
BS 362 362 RR4AB14TF
BS 363 510 RR4AU90TF
BS 511 511 RR4AB14TF
BS 512 543 RR4AU90TF
BS 544 544 RR4AB14TF
BS 545 546 RR4AU90TF
BS 547 547 RR4AB14TF
BS 548 591 RR4AU90TF
BS 592 592 RR4AB14TF
BS 593 745 RR4AU90TF
BS 746 748 RR4AB14JQ
BS 749 773 RR4AU90TF
BS 774 1020 RR4AB14JQ
BS 1021 1065 RR4AQ62JQ

RD RR4AU90TF 773 0 0
GGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCAGTTACTGCTGAGCCGGTTGAGGCTGTTTTTGAGT
CCTGGATATCCATATGAAGAAATTCTCAGAACCTTCCATAATCAGACCAGCATAGTCATG
TGCTCATACCTGCCTTATTTCAACAAATTTAACAGAACC*AGTGGAGGTTTGATAGAGTT
AAATCATGGAGACCCACAGCCTCTGCAGTATGCTGCAAATGCAGCCTTCTTAGCGACATT
GTACAGTGACTATCTTGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATTTCTA
TTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCGAGGACTCAGATCGATTACATACTCGGTAAAAA
CTCTCGGAAAATGAGTTATCTGGTGGGTTTTGGCACAAAATACCCGAAACGCGTGCATCA
TCGAGGAGCTTCGATTCCCAAGAACAAAGTCAAATATAACTGCAAAGGAGGATGGAAATG
GAGAGACAGCAAGAAACCAAACCCAAACACGATTGAAGGAGCCATGGTTGCTGGTCCTGA
CAAACGTGATGGGTTCCGCGATGTCCGGACCAACTACAACTACACTGAACCAACTCTTGC
AGGAAATGCTGGTCTGGTCGCAGCTCTCGTGGCATTGTCTGGTGAAGAAGAGGCAACTGG
TACTATAGACAAAAATACTATCTTCTCAGCCGTTCCTCCGTTGTTCCCTACTCCACCTCC
CCCACCAGCACCATGGAAACCTTAATAAGAAAGCTAAAACCTGTGTGATTATG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4AB14TF 688 0 0
GAGTCCCGGATATCCATATGAAGAAATTCTCAGGACCTTCCATAATCAGACCAGCATAGT
CATGTGCTCATACCTGCCTTATTTCAACAAATTTAACAGAACC*AGTGGAGGTTTGATAG
AGTTAAATCATGGAGACCCACAGCCTCTGCAGTATGCTGCAAATGCAGCCTTCTTAGCGA
CATTGTACAGTGACTATCTTGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATT
TCTATTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCGAGGACTCAGATTGATTATATACTCGGTA
AAAACCCTCGGAAAATGAGTTATCTGGTGGGTTTTGGCACAAAATACCCGAAACGCGTGC
ATCATCGAGGAGCTTCGATTCCCAAGAACAAAGTCAAATATAACTGCAAAGGAGGATGGA
AATGGAGAGACAGCAAGAAACCAAACCCAAACACCATTGAAGGAGCCATGGTTGCTGGTC
CTGACAAGCGCGATGGGTTCCGCGATGTCCGGACCAACTACAACTACACTGAACCGACTC
TTGCAGGAAATGCTGGTCTGGTCGCAGCTCTCGTGGCATTGTCTGGTGAAGAAGAGGCAA
CTGGTACTATAGACAAAAATACTATCTTCTCAGCCGTTCCTCCGTTGTTCCCTACTCCAC
CTCCCCCACCAGCACCATGGAAACCTTA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4AB14JQ 882 0 0
TTCAACAAATTTAACAGAACCCAGTGGAGGTTTGATAGAGTTAAATCATGGAGACCCACA
GCCTCTGCAGTATGCTGCAAATGCAGCCTTCTTAGCGACATTGTACAGTGACTATCTTGA
TGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATTTCTATTCAACCAATGTCCTACG
AGAGTTTGCGAGGACTCAGATTGATTATATACTCGGTAAAAACCCTCGGAAAATGAGTTA
TCTGGTGGGTTTTGGCACAAAATACCCGAAACGCGTGCATCATCGAGGAGCTTCGATTCC
CAAGAACAAAGTCAAATATAACTGCAAAGGAGGATGGAAATGGAGAGACAGCAAGAAACC
AAACCCAAACACCATTGAAGGAGCCATGGTTGCTGGTCCTGACAAGCGCGATGGGTTCCG
CGATGTCCGGACCAACTACAACTACACTGAACCGACTCTTGCAGGAAATGCTGGTCTGGT
CGCAGCACTCGTGGCATTGTCTGGTGAAGAAGAGGCAACTGGTACTATAGACAAAAATAC
TATCTTTTCAGCCGTTCCTCCGTTGTTCCCTACTCCACCTCCCCCACCAGCACCATGGAA
ACCTTAA***GAAAGCTAAAACCTGTGTGATTATGTCCCTGCTGCCAGAAAATGAAAGAG
GTAGAGACCAGAAGATTAGATGTGGTGCCTTGTGTGATACGCACAAGTCAACCATAATCA
GCTAAGCATTTCATGTGGCCTTTACTAGATACGAACCCAATCTGGGTAGCTTACCACGAG
CAATTTTTAAATTTTCTTTTTCGGGGTTGTTCTTTTGAGATATACATATATGTATGCATT
TTACTCTGTATATGTTCGATTCCACTTGTATTCGTTGATTTT

QA 1 882 1 882
DS 

RD RR4AQ62JQ 688 0 0
ATCTGGTGGGTTTTGGCACAAAATACCCGAAACGCGTGCATCATCGAGGAGCTTCGATTC
CCAAGAACAAAGTCAAATATAACTGCAAAGGAGGATGGAAATGGAGAGACAGCAAGAAAC
CAAACCCAAACACCATTGAAGGAGCCATGGTTGCTGGTCCTGACAAGCGCGATGGGTTCC
GCGATGTCCGGACCAACTACAACTACACTGAACCGACTCTTGCAGGAAATGCTGGTCTGG
TCGCAGCTCTCGTGGCATTGTTTGGTGAAGAAGAGGCAACTGGTACTATAGACAAAAATA
CTATTTTTTCAGCCGTTCCTCCGTTGTTCCCTACTCCACCTCCCCCACCAGCACCATGGA
AACCTTAA***GAAAGCTAAAACCTGTGTGATTATGTCCCTGCTGCCAGAAAATGAAAGA
GGTAGAGACCAGAAGATTAGATGTGGTGCCTTGTGTGATACGCACAAGTCAACCATAATC
AGCTAAGCATTTCATGTGGCTTTTACTAGATACGAACCCAATCTGGGTAGCTTACCACGA
GCAATTTTTAAATTTTCTTTTTCGGGGTTGTTCTTTTGAGATATACATATATGTATGCAT
TTTACTCTGTATATGTTCGATTCCACTTGTATTCGTTGATTTTAAACTATGTTTTTAGTG
GGAGTGTGATAAAAAAGGAATTATGAGG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 4

CO CL2859Contig1 982 4 13 U
GGACATACAGACATCTATACTCAAAATATCTCCTTACTAATCACAAACTCTTCTGTTCCT
TTCAAATATGACTGCTCTCTACTCGTTAGCCTCCGCCACTCGACTCTCCGTCTCGCTGCC
TAATCATCACGTTGTGCTCCCCACGCGTCGCCGTTTCCATTTGCCGTTAGCAGCTCTTGC
CTCATCGTCTCCAGAGTCATCATCATCGACCCCTAGCCCTATCTCGATCCCCGTTGTCAA
CGGGAACACGTTGTCAACTTCTCATGGAACTCATCACGATAAGGTTGTTGTGGATGATAA
CAGCCTATTTGCTCGCTTCTTTCGCTCCACCGAATCAACCGTCGAGAGGATCATATTTGA
TTTCCGGTTCCTGGCGCTCTTGGCAGTAGGAGGTTCTCTGGCTGGTTCGCTACTCTGCTT
CCTCAATGGGTGCGTCTATGTCATGGAAGCATATAAAGTCTATTGGACTAACTGTGTCAA
AGGCATCCACAAGGGCCAAATGGTTTTACACCTCGTCGAAGCTATTGATGTGTATCTGGT
TGGGACAGTTATGCTAATATTCAGTATGGGTTTGTATGGACTCTTCATCAGCAACTCCTC
TCCTGATGTCCCTGCTGAATCCGACCGTGCCCTCAAAGCCTCTTCTCTATTCGGAATGTT
TGCCATGAAGGAGAGACCGAAATGGATGAAGATCAGCCCACTTGATGAGCTCAAAACCAA
AGTTGGACATGTTATCGTCATGATCCTTCTGGTGAAGATGTTCGAGAGAAGCAAGATGGT
TACCATCGCCACTGGACTTGATCTGCTAAGCTATTCCGTTTGCATTTTCTTGTCCTCTGC
TTCTCTCTATACCCTCCACAACCTCCACAAAGGAGAGCACTGAGTGTATTATTTGTACAG
AACCAAATCCAATATAAAAGTTTAAGCTTCTGTATATTTGAACAACCAATGTTCTTTGTT
TATTATGATCATTCGCTAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM57TF U 1
AF RR4DS73TF U 37
AF RR4FM57JQ C 641
AF RR4DS73JQ C 265
BS 1 506 RR4FM57TF
BS 507 507 RR4DS73TF
BS 508 651 RR4FM57TF
BS 652 669 RR4DS73TF
BS 670 670 RR4DS73JQ
BS 671 769 RR4DS73TF
BS 770 770 RR4DS73JQ
BS 771 827 RR4DS73TF
BS 828 828 RR4DS73JQ
BS 829 839 RR4DS73TF
BS 840 901 RR4DS73JQ
BS 902 902 RR4FM57JQ
BS 903 982 RR4DS73JQ

RD RR4FM57TF 651 0 0
GGACATACAGACATCTATACTCAAAATATCTCCTTACTAATCACAAACTCTTCTGTTCCT
TTCAAATATGACTGCTCTCTACTCGTTAGCCTCCGCCACTCGACTCTCCGTCTCGCTGCC
TAATCATCACGTTGTGCTCCCCACGCGTCGCCGTTTCCATTTGCCGTTAGCAGCTCTTGC
CTCATCGTCTCCAGAGTCATCATCATCGACCCCTAGCCCTATCTCGATCCCCGTTGTCAA
CGGGAACACGTTGTCAACTTCTCATGGAACTCATCACGATAAGGTTGTTGTGGATGATAA
CAGCCTATTTGCTCGCTTCTTTCGCTCCACCGAATCAACCGTCGAGAGGATCATATTTGA
TTTCCGGTTCCTGGCGCTCTTGGCAGTAGGAGGTTCTCTGGCTGGTTCGCTACTCTGCTT
CCTCAATGGGTGCGTCTATGTCATGGAAGCATATAAAGTCTATTGGACTAACTGTGTCAA
AGGCATCCACAAGGGCCAAATGGTTT*ACACCTCGTCGAAGCTATTGATGTGTATCTGGT
TGGGACAGTTATGCTAATATTCAGTATGGGTTTGTATGGACTCTTCATCAGCAACTCCTC
TCCTGATGTCCCTGCTGAATCCGACCGTGCCCTCAAAGCCTCTTCTCTATT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4DS73TF 803 0 0
GG
AATCACAAACTCTTCTGTTCCTTTCAAATATGACTGCTCTCTACTCGTTAGCCTCCGCCA
CTCGACTCTCCGTCTCGCTGCCTAATCATCACGTTGTGCTCCCCACGCGTCGCCGTTTCC
ATTTGCCGTTAGCAGCTCTTGCCTCATCGTCTCCAGAGTCATCATCATCGACCCCTAGCC
CTATCTCGATCCCCGTTGTCAACGGGAACACGTTGTCAACTTCTCATGGAACTCATCACG
ATAAGGTTGTTGTGGATGATAACAGCCTATTTGCTCGCTTCTTTCGCTCCACCGAATCAA
CCGTCGAGAGGATCATATTTGATTTCCGGTTCCTGGCGCTCTTGGCAGTAGGAGGTTCTC
TGGCTGGTTCGCTACTCTGCTTCCTCAATGGGTGCGTCTATGTCATGGAAGCATATAAAG
TCTATTGGACTAACTGTGTCAAAGGCATCCACAAGGGCCAAATGGTTTTACACCTCGTCG
AAGCTATTGATGTGTATCTGGTTGGGACAGTTATGCTAATATTCAGTATGGGTTTGTATG
GACTCTTCATCAGCAACTCCTCTCCTGATGTCCCTGCTGAATCCGACCGTGCCCTCAAAG
CCTCTTCTCTATTCGGAATGTTTGCCATGAAAGAGAGACCGAAATGGATGAAGATCAGCC
CACTTGATGAGCTCAAAACCAAAGTTGGACATGTTATCGTCATGATCCTTCTGGTGAAGA
TGTTCGAGAGA*GCAAGATGGTTACCATCGCCACTGGACTTGATCTGCTAAGCTATTCCG
TTTGCATTT*CTTGTCCTCTG

QA 3 803 3 803
DS 

RD RR4FM57JQ 288 0 0
TCTTCTCTATTCGGAATGTTTGCCATGAAGGAGAGACCGAAATGGATGAAGATCAGCTCA
CTTGATGAGCTCAAAACCAAAGTTGGACATGTTATCGTCATGATCCTTCTGGTGAAGATG
TTCGAGAGAAGCAAGATGGTTACCATCGCCACTGGACTTGATCTGCTAAGCTATTCCGTT
TGCATTTTCTTGTCCTCTGCTTCTCTCTATATCCTCCACAACCTCCACAAAGGAGAGCAC
TGAGTGTATTATTTGTACAGAACCAAATCCAATATAAAAGTTTAAGC
C

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR4DS73JQ 718 0 0
TGGAACTCATCACGATAAGGTTGTTGTGGATGATAACAGCCTATTTGCTCGCTTCTTTCG
CTCCACCGAATCAACCGTCGAGAGGATCATATTTGATTTCCGGTTCCTGGCGCTCTTGGC
AGTAGGAGGTTCTCTGGCTGGTTCGCTACTCTGCTTCCTCAATGGGTGCGTCTATGTCAT
GGAAGCATATAAAGTCTATTGGACTAACTGTGTCAAAGGCATCCACAAGGGCCAAATGGT
TTTACACCTCGTCGAAGCTATTGATGTGTATCTGGTTGGGACAGTTATGCTAATATTCAG
TATGGGTTTGTATGGACTCTTCATCAGCAACTCCTCTCCTGATGTCCCTGCTGAATCCGA
CCGTGCCCTCAAAGCCTCTTCTCTATTCGGAATGTTTGCCATGAAGGAGAGACCGAAATG
GATGAAGATCAGCCCACTTGATGAGCTCAAAACCAAAGTTGGACATGTTATCGTCATGAT
CCTTCTGGTGAAGATGTTCGAGAGAAGCAAGATGGTTACCATCGCCACTGGACTTGATCT
GCTAAGCTATTCCGTTTGCATTTTCTTGTCCTCTGCTTCTCTCTATACCCTCCACAACCT
CCACAAAGGAGAGCACTGAGTGTATTATTTGTACAGAGCCAAATCCAATATAAAAGTTTA
AGCTTCTGTATATTTGAACAACCAATGTTCTTTGTTTATTATGATCATTCGCTAGAGG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL2860Contig1 1219 3 14 U
GAATCGCAGATAATCCACACCCTCTCTTAGATTTCTCATCATCGTTTCCTAACGAATCAG
ACTCTTACCACTCCACTCTTAATCAGACTTCTCGAGGAAACCCATCGATGGATCTCTGCA
CCCTTGACTCGGCGATCCGAAACCCAATCTTCTCCTCATCGATCCCTGACAAATCATCGC
TCTCAAGGAAACTCGGCGCCTTGGAGATTAGGTTTCAAAAGCGTAAACTTTCTACTTCTG
GGTATCGTTCTTCGGTTGTTCGAGCTGCCTCGAACAAGAGTAACGACGATTCTTCTGCTT
CTGGAGGAGATGCTTCTCAAGAAAACAAGCCTTCTAATGGGAACAAATCAGGTGACTCCT
CTGCTACTCCAAAGCCATTTGGTCTTAATACGGATTGGAGAGAGTTCAGAGCAAACTTGT
TTATGAAGGAGCAGGAAGAAAAAGCAGCAGGTGAGGGTCACAAACCAGACACAACCTCTC
CTCCTGAAGCTGAACCAAGAGGACTGAAATGGGCACATCCCATTCCTTTCCCTGAGACTG
GCTGTGTTCTAGTTGCCACGGAGAAGCTCGACGGTTATAGAACATTTGCGAGAACCGTTG
TGCTTCTTCTTAGAGCAGGAACCAACCACCCACAAGAAGGGCCATTTGGAGTTGTCATCA
ACCGTCCGCTTCACAAAAACATCAAGCACATGAAATCAACTAAAACCGAGCTCGCTACCA
CCTTCTCAGAGTGTTCCTTGTACTTTGGTGGGCCTCTTGAAGCCAGCATGTTCCTGTTGA
AAACCTCGGATAAAACCAAGATACCTGCGCTTGAAGAAGTCATGCCGGGGCTTAACTTTG
GTGCTCGAAACACTTTGGATGAAGCTGCGGTACTTGTAAAGAAAGGAATGCTTGAGCCAC
AGGACTTTAGATTCTTTGTTGGTTACGCAGGTTGGCAACTGGATCAGCTCAGAGAAGAGA
TCGAATCAGATTACTGGCATGTCGCTGCGTGCAGCTCGGAGTTAATATGTGGAGCTTCAC
CGGAAAACTTGTGGGAAGAGATATTGCAGTTGATGGGCGGTCAATACTCAGAGCTTAGCC
GGAAACCCAAGCTGGATATGTAGTAGACCTTTCTTTATGTTTTGAAGATGATTGCCTAGT
TTCTAAGGCTTTTTTAAAGCCAAATGTATAGCTTTACTTCACTGTCTTGTATTTGAGAAT
AAAGCACTTCTATAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F812TF U 6
AF RR4AB60TF U 1
AF RR4AB60JQ C 487
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GG
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CCACTCCACTCTTAATCA******TCGG****ACTTCTCGATGGATCTCTGCACCCTTGA
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AGA

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CCTTCTCAGAGTGTTCCTTGTACTTTGGTGGGCCTCTTGAAGCCAGCATGTTCCTGTTGA
AAACCTCGGATAAA*CCAAGATACCTGCGCTTGAAGAAGTCATG

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DS 

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TTCTTAGAGCAGGAACCAACCACCCACAAGAAGGGCCATTTGGAGTTGTCATCAACCGTC
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TTAGATTCTTTGTTGGTTACGCAGGTTGGCAACTGGATCAGCTCAGAGAAGAGATCGAAT
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GGCTTTTTTAAAGCCAAATGTATAGCTTTACTTCACTGTCTTGTATTTGAGAATAAAGCA
CTTCTATAGTTAC

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DS 



AS 1 3

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CCATTGTACTTCTTCAAAGTATTATCCCTTCGTCTCCCTCCTCTCTCAACTCCCTTTGAA
AACTCCGCCCATCTTTCGAGTCTAAGACTCACCGAAAAAAAATGGCTTTCCGGCGGGGCA
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GTTGGGTGTTCGGGTTCCTACTTTCCTTATCTCTCCCTGGATCGAGAAGGGCACTGTGAT
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TGTGAAGAAACTCTTCAACCTTAAGTCTCACTTCCTTACCAAGAGAGATGCATGGGCTGG
TACATTTGAGAAATACTTCCGTATCCGTGACTCCCCTCGCCAAGATTGTCCAGAGAAACT
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GTATGTTTGAAGCAATTGAAAAAATCTACAAATAATGGAAAGAATGATATGTAAATACAT
GTGTCCACCTCTATGTTCCCCACTTCACTCGGATACATTCTATGATGTGGAAAAAAAGGT
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TGACCTCCATCTACTTAGTAGGAAAAAGATGGAGAGTTCTTGTAATACTAATACATATAC
TTTATCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4AY33TF U 1
AF RR4DI81TF U 413
AF RR4AY33JQ C 351
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BS 793 1104 RR4DI81TF
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RD RR4AY33TF 792 0 0
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ACATGAACCTGAGGGTCCTACACCACATTCACAGTACGAGCATTCTTCGATACCAGCAAC
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TACATTTGAGAAATACTTCCGTATCCGTGACTCCCCTCGCCAAGATTGTCCAGAGAAACT
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TGTTGAGAAGTT

QA 1 792 1 792
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G
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GGGCTGGTACATTTGAGAAATACTTCCGTATCCGTGACTCCCCTCGCCAAGATTGTCCAG
AGAAACTAGCAGAAGTTGAACGATCACTAAGGCCCTTTGGAGCAAAAGAAGACGCAAAGC
TCTCAGAATTCCAGGTGGAGCTGATCCAACTCGCTTCCCAGCTCGTTGGAGACCATCTGC
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CCAACAAGTATGTTTGAAGCAATTGAAAAAATCTACAAATAATGGAAAGAATGATATGTA
AATACATGTGTCCACCTCTATGTTCCCCACTTCACTCGGATACATTCTATGATGTGGAAA
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TTGCTCCTGACCTCCATCTACTTAGTAGGAA

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RD RR4AY33JQ 797 0 0
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TACCAGCAACTGTGAAGAAACTCTTCAACCTTAAGTCTCACTTCCTTACCAAGAGAGATG
CATGGGCTGGTACATTTGAGAAATACTTCCGTATCCGTGACTCCCCTCGCCAAGATTGTC
CAGAGAAACTAGCAGAAGTTGAACGATCACTAAGGCCCTTTGGAGCAAAAGAAGACGCAA
AGCTCTCAGAATTCCAGGTGGAGCTGATCCAACTCT*TTCCCAGCTCGTTGGAGACCATC
TGCTATACTCATATCCAGACATTGGGAAGAACCTGACAGTACGTGAAGGCAACAAATACG
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GTAAATACATGTGTCCGCCTCTATGTTCCCCACTTCACTCGGATACATTCTATGATGTGG
AAAAAAAGGTATATAATTATGTATGTTAAAATGTAATGGATCAAAAGACATGGTAACGTT
ATGTTGCTCCTGACCTCCATCTACTTAGTAGGAAAAAGATGGAGAGTTCTTGTAATACTA
ATACATATACTTTATCC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 4

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CCCCTGAAACTCCCGGTTATTTCGAGAGGAGAATAGCATTGATTAGAACCTCATCAGAAG
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TCCTCTTAGGTCTTCTGGTTTTGGCATTTGAGCATGCAAGAAGAGCTTTCAGGGTCGTCA
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ATAAATCTCAATTTGAAACTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4A123TF U 1
AF RR4A123TFB U 1
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AF RR4A123JQD C 301
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DS 

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AACTT

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 3

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ATACATTTGGGAGTTATTTTGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A258JQD C 1
AF RR4A258TFB U 12
AF RR4AC87TF U 1
BS 1 11 RR4AC87TF
BS 12 462 RR4A258TFB
BS 463 463 RR4AC87TF
BS 464 655 RR4A258TFB
BS 656 656 RR4AC87TF
BS 657 682 RR4A258TFB

RD RR4A258JQD 682 0 0
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ATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTAGGACCTGCTGTT
CGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTC
ATTCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACTGGTGGGATGAAG
GTGAAGGCTGACCGTGATGAGTCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTT
GCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGA
GGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGT
TCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATT*CCCACCGACAGTACACG
TAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGAGCCTCATGATCGT
TCAGCTGTTGTTCCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTAAAGTTAGTTTTG
TCTCTCCATTTCATCCTTTGCTTCGAAAACTTGCGTCTTTTTTGAACAATGTAAAACATT
ATACATTTGG*AGTTATTTTGC

QA 1 682 1 682
DS 

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CCATCCAAAAAAGCCCGAGCATTTTGTCTCTTCTCATCCATCGGTGAACATGTCGAGGAG
AAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTAGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGA
GCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTTAC
TGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGA
CCGTGATGAGTCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATG
CAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAAC
CAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAA
GATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATTTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTG
GACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTTGT
TCCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTAAAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTT
CATCCTTTGCTTCGAAAACTTGCGTCTTTTTTGAACAATGTAAA*CATTATACATTTGGG
AGTTATTTTGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4AC87TF 672 0 0
GGAGAGAACCCCCATCCAAAAAAGCTCGAGCATTTTGTCTCTTCTCATCCATCGGTGAAC
ATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTAGGACCTGCTGTT
CGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTC
ATTCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACTGGTGGGATGAAG
GTGAAGGCTGACCGTGATGAGTCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTT
GCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGG
GGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGT
TCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATT*CCCACCGACAGTACACG
TAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCCATGAGAGCCTCATGATCGT
TCAGCTGTTGTTCCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTAAAGTTAGTTTTG
TCTCTCCATTTCATCCTTTGCTTCGAAAACTTGCGTCTTTTTTGAACAATGTAAAACATT
ATACATTTGG
AG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL2864Contig1 1028 4 4 U
GTAACTTAACTATTTTGTTTTCTTGGAAGTTTTTATTATTCTCAGAGAACCCTGCTCAAG
CTCTCATTCTCCCGGAGTGTTTTAACGAGATTGCATCCCTCTTTATGGATGTTATGGAAA
GGAGAATTTCATCTGGTTATGCCAAACCTCCATGGACATTCAAAGGAAGTGCCTTGTACC
AGATTCATCTTGTGAAGGCTGCTACTGCTCGAGCATTCATCCCTAAGGAACTTCGATTAG
TTGAAGCTTTTGGATACACTCTTGGTGGGTTTTTCCTTGCTAGCTACGATGATAGCCCAG
CTGGTGTCTTTGATGAGCTTGTCGTGATTGCAGGAACTGTATGGAACCCTCCTACATCAT
GCGCATGGGCCGCTAGGGTGCTCGTGAACAGCAATGAGGCTTGTCATCACGGACGCAAGG
TAGGAAGTAGGACTACCAAGCCAAGTTGCAAGATTTTCAAAAAAAATCACTGCAGTTCCA
AAGCGAAAAAGGGAGAGAGCTTTTGGTTTCTTGGACACACTTGGGCTGGGAACTACTCTG
TCTCAACCTGAAGACTTGGTAGAGGTTAAGGTTAGTGAAGTTGATGGTGCTGCTTCTGCA
GATATCTGCAGTATCAAAGTTAGATCAGACGAAATGGAGAAAAAACTCGGAAGTTGGATG
GGACCAGCACCTCAAAATGTCGCTGCCGAGTTTTAGTGGCAATACAAAGTACTTTCCAAA
TCTACTCAAATACTCTTGCCACCTTCACTGCAGGGTGAGGCCTGTAAGACCTGCCGTAGT
ATCAAATCCTTTTGATGATGAGACAGAGAAGTTTTCAGAAGGGAATCACACATCACAGGA
GTTGCATGAAAATGAAAACGAAAGGCAGTTAAGCGTAGCAGTGATGCTATCAAAACCAAT
CATAGCTCTTCAGTTTAAAGACTTAACAATGCAAGTAGAAGCTCCTGTTGTAGTTTAACA
CAACACTAAAGTTCCCAAAACATACACTTCCTTCCTACTACAAGGTTCACATCTTTACAA
CAACAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E744TF U 1
AF RR4E274TF U 1
AF RR4E744JQ C 648
AF RR4E274JQ C 202
BS 1 490 RR4E274TF
BS 491 670 RR4E274JQ
BS 671 671 RR4E744JQ
BS 672 1028 RR4E274JQ

RD RR4E744TF 427 0 0
GTAACTTAACTATTTTGTTTTCTTGGAAGTTTTTATTATTCTCAGAGAACCCTGCTCAAG
CTCTCATTCTCCCGGAGTGTTTTAACGAGATTGCATCCCTCTTTATGGATGTTATGGAAA
GGAGAATTTCATCTGGTTATGCCAAACCTCCATGGACATTCAAAGGAAGTGCCTTGTACC
AGATTCATCTTGTGAAGGCTGCTACTGCTCGAGCATTCATCCCTAAGGAACTTCGATTAG
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TAGGAAG

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DS 

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CTCTCATTCTCCCGGAGTGTTTTAACGAGATTGCATCCCTCTTTATGGATGTTATGGAAA
GGAGAATTTCATCTGGTTATGCCAAACCTCCATGGACATTCAAAGGAAGTGCCTTGTACC
AGATTCATCTTGTGAAGGCTGCTACTGCTCGAGCATTCATCCCTAAGGAACTTCGATTAG
TTGAAGCTTTTGGATACACTCTTGGTGGGTTTTTCCTTGCTAGCTACGATGATAGCCCAG
CTGGTGTCTTTGATGAGCTTGTCGTGATTGCAGGAACTGTATGGAACCCTCCTACATCAT
GCGCATGGGCCGCTAGGGTGCTCGTGAACAGCAATGAGGCTTGTCATCACGGACGCAAGG
TAGGAAGTAGGACTACCAAGCCAAGTTGCAAGATTTTCAAAAAAAATCACTGCAGTTCCA
AAGCGAAAAA

QA 1 490 1 490
DS 

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AGTACTTTCCAAATCTACTCAAATACTCTTGCCACCTTCACTGCAGGGTGAGGCCTGTAA
GACCTGCCGTAGTATCAAATCCTTTTGATGATGAGACAGAGAAGTTTTCAGAAGGGAATC
ACACATCACAGGAGTTGCATGAAAATGAAAACGAAAGGCAGTTAAGCGTAGCAGTGATGC
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TTGTAGTTTAACACAACACTAAAGTTCCCAAAACATACACTTCCTTCCTACTA

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4E274JQ 827 0 0
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TTGGTGGGTTTT*CCTTGCTAGCTACGATGATAGCCCAGCTGGTGTCTTTGATGAGCTTG
TCGTGATTGCAGGAACTGTATGGAACCCTCCTACATCATGCGCATGGGCCGCTAGGGTGC
TCGTGAACAGCAATGAGGCTTGTCATCACGGACGCAAGGTAGGAAGTAGGACTACCAAGC
CAAGTTGCAAGATTTTCAAAAAAAATCACTGCAGTTCCAAAGCGAAAAAGGGAGAGAGCT
TTTGGTTTCTTGGACACACTTGGGCTGGGAACTACTCTGTCTCAACCTGAAGACTTGGTA
GAGGTTAAGGTTAGTGAAGTTGATGGTGCTGCTTCTGCAGATATCTGCAGTATCAAAGTT
AGATCAGACGAAATGGAGAAAAAACTCGGAAGTTGGATGGGACCAGCAC*TCAAAATGTC
GCTGCCGAGTTTTAGTGGCAATACAAAGTACTTTCCAAATCTACTCAAATACTCTTGCCA
CCTTCACTGCAGGGTGAGGCCTGTAAGACCTGCCGTAGTATCAAATCCTTTTGATGATGA
GACAGAGAAGTTTTCAGAAGGGAATCACACATCACAGGAGTTGCATGAAAATGAAAACGA
AAGGCAGTTAAGCGTAGCAGTGATGCTATCAAAACCAATCATAGCTCTTCAGTTTAAAGA
CTTAACAATGCAAGTAGAAGCTCCTGTTGTAGTTTAACACAACACTAAAGTTCCCAAAAC
ATACACTTCCTTCCTACTACAAGGTTCACATCTTTACAACAACAAAA

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 4

CO CL2865Contig1 693 4 21 U
GGCCGACCGGCCTGTAAAGCGCACACTTGTTCATTCTCAAGACCTTAAAACCACCAGGGT
CAGAAGGAGAAGAAGAAGATTATTCTTAAGAAGATGGTGAACTATGTGCTTAAGATCACA
GCTGATCTCGAGAATCTCACGAATCTC*AACCCTCCGGTGGCTGCGATGATCCCAACTTC
CCTTACCTCTTCAAGTTGAAATGCGAACAATGCGGAGAGGTGACTCAGAAAGAAACATGT
GTGACTTTGAATGAGACTTTTACTCCTCCAGGAGGTGGGGGTACTTGTCATCTCGTTCAG
AAGTGTAATTTCTGTGGAAGGGAAGGTAATGTGACAATGATTCCTGGAAAAGGTCGTCCT
TTAACTCTTGAAGATTCTGAGGCTGGAGAGCATGCCCCTCTTATGGTGTTTGGCTGTCGA
GGCTATGAACCCATCGATTTCGGATCTGGTGGATTTTGGAAAGCTGAAGCTGAATCTGGA
ACCAAGTTTGATGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACAGAGTACGATGAGAAG
GGCGAGTGCCCTGTTATGATATCAAACTTCCGTGCTAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAAG
ACTTCAGGAGTCCATTGTTCTGTTTTTCTGATTCTCTACAAACTTTGTGTATTTAAAAAC
TCAGTTCTAATAAAGTTTTACCATGTTCTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4FV44TF U 1
AF RR4CJ94TF U 67
AF RR4AE30JQ C 70
AF RR4AE30TF U 70
BS 1 147 RR4FV44TF
BS 148 148 RR4AE30TF
BS 149 276 RR4FV44TF
BS 277 277 RR4AE30TF
BS 278 308 RR4FV44TF
BS 309 309 RR4AE30TF
BS 310 412 RR4FV44TF
BS 413 413 RR4AE30TF
BS 414 445 RR4FV44TF
BS 446 446 RR4AE30TF
BS 447 458 RR4FV44TF
BS 459 459 RR4CJ94TF
BS 460 470 RR4FV44TF
BS 471 471 RR4CJ94TF
BS 472 565 RR4FV44TF
BS 566 566 RR4CJ94TF
BS 567 603 RR4FV44TF
BS 604 658 RR4CJ94TF
BS 659 659 RR4AE30TF
BS 660 690 RR4CJ94TF
BS 691 693 RR4AE30JQ

RD RR4FV44TF 603 0 0
GGCCGACCGGCCTGTAAAGCGCACACTTGTTCATTCTCAAGACCTTAAAACCACCAGGGT
CAGAAGGAGAAGAAGAAGATTATTCTTAAGAAGATGGTGAACTATGTGCTTAAGATCACA
GCTGATCTCGAGAATCTCACGAATCTCCAACCCTCCGGTGGCTGCGATGATCCCAACTTC
CCTTACCTCTTCAAGTTGAAATGCGAACAATGCGGAGAGGTGACTCAGAAAGAAACATGT
GTGACTTTGAATGAGACTTTTACTCCTCCAGGAGGTAGGGGTACTTGTCATCTCGTTCAG
AAGTGTAAGTTCTGTGGAAGGGAAGGTAATGTGACAATGATTCCTGGAAAAGGTCGTCCT
TTAACTCTTGAAGATTCTGAGGCTGGAGAGCATGCCCCTCTTATGGTGTTTGACTGTCGA
GGCTATGAACCCATCGATTTCGGATTTGGTGGATTTTGAAAAGCTGAAGCCGAATCTGGA
ACCAAGTTTGATGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACAGAGTACGATGAGAAG
GGCGAGTGCCCTGTTATGATATCAAGCTTCCGTGCTAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAAG
ACT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4CJ94TF 624 0 0
AGGGG
GAAGAAGATTATTCTTAAGAAGATGGTGAACTATGTGCTTAAGATCACAGCTGATCTCGA
GAATCTCACGAATCTCCAACCCTCCGGTGGCTGCGATGATCCCAACTTCCCTTACCTCTT
CAAGTTGAAATGCGAACAATGCGGAGAGGTGACTCAGAAAGAAACATGTGTGACTTTGAA
TGAGACTTTTACTCCTCCAGGAGGTAGGGGTACTTGTCATCTCGTTCAGAAGTGTAAGTT
CTGTGGAAGGGAAGGTAATGTGACAATGATTCCTGGAAAAGGTCGTCCTTTAACTCTTGA
AGATTCTGAGGCTGGAGAGCATGCCCCTCTTATGGTGTTTGACTGTCGAGGCTATGAACC
CATCGATTTCGGATTTGGTGGATTTTGGAAAGCTGAAGCTGAACCTGGAACCAAGTTTGA
TGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACAGAGTACGATGAGAAGGGCGAGTGCCC
TGTTATGATATCAAACTTCCGTGCTAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAAGACTTCAGGAGT
CCATTGTTCTGTTTTTCTGATTCTCTACAAACTTTGTGTATTTAAAA*CTCAGTTCTAAT
AAAGTTTTACCATGTTCTG

QA 6 624 6 624
DS 

RD RR4AE30JQ 624 0 0
GG
GAAGAAGATTATTCTTAAGAAGATGGTGAACTATGTGCTTAAGATCACAGCTGATCTCGA
GAATCTCACGAATCTC*AACCCTCCGGTGGCTGCGATGATCCCAACTTCCCTTACCTCTT
CAAGTTGAAATGCGAACAATGCGGAGAGGTGACTCAGAAAGAAACATGTGTGACTTTGAA
TGAGACTTTTACTCCTCCAGGAGGTGGGGGTACTTGTCATCTCGTTCAGAAGTGTAATTT
CTGTGGAAGGGAAGGTAATGTGACAATGATTCCTGGAAAAGGTCGTCCTTTAACTCTTGA
AGATTCTGAGGCTGGAGAGCATGCCCCTCTTATGGTGTTTGGCTGTCGAGGCTATGAACC
CATCGATTTCGGATCTGGTGGATTTTGGAAAGCTGAAGCTGAATCTGGAACCAAGTTTGA
TGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACAGAGTACGATGAGAAGGGCGAGTGCCC
TGTTATGATATCAAACTTCCGTGCTAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAAGACTTCAGGAGT
CCATTGTTCTGTTTTTCTGATTCTCTACAAACTTTGTGTATTTAAAAACTCAGTTCTAAT
AAAGTTTTACCATGTTCTGACT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR4AE30TF 624 0 0
GG
GAAGAAGATTATTCTTAAGAAGATGGTGAACTATGTGCTTAAGATCACAGCTGATCTCGA
GAATCTCACGAATCTC*AACCCTCCGGTGGCTGCGATGATCCCAACTTCCCTTACCTCTT
CAAGTTGAAATGCGAACAATGCGGAGAGGTGACTCAGAAAGAAACATGTGTGACTTTGAA
TGAGACTTTTACTCCTCCAGGAGGTGGGGGTACTTGTCATCTCGTTCAGAAGTGTAATTT
CTGTGGAAGGGAAGGTAATGTGACAATGATTCCTGGAAAAGGTCGTCCTTTAACTCTTGA
AGATTCTGAGGCTGGAGAGCATGCCCCTCTTATGGTGTTTGGCTGTCGAGGCTATGAACC
CATCGATTTCGGATCTGGTGGATTTTGGAAAGCTGAAGCTGAATCTGGAACCAAGTTTGA
TGAGATTGATTTGTCGAGCGGAGAGGAGTTCACAGAGTACGATGAGAAGGGCGAGTGCCC
TGTTATGATATCAAACTTCCGTGCTAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAAGACTTCAGGAGT
CCATTGTTCTGTTTTTCTGATTCTCTACAAACTTTGTGTATTTAAAAACTCAGTTCTAAT
AAAGTTTTACCATGTTCTG
ACT

QA 3 621 3 621
DS 



AS 1 4

CO CL2866Contig1 707 4 3 U
TGGACAAAACAGAGTTAGTTCAGTTGATTTTGTGGTTGAACAACAAAGAGTCTTGCAATA
TAACAAAAAAAAAATTCAAGAAAAAGCAGAGAGAGAGAGATGATTGGTTCTTTTTGTCTA
TGAGTCTACAAAGAAGAGAGTAAAAGAGTTACTGGTCCAATAATAATAAGGGAGAAGCTT
TAGCTTGTACTAATCATCATCTTCATACTCCACTTCATCGGAACTAACTCCTCCCATCAC
GGATACGTAAATAACAACTGCTATAAACTGAGCAGCGAGGAAGAATCTCGCTCTCTTCTT
GAATTTTTTCTCCTCTTCACTCTTTTCTGCCTTTGGTTTGCTCTTTGGCTTCGAACCCTT
TCCTGAAAATGAGGAAGGGAACGAGTGAAGCGGAGGGGAAGGAGATGATGAAGACGCTTC
TAGGAACTCTGACTTGAGTTTCTCAGCATATCTGACAAGATTACTACGTTCCAGAAGTTT
GCACCGAAGCACTGATGTTTCCGGTAATACTTGGATCGTAAAAAGCATGTGTGAGAGAAG
GAAAGCATCCAAACTCGACGGCCTGTCCTCAAATAGAAACTTCTGCTCGCCTAACCTAGT
CGACAAAGCTTCATACGCCTCACTTGCCCTCTTGTATATCAGTTTTTCTCTTTGCTCTGC
GTTTTCTTTGGTGAGTCCTAGACGGTTCTTGGCCAAATACGACTGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI02JQ U 151
AF RR4FG17TF C 1
AF RR4FG17JQ U 2
AF RR4AI02TF C 38
BS 1 1 RR4FG17TF
BS 2 621 RR4FG17JQ
BS 622 707 RR4AI02TF

RD RR4AI02JQ 294 0 0
ACTGGTCCAATAATAATAGGGGAGAAGCTTTAGCTTGTACTAATCATCATCTTCATACTC
CACTTCATCGGAACTAACTCCTCCCATCACGGATACGTAAATAACAACTGCTATAAACTG
AGCAGCGAGGAAAAATCTCGCTCTCTTCTTGAATTTTTTCTCCTCTTCACTCTTTTCTGC
CTTTGGTTTGCTCTTTGGCTTCAAACCCTTTCCTGAAAATGAAGAAGGGAACGAGTGAAG
CGGAGGGGAAGGAGATGATGAAGACGCTTCTAGGAACTCTGACTTGAGTTTCTC

QA 1 294 1 294
DS 

RD RR4FG17TF 624 0 0
TGGACAAAACAGAGTTAGTTCAGTTGATTTTGTGGTTGAACAACAAAGAGTCTTGCAATA
TAACAAAAAAAAAATTCAAGAAAAAGCAGAGAGAGAGAGATGATTGGTTCTTTTTGTCTA
TGAGTCTACAAAGAAGAGAGTAAAAGAGTTACTGGTCCAATAATAATAAGGGAGAAGCTT
TAGCTTGTACTAATCATCATCTTCATACTCCACTTCATCGGAACTAACTCCTCCCATCAC
GGATACGTAAATAACAACTGCTATAAACTGAGCAGCGAGGAAGAATCTCGCTCTCTTCTT
GAATTTTTTCTCCTCTTCACTCTTTTCTGCCTTTGGTTTGCTCTTTGGCTTCGAACCCTT
TCCTGAAAATGAGGAAGGGAACGAGTGAAGCGGAGGGGAAGGAGATGATGAAGACGCTTC
TAGGAACTCTGACTTGAGTTTCTCAGCATATCTGACAAGATTACTACGTTCCAGAAGTTT
GCACCGAAGCACTGATGTTTCCGGTAATACTTGGATCGTAAAAAGCATGTGTGAGAGAAG
GAAAGCATCCAAACTCGACGGCCTGTCCTCAAATAGAAACTTCTGCTCGCCTAACCTAGT
CGACAAAGCTTCATACGCCTC
GCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4FG17JQ 623 0 0
GGACAAAACAGAGTTAGTTCAGTTGATTTTGTGGTTGAACAACAAAGAGTCTTGCAATAT
AACAAAAAAAAAATTCAAGAAAAAGCAGAGAGAGAGAGATGATTGGTTCTTTTTGTCTAT
GAGTCTACAAAGAAGAGAGTAAAAGAGTTACTGGTCCAATAATAATAAGGGAGAAGCTTT
AGCTTGTACTAATCATCATCTTCATACTCCACTTCATCGGAACTAACTCCTCCCATCACG
GATACGTAAATAACAACTGCTATAAACTGAGCAGCGAGGAAGAATCTCGCTCTCTTCTTG
AATTTTTTCTCCTCTTCACTCTTTTCTGCCTTTGGTTTGCTCTTTGGCTTCGAACCCTTT
CCTGAAAATGAGGAAGGGAACGAGTGAAGCGGAGGGGAAGGAGATGATGAAGACGCTTCT
AGGAACTCTGACTTGAGTTTCTCAGCATATCTGACAAGATTACTACGTTCCAGAAGTTTG
CACCGAAGCACTGATGTTTCCGGTAATACTTGGATCGTAAAAAGCATGTGTGAGAGAAGG
AAAGCATCCAAACTCGACGGCCTGTCCTCAAATAGAAACTTCTGCTCGCCTAACCTAGTC
GACAAAGCTTCATACGCCTC
GCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4AI02TF 670 0 0
GAACAACAAAGAGTCTTGCAATATAACAAAAAAAAAATTCAAGAAAAAGCAGAGAGAGAG
AGATGATTGGTTCTTTTTGTCTATGAGTCTACAAAGAAGAGAGTAAAAGAGTTACTGGTC
CAATAATAATAAGGGAGAAGCTTTAGCTTGTACTAATCATCATCTTCATACTCCACTTCA
TCGGAACTAACTCCTCCCATCACGGATACGTAAATAACAACTGCTATAAACTGAGCAGCG
AGGAAGAATCTCGCTCTCTTCTTGAATTTTTTCTCCTCTTCACTCTTTTCTGCCTTTGGT
TTGCTCTTTGGCTTCGAACCCTTTCCTGAAAATGAGGAAGGGAACGAGTGAAGCGGAGGG
GAAGGAGATGATGAAGACGCTTCTAGGAACTCTGACTTGAGTTTCTCAGCATATCTGACA
AGATTACTACGTTCCAGAAGTTTGCACC*AAGCACTGATGTTTCCGGTAATACTTGGATC
GTAAAAAGCATGTGTGAGAGAAG*AAAGCATCCAAACTCGACGGCCTGTCCTCAAATAGA
AACTTCTGCTCGCCTAACCTAGTCGACAAAGCTTCATACGCCTCACTTGCCCTCTTGTAT
ATCAGTTTTTCTCTTTGCTCTGCGTTTTCTTTGGTGAGTCCTAGACGGTTCTTGGCCAAA
TACGACTGCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 2 4

CO CL2867Contig1 694 2 2 U
GGACCTACCCAAAACCTAAAACCCCAGAAAAAAAGTGAGAATAAACCAAAACTGCTTCGC
TCCCAGCTCGTAAGCAGGACAAAAAAGAGAAATGCCGACGCTCACAAAGATTTACTCCAT
GGAAGAAGTGGCAGCTCACAACAAGCAAGATGACTGCTGGATTGTAATCGACGGCAAGGT
CTATGACGTAACCTCTTATATGGATGAGCACCCTGGAGGAGATGATGTACTTCTTGCTGT
CACTGGCAAAGATGCAACGGATGAATTCGAAGACGCGGGGCACAGCAAAACCGCTAGGGA
ACTCATGGAGGAGTATTTCATCGGCGAGCTTGACGAAGATTCCGTACAGGAAATACCAGA
GCTCAAGATCTACAAGAAGGAGGAGCCAAAGGATTCTGTTCAGAAGCTTGTCGTCTTGAC
GAAGCAGTACTGGGTTGTTCCCGTCTCGGTCATCACCATCTCTGTTGCCGTGAGTCTCTT
GTTCTCTCGCAAGAAGTAGTAGGAGTAGTCTCTGGAGACGATCTTGAGTTATTGAATTAC
TGGAGTGAATCAACTATCCACGAGAACTCCCCCCCTCACGTTATAGATTTTGAATCACAG
AAAAGAATCATATTATTTTTCAGTTTTCAATCACTTAATGGTTTTACATTTTTGAGTTAA
TGATATGATTATTGGATGCTTTGGTTTTGCTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4A643JQ C 1
AF RR4A643TF U 1
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CTATGACGTAACCTCTTATATGGATGAGCACCCTGGAGGAGATGATGTACTTCTTGCTGT
CACTGGCAAAGATGCAACGGATGAATTCGAAGACGCGGGGCACAGCAAAACCGCTAGGGA
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C

QA 1 693 1 693
DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BW60TF U 1
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BS 696 716 RR4BW60JQ

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TAA

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DS 

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GAATCATATTATTTTTCAGTTTTCAATCACTTAATGGTTTTACATTTTTGAGTTCATGAT
ATGATTATTGGATGCTTTGGTTTTGCTTATAAAAAAAAAGCCTGTTTGTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

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TACGGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4F262JQ U 22
AF RR4D010JQ U 8
AF RR4D010TF C 1
AF RR4F262TF C 37
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AAAGGACCCTTCAAACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGATACTACTACTTGACAA
TGCAGTTTGTCTACTTAGAAACTTATTACAACATTAAAACATCCGAAGAAAACGGCAGGA
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TCAGTCGTGGAAGGACCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGTATTTATCAAAA
TCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCTCCACGTTCTTG
TCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGGTGGCGCGTGAG
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CTGGTTGCCATACAATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTA
G

QA 1 583 1 583
DS 

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AGACAGGGAAAACAAAAGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGATA
CTACTACTTGACAATGCAGTTTGTCTACTTAGAAACTTATTACAACATCAAAACATCCGA
AGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGAC
TTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGACGAGTCTTGGCGAGCAGCCTCTG
CTGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACC
AGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCAT
CCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGT
AGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGGCCGGCGATCAATT
GAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4D010TF 668 0 0
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ACATATTAGACAGGGAAAACAAAAGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTT
TAGGATACTACTACTTGACAATGCAGTTTGTCTACTTAGAAACTTATTACAACATCAAAA
CATCCGAAGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCC
TCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGACGAGTCTTGGCGAGCA
GCCTCTGCTGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGA
GGAGACCAGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGC
AATTCATCCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGA
GCAGTGTAGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGGCCGGCG
ATCAATTGAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAG
AGTAGCAGAGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTACTTCTTTGGTTGTTGTAATAGTGAG
TACGGTCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4F262TF 632 0 0
TGAATTATATAATAAAACCCTTAGACATATTAGACAGGGAAAACAAAAGGACCCTTCAGA
CATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGATACTACTACTTGACAATGCAGTTTGTCTACT
TAGAAACTTATTACAACATTAAAACATCCGAAGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAA
ACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCC
AACACCGACGAGTCTTGGCGAGCAGCCTCTGCTGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGA
CCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACG
TCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAA
TGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATG
ACAGCGAGCTTCCTTAGGCCGGCGATCAATTGAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAA
TACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAGAGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTAC
TTCTTTGGTTGTTGTAATAGTGAGTACGGTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL2869Contig1 1335 2 2 U
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ATATTCTATTGGAAACTTGAGAGTTTAGTAAAAAAGCATATGAGGTCGTTGAAGATGGGT
GGAGACATGATGGAAGATGATTGGGAGTTTGCTTCATCCTCAAACCCTAACCGAACCCTA
GTTCTTGTCGGCCGTACTGGAAACGGAAAGAGCGCAACAGGTAACAGCATCCTTGGAAAG
AAAGCGTTCAAGTCAAAAGCAAGCTCTAGAGGAGTGACTAGCACATCAGAGTCACAGAGA
GTTGTCAAAGAAGATGGACAGATCATCAACGTTATCGACACTCCTGGTCTGTTTGATTTG
TCAACGGCAGCAGAGTTTATAGGGAAAGAGATTGTGAGATGCATAACTCTTGCTGAAGGT
GGAATCCATGCTGTTCTGTTGGTGTTCACTGTGAGGGGTCGTCCTACAGATGAGGAGCAG
TCTGTTCTCTATCACTTGCAGACGCTTTTCGGCAGTAAGATCTCTGACTATATGATCATT
GTCTTTACCGGTGGGGATGATTTGGAAGACAACGATGAGACCTTGGAGGACTACTTGGGT
CAGGAGTGCCCTGAGTTTCTGAAAGAGATTCTTGAGCTATGTGACAATAGAATGGTACTG
TTTGATAACAAGACTAGCAATAAGCGCAAGAAAGCTGAGTAAGTTCAGAAGCTTCTCTCA
CTTGTTGATTCGGTTGCTAGAAAGAACAATGGAAAACCGTTTACAGATGAGTTGTTCCAT
GAACTACAGGAGGAGGCTATCAAGCTACGTGACCAGAAAAAGGAGGTTGAATCGCTCAAG
GGTTATTCAAAGAGTGAGATATCTGAGTTCAAGAAGCAGATAGAGATATCCTATTACAGA
CAGCTTAGCCGTATCACAGAGATGGTTGAGACAAAGCTGAAAGAAACGGCAAAGAGGCTA
GAGAAGCAGCTAGGTGAAGAGCAAGCAGCAAGACTTGAAGCCGAAGAGAGGGCAAACGAA
GTTCAGAAACGGTCAAGTGATGAGATTAAGAAGCTGAGAGAGAATCTGGAGAGGGCGGAG
AAAGAGACAAAGGAGCTCCAGAAGAAACTGGGAAAGTGCATCAATCTTTGATTGAGATAT
CAAATCCAAGCTTCTTTCAAGTCTCTGATAAGGGCTTTCATTTATTCAAAATATATTGTG
GTTTTATTATCATCAAAAGACAAAAAGGTGTTTTATAAGTCTAAATAATGACGGATGCAC
GTGAATATTATTTTTTCTCTCTTCTGAATTTGATGCTGGACGATTTTGTGTGTTTAGTTG
ATTGCTGCTTGGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG27TF U 1
AF RR4AG27JQ C 467
BS 1 785 RR4AG27TF
BS 786 1335 RR4AG27JQ

RD RR4AG27TF 785 0 0
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GGAGACATGATGGAAGATGATTGGGAGTTTGCTTCATCCTCAAACCCTAACCGAACCCTA
GTTCTTGTCGGCCGTACTGGAAACGGAAAGAGCGCAACAGGTAACAGCATCCTTGGAAAG
AAAGCGTTCAAGTCAAAAGCAAGCTCTAGAGGAGTGACTAGCACATCAGAGTCACAGAGA
GTTGTCAAAGAAGATGGACAGATCATCAACGTTATCGACACTCCTGGTCTGTTTGATTTG
TCAACGGCAGCAGAGTTTATAGGGAAAGAGATTGTGAGATGCATAACTCTTGCTGAAGGT
GGAATCCATGCTGTTCTGTTGGTGTTCACTGTGAGGGGTCGTCCTACAGATGAGGAGCAG
TCTGTTCTCTATCACTTGCAGACGCTTTTCGGCAGTAAGATCTCTGACTATATGATCATT
GTCTTTACCGGTGGGGATGATTTGGAAGACAACGATGAGACCTTGGAGGACTACTTGGGT
CAGGAGTGCCCTGAGTTTCTGAAAGAGATTCTTGAGCTATGTGACAATAGAATGGTACTG
TTTGATAACAAGACTAGCAATAAGCGCAAGAAAGCTGAGTAAGTTCAGAAGCTTCTCTCA
CTTGTTGATTCGGTTGCTAGAAAGAACAATGGAAAACCGTTTACAGATGAGTTGTTCCAT
GAACT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4AG27JQ 869 0 0
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ACTATATGATCATTGTCTTTACCGGTGGGGATGATTTGGAAGACAACGATGAGACCTTGG
AGGACTACTTGGGTCAGGAGTGCCCTGAGTTTCTGAAAGAGATTCTTGAGCTATGTGACA
ATAGAATGGTACTGTTTGATAACAAGACTAGCAATAAGCGCAAGAAAGCTGAGTAAGTTC
AGAAGCTTCTCTCACTTGTTGATTCGGTTGCTAGAAAGAACAATGGAAAACCGTTTACAG
ATGAGTTGTTCCATGAACTACAGGAGGAGGCTATCAAGCTACGTGACCAGAAAAAGGAGG
TTGAATCGCTCAAGGGTTATTCAAAGAGTGAGATATCTGAGTTCAAGAAGCAGATAGAGA
TATCCTATTACAGACAGCTTAGCCGTATCACAGAGATGGTTGAGACAAAGCTGAAAGAAA
CGGCAAAGAGGCTAGAGAAGCAGCTAGGTGAAGAGCAAGCAGCAAGACTTGAAGCCGAAG
AGAGGGCAAACGAAGTTCAGAAACGGTCAAGTGATGAGATTAAGAAGCTGAGAGAGAATC
TGGAGAGGGCGGAGAAAGAGACAAAGGAGCTCCAGAAGAAACTGGGAAAGTGCATCAATC
TTTGATTGAGATATCAAATCCAAGCTTCTTTCAAGTCTCTGATAAGGGCTTTCATTTATT
CAAAATATATTGTGGTTTTATTATCATCAAAAGACAAAAAGGTGTTTTATAAGTCTAAAT
AATGACGGATGCACGTGAATATTATTTTTTCTCTCTTCTGAATTTGATGCTGGACGATTT
TGTGTGTTTAGTTGATTGCTGCTTGGTCG

QA 1 869 1 869
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2871Contig1 1119 4 8 U
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CTGGAACTGAAGCCAACGAAGCAGCCATAAAGTTTTCTAGAAAGTTCCAGAGATTCACCC
ATCCTGATAACAAGGAAGTCGCCACAGGCTTCATCGCCTTTACGAATAGTTTCCATGGTA
GAACCTTAGGAGCTCTTGCCTTGACAAGCAAAGAACAGTACAGGACTCCTTTCGAGCCAA
CCATGCCTGGCGTCACATTCTTGGAGTACGGTAACATTCAAGCCGCCACTGACCTTATCC
GCTCTGGTAAAATAGCTGCGGTGTTTGTGGAGCCTATCCAAGGAGAAGGCGGAGTTTACT
CTGCTACAAAAGAGTTTCTCCAGTCTCTTCGCTCTGCTTGTGATGCTGCTGGATCTCTTC
TCGTCTTCGATGAGGTTCAGTGTGGTTTGGGTCGGACTGGTAACTTATGGGCATATGAAG
CATTCGGTGTAACACCTGATATAATGACGGTTGCAAAGCCTTTAGCCGGTGGGTTACCAA
TTGGAGCGGTGCTTGTGACTGAAAAGGTTGCTGAGACCATCAAATATGGAGATCATGGTA
GCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCAGCCATCGCTGTTGTTGATAAAGTAT
CCAAACCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCTCGAGCAAAGGTCTATACTTCAGGGAACTGTTGG
TGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAGGAGAAGGGCTTATCATAG
GAGTGGAGCTTGATGTGCCAGCGAGTCCACTGGTGGATGCTTGCCGTGATTCAGGTCTTC
TGATCCTGACGGCAGGGAAAGGAAACGTCGTCAGGATTGTTCCACCGTTGATTATATCGG
AAGAGGAGATCGGACGTGCTGTTGAGATTATGTTCCATAGTTTAACTGCTCTTGGTTGAA
GCCTTAAAGGTTGAGCTAGAGCAGAACAGCAAATTGTTTATCGACTTTGATGTGTCTTTT
TAAAAATCTTTACTTGCGTCTTTGATTTAAGCTCAAGTGTACTATTGCCTGTTTGTAAAA
CTTTCAATGTGATCAAATACGCCCCGCTAGTAACATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4D390TF U 1
AF RR4CZ14TF U 162
AF RR4CZ14JQ C 338
AF RR4D390JQ C 338
BS 1 634 RR4D390TF
BS 635 635 RR4CZ14TF
BS 636 691 RR4D390TF
BS 692 776 RR4CZ14TF
BS 777 907 RR4CZ14JQ
BS 908 908 RR4D390JQ
BS 909 1114 RR4CZ14JQ
BS 1115 1119 RR4D390JQ

RD RR4D390TF 691 0 0
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CTGGAACTGAAGCCAACGAAGCAGCCATAAAGTTTTCTAGAAAGTTCCAGAGATTCACCC
ATCCTGATAACAAGGAAGTCGCCACAGGCTTCATCGCCTTTACGAATAGTTTCCATGGTA
GAACCTTAGGAGCTCTTGCCTTGACAAGCAAAGAACAGTACAGGACTCCTTTCGAGCCAA
CCATGCCTGGCGTCACATTCTTGGAGTACGGTAACATTCAAGCCGCCACTGACCTTATCC
GCTCTGGTAAAATAGCTGCGGTGTTTGTGGAGCCTATCCAAGGAGAAGGCGGAGTTTACT
CTGCTACAAAAGAGTTTCTCCAGTCTCTTCGCTCTGCTTGTGATGCTGCTGGATCTCTTC
TCGTCTTCGATGAGGTTCAGTGTGGTTTGGGTCGGACTGGTAACTTATGGGCATATGAAG
CATTCGGTGTAACACCTGATATAATGACGGTTGCAAAGCCTTTAGCCGGTGGGTTACCAA
TTGGAGCGGTGCTTGTGACTGAAAAGGTTGCTGAGACCATCAAATATGGAGATCATGGTA
GCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCGGCCATCGCTGTTGTTGATAAAGTAT
CCAAACCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCTCGAG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4CZ14TF 615 0 0
G
CGAATAGTTTCCATGGTAGAACCTTAGGAGCTCTTGCCTTGACAAGCAAAGAACAGTACA
GGACTCCTTTCGAGCCAATCATGCCTGGCGTCACATTCTTGGAGTACGGTAACATTCAAG
CCGCCACTGATCTTATCCGCTCTGGTAAAATAGCTGCGGTGTTTGTGGAGCCTATCCAAG
GAGAGGGCGGAGTTTACTCTGCTACAAAAGAGTTTCTCCAGTCTCTTCGCTCTGCTTGTG
ATGCTGCTGGATCTCTTCTCGTCTTCGATGAGGTTCAGTGTGGTTTGGGTCGGACTGGTA
ACTTATGGGCATATGAAGCATTCGGTGTAACACCTGATATAATGACGGTTGCAAAGCCTT
TAGCCGGTGGGTTACCAATTGGAGCGGTGCTTGTGACTGAAAAGGTTGCTGAGACCATCA
AATATGGAGATCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCAGCCATCG
CTGTTGTTGATAAAGTATCCAAACCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCTCGAGCAAAGGTCTAT
ACTTCAGGGAACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAG
GAGAAGGGCTTATC

QA 2 615 2 615
DS 

RD RR4CZ14JQ 778 0 0
TCCAA
GAGAGGGCGGAGTTTACTCTGCTACAAAAGAGTTTCTCCAGTCTCTTCGCTCTGCTTGTG
ATGCTGCTGGATCTCTTCTCGTCTTCGATGAGGTTCAGTGTGGTTTGGGTCGGACTGGTA
ACTTATGGGCATATGAAGCATTCGGTGTAACACCTGATATAATGACGGTTGCAAAGCCTT
TAGCCGGTGGGTTACCAATTGGAGCGGTGCTTGTGACTGAAAAGGTTGCTGAGACCATCA
AATATGGAGATCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCAGCCATCG
CTGTTGTTGATAAAGTATCCAAACCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCTCGAGCAAAGGTCTAT
ACTTCAGGGAACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAG
GAGAAGGGCTTATCATAGGAGTGGAGCTTGATGTGCCAGCGAGTCCACTGGTGGATGCTT
GCCGTGATTCAGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGAAACGTCGTCAGGATTGTTC
CACCGTTGATTATATCGGAAGAGGATATCGGACGTGCTGTTGAGATTATGTTCCATAGTT
TAACTGCTCTTGGTTGAAGCCTTAAAGGTTGAGCTAGAGCAGAACAGCAAATTGTTTATC
GACTTTGATGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGCGTCTTTGATTTAAGCTCAAGTGTAC
TATTGCCTGTTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATACGCCCCGCTAGTAAC
G

QA 6 777 6 777
DS 

RD RR4D390JQ 782 0 0
CCAAG
GAGAAGGCGGAGTTTACTCTGCTACAAAAGAGTTTCTCCAGTCTCTTCGCTCTGCTTGTG
ATGCTGCTGGATCTCTTCTCGTCTTCGATGAGGTTCAGTGTGGTTTGGGTCGGACTGGTA
ACTTATGGGCATATGAAGCATTCGGTGTAACACCTGATATAATGACGGTTGCAAAGCCTT
TAGCCGGTGGGTTACCAATTGGAGCGGTGCTTGTGACTGAAAAGGTTGCTGAGACCATCA
AATATGGAGATCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCGGCCATCG
CTGTTGTTGATAAAGTATCCAAACCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCTCGAGCAAAGGTCTAT
ACTTCAAGGAACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAG
GAGAAGGGCTTATCATAGGAGTGGAGCTTGATGTGCCAGCGAGTCCACTGGTGGATGCTT
GCCGTGATTCAGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGAAACGTCGTCAGGATTGTTC
CACCGTTGATTATATCGGAAGAGGAGATCGGACGTGCTGTTGAGATTATGTTCCATAGTT
TAACTGCTCTTGGTTGAAGCCTTAAAGGTTGAGCTAGAGCAGAACAGCAAATTGTTTATC
GACTTTGATGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGCGTCTTTGATTTAAGCTCAAGTGTAC
TATTGCCTGTTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATACGCCCCGCTAGTAACATACC

QA 6 782 6 782
DS 



AS 1 4

CO CL2872Contig1 1215 4 6 U
GACAGGTGAACAAGTAGAGTATACTAGGGCGCTTGAGAGAACCATGTCGAAGGAACTCGG
CAAAATGACCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCTCTCCTATCTTTTGATTAGGAAAGCG
GCACATACCAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAAAACACAGGACTCTGCTAAGTGGTAACA
CGATGTATAGAGTCTGACACCTGCCCGGTGCTGGAAAGTCAAAAGGAGAAGTGTTATAAG
CTTTGAATGGAAGCCCCGATAAACGGCGGCAGTAACTCTAACTGTCCTAAGGTAGCGAAA
TTCCTTGTCGCATAAGTAGCGACCTGCACGAATGGTGTAACGACTGCCCCGCTGTCTCCG
ACATGGACCCAGTGAAATTGAATTCTCCGTGAAGATGCGGAGTACCAACGGCTAGACGGT
AAGACCCCGTGCACCTTCACTATAGCTTCGCAGTGACAACCTTGATCGAATGTGTAGGAT
AGGTGGGAGGTCCTCACATAGAAAGACCAATCCTGAAAGACCACTCTTTCGTCTAAGGGT
GCCTAACCGCCGCACCGAGAATTCGGGGGGAGGCGGGACACTGCGAGGTGGGTAGTTTAT
CTGGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGAT
TCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAACAGA
GACGAAAGTCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTGTGGAAGGGCTCTCGCTCAACGGAT
CAAAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTTATCGACGGAGTCGT
TTGGCACCTCGATGTCGACTCATCACATCCTGGGGTTGAAGGAGGTCCCAAGGGTTCGGT
TGTTCGCCGATTCAAGTGGTACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTTC
CTATCTACCGTTGGTGTTAAAGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACT
GGGTTGGGCCAACCTATGGTGTACCGGTTGTTATGACAATAGCAGCGCCGGGAAGCTAAG
TTGGTACGGAAGAACTGCTGCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGAACAG
GTTTTAGAACAGAACTTCGATAGGCGAGAGGCGGAAGCACCGCGAGGTGTGGAGCCATCT
CGTACTAAACGAAAA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4AQ47TF U 1
AF RR4CC42JQ C 796
AF RR4AQ47JQ C 417
AF RR4CC42TF U 796
BS 1 730 RR4AQ47TF
BS 731 795 RR4AQ47JQ
BS 796 1086 RR4CC42TF
BS 1087 1087 RR4AQ47JQ
BS 1088 1211 RR4CC42TF
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RD RR4AQ47TF 730 0 0
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CAAAATGACCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCTCTCCTATCTTTTGATTAGGAAAGCG
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CTTTGAATGGAAGCCCCGATAAACGGCGGCAGTAACTCTAACTGTCCTAAGGTAGCGAAA
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ACATGGACCCAGTGAAATTGAATTCTCCGTGAAGATGCGGAGTACCAACGGCTAGACGGT
AAGACCCCGTGCACCTTCACTATAGCTTCGCAGTGACAACCTTGATCGAATGTGTAGGAT
AGGTGGGAGGTCCTCACATAGAAAGACCAATCCTGAAAGACCACTCTTTCGTCTAAGGGT
GCCTAACCGCCGCACCGAGAATTCGGGGGGAGGCGGGACACTGCGAGGTGGGTAGTTTAT
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TCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAACAGA
GACGAAAGTC

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DS 

RD RR4CC42JQ 275 0 0
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ATGGTGTACCGGTTGTTATGACAATAGCAGCGCCG

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DS 

RD RR4AQ47JQ 799 0 0
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GGATAGGTGGGAGGTCCTCACATAGAAAGACCAATCCTGAAAGACCACTCTTTCGTCTAA
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TTATCTGGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAA
AGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAA
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GGATCAAAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTTATCGACGGAG
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CGGTTGTTCGCCGATTCAAGTGGTACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTCG
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TAAGTTGGTACGGAAGAACTGCTGCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGA
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ATCTCGTACTAAACGAAAA

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DS 

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CGACTCATCACATCCTGGGGTTGAAGGAGGTCCCAAGGGTTCGGTTGTTCGCCGATTCAA
GTGGTACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTTCCTATCTACCGTTGGT
GTTAAAGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGGGTTGGGCCAACCT
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TGCTGCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGAACAGGTTTTAGAACAGAAC
TTCGATAGGCGAGAGGCGGAAGCACCGCGAGGTGTGGAGCCATCTCGTACTAAACG

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DS 



AS 1 4

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TTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCG
CAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTA
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BQ
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AF RR4G126JQ C 283
AF RR4BZ47JQ C 1
AF RR4G126TF U 1
AF RR4BZ47TF U 1
BS 1 407 RR4G126TF
BS 408 408 RR4BZ47TF
BS 409 619 RR4G126TF
BS 620 624 RR4BZ47JQ

RD RR4G126JQ 282 0 0
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ATTAATAAGGTCTTTAAGAAAATGGTTGCATGGTTTGTTTTC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4BZ47JQ 624 0 0
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TTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCG
CAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTA
TGACTTCGGACGAGATGTTTGGTGCGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTTTTTATTC
AACTCACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTCTTTAAG
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TGTCCGAGATAAGTTATTTATTCT

QA 1 624 1 624
DS 

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CTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATCTACTA
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TTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCG
CAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACGTATGTGTGTTTA
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DS 

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ATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGATCAATATG
CTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATCTACTA
TGGAATCTCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTTTACAAAGATCAATT
TTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCG
CAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTA
TGACTTCGGACGAGATGTTTGGTGCGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTTTTTATTC
AACTCACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTCTTTAAG
AAAATGGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATTAAAGGAA
TGTCCGAGATAAGTTATTT
ATTCT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 4

CO CL2874Contig1 818 4 6 U
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GAACTCAGAGTAAGTAAGAATGGTACAGACGAAGAAGTTCAGAGGTGTCAGGCAACGCCA
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GACGTTTGAGACGGCAGAGGAGGCAGCAAGAGCCTACGACGAGGCGGCTGTTTTAATGAG
CGGCCGCAACGCCAAGACTAACTTCCCCCTCAACAACAACAACAACACAGGAGACACATC
GGAGGGCAAAACAGATATTTCATCCTCCTCTTCATCACTTTCTTCTATCCTCAGCGCCAA
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CCAGCTCCCACATCGGCGTCTGGCAGAA*GCGAGCCGGTTCCAAGTCCGACTCCAGTTGG
GTCATGACGGTGGAGCTAGGTCCCGCTGGCTCCTCCCAAGAGCCTACTAAAAATGCTTCG
CAAGACGATGTTGGTCCGGCCACTGAATTTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCA
ATGGACGAAGAAGAGAAAGCTGCTTTGCAAATGATAGAGGAACTTCTCAATACAAACTAA
ATATTATTTGCCTATATATACCTATTTTTATTGCTGATTTACCGCCATAATTATTAATTA
TACCCATATATATGCCATGTATCGTGTTTATATTTATATGTGATAGTTATAAGTTGTTTT
ATATTTCGTTTTATGTCCAATAAAGTATTAGTATTTGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CL38TF U 124
AF RR4BS92TF U 1
AF RR4CL38JQ C 2
AF RR4BS92JQ C 27
BS 1 630 RR4BS92TF
BS 631 631 RR4CL38JQ
BS 632 748 RR4BS92TF
BS 749 749 RR4CL38JQ
BS 750 774 RR4BS92TF
BS 775 818 RR4CL38JQ

RD RR4CL38TF 484 0 0
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GTTTGAGACGGCAGAGGAGGCAGCAAGAGCCTACGACGAGGCGGCTGTTTTAATGAGCGG
CCGCAACGCCAAGACTAACTTCCCCCTCAACAACAACAACAACACAGGAGACACATCGGA
GGGCAAAACAGATATTTCATCCTCCTCTTCATCACTTTCTTCTATCCTCAGCGCCAAACT
GAGGAAATGCTGCAAGTCTCCTTCGCCTTTCCCTCACCTGCCTCCGTCTTGACACAGCCA
GCTCCCACATCGGCGTCTGGCAGAAAGCGAGCCGGTTCCAAGTCCGACTCCAGTTGGGTC
ATGACGGTGGAGCTAGGTCCCGCTGGCTCCTCCCAAGAGCCTACTAAAAATGCTTCGCAA
GACGATGTTGGTCCGGCCACTGAATTTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCAATG
GACG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4BS92TF 778 0 0
GGATCCATCTTACATATATATTACTCGTCATCAGGAATTCATGTTTTCTCTCTGACAAGA
GAACTCAGAGTAAGTAAGAATGGTACAGACGAAGAAGTTCAGAGGTGTCAGGCAACGCCA
TTGGGGTTCTTGGGTCGCTGAGATTCGCCATCCTCTCTTGAAACGGAGAATTTGGCTTGG
GACGTTTGAGACGGCAGAGGAGGCAGCAAGAGCCTACGACGAGGCGGCTGTTTTAATGAG
CGGCCGCAACGCCAAGACTAACTTCCCCCTCAACAACAACAACAACACAGGAGACACATC
GGAGGGCAAAACAGATATTTCATCCTCCTCTTCATCACTTTCTTCTATCCTCAGCGCCAA
ACTGAGGAAATGCTGCAAGTCTCCTTCGCCTT*CCCTCACCTGCCTCCGTCTTGACACAG
CCAGCTCCCACATCGGCGTCTGGCAGAA*GCGAGCCGGTTCCAAGTCCGACTCCAGTTGG
GTCATGACGGTGGAGCTAGGTCCCGCTGGCTCCTCCCAAGAGCCTACTAAAAATGCTTCG
CAAGACGATGTTGGTCCGGCCACTGAATTTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCA
ATGGACGAAGAAGAGAAAGCTGCTTTGCAA*TGATAGAGGAACTTCTCAATACAAACTAA
ATATTATTTGCCTATATATACCTATTTTTATTGCTGATTTACCGCCATAATTATTAATTA
TACCCATATATATGCCATGTATCGTGTT*ATATTTATATGTGATAGTTATAAGT
GTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4CL38JQ 817 0 0
GATCCATCTTACATATATATTACTCGTCATCAGGAATTCATGTTTTCTCTCTGACAAGAG
AACTCAGAGTAAGTAAGAATGGTACAGACGAAGAAGTTCAGAGGTGTCAGGCAACGCCAT
TGGGGTTCTTGGGTCGCTGAGATTCGCCATCCTCTCTTGAAACGGAGAATTTGGCTTGGG
ACGTTTGAGACGGCAGAGGAGGCAGCAAGAGCCTACGACGAGGCGGCTGTTTTAATGAGC
GGCCGCAACGCCAAGACTAACTTCCCCCTCAACAACAACAACAACACAGGAGACACATCG
GAGGGCAAAACAGATATTTCATCCTCCTCTTCATCACTTTCTTCTATCCTCAGCGCCAAA
CTGAGGAAATGCTGCAAGTCTCCTTCGCCTT*CCCTCACCTGCCTCCGTCTTGACACAGC
CAGCTCCCACATCGGCGTCTGGCAGAA*GCGAGCCGGTTCCAAGTCCGACTCCAGTTGGG
TCATGACGGTGGAGCTAGGTCCCGCTGGCTCCTCCCAAGAGCCTACTAAAAATGCTTCGC
AAGACGATGTTGGTCCGGCCACTGAATTTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCAA
TGGACGAAGAAGAGAAAGCTGCTTTGCAAATGATAGAGGAACTTCTCAATACAAACTAAA
TATTATTTGCCTATATATACCTATTTTTATTGCTGATTTACCGCCATAATTATTAATTAT
ACCCATATATATGCCATGTATCGTGTTTATATTTATATGTGATAGTTATAAGTTGTTTTA
TATTTCGTTTTATGTCCAATAAAGTATTAGTATTTGT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4BS92JQ 792 0 0
GTCATCAGGAATTCATGTTTTCTCTCTGACAAGAGAACTCAGAGTAAGTAAGAATGGTAC
AGACGAAGAAGTTCAGAGGTGTCAGGCAACGCCATTGGGGTTCTTGGGTCGCTGAGATTC
GCCATCCTCTCTTGAAACGGAGAATTTGGCTTGGGACGTTTGAGACGGCAGAGGAGGCAG
CAAGAGCCTACGACGAGGCGGCTGTTTTAATGAGCGGCCGCAACGCCAAGACTAACTTCC
CCCTCAACAACAACAACAACACAGGAGACACATCGGAGGGCAAAACAGATATTTCATCCT
CCTCTTCATCACTTTCTTCTATCCTCAGCGCCAAACTGAGGAAATGCTGCAAGTCTCCTT
CGCCTT*CCCTCACCTGCCTCCGTCTTGACACAGCCAGCTCCCACATCGGCGTCTGGCAG
AA*GCGAGCCGGTTCCAAGTCCGACTCCAGTTGGGTCATGACGGTGGAGCTAGGTCCCGC
TGGCTCCTCCCAAGAGCCTACTAAAAATGCTTCGCAAGACGATGTTGGTCCGGCCACTGA
ATTTGGCGGCGGCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCAATGGACGAAGAAGAGAAAGCTGCTTT
GCAAATGATAGAGGAACTTCTCAATACAAACTAAATATTATTTGCCTATATATACCTATT
TTTATTGCTGATTTACCGCCATAATTATTAATTATACCCATATATATGCCATGTATCGTG
TTTATATTTATATGTGATAGTTATAAGTTGTTTTATATTTCGTTTTATGTCCAATAAAGT
ATTAGTATTTGT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL2875Contig1 1012 2 2 U
GGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGATGTCGGGGAGAAGGGAGATCAGAGATTCA
GAGCCTAAAAGAGATCGTTGTAGATACGATCGCGAATACAGCCCTAAGAGGTCTAGGAGA
GATAGACAACCCGAAGCTGATGGAGTTCTTCTGAGTAAGAAGGATCTGGATGGTTCTGAG
ACAGATAAGAAATCACGCCAGTCCCTGAGAGATGCTGCTCTCCTGGAACCTGATTCTCGG
GGTTTGACAAGAGACGATGAAAAGAAGCACTCCGAGACGACAAAACAAGCTCCCCATCCT
TCACAAGGGCTTCGCTCTAGACCATACCATCAGCAGCATGATGATCGTCGTACTACTGGG
AGAGGAGACAGAAGGCCAACTCCTGACAGAGGATCTTGGAGAGGTTCGAGAGATCAGAGC
AATCGTCGAGCTGGAGATGATCGTAGAGACCAAGACAAAAGCACCTGGCGACACGACAGG
TTCCGTGAGGGTGACGACGACACCAAAGGAGCGCTCTCTCGGAAACGGCCTGCCTTCAGG
GAGAAGAAGATTCCAGAGGAATCGAGGAACGACACAGACAGAACAAGAACTGAGGAGGCA
AAAGACACGAATCTAAACACTCGCAGACAGAACGAGAGAAACTGGAAGAGTAACAATGAG
AGACCTGCAACGGGAAGAGACAGGGTGTGGAACAGAGACGATGGAAGCAGACAGAGTTAT
CGAGCTGATAGAGAGGGATTCAACAGAAACGGACGAAGTGGGTTTCATGGAAGCTGGACA
AAGGCCGAGAAGAAATGGGACCATGACTTGTACGAGGAGGCGAACAAGAGTCCTGCTAGA
GCCAACGAGGAAGAACAGATTGCAAAGGTCGAAGCTTTGTTGGCTTCTTAAAGCTATTGC
TTATTGTTATGTTTCTTGGTGTGGATTTTGCATCTAATCTCTTTAATGTCTTAGTTTTGC
AAGTGTAGAAGATAATTTATGAGTTTATATAATGAAAAACTCTGTTCTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR92TF U 1
AF RR4EV58JQ C 257
BS 1 648 RR4FR92TF
BS 649 1012 RR4EV58JQ

RD RR4FR92TF 652 0 0
GGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGATGTCGGGGAGAAGGGAGATCAGAGATTCA
GAGCCTAAAAGAGATCGTTGTAGATACGATCGCGAATACAGCCCTAAGAGGTCTAGGAGA
GATAGACAACCCGAAGCTGATGGAGTTCTTCTGAGTAAGAAGGATCTGGATGGTTCTGAG
ACAGATAAGAAATCACGCCAGTCCCTGAGAGATGCTGCTCTCCTGGAACCTGATTCTCGG
GGTTTGACAAGAGACGATGAAAAGAAGCACTCCGAGACGACAAAACAAGCTCCCCATCCT
TCACAAGGGCTTCGCTCTAGACCATACCATCAGCAGCATGATGATCGTCGTACTACTGGG
AGAGGAGACAGAAGGCCAACTCCTGACAGAGGATCTTGGAGAGGTTCGAGAGATCAGAGC
AATCGTCGAGCTGGAGATGATCGTAGAGACCAAGACAAAAGCACCTGGCGACACGACAGG
TTCCGTGAGGGTGACGACGACACCAAAGGAGCGCTCTCTCGGAAACGGCCTGCCTTCAGG
GAGAAGAAGATTCCAGAGGAATCGAGGAACGACACAGACAGAACAAGAACTGAGGAGGCA
AAAGACACGAATCTAAACACTCGCAGACAGAACGAGAGAAACTGGAAG
CTGG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EV58JQ 756 0 0
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CTAGACCATACCATCAGCAGCATGATGATCGTCGTACTACTGGGAGAGGAGACAGAAGGC
CAACTCCTGACAGAGGATCTTGGAGAGGTTCTAGAGATCAGAGCAATCGTCGAGCTGGAG
ATGATCGTAGAGACCAAGACAAAAGCACCTGGCGACACGACAGGTTCCGTGAGGGTGACG
ACGACACCAAAGGAGCGCTCTCTCGGAAACGGCCTGCCTTCAGGGAGAAGAAGATTCCAG
AGGAATCGAGGAACGACACAGACAGAACAAGAACTGAGGAGGCAAAAGACACGAATCTAA
ACACTCGCAGACAGAACGAGAGAAACTGGAAGAGTAACAATGAGAGACCTGCAACGGGAA
GAGACAGGGTGTGGAACAGAGACGATGGAAGCAGACAGAGTTATCGAGCTGATAGAGAGG
GATTCAACAGAAACGGACGAAGTGGGTTTCATGGAAGCTGGACAAAGGCCGAGAAGAAAT
GGGACCATGACTTGTACGAGGAGGCGAACAAGAGTCCTGCTAGAGCCAACGAGGAAGAAC
AGATTGCAAAGGTCGAAGCTTTGTTGGCTTCTTAAAGCTATTGCTTATTGTTATGTTTCT
TGGTGTGGATTTTGCATCTAATCTCTTTAATGTCTTAGTTTTGCAAGTGTAGAAGATAAT
TTATGAGTTTATATAATGAAAAACTCTGTTCTATTT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL2876Contig1 1384 4 14 U
GGGCCTTTGCACTGGGTAGATTGGCGCAGGATTCTCACAATCAAGCTGGTATTGCTCATA
GTGGTGGTTTAGGACCTTTATTGAAGCTTCTCGACTCAAGAAATGGATCTCTGCAACATA
ATGCGGCATTTGCTCTCTATGGCCTTGCCGATAATGAGGATAATGTGTCGGATTTTATCA
GGGTGGGAGGTATCCAGAAGCTACAGGATGGAGAGTTTATAGTTCAGGCAACTAAAGATT
GCGTCTCCAAGACAGTGAAGAGATTGGAGGAGAAGATTCATGGAAGAGTTCTGAGACATC
TGTTGTACCTAATGCGCATTTCTGAGAAGTCTATCCAAAGACGAGTTACTCTCGCTCTTG
CTCATCTATGTTCACCAGAAGATCAGAGAACCATATTCATCGATGAAAATGGGTTGGAGT
TGCTACTTGGTCTTCTTGGTTCTACGAACACTAAACAGCAACTTGATGGTGCTGCAGCAT
TGTACAAATTAGCCAATAAATCTATGGCACTTTCTCCAGTTGATGCTGCTCCCCCTTCTC
CAACACAAAGAGTTTATCTCGGAGAGCAGTATGTAAATAGTGCCACGCTGTCTGATGTGA
CTTTTCTAGTCGAAGGAAGGAGATTCTATGCACACAGAATTTGTCTCCTGGCATCTTCAG
ATGCATTTCGCGCAATGTTTGATGGTGGTTACAGAGAAAAGGACGCTAGAGATATTGAGA
TTCCTAATATCAAATGGGAGGTTTTTGAGTTAATGATGAGGTTTATATACACTGGATCCG
TCGACATAACAATTGAGATATCACAAGATCTTCTAAGAGCAGCGGATCAGTATCTCTTGG
AGGGGCTAAAGCGGCTCTGTGAATACACAATTGCTCAGGATATAACATTGGAAAACATAG
GAGGCATGTACGATCTCTCGGAAGCATTTCACGCGATGTCACTGAGACAAGCTTGTATCC
TGTTCATCCTGGAGCATTTCGATAAACTGAGCTCAATGCATGGGCAGAACCAGCTGGTGC
AGAGAACAATACCAGAGATAAGAGAGTACTTTTGTAGAGCTCTAACAAAGTCTACGACAA
ACCTGCAAGGCCTGAGGCTGTAGAATGTGGAAGAAGAAGACTGGTACCTAACTAGAGAGG
TAAAGTAGACAAGGAATATATAGAGAGAGAAAGCTCGATATTAGTAAGAGGTCTTTATGG
TCTTGTCCTATCCTGAGTCTGTTTTAGTAAATTTGCTGTGCGTTTGGTTCATTGTATTTT
ATATCAAATTCTCTTTTGATCACGATCCCGTCGCCACTTTGTATCCAAAACACCAATATG
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GTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

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AF RR4F103JQ C 812
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BS 1025 1192 RR4GK39JQ
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BS 1264 1281 RR4GK39JQ
BS 1282 1384 RR4F103JQ

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GA

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G
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TGCACACAGAATTTGTCTCCTGGCATCTTCAGATGCATTTCGCGCAATGTTTGATGGTGG
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QA 2 757 2 757
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ATTGAGATTCCTAATATCAAATGGGAGGTTTTTGAGTTAATGATGAGGTTTATATACACT
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CTCTTGGAGGGGCTAAAGCGGCTCTGTGAATACACAATTGCTCAGGATATAACATTGGAA
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ACGACAAACCTGCAAGGCCTGAGGCTGTAGAATGTGGAAGAAGAAGACTGGTACCTAACT
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TTTATGGTCTTGTCCTATCCTGAGTCTGTTTTAGTAAATTTGCTGTGCGTTTGGTTCATT
GTATTTTATGTCAAATTCTCTTTTGATC

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DS 

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TGCTCAGGATATAACATTGGAAAACATAGGAGGCATGTACGATCTCTCGGAAGCATTTCA
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DS 



AS 1 4

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TCGCAGGGCTTTGGTACGTGTCCTAGGGACCCATTGCAACTTGGTGTATGCGCCAATGTC
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AATACTTGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTTACTTTTGTC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BQ38JQ C 1
AF RR4BQ38TF U 1
AF RR4DW74TF U 5
AF RR4FH63TF U 5
BS 1 6 RR4BQ38JQ
BS 7 591 RR4BQ38TF
BS 592 627 RR4DW74TF
BS 628 713 RR4FH63TF

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TCGCAGGGCTTTGGTACGTGTCCTAGGGACCCATTGCAACTTGGTGTATGCGCCAATGTC
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AATACTTGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTT

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DS 

RD RR4BQ38TF 591 0 0
GGATCC
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GGCTTTGGTACGTGTCCTAGGGACCCATTGCAACTTGGTGTATGCGCCAATGTCCTTGGC
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GGCTTTCAGTGTCCACCACCACCAGTATCTAGCCCTTAATCTCACCTGATTAAGAACAAG
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GTTGTTAAACAGGGCGTAATAGTGACTATATATGTTGTTATGTGTACGAAGAATAATACT
TGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTT

QA 7 591 7 591
DS 

RD RR4DW74TF 623 0 0
GG
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GGCTTTCAGTGTCCACCACCACCAGTATCTAGCCCTTAATCTCACCTGATTAAGAACAAG
AACCCTATCCAGTAACTACTTACAACGCAAGTATGCTTATACAGTGTTGATGTGTGTTTC
GTTGTTAAACAGGGCGTAATAGTGACTATATATGTTGTTATGTGTACGAAGAATAATACT
TGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTTACTTTTGTCTTGTTC
CCCATATCATATGTTCAAAAA

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR4FH63TF 709 0 0
GG
ACACTTAAAATCAACAAAATACAAAAAATGGTCTCAAAGAGCTCAAACACCATTAGCCTC
ATCATCATCTTCCTCATCTTCAGCCTCGCTGAGGCTGACCTCTTGCTCTCGCCTTCGCAG
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TTCGGTATCGATAAGGCCGTTAGAACAATATTTTTCGCTTGTAATATGGTTTTTCCTATT
GGCTTTCAGTGTCCACCACCGCCAGTATCTAGCCCTTAATCTCACCTGATTAAGAACAAG
AACCCTATCCAGTAACTACTTACAACGCAAGTATGCTTATACAGTGTTGATGTGTGTTTC
GTTGTTAAACAGGGCGTAATAGTGACTATATATGTTGTTATGTGTACGAAGAATAATACT
TGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTTACTTTTGTCTTGTTC
CCCATATCATATGTTCAAAAAGAGCAGATTGCGGATTTAGTATGTGAGAATATAATTTCC
CAAAAATTGGATAGAACCTAAATGATATATAAAAGATATGTATTAGT

QA 3 709 3 709
DS 



AS 1 4

CO CL2878Contig1 1070 4 4 U
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GAATATTCAACAGCCCCTTAAGACGTCCAAGAGATCAAAGAATGGTAATTCTAATTCAGT
TTCAGAAGAAGATAGGTATATTCAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATATAAGCCCTAA
AGAAAAGGTACTATGACTTGGATTAACTGGTGAGGCAAAACAGACTTTGGAATTCTGAAA
AAAAACATCCGTGGAACGATGCACCTGCTAAGGTGAAAACAAAAAAGGGCTTTGCCATTT
AAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAATCAGTCTCCGAGATGTTCACCAATCC
AAGAAACCTGATGTACTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGACACAAGAGCAACAAAGGTT
TTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAAGTTTTGAGATGGAAGATA
CTTGGGTATAATGGGACTATCCCAATACATTTAATCATCGATGAAAA*CCATCAAAAAGT
TACCGTAAGAAAGTTTCTCTGTATTCCTCACAAGAACCAGTTGTTTCCGTTTATTTCTGG
TTGCACTAATTTGTTTTATTGCTTAAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCATATGA
AAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATACAGCCACTGTATGTAGATTAGGAACGGTTGTGCA
AGTCTAGGTCGCGGATTAGTGAAGAAGAGTACAAAAAATGTAGTGGCGGTAAAGGAAGAA
TTGGCTCAAAGGTGACAATGGAGCATATATTTGAGCCATCTTCTCTTCTTAATGTGCCAC
CGGCTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATC
TTAGAGAATATGTAATCACGTTTAATAAAACAGAGACCGTAGACCCGCTGGTGTATGCTA
AAATAAAAGAATCAATCCAAAAAGAAAAAGAAACTGAACTAAAAGAATTGGAGGATTAAA
TGTTTGGACTATATTCAATGAGGATCAATATTTAAATAAGATTACCAATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A296TF U 1
AF RR4A296TFB U 1
AF RR4A296JQD C 324
AF RR4A296JQ C 332
BS 1 527 RR4A296TF
BS 528 528 RR4A296TFB
BS 529 701 RR4A296TF
BS 702 1070 RR4A296JQD

RD RR4A296TF 701 0 0
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CTTGGGTATAATGGGACTATCCCAATACATTTAATCATCGATGAAAAACCATCAAAAAGT
TACCGTAAGAAAGTTTCTCTGTATTCCTCACAAGAACCAGTTGTTTCCGTTTATTTCTGG
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AAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATACAGCCACTGTATGTA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4A296TFB 668 0 0
GTGGACTAACTTTCGAATCGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTGGCTGGATCAATCA
GAATATTCAACAGCCCCTTAAGACGTCCAAGAGATCAAAGAATGGTAATTCTAATTCAGT
TTCAGAAGAAGATAGGTATATTCAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATATAAGCCCTAA
AGAAAAGGTACTATGACTTGGATTAACTGGTGAGGCAAAACAGACTTTGGAATTCTGAAA
AAAAACATCCGTGGAACGATGCACCTGCTAAGGTGAAAACAAAAAAGGGCTTTGCCATTT
AAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAATCAGTCTCCGAGATGTTCACCAATCC
AAGAAACCTGATGTACTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGACACAAGAGCAACAAAGGTT
TTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAAGTTTTGAGATGGAAGATA
CTTGGGTATAATGGGACTATCCCAATACATTTAATCATCGATGAAAA*CCATCAAAAAGT
TACCGTAAGAAAGTTTCTCTGTATTCCTCACAAGAACCAGTTGTTTCCGTTTATTTCTGG
TTGCACTAATTTGTTTTATTGCTTAAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCATATGA
AAGTGTTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4A296JQD 747 0 0
CTCCTCCTCAATCAGTCTCCGAGATGTTCACCAATCCAAGAAACCTGATGTACTTCCATT
CAATGGGCAAGTACAAGACACAAGAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCA
GATCACGGAAGTGGAAAAAGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATCCC
AATACATTTAATCATCGATGAAAA*CCATCAAAAAGTTACCGTAAGAAAGTTTCTCTGTA
TTCCTCACAAGAACCAGTTGTTTCCGTTTATTTCTGGTTGCACTAATTTGTTTTATTGCT
TAAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCATATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAA
ATACAGCCACTGTATGTAGATTAGGAACGGTTGTGCAAGTCTAGGTCGCGGATTAGTGAA
GAAGAGTACAAAAAATGTAGTGGCGGTAAAGGAAGAATTGGCTCAAAGGTGACAATGGAG
CATATATTTGAGCCATCTTCTCTTCTTAATGTGCCACCGGCTTCTTGGTTCATCCGTGGT
ATCGCCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATCTTAGAGAATATGTAATCACGTTT
AATAAAACAGAGACCGTAGACCCGCTGGTGTATGCTAAAATAAAAGAATCAATCCAAAAA
GAAAAAGAAACTGAACTAAAAGAATTGGAGGATTAAATGTTTGGACTATATTCAATGAGG
ATCAATATTTAAATAAGATTACCAATC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4A296JQ 739 0 0
CAATCAGTCTCCGAGATGTTCACCAATCCAAGAAACCTGATGTACTTCCATTCAATGGGC
AAGTACAAGACACAAGAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGG
AAGTGGAAAAAGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATCCCAATACATT
TAATCATCGATGAAAA*CCATCAAAAAGTTACCGTAAGAAAGTTTCTCTGTATTCCTCAC
AAGAACCAGTTGTTTCCGTTTATTTCTGGTTGCACTAATTTGTTTTATTGCTTAAGCAAC
ATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCATATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATACAGCC
ACTGTATGTAGATTAGGAACGGTTGTGCAAGTCTAGGTCGCGGATTAGTGAAGAAGAGTA
CAAAAAATGTAGTGGCGGTAAAGGAAGAATTGGCTCAAAGGTGACAATGGAGCATATATT
TGAGCCATCTTCTCTTCTTAATGTGCCACCGGCTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCGCCGT
CAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATCTTAGAGAATATGTAATCACGTTTAATAAAAC
AGAGACCGTAGACCCGCTGGTGTATGCTAAAATAAAAGAATCAATCCAAAAAGAAAAAGA
AACTGAACTAAAAGAATTGGAGGATTAAATGTTTGGACTATATTCAATGAGGATCAATAT
TTAAATAAGATTACCAATC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL2879Contig1 730 4 5 U
GGGAAACATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCT
GTCGGCAACGGTTCAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGC
GAAGAAAATCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAG
AATGATGTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAA
GACCAAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTGTTGATAGGAGTGGGAGT
GACTGCACTTGGTATCGGGCTAGAGAGCGGACTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGCA
AGCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTTGACACTAGGTTGGATATCGAC
TTACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAAATGACTTATGCTCAGCAGCTTCGTGACTACGA
GTCTCAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCGGAGTTAGAGGCGTTGAT
GGAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCCG
TTCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGCAGGTTTTAATGTTGGTTCTTGTCCCTC
AATGTTGGTTGTATGATACACAAAAGAATACAAATCAAAGAATATGTTGAAACGGTTGAA
GGAATCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG22TF U 1
AF RR4DD35TF U 1
AF RR4EG22JQ C 7
AF RR4DD35JQ C 100
BS 1 612 RR4DD35TF
BS 613 613 RR4EG22JQ
BS 614 626 RR4DD35TF
BS 627 685 RR4EG22JQ
BS 686 730 RR4DD35JQ

RD RR4EG22TF 573 0 0
GGAAAG
CATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCTGTCGGC
AACGGTTCAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCGAAGAA
AATCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGAATGAT
GTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAGACCAA
GAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTGTTGATAGGAGTGGGAGTGACTGC
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CTTTAGAGTCGGTAACAAGGAAATGACTTATGCTCAGCAGCTTCGTGACTACGAGTCTCA
AGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCGGAGTTAGAGGCGTTGATGGAACA
AGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTA

QA 7 573 7 573
DS 

RD RR4DD35TF 626 0 0
GGGAAACATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCT
GTCGGCAACGGTTCAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGC
GAAGAAAATCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAG
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GACTGCACTTGGTATCGGGCTAGAGAGCGGACTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGCA
AGCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTTGACACTAGGTTGGATATCGAC
TTACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAAATGACTTATGCTCAGCAGCTTCGTGACTACGA
GTCTCAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCGGAGTTAGAGGCGTTGAT
GGAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCCG
TTCACCTGCAAA*TTAGTAAAAGAAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4EG22JQ 679 0 0
CATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCTGTCGGC
AACGGTTCAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCGAAGAA
AATCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGAATGAT
GTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAGACCAA
GAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTGTTGATAGGAGTGGGAGTGACTGC
ACTTGGTATCGGGCTAGAGAGCGGACTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGCAAGCAGG
TAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTTGACACTAGGTTGGATATCGACTTACAT
CTTTAGAGTCGGTAACAAGGAAATGACTTATGCTCAGCAGCTTCGTGACTACGAGTCTCA
AGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCGGAGTTAGAGGCGTTGATGGAACA
AGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCCGTTCACC
TGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGCAGGTTTTAATGTTGGTTCTTGTCCCTCAATGTT
GGTTGTATGATACACAAAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DD35JQ 631 0 0
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GGGGAGAGTCAATACACAAAGAATGATGTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAAC
TGAAGAAGATTCTGCCACAAAGACCAAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGT
TCTGTTGATAGGAGTGGGAGTGACTGCACTTGGTATCGGGCTAGAGAGCGGACTTGAGTA
TGTGGGAGTAGATCCTTTGCAAGCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTT
GACACTAGGTTGGATATCGACTTACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAAATGACTTATGC
TCAGCAGCTTCGTGACTACGAGTCTCAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGA
GGCGGAGTTAGAGGCGTTGATGGAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGC
TTAGGCTCCTCTACTGTTCCGTTCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGCAGGTTT
TAATGTTGGTTCTTGTCCCTCAATGTTGGTTGTATGATACACAAAAGAATACAAATCAAA
GAATATGTTGAAACGGTTGAAGGAATCTATC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 3

CO CL2880Contig1 788 3 3 U
AGAATCCAAAACTGTATGATTAAATAACTAAATATTAAAAGTAGTTAAATGGAATAACCA
GCAAAATCTTTCAAAGACTTTCTTATAAAGAACTAAACTTCGTCGTCTTGGTCACATAAG
CAGACTTATTGTTCCAATGAACTTACGTTTCTATATTTTTTTTATGTTTTTATATCTGAG
CTGGCCAAGTCTTCAGCTTCCTCCTCGGCTTGAGTTTCGTCTAGTTCAGCCTCTTCAGCA
TGGTCGGGACCTGCTGCGGAATCTGAGGAGTTGTTAGACGCCTCTGTGATGTTCACAGGT
GGCTGATTCTCCATCAAACCAGAGAGTGCTAGCTTTGGTGACCACTCAAGGACGTCATCA
ATGATGTTTGACATCCTTCTTTGGTACCTGGCCCGAGCAGCTTCATCAGGGGCATGGCGC
CTGAGCAGCATGACAACAACAACAGCCACGACCGTGTAGAAAAGTCGAGACGTCCACTTA
GGAGGTTCTTCGTCGTCTTTATTTGGCCAGAAACGGAACAGTTCCTTCAATGTGGCTTCC
TCTGCAAGAATGTTGGGGAAGAACCAGACACGCTTTCCAAGAAGAATCCACATAGCACCG
AAAGTAACAGCTCTCACGAAAAGCAAGGAGAGAATCATCAAAAGAATGCCAGCACAAGAG
TAGAGAACGATGAGCTTGCAACGGTGTGGGTACACAGGAAACAAACAAATAGCGAGAGTC
AATACAGGCCAGAAGAAGGACAAAAGCGTTTGCCACAGTGGATGCCGTTTCTCAACGTCC
ACGCGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT21JQ U 79
AF RR4BT21TF C 72
AF RR4AK51JQ U 1
BS 1 500 RR4AK51JQ
BS 501 501 RR4BT21JQ
BS 502 788 RR4AK51JQ

RD RR4BT21JQ 485 0 0
TTTT
TTATAAAGAACTAAACTTCGTCGTCTTGGTCACATAAGCAAACTTATTGTTCCAATGAAC
TTACGTTTCTATATTTTTTTTATGTTTTTATATCTGAGCTGGCCAAGTCTTCAGCTTCCT
CCTCGGCTTGAGTTTCGTCTAGTTCAGCCTCTTCAGCATGGTCGGGACCTGCTGCGGAAT
CTGAGGAGTTGTTAGACCCCTCTGTGATGTTCACAGGTGGCTGATTCTCCATCAAACCAA
AAAGTGCTAGCTTTGGTGACCACTCAAGGACGTCATCAATGATGTTTGACATCCTTCTTT
GGTACCTGGCCCGAGCAGCTTCATCAGGGGCATGGCGCCTGAGCAGCATGACAACAACAA
CAGCCACGACCGTGTAAAAAAGTCGAGACGTCCACTTAGGAGGTTCTTCGTCGTCTTTAT
TTGGCCAGAAACGGAACAGTTCCTTCAATGTGGCTTCCTCTGCAAGAATGTTGGGGAA
AAA

QA 5 482 5 482
DS 

RD RR4BT21TF 619 0 0
CAAAGACTTTC
TTATAAAGAACTAAACTTCGTCGTCTTGGTCACATAAGCAGACTTATTGTTCCAATGAAC
TTACGTTTCTATATTTTTTTTATGTTTTTATATCTGAGCTGGCCAAGTCTTCAGCTTCCT
CCTCGGCTTGAGTTTCGTCTAGTTCAGCCTCTTCAGCATGGTCGGGACCTGCTGCGGAAT
CTGAGGAGTTGTTAGACGCCTCTGTGATGTTCACAGGTGGCTGATTCTCCATCAAACCAG
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GGTACCTGGCCCGAGCAGCTTCATCAGGGGCATGGCGCCTGAGCAGCATGACAACAACAA
CAGCCACGACCGTGTAGAAAAGTCGAGACGTCCACTTAGGAGGTTCTTCGTCGTCTTTAT
TTGGCCAGAAACGGAACAGTTCCTTCAATGTGGCTTCCTCTGCAAGAATGTTGGGGAAGA
ACCAGACACGCTTTCCAAGAAGAATCCACATAGCACCGAAAGTAACAGCTCTCACGAAAA
GCAAGGAGAGAATCATCAAAAGAATGCCAGCACAAGAGTAGAGAACGATGAGCTTGCAAC
GGTGTGGG

QA 12 619 12 619
DS 

RD RR4AK51JQ 788 0 0
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GCAAAATCTTTCAAAGACTTTCTTATAAAGAACTAAACTTCGTCGTCTTGGTCACATAAG
CAGACTTATTGTTCCAATGAACTTACGTTTCTATATTTTTTTTATGTTTTTATATCTGAG
CTGGCCAAGTCTTCAGCTTCCTCCTCGGCTTGAGTTTCGTCTAGTTCAGCCTCTTCAGCA
TGGTCGGGACCTGCTGCGGAATCTGAGGAGTTGTTAGACGCCTCTGTGATGTTCACAGGT
GGCTGATTCTCCATCAAACCAGAGAGTGCTAGCTTTGGTGACCACTCAAGGACGTCATCA
ATGATGTTTGACATCCTTCTTTGGTACCTGGCCCGAGCAGCTTCATCAGGGGCATGGCGC
CTGAGCAGCATGACAACAACAACAGCCACGACCGTGTAGAAAAGTCGAGACGTCCACTTA
GGAGGTTCTTCGTCGTCTTTCTTTGGCCAGAAACGGAACAGTTCCTTCAATGTGGCTTCC
TCTGCAAGAATGTTGGGGAAGAACCAGACACGCTTTCCAAGAAGAATCCACATAGCACCG
AAAGTAACAGCTCTCACGAAAAGCAAGGAGAGAATCATCAAAAGAATGCCAGCACAAGAG
TAGAGAACGATGAGCTTGCAACGGTGTGGGTACACAGGAAACAAACAAATAGCGAGAGTC
AATACAGGCCAGAAGAAGGACAAAAGCGTTTGCCACAGTGGATGCCGTTTCTCAACGTCC
ACGCGAAA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL2881Contig1 678 4 3 U
GGCGCTTTGTTAAACCAGAACTGGCAATTTAAGAGCATGCGGACAAACACAAACGGTGTT
GGATGTGCAGCAAGCCAAGGAAGTCATACGGGAACGACCGAGAGAGATCTGAACCTTCTC
AGGGGTGCTACTAACGCTGACCCAATCATTCATAGGGGAATTGGTTCAGATCAAAGCTTG
TTCTCTGTTCTCTCCCAGTGCAGTCAACTGCGCCGCCCCAGATCTGCTTTTGAGCCAGAA
AGTTCGAGTGACCAAGTGGTTGCATCCGGTAACTACGAAATGCTCATGGGGGGAAGCACA
ACTCATGTAGGTAATAGCAGTTTGGCTCTGCCTACGAACAACCCGCTTGATTACTTGAGC
GGTAGCAACAACCTGGTAACAACGTTGATGCCAGAGGATGTAACGTGGATGAACAATCAG
AGTCGCCAGAACTCTGGTCTCCATGACCCTCTAGGCAAGCTGTATCCAAGGTCATGGAAT
CCATAACCATGTTTTTTTTTTTGAAGTTTTGCATTAGAGAAGACGCACACGGGTGTCATC
TTTAAGATTATACAAAACCCAATATGGGTCTCTTAGTTTCTATTTATTTATCTGTTCATG
TACATAGAAAGATACAGAGGAACTTTTGTTTGGTACATATTTAGGTTTTGAGATATGGAC
TAGGAAAAAAGGTTGAGG


BQ
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AF RR4C086JQ C 510
AF RR4BR22TF U 1
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TAG
AAAA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RR4E319TF U 1
AF RR4CP79TF U 284
AF RR4CP79JQ C 566
AF RR4E319JQ C 618
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BS 1117 1127 RR4CP79JQ
BS 1128 1128 RR4E319JQ
BS 1129 1132 RR4CP79JQ
BS 1133 1133 RR4E319JQ
BS 1134 1148 RR4CP79JQ
BS 1149 1149 RR4E319JQ
BS 1150 1312 RR4CP79JQ

RD RR4E319TF 652 0 0
GATGGTAGTTCACAGGGATCTTAAGCCTGAGAACTTGCTTTTGGACTCCAAATGCAATGT
AAAAATTGCTGATTTTGGACTTGGCAACATTATGCGAGATGGTCACTTTTTGAAGACAAG
CTGTGGTAGTCCCAATTATGCTGCTCCAGAGGTCATTTCGGGCAAATTATATGCTGGCCC
TGAAGTAGACGTCTGGAGCTGTGGTGTAATACTCTACGCTCTTCTCTGTGGGACTCTTCC
CTTTGATGATGAGAACATTCCCAACCTTTTTAAGAAGATTAAGGGAGGAATATATACACT
ACCGAGCCATTTATCTGGTGGTGCTAGAGATTTGATCCCCAGGATGCTCGTGGTAGACCC
CATGAAAAGAGTAACCATTCCTGAGATCCGGCAACACCATTGGTTCCAAGCTCATCTTCC
TAGGTATTTAGCTGTTCCTCCTCCAGATACGGTTCAGCAGGCCAAAAAGATTGACGAGGA
GATTCTCCAAGAAGTTATCAATATGGGATTTGACAGAAACCTCCTCATTGAGTCTCTCCG
CAACCGAACCCAAAATGATGGGACTGTGACATACTATCTGATACTGGACAACCGGTTCCG
CGTCTCTGCTGGTTATCTCGGGGCTGAGTTTCAAGAGACTATGGAAG
TACAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CP79TF 725 0 0
GGAGGAATATATACACTACCGAGCCATTTATCTGGTGGTGCTAGAGATTTGATCCCCAGG
ATGCTCGTGGTAGACCCCATGAAAAGAGTAACCATTCCTGAGATCCGGCAACACCATTGG
TTCCAAGCTCATCTTCCTAGGTATTTAGCTGTTCCTCCTCCAGATACGGTTCAGCAGGCC
AAAAAGATTGACGAGGAGATTCTCCAAGAAGTTATCAATATGGGATTTGACAGAAACCTC
CTCATTGAGTCTCTCCGCAACCGAACCCAAAATGATGGGACTGTGACATACTATCTGATA
CTGGACAACCGGTTCCGCGTCTCTGCTGGTTATCTCGGGGCTGAGTTTCAAGAGACTATG
GAAGGTACACCGCGAATGCATCCAGCAGAAAAAGTAGCTTCACCAGTTAGCCATAGGCTT
CCAGGACTGATGGAGTTCCAAGGAGTTGGCTTGAGATCTCAATACCCTGCTGAGAGAAAA
TGGGCTCTTGGACTTCAGTCTAGGGCTCACCCGCGTGAAATAATGACAGAGGTCTTGAAA
GCCCTGCAAGATTTGAGTGTGTGTTGGAAGAAGGTAGGGCCATACAACATGAAGTGCAGA
TGGGTTCCTAACAACTCAGATAGAATGCTCAGTAACTCGATGCATGATAACAACTACTTC
GGAGATGACTCCAGCATAGTAGAAA*CGATGCAGCTGTTAAGTCTCCAA*TGTTGTCAAG
TTTGA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4CP79JQ 747 0 0
GTGACATACTATCTGATACTGGACAACCGGTTCCGCGTCTCTGCTGGTTATCTCGGGGCT
GAGTTTCAAGAGACTATGGAAGGTACACCGCGAATGCATCCAGCAGAAAAAGTAGCTTCA
CCAGTTAGCCATAGGCTTCCAGGACTGATGGAGTTCCAAGGAGTTGGCTTGAGATCTCAA
TACCCTGCTGAGAGAAAATGGGCTCTTGGACTTCAGTCTAGGGCTCACCCGCGTGAAATA
ATGACAGAGGTCTTGAAAGCCCTGCAAGATTTGAGTGTGTGTTGGAAGAAGGTAGGGCCA
TACAACATGAAGTGCAGATGGGTTCCTAACAACTCAGATAGAATGCTCAGTAACTCGATG
CATGATAACAACTACTTCGGAGATGACTCCAGCATAGTAGAAAACGATGCAGCTGTTAAG
TCTCCAAATGTTGTCAAGTTTGAAATTCAGTTGTATAAAACACGGGACGACAAGTATTTG
CTGGATCTGCAGAGAGTACATGGTCCTCAGTTCCTGTTCTTGGATCTCTGTGCTGCTTTT
CTTGCTCAGCTCCGAGTCCTCTTAATAGTCAAAACCGGTAGACTGCTCCAAAGAATAATT
CCCACTTCCCTTTGTTTCTCCTTTTAAGAAATGTTCACTCAAAGACATTAACTTCTTTCA
ATCTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGGACTCATCTAAAATACCTCGTTTGATTTAAAATGTA
AGACCGGACAAGTCTAGTAAAAGAAAT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4E319JQ 695 0 0
TCGGGGCTGAGTTTCAAGAGACTATGGAAGGTACACCGCGAATGCATCCAGCAGAAAAAG
TAGCTTCACCAGTTAGCCATAGGCTTCCAGGACTGATGGAGTTCCAAGGAGTTGGCTTGA
GATCTCAATACCCTGCTGAGAGAAAATGGGCTCTTGGACTTCAGTCTAGGGCTCACCCGC
GTGAAATAATGACAGAGGTCTTGAAAGCCCTGCAAGATTTGAGTGTGTGTTGGAAGAAGA
TAGGGCCATACAACATGAAGTGCAGATGGGTTCCTAACAACTCAGATAGAATGCTCAGTA
ACTCGATGCATGATAACAACTACTTCGGAGATGACTCCAGCATAGTAGAAAACGATGCAG
CTGTTAAGTCTCCAAATGTTGTCAAGTTTGAAATTCAGTTGTATAAAACACGGGACGACA
AGTATCTGCTGGATCTGCAGAGAGTACAAGGTCCTCAGTTCCTGTTCTTGGATCTCTGTG
CTGCTTTTCTTGCTCAGCCCCGAGTCCTCTGAATAATCAAAACCGGTAGACCGCTCCAAA
GAATAATTCCCACTTCCCTTTGTTTCTCCTTTTAAGAAATGTTCACTCAAAGACATTAAC
TTCTTTCAATCTTTTGTTTGTTTGTTTTTT*GGACTCATCTAAAATACCTCGTTTGATTT
AAAATGTAAGACTGGGCAAGTCTAGTAAAAGAAAT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 4

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GGAAACCGGTCCAAATAACAAGTCAACGACAAATAAAAAAACCTCCGCCGCAGATTCTCA
GATCGGATCCTTCGCGCTAGAGAGAGAGAGAGAGACGGAGATGCAGAGGGACGTGTCGAG
CTGCAACACTTACAACTATGGAGACGCTCACTACTGGGACGCCCGTTACGTGCAAGACGC
GCTTTCCTTCGATTGGTACCAACGCTACTCTTCTCTCCGCCCTTTCGTCCGAAGCTTCGT
CCCTACTTCTTCACGAGTCCTCATGGTTGGCTGTGGCAATTCCCTTATGTCAGAGGATAT
GGTCAAGGACGGATACGAGGACATTATGAACGTTGACATATCTTCAGTGGCTGTTGAGAT
GATGCAAACCAAATATGCTTCTGTTCCTCAGCTCAAATATATGCAAATGGATGTTAGAGA
TATGAGTTACTTTGCGGACGATTCCTTTGACACTGTCGTTGACAAAGGAACCCTTGATTC
ATTGATGTGTGGGACTGATGCTCCTCTAAGTGCTTCGAGAATGTTGGGTGAAGTTAGCAG
GCTGATTAAACCTGGAGGGACCTATTTCCTGATAACCTATGGTGATCCGAAAGTGAGAAT
GCCTCATTTGAATCCTTCTGCTTACAACTGGAAGATCTCCTTATACATCATACCAAGACC
AGAATTTAAAAAGCCTGGTGACTGTATCTCGTCATCGAAGTCGTGTCTTGAAGCAATACC
ATTGACAAGTGAAGGATGTTGCCACATGATTATGTTCTGGAGGATCCTGATTCCATTTAT
CTACATATGCAGAAAGACGATGAAGTAGCAGCTCAATACTCTCGTACCATTAATGGAGGA
TGTTCTGTAGTGTGATGCTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC91TF U 1
AF RR4F406TF U 45
BS 1 672 RR4EC91TF
BS 673 863 RR4F406TF

RD RR4EC91TF 672 0 0
GGAAACCGGTCCAAATAACAAGTCAACGACAAATAAAAAAACCTCCGCCGCAGATTCTCA
GATCGGATCCTTCGCGCTAGAGAGAGAGAGAGAGACGGAGATGCAGAGGGACGTGTCGAG
CTGCAACACTTACAACTATGGAGACGCTCACTACTGGGACGCCCGTTACGTGCAAGACGC
GCTTTCCTTCGATTGGTACCAACGCTACTCTTCTCTCCGCCCTTTCGTCCGAAGCTTCGT
CCCTACTTCTTCACGAGTCCTCATGGTTGGCTGTGGCAATTCCCTTATGTCAGAGGATAT
GGTCAAGGACGGATACGAGGACATTATGAACGTTGACATATCTTCAGTGGCTGTTGAGAT
GATGCAAACCAAATATGCTTCTGTTCCTCAGCTCAAATATATGCAAATGGATGTTAGAGA
TATGAGTTACTTTGCGGACGATTCCTTTGACACTGTCGTTGACAAAGGAACCCTTGATTC
ATTGATGTGTGGGACTGATGCTCCTCTAAGTGCTTCGAGAATGTTGGGTGAAGTTAGCAG
GCTGATTAAACCTGGAGGGACCTATTTCCTGATAACCTATGGTGATCCGAAAGTGAGAAT
GCCTCATTTGAATCCTTCTGCTTACAACTGGAAGATCTCCTTATACATCATACCAAGACC
AGAATTTAAAAA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4F406TF 819 0 0
GG
GCCGCAGATTCTCAGATCGGATCCTTCGCGCTAGAGAGAGGGAGAGA**CGGAGATGCAG
AGGGACGTGTCGAGCTGCAACACTTACAACTATGGAGACGCTCACTACTGGGACGCCCGT
TACGTGCAAGACGCGCTTTCCTTCGATTGGTACCAACGCTACTCTTCTCTCCGCCCTTTC
GTCCGAAGCTTCGTCCCTACTTCTTCACGAGTCCTCATGGTTGGCTGTGGCAATTCCCTT
ATGTCAGAGGATATGGTCAAGGACGGATACGAGGACATTATGAACGTTGACATATCTTCA
GTGGCTGTTGAGATGATGCAAACCAAATATGCTTCTGTTCCTCAGCTCAAATATATGCAA
ATGGATGTTAGAGATATGAGTTACTTTGCGGACGATTCCTTTGACACTGTCGTTGACAAA
GGAACCCTTGATTCATTGATGTGTGGGACTGATGCTCTTCTAAGTGCTTCGAGAATGTTG
GGTGAAGTTAGCAGGCTGATTAAACCTGGAGGGACCTATTTCCTGATAACCTAT**TGAT
CCGAAAGTGAGAATGCCTCATTTGAATCCTTCTGCTTACAACTGGAAGATCTCCTTATAC
ATCATACCAAGACCAGAATTTAAAAAGCCTGGTGACTGTATCTCGTCATCGAAGTCGTGT
CTTGAAGCAATACCATTGACAAGTGAAGGATGTTGCCACATGATTATGTTCTGGAGGATC
CTGATTCCATTTATCTACATATGCAGAAAGACGATGAAGTAGCAGCTCAATACTCTCGTA
CCATTAATGGAGGATGTTCTGTAGTGTGATGCTTGTG

QA 3 819 3 819
DS 



CO CL2883Contig2 686 2 4 U
GCGAAGATACTAAAAAAAAGTAAGATGTTTATTCGTATAAAAGAGACACAGAGAGTATAC
ACTTTTAAGAGTTACAAATGGGATATAGATCAAAAGAGAAATACAAAATACAACAATAGA
TCAAAGAAGGGAACACTCAGTGCACAGTTTTGCATTGTTTTACGCCATCCACAAGCATCA
CACTACAGAACATCCTCCATTAATGGGTACGAGAGTATTTGAGCTGCTACTTCATCCGTC
TTTCTGCATATGTAGATAAAATGGGAATCAGGATCCTCCAGAACATAATCATGTGGCAAC
ATTCCTTCACTTGTCAATGGTATTGCTTCAAGACACGACTTCGATGACGAGATACAGTCA
CCAGGCTTTTTAAATTCTGGTCTTGGTATGATGTATAAGGAGATCTTCCAGTTGTAAGCA
GAAGGATTCAAATGAGGCATTCTCACTTTCGGATCACCATAGGTTATCAGGAAATAGGTC
CCTCCAGGTTTAATCAGCCTGCTAACTTCACCCAACATTCTCGAAGCACTTAGAAGAGCA
TCAGTCCCACACATCAATGAATCAAGGGTTCCTTTGTCAACGACAGTGTCAAAGGAATCG
TCCGCAAAGTAACTCATATCTCTAACATCCATTTGCATATATTTGAGCTGAGGAACAGAA
GCATATTTGGTTTGCATCATCTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F406JQ U 1
AF RR4EC91JQ U 12
BS 1 456 RR4F406JQ
BS 457 458 RR4EC91JQ
BS 459 646 RR4F406JQ
BS 647 686 RR4EC91JQ

RD RR4F406JQ 646 0 0
GCGAAGATACTAAAAAAAAGTAAGATGTTTATTCGTATAAAAGAGACACAGAGAGTATAC
ACTTTTAAGAGTTACAAATGGGATATAGATCAAAAGAGAAATACAAAATACAACAATAGA
TCAAAGAAGGGAACACTCAGTGCACAGTTTTGCATTGTTTTACGCCATCCACAAGCATCA
CACTACAGAACATCCTCCATTAATGGGTACGAGAGTATTTGAGCTGCTACTTCATCCGTC
TTTCTGCATATGTAGATAAAATGGGAATCAGGATCCTCCAGAACATAATCATGTGGCAAC
ATTCCTTCACTTGTCAATGGTATTGCTTCAAGACACGACTTCGATGACGAGATACAGTCA
CCAGGCTTTTTAAATTCTGGTCTTGGTATGATGTATAAGGAGATCTTCCAGTTGTAAGCA
GAAGGATTCAAATGAGGCATTCTCACTTTCGGATCA**ATAGGTTATCAGGAAATAGGTC
CCTCCAGGTTTAATCAGCCTGCTAACTTCACCCAACATTCTCGAAGCACTTAGAAGAGCA
TCAGTCCCACACATCAATGAATCAAGGGTTCCTTTGTCAACGACAGTGTCAAAGGAATCG
TCCGCAAAGTAACTCATATCTCTAACATCCATTTGCATATATTTGA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4EC91JQ 675 0 0
AAAAAAAAGTAAGATGTTTATTCGTATAAAAGAGACACAGAGAGTATACACTTTTAAGAG
TTACAAATGGGATATAGATCAAAAGAGAAATACAAAATACAACAATAGATCAAAGAAGGT
AACACTCAGTGCACAGTTTTGCATTGTTTTACGCCATCCACAAGCATCACACTACAGAAC
ATCCTCCATTAATGGGTACGAGAGTATTTGAGCTGCTACTTCATCCGTCTTTCTGCATAT
GTAGATAAAATGGGAATCAGGGTCCTCCAGAACATAATCATGTGGCAACATTCCTTCACT
TGTCAATGGTATTGCTTCAAGACACGACTTCGATGACGAGATACAGTCACCAGGCTTTTT
AAATTCTGGTCTTGGTATGATGTATAAGGAGATCTTCCAGTTGTAAGCAGAAGGATTCAA
ATGAGGCATTCTCACTTTCGGATCACCATAGGTTATCAGGAAATAGGTCCCTCCAGGTTT
AATCAGCCTGCTAACTTCACCCAACATTCTCGAAGCACTTAGAGGAGCATCAGTCCCACA
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ACTCATATCTCTAACATCCATTTGCATATATTTGAGCTGAGGAACAGAAGCATATTTGGT
TTGCATCATCTCAAC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

CO CL2884Contig1 877 4 5 U
GGTCCTCTCTCACTTACTCATCGGAAGAAAGAAAGAAGAAGGATCTTTGTTCTCCCTCTC
TTCTTCTTCTACTTTCGATCTTTGTGATGGCTGCCTTTAATGGATACCAAGGGAATACTC
CCGCCGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCTGCTCCTCCGACTAAGACCG
TTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTTCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAG
GTGACCCGGGAATCTCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGA
TAACAGGAAGCAACGATACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTGCCTCACTTTCT
CCAATGACTATCCTTTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCA
ATGTTGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCAT
ATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCT
CACCATTGAACACCCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGG
TTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCACCAGTGCATGATTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATA
AATCTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGT
CTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTTTATGATCTGATCATCAACACTTTTATCTGTAACCT
TTGCCTTTGATTATCACATAACATGATTTTCCCATAAGAATGAGGGTGTTTTTATTCGTT
TGCTTTCTTTGTTTATGATCATTTTATCTTCTATTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ20TF U 1
AF RR4H996TF U 1
AF RR4GZ20JQ C 142
AF RR4H996JQB C 575
BS 1 586 RR4GZ20TF
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RD RR4GZ20TF 586 0 0
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4H996TF 756 0 0
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TTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTTCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAG
GTGACCCGGGAATCTCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGA
TAACAGGAAGCAACGATACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTGCCTCACTTTCT
CCAATGACTATCCTTTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCA
ATGTTGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCAT
ATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCT
CACCATTGAACACCCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGG
TTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCACCAGTGCATGATTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATA
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CTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTTTATGATCTGAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4GZ20JQ 736 0 0
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TCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAACGATACTG
TGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTGCCTCACTTTCTCCAATGACTATCCTTTCAAAC
CTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGTTGATCTCCATGGCAATA
TCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTAC
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TTTTATCTTCTATTCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4H996JQB 277 0 0
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ATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTTTATGATCTG
ATCATCAACATTTTTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATTATCACATAACATGATTTTCCCA
TAAGAATGAGGGTGTTTTTATTTGTTTGCTTTCTTTG

QA 1 277 1 277
DS 



AS 1 4

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ATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAGAAACTCTTTACCCTCATC
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AAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACATTGCACAGCCCACCGACTTTTCTGTTGCA
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GTAAAGATATTGAGACGTGGAAGTGTAATTTGCAATTTGCAAGATTATAAGTTGTCATGA
AGTCTTTTTATGGCAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4GN87JQ C 1
AF RR4EO20JQ C 37
AF RR4GN87TF U 1
AF RR4EO20TF U 37
BS 1 373 RR4GN87TF
BS 374 374 RR4EO20TF
BS 375 420 RR4GN87TF
BS 421 421 RR4EO20TF
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BS 613 619 RR4EO20TF

RD RR4GN87JQ 615 0 0
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TCGTTGTCTTGTACCATGGCCATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGAAAGCCACTTACTTT
ATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAGAAACTCTTTACCCTCATC
GAGCAACCAGCCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTCTACTGAAGAAGTATTAGAGGAT
ACCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGCCGTCGTGGCTCTGACTTTGAGG
AAAGACGATGACGTCTTTGAGGATGTTGACATTGCACAGCCCACCGACTTTTCTGTTGCA
TGAAGAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGAGAACCTTTGCTTCAACAGGAGTAGGA
ATCTATAAACGCTTTAAGTTATATCTTTCTCTCTCTGCTTGTATCAGACAATTGTTGTAA
GTAAAGATATTGAGACGTGGAAGTGTAATTTGCAATTTGCAAGATTATAAGTTGTCATGA
AGTCTTTTTATG
TCG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4EO20JQ 578 0 0
GG
AGACTTTCTCAGATTTTCCATCCTCGGGATTTTTCCCTGAAAGTAATCACAATCGGCGCC
GGAGGAGGAAGAGATTGTTCAGTCGTTGTCTTGTACCATGGCCATGTATATTCGTGTGAA
GCGCATGAAAGCCACTTACTTTATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAA
GCAGAAACTCTTTACCCTCATCGAGCAACCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTC
TACTGAAGAAGTATTAGAGGATACCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGC
CGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACATTGCACA
GCCCACCGACTTTTCTGTTGCACGAAGAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGAGAAC
CTTTGCTTCAACAGGAGTAGGAATCTATAAACGCTTTAAGTTATATCTTTCTCTCTCTGC
TTGTATCAGACAATTGTTGTAAGTAAAGATATTGAGACGTGGAAGTGTGATTTGCAATTT
GCAAGATTATAAGTTGTCATGAAGTCTTTTTATG
GC

QA 3 576 3 576
DS 

RD RR4GN87TF 615 0 0
GGGCCTTGTTCAGCTGAGTCTGAGAAGAAGAAGAAGCCAGACTTTCTCAGATTTTCCATC
CTCGGGATTTTTCCCGGAAAGTAATCACAATCGGCGCCGGAGGAGGAAGAGATTGTTCAG
TCGTTGTCTTGTACCATGGCCATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGAAAGCCACTTACTTT
ATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAGAAACTCTTTACCCTCATC
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ACCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGCCGTCGTGGCTCTGACTTTGAGG
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TGAAGAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGAGAACCTTTGCTTCAACAGGAGTAGGA
ATCTATAAACGCTTTAAGTTATATCTTTCTCTCTCTGCTTGTATCAGACAATTGTTGTAA
GTAAAGATATTGAGACGTGGAAGTGTAATTTGCAATTTGCAAGATTATAAGTTGTCATGA
AGTCTTTTTATG
TCG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4EO20TF 583 0 0
GG
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GCAGAAACTCTTTACCCTCATCGAGCAACCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTC
TACTGAAGAAGTATTAGAGGATACCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGC
CGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACATTGCACA
GCCCACCGACTTTTCTGTTGCACGAAGAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGAGAAC
CTTTGCTTCAACAGGAGTAGGAATCTATAAACGCTTTAAGTTATATCTTTCTCTCTCTGC
TTGTATCAGACAATTGTTGTAAGTAAAGATATTGAGACGTGGAAGTGTGATTTGCAATTT
GCAAGATTATAAGTTGTCATGAAGTCTTTTTATGGCAAAAA

QA 3 583 3 583
DS 



AS 1 3

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ATATTAGCAATCGAATGAGAAATTTAAAATCTGAAGCAACATACAATCAAAGATCAATGA
GGTACAATCAACAAGCTCTCCCCATTCTTATTGTATACATTTTGACTTCATAAAGTTTCA
ACTTGGTCAAAAGACTGAAGCTGCTCGCCCATTTTCTGAAATGCTTCTTCACTGATCTCA
ACTTTAAGGACAAAAGCCGGGAAAATCCTGTTCTTGTCGGATGGTGAGCTGGAAGAAACA
TTACCACATAGCTTTGATTGCATCTCTACGCAAGATTTGAGATCCTCTCCGGTCCTTGCT
TTGTTCAGCTTGTCGATTATTTCATTCAAAGCTGAGGTTTTCTCTTCTAAACGACGTCTT
TTGATCCTTCTTTTGATGTCATCTTGATCATCTGATTTACCACCCGGTTTCTGAACCTTC
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GGAACAGATGCCAGTGAAAAGGCTTCTTCGAGCAAGTTCACATTACTCATGTACCGATCA
AAAGCTTCATTCTCCACCTCAATGTTTCTGTCTCTGTGCTCTTTTAGCTTCGTAAACCGC
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TTCAGGTTATTAAACTGAGCAAAGTTGCTGGAAAGTTGGCGGATTGATGAAACTCTACTC
CCGGGAGTGCCCTCTGATGCTTTCTGCTCTGATGATGGAGTACTTGGTGCCGTCTTCTCA
GCAGACGTAACAACTCCTTTAAGAACGTGAATCGGGCAGGGATTCTCTGCTCTTGAACAG
CATCCCTTACAAGATTGAAACGGGCATCTGGAGCGAGCGACGTTGCCGCATTGGATACAC
TTGGGTTTGTTGAGGCCACGGAGTGTTTTGGGAGGCGTAGCAGCGGCGGAGAAACCATTG
TTACTCAGAGACGGTGACGAAGTCGCCATCTTTATTCACCAGAGGGGGAGATGCGTAACG
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CAAGTTAACAGATTTTGCAATCGAACGTGTTTTTTTTGTTTTCTCGAAGTTCTCTGCGAT
TTTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G384JQ U 1
AF RR4ER18JQ U 94
AF RR4ER18TF C 600
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BS 350 353 RR4G384JQ
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RD RR4G384JQ 410 0 0
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TTACCACATAGCTTTGATTGCATCTCTACGCAAGATTTGAGATCCTCTTCGGTTCTTGCT
TTGTTCAGCTTGTCGATTATTTCATTCAAAGCTGAGGTTTTCTCTTCTAA

QA 1 410 1 410
DS 

RD RR4ER18JQ 687 0 0
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TTCTGAAATGCTTCTTCACTGATCTCAACTTTAAGTACAGAAGCCGGGAAAATCCTGTTC
TTGTCGGATGGTGAGCTGGAAGAAACATTACCACATAGCTTTGATTGCATCTCTACGCAA
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GAGGTTTTCTCTTCTAAACGACGTCTTTTGATCCTTCTTTTGATGTCATCTTGATCATCT
GATTTACCACCCGGTTTCTGAACCTTCAACAAACCAGCTTTGACAGTCTCCGTGATGCGT
TTCTTGAAGCCCTCTGCTCTCGCGGAATTTGATCTCAGCCTCAGTTTAAGCTCAGAAACA
GTTCTTCCCTCATTGTTACTACTCTCAGGAACAGATGCCAGTGAAAAGGCTTCTTCGAGC
AAGTTCACATTACTCATGTACCGATCAAAAGCTTCATTCTCCACCTCAATGTTTCTGTCT
CTGTGCTCTTTTAGCTTCGTAAACCGCCACGCGTTTAACGCTTGAGCATCCTTTATGGTC
AAAGGCTTTCTCTGGCGAGGAACAGCA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4ER18TF 671 0 0
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TCATTCTCCACCTCAATGTTTCTGTCTCTGTGCTCTTTTAGCTTCGTAAACCGCCACGCG
TTTAACGCTTGAGCATCCTTTATGGTCAAAGGCTTTCTCTGGCGAGGAACAGCATTCAGG
TTATTAAACTGAGCAAAGTTGCTGGAAAGTTGGCGGATTGATGAAACTCTACTCCCGGGA
GTGCCCTCTGATGCTTTCTGCTCTGATGATGGAGTACTTGGTGCCGTCTTCTCAGCAGAC
GTAACAACTCCTTTAAGAACGTGAATCGGGCAGGGATTCTCTGCTCTTGAACAGCATCCC
TTACAAGATTGAAACGGGCATCTGGAGCGAGCGACGTTGCCGCATTGGATACACTTGGGT
TTGTTGAGGCCACGGAGTGTTTTGGGAGGCGTAGCAGCGGCGGAGAAACCATTGTTACTC
AGAGACGGTGACGAAGTCGCCATCTTTATTCACCAGAGGGGGAGATGCGTAACGATACTT
AACGGCCAAATATAAAACCGTTATTCACGAAGACAGGCAACGCCCGAAACTCGTCAAGTT
AACAGATTTTGCAATCGAACGTGTTTTTTTTGTTTTCTCGAAGTTCTCTGCGATTTTGAT
TTCC

QA 8 671 8 671
DS 



AS 1 4

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AGAGCCCTCCTTAATCATGGGGGACATAATCGAGTTCCAGACCATTTATATACCAAAGAT
ATATTCTTAAAAGTCCAGAATCACAGAGATGCATTACACACAGAGATTCCTTTTTTTTCT
TTCTTTCAAGTGGTTTTAGCCAAGGTTGCAAATCTTTCAAGTCCACCTCTAAGCAAGCTT
TCTAAAAAGGGCCGGAGCGCCGATGCCACAGGGGTCAAAAGCGCAGGGACTTCATATGAT
ACAGTTAGCTCAACGAGGCAAGATGAAGGACCTTTAGGGAAGAACCGAACGCTGCCTTTA
TTAGGAAGACCTTCAAGAGATCTCCAATGGATTTTCTGATTAGGAGTAGGCTGAAGATTG
CGAGCAAGCCAAGAATACTTAATGTCTTGGCCAAAAGCATTGTACTTGAGTGACCAACGT
GATAGATCAGGCTTGTCCTTTAACACCTCAACGGATGAAATGAAAGGCATCCACTTAGGG
AAAGATTCACGATCCAAGTAGAAGTTATACGCTACTGACACTGGTATATCTACTTCCATC
TTCACTGTGCAGTCTTGCCACTCCATGGAAACAGAGAAGCGTTTGTTGCGAGTGTTGAAT
CTCGATCTTCGAGTGACGGAAGACGAAGGAGAGCGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCATTT
AGGGGAAGCAACTGAGGAAACGATTTGGGTTTACGATGAAAAGGTTGAGGAGCCAATCTG
TGATTGGAGCAGATGAGATTGGAGGTTTTACAGGTTGTCGACAAATGATTGATCGTGTTC
ATGTGAATTGCTGCTGTTACAGACATTGGAATCTTTTTCTCTGTTTTTTTTTTTTTGCCT
CTTCACAACCACCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ44JQ U 3
AF RR4H404JQB U 1
AF RR4H404TF C 176
AF RR4BZ44TF C 258
BS 1 10 RR4H404JQB
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BS 12 113 RR4H404JQB
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BS 441 441 RR4BZ44JQ
BS 442 536 RR4H404JQB
BS 537 537 RR4BZ44JQ
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BS 641 732 RR4H404JQB
BS 733 816 RR4H404TF
BS 817 914 RR4BZ44TF

RD RR4BZ44JQ 665 0 0
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CTTTCAAGTGGTTTTAGCCAAGGTTGCAAATCTTTCAAGTCCACCTCTAAGCAAGCTTTC
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AGCAAGCCAAGAATACTTAATGTCTTGGCCAAAAGCATTGTACTTGAGTGACCAACGTGA
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CACTGTGCAGTCTTGCCACTCCATGGAAACAGAGAAGCGTTTGTTGCGAGTGTTGAATCT
CGATC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4H404JQB 732 0 0
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TTCTTTCAAGTGGTTTTAGCCAAGGTTGCAAATCTTTCAAGTCCACCTCTAAGCAAGCTT
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AGGGGAAGCAAC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4H404TF 642 0 0
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TGGGGAAAGATTCACGATCCAAGTAGAAGTTATACGCTACTGACACTGGTATATCTACTT
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C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4BZ44TF 657 0 0
GCG
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TAACACCTCAACGGATGAAATGAAAGGCATCCACTTAGGGAAAGATTCACGATCCAAGTA
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CTCCATGGAAACAGAGAAGCGTTTGTTGCGAGTGTTGAATCTCGATCTTCGATTGACGGA
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AGACATTGGAATCTTTTTCTCTGTTTTTTTTTTTTTGCCTCTTCACAACCACCC

QA 4 657 4 657
DS 



AS 1 4

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GCTTTGGATATTTGGACCAGTGCTTGTGTTCTTGTGCTCGGTCACGATGGTGCCTCTTCT
TTATAACCTCGATTTTTTCTTCTTCGGAAAAGAAAGAAGAGAAATCGATAGAAAATCTAG
TTTTGGATCTGTGTAGAACCGTGTTGATAAGCAATATACATTGGACTTGTATGCAGACTT
TGAAGGTTATTTTAGGTTTCGGTTTAAGAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DB10TF U 1
AF RR4DH16TF U 1
AF RR4DB10JQ C 250
AF RR4DH16JQ C 335
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GCT

QA 1 663 1 663
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TCTAATGGCATATGCAGCTTACCATGTTTACTTGTGGTACAAGTTACGTACACACCCTCT
CACCACCATCATCGGTACTAACGCTAGAGCACGCCGTTTTTGGGTCGCTTCTATCATCAA
GGACAACGAAAAGAAAAACATATTGGCCGTTCAAACGCTAAGAAACTGCATAATGGGATC
GACTTTAATGGCCACAACATCAATCCTCCTCTGCGCGGGTCTAGCTGCAGTTGTAAGCAG
CACTTATGCGGTAAAGAAGCCTCTAAGCGAAGCCGTTTACGGAGCTCACGGGGAGTTCAT
GGTGGCTCTTAAGTATGTCACAATCCCCATCTTCTTCCTCTTCTCTTTCTTCTCTCACTC
TCTCTCGATCCGATTCATCAACCAAGTCAATATCCTCATCAACACTCCCTTTCCTCCCGA
GGAGTTGGAGGAGATGATGGACATGATAGCGCCGGAGGAATACGTGGCGGAGTTGCTAGA
GAGAGGGTTTGTTTTGAATACTGTGGGGAACCGGTTGTTCTATGCGGCGTTGCCTTTGAT
GCTTTGGATATTTGGACCAGTGCTTGTGTTCTTGTGCTCGGTCACGATGGTGCCTCTTCT
TTATAACCTCGATTTTTTCTTCTTCGGAAA
GAAAGAAG

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DS 

RD RR4DB10JQ 622 0 0
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QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4DH16JQ 537 0 0
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TTCCTCTTCTCTTTCTTCTCTCACTCTCTCTCGATCCGATTCATCAACCAAGTCAATATC
CTCATCAACACTCCCTTTCCTCCCGAGGAGTTGGAGGAGATGATGGACATGATAGCGCCG
GAGGAATACGTGGCGGAGTTGCTAGAGAGAGGGTTTGTTTTGAATACTGTGGGGAACCGG
TTGTTTTATGCGGCGTTGCCTTTGATGCTTTGGATATTTGGACCAGTGCTTGTGTTCTTG
TGCTCGGTCACGATGGTGCCTTTTCTTTATAACCTCGATTTTTTTTTTTTCGGAAAAGAA
AGAAGAGAAATCGATAGAAAATCTAGTTTTGGATCTGTGTAGAACCGTGTTGATAAGCAA
TATACATTGGACTTGTATGCAGACTTTGAAGGTTATTTTAGGTTTCGGTTTAAGAGC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 4

CO CL2889Contig1 833 4 12 U
GACACTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAGATCAATAGCTGGTGAGGAGGAGGAGAAGCAA
GCAGCGGCGGAGATAAATGGCGGGGTACAGAGTGGAAGATGACTACGATTACCTCTTCAA
AGTCGTCCTGATAGGCGATTCGGGTGTAGGCAAATCGAATCTGCTCTCCAGATTCACCAA
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GAAAGTCGATGAAAAAGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGGTA
CCGTGCCATCACTAGTGCATACTACCGTGGAGCCGTTGGCGCACTCCTAGTATACGATAC
TACCCGCCGTGCAACTTTCGAGAACGTTGACCGGTGGTTGAAGGAGCTCAAGAACCACAC
AGACCCTAACATCGTGGTGATGCTCGTTGGCAACAAATCTGATCTGCGCCATTTGCTAGC
TGTTCCCACGGAAGATGGGAAATCGTATGCTGAGCAGGAATCGCTTTGCTTCATGGAAAC
ATCTGCCCTTGAATCCACCAACGTCGAGAACGCCTTCGCAGAGGTTTTGACGCAGATTTA
CCGTATAACAAGCAAGAAGCAAATGGAGGCTGGTGAAGATGGGAACGGATCTGTTCCAAA
AGGTGAGAAGATCGAGGTTAAAAACGATGTCTCCGCTCTGAAGAAACTCGGTTGCTGCTC
AAATTGAAGTCTTTTTTAATTTTATTTTTGTAATCTGTTGAGTGAGAATTATAAGGTCCA
TTGTTTTGGTTCTCTTCTTGGTTTGTAATAATATTGACATCTATATGAGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4EB60TF U 20
AF RR4EB60JQ C 168
AF RR4F044JQ C 238
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AGACCCTAACATCGTGGTGATGCTCGTTGGCAACAAATCTGATCTGCGCCATTTGCTAGC
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ATCTGCCCTTGAATCCACCAACGTCGAGAACGCCTTCGTAGAGGTTTTGACGCAGATTTA
CCGTATAACAAGCAAGAAGCAAATGGAGGCTGGTGAAGATGGGAACGGATCTGTTCCAAA
AG
G

QA 1 662 1 662
DS 

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GG
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GGGGTACAGAGTGGAAGATGACTACGATTACCTCTTCAAAGTCGTCCTGATAGGCGATTC
GGGTGTAGGCAAATCGAATCTGCTCTCCAGATTCACCAAAAACGAGTTCAATCTCGAGTC
TAAATCCACCATTGGCGTCGAGTTCGCAACTCGGACCTTGAAAGTCGATGAAAAAGTCGT
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CTACCGTGGAGCCGTTGGCGCACTCCTAGTATACGATACTACCCGCCGTGCAACTTTCGA
GAACGTTGACCGGTGGTTGAAGGAGCTCAAGAACCACACAGACCCTAACATCGTGGTGAT
GCTCGTTGGCAACAAATCTGATCTGCGCCATTTGCTAGCTGTTCCCACGGAAGATGGGAA
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CGTCGAGAACGCCTTCGCAGAGGTTTTGACGCAGATTTACCGTATAACAAGCAAGAAGCA
AATGGAGGCTGGTGAAGATGGGAACGGATCTGTTCCAAAAG*TGAGAAGAT

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR4EB60JQ 666 0 0
CCAGATTCACCAAAAACGAGTTCAATCTCGAGTCTAAATCCACCATTGGCGTCGAGTTCG
CAACTCGGACCTTGAAAGTCGATGAAAAAGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCTG
GTCAAGAAAGGTACCGTGCCATCACTAGTGCATACTACCGTGGAGCCGTTGGCGCACTCC
TAGTATACGATACTACCCGCCGTGCAACTTTCGAGAACGTTGACCGGTGGTTGAAGGAGC
TCAAGAACCACACAGACCCTAACATCGTGGTGATGCTCGTTGGCAACAAATCTGATTTGC
GCCATTTGCTAGCTGTTCCCACGGAAGATGGGAAATCGTATGCTGAGCAGGAATCGCTTT
GCTTCATGGAAACATCTGCCCTTGAATCCACCAACGTCGAGAACGCCTTCGCAGAGGTTT
TGACGCAGATTTACCGTATAACAAGCAAGAAGCAAATGGAGGCTGGTGAAGATGGGAACG
GATCTGTTCCAAAAGGTGAGAAGATCGAGGTTAAAAACGATGTCTCCGCTCTGAAGAAAC
TCGGTTGCTGCTCAAATTGAAGTCTTTTTTAATTTTATTTTTGTAATCTGTTGAGTGAGA
ATTATAAGGTCCATTGTTTTGGTTCTCTTCTTGGTTTGTAATAATATTGACATCTATATG
AGTTCT

QA 1 666 1 666
DS 

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CTTGAAAGTCGATGAAAAGGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAG
GTACCGTGCCATCACTAGTGCATACTACCGTGGAGCCGTTGGCGCACTCCTAGTATACGA
TACTACCCGCCGTGCAACTTTCGAGAACGTTGACCGGTGGTTGAAGGAGCTCAAGAACCA
CACAGACCCTAACATCGTGGTGATGCTCGTTGGCAACAAATCTGATCTGCGCCATTTGCT
AGCTGTTCCCACGGAAGATGGGAAATCGTATGCTGAGCAGGAATCGCTTTGCTTCATGGA
AACATCTGCCCTTGAATCCACCAACGTCGAGAACGCCTTCGTAGAGGTTTTGACGCAGAT
TTACCGTATAACAAGCAAGAAGCAAATGGAGGCTGGTGAAGATGGGAACGGATCTGTTCC
AAAAGGTGAGAAGATCGAGGTTAAAAACGATGTCTCCGCTCTGAAGAAACTCGGTTGCTG
CTCAAATTGAAGTCTTTTTTAATTTTATTTTTGTAATCTGTTGAGTGAGAATTATAAGGT
CCATTGTTTTGGTTCTCTTCTTGGTTTGTAATAA

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 4

CO CL2890Contig1 1227 4 7 U
GGATTCCAATTCCGTACATACTCTTCTTATTCCTTTGCATAATCTTTCTTCTTCGTCGGT
TGGGTGCACCGTCAACTTTGAGCTTCATTCTCTGATCGTGTTTGAAAGATTGCTAGCTTT
TGAGAAGAGCTATGAGTAGCTCAGGTAAAAGGAGACTAAGTGATCTTTTAACTCAATCTG
ATAACCGAGTCTGCGCTGATTGTAGCGCTCCAGATCCTAAGTGGGCGTCAGCAAACATCG
GAGTGTTCATATGCTTGAAATGTTGCGGTGTGCACAGAAGCCTTGGTACTCATATCTCAA
AGGTCTTATCTGTGACATTGGACGAATGGTCAGAAGATGAAGTGGATCCAATGATTGAAA
TTGGAGGAAATGCCTCTGCAAATTCAGTTTACGAGGCATTTATACCTGATGGTTGCTCTA
AGCCTGGACCTGATGCTAGTCCTGACCAACGTATGCAGTTTATCAGGTCAAAATATGAAC
ACCAAGAGTTTCTAAAACCAAGCTTGAGGATCACATCCGTGAAGGGCTCAAATTCATCAT
CATCACAACAGCCGCATCTTGAAGGCATGGTTGAGTTTATTGGATTGTTGAAGGTGACTC
TTAAGAAAGGAACCAATCTAGCTGTCAGAGATATGAGGACAAGCGATTCTTATGTTGTGT
TGACTCTCGGACAACAGACCGCAAAATCAACTGTAATGAAGGGCAACTTAAACCCGGTTT
GGAACGAGGAACTCATGCTCTCTGTTCCTCACAACTATGGCTCAGTAAAGTTGCAAGTGT
TTGATTATGACGCACTCTCTGCTGATGACATAATGGGAGAAGCTGGGATTGATATCCAAC
CTCTGATTACATCTGCAATGGCCTTAGGAGACCCTGAAATGTTTGGCGATATGCAGATTG
GTAAATGGCTTAAATCGCGCGACAATGCTCTTATAGAGGACAGCATCATCAACATTGCAG
ATGGGAAAGTGAAACAAGAGGTTCATATCAAGCTTCAGAATGTTGAGTCTGGTGAAATAG
AACTGGAACTTGAGTGGCTCCGTCTTGACCAATAAATGTAACAAACTCTATGTGTTTTGA
GTCATTTTTTTTGTGCACAGACAAAGTGAAATCTTGATCCCAAATGTTTCATTTAAAACC
TAAGATAAGACGTTTGTAAGAAGCCAAATCAGGTTTCAACCCCAACTTCAACATTTCATC
ATGATACTTCATAGCTTTCTTCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW83TF U 1
AF RR4FA33TF U 18
AF RR4FA33JQ C 464
AF RR4CW83JQ C 447
BS 1 689 RR4CW83TF
BS 690 700 RR4FA33TF
BS 701 701 RR4CW83JQ
BS 702 712 RR4FA33TF
BS 713 939 RR4CW83JQ
BS 940 940 RR4FA33JQ
BS 941 1227 RR4CW83JQ

RD RR4CW83TF 708 0 0
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TGGGTGCACCGTCAACTTTGAGCTTCATTCTCTGATCGTGTTTGAAAGATTGCTAGCTTT
TGAGAAGAGCTATGAGTAGCTCAGGTAAAAGGAGACTAAGTGATCTTTTAACTCAATCTG
ATAACCGAGTCTGCGCTGATTGTAGCGCTCCAGATCCTAAGTGGGCGTCAGCAAACATCG
GAGTGTTCATATGCTTGAAATGTTGCGGTGTGCACAGAAGCCTTGGTACTCATATCTCAA
AGGTCTTATCTGTGACATTGGACGAATGGTCAGAAGATGAAGTGGATCCAATGATTGAAA
TTGGAGGAAATGCCTCTGCAAATTCAGTTTACGAGGCATTTATACCTGATGGTTGCTCTA
AGCCTGGACCTGATGCTAGTCCTGACCAACGTATGCAGTTTATCAGGTCAAAATATGAAC
ACCAAGAGTTTCTAAAACCAAGCTTGAGGATCACATCCGTGAAGGGCTCAAATTCATCAT
CATCACAACAGCCGCATCTTGAAGGCATGGTTGAGTTTATTGGATTGTTGAAGGTGACTC
TTAAGAAAGGAACCAATCTAGCTGTCAGAGATATGAGGACAAGCGATTCTTATGTTGTGT
TGACTCTCGGACAACAGACCGCAAAATCA
CTGTATGAAGGCACTTAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4FA33TF 695 0 0
GG
ACTCTTCTTATTCCTTTGCATAATCTTTCTTCTTCGTCGGTTGGGTGCACCGTCAACTTT
GAGCTTCATTCTCTGATCGTGTTTGAAAGATTGCTAGCTTTTGAGAAGAGCTATGAGTAG
CTCAGGTAAAAGGAGACTAAGTGATCTTTTAACTCAATCTGATAACCGAGTCTGCGCTGA
TTGTAGCGCTCCAGATCCTAAGTGGGCGTCAGCAAACATCGGAGTGTTCATATGCTTGAA
ATGTTGCGGTGTGCACAGAAGCCTTGGTACTCATATCTCAAAGGTCTTATCTGTGACATT
GGATGAATGGTCGGAAGATGAAGTGGATTCAATGATTGAAATTGGAGGAAATGCCTCTGC
AAATTCAGTTTACGAGGCATTTATACCTGATGGTTGCTCTAAGCCTGGACCTGATGCTAG
TCCTGACCAACGTATGCAGTTTATCAGGTCAAAATATGAACACCAAGAGTTTCTAAAACC
AAGCTTGAGGATCACATCCGTGAAGGGCTCAAATTCATCATCATCACAACAGCCGCATCT
TGAAGGCATGGTTGAGTTTATTGGATTGTTGAAGGTGACTCTTAAGAAAGGAACCAATCT
AGCTGTCAGAGATATGAGGACAAGCGATTCTTATGTTGTGTTGACTCTCGGACAACAGAC
CGCAAAATCAACTGTAATGAAAGGCAACTTAAA

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR4FA33JQ 729 0 0
CAGGTCAAAATATGAACACCAAGAGTTTCTAAAACCAAGCTTGAGGATCACATCCGTGAA
GGGCTCAAATTCATCATCATCACAACAGCCGCATCTTGAAGGCATGGTTGAGTTTATTGG
ATTGTTGAAGGTGACTCTTAAGAAAGGAACCAATCTAGCTGTCAGAGATATGAGGACAAG
CGATTCTTATGTTGTGTTGACTCTCGGACAACAGACCGCAAAATCAACTGTAATGAAGGG
CAACTTAAACCCGGTTTGGAACGAGGAACTCATGCTCTCTGTTCCTCACAACTATGGCTC
AGTAAAGTTGCAAGTGTTTGATTATGACGCACTCTTTGCTGATGACATAATGGGAGAAGC
TGGGATTGATATCCAACCTTTGATTACATTTGCAATGGCCTTAGGAGACCCTGAAATGTT
TGGCGATATGCAGATTGGTAAATGGCTTAAATCGCGCGACAATGCTTTTATAGAGGACAG
CATCATCAACATTGCAGATGGGAAAGTGAAACAAGAGGTTCATATCAAGCTTCAGAATGT
TGAGTCTGGTGAAATAGAACTGGAACTTGAGTGGCTCCGTCTTGACCAATAAATGTAACA
AACTCTATGTGTTTTGAGTCATTTTTTTTGTGCACAGACAAAGTGAAATCTTGATCCCAA
ATGTTTCATTTAAAACCTAAGATAAGACGTTTGTAAGAAGCCAAATCAGGTTTCAACCCC
AACTTCAAC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4CW83JQ 781 0 0
CAACGTATGCAGTTTATCAGGTCAAAATATGAACACCAAGAGTTTCTAAAACCAAGCTTG
AGGATCACATCCGTGAAGGGCTCAAATTCATCATCATCACAACAGCCGCATCTTGAAGGC
ATGGTTGAGTTTATTGGATTGTTGAAGGTGACTCTTAAGAAAGGAACCAATCTAGCTGTC
AGAGATATGAGGACAAGCGATTCTTATGTTGTGTTGACTCTCGGACAACAGACCGCAAAA
TCAACTGTAATGAAGGGCAACTTAAACCCGGTTTGGAACGAGGAACTCATGCTCTCTGTT
CCTCACAACTATGGCTCAGTAAAGTTGCAAGTGTTTGATTATGACGCACTCTCTGCTGAT
GACATAATGGGAGAAGCTGGGATTGATATCCAACCTCTGATTACATCTGCAATGGCCTTA
GGAGACCCTGAAATGTTTGGCGATATGCAGATTGGTAAATGGCTTAAATCGCGCGACAAT
GCTCTTATAGAGGGCAGCATCATCAACATTGCAGATGGGAAAGTGAAACAAGAGGTTCAT
ATCAAGCTTCAGAATGTTGAGTCTGGTGAAATAGAACTGGAACTTGAGTGGCTCCGTCTT
GACCAATAAATGTAACAAACTCTATGTGTTTTGAGTCATTTTTTTTGTGCACAGACAAAG
TGAAATCTTGATCCCAAATGTTTCATTTAAAACCTAAGATAAGACGTTTGTAAGAAGCCA
AATCAGGTTTCAACCCCAACTTCAACATTTCATCATGATACTTCATAGCTTTCTTCATCC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 4

CO CL2891Contig1 884 4 20 U
GGAGGAAAAGATGTCGACGAGAATGAGATCTTCTTACCTGAAACCACCTCTTCCCAAATC
GCCCCTCCGTCTCCGATCACGCCAAGTCCTCTCCAGCTCCTCTTCATCGATTCTCCAAAC
ACCACCAGGCCTCACGAAGTTCCAGAAACGGAACGTTGCAGCGGATCTGGAACCTAACCT
CCCGATCGAGTACTCATCGATCTCGAGCGAGGTACACGCGATGGCGAAGATGGTGGAGAA
AGAGTTCGCTCAAGAAGAAGTGAAATCCAGAGCTGCGAGTCTGGAGCATATGGCTGCGAA
CTCGGAGGCGGCTCCTGTGTCCGAGAGAGGGAGGTTCTACGATGAGTATTCCGCAAGGAG
GAACGAGAGGCTGAGGAGGAAGAAAGGAGGAGAAGATTCTGTGGTGAAAGGAACTCCTTA
CAATCTCGGAGTCGAGCCTGTGACGACTAAGAGAAGAGGAACCGTTAAGAAGAAGGCTGT
TGTCTCCATGGCCGAGACGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGGTATTCACTGAGGAGTATGAA
GAAGGAGAACAAGAAGCCTCCTCCGATTCCTTTGAATGTTGATGTTAGTGCGATGAAGAG
TGTCACTACTACTACCAGGAGGGTTAGGAGGATCTGATGTTGGTGTGTGGTGGTTCCTTC
TGTTGTGTGAAATTGAAATTTGAGGTTTTGATTTCTGCAACTCTGTTTTAGTATTGTTGT
TGTCTTGCTGGATGCTTTTGGATATTGAAAGTTCTTTTGCTTTGTTTATTAATACATTCA
GATAAGCTTTTTATCTGTCAAATGCATTTTTTGGGTATTTTTTTACTTCAGTAGCGTTAT
TGCTTTAGTGATTATTGATCTTCTTCCACAAACAATTTAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
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30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CF56JQ C 267
AF RR4CF56TF U 1
AF RR4BI50JQ C 188
AF RR4BI50TF U 188
BS 1 211 RR4CF56TF
BS 212 212 RR4BI50TF
BS 213 320 RR4CF56TF
BS 321 321 RR4BI50TF
BS 322 354 RR4CF56TF
BS 355 355 RR4BI50TF
BS 356 478 RR4CF56TF
BS 479 479 RR4BI50TF
BS 480 684 RR4CF56TF
BS 685 685 RR4BI50TF
BS 686 693 RR4CF56TF
BS 694 694 RR4BI50TF
BS 695 699 RR4CF56TF
BS 700 700 RR4BI50TF
BS 701 738 RR4CF56TF
BS 739 739 RR4BI50TF
BS 740 745 RR4CF56TF
BS 746 748 RR4BI50TF
BS 749 766 RR4CF56TF
BS 767 884 RR4BI50TF

RD RR4CF56JQ 280 0 0
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GAGGGAGGTTTTACGATGAGTATTCCGCTAGGAGGAACGAGAGGCTGAGGAGGAAGAAAG
GAGGAGAAGATTCTGTGGTGAAAGGAACTCCTTACAATCTCGGAGTCGAGCCTGTGACGA
CTAAGAGAAGAGGAACCGTTAAGAAGAAGGCTTTTGTCTCCATGGCCGAGACGACGGCGG
CGGCGGCGCCGAGGTATTCACTGAGGAGTATGAAGAAGGA

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4CF56TF 776 0 0
GGAGGAAAAGATGTCGACGAGAATGAGATCTTCTTACCTGAAACCACCTCTTCCCAAATC
GCCCCTCCGTCTCCGATCACGCCAAGTCCTCTCCAGCTCCTCTTCATCGATTCTCCAAAC
ACCACCAGGCCTCACGAAGTTCCAGAAACGGAACGTTGCAGCGGATCTGGAACCTAACCT
CCCGATCGAGTACTCATCGATCTCGAGCGAGATACACGCGATGGCGAAGATGGTGGAGAA
AGAGTTCGCTCAAGAAGAAGTGAAATCCAGAGCTGCGAGTCTGGAGCATATGGCTGCGAA
CTCGGAGGCGGCTCCTGTGTTCGAGAGAGGGAGGTTCTACGATGAGTATTCCGCTAGGAG
GAACGAGAGGCTGAGGAGGAAGAAAGGAGGAGAAGATTCTGTGGTGAAAGGAACTCCTTA
CAATCTCGGAGTCGAGCCTGTGACGACTAAGAGAAGAGGAACCGTTAAGAAGAAGGCTTT
TGTCTCCATGGCCGAGACGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGGTATTCACTGAGGAGTATGAA
GAAGGAGAACAAGAAGCCTCCTCCGATTCCTTTGAATGTTGATGTTAGTGCGATGAAGAG
TGTCACTACTACTACCAGGAGGGTTAGGAGGATCTGATGTTGGTGTGTGGTGGTTCCTTC
TGTTGTGTGAAATTGAAATTTGAG*TTTTGATT*CTGCA*CTCTGTTTTAGTATTGTTGT
TGTCTTGCTGGATGCTTT*GGATAT**GAAGTTCTTTTGCTTTGTT
ATAATACATT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BI50JQ 697 0 0
GG
GTACTCATCGATCTCGAGCGAGGTACACGCGATGGCGAAGATGGTGGAGAAAGAGTTCGC
TCAAGAAGAAGTGAAATCCAGAGCTGCGAGTCTGGAGCATATGGCTGCGAACTCGGAGGC
GGCTCCTGTGTCCGAGAGAGGGAGGTTCTACGATGAGTATTCCGCAAGGAGGAACGAGAG
GCTGAGGAGGAAGAAAGGAGGAGAAGATTCTGTGGTGAAAGGAACTCCTTACAATCTCGG
AGTCGAGCCTGTGACGACTAAGAGAAGAGGAACCGTTAAGAAGAAGGCTGTTGTCTCCAT
GGCCGAGACGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGGTATTCACTGAGGAGTATGAAGAAGGAGAA
CAAGAAGCCTCCTCCGATTCCTTTGAATGTTGATGTTAGTGCGATGAAGAGTGTCACTAC
TACTACCAGGAGGGTTAGGAGGATCTGATGTTGGTGTGTGGTGGTTCCTTCTGTTGTGTG
AAATTGAAATTTGAGGTTTTGATTTCTGCAACTCTGTTTTAGTATTGTTGTTGTCTTGCT
GGATGCTTTTGGATATTGAAAGTTCTTTTGCTTTGTTTATTAATACATTCAGATAAGCTT
TTTATCTGTCAAATGCATTTTTTGGGTATTTTTTTACTTCAGTAGCGTTATTGCTTTAGT
GATTATTGATCTTCTTCCACAAACAATTTAACATG

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR4BI50TF 697 0 0
GG
GTACTCATCGATCTCGAGCGAGGTACACGCGATGGCGAAGATGGTGGAGAAAGAGTTCGC
TCAAGAAGAAGTGAAATCCAGAGCTGCGAGTCTGGAGCATATGGCTGCGAACTCGGAGGC
GGCTCCTGTGTCCGAGAGAGGGAGGTTCTACGATGAGTATTCCGCAAGGAGGAACGAGAG
GCTGAGGAGGAAGAAAGGAGGAGAAGATTCTGTGGTGAAAGGAACTCCTTACAATCTCGG
AGTCGAGCCTGTGACGACTAAGAGAAGAGGAACCGTTAAGAAGAAGGCTGTTGTCTCCAT
GGCCGAGACGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGGTATTCACTGAGGAGTATGAAGAAGGAGAA
CAAGAAGCCTCCTCCGATTCCTTTGAATGTTGATGTTAGTGCGATGAAGAGTGTCACTAC
TACTACCAGGAGGGTTAGGAGGATCTGATGTTGGTGTGTGGTGGTTCCTTCTGTTGTGTG
AAATTGAAATTTGAGGTTTTGATTTCTGCAACTCTGTTTTAGTATTGTTGTTGTCTTGCT
GGATGCTTTTGGATATTGAAAGTTCTTTTGCTTTGTTTATTAATACATTCAGATAAGCTT
TTTATCTGTCAAATGCATTTTTTGGGTATTTTTTTACTTCAGTAGCGTTATTGCTTTAGT
GATTATTGATCTTCTTCCACAAACAATTTAACATG

QA 3 697 3 697
DS 



AS 1 3

CO CL2892Contig1 1193 3 3 U
ACTGTATTTTAGTTGGTTATATAAAAAAAATAAAAATTGTAATTTACATTATTGGTTATA
AATACGGAACCTAAATTCAAATATAGTTATTCTGATTTTTTATAAAAGTATGATTCTAAA
TTTATAACTATTACTAAAATAAAAAAATTATGGACCCTCTAAAATTTTGGACCCTGTTCG
ACCGCTCCACTTGCACGTGCTAAAAGACGGCCCTGGGTCTCAGGGTATAACGGATAGAGA
TCACAACCAGAAACAGAGGATTTCGTTGTCGTTCTTGTTTGATCGGTCACACCAGACGTG
CTCGAGCTTCCATGTGTATCAACATCTCTCATCTTTAACAAGTTCCAGTCGTCTCCGTAT
AAACCAGGATCTGACATAACCTGTGTTAATTCAGTCACTCCCCCCAGCATTTTCAATGCC
TCTGACATTGTTGGTCTCAACGCAGGAGATGAGTTTGTGCAAACAAGAGCAACATTGATC
ATCCTCACCGCTTCTTTTCTATCGAAATGACCTTCGAGAATTGGATCTACAACCTCCAGT
ATGTCCCCTTTCTGATGCAGTGACAGCGCCCAATCAAGAAGTGAGATGTGGTCAGCAGTT
CCCTTGTGTTTAGTATTACTCTTGCCACTAACAATTTCCATTGCCACAACTCCGAAGCTA
TACACGTCTGCTTTCTCTGTTAGTTGACCCCATAGTACATATTCAGGAGCCATATATCCC
ATGGTTCCTGCAACTTTGGTGCTAATGTGAGTGTGTTCTTCTTCATGGAGTCTAGCCAAT
CCGAAGTCAGATATCTTCGCATTTAAGTCAGCATCTAGAAGTACATTAGGAGTTTTGATG
TCACGGTGAACCATTCTGATCATCAATCCTTCATGGAGGAACTCAAGCCCTCTTGCGATT
CCAACACAAATTTTCTGTCTTGCTTTCCAGTTGAGTTTCATGGAGCTCTTTCCAGAAAGC
ACAAGAGCAAGGGAGTTGTTTTCCATGTACTCATACACAAGCATCAATTGATTCTTCTCT
ACACAGCATCCATAAAGCTTGACAAGGTTTGGATGATTCAGACCTGAGATCATGCCTATC
TCATTCACAAACTCACGGTTTCCTTGGCATGACTTGGAAGATAGCCGCTTCACTGCTATG
ATAGTTCCATCTGACAGCTCTCCTTTGAATACGGATCCGAAACCTCCTTCTCC


BQ
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AF RR4BP52JQ U 1
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TCC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FF18JQ U 4
AF RR4FF18TF C 4
AF RR4GU85TF C 1
AF RR4GU85JQ U 5
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CC

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CC

QA 2 653 2 653
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CTACTACGATCTGTAAATAAACACGTTCACAGGTACATCGAACACAATCCAAGATAACAT
TCAAAGTGAGCCAAAACAAAAAATAAATCAAAGTGTTTTAGCAGAGAAACAGAGAAATCA
GATGGTCGAAAGAAACTCAAAAAAAAAAAAGATTTCAGTTCTGCTCCTGGGCTTCTACAG
CCTCCTTGTCTTCGTTGGCCGCAGCCATTAATTCATCAAACTTCTCAGACTTGGCGAGCG
TTATCTCAATCTTAGGCTTCTGCACAGGACGACCCCTTGCACCGTCCTTGATATCCACAG
TCGAAGTCATGATCTTCTTTTCAACAGCAAACCCGCTGTTCTTCAATATCTCAGCTACGG
TAACAACAGTCGCAATGGCCATTCCAAGTGCAGACAACTCCACATCTGCGTACTGCTGCA
TGTACCTCTTGGCGAGATTGACGTAGAAGAACAATGGTTTCTTAGTGTTGGAAACTTGAA
TCCGATTCTTCTTCTGCGAATCAACGGCCAAGCTCATGTTGTTAACTCCTTCCGTGATCC
CTTCCATTGTTAATTAAACTCGAGGTTAACACTTTCTCCCCTCTTTCTCTCGATTTATAT
TTCTCCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4GU85JQ 663 0 0
GGTTTCGAATAGGATATATATTCGAAAACGTTATGCAACAAAATCTTGTCTACAACCTAC
TACGATCTGTAAATAAACACGTTCACAGGTACATCGAACACAATCCAAGATAACATTCAA
AGTGAGCCAAAACAAAAAATAAATCAAAGTGTTTTAGCAGAGAAACAGAGAAATCAGATG
GTCGAAAGAAACTCAAAAAAAAAAAAGATTTCAGTTCTGCTCCTGGGCTTCTACAGCCTC
CTTGTCTTCGTTGGCCGCAGCCATTAATTCATCAAACTTCTCAGACTTGGCGAGCGTTAT
CTCAATCTTAGGCTTCTGCACAGGACGACCCCTTGCACCGTCCTTGATATCCACAGTCGA
AGTCATGATCTTCTTTTCAACAGCAAACCCGCTGTTCTTCAATATCTCAGCTACGGTAAC
AACAGTCGCAATGGCCATTCCAAGTGCAGACAACTCCACATCTGCGTACTGCTGCATGTA
CCTCTTGGCGAGATTGACGTAGAAGAACAATGGTTTCTTAGTGTTGGAAACTTGAATCCG
ATTCTTCTTCTGCGAATCAACGGCCAAGCTCATGTTGTTAACTCCTTCCGTGATCCCTTC
CATTGTTAATTAAACTCGAGGTTAACACTTTCTCCCCTCTTTCTCTCGATTTATATTTCT
CCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 3

CO CL2894Contig1 1374 3 13 U
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AAACCCGAATCTGAGACTTACCGAGTTCGATCCGGATTTTATTGGTGTTCAAACTCAATC
CATCCAAGTGAAGTGAAGCGAAGCGAAGCTCTCGGATAACTAACACAGAGATTTGGTAGG
TAGGGGAACACATCTTTTTGGCTTTACAGTTTTGGGATCCCTTGTTCAATGCTATATCAT
CCGAAACCGCACTAACCAAACTTACCATCTCTACCTCGGCCTTAACCAAGCAGCAGCAGC
TGCTTCTAATGATGATGGAAAGTTCCTTCTTGCTGCCAAGAGGTTTCGGAGGCCTACTTG
CACTGACTACATCATCTCCTTAAACTCTGATGATGTCTCCAGAGGAAGCACTTCCTACAT
CGGAAAGCTAAGGTCTAACTTTCTTGGGACCAAGTTCACTGTCTACGATGCTCAGCCCAC
CAATCCTGGAGCTCAGGTTACCAGAACCCGTTCTTCCAGACTTCTCTCTTTGAAACAAGT
GACCCCCAGAGTTCCTTCTGGCAACTACCCTGTCGCACATATCTCCTATGAGCTTAACGT
CTTGGGCTCCAGAGGACCGAGGAGGATGCAGTGTGTAATGGATGCCATCCCTGCATCAGC
TGTAGAACCTGGAGGTACAGCTCCTACTCAGACGGAACTACTCCACACCAATCTCGATAT
GTTCCCATCCTTCTCCTTCTTCAGGTCTAAATCAGTTCGTTCAGAGAGTCTTCCAACTTC
GTCGACGTCTGGTCCTGCTCAGAAGGAAGGGCTGCTTGTCCTCAAGAACAAAGCCCCCAG
ATGGCACGAACAGCTCCAGTGCTGGTGCCTCAACTTCAATGGGAGAGTCACTGTTGCTTC
CGTCAAAAACTTCCAGCTCGTAGCAGCTCCTGAGAACGGACCTGCTGGACCTGAGCACGA
AAACGTGATTCTCCAGTTTGGGAAAGTCGGCAAAGATGTGTTCACAATGGATTTTCAGTA
CCCTATCTCTGCCTTCCAGGCCCTCACCATTTGCCTTAGCAGCTTCGACACCAAGATAGC
ATGAATGAACGAACCCACCCGCAGGCAGGCGCAGGGTTATTAAGTTGTATCATCATGTTG
AACGATGGGTTTGCTTTTGCCTCTCATTGTCTAAGAAGTGTGTGTGTGTGTACTGTACAT
ATAGTTTCAAAAGTATTGGCAAAGTCCATACAAGGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGACTCA
AAAAGATGACAGTAGACTGTGTTTGTTTGTTGTTATTCCGTTGTACCTTTAATGATTGTA
GTTCCAGACTATGTTTTCATCTTTCTGATAATTTAATCTCAACGTTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H760TF U 1
AF RR4C306TF U 453
AF RR4C306JQ C 569
BS 1 577 RR4H760TF
BS 578 1092 RR4C306TF
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BS 1177 1177 RR4C306JQ
BS 1178 1211 RR4C306TF
BS 1212 1212 RR4C306JQ
BS 1213 1221 RR4C306TF
BS 1222 1374 RR4C306JQ

RD RR4H760TF 577 0 0
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AAACCCGAATCTGAGACTTACCGAGTTCGATCCGGATTTTATTGGTGTTCAAACTCAATC
CATCCAAGTGAAGTGAAGCGAAGCGAAGCTCTCGGATAACTAACACAGAGATTTGGTAGG
TAGGGGAACACATCTTTTTGGCTTTACAGTTTTGGGATCCCTTGTTCAATGCTATATCAT
CCGAAACCGCACTAACCAAACTTACCATCTCTACCTCGGCCTTAACCAAGCAGCAGCAGC
TGCTTCTAATGATGATGGAAAGTTCCTTCTTGCTGCCAAGAGGTTTCGGAGGCCTACTTG
CACTGACTACATCATCTCCTTAAACTCTGATGATGTCTCCAGAGGAAGCACTTCCTACAT
CGGAAAGCTAAGGTCTAACTTTCTTGGGACCAAGTTCACTGTCTACGATGCTCAGCCCAC
CAATCCTGGAGCTCAGGTTACCAGAACCCGTTCTTCCAGACTTCTCTCTTTGAAACAAGT
GACCCCCAGAGTTCCTTCTGGCAACTACCCTGTCGCA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4C306TF 769 0 0
G
GTTCACTGTCTACGATGCTCAGCCCACCAATCCTGGAGCTCAGGTTACCAGAACCCGTTC
TTCCAGACTTCTCTCTTTGAAACAAGTGACCCCCAGAGTTCCTTCTGGCAACTACCCTGT
CGCACATATCTCCTATGAGCTTAACGTCTTGGGCTCCAGAGGACCGAGGAGGATGCAGTG
TGTAATGGATGCCATCCCTGCATCAGCTGTAGAACCTGGAGGTACAGCTCCTACTCAGAC
GGAACTACTCCACACCAATCTCGATATGTTCCCATCCTTCTCCTTCTTCAGGTCTAAATC
AGTTCGTTCAGAGAGTCTTCCAACTTCGTCGACGTCTGGTCCTGCTCAGAAGGAAGGGCT
GCTTGTCCTCAAGAACAAAGCCCCCAGATGGCACGAACAGCTCCAGTGCTGGTGCCTCAA
CTTCAATGGGAGAGTCACTGTTGCTTCCGTCAAAAACTTCCAGCTCGTAGCAGCTCCTGA
GAACGGACCTGCTGGACCTGAGCACGAAAACGTGATTCTCCAGTTTGGGAAAGTCGGCAA
AGATGTGTTCACAATGGATTTTCAGTACCCTATCTCTGCCTTCCAGGCCCTCACCATTTG
CCTTAGCAGCTTCGACACCAAGATAGCATGAATGAACGA*CCCACCCGCAG*CAGGCGCA
GGGTTATTAAGTTGTATCATCATGTTGAACGATGGGTTTGCTTT*GCCTCTCATTGTCTA
AGA*GTGTGTGTGTGTGTACTGTACATATAGTTTCAAA*GTATTGGCA

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR4C306JQ 806 0 0
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CAGTGTGTAATGGATGCCATCCCTGCATCAGCTGTAGAACCTGGAGGTACAGCTCCTACT
CAGACGGAACTACTCCACACCAATCTCGATATGTTCCCATCCTTCTCCTTCTTCAGGTCT
AAATCAGTTCGTTCAGAGAGTCTTCCAACTTCGTCGACGTCTGGTCCTGCTCAGAAGGAA
GGGCTGCTTGTCCTCAAGAACAAAGCCCCCAGATGGCACGAACAGCTCCAGTGCTGGTGC
CTCAACTTCAATGGGAGAGTCACTGTTGCTTCCGTCAAAAACTTCCAGCTCGTAGCAGCT
CCTGAGAACGGACCTGCTGGACCTGAGCACGAAAACGTGATTCTCCAGTTTGGGAAAGTC
GGCAAAGATGTGTTCACAATGGATTTTCAGTACCCTATCTCTGCCTTCCAGGCCCTCACC
ATTTGCCTTAGCAGCTTCGACACCAAGATAGCATGAATGAACGAACCCACCCGCAGGCAG
GCGCAGGGTTATTAAGTTGTATCATCATGTTGAACGATGGGTTTGCTTTTGCCTCTCATT
GTCTAAGAAGTGTGTGTGTGTGTACTGTACATATAGTTTCAAAAGTATTGGCAAAGTCCA
TACAAGGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGACTCAAAAAGATGACAGTAGACTGTGTTTGTTT
GTTGTTATTCCGTTGTACCTTTAATGATTGTAGTTCCAGACTATGTTTTCATCTTTCTGA
TAATTTAATCTCAACGTTTTTTTTTT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 4

CO CL2895Contig1 614 4 1 U
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TATCTCGATTTCTTCTATTCTCCTCCGATTCGCTCTCTAGAAACAGAATAGAAACTGTTT
CAATTTCGGATTCTCTACTTTTACCATGGATGCTAGTCGTAAGAGAGGACCGCCTGAAGC
TAGCTCCAATGGCGGCGGTGGGTTTAAGAAGTCTAGGCTAGAGATGGAATCAACTGGTTT
AGGAAGCTGTACATTTGGTGATAGATGTCACTTTGCACACGGGGAAGCGGAGCTACGCAG
GTCAGGAATCTCCTAAGTTATTATTGCTGGAGTTAGTTTACTTGCAAAACAAGTCTCTTC
TTTATTGTTAGAGTCACGTCTTCACTTACTTTTTATGTTGTTTTCTTTTGTTTATGAGAA
TACAATGTTAGTTTCATTGTCATTGTATGTTTTTTTAGAATTTGGTTTTTGCTAAAATCA
AGTTTGGGAGGTTTCATGAATGATATTCACAAACTTGGAAACAAACAGTGGCTAGGATTT
GTATGCTGCCTTTATTTGATTAATATTCATGTTTTCTCTGCTATATCATATCATCTGGCA
TATGATTTTATGAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4EH42JQ C 1
AF RR4FN74JQ C 1
AF RR4EH42TF U 1
AF RR4FN74TF U 1
BS 1 614 RR4EH42TF

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TACAATGTTAGTTTCATTGTCATTGTATGTTTTTTTAGAATTTGGTTTTTGCTAAAATCA
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TATGATTTTATGAG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 4

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GTATAATCAAAACCCAACATATCCGCAGATAAAAAAGGGCCACAGCTATCTAAAAGCTAT
ATAGACTAACATAACTTCTAACTTCTTCAAGAATGGTGTGGAGGTCCATAATACATAATC
CCTGGTGGCTGGAAAGTTGTACCCTGTTGAGGTTGTTGCTGCTGAGCTAAGTTTGACTGA
GGAATCTGAGGCTGTTGCATATGAGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGAAGTCCAGGTGGCATT
AACGGAATGTTACCAAACCCATAAGGATTGTTCATTACCGGCTGTTTTAGAAACTGCGGT
GGTAAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGATTAGAGATCAAATGGTACTGACCTTGAACTTGA
ACTTGTGCTGTGGGTGTCTGGTTCTGGGGG*TTGTTGTTGTAAGGAGGAGCAAAAGCATT
AGTTACTGAAACAGGAACTGTGCTCTCTGATTTGGATAGACCAGAAGTCTTTGTAGCTTC
AGCTGCAAATGAAGATAGAACAGATTGCATGATCATATGTGATGAGGTAGATGCTGTGAG
CATCGCAGCTATAGAAGCAGGCGTCATTTTTGATGCTTGACCAGACTTGGTGCTGTTGTT
GTTATCAGTTGCAGGGACTGAGCCCGGAGCAGCAGCAACGGTTGTTGGTTTGGGTGCGTA
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CAAAAGGTATTCTTCCTCTTCCAATTGTTTGGCCAGTATTTTCTCTTCGGGTTGTCTTTA
ACAGTAGAGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN80JQ U 1
AF RR4BU15JQ U 35
AF RR4FN80TF C 64
AF RR4BU15TF C 340
BS 1 676 RR4FN80JQ
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BS 832 1032 RR4BU15TF

RD RR4FN80JQ 676 0 0
AAAAGTTTGTTCAGACCCTCATATCCAATGCCGTTGTAAAAGCTTGTAGTACAAATATTT
ATAAGGGAAAAGGTGAACGTTTCTACAACAAGAGCAACGTTACTACAACAAGAGCAACAT
GTATAATCAAAACCCAACATATCCGCAGATAAAAAAGGGCCACAGCTATCTAAAAGCTAT
ATAGACTAACATAACTTCTAACTTCTTCAAGAATGGTGTGGAGGTCCATAATACATAATC
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GGTAAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGATTAGAGATCAAATGGTACTGACCTTGAACTTGA
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AGTTACTGAAACAGGAACTGTGCTCTCTGATTTGGATAGACCAGAAGTCTTTGTAGCTTC
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CATCGCAGCTATAGAA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4BU15JQ 714 0 0
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CAACGTTACTACAACAAGAGCAACATGTATAATCAAAACCCAACATATCCGCAGATAAAA
AAGGGCCACAGCTATCTAAAAGCTATATAGACTAACATAACTTCTAACTTCTTCAAGAAT
GGTGTGGAGGTCCATAATACATAATCCCTGGTGGCTGGAAAGTTGTACCCTGTTGAGGTT
GTTGCTGCTGAGCTAAGTTTGACTGAGGAATCTGAGGCTGTTGCATATGAGGTGGTGGTG
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TTACCGGCTGTTTTAAAAACTGCGGTGGTAAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGATTAAAGA
TCAAATGGTACTGACCTTGAACTTGAACTTGTGCTGTGGGTGTCTGGTTCTGGGGG*TTG
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ATATGTGATGAGGTAGATGCTGTGAGCATCGCAGCTATAGAAGCAGGCGTCATTTTTGAT
GCTTGACCAGACTTGGTGCTGTTGTTGTTATCAGTTGCAGGGACTGAGCCCGGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FN80TF 769 0 0
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TAATCAAAACCCAACATATCCGCAGATAAAAAAGGGCCACAGCTATCTAAAAGCTATATA
GACTAACATAACTTCTAACTTCTTCAAGAATGGTGTGGAGGTCCATAATACATAATCCCT
GGTGGCTGGAAAGTTGTACCCTGTTGAGGTTGTTGCTGCTGAGCTAAGTTTGACTGAGGA
ATCTGAGGCTGTTGCATATGAGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGAAGTCCAGGTGGCATTAAC
GGAATGTTACCAAACCCATAAGGATTGTTCATTACCGGCTGTTTTAGAAACTGCGGTGGT
AAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGATTAGAGATCAAATGGTACTGACCTTGAACTTGAACT
TGTGCTGTGGGTGTCTGGTTCTGGGGG*TTGTTGTTGTAAGGAGGAGCAAAAGCATTAGT
TACTGAAACAGGAACTGTGCTCTCTGATTTGGATAGACCAGAAGTCTTTGTAGCTTCAGC
TGCAAATGAAGATAGAACAGATTGCATGATCATATGTGATGAGGTAGATGCTGTGAGCAT
CGCAGCTATAGAAGCAGGCGTCATTTTTGATGCTTGACCAGACTTGGTGCTGTTGTTGTT
ATCAGTTGCAGGGACTGAGCCCGGAGCAGCAGCAACGGTTGTTGGTTTGGGTGCGTAATC
TTCATCTTTGAGACGTTTCTGCATGTTTTGAGCTTCCTCTGTTTGTTC
C

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4BU15TF 693 0 0
GGCGGAAGTCCAGGTGGCATTAACGGAATGTTACCAAACCCATAAGGATG**TCAT*ACC
GGCTGTTT*AGAAACTGCGGTGGTAAAGGTGGTGGTGCTGCTGCTGGATTAGAGATCAAA
TGGTACTGACCTTGAACTTGAACTTGTGCTGTGGGTGTCTGGTTCTGGGGGGTTGTTGTT
GTAAGGAGGAGCAAAAGCATTAGTTACTGAAACAGGAACTGTGCTCTCTGATTTGGATAG
ACCAGAAGTCTTTGTAGCTTCAGCTGCAAATGAAGATAGAACAGATTGCATGATCATATG
TGATGAGGTAGATGCTGTGAGCATCGCAGCTATAGAAGCAGGCGTCATTTTTGATGCTTG
ACCAGACTTGGTGCTGTTGTTGTTATCAGTTGCAGGGACTGAGCCCGGAGCAGCAGCAAC
GGTTGTTGGTTTTGGTGCGTAATCTTCATCTTTGAGACGTTTCTGCATGTTTTGAGCTTC
CTCTGTTTGTTCTTGTGCTACCTGAATCCGAGCTTCAAGATTCTTCAGTTCAGATTCTTG
TTCACGTAGTGCGTCCTTGAGCTGGTTAACAAGGGAAGTTCTACTTCCTTGAACGGATTT
GAGTTTCTCCATACATTGTCTCAAAAGGTATTCTTCCTCTTCCAATTGTTTGGCCAGTAT
TTTCTCTTCGGGTTGTCTTTAACAGTAGAGAAA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL2897Contig1 1576 3 13 U
CTTTGAAGGTTTAAATGAATATTGAAGGCTTTGGAAAACTTCCAATGGATGAATCATCTT
CCAATATTATCTCCATTACTATTTCATCATCTTCTTCCTTGAGTACCACGCCACCACGAG
GTGATAACACTCATGCGTCTGCATCTGTTCAAGAGAGGTCCTTCTACTTGAGGTTTGCTA
TGAGGGTCTCTAGAGCTAAATGGTTTATCTTCTTGAGGAGAGTGTTTCACTACCAAAACG
GATCAAGATCAGATCTCGGCTCCAATCCTTTCAACTCCACCACGTGGATGATGTATGAGA
TGATAGCTCTGCTTGTTCAGCTTACTGTGGTAACACTCACACTAGCTATCTCAAAAGAAG
AGAGACCTGTTTGGCCAGTGAGGCTATGGATCACAGTTTATGATGTGGGATGTCTCCTCA
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TTGAGCAGCAACATAGAGGCAGAGATGAAACTAGGAGCTCTCATTTAATGAACAGATGCA
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*TGCTTCTGATTCTGACTCAGCTC

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G
TGGGTGTTTGATTCTAGATTTGGTTCTTTCAACCATGCTCCTAAGCTTCACGCCCTATGC
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AAGTAGGT

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TTTATTTGAAGCAAGTAGGTTACTTGTGTGAGTGCCATAAGTTTTGTACAGGAATAGCTC
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CTTGATATAGTGTTCACACTTCATATGGTTATTTCTCT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

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10 10 10 

AF RR4GK54TF U 1
AF RR4BD58TF U 45
AF RR4GK54JQ C 208
BS 1 711 RR4GK54TF
BS 712 814 RR4BD58TF
BS 815 815 RR4GK54JQ
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BS 864 864 RR4GK54JQ
BS 865 873 RR4BD58TF
BS 874 963 RR4GK54JQ

RD RR4GK54TF 711 0 0
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CGCCCTTCTCCGGCGCTTCTTCCGTCCCTCTTTGCTTTCTTCTGAGATCCGCCACCGTCT
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TAAGCTTGTGGATAAGATTGACTTTGGGGAACTATGCAATGAGTTTGAGTGCACAAGTAG
CCCCCAGGTCGAATCCACTGCCAGGCAACTTGCTCGCGACATTCTTGAAATCAGAGAAGG
CAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGTCTCAGTTAAATATAAGGATTCGGTCAGAAGTTT
TACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACCAATGTGGATCACTGCTGGGTTAGAGACTCCCAC
TGTGACGATACAGGAGATGCTGATGTTATCGACCAGCGTCTTGCGTATAAGATGGACACT
CAAGGGAAAACCCAAATCTATTCTTGCTGCTCTAAGTGGAGATCTGGTCATCAAAGTTAT
ATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAGTGGCCAAGTGATTGAGCATGAAGAGTCTTGGGA
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DS 

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AGATCCGCCACCGTCTCCCCCAAGTTTTGAATAGTTCGAGCAGGACTGAAGTATCGGTTG
ATAAATCAGAAGCGGATAAGCTTGTGGATAAGATTGACTTTGGGGAACTATGCAATGAGT
TTGAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTCGAATCCACTGCCAGGCAACTTGCTCGCGACATTC
TTGAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGTCTCAGTTAAATATAAGG
ATTCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACCAATGTGGATCACTGCTG
GGTTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGGTGATGTTATCGACCAGCGTCTTGC
GTATAAGATGGACACTCAAGGGAAAACCCAAATCTATTCTTGCTGCTCTAAGTGGAGATC
TGGTCATCAAAGTTATATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAGTGGCCAAGTGATTGAGC
ATGAAGAGTCTTGGGACTCGTCCTCGTCTTCCCCTATCGCTCAAGCCTATTTCTGGACAT
CACGCCGCCTCTTCGCTGCTTCTGAATCAGCTAAAGACTTGGCCGATGCCACCAAAGACA
TAACCGCCACTTTCACAACTCGAAAAGAGGATACAGAGATATATCGTGATCCAACAGATC
CAACTAAGTATTTCCAAAGAGACGACAGCTTCGAAAGAGATTTCTATCAG*TTGCATTGT
TTCTGGCAATTGTCTACTTTGTTGTACAGTTCTTGAGGA*CACTCTCTA

QA 1 829 1 829
DS 

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GGAACTATGCAATGAGTTTGAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTCGAATCCACTGCCAGGCA
ACTTGCTCGCGACATTCTTGAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGT
CTCAGTTAAATATAAGGATTCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACC
AATGTGGATCACTGCTGGGTTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGCTGATGTT
ATCGACCAGCGTCTTGCGTATAAGATGGACACTCAAGGGAAAACCCAAATCTATTCTTGC
TGCTCTAAGTGGAGATCTGGTCATCAAAGTTATATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAG
TGGCCAAGTGATTGAGCATGAAGAGTCTTGGGACTCGTCCTCGTCTTCCCCTATCGCTCA
AGCCTATTTCTGGACATCACGCCGCCTTTTCGCTGCTTCTGAATCAGCTAAAGACTTGGC
CGATGCCACCAAAGACATAACCGCCACTTTCACAACTCGAAAAGAGGATACAGAGATATA
TCGTGATCCAACAGATCCAACTAAGTATTTCCAAAGAGACGACAGCTTCGAAAGAGATTT
CTATCAGGTTGCATTGTTTCTGGCAATTGTCTACTTTGTTGTACAGTTCTTGAGGAACAC
TCTCTAATTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCCCATTTCTCTAATAGCATATAGTGTAAGTG
TCTATACATTGTTGTATATGATCTGTATAAAAAAAA

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL2899Contig1 1284 4 38 U
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CTTTCTCTGTCCCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGACTTCTCAGGATTGAGAAGCT
CCTCTGCTTCACTTCCCTTCGGCAAGAAACTTTCTTCCGATGAGTTTGTTTCCGCTGTCT
CTTTCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAGTGGTGGATACAGGAAAGGTGTCACCGAGGCTA
AACTTAAAGTGGCCATCAACGGATTCGGTAGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGCTGGC
ATGGCCGTAAGGACTCTCCTTTTGATGTCATTGCCATTAACGACACCGGCGGTGTCAAGC
AGGCTTCTCATCTCCTTAAGTACGACTCAACTCTCGGAATCTTCGACGCTGACGTGAAAC
CTTCCGGAGACGCTGCCCTCTCTGTAGATGGAAAGATCATCAAGGTTGTGTCTAACCGCA
ACCCGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTAGGAATCGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAG
TGTTTGTGGACAGAGAAGGTGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTATCA
TTACAGCTCCAGGCAAAGGAGACATCCCAACTTACGTT*GTTGGTGTCAATGCCGATGCT
TACAACCCCGACGAGCCGATCATCAGCAATGCATCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCC
TTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTTGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACCACTCAC
TCCTACACCGGTGACCAGAGGTTACTAGACGCTAGCCACCGTGACCTAAGGAGAGCAAGA
GCAGCTGCTTTAAACATTGTTCCCACATCCACAGGAGCAGCTAAAGCAGTGGCTCTCGTG
CTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATCGCTCTCCGTGTACCTACACCGAACGTG
TCAGTGGTTGATCTCGTTGTGCAGGTCACCAAGAAGACTTTCGCTGAGGAAGTTAACGCT
GCTTTCAGAGAATCCGCAGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTAGAAGTCTGTGATGAGCCG
CTCGTGTCAGTTGATTTCAGATGCTCAGATGTGTCGTCAACCATTGATTCTTCACTCACT
ATGGTGATGGGAGATGATATGATTAAGGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTAC
TCACAGAGAGTTGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTATCT
ACTTTTCAAATCAAAACTCTTTAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GG81TF U 4
AF RR4AU56TF U 1
AF RR4AU56JQ C 488
AF RR4GG81JQ C 501
BS 1 36 RR4AU56TF
BS 37 37 RR4GG81TF
BS 38 100 RR4AU56TF
BS 101 101 RR4GG81TF
BS 102 161 RR4AU56TF
BS 162 162 RR4GG81TF
BS 163 259 RR4AU56TF
BS 260 260 RR4GG81TF
BS 261 333 RR4AU56TF
BS 334 334 RR4GG81TF
BS 335 586 RR4AU56TF
BS 587 587 RR4GG81TF
BS 588 592 RR4AU56TF
BS 593 593 RR4GG81TF
BS 594 604 RR4AU56TF
BS 605 605 RR4GG81TF
BS 606 638 RR4AU56TF
BS 639 639 RR4GG81TF
BS 640 760 RR4AU56TF
BS 761 761 RR4AU56JQ
BS 762 771 RR4AU56TF
BS 772 772 RR4AU56JQ
BS 773 794 RR4AU56TF
BS 795 872 RR4AU56JQ
BS 873 873 RR4GG81JQ
BS 874 974 RR4AU56JQ
BS 975 975 RR4GG81JQ
BS 976 1025 RR4AU56JQ
BS 1026 1026 RR4GG81JQ
BS 1027 1031 RR4AU56JQ
BS 1032 1032 RR4GG81JQ
BS 1033 1082 RR4AU56JQ
BS 1083 1083 RR4GG81JQ
BS 1084 1259 RR4AU56JQ
BS 1260 1260 RR4GG81JQ
BS 1261 1266 RR4AU56JQ
BS 1267 1267 RR4GG81JQ
BS 1268 1284 RR4AU56JQ

RD RR4GG81TF 731 0 0
GGAT
CTGCTGTTACAACCTTAACTTTGATCCTGCCTGGTCA*CCATGGCTTCAGCTACTTTCTC
TGTCCCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGACTTCTCAGGATTGAGAAGCTCCTCTGC
TTCACTTCCCTTCGGCAAGAAACTTTCTTCCGATGAGTTTGTTTCCGCTGTCTCTTTCCA
GACTTCTGCAATGGGAAGCAGTGGTGGATACAGGAAAGGTGTCACCGAGGCTAAACTTAA
GGTGGCCATCAACGGATTCGGTAGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGCTGGCATGGCCG
TAAGGACTCTCCTTTTGATGTCATTGCCATTAACGACACCGGCGGTGTCAAGCAGGCTTC
TCATCTCCTTAAGTACGACTCAACTCTCGGAATCTTCGACGCTGACGTGAAACCTTCCGG
AGACGCTGCCCTCTCTGTAGATGGAAAGATCATCAAGGTTGTGTCTAACCGCAACCCGTC
TCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTAGGAATCGACATTGTCATTGAAGGAACGGGAGTGTTTGT
GGACAGAGAAGGTGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTATCATTACAGC
TCCAGGCAAAGGAGACATCCCAACTTACGTT*GTTGGTGTCAATGCTGATGCTTACAACC
CCGACGAGCCGATCATCAGCAATGCATCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCC
TTTGTCAAGTCTAGA

QA 5 716 5 716
DS 

RD RR4AU56TF 794 0 0
GGATCTGCTGCTGTTACAACCTTAACTTTGATCCTGTCTGGTCAACCATGGCTTCAGCTA
CTTTCTCTGTCCCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGAGTTCTCAGGATTGAGAAGCT
CCTCTGCTTCACTTCCCTTCGGCAAGAAACTTTCTTCCGATTAGTTTGTTTCCGCTGTCT
CTTTCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAGTGGTGGATACAGGAAAGGTGTCACCGAGGCTA
AACTTAAAGTGGCCATCAATGGATTCGGTAGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGCTGGC
ATGGCCGTAAGGACTCTCCTTTTGATGTCATTGTCATTAACGACACCGGCGGTGTCAAGC
AGGCTTCTCATCTCCTTAAGTACGACTCAACTCTCGGAATCTTCGACGCTGACGTGAAAC
CTTCCGGAGACGCTGCCCTCTCTGTAGATGGAAAGATCATCAAGGTTGTGTCTAACCGCA
ACCCGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTAGGAATCGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAG
TGTTTGTGGACAGAGAAGGTGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCTAAGAAAGTTATCA
TTACTGCTCCAGGCAAAGGAGACATCCCAACTTACGTTTGTTGGTGTCAATGCCGATGCT
TACAACCCCGACGAGCCGATCATCAGCAATGCATCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCC
TTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTTGGTATCATAAAGG*TACAATGACA*CCACTCAC
TCCTACACCGGTGA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4AU56JQ 797 0 0
TCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTAGGAATCGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAGTGTTTGT
GGACAGAGAAGGTGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCTAAGAAGGTTATCATTACTGC
TCCAGGCAAAGGAGACATCCCAACTTACGTT*GTTGGTGTCAATGCCGATGCTTACAACC
CCGACGAGCCGATCATCAGCAATGCATCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCA
AAGTTCTAGACCAGAAGTTTGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACCACTCACTCCTACA
CCGGTGACCAGAGGTTACTAGACGCTAGCCACCGTGACCTAAGGAGAGCAAGAGCAGCTG
CTTTAAACATTGTTCCCACATCCACGGGAGCAGCTAAAGCAGTGGCTCTCGTGCTCCCTA
ACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATCGCTCTCCGTGTACCTACACCGAACGTGTCAGTGG
TTGATCTTGTTGTGCAGGTCACCAAGAAGACTTTCGCTGAGGAAGTTAACGCTGCTTTTA
GAGACTCCGCAGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTAGAAGTCTGTGATGAGCCGCTTGTGT
CAGTTGATTTCAGATGCTCAGATGTGTCGTCAACCATTGATTCTTCACTCACTATGGTGA
TGGGAGATGATATGATTAAGGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCACAGA
GAGTTGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTATC*ACTTTTG
AAATCAAAACTCTTTAT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4GG81JQ 784 0 0
AAGGAGTTAGGAATCGACATTGTCATTGAAGGAACGGGAGTGTTTGTGGACAGAGAAGGT
GCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTATCATTACAGCTCCAGGCAAAGGA
GACATCCCAACTTACGTT*GTTGGTGTCAATGCTGATGCTTACAACCCCGACGAGCCGAT
CATCAGCAATGCATCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCA
GAAGTTTGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCCTACACCGGTGACCAGAG
GTTACTAGACGCTAGCCACCGTGACCTAAGGAGGGCAAGAGCAGCTGCTTTAAACATTGT
TCCCACATCCACAGGAGCAGCTAAAGCAGTGGCTCTCGTTCTCCCTAACCTCAAAGGAAA
ACTCAACGGGATCGCTCTCCGTGTACCTACACCGAACGTGTCAGTGGTTGATCTCGTTGT
GCAGGTGACCAAGAAGACTTTCGCTGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGAATCTGCAGA
GAAAGAGCTTAAAGGTATCCTAGAAGTCTGTGATGAGCCGCTCGTGTCAGTTGATTTCAG
ATGCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCACTCACTATGGTGATGGGAGATGATAT
GGTTAAGGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCTCAGAGAGTTGTTGATTT
GGCTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTATCTACTTTTCAAATCAAAACTCT
TTAT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 4

CO CL2900Contig1 713 4 32 U
GGGAGAAGAAGAGGAGAAGATGAGCAAAGAAAGCGACAAGGACAGACCAGCTTCTCCTAC
ATCTTACGGCACGTTTCAAGGTGTCCCTACTTATCCACCACCGTTGCATCCTCGTCCTCC
GCAGCATCATCCGGTCTCCGGATTCCCTCAGCCGTCTCAGCCTCCAGGAGCAACTCATCA
TGACCTTTCCGTTCATCAATACATTCAAGAACATCAAACCGTTCCTGGATATGCTGTTGA
TGAAGGAAGGCATGTAAGACAAGAACCTCTACCTTGTTGTGGTATTGGAATCGGTTGGTT
CTTGTTCATAACTGGTTTCATCTTTGGTGCAATCCCATGGTACATAGGAATATTCATCCT
AGTATGTGCTAAGATCAACCCACGAGAGAAACCAGGATACATAGCTTGCGCCATCGCTGC
TGTTCTTGCTACAATTGCTATAGTGTTTGGTTTCGTGGGAGGAAGAGAAGTCTGGTCGTG
AGAGTGTATCATCAATGATCAAACAAGAAAACTATACAACTGT**TCATCAAGTTGTTAT
TCTTTTGTAATTAATACCATTTTAAGTCTGTACGTTTGCACAAGAATCAAAAAGCATATT
GGCTTTCAATAAGACTGGATATTTCATTACGCTCATACTGTACTTGCATCGACTTGTAAG
ACGAGTTGTGGTTAGGCAGAGGACTGAATAAAGGTCAAAATGACTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG24TF U 1
AF RR4BL55TF U 1
AF RR4DM50JQ C 7
AF RR4DM50TF U 7
BS 1 18 RR4BL55TF
BS 19 19 RR4DM50TF
BS 20 153 RR4BL55TF
BS 154 154 RR4DG24TF
BS 155 165 RR4BL55TF
BS 166 166 RR4DG24TF
BS 167 191 RR4BL55TF
BS 192 192 RR4DG24TF
BS 193 196 RR4BL55TF
BS 197 197 RR4DG24TF
BS 198 260 RR4BL55TF
BS 261 261 RR4DG24TF
BS 262 266 RR4BL55TF
BS 267 267 RR4DG24TF
BS 268 270 RR4BL55TF
BS 271 271 RR4DG24TF
BS 272 454 RR4BL55TF
BS 455 455 RR4DG24TF
BS 456 490 RR4BL55TF
BS 491 491 RR4DG24TF
BS 492 504 RR4BL55TF
BS 505 505 RR4DG24TF
BS 506 523 RR4BL55TF
BS 524 525 RR4DG24TF
BS 526 571 RR4BL55TF
BS 572 572 RR4DG24TF
BS 573 573 RR4BL55TF
BS 574 574 RR4DG24TF
BS 575 681 RR4BL55TF
BS 682 682 RR4DM50JQ
BS 683 693 RR4BL55TF
BS 694 713 RR4DM50JQ

RD RR4DG24TF 631 0 0
GGGAGAA
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GGCACGTTTCAAGGTGTCCCTACTTATCCACCACCGTTGCATCCTCGTCCTCCGCAGCAT
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ATAACTGGTTTCATCTTTGGTGCAATCCCATGGTACATAGGAATATTCATCCTAGTATGT
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GCTACAATTGCTATAGTGTTTGGTTTCGTGGGAGGAAGAGAAGTCTGGTCGTGAGAGTGT
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TAATTAATACCATTTTAAGTCTGTACGTTTGCACAAGAATCAAAAAGCATATTGGCTTTC
AATAAGACTGGATATTTCATTACG

QA 8 631 8 631
DS 

RD RR4BL55TF 694 0 0
GGGAGAAGAAGAGGAGAAAATGAGCAAAGAAAGCGACAAGGACAGACCAGCTTCTCCTAC
ATCTTACGGCACGTTTCAAGGTGTCCCTACTTATCCACCACCGTTGCATCCTCGTCCTCC
GCAGCATCATCCGGTCTCCGGATTCCCTCAGCCATCTCAGCCTCCCGGAGCAACTCATCA
TGACCTTTCCGCTCATGAATACATTCAAGAACATCAAACCGTTCCTGGATATGCTGTTGA
TGAAGGAAGGCATGTAAGACGAGAACGTCTTCCTTGTTGTGGTATTGGAATCGGTTGGTT
CTTGTTCATAACTGGTTTCATCTTTGGTGCAATCCCATGGTACATAGGAATATTCATCCT
AGTATGTGCTAAGATCAACCCACGAGAGAAACCAGGATACATAGCTTGCGCCATCGCTGC
TGTTCTTGCTACAATTGCTATAGTGTTTGGTTTCATGGGAGGAAGAGAAGTCTGGTCGTG
AGAGTGTATCCTCAATGATCAAACGAGAAAACTATACAACTGTGTTCATCAAGTTGTTAT
TCTTTTGTAATTAATACCATTTTAAGTCTGTGCATTTGCACAAGAATCAAAAAGCATATT
GGCTTTCAATAAGACTGGATATTTCATTACGCTCATACTGTACTTGCATCGACTTGTAAG
ACGAGTTGTGGTTAGGCAGAG*ACTGAATAAAG
T

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4DM50JQ 707 0 0
G
GAAGAGGAGAAGATGAGCAAAGAAAGCGACAAGGACAGACCAGCTTCTCCTACATCTTAC
GGCACGTTTCAAGGTGTCCCTACTTATCCACCACCGTTGCATCCTCGTCCTCCGCAGCAT
CATCCGGTCTCCGGATTCCCTCAGCCGTCTCAGCCTCCAGGAGCAACTCATCATGACCTT
TCCGTTCATCAATACATTCAAGAACATCAAACCGTTCCTGGATATGCTGTTGATGAAGGA
AGGCATGTAAGACAAGAACCTCTACCTTGTTGTGGTATTGGAATCGGTTGGTTCTTGTTC
ATAACTGGTTTCATCTTTGGTGCAATCCCATGGTACATAGGAATATTCATCCTAGTATGT
GCTAAGATCAACCCACGAGAGAAACCAGGATACATAGCTTGCGCCATCGCTGCTGTTCTT
GCTACAATTGCTATAGTGTTTGGTTTCGTGGGAGGAAGAGAAGTCTGGTCGTGAGAGTGT
ATCATCAATGATCAAACAAGAAAACTATACAACTGT**TCATCAAGTTGTTATTCTTTTG
TAATTAATACCATTTTAAGTCTGTACGTTTGCACAAGAATCAAAAAGCATATTGGCTTTC
AATAAGACTGGATATTTCATTACGCTCATACTGTACTTGCATCGACTTGTAAGACGAGTT
GTGGTTAGGCAGAGGACTGAATAAAGGTCAAAATGACTTTTCTTCC

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR4DM50TF 665 0 0
G
GAAGAGGAGAAGATGAGCAAAGAAAGCGACAAGGACAGACCAGCTTCTCCTACATCTTAC
GGCACGTTTCAAGGTGTCCCTACTTATCCACCACCGTTGCATCCTCGTCCTCCGCAGCAT
CATCCGGTCTCCGGATTCCCTCAGCCGTCTCAGCCTCCAGGAGCAACTCATCATGACCTT
TCCGTTCATCAATACATTCAAGAACATCAAACCGTTCCTGGATATGCTGTTGATGAAGGA
AGGCATGTAAGACAAGAACCTCTACCTTGTTGTGGTATTGGAATCGGTTGGTTCTTGTTC
ATAACTGGTTTCATCTTTGGTGCAATCCCATGGTACATAGGAATATTCATCCTAGTATGT
GCTAAGATCAACCCACGAGAGAAACCAGGATACATAGCTTGCGCCATCGCTGCTGTTCTT
GCTACAATTGCTATAGTGTTTGGTTTCGTGGGAGGAAGAGAAGTCTGGTCGTGAGAGTGT
ATCATCAATGATCAAACAAGAAAACTATACAACTGT**TCATCAAGTTGTTATTCTTTTG
TAATTAATACCATTTTAAGTCTGTACGTTTGCACAAGAATCAAAAAGCATATTGGCTTTC
AATAAGACTGGATATTTCATTACGCTCATACTGTACTTGCATCGACTTGTAAGACGAGTT
GTGG

QA 2 665 2 665
DS 



AS 1 4

CO CL2901Contig1 774 4 7 U
AGTGCGAAGGCTTGACCGATAGTAATCATAACACAGGGGTTCATGACAACAAGGTATTTT
AACTAGCAAGTATAGTCATAAGTAGAGCTTTACAATATACAAAAAAGTATATTTTCTTAT
CCCGAAACCATTACACACAAGCTCTACAGATCTTCAGGTACCACGGAGGGCCCGAACACG
TTCTTGAATCAACTTCCTTTCCCAGTCCGCAACATCCTCGAATGCGTTCTCAGG***ATT
CTCAAAGGGCTCTTTCCACGGATCGTTCTTGGCCAGATCATATGTAGCCCCACGTATAGC
TCCTTTGTTAGGCCCACATGGACGCTTTGACACCAATGCGTCATAAGCCGTGTTCAGGTT
CATGTCACAGAACCAATACATATAAGCAATAGAAACCGCAGGAGCTCTTCCCAATCCGGC
TGTGCAATGCACGTAAACTCTCCCTTTACCTTCTGACACCGCCCATTCCAGAGAAGACAC
AGCTTTCGGAAGCTGGCTTCTTAACGAGAGCGGATCAAAGTCTTTAGCGGGTGTTCTCAT
GTGACGGATTCCGAGCTCTTTACATCTTTTGACAATGGAGTCAAGATCGATTCCCCAATA
CTCGATGTCCTTGTCTTGTTGCAAGTTAAGTATGTAAGCAACATTCTCTTCTCGTCTCAA
GTGATCTATATCCTCTGGCTTCTGTGGCTGCGACCCAACGATCAGTTCCTCTCTTATCAA
TCTATAATTCATGCCGAGATCATGATGATACTCATATGGGCTCCTCATCAGTCT


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B595JQ U 1
AF RR4B595TF C 1
AF RR4C627JQ U 1
AF RR4C231JQ U 4
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GATGGTTTGTTGC

QA 4 592 4 592
DS 

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QA 4 767 4 767
DS 

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QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 4

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H712JQB C 1
AF RR4H712TF U 1
AF RR4DN96TF U 1
AF RR4DN96JQ C 108
BS 1 714 RR4DN96TF

RD RR4H712JQB 617 0 0
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QA 1 617 1 617
DS 

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QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4DN96TF 714 0 0
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QA 1 714 1 714
DS 

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AGTCCCATCCAACTAAAATGTTGATTTTCGATCGATGATACTCAAAAAACCGTTGGATTG
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GTTATCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

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CAAGATATCCACATCCACCGCACAGTTGATCCGTAAGGCATGTCTTGAACATGGGTTCTT
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GGGTTTCTTCGAACAAATCGGAGCCTTGAATGATCCTACAGCAGTTGTTCGCCTCTTACG
CTATCCAGGTGAAGTGATTTCGTCGGATGTTGAAACATATGGTGCCTCAGCTCACTCGGA
TTACGGGATGGTCACTCTTCTTTTAACTGATGGAGTCCCAGGACTTCAGGTTTGTAGAGA
CAAGTCAAGACAACCACGTGTTTGGGAAGATGTACCTGGAATTAGAGGGGCGTTCATTGT
CAACATTGGTGATATGATGGAGAGATGGACAAATGGATTGTTCCGGTCTACCCTGCACAG
AGTGATGCCTGTTGGAAAAGAACGTTACTCGGTGTTTTTCTTCTTAGATCCCAATCCAGA
TTGTCACGTGGAATGTTTGGAGAGTTGTTGCAGCGAAACTTGTCCTCCAAGATTCCCTCC
TATCCTTGCCGGCGACTATATTAAGGAGCGTTTCAGGCTAACCTACGAGTCTTAGGAGGT
GTTATTGAATTAATGAATTCAATGGAATTCAATGTAACTGCAATTAGGAATGTTTCAGTG
GATTGGATTGGATTCTTTACAAGATATGATGGATTTTAGTGTTCATTGTAATTCAAAAGG
AAAAGAAATTCAGTTCCAAACATTTATTTTAAGGGTTTTTTTGTCCCTTCGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW36TF U 1
AF RR4AA80TF U 12
AF RR4AA80JQ C 289
AF RR4DW36JQ C 316
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BS 341 646 RR4DW36TF
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BS 799 801 RR4AA80JQ
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BS 871 908 RR4AA80JQ
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AAGCTTCTTTAATCTCCCACTAGATGAGAAGATGTCTTTACTCCGCCGCGATCTTCTCGG
TTATACTCCACTCCATGCTGAGAAACTCGACCCCTCCTTGACCTCCTCCACAGGTGATTC
TAAGGAAAGCTTTTACTTTGGCTCTTTGGAAGGAGCTCTGGCTCAGCGTTATCCAAATCA
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GGGTTTCTTCGAACAAATCGGAGCCTTGAATGATCCTACAGCAGTTGTTCGCCTCTTACG
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TTACGGGATGGTCACTCTTCTTTTAACTGATGGAGTCCCAGGACTT

QA 1 646 1 646
DS 

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CATCCACCGCACAGTTGATCCGTAAGGCATGTCTTGAACATGGGTTCTTCTATGTCAAGA
ACCATGGCATCTCTGAAGAATTGATGGAAGAGGTTTTGAGAGAGAGCAAAAGCTTCTTTA
ATCTCCCACTAGATGAGAAGATGTCTTTACTCCGCCGCGATCTTCTCGGTTATACTCCAC
TCCATGCTGAGAAACTCGACCCCTCCTTGACCTCCTCCACAGGTGATTCTAAGGAAAGCT
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AAGATCTCTTGCCATCATGGAGGCAAGCCATGGAATGTTACTACAAGAATGTCCTGTCCG
TTGGTCGAAAGTTGCTCGGCTTTATTGCCTTGGCATTGGATTTAGATGAGGGTTTCTTCG
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AAGTGATTTCGTCGGATGTTGAAACATATGGTGCCTCAGCTCACTCGGATTACGGGATGG
TCACTCTTCTTTTAACTGATGGAGTCCCAGGACTTCAGGTTTGTAGAGACAAGTCAAGAC
AACCACGTGTTTGGGAAGATGTACCTGGAATTAGAGGGGCGTTCATTGTCAACATTGGTG
ATATGATGGAGAGATGGACAAATGGATTGTTCCGGTCTACCCTGCACAGAGTGATGCCTG
TTGGAAAG**ACGTTACTCGGTGTTTT*CTTCTTAGATCC*AATCCAGATTGTCACGTGG
A*TGTTTGGAGAGTTGTTG

QA 1 859 1 859
DS 

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CACAGGTGATTCTAAGGAAAGCTTTTACTTTGGCTCTTTGGAAGGAGCTCTAGCTCAGCG
TTATCCAAATCAATGGCCTCCTGAAGATCTCTTGCCATCATGGAGGCAAGCCATGGAATG
TTACTACAAGAATGTCCTGTCCGTTGGTCGAAAGTTGCTCGGCTTTATTGCCTTGGCATT
GGATTTAGATGAGGGTTTCTTCGAACAAATCGGAGCCTTGAATGATCCTACAGCAGTTGT
TCGCCTCTTACGCTATCCAGGTGAAGTGATTTCGTCGGATGTTGAAACATATGGTGCCTC
AGCTCACTCGGATTACGGGATGGTCACTCTTCTTTTAACTGATGGAGTCCCAGGACTTCA
GGTTTGTAGAGACAAGTCAAGACAACCACGTGTTTGGGAAGATGTACCTGGAATTAGAGG
GGCGTTCATTGTCAACATTGGTGATATGATGGAGAGATGGACAAATGGATTGTTCCGGTC
TACCCTGCACAGAGTGATGCCTGTTGGAAAAGAACGTTACTCGGTGTTTTTCTTCTTAGA
TCCCAATCCAGATTGTCACGTGGAATGTTTGGAGAGTTGTTGCAGCGAAACTTGTCCTCC
AAGATTCCCTCCTATCCTTGTCGGCGACTATATTAAGGAGCGTTTCAGGCTAACCTACGA
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AATGTTTCAGTGTATTGGATTGGATTCTTTACAAGATATGATGGATTTTAGTGTTCATTG
TAATTCAAAAGGAAAAGAAATTCAGTTCCAAACA
AAA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4DW36JQ 818 0 0
CTTTGGCTCTTTGGAAGGAGCTCTGGCTCAGCGT*ATCCAAATCAATGGCCTCCTGAAGA
TCTCTTGCCATCATGGAGGCAAGCCATGGAATGTTACTACAAGAATGTCCTGTCCGTTGG
TCGAAAGTTGCTCGGCTTGATTGCCTTGGCATTGGATTTAGATGAGGGTTTCTTCGAACA
AATCGGAGCCTTGAATGATCCTACAGCAGTTGTTCGCCTCTTACGCTATCCAGGTGAAGT
GATTTCGTCGGATGTTGAAACATATGGTGCCTCAGCTCACTCGGATTACGGGATGGTCAC
TCTTCTTTTAACTGATGGAGTCCCAGGACTTCAGGTTTGTAGAGACAAGTCAAGACAACC
ACGTGTTTGGGAAGATGTACCTGGAATTAGAGGGGCGTTCATTGTCAACATTGGTGATAT
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AAAAGAACGTTACTCGGTGGTTTTCTTCTTAGATCCCAATCCAGATTGTCACGTGGAATG
TTTGGAGAGTTGTTGCAGCGAAACTTGTCCTCCAAGATTCCCTCCTATCCTTGCCGGCGA
CTATATTAAGGAGCGTTTCAGGCTAACCTACGAGTCTTAGGAGGTGTTATTGAATTAATG
AATTCAATGGAATTCAATGTAACTGCAATTAGGAATGTTTCAGTGGATTGGATTGGATTC
TTTACAAGATATGATGGATTTTAGTGTTCATTGTAATTCAAAAGGAAAAGAAATTCAGTT
CCAAACATTTATTTTAAGGGTTTTTTTGTCCCTTCGCG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 4

CO CL2904Contig1 662 4 2 U
AAGGCAAAAGGTTCATTGCATTTTGTAACAGTCTTGTACCAAGTTTCTGATATTTATATA
CATTAAAGGACTTTTTTTGTTTTACTAAATAGAGAGTCCTGGGAGGTGGAAAAATCTATA
CGAATTTTAATTAGTATATTCAGCAACCTCCACCGTCAGGTTCAACGGAACTGAGAAGGC
CGTTACCACGCAGCTGCATACAGTGTTGCTCCGCGTCGGCCTGAGCACAGACGATGACAA
CAGCCAAACCGTTGATGTGGGCTTCTTGCATAATGTTGACTGCGTTGTCTACAGTCATGC
CTGGTATGACCTTCATCAACACCTGAACCACGTATTCCCTCTTGTTGAAGTTGTCGTTGT
GTAGTATCACCCTGTAAGGTGGAGCCATCTTCTTTGATTTCCTCAAATCAAACTCGGATT
CACGACCAGGAGTGGTTTTCTCTATAATTGGTTTGTCCAACACACCGCCTCCTTTACCCA
ATGCAGACTTAGTCATGAGAACTCCACGATTGTTCACCCGTGGTCCTTTTGAGACAGAAT
GTTTGTCCCCTGATTTGGAATTGAAGAGAGAGCTTGGTGCGAGAGCTAATCTCCCACATA
TCACACACTCCATGTCTTCTTCTCCTCCTCCGTCTATGCTTCTCACTTCTCAACACACAC
CC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR4FP78JQ U 1
AF RR4FP78TF C 1
AF RR4CV86TF C 3
AF RR4CV86JQ U 21
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TCACACACTCCAT
CC

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AA
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ACACACTCCAT
CC

QA 3 613 3 613
DS 

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AATTTTAATTAGTATATTCAGCAACCTCCACCGTCAGGTTCAACGGAACTGAGAAGGCCG
TTACCACGCAGCTGCATACAGTGTTGCTCCGCGTCGGCCTGAGCACAGACGATGACAACA
GCCAAACCGTTGATGTGGGCTTCTTGCATAATGTTGACTGCGTTGTCTACAGTCATGCCT
GGTATGACCTTCATCAACACCTGAACCACGTATTCCCTCTTGTTGAAGTTGTCGTTGTGT
AGTATCACCCTGTAAGGTGGAGCCATCTTCTTTGATTTCCTCAAATCAAACTCGGATTCA
CGACCAGGAGTGGTTTTCTCTATAATTGGTTTGTCCAACACACCGCCTCCTTTACCCAAT
GCAGACTTAGTCATGAGAACTCCACGATTGTTCACCCGTGGTCCTTTTGAGACAGAATGT
TTGTCCCCTGATTTGGAATTGAAGAGAGAGCTTGGTGCGAGAGCTAATCTCCCACATATC
ACACTCTCCATGTCTTCTTCTCCTCCTCCGTCTATGCTTCTCACTTCTCAACACACACCC

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DS 

RD RR4CV86JQ 642 0 0
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TTTACTAAATAGAGAGTCCTGGGAGGTGGAAAAATCTATACGAATTTTAATTAGTATATT
CAGCAACCTCCACCGTCAGGTTCAACGGAACTGAGAAGGCCGTTACCACGCAGCTGCATA
CAGTGTTGCTCCGCGTCGGCCTGAGCACAGACGATGACAACAGCCAAACCGTTGATGTGG
GCTTCTTGCATAATGTTGACTGCGTTGTCTACAGTCATGCCTGGTATGACCTTCATCAAC
ACCTGAACCACGTATTCCCTCTTGTTGAAGTTGTCGTTGTGTAGTATCACCCTGTAAGGG
GGAGCCATCTTCTTTGATTTCCTCAAATCAAACTCGGATTCACGACCAGGAGTGGTTTTC
TCTATAATTGGTTTGTCCAACACACCGCCTCCTTTACCCAATGCAGACTTAGTCATGAGA
ACTCCACGATTGTTCACCCGTGGTCCTTTTGAGACAGAATGTTTGTCCCCTGATTTGGAA
TTGAAGAGAGAGCTTGGTGCGAGAGCTAATCTCCCACATATCACACTCTCCATGTCTTCT
TCTCCTCCTCCGTCTATGCTTCTCACTTCTCAACACACACCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 4

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GCTTTGTTGATGGTTTATTATTCCAAAATGACTGAGATCTTCTGGATTTCTTCTAGCCCT
CTTTACCATGCTTATGCATGGTTCAAGCTGTTTAGTCTGCAGAAAAATTTCAACAAGAAC
TTAAGCCAAAAAGATTTGCAGCTAATAGCATCATCTGTTGTCTTGGCGGCGTTATCTGTT
CCACCGTTTGATAGAGCTCAGAGTGCATCCCATATGGAACTTGAAAATGAGAAAGAACGC
AATTTGAGGATGGCCAACCTCATAGGGTTCAATCTTGAACCTAAATTCGAGGGCAGAGAT
ACGCTTTCAAGGTCAGCTCTTCTGTCAGAGCTGGTTTCAAGAGGTGTTTTGAGCTGTGCA
TCTCAGGAGGTCAAAGATCTTTTCCATGTTCTGGAGCATGAGTTTCACCCGCTTGATCTT
GGCTCCAAGATTCAGCCTCTGCTGGAAAAGATTTCCAAATCTGGTGGGAAGCTGTCGTCA
GCTCCTTCTTTACCAGAAGTGCAACTCTCTCAATATGTTCCTTCTTTGGAGAAGTTTGCT
ACTCTCAGGCTACTTCAACAGGTGTCTAAGATCTATCAGACTATAAGAATTGAGAGTTTA
TCTCAGTTGGTCCCCTTCTTTGAATTCTCAGTGGTAGAGAAGATTTCTGTTGATGCTGTG
AAGAACAACTTTGTTGCCATGAAAGTTGATCACATGAAAGGTGTTGTTATTTTTGGCAAT
TTGGGGATTGAGTCTGATGGACTGAAGGATCATCTGGCTGTTTTTGCCGAGTCTTTGAAC
AAAGTAAGAGCTATGCTGTTTCCTGTACCAAGTAAAGCATCAAAACTAGGTGGCATAGTA
CCGAACCTAGCAGAAACTGTTGAGAAGGAGCACAAGAGACTGCTTGCTCGTAAATCAATC
ATTGAGAAGAGGAAAGAGGATCAAGAGCGTCAACAACTAGAAATGGAACGTGAGGAGGAA
CAGAAACGGCTTAAGCTTCAGAAGCTAACTGAGGAGGCAGAGCAAAAGAGACTTGCGGCA
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GAAGCTAAGGCGTTGCTTGAGGACACAGAGAAACGCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4DY11TF U 1
AF RR4CI56TF U 210
AF RR4CI56JQ C 393
AF RR4DY11JQ C 443
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DS 

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G
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ATTTCCAAATCTGGTGGGAAGCTGTCGTCAGCTCC

QA 2 276 2 276
DS 

RD RR4CI56JQ 727 0 0
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CATGAAAGGTGTTGTTATTTTTGGCAATTTGGGGATTGAGTCTGATGGACTGAAGGATCA
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ACAACTAGAAATGGAACGTGAGGAGGAACAGAAACGGCTTAAGCTTCAGAAGCTAACTGA
GGAGGCAGAGCAAAAGAGACTTGCGGCAGAGCTTCTGGAGAGAAGGAAGCAAAGGATCCT
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ACGCATG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4DY11JQ 674 0 0
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AATTCTCAGTGGTAGAGAAGATTTCTGTTGATGCTGTGAAGAACAACTTTGTTGCCATGA
AAGTTGATCACATGAAAGGTGTTGTTATTTTTGGCAATTTGGGGATTGAGTCTGATGGAC
TGAAGGATCATCTGGCTGTTTTTGCCGAGTCTTTGAACATAGTAAGAGCTATGCTGTTTC
CTGTACCAAGTAAAGCATCAAAACTAGGTGGCATAGTACCGAACCTAGCAGAAACTGTTG
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AAGAGCGTCAACAACTAGAAATGGAACGTGAGGAGGAACAGAAACGGCTTAAGCTTCAGA
AGCTAACTGAGGAGGCAGAGCAAAAGAGACTTGCGGCAGAGCTTCTGGAGAGAAGGAAGC
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ACACAGAGAAACGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

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CTCGAGATCGTTAGACTCTGTGCTTCTCCTGTGTCTATTTCCCGCCATAAATCTCCGGTA
AAATCGGAATCTAGAAAAAGGGTTTTCAAGTTAGCAGATTCTGGTAGTTGGGTTCGTCTT
GGTCGATGTGTTAGGGTTCATTCATCTGCTCTGAACAACGGCGATAATCAGTCAAAAGGG
GAAGAACCTCCAGAATCATTGTTTATGAAAGAGTTGAAGAGACGAGGCATGACTCCTACT
TCGTTGCTTCAAGACTATGAAGTCGATGTAGATGAGATCAAAACTGGTGGTAAAGAAACT
AGAAACAGCTCTAAGACGACTGCAACTACTACTCCTGCGTTTGACCAAAGCTTGTTAAAC
CAGAGGGAGAGATCACTTGCTTTAAACAGTGAAGGGCTTGAGGGATTGATTCCACGTGCT
AGGATCTTGCTGACGATTGGAGGGACTTTCTTCTTGGGTTTTTGGCCCTTGATAGTCTTA
ACTCTTGGCGCCTTCTCTGCCCTTTACCTTTACTTTGGAGCAGATTTCATTCATGATGGA
AGCAGGACTCCGGTTTCACCACCACCTTACATCGATCCATATACTCTGTTGGAGGATGAG
AGGATCTCTGGGATCAATCCTCGTCTAAATTAGCACCAACAATGTGTTCTCGCTGCTCCA
CAGAAGTAGTAGTAAATTATATTGTTGCACTAAGTATATATATCTTCTTTTATCCGTTCC
TTACGGCTGTTAAAATAATGTTACTTCTGTATTGTTTGCGTGCCCCTTTTAAAAAAGTGT
TCACTATAAAGTATAAAAAGTCATCTTCTCATAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C624TF U 1
AF RR4GX65TF U 6
AF RR4F575JQ C 224
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QA 1 686 1 686
DS 

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ACCTCCAGAATCATTGTTTATGAAAGAGTTGAAGAGACGAGGCATGACTCCTACTTCGTT
GCTTCAAGACTATGAAGTCGATGTAGATGAGATCAAAACTGGTGGTAAAGAAACTAGAAA
CAGCTCTAAGACGACTGCAACTACTACTCCTGCGTTTGACCAAAGCTTGTTAAACCAGAG
GGAGAGATCACTTGCTTTAAATAGTGAAGGGCTTGAGGGATTGATTCCACGTGCTAGGAT
CTTGCTGACGATTGGAGGGACTTTCTTCTTGGGTTTTTGGCCCTTGATAGTCTTAACTCT
TGGCGCCTTCTCTGCCCTTTACCTTTACTTTGGAGCAGATTTCATTCATGATGGAAGCAG
GACTCCGGTTTCACCACCACCTTACATCGATCCATATACTCTGTTGGAGGATGAGAGGAT
CTCTGGGATCAATCCTCGTCTAA*TTAGCACCAACAATGTGTTCTCGCTGCTCCACAGAA
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CTGTTAAATAA

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DS 

RD RR4F575JQ 651 0 0
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CTGGTGGTAAAGAAACTAGAAACAGCTCTAAGACGACTGCAACTACTACTCCTGCGTTTG
ACCAAAGCTTGTTAAACCAGAGGGAGAGATCACTTGCTTTAAACAGTGAAGGGCTTGAGG
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GGCCCTTGATAGTCTTAACTCTTGGCGCCTTTTCTGCCCTTTACCTTTACTTTGGAGCAG
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CTCTGTTGGAGGATGAGAGGATCTCTGGGATCAATCCTCGTCTAAATTAGCACCAACAAT
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CTTCTTTTATCCGTTCCTTACGGCTGTTAAAATAATGTTACTTCTGTATTGTTTGCGTGC
CCCTTTTAAAAAAGTGTTCACTATAAAGTATAAAAAGTCATCTTCTCATAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 4

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CTTTTTTTTCTTTTCTTATCGTTGTTGTTTGTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGA
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TGGGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 5 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 10 10 

AF RR4AS13TF U 1
AF RR4EZ23JQ C 344
AF RR4EZ23TF U 427
AF RR4AU74TF U 1
BS 1 513 RR4AS13TF
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TTTGATTACGTTTTGTTCTTATCAGTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTT
TGGGCC

QA 1 666 1 666
DS 

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G
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AATCGTTTTGAAGTTTTGG
CC

QA 2 320 2 320
DS 

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TTTCTTTTCTTATCGTTGTTGTTTGTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGATTTGAT
TACATTTTGTTCTTATCAGTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTTTGG
CC

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR4AU74TF 663 0 0
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TATGTCCTCCGACACGCTACCACCCGGTTCGACCGCCTCTTCACCGCATTTGGGCAAACG
GAGAGCATGAGAGACCGTCACGACGATAGGTCCACAGCGAGTTACGTGACGATAAGGCAA
AGGAAGGGGTGAAGAAAGCGACCGATGCAGCTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATG
CGATGGACGGGGCCTGGAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGCGAAGCCGTTA
CGGGGGATGATGACAACGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTAGAGCTGAAGG
ATGTGAGGCAGCCTGTTGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGC
AAACCGACGGCGAGAATAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGGTGTCTATTG**TTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCTTATCGTTGTTGTTTGTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGA
TTTGATTACGTTTTGTTCTTATCAGTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTT
TGG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 4

CO CL2908Contig1 1038 4 2 U
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GAAGCTTCCAACGCTTTCGGACAGTGGCTTTCTCCTGAAGACGCAGAGGGAATACTAAAG
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ATGGAAGATGATGACTTGAAGGCGGCGATTGCAGCGAGTTTGTTAGATGCTTCTGCGGCT
GGTGCCAGTCTTGGAGCTGTTGGGACTACTTCTCAACGGGAGGAAACTGAGAAACAAAAG
TAGCAGAGGAGATAGAGAACAATGCTTTATTGGTGCGGGTGGGCGAAGGAACATTCACTT
GTTTGTTTGTTTGTTTTGTTATCAACAAGTTTTACATACAGAACATACAAGTTTACATGG
ACATAAACAATAAACGGTTTGTGAAATGGTGTTCTGTTTGAGTTTTTAATTCCATTCACT
ATAAACACGTTCCTTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AR05TF U 1
AF RR4AO60TF U 1
AF RR4AR05JQ C 256
AF RR4AO60JQ C 266
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BS 671 1038 RR4AR05JQ

RD RR4AR05TF 306 0 0
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TTTGAATCGGGCGATGGAGCGAACGAGCAACGGAGGAATGCTGTACCACGAGGTGCAGGA
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TTGCAAAAAGCTTTGGAAGTGTGGGATTTACAAGTGATCCCACTCAACTGTCCCGATGCA
GAGCCT

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR4AO60TF 670 0 0
GGGCTTCGTCACTCATCCTCACACGCAAGCAGAGGAATCTAAAAGGTTTTGACTGAAACC
TTTGAATCGGGCGATGGAGCGAACGAGCAACGGAGGAATGCTGTACCACGAGGTGCAGGA
AGCTAATCTATGCGTCAGGTCATGCTAGAAGGCGCCGCCACCGGAAACTTTGCCGCCGGC
GATTTCTTCTCCGAGGAGTCTCACAATGTTTCCCTCCGTGGCGATTTCAGTATCCAGGTC
TTGCAAAAAGCTTTGGAAGTGTGGGATTTACAAGTGATCCCACTCAACTGTCCCGATGCA
GAGCCTGCGCAGATAGACCCCGAGCTTGAGAACGCCTTCATCTGCCACTTGCATGACCAT
TGGTTTTGCATAAGGAAAGTGAGCGGCGAATGGTATAACTTTGACAGCCTCCTCGCTGCA
CCCCAACACCTATCCAAATTCTACCTTTCTGCGTTTCTCGACTCTCTCAAAGGCTCGGGA
TGGAGCACCTTCATAGTGAAAGGAAACTTCCCGCAGGAGTGTCCCATGTCGTCTTCTTCC
GAAGCTTCCAACGCTTTCGGACAGTGGCTTTCTCCTGAAGACGCAGAGGGAATACTAAAG
GAGACAAGCTCGACACAGAGTTCTTCTTCTTCTGCTGTAAACAACAGAAGCAGTGACAAT
GTTGATCAAC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4AR05JQ 783 0 0
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GACCCCGAGCTTGAGAACGCCTTCATCTGCCACTTGCATGACCATTGGTTTTGCATAAGG
AAAGTGAGCGGCGAATGGTATAACTTTGACAGCCTCCTCGCTGCACCCCAACACCTATCC
AAATTCTACCTTTCTGCGTTTCTCGACTCTCTCAAAGGCTCGGGATGGAGCACCTTCATA
GTGAAAGGAAACTTCCCGCAGGAGTGTCCCATGTCGTCTTCTTCCGAAGCTTCCAACGCT
TTCGGACAGTGGCTTTCTCCTGAAGACGCAGAGGGAATACTAAAGGAGACAAGCTCGACA
CAGAGTTCTTCTTCTTCTGCTGTAAACAACAGAAGCAGTGACAATGTTGATCAACAAAAA
CCGTATCAGGCGTTGTCGCGTGAGGAAGTACAGACGTTTTCAGAGATGGAAGATGATGAC
TTGAAGGCGGCGATTGCAGCGAGTTTGTTAGATGCTTCTGCGGCTGGTGCCAGTCTTGGA
GCTGTTGGGACTACTTCTCAACGGGAGGAAACTGAGAAACAAAAGTAGCAGAGGAGATAG
AGAACAATGCTTTATTGGTGCGGGTGGGCGAAGGAACATTCACTTGTTTGTTTGTTTGTT
TTGTTATCAACAAGTTTTACATACAGAACATACAAGTTTACATGGACATAAACAATAAAC
GGTTTGTGAAATGGTGTTCTGTTTGAGTTTTTAATTCCATTCACTATAAACACGTTCCTT
TTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4AO60JQ 773 0 0
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TTGAGAACGCCTTCATCTGCCACTTGCATGACCATTGGTTTTGCATAAGGAAAGTGAGCG
GCGAATGGTATAACTTTGACAGCCTCCTCGCTGCACCCCAACACCTATCCAAATTCTACC
TTTCTGCGTTTCTCGACTCTCTCAAAGGCTCGGGATGGAGCACCTTCATAGTGAAAGGAA
ACTTCCCGCAGGAGTGTCCCATGTCGTCTTCTTCCGAAGCTTCCAACGCTTTCGGACAGT
GGCTTTCTCCTGAAGACGCAGAGGGAATACTAAAGGAGACAAGCTCGACACAGAGTTCTT
CTTCTTCTGCTGTAAACAACAGAAGCAGTGACAATGTTGATCAACAAAAACCGTATCAGG
CGTTGTCGCGTGAGGAAGTACAGACGTTTTCAGAGATGGAAGATGATGACTTGAAGGCGG
CGATTGCAGCGAGTTTGTTAGATGCTTCTGCGGCTGGTGCCAGTCTTGGAGCTGTTGGGA
CTACTTCTCAACGGGAGGAAACTGAGAAACAAAAGTAGCAGAGGAGATAGAGAACAATGC
TTTATTGGTGCGGGTGGGCGAAGGAACATTCACTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTATCAA
CAAGTTTTACATACAGAACATACAAGTTTACATGGACATAAACAATAAACGGTTTGTGAA
ATGGTGTTCTGTTTGAGTTTTTAATTCCATTCACTATAAACACGTTCCTTTTC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 2 4

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CAACTCCTAAAACCCCTAGGTAACCCCTGTCCCATTCCAAACGAGCCACTCTATCTTGGG
GCATCACAGCCAGCTCGTTGTTGTTTGCGTATGACTTTATGTTCCCCTCAACTTGGTAGT
AAAGTTTACCGTCTTCCCCTACTCTGGAGGAAGTTGTTAGGATGTTTGACTCCCCCTTGA
CACCGAGTCTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A365JQD U 39
AF RR4A365JQ U 1
BS 1 252 RR4A365JQ

RD RR4A365JQD 125 0 0
AATGAGTAAAGTCTATTGTTCTCAACTCCTAAAACCCCTAGGTAACCCCTGTCCCATTCC
AAACGAGCCACTCTATCTTGGGGCATCCCAGCCAGCTCGTTGTTGTTTGCGTATGACTTT
ATGTT

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DS 

RD RR4A365JQ 252 0 0
ATTCTTCCTGGAAAACTTTCTCAGGGGTTTGGAGTCCCAATGAGTAAAGTCTATTGTTCT
CAACTCCTAAAACCCCTAGGTAACCCCTGTCCCATTCCAAACGAGCCACTCTATCTTGGG
GCATCACAGCCAGCTCGTTGTTGTTTGCGTATGACTTTATGTTCCCCTCAACTTGGTAGT
AAAGTTTACCGTCTTCCCCTACTCTGGAGGAAGTTGTTAGGATGTTTGACTCCCCCTTGA
CACCGAGTCTAG

QA 1 252 1 252
DS 



CO CL2909Contig2 770 2 7 U
CTTTGGGTTCCTAACATGGAGACTCCTCTCTCTCCTCGCTCTCTCTCACCTCCTCTCACC
AAACCCACTTCAAATCCCTCTTCTTTCTTCAGACCCATCATTTCCCAGTCCACCAAGTTC
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GTTGGGAGGAGAAACATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAACGGTTTCAGAA
GCCAATCTTCCAACAACAGCAATTGCTTTGACGCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACA
TTTGATGGATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCCGAGGAGCGGGGGCT
GACATATTCTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCCGTGGAGTTTTCCTCG
CCTTCTTCCTCGAAATACAAGTCTCTTTGAGGACTTTGGGCTCACCTGAAGAAGCAGGAA
AGAAAGTACTTAGACAGTACTTTGACTGAGTTCGTGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGT
GAGTCAAACATCCTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCGGAAGACGGTAAACTCTACTACCAA
GTTGAGGTGAACATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGAT
AGAGTGGCTCGTTTGGAATGGGACAGGCGTTACCTAGCGGTTCTAGGAGTTGAGAACAAT
AGACTCTACTCATTGAGACTCCAAACACCTGAGAAAGTTTTCCAGGAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A365TF U 56
AF RR4A365TFB U 1
BS 1 447 RR4A365TFB
BS 448 448 RR4A365TF
BS 449 456 RR4A365TFB
BS 457 457 RR4A365TF
BS 458 502 RR4A365TFB
BS 503 503 RR4A365TF
BS 504 770 RR4A365TFB

RD RR4A365TF 631 0 0
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AGTTCACTAAACCAGAATCTCCAGTTCTCCAAAACTTGTCAACCAATGCCAAACGGGCTT
GTGCAGTTGGGAGGAGAAACATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAACGGTTT
CAGAAGCCAATCTTCCAACAACAGCAATTGCTTTGACGCCTGTGTTCAGAGAGTACATTG
ATACATTTGATGGATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCCGAGGAGCGG
GGGCTGACATATTCTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCCGTGGAGTTTT
CCTCGCCTTCTTCCTCGAAATACAAGTCTCTTTGAGGACTTTGGGCTCACCTGAAGAAGC
AGGAAAGAAAGTACTTAGACAGTACTTTGACTGAGTTCGTGTCCACTAGACTCGGTGTCA
AGCGTGAGTCAAACATCCTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCGGAAGACGGTAAACTCTACT
ACCAAGTTGAGGTGAACATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGC
AAGATAGAGTGGCTCGTTTGGAATGGGACAG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4A365TFB 770 0 0
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AAACCCACTTCAAATCCCTCTTCTTTCTTCAGACCCATCATTTCCCAGTCCACCAAGTTC
ACTAAACCAGAATCTCCAGTTCTCCAAAACTTGTCAACCAATGCCAAACGGGCTTGTGCA
GTTGGGAGGAGAAACATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAACGGTTTCAGAA
GCCAATCTTCCAACAACAGCAATTGCTTTGACGCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACA
TTTGATGGATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCCGAGGAGCGGGGGCT
GACATATTCTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCCGTGGAGTTTTCCTCG
CCTTCTTCCTCGAAATACAAGTCTCTT*GAGGACTT*GGGCTCACCTGAAGAAGCAGGAA
AGAAAGTACTTAGACAGTACTT*GACTGAGTTCGTGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGT
GAGTCAAACATCCTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCGGAAGACGGTAAACTCTACTACCAA
GTTGAGGTGAACATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGAT
AGAGTGGCTCGTTTGGAATGGGACAGGCGTTACCTAGCGGTTCTAGGAGTTGAGAACAAT
AGACTCTACTCATTGAGACTCCAAACACCTGAGAAAGTTTTCCAGGAAGA

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 4

CO CL2910Contig1 900 4 8 U
GGATCACGAGAACAACACATAAACTAATCAAAGAATAAGGAAGCAGGTGAGATCCAATGG
CGGAGAGAGAAGAGGATGTGAAGCTTCTAGGCTTTTGGGCAAGCCCTTTCAGTCGCAGAG
TCGAAATGGCTCTCAAACTTAAAGGAGTGCCTTATGAGTACTTGGAGCAAGACTTGATGA
ACAAGAGCCCTTTGCTTCTTGAGCTAAATCCGGTTCACAAGAAGGTTCCGGTTCTTGTCC
ACAAAGGTAAAATATTGCTCGAGTCACAGCTGATCCTCGAATACATCGACCAAACATGGA
CAAACAATCCAATTCTTCCTCAAGATCCTTACGAGAAAGCTATGGCTTTATTCTGGGCCA
AGGTTGTTGATGAACAGGTCAAAATAAGGTTCAGCACGCTGGTGAAAGCAGAGAAGGGAG
TAGAGGTTGCAATTGAGGAGGCTCGAGAACTCCTTACGTTTCTTGAGAAGGAAGTCACCG
GAAAATATTTATTCGGTGGCAAGACAATTGGATTTTTGGACATGGTCGCTGGAAGCATGA
TTCCGTTTTGCTTGGCTCGGGGTTGGGAAGGTATGGGAATTGATATGATTCCAGAGGAAA
AATTTCCTGAACTTAACAGATGGATCAAGAATCTGCAAGAAATTGACATCGTGAGGGAAT
GCATTCCTCATAGAGAGAAACAAATCGAGCATATGAAGAAAGTTGCAGTGCGTATCAAAT
CGGCATAAGAGATTAATTATCATAGTTTTTGGTCTGGAGTTGTTAACTATATTTTCCGTA
GAACTGTTTGAACAATCTATTAAATAAAGATCAATGATACCTGCATCTGTAATGCTAATA
TTTTGTATGAAATCTAGATATCTCTTTACTATTTTTAATGAGGAGAATGTTTGATAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK88TF U 1
AF RR4G020TF U 15
AF RR4G020JQ C 280
AF RR4GK88JQ C 319
BS 1 81 RR4GK88TF
BS 82 82 RR4G020TF
BS 83 733 RR4GK88TF
BS 734 734 RR4G020JQ
BS 735 749 RR4GK88TF
BS 750 750 RR4G020TF
BS 751 772 RR4GK88TF
BS 773 900 RR4G020JQ

RD RR4GK88TF 772 0 0
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CGGAGAGAGAAGAGGATGTGAGGCTTCTAGGCTTTTGGGCAAGCCCTTTCAGTCGCAGAG
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ACAAGAGCCCTTTGCTTCTTGAGCTAAATCCGGTTCACAAGAAGGTTCCGGTTCTTGTCC
ACAAAGGTAAAATATTGCTCGAGTCACAGCTGATCCTCGAATACATCGACCAAACATGGA
CAAACAATCCAATTCTTCCTCAAGATCCTTACGAGAAAGCTATGGCTTTATTCTGGGCCA
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GAAAATATTTATTCGGTGGCAAGACAATTGGATTTTTGGACATGGTCGCTGGAAGCATGA
TTCCGTTTTGCTTGGCTCGGGGTTGGGAAGGTATGGGAATTGATATGATTCCAGAGGAAA
AATTTCCTGAACTTAACAGATGGATCAAGAATCTGCAAGAAATTGACATCGTGAGGGAAT
GCATTCCTCATAGAGAGAAACAAATCGAGCATATGAAGAAAGTTGCAGTGCGTATCAAAT
CGGCATAAGAGAT*AATTATCATAGTTTT*GGTCTGGAGTTGTTAACTATAT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4G020TF 762 0 0
GG
ACATAAACTAATCAAAGAATAAGGAAGCAGGTGAGATCCAATGGCGGAGAGAGAAGAGGA
TGTGAAGCTTCTAGGCTTTTGGGCAAGCCCTTTCAGTCGCAGAGTCGAAATGGCTCTCAA
ACTTAAAGGAGTGCCTTATGAGTACTTGGAGCAAGACTTGATGAACAAGAGCCCTTTGCT
TCTTGAGCTAAATCCGGTTCACAAGAAGGTTCCGGTTCTTGTCCACAAAGGTAAAATATT
GCTCGAGTCACAGCTGATCCTCGAATACATCGACCAAACATGGACAAACAATCCAATTCT
TCCTCAAGATCCTTACGAGAAAGCTATGGCTTTATTCTGGGCCAAGGTTGTTGATGAACA
GGTCAAAATAAGGTTCAGCACGCTGGTGAAAGCAGAGAAGGGAGTAGAGGTTGCAATTGA
GGAGGCTCGAGAACTCCTTACGTTTCTTGAGAAGGAAGTCACCGGAAAATATTTATTCGG
TGGCAAGACAATTGGATTTTTGGACATGGTCGCTGGAAGCATGATTCCGTTTTGCTTGGC
TCGGGGTTGGGAAGGTATGGGAATTGATATGATTCCAGAGGAAAAATTTCCTGAACTTAA
CAGATGGATCAAGAATCTGCAAGAAATTGACATCGTGAGGGAATGCATTCCTCATAGAGA
GAAACAAATCGAGCATATGAAGAAAGTTGCAGTGCGTATCAAATCGGCATAAGAGAT*AA
TTATCATAGTTTTTGGTCTGGAGTTGTTAACTATAT
TTTC

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4G020JQ 621 0 0
AATACATCGACCAAACATGGACAAACAATCCAATTCTTCCTCAAGATCCTTACGAGAAAG
CTATGGCTTTATTCTGGGCCAAGGTTGTTGATGAACAGGTCAAAATAAGGTTCAGCACGC
TGGTGAAAGCAGAGAAGGGAGTAGAGGTTGCAATTGAGGAGGCTCGAGAACTCCTTACGT
TTCTTGAGAAGGAAGTCACCGGAAAATATTTATTCGGTGGCAAGACAATTGGATTTTTGG
ACATGGTCGCTGGAAGCATGATTCCGTTTTGCTTGGCTCGGGGTTGGGAAGGTATGGGAA
TTGATATGATTCCAGAGGAAAAATTTCCTGAACTTAACAGATGGATCAAGAATCTGCAAG
AAATTGACATCGTGAGGGAATGCATTCCTCATAGAGAGAAACAAATCGAGCATATGAAGA
AAGTTGCAGTGCGTATCAAATCGGCATAAGAGATTAATTATCATAGTTTTTGGTCTGGAG
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GAGGAGAATGTTTGATAATGC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4GK88JQ 565 0 0
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AGGCTCGAGAACTCCTTACGTTTCTTGAGAAGGAAGTCCCCGGAAAATATTTATTCGGTG
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GGGGTTGGGAAGGTATGGGAATTGATATGATTCCAGAGGAAAAATTTCCTGAACTTAACA
GATGGATCAAGAATTTGCAAGAAATTGACATCGTGAGGGAATGCATTCCTCATAGAGAGA
AACAAATCGAGCATATGAAGAAAGTTGCAGTGGGTATCAAATCGGCATAAGAGATTAATT
ATCATAGTTTTTGGTCTGGAGTTGTTAACTATATTTTCCGTAGAACTGTTTGAACAATTT
ATTAAATAAAGATCAATGATACCTGCATCTGTAATGCTAATATTTTGTATGAAATCTAGA
TATCTCTTTACTATTTTTAATGAGG

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 4

CO CL2911Contig1 666 4 2 U
TTTTAGGCAGGAATCAAAATCGATATCTAATATAGTAATGAGACTTATTAGTATAATACA
AAAACAAGTTTCTCAATTATTCAAGGAACAATAGAGATCAGAAGATCATTGCACATCTTT
GTTTTATTATAATAAAATAAGACCAAAACTACAAGTTGTAGACATTAGGAGTTGTGAGTT
TTAGTACAAGGCATACTTCTGGGTCCAGCTTCGAGCCATGGCTTCGTACTTGACCTTGTC
GGTTTTGTATATGTGAGCAATATCTGGAACCAGAGGATCGTCCGGGTTTGGGTCTGTAAG
AAGAGAGCACACAGAGAGAAGCACCTTAGAGATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTT
GAGAATGTCCAAACAGATGTTCCCATTGTTGTTGATGTTAGGGTGAAACACTTTGGTTCT
GAATACAACCTTGGGAGGTTTGAACGGATAATCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGAAA
AACACCTCCCGAGTATGGACTTTCGTTAGGACCCATTATTGTAGCTTGCCAATGAAACAT
GTCTTCACCTACTGGACCTGCACTGCATGACATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAG
TTCTTTCAAAATCCTTCTCGTTGCCATAGTGTTTGATTGAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTG
GGATCC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 

AF RR4B141TF C 1
AF RR4AT37JQ U 5
AF RR4AT37TF C 5
AF RR4B141JQ U 5
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GGATCC

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DS 

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CC

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DS 

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CC

QA 1 662 1 662
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CAAGTTTCTCAATTATTCAAGGAACAATAGAGATCAGAAGATCATTGCACATCTTTGTTT
TATTATAATAAAATAAGACCAAAACTACAAGTTGTAGACATTAGGAGTTGTGAGTTTTAG
TACAAGGCATACTTCTGGGTCCAGCTTCGAGCCATGGCTTCGTACTTGACCTTGTCGGTT
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GAGCACACAGAGAGAAGCACCTTAGAGATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTTGAGA
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ACAACCTTGGGAGGTTTGAACGGATAATCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGAAAAACA
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TCACCTACTGGACCTGCACTGCATGACATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAGTTCT
TTCAAAATCCTTCTCGTTGCCATAGTGTTTGATTGAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTGGGAT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

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ATCGGTGAGGCATCCGAGTCACAACCATCCATTGCGCAGTCACAAATGCGAAGCAAAAGA
CGAAATCATCTGTTCAGGTTGCGATCTCGATCTGATTGGTGCAGCTTTCAAATGCACAAA
ATCCTGCGATTACTTCTTGCACAAGTCATGTTTTGCCCTTCCACGTGAAACCAACCACAA
ATCTCACCAGCCCCACTGTTCAACTTTACTCTATTCCCCAAAGTCAACGTATACGTGTCA
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ACATGTCGGTTGTGTTTCAATGCCTGAAACCGTGAAGCGTGAAGATCACGCGCATCCACT
CACTCTTCTTTACAGTTCTCCTTATACCGAACCCGGTTTAGTTTTCACCTGCGATGTTTG
TAAAGAAACCGTACCGGATAATCTCTGGGCGTACTACTGCATGGAATGTGATTACGGTAC
ACATTTACACTCATGTGCGAGAGAGGAAGAAGAGGCAAAGAAAGGAGAAGGAAGCAAAAG
CTCGGCGAATCAAGAGTTAGCTGCAATGCTCGAAGCTCAAAGAGAGATGGAGAATATGCA
GATTGAGATTCATTTGGCCGTGCAGAGTGCTTTGTTCGCGAAAAAAGCGAATAAGGCAGC
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ATTTACTCGTAATTTCGAATCTTTTTTACTTGCTGTTTGCGTTTCCTTGATTTCGTGTTT
CCAAGCTTTCATGTTGTTGTCCTTTTTATTTGTAATTGTTATCTGAAATTAATAAAAGCG
AAAAGTGTTGTTGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4E043TF U 5
AF RR4G650TF U 1
AF RR4G650JQ C 308
AF RR4E043JQ C 552
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GG
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CGGTTGTGTTTCAATGCCTGAAACCGTGAAGCGTGAAGATCACGCGCATCCACTCACTCT
TCTTTACAGTTCTCCTTATACCGAACCCGGTTTAGTTTTCACCTGCGATGTTTGTAAAGA
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GATTCATT
CGCCATGCAGAGTGCTT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4G650TF 770 0 0
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CGAAATCATCTGTTCAGGTTGCGATCTCGATCTGATTGGTGCAGCTTTCAAATGCACAAA
ATCCTGCGATTACTTCTTGCACAAGTCATGTTTTGCCCTTCCACGTGAAACCAACCACAA
ATCTCACCAGCCCCACTGTTCAACTTTACTCTATTCCCCAAAGTCAACGTATACGTGTCA
GGCCTGCGGTGAGTACGGATCAAGTTTCACCTACAACTGTTCGATCTGTCAGTACGATGT
ACATGTCGGTTGTGTTTCAATGCCTGAAACCGTGAAGCGTGAAGATCACGCGCATCCACT
CACTCTTCTTTACAGTTCTCCTTATACCGAACCCGGTTTAGTTTTCACCTGCGATGTTTG
TAAAGAAACCGTACCGGATAATCTCTGGGCGTACTACTGCATGGAATGTGATTACGGTAC
ACATTTACACTCATGTGCGAGAGAGGAAGAAGAGGCAAAGAAAGGAGAAGGAAGCAAAAG
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GATTGAGATTCATTTGGCCGTGCAGAGTGCTTTGTTCGCGAAAAA*GCGAATAAG*CAGC
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DS 

RD RR4G650JQ 612 0 0
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GGTTGTGTTTCAATGCCTGAAACCGTGAGGCGTGAAGATCACGCGCATCCACTCACTCTT
CTTTACAGTTCTCCTTATACCGAACCCGGTTTAGTTTTCACCTGCGATGTTTGTAAAGAA
ACCGTACCGGATAATCTCTGGGCGTACTACTGCATGGAATGTGATTACGGTACACATTTA
CACTCATGTGCGAGAGAGGAAGAAGAGGCAAAGAAAGGAGAAGGAAGCAAAAGCTCGGCG
AATCAAGAGTTAGCTGCAATGCTCGAAGCTCAAAGAGAGATGGAGAATATGCAGATTGAG
ATTCATTTGGCCGTGCAGAGTGCTTTGTTCGCGAAAAAAGCGAATAAGGCAGCTATTAGT
TATATCTAGTTTTAAGAATTTGTGATCCATTTGGTATTATCTTCACTTTTTCAATTTACT
CGTAATTTCGAATCTTTTTTACTTGCTGTTTGCGTTTCCTTGATTTCGTGTTTCCAAGCT
TTCATGTTGTTGTCCTTTTTATTTGTAATTGTTATCTGAAATTAATAAAAGCGAAAAGTG
TTGTTGCTTCCC

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DS 

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AAGAGTTAGCTGCAATGCTCGAAGCTCAAAGAGAGATGGAGAATATGCAGATTTAGATTC
ATTCGGCCATGCAGAGTGCTTTGTTCGCGAAAAAAGCGAATAAGGCAGCTATTAGTTATA
TCTAGTTTTAAGAATTTGTGATCCATTTGGTATTATCTTCACTTTTTCAATTTACTCGTA
ATTTCGAATCTTTTTTACTTGCTGTTTGCGTTTCCTTGATTTCGTGTTTCCAAGCTTTCA
TGTTGTTGTCCTTTTTATTTGTAATTGTTATCTGAAATTAATAAAAGCGAAAAGTGTTGT
TGC
CT

QA 1 363 1 363
DS 



AS 1 3

CO CL2913Contig1 1438 3 5 U
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GAAGTTTGTTGGGGTAGACACAACAGAAAAAAAACGTCCGAAATGGGTCCCACTCAGAAG
TGGATCTTTACAACAACGAATAGATATACATGCGCTACTGAGTCAGGACACATGTGGATA
CAAACTTAACTTCCAATAACAGTGAAGCAATAAAACAAAGTTGACTATTTTTGATGAGCA
AAGAGAATATGGTTTGGCTCAGTAAGGAACAAGCACACGGACAGAAGGTGGACCAGAGCT
CATGTCTTCCAGCAACAGATCCAGTAGCGCATTGGTTATAGGACCTTCTTTTCCATCAGC
AATAACTTCATCATCCCATTGAATCACAGGTTTGACGAGAACACCGCTCCCAAGCAGCAT
CATCTCATCAGCTTTCTTACCATCTTCCACCGTCACATCCATCACTCTCACACTTTTGAG
CATCCCCTTGCTAACAAGCTGTTCAGCGAGTGTAATCGTTCTCTTCGCCGTACAGCCACT
CAAAACGTTATCAAACCGCGGCATCACAAGCTCCTTACCACCATTAACAACAAACGCCAC
GTTCATGTTCGGACCTTCTGCTATAAACCCATCGTTATCCACCCAAATACCCGCAAATGC
ACCTTTGGCCTCTGCCTCCATTTGCGAGAGGGCGTTAGGGAGATAGTTAACGCTTTTCAC
TGTAGCAAACTCCGGAGGCTTGATGGGAACGGAAGATGTCACTACCTTGACACCTATTCG
GTCAACGTTGAAGTCCTTTTGGTACACAATGGCGTAAAGAGATGGTTTGGGACATTGAGA
TGGAGATAGTGAGAAGTCCCCAGGCCCAGCAGATAGCCAGTATCTTAGTGAGCCGTATCT
ACAACCAGAGACGCTCACGGTTTGGATGAGGATCCTTCTGATAGTTTCACGGTCAAACGG
GAGTGGAATCTTAGACATAGAGGCAGATCGTATAATACGGTCAAGGTGCTGATCCAATTC
ATAAAGGTGTCCGTTAATGATCATGGCGGTATCAAAGACACCGTGACCACGGTGAACCAT
GTGATCATCTAACGGAAGAACCATAGCTGCTGGATCAGTTGTGATTCCGCCAACAACGCT
TGAGTACATGGCCAAGAACTGTTTTCCTTCTCCTACTAGTTTCAGCCTCTCAACAACCTC
ATTGCTGGACAGAACAGGAACATTCCACGAGTGAGAGTTTGAACCAGAGCACATGAGAGT
CCTTCCTCGTCGTGTACGCGGAAATCGCAAGCCGCGACCAGAAGAACATTGTGCTCCGGA
CAGAATGCGTAGAGTACAATTGTTAACTGACAGCTCCGACAAGAAGCCGGTGATGGACTC
CGGAAAATAAACGAATCGAGATGACATTTGAAATAGTGAGCTGAACTGGTTAGAATCC


BQ
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CATCCCCTTGCTAACAAGCTGTTCAGCGAGTGTAATCGTTCTCTTCGCCGTACAGCCACT
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TTTACAACAACGAATAGATATACATGCGCTACTGAGTCAGGACACATGTGGATACAAACT
TAACTTCCAATAACAGTGAAGCAATAAAACAAAGTTGACTATTTTTGATGAGCAAAGAGA
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TTCCAGCAACAGATCCAGTAGCGCATTGGTTATAGGACCTTCTTTTCCATCAGCAATAAC
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ACA

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CCTTTTGGTACACAATGGCGTAAAGAGATGGTTTGGGACATTGAGATGGAGATAGTGAGA
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AGAACTGTTTTCCTTCTCCTACTAGTTTCAGCCTCTCAACAACCTCATTGCTGGACAGAA
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TACGCGGAAATCGCAAGCCGCGACCAGAAGAACATTGTGCTCCGGACAGAATGCGTAGAG
TACAATTGTTAACTGACAGCTCCGACAAGAAGCCGGTGATGGACTCCGGAAAATAAACGA
ATCGAGATGACATTTGAAATAGTGAGCTGAACTGGTTAGAATCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 2 4

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AGAGAGAAAAAAGCTAAAAAAGAAAAGAAAAGAAGAAAGAAGCTTTTGTAACTGAAAGAG
AGTTTTGCGAGAAGGTAACTGAATCTTCTTTCTAATGGTACAAGATAACGAAGCAACATA
GGCTGAAGAAAACCAAAAGCTTTTGACGTTGAGGCACACATATCCAAGTTTGTCTGTACG
TAGTGACCAACGAATGAGATAATGGCGTTTTTTTTCTCTAGATCTCACTGGAGGGGGCAC
TCCTTACGAGAGAAGCTTGTGGGTTACCTCTCACAATCACGCCTTTCAAGCGCGAGAGAG
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CCTGCCACCTCTCTTGCTGCCAGCGCTGACCGAGAACGACTAGCCCTGTGACAGCAGCTG
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CTATCTTTACTTACTCCTCTGG


BQ
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AF RR4DM37JQ U 1
AF RR4DM39JQ U 1
BS 1 294 RR4DM37JQ
BS 295 295 RR4DM39JQ
BS 296 720 RR4DM37JQ
BS 721 802 RR4DM39JQ

RD RR4DM37JQ 720 0 0
AAAATGAGAAAAAATCATAAGAAAAAACAAGTGTATGTGTTTATATATAAACAATAAGAC
AGAGAGAAAAAAGCTAAAAAAGAAAAGAAAAGAAGAAAGAAGCTTTTGTAACTGAAAGAG
AGTTTTGCGAGAAGGTAACTGAATCTTCTTTCTAATGGTACAAGATAACGAAGCAACATA
GGCTGAAGAAAACCAAAAGCTTTTGACGTTGAGGCACACATATCCAAGTTTGTCTGTACG
TAGTGACCAACGAATGAGATAATGGCGTTTTTTTTCTCTAGATCTCACTGGAGGTGGCAC
TCCTTACGAGAGAAGCTTGTGGGTTACCTCTCACAATCACGCCTTTCAAGCGCGAGAGAG
GTTCAAGTACCCTGCTCAGCTTCTCGCTACTGATGCTTGAATGCCACTTGAGCTGCAAAA
CCTGCCACCTCTCTTGCTGCCAGCGCTGACCGAGAACGACTAGCCCTGTGACAGCAGCTG
CAAAGAACAAAGACCACATCGCATTTGCTTCTCTCGTGCGTATATACATGGAAACAGCTC
TCCTTCTCCACCAAGCTTCGCAAGGAAGGTCGTGCCTTGCGTTTTTAGCATCCTTCTCAT
GTCCAGGTGTATCCTTTGCAGTATCAGAACGAAGATTCAACTCCTCCTCGGCATACTCAG
CCGGCTCAGAATGATCATCATACATGGCTGATTCCATGTACTGTCTCGAAGAGCCAAGCG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4DM39JQ 802 0 0
AAAATGAGAAAAAATCATAAGAAAAAACAAGTGTATGTGTTTATATATAAACAATAAGAC
AGAGAGAAAAAAGCTAAAAAAGAAAAGAAAAGAAGAAAGAAGCTTTTGTAACTGAAAGAG
AGTTTTGCGAGAAGGTAACTGAATCTTCTTTCTAATGGTACAAGATAACGAAGCAACATA
GGCTGAAGAAAACCAAAAGCTTTTGACGTTGAGGCACACATATCCAAGTTTGTCTGTACG
TAGTGACCAACGAATGAGATAATGGCGTTTTTTTTCTCTAGATCTCACTGGAGGGGGCAC
TCCTTACGAGAGAAGCTTGTGGGTTACCTCTCACAATCACGCCTTTCAAGCGCGAGAGAG
GTTCAAGTACCCTGCTCAGCTTCTCGCTACTGATGCTTGAATGCCACTTGAGCTGCAAAA
CCTGCCACCTCTCTTGCTGCCAGCGCTGACCGAGAACGACTAGCCCTGTGACAGCAGCTG
CAAAGAACAAAGACCACATCGCATTTGCTTCTCTCGTGCGTATATACATGGAAACAGCTC
TCCTTCTCCACCAAGCTTCGCAAGGAAGGTCGTGCCTTGCGTTTTTAGCATCCTTCTCAT
GTCCAGGTGTATCCTTTGCAGTATCAGAACGAAGATTCAACTCCTCCTCGGCATACTCAG
CCGGCTCAGAATGATCATCATACATGGCTGATTCCATGTACTGTCTCGAAGAGCCAAGCG
CAGGTTCACCATAGAGACTCTGTTCATCAGACATCCCTGACCTCCCGCATCAAGTCTTCG
CTATCTTTACTTACTCCTCTGG

QA 1 802 1 802
DS 



CO CL2914Contig2 631 2 2 U
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CAATCCAATCCAATCCAATCCAATCCAATACGTATCGTCTCTTCATAAGGTAACTCAAGC
AGAGTCCTTTTTTGTTTATAGGGTCATTGGAGATTCTGTGGTAGAAGATGGCTGACAAAG
AGGTGGAACATCCTACTCGTGGGAATGAATGGGAAGTTGTCTCCCTTACTTCATCAGCTT
ATGCTGCTTCTCCTGGTCCTTATAACGTTGAGTCAAGAAGAGATGAGAGGAAGTCTGATC
ATGCTTACTATGGAGCTGAGACTTCACGTGATTTGTTCATGTCTGACCACTTTGTATTCC
CACCTAGCCAGCATGAGGATTTACCCCTTGATGACGAACCTGTTTTCCAAGAGGAAGTAA
GTAAAGATAGCGAAGACTTGATGCCGGAAGGTCAGGGATTGTCTGATGAACAGAGTCTCT
ATGGTGAACCTGCGCTTGGCTCTTCGAGACAGTACATGGAATCAGCCATGTATGATGATC
ATTCTGAGCCGGCTGAGTATGCCGAGGAGGAGTTGAATCTTCGTTCTGATACTGCAAAGG
ATACACCTGGACATGAGAAGGATGCTAAAAA


BQ
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AF RR4DM37TF U 1
AF RR4DM39TF U 1
BS 1 618 RR4DM37TF
BS 619 631 RR4DM39TF

RD RR4DM37TF 618 0 0
GGGATCTTCAAGTCTCCTCCAGAGAGAAGGAGAAGCATCTCTCAGCACCAATCTCCGATC
CAATCCAATCCAATCCAATCCAATCCAATACGTATCGTCTCTTCATAAGGTAACTCAAGC
AGAGTCCTTTTTTGTTTATAGGGTCATTGGAGATTCTGTGGTAGAAGATGGCTGACAAAG
AGGTGGAACATCCTACTCGTGGGAATGAATGGGAAGTTGTCTCCCTTACTTCATCAGCTT
ATGCTGCTTCTCCTGGTCCTTATAACGTTGAGTCAAGAAGAGATGAGAGGAAGTCTGATC
ATGCTTACTATGGAGCTGAGACTTCACGTGATTTGTTCATGTCTGACCACTTTGTATTCC
CACCTAGCCAGCATGAGGATTTACCCCTTGATGACGAACCTGTTTTCCAAGAGGAAGTAA
GTAAAGATAGCGAAGACTTGATGCCGGAAGGTCAGGGATTGTCTGATGAACAGAGTCTCT
ATGGTGAACCTGCGCTTGGCTCTTCGAGACAGTACATGGAATCAGCCATGTATGATGATC
ATTCTGAGCCGGCTGAGTATGCCGAGGAGGAGTTGAATCTTCGTTCTGATACTGCAAAGG
ATACACCTGGACATGAGA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4DM39TF 631 0 0
GGGATCTTCAAGTCTCCTCCAGAGAGAAGGAGAAGCATCTCTCAGCACCAATCTCCGATC
CAATCCAATCCAATCCAATCCAATCCAATACGTATCGTCTCTTCATAAGGTAACTCAAGC
AGAGTCCTTTTTTGTTTATAGGGTCATTGGAGATTCTGTGGTAGAAGATGGCTGACAAAG
AGGTGGAACATCCTACTCGTGGGAATGAATGGGAAGTTGTCTCCCTTACTTCATCAGCTT
ATGCTGCTTCTCCTGGTCCTTATAACGTTGAGTCAAGAAGAGATGAGAGGAAGTCTGATC
ATGCTTACTATGGAGCTGAGACTTCACGTGATTTGTTCATGTCTGACCACTTTGTATTCC
CACCTAGCCAGCATGAGGATTTACCCCTTGATGACGAACCTGTTTTCCAAGAGGAAGTAA
GTAAAGATAGCGAAGACTTGATGCCGGAAGGTCAGGGATTGTCTGATGAACAGAGTCTCT
ATGGTGAACCTGCGCTTGGCTCTTCGAGACAGTACATGGAATCAGCCATGTATGATGATC
ATTCTGAGCCGGCTGAGTATGCCGAGGAGGAGTTGAATCTTCGTTCTGATACTGCAAAGG
ATACACCTGGACATGAGAAGGATGCTAAAAA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL2915Contig1 1002 4 12 U
GGAACAGAGGCATATACACACACACAACACACGCGCATACATACTCGAGAATCAAGAGAA
AAACTATCAAAAGATGAAACTAAGGAGATGTGAGATGGAAGAGGCAACGAAGGAAAAGAA
GATAACAATGATTGGATCTGCAGTTGAAGAACTCTCTGTTCTTTCTATAGCCAAGACCAC
AATAGTTACCACCGAAACATAAGCCACCACCAACATCATCAATCTACCATTAAAGCCTCT
CCTCTCATTTTGCAGATTAATCATCCAAGTTCTTGATAAGATTGGCCCGACAATGGCTGT
TCTCCGACAAGACATTGATCAAAATATTAAAAGATTAGAGGAGATGTGGGAATCTGATCC
CATCGTGTACTCAAATTTGGTTGAGATAATGAGAGAAGAAGCCAATGAAGGATCCTCTAA
GAAGCCTACAAGCTGTAGCAGAGCTGCTCTTTGGCTAACCAGAGCGATGGATTTTACATT
GGCACTATTGCAACGGCTGGTCAAAGACATGTCACAAAATATGGAACAAGCCGTAGAAGA
AAGTTATAACTTGACTATAAAACCATGGCATGGATGGATCTCTTGTGCTGCTTTCAAGGT
GGCTCTTAAGCTGGTACCAAACAATAACACATTCATTAACGTGCTTGCGGGTAAAGACGA
GAGTCACCAGATGGTTCAAGATGATATAAGAAGTTTAATTTCTTTGCTCATTCCACTTCT
AAGCCAACTCCATTCAATTTTGGAACTGTACGAAGTGCACAAACTAAAGTCAACGTGAGA
AAGAGAACGGAGGAGAAGGACTGCAGGAGTATAGTTTGGTTGTGACATAGTCTAACTTAA
AGCATCACTTTTCTGATGGGTTTATCAGTTTTTCTTCGAATGAGTTATATTATCTCGCAG
GCAATGATGATTTTCTTTTTGGTACATGCACTTTTGTTTATTTTAAGACATCTACACGAA
AATTGATGTTGAAATTATCTAAATTTGATGTTTTGGTTTCGT


BQ
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AF RR4DV36TF U 1
AF RR4DT28TF U 1
AF RR4DT28JQ C 307
AF RR4DV36JQ C 320
BS 1 598 RR4DT28TF
BS 599 599 RR4DV36TF
BS 600 678 RR4DT28TF
BS 679 679 RR4DT28JQ
BS 680 726 RR4DT28TF
BS 727 727 RR4DT28JQ
BS 728 744 RR4DT28TF
BS 745 745 RR4DT28JQ
BS 746 762 RR4DT28TF
BS 763 763 RR4DT28JQ
BS 764 772 RR4DT28TF
BS 773 1002 RR4DT28JQ

RD RR4DV36TF 623 0 0
GGAACAGAGGCATATACACACACACAACACACGCGCATACATACTCGAGAATCAAGAGAA
AAACTATCAAAAGATGAAACTAAGGAGATGTGAGATGGAAGAGGCAACGAAGGAAAAGAA
GATAACAATGATTGGATCTGCAGTTGAAGAACTCTCTGTTCTTTCTATAGCCAAGACCAC
AATAGTTACCACCGAAACATAAGCCACCACCAACATCATCAATCTACCATTAAAGCCTCT
CCTCTCATTTTGCAGATTAATCATCCAAGTTCTTGATAAGATTGGCCCGACAATGGCTGT
TCTCCGACAAGACATTGATCAAAATATTAAAAGATTAGAGGAGATGTGGGAATCTGATCC
CATCGTGTACTCAAATTTGGTTGAGATAATGAGAGAAGAAGCCAATGAAGGATCCTCTAA
GAAGCCTACAAGCTGTAGCAGAGCTGCTCTTTGGCTAACCAGAGCGATGGATTTTACATT
GGCACTATTGCAACGGCTGGTCAAAGACATGTCACAAAATATGGAACAAGCCGTAGAAGA
AAGTTATAACTTGACTATAAAACCATGGCATGGATGGATCTCTTGTGCTGCTTTCAAGGT
GGCTCTTAAGCTGGTACCAAACA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4DT28TF 772 0 0
GGAACAGAGGCATATACACACACACAACACACGCGCATACATACTCGAGAATCAAGAGAA
AAACTATCAAAAGATGAAACTAAGGAGATGTGAGATGGAAGAGGCAACGAAGGAAAAGAA
GATAACAATGATTGGATCTGCAGTTGAAGAACTCTCTGTTCTTTCTATAGCCAAGACCAC
AATAGTTACCACCGAAACATAAGCCACCACCAACATCATCAATCTACCATTAAAGCCTCT
CCTCTCATTTTGCAGATTAATCATCCAAGTTCTTGATAAGATTGGCCCGACAATGGCTGT
TCTCCGACAAGACATTGATCAAAATATTAAAAGATTAGAGGAGATGTGGGAATCTGATCC
CATCGTGTACTCAAATTTGGTTGAGATAATGAGAGAAGAAGCCAATGAAGGATCCTCTAA
GAAGCCTACAAGCTGTAGCAGAGCTGCTCTTTGGCTAACCAGAGCGATGGATTTTACATT
GGCACTATTGCAACGGCTGGTCAAAGACATGTCACAAAATATGGAACAAGCCGTAGAAGA
AAGTTATAACTTGACTATAAAACCATGGCATGGATGGATCTCTTGTGCTGCTTTCAAG*T
GGCTCTTAAGCTGGTACCAAACAATAACACATTCATTAACGTGCTTGCGGGTAAAGACGA
GAGTCACCAGATGGTTCA*GATGATATAAGAAGTTTAATTTCTTTGCTCATTCCACTTCT
AAGCCA*CTCCATTCAATTTTGGA*CTGTACGAAGTGCACAA*CTAAAGTCA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4DT28JQ 696 0 0
ACAAGACATTGATCAAAATATTAAAAGATTAGAGGAGATGTGGGAATCTGATCCCATCGT
GTACTCAAATTTGGTTGAGATAATGAGAGAAGAAGCCAATGAAGGATCCTCTAAGAAGCC
TACAAGCTGTAGCAGAGCTGCTCTTTGGCTAACCAGAGCGATGGATTTTACATTGGCACT
ATTGCAACGGCTGGTCAAAGACATGTCACAAAATATGGAACAAGCCGTAGAAGAAAGTTA
TAACTTGACTATAAAACCATGGCATGGATGGATCTCTTGTGCTGCTTTCAAGGTGGCTCT
TAAGCTGGTACCAAACAATAACACATTCATTAACGTGCTTGCGGGTAAAGACGAGAGTCA
CCAGATGGTTCAAGATGATATAAGAAGTTTAATTTCTTTGCTCATTCCACTTCTAAGCCA
ACTCCATTCAATTTTGGAACTGTACGAAGTGCACAAACTAAAGTCAACGTGAGAAAGAGA
ACGGAGGAGAAGGACTGCAGGAGTATAGTTTGGTTGTGACATAGTCTAACTTAAAGCATC
ACTTTTCTGATGGGTTTATCAGTTTTTCTTCGAATGAGTTATATTATCTCGCAGGCAATG
ATGATTTTCTTTTTGGTACATGCACTTTTGTTTATTTTAAGACATCTACACGAAAATTGA
TGTTGAAATTATCTAAATTTGATGTTTTGGTTTCGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4DV36JQ 683 0 0
CAAAATATTAAAAGATTAGAGGAGATGTGGGAATCTGATCCCATCGTGTACTCAAATTTG
GTTGAGATAATGAGAGAAGAAGCCAATGAAGGATCCTCTAAGAAGCCTACAAGCTGTAGC
AGAGCTGCTCTTTGGCTAACCAGAGCGATGGATTTTACATTGGCACTATTGCAACGGCTG
GTCAAAGACATGTCACAAAATATGGAACAAGCCGTAGAAGAAAGTTATAACTTGACTATA
AAACCATGGCATGGATGGATCTCTTGTGCTGCTTTCAAGGTGGCTCTTAAGCTGGTACCA
AACAATAACACATTCATTAACGTGCTTGCGGGTAAAGACGAGAGTCACCAGATGGTTCAA
GATGATATAAGAAGTTTAATTTCTTTGCTCATTCCACTTCTAAGCCAACTCCATTCAATT
TTGGAACTGTACGAAGTGCACAAACTAAAGTCAACGTGAGAAAGAGAACGGAGGAGAAGG
ACTGCAGGAGTATAGTTTGGTTGTGACATAGTCTAACTTAAAGCATCACTTTTCTGATGG
GTTTATCAGTTTTTCTTCGAATGAGTTATATTATCTCGCAGGCAATGATGATTTTCTTTT
TGGTACATGCACTTTTGTTTATTTTAAGACATCTACACGAAAATTGATGTTGAAATTATC
TAAATTTGATGTTTTGGTTTCGT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2916Contig1 697 4 8 U
TTTGGTGAATTTCTTCACATTATATAAGATGTAATGTGACATAACATAATGTAATGAGTA
CAGAGATTTCATGTGAAGAGAGATATATATCATATACAACACAAATACAATTAAGCAAGA
AGCTCCACCACGTCGTCTATCGATTTCAATGTCTTCTCGTAGTAGAGATACGACTCGTAA
ACCTTTGGCGTCCGTACGTAAAAGTCCAACTCACTCATGTTTTCCACTAGTTGGTTTGCG
GCTAGAACGTAATCATTCCGGCGACTCTCCGGCAAGATGTTCATGGCGTTGGTCAGATCC
TGAGACAGATAAGCCTGTTTTAATCGTAAGTAAAAGATGACGTACCTCCACGACATATGG
TCCAACATCTCCCTCATGTCTTTTAATCCTTCAGCCGTCTGTTTTATACGAGCCGCAGCG
TCCTCCGGCGATAACCCTGGCTGAAAGTATTTCTCCTTTATGAATGACCTCGTCCCCCAT
TTCTCCTGTGCTAATGCTGATGACGTGGGGACGATGGCCGTGAGTGTTATAAGCGTTGAC
AGGGTTCTCCGGCGAGTAAAGCTGTCTTGTTGGGATTCTCTGACGCAGCAAATGACAGGG
TATAGTGGGTTTACGCAGCGATGGTGATTTGGCCGGCGTAGATAAGGTGGTGGAGTTTTG
GTGGTGAAGGAGCTCATTTGTTTTTGTTTTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC41JQ U 4
AF RR4EC41TF C 1
AF RR4AX50JQ U 4
AF RR4AX50TF C 4
BS 1 5 RR4EC41TF
BS 6 416 RR4EC41JQ
BS 417 417 RR4AX50JQ
BS 418 586 RR4EC41JQ
BS 587 587 RR4AX50JQ
BS 588 613 RR4EC41JQ
BS 614 663 RR4AX50JQ
BS 664 697 RR4EC41TF

RD RR4EC41JQ 610 0 0
GG
TGAATTTCTTCACATTATATAAGATGTAATGTGACATAACATAATGTAATGAGTACAGAG
ATTTCATGTGAAGAGAGATATATATCATATACAACACAAATACAATTAAGCAAGAAGCTC
CACCACGTCGTCTATCGATTTCAATGTCTTCTCGTAGTAGAGATACGACTCGTAAACCTT
TGGCGTCCGTACGTAAAAGTCCAACTCACTCATGTTTTCCACTAGTTGGTTTGCGGCTAG
AACGTAATCATTCCGGCGACTCTCCGGCAAGATGTTCATGGCGTTGGTCAGATCCTGAGA
CAGATAAGCCTGTTTTAATCGTAAGTAAAAGATGACGTACCTCCACGACATATGGTCCAA
CATCTCCCTCATGTCTTTTAATCCTTCAGCCGTCTGTTTTATACGAGCCGCTGCGTCCTC
CGGCGATAACCCTGGCTGAAAGTATTTCTCCTTTATGAATGACCTCGTCCCCCATTTCTC
CTGTGCTAATGCTGATGACGTGGGGACGATGGCCGTGAGTGTTATAAGCGTTGACAGGGT
TCTCCGGCGAGTAAAGCTGTCTTGTTGGGATTCTCTGACGCGGCAAATGACAGGGTATAG
TGGGTTTA

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR4EC41TF 697 0 0
TTTGGTGAATTTCTTCACATTATATAAGATGTAATGTGACATAACATAATGTAATGAGTA
CAGAGATTTCATGTGAAGAGAGATATATATCATATACAACACAAATACAATTAAGCAAGA
AGCTCCACCACGTCGTCTATCGATTTCAATGTCTTCTCGTAGTAGAGATACGACTCGTAA
ACCTTTGGCGTCCGTACGTAAAAGTCCAACTCACTCATGTTTTCCACTAGTTGGTTTGCG
GCTAGAACGTAATCATTCCGGCGACTCTCCGGCAAGATGTTCATGGCGTTGGTCAGATCC
TGAGACAGATAAGCCTGTTTTAATCGTAAGTAAAAGATGACGTACCTCCACGACATATGG
TCCAACATCTCCCTCATGTCTTTTAATCCTTCAGCCGTCTGTTTTATACGAGCCGCTGCG
TCCTCCGGCGATAACCCTGGCTGAAAGTATTTCTCCTTTATGAATGACCTCGTCCCCCAT
TTCTCCTGTGCTAATGCTGATGACGTGGGGACGATGGCCGTGAGTGTTATAAGCGTTGAC
AGGGTTCTCCGGCGAGTAAAGCTGTCTTGTTGGGATTCTCTGACGCGGCAAATGACAGGG
TATAGTGGGTTTACGCAGCGATGGTGATTTGGCCGGCGTAGATAAGGTGGTGGAGTTTTG
GTGGTGAAGGAGCTCATTTGTTTTTGTTTTTGTTTCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4AX50JQ 661 0 0
CT
TGAATTTCTTCACATTATATAAGATGTAATGTGACATAACATAATGTAATGAGTACAGAG
ATTTCATGTGAAGAGAGATATATATCATATACAACACAAATACAATTAAGCAAGAAGCTC
CACCACGTCGTCTATCGATTTCAATGTCTTCTCGTAGTAGAGATACGACTCGTAAACCTT
TGGCGTCCGTACGTAAAAGTCCAACTCACTCATGTTTTCCACTAGTTGGTTTGCGGCTAG
AACGTAATCATTCCGGCGACTCTCCGGCAAGATGTTCATGGCGTTGGTCAGATCCTGAGA
CAGATAAGCCTGTTTTAATCGTAAGTAAAAGATGACGTACCTCCACGACATATGGTCCAA
CATCTCCCTCATGTCTTTTAATCCTTCAGCCGTCTGTTTTATACGAGCCGCAGCGTCCTC
CGGCGATAACCCTGGCTGAAAGTATTTCTCCTTTATGAATGACCTCGTCCCCCATTTCTC
CTGTGCTAATGCTGATGACGTGGGGACGATGGCCGTGAGTGTTATAAGCGTTGACAGGGT
TCTCCGGCGAGTAAAGCTGTCTTGTTGGGATTCTCTGACGCAGCAAATGACAGGGTATAG
TGGGTTTACGCAGCGATGGTGATTTGGCCGGCGTAGATAAGGTGGTGGAGTTTTGGTG
C

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4AX50TF 661 0 0
CT
TGAATTTCTTCACATTATATAAGATGTAATGTGACATAACATAATGTAATGAGTACAGAG
ATTTCATGTGAAGAGAGATATATATCATATACAACACAAATACAATTAAGCAAGAAGCTC
CACCACGTCGTCTATCGATTTCAATGTCTTCTCGTAGTAGAGATACGACTCGTAAACCTT
TGGCGTCCGTACGTAAAAGTCCAACTCACTCATGTTTTCCACTAGTTGGTTTGCGGCTAG
AACGTAATCATTCCGGCGACTCTCCGGCAAGATGTTCATGGCGTTGGTCAGATCCTGAGA
CAGATAAGCCTGTTTTAATCGTAAGTAAAAGATGACGTACCTCCACGACATATGGTCCAA
CATCTCCCTCATGTCTTTTAATCCTTCAGCCGTCTGTTTTATACGAGCCGCAGCGTCCTC
CGGCGATAACCCTGGCTGAAAGTATTTCTCCTTTATGAATGACCTCGTCCCCCATTTCTC
CTGTGCTAATGCTGATGACGTGGGGACGATGGCCGTGAGTGTTATAAGCGTTGACAGGGT
TCTCCGGCGAGTAAAGCTGTCTTGTTGGGATTCTCTGACGCAGCAAATGACAGGGTATAG
TGGGTTTACGCAGCGATGGTGATTTGGCCGGCGTAGATAAGGTGGTGGAGTTTTGGTG
C

QA 3 660 3 660
DS 



AS 1 4

CO CL2917Contig1 774 4 4 U
AATCGGCATGACGAATCCCGACAAACAGAATCCGGTCGAAGCTCCCGACGTCGAGGCAGC
GCCGGCGGCGAAGACGGAGACGACGCAGGGATCCGGAACGTCATCGTTTTCTGCGATTAC
TCAGAGATGGAAGAGGGAGGATTTGGTAAAGAAAGCGTCTCCGATCGCGAGAGGGTTGTG
TCTTCTGTTCTCTCTCCTCGCTTTCATCATCATGGTCTCTAACTAACATGGATACGGTAG
AAACTTCGACGACTACGAAGAGTACAAATATGTTTTAGCTATTGCGATCATCTCGACGGT
GTACACAGCGTGGCAAACGTTTGTACATCTCTCGAAGAGAGAGTTCTTTGATCGCCGGAC
TTCCATGTTGGTCGATTTTTCCGGTGATCAGATTGTGGCTTATCTTCTCATATCAGCTGC
ATCGTCTGCGATACCATTGACCAACAGATTCATAGAAGGTCAAGATAACATATTCACTGA
TTCTGCTGCTTCAGCAATCAGCATGACTGTCTTCGCCTTCGTCTCTCTAGCTCTCTCTGG
TCTCTTCTCCGGTTACAAACTCTCCACTCATTCTTTTATCTGAATCTGGTTATAAACCTA
ATCATTTGCTTTTCAATCGTTTATTTTATACCGTGTTGATGCTTGAGAGACACGTGTAAA
ATGTCATTCATTCTTTAACTTCCTGTTATGTTGGATCTGTGACTGTTTGATGATACATTG
TACGAAGTGAAAACATTGATTGGCTTAATATCATTTTT*CTATTTCTATGGTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4B466JQ C 1
AF RR4B466TF U 23
AF RR4B995JQ C 1
AF RR4B995TF U 1
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TCTCTTCTCCGGTTACAAACTCTCCACTCATTCTTTTATCTGAATCTGGTTATAAACCTA
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QA 1 774 1 774
DS 

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ACGCAGGGATCCGGAACGTCATCGTTTTCTGCGATTACTCAGAGATGGAAGAGGGAGGAT
TTGGTAAAGAAAGCGTCTCCGATCGCGAGAGGGTTGTGTCTTCTGTTCTCTCTCCTCGCT
TTCATCATCATGGTCTCTAACTAACATGGATACGGTAGAAACTTCGACGACTACGAAGAG
TACAAATATGTTTTAGCTATTGCGATCATCTCGACGGTGTACACAGCGTGGCAAACGTTT
GTACATCTCTCGAAGAGAGAGTTCTTTGATCGCCGGACTTCCATGTTGGTCGATTTTTCC
GGTGATCAGATTGTGGCTTATCTTCTCATATCAGCTGCATCGTCTGCGATACCATTGACC
AACAGATTCATAGAAGGTCAAGATAACATATTCACTGATTCTGCTGCTTCAGCAATCAGC
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QA 1 752 1 752
DS 

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TCTTCTGTTCTCTCTCCTCGCTTTCATCATCATGGTCTCTAACTAACATGGATACGGTAG
AAACTTCGACGACTACGAAGAGTACAAATATGTTTTAGCTATTGCGATCATCTCGACGGT
GTACACAGCGTGGCAAACGTTTGTACATCTCTCGAAGAGAGAGTTCTTTGATCGCCGGAC
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TACGAAGTGAAAACATTGATTGGCTTAATATCATTTTT*CTATTTCTATGGTGC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4B995TF 774 0 0
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GCCGGCGGCGAAGACGGAGACGACGCAGGGATCCGGAACGTCATCGTTTTCTGCGATTAC
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TCTTCTGTTCTCTCTCCTCGCTTTCATCATCATGGTCTCTAACTAACATGGATACGGTAG
AAACTTCGACGACTACGAAGAGTACAAATATGTTTTAGCTATTGCGATCATCTCGACGGT
GTACACAGCGTGGCAAACGTTTGTACATCTCTCGAAGAGAGAGTTCTTTGATCGCCGGAC
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ATCGTCTGCGATACCATTGACCAACAGATTCATAGAAGGTCAAGATAACATATTCACTGA
TTCTGCTGCTTCAGCAATCAGCATGACTGTCTTCGCCTTCGTCTCTCTAGCTCTCTCTGG
TCTCTTCTCCGGTTACAAACTCTCCACTCATTCTTTTATCTGAATCTGGTTATAAACCTA
ATCATTTGCTTTTCAATCGTTTATTTTATACCGTGTTGATGCTTGAGAGACACGTGTAAA
ATGTCATTCATTCTTTAACTTCCTGTTATGTTGGATCTGTGACTGTTTGATGATACATTG
TACGAAGTGAAAACATTGATTGGCTTAATATCATTTTT*CTATTTCTATGGTGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 4

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CGCAGAGAATGGGTTTCTTCCTCAGTTCGTAGACCAGACAACGTTTTACAACCAGATAGT
TCTGAGTCACCTCTTGCCGGCGAATCTATGGGAGCCTTTACCACGTTTCCTCCAAACATG
GCTCCGAAGCTACCTCGCCGGAAACTTATTTTACTTCATCTCTGCCTTCCTCTGGTGCTT
CTACATCTATTACCTTAAACTCAATGTTTACATCCCCGAAGATTCTATTCCTACAAAAAA
GGCAATGATAATGCAAATACATGTAGCAATGAAGGCTATGCCTTGGTACACACTCCTTCC
AACTGTCTCTGAGTATATGATCGAGCGTGGTTGGACCAAATGTTACTCTACACTTGACCA
ATTCAACTGGTTCCTCTGTTTGACTTACATCGTGCTCTATCTTGTTTTTGTTGAGTTTGG
GATGTATTGGGCTCACAGACAGCTTCATGACATTAAATTTCTGTATAAGCATCTCCATGC
CACCCACCATATGTACAACAAACAAAACACACTCTCTCCATTTGCTGGGTTCGCGTTCCA
TCCGTTGGACGGGATACTTCAGGCTTTACCGCACGTGATAGCTATGTTCATAGTGCCAGT
TCATCTCATAACGCATCTGAGTCTTATGTTTTTGGAAGGGATATGGACAGCGAGCATCCA
TGATTGCATCCATGGTAACATATGGCCTATAATGGGTGCTGGATACCATACCATACATCA
TACAACATACAAGCACAACTATGGTAACTATACTATTTTTATGGATTGGATGTTTGGCAC
CCTTGAGATTCCTGTAGCCGAAGATGACAGCTTCTATGAGAAAGCAAAGTGAGATTAATT
TCACATTTGTTTACCCTTGCCTGCATATGTTGTTCTTCTCCTGAGCCTTAGCTTTGTAAT
CACTTTGTTGGAATAAGAAACATGACTTACAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C216TF U 1
AF RR4CE62TF U 1
AF RR4C216JQ C 258
AF RR4CE62JQ C 309
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BS 678 992 RR4C216JQ

RD RR4C216TF 618 0 0
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TCTGAGTCACCTCTTGCCGGCGAATCTATGGGAGCCTTTACCACGTTTCCTCCAAACATG
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CTACATCTATTACCTTAAACTCAATGTTTACATCCCCGAAGATTCTATTCCTACAAAAAA
GGCAATGATAATGCAAATACATGTAGCAATGAAGGCTATGCCTTGGTACACACTCCTTCC
AACTGTCTCTGAGTATATGATCGAGCGTGGTTGGACCAAATGTTACTCTACACTTGACCA
ATTCAACTGGTTCCTCTGTTTGACTTACATCGTGCTCTATCTTGTTTTTGTTGAGTTTGG
GATGTATTGGGCTCACAGACAGCTTCATGACATTAAATTTCTGTATAAGCATCTCCATGC
CACCCACCATATGTACAACAAACAAAACACACTCTCTCCATTTGCTGGGTTCGCGTTCCA
TCCGTTGGACGGGATACT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4CE62TF 619 0 0
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CGCAGAGAATGGGTTTCTTCCTCAGTTCGTAGACCAGACAACGTTTTACAACCAGATAGT
TCTGAGTCACCTCTTGCCGGCGAATCTATGGGAGCCTTTACCACGTTTCCTCCAAACATG
GCTCCGAAGCTACCTCGCCGGAAACTTATTTTACTTCATCTCTGCCTTCCTCTGGTGCTT
CTACATCTATTACCTTAAACTCAATGTTTACATCCCCGAAGATTCTATTCCTACAAAAAA
GGCAATGATAATGCAAATACATGTAGCAATGAAGGCTATGCCTTGGTACACACTCCTTCC
AACTGTCTCTGAGTATATGATCGAGCGTGGTTGGACCAAATGTTACTCTACACTTGACCA
ATTCAACTGGTTCCTCTGTTTGACTTACATCGTGCTCTATCTTGTTTTTGTTGAGTTTGG
GATGTATTGGGCTCACAGACAGCTTCATGACATTAAATTTCTGTATAAGCATCTCCATGC
CACCCACCATATGTACAACAAACAAAACACACTCTCTCCATTTGCTGGGTTCGCGTTCCA
TCCGTTGGACGGGATACT
T

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4C216JQ 735 0 0
AACTCAATGTTTACATCCCCGAAGATTCTATTCCTACAAAAAAGGCAATGATAATGCAAA
TACATGTAGCAATGAAGGCTATGCCTTGGTACACACTCCTTCCAACTGTCTCTGAGTATA
TGATCGAGCGTGGTTGGACCAAATGTTACTCTACACTTGACCAATTCAACTGGTTCCTCT
GTTTGACTTACATCGTGCTCTATCTTGTTTTTGTTGAGTTTGGGATGTATTGGGCTCACA
GACAGCTTCATGACATTAAATTTCTGTATAAGCATCTCCATGCCACCCACCATATGTACA
ACAAACAAAACACACTCTCTCCATTTGCTGGGTTCGCGTTCCATCCGTTGGACGGGATAC
TTCAGGCTTTACCGCACGTGATAGCTATGTTCATAGTGCCAGTTCATCTCATAACGCATT
TGAGTCTTATGTTTTTGGAAGGGATATGGACAGCGAGCATCCATGATTGCATCCATGGTA
ACATATGGCCTATAATGGGTGCTGGATACCATACCATACATCATACAACATACAAGCACA
ACTATGGTAACTATACTATTTTTATGGATTGGATGTTTGGCACCCTTGAGATTCCTGTAG
CCGAAGATGACAGCTTCTATGAGAAAGCAAAGTGAGATTAATTTCACATTTGTTTACCCT
TGCCTGCATATGTTGTTCTTCTCCTGAGCCTTAGCTTTGTAATCACTTTGTTGGAATAAG
AAACATGACTTACAC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4CE62JQ 684 0 0
TAATGCAAATACATGTAGCAATGAAGGCTATGCCTTGGTACACACTCCTTCCAACTGTCT
CTGAGTATATGATCGAGCGTGGTTGGACCAAATGTTACTCTACACTTGACCAATTCAACT
GGTTCCTCTGTTTGACTTACATCGTGCTCTATCTTGTTTTTGTTGAGTTTGGGATGTATT
GGGCTCACAGACAGCTTCATGACATTAAATTTCTGTATAAGCATCTCCATGCCACCCACC
ATATGTACAACAAACAAAACACACTCTCTCCATTTGCTGGGTTCGCGTTCCATCCGTTGG
ACGGGATACTTCAGGCTTTACCGCACGTGATAGCTATGTTCATAGTGCCAGTTCATCTCA
TAACGCATCTGAGTCTTATGTTTTTGGAAGGGATATGGACAGCGAGCATCCATGATTGCA
TCCATGGTAACATATGGCCTATAATGGGTGCTGGATACCATACCATACATCATACAACAT
ACAAGCACAACTATGGTAACTATACTATTTTTATGGATTGGATGTTTGGCACCCTTGAGA
TTCCTGTAGCCGAAGATGACAGCTTTTATGAGAAAGCAAAGTGAGATTAATTTCACATTT
GTTTACCCTTGCCTGCATATGTTGTTCTTCTCCTGAGCCTTAGCTTTGTAATCACTTTGT
TGGAATAAGAAACATGACTTACAC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 4

CO CL2919Contig1 1184 4 6 U
GCTTGTTAAAAATTCTTTAATTTGCAAGAAAAATATTACCTTTTGATCCATAAAAGAGAG
AGAAAAACAGAGTCGAGAACAGTAGTACAAAGATAAAAATGTGAGCGTTCTGTGAATTTG
GAAGGGGTTTACAACAAGAAAAACTTGAATGGGACTTTGATCATTCATCCTCCTTCCACA
TGTCTGCAAATTCATCAGGCTCCAACGGGTTTGAAAGCTCATGCATCTTTCTCCTTGTTT
TTGCTTTGATCTTCTTTGCAAATTTCCCTGCTTTATTTCTTTTCTCCAAGGCTCGGATCT
GGTTTGGAGATACGTAGAATGGGTTCTCGTAAAGGGTTGGACCTCCAAAGCTTCCTCCAA
AGATCTTAATCGGGTTTAAACAAAACCTTGGACCAACCTCGACAAGGGTCATTTTATCAA
GACCACCACGAGCAACCTTGTCTGCCTCATTATGAGGTACTGATATCTGGTAATTACGGA
ACCAGATATGGTCATCGACGATAGAGAAAGCAAAAACATGGTCATGGTAAGGTTTAGACT
TTCTGTGCTCCTTGGGGATTCCAAAAACCTGTGTTAACATCTCTTTCAAGAGTTTCCAGT
GTACATCTTTATCGAAGTTAGATGAGAAGGTCAAGAGAGGACGTGACCCTTTCAGATGAT
TTCCAGTGAGTTTCAGCTCCTCCATTGTGTGAACAGCATTAACCAAGAACTTAACAGAGG
GTCCACTAGGAGACTTGACCATCCACATGTAAAGATCTTTATGCTTCCTACACTCGAAGA
ACAAGCAGGAAGAAGAGCCCTTAAGCTCAACGAGCTCATTAAGGGTCGCGCCTTTACCGC
TCTTAGCTTCAACCTTACTATCCTTCTTACAATGAGGCAGAAGTGACACTATGTTCAACA
TCAGATGTCGGTACCTGAAACTAATCCGACGGGAACAAGTAACGAGAACCTTCTCTTTAT
TCCTGAATCCAGGCACAGACACAGACGCAGCCGCTTCCTTAGCTTCCTCCACATCTTCTT
TCTTATCTTTCCAACCCAAAAGCGTTCTTCTAGGTCTCTCCGGAGCAGAATCGTCCTTCA
CCGGCGCCGCCGCTTCTGCCTCGCTATGCTTTCTCTTCCTCCCCATTCTTTTTTTTCTCT
ATAACAGAAACAGCGCTAAAACTCTTTCTAGGGTTTTAGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EJ48JQ U 24
AF RR4GY22JQ U 1
AF RR4GY22TF C 451
AF RR4EJ48TF C 557
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BS 780 1049 RR4GY22TF
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AS 0 0

AS 1 3

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BQ
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AF RR4GQ27JQ U 162
AF RR4DY86JQ U 1
AF RR4DY86TF C 113
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TGTTCGCAAGACCAGAGTGCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTCTTCTCTTTGC
TGAACTGAACTTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTGACCAAGAAACAGTTGTTTCTCT
TAACGATCTCCCATACCAATTGTCCCGGTACTGTCGCCATTTCCAAGACC
TA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DY86TF 606 0 0
GTGGTTCAACTTCAACAAAAACAACTTCAATAAAAACCCTTCAGCTAAAGCTTTTACTCA
AAAAAAAAACAAACAAACAGTTTCTGGAATAAAAGCTTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTT
GGCACCGGACTTGGCAACCCTAATGCTTTTGCTGATGACACTGAGTCTGGCAAGAGCGAA
TTTCTTCAAGTCTGGCCTGTAGTAGTTGTCAGCCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACGT
CCTGGGGAATTCCTTCTTAAGGATAGACTTGTTGACAGAGACCTTAGGCTTGTTCTGCTT
CCTGGTCTTGGTGGTGGCGAGGACAACACCTTGTTCCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCAC
TGTCTTCTTGTTCGCAAGACCAGAGTGCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTCTT
CTCTTTGCTGAACTGAACTTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTGACCAAGAAACAGTT
GTTTCTCTTAACGATCTCCCATACCAATTGTCCCGGTACTGTCGCCATTTCCAAGACCTA
TTCGTGAGAGAGACTGAGAGAGAGAGAGACTCGGGTTTAGATGGTGATGATGCCGGAGCG
GAGCCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 4

CO CL2922Contig1 1211 4 6 U
GGACTTTTCCAAGCTCCACCAACCATTCAGTGAAGATGAAGAAGAGGAAGCAAAAACGAT
GTCGTCTGAAGCGGAGAAGTCAACGAATTCAGCTCCGGCGACACCGCCGCCGTATTTCTG
GGGAGACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACTTCTCAAGGTGTGCGTAACACCAAATCCTA
CTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTTCTTCCCTTAGATGGTGACAT
CAAAGGAACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGATGTTCCAGAA
GATCTGCATGAGCTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATCTTCTCGGTCA
CGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTGCAGCAACATC
ATTGTCACTCTTTAAGCATGTACGTTACAGCGAGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTTCCT
CTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACACTTCTCATGTACTTTCAATCCGAACCGGA
TACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGGATATGAAACC
GAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGC
AATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCCATGACCCGGAAAAGCTCAAGATCAT
CGCAGCTAACCCACAAAGGTACACAGGGAAGCCTAGAGTTGGAACAATGAGAGAGTTACT
AAGGAAGACTCTATACGTGCAGGAGAACTTCGGGAGAGTAACTATTCCGTTTCTGACGGT
GCACGGGACAGCTGATGGAGTGACGTGTCCTTCATCATCAAAGCTACTATATGAGAAGGC
ATCTAGCGCTGATAAAACACTGAAGCTGTATGATGGGATGTACCATTCATTGATTCAGGG
AGAGCCAGATGAGAATGTTGCAATCGTGTTGAAGGATATGAGAGAGTGGATTGATGAGAG
GGTTGAGAGGTATGGATCTAAGTAAAAGCAAGCTTGAAAGTTACATTTTGCGAGGAGAAA
TGTGCGTTGATATCATGGTTCATAGTGGTTGTTGATTCGAGTTGTTACGTTGTTTGTGTT
TTATCCAAGAACATGACTTTTGGGATGTAATAATAAACTTATATATATCATGGATTACAG
AATCCCTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E166TF U 1
AF RR4E494TF U 1
AF RR4E494JQ C 635
AF RR4E166JQ C 636
BS 1 662 RR4E166TF
BS 663 738 RR4E494TF
BS 739 778 RR4E494JQ
BS 779 779 RR4E166JQ
BS 780 1176 RR4E494JQ
BS 1177 1211 RR4E166JQ

RD RR4E166TF 662 0 0
GGACTTTTCCAAGCTCCACCAACCATTCAGTGAAGATGAAGAAGAGGAAGCAAAAACGAT
GTCGTCTGAAGCGGAGAAGTCAACGAATTCAGCTCCGGCGACACCGCCGCCGTATTTCTG
GGGAGACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACTTCTCAAGGTGTGCGTAACACCAAATCCTA
CTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTTCTTCCCTTAGATGGTGACAT
CAAAGGAACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGATGTTCCAGAA
GATCTGCATGAGCTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATCTTCTCGGTCA
CGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTGCAGCAACATC
ATTGTCACTCTTTAAGCATGTACGTTACAGCGAGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTTCCT
CTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACACTTCTCATGTACTTTCAATCCGAACCGGA
TACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGGATATGAAACC
GAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGC
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4E494TF 741 0 0
GGACTTTTCCAAGCTCCACCAACCATTCAGTGAAGATGAAGAAGAGGAAGCAAAAACGAT
GTCGTCTGAAGCGGAGAAGTCAACGAATTCAGCTCCGGCGACACCGCCGCCGTATTTCTG
GGGAGACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACTTCTCAAGGTGTGCGTAACACCAAATCCTA
CTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTTCTTCCCTTAGATGGTGACAT
CAAAGGAACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGATGTTCCAGAA
GATCTGCATGAGCTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATCTTCTCGGTCA
CGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTGCAGCAACATC
ATTGTCACTCTTTAAGCATGTACGTTACAGCGAGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTTCCT
CTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACACTTCTCATGTACTTTCAATCCGAACCGGA
TACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGGATATGAAACC
GAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGC
AATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCCATGACCCGGAAAAGCTCAAGATCAT
CGCAGCTAACCCACAAAG
TAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4E494JQ 542 0 0
T
TTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGCAATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCC
ATGACCCGGAAAAGCTCAAGATCATCGCAGCTAACCCACAAAGGTACACAGGGAAGCCTA
GAGTTGGAACAATGAGAGAGTTATTAAGGAAGACTCTATACGTGCAGGAGAACTTCGGGA
GAGTAACTATTCCGTTTCTGACGGTGCACGGGACAGCTGATGGAGTGACGTGTCCTTCAT
CATCAAAGCTACTATATGAGAAGGCATCTAGCGCTGATAAAACACTGAAGCTGTATGATG
GGATGTACCATTCATTGATTCAGGGAGAGCCAGATGAGAATGTTGCAATCGTGTTGAAGG
ATATGAGAGAGTGGATTGATGAGAGGGTTGAGAGGTATGGATCTAAGTAAAAGCAAGCTT
GAAAGTTACATTTTGCGAGGAGAAATGTGCGTTGATATCATGGTTCATAGTGGTTGTTGA
TTCGAGTTGTTACGTTGTTTGTGTTTTATCCAAGAACATGACTTTTGGGATGTAATAATA
A

QA 2 542 2 542
DS 

RD RR4E166JQ 576 0 0
TTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGCAATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCC
ATGACCCGGAAAAGCTCAAGATCATCGCAGCTAACCCACAAAGGTACACAGGGAAGCCTA
GAGTTGGAACAATGAGAGAGTTACTAAGGAAGACTCTATACGTGCAGGAGAACTTCGGGA
GAGTAACTATTCCGTTTCTGACGGTGCACGGGACAGCTGATGGAGTGACGTGTCCTTCAT
CATCAAAGCTACTATATGAGAAGGCATCTAGCGCTGATAAAACACTGAAGCTGTATGATG
GGATGTACCATTCATTGATTCAGGGAGAGCCAGATGAGAATGTTGCAATCGTGTTGAAGG
ATATGAGAGAGTGGATTGATGAGAGGGTTGAGAGGTATGGATCTAAGTAAAAGCAAGCTT
GAAAGTTACATTTTGCGAGGAGAAATGTGCGTTGATATCATGGTTCATAGTGGTTGTTGA
TTCGAGTTGTTACGTTGTTTGTGTTTTATCCAAGAACATGACTTTTGGGATGTAATAATA
AACTTATATATATCATGGATTACAGAATCCCTTTCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2924Contig1 703 4 7 U
GGACAATCAATCAGAGTGAGTGCAGAAAGAAAATAAAAAAGATTGCCGAGAGCACAAACC
CTAAATGGCATCTCTCTCCATGGCCTCCGTTACCCTTAGGTTCTCTCCTTTACGCTCTTC
TCCAAAGGTTTCAACTCACGGGTCCGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGC
CTCAGCTCACTGCATATCTGGGCTGCGTGCGGTTATTCCGCAGAAGATAAACACACTCGT
TTCTCAGAATCCTCAGAGGCTTCAGTCTCTTACACTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGAT
GAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAG
GAGGAGATCCGGGAAGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCT
TTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATA
CCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAGGCCTAGGGTAGGGGG*TGATCCTTT
CCGTACCTTTATTTCTCATTTTGTAATCTAAATTGTGATAGAAAGAAATACTTTTGTTTT
GTGATTATTTATTCAATGAGTTTCGCATTTGTGTCTCTTCTTACTCTTAGTTTTCTTGTC
TGGAATGACGAAAGATTTTGTGAATACGACGCAAGTTGTTCGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C130JQ C 16
AF RR4C130TF U 16
AF RR4A211TF U 1
AF RR4A211TFB U 1
BS 1 366 RR4A211TF
BS 367 367 RR4C130TF
BS 368 482 RR4A211TF
BS 483 483 RR4C130TF
BS 484 530 RR4A211TF
BS 531 531 RR4A211TFB
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GG
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CTGGGCTGCGTGCGGTTATTCCGCAGAAGATAAACACACTCGTTTTTCAGAATCCTCAGA
GGCTTCAGTTTCTTACACTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGGCGT
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GAGTTTCGC
C

QA 3 611 3 611
DS 

RD RR4C130TF 612 0 0
GG
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CCATGGCCTCCGTTACCCTTAGGTTCTCTCCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCAACTC
ACGGGTCCGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCATAT
CTGGGCTGCGTGCGGTTATTCCGCAGAAGATAAACACACTCGTTTCTCAGAATCCTCAGA
GGCTTCAGTCTCTTACACTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGGCGT
CAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCCGGGAAGC
AGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACGAAG
TTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATCGAA
AGGCGACTTAAAAACAAGGCCTAGGGTAGGGGGGTGATCCTTTCCGTACCTTTATTTCTC
ATTTTGTAATCTAAATTGTGATAGAAAGAAATACTTTTGTTTTGTGATTATTTATTCAAT
GAGTTTCGC
C

QA 3 611 3 611
DS 

RD RR4A211TF 703 0 0
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CTAAATGGCATCTCTCTCCATGGCCTCCGTTACCCTTAGGTTCTCTCCTTTACGCTCTTC
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CTCAGCTCACTGCATATCTGGGCTGCGTGCGGTTATTCCGCAGAAGATAAACACACTCGT
TTCTCAGAATCCTCAGAGGCTTCAGTCTCTTACACTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGAT
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TTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATA
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QA 1 703 1 703
DS 

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CTAAATGGCATCTCTCTCCATGGCCTCCGTTACCCTTAGGTTCTCTCCTTTACGCTCTTC
TCCAAAGGTTTCAACTCACGGGTCCGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGC
CTCAGCTCACTGCATATCTGGGCTGCGTGCGGTTATTCCGCAGAAGATAAACACACTCGT
TTCTCAGAATCCTCAGAGGCTTCAGTCTCTTACACTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGAT
GAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAG
GAGGAGGTCCGGGAAGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCT
TTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATA
CCCGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAGGCCTAGGGTAGGGGG*TGATCCTTT
CCGTACCTTTATTTCTCATTTTGTAATCTAAATTGTGATAGAAAGAAATACTTTTGTTTT
GTGATTATTTATTCAATGAGTTTCGCATTTGTGTCTCTTCTTACTCTTAGTTTTCTTGTC
TGGAATGACGAAAGATTTTGTGAATACGACGCAAGTTGTTCGT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 3

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TTGAACTCTGGCGACTGTGCATGTTTCAAGCAGACTGCTAATCCTCCAATTGTGTGGTTA
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4DB66JQ U 6
AF RR4DW11JQ U 1
AF RR4DY49JQ U 1
BS 1 746 RR4DW11JQ
BS 747 782 RR4DY49JQ

RD RR4DB66JQ 602 0 0
CAAAC
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AAACTCCAGGAATGGGGAAACGAGAGGTGAAGGATTCGACTCTATCCTTGAGGCTTTCCA
CTCTCTCTCTCAATGGGAACTCAGGAGATGTTACCAACTTGGTGAATTCTACAAGCTTTG
TTCCCGAAACTAGCTTCTTTGCTTCCATCGTTATCTCCACTCCTTCCTTGATCAAGTCAG
CAACCACCACAAAGTCTTTCTCTGACAGTCCTCTTGTCGTCATTGCAGGTGTTCCTATCC
TTATTCCCCCTGGAACCAACGCACTTTTGTCCCCAGGGACAGAGTTCTTGTTTAGTGTAA
TAGATGCCATGTCTAAGATTTTCTCAACCCTTGCACCATCCATGCCCAATGGTCTAA

QA 6 602 6 602
DS 

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TGTAACCAAAGGAGAATATCCACTAGATTCAAACGAAAAATTTACTAAGTTTAAATTTTT
GAAGAAGGAAAAAGGAAACTTGGGACGCAGGCAAGCTAGAGGTGCTGATTAAACCCTAGA
AGATAAAGGTAACTGATAGATAATAAAAGGTACAACAAGACGCCGTCTGTTTTTTGTTTC
CAATGATTTCAAACTCCAGGAATGGGGAAACGAGAGGTGAAGGATTCGACTCTATCCTTG
AGGCTTTCCACTCTCTCTCTCAATGGGAACTCAGGAGATGTTACCAACTTGGTGAATTCT
ACAAGCTTTGTTCCCGAAACTAGCTTCTTTGCTTCCATCGTTATCTCCACTCCTTCCTTG
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GGTCTAAGATCAACGAGAACCAAGTGGTTATCGCTGCCACCAGAAACCAGCTTAAACCCG
AGTTCAACCAATCGGTTAGCTAGAGACCTACAATTAGCCACAACTCTTTTCTGGTAAGCC
TTGAACTCTGGCGACTGTGCATGTTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4DY49JQ 782 0 0
GGTATCAAGT
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GGAGAATATCCACTAGATTCAAACGAAAAATTTACTAAGTTTAAATTTTTGAAGAAGGAA
AAAGGAAACTTGGGACGCAGGCAAGCTAGAGGTGCTGATTAAACCCTAGAAGATAAAGGT
AACTGATAGATAATAAAAGGTACAACAAGACGCCGTCTGTTTTTTGTTTCCAATGATTTC
AAACTCCAGGAATGGGGAAACGAGAGGTGAAGGATTCGACTCTATCCTTGAGGCTTTCCA
CTCTCTCTCTCAATGGGAACTCAGGAGATGTTACCAACTTGGTGAATTCTACAAGCTTTG
TTCCCGAAACTAGCTTCTTTGCTTCCATCGTTATCTCCACTCCTTCCTTGATCAAGTCAG
CAACCACCACAAAGTCTTTCTCTGACAGTCCTCTTGTCGTCATTGCAGGTGTTCCTATCC
TTATTCCCCCTGGAACCAACGCACTTTTGTCCCCAGGGACAGAGTTCTTGTTTAGTGTAA
TAGATGCCATGTCTAAGATTTTCTCAACCCTTGCACCATCCATGCCCAATGGTCTAAGAT
CAACGAGAACCAAGTGGTTATCGCTGCCACCAGAAACCAGCTTAAACCCGAGTTCAACCA
ATCGGTTAGCTAGAGACCTACAATTAGCCACAACTCTTTTCTGGTAAGCCTTGAACTCTG
GCGACTGTGCATGTTTCAAGCAGACTGCTAATCCTCCAATTGTGTGGTTATG

QA 11 782 11 782
DS 



AS 1 4

CO CL2926Contig1 819 4 9 U
AGGAAGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGCATCTCTGCAACTTC
TGAGGTGAAGGAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGG
CAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGTTGCG
AGGCAAAAGAAGGCCGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCCCTCCGTCCTGTT
GTGCACGGACAGACCCTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTT
GAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGCTGGCACCCACCATCGGTATTTCTGTT
GACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAA
ACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGAT
TCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCTATTGTC
CGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCT
TATGACAAGATACGTCTGGAGCGCACTAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGA
GCTGCCGATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGGAGATCCTTCCTCTCTATCTTGCCTT
CATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTGTTTTTGTTATCCTTGAAAGATTTTG
CTGCTACTTGCTTTTGAATTTTATGGAAAAGATCATTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4DZ43TF U 2
AF RR4E840TF U 1
AF RR4DZ43JQ C 156
AF RR4E840JQ C 187
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BS 186 194 RR4E840TF
BS 195 195 RR4DZ43TF
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TGAGGTGAAGGAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGG
CAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGTTGCG
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GTGCACGGACAGACCCTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTT
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GACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAA
ACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGAT
TCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCTATTGTC
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CATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTGTTTTTGTT
TCCTT

QA 1 763 1 763
DS 

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CACTTCTGGACCCCTCCGTCCTGTTGTGCACGGACAGACCCTCAAGTACAACATGAAGGT
CAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGCT
GGCACCCGCCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCT
TCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCG
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CCAGGGTGACTACATGCCTATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTTTGAAGCTTAC
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TTT

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DS 

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GGACAGACCCTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAG
CTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGCTGGCACCCACCATCGGTATTTCTGTTGACCAT
CGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTAC
AAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACT
CCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCTATTGTCCGTGAG
AAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGAC
AAGATACGTCTGGAGCGCACTAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCC
GATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGGAGATCCTTCCTCTCTATCTTGCCTTCATCGT
TTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTGTTTTTGTTATCCTTGAAAGATTTTGCTGCTA
CTTGCTTTTGAATTTTATGGAAAAGATCATTTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

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TTCAGTCCGAGTTTATGAAAGAAGCTTCCAACTTATTACATATACACACAAACCCCACAA
GCAAGCAAACAAACAAAACACATTACATGATTCAAATGAAAGACCTAAAAGCAATGTCCC
TATTCAAGACTACATTGATCATCACACAATGTTTCGTGACTTGCATGAACACTATCTGAA
AAAGGAAAGCTTCAAACCAAGTAACGTTTCATCCAAGAGTTGAAACGAGACCAAGCAAGC
TCCACCGCAGCTTCGTCATCATCAAAATCTCCCAAACTCTTCCTTCTGCTCACTCCTTCC
GGGCTCCTGTTCAAAAACGCGTGCCCGATCCCCGAGTAAATGTGAACCTCGTGGGCTACT
CCCGATGCTTTCAGCTTCTCTTCGAGATTCTTCGCTGCCGTGACATCAAAAAAACCAACA
ATATGGTCAAGCTCTCCAAAATGGGCCTGAACAGGAGCCTTGGCATGTGTTGGATCCGCA
AGCTCAGAGGAAGGGGTTCCATAGAATCCAACAACAGCATCAACCTCTGGAACCAAAACA
GAGCTGGCTATAGCTAGTGCACCTCCCATGCACATTCCAGTCACACCAACCTTTTTGGAG
CCATTAGATTTAAGCCAGTTAACAGAAGCGCTGATATCTTTGACGGCACCTGGCCAGTCA
GGGCCATCCATTAAATGTTTTGCCCCTGCCGCATCAAGACCAACCTTTCCTCGATACAAG
TCAGGTATAAGGGCTTTGAAACCAGGGTCTAGCTGTGAGATTTTAATAGCGTGGTTCTTG
ATCTCAACTTCAATACCCCACCATTCTTGAATCACAACAATCCCGGGCGCACCATCTTTA
CCAACCACATAGACATCGAACGTAGTGTCATCTCTCTGGATTTGTAATTTCTTGAAAGCG
GAATCGGCCATTGATCGGACTGATGAGCGAGAAAACGCAGGACCGAGAATCTAGAGAGCG
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GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 

AF RR4H923JQB U 1
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AF RR4FY09TF C 463
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AGCTCAGAGGAAGGGGTTCCATAAAATCCAACAACAGCATCAACCTCTGGAGCCAAAACA
GAGCTGGCTATAGCTAGTGCACCTCCCATGCACATTCCAGTCACACCAACCTTTTTGGAG
CCATTAGATTTAAGCCAGTTAACAGAAGCGCTGATATCTTTGACGG

QA 1 706 1 706
DS 

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GTTTATGAAAGAAGCTTCCAACTTATTACATATACACACAAACCCCACAAGCAAGCAAAC
AAACAAACCACATTACATGATTCAGATGAAAGTCCTAAGAGCAATGTCCTTATTCAAGAC
TACATTGATCATCACACAATGTTTCGTGACTTGCATGAACACTATCTGAGAAAGGAAAGC
TTCAAACCAAGTAACGTTTCATCCAAGAGTTGAAACGAGACCAAGCAAGCTCCACCGCAG
CTTCGTCATCATCAGAATCTCCCAAACTCTTCCTTCTGCTCACTCCTTCCGGGCTCCTGT
TCAAGAACGCGTGCCCGATCCCCGGGTAAATGTGAACCTCGTGTGCTCCTCCCGATGCTT
TCAGCTTCTCTTCGAGATTCTTCGCTGCCGTGACATCAGAGAAACCAACAATATGGTCAA
GCTCTCCAAAATGGGCCTGAACAGGAGCCTTGGCATGTGTTGGATCCGCAAGCTCAGAGG
AAGGGGTTCCATAGAATCCAACAACAGCATCAACCTCTGGAACCAAAACAGAGCTGGCTA
TAGCTAGTGCACCTCCCATGCACATTCCAGTCACACCAACCTTTTTGGAGCCATTAGATT
TAAGCCAGTTAACAGAAGCGCTGATATCTTTGACGGCACCTGGCCAGTCAGGGCCATCCA
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FY09TF 622 0 0
ACATCAGAG
AAACCAACAATATGGTCAAGCTCTCCAAAATGGGCCTGAACAGGAGCCTTGGCATGTGTT
GGATCCGCAAGCTCAGAGGAAGGGGTTCCATAGAATCCAACAACAGCATCAACCTCTGGA
ACCAAAACAGAGCTGGCTATAGCTAGTGCACCTCCCATGCACATTCCAGTCACACCAACC
TTTTTGGAGCCATTAGATTTAAGCCAGTTAACAGAAGCGCTGATATCTTTGACGGCACCT
GGCCAGTCAGGGCCATCCATTAAATGTTTTGCCCCTGCCGCATCAAGACCAACCTTTCCT
CGATACAAGTCAGGTATAAGGGCTTTGAAACCAGGGTCTAGCTGTGAGATTTTAATAGCG
TGGTTCTTGATCTCAACTTCAATACCCCACCATTCTTGAATCACAACAATCCCGGGCGCA
TCATCTTTACCAACCACATAGACATCGAACGTAGTGTCATCTCTCTGGATTTGTAATTTC
TTGAAAGCGGAATCGGCCATTGATCGGACTGATGAGCGAGAAAACGCAGGACCGAGAATC
TAGAGAGCGCAGAAGAAGACTTGCCGAGTGAAGAAGATAAGAATATGGAAGATGAAAATG
ATGACACGAGTCC

QA 10 622 10 622
DS 

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ACCACATAGGCATCGAACGTAGTGTCATCTCTCTGGATTTGTATTTTCTTGAAAGCGGAA
TCGGCCATTGATCGGACTGATGAGCGAGAAAACGCAGGACCGAGAATCTAGAGAGCGCAG
AAGAAGACTTGCCGAGTGAAGAAGATAAGAATATGGAAGATGAAAATGATGACACGAGTC
C

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 3

CO CL2928Contig1 687 3 4 U
GGACTTCACTCACAATCAAACCCCAAAATACACACAAACCCCTCCTCTCTCTCTCTCTAG
TAACAACAACTCAAACAAACCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCA
GTGACATTCACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACA
CCAGCGACTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCA
CCACCAATGCCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCA
TTACAGAGCACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAAC
TTTCCACAAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAAT
ATTCCCACCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAGCT
ACGCTCTTCAGCTGCTGTCACACAACACTTTACGGTCTTTTTCTCACACACTTTGTTTGC
ACATGTTTGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTT
GGTGTTGTGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTATACGGCTTATTATT
GTTCTAATGAATTCTTGCTTTCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG57TF U 6
AF RR4B203TF U 1
AF RR4FI32TF U 6
BS 1 56 RR4B203TF
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RD RR4CG57TF 641 0 0
GG
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AACTCAAACAAACCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCAGTGACAT
TCACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACACCAGCGA
CTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCACCACCAA
TGCCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCATTACAGA
GCACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACTTTCCAC
AAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAATATTCCCA
CCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAGCTACGCTCT
TCAGCTGCTGTCACACAATACTTTACGGTCTTTTTCTCACACACTTTGTTTGCACATGTT
TGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTTGGTGTTG
TGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR4B203TF 686 0 0
GGACTTCACTCACAATCAAACCCCAAAATACACACAAACCCCTCCTCTCTCTCTCT**AG
TAACAACAACTCAAACAAACCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCA
GTGACATTCACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACA
CCAGCGACTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCA
CCACCAATGCCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCA
TTACAGAGCACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAAC
TTTCCACAAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAAT
ATTCCCACCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAGCT
ACGCTCTTCAGCTGCTGTCACACAACACTTTACGGTCTTTTTCTCACACACTTTGTTTGC
ACATGTTTGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTT
GGTGTTGTGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTATACGGCTTATTATT
GTTCTAATGAATTCTTGCTTT
CTTCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4FI32TF 682 0 0
GG
ACTCACAATCAAACCCCAAAATACACGCAAACCCCTCCTCTCTCTCTCTCTAGTAACAAC
AACTCAAACAAACCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCAGTGACAT
TCACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACACCAGCGA
CTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCACCACCAA
TGCCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCATTACAGA
GCACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACTTTCCAC
AAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAATATTCCCA
CCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAGCTACGCTCT
TCAGCTGCTGTCACACAACACTTTACGGTCTTTTTCTCACACACCTTGTTTGCACATGTT
TGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTTGGTGTTG
TGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTATACGGCTTATTATTGTTCTAA
TGAATTCTTGCTTTCTTCTT

QA 3 682 3 682
DS 



AS 1 4

CO CL2929Contig1 1048 4 6 U
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TGTTATGTATTTTAGTAATGATATGAAGCTTTAAAGACGTTAAGTTTGAGAGGAAAAACT
AAAACCATTCACTACAAAAGATCAAGAACTAGAGATAGTCATGGACATAAAGTCTTATCA
GAATCATGCAGAGGGTTTTGTTAAACACTATTTATTAGCAGATCCGTTTCTTCCATATAC
TTCTGTTCTTGCTGGAATCTTTCTCTCCAAGATGGCCTATGACGTCACCGAATCATTCAG
CTCAATTCATATCAAATCATACTTTGCTCTCACAAATACGAAGAAAATTGTGGAACAACA
GTCAACAGGGGAATTTCTACACTCCATGCGATCGTTATCTCATTGATAGCACTCAACTTT
GTGTTCTTCTCTGATTTGTTTTCTGACCAAAGAAGTCTTCAAGGCCTTATAGTGTTTCGT
AGCTCGCCACTTTCAAACTTTGGTTTAGGGGTGTCAGTTGGTTACTTTATTGCTGATCTT
GGAATGATCATTTGGTTATACCCTTCTTTAGGAGGATCAGAATATATTTTCCATCACTGC
TTATCTGGAGTAGCAGTAGCTTATTCTTTGTTCTCTGGAGAAGCTCAGCTTTACACATAC
ATGGTTTTACTCTCTGAAGTAACTACACCAGAGATCAATCTTAGGTGGTACCTTGACATA
TCTGGTTTGAAGCTATCTAAAGCTTATCTTATTAATGGAGTTGCTATTTTCTTGGCTTGG
TTGACAGCAAGAATCCTTTTGTTCATCTACATGTTTTACCATGTCTACACACGCTATGAT
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AGTGTAATGAACTTGATGTGGTTTGGTAAGATAGTGAAGGGACTGATGAAAACTCTTGAG
AAAAGACAATAAGGAATGAGTTTTTTTAGTAATGTAAATATAAATGTTTTTATGAAAGAA
TCTTACAGGTTAAAGCTCATAATCAATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GO79TF U 1
AF RR4G434TF U 1
AF RR4G434JQ C 433
AF RR4GO79JQ C 433
BS 1 704 RR4G434TF
BS 705 705 RR4G434JQ
BS 706 740 RR4G434TF
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BS 742 772 RR4G434TF
BS 773 1048 RR4G434JQ

RD RR4GO79TF 714 0 0
AGGGTAATATTTTATCTAATATGTTTTCGAGAACTTTGACTGATTCTCTTTCTCTGTTCT
TGTTATGTATTTTAGTAATGATATGAAGCTTTAAAGACGTTAAGTTTGAGAGGAAAAACT
AAAACCATTCACTACAAAAGATCAAGAACTAGAGATAGTCATGGACATAAAGTCTTATCA
GAATCATGCAGAGGGTTTTGTTAAACACTATTTATTAGCAGATCCGTTTCTTCCATATAC
TTCTGTTCTTGCTGGAATCTTTCTCTCCAAGATGGCCTATGACGTCACCGAATCATTCAG
CTCAATTCATATCAAATCATACTTTGCTCTCACAAATACGAAGAAAATTGTGGAACAACA
GTCAACAGGGGAATTTCTACACTCCATGCGATCGTTATCTCATTGATAGCACTCAACTTT
GTGTTCTTCTCTGATTTGTTTTCTGACCAAAGAAGTCTTCAAGGCCTTATAGTGTTTCGT
AGCTCGCCACTTTCAAACTTTGGTTTAGGGGTGTCAGTTGGTTACTTTATTGCTGATCTT
GGAATGATCATTTGGTTATACCCTTCTTTAGGAGGATCAGAATATATTTTCCATCACTGC
TTATCTGGAGTAGCAGTAGCTTATTCTTTGTTCTCTGGAGAAGCTCAGCTTTACACATAC
ATGGTTTTACTCTCTGAAGTA*CTACACCAGAGATCAATCTTAG
TGGTACTTGA

QA 1 704 1 704
DS 

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TGTTATGTATTTTAGTAATGATATGAAGCTTTAAAGACGTTAAGTTTGAGAGGAAAAACT
AAAACCATTCACTACAAAAGATCAAGAACTAGAGATAGTCATGGACATAAAGTCTTATCA
GAATCATGCAGAGGGTTTTGTTAAACACTATTTATTAGCAGATCCGTTTCTTCCATATAC
TTCTGTTCTTGCTGGAATCTTTCTCTCCAAGATGGCCTATGACGTCACCGAATCATTCAG
CTCAATTCATATCAAATCATACTTTGCTCTCACAAATACGAAGAAAATTGTGGAACAACA
GTCAACAGGGGAATTTCTACACTCCATGCGATCGTTATCTCATTGATAGCACTCAACTTT
GTGTTCTTCTCTGATTTGTTTTCTGACCAAAGAAGTCTTCAAGGCCTTATAGTGTTTCGT
AGCTCGCCACTTTCAAACTTTGGTTTAGGGGTGTCAGTTGGTTACTTTATTGCTGATCTT
GGAATGATCATTTGGTTATACCCTTCTTTAGGAGGATCAGAATATATTTTCCATCACTGC
TTATCTGGAGTAGCAGTAGCTTATTCTTTGTTCTCTGGAGAAGCTCAGCTTTACACATAC
ATGGTTTTACTCTCTGAAGTAACTACACCAGAGATCAATCTTAG*TGGTACCTTGACATA
TCTGGTTTGAAGCTATCTAA*GCTTATCTTATTAATGGAGTTGCTATTTTCT

QA 1 772 1 772
DS 

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TGGTTATACCCTTCTTTAGGAGGATCAGAATATATTTTCCATCACTGCTTATCTGGAGTA
GCAGTAGCTTATTCTTTGTTTTCTGGAGAAGCTCAGCTTTACACATACATGGTTTTACTT
TCTGAAGTAACTACACCAGAGATCAATCTTAGGTGGTACCTTGACATATCTGGTTTGAAG
CTATCTAAAGCTTATCTTATTAATGGAGTTGCTATTTTCTTGGCTTGGTTGACAGCAAGA
ATCCTTTTGTTCATCTACATGTTTTACCATGTCTACACACGCTATGATCAGGTGGTAGTG
ATGCATACATTCGGTTATCTGCTAGTTTTTGTCGTACCGAGTGCATTGAGTGTAATGAAC
TTGATGTGGTTTGGTAAGATAGTGAAGGGACTGATGAAAACTCTTGAGAAAAGACAATAA
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AAGCTCATAATCAATG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4GO79JQ 616 0 0
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TCAAACTTTGGTTTAGGGGTGTCAGTTGGTTACTTTATTGCTGATCTTGGAATGATCATT
TGGTTATACCCTTCTTTAGGAGGATCAGAATATATTTTCCATCACTGCTTATCTGGAGTA
GCAGTAGCTTATTCTTTGTTTTCTGGAGAAGCTCAGCTTTACACATACATGGTTTTACTT
TCTGAAGTAACTACACCAGAGATCAATCTTAGGTGGTACCTTGACATATCTGGTTTGAAG
CTATCTAAAGCTTATCTTATTAATGGAGTTGCTATTTTCTTGGCTTGGTTGACAGCAAGA
ATCCTTTTGTTCATCTACATGTTTTACCATGTCTACACACGCTATGATCAGGTGGTAGTG
ATGCATACATTCGGTTATCTGCTAGTTTTTGTCGTACCGAGTGCATTGAGTGTAATGAAC
TTGATGTGGTTTGGTAAGATAGTGAAGGGACTGATGAAAACTCTTGAGAAAAGACAATAA
GGAATGAGTTTTTTTAGTAATGTAAATATAAATGTTTTTATGAAAGAATCTTACAGGTTA
AAGCTCATAATCAATG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

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GGCAGAGCTGGGGACGCAACCAGAATGGTCAACTTGGTCTTGGTGATACTGAAGATTCTC
TAGTGCCTCAGAAGATTCAAGCCTTTGAGAGAATACGAATCAAAATGGTAGCAGCTGGTG
CAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTCTACGGATGGGGATGGGGACGAT
ATGGAAATTTGGGATTAGGTGACCGCAATGACCGCTTGGTCCCTGAAAGGGTTACCTCTG
CTAGTGGTGAGAAGATGAGCATGGTTGCTTGTGGATGGCGGCACACAATAGCAGTGTCTT
ATTCTGGAGCATTATATACTTATGGATGGAGCAAATATGGACAGTTAGGACATGGGGACT
TTGAAGATCACCTTGTTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGAGCAACAGCGTCATCTCCCAGA
TCTCGGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGGAAACTACATGGATGGG
GTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGGGATAACTTAGATCAGTGTTCTCCTTTGC
AAGTTCGGTTTCCCGACGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACAT
TGGCTGTGACTGAAAGAAATAATGTATTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAACGGACAGCTCG
GAATTGGAGAGTCACTTGACAGGAACTATCCTAAGATTATAGAAGCATTGAGCGTTGATG
GAGCAAGTGGACAACATATAGAGTCTTCTAATTTTGACCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGG
TGTCACCGGCAGAGAGATATGCAGTTGTTCCTGATGAAAAGACAGGACAAACGGATGGTT
CTAGCAAAGGCAATGGAAGTGATATGAGTGTCCCCACGAACTGATCTCAAGCTTGTGTTC
GATTTTGAGTTTTTCTTCTTTTTTTTCTCATAAGGTTTTTTTTTTTTTAACGATCTCTGG
TTGTACACCACGTACGTCTGGCCTAGTTTGGGATTTGCTTCTTTTTTCTTGGTCGTCTTT
GTTTAGTTTGTGTTTTGTTACTCAAACTCCAGTCTCTTTATTTTAACCATAATAATGTCT
TACGAATTATGTGGTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H658TF U 1
AF RR4E020TF U 351
AF RR4E024TF U 351
AF RR4H658JQB C 302
BS 1 684 RR4H658TF
BS 685 685 RR4E020TF
BS 686 746 RR4H658TF
BS 747 918 RR4E020TF
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BS 1001 1001 RR4H658JQB
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BS 1060 1100 RR4H658JQB

RD RR4H658TF 746 0 0
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TAGTGCCTCAGAAGATTCAAGCCTTTGAGAGAATACGAATCAAAATGGTAGCAGCTGGTG
CAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTCTACGGATGGGGATGGGGACGAT
ATGGAAATTTGGGATTAGGTGACCGCAATGACCGCTTGGTCCCTGAAAGGGTTACCTCTG
CTAGTGGTGAGAAGATGAGCATGGTTGCTTGTGGATGGCGGCACACAATAGCAGTGTCTT
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TTGAAGATCACCTTGTTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGAGCAACAGCGTCATCTCCCAGA
TCTCGGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGGAAACTACATGGATGGG
GTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGGGATAACTTAGATCAGTGTTCTCCTTTGC
AAGTTCGGTTTCCCGACGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACAT
TGGCTGTGACTGAAAGAAATAATGTATTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAACGGACAGCTCG
GAATTGGAGAGTCACTTGACAGGA*CTATCCTAAGATTATAGAAGCATTGAGCGTTGATG
GAGCAAGTGGACAACATATAGAGTCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4E020TF 568 0 0
G
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ATGGGTGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGCGATAACTTAGATCAGTGTT
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GACAGCTCGGCATTGGAGAGTCACTTGACAGGAACTATCCTAAGATTATAGAAGCATTGA
GCGTTGATGGAGCAAGTGGACAACATATAGAGTCTTCTAATTTTGACCCATCTTCAGGGA
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CGGATGGTTCTAGCAAAGGCAATGGAAGTGATATGAGTGTCCCCACGAACTGATCTCAAG
CTTGTGTTCGATTTTGAGTTTTTCTTC

QA 2 568 2 568
DS 

RD RR4E024TF 709 0 0
G
ATGGGGACTTTGAAGATCACCTTGTTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGAGCAACAGCGTCA
TCTCCCAGATCTCAGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGGAAACTAT
ATGGGTGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGCGATAACTTAGATCAGTGTT
CTCCTTTGCAAGTTCGGTTTCCCGACGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGA
GACATACATTGGCTGTGACTGAAAGAAATAATGTGTTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAACG
GACAGCTCGGCATTGGAGAGTCACTTGACAGGAACTATCCTAAGATTATAGAAGCATTGA
GCGTTGATGGAGCAAGTGGACAACATATAGAGTCTTCTAATTTTGACCCATCTTCAGGGA
AAAGCTGGGTGTCACCGGCAGAGAGATATGCAGTTGTTCCTGATGAAAAGACAGGACAAA
CGGATGGTTCTAGCAAAGGCAATGGAAGTGATATGAGTGTCCCCACGAACTGATCTCAAG
CTTGTGTTCGATTTTGAGTTTTTCTTCTTTTTTTTCTCATAAGGTTTTTTTTTTTTTAAC
GATCTCTGGTTGTACACCACGTACGTCTGGCCTAGTTTGGGATTTGCTT*TTTTTTCTTG
GTCGTCTTTGTTTAGTTTGTGTTTTGTTACTCAAACTCCAGTCTCTTT

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR4H658JQB 799 0 0
TTCTGGAGCATTATATACTTATGGATGGAGCAAATATGGACAGTTAGGACATGGGGACTT
TGAAGATCACCTTGTTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGAGCAACAGCGTCATCTCCCAGAT
CTCGGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGGAAACTACATGGATGGGG
TTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGGGATAACTTAGATCAGTGTTCTCCTTTGCA
AGTTCGGTTTCCCGACGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACATT
GGCTGTGACTGAAAGAAATAATGTATTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAACGGACAGCTCGG
AATTGGAGAGTCACTTGACAGGAACTATCCTAAGATTATAGAAGCATTGAGCGTTGATGG
AGCAAGTGGACAACATATAGAGTCTTCTAATTTTGATCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGGT
GTCACCGGCAGAGAGATATGCAGTTGTTCCTGATGAAAAGACAGGACAAACGGATGGTTC
TAGCAAAGGCAATGGAAGTGATATGAGTGTCCCCACGAACTGATCTCAAGCTTGTGTTCG
ATTTTGAGTTTTTCTTCTTTTTTTTCTCATAAGGTTTTTTTTTT**TAACGATCTCTGGT
TGTACACCACGTACGTCTGGCCTAGTTTGGGATTTGCTTCTTTTTTCTTGGTCGTTTTTG
TTTAGTTTGTGTTTTGTTACTCAAACTCCAGTCTCTTTATTTTAACCATAATAATGTCTT
ACGAATTATGTGGTTTTTT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 4

CO CL2931Contig1 1010 4 8 U
AAAAAACAAAAGTGGGAGATAGATTAAACGAAAAAGAAAACATATTTCAAGACGCAACAA
AAGGACAACAAACATTTAACAAAACCAAACCACAAACACATTTTAACGAACTAAGTTAAA
GATAGGAGAAAGGAAACTGAGACGTAAATGGTAAATAATGGGTGTTCACCGGATAACAAT
TTAAATTTCACTGGCAAAGCTGCTAGACGGCTGTCACGATCTGAGCCGGTTGAACCACGG
TCCACTCTTCAAGAGTACCAGCATAAGGTGTAGGAACGTCCTGAGAAGACAAACACATCA
CCGGAGCATCCAAATAGTCATGGAAGTTCTCATTAATGGCAGCCGTAAGACTAGCTCCAA
TCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACTATCAAAACCCTGTGCGTTTTCTTCACCGAGT
TCCCAATCGTGTAAAGATCAAACGGTTTCAACGACCTGATGTCGATAACCTCAGGGTCAT
ACCCTTTGTTCACCAGCGTTTTAGCCGCCTGCATCACATGGTACCTCATCCGGGAGTAAG
TGAGGATGGTAATATGCTCTCCAGGTCTAACCATCTCAGCTTCTTCAAGGTTGCAGATGT
ATTCTTCGTCAGGGATCTTCTCCTTGAGATTGTAAAGCAGAACGTGCTCAAACAGAATCA
CAGGGTTCTCACTTCTTATGGCGGCTTTCATCAAGCCTTTAGCATTGTAAGGAGTGGAGC
AAGCAACCATCTGGATCCCAGGGATGGACTGGAAGTAAGATTCTAGCCGCTGCGAATGCT
CAGCGCCGAGCTGGCGTCCCACTCCACCGGGACCACGGATGACGACAGGGATAGTGAACT
GACCACCAGATGTGTAGTGAAGCATTCCACAGTTGTTTGAGATTTGGTTGAAGGCTAAGA
GGAGGAAACCCATGTTCATACCTTCGATGACGGGTCTAAGACCAGTCATGGCGGCTCCAA
TGCCCATACCGGTGAAGGCGTTTTCACAAATGGGAGTGTCGAGAACCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D612JQ U 26
AF RR4DI33JQ U 1
AF RR4DI33TF C 86
AF RR4D612TF C 347
BS 1 34 RR4DI33JQ
BS 35 35 RR4D612JQ
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BS 354 654 RR4DI33JQ
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BS 657 745 RR4DI33JQ
BS 746 1010 RR4D612TF

RD RR4D612JQ 683 0 0
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TTTCATCAAGCCTTTAGCATTGT

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AAGCAACCATCTGGATCCCAGGGAT

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DS 

RD RR4DI33TF 661 0 0
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GACGGCTGTCACGATCTGAGCCGGTTGAACCACGGTCCACTCTTCAAGAGTACCAGCATA
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CACTATCAAAACCCTGTGCGTTTTCTTCACCGAGTTCCCAATCGTGTAAAGATCAAACGG
TTTCAACGACCTGATGTCGATAACCTCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAGCGTTTTAGC
CGCCTGCATCACATGGTACCTCATCCGGGAGTAAGTGAGGATGGTAATATGCTCTCCAGG
TCTAACCATCTCAGCTTCTTCAAGGTTGCAGATGTATTCTTCGTCAGGGATCTTCTCCTT
GAGATTGTAAAGCAGAACGTGCTCAAACA**ATCACAGGGTTCTCACTTCTTATGGCGGC
TTTCATCAAGCCTTTAGCATTGTAAGGAGTGGAGCAAGCAACCATCTGGATCCCAGGGAT
C

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AACCTCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAGCGTTTTAGCCGCCTGCATCACATGGTACCT
CATCCGGGAGTAAGTGAGGATGGTAATATGCTCTCCAGGTCTAACCATCTCAGCTTCTTC
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CCTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 4

CO CL2932Contig1 772 4 9 U
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CATGCTGCAAAAAGGATTAAACATCTTCCTTTTCTGCTTATACAAAGCCTTCCCATTGCT
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CGAAATTTATCACCTTGTTTTAATTTTTGATAAATATTGTAAAATTAAGAAAAAAATTAA
AATGTGGTGAATGTTAAAAAAAGTTATATGATAATGAAACTTGAGAAGGTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4EV57TF U 1
AF RR4F507TF U 1
AF RR4EV57JQ C 35
AF RR4F507JQ C 124
BS 1 474 RR4EV57TF
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RD RR4EV57TF 474 0 0
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GACTTTCACAACTCTATATAGGTTATAACAATCCTATTTCAGGGAGTGCTATTCAAAACC
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QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4F507TF 713 0 0
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GATCATACCTCTCAACCATCTTGAAAAACTGCCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAAC
ATTGTTCACTCACAACTAGAACAATTCAAAAGCTTGCTGATGCTTTGGATCCTGAGTCGG
GACTTTCACAACTCTATATAGGTTATAACAATCCTATTTCAGGGAGTGCTATTCAAAACC
TCTTGGTTAACCAATTACAGATTCTGGATCTAAGCAACAATGGGTTGTCAGTTGAAGCGT
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CGAAATTTATCACCTTGTTTTAATTTT*GATAAATATTGTAAAATTAAGAAAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4EV57JQ 738 0 0
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GGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATTGTTCACTCACAACTAGAACAATTCAAAAGCT
TGCTGATGCTTTGGATCCTGAGTCGGGACTTTCACAACTCTATATAGGTTATAACAATCC
TATTTCAGGGAGTGCTATTCAAAACCTCTTGGTTAACCAATTACAGATTCTGGATTTAAG
CAACAATGGGTTGTCAGTTGAAGCGTTGGAAACGTTATACATGGCATGGTCATCATCGGG
ATCACGAACTGGCATAGCCCAAAGGCATGTGAAAGATGAGATTGTCCATTTTTATGTTGA
AGGAAAGATGTGTTGTGGAGTCAAACCATGCTGCAAAAAGGATTAAACATCTTCCTTTTC
TGCTTATACAAAGCCTTCCCATTGCTCTTGGGGTCCAGCAGCTTTGTTATATTAATACTT
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TATTGTAAAATTAAGAAAAAAATTAAAATGTGGTGAATGTTAAAAAAAGTTATATGATAA
TGAAACTTGAGAAGGTAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4F507JQ 649 0 0
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CATACCTCTCAACCATCTTGAAAAACTGCCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATT
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TTTCACAACTCTATATAGGTTATAACAATCCTATTTCAGGGAGTGCTATTCAAAACCTCT
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AAACGTTATACATGGCATGGTCATCATCGGGATCACGAACTGGCATAGCCCAAAGGCATG
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GTGGTGAATGTTAAAAAAAGTTATATGATAATGAAACTTGAGAAGGTAC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 4

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GCAGTCCCCGCGCTGCCCGCGAGCTCGCTCTTGTGGTACTTTATGCCGCATGCTTAGAAG
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AGTTTGACAAGACTTCTTTGTTGAAATATAACCACATGAGCTTTGGAGGACCTCCTGTTA
AAACTGAAACTATTGAATAGGAAGAGGAGCTTGTGCGCCTGGATGAAAATGAGTCCAAGA
TTGAAGCAGAAGTGCTTTCAGCTCCTCCAAAGCTGGTGTACAGCAAACTTGTTTTACGGT
TTGCAAAGAAACTCTTGGCTGCAGTGGCTGATAAATGGGATACTCATGTCCTCGTCATCG
ATAAAATCTCCCCTCCAGATTGGAATAGTGCACCAGCTGGAAGAATACTAGAGTTTTCCA
TTCTTCACTTAGCAATGTCTGAAATTGCAGTTATTGAAACTCGACACCCGATTGCCATCA
ACGAGGCTGTTGATCTCGCCAAACGGTTCTGCGATGGATCAGCGCCACGCATAATCAACG
GATGCCTTAGGACATTTGTCAAGGATAGAGCAGCAACACCAACACCAACACCTCAAGCTT
TAGAACTGAAGCAGAAATTTTCGGTTTTAAGTTAAGAACAAACCCGCATCTACGTTTGGA
GGCAGGCAGGCAGACCTCAGATTTTGGTTCATGGGAAATAAGCTCGTTAGTAAAGTGTTG
ATCCGATGATCTTAAGAGTCTAGACGAGGAGAGATTCGGTCTAAAGCTAACTGAGACTGG
AACTATCTAGTAATCCACTGCAGCTCAACATGATTATTGCTAAGAACACAACATGCCCAG
ATATATGTATAATGTATTCTCCCTTATATATACTTTAAGTAGTCGCTTTAATGTTTCTGT
CTTTGATCATCTTTCAACTCGTGTCCCATATGTTGAGAAAAGAAAAGTTGTATAATCAGA
TTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU06TF U 37
AF RR4FO46TF U 1
AF RR4EU06JQ C 388
AF RR4FO46JQ C 480
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TGAGTCCAGATTGAAG

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DS 

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TTCTT

QA 1 725 1 725
DS 

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ATAACCACATGAGCTTTGGAGGACCTCCTGTTAAAACTGAAACTATTGAAGAGGAAGAGG
AGCTTGTGCGCCTGGATGAAAATGAGTCCAAGATTGAAGCAGAAGTGCTTTCAGCTCCTC
CAAAGCTGGTGTACAGCAAACTTGTTTTACGGTTTGCAAATAAACTCTTGGCTGCAGTGG
CTGATAAATGGGATACTCATGTCCTCGTCATCGATAAAATCTCCCCTCCAGATTGGAATA
GTGCACCAGCTGGAAGAATACTAGAGTTTTCCATTCTTCACTTAGCAATGTCTGAAATTG
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TTTGCGATGGATCAGCGCCACGCATAATCAACGGATGCCTTAGGACATTTGTCAAGGATA
GAGCAGCAACACCAACACCAACACCTCAAGCTTTAGAACTGAAGCAGAAATTTTCGGTTT
TAAGTTAAGAACAAACCCGCATCTACGTTTGGAGGCAGGCAGGCAGACCTCAGATTTTGG
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ATATACTTTAAGTAGTCGCTTT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4FO46JQ 789 0 0
T
AAACTGAAACTATTGAATAGGAAGAGGAGCT*GTGCGCCTGGATGAAAATGAGTCCAAGA
TTGAAGCAGAAGTGCTTTCAGCTCCTCCAAAGCTGGTGTACAGCAAACTTGTTTTACGGT
TTGCAAAGAAACTCTTGGCTGCAGTGGCTGATAAATGGGATACTCATGTCCTCGTCATCG
ATAAAATCTCCCCTCCAGATTGGAATAGTGCACCAGCTGGAAGAATACTAGAGTTTTCCA
TTCTTCACTTAGCAATGTCTGAAATTGCAGTTATTGAAACTCGACACCCGATTGTCATCA
ACGAGGCTGTTGATCTCGCCAAACGGTTCTGCGATGGATCAGCGCCACGCATAATCAACG
GATGCCTTAGGACATTTGTCAAGGATAGAGCAGCAACACCAACACCAACACCTCAAGCTT
TAGAACTGAAGCAGAAATTTTCGGTTTTAAGTTAAGAACAAACCCGCATCTACGTTTGGA
GGCAGGCAGGCAGACCTCAGATTTTGGTTCATGGGAAATAAGCTCGTTAGTAAAGTGTTG
ATCCGATGATCTTAAGAGTCTAGACGAGGAGAGATTCGGTCTAAAGCTAACTGAGACTGG
AACTATCTAGTAATCCACTGCAGCTCAACATGATTATTGCTAAGAACACAACATGCCCAG
ATATATGTATAATGTATTCTCCCTTATATATACTTTAAGTAGTCGCTTTAATGTTTCTGT
CTTTGATCATCTTTCAACTCGTGTCCCATATGTTGAGAAAAGAAAAGTTGTATAATCAGA
TTTTTCTT

QA 2 789 2 789
DS 



AS 1 4

CO CL2934Contig1 721 4 6 U
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TCTAGTACTAATCACATAAACTAGAAAAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCA
GCTACCGTCTTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCGTCAACTCCAAACCCACGACG
GTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCG
TCTCTGAAAGATTTCGGCGTTATGGCCGTCGCAGCTGCAGCGTCCATCGCTTTGGCCGGG
AATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCA
AGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGGAGAAGATCGTTTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCAC
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CTGTCAATT*GAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCT
GG*AAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATTGTTGGGAAAACTCACCACACAAACG
C


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AU04JQ C 1
AF RR4AU04TF U 499
AF RR4AX63JQ C 1
AF RR4AX63TF U 1
BS 1 498 RR4AX63TF
BS 499 609 RR4AU04TF
BS 610 610 RR4AX63TF
BS 611 662 RR4AU04TF
BS 663 663 RR4AX63TF
BS 664 721 RR4AU04TF

RD RR4AU04JQ 721 0 0
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TCTCTGAAAGATTTCGGCGTTATGGCCGTCGCAGCTGCAGCGTCCATCGCTTTGGCCGGG
AATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCA
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ACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCAAGATCTCTA
TGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACACTGACGGAGC
CTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTA
CTGTCAATT*GAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCT
GG*AAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATTGTTGGGAAAACTCACCACACAAACG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AU04TF 223 0 0
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ATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACTGTCAATTTGAATTGTG
ACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCTGGGAAGAGTGTCTTGAAT
TATAAAACAGGATTATTGTTGGGAAAACTCACCACACAAACGC

QA 1 223 1 223
DS 

RD RR4AX63JQ 721 0 0
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TCTAGTACTAATCACATAAACTAGAAAAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCA
GCTACCGTCTTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCGTCAACTCCAAACCCACGACG
GTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCG
TCTCTGAAAGATTTCGGCGTTATGGCCGTCGCAGCTGCAGCGTCCATCGCTTTGGCCGGG
AATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCA
AGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGGAGAAGATCGTTTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCAC
ACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCAAGATCTCTA
TGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACACTGACGGAGC
CTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTA
CTGTCAATT*GAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCT
GG*AAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATTGTTGGGAAAACTCACCACACAAACG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AX63TF 721 0 0
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TCTAGTACTAATCACATAAACTAGAAAAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCA
GCTACCGTCTTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCGTCAACTCCAAACCCACGACG
GTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCG
TCTCTGAAAGATTTCGGCGTTATGGCCGTCGCAGCTGCAGCGTCCATCGCTTTGGCCGGG
AATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCA
AGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGGAGAAGATCGTTTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCAC
ACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCAAGATCTCTA
TGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACACTGACGGAGC
CTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTA
CTGTCAATT*GAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCT
GG*AAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATTGTTGGGAAAACTCACCACACAAACG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 4

CO CL2935Contig1 658 4 9 U
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AAAACTAGATTTAATTTGTAATCTATAATAAAAATTAAGAACCATTATACAGTATGACTC
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GGGATAAACCGGCGAGAATCAAGAGGAATATTGCAGCCTTTGTAGCTAAAATGGCCGTTA
ATATACCCTTAAACGTCGGCTTTGAATGTTTCTTGTGTTTTTTCAGCAACCCCATTCTCA
CTATTTTGAATGGCTAGAAGAGAGAGAGAATTTTCTTCTTTGGTCCCGATGGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4B846TF C 1
AF RR4F024JQ U 172
AF RR4F024TF C 172
AF RR4B846JQ U 176
BS 1 175 RR4B846TF
BS 176 243 RR4F024JQ
BS 244 245 RR4B846JQ
BS 246 478 RR4F024JQ
BS 479 479 RR4B846JQ
BS 480 627 RR4F024JQ
BS 628 629 RR4B846JQ
BS 630 657 RR4F024JQ
BS 658 658 RR4B846JQ

RD RR4B846TF 658 0 0
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AAAACTAGATTTAATTTGTAATCTATAATAAAAATTAAGAACCATTATACAGTATGACTC
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CTATTTTGAATGGCTAGAAGAGAGAGAGAATTTTCTTCTTTGGTCCCGATGGTTGTC
C

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4F024JQ 486 0 0
CCAT
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TC

QA 5 486 5 486
DS 

RD RR4F024TF 486 0 0
CCAT
CCCCACGTAATAATTATTACTAGAAAAAGATTGGGTTAACTAGATTTAATTTTTTGATCA
AAAAAAAAT*TAGATTTAATTTGTAATCTATAATAAAAATTAAGAACCATTATACAGTAT
GACTCACGGCCGCCTAGAGAACTTGTAGAGCCACGAGATGATGCTGAGGGCCGTCAAACT
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TCTCACTATTTTGAATGGCTAGAAGAGAGAGA**ATTTTCTTCTTTGGTCCCGATGGTTG
TC

QA 5 486 5 486
DS 

RD RR4B846JQ 483 0 0
CCCCACGTAATAATTATTACTAGAAAAAGATTGGGTTAACTAGATTTAATTTTTTGATCA
AAAAAAAAACTAGATTTAATTTGTAATCTATAATAAAAATTAAGAACCATTATACAGTAT
GACTCACGGCCGCCTAGAGAACTTGTAGAGCCACGAGATGATGCTGAGGGCCGTCAAACT
GGAGCCGCCCGAGACGGCTAAACCCATAGCTAGCAAACCAGTGGTAATACCTGCTGGTAC
GAGAACCGGACTAAATACGACGAATAGCGGCATAGTGGCGATAAATGCCAAGGATGTCCC
AGAGAGGGATAAACCGGCGAGAATCAAGAGGAATATTGCAGCCTTTGTAGCTAAAATGGC
CGTTAATATACCCTTAAACGTCGGCTTTGAATGTTTCTTGTGTTTTTTCAGCAACCCCAT
TCTCACTATTTTGAATGGCTAGAAGAGAGAGAGAATTTTCTTCTTTGGTCCCGATGGTTG
TCC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 4

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TTTTTTGTTGCTCAAATCAAACTGGTGGTGTTCTTCACTCTTCATCATTTATCATCAAGT
TTTGGTTTGATTTTCTCTATCCTTTCACTTGGTTACATCTAAATCCCGATTGGCTGTTGA
TTATATGTCTTTTTTCACTAATCACGTTGATCTCCTTTCTAAGAGAATCAGTCTCTACTT
TACCGATTAGCCATATGTGGCGTCTTTGTAGAGCATCTTGATTGAAAGGTGATTGAGTTT
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CGACGAAGAGTCCTCCTTCAGTTCGACTCAAGCTTCCTCGGGGTTGCATACGGTGGATTA
AGACCTCTCTATTCAACTTGCCACGGTGTAAGGTGAAAGGTGATCGGGATTAGAAGTGCG
GTTCATCGAAGTCTGGCGTCGAAGTGGTTGTTAATGATGAATCAACAGGTGGTCCGATGT
CGGATTCTTTCTACTCGGAGGCGCGTGATGGCGCGTTCGAAGTTACAAGATCGAAACCTC
ATGCGTTCGTGTGGGTTGACGCGTAGCTCGGAACCTTCAATATCTCGACGCGTGGCCTTA
AACGTGTAACTTGGGAAAGATAGGTTCAGATTGTAGGTTTTGGGTTTGGGCCTTTGAGCT
AATTTTAAAATCGAACTTGTAATTTAGTGGATAGTGGACTTAAACTTCTGATCCATCTTG
TAAGCCCATTGGGCATTTCATTTCAAGGAAATGAATATGTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FS06TF U 1
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AF RR4E910TF U 616
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TACCGATTAGCCATATGTGGCGTCTTTGTAGAGCATCTTGATTGAAAGGTGATTGAGTTT
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BQ
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AF RR4A505TF U 1
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AGAGATTATCTACCCTCTTAAAGACTCCTTTCATTGTGTTCATTAAACGATGATACAAGA
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TGATACAAGAAAAAAAGATTTAATTTTGTTTACGTGAATGTTATTTTTGCAAGAATGTGT
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QA 1 626 1 626
DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DR33TF U 1
AF RR4C443TF U 38
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RD RR4DR33TF 533 0 0
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CTTCTATTCTTACACTTCTTTGGGTAAGGGTTAACCCGTTTGTGGCTAAAGGTGGTCCTA
TTCTCGAGATATGTGGTTTGGACTGCTTGTGATTTGATCCAAGGTTGGTTCCCACAGAGC
AAGAGAGGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATCTACCCTCTTAAAGACT
CCTTTCATTGTGTTCATTAAACGTTGATACAAGAAAAAAAA*GATTTAATTTTGTTTACG
TGAATGTTATTTTTGCAAGAATGTGTTGTAGATATAGAAGAAGTTTGTTGTCTATTTGTT
TTGTTCTTTTGGTGTTGAGAGAAAAGATTTGGCAAATTATTCTTTTAATCGAATATTTCT
GATCTCTTTTGAATATTATTTAGGAAGTGTTTCAGTCTGTTTGTAATCTTATT

QA 1 533 1 533
DS 

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TGTCGTCTGGTCTATTCTCCTGGCTTCTATTCTTACACTTCTTTGGGTAAGGGTTAACCC
GTTTGTGGCTAAAGGTGGTCCTATTCTCGAGATATGTGGTTTGGACTGCTTGTGATTTGA
TCCAAGGTTGGTTCCCACAGAGCAAGAGAGGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
**TTATCTACCCTCTTAAAGACTCCTTTCATTGTGTTCATTAAACGTTGATACAAGAAAA
AAAAAGATTTAATTTTGTTTACGTGAATGTTATTTTTGCAAGAATGTGTTGTAGATATAG
AAGAAGTTTGTTGTCTATTTGTTTTGTTCTTTTGGTGTTGAGAGAAAAGATTTGGCAAAT
TATTCTTTTAATCGAATATTTCTGATCTCTTTTGAATATTATTTAGGAAGTGTTTCAGTC
TGTTTGTAATCTTATT

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

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AACAAACAGAGATTCTCACGGATCGTCTTCACACGTTGCTGAACCATTCTTCAGAAGCGT
ATTAGGGCAGATGGAAACGGTTTACCTAAACCGGAACCCGACTCCTAAATCCGTCTTGGA
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TGGGATTGGTGGTTATGGGATTGACTCGCTTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGGGTATAC
CCAAATGGATGAGCTGAGGTTTCCAGCCAAAAAGCTCAGAGCTTTGTGGTTTGCACCTCC
TCATGCTTCTGTTGTTCCTGGTGGAAGTGGTGTAAATGGTCCTTTACCAAGAGTTTTTAT
CTCAGAGCTTCTAGTCGAGCAGATGAGTTCACAGACTCAGGATGTGATCAGAAAATACAC
CGAAACATCGCCTAATGGGAGAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCTTTGGGTAGTCTGCC
CTGGGAAAAGCCTCAATCTTCCGAGTTTGAACAACTGGCTAGGGAAAGTGAATACGCAGC
ATGGACACTTGCCAATGGGTATGCACTTAACCACGTCACTATCTCTGTCCATCGCCTTAA
ATCTCATCTCAACAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTTCCTTGAAGAAAAAGTTTTAAATTG
AACTCAGAAGAGAGTCCTTAAGTAGTCCTGATGGTGGTTTGCTACAAGCTCACTGTAGCA
GACTCGATTTCTTTCAGTTCTCTGATGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL34TF U 1
AF RR4BU85TF U 115
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TGGGATTGGTGGTTATGGGATTGACTCGCTTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGGGTATAC
CCAAATGGATGAGCTGAGGTTTCCAGCCAAAAAGCTTAGAGCTTTGTGGTTTGCACCTCC
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CTCAGAGCTTCTAGTCGAGCAGATGAGTTCACAGACTCAGGATGTGATCAGAAAATACAC
CGAAACATCGCCTATTGGGAGAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCTTTGGGTAGTCTGCC
CTGGGAAAAGCCTCAATCTTCTGAGTT*GAACAACTGGCTAGGGAAAGTGAATACGCAGC
ATGGACACTTGCCAATGGGTATGCACTTAACCACGTCACTATCTCTGTCCATCGCCTTAA
ATCTCATCTCA*CAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTTCCTTGAAGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4BU85TF 757 0 0
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GACCTTTGGGATTGGTGGTTATGGGATTGACTCGCTTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGG
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TTTTATCTCAGAGCTTCTTGTCGAGCAGATGAGTTCACAGACTCAGGATGTGATCAGAAA
ATACACCGAAACATCTCCTAATGGGAGAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCTTTGGGTAG
TCTGCCCTGGGAAAAGCCTCAATCTTCCGAGTTTGAACAATTGGCTAGGGAAAGTGAATA
CGCAGCATGGACACTTGCCAATGGGTATGCACTTAACCACGTCACTATCTCTGTCCATCG
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AAATTGAACTCAGAAGAGAGTCCTTAAGTAGTCCTGATGGTGGTTTGCTACAAGCTCACT
GTAGCAGACTCGATTTCTTTCAGTTCTCTGATGGAGT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 4

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AGTACAACTACCTATATTATTTATTTAGTGCTTGCGTTGCTTATTATCATGGATGTTCAT
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CTAATATGTAAACATACTCGAATTTGCATGTGTTTCTAGTAATGAAAAAAATTGTGTTGT
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AAAAACTTCTTTTTTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A502TF U 1
AF RR4FM48JQ C 1
AF RR4FM48TF U 1
AF RR4A502JQ C 33
BS 1 124 RR4A502TF
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RD RR4A502TF 524 0 0
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CCGCTT**GGAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTC
ATGGTGCTCATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATCGTGAAC
CATACTATCCGGTAAGGTGGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGGACCTTAAGAAT
AGTACAACTACCTATATTATTTATTTAGTGCTTGCGTTGCTTATTATCATGGATGTTCAT
GAATCATGATGATCCATGAATATGGTTCATCGTTAACTGTCGAGATTAAACATATATCTT
CTAATATGTAAACATACTCGAATTTGCATGTGTTTCTAGTAATGAAAAAAATTGTGTTGT
GGAGTTTGTGTGTGTGTTTGTTGGGGTGGGGGGGGGGGG
GGGAT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4FM48JQ 482 0 0
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCATATCTCCAGATTCTCCACACAGCATGTCTGTAC
AAGCAGGCGCTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGGAATCGGTTATTGGTTCAGAGCCTC
CCGCGTGTGGAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTC
ATGGTGCTCATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT***CGTGAAC
CATACTATCCGGTAAGGTGGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGTACCTTAAGAAT
AGTACAACTACCTATATTATTTATTTAGTGCTTGCGTTGCTTATTATCATGGATGTTCAT
GAATCATGATGATCCATGAATATGGTTCATCGTTAACTGTCGAGATTAAACATATATCTT
CTAATATGTAAACATACTCGAATTTGCATGTGTTTCTAGTAATGAAAAAAATTGTGTTGT
GG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4FM48TF 482 0 0
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCATATCTCCAGATTCTCCACACAGCATGTCTGTAC
AAGCAGGCGCTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGGAATCGGTTATTGGTTCAGAGCCTC
CCGCGTGTGGAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTC
ATGGTGCTCATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT***CGTGAAC
CATACTATCCGGTAAGGTGGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGTACCTTAAGAAT
AGTACAACTACCTATATTATTTATTTAGTGCTTGCGTTGCTTATTATCATGGATGTTCAT
GAATCATGATGATCCATGAATATGGTTCATCGTTAACTGTCGAGATTAAACATATATCTT
CTAATATGTAAACATACTCGAATTTGCATGTGTTTCTAGTAATGAAAAAAATTGTGTTGT
GG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4A502JQ 585 0 0
CCAGATTCTCCACACAGCATGTCTGTACAAGCAGGCGCTCATGATCAACAACTAAAGAGG
AAGGAATCGGTTATTGGTTCAGAGCCTCCCGCTT**GGAAACAAGTGCCTGAATTGCAAG
CCTTCCCTTCCTTATTTATTTGACATTCATGGTGCTCATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGATGATGATGATGATCGTGAACCATACTATCCGGTAAGGTGGATGTGTAGATGT
CGGGAAAAGATATTCGGACCTTAAGAATAGTACAACTACCTATATTATTTATTTAGTGCT
TGCGTTGCTTATTATCATGGATGTTCATGAATCATGATGATCCATGAATATGGTTCATCG
TTAACTGTCGAGATTAAACATATATCTTTTAATATGTAAACATACTCGAATTTGCATGTG
TTTCTAGTAATGAAAAAAATTGTGTTGTGGAGTTTGTGTGTGTGTTTGTTGGGGTGGGGG
GGGGGGGATGACTTTTTCAATCTGATCTTTGTGCATTGTGCCCATTGCTTCTTTTTTTTA
ACTTTGTGTATTTTATATCAGACTAAATAAAAACTTCTTTTTTCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

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GTTAAGACTGGTCTGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGCTA
GCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCT
TTGATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAG
GTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCTAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGA
GCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGT
GGTGGTGTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCATCTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTT
TGTTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCA
AACAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCACTCTTCAGC
TTTCTCGTTAAGCATCTTAAAATCTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CI19TF U 1
AF RR4FQ09TF U 175
AF RR4EB95JQ C 269
AF RR4EB95TF U 269
BS 1 363 RR4CI19TF
BS 364 366 RR4EB95TF
BS 367 453 RR4CI19TF
BS 454 454 RR4FQ09TF
BS 455 531 RR4CI19TF
BS 532 537 RR4FQ09TF
BS 538 538 RR4EB95TF
BS 539 554 RR4FQ09TF
BS 555 570 RR4EB95TF

RD RR4CI19TF 531 0 0
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GTTAAGACTGGTCTGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGCTA
GCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCT
TTGATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAG
GTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCTAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGA
GCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGT
GGT***GTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCATCTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTT
TGTTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTGGTTA*CTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCA
AACAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4FQ09TF 384 0 0
G
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TCAAGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCTAAGAGGAAGCTTGGTACCCACA
AGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTG
GTGGTGGT***GTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCAT*TTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTG
AGCTTTGTTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATAT
GCTCAAACAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCACTCT
TCGGCTTTCTCGTTAAGCA
GAAA

QA 2 380 2 380
DS 

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G
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C

QA 2 302 2 302
DS 

RD RR4EB95TF 302 0 0
G
TGCTAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAG
TGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGAAGAAGAAGTAATC
ATCTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTG
GTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTA
ATATGGATTAATGTTTGTTTCACTCTTCAGCTTTCTCGTTAAGCATCTTAAAATCTTCAC
C

QA 2 302 2 302
DS 



AS 1 3

CO CL2941Contig1 990 3 5 U
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AAAAAAAAAAAAAAGCAGGACGATTATTATTATTATTTTTAATTTATAAGAAAATCAAAA
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ATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATACGGCTGCTTTAGTCAAT
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GGTGGTTTAGCCTTTGGCGTGTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTAC
TTGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCA
TACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAA
TGGATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGACCGG
CTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCTCCAAACTTCCTTGTTCAC
CATATACGCGGAGGGTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTT
CAAGAACATATCCGAGTGTCAGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTT
TCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGT
GTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTATGTGTTACTTACTCTC
GGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCGGAGATCTTTGGTGTTCTCCTTTGTTCTT
GCTTCTGTTACATACCCAAATATTCGTGCGTGAAGCTCAATCAATGTTATATTGTTTTAC
ATAAATAAAAGAATCTCATTTTTTTCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP53TF U 1
AF RR4DI67TF U 242
AF RR4BP53JQ C 302
BS 1 662 RR4BP53TF
BS 663 680 RR4DI67TF
BS 681 681 RR4BP53JQ
BS 682 725 RR4DI67TF
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RD RR4BP53TF 676 0 0
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AAAAAAAAAAAAAAGCAGGACGATTATTATTATTATTTTTAATTTATAAGAAAATCAAAA
TTCATATAATACCTTGAAATTATCATTACGAAGATCGAGAGTATTATCGTGAACAAAGGG
ATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATACGGCTGCTTTAGTCAAT
TCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCACCGACGTTTCGAACCTC
GGTGGTTTAGCCTTTGGCGTGTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTAC
TTGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCA
TACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAA
TGGATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGACCGG
CTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCTCCAAACTTCCTTGTTCAC
CATATACGCGGAGGGTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTT
CA
GACATATCCGAGTG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DI67TF 484 0 0
G
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TGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTACTT
GTTGATATTGGATCGTACCAATTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCATA
CATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAATTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATG
GATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCT
TGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCCAAACTTCCTTGTTCACCA
TATACGCGGAGGGTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATCGGTTGTTACCTTCTTCA
AGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTTTC
AAA

QA 2 484 2 484
DS 

RD RR4BP53JQ 689 0 0
GTGGTTTAGCCTTTGGCGTGTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTACT
TGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCAT
ACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAAT
GGATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGACCGGC
TTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCTCCAAACTTCCTTGTTCACC
ATATACGCGGAGGGTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTTC
AAGAACATATCCGAGTGTCAGGTGGGTTTAGGAACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTTT
CAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGTG
TCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTATGTGTTACTTACTCTCG
GCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCGGAGATCTTTGGTGTTCTCCTTTGTTCTTG
CTTCTGTTACATACCCAAATATTCGTGCGTGAAGCTCAATCAATGTTATATTGTTTTACA
TAAATAAAAGAATCTCATTTTTTTCAACT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 2 4

CO CL2942Contig1 840 2 4 U
GGAGAAAGATGATGAAACAGAGAGAAGTATCTCAGTCTGAAAAGACAGAACCTAACAAGA
ACACTCCAAACTCAGAAGCAGGAACGTAGTGTTTCCAGCTACTAACATAACTGGAGATAA
CTGTAGCTAAAACGTAAAAAGATAAACGAAAGAACAAAAGTTACTGAAGGGAACAAAAAG
TCTGCAATCATCTCTCTTCTGGAAATCCAGCAAACTAGTCAGATCTCTCTCTAGTTTGTG
GATGGTGGTCGAGTGATTCGTGGCCTCACTGGTGTCTTTGATGGACTTACCCTTATGGGT
TGGGATCCAATGACCATCCCGCTGCAATTGAGCGCCCTAGTTGCACTATCCGCCAGAGCA
AACTCAACAAAAGCAATGCGAGTTGAATGCAGTTGATCCCCAAGAAGCCTCAGACGAGTT
ACCTCACCACATGCTGACTCAAAGAAGTTTCTCATATCAGCTTGAGAAACCTTTTTGTCA
ACGTTTGTGCAATAGATGGTCCTTGAACACATCTCCCTTTCATCTTCAGACCTAGGAAGA
AATGTGGGATTCACTGGAAGAATAGCAGTTTTGGAGGGTAAGACCCTCACGGGATAGTAC
CCGAGCATCGTTCCACCAAGGCTTAAAGCTTTATGTGCGCCCTGGTCATCAGCAAACTCG
ACAAACGCAAACCGAAGAACTGAATGTGGATCCCCACAAATTCGACAGTCAACAACTTGT
CCACAGTTACTAAACAAGGCAGCAAGACCCTCCTCAGTCACACTCTGGTCAATGTCAGAA
ACATACACTGTTCTTCTAATACTATCCTCTCTCTGAGCTTTTGAAATTCTTCCAGTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA76JQ U 1
AF RR4GQ52JQ U 251
BS 1 481 RR4DA76JQ
BS 482 482 RR4GQ52JQ
BS 483 734 RR4DA76JQ
BS 735 840 RR4GQ52JQ

RD RR4DA76JQ 734 0 0
GGAGAAAGATGATGAAACAGAGAGAAGTATCTCAGTCTGAAAAGACAGAACCTAACAAGA
ACACTCCAAACTCAGAAGCAGGAACGTAGTGTTTCCAGCTACTAACATAACTGGAGATAA
CTGTAGCTAAAACGTAAAAAGATAAACGAAAGAACAAAAGTTACTGAAGGGAACAAAAAG
TCTGCAATCATCTCTCTTCTGGAAATCCAGCAAACTAGTCAGATCTCTCTCTAGTTTGTG
GATGGTGGTCGAGTGATTCGTGGCCTCACTGGTGTCTTTGATGGACTTACCCTTATGGGT
TGGGATCCAATGACCATCCCGCTGCAATTGAGCGCCCTAGTTGCACTATCCGCCAGAGCA
AACTCAACAAAAGCAATGCGAGTTGAATGCAGTTGATCCCCAAGAAGCCTCAGACGAGTT
ACCTCACCACATGCTGACTCAAAGAAGTTTCTCATATCAGCTTGAGAAACCTTTTTGTCA
ATGTTTGTGCAATAGATGGTCCTTGAACACATCTCCCTTTCATCTTCAGACCTAGGAAGA
AATGTGGGATTCACTGGAAGAATAGCAGTTTTGGAGGGTAAGACCCTCACGGGATAGTAC
CCGAGCATCGTTCCACCAAGGCTTAAAGCTTTATGTGCGCCCTGGTCATCAGCAAACTCG
ACAAACGCAAACCGAAGAACTGAATGTGGATCCCCACAAATTCGACAGTCAACAACTTGT
CCACAGTTACTAAA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GQ52JQ 590 0 0
GAGTGATTCGTGGCCTCACTGGTGTCTTTGATGGACTTACCCTTATGGGTTGGGATCCAA
TGACCATCCCGCTGCAATTGAGCGCCCTAGTTGCACTATCCGCCAGAGCAAACTCAACAA
AAGCAATGCGAGTTGAATGCAGTTGATCCCCAAGAAGCCTCAGACGAGTTACCTCACCAC
ATGCTGACTCAAAGAAGTTTCTCATATCAGCTTGAGAAACCTTTTTGTCAACGTTTGTGC
AATAGATGGTCCTTGAACACATCTCCCTTTCATCTTCAGACCTAGGAAGAAATGTGGGAT
TCACTGGAAGAATAGCAGTTTTGGAGGGTAAGACCCTCACGGGATAGTACCCGAGCATCG
TTCCACCAAGGCTTAAAGCTTTATGTGCGCCCTGGTCATCAGCAAACTCGACAAACGCAA
ACCGAAGAACTGAATGTGGATCCCCACAAATTCGACAGTCAACAACTTGTCCACAGTTAC
TAAACAAGGCAGCAAGACCCTCCTCAGTCACACTCTGGTCAATGTCAGAAACATACACTG
TTCTTCTAATACTATCCTCTCTCTGAGCTTTTGAAATTCTTCCAGTCAAC

QA 1 590 1 590
DS 



CO CL2942Contig2 781 2 2 U
GGATAACAACACAGCAGAGAGAAAGAAAGCTTTCTGTAATTGCAAACTCTATTTCCCAAT
GAGCTGATTAATTAGTACATTTTGTCATACTACGAGATCATGCACTCTTGTCTTTGCTTA
CGTTAATTTGGCAGAGTTTCTTAAAATGAGGTTTTAATTAATAGTAACATTTTTGAATTT
TTTTGCCCATCATTTACTGTAACAGTGTTGAATTTTTTTTTTTGGAAATTCTATTTCTCT
GTTAATTTGATCCAATGGCTGCCATCGCTGAGGATCCCACTACTGATGTTGTTGTTGTCA
AAGAAGTTCATGAGATTTGTATCAACAAAGATTCTGAAAAGATCATCAATGACAAAACTG
ATGAGATGACCTCGCACGAGACTGAGTCGGAGCTCAAACCTGAATCCGAGTTAGATATGC
AAAAGCTGGTGGCTATTTTCAAGAAACTGAATCCTTTGGCTAAGGAGTTCTTTCCCTCTT
ATTACAATCCCAAGAAAAACGGTGAAACTGCAAAAGGTGATCAATTTGATGATTTAACCA
CGGCTAAGAAGCAATCTGGTGAGGAGTTTGGTTCTGATGGAAAGAAGGATGACATTAACC
GGAAGAGAAAAAACAATAATAGCCAAGGGAGAAGGAGGTTGACTGGAAGAATTTCAAAAG
CTCAGAGAGAGGATAGTATTAAATAACAGTGTATGTTTCTGACATTGACCAGAGTGTGAC
TGAGGAGGGCTTGCTGCCTTGTTTATAACTGTGGACAAGTTGTGACTGTCGAATTTGTGG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4GQ52TF U 1
AF RR4DA76TF U 376
BS 1 612 RR4GQ52TF
BS 613 781 RR4DA76TF

RD RR4GQ52TF 612 0 0
GGATAACAACACAGCAGAGAGAAAGAAAGCTTTCTGTAATTGCAAACTCTATTTCCCAAT
GAGCTGATTAATTAGTACATTTTGTCATACTACGAGATCATGCACTCTTGTCTTTGCTTA
CGTTAATTTGGCAGAGTTTCTTAAAATGAGGTTTTAATTAATAGTAACATTTTTGAATTT
TTTTGCCCATCATTTACTGTAACAGTGTTGAATTTTTTTTTTTGGAAATTCTATTTCTCT
GTTAATTTGATCCAATGGCTGCCATCGCTGAGGATCCCACTACTGATGTTGTTGTTGTCA
AAGAAGTTCATGAGATTTGTATCAACAAAGATTCTGAAAAGATCATCAATGACAAAACTG
ATGAGATGACCTCGCACGAGACTGAGTCGGAGCTCAAACCTGAATCCGAGTTAGATATGC
AAAAGCTGGTGGCTATTTTCAAGAAACTGAATCCTTTGGCTAAGGAGTTCTTTCCCTCTT
ATTACAATCCCAAGAAAAACGGTGAAACTGCAAAAGGTGATCAATTTGATGATTTAACCA
CGGCTAAGAAGCAATCTGGTGAGGAGTTTGGTTCTGATGGAAAGAAGGATGACATTAACC
GGAAGAGAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4DA76TF 406 0 0
GCGAT
ACTGAGTCTGAGCTCAAACCTGAATCCGAGTTAGATATGCAAAAGCTGGTGGCTATTTTC
AAGAAACTGAATCCTTTGGCTAAGGAGTTCTTTCCCTCTTATTACAATCCCAAGAAAAAC
GGTGAAACTGCAAAAGGTGATCAATTTGATGATTTAACCACGGCTAAGAAGCAATCTGGT
GAGGAGTTTGGTTCTGATGGAAAGAAGGATGACATTAACCGGAAGAGAAAAAACAATAAT
AGCCAAGGGAGAAGGAGGTTGACTGGAAGAATTTCAAAAGCTCAGAGAGAGGATAGTATT
AAATAACAGTGTATGTTTCTGACATTGACCAGAGTGTGACTGAGGAGGGCTTGCTGCCTT
GTTTATAACTGTGGACAAGTTGTGACTGTCGAATTTGTGGG

QA 6 406 6 406
DS 



AS 1 4

CO CL2943Contig1 1305 4 8 U
CGAAGAAAAATGGTGAAGCTTATCACTGCATGTATTGAATGTTTATGACTTGGTGAAATT
ACATATGCTTTTTCACTTAATTTATCCCAAGATAAATTAAACAATAGGTTACATGACTTG
AGATTTTTTCCGGAGTTACATACACTATATAGAGAAACAATAGAATCAGAGATCAATAAT
GAGAAAAGAAACCCTGCTAATAAGAGACCAATGTTTCTAAAAATCTTTCATGCCTTCTTG
TTCTTTGCCATGGCAGCAATAAGGTCGGACGTGGTGTGAGAGCGGAGGACAAGATCAGAT
AGCGAGAGCTTGAGATCAATGGTTAGTCTCTGAAACACCTGAGATAAAAGCAAGACATCT
GACAATGCTCTGTGAGCATCACCATCCCTTACAAGGTTATAGTAATCCCCTAGAGCTGAT
AATGACGCTTTTGGCTTCACTGTTGCGTCTACAGACTTCATGCTCTCTCTGGCAAGTGGG
AGGGAGTCAAAGAAGAGCCAGTTAGGAGGAATCTCGTAAGAGCAGCGGTTAAACTCGTTG
ATCAAGAACTGAAAATCAAATGTTTTGCCGTTATGCGCAACAATCATCACATAGCCTCCA
GGCTTCTGTCTGCTCTGAACACACCTCAGAAATATCGGTATCATCTCCTCCATTCTTGGA
ACCTCAGGTCGACAAACCATATCGTTCCTGATCCCATGGATGCTAGCATTCAATATAGGA
ACACCAGGGTTGATGAGAGTCTGGAAGGTACTGTTCTCACCACCAGCTAGATCCTGAGCA
GCGATCTCGATGATCCTCTCCTTCACCCTATGCAAGCAGGTCGTCTCGAGATCAGAGACT
ATAACAGTGAGGAAGACTGGACAGATCTTTGTTTTCAGCAAGACGCTGCTGAAGGTTTCC
GAAAGGCTGTTGTTGTAACTTAGTAGTGCTTTCTGCATCTACTATCCTAGTAGTAACGGG
AGGAACAGCTCCTCCAAGGACACTGCTCTTGGTGTTGCTCCTGCTTCCTTGTGTGGTTGT
ACTCACGTTTCTCCTGACCCATCTGCTCTTACTATTATTATTAACCGAGGAAGAGGAGGA
GGAGGCTCTAATATCGAGAAGCTTAGGGGGTGTTGAGTTGTTCTTGAACCAGCCATGGAA
AGAAGTTCCTCCCAATAGGTTGATTCTGAATCTAGAGACTTGCGAGATTGATGAGATACA
CATTCTTCCTCTCCTCTCTAAGTTAAAGATCAATAATCACTCTTCTCGATCTCGTTCGTG
TGTAATGAAAACTTGCATCTGCACGGAATTGAGATGGTTTTTTGA


BQ
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AF RR4CQ03JQ U 53
AF RR4CQ03TF C 600
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GACAATGCTCTGTGAGCTTCACCATCCCTTACAAGGTTATAGTAATCCCCTAGAGCTGAT
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AGGGAGTCAAAGAAGAGCCAGTTAGGAGGAATCTCGTAAGAGCAGCGGTTAAACTCGTTG
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CC

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GAGCTGATAATGACGCTTTTGGCTTCACTGTTGCGTCTACAGACTTCATGCTCTCTCTGG
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ATGAAAACTTGCATCTGCACGGAATTGAGATGGTTTTTTGA

QA 6 706 6 706
DS 



AS 1 4

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GGAGTCTGTCGTAAAGCTTAAGGGCCTTGACATTGATAATCTCAACCAGCACTACACCGT
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4CT96TF U 1
AF RR4FV08TF U 508
AF RR4FV08JQ C 957
AF RR4CT96JQ C 519
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BS 700 700 RR4FV08TF
BS 701 714 RR4CT96TF
BS 715 864 RR4FV08TF
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BS 869 960 RR4FV08TF
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BS 962 1041 RR4FV08TF
BS 1042 1322 RR4CT96JQ

RD RR4CT96TF 714 0 0
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ATCTTTGTGACACGATCAAGGAGCTGGTCCTTTGTGGAACGCCCTGGATTCCTTCTTCTT
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TTTGCGAGAATCAAAGGGTGCGGATGGG*ATGGTGTGGAGTCATCTGGATTTACAGTATC
ATCACATACATTCCTCTTGACGTCCTCAAGCTCATCACCCGCTACATCCTCACTGGCAAA
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QA 1 714 1 714
DS 

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G*GTTCATCACCCGCTACATCCTCACTGGCAAAGCTTGGAACAACATGATTGAGAACAGG
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*CTAAGAGAAGTGCACACTCTCAAAGGCCACGTGGAGTCTGTCGTAAAGCTTAAGGGCCT
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GCACAGACGTATCACGATGATTTGATCAATAAAGTTAGAGAAAATGGCTTTATA

QA 1 534 1 534
DS 

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TTCTTAGCTTAAGGATAAAAAAAA

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DS 

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AGTCATCTGGATTTACAGTATCATCACATACATTCCTCTTGACGTCCTCAAGCTCATCAC
CCGCTACATCCTCACTGGCAAAGCTTGGAACAACATGATTGAGAACAGGACTGCATTCAC
AACCAAGAAAGACTATGGAAGGGGAGAAAGAGAGGCCCAATGGGCTCTAGCTCAACGTAC
ACTCCATGGACTTAAACCCCCGGAGTCAATGTTTGAAGACAAGGCAACCTTCACCGAGCT
TTCTGAGATCGCTGAACAGGCTAAAAAGCGTGCTGAAGTCGCAAGGTAAGCTAAGAGAAG
TGCACACTCTCAAAGGCCACGTGGAGTCTGTCGTAAAGCTTAAGGGCCTTGACATTGATA
ATCTCAACCAGCACTACACCGTTTAAGCCAAACTACAATGATATTTTAAGCACAGACGTA
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ATTTTTTTTTCTACTTCTTGTTTTTTTGTTATGCATTTGTTCTGTTCTTTTTTTATAATA
ATATATTGAGGTTGATGGTGCTAG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 4

CO CL2945Contig1 871 4 20 U
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ATACGTCTCGTAGGTGAAGCCAACGACTATGTAGGAAAGGGAATGGCCGGAGGTGAAGTT
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ACTTGTCTGTATGGTGCAACCGGTGGTTTACTATTTGTCAGAGGCAAAGCAGGAGAGAGA
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GCCGGAAGCTAACTCCGACCACCAGGTGAAAACAACCACCGGGGAAGAAGAGCAAGTGTC
GAACACATTTGCAGTGTAGTTGCGAGAAGTAAACTTTTCTTTGTACAGTCAGAAGTCATG
GCGGACATAAGTTTCAGTTTTTGAGTGTTGTTGCTACATTACGACAAGTTCGCCATTTGC
TTTTGACATGATGATTTGTTTTTTAATTCGGTCTGGATTCGGTTATCTTCCGGTCGTTAA
ATAATAAAAGGAAGTCCTCCATGTTTGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C610TF U 1
AF RR4C055TF U 72
AF RR4C610JQ C 387
AF RR4C055JQ C 679
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QA 1 562 1 562
DS 

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G
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GATTTGTTTT
CT

QA 2 731 2 731
DS 

RD RR4C610JQ 477 0 0
TTT
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GGCAACTTGTACCGCCGAGTGAAGAAGATACGCCGGAAGCTAACTCCGACCCCCAGGTGA
AAACAACCCCCGGGGAAGAAGAGCAAGTGTTGAACACATTTGCAGTGTAGTTGCGAGAAG
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GTTGCTACATTACAACAAGTTCGCCATTTGCTTTTGACATGATGATTTGTTTTTTAATTC
GGTTTGGATTCGGTTATTTTCCGGTCGTTAAATAATAAAAGGAAGTCCTCCATG

QA 4 477 4 477
DS 

RD RR4C055JQ 193 0 0
GTTGCGAGAAGTAAACTTTTCTTTGTACAGTCAGAAGTCATGGCGGACATAAGTTTCAGT
TTTTGAGTGTTGTTGCTACATTACGACAAGTTCGCCATTTGCTTTTGACATGATGATTTG
TTTTTTAATTCGGTCTGGATTCGGTTATCTTCCGGTCGTTAAATAATAAAAGGAAGTCCT
CCATGTTTGTGCG

QA 1 193 1 193
DS 



AS 1 4

CO CL2946Contig1 1061 4 3 U
GGGATTCTCTTTCTCTCTCTCGATCGACGACTGTTCTGTCGGAACCGGAGACGCGCGTCA
CGAGACGAATCTGTTCGAGTCTCCGGAGATCTGATCGAGATGAGTAACAGCGAGCTTCTT
ACCGTCGAGCCTCTCGACCTTCAGTTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCATGCTCT
CTTTACTTGACCAACAAGACCGACAATCATGTCGCCTTTAAGGTTAAGACAACGAATCCG
AAGAAGTATTGCGTTAGGCCTAACACTGGAGTTGTTCTTCCACGGTCCACTTGTGAAGTT
CTTGTGACCATGCAAGCTCAAAAGGAAGCTCCTGCGGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTT
CTGCTTCAAGGTGTAACTGCTAGTCCTGGTATCACAGCCAAGGATGTTACTCCTGAGATG
TTTAGTAAAGAGGCTGGGTATCTGGTTGAGGAGACCAAGCTGAGAGTTACTTATGTTGCT
CCACCACTACCACCATCACCAGTCCGCGAAGGTTCTGAAGAGGGTTCTTCACCAAGGGTT
TCGGTTTCTGATAACGGACAGGCTTCTGAATTTTCTAAATTTAGCGCAGACAAGGCTGAA
CCTCAAGAAAACACATCTGAGGCAAGGGCTCTCATCACGAAGCTAACCGAGGAGAAACAG
TCTGCCATTCAACTGAACAACAAACTTCAAAGAGAACTGGAGCAGTTGAGGCGTGACAGC
AAGAGAAGCCAAAGTGGTATCCCTTTGACGTACGTCCTTCTGGTGGGACTAATCGGTCTA
ATTTTGGGATACATTATGAAGAGCACATAACCACCACCACCAACGCCAACCCACCTCGAG
TCTTTAGTCCCCACACACACATCCACAGACTTATTTCTTAACTCCTTTTCCACTTTTTCG
CGCTTTCTGTATTTGAATATTTCACCTAAGAAAGGTGTCCCTCTAGATGATTTGTGTTCC
TACAGATTTCATAACTTTACTCTACTTTGTTTTTTAACTTTCTTTATTTGTAATCCAAAA
CCTTTTGGTGCTGAAAATTTAATGCGAGAGATGCTGAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E337TF U 1
AF RR4EB11TF U 1
AF RR4EB11JQ C 462
AF RR4E337JQ C 584
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RD RR4E337TF 190 0 0
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CGAGACGAATCTGTTCGAGTCTCCGGAGATCTGATCGAGATGAGTAACAGCGAGCTTCTT
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CTTTACTTGA

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4EB11TF 759 0 0
GGGATTCTCTTTCTCTCTCTCGATCGACGACTGTTCTGTCGGAACCGGAGACGCGCGTCA
CGAGACGAATCTGTTCGAGTCTCCGGAGATCTGATCGAGATGAGTAACAGCGAGCTTCTT
ACCGTCGAGCCTCTCGACCTTCAGTTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCATGCTCT
CTTTACTTGACCAACAAGACCGACAATCATGTCGCCTTTAAGGTTAAGACAACGAATCCG
AAGAAGTATTGCGTTAGGCCTAACACTGGAGTTGTTCTTCCACGGTCCACTTGTGAAGTT
CTTGTGACCATGCAAGCTCAAAAGGAAGCTCCTGCGGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTT
CTGCTTCAAGGTGTAACTGCTAGTCCTGGTATCACAGCCAAGGATGTTACTCCTGAGATG
TTTAGTAAAGAGGCTGGGTATCTGGTTGAGGAGACCAAGCTGAGAGTTACTTATGTTGCT
CCACCACTACCACCATCACCAGTCCGCGAAGGTTCTGAAGAGGGTTCTTCACCAAGGGTT
TCGGTTTCTGATAACGGACAGGCTTCTGAATTTTCTAAATTTAGCGCAGACAAGGCTGAA
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TCTGCCATTCAACTGAACAACAAACTTCAAAGAGAACTGGAGCAGTTGAGGCGTGACAGC
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QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4EB11JQ 600 0 0
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GCAGTTGAGGCGTGACAGCAAGAGAAGCCAAAGTGGTATCCCTTTGACGTACGTCCTTCT
GGTGGGACTAATCGGTCTAATTTTGGGATACATTATGAAGAGCACATAACCACCACCACC
AACGCCAACCCACCTCGAGTCTTTAGTCCCCACACACACATCCACAGACTTATTTCTTAA
CTCCTTTTCCACTTTTTCGCGCTTTCTGTATTTGAATATTTCACCTAAGAAAGGTGTCCC
TCTAGATGATTTGTGTTCCTACAGATTTCATAACTTTACTCTACTTTGTTTTTTAACTTT
CTTTATTTGTAATCCAAAACCTTTTGGTGCTGAAAATTTAATGCGAGAGATGCTGAAAAA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4E337JQ 478 0 0
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TGGGACTAATCGGTCTAATTTTGGGATACATTATGAAGAGCACATAACCACCACCACCAA
CGCCAACCCACCTCGAGTCTTTAGTCCCCACACACACATCCACAGACTTATTTCTTAACT
CCTTTTCCACTTTTTCGCGCTTTCTGTATTTGAATATTTCACCTAAGAAAGGTGTCCCTC
TAGATGATTTGTGTTCCTACAGATTTCATAACTTTACTCTACTTTGTTTTTTAACTTTCT
TTATTTGTAATCCAAAACCTTTTGGTGCTGAAAATTTAATGCGAGAGATGCTGAAAAA

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 4

CO CL2947Contig1 782 4 8 U
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ATATTTTTTTGAAGAGATTGAGAGAACCACATACATAGTTCTAGTTATCCCATAGGCCAT
ATCAATCCCAAAATAGACACTTGGAGTTCTCCATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAG
GCAAAGTTAAATCGTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCA
CAAAGTTGTCTCCATTTTGGCCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCCCATCAAAA
CAAAACACATCCAAATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACA
AGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGA
TGGACAAGG*TCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAG
AAGATATCGGAGA*CCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGCATGAA
CAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTT
ATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTTATTGTTTTAAATACTTGAATTGATTCTCCCCTTAGG
TTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAGTTTTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATT
TT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E072TF U 1
AF RR4CL03TF U 4
AF RR4E072JQ C 74
AF RR4CL03JQ C 72
BS 1 491 RR4E072TF
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BS 574 782 RR4CL03JQ

RD RR4E072TF 495 0 0
GGACTGTATTAGAAATTACTAGACGACGAAATAATTCTACGTAATATCTATATATTCGAG
ATATTTTTTTGAAGAGATTGAGAGAACCACATACATAGTTCTAGTTATCCCATAGGCCAT
ATCAATCCCAAAATAGACACTTGGAGTTCTCCATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAG
GCAAAGTTAAATCGTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCA
CAAAGTTGTCTCCATTTTGGCCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCCCATCAAAA
CAAAACACATCCAAATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACA
AGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGA
TGGACAAGG*TCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAG
AAGATATCGGA
GACC

QA 1 491 1 491
DS 

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GG
GTATTAGAAATTACTAGACGACGAAATAATTCTACGTAATATCTATATATTCGAGATATT
TTTTTGAAGAGATTGAGAGAACCACATACATAGTTCTAGTTATCCCATAGGCCATATCAA
TCCCAAAATAGACACTTGGAGTTCTCCATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAGGCAAA
GTTAAATCGTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCACAAAG
TTGTCTCCATTTTGGTCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCTCATCAAAACAAAA
CACATCCAAATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACAAGCAA
AGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGATGGAC
AAGGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAGAAGAT
ATCGGAAAACCGCAGGAGGAGCTGTTA

QA 3 509 3 509
DS 

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TAGACACTTGGAGTTCTCCATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAGGCAAAGTTAAATC
GTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCACAAAGTTGTCTCC
ATTTTGGCCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCCCATCAAAACAAAACACATCCA
AATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACAAGCAAAGCTTCCA
AGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGATGGACAAGG*TCA
AGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAGAAGATATCGGAGA
*CCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGCATGAACAAGTAGTGGACT
CAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTTTAAATA
AAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTGTTTATTGTTTTAAATACTTGAATTGATTCTC
AC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4CL03JQ 711 0 0
AA
GAGATTGAGAGAACCACATACATAGTTCTAGTTATCCCATAGGCCATATCAATCCCAAAA
TAGACACTTGGAGTTCTCCATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAGGCAAAGTTAAATC
GTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCACAAAGTTGTCTCC
ATTTTGGTCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCTCATCAAAACAAAACACATCCA
AATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACAAGCAAAGCTTCCA
AGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGATGGACAAGG*TCA
AGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAGAAGATATCGGAGA
*CCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGCATGAACAAGTAGTGGACT
CAAAATCAAATTGGCAGCT*TTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTTTAAATA
AAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTGTTTATTGTTTTAAATACTTGAATTGATTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGG
ATGTTTGTGTATTTAGTTTTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATTTT

QA 3 711 3 711
DS 



AS 1 3

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GCAACAATTTCATCTTTGAAGTTGCTTAAGAAAAGACATGATAAAGTCAGGTTTTCTTGT
CTAGCAATCTTTTACATAAAGATTGTAAAAAAATACAAAAAAATATCTCATTTATCTACT
TGCATATATTAACAAAGTTCAGGGCATCATAATATAACCTTTGTTCTGATCAAAAATTAC
AACCAAAAGGTTCTCTATCAAAAAACCTACAAAATCTCTCCCTCCTCAAGATCGTTGATT
CTCATAGCATCAGAAATTTCTGAAACGTCCTCATCCGAATCATCATCATCGTTTATTAAA
ACCAGACCCAACTCAGGTAACCAAGTTCTTGTCGGATCACAGGTACCACAGAGATTAATC
ATAATCTCGTTAAACTTCCAGGGGTTATTCTCTTCAAAGTCAACTTCTTTGACCATCTTT
TCTAGCTCAAGCCGTTCTCTCTCACGTTTCTCTTTCAACTCGGCTTGTGCTCTTATTCTT
GCGGCAAGCTTAGCGACTGCTATCTCTGCTTCAATTCTAGCCTTCTCTTCACGTTGAGTT
TTCTCCATCTGTTCCTTTTCTATCTCTATTCTAATTAGATCAGATTTGTTACTCTTGTCA
AGGACTTTTCTGTGTTTAGCTTTCAGGATGGTCTCTGCGAATTGACATTTGAGTAATGCA
GCACGAATAGCCTTCTCTGGTGGCAACGGAGGCATAGGAGGTAATGGCTTTTTCAACTCA
TTATCCAAAAGTGTATCACGCTGAGAACTGACACAATCATTCTTTGAGCTTATAGACCCA
TTGGAATGTGGATCTGACTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C642JQ U 46
AF RR4G354JQ U 1
AF RR4G354TF C 219
BS 1 98 RR4G354JQ
BS 99 99 RR4C642JQ
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BS 700 803 RR4G354TF

RD RR4C642JQ 160 0 0
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TCTCATTTATCTACTTGCATATATTAACAAAGTTCAGGGCATCATAATATAACCTTTGTT
CTGATCAAAAATTACAACCAAAAGGTTCTCTATCAAAAAA

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR4G354JQ 699 0 0
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CTAGCAATCTTTTACATAAAGATTGTAAAAAAATACAAGAAAATATCTCATTTATCTACT
TGCATATATTAACAAAGTTCAGGTCATCATAATATAACCTTTGTTCTGATCAAAAATTAC
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CTCATAGCATCAGAAATTTCTGAAACGTCCTCATCCGAATCATCATCATCGTTTATTAAA
ACCAGACCCAACTCAGGTAACCAAGTTCTTGTCGGATCACAGGTACCACAGAGATTAATC
ATAATCTCGTTAAACTTCCAGGGGTTATTCTCTTCAAAGTCAACTTCTTTGACCATCTTT
TCTAGCTCAAGCCGTTCTCTCTCACGTTTCTCTTTCAACTCGGCTTGTGCTCTTATTCTT
GCGGCAAGCTTAGCGACTGCTATCTCTGCTTCAATTCTAGCCTTCTCTTCACGTTGAGTT
TTCTCCATCTGTTCCTTTTCTATCTCTATTCTAATTAGATCAGATTTGTTACTCTTGTCA
AGGACTTTTCTGTGTTTAGCTTTCAGGATGGTCTCTGCGAATTGACATTTGAGTAATGCA
GCACGAATAGCCTTCTCTGGTGGCAACGGAGGCATAGGA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4G354TF 585 0 0
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ATCATCATCATCGTTTATTAAAACCAGACCCAACTCAGGTAACCAAGTTCTTGTCGGATC
ACAGGTACCACAGAGATTAATCATAATCTCGTTAAACTTCCAGGGGTTATTCTCTTCAAA
GTCAACTTCTTTGACCATCTTTTCTAGCTCAAGCCGTTCTCTCTCACGTTTCTCTTTCAA
CTCGGCTTGTGCTCTTATTCTTGCGGCAAGCTTAGCGACTGCTATCTCTGCTTCAATTCT
AGCTTTCTCTTCACGTTGAGTTTTCTCCATCTGTTCCTTTTCTATCTCTATTCTAATTAG
ATCAGATTTGTTACTCTTGTCAAGGACTTTTCTGTGTTTAGCTTTCAGGATGGTCTCTGC
GAATTGACATTTGAGTAATGCAGCACGAATAGCCTTCTCTGGTGGCAACGGAGGCATAGG
AGGTAATGGCTTTTTCAACTCATTATCCAAAAGTGTATCACGCTGAGAACTGACACAATC
ATTCTTTGAGCTTATAGACCCATTGGAATGTGGATCTGACTCGCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

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GTTCCATCTCCCGAATCGCTCTAGACTGATGCTGATGATGGATACCGAACCTGATCAGCA
ACAGCAACACCCACCACAAAAGCAAAAGCGACTGTCGAGAAGGAGATGGACACCGTCTCT
CGACAAGGTGTTGGCCGATCTGGTGGTTAAACAGATCCAACAAGGGAACAGACAGAGCAA
CGGTTTCGACAGGAAGACGTGGGTCAACATGCGTAACGAGTTCAACCACCAGACGGGACT
CAACTACAACAACAACCAGCTTAGGAAACATCTGAATGTACTGAGACAGCGTTATGATTC
GGTTAAATCTTCTCAGCTTCATAACCAGCTTGTTATGGAGGATGATGCTTCAGGATGTAT
CTTGGGGTTGGACTTGTGGGAAGATTTTGGTGTGCAGCCTAGGAGTGAACCTGTTAAAGT
TAAAGAGTGTCCTATCTATGACCAGCTTTCTACTATATATGGTGATGTTTCTTCTGAAGG
GATGTATGCTCAGTCAAGTCACTTCGAGGGGTTAGACGAACCAATGCCAAATCATAATAA
TACCTCCGAGAGTTTACCAACACCAAATGTGGAGAGGAAGAGGAAGAGAGAGACTTCTTC
TGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTAATGGAAACTATGGCAGGTACTTTGTCGGA
CATGGTGACTAGTCTGAGGTCAAGGATTGGTGGTTCGGAGACGGAAGAAGAAGAAGGTGA
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TGTCTACTTTGGAGCTTTGGATCTTTTTGAGAGTCCTGGTCTTAGAGAGACCTTTATCTC
TCTTAAAGCTAACAAGTTACGCTTGACATGGTTGCAAGTTAAGTGCAGGAACAAACTTAC
TCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAAGCTATATATATATATATATTGATTTGGAC
TTTTGTAGCTTTCTTTTCTTTTTTGGATTGCTAATGACAAATAATTGAGTGAAAATAGTA
TCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL94TF U 1
AF RR4C769TF U 219
AF RR4C769JQ C 257
AF RR4CL94JQ C 225
BS 1 333 RR4CL94TF
BS 334 334 RR4C769TF
BS 335 391 RR4CL94TF
BS 392 590 RR4C769TF
BS 591 606 RR4CL94JQ
BS 607 607 RR4C769JQ
BS 608 649 RR4CL94JQ
BS 650 650 RR4C769JQ
BS 651 831 RR4CL94JQ
BS 832 832 RR4C769JQ
BS 833 958 RR4CL94JQ
BS 959 959 RR4C769JQ
BS 960 1018 RR4CL94JQ
BS 1019 1019 RR4C769JQ
BS 1020 1032 RR4CL94JQ
BS 1033 1033 RR4C769JQ
BS 1034 1086 RR4CL94JQ

RD RR4CL94TF 400 0 0
TCGATTTTCGTTCATCGGTCTCGTCGTCGGGGAACCATGGAGGATTGAGATCATCACCTC
GTTCCATCTCCCGAATCGCTCTAGACTGATGCTGATGATGGATACCGAACCTGATCAGCA
ACAGCAACACCCACCACAAAAGCAAAAGCGACTGTCGAGAAGGAGATGGACACCGTCTCT
CGACAAGGTGTTGGCCGATCTGGTGGTTAAACAGATCCAACAAGGGAACAGACAGAGCAA
CGGTTTCGACAGGAAGACGTGGGTCAACATGCGTAACGAGTTCAACCACCAGACGGGACT
CAACTACAACAACAACCAGCTTAGGAAACATCTTAATGTACTGAGACAGCGTTATGATTC
GGTTAAATCTTCTCAGCTTCATAACCAGCTT
TGTGATGGA

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR4C769TF 389 0 0
AACAAGGGA
ACAGACAGAACAACGGTTTCGACAGGAAGACGTGGGTCAACATGCGTAACGAGTTCAACC
ACCAGACGGGACTCAACTACAACAACAACCAGCTTAGGAAACATCTGAATGTACTGAGAC
AGCGTTATGATTCGGTTAAATCTTCTCAGCTTCATAACCAGCTTGTTATGGAGGATGATG
CTTCAGGATGTATCTTGGGGTTGGACTTGTGGGAAGATTTTGGTGTGCAGCCTAGGAGTG
AACCTGTTAAAGTTAAAGAGTGTCCTATCTATGACCAGCTTTCTACTATATATGGTGATG
TTTCTTCTGAAGGGATGTATGCTCAGTCAAGTCACTTCGAGGGGTTAGACGAACCAATGC
CAA
TCATATACCTCCGAGAG

QA 10 372 10 372
DS 

RD RR4C769JQ 815 0 0
ACGTG
GGTCAACATGCGTAACGAGT*CAACCACCAGACGGGACTCAACTACAACAACAACCAGCT
TAGGAAACATCTGAATGTACTGAGACAGCGTTATGATTCGGTTAAATCTTCTCAGCTTCA
TAACCAGCTTGTTATGGAGGATGATGCTTCAGGATGTATCTTGGGGTTGGACTTGTGGGA
AGATTTTGGTGTGCAGCCTAGGAGTGAACCTGTTAAAGTTAAAGAGTGTCCTATCTATGA
CCAGCTTTCTACTATATATGGTGATGTTTCTTCTGAAGGGATGTATGCTCAGTCAAGTCA
CTTCGAGGGGTTAGACGAACCAATGCCAAATCATAATA***CCTCCGAGAGTTTACCAAC
ACCAAATGTGGAGAGGAAGAGGAAGAGAGAGACTTTTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGA
TCCAGCAGTAATGGAAACTATGGCAGGTACTTTGTCGGACATGGTGACTAGTCTGAGGTC
AAGGATTGGTGGTTCGGAGACGGAAGAAGAAGAGGGTGATAGGTTTAGTATTGCAAAATG
CATCGGTGCGCTTGACGAGATTGAGAATGTCGATGAAGGTGTCTACTTTGGAGCTTTGGA
TCTTTTTGAGAGTCCTGGTCTTAGAGAGACCTTTATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTACG
CTTGACATGGTTGCAAGTTAAGTGCAGGAACAAACTTACTCCTTCAGTTGCACAGCTAGG
TTGACTTCAAGCTATATATATATAT****TGATTTGGACTTTTGTAGCTTTCTTTTCTTT
TTTGGATTGCTAATGACAAATAATTGAG
CG

QA 6 813 6 813
DS 

RD RR4CL94JQ 862 0 0
GGG
ACAGACAGAGCAACGGTT*CGACAGGAAGACGTGG*TCAACATGCGTAACGAGT*CAACC
ACCAGACGGGACTCAACTACAACAACAACCAGCTTAGGAAACATCTTAATGTACTGAGAC
AGCGTTATGATTCGGTTAAATCTTCTCAGCTTCATAACCAGCTTGTGATGGAGGATGATG
CAGGAGGATGTATCTTGGGGTTGGACTTGTGGGAAGATTTTGGTGTGCAGCCTAGGAGTG
AACCTGTTAAAGTTA**GAGTGTCCTATCTATGACCAGCTTTCTACTATATATGGTGATG
TTTCTTCTGAAGGGATGTATGCTCAGTCAAGTCACTTTGAGGGGTTAGACGAACCAATGC
CAAATCATAATAATACCTCTGAGAGTTTACCAACACCAAATGTGGAGAGGAAGAGGAAGA
GATAGACTTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTAATGGAAACTATGGCAG
GTACTTTGTCGGACATGGTGACTAGTCTGAGGTCAAGGATTGGTGGTTCGGAGACGGAAG
AAGAAGAAGGTGATAGGTTTAGTATCGCAAAATGCATCGGTGCGCTTGACGAGATTGAGA
ATGTGGATGAAGGTGTCTACTTTGGAGCTTTGGATCTTTTTGAGAGTCCTGGTCTTAGAG
AGACCTTTATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTACGCTTGACATGGTTGCAAGTTAAGTGCA
GGAACAAACTTGCTCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAAGCTATATATATATATA
TATTGATTTGGTCTTTTGTAGCTTT*TTTTCTTTTTTGGATTGCTAATGACAAATAATTG
AGTGAAAATAGTATCAGCT

QA 4 862 4 862
DS 



AS 1 4

CO CL2950Contig1 1284 4 11 U
GGAACGACAGCATGGACAAGACAACGACATTGCTTTTGTTCTTCTTCTTGTTCACATTCC
TTACGACTTCTTTCTCTAAAAACCTATGTAACCAAGATGACAAAACCACCCTCCTCAAGA
TCAAAAAAGCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGTGGGACCCTCAAACAGACTGTT
GCTCCTGGTACTGCCTCGAGTGCGGCGACGCCACCGTTAACCACCGTGTCACCTCCCTAA
CCATATTTTCCGGTCAGATCTCCGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTGCCTTATC
TACAGACTCTTGTCTTCCGCAAACTCACTAACCTCACCGGTCAGATCCCACGCACCATTA
CCAAGCTCAAGTATCTCCGGAGCCTCAGGCTGAGCTGGACGAATCTGACCGGTCCGGTTC
CTGGTTTTCTCAGTGAGCTCAAGAATCTCCAGTTCGTAGACCTTTCCTTCAATGATCTCA
CTGGTTCAATACCGAGTTCTCTGTCTTTGTTACCAAATCTTTTGTCCCTTGATCTCAGCA
GGAACAAGCTTACAGGTTCGATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCCAGCAAAAGTACCTG
ACCTTTACCTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTATATACCGAAAACACTAGGCAATCTTG
ATTTTAACCGGATAGATTTCTCCAGGAACAAGCTCGGAGCGATGCTTCGATGTTGTTTGG
AGCCAACAAAACGACATGGTACGTTGATTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTCTC
TAGAGTTGTGATCCCAAAGACACTTGGTATCTTGGACTTGAACCACAATGGGATCACAGG
GAATATCCCGGTTCAGTGGACCGAAGCTCCTCTCCAGTTCTTCAATGTTAGCTATAACAG
ACTATGTGGACACATCCCCACAGGAGGGAAACTTCAGGAATTTGATTCTTATTCCTATTT
TCACAACAAGTGCTTATGTGGTGCACCTCTTGATAGTTGCAAGTGAGATTCAAGCAGCCA
AGCTATCTTTATCCTACTTCTACAAATAATCCAATGAGTCTATAGACAACTGTTATCTTT
ATTTGGATTGATTAATAAAAAAAAAATCAACCAAACTTGATTTGATGAATTTGTAGTACT
ATCTTCAAAAATAATATAAGAATGTAAACAAGAAAAATAAATTTTCTTATAATGGTTCTA
TTACTTTATGAAAATAAAAGTTATAAGCTAAGGTAATTTGATATGTTGAAGCTTAAAGTG
CATCATCGAATATATGGTCAACCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF30TF U 1
AF RR4BX83TF U 4
AF RR4BX83JQ C 706
AF RR4DF30JQ C 738
BS 1 173 RR4DF30TF
BS 174 174 RR4BX83TF
BS 175 484 RR4DF30TF
BS 485 730 RR4BX83TF
BS 731 731 RR4BX83JQ
BS 732 814 RR4BX83TF
BS 815 947 RR4BX83JQ
BS 948 948 RR4DF30JQ
BS 949 994 RR4BX83JQ
BS 995 995 RR4DF30JQ
BS 996 1284 RR4BX83JQ

RD RR4DF30TF 484 0 0
GGAACGACAGCATGGACAAGACAACGACATTGCTTTTGTTCTTCTTCTTGTTCACATTCC
TTACGACTTCTTTCTCTAAAAACCTATGTAACCAAGATGACAAAACCACCCTCCTCAAGA
TCAAAAAAGCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGTGGGACCCTCAAACATACTGTT
GCTCCTGGTACTGCCTCGAGTGCGGCGACGCCACCGTTAACCACCGTGTCACCTCCCTAA
CCATATTTTCCGGTCAGATCTCCGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTGCCTTATC
TACAGACTCTTGTCTTCCGCAAACTCACTAACCTCACCGGTCAGATCCCACGCACCATTA
CCAAGCTCAAGTATCTCCGGAGCCTCAGGCTGAGCTGGACGAATCTGACCGGTCCGGTTC
CTGGTTTTCTCAGTGAGCTCAAGAATCTCCAGTTCGTAGACCTTTCCTTCAATGATCTCA
CTGG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4BX83TF 811 0 0
GG
GACAGCATGGACAAGACAACGACATTGCTTTTGTTCTTCTTCTTGTTCACATTCCTTACG
ACTTCTTTCTCTAAAAACCTATGTAACCAAGATGACAAAACCACCCTCCTCAAGATCAAA
AAAGCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCTCGTGGGACCCTCAAACAGACTGTTGCTCC
TGGTACTGCCTCGAGTGCGGCGACGCCACCGTTAACCACCGTGTCACCTCCCTAACCATA
TTTTCCGGTCAGATCTCCGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTGTCTTATCTACAG
ACTCTTGTCTTCCGCAAACTCACTAACCTCACCGGTCAGATCCCACGCACCATTACCAAG
CTCAAGTATCTCCGGAGCCTCAGGCTGAGCTGGACGAATCTGACCGGTCCGGTTCCTGGT
TTTCTCAGTGAGCTCAAGAATCTCCAGTTCGTAGACCTTTCCTTCAATGATCTCACTGGT
TCAATACCGAGTTCTCTGTCTTTGTTACCAAATCTTTTGTCCCTTGATCTCAGCAGGAAC
AAGCTTACAGGTTCGATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCCAGCAAAAGTACCTGACCTT
TACCTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTATATACCGAAAACACTAGGCAATCTTGATTTT
AACCGGATAGATTTCTCCAGGAACAAGCTCGGAGCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCCA
ACAAA*CGACATGGTACGTTGATTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTCTCTAGAG
TTGTGATCCCAAAGACACTTGGTATCTTG

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR4BX83JQ 579 0 0
TTCGATGTTGTTTGGAGCCAACAAAACGACATGGTACGTTGATTTATCAAGAAACATGTT
CCAGTTCGATCTCTCTAGAGTTGTGATCCCAAAGACACTTGGTATCTTGGACTTGAACCA
CAATGGGATCACAGGGAATATCCCGGTTCAGTGGACCGAAGCTCCTCTCCAGTTCTTCAA
TGTTAGCTATAACAGACTATGTGGACACATCCCCACAGGAGGGAAACTTCAGGAATTTGA
TTTTTATTCCTATTTTCACAACAAGTGCTTATGTGGTGCACCTCTTGAT*GTTGCAAGTG
AGATTCAAGCAGCCAAGCTATCTTTATCCTACTTCTACAAATAATCCAATGAGTCTATAG
ACAACTGTTATCTTTATTTGGATTGATTAATAAAAAAAAAATCAACCAAACTTGATTTGA
TGAATTTGTAGTACTATCTTCAAAAATAATATAAGAATGTAAACAAGAAAAATAAATTTT
CTTATAATGGTTCTATTACTTTATGAAAATAAAAGTTATAAGCTAAGGTAATTTGATATG
TTGAAGCTTAAAGTGCATCATCGAATATATGGTCAACCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4DF30JQ 525 0 0
GGTACGTTGATTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTCTCTAGAGTTGTGATCCCAA
AGACACTTGGTATCTTGGACTTGAACCACAATGGGATCACAGGGAATATCCCGGTTCAGT
GGACCGAAGCTCCTCTCCAGTTCTTCAATGTTAGCTATAACAGACTATGTGGACACATCC
CCACAGGAGGGAAACTTCAGGAATTTGATTCTTATTCCTATTTTCACAACAAGTGCTTAT
GTGGTGCACCTCTTGATAGTTGCAAGTGAGATTCAAGCAGCCAAGCTATCTTTATCCTAC
TTCTACAAATAATCCAATGAGTCTATAGACAACTGTTATCTTTATTTGGATTGATTAATA
AAAAAAAA*TCAACCAAACTTGGTTTGATGAATTTGTAGTACTATCTTCAAAAATAATAT
AAGAATGTAAACAAGAAAAATAAATTTTCTTATAATGGTTCTATTACTTTATGAAAATAA
AAGTTATAAGCTAAGGTAATTTGATATGTTGAAGCTTAAAGTGC
C

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL2951Contig1 966 2 6 U
GGACAAATCACAAACTTTGATCCAAATGGCTACAAGAATCATCTGCCTTCTTCTTGCCTT
ATCCGCGGCATCACTATCCCTCTCTTTGGCTGCTTCCCACGATTTCTCAATCGTTGGATA
TGCCCCTGAGGATTTAGAGTCTCACGACAAACTCATTGAACTCTTCGAAAACTGGCTCTC
CAACTTCGAGAAAGCTTACCAAACCGTTGAAGAGAAGTTACTTAGATTCGAAGTTTTCAA
GGATAATCTCAAACACATCGATGAGACTAACAAGAAAGCCAAAAGCTACTGGCTTGGTCT
CAACGAGTTTGCTGATTTGAGCCACGAAGAGTTCAAGAGTAAGTACTTGGGACTCAAGAC
TGATATTGTGAGACGCGATGACGATGATGAAAGATCTTACCAAGAGTTCGCTTATAAGGA
CGTTGAGGCTTTGCCTAAATCCGTTGACTGGAGAAAGAAAGGAGCCGTTAGCTATGTCAA
GAACCAAGGCTCTTACGGAAGTTGTTGGGCGTTTTCGACGGTAGCTGCAGTGGAAGGTAT
AAACAAGATTGTGACTGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGAACTCATAGACTGTGA
CACAACCTATAACAATGGCTGCAACGGTGGTCTGATGGACTATGCTTTTGACTACATTGT
CAAAAACGGAGGTCTTCGCAAGGAAGAGGATTATCCTTACTCCATGGAAGAAGGAACATG
CGAGACGCAAAAGGATGAATCTGAAAAGGTGACTATCAACGGACACCAAGATGTACCTAC
CAATGACGAGAAGATTCTCTTGAAAGCGTTGGCTCATCAGCCTCTCAGTGTTGCCATTGA
TGCTTCTGGTAGAGAGTTCCAGTTCTATAGCGGTGTAAGTACTTTACTAGACCCATGATC
AAGAAAATGATTGATCAATTGATTCTTGACTGTGTTTGGTATTATGTGAAGGTGTTTTGA
TGGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK55TF U 1
AF RR4DS31TF U 192
BS 1 428 RR4DK55TF
BS 429 429 RR4DS31TF
BS 430 665 RR4DK55TF
BS 666 666 RR4DS31TF
BS 667 684 RR4DK55TF
BS 685 966 RR4DS31TF

RD RR4DK55TF 684 0 0
GGACAAATCACAAACTTTGATCCAAATGGCTACAAGAATCATCTGCCTTCTTCTTGCCTT
ATCCGCGGCATCACTATCCCTCTCTTTGGCTGCTTCCCACGATTTCTCAATCGTTGGATA
TGCCCCTGAGGATTTAGAGTCTCACGACAAACTCATTGAACTCTTCGAAAACTGGCTCTC
CAACTTCGAGAAAGCTTACCAAACCGTTGAAGAGAAGTTACTTAGATTCGAAGTTTTCAA
GGATAATCTCAAACACATCGATGAGACTAACAAGAAAGCCAAAAGCTACTGGCTTGGTCT
CAACGAGTTTGCTGATTTGAGCCACGAAGAGTTCAAGAGTAAGTACTTGGGACTCAAGAC
TGATATTGTGAGACGCGATGACGATGATGAAAGATCTTACCAAGAGTTCGCTTATAAGGA
CGTTGAGGTTTTGCCTAAATCCGTTGACTGGAGAAAGAAAGGAGCCGTTAGCTATGTCAA
GAACCAAGGCTCTTACGGAAGTTGTTGGGCGTTTTCGACGGTAGCTGCAGTGGAAGGTAT
AAACAAGATTGTGACTGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGAACTCATAGACTGTGA
CACAACCTATAACAATGGCTGCAACGGTGGTCTGATGGACTATGCTTTTGACTACATTGT
CAAAA*CGGAGGTCTTCGCAAGGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4DS31TF 775 0 0
G
AGCTTACCAAACCGTTGAAGAGAAGTTACTTAGGTTCGAAGTTTTCAAGGATAATCTCAA
ACACATCGATGAGACTAACAAGAAAGCCAAAAGCTACTGGCTTGGTCTCAACGAGTTTGC
TGATTTGAGCCACGAAGAGTTCAAGAGTAAGTACTTGGGACTCAAGACTGATATTGTGAG
ACGCGATGACGATGATGAAAGATCTTACCAAGAGTTCGCTTATAAGGACGTTGAGGCTTT
GCCTAAATCTGTTGACTGGAGAAAGAAAGGAGCCGTTAGCTATGTCAAGAACCAAGGCTC
TTGCGGAAGTTGTTGGGCGTTTTCGACGGTAGCTGCAGTGGAAGGTATAAACAAGATTGT
GACTGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGAACTCATAGACTGTGACACAACCTATAA
CAATGGCTGCAACGGTGGTCTGATGGACTATGCTTTTGACTACATTGTCAAAAACGGAGG
TCTTCGCAAGGAAGAGGATTATCCTTACTCCATGGAAGAAGGAACATGCGAGACGCAAAA
GGATGAATCTGAAAAGGTGACTATCAACGGACACCAAGATGTACCTACCAATGACGAGAA
GATTCTCTTGAAAGCGTTGGCTCATCAGCCTCTCAGTGTTGCCATTGATGCTTCTGGTAG
AGAGTTCCAGTTCTATAGCGGTGTAAGTACTTTACTAGACCCATGATCAAGAAAATGATT
GATCAATTGATTCTTGACTGTGTTTGGTATTATGTGAAGGTGTTTTGATGGGCG

QA 2 775 2 775
DS 



AS 1 3

CO CL2952Contig1 898 3 5 U
GGTCGAAAACAAGATCCAAATTCCACACACACAACAATAACAACAATACCAACAAAGTCC
ACTCACACAACAATAACAACAGAAACAAACAAAAACAAAAGATACGAAACAAAATGCATT
CCGCTAGTAAACAAACCACGCCACGAACATTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTT
GTTGCCCTCATAAACAGATTTATCAAGAACCCAAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGAT
CCATAACTTCCCATCTTCCCTCTCATAAGCTTCACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTC
ACTATCCTCAAGCATCTCAATAATCTCTCCGGTCTCTCCAGAGAGTTTCAAGATTATTCC
ATGAGGCTTCCCTCCGTTCATGGGATGAACCACTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAA
AAACTTTCCAACCCAAGAGTGAATCAGAAACAACCTAGTGAGCAAATTGCTCTTGCAGTG
CAACGCGACCCAAAAATCACCAGTAGGGGTACGTCGGATATTGTCCGGAGGGCCAGGGAC
CTTGGCGAAAACCTCGGTGGTCCCGGCCTTAGGACCTTTGACCCATATTCTGTGGAGAAT
ACCCGTACCACCTTCACAGGTGATTACAAAAGATCCGTCTTTGCTTAGAGCTAAACCATT
AGGTAAATGAAGTTTGTCCATTATAACTTTGGCCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTAAT
TACTCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATAGACACGTAGAACACTTCCCCGAAATGGTATTT
GTCGCTGCTATCATTGAAATAGAAGACGTCTTCCTCTTCGTCTATGTCCATTTGGTTCGC
AAACATAACTTTGCGGCCTTCGGCTTCATCAACGACTAACTCGGCCAAGCCTCCTTCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD37JQ U 1
AF RR4CN53JQ U 2
AF RR4DD37TF C 213
BS 1 551 RR4DD37JQ
BS 552 729 RR4CN53JQ
BS 730 730 RR4DD37TF
BS 731 798 RR4CN53JQ
BS 799 898 RR4DD37TF

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ACTCACACAACAATAACAACAGAAACAAACAAAAACAAAAGATACGAAACAAAATGCATT
CCGCTAGTAAACAAACCACGCCACGAACATTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTT
GTTGCCCTCATAAACAGATTTATCAAGAACCCAAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGAT
CCATAACTTCCCATCTTCCCTCTCATAAGCTTCACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTC
ACTATCCTCAAGCATCTCAATAATCTCTCCGGTCTCTCCAGAGAGTTTCAAGATTATTCC
ATGAGGCTTCCCTCCGTTCATGGGATGAACCACTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAA
AAACTTTCCAACCCAAGAGTGAATCAGAAACAACCTAGTGAGCAAATTGCTCTTGCAGTG
CAACGCGACCCAAAAATCACCAGTAGGGGTACGTCGGATATTGTCCGGAGGGCCAGGGAC
CTTGGCGAAAA

QA 1 551 1 551
DS 

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GTCGAAAACAAGATCCAAATTCCACACACACAACAATAACAACAATACCAACAAAGTCCA
CTCACACAACAATAACAACAGAAACAAACAAAAACAAAAGATACGAAACAAAATGCATTC
CGCTAGTAAACAAACCACGCCACGAACATTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTTG
TTGCCCTCATAAACAGATTTATCAAGAACCCAAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGATC
CATAACTTCCCATCTTCCCTCTCATAAGCTTCACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTCA
CTATCCTCAAGCATCTCAATAATCTCTCCGGTCTCTCCAGAAAGTTTCAAGATTATTCCA
TGAGGCTTCCCTCCGTTCATGAAATGAACCACTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAAA
AACTTTCCAACCCAAGAGTGAATCAGAAACAACCTAGTGAACAAATTGCTCTTGCAGTGC
AACGCGACCCAAAAATCACCAGTAGGGGTACGTCGGATATTGTCCGGAGGGCCAGGGACC
TTGGCGAAAACCTCGGTGGTCCCGGCCTTAGGACCTTTGACCCATATTCTGTGGAGAATA
CCCGTACCACCTTCACAGGTGATTACAAAAGATCCGTCTTTGCTTAGAGCTAAACCATTA
GGTAAATGAAGTTTGTCCATTATAACTTTGGCCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTAATT
ACTCTTCC*ACTTTGTCCCCGGATATAGACACGTAGAACACTTCCCCGAAATGGTATTTG
TCGCTGCTATCATTGAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4DD37TF 686 0 0
AAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGATCCATAACTTCCCATCTTCCCTCTCATAAGCTT
CACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTCACTATCCTCAAGCATCTCAATAATCTCTCCGG
TCTCTCCAGAGAGTTTCAAGATTATTCCATGAGGCTTCCCTCCGTTCATGGGATGAACCA
CTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAAAAACTTTCCAACCCAAGAGTGAATCAGAAACA
ACCTAGTGAGCAAATTGCTCTTGCAGTGCAACGCGACCCAAAAATCACCAGTAGGGGTAC
GTCGGATATTGTCCGGAGGGCCAGGGACCTTGGCGAAAACCTCGGTGGTCCCGGCCTTAG
GACCTTTGACCCATATTCTGTGGAGAATACCCGTACCACCTTCACAGGTGATTACAAAAG
ATCCGTCTTTGCTTAGAGCTAAACCATTAGGTAAATGAAGTTTGTCCATTATAACTTTGG
CCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTAATTACTCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATAGACA
CGTAGAACACTTCCCCGAAATGGTATTTGTCGCTGCTATCATTGAAATAGAAGACGTCTT
CCTCTTCGTCTATGTCCATTTGGTTCGCAAACATAACTTTGCGGCCTTCGGCTTCATCAA
CGACTAACTCGGCCAAGCCTCCTTCC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL2953Contig1 971 3 7 U
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TCTGTCTCCCACTTATTGTCTGCTATGTTTCTAACAACAGAAAATGAGACACAAGAGATG
GATGAGCTTTAAAGTCTCAAGGTAAGATCAGGCTTTGAGCTATTGTTATTTCCTACAACA
GTTCCATTTACTGCAGCCGTGTTCAGATCAAGACCAGACTCTTTAACAGCCACCACCGAT
GGAGCTTCAGCTTCCTCCACGACCTGACGAAAACTCCCGGGCCAGAATAAATCACTGCCA
TCATCATAGTCAAAGAACACTGGCACAGTATTACCAAAGTACCCTTGATGATGAAACCTT
GCAAGATGAGGAGGAGGCTGAGGCTGGGATAAGGTGTGGTGAAGTAGACTAGAGTGAGCT
TGCATCCCTAGAGAAGAAGAGGTGTATGTGTAAGGCCTGTGATGGTGACCAAACATTCTT
CCCATGTGCATTGCTCGTTTGGCCATGGTTCGTTCTCTCTTATGAGCGTTTTGGTGACCT
CCAAGAGCTTGAGAGCTATAGAACTTGCGTCGACAGTAGTTACAGGAGAAGACTCTCGGG
TTGGATTGACACTTTGTGCCCTTTTCTTCATCGTTGTCGAAACTATCATTGAGCTTGAGA
TCGAGCGAGAGAGGGATAATCGATTCTTGTTTGGATAGATCTTGATTTAACGAGGCATCT
CCTTCTCTAGCTGGTAATTCTAGCGAGGCATCATCAGATTCCGTCATTTTATCTTAACAA
AGATTATGTTGAGATCTGGGAATAGACAGCCGACAGAGGCTGAAGTGGTTGACTTGGAAG
CTTAAGAGAAGTTGTACTCTTTGAGTTAACCAAAAATGGGTCAATCCAGATGTATAAGGA
AAATAAAAGCCAGAGAGAAGAGATAGGATTGGTGATGAAAGGTAGAGAACAAGAGGTACT
GAAGAAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF75JQ U 1
AF RR4GR52JQ U 7
AF RR4EF75TF C 362
BS 1 413 RR4EF75JQ
BS 414 467 RR4GR52JQ
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BS 639 779 RR4GR52JQ
BS 780 971 RR4EF75TF

RD RR4EF75JQ 413 0 0
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GATGAGCTTTAAAGTCTCAAGGTAAGATCAGGCTTTGAGCTATTGTTATTTCCTACAACA
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GGAGCTTCAGCTTCCTCCACGACCTGACGAAAACTCCCGGGCCAGAATAAATCACTGCCA
TCATCATAGTCAAAGAACACTGGCACAGTATTACCAAAGTACCCTTGATGATGAAACCTT
GCAAGATGAGGAGGAGGCTGAGGCTGGGATAAGGTGTGGTGAAGTAGACTAGA

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4GR52JQ 784 0 0
CC
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CCACTTATTGTCTGCTATGTTTCTAACAACAGAAAATGAGACACAAGAGATGGATGAGCT
TTAAAGTCTCAAGGTAAGATCAGGCTTTGAGCTATTGTTATTTCCTACAACAGTTCCATT
TACTGCAGCCGTGTTCAGATCAAGACCAGACTCTTTAACAGCCACCACCGATGGAGCTTC
AGCTTCCTCCACGACCTGACGAAAACTCCCGGGCCAGAATAAATCACTGCCATCATCATA
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AGGAGGAGGCTGAGGCTGGGATAAGGTGTGGTGAAGTAGACTAGAGTGAGCTTGCATCCC
TAGAGAAGAAGAGGTGTATGTGTAAGGCCTGTGATGGTGTCCAAACATTCTTCCCATGTG
CATTGCTCGTTTGGCCATGGTTCGTTCTCTCTTATGAGCGTTTTGGTGACCTCCAAGAGC
TTGAGAGCTATAGAACTTGCGTCGACAGTAGTTACAGGAGAAGACTCTCGGGTTGGATTG
ACACTTTGTGCCCTTTTCTTCATCGTTGTTGAAACTATCATTGAGCTTGAGATCGAGCGA
GAGAGGGATAATCGATTCTTGTTTGGATAGATCTTGATTTAACGAGGCATCTCCTTCTCT
AGCTGGTAATTCTAGCGAGGCATCATCAGATTCCGTCATTTTATCTTAACA
TCAGCAAGTTC

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR4EF75TF 610 0 0
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CCATGTGCATTGCTCGTTTGGCCATGGTTCGTTCTCTCTTATGAGCGTTTTGGTGACCTC
CAAGAGCTTGAGAGCTATAGAACTTGCGTCGACAGTAGTTACAGGAGAAGACTCTCGGGT
TGGATTGACACTTTGTGCCCTTTTCTTCATCGTTGTCGAAACTATCATTGAGCTTGAGAT
CGAGCGAGAGAGGGATAATCGATTCTTGTTTGGATAGATCTTGATTTAACGAGGTATCTC
CTTCTCTAGCTGGTAATTCTAGCGAGGCATCATCAGATTCCGTCATTTTATCTTAACAAA
GATTATGTTGAGATCTGGGAATAGACAGCCGACAGAGGCTGAAGTGGTTGACTTGGAAGC
TTAAGAGAAGTTGTACTCTTTGAGTTAACCAAAAATGGGTCAATCCAGATGTATAAGGAA
AATAAAAGCCAGAGAGAAGAGATAGGATTGGTGATGAAAGGTAGAGAACAAGAGGTACTG
AAGAAGAGCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 3

CO CL2954Contig1 494 3 6 U
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AGCCTAAACGCACTCCTGTCTCCGACAAGGAAATCGAATCCATAATGTTGGGAGGTTGCA
TCTGATGTTTGAAGATTGATCATCACTTTGGGCTTCTTGTCTTTTTCGGCTGGTGAACTT
TATTATATGCTTTTTTAATGTAAAGGAAGAACTAATAATGCAGAGAAGATGATGTGTTGT
ATGAATGATTCTGTTGTATGAATGATTCTGTTTCTCTTTGTCAATTAAAAAACAAAGTCT
ATATAGTTTCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DW64TF U 1
AF RR4CQ47JQ C 20
AF RR4CQ47TF U 20
BS 1 331 RR4DW64TF
BS 332 332 RR4CQ47TF
BS 333 347 RR4DW64TF
BS 348 348 RR4CQ47TF
BS 349 484 RR4DW64TF
BS 485 494 RR4CQ47TF

RD RR4DW64TF 484 0 0
GGGACAACAAAAGAAATCAAGAACAAAGCAAAAACTTTATCAACTCAAGAATCAATAGGA
AGCAGAAGATGAAGAGAATTCCTCGTATCAAATTTCCTCAGAGACATTCCTCTTCTGCTA
CTTCATCAGGTTCTGGACCAGCGCAGGGATCCGTTGCCGGCGGCAAGAGAAACGTGACGG
CGAGTTCAGATGTCCCGGCGGCGCCGAAGAACATTGCTGATGGAGGGAAAGCATCACTCC
AGCCTAAACGCACTCCTGTCTCCGACAAGGAAATCGAATCCATAATGTTGGGAGGTTGCA
TCTGATGTTTGAAGATTGATCATCACTTTGGTCTTCTTGTCTTTTTCTGCTGGTGAACTT
TATTATATGCTTTTTTAATGTAAAGGAAGAACTAATAATGCAGAGAAGATGATGTGTTGT
ATGAATGATTCTGTTGTATGAATGATTCTGTTTCTCTTTGTCAATTAAAAAACAAAGTCT
ATAT

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4CQ47JQ 475 0 0
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TCCTCGTATCAAATTTCCTCAGAGACATTCCTCTTCTGCTACTTCATCAGGTTCTGGACC
AGCGCAGGGATCCGTTGCCGGCGGCAAGAGAAACGTGACGGCGAGTTCAGATGTCCCGGC
GGCGCCGAAGAACATTGCTGATGGAGGGAAAGCATCACTCCAGCCTAAACGCACTCCTGT
CTCCGACAAGGAAATCGAATCCATAATGTTGGGAGGTTGCATCTGATGTTTGAAGATTGA
TCATCACTTTGGGCTTCTTGTCTTTTTCGGCTGGTGAACTTTATTATATGCTTTTTTAAT
GTAAAGGAAGAACTAATAATGCAGAGAAGATGATGTGTTGTATGAATGATTCTGTTGTAT
GAATGATTCTGTTTCTCTTTGTCAATTAAAAAACAAAGTCTATATAGTTTCTAGC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4CQ47TF 475 0 0
AGAACAAAGCAAAAACTTTATCAACTCAAGAATCAATAGGAAGCAGAAGATGAAGAGAAT
TCCTCGTATCAAATTTCCTCAGAGACATTCCTCTTCTGCTACTTCATCAGGTTCTGGACC
AGCGCAGGGATCCGTTGCCGGCGGCAAGAGAAACGTGACGGCGAGTTCAGATGTCCCGGC
GGCGCCGAAGAACATTGCTGATGGAGGGAAAGCATCACTCCAGCCTAAACGCACTCCTGT
CTCCGACAAGGAAATCGAATCCATAATGTTGGGAGGTTGCATCTGATGTTTGAAGATTGA
TCATCACTTTGGGCTTCTTGTCTTTTTCGGCTGGTGAACTTTATTATATGCTTTTTTAAT
GTAAAGGAAGAACTAATAATGCAGAGAAGATGATGTGTTGTATGAATGATTCTGTTGTAT
GAATGATTCTGTTTCTCTTTGTCAATTAAAAAACAAAGTCTATATAGTTTCTAGC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 3

CO CL2955Contig1 1188 3 13 U
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TGGTCGGGTACAGTTTCCTTTTGATTTCTCCCTTGTAGCCGTTACCTGAATTCCCGCAAG
TATGTCCACACCCCCCAAACAGACTTGACGAGGAATCCATTCTAGCGAACAAACACAACC
CCTACACACACCTAGGAGCACCCCTTCCTGCATATCCATACAAGACCCGAGTAGGCGGGT
CGAGGTCCTACGAGGTACCCACTACTCGGAGTACCCTCCCAAAAGGAAAAAGATGTGTTT
GTCAGGTTCGGTTCTTCTTAATTGGATTGGGCGGGTTCGACCAGAAATGCTATGCTTACA
CACAAGACTACCCCTCTTCCCGAAAGCTTCGCGGGGACTACTTTACGACGACGGACGACC
GCCCGTAGGGGGTTTACTGCACAAGGCCCCTGCAAAGGAAAAGCTTTCTACCAGCGAATA
TAAGATACTCCGCTCCGCACAACATAGGGATTAGCACGCTTTCGAAAAAAACATAGAATA
GTAGAAGATCCAGCATGCAGAACACGGCGATCATTAGAAATTCACAAATTAAAAATGCTA
TAATATACTCTTTCCCATAACTTCTCATACCAGACCAACCCACTAAAATGCAAATAGGGA
TCAGAAATGTGGTCAATATCACGAAGAATAAAGAGATACCGTCTATACCCAAATCAAAAT
TGATGTTTTCATAAGGAAGCCATCGAAGGCTTTCCACAAATTGAAATTTGGCCGTAGAAG
AGTCGAATTGTATACAAAGAACAAGAGAATACAAAAAAGTAATAAGAGAGGCACACAAAC
CAATTAATCGTATCAGTCGTATTTGAATTTGGAATGAAAAGAAGAATAATGCTTCCTAGC
ACAGGACACAGAATAAGACCACTTAGATTAAAATAGCATTCACAGAAATGTTCTAACATA
GAGTAGAATCGAACATTGAAGAGATTCGTTGACAACAGTCAAAAGATGGGCGCTAAATTC
CAATACAATAGGGGTCTATCAGTTCAAGTCAGCTGAACACCGTGATTTATGAGTGGGTAG
GTGGGTTAGGCGCGCCTCTCGCCCACTAAGAAGTAATGAGGCTAGTCTCCCCCTGGAAGT
AGTGGTGCCCCCTTCCCGTGTATGCGCCTTTATTTATATTCTTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ79JQ U 1
AF RR4BZ09JQ U 77
AF RR4BZ09TF C 470
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BS 525 813 RR4BZ09JQ
BS 814 1188 RR4BZ09TF

RD RR4CJ79JQ 531 0 0
CACAATAAGACCTGGACGATTATCCCTAACCTCGGTAGCTTACGAGTTTACGTCCATCCC
TGGTCGGGTACAGTTTCCTTTTGATTTCTCCCTTGTAGCCGTTACCTGAATTCCCGCAAG
TGTGTCCACATCCCCCAAACAGACTTGACGAGGAATCCATTCTAGCGAACAAACACAACC
CCTACACACACCTAGGAGCACCCCTTCCTGCATATCCATACAAGACCCGAGTAGGCGGGT
CGAGGTCCTACGAGGTACCCACTACTCGGAGTACCCTCCCAAAAGGAAAAAGATGTGTTT
GTCAGGTTCGGTTCTTCTTAATTGGATTGGGCGGGTTCGACCAGAAATGCTATGCTTACA
CACAAGACTACCCCTCTTCCCGAAAGCTTCGCGGGGACTACTTTACGACGACGGACGACC
GCCCGTAGGGGGTTTACTGCACAAGGCCCCTGCAAAGGAAAAGCTTTCTCCCAGCGAATA
TAAGATACTCCGCTCCGCACAACATAGGGTTTGGCACGCTTTCG
GGAAAAA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4BZ09JQ 737 0 0
CCTC
TTGATTTCTCCCTTGTAGCCGTTACCTGAATTCGCGCAAGTATGTCCACACCCCCCAAAC
AGACTTGACGAGGAATCCATTCTCGCGAACAAACACAACCCCTACACACACCTAGGAGCA
CCCCTTCCTGCATATCCATACAAGACCCGAGTAGGCGGGTCGAGGTCCTACGAGGTACCC
ACTACTCGGAGTACCCTCCCAAAAGGAAAAAGATGTGTTTGTCAGGTTCGGTTCTTCTTA
GTTGGATTGGGCGGGTTCGACCAGAAATGCTATGCTTACACACAAGACTACCCCTCTTCC
CGAAAGCTTCGCGGGGACTACTTTACGACGACGGACGACCGCCCGTAGGGGGTTTACTGC
ACAAGGCCCCTGCAGAGGAAAAGCTTTCTACCAGCGAATATAAGATACTCCGCTCCGCAC
AACATAGGGATTAGCACGCTTTCGAAAAAAACATAGAATAGTAGAAGATCCAGCATGCAG
AACACGGCGATCATTAGAAATTCACAAATTAAAAATGCTATAATATACTCTTTCCCATAA
CTTCTCATACCAGACCAACCCACTAAAATGCAAATAGGGATCAGAAATGTGGTCAATATC
ACGAAGAATAAAGAGATACCGTCTATACCCAAATCAAAATTGATGTTTTCATAAGGAAGC
CATCGAAGGCTTTCCACAAATTGAAATTTGGCCGTAGAAGAGTCGAATTGTATACAAAGA
ACAAGAGAATACA

QA 5 737 5 737
DS 

RD RR4BZ09TF 719 0 0
A
CCAGCGAATATAAGATACTCCGCTCCGCACAACATAGGGATTAGCACGCTTTCGAAAAAA
*CATAGAATAGTAGAAGATCCAGCATGCAGAACACGGCGATCATTAGAAATTCACAAATT
AAAAATGCTATAATATACTCTTTCCCATAACTTCTCATACCAGACCAACCCACTAAAATG
CAAATAGGGATCAGAAATGTGGTCAATATCACGAAGAATAAAGAGATACCGTCTATACCC
AAATCAAAATTGATGTTTTCATAAGGAAGCCATCGAAGGCTTTCCACAAATTGAAATTTG
GCCGTAGAAGAGTCGAATTGTATACAAAGAACAAGAGAATACAAAAAAGTAATAAGAGAG
GCACACAAACCAATTAATCGTATCAGTCGTATTTGAATTTGGAATGAAAAGAAGAATAAT
GCTTCCTAGCACAGGACACAGAATAAGACCACTTAGATTAAAATAGCATTCACAGAAATG
TTCTAACATAGAGTAGAATCGAACATTGAAGAGATTCGTTGACAACAGTCAAAAGATGGG
CGCTAAATTCCAATACAATAGGGGTCTATCAGTTCAAGTCAGCTGAACACCGTGATTTAT
GAGTGGGTAGGTGGGTTAGGCGCGCCTCTCGCCCACTAAGAAGTAATGAGGCTAGTCTCC
CCCTGGAAGTAGTGGTGCCCCCTTCCCGTGTATGCGCCTTTATTTATATTCTTTCTAC

QA 2 719 2 719
DS 



AS 1 4

CO CL2956Contig1 846 4 4 U
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ATCATGTTTATGATAGATTGGTTCTACGGTGTTCTCGCTTCGCTAGGGTTATGGCAGAAA
GAAGCTAAGATCTTGTTCCTCGGACTCGACAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATG
CTCAAGGACGAGAGATTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGTATCCAACCTCTGAAGAACTT
AGCATTGGTAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGTCATCAGATTGCTCGCAGG
GTCTGGAAGGACTACTACGCTAAGGTGGATGCCGTGGTGTACCTAGTGGATGCATACGAC
AAGGAGAGGTTCGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCACTTCTCTCAGACGAATCTTTA
GCCACCGTCCCCTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTACGCTGCATCAGAG
GACGAGCTCCGTTACCACCTCGGCCTCTCCAACTTTACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAAC
CTAGTTGATTCCAACGCAAGACCACTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATG
GGTTATGGCGAAGGCTTCAAGTGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCAAGACTCCAAACC
ACATGGCTATCATTATTGTTAAACCGTAAGTTCCTATAAATCTCGTTTTGTATTTTCTCT
TGCGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTGCATGTGTTGTAAGAAATGTCGTGAAACGTAGCAACT
CGTGTGTCTCTCTACCTTTTGTTTCTTGTAGTGACTTTTAAATTTTAATTCATATTATTT
TAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC47TF U 1
AF RR4F249TF U 5
AF RR4F249JQ C 353
AF RR4AC47JQ C 140
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BS 468 748 RR4AC47TF
BS 749 846 RR4AC47JQ

RD RR4AC47TF 748 0 0
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ATCATGTTTATGATAGATTGGTTCTACGGTGTTCTCGCTTCGCTAGGGTTATGGCAGAAA
GAAGCTAAGATCTTGTTCCTCGGACTCGACAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATG
CTCAAGGACGAGAGATTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGTATCCAACCTCTGAAGAACTT
AGCATTGGTAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGTCATCAGATTGCTCGCAGG
GTCTGGAAGGACTACTACGCTAAGGTGGATGCCGTGGTGTACCTAGTGGATGCATACGAC
AAGGAGAGGTTCGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCACTTCTCTCAGACGAATCTTTA
GCCACCGTCCCCTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTTCGCTGCATCAGAG
GACGAGCTCCGTTACCACCTCGGCCTCTCCAACTTTACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAAC
CTAGTTGATTCCAACGCAAGACCACTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATG
GGTTATGGCGAAGGCTTCAAGTGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCAAGACTCCAAACC
ACATGGCTATCATTATTGTTAAACCGTAAGTTCCTATAAATCTCGTTTTGTATTTTCTCT
TGCGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTGCATG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4F249TF 717 0 0
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CTTGTTCCTCGGACTCGACAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAGGACGA
GAGATTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACCTCTGAAGAATTTAGCATTGGTAA
AATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGA
CTACTACGCTAAGGTGGATGCCGTGGTGTACCTAGTGGATGCATACGACAAGGAGAGGTT
CGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCACTTCTCTCAGACGAATCTTTAGCCACCGTCCC
CTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCG
TTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTTACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAACCTAGTTGATTC
CAACGTAAGACCACTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGA
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ATTATTGTTAAACCGTAAGTTCCTATAAATCTCGTTTTGTATTTTCTCTT

QA 8 717 8 717
DS 

RD RR4F249JQ 458 0 0
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AATCTTTAGCCACCGTCCCCTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTACGCTG
CATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATTTCGGCCTCTCCAACTTTACCACGGGAAAGGGTA
AAGTGAACCTAGTTGATTCCAACGTAAGACCACTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCA
GGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTTCAAGTGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCAAGAC
TCCAAACCACATGGCTATCATTATTGTTAAACCGTAAGTTCCTATAAATCTCGTTTTGTA
TTTTCTCTTGCGTTTCTTTTCTTTTTTTTTTGCATGTGTTGTAAGAAATGTCGTGAAACG
TAGCAACTCGTGTGTCTCTCTACCTTTTGTTTCTTGTA

QA 1 458 1 458
DS 

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TGCAGCACCAGCCGACGCAGTATCCAACCTCTGAAGAACTTAGCATTGGTAAAATCAAGT
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CTAAGGTGGATGCCGTGGTGTACCTAGTGGATGCATACGACAAGGAGAGGTTCGCAGAAT
CGAAAAAGGAACTGGACGCACTTCTTTCAGACGAATCTTTAGCCACCGTCCCCTTCCTCA
TCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTTCGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCACC
TCGGCCTCTCCAACTTTACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAACCTAGTTGATTCCAACGCAA
GACCACTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTTCA
AGTGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCAAGACTCCAAACCACATGGCTATCATTATTGT
TAAACCGTAAGTTCCTATAAATCTCGTTTTGTATTTTCTCTTGCGTTTCTTTTCTTTTTT
TTTTGCATGTGTTGTAAGAAATGTCGTGAAACGTAGCAACTCGTGTGTCTCTCTACCTTT
TGTTTCTTGTAGTGACTTTTAAATTTTAATTCATATTATTTTAAACC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL2957Contig1 884 4 4 U
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AAATTTCTCTGAAAATGGAAATTAATTCTCGCATCAATGAAACCGACAGAAACATCACAG
TTAACGTTGCGGCTGGTGGTGTGTGCACAATTAACGTTAACCCTGTTGGTCGACTCATAC
CACCTCCAGCCATTGATGGAACCCCTGTACCTCCTCGGGCTAACCCTACGGTTTACTTTT
ATATGACCGTGGACGGCAAACCAGCTGGTATGATCATAATGGAACTCTTTGCCGACACGA
CCCCACGGACGGCAGAGAACTTTCGCGCCCTCTGTACCGGTGAGAAAGGCATGGGGAAGC
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TGTGGAACCGTGGTCGAAACAGCACCGGATCTCAGTTCATGATCCACGCGCAGGCGAACC
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CGTATTTGAGTTTATATGTTTATGTTCATATGTCTCAATTTCATTTCGTTTATGAACAAA
TAAAATATTTGTTACTTTGATTTTTAAAATGACCGTTTCCTAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AS08TF U 1
AF RR4B320TF U 1
AF RR4AS08JQ C 67
AF RR4B320JQ C 89
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BS 652 652 RR4B320TF
BS 653 836 RR4AS08TF
BS 837 884 RR4AS08JQ

RD RR4AS08TF 836 0 0
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QA 1 836 1 836
DS 

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CACCTCCAGCCATTGATGGAACCCCTGTACCTCCTCGGGCTAACCCTACGGTTTACTTTT
ATATGACCGTGGACGGCAAACCAGCTGGTATGATCATAATGGAACTCTTTGCCGACACGA
CCCCACGGACGGCAGAGAACTTTCGCGCCCTCTGTACCGGTGAGAAAGGCATGGGGAAGC
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TCCAAGGAGGAGATATCATTGACGGAGGGAAAGGTAACGGAGGCGAATGTATCTACGACA
GTAGGTTTTTCGAGGTTGAGAACTTCATCAAGAAGCACACCGGTCCAGGTATCCTCTCCA
TGTGGAACCGTGGTCGAAACAGCACCGGATCTCAGTTCATGATCCACGCGCAGGCGAACC
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CGTATTTGAGTTTATATGTTTATGTTCATATGTCTCAATT

QA 1 820 1 820
DS 

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ATTATGGCTTTAAGCACGGAAACTTCCGTACCCGTTGCGGTGATCCACAACTGCGGTCAA
ATTTCATAGATATTTGAGAGGTTTACATATTACGACGTTTTATATGTTTATGCTCGTATT
TGAGTTTATATGTTTATGTTCATATGTCTCAATTTCATTTCGTTTATGAACAAATAAAAT
ATTTGTTACTTTGATTTTTAAAATGACCGTTTCCTAAC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4B320JQ 796 0 0
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CGGCCAAGTCGTTCAAGGAATGG*ATATAGTCACGAGCATTATGGCTTTAAGCACGGAAA
CTTCCGTACCCGTTGCGGTGATCCACAACTGCGGTCAAATTTCATAGATATTTGAGAGGT
TTACATATTACGACGTTTTATATGTTTATGCTCGTATTTGAGTTTATATGTTTATGTTCA
TATGTCTCAATTTCATTTCGTTTATGAACAAATAAAATATTTGTTACTTTGATTTTTAAA
ATGACCGTTTCCTAAC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL2958Contig1 710 4 9 U
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TTTCTCATGTTTCATCGCTCTTTCATCATCAAGAAAATCATTAACCAACCATCCTCCTCC
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GTTAGGAGCTGCAGCTGTTTTGTCTGTATCATCTAGTCCTGATGATACCAACAACATCAA
AGCACCCACTCATGGAGGAAGCGGCGAGTTTCTTGTGGATTTAGCTATAGGAAACCCTCC
GGCTAAATACTCTGCTATATTAGATACCGGAAGTGACCTTATATGGACGCAATGCAAGCC
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GTGTGGCGATGAGAACGAAAGAGACGGGTTCTCTCAAGGGTCGGGTCTTG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4G778TF U 1
AF RR4GF07TF U 1
AF RR4GJ65TF U 1
AF RR4B401TF U 2
BS 1 268 RR4G778TF
BS 269 269 RR4GF07TF
BS 270 535 RR4G778TF
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BS 537 642 RR4G778TF
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BS 681 705 RR4GF07TF
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RD RR4G778TF 642 0 0
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DS 

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G
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G
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C

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TGTGGCGATGAGAACGAAAGAGACGGGTTCTCTCAAGGGTCGGGTCTTG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

CO CL2959Contig1 960 4 2 U
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BQ
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AF RR4FZ06TF U 1
AF RR4GM89TF U 1
AF RR4GM89JQ C 232
AF RR4FZ06JQ C 238
BS 1 667 RR4FZ06TF
BS 668 960 RR4GM89JQ

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ATCAAGGATGCGTAAACAAAAACACATCGACGATCTAGCGGCTCAGATCAACCAGCTTTC
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CCAAGCC

QA 1 667 1 667
DS 

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GATCCAAGCCGAGAACTCTATTCTAACGGCTCAGATGGCAGAGCTGAGCTCTAGACTCGA
GTCTTTAAACGAGATCGTCTATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCAGGGTTCGGTGGCGG
TGTCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGGATTAGTAGCGACGG
ATATTACGATGATATGATGAACGGCGTTAATCACTGGGGTGGTTCGGTTTATTATTCTAA
CCAGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATCAAAATTAATTATGAAACTAG
TAC

QA 7 729 7 729
DS 

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TAAATTAGTTTACATCTTATTAATTATTTCAGACAGTTAAAAAAACCCACAGAAGATTTG
TCTTTTTTTTTTTTTTGTTATTGTAATTTTCTTTTTTAAAACTTTTTTGCGGTGGAGTAT
AATGGCGTCATCTAGCAGCACGTACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGCAATCCGAA
CGCCGTCGCCGTCGACGAGCGAAAGCGTAAGAGAATGTTATCGAATCGCGAGTCTGCTCG
TAGATCAAGGATGCGTAAACAAAAACACATCGACGATCTAGCGGCTCAGATCAACCAGCT
TTCAAGCGACAACCGTCAGATCCTGACGAGCCTCACCGTCACATTTCAGCTTCACATGAA
GATCCAAGCCGAGAACTCTATTCTAACGGCTCAGATGGCAGAGCTGAGCTCTAGACTCGA
GTCTTTAAACGAGATCGTCTATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCAGGGTTCGGTGGCGG
TGTCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGGATTAGTAGCGACGG
ATATTACGATGATATGATGAACGGCGTTAATCACTGGGGTGGTTCGGTTTATTATTCTAA
CCAGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATCAAAATTAATTATGAAACTAG
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2960Contig1 1376 4 9 U
GGATCTTCCTCCGTTCCTCATCCTCTCGTTTCTCCTCCTCTCTCTCCTCCGCTATGTCTC
CAGGCGCTAATGGTGATCTGATGAAATCTAGGGTTACGGTCGTGGGCAGTGGCAATTGGG
GAAGCGTTGCTGCTAAGCTCATCGCTTCTAATGCCCTCAAGCTTCCTTCTTTCCATGATG
AAGTGAGGATGTGGGTGTTTGAGGAAGTTCTCCCAAATGGTGAGAAGCTCACTGATGTAA
TCAACAAGACCAATGAAAATGTCAAGTATCTCCCTGGAATCAAGTTAGGAAGAAATGTTG
TTGCAGATCCTGACCTTGAAAACGCAGTGAAGGAAGCAAACATGTTGGTTTTTGTTACAC
CGCATCAATTCATGGGTGGTATATGCAAGAAGCTTAAGGGTAAAGTAACAGGAGAGGTTA
AGGCTATATCTCTTGTTAAAGGGATGGAAGTCAAGAAGGAAGGTCCCCGCATGATCTCTA
CTCTCATCTCCAAGGAACTTGGTATCAACTGTTGTGTTCTTATGGGCGCTAACATCGCCA
ACGAGATTGCTGTGGAGAAGTTTAGCGAAGCAACGGTTGGATACAGAGAGAGTAAAGAAA
TAGCCGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATTTTATGGTCACACCGGTTCATG
ATGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAATGTTGTGGCTATTGCAGCTGGTT
TCGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGCTGCAATCATGAGGATTGGTTTGA
GAGAGATGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCACCTGTTAAAGACAGTACTTTCTTCG
AGAGCTGTGGTGTAGCAGATGTCATAACAACTTGCTTAGGAGGAAGAAACAGAAGAGTAG
CAGAAGCATTTGCCCAAAGTGGAGGAAAAAGGTCTTTTGATGAGCTTGAAGCAGAGATGC
TACAAGGGCAAAAGCTACAGGGTGTTTCCACGGCAAGAGAGGTCTACGAGGTCTTGAACC
ACTGTGGATGGATGGAGATGTTTCCGCTGTTTTCAACGGTTCACCAAATCTGCACAGGTC
GTCTTAAACCTGAAGCCATTGTTCATTACCGTGACCACAAAGCCTGATGATCACTCTTGA
TGGTACCATTCATCTGCAATGAATATTCTGGTGTGTTGATGTACAAGTTTAACGTTTTTG
TTTCTTTGAGAATGTTTTCTGGTGAGTTGGACCTTCTAGCTGGTTTAGAGGATCCTGTTC
ATTCAAAGTTTTTGGTCCAATTGAAATTTAATTTGCTTGGATCGAACACAGTCATGTGCT
CAATGTTGTAATCACTGAGTACTGAATTCGTTTATTAAATTTGAAAGATTCACGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GE28TF U 1
AF RR4AW30TF U 38
AF RR4AW30JQ C 535
AF RR4GE28JQ C 580
BS 1 667 RR4GE28TF
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BS 1195 1376 RR4AW30JQ

RD RR4GE28TF 763 0 0
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CAGGCGCTAATGGTGATCTGATGAAATCTAGGGTTACGGTCGTGGGCAGTGGCAATTGGG
GAAGCGTTGCTGCTAAGCTCATCGCTTCTAATGCCCTCAAGCTTCCTTCTTTCCATGATG
AAGTGAGGATGTGGGTGTTTGAGGAAGTTCTCCCAAATGGTGAGAAGCTCACTGATGTAA
TCAACAAGACCAATGAAAATGTCAAGTATCTCCCTGGAATCAAGTTAGGAAGAAATGTTG
TTGCAGATCCTGACCTTGAAAACGCAGTGAAGGAAGCAAACATGTTGGTTTTTGTTACAC
CGCATCAATTCATGGGTGGTATATGCAAGAAGCTTAAGGGTAAAGTAACAGGAGAGGTTA
AGGCTATATCTCTTGTTAAAGGGATGGAAGTCAAGAAGGAAGGTCCCCGCATGATCTCTA
CTCTCATCTCCAAGGAACTTGGTATCAACTGTTGTGTTCTTATGGGCGCTAACATCGCCA
ACGAGATTGCTGTGGAGAAGTTTAGCGAAGCAACGGTTGGATACAGAGAGAGTAAAGAAA
TAGCCGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATTTTATGGTCACACCGGTTCATG
ATGTTGA*GGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGA*TGTTGTGGCTATTGCAGCTGGTT
TCGTTGATGGTTTGGATATGGGTA
TACACAAAGCTGCATCATG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4AW30TF 818 0 0
GG
CTCTCTCCTCCGCTATGTCTCCAGGCGCTAATGGTGATCTGATGAAATCTAGGGTTACGG
TCGTGGGCAGTGGCAATTGGGGAAGCGTTGCTGCTAAGCTCATCGCTTCTAATGCCCTCA
AGCTTCCTTCTTTCCATGATGAAGTGAGGATGTGGGTGTTTGAGGAAGTTCTCCCAAATG
GTGAGAAGCTCACTGATGTAATCAACAAGACCAATGAAAATGTCAAGTATCTCCCTGGAA
TCAAGTTAGGAAGAAATGTTGTTGCAGATCCTGACCTTGAAAACGCAGTGAAGGAAGCAA
ACATGTTGGTTTTTGTTACACCGCATCAATTCATGGGTGGTATATGCAAGAAGCTTAAGG
GTAAAGTAACAGGAGGGGTTGAGGCTATATCTCTTGTTAAAGGGATGGAAGTCAAGAAGG
AAGGTCCCTGCATGATCTCTACTCTCATCTCCAAGGAACTTGGTATCAACTGTTGTGTTC
TTATGGGCGCTAACATCGCCAACGAGATTGCTGTGGAGAAGTTTAGCGAAGCAACGGTTG
GATACAGAGAGAGTAAAGAAATAGCCGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATT
TTATGGTCACACCGGTTCATGATGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAATG
TTGTGGCTATTGCAGCTGGTTTCGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGCTG
CAATCATGAGGATTGGTTTGAGAGAGATGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCACCTG
TTAAAGACAGTACTTTCTTCGAGAGCTGTGGTGTAG

QA 3 818 3 818
DS 

RD RR4AW30JQ 842 0 0
TCGCCAACGAGATTGCTGTGGAGAAGTTTAGCGAAGCAACGGTTGGATACAGAGAGAGTA
AAGAAATAGCCGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATTTTATGGTCACACCGG
TTCATGATGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAATGTTGTGGCTATTGCAG
CTGGTTTCGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGCTGCAATCATGAGGATTG
GTTTGAGAGAGATGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCACCTGTTAAAGACAGTACTT
TCTTCGAGAGCTGTGGTGTAGCAGATGTCATAACAACTTGCTTAGGAGGAAGAAACAGAA
GAGTAGCAGAAGCATTTGCCCAAAGTGGAGGAAAAAGGTCTTTTGATGAGCTTGAAGCAG
AGATGCTACAAGGGCAAAAGCTACAGGGTGTTTCCACGGCAAGAGAGGTCTACGAGGTCT
TGAACCACTGTGGATGGATGGAGATGTTTCCGCTGTTTTCAACGGTTCACCAAATCTGCA
CAGGTCGTCTTAAACCTGAAGCCATTGTTCATTACCGTGACCACAAAGCCTGATGATCAC
TCTTGATGGTACCATTCATCTGCAATGAATATTCTGGTGTGTTGATGTACAAGTTTAACT
TTTTTGTTTCTTTGAGAATGTTTTCTGGTGAGTTGGACCTTCTAGCTGGTTTAGAGGATC
CTGTTCATTCAAAGTTTTTGGTCCAATTGAAATTTAATTTGCTTGGATCGAACACAGTCA
TGTGCTCAATGTTGTAATCACTGAGTACTGAATTCGTTTATTAAATTTGAAAGATTCACG
AG

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4GE28JQ 795 0 0
GATACAGAGAGAGTAAAGAAATAGCCGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATT
TTATGGTCACACCGGTTCATGATGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAATG
TTGTGGCTATTGCAGCTGGTTTCGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGCTG
CAATCATGAGGATTGGTTTGAGAGAGAGGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCATCTG
TTAAAGACAGTACTTTCTTCGAGAGCTGTGGTGTAGCAGATGTCATAACAACTTGCTTAG
GAGGAAGAAACAGAAGAGTAGCAGAAGCATTTGCCCAAAGTGGAGGAAAAAGGTCTTTTG
ATGAGCT**AAGCAGAGATGCTACAAGGGCAAAAGCTACAGGGTGTTTCCACGGCAAGAG
AGGTCTACGAGGTCTTGAACCACTGTGGATGGATGGAGATGTTTCCGCTGTTTTCAACGG
TTCACCAAATCTGCACAGGTCGTCTTAAACCTGAAGCCATTGTTCATTACCGTGACCACA
AAGCCTGATGATCACTCTTGATGGTACCATTCATCTGCAATGAATATTCTGGTGTGTTGA
TGTACAAGTTTAACGTTTTTGTTTCTTTGAGAATGTTTTCTGGTGAGTTGGACCTTCTAG
CTGGTTTAGAGGATCCTGTTCATTCAAAGTTTTTGGTCCAATTGAAATTTAATTTGCTTG
GATCGAACACAGTCATGTGCTCAATGTTGTAATCACTGAGTACTGAATTCGTTTATTAAA
TTTGAAAGATTCACG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 4

CO CL2961Contig1 711 4 3 U
TTTTTTTGAATATAGTAACATATTATTAACCGCGAAACAAAAGATTTCAAGAATGCAGGG
ACTAGTGCAAATTCAGAACTTTTGCCTGGGCTAAATTGTCACAATCAGAAGTTAAAGGGA
TGAATTGAGGACGTGTCTGCAATTTACAAAGTCGTGGACCAATATAAAAATTACCAAAAG
CCCAGGGACCTGTTTTGCAATAATCTGTGAAATCACCATTGGAAGAGATTCGAGCTTGGC
TTCAACGCGAACAACGTCGAGTCCGTTACAGTGGGACAGAAATTGGAGCTCGGGACCGGT
CTTGCCATAACTGATTCGCGAAGGAGGATAGCTCGAGAATTGGAGTTCGACGGTGAAGAG
GGCCAGTCGCGGCGGAGGTCGTTGCAGTGTCTCGGAGGAGACGAGAACCCTGCGAGGAGA
CGACTTGGACCAGAGATCTCCTGGTGGACGCGTCAGAAAGGAGCTGGAGCTCGACAGTTG
AAGACACGGCCTGGCTTGAGAATCCATGGTGGAGGACGACGGCTAAGGCTGGGTTGAGAG
GAGTACCACCGGTATTTGGGTTGTTCCTATCGACATGATTAGCAGGCTGAGGAACGGAGG
GTGGAGAATCATTCCAAACGGAAAGGAAAATGATGTGGATGAAAGCTGAATATAAGATGG
GGGATTCAAAAAAAAAGATGGGGGATTCAAAAGAATTTTGAGATTCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCGGATACAACAGGCCTCATGTTCGGCTGCTCTTGAACGCACATCGCTGCAATTGCAAGC
GCTTGGTACAGTCCTCTGACAGGGTACTGTCCCTGAAGCAACGGGTCAACCATTTTCGGG
AAGTTCCTCCTGTCTTTGAACAACGGTCGTGCCCATCCGACCAAGTTTTGATCTTTACGA
TCTTTTGTACTGTCAATTGCTTTCCTTCCGGTGATAAGCTCAAGAAGGACTACTCCAAAA
CTGTAGATATCGGATTTAAACGTGAGCTGGCCCGTCATAGCATAGTCGGGAGCACAGTAT
CCGTAAGTTCCCATAACCCTCGTGGAGACATGGGTGTTATCCCCGCTTGGTCCAACTTTA
GCCAACCCAAAGTCCGACAGCTTTGGCTGATAGTCTTCACCGAGCAAGATGTTCGAGCCT
TTGAGAT

QA 12 798 12 798
DS 

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CCACGTCGGATACAACAGGCCTCATGTTCGGCTGCTCTTGAACGCACATCGCTGCAATTG
CAAGCGCTTGGTACAGTCCTCTGACAGGGTACTGTCCCTGAAGCAACGGGTCAACCATTT
TCGGGAAGTTCCTCCTGTCTTTGAACAACGGTCGTGCCCATCCGACCAAGTTTTGATCTT
TACGATCTTTTGTACTGTCAATTGCTTTCCTTCCGGTGATAAGCTCAAGAAGGACTACTC
CAAAACTGTAGATATCGGATTTAAACGTGAGCTGGCCCGTCATAGCATAGTCGGGAGCAC
AGTATCCGTAAGTTCCCATAACCCTCGTGGAGACATGGGTGTTATCCCCGCTTGGTCCAA
CTTTAGCCAACCCAAAGTCCGACAGCTTTGGCTGATAGTCTTCACCGAGCAAGATGTTCG
AGCCTTTGAGATCACGGTAGATCACAGGGGGTTTCATTCTATCGTGCAGATACTCTAGCC
CTCTTGCTGCACCAGCTGCTATTTTCATCCGAGTGTTCCAATCAAGTGGCTTTTTACCAA
AAGGAAGATCATGTAGATGATCTTCAAGAGATCCTAGCGGCATGTACTCGTAGACCAACA
GTCTCTGATCACCCTCAGCGCAAAACCCAATAAGCTTCACC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

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GAACAAAAACAATTGATTCCAGACAAAACAAACTGATGATTATCAAGGAAAGGGTCTAAG
GATAGACAGAGTCGACAGCAAAACTGTGATTAACGAGCTGCTTGCCCCTGTGTGTGTTCT
AAGAGCTGAGTCACTAACTTGTAAGTCCGTCCTGATAAGGCTTTGGTGTGGTTAATCAAC
TGCTCGTGCACGTTGGGTTGAGTAGGCTCCATGATTACGGTTCCCGACTCGGAATCAATC
TTGGCATCGAGCTTTGAGGTGCGGATAAGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCTTCATAG
TACAGATTCAATTTCTCAGCAAGTACCCCCATGTCAATTCTCTGATGAATTCTGCAATAG
GTTTCGAAGATAAAGAGGCGGGCATTTTCAAGAAACTCATCTCTCAGTGGAACAGTTGAA
AAGTCTCCATTCTCTACTCGCTTTCCAAGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTCACAC
TCTTTCATCTTCTTTTGAGCCCCATCGAAGTCATAACTGACAAACACACATGCCAAGAAC
TCCACAATAGGATCTTTGTAGGAGTAGTGCTCCTGTTGAATGACCTTAATGAACTCTTTC
AGTTGAGGCCCTTTCCTTTTGTTGACAACGAAAGCAGTTGCCAAGTAACGTAGCAAGTGT
GGAGCACTCGTTTGTATGGCATTCAGATACTTGTCTTGGTTAAAAAGATCAATGATTTGA
GTCCTTCCGTTATCATGGTTGAAAAAGATATAGAGACCCCAATGCATCAACCAAATCCTG
TTCTGCACTTGGTTTAACGGTGACGCAAAACTCTTTGAGTCGATAATATCTTTAACACGG
TTAAGCTCTTCAAATGCAATGTCCCAGTTCTGCATTAATATCTCAGATGCAAGCTTTCCC
CACAAAGCGCTCAGACTCCTCTCAAGGTTAGAGCAAAGAGTCCTGTACTGGTAAAGGTAA
TCAGCAGCACCAGAATAGTTACCACACTCAAACTGAAACTTGGCGTACTGATACAACGCC
TCAATCTGGTCCGGACCAATCTGGTAACGTTCCTTAAGCATCTGGAGATTATACTGCTTA
TCAGCCCTAAGTTCCTGAACCGCAGCAGGGTTCAAAAGGAAAGTCACGAGCGGTGCCGCA
GCCTCCTCCAGAGACTTGAGCCTCGCCACAACCTCAGCTCTCCTCTACACCATATCTTGG
GGAGCGTCTTCGGTGTGGTAGAGACTCTTGTGAATGTCCATGGCGTAATCAACCATGTTG
GTCTTGTTCAAAAGCTCGATCTTGAACTTGAGGATCTGCTCATCAGGGTAAAGCTGACGC
TCCTGAAGGAACTCGAGTATGGGGAACACCAGGTGCCTATCTAGGTTAGGGGCTACTCGA
GGTGTCAGGTAATAGTTCTCTTTGATTTCCGCCATCGTCGTCATCTTCGTCGAGCTCTCA
AGACGGTAGAGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT03JQ U 1
AF RR4B924JQ U 57
AF RR4FT03TF C 555
AF RR4B924TF C 692
BS 1 62 RR4FT03JQ
BS 63 63 RR4B924JQ
BS 64 758 RR4FT03JQ
BS 759 990 RR4FT03TF
BS 991 991 RR4B924TF
BS 992 1188 RR4FT03TF
BS 1189 1517 RR4B924TF

RD RR4FT03JQ 758 0 0
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GATCAAAAACAATTGATTCCAGACAAAACAAACTGATGATTATCAAGGAAAGGGTCTAAG
GATAGACAGAGTCGACAGCAAAACTGTGATTAACGAGCTGCTTGCCCCTGTGTGTGTTCT
AAGAGCTGAGTCACTAACTTGTAAGTCCGTCCTGATAAGGCTTTGGTGTGGTTAATCAAC
TGCTCGTGCACGTTGGGTTGAGTAGGCTCCATGATTACGGTTCCCGACTCGGAATCAATC
TTGGCATCGAGCTTTGAGGTGCGGATAAGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCTTCATAG
TACAGATTCAATTTCTCAGCAAGTACCCCCATGTCAATTCTCTGATGAATTCTGCAATAG
GTTTCGAAGATAAAGAGGCGGGCATTTTCAAGAAACTCATCTCTCAGTGGAACAGTTGAA
AAGTCTCCATTCTCTACTCGCTTTCCAAGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTCACAC
TCTTTCATCTTCTTTTGAGCCCCATCGAAGTCATAACTGACAAACACACATGCCAAGAAC
TCCACAATAGGATCTTTGTAGGAGTAGTGCTCCTGTTGAATGACCTTAATGAACTCTTTC
AGTTGAGGCCCTTTCCTTTTGTTGACAACGAAAGCAGTTGCCAAGTAACGTAGCAAGTGT
GGAGCACTCGTTTGTATGGCATTCAGATACTTGTCTTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4B924JQ 681 0 0
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TAAGGATAGACAGAGTCGACAGCAAAACTGTGATTAACGAGCTGCTTGCCCCTGTGTGTG
TTCTAAGAGCTGAGTCACTAACTTGTAAGTCCGTCCTGATAAGGCTTTGGTGTGGTTAAT
CAACTGCTCGTGCACGTTGGGTTGAGTAGGCTCCATGATTACGGTTCCCGACTCGGAATC
AATCTTGGCATCGAGCTTTGAGGTGCGGATAAGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCTTC
ATAGTTCAGATTCAATTTCTCAGCAAGTACCCCCATGTCAATTCTCTGATGAATTCTGCA
ATAGGTTTCGAAGATAAAGAGGTGGGCATTTTCAAGAAACTCATCTCTCAGTGGAACAGT
TGAAAAGTTTCCATTCTCTACTCGCTTTCCAAGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTC
ACACTCTTTCATCTTCTTTTGAGCCCCATCGAAGTCATAACTGACAAACACACATGCCAA
GAACTCCACAATAGGATCTTTGTAGGAGTAGTGCTCCTGTCGAATGACCTTAATGAACTC
CTTCAGTTGAGGCCTTTTCCTTTTGTTGACAACGAAAGCAGTTGCCGAGTAACGTAGCAA
GTGTGGAGCACTCGTTTGTAT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4FT03TF 634 0 0
TTGAGCCCCATCGAAGTCATAACTGACAAACACACATGCCAAGAACTCCACAATAGGATC
TTTGTAGGAGTAGTGCTCCTGTTGAATGACCTTAATGAACTCTTTCAGTTGAGGCCCTTT
CCTTTTGTTGACAACGAAAGCAGTTGCCAAGTAACGTAGCAAGTGTGGAGCACTCGTTTG
TATGGCATTCAGATACTTGTCTTGGTTAAAAAGATCAATGATTTGAGTCCTTCCGTTATC
ATGGTTGAAAAAGATATAGAGACCCCAATGCATCAACCAAATCCTGTTCTGCACTTGGTT
TAACGGTGACGCAAAACTCTTTGAGTCGATAATATCTTTAACACGGTTAAGCTCTTCAAA
TGCAATGTCCCAGTTCTGCATTAATATCTCAGATGCAAGCTTTCCCCACAAAGCGCTCAG
ACTCCTCTCAAGGTTA*AGCAAAGAGTCCTGTACTGGTAAAGGTAATCAGCAGCACCAGA
ATAGTTACCACACTCAAACTGAAACTTGGCGTACTGATACAACGCCTCAATCTGGTCCGG
ACCAATCTGGTAACGTTCCTTAAGCATCTGGAGATTATACTGCTTATCAGCCCTAAGTTC
CTGAACCGCAGCAGGGTTCAAAAGGAAAGTCACG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4B924TF 826 0 0
AAGCAGTTGCCGAGTAACGTAGCAAGTGTGGAGCACTCGTTTGTATGGCATTCAGATACT
TGTCTTGGTTAAAAAGATCAATGATTTGAGTCCTTCCGTTATCATGGTTGAAAAAGATAT
AGAGACCCCAATGCATCAACCAAATCCTGTTCTGCACTTGGTTTAACGGTGACGCAAAAC
TCTTTGAGTCGATAATATCTTTAACACGGTTAAGCTCTTCAAATGCAATGTCCCAGTTCT
GCATTAATATCTCAGATGCAAGCTTTCCCCACAAAGCGCTCAGACTCCTCTCAAGGTTAG
AGCAAAGAGTCCTGTACTGGTAAAGGTAATCAGCAGCACCAGAATAGTTACCACACTCAA
ACTGAAACTTGGCGTACTGATACAACGCCTCAATCTGGTCCGGACCAATCTGGTAACGTT
CCTTAAGCATCTGGAGATTATACTGCTTATCAGCCCTAAGTTCCTGAACCGCAGCAGGGT
TCAAAAGGAAAGTCACGAGCGGTGCCGCAGCCTCCTCCAGAGACTTGAGCCTCGCCACAA
CCTCAGCTCTCCTCTACACCATATCTTGGGGAGCGTCTTCGGTGTGGTAGAGACTCTTGT
GAATGTCCATGGCGTAATCAACCATGTTGGTCTTGTTCAAAAGCTCGATCTTGAACTTGA
GGATCTGCTCATCAGGGTAAAGCTGACGCTCCTGAAGGAACTCGAGTATGGGGAACACCA
GGTGCCTATCTAGGTTAGGGGCTACTCGAGGTGTCAGGTAATAGTTCTCTTTGATTTCCG
CCATCGTCGTCATCTTCGTCGAGCTCTCAAGACGGTAGAGAGATCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 3

CO CL2965Contig1 1260 3 7 U
GAGGACAATGTGTGTTCACTTGGGGTTGTTGCTCGGTGTCGGTGGGCATATGCAAGAGCT
TAGGAGGGTTAGGTCTGGGATATTGGGGGAGAATGATAACATGGTTACGATGCATGATGT
GATGGATGCTCAGTGGATGTATGATAACTATAAGGATGAGAGTTATCTCAGGAGGGTGAT
TATGCCTCTTGAGGTTATATTGACGAGTTACAAGAGGCTTGTTGTGAAGGACTCTGCTGT
TAATGCGATTTGTTATGGTGCTAAGCTGATGATTCCTGGGTTGTTGAGGTTCGAGAATGA
TGTTGATGTTGGTACTGAAGTTGTTTTGATGACGACTAAAGGTGAGGCGATTGCTGTTGG
GATCGCTGAGATGACGACGTCGGTGATGGCTACGTGTGACCATGGTGTGGTGGCTAAGAT
TAAGCGGGTGGTGATGGATAGAGACACTTACCCGAGGAAGTGGGGGTTGGGGCCTAGAGC
TTCGATGAAGAAGAAGCTTATTGCTGATGGGAAGTTGGATAAGCACGGGAAGCCGAATGA
GAAAACGCCTGTTGAGTGGAGCAGGAATGTTGTTTTGCCTACTGGTGGTGATGCTATGGT
CGCTGGTGCTGCTGCCGCTCCTGAGAAAGTTGAGGCTGAGAGTGGAGAAGTGCGCAAGCG
TAAGCTTGATGAGAGCAGTGACAGCCCTGCGCCTGTGTCTACCAAGAAAGCCAAAACAAA
AGAGGTTGAGGTTGAAGAGAAGGTGAAGTTTGAGAAAAAGGAGAAGAAGAAAAAGAAGGA
CAAGGAGGAGGATAAAGAAGAGTTGGCAACACCAAAGTTTGAGAAGAAGAAGAAAAAGAA
GAGCAAGGAGACAGATGAAGCTGCTGCTGCGGTTAATGGCGAAGATGAATCACCAGCAGA
GAAGAGTGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACAAGGAGACAGATGAAGCTGGTGGTGG
TGAATCAGCAGAGAAGAGCGAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAAAGCAAAGA
CAGCGACGATGAATAATGAGATGAATTTGTGTTATGCTACTCTTTAAGTTTTGAATCTTT
TGTTTTATGGTATCTATTCTGGGAAAAGTGAGACAAAAGGCATTTATGCTTGTATCCAAA
GTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTTAGTTTTTATGTTATGTTCGTCCTTTTATCTG
TGAGATTCGTTTCACTTAGCTATGAACTTTATGAATATGATGATTATGGTTTATGGGTTC


BQ
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AF RR4FH33JQ C 485
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BS 716 984 RR4FH33JQ
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TAAGCGGGTGGTGATGGATAGAGACACTTACCCGAGGAAGTGGGGGTTGGGGCCTAGAGC
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TAAGCTTGATGAGAGCAGTGACAGCCCTGCGCCTGTGTCTACCAAGAAAGCCAAA
CAA

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DS 

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GGTGCTGCTGCCGCTCCTGAGAAGGTTGAGGCTGAGAGTGGAGAAGTGCGCAAGCGTAAG
CTTGATGAGAGCAGTGACAGCCCTGCGCCTGTGTCTACCAAGAAAGCCAAAACAAAAGAG
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GACGATGAATAATGAGATGAATTTGTGTTATGCTACTCTTTAAGTTTTGAATCTTTTGTT
TTATGGTATCTATTTTGGGAAAAGTGAGACAAAAGGCATTTATGCTTGTATCCAAAGTCT
CACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTTAGTTTTTATGTTATGTTCGTCCTTTTATCTGTGGG
ATTCGTTTCACTTAGCTATGAACTTTATGAA**TGATGATTATGGTTTATGGGTT

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DS 

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G
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AAAGTGAGACAAAAGGCATTTATGCTTGTATCCAAAGTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTT
TTTTTAGTTTTTATGTTATGTTTGTCCTTTTATCTGTGAGATTCGTTTCACTTAGCTATG
AACTTTATGAATATGATGATTATGGTTTATGGGTTC

QA 2 277 2 277
DS 



AS 1 2

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GTTTGGCTCTGCACGGTATCGAGGTGATATGGCTTCGACCTTCTCTCAAGAACTTTATTG
GTAGCTGGTCACTGCCTGATTAACCCCTCTCTATCTTCTACTCTTCTGCAGAAGTCTCGT
GGTTTCGCAACCGTTTTGAATAAGAGAGCATTCAGCTCACAGTTACGCTCTGCCTGTTCA
GATCCCTACGTTGGTCGAGTTATGGCTTCTTCTACTGGACTTGGACCAAAAGCTAGTTAC
GCGACATCATCCATACCTACCAATGAACCTGTTGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAAT
CTTAAAGAGGCTGATATAAAGGTTTTGGATGCCTCATGGTACATGCCACATGAGCAAAGA
AATCCAATCCAAGAGTATCAAGTTGCTCATATTCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGAT
GGAATATCAGATAGAAGAACAAATTTACCACACATGCTGCCGTCTGAGGAAGCTTTTGCT
GCTGCTTGCTCTGCTCTTGGAATCGAGAACAAAGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAG
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GCTTCTAGTGATGCCATTTTGAAAGCCAATGCGGCAAGTGAGGTCGTAGAGAAAATTTAT
CAAGGACAACCAACTAGTCCAATAACTTTCAAAACAAAGTTCCAGCCACATCTTGTATGG
ACACTTGA


BQ
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AF RR4GY04TF U 1
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BS 698 848 RR4DU85TF

RD RR4GY04TF 697 0 0
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GTTTGGCTCTGCACGGTATCGAGGTGATATGGCTTCGACCTTCTCTCAAGAACTTTATTG
GTAGCTGGTCACTGCCTGATTAACCCCTCTCTATCTTCTACTCTTCTGCAGAAGTCTCGT
GGTTTCGCAACCGTTTTGAATAAGAGAGCATTCAGCTCACAGTTACGCTCTGCCTGTTCA
GATCCCTACGTTGGTCGAGTTATGGCTTCTTCTACTGGACTTGGACCAAAAGCTAGTTAC
GCGACATCATCCATATCTACCAATGAACCTGTTGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAAT
CTTAAAGAGGCTGATATGAAGGTTTTGGATGCCTCATGGTACATGCCACATGAGCAAAGA
AATCCAATCCAAGAGTATCAAGTTGCTCATATTCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGTAT
GGAATATCAGATAGAAGAACAAATTTACCACACATGCTGCCGTCTGAGGAAGCTTTTGCT
GCTGCTTGCTCTGCTCTTGGAATCGAGAACAAAGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAG
GGCATCTTTAGTGCCTCTCGTGTTTGGTGGATGTTTAGAGTCTTTGGACATGAAAAAGTA
TGGGTACTTGATGGAG*CTTACCGAGATGGCGTGCTT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DU85TF 634 0 0
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CTGGACTTGGACCAAAAGCTAGTTACGCGACATCATCCATACCTACCAATGAACCTGTTG
TTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAATCTTAAAGAGGCTGATATAAAGGTTTTGGATGCCT
CATGGTACATGCCACATGAGCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAGTTGCTCATATTC
CAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATAGAAGAACAAATTTACCACACA
TGCTGCCGTCTGAGGAAGCTTTTGCTGCTGCTTGCTCTGCTCTTGGAATCGAGAACAAAG
ATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAGGGCATCTTTAGTGCCTCTCGTGTTTGGTGGATGT
TTAGAGTCTTTGGACATGAAAAAGTATGGGTACTTGATGGAGGCTTACCGAGATGGCGTG
CTTCAGGCTACGACGTTGAATCTAGTGCTTCTAGTGATGCCATTTTGAAAGCCAATGCGG
CAAGTGAGGTCGTAGAGAAAATTTATCAAGGACAACCAACTAGTCCAATAACTTTCAAAA
CAAAGTTCCAGCCACATCTTGTATGGACACTTGA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 4

CO CL2967Contig1 1014 4 12 U
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AAAGTTACAGAGAAGGGTGATTTTTTAATTTGGCAAAAACCAATTAATCACATTGAGTGC
AAGAAACTCAAACGAGTTCATAAATCTCCTCCCATATGCACAAAAGCAGTTCAACCTGAT
TCCGCTTGGTATAAAGAATTAGAATCTTGTATAACTCCGTTGCCAGAAGCAAAAGGTCCA
GATGAATTCTCTGGAGGTGCATTGGAGGATTGGCCGGACCGAGCATTTGCGGTCCCACCT
AGGATTATCCAGGGAACTATACCGGAGATCAATGCTGAAAAATTCAGAGAAGACAATGAG
GTTTGGAAGGAGAGAGTAGCATACTACAAACAGATAATGCCAGAGCTTTCAAGGGGAAGG
TTCAGGAACATTATGGACATGAATGCATACCTCGGTGGGTTCGCTGCAGCGATTGTGAAA
TATCCATCTTGGGTTATGAATGTGGTTCCGGTAGACGCAGAGAAGCAAACGTTAGGTGTG
ATTTATGAGAGGGGATTTATAGGAACTTATCAAGACTGGGGTGAAGGATTCTCTACGTAT
CCAAGAACTTATGATCTTATTCACGCTGGTGGATTGTTCAGCATTTACGAGAACAGGTGT
GATGTGACGTTGATCCTACTTGAGATGGATAGAATACTGAGACCAGAAGGAACAGTGGTG
TTTAGGGACACTGTGGAAATGTTAACGAAGATACAAAGCATAACCAATGGAATGAAGTGG
ACAAGTCGAATTATGGATCACGAGAAAGGTCCTTTTATCCCTGAGAAGATCCTTCTCGCT
GTAAAATCCTACTGGACCGGTCCTTCTTCTTAAGCTAGTTTCAGTTTCCTTTTAGACTCT
TTACTTTGATCTTCTTCATCCTCTGATTCGTTCTCATCTCTGCCTCTTTCGTTTTTTAAG
ACTACTATGATTATTTGGGAAAATACAGAGACAAAATTTCAAAGAGTGTTTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
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30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4E724TF U 1
AF RR4E724JQ C 225
AF RR4DK69TF U 235
AF RR4DK69JQ C 280
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BS 368 368 RR4DK69TF
BS 369 369 RR4E724TF
BS 370 370 RR4DK69TF
BS 371 579 RR4E724TF
BS 580 580 RR4DK69TF
BS 581 622 RR4E724TF
BS 623 956 RR4DK69TF
BS 957 958 RR4DK69JQ
BS 959 995 RR4DK69TF
BS 996 996 RR4DK69JQ
BS 997 1014 RR4DK69TF

RD RR4E724TF 622 0 0
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TATCCATCTTGGGTTATGAATGTGGTTCCGGTAGACGCAGAGAAGCAAACGTTAGGTGTG
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CCAAGAACTTATGATCTTATTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4E724JQ 717 0 0
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TGCAGCGATTGTGAAATATCCATCTTGGGTTATGAATGTGGTTCCGGTAGACGCAGAGAA
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AGGATTCTCTACGTATCCAAGAACTTATGATCTTATTCACGCTGGTGGATTGTTCAGCAT
TTACGAGAACAGGTGTGATGTGACGTTGATCCTACTTGAGATGGATAGAATACTGAGACC
AGAAGGAACAGTGGTGTTTAGGGACACTGTGGAAATGTTAACGAAGATACAAAGCATAAC
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QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4DK69TF 780 0 0
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CCACCTAGTATTATCCAGGGAACTATACCGGAGATCAATGCTGAAAAATTCAGAGAAGAC
AATGAGGTTTGGAAGGAGAGAGTAGCATACTACAAACAGATAATGCCAGAGCTTTCAAGG
GGAAGGTTCAGGAACATTATGGACATGAATGCATACCTCGGTGGGTTCGCTGCAGCGATT
GTGAAATATCCATCTTGGGTTATGAATGTGGTTCCGGTAGACGCAGAGAAGCAAACGTTA
GGTGTGATTTATGAGAGGGGATTTATAGGAACTTATCAAGACTGGGGTGAAGGATTCTCT
ACGTATCCAAGAACTTATGATCTTATTCACGCTGGTGGATTGTTCAGCATTTACGAGAAC
AGGTGTGATGTGACGTTGATCCTACTTGAGATGGATAGAATACTGAGACCAGAAGGAACA
GTGGTGTTTAGGGACACTGTGGAAATGTTAACGAAGATACAAAGCATAACCAATGGAATG
AAGTGGACAAGTCGAATTATGGATCACGAGAAAGGTCCTTTTATCCCTGAGAAGATCCTT
CTCGCTGTAAAATCCTACTGGACCGGTCCTTCTTCTTAAGCTAGTTTCAGTTTCCTTTTA
GACTCTTTACTTTGATCTTCTTCATCCTCTGATTCGTTCTCATCTCTGCCTCTTTCGTTT
TT**AGACTACTATGATTATTTGGGAAAATACAGAGACAAA*TTTCAAAGAGTGTTTCCA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4DK69JQ 734 0 0
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AAATTCAGAGAAGACAATGAGGTTTGGAAGGAGAGAGTAGCATACTACAAACAGATAATG
CCAGAGCTTTCAAGGGGAAGGTTCAGGAACATTATGGACATGAATGCATACCTCGGTGGG
TTCGCTGCAGCGATTGTGAAATATCCATCTTGGGTTATGAATGTGGTTCCGGTAGACGCA
GAGAAGCAAACGTTAGGTGTGATTTATGAGAGGGGATTTATAGGAACTTATCAAGACTGG
GGTGAAGGATTCTCTACGTATCCAAGAACTTATGATCTTATTCACGCTGGTGGATTGTTC
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AGACCAGAAGGAACAGTGGTGTTTAGGGACACTGTGGAAATGTTAACGAAGATACAAAGC
ATAACCAATGGAATGAAGTGGACAAGTCGAATTATGGATCACGAGAAAGGTCCTTTTATC
CCTGAGAAGATCCTTCTCGCTGTAAAATCCTACTGGACCGGTCCTTCTTCTTAAGCTAGT
TTCAGTTTCCTTTTAGACTCTTTACTTTGATCTTCTTCATCCTCTGATTCGTTCTCATCT
CTGCCTCTTTCGTTTTTTAAGACTACTATGATTATTTGGGAAAATACAGAGACAAAATTT
CAAAGAGTGTTTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL2968Contig1 1259 3 9 U
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TAAAACGGAAACTTTGGTAATACAACACAAACAGCATTAGCTAGAGGAGGTCAATGTTAT
CTCTTTTGAAAAAAAGCTTGAATTAGTGTGCTGTGTCACAACAGTTGGTTCTACTTTGAG
AATCTGATGATAGTACCAAACCAATCTTCAGGTACACTCTCTCTCAATTCGCCATTGAGC
GCTCTCTGTGAATGAGTAGTCGCAGCCTTGACAATGTAGACATCGATTCCATGTTTTGCA
ATCATAGCAGCTTCTGATATCTTTGTTTCCATTCCACCCGTTGTATCATGTGCAGCAACA
GAGGTTTGGACGTTCTTGTTTGAGAGGTCCAACGCTGGATTCACAACCTTCCAGCTTCCA
TCTTCTCCAACAGCGATCTCTTTCAAGAGCACAGAATCATTCTCTGAAGGTGGTCGATCG
TAAACACCATACACATCTGTGAGGAATACAACATATTCTGGCTTCAAATGATGTGCAAGA
TGACGGATGATAACATCACCACTCAGTATGGTGCAGCCCAGTATATTGTCTAGCACTGCA
TCTCCATGGAGAACAGGGACAAATCCTGAATCGATTGTTTTAGCAACTGTTGATAGATCC
GCAGAAGCCACGGCTCTTTTGGAGGTTGTCCAACCACATGAAAATGGAGACATACCGATT
GTAGGAATACCCTCTCGAGCAAGTGCTCGTACTATTTCAAGATTAAGATTTGTGACAGAT
ATACGAGTAGCAACAAAACCAGCTTTAACAATAGGTTTCTCAAGTCCTCCTTTGTGAACA
CCTGATCTGCTGGCCTGAAAATGCCCAAAGGAACCTGCGCCGTGAACCACAACAAACTTG
CTAAACTCAGAAGAAGAGTCCTCCTGATCACCCAAGTCACCAACATCGCAAGCAATCTCA
GAGCTTCCAGGTCTCTTGCTCCAATCCATTCCAATAACCTTGCTTGGAGCCAAACCCTCC
TCCATCATGGCCTGACGTAACTGACACGCCACAGCTTCAAGATTCTCATCGTGAATCTCC
TCCAGCTCGTTCTTCCGTGTAATCGCCGCACCTCCAAGTTTCACGATGCAACGAATTGAT
CTGGTCGGACTCTCAGGTAGATTCAGCTCCATCGTGTCTCAACTCTCAATAGCTATCGTC
TTAAATTGTCAACGGCGTGTCACTGTCACACTCCCCACTCTAACTCAGCTTCATCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP16JQ U 1
AF RR4AD26JQ U 10
AF RR4AD26TF C 411
BS 1 454 RR4EP16JQ
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QA 1 720 1 720
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ATAACATCACCACTCAGTATGGTGCAGCCCAGTATATTGTCTAGCACTGCATCTCCATGG
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QA 1 855 1 855
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AGCTATCGTCTTAAATTGTCAACGGCGTGTCACTGTCACACTCCCCACTCTAACTCAGCT
TCATCGTCC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 4

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CCTAAGAAACTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE52TF U 46
AF RR4FI63TF U 1
AF RR4DE52JQ C 65
AF RR4FI63JQ C 1
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GG
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TGTTGAACATGCGACTTCTGGTTCTGTTT*GCTAAAGC*TTTGGGCATTA
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G

QA 1 601 1 601
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CCTAAGAAACTC

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DS 



AS 1 4

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AAAACATTAAACATATAAAGCTGTTTTCTGGTCCAAATCAAAAACACAACCTACTGCATT
GAAGGAGGTTTGTGATAGTGTAATGTCATCACATCCTATCTTCTCTCCTCCTAGGAGCAC
ATGTAATGATCTCATCCACTCGCAGTATCATCTCAGCTGCTTCTGTTGCAAAAAGCAAAA
CCGCTTGCTTCACTTTGAATGCTTCATAGATTCCTCTCTCCTCCATGTCTCCTACAGCTC
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GAGCCCGTGAGAAAGCTTCAATGGCATGGGATTTTTTGCCAGCAGTTTTCCTTGCAAGCT
CATCTACTTCCTTCGCCATCACCATCTCTGGCCATCCACCTCCGAGCAACACCCTACTGT
CATTAACCGTTTGGGAGAGTACACATAACGCATCATGTAGTGATCTTTCAGCCTCATCAA
GAACACGGTGACTAGCACCACGTAGGACGATTGAACAAGCCTGGCCCATCGCAACACCAG
AGAAATGGATCAACTTGTCTTCACCAATCATGATTTCTTCGATGAGCTTACAATGCCCAA
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AGATCAGAAGACGACGGAGGGATTCTCGGTTTTGGAGATCTTAGTGACAAAGGAACCTAG
TGTGCTTGCTTGCTCTGAAGAGTAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CT

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GAAGGAGGTTTGTGATAGTGTAATGTCATCGCATCCTATCTTCTCTCCTCCTAGGAGCAC
ATGTAATGATCTCATCCACTCGCAGTATCATCTCAGCTGCTTCTGTTGCAAAAAGCAAAA
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GGCATGGGATTTTTTGCCAGCAGTTTTCCTTGCAAGCTCATCTACTTCCTTCGCCATCAC
CATCTCTGGCCATCCACCTCCGAGCAACACCCTACTGTCATTAACCGTTTGGGAGAGTAC
ACATAACGCATCATGTAGTGATCTTTCAGCCTCATCAAGAACACGGTGACTAGCACCACG
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A*TGTGAAGTGACTTGAGA
TAGTAGC

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GCTTCAATGGCATGGGATTTTTTGCCAGCAGTTTTCCTTGCAAGCTCATCTACTTCCTTC
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GAGAGTACACATAACGCATCATGTAGTGATCTTTCAGCCTCATCAAGAACACGGTGACTA
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DS 



AS 1 3

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ATCTCTGAGAAAAAAAACTCAAAAGCCTGACCGTTATCAGAAACAGAAGCCCTTGGTGAA
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GACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAGGCCTCACGCAATACTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER36JQ U 60
AF RR4A864TF C 27
AF RR4A864JQ U 1
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BS 489 489 RR4A864TF
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AAATGAGTTATTGACATTTTCACTACAAATCAATCAAACACCTTTCAGGTGAAATTGTCA
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AACTCAGGGGGTTATGTGCTCTTCATAATGTATCCCAAAATTAAACCGATTAGTCCGACC
AGAAAAACGTACATCAAAGGCATACCACTTTGGCCTCTCTTACTGTTACGTCTCAACTGG
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TGTCTCTGA
AAAAAAAA

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AATGAGTTATTGACATTTTCACTACAAATCAATCAAACACCTTTCAGGTGAAATTGTCAA
ATACAAAAATAAAAAAAATAGTCTGTTTCCTTTGTTCTTCTTTCCTGTGTGGCGCGAAAA
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GAAAAACGTACATCAAAGGCATACCACTTTGGCCTCTCTTACTGTCACGTCTCAACTGGT
CCAGTTCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGTTGAATGGCAGACTGTTTTTCCTCGGTTAGCT
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GACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAGGCCTCACGCAATACTTTTT

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 4

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ACAAACATTAAGATGTAAGCAAAAAAGAAACTGTAATTGGAGTTGAAAACTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C138TF U 115
AF RR4HB23TF U 1
AF RR4C138JQ C 154
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G
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TAATTGGAGT

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AAACTGGATCACGACTATCTCTGCATGGCTGTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCTGAC
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GAGGTTGTCAAAGGGCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCATATCCAGGTCGGTCCCTGAGT
TTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCGCCTCTGTTGCTAGGTTACCCGAGCAAACCG
ATTGGACTGTTCATAAGACGCTCCATAATCTTCAGATCCGATTCTAACGGAGAAGATCTC
GAAGGTTATGCAGGTGCAGGTCTCTACGACAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTA
GTGCTCGATTACACAACGGATCCTCTCATCACTGACGAGAGCTTCCAGAAAAAGATCCTC
TCAGACATTGCACGCGCAGGAGATGCCATCGAGAGGCTGTATGGAACTCCACAGGATATT
GAAGGTGTGATCAGAGACGGGAAGCTCTATGTCGTCCAGACACGGCCACAAGTGTGATCG
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TTTACTCTATAAGCAAAGAGTGTAAAGCATAAAACGCGCATATAGATTAAAAAATGTGTA
CTACACAAACATTAAGATGTAAGCAAAAAAGAAACTGTAATTGGAGTTGAAAACTTCTTC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 0 0

AS 1 4

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ATGGTCTATCCTCTATGCAAGCAAGGTACAATTCTTGATCTGGATGATAACACTTCATTC
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TTATGTGATATAGTGATATTCAGGGGCGGACGTATTGAATACGGATACGCAGTCACGTGC
CCTCTACTATTTTTAGATTTTTTTTGAATAAGTCAGATTAATTTGATAAAAATGTTTGCA
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BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4AY15JQ C 1
AF RR4AY15TF U 1
AF RR4AZ42JQ C 17
AF RR4AZ42TF U 1
BS 1 484 RR4AY15TF
BS 485 487 RR4AY15JQ

RD RR4AY15JQ 487 0 0
GGAAGCCTTTCAGATCTAACTTTAAAGCCTCAAAGTTTCATCCCTTTGAACTCAGAATTT
GTATTGGTGACCTTCAGATGGGAATGTACCTTAGTTCTCCCTAAAACAGAGAAGTTTTCA
GAAGATTGAGACCAATGACAAAATTAGATTTGTTCAAAAAAAAAAAAGAGAAAATTAGAT
ATGGTCTATCCTCTATGCAAGCAAGGTACAATTCTTGATCTGGATGATAACACTTCATTC
TTGGGTGTCTATGACGGCCATGGAGCAGGGTCCCCGTTCTGATTTTTTTAGACAAGTTCA
TTATGTGATATAGTGATATTCAGGGGCGGACGTATTGAATACGGATACGCAGTCACGTGC
CCTCTACTATTTTTAGATTTTTTTTGAATAAGTCAGATTAATTTGATAAAAATGTTTGCA
ATTTAATGGAAAAGCATAAAAAGTGCCCCAACTCAAAGTTGTTTTTGTTATTTTGTTATT
GAAACAC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR4AY15TF 487 0 0
GGAAGCCTCTCAGATCTAACTCTAAAGCCTCAAAGTCTCATCCCTTTGAACTCAGAATTT
GTATTGGTGACCTTCAGATGGGAATGTACCTTAGTTCTCCCTAAAACAGAGAAGTTTTCA
GAAGATTGAGACCAATGACAAAATTAGATTTGTTCAAAAAAAAAAAAGAGAAAATTAGAT
ATGGTCTATCCTCTATGCAAGCAAGGTACAATTCTTGATCTGGATGATAACACTTCATTC
TTGGGTGTCTATGACGGCCATGGAGCAGGGTCCCCGTTCTGATTTTCTTAGACAAGTTCA
TTATGTGATATAGTGATATTCAGGGGCGGACGTATTGAATACGGATACGCAGTCACGTGC
CCTCTACTATTTTTAGATTTTTTTTGAATAAGTCAGATTAATTTGATAAAAATGTTTGCA
ATTTAATGGAAAAGCATAAAAAGTGCCCCAACTCAAAGTTGTTTTTGTTATTTTGTTATT
GAAA
CAC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4AZ42JQ 468 0 0
TAACTCTAAAGCCTCAAAGTTTCATCCCTTTGAACTCAGAATTTGTATTGGTGACCTTCA
GATGGGAATGTACCTTAGTTCTCCCTAAAACAGAGAAGTTTTCAGAAGATTGAGACCAAT
GACAAAATTAGATTTGTTCAAAAAAAAAAAAGAGAAAATTAGATATGGTCTATCCTCTAT
GCAAGCAAGGTACAATTCTTGTTCTGGATGATAACACTTCATTCTTGGGTGTCTATGACG
GCCATGGAGCAGGGTCCCCGTTCTGATTTTCTTAGACAAGTTCATTATGTGATATAGTGA
TATTCAGGGGCGGACGTATTGAATACGGATACGCAGTCACGTGCCCTCTACTATTTTTAG
ATTTTTTTTGAATAAGTCAGATTAATTTGATAAAAATGTTTGCAATTTAATGGAAAAGCA
TAAAAAGTGCCCCAACTCAAAGTTGTTTTTGTTATTTTGTTATTGAAA

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4AZ42TF 487 0 0
GGAAGCCTCTCAGATCTAACTCTAAAGCCTCAAAGTCTCATCCCTTTGAACTCAGAATTT
GTATTGGTGACCTTCAGATGGGAATGTACCTTAGTTCTCCCTAAAACAGAGAAGTTTTCA
GAAGATTGAGACCAATGACAAAATTAGATTTGTTCAAAAAAAAAAAAGAGAAAATTAGAT
ATGGTCTATCCTCTATGCAAGCAAGGTACAATTCTTGATCTGGATGATAACACTTCATTC
TTGGGTGTCTATGACGGCCATGGAGCAGGGTCCCCGTTCTGATTTTCTTAGACAAGTTCA
TTATGTGATATAGTGATATTCAGGGGCGGACGTATTGAATACGGATACGCAGTCACGTGC
CCTCTACTATTTTTAGATTTTTTTTGAATAAGTCAGATTAATTTGATAAAAATGTTTGCA
ATTTAATGGAAAAGCATAAAAAGTGCCCCAACTCAAAGTTGTTTTTGTTATTTTGTTATT
GAAA
CAC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 2 4

CO CL2975Contig1 755 2 6 U
GGACAATCATCTCTCTCTACCCTCGAATTTTCAAAGTTGCTAAATTTTTCTCTTCCTCTG
TGTTCTCCGGCGAAGTAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTT
CAAAACATGCTTGGAACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAAT
CACACTTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCCATCCTCGAGTGGATTGCTTCA
GTCGCAGCCATATACTTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACA
TCACTATTGATTCCTTACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCTGTCATCTTTAGCCTTTTCAGA
GGAGAAGTTGGTAAATGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAA
CACTTCCGAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGGTCCTACTCATCGTGGTGGCTCCG
AATCTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCTATTTATATGCTTAGGGATT
GGAGGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGCTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACT
AAAGCTAATGGCATCTCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTACCCCGTTTGG
GCTATCATCTTTTAAGCAAAAGATCATTTCACAACTCTCTGTATCTTTGTACCCCATTTG
TTTTATGTAAAAGTGAGTTTGTATGATTCCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4DH80TF U 1
AF RR4DH80JQ C 76
BS 1 680 RR4DH80TF
BS 681 681 RR4DH80JQ
BS 682 714 RR4DH80TF
BS 715 715 RR4DH80JQ
BS 716 750 RR4DH80TF
BS 751 755 RR4DH80JQ

RD RR4DH80TF 753 0 0
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TGTTCTCCGGCGAAGTAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTT
CAAAACATGCTTGGAACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAAT
CACACTTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCCATCCTCGAGTGGATTGCTTCA
GTCGCAGCCATATACTTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACA
TCACTATTGATTCCTTACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCTGTCATCTTTAGCCTTTTCAGA
GGAGAAGTTGGTAAATGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAA
CACTTCCGAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGGTCCTACTCATCGTGGTGGCTCCG
AATCTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCTATTTATATGCTTAGGGATT
GGAGGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGCTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACT
AAAGCTAATGGCATCTCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTACCCCGTTTGG
GCTATCATCTTTTAAGCAAA*GATCATTTCACAACTCTCTGTATCTTTGTACCC*ATTTG
TTTTATGTAAAAGTGAGTTTGTATGATTCC
GCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4DH80JQ 680 0 0
TAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTTCAAAACATGCTTGGA
ACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAATCACACTTTCATGCTC
ACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCCATCCTCGAGTGGATTGCTTCAGTCGCAGCCATATAC
TTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACATCACTATTGATTCCT
TACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCTGTCATCTTTAGCCTTTTCAGAGGAGAAGTTGGTAAA
TGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGG
TTTGAGTTACCGGCTGCTGCGGTCCTACTCATCGTGGTGGCTCCGAATCTAATAGCCTAC
ACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCTATTTATATGCTTAGGGATTGGAGGTTACTTGCTT
CAAGAACACATTAGAGCTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACTAAAGCTAATGGCATC
TCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTACCCCGTTTGGGCTATCATCTTTTAA
GCAAAAGATCATTTCACAACTCTCTGTATCTTTGTACCCCATTTGTTTTATGTAAAAGTG
AGTTTGTATGATTCCCCCCC

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL2975Contig2 839 2 4 U
GGACAACCATCTCTCTCTACCCTCGAATTTTCAAAGTTGCCAGCTTTTTCTCTTCCTCTG
TATTCTCCGGCGAAGTAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTT
CAAAACATGCTTGGAACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAAT
CACACTTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCATCCTCGAGTGGATTGCTTCAG
TCGCAGCCATATACTTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACAT
CACTATTGATTCCTTACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCCGTCATCTTTAGCCTTTTCAGAG
GAGAAGTTGGTAAATGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAAC
ACTTCCGAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGATCCTGCTCATCGTGGTGGCTCCAA
ATCTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCAATTTATATGCTTAGGGATTG
GAGGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGCTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACTA
AAGCTAATGGCATCTCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTCCCCGTTTGGG
CTATCATCTTTTAAGCAAAGATCACTTCACAACTCTCTGTTTCTTTGTACCCCATTTGTT
TTATGTAAAAGTGAGTTTGTATGATTCCGCCACTCATAACTTGTCAACCAATGTTGTTTT
AGTTTTACCCTCTTGACCTATTCACAAGTCAAGACTTTCAAGAAATAAGAATGATCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ40TF U 1
AF RR4GZ40JQ C 72
BS 1 737 RR4GZ40TF
BS 738 738 RR4GZ40JQ
BS 739 765 RR4GZ40TF
BS 766 839 RR4GZ40JQ

RD RR4GZ40TF 765 0 0
GGACAACCATCTCTCTCTACCCTCGAATTTTCAAAGTTGCCAGCTTTTTCTCTTCCTCTG
TATTCTCCGGCGAAGTAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTT
CAAAACATGCTTGGAACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAAT
CACACTTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCATCCTCGAGTGGATTGCTTCAG
TCGCAGCCATATACTTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACAT
CACTATTGATTCCTTACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCCGTCATCTTTAGCCTTTTCAGAG
GAGAAGTTGGTAAATGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAAC
ACTTCCGAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGATCCTGCTCATCGTGGTGGCTCCAA
ATCTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCAATTTATATGCTTAGGGATTG
GAGGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGCTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACTA
AAGCTAATGGCATCTCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTCCCCGTTTGGG
CTATCATCTTTTAAGCAAAGATCACTTCACAACTCTCTGTTTCTTTGTACCCCATTTGTT
TTATGTAAAAGTGAGTT*GTATGATTCCGCCACTCATAACTTGTC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4GZ40JQ 768 0 0
GAAG
TAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTTCAAAACATGCTTGGA
ACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAATCACACTTTCATGCTC
ACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCATCCTCGAGTGGATTGCTTCAGTCGCAGCCATATACT
TGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACATCACTATTGATTCCTT
ACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCCGTCATCTTTAGCCTTTTCAGAGGAGAAGTTGGTAAAT
GGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGT
TTGAGTTACCGGCTGCTGCGATCCTGCTCATCGTGGTGGCTCCAAATCTAATAGCCTACA
CATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCAATTTATATGCTTAGGGATTGGAGGTTACTTGCTTC
AAGAACACATTAGAGCTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACTAAAGCTAATGGCATCT
CCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTCCCCGTTTGGGCTATCATCTTTTAAG
CAAAGATCACTTCACAACTCTCTGTTTCTTTGTACCCCATTTGTTTTATGTAAAAGTGAG
TTTGTATGATTCCGCCACTCATAACTTGTCAACCAATGTTGTTTTAGTTTTACCCTCTTG
ACCTATTCACAAGTCAAGACTTTCAAGAAATAAGAATGATCACG

QA 5 768 5 768
DS 



AS 1 3

CO CL2976Contig1 937 3 10 U
GCACTCTTGGGACACACTGATGTCTCTATCCTCCTCGACAACGAAGCTATCTACGACATC
TGCAGACGTTCCCTCAACATTGAGAGGCCAACCTACACCAACCTCAACCGTCTTGTCTCT
CAGGTTATCTCTTCCTTGACGGCTTCTCTAAGGTTCGATGGTGCCTTGAACGTGGATGTC
ACTGAGTTCCAGACCAACTTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTCATGCTTTCATCCTAC
GCCCCAGTCATCTCCGCTGAGAAAGCCTTCCACGAGCAGCTCTCTGTCGCTGAGATCACT
AACGGTGCTTTCGAGCCAGCCTCCATGATGGCCAAGTGTGACCCACGTCACGGGAAGTAC
ATGGCTTGCTGTTTGATGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAAGACGTCAACGCAGCTGTT
GGAACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTCGTTGACTGGTGTCCTACTGGATTCAAG
TGCGGTATCAACTACCAGCCACCAACTGTTGTCCCAGGAGGCGATCTTGCTAAAGTGCAG
AGGGCTGTTTGTATGATCTCCAACTCCACGAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCGAGGATTGAT
CACAAGTTTGATCTCATGTACGCCAAGCGTGCGTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGT
ATGGAGGAAGGAGAGTTCTCTGAGGCACGTGAGGATCTTGCAGCTTTGGAGAAGGACTAT
GAGGAGGTTGGTGCCGAAGGTGGTGATGATGAGGATGACGAAGGCGAGGAGTACTGAGAA
GATCAACGTTTCGAAAATCTAAATTCTGTTATCCTATGTGTTTGCGTGAATGGGCTCGAA
ACACTCTTGTGACGAACCCTTTGTTTTTCTATTTCTGCTTGAATTTCTGTTCTGATACTC
TATTTGGGTTTTAAATTCTCGTTCTCGTTTCGTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FK73TF U 1
AF RR4C792TF U 382
AF RR4A262TF U 745
BS 1 459 RR4FK73TF
BS 460 462 RR4C792TF
BS 463 537 RR4FK73TF
BS 538 538 RR4C792TF
BS 539 679 RR4FK73TF
BS 680 786 RR4C792TF
BS 787 787 RR4A262TF
BS 788 798 RR4C792TF
BS 799 799 RR4A262TF
BS 800 937 RR4C792TF

RD RR4FK73TF 679 0 0
GCACTCTTGGGACACACTGATGTCTCTATCCTCCTCGACAACGAAGCTATCTACGACATC
TGCAGACGTTCCCTCAACATTGAGAGGCCAACCTACACCAACCTCAACCGTCTTGTCTCT
CAGGTTATCTCTTCCTTGACGGCTTCTCTAAGGTTCGATGGTGCCTTGAACGTGGATGTC
ACTGAGTTCCAGACCAACTTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTCATGCTTTCATCCTAC
GCCCCAGTCATCTCCGCTGAGAAAGCCTTCCACGAGCAGCTCTCTGTCGCTGAGATCACT
AACGGTGCTTTCGAGCCAGCCTCCATGATGGCCAAGTGTGACCCACGTCACGGGAAGTAC
ATGGCTTGCTGTTTGATGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAAGACGTCAACGCAGCTGTT
GGAACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTCGTTGAC***TGTCCTACTGGATTCAAG
TGCGGTATCAACTACCAGCCACCAACTGTTGTCCCAGGAGGCGATCTTGCTAAAGTGTAG
AGGGCTGTTTGTATGATCTCCAACTCCACGAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCGAGGATTGAT
CACAAGTTTGATCTCATGTACGCCAAGCGTGCGTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGT
ATGGAGGAAGGAGAGTTCT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4C792TF 556 0 0
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ACCATCCAGTTCGTTGACTGGTGTCCTACTGGATTCAAGTGCGGTATCAACTACCAGCCA
CCAACTGTTGTCCCAGGAGGCGATCTTGCTAAAGTGCAGAGGGCTGTTTGTATGATCTCC
AACTCCACGAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCGAGGATTGATCACAAGTTTGATCTCATGTAC
GCCAAGCGTGCGTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGTATGGAGGAAGGAGAGTTCTCT
GAGGCACGTGAGGATCTTGCAGCTTTGGAGAAGGACTATGAGGAGGTTGGTGCCGAAGGT
GGTGATGATGAGGATGACGAAGGCGAGGAGTACTGAGAAGATCAATGTTTCGAAAATTTA
AATTCTGTTATCCTATGTGTTTGCGTGAATGGGCTCGAAACACTCTTGTGACGAACCCTT
TGTTTTTCTATTTCTGCTTGAATTTCTGTTCTGATACTCTATTTGGGTTTTAAATTCTCG
TTCTCGTTTCGTCTTA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4A262TF 192 0 0
AAGTCATGGACC
GACGAAGGCGAGGAGTACTGAGAAGATCAACGTTTCGAAAATCTAAATTCTGTTATCCTA
TGTGTTTGCGTGAATGGGCTCGAAACACTCTTGTGACGAACCCTTTGTTTTTCTATTTCT
GCTTGAATTTCTGTTCTGATACTCTATTTGGGTTTTAAATTCTCGTTCTCGTTTCGTCTT

QA 13 192 13 192
DS 



AS 1 4

CO CL2977Contig1 785 4 16 U
AAGTCTTAATACTGATTTATTATAAGCAGCTCTGATACCATAAAGACAACTGCAAGCTAA
GAGCTTGATGAAGAAGAAACTTTATCCATCCAACACAAACAGCATTGGAACACACCTAGC
AAATAGGTCGCTGCTAGCGACGCAAACACAACCACACTACATAATCATTCATCAGATTTT
ATTTAAATATTAAAATTAAAACATTAAGCCTCCTTCTTATCCCCAGTGAGGAGATCCATC
ACCACGCCTTTAAGGCTTCCATTGTTCTTCTTCAGTAGCCTCTTGTTCGTCACATTATCA
CAGAATCCCATTTCCTGAAGCTCCTCTAGCATAGGATCCCACTCGCTTACTCCACAAAGT
GCCTCAACAGACTGCTCAAAGCCGTACTCGTTCTCCCTCAAGATCTCCCTGTTCAGATCA
ATCTCTTTGAATCCCATTTCCTCTAGCTCCTTTAGCATGCCTATCTCCACCTCGTTCTTC
TCTATATCCTCTTCAAGAGGAGCAGGAATGTCCATTGAAAATGAATAAGCACCGCCCAAC
GTCTCAACATTACGCATATTTGGGACCTCAATTATGTTGCATGACGACGAAGATGAAGAT
GGAGTAAGAGTGTTGGGTATAACAGGCTCAACGTCACCAACCAGCAGGTCATCGTTTCCC
GGGATCTGTGACCCAGAAGCTTCTCGTTCTAGATCAGCGCCTTTCACTGTCCCGTTAACA
CTGGAGCTGCCGGTTTGAGCTAGCTCATAATTCACGTTGGTCCCTGTAAACTCTCGTGCA
AATGC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RR4EM20JQ U 1
AF RR4EM20TF C 1
AF RR4AF05JQ U 2
AF RR4AF05TF C 21
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ATTTAAATATTAAAATTAAAACATTAAGCCTCCTTCTTATCCCCAGTGAGGAGATCCATC
ACCACGCCTTTAAGGCTTCCATTGTTCTTCTTCAGTAGCCTCTTGTTCGTCACATTATCA
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C

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DS 

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AA
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ATAGGTCGCTGCTAGCGACGCAAACACAACCACACTACATAATCATTCATCAGATTTTAT
TTAAATATTAAAATTAAAACATTAAGCCTCCTTCTTATCCCCAGTGAGGAGATCCATCAC
CACGCCTTTAAGGCTTCCATTGTTCTTCTTCAGTAGCCTCTTGTTCGTCACATTATCACA
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CTCAACAGACTGCTCAAAGCCGTACTCGTTCTCCCTCAAGATCTCCCTGTTCA*ATCAAT
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TATATCCTCTTC
C

QA 3 494 3 494
DS 

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G
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GCTTGATGAAGAAGAAACTTTATCCATCCAACACAAACAGCATTGGAACACACCTAGCAA
ATAGGTCGCTGCTAGCGACGCAAACACAACCACACTACATAATCATTCATCAGATTTTAT
TTAAATATTAAAATTAAAACATTAAGCCTCCTTCTTATCCCCAGTGAGGAGATCCATCAC
CACGCCTTTAAGGCTTCCATTGTTCTTCTTCAGTAGCCTCTTGTTCGTCACATTATCACA
GAATCCCATTTCCTGAAGCTCCTCTAGCATAGGATCCCACTCGCTTACTCCACAAAGTGC
CTCAACAGACTGCTCAAAGTCGTACTCGTTCTCCCTCAAGATCTCCCTGTTCAGATCAAT
CTCTTTGAATCCCATTTCCTCTAGCTCCTTTAGCATGCCTATCTCCACCTCGTTCTTCTC
TATATCCTCTTCAAGAGGAGCAGGAATGTCCATTGAAAATGAATAAGCACCGCCCAACGT
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GGAGCTGCCGGTTTGAGCTAGCTCATAATTCACGTTGGTCCCTGTAAACTCTCGTGCAAA
TGC

QA 2 784 2 784
DS 

RD RR4AF05TF 765 0 0
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TGGGACCTCAATTATGTTGCATGACGACGAAGATGAAGATGGAGTAAGAGTGTTGGGTAT
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TTCTCGTTCTAGATCAGCGCCTTTCACTGTCCCGTTAACACTGGAGCTGCCGGTTTGAGC
TAGCTCATAATTCACGTTGGTCCCTGTAAACTCTCGTGCAAATGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 4

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TAAAACGGTAATGAGTTTACCTATTTGAGCTTTACATGATATCATACAAACAATATATAC
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ATGTTTTTTTTGTTTCGAGCCTCTGAACTCAAAAATTCCCACTCTTCTTTGCTCGGCCAG
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GCTCGAAATTTGCTGGAGGATACTGCTTCTGGAAAGCGCATTTACTGAAGAGCTCAAGAG
CTTCGTCGTATTTTAGACAGTCCATTTCGTAGACATGTTCAACTCCACGTGATAAGAGCA
AACTCTTGTCTTCTGTGGTTACTATAACTCTACTTCCTGGACAGAGACGATTCACACCCT
CCATGACCTTCTCTAATTCCTCGATCCCTATGTCATCAACTATGATAAGAGTTTGGTTGT
GGACAATCTTTTTCCTTTTGCTGTCGCCAGAGCCGAAGTTGCAACGCAGTGTCTCAGTTG
CTTTTCGCTTAAGACTTTCTGGAGAAAGTAGCTCTTCCTGTGCAGAAAGGTCGTGGCCTT
GATCATACAAGTTCCTCGAGGTTTCAAGAGAATAATGATTCTGGTGACAAGCTGCGGATA
ATTTCTGGTCGATATAATCTTCTCTACTTGATTTGCTAATCCCAGCTCCTGAACTTTCAT
CTTCGAAAAAACACGGATCTTCGAAAGCCAAAGATAGTTTCTTGTAAAGATGCCTTGCAA
TAGTCGTTTTGCCAATTCCTGCCACACCTGTAATACCAATCACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AY86JQ U 10
AF RR4DV38JQ U 1
AF RR4AY86TF C 376
AF RR4DV38TF C 451
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RD RR4AY86JQ 529 0 0
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AATGAGTTTACCTATTTGAGCTTTACATGATATCATACAAACAATATATACAATAAAAAC
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TCTGGATTTCACTTTCCCATTCCTTTTGAGTTCTGTCACGTAAAAAAAAGCCAAGTAATT
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QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4DV38JQ 871 0 0
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TAAAACGGTAATGAGTTTACCTATTTGAGCTTTACATGATATCATACAAACAATATATAC
AATAGAAACAAGTCCTGGTGATGTGGTATGCCTTGTGGGATAATCTTCAATCAGTGGCGT
ATGTTTTTTTTGTTTCGAGCCTCTGGACTCAGAGATTCGCACTCTTCTTTGCTCGGCCAG
CATGCGGTATGCCTTCCTGGCTGTGCTTACGTTGTTCATTGAGCTTCGAAATAAATATTT
TGGCAATGGCTTTTATCTTTTCTTTCTGTTGTGGTTTCGAGCCTCTGCATTCCTTACCCT
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CCTGGACCCTCTGGATTTCACTTTCCCATTCCTTTTGAGTTCTGTCACGTAGAAAAGAGC
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AACTCTTGTCTTCTGTGGTTACTATAACTCTACTTCCTGGACAGAGACGATTCACACCCT
CCATGACCTTCTCTAATTCCTCGATCCCTATGTCATCAACTATGATAAGAGTTTGGTTGT
GGACAATCTTTTTCCTTTTGCTGTCGC*AGAGCCGA*GTTGCA*CGCAGTGTCTCAGTTG
CTTT*CGCTTA*GACTTTCTGGAGAA
GTAGC

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GT
GCTTTAAGCTTTGGTAGTTTAACACAATCTACTTCTTGTCTTGCCTGGACCCTCTGGATT
TCACTTTCCCATTCCTTTTGAGTTCTGTCACGTAGAAAAGAGCCAAGTAATTTAAGGCCC
AAAGGAAGACAGCCGGTTAGTTCGACTGCAAGGACCGAGAGCTGCTCGAAATTTGCTGGA
GGATACTGCTTCTGGAAAGCGCATTCACTGAAGAGCTCAAGAGCTTCGTCGTATTTTAGA
CAGTCCATTTCGTAGACATGTTCAACTCCACGTGATAAGAGCAAACTCTTGTCTTCTGTG
GTTACTATAACTCTACTTCCTGGACAGAGACGATTCACACCC*CCATGACCTTCTCTAAT
TCCTCGATCCCTATGTCATCAACTATGATAAGAGTTTGGTTGTGGCCAATCTTTTTCCTT
TTGCTATCGCCAGAGCCGAAGTTGCAACGCAGTGTCTCAGTTGCTTTTCGCTTAAGACTT
TCTGGAGAAAGTAGCTCTTCCTGTGCAGAAAGGTCGTGGCCTTGATCATGCAAGTTCCTC
GAGGTTTCAAGAGAATAATGATTCTGGTGACAAGCTGCGGATAATTTCTGGTCGATATAA
TCTTCTCTACTTGATTTGCTAATCCCAGCTCCTGAACTTTCATCTTCGAAAAAACACGGA
TCTTCGAAAGCCAAAGATAGTTTCTTGTAAAGATGCCTTGCAATAGTCGTTTTGCCAATT
CCTGCCACACCTGTAATACCAATCACACC

QA 3 751 3 751
DS 

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CG
TTTTGAGTTCTGTCACGTAGAAAAGAGCCAAGTAATTTAAGGCCCAAAGGAAGACAGCCG
GTTAGTTCGACTGCAAGGACCGAGAGCTGCTCGAAATTTGCTGGAGGATACTGCTTCTGG
AAAGCGCATTTACTGAAGAGCTCAAGAGCTTCGTCGTATTTTAGACAGTCCATTTCGTAG
ACATGTTCAACTCCACGTGATAAGAGCAAACTCTTGTCTTCTGTGGTTACTATAACTCTA
CTTCCTGGACAGAGACGATTCACACCCTCCATGACCTTCTCTAATTCCTCGATCCCTATG
TCATCAACTATGATAAGAGTTTGGTTGTGGACAATCTTTTTCCTTTTGCTGTCGCCAGAG
CCGAAGTTGCAACGCAGTGTCTCAGTTGCTTTTCGCTTAAGACTTTCTGGAGAAAGTAGC
TCTTCCTGTGCAGAAAGGTCGTGGCCTTGATCATACAAGTTCCTCGAGGTTTCAAGAGAA
TAATGATTCTGGTGACAAGCTGCGGATAATTTCTGGTCGATATAATCTTCTCTACTTGAT
TTGCTAATCCCAGCTCCTGAACTTTCATCTTCGAAAAAACACGGATCTTCGAAAGCCAAA
GATAGTTTCTTGTAAAGATGCCTTGCAATAGTC
C

QA 3 635 3 635
DS 



AS 1 2

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GTCGCTGCAGCTTGTTGACCCTCTCGGTAAGAACGGGCAAAACGATGGGCTTGAATCTCA
GGGTAATCTCGTATTTCTAAGGGTTATCTCCCTTCGTAAGGGTCGGAAGCTACTTACAAG
GTACCTCCAGCTTCTTATCCCCGGCAGCGAGCTGATGCGTATAGTTTCCATGGCCATTTT
CAGACACTTAAGGTCCTTGTTCGGAGCGCGGTCGTCAGATACCGAAACCAGGGAAACTAC
AATCAAACTTGCAAAAGTTGCCACCTTATGCATCCAAACCATGGATCTTGGACCCGTGAG
TGCGTGTCTAGCAGCAGTTTCTTGTTCTTCAGAGCAGCCACCGCTTCGTCCCTTGGGTAG
TCCCGTTGGAGACGAAGCTACAGCTATTCTCAAATCTGCACTCGACAGAGCTGCCGAGCT
CCTCCGTGCTAATCATTACAACAACGCAGGCATGAATCTGTGGCGTGCGTCCTTTGATGA
GTTCTTCAACTTGCTGATGAAACATTGCATCAGTAAGTACGACAGTATAATGCAGAACTT
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TGTCAGGGAAATGCCAATCGAGCTTCTACGTGCGAGTTTCCCACACATTAGTGATGAGCA
GAAGAGAATACTTGTGGAATTCTTGAAGCTTGGTAGCCAGAAAACGGACACAGTCATAAA
TCAATGATAGTAAAAAAAGAAAAAATCGGTATGGAGCAGAAAAGTGTTGCTAAGCTCTTC
TTTCTTTGATACTCATCTTTTTCTTTCTTGATGACATTAATGATGTGAAAGAAACAGGAG
AAGTTGGCATGTACAGGGAAGGTCTAAAGCTTGTTTTACATATAAGATAGAAAATGAAAG
TTACTGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTTGCTGATGAAACATTGCATCAGTAAGTACGACAGTATAATGCAGAACTTGAATTCGCA
GTTGTCACCACACTTTGGCGCAGAGATGTCCGAAGCTGCTGCACAAGCCATTGTCAGGGA
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TGTACAGGGAAGGTCTAAAGCTTGTTTTACATATAAGATAGAAAATGAAAGTTACTGTTT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

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CGGTCCCGATTTCGCGAGATGTAAGCCCTGGCTCATTGATAACGCTCCCGATCTCTACCC
CGATCTCCTCAAAGAAGCTAATGAGAAGGGAGTAGATAATGTTTCTGATAAGCTCCAGTC
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TAAGAAGGAGGAAGTGAAACGCCTTCCTGGGGGGAAAGTTAAAAAGAAAGAGAGACTAGA
AGTTATCATTGAAAAGGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTCTATCACCATTGTGAAAGGTCT
AGAACTCTTTGGGATAAAACTCAGTGACGCGTCTAAAAAGCTTGGGAAGAAGTTTGCTAC
TGGAGCATCGGTTGTCAAGGGACCAACTGAGAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATAT
TATCTATGACATCGTTGAATTCATTACAGACACTTGGCCCAACGTACCTGAAAGATCCAT
TTTCTTCATTGAAGATGGGAAGAAGGTTCAGGCTGGTTAATGATCATGTTTGTCTTGTTT
TTATTTTTTTTGTTTTTTTTGGCATGGCAGGTTCATGAGGACGAACTAGTTTCCGAGTCC
TCCCATATGTTTCTTCTTATTACCAAACGTCTCTGTTTTTCTTCGTGGATCTTAACATTT
AAAACTATTTTTTTTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EC11TF U 6
AF RR4D935TF U 1
AF RR4EC11JQ C 186
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BS 581 581 RR4EC11TF
BS 582 622 RR4D935TF
BS 623 796 RR4EC11JQ

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GGG
GTTCTCGCTTCTAGAAAGAGAATATCAATCACAAATCTATGGCGGAGAAGCTCGAGCCGG
CGAAGGTTCTGTACTGCGGAGTTTGCTCTCTTCCAGCAGAATACTGCGAGTTCGGTCCCG
ATTTCGCGAGATGTAAGCCCTGGCTCATTGATAACGCTCCCGATCTCTACCCCGATCTCC
TCAAAGAAGCTAATGAGAAGGGAGTAGATAATGTTTCTGATAAGCTCCAGTCGGTGGGAA
TCTCTGGCGCTGATGGTGCTGCACCCTCTTCTTCTCAGACTGGAGGGACATCTAAGAAGG
AGGAAGTGAAACGCCTTCCTGGGGGGAAAGTTAAAAAGAAAGAGAGACTAGAAGTTATCA
TTGAAAAGGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTCTATCACCATTGTGAAAGGTCTAGAACTCT
TTGGGATAAAACTCAGTGACGCGTCTAAAAAGCTTGGGAAGAAGTTTGCTACTGGAGCAT
CGGTTGTCAAGGGACCAACTGAGAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATATTATCTATG
ACATCGTTGAATTCATTACAGACACTTGGCCCAACGTACCTGAAAG

QA 4 589 4 589
DS 

RD RR4D935TF 622 0 0
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CGAGCCGGCGAAGGTTCTGTACTGCGGAGTTTGCTCTCTTCCAGCAGAATACTGCGAGTT
CGGTCCCGATTTCGCGAGATGTAAGCCCTGGCTCATTGATAACGCTCCCGATCTCTACCC
CGATCTCCTCAAAGAAGCTAATGAGAAGGGAGTAGATAATGTTTCTGATAAGCTCCAGTC
GGTGGGAATCTCTGGCGCTGATGGTGCTGCACCCTCTTCTTCTCAGACTGGAGGGACATC
TAAGAAGGAGGAAGTGAAGCGCCTTCCTGGGGGGAAAGTTAAAAAGAAAGAGAGACTAGA
AGTTATCATTGAAAAGGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTCTATCACCATTGTGAAAGGTCT
AGAACTCTTTGGGATAAAACTCAGTGACGCGTCTAAAAAGCTTGGGAAGAAGTTTGCTAC
TGGAGCATCGGTTGTCAAGGGACCAACTGAGAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATAT
TATCTATGACATCGTTGAATTCATTACAGACACTTGGCCCGACGTACCTGAAAGATCCAT
TTTCTTCATTGAAGATGGGAAG

QA 1 622 1 622
DS 

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TCT
TCAAAGAAGCTAATGAGAAGGGAGTAGATAATGTTTCTGATAAGCTCCAGTCGGTGGGAA
TCTCTGGCGCTGATGGTGCTGCACCCTCTTCTTCTCAGACTGGAGGGACATCTAAGAAGG
AGGAAGTGAAACGCCTTCCTGGGGGGAAAGTTAAAAAGAAAGAGAGACTAGAAGTTATCA
TTGAAAAGGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTCTATCACCATTGTGAAAGGTCTAGAACTCT
TTGGGATAAAACTCAGTGACGCGTCTAAAAAGCTTGGGAAGAAGTTTGCTACTGGAGCAT
CGGTTGTCAAGGGACCAACTGAGAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATATTATCTATG
ACATCGTTGAATTCATTACAGACACTTGGCCCAACGTACCTGAAAGATCCATTTTCTTCA
TTGAAGATGGGAAGAAGGTTCAGGCTGGTTAATGATCATGTTTGTCTTGTTTTTATTTTT
TTTGTTTTTTTTGGCATGGCAGGTTCATGAGGACGAACTAGTTTCCGAGTCCTCCCATAT
GTTTCTTCTTATTACCAAACGTCTCTGTTTTTCTTCGTGGATCTTAACATTTAAAACTAT
TTTTTTTT

QA 4 611 4 611
DS 



AS 1 4

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TAATGTATCAATTTATAATACCATATTAACTCATATTTATCTACTTTTCTTACTTTTAAT
TAAGAAAATTAATTTTGTAGATACTTTATACATAAATCTAATTATACAAATTTTGGATTT
TGCTTATACGATGCCGATAAATATCGGCCATATAATTTACTATAGAACGCAAAAAAAAAT
CGATGTAATTAAACACATTGTTATTTCTCAAAATATTATATTAGTACACACATTGCAAAT
CATGTATAACATTTAGTAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BG46JQ C 1
AF RR4BG46TF U 1
AF RR4BG70JQ C 1
AF RR4BG70TF U 1
BS 1 319 RR4BG46TF

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TAAGAAAATTAATTTTGTAGATACTTTATACATAAATCTAATTATACAAATTTTGGATTT
TGCTTATACGATGCCGATAAATATCGGCCATATAATTTACTATAGAACGCAAAAAAAAAT
CGATGTAATTAAACACATTGTTATTTCTCAAAATATTATATTAGTACACACATTGCAAAT
CATGTATAACATTTAGTAC

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4BG46TF 319 0 0
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TAATGTATCAATTTATAATACCATATTAACTCATATTTATCTACTTTTCTTACTTTTAAT
TAAGAAAATTAATTTTGTAGATACTTTATACATAAATCTAATTATACAAATTTTGGATTT
TGCTTATACGATGCCGATAAATATCGGCCATATAATTTACTATAGAACGCAAAAAAAAAT
CGATGTAATTAAACACATTGTTATTTCTCAAAATATTATATTAGTACACACATTGCAAAT
CATGTATAACATTTAGTAC

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4BG70JQ 319 0 0
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TAATGTATCAATTTATAATACCATATTAACTCATATTTATCTACTTTTCTTACTTTTAAT
TAAGAAAATTAATTTTGTAGATACTTTATACATAAATCTAATTATACAAATTTTGGATTT
TGCTTATACGATGCCGATAAATATCGGCCATATAATTTACTATAGAACGCAAAAAAAAAT
CGATGTAATTAAACACATTGTTATTTCTCAAAATATTATATTAGTACACACATTGCAAAT
CATGTATAACATTTAGTAC

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4BG70TF 319 0 0
GCTAATATTCTATGGAATAAATTGCCTATAATATTTTTATTTTTTTACAAATGTTATAAC
TAATGTATCAATTTATAATACCATATTAACTCATATTTATCTACTTTTCTTACTTTTAAT
TAAGAAAATTAATTTTGTAGATACTTTATACATAAATCTAATTATACAAATTTTGGATTT
TGCTTATACGATGCCGATAAATATCGGCCATATAATTTACTATAGAACGCAAAAAAAAAT
CGATGTAATTAAACACATTGTTATTTCTCAAAATATTATATTAGTACACACATTGCAAAT
CATGTATAACATTTAGTAC

QA 1 319 1 319
DS 



AS 1 4

CO CL2982Contig1 1170 4 5 U
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ACGTTAATCATGAGTATGATTCAGGAACAATGATGACTTCACATACCATAAAACTGGTAC
AAGATCTTAAAGATGGATCTAGCCAAGAGAAGACTGCTGCTGCTGCTGAGATACGTCATC
TTACCATTAACAACGTTGAAAACCGTGTTCACATTGGGCGTTGCGGTGCCATCACTCCAC
TGCTGTCACTTCTATACTCAGAAGAAGAGCTAACTCAAGAACACGCAGTCACTGCTCTTC
TGAATCTTTCGATCAGCGAAGTAAGCAAAGCCATGATTGCGGAAGCTGGGGCTATAGAAC
CGCTTGTTCACGTTTTGAACACAGGTAATGACAGAGCCAAAGAGAACTCAGCAGCAACGT
TGTTCAGTCTATCTGTTCTGCAAATCAACAGGGAAAGAATAGGACAGTCTAAAGCAGCTA
TACAGGCTCTGGTGAATCTTCTTGGAAAGGGAACATTCAGAGGGAAGAAAGATGCTGCTT
CTGCGTTGTTCAACCTCTCGATAACTCATGAGAACAAGGCTCGTATTGTGCAAGCTAAGG
CGGTTAAGTATCTTGTGGAGCTGTTAAACCCGGATCTAGAGATGGTTGATAAAGCAGTTG
CTCTTCTTGCGAATCTTTCTGCGGTTGGAGAA*GGGCGTCAAGCAATTGTGAGGGAAGGT
GGAATTCCGTTGCTTGTTGAGACGGTTGATTCAGGGTCTCAGAGAGGGAAAGGGAACGCA
GCTTCTGTGCTGCTTCAGTTGTGTCTGAACAGTCCCAAGTTTTGCACATTGGTGTTGCAA
GAAGGCGCAATACCTCCACTTGTTGCCTTGTCTCAGTCTGGTACACAGAGAGCAAAGGAG
AAGGCACAGCAGCTTTTCAGCCACTTCCGGAACCAGCGAGATGCAAGGATGAAGAAAGGT
AGACCATGATCATCAAGAAACGGAGCTCCAGGAGACTTGTATTGTTAAGCTAGCAGATTT
TTTTTTTACTTTCTCTCTTTCTGCCAGGAACATCATAGTGTCTTCCCTTCTCTCTCCTTT
TTGTGCTGTGTGATGAGTGTGTTAATGCTTGTGTGTGTAGTAGTTATATATATATGTGCA
ACTTGTGAGATTCGAGTTTATAGGAAATGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AS95TF U 1
AF RR4B140TF U 1
AF RR4B140JQ C 268
AF RR4AS95JQ C 537
BS 1 689 RR4AS95TF
BS 690 692 RR4B140TF
BS 693 693 RR4B140JQ
BS 694 712 RR4B140TF
BS 713 1170 RR4B140JQ

RD RR4AS95TF 689 0 0
GGGAGAACCACCAAAGTTACAGTGAGATGTCTCCTAAGAAACACTCAGAAAGTTCAAGCA
ACGTTAATCATGAGTATGATTCAGGAACAATGATGACTTCACATACCATAAAACTGGTAC
AAGATCTTAAAGATGGATCTAGCCAAGAGAAGACTGCTGCTGCTGCTGAGATACGTCATC
TTACCATTAACAACGTTGAAAACCGTGTTCACATTGGGCGTTGCGGTGCCATCACTCCAC
TGCTGTCACTTCTATACTCAGAAGAAGAGCTAACTCAAGAACACGCAGTCACTGCTCTTC
TGAATCTTTCGATCAGCGAAGTAAGCAAAGCCATGATTGCGGAAGCTGGGGCTATAGAAC
CGCTTGTTCACGTTTTGAACACAGGTAATGACAGAGCCAAAGAGAACTCAGCAGCAACGT
TGTTCAGTCTATCTGTTCTGCAAATCAACAGGGAAAGAATAGGACAGTCTAAAGCAGCTA
TACAGGCTCTGGTGAATCTTCTTGGAAAGGGAACATTCAGAGGGAAGAAAGATGCTGCTT
CTGCGTTGTTCAACCTCTCGATAACTCATGAGAACAAGGCTCGTATTGTGCAAGCTAAGG
CGGTTAAGTATCTTGTGGAGCTGTTAAACCCGGATCTAGAGATGGTTGATAAAGCAGTTG
CTCTTCTTGCGAATCTTTCTGCGGTTGGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4B140TF 712 0 0
GGGAGAACCACCAAAGTTACAGTGAGATGTCTCCTAAGAAACACTCAGAAAGTTCAAGCA
ACGTTAATCATGAGTATGATTCAGGAACAATGATGACTTCACATACCATAAAACTGGTAC
AAGATCTTAAAGATGGATCTAGCCAAGAGAAGACTGCTGCTGCTGCTGAGATACGTCATC
TTACCATTAACAACGTTGAAAACCGTGTTCACATTGGGCGTTGCGGTGCCATCACTCCAC
TGCTGTCACTTCTATACTCAGAAGAAGAGCTAACTCAAGAACACGCAGTCACTGCTCTTC
TGAATCTTTCGATCAGCGAAGTAAGCAAAGCCATGATTGCGGAAGCTGGGGCTATAGAAC
CGCTTGTTCACGTTTTGAACACAGGTAATGACAGAGCCAAAGAGAACTCAGCAGCAACGT
TGTTCAGTCTATCTGTTCTGCAAATCAACAGGGAAAGAATAGGACAGTCTAAAGCAGCTA
TACAGGCTCTGGTGAATCTTCTTGGAAAGGGAACATTCAGAGGGAAGAAAGATGCTGCTT
CTGCGTTGTTCAACCTCTCGATAACTCATGAGAACAAGGCTCGTATTGTGCAAGCTAAGG
CGGTTAAGTATCTTGTGGAGCTGTTAAACCCGGATCTAGAGATGGTTGATAAAGCAGTTG
CTCTTCTTGCGAATCTTTCTGCGGTTGGAGAAAGGGCGTCAAGCAATTGTGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4B140JQ 903 0 0
AGCTAACTCAAGAACACGCAGTCACTGCTCTTCTGAATCTTTCGATCAGCGAAGTAAGCA
AAGCCATGATTGCGGAAGCTGGGGCTATAGAACCGCTTGTTCACGTTTTGAACACAGGTA
ATGACAGAGCCAAAGAGAACTCAGCAGCAACGTTGTTCAGTCTATCTGTTCTGCAAATCA
ACAGGGAAAGAATAGGACAGTCTAAAGCAGCTATACAGGCTCTGGTGAATCTTCTTGGAA
AGGGAACATTCAGAGGGAAGAAAGATGCTGCTTCTGCGTTGTTCAACCTCTCGATAACTC
ATGAGAACAAGGCTCGTATTGTGCAAGCTAAGGCGGTTAAGTATCTTGTGGAGCTGTTAA
ACCCGGATCTAGAGATGGTTGATAAAGCAGTTGCTCTTCTTGCGAATCTTTTTGCGGTTG
GAGAA*GGGCGTCAAGCAATTGTGAGGGAAGGTGGAATTCCGTTGCTTGTTGAGACGGTT
GATTCAGGGTCTCAGAGAGGGAAAGGGAACGCAGCTTCTGTGCTGCTTCAGTTGTGTCTG
AACAGTCCCAAGTTTTGCACATTGGTGTTGCAAGAAGGCGCAATACCTCCACTTGTTGCC
TTGTCTCAGTCTGGTACACAGAGAGCAAAGGAGAAGGCACAGCAGCTTTTCAGCCACTTC
CGGAACCAGCGAGATGCAAGGATGAAGAAAGGTAGACCATGATCATCAAGAAACGGAGCT
CCAGGAGACTTGTATTGTTAAGCTAGCAGATTTTTTTTTTACTTTCTCTCTTTCTGCCAG
GAACATCATAGTGTCTTCCCTTCTCTCTCCTTTTTGTGCTGTGTGATGAGTGTGTTAATG
CTTGTGTGTGTAGTAGTTATATATATATGTGCAACTTGTGAGATTCGAGTTTATAGGAAA
TGA

QA 1 903 1 903
DS 

RD RR4AS95JQ 634 0 0
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AAGGCGGTTAAGTATCTTGTGGAGCTGTTAAACCCGGATCTAGAGATGGTTGATAAAGCA
GTTGCTCTTCTTGGGAATCTTTCTGCGGTTGGAGAA*GGGCGTCAAGCAATTGTGAGGGA
AGGTGGAATTCCGTTGCTTGTTGAGACGGTTGATTCAGGGTCTCAGAGAGGGAAAGGGAA
CGCAGCTTCTGTGCTGCTTCAGTTGTGTCTGAACAGTCCCAAGTTTTGCACATTGGTGTT
GCAAGAAGGCGCAATACCTCCACTTGTTGCCTTGTCTCAGTCTGGTACACAGAGAGCAAA
GGAGAAGGCACAGCAGCTTTTCAGCCACTTCCGGAACCAGCGAGATGCAAGGATGAAGAA
AGGTAGACCATGATCATCAAGAAACGGAGCTCCAGGAGACTTGTATTGTTAAGCTAGCAG
ATTTTTTTTTTACTTTCTCTCTTTCTGCCAGGAACATCATAGTGTCTTCCCTTCTCTCTC
CTTTTTGTGCTGTGTGATGAGTGTGTTAATGCTTGTGTGTGTAGTAGTTATATATATATG
TGCAACTTGTGAGATTCGAGTTTATAGGAAATGA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 4

CO CL2983Contig1 1322 4 4 U
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TCAAAACAAATAAAGCAGCCAACAGCCACTGCTGATAAAAGAAATTAACATTTTTTTCTC
TTTTCTTTTCTTGCAGTATTTTCTTATGGTGGTGGTGGTTTATTATTCAATACTCTTGTG
GGGTTTTAGTTCTAAACTAAACTGAGAAAGACACTTTGTTTCTGAAAATCAATCACAGGG
TGTAGTGTTGCTGGATTGCCTCTATGTCAAGTCCCTTCTGCTTCACTACTGATTCCACGT
GACCTTTCAATGTATGATGCTCTCTTAAACTTGCGACTTCAGCCCGTCTCTTGGCCTGAT
CTGCTATCTCTGAAAGTTCTCTATAAGTGCTCTTGTCGTTGAACATATC*GAGGGCTGAG
CAGGTTGCAATCCGTGAAGGGTACGTTGAGCTTGTGCCCATTGTGCTTCCCTCTCTCCTT
TTCCATAGTCTTTCTTTGACGTGAAAGCGGTCTTGTTCTCAATGACATTATCCCAGGCTC
TACCACTTAGTGAATATCTGATGATGAACTTGAGTATATCCAATGGAACGTAAGTAACTA
TACTGTAGAGCCAGATCACTCCTGCCCATCCCCACCCAGTACCTCTGATTCTTGCAAAAT
CCCAGTTTGCATACACCGCAATGAGAGTAGCAATCAGCTGAGCTAAGAAAAAGGCAGCGA
TCAACCATAAGCCAGGACGTTCAGCATAAGACCAGCTACGTGACCTTGTGACAAAGATAA
GCGCCTGGCTAATTATGCTAACTTGGAGGTATATAGCTGATGTAAGCTCATGCGGATTCC
CACTGATAGATCTCACCCCAAACTTTGCCGAGAAGAAGTCAGTGCTCTCTGTAGCCCAGA
AGAAAACGACAGTCATGACTGCAAGGTATGTGCCAAGAACAACGCCAGTGGCAAATATCT
CTTTGAGTTTCCATGAATCAGGAAGTGGAGAAGGCTTTACTCTGTCCTTTGATATGGTCA
TGATAGTACCATCATTCAGGATGGCTATGACCAACACCATGAATGGTGAGAAGTCGAACT
TCCATATGAGTGCAAGCAGCATAAAGCCCATCACTACACGGATTGTGATTGAGACTGCGT
AGATTGTGTAGTTCTTCATTCTCTGGAAGATGGATCTGCTCGTCAAGACAGCACTTACTA
TGACACTGAGGCCTGGCTCGGTTAGTACAATGTCAGATGCACTTCTCGCCGCATCGGTCG
CGTCAGCAACAGCTATTCCGATGTCAGCTCTTTTAAGAGCTGGAGCATCGTTCACTCCAT
CC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DP11JQ U 23
AF RR4AG94JQ U 1
AF RR4A678JQ U 1
AF RR4DP11TF C 707
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TCTTAACCTTGCGACTTCAGCCCGTCTCTTGGCCTGATCTGCTATCTCTGAAAGTTCTCT
ATAAGTGCTCTTGCCGTTGAACATATCTGAGGGCTGAACAGGTTGCAATCCGTGAAGG

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4AG94JQ 822 0 0
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TTTTCTTTTCTTGCAGTATTTTCTTATGGTGGTGGTGGTTTATTATTCAATACTCTTGTG
GGGTTTTAGTTCTAAACTAAACTGAGAAAGACACTTTGTTTCTGAAAATCAATCACAGGG
TGTAGTGTTGCTGGATTGCCTCTATGTCAAGTCCCTTCTGCTTCACTACTGATTCCACGT
GACCTTTCAATGTATGATGCTCTCTTAAACTTGCGACTTCAGCCCGTCTCTTGGCCTGAT
CTGCTATCTCTGAAAGTTCTCTATAAGTGCTCTTGTCGTTGAACATATC*GAGGGCTGAG
CAGGTTGCAATCCGTGAAGGGTACGTTGAGCTTGTGCCCATTGTGCTTCCCTCTCTCCTT
TTCCATAGTCTTTCTTTGACGTGAAAGCGGTCTTGTTCTCAATGACATTATCCCAGGCTC
TACCACTTAGTGAATATCTGATGATGAACTTGAGTATATCCAATGGAACGTAAGTAACTA
TACTGTAGAGCCAGATCACTCCTGCCCATCCCCACCCAGTACCTCTGATTCTTGCAAAAT
CCCAGTTTGCATACACCGCAATGAGAGTAGCAATCAGCTGAGCTAAGAAAAAGGCAGCGA
TCAACCATAAGCCAGGACGTTCAGCATAAGACCAGCTACGTGACCTTGTGACAAAGATAA
GCGCCTGGCTAATTATGCTAACTTGGAGGTATATAGCTGATG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4A678JQ 873 0 0
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TCAAAACAAATAAAGCAGCCAACAGCCACTGCTGATAAAAGAAATTAACATTTTTTTCTC
TTTTCTTTTCTTGCAGTATTTTCTTATGGTGGTGGTGGTTTATTATTCAATACTCTTGTG
GGGTTTTAGTTCTAAACTAAACTGAGAAAGACACTTTGTTTCTGAAAATCAATCACAGGG
TGTAGTGTTGCTGGATTGCCTCTATGTCAAGTCCCTTCTGCTTCACTACTGATTCCACGT
GACCTTTCAATGTATGATGCTCTCTTAAACTTGCGACTTCAGCCCGTCTCTTGGCCTGAT
CTGCTATCTCTGAAAGTTCTCTATAAGTGCTCTTGTCGTTGAACATATC*GAGGGCTGAG
CAGGTTGCAATCCGTGAAGGGTACGTTGAGCTTGTGCCCATTGTGCTTCCCTCTCTCCTT
TTCCATAGTCTTTCTTTGACGTGAAAGCGGTCTTGTTCTCAATGACATTATCCCAGGCTC
TACCACTTAGTGAATATCTGATGATGAACTTGAGTATATCCAATGGAACGTAAGTAACTA
TACTGTAGAGCCAGATCACTCCTGCCCATCCCCACCCAGTACCTCTGATTCTTGCAAAAT
CCCAGTTTGCATACACCGCAATGAGAGTAGCAATCAGCTGAGCTAAGAAAAAGGCAGCGA
TCAACCATAAGCCAGGACGTTCAGCATAAGACCAGCTACGTGACCTTGTGACAAAGATAA
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CACTGATAGATCTCACCCCAAACTTTGCCGAGA

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR4DP11TF 616 0 0
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TGTGACAAAGATAAGCGCCTGGCTAATTATGCTAACTTGGAGGTATATAGCTGATGTAAG
CTCATGCGGATTCCCACTGATAGATCTCACCCCAAACTTTGCCGAGAAGAAGTCAGTGCT
CTCTGTAGCCCAGAAGAAAACGACAGTCATGACTGCAAGGTATGTGCCAAGAACAACGCC
AGTGGCAAATATCTCTTTGAGTTTCCATGAATCAGGAAGTGGAGAAGGCTTTACTCTGTC
CTTTGATATGGTCATGATAGTACCATCATTCAGGATGGCTATGACCAACACCATGAATGG
TGAGAAGTCGAACTTCCATATGAGTGCAAGCAGCATAAAGCCCATCACTACACGGATTGT
GATTGAGACTGCGTAGATTGTGTAGTTCTTCATTCTCTGGAAGATGGATCTGCTCGTCAA
GACAGCACTTACTATGACACTGAGGCCTGGCTCGGTTAGTACAATGTCAGATGCACTTCT
CGCCGCATCGGTCGCGTCAGCAACAGCTATTCCGATGTCAGCTCTTTTAAGAGCTGGAGC
ATCGTTCACTCCATCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

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AAACAATGTTGGGTTTGATTCATGTCCTTGATGAGCTCTTCGTTAGTCTTATGCCACTGC
TTATCATTCACTAGCCAACACTCTGGTCTTGGTTCATCATCTCTCGGTTATAATCGCTTT
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GAGAAGGAGGAGGATAGTCACACGGGTAATAATAATAAGAGGAGGAGAAGAAGCTGGTGG
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AATAACGATGTTGGGGATGTGAGCAAGATTGTCTCCGAGAGTTTCCAACATTTTCCAGGA
GATGAAACGTCATTAAGTAGTAGTATCCACCATTAAAACCCTCCACTTGAGTTCTCTTCC
GTTGCTATGACACAAAAACATTCTTCAACTTTTTTTTAATTTCATATAGACACATAAGAT
AAACATAGGCTATTTTTGTCATTCATCTCGATTCTTTTTGGCTGAGTTGTCGGTGAAAGA
ATTGAGAGAACATTATGTGGGCTCTCTCGGCTTTGGGTTTATGCATACACAATAAACAAA
CCTACAAAAGAAACCCTTTTGGCTTTGGGTTTATGCATACTTGTGAAGTTGTAATCTTAT
CTTCAATATGGTAAGTTATCATATGTTGTGCTTATCTTTATAGTAGGAACATATATTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CA22TF U 1
AF RR4CQ36TF U 1
AF RR4CA22JQ C 79
AF RR4CQ36JQ C 158
BS 1 668 RR4CA22TF
BS 669 669 RR4CQ36TF
BS 670 694 RR4CA22TF
BS 695 698 RR4CQ36TF
BS 699 699 RR4CA22JQ
BS 700 720 RR4CQ36TF
BS 721 721 RR4CA22JQ
BS 722 773 RR4CQ36TF
BS 774 899 RR4CA22JQ

RD RR4CA22TF 694 0 0
GGGTGGCTTTATCTATCGTTTGGTCCTGGCATCTGCTTCTCTCTTTCGGGTTACAGTTGC
AAACAATGTTGGGTTTGATTCATGTCCTTGATGAGCTCTTCGTTAGTCTTATGCCACTGC
TTATCATTCACTAGCCAACACTCTGGTCTTGGTTCATCATCTCTCGGTTATAATCGCTTT
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GAGAAGGAGGAGGATAGTCACACGGGTAATAATAATAAGAGGAGGAGAAGAAGCTGGTGG
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GACGAGACAGCTGAGCTTGAGAAGGATGATGAGATGTCTGATGAAGAGAAATTCGAGACC
TGGAAGAGACGAGCAGAGGCCATTGTGGAGCTACGGGAAGGTCAGGAGGAGATTGCTGGT
AATAACGATGTTGGGGATGTGAGCAAGATTGTCTCCGAGAGTTTCCAACATTTTCCAGGA
GATGAAACGTCATTAAGTAGTAGTATCCACCATTAAAACCCTCCACTTGAGTTCTCTTCC
GTTGCTATGACACAAAAACATTCTTCAACTTTTTTTTAATTTCATATAGACACATAAGAT
AAACATAG*CTATTTTTGTCATTCATCTCGATTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4CQ36TF 773 0 0
GGGTGGCTTTATCTATCGTTTGGTCCTGGCATCTGCTTCTCTCTTTCGGGTTACAGTTGC
AAACAATGTTGGGTTTGATTCATGTCCTTGATGAGCTCTTCGTTAGTCTTATGCCACTGC
TTATCATTCACTAGCCAACACTCTGGTCTTGGTTCATCATCTCTCGGTTATAATCGCTTT
CAATCAATTTCGTTACGGGGTAAGAGAAGGAAGGGGCTTTGGAGACTCGTTCCCAGTGCG
GAGAAGGAGGAGGATAGTCACACGGGTAATAATAATAAGAGGAGGAGAAGAAGCTGGTGG
CAGAGGTTTTTCTTTGATGACGATGGGAACTGGCTTGGTCTGAGAGACGACGACATTGTT
GACGAGACAGCTGAGCTTGAGAAGGATGATGAGATGTCTGATGAAGAGAAATTCGAGACC
TGGAAGAGACGAGCAGAGGCCATTGTGGAGCTACGGGAAGGTCAGGAGGAGATTGCTGGT
AATAACGATGTTGGGGATGTGAGCAAGATTGTCTCCGAGAGTTTCCAACATTTTCCAGGA
GATGAAACGTCATTAAGTAGTAGTATCCACCATTAAAACCCTCCACTTGAGTTCTCTTCC
GTTGCTATGACACAAAAACATTCTTCAACTTTTTTTTAATTTCATATAGACACATAAGAT
AAACATAGGCTATTTTTGTCATTCATCTCGATTCTTTT*GGCTGAGTTGTCGGTGAAAGA
*TTGAGAGAACATTATGTGGGCTCTCTCGGCTTTGGGTTTATGCATACACAAT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4CA22JQ 821 0 0
TTCATGTCCTTGATGAGCTCTTCGTTAGTCTTATGCCACTGCTTATCATTCACTAGCCAA
CACTCTGGTCTTGGTTCATCATCTCTCGGTTATAATCGCTTTCAATCAATTTCGTTACGG
GGTAAGAGAAGGAAGGGGCTTTGGAGACTCGTTCCCAGTGCGGAGAAGGAGGAGGATAGT
CACACGGGTAATAATAATAAGAGGAGGAGAAGAAGCTGGTGGCAGAGGTTTTTCTTTGAT
GACGATGGGAACTGGCTTGGTCTGAGAGACGACGACATTGTTGACGAGACAGCTGAGCTT
GAGAAGGATGATGAGATGTCTGATGAAGAGAAATTCGAGACCTGGAAGAGACGAGCAGAG
GCCATTGTGGAGCTACGGGAAGGTCAGGAGGAGATTGCTGGTAATAACGATGTTGGGGAT
GTGAGCAAGATTGTCTCCGAGAGTTTCCAACATTTTCCAGGAGATGAAACGTCATTAAGT
AGTAGTATCCACCATTAAAACCCTCCACTTGAGTTCTCTTCCGTTGCTATGACACAAAAA
CATTCTTCAACTTTTTTTTAATTTCATATAGACACATAAGATAAACATAGGCTATTTTTG
TCATTCATCTCGATTCTTTTTGGCTGAGTTGTCGGTGAAAGAATTGAGAGAACATTATGT
GGGCTCTCTCGGCTTTGGGTTTATGCATACACAATAAACAAACCTACAAAAGAAACCCTT
TTGGCTTTGGGTTTATGCATACTTGTGAAGTTGTAATCTTATCTTCAATATGGTAAGTTA
TCATATGTTGTGCTTATCTTTATAGTAGGAACATATATTCC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4CQ36JQ 742 0 0
CATCTCTCGGTTATAATCGCTTTCAATCAATTTCGTTACGGGGTAAGAGAAGGAAGGGGC
TTTGGAGACTCGTTCCCAGTGCGGAGAAGGAGGAGGATAGTCACACGGGTAATAATAATA
AGAGGAGGAGAAGAAGCTGGTGGCAGAGGTTTTTCTTTGATGACGATGGGAACTGGCTTG
GTCTGAGAGACGACGACATTGTTGACGAGACAGCTGAGCTTGAGAAGGATGATGAGATGT
CTGATGAAGAGAAATTCGAGACCTGGAAGAGACGAGCAGAGGCCATTGTGGAGCTACGGG
AAGGTCAGGAGGAGATTGCTGGTAATAACGATGTTGGGGATGTGAGCAAGATTGTCTCCG
AGAGTTTCCAACATTTTCCAGGAGATGAAACGTCATTAAGTAGTAGTATCCACCATTAAA
ACCCTCCACTTGAGTTCTCTTCCGTTGCTATGACACAAAAACATTCTTCAACTTTTTTTT
AATTTCATATAGACACATAAGATAAACATAGGCTATTTTTGTCATTCATCTCGATTCTTT
TTGGCTGAGTTGTCGGTGAAAGAATTGAGAGAACATTATGTGGGCTCTCTCGGCTTTGGG
TTTATGCATACACAATAAACAAACCTACAAAAGAAACCCTTTTGGCTTTGGGTTTATGCA
TACTTGTGAAGTTGTAATCTTATCTTCAATATGGTAAGTTATCATATGTTGTGCTTATCT
TTATAGTAGGAACATATATTCC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 2 4

CO CL2985Contig1 876 2 4 U
GTGGAAAATGATACCATTTCCTAATAATGACTCGCATTTTGTCAAAGCCGTCACTGGTTT
TCTACAGTACGGTCTTCTCTTTTCTTCCGACCCACAAATGGATTTAGAATTTGAATATTG
GAGTAACCAAAAGTATTAAGGGTATGTAATCTTGCTTACAACTTGAAAAAAAAATCTTTT
TAGGATTCCCAGTTAGGAATATTAGTCGTAGCTTCGTTCACCATACTTACCAATGTCACC
ACGCTCTCAGGAACACCTTGGGGAGGCAATGTGAGATTTCTTGGGGGCGGTTTATCACCG
TAAGACCGTTTATCGAATCTCCATTCTCCAATCTTTCCATACATCATCTTTCCCTTCATG
TCGAAATCGCAACCGTAAGTGTAATGTATGATATACGTCTTCTTCGTTTCAGTGTCCCAA
GGAGGCTGAATCATGAAGTCTTCGTGTAAAATGTTGCTCACACCATGTAACGCCGACGAA
ACAGCATATGCATACATTTCAAGGACCCATCCAAAAGCTTTATCTGTTTGTGGGTCATTC
TTCATAGCTAAAGAAACGTTCATCCATGTTGGAGCAATTTTCATCAATGCATTCTTAAAG
ACGATCACTGGAGAGTTGCCAATGGGGTCGATTCTTGATATCATGCCATTCTCCTTTGGG
AAGAATTTACGGAGAACCAATTCGTATTTCTTCGGTTAAATATAGGAAAAGGGAAATGCA
GCCCCGCGATTGCCTCTAGCTAGGTTCGGTATTGGTTTAACTATGATATGATCAGGTTCC
GCCATAAGAATGTAATCTTCCTCTATGTGTGCTTGTTGAAGCCATTGCACAAACGCCCAA
GGCCTATTTAGAACTACATATCCCTGATCAACACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BS79JQ U 1
AF RR4BV12JQ U 100
BS 1 472 RR4BS79JQ
BS 473 473 RR4BV12JQ
BS 474 597 RR4BS79JQ
BS 598 876 RR4BV12JQ

RD RR4BS79JQ 599 0 0
GTGGAAAATGATACCATTTCCTAATAATGACTCGCATTTTGTCAAAGCCGTCACTGGTTT
TCTACAGTACGGTCTTCTCTTTTCTTCCGACCCACAAATGGATTTAGAATTTGAATATTG
GAGTAACCAAAAGTATTAAGGGTATGTAATCTTGCTTACAACTTGAAAAAAAAATCTTTT
TAGGATTCCCAGTTAGGAATATTAGTCGTAGCTTCGTTCACCATACTTACCAATGTCACC
ACGCTCTCAGGAACACCTTGGGGAGGCAATGTGAGATTTCTTGGGGGCGGTTTATCACCG
TAAGACCGTTTATCGAATCTCCATTCTCCAATCTTTCCATACATCATCTTTCCCTTCATG
TCGAAATCGCAACCGTAAGTGTAATGTATGATATACGTCTTCTTCGTTTCAGTGTCCCAA
GGAGGCTGAATCATGAAGTCTTCGTGTAAAATGTTGCTCACACCATGTAACGTCGACGAA
ACAGCATATGCATACATTTCAAGGACCCATCCAAAAGCTTTATCTGTTTGTGGGTCATTC
TTCATAGCTAAAGAAACGTTCATCCATGTTGGAGCAATTTTCATCAATGCATTCTTA
GA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4BV12JQ 777 0 0
GGATTTAGAATTTGAATATTGGAGTAACCAAAAGTATTAAGGGTATGTAATCTTGCTTAC
AACTTGAAAAAAAAATCTTTTTAGGATTCCCAGTTAGGAATATTAGTCGTAGCTTCGTTC
ACCATACTTACCAATGTCACCACGCTCTCAGGAACACCTTGGGGAGGCAATGTGAGATTT
CTTGGGGGCGGTTTATCACCGTAAGACCGTTTATCGAATCTCCATTCTCCAATCTTTCCA
TACATCATCTTTCCCTTCATGTCGAAATCGCGACCGTAAGTGTAATGTATGATATACGTC
TTCTTCGTTTCAGTGTCCCAAGGAGGCTGAATCATGAAGTCTTTGTGTAGAATGTTGCTC
ACACCATGTAACGCCGACGAAACAGCATATGCATACATTTCAAGGACCCATCCAAAAGCT
TTATCTGTTTGTGGGTCATTCTTCATAGCTAAAGAAACGTTCATCCATGTTGGAGCAATT
TTCATCAATGCATTCTTAAAGACGATCACTGGAGAGTTGCCAATGGGGTCGATTCTTGAT
ATCATGCCATTCTCCTTTGGGAAGAATTTACGGAGAACCAATTCGTATTTCTTCGGTTAA
ATATAGGAAAAGGGAAATGCAGCCCCGCGATTGCCTCTAGCTAGGTTCGGTATTGGTTTA
ACTATGATATGATCAGGTTCCGCCATAAGAATGTAATCTTCCTCTATGTGTGCTTGTTGA
AGCCATTGCACAAACGCCCAAGGCCTATTTAGAACTACATATCCCTGATCAACACCA

QA 1 777 1 777
DS 



CO CL2985Contig2 724 2 10 U
GGGGACTAATCCTTCTTTCTTTTGGTCTAATTCTTCTTCCTTCTTGGCTCACAGACATAC
ATACAAATCAAACACATAATAAGCACATGAACAAATTTTTAACATATAGAAAAAGGATTT
CAAAAATGGGTTTTCGTGGGAAACTCTTCTTCCCAATGCTCATGACTCTATCTTTGTTTC
TAATAATCAGGTACAACTACATAGTCTCCGGTGATCCTCCTCTCCGGCAAGATCTTCCAG
GACGCCGGTCATTTTCTTCCAAAGATGACGTCATATCTTCCGTCAAGACTCCGTCAAAGA
AGACTAAGAGACTTTTTCACACGGCGGTGACAGCCACTGACTCTGTGTATAGCACATGGC
AGTGTCGGATCATGTACTATTGGTACAACAGGTTCAAGGACGAACCTGGTTCGGAGATGG
GGGGGTATACCCGAATCTTGCATTCTGGTCGACCCGATGGGCTCATGGATGAGATCCCTA
CCTTTATTGCACACCCTCTTCCCTCTGGTGTTGATCAGGGATATGTAGTTCTAAATAGGC
CTTGGGCGTTTGTGCAATGGCTTCAACAAGCACACATAGAGGAAGATTACATTCTTATGG
CAGAACCTGATCATATCATAGTTAAACCAATACCGAACCTAGCTAGAGGCAATCGCGGGG
CTGCATTTCCCTTTTCCTATATTGAACCGAAGAATACGAATTGGTTCTCCGCAAATTCTT
CCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4BV12TF U 1
AF RR4BS79TF U 6
BS 1 143 RR4BV12TF
BS 144 144 RR4BS79TF
BS 145 185 RR4BV12TF
BS 186 186 RR4BS79TF
BS 187 233 RR4BV12TF
BS 234 234 RR4BS79TF
BS 235 601 RR4BV12TF
BS 602 602 RR4BS79TF
BS 603 666 RR4BV12TF
BS 667 724 RR4BS79TF

RD RR4BV12TF 666 0 0
GGGGACTAATCCTTCTTTCTTTTGGTCTAATTCTTCTTCCTTCTTGGCTCACAGACATAC
ATACAAATCAAACACATAATAAGCACATGAACAAATTTTTAACATATAGAAAAAGGATTT
CAAAAATGGGTTTTCGTGGGAAATTCTTCTTCCCAATGCTCATGACTCTATCTTTGTTTC
TAATAGTCAGGTACAACTACATAGTCTCCGGTGATCCTCCTCTCCGGCAAGAT*TTCCAG
GACGCCGGTCATTTTCTTCCAAAGATGACGTCATATCTTCCGTCAAGACTCCGTCAAAGA
AGACTAAGAGACTTTTTCACACGGCGGTGACAGCCACTGACTCTGTGTATAGCACATGGC
AGTGTCGGATCATGTACTATTGGTACAACAGGTTCAAGGACGAACCTGGTTCGGAGATGG
GGGGGTATACCCGAATCTTGCATTCTGGTCGACCCGATGGGCTCATGGATGAGATCCCTA
CCTTTATTGCACACCCTCTTCCCTCTGGTGTTGATCAGGGATATGTAGTTCTAAATAGGC
CTTGGGCGTTTGTGCAATGGCTTCAACAAGCACACATAGAGGAAGATTACATTCTTATGG
CGGAACCTGATCATATCATAGTTAAACCAATACCGAACCTAGCTAGAGGCAATCGCGGGG
CTGCAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4BS79TF 719 0 0
GG
AATCCTTCTTTCTTTTGGTCTAATTCTTCTTCCTTCTTGGCTCACAGACATACATACAAA
TCAAACACATAATAAGCACATGAACAAATTTTTAACATATAGAAAAAGGATTTCAAAAAT
GGGTTTTCGTGGGAAACTCTTCTTCCCAATGCTCATGACTCTATCTTTGTTTCTAATAAT
CAGGTACAACTACATAGTCTCCGGTGATCCTCCTCTCCGGCAAGATCTTCCAGGACGCCG
GTCATTTTCTTCCAAAGATGACGTCATATCTTCCGTCAAGACTCCGTCAAAGAAGACTAA
GAGACTTTTTCACACGGCGGTGACAGCCACTGACTCTGTGTATAGCACATGGCAGTGTCG
GATCATGTACTATTGGTACAACAGGTTCAAGGACGAACCTGGTTCGGAGATGGGGGGGTA
TACCCGAATCTTGCATTCTGGTCGACCCGATGGGCTCATGGATGAGATCCCTACCTTTAT
TGCACACCCTCTTCCCTCTGGTGTTGATCAGGGATATGTAGTTCTAAATAGGCCTTGGGC
GTTTGTGCAATGGCTTCAACAAGCACACATAGAGGAAGATTACATTCTTATGGCAGAACC
TGATCATATCATAGTTAAACCAATACTGAACCTAGCTAGAGGCAATCGCGGGGCTGCATT
TCCCTTTTCCTATATTGAACCGAAGAATACGAATTGGTTCTCCGCAAATTCTTCCCA

QA 3 719 3 719
DS 



AS 1 4

CO CL2986Contig1 967 4 13 U
GGATCCACTTCAGTTCTGTATTCTATAATCATCAAACCTTTAGTGATGATGGCAGCTCCC
GTAGTGTTTTCGTTGAGAATTTCATCTACTCCTAATCATGGGATCAATCGAAATTTTCAA
CCTTTTCTCCTAACCCAAACAGGAGCTCCTCCTAGATATCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCA
AACTCTGAATCTTCCGAACCCAAGGAGAAATTGGTGGTAGATAATGGCTCTACTAGTGAA
ATTTCACCTGCGTCGAAAGTAGCGGAACCATCACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCGGCG
TTCCTGAGTCTCCAAACAGTGATATTAACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCG
CTTTGGCCTTGTTTCTATCAACGAGGCTCGATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTG
CTTCAGCCTTGCCTTACGAGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGTCGACAGTGGTTGAGTTCT
ATGCTGATTGGTGTGAGGTTTGTCGAGAACTTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGC
AATACAAGGACAAAGTGAACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAG
AGCTGGATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGA
ACGAGGAAGGTAACGTGGTCGGAAGGCTCCCGAGGCAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATG
CCCTTGCAGCCGGAAAGCAATCAATTCCTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCG
CCGAAGCACGCAAGGTTCATCAGGTTACTGACCCCTTAAGCCATGGATAGAAAGAGAGAG
AGACATCACAACTCTATAGTGCACAAAAAAGATAGACAGTAAGGGGAACAACTGAAAATT
AGCAATGTTTCATATTTGTAACTAAATGTTCGGTTTCGTTTTATTACATGACTTATAAAA
ACTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ31TF U 1
AF RR4CD03TF U 62
AF RR4CD03JQ C 453
AF RR4EQ31JQ C 308
BS 1 294 RR4EQ31TF
BS 295 295 RR4CD03TF
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BS 334 711 RR4CD03TF
BS 712 712 RR4EQ31JQ
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BS 854 854 RR4CD03JQ
BS 855 967 RR4EQ31JQ

RD RR4EQ31TF 333 0 0
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GTAGTGTTTTCGTTGAGAATTTCATCTACTCCTAATCATGGGATCAATCGAAATTTTCAA
CCTTTTCTCCTAACCCAAACAGGAGCTCCTCCTAGATATCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCA
AACTCTGAATCTTCCGAACCCAAGGAGAAATTGGTGGTAGATAATGGCTCTACTAGTGAA
ATTTCACCTGCGTCGAAAGTAGCGGAACCATCACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCG
TTCCTGAGTCTCCAAACAGTG*TATTAACAGAA

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR4CD03TF 738 0 0
G
AGTGTTTTCGTTGAGAATTTCATCTACTCCTAATCATGGGATCAATCGAAATTTTCAACC
TTTTCTCCTAACCCAAACAGGAGCTCCTCCTAGATATCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCAAA
CTCTGAATCTTCCGAACCCAAGGAGAAATTGGTGGTAGATAATGGCTCTACTAGTGAAAT
TTCACCTGCGTCGAAAGTAGCGGAACCATCACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCGT**TT
CCTGAGTCTCCAAACAGTGATATTAACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCGCT
TTGGCCTTGTTTCTATCAACGAGGCTCGATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTGCT
TCAGCCTTGCCTTACGAGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGTCGACAGTGGTTGAGTTCTAT
GCTGATTGGTGTGAGGTTTGTCGAGAACTTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGCAA
TACAAGGACAAAGTGAACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAG
CTGGATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAAC
GAGGAAGGTAACGTGGTCGGAAGGCTCCCGAGGCAGTATCTAGTTGAGA*TGTCAATGCC
CTTGCAGCCGGAAAGCAATCAATTCCTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCC
GAAGCACGCAAG
TTCAT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4CD03JQ 498 0 0
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GCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGCAATACAAGGACAAAGTGAACTTTGTGATGCTA
AATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTCCT
CATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGAAGGTAACGTGGTCGGAAGGCTCCCG
AGGCAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGCAGCCGGAAAGCAATCAATTCCTCAT
GCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAAGCACGCAAGGTTCATCAGGTTACTGAC
CCCTTAAGCCATGGATAGAAAGAGAGAGAGACATCACAACTCTATAGTGCACAAAAAAGA
TAGACAGTAAGGGGGACAACTGAAAATTAGCAATGTTTCATATTTGTAACTAAATGTTCG
GTTTCGTTTTATTACATG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4EQ31JQ 660 0 0
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CTTGTTTCTATCGACGAGGCTCGATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTGCTTCAGC
CTTGCCTTACGAGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGCCGACAGTGGTTGAGTTCTATGCTGA
TTGGTGTGAGGTTTGTCGAGAACTTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGCAATACAA
GGACAAAGTGAACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGA
TGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGA
AGGTAACGTGGTCGGAAGGCTCCCGAGGCAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGC
AGCCGGAAAGCAATCAATTCCTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAAGC
ACGCAAGGTTCATCAGGTTACTGACCCCTTAAGCCATGGATAGAAAGAGAGAGAGACATC
ACAACTTTATAGTGCACAAAAAAGATAGACAGTAAGGGGAACAACTGAAAATTAGCAATG
TTTCATATTTGTAACTAAATGTTCGGTTTCGTTTTATTACATGACTTATAAAAACTCTAC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

CO CL2987Contig1 868 3 26 U
GGAGGTAATAACACATGATATACGAGCAAAGATAGGACTCTTTTTTTAAGAGACTTAAGT
TTCATGAGAAAACCAAGAGCAGCAATTTTCATTTTGATTCATAGAAACCCAACATGATCA
CATCACATCAACATCCAAAGAAGAAGCTGATCAAATGCAGACAAGATAGAAAACCCAAAT
TACTTAATAAAAAGAAAAGGGTTGCTAATTTTTTTTTCATATCCTTTCGACTTTATCCGC
CTTGATCACAGGATTGGCCTTTGAGATTGCATCACGTCCAACTTCTTTGAAATCGAAGCT
ACACTCGTGCTTCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGTGCTGCCGCATTTGCACTT
AAACCCCATAACCCCAACCTTCTTGTTACAGCTGAAACACCTGTTTGTCCGTGCAGGTTT
CGACGACTCTACCTCCTCCTGTCCCGTGGCTACAGGAACTGAAGACG***GCTCAGTCGA
TAAAACAACAGAGACTGGTTTGGTTTCAAGAGGCTGCTTTTGCTCTGGTGTGATAATGAG
ACTGCAAGATGGAAGCTTAAGTGAGTTCTTGACAGCAGCTTTTGCTACAGCGGTTTGATC
TTCCTCGGCTCGGAGACTTCTGTAACATTTGGAACAGAGGTTCATGTTGGAAGGTGACCC
GAAGAAACCGCATCCGTTGTCGCAGAGCTTTGGCTCAGTTGGTGGGAAGCTTGTGCTGTT
GTTTTGCTCAGAGCTCATTGTTGTTCCTTTTTTTCTTCTCAAATCAGAAACGTGCAGAAC
AATTGAAATTTGTTCCTCTAATCTCAAAGTTTCTTCAACGAAATTTCAGAAAATAAAATA
TTCAGATCTTTCGAAGAAGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI90JQ U 1
AF RR4F656JQ U 77
AF RR4F656TF C 237
BS 1 116 RR4FI90JQ
BS 117 117 RR4F656JQ
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BS 174 256 RR4FI90JQ
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RD RR4FI90JQ 686 0 0
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TACTTAATAAAAAGAAAAGGGTTGCTAATTTTTTTTTCATATCCTTTCGACTTTATCCGC
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ACACTCGTGCTTCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGTGCTGCCGCATTTGCACTT
AAACCCCATAACCCCAACCTTCTTGTTACAGTTGAAACACTTATTCGTCCGTGCAGGTTT
CGACGGCTCTACCTCCTCCTGTCCCGTGGCTACAGGAACTGAAGACGACGGCTAAGTCGT
TAAAACAACAGAGACTGGTTTGGTTTCAAGAGGCTGCTTTTGCTCTGGTGTGATAATGAG
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TTCCTCGGCTCGGAGACTTCTGTAACATTTGGAACAGAGGTTCATGTTGGACGGTGACCC
GAAGAAACCGCATCCGTTGTCGC
AGA

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DS 

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GC
GCAGCAATTTTCATTTTGATTCATAGAAACCCAACATGATCACATCACATCAACATCCAA
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GGTTTGCTAATTTTTTTTTCATATCCTTTCGACTTTATCCGCCTTGATCACAGGATTGGC
CTTTGAGATTGCATCACGTCCAACTTCTTTGAAATCGAAGCTACACTCGTGCTTCTCCGG
GTACCTATGGCTCCCGCAAAACGTGCTGCCGCATTTGCACTTAAACCCCATAACCCCAAC
CTTCTTGTTACAGCTGAAACACCTGTTTGTCCGTGCAGGTTTCGACGACTCTACCTCCTC
CTGTCCCGTGGCTACAGGAACTGAAGACG***GCTCAGTCGATAAAACAACAGAAACTGG
TTTGGTTTCAAGAGGCTGCTTTTGCTCTGGTGTGATAATGAGACTGCAAGATGGAAGCTT
AAGTGAGTTCTTGACAGCAGCTTTTGCTACAGCGGTTTGATCTTCCTCGGCTCGGAGACT
TCTGTAACATTTGGAACAGAGGTTCATGTTGGAAGGTGACCCGAAGAAACCGCATCCGTT
GTCGC

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR4F656TF 632 0 0
TCCG
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ACACTCGTGCTTCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGTGCTGCCGCATTTGCACTT
AAACCCCATAACCCCAACCTTCTTGTTACAGCTGAAACACCTGTTTGTCCGTGCAGGTTT
CGACGACTCTACCTCCTCCTGTCCCGTGGCTACAGGAACTGAAGACG***GCTCAGTCGA
TAAAACAACAGAGACTGGTTTGGTTTCAAGAGGCTGCTTTTGCTCTGGTGTGATAATGAG
ACTGCAAGATGGAAGCTTAAGTGAGTTCTTGACAGCAGCTTTTGCTACAGCGGTTTGATC
TTCCTCGGCTCGGAGACTTCTGTAACATTTGGAACAGAGGTTCATGTTGGAAGGTGACCC
GAAGAAACCGCATCCGTTGTCGCAGAGCTTTGGCTCAGTTGGTGGGAAGCTTGTGCTGTT
GTTTTGCTCAGAGCTCATTGTTGTTCCTTTTTTTCTTCTCAAATCAGAAACGTGCAGAAC
AATTGAAATTTGTTCCTCTAATCTCAAAGTTTCTTCAACGAAATTTCAGAAAATAAAATA
TTCAGATCTTTCGAAGAAGAAAAAAAAA

QA 5 632 5 632
DS 



AS 1 4

CO CL2988Contig1 941 4 3 U
GGACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGATTCAGACACAAAAA
ATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCACCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAGGAC
ATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCACGAAAC
CTTTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAGACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTT
GAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTCGCTCGC
CATCTGTACTCGCCCGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAAC
GTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAA
GGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTG
ATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAG
TCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCAATGGAGCTGGCTTTGTCT
TTGGAGAAGCTGGTCAATGAGAAGCTCCTTAACGTGCATAGTGTGGCTTCGAAGAACGAT
GATGTCCAGTTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTTGAAGCGATT
AAGAAAATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCAAGGGACATGGAACATGG
CATTTCGATCAAGAGCTTCTGGAAGCTGCTGCTGCTTAATCTCTTCTTATAAACTGATGC
TGCTTAATCTGTTTTGGTTGTAATCTCTCTTATAAACTCTTGTTCCCTGATCTATTTTGG
TTCTGGACTATTGAGCAGAGTTAGTTTTGTTTGGACCTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A048TF U 1
AF RR4A048TFB U 1
AF RR4A048JQ C 194
AF RR4A048JQD C 227
BS 1 706 RR4A048TF
BS 707 751 RR4A048TFB
BS 752 941 RR4A048JQ

RD RR4A048TF 706 0 0
GGACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGATTCAGACACAAAAA
ATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCACCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAGGAC
ATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCACGAAAC
CTTTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAGACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTT
GAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTCGCTCGC
CATCTGTACTCGCCCGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAAC
GTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAA
GGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTG
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TCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCAATGGAGCTGGCTTTGTCT
TTGGAGAAGCTGGTCAATGAGAAGCTCCTTAACGTGCATAGTGTGGCTTCGAAGAACGAT
GATGTCCAGTTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAAC

QA 1 706 1 706
DS 

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ATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCACCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAGGAC
ATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCACGAAAC
CTTTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAGACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTT
GAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTCGCTCGC
CATCTGTACTCGCCCGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAAC
GTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAA
GGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTG
ATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAG
TCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCAATGGAGCTGGCTTTGTCT
TTGGAGAAGCTGGTCAATGAGAAGCTCCTTAACGTGCATAGTGTGGCTTCGAAGAACGAT
GATGTCCAGTTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTTGAAGCGATT
AAGAAAATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4A048JQ 748 0 0
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AGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTCGCTCGCCATCTGTACTCGC
CCGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAACGTGTCGTATGTGT
ATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGCCTTGCCAAGT
TTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGA
ACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGATC
ACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCAATGGAGCTGGCTTTGTCTTTGGAGAAGCTGG
TCAATGAGAAGCTCCTTAACGTGCATAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGTCCAGTTGG
CAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTTGAAGCGATTAAGAAAATCTCTG
AATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCAAGGGACATGGAACATGGCATTTCGATCAAG
AGCTTCTGGAAGCTGCTGCTGCTTAATCTCTTCTTATAAACTGATGCTGCTTAATCTGTT
TTGGTTGTAATCTCTCTTATAAACTCTTGTTCCCTGATCTATTTTGGTTCTGGACTATTG
AGCAGAGTTAGTTTTGTTTGGACCTCTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4A048JQD 715 0 0
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TCTCGCTCGCTCGCCATCTGTACTCGCCCGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCA
ATGTGGAGTACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATA
ACGTTGCTCTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACC
ACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTA
TGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCAATGG
AGCTGGCTTTGTCTTTGGAGAAGCTGGTCAATGAGAAGCTCCTTAACGTGCATAGTGTGG
CTTCGAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAAC
AGGTTGAAGCGATTAAGAAAATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCAAGG
GACATGGAACATGGCATTTCGATCAAGAGCTTCTGGAAGCTGCTGCTGCTTAATCTCTTC
TTATAAACTGATGCTGCTTAATCTGTTTTGGTTGTAATCTCTCTTATAAACTCTTGTTCC
CTGATCTATTTTGGTTCTGGACTATTGAGCAGAGTTAGTTTTGTTTGGACCTCTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

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CATAATATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGTGGAAACGTGTT
CTCGGGTCAATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAATAACAAGAAGATGCTAAACAG
AACTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCG
ACCAGATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCA
TCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTCTACAGTTTCAAACAATCAACGAATCTTA
CGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGGAGGAATATGAGCCATT
CGATGTGTATGAAGACAGATTCAACGGAATGAATGATACAGATTGTGACACGTGGGAGGA
ATGGATGGGGGTGGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCACGTCAACCCTTAT
GCTTGAAGAACAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAAT
GAACGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTCGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCT
CCAATCATGTGAATCAGTCAATAATTACCATTACTTTTAAGACTGTCAATGTCAAGTTCT
ATGATTTTGTTAAACCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH92TF U 1
AF RR4GL64JQ C 3
AF RR4GL64TF U 3
BS 1 314 RR4DH92TF
BS 315 316 RR4GL64TF
BS 317 355 RR4DH92TF
BS 356 356 RR4GL64TF
BS 357 436 RR4DH92TF
BS 437 437 RR4GL64TF
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BS 491 683 RR4GL64TF
BS 684 684 RR4GL64JQ
BS 685 699 RR4GL64TF
BS 700 700 RR4GL64JQ
BS 701 714 RR4GL64TF
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BS 716 744 RR4GL64TF

RD RR4DH92TF 491 0 0
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CATAATATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGTGGAAACGTGTT
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AACTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCG
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ATGGATGGGG
G

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DS 

RD RR4GL64JQ 735 0 0
GG
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ATATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGTGGAAACGTGTTCTCG
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GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
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TTTT
TGTTAAACC

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4GL64TF 742 0 0
GG
ATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCCCAAAAAGATTGTTTCCTTCTGTAAATCATA
ATATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGTGGAAACGTGTTCTCG
GGTCAATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAATAACAAGAAGATGCTAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTCTACAGTTTCAAACAATCAACGAATCTTACGAT
ATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCGAT
GTGTATGAAGACAGATTCAACGGAATGAATGATACAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGGTGGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCACGTCAACCCTTATGCTT
GAAGAACAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAAC
GATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTCGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TCATGTGAATCAGTCAATA*TTACCATTACTTTTA*GACTGTCAATGTCA*GTTCTATGA
TTTTGTTAAACCAAAAAAAA

QA 3 742 3 742
DS 



AS 1 4

CO CL2990Contig1 932 4 12 U
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CATCAGAGACTCTGTCTTTTCTTATTCACATACATCCTTCACCATCTCATTTCATCGATC
CCTCTCTCTCTCTCTCTCT**GAAGCAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAACTCCGACAACC
AGAGAATTTATGCTCTCCCATTGCACCACCGCAAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTCTCTCC
TCCTCCTCCTCCTTCACTTTTGGCTCTTGCAAGGAATCCTGGTACTTCCGTTGCATCGGT
GTCGACCCTTGAAGCAACCCAAACTCCCATCAAAAGTCTTATTTTCTTTTTTTTGGCGTT
TATTGTTAAAGATGTTGCTGTACAACAACAACAACAAGCAGAAGAAAACACACAAGTCCA
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TTGTTCTGTCTAAGAAGTTAGAAGCACAAAATCTTGGAGGTTCTGTGGACACATCAACAA
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TCACACTAATAAATGGATTTGAGGTTTGATAG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM69TF U 3
AF RR4F928TF U 1
AF RR4FD03TF U 4
AF RR4GM69JQ C 233
BS 1 544 RR4F928TF
BS 545 545 RR4GM69TF
BS 546 690 RR4F928TF
BS 691 691 RR4FD03TF
BS 692 736 RR4F928TF
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BS 738 752 RR4FD03TF
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BS 763 763 RR4GM69JQ
BS 764 786 RR4FD03TF
BS 787 932 RR4GM69JQ

RD RR4GM69TF 712 0 0
G
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CTCTCTCTCTCTCTCT**GAAGCAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAACTCCGACAACCAGA
GAATTTATGCTCTCCCATTGCACCACCGCAAGGGCGAGCTCTCTCCTCCCTCTCTCCTCC
TCCTCCTCCTTCACTTTTGGCTCTTGCAAGGAATCCTGGTACTTCCGTTGCATCGGTGTC
GACCCTTGAAGCAACCCAAACTCCCATCAAAAGTCTTATTTTCTTTTTTTTGGCGTTTAT
TGTTAAAGATGTTGCTGTACAACAACAACAACAAGCAGAAGAAAACACACAAGTCCAAGA
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TCAAAGAAGATGAAACTGTTTCAAATGTCATTGACTATGCTCTCAAATGCTATGCTCGTG
AAGGCAGGCTTCCACTACTCGGTTCTGATTCTAGCTTTTTCCTCCTCTACTCTCCTTACT
ATGCAGTTGAAGCATTCAATCCATGGGGAAAGATTGGTTCAACCGGGTCCAGGAACTTTG
TTCTGTCTAAGAAGTTAGAAGCACAAA*TCTTGGAGGTTCTGTGGACACAT

QA 2 712 2 712
DS 

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CATCAGAGACTCTGTCTTTTCTTATTCACATACATCCTTCACCATCTCATTTCATCGATC
CCTCTCTCTCTCTCTCTCT**GAAGCAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAACTCCGACAACC
AGAGAATTTATGCTCTCCCATTGCACCACCGCAAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTCTCTCC
TCCTCCTCCTCCTTCACTTTTGGCTCTTGCAAGGAATCCTGGTACTTCCGTTGCATCGGT
GTCGACCCTTGAAGCAACCCAAACTCCCATCAAAAGTCTTATTTTCTTTTTTTTGGCGTT
TATTGTTAAAGATGTTGCTGTACAACAACAACAACAAGCAGAAGAAAACACACAAGTCCA
AGATTAACAGGTTCCTCGTTAGCATCAGTTTCTTAGGAAGTGCTGGACCCATTCGTTTTG
TTGTCAAAGAAGATGAAACTGTTTCAAATGTCATTGACTATGCTCTCAAATGCTATGCTC
GTGAGGGCAGGCTTCCACTACTCGGTTCTGATTCTAGCTTTTTCCTCCTCTACTCTCCTT
ACTATGCAGTTGAAGCATTCAATCCATGGGGAAAGATTGGTTCAACCGGGTCCAGGAACT
TTGTTCTGTCTAAGAAGTTAGAAGCACAAA*TCTTGGAGGTTCTGTGGACACATCAACAA
CAACAATCAGGA*GAC
CTCTGGG

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DS 

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CAGAGACTCTGTCTTTTCTTATTCACATACATCCTTCACCATCTCATTTCATCGATCCCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAGCAGCGTCTTGAATGGTAGAAACAACTCCGACAACCAGA
GAATTTATGCTCTCCCATTGCACCACCGCAAGGGCGAGCTTTCTCCTCCCTCTCTCCTCC
TCCTCCTCCTTCACTTTTGGCTCTTGCAAGGAATCCTGGTACTTCCGTTGCATCGGTGTC
GACCCTTGAAGCAACCCAAACTCCCATCAAAAGTCTTATTTTCTTTTTTTTGGCGTTTAT
TGTTAAAGATGTTGCTGTACAACAACAACAACAAGCAGAAGAAAACACACAAGTCCAAGA
TTAACAGGTTCCTCGTTAGCATCAGTTTCTTAGGAAGTGCTGGACCCATTCGTTTTGTTG
TCAAAGAAGATGAAACTGTTTCAAATGTCATTGACTATGCTCTCAAATGCTATGCTCGTG
AAGGCAGGCTTCCACTACTCGGTTCTGATTCTAGCTTTTTCCTCCTCTACTCTCCTTACT
ATGCAGTTGAAGCATTCAATCCATGGGGAAAGATTGGTTCAACCGGGTCCAGGAACTTTG
TTCTGTCTAAGAAGTTAGAAGCACAAAATCTTGGAG*TTCTGTGGACACATCAACAACAA
CAATCAGAA*GAC*TCTGGGAAATGGAAG*CATGGCTCA*CAAGTCTCTAGGACTTATGG
TTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4GM69JQ 700 0 0
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GCATCGGTGTCGACCCTTGAAGCAACCCAAACTCCCATCAAAAGTCTTATTTTCTTTTTT
TTGGCGTTTATTGTTAAAGATGTTGCTGTACAACAACAACAACAAGCAGAAGAAAACACA
CAAGTCCAAGATTAACAGGTTCCTCGTTAGCATCAGTTTCTTAGGAAGTGCTGGACCCAT
TCGTTTTGTTGTCAAAGAAGATGAAACTGTTTCAAATGTCATTGACTATGCTCTCAAATG
CTATGCTCGTGAAGGCAGGCTTCCACTACTCGGTTCTGATTCTAGCTTTTTCCTCCTCTA
CTCTCCTTACTATGCAGTTGAAGCATTCAATCCATGGGGAAAGATTGGTTCAACCGGGTC
CAGGAACTTTGTTCTGTCTAAGAAGTTAGAAGCACAAAATCTTGGAGGTTCTGTGGACAC
ATCAACAACAACAATCAGGAAGACCTCTGGGAAATGGAAGGCATGGCTCAACAAGTCTCT
AGGACTTATGGTTCCTTCTCATTAGATCATGTTTTTTGGGGTTTCTACGTACACTTCTCT
TTTTGGTTTTCTTGTCAAGAGGAATAAGCTTTACAAACACTTGTGCTTCAGCTTTTTGTT
GTATTTTGTCACACTAATAAATGGATTTGAGGTTTGATAG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

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ATCCCCCAGCGCCGCCTAACTTCTTCTTGGCTCAGATCTGTTGCTCTCCGGTGACTGACG
CTCTTTGTCGGTACCGGAGGGGCACCCTTGTTTCTCTTTCATTTGTATTACTTATTTAGG
AACAAATTTTGCCAAACTGGAGTGTCGATTGTAGACATGTTTGCTCTCCGAGGCTCACTG
CTCTAGAGATCTCCTGTTCGCCTGAGGCGGTATGAGGTTTCGACGGTGTGTGTTTCGTTG
AAGAGCGGCGAAGTCGCGGTGGAGTCTTCGCAGATCTATGTCCTTGCTTCCAGTTTCTCG
GGGATTATAGTATTTAAGTCTGTTGGAATCTAAATCTAGTTGTGCAGGTTCGAGTGTGGT
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CTTCCCTGCTTGGTCTTCCTTTCCTGCTGGTTAGTGTAGTTTAGCTCTGTTGGTGGTTCC
CTCGCGGTTTGATAGATGTGCTTATCCTTGGTTCATTTGCGACGGCTGTTGTCCTTCTCG
GTTCGTGGATTCTCCGGCTCGCTCTAAGGATTTGGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTTCT
TGTGGAGGTTTGTAAGTTAAAGATAGTCTTCTTCCTCCTGGGTTTGTTCTCTGTTGTTAC
TCGTGGCTCACGGTATGTTCCGGAGCAGTACAGAGTTTCAGAGGCTCCCCTCTAATAAGG
TCATCTGTAGGTGTGCGCGTATCTCTTCTATCCTTCCTCGGTGGACCAGCTTGCTTGGGT
TTCTTTTTAATTTGATTTTAGGTTCCAACAGTCTTTGCTTTCATCCATTAGTGTTTATAG
CTTATGTTTGGCTCCAAAGAATTCTTGAATTCTGTTGGCTTTTGACTCCAGAGGACATGT
TTGTTCCTGCTGGCTCAGTTTCCTAATCATGTATCCCAAGTTTGTATCTCAAACTTTGTA
TCTTTCTATTGTTAATGGAAGTTCCAGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4B158TF U 1
AF RR4D529TF U 42
AF RR4B158JQ C 182
AF RR4D529JQ C 465
BS 1 184 RR4B158TF
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BS 186 593 RR4B158TF
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BS 595 763 RR4B158TF
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RD RR4B158TF 777 0 0
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ATCCCCCAGCGCCGCCTAACTTCTTCTTGGCTCAGATCTGTTGCTCTCCGGTGACTGACG
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AACAGATTTTGCCAAACTGGAGTGTCGATTGTAGACATGTTTGCTCTCCGAGGCTCACTG
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AAGAGCGGCGAAGTCGCGGTGGAGTCTTCGCAGATCTATGTCCTTGCTTCCAGTTTCTCG
GGGATTATAGTATTTAAGTCTGTTGGAATCTAAATCTAGTTGTGCAGGTTCGAGTGTGGT
GTTGTGGAAGCTGTCTGAGTTGGCTCTTGCTGTGTCTGGCCTGTTCTGGTATGGTTCTCC
CTTCCCTGCTTGGTCTTCCTTTCCTGCTGGTTAGTGTAGTTTAGCTCTGTTGGTGGTTCC
CTCGCGGTTTGATAGATGTGCTTATCCTTGGTTCATTTGCGACGGCTGTTGTCTTTCTCG
GTTCGTGGATTCTCCGGCTCGCTCTAAGGATTTGGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTTCT
TGTGGAGGTTTGTAAGTTAAAGATAGTCTTCTTCCTCCTGGGTTTGTTCTCTGTTGTTAC
TCGTGGCTCACGGTATGTTCCGGAGCAGTACAGAGTTTCAGAG
GCTCCCCTCTAATA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4D529TF 729 0 0
GG
AACCCTACTTTTCTCTCATCCCCCAGCGCCGCCTAACTTCTTCTTGGCTCAGATCTGTTG
CTCTCCGGTGACTGACGCTCTTTGTCGGTACCGGAGGGGCACCCTTGTTTCTCTTTCATT
TGTATTACTTATTTAGGAACAAATTTTGCCAAACTGGAGTGTCGATTGTAGACATGTTTG
CTCTCCGAGGCTCACTGCTCTAGAGATCTCCTGTTCGCCTGAGGCGGTATGAGGTTTCGA
CGGTGTGTGTTTCGTTGAAGAGCGGCGAAGTCGCGGTGGAGTCTTCGCAGATCTATGTCC
TTGCTTCCAGTTTCTCGGGGATTATAGTATTTAAGTCTGTTGGAATCTAAATCTAGTTGT
GCAGGTTCGAGTGTGGTGTTGTGGAAGCTGTCTGAGTTGGCTCTTGCTGTGTCTGGCCTG
TTCTGGTATGGTTCTCCCTTTCCTGCTTGGTCTTCCTTTCCTGCTGGTTAGTGTAGTTTA
GCTCTGTTGGTGGTTCCCTCGCGGTTTGATAGATGTGCTTATCCTTGGTTCATTTGCGAC
GGCTGTTGTCCTTCTCGGTTCGTGGATTCTCCGGCTCGCTCTAAGGATTTGGGGGCTTCG
GTCCTTCTGCACCTTCTTGTGGAGGTTTGTAAGTTAAAGATAGTCTTCTTCCTCCTGGGT
TTGTTCTCTGTTGTTACTCGTGGCTCACGGTATGTTCCGGAGCAGTACAGAGTTTCAGAG
CTCCCTC

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4B158JQ 870 0 0
ACAG
ATTTTGCCAAACTGGAGTGTCGATTGTAGACATGTT*GCTCTCCGAGGCTCACTGCTCTA
GAGATCTCCTGTTCGCCTGAGGCGGTATGAGGTTTCGACGGTGTGTGTTTCGTTGAAGAG
CGGCGAAGTCGCGGTGGAGTCTTCGCAGATCTATGTCCTTGCTTCCAGTTTCTCGGGGAT
TATAGTATTTAAGTCTGTTGGAATCTAAATCTAGTTGTGCAGGTTCGAGTGTGGTGTTGT
GGAAGCTGTCTGAGTTGGCTCTTGCTGTGTCTGGCCTGTTCTGGTATGGTTCTCCCTTCC
CTGCTTGGTCTTCCTTTCCTGCTGGTTAGTGTAGTTTAGCTCTGTTGGTGGTTCCCTCGC
GGTTTGATAGATGTGCTTATCCTTGGTTCATTTGCGACGGCTGTTGTCTTTCTCGGTTCG
TGGATTCTCCGGCTCGCTCTAAGGATTTGGGGGCTTCGGTCCTTCTGCACCTTCTTGTGG
AGGTTTGTAAGTTAAAGATAGTCTTCTTCCTCCTGGGTTTGTTCTCTGTTGTTACTCGTG
GCTCACGGTATGTTCCGGAGCAGTACAGAGTTTCAGAGGCTCCCCTCTAATAAGGTCATC
TGTAGGTGTGCGCGTATCTCTTCTATCCTTCCTCGGTGGACCAGCTTGCTTGGGTTTCTT
TTTAATTTGATTTTAGGTTCCAACAGTCTTTGCTTTCATCCATTAGTGTTTATAGCTTAT
GTTTGGCTCCAAAGAATTCTTGAATTCTGTTGGCTTTTGACTCCAGAGGACATGTTTGTT
CCTGCTGGCTCAGTTTCCTAATCATGTATCCCAAGTTTGTATCTCAAACTTTGTATCTTT
CTATTGTTAATGGAAGTTCCAGTGCG

QA 5 870 5 870
DS 

RD RR4D529JQ 587 0 0
TCTGGTATGGTTCTCCCTTTCCTGCTTGGTCTTCCTTTCCTGCTGGTTAGTGTAGTTTAG
CTCTGTTGGTGGTTCCCTCGCGGTTTGATAGATGTGCTTATCCTTGGTTCATTTGCGACG
GCTGTTGTCCTTCTCGGTTCGTGGATTCTCCGGCTCGCTCTAAGGATTTGGGGGCTTCGG
TCCTTCTGCACCTTCTTGTGGAGGTTTGTAAGTTAAAGATAGTCTTCTTCCTCCTGGGTT
TGTTCTCTGTTGTTACTCGTGGCTCACGGTATGTTCCGGAGCAGTACAGAGTTTCAGAGG
CTCCCCTCTAATAAGGTCATCTGTAGGTGTGCGCGTATCTCTTCTATCCTTCCTCGGTGG
ACCAGCTTGCTTGGGTTTCTTTTTAATTTGATTTTAGGTTCCAACAGTCTTTGCTTTCAT
CCTTTAGTGTTTATAGCTTATGTTTGGCTCCAAAGAATTCTTGAATTCTGTTGGCTTTTG
GCTCCAGAGGACATGTTTGTTCCTGCTGGCTCAGTTTCCTAATCATGTGTCCCAAGTTTG
TATCTCAAACTTTGTATCTTTCTATTGTTAATGGAAGTTCCAGTG
TG

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 3

CO CL2992Contig1 1346 3 9 U
GACAAACAAGTATTATATATTGATTACCTTGTTAGAGCATAGAGATGAAACCCTAGATGT
GTCGAGTTCTAAGAGCACCATTAACCCAAGCTTCTTAAATGGAGTGCTTAATCAATTTTT
AATAATAAAAATGTGTTAAGCACTTAATCTAAGAAACCTATAAATTGTTGTTCTCCAATG
GAGATTGCTTATTTTGGGGTGCTTAAAGAAAAAAAACATTGTTTTTTTTTATATGATGAT
GAGCCTGCGATGGTGAGGAGCATATTTGCCATGATAATAACTTGTTCATCTTCAACCTCT
AATGCACGAACACTCGCACAGTTCCTCAAAACAGCCCTGAGACAAGTACAAGTATCACCA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AGAGACATC

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TGATTATAAGCACCCCAGGAAGCCTCATCCACTCGTTTAATGTCCGTGACTACAAATCAT
AGAATAGAACATTAACAACATCAATCAATACTTGAAAGCACCGGAGACATCATAGGTTCC
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DS 

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AATGTCCGTGACTACAAATCATAGAATAGAACATTAACAACATCAATCAATACTTGAAAG
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CATCCACGTAAACCACCTTCAATAACAACAAGTCGCTTAAGTCAATCAAAAATAGAACCA
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AAGGTAGAGTGATGAAGCGTGGAGGAAATCAATAGAGGGTGAGGTGATGAATCGTCCC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

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TGAAGTAGCCTTCTCCGACCGACTACATCTCCGTGTACCTGCTTTGTTCAGACCACAACA
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AATCAGGATAAGAGGTGGAAGAGAAAGGGAAGTGACTCCAAGAAAACAAAACATAGAAGG
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ACAGACTACTGTTTGTTGTTTTACGGCCTTCGTTTGAAGGATTGGCTCTGCTGTTTACAT
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT01TF U 1
AF RR4AM35TF U 27
AF RR4AM35JQ C 122
AF RR4GT01JQ C 144
BS 1 462 RR4GT01TF
BS 463 463 RR4AM35TF
BS 464 569 RR4GT01TF
BS 570 570 RR4AM35TF
BS 571 663 RR4GT01TF
BS 664 666 RR4AM35TF
BS 667 667 RR4AM35JQ
BS 668 718 RR4AM35TF
BS 719 719 RR4AM35JQ
BS 720 801 RR4AM35TF
BS 802 873 RR4AM35JQ
BS 874 896 RR4GT01JQ

RD RR4GT01TF 663 0 0
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TGAAGTAGCCTTCTCCGACCGACTACATCTCCGTGTACCTGCTTTGTTCAGACCACAACA
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CTTCCTTCCTTAGCTTTAGACTCCAAAACTGGTTCCAGTTCAAGTAAAGTAGCTGAGAGA
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CCTACTGATCCAAAGAAAGTCAACAAGATGATTAGAAAGCAAATCAAAGACACCACTGGC
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TATGATCGACTGTCAAAGAAGGATAGAAAGACAAGCCTTGCTGATGACTTGGTTTCAGAC
CCCAAAGTTTCTCAGTACAGGAAGCGTAAAGTCAGGGAGATTGAAGAGAAGAACAGATCT
AAT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4AM35TF 775 0 0
GG
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AACCATTGATTGGTCTTAAATGGGAACCGAAGCTTCCTTCCTTAGCTTTAGACTCCAAAA
CTGGTTCCAGTTCAAGTAAAGTAGCTGAGAGACACGAAAGCAGCTCTCTCTGGACGTCTA
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TGATTAGAAAGCAAATCAAAGACACCACTGGCTCAAACTGGTTTGATATGCCTGCACCAA
CGATGACTCCTGAGTTGAAAAGAGACCTTCAGTTGCTTAAGTTGAGGGATGTAATGGATC
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TTGGTACAGTAATTGAACCAGCGCAAGAGTTCTATGATCGACTGTCAAAGAAGGATAGAA
AAACAAGCCTTGCTGATGACTTGGTTTCAGACCCCAAAGTTTCTCAGTACAGGAAGCGTA
AAGTCAGGGAGATTGAAGAGAAGAACAGATCTAATCAG*ATAAGAGGTGGAAGAGAAAGG
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ATCTCGTTTTTGGTTCACCTTATCTTGTAATGACAGACTACTGTTTGTTGTTT

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR4AM35JQ 753 0 0
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TTCCTTCCTTAGCTTTAGACTCCAAAACTGGTTCCAGTTCAAGTAAAGTAGCTGAGAGAC
ACGAAAGCAGCTCTCTCTGGACGTCTAAGTCAGAGCT**TTGATGGTCTCTGTCTCCCAC
CTACTGATCCAAAGAAAGTCAACAAGATGATTAGAAAGCAAATCAAAGACACCACTGGCT
CAAACTGGTTTGATATGCCTGCACCAACGATGACTCCTGAGTTGAAAAGAGACCTTCAGT
TGCTTAAGTTGAGGGATGTAATGGATCCTAAGAAACACTACAAGAGAGTTGCGTCCCAGT
CAAAACTAGCTGAAAAGTATTTCCAGGTTGGTACAGTAATTGAACCAGCGCAAGAGTTCT
ATGATCGACTGTCAAAGAAGGATAGAAAAACAAGCCTTGCTGATGACTTGGTTTCAGACC
CCAAAGTTTCTCAGTACAGGAAGCGTAAAGTCAGGGAGATTGAAGAGAAGAACAGATCTA
ATCAGGATAAGAGGTGGAAGAGAAAGGGAAGTGACTCCAAGAAAACAAAACATAGAAGGC
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CAGACTACTGTTTGTTGTTTTACGGCCTTCGTTTGAAGGATTGGCTCTGCTGTTTACATG
TCTGGATAATTAAAAAGCTTTGATTCGAATTG
T

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4GT01JQ 753 0 0
GGTTAAACCATTGATTGGTCTTAAATGGGAACCGAAGCTTCCTTCCTTAGCTTTAGACTC
CAAAACTGGTTCCAGTTCAAGTAAAGTAGCTGAGAGACACGAAAGCAGCTCTCTCTGGAC
GTCTAAGTCAGAGCTCGTTGATGGTCTCTGTCTCCCACCTACTGATCCAAAGAAAGTCAA
CAAGATGATTAGAAAGCAAATCAAAGACACCACTGGCTCAAACTGGTTTGATATGCCTGC
ACCAACGATGACTCCTGAGTTGAAAAGAGACCTTCAGTTGCTTAAGTTGAGGGATGTAAT
GGATCCTAAGAAACACTACGAGAGAGTTGCGTCCCAGTCAAAACTAGCTGAAAAGTATTT
CCAAGTTGGTACAGTAATTGAACCAGCGCAAGAGTTCTATGATCGACTGTCAAAGAAGGA
TAGAAAGACAAGCCTTGCTGATGACTTGGTTTCAGACCCCAAAGTTTCTCAGTACAGGAA
GCGTAAAGTCAGGGAGATTGAAGAGAAGAACAGATCTAATCAGGATAAGAGGTGGAAGAG
AAAGGGAAGTGACTCCAAGAAAACAAAACATAGAAGGCACTGAATTGCATTTACCAGAGA
ATATGATCTCGTTTTTGGTTCACCTTATCTTGTAATGACAGACTACTGTTTGTTGTTTTA
CGGCCTTCGTTTGAAGGATTGGCTCTGCTGTTTACATGTCTGGATAATTAAAAAGCTTTG
ATTCGAATTGAATAGATCATAAGAGTATTTTGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 4

CO CL2994Contig1 959 4 11 U
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CGGTAACTATCCGGAGTGGAGTCTCTTCGTTCAAGTGATGGATCCTGCTCATGAAGACAA
GTTTGACTTCGACCCTCTTGATGTCACAAAGATCTGGCCTGAAGATATCTTGCCTCTGCA
GCCCGTTGGTCGCTTGGTGTTGAACAAAAACATCGACAACTTCTTTAACGAGAATGAGCA
GATTGCTTTCTGCCCTGCTATTGTGGTTCCTGGCGTCCATTATTCAGATGATAAACTACT
CCAGACCAGGATCTTCTCCTACGCCGATAGTCAGAGACACCGTCTCGGACCAAACTATCT
GCAATTACCTGTCAATGCCCCCAAATGTGCTCATCACAACAATCACCATGAAGGTTTTAT
GAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTTAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCG
TCATGCTGACAAATACCCAACAACTCCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCAT
GATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAGCAGCCAGGGGAACGGTACCGGTCCTGGGATGCAGA
CAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGTTTTGTTGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCA
CGAGATCCGCAGCATTTGGATATCTTACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAA
ACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAGCCAAAGTTCTGAATGGTTGTCATCTCAAAAGACTA
TTAAGTAAACCCAATATGTGCTCACATATTGCGCTTTGGTAATAGTTCATTTAAATAATC
CGTGACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTAGTTCATGTTGTAATCTTCTATTCAC
AATGTTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTAAGCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX38TF U 1
AF RR4C934TF U 177
AF RR4BX38JQ C 203
AF RR4C934JQ C 223
BS 1 183 RR4BX38TF
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BS 920 959 RR4BX38JQ

RD RR4BX38TF 602 0 0
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CGGTAACTATCCGGAGTGGAGTCTCTTCGTTCAAGTGATGGATCCTGCTCATGAAGACAA
GTTTGACTTCGACCCTCTTGATGTCACAAAGATCTGGCCTGAAGATATCTTGCCTCTGCA
GCCTGTTGGTCGCTTGGTGTTGAACAAAAACATCGACAACTTCTTTAACGAGAATGAGCA
GATTGCTTTCTGTCCTGCTATTGTGGTTCCTGGCGTCCATTATTCAGATGATAAACTACT
CCAGACCAGGATCTTCTCCTACGCCGATAGTCAGAGACACCGTCTCGGACCAAACTATCT
GCAATTACCTGTCAATGCCCCCAAATGTGCTCATCACAACAATCACCATGAAGGTTTTAT
GAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTTAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCG
TCATGCTGACAAATACCCAACAACTCCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCAT
GATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAGCAGCCAGGGGAACGGTACCGGTCCTGGGATGCAGA
CA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4C934TF 681 0 0
G
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GCAGATTGCTTTCTGCCCTGCTATTGTGGTTCCTGGCGTCCATTATTCAGATGATAAACT
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TCTGCAATTACCTGTCAATGCCCCCAAATGTGCTCATCACAACAATCACCATGAAGGTTT
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TCGTCATGCTGACAAATACCCAACAACTCCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTG
CATGATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAGCAGCCAGGGGAACGGTACCGGTCCTGGGATGC
AGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGTTTTGTTGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCAC
CCACGAGATCCGCAGCATTTGGATATCTTACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACA
GAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAGCCAAAGTTCTGAATGGTTGTCATCTCAAAAGA
CTATTAAGTAAACCCAATATGTGCTCACATATTGCGCTTTGGTAATAGTTCATTTAAATA
ATCCGTGACA*TGAAATGTG

QA 2 681 2 681
DS 

RD RR4BX38JQ 757 0 0
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CAGCAGCCAGGGGAACGGTACCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAG
CGTTTTGTTGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGATA
TCTTACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTG
AAGCCAAAGTTTTGAATGGTTGTCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAACCCAATATGTGCT
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AAGGATACTTCTAGTTCATGTTGTAATCTTCTATTCACAATGTTAACGAATATTTTTTAA
GGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTAAGCTTAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4C934JQ 729 0 0
CTTTAATGAGAATGAGCAGATTGCTTTCTGCCCTGCTATTGTGGTTCCTGGCGTCCATTA
TTCAGATGATAAACTACTCCAGACCAGGATCTTCTCCTACGCCGATAGTCAGAGACACCG
TCTCGGACCAAACTATCTGCAATTACCTGTCAATGCCCCCAAATGTGCTCATCACAACAA
TCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGTTAATTACTTCCCTTC
AAGGTTGAATCCGGTTCGTCATGCTGACAAATACCCAACAACTCCTGTTTTCTGCTCTGG
AAATCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAGCAGCCAGGGGAACGGTA
CCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGTTTTGTTGAAGCGCTTGC
TGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGATATCTTACTGGTCTCAGGCAGA
CAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAGCCAAAGTTCTGAATGGT
TGTCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAACCCAATATGTGCTCACATATTGCGCTTTGGTAA
TAGTTCATTTAAATAATCCGTGACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTAGTTCATG
TTGTAATCTTCTATTCACAATGTTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTAT
GCGTTATG
C

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL2995Contig1 809 3 3 U
TTTTGACACAAACAAGAAATGCTTTACTAACTACATCGGAATCACAAGTGTTTCAAGATC
GTAGAACACTAACTTAAATTATACTAAGACTAAAGAGCATATAGACATATGCATTTGCAC
TTACAAAGGAACGTTAAAAGGATGCTCTTTTCATTCATTTTTTATTTTATTTTTTTGCCT
ATCAAGCCTTATAGGCTCCAAATTAGCTTTGCAGATTTCTCTGGTCGGTTTCAGGCTGTT
CGGTTTCAGGATGTTCGGGTTGAGGAACCGGACCACCTCCGTTCATTCTCGCACGTGCTT
CTGCAAACATAAGTTGCTGCTCAGCTGCTGCTTCCTCCTCAGTCATCTGAGCTCCACTGT
TGCATTTCACACTCCTCTGCGTGTCCTGCATGGTTTCATACTTATGTTGCTCATAAGCAG
CATAGACTTCCTCAATATATTCTCCAAATCCAAGAACCTGTAACGCCTTGAGAACATGCT
CAGGAGCAATCGTTCGTCTATCCTCTTTGTTACAAACCTCATTAGATTCTGAAGATACAA
GATTTATAAACTCTACACAACACTCAATAAGAAGATAT*GAGCGTCTCTAGCAACACGAA
CATCAGGTGGTAACATCTCCTTTATGATCTTAGTCATCGTAGCTTTCGGAAGCGAAGAGT
CTTCTTTGGATTTGCCGACTATATCCATCGGATCCATTGTTCAAATCGTAACTGAGTCAA
CACGGTACGAATCGCTATACAGACGAGTCGCGGCGAGATCTTATCGGAGGCGATTAGGGC
AGACGGAAATGCGCGTGAATCCCACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR40TF C 1
AF RR4DR40JQ U 3
AF RR4AB73JQ U 210
BS 1 9 RR4DR40TF
BS 10 728 RR4DR40JQ
BS 729 809 RR4AB73JQ

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GTAGAACACTAACTTAAAT*ATACTAAGACTAAAGAGCATATAGACATATGCATTTGCAC
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CAGGAGCAATCGTTCGTCTATCCTCTTTGTTACAAACCTCATTAGATTCTGAAGATACAA
GATTTATAAACTCTACACAACACTCAATAAGAAGATAT*GAGCGTCTCTAGCAACACGAA
CATCAGGTGGTAACATCTCCTTTATGATCTTAGTCATCGTAGCTTTCGGAAGCGAAGAGT
CTTCTTTGGATTTGCCGACTATATCCATCGGATCCATTGTTCAAATCGTAACTGAGTCAA
CACGGTAC
CCC

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DS 

RD RR4DR40JQ 729 0 0
GAACACA
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TAACTTAAATTATACTAAGACTAAAGAGCATATAGACATATGCATTTGCACTTACAAAGG
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TATAGGCTCCAAATTAGCTTTGCAGATTTCTCTGGTCGGTTTCAGGCTGTTCGGTTTCAG
GATGTTCGGGTTGAGGAACCGGACCACCTCCGTTCATTCTCGCACGTGCTTCTGCAAACA
TAAGTTGCTGCTCAGCTGCTGCTTCCTCCTCAGTCATCTGAGCTCCACTGTTGCATTTCA
CACTCCTCTGCGTGTCCTGCATGGTTTCATACTTATGTTGCTCATAAGCAGCATAGACTT
CCTCAATATATTCTCCAAATCCAAGAACCTGTAACGCCTTGAGAACATGCTCAGGAGCAA
TCGTTCGTCTATCCTCTTTGTTACAAACCTCATTAGATTCTGAAGATACAAGATTTATAA
ACTCTACACAACACTCAATAAGAAGATAT*GAGCGTCTCTAGCAACACGAACATCAGGTG
GTAACATCTCCTTTATGATCTTAGTCATCGTAGCTTTCGGAAGCGAAGAGTCTTCTTTGG
ATTTGCCGACTATATCCATCGGATCCATTGTTCAAATCGTAACTGAGTCAACACGGTAC
CCC

QA 8 726 8 726
DS 

RD RR4AB73JQ 600 0 0
TGCAGATTTCTCTGGTCGGTTTCAGGCTGTTCGGTTTCAGGATGTTCGGGTTGAGGAACC
GGACCACCTCCGTTCATTCTCGCACGTGCTTCTGCAAACATACGTTGCTGCTCAGCTGCT
GCTTCCTCCTCAGTCATCTGAGCTCCACTGTTGCATTTCACACTCCTCTGCGTGTCCTGC
ATGGTTTCATACTTATGTTGCTCATAAGCAGCATAGACTTCCTCAATATATTCTCCAAAT
CCCAGAACCTGTGACGCCTTGAGAACATGCTCAGGAACAATCGTTCGTCTATCCTCTTTG
TTACAAACCTCATTAGATTCTGAAGATACAAGATTTATAAACTCTACACAACACTCAATA
AGAAGATCTTGAGCGTCTCTAGCAACACGAACATCAGGTGGTAACATCTCCTTTATGATC
TTAGTCATCGTAGCTTTCGGAAGCGAAGCGTCTTCTTTGGATTTGCCGACTATATCCATC
GGATCCATCGCTTAAATCGTAACTGAGTCAACACGGTACGAATCGCTATACAGACGAGTC
GCGGCGAGATCTTATCGGAGGCGATTAGGGCAGACGGAAATGCGCGTGAATCCCACTCCC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 4

CO CL2996Contig1 1756 4 18 U
GGACGAATATTCGTACAAACGGTAGTACACGGAGGAGGAGGAGTGAAGAGAAGAGCGATA
ATGGCGTCTAACGGTTTCGCGATGTTATCGATCCTTGTGTTATCATCTCTCCTCGCTTCG
TCTATTAGAAGCGAAGAAGCGACGAAGGAGTTCGTCTTGACGTTGGATCACTCTAACTTC
ACCGATACCATCAACAAGCACGACTTCATCGTCGTCGAGTTCTACGCCCCTTGGTGTGGC
CACTGCAAGAGTCTTGCTCCTGAGTATGAGAAGGCTGCAGCGGAGTTGAGCAGCCAAAGC
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GAGTACAAGATTCAGGGATTCCCAACGATTAAGATTCTGAGGAACGGTGGGAAGTCGGTT
CAAGATTACAACGGACCTCGTGAATCCGCGGGTATTGTGACTTATGTGAAGAAGCAGAGT
GGACCTGCTTCTGCTGAGATTAAGTCAGCTGATGCTGCTGGTGAGGTTATTGGTGAGAAG
AACGTTGTTGCTGTTGGTGTGTTCCCTAAGTTATCCGGTGAGGAGTTTGATTCTTTCGTG
GCCCTTGCTGAGAAACTGCGCGCTGACTATGATTTCGCACATACTTTGGACGCCAAGCTT
CTTCCTCGTGGAGACTCATCTGTGGCAGGACCTGTCGTGAGGCTATTCAAGCCTTTCGAT
GAACTTTTTGTCGATTCCAAGGATTTCAATGGGGAAGCTCTGGAGAAGTTTGTCAAAGAA
TCAAGCATTCCTCTTGTTACCGTCTTTGACAAAGATCCAAGCAACCACCCATATGTTGCC
AAATTCTTCGACAGCCCTGCCACTAAGGTAATGATGTTCGTTAACTTCACTGGAGAAACA
GCCGAGTCTCTAAAATCAAAGTTCCGTGAAATTGCTACATCCTACAAAGGAAAAGATCTT
GCCTTCCTTGTTGGTGATGCCGAGAACAGCCAAGGCGCTTTGCAGTACTTTGGACTCGAA
GAGAGCCAAGTTCCCCTCATCATCATCCAGACTCCTGACAGCAAGAAGTATTTGAAAGCA
AACGTTGTGGTTGACCAGATTGAATCATGGATGAAGGACTTCAAGGACGGGAAAGTTGCC
GCCCACAAAAAATCTCAGCCTATCCCAGCTGAAAACAACGAGCCAGTGAAGGTTGTTGTA
GCTGAGAGCCTTGACGACATGGTTTTCAACTCTGGAAAGAATGTGTTGATTGAATTCTAC
GCACCGTGGTGTGGACATTGCCAAAAACTTGCCCCAATCTTGGACGAAGTGGCTTTGTCG
TTCCAGAACGACCCAAGTGTCATCGTAGCAAAACTAGACGCAACCGCAAATGATATCCCA
AGCGATACATTTGATGTGAAAGGCTTCCCAACGATTTACTTCAGATCAGCGGATGGAAAG
GTTGTATTGTACGATGGAAGCAGAACAAAGGAAGACTTCATAAGCTTCGTTGAGAAGAAC
AAGCCAGCTTCTCATCGTGAAGAGTCTTCTACTACTGTTAGGAGTGGAGAACATAAGACT
GAGGAATCGGCCGCAAAGGACGAGCTGTAAAAGCCTTGTTTTTTTTTTTTTGCTTTTATC
TCTTTCTGACATTTGAACCCAGTGTTACCCGGTAATAAGATCAAATAAAACCATATTTTA
ATCATACACTTTGATGTTTGAGCATATGGGAGATGCTAGTTTTGTATATAAAGCTAGTAA
ATTTTCCTTTTTATTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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G
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CC

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC78TF U 1
AF RR4AO28TF U 134
AF RR4AO28JQ C 587
AF RR4AC78JQ C 551
BS 1 171 RR4AC78TF
BS 172 172 RR4AO28TF
BS 173 608 RR4AC78TF
BS 609 949 RR4AO28TF
BS 950 1387 RR4AC78JQ

RD RR4AC78TF 608 0 0
GTGGCCAGCTTCTTGGCTTCAGCCGTATGTTCCAAACTTGGAAGGAAGCCCACTATGCAG
TTTGCTTCTGTCTTCTTCTTGATCGGTGTCGGGCTAACCGCAGGAGCCGTTAACATCTTT
ATGTTGATCGTTGGAAGAATCTTGCTTGGCTTCGGTGTAGGCTTTGGCAATTAGGCAGTG
CCGCTTTTCCTGTCGAAGATTGCTCCGGCTCAACTCAGAGGAGGTCTCAACATTGTGTTC
CAACTCATGGTTACTATTGGAATCTTTATTGCCAACCTTGTCAATTACTTCACTGCCACG
GTTCACCCTAACGGATGGCGCATTGCTCTCGGTGGAGCCGCGGTACCGGCGGTTATCCTC
CTCTTCGGTTCATTCATCATCTGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAACAAGAAC
GAAGAAGGCAAAGAAGCCCTAAGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAGTAT
GAATCTATCGTCCATGCCTGCGAGATCGCGAGTCAAGTCAAGGATCCTTACAGGAAACTG
TTAAAGCCAGCGAGTCGCCCACCTTTCATCATCGGAATGCTTCTACAACTTTTCCAGCAG
TTTACAGG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4AO28TF 816 0 0
GAAGAATCTTGCTTGGCTTCGGTGTAGGCTTTGGCAATCAGGCAGTGCCGCTTTTCCTGT
CGGAGATTGCTCCGGCTCAACTCAGAGGAGGTCTCAACATTGTGTTCCAACTCATGGTTA
CTATTGGAATCTTTATTGCCAACCTTGTCAATTACTTCACTGCCGCGGTTCACCCTAACG
GATGGCGTATTGCTCTCGGTGGAGCCGCGGTACCGGCGGTTATCCTCCTCTTCGGTTCAT
TCATCATCTGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAACAAGAACGAAGAAGGCAAAG
AAGCCCTAAGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAGTATGAATCTATCGTCC
ATGCCTGCGAGATCGCGAGTCAAGTCAAGGATCCTTACAGGAAACTGTTAAAGCCAGCGA
GTCGCCCACCTTTCATCATCGGAATGCTTCTACAACTTTTCCAGCAGTTTACAGGAATCA
ATGCCATTATGTTCTATGCACCGGTCTTGTTCCAGACCGTTGGCTTTGGAAGCGATGCGG
CTCTTCTCTCTGCGGTTATCACCGGAGTTATCAATGTTCTCAGTACGTTCGTCGGGATTT
ACCTCGTCGATAGAACCGGACGGAGATTCCTTCTTCTCCAATCTTCCGTTCACATGCTCA
TTTGCCAGTTGATCATTGGAATCATCCTAGCGAAAGACTTGGGCACCACGGGATCACTAG
GGAAGCCACAAGCCTTAGTGGTTGTGATCTTTGTGTGCGTTTACGTGATGGGTTTCGCGT
GGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTGATTCCTAGCG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AO28JQ 784 0 0
AACTTTTCCAGCAGTTTACAGGAATCAATGCCATTATGTTCTATGCACCGGTCTTGTTCC
AGACCGTTGGCTTTGGAAGCGATGCGGCTCTTCTCTCTGCGGTTATCACCGGAGTTATCA
ATGTTCTCAGTACGTTCGTCGGGATTTACCTCGTCGATAGAACCGGACGGAGATTCCTTC
TTCTCCAATCTTCCGTTCACATGCTCATTTGCCAGTTGATCATTGGAATCATCCTAGCGA
AAGACTTGGGCACCACGGGATCACTAGGGAAGCCACAAGCCTTAGTGGTTGTGATCTTTG
TGTGCGTTTACGTGATGGGTTTCGCGTGGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTGATTCCTA
GCGAGACGTTTCCTCTAGAAACTCGAACTGCAGGATTCGCTGTTGCGGTCTCGTGCAACA
TGTTCTTCACCTTCGTGATCGCTCAGGCTTTCTTGTCGATGCTTTGCGGGATGAGATCGG
GGATTTTCTTCTTCTTCAGCGCTTGGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTTTTCG
TACCGGAAACTAAAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGAGAGAGTGTGGAAGCCACATT
GGTTCTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGAA
ACCATACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTTCCAGTTTCTTTTTCTTGTTGATGTTTGAATT
CTTTTGTTAATTATTTTGTTTATGTGAGAACATAGAGTGTAATAAGACCAACTTGTATAT
TCAG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AC78JQ 837 0 0
CGAGTCGCCCAC*TTTCATCATCGGAATGCTTCTACAACTTTTCCAGCAGTTTACAGGAA
TCAATGCCATTATGTTCTATGCACCGGTCTTGTTCCAGACCGTTGTCTTTGGAAGCGATG
CAGCTCTTCTCTCTGCGGTTATCACCGGAGTTATCAATGTTCTCAGTACGTTCGTCGGGA
TTTACCTCGTCGATAGAACCGGACGGAGATTCCTTCTTCTCCAATCTTCCGTTCACATGC
TCATTTGCCAGTTGATCATTGGAATCATCCTAGCGAAAGACTTGGGCACCACGGGATCAC
TAGGGAAGCCACAAGCCTTAGTGGTTGTGATCTTTGTGTGCGTTTACGTGATGGGTTTCG
CGTGGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTGATTCCTAGCGAGACGTTTCCTCTAGAAACTC
GAACTGCAGGATTCGCTGTTGCGGTCTCGTGCAACATGTTCTTCACCTTCGTGATCGCTC
AGGCTTTCTTGTCGATGCTTTGCGGGATGAGATCGGGGATTTTCTTCTTCTTCAGCGCTT
GGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTTTTCGTACCGGAAACTAAAGGAGTCGCTA
TTGATGACATGAGGGAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGAGGTATATGCTTG
CTGAGGATGATGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGAAACCATACCTGTCTTTGTGTGTTTC
TTTTTCCAGTTTCTTTTTCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTGTTAATTATTTTGTTTATG
TGAGAACATAGAGTGTAATAAGACCAACTTGTATATTCAGGTTAGGTATTTTATTCC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 2 4

CO CL2998Contig1 424 2 5 U
GGGTTGTTGAATCACATCTCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGA
AAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGT
ATACATTCGCCAACAACAGCACCAATACCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCATATGTTG
TCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAG
AGATTGGCCGTAAGAAGAACATCCCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAAT
TGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTAAGAAATAGAAATGGGATG
TGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTTG
TTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4GB70TF U 14
AF RR4DJ42TF U 1
BS 1 242 RR4DJ42TF
BS 243 243 RR4GB70TF
BS 244 247 RR4DJ42TF
BS 248 248 RR4GB70TF
BS 249 424 RR4DJ42TF

RD RR4GB70TF 409 0 0
GG
ATCTCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGA
TAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACA
ACAGCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCATATGTTGTCTACCCTGAAGAGG
CACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGATTGGCCGTAAGA
AGAACATCCCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGT
AATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTAAGAAATAGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAAT
GAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTT
TGTT

QA 3 405 3 405
DS 

RD RR4DJ42TF 424 0 0
GGGTTGTTGAATCACATCTCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGA
AAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGT
ATACATTCGCCAACAACAGCACCAATACCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCATATGTTG
TCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAG
AGCTTGGTCGTAAGAAGAACATCCCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAAT
TGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTAAGAAATAGAAATGGGATG
TGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTTG
TTAC

QA 1 424 1 424
DS 



CO CL2998Contig2 462 2 2 U
GGTTGAATCACATCTCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGG
GATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATAC
ATTCGCCAACAACAGCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCGTACGTTGTCTA
CCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCT
TGCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCT
CGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAATAGAAATGGGATG
TGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTCGTA
ACATATCTTGTACTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FM34JQ C 1
AF RR4FM34TF U 1
BS 1 1 RR4FM34JQ
BS 2 462 RR4FM34TF

RD RR4FM34JQ 462 0 0
GGTTGAATCACATCTCTGATTTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGG
GATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATAC
ATTCGCCAACAACAGCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCGTACGTTGTCTA
CCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCT
TGCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCT
CGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAATAGAAATGGGATG
TGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTCGTA
ACATATCTTGTACTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGA

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4FM34TF 462 0 0
G
GTTGAATCACATCTCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGG
ATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACA
TTCGCCAACAACAGCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCGTACGTTGTCTAC
CCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTT
GCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCTC
GGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAATAGAAATGGGATGT
GTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTCGTAA
CATATCTTGTACTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGA

QA 2 462 2 462
DS 



AS 1 4

CO CL2999Contig1 1248 4 9 U
GGGAGCTTTCTTACTTTCTAAATGGAGTTGAGGAATCGAGAAAAGTTGGTAATCAGCTAG
CTCTCAGGATTTGTGCTTTACTTGCGGAAGAGTGGTGTCTTTTTAGAAAGTCAAATTTCG
ATTCTAGTAAACTTGAAATGTTAGGATATTGTCCAGAGAGTGTTATTCTCAAGAAATATT
GGAAACTCTGTGAAGAAATTTTTAACACATCAGATGAGACAGATGAGGAGGATGAAAATA
AGGAGTATGTAGCGGAGACGAACAGAGATGTTGCAGCCATTGCTGCCTGCAAGTTGGTTA
CTTGTGGTGTGGTGCCGAAGGATTATCTAGGACCGGAGATAATATCTCATCTTGTTATGC
ATGGACCTAGTGTTACAGAAGTCATAAAGAATCTTATAACATGCTTAAGGAAAACAGAAG
ATGACATCTCCAATATCTATATGGAATCCTTGAAAAGGGGATATCAACGGTATGAAAGCG
AACTTTCTAGTGACGGTGGAGAATCAAGAGTAGAAAAAAGTCTTCAAGTGTGCCGGGAGC
TTACTGGTCGGCTATCAGGAATGTATGTTGGTGCTGCTCGCAACAAACACAGATTGGAGA
TTTTGAGCGTGGTCAAGGAAGGTGTTGAGTTTGCATTCAGGGACGCACCGAAACAAATGT
TGTTTCTGGAAGTTGCTATCCTTCCATTTGCAATGAAACTCTCAGTGCCGGACATCATTG
ACATTAAGAGGGAGGTTCAGGGGCGTATAGTGCATGTTAATACAGATGAAGACCCCAGCG
GATGGCGTCCTTGCTTCACCTTCTTAGAAACATTGGAGGAGAAATGCTTAAAAACCGAGG
ATGTACAAGACGACAAGGAAGGAGTAGCTGTAAAACGCAGCAGGGGACGTAGGCCCAAAA
AAACGGGCTGAAACAGAGCGAAAGAGGCTGTTTGATGAGGAAAGCGGAAGCGATGAGGAT
GAATCCATCAGTGGTGGCTCTGACAAAGAAGACAAGGGAGATTTTGTAGACGAGGACGCT
CCTCTTATTGAGACAATCAGATCGGCTGCAAGACGGAGGGCACTAAGAGGCGAACGGTCC
AAGTGACAATTGACTCGAGAGTGTATTGCTCTCAGTTTTATTTATATGTGCTTTGGACAG
ATCAAAGTGCTTCTAGTAATTCTGTTTGCCAACAATGTAGGAGAAACCAAACAAAACCTT
GCTCTCTGTTATATATGAATTGTAATCTAAGTGTGTGTTTTTTACCCC


BQ
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AF RR4CW01TF U 1
AF RR4GK31TF U 142
AF RR4CW01JQ C 453
AF RR4GK31JQ C 455
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BS 951 951 RR4GK31JQ
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TTTTGAGCGTGGTC

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DS 

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G
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C

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AA
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TGCTCGCAGCAAACACAGATTGGAGATTTTGAGCGTGGTCAAGGAAGGTGTTGAGTTTGC
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GAAACTCTCAGTGCCGGACATCATTGACATTAAGAGGGAGGTTCAGGGGCGTATAGTGCA
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GGAGGAGAAATGCTTAAAAACCGAGGATGTACAAGACGACAAGGAAGGAGTAGCTGTAAA
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AGGGAGATTTTGTAGACGAGGACGCTCCTCTTATTGAGACAATCAGATCGGCTGCAAGAC
GGAGGGCACTAAGAGGCGAACGGTCCAAGTGACAATTGACTCGAGAGTGTATTGCTCTCA
GTTTTATTTATATGTGCTTTGGACAGATCAAAGTGTTTCTAGTAATTCTGTTTGCCAACA
ATGTAGGAGAAACCAAACAAAACCTTGCTCTCTGTTATATATGAATTGTAATCTAAGTGT
GTGTTTTT
CACC

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DS 



AS 1 3

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AAGGATGAGTCTTAGACACCATCCTGTTTTTCTAATTGTAAGCAACCCCATAGACATGAG
AGCTTAAGTAAGCCAAGCTAGACAGAGAGACCTTGTTGATATCTGCACCGCCATTGAACC
GGGCTTCTAAAATATAATCTCCAGTGCGCCTAGTCAAGTGACATCCATCAGCAACAACTT
GTTGCAATGGGTCCAAAACATTCTGCACCAACCTCAAAAATGATCCATCTTCTCCTGCAA
CATGTTCTATGAAAAGGTAAACCCCACCCGGTCTTAGTACCCGTTTTATCTCATTGAGCG
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CATCCTCTAATGGTATAGCTTCTGCGACAGCATGAATGAATCTGAAATCTTCAGGTTTCA
GCCCTGCTTCTGCCGCGGATTTACGCGCGTAACTCTCCATCTTAGCGTTTGGATCCACAC
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GACATAATCTGAAGGACGAAACAGAGTCTGTCGCAATAGGAGTCATCTGTGTTTTGACGG
AATCTTGTGAAGCCTCCTTAGTCGTTCTTCTTCGTTGTGAACATGTAATAGTCGAGATCA
GTGACAAGTGAACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR41JQ U 35
AF RR4AK92JQ U 1
AF RR4FR41TF C 197
BS 1 367 RR4AK92JQ
BS 368 368 RR4FR41JQ
BS 369 448 RR4AK92JQ
BS 449 449 RR4FR41JQ
BS 450 460 RR4AK92JQ
BS 461 461 RR4FR41JQ
BS 462 468 RR4AK92JQ
BS 469 469 RR4FR41JQ
BS 470 511 RR4AK92JQ
BS 512 512 RR4FR41JQ
BS 513 547 RR4AK92JQ
BS 548 548 RR4FR41JQ
BS 549 550 RR4AK92JQ
BS 551 551 RR4FR41JQ
BS 552 563 RR4AK92JQ
BS 564 564 RR4FR41JQ
BS 565 828 RR4AK92JQ
BS 829 974 RR4FR41TF

RD RR4FR41JQ 746 0 0
CAATCATCATCATAATGATATACTTTAAGGATGAGTCTTAGACACCATCCTGTTTTTCTA
ATTGTAAGCAACCCCATAGACATGAGAGCTTAAGTAAGCCAAGCTAGACAGAGAGACCTT
GTTGATATCTGCACCGCCATTGAACCGGGCTTCTAAAATATAATCTCCAGTGCGCCTAGT
CAAGTGACATCCATCAGCAACAACTTGTTGCAATGGGTCCAAAACATTCTGCACCAACCT
CAAAAATGATCCATCTTCTCCTGCAACATGTTCTATGAAAAGGTAAACCCCACCCGGTCT
TAGTACCCGTTTTATCTCATTGAGCGTTCTAGTAACATCTGCGACAGAACAAAGCACGAG
AGTCCCCACAACTGCATCAACCGATGCATCCTCTAATGGTATAGCTTCTGCGACAGCATG
AATGAATCTGAAATCTTCAGGTTTCAGCCCTGCTTCTGCCGCGGATTTACGCGCGTAACT
CTCCATCTTAGCGTTTGGATCCACACCAAGAACGGAAACGTTTGGAATAACCGAGTAGTA
CTTGAAATTAGGACCTGTTCCAACGCCAATCTCCAAAACCTTTTCTGCTTTTCCCACCAA
ATTATCAAAGAGTTTCATCTTGTAACTCGAAATCTCTTTCTCGTACGGTTCTATGCTAGT
ATCCATAGACCAAGCAAAGAGCTCATCGTACCAGTCTGGCTTTGGAGGACGCAGCGTTTT
CAAATCTTCCGTTGA
CTAGAAGCAGC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4AK92JQ 828 0 0
GGTTTAAATTTTTTTTATTACCATTGAAGATGTACAATCATCATCATAATGATATACTTT
AAGGATGAGTCTTAGACACCATCCTGTTTTTCTAATTGTAAGCAACCCCATAGACATGAG
AGCTTAAGTAAGCCAAGCTAGACAGAGAGACCTTGTTGATATCTGCACCGCCATTGAACC
GGGCTTCTAAAATATAATCTCCAGTGCGCCTAGTCAAGTGACATCCATCAGCAACAACTT
GTTGCAATGGGTCCAAAACATTCTGCACCAACCTCAAAAATGATCCATCTTCTCCTGCAA
CATGTTCTATGAAAAGGTAAACCCCACCCGGTCTTAGTACCCGTTTTATCTCATTGAGCG
TTCTAGTGACATCTGCGACAGAACAAAGCACGAGAGTCCCCACAACTGCATCAACCGATG
CATCCTCTAATGGTATAGCTTCTGCGACCGCATGAATGAAGCTGAAATATTCAGGTTTCA
GCCCTGCTTCTGCCGCGGATTTACGCGCGTAGCTCTCCATCTTAGCGTTTGGATCCACAC
CAAGAACAGAGACGTTTGGAATAGCCGAGTAGTACTTGAAATTAGGACCTGTTCCAACGC
CAATCTCCAAAACCTTTTCTGCTTTTCCCACCAAATTATCAAAGAGTTTCATCTTGTAAC
TCGAAATCTCTTTCTCGTACGGTTCTATGCTAGTATCCATAGACCAAGCAAAGAGCTCAT
CGTACCAGTCTGGCTTTGGAGGACGCAGCGTTTTCAAATCTTCCGTTGAACTAAAAGCAG
CGTAGGAGGGAGACAGGGGAAGAAGCGGCATAGCTCCTATGAAATGCC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4FR41TF 778 0 0
ATCTC
CAGTGCGC*TAGTCAAGTGACATCCATCAGCAACAACTTGT*GCAATGG*TCCAAA*CAT
*CTGCACCAAC*TCAAAAATGATCCATCT*CTC*TGCAACATGTTCTATGAAAAGGTAAA
CCCCACCCGGTCTTAGTACCCGTTTTATCTCATTGAGCGTTCTAGTAACATCTGCGACAG
AACAAAGCACGAGAGTCCCCACAACTGCATCAACCGATGCATCCTCTAATGGTATAGCTT
CTGCGACAGCATGAATGAATCTGAAATCTTCAGGTTTCAGCCCTGCTTCTGCCGCGGATT
TACGCGCGTAACTCTCCATCTTAGCGTTTGGATCCACACCAAGAACGGAAACGTTTGGAA
TAACCGAGTAGTACTTGAAATTAGGACCTGTTCCAACGCCAATCTCCAAAACCTTTTCTG
CTTTTCCCACCAAATTATCAAAGAGTTTCATCTTGTAACTCGAAATCTCTTTCTCGTACG
GTTCTATGCTAGTATCCATAGACCAAGCAAAGAGCTCATCGTACCAGTCTGGCTTTGGAG
GACGCAGCGTTTTCAAATCTTCCGTTGAACTAGAAGCAGCGTAGGAGGGAGACAGGGGAA
GAAGCGGCATAGCTCCTATGAAATGCCTTCTTCCGCAGGGACATAATCTGAAGGACGAAA
CAGAGTCTGTCGCAATAGGAGTCATCTGTGTTTTGACGGAATCTTGTGAAGCCTCCTTAG
TCGTTCTTCTTCGTTGTGAACATGTAATAGTCGAGATCAGTGACAAGTGAACG

QA 6 778 6 778
DS 



AS 2 4

CO CL3001Contig1 692 2 2 U
GGTTAAAAAAAATTTATTAGCGTATATTTAAATCTGAATATCAACCACTCAAACATATCA
TGGCTGCATCATATATTAGATACCTATAATCATAATAGACTCCGACATGGTTGTCCTTAT
AATCAATCAAACATTTGATTGGCTCGGGTTCTTATTAATCTTACGTACATCCCAAATCTC
GCAGAAATAAGCCAAGTCCTCCTACATATGATGACATGGCACCCTCCAAACTTTGACCGA
CTTGTCAAGACTTCCACTATACACAATCAATCTCCCATCTCCTCCGTCTTCGTCATCTCC
TCCCCATGGTTCAGCCACCGCCAAACACTTAACCGGTCCGGTATGACCGGTAAAAACCGA
AACACATGTGTGGACTCTCCCTTCCCTCCTCCACACGCATATCTTCTTATCCGCCGCACC
ACTAAACACCAATTCTCCGGCTGCCGCGAGACAGAGAACAGCAAGCCTATGTTTCTTGAA
AATACCACGATGCTTCAACACTTTCTTCTCTCCCATCTCCCAGTAATTCACAGCACCGTC
GCTGGAACCACTATAAACCGCCACGTGGCTAGTGACCAAAGCCGTAACAGCAGATTATTG
TTTCAACAAAGTCTGAACCAGACTATGCGCAGTACGCTTCCCACGAACCTCCCGTTTCCA
AACCTTAACCGTTCCATCTGCCGAGCCAGTGA


BQ
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AF RR4FR43JQ U 1
AF RR4GF73JQ U 1
BS 1 450 RR4FR43JQ
BS 451 692 RR4GF73JQ

RD RR4FR43JQ 450 0 0
GGTTAAAAAAAATTTATTAGCGTATATTTAAATCTGAATATCAACCACTCAAACATATCA
TGGCTGCATCATATATTAGATACCTATAATCATAATAGACTCCGACATGGTTGTCCTTAT
AATCAATCAAACATTTGATTGGCTCGGGTTCTTATTAATCTTACGTACATCCCAAATCTC
GCAGAAATAAGCCAAGTCCTCCTACATATGATGACATGGCACCCTCCAAACTTTGACCGA
CTTGTCAAGACTTCCACTATACACAATCAATCTCCCATCTCCTCCGTCTTCGTCATCTCC
TCCCCATGGTTCAGCCACCGCCAAACACTTAACCGGTCCGGTATGACCGGTAAAAACCGA
AACACATGTGTGGACTCTCCCTTCCCTCCTCCACACGCATATCTTCTTATCCGCCGCACC
ACTAAACACCAATTCTCCGGCTGCCGCGAG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4GF73JQ 692 0 0
GGTTAAAAAAAATTTATTAGCGTATATTTAAATCTGAATATCAACCACTCAAACATATCA
TGGCTGCATCATATATTAGATACCTATAATCATAATAGACTCCGACATGGTTGTCCTTAT
AATCAATCAAACATTTGATTGGCTCGGGTTCTTATTAATCTTACGTACATCCCAAATCTC
GCAGAAATAAGCCAAGTCCTCCTACATATGATGACATGGCACCCTCCAAACTTTGACCGA
CTTGTCAAGACTTCCACTATACACAATCAATCTCCCATCTCCTCCGTCTTCGTCATCTCC
TCCCCATGGTTCAGCCACCGCCAAACACTTAACCGGTCCGGTATGACCGGTAAAAACCGA
AACACATGTGTGGACTCTCCCTTCCCTCCTCCACACGCATATCTTCTTATCCGCCGCACC
ACTAAACACCAATTCTCCGGCTGCCGCGAGACAGAGAACAGCAAGCCTATGTTTCTTGAA
AATACCACGATGCTTCAACACTTTCTTCTCTCCCATCTCCCAGTAATTCACAGCACCGTC
GCTGGAACCACTATAAACCGCCACGTGGCTAGTGACCAAAGCCGTAACAGCAGATTATTG
TTTCAACAAAGTCTGAACCAGACTATGCGCAGTACGCTTCCCACGAACCTCCCGTTTCCA
AACCTTAACCGTTCCATCTGCCGAGCCAGTGA

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL3001Contig2 744 2 1 U
GGGAGGTTTTACGACACACTCTGAAACCAAAATGCCGCGTTCCGACCGGGCCCGGGAATA
TTCTTGGAACCAAAGCGAAGAAAACAGCCTGGTCGGGTCGATTGTTCAAGAAGAAGGCCA
CATTTACTCGTTAGCAGCGACAAATGATCTTCTGTTCACAGGATCGGACAATAATCACAT
TAGGGTTTGGAAGAACCTAAACGAGTTTAGTGAGTTTAAATCGAACAGCGGTTTGGTGAA
AGCGATAGTGATATGTCGTGAGGAGAATAATAAGGTGTTCACGGGTCATCAAGACGGTAA
GATCCGGGTCTGGAAAACCTCGCACAAGAATCCTCGAGTGTACACACGCGCCGGGAGCTT
ACCGGCTTTGAAAGACGTGTTGAAGAAGTCAGTGAAGCCGTAACTACGTGGAGGTGAGAA
GACGTCGTACGGCGCTATGGATCAAACACTCCGACGCCGTTTCGTGTTTGAGTCTTGTGG
AAGATCAAGGGCTGTTATACTCCGCCTCATGGGATCGGACGGTCAAGGTTTGGCGCATTC
ACGATTTGAAATGTTTGGAATCTATTAAAGCTCATGATGACGCCGTCAACTCCGTCGTAG
CCGGTGGTTCCTGCGACGGTCTTGTGTTCACTGGCTCGGCAGATGGAACGGTTAAGTTTG
GAAACGGGAGGTTCGTGGGAAGCGTACTGCGCATAGTCTGGTTCAGACTTTGTTGAACAA
AATCTGCTGTTACGCTTTGGTCAC


BQ
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AF RR4GF73TF U 1
AF RR4FR43TF U 1
BS 1 744 RR4FR43TF

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QA 1 648 1 648
DS 

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CATTTACTCGTTAGCAGCGACAAATGATCTTCTGTTCACAGGATCGGACAATAATCACAT
TAGGGTTTGGAAGAACCTAAACGAGTTTAGTGAGTTTAAATCGAACAGCGGTTTGGTGAA
AGCGATAGTGATATGTCGTGAGGAGAATAATAAGGTGTTCACGGGTCATCAAGACGGTAA
GATCCGGGTCTGGAAAACCTCGCACAAGAATCCTCGAGTGTACACACGCGCCGGGAGCTT
ACCGGCTTTGAAAGACGTGTTGAAGAAGTCAGTGAAGCCGTAACTACGTGGAGGTGAGAA
GACGTCGTACGGCGCTATGGATCAAACACTCCGACGCCGTTTCGTGTTTGAGTCTTGTGG
AAGATCAAGGGCTGTTATACTCCGCCTCATGGGATCGGACGGTCAAGGTTTGGCGCATTC
ACGATTTGAAATGTTTGGAATCTATTAAAGCTCATGATGACGCCGTCAACTCCGTCGTAG
CCGGTGGTTCCTGCGACGGTCTTGTGTTCACTGGCTCGGCAGATGGAACGGTTAAGTTTG
GAAACGGGAGGTTCGTGGGAAGCGTACTGCGCATAGTCTGGTTCAGACTTTGTTGAACAA
AATCTGCTGTTACGCTTTGGTCAC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

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CAGAAAGACATAGAGTACTATACTCGGAGTAGATATAAGAGAGGTAAAGCTTTCCAAAAT
AATCACTTGGCTGCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCAGTATCAAGCTCGAGACCTTCTGCT
GCTAACAGCTGAGTAATGAGCTTCTTCTTATCCTCCTCTGCTTTCTTTCGCATCAAATCT
CTTTTCTTCAATACCAGCGTGTGTCTCTTTAGAGTACTGTTAAACAACTCTCTCGATGCT
TTCTTCTCTTTCTCCAGTATCTTCCTCTCTTCTTCCGGATCCACCTTGGAACGAGAAAGA
CGACGAGCACGCAGGTTAATCTCAAGCTGTTGTTGCTCAGCCCAAGCTGCAATAGCCATG
TCGCCTCTCTGATCAAACGCTTTACGCTTTTTCATCAGCCATTCCATCCAAGCTTGTGAT
GCCTTCATTGGATTCACTCGGTTATCCATATCATACTCTCTTCTCTTCTCCGTGTCCATG
AGCAGCTCGTATGCCGCCTGAATCTTGATGAATCTACCTTCTGCTGTCTCTCCTTCTTCA
AGCGTCCCTTTCCCATCATAAACATCAGGATGATAATACTTGGCTAATCGTCTGTACGCC
ACCTTAATCTGCTCTTCCTCTGCACCTCGTTCCAGCTCAAGAGTATCGTAAGGATACTTC
TCTTCGCTCCAATTCGAAGCTGCCCTGACGAGAGTCTTCCTCTGACTCTGACTCACACCA
AACCAAAAGTTCGAATCTTTAGACGCGACCCATGACGAAGACGGAAACGAACTCGAGACC
CGAGTCCTAAATCTGAGTTTCTGAATCGAAACCTTGACGATTGATCGAGATTGGTTTCTA
CTACAACACACGATCGAAGCAAACACCGTGTGTGGTCTACAAATAGCTCTAAGGTTGCTC
ATCACTTCAATCGCCGCACCCAGAAACTAGAATTCATATAAAAATCGAATTCTCCCAAAT
GAAATTTTTCTCGGAAAATTATACAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A717JQ U 1
AF RR4CM38JQ U 5
AF RR4A717TF C 228
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RD RR4A717JQ 708 0 0
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CTTTTCTTCAATACCAGCGTGTGTCTCTTTAGAGTACTGTTAAACAACTCTCTCGATGCT
TTCTTCTCTTTCTCCAGTATCTTCCTCTCTTCTTCCGGATCCACCTTGGAACGAGAAAGA
CGACGAGCACGCAGGTTAATCTCAAGCTGTTGTTGCTCAGCCCAAGCTGCAATAGCCATG
TCGCCTCTCTGATCAAACGCTTTACGCTTTTTCATCAGCCATTCCATCCAAGCTTGTGAT
GCCTTCATTGGATTCACTCGGTTATCCATATCATACTCTCTTCTCTTCTCCGTGTCCATG
AGCAGCTCGTATGCCGCCTGAATCTTGATGAATCTACCTTCTGCTGTCTCTCCTTCTTCA
AGCGTCCCTTTCCCATCATAAACATCAGGATGATAATACTTGGCTAATCGTCTGTACGCC
ACCTTAATCTGCTCTTCCTCTGCACCTCGTTCCAGCTCAAGAGTA
TCG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4CM38JQ 701 0 0
GC
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GACATAGAGTACTATACTCGGAGTAGATATAAGAGAGGTAAAGCTTTCCAAAATAATCAC
TTGGCTGCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCAGTATCAAGCTCGAGACCTTCTGCTGCTAAC
AGCTGAGTAATGAGCTTCTTCTTATCCTCCTCTGCTTTCTTTCGCATCAAATCTCTTTTC
TTCAATACCAGCGTGTGTCTCTTTAGAGTACTGTTAAACAACTCCCTCGATGCTTTCTTC
TCTTTCTCCAGTATCTTCCTCTCTTCTTCCGGATCCACCTTGGAACGAGAAAGACGACGA
GCACGCAGGTTAATCTCAAGCTGTTGTTGCTCAGCCCAAGCTGCAATAGCCATGTCGCCT
CTCTGATCAAACGCTTTACGCTTTTTCATCAGCCATTCCATCCAAGCTTGTGATGCCTTC
ATTGGATTCACTCGGTTATCCATATCATACTCTCTTCTCTTCTCCGTGTCCATGAGCAGC
TCGTATGCCGCCTGAATCTTGATGAATCTACCTTCTGCTGTCTCTCCTTCTTCAAGCGTC
CCTTTCCCATCATAAACATCAGGATGATAATACTTGGCTAATCGTCTGTACGCCACCTTA
ATCTGCTCTTCCTCTGCACCTCGTTCCAGCTCGAGAGTA

QA 3 701 3 701
DS 

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TGCAATAGCCATGTCGCCTCTCTGATCAAACGCTTTACGCTTTTTCATCAGCCATTCCAT
CCAAGCTTGTGATGCCTTCATTGGATTCACTCGGTTATCCATATCATACTCTCTTCTCTT
CTCCGTGTCCATGAGCAGCTCGTATGCCGCCTGAATCTTGATGAATCTACCTTCTGCTGT
CTCTCCTTCTTCAAGCGTCCCTTTCCCATCATAAACATCAGGATGATAATACTTGGCTAA
TCGTCTGTACGCCACCTTAATCTGCTCTTCCTCTGCACCTCGTTCCAGCTCAAGAGTATC
GTAAGGATACTTCTCTTCGCTCCAATTCGAAGCTGCCCTGACGAGAGTCTTCCTCTGACT
CTGACTCACACCAAACCAAAAGTTCGAATCTTTAGACGCGACCCATGACGAAGACGGAAA
CGAACTCGAGACCCGAGTCCTAAATCTGAGTTTCTGAATCGAAACCTTGACGATTGATCG
AGATTGGTTTCTACTACAACACACGATCGAAGCAAACACCGTGTGTGGTCTACAAATAGC
TCTAAGGTTGCTCATCACTTCAATCGCCGCACCCAGAAACTAGAATTCATATAAAAATCG
AATTCTCCCAAATGAAATTTTTCTCGGAAAATTATACAAAAG

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 4

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GTGGTTTAATCCCCATTCTACTTTGCTCCGACGATGATGAATAATAACTTAACAGACGAT
TCCGAGTGGGAAGTGAGACCTGGTGGTATGCTCGTCCAACGAAGAGACGACGCTTCCTCC
TCCGAACCACAACCTCTCCACCACGATCCCACCTCTGCTTCCGCCGTTTATGCTCAGACC
ATCAGGATCAACGTTTCCCATGGCTCATCGCACCACGATCTTCACTTCTCTCCCCTCGCC
ACTTTCGGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGGATTAGAGGCTACTAGCAAT
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AGGCAGTTGCTTAAACTGGATGGTATCGAGGCAGAAGGAGAAGCTAGAGTACAGCGAAAG
GCAGAGGTGCGTAGAGTGCAAAAGTTGCAGGAGGCTGTGGATACGTTGAAAGGGAAGATG
TTCAAACCCGTTTGTGGATCAAACCAAAGCAGCGGCTGTAAGCACTGAGTGGGAAACATT
CGGAAACGGTGTTGGAAGCTTGGACCCTCCTCCTCCTGCTTCTCCTTCTGCTAATGTAAC
TCAAGACTGGGAGAAATTTGACTGACCATTTCATTATTGTTACGTATCCAAAAAAAAGTA
ATAAAGAAAAATTTTCTTGTTCCTTTTTAATTACTGCTGTTAAATGAAAAAAGAAATGAT
CAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 

AF RR4B907TF U 1
AF RR4BA29TF U 1
AF RR4BA29JQ C 436
AF RR4B907JQ C 548
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TCCGAACCACAACCTCTCCACCACGATCCCACCTCTGCTTCCGCCGTTTATGCTCAGACC
ATCAGGATCAACGTTTCCCATGGCTCATCGCACCACGATCTTCACTTCTCTCCCCTCGCC
ACTTTCGGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGGATTAGAGGCTACTAGCAAT
CTGAAGATCTTGTTCAGGGGAGTTGAGAAAGATGACGCTGAGCAACTGCAAGCTTCTGGT
GTTAAGGATGGGTCTAAGCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATAATAATAATAATAAGAGA
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AAAGCTGTCTCTGGAGAGATCGATAAGCTCTCGGACAAAGTTGTTGCTTTAGAAGTTTCT
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AGGCAGTTGCTTAAACTGGATGGTATCGAGGCAGAAGGAGAAGCTAGAGTACAGCGAAAG
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TTCAAACCCGTTTGTGGATCAAACCAA*GCAGCGGCTGTAAGCACTGAGTGGGAAACATT
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TT
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GTTTGTGGATCAAACCAAAGCAGCGGCTGTAAGCACTGAGTGGGAAACATTCGGAAACGG
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GGAGAAATTTGACTGACCATTTCATTATTGTTACGTATCCAAAAAAAAGTAATAAAGAAA
AATTTTCTTGTTCCTTTTTAATTACTGCTGTTAAATGAAAAAAGAAATGATCAG

QA 3 476 3 476
DS 



AS 1 4

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CCTCCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGGACCTGAAACAGTACAGGACT
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TCTTGCACATGGAAGAGGTACGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACACAGAGC
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TCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCA
TCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTA
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CTATTTGTCCTTGTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGAATAAATGAGAACTGTATCCT
TTCATCTGTATATACACACAAAATGAAGTTGTTATATAATGTTATTAGAT


BQ
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AF RR4CF10TF U 1
AF RR4CU96TF U 62
AF RR4CU96JQ C 310
AF RR4BX82JQ C 432
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BS 470 470 RR4CU96TF
BS 471 487 RR4CF10TF
BS 488 488 RR4CU96TF
BS 489 538 RR4CF10TF
BS 539 693 RR4CU96TF
BS 694 1113 RR4CU96JQ
BS 1114 1130 RR4BX82JQ

RD RR4CF10TF 538 0 0
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CTTGTGCTGAAGACTTCGAAACTATGTCTTGTCTGGGTAGGATCTCGTCTGTTTCCTACC
CACCTGATCCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCGGAGCTGTCTTCACTTAGGCCAAATC
GAAGGCTGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTCTTCCTCTCTCGATTCTGACT
CCTCCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGGACCTGAAACAGTACAGGACT
TTGCCAAAATGCAGTTGCAAGAGATTCAAGATAACATTAGAAGCCGACGAAACAAGATCT
TCTTGCACATGGAAGAGGTACGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACACAGAGC
TTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCATCCTTTATCCCGT
TCTTACCCCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4CU96TF 633 0 0
GG
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CTGATCCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCGAAGCTGTCTTCACTTAGGCCAAATCGAA
GGCTGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTCTTCCTCTCTCGATTCTGACTCCT
CCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGGACCTGAAACAGTACAGGACTTTG
CCAAAATGCAATTGCAAGAGATTCAAGATAACATTAGAAGCCGACGAAACAAGATCTTCT
TGCACATGGAAGAGGTACGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACACAGAGCTTG
GAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCGTCTTTTATCCCGTTCT
TACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCATCG
CTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAG
GAGGCACGTCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAATTGAGTCAAG
TAGACCCAATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAG
A

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR4CU96JQ 804 0 0
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TGGAAGAGGTACGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACACAGAGCTTGGAATCG
TAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCGTCTTTTATCCCGTTCTTACCTC
CATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCTGGGA
TCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGAGGCA
CGTCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAATTGAGTCAAGTAGACC
CAATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATTTCAGCTTTGATGGTAGTTG
AAGTCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTGTCTAGGAACTGGGT
ATCTAGCATGTGCTCGTTGCTCTAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGCTGAACCGGTTTCAG
CTATTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAGATGTTCAAACTGTT
CTGGTGCTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGATGGCTATGGCTAGCG
AGCACGACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCCACTTCTCCAAGAAATCTATTTGTC
CTTGTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGAATAAATGAGAACTGTATCCTTTCATCTGT
ATATACACACAAAATGAAGTTGTT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4BX82JQ 699 0 0
GACGAAGAGCAAGAACACGAGTTCCCTAACTTCCCGTCTTTTATCCCGTTCTTACCTCCA
TTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCTGGGATC
ATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGAGGCACG
TCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAATTGAGTCAAGTAGACCCA
ATAGTAGCGTCCTTTTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATTTCAGCTTTGATGGTAGTTGAA
GTCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTGTCTAGGAACTGGGTAT
CTAGCATGTGCTCGTTGCTCTAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGCTGAACCGGTTTCAGCT
ATTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAGATGTTCAAACTGTTCT
GGTGCTGGAAAGGTGATGT**CCGACATGTCTGTGCACAGGGATGGCTATGGCTAGCGAG
CACGACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCCACTTCTCCAAGAAATCTATTTGTCCT
TGTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGAATAAATGAGAACTGTATCCTTTCATCTGTAT
ATACACACAAAATGAAGTTGTTATATAATGTTATTAGAT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

CO CL3005Contig1 979 4 6 U
GGAAAAGCATCCCAGTTTCTTCGATTTTGTCCGATCAACCAGAGCTGGGTGTACAGATCG
AAGAAGAAGAAGGAAGATGTTTCTCACTAGGACGGAGTATGACAGAGGAGTCAACACTTT
TTCTCCTGAAGGCAGGTTATTCCAAGTCGAGTATGCCATTGAAGCTATTAAGCTGGGTTC
TACTGCAATTGGAGTAAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATCAC
CTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGG
CTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTTGA
GACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACAACCCAAGC
GCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTT
TGGAGTCTCCCTTCTCATCGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGA
TCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGATTGGTTCAGGATCAGAAGGAGC
TGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTTAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGAT
CGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAATAATGTGGACAT
TGCCAAGGTAGCTCCAGCGTACCATCTCTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCAGTCATTAG
TCGTCTTTGAGGGGAGACTCTCTCAATACGGGTGATGCATCTAATCCGCTTTGCGTCTAC
TTCGAGTACACCAAATGGCTTTCTTTCATTTTGTCTGTTATAGACAGACTGATGTTTCAT
GAGACAGTTTGGTCTCTGTTGTGTAAGAAAATCTTTCAGTACCTTTCTCGGATTATAAAA
CTTCAACTATTATTATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER76TF U 1
AF RR4DK36TF U 7
AF RR4ER76JQ C 206
AF RR4DK36JQ C 250
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RD RR4ER76TF 693 0 0
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CTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGG
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QA 1 693 1 693
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GG
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TTGGAGTAAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCCCCTT
TACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCA
TGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTTGAGACTCAAA
ACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACAACCCAAGCGCTGTGTG
ATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCT
CCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTG
GAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGATTGGTTCGGGATCAGAAGGAGCTGATAGTT
CTCTTCAAGAGCAATTTAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTAT
CTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAATGTGACTCCAAATAATGTGGACATTGCC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR4ER76JQ 767 0 0
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GTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCT
GATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTAT
GGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACAACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTT
GGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATCGCTGGT
CATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGC
AATGCAAAAGCGATTGGTTCAGGATCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTT
AACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTT
ATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAATAATGTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCGTACCAT
CTCTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGGGAGACTCTCTCA
ATACGGGTGATGCATCTAATCCGCTTTGCGTCTACTTCGAGTACACCAAATGGCTTTCTT
TCATTTTGTCTGTTATAGACAGACTGATGTTTCATGAGACAGTTTGGTCTCTGTTGTGTA
AGAAAATCTTTCAGTACCTTTCTCGGATTATAAAACTTCAACTATT
G

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4DK36JQ 730 0 0
ACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCAT
GAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTTGAGACTCAAAA
CCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACAACCCAAGCGCTGTGTGA
TCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTC
CCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGG
AACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGATTGGTTCGGGATCAGAAGGAGCTGATAGTTC
TCTTCAAGAGCAATTTAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATC
TATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAATAATGTGGACATTGCCAAGGT
AGCTCCAGCGTACCATCTCTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTG
AGGGGAGACTCTCTCAATACGGGTGATGCATCTAATCCGCTTTGCGTCTACTTCGAGTAC
ACCAAATGGCTTTCTTTCATTTTGTCTGTTATAGACAGACTGATGTTTCATGAGACAGTT
TGGTCTCTGTTGTGTAAGAGAATCTTTCAGTACCTTTCTCGGATTATAAAACTTCAACTA
TTATTATCTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 4

CO CL3006Contig1 1332 4 3 U
GAATTCAGTGTAAATTCTTGCTTGCGTAACACTTAAGTAGACAAAAAGAGAAATTGTAGC
TTATACAACACTATCAAATAAAGTCCCAAGAAGCCATCAGACTATGTCTCTTCTTTATTC
ACACACAAATACAGACAAGGAGCAACAAACAAATAAAACCAAGAAACCAAACTCCATCGA
GAGCTGATTGTGATCATATCTTGGCAAAATCAACAGTCTTCTTTCCATCATGTGCCTTCT
TGAAGAAGTACCTGACGTAATCAGAATACACGACCTCTCTATAGATAGGTTCCTCTCCAT
TTGCTATCACCTCAGGAAGAGGACCAATCACTGATTCTGGTTTCGGATTCACAAAGATAG
GAACCGAGATTCTATTGTTGCTACCGTTAGCTAAGACACGGTGCTCCACGCTCTTGTAAC
GACCATTGCTCAAGATCTGCATGGCGTCTCCGATGTTGATCACGAAAGATCCGGGGACCG
GTGGCACGTGAACCCAGTTCCCTGACGACAGAGAGCGCACATGGAGGCCACCGATCTGGT
CTTGTAAGAGAATGGTGAGGGAAGAGACGTCTGAGTGGCGACCAACGCCAACAGTTAGGT
CAGGGTTAGGACAGATGGGATAGTAGTTGAGGTTGACTCGAACTGAACCCATGAAGAGTG
ACTCTTTGGTCTTGTCTAGCTCTTTCACATTGAGGTTCTTCCCTAAGTACTCTAGAAGCT
TCCTCACCATTGTCTTGGACTTGTTCATGTACTCTAGAGCCTCATTCTTGCAAACATCAG
GCCAAAACTGTTCAGCTTCAGCTTCAGAGACAAAGAAGAGACTGAGATAATCTTTCCACT
CCAGAGCCTTCTCTGCACGAGGACTAAAACTCGTACCGAACCTAACATTCGTAGACAGAG
AATTCTCCTTTGTGTATTTGCTCTTCTCCTCAACAGGAAGATTAAAGAACATGTGAGTAG
CGGCCTTCACGTTGTCAAGAACTTCCAAAGGAACTCCATGGTTGATCACTTGGAAGAAAC
CCCATTTCTCAGCAGCGTCACATATAGCTTCAGCGACTTTGCTCTCGTCGGGGTACGACA
TGTCGATGACAGGAATGGCTTCATCTGTCTCGTTGACGAACTTGTTGATGAGACGTTCTT
CGAATGGTTGAATGTATTGGTCTGGGAGAGCTTTGATTCCTGTTTCTGATAAACCCTTTA
CGCCGTTGCCTTTGTTTACAACGAACTCGGTTACTTCAGCTGGGTCTGCGAATCGGGCGG
TAGAGAGTGTTGGAGCCATTAGGTGGAAATTTGGGGATAAAGATTGTGGATTTGGATTGT
GTTGTGTTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GL15TF C 1
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AF RR4A993TF C 506
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GACCATTGCTCAAGATCTGC
C

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GAGCTGATTGTGATCATATCTTGGCAAAATCAACAGTCTTCTTTCCATCATGTGCCTTCT
TGAAGAAGTACCTGACGTAATCAGAATACACGACCTCTCTATAGATAGGTTCCTCTCCAT
TTGCTATCACCTCAGGAAGAGGACCAATCACTGATTCTGGTTTCGGATTCACAAAGATAG
GAACCGAGATTCTATTGTTGCTACCGTTAGCTAAGACACGGTGCTCCACGCTCTTGTAAC
GACCATTGCTCAAGATCTGC
C

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DS 

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GGCAAAATCAACAGTATTCTTTCCATCATGTGCCTTCTTGAAGAAGTACCTGACGTAATC
AGAATACACGACCTCTCTATAGATAGGTTCCTCTCCATTTGCTATCACCTCAGGAAGAGG
ACCAATCACTGATTCTGGTTTCGGATTCACAAAGATAGGAACCGAGATTCTATTGTTGCT
ACCGTTAGCTAAGACACGGTGCTCCACGCTCTTGTAACGACCATTGCTCAAGATCTGCAT
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CTCCTCAACAGGAAGATTAAAGAACATGTGAGTAGCGGCCTTCACGTTGTCAAGAACTTC
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GAAATTTGGGGATAAAGATTGTGGATTTGGATTGTGTTGTGTTGTCC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 4

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TCTGCCTTGTTTTTTCTCTGTGCATTCCCTGATGTTTGTTCCGAGAATTCTGTCGCGAGT
TTCCGCAGCGCGGGATTGCGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCTCTTCCGGCGAGGAGCCGG
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GCAGTTCAGGTTCTGCCTCTTGGTTCGTTTCCACTCCAAAGGTTCTCTTTTTCTTCTTCC
TCCACCACGCCTGAATCAAATGAAAAGGAGAGCAACTCTGAGGCCTCGAAGACATCTGGG
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GATGATGAGGAGTTGTCAGTGGATGATTTGAGGAAGCTCGTTGCTGAGAAGGAAGAGCTG
CTTTCTGAAAAGGAGGAAGAGATTAAGCAAATGAAAGATAAAGTTCTTCGCACTTACGCA
GAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAGAAGTATGCC
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CTCTTAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCTGAGGTGTTT
AAGAAATTTGGTATGGAGAAGTACGATCCTATCAACGAGCCGTTTGATCCAAACAGACAT
AACGCAGTGTTTCAAGTCCCGGATGCCTCTAAGCCAGAAGGCACAGTTGCTCATGTCCTC
AAGTCTGGTTACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTTGGTGTTACTCAA
GGAGGAGAGGCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTCTGATGCTTAACAAGGAGTCAGCTGGTTT
TCATAAGTTTTTGCTACTGTTCTTTGTTTCGAGCAACTCAATTAACAGAAGTCATAGTTT
TTCTCTTGTCGTTTGGTTATTCATTGGATGAACATGATCTTCCCATAAGTTACTGGACAT
GGCAAGCTTGCCGAGGAAGTCCTGCTTTTGTATC


BQ
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TTCCGCAGCGCGGGATTGCGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCTCTTCCGGCGAGGAGCCGG
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GCAGTTCAGGTTCTGCCTCTTGGTTCGTTTCCACTCCAAAGGTTCTCTTTTTCTTCTTCC
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CTTTCTGAAAAGGAGGAAGAGATTAAGCAAATGAAAGATAAAGTTCTTCGCACTTACGCA
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CTCTT

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AAAGAC

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GAG
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TGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAGAAGTATGCCATAC
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TAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCTGAGGTGTTTAAGA
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CTTGTCGTTTGGTTATTCATTGGATGAACATGTTCTTCCCATAAGTTACTG

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CTTCTT
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GCTTTCTGAAAAGGAGGAAGAGATTAAGCAAATGAAAGATAAAGTTCTTCGCACTTACGC
AGAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAGAAGTATGC
CATACAGAATTTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTTGGAAGAGCTTCTTC
GGTTGTCAAGGAAAGCTTCTCAAAGCTTGACACTACGGAAGATTCGGCTGGAGCTACTCC
GCTCTTAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCTGAGGTGTT
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AGGAGGAGAGGCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTCTGATGCTTAACAAGGAGTCAGCTGGTT
TTCATAAGTTTTTGCTACTGTTCTTTGTTTCGAGCAACTCAATTAACAGAAGTCATAGTT
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TGGCAAGCTTGCCGAGGAAGTCCTGCTTTTGTATC

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DS 



AS 1 4

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CTAGGATCGCCATGAACCAACAGCTGGAGTCTCATTGTTGTGGTTGCTAAGTTGCCGCGA
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CGCCTTTGATAACCTGCTAATTAGCACACACAACTACCATATCGTACGACGGCTCAAACA
AATGCATTCGGAGTGAACGTTCCGGCACAGTCGAAACCGGAGATCCGGATAAAGGTGAAG
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CTCACACTAAACACAGATTGACTGTTACGCTTCTTCTTGATTTGATCACATCTAGCACAT
CTACAAGACACCGCTCTTATTCGGAAGGGGAGAGTAAGGTTGGGTTTGCCACACCATCGG
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AGATCTCCCGCAGCCGAGCCAAACACTTTTGACCTCTACCTCTGACTCGCCGAATCACCA
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CGAAGGTTTAGTTTTAGTTTTTGGGAGAAAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FG95JQ U 1
AF RR4DH91JQ U 2
AF RR4DH91TF C 695
AF RR4FG95TF C 952
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BS 651 793 RR4DH91JQ
BS 794 794 RR4DH91TF
BS 795 837 RR4DH91JQ
BS 838 1116 RR4DH91TF
BS 1117 1117 RR4FG95TF
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BS 1370 1370 RR4FG95TF
BS 1371 1414 RR4DH91TF

RD RR4FG95JQ 650 0 0
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CTAGGATCGCCATGAACCAACAGCTGGAGTCTCATTGTTGTGGTTGCTAAGTTGCCGCGA
GTTAACAGGGAATAGGCCAGCCCTCATAACCTCTCTGCTCCTACAGCTTCATCACAAACA
CGCCTTTGATAACCTGCTAATTAGCACACACAACTACCGTATCGTACGACGGCTCAAACA
AATGCATTCGGAGTGAACGTTCCGGCACAGTCGAAACCGGAGATCCGGATAAAGGTGAAG
CTGTATGCCTCTGCTCCACCGATCTAGCCAAAACCTTTGCCGCACAGTTAGCTAATCTGT
GCTACCGCATGAAACATTCACTCAACTGTCGAGTACCACCGCAAAAAAATAGAGCTGCTG
CTCACACTAAACACAGATTGACTGTTACGCTTCTTCTTGATTTGATCACATCTAGCACAT
CTACAAGACACCGCTCTTATTCGGAAGGGGAGAGTAAGGTTGGGTTTGCC

QA 1 650 1 650
DS 

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CGAAATGTAGAAATACCACAACTAATACAAATCGTGAATAACAAAACAACGCACAATGTC
TAGGATCGCCATGAACCAACAGCTGGAGTCTCATTGTTGTGGTTGCTAAGTTGCCGCGAG
TTAACAGAGAATAGGCCAGCCCTCATAACCTCTCTGCTCCTACAGCTTCATCACAAACAC
GCCTTTGATAACCTGCTAATTAGCACACACAACTACCATATCGTACGACGGCTCAAACAA
ATGCATTCGGAGTGAACGTTCCGGCCCAGTCGAAACCGGAGATCCGGATAAAGGTGAAGC
TGTATGCCTCTGCTCCACCGATCTAGCCAAAACCTTTGCCGCACAGTTAGCTAATCTGTG
CTACCGCATGAAACATTCACTCAACTGTCGAGTACCACCGCAAAAAAATAGAGCTGCTGC
TCACACTAAACACAGATTGACTGTTACGCTTCTTCTTGATTTGATCACATCTAGCACATC
TACAAGACACCGCTCTTATTCGGAAGGGGAGAGTAAGGTTGGGTTTGCCACACCATCGGA
CTTGCCCAAAGGAGAAGAAGCTTCACACCCGTGAGTACTGTCTCTGCGCAGAGCACTTCC
TCACAGACAGAGAAGCAAGTGTGACGCCACTAGCTATCCGCACGCGCCTAGATAGCCACA
CACACCACTGCA*CACCGCAGATCTCATCTTGTACACAGTCAGCAGAGAGTAAAAA

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DS 

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CTATCCGCACGCGC*TAGATAGCCACACACACCACTGCAACACCGCAGATCTCATCTTGT
ACACAGTCAGCAGAGAGTAAAAAAGACAGTAAAACCCAAAGGCCCGCTCTCAAATTACTA
CTCATAGTCCAGATCCGGAACGGAAGTTGAACCAAGGAACAAAGTGCCACTTCCTCAGTC
ATGCCCCAACAACCGGTAAACTAACGATAGTCACCGCACCAACACACCCCGAGAACCCAC
TAAACCGCTCAAACTACACTGGAGAACTCACCAGACTGGACAAAAACGCAGGGACAACTT
ACAGATACAGTCCTCACGTACCTCGTCACCACCTGCTCGAAGCCAGATCTGAGAAAAAAA
AATTCCAGATCTGAGCCGGAAAGAGGAGATCTCCCGCAGCCGAGCCAAACACTTTTGACC
TCTACCTCTGACTCGCCGAATCACCACCAATCTAACTACATCGGACTCCTAACACGAACA
ACGGCGTAAGGAGAAAATTAGTAGCAGGGATACGAGCACATCACCAGAGAGAGAGAAAGA
AGATGAGAGGCGAAGATTAAAAGAAGAAACACATGGGGTGGGGGGCCGACGGCGGATCCG
CCGACCACCGTTTTGGATCTAGGGTTCGAAGGTTTAGTTTTAGTTTTTGGGAGAAAAAAA

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DS 

RD RR4FG95TF 463 0 0
AAACTAACGATAGTCACCGCACCAACACACCCCGAGAACCCACTAAACCGCTCAAACTAC
ACTGGAGAACTCACCAGACTGGACAAAAACGCAGGGACAACTTACGGATACAGTCCTCAC
GTACCTCGTCACCACCTGCTCGAAGCCAGATCTGAGAAAAAAAAACTCCAGATCTGAGCC
GGAAAGAGGAGATCTCCCGCAGCCGAGCCAAACACTTTTGACCTCTACCTCTGACTCGCC
GAATCACCACCAATCTAACTACATCGGACTCCTAACACGAACAACGGCGTAAGGAGAAAA
TTAGTAGCAGGGATACGAGCACATCACCAGGGAGAGAGAAAGAAGATGAGAGGCGAAGAT
TAAAAGAAGAAACACATGGGGTGGGGGGCCGACGGCGGGTCCGCCGACCACCGTTTTGAA
TCTAGGGTTCGAAGGTTTAGTTTTAGTTTTTGGGAGAAAAAAA

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 3

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GGATCTCAAAAAACGCATGCAACAACAACAGCATCGAAGTTCATCCATCTTCACGTATTA
ACTTAGAATCAAAGCAAACTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATCAATGGCATCCTCTGGTGCG
GTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCA
TCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGA
GTTTCGTTGGGAGATTCGAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAG
ATCTGTGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCG
AAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGT
GGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAGCAAAAGCTGGACTTAAA
TCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTT*CGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGA
TAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCCGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGT
CAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCCAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTT
TGGAAGAAAGTTAACCGAGACTCAGAAGCCAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGG
ATTCATATACACTTTACCAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTGTGTCCTCA
ATGTATAGCACCAAAGAAAAGGTTTGCGAGGTATGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGG
AGGAGGACTGCCTCCGATTGGTGTTATCGTTGGGTTACTCGCCGGTCTTGGAGCTGTTGG
AGCTCTGCTTGTGTATGGTCTTCAGTGACATTTTATAGAACTTGTATAATTTGTCTATCA
AACAAGTCCCTTAATTGAGTTTTGTGATTCTAAACCAAGAATGAATGTTGATGACTTGTT
GACATCAACTTGAGAATTTAATTCAGTTCTTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D295TF U 1
AF RR4CN08TF U 280
AF RR4CN08JQ C 206
BS 1 568 RR4D295TF
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BS 744 1057 RR4CN08JQ

RD RR4D295TF 568 0 0
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ACTTAGAATCAAAGCAAACTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATCAATGGCATCCTCTGGTGCG
GTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCA
TCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGA
GTTTCGTTGGGAGATTCGAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAG
ATCTGTGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCG
AAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGT
GGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAGCAAAAGCTGGACTTAAA
TCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTT*CGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGA
TAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4CN08TF 468 0 0
TTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCTGTGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTC
AAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTG
ACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGGAAC
GCAGCAAAAGCTGGACTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTTTCGG
AGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCCGGCCAAACC
TGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCCAAATAA
GCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGA*GAAG**TAACCGAGACTCAGAAGC**AGAGCTAC
TCACATTTGTCTTGAT*GTGGAT*CATATACACTTTACCAAAAC
TTTT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4CN08JQ 852 0 0
CTCTCTCTC
TTCCCCAGAAAACTGT*TTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGAT*CGAAGAAGAGTGTATCAG
AGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCTGTGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCG
AAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGG
GTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTG
GGAACGCAGCAAAAGCTGGACTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTT
T*CGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCCGGCC
AAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCCA
AATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCGAGACTCAGAAGGCAAGA
GCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTACCAAAACCTTTTGATGAA
CAGCCGGATACATACGTGTGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGAAAAGGTTTGCGAGGTAT
GACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGGAGGAGGACTGCCTCCGATTGGTGTTATCGTTGGG
TTACTCGCCGGTCTTGGAGCTGTTGGAGCTCTGCTTGTGTATGGTCTTCAGTGACATTTT
ATAGAACTTGTATAATTTGTCTATCAAACAAGTCCCTTAATTGAGTTTTGTGATTCTAAA
CCAAGAATGAATGTTGATGACTTGTTGACATCAACTTGAGAATTTAATTCAGTTCTTTTA
TGC

QA 10 852 10 852
DS 



AS 1 3

CO CL3010Contig1 1311 3 9 U
AAATGATAAATCTGCTGATTTTGATTTGTTAACTAAAATATTCAACTAATTACAATCGTT
AAAGAAAAAAAAAATAAAACTTCCATTAACAAAAAAAAAATGAAAAGGGAGTTTCCATAA
ACGGGGTCAAGATGACATGTTGACATGAACGCTAGCGTTTTTGGGAAAACTACAGATCGG
GCACGTGTGCACACTGGACCCACACACTCCACACAAGCACAAGTGTCTGCACGGTAAAAG
CAACACACACGATTCCTCCTCCCCACAGTTTCTGCACATCCTACCTTTCGCCGCCTTATC
ATGCGCCCTCGTCGCTACCCTACGCCTACTAACCGTTTCTTCACCCGCGCTACTCCCGCA
ACACGACTCCGCGTCATCGTCGTCGTTATCGCCGTTACCGTTATCTAATCCCGCGCCAAA
GTCGTTAACCTGCGCCAGTACCTGCTCGAGGTTGTTGCGGAGGTCGTTGGCGGTCGCTTC
GTTGGTCTGAGCGAGATCCCGCCAGATTTGGTTCTCGGTGGAGAGTGACCTCACGCGTTC
CTCGAGCGCGTGGTTTATCTTCCCGATTCTGTCACTTTCTTCTTCTTTGGCACGAAGCCT
ATGCTCTATAGCCTCCATAATAGTCCTCGCTTGCCTCTTCCTCTTCTCTTGAATCTCGAG
TCTCACTCTCTCCATATGAAGGGAGACAAACCGATCGATGTCGTGCTGTTGCTGATTGAT
GTGAGAGGAGATATCAATGTCTTGGCCAAGAAACGAAAAGGGAGTAACACACGGTGACCA
TGATCTAGGATTATAATCCGATGCTGAATCTCTGGAGCGTTTTTTCGTGTGTAAAGATAA
CAAATCACAGTTGAGATTACCACCATCGGGGTAATAAGTGAATGAATCAGTTGTTGTCGG
AATAGTATCAGCGGTGGATGAGCCGCCGTACATGTTAAGAAGAGGAGGCGAATCGTCTGT
CACGGAGAAAGGTGAAACGACGCCGTATCCGGTTTGGTTATTCGTGAAGAAACCGACATT
AGTCGGTTCCATGGTTGTGTTGTTGTGGTTGTTGTTATTCATCACTAAGTCTCTGTTGGA
GAAGAGTTGAAGAGGAGAGAAATGGAGATGGTGAGCATCGACGGCCATGAAAAGAGAGAT
CTCTCTGATGATGATGATGAGAATAGGGGGAGGAGGAGGAAGTTTAAAAGAGATAGAAAT
GCATGCGTTTCGGTTTTTATTTTGCGGTTTTGATATGCGTGAAGAGGAGGGCCCCTTTGT
TTTTTCCTTTTTTTATTATTCTTACTTTCTCTTATTCAAAGACCAATTCCC


BQ
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GTGCACACTGGACCCACACACTCCACACAAGCACAAGTGTCTGCACGGTAAAAGCAACAC
ACACGATTCCTCCTCCCCACAGTTTCTGCACATCCTACCTTTCGCCGCCTTATCATGCGC
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CTTACGGTGGCGGTTGCGGCTCCTGTGCTCGTGATGCTCTTCGAAACGTATTTCCTCGGC
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ACTCGTCTGGCGTCGAGCGGTCTGATGGGCTTGGCTGCGTGGCTCGTATGGGTGGACGGT
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AAATAAACAAGTTGTGATCTTCCTA

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C
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C
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ATCTC

QA 2 726 2 726
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TTA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4C247TF U 157
AF RR4GA53TF U 1
AF RR4GA53JQ C 485
BS 1 266 RR4GA53TF
BS 267 267 RR4C247TF
BS 268 365 RR4GA53TF
BS 366 366 RR4C247TF
BS 367 414 RR4GA53TF
BS 415 415 RR4C247TF
BS 416 715 RR4GA53TF
BS 716 716 RR4GA53JQ
BS 717 725 RR4GA53TF
BS 726 1203 RR4GA53JQ

RD RR4C247TF 283 0 0
G
GCAGATGGTGTAGCAGTCAAAGTAGTTGGTGAAGAGACTTTTCGTATATCCAGAAAGCTG
GTGGATGGTGTTGTGCTCGTCACTCGTGATGCTATCTGTGCATCAATAAAGGATATGTTT
GAGGAGCAACGGAACATTTTAGAACCAGCAGGTGCGCTTGCGATCGCGGGAGCTGAAGCG
TACTGTAAATATTACGGTCTAAAGGACGCGAATGTTGTAGCCATAACCAGTGGTGCGAAC
ATGAACTTTGACAAGCTGAGGATTGTGACGGAACTCGCCAA
T

QA 2 282 2 282
DS 

RD RR4GA53TF 725 0 0
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GGTGAAGATCATTGGTGTAGAGCCAGCTGATGCAAACACTATGGCGTTGTCGCTGCATCA
CGGCGAGAGAGTGATACTGGACCAGGTTGGGGGTTTTGCAGATGGTGTAGCAGTCAAAGT
AGTTGGTGAAGAAACTTTTCGTATATCCAGAAAGCTGGTGGATGGTGTTGTGCTCGTCAC
TCGTGATGCTATCTGTGCATCAATAA*GGATATGTTTGAGGAGCAACGGAACATATTAGA
ACCAGCAGGTGCGCTTGCGATCGCGGGAGCTGAAGCGTACTGTAAATATTACGGTCTAAA
GGACGTGAATGTTGTAGCCATAACCAGTGGTGCGAACATGAACTTTGACAAGCTTAGGAT
TGTGACGGAACTCGCCAATGTCGGTAGGCAACAGGAGGCTGTTCTTGCTACTATCTTGCC
TGAAAAACCTGGAAGCTTTAAGCAGTTCTGTGAATTGGTTGGACCAGTGAACATAACTGA
GTTCAAGTATAGATGTGGGTCGGAAAAGGAATCTGTTGTACTATACAGTGTTGGAGTGCA
CACAGCCGGAGAGCTGAAAGCACTAGAGAAGAGAATGGAATCTTCTCAGCTCAGAACTAG
GAACCTCACGACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTACTTGATGGGTGGA*GATC
AAGTG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4GA53JQ 719 0 0
AAACCTGGAAGCTTTAAGCAGTTCTGTGAATTGGTTGGACCAGTGAACATAACTGAGTTC
AAGTATAGATGTGGGTCGGAAAAGGAATCTGTTGTACTATACAGTGTTGGAGTGCACACA
GCCGGAGAGCTGAAAGCACTAGAGAAGAGAATGGAATCTTCTCAGCTCAGAACTAGGAAC
CTCACGACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTACTTGATGGGTGGAAGATCAAGT
GTTGAAGAAGAGGTTTTCTGCCAGTTCACCTTCCCAGAGAGACCTGGTGCTCTGATGAAC
TTCTTGGACTCTTTCAGTCCCCGTTGGAACATTAGCCTTTTCCATTACCGCGCAGAGGGT
GGGGCAGGTGCAAATGTGTTGGTCGGAATCCAAGTGCCGGAACAAGAAATGATTGAGTTC
AGAAACCGAGCTCAAGTTCTTGGATACGAGTACGTCTTGGTAAGCGAAGACACTGTTTTC
AAGCTTCTTATGCACTGAGTTTAAAGCTGTGATGGGGAGACCAAAACCGAGGAAGTAGTA
GAAGAACACATGAGTGGTATTCCTTGTGTCCATTGGTTGTTCTTGAGCTCTGTTAGAAAC
AAAATATGTGAGTTTCAGGCTTTTATGTCACGGGCCTGTTGCGCTAGCCTGTAACCTTTA
TTGCCTACGGGCTATGCTGTAGACTTATGTATACCTTTCAGCAAATAATGTGAGGCTTA

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL3013Contig1 710 2 3 U
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AAAAAATGGAGCTGGATCTTGATCTCTCTCTATCACCTCGTACTAATTCTTCAAATTTGG
GGTTTGGCTTCGACCTCAACAAGCATTTGAGTACCAAAGAAAAACGTTTTGAGGCGATGC
TTGGGTTGGAGAATATGGAAGAAGATTGTTATGTGCCAAAACCATGTTCGTTTTCTTTGA
ATGGCCAGCCAGACGAGGAAGATGAAGATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACG
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TTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCACGAACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAG
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CTAGAGATTGTCTGTGTCCATTTACAAGACTTTTGTTCTAAATATTTAAAAAATTAAATC
GAATACTATTTAAGTATTTGTAACTAAAATGTCTATCTGGTTAAATTTCC


BQ
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AF RR4BJ15JQ C 1
AF RR4BJ15TF U 1
BS 1 3 RR4BJ15JQ
BS 4 699 RR4BJ15TF
BS 700 710 RR4BJ15JQ

RD RR4BJ15JQ 710 0 0
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AAAAAATGGAGCTGGATCTTGATCTCTCTCTATCACCTCGTACTAATTCTTCAAATTTGG
GGTTTGGCTTCGACCTCAACAAGCATTTGAGTACCAAAGAAAAACGTTTTGAGGCGATGC
TTGGGTTGGAGAATATGGAAGAAGATTGTTATGTGCCAAAACCATGTTCGTTTTCTTTGA
ATGGCCAGCCAGACGAGGAAGATGAAGATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACG
AGAGGATCAACATATCTAATCCAGCGGCTACCATTGAAAGAGGTAGACGATCAACATCAT
CAATGTATGTCAAGGTGAAGATGGATGGTGTGGCAATAACAAGAAAGGTGGACATTAAGC
TTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCACGAACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAG
ATTGTGGTAGAGAAGATACAAACTTCAAATTCACCTTCCAAGGGAAAGAGGGTGACTGGC
TATTACCAGGGGATGCTCCATGGAAGATCTTTGCTGAATCTGTTCATCGTATATCAATAA
CTAGAGATTGTCTGTGTCCATTTACAAGACTTTTGTTCTAAATATTTAAAAAATTAAATC
GAATACTATTTAAGTATTTGTAACTAAAATGTCTATCTGGTTAAATTTCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4BJ15TF 710 0 0
CCA
AACCCAAACAAGAAAAGAACATAAGCTTTTAGTTCCATCAAAGACGAAGCTGCACCTAAA
AAATGGAGCTGGATCTTGATCTCTCTCTATCACCTCGTACTAATTCTTCAAATTTGGGGT
TTGGCTTCGACCTCAACAAGCATTTGAGTACCAAAGAAAAACGTTTTGAGGCGATGCTTG
GGTTGGAGAATATGGAAGAAGATTGTTATGTGCCAAAACCATGTTCGTTTTCTTTGAATG
GCCAGCCAGACGAGGAAGATGAAGATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACGAGA
GGATCAACATATCTAATCCAGCGGCTACCATTGAAAGAGGTAGACGATCAACATCATCAA
TGTATGTCAAGGTGAAGATGGATGGTGTGGCAATAACAAGAAAGGTGGACATTAAGCTTT
TCGACTCTTACGAGTCTCTCACGAACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAGATT
GTGGTAGAGAAGATACAAACTTCAAATTCACCTTCCAAGGGAAAGAGGGTGACTGGCTAT
TACCAGGGGATGCTCCATGGAAGATCTTTGCTGAATCTGTTCATCGTATATCAATAACTA
GAGATTGTCTGTGTCCATTTACAAGACTTTTGTTCTAAATATTTAAAAAATTAAATCGAA
TACTATTTAAGTATTTGTAACTAAAATGTCTATCTG
GTTAAATTTCC

QA 4 699 4 699
DS 



AS 1 3

CO CL3014Contig1 878 3 5 U
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CTTTAACTTTCTTCATCGGTTTTCTTAGTCTTCTCGATTTCTAGCAAATAAATCCTCTCA
GCTTCTGGTACAGCCTTGGTTAAAGCTTGAAGCCTATGGTTCAAGTCATCAAGCTTGTTC
ATTAACCTATCGTTAGTGAACATTCCCATACAAACGCTCTTGATCGTTACCCAGCTTTCA
ATCAAAGGCAAACCAATTATCACAATCGATCCTATAGTTCCCCAAGCTACAGCCACAATT
GCCCAAAACCAGAAATATCCTCTGCTAAACACACGTGCTGGGAGAGAGAGAACTGGCCAG
ATGACAACAATGAGGAGAGTGAAGACAAGACCCCATTTAACAATCCAAGCTTTGGCTCTT
CTCAGCTTCTCTTCTTTTAGCTCCTCTACAGGAACATCGATATCGTTCCCTGGAGCCTCA
GCTTCCACCACTTTGATTTCCTTCGTCGTCGACCAATCGTAGTTCTGTGGCTGTACTAGA
CTACACACCGCATGGATCAACCCTCCTGTTAGAATAGCAACGAGGTTACCAGCAAGCATG
GGTGCATTTCTCCCTGTGGTATCAAGATCAACACGTCCGTATTGAATCTTTGCGGTTGAT
AACCAAGTAACAATCCCAAGAACACAGCCAGAGATCGACCCCAGAATCGCACCAAAGGCA
TTAGCTTTACTCCACAGAAGCATGAAAGCAATGGGAATAACGGCAGAGCCAATGAGAACT
CCCATCGCGAGATACATCCATCCGAGCGAAACCCCGGCTTTGTTCAAGATCACTGCAAGA
ATCCCCATGAAACATCCAAATCCAAGAACAGCGGATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN45JQ U 1
AF RR4FM68JQ U 1
AF RR4EN45TF C 140
BS 1 606 RR4EN45JQ
BS 607 691 RR4FM68JQ
BS 692 692 RR4EN45TF
BS 693 712 RR4FM68JQ
BS 713 878 RR4EN45TF

RD RR4EN45JQ 606 0 0
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CTTTAACTTTCTTCATCGGTTTTCTTAGTCTTCTCGATTTCTAGCAAATAAATCCTCTCA
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CTCAGCTTCTCTTCTTTTAGCTCCTCTACAGGAACATCGATATCGTTCCCTGGAGCCTCA
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CTACACACCGCATGGATCAACCCTCCTGTTAGAATAGCAACGAGGTTACCAGCAAGCATG
GGTGCA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4FM68JQ 712 0 0
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CTTTAACTTTCTTCATCGGTTTTCTTAGTCTTCTCGATTTCTAGCAGATAAATCCTCTCA
GCTTCTGGTACAGCCTTGGTTAAAGCTTGAAGCCTATGGTTCAAGTCATCAAGCTTGTTC
ATTAACCTATCGTTAGTGAACATTCCCATACAAACGCTCTTGATCGTTACCCAGCTTTCA
ATCAGAGGCAAACCAATTATCACAATCGATCCTATAGTTCCCCAAGCTACAGCCACAATT
GCCCAAAACCAGAAATATCCTCTGCTAAACACACGTGCTGGGAGAGAGAGAACTGGCCAG
ATGACAACAATGAGGAGAGTGAAGACAAGACCCCATTTAACAATCCAAGCTTTGGCTCTT
CTCAGCTTCTCTTCTTTTAGCTCCTCTACAGGAACATCGATATCGTTCCCTGGAGCCTCA
GCTTCCACCACTTTGATTTCCTTCGTCGTCGACCAATCGTAGTTCTGTGGCTGTACTAGA
CTACACACCGCATGGATCAACCCTCCTGTTAGAATAGCAACGAGGTTACCAGCAAGCATG
GGTGCATTTCTCCCTGTGGTATCAAGATCAACACGTCCGTATTGAATCTTTGCGGTTGAT
AACCAAGTAACAATCCCAAGAACACAGCCAGGGATCGACCCCAGAATCGCAC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EN45TF 739 0 0
TTAAAGCTTGAAGC*TATGGTTCAAGTCATCAAGCTTGTTCATTAACCTATCGTTAGTGA
ACATTCCCATACAAACGCTCTTGATCGTTACCCAGCTTTCAATCAAAGGCAAACCAATTA
TCACAATCGATCCTATAGTTCCCCAAGCTACAGCCACAATTGCCCAAAACCAGAAATATC
CTCTGCTAAACACACGTGCTGGGAGAGAGAGAACTGGCCAGATGACAACAATGAGGAGAG
TGAAGACAAGACCCCATTTAACAATCCAAGCTTTGGCTCTTCTCAGCTTCTCTTCTTTTA
GCTCCTCTACAGGAACATCGATATCGTTCCCTGGAGCCTCAGCTTCCACCACTTTGATTT
CCTTCGTCGTCGACCAATCGTAGTTCTGTGGCTGTACTAGACTACACACCGCATGGATCA
ACCCTCCTGTTAGAATAGCAACGAGGTTACCAGCAAGCATGGGTGCATTTCTCCCTGTGG
TATCAAGATCAACACGTCCGTATTGAATCTTTGCGGTTGATAACCAAGTAACAATCCCAA
GAACACAGCCAGAGATCGACCCCAGAATCGCACCAAAGGCATTAGCTTTACTCCACAGAA
GCATGAAAGCAATGGGAATAACGGCAGAGCCAATGAGAACTCCCATCGCGAGATACATCC
ATCCGAGCGAAACCCCGGCTTTGTTCAAGATCACTGCAAGAATCCCCATGAAACATCCAA
ATCCAAGAACAGCGGATCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL3015Contig1 709 4 3 U
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CATCAATCACAACAGCCAAACTCTGACAGTTTTTATCATGATCATTTTCTTCATTGCTGC
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CGAAGATACTTATGAAAGATTGTGACGATTTTCGGATTAGGAACGTCTAAGAAAGTTCTG
GTGCGGTTGAGCCACTTTTTTGATGGATGCTGCTGCAGCTCTGATGGGCTAGCCGCACCA
GTATTTGGCGTTTGGACCATGTTTTTTTCTTTCTTTTGGTGGAAGAGCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DQ64JQ U 2
AF RR4DQ64TF C 1
AF RR4DX49TF C 89
AF RR4DX49JQ U 2
BS 1 1 RR4DQ64TF
BS 2 543 RR4DQ64JQ
BS 544 709 RR4DX49JQ

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ATCAATCACAACAGCCAAACTCTGACAGTTTTTATCATGATCATTTTCTTCATTGCTGCC
ACCTTTACCTGCAGAATGATCGACATGTTGTTGTTCTTCTTCTCCTTCCACGACCGAGCT
AGCAACCTGCTTTGACTCGTGCCTGGTCGTAACAGCAATGACGATACCAAGACCGAGAAA
GACGAAAACAGGAAGAAAGATAAGGGACAAGCCGTAGTAGATGATCCATTGGAAACCGGC
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GA

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4DQ64TF 709 0 0
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CGAAGATACTTATGAAAGATTGTGACGATTTTCGGATTAGGAACGTCTAAGAAAGTTCTG
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GTATTTGGCGTTTGGACCATGTTTTTTTCTTTCTTTTGGTGGAAGAGCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4DX49TF 621 0 0
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CAACGCTTTCTCATTGGACTTTTTGTCATATTCATCAATCACAACAGCCAAACTCTGACA
GTTTTTATCATGATCATTTTCTTCATTGCTGCCACCTTTACCTGCAGAATGATCGACATG
TTGTTGTTCTTCTTCTCCTTCCACGACCGAGCTAGCAACCTGCTTTGACTCGTGCCTGGT
CGTAACAGCAATGACGATACCAAGACCGAGAAAGACGAAAACAGGAAGAAAGATAAGGGA
CAAGCCGTAGTAGATGATCCATTGGAAACCGGCGTGGCTCATGCCATGAAACATCCACTC
AAAGACGAAAGCAATGCCTGAGGAAAACGTGGCGAAGATACTTATGAAAGATTGTGACGA
TTTTCGGATTAGGAACGTCTAAGAAAGTTCTGGTGCGGTTGAGCCACTTTTTTGATGGAT
GCTGCTGCAGCTCTGATGGGCTAGCCGCACCAGTATTTGGCGTTTGGACCATGTTTTTTT
CTTTCTTTTGGTGGAAGAGCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DX49JQ 708 0 0
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ATCGCATCGAAAATAAAGGAAATAAATTACATGGGGGAAGACGGATGATCCCATAGTGAC
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GCGTTCTAGTTTTGAGGTTTTATGCTCCAACGCTTTCTCATTGGACTTTTTGTCATATTC
ATCAATCACAACAGCCAAACTCTGACAGTTTTTATCATGATCATTTTCTTCATTGCTGCC
ACCTTTACCTGCAGAATGATCGACATGTTGTTGTTCTTCTTCTCCTTCCACGACCGAGCT
AGCAACCTGCTTTGACTCGTGCCTGGTCGTAACAGCAATGACGATACCAAGACCGAGAAA
GACGAAAACAGGAAGAAAGATAAGGGACAAGCCGTAGTAGATGATCCATTGGAAACCGGC
GTGGCTCATGCCATGAAACATCCACTCAAAGACGAAAGCAATGCCTGAGGAAAACGTGGC
GAAGATACTTATGAAAGATTGTGACGATTTTCGGATTAGGAACGTCTAAGAAAGTTCTGG
TGCGGTTGAGCCACTTTTTTGATGGATGCTGCTGCAGCTCTGATGGGCTAGCCGCACCAG
TATTTGGCGTTTGGACCATGTTTTTTTCTTTCTTTTGGTGGAAGAGCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL3016Contig1 1383 4 11 U
GAGAACCTCTCTTTGCTCAGATTCAACTCACTCTGGGAACACGCCTATCGCCACGACTCT
CTCCTCGTCTTCTCAACCGGAAGATCACCGACTCTGTACAAAGAACTCAGAAAGGAGAAG
CCTTTGCTGACCCCTGATGTTACCATCATGTCTGTAAGGACTGAGATTACTTATGGTAAC
TCCATGGTTCCTGATCATGGTTGGGTTGATACTTTAAACCATAAATGGGACTTGGGGGTT
GTTAAAGAAGAAACTAGCAAGTTCTCTGAGTTAACTCTTCAGGCAGAGACTGAGCAGAGG
CCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGACAAGAGTAAGGCTCAGGAAGTGACCAAGGAGCTG
TCACTGCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTCAAAATAATCTACAGTGGAGGCATGGAT
TTGGACATCTTACCACAAGGTGCTGGGAAGGGACAAGCGCTAGCTTATCTCCTCAAGAAG
CTCAAGAGCGAAGGAAAGCTCCCTGTTAACACTCTTGCCTGCGGAGACTCCGGGAACGAT
GCTGAGCTCTTTAGCATTCCCGATGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATGCACAGGAAGAA
CTGTTGAAGTGGCATGCTGAGAACGCCAAAGACAACCCGAAGGTGATCCATGCGAAGGAG
AGGTGTGCAGGTGGGATTATACAGGCGGTTGGTGAGTTCGAGCTCGGTCCAAACCTTTCT
CCGAGAGATGTATCTGACTCCTTGGAGTGCAAGGTGGAGAATGCGAACCCTGGTCATGAG
GTTGTGAAGTTTTTCTTGTTCTATGAGAGGTGGAGACGTGGTGAGGTTGAGAACTCAGAG
GCGTATGCGGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGGTGTGTTTGTACATCCATCA
GGTGCGGAAAAATCTCTGATAGATACAATTGATGAGCTGAGGAAGCACCATGGTGACAAG
CAAGGGAAGAAGTTTAGGGTTTGGGTTGATCAAGTCTTGGCAACAGAAACTGCTCCTGGG
ACATGGATGGTAAAGCTTGCTAAATGGGAACAAAGTGGTGATGAACGCATAGGGTGCACA
ACGACTGTCAAGTTCACAACAAAGGAAGGGGAAGGGTTGGTGTGGGAACATGTAGAGCAA
ACATGGTCGGAGGAATCAAAGTTGAAGGATGATAGCAGCTGGATCATCTGAATCACTCAA
TTTCTCTCCACAGATTAAGAATCTTTCTCTTTTCTTCTCTTATGAATCTCTACCATAAGT
CATTGAAACTTCGGCTTTAACACACGAAATCCAATAAAACATTGCCTTGTTAAATCTTGG
TACTAAAACTCATCCACATGATACATCTATTATCTATATCTCCAAGTTAACTCTGTTTTT
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4BS20TF U 1
AF RR4GR59TF U 470
AF RR4GR59JQ C 955
AF RR4BS20JQ C 582
BS 1 669 RR4BS20TF
BS 670 670 RR4GR59TF
BS 671 709 RR4BS20TF
BS 710 710 RR4GR59TF
BS 711 753 RR4BS20TF
BS 754 896 RR4GR59TF
BS 897 897 RR4BS20JQ
BS 898 1100 RR4GR59TF
BS 1101 1236 RR4BS20JQ
BS 1237 1237 RR4GR59JQ
BS 1238 1383 RR4BS20JQ

RD RR4BS20TF 754 0 0
GAGAACCTCTCTTTGCTCAGATTCAACTCACTCTGGGAACACGCCTATCGCCACGACTCT
CTCCTCGTCTTCTCAACCGGAAGATCACCGACTCTGTACAAAGAACTCAGAAAGGAGAAG
CCTTTGCTGACCCCTGATGTTACCATCATGTCTGTAAGGACTGAGATTACTTATGGTAAC
TCCATGGTTCCTGATCATGGTTGGGTTGATACTTTAAACCATAAATGGGACTTGGGGGTT
GTTAAAGAAGAAACTAGCAAGTTCTCTGAGTTAACTCTTCAGGCAGAGACTGAGCAGAGG
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TTGGACATCTTACCACAAGGTGCTGGGAAGGGACAAGCGCTAGCTTATCTCCTCAAGAAG
CTCAAGAGCGAAGGAAAGCTCCCTGTTAACACTCTTGCCTGCGGAGACTCCGGGAACGAT
GCTGAGCTCTTTAGCATTCCCGATGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATGCACAGGAAGAA
CTGTTGAAGTGGCATGCTGAGAACGCCAAAGACAACCCGAAGGTGATCCATGCGAAGGAG
AGGTGTGCATGTGGGATTATACAGGCGGTTGGTGAGTTCGAGCTCGGTC*AAACCTTTCT
CCGAGAGATGTATCTGACTCCTTGGAGTGCAAG
T

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4GR59TF 631 0 0
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CCGGGAACGATGCTGAGCTCTTTAGCATTCCCGATGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATG
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ATGCGAAGGAGAGGTGTGCAGGTGGGATTATACAGGCGGTTGGTGAGTTCTAGCTCGGTC
CAAACCTTTCTCCGAGAGATGTATCTGACTTCTTGGAGTGCAAGGTGGAGAATGCGAACC
CTGGTCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTCTATGAGAGGTGGAGACGTGGTGAGGTTG
AGAACTCAGAGGCGTATGCGGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGGTGTGTTTG
TACATCCGTCAGGTGCGGAAAAATCTCTGATAGATACAATTGATGAGCTGAGGAAGCACC
ATGGTGACAAGCAAGGGAAGAAGTTTAGGGTTTGGGTTGATCAAGTCTTGGCAACAGAAA
CTGCTCCTGGGACATGGATGGTAAAGCTTGCTAAATGGGAACAAAGTGGTGATGAACGCA
TAGGGTGCACAACGACTGTCAAGTTCACAAC

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DS 

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CCTGGGACATGGATGGTAAAGCTTGCTAAATGGGAACAAAGTGGTGATGAACGCATAGGG
TGCACAACGACTGTCAAGTTCACAACAAAGGAAGGGGAAGGGTTGGTGTGGGAACATGTA
GAGCAAACATGGTCGGAGGAATCAAAGTTGAAGGATGATAGCAGCTGGATCATCTGAATC
ACTCAATTTCTCTCCACAGATTAAGAATCTTTCTCTTTTCTTCTCTTATGAATCTCTACC
ATAAGTCATTGAAACTTCGGCTTTAACACACGAGATCCAATAAAACATTGCCTTGTTAA
GC

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4BS20JQ 802 0 0
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GGTGATCCATGCGAAGGAGAGGTGTGCAGGTGGGATTATACAGGCGGTTGGTGAGTTCGA
GCTCGGTCCAAACCTTTCTCCGAGAGATGTATCTGACTCCTTGGAGTGCAAGGTGGAGAA
TGC****CCTGGTCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTCTATGAGAGGTGGAGACGTGG
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TGTGTTTGTACATCCATCAGGTGCGGAAAAATTTTTGATAGATACAATTGATGAGCTGAG
GAAGCACCATGGTGACAAGCAAGGGAAGAAGTTTAGGGTTTGGGTTGATCAAGTCTTAGC
AACAGAAACTGCTCCTGGGACATGGATGGTAAAGCTTGCTAAATGGGAACAAAGTGGTGA
TGAACGCATAGGGTGCACAACGACTGTCAAGTTCACAACAAAGGAAGGGGAAGGGTTGGT
GTGGGAACATGTAGAGCAAACATGGTCGGAGGAATCAAAGTTGAAGGATGATAGCAGCTG
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ATGAATCTCTACCATAAGTCATTGAAACTTCGGCTTTAACACACGAAATCCAATAAAACA
TTGCCTTGTTAAATCTTGGTACTAAAACTCATCCACATGATACATCTATTATCTATATCT
CCAAGTTAACTCTGTTTTTCTC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 4

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AAGAATATCACAAAGAACAAAACGTCGTCACCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCCCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGCGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4AG80JQ C 1
AF RR4FA41JQ C 1
AF RR4FA41TF U 1
AF RR4AG80TF U 1
BS 1 201 RR4FA41TF
BS 202 203 RR4AG80TF
BS 204 225 RR4FA41TF
BS 226 226 RR4AG80TF
BS 227 396 RR4FA41TF
BS 397 397 RR4AG80TF
BS 398 471 RR4FA41TF

RD RR4AG80JQ 471 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCCCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4FA41JQ 471 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAACGTCGTCACCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAA**TAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGCGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGTCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4FA41TF 471 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAACGTCGTCACCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAA**TAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGCGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGTCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4AG80TF 471 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCCCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 4

CO CL3018Contig1 469 4 3 U
GGAGTGGCCATTACGCCGGGGGAAACTTTCAAAAGGCATTTTGTCGGCTGATTCTGCGAA
GCTAACGAAGATGGTTCTACAAAACGATATTGATCTGCTGAACCCACCAGCTGAGCTTGA
GAAGAGGAAACACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAGTCTCCCAATTCATTTTTCATGGATGT
GAAGTGCCAAGGCTGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCACTCGCAGACGGTTGTGGT
GTGTGCAAACTGCCAGAATGTGCTGTGCCAACCCACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGA
AGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGACACAAGATCAAGACGGCTCCACTCCACCCACACCT
TCTTTCCTTCCTTTTGTTTCTTGTATGATTTTTGAGCTAGTATACTTTATATGTTGATGA
CTTGAGTTTCAGAGCATGGATCTTATTGTTAAAAGTTCGTTTCGTTACC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E417JQ C 1
AF RR4E417TF U 58
AF RR4E469JQ C 1
AF RR4E469TF U 1
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DS 

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GAAGTGCCAAGGCTGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCACTCGCAGACGGTTGTGGT
GTGTGCAAACTGCCAGAATGTGCTGTGCCAACCCACAGGAGGAAAGGCTAGGCTCACAGA
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TCTTTCCTTCCTTTTGTTTCTTGTATGATTTTTGAGCTAGTATACTTTATATGTTGATGA
CTTGAGTTTCAGAGCATGGATCTTATTGTTAAAAGTTCGTTTC
GTTACC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 4

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TAAACCAATAATAACAGTATATGCGATTGTGTCTCGATCATGTATTTTACTGTCTGTGAG
GAGTTTTTGTGGCATAAGCTGGGCATAGATACATATCCAAATCTATCATCCAGGTCCAGG
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GTATGC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR4H014JQ U 3
AF RR4H140JQ U 3
AF RR4H140TF C 1
AF RR4H014TF C 20
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QA 1 689 1 689
DS 

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AGGTGAGCTGCTTAAAATAAAGGTAATGTAGATAACGCCTTTGGTAATGTATTTAAAATA
AAGGTATTTGATAGAGATGTGGCGCTACGTCCTTGGTTATAGTCTATCGGGTCATAACCT
ATCAGAAAGAGGTGAGCTGTAACGCTACCGCATCCCAATCTAACTTCCAGTGATCCACTA
AACCAATAATAACAGTATATGCGATTGTGTCTCGATCATGTATTTTACTGTCTGTGAGGA
GTTTTTGTGGCATAAGCTGGGCATAAATACATATCCAAATCTATCATCCAGGTCCAGGAA
AAAATCAACTTTTTTCTACTTCTCAGTCACCTTGTTCCATCTTGCTCCCTTTCCATCTAT
GTAGCTTATGCATGCATCGAGACCTAGCCCCTGTTACCATAAGCATGTAATTTTGACCAA
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TAAAAACGTGAAGCAACTCTCTATTACTCAATAAGAATATTATAGATATATACATTAGAA
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QA 1 712 1 712
DS 

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TAAACCAATAATAACAGTATATGCGATTGTGTCTCGATCATGTATTTTACTGTCTGTGAG
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GTATGC

QA 1 726 1 726
DS 

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TGTATGAAAATGTTAGAAGTGGATCCTCAGATATCGAAAATAAAGGTGAGCTGCTTAAAA
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TGTAACGCTACCGCATCCCAATCTAACTTCCAGTGATCCACTAAACCAATAATAACAGTA
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TAAAATGGTCATAGAAGGGGTTGAAAGAACTATCTCAGAAGGTATGC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

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AAGACAATACAAGGCTGACTTTGAAAGAAAGTCAGCATCAACATTTGAAGAACGCGGAAT
ATAACGAAACGAAATAGAGTCTAGGGTACTAGCCAGAGTCCTGATATCATGTAGCACACC
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AAACATGATGAGGCTCCTAACATGAGATGAAACTGCAGCAAGAAGTGCAGCCTTGACCGC
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AGGAACCACAATACGTGGTAGGGAAGGCTTTGAGACAACAGTCTGAGCCGCCCTCCAAGC
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GAGAAGCTTGTTTCTATTTGTCCATAGAATCCAAAGAATCCATGGATATAGAGGCGTGGT
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CAAATTCGTATTTTTCTTTAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH28JQ U 188
AF RR4EW51JQ U 57
AF RR4EW51TF C 1
AF RR4BH28TF C 205
BS 1 56 RR4EW51TF
BS 57 187 RR4EW51JQ
BS 188 366 RR4BH28JQ
BS 367 367 RR4EW51JQ
BS 368 419 RR4BH28JQ
BS 420 435 RR4EW51JQ
BS 436 532 RR4EW51TF
BS 533 533 RR4BH28TF
BS 534 677 RR4EW51TF
BS 678 926 RR4BH28TF

RD RR4BH28JQ 232 0 0
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QA 1 232 1 232
DS 

RD RR4EW51JQ 383 0 0
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CCGCCAGGGCTTCTGCTACGAAAGCAAAAGGAACAGAGCGCCGGTGTGAAGTAAAGTTTT
CTGTGATGAAGTTGGTCGCGTCTCGCAGCTGCCAACCGAGCCCACAGTTTCCTGAAGTTG
GATCCCAAGCTGCATCCGA
AAAA

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR4EW51TF 679 0 0
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AAGACAATACAAGGCTGACTTTGAAAGAGAGTCAGCATCAACATTTGAAGAACGCGGAAT
ATAACGAAACGAAATAGAGTCTAGGGTACTAGCCAGAGTCCTGATATCATGTAGCACACC
CTGAAGAACCACAGATTGCCCTTGAGAGTTCAAAAGCGAGATGAGATTCTTTGAGTCCGA
GAACATGATGAGGCTCCTAACATGAGATGAAACTGCAGCAAGAAGTGCAGCCTTGACCGC
CAGGGCTTCTGCTACGAGAGCAGAAGGAACAGAGCGCCGGTGTGAAGTAGAGTTTTCTGT
GATGAAGTTGGTCGCGTCTCGCAGCTGCCAACCGAGCCCACAGTTTCCTGAAGTTGGATC
CCAAGCTGCATCCGAGAAAGAAGACCAAGTATATGAGTTAGTAGCCTGTGAAGTAACTAA
AGGAACCACAATACGTGGTAGGGAAGGCTTTGAGACAACAGTCTGAGCCGCCTTCCAAGC
TCTAGAATCCTGTAAAGCTTTTAGGATCGTGTTCTCTTCTGAGAATTCCCTGTGATCAAA
GAGAAGCTTGTTTCTATTTGTCCATAGAATCCAAAGAATCCATGGATATAGAGGCGTGGT
TCCTAGGCCTAGAGGAG
CC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4BH28TF 722 0 0
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AGATGAAACTGCAGCAAGAAGTGCAGCCTTGACCGCCAGGGCTTCTGCTACGAGAGCAGA
AGGAACAGAGCGCCGGTGTGAAGTAGAGTTTTCTGTGATGAAGTTGGTCGCGTCTCGCAG
CTGCCAACCGAGCCCACAGTTTCCTGAAGTTGGATCCCAAGCTGCATCCGAGAAAGAAGA
CCAAGTATATGAGTTAGTAGCCTGTGAAGTAACTAAAGGAACCACAATACGTGGTAGGGA
AGGCTTTGAGACAACAGTCTGAGCCGCCCTCCAAGCTCTAGAATCCTGTAAAGCTTTTAG
GATCGTGTTCTCTTCTGAGAATTCCCTGTGATCAAAGAGAAGCTTGTTTCTATTTGTCCA
TAGAATCCAAAGAATCCATGGATATAGAGGCGTGGTTCCTAGGCCTAGAGGAGGGAGCGA
GATCATCCTACGACACTGGTGAAGTAGATCAGAAACAGAGGAGATGGCTTGTGGGTTCGG
TTTAAACAGGCAAGGAGCGAGATCCCACACCTTCTGTGCAAACGGACAGTGCAAGAGGAC
ATGGATTTCAGTTTCCAGAGCTCCACATCGTTGACACGAAATTGTATTCTTTATTGATAG
AACATCAAAACAAATGTGAAAACAAAAAACAATGATCAAATTCGTATTTTTCTTTAAAAC
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3021Contig1 947 3 19 U
GGGGAGAGCTATCTTTCTTGATTATGATGGCACTCTTGTCCCTGAAAGCTCCATTACTCA
AGATCCAAGCGCTGAGGTTTTGTCTGTTCTAAAGGCTCTTTGTGAGGATGCTAAGAACAC
TGTGTTTATTGTTAGTGGGAGAGGACCGGAGTCTTTGAGCGAGTGGTTGTCTCCTTGTGA
GAATCTTGGTATAGCTGCTGAACATGGATACTTCATAAGGTGTAATAGCAAGAAAGAGTG
GGAGACTTGTTACTCGTCTACGGGTACAGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTGATGAG
ATCATACATGGAGGCAACAGATGGGTCTAGTATAGAGTTTAAAGAGAATGCTCTTGTGTG
GCATCATCAAGATGCTGATCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCA
TCTAGAGAGCGTGCTTGCGAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATCGTTGA
AGTAAAACCACAGGGTGTAAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGT
TGAACGTGGTGAACCGCCAGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGA
TATGTTTGAGGGTATGCTGAGTACTGTGACGAATCCAGAGCTTCTGATTCAGCCAGAGGT
TTTTGCCTGCACTGTTGGGAGGAAACCAAGTAAGGCCAAGTACTTTTTGGACGATGTAGC
TGATGTGCTTAAGCTACTAAAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACTACTTC
TCACACAGAAGTTGCATTTGAAAGCATCTTTTAAAAGTGGAAGTGTCAAAAAATAACCGG
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CTTTTGAAGGATTTATTGTTTTTTGGTTTTAACTATTGTTTTGGGTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DU53TF U 1
AF RR4FZ56TF U 241
AF RR4FZ56JQ C 434
BS 1 369 RR4DU53TF
BS 370 370 RR4FZ56TF
BS 371 549 RR4DU53TF
BS 550 550 RR4FZ56TF
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TGATGTGCTTA*GCTACTAAAAGGTTTGGGGGAT*CATCGTTGAGCTTGA
GACTACTCTCACACAG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4FZ56TF 649 0 0
GGAGACTTGTTACTCGTCTACGGGTACAGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTGATGAG
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GCATCATCAAGATGCTGATCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCA
TCTAGAGAGCGTGCTTGCGAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATCGTTGA
AGTAAAACCACAGGGTGTAAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGT
TGAACGTGGTGAACCGCCAGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGA
TATGTTTGAGGGTATGCTGAGTACTGTGACGAATCCAGAGCTTCTGATTCAGCCAGAGGT
TTTTGCCTGCACTGTTGGGAGGAAACCAAGTAAGGCCAAGTACTTTTTGGACGATGTAGC
TGATGTGCTTAAGCTACTAAAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACTACTTC
TCACACAGAAGTTGCATTTGAAAGCATCTTTTAAAAGTGGAAGTGTCAAAAAATAACCGG
AGTTAAATTTACTTAACATCAAAATGTAAAAAA*GAAAATGAGAAATGG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4FZ56JQ 514 0 0
CTTGCGAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATCGTTGAAGTAAAACCACAG
GGTGTAAGCAAAGGTTTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGTGAA
CCCCCAGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATATGTTTGAGGGT
ATGCTGAGTACTGTGACGAATCCAGAGCTTTTGATTCAGCCAGAGGTTTTTGCCTGCACT
GTTGGGAGGAAACCAAGTAAGGCCAAGTACTTTTTGGACGATGTAGCTGATGTGCTTAAG
CTACTAAAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACTACTTTTCACACAGAAGTT
GCATTTGAAAGCATTTTTTAAAAGTGGAAGTGTCAAAAAATAACCGGAGTTAAATTTACT
TAACATCAAAATGTAAAAAAAGAAAATGAGAAATGGTATTTAATTTGCTTTTGAAGGATT
TATTGTTTTTTGGTTTTAACTATTGTTTTGGGTT

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 4

CO CL3022Contig1 837 4 2 U
GGATGAGAACACTCCAATAGTCTCGTCCTCTTCCTCTTGCGTCCATCTCTCCCTCTAAAA
CAACAATGGCAATGTGGGGTTTGGTCTTATGCGTTCTTACAATTCTTGCTGATTTCACAA
CAATTTCTGAAGCAAGAATCCCAGGAGTTTACAGTGGAGGTGGTTGGGAAACTGCTCATG
CTACTTTCTATGGTGGCTCTGATGCTTCCGGCACCATGGGAGGTGCTTGTGGGTACGGGA
ACTTGTACAGCCAAGGCTACGGCGTGAACACGGCGGCTCTAAGCACGGCTCTATTCAACA
ACGGTTACAGTTGCGGTGCTTGTTTCGAGCTCAAATGCGCGAGTGACCCTAAGTGGTGCC
ACTCAGGCAGCCCTTCCATCTTCGTCACTGCCACCAACTTCTGTCCTCCTAACTTCGCTC
AGCCTAGTGACAATGGAGGATGGTGCAACCCTCCTAGGCCTCACTTCGATCTCGCTATGC
CTATGTTCCTCAAGATCGCCGAGTATCGAGCCGGAATCATCCCCGTCTCTTTCCGCCGGA
CCGTTTTACGAAGACCCTGATTGGGACGGGTGAAGAACGTGAGGGGGTCTACTACTTTAC
TGGGGTCACAGCTGCACGAGTTCATCGGACTGAGTTAAAGAATGCTTCTACTTCAGAACT
ATGGCATCGACGGCTAGGACACCCATCTTATAGGGTTTTATCGGCTTTACCTGTTTTAGA
TAGAATGGTGTTTGATTCAGAACAAGCTTCGTCTTGTGAGATTTGTTTTCGTGCTAAGCA
GACACGACGAGTTTTTAATGATAGTTTGAATAAAGCTTCTTTGCCTCTTTCGCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BK34TF U 1
AF RR4CV27TF U 8
AF RR4CV27JQ C 98
AF RR4BK34JQ C 127
BS 1 710 RR4BK34TF
BS 711 837 RR4CV27JQ

RD RR4BK34TF 710 0 0
GGATGAGAACACTCCAATAGTCTCGTCCTCTTCCTCTTGCGTCCATCTCTCCCTCTAAAA
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CAATTTCTGAAGCAAGAATCCCAGGAGTTTACAGTGGAGGTGGTTGGGAAACTGCTCATG
CTACTTTCTATGGTGGCTCTGATGCTTCCGGCACCATGGGAGGTGCTTGTGGGTACGGGA
ACTTGTACAGCCAAGGCTACGGCGTGAACACGGCGGCTCTAAGCACGGCTCTATTCAACA
ACGGTTACAGTTGCGGTGCTTGTTTCGAGCTCAAATGCGCGAGTGACCCTAAGTGGTGCC
ACTCAGGCAGCCCTTCCATCTTCGTCACTGCCACCAACTTCTGTCCTCCTAACTTCGCTC
AGCCTAGTGACAATGGAGGATGGTGCAACCCTCCTAGGCCTCACTTCGATCTCGCTATGC
CTATGTTCCTCAAGATCGCCGAGTATCGAGCCGGAATCATCCCCGTCTCTTTCCGCCGGA
CCGTTTTACGAAGACCCTGATTGGGACGGGTGAAGAACGTGAGGGGGTCTACTACTTTAC
TGGGGTCACAGCTGCACGAGTTCATCGGACTGAGTTAAAGAATGCTTCTACTTCAGAACT
ATGGCATCGACGGCTAGGACACCCATCTTATAGGGTTTTATCGGCTTTAC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4CV27TF 661 0 0
AACACTCCAATAGTCTCGTCCTCTTCCTCTTGCGTCCATCTCTCCCTCTAAAACAACAAT
GGCAATGTGGGGTTTGGTCTTATGCGTTCTTACAATTCTTGCTGATTTCACAACAATTTC
TGAAGCAAGAATCCCAGGAGTTTACAGTGGAGGTGGTTGGGAAACTGCTCATGCTACTTT
CTATGGTGGCTCTGATGCTTCCGGCACCATGGGAGGTGCTTGTGGGTACGGGAACTTGTA
CAGCCAAGGCTACGGCGTGAACACGGCGGCTCTAAGCACGGCTCTATTCAACAACGGTTA
CAGTTGCGGTGCTTGTTTCGAGCTCAAATGCGCGAGTGACCCTAAGTGGTGCCACTCAGG
CAGCCCTTCCATCTTCGTCACTGCCACCAACTTCTGTCCTCCTAACTTCGCTCAGCCTAG
TGACAATGGAGGATGGTGCAACCCTCCTAGGCCTCACTTCGATCTCGCTATGCCTATGTT
CCTCAAGATCGCCGAGTATCGAGCCGGAATCATCCCCGTCTCTTTCCGCCGGACCGTTTT
ACGAAGACCCTGATTGGGACGGGTGAAGAACGTGAGGGGGTCTACTACTTTACTGGGGTC
ACAGCTGCACGAGTTCATCGGACTGAGTTAAAGAATGCTTCTACTTCAGAACTATGGCAT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4CV27JQ 740 0 0
TACAATTCTTGCTGATTTCACAACAATTTCTGAAGCAAGAATCCCAGGAGTTTACAGTGG
AGGTGGTTGGGAAACTGCTCATGCTACTTTCTATGGTGGCTCTGATGCTTCCGGCACCAT
GGGAGGTGCTTGTGGGTACGGGAACTTGTACAGCCAAGGCTACGGCGTGAACACGGCGGC
TCTAAGCACGGCTCTATTCAACAACGGTTACAGTTGCGGTGCTTGTTTCGAGCTCAAATG
CGCGAGTGACCCTAAGTGGTGCCACTCAGGCAGCCCTTCCATTTTCGTCACTGCCACCAA
CTTCTGTCCTCCTAACTTCGCTCAGCCTAGTGACAATGGAGGATGGTGCAACCCTCCTAG
GCCTCACTTCGATCTCGCTATGCCTATGTTCCTCAAGATCGCCGAGTATCGAGCCGGAAT
CATCCCCGTCTCTTTCCGCCGGACCGTTTTACGAAGACCCTGATTGGGACGGGTGAAGAA
CGTGAGGGGGTCTACTACTTTACTGGGGTCACAGCTGCACGAGTTCATCGGACTGAGTTA
AAGAATGCTTCTACTTCAGAACTATGGCATCGACGGCTAGGACACCCATCTTATAGGGTT
TTATCGGCTTTACCTGTTTTAGATAGAATGGTGTTTGATTCAGAACAAGCTTCGTCTTGT
GAGATTTGTTTTCGTGCTAAGCAGACACGACGAGTTTTTAATGATAGTTTGAATAAAGCT
TCTTTGCCTCTTTCGCTTAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4BK34JQ 711 0 0
CTGAAGCAAGAATCCCAGGAGTTTACAGTGGAGGTGGTTGGGAAACTGCTCATGCTACTT
TCTATGGTGGCTCTGATGCTTCCGGCACCATGGGAGGTGCTTGTGGGTACGGGAACTTGT
ACAGCCAAGGCTACGGCGTGAACACGGCGGCTTTAAGCACGGCTCTATTCAACAACGGTT
ACAGTTGCGGTGCTTGTTTCGAGCTCAAATGCGCGAGTGACCCTAAGTGGTGCCACTCAG
GCAGCCCTTCCATTTTCGTCACTGCCACCAACTTCTGTCCTCCTAACTTCGCTCAGCCTA
GTGACAATGGAGGATGGTGCAACCCTCCTAGGCCTCACTTCGATCTCGCTATGCCTATGT
TCCTCAAGATCGCCGAGTATCGAGCCGGAATCATCCCCGTCTCTTTCCGCCGGACCGTTT
TACGAAGACCCTGATTGGGACGGGTGAAGAACGTGAGGGGGTCTACTACTTTACTGGGGT
CACAGCTGCACGAGTTCATCGGACTGAGTTAAAGAATGCTTCTACTTCAGAACTATGGCA
TCGACGGCTAGGACACCCATCTTATAGGGTTTTATCGGCTTTACCTGTTTTAGATAGAAT
GGTGTTTGATTCAGAACAAGCTTCGTCTTGTGAGATTTGTTTTCGTGCTAAGCAGACACG
ACGAGTTTTTAATGATAGTTTGAATAAAGCTTCTTTGCCTCTTTCGCTTAT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 4

CO CL3023Contig1 470 4 5 U
GGAGACTGCGTCTCCTCTTTCTCCTACACAATCAAAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGA
CCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTGAAAACTGCCCCTGCTGATTTCCG
GTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACTGTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTG
TACAACTGCAAAGGGAGAAGACTCCAATGAATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGC
TCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAACGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCC
TGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGATCAGGCTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCA
GAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGTTGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTT
TTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTGGAAAGACATTCTTTTGGATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4CX09JQ C 1
AF RR4CO31JQ C 28
AF RR4CO31TF U 28
AF RR4CX09TF U 1
BS 1 29 RR4CX09TF
BS 30 181 RR4CO31TF
BS 182 182 RR4CX09TF
BS 183 469 RR4CO31TF
BS 470 470 RR4CX09JQ

RD RR4CX09JQ 470 0 0
GGAGACTGCGTCTCCTCTTTCTCCTACACAATCAAAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGA
CCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTGAAAACTGCCCCTGCTGATTTCCG
GTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACTGTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTG
TACAACTGCAAAGGGAGAGGACTCCAATGAATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGC
TCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCC
TGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGATCAGGCTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCA
GAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGTTGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTT
TTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTGGAAAGACATTCTTTTGGATTG

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4CO31JQ 442 0 0
GG
AATCAAAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGACCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGA
TTGAGTTGAAAACTGCCCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACT
GTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTGTGCAACTGCAAAGGGAGAAGACTCCAATG
AATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGT
GGAACGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGATCAGG
CTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCAGAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGT
TGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTG
GAAAGACATTCTTTTGGATT

QA 3 442 3 442
DS 

RD RR4CO31TF 442 0 0
GG
AATCAAAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGACCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGA
TTGAGTTGAAAACTGCCCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACT
GTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTGTGCAACTGCAAAGGGAGAAGACTCCAATG
AATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGT
GGAACGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGATCAGG
CTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCAGAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGT
TGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTG
GAAAGACATTCTTTTGGATT

QA 3 442 3 442
DS 

RD RR4CX09TF 470 0 0
GGAGACTGCGTCTCCTCTTTCTCCTACACAATCAAAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGA
CCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTGAAAACTGCCCCTGCTGATTTCCG
GTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACTGTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTG
TACAACTGCAAAGGGAGAGGACTCCAATGAATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGC
TCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCC
TGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGATCAGGCTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCA
GAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGTTGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTT
TTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTGGAAAGACATTCTTTTGGATT
G

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 4

CO CL3024Contig1 858 4 2 U
GGACTCAATCAGTTTCTCTGTTTTGTCTTTCTGCTCCTTCACACCTCCAAAAGTCAAACC
AGCTCTTTTTGAAAATTTAGAGTCTTTATCTATTATTTTGTCGGTCAGGATGATAGGCCG
GATCCTCGCCGAAATCATGGAGAGTCCGGCGGTGGCTGCAGCAGGTGACTCAGTTCTGGG
TACTATCAAAATCATCCAACCTGCCATGATACTTGGTGCAATACCTTTCACCAAGAAGTT
GATCTTCACAAACGGTGCACCTCTTTTCTTCTTCACAGATAGCTGCATGATTCTTGGGGA
CGCCATGATACCATGTATACTGCTGGCACTTGGTGGGAATCTCATCAACGGACCAGGAAG
TTCAAGACTTGGTTTTAAGACAACAGCGGCGATTATATTTGGACGGTTGGTGTTGGTGCC
ACCGGTAGGACTAGGGATAGTGACATTAGCAGACAGACTTGGGTTCCTTCCAGCTGGTGA
CAAGATGTTCAAGTTTGTGTTGCTCTTACAGCACACAATGCCTACCTCTGTGCTGTCTGG
AGCTGTTGCTAACCTTAGAGGCTGTGGAAGAGAATCGGCTGCTGTGCTCTTCTGGGTTCA
CATTTTCGCCATCTTCTCAATGGCTGGATGGATGGTGCTGTATATCAACATACTCTTCTA
AACACATCCTGCTTCTCCCACATTCATCTCACACTATGCTGTAAATACAAGGGCATCTTC
ATATGTGCCTCAACCACCCTAAGATTAGTTTTTTTTTTCTTTTACTTTCTTGTGTAAATG
TGAGTTTATAACTCTTACCGACTACTGCAACATGAACTGAGAACCCTTTCTTTTCTCTGA
ATAAATTAAAAATTATAT


BQ
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TACCTCTGTGCTGTCTGGAGCTGTTGCTAACCTTAGAGGCTGTGGAAGAGAATCGGCTGC
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TACTTTCTTGTGTAAATGTGAGTTTATAACTCTTACCGACTACTGCAACATGAACTGAGA
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QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

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CATTACTCCTTTCGCTCTCGTTCTTGAGAGGAACTCAAGACCAAGGCTGACTTTCAAAAT
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TATATATCAAGCTGTTGTCAG


BQ
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AF RR4CD12TF U 336
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CATTACTCCTTTCGCTCTCGTTCTTGAGAGGAACTCAAGACCAAGGCTGACTTTCAAAAT
CTTATTACAAATATCCATCCTGAGTTTATTTGAGCCTGTGGTTGAACAAAACCTGTACTA
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AGCGAGCTGCTTCAGTTGGTCATGTTACATCATTTT

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DS 

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G
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TAAGCCAAGGGTGATTATTGGGCAGTCACATGCTATGAATACTCCAAAGCAGGATGATAT
AGGAAAAGGATCAGTTATGCTTGTAGCGAGCTGCTTCAGTTGGTCATGTTACATCATTTT
ACAGGCAAACATTCTGAATACATATCATGCTGAGCTCTCGCTAACAGCACTTATGTGCAT
TATGGGGATGCTGGAGGCTAGTGTTATAGCATTGATATGGGAAAGGAAGAACATGTCTGT
CTGGAAAATCCACCTGGGCATGAAGCTTTTAGCTTCAATATATGGGGGACTTGTCTCAGG
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ATTTAACCCTCTCAGCATGGTCATCGTTGCCATACTGAGTTCCTTTGTTTTCTTGGAAAA
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DS 

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TCATGCTGAGCTCTCGCTAACAGCACTTATGTGCATTATGGGGATGCTGGAGGCTAGTGT
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GGCATCAAAGAAGAGAGGGCCTGTGTTTGTGAGCGCATTTAACCCTCTCAGCATGGTCAT
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AGTAGAGCAGCATCTACCAAACGCTGGGTGTGCAGAGACTGTGGCGAAAACTGACGAGCA
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AAAGCCAGCAACTCAGTCTCACTCAGTCTGATATGCTGATTCTGTTACATTCTCTCTAAT
ATAATGCACCACATTTTTGGTAGTATTAACAGTATATGGTTTGCCAGAAAAGCAAGCAAT
GCTATCTGCATCTTAAGTTTTGGAGTATAATTGCAGAAATTTAGAAACCTTAGTAAGGGA
AGCCATTGTGGTAGATTTCTGATAACCTCCATTTATAAGAATGAAAGAAGCCTATACATA
TATATATCAAGCTGTTGTCAG

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DS 



AS 1 4

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AGTGGAAATCTGTTTTGGTTAGCTCTCCTCCTCCTGGTCGTTGGGGTCATACTCTTTCTT
GTGTCAACGGCTCTCGTTTAGTAGTCTTTGGAGGTTACGGTAGCCATGGGTTACTCAACG
ATGTCTTCTTACTAGACCTTGATGCAGACCCTCCTACATGGAGAGAAGTATCCGGTTTAG
CCCCTCCAATACCGAGATCGTGGCATAGCTCGTGTACGCTCGATGGAACCAAGCTGATTG
TATCTGGTGGTTGTGCTGATTCAGGAGCTTTGCTTAACGATACATTCTTGCTTGACTTTC
GATGGATACACCAACTTGGAGGGAGATAAGAGTTCCATGGTCTCCTCCATCTCGCCTCGA
ACATACTTTAACAGTGTACGGTGACCGGAAGATACTTATGTTTGGTGGTCTTGCGGAATA
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TGCAGGGCTTGACTCGGCTTCTCAGCTTTATCTTCTTGATCCAACGGAGGAGAAACCGGC
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TGTGGTGGGAGGGACTCGGTTGGTCGCCTTTGGTGGCCAGACAGGTGAAGAGTGGATGTT
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TGAAGAGAAGAGGCTCTTCTAGAAATGGAAACTCAGATGGTTCTTAGTTGCTCTGTACAT
GATGAGTTTGAGAGTCCATGTTTTGTTAGTATTTTGGGTATTATGGTATTTGTATATTCA
ACATTACGAATCTTATTTGTATATTCCTTCTTGTGTAGTACAATCTTGTAGGTGACCGGA
TGATCCAAAACCAAACTTAATGTTAAAATCTGCTGTATTTCTCTAC


BQ
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AF RR4EK95TF U 1
AF RR4BB15TF U 169
AF RR4BB15JQ C 676
AF RR4EK95JQ C 999
BS 1 193 RR4EK95TF
BS 194 194 RR4BB15TF
BS 195 265 RR4EK95TF
BS 266 266 RR4BB15TF
BS 267 304 RR4EK95TF
BS 305 305 RR4BB15TF
BS 306 403 RR4EK95TF
BS 404 404 RR4BB15TF
BS 405 412 RR4EK95TF
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BS 481 667 RR4EK95TF
BS 668 909 RR4BB15TF
BS 910 1122 RR4BB15JQ
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BS 1174 1174 RR4EK95JQ
BS 1175 1226 RR4BB15JQ
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BS 1228 1381 RR4BB15JQ
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BS 1383 1498 RR4BB15JQ
BS 1499 1546 RR4EK95JQ

RD RR4EK95TF 671 0 0
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GTGGGCTATGTGGGATATTCGAGCTGAGCGATGAGGTCATGGCTTACAGGATCTTGTCTC
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TTACGACACACGAAGCAACTGCTTGGAGGAAGTTCTCCGTTGGAGGTATTGTTCAGCCTT
CTCGGTGTAACTTCAGCACTTGTGCGGTTGGGAACAAGATTGTTATCTTCGGTGGGGAAG
GTGTGAACATGGAACCGATGAATGATACGTTTGTGTTGGACCTTGGCTCCACTAGTCCCG
AGTGGAAATCTGTTTTGGTTAGCTCTCCTCCTCCTGGTCGTTGGGGTCATACTCTTTCTT
GTGTCAACGGCTCTCGTTTAGTAGTCTTTGGAGGTTACGGTAGCCATGGGTTACTCAACG
ATGTCTTCTTACTAGACCTTGATGCAGACCCTCCTACATGGAGAGAAGTATCCGGTTTAG
CCCCTCC
TATA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BB15TF 741 0 0
G
TAATGAGCTGACGAAGAACGATGACGTGTGGAGAATGGTCTGCCAGAACACGTGGGGGAG
TGAAGCTACACGTGTTCTCGAGACTGTTCCCGGCGCAAAGAGGATCGGTTGGGTGAGATT
AGCTCGAGAGTTTACCACACACGAAGCAACTGCTTGGAGGAAGTTCTCCGTTGGAGGTAT
TGTTCAGCCTTCTCGGTGTAACTTCAGCACTTGTGCGGTTGGGAACAAGATTGTGATCTT
CGGCGGGGAAGGTGTGAACATGGAACCGATGAATGATACGTTTGTGTTGGACCTTGGCTC
CACTAGTCCCAAGTGGAAATCTGTTTTGGTTAGCTCTCCTCCTCCTGGTCGTTGGGGTCA
TACTCTTTCTTGTGTCAACGGCTCTCGTTTAGTAGTCTTTGGAGGTTACGGTAGCCATGG
GTTACTCAACGATGTCTTCTTACTAGACCTTGATGCAGACCCTCCTACATGGAGAGAAGT
ATCCGGTTTAGCCCCTCCAATACCGAGATCGTGGCATAGCTCGTGTACGCTCGATGGAAC
CAAGCTGATTGTATCTGGTGGTTGTGCTGATTCAGGAGCTTTGCTTAACGATACATTCTT
GCTTGACTTTCGATGGATACACCAACTTGGAGGGAGATAAGAGTTCCATGGTCTCCTCCA
TCTCGCCTCGAACATACTTTAACAGTGTACGGTGACCGGAAGATACTTATGTTTGGTGGT
CTTGCGGAATATGGTTCTAG

QA 2 741 2 741
DS 

RD RR4BB15JQ 824 0 0
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CTGATTCAGGAGCTTTGCTTAACGATACATTCTTGCTTGACTTTCGATGGATACACCAAC
TTGGAGGGAGATAAGAGTTCCATGGTCTCCTCCATCTCGCCTCGAACATACTTTAACAGT
GTACGGTGACCGGAAGATACTTATGTTTGGTGGTCTTGCGGAATATGGTTCTAGGAGGTT
CCGGTCTAATGATGTATACACGATGAATCTTAGTGAGGATACACCGTGCTGGAGACCTGT
GGTTGGGTATGGAACTAGCCTTCCTGGAGGCGTGGCAGCTCCGAGGTTGGATCATGTGGC
GATTAGTCTCCCGGGTGGGCAAATCTTGATCTTTGGTGGTTCGGTTGCAGGGCTTGACTC
GGCTTCTCAGCTTTATCTTCTTGATCCGACGGAGGAGAAACCGGCTTGGAGAGTGTTGAA
TGTTAAGGGAAGCTCGCCGCAGTTTGCGTGGGGACACACGACATGTGTGGTGGGAGGGAC
TCGGTTGGTCGTCTTTGGTGGCCAGACAGGTGAAGAGTGGATGTTAAATGAAGCTCATGA
ACTGTTGTTAGCCAACTCTAGTACTAAAATCACCTCATCGAGACATGAAGAGAAGAGGCT
CTTCTAGAAATGGAAACTCAGATGGTTCTTAGTTGCTCTGTACATGGTGAGTTTGAGAGT
CCATGTTTTGTTAGTATTTTGGGTATTATGGTATTTGTATATTCAACATTACGAATCTTA
TTTGTATATTCCTTCTTGTGTAGTACAATCTTGTAGGTGACCG
T

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4EK95JQ 548 0 0
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TCTTGATCTTTGGTGGTTCGGTTGCAGGGCTTGACTCGGCTTTTCAGCTTTATCTTCTTG
ATCCAACGGAGGAGAAACCGGCTTGGAGAGTGTTGAATGTTAAGGGAAGCTCGCCACAGT
TTGCGTGGGGACACACGACATGTGTGGTGGGAGGGACTCGGTTGGTCGCCTTTGGTGGCC
AGACAGGTGAAGAGTGGATGTTAAATGAAGCTCATGAACTGTTGTTAGCCAACTCTAGTA
CTAAAATCACCTCATCGAGACATGAAGAGAAGATGTTTTTCTAGAAATGGAAACTCAGAT
GGTTTTTAGTTGCTCTGTACATGATGAGTTTGAGAGTCCATGTTTTGTTAGTATTTTGGG
TATTATGGTATTTGTATATTCAACATTACGAATTTTATTTGTATATTCCTTCTTGTGTAG
TACAATTTTGTAGGTGACCGGATGATCCAAAACCAAACTTAATGTTAAAATCTGCTGTAT
TTCTCTAC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 4

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GGGTGTAAAAATTAAATATTAACATATATTTAAAACTTCTCTACATATATAAACTGATCC
CATTACAAAACTGTATGTGTGTTTATTTTGTAGTCTCTTCAGCATGCCGCTGCAATAAAC
TTGAAATCACACTACTCCGTTTAAACCTCCGGTTATTACCAA**CGGTTCCTTGTCGATG
AAGACCGGTCGACCCGGTTCTTGTCTTCCTCAACCGCTCTGTTCCATCGTTCTTTAAAGG
TCTGAAGCTCCCATGTTGATTGTCTCCGTATCTCTGTTCTTGAATCAAAAGCAGGAGAGC
CGCGTCTTCTGTTGACAACACTGCGAGCTGAGTTCTTCTTGTCAGGATAACCACTTCCAC
CTAGAGTTTGAATGCCTTGATGGAAGATATATTCACTGTCAACAATACCAACTTTCTTGC
TACGGTCACCCTGAGCACAGTAGCCAAGTTTCATATCCATTCCCCATCCATGAACCAGAT
CATTTTGTATAAGATTCCAAGTGCAGAACCAAGCAGATCTTGAAAACACTGGAGCCATTC
CTTCAACAAATCCGGTGCACGGAGGCCCTTCACTAGCATTTGAGCACTTCATATTGCCTC
TACTATCATACACTCGTCTATGGAATACTTTTGTTCTAGACCGGACTGTAATCCTATGAT
GAACCTCGGTTGAGTTTGGATGTAAGGCCGGTTGAGATATCTCAAGTCCTGCTGCTTTAC
TATCCTCAAGTATTTTTGCGGGTTGAAGTTCTCAACTCCAAGATCTTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ54JQ U 1
AF RR4E021JQ U 1
AF RR4E021TF C 2
AF RR4H044JQ U 2
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BS 653 773 RR4H044JQ

RD RR4DQ54JQ 652 0 0
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CATTACAAAACTGTATGTGTGTTTATTTTGTAGTCTCTTCAGCATGCCGCTGCAATAAAC
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CTAGAGTTTGAATGCCTTGATGGAAGATATATTCACTGTCAACAATACCAACTTTCTTGC
TACGGTCACCCTGAGCACAGTAGCCAAGTTTCATATCCATTCCCCATCCATGAACCAGAT
CATTTTGTATAAGATTCCAAGTGCAGAACCAAGCAGATCTTGAAAACACTGGAGCCATTC
CTTCAACAAATCCGGTGCACGGAGGCCCTTCACTAGCATTTGAGCACTTCATATTGCCTC
TACTATCATACACTCGTCTATGGAATACTTTTGTTCTAGACCGGACTGTAAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4E021JQ 630 0 0
GGGTGTA
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CTCCCATGTTGATTGTCTCCGTATCTCTGTTCTTGAATCAAAAGCAGGAGAGCCGCGTCT
TCTGTTGACAACACTGCGAGCTGAGTTCTTCTTGTCAGGATAACCACTTCCACCTAGAGT
TTGAATGCCTTGATGGAAGATATATTCACTGTCAACAATACCAACTTTCTTGCTACGGTC
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ATACACTCGTCTATGGAATACTT

QA 8 630 8 630
DS 

RD RR4E021TF 715 0 0
GGTGTA
AAAATTAAATATTAACATATATTTAAAACTTCTCTACATATATAAACTGATCCCATTACA
AAACTGTATGTGTGTTTATTTTGTAGTCTCTTCAGCATGCCGCTGCAATAA*CTTGAAAT
CACACTACTCCGTTTAAACCTCCGGTTATTACCAA**CGGTTCCTTGTCGATGAAGACCG
GTCGACCCGGTTCTTGTCTTCCTCAACCGCTCTGTTCCATCGTTCTTTAAAGGTCTGAAG
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TCTGTTGACAACACTGCGAGCTGAGTTCTTCTTGTCAGGATAACCACTTCCACCTAGAGT
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ACCCTGAGCACAGTAGCCAAGTTTCATATCCATTCCCCATCCATGAACCAGATCATTTTG
TATAAGATTCCAAGTGCAGAACCAAGCAGATCTTGAAAACACTGGAGCCATTCCTTCAAC
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ATACACTCGTCTATGGAATACTTTTGTTCTAGACCGGACTGTAATTCTATGGTGAACTTC
GGTTGAGTTTGGATGTAAGGCCGGTTGAGATATCTCAAGTCCTGCTGC
C

QA 7 714 7 714
DS 

RD RR4H044JQ 772 0 0
GAATGT
AAAATTAAATATTAACATATATTAAAAACTTCTCTACATATATAAACTGATCCCATTACA
GAACTGTATGTGTGTCTATTTCGTAGTCTCTTCAGCATGCCGCTGCAATAAACTTGAAAT
CACACTACTCCGTTTAAACCTCCGGTTATTACCAATACGGTTCCTTGTCGATGAAGACCG
GTCTACCCAGTTCTTGTCTTCCTCAACCGCTCTGTTCCATCGTTCTTTAAAAGTTTGAAG
CTCCCATGTTGATTGTCTCCGTATCTCTGTTCTTGAATCAAAAGCAGGAGAGCCGCGTCT
TCTGTTGACAACACTGCGAGCTGAGTTCTTTTTGTCAGGATAACCACTTCCACCTAGAGT
TTGAATGCCTTGATGGAAGATATATTCACTGTCCACAATGCCAACTTTCTTGCTACGGTC
ACCCTGAGCACAGTAGCCAAGTTTCATATCCATTCCCCATCCATGAACCAGATCATTTTG
TATAAGATTCCAAGTGCAAAACCAAGCAGATCTTGAAAACACTGGAGCCATTCCTTCAAC
AAATCCGGTGCATGGAGGGCCTTCACTAGCATTTGAGCACTTCATATTGCCTCTATTATC
ATACACTCGTCTATGGAATACTTTTGTTCTAGACCGGACCGTAATCCTATGATGAACCTC
GGTTGAGTTTGGATGTAAGGCCGGTTGAGATATCTCAAGTCCTGCTGCTTTACTATCCTC
AAGTATTTTTGCGGGTTGAAGTTCTCAACTCCAAGATCTTCGTCCC

QA 7 772 7 772
DS 



AS 1 4

CO CL3028Contig1 670 4 5 U
ACAAAAAACAAGGAAGAAAACTCCAGTAAAACCATAAGATCTTATTATTTCTTTCTACAA
TGAGCATATTGAAAAATTTAGTAATCATCTCCGTTCTCGGAATATTTTTAGCACCTCGTT
ATTCCGAATCTGAGATATCTTGCAGTGTTGTTCTAAGCGATTTGCAGCCATGTGTTAGCT
ACTTGACTAGCGGAAGTGGAAAACCTCCGGCGACTTGTTGCGAAGGAGTTCAAAAATTAG
ACGCAGCGACCACTACATCTGCCGATAAAAAGGAGGCTTGTGAATGCATCAAGTCAGTGG
CTAGCACTGTCACCGTGAAGCCTGAATTGGCTAAAGCTCTCGCTAGCAATTGTAACGCAA
GCTTGCCGGTTGACGCATCTTCTACTGTCGACTGCAAAACGGTTGGTTGAGATATTTTCA
GTATCATGGAGTGGTCCGTCTATCATTCTTAAGTATGACATTTACATCAATAAAGGCCTT
GTATTATATTGTTTGTGTCTCTAGGCCAAATCATTATAAGGTTCATATAATTTAGTTACG
TTGCATATGTTAATGTATAAGTATTATCTGTTAAATTCTTAACTAGTGCATTTACTTTCG
CCGGTGGTTTGGGTATCTGTGTAAACAGATGTTTCCATTTCCACTACAAGAAAAACAAGG
TACTTCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY52TF U 1
AF RR4FT91TF U 11
AF RR4FT91JQ C 200
AF RR4CY52JQ C 378
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BS 651 670 RR4CY52JQ

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ATTCCGAATCTGAGATATCTTGCAGTGTTGTTCTAAGCGATTTGCAGCCATGTGTTAGCT
ACTTGACTAGCGGAAGTGGAAAACCTCCGGCGACTTGTTGCGAAGGAGTTCAAAAATTAG
ACGCAGCGACCACTACATCTGCCGATAAAAAGGAGGCTTGTGAATACATCAAGTCAGTGG
CTAGCACTGTCACCGTGAAGCCTGAATTGGCTAAAGCTCTCGCTAGCAATTGTAACGCAA
GCTTGCCGGTTGACGCATCTTCTACTGTCGACTGCAAAACGGTTGGTTGAGATATTTTCA
GTATCATGGAGTGGTCCGTCTATCATTCTTAAGTATGACATTTACATCAATAAAGGCCTT
GTATTATATTGTTTGTGTCTCTAGGCCAAATCATTATAAGGTTCATATAATTTAGTTACG
TTGCATATGTTAATGTATAAGTATTATCTGTTAAATTCTTAACTAGTGCATTTACTTTCG
CCGGTGGTTTGGGTATCTGTGTAAACAGATGTTTCCATTTCCACTA
CAAG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4FT91TF 636 0 0
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GAAAAATTTAGTAATCATCTCCGTTCTCGGAATATTTTTAGCACCTCGTTATTCCGAATC
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CGGAAGTGGAAAACCTCCGGCGACTTGTTGCGAAGGAGTTCAAAAATTAGACGCAGCGAC
CACTACATCTGCCGATAAAAAGGAGGCTTGTGAATGCATCAAGTCAGTGGCTAGCACTGT
CACCGTGAAGCCTGAATTGGCTAAAGCTCTCGCTAGCAATTGTAACGCAAGCTTGCCGGT
TGACGCATCTTCTACTGTCGACTGCAAAACGGTTGTTTGAGATATTTTCAGTATCATGGA
GTGGTCCGTCTATCATTCTTAAGTATGACATTTACATCAATAAAGGCCTTGTATTATATT
GTTTGTGTCTCTAGGCCAAATCATTATAAGGTTCATATAATTTAGTTACGTTGCATATGT
TAATGTATAAGTATTATCTGTTAAATTCTTAACTAGTGCATTTACTTTCGCCGGTGGTTT
GGGTATCTGTGTAAACAGATGTTTCCATTTCCACTA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FT91JQ 456 0 0
AAAACCTCCGGCGACTTGTTGCGAAGGAGTTCAAAAATTAGACGCAGCGACCACTACATC
TGCCGATAAAAAGGAGGCTTGTGAATGCATCAAGTCAGTGGCTAGCACTGTCACCGTGAA
GCCTGAATTGGCTAAAGCTCTCGCTAGCAATTGTAACGCAAGCTTGCCGGTTGACGCATC
TTCTACTGTCGACTGCAAAACGGTTGTTTGAGATATTTTCAGTATCATGGAGTGGTCCGT
CTATCATTCTTAAGTATGACATTTACATCAATAAAGGCCTTGTATTATATTGTTTGTGTC
TCTAGGCCAAATCATTATAAGGTTCATATAATTTAGTTACGTTGCATATGTTAATGTATA
AGTATTATCTGTTAAATTCTTAACTAGTGCATTTACTTTCGCCGGTGGTTTGGGTATCTG
TGTAAACAGATGTTTCCATTTCCACTACAAG
AAAAA

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4CY52JQ 293 0 0
TCTTTTACTGTCGACTGCAAAACGGTTGGTTGAGATATTTTCAGTATCATGGAGTGGTCC
GTCTATCATTCTTAAGTATGACATTTACATCAATAAAGGCCTTGTATTATATTGTTTGTG
TCTTTAGGCCAAATCATTATAAGGTTCATATAATTTAGTTACGTTGCATATGTTAATGTA
TAAGTATTATCTGTTAAATTCTTAACTAGTGCATTTACTTTCGCCGGTGGTTTGGGTATC
TGTGTAAACAGATGTTTCCATTTCCACTACAAGAAAAACAAGGTACTTCAGCC

QA 1 293 1 293
DS 



AS 1 3

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CTATAGCTGTTGTACTGTGGTGGATATGGAAAACTCTAAAGTGGGTTTGGTTTGAACCAA
AGATGCTTGAAAGTTACCTGAGAAGACAGGGCATTGCCGGAACTCCTTACACGCCACTCG
TCGGAGATATGAGAACGAACAATAGGATGACAAACGAGGCAAGGTCCAAACCCATCAAAC
TAACGGATGATATCATCCCACGTGTCTTGCCTTTCTCCTCGCACATGCTCAAGACTTACG
GAAGAACTTTCTTTACATGGCGTGGAACTATACCAACCATTACCATTACGGATCCTGAGC
AAATCAAGGAAGTGTTCAACAAAGTTTATGATTTCCCAAAACCACATACATTCCCTTTGA
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GAATCATCAACCCTGCTTTCCACCTTCAGAAGATTAAGAATATGGTACCTGTGTTCCATC
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GTGAGGTGGACGTTTGGCCTGGACTTATGAGTATAACAGAAGACGTGATCTCTCGTACTG
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A341TFB U 1
AF RR4A325TF U 4
AF RR4A325TFB U 4
BS 1 101 RR4A341TFB
BS 102 102 RR4A325TF
BS 103 550 RR4A341TFB
BS 551 551 RR4A325TF
BS 552 598 RR4A341TFB
BS 599 599 RR4A325TF
BS 600 643 RR4A341TFB
BS 644 644 RR4A325TF
BS 645 780 RR4A341TFB
BS 781 782 RR4A325TFB
BS 783 791 RR4A325TF
BS 792 792 RR4A325TFB
BS 793 832 RR4A325TF
BS 833 840 RR4A325TFB

RD RR4A341TFB 789 0 0
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CTATAGCTGTTGTACTGTGGTGGATATGGAAAACTCTAAAGCGGGTTTGGTTTGAACCAA
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TAACGGATGATATCATCCCACGTGTCTTGCCTTTCTCCTCGCACATGCTCAAGACTTACG
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GAATCATCAACCCTGCTTTCCACCTTCAGAAGATTAAGAATATGGTACCTGTGTTCCATC
AGAGCTGCAATGAGGTTATTGACAAATGGGACAGGATAGTCTCGGACAAAGGGTCATCCT
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CTTTTGGCAGCAGCTATAAAGATGGACAGAGGATATTTGAGCTCCAAACAGAACTAGCAC
AGCTCATCATCCAAGCTTTTAGTAAATCTTACATCCCTGGATATAGATATCTCCCAACAA
AGACATAGA

QA 1 780 1 780
DS 

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GG
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AATAGAGGATTAAAGCAGCAGCCAAAGAAACGCATGATATACTGAAA

QA 3 829 3 829
DS 

RD RR4A325TFB 837 0 0
GG
ACTTTTCTGGAGACGAAAATGCAAACATCAGCTGCGTCAGCAATAGTTTCAGGAGCTATA
GCTGTTGTACTGTGGTGGATATGGAAAACTCTAAAGTGGGTTTGGTTTGAACCAAAGATG
CTTGAAAGTTACCTGAGAAGACAGGGCATTGCCGGAACTCCTTACACGCCACTCGTCGGA
GATATGAGAACGAACAATAGGATGACAAACGAGGCAAGGTCCAAACCCATCAAACTAACG
GATGATATCATCCCACGTGTCTTGCCTTTCTCCTCGCACATGCTCAAGACTTACGGAAGA
ACTTTCTTTACATGGCGTGGAACTATACCAACCATTACCATTACGGATCCTGAGCAAATC
AAGGAAGTGTTCAACAAAGTTTATGATTTCCCAAAACCACATACATTCCCTTTGAGCAAC
CTTATAGTCAGTGGACTGTTTAGTTATGATGGTGATAAATGGTCAAAACACAGAAGAATC
ATCAACCCTGCTTTCCACCTTCAGAAGATTAAGAATATGGTACCTGTGTTCCATCAGAGC
TGCAACGAGGTTATTGACAAATGGGACAGGATAGTCTCGGACAAAGGGTCATCTTGTGAG
GTGGACGTTTGGCCTGGACTTATGAGTATAACAGAAGACGTGATCTCTCGTACTGCTTTT
GGCAGCAGCTATAAAGATGGACAGAGGATATTTGAGCTCCAAACAGAACTAGCACAGCTC
ATCATCCAAGCTTTTAGTAAATCTTACATCCCTGGATATAGATATCTCCCAACAAAGGAC
AATAGAAGATTAAAGCAGCAGCCAAAGAAACGCATGATATACTGAAAGGGCTCGT

QA 3 837 3 837
DS 



AS 1 4

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AAGGGGAAAAAAACAACAGCGTATCTCACAGATAATATCTAAGATTCACTCAAAGATACA
AGATTTATATAGTCAGAAATTTCATATTCACTCGTTGAGGGAAAAGATAGGAATAACCCT
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AGCTCAAGCAAGTGTCTTGAGCCAAGAAACATGGTTTTGTCTTCAGCCTTTTCCACCACC
CTTGCGAGGTGGGGTTCCTCGCCTACCGTTCTTGCCAAACCCAAAGTTTACTTTCTTTTC
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TGCGTTGTCAAACTCTCCACAGTAGTTTGGTGCCGAGAATATCGTAACTAGCTGCCTGTT
TGCAAAGAACTCATACCCATCTTCCACAACCTGATGAGCTCTGCAGATTAGGTCAAGGTC
ATGCTTCTGAAGAAACTCCTCAACCTTATCAACCCCAAAAGTGTAAGAAACCCCCCTGTC
ATTCTCTCCCCACCCTTCAATATCCTTGTCCGGATCAGACCACAACAGATCACACAATAA
CCCATGATCAGGAATATCGATAGGACGAGCAATGTTCCTGATCTCATCCAAATGCTTCAA
CTCAGGGGACAGCCCACCGTGCATACACAGTATCTTATCATCGATGAGAGCAGCGACAGG
TAGACAGTTAAAACAGTCGGTGAACACCTTCCACATTTTAACGCTATATCTCTTCTTGCA
CTCGTCGTAGAACCCGTAGATACGGTTTATAGAAGCGCACTCATGGTTCCCACGCAAGAG
GAAGAAGTTCTCTTTGTATTTGATCTTGTAGGCGAGGAGGAGGCATATGGTCTCCACGCT
CTGCTTGCCACGGTCTACGTAGTCCCCGAGGAAGAGATAGTTCGCAGCAGGTGGGTAGCC
ACCGTACTCGAACAACCTCAGGAGATCTGAGAACTGTCCATGTGTATCTCCACAAATCTT
GATGGGAGCCTCGAGTTCGAGGAGATTAGGTTGACTGAGGAAGATTTGTTTGGCGGTGGA
GCAGAGGTGTTTGATCTCGTCGTCCGTCAACTGCACCTGCTTCGTCGTCTTGCCGTTTTT
GGCACCCAATAACCTCTTTATCACATCATCCACCACACTATCTTCCATCAAAAGGAACAA
ACGCCACCTCGATGAAGAGTTTCGGTTTCCGACGACCTCCGGGGCGTGATGATGATAATA
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TTGTGAAAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ43JQ U 42
AF RR4H467JQB U 1
AF RR4H467TF C 424
AF RR4FJ43TF C 859
BS 1 638 RR4H467JQB
BS 639 945 RR4H467TF
BS 946 1393 RR4FJ43TF

RD RR4FJ43JQ 483 0 0
GA
GTTTCCTTAAATGTTTCAAGGGGAAAAAAACAACAGCGTATCTCACAGATAATATCTAAG
ATTCACTCAAAGATACAAGATTTATATAGTCAGAAATTTCATATTCACTCGTTGAGGGAA
AAGATAGGAATAACCCTTTTGCCATAAGTGATCCAGAGCAGAAGAAGATGACAGTTTGAT
TGATGATAATAACATTCAGCTCAAGCAAGTGTCTTGAGCCAAGAAACATGGTTTTGTCTT
CAGCCTTTTCCACCACCCTTGCGAGGTGGGGTTCCTCGCCTACCGTTCTTGCCAAACCCA
AAGTTTCCTTTCTTTTCAGAAGCTTTAAGGATTTGAAAAGAGCATGTCAAAGAATCATCC
ACGCTCATCATCGCACCTGCGTTGTCAAACTCTCCACAGTAGTTTGGTGCCGAGAATATC
GTAACTAGCTGCCTGTTTGCAAAGAACTCATACCCATCTTCCACAACCTGATGAGCTCTG
C

QA 3 483 3 483
DS 

RD RR4H467JQB 638 0 0
CGTCAAGGTTTTGTCAAGTTACGTCACAGAAGAACATCATGAGGTTTCCTTAAATGTTTC
AAGGGGAAAAAAACAACAGCGTATCTCACAGATAATATCTAAGATTCACTCAAAGATACA
AGATTTATATAGTCAGAAATTTCATATTCACTCGTTGAGGGAAAAGATAGGAATAACCCT
TTTGCCATAAGTGATCCAAAGCAAAAAAAGATGACAGTTTGATTGATGATAATAACATTC
AGCTCAAGCAAGTGTCTTGAGCCAAGAAACATGGTTTTGTCTTCAGCCTTTTCCACCACC
CTTGCGAGGTGGGGTTCCTCGCCTACCGTTCTTGCCAAACCCAAAGTTTACTTTCTTTTC
AAAAGCTTTAAGGATTTGAAAAGAGCATGTCAAAGAATCATCCACGCTCATCATCGCACC
TGCGTTGTCAAACTCTCCACAGTAGTTTGGTGCCGAGAATATCGTAACTAGCTGCCTGTT
TGCAAAGAACTCATACCCATCTTCCACAACCTGATGAGCTCTGCAGATTAGGTCAAGGTC
ATGCTTCTGAAGAAACTCCTCAACCTTATCAACCCCAAAAGTGTAAGAAACCCCCCTGTC
ATTCTCTCCCCACCCTTCAATATCCTTGTCCGGATCAG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4H467TF 525 0 0
GTTGTCAAACTCTCCACAGTAGTTTGGTGCCGAGAATATCGTAACTAGCTGCCTGTTTGC
AAAGAACTCATACCCATCTTCCACAACCTGATGAGCTCTGCAGATTAGGTCAAGGTCATG
CTTCTGAAGAAACTCCTCAACCTTATCAACCCCAAAAGTGTAAGAAACCCCCCTGTCATT
CTCTCCCCACCCTTCAATATCCTTGTCCGGATCAGACCACAACAGATCACACAATAACCC
ATGATCAGGAATATCGATAGGACGAGCAATGTTCCTGATCTCATCCAAATGCTTCAACTC
AGGGGACAGCCCACCGTGCATACACAGTATCTTATCATCGATGAGAGCAGCGACAGGTAG
ACAGTTAAAACAGTCGGTGAACACCTTCCACATTTTAACGCTATATCTCTTCTTGCACTC
GTCGTAGAACCCGTAGATACGGTTTATAGAAGCGCACTCATGGTTCCCACGCAAGAGGAA
GAAGTTCTCTTTGTATTTGATCTTGTAGGCGAGGAGGAGGCA
CCT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4FJ43TF 535 0 0
GATACGGTTTATAGAAGCGCACTCATGGTTCCCACGCAAGAGGAAGAAGTTCTCTTTGTA
TTTGATCTTGTAGGCGAGGAGGAGGCATATGGTCTCCACGCTCTGCTTGCCACGGTCTAC
GTAGTCCCCGAGGAAGAGATAGTTCGCAGCAGGTGGGTAGCCACCGTACTCGAACAACCT
CAGGAGATCTGAGAACTGTCCATGTGTATCTCCACAAATCTTGATGGGAGCCTCGAGTTC
GAGGAGATTAGGTTGACTGAGGAAGATTTGTTTGGCGGTGGAGCAGAGGTGTTTGATCTC
GTCGTCCGTCAACTGCACCTGCTTCGTCGTCTTGCCGTTTTTGGCACCCAATAACCTCTT
TATCACATCATCCACCACACTATCTTCCATCAAAAGGAACAAACGCCACCTCGATGAAGA
GTTTCGGTTTCCGACGACCTCCGGGGCGTGATGATGATAATAACGTCTCCGATCAAATAG
TCTGTTGTAGGTAAGGTAGGTAGACGCAGAGAGAATTGAGTTTTGTGAAAGGTCC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 4

CO CL3031Contig1 468 4 15 U
GATAGACACAATCGACGACGAGGACGCCGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAAAAAATG
CCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGCCTCCTGT
TTAATCGGCGGTGTTGGTCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGACTCACTC
GAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTGGTGTCACAGGG
ACGAAACAGACCTAATCCAAGCATTGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGATCATCATT
TTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTGTTTACAAGTGAAATAAGCCAAACTTCATGTTT
TTTTTT*GTTATGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTCTCTTCGTCTTT
TTATCACATGTATTCATTTCCTAATGACAAATCGAAAAGCTTGAAACT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4AS85TF U 1
AF RR4CR71TF U 47
AF RR4BT87JQ C 1
AF RR4BT87TF U 1
BS 1 26 RR4AS85TF
BS 27 27 RR4BT87TF
BS 28 30 RR4AS85TF
BS 31 31 RR4BT87TF
BS 32 114 RR4AS85TF
BS 115 115 RR4CR71TF
BS 116 142 RR4AS85TF
BS 143 143 RR4CR71TF
BS 144 241 RR4AS85TF
BS 242 242 RR4BT87TF
BS 243 263 RR4AS85TF
BS 264 264 RR4BT87TF
BS 265 366 RR4AS85TF
BS 367 367 RR4BT87TF
BS 368 468 RR4AS85TF

RD RR4AS85TF 468 0 0
GATAGACACAATCGACGACGAGGACGACGATGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAAAAAATG
CCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGCCACCTGT
TTAATCGGCGGTGTTGGTCTCTCTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGACTCACTC
GAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTGGTGTCACAGGG
AAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGATCATCATT
TTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTGTTTACAAGTGAAATAAGCCAAACTTCATGTTT
TTTTTTTGTTATGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTCTCTTCGTCTTT
TTATCACATGTATTCATTTCCTAATGACAAATCGAAAAGCTTGAAACT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4CR71TF 402 0 0
AGTGAGAAAAAATGCCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTG
TCGCCGCCTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGTCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTA
TTCTAGACTCACTCGAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTG
CTGGTGTCACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACA
TTCAGATCATCATTTTTCCTCTT*GTCTTTTAACTCTTTCTGTTTACAAGTGAAATAAGC
CAAACTTCATGTTTTTTTTTTGTTATGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACA
CTCTCTTCGTCTTTTTATCACATGTATTCATTTCCGAATGAC

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4BT87JQ 463 0 0
GATAGACACAATCGACGACGAGGACGCCGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAAAAAATG
CCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGCCTCCTGT
TTAATCGGCGGTGTTGGTCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGACTCACTC
GAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTGGTGTCACAGGG
ACGAAACAGACCTAATCCAAGCATTGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGATCATCATT
TTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTGTTTACAAGTGAAATAAGCCAAACTTCATGTTT
TTTTTT*GTTATGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTCTCTTCGTCTTT
TTATCACATGTATTCATTTCCTAATGACAAATCGAAAAGCTTG

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4BT87TF 463 0 0
GATAGACACAATCGACGACGAGGACGCCGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAAAAAATG
CCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGCCTCCTGT
TTAATCGGCGGTGTTGGTCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGACTCACTC
GAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTGGTGTCACAGGG
ACGAAACAGACCTAATCCAAGCATTGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGATCATCATT
TTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTGTTTACAAGTGAAATAAGCCAAACTTCATGTTT
TTTTTT*GTTATGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTCTCTTCGTCTTT
TTATCACATGTATTCATTTCCTAATGACAAATCGAAAAGCTTG

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 4

CO CL3032Contig1 1198 4 9 U
TTTTTGGCACACGAAATTTCAAGAACTGATAAATAAGAAAAGAAAGATATGTAAATCACT
TCTTCTTGAACAAGAAGTGTGAAACCATCCACTCTTCTCCATTGTTGTATCCAAAAAGCT
CAGCAACCGCGATGAAGAAGGTTCTCCAGTAAACCGTCCACTTCACTGCCTCCTCTTTCC
CATAAGTCATTTCCATTATCTCCTTTATCGCAACTCTCTCCTTGTCCATTCTTTTCAGCC
ACTCTTCACTGGTATTTGCATAATGCTTCCCATTTAGTAGCCAATGATCCACAATCGCAA
CATCTTCTTGGAAGTAGAGGAAAAGATTTGCTGATGGCATTGTTCCTCCACTGAAAAAGT
GTCTTGTGATCCAGTCATCGTCATTCACATCCTCAAAGTGGTAAGCAAATGTCTTATGGC
AGAAATAGTGAACAAACAGAAGACCATCTTCCTTCATCCACTTTCCAATTTTCTTCAGAA
GCTCCCCATAGTTTTTCATATGCTCGAACATTTCGATGGAGAATACTCGGTCATATGTCC
CTTCATGCTCAAATGTGCTAATATCTCCAACCATTATTTCGATATTTTGAATCCCACGTT
TCCAGCATTGCTCCTCGATGAATGCTTTCTGTGTTTTTGAGTTGCAGAGACCTGTTATCT
TGCAGTTGCTGTACTTGCGGGCAATGTACAAGGACAAAGATCCCCAGCCACATCCGACAT
CAAGAACACTCTGTCCATCTTCCACTTTAGCCCTCTGGCAATATAGAGCCAGCATTGCTT
CCTCTGCATCTTCTAGGCTACTTGAATCGTTAGAGAAGTAGCAAGAGCTGTATTTCATGT
TTCTTCCAAGAACAAGCTCGAAGAAAGCTGTTGGTAATTCATAGTGTTGAGTCTTTGGCT
TCTCGGTGTTGATCGCTATAGGCATCTCTTTTATAGCGTTGACGAAACGGAGGAGATCGG
AAAGTTGCAGATCCGCCGTGGGTTTGTAACCGGAACGAAGTCGAACGGCGAGAAGCAGAC
GCGTCAACCGCCTTATGACAACATCTGGTAAAAGATTCTTCTCCAACAGTGTTAAAACTG
TCTTCACGGATGCGTCATAAGCTACCTTAACAATCTTCTCCATTACTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCGAGTTATTTTTTCCTCGTTGGTCGTTACGATGTACTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CG23JQ U 1
AF RR4AT13JQ U 139
AF RR4AT13TF C 453
AF RR4CG23TF C 456
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BS 357 516 RR4CG23JQ
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BS 567 1198 RR4AT13TF

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DS 

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CATAATGCTTCCCATTTAGTAGCCAATGATCCACAATCGCAACATCTTCTTGGAAGTAGA
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TAATATCT

QA 1 428 1 428
DS 

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TTC
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TTGGTCGTTACGATGTACTCTCC

QA 4 746 4 746
DS 

RD RR4CG23TF 724 0 0
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ATGGAGAATACTCGGTCATATGTCCCTTCATGCTCAAATGTGCTAATATCTCCAACCATT
ATTTCGATATTTTGAATC**ACGTTTCCAGCATTGCTCCTCGATGAATGCTTTCTGTGTT
TTTGAGTTGCAGAGACCTGTTATCTTGCAGTTGCTGTACTTGCGGGCAATGTACAAGGAC
AAAGATCCCCAGCCACATCCGACATCAAGAACACTCTGTCCATCTTCCACTTTAGCCCTC
TGGCAATATAGAGCCAGCATTGCTTCCTCTGCATCTTCTAGGCTACTTGAATCGTTAGAG
AAGTAGCAAGAGCTGTATTTCATGTTTCTTCCAAGAACAAGCTCGAAGAAAGCTGTTGGT
AATTCATAGTGTTGAGTCTTTGGCTTCTCGGTGTTGATCGCTATAGGCATCTCTTTTATA
GCGTTGACGAAACGGAGGAGATCGGAAAGTTGCAGATCCGCCGTGGGTTTGTAACCGGAA
CGAAGTCGACCGGCGAGAAGCAGACGCGTCAACCGCCTTATGACAACATCTGGTAAAAGA
TTCTTCTCCAACAGTGTTAAAACTGTCTTCACGGATGCGTCATAAGCTACCTTAACAATC
TTCTCCATTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAGTTATTTTTTCCTCG
TT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3033Contig1 800 3 2 U
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AATACTTCCTGAAAACTGTAACCGCAAAGAAAAGAGAGTTTCAATATAAGATTCTTTTGA
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CTTCGGTAGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCTTCACCAGAGGCCGGTTCTGGCTGTGCCT
CACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTAGCTGGTGGTGCTTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTG
GTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCCAGTGCTTCAGCCTTCTTTGTAACATCAG
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TCATCCACGCTTCTGCTTCCACACACTAGTTCAACACCTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCAA
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CACCCACCTTCTTGAGCTCCTCGAGCTTTGCGACATAAACACCTTTAGTCTCATCTTCTC
CGTCTTCATACAACCAATCCTCTACTTCCTGGAGCTTCGCTAGGAAAGCCTCCCTCTCTG
ACTCCGTTATGTACTCATGGTATTTGTCACTCAGTTTGTTTCTCATATCATAAACATATG
ACTCGACAGCATTCTTCTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B024JQ U 1
AF RR4B024TF C 1
AF RR4D163JQ U 54
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CACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTAGCTGGTGGTGCTTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTG
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CTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGAAGCGCCTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCCC
TCATCCACGCTTCTGCTTCCACACACTAGTTCAACACCTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCAA
TGTGGTCAAACTTGGAATCATTCGAGACAGCTGCCTCTCTGTAGCTGTTAACACAGTGAC
CAAGCTGTCCAATGACTGTCCCTCTCTCCTGTGACTCCTTGA*CCGCATTTCAACTGGGT
CACCCACCTTCTTGAGCTCCTCGAGCTTTGCGACATAAACACCTTTAGTCTCATCTTCTC
CGTCTTCATACAACCAATCCTCTACTTCCTGGAGCTTCGCTAGGAAAGC

QA 1 709 1 709
DS 

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C
GAAAATAATACTTCCTGAAAACTGTAAACGCAAAGAAAAGAGAGTTTCAATATAAGATTC
TTTTGAGGGAAAACAAGAAAGTAAAAACAAAATCGATACACAGCACCATCATCTCTTAGG
CACTATCTTCGGTAGGCTTCTCAGTCTCCATCGGTTCTTCACCAGAGGCCGGTTCTGGCT
GTGCCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTAGCTGGTGGTGCTTCCGGTTTAGCAACCG
GCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAAAACTTGTCCAGTGCTTCAGCCTTCTTTGTAA
CATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGAAGCGCCTCCTGCTGCTGCTGCT
TCTCCCTCATCCACGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTCAACACCTTTTGCTTCTCTTCTA
GTTCAATGTGGTCAAACTTGGAATCATTCGAGACAGCTACCTCTCTGTAGCTGTTAACAC
AGTGAC**AGCTGTCCAATGACTGTCCCTCTCTCCTGTGACTCCTTGAACCGCATTTCAA
CTGGGTCACCCACCTTCTTGAGCTCCTCGAGCTTTGCGACATAAGCACCTTTAGTCTCAT
CTTCTCCGTCTTCATACAACCAATCCTCTACTTCCTGGAGCTTCGCTAGGAAAGCCTCCC
TCTCTGACTCCGTTATGTACTCATGGTATTTGTCACTCAGTTTGTTTCTCATATCATAAA
CATATGACTCGACAGCATTCTTCTTG

QA 2 747 2 747
DS 



AS 1 3

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ38JQ U 1
AF RR4CJ06JQ U 1
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QA 1 584 1 584
DS 

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TTCATAATGTAAAAAACCGCGCTTCAAAGCCATGAGTCTCTATTGCAAAGGCTGATTACT
GATCCACCTTTGAAACATAATAGATGTCTCGTTTGGTTTATACTCTGCCGTGTGTCCACT
TCCCTTGATAGTAGAAAATGTCATCTTATTGGAATAAGTTCTTGTGTATCCAGCAATTTG
AGATTTTATCATCCAAGGCCTCCAGTCATCAATGATGGAGTAATTGAGGGATTTGATCCA
GGCTTGAGTTGCTAGGGAAGGCATCGTCATGTCATGATCACCACTATAAATAAGAGACCG
GTATCCTCTGATGCTGTTATTCACATGATAAGGTACGCTGCTTATAATGTCGGAACTGTA
TGGAATAGTC**GTTACATCGCTTCCAATGTCCTTTAGTCCCCTTTTGCACATGGAGAGC
TTCACGGACTCTTTCGTTGTTGGCCCAACTTTCAATGAGATAATGTAGATAATAATAGCA
ATCAGGAGATATATTTTCCGTTTCATCATCCTTGCAATCTGGCAATAGTATATTATTTTC
ATTTATTTTGTCAGTGCACTTATGGTATTCTGCAACAACTTCCAAACACTTTGTATTACG
TGGATCCACATTTACATAAACTCCTTTGCA*TTTGTGTTCAGTGACTCGTATAGTTCATC
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TG

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DS 

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TTTCCGTTTCATCATCCTTGCAATCTGGCAATAGTATATTATTTTCATTTATTTTGTCAG
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QA 11 753 11 753
DS 



AS 1 3

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ATACTATACAAATCGTGCCCCTAAATAGATTCACTTGTTTAATATCATGTCTCCTCGTTC
TTGACTGGGATCCAACGGTTATCAAACGTAAATCCTTTCTTTCCCCGGGTAAAAAAACCC
TATAACGAACCCTAAAAGCACACCCATAACCAACAAGCCTGATCCTTTGACATACCATGA
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ATCTTTATTCCCACTGATTACTTCCCCAGATGCTAACATCTCGACAGCATCATGGACTTC
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TAGATGAACCGGGCTTCCTCGCCACTGTTTGCCGCAAGTGTTGTTGCTTATCGGACAGAA
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AGTGTACATCGGTCTGTGCCCTTGCACAACGACAAACGGTGTTTTGTTCCTGTTCACAGA
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GGAAATATAAAGAAAATGAACCGATCCCATATCGTAAGAATAGTACAGATTCCTCGTCGG
AGGAGCTTTCGTTCCCGTTGGTTCTGATGAGTTCCCAGGCATGTTGAACTTGAGACTATA
CGGCACACCACACTCACCACCACCATCGCTACCATACGTTCCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ48JQ U 26
AF RR4FL60JQ U 1
AF RR4GJ48TF C 414
BS 1 68 RR4FL60JQ
BS 69 69 RR4GJ48JQ
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RD RR4GJ48JQ 510 0 0
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CCAGATGCTAACATCTCGACAGCATCATGGACTTCCCCGTCGTGGTTACCCACAAAAGAA
A*AGTGAGCTTCTCTTTGTTTGCAACTAGA

QA 1 510 1 510
DS 

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ATACTATACAAATCGTGCCCCTAAATAGATTCACTTGTTTAATATCATGTCTCCTCGTTC
TTGACTGGGATCCAACGGTTATCAGACGTAGATCCTTTCTTTCCCCGGGTAAAAAAACCC
TATAACGAACCCTAAAAGCACACTCATAACCAACAAGCCTGCTCCTTTGACATACCATGA
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ATCTTTATTCCCACTGATTACTTCCCCAGATGCTAACATCTCGACAGCATCATGGACTTC
CCCGTCGTGGTTACCCACAAAAGAAACAGTGAGCTTCTCTTTGTTTGCAACTAGACGAGT
GTACCCAAACTCACCTGTTCGGTACATCGACTGTTCAGGCTGAGGGAATATAGGAAGCCC
TGGATGGTTCGGTCTCGGCTGCCAGATCGGTTGCCAGTCTTGACCACCCATACCGATCAC
TAGATGAACCGGGCTTCCTCGCCACTGTTTGCCGCAAGTGTTGTTGCTTATCGGACAGAA
CCTCTCGTATCTATGAACATGTCCCCACA*AGCAAGCGTCACGTTATTCTCCACAAACAG
CGGTTCCAAATGCTCCACCATCTTTTGTCTAATCATAGCGTCT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4GJ48TF 713 0 0
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GGACTTCCCCGTCGTGGTTACCCACAAAAGAAA*AGTGAGCTTCTCTTTGTTTGCAACTA
GACGAGTGTACCCAAACTCACCTGTTCGGTACATCGACTGTTCAGGCTGAGGGAATATAG
GAAGCCCTGGATGGTTCGGTCTCGGCTGCCAGATCGGTTGCCAGTCTTGACCACCCATAC
CGATCACTAGATGAACCGGGCTTCCTCGCCACTGTTTGCCGCAAGTGTTGTTGCTTATCG
GACAGAACCTCTCGTGTCTATGAACATGTCCCCACGGAGCAAGCGTCACGTTATTCTCCA
CAAACAGCGGTTCCAAATGCTCCACCATCTTTTGTCTAATCATAGCGTCTCTAACCTCGT
TGCTAGTAGTGTACATCGGTCTGTGCCCTTGCACAACGACAAACGGTGTTTTGTTCCTGT
TCACAGACTCAAGATCTCGCTTTATGAACTCGTGCTGAATCCCTCCTTTAAGAAAATTCG
TCTCAGTGGAAATATAAAGAAAATGAACCGATCCCATATCGTAAGAATAGTACAGATTCC
TCGTCGGAGGAGCTTTCGTTCCCGTTGGTTCTGATGAGTTCCCAGGCATGTTGAACTTGA
GACTATACGGCACACCACACTCACCACCACCATCGCTACCATACGTTCCCCAC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

CO CL3036Contig1 863 4 5 U
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AATGCTCCAGAAACAGCAAAACCAAACAAAACGTATGACTAAACTCGAAAAATAGATGTT
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GATAATTGAATTGCCAACTGGTCACAAAGGCTTCACAGACCCTTTAAAGAATCTCCAGCT
TTGCCTGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCT
CCCTCGTACATGTTCTTCACCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCA
AGACTAGGTTTAATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGAC
TTGAACATCGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACA
ATCTCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGGACATCATGGATC
TTGACATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTATTCATCAACACCTTCC
AAAGATATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTT
ACGTAGTTCAATGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGGAACCGGT
TCGAGCTCTGGCTTTACATTTGAAGCGCTTGCCGACTCTCTCAGCTTCTCCAAATTGCAA
ATCTCGGAACTGATGAGATTGAGAACACGGGTTCTCTTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTG
AGTTCTTCCAAATCAAGCCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT73JQ U 1
AF RR4DW75JQ U 78
AF RR4GT73TF C 307
AF RR4DW75TF C 254
BS 1 137 RR4GT73JQ
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BS 797 802 RR4DW75JQ
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RD RR4GT73JQ 796 0 0
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TTGCCTGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCT
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AGACTAGGTTTAATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGAC
TTGAACATCGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACA
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TTGACATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTATTCATCAACACCTTCC
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ATCTCGGAACTGATGA

QA 1 796 1 796
DS 

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ATCTTCTTTGTAGTGAATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGACTTGAACATCGTGATAAC
AATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACAATCTCTTTGTGCAACTT
GGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGGACATCATGGATCTTGACATCCAAAGACAT
CGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTATTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTACACCTT
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ATTGA
GAA

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DS 

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GGTTTAATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGACTTGAAC
ATCGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACAATCTCT
TTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGGACATCATGGATCTTGACA
TCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTATTCATCAACACCTTCCAAAGAT
ATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAG
TTCAATGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGGAACCGGTTCGAGC
TCTGGCTTTACATTTGAAGCGCTTGCCGACTCTCTCAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCG
GAACTGATGA
GATTGA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4DW75TF 610 0 0
CATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACATGT
TCTTCATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTTAA
TCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGACTTGAACATCGTGA
TAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACAATCTCTTTGTGCA
ACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGGACATCATGGATCTTGACATCCAAAG
ACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTATTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTACA
CCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGTTCAATG
CAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGGAACCGGTTCGAGCTCTGGCT
TTACATTTGAAGCGCTTGTCGACTCTCTCAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCGGAACTGA
TGAGATTGAGAACACGGGTTCTCTTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTGAGTTCTTCCAAAT
CAAGCCCGAC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL3037Contig1 841 2 2 U
GGATACAGTAAGTTTGCAACTTTCTCAGAGAAACTTCCTTTTCAGTTTGTACTATTCTTC
GCTGCTTCACTCGTTCTTTAGGGTTCCATTTTCTTTTACTTTCTTTTGGTTTGGTAGACT
CGAGTTTCTGTTTCTGTTTCTGTTTGCAAAGTTTGAGCCTTTGTTGATCACGTTCTGGTT
GCGATCTAGGTCTGAGATGGCCGAGCCACTAGGACAGCTCCAGGTGACTGTTATTCGAGG
AAAGAAACTAGCGATCCGAGACTTCAAGTCAAGTGATCCGTACGTGATAGTCAAGTTGGG
AAATGAGACAGCCAAGACCAAAGTGATCAACAATTGCTTGAACCCTGTGTGGGATGAGGA
ACTGAGCTTTACACTCAAAGATCCTGCAGCAGTTCTCGCATTGGAAGTGTTTGATAAAGA
TAGGTTCAAGGCAGATGACAAGATGGGTCATGCCACTCTCAGCCTTCAACCACTCATCTC
AGTAGCCAGACTAAGGCATATAGTGCACGTGTCCTCTGGCGAGACAACGCTTAGGAAAGT
GTTGCCAGATTCAGACAACTGCTTATCTCGTGAGAGCACAATCAGTTGCATAGACGGAGA
GGTGGTGCAGAGTGTGTGGCTGAAGCTCTGCGCTGTTGAGTCGGGTGAGATTGAGTTGAA
GATCAAGTTGATTGATCCTCCTGGAACCAAGAAGCATTAGGGATTTAATGATTCCAGATG
TGTGTGGTATGTTGTAGCAAGCAACCCCTTTGTGTTTAGTTATATTGCAACATGTATGGT
CTTTGTTTCCAAATGAATGTGAAACAGCTTTTAAGACTTTAAAGCTTTTCCCTTTGTGCC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4H109TF U 1
AF RR4H109JQ C 16
BS 1 724 RR4H109TF
BS 725 841 RR4H109JQ

RD RR4H109TF 743 0 0
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GCTGCTTCACTCGTTCTTTAGGGTTCCATTTTCTTTTACTTTCTTTTGGTTTGGTAGACT
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AAAGAAACTAGCGATCCGAGACTTCAAGTCAAGTGATCCGTACGTGATAGTCAAGTTGGG
AAATGAGACAGCCAAGACCAAAGTGATCAACAATTGCTTGAACCCTGTGTGGGATGAGGA
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AGTAGCCAGACTAAGGCATATAGTGCACGTGTCCTCTGGCGAGACAACGCTTAGGAAAGT
GTTGCCAGATTCAGACAACTGCTTATCTCGTGAGAGCACAATCAGTTGCATAGACGGAGA
GGTGGTGCAGAGTGTGTGGCTGAAGCTCTGCGCTGTTGAGTCGGGTGAGATTGAGTTGAA
GATCAAGTTGATTGATCCTCCTGGAACCAAGAAGCATTAGGGATTTAATGATTCCAGATG
TGTG
GGGGTATGTTGTAGCAAGC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4H109JQ 826 0 0
GCAACTTTCTCAGAGAAACT*CCTTTTCAGTTTGTACTATTCTTCGCTGCTTCACTCGTT
CTTTAGGGTTCCATTTTCTTTTACTTTCTTTTGGTTTGGTAGACTCGAGTTTCTGTTTCT
GTTTCTGTTTGCAAAGTTTGAGCCTTTGTTGATCACGTTCTGGTTGCGATCTAGGTCTGA
GATGGCCGAGCCACTAGGACAGCTCCAGGTGACTGTTATTCGAGGAAAGAAACTAGCGAT
CCGAGACTTCAAGTCAAGTGATCCGTACGTGATAGTCAAGTTGGGAAATGAGACAGCCAA
GACCAAAGTGATCAACAATTGCTTGAACCCTGTGTGGGATGAGGAACTGAGCTTTACACT
CAAAGATCCTGCAGCAGTTCTCGCATTGGAAGTGTTTGATAAAGATAGGTTCAAGGCAGA
TGACAAGATGGGTCATGCCACTTTCAGCCTTCAACCACTCATCTCAGTAGCCAGACTAAG
GCATATAGTGCACGTGTCCTCTGGCGAGACAACGCTTAGGAAAGTGTTGCCAGATTCAGA
CAACTGCTTATCTCGTGAGAGCACAATCAGTTGCATAGACGGAGAGGTGGTGCAGAGTGT
GTGGCTGAAGCTTTGCGCTGTTGAGTCGGGTGAGATTGAGTTGAAGATCAAGTTGATTGA
TCCTCCTGGAACCAAGAAGCATTAGGGATTTAATGATTCCAGATGTGTGTGGTATGTTGT
AGCAAGCAACCCCTTTGTGTTTAGTTATATTGCAACATGTATGGTCTTTGTTTCCAAATG
AATGTGAAACAGCTTTTAAGACTTTAAAGCTTTTCCCTTTGTGCCG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 4

CO CL3038Contig1 692 4 2 U
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CACAAAACAAGATTCGAATCTAGTTTAAAGGGATAATTGTGAATGGCAAACACGGCTTGC
TTTATGATCGTGGCTCGGAATGATATTCCAATCTATGAAGCTGAAGTTGGCTCTGCTGCT
AAAAGAGAAGATGCTGCTCAGTTGCACCAGTTTATATTACATGCCGCATTAGATGTCGTC
CAAGACTTAGCATGGACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCTGTCGACAGGTTTAACGAT
CTGGTTGTCTCAGTCTATGTTACTGCAGGTCATACTCGTCTCATGCTCCTTCACGATTCA
CGCAATGAGGATGGCATCAAGAGCTTCTTTCAGGAGGTCCATGAGCTTTATATTAAGATT
CTTCTGAATCCCTTGTATCTGCCTGGTTCTCGCATCACATCGACGCATTTTGACACCAAG
GTACGTGCACTCGCAAGAAAGTACCTCTAGAGAAGACACGAGATCCTATCTCCAGCTCAG
TTTTCTTGGATCCATATGGCTATTGTTTGTCTCATGCTGGGTGTCAGTTGAATTTACTTG
TATGACTTTCAAGCACATTCCATAGCTTCATCTTTGATTGTTAGAAACTATGGAAAACAG
AGGAGTTTTATTAAGAGTTTCCTTTGCAATTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4BE03JQ C 1
AF RR4C988JQ C 1
AF RR4C988TF U 1
AF RR4BE03TF U 1
BS 1 687 RR4C988TF
BS 688 692 RR4BE03JQ

RD RR4BE03JQ 692 0 0
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CACAAAACAAGATTCGAATCTAGTTTAAAGGGATAATTGTGAATGGCAAACACGGCTTGC
TTTATGATTGTGGCTCGGAATGATATTCCAATCTATGAAGCTGAAGTTGGCTCTGCTGCT
AAA*GAGAAGATGCTGCTCAGTTGCACCAGTTTATATTACATGCCGCATTAGATGTCGTC
CAAGACT*AGCATGGACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCTGTCGACAGGTTTAACGAT
CTGGTTGTCTCAGTCTATGTTACTGCAGGTCATACTCGTCTCATGCTCCTTCACGATTCA
CGCAATGAGGATGGCATCAAGAGCTTCTTTCAGGAGGTCCATGAGCTTTATATTAAGATT
CTTCTGAATCCCTTGTATCTGCCTGGTTCTCGCATCACATCGACGCATTTTGACACCAAG
GTACGTGCACTCGCAAGAAAGTACCTCTAGAGAAGACACGAGATCCTATCTCCAGCTCAG
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TATGACTTTCAAGCACATTCCATAGCTTCATCTTTGATTGTTAGAAACTATGGAAAACAG
AGGAGTTTTATTAAGAGTTTCCTTTGCAATTC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4C988JQ 687 0 0
GGAACTCCTTATTGAATGATTCAATCTTCCTTCGGCTCTCTCGATCTGAATCTCAGGAAG
CACAAAACAAGATTCGAATCTAGTTTAAAGGGATAATTGTGAATGGCAAACACGGCTTGC
TTTATGATCGTGGCTCGGAATGATATTCCAATCTATGAAGCTGAAGTTGGCTCTGCTGCT
AAAAGAGAAGATGCTGCTCAGTTGCACCAGTTTATATTACATGCCGCATTAGATGTCGTC
CAAGACTTAGCATGGACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCTGTCGACAGGTTTAACGAT
CTGGTTGTCTCAGTCTATGTTACTGCAGGTCATACTCGTCTCATGCTCCTTCACGATTCA
CGCAATGAGGATGGCATCAAGAGCTTCTTTCAGGAGGTCCATGAGCTTTATATTAAGATT
CTTCTGAATCCCTTGTATCTGCCTGGTTCTCGCATCACATCGACGCATTTTGACACCAAG
GTACGTGCACTCGCAAGAAAGTACCTCTAGAGAAGACACGAGATCCTATCTCCAGCTCAG
TTTTCTTGGATCCATATGGCTATTGTTTGTCTCATGCTGGGTGTCAGTTGAATTTACTTG
TATGACTTTCAAGCACATTCCATAGCTTCATCTTTGATTGTTAGAAACTATGGAAAACAG
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QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4C988TF 687 0 0
GGAACTCCTTATTGAATGATTCAATCTTCCTTCGGCTCTCTCGATCTGAATCTCAGGAAG
CACAAAACAAGATTCGAATCTAGTTTAAAGGGATAATTGTGAATGGCAAACACGGCTTGC
TTTATGATCGTGGCTCGGAATGATATTCCAATCTATGAAGCTGAAGTTGGCTCTGCTGCT
AAAAGAGAAGATGCTGCTCAGTTGCACCAGTTTATATTACATGCCGCATTAGATGTCGTC
CAAGACTTAGCATGGACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCTGTCGACAGGTTTAACGAT
CTGGTTGTCTCAGTCTATGTTACTGCAGGTCATACTCGTCTCATGCTCCTTCACGATTCA
CGCAATGAGGATGGCATCAAGAGCTTCTTTCAGGAGGTCCATGAGCTTTATATTAAGATT
CTTCTGAATCCCTTGTATCTGCCTGGTTCTCGCATCACATCGACGCATTTTGACACCAAG
GTACGTGCACTCGCAAGAAAGTACCTCTAGAGAAGACACGAGATCCTATCTCCAGCTCAG
TTTTCTTGGATCCATATGGCTATTGTTTGTCTCATGCTGGGTGTCAGTTGAATTTACTTG
TATGACTTTCAAGCACATTCCATAGCTTCATCTTTGATTGTTAGAAACTATGGAAAACAG
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QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4BE03TF 692 0 0
GGAACTCCTTATTGAATGATTCAATCTTCCTTCGGCTCTCTCGATCTGAATCTCAGGAAG
CACAAAACAAGATTCGAATCTAGTTTAAAGGGATAATTGTGAATGGCAAACACGGCTTGC
TTTATGATTGTGGCTCGGAATGATATTCCAATCTATGAAGCTGAAGTTGGCTCTGCTGCT
AAA*GAGAAGATGCTGCTCAGTTGCACCAGTTTATATTACATGCCGCATTAGATGTCGTC
CAAGACT*AGCATGGACTACAAGTGCCATGTTCTTGAAGTCTGTCGACAGGTTTAACGAT
CTGGTTGTCTCAGTCTATGTTACTGCAGGTCATACTCGTCTCATGCTCCTTCACGATTCA
CGCAATGAGGATGGCATCAAGAGCTTCTTTCAGGAGGTCCATGAGCTTTATATTAAGATT
CTTCTGAATCCCTTGTATCTGCCTGGTTCTCGCATCACATCGACGCATTTTGACACCAAG
GTACGTGCACTCGCAAGAAAGTACCTCTAGAGAAGACACGAGATCCTATCTCCAGCTCAG
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TATGACTTTCAAGCACATTCCATAGCTTCATCTTTGATTGTTAGAAACTATGGAAAACAG
AGGAGTTTTATTAAGAGTTTCCTTTGC
AATTC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 4

CO CL3039Contig1 1245 4 5 U
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CTTATAGATCGTTTCAATTAGGGTTTCGTTTTTGATCGTGAAAGAAAGATGGTGAAGAAG
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TCGTTTGGTCACTCTTCCGTTGAGTCCGTGGTCTCCGCTTATCTCTCCGGACAGAGACTT
GCTCCTGTTTCAACTTGTGATAATACCAAAGCGACGAGAGAAGACCTCGGTATCTGTATG
GCTCGCAAGGATCTAGGGTTAGGGTTTTGGTGGGACGATGACAAGCTCGTCAACTCGAAT
GATCCGGAAGAGCTTATGGAAGCGATGGAATCTATGAAAGTACTATACAGCCGTCTCAAG
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ATTACCTATGATGATTTACCAGAGCTGCCACCTCTTGTTGTTAGCAACAGTGACAAAGAA
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TTGCCTTCTGCAGCTGAAAAAAGCTTGGAAGAAGCGACGATGGCTCTTGATTTCGATAGT
ATTTTTGAAGGTCTGATGTCCTATGATGATGTGGATCTCTCCTGGTCTGATGACTTATTG
TTCATGTAACTTTTTAGGAGAGTATACGTTCGGTCTGGTCTCGATCAGTTTTTCTCACAT
GATAGAAAATTGATCGAACTCATACCGGTTTATTTGGTTTGTATCTCTGATGTCTTAATC
AATTGTAATAAAATGTTTAACAAGCAAGTAAAATTTGAGTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BK96TF U 328
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AF RR4BK96JQ C 491
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GCTCCTGTTTCAACTTGTGATAATACCAAAGCGACGAGAGAAGACCTCGGTATCTGTATG
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G
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AAGAAGCGACGATGGCTCTTGATTTCGATAG

QA 2 692 2 692
DS 

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GGAATCTATGAAAGTACTATACAGCCGTCTCAAGGAATTGGAAGATCAAACCCTAACAAC
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GGAAGAAGCGACGATGGCTCTTGATTTCGATAGTATTTTTGAAGGTCTGATGTCCTATGA
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GGTTTATTTGGTTTGTATCTCTGATGTCTTAATCAATTGTAATAAAATTTTTAACAAGCA
AGTAAAATTTGAGTTTGTG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4BK96JQ 735 0 0
ATCTAGGGTTAGGGTTTTGGTGGGACGATGACAAGCTCGTCAACTCGAATGATCCGGAAG
AGCTTATGGAAGCGATGGAATCTATGAAAGTACTATACAGCCGTCTCAAGGAATTGGAAG
ATCAAACCCTAACAACAACAACAACGATCGACGAGGAAGACATGGTTGAGATTTCACCTG
AGTCGGATGAATGGAGCGAGATGGATCTTCATAAACTCCTCCAAGATTGTGATTGTGAAG
AAGAGGATCAGAGTGTACCTGATAAAACCTGCAACAACAGCAACTCTGAATCATCTGCAG
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ATCAGAACGTATCTGTCAAAACCTGCAACAACAACAACTCTGTATCATCATTGCCTTCTG
CAGCTGAAAAAAGCTTGGAAGAAGCGACGATGGCTCTTGATTTCGATAGTATTTTTGAAG
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TTTTTAGGAGAGTATACGTTCGGTCTGGTCTCGATCAGTTTTTCTCACATGATAGAAAAT
TGATCGAACTCATACCGGTTTATTTGGTTTGTATCTCTGATGTCTTAATCAATTGTAATA
AAATGTTTAACAAGC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 3

CO CL3040Contig1 1312 3 8 U
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CTAAGAAGATAAACACCAAAAATTAAATGATAGACGAACAGCGAATGAGCCAAGGGTATG
TGTTTTCACGCATGCTTTTTCATTCAGTAGAGCGTAGACATTACTATTGCTGCTTGCATT
CAGGTGGCCTCTCGCCTTGTTGACCGTCACCAACAACCACCTGAGACCTGCCTCCCTTCT
TGCGTCCGCTTGATGGCTTCTTTTTAGTCTTGCTATCTTCTTCATCTTCATCATCCTCCT
CATCCTCTTCCTCCTCATCTTCCGCATCTTCGTCCACGTCAATATCATCGTCCTCATCAT
CATCTAAATCAAACTCCTCTCCATCCATAGTCTCACCAGTAAACCATGAGACTGCATGAG
GGATAATCTTCTCCCGGATAGCAGATCCAATGTCATAATCTTGTTCCATCAGATTCTGAA
GTTCCTCAGCACTGTCCTAGTCGATATCTTCATCTTCCTCCGGGACTTGTGGAGGATTAA
AGAAGTTGAAGAAGCTTTCACAATCTTCCATTTTGGTGATCGGTTTGGCGTTTGAACCTT
TCTTAGGCTTCTTCTTAAGAATCTTCTGAGTAAGACACTTTCCAGGATACCAATCAATTT
CTGTCCCTATAGCCTTCTCAAGCAGTGGGTCATCTTCATCAATCATATGATAAGACTTCG
TCAAGACAGCGTTCTTAAAATAGGGATTCGAGTCAAAGAAAAACTCAAGTTTGAATCCTT
TAGGCTCTTCAGTCTTGCACCACTTAATATCCTTAAGATATTTGAGAGCCTCTTCATCAC
GCTCTGTGACCTCATCGGAAGTAACATCATTGTTTTTCAAGGCCGTCAGCCAGAAACTTG
GAACTCCTTTCTCTTCTGCAGTTTTTTCCTCTCCTTGGTCCATCTTTGTATCCTCCGGAG
TCGGTTCAACTTCAGTAACTCCATTCACAATCTCATAACGCTTGATATACAAAGGCTGAT
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GACTCTCGAGAACATCAGAACGCTGACCAGCCATAAGCTTGTTCTTGAGAGCGTTCATAA
GGCCAGCTCGATCCTCGTCTTTAAGAGATGCGGTTAGATCGGCGAGGTTGAAGTTGTCCT
TGTCGCCGCTCATCTTTTCTGAGGATTTTTTGCTTTGGAGGTTTGAAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS35JQ U 42
AF RR4G985JQ U 1
AF RR4G917TF C 601
BS 1 323 RR4G985JQ
BS 324 324 RR4GS35JQ
BS 325 335 RR4G985JQ
BS 336 336 RR4GS35JQ
BS 337 718 RR4G985JQ
BS 719 719 RR4G917TF
BS 720 734 RR4G985JQ
BS 735 1312 RR4G917TF

RD RR4GS35JQ 314 0 0
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CGAATGAGCCAAGGGTATGTGTTTTCACGCATGCTTTTTCATTCAGTAGAGCGTAGACAT
TACTATTGCTGCTTGCATTCAGGTGGCCTCTCGCCTTGTTGACCGTCACCAACAACCACC
TGAGACCTGCCTCCCTTCTTGCGTCCGCTTGATGGCTTCTTTTTAGTCTTGCTATCTTCT
TCATCTTCATCATCCTCCTCATCCTCTTCCTCCTCATCTTCCGCATCTTCGTCCACGTCA
ATATCATCGTCCTC

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR4G985JQ 734 0 0
GGGGATAATTCATTGATTGATATTTGATTGATAAACACCAAGGAAAAGTCTTAAGTGATT
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TGTTTTCACGCATGCTTTTTCATTCAGTAGAGCGTAGACATTACTATTGCTGCTTGCATT
CAGGTGGCCTCTCGCCTTGTTGACCGTCACCAACAACCACCTGAGACCTGCCTCCCTTCT
TGCGTCCGCTTGATGGCTTCTTTTTAGTCTTGCTATCTTCTTCATCTTCATCATCCTCCT
CATCCTCTTCCTCCTCATCTTCCTCATCTTCGTCCTCGTCAATATCATCGTCCTCATCAT
CATCTAAATCAAACTCCTCTCCATCCATAGTCTCACCAGTAAACCATGAGACTGCATGAG
GGATAATCTTCTCCCGGATAGCAGATCCAATGTCATAATCTTGTTCCATCAGATTCTGAA
GTTCCTCAGCACTGTCCTAGTCGATATCTTCATCTTCCTCCGGGACTTGTGGAGGATTAA
AGAAGTTGAAGAAGCTTTCACAATCTTCCATTTTGGTGATCGGTTTGGCGTTTGAACCTT
TCTTAGGCTTCTTCTTAAGAATCTTCTGAGTAAGACACTTTCCAGGATACCAATCAATTT
CTGTCCCTATAGCCTTCTCAAGCAGTGGGTCATCTTCATCAATCATATGATAAGACTTTG
TCAAGACAGCGTTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4G917TF 712 0 0
TTTCTTAGGCTC
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CCTTCTCAAGCAGTGGGTCATCTTCATCAATCATATGATAAGACTTCGTCAAGACAGCGT
TCTTAAAATAGGGATTCGAGTCAAAGAAAAACTCAAGTTTGAATCCTTTAGGCTCTTCAG
TCTTGCACCACTTAATATCCTTAAGATATTTGAGAGCCTCTTCATCACGCTCTGTGACCT
CATCGGAAGTAACATCATTGTTTTTCAAGGCCGTCAGCCAGAAACTTGGAACTCCTTTCT
CTTCTGCAGTTTTTTCCTCTCCTTGGTCCATCTTTGTATCCTCCGGAGTCGGTTCAACTT
CAGTAACTCCATTCACAATCTCATAACGCTTGATATACAAAGGCTGATACAACTTCTCAT
ACTTGGCTTCAAGAACAGCTCTCTCCTCACGGAACTTCGCCTCAAGCTCATCATGCTTTC
CCTGTATGTCCCTCAAGGCTTCAACACGGTTTCTCACTAGAGGAGTCAGACTCTCGAGAA
CATCAGAACGCTGACCAGCCATAAGCTTGTTCTTGAGAGCGTTCATAAGGCCAGCTCGAT
CCTCGTCTTTAAGAGATGCGGTTAGATCGGCGAGGTTGAAGTTGTCCTTGTCGCCGCTCA
TCTTTTCTGAGGATTTTTTGCTTTGGAGGTTTGAAAGTCC

QA 13 712 13 712
DS 



AS 1 4

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TCTCAGTAGCAACACCACCACCAGACCTCATCTTGCGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTC
TCTTCCTCTTGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTACGCTTAGCGACCTTGAGAGCACGCT
TGTCTTTACCAACCTTAAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGTAGGGAGCAAAACCAGCTA
CTTCCCTAATCAATGATCTGATAAAGAGTGTCCTCTTGCTCGTTTGTCCTTTGCGAGAAC
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AACCAGTCTTTACTTGCGGAGTTGTCATCTTCTTCTTGCTTTTGGATCGAGCTCCTCCTC
CGAAAGAAGGAAGACGGACTGAAAACTCTGAATGTATATACGGAGGAGGCTCCC


BQ
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0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC70JQ U 8
AF RR4BC34TF C 121
AF RR4GC70TF C 1
AF RR4BC34JQ U 121
BS 1 7 RR4GC70TF
BS 8 217 RR4GC70JQ
BS 218 218 RR4BC34JQ
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BS 221 256 RR4GC70JQ
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BS 500 500 RR4GC70TF
BS 501 574 RR4BC34JQ
BS 575 575 RR4GC70TF
BS 576 605 RR4BC34JQ
BS 606 654 RR4GC70TF

RD RR4GC70JQ 255 0 0
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TTTCTTGATTTTTCAGTAATTAAATGAAATAAGAGGTAATAAAAAATAAAATGATAAGCT
TCAACCAATGATCACCAGTCACGGACAAAATTCTCTTCAAATCCCAAATACTACTAAAAC
AGACATAATATGAATAACTTGTCATTCTGAAAAATATGTTGCTCACTTCTTCTTCTCAGT
AGCAACACC
CCCCCC

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR4BC34TF 449 0 0
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CTAAAACAGACATAATATGAATAACTTGTCATTCTGAGAGATATGTTGCTCACTTCTTCT
TCTCAGTAGCACCACCACCACCAGACCTCATCTTGCGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTC
TCTTCCTCTTGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTACGCTTAGCGACCTTGAGAGCACGCT
TGTCTTTACCAACCTTAAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGTAGGGAGCAAAACCAGCTA
CTTCCCTAATCAATGATCTGATAAAGAGTGTCCTCTTGCTCGTTTGTCCTTTGCGAGAAC
GAGGACGAGGAGCTAATTCGCGTCTGGTGACAACATGTCCTTTGTTCAACCCTACGAACA
AACCAGTCTTTACTTGCGGAGTTGTCATC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR4GC70TF 654 0 0
TTTTTTTATAAAATTTACTTGGATGGTGCTTTCTGGAGCATTTTGCTTTGATTGTTCAAA
GGTACATTTTCTTGATTTTTCAGTAATTAAATGAAATAAGAGGTAATAAAAGATAAAATG
ATAAGCTTCAACCAATGATCACCAGTCACGGACAAAATTCTCTTCAAATCCCAAATACTA
CTAAAACAGACATAATATGAATAACTTGTCATTCTGAGAGATATGTTGCTCACTTCTTCT
TCTCAGTAGCAACACCACCACCAGACCTCATCTTGCGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTC
TCTTCCTCTTGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTACGCTTAGCGACCTTGAGAGCACGCT
TGTCTTTACCAACCTTAAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGTAGGGAGCAAAACCAGCTA
CTTCCCTAATCAATGATCTGATAAAGAGTGTCCTCTTGCTCGTTTGTCCTTTGCGAGAAC
GAGGACGAGGAGCTAATTCGCGTCTGGTGACAACATGTCCTTTGTTCAACCCTACGAACA
AACCAGTCTTTACTTGCGGAGTTGTCATCTTCTTCTTGCTTTTGGATCGAGCTCCTCCTC
TGAAAGAAGGAAGACGGACTGAAAACTCTGAATGTATATACGGAGGAGGCTCCC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BC34JQ 488 0 0
ATAAGCTTCGACCAATGATCACCAGTCACGGACAAAATTCTCTTCAAATCCCAAATACTA
CTAAAACAGACATAATATGAATAACTTGTCATTCTGAGAGATATGTTGCTCACTTCTTCT
TCTCAGTAGCACCACCACCACCAGACCTCATCTTGCGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTC
TCTTCCTCTTGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTACGCTTAGCGACCTTGAGAGCACGCT
TGTCTTTACCAACCTTAAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGTAGGGAGCAAAACCAGCTA
CTTCCCTAATCAATGATCTGATAAAGAGTGTCCTCTTGCTCGTTTGTCCTTTGCGAGAAC
GAGGACGAGGAGCTAATTCCCGTCTGGTGACAACATGTCCTTTGTTCAACCCTACGAACA
AACCAGTCTTTACTTGCGGAGTTGTCATCTTCTTTTTGCTTTTGGATCGAGCTCCTCCTC
CGAAA
CCC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 3

CO CL3042Contig1 1200 3 9 U
GGAGATCTCGAGAGATTGGATCGGTGTTGAAGCCGTCTCGCCGGGAAGGAGTAAAATGGC
GGCGAAGCAGATGGAAGAGATACAGAAGAAGCTAGCGGTGCTGAGTTACCCAAGGGCAAA
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CTTCTTCAAGTTGTTAGGTGATAAGTCTCCTTTCTCACAGCAAAATCTTCAGGGAGATGC
TGGAGTTCGTGATGAAGAAACTGTTCGCATTCAGTATTTGGCAGAGATTGCAAAGTTTCT
GGGGTTCACACCAACTGTAGACATTGAAGCCATTCAAGGACATGGAACCTATGAAGATCG
AATGGAAATGCTTCGCAATATTGTTGATTTAGTGGAGGCAAGCCTCTTCTCTGATAATCC
CCAATGGAGTATTGATGAGCAGGTTGCCAAAGACATTCAGCTTATAGATGCTATTGCTGA
GAGACAGTCTCTTATATTTTCTGAGGAATGCAAACTCTTCCCTGCTGATGTGCAGATTCA
GTCAATATATCCTTTACCAGATGTTTCAGAACTGGAGACTAAACTTTCAGAACAGGCCAA
GATTCTCTCTAATCTTCAGCAAAAAGTTGATGATTTAGCAGCAAAGCATGCCTACAACCC
CGACGAAGAATATGCAGAAGTGGAATCTGAACTAAAGGGCTCGTTTAGAATCATTCCTTG
AAACAGCTAGAGCGTTCAACACAATCTACACAAAGGAAATCCGACCATGGACTCACATGA
TGGAAGTACCTCAGCTTCATGGGTTTGGTCCTGCTGCAAACCGTTTACTGGAGGCATATA
ATATGCTTCTCAAGTTCCTAGGGAACTTGAAGAACCTAAGAGACTCACATGCAGCACTGT
CGATTGGATCATCTGGAACAGTAGCTGGAGAGCCGTCTTCCGTAACTAGAATTGTGTCTG
AGTGTGAAGCCGCGTTAACTGTTCTTAATCGAGACCTTGGAATCCTCTCTGCTTCTATTG
CTCGTGAGCAAGGGGAGCGTCTGTAAAAACTGTGACAGTTGAACATAATTTCTGTTTAAT
TCTTAGAAATCTCTTTTAGGAGTGTGTTTATGATCACAATAGTCTTCAACTATTTTTTTC
TTGTGTGTTGCCAAGTTTGTTTTAAAACAAATCGAATCAATCTAAAAGTGAAGTTCCTCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DQ82TF U 1
AF RR4BF59TF U 29
AF RR4BF59JQ C 353
BS 1 89 RR4DQ82TF
BS 90 90 RR4BF59TF
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BS 237 237 RR4BF59TF
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BS 828 1200 RR4BF59JQ

RD RR4DQ82TF 269 0 0
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TGGAGTTCGTGATGAAGAAACTGTTCG
AT

QA 1 267 1 267
DS 

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GAG
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CAGTATTTGGCAGAGATTGCAAAGTTTCTGGGGTTCACACCAACTGTAGACATTGAAGCC
ATTCAAGGACATGGAACCTATGAAGATCGAATGGAAATGCTTCGCAATATTGTTGATTTA
GTGGAGGCAAGCCTCTTCTCTGATAATCCCCAATGGAGTATTGATGAGCAGGTTGCCAAA
GACATTCAGCTTATAGATGCTATTGCTGAGAGACAGTCTCTTATATTTTCTGAGGAATGC
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CTGGAGACTAAACTTTCAGAACAGGCCAAGATTCTCTCTAATCTTCAGCAAAAAGTTGAT
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TGCTGCAAACCGTTTA

QA 4 799 4 799
DS 

RD RR4BF59JQ 848 0 0
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ATTGCTGAGAGACAGTCTCTTATATTTTCTGAGGAATGCAAACTCTTCCCTGCTGATGTG
CAGATTCAGTCAATATATCCTTTACCAGATGTTTCAGAACTGGAGACTAAACTTTCAGAA
CAGGCCAAGATTCTCTCTAATCTTCAGCAAAAAGTTGATGATTTAGCAGCAAAGCATGCC
TACAACCCCGACGAAGAATATGCAGAAGTGGAATCTGAACTAA*GGGCTCGTTTAGAATC
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TCACATGATGGAAGTACCTCAGCTTCATGGGTTTGGTCCTGCTGCAAACCGTTTACTGGA
GGCATATAATATGCTTCTCAAGTTCCTAGGGAACTTGAAGAACCTAAGAGACTCACATGC
AGCACTGTCGATTGGATCATCTGGAACAGTAGCTGGAGAGCCGTCTTCCGTAACTAGAAT
TGTGTCTGAGTGTGAAGCCGCGTTAACTGTTCTTAATCGAGACCTTGGAATCCTCTCTGC
TTCTATTGCTCGTGAGCAAGGGGAGCGTCTGTAAAAACTGTGACAGTTGAACATAATTTC
TGTTTAATTCTTAGAAATCTCTTTTAGGAGTGTGTTTATGATCACAATAGTCTTCAACTA
TTTTTTTCTTGTGTGTTGCCAAGTTTGTTTTAAAACAAATCGAATCAATCTAAAAGTGAA
GTTCCTCG

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

CO CL3043Contig1 703 2 1 U
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BQ
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AF RR4B109JQ C 1
AF RR4B109TF U 1
BS 1 703 RR4B109TF

RD RR4B109JQ 703 0 0
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TCGTTTAAAAAAGGAAGAAAATAATAAGAATAGTTATTTGTGG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4B109TF 703 0 0
GGTTTTGATTCCTCCCTTCATAGAAGATGATCACTCTCCTTTACCCGCTTGGATGATCGA
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AAAGGGAGGCTTCAAACGCGCTTCTTTGCGGTTTGTGGCGGTTTCTACCCGCACGAGGGT
TATGTTTTACAGCACGTTTTACGCGATGAGAAGCGATGACTTCTCGTCTCTGTGTGGCCC
CGTGATCGACGATGTTAAGCTCCTCAGCGTTCACAAGGCGTAAAATGGTCCTTGTTTTAT
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GTGCTTTTTAAATGAGATGATTTATATACCGAGTGAGTTGTTATGGCATAGAGTTATATA
TAAAACAGAAATGTCTTGCTTATATCTATTTTCTTGTATGAGAAGGCTGAAGAAATGTTG
TCGTTTAAAAAAGGAAGAAAATAATAAGAATAGTTATTTGTGG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL3045Contig1 789 4 13 U
GGGTCAACTCAGTAGCTTGAGACGAAGACCCGGCGGAGGGAGATGAAGCTGAAGCAATTA
GAAGGCTTGCTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAACCCTAAAGTTGAATTGGAGCAGTAC
CCAACTGGTCCTCATATTGCTTCTCGCATGCTTTTCACCGCAGAGAATTCATATGGAGAC
ATAACTGATAAAGTCGTTGCGGATTTTGGCTGTGGCTGCGGTACTTTAAGTACTGCTGCT
TCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGGATACGATATCGACCTTCAGTCTCTTGAAACA
GCAACACTTAACGCAGAGGAACTTGAGGTGGAGATAGATTTAGTTCAATGTGACATTACA
AAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGTGGATACTGTTGTAATGAATCCTCCCTTTGGA
ACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTCCTCTCTGCGGCAATGAAGGTCGCCTCTCAA
GCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACCAGAGAACACATTAAAAGGGCAGCGTTGCGT
GATTTTAATGCCAAAAGTGCTGAAGTTATATGTGAGCTCCGGTATGACTTGCCAAAACTC
TACAAGTTCCACAAACGAAAAGAAGTCGATATTGCGGTTGATTTCTGGCGTTTTGAGCCT
AGACAGAACTAGACCCGCCACGTTCTTGCAATGTTTAGCTTTGAGTTGACATTTGGTTAT
AATGTGGGATATTTCATGATATGAACTCAAGTTTTATAAATGTTTGCTGATTTGAACTAA
GAAGATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF47TF U 1
AF RR4FY60TF U 49
AF RR4FY60JQ C 253
AF RR4DF47JQ C 210
BS 1 95 RR4DF47TF
BS 96 96 RR4FY60TF
BS 97 341 RR4DF47TF
BS 342 342 RR4FY60TF
BS 343 347 RR4DF47TF
BS 348 348 RR4FY60TF
BS 349 457 RR4DF47TF
BS 458 458 RR4FY60TF
BS 459 573 RR4DF47TF
BS 574 642 RR4FY60TF
BS 643 643 RR4DF47JQ
BS 644 745 RR4FY60TF
BS 746 789 RR4DF47JQ

RD RR4DF47TF 573 0 0
GGGTCAACTCAGTAGCTTGAGACGAAGACCCGGCGGAGGGAGATGAAGCTGAAGCAATTA
GAAGGCTTGCTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAATCCTAAAGTTGAATTGGAGCAGTAC
CCAACTGGTCCTCATATTGCTTCTCGCATGCTTTTCACCGCAGAGAATTCATATGGAGAC
ATAACTGATAAAGTCGTTGCGGATTTTGGCTGTGGCTGCGGTACTTTAAGTACTGCTGCT
TCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGGATACGATATCGACCTTCAGTCTCTTGAAACA
GCAACACTTAACGCAGAGGAACTTGAGGTGGAGATAGATTTTGTTCAGTGTGACATTACA
AAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGTGGATACTGTTGTAATGAATCCTCCCTTTGGA
ACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTCCTCTCTGTGGCAATGAAGGTCGCCTCTCAA
GCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACCAGAGAACACATTAAAAGGGCAGCGTTGCGT
GATTTTAATGCCAAAAGTGCTGAAGTTATATGT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4FY60TF 697 0 0
G
TGAAGCAATTAGAAGGCTTGTTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAACCCTAAAGTTGAAT
TGGAGCAGTACCCAACTGGTCCTCATATTGCTTCTCGCATGCTTTTCACCGCAGAGAATT
CATATGGAGACATAACTGATAAAGTCGTTGCGGATTTTGGCTGTGGCTGCGGTACTTTAA
GTACTGCTGCTTCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGGATACGATATCGACCTTCAGT
CTCTTGAAACAGCAACACTTAACGCTGAGGAACTTGAGGTGGAGATAGATTTAGTTCAAT
GTGACATTACAAAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGTGGATACTGTTGTAATGAATC
CTCCCTTTGGAACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTCCTCTCTGCGGCAATGAAGG
TCGCCTCTCAAGCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACCAGAGAACACATTAAAAGGG
CAGCGTTGCGTGATTTTAATGCCAAAAGTGCTGAAGTTATATGTGAGCTCCGGTATGACT
TGCCAAAACTCTACAAGTTCCACAAACGAAAAGAAGTCGATATTGCGGTTGATCTCTGGC
GTTTTGAGCCTAGACAGAACTAGACCCGCCACGTTCTTGCAATGTTTAGCTTTGAGTTGA
CATTTGGTTATAATGTGGGATATTTCATGATATGAA

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR4FY60JQ 526 0 0
GCTGCCTGTGTGATTGGATACGATATCGACCTTCAGTCTCTTGAAACAGCAACACTTAAC
GCTGAGGAACTTGAGGTGGAGATAGATTTAGTTCAATGTGACATTACAAAGTTAGAGTTA
AAAGGCCACCAGATTGTGGATACTGTTGTAATGAATCCTCCCTTTGGAACACGAAAGAAA
GGAGCTGACATGGAGTTCCTCTCTGCGGCAATGAAGGTCGCCTCTCAAGCTGTTTACTCC
TTGCATAAGACATCTACCAGAGAACACATTAAAAGGGCAGCGTTGCGTGATTTTAATGCC
AAAAGTGCTGAAGTTATATGTGAGCTCCGGTATGACTTGCCAAAACTCTACAAGTTCCAC
AAACGAAAAGAAGTCGATATTGCGGTTGATTTCTGGCGTTTTGAGCCTAGACAGAACTAG
ACCCGCCACGTTCTTGCAATGTTTAGCTTTGAGTTGACATTTGGTTATAATGTGGGATAT
TTCATGATATGAACTCAAGTTTTATAAATGTTTGCTGATTTGAAC
C

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4DF47JQ 580 0 0
CTGTGGCTGCGGTACTTTAAGTACTGCTGCTTCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGG
ATACGATATCGACCTTCAGTCTCTTGAAACAGCAACACTTAACGCAGAGGAACTTGAGGT
GGAGATAGATTTTGTTCAGTGTGACATTACAAAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGT
GGATACTGTTGTAATGAATCCTCCCTTTGGAACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTT
CCTCTCTGTGGCAATGAAGGTCGCCTCTCAAGCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATTTAC
CAGAGAACACATTAAAAGGGCAGCGTTGCGTGATTTTAATGCCAAAAGTGCTGAAGTTAT
ATGTGAGCTCCGGTATGACTTGCCAAAACTTTACAAGTTCCACAAACGAAAAGAAGTCGA
TATTGCGGTTGATTTCTGGCGTTTTGAGCCTAGACAGAACTAGACCCGCCACGTTCTTGC
AATGTTTAGCTTTGAGTTGACATTTGGTTATAATGTGGGATATTTCATGATATGAACTCA
AGTTTTATAAATGTTTGCTGATTTGAACTAAGAAGATGAA

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 4

CO CL3046Contig1 734 4 12 U
GGATCTCACAAACAAAAACACAACACACACAAACAAGGCTGTGAAGATATATCAATAGAC
AAAACAAATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGAAAAGGAAAAGATAACAAAAGT
GAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCATTGTTTGGGTTCCTGGTGATCG
CTGTCGTCACCCCATTGGCGGACGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCAG
ATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAAC
AATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCCG
TGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTC
TAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACT
CAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTG
CTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTTAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
GTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG43TF U 6
AF RR4GU86JQ C 1
AF RR4GU86TF U 1
AF RR4EG43JQ C 422
BS 1 7 RR4GU86JQ
BS 8 36 RR4EG43TF
BS 37 37 RR4GU86TF
BS 38 190 RR4EG43TF
BS 191 191 RR4GU86TF
BS 192 298 RR4EG43TF
BS 299 299 RR4GU86TF
BS 300 512 RR4EG43TF
BS 513 686 RR4GU86TF
BS 687 687 RR4GU86JQ
BS 688 703 RR4GU86TF
BS 704 734 RR4EG43JQ

RD RR4EG43TF 507 0 0
GG
ACAAACAAAAACACAACACACACAAACAAAGCTGTGAAGATATATCAATAGACAAAACAA
ATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGAAAAGGAAAAGATAACAAAAGTGAGAAGC
AATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCATTGTTTGGGTTCCTGGTGATCGCTGTCGT
CACTCCATTGGCGGACGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCAGATGTTCC
GAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGATCAATTCAA
CCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCCGTGTTGAA
TCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTCTAAAATA
CAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTGT
GGTTATTCAACCATGGCTCCATTCG

QA 3 507 3 507
DS 

RD RR4GU86JQ 704 0 0
GGATCTCACAAACAAAAACACAACACACACAAACAAGGCTGTGAAGATATATCAATAGAC
AAAACAAATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGAAAAGGAAAAGATAACAAAAGT
GAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCATTGTTTGGGTTCCTGGTGATCG
CTGTCGTCACCCCATTGGCGGACGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCAG
ATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAAC
AATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCCG
TGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTC
TAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACT
CAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTG
CTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTTAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
GTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATG
G

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4GU86TF 711 0 0
GGATCTC
ACAAACAAAAACACAACACACACAAACAAGGCTGTGAAGATATATCAATAGACAAAACAA
ATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGAAAAGGAAAAGATAACAAAAGTGAGAAGC
AATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCATTGTTTGGGTTCCTGGTGATCGCTGTCGT
CACCCCATTGGCGGACGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCAGATGTTCC
GAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAACAATTCAA
CCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCCGTGTTGAA
TCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTCTAAAATA
CAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTGT
GGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTGCTACTCC
TGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCCAAAAAGA
TCAAAAGTGTTTAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTTGTAATGT
TTCACGTTGTTCATAATGA*GACAAAAGATGTTATG
GAAAAAAA

QA 8 703 8 703
DS 

RD RR4EG43JQ 313 0 0
AAAATACAATTTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGATTC
AGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTGC
TACTCCTGTTTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCCA
AAAAGATCAAAGGTGTTTAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTTG
TAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGACT
TGTTAGAATATAT

QA 1 313 1 313
DS 



AS 1 2

CO CL3047Contig1 758 2 2 U
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AAATACTCAGAGAGTCCGAGACCGAGTTAACTCGCCAGATTCAGCTGTAGATCAAATGGC
TGGGGTTATGCAGAAGTTCCTAGTTGCATCAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCAT
CTTATACGGTTTCAACCATGATTTGCTCCCTGGTTCAACAACATTGTCCCCACACTCTCT
TACACTTCTAAGTGGATTTCTTGCGGTGGTATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACAT
CTGTCTGGCCCTGAAAGAACCTGTGGATAAACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGA
GGCCAAAGATAGTGTGAAGAAACTGACATCAGGATCAGGAGTCCCGAGCACTGACCCGGC
ACTTAAGAAACAAGAGTAAGAGGTTACCAAATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACAGCG
CTGATATTGCATCTGATGGCGAGCATGTTTCAGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTT
GTAGAAATTCTTGGCTGGTAGATTATCCTCTGTTGTGACATTTGATGGTTTTGGGGGTTT
GGTTTAAGCAACAGAAACTGCATTGTTCATGTTGAACGGATACGATAGCTTATGTTTTAG
GGACAAAACTGTGTTTCCAGTTGGTGTTCCTTCATTGCAAGGATTGATAAGTTTGGAAGA
AACCTAAGTAATATAATAGTTTCTCTCATCTAGAAAAA


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW86TF U 1
AF RR4BW86JQ C 4
BS 1 738 RR4BW86TF
BS 739 758 RR4BW86JQ

RD RR4BW86TF 738 0 0
GGAAGAGAGAGAGAGAACCGAAAAAAAGAAATCTAGACATTGGAAATTGCAGGAAAGCAA
AAATACTCAGAGAGTCCGAGACCGAGTTAACTCGCCAGATTCAGCTGTAGATCAAATGGC
TGGGGTTATGCAGAAGTTCCTAGTTGCATCAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCAT
CTTATACGGTTTCAACCATGATTTGCTCCCTGGTTCAACAACATTGTCCCCACACTCTCT
TACACTTCTAAGTGGATTTCTTGCGGTGGTATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACAT
CTGTCTGGCCCTGAAAGAACCTGTGGATAAACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGA
GGCCAAAGATAGTGTGAAGAAACTGACATCAGGATCAGGAGTCCCGAGCACTGACCCGGC
ACTTAAGAAACAAGAGTAAGAGGTTACCAAATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACAGCG
CTGATATTGCATCTGATGGCGAGCATGTTTCAGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTT
GTAGAAATTCTTGGCTGGTAGATTATCCTCTGTTGTGACATTTGATGGTTTTGGGGGTTT
GGTTTAAGCAACAGAAACTGCATTGTTCATGTTGAACGGATACGATAGCTTATGTTTTAG
GGACAAAACTGTGTTTCCAGTTGGTGTTCCTTCATTGCAAGGATTGATAAGTTTGGAAGA
AACCTAAGTAATATAATA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4BW86JQ 755 0 0
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TACTCAGAGAGTCCGAGACCGAGTTAACTCGCCAGATTCAGCTGTAGATCAAATGGCTGG
GGTTATGCAGAAGTTCCTAGTTGCATCAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCATCTT
ATACGGTTTCAACCATGATTTGCTCCCTGGTTCAACAACATTGTCCCCACACTTTCTTAC
ACTTTTAAGTGGATTTCTTGCGGTGGTATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACATCTG
TCTGGCCCTGAAAGAACCTGTGGATAAACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGAGGC
CAAAGATAGTGTGAAGAAACTGACATCAGGATCAGGAGTCCCGAGCACTGACCCGGCACT
TAAGAAACAAGAGTAAGAGGTTACCAAATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACAGCGCTG
ATATTGCATCTGATGGCGAGCATGTTTCAGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTTGTA
GAAATTCTTGGCTGGTAGATTATCCTCTGTTGTGACATTTGATGGTTTTGGGG*TTTGGT
TTAAGCAACAGAAACTGCATTGTTCATGTTGAACGGATACGATAGCTTATGTTTTAGGGA
CAAAACTGTGTTTCCAGTTGGTGTTCCTTCATTGCAAGGATTGATAAGTTTGGAAGAAAC
CTAAGTAATATAATAGTTTCTCTCATCTAGAAAAA

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3048Contig1 700 2 11 U
GTGAAAAGAAGAATAAAGAGTATATTTTATTTTGTATAATACAAGCAGTTGGTGATGGTC
CAATGGACAGATAGAGAGAGTCTGTATCTAAATCCAACAAGTTCACAAACCCTATGCGAC
AATTCTTATGGACAAATACACAATCAAACTTGTTGTTCAAGAATCCGCCAAGCCTGCTGC
TGACTGCCTTAAAACCGTTTGCTGGTTGGGACATGCGCGTAAAAGTGTGCAAATGTCGTT
TTTCACTAGGAATTCCTCTGCATTCACGAGGATCAAAGGTCCATACTCGAACACCAACTT
CTTGCACTTCTTCTCGTACTCGTGGTTTTTGAACGATTTGCATCCCTTAAGAAGCAGCTC
AACTATATCCAACTGTGTGTCGGGATCTTGTAGTTTGATGAAAATCTCAAAAACAGTCCT
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AGGGAGGTAGTAGTCAACCAAAGTTATGCACTGTTGTTCAAATCCGCGGATATGGGAACA
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AGCAGAGTTAACATACTCCTCACATAGACTGCATACCTTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD75JQ U 3
AF RR4F323JQ U 1
BS 1 222 RR4F323JQ
BS 223 223 RR4CD75JQ
BS 224 231 RR4F323JQ
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RD RR4CD75JQ 535 0 0
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TTCTTATGGACAAATACACAATCAAACTTGTTGTTCAAGAATCCGCCAAGCCTGCTGCTG
ACTGCCTTAAAACCGTTTGCTGGTTGG*ACATGCGCGTAAAAGTGTGCAAATGTCGTTTT
TCACTAGGAATTCCTCTGCATTCACGAGGATCAAAGGTCCATACTCGAACACCAACTTCT
TGCACTTCTTCTCGTACTCGTGGTTTTTGAACGATTTGCATCCCTTAAGAAGCAGCTCAA
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GGCAAACATCGCAAGTATCCTGACGAGCTTCTTCAACAAGAGCTACGACGTGACCACAAA
GATTCAACCGCTTGCAAAAATAATGAGGTTGAAAGGACTCAAGATGCAAGAA
AAA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4F323JQ 700 0 0
GTGAAAAGAAGAATAAAGAGTATATTTTATTTTGTATAATACAAGCAGTTGGTGATGGTC
CAATGGACAGATAGAGAGAGTCTGTATCTAAATCCAACAAGTTCACAAACCCTATGCGAC
AATTCTTATGGACAAATACACAATCAAACTTGTTGTTCAAGAATCCGCCAAGCCTGCTGC
TGACTGCCTTAAAACCGTTTGCTGGTTGGGACATGCGCGTAAGAGTGTGCAGATGTCGTT
TTTCACTAGGAATTCCTCTGCATTCACGAGGATCAAAGGTCCATACTCGAACACCAACTT
CTTGCACTTCTTCTCGTACTCGTGGTTTTTGAACGATTTGCATCCCTTAAGAAGCAGCTC
AACTATATCCAACTGTGTGTCGGGATCTTGTAGTTTGATGAGAATCTCAGAAACAGTCCT
GTGGCAAACATCGCAAGTATCCTGACGAGCTTCTTCAACAAGAGCTACGACGTGACCACA
AAGATTCAACCGCTTGCAGAAATAATGAGGTTGAAAGGACTCAAGATGCAAGAAGAAGAG
AGGGAGGTAGTAGTCAACCAAAGTTATGCACTGTTGTTCAAATCCGCGGATATGGGAACA
CTGGTCATGAAGGTCCTCTAATATCTGACTCTGTGTTTCGTTTTTCTCAAGGTAGCTGAG
AGCAGAGTTAACATACTCCTCACATAGACTGCATACCTTT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

CO CL3049Contig1 555 4 10 U
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ATAGGCAAGAACTGTGACATCGTCTTGGATTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAGAGAAT
CTAAACTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTTCGAGACATTCTTTGGCTCGAACAACT
TTAGACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTC
TGTAAAATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGC
GCATTAATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCTGCATTGCTTCCTGCGCAACACCA
GTTTTAGACGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATC
CCAGAACCCATCACAATGAACTGCGCAATTATTCTACTAGCCATGGAAGCAAATTAGTTG
ACCCGTCTGAAATTCGAGAAGATGCCTCCTTTCCTTCGCTTATTGATATGCTTAAACTCA
GCGGGTGATCCCGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BD77JQ U 1
AF RR4BD77TF C 1
AF RR4BA70JQ U 35
AF RR4BA70TF C 35
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BS 184 184 RR4BA70JQ
BS 185 423 RR4BD77JQ
BS 424 424 RR4BA70JQ
BS 425 466 RR4BD77JQ
BS 467 467 RR4BA70JQ
BS 468 486 RR4BD77JQ
BS 487 487 RR4BA70JQ
BS 488 513 RR4BD77JQ
BS 514 555 RR4BA70JQ

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ATAGGCAAGAACTGTGACATCGTCTTGGATTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAGAGAAT
CTAAACTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTTCGAGACATTCTTTGGCTCGAACAACT
TTAGACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTC
TGTAAAATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGC
GCATTAATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCTGCATTGCTTCCTGCGCAACACCA
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ACCCGTTTGAAATTCGAGAAGATGCCTCCTTTC
GTTCACC

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DS 

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CTT
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CGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCATTAATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCT
GCATTGCTTCCTGCGCAACACCAGTTTTAGACGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGGCTT
GAAAGACAGCACGACCCAATATCCCAGAACCCATCACAATGAACTGCGCAATTATTCTAC
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GCTTATTGATATGCTTAAACTCAGCGGGTGATCCCGCC

QA 4 521 4 521
DS 



AS 1 4

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GATTCGCCAAACCCTGCGCACCAAGACATCCCAAACTCCGCCTCGTTATGCCCATAGTAA
CAGGCAGGATCAAGAATGACAGGTTCGCTGTTCTTGTCGTATGCTATGTTCCCGCTCCAG
AGATCTCCATGTAACAAGCAAGGTTCTATGACAACATTCTCAAAGAGAGAAGCCATGTTC
TGTATCAGTGGATAACCTTTCTGGTAAATTGCAGAGTCACCGTATTGATCCCTAAGTAAC
TTTAGCTGGTAACCTAATCTCTTCTCACCATAAAACTCAATCCAATCTGATGACCAAGTG
TTTATCTGTGGGGTACTTCCAATAGTGTTGTCAACCTCAAAACCAAAGCCTTTTGAGGAC
TTTCCTGCCTTATGCATCTCAGCTAGCTTCCTTCCTAGCTCAGCCTGGCTGCCTCTTGAT
CCAAACTCTATAAACTCCATGATGATATAAGATCCACCTGTTGGCAATGCTCCAACTTTG
TGTGGCTTGGGGACACGGATGGAACTGGTTTCATACATAGCCTCAAGACCAAGAGCCTCT
CCTTCAAACATCTCAGGTCCAATACTCCTGTTTGTTTTAACAAAGAAAGAAGCAGAATCA
GTATGATAATGAGTAGCAAGATTGATGCACCCACCACCAACAGAAGTAATCTTCGTGATC
TGACTAGCTTTTCCTTCTGTTAGAATCCATTCACGAATTGGATCCTCACTCATTGCAGCC
ATAGCAAAAAATTTGGGTCGAGAGAAGCTGCAAAGATGAAGCTTTGGCCGAGCAGAGTAG
CAAAGACTAAGAGAAGCCACCACAGCCGCCATTTTTCATTCTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4FL64JQ U 1
AF RR4FI18JQ U 51
AF RR4FL64TF C 345
AF RR4FI18TF C 348
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RD RR4FL64JQ 673 0 0
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TTTAGCTGGTAACCTAATCTCTTCTCACCATAAAACTCAATCCAATCTGATGACCAAGTG
TTTATCTGTGGGGTACTTCCAATAGTGTTGTCAACCTCAAAACCAAAGCCTTTTGAGGAC
TTTCCTGCCTTAT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FI18JQ 742 0 0
AG
AATGCTAGGCCTTTTTCAAATAATGCTTCTAATAAAGAGTACATCATGATGATATTTTCT
CTCACCAGCTTTATACATTTTAAACTTTGAGCATCCTAAGATAACCATCAATGATCGACA
TTGCAGAGGAACGATAGCCCGATCCAAAGAGGTTGTAATGATTCAAGTAGTGATAAAGCA
AATACAGATCCCTCCTCTTCTCAAATCCAGCTTCTTTTGGCATCACCTTGAAATAGGCAT
TATAGAAAGATTCGCCAAACCCTGCGCACCAAGACATCCCAAACTCCGCCTCGTTATGCC
CATAGTAACAGGCAGGATCAAGAATGACAGGTTCGCTGTTCTTGTCGTATGCTATGTTCC
CGCTCCAGAGATCTCCATGTAACAAGCATGGTTCTATGACAACATTCTCAAAGAGGGAAG
CCATGTTCTGTATCAGTGGATAACCTTTCTGGTAAATTGCAGAGTCACCGTATTGATCCC
TAAGTAACTTTAGCTGGTAACCTAATCTCTTCTCGCCGTAGAACTCAATCCAATCTGATG
ACCAAGTGTTTATCTGTGGGGTACTTCCAATAGTGTTGTCAACCTCAAAACCAAAGCCTT
TTGAGGACTTTCCTGCCTTATGCATCTCAGCTAGCTTCCTTCCTAGCTCAGCCTGGCTGC
CTCTTGATCCAAACTCTATAAACTCCATGATGATATAAGATCCACCTGTTGGCAATGCTC
CAACTTTGTGTGGCTTGGGG

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR4FL64TF 780 0 0
CGT
ATGCCCATAGTAACAGGCAGGATCAAGAATGACAG*TTCGCTGTTCT*GTCGTATGCTAT
GTTCCCGCTCCAGAGATCTCCATGTAACAAGCAAGGTTCTATGACAACATTCTCAAAGAG
AGATGCCATGTTCTGTATCAGTGTATAACCTTTCTGGTAAATTGCAGAGTCACCGTATTG
ATCCCTAAGTAACTTTAGCTGGTAACCTAATCTCTTCTCACCATAAAACTCAATCCAATC
TGATGACCAAGTGTTTATCTGTGGGGTACTTCCAATAGTGTTGTCAACCTCAAAACCAAA
GCCTTTTGAGGACTTTCCTGCCTTATGCATCTCAGCTAGCTTCCTTCCTAGCTCAGCCTG
GCTGCCTCTTGATCCAAACTCTATAAACTCCATGATGATATAAGATCCACCTGTTGGCAA
TGCCCCAACTTTGTGTGGCTTGGGGACACGGATGGTACTGGTTTCATACATAGCCTCAAG
ACCAAGAGCCTCTCCTTCAAACATCTCAGGTCCAATACTCCTGTTTGTTTTAACAAAGAA
AGAAGCAGAATCAGTATGATAATGGGTAGCAAGATTGATGCAGCCACCACCAACAGAAGT
GATCTTCGTGATCTGACTAGCTTTTCCTTCTGTTAGAATCCATTCACGAATTGGATCCTC
ACTCATTGCAGCCATAGTAAAAATTTTGGGTCGAGAGAAGCTGCAAAGATGAAGCTTTGG
CCGAGCAGAGTAGCAAAGACTAAGAGAAGCCACCACAGCCGCCATTTTTCATTCTCC

QA 4 780 4 780
DS 

RD RR4FI18TF 780 0 0
ATGCCCATAGTAACAGGCAGGATCAAGAATGACAG*TTCGCTGTTCTTGTCGTATGCTAT
GTTCCCGCTCCAGAGATCTCCATGTAACAAGCATGGTTCTATGACAACATTCTCAAAGAG
GGAAGCCATGTTCTGTATCAGTGGATAACCTTTCTGGTAAATTGCAGAGTCACCGTATTG
ATCCCTAAGTAACTTTAGCTGGTAACCTAATCTCTTCTCGCCGTAGAACTCAATCCAATC
TGATGACCAAGTGTTTATCTGTGGGGTACTTCCAATAGTGTTGTCAACCTCAAAACCAAA
GCCTTTTGAGGACTTTCCTGCCTTATGCATCTCAGCTAGCTTCCTTCCTAGCTCAGCCTG
GCTGCCTCTTGATCCAAACTCTATAAACTCCATGATGATATAAGATCCACCTGTTGGCAA
TGCTCCAACTTTGTGTGGCTTGGGGACACGGATGGATCTTGTTTCATACATAGCCTCAAG
ACCAAGAGCCTCTCCTTCAAACATCTCAGGTCCAATACTCCTGTTTGTTTTAACAAAGAA
AGAAGCAGCATCAGTATGATAATGAGTAGCAAGATTGATGCACCCACCACCAACAGAAGT
AATCTTCGTGATCTGACTAGCTTTTCCTTCTGTTAGAATCCATTCACGAATTGGATCCTC
ACTCATTGCAGCCATAGCAAAAAATTTGGGTCGAGAGAAGCTGCAAAGATGAAGCTTTGG
CCGAGCAGAGTAGCAAAGACTAAGAGAAGCCAGCACAGCCGCCATTTTTCATTCTCCCCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 2 4

CO CL3051Contig1 636 2 3 U
GGGAAGGTCACTAGACTAATGGCGAATTTGATGATGCTGAGGTTACCTAACAGCTTGAGA
AGCTTCTCTGTTTCGGCTTCTTCTTCTTCAAACGGTAACTTTGTTCAAAACCTCGCTTCT
ATCCTTAAAACTATGGTGAATCTGACACTGATTTTGATTTTTCAGGTTCGCCGCCGGTGA
TCGGAGGATCTAGCGGCGGTGTAGGGCCGATGATCGTGGAGTTGCCGCTGGAGAAGATAC
GGAGACCGTTGATGCGAACAAGATCCAACGACCAGAACAAAGTGAATGAGCTCATGGATA
GCATTCGCCAAATCGGTCTTCAAGTTCCGATCGATGTGATCGAAGTTGATGGAGCTTACT
ATGGCTTCTCTGGTTGCCACAGGTACGAGGCACATCAGAAGTTAGGTCTCCCAACTATAC
GCTGCAAAATCCGCAAAGGAACAAAGGAAACATTAAGGCATCACCTTCGCTGAGACCCTG
AGAATATTCATCACTTTATATGAAATGTGTAATTGGTGGAATCTGTGTATTTGTCTGTAT
AAAGAATTTAAATAAAAACTTTGTAACATCTCTGAAATTCTCTGACTGGTCGGAGAAAGA
GGATAAGGGGAATCCACTATATATATGTTCAGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A677TF U 1
AF RR4A677JQ C 163
BS 1 475 RR4A677TF
BS 476 476 RR4A677JQ
BS 477 636 RR4A677TF

RD RR4A677TF 636 0 0
GGGAAGGTCACTAGACTAATGGCGAATTTGATGATGCTGAGGTTACCTAACAGCTTGAGA
AGCTTCTCTGTTTCGGCTTCTTCTTCTTCAAACGGTAACTTTGTTCAAAACCTCGCTTCT
ATCCTTAAAACTATGGTGAATCTGACACTGATTTTGATTTTTCAGGTTCGCCGCCGGTGA
TCGGAGGATCTAGCGGCGGTGTAGGGCCGATGATCGTGGAGTTGCCGCTGGAGAAGATAC
GGAGACCGTTGATGCGAACAAGATCCAACGACCAGAACAAAGTGAATGAGCTCATGGATA
GCATTCGCCAAATCGGTCTTCAAGTTCCGATCGATGTGATCGAAGTTGATGGAGCTTACT
ATGGCTTCTCTGGTTGCCACAGGTACGAGGCACATCAGAAGTTAGGTCTCCCAACTATAC
GCTGCAAAATCCGCAAAGGAACAAAGGAAACATTAAGGCATCACCTTCGCTGAGAGCCTG
AGAATATTCATCACTTTATATGAAATGTGTAATTGGTGGAATCTGTGTATTTGTCTGTAT
AAAGAATTTAAATAAAAACTTTGTAACATCTCTGAAATTCTCTGACTGGTCGGAGAAAGA
GGATAAGGGGAATCCACTATATATATGTTCAGTACC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4A677JQ 474 0 0
CA
GGTTCGCCGCCGGTGATCGGAGGATCTAGCGGCGGTGTAGGGCCGATGATCGTGGAGTTG
CCGCTGGAGAAGATACGGAGACCGTTGATGCGAACAAGATCCAACGACCAGAACAAAGTG
AATGAGCTCATGGATAGCATTCGCCAAATCGGTCTTCAAGTTCCGATCGATGTGATCGAA
GTTGATGGAGCTTACTATGGCTTCTCTGGTTGCCACAGGTACGAGGCACATCAGAAGTTA
GGTCTCCCAACTATACGCTGCAAAATCCGCAAAGGAACAAAGGAAACATTAAGGCATCCC
CTTCGCTGAGACCCTGAGAATATTCATCACTTTATATGAAATGTGTAATTGGTGGAATCT
GTGTATTTGTCTGTATAAAGAATTTAAATAAAAACTTTGTAACATTTCTGAAATTCTCTG
ACTGGTCGGAGAAAGAGGATAAGGGGAATCCACTATATATATGTTCAGTACC

QA 3 474 3 474
DS 



CO CL3051Contig2 509 2 2 U
GGAGAGAGAAGAAGAAGGTGACTAATGGCGAATTTGATGATGCTGAGGTTACCTAGCAGC
TTGAGAAGCTTCTCTGTTTCCGCTTCTTCTTCTTCAAACGGTTCACCGCCGGTGATCGGA
GGATCTAGCGGCGGTGTAGGGCCGATGATCGTGGAGTTGCCGCTGGAGAAGATACGGAGA
CCGTTGATGCGAACAAGATCCAACGACCAGAACAAAGTGAAGGAGCTCATGGATAGCATT
CGCCAAATCGGTCTTCAAGTTCCGATCGATGTGATCGAAGTTGATGGAGCTTACTATGGC
TTCTCTGGTTGTCACAGGTACGAGGCACATCAGAAGTTAGGTCTGCCAACTATACGCTGC
AAAATCCGCAAAGGAACAAAGGAAACACTAAGGCATCACCTTCGCTGAGAGCCTGAGAAT
ACTCATCACTTTATTCTATGAAATGTGTACTTGGTGGAATCTGTGTATTTGTCCGTATAA
AATAATTTAAATAAAAACTTTGTAACATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4CD87JQ C 1
AF RR4CD87TF U 1
BS 1 508 RR4CD87TF
BS 509 509 RR4CD87JQ

RD RR4CD87JQ 509 0 0
GGAGAGAGAAGAAGAAGGTGACTAATGGCGAATTTGATGATGCTGAGGTTACCTAGCAGC
TTGAGAAGCTTCTCTGTTTCCGCTTCTTCTTCTTCAAACGGTTCACCGCCGGTGATCGGA
GGATCTAGCGGCGGTGTAGGGCCGATGATCGTGGAGTTGCCGCTGGAGAAGATACGGAGA
CCGTTGATGCGAACAAGATCCAACGACCAGAACAAAGTGAAGGAGCTCATGGATAGCATT
CGCCAAATCGGTCTTCAAGTTCCGATCGATGTGATCGAAGTTGATGGAGCTTACTATGGC
TTCTCTGGTTGTCACAGGTACGAGGCACATCAGAAGTTAGGTCTGCCAACTATACGCTGC
AAAATCCGCAAAGGAACAAAGGAAACACTAAGGCATCACCTTCGCTGAGAGCCTGAGAAT
ACTCATCACTTTATTCTATGAAATGTGTACTTGGTGGAATCTGTGTATTTGTCCGTATAA
AATAATTTAAATAAAAACTTTGTAACATC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4CD87TF 509 0 0
GGAGAGAGAAGAAGAAGGTGACTAATGGCGAATTTGATGATGCTGAGGTTACCTAGCAGC
TTGAGAAGCTTCTCTGTTTCCGCTTCTTCTTCTTCAAACGGTTCACCGCCGGTGATCGGA
GGATCTAGCGGCGGTGTAGGGCCGATGATCGTGGAGTTGCCGCTGGAGAAGATACGGAGA
CCGTTGATGCGAACAAGATCCAACGACCAGAACAAAGTGAAGGAGCTCATGGATAGCATT
CGCCAAATCGGTCTTCAAGTTCCGATCGATGTGATCGAAGTTGATGGAGCTTACTATGGC
TTCTCTGGTTGTCACAGGTACGAGGCACATCAGAAGTTAGGTCTGCCAACTATACGCTGC
AAAATCCGCAAAGGAACAAAGGAAACACTAAGGCATCACCTTCGCTGAGAGCCTGAGAAT
ACTCATCACTTTATTCTATGAAATGTGTACTTGGTGGAATCTGTGTATTTGTCCGTATAA
AATAATTTAAATAAAAACTTTGTAACAT
C

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 4

CO CL3052Contig1 1008 4 7 U
CATCAAGAACCCATCCTCATGACATTATATTGATTTGTAACGAAAACCAATTCATTTAGT
ATGATGAAATGAGTCAAATGGTCATTTGATCTCATCATTCAACAGTACATTCTCTTTCCC
CCCCTAAAAAAAAGAAAAGCAAAAATGGGATTTGAATGTGTATGTTTTCATGATCTCTCA
AAGAGACCTTTAACATAAACCATGCCTTTCTCACTAAGCTGAAGTTCCTTCCTCATCTCT
TCAACTTGCACATCATCTCCTTGAACAACAATCTCATCCAGTTTCCCCTTTCTTCCCACC
ATCATCTTCACCTTGATCTCCTCCTTCCTCGACGCCTTCTTCCAGTAATACGCTCCTGCG
AGTGGACTAAGAATGGTAATGAAGAACCAGTTATTTCCAAAATCAGGCACTGTAATGGTT
AGTACAAGACCCACGCTTGCTAAGCTTATACATGTACAAAACGTGAGCAGAGCAGCTTGT
CCTCTACTCGGAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATTGTCTCTCCACGATCAGTAACATTA
AAGTTCTTCCTTGTGAAGAAAGAAAGAATCTCTCCAGCAACTTGCTTTGGTTCCTTCTTG
ATCCCTTCGCTAACAACAAACGTCTTCCTCACTATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTGATG
AGAGACCAAAGACCTGGAACTGAGATAACGAACAAACCCAAAGACGTGTAGTAGCTAGCT
AACGAGTAGCCACCACCAGTCTCCGCCATCAACAGTAATGAACTAGGGTTATGTTCCCAC
CATTGATGAATCTGAATCGCTGAAGAAGATACGGCGGAGAGAGGCTCCACAACCATGGCG
GTGACGGGGGAGACTCTGTTCCGCTTCGTCTCACATTCCCGTCTCCGCCGTGGAAGAACC
CTTTTGATCTCTACGTCTCTTGAAGTCACCCATGGACAAGACAACGGCGGAGAAAACAGC
TTCGTCGCCATTGTCCGAAAGTCGAAAGCTTTATCTGTGTCGTCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED53JQ U 1
AF RR4A388JQ U 39
AF RR4ED53TF C 236
AF RR4A388TF C 193
BS 1 53 RR4ED53JQ
BS 54 54 RR4A388JQ
BS 55 132 RR4ED53JQ
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BS 134 758 RR4ED53JQ
BS 759 827 RR4A388JQ
BS 828 1008 RR4A388TF

RD RR4ED53JQ 758 0 0
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ATGATGAAATGAGTCAAATGGTCATTTGATCTCATCATTCAACAGTACATTCTCTTTCCC
CCCCTAAAAAAA*GAAAAGCAAAAATGGGATTTGAATGTGTATGTTTTCATGATCTCTCA
AAGAGACCTTTAACATAAACCATGCCTTTCTCACTAAGCTGAAGTTCCTTCCTCATCTCT
TCAACTTGCACATCATCTCCTTGAACAACAATCTCATCCAGTTTCCCCTTTCTTCCCACC
ATCATCTTCACCTTGATCTCCTCCTTCCTCGACGCCTTCTTCCAGTAATACGCTCCTGCG
AGTGGACTAAGAATGGTAATGAAGAACCAGTTATTTCCAAAATCAGGCACTGTAATGGTT
AGTACAAGACCCACGCTTGCTAAGCTTATACATGTACAAAACGTGAGCAGAGCAGCTTGT
CCTCTACTCGGAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATTGTCTCTCCACGATCAGTAACATTA
AAGTTCTTCCTTGTGAAGAAAGAAAGAATCTCTCCAGCAACTTGCTTTGGTTCCTTCTTG
ATCCCTTCGCTAACAACAAACGTCTTCCTCACTATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTGATG
AGAGACCAAAGACCTGGAACTGAGATAACGAACAAACCCAAAGACGTGTAGTAGCTAGCT
AACGAGTAGCCACCACCAGTCTCCGCCATCAACAGTAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4A388JQ 789 0 0
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TCAACAGTACATTCTCTTTCCCCCCCTAAAAAAAAGAAAAGCAAAAATGGGATTTGAATG
TGTATGTTTTCATGATCTCTCAAAGAGACCTTTAACATAAACCATGCCTTTCTCACTAAG
CTGAAGTTCCTTCCTCATCTCTTCAACTTGCACATCATCTCCTTGAACAACAATCTCATC
CAGTTTCCCCTTTCTTCCCACCATCATCTTCACCTTGATCTC*TCTTTCCTCGACGCCTT
CTTCCAGTAATACGCTCCTGCGAGTGGACTAAGAATGGTAATGAAGAACCAGTTATTTCC
AAAATCAGGCACTGTAATGGTTAGTACAAGACCCACGCTTGCTAAGCTTATACATGTACA
AAACGTGAGCAGAGCAGCTTGTCCTCTACTCGGAACCATTGTTCCTTCAAGCGTGATTGT
CTCTCCACGATCAGTAACATTAAAGTTCTTCCTTGTGAAGAAAGAAAGAATCTCTCCAGC
AACTTGCTTTGGTTCCTTCTTGATCCCTTCGCTAACAACAAACGTCTTCCTCACTATCTT
TGATTTAACAGAGCGTTTGATGAGAGACCAAAGACCTGGAACTGAGATAACGAACAAACC
CAAAGACGTGTAGTAGCTAGCTAACGAGTAGCCACCACCAGTCTCCGCCATCAACAGTAA
TGAACTAGGGTTATGTTCCCACCATTGATGAATCTGAATCGCTGAAGAAGATACGGCGGA
GAGAGGCTC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4ED53TF 638 0 0
TCTCTTCAACTTGCACATCATCTCCTTGAACAACAATCTCATCCAGTTTCCCCTTTCTTC
CCACCATCATCTTCACCTTGATCTCCTCCTTCCTCGACGCCTTCTTCCAGTAATACGCTC
CTGCGAGTGGACTAAGAATGGTAATGAAGAACCAGTTATTTCCAAAATCAGGCACTGTAA
TGGTTAGTACAAGACCCACGCTTGCTAAGCTTATACATGTACAAAACGTGAGCAGAGCAG
CTTGTCCTCTACTCGGAACCATTGTTCCTTCAAACGTGATTGTCTCTCCACGATCAGTAA
CATTAAAGTTCTTCCTTGTGAAGAAAGAAAGAATCTCTCCAGCAACTTGCTTTGGTTCCT
TCTTGATCCCTTCGCTAACAACAAACGTCTTCCTCACTATCTTTGATTTAACAGAGCGTT
TGATGAGAGACCAAAGACCTGGAACTGAGATAACGAACAAACCCAAAGACGTGTAGTAGC
TAGCTAACGAGTAGCCACCACCAGTCTCCGCCATCAACAGTAATGAACTAGGGTTATGTT
CCCACCATTGATGAATCTGAATCGCTGAAGAAGATACGGCGGAGAGAGGCTCCACAACCA
TGGCGGTGACGGGGGAGACTCTGTTCCGCTTCGTCTC
C

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4A388TF 816 0 0
ACATAAACCATGCCTTTCTCACTAAGCTGAAGTTC*TTCCTCATCTCTTCAACTTGCACA
TCATCTCCTTGAACAACAATCTCATCCAGTTTCCCCTTTCTTCCCACCATCATCTTCACT
TTGATCTC*TCTTTCCTCGACGCCTTCTTCCAGTAATACGCTCCTGCGAGTGGACTAAGA
ATGGTAATGAAGAACCAGTTATTTCCAAAATCAGGCACTGTAATGGTTAGTACAAGACCC
ACGCTTGCTAAGCTTATACATGTACAAAACGTGAGCAGAGCAGCTTGTCCTCTACTCGGA
ACCATTGTTCCTTCAAGCGTGATTGTCTCTCCACGATCAGTAACATTAAAGTTCTTCCTT
GTGAAGAAAGAAAGAATCTCTCCAGCAACTTGCTTTGGTTCCTTCTTGATCCCTTCGCTA
ACAACAAACGTCTTCCTCACTATCTTTGATTTAACAGAGCGTTTGATGAGAGACCAAAGA
CCTGGAACTGAGATAACGAACAAACCCAAAGACGTGTAGTAGCTAGCTAACGAGTAGCCA
CCACCAGTCTCCGCCATCAACAGTAATGAACTAGGGTTATGTTCCCACCATTGATGAATC
TGAATCGCTGAAGAAGATACGGCGGAGAGAGGCTCCACAACCATGGCGGTGACGGGGGAG
ACTCTGTTCCGCTTCGTCTCACATTCCCGTCTCCGCCGTGGAAGAACCCTTTTGATCTCT
ACGTCTCTTGAAGTCACCCATGGACAAGACAACGGCGGAGAAAACAGCTTCGTCGCCATT
GTCCGAAAGTCGAAAGCTTTATCTGTGTCGTCTGCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 3

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CTATACAAGAAAGTATACCTTTATTTCTCTATATAATACCCAAAAGAGAGAGAACCAAGA
AACAAAACTAGAACATAAGAAATAGAAGAGAGGTGTAGTTGATGTAGGCAGAGAAGGTTG
TGAGGATAGAACAATGCAGTTGCTAGTTGCTGAGGAAGAAGAAACTTTGTTTCTTTGTCC
GTGTGTGTGAATTTTTGCCCTTTCTAGGAAGATAAAAGAGAGAGAGAGGCAACACTGTAT
ATGTGGCTTTGTGTCTGAATTGCTATCTTGGATGCTGTATTATCACTAGAACTGAATCTT
TGTGCCTTTCATAGTTTGAATGCGGCATTGGCACTCCAATGTTCCATTCACGACTTCGGA
ATTCTTTAAATGTCTTTGCATCCATTTCCATGCTATAAATTGGAGGGATAACTGTATGAT
CTTTTGGTTTTAATGTAGGCATGACTGAGAACCGTGGTGCCATGTCCTGAGACCTGAAAG
TCCAGCCAATATAGAGAAAAATGCAAAACTGAGCCCACTCTCGAATCAGTAGCCTGAGCC
AATAGTTCTGTGAGGAGTTATCCATGTTCATATAGATCACAGTTTCTGCCATTGCTACTA
TCTGCATAGATCCTTGGAATTTTTTGAACATGATGTATTTAGCATAGACAGCATCATGCA
TAGCTTGAACATTCTCATCCTCAATGAAACTCAGCTGTTCTCGTAACACAGATAAGTTTT
GTGATATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G377JQ U 1
AF RR4BX51JQ U 162
AF RR4BX51TF C 35
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RD RR4G377JQ 561 0 0
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CTATACAAGAAAGTATACCTTTATTTCTCTATATAATACCCAAAAGAGAGAGAACCAAGA
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TGAGGATAGAACAATGCAGTTGCTAGTTGCTGAGGAAGAAGAAACTTTGTTTCTTTGTCC
GTGTGTGTGAATTTTTGCCCTTTCTAGGAAGATAAAAGAGAGAGAGAGGCAACACTGTAT
ATGTGGCTTTGTGTCTGAATTGCTATCTTGGATGCTGTATTATCACTAGAACTGAATCTT
TGTGCCTTTCATAGTTTGAATGCGGCATTGGCACTCCAATGTTCCATTCATGACTTCGGA
ATTCTTTAAATGTCTTTGCATCCATTTCCATGCTATAAATTGGAGGGATAACTGTATGAT
CTTTTGGTTTTAATGTAGGCATGACTGAGAACCGTGGTGCCATGTCCTGAGACCTGAAAG
TCCAGCCAATATAGAGAAAAA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4BX51JQ 389 0 0
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AAACTTTGTTTCTTTGTCCGTGTGTGTGAATTTTTGCCCTTTCTAGGAAGATAAAAAAAA
GAGAGAGGCAACACTGTATATGTGGCTTTGTGTCTGAATTGCTATCTTGGATGCTGTATT
ATCACTAAAACTGAATCTTTGTGCCTTTCATAGTTTGAATGCGGCATTGGCACTCCAATG
TTCCATTCACGACTTCGGAATTCTTTAAATGTCTTTGCATCCATTTCCATGCTATAAATT
GGAGGGATAACTGTATGATCTTTTGGTTTTAATGTAGGCATGACTGAAAACCGTGGTGCC
ATGTCCTGAGACCTGAAAGTCCAGCCAAT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4BX51TF 757 0 0
TAT
ACTCTACTAGTTA*CTTTTGCATCTATACAAGAAAGTATAC*TTTATTTCTCTATATAAT
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GTTGATGTAGGCAGAGAAGGTTGTGAGGATAGAACAATGCAGTTGCTAGTTGCTGAGGAA
GAAGAAACTTTGTTTCTTTGTCCGTGTGTGTGAATTTTTGCCCTTTCTAGGAAGATAAAA
GAGAGAGAGAGGCAACACTGTATATGTGGCTTTGTGTCTGAATTGCTATCTTGGATGCTG
TATTATCACTAGAACTGAATCTTTGTGCCTTTCATAGTTTGAATGCGGCATTGGCACTCC
AATGTTCCATTCACGACTTCGGAATTCTTTAAATGTCTTTGCATCCATTTCCATGCTATA
AATTGGAGGGATAACTGTATGATCTTTTGGTTTTAATGTAGGCATGACTGAGAACCGTGG
TGCCATGTCCTGAGACCTGAAAGTCCAGCCAATATAGAGAAAAATGCAAAACTGAGCCCA
CTCTCGAATCAGTAGCCTGAGCCAATAGTTCTGTGAGGAGTTATCCATGTTCATATAGAT
CACAGTTTCTGCCATTGCTACTATCTGCATAGATCCTTGGAATTTTTTGAACATGATGTA
TTTAGCATAGACAGCATCATGCATAGCTTGAACATTCTCATCCTCAATGAAACTCAGCTG
TTCTCGTAACACAGATAAGTTTTGTGATATATGC

QA 4 757 4 757
DS 



AS 1 4

CO CL3054Contig1 779 4 4 U
GCGGTTAATTTTTTTTAATTAACTATTTTTATATTACTCCTAGCAACGAATCGGTTTTCT
AGTTAATTAAAGATGATTTCTAACCAAAATGTATTTAACTATTTAGTTTATAGAGCCGCA
TCATCATCATCAGACATGGCACATACAATCAGGAGCCGGATAAGTATAGATAGACTGTTT
AGGTTTCCTTAACCGGATCTGTCCCTGTCTATTCACGTGTCCTTCGCCAAGCGCCTGTTG
AAAATCAACCCAAGTGATGCTTCTGTTGAGGAAAACCTGTCCCATCAAAGCCATGTTCGG
TCTAATCGTTTTGAGATTCTCGAACGTTCGATGACCGACGAGAGCGTTGTGCATGTTTCC
AGGCGACGCGGAGATGAACACGTCGCTGTGCATGCTTACGTAGTAATCAAGTGCAGCTAG
TAAAGAGGCTTTGCCTTTGATCCGAGCTCGTTCTTCGGAAGAGGCAAGACTTCTTTTGTC
TTCCATTCTTGGGAAGACTTGTCTTAACGCTGAGATCCTAGCTTCTCCTCCATATACCTT
GTGGGAAGCGAGATAGAGACGAGTGTTGTTGTCGAAACCGAAAGCAGCCAAGAGAAGTCC
CATCTCTTCTGGTGTTAGAGGACACCGTCCTTGGCTTCTTAGCTCTTCGTCTGTGAACTG
AGAGTTCAACACTCTTCCCTGCCAAATCATTTGTCGGTACTTGGCCAATGCAAGCTTCTC
TGCTTTGCCTCCACCAAAATCACACGCCGAATGTGCAGCCATATCCTTGTCAAGCGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU55TF C 1
AF RR4GU55JQ U 12
AF RR4DP34JQ U 65
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AGGTTTCCTTAACCGGATCTGTCCCTGTCTATTCACGTGTCCTTCGCCAAGCGCCTGTTG
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AGAGTTCAACACTCTTCCCTGCCAAATCATTTGTCGGTACTTGGCCAATGCAAGCTTCTC
TGCTTTGCCTCCACCAAAATCACAC
AC

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TGAGATTCTCGAACGTTCGATGACCGACGAGAGCGTTGTGCATGTTTCCAGGCGACGCGG
AGATGAACACGTCGCTGTGCATGCTTACGTAGTAATCAAGTGCAGCTAGTAAAGAGGCTT
TGCCTTTGATCCGAGCTCGTTCTTCGGAAGAGGCAAGACTTCTTTTGTCTTCCATTCTTG
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GTGTTAGAGGACACCGTCCTTGGCTTCTTAGCTCTTCGTCTGTGAACTGAGAGTTCAACA
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CACCAAAATCACAC
AC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4DP34JQ 706 0 0
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QA 1 706 1 706
DS 

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CATCATCAGACATGGCACATACAATCAGGAGCCGGATAAGTATAGATAGACTGTTTAGGT
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GACGCGGAGATGAACACGTCGCTGTGCATGCTTACGTAGTAATCAAGTGCAGCTAGTAAA
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TTGCCTCCACCAAAATCACACGCCGAATGTGCAGCCATATCCTTGTCAAGCGAAG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL3055Contig1 809 4 16 U
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TACCAGTGGTATGTTTGAGTGGCGCGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 15 30 30 30 30 0 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY20JQ U 1
AF RR4GY20TF C 229
AF RR4EG42JQ U 8
AF RR4EG42TF C 229
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RD RR4GY20JQ 780 0 0
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CTCCGAGACACGGTGGTGCCACGCGTTGAATGCATACTGCATGGCTTGCCATCTCCTT
CC

QA 1 778 1 778
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CCATCTCCTT
CC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4EG42JQ 775 0 0
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ACTACACTTGCAGGAGATGATAATACATGAAAACTATACATGGTAAGCTCTCCATTGGTG
CATGAGTTCATTAAGTTACTCTTATGCAGCTAGCTCTGCAATTTCTGCAAGGGGCTTCCA
CGTGAACTTTCTCCAGTTGCCACATTCAGCAACAACCCTGACATTAGGACGGAGAGAAGG
AAG**GAGCGAGGA******GTTCAGACTTTGAGAGGACCTTTGCTTCAATGACCCAGAC
GACAAGTCCCTTGGCACTAGGCGGAAGAGCTGAAAGTCTGTAGTCAACTTCTGGTGGATA
GTACCACCTTGCTATTGGTTGTTTCCCAAGGTGGGCAGGGCAAACAGGATAAGGGTTAAG
GAGTGTGGTCTCTGGATCACCAAGTCCTCGAGCTGAGATGTCAAGAAAGTAGTAGCCCTG
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AATAATACTCACAGAGAAGGGACTAACTGTTTTGCTCCTATTCACTTGCGAGGCTCCGAG
ACACGGTGGTGCCACGCGTTGAATGCATACTGCATGGCTTGCCATCTCCTT
AGTA

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DS 

RD RR4EG42TF 581 0 0
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AGTCAACTTCTGGTGGATAGTACCACCTTGCTATTGGTTGTTTCCCAAGGTGGGCAGGGC
AAACAGGATAAGGGTTAAGGAGTGTGGTCTCTGGATCACCAAGTCCTCGAGCTGAGATGT
CAAGAAAGTAGTAGCCCTGTTCTTTGAGACGGTTAAGATACCTACCTTCGTATCCACCCT
CGTGAGGAGTGTAGATGGCTATTGACTTGTGCTTTTCCACGTCCTCGAGCCAACGACCGA
TGTCTGGCTTCACCAGGTCTCCTCCGATGAAGTCAACGAGGCTGCATCTCACGCCACTGC
TTCTTCTCTTCCTTCTAGTAATAATACTCACAGAGAAGGGACTAACTGTTTTGCTCCTAT
TCACTTGCGAGGCTCCGAGACACGGTGGTGCCACGCGTTGAATGCATACTGCATGGCTTG
CCATCTCCTTAGTACCAGTGGTATGTTTGAGTGGCGCGTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 4

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TCTTCTTCCTCCTCTCCTCTTCTCTCTCCACCTCCTCCTGCTCATGTCCTCCATCTGCAT
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ATGATATAGAGTGGGTCAGAGATCTGATTAGATCCAATGGTTTGCATATGCAGAAGAACG
AGCTCAGGAAAGGGATTAATCCTCGCACTAGAGATCAACAACTCGCAGATCTGAAACAGT
ACAAGGGTATATCTCATTACGAAGGAGACAACAACCACACAGCTCTCCCATGCCCTGGTG
AGCTACTAGTCGAGCAGCATCACAGTAACTACGGCGAGCCATGGGCAGGTGGACGCGACG
TATTCGAGTTCTTAGCCGAATCCTCCAATCTCAGACCAAACTCTCGCGTCCTGGAAATCG
GGTGTGGCACCTTACGCGTGGGTCTGCATTTCATACGCTATCTCAACCCAAGTCACTTCC
ACTGCCTCGAAAAGGACGAGCTCTCTCTGATGGCTGCTTTGAGATGCGAGCTCCCATCTC
AAGGTCTTCTCCACAAACGCCCTCTTATACTCAGAGGAGAAGACATGGAGTTCAGCAAGT
TCGGGTTAGATACAACGTATGATCTGATCTACGCGAGTGCCGTGTTCCTCCACATGCCTG
ATAAGCTCGTGTGGATGGGACTCGAGAGGCTGGTTGAGAAGTTGAAGCCTTACGATGGGA
GGATCTTCGTGTCGCATAACGTGAAGTTTTGCTCGAGGTTAGGTGGGGACGAGTGTGCGA
AGAGGCTAGCGAGTTTGGGACTTGAGTATCTTGGCAAACAGACGCATGATAGCTCGCTGT
TTAATCACTACGAGATCTGGTTCGGGTTTAGACGATTTAAGACGTAAAAGATTGTTTGAA
GTATCTGTTTTCTTCACACGTTATGAGGGATTTTAAAGAGTCCTAAGAGATTGTTTCTGT
AGAGAAGATGTCAAGTGCAGAGATGACTGTATGTCTGTATCTTACTTTTTTTGTGTTTAT
TACTTTATGGTGGGAGATCCGTGTATCTAATACAATAAAGTTGTG


BQ
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AF RR4H617TF U 1
AF RR4H617JQB C 281
AF RR4EO33JQ C 646
AF RR4EO33TF U 646
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QA 1 608 1 608
DS 

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QA 18 905 18 905
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RD RR4EO33TF 509 0 0
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TGGAGTTCAGCAAGTTCGGGTTAGATACAACGTATGATCTGATCTACGCGAGTGCCGTGT
TCCTCCACATGCCTGATAAGCTCGTGTGGATGGGACTCGAGAGGCTGGTTGAGAAGTTGA
AGCCTTACGATGGGAGGATCTTCGTGTCGCATAACGTGAAGTTTTGCTCGAGGTTAGGTG
GGGACGAGTGTGCGAAGAGGCTAGCGAGTTTGGGACTTGAGTATCTTGGCAAACAGACGC
ATGATAGCTCGCTGTTTAATCACTACGAGATCTGGTTCGGGTTTAGACGATTTAAGACGT
AAAAGATTGTTTGAAGTATCTGTTTTCTTCACACGTTATGAGGGATTTTAAAGAGTCCTA
AGAGATTGTTTCTGTAGAGAAGATGTCAAGTGCAGAGATGACTGTATGTCTGTATCTTAC
TTTTTTTGTGTTTATTACTTTATGGTGGG

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 4

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TTTTCCAAAAAGATCGTTCAAATTAGATAAATATAACTACTGAAGTAGCAAATATTATAT
TAGTCTTCAAATACACTTAAACATCAAACATAGACAGATGGGTTATGATATTAGAAATTA
ACAAACCACTCTTCAAATCCAAATGGAAAAGGAGACTGGTGGATTGATTCAAAACAATCT
CTTGCAGAATTCTAACAACTTTCTTTGGGATTGCAAGAGACAACTTCAATGTCTCCCGGG
AAGTAGCGAACCACTGCACGATAGGGTTTTGTCTGATTACCATCTAAGTAGGATCATTGA
CTTCGAATGAGAGGTAGAAAGTGACTGCGCAGGATGGATGATAGTTTGCAATCAAAATCT
TGCCCAGTTCCAAACTTGTTCCTCTTTCTGTGTTTGTTTTGGTGAGAGCGAGGTTCACCA
AAGTAGCTACGAAATCTCTGTTAGTTTCAGGCTCATCAACCATTGTACTATCGTCCAGAT
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CGAAACCCTCGGGACGGCCATTATAGCGGGGGGTTGTTTCCTCCTCCGTCTTCTTCTGAC
GCTTCGGTGATGGAGGATCGGATCTTTCCATCGCTGGTTCGGGGACAATCGAGACAGAAG
AGACTATGCGAGAGAAAAAAACCCTGATTTTGTCCCCGATTCTTCCTTTTTTTCTTATAC
AAACCAAACCACGAGTTAAAAGATAATTTTATGTGTTAAAAGATTGTACTCC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BA92TF C 1
AF RR4B655TF C 4
AF RR4B655JQ U 5
AF RR4BA92JQ U 5
BS 1 4 RR4BA92TF
BS 5 818 RR4B655JQ
BS 819 832 RR4BA92JQ

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T
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CCTATCCAACTCTTGGTCGAACAACTCCATCTCCTCGTCGGAGCACTCGTCGGATTCGAA
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CGGTGATGGAGGATCGGATCTTTCCATCGCTGGTTCGGGGACAATCGAGACAGAAGAGAC
TATGCGAGAGAAAAAAACCCTGATTTTGTCCCCGATTCTTCCTTTTTTTCTTATACAAAC
CAAACCACGAGTTAAAAGATAATTTTATGTGTTAAAAGATTGTACTCC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 4

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TTAGGTTTTTAAGTTCTTTCAGGATCTATCTGACCATTCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ19JQ U 1
AF RR4AW12JQ U 32
AF RR4DQ19TF C 75
AF RR4AW12TF C 106
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QA 1 548 1 548
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AAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACTTATCAACCCATTCGCCGGGGCACAGGGATC
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DS 

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TCTTATTGAT
CC

QA 15 744 15 744
DS 

RD RR4AW12TF 779 0 0
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AACTTATCACATTCTGGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGTGATATTCAATG
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CGGACTCTCTTGGTGTTAGGTTTTTAAGTTCTTTCAGGATCTATCTGACCATTCCCCCC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 2 4

CO CL3059Contig1 854 2 2 U
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CCTCAAATCCAACACCCGCCGCATCTCCGTCTCCGCCACCAGATCCTTCTCATAACCATC
ACCTCCGCCATCTCCGTCGGAGACAAACTCCCAGACTCCACTCTCTCCTACCTCGACCCC
GCCACCAACGACGTCAAAACAGTCACCGTCTCCTCCCTAACCGCCGGGAAGAAAACATCC
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TCTCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAAGGCGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTCCGTGA
ACGACGCGTTCGTGATGGAGGCGTGGAGGAAGGACCTCGGGATCAACGACGAGGTGATGC
TGTTATCCGATGGTAACGGAGAGTTCACGGGGAAGCTTGGCGTCGAGTTGGATTTGAGGG
ATAAGCCTGTGGGACTCGGAGTTAGGTCGAGGAGGTACGCGATTCTGGCGGAGGATGGTG
TTGTCAAGGTTCTGAATCTTGAAGAAAGAGGCGCTTTTACCAACAGTAGTGCTGAGGATA
TGCTTAAAGCTCTTTGATCCCGTTTCTTTTTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTGCTGTCTTCT
CTTATGTTGGAGGCTTGGAGCTTTCTATGTTTCATGTCGGATAATGTAATAACAAATCGG
AATCGTTTGTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF68TF U 1
AF RR4AF68JQ C 92
BS 1 795 RR4AF68TF
BS 796 854 RR4AF68JQ

RD RR4AF68TF 795 0 0
GGACCAAACATTTCATTTGAACCGCTCAACACCATCATCCATGGCAACTTCTCTCTCTGT
CTCCAGACTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCCACCGCCATATCCATCGCCAAACCGTT
ACTCTCCCCAACCTTCACGGCGCCTTTATCTTTCACGCGCTCTCTCGCTCCTAACCTCTC
CCTCAAATCCAACACCCGCCGCATCTCCGTCTCCGCCACCAGATCCTTCTCATAACCATC
ACCTCCGCCATCTCCGTCGGAGACAAACTCCCAGACTCCACTCTCTCCTACCTCGACCCC
GCCACCAACGACGTCAAAACAGTCACCGTCTCCTCCCTAACCGCCGGGAAGAAAACATCC
TCTTCGCCGTCCCGGGCGCCTTCACTCCGACCTGCTCGCAGAAACACGTCCCCGGGTTCG
TCTCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAAGGCGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTCCGTGA
ACGACGCGTTCGTGATGGAGGCGTGGAGGAAGGACCTCGGGATCAACGACGAGGTGATGC
TGTTATCCGATGGTAACGGAGAGTTCACGGGGAAGCTTGGCGTCGAGTTGGATTTGAGGG
ATAAGCCTGTGGGACTCGGAGTTAGGTCGAGGAGGTACGCGATTCTGGCGGAGGATGGTG
TTGTCAAGGTTCTGAATCTTGAAGAAAGAGGCGCTTTTACCAACAGTAGTGCTGAGGATA
TGCTTAAAGCTCTTTGATCCCGTTTCTTTTTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTGCTGTCTTCT
CTTATGTTGGAGGCT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4AF68JQ 763 0 0
GCCACCGCCATATCCATCGCCAAACCGTTACTCTCCCCAACCTTCACGGCGCCTTTATCT
TTCACGCGCTCTCTCGCTCCTAACCTCTCCCTCAAATCCAACACCCGCCGCATCTCCGTC
TCCGCCACCAGATCCTTCTCATAACCATCACCTCCGCCATCTCCGTCGGAGACAAACTCC
CAGACTCCACTCTCTCCTACCTCGACCCCGCCACCAACGACGTCAAAACAGTCACCGTCT
CCTCCCTAACCGCCGGGAAGAAAACATCCTCTTCGCCGTCCCGGGCGCCTTCACTCCGAC
CTGCTCGCAGAAACACGTCCCCGGGTTCGTCTCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAAGG
CGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTCCGTGAACGACGCGTTCGTGATGGAGGCGTGGAGGAA
GGACCTCGGGATCAACGACGAGGTGATGCTGTTATCCGATGGTAACGGAGAGTTCACGGG
GAAGCTTGGCGTCGAGTTGGATTTGAGGGATAAGCCTGTGGGACTCGGAGTTAGGTCGAG
GAGGTACGCGATTCTGGCGGAGGATGGTGTTGTCAAGGTTCTGAATCTTGAAGAAGGAGG
CGCTTTTACCAACAGTAGTGCTGAGGATATGCTTAAAGCTCTTTGATCCCGTTTCTTTTT
CTCTGTTTGTGTTTTGTTTGCTGTCTTCTCTTATGTTGGAGGCTTGGAGCTTTCTATGTT
TCATGTCGGATAATGTAATAACAAATCGGAATCGTTTGTGAAC

QA 1 763 1 763
DS 



CO CL3059Contig2 882 2 4 U
GGATCCGAGAAGACACAATCTCGAGTCACTCACCAAACATTTCATTTGAACCGCTCAACA
CTATCATCCATGGCAACTTCTCTCTCCGTCTCCAGACTCCTCTCCTCCTCCTCCTCAGCC
ACCGCCATCTCCGTCGCCAAACCGTTACTCTCCCCAACCTTCACGGCGCCTTTATCTTTC
ACGCGCTCTCTCGCTCCTAACCTCTCCCTCAAATCCAACACCCGCCGCATCACCACCCTC
TCCGCCACCAGATCCTTCTCAACAACCTTCACCTCCGCCATTTCCGTCGGAGACAAACTC
CCAGACTCCACTCTCTCCTACCTCGACCCCGCCACCAACGACGTCAAAACAGTCACCGTC
TCCTCCCTAACCGCCGGGAAGAAAACCATCCTCTTCGCCGTCCCGGGCGCCTTCACTCCG
ACCTGCTCGCAGAAACACGTCCCTGGATTCGTCTCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAA
GGCGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTCCGTAAACGACGCGTTCGTGATGGAAGCGTGGAGG
AAGGACCTCGGGATCGACGACGAGGTGATGCTGCTGTCCGACGGTAACGGGGAGTTCACG
GGTAAGCTTGGCGTTGAGTTGGATTTGAGGGATAAGCCTGTGGGACTCGGAGTTAGGTCA
AGGAGGTACGCGATTCCGGCGGAGGATGGTGTTGTCAAGGTTCTGAATCTTGAAGAAGGA
GGCGCTTTTACGAACAGTAGTGCTGAGGATATGCTTAAAGCTCTTTGACCCCGTTTCTTT
TTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTGCTGTCTTCTCTTATGTTGGAGGCTTGGAGCTTTCTATG
TTTCATGTCGGATAATGTAATAACAAATCGGAATCGTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D059TF U 1
AF RR4D059JQ C 394
BS 1 678 RR4D059TF
BS 679 679 RR4D059JQ
BS 680 696 RR4D059TF
BS 697 882 RR4D059JQ

RD RR4D059TF 696 0 0
GGATCCGAGAAGACACAATCTCGAGTCACTCACCAAACATTTCATTTGAACCGCTCAACA
CTATCATCCATGGCAACTTCTCTCTCCGTCTCCAGACTCCTCTCCTCCTCCTCCTCAGCC
ACCGCCATCTCCGTCGCCAAACCGTTACTCTCCCCAACCTTCACGGCGCCTTTATCTTTC
ACGCGCTCTCTCGCTCCTAACCTCTCCCTCAAATCCAACACCCGCCGCATCACCACCCTC
TCCGCCACCAGATCCTTCTCAACAACCTTCACCTCCGCCATTTCCGTCGGAGACAAACTC
CCAGACTCCACTCTCTCCTACCTCGACCCCGCCACCAACGACGTCAAAACAGTCACCGTC
TCCTCCCTAACCGCCGGGAAGAAAACCATCCTCTTCGCCGTCCCGGGCGCCTTCACTCCG
ACCTGCTCGCAGAAACACGTCCCTGGATTCGTCTCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAA
GGCGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTCCGTAAACGACGCGTTCGTGATGGAAGCGTGGAGG
AAGGACCTCGGGATCGACGACGAGGTGATGCTGCTGTCCGACGGTAACGGGGAGTTCACG
GGTAAGCTTGGCGTTGAGTTGGATTTGAGGGATAAGCCTGTGGGACTCGGAGTTAGGTCA
AGGAGGTACGCGATTCCG*CGGAGGATGGTGTTGTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4D059JQ 489 0 0
TTCGCCGTCCCGGGCGCCTTCATTCCGACCTGCTCGCAGAAACACGTCCCTGGATTCGTC
TCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAAGGCGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTCCGTAAAC
GACGCGTTCGTGATGGAAGCGTGGAGGAAGGACCTCGGGATCGACGACGAGGTGATGCTG
CTGTCCGACGGTAACGGGGAGTTCACGGGTAAGCTTGGCGTTGAGTTGGATTTGAGGGAT
AAGCCTGTGGGACTCGGAGTTAGGTCAAGGAGGTACGCGATTCCGGCGGAGGATGGTGTT
GTCAAGGTTCTGAATCTTGAAGAAGGAGGCGCTTTTACGAACAGTAGTGCTGAGGATATG
CTTAAAGCTCTTTGACCCCGTTTCTTTTTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTGCTGTCTTCTCT
TATGTTGGAGGCTTGGAGCTTTCTATGTTTCATGTCGGATAATGTAATAACAAATCGGAA
TCGTTTGTG

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 3

CO CL3060Contig1 1895 3 13 U
GAGCTGAAGGAAGGAAATATTATTATAACAAGGTTACAAAGGAGTCTAAGTGGACAATTC
CGGAAGATTTAAAGTTAGCTCGGGAACAAGCCGAATTAGCTAGTGCAAAGAGGTCCCATT
CCGAACCTGGATCGACCTCTCTATCCCACATTGCTGCATCCTCATCTGATCTAGCTGTTA
GCACTCCTGTGACCGCAGTTGTTCCCAGCACATCTCCAATAATTCCTGCGCATTCTTCAA
GTCCTATTCCAGCGGGTTTGGCTGTACCTGTCACCCGTCCTCCCCCTGCTACTCCTGTTA
CTCCAAAGTCAGCTGCAACTAGTGATACTGAGGCTACTGCAATGAAAATGGATAATTTAC
CGTCTCAGGGGGCATATGAATCGAAGGATGGAGCGCCCGCACCAAACAATGAGGTTGATA
ATAAGGAAATGTCGGTGAATGGAAAATCCAATATGACAGCTGCTGGTGACAAATCAAACG
TTGAGGAACCCATGATGTATGCTACTAAGCAGGAGGCTAAAGCTGCTTTCAAGTCTCTTT
TGGAATCTGTAAATGTTCAGTCCGACTGGACATGGGAACAGACAACTAAAGAGATTGTTC
ATGATAAAAGATATGGTGCTTTGAGGACACTCGGTGAGCGGAAACAAGCTTTTAACGAGT
ATCTCGGTCAAAGGAAAAAAGTGGAAGCTGAGGAAAGGCGATGGAGACAGAAGAAAGCGC
GGGAAGAATTTGTCAAGATGCTAGAGGAGTGTGAAGAATTATCATCATCCCTGAAATGGA
GCAAAGCTTTGAGTTTGTTTGAAAATGATGAGCGTTTTAAAACTGTTGATCGCCCAAGGG
ATCGTGAAGATCTTTTTGACAATTATATTGTGGAACTTGAGAGGAAGGAAAGAGAGAAGG
CAGTGGCAGAACATCGGCAGAAGATGGCAGAATATCGGAAGTTTCTTGAAACCTGTGACT
ATATCAAAGCCAGTACACAATGGCGCAAAATTCAGGATAGACTGGAGGATGATGAAAGAA
GCGCATCTCTTGAAAAGATAGATCGTTTGATTGGTTTTGAGGATTACATTAATGACCTGG
AGAAGGAAGAAGAGGAGCTGAAGAGGGTAGAGAAAGAACATGTTAGGCGGGCTGAGAGAA
AAAACCGTGATGCATTTCGTACACTATTGGAAGAACATGTCGCTGCTGGCATCCTTACAG
CCAAGACCTATTGGTTGGAGTATTGCATTGAGGTAAGAGACTTGCCTCAATACCAAGCTG
TTGCATCTAATTTGTCTGGCTCAACTCCGAAAGACCTATTCGAAGATATCACGGAAGAAT
TAGAGAAGCAGTATCACGAGGACAAGAGTCGCGTAAAGGATGCGATGAAGTCAAGGAAGG
TTTCCATGGTCGCCTCATGGATGTTTGAAGATTTTCAATCTGCTCTTTCAGAAGATCTCA
GTTCTCAACCAATATCAGACATAAATTTAAAGCTTATATATAATGACTTGGTTGAGAGGA
TGAAGGAAAAAGAAGAAAAAGAAGCCAGAAAGCTTCAGCGTTTGGCTGAAGAATTTACCA
ATTTCTTACGCACTTTCAAGGAAATAACCGCAGCATCAAATTGGGAAGATGTCAAACAAC
TAGTGGAAGAAAGTCAAGAGTACAGATCGATTGGAGATGATGATGTTAGCAGAGGGCTTT
TTGAGGAATACATAGCGAGTTTACAGGAAAAGGCAAAGGAGAAGGAGCGTAAGCGTGATG
AGGAAAAGAGTAGGAAAGAGAAGGATAGGGAGGAGAAAGAAAAGCGGAAAGACAAGGAGA
AGGAGAGAAGGGAAAAGGAAAGAGAACGCGAAAAAGAGAGGAGTAGCAAAAGGGAGGAAT
CGGATGGTGATACCGTAGATGTGAGTGAAGGTCAC


BQ
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AF RR4AE96TF U 1
AF RR4CE78TF U 642
AF RR4CE78JQ C 1108
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BS 809 826 RR4AE96TF
BS 827 1344 RR4CE78TF
BS 1345 1345 RR4CE78JQ
BS 1346 1356 RR4CE78TF
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BS 1358 1372 RR4CE78TF
BS 1373 1895 RR4CE78JQ

RD RR4AE96TF 826 0 0
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CGGAAGATTTAAAGTTAGCTCGGGAACAAGCCGAATTAGCTAGTGCAAAGAGGTCCCATT
CCGAACCTGGATCGACCTCTCTATCCCACATTGCTGCATCCTCATCTGATCTAGCTGTTA
GCACTCCTGTGACCGCAGTTGTTCCCAGCACATCTCCAATAATTCCTGCGCATTCTTCAA
GTCCTATTCCAGCGGGTTTGGCTGTACCTGTCACCCGTCCTCCCCCTGCTACTCCTGTTA
CTCCAAAGTCAGCTGCAACTAGTGATACTGAGGCTACTGCAATGAAAATGGATAATTTAC
CGTCTCAGGGGGCATATGAATCGAAGGATGGAGCGCCCGCACCAAACAATGAGGTTGATA
ATAAGGAAATGTCGGTGAATGGAAAATCCAATATGACAGCTGCTGGTGACAAATCAAACG
TTGAGGAACCCATGATGTATGCTACTAAGCAGGAGGCTAAAGCTGCTTTCAAGTCTCTTT
TGGAATCTGTAAATGTTCAGTCCGACTGGACATGGGAACAGACAACTAAAGAGATTGTTC
ATGATAAAAGATATGGTGCTTTGAGGACACTCGGTGAGCGGAAACAAGCTTTTAACGAGT
ATCTCGGTCAAAGGAAAAAAGTGGAAGCTGAGGAAAGGCGATGGAGACAGAAGAAAGCGC
GGGAAGAATTTGTCAAGATGCTAGAGGAGTGTGAAGAATTATCATCATCCCTGAA*TGGA
GCAAAGCTTTGAGTTTGTTTGAAA*TGGTGAGCGTTTTAAAACTGT

QA 1 826 1 826
DS 

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G
AACAAGCTTTTAACGAGTATCTCGGTCAAAGGAAAAAAGTGGAAGCTGAGGAAAGGCGAT
GGAGACAGAAGAAAGCGCGGGAAGAATTTGTCAAGATGCTAGAGGAGTGTGAAGAATTAT
CATCATCCCTGAAATGGAGCAAAGCTTTGAGTTTGTTTGAAAATGATGAGCGTTTTAAAG
CTGTTGATCGCCCAAGGGATCGTGAAGATCTTTTTGACAATTATATTGTGGAACTTGAGA
GGAAGGAAAGAGAGAAGGCAGTGGCAGAACATCGGCAGAAGATGGCAGAATATCGGAAGT
TTCTTGAAACCTGTGACTATATCAAAGCCAGTACACAATGGCGCAAAATTCAGGATAGAC
TGGAGGATGATGAAAGAAGCGCATCTCTTGAAAAGATAGATCGTTTGATTGGTTTTGAGG
ATTACATTAATGACCTGGAGAAGGAAGAAGAGGAGCTGAAGAGGGTAGAGAAAGAACATG
TTAGGCGGGCTGAGAGAAAAAACCGTGATGCATTTCGTACACTATTGGAAGAACATGTCG
CTGCTGGCATCCTTACAGCCAAGACCTATTGGTTGGAGTATTGCATTGAGGTAAGAGACT
TGCCTCAATACCAAGCTGTTGCATCTAATTTGTCTGGCTCAACTCCGAAAGACCTATTCG
AAGATATCACGGAAGAATTAGAGAAGCAGTATCACGAGGACA*GAGTCGCGTAA*GGATG
CGATGAAGTC

QA 2 731 2 731
DS 

RD RR4CE78JQ 788 0 0
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TGGAAGAACATGTCGCTGCTGGCATCCTTACAGCCAAGACCTATTGGTTGGAGTATTGCA
TTGAGGTAAGAGACTTGCCTCAATACCAAGCTGTTGCATCTAATTTGTCTGGCTCAATTC
CGAAAGACCTATTCGAAGATATCACGGAAGAATTAGAGAAGCAGTATCACGAGGACAAGA
GTCGCGTAAAGGATGCGATGAAGTCAAGGAAGGTTTCCATGGTCGCCTCATGGATGTTTG
AAGATTTTCAATCTGCTCTTTCAGAAGATCTCAGTTCTCAACCAATATCAGACATAAATT
TAAAGCTTATATATAATGACTTGGTTGAGAGGATGAAGGAAAAAGAAGAAAAAGAAGCCA
GAAAGCTTCAGCGTTTGGCTGAAGAATTTACCAATTTCTTACGCACTTTCAAGGAAATAA
CCGCAGCATCAAATTGGGAAGATGTCAAACAACTAGTGGAAGAAAGTCAAGAGTACAGAT
CGATTGGAGATGATGATGTTAGCAGAGGGCTTTTTGAGGAATACATAGCGAGTTTACAGG
AAAAGGCAAAGGAGAAGGAGCGTAAGCGTGATGAGGAAAAGAGTAGGAAAGAGAAGGATA
GGGAGGAGAAAGAAAAGCGGAAAGACAAGGAGAAGGAGAGAAGGGAAAAGGAAAGAGAAC
GCGAAAAAGAGAGGAGTAGCAAAAGGGAGGAATCGGATGGTGATACCGTAGATGTGAGTG
AAGGTCAC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 2 4

CO CL3061Contig1 891 2 9 U
CGAATTCTAACACATAATATCGGTTTATACCAACAGAAAAAAATGTTTTACAGAACCGGC
AAAAAAAAAACTTTTAGTCCTTTACCAAACCGGCTTTGCTAGCTCCCAAGAACCAAATAT
CATACACTTTTTTCAATTCAAACAGATTTGTTCTGTATTAGTCTATTTATCTCCAGAGAA
CCAGGTCTCACTTCTTCCAGGGTTCATCAAATGGTCATAAACCAGCAATCACAACTTGAA
TACTCCGGTTTAGCCATTCGCTATGGTCTCTAATATAACATCATTCAAGTAATCAATCGG
ACCAGGCAAGCACCAATGCAGACAATCATTCTGTACCTTTGCATTTTTGTCTTTATCAAA
CGGTCTGAACTGTCGGTACGCACCCGGATGACCATCGGGTCGAGTCAGTAACATCCCAGT
GAAATCCAAAAGCTTTACATTACCACCACCACCGTCCTCACCCGTCTTCTCTCTAACCGC
TCTTTCGAACTGACCAATCTCTAAACCTCTTAGTATCTTATGCACGTTTTTCATCTCAGC
CTCCTCATCACTCACCGGCTCGGTCTGCTTACACGTCCCACCGTTATGCCACTCCCCGTT
CTGGAAATGGTCTGGAGTCGCAGTCCTGAAAAACACCGTACCTTTACGGTTAGTCTCATC
AGCTAAGAAGTCCATGACGTTACGCAGCGATGCGTTATAAGCATGGTCGAAGCCTAGCCC
TTCCAAGCGAGACTTCTCCGGACAGATATGGCAACCGACCGGTTTAGCATTTTCGTGATA
AACCGCTGCTTTAAGATACCATTTACCGGTTGAGATGATTGCGTAGTCTAGAGTAGCATC
AGACTGGTCCATGACTCATCGAGTTTGTCGAGATGTAGCTGGACCGCAGCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX34JQ U 7
AF RR4CM95JQ U 1
BS 1 69 RR4CM95JQ
BS 70 70 RR4DX34JQ
BS 71 573 RR4CM95JQ
BS 574 574 RR4DX34JQ
BS 575 731 RR4CM95JQ
BS 732 732 RR4DX34JQ
BS 733 799 RR4CM95JQ
BS 800 800 RR4DX34JQ
BS 801 891 RR4CM95JQ

RD RR4DX34JQ 826 0 0
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AAAACTTTTAGTCCTTTACCAAACCGGCTTTGCTAGCTCCCAAGAACCAAATATCATACA
CTTTTTTCAATTCAAACAGATTTGTTCTGTATTAGTCTATTTATCTCCAGAGAACCAGGT
CTCACTTCTTCCAGGGTTCATCAAATGGTCATAAACCAGCAATCACAACTTGAATACTCC
GGTTTAGCCATTCGCTATGGTCTCTAATATAACATCATTCAAGTAATCAATCGGACCAGG
CAAGCACCAATGCAGACAATCATTCTGTACCTTTGCATTTTTGTCTTTATCAAACGGTCT
GAACTGTCGGTACGCACCCGGATGACCATCGGGTCGAGTCAGTAACATCCCAGTGAAATC
CAAAAGCTTTACATTACCACCACCACCGTCCTCACCCGTCTTCTCTCTAACCGCTCTTTC
GAACTGACCAATCTCTAAACCTCTTAGTATCTTATGCACGTTTTTCATCTCAGCCTCCTC
ATCACTCACCGGCTCGGTCTGCTTACACGTCCCACCGTTATGCCACTCCCCGTTCTGGAA
ATGGTCTGGAGTCGCAGTCCTGAAAAACACCGTACCTTTACGGTTAGTCTCATCAGCTAA
GAAGTCCATGACGTTACGCAGCGATGCGTTATAAGCATGGTCGAAGCCTAGCTCTTCCAA
GCGAGACTTCTCCGGACAGATATGGCAACCGACCGGTTTAGCATTTTCGTGATAAACCGC
TGCTTTAAGATACCATTTACCGGTTGAGATGATTGCGTAGTCTAGA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4CM95JQ 891 0 0
CGAATTCTAACACATAATATCGGTTTATACCAACAGAAAAAAATGTTTTACAGAACCGGC
AAAAAAAAA*CTTTTAGTCCTTTACCAAACCGGCTTTGCTAGCTCCCAAGAACCAAATAT
CATACACTTTTTTCAATTCAAACAGATTTGTTCTGTATTAGTCTATTTATCTCCAGAGAA
CCAGGTCTCACTTCTTCCAGGGTTCATCAAATGGTCATAAACCAGCAATCACAACTTGAA
TACTCCGGTTTAGCCATTCGCTATGGTCTCTAATATAACATCATTCAAGTAATCAATCGG
ACCAGGCAAGCACCAATGCAGACAATCATTCTGTACCTTTGCATTTTTGTCTTTATCAAA
CGGTCTGAACTGTCGGTACGCACCCGGATGACCATCGGGTCGAGTCAGTAACATCCCAGT
GAAATCCAAAAGCTTTACATTACCACCACCACCGTCCTCACCCGTCTTCTCTCTAACCGC
TCTTTCGAACTGACCAATCTCTAAACCTCTTAGTATCTTATGCACGTTTTTCATCTCAGC
CTCCTCATCACTCACCGGCTCGGTCTGCTTACATGTCCCACCGTTATGCCACTCCCCGTT
CTGGAAATGGTCTGGAGTCGCAGTCCTGAAAAACACCGTACCTTTACGGTTAGTCTCATC
AGCTAAGAAGTCCATGACGTTACGCAGCGATGCGTTATAAGCATGGTCGAAGCCTAGCCC
TTCCAAGCGAGGCTTCTCCGGACAGATATGGCAACCGACCGGTTTAGCATTTTCGTGATA
AACCGCTGCTTTAAGATAC*ATTTACCGGTTGAGATGATTGCGTAGTCTAGAGTAGCATC
AGACTGGTCCATGACTCATCGAGTTTGTCGAGATGTAGCTGGACCGCAGCG

QA 1 891 1 891
DS 



CO CL3061Contig2 757 2 12 U
GCAACTTATGAGGAACAAATCATGGGCGTTCATTGGTGACTCCATCGTGCGTAACCACGT
CGAATCTCTGCTTTGTATGCTCTATTCGGTCGAAGAACCGGTTGAAGTGTACCACGACAA
GGAGTACAAATCGAAAAGATGGCATTTCCCTATACATAACCTAACGATATCCAACGTCTG
GTCGCCGTTTCTAGTCCAAGCCGCTATTTTCGAAGATTCAGACGGTGTCTCAACCGCTGC
GGTCCAGCTACATCTCGACAAACTCGATGAGTCATGGACCAGTCTGATGCCTACTCTAGA
CTACGCAATCATCTCAACCGGTAAATGGTATCTTAAAGCAGCGGTTTATCACGAAAATGC
TAAACCGGTCGGTTGCCATATCTGTCCGGAGAAGCCTCGCTTGGAAGAGCTAGGCTTCGA
CCATGCTTATAACGCATCGCTGCGTAACGTCATGGACTTCTTAGCTGATGAGACTAACCG
TAAAGGTACGGTGTTTTTCAGGACTGCGACTCCAGACCATTTCCAGAACGGGGAGTGGCA
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GACGGGTGAGAACGGTGGTGGTGGTAATGTAAAGCTTTTGGATTTCACTGGGATGTTACT
GACTCGACCCGATGGTCATCCGGGTGCGTACCGACAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CM95TF U 1
AF RR4DX34TF U 5
BS 1 21 RR4CM95TF
BS 22 22 RR4DX34TF
BS 23 129 RR4CM95TF
BS 130 130 RR4DX34TF
BS 131 407 RR4CM95TF
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BS 409 670 RR4CM95TF
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BS 700 756 RR4CM95TF
BS 757 757 RR4DX34TF

RD RR4CM95TF 756 0 0
GCAACTTATGAGGAACAAATCGTGGGCGTTCATTGGTGACTCCATCGTGCGTAACCACGT
CGAATCTCTGCTTTGTATGCTCTATTCGGTCGAAGAACCGGTTGAAGTGTACCACGACAA
GGAGTACAAGTCGAAAAGATGGCATTTCCCTATACATAACCTAACGATATCCAACGTCTG
GTCGCCGTTTCTAGTCCAAGCCGCTATTTTCGAAGATTCAGACGGTGTCTCAACCGCTGC
GGTCCAGCTACATCTCGACAAACTCGATGAGTCATGGACCAGTCTGATGCCTACTCTAGA
CTACGCAATCATCTCAACCGGTAAATGGTATCTTAAAGCAGCGGTTTATCACGAAAATGC
TAAACCGGTCGGTTGCCATATCTGTCCGGAGAAGCCTCGCTTGGAAGGGCTAGGCTTCGA
CCATGCTTATAACGCATCGCTGCGTAACGTCATGGACTTCTTAGCTGATGAGACTAACCG
TAAAGGTACGGTGTTTTTCAGGACTGCGACTCCAGACCATTTCCAGAACGGGGAGTGGCA
TAACGGTGGGACATGTAAGCAGACCGAGCCGGTGAGTGATGAGGAGGCTGAGATGAAAAA
CGTGCATAAGATACTAAGAGGTTTAGAGATTGGTCAGTTCGAAAGAGCGGTTAGAGAGAA
GACGGGTGAGGACGGTGGTGGTGGTAATGTAAAGCTTT*GGATTTCACTGGGATGTTACT
GACTCGACCCGATGGTCATCCGGGTGCGTACCGACA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4DX34TF 753 0 0
G
TTATGAGGAACAAATCATGGGCGTTCATTGGTGACTCCATCGTGCGTAACCACGTCGAAT
CTCTGCTTTGTATGCTCTATTCGGTCGAAGAACCGGTTGAAGTGTACCACGACAAGGAGT
ACAAATCGAAAAGATGGCATTTCCCTATACATAACCTAACGATATCCAACGTCTGGTCGC
CGTTTCTAGTCCAAGCCGCTATTTTCGAAGATTCAGACGGTGTCTCAACCGCTGCGGTCC
AGCTACATCTCGACAAACTCGATGAGTCATGGACCAGTCTGATGCCTACTCTAGACTACG
CAATCATCTCAACCGGTAAATGGTATCTTAAAGCAGCGGTTTATCACGAAAATGCTAAAC
CGGTCGGTTGCCATATCTGTCCGGAGAAGTCTCGCTTGGAAGAGCTAGGCTTCGACCATG
CTTATAACGCATCGCTGCGTAACGTCATGGACTTCTTAGCTGATGAGACTAACCGTAAAG
GTACGGTGTTTTTCAGGACTGCGACTCCAGACCATTTCCAGAACGGGGAGTGGCATAACG
GTGGGACGTGTAAGCAGACCGAGCCGGTGAGTGATGAGGAGGCTGAGATGAAAAACGTGC
ATAAGATACTAAGAGGTTTAGAGATTGGTCAGTTCGAAAGAGCGGTTAGAGAGAAGACGG
*TGAGACGGGTGGTGGTGGTAATGTAAAGCTTTTGGATTTCACTGGGATGT*ACTGACTC
GACC*GATGGTCATCCGG*TGCGTACCGACAG

QA 2 753 2 753
DS 



AS 1 4

CO CL3062Contig1 482 4 3 U
GGATACCCAATAATATATACTCAAAACTGATAGACAATTCCAACAGCTTTATAGAAATTA
AAAGACATGGGAGGTTCAAGAACAGCCTCTTCAGACATCACTGCTTGGTGTTCTGCTGTT
GTGTTGTTGTCTCTAATACTTCTCATGTTATCCGTTCGAGAGAACAACGCTTCTAATGAT
TCGGTCAGAGGGTTTCAATTCTCAGAGAAACCTTGTGAAGAGATTTACGTCGTCGGAGAA
GGAGAAACGCTTCACACCATCGGAGATAAATGCGGCGACCCGTTTATTGTCGAGCGAAAC
CCGCATATCCATGACCCGGATGATGTCTTTCCCGGTCTTGTTCTCAGGATCGCACCTTTT
TACTTCTCTAGAAAAGTTCAAAATATTTGAAAAACGTTTCTTCTTTTCTTGTAGTTTTGT
CTAAAGCATACTCTTCCCTCAGTCTGTATGTATTTATGTATATACTAAAGAAGTTTTAAA
GC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 

AF RR4AV84JQ C 1
AF RR4BP24JQ C 1
AF RR4BP24TF U 1
AF RR4AV84TF U 1
BS 1 440 RR4BP24TF
BS 441 441 RR4AV84TF
BS 442 482 RR4BP24TF

RD RR4AV84JQ 482 0 0
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DS 

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TCGGTCAGAGGGTTTCAATTCTCAGAGAAACCTTGTGAAGAGATTTACGTCGTCGGAGAA
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GC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4BP24TF 482 0 0
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GC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4AV84TF 482 0 0
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AAAGACATGGGAGGTTCAAGAACAGCCTCTTCAGACATCACTGCTTGGTGTTCTGCTGTT
GTGTTGTTGTCTCTAATACTTCTCATGTTATCCGTTCGAGAGAACAACGCTTCTAATGAT
TCGGTCAGAGGGTTTCAATTCTCAGAGAAACCTTGTGAAGAGATTTACGTCGTCGGAGAA
GGAGAAACGCTTCACACCATCGGAGATAAATGCGGCGACCCGTTTATTGTCGAGCGAAAC
CCGCATATCCATGACCCGGATGATGTCTTTCCCGGTCTTGTTCTCAGGATCGCACCTTTT
TACTTCTCTAGAAAAGTTCAAAATATTTGAAAAACGTTTCTTCTTTTCTTGTAGTTTTGT
CTAAAGCATACTCTTCCCTCAGTCTGTATGTATTTATGTATATACTAAAGAAGTTTTAAA
GC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 3

CO CL3063Contig1 948 3 11 U
GGGGCAGTAAGGAGATCTAAGCACGAACCAAACCCCGTATTGTGGTGCAGAGAAGGAGAC
GAAGGAAGAAAGACAAAGATCGACGAAGATGAACATTTTCAGATTAGCAGGTGATATGAC
TCACCTAGCCAGTGTTCTCGTCTTGCTCCTCAAGATCCACACCATCAAATCCTGCGCCGG
TGTGTCACTAAGGACGCAAGAACTGTACGCCATTGTGTTCGCGACGCGTTATTTGGATAT
TTTCACGAGCTTCGTGTCAGTCTACAACACCTTCATGAAGCTGGTCTTCTTAGGAAGCTC
CTTTTCGATTGTCTGGTACATTAGGTATCACAAGGCTGTCCACAGGACTTACGACAGGGA
GCAGGACACGTTTCGCCACTGGTTCCTTGTCCTTCCTTGCCTTGTCTTGGCTCTTCTCAT
CCACGAGAAGTTCACCTTTCTCGAGGTGCTCTGGACGTTTTCGCTGTACTTGGAAGCTGT
TGCTATATTGCCTCAGCTTGTCTTGCTGCAAAGGACTAGAAATATCGATAACTTGACTGG
CCAATACATTTTTCTCCTTGGTGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGGATCTACCG
TTACTTCACTGAGCCCCACTTTGTTCATTGGATAACCTGGATCGCGGGGCTTGTCCAGAC
ATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTACTATTATTTCCTTAGCTGGAAGAACAACAAAA*GCT
CCAACTGCCAGCTTAATTTTCTGAAGTTTTTGATGCTCGGAAACCCTAAGGATTCAATTT
GGTGCCGGTTAGAGGTTTACCAATTTACTCTGTTGGTGGTTAGTGGAGGAGACAAGCATA
GATATTATGTAAACTCCAGTTACTGAACTTACACTCTCTTTTGAACCTTTTTCGTGTCTC
AGCTTTTTGCTCGAGTTAACTTGTTACTAAAGGATTTCGAAGGACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM91TF U 1
AF RR4FQ21TF U 7
AF RR4FQ21JQ C 304
BS 1 154 RR4BM91TF
BS 155 155 RR4FQ21TF
BS 156 350 RR4BM91TF
BS 351 351 RR4FQ21TF
BS 352 724 RR4BM91TF
BS 725 725 RR4FQ21TF
BS 726 742 RR4BM91TF
BS 743 743 RR4FQ21TF
BS 744 760 RR4BM91TF
BS 761 762 RR4FQ21TF
BS 763 948 RR4FQ21JQ

RD RR4BM91TF 760 0 0
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GAAGGAAGAAAGACAAAGATCGACGAAGATGAACATTTTCAGATTAGCAGGTGATATGAC
TCACCTAGCCAGTGTTCTCGTCTTGCTCCTCAAGGTCCACACCATCAAATCCTGCGCCGG
TGTGTCACTAAGGACGCAAGAACTGTACGCCATTGTGTTCGCGACGCGTTATTTGGATAT
TTTCACGAGCTTCGTGTCAGTCTACAACACCTTCATGAAGCTGGTCTTCTTAGGAAGCTC
CTTTTCGATTGTCTGGTACATTAGGTATCACAAGGCTGTCCACAGGACTTGCGACAGGGA
GCAGGACACGTTTCGCCACTGGTTCCTTGTCCTTCCTTGCCTTGTCTTGGCTCTTCTCAT
CCACGAGAAGTTCACCTTTCTCGAGGTGCTCTGGACGTTTTCGCTGTACTTGGAAGCTGT
TGCTATATTGCCTCAGCTTGTCTTGCTGCAAAGGACTAGAAATATCGATAACTTGACTGG
CCAATACATTTTTCTCCTTGGTGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGGATCTACCG
TTACTTCACTGAGCCCCACTTTGTTCATTGGATAACCTGGATCGCGGGGCTTGTCCAGAC
ATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTACTATTATTTCCTTAGCTGGAAGAACAACAAAA*GCT
CCAATTGCCAGCTTAATTTTCTAAAGTTTTTGATGCTCGG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4FQ21TF 763 0 0
GG
AAGGAGATCTA*GCACGAACCAAACCCCGTATTGTGGTGCAGAGAAGGAGACGAAGGAAG
AAAGACAAAGATCGACGAAGATGAACATTTTCAGATTAGCAGGTGATATGACTCACCTAG
CCAGTGTTCTCGTCTTGCTCCTCAAGATCCACACCATCAAATCCTGCGCCGGTGTGTCAC
TAAGGACGCAAGAACTGTACGCCATTGTGTTCGCGACGCGTTATTTGGATATTTTCACTA
GCTTCGTGTCTGTCTA**ACACCTTCATGAAGCTGGTCTTCTTAGGAAGCTCCTTTTCGA
TTGTCTGGTACATTAGGTATCACAAGGCTGTCCACAGGACTTACGACAGGGAGCAGGACA
CGTTTCGCCACTGGTTCCTTGTCCTTCCTTGCCTTGTCTTGGCTCTTCTCATCCACGAGA
AGTTCACCTTTCTCGAGGTGCTCTGGACGTTTTCGCTGTACTTGGAAGCTGTTGCTATAT
TGCCTCAGCTTGTCTTGCTGCAAAGGACTAGAAATATCGATAACTTGACTGGCCAATACA
TTTTTCTCCTTGGTGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGGATCTACCGTTACTTCA
CTGAGCCCCACTTTGTTCATTGGATAACCTGGATCGCGGGGCTTGTCCAGACATTGCTCT
ATGCCGACTTCTTCTACTATTATTTCCTTAGCTGGAAGA*CAACAAAA*GCTCCAACTGC
CAGCTTA*TTTTCTGAAGTTTT*GATGCTCGGAA
CCCTAAG

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR4FQ21JQ 645 0 0
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GGACACGTTTCGCCACTGGTTCCTTGTCCTTCCTTGCCTTGTCTTGGCTCTTCTCATCCA
CGAGAAGTTCACCTTTCTCGAGGTGCTCTGGACGTTTTCGCTGTACTTGGAAGCTGTTGC
TATATTGCCTCAGCTTGTCTTGCTGCAAAGGACTAGAAATATCGATAACTTGACTGGCCA
ATACATTTTTCTCCTTGGTGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGGATCTACCGTTA
CTTCACTGAGCCCCACTTTGTTCATTGGATAACCTGGATCGCGGGGCTTGTCCAGACATT
GCTCTATGCCGACTTCTTCTACTATTATTTCCTTAGCTGGAAGAACAACAAAAAGCTCCA
ACTGCCAGCTTAATTTTCTGAAGTTTTTGATGCTCGGAAACCCTAAGGATTCAATTTGGT
GCCGGTTAGAGGTTTACCAATTTACTCTGTTGGTGGTTAGTGGAGGAGACAAGCATAGAT
ATTATGTAAACTCCAGTTACTGAACTTACACTCTCTTTTGAACCTTTTTCGTGTCTCAGC
TTTTTGCTCGAGTTAACTTGTTACTAAAGGATTTCGAAGGACAGT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 4

CO CL3064Contig1 823 4 21 U
GGACAGCCTCCTCCGATGTATAGTCTCTCACTCTTCTTCCCTCCCC*AGAAGAACACGTG
GGGAATACCGAGTCGAGTTATATCATTGGGGTAGACCCAGACTTGTCCGGTGCTTTGGCT
CTCTTGAAATTTAACCACCTCTTGGGTTCTTCCGAAGCTCAGGTCTTTGATACTCCTCAC
CTGCCGGTTTTAGTTGGAAATAGAGTGCGGAAACGTTTGGATGCAAAGTCAATAGTTCAA
TTGATTCGAAGTCTAGATATACCCTCTGGAAGTACGGCATATATAGAGCAATCAACTCCC
TATCCTAAAGATGGGAAACAGGGTTGGTATAGCGGAGGTTTTGGATTTGGATTTTGGTTA
GGAACACTTGTTACCTCAGGCTTTTCGGTTGTTCCCGTTTCTTCAGCCTTGTGGAAGAGG
CATTTT*CAACTT*GCTGGTGGAAACTGCACAAAGGATGATAGTAGACGAGTT*GCATCG
GAGTT*GTTTCCCTT*GCTTAGTTCGCAACTCAAGAGAAAAAAAAGACCATGGTCGAGCT
GAAGCGTTGCTCATT*GCGGCATATGG*TGAAACTCTTAAAACCTCCAAACTGTTGATCA
CGCCTCAAGAGTTTGTATCTGAGGTTCACTCTTT*AGAAAGCTAGTCATTTTGATGTTTT
TCACTCTCAACTCATTAGTTTCTTATCAAACAATTCTGATTTGTACTCGATACTTACCAT
TGCTAACTTGTTAGTTTAGACTTTCAAATAACATCTCGAGATCAAATATCGTGCTTCTGG
TAAGAAGCTGTAAGTTAGCATGAGATCTGATGATGTTTGCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A279TF U 20
AF RR4A279JQ C 1
AF RR4A279JQD C 15
AF RR4A279TFB U 1
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TGGAAACTGCACAAAGGATGATAGTAGACGAGTTCGCATCGGAGTTTGTTTCCCTTCGCT
TAGTTCGCAACTCAAGAGAAAAAAAAGACCATGGTCGAGCTGAAGCGTTGCTCATTTGCG
GCATATGGGTGAAACTCTTAAAACCTCCAAACTGTTGACCACGCCTCAAGAGTTTGTATC
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DS 

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DS 

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GATGT
ATAGTCTCTCACTCTTCTTCCCTCCCCCAGAAGAACACGTGGGGAATACCGAGTCGAGTT
ATATCATTGGGGTAGACCCAGACTTGTCCGGTGCTTTGGCTCTCTTGAAATTTAACCACC
TCTTGGGTTCTTCCGAAGCTCAGGTCTTTGATACTCCTCACCTGCCGGTTTTAGTTGGAA
ATAGAGTGCGGAAACGTTTGGATGCAAAGTCAATAGTTCAATTGATTCGAAGTCTAGATA
TACCCTCTGGAAGTACGGCATATATAGAGCAATCAACTCCCTATCCTAAAGATGGGAAAC
AGGGTTGGTATAGCGGAGGTTTTGGATTTGGATTTTGGTTAGGAACACTTGTTACCTCAG
GCTTTTCGGTTGTTCCCGTTTCTTCAGCCTTGTGGAAGAGGCATTTT*CAACTT*GCTGG
TGGAAACTGCACAAAGGATGATAGTAGACGAGTT*GCATCGGAGTT*GTTTCCCTT*GCT
TAGTTCGCAACTCAAGAGAAAAAAAAGACCATGGTCGAGCTGAAGCGTTGCTCATT*GCG
GCATATGG*TGAAACTCTTAAAACCTCCAAACTGTTGATCACGCCTCAAGAGTTTGTATC
TGAGGTTCACTCTTT*AGAAAGCTAGTCATTTTGATGTTTTTCACTCTCAACTCATTAGT
TTCTTATCAAACAATTCTGATTTGTACTCGATACTTACCATTGCTAACTTGTTAGTTTAG
ACTTTCAAATAACATCTCGAGATCAAATATCGTGCTTCTGGTAAGAAGCTGTAAGTTAGC
ATGAGATCTGATGATGTTTGCTTC

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DS 

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CTCTTGAAATTTAACCACCTCTTGGGTTCTTCCGAAGCTCAGGTCTTTGATACTCCTCAC
CTGCCGGTTTTAGTTGGAAATAGAGTGCGGAAACGTTTGGATGCAAAGTCAATAGTTCAA
TTGATTCGAAGTCTAGATATACCCTCTGGAAGTACGGCATATATAGAGCAATCAACTCCC
TATCCTAAAGATGGGAAACAGGGTTGGTATAGCGGAGGTTTTGGATTTGGATTTTGGTTA
GGAACACTTGTTACCTCAGGCTTTTCGGTTGTTCCCGTTTCTTCAGCCTTGTGGAAGAGG
CATTTT*CAACTT*GCTGGTGGAAACTGCACAAAGGATGATAGTAGACGAGTT*GCATCG
GAGTT*GTTTCCCTT*GCTTAGTTCGCAACTCAAGAGAAAAAAAAGACCATGGTCGAGCT
GAAGCGTTGCTCATT*GCGGCATATGG*TGAAACTCTTAAAACCTCCAAACTGTTGATCA
CGCCTCAAGAGTTTGTATCTGAGGTTCACTCTTT*AGAAAGCTAGTCATTTTGATGTTTT
TCACTCTCAACTCATTAGTTTCTTATCAAACAATTCTGATTTGTACTCGATACTTACCAT
TGCTAACTTGTTAGTTTAGACTTTCAAATAACATCTCGAGATCAAATATCGTGCTTCTGG
TAAGAAGCTGTAAGTTAGCATGAGATCTGATGATGTTTGCTTC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 3

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TACGTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCAGGCGCTCGTCACCGGCCGTATTCCCTGGTTA
TCGGCGAAATCTACTCTTCGTTCTCTGACCTGTAGATCGATCCAGCTACGATATCAGCCA
TGAATCCTGAATATGACTATCTCTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGATTCTGGTGTTGGAA
AGTCCTGCTTGCTTCTTAGGTTTGTTGATGATTCCTACCTCGATAGCTACATCAGTACCA
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CTACAAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTTCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGA
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AGCAATCAGGCTGCTGCTCTTCTTAATGCGTTTTGTCAACACTTTTAACCATATATATTA
TCTCATTTGTTTCCATGTAGGACACCTGAACAACGTTATTTCTTCATCTTTTGTATTTGT
TTTTTTCAGTCACTTTTATTTCCAAAAGCTTTTAAACTGTTTGTATTGATGTACGTGGAA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C843TF U 45
AF RR4GY80TF U 1
AF RR4GY80JQ C 249
BS 1 123 RR4GY80TF
BS 124 124 RR4C843TF
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BS 690 690 RR4GY80JQ
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BS 710 710 RR4GY80JQ
BS 711 719 RR4GY80TF
BS 720 720 RR4GY80JQ
BS 721 729 RR4GY80TF
BS 730 730 RR4GY80JQ
BS 731 758 RR4GY80TF
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GG
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AATCAAACTCCAGATTTGGGATACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAG
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GCTACTGGTTGGGAACAAGTGTGATCTCACTTCACGGAAAGTTGTATCCACTGAGA

QA 3 538 3 538
DS 

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AATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGA
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CTACAAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTTCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGA
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AGCAATCAG*CTGCTGCTCTTCTTAATGCGTTTTGTCA
CACT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4GY80JQ 748 0 0
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GACTTTAAAATCCGCACAGTCGAACAAGATGGAAAGACAATCAAACTCCAGATTTGGGAT
ACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGAGCTCATGGA
ATCATTGTGACTTACGATGTAACAGACCAAGAAAGCTTCAACAATGTCAAGCAATGGCTA
AATGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAGTGT
GATCTCACTTCACAGAAAGTTGTATCCACTGAGACAGCTTTCGCCAAGAATGCTACAAAT
GTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTTCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGCCAACCT
GCTGGTGGATTTAAGCCTTCAACAGTCCAGATCCGAGGACAACCTGTAAACCAGCAATCA
GGCTGCTGCTCTTCTTAATGCGTTTTGTCAACACTTTTAACCATATATATTATCTCATTT
GTTTCCATGTAGGACACCTGAACAACGTTATTTCTTCATCTTTTGTATTTGTTTTTTTCA
GTCACTTTTATTTCCAAAAGCTTTTAAACTGTTTGTATTGATGTACGTGGAAACACTAAG
TTCGGTTGTAAAAGTTTTTCGTGCAAATCAATGTGCTAAGTGGTGTGTTTTCTTCCTGAA
AGCCTTAATAAAATTAGAAATAATTACC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL3066Contig1 953 4 3 U
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CTAATTTGAGCAATGGAGATTGACAGAGAAGATGGAAGAAGACCGAATCAGCTGAGACCC
CTTGCTTGTTCCCGTAACATCCTTCATCGTCCTCATGGCTCTGCTAGCTGGTCCCAAGGG
GATACAAAAGTTCTAGCTGCAGTGTATGGACCTAAACCTGGAACGAGGAAGAACGAGAAC
CCTGAGAAGGCTTGCTTTGAAGTCATATGGAAGCCTAAATCAGGACAGATTGGAAAAGCC
GAAAAGGAGTATGATATGATACTAAAAAAGACAATACAGAGTATTTGTGTCTTGACGGTG
AATCCAAATACCACCACCTCCGTGATCATTCAGGTTGTACATGATGATGGTTCTCTTCTT
CCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCCTGTAGACGCAGGAATACCTATGAAGCAT
CTCGCTGTTGCTATATGTTGTTGCCTGGCTGATAGTGGATATGTCGTACTCGATCCAAAC
AAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTTATTTAGTCTTTCAAATACAACTCTCT
CTGTTCTTCCGGAAGTGGAAGGCGAGCCAGTAGAGCATGGGATCATTACATCAGTCACGC
ATGGAGTCATGTCAGTGGACGATTACTTCCTGTGTGTAGAGAACGGTCGTGCTGCTACGG
CTAGTTTATCTGCATTTTTTAGGAAGAACTTCCAACAAACCCAAGGAGCTGTTTAGAAGC
ATGAAATCCATGTGCTTTCCCGTTAGAATTTGAACGTTTTTGTTTTCCTCCTTGTAGCTT
TATGGGAACTTAATGGTCAATGTGTTTAATCAATTTTTTTAAAACAAAACAAAATTTTCG
TATGCTTAGTTATGTAAACAGACGACCCTCTTTCCTTTAATACAATTATTACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A771TF U 1
AF RR4A839TF U 1
AF RR4A839JQ C 173
AF RR4A771JQ C 240
BS 1 722 RR4A771TF
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CT

QA 1 722 1 722
DS 

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CCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCCTGTAGACGCAGGAATACCTATGAAGCAT
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AAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTTATTTAGTCTTTCAAATACAACTCTCT
CTGTTCTTCCGGAAGTGGAAGGCGAGCCAGTAGAGCATGGGATCATTACATCAGTCACGC
ATGGAGTCATGTCAGTGGACGATTACTTCCTGTGTGTAGAGAACGGTCGTGCTGCTACGG
CTAGTTTATCTGCATTTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4A839JQ 781 0 0
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TGACGGTGAATCCAAATACCACCACCTCCGTGATCATTCAGGTTGTACATGATGATGGTT
CTCTTCTTCCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCCTGTAGACGCAGGAATACCTA
TGAAGCATCTCGCTGTTGCTATATGTTGTTGCCTGGCTGATAGTGGATATGTCGTACTCG
ATCCAAACAAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTTATTTAGTCTTTCAAATAC
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AGTCACGCATGGAGTCATGTCAGTGGACGATTACTTCCTGTGTGTAGAGAACGGTCGTGC
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TGTAGCTTTATGGGAACTTAATGGTCAATGTGTTTAATCAATTTTTTTAAAACAAAACAA
AATTTTCGTATGCTTAGTTATGTAAACAGACGACCCTCTTTCCTTTAATACAATTATTAC
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4A771JQ 714 0 0
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CGAAAAGGAGTATGATATGATACTAAAAAAGACAATACAGAGTATTTGTGTCTTGACGGT
GAATCCAAATACCACCACCTCCGTGATCATTCAGGTTGTACATGATGATGGTTCTCTTCT
TCCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCCTGTAGACGCAGGAATACCTATGAAGCA
TCTCGCTGTTGCTATATGTTGTTGCCTGGCTGATAGTGGATATGTCGTACTCGATCCAAA
CAAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTTATTTAGTCTTTCAAATACAACTCTC
TCTGTTCTTCCGGAAGTGGAAGGCGAGCCAGTAGAGCATGGGATCATTACATCAGTCACG
CATGGAGTCATGTCAGTGGACGATTACTTCCTGTGTGTAGAGAACGGTCGTGCTGCTACG
GCTAGTTTATCTGCATTTTTTAGGAAGAACTTCCAACAAACCCAAGGAGCTGTTTAGAAG
CATGAAATCCATGTGCTTTCCCGTTAGAATTTGAACGTTTTTGTTTTCCTCCTTGTAGCT
TTATGGGAACTTAATGGTCAATGTGTTTAATCAATTTTTTTAAAACAAAACAAAATTTTC
GTATGCTTAGTTATGTAAACAGACGACCCTCTTTCCTTTAATACAATTATTACC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL3067Contig1 1106 4 16 U
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TGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCCACTTACCCTATGTATGACTCCAGAGCGTCTTT
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CGATGCTGTTGAAGCTCTTGCGGACGACAAAACCGTAGCTATAGTTGTTGTCAACCCTTG
CAATCCGTGTGGAAACGTTTTTGCTCGCCAACATCTTCAAAAGATTGCAGAGACAGCTTG
CAAGCTTGGAATACTTTTGATCGCAGACGAAGTTTATGACCATTATGCATTTGGGGATAA
ACCATTTGTGTCCATGGCAGAGTTTGCAGAGATAGTGCCTGTAGTTTTGTTAGGCGCCAT
ATCAAAAAGATGGTTTGTTCCTGGCTGGAGACTTGGCTGGATGGTGACTCTTGACCCTCA
TAGCATCATGAAAGATTCTGGGTTTCTTCAGTCTCTTACCAACGTCATCAACATTTCGAC
GGACGCTGCAACGTTCATTCAGGGTGCCATTCCTGATATCCTTGGGAATACGAAAGAAGA
ATTCTTCTCATTGAAACTTGAAAGGGTGAGAGAATGTGCAGAGATTTGTTATGAAGAGAT
TATGAAGATCCCTTGCATCACTTGCCCCAGCAAACCC*GAGGGATCAATGTTCACGATGG
TGAAGTTAAACCTCTCGCTACTCGGAGATATCAGTGATGATTTGGACTTCTGCTGCAAGC
TGGCTAAAGAGGAATCGTTGATCATCCTACCAGGTCGAGCTGTTGGGCTCAAGAACTGGC
TACGTATCACTTTTGCGGTTGAGCTCGATCTCCTCATAGACGGCTTTTCCAGGCTAAAGA
ACTTTGCCCAGAGACACTCCAAGAAAAACCCATGATTGTTAAGTCTCTCTCTCCTTCTCA
ATAGTCAAAGCAAATTTGAAACTTTTAAAACAAGACATTGTAATAACTATTAAGCTTTGT
TTTTCATTGAACAAAAATATGAACCAAGTGATGCCAAACAGCAGCTGTTGCCATGAGTTC
TTCTCAATGTCAAACATTAGCAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS82TF U 1
AF RR4FI65TF U 45
AF RR4BF02TF U 46
AF RR4BS82JQ C 458
BS 1 89 RR4BS82TF
BS 90 90 RR4FI65TF
BS 91 126 RR4BS82TF
BS 127 127 RR4FI65TF
BS 128 238 RR4BS82TF
BS 239 239 RR4FI65TF
BS 240 404 RR4BS82TF
BS 405 405 RR4FI65TF
BS 406 768 RR4BS82TF
BS 769 777 RR4FI65TF
BS 778 793 RR4BF02TF
BS 794 794 RR4BS82JQ
BS 795 831 RR4BF02TF
BS 832 832 RR4BS82JQ
BS 833 853 RR4BF02TF
BS 854 1106 RR4BS82JQ

RD RR4BS82TF 780 0 0
GCATATTACTTCGGGTTGTTTGCAAGCCATTGAGATTTTGATCTCCTCACTCGCGAAACC
TGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCCATTTACCCTATGTATGACTCCAGAGCGTCTTT
CAGTCATCTAGAGATTCGTTATTTCGACCTCCTACCAGAAAATGGTTGGGATGTTGATCT
CGATGCTGTTGAAGCTCTTGCGGACGACAAAACCGTAGCTATAGTTGTTGTCAACCCTCG
CAATCCGTGTGGAAACGTTTTTGCTCGCCAACATCTTCAAAAGATTGCAGAGACAGCTTG
CAAGCTTGGAATACTTTTGATCGCAGACGAAGTTTATGACCATTATGCATTTGGGGATAA
ACCATTTGTGTCCATGGCAGAGTTTGCAGAGATAGTGCCTGTAGCTTTGTTAGGCGCCAT
ATCAAAAAGATGGTTTGTTCCTGGCTGGAGACTTGGCTGGATGGTGACTCTTGACCCTCA
TAGCATCATGAAAGATTCTGGGTTTCTTCAGTCTCTTACCAACGTCATCAACATTTCGAC
GGACGCTGCAACGTTCATTCAGGGTGCCATTCCTGATATCCTTGGGAATACGAAAGAAGA
ATTCTTCTCATTGAAACTTGAAAGGGTGAGAGAATGTGCAGAGATTTGTTATGAAGAGAT
TATGAAGATCCCTTGCATCACTTGCCCCAGCAAACCC*GAGGGATCAATGTTCACGATGG
TGAAGTTAAACCTCTCGCTACTCGGAGATATCAGTGATGATTTGGACT
CTGCTGCAGCTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4FI65TF 739 0 0
G
CTCACTCGCGAAACCTGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCCACTTACCCTATGTATGA
CTCCAGAGCGTCTTTCAGTCAGCTAGAGATTCGTTATTTCGACCTCCTACCAGAAAATGG
TTGGGATGTTGATCTCGATGCTGTTGAAGCTCTTGCGGACGACAAAACCGTAGCTATAGT
TGTTGTCAACCCTTGCAATCCGTGTGGAAACGTTCTTGCTCGCCAACATCTTCAAAAGAT
TGCAGAGACAGCTTGCAAGCTTGGAATACTTTTGATCGCAGACGAAGTTTATGACCATTA
TGCATTTGGGGATAAACCATTTGTGTCCATGGCAGAGTTTGCAGAGATAGTGCCTGTAGT
TTTGTTAGGCGCCATATCAAAAAGATGGTTTGTTCCTGGCTGGAGACTTGGCTGGATGGT
GACTCTTGACCCTCATAGCATCATGAAAGATTCTGGGTTTCTTCAGTCTCTTACCAACGT
CATCAACATTTCGACGGACGCTGCAACGTTCATTCAGGGTGCCATTCCTGATATCCTTGG
GAATACGAAAGAAGAATTCTTCTCATTGAAACTTGAAAGGGTGAGAGAATGTGCAGAGAT
TTGTTATGAAGAGATTATGAAGATCCCTTGCATCACTTGCCCCAGCAAACCC*GAGGGAT
CAATGTTCACGATGGTGAAGTTAAACCTCTCGCTACTCGGAGATATCAGTGATGATTTGG
ACTTCTGCTGCA
GCTGGC

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4BF02TF 808 0 0
CTCACTCGCGAAACCTGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCCACTTACCCTATGTATGA
CTCCAGAGCGTCTTTCAGTCAGCTAGAGATTCGTTATTTCGACCTCCTACCAGAAAATGG
TTGGGATGTTGATCTCGATGCTGTTGAAGCTCTTGCGGACGACAAAACCGTAGCTATAGT
TGTTGTCAACCCTTGCAATCCGTGTGGAAACGTTTTTGCTCGCCAACATCTTCAAAAGAT
TGCAGAGACAGCTTGCAAGCTTGGAATACTTTTGACCGCAGACGAAGTTTATGACCATTA
TGCATTTGGGGATAAACCATTTGTGTCCATGGCAGAGTTTGCAGAGATAGTGCCTGTAGT
TTTGTTAGGCGCCATATCAAAAAGATGGTTTGTTCCTGGCTGGAGACTTGGCTGGATGGT
GACTCTTGACCCTCATAGCATCATGAAAGATTCTGGGTTTCTTCAGTCTCTTACCAACGT
CATCAACATTTCGACGGACGCTGCAACGTTCATTCAGGGTGCCATTCCTGATATCCTTGG
GAATACGAAAGAAGAATTCTTCTCATTGAAACTTGAAAGGGTGAGAGAATGTGCAGAGAT
TTGTTATGAAGAGATTATGAAGATCCCTTGCATCACTTGCCCCAGCAAACCCCGAGGGAT
CAATGTTCACGATGGTGAAGTTAAACCTCTCGCTACTCGGAGATATCAGTGATGATTTGG
ACTTCTGCTGCAAGCTGGCTAAAGAGGA*TCGTTGATCATCCTACCAGGTCGAGCTGTTG
GGCTCA*GAACTGGCTACGTATCACTTT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4BS82JQ 649 0 0
TGGATGGTGACTCTTGACCCTCATAGCATCATGAAAGATTCTGGGTTTCTTCAGTCTCTT
ACCAACGTCATCAACATTTCGACGGACGCTGCAACGTTCATTCAGGGTGCCATTCCTGAT
ATCCTTGGGAATACGAAAGAAGAATTCTTCTCATTGAAACTTGAAAGGGTGAGAGAATGT
GCAGAGATTTGTTATGAAGAGATTATGAAGATCCCTTGCATCACTTGCCCCAGCAAACCC
*GAGGGATCAATGTTCACGATGGTGAAGTTAAACCTCTCGCTACTCGGAGATATCAGTGA
TGATTTGGACTTCTGCTGCAAGCTGGCTAAAGAGGAATCGTTGATCATCCTACCAGGTCG
AGCTGTTGGGCTCAAGAACTGGCTACGTATCACTTTTGCGGTTGAGCTCGATCTCCTCAT
AGACGGCTTTTCCAGGCTAAAGAACTTTGCCCAGAGACACTCCAAGAAAAACCCATGATT
GTTAAGTCTCTCTCTCCTTCTCAATAGTCAAAGCAAATTTGAAACTTTTAAAACAAGACA
TTGTAATAACTATTAAGCTTTGTTTTTCATTGAACAAAAATATGAACCAAGTGATGCCAA
ACAGCAGCTGTTGCCATGAGTTCTTCTCAATGTCAAACATTAGCAATGC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 3

CO CL3068Contig1 590 3 13 U
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TGGCAGTTTTTTAACAACAAAATATATATGGCAGTTAAAAGTTGTTTTTTGAGCAAAAAC
AGTAAATTTTGTTTGATAGCAAATCTTTATGACCTAAAACATGTCGGATAATAACAATAA
ACTCCCTTGAAACGAAAACTCGAAAGGATAATGGCATTAATTGTTATTATCATAAATGTC
CGGAACAATGATCCCTTAAAGTCGGAGGGAAGTCGGGAGCGAAGGCAAACCTCTCAGTAA
TACAATCTGCACTGAGACCCAAGAAGGCATGACAACAAGAGTGACCAATAGTCCCGATTT
CTCCGTTTACAAACGATTGGACAATTTCTTGGAGACAGTTGGGAATAGCATACAGGGATG
ACATACAATCTGTTGGGTCCGGTCCAGGTATAGGCTGCGAAGGTAACGTTTGAGCTGTAC
CGAACACGGCCATGAATGCAACTGGAAGAAGGAAGAAAAACTTGTTGATCGTCCACATTT
TTTATTAGAGAAATTGTAATAAGTTATTGATGTTTTAATCTTTGATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CS46JQ U 1
AF RR4F516TF C 256
AF RR4F516JQ U 49
BS 1 71 RR4CS46JQ
BS 72 72 RR4F516JQ
BS 73 115 RR4CS46JQ
BS 116 116 RR4F516JQ
BS 117 196 RR4CS46JQ
BS 197 197 RR4F516JQ
BS 198 258 RR4CS46JQ
BS 259 259 RR4F516JQ
BS 260 279 RR4CS46JQ
BS 280 280 RR4F516JQ
BS 281 355 RR4CS46JQ
BS 356 356 RR4F516JQ
BS 357 590 RR4CS46JQ

RD RR4CS46JQ 590 0 0
CGTGAAATTATCCTTATTATTATTTAGTTATACGCAAGATGTTTACATCAACATGAAATA
TGGCAGTTTTT*AACAACAAAATATATATGGCAGTTAAAAGTTGTTTTTTGAGCAGAAAC
AGTAAATTTTGTTTGATAGCAAATCTTTATGACCTAAAACATGTCGGATAATAACAATAA
ACTCCCTTGAAACGAAGACTCGAAAGGATAATGGCATTAATTGTTATTATCATAAATGTC
CGGAACAATGATCCCTTAGAGTCGGAGGGAAGTCGGGAGAGAAGGCAAACCTCTCAGTAA
TACAATCTGCACTGAGACCCAAGAAGGCATGACAACAAGAGTGACCAATAGTCCCAATTT
CTCCGTTTACAAACGATTGGACAATTTCTTGGAGACAGTTGGGAATAGCATACAGGGATG
ACATACAATCTGTTGGGTCCGGTCCAGGTATAGGCTGCGAAGGTAACGTTTGAGCTGTAC
CGAACACGGCCATGAATGCAACTGGAAGAAGGAAGAAAAACTTGTTGATCGTCCACATTT
TTTATTAGAGAAATTGTAATAAGTTATTGATGTTTTAATCTTTGATATCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4F516TF 335 0 0
TTAG
AGTCGGAGGGAAGTCGGGAGCGAAGGCAA*CCTCTCAGTAATACAATCTGCACTGAGACC
CAAGAAGGCATGACAACAAGAGTGACCAATAGTCCCGATTTCTCCGTTTACAAACGATTG
GACAATTTCTTGGAGACAGTTGGGAATAGCATACAGGGATGACATACAATCTGTTGGGTC
CGGTCCAGGTATAGGCTGCGAAGGTAACGTTTGAGCTGTACCGAACACGGCCATGAATGC
AACTGGAAGAAGGAAGAAAAACTTGTTGATCGTCCACATTTTTTATTAGAGAAATTGTAA
TAAGTTATTGATGTTTTAATCTTTGATATCC

QA 5 335 5 335
DS 

RD RR4F516JQ 542 0 0
CG
ACATGAAATATGGCAGTTTTTTAACAACAAAATATATATGGCAGTTAAAAGTTGTTTTTT
GAGCAAAAACAGTAAATTTTGTTTGATAGCAAATCTTTATGACCTAAAACATGTCGGATA
ATAACAATAAACTCCCTTGAAACGAAAACTCGAAAGGATAATGGCATTAATTGTTATTAT
CATAAATGTCCGGAACAATGATCCCTTAAAGTCGGAGGGAAGTCGGGAGCGAAGGCAAAC
CTCTCAGTAATACAATCTGCACTGAGACCCAAGAAGGCATGACAACAAGAGTGACCAATA
GTCCCGATTTCTCCGTTTACAAACGATTGGACAATTTCTTGGAAACAGTTGGGAATAGCA
TACAGGGATGACATACAATCTGTTGGGTCCGGTCCAGGTATAGGCTGCGAAGGTAACGTT
TGAGCTGTACCGAACACGGCCATGAATGCAACTGGAAGAAGGAAGAAAAACTTGTTGATC
GTCCACATTTTTTATTAAAGAAATTGTAATAAGTTATTGATGTTTTAATCTTTGATATCC

QA 3 542 3 542
DS 



AS 1 4

CO CL3069Contig1 700 4 1 U
GGAAGAGATATCCCCCAATTGTGATCGAATTAGGGTTTTCAGGAGCACAAAAACAATGTC
GACCGGGAAACCTAAGCAAGGCGACACGAGATTGGTGGTTGCTGCCACGACGGCGTCGGT
ATTAATGGAGGCAAAGAAAGCTGAAAACGGAGGATCGACATCTATCGTGGAGTATAAACC
TCCGGTGATGCTGGAAGACGAAGAAGATCTAGAGGTAAAGCTTAGAAGAATCCTCGAGAA
CGTCCCGGTTCGCGTTAGCAACACCTCTGGTAGATCCGCTGGTTCTGGATCCGGTGATTT
CCACCAGTACCGGCAAATGAGGCGAAGAGAGCAAGACCGTCTGACAAGAATGGATATTGA
CTACAACAAGCGTTTGAAAATGGCGGAATTTACTATAAGAAGAGAAGAGAAACTGAAAGC
TGCAGAGGAAAAAACATCAAAGAAGCGTTTGAAACGTCAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGCA
AGAGAAGAAGAGAAAACCGAACACTGAAGAACAAGGAGAGCAACCTAGAAAAGAAGTATC
ATCTGATGACGAAGCAGATGAAGAAGAGTCTGTTGTAGAAGCTCGTCCACGTCCGATATT
TAACATATCGAGGTTCAAAGAGAAGTGTCCATAATCTTTTGTTGTGACATGTTACTATGT
ATCCCAAAACTGTCGTTGCCAGATGCGTTTCTTTCTTTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4C580TF U 102
AF RR4BW26TF U 1
AF RR4C580JQ C 1
AF RR4BW26JQ C 80
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DS 

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TCCGGTGATGCTGGAAGACGAAGAAGATCTAGAGGTAAAGCTTAGAAGAATCCTCGAGAA
CGTCCCGGTTCGCGTTAGCAACACCTCTGGTAGATCCGCTGGTTCTGGATCCGGTGATTT
CCACCAGTACCGGCAAATGAGGCGAAGAGAGCAAGACCGTCTGACAAGAATGGATATTGA
CTACAACAAGCGTTTGAAAATGGCGGAATTTACTATAAGAAGAGAAGAGAAACTGAAAGC
TGCAGAGGAAAAAACATCAAAGAAGCGTTTGAAACGTCAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGCA
AGAGAAGAAGAGAAAACCGAACACTGAAGAACAAGGAGAGCAACCTAGAAAAGAAGTATC
ATCTGATGACGAAGCAGATGAAGAAGAGTCTGTTGTAGAAGCTCGTCCACGTCCGATATT
TAACATATCGAGGTTCAAAGAGAAGTGTCCATAATCTTTTGTTGTGACATGTTACTATGT
ATCCCAAAACTGTCGTTGCCAGATGCGTTTCTTTCTTTTC

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GAGAAGTGTCCATAATCTTTTGTTGTGACATGTTACTATGTATCCCAAAACTGTCGTTGC
CAGATGCGTTTCTTTCTTTTC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 4

CO CL3070Contig1 992 4 14 U
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TGGGTCCATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTCACTGGTGAGTTCCCTGGAGATTACG
GATGGGACACCGCTGGTCTCTCAGCCGACCCTGAGACTTTTGCTAGGAACCGTGAGCTAG
AAGTTATCCACTGCAGATGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCT
TGGCTCGTAATGGTGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTTTGGTTCAAGGCAGGTTCACAGATCT
TCAGCGAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATCT
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TGGGACTCGCTACCGATCCAGAAGCTTTCGCAGAGTTGAAGGTGAAAGAGATCAAGAACG
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AGTTTGTGTTGTGATGTTTCCCTAAGTAAATTTGTGAAATTTCCATTGTCGTACCATTGT
ATTATTTATCAGAAATCGAACCTCTTTTTCTC


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EE41TF U 1
AF RR4CV95TF U 1
AF RR4CV95JQ C 186
AF RR4EE41JQ C 422
BS 1 42 RR4CV95TF
BS 43 43 RR4EE41TF
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RD RR4EE41TF 556 0 0
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TAGCTATTTGGGC
TAC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4CV95TF 696 0 0
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AGAAGCTCTCACCGGGAGCCTCCGAAGTCTTTGGAACCGGTCGTGTCACCATGCGTAAAA
CCGTCAAACCCACCGGTCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACT
TGGGTCCATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTCACTGGTGAGTTCCCTGGAGATTACG
GATGGGACACCGCTGGTCTCTCAGCCGACCCTGAGACTTTTGCTAGGAACCGTGAGCTAG
AAGTTATCCACTGCAGATGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCT
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TCAGCGAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATCT
TAGCCATTTGGGCCACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTGGCTG
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TGGGACTCGCTACCGATCCAGA*GCTTTCGCAGAGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4CV95JQ 807 0 0
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CCATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTCACTGGTGAGTTCCCTGGAGATTACGGATGG
GACACCGCTGGTCTCTCAGCCGACCCTGAGACTTTTGCTAGGAACCGTGAGCTAGAAGTT
ATCCACTGCAGATGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCTTGGCT
CGTAATGGTGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGC
GAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATTTTAGCC
ATTTGGGCCACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTGGCTGGAGAA
GGACCATTGGGAGAAGCGGAGGATTTGCTTTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCGTTGGGA
CTCGCTACCGATCCAGAAGCTTTCGCAGAGTTGAAGGTGAAAGAGATCAAGAACGGAAGG
TTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTGCAGGCCATTGTCACCGGAAAGGGACCG
TTGGAGAATCTCGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTCAACAACAATGCATGGGCTTTCGCC
ACCAACTTCGTCCCCGGAAAATGAGCTAGTTATGTGAGTGAGAGCAGAGAAAGAGAGTTT
GTGTTGTGATGTTTCCCTAAGTAAATTTGTGAAATTTCCATTGTCGTACCATTGTATTAT
TTATCAGAAATCGAACCTCTTTTTCTC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4EE41JQ 571 0 0
GGCCCGTAACGGA
GTGAAGTTCGGAGAAGCGGTTTGGTTCAAGGCAGGTTCACAGATCTTCAGCGAAGGAGGG
CTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATCTTAGCTATTTGGGCT
ACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAGGGTTACAGAGTCGCTGGAGAAGGACCATTG
GGAGAAGCGGAGGATTTGCTTTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCGTTGGGTCTAGCTACC
GATCCAGAAGCTTTCGCAGAGTTGAAGGTGAAAGAGATCAAGAACGGAAGGTTGGCTATG
TTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTGCAGGCCATTGTCACAGGAAAGGGACCGTTGGAGAAT
CTTGCTGACCATTTGGCTGATCCTGTCAACAACAATGCATGGGCCTTCGCCACCAACTTC
GTCCCTGGAAAGTGAGCTAGTTATGTGAGTGAGAGCAGAGAAAGAGAGTTTGTGTTGTGA
TGTTTCCCTAAGTAAATTTGTGAAATTTCCATTGTCGTACCATTGTATTATTTATCAGAA
ATCGAACCTCTTTTTCTC

QA 14 571 14 571
DS 



AS 1 2

CO CL3071Contig1 1063 2 10 U
GGCTTTTAACTTGCATCAGCTTTAATTTTATTTAAGTCAATGAATGCACAAATACAACGA
GTGATATTCAAATGTTTTTTTTTCCTTGCTTTCTGTATCATACACATTATTATAAATTAT
AATCCTAAACCATCCCGGTTCTTAACATTTTAAATGCAATGGTTTATCTCTTCCCCCGGT
TATTGAAACTAAAAGAGAGCTTCACTTGCCAGTGTAAAGAGGCTTACGCTTCTCAGCAAA
CGCAGATAATCCTTCCAGACGATCTTGAGTGTTAAGAAGCTTCTGATAACACATCTCCTC
TAGCTCCAAACCTGAAGCCATATTCGTCTCTATTCCTTCATCTATCGCTCTCTTCGCCAT
CTTTATCGCCACTGGACCTTTTTCATTTATCTGCTGAGCCACTTCCATTGCTTTCATATG
AGCCTCGCCCGCCGTAACACAAAAGTTCACTAGCCCTTTAGTTGCAGCTTCTTTTGCATC
AATCTTTCGACCTGTGAATATAAGTTCCTTCGAAACCGATCTCCCAACCAGCCTTGAGAG
CCTCTGTGTTCCACCAGCACCAGGGATTACAGCGAGTCCTGTTTCAGGCAAACCAAATAC
TGCATTTTCACCAGAGATTCGAAGATCACAGGATAAAGCCATTTCGAGTCCACATCCTAG
TGCCACACCTTCTATTGCAGCAATAGTTGGGATACTCAATGCCTCTATGAAAGAGAACAT
GTAGCGCAACGAGTTGACATATGTGTGAACCTCAGATGGAGTCATCGTTCTACGTTCCTT
GAGATCTGCACCTGCACAGAAAACTCCAGGAACCAGACTTGTAATCATGACAACTCTAGC
GGAACTATCTTGCTGTATGGTCTCAAATGTGTTCTGGAGACTTTTTAGCATCTCCTTATT
AATAGCATTTTTGGCCACAGGCCTGTCTAGGTTGACCTCGACGATCCCAGAATCGGAACC
AGAGAGACGGTTAAGCTTGACAGATTCAGGGGGAGCGGTTTCAATGATGAGAGTCCGGCA
GGTCTGAAGCATGCACCTTCGGCTAATAGATCGTTTCCCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C274JQ U 1
AF RR4AT56TF C 382
BS 1 510 RR4C274JQ
BS 511 511 RR4AT56TF
BS 512 513 RR4C274JQ
BS 514 514 RR4AT56TF
BS 515 609 RR4C274JQ
BS 610 610 RR4AT56TF
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BS 655 708 RR4C274JQ
BS 709 1063 RR4AT56TF

RD RR4C274JQ 708 0 0
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GTGATATTCAAATGTTTTTTTTTCCTTGCTTTCTGTATCATACACATTATTATAAATTAT
AATCCTAAACCATCCCGGTTCTTAACATTTTAAATGCAATGGTTTATCTCTTCCCCCGGT
TATTGAAACTAAAAGAGAGCTTCACTTGCCAGTGTAAAGAGGCTTACGCTTCTCAGCAAA
CGCAGATAATCCTTCCAGACGATCTTGAGTGTTAAGAAGCTTCTGATAACACATCTCCTC
TAGCTCCAAACCTGAAGCCATATTCGTCTCTATTCCTTCATCTATCGCTCTCTTCGCCAT
CTTTATCGCCACTGGACCTTTTTCATTTATCTGCTGAGCCACTTCCATTGCTTTCATATG
AGCCTCGCCCGCCGTAACACAAAAGTTCACTAGCCCTTTAGTTGCAGCTTCTTTTGCATC
AATCTTTCGACCTGTGAATATAAGTTCCTTTGATACCGATCTCCCAACCAGCCTTGAGAG
CCTCTGTGTTCCACCAGCACCAGGGATTACAGCGAGTCCTGTTTCAGGCAAACCAAATAC
TGCATTTTCGCCAGAGATTCGAAGATCACAGGATAAAGCCATTTCGAGTCCACCTCCTAG
TGCCACACCTTCTATTGCAGCAATAGTTGGGATACTCAATGCCTCTAT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4AT56TF 682 0 0
CTCG
TTTATCTGCTTAGCCACTTCCATTGCTTTCATATGAGCCTCGCCCGCCGTAACACAAAAG
TTCACTAGCCCTTTCTTTGCAGCTTCTTTTGCATCAATCTTTCGACCTGTGAATATAAGT
TCCTTCGAAACCGATCTCCCAACCAGCCTTGAGAGCCTTTGTGTTCCACCAGCACCAGGG
ATTACAGCGAGTCCTGTTTCAGGCAAACCAAATACTGCATTTTCACCAGAGATTCGAAGA
TCACAGGATAAAGCCATTTCGAGTCCACATCCTAGTGCCACACCTTCTATTGCAGCAATA
GTTGGGATACTCAATGCCTCTATGAAAGAGAACATGTAGCGCAACGAGTTGACATATGTG
TGAACCTCAGATGGAGTCATCGTTCTACGTTCCTTGAGATCTGCACCTGCACAGAAAACT
CCAGGAACCAGACTTGTAATCATGACAACTCTAGCGGAACTATCTTGCTGTATGGTCTCA
AATGTGTTCTGGAGACTTTTTAGCATCTCCTTATTAATAGCATTTTTGGCCACAGGCCTG
TCTAGGTTGACCTCGACGATCCCAGAATCGGAACCAGAGAGACGGTTAAGCTTGACAGAT
TCAGGGGGAGCGGTTTCAATGATGAGAGTCCGGCAGGTCTGAAGCATGCACCTTCGGCTA
ATAGATCGTTTCCCGGCC

QA 5 682 5 682
DS 



AS 1 4

CO CL3072Contig1 705 4 6 U
GGGTTTCTGTGGAAGGAAGAAAGAAAAAGATGGAGGAGAAGAAGAAGCAAAAAACAGAGA
TTTCGTCAACGGAAGCTGTTCTTCTCGGAGCTCTAGCTCCAGGCGTCAATGCTCCAACAT
GGAACACTCTGAGGTTCGCGTTTCTTCTGCTGGGTCTCTGTCTCACTTTCATGCTCTCCA
TAGCTTTCACCAGCGGCCAATCCATGTTACTTGTTCACGTTGGCTTCCTCATTCTAATCG
CATCTTCTCTCTTTGTCCTCCTCAATTGGTTTCTTGCTCAGACAGGGTTAGTACCAGTTG
AGACACAGATGCAGGAGTTGAACTTGGCACCTACCACTGATAAAAGCAATTGATCAAGGA
CGGCGCTATGTTTTTAGTTGCTCAGGCGTAGTTGACACAAAGTAACAGTTCAATCAATAC
CAAGGATTGGATTTTTGGTGCAACCAGAAAAATCCAGTTTCTGTTGAAAGTATACAATCA
GCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTCTTGTTTTATTTTCTTTCTTTGTCTTAATGGAGGA
TGCAGAAGAAGCACGAACAGCAAGGGTTTGGTTTGCTCAATTCTCCAACATTACCTCCTT
TTCTTTGTTTTTGTAATTCCCATACTAAGTTTGTAAGAAGGTGATTATTATTTACAATGG
ATTCAAGGGTAATCTAACTCTAATTCATCCCTCAGTTAAGAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4DF89TF U 48
AF RR4DS15JQ C 1
AF RR4DF89JQ C 161
AF RR4DS15TF U 1
BS 1 47 RR4DS15TF
BS 48 635 RR4DF89TF
BS 636 640 RR4DS15TF
BS 641 641 RR4DS15JQ
BS 642 702 RR4DS15TF
BS 703 705 RR4DS15JQ

RD RR4DF89TF 588 0 0
CAAAAAACAGAGATTTCGTCAACGGAAGCTGTTCTTCTCGGAGCTCTAGCTCCAGGCGTC
AATGCTCCAACATGGAACACTCTGAGGTTCGCGTTTCTTCTGCTGGGTCTCTGTCTCACT
TTCATGCTCTCCATAGCTTTCACCAGCGGCCAATCCATGTTACTTGTTCACGTTGGCTTC
CTCATTCTAATCGCATCTTCTCTCTTTGTCCTCCTCAATTGGTTTCTTGCTCAGACAGGG
TTAGTACCAGTTGAGACACAGATGCAGGAGTTGAACTTGGCACCTACCACTGATAAAAGC
AATTGATCAAGGACGGCGCTATGTTTTTAGTTGCTCAGGCGTAGTTGACACAAAGTAACA
GTTCAATCAATACCAAGGATTGGATTTTTGGTGCAACCAGAAAAATCCAGTTTCTGTTGA
AAGTATACAATCAGCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTCTTGTTTTATTTTCTTTCTTTG
TCTTAATGGAGGATGCAGAAGAAGCACGAACAGCAAGGGTTTGGTTTGCTCAATTCTCCA
ACATTACCTCCTTTTCTTTGTTTTTGTAATTCCCATACTAAGTTTGTA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4DS15JQ 705 0 0
GGGTTTCTGTGGAAGGAAGAAAGAAAAAGATGGAGGAGAAGAAGAAGCAAAAAACAGAGA
TTTCGTCAACGGAAGCTGTTCTTCTCGGAGCTCTAGCTCCAGGCGTCAATGCTCCAACAT
GGAACACTCTGAGGTTCGCGTTTCTTCTGCTGGGTCTCTGTCTCACTTTCATGCTCTCCA
TAGCTTTCACCAGCGGCCAATCCATGTTACTTGTTCACGTTGGCTTCCTCATTCTAATCG
CATCTTCTCTCTTTGTCCTCCTCAATTGGTTTCTTGCTCAGACAGGGTTAGTACCAGTTG
AGACACAGATGCAGGAGTTGAACTTGGCACCTACCACTGATAAAAGCAATTGATCAAGGA
CGGCGCTATGTTTTTAGTTGCTCAGGCGTAGTTGACACAAAGTAACAGTTCAATCAATAC
CAAGGATTGGATTTTTGGTGCAACCAGAAAAATCCAGTTTCTGTTGAAAGTATACAATCA
GCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTCTTGTTTTATTTTCTTTCTTTGTCTTAATGGAGGA
TGCAGAAGAAGCACGAACAGCAAGGGTTTGGTTTGCTCAATTCTCCAACATTACCTCCTT
TTCTTTGTTTTTGTAATTCCCATACTAAGTTTGTAAGAAGGTGATTATTATTTACAATGG
ATTCAAGGGTAATCTAACTCTAATTCATCCCTCAGTTAAGAAACC

QA 1 705 1 705
DS 

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TGGCTTCCTCATTCTAATCGCATCTTCTCTCTTTGTCCTCCTCAATTGGTTTCTTGCTCA
GACAGGGTTAGTACCAGTTGAGACACAGATGCAGGAGTTGAACTTGGCACCTACCACTGA
TAAAAGCAATTGATCAAGGACGGCGCTATGTTTTTAGTTGCTCAGGCGTAGTTGACACAA
AGTAACAGTTCAATCAATACCAAGGATTGGATTTTTGGTGCAACCAGAAAAATCCAGTTT
CTGTTGAAAGTATACAATCAGCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTCTTGTTTTATTTTCT
TTCTTTGTCTTAATGGAGGATGCAGAAGAAGCACGAACAGCAAGGGTTTGGTTTGCTCAA
TTCTCCAACATTACCTCCTTTTCTTTGTTTTTGTAATTCCCATACTAAGTTTGTAAGAAG
GTGATTATTATTTACAATGGATTCAAGGGTAATCTAACTCTAATTCATCCC
CC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4DS15TF 704 0 0
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TTTCGTCAACGGAAGCTGTTCTTCTCGGAGCTCTAGCTCCAGGCGTCAATGCTCCAACAT
GGAACACTCTGAGGTTCGCGTTTCTTCTGCTGGGTCTCTGTCTCACTTTCATGCTCTCCA
TAGCTTTCACCAGCGGCCAATCCATGTTACTTGTTCACGTTGGCTTCCTCATTCTAATCG
CATCTTCTCTCTTTGTCCTCCTCAATTGGTTTCTTGCTCAGACAGGGTTAGTACCAGTTG
AGACACAGATGCAGGAGTTGAACTTGGCACCTACCACTGATAAAAGCAATTGATCAAGGA
CGGCGCTATGTTTTTAGTTGCTCAGGCGTAGTTGACACAAAGTAACAGTTCAATCAATAC
CAAGGATTGGATTTTTGGTGCAACCAGAAAAATCCAGTTTCTGTTGAAAGTATACAATCA
GCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTCTTGTTTTATTTTCTTTCTTTGTCTTAATGGAGGA
TGCAGAAGAAGCACGAACAGCAAGGGTTTGGTTTGCTCAATTCTCCAACATTACCTCCTT
TTCTTTGTTTTTGTAATTCCCATACTAAGTTTGTAAGAAG*TGATTATTATTTACAATGG
ATTCAAGGGTAATCTAACTCTAATTCATCCCTCAGTTAAGAA
CC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 4

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AACTTCATGTTCTTGAGCTCTGCACTCCCCCTGAGAAAGGGGATCAGAAGTTAATTTCGA
TGACTGCGCAGCAAATATGCATAGAGAATCTCGTTCCATGTATCAGGAACTCCAGGCAAG
CACCAGTGGATGCAATCTCCATAGTTTTTAGGATCAGCTCTCTGTGCCTTTGTCAAAAGC
TTCCCTCTCCGTTCTCCATACACAGTCGTGTGTCCGTCTTTCCGGTATTCTGATAGCTGA
GTGATGTTCAGGAGCGTTGCTTTGTCTCCAACTCTGCTTAGAACATCACCAACTATCTTC
ATGATGTCTTGGTTTGATCCTGTGCCCCAGTATGATGGTTTGTCTATTGGATATAACTCG
TTATAACAGGTTCCTTCGCTCCCTGGATTCCACTCCCAGCTCCATAGGTGAGTTGGGGAC
ATGCTTGTGAAGAAAACTCTTTGCTTCACTGAATTGATCTTCGTCTCTAACCACTTGGCC
CATGTTTCCAACGCTATTCTATAAGCATTCGTCACATTATACTCTTGGACTTTACTAGTA
TCTCCCCACGTTGCATTGATCTTAGGTTGATGCATCCACCAAACATAACTCTCAAAGACT
AGAACATCAACACCTTCCCAGCTCTTGCTATGTTTCTCATGGCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E220JQ U 1
AF RR4E331JQ U 1
BS 1 697 RR4E220JQ
BS 698 765 RR4E331JQ

RD RR4E220JQ 697 0 0
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QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4E331JQ 765 0 0
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AACTTCATGTTCTTGAGCTCTGCACTCCCCCTGAGAAAGGGGATCAGAAGTTAATTTCGA
TGACTGCGCAGCAAATATGCATAGAGAATCTCGTTCCATGTATCAGGAACTCCAGGCAAG
CACCAGTGGATGCAATCTCCATAGTTTTTAGGATCAGCTCTCTGTGCCTTTGTCAAAAGC
TTCCCTCTCCGTTCTCCATACACAGTCGTGTGTCCGTCTTTCCGGTATTCTGATAGCTGA
GTGATGTTCAGGAGCGTTGCTTTGTCTCCAACTCTGCTTAGAACATCACCAACTATCTTC
ATGATGTCTTGGTTTGATCCTGTGCCCCAGTATGATGGTTTGTCTATTGGATATAACTCG
TTATAACAGGTTCCTTCGCTCCCTGGATTCCACTCCCAGCTCCATAGGTGAGTTGGGGAC
ATGCTTGTGAAGAAAACTCTTTGCTTCACTGAATTGATCTTCGTCTCTAACCACTTGGCC
CATGTTTCCAACGCTATTCTATAAGCATTCGTCACATTATACTCTTGGACTTTACTAGTA
TCTCCCCACGTTGCATTGATCTTAGGTTGATGCATCCACCAAACATAACTCTCAAAGACT
AGAACATCAACACCTTCCCAGCTCTTGCTATGTTTCTCATGGCAT

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL3073Contig2 807 2 1 U
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GGGTTTGGGACAATGTCTCGTACCCTCTTTACACCGAGAAGAGCTGTCCTTATTTGGTCT
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GTATGGTACAATCTGTAATACCTGACAACAAGAAGTCTTTCCACAGGGTTCCTCCTATGA
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TGGAATCGATTTCAGATCATGCAACTAATCATACAGTACACAAAAGTTGGTTAACCTTGA
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TGTTTGGTGGATGCATCAACCTAAGATCAATGCAACGTGGGGAGATACTAGTAAAGTCAA
GAGTATAATGTGACGATGCTTATAGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E331TF U 1
AF RR4E220TF U 1
BS 1 807 RR4E220TF

RD RR4E331TF 686 0 0
GGATTTGAGTCTGTTTCCAAATGTCAAAACAAACATCTGCAGATTCGCGGATGATTCAGT
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ATGAACTCAAGAGCAACAAGAGCCGGATATTCAACCTCTATGGCTTCAGACAGAAACCAT
CAGTGTTTGTCACCAAAGAGGATCAGCTTGATGAGAGCTGCAACGTCTTCGAAGGACAAT
GGGTTTGGGACAATGTCTCGTACCCTCTTTACACCGAGAAGAGCTGTCCTTATTTGGTCT
AACAAACAACATGTCAACGGAACGGACGACCTGATTCTTCTTACCAGAACTGGAGATGGC
AACCTAGCTTATGTGACTTGCCCAGGTTCGATGCTTTGAAACTGTTGGACGTGTTGAGAG
ACAAAAGACTGATGTTCGTAGGAGACTCAGTGCAGAGAAGCACGTTCGAGTCGATGATCT
GTATGGTACAATCTGTAATACCTGACAACAAGAAGTCTTTCCACAGGGTTCCTCCTATGA
AGATCTTCAGAGCTGAG*AATACAATGTGTCTATTGAGTATTACTGGGCACCTTTCATTG
TGGAATCGATTTCAGATCATGCAACTAATCATACAGTACACAAAAGTTGGTTAACCTTGA
TGCCATTGAGAA
CATAGCAGAGCTGG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4E220TF 807 0 0
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ATGAACTCAAGAGCAACAAGAGCCGGATATTCAACCTCTATGGCTTCAGACAGAAACCAT
CAGTGTTTGTCACCAAAGAGGATCAGCTTGATGAGAGCTGCAACGTCTTCGAAGGACAAT
GGGTTTGGGACAATGTCTCGTACCCTCTTTACACCGAGAAGAGCTGTCCTTATTTGGTCT
AACAAACAACATGTCAACGGAACGGACGACCTGATTCTTCTTACCAGAACTGGAGATGGC
AACCTAGCTTATGTGACTTGCCCAGGTTCGATGCTTTGAAACTGTTGGACGTGTTGAGAG
ACAAAAGACTGATGTTCGTAGGAGACTCAGTGCAGAGAAGCACGTTCGAGTCGATGATCT
GTATGGTACAATCTGTAATACCTGACAACAAGAAGTCTTTCCACAGGGTTCCTCCTATGA
AGATCTTCAGAGCTGAGGAATACAATGTGTCTATTGAGTATTACTGGGCACCTTTCATTG
TGGAATCGATTTCAGATCATGCAACTAATCATACAGTACACAAAAGTTGGTTAACCTTGA
TGCCATTGAGAAACATAGCAAGAGCTGGGAAGGTGTTGATGTTCTAGTCTTTGAGAGTTA
TGTTTGGTGGATGCATCAACCTAAGATCAATGCAACGTGGGGAGATACTAGTAAAGTCAA
GAGTATAATGTGACGATGCTTATAGAA

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 4

CO CL3074Contig1 1109 4 9 U
CTCACATAAGCTCTTTGGAAGAAAAAATTGTTGGGTAAGTACGTACACATGAAAACCATA
AGGTTCTATTTTATCAAATGCAAACAAACCATATACTATACAAATTAGTTCCAAACTTAT
GTAATATATGGCCTTTAAAAACACAAACCACGAGAAGGGGGCTAAATTGAGTAGATTCGG
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AGAGAGAGAGAGGAGAGAGATTTTATCCGAAGAGTCAACATCCATTTCTATGTTTTGTTA
CATAGAAAATCACAGTTGAAGCAGAGGCAGCGCCATTACAACCCCGAAAACCGACACTAG
CAACAGTATAATCCACGCTGGCAATCCCTGCTTCTTGTTCTTCCTCCTCTCCTTCAATCC
ACCATCTGAGTCCTCCTTTGTTGTGTCGACTATTTTCTCTGACTCCGCTTTGGCATTGCT
CTCTTGAGGAGACTCTGGTGCCGCCTGCTGCGTTTGCTCGGCTAGTTGCTGCTGGTTGTA
CTTCTCTACGTACTCTGGGAATAGCTTTCTGAATGCTGGGGTTTTACAATTGAAAGCGAG
CGATGACTTAGCCAGCCGCTGTTTCTCAGCTACAGTTGTGTTCACACTTCCAGTTGTCGG
ACTAGTATCCACCATAAATGAGAGGAGCCCTGTAAGTATGCTTGACACAGACCACATTGG
ATTCCAGCTTTCTGGATGAAAATCACTCATAGACAAACAGATCTTCTTTTGTGTAATGAA
TCGACCATTTGGTGTAGTCATTGTAATTCCAGGTGGCTTGTAAGGATACTCGGGAGGGAA
ATTGATCTTTCCATAGTAAAATCCACCAGCAAAAGGTGTTCCATCACTTCCTTCCAGCAC
ATAATGCCACTCGAGAATGTCATTTGGGGAAGGACGAGCAACAACATGGGAGACTGGTTC
CTTGCAAAGTGCTCTATATTCCTTTTGAAGACGTTTTATACAAGCCTTTTCTGCCATCTA
GTTATGGAGTGTAAGAGAACAACTGCAGCTGCTTGATCGAATTTTGTCGAGGAGGATTCG
CTGTCTCGTTGATTTCACTTTCTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H555JQB U 1
AF RR4ED56JQ U 45
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AF RR4H555TF C 1008
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AGAG********GAGAGAGATTTTATCCGAAGAGTCAACATCCATTTCTATGTTTTGTTA
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DS 

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DS 

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CTTTTGAAGACGTTTTATACAAGCCTTTTCTGCCATCTAGTTATGGAGTGTAAGAGGACA
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CTCTTTCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4H555TF 102 0 0
TTTT
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GAGGATTCGCTGTCTCGTTGATTTCACTTTCTCTTTCC

QA 5 102 5 102
DS 



AS 1 4

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CCCCCCGGCAAGTCAGTTATCTCTTTGTCCCATTATCTATATCTCAGACACTCTTTCGGT
CGTCATATTTCTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGCGTAAATGGGTATTTTTCCTGAGTTTG
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CTGTGAGAGAGAAAAAAACTCACGATGAGAGAGATGAGACGAAGAAGCAATTAAAACTGT
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CAGACCATAATATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGATTTTACATTAGGATTGCCAC
CTCAAGCAGCTTACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCA
ATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGA
ATAGGCCGGTCCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCTGGAA
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AAATGAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTTAAGGTTAACTATAGAGTGGAGCCAA
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GAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCAGAATTTTA
GGCCTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTG
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CGCCTAGCGCAGGGGTGAAAGTGATGAACAAATTTTCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF57TF U 9
AF RR4EF49TF U 1
AF RR4FF57JQ C 634
AF RR4EF49JQ C 505
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BS 500 500 RR4FF57TF
BS 501 668 RR4EF49TF
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RD RR4FF57TF 545 0 0
GG
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AGTCAGTTATCTCTTTGTCCCATTATCTATATCTCAGACACTCTTTCGGTCGTCATATTT
CTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAATGGGTATTTTTCCTGAGTTTGGTGGCTGGAT
CAGTCAGAACACTCAACAGCATAAAAAATCTGAAAATGTTAA*TCCAAGCCTGTGAGAGA
GAAAAAAACTCACGATGAGAGAGATGAGACGAAGGAGCAATTAAAGCTGTGGAGAGATGC
AAATAAGAAGGAACAGTATAATGAACCTTCTCCCACGGTGAAGGTGCATACAGACCATAA
TATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGATTTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGC
TTACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCAATGGCCGCCC
ACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCCGGT
CCT

QA 3 545 3 545
DS 

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CCCCCCGGCAAGTCAGTTATCTCTTTGTCCCATTATCTATATCTCAGACACTCTTTCGGT
CGTCATATTTCTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGCGTAAATGGGTATTTTTCCTGAGTTTG
GTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCATAAAAAATCTGAAAATGTTAAATCCAAGC
CTGTGAGAGAGAAAAAAACTCACGATGAGAGAGATGAGACGAAGAAGCAATTAAAACTGT
GGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAGTATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAAGGTGCATA
CAGACCATAATATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGATTTTACATTAGGATTGCCAC
CTCAAGCAGCTTACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCA
ATGGCCGCCCACTTCTGAAGGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGA
ATAGGCCGGTCCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCTGGAA
CTATCCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGA
AAATGAGA

QA 1 668 1 668
DS 

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CAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGAAAATGAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGT
TTAAGGTTAACTATAGAGTGGAGCCAATGTTTGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACA
AGAAGCCGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGT
CCAAGGTTAAAGTGGACCAGAATTTTAGGCCTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCACTGCTGT
CTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGTGGAAGATTTTCAAA
CGCGGGCTGGCGATATCCGTCGGTTGTAACGT
TT

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DS 

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TATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCCGGTCCTGGAGGTTGAGA
AAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCTGGAACTATCCCAATACGTCTAAATGTCC
TCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGAAAATGAGAAAAGGAATGGACTACA
TGGAAACGTTTAAGGTTAACTATAGAGTGGAGCCAATGTTTGTTGATGCAGAACGCTTGT
GCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGAT
TGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCAGAATTTTAGGCCTTCTTTTCCTTGGAATCTGC
CACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGTGGAAG
ATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCGTCGGTTGTAACGTCTTCGTAAAACAACACATC
AAATAGTGTTTTAAAATCGCATTATCATAAATTCGAATAGCAGATTTTTTTTAAAATCTT
GATATTTTTCACCAATAAGTACCGGGAAAAGATTTGCGCCTAGCGCAGGGGTGAAAGTGA
TGAACAAATTTTCCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 3

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GCTCTCGTTCTTCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCCGGC
AATGGCACCACTACACCTTCGACATCGCCATCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCTTCC
ACTGGAAGCACCGGAGCTTCTTCAACGGCCAAACCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAAC
TTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTCGTGGCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGATCT
ACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTG
TTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTCTAATAATAATAATTTCCAACATGT
CTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B383JQ C 1
AF RR4B383TF U 1
AF RR4GI21TF U 572
BS 1 696 RR4B383TF
BS 697 727 RR4GI21TF

RD RR4B383JQ 697 0 0
GGACACAACTTTCGAAGGAAGACAACAAAACCGTTTTTTTGAAACATTAACTCTTTGTTT
TTGAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCGCCGTTGTTTTTGTGTTTTTCGCTGTTTCT
TCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGGTGGAGGAAAAGGAGATGCTCAC
TCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCTCCACTCGGTGACTCCT
CCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACGTGT
CTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAAAAC
GCTCTCGTTCTTCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCCGGC
AATGGCACCACTACACCTTCGACATCGCCATCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCTTCC
ACTGGAAGCACCGGAGCTTCTTCAACGGCCAAACCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAAC
TTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTCGTGGCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGATCT
ACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTG
TTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTC
T

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4B383TF 697 0 0
GGACACAACTTTCGAAGGAAGACAACAAAACCGTTTTTTTGAAACATTAACTCTTTGTTT
TTGAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCGCCGTTGTTTTTGTGTTTTTCGCTGTTTCT
TCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGGTGGAGGAAAAGGAGATGCTCAC
TCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCTCCACTCGGTGACTCCT
CCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACGTGT
CTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAAAAC
GCTCTCGTTCTTCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCCGGC
AATGGCACCACTACACCTTCGACATCGCCATCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCTTCC
ACTGGAAGCACCGGAGCTTCTTCAACGGCCAAACCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAAC
TTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTCGTGGCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGATCT
ACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTG
TTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTC
T

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4GI21TF 156 0 0
G
GGCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGATCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCAT
TGTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAA
TTTCTAATAATAATAATTTCCAACATGTCTTTACC

QA 2 156 2 156
DS 



AS 1 4

CO CL3077Contig1 1542 4 10 U
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AAGCGAAACTCAATCCAACCATTCGTTTGTATAGAATCTAAACCGGAAAACCGGTTTGAT
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ACGAACGTTACAGTACACTCCAATGTAATACTTTGCAAATTGGTATGTGTTAGCCCTGTT
GGCTCATTAAAATCTCCACAGCTACGTTTAAATCGTCATCTGCAGCAGCAAGTGCAACCT
CCACTTGTGTCCTTTCAAAGCCCATGGCAACGAGTTTCTGGATTTGTTCTTCAGAAGCAG
CAACACGACCCTGGGATTGAGGTAGGACTGCTGCATTTGCTATTGGCACCTGCCTTGTGG
TGGGGATTGGCTCTGGCATGCCAGTCACAGTTGCATCAAAAAGGCGGTCTGGAGTGTTAT
CTTCCAATAGTCTAGCATGGAGGTTTGGGTTTGTTTCTCCAGCTGGAGGGGTTAGATCAC
GGGCAGTACCGCTAAGAGTTCTACCTCTTCCCGGAAATCTACTATCCTCAGAAGATTGAT
TAGATGCTTCCCTCTGTGGCAGCCATGAAGACAAGGATCTCCACGCATTTCCTGTAGAGA
AACCACTGGATGTCGTGTTTTGTACAGAATAAGTGGGCATGTAACTGGAAGGATTTCCAC
CAGTGCACATAATGAATTTGGGTCACCTTACACAGCTAGCCATCCATGAGGCTGACTCAA
TGTTGGAGAAAAATGAAGAGCCGGGCATCAAGAAATTGAAAAGGCCATAAGAATATGCAA
ATCCAGACAAGATGCCACATAGGTGACCAAGCAGCGAAACATTTGTCATGAGAAGCTGGA
ATGCAATCAATAAGATCCATGGATATAGTTTAGCGGGCACGTTGAAGAGACCAAACACAC
TTCTAGAGGTGACTCCACTGAGACTTGTCTCTATGACAATCATTGAGAACAAGATTCCAG
AGAATCCAATCGCGCACTCATTCATGAGATGGTCATACTGATAGAAAGGGTTATATCCCG
CCAACGATGCTATAAGAAGATGCAATACGGCATTGGTCGTTGCCAGCAAAATAGTCAGGT
AAAACAAGCGGACAGATCCCATGATTCTCTCCAGCTCAGATTCCATAGGAACCAAAGCCA
TCATGTTGAACATAACATGAAGAATGGATCCGTGGAATAAAATGGCCGTGTAAAACCTAT
AAACTTGAAACCGCGATAGAATTGCAGAGGGTAAGAAGCAGACTTCGTAGAAAGTGTCGT
ATCCAGTTAAGAGGCAAATCAGGTAAATGAGCCCGCAAATCACAACCACCGAAGAGGTGA
GGAAAGGTATAGCATTCCACACTGTGAAACTCTTGTTTGAATCCCAGCCTCGGTAACAAT
GTTCGGCCTCATCTTCCAAGTCGCTACGAATTAGTCCCCTTCTCTGCTCGCTGATTGAGT
GTATTTGAATTTCGACGACGACCATGGAAGGAAGGAAAGTCC


BQ
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AF RR4H084JQ U 1
AF RR4AF95JQ U 7
AF RR4H084TF C 323
AF RR4AF95TF C 792
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TGGGGATTGGCTCTGGCATGCCAGTCACAGTTGCATCAAAAAGGCGGTCTGGAGTGTTAT
CTTCCAATAGTCTAGCATGGAGGTTTGGGTTTGTTTCTCCAGCTGGAGGGGTTAGATCAC
GGGCAGTAC

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AACTCAATCCAACCATTCGTTTGTATAGAATCTAAACCGGAAAACCGGTTTGATTATCTG
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TTAAGATCTCCACAGCTACGTTTAGATCGTCATCTGCAGCAGCAAGTGCAACCTCCACTT
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ATAGTCTAGCATGGAGGTTTGGGTTTGTTTCTCCAGCTGGAGGGGTTAGATCACGGGCAG
TACCGCTAAGAGTTCTACCTCTTCCCGGAAATCTACTATCCTCAGAAGATTGATTAGATG
CTTCCCTCTGTGGCAGCCATGAAGACAAGGATCTCCACGCATTTCCTGTAGAGAAACCAC
TGGATGTCGTGTTTTGTACAGAATAAGTGGGCATGTAACTGGAGGGATTTCCACCAGTGC
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GTTTGGGTTTGTTTCTCCAGCTGGAGGGGTTAGATCACGGGCAGTACCGCTAAGAGTTCT
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TACAGAATAAGTGGGCATGTAACTGGAAGGATTTCCACCAGTGCACATAATGAATTTGGG
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ATATAGTTTAGCGGGCACGTTGAAGAGACCAAACACACTTCT
C

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ATGCCACATAGGTGACCAAGCAGCGAAACATTTGTCATGAGAAGCTGGAATGCAATCAAT
AAGATCCATGGATATAGTTTAGCGGGCACGTTGAAGAGACCAAACACACTTCTAGAGGTG
ACTCCACTGAGACTTGTCTCTATGACAATCATTGAGAACAAGATTCCAGAGAATCCAATC
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ATAAGAAGATGCAATACGGCATTGGTCGTTGCCAGCAAAATAGTCAGGTAAAACAAGCGG
ACAGATCCCATGATTCTCTCCAGCTCAGATTCCATAGGAACCAAAGCCATCATGTTGAAC
ATAACATGAAGAATGGATCCGTGGAATAAAATGGCCGTGTAAAACCTATAAACTTGAAAC
CGCGATAGAATTGCAGAGGGTAAGAAGCAGACTTCGTAGAAAGTGTCGTATCCAGTTAAG
AGGCAAATCAGGTAAATGAGCCCGCAAATCACAACCACCGAAGAGGTGAGGAAAGGTATA
GCATTCCACACTGTGAAACTCTTGTTTGAATCCCAGCCTCGGTAACAATGTTCGGCCTCA
TCTTCCAAGTCGCTACGAATTAGTCCCCTTCTCTGCTCGCTGATTGAGTGTATTTGAATT
TCGACGACGACCATGGAAGGAAGGAAAGTCC

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DS 



AS 1 4

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TCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGA
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BQ
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AF RR4DX95JQ U 5
AF RR4DV28TF C 1
AF RR4DV28JQ U 5
AF RR4DX95TF C 5
BS 1 4 RR4DV28TF
BS 5 701 RR4DV28JQ

RD RR4DX95JQ 577 0 0
CGAAGAACTCAAAAATTGAAACCAAATGTAAAAAAGTATTCCATCCCAATGTAATTCTGA
AACATAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGAGAAATAACCAAACATAACGTTGATCAC
CGGTAACGACGGAGAGATAGCGAGTTGTTCTTCTTCCACGTAGCCCTGCGGGAAGGTCTG
TTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTG
AGCCCTCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCTGGGATCA
TTTCGAACGGCATTGTGTGCAGGGTCAACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGTAGAG
TCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGACGACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGCACGT
TCCTCAGCAACAGATCTCTTACTACGCTGGAATTTGAGCTGTGTCACTCCCTGGTTTGTG
GGTTTACCATAGACAATACCCTTAGGCACAGGACTCTTACGCCCTCCACGTCTCACACGC
ACCCGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4DV28TF 701 0 0
TTTTCGAAGAACTCAAAAATTGAAACCAAATGTAAAAAAGTATTCCATCCCAATGTAATT
CTGAAACATAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGAGAAATAACCAAACATAACGTTGA
TCACCGGTAACGACGGAGAGATAGCGAGTTGTTCTTCTTCCACGTAGCCCTGCGGGAAGG
TCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGA
GGTGAGCCCTCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCTGGG
ATCATTTCGAACGGCATTGTGTGCAGGGTCAACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGT
AGAGTCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGACGACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGC
ACGTTCCTCAGCAACAGATCTCTTACTACGCTGGAATTTGAGCTGTGTCACTCCCTGGTT
TGTGGGTTTACCATAGACAATACCCTTAGGCACAGGACTCTTACGCCCTCCACGTCTCAC
ACGCACCCGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCCGAGACGACGAGCTTTGTC
TGGACGGGTGGGACGAACAAGACGAACAATGGAAGGCTGCTGGCGATACTCCCAGCACCT
AACCCTCTGCACAAACCCCATCACATCCGACTGCTTCTTCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4DV28JQ 697 0 0
CGAAGAACTCAAAAATTGAAACCAAATGTAAAAAAGTATTCCATCCCAATGTAATTCTGA
AACATAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGAGAAATAACCAAACATAACGTTGATCAC
CGGTAACGACGGAGAGATAGCGAGTTGTTCTTCTTCCACGTAGCCCTGCGGGAAGGTCTG
TTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTG
AGCCCTCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCTGGGATCA
TTTCGAACGGCATTGTGTGCAGGGTCAACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGTAGAG
TCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGACGACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGCACGT
TCCTCAGCAACAGATCTCTTACTACGCTGGAATTTGAGCTGTGTCACTCCCTGGTTTGTG
GGTTTACCATAGACAATACCCTTAGGCACAGGACTCTTACGCCCTCCACGTCTCACACGC
ACCCGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCCGAGACGACGAGCTTTGTCTGGA
CGGGTGGGACGAACAAGACGAACAATGGAAGGCTGCTGGCGATACTCCCAGCACCTAACC
CTCTGCACAAACCCCATCACATCCGACTGCTTCTTCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DX95TF 697 0 0
CGAAGAACTCAAAAATTGAAACCAAATGTAAAAAAGTATTCCATCCCAATGTAATTCTGA
AACATAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGAGAAATAACCAAACATAACGTTGATCAC
CGGTAACGACGGAGAGATAGCGAGTTGTTCTTCTTCCACGTAGCCCTGCGGGAAGGTCTG
TTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTG
AGCCCTCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCTGGGATCA
TTTCGAACGGCATTGTGTGCAGGGTCAACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGTAGAG
TCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGACGACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGCACGT
TCCTCAGCAACAGATCTCTTACTACGCTGGAATTTGAGCTGTGTCACTCCCTGGTTTGTG
GGTTTACCATAGACAATACCCTTAGGCACAGGACTCTTACGCCCTCCACGTCTCACACGC
ACCCGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCCGAGACGACGAGCTTTGTCTGGA
CGGGTGGGACGAACAAGACGAACAATGGAAGGCTGCTGGCGATACTCCCAGCACCTAACC
CTCTGCACAAACCCCATCACATCCGACTGCTTCTTCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL3079Contig1 520 4 4 U
GGGGCTCAACCAACGCGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGAGCTTGTGTTGACGTTCTG
GGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGTGTTGTCCAGTGTTA
CAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCATAAGACTTAAGCTT
CTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAGGCTCTCATCACTTGTGGAATCAAC
CCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAAACAACGTACGATCTATCA
AGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTTCTTTTTGTTGAAGA
TCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTTTTGTCCCTT*GTCG
TTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAATC
TGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4CP81JQ C 1
AF RR4CP81TF U 363
AF RR4CY12JQ C 1
AF RR4CY12TF U 1
BS 1 362 RR4CY12TF
BS 363 415 RR4CP81TF
BS 416 416 RR4CY12TF
BS 417 520 RR4CP81TF

RD RR4CP81JQ 520 0 0
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GGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGTGTTGTCCAGTGTTA
CAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCATAAGACTTAAGCTT
CTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAGGCTCTCATCACTTGTGGAATCAAC
CCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAAACAACGTACGATCTATCA
AGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTTCTTTTTGTTGAAGA
TCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTTTTGTCCCTT*GTCG
TTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAATC
TGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTAG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4CP81TF 158 0 0
AGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTTTTGTCCCTTTGTCGTT
GTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAATCTG
TCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTAG

QA 1 158 1 158
DS 

RD RR4CY12JQ 520 0 0
GGGGCTCAACCAACGCGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGAGCTTGTGTTGACGTTCTG
GGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGTGTTGTCCAGTGTTA
CAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCATAAGACTTAAGCTT
CTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAGGCTCTCATCACTTGTGGAATCAAC
CCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAAACAACGTACGATCTATCA
AGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTTCTTTTTGTTGAAGA
TCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTTTTGTCCCTT*GTCG
TTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAATC
TGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTAG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4CY12TF 520 0 0
GGGGCTCAACCAACGCGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGAGCTTGTGTTGACGTTCTG
GGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGTGTTGTCCAGTGTTA
CAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCATAAGACTTAAGCTT
CTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAGGCTCTCATCACTTGTGGAATCAAC
CCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAAACAACGTACGATCTATCA
AGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTTCTTTTTGTTGAAGA
TCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTTTTGTCCCTT*GTCG
TTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAATC
TGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTAG

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 4

CO CL3080Contig1 576 4 3 U
GGCCGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTTGTGGCT
TCATCAACTTCTCTATCAAGCTACGCAAAACCTAGACTTCCTAAGATTCAAGCTTCGCTG
TCTAATTACCCTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCTACAAGTGAA
GACTTTCTGCAAAAGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTTAAGCTTGTCAAA
GATGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGAT
GCTTTTCTAGCCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATA
GACATTGCGAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCT
GAGAAGCTCCAGGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAA
ACATTTAGTACCAAGTTAACGAAACTGTGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAA
TGATCAAATATAAACAAAATGTTGTTTTTTACTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4BK88JQ C 1
AF RR4E493JQ C 79
AF RR4E493TF U 11
AF RR4BK88TF U 1
BS 1 10 RR4BK88TF
BS 11 573 RR4E493TF
BS 574 576 RR4BK88JQ

RD RR4BK88JQ 576 0 0
GGCCGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTTGTGGCT
TCATCAACTTCTCTATCAAGCTACGCAAAACCTAGACTTCCTAAGATTCAAGCTTCGCTG
TCTAATTACCCTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCTACAAGTGAA
GACTTTCTGCAAAAGTAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTTAAGCTTGTCAAA
GATGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGAT
GCTTTTCTAGCCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATA
GACATTGCGAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCT
GAGAAGCTCCAGGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAA
ACATTTAGTACCAAGTTAACGAAACTGTGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAA
TGATCAAATATAAACAAAATGTTGTTTTTTACTACT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4E493JQ 495 0 0
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AGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTTTACAAGTGAAGACTTTTTGCAAAAGGAG
TTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTTAAGCTTGTCAAAGATGAGTCAATGAAGAGA
TCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTTTCAGGAGGATGCTTTTTTAGCCATTGAG
ACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGGGGATGATTTATATAGACATTGGGAAACCAGGG
AAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTTTGGTCCCCCTGAGAAGCTCCAGGTGCCA
GAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAAACATTTAGTACCAAGTTA
ACGAAACTGTGTCTGTATTTGGGTAGAAACATTAAGAGACAATGATCAAATATAAACAAA
ATGTTGTTTTTTACT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4E493TF 563 0 0
CGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTTGTGGCTTCATCAACTT
CTCTATCAAGCTACGCAAAACCTAGACTTCCTAAGATTCAAGCTTCGCTGTCTAATTACC
CTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCTACAAGTGAAGACTTTCTGC
AAAAGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTTAAGCTTGTCAAAGATGAGTCAA
TGAAGAGATCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGATGCTTTTCTAG
CCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATAGACATTGCGA
AACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCTGAGAAGCTCC
AGGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAAACATTTAGTA
CCAAGTTAACGAAACTGTGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAATGATCAAATA
TAAACAAAATGTTGTTTTTTACT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4BK88TF 576 0 0
GGCCGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTTGTGGCT
TCATCAACTTCTCTATCAAGCTACGCAAAACCTAGACTTCCTAAGATTCAAGCTTCGCTG
TCTAATTACCCTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCTACAAGTGAA
GACTTTCTGCAAAAGTAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTTAAGCTTGTCAAA
GATGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGAT
GCTTTTCTAGCCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATA
GACATTGCGAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCT
GAGAAGCTCCAGGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAA
ACATTTAGTACCAAGTTAACGAAACTGTGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAA
TGATCAAATATAAACAAAATGTTGTTTTTTACT
ACT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 3

CO CL3081Contig1 833 3 26 U
CGTTGAAACAGTGCAAGTCATACACCAATCTGTTCATAGTATAACAAGCAGAGAACAATT
TTATTTTGATTCATAATGATCTGGCTGTGAAAATATACCACAACAGTCCAACCACATAAA
TAAACTATCCTAATGAAAAAAAAAGGTTACAATAGGACACTTCTTGAAGGGACAGAAGTA
TATAGAAAAAAAAA*GAATCAAGAATGGTCGGTCTTCTTGTTTAGACAGAGACAACAGGG
AAAGAAGGTCAAAATGACTTCTGAGTTATCTCAGTCATGTTGCTTATTCTCAGAGACAAA
TGCAAGGTCGGAGATCTTTTAATAGTCATCCACAAAGTGAACATCAAGCCCTTCTTTCAC
ATCCTCCGAAAGCTCTTCAAAGTCTCTCATGTTTGCTTCCGGAAATATGATAGTCTCTCA
CCCTGCCTTCTTGTAAATCTTCTCGATTTATTTCTGGAGATTCCTAACTCCTGCTTCTCT
GCAGTAATTTTCTATCAATGAAAGAAGATCTGCATCACTCACCTCAACCAGATTTTTTTC
TGCTCTGAGATGATGAAATCTTTCTCCTTCATGGACAGAGGTCATTGAAAATGGAAGTTG
TATCTGAATATGATCGCTTGAGAGAGAGGCGGAGAGTGAACTGCGGTGAGAGAAAGAGAC
GCGAAGAGGAGACGCGGTGGAGAGCGGCGGAGAGGAGACGCGGCGGAGGGAAGATCAGAG
GGAAGATATAGCAACAGCAGCGAGACAGCAACCAGTGTAAGCGGCTGAGACGGGTTGACT
TCACCGGAATCGCTCAAGAGATTGAGAGAGAGTAACGGCCGCTAGGGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CN10JQ U 1
AF RR4B779JQ U 9
AF RR4B779TF C 9
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T

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CG
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AAAA*GAATCAAGAATGGTCGGTCTTCTTGTTTAGACAGAGACAACAGGGAAAGAAGGTC
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QA 3 825 3 825
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4GN02TF U 4
AF RR4AV10TF U 1
AF RR4GN02JQ C 42
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GG
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CAAATCTAT
C

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DS 

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CAAA
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TCATAGGACACCTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACACCGCTCCTGACGACACCAA
GGGTGTTTGGTGGATCAAATCTATCTTGGGCAAATAGATATTTACATGAACGCTAAAAGG
AGACTTGGTTTCACTTCCTTTGTCTGTGTAGTATACTACACCTTTCGTTTACTTTAGTAC
TCATCGTTCTGCTTTTGTTTATTTTCAACATTTAAAACCATCTATTTGAAGTATCAAGTA
CCC

QA 5 727 5 727
DS 



AS 1 4

CO CL3083Contig1 890 4 8 U
GACGCTATAATTTGTACAGTTGAGCACACTGTCGAAAACTTCACTGCTTGGCAACGGTTT
TTACCCAATGGACCCATCGCACTTCTTCCCATTGGTGACAAGTTTAGCAACATAGTCTGG
ACTATGATCCAACAGAGGCGTCAGATCGCAAGTCGATGAGCGAAGATGACTTCATCAAAG
CTGTAAACGACGCTCTGGATTATGGATACGGTCCACATCCAGAGACAACAGGTTCAGGGG
GTAGTAGTCTCTCTTGGCTTACAGGAGATGTAAACATATCCGCCAAGGAGAGGTTTGAAA
CTCCACCAAAGGTTGTGAAGCTTTCATCAGAAAGAATGATGTTTCCTTT*GTCTTTAAG*
GCATGCAAAGGACTATGTGTCAAACCGTGTGGCTCTCGTGGGTGACTCAGCTCATACTGT
TCACCCGTTGGCCGGTCAAGGAGTTAATCTAGGATTTGCTGATGCGAGTGCTCTCTCCAG
AGCTATAGCTGAAGGCATTGCTCTTGGTACCGATATTGGCGAGGCGAATCTGCTCAAACG
ATATGAAGCGGAGAGAAAACCTGCAAACATAGCAATGATGGCGGTTTTAGATGGAATCCA
GAAGATGTACGCAGTGAATTTCGGACCGCTGAATGCATTGAGAGCGGCTGCATTTCACGG
GGCTCACTACATTTCCCCTCTCAAAAAGCGTATCATATCATATGCTTCAGGAGAGCCGTC
TTTGCCACTCTTTTCTTGAGCAAACCAGTATCTTATCAGAGAGATTGGTCGCCTCTCTAT
CAAGAACTCTGAATCTTCTCTCTTCTTTTACCTTATAGATACTTAATGGTTATTGAAAAC
GACTTCTGTAGTGTATAAGTTGACCTGTATCTTTGAATTTTATATTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A087TFB U 316
AF RR4A087TF U 1
AF RR4A087JQ C 63
AF RR4A087JQD C 65
BS 1 808 RR4A087TF
BS 809 809 RR4A087JQ
BS 810 830 RR4A087TF
BS 831 831 RR4A087JQ
BS 832 838 RR4A087TF
BS 839 839 RR4A087JQ
BS 840 853 RR4A087TF
BS 854 890 RR4A087JQ

RD RR4A087TFB 367 0 0
TGAAGCTTTCATCAGAAAGAATGATGTTTCCTTTTGTCTTTAAGAGCATGCAAAGGACTA
TGTGTCAAACCGTGTGGCTCTCGTGGGTGACTCAGCTCATACTGTTCACCCGTTGGCCGG
TCAAGGAGTTAATCTAGGATTTGCTGATGCGAGTGCTCTCTCCAGAGCTATAGCTGAAGG
CATTGCTCTTGGTACCGATATTGGCGAGGCGAATCTGCTCAAACGATATGAAGCGGAGAG
AAAACCTGCAAACATAGCAATGATGGCGGTTTTAGATGGAATCCAGAAGATGTACGCAGT
GAATTTCGGACCGCTGAATGCATTGAGAGCGGCTGCATTTCACGGGGCTCACTACATTTC
CCCTCTC

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4A087TF 853 0 0
GACGCTATAATTTGTACAGTTGAGCACACTGTCGAAAACTTCACTGCTTGGCAACGGTTT
TTACCCAATGGACCCATCGCACTTCTTCCCATTGGTGACAAGTTTAGCAACATAGTCTGG
ACTATGATCCAACAGAGGCGTCAGATCGCAAGTCGATGAGCGAAGATGACTTCATCAAAG
CTGTAAACGACGCTCTGGATTATGGATACGGTCCACATCCAGAGACAACAGGTTCAGGGG
GTAGTAGTCTCTCTTGGCTTACAGGAGATGTAAACATATCCGCCAAGGAGAGGTTTGAAA
CTCCACCAAAGGTTGTGAAGCTTTCATCAGAAAGAATGATGTTTCCTTT*GTCTTTAAG*
GCATGCAAAGGACTATGTGTCAAACCGTGTGGCTCTCGTGGGTGACTCAGCTCATACTGT
TCACCCGTTGGCCGGTCAAGGAGTTAATCTAGGATTTGCTGATGCGAGTGCTCTCTCCAG
AGCTATAGCTGAAGGCATTGCTCTTGGTACCGATATTGGCGAGGCGAATCTGCTCAAACG
ATATGAAGCGGAGAGAAAACCTGCAAACATAGCAATGATGGCGGTTTTAGATGGAATCCA
GAAGATGTACGCAGTGAATTTCGGACCGCTGAATGCATTGAGAGCGGCTGCATTTCACGG
GGCTCACTACATTTCCCCTCTCAAAAAGCGTATCATATCATATGCTTCAGGAGAGCCGTC
TTTGCCACTCTTTTCTTGAGCAAACCAGTATCTTATCAGAGAGATTGGTCGCCTCTCTAT
CAAGAACTCTGAATCTTCTCTCTTCTTT*ACCTTATAGATACTTAATGGT*ATTGAAA*C
GACTTCTGTAGTG

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR4A087JQ 828 0 0
AC
CCAATGGACCCATCGCACTTCTTCCCATTGGTGACAAGTTTAGCAACATAGTCTGGACTA
TGATCCAACAGAGGCGTCAGATCGCAAGTCGATGAGCGAAGATGACTTCATCAAAGCTGT
AAACGACGCTCTGGATTATGGATACGGTCCACATCCAGAGACAACAGGTTCAGGGGGTAG
TAGTCTCTCTTGGCTTACAGGAGATGTAAACATATCCGCCAAGGAGAGGTTTGAAACTCC
ACCAAAGGTTGTGAAGCTTTCATCAGAAAGAATGATGTTTCCTTT*GTCTTTAAG*GCAT
GCAAAGGACTATGTGTCAAACCGTGTGGCTCTCGTGGGTGACTCAGCTCATACTGTTCAC
CCGTTGGCCGGTCAAGGAGTTAATCTAGGATTTGCTGATGCGAGTGCTCTCTCCAGAGCT
ATAGCTGAAGGCATTGCTCTTGGTACCGATATTGGCGAGGCGAATCTGCTCAAACGATAT
GAAGCGGAGAGAAAACCTGCAAACATAGCAATGATGGCGGTTTTAGATGGAATCCAGAAG
ATGTACGCAGTGAATTTCGGACCGCTGAATGCATTGAGAGCGGCTGCATTTCACGGGGCT
CACTACATTTCCCCTCTCAAAAAGCGTATCATATCATATGCTTCAGGAGAGCCGTCTTTG
CCACTCTTTTCTTGAGCAAACCAGTATCTTATCAGAGAGATTGGTCGCCTCTCTATCAAG
AACTCTGAATCTTCTCTCTTCTTTTACCTTATAGATACTTAATGGTTATTGAAAACGACT
TCTGTAGTGTATAAGTTGACCTGTATCTTTGAATTTTATATTTCTG

QA 3 828 3 828
DS 

RD RR4A087JQD 826 0 0
CCAATGGACCCATCGCACTTCTTCCCATTGGTGACAAGTTTAGCAACATAGTCTGGACTA
TGATCCAACAGAGGCGTCAGATCGCAAGTCGATGAGCGAAGATGACTTCATCAAAGCTGT
AAACGACGCTCTGGATTATGGATACGGTCCACATCCAGAGACAACAGGTTCAGGGGGTAG
TAGTCTCTCTTGGCTTACAGGAGATGTAAACATATCCGCCAAGGAGAGGTTTGAAACTCC
ACCAAAGGTTGTGAAGCTTTCATCAGAAAGAATGATGTTTCCTTT*GTCTTTAAG*GCAT
GCAAAGGACTATGTGTCAAACCGTGTGGCTCTCGTGGGTGACTCAGCTCATACTGTTCAC
CCGTTGGCCGGTCAAGGAGTTAATCTAGGATTTGCTGATGCGAGTGCTCTCTCCAGAGCT
ATAGCTGAAGGCATTGCTCTTGGTACCGATATTGGCGAGGCGAATCTGCTCAAACGATAT
GAAGCGGAGAGAAAACCTGCAAACATAGCAATGATGGCGGTTTTAGATGGAATCCAGAAG
ATGTACGCAGTGAATTTCGGACCGCTGAATGCATTGAGAGCGGCTGCATTTCACGGGGCT
CACTACATTTCCCCTCTCAAAAAGCGTATCATATCATATGCTTCAGGAGAGCCGTCTTTG
CCACTCTTTTCTTGAGCAAACCAGTATCTTATCAGAGAGATTGGTCGCCTCTCTATCAAG
AACTCTGAATCTTCTCTCTTCTTTTACCTTATAGATACTTAATGGTTATTGAAAACGACT
TCTGTAGTGTATAAGTTGACCTGTATCTTTGAATTTTATATTTCTG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 3

CO CL3084Contig1 1305 3 5 U
TTGATCATATTGGCGAAAATGGATTTGTGTTTGCATCATTTGTAGCGTCACGAGAGCTTT
CTGGCTTTTGGAACATTCTTGTATATTCTGGTTCAATCTTTTTTTTTTTGTGTAGGGCAT
GCACATCACTGCAATTCTGACATATTTTTAGCAATTGTCATTAACTTTTAGCCATCTATG
TATGTATTTCTTCCACAAATAAACCTTTTCATATACATTCTCGCATTTGTTTCTGTCAAC
CAATTCTAAAAAGGCTTTTGGTGTCTGTGTGTCCCATTTTTTTGGAAAATATTTTTGAGT
GATCAGTCTTTTTAGAAGTTGGTGTTGGCAAACACAAAGAACACGGTGATTAGTTACAAA
AACTTGTATAAACGAATCAAGCCTGTTATTACTCACACTATGTAAATAGTTATAGAGCAT
GATGACAGCACAAGTTCACACACAGCTTGCAATTTTTCGCAAAGCAATGAGCTTTCACAT
TGATCTATAAAATAAGAATACTTCCATATAGGTGGGTGTAAGACATGCTTGTCTTTTTAA
ACATAAGGATTTGAAATCACAAGCAAGGTTCCTTACGAGATAGATGCCACTTACTTAAAT
GCAAGATGGTAGAAGAGGTCCGTGGCAGACAAAGGCCACGGCAATATATATGATCACCAG
TAGTACTAGTATTAAGAGGAACGTGAGCTTGCAGTTTCTCCACCAGACGGTGCTTCTGAA
ACGGCGAGCTTGCTTTCTGAAACGGAATGTGTTCCCTTGCATATTGGCGGTTTTGTCGAC
AAGTAGCTCCAAGCGTTCACCTCTATCTAGAACTTTGTCAATGTTCTCTATCATCATCAC
GCACCTGACTCATTTCACCCTTAATCCGATTAGTCCTATCGGCGTTAGGATCATTAGAGT
AAAACTCAATCTGCTGACTGAGAACTCTAGAGAACTCGTCGTTCATGGCGTAAGCTTGTG
CTGTATGAACTGCCCTCCCGTACGTCCTCACGAACCTCTGGTGAATATCCTCCAGAAACG
CAAAAGGAATCCTCCTGCCGGCGGTTTCCTCGGCCATACAGAGGACGGTGAGGCCATCGG
TGCGTTTAACGTGGAAGACGTAGCGATCCTGAGAGTAGGAGATGTTGCTGTAGTTGTTGT
TCCCGGGGACCTTCTCCAGGATCTGCTTGGCGATCGTGCTCGCGTTCGTAGACGTCGCGC
TGAACTCCGCCAGCACCACCGTCCCACGCGCCACCAGTGCGTACAGAATCGCCATGACGG
AATCAACAAACAAAGAGAGGGGAGAGAGGGAGGATCAACGAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E506TF U 1
AF RR4E415JQ U 366
AF RR4E415TF C 769
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TATGTATTTCTTCCACAAATAAACCTTTTCATATACATTCTCGCATTTGTTTCTGTCAAC
CAATTCTAAAAAGGCTTTTGGTGTCTGTGTGTCCCATTTTTTTGGAAAATATTTTTGAGT
GATCAGTCTTTTTAGAAGTTGGTGTTGGCAAACACAAAGAACACGGTGATTAGTTACAAA
AACTTGTATAAACGAATCAAGTCTGTTATTACTCACACTATGTAAATAGTTATAGAGCAT
GATGACAGCACAAGTTCACACACAGCTTGCAATTTTTCGCAAAGCAATGAGCTTTCACAT
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ACATAAGGATTTGAAATCACAAGCAAGGTTCCTTACGAGAT

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DS 

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CAGCACAAGTTCACACACAGCTTGCAATTTTTCGCAAAGCAATGAGCTTTCACATTGATC
TATAAAATAAGAATACTTGCATATAGGTGGGTGTAAGACATGCTTGTTTTTTTAAACATA
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TCAATCTGCTGACTGAGAACTCTAGAGAACTCGTCGTTCATGGCGTAAGCTTGTGCTGTA
TGAACTGCCCTCCCGTACGTCCTCACGAACCTCTGGTGAATATCCTCCAGAAACGCAAAA
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TTAACGTGGAAGACGTAGCGATCCTGAGAGTAG
AGA

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DS 

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CGG
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CATCATCACGCACCTGACTCATTTCACCCTTAATCCGATTAGTCCTATCGGCGTTAGGAT
CATTAGAGTAAAACTCAATCTGCTGACTGAGAACTCTAGAGAACTCGTCGTTCATGGCGT
AAGCTTGTGCTGTATGAACTGCCCTCCCGTACGTCCTCACGAACCTCTGGTGAATATCCT
CCAGAAACGCAAAAGGAATCCTCCTGCCGGCGGTTTCCTCGGCCATACAGAGGACGGTGA
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AGTTGTTGTTCCCGGGGACCTTCTCCAGGATCTGCTTGGCGATCGTGCTCGCGTTCGTAG
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CCATGACGGAATCAACAAACAAAGAGAGGGGAGAGAGGGAGGATCAACGAAGAA

QA 4 537 4 537
DS 



AS 1 3

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AAATAACTGCTAACTTTGCTCTCTTTTCTGATGAAAATAATATGAGTTTGATATTCCCAC
TTGAAAAAAATAAGCTGCATGTATCCAGAGAACCTGACAATGGTCTAGAACTAAGGAACG
CTTTTAAATCAAACACCTAGACTGCTATAAAGATTCTGCACATCAAAGTCCCACACAGTA
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TTGGCAAAAATGTCATCGATGTTGAAATCCAGCCTTGGACTAACAGTTGCTAGCTTCATC
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CCTGCTTTGCCTGTGATCTTGTCGCATCCAGGAACTAAATCTTGTAGAAACTTCATTCTC
TCACTGATCTTTTCTCTTCTAGCTCGTTCTGCAATGCTGTGGCTATCGGTGGCTTGGCCT
CTCCGTGCACGAACATGAATATAATCCGTTCTCTGCGAGTCTTTCGTCACTTTTGATGAA
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CTTTTATGGCTCTGCTCTGTTAATTTCGACTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCAACTGCT
GTCATTATCTTCTTCTTCTCATTACAAACCTTAGTCTCTGTCTCGACGCAACCAAACTTC
CTTTTCTTGAAATTTCCAGACTCGGTTGTAATATTTCCCGGAGCAACTGAGATTCTCGCG
TCACCGTGCACCGTCGTATATCCATAAACCGCCGGAAGATCCAAACCGGCCGACGCTAGA
AAGCCGTCAATATCGCCGCCGTTAGTCGTGGAAGAATTGGAGAAGAAGCCGGGATAGTGG
TGGTAGTTGAGGTGAGCCCTTTGGCGCTCTAGGACAGACATGTCGCTACAGTTGAGTAAA
AGCTCAGCTTCTGTAGCTTCTCCGTTCATCATCATCATTTTTCTACTTTAGAAACTTGGG
AGTGGTAGAGAAACAGAGTCC


BQ
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AF RR4AI80JQ U 1
AF RR4A540JQ U 7
AF RR4A540TF C 481
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RD RR4AI80JQ 869 0 0
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AAATAACTGCTAACTTTGCTCTCTTTTCTGATGAAAATAATATGAGTTTGATATTCCCAC
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TCACTGATCTTTTCTCTTCTAGCTCGTTCTGCAATGCTGTGGCTATCGGTGGCTTGGCCT
CTCCGTGCACGAACATGAATATAATCCGTTCTCTGCGAGTCTTTCGTCACTTTTGATGAA
TCGTTAGAGCAGCTGTTCTGTTCTTTCTTCGCTTTATTCTTCATCTTCATCATCATGATG
CTTTTATGGCTCTGCTCTGTTACTTTCG
C

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR4A540JQ 911 0 0
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TGTTTGGCATCTATACACACAATACTGTATACACACTCTTGTCTCTGATACTACAATGAT
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CATCCAGGAACTAAATCTTGTAGAAACTTCATTCTCTCACTGATCTTTTCTCTTCTAGCT
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TCCGTTCTCTGCGAGTCTTTCGTCACTTTTGATGAATCGTTAGAGCAGCTGTTCTGTTCT
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GTCATTATCTTCTTCTTCTCATTACAAACCTTAGTCTCTGTCTCGACGCAACCAAACTTC
CTTTTCTTGAAATTTCCAGACTCGGTTGTAATATTTCCCGGAGCAACTGAGATTCTCGCG
TCACCGTGCACCGTCGTATATCCATAAACCGCCGGAAGATCCAAACCGGCCGACGCTAGA
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AGTGGTAGAGAAACAGAGTCC

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DS 



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TTCGATCCGTCGAAGCTTCCACGGCTCAGGCGACCGAAGAACCAGCAGATCAAGGTGCGT
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AAGTTCAATTCCCGTAAAGAAGACGTCATTGGCGAGACATATCTGGGGATTCAAATCTTT
AGATTCTACTTCAAGTGCACCAAGTGCTCTGCGGAGCTGACAATGAAGACGGATCCACAG
AACTCTGATTATATTGTGGAATCTGGGGCAAGTCGTAATTACGAACCCTGGCGTGCCGAA
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AAGTCTTTGGAGAACCGGACCTTGGATTCCAAAAGGGAAATGGACATTATAGTCGCTCTT
GATGAAATGAAATCAATGAAGTCTAGACACGCTACTGTGAGCGTAGATGCGATGCTGAAG
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GAAGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATATTCCCAGCTTTCAGAAGGAG
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AAGCAAGCTACCAGCAAGCAACCCTTCAAATCCATTCACATAACAGTCATCAAGAAGCAA
TCTCAACCAACTTCTTCTACGACTCCAGCTCCTGCACAACCAGAGGAGAAGAAGAGTGAC
GTTGTGGCTAACGCCGGGTTGGCATCTTTGTTCCAGAACTATGGCAGTGATGATGAAGAC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F474TF U 1
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DS 

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GATGATGATGATGATGATGATGATGAT***ATTCCCAGCTTTCAGAAGGAGAAGAAAGAA
GGATCATCATCTTCAGATCTTTCAAAGAAGAGAAAGGCATCAGAAGAAAGTCCAAGCAAC
CCCACAGATATTTTGACTAATTCATCTGCAGATAACCCGAAGCAGCCCAAGAAGCAAGCT
ACCAGCAAGCAACCCTTCAAATCCATTCACATAACAGTCATCAAGAAGCAATCTCAACCA
ACTTCTTCTACGACTCCAGCTCCTGCACAACCAGAGGAGAAGAAGAGTGACGTTGTGGCT
AACGCCGGGTTGGCATCTTTGTTCCAGAACTATGGCAGTGATGATGAAGACGAGGATTGA
TTTGTTCTTTTTGGGTTCTCATCAGGTTTCGCACTCTTTATAGTGTTCTTATATCAGTGT
TTCAGAATTGAAGACATCCATGTACTGTTCATAACATGAGATTTTTTTTCAGAAAACTTT
GACTGGATATTACAATGCATATTTGGAGAAGTTTCTTAATGAAATTGTTTTGCAGACAAG
CAGAAAACATG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 4

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TCATTATTGTCACATTCCACAAAGCTAGTTACAAGTCGGGTATATAATGATACATATTCA
TATCTGGAACAAAACACGACCAAACAAAAATCAGAGGGAAGAAGAAGAAAGTTCTCAGGA
TTTGGAGAATGCACGGAGCGTAGCATCCAACGCCTCCCGATCATAATCTCCAGTGAAAAC
GCAGTTTCCCAGCGGACCTTTCAGGAGAATCAGCCTCAGCAGTCCATCTGCCACTTTCTT
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GGTAGCTCGCAAGCCGCTTTCTTTCTCATCCTGTGACACAACATCTGCCTTGTTTTCACA
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CTGCTCCTGCCATTCAAAGAAGTCAGCATCCCTGATAAGCCCGTACTTGATAACTTCAGC
AAGACCTGAAGCCATCTCCCTGTCTGGCAGTGTGTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 



AS 1 4

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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ53JQ U 1
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GG
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CAAACATATTCTG

QA 3 855 3 855
DS 

RD RR4BJ53TF 754 0 0
CAATCTCTGCCT*CTAGATGAAAGCTTT*CCACGCTTT*CTTTTCAATTACCTGTTAACA
AAGATGGCGGTTGGACTGCCTGGAGATGGAGGATTCTGCGTCAGGAGTGAAGCATATGGA
CCAGCTTTAGCCACATCATTAGGGTCACTTGCTGAATAGATTTCAACCTCTTCAAGACCA
ACTTGCCGCTTGATCAAGTCCACGTTACTCTTAAGAACTTCCATCTCTCCAAAAGGCAGC
TTCAAATTTAAAGCCTGACTGCCAATGGCTATTGCCTCGTCCTTCTTGAATTTAAGGAAA
GGCATGCAAAGCTTCTGAATCTGCTTGAAGTTTTCTGCCTGTCCATCCTTCTGCAATATC
TCCCTTAGTTCTGCAAGTATCTCTGCATCAGGGGCAAAACAATTGGTCTGTTGGTCGAAT
TTGCTTTGCAGAATTTGGAGG**GTGAGCTCTCCACCCGTCAAATTGCTCGTTCACATAT
ACAAGGCCTTTCAGATTCGAGTATGCCACTGCTGTTACTTGAGCACCTTTTTTAGCAGCC
TTCTTGGAACCTAAGAGCTGCTTTTGTAGAAGCTTTCTCATCAAGACGATAGAATCTTGC
AAATATTTGTTAGCACCCTTGAGAACTAGATCTGGCTCATTTGATGCTGGCCAGCCTGCT
TTTACCACACAGCCTTCTTTCTTCAAAAGTTTCCTCCAAACATATTCTGCAAAATGAGGA
CAGATTGGTTCAATGAGGCGTGTTTGCACATCCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

CO CL3089Contig1 758 4 15 U
TGGAACAAGAAATGTAGCAGGCGCTTATAAAACATAGTTATGGATTATGTTTAAACACTC
GGGAAAGCATCTTAAAATGGACGGTGTTGTCTGAATATTACAGAGGGCTCATAAAAGCAA
AACACCGAAGTTGAGACACCTCAGAACAGCTACGACGGATTCAAAAGCCTAGGATGGTAT
CAGGCTGAGCAACGGTAAGATGGAAATCCATGTGTTCTATCAAAAATTGACGAACAGTGG
AGAACTTGGCGTCTTTTTCTAAGTTTTCGTCTTTAGAGATTACAAGGACATAGAGTGGTT
AATTACTTTCATCACTACAGGTCTGTGCCCAGAAAATGATGTCTATTAGCATCATGCGGA
TTCTGGAACCTCTATCCCCTCTAAGTAAAATGGGGATAATTCCATAGTTGCAATACTCTT
GAAGCCGTTCATCAGAGAATTGATTCTTATCACTATAGAAAGCACTGGTTGACACCATCC
CATGATAACCTTCGTGCCGTAAATGGAATCTAACTTCCTCTTTGATTTCCTTTGGTTCAT
GGATTGGCATATCATCAAAGTCCACGATGACATG*TATGGATGTCACAGAATTTTTACTG
CCGAGATCTTCGAAACCCCGGTGTGAATTTCCGGTAGGGCTCATCGAGAAAATTTGAGAC
GCTTACGATTGGAAGCTATTTGTTGAGACGGTCGCCTCTGTGAGTTTAGGGTTAGATCTG
TTCTAGAAATCACGCCCTCTCCGTCTTTCTACCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G369JQ U 2
AF RR4G369TF C 1
AF RR4CO50JQ U 5
AF RR4CO50TF C 135
BS 1 5 RR4G369TF
BS 6 79 RR4CO50JQ
BS 80 80 RR4G369JQ
BS 81 289 RR4CO50JQ
BS 290 290 RR4G369JQ
BS 291 292 RR4CO50JQ
BS 293 293 RR4G369JQ
BS 294 436 RR4CO50JQ
BS 437 437 RR4G369JQ
BS 438 516 RR4CO50JQ
BS 517 517 RR4G369JQ
BS 518 574 RR4CO50JQ
BS 575 575 RR4G369JQ
BS 576 733 RR4CO50JQ
BS 734 758 RR4G369TF

RD RR4G369JQ 704 0 0
GGAA
CAAGAAATGTAGCAGGCGCTTATAAAACATAGTTATGGATTATGTTTAAACACTCGGGAA
AGCATCTTAAAATGGACGGTGTTGTCTGAATATTACAGAGGGCTCATAAAAGCAAAACAC
CGAAGTTGAGACACTTCAGAACAGCTACGACGGATTCAAAAGCCTAGGATGGTATCGGGC
TGAGCAACGGTAAGATGGAAATCCATGTGTTCTATCAAAAATTGACGAACAGTGGAGAAC
TTGGCGTCTTTTTCTAAGTTTTCGTCTTTAGAGATTACAAGGACATAGAGTGGTTCATTA
CTTTCATCACTACAGGTCTGTGCCCAGAAAATGATGTCTATTAGCATCATGCGGATTCTG
GAACCTCTATCCCCTCTAAGTAAAATGGGGATAATTCCATAGTTGCAATACTCTTGAAGC
CGTTCATCAGAGAATTGATTCTTATCACTATAGAAAGCACTGGTTGACACCATCCCATGA
TAACCTTCGTGCCGTAAATGGAAT*TAACTTCTTCTTTGATTTCCTTTGGTTCATGGATT
GGCATATCATCAAAGTCCACGATGACATG*TATGGATGTCACAGAATTTTTACTGCCGAG
ATCTTCGAAACCCCGGTGTGAATTTCCGGTAGGGCTCATCGAGAAAATTTGAGACGCTTA
CGATTGGAAGCTATTTGTTGAGACGGTCGCCTCTGTGAGT

QA 5 704 5 704
DS 

RD RR4G369TF 758 0 0
TGGAACAAGAAATGTAGCAGGCGCTTATAAAACATAGTTATGGATTATGTTTAAACACTC
GGGAAAGCATCTTAGAATGGACGGTGTTGTCTGAATATTACAGAGGGCTCATAAAAGCAA
AACACCGAAGTTGAGACACTTCAGAACAGCTACGACGGATTCAAAAGCCTAGGATGGTAT
CGGGCTGAGCAACGGTAAGATGGAAATCCATGTGTTCTATCAAAAATTGACGAACAGTGG
AGAACTTGGCGTCTTTTTCTAAGTTTTCGTCTTTAGAGATTACAAGGACATAGAGTGGTT
CATTACTTTCATCACTACAGGTCTGTGCCCAGAAAATGATGTCTATTAGCATCATGCGGA
TTCTGGAACCTCTATCCCCTCTAAGTAAAATGGGGATAATTCCATAGTTGCAATACTCTT
GAAGCCGTTCATCAGAGAATTGATTCTTATCACTATAGAAAGCACTGGTTGACACCATCC
CATGATAACCTTCGTGCCGTAAATGGAAT*TAACTTCTTCTTTGATTTCCTTTGGTTCAT
GGATTGGCATATCATCAAAGTCCACGATGACATG*TATGGATGTCACAGAATTTTTACTG
CCGAGATCTTCGAAACCCCGGTGTGAATTTCCGGTAGGGCTCATCGAGAAAATTTGAGAC
GCTTACGATTGGAAGCTATTTGTTGAGACGGTCGCCTCTGTGAGTTTAGGGTTAGATCTG
TTCTAGAAATCACGCCCTCTCCGTCTTTCTACCTATCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4CO50JQ 731 0 0
G
CAAGAAATGTAGCAGGCGCTTATAAAACATAGTTATGGATTATGTTTAAACACTCGGGAA
AGCATCTTAAAATGAACGGTGTTGTCTGAATATTACAGAGGGCTCATAAAAGCAAAACAC
CGAAGTTGAGACACCTCAGAACAGCTACGACGGATTCAAAAGCCTAGGATGGTATCAGGC
TGAGCAACGGTAAGATGGAAATCCATGTGTTCTATCAAAAATTGACGAACAGTGGAGAAC
TTGGCGTCTTTTTCTAAGTTTTCGTCTTTAGAGATTACAAGGACCTAAAGTGGTTAATTA
CTTTCATCACTACAGGTCTGTGCCCAGAAAATGATGTCTATTAGCATCATGCGGATTCTG
GAACCTCTATCCCCTCTAAGTAAAATGGGGATAATTCCATAGTTGCAATACTCTTGAAGC
CGTTCATCAGAAAATTGATTCTTATCACTATAGAAAGCACTGGTTGACACCATCCCATGA
TAACCTTCGTGCCGTAAATGGAATCTAACTTTCTCTTTGATTTCCTTTGGTTCATGGATT
GGCATATCATCAAAGTCCACGATGACATGGTATGGATGTCACAGAATTTTTACTGCCGAG
ATCTTCGAAACCCCGGTGTGAATTTCCGGTAGGGCTCATCGAGAAAATTTGAGACGCTTA
CGATTGGAAGCTATTTGTTGAGACGGTCGCCTCTGTGAGTTTAGGGTTAGATCTGTTCTA
GAAATCAC
CC

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR4CO50TF 601 0 0
GACACCTCAGAACAGCTACGACGGATTCAAAAGCCTAGGATGGTATCAGGCTGAGCAACG
GTAAGATGGAAATCCATGTGTTCTATCAAAAATTGACGAACAGTGGAGAACTTGGCGTCT
TTTTCTAAGTTTTCGTCTTTAGAGATTACAAGGACCTAGAGTGGTTAATTACTTTCATCA
CTACAGGTCTGTGCCCAGAAAATGATGTCTATTAGCATCATGCGGATTCTGGAACCTCTA
TCCCCTCTAAGTAAAATGGGGATAATTCCATAGTTGCAATACTCTTGAAGCCGTTCATCA
GAGAATTGATTCTTATCACTATAGAAAGCACTGGTTGACACCATCCCATGATAACCTTCG
TGCCGTAAATGGAATCTAACTTTCTCTTTGATTTCCTTTGGTTCATGGATTGGCATATCA
TCAAAGTCCACGATGACATG*TATGGATGTCACAGAATTTTTACTGCCGAGATCTTCGAA
ACCCCGGTGTGAATTTCCGGTAGGGCTCATCGAGAAAATTTGAGACGCTTACGATTGGAA
GCTATTTGTTGAGACGGTCGCCTCTGTGAGTTTAGGGTTAGATCTGTTCTAGAAATCAC
CC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 4

CO CL3090Contig1 801 4 9 U
GGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAAGGTAAATCC
TACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATGGGCAACCATGTCGCTGT
GACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGTGATCGCAAG
CTCTCTCTTGCATTCCGTAAGATTGATAGCAGGTGCTTCAGCTTCGTTTGAGAAAAACTG
TGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAGAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGAGTCTCTTAT
GCTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAA
AGCTCACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCTC
TGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGATTGATGTTG
AGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGTTAAGGGTGTAATGACAAATAAGCAA
ATCCCAGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGATGTATCAGTT
ATTTTTGTTGAATAAAGGAGTAACTATTCATGTTTAGACCAGAAAGAAAGAGTAACTAGT
CATGTCAGGATGAAGGAAGGAGAGAACTAAACATGTGTAGTGTGTTATGTAATACGGGTG
ATGGCTGCTGTGGTATGGGACTCGACGATGTGGACTTGGCCAATATTGTGTTGGAAGGCC
TTTCGTGGCTTCAGGATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX07TF U 1
AF RR4F007JQ C 16
AF RR4EX20TF U 245
AF RR4CX07JQ C 80
BS 1 285 RR4CX07TF
BS 286 298 RR4EX20TF
BS 299 299 RR4F007JQ
BS 300 394 RR4EX20TF
BS 395 395 RR4F007JQ
BS 396 590 RR4EX20TF
BS 591 591 RR4F007JQ
BS 592 629 RR4EX20TF
BS 630 801 RR4CX07JQ

RD RR4CX07TF 285 0 0
GGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAAGGTAAATCC
TACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATGGGCAACCATGTCGCTGT
GACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGTGATCGCAAG
CTCTCTCTTGCATTCCGTAAGATTGATAGCAGGTGCTTCAGCTTCGTTTGAGAAAAACTG
TGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAGAGAAAGGATCTCAAAGCTATT

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR4F007JQ 614 0 0
TGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAAGGTAAATCCTACACAGTGTGAGGC
CTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATAGGCAACCATGTCGCTGTGACAGTTGGTGGGTC
AAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGTGATCGCAAGCTCTCTCTTGCATTC
CGTAAGATTGATAGCAGATGCTTCAGCTTCGTTTGAGAAAAACTGTGTGAGGGGCATTGA
GGCCAACAGAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGAGTCTCTTATGCTTGTGACATCATT
GAATCCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAAGCTCACAAAGAAGG
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G
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ACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCGTCTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCTCTGAAG
AGTTTGATACGCTTGTCGTCCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGATTGATGTTGAGCTA
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AGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGAGGTATCAGTTATTTT
TGTTGAATAAAGGAGTAACTATTC

QA 2 385 2 385
DS 

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CCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAAGCTCACAAAGAAGGATCG
ACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCTCTGAAGAGTTTGATACGCTT
GTCGTCCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGATTGATGTTGAGCTAAAAGCTTCATTTCA
CATGTCTTATTCTTGTTAAGGGTGTAATGACAAATAAGCAAATCCCAGAAACTCAAATTC
AGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGATGTATCAGTTATTTTTGTTGAATAAAGGA
GTAACTATTCATGTTTAGACCAGAAAGAAAGAGTAACTAGTCATGTCAGGATGAAGGAAG
GAGAGAACTAAACATGTGTAGTGTGTTATGTAATACGGGTGATGGCTGCTGTGGTATGGG
ACTCGACGATGTGGACTTGGCCAATATTGTGTTGGAAGGCCTTTCGTGGCTTCAGGATTT
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

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TCTTGAATCAGTGATGGGAGATAAAGTCGACGACTTTGGTGTTTGCGTCGCCGGAAGCTC
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CTCAGTTTGACACCGTAGCTCGTTACCACCATCACCACCACCACCACCATCTCACGTCAA
ATTTTAATGTGCTGCTCAGTTCGTCGCGAATCTGGCCAATAGTTAACCGACGCAGAATCA
CTCTCTACCAATTCTTCTCTCGTCAATCGCAGCGAAGAAGAAGAAGAAAAGACCCTAAAT
CGTATTTAGGAGCTCCATCAATGGCGTTGATGCTGGCTCGCAGGTGACTAATTACCCTTT
GTGCTCACCATTGCGTATGAATCTCGTTTGCTCCTGTTTTTGGAATCAAGGATCACTCTC
TGTCTCTTCGGGATTGTGTCTGTAATTGTAACTGTCCATTTGATGCTTTTGACAAGGCTC
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GGCCAAGAGTATGTTTTCAGACCACATTGTGTTTGCGTTTGTAGGATTTTATGTCTGAGG
ATGTTACCTTTTGTGGTGTATTTGATGGTCCTTTTGGTCATCTTGTTGCTTGAGTGAGAT
ATACATTGCCTCTGAAGTTGGAGTCTTTCCTTCATGTCTGAGATACATTGTAACATTAAC
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CGATGGCTTACCCAGACAAGATTTTAAGAGTTGGCAAGAGTTATGTTGGTAGTATAAGAC
TTAAGTGTAAGACAGGAAAAGTTTCTACTTAAAATATATGTTTTATAAATTTATTGATAA
ATTTTTGTAAGGCAACTGTAAAATGAAGAAGTAAACGAAATGTTAAAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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ATTGACTTCCTCAAATTCTCATTTTCGATCTCTAATCTCGATTGAAGCTTCACCACCACA
CTCAGTTTGACACCGTAGCTCGTTACCACCATCACCACCACCACCACCATCTCACGTCAA
ATTTTAATGTGCTGCTCAGTTCGTCGCGAATCTGGCCAATAGTTAACCGACGCAGAATCA
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CGTATTTAGGAGCTCCATCAATGGCGTTGATGCTGGCTCGCAGGTGACTAATTACCCTTT
GTGCTCACCATTGCGTATGAATCTCGTTTGCTCCTGTTTTTGGAATCAAGGATCACTCTC
TGTCTCTTCGGGATTGTGTCTGTAATTGTAACTGTCCATTTGATGCTTTTGACAAGGCTC
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DS 

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TCTGTCTCTTCGGGATTGTGTCTGTAATTGTAACTGTCCATTTGATGCTTTTGACAAGGC
TCTAGAGAGTGTAGATGAAACTCTCGTGTCTCGTGTCTCGACTAGTAGTAAGAGTGTGTG
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DS 

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GTGAGCAAAAGGGCCAAGAGTATGTTTTCAGACCACATTGTGTTTGCGTTTGTAGGATTT
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GTAACATTAACAAGATGCTTGTGTATGGAAATGAAGATGATTTTGGAGACAGCAATGATG
ATGATGTTGATCGATGGCTTACCCAGACAAGATTTTAAGAGTTGGCAAGAGTTATGTTGG
TAGTATAAGACTTAAGTGTAAGACAGGAAAAGTTTCTACTTAAAATATATGTTTTATAAA
TTTATTGATAAATTTTTGTAAGGCAACTGTAAAATGAAGAAGTAAACGAAATGTTAAAAC
C

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DS 



AS 1 3

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AAAACTAGTATCACAACTTTAGCTTCCCCTGTTCTAAAAAAATCCGCTGCCTAGGAACCC
CCAAATTCCTGAAGGCTTCTTGCTTTCCTCCCGAAATTTTCCAAAAAAGGCATCGTTGAT
TTGGTCAGGGGTTGGCCTTTCAGAGTATGTTGATATCAACACATACTTTTCCTTTCCATT
TTCCTCGTTCACTCTCTTGTAAAGCTCATACCGGTAAGGATAAGACATCCTTAGAGCGCC
CATAATTGGGTATTGTGTTCCAGCATAATAAAGTAGCCGAAATACATAGCAGTTGTCAAA
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GGGTAAGTCCTTGAGGCGAGGATTGATAAGTACAACTGGCCTCTTACCAGCAGCAGTAGT
CATCGCTTGTAGGTCATCTATGATACAGTTTCCAACGGCATTTTGTGGAGCCACTAAGAT
GGATATGTCGTCTTCTTCATCAACTTCTTTACCACCAATTGCACCGAGCTTGACGAAAGT
TCCCAAAGTTGAATCATCACCCCAGTCCATATATTCTAATATCTTTCGAGTGCCTGCCAA
CTGCAGTGGCATCCCAGCGAGGGCACCTTCCCCCATTGACCCCTGAACACAAACCTTCAC
TCTTTTTCCATCATCAGCGAATGATAAAGCTAGAGTTCGAACCAGTTCCATCAATGTTCC
TATCCGGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX03JQ U 1
AF RR4A595JQ U 17
AF RR4A595TF C 245
BS 1 262 RR4DX03JQ
BS 263 263 RR4A595JQ
BS 264 264 RR4DX03JQ
BS 265 265 RR4A595JQ
BS 266 343 RR4DX03JQ
BS 344 344 RR4A595JQ
BS 345 353 RR4DX03JQ
BS 354 354 RR4A595JQ
BS 355 527 RR4DX03JQ
BS 528 760 RR4A595JQ
BS 761 848 RR4A595TF

RD RR4DX03JQ 527 0 0
AAGTTCTCGGCCATAGTGAACCAAAGTGAGGTTACTCTTTGGTTGTGTGCGTAATAATCA
CAATATTTAATGTGCCCCACATTGAGATCATCAAAACATTGAAACCTAATAAAATGGGCC
AAAACTAGTATCACAACTTTAGCTTCCCCTGTTCTAAAAAAATCCGCTGCCTAGGAACCC
CCAAATTCCTGAAGGCTTCTTGCTTTCCTCCCGAAATTTTCCAAAAAAGGCATCGTTGAT
TTGGTCAGGGGTTGGCCTTTCAAAATATGTTGATATCAACACATACTTTTCCTTTCCATT
TTCCTCGTTCACTCTCTTGTAAAGCTCATACCGGTAAGGATAAAACATCCTTAAAGCGCC
CATAATTGGGTATTGTGTTCCAGCATAATAAAGTAGCCGAAATACATAGCAGTTGTCAAA
TGTTAAGGCGTATTCCAGCCTTTTTTCCCTGCCCATTGTTTGCATTATGCCACTTGAAGC
GGGTAAGTCCTTGAGGCGAGGATTGATAAGTACAACTGGCCTCTTAC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4A595JQ 744 0 0
C
GAACCAAAGTGAGGTTACTCTTTGGTTGTGTGCGTAATAATCACAATATTTAATGTGCCC
CACATTGAGATCATCAAAACATTGAGACCTAATAAAATGGGCCAAAACTAGTATCACAAC
TTTAGCTTCCCCTGTTCTAGAAAAATCCGCTGCCTAGGAACCCCCAGATTCCTGAAGGCT
TCTTGCTTTCCTCCCGAGATTTTCCAGAAAAGGCATCGTTGATTTGGTCAGGGGTTGGCC
TTTCAGAGTATGTTGATATCAACACATACTTTTCCTTTCCATTTTCCTCGTTCACTCTCT
TGTAAAGCTCATACCGGTAAGGATAAGACATCCTTAGAGCGCCCATAATTGGGTATTGTG
TTCCAGCATAATAAAGTAGCCGAAATACATAGCAGTTGTCAAATGTTAAGGCGTATTCCA
GCCTTTTTTCCCTGCCCATTGTTTGCATTATGCCACTTGAAGCGGGTAAGTCCTTGAGGC
GAGGATTGATAAGTACAACTGGCCTCTTACCAGCAGCAGTAGTCATCGCTTGTAGGTCAT
CTATGATACAGTTTCCAACGGCATTTTGTGGAGCCACTAAGATGGATATGTCGTCTTCTT
CATCAACTTCTTTACCACCAATTGCACCGAGCTTGACGAAAGTTCCCAAAGTTGAATCAT
CACCCCAGTCCATATATTCTAATATCTTTCGAGTGCCTGCCAACTGCAGTGGCATCCCAG
CGAGGGCACCTTCCCCCATTGAC

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR4A595TF 604 0 0
TCAGGGGTTGGCCTTTCAGAGTATGTTGATATCAACACATACTTTTCCTTTCCATTTTCC
TCGTTCACTCTCTTGTAAAGCTCATACCGGTAAGGATAAGACATCCTTAGAGCGCCCATA
ATTGGGTATTGTGTTCCAGCATAATAAAGTAGCCGAAATACATAGCAGTTGTCAAATGTT
AAGGCGTATTCCAGCCTTTTTTCCCTGCCCATTGTTTGCATTATGCCACTTGAAGCGGGT
AAGTCCTTGAGGCGAGGATTGATAAGTACAACTGGCCTCTTACCAGCAGCAGTAGTCATC
GCTTGTAGGTCATCTATGATACAGTTTCCAACGGCATTTTGTGGAGCCACTAAGATGGAT
ATGTCGTCTTCTTCATCAACTTCTTTACCACCAATTGCACCGAGCTTGACGAAAGTTCCC
AAAGTTGAATCATCACCCCAGTCCATATATTCTAATATCTTTCGAGTGCCTGCCAACTGC
AGTGGCATCCCAGCGAGGGCACCTTCCCCCATTGACCCCTGAACACAAACCTTCACTCTT
TTTCCATCATCAGCGAATGATAAAGCTAGAGTTCGAACCAGTTCCATCAATGTTCCTATC
CGGC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 4

CO CL3093Contig1 884 4 5 U
GGAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCTTTCTTCTCTTATCCTCAAGACAGCA
GAAATGGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTTAGCC
TCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCTTAAGCAG
ACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATACTTCA
ATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTATG
GGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCT
GTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTGGAGCA
CAGATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTC
ATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAGATCTCAAG
CCATTGAACGACCGAGTCTTTATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGGAGG
GTTGTTGCTAACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGG
ACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAGCGTCAGCCACTAGCAATATCGACTGGAATCAC
AGTTCTTTACTCCAAGTATGCTGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACAT
CGCCCTGAGAGCTTCGGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTTACATCTTTGTGACCTA
CTATTTGTATCCCAAATGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C063TF U 1
AF RR4BV39TF U 33
AF RR4BV39JQ C 203
AF RR4C063JQ C 736
BS 1 538 RR4C063TF
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RD RR4C063TF 544 0 0
GGAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCTTTCTTCTCTTATCCTCAAGACAGCA
GAAATGGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTTAGCC
TCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCTTAAGCAG
ACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATACTTCA
ATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTATG
GGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCT
GTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTGGAGCA
CAGATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTC
ATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAGATCTCA
GCCTTG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4BV39TF 597 0 0
G
CTTTCTTCTCTTATCCTCAAGACAGCAGAAATGGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCA
GTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTTAGCCTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGA
ACTTTGAAACCAGGCACCCTTAAGCAGACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCT
TCCGTCGTTGCTCCCAAGTATACTTCAATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTTAAG
ACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCA
AAACCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAA
ATCAATATCGATGTCCCTACTGGAGCACAGATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAA
GTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTT
GAGACGGAGGACATCAAAGATCTCAAGCCATTGAACGACCGAGTCTTTATTAAGGTTGCT
GAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGGAGGGTTGTTGCTAACCGAGACTACCAAAGAGA

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR4BV39JQ 682 0 0
TCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATACTTCAATTAAGCCATTGGGAGATAGAG
TTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCA
CAGCTCAATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTG
GGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTGGAGCACAGATCATTTACTCCAAATACG
CAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTG
TTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAGATCTCAAGCCATTGAACGACCGAGTCTTTA
TTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGG*AGGGTTGTTGCTAACCGAGACTACC
AAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAA
GGTAAGCGTCAGCCACTAGCAATATCGACTGGAATCACAGTTCTTTACTCCAAGTATGCT
GGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACATCGCCCTGAGAGCTTCGGATGTG
ATGGCTATCCTTTCTTAGTTTTACATCTTTGTGACCTGCTATTTGTATCCCAAATGTGGA
AATTTTTCATAAACGGCTTCAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4C063JQ 149 0 0
GTATGCTGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACATCGCCCTGAGAGCTTC
GGATGTGATGGCTATCCTTTTTTAGTTTTACATCTTTGTGACCTACTATTTGTATCCCAA
ATGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCAG

QA 1 149 1 149
DS 



AS 1 4

CO CL3094Contig1 1279 4 8 U
GGGTCCGAAAAAAATCTCTTTTATTTTAAGTTTTAGTTGCATACACTGGCACTCAAATCG
TCACAACGACAGTCAAAAGGGGAAATAAACGGCCAATAAAAAAAAAACAATCTGAAAAAA
AAATCAGAAATCCATAAGATTTGATCTCCGGTGACCCGACGTTCGGTGTTCCGATCACCG
TTGAAAAATGGATTCTCGAGTTTCTCTGTTCTGAGTAAACTCACACGGAGAAGAAGAAAG
CTTAAAATGGATTCGGAAGATACGAAGAAGCAGCAAAAGAGGGTCTTCTCTTTGTTAGCT
TTACGATTCTGTACAGTGATAGGATTCTGGATCATCGTCTTCTTCGTCTTGTCGTTTCTG
TTAGGAGTGTTAGTGATTATACTCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTATTCTCCATCT
GCCTCTCTTGCTTCCCGCTGCAAGATTCTTTCCAGCTCTGTTGATCTTAGGTCTTCCAAA
GTGTGCGGTATTGGACTTTTGAACAGCAAAGCACAACATGTGTTTCACCCTTTTGAGAGA
GATAAATTCAGATGTCGCTATGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAAGTAGAATATAAA
GATCACTTAATGGGTCAAACGAGGCTAGCGTTCTCAGAAGCACCTAATGAAGCCCTTCCT
CCTGAGTGCAGACCTAACTTTGGTGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAACTTCAAGGTGAAT
GAGACTTACGATTGCTGGTACACATTAGGGATTCCAAAAATCAAGCTTTATCAGGACGGC
TTTTTCGGTTGCCAACCAAATGATCTTTCTTTCACCGACATTTTTAAACAATACGCTGTC
TTAGTCTCCAAGTTAATACAGTCCTGGTTTAATGGAAAACGAAGACCAAAGTACTGGAGA
TATGATGTGATCGCTGGCGTTGTATCTGGCTTTTCTACTTCTATAGTCACAGTCTTCATC
GTACGGATCTTAAGTAATGCAAAATCTTGGTTCCCTCGAGCTTGTTGTTCGGTTAAGAGC
CGGCTGTCTAAAGTGAATCTCCTGGTACAAGTGAAGCGTGCGTGTTTGGTCATTGTTTAC
TTCTACATTCTCGGATGGATGGCTACACAGTACTTGAAAATTCTGTTTCCACAGGCTTAG
AAGAAACACATGTATAAAGAGTTGTGTGATGTAATCTTTAAACCATTTACAGCAAAAGTA
AGCAAATGCAGAGAACAGTTTTAGAATCTGATGAACGTTTTGATTAAACAGCCTAAAAGA
AACTGATGAATTCTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D752TF U 1
AF RR4E575TF U 260
AF RR4E575JQ C 504
AF RR4D752JQ C 703
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BS 340 619 RR4D752TF
BS 620 933 RR4E575TF
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CTTAAAATGGATTCGGAAGATACGAAGAAGCAGCAAAAGAGGGTCTTCTCTTTGTTAGCT
TTACGATTCTGTACAGTGATAGGATTCTGGATCATCGTTTTCTTCGTCTTGTCGTTTCTG
TTAGGAGTGTTAGTGATTATACTCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTATTCTCCATCT
GCCTCTCTTGCTTCCCGCTGCAAGATTCTTTCCAGCTCTGTTGATCTTAGGTCTTCCAAA
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GATCACTTAATGGGTCAAA

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TAGGATTCTGGATCATCGTCTTCTTCGTCTTGTCGTTTCTGTTAGGAGTGTTAGTGATTA
TACTCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTATTCTCCATCTGCCTCTCTTGCTTCCCGCT
GCAAGATTCTTTCCAGCTCTGTTGATCTTAGGTCTTCCAAAGTGTGCGGTATTGGACTTT
TGAACAGCAAAGCACAACATGTGTTTCACCCTTTTGAGAGAGATAAATTCAGATGTCGCT
ATGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAAGTAGAATATAAAGATCACTTAATGGGTCAAA
CGAGGCTAGCGTTCTCAGAAGCACCTAATGAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACT
TTGGTGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAACTTCAAGGTGAATGAGACTTACGATTGCTGGT
ACACATTAGGGATTCCAAAAATCAAGCTTTATCAGGACGGCTTTTTCGGTTGCCAACCAA
ATGATCTTTCTTTCACCGACATTTTTAAACAATACGCTGTCTTAGTCTCCAAGTTAATAC
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TTGTATCTGGCTTT*CTACTTCTATAGTCACAGTCTTCATCG

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TTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAAGTAGAATATAAAGATCACTTAATGGGTCAAACGAG
GCTAGCGTTCTCAGAAGCACCTAATGAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACTTTGG
TGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAACTTCAAGGTGAATGAGACTTACGATTGCTGGTACAC
ATTAGGGATTCCAAAAATCAAGCTTTATCAGGACGGCTTTTTCGGTTGCCAACCAAATGA
TCTTTCTTTCACCGACATTTTTAAACAATACGCTGTCTTAGTCTCCAAGTTAATACAGTC
CTGGTTTAATGGAAAACGAAGACCAAAGTACTGGAGATATGATGTGATCGCTGGCGTTGT
ATCTGGCTTTTCTACTTCTATAGTCACAGTCTTCATCGTACGGATCTTAAGTAATGCAAA
ATCTTGGTTCCCTCGAGCTTGTTGTTCGGTTAAGAGCCGGCTGTCTAAAGTGAATCTCCT
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TACACAGTACTTGAAAATTCTGTTTCCACAGGCTTAGAAGAAACACATGTATAAAGAGTT
GTGTGATGTAATCTTTAAACCATTTACAGCAAAAGTAAGCAAATGCAGAGAACAGTTTTA
G
G

QA 1 721 1 721
DS 

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AAGCTTTATCAGGACGGCTTTTTCGGTTGCCAACCAAATGATCTTTCTTT*ACCGACATT
TTTAAACAATACGCTGTCTTAGTCTCCAAGTTAATACAGTCCTGGTTTAATGGAAAACGA
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ATAGTCACAGTCTTCATCGTACGGATCTTAAGTAATGCAAAATCTTGGTTCCCTCGAGCT
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TGTTTGGTCATTGTTTACTTCTACATTCTCGGATGGATGGCTACACAGTACTTGAAAATT
CTGTTTCCACAGGCTTAGAAGAAACACATGTATAAAGAGTTGTGTGATGTAATCTTTAAA
CCATTTACAGCAAAAGTAAGCAAATGCAGAGAACAGTTTTAGAATCTGATGAACGTTTTG
ATTAAACAGCCTAAAAGAAACTGATGAATTCTTCTGC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 4

CO CL3095Contig1 840 4 7 U
GGAGACTCTCCTTCGTCCTCCCTGCCTCCATCGGCGCCGATCTTGACGAAACGGATTGAA
AGGCTGTGTTGTGTGGTCATCGTAATTACTCCGGATGTCTTTAATTCGTGCCTCTAATGC
GGTCTCTTCGGTTGCGCTGTTCATATCTGTATGTGTTATAAGAAGGGTGTTCTTCTCCGA
TCTGAAGTCCGCCCGGTGCTCCGCCGTCGTGGAGGCGCGACTGTTGCGATTCTGGGAAGC
CAGAAACGTCAAACGTGGTGGGGAGCTCATGTGGGCTGATCTTCTGTTGGTGGATGTCAA
TGTCATACTACAGAAAATTGCGGCTTTGATCTCTGCCAAGAGCCTTTCAAGTACAGATTG
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GTGAACTCCAAGTAAATTCTCTGATTTGAGATTAATGTGCTTCTTGCATTGGTTACCCTC
AAAACACAGGAGATTCAGTTGACTTACTTTGATCCAGGGAGCGCAGTAACAACAACACCA
ATCTCATGTTCTGACCAAAGATGCAGCTTGGGTGTTCAGTCATCTAATTCAAGCTGTTCT
GTTCAGAGCAGCCTTTGCGCTTACACGTTTCAGTATGGG*ATGGAAGTGGAACCTCAGGG
TTCTTCGTCTCTGATGTCTTGCAGTTTGACATTCGTTTGATTCCCATGACTTTGGCCAGA
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CAGTGATGAGCTCAAGGCTCAAGCCTTTTACTAATGTCACCTTCTCACCTGGATGTTTTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DK32TF U 1
AF RR4DM27TF U 1
AF RR4DK32JQ C 90
AF RR4DM27JQ C 133
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BS 640 640 RR4DM27TF
BS 641 728 RR4DK32TF
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BS 734 734 RR4DK32JQ
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BS 799 840 RR4DK32JQ

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GGTCTCTTCGGTTGCGCTGTTCATATCTGTATGTGTTATAAGAAGGGTGTTCTTCTCCGA
TCTGAAGTCCGCCCGGTGCTCCGCCGTCGTGGAGGCGCGACTGTTGCGATTCTGGGAAGC
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TGTCATACTACAGAAAATTGCGGCTTTGATCTCTGCCAAGAGCCTTTCAAGTACAGATTG
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GTGAACTCCAAGTAAATTCTCTGATTTGAGATTAATGTGCTTCTTGCATTGGTTACCCTC
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ATCTCATGTTCTGACCAAAGATGCAGCTTGGGTGTTCAGTCATCTAATTCAAGCTGTTCT
GTTCAGAGCAGCCTTTGCGCTTACACGTTTCAGTATGGGGATGGAAGTGGAACCTCAGGG
TTCTTCGTCTCTGATGTCTTGCAGTTTGACATTCGTTTGATTCCCATGACTTTGGCCAGA
CATGTCTC

QA 1 728 1 728
DS 

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AGGCTGTGTTGTGTGGTCATCGTAATTACTCCGGATGTCTTTAATTCGTGCCTCTAATGC
GGTCTCTTCGGTTGCGCTGTTCATATCTGTATGTGTTATAAGAAGGGTGTTCTTCTCCGA
TCTGAAGTCCGCCCGGTGCTCCGCCGTCGTGGAGGCGCGACTGTTGCGATTCTGGGAAGC
CAGAAACGTCAAACGTGGTGGGGAGCTCATGTGGGCTGATCTTCTGTTGGTGGATGTCAA
TGTCATACTACAGAAAATTGCGGCTTTGATCTCTGCCAAGAGCCTTTCAAGTACAGATTG
ACACAGGAGGTGATGTTTCGTGTGTTAGTTATGCTTCTTGCGATGGCTGCCCTCAAACCA
GTGAACTCCAAGTAAATTCTCTGATTTGAGATTAATGTGCTTCTTGCATTGGTTACCCTC
AAAACACAGGAGATTCAGTTGACTTACTTTGATCCAGGGAGCGCAGTAACAACAACACCA
ATCTCATGTTCTGACCAAAGATGCAGCTTGGGTGTTCAGTCATCTAATTCAAGCTGTTCT
GTTCAGAGCAGCCTTTGCGCTTACACGTTTCAGTATGGG*ATGGAAGTGGAACCTCAGGG
TTCTTCGTCTCTGATGTCTTGCAGTTTGACATTCGTTTGATTCCCATGACTTTGGCCAGA
CATGTCTCATTTT*GATTTAGTGCTCTGTTTCTAAGTGTTTTCTTCTTGCATCGCTTGAA
CAGTGATGAGCTCAAGGC

QA 1 798 1 798
DS 

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TATGTGTTATAAGAAGGGTGTTCTTCTCCGATCTGAAGTCCGCCCGGTGCTCCGCCGTCG
TGGAGGCGCGACTGTTGCGATTCTGGGAAGCCAGAAACGTCAAACGTGGTGGGGAGCTCA
TGTGGGCTGATCTTCTGTTGGTGGATGTCAATGTCATACTACAGAAAATTGCGGCTTTGA
TTTCTGCCAAGAGCCTTTCAAGTACAGATTGACACAGGAGGTGATGTTTCGTGTGTTAGT
TATGCTTCTTGCGATGGCTGCCCTCAAACCAGTGAACTCCAAGTAAATTTTTTGATTTGA
GATTAATGTGCTTCTTGCATTGGTTACCCTCAAAACACAGGAGATTCAGTTGACTTACTT
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GGGTGTTCAGTCATTTAATTCAAGCTGTTCTGTTCAGAGCAGCCTTTGCGCTTACACGTT
TCAGTATGGG*ATGGAAGTGGAACCTCAGGGTTCTTCGTCTCTGATGTCTTGCAGTTTGA
CATTCGTTTGATTCCCATGACTTTGGCCAGACATGTCTCATTTTTGATTTAGTGCTCTGT
TTCTAAGTGTTTTCTTCTTGCATCGCTTGAACAGTGATGAGCTCAAGGCTCAAGCCTTTT
ACTAATGTCACCTTCTCACCTGGATGTTTTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4DM27JQ 708 0 0
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CCGGTGCTCCGCCGTCGTGGAGGCGCGACTGTTGCGATTCTGGGAAGCCAGAAACGTCAA
ACGTGGTGGGGAGCTCATGTGGGCTGATCTTCTGTTGGTGGATGTCAATGTCATACTACA
GAAAATTGCGGCTTTGATTTCTGCCAAGAGCCTTTCAAGTACAGATTGACACAGGAGGTG
ATGTTTCGTGTGTTAGTTATGCTTCTTGCGATGGCTGCCCTCAAACCAGTGAACTCCAAG
TAAATTTTTTGATTTGAGATTAATGTGCTTCTTGCATTGGTTACCCTCAAAACACAGGAG
ATTCAGTTGACTTACTTTGATCCAGGGAGCGCAGTAACAACAACACCAATCTCATGTTCT
GACCAAAGATGCAGCTTGGGTGTTCAGTCATTTAATTCAAGCTGTTCTGTTCAGAGCAGC
CTTTGCGCTTACACGTTTCAGTATGGG*ATGGAAGTGGAACCTCAGGGTTCTTCGTCTCT
GATGTCTTGCAGTTTGACATTCGTTTGATTCCCATGACTTTGGCCAGACATGTCTCATTT
TTGATTTAGTGCTCTGTTTCTAAGTGTTTTCTTCTTGCATCGCTTGAACAGTGATGAGCT
CAAGGCTCAAGCCTTTTACTAATGTCACCTTCTCACCTGGATGTTTTT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

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AACGCTGAGTAACACACTTTCTTACAAAACCCAATACCCACAGACCAAACCAACCAAAGG
GAACACTCTATATACTCAATAACAAGAGACAAAAAGACCAACAGACTAAATGGTAGCAAC
GGATAGAGCCATGAGGAGACAATTGAACAACCAGGCACTCATCAATGCTTTCTTGATTGA
TGATGCAGCACTCAAACCGCAAGCACTACGATAACAATCAGGAGCACGATACCAAAAATC
ACCAAGAGCAAGCACGTCAGGGAAGAGTTCGATCTTTGTGTCTTTGAGGCTTTTGCGAGA
TGGGATTTTCCTTGTGCAGTTGCAGCGTGGGAGTTATCAATGTGAGTACTGATATCATCA
ATCATGGTTCCTTGATCATGTACCAACACTGCCAAGTATTTGAAGATTTCATGCACCTCC
CCGATTTGTTGCTGGATTTCTTCTATCCCTTGCTCTCTTTCTTCAATAATAGCCTCATTA
AACGCAATCTCATTGTCCAACAGTACAAATTCTTGTCTTTTTGATTCAACAAGAAGCGCA
CGCTGCTCTTGATGCTTATCTGCATTCACATCTATCTCACTGGCTGTATAGCTAGAAGGA
GGAGATGGTAGGGTCACAAGAGGAGCATACACGGTTTCTCTTTCAGCAGCGAGACGCTGA
GCCTTTTGAAACTCTTTCAATACAGATTGAAAGTCTTTTGCAAGCTTAGCATCCACAATC
TTCTTCTTTTGATTAACACCTCTTTGATGATCAGTTTCACTAGCTTCTTTAAGTTTAGCT
GCTGTGTCTTTCACTAACTGTCCGATATATAGTCTTGCCTTGTGCAGCTTATCTCGGAGC
TCGGGGGTGTCTTTGGGAGTACCGAGAGTGTTGACGAGTCGTTGGAAGCTAGAGACGCTT
GTGTTGATCTGAAAAATACCAGAAGCTACGGCTTGCGTCGTGTCTTGTCGAACTCCTCCT
CCATTGATGTTCCTTGACGAAGCTAATGATCTTCCTCTTCCCGCCTCTAAATCTCGAAAA
CTCATCCCTTTCTCCAAGTCTCGGGAAACCCACCACGAAAGTCTCTTCCTTTTGACGGTG
AGTATCGAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGACAGAGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4FI78JQ U 1
AF RR4EL74JQ U 5
AF RR4EL74TF C 400
AF RR4FI78TF C 459
BS 1 330 RR4FI78JQ
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BS 655 742 RR4EL74JQ
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BS 1088 1188 RR4EL74TF

RD RR4FI78JQ 654 0 0
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AACGCTGAGTAACACACTTTCTTACAAAACCCAATACCCACAGACCAAACCAACCAAAGG
GAACACTCTATATACTCAATAACAAGAGACAAAAAGACCAACAGACTAAATGGTAGCAAC
GGATAGAGCCATGAGGAGACAATTGAACAACCAGGCACTCATCAATGCTTTCTTGATTGA
TGATGCAGCACTCAAACCGCAAGCACTACGATAACAATCAGGAGCACGATACCAAAAATC
ACCAAGAGCAAGCACGTCAGGGAAGAGTTC*ATCTTTGTGTCTTTGAGGCTTTTGCGAGA
TGGGATTTTCCTTGTGCAGTTGCAGCGTGGGAGTTATCAATGTGAGTACTGATATCATCA
ATCATGGTTCCTTGATCATGTACCAACACTGCCAAGTCTTTGAAGATTTCATGCACCTCC
CCGATTTGTTGCTGGATTTCTTCTATCCCTTGCTCTCTTTCTTCAATAATAGCCTCATTA
AACGCAATCTCATTGTCCAACAGTACAAATTCTTGTCTTTTTGATTCAACAAGAAGCGCA
CGCTGCTCTTGATGCTTATCTGCATTCACATCTATCTCACTGGCTGTATAGCTA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4EL74JQ 738 0 0
GG
TTTCACTTTTATCAATCACTCTGGTCTTCAACAGAAGAATTGTCTTACATAGACAACGCT
GAGTAACACACTTTCTTACAAAACC*AATACCCACAGACCAAACCAACCAAAGGGAACAC
TCTATATACTCAATAACAAGAGACAAAAAGACCAACAGACTAAATGGTAGCAACGGATAG
AGCCATGAGGAGACAATTGAACAACCAGGCACTCATCAATGCTTTCTTGATTGATGATGC
AGCACTCAAACCGCAAGCACTACGATAACAATCAGGAGCACGATACCAAAAATCACCAAG
AGCAAGCACGTCAGGGAAGAGTTCGATCTTTGTGTCTTTGAGGCTTTTGCGAGATGGGAT
TTTCCTTGTGCAGTTGCAGCGTGGGAGTTATCAATGTGAGTACTGATATCATCAATCATG
GTTCCTTGATCATGTACCAACACTGCCAAGTATTTGAAGATTTCATGCACCTCCCCGATT
TGTTGCTGGATTTCTTCTATCCCTTGCTCTCTTTCTTCAATAATAGCCTCATTAAACGCA
ATCTCATTGTCCAACAGTACAAATTCTTGTCTTTTTGATTCAACAAGAAGCGCACGCTGC
TCTTGATGCTTATCTGCATTCACATCTATCTCACTGGCTGTATAGCTAGAAGGAGGAGAT
GGTAGGGTCACAAGAGGAGCATACACGGTTTCTCTTTCAGCAGCGAGACGCTGAGCCTTT
TGAAACTCTTTCAATA

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR4EL74TF 789 0 0
ATGTGAGTACTGATATCATCAATCATGGTTC*TTGATCATGTACCAACACTGCCAAGTAT
T*GAAGATTTCATGCACCTCCCCGATTTGTTGCTGGATTTCTTCTATCCCTTGCTCTCTT
TCTTCAATAATAGCCTCATTAAACGCAATCTCATTGTCCAACAGTACAAATTCTTGTCTT
TTTGATTCAACAAGAAGCGCACGCTGCTCTTGATGCTTATCTGCATTCACATCTATCTCA
CTGGCTGTATAGCTAGAAGGAGGAGATGGTAGGGTCACAAGAGGAGCATACACGGTTTCT
CTTTCAGCAGCGAGACGCTGAGCCTTTTGAAACTCTTTCAATACAGATTGAAAGTCTTTT
GCAAGCTTAGCATCCACAATCTTCTTCTTTTGATTAACACCTCTTTGATGATCAGTTTCA
CTAGCTTCTTTAAGTTTAGCTGCTGTGTCTTTCACTAACTGTCCGATATATAGTCTTGCC
TTGTGCAGCTTATCTCGGAGCTCGGGGGTGTCTTTGGGAGTACCGAGAGTGTTGACGAGT
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CCCGCCTCTAAATCTCGAAAACTCATCTCTTTCTCCAAGTCTCGGGAAACCCACCACGAA
AGTCTCTTCCTTTTGACGGTGAGTATCGAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGACAG
AGAGATTCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4FI78TF 727 0 0
TCTTGAAGA
TTCATGCACCTCCCCGATTTGT*GCTGGATT*CTTCTATCCCTTGCTCTCTTTCTTCAAT
AATAGCCTCATTAAACGCAATCTCATTGTCCAACAGTACAAATTCTTGTCTTTTTGATTC
AACAAGAAGCGCACGCTGCTCTTGATGCTTATCTGCATTCACATCTATCTCACTGGCTGT
ATAGCTAGAAGGAGGAGATGGTAGGGTCACAAGAGGAGCATACACGGTTTCTCTTTCAGC
AGCGAGACGCTGAGCCTTTTGAAACTCTTTCAATACAGATTGAAAGTCTTTTGCAAGCTT
AGCATCCACAATCTTCTTCTTTTGATTAACACCTCTTTGATGATCAGTTTCACTAGCTTC
TTTAAGTTTAGCTGCTGTGTCTTTCACTAACTGTCCGATATATAGTCTTGCCTTGTGCAG
CTTATCTCGGAGCTCGGGGGTGTCTTTGGGAGTACCGAGAGTGTTGACGAGTCGTTGGAA
GCTAGAGACGCTTGTGTTGGTCTGAAAAATACCAGAAGCTACGGCTTGCGTCGTGTCTTG
TCGAACTCCTCCTCCATTGATGTTCCTTGACGAAGCTAATGATCTTCCTCTTCCCGCCTC
TAAATCTCGAAA*CTCATCCCTTTCTCCAAGTCTCGGGAAACCCACCACGAAAGTCTCTT
CCTTTTGACGGTGAGTATCGAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGACAGAGAG
CC

QA 10 725 10 725
DS 



AS 1 4

CO CL3097Contig1 1350 4 2 U
TTTTTCAGGCCATCGACGTCGCTCACAACGGGTGCATTTTGCCCGAGGAGCTCTGGGAGG
CTCTGGTTAAGGCTGGCATTGAAATAGATGACGAGGAACTCGCTCGTTTTGTGGACCATG
TTGATAAGGACAACAATGGAACCATAACGTTCGAGGACTGGAGAGATTTTCTTCTGTTAT
ACCCTCACGAAGCCACCATTGAGAACATATACCATCACTGGGAAAGAGTCTGCTTGATAG
ACATCGGAGAGCAAGCTGTTATACCAGACGGTATAAGCAAACATGTCAAAAGAACAGGCT
GCTTCTCGCGGGAGGATTAGCCGGAGCCATTTCCAGAACCGCGACCGCGCCTCTCGATCG
CTTGAAAGTCGTTCTGCAGGTTCAGAGAGGGCACGCGGGGGTCCTCCCGACCGTCAAGAA
GATATGGAGGGAAGATAAGTTGAAGGGTTTCTTCAGAGGTAACGGGTTGAATGTGATGAA
GGTTGCTCCCGAGAGCGCCATCAAGTTCTGTGCGTACGAGATGCTGAAACCTATGATTGG
TGGGGGAGAGGGAGGTATATCGGTACGAGCGCGAGGCTTTTGGCTGGTGGAATGGCTGGT
GCGGTGGCTCAGACCGCTATTTACCCTATGGATCTTGTGAAGACTCGGTTGCAGACTTGT
TGTGTGAGCGAAGGTGGGAAGGCGCCGAAGCTGTGGAAGCTCACGAAGGATATATGGGTG
AGGGAGGGACCTAGGGCGTTCTATAAGGGTCTGTTTCCGTCTCTTCTTGGGATTATACCT
TATGCAGGGATCGATCTAGCTGCTTATGAAACGCTAAAGGACTTGTCTAGAACATACATT
CTTCAAGACACCGAGCCGGGTCCACTGATACAGCTTAGCTGTGGAATGACATCAGGAGCT
CTCGGAGCATCATGCGTTTACCCGTTACAGGTTGTAAGAACAAGAATGCAAGCAGATAGT
TCAGAGACGACAATGAGGCAAGAGTTTATGAAAACGATGAGAGGCGAAGGTTTGAGAGGA
TTCTACAGAGGACTCTTACCTAATCCTCTCAAAGTAGTTCCAGCTGCAAGCATTACATAC
ATGGTTTATGAAGCTATGAAGAAAAACATGGCTCTTGATTGATTAGAGCCAAAATACACA
TTTTTCTTGGGGTTTAGTCATTCTTTTTTTTTTTTTATTCGAGAAGCAGATGGTTTCTTG
ACTCTTGAGCTCTAGATTTATGCGAGATAACATAAACAAGCCGGTACTGTAATATGTCTG
GTCTTTGATGTGTTCATGATCCAAGGCTCAAGTCTGTAAAGTTACATATTCAAAACGGAT
ATTGGATGGGTTAAATTTACGTTTTGGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G986TF U 1
AF RR4FO02TF U 1
AF RR4G986JQ C 562
AF RR4FO02JQ C 831
BS 1 643 RR4FO02TF
BS 644 1350 RR4G986JQ

RD RR4G986TF 369 0 0
TTTTTCAGGCCATCGACGTCGCTCACAACGGGTGCATTTTGCCCGAGGAGCTCTGGGAGG
CTCTGGTTAAGGCTGGCATTGAAATAGATGACGAGGAACTCGCTCGTTTTGTGGACCATG
TTGATAAGGACAACAATGGAACCATAACGTTCGAGGACTGGAGAGATTTTCTTCTGTTAT
ACCCTCACGAAGCCACCATTGAGAACATATACCATCACTGGGAAAGAGTCTGCTTGATAG
ACATCGGAGAGCAAGCTGTTATACCAGACGGTATAAGCAAACATGTCAAAAGAACAGGCT
GCTTCTCGCGGGAGGATTAGCCGGAGCCATTTCCAGAACCGCGACCGCGCCTCTCGATCG
CTTGAAAGT

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4FO02TF 643 0 0
TTTTTCAGGCCATCGACGTCGCTCACAACGGGTGCATTTTGCCCGAGGAGCTCTGGGAGG
CTCTGGTTAAGGCTGGCATTGAAATAGATGACGAGGAACTCGCTCGTTTTGTGGACCATG
TTGATAAGGACAACAATGGAACCATAACGTTCGAGGACTGGAGAGATTTTCTTCTGTTAT
ACCCTCACGAAGCCACCATTGAGAACATATACCATCACTGGGAAAGAGTCTGCTTGATAG
ACATCGGAGAGCAAGCTGTTATACCAGACGGTATAAGCAAACATGTCAAAAGAACAGGCT
GCTTCTCGCGGGAGGATTAGCCGGAGCCATTTCCAGAACCGCGACCGCGCCTCTCGATCG
CTTGAAAGTCGTTCTGCAGGTTCAGAGAGGGCACGCGGGGGTCCTCCCGACCGTCAAGAA
GATATGGAGGGAAGATAAGTTGAAGGGTTTCTTCAGAGGTAACGGGTTGAATGTGATGAA
GGTTGCTCCCGAGAGCGCCATCAAGTTCTGTGCGTACGAGATGCTGAAACCTATGATTGG
TGGGGGAGAGGGAGGTATATCGGTACGAGCGCGAGGCTTTTGGCTGGTGGAATGGCTGGT
GCGGTGGCTCAGACCGCTATTTACCCTATGGATCTTGTGAAGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4G986JQ 789 0 0
GGTACGAGCGCGAGGCTTTTGGCTGGTGGAATGGCTGGTGCGGTGGCTCAGACCGCTATT
TACCCTATGGATCTTGTGAAGACTCGGTTGCAGACTTGTTGTGTGAGCGAAGGTGGGAAG
GCGCCGAAGCTGTGGAAGCTCACGAAGGATATATGGGTGAGGGAGGGACCTAGGGCGTTC
TATAAGGGTCTGTTTCCGTCTCTTCTTGGGATTATACCTTATGCAGGGATCGATCTAGCT
GCTTATGAAACGCTAAAGGACTTGTCTAGAACATACATTCTTCAAGACACCGAGCCGGGT
CCACTGATACAGCTTAGCTGTGGAATGACATCAGGAGCTCTCGGAGCATCATGCGTTTAC
CCGTTACAGGTTGTAAGAACAAGAATGCAAGCAGATAGTTCAGAGACGACAATGAGGCAA
GAGTTTATGAAAACGATGAGAGGCGAAGGTTTGAGAGGATTCTACAGAGGACTCTTACCT
AATCCTCTCAAAGTAGTTCCAGCTGCAAGCATTACATACATGGTTTATGAAGCTATGAAG
AAAAACATGGCTCTTGATTGATTAGAGCCAAAATACACATTTTTCTTGGGGTTTAGTCAT
TCTTTTTTTTTTTTTATTCGAGAAGCAGATGGTTTCTTGACTCTTGAGCTCTAGATTTAT
GCGAGATAACATAAACAAGCCGGTACTGTAATATGTCTGGTCTTTGATGTGTTCATGATC
CAAGGCTCAAGTCTGTAAAGTTACATATTCAAAACGGATATTGGATGGGTTAAATTTACG
TTTTGGTTC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4FO02JQ 520 0 0
AACATACATTCTTCAAGACACCGAGCCGGGTCCACTGATACAGCTTAGCTGTGGAATGAC
ATCAGGAGCTCTCGGAGCATCATGCGTTTACCCGTTACAGGTTGTAAGAACAAGAATGCA
AGCAGATAGTTCAGAGACGACAATGAGGCAAGAGTTTATGAAAACGATGAGAGGCGAAGG
TTTGAGAGGATTCTACAGAGGACTCTTACCTAATCCTCTCAAAGTAGTTCCAGCTGCAAG
CATTACATACATGGTTTATGAAGCTATGAAGAAAAACATGGCTCTTGATTGATTAGAGCC
AAAATACACATTTTTCTTGGGGTTTAGTCATTTTTTTTTTTTTTTTATTCGAGAAGCAGA
TGGTTTCTTGACTCTTGAGCTCTAGATTTATGCGAGATAACATAAACAAGCCGGTACTGT
AATATGTCTGGTCTTTGATGTGTTCATGATCCAAGGCTCAAGTCTGTAAAGTTACATATT
CAAAACGGATATTGGATGGGTTAAATTTACGTTTTGGTTC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 4

CO CL3098Contig1 992 4 2 U
GGATACCAATTAACTTGGCTTTGAAGCCCTCTATTTGCTTCTTCATCTTCCTTCCTTCCT
TCCTTCTCTCTCTGCGCCTTTTAGATTCTCAAAACTCATTTCCCCCACCCTCTCCTAACC
CAAACATCATTCTTGTTCTCTGTGCTGAGGACACACGCACGTACACGAGTTAGTCTTCAG
ATGGGATCCTGTGTCTCCTCTTCTCACAACACCATCAAGACTTCCTCTGATTCCGCCGCA
AAGCTTTCGGCTCTAATCTCTGAACCTGACACGACATCCCCCGTTAAGAATGACATCATA
AATCCGGCCACAATCAATGGGAACTCTTTCATAGATTCCGCTCCTCGGGATTCCTCAGAG
GAGATCACGTTTTTCGATTCAAGGGGGTGGCTTGATTCTGACTGTGAAGATGATTTCATG
AGCGTTGATGGTGAATTTACGCCGTCACGAGGAACAACACCGGTCCATCACAAATTCTGT
GACCAAACTACTAAAGCAGATGAGCAAAAATATAAAGAAGAACCGTCTCCAACAGACAAC
AAGAAGAGACTCATCGAACTCTTCAAAGAGACGCAGGATCAAGATGAGGATGAGGATGAA
GAAGAGGATGACGTGGCAGAAGGTAAAGCAAGAGCATGTCTCTGGCTAAGAACACCGGCC
AGATCTTCTGCACCGGCGACTCCTTATAATAATAATGATACAGAAAGACAACAACTCAAG
AGAGTGAAATCGGCGGCTCAAGGCGGCTGCGTTCTGCGTTTGGTTTCTTGTAGCAGCTTC
ACTGAGCGGCGACGGAAGATGATGAATCATACCCCCGTTCACGTCCAACGCTAAGCCACC
CCTCCTCCCTTCCTAAGAAAACTTAATTAAACTACTATATACGTTTAGCTTCTTAATTTG
TCCCCCCTAGTTTCTTTTCTAAACGCTCTGACAATGTTCTCTTCGTAGCTCATAATGCCT
TCTTACATTTGTAATAATGCACTATTTTCTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AG84TF U 1
AF RR4AE50TF U 1
AF RR4AE50JQ C 270
AF RR4AG84JQ C 270
BS 1 790 RR4AE50TF
BS 791 992 RR4AE50JQ

RD RR4AG84TF 729 0 0
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TCCTTCTCTCTCTGCGCCTTTTAGATTCTCAAAACTCATTTCCCCCACCCTCTCCTAACC
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AAGCTTTCGGCTCTAATCTCTGAACCTGACACGACATCCCCCGTTAAGAATGACATCATA
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AGCGTTGATGGTGAATTTACGCCGTCACGAGGAACAACACCGGTCCATCACAAATTCTGT
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AAGAAGAGACTCATCGAACTCTTCAAAGAGACGCAGGATCAAGATGAGGATGAGGATGAA
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AGATCTTCTGCACCGGCGACTCCTTATAATAATAATGATACAGAAAGACAACAACTCAAG
AGAGTGAAA

QA 1 729 1 729
DS 

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GGATACCAATTAACTTGGCTTTGAAGCCCTCTATTTGCTTCTTCATCTTCCTTCCTTCCT
TCCTTCTCTCTCTGCGCCTTTTAGATTCTCAAAACTCATTTCCCCCACCCTCTCCTAACC
CAAACATCATTCTTGTTCTCTGTGCTGAGGACACACGCACGTACACGAGTTAGTCTTCAG
ATGGGATCCTGTGTCTCCTCTTCTCACAACACCATCAAGACTTCCTCTGATTCCGCCGCA
AAGCTTTCGGCTCTAATCTCTGAACCTGACACGACATCCCCCGTTAAGAATGACATCATA
AATCCGGCCACAATCAATGGGAACTCTTTCATAGATTCCGCTCCTCGGGATTCCTCAGAG
GAGATCACGTTTTTCGATTCAAGGGGGTGGCTTGATTCTGACTGTGAAGATGATTTCATG
AGCGTTGATGGTGAATTTACGCCGTCACGAGGAACAACACCGGTCCATCACAAATTCTGT
GACCAAACTACTAAAGCAGATGAGCAAAAATATAAAGAAGAACCGTCTCCAACAGACAAC
AAGAAGAGACTCATCGAACTCTTCAAAGAGACGCAGGATCAAGATGAGGATGAGGATGAA
GAAGAGGATGACGTGGCAGAAGGTAAAGCAAGAGCATGTCTCTGGCTAAGAACACCGGCC
AGATCTTCTGCACCGGCGACTCCTTATAATAATAATGATACAGAAAGACAACAACTCAAG
AGAGTGAAATCGGCGGCTCAAGGCGGCTGCGTTCTGCGTTTGGTTTCTTGTAGCAGCTTC
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QA 1 790 1 790
DS 

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AACTACTATATACGTTTAGCTTCTTAATTTGTCCCCCCTAGTTTCTTTTCTAAACGCTCT
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TGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4AG84JQ 723 0 0
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CATAGATTCCGCTCCTCGGGATTCCTCAGAGGAGATCACGTTTTTCGATTCAAGGGGGTG
GCTTGATTCTGACTGTGAAGATGATTTCATGAGCGTTGATGGTGAATTTACGCCGTCACG
AGGAACAACACCGGTCCATCACAAATTCTGTGACCAAACTACTAAAGCAGATGAGCAAAA
ATATAAAGAAGAACCGTCTCCAACAGACAACAAGAAGAGACTCATCGAACTCTTCAAAGA
GACGCAGGATCAAGATGAGGATGAGGATGAAGAAGAGGATGACGTGGCAGAAGGTAAAGC
AAGAGCATGTCTCTGGCTAAGAACACCGGCCAGATCTTCTGCACCGGCGACTCCTTATAA
TAATAATGATACAGAAAGACAACAACTCAAGAGAGTGAAATCGGCGGCTCAAGGCGGCTG
CGTTCTGCGTTTGGTTTCTTGTAGCAGCTTCACTGAGCGGCGACGGAAGATGATGAATCA
TACCCCCGTTCACGTCCAACGCTAAGCCACCCCTCCTCCCTTCCTAAGAAAACTTAATTA
AACTACTATATACGTTTAGCTTCTTAATTTGTCCCCCCTAGTTTCTTTTCTAAACGCTCT
GACAATGTTCTCTTCGTAGCTCATAATGCCTTCTTACATTTGTAATAATGCACTATTTTC
TGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 4

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TAGCCTGCTTTAAACAAAGGTCATAAAACCTTTAATGTGATGATGTACGGGCTGTGACGT
ATCCAAATTTTCGGACATTCTCC


BQ
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AF RR4BQ62TF U 1
AF RR4BQ62JQ C 1
BS 1 2 RR4BQ62JQ
BS 3 619 RR4BQ62TF
BS 620 683 RR4BQ62JQ

RD RR4BQ62TF 625 0 0
GG
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ATGCAAGTGAATCAACCAAAAGTGGAAACAAATATTTTCTCTAGCGTTTCAAATTTTGTA
GCCTGCTTTAAACAAAG
GTCATA

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4BQ62JQ 683 0 0
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CTCAAATCAAATCCATGGCGGACGACGATTACCAAGATGTCGACGATTTGGGGTACGAGG
ACGAGCCAGCGGAGCCGGAGATTGAGGAAGGAATAGAGGAGGATGCTGATATGAAGGAAA
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CGCGTCCGCGTAAAACATCCAAGTTCATGACCAAGTATGAGCGGGCTAGGATACTAGGCA
CTCGTGCTCTCCAGATAAGCATGAATGCACCCGTGATGGTGGAGCTGGAGGGTGAAACTG
ATCCACTTGAGATCGCAATGAAGGAGCTTAGACAGCGTAAGATACCCTTCACGATCAGGC
GTTACTTACCCGACGGGAGTTTTGAAGAATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAATACT
CGTGGGAACGTCAAGTCGGTGGTGATTAATCCATAAAATTGCTCTTATTATGTTATTGTT
ATATGCAAGTGAATCAACCAAAAGTGGAAACAAATATTTTCTCTAGCGTTTCAAATTTTG
TAGCCTGCTTTAAACAAAGGTCATAAAACCTTTAATGTGATGATGTACGGGCTGTGACGT
ATCCAAATTTTCGGACATTCTCC

QA 1 683 1 683
DS 



CO CL3099Contig2 744 2 4 U
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CCGAATAAAAATCCAATCCTCCAGTCAGTCAGTTCCTCACACACCAAAGCGGCCTCTGCT
ACGACACCTAGGGTTTCACGAGGAGTGAAAATCTCAAATCAAATCCATGGCGGACGACGA
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GACCAAGTATGAGCGGGCTAGGATACTAGGCACTCGTGCTCTCCAGATAAGCATGAATGC
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ATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAAGACTCGTGGAAACGTCAAGTCGGTGGTGATTA
ATCCATAAAATTGCTCTTATTATGTAGACCTTCTATGTTATTGTTATATGCAAGTGAATC
AACCAAAAGTGGAAACAAATATTTTCTCTAGTGTTTCAAATTTTGTAGCCTGCTTTAAAC
AAAGGTCATAAAACCTTTAATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FJ19TF U 1
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AAAG
TCAT

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DS 

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TAGGATACTAGGCACTCGTGCTCTCCAGATAAGCATGAATGCACCTGTGATGGTGGAGCT
GGAGGGTGAAACTGATCCACTTGAGATCGCAATGAAGGAGCTTAGACAGCGTAAGATACC
TTTCACGATCAGGCGTTACTTACCCGACGGGAGTTTTGAAGAATGGGGAGTGGATGAACT
CATTGTGGAAGACTCGTGGAAACGTCAAGTCGGTGGTGATTAATCCATAAAATTGCTCTT
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AATGTG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

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TTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTCTCGTTCCAGAGCTCAAGCTGTGCAATCACCTGG
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GGATCAATCTCAGTCACGATCACACGTGCACCGGCGGTTTTCATGGCTGCAGCACAACCC
TTTCCGACATCACCATAACCGCAGATAACAGCGACCTTTCCGGCGATCATGACATCAGTG
GCTCTCATGAGACCGTCAGGGAGAGAGTGGCGACATCCATACAAGTTGTCAAACTTGCTC
TTAGTGACGGAGTCATTGACGTTAATGGCAGGGAACAAGAGAGCTCCAGTCTCCTGCATC
TGGTAAAGCCTCTTAACACCAGTGGTCGTCTCCTCAGAGACACCAACCAATCTCTCCTTC
ATCTTGTCCCA


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV07JQ U 1
AF RR4GV07TF C 1
AF RR4CE82JQ U 46
AF RR4CE82TF C 572
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RD RR4GV07JQ 716 0 0
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AGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACACCCACCTATCA
GTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCAAGTCCTTGCATGTCG
ATTTCATTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACAATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4GV07TF 716 0 0
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ACTCAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACAAAGA
ACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAAGGACCT
TCAACGGGTATGCTAACGTAGTCGGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGCACCT
AGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACATATACC
TTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTCTCGTTCCAGAGCTCAAGCTGTGCAATCACCTGG
TTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTAGGGTGTCCAGTGGCACATCCCAAGTTCATC
AGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACACCCACCTATCA
GTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCAAGTCCTTGCATGTCG
ATTTCATTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACAATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4CE82JQ 705 0 0
GGGA
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ACCAATATTTGATCAACTTCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACC*A
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GTCTAGCACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCA
AAACATATACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTCTCGTTCCAGAGCTCAAGCTGTG
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CCAAGTTCATCAGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACA
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CTTGCATGTCGATTTCATTGTAAAAGTGACCAATGTTGCAGACAATGGCGTTGTTCTTCA
TCTTCCCCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCA

QA 5 705 5 705
DS 

RD RR4CE82TF 580 0 0
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CAATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCCCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAG
TGGTGGTGCAAAAGATGTCAGCTTCAGAGACAACGTCCTCAAGGGTTAGAACTTGAAGGC
CTTCCATGAGAGCCTGAAGGGCACATATTGGATCAATCTCAGTCACGATCACACGTGCAC
CGGCGGTTTTCATGGCTGCAGCACAACCCTTTCCGACATCACCATAACCGCAGATAACAG
CGACCTTTCCGGCGATCATGACATCAGTGGCTCTCATGAGACCGTCAGGGAGAGAGTGGC
GACATCCATACAAGTTGTCAAACTTGCTCTTAGTGACGGAGTCATTGACGTTAATGGCAG
GGAACAAGAGAGCTCCAGTCTCCTGCATCTGGTAAAGCCTCTTAACACCAGTGGTCGTCT
CCTCAGAGACACCAACCAATCTCTCCTTCATCTTGTCCCA

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 4

CO CL3101Contig1 758 4 3 U
GGGAAGCTAGTTTTGTGGAGCTACCATCTCTTCTTGTTGATTCTTCAGAAACACACTGTT
CCATTATCTCTCTTACAACAACCACATAAGCAAAAAGCAAACTTGTTTTCAAGATGGAGA
AGAAACTGATAATGTTTTTGTTTGTTCTTCTGCAACTGCTGTTAGTAGTAAACTCTCTTT
CTCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAATGGGTTTTGTTTACT
GCGATGTCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTTCATGTCCGGCGTGGAAG
TGAGAATAGTCTGCAGATTCAAATCAGCTTCATCGAGAACAAACGAGATGGTAACATTCT
CTGCAAACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCATAACTTCTCTAGATT
GCGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGTCGGAAGAAGAAGCT
CTTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGATCAAGTCGTGTTTA
AGTCTAAACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAATTTCAGACCCTTCA
AGAGGGATCTTGCCTTGTGTGGCAAGAAATAGAGGGTTTTTAAACAATTATCTTCGACTG
TTATTGAGTATGTTGCTTCTACTCAGAGATATCGTCTTAGCAGCACGAAGAAGATATCGT
TTTTATTTAATCAAATAACTGAAAATGCGTTTCTGTCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BM43TF U 1
AF RR4GU19TF U 45
AF RR4BM43JQ C 2
AF RR4GU19JQ C 45
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BS 338 705 RR4GU19TF
BS 706 758 RR4BM43JQ

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DS 

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GG
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AGTAAACTCTCTTTCTCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAAT
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AACTTCTCTAGATTGCGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGT
CGGAAGAAGAAGCTCTTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGA
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QA 3 661 3 661
DS 

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CATTATCTCTCTTACAACAACCACATAAGCAAAAAGCAAACTTGTTTTCAAGATGGAGAA
GAAACTGATAATGTTTTTGTTTGTTCTTCTGCAACTGCTGTTAGTAGTAAACTCTCTTTC
TCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAATGGGTTTTGTTTACTG
CGATGTCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTTCATGTCCGGCGTGGAAGT
GAGAATAGTCTGCAGATTCAAATCAGCTTCATCGAGAACAAACGAGATGGTAACATTCTC
TGCAAACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCATAACTTCTCTAGATTG
CGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGTCGGAAGAAGAAGCTC
TTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGATCAAGTCGTGTTTAA
GTCTAAACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAATTTCAGACCCTTCAA
GAGGGATCTTGCCTTGTGTGGCAAGAAATAGAGGGTTTTTAAACAATTATCTTCGACTGT
TATTGAGTATGTTGCTTCTACTCAGAGATATCGTCTTAGCAGCACGAAGAAGATATCGTT
TTTATTTAATCAAATAACTGAAAATGCGTTTCTGTCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GU19JQ 714 0 0
GG
AGAAACACACTGTTCCATTATCTCTCTTACAACAACCACATAAGCAAAAAGCAAACTTGT
TTTCAAGATGGAGAAGAAACTGATAATGTTTTTGTTTGTTCTTCTGCAACTGCTGTTAGT
AGTAAACTCTCTTTCTCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAAT
GGGTTTTGTTTACTGCGATGTCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACATACAGTTACTTCAT
GTCCGGCGTGGAAGTGAGAATAGTCTGCAGATTCAAATCAGCTTCATCGAGAACAAACGA
GATGGTAACATTCTCTGCAAACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCAT
AACTTCTCTAGATTGCGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGT
CGGAAGAAGAAGCTCTTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGA
TCAAGTCGTGTTTAAGTCTAAACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAA
TTTCAGACCCTTCAAGAGGGATCTTGCCTTGTGTGGCAAGAAATAGAGAGTTTTTAAACA
ATTATCTTCGACTGTTATTGAGTATGTTGCTTCTACTCAGAGATATCGTCTTAGCAGCAC
GAAGAAGATATCGTTTTTATTTAATCAAATAACTGAAAATGCGTTTCTGT
TT

QA 3 712 3 712
DS 



AS 1 3

CO CL3102Contig1 990 3 21 U
CACTTTGCTGAAAAGAAATAAAAGATAAAATGGTGGTACAAAAGTAAATGGATACAGATG
AGAGTACAATGTTGGTACAGTTTTCTGACCAGTGGATGGATTATACAGTTAACCAAATGC
ACTATGGTGGAGGGGTGCAGAGTCACGGCTCATCTTTCTCTGCTGATTCGCATCTTCATC
TTTGTTCTCTATCTCTGCGCTCGAGGAGGGTTTAGAAGTGTTGAGTAACCCTTTGAACCA
ACTGCCTTGCAATCTCACGTTCCCATTTTCTGAATTGGTGAGGGTACCTCCAGGTCGTTG
CTGAGAGCCGTTGGAGCCGTTGGTTACGTTTGATGTAACATTGGAAAGGAAGCGATATGC
CACTTTACTAGCTGATACTAGTTCAGTTTTGGCTTGCTTTATCCTCATCGCTGTGTTTCC
TGCAACTTCCAAGGCCGTGTCACCAGCATGAGCAAATCGATTCACCCAACCTGGGAGCTT
TGGGACGCCAAGTACATCACAGAGAACATCACAGAAGTGATTGCAGTTTTTGGACAAGAG
ATCATAAGAATGTCCAGGCCATTCCCTGCTGAGATCACGCAGGATCTGATTGACCATGAA
AATGGTGCAATCAGTCCTCCCAAGGACGATTTTCTCACGATAAGTATACATAGGGTTCTT
GCTGCTAGGACAGCTGAAGACGCCAGTTCCTTGTTCACAAAACCCATAAGACCACTCATC
ATCTCCATATACCTGAATGGCGCTGTGGAAGATGCCGCCAAGGCCAATACCGTCTTTGAA
GAACCTGTTGATCTGGAGAATGGTGTTGTTTGTCTTCTCCGATCCACTGTTTGTCACATC
GTATATGTGTAGTACAACCTCCGCCATGATTACTCCCTCTCACTACCAGATAAAGCTCGA
ACCCTAATTTCTAAGCAAATGAGGAGTTGGAAGATTCTATCTGTAGCTGGAAACCCTAAA
TAAAGGACTTGAACCAAATCCACTTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GZ08JQ U 1
AF RR4AW40JQ U 26
AF RR4GZ08TF C 281
BS 1 38 RR4GZ08JQ
BS 39 39 RR4AW40JQ
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BS 102 213 RR4GZ08JQ
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BS 540 622 RR4AW40JQ
BS 623 990 RR4GZ08TF

RD RR4GZ08JQ 539 0 0
CACTTTGCTGAAAAGAAATAAAAGATAAAATGGTGGTAGAAAAGTAAATGGATACATATG
AGAGTACAGTTTTGGTACAGTTTTC*GACGTGTGGA*****TATACAGTTAACCAAATGC
ACTATGGTGGAGGGGTGCAGAGTCACGGCTCATCTTTCTCTGCTGATTCGCATCTTCATC
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ACTGCCTTGCAATCTCACGTTCCCATTTTCTGAATTGGTGAGGGTACCTCCAGGTCGTTG
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CACTTTACTAGCTGATACTAGTTCAGTTTTGGCTTGCTTTATCCTCATCGCTGTGTTTCC
TGCAACTTCCAAGGCCGTGTCACCAGCATGAGCAAATCGATTCACCCAACCTGGGAGCTT
TGGGACGCCAAGTACATCACAGAGAACATCACAGAAGTGATTGCAGTTTTTGGACAAGA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4AW40JQ 597 0 0
CCAATAGT
TGGTACAAAAGTAAATGGATACAGATGAGAGTACAATGTTGGTACAGTTTTCTGACCAGT
GGATGGATTATACAGTTAACCAAATGCACTATGGTGGAGGGGTGCAGAGTCACGGCTCAT
CTTTCTCTGCTGATTCGCATCTTCATCTTTGTTCTCTATCTCTGTGCTTGAGGAGGGTTT
AGAAGTGTTGAGTAACCCTTTGAACCAACTGCCTTGCAATCTCCCGTTCCCATTTTCTGA
GTTGGTGAGGGTTCCTCCAGGTCGTTGCTGAGAGCCATTGGAGCCGTTGGTTACGTTTGA
TGTAACATTGGAAAGGAAGCGATATGCCACTTTACTAGCTGATACTAGTTCAGTTTTGGC
TTGCTTTATCCTCATCGCTGTGTTTCCTGCAACTTCCAAGGCCGTGTCACCAGCATGAGC
AAATCGATTCACCCAACCTGGGAGCTTTGGGACGCCAAGTACATCACAGAGAACATCACA
GAAGTGATTGCAGTTTTTGGACAAGAGATCATAAGAATGTCCAGGCCATTCCCTGCTGAG
ATCACGCAGGATCTGATTGACCATGAAAATGGTGCAATCAGTCCTCCCA

QA 9 597 9 597
DS 

RD RR4GZ08TF 710 0 0
GTGAGGGTACTCAGGTCG
TGCTGAGAGCCGTTGGAGCCGTTGGTTACGTTTGATGTAACATTGGAAAGGAAGCGATAT
GCCACTTTACTAGCTGATACTAGTTCAGTTTTGGCTTGCTTTATCCTCATCGCTGTGTTT
CCTGCAACTTCCAAGGCCGTGTCACCAGCATGAGCAAATCGATTCACCCAACCTGGGAGC
TTTGGGACGCCAAGTACATCACAGAGAACATCACAGAAGTGATTGCAGTTTTTGGACAAG
AGATCATACGAATGTCCAGGCCATTCCCTGCTGAGCTCACGCAGGATCTGATTGACCATG
AAAATGGTGCAATCAGTCCTCCCAAGGACGATTTTCTCACGATAAGTATACATAGGGTTC
TTGCTGCTAGGACAGCTGAAGACGCCAGTTCCTTGTTCACAAAACCCATAAGACCACTCA
TCATCTCCATATACCTGAATGGCGCTGTGGAAGATGCCGCCAAGGCCAATACCGTCTTTG
AAGAACCTGTTGATCTGGAGAATGGTGTTGTTTGTCTTCTCCGATCCACTGTTTGTCACA
TCGTATATGTGTAGTACAACCTCCGCCATGATTACTCCCTCTCACTACCAGATAAAGCTC
GAACCCTAATTTCTAAGCAAATGAGGAGTTGGAAGATTCTATCTGTAGCTGGAAACCCTA
AATAAAGGACTTGAACCAAATCCACTTCCTTC

QA 19 710 19 710
DS 



AS 1 4

CO CL3103Contig1 754 4 1 U
TTTAGATCAGTTATTTGGTTTTATTACACAAAGGACAAATAAAGGAGAAAAACAGAACCA
AGAAGATCATATCACTACTTCTTGGGTTGGAACTTGGTTTTGATGTGTTTAACAGTCCCC
GGAGACGTCTGAAACGCTTGAGCCAAGATCTGATCAGGAACAGGAGGCGTAGAACCGAAC
AAAGTAGCACCAAGAGACTGAGTCCCGGGAAGCTGGCTGTTGAAAGCAGCGATGACAGAA
GCAGGGATGCGACCGTTGTTCTTCTGGAAATGAACAAGCCCCTTGGGGAAAGCAAAGACG
TCGCCTTTCTTGAGAGACTGAGAGATGAGCTTGTTGGCCGTGGTGAGGAACCCGACGTCG
AGGGCTCCTTCGAGGACGTAGACGACTTCGGTGGCGCGAGGGTGAGTGTGAGGCGGGTTT
AAGCCTCCCGGCGCGTAGTCGATGCGTGCGAGGGAGACGCCGAGGGTGTTGAGTCCCGGG
ATGGCCATCACGTTCGCGCCTGTGACTAAGGAGCCGAATGTGTTGTTGGTGAGACCTGGA
TTGGCTATTCCTTGCGAGAAGAAATCGAGTGGTGTGACGTTGGCTGCGTCTTTGCAAGGG
AAGCCATTGACTTTGATTCCGGAGGAGAGACCAGCGACACAGAGGTCTTGGAGCATGTCG
GGATCTGCGGAGACTGTAATGAAGAAAATGGCGACAAGGGCGAGGGAGATGGAGAGAAAT
GGAGCCATGTTGATTGTTGTTGTTTGATGGTGTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4G151JQ U 4
AF RR4GT49JQ U 1
AF RR4G151TF C 53
AF RR4GT49TF C 100
BS 1 754 RR4GT49JQ

RD RR4G151JQ 376 0 0
AGATCAGTTATTTGGTTTTATTACACAAAGGACAAATAAAGGAGAAAAACAGAACCAAGA
AGATCATATCACTACTTCTTGGGTTGGAACTTGGTTTTGATGTGTTTAACAGTCCCCGGA
GACGTCTGAAACGCTTGAGCCAAGATCTGATCAGGAACAGGAGGCGTAAAACCGAACAAA
GTAGCACCAAGAGACTGAGTCCCGGGAAGCTGGCTGTTGAAAGCAGCGATGACAGAAGCA
GGGATGCGACCGTTGTTCTTCTGGAAATGAACAAGCCCCTTGGGGAAAGCAAAGACGTCG
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GCTCCTTCGAGGACGT

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR4GT49JQ 754 0 0
TTTAGATCAGTTATTTGGTTTTATTACACAAAGGACAAATAAAGGAGAAAAACAGAACCA
AGAAGATCATATCACTACTTCTTGGGTTGGAACTTGGTTTTGATGTGTTTAACAGTCCCC
GGAGACGTCTGAAACGCTTGAGCCAAGATCTGATCAGGAACAGGAGGCGTAGAACCGAAC
AAAGTAGCACCAAGAGACTGAGTCCCGGGAAGCTGGCTGTTGAAAGCAGCGATGACAGAA
GCAGGGATGCGACCGTTGTTCTTCTGGAAATGAACAAGCCCCTTGGGGAAAGCAAAGACG
TCGCCTTTCTTGAGAGACTGAGAGATGAGCTTGTTGGCCGTGGTGAGGAACCCGACGTCG
AGGGCTCCTTCGAGGACGTAGACGACTTCGGTGGCGCGAGGGTGAGTGTGAGGCGGGTTT
AAGCCTCCCGGCGCGTAGTCGATGCGTGCGAGGGAGACGCCGAGGGTGTTGAGTCCCGGG
ATGGCCATCACGTTCGCGCCTGTGACTAAGGAGCCGAATGTGTTGTTGGTGAGACCTGGA
TTGGCTATTCCTTGCGAGAAGAAATCGAGTGGTGTGACGTTGGCTGCGTCTTTGCAAGGG
AAGCCATTGACTTTGATTCCGGAGGAGAGACCAGCGACACAGAGGTCTTGGAGCATGTCG
GGATCTGCGGAGACTGTAATGAAGAAAATGGCGACAAGGGCGAGGGAGATGGAGAGAAAT
GGAGCCATGTTGATTGTTGTTGTTTGATGGTGTC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4G151TF 702 0 0
CAGAACCAAGAAGATCATATCACTACTTCTTGGGTTGGAACTTGGTTTTGATGTGTTTAA
CAGTCCCCGGAGACGTCTGAAACGCTTGAGCCAAGATCTGATCAGGAACAGGAGGCGTAG
AACCGAACAAAGTAGCACCAAGAGACTGAGTCCCGGGAAGCTGGCTGTTGAAAGCAGCGA
TGACAGAAGCAGGGATGCGACCGTTGTTCTTCTGGAAATGAACAAGCCCCTTGGGGAAAG
CAAAGACGTCGCCTTTCTTGAGAGACTGAGAGATGAGCTTGTTGGCCGTGGTGAGGAACC
CGACGTCGAGGGCTCCTTCGAGGACGTAGACGACTTCGGTGGCGCGAGGGTGAGTGTGAG
GCGGGTTTAAGCCTCCCGGCGCGTAGTCGATGCGTGCGAGGGAGACGCCGAGGGTGTTGA
GTCCCGGGATGGCCATCACGTTCGCGCCTGTGACTAAGGAGCCGAATGTGTTGTTGGTGA
GACCTGGATTGGCTATTCCTTGCGAGAAGAAATCGAGTGGTGTGACGTTGGCTGCGTCTT
TGCAAGGGAAGCCATTGACTTTGATTCCGGAGGAGAGACCAGCGACACAGAGGTCTTGGA
GCATGTCGGGATCTGCGGAGACTGTAATGAAGAAAATGGCGACAAGGGCGAGGGAGATGG
AGAGAAATGGAGCCATGTTGATTGTTGTTGTTTGATGGTGTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4GT49TF 655 0 0
TTGATGTGTTTAACAGTCCCCGGAGACGTCTGAAACGCTTGAGCCAAGATCTGATCAGGA
ACAGGAGGCGTAGAACCGAACAAAGTAGCACCAAGAGACTGAGTCCCGGGAAGCTGGCTG
TTGAAAGCAGCGATGACAGAAGCAGGGATGCGACCGTTGTTCTTCTGGAAATGAACAAGC
CCCTTGGGGAAAGCAAAGACGTCGCCTTTCTTGAGAGACTGAGAGATGAGCTTGTTGGCC
GTGGTGAGGAACCCGACGTCGAGGGCTCCTTCGAGGACGTAGACGACTTCGGTGGCGCGA
GGGTGAGTGTGAGGCGGGTTTAAGCCTCCCGGCGCGTAGTCGATGCGTGCGAGGGAGACG
CCGAGGGTGTTGAGTCCCGGGATGGCCATCACGTTCGCGCCTGTGACTAAGGAGCCGAAT
GTGTTGTTGGTGAGACCTGGATTGGCTATTCCTTGCGAGAAGAAATCGAGTGGTGTGACG
TTGGCTGCGTCTTTGCAAGGGAAGCCATTGACTTTGATTCCGGAGGAGAGACCAGCGACA
CAGAGGTCTTGGAGCATGTCGGGATCTGCGGAGACTGTAATGAAGAAAATGGCGACAAGG
GCGAGGGAGATGGAGAGAAATGGAGCCATGTTGATTGTTGTTGTTTGATGGTGTC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 2 4

CO CL3104Contig1 517 2 2 U
GACAGATCATCTAATTCTCCTTCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAATGTCAGGAA
GAGGAAAAGGAGGAAAGGGACTGGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAAGTTCTGA
GAGACAACATCCAAGGGATCACCAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCG
TGAAGCGAATCAGCGGCTTGATCTACGAAGAAACGAGAGGTGTTCTGAAGATCTTTCTCG
AGAACGTGATCAGAGACGCCGTCACTTACACTGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACCG
CGATGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTT
AATTTATCTGGTTTGGTGTGTGCTTGTTGCTACTGATTTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATC
TTAGGGTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATG
AAAGTTCGATTACTCTATTTTAAGTTTTTTTTGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EI59JQ C 1
AF RR4EI59TF U 1
BS 1 5 RR4EI59JQ
BS 6 517 RR4EI59TF

RD RR4EI59JQ 517 0 0
GACAGATCATCTAATTCTCCTTCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAATGTCAGGAA
GAGGAAAAGGAGGAAAGGGACTGGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAAGTTCTGA
GAGACAACATCCAAGGGATCACCAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCG
TGAAGCGAATCAGCGGCTTGATCTACGAAGAAACGAGAGGTGTTCTGAAGATCTTTCTCG
AGAACGTGATCAGAGACGCCGTCACTTACACTGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACCG
CGATGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTT
AATTTATCTGGTTTGGTGTGTGCTTGTTGCTACTGATTTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATC
TTAGGGTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATG
AAAGTTCGATTACTCTATTTTAAGTTTTTTTTGGTAC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR4EI59TF 517 0 0
GACAG
ATCATCTAATTCTCCTTCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAATGTCAGGAAGAGGA
AAAGGAGGAAAGGGACTGGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAAGTTCTGAGAGAC
AACATCCAAGGGATCACCAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCGTGAAG
CGAATCAGCGGCTTGATCTACGAAGAAACGAGAGGTGTTCTGAAGATCTTTCTCGAGAAC
GTGATCAGAGACGCCGTCACTTACACTGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACCGCGATG
GATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTTAATTT
ATCTGGTTTGGTGTGTGCTTGTTGCTACTGATTTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATCTTAGG
GTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATGAAAGT
TCGATTACTCTATTTTAAGTTTTTTTTGGTAC

QA 6 517 6 517
DS 



CO CL3104Contig2 496 2 3 U
GGACTCACAAATCATCTAATTTTCCTTCCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAAATG
TCAGGAAGAGGAAAAGGAGGAAAGGGACTTGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAA
GTTCTGAGAGACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGA
GGAGGCGTGAAGCGAATCAGCGGCTTGATCTACGAAGAAACCAGAGGTGTTCTGAAGATC
TTTCTCGAGAATGTCATCAGAGACGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACG
GTCACGGCGATGGATGTCGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTC
GGTGGTTAATTATCTCGGTTTGCTGTGTTGCTACTGATTAATTCTTGCTGTCAAGAAATC
TTAGAGTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATG
AAAGTTCGATCACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4GO36JQ C 1
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TTAGAGTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATG
AAAGTTCGATCACTCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4GO36TF 496 0 0
GGACTCACAA
ATCATCTAATTTTCCTTCCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAAATGTCAGGAAGAG
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ACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCGTGA
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ATGTCATCAGAGACGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACGGCGA
TGGATGTCGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTTAAT
TATCTCGGTTTGCTGTGTTGCTACTGATTAATTCTTGCTGTCAAGAAATCTTAGAGTGTT
TTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATGAAAGTTCGAT
CACTC
C

QA 11 495 11 495
DS 



AS 1 4

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CCTGTTATGGTCGTCGGTATCGACGAAAGCGAGCAGAGCACTTACGCCTTGGAGTGGGCC
CTCGATCGTTTCTTCGTTCCCTTCGCTCCTAATTTTCCCTTCAAGCTCTTCATCGTCCAC
GCCAAACCTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTCTCGCTGGTCCCGGAACTGCGGAGGTTGTG
CCTTATGTTGATTCCAATTTGAAGCATATGGCTGCTAGGGTTATCGAGATGGCCAAAGGA
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CTTATATCCATTAAACTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4F121TF U 1
AF RR4AW14JQ C 89
AF RR4AW14TF U 89
AF RR4F121JQ C 264
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RD RR4F121TF 725 0 0
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ATGCGAAAGGATCCAAAGACAAAATCATGTATCATTTATATATCATCTTCTACATTTTGT
ACGTA

QA 1 725 1 725
DS 

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GTATCATTTATATATCATCTTCTACATTTTGTACGTACGTGCGCGACATCAAATACTTGT
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QA 1 714 1 714
DS 

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GTCTCGCTGGTCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATTCCAATTTGAAGCATA
TGGCTGCTAGGGTTATCGAGATGGCCAAAGGAATCTGTCAGAGCAAATCTGTTCATGGCG
CTAAGTTGGAAGTTTTTGAAGGTGATGCAAGAAGTATCCTGTGCGATGTTGTGGATAAAC
ACCATGCTTCTCTTCTTGTCGTGGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTC
TGGGGAGCGTGAGCGACTACTGTGCGCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGA
AGCCAAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAACCCAAGCTGTGTATCTCAGTCAAATT
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GTATCATTTATATATCATCTTCTACATTTTGTACGTACGTGCGCGACATCAAATACTTGT
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QA 1 714 1 714
DS 

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ATCATGTATCATTTATATATCATCTTCTACATTTTGTACGTATGTGCGCGACATCAAATA
CTTGTGTGTAACATTGTTTTATTGTATGACATGTACTCTTATATCCATTAAACTATTTT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

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GACAATGCGTTGTGGGAGTCTCCATCTTCATTAGAAGTGGAAGCCATGCTGGGTGTAGAT
GCTGCCGGTGTGACTCAGGGAGAGGAGAACCCTATGGACCTATGGAGCTTAGATGATATC
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CTATGTGTGTGTTGGTGAGTTTCATCCCATTGTGGATTCAATCTAGTGAGTCTTTAACAT
TTTTTTTTGTCTTTCTGTTCTTTTCTTAAGACAGTTCATTAATCTTTTGAGCTCTGTTTT
TGATCTTTCTTCAATGGCATTTTACATTATATAATAAAACAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AL41JQ C 1
AF RR4AL41TF U 1
BS 1 1 RR4AL41JQ
BS 2 702 RR4AL41TF

RD RR4AL41JQ 702 0 0
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GACAATGCGTTGTGGGAGTCTCCATCTTCATTAGAAGTGGAAGCCATGCTGGGTGTAGAT
GCTGCCGGTGTGACTCAGGGAGAGGAGAACCCTATGGACCTATGGAGCTTAGATGATATC
AATTACATGCTGGAAGGAGTCTTCTGAAGTGATTGATGGTTGCCGAGTTTGTAAATAAAA
CTATGTGTGTGTTGGTGAGTTTCATCCCATTGTGGATTCAATCTAGTGAGTCTTTAACAT
TTTTTTTTGTCTTTCTGTTCTTTTCTTAAGACAGTTCATTAATCTTTTGAGCTCTGTTTT
TGATCTTTCTTCAATGGCATTTTACATTATATAATAAAACAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AL41TF 702 0 0
G
AACGCCCTTCTGCTAAGAAGCCAGTGGCTAAACCAAACCAAACCCCAGCTTTGGTTCAGC
AGCAGCCAGTGAGTCAGTACTGCAACAACTCCTTTGGTGATGTGAGTTACATGGAAGAGA
AGCCTCAGATGTACAACAACCAGTACTTCAGTTCTGATCAGGGGAGTAACTCATTTGACT
GCTCTGAGTTTGGGTTGAGTAATCACAACGGCCCCAAGACACCTGAGATCTCTTCAGTGG
TTGTCAGTAATCACCAAGCTCCGTTCACTGAAGAAACCAATGCAGCCAAGAAGCTCAAAC
TCAGCTCTCATGACGGGACAAGCTGCAATGATCAGTGTGATGATCTGATGGCATACCTTG
ACAATGCGTTGTGGGAGTCTCCATCTTCATTAGAAGTGGAAGCCATGCTGGGTGTAGATG
CTGCCGGTGTGACTCAGGGAGAGGAGAACCCTATGGACCTATGGAGCTTAGATGATATCA
ATTACATGCTGGAAGGAGTCTTCTGAAGTGATTGATGGTTGCCGAGTTTGTAAATAAAAC
TATGTGTGTGTTGGTGAGTTTCATCCCATTGTGGATTCAATCTAGTGAGTCTTTAACATT
TTTTTTTGTCTTTCTGTTCTTTTCTTAAGACAGTTCATTAATCTTTTGAGCTCTGTTTTT
GATCTTTCTTCAATGGCATTTTACATTATATAATAAAACAT

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 4

CO CL3107Contig1 702 4 1 U
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CTTAGTGTTTATTTTAGATGTTTAAGTGGAGAGTATACCTTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4B371JQ C 1
AF RR4AT15JQ C 1
AF RR4AT15TF U 1
AF RR4B371TF U 1
BS 1 702 RR4AT15TF

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TTTTG

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DS 

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QA 1 702 1 702
DS 

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QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4B371TF 702 0 0
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CTATGATGCTCTTCTAGTGGAAGATGAAGATCAAAATATGGCTTTCCAGTTATAAGTAAC
GGGCGTCCTTGTGGATTTAGTTTTTTTTTTCGTTCTCGTTTGCCGTTCAAACTTATGGCC
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QA 1 702 1 702
DS 



AS 0 0

AS 1 4

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TTTTTTTAGGGCTTTTTTTTGTTGAGATGAAGATTCTTGTTTTTACGTTTCCCCAGTTCT
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CTATTCTTTTTCCGGGAGTCTCTTGATTATTTTAGAAAAACAGAAGATTATTCATTGAAT
GTTCAAAATTTGTTATATTATTAGTATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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G
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CCTGCTAATGTCCTTTACTGTGGTGCTTTACAGAAATTACAAAAGCCCCAAAAGATATCA
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ATTAGTATTTTCTT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 4

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AACAACAGGGAAACGAGAAATAAATACTTCAAAGGGAAAACATAGACTAGAAAGGAAGAT
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BQ
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25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU56JQ U 1
AF RR4CA03JQ U 6
AF RR4DU56TF C 517
AF RR4CA03TF C 973
BS 1 721 RR4DU56JQ
BS 722 1113 RR4DU56TF
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RD RR4DU56JQ 721 0 0
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AAGCATCCAGGCTTTTGCAATCACAGTAGCACAATCTGCAACAAAACATACCGGCGGCAG
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CAAAAGGCCTAACTGAATAAGCCAAAAAACAGTTGTAGTTGCTCCTTTGTAGAGCCGAGC
AATAAATTGATGAACTGTTCTTGCAGGAAGCAACTTTATCCGATATGATCATAAATGAAG
CCGGAGCAGGATTATCAACTTTCCATCCCTCCAAATCTGAATACATGCTACTGTATGCGA
C

QA 1 721 1 721
DS 

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GAAAAGATCCAT
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CTTCCACTGCACTTCTGAAGAGTGTGTCCTCCTCCTCTTGTCTCTGAAACTGCAAGTAAG
CTATCCCAGAGCCATTCTGCAGAAGTGAGCAGGACTGGCATTTCAAAAGGCCTAACTGAA
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TTCTTGCAGGAAGCAACTTTATCCGATATGATCATAAATGAAGCCGGAGCAGGATTATCA
ACTTTCCATCCCTCCAAATCTGAATACATGCTACTGTATGCGAC

QA 13 716 13 716
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AGTTGCTCCTTTGTAGAGCCGAGCAATAAATTGATGAACTGTTCTTGCAGGAAGCAACTT
TATCCGATATGATCATAAATGAAGCCGGAGCAGGATTATCAACTTTCCATCCCTCCAAAT
CTGAATACATGCTACTGTATGCGACCCAGGGAAGGACATGTGCAAAATCGACACCAGTGG
AAGAGAGCGCTGAAAGATGGTGATGAGGGGTTTCGTTATGGTTGGCATAGGCAGTGATGG
GGACAGGACCAGAGTAGCCTAGTTCCTTTAACGCCCTTTCTATACTTGGACGGACCCTAC
GAGCATCATACCCCTCAGGAATCGGACAGTCTTTCATGCTCCACAAGACCAGTATTTTAG
CTGTGGCGTGTTCAGGGGTGGCCGGGTGGTTCCTTGCCCAATTCTTTGTTACACATAAGA
GTCGTGTGTACGGAGGATCTACAGCCTCTTTTAGTCCATGCTTATAGCTCGAGAGATGCT
TCCTGTATTTCTTCAGGCTTTTGCAACTAAAATCACACGATTTGCAATAAAACATGC
C

QA 1 597 1 597
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RD RR4CA03TF 693 0 0
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CATGCTTATAGCTCGAGAGATGCTTCCTGTATTTCTTCAGGCTTTTGCAACTAAAATCAC
ACGATTTGCAATAAAACATGCAGGCAGCAGATAATGATAATCCTCCACCCTCCTCCTCCA
CAACATTAAGTAGTAATGGTTCGCTTAGTAATTGTTTCCACCGCCAATTTGCTTGACGGA
AAAGCAATGAATCACTCCAAGGTTTCATTGAATAAGCCAGAAAAAGGTGGTATCTAGTGC
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ACCGCCTGCTTTCGGAATTGGTATGTGCAACAGTGACTCCAGTGGAAGAGAGCCCTCGCA
AGACGTGGCAAGGGGTTTGTTTTTGGTCGCCATAGGCAGTGATGGAGACAGGACCAGAGT
AGCCTAGTTCCTTGAACGCTCTTTCTATACTTGGACGGACCCGACGAGCATCATACCCCT
CCCGTGGTATCGGGCAGTCATTCATGTCCCACCACACCTCTATTTTAGCTGTCTTCGCCC
CATCGCCGTTCCCCGACATCCTCTCTCTCTCCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 4

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TTTATATATGTACTATTGAGATACACAAGGTTGTGAAATAAAACTTTTTGAGTTTTTTTT
***TTACAAATGGGTTGTTCATGACTCTTTGCGTTTTCTAGGAGTCGCTCTACTTAAATA
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TCTTCAACTCCTTGATAGCTCAGCCACTTGTCTCGCTGTCCCCAGCACACGGTGGTTGGG
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BQ
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AF RR4C682JQ U 156
AF RR4CB28JQ U 1
AF RR4GG95JQ U 145
AF RR4F581JQ U 301
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BS 198 201 RR4CB28JQ
BS 202 202 RR4GG95JQ
BS 203 229 RR4CB28JQ
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BS 507 507 RR4GG95JQ
BS 508 707 RR4CB28JQ

RD RR4C682JQ 415 0 0
GC
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ATAAAACTTTTTGAGTTTTTTTTTTTTTACAAATGGGTTGTTCATGACTCTTTGCGTTTT
CTAGGAGTCGCTCTACTTAAATAAGAGCAGATTTGCTTATGATTCTTGAGATCAGTCCCC
CAATCTCTTCTCCGCAATCCTCTTGTACATGATGGCCAGCCATTGGAAGTTCAACGAGAT
TATGTCCCGAACTCTTGCAGAACTCTTCAACTCCTTGATAGCTCAGCCACCTGTCTCGCT
GTCCCCAGCACACGGTGGTTGGGATTTTCCAGTCTTTATCCATCAATGAGGTCCTCATTT
CTTCTGTATAGCCCTTAAGCTCCTTCTTCATGGCCCTGCTGATGGCGTTAAGT

QA 3 415 3 415
DS 

RD RR4CB28JQ 707 0 0
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TCTTCTATCTCTCAGTTTATAGAGCCTCAAAGTTTGTAGCACAAAAATCTTACTAATGAC
TTTATATAT***CATTGGAGACACACAAGGTTGTGAAATAAAACTTTTT****TTTTTTT
***TTACAAATGGGTTGTTCATGACTCTTTGCGTTTTCTCGGAGTCGCTCTACTTAAATA
AAAGCAAATTTGCTTATGATTCTTGAGATCAGTCCCCCAATCTCTTCTCCGCAATCCTCT
TGTACATGATGACCAGCCATTGGAAGTTCAACGAGATTATGTCCCGAACTCTTGCAAAAC
TCTTCAACTCCTTGATAGCTCAGCCACTTGTCTCGCTGTCCCCAGCACACGGTGGTTGGG
ATTTTCCAGTCTTTATCCATCAATGAAGTCCTCATTTCTTCTGTATAGCCCTTAAGCTCC
TTCTTCATGGCCCTGCTGATGGCGTTAAGTGCAAAACCAGAAGAACCTGAGGTAAGATAA
GGTCTTCGGTAAACCATTGCATCATCTTCTTTCATTTTGTAAGGACCACAGCTCGTCAAA
GGCTTGTCACTTGCTCTCAGAGGATCCTGAGAGAAAATCTCCCCGAG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4GG95JQ 563 0 0
CCTCAAAGTTTGTAGCACAAAAATCTTACTAATGGCTTTATATATGTACTATTGAGATAC
ACAAGGTTGTGAAATAAAACTTTTTGAGTTTTTTTT***TTACAAATGGGTTGTTCATGA
CTCTTTGCGTTTTCTAGGAGTCGCTCTACTTAAATAAGAGCAAATTTGCTTATGATTCTT
GAGATCAGTCCCCCAATCTCTTCTCCGCAATCCTCTTGTACATGATGGCCAGCCATTGGA
AGTTCAACGAGATTATGTCCCGAACTCTTGCAAAACTCTTCAACTCCTTGATAGCTCAGC
CACTTGTCTCGCTGTCCCCAGCACACGGTGGTTGGGATTTTCCAGTCTTTATCCATCAAT
GAGGTCCTCATTTCTTCTGTATAGCCCTTAAGCTCCTTCTTCATGGCCCTGCTGATGGCG
TTAAGTGCAAAACCAGAAGAACCTGAGGTAAGATAAGGTCTTCGGTAAACCATTGCATCA
TCTTCTTTCATTTTGTAAGGACCACAGCTCGTCAAAGGCTTGTCACTTGCTCTCAGAGGA
TCCTGAGAGAAAATCTCCCCGAG

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4F581JQ 388 0 0
AA
AGCAGATTTGCTTATGATTCTTGAGATCAGTCCCCCAATCTCTTCTCCGCAATCCTCTTG
TACATGATGGCCAGCCATTGGAAGTTCAACGGGATTATGTCCCGAACTCTTGCAGAACTC
TTCAACTCCTTGATAGCTCAGCCACTTGTCTCGCTGTCCCCAGCACACGGTGGTTGGGAT
TTTCCAGTCTTTATCCATCAATGAGGTCCTCATTTCTTCTGTATAGCCCTTAAGCTCCTT
CTTCATGGCCCTGCTGATGGCGTTAAGTGCAAAACCAGAAGAACCTGAGGTAAGATAAGG
TCTTCGGTAAACCATTGCATCATCTTCTTTCATTTTGTAAGGACCACAGCTCGTCAAAGG
CTTGTCACTTGCTCTCAGAGGATCCT

QA 3 388 3 388
DS 



AS 1 2

CO CL3112Contig1 1061 2 2 U
GTGGACTCAAAAGTCAACAGCGAGAAGTAAAAAGTAGTGAGAGGAGGAGGAAGGGAGGAA
GGAAGGAAGGAAGTATATCTACAGGTAAAGTCTTTCTGCAAAATCTCTCGGGGGACTTAT
GGCAAGAGTCGTCGAGTCTGACACGGTTCCTGGAGGTTCCGATGTACTACAGCTAAGTCT
TGACTCGATCAGGGAATCGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCTTCAGCTTGATCGA
GAGAGCTAAGTTTCCACTCAATTCAGCTGAAAACTCCTCTTCTCTGACTGAGTTCTTTGT
CGGAGAGATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGAAAACCCGGAAGAGAATCC
TTTCTTCCTTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACACCCAAATATCCACCGGTTCT
GTATCCTAAGGCCTCATCTGTTAACATAAACAAAAGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGA
ACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTATGCATCAACTGCTGCTTC
TGATCTCGCTTGTTTACAAGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTTTGTTGCTGA
GGTCAAATTCAGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATTCGCTCTAAGGATACAGA
GGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTTGAGAAAGTAGAAGAAATGGTTAAGAAGAGAGTCGA
GAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTGAAGTGCGTCTCTGGTGGTGCTGATGAGAG
GGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATCCATATCTAGTCTCTCGCATCTATGGAGAATGGCT
TATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGAGTATCTTCTACGTCGTCTCGATTGAATCTC
GAGTCATCATTAAACAAGATGATGAGTCCATCGTCTTTTTCCACAAACTCTTGCAAGATT
TGTTTTTTCATTACAGACTATCATCAATCAAACACTTGTCCAATATGAATAAACCAAACC
GATTTGATCAAAAACTGAATAAAATTTTAGCTTGGGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI25TF U 1
AF RR4AI25JQ C 298
BS 1 770 RR4AI25TF
BS 771 1061 RR4AI25JQ

RD RR4AI25TF 785 0 0
GTGGACTCAAAAGTCAACAGCGAGAAGTAAAAAGTAGTGAGAGGAGGAGGAAGGGAGGAA
GGAAGGAAGGAAGTATATCTACAGGTAAAGTCTTTCTGCAAAATCTCTCGGGGGACTTAT
GGCAAGAGTCGTCGAGTCTGACACGGTTCCTGGAGGTTCCGATGTACTACAGCTAAGTCT
TGACTCGATCAGGGAATCGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCTTCAGCTTGATCGA
GAGAGCTAAGTTTCCACTCAATTCAGCTGAAAACTCCTCTTCTCTGACTGAGTTCTTTGT
CGGAGAGATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGAAAACCCGGAAGAGAATCC
TTTCTTCCTTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACACCCAAATATCCACCGGTTCT
GTATCCTAAGGCCTCATCTGTTAACATAAACAAAAGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGA
ACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTATGCATCAACTGCTGCTTC
TGATCTCGCTTGTTTACAAGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTTTGTTGCTGA
GGTCAAATTCAGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATTCGCTCTAAGGATACAGA
GGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTTGAGAAAGTAGAAGAAATGGTTAAGAAGAGAGTCGA
GAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTGAAGTGCGTCTCTGGTGGTG
CTGATGAGAGGGAGA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4AI25JQ 764 0 0
TGTCGGAGAGATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGAAAACCCGGAAGAGAA
TCCTTTCTTCCTTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACACCCAAATATCCACCGGT
TCTGTATCCTAAGGCCTCATCTGTTAACATAAACAAAAGGCTTTGGGATGTTTACTTTAA
AGAACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTATGCATCAACTGCTGC
TTCTGATCTCGCTTGTTTACAAGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTTTGTTGC
TGAGGTCAAATTCAGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATTCGCTCTAAGGATAC
AGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTTGAGAAAGTAGAAGAAATGGTTAAGAAGAGAGT
CGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTGAAGTGCGTCTCTGGTGGTGCTGATGA
GAGGGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATCCATATCTAGTCTCTCGCATCTATGGAGAATG
GCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGAGTATCTTCTACGTCGTCTCGATTGAAT
CTCGAGTCATCATTAAACAAGATGATGAGTCCATCGTCTTTTTCCACAAACTCTTGCAAG
ATTTGTTTTTTCATTACAGACTATCATCAATCAAACACTTGTCCAATATGAATAAACCAA
ACCGATTTGATCAAAAACTGAATAAAATTTTAGCTTGGGCTTTT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 4

CO CL3113Contig1 808 4 11 U
GGGCCTGACGCCTCTCATGCTTCCATTGACGCAACTCCACGCACAGATCTCTGACGAACA
TCTTTCGATCTCCGACGAACTTCGAGCTATCTCTCTCGATCTCCGGCGAACTCCGACATC
TCAAGCTCTCTCTCTCGATCTCCGGCGAACTCCGAGCTCTCTCTCGATCCATCTCGCAGA
GCTCTCTCTCTCTGGATCCATCTCGCAGAGCTCTCTCTCTCTCAATCTCCGACATCTCAA
GCTCTCTCTCTCGATCTACGGTGAACTCCGAGCTCTCTCTCTCGATCTATCCATTGCAGA
GCTCTCTCTCTCGATCTACCCATCTCCCAGCTCATCTCATCTCAAGCTCTCTCTTCTCCA
TACCCATCTCGAGCTCGACCAAACCCATCACTTCCTTCTCTCGTTGAGCTGGACAGGAAC
AGCGCCCAAGGAATCATCTCCCAGTTCTTGAAGCACTTGGACACGCCAAAACTCTCAGGC
TCTCTCAGGCTTCTCCATAGCTTTCTCGAAGCAAACCCATCTCTCCAAGAATCCTTCATT
TCATTACTGGCTACAGAGGCATCATAGTCAACTTCCTGTTGTTTAGAGAACAAGAGCAAG
CTTGCATTGTTCAAAGGAACATCGGCTGATGATGAAGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATG
CTACTCTCTGTATAAAAGAATGGCCAACAGAAGCTCTAACTCTATGAAAGAATCACTAGA
TATCCATAAGGATTTTGCAGTTGATCTTCCAGCAATCACTATGTATTAATTCTTTTAAAC
ATATTTCTATGCTACTCTTTCAAAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM47TF U 1
AF RR4A945TF U 17
AF RR4A945JQ C 78
AF RR4GM47JQ C 258
BS 1 153 RR4GM47TF
BS 154 154 RR4A945TF
BS 155 416 RR4GM47TF
BS 417 417 RR4A945TF
BS 418 594 RR4GM47TF
BS 595 595 RR4A945TF
BS 596 637 RR4GM47TF
BS 638 638 RR4A945TF
BS 639 672 RR4GM47TF
BS 673 797 RR4A945TF
BS 798 808 RR4GM47JQ

RD RR4GM47TF 672 0 0
GGGCCTGACGCCTCTCATGCTTCCATTGACGCAACTCCACGCACAGATCTCTGACGAACA
TCTTTCGATCTCCGACGAACTTCGAGCTATCTCTCTCGATCTCCGGCGAACTCCGACATC
TCAAGCTCTCTCTCTCGATCTCCGGCGAACTCCTAGCTCTCTCTCGATCCATCTCGCAGA
GCTCTCTCTCTCTGGATCCATCTCGCAGAGCTCTCTCTCTCTCAATCTCCGACATCTCAA
GCTCTCTCTCTCGATCTACGGTGAACTCCGAGCTCTCTCTCTCGATCTATCCATTGCAGA
GCTCTCTCTCTCGATCTACCCATCTCCCAGCTCATCTCATCTCAAGCTCTCTCTTCTCCA
TACCCATCTCGAGCTCGACCAAACCCATCACTTCCTTCTCTCGTTGAGCTGGACAGTAAC
AGCGCCCAAGGAATCATCTCCCAGTTCTTGAAGCACTTGGACACGCCAAAACTCTCAGGC
TCTCTCAGGCTTCTCCATAGCTTTCTCGAAGCAAACCCATCTCTCCAAGAATCCTTCATT
TCATTACTGGCTACAGAGGCATCATAGTCAACTTCCTGTTGTTTAGAGAACAAGGGCAAG
CTTGCATTGTTCAAAGGAACATCGGCTGATGATGAAG*CTTCAAGTTCTCTTTCTGAATG
CTACTCTCTGTA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4A945TF 781 0 0
GG
GCTTCCATTGACGCAACTCCACGCACAGATCTCTGACGAACATCTTTCGATCTCCGACGA
ACTTCGAGCTATCTCTCTCGATCTCCGGCGAACTCCGACATCTCAAGCTCTCTCTCTCGA
TCTCCGGCGAACTCCGAGCTCTCTCTCGATCCATCTCGCAGAGCTCTCTCTCTCTGGATC
CATCTCGCAGAGCTCTCTCTCTCTCAATCTCCGACATCTCAAGCTCTCTCTCTCGATCTA
CGGTGAACTCCGAGCTCTCTCTCTCGATCTATCCATTGCAGAGCTCTCTCTCTCGATCTA
CCCATCTCCCAGCTCATCTCATCTCAAGCTCTCTCTTCTCCATACCCATCTCGAGCTCGA
CCAAACCCATCACTTCCTTCTCTCGTTGAGCTGGACAGGAACAGCGCCCAAGGAATCATC
TCCCAGTTCTTGAAGCACTTGGACACGCCAAAACTCTCAGGCTCTCTCAGGCTTCTCCAT
AGCTTTCTCGAAGCAAACCCATCTCTCCAAGAATCCTTCATTTCATTACTGGCTACAGAG
GCATCATAGTCAACTTCCTGTTGTTTAGAGAACAAGAGCAAGCTTGCATTGTTCAAAGGA
ACATCGGCTGATGATGAAGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGCTACTCTCTGTATAAAAG
AATGGCCAACAGAAGCTCTAACTCTATGAAAGAATCACTAGATATCCATAAGGATTTTGC
AGTTGATCTTCCAGCAATCACTATGTATTAATTCTTTTAAACATATTTCTATGCTACTC

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR4A945JQ 720 0 0
AACTTCGAGCTATCTCTCTCGATCTCCGGCGAACTCCGACATCTCAAGCTCTCTCTCTCG
ATCTCCGGCGAACTCCGAGCTCTCTCTCGATCCATCTCGCAGAGCTCTCTCTCTCTGGAT
CCATCTCGCAGAGCTCTCTCTCTCTCAATCTCCGACATCTCAAGCTCTCTCTCTCGATCT
ACGGTGAACTCCGAGCTCTCTCTCTCGATCTATCCATTGCAGAGCTCTCTCTCTCGATCT
ACCCATCTCCCAGCTCATCTCATCTCAAGCTCTCTCTTCTCCATACCCATCTCGAGCTCG
ACCAAACCCATCACTTCCTTCTCTCGTTGAGCTGGACAGGAACAGCGCCCAAGGAATCAT
CTCCCAGTTCTTGAAGCACTTGGACACGCCAAAACTCTCAGGCTCTCTCAGGCTTCTCCA
TAGCTTTCTCGAAGCAAACCCATCTCTCCAAGAATCCTTCATTTCATTACTGGCTACAGA
GGCATCATAGTCAACTTCCTGTTGTTTAGAGAACAAGAGCAAGCTTGCATTGTTCAAAGG
AACATCGGCTGATGATGAAGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGCTACTCTCTGTATAAAA
GAATGGCCAACAGAAGCTCTAACTCTATGAAAGAATCACTAGATATCCATAAGGATTTTG
CAGTTGATCTTCCAGCAATCACTATGTATTAATTCTTTTAAACATATTTCTATGCTACTC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GM47JQ 551 0 0
ACGGTGAACTCCGAGCTCTCTCTCTCGATCTATCCATTGCAGAGCTCTCTCTCTCGATCT
ACCCATCTCCCAGCTCATCTCATCTCAAGCTCTCTCTTCTCCATACCCATCTCGAGCTCG
ACCAAACCCATCACTTCCTTCTCTCGTTGAGCTGGACAGTAACAGCGCCCAAGGAATCAT
CTCCCAGTTCTTGAAGCACTTGGACACGCCAAAACTCTCAGGCTCTCTCAGGCTTCTCCA
TAGCTTTCTCGAAGCAAACCCATCTCTCCAAGAATCCTTCATTTCATTACTGGCTACAGA
GGCATCATAGTCAACTTCCTGTTGTTTAGAGAACAAGGGCAAGCTTGCATTGTTCAAAGG
AACATCGGCTGATGATGAAGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGCTACTCTCTGTATAAAA
GAATGGCCAACAGAAGCTCTAACTCTATGAAAGAATCACTAGATATCCATAAGGATTTTG
CAGTCGATCTTCCAGCAATCACTATGTATTAATTCTTTTAAACATATTTCTATGCTACTC
TTTCAAAAGTT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 4

CO CL3114Contig1 796 4 7 U
GAACGTTCTTTACATCGTCGAGAACATCAACGTCGCTGCTATTGAGACAACATTGTGGTC
CATCGAATGGGGAATCGCGGAGCTAGTGAACCATCCTGAGATCCAGAGCAAGCTAAGGAA
CGAAATCGACACGGTTCTTGGACCAGGAGTTCAAGTCACAGAGCCTGAGCTTCACAAGCT
TCCATACCTCCAAGCCGTGATCAAGGAAACGCTTCGTCTAAGAATGGCTATTCCTCTCCT
CGTCCCTCACATGAACCTCAACGACGCTAAGCTCGCTGGCTACGACATCCCGGCGGAGAG
CAAGATCTTGGTCAATGCCTGGTGGCTAGCTAACAACCCCGAGAGCTGGAAGAAACCTGA
AGAGTTTAGGCCCGAGAGGTTCTTTGAAGAAGAGGCTCACGTGGAAGCAAACGGCAATGA
CTTTAGGTATGTGCCGTTTGGTGTTGGACGAAGAAGCTGTCCAGGGATTATATTGGCGTT
GCCTATTTTGGGAATCACGATTGGTAGGTTGGTTCAGAACTTCGAGCTTCTTCCTCCTCC
AGGACAGTCTAAAGTGGATACTTCTGAGAAAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTCA
CCACTCCACAATCGTAATGAAGCCAAGGTCCTTTTAAAATTTGAAAAGAATCACACGACT
TGTGTTATAAACAGCACTACAGTGATGTTTGTTGAATATTCCTTGTTTTTGTAATCTATT
TCGTAAGTCTTTAAATGGTTTCGTTTCTTGCAATAAACAGTTGCTCCCGCTGTTTTGAAA
TGGACCAAGTTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG09TF U 193
AF RR4FV81TF U 1
AF RR4CG09JQ C 193
AF RR4FV81JQ C 309
BS 1 210 RR4FV81TF
BS 211 211 RR4CG09TF
BS 212 701 RR4FV81TF
BS 702 721 RR4CG09JQ
BS 722 722 RR4FV81JQ
BS 723 776 RR4CG09JQ
BS 777 796 RR4FV81JQ

RD RR4CG09TF 297 0 0
G
GCCGTGATCAAGGAAACGCTTCGTCTAAGAATGGCTATTCCTCTCCTCGTCCCTCACATG
AACCTCAACGACGCTAAGCTCGCTGGCTACGACATCCCGGCGGAGAGCAAGATCTTGGTC
AATGCCTGGTGGCTAGCTAACAACCCCGAGAGCTGGAAGAAACCTGAAGAGTTTAGGCCC
GAGAGGTTCTTTGAAGAAGATGCTCACGTGGAAGCAAACGGCAATGACTTTAGGTATGTG
CCGTTTGGTGTTGGACGAAGAAGCTGTCCAGGGATTATATTGGCGTTGCCTATTTT

QA 2 297 2 297
DS 

RD RR4FV81TF 701 0 0
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CATCGAATGGGGAATCGCGGAGCTAGTGAACCATCCTGAGATCCAGAGCAAGCTAAGGAA
CGAAATCGACACGGTTCTTGGACCAGGAGTTCAAGTCACAGAGCCTGAGCTTCACAAGCT
TCCATACCTCCAAGCCGTGATCAAGGAAACACTTCGTCTAAGAATGGCTATTCCTCTCCT
CGTCCCTCACATGAACCTCAACGACGCTAAGCTCGCTGGCTACGACATCCCGGCGGAGAG
CAAGATCTTGGTCAATGCCTGGTGGCTAGCTAACAACCCCGAGAGCTGGAAGAAACCTGA
AGAGTTTAGGCCCGAGAGGTTCTTTGAAGAAGAGGCTCACGTGGAAGCAAACGGCAATGA
CTTTAGGTATGTGCCGTTTGGTGTTGGACGAAGAAGCTGTCCAGGGATTATATTGGCGTT
GCCTATTTTGGGAATCACGATTGGTAGGTTGGTTCAGAACTTCGAGCTTCTTCCTCCTCC
AGGACAGTCTAAAGTGGATACTTCTGAGAAAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTCA
CCACTCCACAATCGTAATGAAGCCAAGGTCCTTTTAAAATTTGAAAAGAATCACACGACT
TGTGTTATAAACAGCACTACAGTGATGTTTGTTGAATATTC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4CG09JQ 584 0 0
G
GCCGTGATCAAGGAAACGCTTCGTCTAAGAATGGCTATTCCTCTCCTCGTCCCTCACATG
AACCTCAACGACGCTAAGCTCGCTGGCTACGACATCCCGGCGGAGAGCAAGATCTTGGTC
AATGCCTGGTGGCTAGCTAACAACCCCGAGAGCTGGAAGAAACCTGAAGAGTTTAGGCCC
GAGAGGTTCTTTGAAGAAGATGCTCACGTGGAAGCAAACGGCAATGACTTTAGGTATGTG
CCGTTTGGTGTTGGACGAAGAAGCTGTCCAGGGATTATATTGGCGTTGCCTATTTTGGGA
ATCACGATTGGTGGGTTGGTTCAGAACTTCGAGCTTCTTCCTCCTCCAGGACAGTCTAAA
GTGGATACTTTTGAGAAAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTCACCACTCCACAATC
GTAATGAAGCCAAGGTCCTTTTAAAATTTGAAAAGAATCACACGACTTGTGTTATAAACA
GCACTACAGTGATGTTTGTTGAATATTCCTTGTTTTTGTAATCTATTTTGTAAGTCTTTA
AATGGTTTCGTTTCTTGCAATAAACAGTTGCTCCCGCTGTTTT

QA 2 584 2 584
DS 

RD RR4FV81JQ 488 0 0
TGGTCAATGCCTGGTGGCTAGCTAACAACCCCGAGAGCTGGAAGAAACCTGAAGAGTTTA
GGCCCGAGAGGTTCTTTGAAGAAGAGGCTCACGTGGAAGCAAACGGCAATGACTTTAGGT
ATGTGCCGTTTGGTGTTGGACGAAGAAGCTGTCCAGGGATTATATTGGCGTTGCCTATTT
TGGGAATCACGATTGGTAGGTTGGTTCAGAACTTCGAGCTTCTTCCTCCTCCAGGACAGT
CTAAAGTGGATACTTCTGAGAAAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTCACCACTCCA
CAATCGTAATGAAGCCAAGGTCCTTTTAAAATTTGAAAAGAATCACACGACTTGTGTTAT
AAACAGCACTACAGTGATGTTTGTTGAATATTCCTTGTTTTTGTAATCTATTTCGTAAGT
CTTTAAATGGTTTCGTTTCTTGCAATAAACAGTTGCTCCCGCTGTTTTGAAATGGACCAA
GTTGTTAC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 3

CO CL3115Contig1 998 3 12 U
GCAGAAGCGTCAGGTAGAAGAGCTTCTCATGAACTCTAAGGATGAACTCCGAGCGAATAA
GGTAGAGTATGAAGCAAAGCTCAACGAGATGGAGAGAATGTTGGAAGGACTCGTGGAGAA
ATCCAGAAATCTAGAGAGCGAGAAGAGGAAACAAGAAGATGCCAATGCAGATTTAAAACA
GGAGATCACAAGGCTTAAGGATGAGATTGAGATCTTGAGAGTTGAGCTATCAAGCACAAT
TGCAGAGATGAAGAAAGGATCAGAGTCTTTGGCAGAGGAGTTGCAGTTTATCAAAGATGA
AAAAGAAGCAGTCGTTACCATTTTAAAAGCAGAAGTAGAAACTGCAAGAGGGAAATGTGA
TGATCTAAAGGAAAGAATAATACTGCTTGAGGAACACATCAGACTAAAGGAAAATGCTGT
AGAAGACTCTTCAAAGATGTTTATCGAAAAGGAAAAGGAATTGAATAGCCGAATCGAGGA
ATTGGAGACTGAACTCAACAAACTAAGTCTGAATAGCCTAGAGACTGGTGAATGTCTGCA
TGGTCAAGCAGCAGCTATTGCTTCGCAAAATGGAGAAGTACTGAGTGATGATCTTAAAGA
CTTGGCAAATGAAGTAGCATCGCTAAAAGAGCAAAATGAAGTGATAGAAATGGAGTTGAA
GGAGATGCAAGAGAGGTATTCAGATATAAGTGTAAGATTTGCAGAAGTTGAAAGTGAGAG
ACAACGACTTGTCATGACTGTACGTAATCTTAAGAATGCCAAGAGGAGCTAGAAACCCAT
ATTCTCACGACCATAAGAAGATTGTACAAATTTCTCTCCTTTTCAATATATAAATTTACT
TTTCCTGATTTTGTTTCATATTTATATATAGTATAAATTTTGTTGTTTGAGTGAAAGAAA
AGTGAGTTTTGAATTTTGACTTTTTTTTTGGTGTATTTATATAATGATGAACGCGTTGTA
TAATATTTCAAATGTATTCCAATTCCAATCCAAGGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY46TF U 195
AF RR4B887TF U 1
AF RR4BY46JQ C 243
BS 1 286 RR4B887TF
BS 287 287 RR4BY46TF
BS 288 333 RR4B887TF
BS 334 334 RR4BY46TF
BS 335 373 RR4B887TF
BS 374 374 RR4BY46TF
BS 375 605 RR4B887TF
BS 606 606 RR4BY46TF
BS 607 645 RR4B887TF
BS 646 646 RR4BY46TF
BS 647 759 RR4B887TF
BS 760 998 RR4BY46JQ

RD RR4BY46TF 499 0 0
G
TAAGGATGAGATTGAGATCTTGAGAGTTGAGCTATCAAGCACAATTGCAGAGATGAAGAA
AGGATCAGAGTCTTTGGCAGAGGAGTTGCAGTTTATCAAAGATGAAAAAGAAGCAGTCGT
TACCATTTTAAAAGCAGAAGTAGAAACTGCAAGAGGGAAATGTGATGATCTAAAGGAAAG
AATAATACTGCTTGAGGAACACATCAGACTAAAGGAAAATGCTGTAGAAGACTCTTCAAA
GATGTTTATCGAAAAGGAAAAGGAATTGAATAGCCGAATCGAGGAATTGGAGACTGAACT
CAACAAACTAAGTCTGAATAGCCTAGAGACTGGTGAATGTCTGCATGGTCAAGCAGCAGC
TATTGCTTCGCAAAATGGAGAAGTACTGAGTGATGATCTTAAAGACTTGGCAAATGAAGT
AGCATCGCTAAAAGAGCAAAATGAAGTGATAGAAATGGAGTTGAAGGAGATGCAAGAGAG
GTATTCAGATATAAGTGT

QA 2 499 2 499
DS 

RD RR4B887TF 759 0 0
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AAAAGAAGCAGTCGTTACCATTTTAAAAGCAGAGGTAGAAACTGCAAGAGGGAAATGTGA
TGATCTAAAGGAA*GAATAATACTGCTTGAGGAACACATCAGACTAAAGGAAAATGCTGT
AGAAGACTCTTCAAAGATGTTTATCGAAAAGGAAAAGGAATTGAATAGCCGAATCGAGGA
ATTGGAGACTGAACTCAACAAACTAAGTCTGAATAGCCTAGAGACTGGTGAATGTCTGCA
TGGTCAAGCAGCAGCTATTGCTTCGCAAAATGGAGAAGTACTGAGTGATGATCTTAAAGA
CTTGGTAAATGAAGTAGCATCGCTAAAAGAGCAAAATGAAGTGATGGAAATGGAGTTGAA
GGAGATGCAAGAGAGGTATTCAGATATAAGTGTAAGATTTGCAGAAGTTGAAAGTGAGAG
ACAACGACTTGTCATGACTGTACGTAATCTTAAGAATGC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4BY46JQ 756 0 0
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AAGAAGCAGTCGTTACCATTTTAAAAGCAGAAGTAGAAACTGCAAGAGGGAAATGTGATG
ATCTAAAGGAAAGAATAATACTGCTTGAGGAACACATCAGACTAAAGGAAAATGCTGTAG
AAGACTCTTCAAAGATGTTTATCGAAAAGGAAAAGGAATTGAATAGCCGAATCGAGGAAT
TGGAGACTGAACTCAACAAACTAAGTCTGAATAGCCTAGAGACTGGTGAATGTCTGCATG
GTCAAGCAGCAGCTATTGCTTCGCAAAATGGAGAAGTACTGAGTGATGATCTTAAAGACT
TGGCAAATGAAGTAGCATCGCTAAAAGAGCAAAATGAAGTGATAGAAATGGAGTTGAAGG
AGATGCAAGAGAGGTATTCAGATATAAGTGTAAGATTTGCAGAAGTTGAAGGTGAGAGAC
AACGACTTGTCATGACTGTACGTAATCTTAAGAATGCCAAGAGGAGCTAGAAACCCATAT
TCTCACGACCATAAGAAGATTGTACAAATTTCTCTCCTTTTCAATATATAAATTTACTTT
TCCTGATTTTGTTTCATATTTATATATAGTATAAATTTTGTTGTTTGAGTGAAAGAAAAG
TGAGTTTTGAATTTTGACTTTTTTTTTGGTGTATTTATATAATGATGAACGCGTTGTATA
ATATTTCAAATGTATTCCAATTCCAATCCAAGGGAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL3116Contig1 703 4 2 U
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GGTCAAATCACACTAATCACCGGAGTTTTCTACTGGGTGGCTCAGCTTCTCGGCTCTACC
GCCGCTTGCTTCCTTCTTAAATACGTCACCGGTGGTTTGGCGGTTCCAACCCACAGCGTT
GCTGCGGGAGTAGGAGCGATAGAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACTTTCGCTTTG
GTCTACACCGTCTACGCCACCGCTGCTGATCCCAAGAAAGGTTCTCTCGGAACCATCGCT
CCCCTCGCCATTGGTCTCATCGTCGGTGCCAACATCCTAGCCGCCGGTCCATTCTCCGGT
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ACTGGGTCTACTGGGTTGGACCACTCATCGGTGGTGGACTCGCTGGAGTTACCTACGGAA
ATGTCTTCATGACTTCCGAACATGTTCCTCTTGCTTCTGAGTTCTAATCAAGAAAATGTG
ATTATTCTGTGTTTGGTTTCTTTGTCTCTCGATCGATTTGTTGCTTTGTTCGGAGTTTGG
TCAGGTTTCATTGTATCTTGTAAGTTGTATCCAATTTGTATGAATATCATTTGATGGAAT
CACTTCGTTGTATCTAATGGAATCGTTACGATAGTTTTATGGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FJ41TF U 1
AF RR4EK50JQ C 1
AF RR4FJ41JQ C 325
AF RR4EK50TF U 1
BS 1 462 RR4FJ41TF
BS 463 703 RR4EK50TF

RD RR4FJ41TF 462 0 0
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GGTCAAATCACACTAATCACCGGAGTTTTCTACTGGGTGGCTCAGCTTCTCGGCTCTACC
GCCGCTTGCTTCCTTCTTAAATACGTCACCGGTGGTTTGGCGGTTCCAACCCACAGCGTT
GCTGCGGGAGTAGGAGCGATAGAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACTTTCGCTTTG
GTCTACACCGTCTACGCCACCGCTGCTGATCCCAAGAAAGGTTCTCTCGGAACCATCGCT
CCCCTCGCCATTGGTCTCATCGTCGGTGCCAACATCCTAGCCGCCGGTCCATTCTCCGGT
GGATCCATGAACCCAGCACGTTCCTTTGGACCAGCTGTTGCAGCTGGAGATTCTCTGGTC
ACTGGGTCTACTGGGTTGGACCACTCATCGGTGGTGGACTCG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4EK50JQ 703 0 0
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GGTCAAATCACACTAATCACCGGAGTTTTCTACTGGGTGGCTCAGCTTCTCGGCTCTACC
GCCGCTTGCTTCCTTCTTAAATACGTCACCGGTGGTTTGGCGGTTCCAACCCACAGCGTT
GCTGCGGGAGTAGGAGCGATAGAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACTTTCGCTTTG
GTCTACACCGTCTACGCCACCGCTGCTGATCCCAAGAAAGGTTCTCTCGGAACCATCGCT
CCCCTCGCCATTGGTCTCATCGTCGGTGCCAACATCCTAGCCGCCGGTCCATTCTCCGGT
GGATCCATGAACCCAGCACGTTCCTTTGGACCAGCTGTTGCAGCTGGAGATTCTCTGGTC
ACTGGGTCTACTGGGTTGGACCACTCATCGGTGGTGGACTCGCTGGAGTTACCTACGGAA
ATGTCTTCATGACTTCCGAACATGTTCCTCTTGCTTCTGAGTTCTAATCAAGAAAATGTG
ATTATTCTGTGTTTGGTTTCTTTGTCTCTCGATCGATTTGTTGCTTTGTTCGGAGTTTGG
TCAGGTTTCATTGTATCTTGTAAGTTGTATCCAATTTGTATGAATATCATTTGATGGAAT
CACTTCGTTGTATCTAATGGAATCGTTACGATAGTTTTATGGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FJ41JQ 379 0 0
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TTTGGACCAGCTGTTGCAGCTGGAGATTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGTTGGACCAC
TCATCGGTGGTGGACTCGCTGGAGTTACCTACGGAAATGTCTTCATGACTTCCGAACATG
TTCCTCTTGCTTCTGAGTTCTAATCAAGAAAATGTGATTATTCTGTGTTTGGTTTCTTTG
TCTCTCGATCGATTTGTTGCTTTGTTCGGAGTTTGGTCAGGTTTCATTGTATCTTGTAAG
TTGTATCCAATTTGTATGAATATCATTTGATGGAATCACTTCGTTGTATCTAATGGAATC
GTTACGATAGTTTTATGGC

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR4EK50TF 703 0 0
GGAGCCAACATCTCCGGTGGCCGTGTGAACCCAGCCGTCACTTTTGGCCTTTCTGTCGGT
GGTCAAATCACACTAATCACCGGAGTTTTCTACTGGGTGGCTCAGCTTCTCGGCTCTACC
GCCGCTTGCTTCCTTCTTAAATACGTCACCGGTGGTTTGGCGGTTCCAACCCACAGCGTT
GCTGCGGGAGTAGGAGCGATAGAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACTTTCGCTTTG
GTCTACACCGTCTACGCCACCGCTGCTGATCCCAAGAAAGGTTCTCTCGGAACCATCGCT
CCCCTCGCCATTGGTCTCATCGTCGGTGCCAACATCCTAGCCGCCGGTCCATTCTCCGGT
GGATCCATGAACCCAGCACGTTCCTTTGGACCAGCTGTTGCAGCTGGAGATTCTCTGGTC
ACTGGGTCTACTGGGTTGGACCACTCATCGGTGGTGGACTCGCTGGAGTTACCTACGGAA
ATGTCTTCATGACTTCCGAACATGTTCCTCTTGCTTCTGAGTTCTAATCAAGAAAATGTG
ATTATTCTGTGTTTGGTTTCTTTGTCTCTCGATCGATTTGTTGCTTTGTTCGGAGTTTGG
TCAGGTTTCATTGTATCTTGTAAGTTGTATCCAATTTGTATGAATATCATTTGATGGAAT
CACTTCGTTGTATCTAATGGAATCGTTACGATAGTTTTATGGC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL3117Contig1 866 4 4 U
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AACATAAACATAAACCTCAAATCGAAACAATGAGATGCTACAAAGGATCATCCATTCTCG
CCACCAGTCATTACCCATTCCTCTATAAACGACCAGTCTCCTCTCTACCCGCTTCTTTCC
CTTCTACTACCCTCTCATACCCAACCCGAAACCGGTTCGTATCAACCCGGATCCAAGCCC
GGCTCATTCACGACGACCCGGTAAAACAATCGGAGGATTTGAGCTTCTACGATCTCCTCG
GCGTCACCGAATCCGTTAGTCTCCCGGAAATCAAACAGGCGTATAAACAGCTTGCTCGAA
AGTATCATCCCGATGTTTCGCCGCCGGATCGGGTCGAGGAATACACAGATCGGTTTATTA
GGGTTCAAGAAGCTTACGAGACTCTTTCGGATCCTACCCGGAGAGTTCTCTACGACAGAG
ATTTGTCTATGGGATTCTCATTTTCGTTCTCAGGACGACGCCGGAATCGATACGACGATG
AGGAAATTGTGGAAGAGAAGGGTGAGTGGAAGAAAAAATGGCAAACTCAGCTCTCAGGGC
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GTCAACATCACATGTCTGAAGATTCTACTTCTTAACACACAACCACCATATCTGGCCTCC
TTAATTTACTATAGGTTTTTAGCGTAACTACCTGCAAATCTGTATATATTGTATAATATA
AAATTATAAATCCTTTTGTGTGTCTATAATGTGCAAGCACATCACAAAACCTAATCACTA
AATAAGTTTCTTTTGCTTGTGGTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FS68TF U 1
AF RR4GF54TF U 1
AF RR4GF54JQ C 64
AF RR4FS68JQ C 68
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BQ
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AF RR4AI57JQ C 1
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G
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RD RR4AG60TF 516 0 0
G
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QA 2 516 2 516
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CTT**CCTTTTATTCTGTGAACTAGAAAAGTAATCTCAAAGGTACTATTGATCT
CG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

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ATTCTACCAGAACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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G

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ACGCTTGCGACCGATGTCCTCACCGCTCTAAGGCTGCTTTCTTCTCCTCCGCATCTGCCC
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CCGCCGCCGTTCCTTCCATCTACAAAGACGGCGCTGGCTGCGGTGCTTGCTTTCAGGTCA
GATGCAACAACCTCACTCTTTGCAGCACCAAAGGAACCACGGTGATGGTCACCGACCTCA
ACATGAGCAACCAGACCGATCTCGTCCTCAGCAGCAGAGCCTTCAGGGCCATGGCCAAAC
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AAAAAACCATACTACTTGGCTATAAAGCTCTTGTACCAAGGAGGCCAAACCGAAGTCGTA
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GCTGGCTAC

QA 1 729 1 729
DS 

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QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4DM79JQ 595 0 0
TC
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TGACTTTGACTTACTTCTCCTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTAGAAGCATTCCTTATATC
ATCATCATGTACTATAAATAATCAAAACCATTAACTGAGATTCTACCAGAACC

QA 3 595 3 595
DS 



AS 1 4

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AGTACTGGATCATGGGAGACCTCGAGACCCCACCGGAGAAACGAATCGGATCTTTCGCGA
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TGTCTCACAACCAGAGACAACGTCACACTCTTCTTTATTTCAAAGGCGCTAAGCACCGAC
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GAATGGCAAAGGTGCAGTCGGTTTTTGCCTATGATAATGGCCAAGCCGATGGGATTGGAC
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CCATAATGATTTGAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FW60TF U 1
AF RR4G366TF U 1
AF RR4G366JQ C 578
AF RR4FW60JQ C 783
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BS 699 808 RR4FW60TF
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BS 810 817 RR4G366TF
BS 818 1275 RR4G366JQ

RD RR4FW60TF 816 0 0
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CCATACAAAGCCTATGCGTCCCTGTGAT
GTCAGCGA

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AGTACTGGATCATGGGAGACCTCGAGACCCCACCGGAGAAACGAATCGGATCTTTCGCGA
AACGGGTCTTCAGCGAATCCGAAGCTGATGTAGTCTTCGTGCCCTTCTTCGCGACCCTAA
GCGCGGAGATGGAGCTTGGTAATGGCAAAGGCTCCTCCTTTAGAAAGAGATCTGGAAACG
AAGATTATCAGAGGCAGAGACAAGTCCTTGACTTTTTGAACAACACTCGAGCTTGGAAGC
GATCCGGTGGTCGTGATCACGTTTTTGTTCTTACCGACCCTGTTGCAATGTGGCATGTTC
GTGAGGAGATTGCTCTCTCTATTCTACTTGTGGTGGATTTTGGAGGATGGTTCAGGCAAG
ATTCCAAGTCTTTCAACCGTACTACTAGTAGCGGCTTCCCTGAGAGGATTGAGCATACCC
AAGTCTCTGTGATCAAGGATGTCATTGTTCCATACACGCATCTTCTTCCTCGCCTTGATT
TGTCTCACAACCAGAGACAACGTCACACTCTTCTTTATTTCAAAGGCGCTAAGCACCGAC
ATCGGGGAGGGTTGATTAGAGAAAAGCTATGGGACTTGCTGGTGGATGAACACGACATTG
TCATGGAAGAAG*TTTCCCTAATGCAACGGGAAGAGAACAGTCGATAAGAGGGATGAGAA
ACTCAGAGT*CTGC*TGCATC*AGCTGGTGACACTCCCACTTCATGCCGTCTCTTTGACG
CCATACAAAGC*TATGCGTCCCTGTGAT*GTCAGCGA
CA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4G366JQ 698 0 0
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GCTGGTGGATGAACACGACATTGTCATGGAAGAAGGTTTCCCTAATGCAACGGGAAGAGA
ACAGTCGATAAGAGGGATGAGAAACTCAGAGTTCTGCCTGCATCCAGCTGGTGACACTCC
CACTTCATGCCGTCTCTTTGACGCCATACAAAGCCTATGCGTCCCTGTGATTGTCAGCGA
CAACATTGAGCTCCCCTTTGAAGGAATCCTAGATTACTCTGAATTCTCGGTCTTTGTCTC
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AGTTGGTACTTCTGTCCCTCTTCGCTGTCAATGTATCTGAACTGTGGAACCAAACCCAAT
TTTTTGTTTTGTTTTTTTCTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTGTTCACCAACATTGTTTTGT
CCTATGCAGTGTAAAATACAATACCATAATGATTTGAC

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DS 

RD RR4FW60JQ 493 0 0
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ATCCTAGATTACTCTGAATTCTCGGTCTTTGTCTCTGTAAGTGATGCGTTAACACCTAAA
TGGTTGGCTAATCATCTCAGAAGCTTCTCCCAAGGAGACAAGGAAACATTTAGAAGTAGA
ATGGCAAAGGTGCAGTCGGTTTTTGCCTATGATAATGGCCAAGCCGATGGGATTGGACCG
ATTCAACCTGATGGTGCGGTGAATCACATATGGAAGAAGGTTCATCAGAAGGTGCCAGTG
GTGAAGAAAGCAGTGATTAGGGAGAGGAGAAAACCAGTTGGTACTTCTGTCCCTCTTCGC
TGTCAATGTATCTGAACTGTGGAACCAAACCCAATTTTTTGTTTTGTTTTTTTCTTTTTT
TTTGGTTTTTGTTTTGTTCACCAACATTGTTTTGTCCTATGCAGTGTAAAATACAATACC
ATAATGATTTGAC

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 3

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AAAAATATTCAAAAGAGACAAAAAAAAAAAGACAAAACATTTTCTCATTCTTCTTTCATC
AATCTCTCATTTGAGTTTCAAGGTTTTGCTACAGTTAGGGGAAAGGTTGTATCTTGATTC
TTGGTAATGGGCCTAATGGCTGAGATTTGAGGAGGAAGAAGAAGAAGACTTTCATTTTTT
TTTTTTGAACTTGCGGCGGAGATGAGCGCTTCGAGGTTCATAAAATGTGTCACAGTCGGC
GATGGTGCTGTCGGAAAAACATGTATGCTGATTTCTTACACCAGCAACACTTTCCCCACG
GACTATGTTCCAACTGTTTTCGACAACTTCAGTGCTAATGTGGTTGTAGATGGGAACACT
GTGAATCTTGGCTTGTGGGATACAGCCGGTCAAGAAGACTATAACAGATTAAGACCATTG
AGTTCCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACG
AGAACATAGCCAAGAAGTGGATTCCTGAGCTCAGGCATTATGCCCCTGGAGTTCCTATTA
TCCTCGTTGGAACAAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCTG
GTGCAGTGCCGATTACTACAAACCAGGGAGAAGAACTAAAGAAACTGATAGGATCTCCGG
TTTACATTGAGTGTAGTTCAAAGACTCAGCAGAACGTTAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTA
TAAAAATGGTGCTTCAGCCACCGAATCAAAAAAAGAAGAAATTGAATAAGAGTCTTTGTG
CTTTATTGTGACCTCATCTTTAAAGAAAAAATGAAGAAGATTTATTGGTAGAGACAAAAA
AGAAAAGAGAGTAGCATCAAATGCAGCCTTGGTGGGTCATTTGAAGTGAGGCCAAGTGGG
ATTCTAAGTAAGAGAAAGGGATGAGTTCTTGGTGTGTTGTTGTTGTACTTCCTCTATGTA
GACTAGTCTCTTAATGCTTTTTTAAAGACTGCTTGAAACCTTTTTGTACTTTTAACAGAC
GAGTTTTAATTAATTTTATCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS86TF U 1
AF RR4D983TF U 200
AF RR4D983JQ C 348
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BS 841 1044 RR4D983JQ

RD RR4AS86TF 254 0 0
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AATCTCTCATTTGAGTTTCAAGGTTTTGCTACAGTTAGGGGAAAGGTTGTATCTTGATTC
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TTTTTTGAACTTGCGGCGGAGATGAGCGCTTCGAGGTTCATAAAATGTGTCACAGTCGGC
GATGGTGCTGTCGG

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR4D983TF 641 0 0
G
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CGACAACTTCAGTGCTAATGTGGTTGTAGATGGGAACACTGTGAATCTTGGCTTGTGGGA
TACAGCCGGTCAAGAAGACTATAACAGATTAAGACCATTGAGTTCCGTGGTGCAGATGTC
TTCATTCTTGCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAAGAAGTGG
ATTCCTGAGCTCAGGCATTATGCCCCTGGAGTTCCTATTATCCTCGTTGGAACAAAACTC
GATCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCTGGTGCAGTGCCGATTACTACA
AACCAGGGAGAAGAACTAAAGAAACTGATAGGATCTCCGGTTTACATTGAGTGTAGTTCA
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CCGAATCAAAAAAAGAAGAAATTGAATAAGAGTCTTTGTGCTTTATTGTGACCTCATCTT
TAAAGAAAAAATGAAGAAGATTTATTGGTAGAGACAAAAA

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR4D983JQ 697 0 0
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GGAGTTCCTATTATCCTCGTTGGAACAAAACTCGATCTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTC
ATAGACCATCCTGGTGCAGTGCCGATTACTACAAACCAGGGAGAAGAACTAAAGAAACTG
ATAGGATCTCCGGTTTACATTGAGTGTAGTTCAAAGACTCAGCAGAACGTTAAAGCAGTC
TTTGACGCAGCTATAAAAATGGTGCTTCAGCCACCGAATCAAAAAAAGAAGAAATTGAAT
AAGAGTCTTTGTGCTTTATTGTGACCTCATCTTTAAAGAAAAAATGAAGAAGATTTATTG
GTAGAGACAAAAAAGAAAAGAGAGTAGCATCAAATGCAGCCTTGGTGGGTCATTTGAAGT
GAGGCCAAGTGGGATTCTAAGTAAGAGAAAGGGATGAGTTCTTGGTGTGTTGTTGTTGTA
CTTCCTCTATGTAGACTAGTCTCTTAATGCTTTTTTAAAGACTGCTTGAAACCTTTTTGT
ACTTTTAACAGACGAGTTTTAATTAATTTTATCATCG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL3122Contig1 495 4 4 U
GGACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTATCGCTCTCTCTTAAACTTTCTTCCTCTCTC
GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
TCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGAT
CCATCCATCTCAATCGATTCTCATAAATCTTCAATCCATCGTCTCGTCTCTTCTCGTGTC
TGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGTT
TAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAAT
TCTAATGTTTATTTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4GL36TF U 1
AF RR4BY82JQ C 1
AF RR4GL36JQ C 1
AF RR4BY82TF U 1
BS 1 359 RR4GL36TF
BS 360 360 RR4BY82TF
BS 361 431 RR4GL36TF
BS 432 495 RR4BY82TF

RD RR4GL36TF 431 0 0
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TAATGTGTTCT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4BY82JQ 495 0 0
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TCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGAT
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TGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGTT
TAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAAT
TCTAATGTTTATTTT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4GL36JQ 495 0 0
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GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
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AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGAT
CCATCCATCTCAATCGATTCTCATAAATCTTCAATCCATCGTCTCGTCTCTTCTCGTGTT
TGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGTT
TAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAAT
TCTAATGTTTATTTT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4BY82TF 495 0 0
GGACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTATCGCTCTCTCTTAAACTTT*TTCCTCTCTC
GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
TCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGAT
CCATCCATCTCAATCGATTCTCATAAATCTTCAATCCATCGTCTCGTCTCTTCTCGTGTC
TGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGTT
TAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAAT
TCTAATGTTTATTTT

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 4

CO CL3123Contig1 1044 4 11 U
CAAAACATACATCATTTTTAAGCTCAAAACATGGGGTCTTTGGTTATAAAAGATAATACA
AACATAGACCTAACACATCACACGATTCAAGATATTCATACTACAACATGATATGTTACA
TTTAGAGTGTTTACTTGAGGACCATAGCTAATTGGTTAGCCACTGAAGATTTCAATGTAG
GAGAAACAGGAGAGTCCCCAAAGAACACATCAAACAAAGCAGATGTAACACTACCTGACT
CGATCTCTGCATCCACGTCTTTTGGCAGCCCTCCAGAAGACACAGAAACAAGCATTTTAG
AAGGATTGATCCAAGTCAAGAGAATGACACTTCCTTTGTTGAGAGGTCTGTTTTGGAAGA
TCCCTTGGAATGTAGAGAGAGCGGTTTTATCATCAGATGTAGGAGATTTGATTCTAGGTG
AAATGGCATCGTCCAATGCATCCCAGAAGGTTTTGCCATCAACATCTCTCACAAGAACAA
TCTGCAATGACTTCTCTGCTTGATCTTGAAAGATTGAACTAAAGAGTGATGAATCTCTCT
GAATCTCATCAGCAGACCGCCCTTTCCAAGCGCTTAACCCGGTTAAGATAGATTCATTCA
CGTATAAACCCGCAGCATAGACTTTGACACCAATGATAGCAAACTTCTTCTCCCTAAACC
CAGTGCCGAGCAAGGAGAGCGTGGTAGAACAACCAGGTAATGCCACTGATCTCTGAAACT
TCACACTTGTAGCCGGTTCTTCCACGTTCTCATCTGCATTTCCAACTGAAGAAGCTGCGG
ATTTGACCACCATGCGTGAAGTTTCAACACAATGAAAGGAGCTTCCTTTCTTAGATGGGT
GGATGGAGAGAGATGAAACGCAATTCACAGTTGGAAGCACTGAAACTCGATTCGGGGACT
GGTGTCTGGATCCAGCATTAACTCTGTTCAGACAGACACTTCGCAGAGAGAGACCACGGA
TTACAGAGGGAAATGCCGTAAGAACAACTCCGTCCATGTTCGAAATCTCCGGCGATGAAT
CCTAGAAGTGTGTTTGATCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D204JQ U 1
AF RR4BS25JQ U 15
AF RR4BS25TF C 216
AF RR4D204TF C 304
BS 1 34 RR4D204JQ
BS 35 35 RR4BS25JQ
BS 36 271 RR4D204JQ
BS 272 272 RR4BS25JQ
BS 273 357 RR4D204JQ
BS 358 358 RR4BS25JQ
BS 359 470 RR4D204JQ
BS 471 471 RR4BS25JQ
BS 472 550 RR4D204JQ
BS 551 776 RR4BS25JQ
BS 777 1044 RR4BS25TF

RD RR4D204JQ 550 0 0
CAAAACATACATCATTTTTAAGCTCAAAACATGGTGTCTTTGGTTATAAAAGATAATACA
AACATAGACCTAACACATCACACGATTCAAGATATTCATACTACAACATGATATGTTACA
TTTAGAGTGTTTACTTGAGGACCATAGCTAATTGGTTAGCCACTGAAGATTTCAATGTAG
GAGAAACAGGAGAGTCCCCAAAGAACACATCAAACAAAGCAGATGTAACACTACCTGACT
CGATCTCTGCATCCACGTCTTTTGGCAGCCCCCCAGAAGACACAGAAACAAGCATTTTAG
AAGGATTGATCCAAGTCAAGAGAATGACACTTCCTTTGTTGAGAGGTCTGTTTTGGA*GA
TCCCTTGGAATGTAGAGAGAGCGGTTTTATCATCAGATGTAGGAGATTTGATTCTAGGTG
AAATGGCATCGTCCAATGCATCCCAGAAGGTTTTGCCATCAACATCTCTCTCAAGAACAA
TCTGCAATGACTTCTCTGCTTGATCTTGAAAGATTGAACTAAAGAGTGATGAATCTCTCT
GAATCTCATC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4BS25JQ 762 0 0
TTTTTAAGCTCAAAACATGGGGTCTTTGGTTATAAAAGATAATACAAACATAGACCTAAC
ACATCACACGATTCAAGATATTCATACTACAACATGATATGTTACATTTAGAGTGTTTAC
TTGAGGACCATAGCTAATTGGTTAGCCACTGAAGATTTCAATGTAGGAGAAACAGGAGAG
TCCCCAAAGAACACATCAAACAAAGCAGATGTAACACTACCTGACTCGATCTCTGCATCC
ACGTCTTTTGGCAGCCCTCCAGAAGACACAGAAACAAGCATTTTAGAAGGATTGATCCAA
GTCAAGAGAATGACACTTCCTTTGTTGAGAGGTCTGTTTTGGAAGATCCCTTGGAATGTA
GAGAGAGCGGTTTTATCATCAGATGTAGGAGATTTGATTCTAGGTGAAATGGCATCGTCC
AATGCATCCCAAAAGGTTTTGCCATCAACATCTCTCACAAGAACAATCTGCAATGACTTC
TCTGCTTGATCTTGAAAGATTGAACTAAAGAGTGATGAATCTCTCTGAATCTCATCAGCA
GACCGCCCTTTCCAAGCGCTTAACCCGGTTAAGATAGATTCATTCACGTATAAACCCGCA
GCATAGACTTTGACACCAATGATAGCAAACTTCTTCTCCCTAAACCCAGTGCCGAGCAAG
GAGAGCGTGGTAGAACAACCAGGTAATGCCACTGATCTCTGAAACTTCACACTTGTAGCC
GGTTCTTCCACGTTCTCATCTGCATTTCCAACTGAAGAAGCT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BS25TF 829 0 0
CAACAAGCAGATGTACATA
CTGACTCGATCTCTGCATCCACGTCTTT*GGCAGCC*TCCAGAAGACACAGAAACAAGCA
TTT*AGAAGGAT*GATCCAAGTCAAGAGAATGACACT*CCTTTGTTGAGAGGTCTGTTT*
GGAAGATCCCTTGGAATGTAGAGAGAGCGGTTTTATCATCAGATGTAGGAGATTTGATTC
TAGGTGAAATGGCATCGTCCAATGCATCCCAGAAGGTTTTGCCATCAACATCTCTCACAA
GAACAATCTGCAATGACTTCTCTGCTTGATCTTGAAAGATTGAACTAAAGAGTGATGAAT
CTCTCTGAATCTCATCAGCAGACCGCCCTTTCCAAGCGCTTAACCCGGTTAAGATAGATT
CATTCACGTATAAACCCGCAGCATAGACTTTGACACCAATGATAGCAAACTTCTTCTCCC
TAAACCCAGTGCCGAGCAAGGAGAGCGTGGTAGAACAACCAGGTAATGCCACTGATCTCT
GAAACTTCACACTTGTAGCCGGTTCTTCCACGTTCTCATCTGCATTTCCAACTGAAGAAG
CTGCGGATTTGACCACCATGCGTGAAGTTTCAACACAATGAAAGGAGCTTCCTTTCTTAG
ATGGGTGGATGGAGAGAGATGAAACGCAATTCACAGTTGGAAGCACTGAAACTCGATTCG
GGGACTGGTGTCTGGATCCAGCATTAACTCTGTTCAGACAGACACTTCGCAGAGAGAGAC
CACGGATTACAGAGGGAAATGCCGTAAGAACAACTCCGTCCATGTTCGAAATCTCCGGCG
ATGAATCCTAGAAGTGTGTTTGATCTTTCG

QA 20 829 20 829
DS 

RD RR4D204TF 728 0 0
GGA
TGATCCAAGTCAAGAGAATGACACT**CTTTGTTGAGAGGTCTGTTTTGGA*GATCCCTT
GGAATGTAGAGAGAGCGGTTTTATCATCAGATGTAGGAGATTTGATTCTAGGTGAAATGG
CATCGTCCAATGCATCCCAGAAGGTTTTGCCATCAACATCTCTCTCAAGAACAATCTGCA
ATGACTTCTCTGCTTGATCTTGAAAGATTGAACTAAAGAGTGATGAATCTCTCTGAATCT
CATCAGCAGACCGCCCTTTCCAAGCGCTTAACCCGGTTAAGATAGATTCATTCACGTATA
AACCCGCAGCATAGACTTTGACACCAATGATAGCAAACTTCTTCTCCCAAAACCCAGTGC
CGAGCAAGGAGAGCGTGGTAGAACAACCAGGTAATGCCACTGATCTCTGAAACTTCACAC
TTGTAGCCGGTTCTTCCACGTTCTCATCTGCATTTCCAACTGAAGAAGCTGCGGATTTGA
CCACCATGCGTGAAGTTTCAACACAATGAAAGGAGCTTCCTTTCTTAGATGGGTGGATGG
AGAGAGATGAAACGCAATTCACAGTTGGAAGCACTGAAACTCGATTCGGGGACTGGTGTC
TGGATCCAGCATTAACTCTGTTCAGACAGACACTTCGCAGAGAGAGACCACGGATTACAG
AGGGAAATGCCGTAAGAACAACTCCGTCCATGTTCGAAATCTCCGGCGATGAATCCTAGA
AGT
CC

QA 4 726 4 726
DS 



AS 1 4

CO CL3124Contig1 539 4 5 U
GGGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCCGGGTAGCCATAAGTCCCCACCAGGCACTGGGA
AGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGTAGACTTGTTGGGAGGTT
TAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGATACTTAAAGGCC
TCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACC
TTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCAAAAACCCACCTC
CGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAA
AAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTTTCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAA
TCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCGCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAG
ATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BW31TF U 1
AF RR4GC57JQ C 48
AF RR4GC57TF U 48
AF RR4BW31JQ C 27
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BS 137 137 RR4GC57TF
BS 138 539 RR4BW31TF

RD RR4BW31TF 539 0 0
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TTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCAAAAACCCACCTC
CGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAA
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QA 1 539 1 539
DS 

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G
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TGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGA
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AAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCA
AAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAA
CTTGGAGAAAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTTTCCTTTCACGTGTATT
AATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCGCTTCTGCTTGTATCG
TTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTATT
TTTAACGAATG

QA 2 492 2 492
DS 

RD RR4GC57TF 492 0 0
G
CAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGTAGACT
TGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGA
TACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACACTTAAGCTTA
AAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCA
AAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAA
CTTGGAGAAAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTTTCCTTTCACGTGTATT
AATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCGCTTCTGCTTGTATCG
TTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTATT
TTTAACGAATG

QA 2 492 2 492
DS 

RD RR4BW31JQ 513 0 0
CCGGGTAGCCATAAGTCCCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTG
AAGTTGGGGGCGTGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTGGGAGACCCA
GCCGTTAACAAATGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGT
CTTTGCACTACACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTT
CAGCTTCTTCTTACCTGTGGCAAAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAA
ATTTAGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCT
GGTTTTTCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATA
TCTATCGCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAA
GTACGATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATG

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 4

CO CL3125Contig1 948 4 5 U
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AAGAAGGGTCTGAAAGAAGCAAAAGTAACTCGACCCTGGAACTGTATCATATAAGAGCGG
TACAGTGCCTTGTCAAAACAATTAACCGCATAAACCTCTACCAAAAGACTGAGAAGATAC
GTCCCTCTGATTGAGAGCCCCCCCCTAGGCGTTTTCCGCAGATGGGTTCTCATGCACATA
CGTGCCAACTGATTTGAACCATCGCAGCAAGTTACGATGATCCTTTACATAGAGCCATGC
CTGAAGAAACGGGAAGAGACTCTCGTTCACACCTCGCTCCTCCAGGAAGCTATGGAATAC
GTCTCTCATCTTCTCATCCAGCTCTTCAAAAGAAGGGCCAGTGTAACGAGCAGGATCATC
GGACAACTCCAAATCCTCGAGCTTGGGCCTCATGGAAACAGAGTGAATACCCAACGCATC
CGGGTAAAGCCCGCAAAGGAAATGAAGAGACTCAGCCTGGTTCGGCTTCGACACAGCCAC
GTGGAGGAACAGCTGGTTAATCCCATCCTCGTCTTCATCATCACCACCTCCGTGAGCAAG
CCTCATCACAAAGAGACTAATCTCTTCGTTTCCGACAGATTTCTTCAGAACAGCGCCGGT
TCCCTAGAGCGATCCTTTCACAATCTCGAACGGTGAAGGAGGTGTCACTTTGGGAGGAGG
AGTCATCTTGGAGACTTCTAGGTAATGTTCCTTTAGGGAACGGAGTAGCATCGAATCGAC
GGCGGCTGAAACGTCGCTTGGCTTTCCGCTTCCACCTGATTTGCTGGATAGAGCTCTTTG
AAATTGACGCCGGACTGCGACGTTACCGATCACTCTTCTCAACATTTTTTACTTCTCCGT
CTCGAATACAGCGGCGAGTTGCCTTCTTTCTTCGCCGAGTAATCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER84JQ U 1
AF RR4AG95JQ U 59
AF RR4AG95TF C 210
AF RR4ER84TF C 214
BS 1 439 RR4ER84JQ
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RD RR4ER84JQ 503 0 0
ATAGAATTGACAAAAATTAACTTTTCTTAAACAACATCACTGATGCATATGTTTTCTTGA
AAGAAGGGTCTGAAAGAAGCAAAAGTAACTCGACCCTGGAACTGTATCATATAAGAGCGG
TACAGTGCCTTGTCAAAACAATTAACCGCATAAACCTCTACCAAAAGACTGAGAAGATAC
GTCCCTCTGATTGAGAGCCCCCCCCTAGGCGTTTTCCGCAGATGGGTTCTCATGCACATA
CGTGCCAACTGATTTGAACCATCGCAGCAAGTTACGATGATCCTTTACATAGAGCCATGC
CTGAAGAAACGGGAAGAGACTCTCGTTCACACCTCGCTCCTCCAGGAAGCTATGGAATAC
GTCTCTCATCTTCTCATCCAGCTCTTCAAAAGAAGGGCCAGTGTAACGAGCAGGATCATC
GGACAACTCCAAATCCTCG*GCTTGGGCCTCATGGAAACAGAGTGAATACCCAACGCATC
CGGGTAAAGCCCGCAAAGGAAAT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4AG95JQ 696 0 0
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GGTACAGTGCCTTGTCAAAACAATTAACCGCATAAACCTCTACCAAAAGACTGAGAAGAT
ACGTCCCTCTGATTGAGAGCCCCCCCCTAGGCGTTTTCCGCAGATGGGTTCTCATGCACA
TACGTGCCAACTGATTTGAACCATCGCAGCAAGTTACGATGATCCTTTACATAGAGCCAT
GCCTGAAGAAACGGGAAGAGACTCTCGTTCACACCTCGCTCCTCCAGGAAGCTATGGAAT
ACGTCTCTCATCTTCTCATCCAGCTCTTCAAAAGAAGGGCCAGTGTAACGAGCAGGATCA
TCGGACAACTCCAAATCCTCGAGCTTGGGCCTCATGGAAACAGAGTGAATACCCAACGCA
TCCGGGTAAAGCCCGCAAAGGAAATGAAGAGACTCAGCCTGGTTCGGCTTCGACACAGCC
ACGTGGAGGAACAGCTGGTTAATCCCATCCTCGTCTTCATCATCACCACCTCCGTGAGCA
AGCCTCATCACAAAGAGACTAATCTCTTCGTTTCCGACAGATTTCTTCAGAACAGCGCCG
GTTCCCTAGAGCGATCCTTTCACAATCTCGAACGGTGAAGGAGGTGTCACTTTGGGAGGA
GGAGTCATCTTGGAGACTTCTAGGTAATGTTCCTTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4AG95TF 739 0 0
GCGT
TTCCGCAGATGGGTTCTCATGCACATACGTGCCAACTGATTTGAACCATCGCAGCAAGTT
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TCGCTCCTCCAGGAAGCTATGGAATACGTCTCTCATCTTCTCATCCAGCTCTTCAAAAGA
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TTCATCATCACCACCTCCGTGAGCAAGCCTCATCACAAAGAGACTAATCTCTTCGTTTCC
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TGAAGGAGGTGTCACTTTGGGAGGAGGAGTCATCTTGGAGACTTCTAGGTAATGTTCCTT
TAGGGAACGGAGTAGCATCGAATCGACGGCGGCTGAAACGTCGCTTGGCTTTCCGCTTCC
ACCTGATTTGCTGGATAGAGCTCTTTGAAATTGACGCCGGACTGCGACGTTACCGATCAC
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GCCGAGTAATCACCC

QA 5 739 5 739
DS 

RD RR4ER84TF 721 0 0
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ACGATGATCCTTTACATAGAGCCATGCC*GAAGAAACGGGAAGAGACTCTCGTTCACACC
TCGCTCCTCCAGGAAGCTATGGAATACGTCTCTCATCTTCTCATCCAGCTCTTCAAAAGA
AGGGCCAGTGTAACGAGCAGGATCATCGGACAACTCCAAATCCTCG*GCTTGGGCCTCAT
GGAAACAGAGTGAATACCCAACGCATCCGGGTAAAGCCCGCAAAGGAAATGAAGAGACTC
AGCCTGGTTCGGCTTCGACACAGCCACGTAGAGGAACAGCTGGTTAATCCCATCCTCGTC
TTCATCATCACCACCTCCGTGAGCAAGCCTCATCACAAAGAGACTAATCTCTTCGTTTCC
GACAGATTTCTTCAGAACAGCGCCGGTTCCCTCGAGCGATCCTTTCACAATCTCGAACGG
TGAAGGAGGTGTCACTTTGGGAGGAGGAGTCATCTTGGAGACTTCTAGGTAATGTTCCTT
TAGGGAACGGAGTAGCATCGAATCGACGGCGGCTGAAACGTCGCTTGGCTTTCCGCTTCC
ACCTGATTTGCTGGATAGAGCTCTTTGAAATTGACGCCGGACTGCGACGTTACCGATCAC
TCTTCTCAACATTTTTTACTTCTCCGTCTCGAATACAGCGGCGAGTTGCCTTCTTTCTTC
C

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

CO CL3126Contig1 1147 4 12 U
GGTTGAAGAGGAGAGAAGTGAACCTGCTTCTGTTCCAGTTCCCATGCCAGATTTGTCTCT
ACCTGCATCGTTCGACTCTGACAATCCTACTCACAGGTACCGGTCCCTTGATTCCTCCAA
CCAGTGGCTTGTTAGGCCAGTCCTGGAAACTCAGGGGTGGGATCATGATGTTGGCTATGA
AGGTGTAAATGCAGAACGTCTTTTTGTTGTTAAAGAAAAGATACCAATATCTTTCTCGGG
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TAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4DM41TF U 141
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AF RR4DM41JQ C 433
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GG
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C
TCTTT

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G
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CTTAGGTTTCGAAATGCAAAATGCTGGGAAGGAATTGGCTTACACTCTTCGAAGTGACAT
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AGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGACTATCCGCTTGGTAGGTTTTTATCTACTCTGGGACT
CTCTGTGATGGACTGGCATGGTGATCTTGCTATTGGAGGGAATATACAGTCCCAAGTGCC
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TGGCGGTAGTTTAGAAGCTCAGTTGAGAGACAAAGACTATCCGCTTGGTAGGTTTTTATC
TACTCTGGGACTCTCTGTGATGGACTGGCATGGTGGTCTTGCTATTGGAGGGAATATACA
GTCCCAAGTGCCCATAGGATGTTCATCTAATCTAATTGCTCGTGCTAATCTGAACAACAG
AGGGGCAGGGCAAGTAAGCATCCGGGTAAACAGCTCTGAGCAGCTCCAACTTGCTATTGT
CGCACTTGTTCCCCTTTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTATTCCCCTCAGCAAATGGAGTA
TTGACAATAAGAAGAACACTTCGGGTTTCAATTCACTTCCTACAAGAACATCCTAGAGTG
AACCTTGGTGTGCCCTTTGGGTTGAAAACTTTAAGAACAAATTGTTGGAGGAGGCATCTG
TTTTCTTTAAATAGCCAGAACACTTGCTCGTTCCTTGTCTAATTTAAGCTTAGTTGTGGT
TTTATTCTCTTTCCAGAACATTTGTATGGCCTTCTGTTCATGTCTACTCCTGATTTTTCA
TAAAGCCTTGTTTAAAAGTAATGTATGCTGCAATCTACTTGTTGATCTTAAGACC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

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TGGGGAAGACTTGTATGCTAATTTCATATACCAGCAATACTTTTCCTACGGATTACGTTC
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GCCTGTGGGATACTGCTGGGCAGGAAGATTACAACAGGCTTCGGCCTTTGAGTTACAGAG
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CTATAACAACTGCTCAGGGAGAAGACCTAAGAAAGATGATTGGAGCTGTCAGGTACTTAG
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CATGTCAA


BQ
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 

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AF RR4D280TF U 9
AF RR4F153JQ C 60
AF RR4D280JQ C 78
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AAGAAAAGAAAATGAGCACAGCAAGATTCATCAAGTGTGTGACGGTCGGAGATGGAGCTG
TGGGGAAGACTTGTATGCTAATTTCATATACCAGCAATACTTTTCCTACGGATTACGTTC
CGACAGTTTTTGACAATTTCAGTGCGAATGTGGTGGTCGATGGAAGTACTGTCAATCTCG
GCCTGTGGGATACTGCTGGGCAGGAAGATTACAACAGGCTTCGGCCTTTGAGTTACAGAG
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ACAAAAAGTGGCTTTCGGAGCTGAAACATTATGCGCCTAGCATCCCCATTGTGCTCGTCG
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CTATAACAACTGCTCAGGGAGAAGACCTAAGAAAGATGATTGGAGCTGTCAGGTACTTAG
AATGCAGCTCCAAAACCCAGCAGAATGTGAAGGCAGTGTTTGATACAGCGATTCGGGTAT
CGTTAAGGCCACCAAAGGCAAAAAAGAAG*TAAAGCCATTGAGGACCAAGAGATCACGAA
CATGCTTTTTCTTTTAAA*TTTCATCATTTAAATAAAA*TAATATACACATGTATTTCAA
TTTTTTT*CTTATATTTGTA*TGACAAAAGG*ATTCATTAGC
A

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DS 

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GGA
AAACACACACCCAATTCACAAACAGAGAAATAAAAGAAATTGAAGCTAAAAGGAAAGAAA
ATGAGCACAGCAAGATTCATCAAGTGTGTGACGGTCGGAGATGGAGCTGTGGGGAAGACT
TGTATGCTAATTTCATATACCAGCAATACTTTTCCTACGGATTACGTTCCGACAGTTTTT
GACAATTTCAGTGCGAATGTGGTGGTCGATGGAAGTACTGTCAATCTCGGCCTGTGGGAT
ACTGCTGGGCAGGAAGATTACAACAGGCTTCGGCCTTTGAGTTACAGAGGAGCAGATGTG
TTTTTATTGGCATTTTCCCTAATAAGCAAGGCCAGTTACGAGAACATTTACAAAAAGTGG
CTTTCGGAGCTGAAACATTATGCGCCTAGCATCCCCATTGTGCTCGTCGGAACCAAATTA
GATTTGAGGGATGACAAGCAGTTCTTAAAAGATCATCCAGGAGCAGCTTCTATAACAACT
GCTCAGGGAGAAGACCTAAGAAAGATGATTGGAGCTGTCAGGTACTTAGAATGCAGCTCC
AAAACCCAGCAGAATGTGAAGGCAGTGTTTGATACAGCGATTCGGGTAGCGTTAAGGCCA
CCAAAGGCAAAAAAGAAGATAAAGCCATTGAG*ACCAAGAGATCACGAACATGCTTTTTC
TTTTAAA*TTTCATCATTTAAATAAAA*TAATATACACATGTATTTCAATTTTTTT*CTT
ATATTTGTA*TGACAAAAGGGATTCATTAGCCATAAACAATTTCTGCCGCATGTCAA

QA 4 780 4 780
DS 

RD RR4F153JQ 727 0 0
AAAGAAAAGAAAATGAGCACAGCAAGATTCATCAAGTGTGTGACGGTCGGAGATGGAGCT
GTGGGGAAGACTTGTATGCTAATTTCATATACCAGCAATACTTTTCCTACGGATTACGTT
CCGACAGTTTTTGACAATTTCAGTGCGAATGTGGTGGTCGATGGAAGTACTGTCAATCTC
GGCCTGTGGGATACTGCTGGGCAGGAAGATTACAACAGGCTTCGGCCTTTGAGTTACAGA
GGAGCAGATGTGTTTTTATTGGCATTTTCCCTAATAAGCAAGGCCAGTTACGAGAACATT
TACAAAAAGTGGCTTTCGGAGCTGAAACATTATGCGCCTAGCATCCCCATTGTGCTCGTC
GGAACCAAATTAGATTTGAGGGATGACAAGCAGTTCTTAAAAGATCATCCAGGAGCAGCT
TCTATAACAACTGCTCAGGGAGAAGACCTAAGAAAGATGATTGGAGCTGTCAGGTACTTA
GAATGCAGCTCCAAAACCCAGCAGAATGTGAAGGCAGTGTTTGATACAGCGATTCGGGTA
TCGTTAAGGCCACCAAAGGCAAAAAAGAAGGTAAAGCCATTGAGGACCAAGAGATCACGA
ACATGCTTTTTCTTTTAAAATTTCATCATTTAAATAAAAATAATATACACATGTATTTCA
ATTTTTTTTCTTATATTTGTAATGACAAAAGGGATTCATTAGCCATAAACAATTTCTGCC
GCATGT
T

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4D280JQ 709 0 0
ACAGCAAGATTCATCAAGTGTGTGACGGTCGGAGATGGAGCTGTGGGGAAGACTTGTATG
CTAATTTCATATACCAGCAATACTTTTCCTACGGATTACGTTCCGACAGTTTTTGACAAT
TTCAGTGCGAATGTGGTGGTCGATGGAAGTACTGTCAATCTCGGCCTGTGGGATACTGCT
GGGCAGGAAGATTACAACAGGCTTCGGCCTTTGAGTTACAGAGGAGCAGATGTGTTTTTA
TTGGCATTTTCCCTAATAAGCAAGGCCAGTTACGAGAACATTTACAAAAAGTGGCTTTCG
GAGCTGAAACATTATGCGCCTAGCATCCCCATTGTGCTCGTCGGAACCAAATTAGATTTG
AGGGATGACAAGCAGTTCTTAAAAGATCATCCAGGAGCAGCTTCTATAACAACTGCTCAG
GGAGAAGACCTAAGAAAGATGATTGGAGCTGTCAGGTACTTAGAATGCAGCTCCAAAACC
CAGCAGAATGTGAAGGCAGTGTTTGATACAGCGATTCGGGTAGCGTTAAGGCCACCAAAG
GCAAAAAAGAAGATAAAGCCATTGAGGACCAAGAGATCACGAACATGCTTTTTCTTTTAA
AATTTCATCATTTAAATAAAAATAATATACACATGTATTTCAATTTTTTTTCTTATATTT
GTAATGACAAAAGGGATTCATTAGCCATAAACAATTTCTGCCGCATGT
C

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL3128Contig1 977 4 8 U
GGAGGGCTTCCGCGTCTCTCTTGCTCTCTCTCAAATCACGTTCATTAGGGTTCTCTCAGA
CTCGGTATCGTCACCGTCTTCGCCCCCGCGAAGCTCAGTTCGAAGATGTTCACGGCGGAT
ATACCACCGAATCAGTCAATCTACATCAAAAACCTCAATGAGAGAATCAAGAAAGAAGAA
TTGAAGAGATCTCTTTACTGTTTGTTCTCACAGTTTGGGAGGATACTTGATGTGGTTGCT
TTGAAGACTCCTAAGCTCCGTGGTCAAGCTTGGGTTGCCTTTAGTGACGTCACTGCTGCT
ACTAATGCCGTTCGCCAGATGCAGAACTTCCCTTTCTATGATAAGCCTATGCGCATACAG
TTCGCAAAGGAAAAGTCAGATTGTATTGCTAAAGAGGAAGGAACTTTCGTTCCCAAAGAT
AAGAAGAGGAAGAAACAAGAGAAAGCTGAAAGAAAGCGTGAAGAAACCCAACGACCAAAC
ACAGCTAATGGCCCAACTCCACAGAACGGAGCCCCTCCGCCATCATCGTTCAAGCCGAGC
GGACAAGATGCAATGCCACCAAACAACATACTCTTCATTCAGGATCTTCCGCACGATACA
ACAACCGCTATGCTTGAGTTTCTCTTCCGTCAGTATCCTGGATTCAAAGAGATAAGAATG
GTCGCCGCTAAACCAGGGATCGCATTTGCTGAGTTCGAAGACGATGTTAAATCTTCCATG
GCTATGCACGGTCTTCAGGACTTCAAAATCACTCCCCAGTATCCGATGCTCATCTCTTTC
GCCAAGAAATGAAGAGAAATTGCTTGTGTTTGTTGTGTCTTTTAAGATGATGACAATGAG
ACTGTTAGTGTGTATAACCGACGGTTTAATGTTTTAGTTCGATTGACTCCGGTTTGGTTT
TAATCAGAGACCCCTTAATACGCGGTTTCACACTATCTCATTGTCACTTGTCAACCATTT
ATAAAAATATTAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ73TF U 1
AF RR4FZ87TF U 16
AF RR4AE64TF U 62
AF RR4FZ87JQ C 309
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RD RR4DZ73TF 734 0 0
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TTGAAGACTCCTAAGCTCCGTGGTCAAGCTTGGGTTGCCTTTAGTGACGTCACTGCTGCT
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GCTATGCACGGTCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4FZ87TF 719 0 0
GG
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CTTCGCCCCCGCGAAGCTCAGTTCGAAGATGTTCACGGCGGATATACCACCGAATCAGTC
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CTGTTTGTTCTCACAGTTTGGGAGGATACTTGATGTGGTTGCTTTGAAGACTCCTAAGCT
CCGTGGTCAAGCTTGGGTTGCCTTTAGTGA*GTCACTGCTGCTACTAATGCCGTTCGCCA
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AGAGAAAGCTGAAAGAAAGCGTGAAGAAACCCAACGACCAAACACAGCTAATGGCCCAAC
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GTTTCTCTTCCGTCAGTATCCTGGATTCAAAGAGATAAGAATGGTCGCCGCTAAACCAGG
GATCGCATTTGCTGAGTTCGAAGACGATGTTAAATCTTCCATGGCTATGCACGGTCT

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR4AE64TF 673 0 0
GG
GGTATCGTCACCGTCTTCGCCCCCGCGAAGCTCAGTTCGAAGATGTTCACGGCGGATATA
CCACCGAATCAGTCAATCTACATCAAAAACCTCAATGAGAGAATCAAGAAAGAAGAATTG
AAGAGATCTCTTTACTGTTTGTTCTCACAGTTTGGGAGGATACTTGATGTGGTTGCTTTG
AAGACTCCTAAGCTCCGTGGTCAAGCTTGGGTTGCCTTTAGTGACGTCACTGCTGCTACT
AATGCCGTTCGCCAGATGCAGAACTTCCCTTTCTATGATAAGCCTATGCGCATACAGTTC
GCAGAGGAAAAGTCAGATTGTATTGCTAAAGAGGAAGGAACTTTCGTTCCCAAAGATAAG
AAGAGGAAGAAACAAGAGAAAGCTGAAAGAAAGCGTGAAGAAACCCAACGACCAAACACA
GCTAATGGCCCAACTCCACAGAACGGAGCCCCTCCGCCATCATCGTTCAAGCCGAGCGGA
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ACCGCTATGCTTGAGTTTCTCTTCCGTCAGTATCCTGGATTCAAAGAGATAAGAATGGTC
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ATGCACGGTCT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4FZ87JQ 669 0 0
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GGAAAAGTCAGATTGTATTGCTAAAGAGGAAGGAACTTTCGTTCCCAAAGATAAGAAGAG
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TGCAATGCCACCAAACAACATACTCTTCATTCAGGATCTTCCGCACGATACAACAACCGC
TATGCTTGAGTTTCTCTTCCGTCAGTATCCTGGATTCAAAGAGATAAGAATGGTCGCCGC
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CGGTCTTCAGGACTTCAAAATCACTCCCCAGTATCCGATGCTCATCTCTTTCGCCAAGAA
ATGAAGAGAAATTGCTTGTGTTTGTTGTGTCTTTTAAGATGATGACAATGAGACTGTTAG
TGTGTATAACCGACGGTTTAATGTTTTAGTTCGATTGACTCCGGTTTGGTTTTAATCAGA
GACCCCTTAATACGCGGTTTCACACTATCTCATTGTCACTTGTCAACCATTTATAAAAAT
ATTAAATTT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

CO CL3129Contig1 1302 4 6 U
AAGTAATAAGTCACTACTATATAAATCAACAAATAACTTACAAAAAACAAGCCCTTCACA
TCATCATCATCATCATCAACGATATCATAATGTATGAATATTTATAAACAAGCCCCTCGA
CGTTTACCAACCTTTTGTAATTTCCTGCGGTATACCTGAGGATACTCTTGAAAGGTTGTT
TTTTCTTTCTTGCGTGTCTACCGAGTTCTGAAAACTAAAAGAGATTCTCAAATCCATCAG
TTTACTACAACACAAAGCCATGAATGGCTGAAAAAAGGGAAAGTTGAAACATGAGAAAAA
GAAGCTGCGAGTATTCTTCATGTAGCTCAAAATGACCCACTCACTCTAAAAACAACGCAT
ATAGAAAAAAGTATTCATCATCCACTTCAGATTTTCCTAAAACCCAGCTCAACGACGTTT
GTTGCTGCTGTTCTTCTTGCTCTTCTTCTTTCTACTGCTTCTTCTGTCTTCATCAGAATC
AGAGTCCGAAGCTGATTCTGAATCAGATGACTCCTCAGATGAAGAAGAGCTGTATCTTCT
TCTCCTTTGCCTCTCCTTCCTCTGCTTTGGCTTCTTCTTGCTCTTCCTCTTATTCCTTCT
CCTCCTCCTTTCCTCCTCTGAGTCAGACGACGAACTGTATTCAGAATCACTCTCTCCAAA
TGATTCAGAGCCGTCACTACTATCTGCTTCAAACACAGAGGCTTCGCTATCACTCCCGGA
ATCAGACTTCGACCTCTGCTTTCTCTTGCTCTTCTTAGACGACCGCCTCTCACCTTCCTC
ATCATCTTTCCCGTTTCCTGCATCTACCTTCTCATCATCACCAAGATCATCAACAGAAGG
CTTCATCCTCAGCTTAGGGTTCTTAAGCTGCTGGGTTCTCGAAGGCCTAGAGATGTAAAC
CCTCTCGTTCTTGCACTCATAAGTCCAGTGCCCCGTCTGGAAACACTTCTGGCACTGCGA
AGCCGCCAAGCTGCTTCCTCCTCCCACGACAGATGCCGACACCGACTTGTCCTTCCTCTC
CCCAAGCCTGACGGCTTTCTCGGTACTCATAAGATACATCTGCCTCTTGGCTTCCCTCTT
CTCCTGCCATCTGCTCGGACCTTCTTCCTTCTGACCGTAAGCGTTGACGTTCCTGGAAGC
TGCAGCCGCTGCTCGCTCGGCTTGGGTACGGCTTAAACCTTTGGAAGCAGTGAGTGCTGC
GGCCTTGATCCTGTCGGCTGCAACCTGTGCTTTCTCATCCTTCGATTCAGACATGTCTGT
AGTGGTCTCTTTTGAGCTAATCAAAGACTCTTTCTTCTGATT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FE23JQ U 1
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CAAAAGAGAGGAAACCCAAAAAAAAACAAGCGTCACGATAAACAATGGTCAAGACAGAGT
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CAAAACTCGACACAATTCCACGGGTTGATCTGTCAAGACCCATGTTTTGATCAATCCTCA
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TATCTTGGATGAGACTACAATGTGCAACACCAACGCTGTGGCCACCACCAA*TAAGTGTA
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TGCATACGAAGCAAAGCTGCAGTAATGCTACGGTCACGGCGGAAACGGTTGGCAACAACA
TTAGCAACGATAGATTCAGCTCGTGGGCATGATCGGCCGTAGAACCCGAACCGGAGCTGG
GCGAAAGCAGAGGGAGCAAGGAAGCAGAACAGGAAAAACAAAGCTGTGATTGACCTCATT
TTCGAAATGATGAGCTCTTCTTTGCCTCTCTCCAATGAATGTTTCTTCCAAGTATTGGTG
ATT
CC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

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AACAGTTGCATCCATTGCTGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGCATACAACATTTCTTAT
GTGGGAAGGCTTGCTGTTCGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACACCGGTAACGTCAGGCA
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GTTTTTATGAGGAATGGATTATATGTAAACC*GACTTGGTTTGTTTAATATTCATACAAT
CATATGATCCTTATCGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4B037TF U 1
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AF RR4G707JQ C 345
AF RR4G707TF U 345
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GTTTTTATGAGGA
T

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CCATTGCTGCTTGTGCTCCCGGTATCGATCCGCATACAACATTTCTTATGTGGGAAGGCT
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TGCCCATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCAAGAGATTAGTTCCTCTAATGACTCCG
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TATCGC

QA 1 846 1 846
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G
AGTTGAAGGCGGTCTAACAGTTGCATCCATTGCTGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGCA
TACAACATTTTTTATGTGGGAAGGCTTGTTGTTCGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACAC
CGGTAACGTCAGGCAAACTCTACAGAGGAAATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACCC
ATGTATGGTGCATTGTTGTCTCCATTTTTGTGCGGTTTGTCAAGAGCACCGTGAGATGAA
GAACCGTCTTTCAGACAACTTTGTGATGCCCATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCA
AGAGATGAGTGCCTCTAATGACTCTGTCCCTGTTTCACGTCATGGCTCTGGGCTCGAGAT
GCGGCCATTGTAGAGACTCAATGTTTCAACCAGATTTCAAGGTCCTGTTTTGTTTTGTTT
TGTAATGGACCTGTTGTTTTTATGAGGAATGGATTATATGTAAACC*GACTTGGTTTGTT
TAATATTCATACAATCATATGATCCTTATCGC

QA 2 513 2 513
DS 

RD RR4G707TF 513 0 0
G
AGTTGAAGGCGGTCTAACAGTTGCATCCATTGCTGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGCA
TACAACATTTCTTATGTGGGAAGGCTTGTTGTTCGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACAC
CGGTAACGTCAGGCAAACTCTACAGAGGAAATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACCC
ATGTATGGTGCATTGTTGTCTCCATTTTTGTGCGGTTTGTCAAGAGCACCGTGAGATGAA
GAACCGTCTTTCAGACAACTTTGTGATGCCCATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCA
AGAGATGAGTGCCTCTAATGACTCTGTCCCTGTTTCACGTCATGGCTCTGGGCTCGAGAT
GCGGCCATTGTAGAGACTCAATGTTTCAACCAGATTTCAAGGTCCTGTTTTGTTCTGTTT
TGTAATGGACCTGTTGTTTTTATGAGGAATGGATTATATGTAAACC*GACTTGGTTTGTT
TAATATTCATACAATCATATGATCCTTATCGC

QA 2 513 2 513
DS 



AS 1 4

CO CL3132Contig1 895 4 9 U
GGACATCTTCAACCAAACTCACAAACAAGAAGAAGAACCATAACAAGAAAAAGAGAAGGA
TTCTGCGTTGGAAACCACACAAGAACATAGAGAGATAAGACTTCTTGATCTTGAAAAAGA
AGAATGGCGTATGAGAAAGTCAACGAGCTTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGGA
TTACCTGGAACAGAACAAGTTAAAGAAGAACAAGACGTTTCTTGCGTTAGAAGCAACAAA
CGTCAACTACAAAGCGATAACGAGGAAGAATCGACTACACCTCCTGCAAAAACTCAAATC
GTCGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAGCAACAACAACAACAGTGTTAGC
TATGTGAAAGTGAGTATGGACGGAGCTCCATACCTCCGTAAAATAGATCCAAAACATACA
AAAACTATCCAGAGCTTCTCAAGGCGTTGGAGAACATGTTCAAGTTCACGGTCGGTGAAT
ACTGCGAAAGAGAAGGATACAAAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATG
GAGACTGGATGTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGCTTTAGAC
TCTGCCCTATGATGATGTTGATGAAGAGACTTCGATGAGAGCTTCTGATGATTGAAACCC
TTTATTTGATTTGGATCTGATCGGTGTTTGAGTAGTTGACCCCCCCATAAACAAATCCTT
CAGGGTTTTGTTCAATGAGATAGTTCCATCTTCAAGTGTTTTTTTGTTTTTTAGATTCGG
AGTTCCATGTAAAGGATACATGAATTTTTTTAATGTATAATACGGACATATACACAATAT
AGATGCATATGTAGCAATGTTATTTTGAGGAAAAAACAGTCTTTAATTTCGTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CW88TF U 1
AF RR4BI07TF U 1
AF RR4CW88JQ C 363
AF RR4BI07JQ C 631
BS 1 495 RR4BI07TF
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BS 894 895 RR4BI07JQ

RD RR4CW88TF 705 0 0
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GTCGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAGCAACAACAACAACAGTGTTAGC
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AAAACTATCCAGAGCTTCTCAAGGCGTTGGAGAACATGTTCAAGTTCACGGTCGGTGAAT
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GAGACTGGATGTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGCTTTAGAC
TCTGCCCTATGATGATGTTGATGAAGAGACTTCGATGAGAGCTTCTGATGATTGAAACCC
TTTATTTGATTTGGATCTGATCGGTGTTTGAGTAGTTGACC
ACAC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4BI07TF 806 0 0
GGACATCTTCAACCAAACTCACAAACAAGAAGAAGAACCATAACAAGAAAAAGAGAAGGA
TTCTGCGTTGGAAACCACACAAGAACATAGAGAGATAAGACTTCTTGATCTTGAAAAAGA
AGAATGGCGTATGAGAAAGTCAACGAGCTTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGGA
TTACCTGGAACAGAACAAGTTAAAGAAGAACAAGACGTTTCTTGCGTTAGAAGCAACAAA
CGTCAACTACAAAGCGATAACGAGGAAGAATCGACTACACCTCCTGCAAAAACTCAAATC
GTCGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAGCAACAACAACAACAGTGTTAGC
TATGTGAAAGTGAGTATGGACGGAGCTCCATACCTCCGTAAAATAGATCCAAAACATACA
AAAACTATCCAGAGCTTCTCAAGGCGTTGGAGAACATGTTCAAGTTCACGGTCGGTGAAT
ACTGCGAAAGAGAAGAATACAAAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATG
GAGACTGGATGTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGCTTTAGAC
TCTGCCCTATGATGATGTTGATGAAGAGACTTCGATGAGAGCTTCTGATGATTGAAACCC
TTTATTTGATTTGGATCTGATCGGTGTTTGAGTAGTTGACCACACCATAAACAAATCCTT
CAGGGTTTTGTTCAATGAGATAGTTCCATCTTCAAGTGTTTTTTTGTTTTTTAGATTCGG
AGTTCCATGTAAAGGATACATGAATT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4CW88JQ 533 0 0
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AACTATCCAGAGCTTCTCAAGGCGTTGGAGAACATGTTCAAGTTCACGGTCGGTGAATAC
TGGGAAAGAGAAGGATACAAAGGATTTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGA
GACTGGATGTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTTTTTTCCTCTTGCTTTAGACTT
TGCCCTATGATGATGTTGATGAAGAGACTTCGATGAGAGCTTTTGATGATTGAAACCCTT
TATTTGATTTGGATCTGATCGGTGTTTGAGTAGTTGACCCCCCCATAAACAAATCCTTCA
GGGTTTTGTTCAATGAGATAGTTCCATCTTCAAGTGTTTTTTTGTTTTTTAGATTCGGAG
TTCCATGTAAAGGATACATGAATTTTTTTAATGTATAATACGGACATATACACAATATAG
ATGCATATGTAGCAATGTTATTTTGAGGAAAAAACAGTCTTTAATTTCGTT
AT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4BI07JQ 265 0 0
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AGTAGTTGACCCCCCCATAAACAAATCCTTCAGGGTTTTGTTCAATGAGATAGTTCCATT
TTCAAGTGTTTTTTTGTTTTTTAGATTTGGAGTTCCATGTAAAGGATACATGAATTTTTT
TAATGTATAATACGGACATATACCCAATATAGATGCATATGTAGCAATGTTATTTTGAGG
AAAAAACAGTTTTTAATTTCGTTTT

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 3

CO CL3133Contig1 1519 3 15 U
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TGAGATACTGATGCAAGCTCTTCTCTTCTGAATCGGATAGATTCATATCTGAAAGAGTTT
GACAATACGTTCTTTCCAAATTTACTCTTTGTCCCTCTATTAGAGGTGTTCCAGAAATGT
CTGCAATCGAGTAAATATCTCTACGAACTAATGGATCGGATCGAATTGGAAAATGGAAAG
ATTTGTACAAGTTATACCTTTCGTCACCACTTTGTGGAAAATTGTTAGATATGAATATGT
TAGATACCTGTGACTCGATTGACGAAGGTGAAATAGTATCTCTCTCCAAAAAAGCATGTT
TTTTTTTACCACCACACGAAGAAAATATTTTGTTGTGAATGAACAAGATAGTGAGGAATT
GTCCATACGTAAAATCAGAATTATTGAGACGGGCCTTTTCCACATAAAAAGGGAATCTTT
TGTTACAATAGAAGCAGAAGTGATGTGGATTATTCAAGAATCGAAGTCGATGTGCTTTAG
AAAAAGAAGATATCAATGAACTTCTCTGAAATGGTTTCACGGGATTCAGCCAATTGTCTT
GATCGTGGGATACGATTGAGAAATAGGAATCCGTGTTATCAAAAGATTTCCTGCGATTCT
TTCTAGTATGGAATGAGTCAATCATCCACTTTGGTATCTTATTGAACAAAAATGGTGATA
TTGTTCCTCCATTGATCAAGAATTTCGATTTTTGAGAAGTATTATGATCATCCAATAAAA
AGGGTTTCAATTTTTTAAAATGAACGATTTGAAGACCTATTGATTCTAACAACTGATTGC
AGGGTTGATCGTTCGGACCTTTCAATTCATAGATGTGGATCTCAGACCTATGAATGGGGA
TATTCTAGAAACTCACAAAGAAAAAAGGAAGTGAGTTAGACAAAAAGAGAAGTAACTTGG
ACAAAAAACGAAGTAACTTGGACAAAAAGAAACGAAGTGACTTAGAAAAATCTTTTTTAT
CAATAACCTCAGACCAATCAATCGAATATTGATTAATACATAATCGATCGAACACTACTT
GAAAACGGCTCTTCCGCTCAGAAACGAAATGTTTCAAATGCTCCTGGAAATTCTTGCTAC
CATTGGACCATTTGTATCTATATGCATTAGGATCCCGATTTATGGATCTCTCGGTTCGAG
AAAGAAAAATAAGAGGAGCGAACCATTTCTTCTGACTCTTTTTCAAATTCGATAAATGTT
GGTTGATCGTATCTTTCATTATAGTTCTATGATTCAGAGTATCATTTCCTATTAGATCCC
TTTGAATTCCATATTCGAAGTTGCGATCAGGTCTCTTCATTAAAAAGAATCGATTCAATA
CATTTCTTATGTACCCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV08TF U 1
AF RR4FU35JQ U 605
AF RR4FU35TF C 927
BS 1 651 RR4GV08TF
BS 652 652 RR4FU35JQ
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BS 665 665 RR4FU35JQ
BS 666 699 RR4GV08TF
BS 700 700 RR4FU35JQ
BS 701 705 RR4GV08TF
BS 706 706 RR4FU35JQ
BS 707 746 RR4GV08TF
BS 747 747 RR4FU35JQ
BS 748 763 RR4GV08TF
BS 764 1290 RR4FU35JQ
BS 1291 1291 RR4FU35TF
BS 1292 1317 RR4FU35JQ
BS 1318 1519 RR4FU35TF

RD RR4GV08TF 766 0 0
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TCCTCTGTAAATATTTCTCAGAACATGGAGTGTGAATCAAACCCACGTTTGAATTGAAAT
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ATTTGTACAAGTTATACCTTTCGTCACCACTTTGTGGAAAATTGTTAGATATGAATATGT
TAGATACCTGTGACTCGATTGACGAAGGTGAAATAGTATCTCTCTCCAAAAAAGCATGTT
TTTTTTTACCACCACACGAAGAAAATATTTTGTTGTGAATGAACAAGATAGTGAGGAATT
GTCCATACGTAAAATCAGAATTATTGAGACGGGCCTTTTCCACATAAAAAGGGAATCTTT
TGTTACAATAGAAGCAGAAGTGATGTGGATTATTCAAGAATCGAAGTCGATTTGCTTTAG
AAAA*GAAGATATCAATGAACTTCTCTGAAATGGTTTCATGGGAT*CAGCCAATTGTCTT
GATCGTGGGATACGATTGAGAAATAG*AATCCGTGTTATCAAA
GAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4FU35JQ 713 0 0
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AGAAGATATCAATGAACTTCTCTGAAATGGTTTCACGGGATTCAGCCAATTGTCTTGATC
GTGGGATACGATTGAGAAATAGGAATCCGTGTTATCAAAAGATTTCCTGCGATTCTTTCT
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TCCTCCATTGATCAAGAATTTCGATTTTTGAGAAGTATTATGATCATCCAATAAAAAGGG
TTTCAATTTTTTAAAATGAACGATTTGAAGACCTATTGATTCTAACAACTGATTGCAGGG
TTGATCGTTCGGACCTTTCAATTCATAGATGTGGATCTCAGACCTATGAATGGGGATATT
CTAGAAACTCACAAAGAAAAAAGGAAGTGAGTTAGACAAAAAGAGAAGTAACTTGGACAA
AAAACGAAGTAACTTGGACAAAAAGAAACGAAGTGACTTAGAAAAATCTTTTTTATCAAT
AACCTCAGACCAATCAATCGAATATTGATTAATACATAATCGATCGAACACTACTTGAAA
ACGGCTCTTCCGCTCAGAAACGAAATGTTTCAAATGCTCCTGGAAATTCTTGCTACCATT
GGACCATTTGTATCTATATGCATTAG*ATCCCGATTTATGGATCTCTCGGTTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4FU35TF 593 0 0
ATTTGAAGAC*TATTGATTCTAACAACTGATTGCAGGGTTGATCGTTCGGACCTTTCAAT
TCATAGATGTGGATCTCAGACCTATGAATGGGGATATTCTAGAAACTCACAAAGAAAAAA
GGAAGTGAGTTAGACAAAAAGAGAAGTAACTTGGACAAAAAACGAAGTAACTTGGACAAA
AAGAAACGAAGTGACTTAGAAAAATCTTTTTTATCAATAACCTCAGACCAATCAATCGAA
TATTGATTAATACATAATCGATCGAACACTACTTGAAAACGGCTCTTCCGCTCAGAAACG
AAATGTTTCAAATGCTCCTGGAAATTCTTGCTACCATTGGACCATTTGTATCTATATGCA
TTAGGATCCCGATTTATGGATCTCTCGGTTCGAGAAAGAAAAATAAGAGGAGCGAACCAT
TTCTTCTGACTCTTTTTCAAATTCGATAAATGTTGGTTGATCGTATCTTTCATTATAGTT
CTATGATTCAGAGTATCATTTCCTATTAGATCCCTTTGAATTCCATATTCGAAGTTGCGA
TCAGGTCTCTTCATTAAAAAGAATCGATTCAATACATTTCTTATGTACCCATC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 4

CO CL3134Contig1 966 4 6 U
GTACTGAAGATTTTTAAATTAGTTCATGGAGCTACAGCAATACCATATTGTTTCATGCTC
ACAAACCAAGAACTCTAAGATGCAACACACACAGAGATATTAAGGTAGCATAAGATAGAG
ATGTATTAAATTCATAGGTCCGTCTTAAATCATCCGCTGAAGGTTTGGACAATGGTGTTG
TGCCATGGGTCAGACAAGTGCTGCAACAGGTTCTCAAATGGTCCCTTTCCAGTCACATTG
TGTTGAATCACGAACCCTAAGAATGCCAACATCGCCAACCTCCCATTTGCAAGCTCTTTC
TCCTTAGCCTCGAGCGTAGGAGCGAAGTTAAGAGGGTTAAAGATTCCTCCGGGGTAACCA
ACTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGAAGATAGGGTCTTGGTTCACACTTCCTGGG
TTCTTAATGTCTTGCCACCGTCTGATCTCAACGTAATGAAACAATATGAACTCGATCACG
AACAATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCTCTTTCCCGGCATCATACCACTCAGGAACG
TTGATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAGGCAAAAGCATCCCTGCGACGCCGAGCATG
GCCCACCGTCCGTTGACAAGCTCTGCCTGGATGAACCACTTCAAGTTCTCTGGATCCTCT
GCCAGTCCCAATGGGTCAAACCCATTATCACCGGCAAGACTGCCGTTGAGATAACCAGGA
GATGCCAAACCGGGCAACCATTCTCCTTTCTTAGCTTCAACCTTGAACGAGGACGTCTTT
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CTTGGCTTGGAAGTGCATGGTCTGAATATCGAGGCCGAGGCTTGAGTAGTGACAGTGGCC
ATTTCCCCTACAGAGCTTGGATACAGGAAGGTAGTAGAGAATGGATTGGAATCAAGAAGA
GATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 

AF RR4FG26JQ U 122
AF RR4H215JQ U 1
AF RR4FG26TF C 172
AF RR4H215TF C 231
BS 1 299 RR4H215JQ
BS 300 300 RR4FG26JQ
BS 301 592 RR4H215JQ
BS 593 709 RR4FG26TF
BS 710 711 RR4H215TF
BS 712 966 RR4FG26TF

RD RR4FG26JQ 355 0 0
TGTATTAAATTCATAGGTCCGTCTTAAATCATCCGCTGAAGGTTTGGACAATGGTGTTGT
GCCATGGGTCAAACAAGTGCTGCAACAGGTTCTCAAATGGTCCCTTTCCAGTCACATTGT
GTTGAATCACGAACCCTAAAAATGCCAACATCCCCAACCTCCCATTTGCAAGCTCTTTCT
CCTTAGCCTCGAGCGTAGGAGCGAAGTTAAAAGGGTTAAAAATTCCTCCGGGGTAACCAA
CTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGAAAATAGGGTCTTGGTTCACACTTCCTGGGT
TCTTAATGTCTTGCCACCGTCTGATCTCAACGTAATGAAACAATATGAACTCGAT

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR4H215JQ 592 0 0
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ACAAACCAAGAACTCTAAGATGCAACACACACAGAGATATTAAGGTAGCATAAGATAGAG
ATGTATTAAATTCATAGGTCCGTCTTAAATCATCCGCTGAAGGTTTGGACAATGGTGTTG
TGCCATGGGTCAGACAAGTGCTGCAACAGGTTCTCAAATGGTCCCTTTCCAGTCACATTG
TGTTGAATCACGAACCCTAAGAATGCCAACATCGCCAACCTCCCATTTGCAAGCTCTTTT
TCCTTAGCCTCGAGCGTAGGAGCGAAGTTAAGAGGGTTAAAGATTCCTCCGGGGTAACCA
ACTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGAAGATAGGGTCTTGGTTCACACTTCCTGGG
TTCTTAATGTCTTGCCACCGTCTGATCTCAACGTAATGAAACAATATGAACTCGATCACG
AACAATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCTCTTTCCCGGCATCATACCACTCAGGAACG
TTGATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAGGCAAAAGCATCCCTGCGACGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4FG26TF 795 0 0
ATGGTGTTGTGCCATGG*TCAGACAAGTGCTGCAACAGGTTCTCAAATG*TCCCTTTCCA
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AGCTCTTTCTC*TTAGCCTCGAGCGTAGGAGCGAAGTTAAGAGGGTTAAAGATTCCTCCG
GGGTAACCAACTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGAAGATAGGGTCTTGGTTCACA
CTTCCTGGGTTCTTAATGTCTTGCCACCGTCTGATCTCAACGTAATGAAACAATATGAAC
TCGATCACGAACAATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCTCTTTCCCGGCATCATACCAC
TCAGGAACGTTGATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAGGCAAAAGCATCCCTGCGACG
CCGAGCATGGCCCACCGTCCGTTGACAAGCTCTGCCTGGATGAACCACTTCAAGTTCTCT
GGATCCTCTGCCAGTCCCAATGGGTCAAACCCATTATCACCGGCAAGACTGCCGTTGA**
TAACCAGGAGATGCCAAACCGGGCAACCATTCTCCTTTCTTAGCTTCAACCTTGAACGAG
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GTGAGGAATCTTGGCTTGGAAGTGCATGGTCTGAATATCGAGGCCGAGGCTTGAGTAGTG
ACAGTGGCCATTTCCCCTACAGAGCTTGGATACAGGAAGGTAGTAGAGAATGGATTGGAA
TCAAGAAGAGATTCC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4H215TF 736 0 0
CCAGTCACATGTG
TGA*TCACGAACC*TAAGAATGCCAACATCGCCAACCTCCCATTTGCAAGCTCTTTT**C
TTAGCCTCGAGCGTAGGAGCGAAGTTAAGAGGGTTAAAGATTCCTCCGGGGTAACCAACT
TCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGAAGATAGGGTCTTGGTTCACACTTCCTGGGTTC
TTAATGTCTTGCCACCGTCTGATCTCAACGTAATGAAACAATATGAACTCGATCACGAAC
AATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCTCTTTCCCGGCATCATACCACTCAGGAACGTTG
ATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAGGCAAAAGCATCCCTGCGACGCCGAGCATGGCC
CACCGTCCGTTGACAAGCTCTGCCTGGGTGAACTACTTCAAGTTCTCTGGATCCTCTGCC
AGTCCCAATGGGTCAAACCCATTATCACCGGCAAGACTGCCGTTGAGATAACCAGGAGAT
GCCAAACCGGGCAACCATTCTCCTTTCTTAGCTTCAACCTTGAACGAGGACGTCTTTGAG
CCGATTGACTTAAACGACAATTCTCGGTTCAACCTACCGGAAGAACCGGTGAGGAATCTT
GGCTTGGAAGTGCATGGTCTGAATATCGAGGCCGAGGCTTGAGTAGTGACAGTGGCCATT
TCCCCTACAGAGCTTGGATACAGGAAGGTAGTAGAGAATGGATTGGAATCAAGAAGAGAT
TCC

QA 14 736 14 736
DS 



AS 1 4

CO CL3135Contig1 1120 4 4 U
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GACTCTCTTTCTTGTGTTTTAAGGACTTGCGCATAAAGCATATTTGTACAAGATCCTTGG
ACCTCTTCTACATGGTCTGGTGGAATCCCGTATGTGGTAAAGTTTTCATCATCGGATGTT
TCTCCATCAGAATCATCACAGTAATCGAATCGATCACCCTCTTCGTCTGTATCTTCTTCG
TCTTCACACAATAGTTCATCTCTTTCTTTGGGTTGTTTCTGATCTTCCGCAGCTCTTTCC
CCAGCAATTTTTTTCGCTTTAAACTCCACACATATTCGAACGTTCTCGTCTTTGTAGAGA
CCCAAGAATGCATGAAACTGCCTATCGTTTCCTATTTTCACAGGTGGTGTATCGATGCTT
TGTTTTTGTAGATTCCGCTTCGGCAAAACGTACCTCAGTTCCAAATCGTAATCTGCAAAA
TCAACTTCGTAATCCTCAAATATAATTTCAACAAAATCCTCAAATCGATTGTTTTCATTC
GCAGCAACCAATATGCTCCCTCGCTCGTTGTCTACTTCAAATAACCACCTAGTTTTCTCA
ACTTTCCACTTCCCACAGACGAGAACTATGTGTTCCATTACTCTCTCCTCGATCTGAATT
AAAAGATGCAGTTGTAAGTCACCATGAAAGTGGATCACGTGTTTCTGAGTGGAAGGTCAC
AGGAAGAAGAAGACGTTAAAGAACGTAAAACCTAATTGGAGTTAACGTGGACATATCTTT
TAGATTAAACCAATGTTTCAAATTGGTTTAAATTAATTTAAACCGAAAATAACTCTAAAC
CAAATTTCAAAATTAATTAAAACCAAATTTAATCAATCCCAACCGAGATCCAATTTAAAT
TAAACCGAAATTTAGATGAATTTAACCAGAAATTCGAATTGTGTCCCACTCTAGTAATTA
AAATTTATTTAAAAGTCTGCCGTCAAAGACTACAATTTAAAAAATCTGCCACCAAATGAA
TACAAAAGTCTGCCGTAAAATTAAATCGGGCAAATATATCTATCAGCAAAATATATGTCT
ATTAACGATAAACATATCTGTCTCAAAACTCTGACTACTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4G654TF U 1
AF RR4G720TF U 1
AF RR4G654JQ C 313
AF RR4G720JQ C 356
BS 1 659 RR4G654TF
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BS 661 705 RR4G654TF
BS 706 1120 RR4G654JQ

RD RR4G654TF 705 0 0
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TCTTCACACAATAGTTCATCTCTTTCTTTGGGTTGTTTCTGATCTTCCGCAGCTCTTTCC
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AAAAGATGCAGTTGTAAGTCACCATGAAAGTGGATCACGTGTTTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4G720TF 711 0 0
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GACTCTCTTTCTTGTGTTTTAAGGACTTGCGCATAAAGCATATTTGTACAAGATCCTTGG
ACCTCTTCTACATGGTCTGGTGGAATCCCGTATGTGGTAAAGTTTTCATCATCGGATGTT
TCTCCATCAGAATCATCACAGTAATCGAATCGATCACCCTCTTCGTCTGTATCTTCTTCG
TCTTCACACAATAGTTCATCTCTTTCTTTGGGTTGTTTCTGATCTTCCGCAGCTCTTTCC
CCAGCAATTTTTTTCGCTTTAAACTCCACACATATTCGAACGTTCTCGTCTTTGTAGAGA
CCCAAGAATGCATGAAACTGCCTATCGTTTCCTATTTTCACAGGTGGTGTATCGATGCTT
TGTTTTTGTAGATTCCGCTTCGGCAAAACGTACCTCAGTTCCAAATCGTAATCTGCAAAA
TCAACTTCGTAATCCTCAAATATAATTTCAACAAAATCCTCAAATCGATTGTTTTCATTC
GCAGCAACCAATATGCTCCCTCGCTCGTTGTCTACTTCAAATAACCACCTAGTTTTCTCA
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AAAAGATGCAGTTGTAAGTCACCATGAAAGTGGATCACGTGTTTC
TGAGTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4G654JQ 808 0 0
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TGAAACTGCCTATCGTTTCCTATTTTCACAGGTGGTGTATCGATGCTTTGTTTTTGTAGA
TTCCGCTTCGGCAAAACGTACCTCAGTTCCAAATCGTAATCTGCAAAATCAACTTCGTAA
TCCTCAAATATAATTTCAACAAAATCCTCAAATCGATTGTTTTCATTCGCAGCAACCAAT
ATGCTCCCTCGCTCGTTGTCTACTTCAAATAACCACCTAGTTTTCTCAACTTTCCACTTC
CCACAGACGAGAACTATGTGTTCCATTACTCTCTCCTCGATCTGAATTAAAAGATGCAGT
TGTAAGTCACCATGAAAGTGGATCACGTGTTTCTGAGTGGAAGGTCACAGGAAGAAGAAG
ACGTTAAAGAACGTAAAACCTAATTGGAGTTAACGTGGACATATCTTTTAGATTAAACCA
ATGTTTCAAATTGGTTTAAATTAATTTAAACCGAAAATAACTCTAAACCAAATTTCAAAA
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TAGATGAATTTAACCAGAAATTCGAATTGTGTCCCACTCTAGTAATTAAAATTTATTTAA
AAGTCTGCCGTCAAAGACTACAATTTAAAAAATCTGCCACCAAATGAATACAAAAGTCTG
CCGTAAAATTAAATCGGGCAAATATATCTATCAGCAAAATATATGTCTATTAACGATAAA
CATATCTGTCTCAAAACTCTGACTACTT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4G720JQ 765 0 0
AGAGACCCAAGAATGCATGAAACTGCCTATCGTTTCCTATTTTCACAGGTGGTGTATCGA
TGCTTTGTTTTTGTAGATTCCGCTTCGGCAAAACGTACCTCAGTTCCAAATCGTAATCTG
CAAAATCAACTTCGTAATCCTCAAATATAATTTCAACAAAATCCTCAAATCGATTGTTTT
CATTCGCAGCAACCAATATGCTCCCTCGCTCGTTGTCTACTTCAAATAACCACCTAGTTT
TCTCAACTTTCCACTTCCCACAGACGAGAACTATGTGTTCCATTACTCTCTCCTCGATCT
GAATTAAAAGATGCAGTTGTAAGTCACCATGAAAGTGGATCACGTGTTTCTGAGTGGAAG
GTCACAGGAAGAAGAAGACGTTAAAGAACGTAAAACCTAATTGGAGTTAACGTGGACATA
TCTTTTAGATTAAACCAATGTTTCAAATTGGTTTAAATTAATTTAAACCGAAAATAACTC
TAAACCAAATTTCAAAATTAATTAAAACCAAATTTAATCAATCCCAACCGAGATCCAATT
TAAATTAAACCGAAATTTAGATGAATTTAACCAGAAATTCGAATTGTGTCCCACTCTAGT
AATTAAAATTTATTTAAAAGTCTGCCGTCAAAGACTACAATTTAAAAAATCTGCCACCAA
ATGAATACAAAAGTCTGCCGTAAAATTAAATCGGGCAAATATATCTATCAGCAAAATATA
TGTCTATTAACGATAAACATATCTGTCTCAAAACTCTGACTACTT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL3136Contig1 847 3 2 U
GGTAAAGAAGAATACTACTACTCATCATGCCAACACAATGTAATGCAAGATTCAGGGTTG
TTTTCTATCTACAAAATGCATCCTCAGGGAAAGCTAGTTGGCTTGAGTATCTCTTCAAAC
GTCTAGGAAGATGGGACAGGAACATATCCGGTACGAGCTCTTAGTGTTTCGGTTCTTTTG
CTTCTCTCCATCACTCCCACCAGCCATTCTACACTTTCCTTGATTCCTCTTCCATCATAT
CCAGAAACTGCTTCAAACATGTGCACCCTTTCATCCAGTTTCTTCAGATCCAAGTAACGA
TCCAGTTCCTCAGCAGAAACAGCATTTGAGAGATCTTGCTTGTTTGCCAATATCAAAAGA
GGCGCTCCTTGCAAATCCTCATGCCGCAGTGCTTTTTCTAGAGCAGATTTAGACTCTTCA
AAGCGAGAAGGGCAAGCTGCATCGATCAAATATATCAATGCGTGTGCTTCTTCATAATAC
TTTTCCCAAATCGAACGCAGACCAGGCTGACCGCCGAGGTCCCAAAACACAATTTTGGCG
TTAGAGACTTCAACACGACCAATGTTTAGGCCAACAGTGGGAACAATTCGATCATGCGGA
AGACCTTCAGAGATTGAGTAGATCGTCTTCAGCTTCTCCAAGAACGTCGTCTTGCCAGCT
TTGTCGATACCAAGAATGAGGACGTGGAACTCAGTCTTGCTGAACATGTAAGTCCACAGT
CCATGCATCAGCGAAAACATCACTCGTGCTTACACCAGTGTTGAATAAGATCTCGTTTTT
TTTTTTGCACTCAACTGTGTTGGTCTTCTTCTTCTTCGATTTGAACGTTCCTTTCACTTT
CTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT31JQ U 155
AF RR4F718JQ U 1
AF RR4F718TF C 66
BS 1 587 RR4F718JQ
BS 588 847 RR4F718TF

RD RR4GT31JQ 154 0 0
GAGCTCTTAGTGTTTCGGTTCTTTTGCTTCTCTCCATCACTCCCACCAGCCATTCTACAC
TTTCCTTGATTCCTCTTCCATCATATCCAGAAACTGCTTCAAACATGTACACCCTTTCAT
CCAGTTTCTTTAGATCCAAGTATCGGTCCAGTTC

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR4F718JQ 588 0 0
GGTAAAGAAGAATACTACTACTCATCATGCCAACACAATGTAATGCAAGATTCAGGGTTG
TTTTCTATCTACAAAATGCATCCTCAGGGAAAGCTAGTTGGCTTGAGTATCTCTTCAAAC
GTCTAGGAAGATGGGACAGGAACATATCCGGTACGAGCTCTTAGTGTTTCGGTTCTTTTG
CTTCTCTCCATCACTCCCACCAGCCATTCTACACTTTCCTTGATTCCTCTTCCATCATAT
CCAGAAACTGCTTCAAACATGTGCACCCTTTCATCCAGTTTCTTCAGATCCAAGTAACGA
TCCAGTTCCTCAGCAGAAACAGCATTTGAGAGATCTTGCTTGTTTGCCAATATCAAAAGA
GGCGCTCCTTGCAAATCCTCATGCCGCAGTGCTTTTTCTAGAGCAGATTTAGACTCTTCA
AAGCGAGAAGGGCAAGCTGCATCGATCAAATATATCAATGCGTGTGCTTCTTCATAATAC
TTTTCCCAAATCGAACGCAGACCAGGCTGACCGCCGAGGTCCCAAAACACAATTTTGGCG
TTAGAGACTTCAACACGACCAATGTTTAGGCCAACAGTGGGAACAAT
T

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4F718TF 782 0 0
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GGAAGATGG*ACAGGAACATATCCGGTACGAGCTCTTAGTGTTTCGGTTCTTTTGCTTCT
CTCCATCACTCCCACCAGCCATTCTACACTTTCCTTGATTCCTCTTCCATCATATCCAGA
AACTGCTTCAAACATGTGCACCCTTTCATCCAGTTTCTTCAGATCCAAGTAACGATCCAG
TTCCTCAGCAGAGACAGCATTTGAGAGATCTTGCTTGTTTGCCAATATCAAAAGAGGCGC
TCCTTGCAAATCCTCATGCCGCAGTGCTTTTTCTAGAGCAGATTTAGACTCTTCAAAGCG
AGAAGGGCAAGCTGCATCGATCAAATATATCAATGCGTGTGCTTCTTCATAATACTTTTC
CCAAATCGAACGCAGACCAGGCTGACCGCCGAGGTCCCAAAACACAATTTTGGCGTTAGA
GACTTCAACACGACCAATGTTTAGGCCAACAGTGGGAACAATTCGATCATGCGGAAGACC
TTCAGAGATTGAGTAGATCGTCTTCAGCTTCTCCAAGAACGTCGTCTTGCCAGCTTTGTC
GATACCAAGAATGAGGACGTGGAACTCAGTCTTGCTGAACATGTAAGTCCACAGTCCATG
CATCAGCGAAAACATCACTCGTGCTTACACCAGTGTTGAATAAGATCTCGTTTTTTTTTT
TGCACTCAACTGTGTTGGTCTTCTTCTTCTTCGATTTGAACGTTCCTTTCACTTTCTCTT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL3137Contig1 1056 4 3 U
GGGTCTTTAGTAGTGTGAAAGAGAATGTCGGAGATTGTAAACTTGTCGCCGTCTCTGAGA
TCTTTAAAACCAAAGGTCTCACCTTTGGTACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCAA
GTCTCGAGCTCGTCGCGGAGATTAAAGTTTCTATCTTTTCCCGGGAAAATCAGTCTGGCA
ACGGGGAGACTCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGTTACAAGAGGTAGATGATGATGAC
TCGCCGGTCTCGGTCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCTATAGACACTTCGATGAGGTGATG
GAGGAAGCTCAGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTGATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTGCAGG
AAATGTATTTACTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGACTG
AGGTTTTATCATGTTGATGTCAACGCTGTGCCATACAAACTGGTGTCTCGTGCAGGAGTA
ACGGTAATGAACCTTCCTAATTTAAAACTTTGGGGAGTCTTTGTTATTGATATAAACAAC
AACTAAATGTAATCTTTGTTTGGAAACACTACACGGAAAATGCCAACGATTCAGGTGATC
CAATCTGTTTCCCATCATCCATGCCTTGAAATGATCTTCATATTTTGGATCTTTTAAACT
CTTTCTAATTTATGTATCTTGTTCCCTCTCTGCAGCTATGGAGAGATGACAAGAAACAAG
CTGAAGTCATCGGTGGTCACAAAGCGCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGAGAGATGATAG
AGAACGATTCAATCACTTGAAAAGTTAACGGGATACTCTGCTCTCTTTTTCTCCCCCTCT
GATTGTTCTTAGTTTTTGGTAGTCCTCCTGGTTTTGAAAGACAACGATTGTAGTAGATTA
GTAGGATATTGCAATATCAAACGCTCTTTTGGCATCATCTTTTTTTTTTTTACATGTATA
CATAGTGGGACTGAGAGCTTTGGCAGGCAAGAACTGTAACCTTCCTTTATCGATTTATTC
CAACATATATATATAAAAGTACAGCCTTTGAATGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AB82TF U 1
AF RR4AI44TF U 1
AF RR4AI44JQ C 181
AF RR4AB82JQ C 311
BS 1 692 RR4AB82TF
BS 693 823 RR4AI44TF
BS 824 1056 RR4AI44JQ

RD RR4AB82TF 692 0 0
GGGTCTTTAGTAGTGTGAAAGAGAATGTCGGAGATTGTAAACTTGTCGCCGTCTCTGAGA
TCTTTAAAACCAAAGGTCTCACCTTTGGTACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCAA
GTCTCGAGCTCGTCGCGGAGATTAAAGTTTCTATCTTTTCCCGGGAAAATCAGTCTGGCA
ACGGGGAGACTCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGTTACAAGAGGTAGATGATGATGAC
TCGCCGGTCTCGGTCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCTATAGACACTTCGATGAGGTGATG
GAGGAAGCTCAGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTGATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTGCAGG
AAATGTATTTACTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGACTG
AGGTTTTATCATGTTGATGTCAACGCTGTGCCATACAAACTGGTGTCTCGTGCAGGAGTA
ACGGTAATGAACCTTCCTAATTTAAAACTTTGGGGAGTCTTTGTTATTGATATAAACAAC
AACTAAATGTAATCTTTGTTTGGAAACACTACACGGAAAATGCCAACGATTCAGGTGATC
CAATCTGTTTCCCATCATCCATGCCTTGAAATGATCTTCATATTTTGGATCTTTTAAACT
CTTTCTAATTTATGTATCTTGTTCCCTCTCTG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4AI44TF 823 0 0
GGGTCTTTAGTAGTGTGAAAGAGAATGTCGGAGATTGTAAACTTGTCGCCGTCTCTGAGA
TCTTTAAAACCAAAGGTCTCACCTTTGGTACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCAA
GTCTCGAGCTCGTCGCGGAGATTAAAGTTTCTATCTTTTCCCGGGAAAATCAGTCTGGCA
ACGGGGAGACTCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGTTACAAGAGGTAGATGATGATGAC
TCGCCGGTCTCGGTCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCTATAGACACTTCGATGAGGTGATG
GAGGAAGCTCAGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTGATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTGCAGG
AAATGTATTTACTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGACTG
AGGTTTTATCATGTTGATGTCAACGCTGTGCCATACAAACTGGTGTCTCGTGCAGGAGTA
ACGGTAATGAACCTTCCTAATTTAAAACTTTGGGGAGTCTTTGTTATTGATATAAACAAC
AACTAAATGTAATCTTTGTTTGGAAACACTACACGGAAAATGCCAACGATTCAGGTGATC
CAATCTGTTTCCCATCATCCATGCCTTGAAATGATCTTCATATTTTGGATCTTTTAAACT
CTTTCTAATTTATGTATCTTGTTCCCTCTCTGCAGCTATGGAGAGATGACAAGAAACAAG
CTGAAGTCATCGGTGGTCACAAAGCGCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGAGAGATGATAG
AGAACGATTCAATCACTTGAAAAGTTAACGGGATACTCTGCTC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4AI44JQ 876 0 0
ACGGGGAGACTCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGTTACAAGAGGTAGATGATGATGAC
TCGCCGGTCTCGGTCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCTATAGACACTTCGATGAGGTGATG
GAGGAAGCTCAGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTGATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTGCAGG
AAATGTATTTACTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGACTG
AGGTTTTATCATGTTGATGTCAACGCTGTGCCATACAAACTGGTGTCTCGTGCAGGAGTA
ACGGTAATGAACCTTCCTAATTTAAAACTTTGGGGAGTCTTTGTTATTGATATAAACAAC
AACTAAATGTAATCTTTGTTTGGAAACACTACACGGAAAATGCCAACGATTCAGGTGATC
CAATCTGTTTCCCATCATCCATGCCTTGAAATGATCTTCATATTTTGGATCTTTTAAACT
CTTTCTAATTTATGTATCTTGTTCCCTCTCTGCAGCTATGGAGAGATGACAAGAAACAAG
CTGAAGTCATCGGTGGTCACAAAGCGCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGAGAGATGATAG
AGAACGATTCAATCACTTGAAAAGTTAACGGGATACTCTGCTCTCTTTTTCTCCCCCTCT
GATTGTTCTTAGTTTTTGGTAGTCCTCCTGGTTTTGAAAGACAACGATTGTAGTAGATTA
GTAGGATATTGCAATATCAAACGCTCTTTTGGCATCATCTTTTTTTTTTTTACATGTATA
CATAGTGGGACTGAGAGCTTTGGCAGGCAAGAACTGTAACCTTCCTTTATCGATTTATTC
CAACATATATATATAAAAGTACAGCCTTTGAATGCC

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR4AB82JQ 746 0 0
AGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTGATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTGCAGGAAATGTATTT
ACTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGACTGAGGTTTTATC
ATGTTGATGTCAACGCTGTGCCATACAAACTGGTGTCTCGTGCAGGAGTAACGGTAATGA
ACCTTCCTAATTTAAAACTTTGGGGAGTCTTTGTTATTGATATAAACAACAACTAAATGT
AATCTTTGTTTGGAAACACTACACGGAAAATGCCAACGATTCAGGTGATCCAATCTGTTT
CCCATCATCCATGCCTTGAAATGATCTTCATATTTTGGATCTTTTAAACTCTTTCTAATT
TATGTATCTTGTTCCCTCTCTGCAGCTATGGAGAGATGACAAGAAACAAGCTGAAGTCAT
CGGTGGTCACAAAGCGCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGAGAGATGATAGAGAACGATTC
AATCACTTGAAAAGTTAACGGGATACTCTGCTCTCTTTTTCTCCCCCTCTGATTGTTCTT
AGTTTTTGGTAGTCCTCCTGGTTTTGAAAGACAACGATTGTAGTAGATTAGTAGGATATT
GCAATATCAAACGCTCTTTTGGCATCATCTTTTTTTTTTTTACATGTATACATAGTGGGA
CTGAGAGCTTTGGCAGGCAAGAACTGTAACCTTCCTTTATCGATTTATTCCAACATATAT
ATATAAAAGTACAGCCTTTGAATGCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 3

CO CL3138Contig1 1046 3 11 U
GGAGGGAAGGGACGAGGATGATTCTGATAACCTCACAGTCAGTGACGTACCTGCGTCACT
CCCTCCACGATCCTTACGCAAGATCTCTGCAAGGCCGCTGCCATTTTAGCTGGAGTAGCC
AAACCTCGACCGTCAATCAATGCATTCCACGGCAGACAATGAACGGCTTCCAAATACGAA
CAGGAGACAAAAGATCCATCTCATGCTTGGCTCGCCGGAAACCGGAGACGGTAACGGTTG
AGGTTGAAGATGATCCTCTCCGGAGTAACCTTCGCCCTCTACGGTGGACAGCTTAAGCCG
TGTACATACTATGGCTATTTCTTCTCCCTTATGCTCCCGGAGATCCAGTTTGGGCAATTA
GCTCAGAGACAGTGAACTCTCTTTTGGGACTTTCATTGAACTTCTTCTTTATCTTGCCTC
TTACAAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGAAGCTCCTGTACTTCACCCTATGGCTGAAG
GCTTATCCAACTTCGTAATAGCTTGGACACTCATGTTTGCTCCGCTGCTATACACAGACC
GAAAGAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGACGTCTTATGGGGTCTCATGATGTTCCTCA
CAAACACGTTTCTGATCCCGTACATGGCTATACGGCTCAATGACGCTGATCCAGATGATA
AACCGAGCAAAAGGTCTCAACTCGGGGAAGCCATGACCAAAGGTGCACCTATAGTTGGTC
TCACGGGTGTTACTGTTTGTCTGATATCGACTTTGTGGTCTCTCTACGGTCGAGCAGATG
GAGGTTTCGGTGGAATAATGGAGAGATGTCAGTATCTGATTGGTTATTTGGGATCGGAGA
GACTAGCTTACTCGTTTATATGGGATATATGTTTGTACACAGTTTTTCGGCCATGGTTGA
TTGGAGAGAACCTGCAAAATGTGAAGAAGAGCAAGGTTGATTTAGTGAGTTATCTTAGGT
TTGTTCCTGTTCTTGGTTTGCTTTCATATCTTCTGTTTCTCAATCTTGACGATGAAGATT
AATAATTTGTTAAATAATTGTGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AO93TF U 1
AF RR4AS83JQ C 364
AF RR4AS83TF U 648
BS 1 481 RR4AO93TF
BS 482 482 RR4AS83JQ
BS 483 486 RR4AO93TF
BS 487 487 RR4AS83JQ
BS 488 524 RR4AO93TF
BS 525 525 RR4AS83JQ
BS 526 632 RR4AO93TF
BS 633 652 RR4AS83JQ
BS 653 958 RR4AS83TF
BS 959 959 RR4AS83JQ
BS 960 1046 RR4AS83TF

RD RR4AO93TF 632 0 0
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CCCTCCACGATCCTTACGCAAGATCTCTGCAAGGCCGCTGCCATTTTAGCTGGAGTAGCC
AAACCTCGACCGTCAATCAATGCATTCCACGGCAGACAATGAACGGCTTCCAAATACGAA
CAGGAGACAAAAGATCCATCTCATGCTTGGCTCGCCGGAAACCGGAGACGGTAACGGTTG
AGGTTGAAGATGATCCTCTCCGGAGTAACCTTCGCCCTCTACGGTGGACAGCTTAAGCCG
TGTACATACTATGGCTATTTCTTCTCCCTTATGCTCCCGGAGATCCAGTTTGGGCAATTA
GCTCAGAGACAGTGAACTCTCTTTTGGGACTTTCATTGAACTTCTTCTTTATCTTGCCTC
TTACAAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGAAGCTCCTGTACTTCACCCTATGGCTGAAG
GGTTATTCAACTTCGTAATAGCTTGGACACTCATGTTTGCTCCGTTGCTATACACAGACC
GAAAGAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGACGTCTTATGGGGTCTCATGATGTTCCTCA
CAAACACGTTTCTGATCCCGTACATGGCTATA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4AS83JQ 683 0 0
G
AGAGACAGTGAACTCTCTTTTGGGACTTTCATTGAACTTCTTCTTTATCTTGCCTCTTAC
AAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGAAGCTCCTGTTCTTCACCCTATGGCTGAAGGCTT
ATCCAACTTCGTAATAGCTTGGACACTCATGTTTGCTCCGCTGCTATACACAGACCGAAA
GAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGACGTCTTCTGGGGTCTCATGATGTTCCTCACAAA
CACGTTTCTGATCCCGTACATGGCTATACGGCTCAATGACGCTGATCCAGATGATAAACC
GAGCAAAAGGTCTCAACTCGGGGAAGCCATGACCAAAGGTGCACCTATAGTTGGTCTCAC
GGGTGTTACTGTTTGTCTGATATCGACTTTGTGGTCTCTCTACGGTCGAGCAGATGGAGG
TTTCGGTGGAATAATGGAGAGATGTCAGTATCTGATTGGTTATTTGGGATCGGAGAGACT
AGCTTACTCGTTTATATGGGATATATGTTTGTACACAGTTTTTCGGCCATGGTTGATTGG
AGAGAACCTGCAAAATGTGAAGAAGAGCAAGGTTGATTTAGTGAGTTATCTTAGGTTTGT
TCCTGTTCTTGGTTTGCTTTCATATCTTCTGTTTCTCAATCTTGACGATGAAGATTAATA
ATTTGTTAAATAATTGTGACAT

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR4AS83TF 399 0 0
GATCC
AGATGATAAACCGAGCAAAAGGTCTCAACTCGGGGAAGCCATGACCAAAGGTGCACCTAT
AGTTGGTCTCACGGGTGTTACTGTTTGTCTGATATCGACTTTGTGGTCTCTCTACGGTCG
AGCAGATGGAGGTTTCGGTGGAATAATGGAGAGATGTCAGTATCTGATTGGTTATTTGGG
ATCGGAGAGACTAGCTTACTCGTTTATATGGGATATATGTTTGTACACAGTTTTTCGGCC
ATGGTTGATTGGAGAGAACCTGCAAAATGTGAAGAAGAGCAAGGTTGATTTAGTGAGTTA
TCTTAG*TTTGTTCCTGTTCTTGGTTTGCTTTCATATCTTCTGTTTCTCAATCTTGACGA
TGAAGATTAATAATTTGTTAAATAATTGTGACAT

QA 6 399 6 399
DS 



AS 1 4

CO CL3139Contig1 709 4 5 U
GGACCAAGATAAAGAAAAGAAACCCCAACACGAACTAGTCTATCAGTGGCAAAGCAGTGC
GGTAACGATGGCAGCGTCTCCAATGGAAGGCAAATGGGTTCAGCTAAAACAGAAAGGAAC
CGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGCCATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTT
TGGAGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTACA
CACTCTAACATGGTCCATCCAAGAAGCTTCAGGGGAGGTTGATCCTAGCGACTTGGGGCA
TATGGGAGCAGGGTGTTTCACGGCTGAAGCTTATGGGCTTGACACGGAGACGCTGGAGTG
GAGGAAGTGGGAGGATGGGTTTGGATCAGAGGAGGAGGAGCATCCAGGGGCTAGAGGATG
GTGTGCGTTTGCGGCTGGGTCGAGGGATGGTAAGGAAGGGTTGTTGGTTTATGGAGGGAA
CTCGCCGAGTAATGATAGGCTTGGTGATATCTTCTTCTTCACTCCAAACACTACTCATGT
GGTTGGTAACTAAGTGTTGTTTGGTTGGTAAGTCAATGTTATGATTCTGTGAGCTTTTAA
GCCATGAGTCTGTTACTAAGTTGTTTCTGTTTTTGGTGAAGCTTTTATGTTTATCTACGC
TTTTGTAAAATTTGAATGATCATTGAAGAATTATAAATAAGCATTGTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DF34TF U 1
AF RR4DH64JQ C 1
AF RR4DH64TF U 1
AF RR4DF34JQ C 78
BS 1 669 RR4DF34TF
BS 670 670 RR4DH64JQ
BS 671 689 RR4DF34TF
BS 690 690 RR4DH64JQ
BS 691 709 RR4DH64TF

RD RR4DF34TF 695 0 0
GGACCAAGATAAAGAAAAGAAACCCCAACACGAACTAGTCTATCAGTGGCAAAGCAGTGC
GGTAACGATGGCAGCGTCTCCAATGGAAGGCAAATGGGTTCAGCTAAAACAGAAAGGAAC
CGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGCCATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTT
TGGAGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTACA
CACTCTAACATGGTCCATCCAAGAAGCTTCAGGGGAGGTTGATCCTAGCGACTTGGGGCA
TATGGGAGCAGGGTGTTTCACGGCTGAAGCTTATGGGCTTGACACGGAGACGCTGGAGTG
GAGGAAGTGGGAGGATGGGTTTGGATCAGAGGAGGAGGAGCATCCAGGGGCTAGAGGATG
GTGTGCGTTTGCGGCTGGGTCGAGGGATGGTAAGGAAGGGTTGTTGGTTTATGGAGGGAA
CTCGCCGAGTAATGATAGGCTTGGTGATATCTTCTTCTTCACTCCAAACACTACTCATGT
GGTTGGTAACTAAGTGTTGTTTGGTTGGTAAGTCAATGTTATGATTCTGTGAGCTTTTAA
GCCATGAGTCTGTTACTAAGTTGTTTCTGTTTTTGGTGAAGCTTTTATGTTTATCTACGC
TTTTGTAAA*TTTGAATGATCATTGAAGA
ATTATA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DH64JQ 709 0 0
GGACCAAGATAAAGAAAAGAAACCCCAACACGAACTAGTCTATCAGTGGCAAAGCAGTGC
GGTAACGATGGCAGCGTCTCCAATGGAAGGCAAATGGGTTCAGCTAAAACAGAAAGGAAC
CGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGCCATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTT
TGGAGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTACA
CACTCTAACATGGTCCATCCAAGAAGCTTCAGGGGAGGTTGATCCTAGCGACTTGGGGCA
TATGGGAGCAGGGTGTTTCACGGCTGAAGCTTATGGGCTTGACACGGAGACGCTGGAGTG
GAGGAAGTGGGAGGATGGGTTTGGATCAGAGGAGGAGGAGCATCCAGGGGCTAGAGGATG
GTGTGCGTTTGCGGCTGGGTCGAGGGATGGTAAGGAAGGGTTGTTGGTTTATGGAGGGAA
CTCGCCGAGTAATGATAGGCTTGGTGATATCTTCTTCTTCACTCCAAACACTACTCATGT
GGTTGGTAACTAAGTGTTGTTTGGTTGGTAAGTCAATGTTATGATTCTGTGAGCTTTTAA
GCCATGAGTCTGTTACTAAGTTGTTTCTGTTTTTGGTGAAGCTTTTATGTTTATCTACGC
TTTTGTAAAATTTGAATGATCATTGAAGAATTATAAATAAGCATTGTTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4DH64TF 709 0 0
GGACCAAGATAAAGAAAAGAAACCCCAACACGAACTAGTCTATCAGTGGCAAAGCAGTGC
GGTAACGATGGCAGCGTCTCCAATGGAAGGCAAATGGGTTCAGCTAAAACAGAAAGGAAC
CGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGCCATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTT
TGGAGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTACA
CACTCTAACATGGTCCATCCAAGAAGCTTCAGGGGAGGTTGATCCTAGCGACTTGGGGCA
TATGGGAGCAGGGTGTTTCACGGCTGAAGCTTATGGGCTTGACACGGAGACGCTGGAGTG
GAGGAAGTGGGAGGATGGGTTTGGATCAGAGGAGGAGGAGCATCCAGGGGCTAGAGGATG
GTGTGCGTTTGCGGCTGGGTCGAGGGATGGTAAGGAAGGGTTGTTGGTTTATGGAGGGAA
CTCGCCGAGTAATGATAGGCTTGGTGATATCTTCTTCTTCACTCCAAACACTACTCATGT
GGTTGGTAACTAAGTGTTGTTTGGTTGGTAAGTCAATGTTATGATTCTGTGAGCTTTTAA
GCCATGAGTCTGTTACTAAGTTGTTTCTGTTTTTGGTGAAGCTTTTATGTTTATCTACGC
TTTTGTAAA*TTTGAATGATCATTGAAGA*TTATAAATAAGCATTGTTC

QA 1 709 1 709
DS 

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CTCCAATGGAAGGCAAATGGGTTCAGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAA
GCTCTCACGCCATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGAGGCGAGTTCCAGC
CCCGTGTCCCCGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTACACACTCTAACATGGTCCA
TCCAAGAAGCTTCAGGGGAGGTTGATCCTAGCGACTTGGGGCATATGGGAGCAGGGTGTT
TCACGGCTGAAGCTTATGGGCTTGACACGGAGACGCTGGAGTGGAGGAAGTGGGAGGATG
GGTTTGGATCAGAGGAGGAGGAGCATCCAGGGGCTAGAGGATGGTGTGCGTTTGCGGCTG
GGTCGAGGGATGGTAAGGAAGGGTTGTTGGTTTATGGAGGGAACTCGCCGAGTAATGATA
GGCTTGGTGATATCTTCTTCTTCACTCCAAACACTACTCATGTGGTTGGTAACTAAGTGT
TGTTTGGTTGGTAAGTCAATGTTATGATTCTGTGAGCTTTTAAGCCATGAGTCTGTTACT
AAGTTGTTTCTGTTTTTGGTGAAGCTTTTATGTTTATCTACGCTTTTGTAAAATTTGAAT
GATCATTGAAGAATTATAAATAAGCATTGTTC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 4

CO CL3140Contig1 507 4 8 U
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TGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCTTGT
TTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAACGAGAGTCACGAGAT
GCTTAGACAAGGATTCACTCATGCTTTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTACGT
TTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCATCGA
CAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTATAGCACCGTG
AAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTGTGAG
TTGTTTCGGTTTATGTATGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCAATTCCGGTTCG
GAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4AP50JQ C 1
AF RR4EJ23JQ C 1
AF RR4EJ23TF U 1
AF RR4AP50TF U 1
BS 1 31 RR4EJ23TF
BS 32 32 RR4AP50TF
BS 33 251 RR4EJ23TF
BS 252 252 RR4AP50TF
BS 253 257 RR4EJ23TF
BS 258 258 RR4AP50TF
BS 259 505 RR4EJ23TF
BS 506 507 RR4AP50JQ

RD RR4AP50JQ 507 0 0
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TGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCTTGT
TTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTCACGAGAT
GCTTAGACAAGGATTCACTCATGCTTTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTACGT
TTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTTTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCATCGA
CAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTATAGCACCGTG
AAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTGTGAG
TTGTTTCGGTTTATGTATGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCAATTCCGGTTCG
GAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGCC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4EJ23JQ 507 0 0
GGATATAAGAGGCGAAAAGAGTTATTTAATGTCGACGTCAGGGTTTAAGCATTTGGTGGT
TGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCTTGT
TTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAACGAGAGTCACGAGAT
GCTTAGACAAGGATTCACTCATGCTTTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTACGT
TTCTTTCACAATCCATCTTCTTCACGTTGAGTTTTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCATCGA
CAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTATAGCACCGTG
AAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTGTGAG
TTGTTTCGGTTTATGTATGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCAATTCCGGTTCG
GAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTG
GC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4EJ23TF 507 0 0
GGATATAAGAGGCGAAAAGAGTTATTTAATGTCGACGTCAGGGTTTAAGCATTTGGTGGT
TGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCTTGT
TTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAACGAGAGTCACGAGAT
GCTTAGACAAGGATTCACTCATGCTTTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTACGT
TTCTTTCACAATCCATCTTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCATCGA
CAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTATAGCACCGTG
AAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTGTGAG
TTGTTTCGGTTTATGTATGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCAATTCCGGTTCG
GAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTG
GC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4AP50TF 507 0 0
GGATATAAGAGGCGAAAAGAGTTATTTAATGGCGACGTCAGGTTTTAAGCATTTGGTGGT
TGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCTTGT
TTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTCACGAGAT
GCTTAGACAAGGATTCACTCATGCTTTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTACGT
TTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCATCGA
CAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTATAGCACCGTG
AAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTGTGAG
TTGTTTCGGTTTATGTATGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCAATTCCGGTTCG
GAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTG
CC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 4

CO CL3141Contig1 1220 4 12 U
GGAGACACATAAACAAATAAGAACTTTTGTTTTACTATATTCCGAGAATGAATATCGCAG
GTATTGTTCCAACGTTGTATGAAGCTATTGCTCCGACTTTCCATGGCGAGTGGATCAAGG
TAGAGCAAAAAGGAAAGGGACCAGGACCGAGAAGTTCGCACGCCATAGCCGTGGCAGGAG
ACAAGTTATACTCATTTGGTGGCGAATTAACATCCAATGTCCCCGTCGACAAAGACCTTT
ACGTCTTTGACCTCAACACCCACACTTGGTCAATCGCTCCGGCCACCGGAGACATTCCAA
CACTCAGTTGCTTAGGCGTCGCCATGGTGGCCGTTGGATCCACACTCTACGTTTTTGGCG
GCCGTGATGCGTCCCGAAAGTACAACGGGTTTTACTCGTACGACACTGTGAAAAACGAGT
GGAAACTTGTGACTGGGGTAGAGGAAGGACCCGAGGCTCGTAGCTTCCACTCCATGGCTT
CGGATGCAGCGAACGTGTACTTGTTTGGTGGGTGTTTTACGGGTTCTACGGAGACGAGTG
TGATGATGTCCATTGCTTCGATGTGGATCAAAACGTGTGGACTAAAGTCGAGACTACTGG
GGAGAAGCCTTCACCAAGGAGCGTTTTCGCGATTGCGGCTGTTGGGAAACATGTCATTGT
AGTTGGAGGGGAGATCGAGATGGACCCTCAGGCCCATGTTGGTCCTGGGAAGTTGTGTGG
CAAAGGTTTCGTGTTGGACACGGAAACGCTGGTGTGGAAGAACCTGGAAGATGGTGGAGG
GGAGGCACCGACTGAACCGCGTGGCTGGTGTGCATCGACGGCTGCGACGGTAAATGGAAA
GAAAGGGATGCCGATGTTTGGTGGGAAGGCTCAGACCAACAACCGCTTTGATGATCTTTA
CTTCTACGCGGTGAAAGAGCTTAACCCTCTCATCAATGTTCGTGTTGGACTTGGATTATT
TTAATCTCATAAGGAGATTTGTCAGAGACTGAGAGTTGGTGTAAAATACCTAAAAATAAT
GGGTCTCTGCTTGTGGTTTGAAGTCTGGTGTGATCAAAACATCAAAGTCTGTTTTTGTTT
TTGTTTGTTTTAAGTATTTAATAATGTGTGACTCTGCTTGTGGTTTGAAGTATTCTGTAA
CTGAAACGTCAAAGTCTGTATGTGATGAATAATGCGTGTCTCTGCTTGTGGTTGGAAATA
TATATTGTGATTGTGAACCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ85TF U 1
AF RR4AO92TF U 1
AF RR4GZ85JQ C 667
AF RR4AO92JQ C 334
BS 1 71 RR4AO92TF
BS 72 72 RR4GZ85TF
BS 73 174 RR4AO92TF
BS 175 175 RR4GZ85TF
BS 176 690 RR4AO92TF
BS 691 691 RR4AO92JQ
BS 692 720 RR4AO92TF
BS 721 851 RR4AO92JQ
BS 852 852 RR4GZ85JQ
BS 853 1065 RR4AO92JQ
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GTGAG

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ACGTCTTTGACCTCAACACCCACACTTGGTCAATCGCTCCGGCCACCGGAGACATTCCAA
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CGGATGCAGCGAACGTGTACTTGTTTGGTGGGTGTTTTACGGGTTCTACGGAGACGAGTG
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CGCGGTGAAAGAGCTTAACCCTCTCATCAATGTTCGTGTTGGACTTGGATTATTTTAATC
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ACTCGTACGACACTGTGAAAAACGAGTGGAAACTTGTGACTGGGGTAGAGGAAGGACCCG
AGGCTCGTAGCTTCCACTCCATGGCTTCGGATGCAGCGAACGTGTACTTGTTTGGTGGGT
GTTTTACGGGTTCTACGGAGACGAGTGTGATGATGTCCATTGCTTCGATGTGGATCAAAA
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GACCAACAACCGCTTTGATGATCTTTACTTCTACGCGGTGAAAGAGCTTAACCCTCTCAT
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AGTTGGTGTAAAATACCTAAAAATAATGGGTCTCTGCTTGTGGTTTGAAGTCTGGTGTGA
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CTGCTTGTGGTTTGAAGTATTCTGTAACTGAAACGTCAAAGTCTGTATGTGATGAATAAT
GCGTGTCTCTGCTTGTGGTTGGAAATATATATTGTGATTGTGAACCA

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DS 



AS 1 4

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TACTGTGAAACAAATGAAAATAAACAATGTTTTAACATAAAATAATAATAATAATAAGCA
AACAGAATGTCACTTTCTTGTTTTCAGGAAGAGGATTTTTTTGTGTATTATGAAGTGAAT
AAGCCCCAATGATGATATGATGGCAGAATTTCCTTGATCTTGTCAAGTCTCTTGAGAATG
TCCAGAAACGATGGTCTCTGGTTCATGTCTGCGTCCC*AGCATTTCACTATTAACTCTCT
TAAATCAGGTGTGCATCCTTTGGAACGGAAAGTAGGTCTGTGCCCATCTGATACATGTTT
GGCCGCTTCATACGGCTCGTAGTTCGCAAATGGTGGCTCTCCTTCTAGCATCTCGTAAAG
TATCATTGCAAAGGAGAAGACGTCCACTTTCTTGTCGTATTTTCTATGCTTGAATACTTC
AGGAGCCATATACCGGTAGCTCCCGGTTTCTCCAGTCATTTTGTAGACATCATGAGAGTT
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TTAACATAAGTGGCTTTCTTTCGGTAACGGCTCCTAAGAATTGCACTATATTGGGATGGC
GAAGCTTAACTAGCAAATCAACCTCATGCCTGAAGTCCTGAATAACCAGTCTATCATCTG
AGAGAGAGGGAAGAATACGTTTGACAGCAACTGGTGTTCCTATCCAATAGGCTTTCACAA
TCTCACCAAAGGAACCCTTTCCAATCATGGCTGCATTAGAGAAATACAGCTCAGCAGGTT
CAATTTCCCAGTCACATTTCTTTGGAATTGGCGGTTGCACAGGCTTTGGTTCAAAGTGAC
TCCCGTTTTGACCATAAGATAAACCGCCATGAGATTTAAGTAGCTCGATCATTTTCTGCT
TCCTAGCTCCTTCTGCGTCAGCCAGAGGCGTGTTCTTCCACCTGTCCTGAGCGTTGACAT
CAGCACCAAACTCGATCAGACATTTGACGACATCGATCCACCCATGAAGAGACGCCACGT
GGAGAGGCGTTCGCTTGTCATAGTCTCTGGCGTGAACCAGAGACGGATCTTCCTCCAGGA
GCTTCCGAACCGCAGCCGCGTCGTTCTGGTGCGCGTGCCACAGGATCAGAGACGTTCTGC
TCACGCGCGCCTTCTCCTTCTGTTTGTCGTACGCCGGTGATGGACCGGCGCTCGTTTCGC
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ATTATTTAGTTTGAGAACAGAGAGGGAGGTGATGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BN59JQ U 1
AF RR4BN59TF C 219
AF RR4AB17JQ U 2
AF RR4AB17TF C 871
BS 1 25 RR4BN59JQ
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RD RR4BN59JQ 723 0 0
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AAGCCCCAATGATGATATGATGGCAGAATTTCCTTGATCTTGTCAAGTCTCTTGAGAATG
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TATCATTGCAAAGGAGAAGACGTCCACTTTCTTGTCGTATTTTCTATGCTTGAATACTTC
AGGAGCCATATACCGGTAGCTCCCGGTTTCTCCAGTCATTTTGTAGACATCATGAGAGTT
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GTGAAGATATGTCATTCCTCTAGCGATGTCCAAGGCAAAGTTAACAGCAGTAGCTGGAGT
AAG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4BN59TF 648 0 0
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CTCCTTCTAGCATCTCGTAAAGTATCATTGCAAAGGAGAAGACGTCCACTTTCTTGTCGT
ATTTTCTATGCTTGAATACTTCAGGAGCCATATACCGGTAGCTCCCGGTTTCTCCAGTCA
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CTTTCAAGTGGTCTGCACTCGAATTAACCAGAAGAACGTTCCTCGGTTTAAGATCTCGGT
GAATGATAACATTAGGTTCATTGTGAAGATATGTCATTCCTCTAGCGATGTCCAAGGCAA
AGTTAACAGCAGTAGCTGGAGTAAGACCACCCTTTTCTTTGAGGTATTGG*TGAAGATCT
CCCCCGCGTAAGTATTCAGTGATTAACATAAGTGGCTTTCTTTCGGTAACGGCTCCTAAG
AATTGCACTATATTGGGATGGCGAAGCTTAACTAGCAAATCAACCTC
C

QA 1 647 1 647
DS 

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GC
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TGTGAAACAAATGAGAATAAACAATGTTTTAACATAGAATAATAATAATAATAAGCAAAC
AGAATGTCACTTTCTTGTTTTCAGGAAGAGGATTTTTTTGTGTATTATGAAGTGAATAAG
CCCCAATGATGATCTGATGGCAGAGTTTCCTTGATCTTGTCAAGTCTCTTGAGAATGTCC
AGAAACGATGGTCTCTGGTTCATGTCTGCGTCCC*AGCATTTCACTATTAACTC*CTTAA
ATCAGGTGTGCATCCTTTGGAACGGAAAGTAGGTCTGTGCCCATCTGATACATGTTTGGC
CGCTTCATACGGCTCGTAGTTCGCAAATGGTGGCTCTCCTTCTAGCATCTCGTAAAGTAT
CATTGCAAAGGAGAAGACGTCCACTTTCTTGTCGTATTTTCTATGCTTGAATACTTCAGG
AGCCATATACCGGTAGCTCCCGGTTTCTCCAGTCATTTTGTAGACATCATGAGAGTTTTG
AACCTTTATGAGCTTACTAAGCCCAAAGTCTCCAACTTTCAAGTGGTCTGCACTCGAATT
AACCAGAAGAACGTTCCTCGGTTTAAGATCTCGGTGAATGATAACATTAGGTTCATTGTG
AAGATATGTCATTCCTCTAGCGATGTCCAAGGCAAAGTTAACAGCAGTTGCTGGAGTAAG
ACCACCCTTTTCTTTGAGGTATTGGGTGAAGATCTCCCCCGCGTAAGTATTCAGTGATTA
ACATAAGTGGCTT*CTTTCGGTAACGGCTCCTAAGAATTGCACTATATTGGGATGGCGAA
GCTTAACTAGCAAATCAACCTCATGCCTGAAGTCCTGAATAACCAGTCTATCATCTGAGA
GAGAGGGAAGAATACGTTTGACAGCAACTGGTGTTCCTATC

QA 3 943 3 943
DS 

RD RR4AB17TF 725 0 0
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CTGGTGTTCCTATCCAATAGGCTTTCACAATCTCACCAAAGGAACCCTTTCCAATCATGG
CTGCATTAGAGAAATACAGCTCAGCAGGTTCAATTTCCCAGTCACATTTCTTTGGAATTG
GCGGTTGCACAGGCTTTGGTTCAAAGTGACTCCCGTTTTGACCATAAGATAAACCGCCAT
GAGATTTAAGTAGCTCGATCATTTTCTGCTTCCTAGCTCCTTCTGCGTCAGCCAGAGGCG
TGTTCTTCCACCTGTCCTGAGCGTTGACATCAGCACCAAACTCGATCAGACATTTGACGA
CATCGATCCACCCATGAAGAGACGCCACGTGGAGAGGCGTTCGCTTGTCATAGTCTCTGG
CGTGAACCAGAGACGGATCTTCCTCCAGGAGCTTCCGAACCGCAGCCGCGTCGTTCTGGT
GCGCGTGCCACAGGATCAGAGACGTTCTGCTCACGCGCGCCTTCTCCTTCTGTTTGTCGT
ACGCCGGTGATGGACCGGCGCTCGTTTCGCCGCCGTCTCCAGCCGCCGACGTTTCGGAGC
TCATCCCAGTGAGGTTATTTTGAGAATAAAAAGGGTTTCGATTTAGTTCGGTCGAAAGAT
GAGAGAGTTCGTTGAGTGATTGAGGGTTCGATTATTTAGTTTGAGAACAGAGAGGGAGGT
GATGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 4

CO CL3143Contig1 960 4 7 U
GGAAAGAAAAAAAGAAATGAGGGAAACTCAGCATGGTTGGTGAAAAGTCATTATCTTTGA
AGGTGTATTGTATATTATATGATCTTGATAATATGATCTTGTGAGTTGTTTCTCCCATAG
ACGATCACAATCATCTTCCTCCAATCGTTTCCAGCCAAAAAAACCTACAATGGCCGAGTC
TGCAAGCAGAAACTTTTCAAAAAAGCTCATCGAAATTGATATAAGCTCGGATACGGTGTG
CCCATGGTGCTTTGTGGGGAAGAAGAATCTTGACAAAGCCATTGATGCATCTAAAGATCA
ATACAACTTTGAGATTCGATGGCATCCTTTTTTCCTCGATGCATCTGCACCCAAAGAAGG
TGTGAACAAGAAAGAGTTTTATAGACAAAAATTTGGAAGCAGAGTTGAAGCAATGTTCAG
AAGAATGTCTGAGATCTTCAAAGGTATTGGGTTAGAGTATGACACATCCGGTCTCACAGG
CAACACTCTGGATAGTCATAGACTCATACATTATGCGGGGAAACAAGCGCCGGATAAACA
ACATAGCCTTGTTGAAGAGTTGTGTCTTGGTTACTTCACGCAGGGAAAGTACATAGGGGA
CAGGGAGTTTCTGGCTGAGACGGCTAAAAAGCTTGGCATAGACGGAGCAGAAGTATTCCT
CTCAGAGCCCACCAATGGAACCACAGAGGTAAAAGAAGAGCTGAAGAAGTATTCGCAGAA
TATCACTGGGG*TTCCACATTACACTATCAACGGGAAGGTGAAACTGAGCGGTGCACAAC
CGCCTGAGACATTCCAGAGTGCGTTTGAAGCAGCTTCTTCTTAAAACACAAAACAGTGGA
CTTAAGTAAAGATTATGTATGCTCTGTCTGTAGTTTGAACTGCTGAGTTCCAACTTTTCA
AGAACTTAATGTAATAATAATGAATAAAGGTTTGGTCTTTGATGGTTTTGCCTGAACAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC22TF U 1
AF RR4CC22JQ C 198
AF RR4B841TF U 114
AF RR4B841JQ C 200
BS 1 536 RR4CC22TF
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BS 538 630 RR4CC22TF
BS 631 731 RR4B841TF
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RD RR4CC22TF 630 0 0
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QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4CC22JQ 621 0 0
CA
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TGCGTTTGAAGCAGCTT
TT

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR4B841TF 812 0 0
GGG
ATAGACGATCACAATCATCTTCCTCCAATCGTTTCCAGCCAAAAAAACCTACAATGGCCG
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TGTGCCCATGGTGCTTTGTGGGGAAGAAGAATCTTGACAAAGCCATTGATGCATCTAAAG
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AAGGTGTGAACAAGAAAGAGTTTTATAGACAAAAATTTGGAAGCAGAGTTGAAGCAATGT
TCAGAAGAATGTCTGAGATCTTCAAAGGTATTGGGTTAGAGTATGACACATCCGGTCTCA
CAGGCAACACTCTGGATAGTCATAGACTCATACATTATGCGGGGAAACAAGCGCCGGATA
AACAACATAGCCTTGTTGAAGAGTTGTGTCTTGGTTACTTCACGCAGGGAAAGTACATAG
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CAACCGCCTGAGACATTCCAGAGTGCGTTTGAAGCAGCTTCTTCTTAAAACACAAAACAG
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TTCAAGAACTTAATGTAATAATAATGAAT

QA 4 812 4 812
DS 

RD RR4B841JQ 761 0 0
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AAAGGTATTGGGTTAGAGTATGACACATCCGGTCTCACAGGCAACACTCTGGATAGTCAT
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TTACACTATCAACGGGAAGGTGAAACTGAGCGGTGCACAACCGCCTGAGACATTCCAGAG
TGCGTTTGAAGCAGCTTCTTCTTAAAACACAAAACAGTGGACTTAAGTAAAGATTATGTA
TGCTCTGTCTGTAGTTTGAACTGCTGAGTTCCAACTTTTCAAGAACTTAATGTAATAATA
ATGAATAAAGGTTTGGTCTTTGATGGTTTTGCCTGAACAAC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

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CTTTTGTCTTCTGACTCTTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGAGCAGACATAAAAAAACCT
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ACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTT
AGAGCCGAGATGGGAGTTGAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGATCCC
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GCTGTTAAGTTTGTTTAAAAGCACTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATATGTTA
TTAAGTTTATCAAATAGATTGATGGAGGGTGTGGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EL19JQ C 1
AF RR4EL19TF U 1
AF RR4D042JQ C 11
AF RR4D042TF U 11
BS 1 309 RR4EL19TF
BS 310 310 RR4D042TF
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BS 356 356 RR4D042TF
BS 357 497 RR4EL19TF
BS 498 516 RR4D042TF

RD RR4EL19JQ 498 0 0
GGGTCTTTTATTGTTTTGACAGTCAGTAAAACACATCGCTTCATCTCCGTCGTCTCGTCG
CTTTTGTCTTCTGACTCTTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGAGCAGACATAAAAAAACCT
AAAATGGATGGGCATGACTCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTT
GCCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATC
ACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTT
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GCTGTTAAGTTTGTTTAAAAGCACTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATATGTTA
TTAAGTTTATCAAATAG
G

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4EL19TF 502 0 0
GGGTCTTTTATTGTTTTGACAGTCAGTAAAACACATCGCTTCATCTCCGTCGTCTCGTCG
CTTTTGTCTTCTGACTCTTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGAGCAGACATAAAAAAACCT
AAAATGGATGGGCATGACTCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTT
GCCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATC
ACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTT
AGAGCCGAGGTGGGAGTTGAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGCTCCC
AAAACACCTCCTAGTTCCACTTGAACTCTTAAGGGTCACATGTTCTTTCTGCGCAGAAAC
GCTGTTAAGTTTGTTTAAAAGCACTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATATGTTA
TTAAGTTTATCAAATAG
GAAAA

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4D042JQ 506 0 0
TTT
TTTTGACAGTCAGTAAAACACATCGCTTCATCTCCGTCGTCTCGTCGCTTTTGTCTTCTG
ACTCTTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGAGCAGACATAAAAAAACCTAAAATGGATGGGC
ATGACTCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATTTTT
TGCAGCAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATCACAAAGATCGATG
ACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTTAGAGCCGAGATGG
GAGTTGAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGATCCCAAAACACCTCCTA
GTTC*ACTTGAACTCTTAAGGGTCACATGTTCTTTTTGCGCAGAAACGCTGTTAAGTTTG
TTTAAAAGCACTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATATGTTATTAAGTTTATCAA
ATAGATTGATGGAGGGTGTGGGT

QA 4 506 4 506
DS 

RD RR4D042TF 506 0 0
TTT
TTTTGACAGTCAGTAAAACACATCGCTTCATCTCCGTCGTCTCGTCGCTTTTGTCTTCTG
ACTCTTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGAGCAGACATAAAAAAACCTAAAATGGATGGGC
ATGACTCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTC
TGCAGCAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATCACAAAGATCGATG
ACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTTAGAGCCGAGATGG
GAGTTGAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGATCCCAAAACACCTCCTA
GTTC*ACTTGAACTCTTAAGGGTCACATGTTCTTTCTGCGCAGAAACGCTGTTAAGTTTG
TTTAAAAGCACTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATATGTTATTAAGTTTATCAA
ATAGATTGATGGAGGGTGTGGGT

QA 4 506 4 506
DS 



AS 1 3

CO CL3145Contig1 512 3 6 U
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CATCAGGAAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCAT
ACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGATTTG
CTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGA
AAGTAGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAG
AATTCAAGTTCTTCGAAGTCGGTGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGAGAGGAT
GTTTGCTATGTCTATATAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGCGTGTTAAACACAA
CCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTGTTTTTTTTTTTTT*AAAAATCACTTGACA
AGGAGTGACTTTGGCCAATGAAAATATTTGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4DE64TF U 1
AF RR4FM40JQ C 1
AF RR4FM40TF U 1
BS 1 406 RR4DE64TF
BS 407 407 RR4FM40TF
BS 408 464 RR4DE64TF
BS 465 465 RR4FM40TF
BS 466 509 RR4DE64TF
BS 510 512 RR4FM40JQ

RD RR4DE64TF 509 0 0
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CTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGA
AAGTAGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAG
AATTCAAGTTCTTCGAAGTCGGTGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGAGAGGAT
GTTTGCTATGTCTATATAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACACAA
CCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTGTTTTTTTTTTTTTTAAAAATCACTTGACA
AGGAGTGACTTTGGCCAATGAAAATATTT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4FM40JQ 512 0 0
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CATCAGGAAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCAT
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CTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGA
AAGTAGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTTTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAG
AATTCAAGTTTTTCGAAGTCGGTGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGAGAGGAT
GTTTGCTATGTCTATATAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGCGTGTTAAACACAA
CCACTGATCTTTTGAGCCTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTTTT*AAAAATCACTTGACA
AGGAGTGACTTTGGCCAATGAAAATATTTGAG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4FM40TF 512 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGTTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTGTG
CATCAGGAAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCAT
ACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGATTTG
CTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGA
AAGTAGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAG
AATTCAAGTTCTTCGAAGTCGGTGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGAGAGGAT
GTTTGCTATGTCTATATAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGCGTGTTAAACACAA
CCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTGTTTTTTTTTTTTT*AAAAATCACTTGACA
AGGAGTGACTTTGGCCAATGAAAATATTT
GAG

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 4

CO CL3146Contig1 1247 4 12 U
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GTGGGACGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTT
GGAGCTGCAGGTGGAATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTC
TCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACTGCTGACGTTAGCCAT
ATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCAACTTGAGGACGCGCTA
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GCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACT
ACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCGGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGA
GAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTATTGTCA
CAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAAATTGAGTACCTCACGAACCGGGTT
CAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGGATCTGCAACACTTTCA
ATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGGGTTAAGAGGAGATGCG
AATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTTAGCTTTCTTTGCCACC
AAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCGGAGGAAGTGTACCAGCTTGGACCTTTGAATGAA
TATGAAAGGGTTGGCCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAATTAGCTGGAAGCATTCAGAAAGGT
GTCGACTTCATCAGGAAATGAAAATAAGAATAATCAGAGAGAGAAAATAAGATCTTCATC
TTCCTAAAATCATATGATCATGTATACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTTACTC
ATCATGCCTATTTCCAGCTTTCTTCCTCTTCAACTTTGTAAAAATTGTTTGGCTTCTTAA
ACGCACTTCTTCTCTATGGGTTCATGATGAAGGTAGATTTTAACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F524TF U 1
AF RR4CH95TF U 137
AF RR4CH95JQ C 522
AF RR4F524JQ C 595
BS 1 381 RR4F524TF
BS 382 382 RR4CH95TF
BS 383 441 RR4F524TF
BS 442 442 RR4CH95TF
BS 443 523 RR4F524TF
BS 524 524 RR4CH95TF
BS 525 621 RR4F524TF
BS 622 820 RR4CH95TF
BS 821 856 RR4CH95JQ
BS 857 857 RR4F524JQ
BS 858 1212 RR4CH95JQ
BS 1213 1247 RR4F524JQ

RD RR4F524TF 621 0 0
GTGATATCACCTCATCTTCAACCTTCTTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTA
GTGGGACGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTT
GGAGCTGCAGGTGGAATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTC
TCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACTGCTGACGTTAGCCAT
ATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCAACTTGAGGACGCGCTA
ACTGGTATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGT
GATGATCTCTTTAAAATCAATTCTGGGATTGTTAAGACGCCATGTGAAGGAGTAGCCAAA
TGCTGTCCTAATGCTATCGTCGACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATT
GCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAGGCTCCTTGGTGTTACT
ACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCGGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGA
GAAGTTGATGTACCAGTGGTT

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DS 

RD RR4CH95TF 684 0 0
G
AGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTTTACTTCATCTCTA
CGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACTGCTGACGTTAGCCATATGGACACTGGAGCTGT
TGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCAACTTGAGGACGCGCTAACTGGTATGGATCTTGT
GATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGATCTCTTTAAAAT
CAATGCTGGGATTGTTAAGACGCTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGTCCTAATGCTAT
CGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAA
GAAAGCTGGGACTTATGGTCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCG
TGCCAATACATTTGTGGCGGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGT
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AGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGGATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGC
AAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTC

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR4CH95JQ 693 0 0
GAA
GCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCGGAAGTTCT
TGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAAT
CTTGCCACTATTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAAATTGAGTA
CCTCACGAACCGGGTTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGG
ATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGG
GTTAAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTTTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTT
AGCTTTCTTTGCCACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCGGAGGAAGTGTACCAGCT
TGGACCTTTGAATGAATATGAAAGGGTTGGCCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAATTAGCTGG
AAGCATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAAATAAGAATAATCAGAGAGAGA
AAATAAGATCTTCATCTTCCTAAAATCATATGATCATGTATACTACTACTACTACTACTA
CTACTACTACTTACTCATCATGCCTATTTCCAGCTTTCTTCCTCTTCAACTTTGTAAAAA
TTGTTTGGCTTCTTAAACGCACTTCTTC
CC

QA 4 691 4 691
DS 

RD RR4F524JQ 653 0 0
CCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTA
TTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAAATTGAGTACCTCACGAAC
CGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGGATCTGCAACA
CTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGGGTTAAGAGGA
GATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTTAGCTTTCTTT
GCCACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCGGAGGAAGTGTACCAGCTTGGACCTTTG
AATGAATATGAAAGGGTTGGCCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAATTAGCTGGAAGCATTCAG
AAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAAATAAGAATAGTCAGAGAGAGAAAATAAGATC
TTCATCTTCCTAAAATCATATGATCATGTATACTACTACTACTACTACTACTACT*****
*TACTCATCATGCCTATTTCCAGCTTTCTTCCTCTTCAACTTTGTAAAAATTGTTTGGCT
TCTTAAACGCACTTCTTCTCTATGGGTTCATGATGAAGGTAGATTTTAACATT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 3

CO CL3147Contig1 887 3 10 U
GGGGAAGTCTATCTGCTCATTTCCTCACATGATCAAAGAGAGATAGAAAGGGTTTAAACT
TTCCTTAATTATAAGCATAAATCATTTCAACGCTAATGGTTTCTCGACAAGAAGAAACCC
TTTTCTCTAGAAAGAGAGATTTTACAGCCTATGGAGAAGAGTTTCACAATTTATTCAAGA
AGACCAAACAAGAAGATCAATCACATGGAACACTTCAGAGAGCCATGTTAAATGAAGGAT
CAAACTCAGAGAGTATGAGATCAGTTACGTTTGATTTTGAACTTAACCTCCACACTCCTC
TACCTTCAGGCTGGCAGAAATCTATAGAGACTAAGAGCTATCCGAGAACATCTGTGGATC
ATAGGACGAGACACCCCAACGATCCGTTGCTTGTCGAGCGACCAAAGATGAGTCTAGACC
TTGAACTGAACCTCTCACCTTCTTATTCACCTACAAAGGCCGCTACGGAAATAGAAGAAT
CCTCAAATGACAATGAAAACGTGTCATCATCGAAGGGTATCAATCTGGCAAGCCCGAGAA
TGAAGACCACGACTGTGACAGGATTAAAACGATCATTGTCATGGCTTGCGTTCGAAGGTG
GTGATGACGATGACGTTGACTGCAAGGAGCAAGAGATGGTAACAAAAGTGTGCATGAAAT
GCCACATGCTGGTTATGCTGTGCACATCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGC
ACCCACATGATCACAGCTCTACTAAACTGTTTAAACCATCGAATTTGCTTACGCTCTTGT
GTTACGCTTTACTGAATCTATTAAAAAATTGTACGCAATAATATGAACCATCGAGAGTCT
TGAGAAAGACAGTTATGTATAGACTACAGTACTAAAGTTTATTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ51TF U 1
AF RR4AJ65JQ C 445
AF RR4AJ65TF U 9
BS 1 527 RR4BZ51TF
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BS 676 735 RR4BZ51TF
BS 736 887 RR4AJ65TF

RD RR4BZ51TF 740 0 0
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TTCCTTAATTATAAGCATAAATCATTTCAACGCTAATGGTTTCTCGACAAGAAGAAACCC
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TGAAGACCACGACTGTGACAGGATTAAAACGATCATTGTCATGGCTTGCGTTTGAAGGTG
GTGATGACGATGACGTTGACTGCAAGGAGCAAGAGATGGTAACAAAAGTGTGCATGAAAT
GC*ACATGCTGGTTTTGCTGTGCACATCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGC
ACCCACATGATCACA
GCTCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4AJ65JQ 291 0 0
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TAAAACGATCATTGTCATGGCTTGCGTTCGAAGGTGGTGATGACGATGACGTTGACTGCA
AGGAGCAAGAGATGGTAACAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTTATGCTGTGCA
CATCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGCACCCACATGATCACA

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR4AJ65TF 879 0 0
GG
ATCTGCTCATTTCCTCACATGATCAAAGAGAGATAGAAAGGGTTTAAACTTTCCTTAATT
ATAGGCATAAATCATTTCAACGCTAATGGTTTCTCGACAAGAAGAAACCCTTTTCTCTAG
AAAGAGAGATTTTACAGCCTATGGAGAAGAGTTTCACAATTTATTCAAGAAGACCAAACA
AGAAGATCAATCACATGGAACACTTCAGAGAGCCATGTTAAATGAAGGATCAAACTCAGA
GAGTATGAGATCAGTTACGTTTGATTTTGAACTTAACCTCCACACTCCTCTACCTTCAGG
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CAATGAAAACGTGTCATCATCGAAGGGTATCAATCTGGCAAGCCCGAGAATGAAGACCAC
GACTGTGACAGGATTAAAACGATCATTGTCATGGCTTGCGTTCGAAGGTGGTGATGACGA
TGACGTTGACTGCAAGGAGCAAGAGATGGTAACAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCT
GGTTATGCTGTGCACATCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGCACCCACATGA
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AGTTATGTATAGACTACAGTACTAAAGTTTATTCTAT

QA 3 879 3 879
DS 



AS 1 4

CO CL3148Contig1 897 4 6 U
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TGCCGAGATCATGGTTAAAGCCGAGCCAAAACCTGTTGGTCGTATTCGACGAGCTTGGGG
GAAACCCATCAGCTGTTTCTCTGGTTAAAAGATCAGTATCTGGAGTCTGTGCTGAAGTCT
CTGAGTACCATCCGAATATCAAGAACTGGCAACTGGAAAGCTATGGTAAAGAAGGACAAA
CGTTTCATAGACCAAAGGTTCATTTGAAGTGTAGTCCTGGTCAGGCCATTTCAGCTATCA
AGCTCGCAAGCTTTGGCACTCCTTTAGGGAAATGTGGGAGTTACCAACAAGGAGAGTGTC
ATGCAGCTGCTTCATACGCTATCTTAGAGAGGAAGTGTGTAGGAAAAGCGAGGTGCGCAG
TGACGATATCAAACAGTAACTTCGGGAAAGATCCGTGTCCGAATGTGTTGAAACGGTTGA
CTGTTGAAGCAGTTTGTTCTCATGAGACATCTGTAACCAGTTGGAGACCTTGAAGACAAA
TATTGTTCTACAAAATGTATAACCAAACTATACAGAGAGAGAGGAAAAAATAAGTAAGCT
GAGTTAAAATCTGTGTCTGTGTGTGTTAGTTTTGAACAGAAGAACTTTGTGGTTTAGAGT
AGTTTGAGTTAGGTAAGAGAGGAGAGTCTATAGAGTTGTGATGAGTCTTGGGCAATTCCG
GGTCTTGTCAAAAACGTTTCTGCCCACCGGTTTACCTACGACCATTTTAACCGGTTATGG
AGACTGGAATTGTTGGGTATGAATGAAGTCTGGTTGAATGTTTGGTTTTGATTTGTCTCT
GTAATCAACGATGAATGTTACGAGTTTTCTATTGTGTGAGTGTGATCCATTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F260TF U 1
AF RR4F260JQ C 313
AF RR4CH34JQ C 390
AF RR4CH34TF U 395
BS 1 539 RR4F260TF
BS 540 540 RR4CH34TF
BS 541 589 RR4F260TF
BS 590 590 RR4CH34TF
BS 591 685 RR4F260TF
BS 686 897 RR4CH34TF

RD RR4F260TF 685 0 0
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TGCCGAGATCATGGTTAAAGCCGAGCCAAAACCTGTTGGTCGTATTCGACGAGCTTGGGG
GAAACCCATCAGCTGTTTCTCTGGTTAAAAGATCAGTATCTGGAGTCTGTGCTGAAGTCT
CTGAGTACCATCCGAATATCAAGAACTGGCAACTGGAAAGCTATGGTAAAGAAGGACAAA
CGTTTCATAGACCAAAGGTTCATTTGAAGTGTAGTCCTGGTCAGGCCATTTCAGCTATCA
AGCTCGCAAGCTTTGGCACTCCTTTAGGGAAATGTGGGAGTTACCAACAAGGAGAGTGTC
ATGCAGCTGCTTCATACGCTATCTTAGAGAGGAAGTGTGTAGGAAAAGCGAGGTGCGCAG
TGACGATATCAAACAGTAACTTCGGGAAAGATCCGTGTCCGAATGTGTTGAAACGGTTGA
CTGTTGAAGCAGTTTGTTCTCATGAGACATCTGTAACCAGTTGGAGACCTTGAAGACAAC
TATTGTTCTACAAAATGTATAACCAAACTATACAGAGAGAGAGGAAAAA*TAAGTAAGCT
GAGTTAAAATCTGTGTCTGTGTGTGTTAGTTTTGAACAGAAGAACTTTGTGGTTTAGAGT
AGTTTGAGTTAGGTAAGAGAGGAGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4F260JQ 564 0 0
TTGGCACTCCTTTAGGGAAATGTGGGAGTTACCAACAAGGAGAGTGTCATGCAGCTGCTT
CATACGCTATCTTAGAGAGGAAGTGTGTAGGAAAAGCGAGGTGCGCAGTGACGATATCAA
ACAGTAACTTCGGGAAAGATCCGTGTCCGAATGTGTTGAAACGGTTGACTGTTGAAGCAG
TTTGTTCTCATGAGACATCTGTAACCAGTTGGAGACCTTGAAGACAACTATTGTTCTACA
AAATGTATAACCAAACTATACAGAGAGAGAGGAAAAA*TAAGTAAGCTGAGTTAAAATCT
GTGTCTGTGTGTGTTAGTTTTGAACAGAAGAACTTTGTGGTTTAGAGTAGTTTGAGTTAG
GTAAGAGAGGAGAGTCTATAGAGTTGTGATGAGTCTTGGGCAATTCCGGGTCTTGTCAAA
AACGTTTCTGCCCACCGGTTTACCTACGACCATTTTAACCGGTTATGGAGACTGGAATTG
TTGGGTATGAATGAAGTCTGGTTTAATGTTTGGTTTTGATTTGTCTCTGTAATCAACGAT
GAATGTTACGAGTTTTCTATTGT
C

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4CH34JQ 508 0 0
GGGAA
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GTGTCCGAATGTGTTGAAACGGTTGACTGTTGAAGCAGTTTGTTCTCATGAGACATCTGT
AACCAGTTGGAGACCTTGAAGACAAATATTGTTCTACAAAATGTATAACCAAACTATACA
GAGAGAGAGGAAAAAATAAGTAAGCTGAGTTAAAATCTGTGTCTGTGTGTGTTAGTTTTG
AACAGAAGAACTTTGTGGTTTAGAGTAGTTTGAGTTAGGTAAGAGAGGAGAGTCTATAGA
GTTGTGATGAGTCTTGGGCAATTCCGGGTCTTGTCAAAAACGTTTCTGCCCACCGGTTTA
CCTACGACCATTTTAACCGGTTATGGAGACTGGAATTGTTGGGTATGAATGAAGTCTGGT
TGAATGTTTGGTTTTGATTTGTCTCTGTAATCAACGATGAATGTTACGAGTTTTCTATTG
TGTGAGTGTGATCCATTTGTTCC

QA 6 508 6 508
DS 

RD RR4CH34TF 503 0 0
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GTGTCCGAATGTGTTGAAACGGTTGACTGTTGAAGCAGTTTGTTCTCATGAGACATCTGT
AACCAGTTGGAGACCTTGAAGACAAATATTGTTCTACAAAATGTATAACCAAACTATACA
GAGAGAGAGGAAAAAATAAGTAAGCTGAGTTAAAATCTGTGTCTGTGTGTGTTAGTTTTG
AACAGAAGAACTTTGTGGTTTAGAGTAGTTTGAGTTAGGTAAGAGAGGAGAGTCTATAGA
GTTGTGATGAGTCTTGGGCAATTCCGGGTCTTGTCAAAAACGTTTCTGCCCACCGGTTTA
CCTACGACCATTTTAACCGGTTATGGAGACTGGAATTGTTGGGTATGAATGAAGTCTGGT
TGAATGTTTGGTTTTGATTTGTCTCTGTAATCAACGATGAATGTTACGAGTTTTCTATTG
TGTGAGTGTGATCCATTTGTTCC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 4

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TGGTAAAAAGGTTGCTACTCACACACGGCGTGAACCCATTGGTCGTTGAGATTGATGAAG
AAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGGTAAAACCGTAATTAATAAAG
AGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGGAGGATTGGAGAATCTGATGG
CTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAGCAGGGGCTTTATGGCTTT
GATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATTATTTGCTATATGTTTTTGGT
GATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAATTAATGTTATGTGATTCGGTTGATCATAGAGAA
ACACATAAAATTAGAAAAGCACAAAAACAAAATTTTCCTGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EJ03TF U 1
AF RR4EJ03JQ C 1
AF RR4AI29JQ C 1
AF RR4AI29TF U 1
BS 1 244 RR4EJ03TF
BS 245 245 RR4AI29TF
BS 246 585 RR4EJ03TF
BS 586 586 RR4AI29TF
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RD RR4EJ03TF 592 0 0
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CTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAGCAGGGGCTTTATGGCTTT
GATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATTATTTGTTATATG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4EJ03JQ 639 0 0
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CTAGATCAATTATGCAAAAAGCAATAAGGCCATCCGAGTCATCGTGGACGAAGACCACAC
CCGTCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAACCATCATCATCACTATCATGGCTAA
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TGGTAAAAAGGTTGCTACTCACACACGGCGTGAACCCATTGGTCGTTGAGATTGATGAAG
AAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGGTAAAACCGTAATTAATAAAG
AGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGGAGGATTGGAGAATCTGATGG
CTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAGCAGGGGCTTTATGGCTTT
GATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATTATTTGTTATATGTTTTTGGT
GATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAATTAATGTTATG
C

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4AI29JQ 701 0 0
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TTTTGGTGATGGAAAATGCTGTGGTGGTGTTTGCCAGGAGAGGCTGTTGTATGGGACATG
TGGTAAAAAGGTTGCTACTCACACACGGCGTGAACCCATTGGTCGTTGAGATTGATGAAG
AAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGGTAAAACCGTAATTAATAAAG
AGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGGAGGATTGGAGAATCTGATGG
CTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAGCAGGGGCTTTATGGCTTT
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GATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAATTAATGTTATGTGATTCGGTTGATCATAGAGAA
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QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4AI29TF 701 0 0
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CCGTCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAACCATCATCATCACTATCATGGCTAA
CATCATCACCATCACCACAAAACACACCATGTTCAAGCACTAAGAAATCAAGCTATAACG
TTTTGGTGATGGAAAATGCTGTGGTGGTGTTTGCCAGGAGAGGCTGTTGTATGGGACATG
TGGTAAAAAGGTTGCTACTCACACACGGCGTGAACCCATTGGTCGTTGAGATTGATGAAG
AAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGGTAAAACCGTAATTAATAAAG
AGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGGAGGATTGGAGAATCTGATGG
CTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAGCAGGGGCTTTATGGCTTT
GATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATTATTTGCTATATGTTTTTGGT
GATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAATTAATGTTATGTGATTCGGTTGATCATAGAGAA
ACACATAAAATTAGAAAAGCACAAAAACAAAATTTTCCTGT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

CO CL3150Contig1 836 3 6 U
CACAATTAATATAAATATAATTTGATTTATTACAAAGTAAACCAATGCATTATTTTTACA
CATTCTTGTTTTAAGACGCCCACATTCCTCATGGACTTGCACGCTTTGAACTCAAATAAG
AACAGAAAAACGCAAAAGAGTTTACTACATGACCAGTTTGAGATCCTTTCACTGACCAGT
TTTGGACAACGCCTTAGTTCTAATTTCTTAACCATGTATGCATGCACAAGGGACTAAGGA
TGGGGTCGATGGCCTTAAATACCCTTTGAACCGGGAACCTCGATCCACTCGAGCTGTAGC
TCGACCTCTCCACACTCCACGTGCTGGAGTCTAAGGAACATATTCTGCACAAGCTTGCCT
TGGCTCAACACAATATGGCTCTCTTCAAACAAACAGTTTTGTCTGGTCGGTTGTACCTTC
ATGATTATGGTTCCGTTGGGAAGTCCACCTTCAAGCTTATGGCGTAGTTTAATGGCTTCA
AGATATGGAGCAATGCCAAACTCTGCTTCTCCCATCTTATCATCCGCCGAGAACAAGTCC
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TCGTTCCATTCCGGGTTTATACTATGTTTGATTACACGGGTTTTAAGCTTCTGTTTTCCT
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TGCAAAGTTGGTTTCTGGTAGAAACTGTGCTTTTGGACTTTGGAAAGCTGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DP44JQ U 24
AF RR4CL50JQ U 1
AF RR4CL50TF C 197
BS 1 123 RR4CL50JQ
BS 124 124 RR4DP44JQ
BS 125 813 RR4CL50JQ
BS 814 814 RR4CL50TF
BS 815 835 RR4CL50JQ
BS 836 836 RR4CL50TF

RD RR4DP44JQ 751 0 0
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ATTCCTCATGGACTTGCACGCTTTGAACTCAAATAAGAACAGAAAAACGCAAAAGAGTTT
ACTACATGACCAGTTTGAGATCCTTTCACTGACCAGTTTTGGACAACGCCTTAGTTCTAA
TTTCTTAACCCTGTATGCATGCACAAGGGACTAAGGATGGGGTCGATGGCCTTAAATACC
CTTCGAACCGGGAACCTCGATCCACTCGAGCTGTAGCTCGACCTCTCCACACTCCACGTG
CTGGAGTCTAAGGAACATATTCTGCACAAGCTTGCCTTGGCTCAACACAATATGGCTCTC
TTCAAACAGA*AGTTTTGTCTGGTCGGTTGTACCTTCATGATTATGGTTCCGTTGGGAAG
TCCTCCTTCAAGCTTATGGCGTAGTTTAATGGCTTCAAGATATGGAGCAATGCCAAACTC
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AGTGAGGTTTGGATCTGTAACAGAAAGAGTTAAATAGTCGTTCCATTCCGGGTTTATACT
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GCTGCTTGAGGTATATCTAATGGCGAGATTCACACCTCTCTTCACATGAATTCTCAGAAG
ACCCAGTAGATTCTCCATTTTTTGGTCAATT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4CL50JQ 835 0 0
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CATTCTTGTTTTAAGACGCCCACATTCCTCATGGACTTGCACGCTTTGAACTCAAATAAG
AACGGAAAAACGCAAAAGAGTTTACTACATGACCAGTTTGAGATCCTTTCACTGACCAGT
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TGGGGTCGATGGCCTTAAATACCCTTTGAACCGGGAACCTCGATCCACTCGAGCTGTAGC
TCGACCTCTCCACACTCCACGTGCTGGAGTCTAAGGAACATATTCTGCACAAGCTTGCCT
TGGCTCAACACAATATGGCTCTCTTCAAACAAACAGTTTTGTCTGGTCGGTTGTACCTTC
ATGATTATGGTTCCGTTGGGAAGTCCACCTTCAAGCTTATGGCGTAGTTTAATGGCTTCA
AGATATGGAGCAATGCCAAACTCTGCTTCTCCCATCTTATCATCCGCCGAGAACAAGTCC
TTGTCGTAAACCGTAAGTTTAACAGTGAGGTTTGGATCTGTAACAGAAA**GTTAAATCG
TCGTTCCATTCCGGGTTTATACTATGTTTGATTACACGGGTTTTAAGCTTCTGTTTTCCT
GAGCGAAAGACGATGTAAGGATCGCTGCTTGAGGTATCTCTAATGGCGAGATTCACACCT
CTCTTCACATGAATTCTCAGAAGACCCAGTAGATTCTCCATTTTTTGGTCAATTGCAAGA
TGCAAAGTTGGTTTCTGGTAGAAACTGTGCTTT*GGACTTTGGAAAGCTGCGATC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4CL50TF 640 0 0
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AAATACCCTTTGAACCGGGAACCTCGATCCACTCGAGCTGTAGCTCGACCTCTCCACCCT
CCACGTGCTGGAGTCTAAGGAACATATTCTGCACAAGCTTGCCTTGGCTCAACACAATAT
GGCTCTCTTCAGACAAACAGTTTTGTCTGGTCGGTTGTACCTTCATGATTATGGTTCCGT
TGGGAAGTCCACCTTCAAGCTTATGGCGTAGTTTAATGGCTTCAAGATATGGAGCAATGC
CAAACTCTGCTTCTCCCATCTTATCATCCGCCGAGAACAAGTCCTTGTCGTAAACCGTAA
GTTTAACAGTGAGGTTTGGATCTGTAACAGAAA**GTTAAATCGTCGTTCCATTCCGGGT
TTATACTATGTTTGATTACACGGGTTTTAAGCTTCTGTTTTCCTGAGCGAAAGACGATGT
AAGGATCGCTGCTTGAGGTATCTCTAATGGCGAGATTCACACCTCTCTTCACATGAATTC
TCAGAAGACCCAGTAGATTCTCCATTTTTTGGTCAATTGCAAGATGCAAAGTTGGTTTCT
GGTAGAAACTGTGCTTTTGGACTTTGGAAAGCTGCGATCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 4

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TGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTATGTTCTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AU47JQ C 1
AF RR4B061JQ C 1
AF RR4AU47TF U 1
AF RR4B061TF U 1
BS 1 454 RR4AU47TF

RD RR4AU47JQ 454 0 0
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GTTTCCACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCTGTGGTGGTGAAAGTGATGGGCCGTA
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AGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGTGGAAACAAGA
AAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTCTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGT
TGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATC
TGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTATGTTCTC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4B061JQ 454 0 0
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GTTTCCACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCTGTGGTGGTGAAAGTGATGGGCCGTA
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TTATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCTG
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AAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTCTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGT
TGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATC
TGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTATGTTCTC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4AU47TF 454 0 0
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AAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTCTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGT
TGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATC
TGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTATGTTCTC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4B061TF 454 0 0
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TTATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCTG
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AAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTCTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGT
TGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATC
TGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTATGTTCTC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 4

CO CL3152Contig1 518 4 2 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B610JQ U 11
AF RR4CF09JQ U 1
AF RR4CF09TF C 1
AF RR4B610TF C 11
BS 1 498 RR4CF09JQ
BS 499 518 RR4B610TF

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AAC

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GATA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4CF09TF 502 0 0
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AGTGAGGAGCTTGGACTGTGGAAGAGCAGAGAGAAGCCAGGACTGCAGAGGAGACCTGAC
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GATA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4B610TF 508 0 0
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AGAAAAATTCTGAAATTCCCGAGGATAACAAAAATGTCAATCTGAAACTTCTAGTTTCTA
AACAAAAAGCTAGATCTAACAAGTGAAAACTAAAGGCATAATAAAAACTTCTGTTGGAGA
TGTTTATGTGGAATGCTGAGATGGACGAGACATAGCTACCACGGTGAACCAGTGAGGAGC
TTGGACTGTGGAAGAGCAGAGAGAAGCCAGGACTGCAGAGGAGACCTGACTGCATAGGAG
AAGAAAAGAGATTGGACAGCGAGTCTGCGGCCACCGAGGAGACGACCGGAGACGGGACTG
CCACAACTGCCTTGCACCACCGGAGAGGAGAAGACCGAAGAGGAGATGAACGAACAGGAG
ACCACGCCTTGCACTAACAGAGAAATAAAGAGGAGAATGATATTCGTAGAGGGGAAGAAG
AGATGAGGATACGGATGAAGATGGACCC

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 4

CO CL3153Contig1 1055 4 13 U
GGAACAAACATCGTCTCTCCTCCATTGCTATTGGCTTCCTGAATCTTCGTCGAAGATGAG
GATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAATTTCACTCTCTTCAATCTCCTCCCATGT
TTTGTCAGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGAAACAATCGTGA
ACCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCGGGTGATAATCT
GGAATCGATGGCGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGA
GGAAGAATCTAGTACCGGATGGACCTCTCCTCAGCAGAACATCAGCACTGTCTTGATGGA
AACTGATAAACAACAACAGCTCAAGCTCAAGACCCCTGATCAACTCCTTCAACCACTCAA
CGACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTCAAGTC
AGTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAA
TTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAA
AGAGAGGTATCATTCTCATATTTTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACCGGAACGCC
TCGAGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTATGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTCTCTCAC
TGAGCTGTCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAAGCATCC
GCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTATCACACACGATCCACTGCAATTTGATCCCGGTGGA
AGAAGACGCAACAAGAAACGAGGAAGAACGAGTAGTGAGCGAATCACCTAAGGTTGCCGA
TTCTTGAAAACCACTTAAGTGAAATACAGGAGTAACAGTTAAAACAGTAACTATATATAA
GAAGAGCTAGTATATATCCAGTGTCGGTGAATTGCTCATGGTTATAAACCTGTTTTCATG
AAGAATGAATGAGATGAATCCATCCAAGTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4H595TF U 1
AF RR4GU03TF U 22
AF RR4GU03JQ C 326
AF RR4H595JQB C 475
BS 1 191 RR4H595TF
BS 192 192 RR4GU03TF
BS 193 251 RR4H595TF
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BS 761 800 RR4GU03TF
BS 801 801 RR4GU03JQ
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BS 880 880 RR4H595JQB
BS 881 1055 RR4GU03JQ

RD RR4H595TF 760 0 0
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GATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAATTTCACTCTCTTCAATCTCCTCCCATGT
TTTGTCAGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGAAACAATCGTGA
ACCAAAGTACATGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCGGGTGATAATCT
GGAATCGATGGTGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGA
GGAAGAATCTAGTACCGGATGGACCTCTCCTCAGCAGAACATCAGCACTGTCTTGATGGA
AACCGATAAACAACAACAGCTCAAGCTCAAGACCCCTGATCAACTCCTTCAACCACTCAA
CGACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTCAAGTC
AGTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAA
TTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAA
AGAGAGGTATCATTCTCATATTTTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACCGGAACGCC
TCGAGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTATGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTCTCTCAC
TGAGCTGTCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GU03TF 810 0 0
GG
ATTGCTATTGGCTTCCTGAATCTTCGTCGAAGATGAGGATCACGCAGATCTTATTACCTC
TGCTAATAATTTCACTCTCTTCAATCTCCTCCCATGTTTTGTCTGATCAGATCTTTCCAG
CTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGAAACAATCGTGAACCAAAGTACACGATCGAGTATC
TCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCGGGTGATAATCTGGAATCGATGGCGATGCATGACA
AGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGAGGAAGAATCTAGTACCGGATGGA
CCTCTCCTCAGCAGAACATCAGCACTGTCTTGATGGAAACTGATAAACAACAACAGCTCA
AGCTCAAGACCCCTGATCAACTCCTTCAACCACTCAACGACCAATGCCTTCTCAGGCAAG
AGGGTTGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTCAAGTCAGTAAGGCAGCTACACCTTGAGG
ATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACGCAGAGGCAACTGCTG
CTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCTCATATTT
TCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACCGGAACGCCTCGAGAAGTCGAGGTGAGGTTTG
TATGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTCTCTCACTGAGCTGTCCACTTGCAAGTACG
CACTGACTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAAC*AG
TATCACACACGATCCACTGCAATTTGAT

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR4GU03JQ 730 0 0
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CTCAAGACCCCTGATCAACTCCTTCAACCACTCAACGACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAG
GGTTGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTCAAGTCAGTAAGGCAGCTACACCTTGAGGAT
GGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCT
TTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCTCATATTTTC
ACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACCGGAACGCCTCGAGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTA
TGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTCTCTCACTGAGCTGTCCACTTGCAAGTACGCA
CTGACTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTA
TCACACACGATCCACTGCAATTTGATCCCGGTGGAAGAAGACGCAACAAGAAACGAGGAA
GAACGAGTAGTGAGGGAATCACCTAAGGTTGCCGATTCTTGAAAACCACTTAAGTGAAAT
ACAGGAGTAACAGTTAAAACAGTAACTATATATAAGAAGAGCTAGTATATATCCAGTGTC
GGTGAATTGCTCATGGTTATAAACCTGTTTTCATGAAGAATGAATGAGATGAATCCATCC
AAGTTTTACT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4H595JQB 576 0 0
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GGGTAATTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTTTAC
TATGAAAGAGAGGTATCATTTTCATATTTTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACCGG
AACGCCTCGAGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTATGGGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTT
TCTCACTGAGCTGTCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAA
GCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTATCACACACGATCCACTGCAATTTGATCCC
GGTGGAAGAAGACGCAACAAGAAACGAGGAAGAACGAGTAGTGAGCGAATCACCTAAGGT
TGCCGATTCTTGAAAACCACTTAAGTGAAATACAGGAGTAACAGTTAAAACAGTAACTAT
ATATAAGAAGATTTAGTATATATCCAGTGTCGGTGAATTGCTCATGGTTATAAACCTGTT
TTCATGAAGAATGAATGAGATGAATCTATCCAAGTT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 3

CO CL3154Contig1 1264 3 23 U
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GAGGTCATCACGCCAAATATGTACAACATGAATCTGTGGGAGACTTCTGGACATGCTGCA
AATTACAAGGATAATATGTTTACTTTTGATATTGAGAAGCAGGAGTTCGGGCTCAAACCA
ATGAATTGCCCTGGTCACTGTTTGATGTTCCAACACAGGGTTCGCTCATACAGAGAGTTA
CCTATCAGAATGGCTGACTTTGGAGTGTTACACCGCAATGAGGCAAGTGGAGCCCTTAGT
GGGTTGACTCGCGTCCGACGGTTCCAGCAGGATGATGCACACATATTCTGTACAGAGGAT
CAGATTACGGAAGAAGTGAAAGGTGTGTTGGAGTTCATTGACTATGCGTACAAAATCTTT
GGATTCACCTATGAGCTGAAGCTTTCAACGAGGCCAGAAAAGTACCTTGGAGATTTGGCG
ACATGGGATAAAGCTGAAAACGATCTCAAAGTTGCCCTAGATGCCTTTGGAAAGACATGG
CAGTTGAACGAAGGAGATGGTGCCTTTTATGGCCCTAAGATAGATATTACTGTCTCCGAT
GCGCTTAATAGGAAATTTCAGTGCGCTACTTTACAGCTTGATTTTCAACTTCCTGATCGC
TTCAAACTGGAGTACTCAGGTGACGACGAAGCTAAGAGGAACAGGCCTGTGATGATACAC
AGAGCCGTGCTGGGATCTGTGGAACGCATGTTCGCCATCTTACTGGAGCACTACAAAGGG
AAATGGCCGTTCTGGTTAAGTCCGCGACAGGCCATAGTGTGCCCTATATCGAAGAAGTCC
GAGGAGTATGCTTTGAAGGTGAAAGCCCAAATTCATGACGCTGGGTACTACGTGGATGCG
GACATAACTGACAGAAAGATCGATAAAAAGGTGCGAGAAGCTAAGCTTGCGCAGTACAAC
TACATACTTGTGGTTGGTGAAACCGAAGCTGCTACAGGACAGGTGAGTGCACGGATAAGA
GACAGTGCAGCCCACTCGGTGAAGAGCATCGAGGATTTACTGGAAGAATTCAAGACCAAG
ACTGCCGAGTATCAATGAGAGATCAGACTCTTAAAACTTCAAGTTTGATTTTATTTTGAT
GATACTGTTTTTGTTTTAAATTTAATTATGCAAAAAATAGAGTAAAAACCAGATTGAAGT
GTTTACTTATCATTAAACCAGATTCTAAAGTTTCATTACTTCTCTAGCGATTTTGCTTCC
TATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4EZ37TF U 1
AF RR4DG92TF U 403
AF RR4EZ37JQ C 593
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ACATGGGATAAAGCTGAAAACGATCTCAAAGTTGCCCTAGATGCCTT*GGAAAGACATGG
CAGTTGAACGAAGGAGATGGTGCCTTTTATGGCCCTAAGATAGATATTACTGTCTCCGAT
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TTCAAACTGGAGTACTCAG*TGACGACGAAGCTAAGAG
TA

QA 1 698 1 698
DS 

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G
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ACCTTGGAGATTTGGCGACATGGGATAAAGCTGAAAACGATCTCAAAGTTGCTCTAGATG
CCTTTGGAAAGACATGGCAGTTGAACGAAGGAGATGGTGCCTTTTATGGCCCTAAGATAG
ATATTACTGTCTCTGATGCGCTTAATCGGAAATTTCAGTGCGCTACTTTACAGCTTGATT
TTCAACTTCCTGATCGCTTCAAACTGGAGTACTCAGGTGACGACGAAGCGAAGAGGAACA
GGCCTGTGATGATACACAGAGCCGTGCTGGGATCTGTGGAACGCATGTTCGCCATTTTAC
TGGAGCACTACAAAGGGAAATGGCCGTTCTGGTTGAGTCCGCGACAGGCCATAGTGTGCC
CTATATCGAAGAAGTCTGAGGAGTATGCTTTGAAGGTGAAAGCCCAAATTCATTACGCTG
GGTACTACGTGGATGCTGACATAACTGACAGAAAGATTGATAAAAAGGTGCGAGAAGCTA
AGCTTGCGCAGTACAACTACATACTTGTGGTTGGTGAAACCGAAGCTGCTACAGGACAGG
TGAGTGTACGGATAAGAGACAGTGCAGCCCACTCGGTGAAGAGCATCGAGGATTTACTGG
AAGAATTCAAGACCAAGACTGCCGAGTATCAATGAGAGATCAGACTCTTAAAAGTTCAAG
TTTGATTTTATTT
GATGAATACTGTTTTGTT

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR4EZ37JQ 672 0 0
TCTCCGATGCGCTTAATAGGAAATTTCAGTGCGCTACTTTACAGCTTGATTTTCAACTTC
CTGATCGCTTCAAACTGGAGTACTCAGGTGACGACGAAGCTAAGAGTAACAGGCCTGTGA
TGATACACAGAGCCGTGCTGGGATCTGTGGAACGCATGTTCGCCATCTTACTGGAGCACT
ACAAAGGGAAATGGCCGTTCTGGTTAAGTCCGCGACAGGCCATAGTGTGCCCTATATCGA
AGAAGTCCGAGGAGTATGCTTTGAAGGTGAAAGCCCAAATTCATGACGCTGGGTACTACG
TGGATGCGGACATAACTGACAGAAAGATCGATAAAAAGGTGCGAGAAGCTCAGCTTGCGC
AGTACAACTACATACTTGTGGTTGGTGAAACCGAAGCTGCTACAGGACAGGTGAGTGCAC
GGATAAGAGACAGTGCAGCTCACTCGGTGAAGAGCATCGAGGATTTACTGGAAGAATTCA
AGACCAAGACTGCCGAGTATCAATGAGAGATCAGACTCTTGAAACTTCAAGTTTGATTTT
ATTTTGATGATACTGTTTTTGTTTTAAATTTAATTATGCAAAAAATAGAGTAAAAACCAG
ATTGAAGTGTTTACTTATCATTAAACCAGATTCTAAAGTTTCATTACTTCTCTAGCGATT
TTGCTTCCTATC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 4

CO CL3155Contig1 954 4 20 U
GGCTCGCCTCCGTCGCTCATCTTTGTAACTCAGTGAAAAAGGTTCGAGCTTTTAGAGAAT
AATGGCTGCCTTCCCCAACCTTAACACTGAAGCTGGATTGAAGAAGCTCGATGAGCATCT
TCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTTGC
TGCTCTTGCAAAGCCACCAACCTCGCAGTTTGTGAACGCTTCTCGTTGGTACAACCACAT
CGATGCCCTCTTGAGGATCTCAGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAGGG
ATCAGCCCCAGTTGCGGAAGAGGCTATTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGC
TGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACAGAGGAGGAGAA
GAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCTGG
AAAGTCATCAGTTTTGATTGATATCAAGCCGTGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCT
AGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTTGT
ACCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGT
CTCTGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCCA
GAGCTGTGACATTGTTGCTTTCAACAAAATCTAAGGATGTCATCTTTGCTATAAGGAAGC
GCTATTGCAGTCTGATTATTGTTTCCAAGTTTCTTGTGGACTCATGTTTTTGATTTTGCT
ATGGTTTGCCTTATCTCCTGTTTAATTTTGATATTTATGAAGAAGACAGTTTCGTTATTC
GCTTGAAGTTTACTTTCCAACAAATGTCAAATGAGTGATTTTGTTGAACTAGGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EW37TF U 4
AF RR4BQ93TF U 1
AF RR4EW37JQ C 195
AF RR4BQ93JQ C 124
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RD RR4EW37TF 769 0 0
GG
GCCTCCGTCGCTCATCTTTGTAACTCAGTGAAAAAGGTTCGAGCTTTTAGAGAATAATGG
CTGCCTTCCCCAACCTTAACACTGAAGCTGGATTGAAGAAGCTCGATGAGCATCTTCTCA
CTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTTGCTGCTC
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CCCTCTTGAGGATCTCAGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAGGGATCAG
CCCCAGTTGCGGAAGAGGCTATTGCTACTCCTCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGCTGCTG
ATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGG
CTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGT
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AAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTTGTACCGG
TTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTG
TTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCCAGAGCT
GTGACATTGTTGCTTTCA*CAAAATCTAAG*ATGTCATCTTTGCTAT

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR4BQ93TF 812 0 0
GGCTCGCCTCCGTCGCTCATCTTTGTAACTCAGTGAAAAAGGTTCGAGCTTTTAGAGAAT
AATGGCTGTCTTCCCCAACCTTAACACTGAAGCTGGATTGAAGAAGCTCGATGAGCATCT
TCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTTGC
TGCTCTTGCAAAGCCACCAACCTCGCAGTTTGTGAACGCTTCTCGTTGGTACAACCACAT
CGATGCCCTCTTGAGGATCTCAGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAGGG
ATCAGCCCCAGTTGCGGAAGAGGCTATTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGC
TGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACAGAGGAGGAGAA
GAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCTGG
AAAGTCATCAGTTTTGATTGATATCAAGCCGTGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCT
AGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTTGT
ACCGGTTGGTTACG*TATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGT
CTCTGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGC*AATCAATGAGTT*GTCCA
GAGCTGTGACATTGTTGCTTTCA*CAAA*TCTAAG*ATGTCATCTTTGCTATAAG**AGC
GCTAT*GCAGTCTGATTATTGTT
CCAGTTCTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4EW37JQ 711 0 0
CACCA
ACCTCGCAGTTTGTGAACGCTTCTCGTTGGTACAACCACATCGATGCCCTCTTGAGGATC
TCAGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCCCAGTTGCGGAA
GAGGCTATTGCTACTCCTCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGCTGCTGATGAAGAGGATGAT
GATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCTGCTGAAGAGAGA
GCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGTCATCAGTTTTGATT
GATATCAAGCCGTGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCC
GTCCAGATGGAAGGTTTATTTTGGGGAGCATCCAAGCTTGTACCGGTTGGTTACGGTATC
AAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTGTTGACACCATGATT
GAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCT
TTCAACAAAATCTAAGGATGTCATCTTTGCTATAAGGAAGCGCTATTGCAGTCTGATTAT
TGTTTCCAAGTTTCTTGTGGACTCATGTTTTTGATTTTGCTATGGTTTGCCTTATCTCCT
GTTTAATTTTGATATTTATGAAGAAGACAGTTTCGTTATT
TGCTGG

QA 6 705 6 705
DS 

RD RR4BQ93JQ 831 0 0
CACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTTGCTGC
TCTTGCAAAGCCACCA*CCTCGCAGTTTGTGAACGCTTCTCGTTGGTACAACCACATCGA
TGCCCTCTTGAGGATCTCAGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAGGGATC
AGCCCCAGTTGCGGAAGAGGCTATTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGCTGC
TGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACAGAGGAGGAGAAGAA
GGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCTGGAAA
GTCATCAGTTTTGATTGATATCAAGCCGTGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGA
GGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTTGTACC
GGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGTCTC
TGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCCAGAG
CTGTGACATTGTTGCTTTCAACAAAATCTAAGGATGTCATCTTTGCTATAAGGAAGCGCT
ATTGCAGTCTGATTATTGTTTCCAAGTTTCTTGTGGACTCATGTTTTTGATTTTGCTATG
GTTTGCCTTATCTCCTGTTTAATTTTGATATTTATGAAGAAGACAGTTTCGTTATTCGCT
TGAAGTTTACTTTCCAACAAATGTCAAATGAGTGATTTTGTTGAACTAGGT

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 4

CO CL3156Contig1 843 4 12 U
GGCCTTTGTGCGTTTCCAACCCACTCTACTCCCTTGCCGTCGCTTCCGTTGGTCAGGAAC
TTATTCGGAGAACAACAATGGCCACTCAAGCTGCCTCATTCACTGGCAACTTAAAGAAAG
CTGTGGCGGGTATAAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTCGTTGGCGAGTTTTTGATGCCA
AAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAGCATCTCAGATATCAACAGTGCTTCAAGCCAAAGATA
AGCCTACTTATTGTCCCAACCGCGATGATGGTGATATTTGCATTGTTCTCAATGCTAAGG
ATATCGGCATCACTGGTAGAAAGCTCACTGACAAGTTCTACCGCTGGCATACCGGATATG
TTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTGAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACTGAGGTCA
TCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTAGTAACAATTTGCGTGATGACAGAGATCGGA
AGTTGAGGATATTTGAAGGCAATGAACATCCTTTTGGAGACAAGCCACTCGAGCCATTCG
TCATGCCT*CCTCGTACAGTGAGAGAGATGCGACCGCGCGCAAGGCGAGCAATGATCC*G
TGCCCAGAAGAAGGCAGAGCAGGCAGAAAATGGTGGAGCAGAGGTTAAGAAAGGTAAGAA
GAGGACTCCTTCTCAAAGTGTAACTGCGTAGAAGAAAAGCTTTCACAGATGTTGTTGATT
CAGTCTTATTAAAGCAACGATCATAATGAAGGGCGTGGTGGATAAGCTTTGTAAGTTTTT
TTTGGTTGTTGAGTGCCAGACAATAGACACGACGGCCCTATCATAAAGCAAAGCAAAACC
CTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4C434TF U 82
AF RR4EX35TF U 1
AF RR4EX35JQ C 99
AF RR4HB40JQB C 102
BS 1 133 RR4EX35TF
BS 134 134 RR4C434TF
BS 135 327 RR4EX35TF
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BS 329 548 RR4EX35TF
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BS 668 692 RR4EX35JQ
BS 693 693 RR4HB40JQB
BS 694 843 RR4EX35JQ

RD RR4C434TF 537 0 0
CCACTCAAGCTGCCTCATTCACTGGCAACTTAAAGAAAGCTGTGGCGGGTATAAAGCGTA
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TAGCATCTCAGATATCAACAGTGCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTTCCAACC
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AGCTCACTGACAAGTTCTACCGCTGGCACACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGA
GTCTGAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCA
TGCTTCCTAGTAACAATTTGCGTGATGGCAGAGATCGGAAGTTGAGGATATTTGAAGGCA
ATGAACATCCTTTTGGGGACAAGCCACTCGAGCCATTCGTGATGCCG*CCTCGTACAGTG
AGAGAGATGCGACCCCGCACTAGGCGAGCAATGATCC*GTGCCCAGAAGAAGGC
TGA

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4EX35TF 667 0 0
GGCCTTTGTGCGTTTCCAACCCACTCTACTCCCTTGCCGTCGCTTCCGTTGGTCAGGAAC
TTATTCGGAGAACAACAATGGCCACTCAAGCTGCCTCATTCACTGGCAACTTAAAGAAAG
CTGTGGCGGGTATGAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTCGTTGGCGAGTTTTTGATGCCA
AAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAGCATCTCAGATATCAACAGTGCTTCAAGCCAAAGATA
AGCCTACTTATTGTCCCAACCGCGATGATGGTGATATTTGCATTGTTCTCAATGCTAAGG
ATATCGGCATCACTGGTAGAAAGCTCATTGACAAGTTCTACCGCTGGCATACCGGATATG
TTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTGAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACTGAGGTCA
TCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTAGTAACAATTTGCGTGATGACAGAGATCGGA
AGTTGAGGATATTTGAAGGCAATGAACATCCTTTTGGAGACAAGCCACTCGAGCCATTCG
TCATGCCTTCCTCGTACAGTGAGAGAGATGCGACCGCGCGCAAGGCGAGCAATGATCCCG
TGCCCAGAAGAAGGCAGAGCAGGCAGAAAATGGTGGAGCAGAGGTTAAGAAAGGTAAGAA
GAGGACT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EX35JQ 745 0 0
TTC
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GTGCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCCAACCGCGATGATGGTGATATTTGC
ATTGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACTGGTAGAAAGCTCATTGACAAGTTCTAC
CGCTGGCATACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTGAAAGATCAGATGGCC
AAAGACCCCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTAGTAACAATTTG
CGTGATGACAGAGATCGGAAGTTGAGGATATTTGAAGGCAATGAACATCCTTTTGGAGAC
AAGCCACTCGAGCCATTCGTCATGCCT*CCTCGTACAGTGAGAGAGATGCGACCGCGCGC
AAGGCGAGCAATGATCC*GTGCCCAGAAGAAGGCAGAGCAGGCAGAAAATGGTGGAGCAG
AGGTTAAGAAAGGTAAGAAGAGGACTCCTTCTCAAAGTGTAACTGCGTAGAGGAAAAGCT
TTCACAGATGTTGTTGATTCAGTCTTATTAAAGCAACGATCATAATGAAGGGCGTGGTGG
ATAAGCTTTGTAAGTTTTTTTTGGTTGTTGAGTGCCAGACAATAGACACGACGGCCCTAT
CATAAAGCAAAGCAAAACCCTT

QA 4 745 4 745
DS 

RD RR4HB40JQB 742 0 0
ACTGGCAACTTAAAGAAAGCTGTGGCGGGTATAAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTCGT
TGGCGAGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAGCATCTCAGATATCAACA
GTGCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCCAACCGCGATGATGGTGATATTTGC
ATTGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCGCTGGTAGAAAGCTCACTGACAAGTTCTAC
CGCTGGCATACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTGAAAGATCAGATGGCC
AAAGACCCCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTAGTAACAATTTG
CGTGATGACAGAGATCGGAAGTTGAGGATATTTGAAGGCAATGAACATCCTTTTGGGGAC
AAGCCACTCGAGCCATTCGTCATGCCT*CCTCGTACAGTGAGAGAGATGCGACCGCGCGC
AAGGCGAGCAATGATCC*GTGCCCAGAAGAAGGCAGAGCAGGCAGAAAATGGTGGAGCAG
AGGTTAAGAAAGGTAAGAAGAGGACTCCTTCTCAAAGTGTAACTGCGTAGAAGAAAAGCT
TTCACAGATGTTGTTGATTCAGTCTTATTAAAGCAACGATCATAATGAAGGGCGTGGTGG
ATAAGCTTTGTAAGTTTTTTT*GGTTGTTGAGTGCCAGACAATAGACACGACGGCCCTAT
CATAAAGCAAAGCAAAACCCTT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 4

CO CL3157Contig1 1425 4 17 U
GGATTCCCTTCTTCTCGAACCATATACACAAACATATAGACAAAAAACACACATATATAA
AGATGATATGCGAGGAGACATATCATCAACAACCACAGGGACAGATCAAGGAACATATGA
TGACGATGATGATGATGGATCCACACCAAAGTAGGAAATCACCATTATCATCGCCATCAT
CTCCATCATCATCACCTAGATCATCATCACCAAGATCACCATCATTCAATAACATTAACA
ATGAGGAGGAGAGGTTAGAAGTTGTGAATATGAGTGGGATGGCCTTAGAATCTCTCCCTA
ATCCATCAATCAACTTAGCTCAGATTTGCAAGCTTGATCTCTCCAACAATTATCTTCAGA
CCATACCAGAATCACTTACAGCAAGACTACTCAACTTAATAGCATTAGATGTTCATTCTA
ATCAGCTCAAAGCTCTTCCAAATTCCATTGGTTGTCTCTCCAAACTCAAGACCCTCAACG
TCTCTGGAAACTTTCTTGTTTCACTCCCCAAATCTATCCAGCATTGCAGGTCACTGGAAG
AACTCAATGCAAACTTCAACAAACTCATTAGATTACCAGACTCCATTGGATACGAACTCA
CCAATCTAAGAAAACTCTCTATCAACTCCAACAAGCTCATTAGCCTCCCAATCTCCATTA
CTCACCTTACTTCTCTCCGTGTCCTCGACGCTCGTCTCAACTGCCTCATGATTCTCCCTG
ATGATCTAGAGAATCTTATCAACCTCGAGATCCTCAATGTCAGCCAGAACTTTCAGTACC
TTACAGCCCTCCCCTCTTCCATTGGCCTCTTAATGAACCTCATCGAGCTTGACGTTAGCT
ACAACAAGATCACTGTCTTGCCTGAGTCCATTGGCTGCATGAGACGGCTAAGGAAACTGA
GTGTTGAGGGAAACCCACTCGTGTCCCCTCCTGCTGAGGTGATGGAGCAGAACTTGCAAG
TGGTGAGAGAGTATCTGACACAGAAAATTAATGGTACCGCACCCAGGAGTCCCAGCAAGA
AGAAGTCATGGGGGTTTGGTAAGCTAGTGAAGTATGGGACGTTCAATGGTGGATCAAGGA
GCTGGAATAGGGAAGAGAGAGAAGGGTTCATCATGCCTGAATACCGTTCTATTGACAGTC
TTACTTCACCGAGGTACTCTGGAATGTTCTCCCCTCGCCGTCTCTTTTCTCCAAGAAGTT
ATTTCAGCAGATAAAAATTCAGACAACAATACAGAGGTTCCATGTTGCTACAAGCTATAG
ATACACTATAGATACATCTGTAGCATCAAAAGCCAAAAAAGAATCCAAAATTTTCTATCA
TTTTAAAATTTCAGTATTAGTAAAATGTATAAAAAGTAACTCAATATGTTCATCAGATTC
TAGATTTCTTGTTTTTTTTTTAATTCCATATTCTTGCACCTGGTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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DS 



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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EI94TF U 1
AF RR4FX33TF U 1
AF RR4FX33JQ C 247
AF RR4EI94JQ C 397
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BS 298 298 RR4FX33TF
BS 299 459 RR4EI94TF
BS 460 460 RR4FX33TF
BS 461 728 RR4EI94TF
BS 729 748 RR4FX33TF
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BS 793 1018 RR4FX33JQ
BS 1019 1201 RR4EI94JQ

RD RR4EI94TF 728 0 0
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AGGGCAAGATCTCTGGTGGTAGTAATCCCCCTCGTGATGCTGACGATACATTTTCTGGAC
CTGGTAACGGTAGTAGTAGTAGTAGAGATGAACCTCAGACTGGTGGCTGGCTCCATAAAT
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TCAAAGAGTCTCTGTTCCCGTTCCGTGGAACTTTTACTGAGAAGACTGCCGATAAGCCTG
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TTGTGACTTGGTCCGCAGGAGTGTTCTATGGATATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTGT
ATGTTGTTCTCAAGTACTTCTCTGCGCCTTCAGGGCTTGTCCAGCTCTTCTGCCTCTACG
GCTATTCCTTGTTCATCTTCATCCCTGCATTGTGCCTGTCGGTGGTGCCAGTGGAGATCT
TTAGATGG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4FX33TF 792 0 0
GGGAGACTAACGTGAGATCGAGAAGGAAGGAGGAGGAGAGCAAGATGATGACCGGCGGGA
ACTACACGACTATCGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCTGTTCCAGATCCAG
GCCACACCACCGTCAAATTCACAGAATCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTGCTC
AGGGCAAGATCTCTGGTGGTAGTAATCCCCCTCGTGATGCTGACGATACATTTTCTGGAC
CTGGTAACGGTAGTAGTAGTAGTAGAGATGAACCTCAGACTGGTGGCTGGCTCCATAGAT
TCACTGTTGGTGCTTACAAGCCGTTCTTCGATGTCGACACTTCGGATGTTGTGGACAGAC
TCAAAGAGTCTCTGTTCCCGTTCCGTGGAACTTTTACTGAGAAGACTGCCGATAAGCCTG
ACTTGTATGGTCCGTTTTGGATATGCACGACTTTGATATCCGTGGCGGCATCTATCGGCA
CGTTTGTCACGTACGTGGCACACAAATGGAAGAAACAGGAATGGAACTACGATATCAATC
TTGTGACTTGGTCCGCAGGAGTGTTCTATGGATATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTGT
ATGTTGTTCTCAAGTACTTCTCTGCGCCTTCAGGGCTTGTCCAGCTCTTCTGCCTCTACG
GCTATTCCTTGTTCATCTTCATCCCTGCAT*GTGCCTGTCGGTGGTGCCAGTGGAGATCT
TTAGATGGGTCATCGCGGGTGTGGCAGG*TTCATGTCTGCGACATTTGTAGCTCTGAACC
TCAAAGCGCATA

QA 1 792 1 792
DS 

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ACGGTAGTAGTAGTAGTAGAGATGAACCTCAGACTGGTGGCTGGCTCCATAGATTCACTG
TTGGTGCTTACAAGCCGTTCTTCGATGTCGACACTTCGGATGTTGTGGACAGACTCAAAG
AGTCTCTGTTCCCGTTCCGTGGAACTTTTACTGAGAAGACTGCCGATAAGCCTGACTTGT
ATGGTCCGTTTTGGATATGCACGACTTTGATATCCGTGGCGGCATCTATCGGCACGTTTG
TCACGTACGTGGCACACAAATGGAAGAAACAGGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGA
CTTGGTCCGCAGGAGTGTTCTATGGATATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTGTATGTTG
TTCTCAAGTACTTCTCTGCGCCTTCAGGGCTTGTCCAGCTCTTCTGCCTCTACGGCTATT
CCTTGTTCATCTTCATCCCTGCATTGTGCCTGTCGGTGGTGCCAGTGGAGATCTTTAGAT
GGGTCATCGCGGGTGTGGCAGGGTTCATGTCTGCGACATTTGTAGCTCTGAACCTCAAAG
CGCATATCAATTCAGCTGGAGAGAGATCAATCCTGATAATCGCAAGTATATTTCTTTTGC
AGCTGGGGCTTGCGGTTGTGCTGAAGCTATATCTATTTACTGTCACCGTATGATTTTTGA
TTCATAAAGGTTTTCAGAACAAATATGATTTGATTCATAAAGGTTTTCAGAAAATTTGTT
CTTAAAACAAAAAGGTGATGTGTTTTATGATAATATATCTACAGATTCATCC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4EI94JQ 805 0 0
CTGAGAAGACTGCCGATAAGC*TGACTTGTATGGTCCGTTTTGGATATGCACGACTTTGA
TATTCGTGGCGGCATCTATCGGCACGTTTGTCACGTACGTGGCACACAAATGGAAGAAAC
AGGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCCGCAGGAGTGTTCTATGGATATG
TCACGCTTGTTCCTCTCGCGTTGTATGTTGTTCTCAAGTACTTCTCTGCGCCTTCAGGGC
TTGTCCAGCTCTTCTGCCTCTACGGCTATTCCTTGTTCATCTTCATCCCTGCATTGTGCC
TGTCGGTGGTGCCAGTGGAGATCTTTAGATGGGTCGTCGCGGGTGTGGCAGGGTTCATGT
TTGCGACATTTGTAGCTTTGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCAGCTGGAGAGAGATCAA
TCCTGATAATCGCAAGTATATTTCTTTTGCAGCTGGGGCTTGCGGTTGTGCTGAAGCTAT
ATCTATTTACTGTCACCGTATGATTTTTGATTCATAAAGGTTTTCAGAACAAATATGATT
TGATTCATAAAGGTTTTCAGAAAATTTGTTCTTAAAACAAAAAGGTGATGTGTTTTATGA
TAATATATCTACAGATTCATCCATAAACATTCTCTCAGATTTACTAAATTTTGTCAAAAA
AAAATACTTACTAATTTTTTTTGTACTGTATTAAATTTAAAGTTTACCAATTTAACAAAT
GTAACTCTTATAACTATAGCTTACCAATTTAACAAATGTAACTCTTATAACTATAACTAT
TCGTTTAAAGATCCATTTTCATACG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 3

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ATTACAACAAACAAACAACACAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGCTCAACAACATCGCGC
ACTCTTCTGTTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACATCCGAGCGGCTTCCGAGTTTGCA
GGAGAATTCGGATTAGGGTCACAGAGCAGCGACTGGATGGAGGTAAGTATAGTAGCAACA
TCATATATAGGGCTCCACTGGTTTTGCAGAATGTCCAAGCAAATACTCCCATCTGCATAA
ATATTTGGATGAAACATCCGTGACACAAAACGAACTGTTGGAGGTTTATTAGGATAATCT
TCAGAGAACTGCAGTGACAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGTGTGTCATCAGGCCCG
AATATGACAGCGTTCCAGAGCATGATGTTATTGTCTTGTGGAGCACCGCTGATACCAGCA
GGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTTGCTGGTGTCGAC
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TAAGCTGGCGATTAAAGGAAGAGGTTTTCAAGAGAACATCTGTGTGGAGGCGATGACCGA
CGGTGGGGGCCGGTTCTTGGGTTCACCGTGCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS18JQ U 1
AF RR4BS18TF C 10
AF RR4C188JQ U 38
BS 1 559 RR4BS18JQ
BS 560 560 RR4C188JQ
BS 561 692 RR4BS18JQ
BS 693 815 RR4C188JQ

RD RR4BS18JQ 692 0 0
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GATCATAAATCTCCACACACTAAAAGAGTTTTGAAAACACAAAAGACATGAATGGAAAAG
ATAAGTGAAAGTTTGTTGCTTTTAAAGGTGACATTTTGAGAGTAGGAGAGAGTTACAAAG
ATTACAACAAACAAACAACACAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGCTCAACAACATCGCGC
ACTCTTCTGTTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACATCCGAGCGGCTTCCGAGTTTGCA
GGAGAATTCGGATTAGGGTCACAGAGCAGCGACTGGATGGAGGTAAGTATAGTAGCAACA
TCATATATAGGGCTCCACTGGTTTTGCAGAATGTCCAAGCAAATACTCCCATCTGCATAA
ATATTTGGATGAAACATCCGTGACACAAAACGAACTGTTGGAGGTTTATTAGGATAATCT
TCAGAGAACTGCAGTGACAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGTGTGTCATCAGGCCCG
AATATGACAGCGTTCCAGAACATGATGTTATTGTCTTGTGGAGCACCGCTGATACCAGCA
GGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTTGCTGGTGTCGAC
ATCCTCCCTCTCTATCTAACCCGTGAAAAAAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4BS18TF 684 0 0
GACTTTGTGACCAGT*CATACACAAAGAGAGCAAGAAACAGGTTCAAGGAAGATCATAAA
TCTCCACACACTAAAAGAGTTT*GAAAACACAAAAGACATGAATGGAAAAGATAAGTGAA
AGTTTGTTGCTTTTAAAGGTGACATTTTGAGAGTAGGAGAGAGTTACAAAGATTACAACA
AACAAACAACACAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGCTCAACAACATCGCGCACTCTTCTG
TTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACATCCGAGCGGCTTCCGAGTTTGCAGGAGAATTC
GGATTAGGGTCACAGAGCAGCGACTGGATGGAGGTAAGTATAGTAGCAACATCATATATA
GGGCTCCACTGGTTTTGCAGAATGTCCAAGCAAATACTCCCATCTGCATAAATATTTGGA
TGAAACATCCGTGACACAAAACGAACTGTTGGAGGTTTATTAGGATAATCTTCAGAGAAC
TGCAGTGACAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGTGTGTCATCAGGCCCGAATATGACA
GCGTTCCAGAGCATGATGTTATTGTCTTGTGGAGCACCGCTGATACCAGCAGGTGGGTCT
TGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTTGCTGGTGTCGACATCCTCCCT
CTCTATCTAACCCGTGAAAAAAA
A

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4C188JQ 778 0 0
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CACAAAAGACATGAATGGAAAAGATAAGTGAAAGTTTGTTGCTTTTAAAGGTGACATTTT
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AGCTTTGCTCAACAACATCGCGCACTCTTCTGTTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACA
TCCGAGCGGCTTCCGAGTTTGCAGGAGAATTCGGATTAGGGTCACAGAGCAGCGACTGGA
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CCCATGGTGTGTCATCAGGCCCGAATATGACAGCGTTCCAGAGCATGATGTTATTGTCTT
GTGGAGCACCGCTGATACCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCA
ACCTCTTCCTTGCTGGTGTCGACATCCTCCCTCTCTATCTAACCCGTGAAAAAAAACAGA
TCTTGTTGTTTGTTGAGTAATAATAAGCTGGCGATTAAAGGAAGAGGTTTTCAAGAGAAC
ATCTGTGTGGAGGCGATGACCGACGGTGGGGGCCGGTTCTTGGGTTCACCGTGCGATC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

CO CL3160Contig1 1233 3 17 U
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TAAATACAGATCTTGAGTTGAGAATCTGAGTTAGAACCAAAATAAGATGAATGTGATGAC
GCCATTTACAATGAAACATTCACATATTTTATGGCTTCATCAGCATCCCTTTGATATATT
CCAAAACTCCATCCACATCAACCGTCCACGCCACTGATACTGGTGAATATCCCACCCATG
GATTGCTCCCATTCCATCTCTTGAGGCCTTGATCCATGAGAGTATGGCCAACACATATTC
CTTGAGTCTCCACCCGAACAACACCTTTCTTATATGTGAACAGATCAGGCCGTACTACAG
CCACAAAGCTGACGGGGTCATGGAGGTAAACTCCGTAAACACCATCAGATTTGACGTGCC
AATCTCTGTAAAACTTGCACATGTCACTTAATAACTTGGCGTGTTACCCCTTGGAGTCAC
GCAGGGCTAAAAGGTCATCATCAGTTAGTTGAAGTTGGGTAGTGATGTTAACCCCAAAAA
CAGTGATATCAGCACCACAAGTGAACACAACATCAGCTGCTTCCGGGTCACCATATATAT
TGGCTTCAGCTGCAGGATTGACATTCCCCAAAGCAAAGAAAGCTCCACCAAGTACAACAA
TCTTCTTCACCTTACTAGCAAATGAACTATCTCGTTTAATGGCTATTGCAAGGTTGGTTA
GAGGTCCAAGGGCGAGGATGGTGACTTCGCCAGGATGCTCAGAGACTTTCTCCACTAGAA
ACTCAGCTGCACTTTTGTCACATTTGTTTCCACTAGGAAGAGGAACAGAGACATCTCCTA
GTCCATTTTTACCGTGAACAAAATCAGCAACACGTGGGATCCCACCCTTTAAGGGTTCGG
AGCTTCCTTCAGCCACAGGAAGATCAGGGAAGCCAGCAATCTCACACAGGAGTAAGGCGT
TGCGAGTAGCATCTTGTGTAGAAACATTACCAAAGACAGTGGTGAGTCCTAATATCTCCA
GCTCCGGTGTTTGAAACGCCATCATTATCGCCATGCTATCATCGATTCCTGGGTCTGTAT
CGATAATGAGCTCCTCACGCTTAGAAGAAGCAGAGATACCCAAAACGTCGCCGTTTGAGA
TCCCACCGTTGCAAATCTCCTCCATCTCTGACGGGAAGTTAATTTTTGATTTCTCAAACT
CAGCAAATGAACTTTAAAACCCAACTGAAACCC


BQ
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AF RR4GE85JQ U 1
AF RR4CI74JQ U 2
AF RR4CI74TF C 542
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CAGTGA

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GG
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ATACAGATCTTGAGTTGAGAATCTGAGTTAGAACCAGAATAAGATGAATGTGATGACGCC
ATTTACAATGAAACATTCACATATTTTATGGCTTCATCAGCATCCCTTTGATATATTCCA
AAACTCCATCCACATCTACCGTCCACGCCACTGATACTGGTGAATATCCCACCCATGGAT
TGCTCCCATTCCATCTCTTGAGGCCTTGATCCATGAGAGTGTGGCCAACACATATTCCTT
GTGTTTCCACCCGAACAACGCCTTTCTTATATGTGAACAGATCAGGCCGTACTACAGCCA
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QA 3 708 3 708
DS 

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GATAATGAGCTCCTCACGCTTAGAAGAAGCAGAGATACCCAAAACGTCGCCGTTTGAGAT
CCCACCGTTGCAAATCTCCTCCATCTCTGACGGGAAGTTAATTTTTGATTTCTCAAACTC
AGCAAATGAACTTTAAAACCCAACTGAAACCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 2 4

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GACGTCGCTGTCAACAGTTACTACCAGAAGAAAGCTTCCTCCGGTGCCACCTGTGACTTC
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TCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCACTGGGACACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGA
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AAAAAGAACCATCACGGTTGGGCTGAGAGCCAACGGCTTTATGAGGTTGCGCAAATCGGA
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GAGATGCTCTTTTGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C723TF U 1
AF RR4C723JQ C 516
BS 1 664 RR4C723TF
BS 665 665 RR4C723JQ
BS 666 705 RR4C723TF
BS 706 917 RR4C723JQ

RD RR4C723TF 709 0 0
GCTCTGTGTCTGGTTCTCTCCATGATTACCTATTCAAATGCTGCGTATTGTGTATGCAAA
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GACGTCGCTGTCAACAGTTACTACCAGAAGAAAGCTTCCTCCGGTGCCACCTGTGACTTC
AACGGCGCCGCTGTTATCTCTACCTCCCCTCCGTCAACTGCTTCAAGCTGTTTAACTGGT
TCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCACTGGGACACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGA
ACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGTGGCTTCCCATCCACCGGGACTCCGTCAACCGGG
ACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACGGGGACTCCTTCCACTTCAACTGGCATGCCAAAC
TCTAGCACGCCAGCAAACGGAATGCCAACTTCGTCTTCATCATCCGTGTTCCCTGGTACT
ACTCTTGGACCGACCGGGAGCGGTGGATTCGCCGATCCTAACGCTGGAGAGAAGATCTCA
GTCCGAACTAACGCTGCCTTCTTCTTACTAACCGGTGTAGCTATTATGCTTGTGGTTTAG
AAAA*GAACCATCACGGTTGGGCTGAGAGCCAACGGCTTTATGAG
TTGC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4C723JQ 402 0 0
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TCCTAACGCTGGAGAGAAGATTTCAGTCCGAACTAACGCTGCCTTTTTTTTACTAACCGG
TGTAGCTATTATGCTTGTGGTTTAGAAAAAGAACCATCACGGTTGGGCTGAGAGCCAACG
GCTTTATGAGGTTGCGCAAATCGGATAGAGCTGCTATATTTTTTTTTTTTTCCGTTCACT
TTTGCCTTTGTAGGGTTTCGAACTGGAGTTTACTATTATTAGGTTTGGCCGGGAGACATC
ATGCTGGGTTAGTAGCTAGCTAGTAATATGGGATGTACAACTTAAAAGCGAGATCTTTTG
ACGTTATTTTGTAAATTCGGAGGATGAGATGCTCTTTTGTTT

QA 1 402 1 402
DS 



CO CL3161Contig2 1100 2 8 U
GGCTAGAACTCTCTCTCTCTCTCTCAAAGACACTCGTCTCAAAGGATCTCTGAAACCTAA
AAACCAAGTTGGATCTGAGCTATATTTCTTCTAATATTCTTCTATCACGACTAAAAAATC
CACGTCATGTCGGTTTTACTTACTCTGTGTCTGGTTCTCTCCATGATTACCTATTCAAAT
GCTGCGTATTGTGTATGCAAAGACGGGAACGAGCAAGTGCTTCAGAAAGCCATAGATTAC
GCATGTGGAGCAGGAGCTGACTGTTCTCAGATCCAGCAGAACGGAGCTTGTTTCCAACCT
AATACCATCAAAGCCCACTGCGACGTCGCTGTCAACAGTTACTACCGGAAGAAAGCTTCC
TCCGGTGCCACCTGTGACTTTAACGGCGCCGCTGTTATCTCTACCTCCCCTCCGTCAACT
TCAAGCTGTTTAACTGGTTCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACT
GGGACACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGT
GGCTTCCCATCCACCGGGACTCCGTCAACCGGGACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACG
GGGACTCCTTCCACTTCAACTGGCATGCCGAACTCTGGCACGCCAGCAAACGGAATGCCA
ACTTCGTCTTCATCATCCGTGTTCCCTGGTACTACTCTTGGACCGACCGGGAGCGGTGGA
TTCGCCGATCTTAACGCTGGAGAGAAGATCTCAGTCCGAACTAACGCTGCCTTCTTCTTA
CTAACCGGTGTAGCTATTATGCTTGTGGTTTAGAAGAAACATCACGGTTGGGCTGAGATT
TTGCCAACGGCTTTATGAGGTTGCGCAAATCGGATAGAGCTGCTATATCTTTTTTTTTTC
CGTTCACTTTTGCCTTTGTAGGTTTTCGAACTGGAGTTTACTATTATTAGGCTTGGCCGG
GAGACATCATGCTGGTTTAGTAGCTAGCTAGTAATATGGGATGTACAACCTAAACGCGAG
ATCTTTTGACGTTATTTTGTAGATTCGGAGGATGAGATGCTCTTTTGTTTCTTTGAATCT
TTCATCTTTTAATACGTACC


BQ
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AF RR4CG31TF U 1
AF RR4CG31JQ C 434
BS 1 669 RR4CG31TF
BS 670 670 RR4CG31JQ
BS 671 682 RR4CG31TF
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BS 684 688 RR4CG31TF
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BS 704 1100 RR4CG31JQ

RD RR4CG31TF 708 0 0
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AAACCAAGTTGGATCTGAGCTATATTTCTTCTAATATTCTTCTATCACGACTAAAAAATC
CACGTCATGTCGGTTTTACTTACTCTGTGTCTGGTTCTCTCCATGATTACCTATTCAAAT
GCTGCGTATTGTGTATGCAAAGACGGGAACGAGCAAGTGCTTCAGAAAGCCATAGATTAC
GCATGTGGAGCAGGAGCTGACTGTTCTCAGATCCAGCAGAACGGAGCTTGTTTCCAACCT
AATACCATCAAAGCCCACTGCGACGTCGCTGTCAACAGTTACTACCGGAAGAAAGCTTCC
TCCGGTGCCACCTGTGACTTTAACGGCGCCGCTGTTATCTCTACCTCCCCTCCGTCAACT
TCAAGCTGTTTAACTGGTTCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACT
GGGACACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGT
GGCTTCCCATCCACCGGGACTCCGTCAACCGGGACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACG
GGGACTCCTTCCACTTCAACTGGCATGCCGAACTCTGGCACGCCAGCAAACGGAATGCCA
ACTTCGTCT*CATCATCCGTGT*CCCTG*TACTACTCTTGGAC
GACGG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4CG31JQ 667 0 0
ACTGG
TCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCCCAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAAGCACAGGA
ACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGTGGCTTCCCATCCACCGGG
ACTCCGTCAACCGGGACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACGGGGACTCCTTCCACTTCA
ACTGGCATGCCGAACTCTGGCACGCCAGCAAACGGAATGCCAACTTCGTCTTCATCATCC
GTGTTCCCTGGTACTACTCTTGGACCGACCGGGAGCGGTGGATTCGCCGATCTTAACGCT
GGAGAGAAGATCTCAGTCCGAACTAACGCTGCCTTCTTCTTACTAACCGGTGTAGCTATT
ATGCTTGTGGTTTAGAAGAAACATCACGGTTGGGCTGAGATTTTGCCAACGGCTTTATGA
GGTTGCGCAAATCGGATAGAGCTGCTATATCTTTTTTTTTTCCGTTCACTTTTGCCTTTG
TAGGTTTTCGAACTGGAGTTTACTATTATTAGGCTTGGCCGGGAGACATCATGCTGGTTT
AGTAGCTAGCTAGTAATATGGGATGTACAACCTAAACGCGAGATCTTTTGACGTTATTTT
GTAGATTCGGAGGATGAGATGCTCTTTTGTTTCTTTGAATCTTTCATCTTTTAATACGTA
CC

QA 6 667 6 667
DS 



AS 1 4

CO CL3162Contig1 895 4 14 U
GTCATAATCAGATGGTACCACAAAACTACTCAAATGGATTTGGACAAGGGTCATCTGGTC
CTGTCTGGAATCTCCAGATTACCCAGCAACCATCTTCTCCTGCATATGGAAACCAAAACC
AACCCTTTTCACCTACCTTTAGCCCGCCAGTCTCACCTCACTATGGTGGACAAAACAACA
ATGTTTTAGCACTGCCACCACCACCATGGGAAGCTCAATCTCCAAGCTCTAGTCCTCACT
ACTCTCCTACTCACCCGATGCAAGTGACTCAAGTTGTCATCACGACACACACTCATCAAC
CGCTAGGTTACAACCCTCAAGGTGGCTCTCCTCATGCTCTCAACAACCCTCAAGGTGGCT
CTCCTTATGCTATCAACAACAACAATAACATGTTCGGTATGATCCCCTCTCCAATGACAG
GAGGCCACATGCAACCCTTCGGCCATCAGAATCCTGCTGCCATGTACGGAGGCTACGGAG
GACAACCTCAGCCACCACAACAGTATTTTGGTGAACAACAAATGTATGGAGGCTATGGAG
GGCAACCTCAGCCACCACAAGAGTTAGAACAACAAATGTATGGAATGTCACTTCGACAAT
GGAACCAGCAATGGCAACCCCTACCAAGTGTCTTCTCATCCTTCGGGTCTTAATTATCAG
CAACCAATGATGAAACCTGTGAACAAGAAACCAGAGGACAAGTTGTTTGGAGATCTTGTT
GAACTATCCAAGAACAAGGAGCCTACTGAACGAGCCGGTAGTATGTAAAACCTCACATTT
TTCACCAGTTTTTATAGAGTTTTTAAAATTTTCATGTTGACTTTATACAATTTTTAAAAA
TAATTTTGAATTATTCCTTTGTCACCAAAAGTGAATAACATCATCATTTTCATTG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B317TF U 1
AF RR4AV45TF U 1
AF RR4AV45JQ C 203
AF RR4B317JQ C 231
BS 1 685 RR4AV45TF
BS 686 686 RR4B317TF
BS 687 696 RR4AV45TF
BS 697 697 RR4B317TF
BS 698 700 RR4AV45TF
BS 701 701 RR4B317TF
BS 702 730 RR4AV45TF
BS 731 733 RR4AV45JQ
BS 734 738 RR4AV45TF
BS 739 739 RR4AV45JQ
BS 740 769 RR4AV45TF
BS 770 770 RR4AV45JQ
BS 771 781 RR4AV45TF
BS 782 895 RR4AV45JQ

RD RR4B317TF 732 0 0
GTCATAATCAGATGGTACCACAAAACTACTCAAATGGATTTGGACAAGGGTCATCTGGTC
CTGTCTGGAATCTCCAGATTACCCAGCAACCATCTTCTCCTGCATATGGAAACCAAAACC
AACCCTTTTCACCTACCTTTAGCCCGCCAGTCTCACCTCACTATGGTGGACAAAACAACA
ATGTTTTAGCACTGCCACCACCACCATGGGAAGCTCAATCTCCAAGCTCTAGTCCTCACT
ACTCTCCTACTCACCCGATGCAAGTGACTCAAGTTGTCATCACGACACACACTCATCAAC
CGCTAGGTTACAACCCTCAAGGTGGCTCTCCTCATGCTCTCAACAACCCTCAAGGTGGCT
CTCCTTATGCTATCAACAACAACAATAACATGTTCGGTATGATCCCCTCTCCAATGACAG
GAGGCCACATGCAACCCTTCGGCCATCAGAATCCTGCTGCCATGTACGGAGGCTACGGAG
GACAACCTCAGCCACCACAACAGTATTTTGGTGAACAACAAATGTATGGAGGCTATGGAG
GGCAACCTCAGCCACCACAAGAGTTAGAACAACAAATGTATGGAATGTCACTTCGACAAT
GGAACCAGCAATGGCAACCCCTACCAAGTGTCTTCTCATCCTTCGGGTCTTAATTATCAG
CAACCAATGATGAAACCTGTGAACAAGAAACCAGAGGACAAGTTGTTTGGAGATCTTGTT
GAACTATCCA
AG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4AV45TF 791 0 0
GTCATAATCAGATGGTACCACAAAACTACTCAAATGGATTTGGACAAGGGTCATCTGGTC
CTGTCTGGAATCTCCAGATTACCCAGCAACCATCTTCTCCTGCATATGGAAACCAAAACC
AACCCTTTTCACCTACCTTTAGCCCGCCAGTCTCACCTCACTATGGTGGACAAAACAACA
ATGTTTTAGCACTGCCACCACCACCATGGGAAGCTCAATCTCCAAGCTCTAGTCCTCACT
ACTCTCCTACTCACCCGATGCAAGTGACTCAAGTTGTCATCACGACACACACTCATCAAC
CGCTAGGTTACAACCCTCAAGGTGGCTCTCCTCATGCTCTCAACAACCCTCAAGGTGGCT
CTCCTTATGCTATCAACAACAACAATAACATGTTCGGTATGATCCCCTCTCCAATGACAG
GAGGCCACATGCAACCCTTCGGCCATCAGAATCCTGCTGCCATGTACGGAGGCTACGGAG
GACAACCTCAGCCACCACAACAGTATTTTGGTGAACAACAAATGTATGGAGGCTATGGAG
GGCAACCTCAGCCACCACAAGAGTTAGAACAACAAATGTATGGAATGTCACTTCGACAAT
GGAACCAGCAATGGCAACCCCTACCAAGTGTCTTCTCATCCTTCGGGTCTTAATTATCAG
CAACCAATGATGAAACCTGTGAACA*GAAACCAGAG*ACA*GTTGTTTGGAGATCTTGTT
GAACTATCCAG**ACAAG*AGCCTACTGAACGAGCCGGTAGTATGTAAA*CCTCACATTT
T
CACAGTTTTT

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AV45JQ 693 0 0
ACCATGGGAAGCTCAATCTCCAAGCTCTAGTCCTCACTACTCTCCTACTCACCCGATGCA
AGTGACTCAAGTTGTCATCACGACACACACTCATCAACCGCTAGGTTACAACCCTCAAGG
TGGCTCTCCTCATGCTCTCAACAACCCTCAAGGTGGCTCTCCTTATGCTATCAACAACAA
CAATAACATGTTCGGTATGATCCCCTCTCCAATGACAGGAGGCCACATGCAACCCTTCGG
CCATCAGAATCCTGCTGCCATGTACGGAGGCTACGGAGGACAACCTCAGCCACCACAACA
GTATTTTGGTGAACAACAAATGTATGGAGGCTATGGAGGGCAACCTCAGCCACCACAAGA
GTTAGAACAACAAATGTATGGAATGTCACTTCGACAATGGAACCAGCAATGGCAACCCCT
ACCAAGTGTCTTCTCATCCTTCGGGTTTTAATTATCAGCAACCAATGATGAAACCTGTGA
ACAAGAAACCAGAGGACAAGTTGTTTGGAGATCTTGTTGAACTATCCAAGAACAAGGAGC
CTACTGAACGAGCCGGTAGTATGTAAAACCTCACATTTTTCACCAGTTTTTATAGAGTTT
TTAAAATTTTCATGTTGACTTTATACAATTTTTAAAAATAATTTTGAATTATTCCTTTGT
CACCAAAAGTGAATAACATCATCATTTTCATTG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4B317JQ 665 0 0
AGTCCTCACTACTCTCCTACTCACCCGATGCAAGTGACTCAAGTTGTCATCACGACACAC
ACTCATCAACCGCTAGGTTACAACCCTCAAGGTGGCTCTCCTCATGCTCTCAACAACCCT
CAAGGTGGCTCTCCTTATGCTATCAACAACAACAATAACATGTTCGGTATGATCCCCTCT
CCAATGACAGGAGGCCACATGCAACCCTTCGGCCATCAGAATCCTGCTGCCATGTACGGA
GGCTACGGAGGACAACCTCAGCCACCACAACAGTATTTTGGTGAACAACAAATGTATGGA
GGCTATGGAGGGCAACCTCAGCCACCACAAGAGTTAGAACAACAAATGTATGGAATGTCA
CTTCGACAATGGAACCAGCAATGGCAACCCCTACCAAGTGTTTTTTCATCCTTCGGGTTT
TAATTATCAGCAACCAATGATGAAACCTGTGAACAAGAAACCAGAGGACAAGTTGTTTGG
AGATCTTGTTGAACTATCCAAGAACAAGGAGCCTACTGAACGAGCCGGTAGTATGTAAAA
CCTCACATTTTTCACCAGTTTTTATAGAGTTTTTAAAATTTTCATGTTGACTTTATACAA
TTTTTAAAAATAATTTTGAATTATTCCTTTGTCACCAAAAGTGAATAACATCATCATTTT
CATTG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL3163Contig1 1094 2 4 U
GGGAGGACACTGTCGCCGTGTGTGGAAAAACATTCTCATTCTCTCTCTTCTTCCTCCATG
AATCTCCTCAAAACGATTCATCACCAGTCCACTCTCACTCAATTTTACCATTTCGCCACT
ACACACTCCTTCGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTGTTGTCACTCTCTCCACAACGACCCAGA
ATCTCTCTCGTTTCTACCTCCAACCGAACCTCCTTCGCACTCTCGAGCATCTCAAGCACC
AGAGCTTCGTTCTCAGGTAATCAAGAGGATGATGGGAAGAGAGAAGAATCTGGAGATGAG
TTGGTTTACCAGAAGACGCTGAGGCTGGTGGAATGCGCCATGTTCGCCGCCGTCACGGGA
CTCGTTTACTTCCTCAGCAACTCTCTCGCCATCGAGAACTTCTTTGGGTGTTTCTTCGCG
TTGCCAATAGTGATCTCCTCGATAAGATGGAACATCGCAGGCGGCAGGAAGACAATGGTT
GCTACCGTCATGCTCTTTTTCATATTATCAGGTCCGGTCAAAGCTTTAACTTACTTTCTT
ATGCATGGTCTTCTGGGGCTTGCAATTGGTTCATTGTGGAGAATGAAGGCAAGCTGGCGT
CTCTCCATTTTCTTGTGCACAATGGTCCGAGCATTGGGTCTCATAGGATATGTTCTGACA
TCATCCTTCCTAATAAGAGAAAACATTCTTGCTGTGATCACAATTAACATCCACGCCTCA
CTCTCCTATGTTTTCACCGCAATGGGCCTGAACCTAATGCCTTCCATGAGCCTCATCTAT
ATGATATTTGGAACAGTGCTGTTGCTAAACAGTGGATTCTTTGTGCTGTTGCTGCATATC
CTCTACTCAATCTTCCTCACAAGACTTGGGATGAAATCTGAATTGAGGTTACCTGCCTGG
TTAGACAAAGCAATATGATGGTATTCACAGGATCCACACAGAAACAGAAAGCAGAGTTGG
TGGTAGATTTTGTGTAGAGCATCTCTGGTGGAGCATATTTTTGTAAAACTTGTAGTGCTG
ACGGGCAAATCCAAACCCCAAACAAAAATTTGTTTATAATCTGATCAGTACTGTAATTTT
CATATCAAACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC25TF U 1
AF RR4AX81JQ C 573
BS 1 581 RR4DC25TF
BS 582 582 RR4AX81JQ
BS 583 704 RR4DC25TF
BS 705 1094 RR4AX81JQ

RD RR4DC25TF 708 0 0
GGGAGGACACTGTCGCCGTGTGTGGAAAAACATTCTCATTCTCTCTCTTCTTCCTCCATG
AATCTCCTCAAAACGATTCATCACCAGTCCACTCTCACTCAATTTTACCATTTCGCCACT
ACACACTCCTTCGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTGTTGTCACTCTCTCCACAACGACCCAGA
ATCTCTCTCGTTTCTACCTCCAACCGAACCTCCTTCGCACTCTCGAGCATCTCAAGCACC
AGAGCTTCGTTCTCAGGTAATCAAGAGGATGATGGGAAGAGAGAAGAATCTGGAGATGAG
TTGGTTTACCAGAAGACGCTGAGGCTGGTGGAATGCGCCATGTTCGCCGCCGTCACGGGA
CTCGTTTACTTCCTCAGCAACTCTCTCGCCATCGAGAACTTCTTTGGGTGTTTCTTCGCG
TTGCCAATAGTGATCTCCTCGATAAGATGGAACATCGCAGGCGGCAGGAAGACAATGGTT
GCTACCGTCATGCTCTTTTTCATATTATCAGGTCCGGTCAAAGCTTTAACTTACTTTCTT
ATGCATGGTCTTCTGGGGCTTGCAATTGGTTCATTGTGGAGGATGAAGGCAAGCTGGCGT
CTCTCCATTTTCTTGTGCACAATGGTCCGAGCATTGGGTCTCATAGGATATGTTCTGACA
TCATCCTTCCTAATAAGAGAAAACATTCTTGCTGTGATCACAAT
CAAC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4AX81JQ 522 0 0
ATTGTGGAGAATGAAGGCAAGCTGGCGTCTCTCCATTTTCTTGTGCACAATGGTCCGAGC
ATTGGGTCTCATAGGATATGTTCTGACATCATCCTTCCTAATCAGAGAAAACATTCTTGC
TGTGATCACAATTAACATCCACGCCTCACTCTCCTATGTTTTCACCGCAATGGGCCTGAA
CCTAATGCCTTCCATGAGCCTCATCTATATGATATTTGGAACAGTGCTGTTGCTAAACAG
TGGATTCTTTGTGCTGTTGCTGCATATCCTCTACTCAATCTTCCTCACAAGACTTGGGAT
GAAATCTGAATTGAGGTTACCTGCCTGGTTAGACAAAGCAATATGATGGTATTCACAGGA
TCCACACAGAAACAGAAAGCAGAGTTGGTGGTAGATTTTGTGTAGAGCATCTCTGGTGGA
GCATATTTTTGTAAAACTTGTAGTGCTGACGGGCAAATCCAAACCCCAAACAAAAATTTG
TTTATAATCTGATCAGTACTGTAATTTTCATATCAAACACCC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 4

CO CL3164Contig1 1189 4 7 U
GGTCTCAGGATAAATCATGGAGGGTGCGCTACATGGTTGCTAATCAGCTATACGAACTTT
GCGAGGCAGTGGGTCCTGATTGCACCAAGACGGATTTGGTTCCTGCATATGTGAGATTGC
TACGTGACAATGAGGCTGAAGTGCGTATAGCAGCAGCGGGAAAAGTGACTAAGTTCTGTC
AGCTTTTGAATCCAGAGCTTGCCATCCAGCACATCCTTCCTTGTGTGAAGGAATTATCAT
CTGATTCTTCTCAACATGTCCGATCTGCTCTAGCTTCAGTAATAATGGGGATGGCTCCTA
TCCTTGGCAAGGATTCAACCATTGAGCATCTGCTACCAATTTTTCTTTCCCTTTTGAAAG
ATGAGTTTCCTGATGTACGACTCAACATCATAAGCAAGCTAGATCAAGTCAACCAGGTTA
TTGGAATCGATCTGCTATCACAGTCCTTGTTGCCTGCGATTGTTGAGCTTGCTGAGGATC
GGCACTGGAGAGTCCGGCTTGCTATAATTGAGTACGTTCCTCTGTTGGCTAGCCAGTTAG
GTATAGGGTTCTTCGATGACAAGCTCGGAGCCCTTTGCATGCAATGGATGCAAGACAAGG
TCTACTCTATCCGTGAAGCTGCAGCAAACAACTTAAAGCGCCTTGCAGAGGAGTTTGGTT
CTAAATGGGCAATGCAGCACATAGTTCCCCAGGTGTTGGACATGGTCAACAATCCGCACT
ACCTACATAGGATGATGGCTCTACGTGCAATCTCTCTCATGGCTCCTGTAATGGGATCAG
AAATCACGTGCTCTAAGTTTCTTCCTGTGGTGGTTGAGGCATCCAAAGACAGAGTTCCAA
ACATCAAGTTCGATGTTGCTAAGCTTCTGCAATCCCTCATCCCCATAGTCGACCAATCAG
TGGTTGATAAAACAATCCGTCAGTGTTTGGTGGACCTGAGCGAGGACCCTGATGTCGATG
TTCGCTATTTTGCAAACCAAGCGCTTCGTTCCATTGATGCTGCCGCAGTGGCGCAATCCT
GAATGTTTCAAATGTTTTTAACGATAAATAATCTTCAATCCTGAATATTTTTTCGTCATG
TTTCTCACTATATGTGTTCTCTTCTTTGATTTGTTTGTCTAAAACGCCATTTTGGTTGAT
GGTTGTGAACTGCATTTGTCGTATTTTAGTAAAATTGTTTTCATTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A625TF U 1
AF RR4B949JQ C 345
AF RR4B949TF U 345
AF RR4A625JQ C 354
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BS 632 662 RR4A625TF
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BS 815 1108 RR4B949TF
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AGCTTTTGAATCCAGAGCTTGCCATCCAGCACATCCTTCCTTGTGTGAAGGAATTATCAT
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TCCTTGGCAAGGATTCAACCATTGAGCATCTGCTACCAATTTTTCTTTCCCTTTTGAAAG
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GGCACTGGAGAGTCCGGCTTGCTATAATTGAGTACGTTCCTCTGTTGGCTAGCCAGTTAG
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TCTACTCTATCCGTGAAGCTGCAGCAAACAGCTTAAAGCGCCTTGCAGAGGAGTTTGGTT
CTGAATGGGCAATGCAGCACATAGTTCCCCAGGTGTTGGACATGGTCAACAATCCGCACT
ACCTACATAGGATGATGGCTCTACGTGCAATCTCTCTCATGGCTCCTGTAATGGGATCAG
AAATCACGTGCTCTAAGTTTCTTCCTGTGGTGGT

QA 1 814 1 814
DS 

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TTGGCTAGCCAGTTAGGTATAGGGTTCTTCGATGACAAGCTCGGAGCCCTTTGCATGCAA
TGGATGCAAGACAAGGTCTACTCTATCCGTGAAGCTGCAGCAAACAACTTAAAGCGCCTT
GCAGAGGAGTTTGGTTCTAAATGGGCAATGCAGCACATAGTTCCCCAGGTGTTGGACATG
GTCAACAATCCGCACTACCTACATAGGATGATGGCTCTACGTGCAATCTCTCTCATGGCT
CCTGTAATGGGATCAGAAATCACGTGCTCTAAGTTTCTTCCTGTGGTGGTTGAGGCATCC
AAAGACAGAGTTCCAAACATCAAGTTCGATGTTGCTAAGCTTCTGCAATCCCTCATCCCC
ATAGTCGACCAATCAGTGGTTGATAAAACAATCCGTCAGTGTTTGGTGGACCTGAGCGAG
GACCCTGATGTCGATGTTCGCTATTTTGCAAACCAAGCGCTTCGTTCCATTGATGCTGCC
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ATATTTTTTCGTCATGTTTCTCACTATATGTGTTCTCTTCTTTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4B949TF 764 0 0
CTTTCCCTTTTGAAAGATGAGTTTCCTGATGTACGACTCAACATCATAAGCAAGCTAGAT
CAAGTCAACCAGGTTATTGGAATCGATCTGCTATCACAGTCCTTGTTGCCTGCGATTGTT
GAGCTTGCTGAGGATCGGCACTGGAGAGTCCGGCTTGCTATAATTGGGTACGTTCCTCTG
TTGGCTAGCCAGTTAGGTATAGGGTTCTTCGATGACAAGCTCGGAGCCCTTTGCATGCAA
TGGATGCAAGACAAGGTCTACTCTATCCGTGAAGCTGCAGCAAACAACTTAAAGCGCCTT
GCAGAGGAGTTTGGTTCTAAATGGGCAATGCAGCACATAGTTCCCCAGGTGTTGGACATG
GTCAACAATCCGCACTACCTACATAGGATGATGGCTCTACGTGCAATCTCTCTCATGGCT
CCTGTAATGGGATCAGAAATCACGTGCTCTAAGTTTCTTCCTGTGGTGGTTGAGGCATCC
AAAGACAGAGTTCCAAACATCAAGTTCGATGTTGCTAAGCTTCTGCAATCCCTCATCCCC
ATAGTCGACCAATCAGTGGTTGATAAAACAATCCGTCAGTGTTTGGTGGACCTGAGCGAG
GACCCTGATGTCGATGTTCGCTATTTTGCAAACCAAGCGCTTCGTTCCATTGATGCTGCC
GCAGTGGCGCAATCCTGAATGTTTCAAATGTTTTTAACGATAAATAATCTTCAATCCTGA
ATATTTTTTCGTCATGTTTCTCACTATATGTGTTCTCTTCTTTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4A625JQ 836 0 0
TTGAAAGATGAGTTTC*TGATGTACGACTCAACATCATAAGCAAGCTAGATCAAGTCAAC
CAGGTTATTGGAATCGATCTGCTATCACAGTCCTTGTTGCCTGCGATTGTTGAGCTTGCT
GAGGATCGGCACTGGAGAGTCCGGCTTGCTATAATTGAGTACGTTCCTCTGTTGGCTAGC
CAGTTAGGTATAGGGTTCTTCGATGACAAGCTCGGAGCCCTTTGCATGCAATGGATGCAA
GACAAGGTCTACTCTATCCGTGAAGCTGCAGCAAACAGCTTAAAGCGCCTTGCAGAGGAG
TTTGGTTCTGAATGGGCAATGCAGCACATAGTTCCCCAGGTGTTGGACATGGTCAACAAT
CCGCACTACCTACATAGGATGATGGCTCTACGTGCAATCTCTCTCATGGCTCCTGTAATG
GGATCAGAAATCACGTGCTCTAAGTTTCTTCCTGTGGTGGTTGAGGCATCCAAAGACAGA
GTTCCAAACATCAAGTTCAATGTTGCTAAGCTTCTGCAATCCCTCATCCCCATAGTCGAC
CAATCAGTGGTTGATAAAACAATCTGTCAGTGTTTGGTGGACCTGAGCGAGGACCCTGAT
GTCGATGTTCGCTATTTTGCAAACCAAGCGCTTCGTTCCATTGATGCTGCCGCAGTGGCG
CAATCCTGAATGTTTCAAATGTTTTTAACGATAAATAATCTTCAATCCTGAATATTTTTT
CGTCATGTTTCTCACTATATGTGTTCTCTTCTTTGATTTGTTTGTCTAAAACGCCATTTT
GGTTGATGGTTGTGAACTGCATTTGTCGTATTTTAGTAAAATTGTTTTCATTTGTT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL3165Contig1 834 2 2 U
ATTCAATCAACACTGCCAAGGTAAAACAAGGCTGAAGTACGAGATGAAATCGTACCAGGA
GTATGTTGTGAAAGAGCTGAGGCAGATCGCTGAAGACAATCAGCAGCTAAACTGGTTCAA
GAACAAGCTGACAAAACAGAACAAGCACGCCAAGGTGCTTGAGGAGTCTCTGGGAATATT
GAGCGAGAAGCTGCGTAAGACTGCAGAAGATAACCGTATCGTGAGACAGAGAACAAAGAT
GCAGCATGAGCAGAACAGAGAAGAGATGGATTCACAAGACAAGTTTTTCAAAGAGTCCAT
CAAGCAGATACATGAGAAAAGAGATGCAAAGGAAGAGAACTTCGAGATGCTGCAGCAGCA
GGAGCGTGCTAAAGTGGTTTTGCGAAAGAGAGCTGAAGAAGTGTCCAGCTTCATAGAATG
TCAAGAGAAGGAGATGAAAGAGTTTGTGGAGGAGAGGGAGAAGCTGATAGAAGAGCAGGA
GAAGAAGATGGCAGACTGGAAGAAGAAGTACTTCGAGGGGATGCTTGATCTAGAGAGGGA
GTTTGACAAGGCGTTGTAGCAGCTCATGAGCAAGCACGGCCTCCACGATGCAGATGACAC
AGAAGACTACTAGCTTGGCGAGATTGGAGCAAAGACTATTCTCATTCTCAGCAGAGATAA
TAATAATCTAAAGAGATTTTAAGACACTATTATTATTCTCCATTTTCAGTAAGTCGGCTA
AGGAAGAAGTATTTTGTGACCAAAAGGGGATGTATTCAACTGAGAGTTTCAGGTGATTTG
TATTAAAATGACAAATCCACTGTTTTTCAAACATGAATTTTAAAAACTCATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TCC


BQ
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CTTCTCCATGCGTTTGGAGAAGATGCATCTCCAAAAGTGCGGGAAACTGAAGACCTTATG
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TGCGGGAAACTGAAGACCTTATGGCGACGAAGAAACAAGTGGTGAGAAAGAAAGACAAGG
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AAGCCTACGGAGCATTCAGCGATGCAATACAGGTAATACTTGATGAGACAAAAGGTAAGA
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GCTATATACACATATAACACAAGGATCACCTTTAATAGC

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C
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C
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CCCATCAAGCCCACTTTCTTGTTACAGCTCAAGCACCTCGTCTTGGCGCTAGTCCGTGGA
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TCTGTTTCCGTGCGAGTCGAAATTAACTTTATTTCC

QA 2 757 2 757
DS 



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CTTTCAACCTCCCAGCCTTGTTGACCGGACTATCCAAAATCATCAAAAGAGCCTGATGAG
TGATGTCTGGCCTGTAATGAGCAGGATCTCTTCCATTCTTCCTCAAGAAATTAGCATGAT
CATCAGAGTTTAGTAGCTGGTAAGTCTTTCCAACTTGGGCAACTTCGAGAGAAGCCTTCT
CAAGCACAAAAATAACACCAGTCTGGTCCTTCTTATTACCAGACACGACAATAGGTATTC
C


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AL44JQ U 1
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DS 

RD RR4CW51JQ 779 0 0
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TATTCC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4CW51TF 731 0 0
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ATAGGTATTCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

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GAAAGATAAAGTGGAAAAAAGTTTGAGAAATCAAATTGTGATGTATTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D531JQ U 1
AF RR4DJ93JQ U 1
AF RR4DJ93TF C 530
BS 1 293 RR4D531JQ
BS 294 732 RR4DJ93JQ
BS 733 1311 RR4DJ93TF

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CTTAGGATCATCACATATCATATACTTCTTAACTCCCTTTTCATCCACACTTC

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR4DJ93JQ 732 0 0
GGACAGGTTTAAAATAGTTTTATTTAGTGGCAAAGACTTTTAACACAGAACATATAAACA
CAAAATGAATGAAGTGATACTGAACAAACAACTGAGCTTTAGAGGAAGAACCCTAAAAGT
GTTTTTGTTTCTTCCTCCTCACGCTTTCATAAAAGAGGCTGTAAGACTTTCGTGTAAAAC
AGAGTAAACCGATCTCCATCCTTCTTCTGTAGGGTGACTATCATCCCAAAAGAAGGCAGA
CTTAGGATCATCACATATCATATACTTCTTAACTCCCTTTTCATCCACACTTCCACAGAA
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TGGATTTGCTCCTTTGTTGTTGAAGACGTTCAAGAAAGCGTTGTAAAGATCAATGATGAT
GAAAGTGGACTGTTTGATTTCGTTATTGAGCTTTACCACGGCTTGTTGCAACAAGCTGTT
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GACGAGCGCGAC

QA 1 732 1 732
DS 

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ATGTTCTTGAAGAAATCGATTTGAGTGGTCATATTCGGCAATGGAACTTGAGTGTTGAAC
ACTCCTGTTCCTCCGTACGCAAAGTTCATTCCGTACTGTAAACGTTTCTTTCCCGCGTAA
TTTTTCCAGAAGTTTGGGATTGGTGATTTTATCCCCACGAATTTTGCTAGAAAATCAGTG
GCGACGCGGCCATCGGAAAAACGGCCAGCGGGTTTACCGGGGAAAGTGATACCGTAAGGA
AATTTCCAAGAACTAGAGAGAGACTTCTTAATGTTCCCTGTGTCTGCATAAGAGTCTCCG
AACACAAACAGCTTCGTTGGTCTGAATCCGTACAAACGATGATTCTTTTCTGAGCCCTCA
ACTCCATTAATTTCAGCAAAAAGTGGAGAAGTGAATAGAACTCCATAGAGGCATAAAAAG
AGTTTGATCAAAGAATCCATTTTCAAGATTTCAGAGCAAAGACTTCTCTTTATTGAGAAA
GAGAAAGATAAAGTGGAAAAAAGTTTGAGAAATCAAATTGTGATGTATTCTCC

QA 10 782 10 782
DS 



AS 1 4

CO CL3169Contig1 771 4 4 U
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TATCAAGGTCTAATCTTATGTGTTTATTACATTTATGCTGTATACTCCAGAACATGTTCT
TATATTTCTTGATAGGTAATCTCAACCAAGAACGCCGTATAAATGGGGAAAAAGAGTAAC
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AAAAAAAGAGTTGTCTCATAAATCATCGATGCCTCTAGCCACTTCCATCGAGTTGACCTT
GAGAAAGAAGGTGAGCCATGTATTGAGAGTGGTAAACGTATGGAGACTTTCCCTGGCGCT
CAAAATGCTTAGCCATTATGCAGAACTCGACAGGACCCCAATCCTCCGATTCATAGCAAT
TCCCAAGCGCCGCTTTGTACAGCTTAGCTGTGTCGGTCAGAAGTTCAGTGCCGGCAGGGT
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BQ
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AF RR4EY07JQ U 5
AF RR4F702JQ U 5
AF RR4EY07TF C 1
AF RR4F702TF C 9
BS 1 4 RR4EY07TF
BS 5 682 RR4EY07JQ
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RD RR4EY07JQ 678 0 0
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QA 1 678 1 678
DS 

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AAGGTCTAATCTTATGTGTTTATTACATTTATGCTGTATACTCCAGAACATGTTCTTATA
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AAAGTTCCAGATACCCGAGCTCGACTTTGCAATAACAAGATTAGGTACACAGCTGAAAAA
AAAGAGTTGTCTCATAAATCATCGATGCCTCTAGCCACTTCCATCGAGTTGACCTTGAGA
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ATGCTTAGCCATTATGCAGAACTCGACAGGACCCCAATCCTCCGATTCATAGCAATTCCC
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GATCTTTATAATCTCATTGCAAACATCCAATATCATCATCTTCATCCTAGAAACCCCAAC
TCACTCAAACCGAGTCAGATCAGAAACCTGTGGAAACTCTC

QA 1 701 1 701
DS 

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TATATTTCTTGATAGGTAATCTCAACCAAGAACGCCGTATAAATGGGGAAAAAGAGTAAC
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AGAATGTGAGGGCGGCAGTGAAGCAGTAGAATCCAGCGTAAGAGACAACCCGTCTTAGCT
TCTGGATCTTTATAATCTCATTGCAAACATCCAATATCATCATCTTCATCCTAGAAACCC
CAACTCACTCAAACCGAGTCAGATCAGAAACCTGTGGAAACTCTCTCAGGTATTATATCG
AACACCTTGTGATCACTTCCAACAAACATAAGCACGTCTTCCGACAAGTCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4F702TF 763 0 0
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TCTAATCTTATGTGTTTATTACATTTATGCTGTATACTCCAGAACATGTTCTTATATTTC
TTGATAGGTAATCTCAACCAAGAACGCCGTATAAATGGGGAAAAAGAGTAACGAACAAAG
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AGGGCGGCAGTGAAGCAGTAGAATCCAGCGTAAGAGACAACCCGTCTTAGCTTCTGGATC
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GTGATCACTTCCAACAAACATAAGCACGTCTTCCGACAAGTCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

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GTTGTATTCCACTTTCTAAGTTTCAGATTTTATGTATTTGCAGATTTTAAATATGTATTA
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX05TF U 1
AF RR4GM49TF U 1
AF RR4GM49JQ C 159
AF RR4FX05JQ C 670
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TGAATCTGTGGTGGGTCTCTTCGTTTTCTTCATTAAGAGAAACCTCTTTCTCTCTTTTAG
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TCTCTCCGGTGACCTCTCTCTCTCCGACGACCTCTCTCTCTCTCGCTCAGGATGGATTTA
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GG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GM49TF 738 0 0
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TGAATCTGTGGTGGGTCTCTTCGTTTTCTTCATTAAGAGAAACCTCTTTCTCTCTTTTAG
TCTCTGGCGCCTTCTCTCTCTTTCTCAGTCTCTCTCAGGCGCTCTCTCTCCGACAACCTC
TCTCTCCGGTGACCTCTCTCTCTCCGGCGACCTCTCTCTCTCTCGCTCAGGATGGATTTA
GAGAGTCTCAACACAATTGCAATCCTTGATGCTCAAAGAGAGTACATGGACATGAATGAA
GAAGATGGCTTGAATGAAGAAGATGCTTTGAATGAGGAAAATGAGGAAAATGCGATGAGA
GAAGGAGAAACAGAAATGCAAGAACCAGAACAAGGTGACACACAAGCTGCTGGAACAACT
CAAGCGACACAACCACAAGGTCGACAACCACGTAAGAGACGTTTAACTTCTAAAGTCTGG
GAGGATTTTACATCTGTTGGGGTTGAAAGTGATGGCAAGGAAAGAGGTCAGTGTAACTAT
TGTGGTAAAAAGCTAGTGATCAATACTAGAACACATGGTACACATCACTTGAGTCGCCAT
TTAGACACTTGTCCAGAAAAGCCTAAAGCGGTAGATAGGCCTGCATATGATCATCAGATT
GATAGAAAGATGACTAGCGAGATCATTATCTATCATGATTTGCCATTTAGATATGCTGAG
TATGAGAAGGT
AGAGCTA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4GM49JQ 663 0 0
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TCTCTCGCTCAGGATGGATTTAGAGAGTCTCAACACAATTGCAATCCTTGATGCTCAAAG
AGAGTACATGGACATGAATGAAGAAGATGGCTTGAATGAAGAAGATGCTTTGAATGAGGA
AAATGAGGAAAATGCGATGAGAGAAGGAGAAACAGAAATGCAAGAACCAGAACAAGGTGA
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ACGTTTAACTTCTAAAGTCTGGGAGGATTTTACATCTGTTGGGGTTGAAAGTGATGGCAA
GGAAAGAGGTCAGTGTAACTATTGTGGTAAAAAGCTAGTGATCAATACTAGAACACATGG
TACACATCACTTGAGTCGCCATTTAGACACTTGTCCAGAAAAGCCTAAAGCGGTAGATAG
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TTTGCCATTTAGATATGCTGAGTATGAGAAGGTTAGAGCTAGGGATTTGTATCTCAATCC
GGATTGTAAACCAATATGTAGACAAACTGCTGTCGCTGATGTCTTTAGAAGGTATGAAAT
AG
G

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4FX05JQ 788 0 0
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GTCGCTGATGTCTTTAGAAGGTATGAAATAGAAAAGGAAAAGCTTAGGAATGTGTTTGCA
AAGCATCAGGGTAGAGTTTGCTTTACTTCTGATTTGTGGGTAGCTCGTCCCACTACCATG
GGTTATCTCTGTCTGACTGCCTCGTTCATCGATGATGACTGGAGGTTGAACAATAAGGTC
TTAGCCTTCTGTGTTGTGAGGTGTCCACACACTGGTGGGGAACTTGCTAGCACGATCATT
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ATAGTGAAAGATGGGTTAGAGTTAGCAAAGAACCTTTTACATGACATTAGGGAAAGTGTC
AGGTACGTAAAGGCATCTCCACAAAGGATACAGTCCTTTGCTTTGTTTCTATCTAGGTCT
GGTCGTTAAATTTCAGACACAAGCTTTACGTACTTTCAGATTCTATGGTTTGTTGTATTC
CACTTTCTAAGTTTCAGATTTTATGTATTTGCAGATTTTAAATATGTATTAAATAAACTG
CAGATTTT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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AAGCCAGTGCACAAGGCTTGAAAGTAGGCTTCTACAGCAAAACATGCCCACATGCCGAGG
GTATTGTTAGAAAGGTCGTGTTCGCTGCGATGAAGAAAGCTCCTACACTTGGTGCTCCTT
TGCTTAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTTGTTCGGGGATGTGATGGATCAGTTTTGTTAG
ATTCATCGAACAATCAAGCCGAGAAGAATGCGGTTCCTAACCTAAGCCTTCGAGGGTTTG
GCATCATAGACGATTCCAAGGCGGCTCTAGAAAAAGTGTGTCCTGGCGTAGTTTCTTGCT
CTGATATCTTAGCCCTTATTGCTAGGGACGCAATGGTTGCACTTGAAGGACCAACATGGG
AAGTAGAAACGGGAAGAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTTGCCAT
CACCTTTTGATAACATCGCCAAGCTTATCACCGATTTTAGCACAAAGGGACTCAACGAGA
AAGATCTAGTCGTTCTTTCAGGTGGACACACTATTGGAATGGGACATTGTCCTCTGATGA
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ATCCGGGAAGTTTCAAGACATTCGACGTGAGCTACTTCAAGCTAGTGGCAAAGAGAAGAG
GGCTTTTCCAGTCGGATGCTGCTCTGTTGGACAACTCAAAGACTAGGGCTTATGTCTTGC
AGCAGGCACGTGGGTCAACCTTCTTTCATGACTTTGGTGTCTCAATGGTGAAAATGGGTC
GGATCGGGGTTCTTACTGGTCGTGCCGGGGAGATTCGTAAAATGTGTCGCGTTCCTAATT
AAAGAGATTATAAAAGAATGAAAACATATCTCTAGCCGAGTTTGATTCTTGTTGTGGTTT
GCTTCTATATGTGATTGTTGGGAATATGCTGTATTTAATATGTCAAACAAATAAGCCTTG
TAAGTTGTACCTTTTTTTAAAAAAGGAAATTGGATTGTTCTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AC32TF U 1
AF RR4AC32JQ C 439
BS 1 724 RR4AC32TF
BS 725 1185 RR4AC32JQ

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ACGC
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TTGCT
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TTTCATGACTTTGGTGTCTCAATGGTGAAAATGGGTCGGATCGGGGTTCTTACTGGTCGT
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ATATGCTGTATTTAATATGTCAAACAAATAAGCCTTGTAAGTTGTACCTTTTTTTAAAAA
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QA 6 747 6 747
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AS 1 4

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AAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTGAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAAATGTTC
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TGCTCAGAACCTTTGATGTGAGGAATGATTTGTACTCTTTTATTTTGCACTGTTTGCAGT
TCACAGTTTGTTTTTGCC


BQ
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AF RR4BR19TF U 1
AF RR4CK54TF U 4
AF RR4BR19JQ C 191
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GTTTGCATATCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAGCTTGCTAGC
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TCTGGTCCCAACGATGAATCCCCAGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAGTGGCGAGAGAAG
AGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTGAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAAATGTTCTGA
TCAAATTTTAACTTCATAGCTCTAAAGAGAGTTTCCATCGAACTGTCAAGACACAACCCG
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AGAA*CTGGCTATATCATAATGATAAAAAAA

QA 1 751 1 751
DS 

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AAGGAGGATTCTTTAACGCTATCATGACCTTCCCGCAGAACTATCCTAATAGCCCACCAA
GCGTGAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGCCGTGTTTGCA
TATCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCT
GGACCCCTGTTCATACTGTTGAAAGTATTATGTTGAGTATTATATCTATGCTCTCTGGTC
CCAACGATGAATCCCCAGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAGTGGCGAGAGAAGAGAGACG
AGTTCAAGAAGAAAGTGAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAAATGTTCTGATCAAATT
TTAACTTCATAGCTCTAAAGAGAGTTTCCATCGAACTGTCAAGACACAACCCGGTTTACA
TCTTCTTTTCGCTGCGTTCGAGAATCAGAGCGTTCTGAAAAGTCTTGTTCTTGAGAAACT
GGCTATATCATAATGATAAAAAAAATTTAATCGTTTAAGAATGCTTTCTTTGCTCAGAAC
CTTTGATGTGAGGAATGATTTGTACTCTTTTATTTTGCACTGTTTGCAGTTCACAGTTTG
TTTTTGCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4CK54JQ 516 0 0
AATGTTTATTCTGATGGCCGTGTTTGCATATCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCA
AGCGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAAAGTATTATG
TTGAGTATTATATCTATGCTCTCTGGTCCCAACGATGAATCCCCAGCAAACGTTGAAGCT
GCTAAAGAGTGGCGAGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTGAGCCGCTGTGTCAGA
AAGTCTCAAGAAATGTTCTGATCAAATTTTAACTTCATAGCTTTAAAGAGAGTTTCCATC
GAACTGTCAAGACACAACCCGGTTTACATCTTCTTTTCGCTGCGTTCGAGAATCAGAGCG
TTCTGAAAAGTCTTGTTCTTGAGAAACTGGCTATATCATAATGATAAAAAAAATTTAATC
GTTTAAGAATGCTTTCTTTGCTCAGAACCTTTGATGTGAGGAATGATTTGTATTTTTTTA
TTTTGCACTGTTTGCAGTTCACAGTTTGTTTTTGCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 4

CO CL3173Contig1 903 4 10 U
GGGCAGAAGTCACATTTGTTTTATTGTCCCTTGTAAAGATCCAAAGATGAGCGAAGAAAC
ATATGAAGAAACGATGGAATCAAACGGGTCTCCTCGTCCTGCTCCAAAACTCAACGAGAG
GATTCTCTCAACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACATCCATGGCACGACCTTGAGAT
CGGTCCTGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGT
GAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATC
GGTTGTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCC
TCTCGATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAG
AGCCATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGT
CTGTGCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCG
TCTCTCAGAGATCCGTCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGC
TGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCT
ATACGCTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTT
ATATTCCCATACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGACTATTGTTTTAAATAATTAT
ATCTGAATATTACAGTTTTCTCTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTTCTTGAGATGTTGCA
ATTTTGTTATATTGTATAACTAGGATAAACCCGCCCTACGGGCGGGCGAATTAATAAACT
AAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 5 5 5 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR4GC81TF U 1
AF RR4EM64TF U 1
AF RR4EM64JQ C 190
AF RR4GC81JQ C 190
BS 1 733 RR4EM64TF
BS 734 734 RR4GC81TF
BS 735 769 RR4EM64TF
BS 770 770 RR4EM64JQ
BS 771 773 RR4EM64TF
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BS 778 798 RR4EM64TF
BS 799 799 RR4EM64JQ
BS 800 812 RR4EM64TF
BS 813 903 RR4EM64JQ

RD RR4GC81TF 772 0 0
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CGGTCCTGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGT
GAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATC
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ATACGCTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTT
ATATTCCCATACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGACTATTGTTT
TAA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4EM64TF 827 0 0
GGGCAGAAGTCACATTTGTTTTATTGTCCCTTGTAAAGATCCAAAGATGAGCGAAGAAAC
ATATGAAGAAACGATGGAATCAAACGGGTCTCCTCGTCCTGCTCCAAAACTCAACGAGAG
GATTCTCTCAACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACATCCATGGCACGACCTTGAGAT
CGGTCCTGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGT
GAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATC
GGTTGTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCC
TCTCGATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAG
AGCCATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGT
CTGTGCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCG
TCTCTCAGAGATCCGTCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGC
TGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCT
ATACGCTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTT
ATATTCCCATACG*CGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGACTATTGTTTAAAA***ATAT
ATCTGAATATTACAGTTT*CTCTTGTTATTTT
GTTGTGTCTTCTTGA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4EM64JQ 714 0 0
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TCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGG
ATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTCTGTGCTGA
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QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GC81JQ 714 0 0
AGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGTGAAGTATGA
ACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATCGGTTGTTTA
TCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTCGATGT
TCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGG
ATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTCTGTGCTGA
TGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGTCTCTCAGA
GATCCGTCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGA
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GTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTTATATTCCCA
TACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGACTATTGTTTTAAATAATTATATCTGAATA
TTACAGTTTTCTCTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTTCTTGAGATGTTGCAATTTTGTTA
TATTGTATAACTAGGATAAACCCGCCCTACGGGCGGGCGAATTAATAAACTAAT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL3174Contig1 1003 4 6 U
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CTTGATGAGGCAGATCGGATGATAGACATGGGTTTCGAGCCTCAGGTTGCAGGCGTGTTA
GATGCTATGCCTTCGAGTAATTTGAAACCTGAGAACGAAGAGGAGCTTGACGAGAAGAAG
ATTTACAGAACGACGTATATGTTCAGTGCTACGATGCCTCCTGGTGTAGAGAGGCTCGCT
AGGAAGTACTTGAGGAACCCTGTTGTTGTCACCATTGGTACTGCAGGAAAGGCCACGGAT
TTGATCTCGCAGCACGTGATTATGATGAAAGAATCTGAGAAGTTCTTTAGGCTGCAGAAA
CTGCTGGATGAGCTCAACGATAAGACTGCCATTGTGTTCGTTAACACGAAGAAAAACTGC
GACTCTATTGCTAAGAATCTTGACAAGGCAGGGTACCGCGTCACGACCTTACACGGTGGG
AAGTCGCAGGAGCAGAGAGAGATCAGCTTGGGAGGATTCAGAGCGAAGAGATACAACGTC
CTTGTCGCAACTGATGTTGTGGGACGTGGAATCGATATCCCGGATGTGGCTCATGTCATA
AACTATGACATGCCTAAACATATAGAGATGTATACTCATCGTATCGGGCGTACTGGACGT
GCTGGGAAGAGCGGTGTTGCGACTTCGTTCCTGACACTTCATGATACCGACGTCTTTTAT
GATCTGAAGCAGATGCTTGTTCAGAGCAACAGTGCGGTGCCCCCTGAGCTGGCTAGACAT
GAAGCGTCCAGATTCAAACCAGGTACGGTTCCTGATAGACCACCAAGACACAGTGACACT
GTCTACATAAACTGAGGCCTTTAGGATCTGTTGGATTTGTTCTTGAAATTTCCCAGTCAT
GTTTACCTTTTGGGAGAATCGGTATCTCCTTTACTCTTAAGTGATCTCATGTGTTATCTT
TATGATTTGTAGTCTGATATTGAAGGAAACAGTAGTTGAAACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG02TF U 1
AF RR4GV05TF U 1
AF RR4GV05JQ C 185
AF RR4GG02JQ C 271
BS 1 740 RR4GG02TF
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BS 764 764 RR4GV05JQ
BS 765 788 RR4GV05TF
BS 789 994 RR4GV05JQ
BS 995 1003 RR4GG02JQ

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QA 1 740 1 740
DS 

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CTTGATGAGGCAGATCGGATGATAGACATGGGTTTCGAGCCTCAGGTTGCAGGCGTGTTA
GATGCTATGCCTTCGAGTAATTTGAAACCTGAGAACGAAGAGGAGCTTGACGAGAAGAAG
ATTTACAGAACGACGTATATGTTCAGTGCTACGATGCCTCCTGGTGTAGAGAGGCTCGCT
AGGAAGTACTTGAGGAACCCTGTTGTTGTCACCATTGGTACTGCAGGAAAGGCCACGGAT
TTGATCTCGCAGCACGTGATTATGATGAAAGAATCTGAGAAGTTCTTTAGGCTGCAGAAA
CTGCTGGATGAGCTCAACGATAAGACTGCCATTGTGTTCGTTAACACGAAGAAAAACTGC
GACTCTATTGCTAAGAATCTTGACAAGGCAGGGTACCGCGTCACGACCTTACACGGTGGG
AAGTCGCAGGAGCAGAGAGAGATCAGCTTGGGAGGATTCAGAGCGAAGAGATACAACGTC
CTTGTCGCAACTGATGTTGTGGGACGTGGAATCGATATCCCGGATGTGGCTCATGTCATA
AACTATGACATGCCTAAACATATAGAGATGTATACTCATCGTATCGGGCGTACTGGACGT
GCTGGGAAGAGCGGTGTTGCGACTTCGTTCCTGACACTTCATGATACCGACGTCTTTTAT
GATCTGAAGCAGATGCTTGTTCAGAGCAACAGTGCGGTGCCCC*TGAGCTGGCTAGACAT
GAAGCGTC
AG

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DS 

RD RR4GV05JQ 810 0 0
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AGTACTTGAGGAACCCTGTTGTTGTCACCATTGGTACTGCAGGAAAGGCCACGGATTTGA
TCTCGCAGCACGTGATTATGATGAAAGAATCTGAGAAGTTCTTTAGGCTGCAGAAACTGC
TGGATGAGCTCAACGATAAGACTGCCATTGTGTTCGTTAACACGAAGAAAAACTGCGACT
CTATTGCTAAGAATCTTGACAAGGCAGGGTACCGCGTCACGACCTTACACGGTGGGAAGT
CGCAGGAGCAGAGAGAGATCAGCTTGGGAGGATTCAGAGCGAAGAGATACAACGTCCTTG
TCGCAACTGATGTTGTGGGACGTGGAATCGATATCCCGGATGTGGCTCATGTCATAAACT
ATGACATGCCTAAACATATAGAGATGTATACTCATCGTATCGGGCGTACTGGACGTGCTG
GGAAGAGCGGTGTTGCGACTTCGTTCCTGACACTTCATGATACCGACGTCTTTTATGATC
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CGTCCAGATTCAAACCAGGTACGGTTCCTGATAGACCACCAAGACACAGTGACACTGTCT
ACATAAACTGAGGCCTTTAGGATCTGTTGGATTTGTTCTTGAAATTTCCCAGTCATGTTT
ACCTTTTGGGAGAATCGGTATCTCCTTTACTCTTAAGTGATCTCATGTGTTATCTTTATG
ATTTGTAGTCTGATATTGAAGGAAACAGTA

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DS 

RD RR4GG02JQ 733 0 0
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ATTGTGTTCGTTAACACGAAGAAAAACTGCGACTCTATTGCTAAGAATCTTGACAAGGCA
GGGTACCGCGTCACGACCTTACACGGTGGGAAGTCGCAGGAGCAGAGAGAGATCAGCTTG
GGAGGATTCAGAGCGAAGAGATACAACGTCCTTGTCGCAACTGATGTTGTGGGACGTGGA
ATCGATATCCCGGATGTGGCTCATGTCATAAACTATGACATGCCTAAACATATAGAGATG
TATACTCATCGTATCGGGCGTACTGGACGTGCTGGGAAGAGCGGTGTTGCGACTTCGTTC
CTGACACTTCATGATACCGACGTCTTTTATGATCTGAAGCAGATGCTTGTTCAGAGCAAC
AGTGCGGTGCCACCTGAGCTGGCTAGACATGAAGCGTCCAGATTCAAACCAGGTACGGTT
CCTGATAGACCACCAAGACACAGTGACACTGTCTACATAAACTGAGGCCTTTAGGATCTG
TTGGATTTGTTCTTGAAATTTCCCAGTCATGTTTACCTTTTGGGAGAATCGGTATCTCCT
TTACTCTTAAGTGATCTCATGTGTTATCTTTATGATTTGTAGTCTGATATTGAAGGAAAC
AGTAGTTGAAACG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL3175Contig1 931 4 4 U
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TATAGATCTGATGGCATCTACTGAAAACCCCGATCCAGAAACCGGCAAATCCGAACCGCT
TCCCGCGTCGACTGAACCATTACCACCAACACCACCACCGTCCTCACCCGCCGGTTTCCT
AGATTGTCGGAAAATGTACATCATAATTAGAGTTCTGCTTTTCTCGGCCACACTGACTGC
TCTTATAGTAATGGTGACCAGCGACCAGACCGAGATTACTCAGCTCCCTGGAGCTCCGTC
TCCTGCTCCTGTCTCCGCCGAGTTCAGTGACTCGCCCGCTTTCATATACTTCGTGGTGGC
TCTTGTGGTGGCTGGTTTCTACGCCTTACTCTCAACGATCATTTCCATATCTCTACTCTT
ACGACCTGAGTTCGCTGCACAGTTCAACATTTACATATCCTCCATCGATATGGTGGTGAT
GGGGATTTTGGCGTCTGCGACGGGAACGGCGGGAGGAGTTGCGTACATAGCGTTGAAAGG
AAACGAAGATATTGGATGGAACAAGATTTGTAATGTCTACGACAAGTTTTGTCGTTACAT
TGCAACTTCGCTTGCCTTATCTCTCTTTGCTTCTCTTCTGCTCCTTGTTCTATCCATTTG
CTCTCTGTCCAAGAGAACAACAACAACATGAACAAGTATTAAACCGCAATTGCAAAATCC
TATAATCCTATTCCTAACGTGTGCATTGTTCACACGGGCGTGTTTGTGTATGTGTATTCT
TTGTGTCTGATTTGGTTTGCTCGTTATATGCTATGTATATTTCTCTATCTCACGGTGTTG
TTGTAACTTTTGATCATAAGCATGCGTTTCTGTCTGTTGGCTGTATTTGTAGTTTAAATC
AATGAATCGTGTGATTTCACATATCTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF47TF U 5
AF RR4AT68TF U 1
AF RR4AT68JQ C 183
AF RR4GF47JQ C 417
BS 1 675 RR4AT68TF
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BS 677 863 RR4AT68TF
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RD RR4GF47TF 746 0 0
GG
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TCGGAAACTAGACATCATAATTAGAGTTCTGCTCTTCTCAGCCACACTGACTGCTCTTAT
AGTAATGGTGACCAGCGACCAGACCGAGATTACTCAGCTCCCTGGAGCTCCGTCTCCTGC
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TGAGTTCGCTGCACAGTTCAACATTTACATATCCTCCATCGATATGGTGGTGATGGGGAT
TTTGGCGTCTGCGACGGGAACGGCGGGAGGAGTTGCGTACATAGCGTTGAAAGGAAACGA
AGATATTGGATGGAACAAGATTTGTAATGTCTACGACAAGTTTTGTCGTTACATTGCAAC
TTCGCTTGCCTTATCTCTCTTTGCTTCTCTTCTGCTCCTTGTTCTATCCATTTGCTCTCT
GTCCAAGAGAACAACAACAACATGAACAAGTATTAAACCGCAATTGCAAA*TCCTATAAT
CCTATTCCTAACGTGTGCATTGTT

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR4AT68TF 863 0 0
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TATAGATCTGATGGCATCTACTGAAAACCCCGATCCAGAAACCGGCAAATCCGAACCGCT
TCCCGCGTCGACTGAACCATTACCACCAACACCACCACCGTCCTCACCCGCCGGTTTCCT
AGATTGTCGGAAAATGTACATCATAATTAGAGTTCTGCTTTTCTCGGCCACACTGACTGC
TCTTATAGTAATGGTGACCAGCGACCAGACCGAGATTACTCAGCTCCCTGGAGCTCCGTC
TCCTGCTCCTGTCTCCGCCGAGTTCAGTGACTCGCCCGCTTTCATATACTTCGTGGTGGC
TCTTGTGGTGGCTGGTTTCTACGCCTTACTCTCAACGATCATTTCCATATCTCTACTCTT
ACGACCTGAGTTCGCTGCACAGTTCAACATTTACATATCCTCCATCGATATGGTGGTGAT
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AAACGAAGATATTGGATGGAACAAGATTTGTAATGTCTACGACAAGTTTTGTCGTTACAT
TGCAACTTCGCTTGCCTTATCTCTCTTTGCTTCTCTTCTGCTCCTTGTTCTATCCATTTG
CTCTCTGTCCAAGAGGACAACAACAACATGAACAAGTATTAAACCGCAATTGCAAAATCC
TATAATCCTATTCCTAACGTGTGCATTGTTCACACGGGCGTGTTTGTGTATGTGTATTCT
TTGTGTCTGATTTGGTTTGCTCGTTATATGCTATGTATATTTCTCTATCTCACGGTGTTG
TTGTAACTTTTGATCATAAGCAT

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4AT68JQ 749 0 0
ATTGTCGGAAAATGTACATCATAATTAGAGTTCTGCTTTTCTCGGCCACACTGACTGCTC
TTATAGTAATGGTGACCAGCGACCAGACCGAGATTACTCAGCTCCCTGGAGCTCCGTCTC
CTGCTCCTGTCTCCGCCGAGTTCAGTGACTCGCCCGCTTTCATATACTTCGTGGTGGCTC
TTGTGGTGGCTGGTTTCTACGCCTTACTCTCAACGATCATTTCCATATCTCTACTCTTAC
GACCTGAGTTCGCTGCACAGTTCAACATTTACATATCCTCCATCGATATGGTGGTGATGG
GGATTTTGGCGTCTGCGACGGGAACGGCGGGAGGAGTTGCGTACATAGCGTTGAAAGGAA
ACGAAGATATTGGATGGAACAAGATTTGTAATGTTTACGACAAGTTTTGTCGTTACATTG
CAACTTCGCTTGCCTTATCTCTCTTTGCTTCTCTTCTGCTCCTTGTTCTATCCATTTGCT
CTCTGTCCAAGAGGACAACAACAACATGAACAAGTATTAAACCGCAATTGCAAAATCCTA
TAATCCTATTCCTAACGTGTGCATTGTTCACACGGGCGTGTTTGTGTATGTGTATTCTTT
GTGTCTGATTTGGTTTGCTCGTTATATGCTATGTATATTTCTCTATCTCACGGTGTTGTT
GTAACTTTTGATCATAAGCATGCGTTTCTGTCTGTTGGCTGTATTTGTAGTTTAAATCAA
TGAATCGTGTGATTTCACATATCTATGTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GF47JQ 504 0 0
TCTTACGACCTGAGTTCGCTGCACAGTTCAACATTTACATATCCTCCATCGATATGGTGG
TGATGGGGATTTTGGCGTCTGCGACGGGAACGGCGGGAGGAGTTGCGTACATAGCGTTGA
AAGGAAACGAAGATATTGGATGGAACAAGATTTGTAATGTTTACGACAAGTTTTGTCGTT
ACATTGCAACTTCGCTTGCCTTATCTCTCTTTGCTTTTTTTCTGCTCCTTGTTCTATCCA
TTTGCTCTCTGTCCAAGAGAACAACAACAACATGAACAAGTATTAAACCGCAATTGCAAA
ATCCTATAATCCTATTCCTAACGTGTGCATTGTTCACACGGGCGTGTTTGTGTATGTGTA
TTCTTTGTGTCTGATTTGGTTTGCTCGTTATATGCTATGTATATTTCTCTATCTCACGGT
GTCGTTGTAACTTTTGATCATAAGCATGCGTTTCTGTCTGTTGGCTGTATTTGTAGTTTA
AATCAATGAATCGTGTGATTTCAC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 4

CO CL3176Contig1 766 4 4 U
GGACAGTGCTATAGCTTTGTGCCTCTTTTGACCATAGAAAGAAGAAGCTTTGTGCCTCTT
TTGCAGTTAAAGCTCAACCAACAAGATGATTATCACAGAGACCAACCGCAGAGAGATCTG
CAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATCTCCCAAAGCA
TCCGTTGATTGAGTCAGTGCCCAACCTTCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTTAGGGAGACATTCGCTTGGATGCACTATTATTGGTTTCTCACCAACGA
AGGGATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCGTCAGACGTTGTTCCCGCGACTTT
GAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGATCGCCCAAG
AGGACCTCGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGGTACCGTGCAGG
GCCACGTGGTGGTGATGCAGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATTACCAGCCGTC
TTTCCAAGGAGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCGGTTTCAACGCAGC
AGCACCATCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGCTTTGATTATTGAAA
GACGAGTTTTGTTTTTTGTTTTGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAACGCAAATCCAGAATC
TATAATCTATCTATTTCTCTGACTTTTTGGTCTGAGTTAACAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ24TF U 6
AF RR4GF16JQ C 1
AF RR4GF16TF U 1
AF RR4EJ24JQ C 65
BS 1 7 RR4GF16JQ
BS 8 611 RR4EJ24TF
BS 612 741 RR4GF16TF
BS 742 766 RR4EJ24JQ

RD RR4EJ24TF 606 0 0
GG
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TCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGATCGCCCAAGAGGACCT
CGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGGTACCGTGCAGGGCCACGT
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GGAGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCGGTTTCAACGCAGCAGCACCA
TCTG

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DS 

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CAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATCTCCCAAAGCA
TCCGTTGATTGAGTCAGTGCCCAACCTTCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTTAGGGAGACATTCGCTTGGATGCACTATTATTGGTTTCTCACCAACGA
AGGGATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCGTCAGACGTTGTTCCCGCGACTTT
GAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGATCGCCCAAG
AGGACCTCGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGGTACCGTGCAGG
GCCACGTGGTG*TGATGCAGGATGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATTACCAGCCGTC
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AGCACCATCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGCTTTGATTATTGAAA
GACGAGTTTTGTTTTTTGTTTTGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAACGCAAATCCAGAATC
TATAATCTATCTATTTCTCTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GF16TF 741 0 0
GGACAGT
GCTATAGCTTTGTGCCTCTTTTGACCATAGAAAGAAGAAGCTTTGTGCCTCTTTTGCAGT
TAAAGCTCAACCAACAAGATGATTATCACAGAGACCAACCGCAGAGAGATCTGCAAGTAC
CTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATCTCCCAAAGCATCCGTTG
ATTGAGTCAGTGCCCAACCTTCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTCCAAGGAG
TACGTTAGGGAGACATTCGCTTGGATGCACTATTATTGGTTTCTCACCAACGAAGGGATT
GAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCGTCAGACGTTGTTCCCGCGACTTTGAAGAAG
TCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGATCGCCCAAGAGGACCT
CGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGGTACCGTGCAGGGCCACGT
GGTG*TGATGCAGGATGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATTACCAGCCGTCTTTCCAA
GGAGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCGGTTTCAACGCAGCAGCACCA
TCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGCTTTGATTATTGAAAGACGAGT
TTTGTTTTTTGTTTTGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAACGCAAATCCAGAATCTATAATC
TATCTATTTCTCTG

QA 8 741 8 741
DS 

RD RR4EJ24JQ 702 0 0
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TACCTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATCTCCCAAAGCATCCG
TTGATTGAGTCAGTGCCCAACCTTCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTCCAAG
GAGTACGTTAGGGAGACATTCGCTTGGATGCACTATTATTGGTTTCTCACCAACGAAGGG
ATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCGTCAGACGTTGTTCCCGCGACTTTGAAG
AAGTCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGATCGCCCAAGAGGA
CCTCGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGGTACCGTGCAGGGCCA
CGTGGTGGTGATGCAGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATTACCAGCCGTCTTTC
CAAGGAGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCGGTTTCAACGCAGCAGCA
CCATCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGCTTTGATTATTGAAAGACG
AGTTTTGTTTTTTGTTTCGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAACGCAAATCCAGAATCTATA
ATCTATCTATTTCTCTGACTTTTTGGTCTGAGTTAACAAATC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 4

CO CL3177Contig1 1213 4 14 U
GGAGAGATAGAGAAAACGGTGTTACCGCTTTTAGGAGAGAGAAAGATAGAGAGAGAAGAA
GTTTGTTTCTTCATTTAGAAAATTTAGATACAGAGAAGAGAAGAACAGAGTTTGTGATGA
TGAGTCTGAGAAGAGGAGGAGAAAGACAAGACTTTCCGGCAGCGTACAACGTTGTCCATA
AGCTGCCTCACGGTGACAGTCCTTATGTCCGAGCAAAACATGTTCAGCTGGTGGAGAAGG
ATGCAGAAGCAGCGATAGAGCTGTTCTGGATAGCGATCAAAGCGAGGGACAGAGTGGACA
GCGCTCTTAAGGACATGGCTTTGCTTATGAAACAACAGAACAGAGCAGAAGAAGCCATTG
ATGCGATTCATTCCTTTAGGTATCTTTGTTCGAGACAAGCTCAAGAATCACTCGACAATG
TCCTCATCGATCTCTACAAGAAGTGTGGGAGGATAGAAGAGCAAGTCGAGCTATTGAAGC
AGAAGCTTTGGATGATATACCAAGGGGAAGCGTTCAACGGGAAGCCGACGAAGACGGCGA
GGTCTCACGGGAAGAAGTTTCAGGTCACGGTCGAGAAGGAGACGTCTAGGATCTTGGGG*
AACTTGGGATGGGCTTATATGCAGCTAAAGGACTACACAGCGGCTGAGACCGTGTACCGT
AAAGCTCAAGTCGTAGAGCCTGATGCAAACAAGACTTGTAATCTGTGCACTTGTCTCATC
AAGCAAGGGAAGGTCGACGAGGCGAGGACGATTCTGTATCGCGATGTGTTGCAAGAGAAG
AGAGAAGGGTTTGATGATGATTCGAGGTTGAAGGTTCGAGTTCAAGAGCTTCTGAGCGAG
CTAGAGCCTGTTGTCGCTGCTTCTGTGTCTGTGGAATGTGAAGTCGGTATGGATGAGATC
GCGGTTGTTGAAGGGATTGACGAGTTTATGAAAGAATGGAGGAGGCCTTTGAGGACGAGA
AGGCTTCCGATTTTCGAAGAGATCTTACCACTGAGAGATCAACTGGCTTGTTGATGATAC
TCTGTTTGCTTTGGTCTTTGGATACTGAATAGGGAACTTTCTTGTGTTAAAAGAATGTTA
GGTGAATGTAAGTTTACTTCTTGTAAGCTGTTTTGGTATCATGGTTAGCTTGTTACTACT
GTTCAATGAGTGACTCTCGTTCCAAATACTCTGTACTACTTTCATCGAATAGAAAAAATG
GTATGTAGAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4DR13JQ C 443
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GTTTGTTTCTTCATTTAGAAAATTTAGATACAGAGAAGAGAAGAACAGAGTTTGTGATGA
TGAGTCTGAGAAGAGGAGGAGAAAGACAAGACTTTCCGGCAGCGTACAACGTTGTCCATA
AGCTGCCTCACGGTGACAGTCCTTATGTCCGAGCAAAACATGTTCAGCTGGTGGAGAAGG
ATGCAGAAGCAGCGATAGAGCTGTTCTGGATAGCGATCAAAGCGAGGGACAGAGTGGACA
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ATGCGATTCATTCCTTTAGGTATCTTTGTTCGAGACAAGCTCAAGAATCACTCGACAATG
TCCTCATCGATCTCTACAAGAAGTGTGGGAGGATAGAAGAGCAAGTCGAGCTATTGAAGC
AGAAGCTTTGGATGATATACCAAGGGGAAGCGTTCAACGGGAAGCCGACGAAGACGGCGA
GGTCTCACGGGAAGAAGTTTCAGGTCACGGTCGAGAAGGAGACGTCTAGGATCTTGGGG*
AACTTGGGATGGGCTTATATGCAGCTAAAGGACTACACAGCGGCTGAGACCGTGTACCGT
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AAGCAAGGAA**GTCGACGAG*CGAGGACGAT*CTGTATCGCGATGTGTTGCA
GAGAGA

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DS 

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GG
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CTTCATTTAGAAAATTTAGATACAGAGAAGAGAAGAG*AGAGTTTGTGATGATGAGTCTG
AGAAGAGGAGGAGAAAGACAAGACTTTCCGGCAGCGTACAACGTTGTCCATAAGCTGCCT
CACGGTGACAGTCCTTATGTCCGAGCAAAACATGTTCAGCTGGTGGAGAAGGATGCAGAA
GCAGCGATAGAGCTGTTCTGGATAGCGATCAAAGCGAGGGACAGAGTGGACAGCGCTCTT
AAGGACATGGCTTTGCTTATGAAACAACAGAACAGAGCAGAAGAAGCCATTGATGCGATT
CATTCCTTTAGGTATCTTTGTTCGAGACAAGCTCAAGAATCACTCGACAATGTCCTCATC
GATCTCTACAAGAAGTGTGGGAGGATAGAAGAGCAAGTCGAGCTATTGAAGCAGAAGCTT
TGGATGATATACCAAGGGGAAGCGTTCAACGGGAAGCCGACGAAGACGGCGAGGTCTCAC
GGGAAGAAGTTTCAGGTCACGGTCGAGAAGGAGACGTCTAGGATCTTGGGGGAACTTGGG
ATGGGCTTATATGCAGCTAAAGGACTACACAGCGTCTGAGACCGTGTACCGTAAAGCTCA
AGTCGTAGAGCCTGATGCAAACAAAGCTTGTAATCTGTGCACTTGTCTCATCAAGCAAGG
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GTTTGATGATGATT

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DS 

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AGGGATGCAGAAGCAGCGATAGAGCTGTTCTGGATAGCGATCAAAGCGAGGGACAGAGTG
GACAGCGCTCTTAAGGACATGGCTTTGCTTATGAAACAACAGAACAGAGCAGAAGAAGCC
ATTGATGCGATTCATTCCTTTAGGTATCTTTGTTCGAGACAAGCTCAAGAATCACTCGAC
AATGTCCTCATCGATCTCTACAAGAAGTGTGGGAGGATAGAAGAGCAAGTCGAGCTATTG
AAGCAGAAGCTTTGGATGATATACCAAGGGGAAGCGTTCAACGGGAAGCCGACGAAGACG
GCGAGGTCTCACGGGAAGAAGTTTCAGGTCACGGTCGAGAAGGAGACGTCTAGGATCTTG
GGG*AACTTGGGATGGGCTTATATGCAGCTAAAGGACTACACAGCGTCTGAGACCGTGTA
CCGTAAAGCTCAAGTCGTAGAGCCTGATGCAAACAAGGCTTGTAATCTGTGCACTTGTCT
CATCAAGCAAGGGAAGGTCGACGAGGCGAGGACGATTCTGTATCGCGATGTGTTGCAAGA
GAAGAGAGAAGGGTTTGATGATGATTCGAGGTTGAAGGTTCGAGTTCAAGAGCTTCTGAG
CGAGCTAGAGCCTGTTGTCGCTGCTTCTGTGTCTGTGGAATGTGAAGTCGGTATGGATGA
GATCGCGGTTGTTGAAGGGATTGACGAGTTTATGAAAGAATGGAGGAGGCCTTTGAGGAC
GAGAAGGCTTCCGATTTTCGAAGAGATCTTACCACTGAGAGATCAACTGGCTTGTTGATG
ATACTCTGTTTGCTTTGGTCTTTGGATACTGAATAGGGAACTTTCTTGTGTTAAAAGAAT
GTTAGGTGAATGTAAGTTTACTTCTTGTAAGCTGTTTTGGTATCATGGTTAGCTTGTTAC
TACTG
C

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DS 

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AGGGGAAGCGTTCAACGGGAAGCCGACGAAGACGGCGAGGTCTCACGGGAAGAAGTTTCA
GGTCACGGTCGAGAAGGAGACGTCTAGGATCTTGGGG*AACTTGGGATGGGCTTATATGC
AGCTAAAGGACTACACAGCGGCTGAGACCGTGTACCGTAAAGCTCAAGTCGTAGAGCCTG
ATGCAAACAAGACTTGTAATCTGTGCACTTGTCTCATCAAGCAAGGGAAGGTCGACGAGG
CGAGGACGATTCTGTATCGCGATGTGTTGCAAGAGAAGAGAGAAGGGTTTGATGATGATT
CGAGGTTGAAGGTTCGAGTTCAAGAGCTTCTGAGCGAGCTAGAGCCTGTTGTCGCTGCTT
CTGTGTCTGTGGAATGTGAAGTCGGTATGGATGAGATCGCGGTTGTTGAAGGGATTGACG
AGTTTATGAAAGAATGGAGGAGGCCTTTGAGGACGAGAAGGCTTCCGATTTTCGAAGAGA
TCTTACCACTGAGAGATCAACTGGCTTGTTGATGATACTCTGTTTGCTTTGGTCTTTGGA
TACTGAATAGGGAACTTTCTTGTGTTAAAAGAATGTTAGGTGAATGTAAGTTTACTTCTT
GTAAGCTGTTTTGGTATCATGGTTAGCTTGTTACTACTGTTCAATGAGTGACTCTCGTTC
CAAATACTCTGTACTACTTTCATCGAATAGAAAAAATGGTATGTAGAGGAC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

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GGGAAACTTAGCTGTAATAACTCAGTGACTCTTCGGCTCTTATTCATATTATAACCCTCG
ATCACAACAAGATCCGACCCACATCTATTGCTTCAATTGCCCTTCAGTCTACCTAGATCT
TCAATTCAGAAGCCTGAAACCTAACGCTTCTTTTTCCACCTCTCCATCGATTTAATGCTC
CACCGTTATGAGTATATATAACCTTCTCATTGGCCTCTCAAACGCATGCACTTCCTTCTG
TTTCCTTTTTATTTGCGCGCTTAGAGATTCTGTACAAGAATGGCTACTTCACAGCTCCAT
TTGTCCAACTTGAAGGTAGGCGGGTCCAGGCAGGTTGTACAGACGCGACTCCTCCGTTTT
TGGGAGTCTCGCATTGTCGAAAAAGGAGAAGAGAGAGTTCTTTCATGATTTGGCTCCGCT
ATTGTGGCACTCTGTCGGTTCCTGCTCTTCTACAGGCACTCTTCGTCCATTGAAGCTGTC
TGGAACCTTTACATGGCGAAACAGAACCAAACTATCACAGTGACACTTTAGTGGTTGGGA
TTAGGAAGAAGGCGATGGAAGAAGTTCTCTTGAGCTGATAATATTAGCCTGGGGAAGGCA
GAGATGGGTGCATATCAATGTAGGAAAGCTCAAGAATCACTGTCAGGCCACGCTTCCCAT
AAGTTTCTGAGACATCTTACTGGAAACTTTGGAAAAAACAATGAGGTCAAAATGGATTTT
AATCCCAACCATAGGTGTAACTATCTCATATTATTTCATCCTAATTCGGCTTGGTTACGT
TGGCTTAGAGGAGGGTCCCATTTCTCGCGTAAAAGTGATAGTTAACCATTCAGCCTTTCT
CAACCAAGTATCCCCTTCCCTTATTAAAGAAATTTGATAATGAAATGAGGCAGGCTGTAC
TAGCACTAGCAGTGTGTTCAAAAGAGTTTGGCTCTTGGATGGTAGCACATGCGACAGAGT
TATTGATAGTTGGAAGCGATGAAGGAGAAGTGTTTGCACATGAGGAGCAGCAAAATTTGG
GTGGAATCAACATGGAAAAGCTCCATAGACTTGACTATGCTCAAGTCTTTCTTCTTATGC
TCTGACTCTGAAGTCCTTTTTTGCGGATAGCTCCTTTTGTCTATCATCTTGCACAAAACA
GGAATTAGGCTTTTTAAACTGTTGTTCTGTTGGCAGCCACCACAAGAAAATCAGTTGCTT
TTAGTGTGAAAAATTGTCTCTCTCATACATTGTTACTTTGTCAAGTTATGCCATTTTAAT
TAAAAAACTAGATTCTAATCCGCTTTTTAAAGGGCGGATATATTTTTTTATTTGTATTTT
TAGAAGTTTTATTTTGACATTTGTGTTTCTAATCATATTTATAAAAAGAAGAAGAGATTT
T


BQ
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10 

AF RR4G463TF U 1
AF RR4G463JQ C 598
BS 1 683 RR4G463TF
BS 684 1381 RR4G463JQ

RD RR4G463TF 683 0 0
GGGAAACTTAGCTGTAATAACTCAGTGACTCTTCGGCTCTTATTCATATTATAACCCTCG
ATCACAACAAGATCCGACCCACATCTATTGCTTCAATTGCCCTTCAGTCTACCTAGATCT
TCAATTCAGAAGCCTGAAACCTAACGCTTCTTTTTCCACCTCTCCATCGATTTAATGCTC
CACCGTTATGAGTATATATAACCTTCTCATTGGCCTCTCAAACGCATGCACTTCCTTCTG
TTTCCTTTTTATTTGCGCGCTTAGAGATTCTGTACAAGAATGGCTACTTCACAGCTCCAT
TTGTCCAACTTGAAGGTAGGCGGGTCCAGGCAGGTTGTACAGACGCGACTCCTCCGTTTT
TGGGAGTCTCGCATTGTCGAAAAAGGAGAAGAGAGAGTTCTTTCATGATTTGGCTCCGCT
ATTGTGGCACTCTGTCGGTTCCTGCTCTTCTACAGGCACTCTTCGTCCATTGAAGCTGTC
TGGAACCTTTACATGGCGAAACAGAACCAAACTATCACAGTGACACTTTAGTGGTTGGGA
TTAGGAAGAAGGCGATGGAAGAAGTTCTCTTGAGCTGATAATATTAGCCTGGGGAAGGCA
GAGATGGGTGCATATCAATGTAGGAAAGCTCAAGAATCACTGTCAGGCCACGCTTCCCAT
AAGTTTCTGAGACATCTTACTGG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4G463JQ 784 0 0
GC
AGAGATGGGTGCATATCAATGTAGGAAAGCTCAAGAATCACTGTCAGGCCACGCTTCCCA
TAAGTTTCTGAGACATCTTACTGGAAACTTTGGAAAAAACAATGAGGTCAAAATGGATTT
TAATCCCAACCATAGGTGTAACTATCTCATATTATTTCATCCTAATTCGGCTTGGTTACG
TTGGCTTAGAGGAGGGTCCCATTTCTCGCGTAAAAGTGATAGTTAACCATTCAGCCTTTC
TCAACCAAGTATCCCCTTCCCTTATTAAAGAAATTTGATAATGAAATGAGGCAGGCTGTA
CTAGCACTAGCAGTGTGTTCAAAAGAGTTTGGCTCTTGGATGGTAGCACATGCGACAGAG
TTATTGATAGTTGGAAGCGATGAAGGAGAAGTGTTTGCACATGAGGAGCAGCAAAATTTG
GGTGGAATCAACATGGAAAAGCTCCATAGACTTGACTATGCTCAAGTCTTTCTTCTTATG
CTCTGACTCTGAAGTCCTTTTTTGCGGATAGCTCCTTTTGTCTATCATCTTGCACAAAAC
AGGAATTAGGCTTTTTAAACTGTTGTTCTGTTGGCAGCCACCACAAGAAAATCAGTTGCT
TTTAGTGTGAAAAATTGTCTCTCTCATACATTGTTACTTTGTCAAGTTATGCCATTTTAA
TTAAAAAACTAGATTCTAATCCGCTTTTTAAAGGGCGGATATATTTTTTTATTTGTATTT
TTAGAAGTTTTATTTTGACATTTGTGTTTCTAATCATATTTATAAAAAGAAGAAGAGATT
TT

QA 3 784 3 784
DS 



AS 1 4

CO CL3179Contig1 945 4 19 U
CGGGGCAAGTAACAGGTTCACAATATATGTGACGTAAAGGCCAAAACAGTCACCAAAAGA
AAAGAAAAACTCAAGACTTTGTTCACTACACTGTTTATATGAATGACTGATTGATTAAAG
GTAGTGCTCTAGTGCTTCTTGAGAGCGTTCATCTTGTCCCTGAGGTAATAAAGTTTGGCT
CTTCTTACTCTCTTCTTGTCCAACACCTTAATCTCCCTCAGGTTTGGCGAATACAAGGGG
AACATGGATTCGACTCCCACTCCGGCCACCAGCCTTCTAATCCTAAACGTAGAGTTAAGT
CCAGCGTTACGTCTTGCTATCACAATTCCTTTTACTATTGAAACACGCCTCTTGTTCTCA
GGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCAGGCCTTATCTCCGGTATCTCCCTACCA
TTCCTCACTTCCTCAACGGCCTCCTTGTCTACAATCTGCATGATATGCTTGGCTGTTTTA
TCAAGCCGTTTGAAGTTGATTCTGGGAGGCACATCAGGAGCTGACACAGAGAGTCCTTGA
TGACTAGACTCAACAGAATCTCCAATGGTGGAAAAGCACCTCGATGCATACGTAAAGCTC
TGTTGTCTAGGTACTGCGGAAGAGAAAGAAACCGCCTTTGTCAGCGAGCTGATGAGATAC
TTCGCTGGTGAATCGAAAGCTCTTGTGGAACGGAAAGAATCAAACCCTCCTCCAAGCCTC
CTCGATTCATTCTCAGACCAGCTTGGGGAAGAAGAAGTGAAACGAGGAAGAGTGTTGGAG
ATGGAGAAACGGTTCCTTTGAAGCAAACTTGCTTTGCTCCGGATCGATTGCATTTCTCCG
ACAAGAGGACTCTCACTCGACCTTGTGTCCTGAAAATATAATCAAATCTGTTTAGGCTTT
GAGAGTTTTGCACTGATGTTCCGATTGGCGGAGTTTGGGCCTCCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H058JQ U 1
AF RR4CG50JQ U 2
AF RR4CG50TF C 272
AF RR4H058TF C 457
BS 1 102 RR4H058JQ
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BS 104 644 RR4H058JQ
BS 645 645 RR4CG50JQ
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BS 790 793 RR4CG50JQ
BS 794 794 RR4CG50TF
BS 795 806 RR4CG50JQ
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BS 808 828 RR4CG50JQ
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BS 844 844 RR4CG50TF
BS 845 863 RR4CG50JQ
BS 864 945 RR4CG50TF

RD RR4H058JQ 735 0 0
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CTTCTTACTCTCTTCTTGTCCAACACCTTAATCTCCCTCAGGTTTGGCGAATACAAGGGG
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TGACTAGACTCAACAGAATCTCCAATGGTGGAAAAGCACCTCGATGCATACGTAAAGCTC
TGTTGTCTAGGTACTGCGGAAGAGAAAGAAACCGCCTTTGTCAGTGAGCTGATGAGATAC
TTCGCTGGTGAATCGAAAGCTCTTGTGGAACGGAAAGAATCAAACCCTCCTCCAAGCCTC
CTCGATTCATTCTCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4CG50JQ 876 0 0
GGA
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TGCTCTAGTGCTTCTTGAGAGCGTTCATCTTGTCCCTGAGGTAATAAAGTTTGGCTCTTC
TTACTCTCTTCTTGTCCAACACCTTAATCTCCCTCAGGTTTGGCGAATACAAGGGGAACA
TGGATTCGACTCCCACTCCGGCCACCAGCCTTCTAATCCTAAACGTAGAGTTAAGTCCAG
CGTTACGTCTTGCTATCACAATTCCTTTTACTATTGAAACACGCCTCTTGTTCTCAGGCA
CTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCAGGCCTTATCTCCGGTATCTCCCTACCATTCC
TCACTTCCTCAACGGCCTCCTTGTCTACAATCTGCATGATATGCTTGGCTGTTTTATCAA
GCCGTTTGAAGTTGATTCTGGGAGGCACATCAGGAGCTGACACAGAGAGTCCTTGATGAC
TAGACTCAACAGAATCTCCAATGGTGGAAAAGCACCTCGATGCATACGTAAAGTTCTGTT
GTCTAGGTACTGCGGAAGAGAAAGAAACCGCCTTTGTCAGCGAGCTGATGAGATACTTCG
CTGGTGAATCGAAAGCTCTTGTGGAACGGAAAGAATCAAACCCTCCTCCTAGCCTCCTCG
ATTCATTCTCAGACCAGCTTGGGGAAGAAGAAGTGAA*CGAGGAAGAGTGTTGGAGATGG
AGAA*CGGT*CCTTTGAAGCAA*CTTGCTTTGCTCCGGATCGAT*GCATTTCTCCGACA*
GAGGACTCTCACTCGACCT
GTGTCTGAAATATA

QA 4 862 4 862
DS 

RD RR4CG50TF 674 0 0
ACCAGCTTCTATCT
AACGTAGAGTTAAGTCCAGCGTTACGTCTTGCTATCACAAT*CCTTTTACTATTGAAACA
CGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCAGGCCTTATCTCC
GGTATCTCCCTACCATTCCTCACTTCCTCAACGGCCTCCTTGTCTACAATCTGCATGATA
TGCTTGGCTGTTTTATCAAGCCGTTTGAAGTTGATTCTGGGAGGCACATCAGGAGCTGAC
ACAGAGAGTCCTTGATGACTAGACTCAACAGAATCTCCAATGGTGGAAAAGCACCTCGAT
GCATACGTAAAGTTCTGTTGTCTAGGTACTGCGGAAGAGAAAGAAACCGCCTTTGTCAGC
GAGCTGATGAGATACTTCGCTGGTGAATCGAAAGCTCTTGTGGAACGGAAAGAATCAAAC
CCTCCTCCTAGCCTCCTCGATTCATTCTCAGACCAGCTTGGGGAAGAAGAAGTGAAACGA
GGAAGAGTGTTGGAGATGGAGAAACGGTTCCTTTGAAGCAAACTTGCTTTGCTCCGGATC
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ATCTGTTTAGGCTTTGAGAGTTTTGCACTGATGTTCCGATTGGCGGAGTTTGGGCCTCCC

QA 15 674 15 674
DS 

RD RR4H058TF 482 0 0
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TTTGTCAGTGAGCTGATGAGATACTTCGCTGGTGAATCGAAAGCTCTTGTGGAACGGAAA
GAATCAAACCCTCCTCCAAGCCTCCTCGATTCATTCTCAGACCAGCTTGGGGAAGAAGAA
GTGAAACGAGGAAGAGTGTCGGAGATGGAGAAACGGTTCCTTTGAAGCAAACTTGCCTTG
CTCCGGATCGATTGCATTTCTCCGACAAGAGGACTCTCACTCGACCTTGTGTCCTGAAAA
TATAATCAAATCTGTTTAGGCTTTGAGAGTTTTGCACTGATGTTCCGATTGGCGGAGTTT
CC

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 4

CO CL3180Contig1 297 4 1 U
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BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4FF04JQ C 1
AF RR4FF04TF U 1
AF RR4FI28JQ C 1
AF RR4FI28TF U 1
BS 1 297 RR4FF04TF

RD RR4FF04JQ 297 0 0
GGAATTCCATACTCGATTTCATAGATACATATAGAATTCTGTGGAAAGCCGTATTCGATG
AAAGTCGTATGTACGGTTTGGAGGGAGATCTTTCATATCTTTCGAGATCCACCCTACAAT
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QA 1 297 1 297
DS 

RD RR4FF04TF 297 0 0
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AAAGTCGTATGTACGGTTTGGAGGGAGATCTTTCATATCTTTCGAGATCCACCCTACAAT
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AACCCCTTTCACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGGAAAAACTGCAAAATCCGA
TCCAATTTATCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAACACGG

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR4FI28JQ 297 0 0
GGAATTCCATACTCGATTTCATAGATACATATAGAATTCTGTGGAAAGCCGTATTCGATG
AAAGTCGTATGTACGGTTTGGAGGGAGATCTTTCATATCTTTCGAGATCCACCCTACAAT
ATGGGGTCAAAAAGCCAAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACAGATTCTTG
AACCCCTTTCACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGGAAAAACTGCAAAATCCGA
TCCAATTTATCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAACACGG

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR4FI28TF 297 0 0
GGAATTCCATACTCGATTTCATAGATACATATAGAATTCTGTGGAAAGCCGTATTCGATG
AAAGTCGTATGTACGGTTTGGAGGGAGATCTTTCATATCTTTCGAGATCCACCCTACAAT
ATGGGGTCAAAAAGCCAAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACAGATTCTTG
AACCCCTTTCACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGGAAAAACTGCAAAATCCGA
TCCAATTTATCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAACACGG

QA 1 297 1 297
DS 



AS 1 3

CO CL3181Contig1 1576 3 15 U
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CCAGAAATCGCTTAATCAGAAACAGCTGGAAAATCAGGAGCTACTACTAAAGTCTATTTC
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AATACACTGGAGATCTTTTGAAGTAGAAAGGACAAATATATTTAATCGTATAATCGAGAC
AATAGCATCCGCTATCGAGATGCAGGAAAACGACGATGTACTATGCTATTGGTTATCCAA
TTCCGCCACACTTTTAATGTTGCTTGAACGAACTCTGAAAGCCGGTAACGTACCTCCCTC
GAGACATCGGGCGATGTCTACATCTTTGTTTGGACGGGTATCTCAGAGTTTCATAGGTTC
TCCACAAAGTGTTGGATTCCCATTTATGAATGGAAGGGCGATTGGTGGTGGGCTAGACGA
ACTACGTCAAGTGGAAGCTAAATATCCTGCTTTGCTTTTCAAGCAGCAACTCACCGCTTA
CCTAGAAAAGATTTATGGAGTGATCCGAGACCGTATGAAGAGAGAGATTGCGCCTCTGCT
TGCTGTTTGCATTCAGGCACCAAGGCAACCACGTTCTGGTTTAATAAAAGGGCGTTCACA
TAATAATTTTGAGGCTCAAAAAGCGCTAAGTGCTCATTGGCAAAGCATTGTCACATGTTT
AAACGGCCACTTGAGGACTATGAGGGCCAACTATGTGCCTTCGCTGTTAATTTCTAAAGT
GTTCGGGCAGATATTTTCATTTATCAATGTTCAGTTGTTTAACAGCCTTGTTTTGAGACG
TGAATGCTGTTCGTTTAGCAACGGGGAGTATGTAAAAACAGGGCTTGCAGAGCTTGAAAA
ATGGTGCCATGATGCAACAGAGGAGTTTGCTGGTTTGGCTTGGGATGAACTTAAGCACAT
CAGACAAGCTGTTGGCTTCTTGGTTATACATCAGAAGCCAAAGAAAAGCTTACACGAGAT
AACTACTGAACTTTGTCCGGTGCTTACCGTGCAGCAACTTTACAGGATCAGTACTATGTA
TTCGGACGACAAATACGGAACACATAGCGTATCTTCAGAGGCGATGGCAAGCATGCGGCA
GACGGTTTCAGAGGATACCAACAAGTCATTTTTACTAGACGACGATTCAAGCATCCCATT
CTCGCTTGAAGACATCTCGAAATCGATGCCAAACGTAGAGGTTACGGAGATCGATCCTCC
TCCATTGATTCGCCAAAACACCAGCTTCATGTTCTTGTTGGAAAGGTCAGACTGAAGTTT
CAGACAGAAGTAGTCACTACCGAATCGATCTTTAGGACATTTTCAAATTAGGAAATCAGT
GTTGTTGTGCTATAGAAACAGAGCCTGTACATAGGCTTTCTTTGCCAGTGGTGTTCTGGT
TATATTTTGCTAGGCTTTCTTTGCCAGTGGTGTTCTGGTTATATTTTGCTATTCTTATGG
GTACCAGGAAAGCCTTTTTATAATGTAAAACTACAATTGCTTAAACGAAGTGCAAAGCAA
GGAAAAGATATTGTGG


BQ
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CATCGGGCGATGTCTACATCTTTGTTTGGACGGGTATCTCAGAGTTTCATAGGTTCTCCA
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ACTGAACTTTGTCCGGTGCTTAC*GTGCAGCA*CTTTACAGGATCAGTACTATGTATTCG
GACGACAAA

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DS 

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ACTATGTG
CTTCGCTGTTAATTTCTAAAGTGTTCGGGCAGATATTTTCATTTATCAATGTTCAGTTGT
TTAACAGCCTTGTTTTGAGACGTGAATGCTGTTCGTTTAGCAACGGGGAGTATGTAAAAA
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TCTTTGCCAGTGGTGTTCTGGTTATATTTTGCTAGGCTTTCTTTGCCAGTGGTGTTCTGG
TTATATTTTGCTATTCTTATGGGTACCAGGAAAGCCTTTTTATAATGTAAAACTACAATT
GCTTAAACGAAGTGCAAAGCAAGGAAAAGATATTGTGG

QA 9 826 9 826
DS 



AS 1 4

CO CL3182Contig1 1433 4 9 U
AAAAAGGAACGAAACAGCATCTTTTTATTTTCTTATTATTGTTTCTAACAGACACAACAA
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CTCCTTAAAACCTATTCATCGTATGCATCTTCCTTACCGATACATTTAAAGCTTGAGGTT
TCTCAGGAGTTGGCCCCATCTTGGAGTTTCCTCATCAAAAATGCAGGTCAAAGGTGAAAC
TAATACCCCACTGCCTCCAACCGCTCTGAGTTGCTTCACTGACTCGTATAAGGCCTTCTT
TGGCACACAAATCACAATGGCATAGTAGTCAATCGATACTTTTCCATCTTGTTTACAGTA
GACTGGGCTTATTGTTGGTCCCTGCAGTCCTGACAATAATGGTTGGCTCAGCACGCATTC
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GTCGGTCAATGCTCTTCTGCTTGCCACAAGTACCGCCTGACTTTCCAGCACAACGCCTCC
TTCAATCTCTTTTAAGTTATTTTCTTTGAGTGTTGTCCCACTACTCACAAGGTCCAGTAT
GGCATCAGCTATACCCATCGCAGGAGCTGCCTCCAGAGCTCCGTCTGCAGTTGAAAATGC
CACATGCTTTATACCATTTTCTTTCATAAATTTGGGGCCGAGATAAGTGAAGCCAGTAGC
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GAGAGCTTCATGGACAATGATAAGATCTTCATTTCCCTGGCCAAACTCACTAAGTGTGTC
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ATTGACTTGTTTGACAGACAGTTGACAGTCTTTGAGAAGATCGATAGCGTCGGCGGCCAT
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TCTGAGGCATCTACGGCGAGTTGCGAGGGAGAAGAAGGCGGAAGAGGAAGGAGACGGGGA
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI75JQ U 114
AF RR4G088JQ U 1
AF RR4G088TF C 309
AF RR4FI75TF C 686
BS 1 161 RR4G088JQ
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BS 662 866 RR4G088TF
BS 867 1433 RR4FI75TF

RD RR4FI75JQ 330 0 0
AAAAAAAAAAAAAAACAA
AACTAAAGTTGACGCAAAAGTACCAACCCAAAAATTCAAACCAAAGGGTCTCCTTAAAAC
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GGCCCCATCTTGGAGTTTCCTCATCAAAAATGTAGGTCAAAGGTGAAACTAATACCCCAC
TGCCTCCAACCGCTCTGAGTTGCTTCACTGACTCGTATAAGGCCTTCTTTGGCACACAAA
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TTGTTGGTCCCT

QA 19 330 19 330
DS 

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AAAGAAGACAGAACTAAAGTTGACACAAAAGTACCAACCCAGAGATTCAAACCAAAGGGT
CTCCTTAAAACCTATTCATCGTATGCATCTTCCTTACCGATACATTTAAAGCTTGAGGTT
TCTCAGGAGTTGGCCCCATCTTGGAGTTTCCTCATCAAAAATGCAGGTCAGAGGTGAAAC
TAATACCCCACTGCCTCCAACCGCTCTGAGTTGCTTCACTGACTCGTATAAGGCCTTCTT
TGGCACACAAATCACAATGGCATAGTAGTCAATCGATACTTTTCCATCTTGTTTACAGTA
GACTGGGCTTATTGTTGGTCCCTGCAGTCCTGACAATAATGGTTGGCTCAGCACGCATTC
AGCCACTTCCTGAGCACTATTTCCTCTCATGTTTGCAACAACAGTGAACTGGCCATCTGC
CTTCAGATGGGCCTCCAGTCTCTCCAGAATCTCGTGCACTGTGTTTAACGCTCCTTCTCT
GTCGGTCAATGCTCTTCTGCTTGCCACAAGTACCGCCTGACTTTCCAGCACAACGCCTCC
T

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DS 

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AAATCACAATGGCATAGTAGTCAATCGATACTTTTCCATCTTGTTTACAGTAGACTGGGC
TTATTGTTGGTCCCTGCAGTCCTGACAATAATGGTTGGCTCAGCACGCATTCAGCCACTT
CCTGAGCACTATTTCCTCTCATGTTTGCAACAACAGTGAACTGGCCATCTGCCTTCAGAT
GGGCCTCCAGTCTCTCCAGAATCTCGTGCACTGTGTTTAACGCTCCTTCTCTGTCGGTCA
ATGCTCTTCTGCTTGCCACAAGTACCGCCTGACTTTCCAGCACAACGCCTCCTTCAATCT
CTTTTAAGTTATTTTCTTTGAGTGTTGTCCCACTACTCACAAGGTCCAGTATGGCATCAG
CTATACCCATCGCAGGAGCTGCCTCCAGAGCTCCGTCTGCAGTTGAAAATGCCACATGCT
TTATACCATTTTCTTTCATAAATTTGGGGCCGAGATAAGTGAAGCCAGTAGCAACGCGCA
ATGGTCTCTCCTCACTCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4FI75TF 748 0 0
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TGTCCCACTACTCACAAGGTCCAGTATGGCATCAGCTATATCCATCGCAGGAGCTGC*TC
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CATTTGCGCTAGCTCCTTGAGGGAATTTATGTTCTCGAAAATTCCATAGTTGGGTATCGC
AATGGAGAGATGGCAGTCTCCAAAGTTGAGAGCTTCATGGACAATGATAAGATCTTCATT
TCCCTGGCCAAACTCACTAAGTGTGTCAAGACCGACGATACCTAAATCCAGATCTCCTGA
GAGTAACTTCCTAACAATGTCTTTTGGCCGTTGGAACCAGACTTCAGTGTTTGGTAACTG
GGGAATTTGTGCAACGTATTGCCTAGGATTGACTTGTTTGACAGACAGTTGACAGTCTTT
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AGGGCATTGTTGTAAATTCC

QA 9 748 9 748
DS 



AS 1 4

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GGTTTTTGTATTTTTGCAGCGTTCTCTACTCTCTCTATAGAACTGATGTTCTAGTTTCTG
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BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4AS12JQ C 1
AF RR4AY31JQ C 1
AF RR4AS12TF U 1
AF RR4AY31TF U 1
BS 1 349 RR4AS12TF

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DS 

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QA 1 349 1 349
DS 

RD RR4AS12TF 349 0 0
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TGAAGAAACCTCATATAACAATGGACACTGGAGGAGCATCTCTTAGTTTTTCACTTTCTC
GGTTTTTGTATTTTTGCAGCGTTCTCTACTCTCTCTATAGAACTGATGTTCTAGTTTCTG
ATTTGACCAATGTGATATGAGAATATCTTAGTGGAAGATTTGTTGCTTG

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR4AY31TF 349 0 0
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GGTTTTTGTATTTTTGCAGCGTTCTCTACTCTCTCTATAGAACTGATGTTCTAGTTTCTG
ATTTGACCAATGTGATATGAGAATATCTTAGTGGAAGATTTGTTGCTTG

QA 1 349 1 349
DS 



AS 2 4

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AACTGATATAATAATCTAGAGAACCCCGAAAGCTTCTTTGATAGCGTGTATAACACGCGA
AAAAACTTCTTCTCCAAACATTCTCGGAAACTGTAAATCCAAATCTTCCTCTATGCTCTT
CCTTCTGAAGCTTTTTATCTCTTCTTTCCAACTCCAACTTCTCTTCTTCTCCCAACACTC
TCTTCTCTCCCTCTTCCTCCTTCGCGCAACGTGACAGCCAAACCTCAAGGACTTGCTTAA
CAGCTGGACTCACATGCTCCCTCAAAATCTCCTCCAGCCTCTCCCCTTCCTCCGCGTCGA
TTTTAAGCATGGAAGTTGGAGAGAAAGCAGAGCGGACAAAGAGAGAAGGCGAGACGTAGG
GTTTGACCTCGGGAAGCTTGAGGAGTGACTGGCGATGAGTATCGAGAGCGGTGTCTTGGT
AATATGTCTCGAGATAGCCAGGGTGACGAACGAGGTCTTTGCGATGAGGGAGGTCGAGGA
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4AG96JQ U 104
AF RR4AG96TF C 1
BS 1 103 RR4AG96TF
BS 104 244 RR4AG96JQ
BS 245 245 RR4AG96TF
BS 246 375 RR4AG96JQ
BS 376 543 RR4AG96TF

RD RR4AG96JQ 276 0 0
GCGTGTATAACACGCGAAAAAACTTCTTCTCCAAACATTCTCGGAAACTGTAAATCCAAA
TCTTCCTCTATGCTCTTCCTTCTGAAGCTTTTTATCTCTTCTTTCCAACTCCAACTTCTC
TTCTTCTCCCAACACTCTCTTTTCTCCCTCTTCCTCCTTCGCGCAACGTGACAGCCAAAC
CTCAAGGACTTGCTTAACAGCTGGACTCACATGCTCCCTCAAAATCTCCTCCAGCCTCTC
CCCTTCCTCCGCGTCGATTTTAAGCATGGAAG
TTGG

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR4AG96TF 543 0 0
ATAAAGATATTGTTGAAGTTGTATATTATTAGTACAATGACGATAATTAGCTAAGTCTTT
AACTGATATAATAATCTAGAGAACCCCGAAAGCTTCTTTGATAGCGTGTATAACACGCGA
AGAAACTTCTTCTCCAAACATTCTCGGAAACTGTAAATCCAAATCTTCCTCTATGCTCTT
CCTTCTGAAGCTTTTTATCTCTTCTTTCCAACTCCAACTTCTCTTCTTCTCCCAACACTC
TCTTCTCTCCCTCTTCCTCCTTCGCGCAACGTGACAGCCAAACCTCAAGGACTTGCTTAG
CAGCTGGACTCACATGCTCCCTCAAAATCTCCTCCAGCCTCTCCCCTTCCTCCGCGTCGA
TTTTAAGCATGGAAGTTGGAGAGAAAGCAGAGCGGACAAAGAGAGAAGGCGAGACGTAGG
GTTTGACCTCGGGAAGCTTGAGGAGTGACTGGCGATGAGTATCGAGAGCGGTGTCTTGGT
AATATGTCTCGAGATAGCCAGGGTGACGAACGAGGTCTTTGCGATGAGGGAGGTCGAGGA
TGC

QA 1 543 1 543
DS 



CO CL3184Contig2 1081 2 2 U
GAACACTCTCTACTCTTCGTCTCCGCCTTTTCTCTCGCCGTTAACTTCGATACGATCAAA
ACCGTCGCGATTCTCAAAGACACTCACTGTCCGAGCTCAATTCCAGTCCATGGATGATCA
TCAAAACGATCTTCTCCGTCAGAAATTCATGGAGTTTCCATACGTCTCGCCCACGCGCAG
GGCTCTAATGGCTGATCTCATGTCGACGTTGGAGGATCGCCTCCACTCACAACTCCTTCC
ATGTACACTCCCGCCGGATGTACGGAACTTCAAGAACCCTAACGGTTCCGCCGAAGCGTC
TCTTCACATCAGATCCGGCGAGAAATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGAT
ACACGTCAAGATTCCGACAGGAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAA
CACCTCAACAGAAGCTCCAAACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCT
CGTTCTCATCCTCGACCTCCCTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGA
GACATATTACCAAGACACCGCTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGA
GGTCAAACCCTACGTCTCGCCTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCAACAGCTTC
CATGCTTAAAATCGACGCGGAGGAAGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGGGAGCATGC
GAGTCCAGCTGCTAAGCAAGTCCTTGAGGTTTGGCTGGAGCGTTGCGCGAGGGAGGAAGA
GAAGAGAGTGTTGGGAGAAGAAGAGAAGTTAGAGTTGGAAAGAAGAGACAAAAGCTTCAG
AAAGAAGAGCATAGAGGAAGATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGT
TTCTTCGCGTGTTATACACGCTATCAAAGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAACTCTAGATTAT
TATATCAGTTAAAGACTTAGCTAATTATCGTCATTGTATTAATATACAACTTAAACAATA
TCTTTATAAAGCCTTACAAGTAAATAGCGTTCGTAACGCAGCTTGTGAAAACGTTTACTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4CW41TF U 1
AF RR4CW41JQ C 321
BS 1 670 RR4CW41TF
BS 671 1081 RR4CW41JQ

RD RR4CW41TF 675 0 0
GAACACTCTCTACTCTTCGTCTCCGCCTTTTCTCTCGCCGTTAACTTCGATACGATCAAA
ACCGTCGCGATTCTCAAAGACACTCACTGTCCGAGCTCAATTCCAGTCCATGGATGATCA
TCAAAACGATCTTCTCCGTCAGAAATTCATGGAGTTTCCATACGTCTCGCCCACGCGCAG
GGCTCTAATGGCTGATCTCATGTCGACGTTGGAGGATCGCCTCCACTCACAACTCCTTCC
ATGTACACTCCCGCCGGATGTACGGAACTTCAAGAACCCTAACGGTTCCGCCGAAGCGTC
TCTTCACATCAGATCCGGCGAGAAATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGAT
ACACGTCAAGATTCCGACAGGAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAA
CACCTCAACAGAAGCTCCAAACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCT
CGTTCTCATCCTCGACCTCCCTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGA
GACATATTACCAAGACACCGCTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGA
GGTCAAACCCTACGTCTCGCCTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCAACAGCTTC
CATGCTTAAA
TCGAC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4CW41JQ 761 0 0
AGAAATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGATACACGTCAAGATTCCGACAG
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ACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTCGACCTCC
CTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGAGACATATTACCAAGACACCG
CTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTACGTCTCGC
CTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCAACAGCTTCCATGCTTAAAATCGACGCGG
AGGAAGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGGGAGCATGCGAGTCCAGCTGCTAAGCAAG
TCCTTGAGGTTTGGCTGGAGCGTTGCGCGAGGGAGGAAGAGAAGAGAGTGTTGGGAGAAG
AAGAGAAGTTAGAGTTGGAAAGAAGAGACAAAAGCTTCAGAAAGAAGAGCATAGAGGAAG
ATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGTTTCTTCGCGTGTTATACACG
CTATCAAAGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAACTCTAGATTATTATATCAGTTAAAGACTTAG
CTAATTATCGTCATTGTATTAATATACAACTTAAACAATATCTTTATAAAGCCTTACAAG
TAAATAGCGTTCGTAACGCAGCTTGTGAAAACGTTTACTCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL3185Contig1 1078 4 11 U
GGAACCCCAAGCGTAAAGATGCGGTCACTACTCTTGCCGCCGGCGAGCTCTCCCGGCGTA
TTCGCCGTTGCGCTGCGGCCAGGTTTCCAACAACGCCTCTCAACCCGCCACCTGCCATTG
TTCAATCCACTCGGCTTGGCTCCAACCCAGCTTATCTCGCCGAAGAGGAGATCGACCATA
TCTTCCTACCAGTCTCCGTCATCTCTACCCGTCTACGGTTTCCAAATTCGAGGATCTAAA
CCTAGTTTCACGGTGGCTTTTTCCTCTCCCACGTCTCCTGCTTCAGTTTCGGCTGATAAT
GAAGTCGACAAGGCGAAACTCGCTCAGGTTGCAAAGAGACTAGAGAAGACTTCAAGGTAC
TTCAAGAGGCTTGGGAGTATTGGTTTCTGGGGGCAGCTTGTGTCAACTGTTGTGGCTGCC
GTCATTCTATCCTTTTCCATTGTTGTAACTGGGAAACCCACTTCACCTGCTACTTTCTAC
GCTACCGCAACTGGCATCGCTGCTGCTTTTGTCTCTGTCTTCTGGTCCTTTGGTTATATT
CGCCTCTCTGACAGGCTCCGTCGAACTGCCGCTGACCCTGCCAAGGCCCCGCCTCGTGCA
GATGTTGTGAAAGGGTTGAGAAGTGGGATTATGGTAAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCA
ATTCTCGGGATGCAAGCAACGGTTGGGTTTTTAGTTGCAAAGGCGTTGACAACCTCAGCA
AACCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCAAGGATACAGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTC
CTCGTTCAGGCATCGGCGAACACCTTACTTTCTCATTTTCTAGGCCTTGTTTGTTCCTTA
GAGCTGTTGCGATCCGTGACAGTACCCAACTCCGAATCCGCCTTCGTTCCTAAAGTTGCT
TGAGTTTCTGCCTTTTGTAGGCCTTAGCTCTTGTATTCACAAACGTTTACCGCAGACTTA
TTTTCTTTCATAAATGAGAACCAACTGTTGTGGACTCAACCGCTTTATTACTGCCTAAAG
CACATGCTTCTTTGCCAGCAAGAAATGTTGCAAGATTTAAATGTATATTTCCAAGGCC


BQ
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25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G553TF U 1
AF RR4CR60TF U 2
AF RR4G553JQ C 273
AF RR4CR60JQ C 362
BS 1 419 RR4G553TF
BS 420 420 RR4CR60TF
BS 421 691 RR4G553TF
BS 692 692 RR4G553JQ
BS 693 702 RR4G553TF
BS 703 703 RR4G553JQ
BS 704 711 RR4G553TF
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BS 713 761 RR4G553TF
BS 762 997 RR4G553JQ
BS 998 1078 RR4CR60JQ

RD RR4G553TF 767 0 0
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TTCAATCCACTCGGCTTGGCTCCAACCCAGCTTATCTCGCCGAAGAGGAGATCGACCATA
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CCTAGTTTCACGGTGGCTTTTTCCTCTCCCACGTCTCCTGCTTCAGTTTCGGCTGATAAT
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GTCATTCTATCCTTTTCCATTGTTGTAACTGGGAAACCCACTTCACCTGCTACTTTCTAC
GCTACCGCAACTGGCATCGCTGCTGCTTTTGTCTCTGTCTTCTGGTCCTTTGGTTATATT
CGCCTCTCTGACAGGCTCCGTCGAACTGCCGCTGACCCTGCCAAGGCCCCGCCTCGTGCA
GATGTTGTGAAAGGGTTGAGAAGTGGGATTATGGTAAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCA
ATTCTCGGGATGCAAGCAACGGTTGGGTTTT*AGTTGCAAAG*CGTTGACA*CCTCAGCA
AACCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCAAGGATACAGTCCCGT
CTTGCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CR60TF 771 0 0
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TCGCCGTTGCGCTGCGGCCAGGTTTCCAACAACGCCTCTCAACCCGCCACCTGCCATTGT
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CTTCCTACCAGTCTCCGTCATCTCTACCCGTCTACGGTTTCCAAATTCGAGGATCTACAC
CTAGTTTCACGGTGGCTTTTTCCTCTCCCACGTCTCCTGCTTCAGTTTCGGCTGATAATG
AAGTCGACAAGGCGAAACTCGCTCAGGTTGCAAAGAGACTAGAGAAGACTTCAAGGTACT
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ATGTTGTGAAAGGGTTGAGAAGTGGGATTATGGTAAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCAA
TTCTCGGGATGCAAGCAACGGTTGGGTTTT*AGTTGCAAAG*CGTTGACA*C*TCAGCAA
ACCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCA**GATACAGTCCCGT
CTGCTCTGATG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4G553JQ 725 0 0
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AAAGAGACTAGAGAAGACTTCAAGGTACTTCAAGAGGCTTGGGAGTATTGGTTTCTGGGG
GCAGCTTGTGTCAACTGTTGTGGCTGCTGTCATTCTATCCTTTTCCATTGTTGTAACTGG
GAAACCCACTTCACCTGCTACTTTCTACGCTACCGCAACTGGCATCGCTGCTGCTTTTGT
CTCTGTCTTCTGGTCCTTTGGTTATATTCGCCTCTCTGACAGGCTCCGTCGAACTGCCGC
TGACCCTGCCAAGGCCCCGCCTCGTGCAGATGTTGTGAAAGGGTTGAGAAGTGGGATTAT
GGTAAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCAATTCTCGGGATGCAAGCAACGGTTGGGTTTTT
AGTTGCAAAGGCGTTGACAACCTCAGCAAACCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCAAGGATA
CAGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTCCTCGTTCAGGCATCGGCGAACACCTTACTTTC
TCATTTTCTAGGCCTTGTTTGTTCCTTAGAGCTGTTGCGATCCGTGACAGTACCCAACTC
CGAATCCGCCTTCGTTCCTAAAGTTGCTTGAGTTTCTGCCTTTTGTAGGCCTTAGCTCTT
GTATTCACAAACGTTTACCGCAGACTTATTTTCTTTCATAAATGAGAACCAACTGTTGTG
GACTC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4CR60JQ 717 0 0
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TCATTCTATCCTTTTCCATTGTTGTAACTGGGAAACCCACTTCACCTGCTACTTTCTACG
CTACCGCAACTGGCATCGCTGCTGCTTTTGTCTCTGTCTTCTGGTCCTTTGGTTATATTC
GCCTCTCTGACAGGCTCCGTCGAACTGCCGCTGACCCTGCCAAGGCCCCGCCTCGTGCAG
ATGTTGTGAAAGGGTTGAGAAGTGGGATTATGGTAAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCAA
TTCTCGGGATGCAAGCAACGGTTGGGTTTTTAGTTGCAAAGGCGTTGACAACCTCAGCAA
ACCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCAAGGATACAGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTCC
TCGTTCAGGCATCGGCGAACACCTTGCTTTCTCATTTTTTAGGCCTTGTTTGTTCCTTAG
AGCTGTTGCGATCCGTGACAGTACCCAACTCCGAATCCGCCTTCGTTCCTAAAGTTGCTT
GAGTTTCTGCCTTTTGTAGGCCTTAGCTCTTGTATTCACAAACGTTTACCGCAGACTTAT
TTTCTTTCATAAATGAGAACCAACTGTTGTGGACTCAACCGCTTTATTACTGCCTAAAGC
ACATGCTTCTTTGCCAGCAAGAAATGTTGCAAGATTTAAATGTATATTTCCAAGGCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 2 4

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AGCTTCGTTCAATCTTTTTATCATAACAAAGATTTTTTATTGAATATCAGACATCAAATG
AACTTGGATCACTCAAACTTCAACCCTGAACCTTTTAGTTTCTTCTCAACCATCTCATCG
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AAAAAACCATGGTGAGGAATTCCACAAGTAGATCTCCCTGTCTTGTTGGCCTCCAGGTTA
CTCAAGTTACCAAGACTACACAGCTCCAAGATCTTCTCTACAATTCCACTTTGCTTTTCT
TCTTCGGTGAAAGAACAACCTAAGAAATCTGCGAGCCTCATAACTTGAGCCTCAGGCTTC
TCTATCATTTCTTCATACCTCATGAAGAGTACCGGATTCCAATCCACCAAGCTCTCTTTC
CAGTAACTTAATACTTGTTCCTGAAACGGTCCAAAGAAGCTAGCCCCTTTAACATACTCT
TCAACTATATCTTCAAGCGCGTAGTTCCTAACAAGCTTGCTCCTGAAATGCCAACGAGAG
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TCTAGGCCAGGACATTGATTCTTGACATATAAATCAAGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX58JQ U 1
AF RR4FP46JQ U 1
BS 1 761 RR4FP46JQ

RD RR4FX58JQ 700 0 0
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TCTATCATTTCTTCATACCTCATGAAGAGTACCGGATTCCAATCCACCAAGCTCTCTTTC
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TCAACTATATCTTCAAGCGCGTAGTTCCTAACAAGCTTGCTCCTGAAATGCCAACGAGAG
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QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4FP46JQ 761 0 0
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AGCTTCGTTCAATCTTTTTATCATAACAAAGATTTTTTATTGAATATCAGACATCAAATG
AACTTGGATCACTCAAACTTCAACCCTGAACCTTTTAGTTTCTTCTCAACCATCTCATCG
AGTTTTCTTGCCATATCATCAGTGAGATGATTCTTCCAGTCACCAACTCCTCCTTTACGA
AAAAAACCATGGTGAGGAATTCCACAAGTAGATCTCCCTGTCTTGTTGGCCTCCAGGTTA
CTCAAGTTACCAAGACTACACAGCTCCAAGATCTTCTCTACAATTCCACTTTGCTTTTCT
TCTTCGGTGAAAGAACAACCTAAGAAATCTGCGAGCCTCATAACTTGAGCCTCAGGCTTC
TCTATCATTTCTTCATACCTCATGAAGAGTACCGGATTCCAATCCACCAAGCTCTCTTTC
CAGTAACTTAATACTTGTTCCTGAAACGGTCCAAAGAAGCTAGCCCCTTTAACATACTCT
TCAACTATATCTTCAAGCGCGTAGTTCCTAACAAGCTTGCTCCTGAAATGCCAACGAGAG
ACCAACACATCTTTTATGTTTCTACACACGTAAACAACCTTGCAAGGAGAATCTCTTAGA
GATTCATGAAGCATTTGAAAAGGCATGTGGGTTGCAAAAATCCGAGGCGAAGGAAGCTCT
TCTAGGCCAGGACATTGATTCTTGACATATAAATCAAGTTC

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL3186Contig2 780 2 4 U
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ACATTTCCGAGCACGAGACACCGATATCATCCTAGCTTCTGTACCCAAATCAGGAACCAC
CTGGCTCAAGGCTCTTGTATTCGCTGTTCCATAGAAGCAAGTATGCTCCTAATCTGTATC
TCATCCTCTCCTCTCTGATAATCCCCACAACCTCGTCCGGTTTCTTGAACTTGATTTATA
TGTCAAGAATCAATGTCCTGGCCTAGAAGAGCTTCCTTCGCCTCGGATTTTTGCAACCCA
CATGCCTTTTCAAATGCTTCATGAATCTCTAAGAGATTCTCCTTGCAAGGTTGTTTACGT
GTGTAGAAACATAAAAGATGTGTTGGTCTCTCGTTGGCATTTCAGGAGCAAGCTTGTTAG
GAACTACGCGCTTGAAGATATAGTTGAAGAGTATGTTAAAGGGGCTAGCTTCTTTGGACC
GTTTCAGGAACAAGTATTAAGTTACTGGAAAGAGAGCTTGGTGGATTGGAATCCGGTACT
CTTCATGAGGTATGAAGAAATGATAGAGAAGCCTGAGCTCAAGTTATGAGGCTCGCAGAT
TTCTTAGTTGTTCTTTCACCGAGAAGAAAGCAAAGTGGATTGTAGAGAGATCTTGGAGCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP46TF U 1
AF RR4FX58TF U 1
BS 1 607 RR4FP46TF
BS 608 608 RR4FX58TF
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BS 728 780 RR4FX58TF

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TCATCCTCTCCTCTCTGATAATCCCCACAACCTCGTCCGGTTTCTTGAACTTGATTTATA
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TTCTTAG
TTG

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DS 

RD RR4FX58TF 780 0 0
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ATGTCTGAATCTGATCTCTTCTTTACCTTCAGAGAAAGATTTCACGGGAAAAAAACTCTA
CAACTACCAAGGATCTTGGTACTATCCCAATACACTCCAAGCAATCCTAAACTTCCAAAA
ACATTTCCGAGCACGAGACACCGATATCATCCTAGCTTCTGTACCCAAATCAGGAACCAC
CTGGCTCAAGGCTCTTGTATTCGCTGTTCCATAGAAGCAAGTATGCTCCTAATCTGTATC
TCATCCTCTCCTCTCTGATAATCCCCACAACCTCGTCCGGTTTCTTGAACTTGATTTATA
TGTCAAGAATCAATGTCCTGGCCTAGAAGAGCTTCCTTCGCCTCGGATTTTTGCAACCCA
CATGCCTTTTCAAATGCTTCATGAATCTCTAAGAGATTCTCCTTGCAAGGTTGTTTACGT
GTGTAGAAACATAAAAGATGTGTTGGTCTCTCGTTGGCATTTCAGGAGCAAGCTTGTTAG
GAACTACGCGCTTGAAGATATAGTTGAAGAGTATGTTAAAGGGGCTAGCTTCTTTGGACC
GTTTCAGGAACAAGTATTAAGTTACTGGAAAGAGAGCTTGGTGGATTGGAATCCGGTACT
CTTCATGAGGTATGAAGAAATGATAGAGAAGC*TGAGCTCAAGTTATGAG*CTCGCAGAT
TTCTTAGTTGTTCTTTCACCGAGAAGAAAGCAAAGTGGATTGTAGAGAGATCTTGGAGCT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 4

CO CL3187Contig1 1341 4 4 U
GATTCTGAAGAAACTATCAAAAAGTCTGCAGAATCGTTAGGGAAAGATGGCTTCATCAAC
TACTTTGGCTTGCAGCGTTTCGGAAGTGGTTCAGTACCAACTCACCATGTTGGAGCCGCA
CTGCTGAAAGGAGAGTGGAAAGAAGCGGTGGGCATGATTCTTGATCCAAGAGAAAGTGAA
AGGAATGTAGTAAATGAAGCCCGGGAATACTATAAAGAAACTGGCGACATTGACGGGACT
CTAAGGCAATTACCGCGGTACCTCGTTGCTGAAAGAGCCATTCTGCAGTGTCTGAAGAAA
TGTCCTGGGAACTACCTGCAGGCTCTGAAAGGCATACCCAGAACTTTGAGAATGATGTAT
GTACATAGTTATCAGAGCTACTTATGGAACAATGCAGCAAGTTTGCGCGTGCAAAAATAC
GGCACCAACCAAGTTGTGTTGGGGGATTTGGTAAGTACAAAAGTAGATGATGCGAAGAAA
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CAATTAGATGATACTGCTGTTGTTGATCTTCCAGGAGAAAGGAGTGATCTTGTTAAGGTT
ATAGGTATAGAAGACATAGAAGCTGGAACTTACTCTACCAGTGACATTGTCCTCCCTCTT
CCTGGTTCCAGAGTTATTTACCCGTCCAATGACATTGCCGAAATTTTTCATGATTTAGCA
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CTGACTTACACTGACAGCAATAAACCATTGGCAGAGACGGACCTGGACAGTATAACCATG
GAAAAGCCGGTGGGTAAAGTTGAATCAGCTGAAGAAACTGAATCGAAAAAATCCGATAGC
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AAAATGGCACTTACACTTCCATCTTCTTGCTATGCAACAATGGCAATCAGAGAGCTGTTA
AAGACGTCAACTTCTGTTGCATATCATAAGACACTAAACTAGTGATTAACACACTGCTAA
GAAGCCATCTACTCGACATCTTTGCTGATTGTGTTACTTTGTCTTAGTTGCCTCGAGTCT
ATTCAGAACTCTGTTGTCTTCTTTTGTCATTTATCAAGGATATGATTTGGCAAATTTTGT
CTGAAGTAAGCATCAAACCGACAATGACAGTTGTAACTTCTTAAAAAATTCAATGTATCA
GTTACAGAGAGGTTAGCTACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FN85TF U 1
AF RR4FE52TF U 1
AF RR4FE52JQ C 569
AF RR4FN85JQ C 656
BS 1 725 RR4FE52TF
BS 726 726 RR4FE52JQ
BS 727 753 RR4FE52TF
BS 754 1341 RR4FE52JQ

RD RR4FN85TF 716 0 0
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TACTTTGGCTTGCAGCGTTTCGGAAGTGGTTCAGTACCAACTCACCATGTTGGAGCCGCA
CTGCTGAAAGGAGAGTGGAAAGAAGCGGTGGGCATGATTCTTGATCCAAGAGAAAGTGAA
AGGAATGTAGTAAATGAAGCCCGGGAATACTATAAAGAAACTGGCGACATTGACGGGACT
CTAAGGCAATTACCGCGGTACCTCGTTGCTGAAAGAGCCATTCTGCAGTGTCTGAAGAAA
TGTCCTGGGAACTACCTGCAGGCTCTGAAAGGCATACCCAGAACTTTGAGAATGATGTAT
GTACATAGTTATCAGAGCTACTTATGGAACAATGCAGCAAGTTTGCGCGTGCAAAAATAC
GGCACCAACCAAGTTGTGTTGGGGGATTTGGTAAGTACAAAAGTAGATGATGCGAAGAAA
ACCGTGGACAGTTTGACCTCTGAACACAAGGAAAACAGCGAAGAGGCATTAGATTGTGAC
CAATTAGATGATACTGCTGTTGTTGATCTTCCAGGAGAAAGGAGTGATCTTGTTAAGGTT
ATAGGTATAGAAGACATAGAAGCTGGAACTTACTCTACCAGTGACATTGTCCTCCCTCTT
CCTGGTTCCAGAGTTATTTACCCGTCCAATGACATTGCCGAAATTTTTCATGATTT

QA 1 716 1 716
DS 

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TACTTTGGCTTGCAGCGTTTCGGAAGTGGTTCAGTACCAACTCACCATGTTGGAGCCGCA
CTGCTGAAAGGAGAGTGGAAAGAAGCGGTGGGCATGATTCTTGATCCAAGAGAAAGTGAA
AGGAATGTAGTAAATGAAGCCCGGGAATACTATAAAGAAACTGGCGACATTGACGGGACT
CTAAGGCAATTACCGCGGTACCTCGTTGCTGAAAGAGCCATTCTGCAGTGTCTGAAGAAA
TGTCCTGGGAACTACCTGCAGGCTCTGAAAGGCATACCCAGAACTTTGAGAATGATGTAT
GTACATAGTTATCAGAGCTACTTATGGAACAATGCAGCAAGTTTGCGCGTGCAAAAATAC
GGCACCAACCAAGTTGTGTTGGGGGATTTGGTAAGTACAAAAGTAGATGATGCGAAGAAA
ACCGTGGACAGTTTGACCTCTGAACACAAGGAAAACAGCGAAGAGGCATTAGATTGTGAC
CAATTAGATGATACTGCTGTTGTTGATCTTCCAGGAGAAAGGAGTGATCTTGTTAAGGTT
ATAGGTATAGAAGACATAGAAGCTGGAACTTACTCTACCAGTGACATTGTCCTCCCTCTT
CCTGGTTCCAGAGTTATTTACCCGTCCAATGACATTGCCGAAATTTTTCATGATTTAGCA
AAGAACGACGGTATCAGCCTAACAGAGAGCATT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4FE52JQ 773 0 0
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CTTACTCTACCAGTGACATTGTCCTCCCTCTTCCTGGTTCCAGAGTTATTTACCCGTCCA
ATGACATTGCCGAAATTTTTCATGATTTAGCAAAGAAGGACGGTATCAGCCTAACAGAGA
GCATTCACGGTGTAAAGGAATTCTCAATAACTAGCATGACGGGTGGTTATAGACGTGTTT
TCCAGAAGCCAATTGACTTTGAATGGGAGTTACTGACTTACACTGACAGCAATAAACCAT
TGGCAGAGACGGACCTGGACAGTATAACCATGGAAAAGCCGGTGGGTAAAGTTGAATCAG
CTGAAGAAACTGAATCGAAAAAATCCGATAGCAACCAACCAGAATCATGTGAAACCGATT
TGAAAGATGCTGAGCAGACACAGTTGGCTCTCAAAATGGCACTTACACTTCCATCTTCTT
GCTATGCAACAATGGCAATCAGAGAGCTGTTAAAGACGTCAACTTCTGTTGCATATCATA
AGACACTAAACTAGTGATTAACACACTGCTAAGAAGCCATCTACTCGACATCTTTGCTGA
TTGTGTTACTTTGTCTTAGTTGCCTCGAGTCTATTCAGAACTCTGTTGTCTTCTTTTGTC
ATTTATCAAGGATATGATTTGGCAAATTTTGTCTGAAGTAAGCATCAAACCGACAATGAC
AGTTGTAACTTCTTAAAAAATTCAATGTATCAGTTACAGAGAGGTTAGCTACT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4FN85JQ 686 0 0
CTCTTCCTGGTTCCAGAGTTATTTACCCGTCCAATGACATTGCCGAAATTTTTCATGATT
TAGCAAAGAAGGACGGTATCAGCCTAACAGAGAGCATTCACGGTGTAAAGGAATTCTCAA
TAACTAGCATGACGGGTGGTTATAGACGTGTTTTCCAGAAGCCAATTGACTTTGAATGGG
AGTTACTGACTTACACTGACAGCAATAAACCATTGGCAGAGACGGACCTGGACAGTATAA
CCATGGAAAAGCCGGTGGGTAAAGTTGAATCAGCTGAAGAAACTGAATCGAAAAAATCCG
ATAGCAACCAACCAGAATCATGTGAAACCGATTTGAAAGATGCTGAGCAGACACAGTTGG
CTCTCAAAATGGCACTTACACTTCCATCTTCTTGCTATGCAACAATGGCAATCAGAGAGC
TGTTAAAGACGTCAACTTCTGTTGCATATCATAAGACACTAAACTAGTGATTAACACACT
GCTAAGAAGCCATCTACTCGACATCTTTGCTGATTGTGTTACTTTGTCTTAGTTGCCTCG
AGTCTATTCAGAACTCTGTTGTCTTCTTTTGTCATTTATCAAGGATATGATTTGGCAAAT
TTTGTCTGAAGTAAGCATCAAACCGACAATGACAGTTGTAACTTCTTAAAAAATTCAATG
TATCAGTTACAGAGAGGTTAGCTACT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 4

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GGAACACGTACTGGTGTGTAGAGATAAAACCTCTCTCTATAAACCTCTCTAACTTCTCTC
TAGAGACAACCACCGTGTAAAGTTCTTCCGGCCGACGGTGTGGGCTCCGTTAGCCACGTT
AGCCATCGTCGGTCCGGCATCTCTTTGTCTTTTTGTTTTTTTCTTCTGGGTTTTACTTAG
TTTGTATCGTTTGGTTTCGGCGTCGTACGTTTGATTTTGCCTCCGGGAAGTTGTGGTTTT
GCTTCGCCGGCTTTGTTTCCGGGAGACGGTGACTCTTTCCGTACCGTTTATCGCCGGCTT
ATATCGGGTTTCTCATGCTATGTCGATCTATGAATATAGGATTATCTGTTACTTGCCTCT
CGATCTAAAATCTATTGGAGATGGAGGTTCGATTGTAGACAATTACTCTTGGAAAAAATT
CATAGATCCGCTTTGTTTCAACAGCTCGTTGTTGAGTTGTTTGTTTGGGTGAATGATTTG
TCCCGGATCGGACTTCGCCGTCGACGGAGAGCCGTGGTGTCGTGGTTCTGGTGCCGGAGA
AGAAGGTGACTATCGTTAGGACGCGTGTACTCTGATATTCGTGTGATCAAACGCGTGGAA
GGGTGACTCAACCCTTTTGTATTGGGCTTTTGTCCCACTTTATATTTAGTGTACTTTGGG
CCTGTTTTGGGGCTTATGTAGTTACGGTTTGGACTGGTCTTGTTGGACCATGTGCCATTA
ATAAAATCCCAGATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4GH76TF U 1
AF RR4GH76JQ C 1
AF RR4BC06JQ C 6
AF RR4BC06TF U 20
BS 1 7 RR4GH76JQ
BS 8 35 RR4GH76TF
BS 36 37 RR4BC06TF
BS 38 508 RR4GH76TF
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BS 510 682 RR4GH76TF
BS 683 736 RR4BC06TF
BS 737 737 RR4BC06JQ

RD RR4GH76TF 682 0 0
GGAACAC
GTACTGGTGTGTAGAGATAAAACCTCTC**TATAAACCTCTCTAACTTCTCTCTAGAGAC
AACCACCGTGTAAAGTTCTTCCGGCCGACGGTGTGGGCTCCGTTAGCCACGTTAGCCATC
GTCGGTCCGGCATCTCTTTGTCTTTTTGTTTTTTTCTTCTGGGTTTTACTTAGTTTGTAT
CGTTTGGTTTCGGCGTCGTACGTTTGATTTTGCCTCCGGGAAGTTGTGGTTTTGCTTCGC
CGGCTTTGTTTCCGGGAGACGGTGACTCTTTCCGTACCGTTTATCGCCGGCTTATATCGG
GTTTCTCATGCTATGTCGATCTATGAATATAGGATTATCTGTTACTTGCCTCTCGATCTA
AAATCTATTGGAGATGGAGGTTCGATTGTAGACAATTACTCTTGGAAAAAATTCATAGAT
CCGCTTTGTTTCAACAGCTCGTTGTTGAGTTGTTTGTTTGGGTGAATGATTTGTCCCGGA
TCGGACTTCGCCGTCGACGGATAGCCGTGGTGTCGTGGTTCTGGTGCCGGAGAAGAAGGT
GACTATCGTTAGGACGCGTGTACTCTGATATTCGTGTGATCAAACGCGTGGAAGGGTGAC
TCAACCCTTTTGTATTGGGCTTTTGTCCCACTTTATATTTAGTGTACTTTGGGCCTGTTT
TGGGGCTTATGTAGT

QA 8 682 8 682
DS 

RD RR4GH76JQ 737 0 0
GGAACACGTACTGGTGTGTAGAGATAAAACCTCTC**TATAAACCTCTCTAACTTCTCTC
TAGAGACAACCACCGTGTAAAGTTCTTCCGGCCGACGGTGTGGGCTCCGTTAGCCACGTT
AGCCATCGTCGGTCCGGCATCTCTTTGTCTTTTTGTTTTTTTCTTCTGGGTTTTACTTAG
TTTGTATCGTTTGGTTTCGGCGTCGTACGTTTGATTTTGCCTCCGGGAAGTTGTGGTTTT
GCTTCGCCGGCTTTGTTTCCGGGAGACGGTGACTCTTTCCGTACCGTTTATCGCCGGCTT
ATATCGGGTTTCTCATGCTATGTCGATCTATGAATATAGGATTATCTGTTACTTGCCTCT
CGATCTAAAATCTATTGGAGATGGAGGTTCGATTGTAGACAATTACTCTTGGAAAAAATT
CATAGATCCGCTTTGTTTCAACAGCTCGTTGTTGAGTTGTTTGTTTGGGTGAATGATTTG
TCCCGGATCGGACTTCGCCGTCGACGGATAGCCGTGGTGTCGTGGTTCTGGTGCCGGAGA
AGAAGGTGACTATCGTTAGGACGCGTGTACTCTGATATTCGTGTGATCAAACGCGTGGAA
GGGTGACTCAACCCTTTTGTATTGGGCTTTTGTCCCACTTTATATTTAGTGTACTTTGGG
CCTGTTTTGGGGCTTATGTAGTTACGGTTTGGACTGGTCTTGTTGGACCATGTGCCATTA
ATAAAATCCCAGATGG
C

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4BC06JQ 732 0 0
GG
GTACTGGTGTGTAGAGATAAAACCTCTCTCTATAAACCTCTCTAACTTCTCTCTAGAGAC
AACCACCGTGTAAAGTTCTTCCGGCCGACGGTGTGGGCTCCGTTAGCCACGTTAGCCATC
GTCGGTCCGGCATCTCTTTGTCTTTTTGTTTTTTTCTTCTGGGTTTTACTTAGTTTGTAT
CGTTTGGTTTCGGCGTCGTACGTTTGATTTTGCCTCCGGGAAGTTGTGGTTTTGCTTCGC
CGGCTTTGTTTCCGGGAGACGGTGACTCTTTCCGTACCGTTTATCGCCGGCTTATATCGG
GTTTCTCATGCTATGTCGATCTATGAATATAGGATTATCTGTTACTTGCCTCTCGATCTA
AAATCTATTGGAGATGGAGGTTCGATTGTAGACAATTACTCTTGGAAAAAATTCATAGAT
CCGCTTTGTTTCAACAGCTCGTTGTTGAGTTGTTTGTTTGGGTGAATGATTTGTCCCGGA
TCGGACTTCGCCGTCGACGGAGAGCCGTGGTGTCGTGGTTCTGGTGCCGGAGAAGAAGGT
GGCTATCGTTAGGACGCGTGTACTCTGATATTCGTGTGATCAAACGCGTGGAAGGGTGAC
TCAACCCTTTTGTATTGGGCTTTTGTCCCACTTTATATTTAGTGTACTTTGGGCCTGTTT
TGGGGCTTATGTAGTTACGGTTTGGACTGGTCTTGTTGGACCATGTGCCATTAATAAAAT
CCCAGATGGC

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR4BC06TF 717 0 0
AGAGATAAAACCT
CTCTCTATAAACCTCTCTAACTTCTCTCTAGAGACAACCACCGTGTAAAGTTCTTCCGGC
CGACGGTGTGGGCTCCGTTAGCCACGTTAGCCATCGTCGGTCCGGCATCTCTTTGTCTTT
TTGTTTTTTTCTTCTGGGTTTTACTTAGTTTGTATCGTTTGGTTTCGGCGTCGTACGTTT
GATTTTGCCTCCGGGAAGTTGTGGTTTTGCTTCGCCGGCTTTGTTTCCGGGAGACGGTGA
CTCTTTCCGTACCGTTTATCGCCGGCTTATATCGGGTTTCTCATGCTATGTCGATCTATG
AATATAGGATTATCTGTTACTTGCCTCTCGATCTAAAATCTATTGGAGATGGAGGTTCGA
TTGTAGACAATTACTCTTGGAAAAAATTCATAGATCCGCTTTGTTTCAACAGCTCGTTGT
TGAGTTGTTTGTTTGGGTGAATGATTTGTCCCGGATCGGACTTCGCCGTCGACGGAGAGC
CGTGGTGTCGTGGTTCTGGTGCCGGAGAAGAAGGTGGCTATCGTTAGGACGCGTGTACTC
TGATATTCGTGTGATCAAACGCGTGGAAGGGTGACTCAACCCTTTTGTATTGGGCTTTTG
TCCCACTTTATATTTAGTGTACTTTGGGCCTGTTTTGGGGCTTATGTAGTTACGGTTTGG
ACTGGTCTTGTTGGACCATGTGCCATTAATAAAATCCCAGATGG

QA 14 717 14 717
DS 



AS 1 2

CO CL3189Contig1 573 2 5 U
GCACTACTTGGAGTCCACTTGCATCTGGTGTGCTCAATGGTAAATACAACAAGGGAGCTA
TTCCTTCGGACAGCCGATTTGCATTGGAGAACTACAAAAACCTTGCCAATAGATCAATTG
TGGATGATGTTCTGAGGAAAGTTAGTGGTCTCAAGCCTATTGCAGATGAGCTAGGTGTAA
CATTGGCTCAGCTTGCAATCGCGTGGTGTGCTTCAAATCCTAATGTGTCTTCTGTTATCA
CTGGTGCCACAAGGGAGTCACAGATTCAAGAAAACATGAAGGCTGTTGATGTGATCCCAT
TGTTGACGCCACATGTTCTTGACAAGATCGAGCAAGTGATACAGAGCAAACCTAAACGTC
CTGAATCATACCGTTAAAAACCAAATCATGAGATCTCTCTTTTCCTTATCGGAACGGTTT
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TTTTTGTTAGTTTCTATATTGTTTGTGAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EE25TF U 1
AF RR4EE25JQ C 22
BS 1 36 RR4EE25TF
BS 37 37 RR4EE25JQ
BS 38 116 RR4EE25TF
BS 117 117 RR4EE25JQ
BS 118 573 RR4EE25TF

RD RR4EE25TF 573 0 0
GCACTACTTGGAGTCCACTTGCATCTGGTGTGCTCACTGGTAAATACAACAAGGGAGCTA
TTCCTTCGGACAGCCGATTTGCATTGGAGAACTACAAAAACCTTGCCAATAGATCACTTG
TGGATGATGTTCTGAGGAAAGTTAGTGGTCTCAAGCCTATTGCAGATGAGCTAGGTGTAA
CATTGGCTCAGCTTGCAATCGCGTGGTGTGCTTCAAATCCTAATGTGTCTTCTGTTATCA
CTGGTGCCACAAGGGAGTCACAGATTCAAGAAAACATGAAGGCTGTTGATGTGATCCCAT
TGTTGACGCCACATGTTCTTGACAAGATCGAGCAAGTGATACAGAGCAAACCTAAACGTC
CTGAATCATACCGTTAAAAACCAAATCATGAGATCTCTCTTTTCCTTATCGGAACGGTTT
CAGAAATGAGTGGTGCATGCAAAGGGAGATCATTTTGGAGCTTCTTGGATGTTGTCTTTG
TGTTGTTCTCATGCATTTTAAAACTCAGAGAGACAGAGAGCGTTATTATTTATATGTGTG
TTTTTGTTAGTTTCTATATTGTTTGTGAAACTT

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DS 

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AAGGGAGATCATTTTGGAGCTTCTTGGATGTTGTCTTTGTGTTGTTTTCATGCATTTTAA
AACTCAGAGAGACAGAGAGCGTTATTATTTATATGTGTGTTTTTGTTAGTTTTTATATTG
TTTGTGAAACTT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 3

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AAATGGGTGGATCTGAAATTTCAAGATCAGAGGAGAAGATTGATGTAGGGTTCATCAAAT
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GGAGAGATAACCCTTCATGGATAGATCAGCCTCCTAATGTGCAGGTAAGAGAGAAATCTA
AATACTTTAGATTTGACATATTTCAGATCTTTCAAAATTTCCTCAAATTTTGATGTTTTT
CAGGTGAAATCACAAAATGGTTTGTTTTGCCATTTGAATGCAGAGTTTAACGTGGGATTG
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ATCGGGTCGAAGGTGACAATGGATCAGATGTTTCAGCCTTCTGCTATTCTTACACCACCT
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CTTCTTGCCGAAGCTGCTCGGATCCGAGGAGGAGGCCGTGATGATGATCAAGGAAGAAAC
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GATAAAATCCGGCATTGAGGGTGTTTAAGTATCTGTATCCATAGGGCATTCATATATATT
GACAAATCATTATTATGACAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW15TF U 1
AF RR4DG40TF U 491
AF RR4DG40JQ C 491
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G
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QA 2 750 2 750
DS 

RD RR4DG40JQ 791 0 0
G
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AGCGGCCTGGAAGTTCCTTTGGTGGGCTGGAACTTTCCCTATACATCTAATTGTCCAAGA
AAACCGAAAACATCTCATGTCAAATTACAAGCAAGAGAAATTAATGTTCATGAAAGTGTT
TGAGGGCTGTTGGAGGGTGGAGCCATTGTTTATAGACGAACATTTGTGTGATCGTTTGAA
ACCAAAAACACAAGAAGACTACGATAGTTGTACCAACGGACGAGGAAGGATCGGGTCGAA
GGTGACAATGGATCAGATGTTTCAGCCTTCTGCTATTCTTACACCACCTCCTCTCTCTTG
GTACATTCGTGGGATCACCACTAAAACAACGGAGAGTATGATTGAAGATCTTCTTGCCGA
AGCTGCTCGGATCCGAGGAGGAGGCCGTGATGATGATCAAGGAAGAAACGGCAACGAATT
GGAGAAGAGGAAAGTTGAGGACATTAAGGAGAGATGGAGATCGAGAAGGGGTAATGGGAG
GAGATTTACCAATCGGAGAAAGATTTAAACCTTATATAAAAGAAACATCCACTCAATTAT
TGCAATGATGTAGTACTTTGTTAATCTCATCGTAGTTCCAATGGCTTTAGATAAAATCCG
GCATTGAGGGTGTTTAAGTATCTGTATCCATAGGGCATTCATATATATTGACAAATCATT
ATTATGACAT

QA 2 791 2 791
DS 



AS 1 3

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ATTCAACTTGTCAAAGTTATAATCATTTCAAGTTCAACCAAAAACGAAGTGAAACCCATA
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CTTCCCAGTTAGTTGTCTTATAGTAAAGTGCATATATTATTAATTGTATTATTCCTGATA
GACATCCAAGAACATTTGGGATCAAAATATAGAGGTCAAATTTAAGACATGCATAAGCGA
GCCAAATGGTTCCGTTCATGAAGTCGGCTAAAGACACGAAGAACGGCATACACTTCACGC
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AAATAACGCATAAGATCCCAACAAGCATAGATCTCTTTTTTGTTGTATGCAAAAAATACA
ATGTGCAGAAGACCACCACAGCCATCAATATCACCTCAATCACCATAGCTATTGTGATCT
TTTTGCGGACAGGCGAGGTAGCAAAGGAAGTCCGCAAAAGGCCCACATCATGCAGTTTAA
AACTGTAGCTAAGTATGGATCTGGCTTAAACTCTGACACCGATTTCATCTTCCATATCTT
CACCATCGTTGGTATTGGAGCGGAGTACATGCCGAAGGCGATCACGTTTCCGATGATTCC
GACGATCGTCCTGGCTGTGTTGGTGTCCGTCATGTTGCTATGTATCTCGACGAATTTTCG
TGTTTTTATAAATTTTCTCAAAGATCTAATAGATTTCTAGAGAAAAAGAATATTAGATTA
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GTTTCTGATATGTGATAGGTTAGGTTTGATTTGATGAAACAATCCTTTTTTTGTTTTTTC
CAGTATTTGGATTATTTTTGGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY55JQ U 1
AF RR4HA49JQB U 14
AF RR4GY55TF C 556
BS 1 255 RR4GY55JQ
BS 256 737 RR4HA49JQB
BS 738 738 RR4GY55TF
BS 739 793 RR4HA49JQB
BS 794 1227 RR4GY55TF

RD RR4GY55JQ 255 0 0
TACTGTGATCTTAAACATCAAACCGTAATGGACGATTTTTTTTTCAATAAATGTTATACA
ATAATCTATTTTTTTGTAAAAAACAACAATCTAATTGTATTGTAAAAAAAATTGCATAGG
ATTCAACTTGTCAAAGTTATAATCATTTCAAGTTCAACCAAAAACGAAGTGAAACCCATA
TTTTTCTTCCTACTCAAAAAACGTTTAACTTGGTTCCCCCCCTTCATTTTTTTTTGTCTT
TTCGTTGGCATTTCT

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4HA49JQB 780 0 0
G
ACATCAAACCGTAATGGACGATTTTTTTT*CAATAAATGTTATACAATAATCTATTTTTT
TGTAAAAAACAACAATCTAATTGTATTGTAAGAAAAATTGCATAGGATTCAACTTGTCAA
AGTTATAATCATTTCAAGTTCAACCAAAAACGAAGTGAAACCCATATTTTTCTTCCTACT
CAAGAAACGTTTAACTTGGTTCCTCCTCTTCATTTTTTTTTGTCTTTTCGTTGGCATTTC
TTCTGATACTAAACTTAACGATGAAGCTGGTCTCACCACTCGATGATCGCACTTCTTGTA
AAACAGAAAACAAATGTGGAAGTCCAATCTGTAGCATGCAATTATCAAGCTTGGGAAGGC
TCGATTTCAGCATTCGAATTGCTATTTTCTTTATCTTCATCATCGTCTTCCCAGTTAGTT
GTCTTATAGTAAAGTGCATATATTATTAATTGTATTATTCCTGATAGACATCCAAGAACA
TTTGGGATCAAAATATAGAGGTCAAATTTAAGACATGCATAAGCGAGCCAAATGGTTCCG
TTCATGAAGTCGGCTAAAGACACGAAGAACGGCATACACTTCACGCTCTTTTTCTTTATC
ACGAGTCTCATGGCGGTTAAAGGAGAAACATACATGATAACATTGAAAATAACGCATAAG
ATCCCAACAAGCATAGATCTCTTTTTTGTTGTATGCAAAAAATACAATGTGCAGAAGACC
ACCGCAGCCATCAATATCACCTCAATCACCATAGCTATTGTGATCTTTTTGCGGACAGG

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4GY55TF 672 0 0
TCATGAAGTCGGCTAAAGACACGAAGAACGGCATACACTTCACGCTCTTTT*CTTTATCA
CGAGTCTCATGGCGGTTAAAGGAGAAACATACATGATAACATTGAAAATAACGCATAAGA
TCCCAACAAGCATAGATCTCTTTTTTGTTGTATGCAAAAAATACAATGTGCAGAAGACCA
CCACAGCCATCAATATCACCTCAATCACCATAGCTATTGTGATCTTTTTGCGGACAGGCG
AGGTAGCAAAGGAAGTCCGCAAAAGGCCCACATCATGCAGTTTAAAACTGTAGCTAAGTA
TGGATCTGGCTTAAACTCTGACACCGATTTCATCTTCCATATCTTCACCATCGTTGGTAT
TGGAGCGGAGTACATGCCGAAGGCGATCACGTTTCCGATGATTCCGACGATCGTCCTGGC
TGTGTTGGTGTCCGTCATGTTGCTATGTATCTCGACGAATTTTCGTGTTTTTATAAATTT
TCTCAAAGATCTAATAGATTTCTAGAGAAAAAGAATATTAGATTAATTAATTTGATTCTT
CTTTCTATATATATATAATATATTTCTTTACAGTTTTGTCTTCTTGTTTCTGATATGTGA
TAGGTTAGGTTTGATTTGATGAAACAATCCTTTTTTTGTTTTTTCCAGTATTTGGATTAT
TTTTGGTTTTCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 2 4

CO CL3192Contig1 642 2 2 U
GGAGTGAGAATCAAATCTCTCCTTCTTTATCCGTCGGTGTTGCTCTTCTTCTCTTCCTCA
ACGATTTATCTGATCCAAATCAACTCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAG
TGGAGCGCTGAACATAAAGAAGTGGGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAA
AACTGTGGCGGAGGGGAGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCAT
TGAGATTAGTGACTGCTGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGC
TTATCCGCGTGATTTCATGCAAGTAGGGAGAGTCAGAGTGCAGTTGAAAAAAAGAGGATG
GGACTTTTGTTAATCCTTCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAAT
TGGTACCCAGACATCCAGAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAG
AACCTCAGGCAACAACATCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCAGGCAAAGGTGGCAAGA
AGAAGAGATAACTTAACAAGCTCTCTCACTCTTTTTTTCTCCTTCGTATCAGATTCTATG
GTTTTTAATTTCATAAACTCACAAGAACGTGTTTGCAAATGT


BQ
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AF RR4AN36JQ C 1
AF RR4AN36TF U 1
BS 1 9 RR4AN36JQ
BS 10 642 RR4AN36TF

RD RR4AN36JQ 642 0 0
GGAGTGAGAATCAAATCTCTCCTTCTTTATCCGTCGGTGTTGCTCTTCTTCTCTTCCTCA
ACGATTTATCTGATCCAAATCAACTCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAG
TGGAGCGCTGAACATAAAGAAGTGGGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAA
AACTGTGGCGGAGGGGAGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCAT
TGAGATTAGTGACTGCTGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGC
TTATCCGCGTGATTTCATGCAAGTAGGGAGAGTCAGAGTGCAGTTGAAAAAAAGAGGATG
GGACTTTTGTTAATCCTTCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAAT
TGGTACCCAGACATCCAGAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAG
AACCTCAGGCAACAACATCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCAGGCAAAGGTGGCAAGA
AGAAGAGATAACTTAACAAGCTCTCTCACTCTTTTTTTCTCCTTCGTATCAGATTCTATG
GTTTTTAATTTCATAAACTCACAAGAACGTGTTTGCAAATGT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4AN36TF 642 0 0
GGAGTGAGA
ATCAAATCTCTCCTTCTTTATCCGTCGGTGTTGCTCTTCTTCTCTTCCTCAACGATTTAT
CTGATCCAAATCAACTCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAGTGGAGCGCT
GAACATAAAGAAGTGGGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAAAACTGTGGC
GGAGGGGAGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCATTGAGATTAG
TGACTGCTGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGCTTATCCGCG
TGATTTCATGCAAGTAGGGAGAGTCAGAGTGCAGTTGAAAAAAAGAGGATGGGACTTTTG
TTAATCCTTCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAATTGGTACCCA
GACATCCAGAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAGAACCTCAGG
CAACAACATCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCAGGCAAAGGTGGCAAGAAGAAGAGAT
AACTTAACAAGCTCTCTCACTCTTTTTTTCTCCTTCGTATCAGATTCTATGGTTTTTAAT
TTCATAAACTCACAAGAACGTGTTTGCAAATGT

QA 10 642 10 642
DS 



CO CL3192Contig2 590 2 4 U
GGGAGAATCATCAAATCTCTCCTTCTGTCTCCGTCGGTGTTGCTCTTCTTCTCTTCCTCA
ACGATTTATCTGATTCGAAGCAACTCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAG
TGGAGCGCTGAACATAAAGAAGTGGGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAA
AACTGTGGCGGAGGGGAGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCAT
TGAGATTAGTGACTGCTGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGC
GTACCCGCGTGATTTCATGCAAGTTGGGAGAGTGAGAGTGCAGTTGAAAAAAGAGGATGG
GACTTTTGTTAATCCTGCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGAGGCAGAAAATTGCGGAATT
GGTACCCAGACATCCAGAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAGA
ACCTCAGGCAACAACATCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCGGGCAAAGGTTGCAAGAA
GAAGAGATAAATTAACAAGCTCTCTCACTCTTTTTTCTCCTTCGTATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA65TF U 1
AF RR4EA65JQ C 348
BS 1 401 RR4EA65TF
BS 402 402 RR4EA65JQ
BS 403 575 RR4EA65TF
BS 576 590 RR4EA65JQ

RD RR4EA65TF 586 0 0
GGGAGAATCATCAAATCTCTCCTTCTGTCTCCGTCGGTGTTGCTCTTCTTCTCTTCCTCA
ACGATTTATCTGATTCGAAGCAACTCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAG
TGGAGCGCTGAACATAAAGAAGTGGGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAA
AACTGTGGCGGAGGGGAGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCAT
TGAGATTAGTGACTGCTGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGC
GTACCCGCGTGATTTCATGCAAGTTGGGAGAGTGAGAGTGCAGTTGAAAAAAGAGGATGG
GACTTTTGTTAATCCTGCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAATT
GGTACCCAGACATCCAGAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAGA
ACCTCAGGCAACAACATCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCGGGCAAAGGTTGCAAGAA
GAAGAGATAAATTAACAAGCTCTCTCACTCTTTTT
CTCCTTCGTAT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4EA65JQ 243 0 0
AAAAAGAGGATGGGACTTTTGTTAATCCTGCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGAGGCAGA
AAATTGTGGAATTGGTACCCAGACATCCAGAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGG
GGAAGAAGCAAGAACCTCAGGCAACAACATCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCGGGCA
AAGGTTGCAAGAAGAAGAGATAAATTAACAAGCTCTCTCACTCTTTTTTCTCCTTCGTAT
CAG

QA 1 243 1 243
DS 



AS 1 3

CO CL3193Contig1 409 3 5 U
AGACTTTCGTCAATCTTCAATCATATAGTTGAAGAGTGTCTTAACTTTCAAACAAAACCA
AAGTCGAATGCATGAAAGGAAAAGACTTTGGATCTGTACAATTAGTCCTATCAGACAGCT
ACAACTGGTGAGAGTGAGGGTGAGGGTGACTCGTCGTAGGAGATGGAAATCAGCTCTGAT
CTGAGCTTTTCAGCATCTTCAGAGTTTCTTTTAGTGACGACTCCGTTTGTTGTAGTGGCG
GCGATAGGTTTCACATCTGAGGACGTTAGAGACTCTTCAACCTCCTCCGGTGAAGTGTAG
GAGATGGCAATGAGAGACTCACGTGCTTCTTCTTGAGAGATATCGTAACTCGGTTGTTCC
ATTCAAACAATCAATGCCTTTTTCTACGCTTCTTCTCTTTGTTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C180JQ U 9
AF RR4B948TF C 1
AF RR4B948JQ U 97
BS 1 9 RR4B948TF
BS 10 132 RR4C180JQ
BS 133 133 RR4B948JQ
BS 134 282 RR4C180JQ
BS 283 409 RR4B948JQ

RD RR4C180JQ 274 0 0
C
TCAATCTTCAATCATATAGTTGAAGAGTGTCTTAACTTTCAAACAAAACCAAAGTCGAAT
GCATGAAAGGAAAAGACTTTGGATCTGTACAATTAGTCCTATCAGACAGCTACAACTGGT
GAGGGTGAGGGTGAGGGTGACTCGTCGTAGGAGATGGAAATCAGCTCTGATCTGAGCTTT
TCAGCATCTTCAGAGTTTCTTTTAGTGACGACTCCGTTTGTTGTAGTGGCGGCGATAGGT
TTCACATCTGAGGACGTTAGAGACTCTTCAACC

QA 2 274 2 274
DS 

RD RR4B948TF 409 0 0
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AAGTCGAATGCATGAAAGGAAAAGACTTTGGATCTGTACAATTAGTCCTATCAGACAGCT
ACAACTGGTGAGAGTGAGGGTGAGGGTGACTCGTCGTAGGAGATGGAAATCAGCTCTGAT
CTGAGCTTTTCAGCATCTTCAGAGTTTCTTTTAGTGACGACTCCGTTTGTTGTAGTGGCG
GCGATAGGTTTCACATCTGAGGACGTTAGAGACTCTTCAACCTCCTCCGGTGAAGTGTAG
GAGATGGCAATGAGAGACTCACGTGCTTCTTCTTGAGAGATATCGTAACTCGGTTGTTCC
ATTCAAACAATCAATGCCTTTTTCTACGCTTCTTCT
CTTTGTTTCGTCC

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4B948JQ 313 0 0
TACAATTAGTCCTATCAGACAGCTACAACTGGTGAGAGTGAGGGTGAGGGTGACTCGTCG
TAGGAGATGGAAATCAGCTCTGATCTGAGCTTTTCAGCATCTTCAGAGTTTCTTTTAGTG
ACGACTCCGTTTGTTGTAGTGGCGGCGATAGGTTTCACATCTGAGGACGTTAGAGACTCT
TCAACCTCCTCCGGTGAAGTGTAGGAGATGGCAATGAGAGACTCACGTGCTTCTTCTTGA
GAGATATCGTAACTCGGTTGTTCCATTCAAACAATCAATGCCTTTTTCTACGCTTCTTCT
CTTTGTTTCGTCC

QA 1 313 1 313
DS 



AS 1 4

CO CL3194Contig1 671 4 4 U
GGATCGAATTATTTCTCTTCTCACAGTCTGTCTGAATTCGACATATCGCCGGTAGGAATT
CGATCTATTTGTGGGACTTTATTCATTTCATCTTATTGACGATTCCAGTAGAGATTCAGA
TTGGACAATAAACCGTAACTGAAGCACGATGCCGACTCTACAAGGCTCTTTGCCTCCTGA
ACTCGCTAACAATGTGGTTAGGTTGTACCGAGAATGTCTTCGTAGAGCTACATTCATTGG
TAAGCAGCAACACAACACTGATCTGGTGGCTGGTATGGTGAGGCAGCAATTTAAAAAACA
CATGAATGAGACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAGTTAAAGGATGATGCTGCTCGGGGACT
CATTAACCACATGTTGTTTGAGTCGGAGAAGCTAACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGAAC
CTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTTACTCTCTCTGGTTCATTGTTAGCCAA
TGATGCAAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTTTGTCATAGCTTAAATGTTTCATAACA
TTGATCAAAGTGGTTCTATACTTCTAATCGAATCATACAGTTCTTCCCCTTTGGTTTGGA
TACTTCGAAAGTCAGTACAATTTTAGATTTTGACGAAATAAATCTAAAAAGGAACCTTTT
CGAGTGAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY01TF U 1
AF RR4EV36JQ C 239
AF RR4EV36TF U 239
AF RR4DY01JQ C 35
BS 1 116 RR4DY01TF
BS 117 238 RR4DY01JQ
BS 239 589 RR4EV36TF
BS 590 671 RR4DY01JQ

RD RR4DY01TF 116 0 0
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CGATCTATTTGTGGGACTTTATTCATTTCATCTTATTGACGATTCCAGTAGAGATT

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR4EV36JQ 351 0 0
GGTAAGCAGCAACACAACACTGATCTGGTGGCTGGTATGGTGAGGCAGCAATTTAAAAAA
CACATGAATGAGACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAGTTAAAGGATGATGCTGCTCGGGGA
CTCATTAACCACATGTTGTTTGAGTCGGAGAAGCTAACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGA
ACCTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTTACTCTCTCTGGTTCATTGTTAGCC
AATGATGCAAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTTTGTCATAGCTTAAATGTTTCATAA
CATTGATCAAAGTGGTTCTATACTTCTAATCGAATCATACAGTTCTTCCCC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4EV36TF 351 0 0
GGTAAGCAGCAACACAACACTGATCTGGTGGCTGGTATGGTGAGGCAGCAATTTAAAAAA
CACATGAATGAGACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAGTTAAAGGATGATGCTGCTCGGGGA
CTCATTAACCACATGTTGTTTGAGTCGGAGAAGCTAACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGA
ACCTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTTACTCTCTCTGGTTCATTGTTAGCC
AATGATGCAAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTTTGTCATAGCTTAAATGTTTCATAA
CATTGATCAAAGTGGTTCTATACTTCTAATCGAATCATACAGTTCTTCCCC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4DY01JQ 637 0 0
AATTCGACATATCGCCGGTAGGAATTCGATCTATTTGTGGGACTTTATTCATTTCATCTT
ATTGACGATTCCAGTAGAGATTCAGATTGGACAATAAACCGTAACTGAAGCACGATGCCG
ACTCTACAAGGCTCTTTGCCTCCTGAACTCGCTAACAATGTGGTTAGGTTGTACCGAGAA
TGTCTTCGTAGAGCTACATTCATTGGTAAGCAGCAACACAACACTGAGCTGGTGGTTGGT
ATGGTGAGGCAGCAATTTAAAAAACACATGAATGAGACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAG
TTAAAGGATGATGCTGCTCGGGGACTCATTAACCACATGTTGTTTGAGTCGGAGAAGCTA
ACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGAACCTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTT
ACTCTCTCTGGTTCATTGTTAGCCAATGATGCAAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTT
TGTCATAGCTTAAATGTTTCATAACATTGATCAAAGTGGTTCTATACTTCTAATCGAATC
ATACAGTTCTTCCCCTTTGGTTTGGATACTTCGAAAGTCAGTACAATTTTAGATTTTGAC
GAAATAAATCTAAAAAGGAACCTTTTCGAGTGAGATC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL3195Contig1 1383 3 7 U
GGAAAGAAAAAAAGAAAAGAAAAGGAAATAAATATTAAGATTCTTCTTCTCTCCAATGGC
GAAACTAACGACGGAGTCCCCTGTCTGCCGCAAAATTGTGCTTTCTTTCTTGGATTTTCT
CGATTCCGTGGAAGTAGCTCCCGGTGTAGACGAGGAAGGGCTTGAGGTTGCTAAAGAATG
CATAAAGGAAGCATTTAAGATCACTTCAGATTCTCCCACAGACGACCCTAACTCCAAACC
CATTTCGCTTGTCAGTCTCTTCACTTCTCCTCCTAAGGGTGATGAGTCTAGTTCCTCTTC
AGGTCCTCCTCACTTGTCCAACTCAGTTGATGCAACAAGCAAACAACCTCTCTTTAACGG
GACTTGTAGAGATGAACTATTTGGGCAACTCTTTGGTGCGCTTGAGAAAGTTCGGTATTT
CAATACCACGCCTAACGGAGATGATGATCCTGCTCAGCTGGAGAAAGCTACCAAGATTTT
TCATGATGCTATCGCTGAAATGGAGAATTCTGGATGCCAGACATTTGATGCCAAAAGCTT
GGCAGAAACATTCAAGTGCCAAGGTAACAAGGCCATGCAGTCCCAGCAGTATCTGGAGGC
GATCGAGCTGTATTCTTTTGCAATTTCACTCTCAGATAAAAACGCTGTTTTTTACTGCAA
CCGGGCTGCTGCATATACCCAGATCAGAATGTGCTCAGAAGCAATCAAAGGACTGTCTTA
AATCCATTGAGATAGATCCAAACTATAGTAAGGCTTACAGTCGTCTTGGGTTAGCATATT
ATGCTCAAGGAAAGTATGCTGATGCTATTGAGAAAGGATTCAAGAAAGCTTTGGAGTTGG
ATCCGCATAATGAATCTGTCAAAGAAAACATCAGGGTGGCTGAACAAAGACTAAGAGAAG
AAGAACAAGGAGGACAGAGACGTAATCAAGATCCGGGAATGGGAGGGCAAGGAGGGCAAG
GAATACCTTCTCAGTTCTCGATGCCTTTAAACCCTGATATGATGAACATGTTCATGAACA
TGGCGGGGAATGGTAGTAACAGAAACGTTGGTACAAATGAGCCTGAGATTCGCCTAGGCG
GAAACATCAACATAGATCTTGGAGGTTCGGATCAAATGCCTGAAGAGTTCTCAGGTGCGT
TGCGATCAATGATGCAGATGTTTGGAGGAGGAGGATCACAGGAAGGCAACCATAACAATA
ACAACAATCCTCAGGGTACTAATGGTGCACATGGAAGACCATCTGGAAATTAAACTTTAA
AGACTCGTGTTGTGTTTTCTAAGGTTATTATACGGTTTGAGTTTATTGCTCCAAAACTTT
TCTAGGTTTTTGAATTTTAACAGCAGAACGATGTAATGTTATCACAAAATGATTGTTCTA
AGC


BQ
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10 10 10 

AF RR4AH43TF U 1
AF RR4DC57TF U 701
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QA 8 229 8 229
DS 

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GTTTGAGTTTATTGCTCCAAAACTTTTCTAGGTTTTTGAATTTTAACAGCAGAACGATGT
AATGTTATCACAAAATGATTGTTCTAAGC

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 4

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GCCCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTAGCTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAG
GTGGATCATCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCAC
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BQ
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AF RR4FP86TF U 1
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AF RR4DL51TF U 1
AF RR4F392TF U 1
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BS 719 743 RR4DL51TF

RD RR4FP86TF 641 0 0
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GCCCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTAGCTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAG
GTGGATCATCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCAC
AAGAACTACAATGGTCTAGGAGAGACGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTG
AAGTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGGTTGACCAGG
TTCGCCGATCTGACCAACGAAGAGTTTCGAGCCATCTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGG
ACTAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGGAGACAAGTTGCCTGAA
GAAGTTGACTGGAGAGCCAAAGGCGCCGTTGTTCCGGTCAAAAATCAAGGATCATGTGGA
AGTTGTTGGGCGTTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAAACAGGG
GAGTTGATATCTCTGTCGGAGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAATAGTGGA
TGTAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4GF52TF 663 0 0
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GCCCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTAGCTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAG
GTGGATCATCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCAC
AAGAACTACAATGGTCTAGGAGAGACGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTG
AAGTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGGTTGACCAGG
TTCGCCGATCTGACCAACGAAGAGTTTCGAGCCATCTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGG
ACTAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGGAGACAAGTTGCCTGAA
GAAGTTGACTGGAGAGCCAAAGGCGCCGTTGTTCCGGTCAAAAATCAAGGATCATGTGGA
AGTTGTTGGGCGTTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAAACAGGG
GAGTTGATATCTCTGTCGGAGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAATAGTGGA
TGTAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTATTAACAACGGTGGTATTGAT
A
CA

QA 1 661 1 661
DS 

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GCCCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTAGCTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAG
GTGGATCATCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCAC
AAGAACTACAATGGTCTAGGAGAGACGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTG
AAGTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGATTGACCAGG
TTCGCCGATCTGACCAACGAAGAGTTTCGAGCCATCTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGG
ACTAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGGAGACAAGTTGCCTGAA
GAAGTTGACTGGAGAGCCAAAGGCGCCGTTGTTCCGGTCAAAAATCAAGGATCATGTGGA
AGTTGTTGGGCGTTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAAACAGGG
GAGTTGATATCTCTGTCGGGGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAATAGTGGA
TGTAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTATTAACAACGGTGGTATTGAT
ACAGAGGAAGATTATCCTTATACCGCTACTGATGATAACATATGCAATACCGATAG**AG
AACACTCGTGTTGTTACCATCGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4F392TF 742 0 0
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GCCCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTAGCTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAG
GTGGATCATCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCAC
AAGAACTACAATGGTCTAGGAGAGACGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTG
AAGTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGGTTGACCAGG
TTCGCCGATCTGACCAACGAAGAGTTTCGAGCCATCTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGG
ACTAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGAAGACAAGTTGCCTGAA
GAAGTTGACTGGAGAGCCAAAGGCGCCGTTGTTCCGGTCAAAAATCAAGGATCATGTGGA
AGTTGTTGGGCGTTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAAACAGGG
GAGTTGATATCTCTGTCGGAGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAATAGTGGA
TGTAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTATTAACAACGGTGGTATTGAT
A*AGAGGAAGATTATCCTTATACCGCTACTGATGATAACATATGCAATACCGATAAGAAG
AACACTCGTGTTGTTACCATCG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 4

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ATAAGCTTTTGAAGTTTGGTGTGCCCTGCAAAGTTTCCTGGTGGAAGATTTGTTTCTTTC
TTTCTTTAAGACTTTGAGCTTTTCTATTTAATAAAGCATTATGTTTCTACCTCTATGTCA
ACCAGTTCAATCCTTGGGTTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATC
TCTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCT
GTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATCTTCAGTGTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A194JQ C 1
AF RR4A194TF U 138
AF RR4A194JQD C 1
AF RR4A194TFB U 1
BS 1 137 RR4A194TFB
BS 138 337 RR4A194TF

RD RR4A194JQ 337 0 0
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TTTCTTTAAGACTTTGAGCTTTTCTATTTAATAAAGCATTATGTTTCTACCTCTATGTCA
ACCAGTTCAATCCTTGGGTTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATC
TCTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCT
GTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATCTTCAGTGTGC

QA 1 337 1 337
DS 

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TTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCTGTAGCTCCATGAACTAA
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QA 1 200 1 200
DS 

RD RR4A194JQD 337 0 0
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TTTCTTTAAGACTTTGAGCTTTTCTATTTAATAAAGCATTATGTTTCTACCTCTATGTCA
ACCAGTTCAATCCTTGGGTTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATC
TCTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCT
GTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATCTTCAGTGTGC

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR4A194TFB 337 0 0
GGGCAGCGCAGCAATTTTCGGGCTTTTCCTAGGTGCTGGCAGTTTGATACACTGTGGAAA
ATAAGCTTTTGAAGTTTGGTGTGCCCTGCAAAGTTTCCTGGTGGAAGATTTGTTTCTTTC
TTTCTTTAAGACTTTGAGCTTTTCTATTTAATAAAGCATTATGTTTCTACCTCTATGTCA
ACCAGTTCAATCCTTGGGTTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATC
TCTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCT
GTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATCTTCAGTGTGC

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 3

CO CL3198Contig1 1004 3 15 U
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CTTCCAGTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTT
CTTCTCTCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATT
CCAAATCTTCAGAAACATCGGTTCCCCAAGAGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTG
GGCTCTCTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCT
CTGCAGCCTCGATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTGCTGGCAAC
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TAAGAACATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCTTTATAATCC
TCCCTGCTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCCGTCCAAGCAAAAGCTCCATTGGAA
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TCAGTTTGTCCTTTGCAACCTTGAAATTCTTGTAGAGCAACTCAGCTTGAGATGGAGCAG
CTTGCATGTGCATGTCCTGTCCCTTGTCAAATGCTTCCCATGAGTGGATGTTCATCTGTT
TGAACTCTAAAGCTTGGCCACTGTTTCTGTACTGATTATCTCCCAAATAAAATTTATCAT
TGGGATCTGCATCTGGAAGTGGGTCTTCACGCATGGATCGCGTTTTAGGGTCATAATGAG
CCGAATTGATATCAAGGTTCAACAGGTATTTTGCTGTGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX76JQ U 1
AF RR4AE12JQ U 6
AF RR4AE12TF C 241
BS 1 120 RR4GX76JQ
BS 121 121 RR4AE12JQ
BS 122 312 RR4GX76JQ
BS 313 313 RR4AE12JQ
BS 314 353 RR4GX76JQ
BS 354 354 RR4AE12JQ
BS 355 580 RR4GX76JQ
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BS 582 635 RR4GX76JQ
BS 636 636 RR4AE12JQ
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BS 739 769 RR4GX76JQ
BS 770 912 RR4AE12JQ
BS 913 1004 RR4AE12TF

RD RR4GX76JQ 770 0 0
CCAAATGTAATAAGGTTCATTTATTTCCACCGCAAGTGTTGAGAGTAAACAGATGCAAAA
GTAATAAGTTTTCTTCAGGCTAAAATGGTAACACAGGACAAACGAGAAACATTTTTTTTC
CGAGGAAATCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAGCTTCCATTT
CTTCCAGTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTT
CTTCTCTCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATT
CCAAATCTTCAGGAACATCGGTTCCCCAAGAGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCCTCTTTG
GGCTCTCTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCT
CTGCAGCCTCGATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTGCTGGCAAC
ATCTATATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGTGATTGTTAG
TAAGAACATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACATCCTGTCCCTTTATAATCC
TCCCTGCTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCTGTCCAAGCAAAAGCTCCATTGGAA
TTTCATCTTCTGTAGAAGCATTCCCATACTTTTCCATGATTGTGTCCTTTGTCTGAGTCT
TCAGTTTGTCCTTTGCA*CCTTGAAATTCTTGTAGAGCAACTCAGCTTG
C

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4AE12JQ 907 0 0
C
GTAATAAGGTTCATTTATTTCCACCGCAAGTGTTGAGAGTAAACAGATGCAAAAGTAATA
AGTTTTCTTCAGGCTAAAATGGTAACACAGGACAAACGAGAAACATTTTTTTTCAGAGGA
AATCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAGCTTCCATTTCTTCCA
GTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTTCTTCTC
TCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAAT
CTTCAGAAACATCGGTTCCCCAAGAGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTGGGCTCT
CTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCTCTGCAG
CCTCGATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTGCTGGCAACATCTAT
ATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGTGATTGTTAGTAAGAA
CATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCTTTATAATCCTCCCTG
CTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCCGTCCAAGCAAAAGCTCCATTGGAATTTCAT
CTTCTGTAGAAGCATTCCCATACTTTTCCATGATTGTGTCCTTTGTCTGAGTCTTCAGTT
TGTCCTTTGCAACCTTGAAATTCTTGTAGAGCAACTCAGCTTGAGATGGAGCAGCTTGCA
TGTGCATGTCCTGTCCCTTGTCAAATGCTTCCCATGAGTGGATGTTCATCTGTTTGAACT
CTAAAGCTTGGCCACTGTTTCTGTACTGATTATCTCCCAAATAAAATTTATCATTGGGAT
CTGCAT

QA 2 907 2 907
DS 

RD RR4AE12TF 764 0 0
CTTCTCTCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATT
CCAAATCTTCAGAAACATCGGTTCCCCAAGAGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTG
GGCTCTCTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCT
CTGCAGCCTCGATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTGCTGGCAAC
ATCTATATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGTGATTGTTAG
TAAGAACATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCTTTATAATCC
TCCCTGCTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCCGTCCAAGCAAAAGCTCCATTGGAA
TTTCATCTTCTGTAGAAGCATTCCCATACTTTTCCATGATTGTGTCCTTTGTCTGAGTCT
TCAGTTTGTCCTTTGCAACCTTGAAATTCTTGTAGAGCAACTCAGCTTGAGATGGAGCAG
CTTGCATGTGCATGTCCTGTCCCTTGTCAAATGCTTCCCATGAGTGGATGTTCATCTGTT
TGAACTCTAAAGCTTGGCCACTGTTTCTGTACTGATTATCTCCCAAATAAAATTTATCAT
TGGGATCTGCATCTGGAAGTGGGTCTTCACGCATGGATCGCGTTTTAGGGTCATAATGAG
CCGAATTGATATCAAGGTTCAACAGGTATTTTGCTGTGTCTTCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 4

CO CL3199Contig1 1266 4 17 U
GGGAAGCGAAAAAGAACACAGAGAAAGCTGGAAAATTAAAAAAAAAATCCCTTCTTTCCT
GCAGAAGAGAAGAGAGAATCTATCGATAGGTTTTGCTGTGTTTTGTTAATTAGTGAAGAT
GATGGTAGCAGCTATTAACAGCTTCGATCTTTGGCAAAAGGATGTTTTTTT*CTCAGCAG
CAGAGGAGGTCCAAGAATCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTTGGATTAAAG
AGAAGAGACAAGGTCGATCAGACCAGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTTTGAGCACTG
CTAAATGGCAGCTGGAAGAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCACCACGGACATTGCC
GAGACGACACTACCTTGACTCGGCATAAATAGTTTGTCACCGCTATCGAGAACCAGATTT
ACCGAGTGCAGTCCGCACTGCAAGAGTCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGCCTCTGCGTC
TGGTTGATCTCAACAAGGAAGAGCGTGATGACCTCGCCATGTTTCTCTCTGGCTCTTCTT
CTCTGACCTCGGATAGTTTCAGCAGTGGAAGAAGAAGCACCAACTTGAGAGACTCCTCGA
CGAGCTCCTTGGTTGAAAACACGCGTGGGAGAAGAGAGACTAGCTGTGTGATAGACATTG
TTGACGAGGGAGGTAGCCCTGAAAGTGCTGATGCTGTGATCCGCGTGCAGCAGGATGCGG
ACAAGAGGTCGGGGACGAGAAGAACATGGAGTTCACCGAATGTTCCTAACGTAACTACGT
TGAGGATTAACGTGGGAAGAGGAGGAGAAGAAGACGAAGAAGAGACTTGTGTTTGACATC
GAAGACACTCCTAAGGAGAAAGGATCTAAACCTCTGTTTTCGATGCAGAGATGTCGTGAT
TATAACCTTATCTTTGACAGAGTCAGACAATATCAAAGGAGGTTTCGTGTTCCCTTTAGC
AGACCGGTCCAGCTCATTCTTTCCTTAACGCTAATCTTGTTTCTTCTATTACTGTTTCGA
GTTTATTAGTCTTGACAACTTAAAACTTTGGTTTGCTGAAACACTCGAGAACATTTGACA
AGATTACATATTCTTGCTTGTTGGTTGGTCACACACATCAGAAGAACAAGCCTGCATTTT
CTTTACTTTCTTTTGTCCTCAAGGAAACATATATAGGGACTTTGTAACTTTGTAGGTCTA
TTGTATACTAAAAAAAATTTCGTGTGTTGTTGTTACAAATCTATGCGGTTAAGGTTGTTG
AAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4GX90TF U 1
AF RR4C993TF U 111
AF RR4C993JQ C 111
AF RR4GX90JQ C 502
BS 1 171 RR4GX90TF
BS 172 172 RR4C993TF
BS 173 344 RR4GX90TF
BS 345 345 RR4C993TF
BS 346 389 RR4GX90TF
BS 390 390 RR4C993TF
BS 391 595 RR4GX90TF
BS 596 596 RR4C993TF
BS 597 669 RR4GX90TF
BS 670 672 RR4C993TF
BS 673 709 RR4GX90TF
BS 710 776 RR4C993JQ
BS 777 777 RR4GX90JQ
BS 778 790 RR4C993JQ
BS 791 791 RR4GX90JQ
BS 792 795 RR4C993JQ
BS 796 1266 RR4GX90JQ

RD RR4GX90TF 711 0 0
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GCAGAAGAGAAGAGAGAATCTATCGATAGGTTTTGCTGTGTTTTGTTAATTAGTGAAGAT
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CAGAGGAGGTCCAAGAATCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTTGGATTAAAG
AGAAGAGACAAGGTCGATCAGACCAGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTTTGAGCACTG
CTAAATGGCAGCTGGAAGAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCGACCACGGACATTGCC
GAGACGACACTACCTTGACTCGGCATAAACAGTTTGTCACCGCTATCGAGAACCAGATTT
ACCGAGTGCAGTCCGCACTGCAAGAGTCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGCCTCTGCGTC
TGGTTGATCTCAACAAGGAAGAGCGTGATGACCTCGCCATGTTTCTCTCTGGCTCTTCTT
CTCTGACCTCGGATAGTTTCAGCAGTGGAAGAAGAAGCACCAACTTGAGAGACTCTTCGA
CGAGCTCCTTGGTTGAAAACACGCGTGGGAGAAGAGAGACTAGCTGTGTGATAGACATTG
TTGACGAGG**AGTAGCCCTGAAAGTGCTGATGCTGTGATCCGCGTGCA
GC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4C993TF 599 0 0
G
AGTGAAGATGATGGTAGCAGCTATTAACAGCTTCGATCTTTGGCAAAAGGATGTTTTTTT
*CTCAGCAGCAGAGGAGGTCCAAGAATCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTT
GGATTAAAGAGAAGAGACAAGGTCGATCAGACCAGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTT
TGAGCACTGCTAAATGGCAGCTGGAAGAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCACCACG
GACATTGCCGAGACGACACTACCTTGACTCGGCATAAATAGTTTGTCACCGCTATCGAGA
ACCAGATTTACCGAGTGCAGTCCGCACTGCAAGAGTCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGC
CTCTGCGTCTGGTTGATCTCAACAAGGAAGAGCGTGATGACCTCGCCATGTTTCTCTCTG
GCTCTTCTTCTCTGACCTCGGATAGTTTCAGCAGTGGAAGAAGAAGCACCAACTTGAGAG
ACTCCTCGACGAGCTCCTTGGTTGAAAACACGCGTGGGAGAAGAGAGACTAGCTGTGTGA
TAGACATTGTTGACGAGGGAGGTAGCCCTGAAAGTGCTGATGCTGTGATCCGCGTGCA

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR4C993JQ 685 0 0
G
AGTGAAGATGATGGTAGCAGCTATTAACAGCTTCGATCTTTGGCAAAAGGATGTTTTTTT
*CTCAGCAGCAGAGGAGGTCCAAGAATCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTT
GGATTAAAGAGAAGAGACAAGGTCGATCAGACCAGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTT
TGAGCACTGCTAAATGGCAGCTGGAAGAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCACCACG
GACATTGCCGAGACGACACTACCTTGACTCGGCATAAATAGTTTGTCACCGCTATCGAGA
ACCAGATTTACCGAGTGCAGTCCGCACTGCAAGAGTCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGC
CTCTGCGTCTGGTTGATCTCAACAAGGAAGAGCGTGATGACCTCGCCATGTTTCTCTCTG
GCTCTTCTTCTCTGACCTCGGATAGTTTCAGCAGTGGAAGAAGAAGCACCAACTTGAGAG
ACTCCTCGACGAGCTCCTTGGTTGAAAACACGCGTGGGAGAAGAGAGACTAGCTGTGTGA
TAGACATTGTTGACGAGGGAGGTAGCCCTGAAAGTGCTGATGCTGTGATCCGCGTGCAGC
AGGATGCGGACAAGAGGTCGGGGACGAGAAGAACATGGAGTTCACCGAATGTTCCTAACG
TAACTGCGTTGAGGATTAATGTGG

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4GX90JQ 765 0 0
AGCGTGATGACCTCGCCATGTT*CTCTCTGGCTCTTCTTCTCTGACCTCGGATAGTTTCA
GCAGTGGAAGAAGAAGCACCAACTTGAGAGACTCTTCGACGAGCTCCTTGGTTGAAAACA
CGCGTGGGAGAAGAGAGACTAGCTGTGTGATAGACATTGTTGACGAGGGAGGTAGCCCTG
AAAGTGCTGATGCTGTGATCCGCGTGCAGCAGGATGTGGATAAGAGGTCGGGGACGAGAA
GAACATGGAGTTCACCGAATGTTCCTAACGTAACTACGTTGAGGATTAACGTGGGAAGAG
GAGGAGAAGAAGACGAAGAAGAGACTTGTGTTTGACATCGAAGACACTCCTAAGGAGAAA
GGATCTAAACCTCTGTTTTCGATGCAGAGATGTCGTGATTATAACCTTATCTTTGACAGA
GTCAGACAATATCAAAGGAGGTTTCGTGTTCCCTTTAGCAGACCGGTCCAGCTCATTCTT
TCCTTAACGCTAATCTTGTTTCTTCTATTACTGTTTCGAGTTTATTAGTCTTGACAACTT
AAAACTTTGGTTTGCTGAAACACTCGAGAACATTTGACAAGATTACATATTCTTGCTTGT
TGGTTGGTCACACACATCAGAAGAACAAGCCTGCATTTTCTTTACTTTCTTTTGTCCTCA
AGGAAACATATATAGGGACTTTGTAACTTTGTAGGTCTATTGTATACTAAAAAAAATTTC
GTGTGTTGTTGTTACAAATCTATGCGGTTAAGGTTGTTGAAGTTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL3201Contig1 341 4 10 U
GGGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGACTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCGA
AA*GATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAGATCTTTCCTGAGCTCCAAGTTCTC
TACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAAGCCAGCGACAA
CAAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTGTGTTTCGATGTTGCGTTTCTATGCTC
TAAAAACATTTTCAGTTTGAATGTTTCATCTTTACTTAATTAGCTTTTGATCATATCCAG
TTTCTTATATGTCAAATTGAAGATATCCAATTCACCTTAAG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR4G402TF U 1
AF RR4BE78TF U 2
AF RR4G302JQ C 2
AF RR4G302TF U 2
BS 1 32 RR4G402TF
BS 33 33 RR4G302TF
BS 34 36 RR4G402TF
BS 37 37 RR4G302TF
BS 38 62 RR4G402TF
BS 63 63 RR4G302TF
BS 64 237 RR4G402TF
BS 238 238 RR4G302TF
BS 239 294 RR4G402TF
BS 295 341 RR4BE78TF

RD RR4G402TF 294 0 0
GGGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGGGAAGTTACCAGAGATTTGATCGA
AAAGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAGATCTTTCCTGAGCTCCAAGTTCTC
TACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAAGCCAGCGACAA
CAAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTGTGTTTCGATGTTGCGTTTCTATGTTC
TAAAAACATTTTCAGTTTGAATGTTTCATCTTTACTTAATTAGCTTTTGATCAT

QA 1 294 1 294
DS 

RD RR4BE78TF 340 0 0
GGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGGGAAGTTACCAGAGATTTGATCGAA
AAGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAGATCTTTCCTGAGCTCCAAGTTCTCT
ACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAAGCCAGCGACAAC
AAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTGAGTTTCGATGTTGCGTTTCTATGTTCT
AAAAACATTTTCAGTTTGAATGTTTCATCTTTACTTAATTAGCTTTTGATCATATCCAGT
TTCTTATATGTCAAATTGAAGATATCCAATTCACCTTAAG

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR4G302JQ 337 0 0
GGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGACTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCGAA
A*GATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAGATCTTTCCTGAGCTCCAAGTTCTCT
ACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAAGCCAGCGACAAC
AAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTGTGTTTCGATGTTGCGTTTCTATGCTCT
AAAAACATTTTCAGTTTGAATGTTTCATCTTTACTTAATTAGCTTTTGATCATATCCAGT
TTCTTATATGTCAAATTGAAGATATCCAATTCACCTT

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR4G302TF 337 0 0
GGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGACTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCGAA
A*GATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAGATCTTTCCTGAGCTCCAAGTTCTCT
ACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAAGCCAGCGACAAC
AAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTGTGTTTCGATGTTGCGTTTCTATGCTCT
AAAAACATTTTCAGTTTGAATGTTTCATCTTTACTTAATTAGCTTTTGATCATATCCAGT
TTCTTATATGTCAAATTGAAGATATCCAATTCACCTT

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 3

CO CL3202Contig1 539 3 3 U
GGAAAACATCACTATTTCATTATCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAAATTTGGTTTATTGG
TTTCGTTGTTCTTACAATTCTTCAGTTCGGAAAAATGGCGATTGCACAGACAACCAAAGG
TCCCAGATATTGTTCTAATACTTATTCGATAAAAGGTGAAACATGTAATGCCAATAATTG
TAAAACCGAATGTCTCAAAAGGCATAAACTGGGGGAAGGTGTTTGCGTATCCGACAACGG
AAGACCATTGGCATGCCGATGTCGTTATCCATATGGTGATTTTCCACGTCCTTGTTAATG
AAACTCGAATAATATTTATAATATACTATGCTTTTGTCATAGAAAAAATAAAATTATTAA
TAAATTGTTGCATGCTGGTGTTTTGGCATGCTTAATAAGGTACACTATGTTACTGAATAC
AAATATAAACTAGATTATGAAATTTAATTTTTATATTTATGTTTTTAATCATATTTGTAT
TTTTGTATTATATTTCTTTTGTAAAATGTTTTAATAATTGTATTAAAATAGTTGGACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW65JQ C 96
AF RR4AW65TF U 96
AF RR4EW03TF U 1
BS 1 210 RR4EW03TF
BS 211 211 RR4AW65TF
BS 212 539 RR4EW03TF

RD RR4AW65JQ 301 0 0
G
GGCGATTGCACAGACAACCAAAGGTCCCAGATATTGTTCTAATACTTATTCGATAAAAGG
TGAAACATGTAATGCCAATAATTGTAAAACCGAATGTCTCAAAAGGCATAAACTGGGGGA
AGGTGTTTGCGTATCCGACAACGGAAGACCATTGGCATGCCGATGTCGTTATCCATATGG
TGATTTTCCACGTCCTTGTTAATGAAACTCGAATAATATTTATAATATACTATGCTTTTG
TCATAGAAAAAATAAAATTATTAATAAATTGTTGCATGCTGGTGTTTTGGCATGCTTAAT

QA 2 301 2 301
DS 

RD RR4AW65TF 301 0 0
G
GGCGATTGCACAGACAACCAAAGGTCCCAGATATTGTTCTAATACTTATTCGATAAAAGG
TGAAACATGTAATGCCAATAATTGTAAAACCGAATGTCTCAAAAGGCATAAACTGGGGGA
AGGTGTTTGCGTATCCGACAACGGAAGACCATTGGCATGCCGATGTCGTTATCCATATGG
TGATTTTCCACGTCCTTGTTAATGAAACTCGAATAATATTTATAATATACTATGCTTTTG
TCATAGAAAAAATAAAATTATTAATAAATTGTTGCATGCTGGTGTTTTGGCATGCTTAAT

QA 2 301 2 301
DS 

RD RR4EW03TF 539 0 0
GGAAAACATCACTATTTCATTATCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAAATTTGGTTTATTGG
TTTCGTTGTTCTTACAATTCTTCAGTTCGGAAAAATGGCGATTGCACAGACAACCAAAGG
TCCCAGATATTGTTCTAATACTTATTCGATAAAAGGTGAAACATGTAATGCCAATAATTG
TAAAACCGAATGTCTCAAAAGGCATAAACTAGGGGAAGGTGTTTGCGTATCCGACAACGG
AAGACCATTGGCATGCCGATGTCGTTATCCATATGGTGATTTTCCACGTCCTTGTTAATG
AAACTCGAATAATATTTATAATATACTATGCTTTTGTCATAGAAAAAATAAAATTATTAA
TAAATTGTTGCATGCTGGTGTTTTGGCATGCTTAATAAGGTACACTATGTTACTGAATAC
AAATATAAACTAGATTATGAAATTTAATTTTTATATTTATGTTTTTAATCATATTTGTAT
TTTTGTATTATATTTCTTTTGTAAAATGTTTTAATAATTGTATTAAAATAGTTGGACAA

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 4

CO CL3203Contig1 792 4 6 U
CAATGGATCAAAAAGTTGCATTATATTTTGATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAG
AAAGTGCAGTCACAGCAGCACACGTGTACTACATACAGATATATTATTTGTTGTAGTTTT
CTTCATAAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCACCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGT
CAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACAC
TGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCT
CTCAAGCAAATCCGAAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAA
CCTAACGTACCTGCTGAAATTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAGAT
GAGGAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGAT
GAGGATCTGGAATGGTTGGTATTGCGCGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAA
GAACGGGTAGAAGTAACAGACGGCTGAGATTATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTC
TCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGTCTAGGTTTTGAGAA
TTGGGTGTTAGGGCTTAGAGGGAGAGAAAA*GAACGCCCGGTTGGGTTTCCGGTTTGGAA
GAAGGCGAGAGATGGTAATGGAGAGACAAGATGAGATATTGCCATTGCTCTGTGTCTGTT
TCCGCTTCACCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR53JQ U 5
AF RR4DZ54JQ U 1
AF RR4DZ54TF C 28
AF RR4BR53TF C 160
BS 1 314 RR4DZ54JQ
BS 315 315 RR4BR53JQ
BS 316 417 RR4DZ54JQ
BS 418 418 RR4BR53JQ
BS 419 773 RR4DZ54JQ
BS 774 792 RR4BR53TF

RD RR4BR53JQ 642 0 0
GGATCAAAAAGTTGCATTATATTTTGATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAGAAAG
TGCAGTCACAGCAGCACACGTGTACTACATACAGATATATTATTTGTTGTAGTTTTCTTC
ATAAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCATCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGTCAGA
CCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTG
CTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCTCTCA
AGCAAATCCGAAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAACCTA
ACGTACCTGCTGAAATTAGAGTTCCTCACGGCGACGAAGTAGAGAGCGATGAAGATGAGG
AAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGG
ATCTGGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAAGAAC
GGGTAGAAGTAACAGACGGCTGAGATTATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCC
TTGGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4DZ54JQ 774 0 0
CAATGGATCAAAAAGTTGCATTATATTTTGATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAG
AAAGTGCAGTCACAGCAGCACACGTGTACTACATACAGATATATTATTTGTTGTAGTTTT
CTTCATAAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCACCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGT
CAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACAC
TGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCT
CTCAAGCAAATCCGGAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAA
CCTAACGTACCTGCTGAAATTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAAAT
GAGGAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGAT
GAGGATCTGGAATGGTTGGTATTGCGCGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAA
GAACGGGTAGAAGTAACAGACGGCTGAGATTATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTC
TCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGTCTAGGTTTTGAGAA
TTGGGTGTTAGGGCTTAGAGGGAGAGAAAA*GAACGCCCGGTTGGGTTTCCGGTTTGGAA
GAAGGCGAGAGATGGTAATGGAGAGACAAGATGAGATATTGCCATTGCTCTGT
C

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4DZ54TF 748 0 0
TTGATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAGAAAGTGCAGTCACAGCAGCACACGTGT
ACTACATACAGATATATTATTTGTTGTAGTTT*CTTCATAAATCAAAGGACTTGCCTATC
AGCAGCACCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGTCAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCC
ATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATC
CAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCTCTCAAGCAAATCCGGAAAAATCAACAG
CACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAACCTAACGTACCTGCTGAAATTAGAGTT
CCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAGATGAGGAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTT
GAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGGATCTGGAATGGTTGGTATTGCGC
GATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAAGAACGGGTAGAAGTAACAGACGGCTGA
GATTATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGCGGC
GGCTCTTTCCCTTGAAAGTCTAGGTTTTGAGAATTGGGTGTTAGGGCTTAGAGGGAGAGA
AAA*GAACGCCCGGTTGGGTTTCCGGTTTGGAAGAAGGCGAGAGATGGTAATGGAGAGAC
AAGATGAGATATTGCCATTGCTCTGT
CC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4BR53TF 633 0 0
AACAATGGGCAACCTCGGGGTCAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACA
GACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCC
ATCTCTAGGATTAAAGCTCCTCTCAAGCAAATCCGAAAAAATCAACAGCACGTCGAGCAC
AATGGCCTGCATCGTGTTGAACCTAACGTACCTGCTGAAATTAGAGTTCCTCACGGCGAC
GAAGTAGAGAGCGATGAAGATGAGGAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGAT
GGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGGATCTGGAATGGTTGGTATCGCGTGATGATGAATTT
ACCGTACTGAATCCCATCGAAGAACGGGTAGAAGTAACAGACGGCTGAGATTATCCGATC
TGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCT
TGAAAGTCTAGGTTTTGAGAATAGGGTGTTAGGGCTTAGAGGGAGAGAAAAAGAACGCCC
GGTTGAGTTTCCGGTTTGGAAGAAGGCGAGAGATGGTAATGGAGAGACAAGATGAGATAT
TGCCGTTGCTCTGTGTCTGTTTCCGCTTCACCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

CO CL3204Contig1 738 4 10 U
ATGCATGTACTTTTACAAAAAGAAAAAGATATTAAGCATGTTAGTGACAAACTAAATGCC
ATAATCCAAAGCCCATATCCATACTCATAAGTCATAACCATTATAACAATAATATAAAAC
GTCTTAACATTTTTACCCAAGAAAAAATAATATAACACGTGGAAGATTATGGCATCAAAA
TCTAAGAAAGTGGCCTTTGATTAGATGAATTTCCACTAATGCAGAGAGCACCGTGCCCAG
CCGTAAGCTTCACCAGCAATCATTTTCAGAGCTTAGTCATTGCTGATGTTTGCCCAAATC
ACCTCGTCTTTTCTTGATACAATCTCTCCGTCGGTAAAGAATCAGAGAAATAAGCAGTTC
AGTGAGTTTTTTTTCTGTGCAGCACTAATTTGTAATCTCTTTCTTCAATAAGTATAACAT
GAATCACTGACGCCTTAAATCTGCAATCGTTTATCGAAGCTATACATGGTTGGTGAGTAA
AACAACAGTTATGTTTTCCCCTTTAGTTATACACTTGCTCATTTGAAACTATGATTGTTT
TCTGATTTACCGTTTACTTTTGTAGTATCTCTCGAGTGCTGTGGTTGATCTCGGGCAAAT
GCAGTTTCTTACCTGTCTCCCAGAAGCACTTTTCTTGCAGAAGGTGTTTTCTTTAGACGA
ACGTCTCTTGACAATCTGGGGCAATTACGATGTCTGAATTTGTCTGGATTACAATGATTG
AGAAGGAGAAAGTGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E221JQ U 1
AF RR4E221TF C 1
AF RR4CT86JQ U 58
AF RR4CT86TF C 58
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BS 78 178 RR4E221JQ
BS 179 179 RR4CT86JQ
BS 180 307 RR4E221JQ
BS 308 308 RR4CT86JQ
BS 309 373 RR4E221JQ
BS 374 374 RR4CT86JQ
BS 375 721 RR4E221JQ
BS 722 738 RR4CT86JQ

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A
C

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AGTGAGTTTTTTT*CTGTGCAGCACTAATTTGTAATCTCTTTCTTCAATAAGTATAACAT
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AACAACAGTTATGTTTTCCCCTTTAGTTATACACTTGCTCATTTGAAACTATGATTGTTT
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A
C

QA 1 721 1 721
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GT
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GAGAAGGAGAAAGTGATCC

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GT
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ATCTAAGCAAGTGGCCTTTGATTAGATGAATTTCCACTAATGCAGAGAGCACCGTGCCCA
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GAGAAGGAGAAAGTGATCC

QA 3 681 3 681
DS 



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BQ
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AF RR4FP37JQ C 1
AF RR4G987JQ C 1
AF RR4FP37TF U 1
AF RR4G987TF U 1
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QA 1 344 1 344
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QA 1 344 1 344
DS 

RD RR4G987TF 344 0 0
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QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 4

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E296JQ U 28
AF RR4DS21JQ U 27
AF RR4DS21TF C 1
AF RR4E296TF C 316
BS 1 27 RR4DS21TF
BS 28 159 RR4DS21JQ
BS 160 160 RR4E296JQ
BS 161 163 RR4DS21JQ
BS 164 164 RR4E296JQ
BS 165 227 RR4DS21JQ
BS 228 228 RR4E296JQ
BS 229 317 RR4DS21JQ
BS 318 318 RR4DS21TF
BS 319 351 RR4DS21JQ
BS 352 652 RR4DS21TF

RD RR4E296JQ 237 0 0
ACAACACGAAGGGCATCGATATCCATAAAAACAAAGCTGGGGTTAACATCTTGGTTAATG
GTGCTGTAAGCACCAGTAGCAAAACCCGGGTTGATGACAACTCCTCCCTCGTGTTTGTAG
GCAGTGAACTGGTGGGTATGTCCAGTCACGAGTATGTCCACGTCGAGCTGTCTCTGAAGC
ATGGCCAGTGAGTCTAAATCGCCCCATGGGATCACCTGGTGGCCGTGGCA
AAAGCCG

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR4DS21JQ 325 0 0
T
ACAACACGAAGGCCATCGATATCCATAAAAACAAAGCTGGGGTTAACATCTTGGTTAATG
GTGCTGTAAGCACCAGTAGCAAAACCCGGGTTGATGACAACTCCTCCCTCGTGTTTGTAG
GCAGTGAACTGGGGGGGATGTCCAGTCACGAGTATGTCCACGTCGAGCTGTCTCTGAAGC
ATGGCCAGTGAGTCTAAATCCCCCCATGGGATCACCTGGTGGCCGTGGCAAAGGCCGAGC
TTGAATTGGCCAATAAACAAGGTTTTAGTGTCGGGGTAACGTGCATCTTCCTCAAACTCG
CCTTGAACTATATGCAAATCAGGG

QA 2 325 2 325
DS 

RD RR4DS21TF 652 0 0
CCATCGATGAGCTCATAGACATAGACTACAACACGAAGGCCATCGATATCCATAAGAACA
AAGCTGGGGTTAACATCTTGGTTAATGGTGCTGTAAGCACCAGTAGCAGAGCCCGGGTTG
ATGACAACTCCTCCCTCGTGTTTGTAGGCAGTGAACTGGTGGGTATGTCCAGTCACGAGT
ATGTCCACGTCGAGCTGTCTCTGAAGCATGGCCAGTGAGTCTAAATCGCCCCATGGGATC
ACCTGGTGGCCGTGGCAGAGGCCGAGCTTGAATTGGCCAATAGACAAGGTTTTAGTGTCG
GGGTAACGTGCATCTTCGTCAAACTCGCCTTGAACTATATGCAAATCAGGGCAGATTGTC
TTCAAGTAGTCATGTATTTCTTTGATGGAGAGGTTGCCAGTGCAGAGGATGTGTTGAATC
TTGCCAGGAACGAGCATGGATTTGAACTTTGGGGGTAGATCAGCCGCTCTTTGGGGTACA
TGAATATCCCCCAACGCCAATACCAACACCATTTCCAAAAAAAAAAAAAAATCGGGCCTC
CGGATCAGGATTGAAATTAGAATACCAGATGGATTTGGTTTCTCAGAGATCGTCCATGGG
AAGATCCCTTTCTTTTTTCCTTTGTTTTTTTCTCTTCTAGCTCTCTGTCTCC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4E296TF 337 0 0
TCGTCAAACTCGCCTTGAACTATATGCAAATCAGGGCAGATTGTCTTCAAGTAGTCATGT
ATTTCTTTGATGGAGAGGTTGCCAGTGCAGAGGATGTGTTGAATCTTGCCAGGAACGAGC
ATGGATTTGAACTTTGGGGGTAGATCAGCCGCTCTTTGGGGTACATGAATATCCCCCAAC
GCCAATACCAACACCATTTCCAAAAAAAAAAAAAAATCGGGCCTCCGGATCAGGATTGAA
ATTAGAATACCAGATGGATTTGGTTTCTCAGAGATCGTCCATGGGAAGATCCCTTTCTTT
TTTCCTTTGTTTTTTTCTCTTCTAGCTCTCTGTCTCC

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 4

CO CL3207Contig1 451 4 3 U
GCATGGCGAGAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTACATTAGGAGTCGTGG
TAAGTTTCTCATTTGCGCACGGCACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGAGA
GCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAAC
AGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGATGATG
ATACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATACCGATGATGATG
ATGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTA
TAACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATT
TAGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR4EK73JQ C 1
AF RR4EK73TF U 1
AF RR4DM78TF U 3
AF RR4F385TF U 1
BS 1 9 RR4EK73JQ
BS 10 448 RR4EK73TF
BS 449 451 RR4EK73JQ

RD RR4EK73JQ 451 0 0
GCATGGCGAGAGTTTTTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTACATTAGGAGTCGTGG
TAAGTTTCTCATTTGCGCACGGCACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGAGA
GCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAAC
AGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGATGATG
ATACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATACCGATGATGATG
ATGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTA
TAACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATT
TAGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCCG

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4EK73TF 451 0 0
GCATGGCGA
GAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTACATTAGGAGTCGTGGTAAGTTTCT
CATTTGCGCACGGCACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGAGAGCAGTAAGA
CAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAACAGGTCATGG
GTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGATGATGATACTGATA
CAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATACCGATGATGATGATGATGACA
AGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTATAACAATTT
TATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATTTAGATAAAT
AAAAGGAATACATCATTTC
CCG

QA 10 448 10 448
DS 

RD RR4DM78TF 446 0 0
GCATGGC
GAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTACATTAGGAGTCGTGGTAAGTTTCT
CATTTGCGCACGGCACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGAGAGCAGTAAGA
CAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAACAGGTCATGG
GTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGATGATGATACTGATA
CAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATACCGATGATGATGATGATGACA
AGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTT*ACAAATTAATAATGTTGATATTATAACAATTT
TATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATTTAGATAAAT
AAAAGGAATACATCATTTC

QA 8 446 8 446
DS 

RD RR4F385TF 451 0 0
GCATGGCGA
GAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTACATTAGGAGTCGTGGTAAGTTTCT
CATTTGCGCACGGCACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGAGAGCAGTAAGA
CAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAACAGGTCATGG
GTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGATGATGATACTGATA
CAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATACCGATGATGATGATGATGACA
AGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTATAACAATTT
TATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATTTAGATAAAT
AAAAGGAATACATCATTTC
CCG

QA 10 448 10 448
DS 



AS 1 4

CO CL3208Contig1 971 4 8 U
GGAGTAGCAAAATCTCCACCAAGAAAAATCTGAATCGGTCTCGCTTGCTAATACAAGCTC
ATTGCAAAGTGATGAAGACATGGCTGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCACTTCTGC
ACTCCAACTTCCTACTACTCCTACTCCAAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCAT
AATGGAAGCAATATCTACCATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGC
CTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTTTCTACCAAGCT
AAAGTACTTGACAGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACA
CACCACTCCTTTGTCTTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAG
TGTTCTTTCTTTGCCTTCGCCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAGTGTTCAGACAAAGGC
TCAGATTGATACAGAGTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGC
TGCAGAACAGGCAGTTGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAA
GGAAGCAGAGGCAGCAGAAGCCGAAGCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAAGAAGCTTT
AAAAACACTGAGAGGAAGAAACAACTGCAAAATGATGGCCTGTACGTGAGGTGACAGAGA
AGAAGAAGCTAAATGTGTTGCAGGTGAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTGTGTGT
TGATGATTCTCTACTTGGGAACTCTTTTTAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGCTAAAG
CCATTGTATTTTTGTTCACACTTTACTTCACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACATGTCCA
CTGCAGCTTTTCGTGTAAAACTTGATAAGAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATACTTTCATA
AACATCGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EA09TF U 16
AF RR4E918TF U 1
AF RR4E918JQ C 256
AF RR4EA09JQ C 256
BS 1 664 RR4E918TF
BS 665 665 RR4E918JQ
BS 666 691 RR4E918TF
BS 692 692 RR4E918JQ
BS 693 710 RR4E918TF
BS 711 711 RR4E918JQ
BS 712 721 RR4E918TF
BS 722 971 RR4E918JQ

RD RR4EA09TF 510 0 0
CCACCAAGAAAAATCTGAATCGGTCTCGCTTGCTAATACAAGCTCATTGCAAAGTGATGA
AGACATGGCTGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCACTTCTGCACTCCAACTTCCTAC
TACTCCTACTCCAAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAATATC
TACCATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGCCTACATTGAGGAACA
ATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTTTCTACCAAGCTAAAGTACTTGACAGC
TTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACACACCACTCCTTTGTC
TTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTCTTTCTTTGCC
TTCGCCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAGTGTTCAGACAAAGGCTCAGATTGATACAGA
GTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACA

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4E918TF 721 0 0
GGAGTAGCAAAATCTCCACCAAGAAAAATCTGAATCGGTCTCGCTTGCTAATACAAGCTC
ATTGCAAAGTGATGAAGACATGGCTGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCACTTCTGC
ACTCCAACTTCCTACTACTCCTACTCCAAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCAT
AATGGAAGCAATATCTACCATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGC
CTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTTTCTACCAAGCT
AAAGTACTTGACAGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACA
CACCACTCCTTTGTCTTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAG
TGTTCTTTCTTTGCCTTCGCCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAGTGTTCAGACAAAGGC
TCAGATTGATACAGAGTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGC
TGCAGAACAGGCAGTTGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAA
GGAAGCAGAGGCAGCAGAAGCCGAAGCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAAGAAGCTTT
AAAA*CACTGAGAGGAAGAAACAACTGCAAA*TGATGGCCTGTACGTGAG*TGACAGAGA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4E918JQ 716 0 0
ATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTTTCTACCAAGCTAAAGTACTTGACAGC
TTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACACACCACTCCTTTGTC
TTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTCTTTCTTTGCC
TTCGCCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAGTGTTCAGACAAAGGCTCAGATTGATACAGA
GTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGCTGCAGAACAGGCAGT
TGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAAGGAAGCAGAGGCAGC
AGAAGCCGAAGCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAAGAAGCTTTAAAAACACTGAGAGG
AAGAAACAACTGCAAAATGATGGCCTGTACGTGAGGTGACAGAGAAGAAGAAGCTAAATG
TGTTGCAGGTGAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTGTGTGTTGATGATTCTCTACT
TGGGAACTCTTTTTAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGCTAAAGCCATTGTATTTTTGT
TCACACTTTACTTCACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACATGTCCACTGCAGCTTTTCGTG
TAAAACTTGATAAGAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATACTTTCATAAACATCGAGCT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4EA09JQ 716 0 0
ATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTTTCTACCAAGCTAAAGTACTTGACAGC
TTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACACACCACTCCTTTGTC
TTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTCTTTCTTTGCC
TTCGCCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAGTGTTCAGACAAAGGCTCAGATTGATACAGA
GTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGCTGCAGAACAGGCAGT
TGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAAGGAAGCAGAGGCAGC
AGAAGCCGAAGCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAAGAAGCTTTAAAAACACTGAGAGG
AAGAAACAACTGCAAAATGATGGCCTGTACGTGAGGTGACAGAGAAGAAGAAGCTAAATG
TGTTGCAGGTGAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTGTGTGTTGATGATTCTCTACT
TGGGAACTCTTTTTAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGCTAAAGCCATTGTATTTTTGT
TCACACTTTACTTCACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACATGTCCACTGCAGCTTTTCGTG
TAAAACTTGATAAGAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATACTTTCATAAACATCGAGCT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 4

CO CL3209Contig1 228 4 2 U
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TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCGGATTTGGGATTTG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D017JQ C 1
AF RR4GC52JQ C 1
AF RR4GC52TF U 1
AF RR4D017TF U 1
BS 1 214 RR4GC52TF
BS 215 228 RR4D017TF

RD RR4D017JQ 228 0 0
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TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCGGATTTGGGATTTG

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR4GC52JQ 214 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGC

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR4GC52TF 214 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGC

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR4D017TF 228 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCGGATTTGGGATTTG

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 4

CO CL3210Contig1 220 4 1 U
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AAATTATTTGGATAAATAATAAAGTATATTGCAAGTGTGTAACCATATTACAATTAGCCC
GGGAAGAAAAATACAAGGGGCTTTTAGGATGCTAAAAAGAAGAGCTTAACACTTTAAGCT
ACATTATATCATATGATTATAAATTTATAACATGTTAGTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AU41JQ C 1
AF RR4AY81JQ C 1
AF RR4AU41TF U 1
AF RR4AY81TF U 1
BS 1 220 RR4AU41TF

RD RR4AU41JQ 220 0 0
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AAATTATTTGGATAAATAATAAAGTATATTGCAAGTGTGTAACCATATTACAATTAGCCC
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ACATTATATCATATGATTATAAATTTATAACATGTTAGTT

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR4AY81JQ 220 0 0
ACGTTGTGACTTGTGAGAGAATTATCTTTTTGAAAATATATTTTCATATGCAAGTATTGA
AAATTATTTGGATAAATAATAAAGTATATTGCAAGTGTGTAACCATATTACAATTAGCCC
GGGAAGAAAAATACAAGGGGCTTTTAGGATGCTAAAAAGAAGAGCTTAACACTTTAAGCT
ACATTATATCATATGATTATAAATTTATAACATGTTAGTT

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR4AU41TF 220 0 0
ACGTTGTGACTTGTGAGAGAATTATCTTTTTGAAAATATATTTTCATATGCAAGTATTGA
AAATTATTTGGATAAATAATAAAGTATATTGCAAGTGTGTAACCATATTACAATTAGCCC
GGGAAGAAAAATACAAGGGGCTTTTAGGATGCTAAAAAGAAGAGCTTAACACTTTAAGCT
ACATTATATCATATGATTATAAATTTATAACATGTTAGTT

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR4AY81TF 220 0 0
ACGTTGTGACTTGTGAGAGAATTATCTTTTTGAAAATATATTTTCATATGCAAGTATTGA
AAATTATTTGGATAAATAATAAAGTATATTGCAAGTGTGTAACCATATTACAATTAGCCC
GGGAAGAAAAATACAAGGGGCTTTTAGGATGCTAAAAAGAAGAGCTTAACACTTTAAGCT
ACATTATATCATATGATTATAAATTTATAACATGTTAGTT

QA 1 220 1 220
DS 



AS 1 4

CO CL3211Contig1 1385 4 2 U
GACTTCATCATATCTCCTTCTCCCCTTGCTTAAACCCAGAACCTCAAATCATGTTACAAT
CTCTTCACCTCCGCTTTCACTCCTCCCCGTCACCTTCGAGAAGAGAGTCTCTGACTCCAT
CGATTACCTCCTCACTTCCTTTCTCCTTTTGCTCGTTCCGACCAAGCAAAACCCAGAAAC
CGAACCGGCGGCTAGTTCAACTCTGCGCCCCTTACGAGGTCGGAGGCGGATACACCGACG
AGGAGCTCTTCGAAAGATACGGAACCCATCAGAGTAAAACCAACGTCGACGACAAGCTTG
ACCCATCTGAGTACGAGGCGTTGCTTAAAGGAGGCGAACAAGTAACCTCAGTTCTCGAAG
AGATGATAACCCTCCTGCAAGATATGAAGATGAATGAAGCATCTGAGAACGTTGCTGTGG
AATTGGCTGCGCAAGGAGTTATAGGGAAAAGAGTTGATGAGATGGAGTCTGGGTTTATGA
TGGCTCTTGATTACATGATTCAACTCGCTGACAGAGACCAAGACGATAAGAGGAAGGCTT
TGTTAGAGGTCGTCAAGGAGACTGTCTTATCTCATCTCACTAAAAAATGTCCTCCTCATG
TGCAAGTGATTGGTCTACTCTGTAGAACACCTAAGAAAGAGAGTAGACAAGAGCTGCTGC
GTAGGGTGGCTGCAGGTGGTGGGGCTTTTGAAGGCAAGGACGGTACTAAGCTTCATTTAC
CCGGAGCTAATCTGAATGACATAGCTAATCAAGCTGATGACTTGCTAGAGACTATGGAGA
CAAGGCCGGCTGTTCCTGATAGGAAACTACTAGCGAGGCTTGTTTTAATCAGAGAGGAAG
CGAGGAACATGATGGGAGGAGGTATACTTGATGAGAGAAATGACCGTGGTTTCTCCACTC
TGCCTGAATCAGCGGTGAATTTCTTAACCAAATTGGTAGCTCTGAAACCTGGAAAGACAG
TGCAGCAAATGATCAAGAATGTCATGCAAGGGAAAGATGAAGGTGCAGATGATCTTAGCA
ATGGGGAGGATGGTTCTGGCCAAGGAAGAAGACAAAGTGGATTAAACGGAAGGGGAAGCT
TTACAGGGAAAAAACCATTACCAGTAAGGCCAGGAATGTTTCTAGAGACTGTCACAAAGG
TAATGGGAAGCATATACTCGGGTAATTCATCCGGTATCACGGCACAACATCTAGAATGGG
TACACGAGAAAACTCTCCAAGTTCTTGAAGAAATTGCGTATTAGCTTGTATCTTCATTGT
TACCAAACCAACAATGAAAGTAGATGTTGTGTCCTCCATAGATGTTGTTCACTATATAAT
AATTGTAACTTGGTTGGTTGATATTTGACGAATGTTGAGCACATCTCATAAATTTGGTAT
CCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RR4A218TF U 137
AF RR4A218TFB U 1
AF RR4A218JQ C 736
AF RR4A218JQD C 599
BS 1 811 RR4A218TFB
BS 812 1385 RR4A218JQD

RD RR4A218TF 222 0 0
TCCTTTCTCCTTTTGCTCGTTCCGACCAAGCAAAACCCAGAAACCGAACCGGCGGCTAGT
TCAACTCTGCGCCCCTTACGAGGTCGGAGGCGGATACACCGACGAGGAGCTCTTCGAAAG
ATACGGAACCCATCAGAGTAAAACCAACGTCGACGACAAGCTTGACCCATCTGAGTACGA
GGCGTTGCTTAAAGGAGGCGAACAAGTAACCTCAGTTCTCGA

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4A218TFB 811 0 0
GACTTCATCATATCTCCTTCTCCCCTTGCTTAAACCCAGAACCTCAAATCATGTTACAAT
CTCTTCACCTCCGCTTTCACTCCTCCCCGTCACCTTCGAGAAGAGAGTCTCTGACTCCAT
CGATTACCTCCTCACTTCCTTTCTCCTTTTGCTCGTTCCGACCAAGCAAAACCCAGAAAC
CGAACCGGCGGCTAGTTCAACTCTGCGCCCCTTACGAGGTCGGAGGCGGATACACCGACG
AGGAGCTCTTCGAAAGATACGGAACCCATCAGAGTAAAACCAACGTCGACGACAAGCTTG
ACCCATCTGAGTACGAGGCGTTGCTTAAAGGAGGCGAACAAGTAACCTCAGTTCTCGAAG
AGATGATAACCCTCCTGCAAGATATGAAGATGAATGAAGCATCTGAGAACGTTGCTGTGG
AATTGGCTGCGCAAGGAGTTATAGGGAAAAGAGTTGATGAGATGGAGTCTGGGTTTATGA
TGGCTCTTGATTACATGATTCAACTCGCTGACAGAGACCAAGACGATAAGAGGAAGGCTT
TGTTAGAGGTCGTCAAGGAGACTGTCTTATCTCATCTCACTAAAAAATGTCCTCCTCATG
TGCAAGTGATTGGTCTACTCTGTAGAACACCTAAGAAAGAGAGTAGACAAGAGCTGCTGC
GTAGGGTGGCTGCAGGTGGTGGGGCTTTTGAAGGCAAGGACGGTACTAAGCTTCATTTAC
CCGGAGCTAATCTGAATGACATAGCTAATCAAGCTGATGACTTGCTAGAGACTATGGAGA
CAAGGCCGGCTGTTCCTGATAGGAAACTACT

QA 1 811 1 811
DS 

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ATGACATAGCTAATCAAGCTGATGACTTGCTAGAGACTATGGAGACAAGGCCGGCTGTTC
CTGATAGGAAACTACTAGCGAGGCTTGTTTTAATCAGAGAGGAAGCGAGGAACATGATGG
GAGGAGGTATACTTGATGAGAGAAATGACCGTGGTTTTTCCACTCTGCCTGAATCAGCGG
TGAATTTCTTAACCAAATTGGTAGCTCTGAAACCTGGAAAGACAGTGCAGCAAATGATCA
AGAATGTCATGCAAGGGAAAGATGAAGGTGCAGATGATTTTAGCAATGGGGAGGATGGTT
CTGGCCAAGGAAGAAGACAAAGTGGATTAAACGGAAGGGGAAGCTTTACAGGGAAAAAAC
CATTACCAGTAAGGCCAGGAATGTTTCTAGAGACTGTCACAAAGGTAATGGGAAGCATAT
ACTCGGGTAATTCATCCGGTATCACGGCACAACATCTAGAATGGGTACACGAGAAAACTC
TCCAAGTTCTTGAAGAAATTGCGTATTAGCTTGTATCTTCATTGTTACCAAACCAACAAT
GAAAGTAGATGTTGTGTCCTCCATAGATGTTGTTCACTATATAATAATTGTAACTTGGTT
GGTTGATATTTGACGAATGT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4A218JQD 787 0 0
TGTGCAAGTGATTGGTCTACTCTGTAGAACAC*TAAGAAAGAGAGTAGACAAGAGCTGCT
GCGTAGGGTGGCTGCAGGTGGTGGGGCTTTTGAAGGCAAGGACGGTACTAAGCTTCATTT
ACCCGGAGCTAATCTGAATGACATAGCTAATCAAGCTGATGACTTGCTAGAGACTATGGA
GACAAGGCCGGCTGTTCCTGATAGGAAACTACTAGCGAGGCTTGTTTTAATCAGAGAGGA
AGCGAGGAACATGATGGGAGGAGGTATACTTGATGAGAGAAATGACCGTGGTTTCTCCAC
TCTGCCTGAATCAGCGGTGAATTTCTTAACCAAATTGGTAGCTCTGAAACCTGGAAAGAC
AGTGCAGCAAATGATCAAGAATGTCATGCAAGGGAAAGATGAAGGTGCAGATGATCTTAG
CAATGGGGAGGATGGTTCTGGCCAAGGAAGAAGACAAAGTGGATTAAACGGAAGGGGAAG
CTTTACAGGGAAAAAACCATTACCAGTAAGGCCAGGAATGTTTCTAGAGACTGTCACAAA
GGTAATGGGAAGCATATACTCGGGTAATTCATCCGGTATCACGGCACAACATCTAGAATG
GGTACACGAGAAAACTCTCCAAGTTCTTGAAGAAATTGCGTATTAGCTTGTATCTTCATT
GTTACCAAACCAACAATGAAAGTAGATGTTGTGTCCTCCATAGATGTTGTTCACTATATA
ATAATTGTAACTTGGTTGGTTGATATTTGACGAATGTTGAGCACATCTCATAAATTTGGT
ATCCACC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 4

CO CL3212Contig1 939 4 6 U
GGATCTCTTTACAGACCATGTTTCTGTAAACCAGAGAACATCTCACAACATAAACTCTCT
CTTTCACATTTTCCAGACAAGAAAAAAATGGCTGCAGCATTCTCTTACACTGCGTGTCCT
AAGCTATCTCTATTACAGCCTCCCATGGCTGCTCAAATCCGACCATTTAGGACATCACAA
AAGGCTTTCGTGGTGACGAACCCTGAGCAAGACAACACACTCCAAGAACAAGACATAGAG
ACAATCAAAGAAGAGCAACCAGCAGAGAAGCAGATGAAGAAGCAGCCCACGCCATTGAGA
CCAGTGGAGAAACAGTCTAATGTGAAGAGCACAGGCTTGCCAAGAGAGTTTGGTGGTGAG
TGGCTAAGCAGTGTGACACGCCACGTCAGGATATACGCTGCTTATATAGATCCTGAGACT
TGTGAGTTTGACCAGACGCAGTTGGATAAACTCACTTTGATTCTTGATCCAACTGAAGAG
TTTGTGTGGGAAGATGAAAGCTGTAACAAGGTTTATTCTTATTTCCAAGAACTTGTCGAT
CACTATGAGGGAGCACCATTGACAGAGTATACACTAAGGTTGATAGGATCAGACGTAGAG
CATTACATAAGGAAGATGTTGTTTGATGGAGAGATACAATACAATATGGACGCAAGAGTT
CTTAATTTCAGTATGGGAAAGCCTCGTGTTCAGTTCAACACCAGCAACATTGAAGGTGGT
GGAGATGACCAGCCTCAAGAAGATGCATAATGAAAACAGCTCTATACCAAAGTTGTGTAC
AAACGAGATCAAAAATATATGACGTTTTTTATATGGGATGATAAAATACTCTTTTTTTTC
TTTTTCCCATTCTCTCAGTCTTATAAGAATATAAAGCATGTCCATGATTTTGCTGACACT
ATAGTTTAAGAGTTCCACAAGTAGTTGAGTTTGTGCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX36TF U 1
AF RR4BN13JQ C 38
AF RR4BN13TF U 38
AF RR4CX36JQ C 158
BS 1 713 RR4CX36TF
BS 714 715 RR4BN13TF
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BS 717 795 RR4BN13TF
BS 796 839 RR4BN13JQ
BS 840 939 RR4CX36JQ

RD RR4CX36TF 713 0 0
GGATCTCTTTACAGACCATGTTTCTGTAAACCAGAGAACATCTCACAACATAAACTCTCT
CTTTCACATTTTCCAGACAAGAAAAAAATGGCTGCAGCATTCTCTTACACTGCGTGTCCT
AAGCTATCTCTATTACAGCCTCCCATGGCTGCTCAAATCCGACCATTTAGGACATCACAA
AAGGCTTTCGTGGTGACGAACCCTGAGCAAGACAACACACTCCAAGAACAAGACATAGAG
ACAATCAAAGAAGAGCAACCAGCAGAGAAGCAGATGAAGAAGCAGCCCACGCCATTGAGA
CCAGTGGAGAAACAGTCTAATGTGAAGAGCACAGGCTTGCCAAGAGAGTTTGGTGGTGAG
TGGCTAAGCAGTGTGACACGCCACGTCAGGATATACGCTGCTTATATAGATCCTGAGACT
TGTGAGTTTGACCAGACGCAGTTGGATAAACTCACTTTGATTCTTGATCCAACTGAAGAG
TTTGTGTGGGAAGATGAAAGCTGTAACAAGGTTTATTCTTATTTCCAAGAACTTGTCGAT
CACTATGAGGGAGCACCATTGACAGAGTATACACTAAGGTTGATAGGATCAGACGTAGAG
CATTACATAAGGAAGATGTTGTTTGATGGAGAGATACAATACAATATGGACGCAAGAGTT
CTTAATTTCAGTATGGGAAAGCCTCGTGTTCAGTTCAACACCAGCAACATTGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4BN13JQ 804 0 0
GG
ATCTCACAACATAAACTCTCTCTTTCACATTTTC*AGACAAGAAAAAA*TGGCTGCAGCA
TTCTCTTACACTGCGTGTCCTAAGCTATCTCTATTACAGCCTCCCATGGCTGCTCAAATC
CGACCATTTAGGACATCACAAAAGGCTTTCGTGGTGACGAACCCTGAGCAAGACAACACA
CTCCAAGAACAAGACATAGAGACAATCAAAGAAGAGCAACCAGCAGAGAAGCAGATGAAG
AAGCAGCCCACGCCATTGAGACCAGTGGAGAAACAGTCTAATGTGAAGAGCACAGGCTTG
CCAAGAGAGTTTGGTGGTGAGTGGCTAAGCAGTGTGACACGCCACGTCAGGATATACGCT
GCTTATATAGATCCTGAGACTTGTGAGTTTGACCAGACGCAGTTGGATAAACTCACTTTG
ATTCTTGATCCAACTGAAGAGTTTGTGTGGGAAGATGAAAGCTGTAACAAGGTTTATTCT
TATTTCCAAGAACTTGTCTATCACTATGAGGGAGCACCATTGACAGAGTATACACTAAGG
TTGATAGGATCAGACGTAGAGCATTACATAAGGAAGATGTTGTTTGATGGAGAGATACAA
TACAATATGGATGCAAGAGTTCTTAATTTCAGTATGGGAAAGCCTCGTGTTCAGTTCAAC
ACCAGCAACATTGAAGGTGGTGGAGATGACCAGCCTCAAGAAGATGCATAATGAAAACAG
CTCTATACCAAAGTTGTGTACAAACGAGATCAAAAATATATGACGTTTTTTATATGGGAT
GATAAAATACTCTTTTTTTT
TC

QA 3 802 3 802
DS 

RD RR4BN13TF 758 0 0
GG
ATCTCACAACATAAACTCTCTCTTTCACATTTTTCAGACAAGAAAAAAATGGCTGCAGCA
TTCTCTTACACTGCGTGTCCTAAGCTATCTCTATTACAGCCTCCCATGGCTGCTCAAATC
CGACCATTTAGGACATCACAAAAGGCTTTCGTGGTGACGAACCCTGAGCAAGACAACACA
CTCCAAGAACAAGACATAGAGACAATCAAAGAAGAGCAACCAGCAGAGAAGCAGATGAAG
AAGCAGCCCACGCCATTGAGACCAGTGGAGAAACAGTCTAATGTGAAGAGCACAGGCTTG
CCAAGAGAGTTTGGTGGTGAGTGGCTAAGCAGTGTGACACGCCACGTCAGGATATACGCT
GCTTATATAGATCCTGAGACTTGTGAGTTTGACCAGACGCAGTTGGATAAACTCACTTTG
ATTCTTGATCCAACTGAAGAGTTTGTGTGGGAAGATGAAAGCTGTAACAAGGTTTATTCT
TATTTCCAAGAACTTGTCTATCACTATGAGGGAGCACCATTGACAGAGTATACACTAAGG
TTGATAGGATCAGACGTAGAGCATTACATAAGGAAGATGTTGTTTGATGGAGAGATACAA
TACAATATGGATGCAAGAGTTCTTAATTTCAGTATGGGAAAGCCTCGTGTTCAGTTCAAC
ACCAGCAACATTGAAG*TGGTGGAGATGACCAGCCTCAAGAAGATGCATAATGAAAACAG
CTCTATACCAAAGTTGTGTACAAACGAGATCAAAAA

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4CX36JQ 782 0 0
TCCGACCATTTAGGACATCACAAAAGGCTTTCGTGGTGACGAACCCTGAGCAAGACAACA
CACTCCAAGAACAAGACATAGAGACAATCAAAGAAGAGCAACCAGCAGAGAAGCAGATGA
AGAAGCAGCCCACGCCATTGAGACCAGTGGAGAAACAGTCTAATGTGAAGAGCACAGGCT
TGCCAAGAGAGTTTGGTGGTGAGTGGCTAAGCAGTGTGACACGCCACGTCAGGATATACG
CTGCTTATATAGATCCTGAGACTTGTGAGTTTGACCAGACGCAGTTGGATAAACTCACTT
TGATTCTTGATCCAACTGAAGAGTTTGTGTGGGAAGATGAAAGCTGTAACAAGGTTTATT
CTTATTTCCAAGAACTTGTCGATCACTATGAGGGAGCACCATTGACAGAGTATACACTAA
GGTTGATAGGATCAGACGTAGAGCATTACATAAGGAAGATGTTGTTTGATGGAGAGATAC
AATACAATATGGACGCAAGAGTTCTTAATTTCAGTATGGGAAAGCCTCGTGTTCAGTTCA
ACACCAGCAACATTGAAGGTGGTGGAGATGGCCAGCCTCAAGAAGATGCATAATGAAAAC
AGCTCTATACCAAAGTTGTGGACAAACGAGATCAAAAATATATGACGTTTTTTATATGGG
ATGATAAAATACTCTTTTTTTTCTTTTTCCCATTCTCTCAGTCTTATAAGAATATAAAGC
ATGTCCATGATTTTGCTGACACTATAGTTTAAGAGTTCCACAAGTAGTTGAGTTTGTGCC
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL3213Contig1 1752 4 10 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCTGTATATATAAATTTAAAATACTAA
AAAGAAGGAAAAAAAAGACAGAGTGTGAAATTGCGAGAGATAATGACGAAATATGGTGAG
CAGAGAGATTCTCCGGCTATAGCAGCTTCGACGGTCACCGCCCCAAAACGATTTTTGACT
CCTGGAAGATTCGTGACGATCTTGTGTATAGTGAACCTGATAAATTACGTGGATCGAGGA
GTGATTGCGAGTAATGGTGTTAACGGAAGCTCGAGAACTTGTGATTCCAAAGGCCTCTGC
TCTGCTGGCACTGGCATTCAAGGAGAGTTTGGGTTAAGCAACTTTCAAGATGGTCTTCTG
TCTTGCCTTTATGGTTGGTCTTCTTGTTGCTTCTCCCATCTTCGCTGCTCTCTCCAAAAG
GTTCACTCCTTTTAAACTGATTGGTGTTGGACTAACTGTTTGGACTCTCGCTGCTGTTGG
TTGCGGCTTCTCTTACAACTTCTGGATGATTGCTGTTTTCCGAATGTTTGTTGGGGTTGG
TGAAGCTTCCTTCATTAGTCTTGCAGCACCTTACATCGATGATAGCGCTCCTGCTGCAAG
GAAAAATCTGTGGCTTGGACTGTTCTACATGTGTATACCAGCACGAGTTGCTCTTGGCTA
CGTGTTTGGTGGATATGTTGGAAACCATCTTGGATGGCGTTGGGCGTTTTACATTGAGGC
AATCGCAATGGCTTTCTTTGTTGTTTTGTCCTTCTGTATCAAACCTCCACAGCTCAAAGG
TTTTGCTGCTAAAGAATCGAAGAAACCCTCTCCGTCTATTGAAACGGTGGCTCTCACACA
TGCGGAAGCTAAAGCCGTAACCCCCAAACCAAAGACTCAGAACCTGGTAGTCGTATTTGG
AAAAGACATGAAGGCTCTTTTCAGCGAGAAAGTATTTATAGTGAACGTTCTTGGCTACAT
CACCTACAACTTTGTGATCGGAGCTTACTCATATTGGGGACCAAAAGCTGGTTTTGGTAT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4G022TF U 1
AF RR4GD45TF U 556
AF RR4GD45JQ C 1064
AF RR4G022JQ C 1072
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BS 702 766 RR4G022TF
BS 767 1166 RR4GD45TF
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BS 1751 1752 RR4G022JQ

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TCTGCTGGCACTGGCATTCAAGGAGAGTTTGGGTTAAGCAACTTTCAAGATGGTCTTCTG
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AATCGCAATGGCTTTCTTTGTTGTTTTGTCCTTCTGTATCAAACCT

QA 1 766 1 766
DS 

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G
AGTCTTGCAGCACCTTACATCGATGATAGCGCTCCTGCTGCAAGGAAAAATCTGTGGCTT
GGACTGTTCTACATGTGTATACCAGCAGGAGTTGCTCTTGGCTACGTGTTTGGTGGATAT
GTTGGAAACCATCTTGGATGGCGTTGGGCGTTTTACATTGAGGCAATCGCAATGGCTTTC
TTTGTTGTTTTGTCCTTCTGTATCAAACCTCCACAGCTCAAAGGTTTTGCTGCTAAAGAA
TCGAAGAAACCCTCTCCGTCTATTGAAACGGTGGCTCTCACACATGCGGAAGCTAAAGCC
GTAACCCCCAAACCAAAGACTCAGAACCTGGTAGTCGTATTTGGAAAAGACATGAAGGCT
CTTTTCAGCGAGAAAGTATTTATAGTGAACGTTCTTGGCTACATCACCTACAACTTTGTG
ATCGGAGCTTACTCATATTGGGGACCAAAAGCTGGTTTTGGTATCTACCATATGAAAAAC
GCAGACATGGTTTTTGGAGGCCTTACTATCATCTGTGGTATCATTGGAACTTTAGGCGGA
AGCTACGTACTTGATCGCATCAACGCTACACTTCCAAACACCTTCAAGTTACTAGCGGCA
TCAACTTTAT

QA 2 611 2 611
DS 

RD RR4GD45JQ 689 0 0
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ACACTTCCAAACACCTTCAAGTTACTAGCGGCATCAACTTTATTCGGCGCAGCGTTTTGT
TTCGTTGCTTTCTGCATGAAGAATATGTATGCATTCATCGGTCTGTTCGCAGTGGGAGAG
ATTTTAATCTTTGCTCCACAGGCCCCGGTTAACTTTGTGTGTCTACATTGCGTTAGACCA
AACTTGAGACCACTATCAATGGCTTCTTCAACTGTTTTGATCCATATCTTAGGAGATGTT
CCTTCTTCTCCTCTGTATGGAAAAATGCAGGATCGTCTCAAAAACTGGAGGACATCAACT
CTTATTATTACTTCAATCCTCTTCCTCGCAGCTATTATATGGGGCATTGGGATATTTATG
AATAGTGTGGACCGTTCTAATGAAAAGAGTGAAGATGAGGTCGAGGAGGAAGAGAAATTG
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ATTCATTTGATTCATTTTCTGTCTCCTTGCTTCTTAATTTCTTTGGTGTACATAAACTAA
TTTTTTAATAATAAAATTTTGCTTTGA
TC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4G022JQ 681 0 0
TGGTATCATTGGAACTTTAGGCGGAAGCTACGTACTTGATCGCATCAACGCTACACTTCC
AAACACCTTCAAGTTACTAGCGGCATCAACTTTATTCGGCGCAGCGTTTT**TTCGTTGC
TTTCTGCACGAAGAATATGTATGCATTCATCGGTCTGTTCGCAGTGGGAGAGATTTTAAT
CTTTGCTCCACAGGCCCCGGTTAACTTTGTGTGTCTACATTGCGTTAGACCAAACTTGAG
ACCACTATCAATGGCTTCTTCAACTGTTTTGATCCATATCTTAGGAGATGTTCCTTCTTC
TCCTCTGTATGGAAAAATGCAGGATCGTCTCAAAAACTGGAGGACATCAACTCTTATTAT
TACTTCAATCCTCTTCCTCGCAGCTATTATATGGGGCATTGGGATATTTATGAATAGTGT
GGACCGTTCTAATGAAAAGAGTGAAGATGAGGTCGAGGAGGAAGAGAAATTAGAAACCAA
AGCAGACAACAACAACAACAACTCTGTTCCCGTCTAAAATTTTGAGGACATTTATCAATT
TTTCTTCAACCACAAAATAAAAATTCTTTCGCATTTGTTCAGTTGAACTACAATTCATTT
GATTCATTTTCTGTCTCCTTGCTTCTTAATTTCTTTGGTGTACATAAACTAATTTTTTAA
TAATAAAATTTTGCTTTGAGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 2 4

CO CL3214Contig1 1225 2 8 U
AGGTAACTTAGGATTTAAGTTTTAACACACCCTGCACAATCCTTCCATGTACTTTTTTAA
ACACTTTGCTTTATCACATTACCTATGTAAAGGGAACAAGACCCTTAGTCAAATTCATCC
CCATCATCAACCAAAAATACTGATCAGCTATAGAACCTTTTTAAGAAAAGAAAAACTGCT
CCTAATGCTTTTCTCTCTCTATTGAATAAAATAAAAGCATATCCGATAAACGAAACATGG
CCGTGTCTTCTTCTGATCATTTGTTGTCTTGTGTCTTTACCCTTCAACGGATCTGATGGT
ACTGTGTGATGCCTCGTTTTGGTGGTAGCTTTCTCAAGATGAAGAGGACCAAAGAGGAAG
GTAATATCTCTACCAACAGGTAATATATGAAGTTGAGAATGGGGTGATCCAACACATCAA
GGTTTGCCCCTTCGTCGAAAGCAGCGAAGCACATCATGATACATCTGATGAGGAAACAAG
TAGAGCATATGGTTGTCACGTAACCAACCTCTTGCAGCTTTTTGCGGCGTCCGTTAGATT
CTGCTGGAAAATTTTGCAACATTAGGAAAAGCCGTCCACCGTAAAGTAGAAATCCAAGGG
CAGCAAACAAGGAAGCACCTGCAAAGAACATCTTTGAAAGGATAACCATAACACGAACAG
GCTTCCACCACAAAACCAACCAAAGAGCAATCTGAACTACATACACAACAGCATTGATTG
TGAAGAAACCTGGCCTTAGTCCATCAGTGGACACAGCACGCGCCTGATAGTAAATCTCAG
CCCAGAAGAGGACTAGAAGAGCATAAGTGGTAAAGAAAGCAAGACTTGGTATATCAAGCA
ATATATGTTGCAGAATCTCTGGATGCATAAACTGCACATCTCTCCTGAAAACAAACACCA
CAGCCCTCACTCCGTTGACGACGAAATTGAGGAAGTGGAAGACCTTCTGCGTCGTCCATC
CGTATTCTGGAACTCTCAATTGGATTCTCACCAGTTGAATCAGAGCGACGATGGAGACGA
TTCCGTAGAGAAGAGCGAGAGCGTGGAAGATACGATCCTGCCAAATCGGAGACTCGTTGA
CATCCGACCACCAACTCGAAGCGTCCTTGAGATCCAACGCTTCCACCGCCGAAGAAGACG
ACGTCATCATCTCCGACGCGTATTGCATCATCTCCACACCGCCGATTCTCATTTTTTTTC
TTTTTTAAGAAATCGATTGAATCCC


BQ
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AF RR4BP07JQ U 1
AF RR4AY94TF C 433
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RD RR4BP07JQ 702 0 0
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CCTAATGCTTTTCTCTCTCTATTGAATAAAATAAAAGCATATCCGATAAACGAAACATGG
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QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AY94TF 793 0 0
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CTAGAAGAGCATAAGTGGTAAAGAAAGCAAGACTTGGTATATCAAGCAATATATGTTGCA
GAATCTCTGGATGCATAAACTGCACATCTCTCCTGAAAACAAACACCACAGCCCTCACTC
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CTCTCAATTGGATTCTCACCAGTTGAATCAGAGCGACGATGGAGACGATTCCGTAGAGAA
GAGCGAGAGCGTGGAAGATACGATCCTGCCAAATCGGAGACTCGTTGACATCCGACCACC
AACTCGAAGCGTCCTTGAGATCCAACGCTTCCACCGCCGAAGAAGACGACGTCATCATCT
CCGACGCGTATTGCATCATCTCCACACCGCCGATTCTCATTTTTTTTCTTTTTTAAGAAA
TCGATTGAATCCC

QA 1 793 1 793
DS 



CO CL3214Contig2 796 2 4 U
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CACTTCCTCAATTTCGTGGTGAATGGAGTCAGGGCTGTGGTTTTTGTATTTAGACGAGAT
GTGCAGTTCATGCATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATATCCCAAGTCTTGCT
TTCTTCACCACCTATGCTCTTCTTGTTCTCTTCTGGGCGGAGATATACTACCAGGCGCGT
GCTGTGTCCACTGATGGACTGAGACCAGGCTTCTTCACAATCAATGCTGTTGTTTATGTT
GTTCAGATTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTAATCCTA
TCAAAGATGTTCTTTGCAGGTGCTTCGTTGTTCGCTGCCCTTGGATTTTTACTTTACGGT
GGAAGGCTTTTCCTGATGTTGCAACGTTTTCCGGTAGAATCGAAAGGACGGCGCAAGAAG
CTGCAAGAGGTTGGTTACGTGACAACCATATGCTTTACGTGTTTCCTCATCAGATGTATC
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TTAACTTCATATATTACCTGTTGGTAGAGATATTACCTTCCTCTTTAGTCCTCTTCATAT
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AGACACGACAAACTAC


BQ
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AF RR4GO64TF U 1
AF RR4GO64JQ C 256
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CAACTTGTGAGAATCCAATTGAGAGTTCCAGAGTACGGGTGGACGACGCAGAAGGTCTTT
CACTTCCTCAATTTCGTGGTGAATGGAGTCAGGGCTGTGGTTTTTGTATTTAGACGAGAT
GTGCAGTTCATGCATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATATCCCAAGTCTTGCT
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GTTCAGATTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTAATCCTA
TCAAAGATGTTCTTTGCAG*TGCTTCGTTGTTCGCTGCCCTTGGATTT
TA

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4GO64JQ 541 0 0
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GGACTGAGACCAGGCTTCTTCACAATCAATGCTGTTGTTTATGTTGTTCAGATTGCTCTT
TGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTAATCCTATCAAAGATGTTCTTT
GCAGGTGCTTCGTTGTTCGCTGCCCTTGGATTTTTACTTTACGGTGGAAGGCTTTTCCTG
ATGTTGCAACGTTTTCCGGTAGAATCGAAAGGACGGCGCAAGAAGCTGCAAGAGGTTGGT
TACGTGACAACCATATGCTTTACGTGTTTCCTCATCAGATGTATCATGATGTGTTTTGCT
GCTTTCGACGAGGGGGCAAACCTTGATTGCTGGATCATCCCATCCTTAACTTCATATATT
ACCTGTTGGTAGAGATATTACCTTCCTCTTTAGTCCTCTTCATATTGAGAAAGCTACCAC
CAAAGCGAGGCATCACACAGTACCATCAGATTCGCTGAAATGTAAAGACACGACAAACTA
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL3215Contig1 860 2 2 U
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ATGATATTTATGTTGCACAGGCTTCAAGGTGGATGTCCCGCGACTAAGGGGTTCAAGACT
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GTGTCTTTGGTGCAATGGACTAGAACAGTCGTTACAGTTGTGAAAACGGCCGTGGAGACA
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GGAGGTCATGGCGGACACGGTGCAGAAGCTGTTCAGACTCAGCCTGGCAACTAAATCTAT
CAATATTTTAACGACCATGTATGATTTCATCTCCGTATGCACGTATGTATGTGTATGACT
ATAAGTAAAGCCATGGTGAGTTTTAAATGAAGTTACTTAAGTTAAATAAAAGAAATTAGG
TAAATAAATGTTCTCAATGTAATGTCTCTATGTTCGAGTTGTAATATGCACTCTTTGCAA
AAATAAAATCGTTTGTAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GK61TF U 1
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BS 1 774 RR4GK61TF
BS 775 860 RR4GK61JQ

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DS 

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TGTAATGTCTCTATGTTCGAGTTGTAATATGCACTCTTTGCAAAAATAAAATCGTTTGTA
GTT

QA 1 243 1 243
DS 



AS 1 4

CO CL3216Contig1 1265 4 6 U
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AAAAAAAAAAAACATTTTTCTTCTGAAACGAGGCAATGCCGACTAGTCAGAAAATCCCAA
CTTGGGTTGCCGCCGCGGCTATCATTGCCATCTTGGCTGTGGTTTCATATCAGACTCTAT
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AAGGTCGCAAAGTTATGTTTGCAAACCAAGGGGATCTTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCT
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CCCGTGACATCTTTACGAGGGTCCCTGGATACCCTGACAACATCCGGCTGTCACCAAGTG
GAGACTTTTGGATTGGCATACACTCCAAGAAATCTCTAGTGGGGCGATTGGTGATGGGGA
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GAGAAGATGGAAAGATATGGTTTGGGTCTGTTTTTTATCCAGCCGTTTGGGTTCTTGATC
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CAGTA


BQ
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15 15 15 15 15 

AF RR4CO15TF U 120
AF RR4FK78TF U 1
AF RR4CO15JQ C 543
AF RR4FK78JQ C 583
BS 1 630 RR4FK78TF
BS 631 655 RR4CO15JQ
BS 656 656 RR4FK78JQ
BS 657 773 RR4CO15JQ
BS 774 774 RR4FK78JQ
BS 775 1265 RR4CO15JQ

RD RR4CO15TF 231 0 0
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TTTGCGGCGGACAATGTAGAGGGCACCAAAATGGTTTTGCCATTTGCTAAGACCATTCCA
ATTCCTGTTGCTGGACCAGAGAGCATCGAGTTCGACCCACAAGGAGAAGGTCCTTATGCT
GCCGTCGTGGACGGTCGTATTCTCAAGTGGCGAGGCGATGACCTAGGCTGG

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR4FK78TF 630 0 0
GGATAACGATAGTTTACTAAGTGCTATTACACACATCTCTTTAGTAACATTTTTCTTCTG
AAAAAAAAAAAACATTTTTCTTCTGAAACGAGGCAATGCCGACTAGTCAGAAAATCCCAA
CTTGGGTTGCCGCCGCGGCTATCATTGCCATCTTGGCTGTGGTTTCATATCAGACTCTAT
TTGCGGCGGACAATGTAGAGGGCACCAAAATGGTTTTGCCATTTGCTAAGACCATTCCAA
TTCCTGTTGCTGGACCAGAGAGCATCGAGTTCGACCCACAAGGAGAAGGTCCTTATGCTG
CCGTCGTGGACGGTCGTATTCTCAAGTGGCGAGGCGATGACCTAGGCTGGGTTGAGTTTG
CCCACACATCTCCTCACAGAGGGAATTGTTCAAGCCGTGAAGTAGTGCCTACTTGTGGAA
GACCATTGGGACTTAGTTTTGAGAAGAAAACAGGAGATCTATACATATGCGATGGTTACC
TAGGGCTCATGAAGGTTGGACCTCAGGGAGGATTGGCCGAGTTGGTTGTGGACGAGGCCG
AAGGTCGCAAAGTTATGTTTGCAAACCAAGGGGATCTTGACGAAGAGGAAGATGTCTTCT
ATTTCAATGATAGTAGTAACAAGTATCATT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4CO15JQ 723 0 0
GGTCGCAAAGTTATGTTTGCAAACCAAGGGGATCTTGGCGAAGAGGAAGATGTCTTCTAT
TTCAATGATAGTAGTGACAAGTATCATTTCAGGGAGGTATTTTTCGTGGCAGCCAATGGC
GAGCGGTCGGGAAGAGTGATCAGATATGACAAGAAGACGAAGGAGGCCAAAGTTGTGATG
GACAATCTACGTTGTAATAACGGTTTGGCTCTAAACAAAGACCGGTCTTTTTTAATCGTT
TGCGAGTCGGCCACGGGTTTTGTTCATCGATATTGGATAAAAGGTCCTAAAGCGGGGACC
CGTGACATCTTTACGAGGGTCCCTGGATACCCTGACAACATCCGGCTGTCACCAAGTGGA
GACTTTTGGATTGGCATACACTCCAAGAAATCTCTAGTGGGGCGATTGGTGATGGGGAAC
AAATGGCTCGGGAAGCTGGTTGAGAAGACAGTGAATTTGGACTTGTTGATTGCCGTGCTG
AACGAATTCAAACCGAATGGAATGGCCGTGAAAATCTCCGGGGAGACGGGAGAGATCCTT
GAGATACTTGAGGATAAAGAAGGGAAGACGATGAAATATGTGAGTGAGGCTTATGAGAGA
GAAGATGGAAAGATATGGTTTGGGTCTGTTTTTTATCCAGCCGTTTGGGTTCTTGATCGC
AAGTAACTCTGTTTTTCTTTTTAACTATGTATAGTTGCACGCAGTGATGTGTTCTATACA
GTA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4FK78JQ 683 0 0
AAGAGGAAGATGTCTTCTATTTCAATGATAGTAGTAACAAGTATCATTTCAGGGAGGTAT
TTTTCGTGGCTGCAAATGGCGAGCGGTCGGGAAGAGTGATCAGATATGATAAGAAGACGA
AGGAGGCCAAAGTTGTGATGGACAATCTACGTTGTAATAACGGTTTGGCTCTAAACAAAG
GCCGGTCTTTTCTAATCGTTTGCGAGTCGGCCACGGGTTTTGTTCATCGATATTGGATAA
AAGGTCCTAAAGCGGGGACCCGTGACATCTTTACGAGGGTCCCTGGATACCCTGACAACA
TCCGGCTGTCACCAAGTGGAGACTTTTGGATTGGCATACACTCCAAGAAATCTCTAGTGG
GGCGATTGGTGATGGGGAACAAATGGCTCGGGAAGCTGGTTGAGAAGACAGTGAATTTGG
ACTTGTTGATTGCCGTGCTGAACGAATTCAAACCGAATGGAATGGCCGTGAAAATCTCCG
GGGAGACGGGAGAGTTCCTTGAGATACTTGAGGATAAAGAAGGGAAGACGATGAAATATG
TGAGTGAGGCTTATGAGAGAGAAGATGGAAAGATATGGTTTGGGTCTGTTTTTTATCCAG
CCGTTTGGGTTCTTGATCGCAAGTAACTCTGTTTTTCTTTTTAACTATGTATAGTTGCAC
GCAGTGATGTGTTCTATACAGTA

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL3217Contig1 767 4 4 U
TCTTTTGTCAACTTTTCGTTTTATTAAAACAAAGCCCAAAGAATAATTTACAAACAGACT
CAGCTATAAAATTTGGCACAAAACAAAACCCATATAAACCAACAGATAATGATGAAAACA
GGGTTGACACGTGGTCAATACGTGACCGTGTTTCTTCAATCGAGAAAGAAGAAAGCGGTG
ACGAAACTTTTCGTCGAAATACCAACAGTCTCTGTTCCGTACTTGTTCTTCTTTTCCAAT
TGTTAGATTTTATACCAGGAAAGAGCTTTAAAAGAAAAGGATAGAAACTTGCCAGAACAC
TAATCCTTATAGTAGCTCCGACTCATCTAGAATCTGTCCTCAGCCTCCGAAGCTTAATCC
AAACCTTATTTCTTGATCTTCGTGGAGACTACGCCTGAACACGAGCGAAGCTTGATACCA
CCTCCCAATCAAGAGCCAAGCTTGTCTAACAAAGAGGAAATTCAACCTCTCAATTGTACG
GTGTACCATATTAACGCAGAAGGAGAAGAACCCAACCATATTTTTATTTATGTTCAACAT
ATCAGAGGAAGATAAGAGTGATAATCAAACTCTGATCTTGTTGAACTTTACACTCCAAAA
TCGCCTATGCGAAAAGAAAATCGCCTATGCGAAAAAGAAATCGCCGAAGCGAACAAAAAA
GATCGATCTGTTGATCGAATTATAATACAAACAAAAAGTTTAGATCTTCATCCTTCTGAA
AGATGAATGTTTGGTAAGAGGGGGAAGAGAAAATTCTCTCTCTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4EN20JQ U 6
AF RR4FH32JQ U 6
AF RR4FH32TF C 1
AF RR4EN20TF C 5
BS 1 6 RR4FH32TF
BS 7 546 RR4EN20JQ
BS 547 764 RR4FH32TF
BS 765 767 RR4EN20TF

RD RR4EN20JQ 541 0 0
G
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TAAAATTTGGCACAAAACAAAACCCATATAAACCAACAGATAATGATGAAAACAGGGTTG
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CTTTTCGTCGAAATACCAACAGTCTCTGTTCCGTACTTGTTCTTCTTTTCCAATTGTTAG
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TATTTCTTGATCTTCGTGGAGACTACGCCTGAACACGAGCGAAGCTTGATACCACCTCCC
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CATATTAACGCAGAAGGAGAAGAACCCAACCATATTTTTATTTATGTTCAACATATCAGA

QA 2 541 2 541
DS 

RD RR4FH32JQ 542 0 0
G
GTCAACTTTTCGTTTTATTAAAACAAAGCCCAAAGAATAATTTACAAACAGACTCAGCTA
TAAAATTTGGCACAAAACAAAACCCATATAAACCAACAGATAATGATGAAAACAGGGTTG
ACACGTGGTCAATACGTGACCGTGTTTCTTCAATCGAGAAAGAAGAAAGCGGTGCCGAAA
CTTTTCGTCGAAATACCAACAGTCTCTGTTCCGTACTTGTTCTTCTTTTCCAATTGTTAG
ATTTTATACCAGGAAAGAGCTTTAAAAGAAAAGGATAGAAACTTGCCAGAACACTAATCC
TTATAGTAGCTCCGACTCATCTAGAATCTGTCCTCAGCCTCCGAAGCTTAATCCAAACCT
TATTTCTTGATCTTCGTGGAGACTACGCCTGAACACGAGCGAAGCTTGATACCACCTCCC
AATCAAGAGCCAAGCTTGTCTAACAAAGAGGAAATTCAACCTCTCAATTGTACGGTGTAC
CATATTAACGCAGAAGGAGAAGAACCCAACCATATTTTTATTTATGTTCAACATATCAGA
G

QA 2 541 2 541
DS 

RD RR4FH32TF 766 0 0
TCTTTTGTCAACTTTTCGTTTTATTAAA*CAAAGCCCAAAGAATAATT*ACAAACAGACT
CAGCTATAAAATT*GGCACAAAACAAAACCCATATAAACCAACAGATAATGATGAAAACA
GGGTTGACACGTGGTCAATACGTGACCGTGTTTCTTCAATCGAGAAAGAAGAAAGCGGTG
CCGAAACTTTTCGTCGAAATACCAACAGTCTCTGTTCCGTACTTGTTCTTCTTTTCCAAT
TGTTAGATTTTATACCAGGAAAGAGCTTTAAAAGAAAAGGATAGAAACTTGCCAGAACAC
TAATCCTTATAGTAGCTCCGACTCATCTAGAATCTGTCCTCAGCCTCCGAAGCTTAATCC
AAACCTTATTTCTTGATCTTCGTGGAGACTACGCCTGAACACGAGCGAAGCTTGATACCA
CCTCCCAATCAAGAGCCAAGCTTGTCTAACAAAGAGGAAATTCAACCTCTCAATTGTACG
GTGTACCATATTAACGCAGAAGGAGAAGAACCCAACCATATTTTTATTTATGTTCAACAT
ATCAGAGGAAGATAAGAGTGATAATCAAACTCTGATCTTGTTGAACTTTACACTCCAAAA
TCGCCTATGCGAAAAGAAAATCGCCTATGCGAAAAAGAAATCGCCGAAGCGAACAAAAAA
GATCGATCTGTTGATCGAATTATAATACAAACAAAAAGTTTAGATCTTCATCCTTCTGAA
AGATGAATGTTTGGTAAGAGGGGGAAGAGAAAATTCTCTCTCTC
CC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4EN20TF 763 0 0
TG
GTCAACTTTTCGTTTTATAAAA*CAAAGCCCAAAGAATAATT*ACAAACAGACTCAGCTA
TAAAATTTGGCACAAAACAAAACCCATATAAACCAACAGATAATGATGAAAACAGGGTTG
ACACGTGGTCAATACGTGACCGTGTTTCTTCAATCGAGAAAGAAGAAAGCGGTGACGAAA
CTTTTCGTCGAAATACCAACAGTCTCTGTTCCGTACTTGTTCTTCTTTTCCAATTGTTAG
ATTTTATACCAGGAAAGAGCTTTAAAAGAAAAGGATAGAAACTTGCCAGAACACTAATCC
TTATAGTAGCTCCGACTCATCTAGAATCTGTCCTCAGCCTCCGAAGCTTAATCCAAACCT
TATTTCTTGATCTTCGTGGAGACTACGCCTGAACACGAGCGAAGCTTGATACCACCTCCC
AATCAAGAGCCAAGCTTGTCTAACAAAGAGGAAATTCAACCTCTCAATTGTACGGTGTAC
CATATTAACGCAGAAGGAGAAGAACCCAACCATATTTTTATTTATGTTCAACATATCAGA
GGAAGATAAGAGTGATAATCAAACTCTGATCTTGTTGAACTTTACACTCCAAAATCGCCT
ATGCGAAAAGAAAATCGCCTATGCGAAAAAGAAATCGCCGAAGCGAACAAAAAAGATCGA
TCTGTTGATCGAATTATAATACAAACAAAAAGTTTAGATCTTCATCCTTCTGAAAGATGA
ATGTTTGGTAAGAGGGGGAAGAGAAAATTCTCTCTCTCACC

QA 3 763 3 763
DS 



AS 1 3

CO CL3218Contig1 1083 3 21 U
GGGAGTTCATAGAGACGAAGCCAAGTTCAAAATCATATACATCCACGGCTTCGATTCTAG
TATGCTCGACTCGCCTTTCCCCTATTTCTTATCGCCGGCTCTTGTGGAGGAGTTGAGGAT
ATACACTGTGTCTTTCGACCGTCCTGGTTACGGAGAGAGTGATCCTGACCCGAACCGATC
ACCGAGAAGCATAGCATTGGATATAGAAGAGCTGGCTGATGGGTTAGGACTAGGACCTAA
CTTCTATGTCTTTGGTCTCTCCATGGGTGGTGAAATCACTTGGGCATGCCTTAAGTACAT
TCCTCACAGGTTAGCAGGAGCAGCGCTTGTAGCACCAGCGATTAACTACTGGTGGAGAAA
CTTACCAGGAGACATAACAAGAGAAGCTTTCTCACTCATGTATCCTGCAGATCAATGGTC
ACTTCGCGTAGCTCACTATGCTCCTTGGCTTACGTATTGGTGGAACACTCAGAAATGGTT
CCCAATCTCCAATGTGATCGCTGGGAACCCCATCATTTTCTCCCGTCAGGACATGGAGGT
CTTGTCTAAGCTCGGATTCATCAGTCCAAATCGGGCATACACAAGACAACAAGGTGAATA
CGAAAGCCTACACCGAGATTTGAATGTTGGATTTTCAAGCTGGGAGTTCGATCCTTTAGA
CCTTCAAGATCCGTTCCCGAACAAGAATGGCTCGGTTCACTTATGGCATGGTGATGAGGA
CAGGTTTGTGCCAGTGAAGCTTCAGAGTTATATAGCATCAAAGCTTCCATGGATTCATTA
CCATGAAATCTCAGGATCAGGACATTTGTTACCTCTTGTGGAAGGTGTGACTGATAAGAT
CATAAAGTCTCTTTTGGTTGGGGAGTAAGAAGTAAAGTGAGAGAGTAGAGAAGCTTCTGC
TTGAGACAGATGTTTTCTGCTTGCAATGGCTACAAGTACAAACTAGTTATGTGCAACTAT
TAAGTAAGTCAGAGTAGAGAAGAAACTTGTTTCAAGTCATTGTGGTTTATTGCTTGTACT
ATAGTATATTATCATCATGAATCGACCTTCAATTAATTGCTTAATCTCAATTTGGTTTTA
GTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RR4F727TF U 1
AF RR4GQ80TF U 468
AF RR4BL74JQ C 254
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CTTCTATGTCTTTGGTCTCTCCATGGGTGGTGAAATCACTTGGGCATGCCTTAAGTACAT
TCCTCACAGGTTAGCAGGAGCAGCGCTTGTAGCACCAGTGATTAACTACTGGTGGAGGAA
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CCCGATCTCCAATGTGGTCGCTGGAAACCCCATCATTTTCTCCCGT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4GQ80TF 262 0 0
GCTCA
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GATGAGGACAGGTT
GTG

QA 6 259 6 259
DS 

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T
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CAGGAGCAGCGCTTGTAGCACCAGCGATTAACTACTGGTGGAGAAACTTACCAGGAGACA
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ACTATGCTCCTTGGCTTACGTATTGGTGGAACACTCAGAAATGGTTCCCAATCTCCAATG
TGATCGCTGGGAACCCCATCATTTTCTCCCGTCAGGACATGGAGGTCTTGTCTAAGCTCG
GATTCATCGGTCCAAATCGGGCATACACAAGACAACAAGGTGAATACGAAAGCCTACACC
GAGATTTGAATGTTGGATTTTCAAGCTGGGAGTTCGATCCTTTAGACCTTCAAGATCCGT
TCCCGAACAAGAATGGCTCGGTTCACTTATGGCATGGTGATGAGGACAGGTTTGTGCCAG
TGAAGCTTCAGAGTTATATAGCATCAAAGCTTCCATGGATTCATTACCATGAAATCTCAG
GATCAGGACATTTGTTACCTCTTGTGGAAGGTGTGACTGATAAGATCATAAAGTCTCTTT
TGGTTGGGGAGTAAGAAGTAAAGTGAGAGAGTAGAGAAGCTTCTGCTTGAGACAGATGTT
TTCTGCTTGCAATGGCTACAAGTACAAACTAGTTATGTGCAACTATTAAGTAAGTCAGAG
TAGAGAAGAAACTTGTTTCAAGTCATTGTGGTTTATTGCTTGTACTATAGTATATTATCA
TCATGAATCGACCTTCAATTAATTGCTTAATCTCAATTTGGTTTTAGTT

QA 2 830 2 830
DS 



AS 1 4

CO CL3219Contig1 1075 4 5 U
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TTAGGCAAAGCAGAGGAACAAACACATACACACGATGTTTCACACAAGTAGTAGTAGTAG
TAGTAGTACATTCACAAAAGAGAAGTAAACTAAGAGTAACTCAATCAGCTTCTGGACTTG
AATGGGGTGGCTCTGATGACAATCACGTGGTAAAGAGAAGCAAGTGCAGCACCGATGAAT
GGTCCAACCCAAAACACCCAATGGTCGTCCCAAGCGTTGTCCTTGTTGAAGATGATTGCA
GCTCCAAGACTCCTCGCTGGGTTGATTCCAGTACCAGTGATGGGGATGGTTGCTAAGTGG
ACCAAGAACACGGCGAATCCGATAGGAAGAGGTGCAAGAATGGGAACATGAGAGTCACGA
GCGTTCCTCTTGGAGTCAGTGGCGGAGAAGACGGTGTAAACAAGGACAAAAGTTCCAATA
ATCTCAGCTCCGAGACCACTTCCTTTAGTGTAACCAGGAGCTACAGTGTTGGCCCCACCT
CCTAGAGCTTGGTACTGCTTTGGTTGGAATCCCTTGACCACACCAGCTCCACAGATGGCT
CCTAAGCACTGCATCACTATGTAGTATACAGCTCGTGTGAGCGAAAGCTTTCTGGCCAAG
AACAGACCGAACGTGACAGCTGGGTTGATGTGTCCACCGGAGATACCAGCGGTGCAGTAG
ACGAGAGCGAAGATCATACCACCGAAAGCCCAAGCGATCCCTTGGATTCCGACAGGAGCA
CACATGTTCGGTGACCTCTTGACTCCCATGACGGTCAAAACAGTGATGTAAAGGAACAAG
AACGTGGCGATGAACTCAGCGATCCCGACTCTCCAGAAGGACCACGAAGCAAGCTCGCCG
GGCTCGAACAAGGGCGCAGGAGGTGGCTCCTTGTAGTCCTTGTCGCTCTGAGTCGATGTT
CCGATCGGTTGTCTCTCCGGAAACTTGTTGGCTCCGACTCTAACATCTTCTTCCTTGCCT
TCCATCTCCAGACGTCTCTTTTCTCTCTCTAGATGAGTGTGTAATAATAATGTCC


BQ
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AF RR4FM07JQ U 1
AF RR4FM07TF C 1
AF RR4DR93JQ U 19
AF RR4DR93TF C 290
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TAGTAGTACATTCACAAAAGAGAAGTAAACTAAGAGTAACTCAATCAGCTTCTGGACTTG
AATGGGGTGGCTCTGATGACAATCACGTGGTAAAGAGAAGCAAGT

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR4FM07TF 225 0 0
AAGATCAGAATTTCTTTTTCAGGGGAATGTCTCTGATTCGTATTACAAATAGAGTCTGCA
TTAGGCAAAGCAGAGGAACAAACACATACACACGATGTTTCACACAAGTAGTAGTAGTAG
TAGTAGTACATTCACAAAAGAGAAGTAAACTAAGAGTAACTCAATCAGCTTCTGGACTTG
AATGGGGTGGCTCTGATGACAATCACGTGGTAAAGAGAAGCAAGT

QA 1 225 1 225
DS 

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C
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AAACACATACACACGATGTTTCACACAAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTACATTCACAAAA
GAGAAGTAAACTAAGAGTAACTCAATCAGCTTCTGGACTTGAATGGGATGGCTCTGATGA
CAATCACGTGGTAAAGAGCAGCAAGTGCAGCACCGATGAATGGTCCAACCCAAAACACCC
AATGGTCGTCCCAAGCGTTGTCCTTGTTGAAGATGATTGCAGCTCCAAGACTCCTCGCTG
GGTTGATTCCAGTACCAGTGATGGGGATGGTTGCTAAGTGGACCAAGAACACGGCGAATC
CGATAGGAAGAGGTGCAAGAATGGGAACATGAGAGTCACGAGCGTTCCTCTTGGAGTCAG
TGGCGGAGAAGACGGTGTAAACAAGGACAAAAGTTCCAATAATCTCAGCTCCGAGACCAC
TTCCTTTAGTGTAACCAGGAGCTACAGTGTTGGCCCCACCTCCTAGAGCTTGGTACTGCT
TTGGTTGGAATCCCTTGACCACACCAGCTCCACAGATGGCTCCTAAGCACTGCATCACTA
TGTAGTATACAGCTCGTGTGAGCGAAAGCTTTCTGGCCAAGAACAGACCGAACGTGACAG
CTGGGTTGATGTGTCCACCGGAGATACCAGCGGTGCAGTAGACGAGAGCGAAGATCATAC
CACCGAAAGCCCAAGCGATCCCTTGGATTCCGACAGGAGCACACATGTTCG*TGACCTCT
TGACTCCCATGACGGTCAAAA

QA 2 802 2 802
DS 

RD RR4DR93TF 786 0 0
AAGATGA
TGCAGCTCCAAGACTCCTCGCTGGGTTGAT*CCAGTACCAGTGATGGGGATGGT*GCTAA
GTGGACCAAGAACACGGCGAATCCGATAGGAAGAGGTGCAAGAATGGGAACATGAGAGTC
ACGAGCGTTCCTCTTGGAGTCAGTGGCGGAGAAGACGGTGTAAACAAGGACAAAAGTTCC
AATAATCTCAGCTCCGAGACCACTTCCTTTAGTGTAACCAGGAGCTACAGTGTTGGCCCC
ACCTCCTAGAGCTTGGTACTGCTTTGGTTGGAATCCCTTGACCACACCAGCTCCACAGAT
GGCTCCTAAGCACTGCATCACTATGTAGTATACAGCTCGTGTGAGCGAAAGCTTTCTGGC
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GTAGACGAGAGCGAAGATCATACCACCGAAAGCCCAAGCGATCCCTTGGATTCCGACAGG
AGCACACATGTTCGGTGACCTCTTGACTCCCATGACGGTCAAAACAGTGATGTAAAGGAA
CAAGAACGTGGCGATGAACTCAGCGATCCCGACTCTCCAGAAGGACCACGAAGCAAGCTC
GCCGGGCTCGAACAAGGGCGCAGGAGGTGGCTCCTTGTAGTCCTTGTCGCTCTGAGTCGA
TGTTCCGATCGGTTGTCTCTCCGGAAACTTGTTGGCTCCGACTCTAACATCTTCTTCCTT
GCCTTCCATCTCCAGACGTCTCTTTTCTCTCTCTAGATGAGTGTGTAATAATAATGTCC

QA 8 786 8 786
DS 



AS 1 3

CO CL3220Contig1 958 3 4 U
GAAACTCAACACGTAGTTGTATATAGCGTGAAAATTTTATTCGAAAGAGAACATTACAGT
TACAAAACGTGACAGTACCAACCTCAAGCTTATGGTTGATAGGAGAAACCGTTAACCGTG
AGGCCTCCATCAACACAAATGGTCTGACCAGTAATATAAGAAGCTGCAGGAAGACACAAG
AAGACCACTAGTGATGCAACTTCATTCGGCTCTCCAGCTCGACCAAGTGGAGTTCTACCG
AACAGTTCTTCCCTGTACACGACGTCCTCAAGATAAGGTTGGGCCAGCGGAGTGTTGATG
ATATTAGGTGCAACAGCGTTGGCTCGTATGCCGTCTTTTGCCCATTCACATGCCAAATTT
CTAGCTAGCTGATTTATAGCTCCTTTGGTTACACCGTAAATGGATCCACCGGTCATGGAT
ACAACCCCCGCAACAGAGGACAAGAAGACAATGATTCCATAGCCTGAAGCCTTTAGGAGA
GGATGTGAAAGCTGGCAAAAATGGTAAGCAGATTCCAAGTTTGTGGAGATATGGAAAGCG
AAATCGTCTGCTCCATATTCTGTTGTTGGCTTTCCGCGAAGTACACCCACATTGTTCACG
AAAATGTTGAGCTTGCCATCAAACAGCGAGGATACTTTTTGTATCAAAGTTTCTCTCTCG
GGACGAGAGGTTACATCACAGACTGAGCCACTCACTTGAAACCCTTTCTTCTCCCATTGG
CTTAAACTTTGATTGAGTAAAGTTTCAGGTATGTCACACACATGGATTCTAGCTCCAAAA
CTAGCTAATTCCTCTACTATGGCATACCCGATTCCGCTGGCTCCACCAGTTACAAGAGCA
TTCATACCTTGAAGACTCTATCTCTTATCCATCTTTTTTTTAATCTCTATATCAGGTGTG
ATTAGTAACGACCAGAATCGCCACAGATTATATACAGACAATGAATGATTCTGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF17JQ U 23
AF RR4BY60JQ U 1
AF RR4BY60TF C 243
BS 1 81 RR4BY60JQ
BS 82 82 RR4FF17JQ
BS 83 774 RR4BY60JQ
BS 775 958 RR4BY60TF

RD RR4FF17JQ 593 0 0
ATAGCGTGAAAATTTTATTCGAAAGAGAACATTACAGTTACAAAACGTGACAGTACCAAC
CTCAAGCTTATGGTTGATAGGAGAAACCGTTAACCGTGAGGCCTCCATCAACACAAATGG
TCTGACCAGTAATATAAGAAGCTGCAGGAAGACACAAGAAGACCACTAGTGATGCAACTT
CATTCGGCTCTCCAGCTCGACCAAGTGGAGTTCTACCGAACAGTTCTTCCCTGTACACGA
CGTCCTCAAGATAAGGTTGGGCCAGCGGAGTGTTGATGATATTAGGTGCAACAGCGTTGG
CTCGTATGCCGTCTTTTGCCCATTCACATGCCAAATTTCTAGCTAGCTGATTTATAGCTC
CTTTGGTTACACCGTAAATGGATCCACCGGTCATGGATACAACCCCCGCAACAGAGGACA
AGAAGACAATGCTTCCATAGCCTGAAGCCTTTAGGAGAGGATGTGAAAGCTGGCAAAAAT
GGTAAGCAGATTCCAAGTTTGTGGAGATATGGAAAGCGAAATCGTCTGCTCCATATTCTG
TTGTTGGCTTTCCGCGAAGTACACCCACATTGTTCACGAAAATGTTGAGCTTG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4BY60JQ 774 0 0
GAAACTCAACACGTAGTTGTATATAGCGTGAAAATTTTATTCGAAAGAGAACATTACAGT
TACAAAACGTGACAGTACCAATCTCAAGCTTATGGTTGATAGGAGAAACCGTTAACCGTG
AGGCCTCCATCAACACAAATGGTCTGACCAGTAATATAAGAAGCTGCAGGAAGACACAAG
AAGACCACTAGTGATGCAACTTCATTCGGCTCTCCAGCTCGACCAAGTGGAGTTCTACCG
AACAGTTCTTCCCTGTACACGACGTCCTCAAGATAAGGTTGGGCCAGCGGAGTGTTGATG
ATATTAGGTGCAACAGCGTTGGCTCGTATGCCGTCTTTTGCCCATTCACATGCCAAATTT
CTAGCTAGCTGATTTATAGCTCCTTTGGTTACACCGTAAATGGATCCACCGGTCATGGAT
ACAACCCCCGCAACAGAGGACAAGAAGACAATGATTCCATAGCCTGAAGCCTTTAGGAGA
GGATGTGAAAGCTGGCAAAAATGGTAAGCAGATTCCAAGTTTGTGGAGATATGGAAAGCG
AAATCGTCTGCTCCATATTCTGTTGTTGGCTTTCCGCGAAGTACACCCACATTGTTCACG
AAAATGTTGAGCTTGCCATCAAACAGCGAGGATACTTTTTGTATCAAAGTTTCTCTCTCG
GGACGAGAGGTTACATCACAGACTGAGCCACTCACTTGAAACCCTTTCTTCTCCCATTGG
CTTAAACTTTGATTGAGTAAAGTTTCAGGTATGTCACACACATGGATTCTAGCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4BY60TF 716 0 0
CAGTTCTTCCCTGTACACGACGTCCTCAAGATAAGGTTGGGCCAGCGGAGTGTTGATGAT
ATTAGGTGCAACAGCGTTGGCTCGTATGCCGTCTTTTGCCCATTCACATGCCAAATTTCT
AGCTAGCTGATTTATAGCTCCTTTGGTTACACCGTAAATGGATCCACCGGTCATGGATAC
AACCCCCGCAACAGAGGACAAGAAGACAATGATTCCATAGCCTGAAGCCTTTAGGAGAGG
ATGTGAAAGCTGGCAAAAATGGTAAGCAGATTCCAAGTTTGTGGAGATATGGAAAGCGAA
ATCGTCTGCTCCATATTCTGTTGTTGGCTTTCCGCGAAGTACACCCACATTGTTCACGAA
AATGTTGAGCTTGCCATCAAACAGCGAGGATACTTTTTGTATCAAAGTTTCTCTCTCGGG
ACGAGAGGTTACATCACAGACTGAGCCACTCACTTGAAACCCTTTCTTCTCCCATTGGCT
TAAACTTTGATTGAGTAAAGTTTCAGGTATGTCACACACATGGATTCTAGCTCCAAAACT
AGCTAATTCCTCTACTATGGCATACCCGATTCCGCTGGCTCCACCAGTTACAAGAGCATT
CATACCTTGAAGACTCTATCTCTTATCCATCTTTTTTTTAATCTCTATATCAGGTGTGAT
TAGTAACGACCAGAATCGCCACAGATTATATACAGACAATGAATGATTCTGCCTCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 4

CO CL3221Contig1 824 4 4 U
GGAGATTGAGGGAGAAGGGAGACATATTGGTTTCGGCGGAATTAGGGTTAGACATGGCGG
CTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGG
TTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTGGAGAACTGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGA
GGATGCGAGGGAAAGAGGACAAAACGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATC
TCATCAACGAACAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGAT
GCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAG
AAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATTGGCTCAGGAAGCCATTGCGAATTACAACACTA
GAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTG
GATTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGCTTC
AAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCTGTAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAAC
CCCGTCAACAAGAATGCGATGAAGCTAGGAGAGTTGTGAAGAAACCGAGGTATAATACAA
GATCAAGCAAGCGTGCGGGTGTCATTACTTATGTCTCTTAGATAATGCAATTACCATTGT
CCGAGATATTCTCCTGTTTGAGGGGAATTTTATCTCTGTATCATTATGTCTATGTATGAC
TTTTGTGGGACAACAACTACTAAAATATTAAAACTTTTATCCAG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DB22TF U 1
AF RR4BZ48TF U 26
AF RR4DB22JQ C 3
AF RR4BZ81JQ C 68
BS 1 589 RR4DB22TF
BS 590 700 RR4BZ48TF
BS 701 822 RR4DB22JQ
BS 823 824 RR4BZ81JQ

RD RR4DB22TF 589 0 0
GGAGATTGAGGGAGAAGGGAGACATATTGGTTTCGGCGGAATTAGGGTTAGACATGGCGG
CTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGG
TTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTGGAGAACTGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGA
GGATGCGAGGGAAAGAGGACAAAACGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATC
TCATCAACGAACAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGAT
GCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAG
AAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATTGGCTCAGGAAGCCATTGCGAATTACAACACTA
GAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTG
GATTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGCTTC
AAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCTGTAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4BZ48TF 675 0 0
GCG
GGTTTCGGCGGAATTAGGGTTAGACATGGCGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAAT
CATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTGGAGA
ACTGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACAAAACGAG
TCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCATCAACGAACAGATCAGGAAGTCACA
GGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCA
TGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATT
GGCTCAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGA
GGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGC
CAAAGATCCTTGCGACCAGTCAAAAGTGTTTCAAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCTGTAG
AGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAACCCCGTCAACAAGAATGCGATGAAGCTAG
GAGAGTTGTGAAGAAACCGAGGTATAATACAAGATCAAGCAAGCGTGCGGGTGTCATTAC
TTATGTCTCTTA

QA 4 675 4 675
DS 

RD RR4DB22JQ 820 0 0
AGATTGAGGGAGAAGGGAGACATATTGGTTTCGGCGGAATTAGGGTTAGACATGGCGGCT
TCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTT
GCATGCTTTAAGAACCTCTTTGGAGAACTGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGAGG
ATGCGAGGGAAAGAGGACAAAACGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTC
ATCAACGAACAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGC
CTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAA
ACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATTGGCTCAGGAAGCCATTGCGAATTACAACACTAGA
GAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGA
TTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGCTTCAA
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GAGATATTCTCCTGTTTGAGGGGAATTTTATCTCTGTATCATTATGTCTATGTATGACTT
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QA 1 820 1 820
DS 

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AGGGAAAGAGGACAAAACGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCATCAA
CGAACAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTT
TGATTTTTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGA
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ATTCTCCTGTTTGAGGGGAATTTTATCTCTGTATCATTATGTTTATGTATGACTTTTGTG
GGACAACAACTACTAAAATATTAAAACTTTTATCCAG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 3

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CAGTGGTCAAAAATCCAAAAGCCAATATTGACATGCTCTGAGAAGGTCAAGGCAAGGCTT
TCATCTCTTCAGTTTAAAACTCTGAAAATTCCAATCAGTAATGTTTCTGAATGTCTTACG
GAAGGGGCCAAAAAACCAATTGAAGCTATATATGTATCATCTTCAAAGTCCAAGGAGAAT
GGGAAATGTGATCCTTTAGTTGTTGTTGTCCATGGAGGGCCTCACTCGATTGCACCATGC
AGCTTCTCCAAGTCTTTGGCCTATCTCTCCTCAATCGGCTACAGTCTGCGGATTGTAAAT
TACAGGGGTTCGTTGGGATTTGGGGAAGATGCGTTGCAGTCTCTACCTGGAAAAGTTGGA
TCACAGGACGTGAACGATGTGCTCTCGGCTGTAGACCATGCTGTTGAAATGGGACTTGCA
GACCCGTCTAGAATGACCTTGCTAGGTGGCTCTCATGGTGGGTTTCTCACTACACACTTG
ATTGGCCAGGCGCCAGATAAATTTGTGGCAGCAGCTGCAAGGAATCCTGTATGCAACCTT
GCATCAATGGTTGGGATTACGGATATACCTGATTGGTGTTTCTTTGAAGCCTATGGTGAC
CGGACTCACTATACAGAAGCCCCATCACCCGAAGATATGTCTCGGCTTCATCAAATGTCT
CCTATATCACACATCTCAAAGGTGAAAACACCCACTTTGTTTCTCTTGGGAACTATGGAT
CTCCGTGTTCCCATTCCAAACGGATTTCAATATGTGAGAGCCTTAAAGGAGAAAGGAGTT
GAGGTTAAAGTGTTAGTCTTTCCCAATGACAATCATCCCTTAGACAGACCGCAGACGGAT
TATGAAAGCTTTCTCAACATTGCTGTTTGGTTCAACAAGTACTGCAAGCTGTGAACACCT
CATTTCTTTTTATTGTCTGAATACTGAGTTTATTAACTGAAGTGGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F273TF U 1
AF RR4BD70TF U 214
AF RR4BD70JQ C 301
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QA 1 717 1 717
DS 

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G
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QA 2 800 2 800
DS 

RD RR4BD70JQ 829 0 0
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GGGAAATGTGATCCTTTAGTTGTTGTTGTCCATGGAGGGCCTCACTCGATTGCACCATGC
AGCTTCTCCAAGTCTTTGGCCTATCTCTCCTCAATCGGCTACAGTCTGCGGATTGTAAAT
TACAGGGGTTCGTTGGGATTTGGGGAAGATGCGTTGCAGTCTCTACCTGGAAAAGTTGGA
TCACAGGACGTGAACGATGTGCTCTCGGCTGTAGACCATGCTGTTGAAATGGGACTTGCA
GACCCGTCTAGAATGACCTTGCTAGGTGGCTCTCATGGTGGGTTTCTCACTACACACTTG
ATTGGCCAGGCGCCAGATAAATTTGTGGCAGCAGCTGCAAGGAATCCTGTATGCAACCTT
GCATCAATGGTTGGGATTACGGATATACCTGATTGGTGTTTCTTTGAAGCCTATGGTGAC
CGGACTCACTATACAGAAGCCCCATCACCCGAAGATATGTCTCGGCTTCATCAAATGTCT
CCTATATCACACATCTCAAAGGTGAAAACACCCACTTTGTTTCTCTTGGGAACTATGGAT
CTCCGTGTTCCCATTCCAAACGGATTTCAATATGTGAGAGCCTTAAAGGAGAAAGGAGTT
GAGGTTAAAGTGTTAGTCTTTCCCAATGACAATCATCCCTTAGACAGACCGCAGACGGAT
TATGAAAGCTTTCTCAACATTGCTGTTTGGTTCAACAAGTACTGCAAGCTGTGAACACCT
CATTTCTTTTTATTGTCTGAATACTGAGTTTATTAACTGAAGTGGAAAT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 3

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TTCGTGAGCGTTGGATCTCTTTCTGGCGATGATGTGAGCCGCAGCCGTTGTCTTGTCTTC
TTCCTCCTCCTCTTCATCGTCGTCCTCTTCCTCTTCATCGTCATCTTCTTTGTATTCCTC
CTCTTCTTCCTCTTCCTCTTTATCTTGAGAGGCAAAACAACCTTTCACTTTCTTGTGGCT
TGCCCTGTGTCCACCCAATGCCTGATGCGACGCAAATACCTTCTTGCAAGCTTTGCATTG
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TGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DB57JQ U 59
AF RR4DU43JQ U 1
AF RR4DU43TF C 94
BS 1 739 RR4DU43JQ
BS 740 906 RR4DU43TF

RD RR4DB57JQ 661 0 0
CACTTTAATTGTATGTGAAGTATATATATATAAACGAACGGATATATAACCAGCAACTTA
ATCAATTAGTCAGCCATCAAGACCAATCACCACTAGCGAGTTTTAACCATGAATTAGATG
AAGTAGCGTTGTGATTGTTGCCACCGCCATCTCTCCCCACGCTCATGACCGTTGGATCAA
CGGAATACTCCTGGCAAGCTAAGTTGAGATCTAGAGATGGTTGATCTAGCGCCTGAGACC
TCGCGGCAGAAGAATCATGTAGTGGCGTCATACGAAGATAAGTGGAAGGGGTTAACCAGT
GACATCTTTTGTGACCCCCC*AAGGCTTGTCCCGATGAGAATACGCGATGGCAGACGGTG
CATTCGTGAGCGTTGGATCTCTTTCTGGCGATGATGTGAGCCGCAGCCGTTGTCTTGTCT
TCTTCCTCCTCCTCTTCATCGTCGTCCTCTTCCTCTTCATCGTCATCTTCTTTGTATTCC
TCCTCTTCTTCCTCTTCCTCTTTATCTTGAGAGGCAAAACAACCTTTCACTTTCTTGTGG
CTTGCCCTGTGTCC*CCCAATGCCTGATGCGACGCAAATACCTTCTTGCAAGCTTTGCAT
TGGAAAACATGTGCAGTTTTTTGTTTTTTCACGGTTTTGCTCTTGCCGTGTCCATGCCTG
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4DU43JQ 739 0 0
GCGTGAAATGTATAGTATTAGTATAATAAATCCATACAACTCTATAAATTAAATAATGCA
CTTTAATTGTATGTGAAGTATATATATATAAACGAACGGATATATAACCAGCAACTTAAT
CAATTAGTCAGCCATCAAGACCAATCACCACTAGCGAGTTTTAACCATGAATTAGATGAA
GTAGCGTTGTGATTGTTGCCACCGCCACCTCTCCCCACGCTCAAGACCGTTGGATCAACG
GAATATTCCTGGCAAGCTAAGTTGAGATCTAGAGATGGTTGATCTAGCGCCTGAGACCTC
ACGGTAGAAGAATCATGTAGTGGCGTCATACGAAGATAAGTGGAAAGTGTTAACCAGTGA
CATCTTTTGTGACCCCCC*AAGGCTTGTCCCGATGAGAATACGCGATGGCAGACGGTGCA
TTCGTGAGCGTTGGATCTCTTTCTGGCGATGATGTGAGCCGCAGCCGTTGTCTTGTCTTC
TTCCTCCTCCTCTTCATCGTCGTCCTCTTCCTCTTCATCGTCATCTTCTTTGTATTCCTC
CTCTTCTTCCTCTTCCTCTTTATCTTGAGAGGCAAAACAACCTTTCACTTTCTTGTGGCT
TGCCCTGTGTCCACCCAATGCCTGATGCGACGCAAATACCTTCTTGCAAGCTTTGCATTG
GAAAACATGTGCAGTTTTTTGTTTTTTCACGGTTTTGCTCTTGCCGTGTCCATGCCTGTT
GTTGTTGTTGTTGTAAGCA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4DU43TF 813 0 0
GAACGGATATATAACCAGCAACTTAATCAATTAGTCAGCCATCAAGACCAATCACCACTA
GCGAGTTT*AACCATGAATTAGATGAAGTAGCGTTGTGATTGTTGCCACCGCCACCTCTC
CCCACGCTCAAGACCGTTGGATCAACGGAATATTCCTGGCAAGCTAAGTTGAGATCTAGA
GATGGTTGATCTAGCGCCTGAGACCTCACGGTAGAAGAATCATGTAGTGGCGTCATACGA
AGATAAGTGGAAAGTGTTAACCAGTGACATCTTTTGTGACCCCCCCAAGGCTTGTCCCGA
TGAGAATACGCGATGGCAGACGGTGCATTCGTGAGCGTTGGATCTCTTTCTGGCGATGAT
GTGAGCCGCAGCCGTTGTCTTGTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCATCGTCGTCCTCTTCCTC
TTCATCGTCATCTTCTTTGTATTCCTCCTCTTCTTCCTCTTCCTCTTTATCTTGAGAGGC
AAAACAACCTTTCACTTTCTTGTGGCTTGCCCTGTGTCCACCCAATGCCTGATGCGACGC
AAATACCTTCTTGCAAGCTTTGCATTGGAAAACATGTGCAGTTTTTTGTTTTTTCACGGT
TTTGCTCTTGCCGTGTCCATGCCTGTTGTTGTTGTTGTTGTAAGCACTCCCTGAATTGGA
CAGCAACACAAGACAGTTGGCAAGCTCTTCGTCTTCGTTTGGATACAAGTTAAGATGATG
ATTCGATCTCTCCCTCTTCCATGGAGGACGTGGCATATTGCCTTCATCGTGTTGTCCTTG
ACTACTGAACATGATCAAATCAATGCATGATCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 2 4

CO CL3224Contig1 803 2 10 U
GGCAACAACCGTTTCCAATGCAAACTCCGGTGATCATGTCCTAGGGGTCTCTCTCCGTCC
TCTCTTTCTCCAGGAACTCAAAGGCTCTTACCTCTTATTGAGGCTTTCTTTGTTCTCTGT
GAGAAAATTCAAACTCCGTCAATATTACAGCAGGATCAGGGGAATGTGACAGCGAGAGAA
GTAAAGGAGTCTTCTCACAGTTCATCATCTAAAACCAGTGCAGAGTCTCAGAAAAAAACT
GATGGCTCTTTTACCTTTTCAAAGTTTGCGGAGAAGCATAGGCGACTGTTGAATTCGTTT
GTTAGGCAAAATCCAAGTTTACTGGAGAAGTCCCTTTCAGTGATGCTAAAGGCACCAAGG
CTGATTGATTTTGATAACAAGAAAGTCTACTTCAGATCAAGGATAAGACACCAGCATGAT
CAACACATTTCTGGGCCATTGCGGATTAGCGTCCGCCGAGCTTATTTGTTGGAAGATTCA
TACAACCAGTTACGCATGCGCTCCCCACAGGATCTGAAAGGACGTCTGAATGTGCAGTTT
CAAGGTGAGGAAGGTATTGATGCTGGTGGTCTTACAAGAGAATGGTATCAGTTACTGTCA
AGAGTTATATTTGACAAAGGAGCGTTGCTTTTCACCACCGTTGGAAATGATGCCACCTTC
CAGCCTAATCCCAATTCTGTTTACCAAACCGAGCATCTGTCATACTTCAAATTTGTTGGT
CGCATGGTGGCGAAGGCGTTGTTTGATGGGCAGCTTTTGGATGTTTATTTCACTCGTTCC
TTTTATAAACACATACTCGGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC84TF U 1
AF RR4DG95TF U 139
BS 1 158 RR4EC84TF
BS 159 159 RR4DG95TF
BS 160 174 RR4EC84TF
BS 175 175 RR4DG95TF
BS 176 347 RR4EC84TF
BS 348 348 RR4DG95TF
BS 349 360 RR4EC84TF
BS 361 361 RR4DG95TF
BS 362 706 RR4EC84TF
BS 707 803 RR4DG95TF

RD RR4EC84TF 706 0 0
GGCAACAACCGTTTCCAATGCAAACTCCGGTGATCATGTCCTAGGGGTCTCTCTCCGTCC
TCTCTTTCTCCAGGAACTCAAAGGCTCTTACCTCTTATTGAGGCTTTCTTTGTTCTCTGT
GAGAAAATTCAAACTCCGTCAATATTACAGCAGGATCATGGGAATGTGACAGCGGGAGAA
GTAAAGGAGTCTTCTCACAGTTCATCATCTAAAACCAGTGCAGAGTCTCAGAAAAAAACT
GATGGCTCTTTTACCTTTTCAAAGTTTGCGGAGAAGCATAGGCGACTGTTGAATTCGTTT
GTTAGGCAAAATCCAAGTTTACTGGAGAAGTCCCTTTCAGTGATGCTCAAGGCACCAAGG
TTGATTGATTTTGATAACAAGAAAGTCTACTTCAGATCAAGGATAAGACACCAGCATGAT
CAACACATTTCTGGGCCATTGCGGATTAGCGTCCGCCGAGCTTATTTGTTGGAAGATTCA
TACAACCAGTTACGCATGCGCTCCCCACAGGATCTGAAAGGACGTCTGAATGTGCAGTTT
CAAGGTGAGGAAGGTATTGATGCTGGTGGTCTTACAAGAGAATGGTATCAGTTACTGTCA
AGAGTTATATTTGACAAAGGAGCGTTGCTTTTCACCACCGTTGGAAATGATGCCACCTTC
CAGCCTAATCCCAATTCTGTTTACCAAACCGAGCATCTGTCATACT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4DG95TF 665 0 0
G
CAATATTACAGCAGGATCAGGGGAATGTGACAGCGAGAGAAGTAAAGGAGTCTTCTCACA
GTTCATCATCTAAAACCAGTGCAGAGTCTCAGAAAAAAACTGATGGCTCTTTTACCTTTT
CAAAGTTTGCGGAGAAGCATAGGCGACTGTTGAATTCGTTTGTTAGGCAAAATCCAAGTT
TACTGGAGAAGTCCCTTTCAGTGATGCTAAAGGCACCAAGGCTGATTGATTTTGATAACA
AGAAAGTCTACTTCAGATCAAGGATAAGACACCAGCATGATCAACACATTTCTGGGCCAT
TGCGTATTAGCGTCCGCCGAGCTTATTTGTTGGAAGATTCATACAACCAGTTACGTATGC
GCTCCCCACAGGATCTGAAAGGACGTCTGAATGTGCAGTTTCAAGGTGAGGAAGGTATTG
ATGCTGGTGGTCTTACAAGAGAATGGTATCAGTTACTGTCAAGAGTTATATTTGACAAAG
GAGCGTTGCTTTTCACCACCGTTGGAAATGATGCCACCTTCCAGCCTAATCCCAATTCTG
TTTACCAAACCGAGCATCTGTCATACTTCAAATTTGTTGGTCGCATGGTGGCGAAGGCGT
TGTTTGATGGGCAGCTTTTGGATGTTTATTTCACTCGTTCCTTTTATAAACACATACTCG
GTGT

QA 2 665 2 665
DS 



CO CL3224Contig2 1194 2 2 U
GGAATGGTATCAGTTACTGTCAAGAGTTATATTTGACAAAGGAGCGTTGCTTTTCACTAC
CGTTGGAAATGATGCCACCTTCCAGCCGAATCCCAACTCTGTTTACCAAAATGAGCATCT
GTCATACTTCAAATTTGTTGGTCGCATGGTAGCTAAGGCGTTGTTAGATGGGCAGCTTTT
GGATGTTTATTTTACGCGCTCCTTCTATAAACACATACTTGGTGTGAAGGTAACCTATCA
TGACATTGAGGCAGTGGATCCTGATTACTACAAGAATTTGAAGTGGCTGTTAGAGAATGA
TGTGAGCGACATACTCGACCTCACATTTAGTATGGACGCAGATGAGGAAAAACGCATTCT
TTACGAAAAGACCGAGGTGAGGACTGTGAGCTTAAACCTGGAGGAAGAAACATACGGGTA
ACAGAGGAAACAAAACATGAATATGTTGACCTTGTGGCCGGACACATACTTACCAATGCT
ATTCGTCCTCAAATCAACGCCTTCCTAGAAGGCTTTAACGAGTTGATACCTCGTGAGCTC
GTTTCCATTTTTAACGATAAAGAGCTCGAGCTCCTAATCAGTGGATTGCCTGAGATTGAC
TTCGATGATCTTAAAGCAAATACCGAGTATAGCAGCTACACGGCTGGATCCCCTGTGATT
CATTGGTTCTGGGAGGTGGTTAAAGCTTTTAGCAAGGAAGACATGGCTAGATATCTTCAA
TTTGTCGCCGGCACATCAAAGGTTCCTTTAGAAGGTTTCAAGGCACTGCAAGGTATTTCT
GGACCTCAAAGATTACAAATCCACAAAGCATATGGAAGTCCAGAGCGGCTGCCATCAGCT
CATACATGTTTTAACCAACTAGACCTTCCAGAGTATCCATCTAAGGAACAACTTAAGGAA
CGACTGCTACTTGCCATTCACGAAGCCAGTGAAGGTTTCGGGTTTGCTTGAACAAATCCT
TCATTCTTTCGGCTCTCCTCTGTATATATCTTACGAAGATTTTCAGGCAGGATAAGGGAG
ACGAGAGGAGCTTTTTGATAAAAATACTTGTAGAATGAATAGAAAACTCGAGTGGTCTTT
ACTTTTTTTTTTTTATCTCACCATATGGTAATTTTTTAGTATTAGAAGACTTTTTTCTCT
TCTGGTTTTTGTAAAGCAGAAATCTCTAAATAGAAGAAGAAATGCTTTTAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FK96TF U 1
AF RR4FK96JQ C 610
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BS 727 1194 RR4FK96JQ

RD RR4FK96TF 726 0 0
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CGTTGGAAATGATGCCACCTTCCAGCCGAATCCCAACTCTGTTTACCAAAATGAGCATCT
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GGATGTTTATTTTACGCGCTCCTTCTATAAACACATACTTGGTGTGAAGGTAACCTATCA
TGACATTGAGGCAGTGGATCCTGATTACTACAAGAATTTGAAGTGGCTGTTAGAGAATGA
TGTGAGCGACATACTCGACCTCACATTTAGTATGGACGCAGATGAGGAAAAACGCATTCT
TTACGAAAAGACCGAGGTGAGGACTGTGAGCTTAAACCTGGAGGAAGAAACATACGGGTA
ACAGAGGAAACAAAACATGAATATGTTGACCTTGTGGCCGGACACATACTTACCAATGCT
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GTTTCCATTTTTAACGATAAAGAGCTCGAGCTCCTAATCAGTGGATTGCCTGAGATTGAC
TTCGATGATCTTAAAGCAAATACCGAGTATAGCAGCTACACGGCTGGATCCCCTGTGATT
CATTGGTTCTGGGAGGTGGTTAAAGCTTTTAGCAAGGAAGACATGGCTAGATATCTTCAA
TTTGTC

QA 1 726 1 726
DS 

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TGGGAGGTGGTTAAAGCTTTTAGCAAGGAAGACATGGCTAGATATCTTCAATTTGTCGCC
GGCACATCAAAGGTTCCTTTAGAAGGTTTCAAGGCACTGCAAGGTATTTCTGGACCTCAA
AGATTACAAATCCACAAAGCATATGGAAGTCCAGAGCGGCTGCCATCAGCTCATACATGT
TTTAACCAACTAGACCTTCCAGAGTATCCATCTAAGGAACAACTTAAGGAACGACTGCTA
CTTGCCATTCACGAAGCCAGTGAAGGTTTCGGGTTTGCTTGAACAAATCCTTCATTCTTT
CGGCTCTCCTCTGTATATATCTTACGAAGATTTTCAGGCAGGATAAGGGAGACGAGAGGA
GCTTTTTGATAAAAATACTTGTAGAATGAATAGAAAACTCGAGTGGTCTTTACTTTTTTT
TTTTTATCTCACCATATGGTAATTTTTTAGTATTAGAAGACTTTTTTCTCTTCTGGTTTT
TGTAAAGCAGAAATCTCTAAATAGAAGAAGAAATGCTTTTAAATT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 3

CO CL3225Contig1 1442 3 3 U
GAGACTTATTAGATTTGAATTGTTTTTTACTTGAATAAAGAAGAAAACATAGTACTTAAG
AAATTTTTGCAAGTATGTTCTAAACAATTTAATGATCTGTAATAACACATGAGTGCAGCT
TCTCACTCTGTCTTTAAGTACTTGGCAAGCTCATCCAGTGCTCTGTATGAGGAGCCTCCA
CTTCTCACAGAGGCTTCAAGCTTTTCTTTCAGAACATGGGCTCTCTCCCTCATGCTTTCA
TCCACCATCAACCTCTTCACGGCTCTCTCGACCCCTCCTCTTTCTACTTCACCTTGAAGC
TGAAACCCTATTCTCCAAACACTTTCTATATATATTGCGTTTAACTTCTGCTCCCCACAG
AAAGGCCTGCAAATCATTGGAACTCCTTCCACAATGCTCTCGAGCGTTGAGTTCCATCTG
CAGTGGCTCCAGAATCCTCCAACTGCAGGATGTCCAAGTACTTCATGCTGCGGTGCCCAT
TTCACAATGTATCCCTTTTCTGAGACAATCTTACTGACTTCCTCTGGCAGTGACTCAGAG
CCAGGTCGGATGACCCACAAGAAAGGCTGGTTGCTATTAGACAATCCCCAAGCCATCTCC
ATGACTTCCTTTGGTTCCATTTGAGCTTTGCTTCCCAAGATTATGTATATGACAGACCTC
TGTACCTGCTTGTTCAGCCATTCAATGCAGCTCCTGTCCTCTTCCAGTAAGCTAGAATTT
GCTGAAGCTGTAATGTGAAGAGGGCCTAATGAAAACAATGGAATATTGAGCTCTTGTTGC
AGCCATGATAGAGAAGAGCTCTCTAGACAGCTCGTTGTGTTGATGATAACAGCAGAAGCC
GTTCTTTTGTTAAACACTTCCCTACATATCTCCAAAAATCGATCCAGTGGTCCCATTCCT
GAAAATGGTAGGTTTTTGTATCTTAGTGGATCTAAATTTTCCACCACCTTGTCTTGCACT
TTAGGATCTTCAATGTCAATCAAGAACTTCTCGGCATTGAGTTTGCTTAGAACACAGCCG
CAAGCATGATTTGTAGCACTGGCAGTGCTTAATATGACACTTGGGATCTTGAACTCCTTA
GCTGCAGCTTCAGAGAAGTACATGAGCTCGTCATAGATGATATATGCGATGTCATTTTCA
TGTTGTAGCAACAACTGCGCTACACAGTCCTTGAAGCTTGCCTCGCTTGTTTTGTTGAGC
TTCAACAGAAACTCGACTAGTCCGAGGCTCTCTTGTTCAGACACCGGTACGGTTTCTGGT
ATGGTGACAAATTGAAAGCTAGGGAAGTGTTGAGAAGAGGTTACTTGTTTGCATTCTCTT
TGAGCAACTGTAATTGAGAAGCCCTTAAAGCTAAGGGCTTGTCCGAGTTGCATCATTGGA
GTTATATGCCCTTGTGCTGGAAATGGAACCGACACTATCCTTCTCTTCTCTGCTATTTTT
TC


BQ
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10 10 

AF RR4A086JQ U 1
AF RR4A086JQD U 1
AF RR4A086TF C 674
BS 1 523 RR4A086JQ
BS 524 776 RR4A086JQD
BS 777 1442 RR4A086TF

RD RR4A086JQ 523 0 0
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TCTCACTCTGTCTTTAAGTACTTGGCAAGCTCATCCAGTGCTCTGTATGAGGAGCCTCCA
CTTCTCACAGAGGCTTCAAGCTTTTCTTTCAGAACATGGGCTCTCTCCCTCATGCTTTCA
TCCACCATCAACCTCTTCACGGCTCTCTCGACCCCTCCTCTTTCTACTTCACCTTGAAGC
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AAAGGCCTGCAAATCATTGGAACTCCTTCCACAATGCTCTCGAGCGTTGAGTTCCATCTG
CAGTGGCTCCAGAATCCTCCAACTGCAGGATGTCCAAGTACTTCATGCTGCGGTGCCCAT
TTCACAATGTATCCCTTTTCTGAGACAATCTTACTGACTTCCT

QA 1 523 1 523
DS 

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GAGACTTATTAGATTTGAATTGTTTTTTACTTGAATAAAGAAGAAAACATAGTACTTAAG
AAATTTTTGCAAGTATGTTCTAAACAATTTAATGATCTGTAATAACACATGAGTGCAGCT
TCTCACTCTGTCTTTAAGTACTTGGCAAGCTCATCCAGTGCTCTGTATGAGGAGCCTCCA
CTTCTCACAGAGGCTTCAAGCTTTTCTTTCAGAACATGGGCTCTCTCCCTCATGCTTTCA
TCCACCATCAACCTCTTCACGGCTCTCTCGACCCCTCCTCTTTCTACTTCACCTTGAAGC
TGAAACCCTATTCTCCAAACACTTTCTATATATATTGCGTTTAACTTCTGCTCCCCACAG
AAAGGCCTGCAAATCATTGGAACTCCTTCCACAATGCTCTCGAGCGTTGAGTTCCATCTG
CAGTGGCTCCAGAATCCTCCAACTGCAGGATGTCCAAGTACTTCATGCTGCGGTGCCCAT
TTCACAATGTATCCCTTTTCTGAGACAATCTTACTGACTTCCTCTGGCAGTGACTCAGAG
CCAGGTCGGATGACCCACAAGAAAGGCTGGTTGCTATTAGACAATCCCCAAGCCATCTCC
ATGACTTCCTTTGGTTCCATTTGAGCTTTGCTTCCCAAGATTATGTATATGACAGACCTC
TGTACCTGCTTGTTCAGCCATTCAATGCAGCTCCTGTCCTCTTCCAGTAAGCTAGAATTT
GCTGAAGCTGTAATGTGAAGAGGGCCTAATGAAAACAATGGAATATTGAGCTCTTG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4A086TF 769 0 0
TCAGCCATTCAATGCAGCTCCTGTCCTCTTCCAGTAAGCTAGAATTTGCTGAAGCTGTAA
TGTGAAGAGGGC*TAATGAAAACAATGGAATATTGAGCTCTTGTTGCAGCCATGATAGAG
AAGAGCTCTCTAGACAGCTCGTTGTGTTGATGATAACAGCAGAAGCCGTTCTTTTGTTAA
ACACTTCCCTACATATCTCCAAAAATCGATCCAGTGGTCCCATTCCTGAAAATGGTAGGT
TTTTGTATCTTAGTGGATCTAAATTTTCCACCACCTTGTCTTGCACTTTAGGATCTTCAA
TGTCAATCAAGAACTTCTCGGCATTGAGTTTGCTTAGAACACAGCCGCAAGCATGATTTG
TAGCACTGGCAGTGCTTAATATGACACTTGGGATCTTGAACTCCTTAGCTGCAGCTTCAG
AGAAGTACATGAGCTCGTCATAGATGATATATGCGATGTCATTTTCATGTTGTAGCAACA
ACTGCGCTACACAGTCCTTGAAGCTTGCCTCGCTTGTTTTGTTGAGCTTCAACAGAAACT
CGACTAGTCCGAGGCTCTCTTGTTCAGACACCGGTACGGTTTCTGGTATGGTGACAAATT
GAAAGCTAGGGAAGTGTTGAGAAGAGGTTACTTGTTTGCATTCTCTTTGAGCAACTGTAA
TTGAGAAGCCCTTAAAGCTAAGGGCTTGTCCGAGTTGCATCATTGGAGTTATATGCCCTT
GTGCTGGAAATGGAACCGACACTATCCTTCTCTTCTCTGCTATTTTTTC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 4

CO CL3226Contig1 722 4 6 U
CTCGCATCCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGAGGGAT
ATCAAGGTTCAGAAGTTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACC
CGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTTTTCTCCAAGGCGAGG
TACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTG
AGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTGAAGGAGTACGAGCTG
TTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACATTGAT
CTTGGTATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTACGTTGTTCTT
GAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAA
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CTCAACAAGTCTCAACATCACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGT*GGTGTTTTGGC
TCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTTGATAAGTCTTTCTTGTTGTGGTAGAATC
CTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCGTTTTCAATTTTAAAACTA
AA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 

AF RR4A009TF U 456
AF RR4A009JQD C 1
AF RR4A009TFB U 1
AF RR4A009JQ C 1
BS 1 455 RR4A009TFB
BS 456 588 RR4A009TF
BS 589 589 RR4A009TFB
BS 590 702 RR4A009TF
BS 703 714 RR4A009TFB
BS 715 722 RR4A009JQ

RD RR4A009TF 247 0 0
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CCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAACATCACCGGTTGAAGAGTTT
CATTTTGTTTTGTTGGTGTTTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTTGAT
AAGTCTTTCTTGTTGTGGTAGAATCCTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAG
GTTATCG

QA 1 247 1 247
DS 

RD RR4A009JQD 719 0 0
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TACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTG
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CTTGGTATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTACGTTGTTCTT
GAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAA
CATAGGGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATC
CTCAACAAGTCTCAACATCACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGT*GGTGTTTTGGC
TCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTTGATAAGTCTTTCTTGTTGTGGTAGAATC
CTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCGTTTTCAATTTTA
AAACT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4A009TFB 714 0 0
CTCGCATCCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGAGGGAT
ATCAAGGTTCAGAAGTTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACC
CGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTTTTCTCCAAGGCGAGG
TACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTG
AGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTGAAGGAGTACGAGCTG
TTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACATTGAT
CTTGGTATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTACGTTGTTCTT
GAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAA
CATAGGGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATC
CTCAACAAGTCTCAACATCACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGT*GGTGTTTTGGC
TCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTTGATAAGTCTTTCTTGTTGTGGTAGAATC
CTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCGTTTTCAATTTTA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4A009JQ 722 0 0
CTCGCATCCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGAGGGAT
ATCAAGGTTCAGAAGTTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACC
CGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTTTTCTCCAAGGCGAGG
TACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTG
AGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTGAAGGAGTACGAGCTG
TTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACATTGAT
CTTGGTATCAAGTACGATCCTTTTACGGGTATCTATGGAATGGACTTTTACGTTGTTCTT
GAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAA
CATAGGGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATC
CTCAACAAGTCTCAACATCACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGT*GGTGTTTTGGC
TCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTTGATAAGTCTTTCTTGTTGTGGTAGAATC
CTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCGTTTTCAATTTTAAAACTA
AA

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL3227Contig1 1383 2 6 U
CTCAAACACCAAACTATGTTTTCTAGTTACCAACACAGATTCTTCTTTCAAGAACCTAAG
AAAACACACAAAAAAAAAAAACTGAAATTGGAAAAACTGTTTTAGTTTTCTAGAGTGGAG
CTAGATGGGACCGGTTCTGAAGGCGATATCAAGATCAGAGATCAAATCATCAGCATCCTC
AATGCCTGCTGATATACGGACAAGATCTTCAGTCAACCCTCTGGCCTCACGAACTTCTGC
AGGTATGCTTGCATGTGACATGAAGCATGGCATGCTTATAAGTGACTTAACACTCCCAAA
ACTGACAGCAATGCTGAAGTATTTGGTGGTTTCCACAAGATGCTTAAATAGCGCGACAGA
CCCTGTTATGAAGCTAAAAACTGATCCTGCACCCTTTGCCTGAAAGAAGTGGAGATGGTG
ACCAGGATGATCTGGTAAACCAGCATGGTACACTTGCTTTACTCTTGGATGCGTAAACAA
GTACATTGCGATCTTCCGTGCGTTTTCCTGTTGCTTCTCTATACGTAAAGCCATTGTCTT
GATTCCTCGTAGGCAAAGCCAACAGTCGAAAGGAGCTAATCCAGAACCTTCCGAGTTTTG
GAGGAAGTACAATTCCTTTGCCAATTTTTCGCCTTTTACAGAAAGCACACCCGCCCATCA
AATCACTGTGTCCGGCTATAAACTTAGTAGCCGAGTGCATCACGATATCAGCTCCAAGTT
CTAATGGCCGAGAGAGCACCGGCGACATTATACTGTTGTCCACTAACAAAAGTGCACCTT
GAGCATGAGCCATCTCAGCTATTTTTCGTATATCAGAGATTTGTTGTCTGGGGTTGGTTG
GAGACTCAAGCCACACAAGTTTTGTCCTGGGACCAATGGCAGCAGCAACCTCCTCTAAAC
TAGTTGTGTTTACTCGTTTGACCACAACGCCAGATCTTGGAACTACATTGGATAGTAATC
TGTCTGAGCCACCATATAAATCATCCCCAGCCACAAGCTCGTCGCCAGATTTGAGAAGGT
GGGTAACAGCAGCAAGAGCAGCCATTCCACTAGTAAAGCAAAATGCTCTATCCGCCTTGT
CAAGCTTCGCAAGGAGACTTTCAAGTGCATCACGTGTAGGATTCCCACTTCTTGTGTAAT
CATATGGACCATTTTCTATAGCAGAAGGCTGCTTAAACGTAGCAGTCTGGTAAAGGGGAG
TGCTCATTGCATCAAAGGGATCAAATTTATTATCCAAGTTCATCAGTAACGTAGCGACGC
TAGCTTCTTCTCTCACATTAACAGCATTTAAGCAATCTTGGGTGGTGTCAACTACAGAAT
GAGTGTTTCCGTCGATGCTCTTCTCCATCACGCAGCTCAGCTTGAACAGGTTCCGATTCG
AGC


BQ
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10 10 10 

AF RR4CC19JQ U 1
AF RR4AZ39TF C 593
BS 1 655 RR4CC19JQ
BS 656 656 RR4AZ39TF
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BS 693 708 RR4CC19JQ
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AAAACACACAAAAAAAAAAAACTGAAATTGGAAAAACTGTTTTAGTTTTCTAGAGTGGAG
CTAGATGGGACCGGTTCTGAAGGCGATATCAAGATCAGAGATCAAATCATCAGCATCCTC
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AATCACTGTGTCCGGCTATAAACTTAGTAGC*GAGTGCATCACGATAT

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DS 

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GAGAAGGTGGGTAACAGCAGCAAGAGCAGCCATTCCACTAGTAAAGCAAAATGCTCTATC
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TGTGTAATCATATGGACCATTTTCTATAGCAGAAGGCTGCTTAAACGTAGCAGTCTGGTA
AAGGGGAGTGCTCATTGCATCAAAGGGATCAAATTTATTATCCAAGTTCATCAGTAACGT
AGCGACGCTAGCTTCTTCTCTCACATTAACAGCATTTAAGCAATCTTGGGTGGTGTCAAC
TACAGAATGAGTGTTTCCGTCGATGCTCTTCTCCATCACGCAGCTCAGCTTGAACAGGTT
CCGATTCGAGC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 3

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GGAGTCTTTGGCGCTAAATGCAAAACATCCTTAAACTTCGCGATTGCTCGGATGAAATTA
CTACAAAACAAGAGAGACATGCATCTCAAACACATGAAGAAGGAGATCGCTCAGTTCTTA
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TATGGGCAGCTTATGAGATCTTGGAACTGTTCTGCGAGTTTGTGCTTGCTCGTGTTCCAA
TTCTTGAAAGTCAAAAGGAATGTCCGAGAGAGTTGAGAGAAGCTATTGCTAGCATTATCT
TTGCTGCTCCAAGGTGCTCTGAAGTGCCTGATCTTCTTCAGCTTAAGAATCTTTTTGGTA
CTAAATATGGAGAAGAGTTTATCATGGTTTCTTCTGAGCTCCGTCCTGATTCTGGTGTCA
ATCGTACAATCATTGAAAAGCTTTCTCCTGCAAGTCCCTCTGGAGAGGTAAGGCTCAAGG
TTTTGAAGGAAATTGCCAAGGAGTACAGTTTGAATTGGGATTCTTCTGCCACGGAAGCTG
AGTTCATGAAGAGCCATGAAGACTTACTGGGTGGAACTAAGCAAATAGATCGTCAAGATA
TTGTCTCTGAATCTAGACCATCCCAACAGGGTAACACTCAATCTTTGGTCTCTAGGGAAG
CTGAGGTTCTGTCTGCAGAGGCCACACAGAGACTCCAGAGGCTTCAAGCCCAAAACCCAT
TGAGCAAAAACATGTCATCATTACCTAAGCTGCATGTAGCATCTCAAGCGCCTCCTGATA
CAAGACGAGATCACAGTGATGTAATGGAGAGAGCTCTGGCTGCTATAACCAGCGCTGATC
GTGCAACTGCAGCAGCTCGTGCTGCAGTCCAACTAGTGAATGTCTCTTATGGGGCTGCAC
CTACTGTAGCAGCAGAAGGGAAGCCTTCAAACTTAATGTAGCTGCCACGTCATGATGATT
TGTGAAAGAAGAATAACGATGTTACCTTAGGTTTGGAAATGAGTATATGCTAAAGAGCAA
CGGTAAAAATATGCTTATGAGATTGTGTGGCCTTGAGAAATGATTACAAAAGTTTAACTG
TGGTGGTCCT


BQ
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI31TF U 1
AF RR4DI31JQ C 315
AF RR4GZ13TF U 987
BS 1 712 RR4DI31TF
BS 713 987 RR4DI31JQ
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RD RR4DI31TF 712 0 0
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TATGGGCAGCTTATGAGATCTTGGAACTGTTCTGCGAGTTTGTGCTTGCTCGTGTTCCAA
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TTGCTGCTCCAAGGTGCTCTGAAGTGCCTGATCTTCTTCAGCTTAAGAATCTTTTTGGTA
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QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4DI31JQ 770 0 0
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GAAAAGCTTTCTCCTGCAAGTCCCTCTGGAGAGGTAAGGCTCAAGGTTTTGAAGGAAATT
GCCAAGGAGTACAGTTTGAATTGGGATTCTTCTGCCACGGAAGCTGAGTTCATGAAGAGC
CATGAAGACTTACTGGGTGGAACTAAGCAAATAGATCGTCAAGATATTGTCTCTGAATCT
AGACCATCCCAACAGGGTAACACTCAATCTTTGGTCTCTAGGGAAGCTGAGGTTCTGTCT
GCAGAGGCCACACAGAGACTCCAGAGGCTTCAAGCCCAAAACCCATTGAGCAAAAACATG
TCATCATTACCTAAGCTGCATGTAGCATCTCAAGCGCCTCCTGATACAAGACGAGATCAC
AGTGATGTAATGGAGAGAGCTCTGGCTGCTATAACCAGCGCTGATCGTGCAACTGCAGCA
GCTCGTGCTGCAGTCCAACTAGTGAATGTCTCTTATGGGGCTGCACCTACTGTAGCAGCA
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AACGATGTTACCTTAGGTTTGGAAATGAGTATATGCTAAAGAGCAACGGT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4GZ13TF 164 0 0
G
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TGGCCTTGAGAAATGATTACAAAAGTTTAACTGTGGTGGTCCT

QA 2 164 2 164
DS 



AS 1 3

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ATCTTCTTCTTAGCCGTCCAAATCTTCCTCCTCGCCATCGTTTCTTCCACCGGAGACGAC
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ATGATTCAACCACCAGTTACAAACAATTCCTACTTCGGAGCCATCTCCATGATCGACAAC
GCCTTGACGACGAAAGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGTCAGGCCCAAGGCTTTTAC
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GGGAAGTACAACGGAAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCAGAGGTC
AGAGAAATGCCTATTGTCGGAGGAAGTGGGCTTTTCCGATTTGCTAGAGGCTACGCTGAG
GCTCGGACAAAGTGGATTAATCTCAAGAACGGCGATGCTACTGTTGAGTATAGCTGTTAT
GTTTTGCATTATTGATGTTTTTTTT*GTAGTAATTATATATTTCATGGCGACCTAATAAG
ATTTTTATATGTTATGCTTTCTTAAGTTTTCTTTTTGCATTTTGGTTTATGGTGTGTCTG
GTGGATTTGTGGTAGTAGTTTTGTGGGTTAATAATATTTATAATAGTTTTATTTCAAGGA
GGTTTTGATGCTAAGTATCCCTTACACTGTTACACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AL19TF U 1
AF RR4B981TF U 4
AF RR4B981JQ C 71
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RD RR4AL19TF 758 0 0
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ATTTTTATATGTTATGCTTTCTTAAGTTTTCTTTTTGCATTTTGGTTTAAAGTGTGTCTG
GTGGATTTGTGGTAGTAGTTTTGTGGGTTAATAATAT
G

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4B981TF 815 0 0
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QA 8 815 8 815
DS 

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TCAAAGTCTATTGGCACGACATCTTAAGTGGTCCAAACCCAACCTCCATCATGATTCAAC
CACCAGTTACAAACAATTCCTACTTCGGAGCCATCTCCATGATCGACAACGCCTTGACGA
CGAAAGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGTCAGGCCCAAGGCTTTTACGCCGGAGCAG
CCCAAAAGGAATTGGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGCTTTTAAGACAGGGAAGTACA
ACGGAAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCAGAGGTCAGAGAAATGC
CTATTGTCGGAGGAAGTGGGCTTTTCCGATTTGCTAGAGGCTACGCTGAGGCTCGGACAA
AGTGGATTAATCTCAAGAACGGCGATGCTACTGTTGAGTATAGCTGTTATGTTTTGCATT
ATTGATGTTTTTTTT*GTAGTAATTATATATTTCATGGCGACCTAATAAGATTTTTATAT
GTTATGCTTTCTTAAGTTTTCTTTTTGCATTTTGGTTTATGGTGTGTCTGGTGGATTTGT
GGTAGTAGTTTTGTGGGTTAATAATATTTATAATAGTTTTATTTCAAGGAGGTTTTGATG
CTAAGTATCCCTTACACTGTTACACA

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

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CTACTTCTCTACAAGCATAACATCCAAACCTCTTCTTTCTTCCAAACACTTTAATCGTTT
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TATATATGGTAGCTGAATGATCCAACCGAGAACAGGTATCTTTTGTACGAAAACTGCCAA
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CATCTCGAAGGACATCATCATTGTGGCCTGCTCTGCTTGCTTCTTCAACCTTTCGCTGAT
TCGTAGACGAATTGGACGCAGAGAGAGAGAGAGAAGATAGAGAAAGAGGTCTCACCGATC
TCGTTACCGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4CC23JQ U 1
AF RR4A752JQ U 22
AF RR4CC23TF C 136
AF RR4A752TF C 49
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TCGTAGACGAATTGGACGCAGAGAGAGAGA
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ATCCAAACCTCTTCTTTCTTCCAAACACTTTAATCGTTTGTCTCTCGAGTTGACTTATAC
GGGTACACGCTTGCCCCTGTACTTGTCAAAGAAGGATCTTGTATGTGGTAGCTGAATGAT
CCAACCGAGAACAGGTATCTTTTGTACGAAAACTGCCAAGGTTGGCCAGAAGCCGCTGAA
GAGAACAAAAAAGCCATAGGTCTCTAACATCATTCCAAGGATAGGCCATCCAAGGACTAC
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CTGCATGGTAGACTTGAGGCCAATGGTAAGACTAACCCCAGAGATGAAAAGAATATTTCC
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AAATGCTGTCAGCCCTAAACCAATTTTTTTTCGGTCATTCATCTCGAAGGACATCATCAT
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GAAAAACTGCATGGTAGACTTGAGGCCAATGGTAAGACTAACCCCAGAGATGAAAAGAAT
ATTTCCCATGGCAAGTAAGCCCTTATCGAAGACAAACATGATTCCCAGAAAGGAGAAGAA
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CATCATTGTGGCCTGCTCTGCTTGCTTCTTCAACCTTTCGCTGATTCGTAGACGAATTGG
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GAAAACTGCCAAGGTTGGCCAGAAGCCGCTGAAGAGAACAAAAAAGCCATAGGTCTCTAA
CATCATTCCAAGGATAGGCCATCCAAGGACTACAAAGAAGAAGCCGGTCCCAAAAGATAT
GGTTCCCTTATAGTTCTGACGCTTGGTGAAAAACTGCATGGTAGACTTGAGGCCAATGGT
AAGACTAACCCCAGAGATGAAAAGAATATTTCCCATGGCAAGTAAGCCCTTATCGAAGAC
AAACATGATTCCCAGAAAGGAGAAGAAAACGCCAAATGCTGTCAGCCCTAAACCAATTTT
TTTTCGGTCATTCATCTCGAAGGACATCATCATTGTGGCCTGCTCTGCTTGCTTCTTCAA
CCTTTCGCTGATTCGTAGACGAATTGGACGCAGAGAGAGAGAGAGAAGATAGAGAAAGAG
GTCTCACCGATCTCGTTACCGGCCC

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DS 



AS 1 4

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CGGTGTTATGGGACTCTTTTACATGCTGGTTGCTCAGCAGCTGCCTGAACCGGAGAGCTC
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GACGGTGTTGGTGGCGGTTGTGGTTCTAATAGCCGCCGTGGTATACCGGAGATAGAACAG
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TTTATCTTCTTGTATACAAAAGAATCAAAATAAAAAGAATATGTTGTCCGCTTACTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AE84TF U 1
AF RR4A485TF U 1
AF RR4AE84JQ C 273
AF RR4A485JQ C 334
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CGCGATTGACACGAGGGGTGTCGTGGATAGATCGGGATGCACGGAGTGTCGTTGTGATCT
CTATAATGTAACCATCGACGAGTACGGTCGAGCTATAAAACCGGATTACAAAGGTGGTTT
GTACTGCTGCTACGATAAGACTCAGTGTCTTGTGAGAAACGGGTTTGATAATGTGGAGGA
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CGGGTATATTGTCTACGGAGCAGCTCACCAGCACGCCGGTGGTATCGGTGCTGCTCTATA
CCGAGAGGACGGTGAGGGGATTTGCACTTCGACGCCAAAGTATGGGAATGGAGACGAGCC
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AGTGAGTTATGGAGAGACACTGACTTTGGAGTTCAATTACAGTAGCGCCGTTGGTCATAC
CGGTGTTATGGGACTCTTTTACATGCTGGTTGCTCAGCAGCTGCCTGAAC

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QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4A485JQ 745 0 0
GAGATGGGTTGATTGGGACAGCTCGGTGGTGGTGCCCGCTAAGGTTTATATCCTCGATGT
TACGGATTCTTGGGAACGTTCGGAAGGTTCAACAGGAGATAGCCAAGAACATTTTTGCCA
TGTGGAATACGAGGTGAAGCCGTGCAAAAAAACCAATGGCGATGGATGTGTTGACGTCAA
GAAGAAGAGCTTAATGATGCCGTTTAACGGGTATATTGTCTACGGAGCAGCTCACCAGCA
CGCCGGTGGTATCGGTGCTGCTCTATACCGAGAGGACGGTGAGGGGATTTGCACTTCGAC
GCCAAAGTATGGGAATGGAGACGAGCCTGGGAACGAAGCTGGTTATATTGTTGGAATGTC
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CAATTACAGTAGCGCCGTTGGTCATACCGGTGTTATGGGACTCTTTTACATGCTGGTTGC
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AAAGAATATGTTGTCCGCTTACTCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

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GATCTGTTAATCCGTCTATGCCTCCTCCACCTCCTCCTCATCCGGTTTCCTCTAACCGGA
GTTCAAACCATAGAAACGGTTTCGTCGGCAGCAAGGAAATCTTCCTTTCCAGGAATCAAG
AAGACCGATCAGCCAACGGATCACCATCAAGGAACACCAATAACGGCCGTACGGTGTCCA
GATCGGGAGGCTCAAAGCGATCTCCACCGTCTCCTGACCAAATCGAGAAGATATCAAGCG
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AGCATCAAAGAGTGAGCAGATCAGAATCAATGGCTCACGCTCATCCAGAGCTGGAGACAA
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TTCCTCATCGACCCAGGAAACGAGCTAAGAACATTGATAAATCCCTACAGTATTGTTTTC
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AGAACCAGTGGAGCAAGAGCTATCGAGAAGCTCACCCTGTTTTATTTCCTATTTTTCTTA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BM24TF U 1
AF RR4G725TF U 481
AF RR4BM24JQ C 1004
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CATTCTCCTTTCTTATATATATTCCTTTTGATTCTCTGCTGATCGGTACGAGAAAGCAGA
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CGAATCCTAGATTTCTGAAAATAATCACAGATCGGAAATCGAAAGAAAAAAAAAAACATT
ACCATTACAGAACTCGAATCGGGTTTTCACTTGGGGGTATAATGATGAGGTATCAGAGAG
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AAACAGATCCCACCCCTACTACCAAGCGCGGCGGAGATGTGCTGTTACAGTGGGGACAGC
GGAAGCGAT

QA 1 609 1 609
DS 

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G
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AGACCGATCAGCCAACGGATCACCATCAAGGAACACCAATAACGGCCGTACGGTGTCCAG
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CAGAGATCATCATCATCAGAACCAGAGACAAAACGGGTTGGATCACAACCATAATCAACA
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TCCTCATC

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR4BM24JQ 610 0 0
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TATGAAAGGCACAAAGCTTCCTCATCGACCCAGGAAACGAGCTAAGAACATTGATAAATC
CCTACAGTATTGTTTTCCAGGGCTGTGGTTATTTGATTTACCCAAGAACCGTTATGATGT
TAGGGAGAAGAAAAATGTGAAGAAGCAGCAGCAGAAACGGAGAGGGTTGAAAGGTATGGA
GGACTTGGACACCGACTCCGAGTAATATCTGGTTCTTACTTTCTATTTTTTTCTTTGTGG
TTTTCGATTTTCTCTTTTTGAGAGGGGGATGAAGCACGTGTGGCTTTGCTTGTGATGCTC
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ATTTCCTATTTTTCTTAATCTTTATCCTTATTTTCCTCATTTTTTTCAGTTTATAAAAGT
TCTTTTTTCT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

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TGGTACTAGTTCTGCTTGATATCTGATAATATGGCAACTGTCAAAAAGCTTTCTTCTTTC
TTATTCTGTAATCCTCGTTTCGTGATGTGTTTGAATCTGTGTGTAAGAAGGCTTGTCGAT
TAGAAAAGTCATTCCAATTTAAAACATTTATTAACTATTGATTTGCGTGCAGATTATTTG
ACATTTGTATTTATAAGATTGCAACCAACAGATTAAAATGATCTACTATTTAAGAGGTAA
CTTAAAATGGTAATTACTCTCAGTTCTTCTCACTCACAAGATGGGAGAAACAATACATTT
ACACAGGTGGTTACAATTAATTTTTCTTTTATAAGAGTTTTTAGTGATCGTTTTGTATAT
TTCTTGAACGAGTTGCTGTACCATCAAAGCTCTGTGGACTGGTGATCCTTTTGGCTAAAC
AAAGAGCTTTTTGACTTCTTTGTTCACCACTGGTAGATCTGAGGGAGAGTCCGGCCATGG
TGTCCTCTTTGATGGAACTATGATTTCCAAGGGTGAATTTATTATCCAGCTTCATAAAAG
TTAATATATAAAATTGCAAGTCTAGATGTGATAATGTAATGAGAAATCTGACTTCATAGA
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ATGAACTACTGTATTCGGACAAAAAAGATATTGACCTGAATAGCCCCGCACTTTACGACA
ACATAGTTTCTGTCCTTTTACAACTATGTAATATAAATACAAGCCCATACCTTAAGTTGA
AGGCCCAAACAGTATTCGAAACA


BQ
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AF RR4B233JQ C 881
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GCCGGAGGTTGTATCAAGTAATGGTGGAGGAAGTAGATTAGCGATGATAAGATCAAAGTT
GGGGTTTCTTGGTGGAAGGAACTTGGTAACTTGCACATTCAGGAGATGGTCTTCTCATAA
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TCTTTCTTATTCTGTAATCCTCGTTTCGTGATGTGTTTGAATCTGTGTGTAAGAAGGCTT
GTCGATTAGAAAAGTCATTCCAATTTAAAACATTTATTAACT

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G
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GTTTGAATCTGTGTGTAAGAAGGCTTGTCGATTAGAAAAGTCATTCCAATTTAAAACATT
TATTAACTATTGATTTGCGTGCAGATTATTTGACATTTGTATTTATAAGATTGCAACCAA
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CTCACTCACAAGATGGGAGAAACAATACATTTACACAGGTGGTTACAATTAATTTTTCTT
TTATAAGAGTTTTTAGTGATCGTTTTGTATATTTCTTGAACGAGTTGCTGTACCATCAAA
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ATTTGCGTGCAGATTATTTGACATTTGTATTTATAAGATTGCAACCAACAGATTAAAATG
ATCTACTATTTAAGAGGTAACTTAAAATGGTAATTACTCTCAGTTCTTCTCACTCACAAG
ATGGGAGAAACAATACATTTACACAGGTGGTTACAATTAATTTTTCTTTTATAAGAGTTT
TTAGTGATCGTTTTGTATATTTCTTGAACGAGTTGCTGTACCATCAAAGCTCTGTGGACT
GGTGATCCTTTTGGCTAAACAAAGAGCTTTTTGACTTCTTTGTTCACCACTGGTAGATCT
GAGGGAGAGTCCGGCCATGGTGTCCTCTTTGATGGAACTATGATTTCCAAGGGTGAATTT
ATTATCCAGCTTCATAAAAGTTAATATATAAAATTGCAAGTCTAGATGTGATAATGTAAT
GAGAAATCTGACTTCATAGAGAATGCGAGTGTAGAACAAGGTGGGATTCCTTAAGTTCGA
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TAGCCCCGCACTTTACGACAACATAGTTTCTGTCCTTTTACAACTATGTAATATAAATAC
AAGCCCATACCTTAAGTTGAAGGCCCAAACAGTATTCGAAAC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL3234Contig1 848 3 4 U
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ATTTCTTTATTACAATTTGATATTTATTTCTGTATTTACTGTGTTAGCTTTTGTGATTTT
GTTGAGTGTTTGTGAAATTCTTTTAATTTGGTACGTGTTGTGTTAGATGTTGTGATTGTC
TTAGCTTTTGTGATTTGTTGAGTGTTCGTGACGTTTCATTTTGTTGTTGTCTTATTTGTG
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GAACACCTTTAAAAGAAGTAATAAGAAAATGATTGGCTCTCTCAAGTGGACGAAAATACT
CAATCAAAATTGAGCCCTAGCAAGTTGCATCTTTAAGTGATATAGTCTTTCTGAGAGATT
TGGTTTGTTGATGTCACCTTTATAGATCCAGCAGCAGTAAGTTATGTCGACGCATAGTTA
TTGGAAGATTGACTGGTCTTTTGCCAAGCACCCATGCCTTATTTGCATTTGCAGTATAAA
AGGCTCTTTGTCTGGAGGTGGGAGCAGAAGATATAGATCCTTAATAGCGTTACTCGTTGT
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CCTGACTTACTATCCACAAATTCATCCAGTCTCAGAATTCTCGAAACATTCCACTAGTCC
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TCAATGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A265JQD U 1
AF RR4A265JQ U 1
AF RR4A265TFB C 43
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BS 476 761 RR4A265JQ
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GTTGAGTGTTTGTGAAATTCTTTTAATTTGGTACGTGTTGTGTTAGATGTTGTGATTGTC
TTAGCTTTTGTGATTTGTTGAGTGTTCGTGACGTTTCATTTTGTTGTTGTCTTATTTGTG
TGAGTTGGTGGTGTAAGTAGTTTACACATGAGAAGAGAGACAAAGATTTCCATCACCCAA
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CAATCAAAATTGAGCCCTAGCAAGTTGCATCTTTAAGTGATATAGTCTTTCTGAGAGATT
TGGTTTGTTGATGTCACCTTTATAGATCCAGCAGCAGTAAGTTATGTCGA

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ATTTCTTTATTACAATTTGATATTTATTTCTGTATTTACTGTGTTAGCTTTTGTGATTTT
GTTGAGTGTTTGTGAAATTCTTTTAATTTGGTACGTGTTGTGTTAGATGTTGTGATTGTC
TTAGCTTTTGTGATTTGTTGAGTGTTCGTGACGTTTCATTTTGTTGTTGTCTTATTTGTG
TGAGTTGGTGGTGTAAGTAGTTTACACATGAGAAGAGAGACAAAGATTTCCATCACCCAA
CTCTCAGTGGTTCTGCTGGACTGATGATTTGCCTTTGCAGCTTCTAAAACTCAAAGATCT
GAACACCTTTAAAAGAAGTAATAAGAAAATGATTGGCTCTCTCAAGTGGACGAAAATACT
CAATCAAAATTGAGCCCTAGCAAGTTGCATCTTTAAGTGATATAGTCTTTCTGAAAGATT
TGGTTTGTTGATGTCACCTTTATAGATCCAGCAGCAGTAAGTTATGTCGACGCATAGTTA
TTGGAAGATTGACTGGTCTTTTGCCAAGCACCCATGCCTTATTTGCATTTGCAGTATAAA
AGGCTCTTTGTCTGGAGGTGGGAGCAGAAGATATAGATCCTTAATAGCGTTACTCGTTGT
TCATCAAGATTCCTTGTCAAATTGCTTGATCAAAAACGTTGTTTATTGCAACATAAAAAC
CCTGACTTACTATCCACAAATTCATCCAGTCTCAGAATTCT

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DS 

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AA
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AGATGTTGTGATTGTCTTAGCTTTTGTGATTTGTTGAGTGTTCGTGACGTTTCATTTTGT
TGTTGTCTTATTTGTGTGAGTTGGTGGTGTAAGTAGTTTACACATGAGAAGAGAGACAAA
GATTTCCATCACCCAACTCTCAGTGGTTCTGCTGGACTGATGATTTGCCTTTGCAGCTTC
TAAAACTCAAAGATCTGAACACCTTTAAAAGAAGTAATAAGAAAATGATTGGCTCTCTCA
AGTGGACGAAAATACTCAATCAAAATTGAGCCCTAGCAAGTTGCATCTTTAAGTGATATA
GTCTTTCTGAGAGATTTGGTTTGTTGATGTCACCTTTATAGATCCAGCAGCAGTAAGTTA
TGTCGACGCATAGTTATTGGAAGATTGACTGGTCTTTTGCCAAGCACCCATGCCTTATTT
GCATTTGCAGTATAAAAGGCTCTTTGTCTGGAGGTGGGAGCAGAAGATATAGATCCTTAA
TAGCGTTACTCGTTGTTCATCAAGATTCCTTGTCAAATTGCTTGATCAAAAACGTTGTTT
ATTGCAACATAAAAACCCTGACTTACTATCCACAAATTCATCCAGTCTCAGAATTCTCGA
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QA 3 806 3 806
DS 



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TCAG


BQ
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AF RR4EG16JQ C 1
AF RR4FB27JQ C 1
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AF RR4FB27TF U 1
BS 1 184 RR4EG16TF

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TCCGTAGCACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCTTTTCGTTAGCAGGTTTATTAATAGAG
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TCAG

QA 1 184 1 184
DS 

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TCCGTAGCACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCTTTTCGTTAGCAGGTTTATTAATAGAG
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TCAG

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR4FB27TF 184 0 0
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TCCGTAGCACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCTTTTCGTTAGCAGGTTTATTAATAGAG
ATTAATCGTTTATTTCCAGATGCATTAACATTTCCCTTTTTTTAATTCTAGTTATTAACA
TCAG

QA 1 184 1 184
DS 



AS 1 4

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GGTCGGAGGAGGAAGGTAACACATGATTGGCCATACCCTTTTGCTGAAGGGAAGCTCTTT
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TTTGGTGACATTGTCATAGTACCTTACATGGATCACTATGATCTTGTTGTGCTCAAGACG
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GATGATACGTTTGTGAGAGTGGATGCTGTTATCCAAGAAGCAGAAAAGGTTAAAGGAAGA
GATAGCCTTTATATTGGAAACATTAATTTCTACCATAAGCCTCTCCGCACCGGTAAATGG
GCTGTCACATACGAGGAATGGCCAGAAGAGTATTATCCTCCTTATGCAAATGGTCCGGGT
TACATCTTGTCATATGACATAGCTAAGTTCATCGTCGATGATTTTGAACAGCAGAGACTA
AGATTATTCAAGATGGAAGATGTGAGCATGGGAATGTGGGTGGAGAAGTTCAACGAGACT
AGACCGGTGGCAGTGGTTCACAGCCTCAAGTTCTGCCAGTTTGGATGCATAGAAGACTAC
TTCACTGCTCATTATCAGTCGCCTCGCCAGATGATTTGCATGTGGGATAAGCTGCAGCGA
CTCGGGAAGCCTCATTGCTGCAACATGAGATGATGACATAACTTTGTCTTCTTTTTTTTT
TGGCTGGATTCTTGTTAGAAAGGAAAATGAAGAAGCAGATGGGAGTTTATGGAGCTAACT
TGTTTTAGATCTCTGATGTATAGACAGGAACAATCTATAATGTATCTATCTATCTATATA
ATATTTAATGAAGGGATCTTGAAAACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP08TF U 1
AF RR4AJ46TF U 1
AF RR4AP08JQ C 441
AF RR4AJ46JQ C 536
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BS 808 860 RR4AJ46TF
BS 861 1278 RR4AP08JQ
BS 1279 1287 RR4AJ46JQ

RD RR4AP08TF 799 0 0
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GTTCTTACCCTTAGAGCTGGGATGTAAGGTTACCACATCAGCGTTAACGGAAGACATATC
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GTGAGGAAGTCATGGATGCAACAAAAGCTAGTTAGGTCATCAAAAGTTGTCGCACGGTTC
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TTTGGTGACATTGTCATAGTACCTTACATGGATCACTATGATCTTGTTGTGCTCAAGACG
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GCTGTCACATACGAG
AATG

QA 1 795 1 795
DS 

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GGTCGGAGGAGGAAGGTAACACATGATTGGCCATACCCTTTTGCTGAAGGGAAGCTCTTT
GTTCTTACCCTTAGAGCTGGGATGTAAGGTTACCACATCAGCGTTAACGGAAGACATATC
ACATCTTTCCCTTACAGAACCGGGTTTGTACTAGAGGATGCTACTGGATTAGCAGTCAAG
GGGAACATTGATGTGCATTCCATATATGCCTCCTCTTTACCCTCTACTAACCCGAGTTTC
GCGCCGCAAAAGCATATGGAGATGCAAAGCAGATGGAAAGCTCCTTCGTTACCTCAGAAG
CCTGTAGAGCTGTTCATTGGTATTCTCTCTGCTGGTAACCATTTTGCAGAGAGAATGGCT
GTGAGGAAGTCATGGATGCAACAAAAGCTAGTTAGGTCATCAAAAGTTGTCGCACGGTTC
TTTGTGGCATTGCACGGAAGAAAAGAAGTCAATGTGGATCTAAAGAAAGAAGCTGAATAT
TTTGGTGACATTGTCATAGTACCTTACATGGATCACTATGATCTTGTTGTGCTCAAGACG
GTTGCCATCTGCGAATATGGGGTTAGCACAGTGGCGGCAAAGTATATAATGAAATGTGAC
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TACATCTTGTCATATGACAT

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DS 

RD RR4AP08JQ 838 0 0
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ACCTTACATGGATCACTATGATCTTGTTGTGCTCAAGACGGTTGCCATCTGCGAATATGG
GGTTAGCACAGTGGCGGCAAAGTATATAATGAAATGTGACGATGATACGTTTGTGAGAGT
GGATGCTGTTATCCAAGAAGCAGAAAAGGTTAAAGGAAGAGATAGCCTTTATATTGGAAA
CATTAATTTCTACCATAAGCCTCTCCGCACCGGTAAATGGGCTGTCACATACGAGGAATG
GCCAGAAGAGTATTATCCTCCTTATGCAAATGGTCCGGGTTACATCTTGTCATATGACAT
AGCTAAGTTCATCGTCGATGATTTTGAACAGCAGAGACTAAGATTATTCAAGATGGAAGA
TGTGAGCATGGGAATGTGGGTGGAGAAGTTCAACGAGACTAGACCGGTGGCAGTGGTTCA
CAGCCTCAAGTTCTGCCAGTTTGGATGCATAGAAGACTACTTCACTGCTCATTATCAGTC
GCCTCGCCAGATGATTTGCATGTGGGATAAGCTGCAGCGACTCGGGAAGCCTCATTGCTG
CAACATGAGATGATGACATAACTTTGTCTTCTTTTTTTTTTGGCTGGATTCTTGTTAGAA
AGGAAAATGAAGAAGCAGATGGGAGTTTATGGAGCTAACTTGTTTTAGATCTCTGATGTA
TAGACAGGAACAATCTATAATGTATCTATCTATCTATATAATATTTAATGAAGGGATC

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DS 

RD RR4AJ46JQ 752 0 0
AATATTTTGGTGACATTGTCATAGTACCTTACATGGATCACTATGATCTTGTTGTGCTCA
AGACGGTTGCCATCTGCGAATATGGGGTTAGCACAGTGGCGGCAAAGTATATAATGAAAT
GTGACGATGATACGTTTGTGAGAGTGGATGCTGTTATCCAAGAAGCAGAAAAGGTTAAAG
GAAGAGATAGCCTTTATATTGGAAACATTAATTTCTACCATAAGCCTCTCCGCACCGGTA
AATGGGCTGTCACATACGAGGAATGGCCAGAAGAGTATTATCCTCCTTATGCAAATGGTC
CGGGTTACATCTTGTCATATGACATAGCTAAGTTCATCGTCGATGATTTTGAACAGCAGA
GACTAAGATTATTCAAGATGGAAGATGTGAGCATGGGAATGTGGGTGGAGAAGTTCAACG
AGACTAGACCGGTGGCAGTGGTTCACAGCCTCAAGTTCTGCCAGTTTGGATGCATAGAAG
ACTACTTCACTGCTCATTATCAGTCGCCTCGCCAGATGATTTGCATGTGGGATAAGCTGC
AGCGACTCGGGAAGCCTCATTGCTGCAACATGAGATGATGACATAACTTTGTCTTCTTTT
TTTTTTGGCTGGATTCTTGTTAGAAAGGAAAATGAAGAAGCAGATGGGAGTTTATGGAGC
TAACTTGTTTTAGATCTCTGATGTATAGACAGGAACAATCTATAATGTATCTATCTATCT
ATATAATATTTAATGAAGGGATCTTGAAAACC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL3237Contig1 938 4 12 U
GGATCAAAATCACCCTTTACTGAAAAACAATAAAATCTAAAAGAATGACATTTTCATATT
CTCTACCCAAAAGATTTGTTTCCTCTATTTTGGCTATGCAATTCTTCATCATACATAGTG
TTTCTTCGTTGAACCTTACCAATGATTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTGATCAAGGGA
TATATAATTCTGGAAGTGAGTACGAGGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTA
ATGGTAATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCACAAGCTTGGGTCGTGAACCTGCTCCTG
ATGCTGTTACCGTCATGTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCCGTTCAT
GTGCTGACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAA
TATGGTATGACCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATA
CTGACTACAAGAATATTTTTTTCTATGTACAACTCAAATAACGTGAAAGGAGATGCAAAA
TTGTTTGTTAAGAAGGTGTTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAAT
AGCGAGGCTGGCGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAGGGAAAAAGAAGCTTGGGAAAAAT
ACATTGTATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAATTAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGATA
TGGAGCATCGCAAAGCTTTTCAAGAACGACAACATTAAACAAGGAGGAAGAGTTTTAGGT
TCGAACTGTGAAGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTATTAGGAGTTGAGCATTTTTTGTG
GTGGTGATGAATATATCCGCTTCGTAACTTCTAATTATGTTTTAGTTTTGTTTACTTTTT
TTGCTGAAGTTTAATACATATATTAATAAATAGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BO15TF U 1
AF RR4FI71TF U 5
AF RR4FI71JQ C 146
AF RR4BO15JQ C 192
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BS 710 742 RR4BO15TF
BS 743 938 RR4FI71JQ

RD RR4BO15TF 752 0 0
GGATCAAAATCACCCTTTACTGAAAAACAATAAAATCTAAAAGAATGACATTTTCATATT
CTCTACCCAAAAGATTTGTTTCCTCTATTTTGGCTATGCAATTCTTCATCATACATAGTG
TTTCTTCGTTGAACCTTACCAATGATTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTGATCAAGGGA
TATATAATTCTGGAAGTGAGTACGAGGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTA
ATGGTAATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCACAAGCTTGGGTCGTGAACCTGCTCCTG
ATGCTGTTACCGTCATGTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCCGTTCAT
GTGCTGACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAA
TATGGTATGACCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATA
CTGACTACAAGAATATTTTTT*CTATGTACAACTCAAATAACGTGAAAGGAGATGCAAAA
TTGTTTGTTAAGAAGGTGTTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAAT
AGCGAGGCTGGCGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAGG*AAAAAGAAGCTTGGGAAAA*T
ACATTGTATGCAATGGTGCAGTGTGTAGA*TTAACAATAGATTGTAAA*GTTGTTTGATA
TGGAGCATCGCAAAGCTTTTCA
GACGACACAT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4FI71TF 752 0 0
A
AAAATCACCCTTTACTGAAAAACAATAAAATCTAAAAGAATGACATTTTCATATTCTCTA
CCCAAAAGATTTGTTTCCTCTATTTTGGCTATGCAATTCTTCATCATACATAGTGTTTCT
TCGTTGAACCTTACCAATGATTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTGATCAAGGGATATAT
AATTCTGGAAGTGAGTACGAGGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTAATGGT
AATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCACAAGCTTGGGTCGTGAGCCTGCTCCTGATGCT
GTTACCGTCATGTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCCGTTCATGTGCT
GACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAATATGG
TATGACCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATACTGAC
TACAAGAATATTTTTTTCTATGTACAACTCAAATAACGTGAAAGGAGATGCAAAATTGTT
TGTTAAGAAGGTGTTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAATAGCGA
GGCTGGCGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAGGGAAAAAGAAGCTTGGGAAAA*TACATT
GTATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAATTAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAG
CATCGCAAAGCTTTTCA
AGAACGACAACATT

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4FI71JQ 793 0 0
TTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTGATCAAGGGATATATAATTCTGGAAGTGAGTACGA
GGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTAATGGTAATTATTATAACAACGGTTT
TGTGCGCACAAGCTTGGGTCGTGAGCCTGCTCCTGATGCTGTTACCGTCATGTTCCAGTG
TCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCCGTTCATGTGCTGACACTGCAGTTGCAGGGTT
TCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAATATGGTATGACCAATGTTTTTTTTG
GGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATACTGACTACAAGAATATTTTTTTCTA
TGTACAACTCAAATAACGTGAAAGGAGATGCAAAATTGTTTGTTAAGAAGGTGTTGGATT
TTTTTTTTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAATAGCGAGGCTGGCGACCTCGTCATAC
TTTACGCAGAAGGGAAAAAGAAGCTTGGGAAAAATACATTGTATGCAATGGTGCAGTGTG
TAGAATTAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAGCATCGCAAAGCTTTTCAAGA
ACGACAACATTAAACAAGGAGGAAGAGTTTTAGGTTCGAACTGTGAAGTAAGATATGAGC
TATACCCTTTTATTAGGAGTTGAGCATTTTTTGTGGTGGTGATGAATATATCCGCTTCGT
AACTTCTAATTATGTTTTAGTTTTGTTTACTTTTTTTGCTGAAGTTTAATACATATATTA
ATAAATAGTGTTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4BO15JQ 747 0 0
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TATAACAACGGTTTTGTGCGCACAAGCTTGGGTCGTGAACCTGCTCCTGATGCTGTTACC
GTCATGTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCCGTTCATGTGCTGACACT
GCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAATATGGTATGAC
CAATGTTTTTTTTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATACTGACTACAAG
AATATTTTTT*CTATGTACAACTCAAATAACGTGAAAGGAGATGCAAAATTGTTTGTTAA
GAAGGTGTTGGATTTTTTCTTTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAATAGCGAGGCTGG
CGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAGGGAAAAAGAAGCTTGGGAAAAATACATTGTATGC
AATGGTGCAGTGTGTAGAATTAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAGCATCGC
AAAGCTTTTCAAGAACGACAACATTAAACAAGGAGGAAGAGTTTTAGGTTCGAACTGTGA
AGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTATTAGGAGTTGAGCATTTTTTGTGGTGGTGATGAA
TATATCCGCTTCGTAACTTCTAATTATGTTTTAGTTTTGTTTACTTTTTTTGCTGAAGTT
TAATACATATATTAATAAATAGTGTTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 4

CO CL3238Contig1 473 4 5 U
GGATATCAGAATGAAAACCCACGTTTTATCTAGCCTTCTCTTCCTGGTTCTCTGCATCTA
CAGCCTTAAAACGACGGTCCATGGAGCTGGAGAATGCGGGAGAAACCCTCCAGACAGAGA
AGCCATAAAGCTGGCTCCTTGCGCAATGGCTGCACAAGACAAGTCTTCTAAAGTGTCTGC
GACATGCTGTGATCGAATCAAACAAATGGGGAGGAACCCCAAATGTCTTTGCGCTGTCAT
GCTCTCCTCTACGGCTAGGAACTCTGGAGCAAAGCCAGAGATCTCAATGACCATTCCTAA
ACGCTGCAACATCGCTGATCGTCCCATCGGTTACAAATGTGGAGCTTATACTCTGCCTTG
AAGTAGCAGACAGAGAGAGCAGTAAACGTTCTTCTATACCAGACTAATATGTCACGCATG
TGTATTACTTGGTTTCAGTAATAAAATTTGATCAAACACAATTATTGATCATG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AT64JQ C 1
AF RR4FU24JQ C 178
AF RR4FU24TF U 178
AF RR4AT64TF U 1
BS 1 178 RR4AT64TF
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BS 184 184 RR4AT64TF
BS 185 459 RR4FU24TF
BS 460 473 RR4AT64TF

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G
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TGAAGTAGCAGACAGAGAGAGCAGTAAACGTTCTTCTATACCAGACTAATATGTCACGCA
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G

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DS 

RD RR4FU24TF 283 0 0
G
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ATGCTCTCCTCTACGGCTAGGAACTCTGGAGCAAAGCCAGAGATCTCAATGACCATTCCT
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TGAAGTAGCAGACAGAGAGAGCAGTAAACGTTCTTCTATACCAGACTAATATGTCACGCA
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G

QA 2 282 2 282
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RD RR4AT64TF 473 0 0
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GACATGCTGTGATCGAATCAAACAAATGGGGAGGAACCCCAAATGTCTTTGCGCTGTCAT
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ACGCTGCAACATCGCTGATCGTCCCATCGGTTACAAATGTGGAGCTTATACTCTGCCTTG
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QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 

AF RR4AE11JQ C 1
AF RR4AH06JQ C 1
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AF RR4AH06TF U 1
BS 1 185 RR4AE11TF

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QA 1 185 1 185
DS 

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QA 1 185 1 185
DS 

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QA 1 185 1 185
DS 



AS 1 3

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AG05TF U 10
AF RR4AH49TF U 1
AF RR4AG05JQ C 211
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BS 538 705 RR4AH49TF
BS 706 706 RR4AG05JQ
BS 707 765 RR4AH49TF
BS 766 1071 RR4AG05JQ

RD RR4AG05TF 624 0 0
AATCATCTCAAAGCAAGCAAAAAGAAAACAAAAAA**GTCATGGAATCATTCTCGTCCTT
CTTCGATTCACAACCTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAGGAACCTCCGTCA
GATTTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGATTTATCTTACTCTGTGTTGTGCTCT
TGTTGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTCCACGTCCTCTGGAACATTGGTGGTATTCTCAC
TACCATCGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTCTCCTCCTTATCAACAACA
AAAGAGGCTTTTACTTCTGTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCAGTTGGTCCCTT
GATCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCGCTGCGTTTGTCGGAACTGC
GATAGCCTTTATCTGTTTCTCCGGAGCAGCGATGCTGGCAAGACGCAGAGAGTATCTCTA
CCTCGGAGGACTCCTTTCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCGGTTCGCCTCTTC
CATCTTCGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGCCTCTTGATCTT
TGTGGGATACATGGTGGTGGACAC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4AH49TF 770 0 0
GGACATTTTAATCATCTCAAAGCAAGCAAAAAGAAAACAAAAAAAAGTCATGGAATCATT
CTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAA
CCTCCGTCAGATTTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTG
TTGTGCTCTTGTTGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGG
TATTCTCACTACCATTGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTGTCCTCCTTA
TGAACAACAAAAGAGGCTTTTACTTCTGTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGT
TGGTCCCTCGATCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCATTCGT
CGGAACTGCGATAGCCTTTATCTGTTTCTCGGGGGCAGCGATGCTGGCAAGACGCATAGA
GTATCTCTACCTCGGAGGACTCCTTTCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCAGTT
CGCCTCTTCCATCTTCGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGCCT
CTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACACTCAAGATATTATAGAGAAGGCCCACCT
CGGTGACATGGACTACGTGAAACATTCCTTGACCCTTTTCACCGATTTTGTAGCTGTGTT
TGTTCGTATCCTCATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGA
AGAGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4AG05JQ 861 0 0
TTACCTCCACGTCCTCTGGAACATTGGTGGTATTCTCACTACCATCGGATGCTTTGGAAG
CATGATTTGGCTGCTCTCCTCTCCTCCTTATCAACAACAAAAGAGGCTTTTACTTCTGTT
TCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCAGTTGGTCCCTTGATCAAAGTGGCAGTTGATTT
TGACCCAAGCATCCTTATCGCTGCGTTTGTCGGAACTGCGATAGCCTTTATCTGTTTCTC
CGGAGCAGCGATGCTGGCAAGACGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGACTCCTTTCATC
TGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCGGTTCGCCTCTTCCATCTTCGGTGGCTCTGCATC
TATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGCCTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGA
CACTCAGGATATTATAGAGAAGGCCCACCTCGGTGACATGGACTACGTGAAACATTCGTT
GACCCTTTTCACCGACTTTGTAGCTGTGTTTGTTCGTATTCTCATCATAATGCTGAAGAA
CTCGGCAGATAAAGAAGAGAAAAAGAAGAAGAGGAGGAACTGAGATTAAAAGTGAGGAAG
AAAGCTAATAGAGAGTGGGTGATATAAGTACATGAAAGCTTTGGTGTTTTTACTTGTTTG
AGACAGTTTTGCTAAAAACACATGCATGTTACCTTATTTGTGTATTCTTCTAAGTGGCTC
CCGATTGTAAATGGATCTAGTGGTGTTCGTTTTTCGTTCATTATCTTAGTACTGTTTAAA
AAAGTATTAGTTGGGGATTCTACGTTTTTTTTTGGGTGTAATTTCGCGTCTGGTCGCCAA
GAGAAAAGCAAATATTTGTGC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 4

CO CL3241Contig1 683 4 7 U
TTCGCATATCAAGTGTGTAATAGAAATTATAAGAGCATATCACAA*TTGGTTTTACTTAT
TATTGAATCAGG*ATCATCTCCTTACAACGCTCTTAATCACAACAAACACAAAATTTACA
AACTCCAATCCCATTACCTCCCAATGTTTCTTCCCTAAACTCTCCACAAACTCGTCAATA
CTCCGATCAAAGCTTCCTCCTTCACTCATCGCCTTCACAGCCAAATCTTTCCACTTCTTA
AAACTCTCTCTAATCTCCACACTACTCTCTCCTTCCATCACTCCTCTCAAACACCTCACC
ACCTCACCCTTTTCTGGATCCTTCTTTGCAGCCTCTAGCTTCAAAGCCCTCTCAAGCTCT
CTCGACTTGGAAACCCTCCGTTTCTTTTTATCTTTCCCGGGCTCCTCGTCGTCGTCAATC
TTGAAATAACTGAACGTGAAATCCTTAGCAGCCTCTTCCACATCCAGCTTACCCTTACCT
TTATCTAATAAGGCCTTACTATTATCTTCCACAGTCTTATCCTCAAAACCTGACTCCCTC
TTTCTCTTGTTAGGTACAACCTTCTTCCTCTTCTCGTGGCTTCTTGGTCTATCTGAACCT
CCACGACCACCTTTAAGCTCATCGATTTTGCGGTGGAGACGTTGCCTCAGCTCCTCGTAA
GTAACCTCATCAGTCTTCTTACC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB61TF C 4
AF RR4AB61JQ U 20
AF RR4AF40JQ U 341
AF RR4AF40TF C 1
BS 1 23 RR4AF40TF
BS 24 32 RR4AB61JQ
BS 33 33 RR4AF40TF
BS 34 330 RR4AB61JQ
BS 331 340 RR4AF40TF
BS 341 559 RR4AF40JQ
BS 560 683 RR4AF40TF

RD RR4AB61TF 108 0 0
GCATATCAAGTGTGTAATAGAAATTATAAGAGCATATCACAAATTGGTTTTACTTATTAT
TGAATCAGGGATCATCTCCTTACAACGCTCTTAATCACAACAAA
ACAC

QA 1 104 1 104
DS 

RD RR4AB61JQ 314 0 0
ATAA
AAATTATAAAAGCATATCACAA*TTGGTTTTACTTATTATTGAATCAGG*ATCATCTCCT
TACAACGCTCTTAATCACAACAAACACAAAATTTACAAACTCCAATCCCATTACCTCCCA
ATGTTTCTTCCCTAAACTCTCCACAAACTCGTCAATACTCCGATCAAAGCTTCCTCCTTC
ACTCATCGCCTTCACAGCCAAATCTTTCCACTTCTTAAAACTCTCTCTAATCTCCACACT
ACTCTCTCCTTCCATCACTCCTCTCAAACACCTCACCACCTCACCCTTTTCTGGATCCTT
CTTTGCA
CCC

QA 5 311 5 311
DS 

RD RR4AF40JQ 219 0 0
TCAAAGCCCTCTCAAGCTCTCTCGACTTGGAAACCCTCCGTTTCTTTTTATCTTTCCCGG
GCTCCTCGTCGTCGTCAATCTTGAAATAACTGAACGTGAAATCCTTAGCAGCCTCTTCCA
CATCCAGCTTACCCTTACCTTTATCTAATAAGGCCTTACTATTATCTTCCACAGTCTTAT
CCTCAAAACCTGACTCCCTCTTTCTCTTGTTAGGTACAA

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR4AF40TF 683 0 0
TTCGCATATCAAGTGTGTAATAGAAATTATAAGAGCATATCACAA*TTGGTTTTACTTAT
TATTGAATCAGG*ATCATCTCCTTACAACGCTCTTAATCACAACAAACACAAGATTTACA
AACTCCAATCTCATTACCTCTCAATGTTTCTTCCCTAAACTCTCCACAAACTCGTCAATA
CTCCGATCAGAGCTTCCTCCTTCACTCATCGCCTTCACAGCCAAATCTTTCCACTTCTTA
GAACTCTCTCTAATCTCCACACTACTCTCTCCTTCCATCACTCCTCTCAAACACCTCACC
ACCTCACCCTTTTCTGGATCCTTCTTTGCAGCCTCTAGCTTCAAAGCCCTCTCAAGCTCT
CTCGACTTGGAAACCCTCCGTTTCTTTTTATCTTTCCCGTGCTCCTCGTCGTCGTCGATC
TTGAAATAACTGAACGTGAGATCCTTAGCAGCCTCTTCCACATCCAGCTTACCCTTACCT
TTATCTAATAAGGCCTTACTATTATCTTCCACAGTCTTATCCTCAGAACCTGACTCCCTC
TTTCTCTTGTTAGGTACAACCTTCTTCCTCTTCTCGTGGCTTCTTGGTCTATCTGAACCT
CCACGACCACCTTTAAGCTCATCGATTTTGCGGTGGAGACGTTGCCTCAGCTCCTCGTAA
GTAACCTCATCAGTCTTCTTACC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL3242Contig1 1229 4 4 U
GGAGTTTCATTTCATTACCTCTCCAATGGCGTCTACTTTGAATGCTGCTGTGTCTCTCAC
ATCTTCCAAGTCTTCTTCATTTCCAGCTACAAGCTGTGCCATTGCTCCTGAAAGGATCAG
GTTTGGTAAGGGTGCTTTTAACTACAAAAGCAACAGTGTGGTGACAAGCAGAAGAGTGGT
TTCAGTAAGAGCTGAAGTCACAACAGATGCTCCTCCAGTGAAGAAAGTAGAGAAAGAGTC
TAAGAAGAACGAGGAAGGTGTGATTACTAACAAGTACAGACCAAAAGAGCCTTACACCGG
AAAAGTCCTCCTCAACACCAAAATCACAGCTGATGATGCTCCTGGAGAGACCTGGCACAT
GGTTTTCAGCCATGCAGGAGAAATACCGTACAGAGAGGGACAATGTTGGTGTGATTGCTG
ATGGAGTTGACAAGAACGGAAAGCCTAACAAAGTCAGGCTTTACTCCATTGCAAGCAGCG
CTCTTGGAGATCTTGGCAACTCTGAAACTGTTTCTCTGTGTGTGAAAAGGCTTGTTTATA
CTAATGACGCAGGAGAGGTTGTTAAAGGAGTTTGCTCAAACTTCTTGTGTGACTTGAAAC
CAGGAAGTGATGTCAAGCTCACTGGTCCTGTAGGGAAAGAAATGCTTATGCCTAAGGATC
CAAACGCCACTGTTATTATGCTTGCCACAGGGACAGGAATAGCTCCTTTTAGGTCTTTCT
TGTGGAAGATGTTCTTCGAGAAACATGATGACTACAAGTTTAATGGCTTAGCTTGGTTGT
TCTTGGGTGTACCAACCACTAGTTCATTGCTATACACAGAGGAGTTTGATAGGATGAAAG
CAAAGGCACCAGAGAACTTCAGGGTTGATTACGCGATAAGCAGAGAACAAGCAAATGATA
AAGGAGAGAAAATGTATATCCAGACAAGAATGGCACAATACGCACCTGAGCTATGGGAGT
TGCTGAAGAAAGACAACACGTTTGTCTACATGTGTGGGCTTAAGGGGATGGAGAAAGGAA
TTGACGACATCATGGTCTCCTTAGCTGCTAATGACGGTATTGACTGGTTTGATTATAAGA
AGCAGTTGAAGAAGGCAGAGCAATGGAACGTTGAAGTTTACTGATTTGAACATTCTATAT
GGCAAAAGTATTAGTGTAATTTTTTTCAGATCCAATGTCTCTGTAATCTGAACATAAGTT
TATGTTTTAGATATATATACATTATACCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D087JQ C 1
AF RR4D087TF U 1
AF RR4BJ03TF U 1
AF RR4BJ03JQ C 419
BS 1 711 RR4BJ03TF
BS 712 712 RR4BJ03JQ
BS 713 762 RR4BJ03TF
BS 763 1229 RR4BJ03JQ

RD RR4D087JQ 282 0 0
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ATCTTCCAAGTCTTCTTCATTTCCAGCTACAAGCTGTGCCATTGCTCCTGAAAGGATCAG
GTTTGGTAAGGGTGCTTTTAACTACAAAAGCAACAGTGTGGTGACAAGCAGAAGAGTGGT
TTCAGTAAGAGCTGAAGTCACAACAGATGCTCCTCCAGTGAAGAAAGTAGAGAAAGAGTC
TAAGAAGAACGAGGAAGGTGTGATTACTAACAAGTACAGA
GC

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4D087TF 282 0 0
GGAGTTTCATTTCATTACCTCTCCAATGGCGTCTACTTTGAATGCTGCTGTGTCTCTCAC
ATCTTCCAAGTCTTCTTCATTTCCAGCTACAAGCTGTGCCATTGCTCCTGAAAGGATCAG
GTTTGGTAAGGGTGCTTTTAACTACAAAAGCAACAGTGTGGTGACAAGCAGAAGAGTGGT
TTCAGTAAGAGCTGAAGTCACAACAGATGCTCCTCCAGTGAAGAAAGTAGAGAAAGAGTC
TAAGAAGAACGAGGAAGGTGTGATTACTAACAAGTACAGA
GC

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4BJ03TF 762 0 0
GGAGTTTCATTTCATTACCTCTCCAATGGCGTCTACTTTGAATGCTGCTGTGTCTCTCAC
ATCTTCCAAGTCTTCTTCATTTCCAGCTACAAGCTGTGCCATTGCTCCTGAAAGGATCAG
GTTTGGTAAGGGTGCTTTTAACTACAAAAGCAACAGTGTGGTGACAAGCAGAAGAGTGGT
TTCAGTAAGAGCTGAAGTCACAACAGATGCTCCTCCAGTGAAGAAAGTAGAGAAAGAGTC
TAAGAAGAACGAGGAAGGTGTGATTACTAACAAGTACAGACCAAAAGAGCCTTACACCGG
AAAAGTCCTCCTCAACACCAAAATCACAGCTGATGATGCTCCTGGAGAGACCTGGCACAT
GGTTTTCAGCCATGCAGGAGAAATACCGTACAGAGAGGGACAATGTTGGTGTGATTGCTG
ATGGAGTTGACAAGAACGGAAAGCCTAACAAAGTCAGGCTTTACTCCATTGCAAGCAGCG
CTCTTGGAGATCTTGGCAACTCTGAAACTGTTTCTCTGTGTGTGAAAAGGCTTGTTTATA
CTAATGACGCAGGAGAGGTTGTTAAAGGAGTTTGCTCAAACTTCTTGTGTGACTTGAAAC
CAGGAAGTGATGTCAAGCTCACTGGTCCTGTAGGGAAAGAAATGCTTATGCCTAAGGATC
CAAACGCCACTGTTATTATGCTTGCCACAGGGACAGGAATAGCTCCTTTTATGTCTTTCT
TGTGGAAGATGTTCTTCGAGAAACATGATGACTACAAGTTTA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BJ03JQ 811 0 0
TGATGGAGTTGACAAGAACGGAAAGCCTAACAAAGTCAGGCTTTACTCCATTGCAAGCAG
CGCTCTTGGAGATCTTGGCAACTCTGAAACTGTTTCTCTGTGTGTGAAAAGGCTTGTTTA
TACTAATGACGCAGGAGAGGTTGTTAAAGGAGTTTGCTCAAACTTCTTGTGTGACTTGAA
ACCAGGAAGTGATGTCAAGCTCACTGGTCCTGTAGGGAAAGAAATGCTTATGCCTAAGGA
TCCAAACGCCACTGTTATTATGCTTGCCACAGGGACAGGAATAGCTCCTTTTAGGTCTTT
CTTGTGGAAGATGTTCTTCGAGAAACATGATGACTACAAGTTTAATGGCTTAGCTTGGTT
GTTCTTGGGTGTACCAACCACTAGTTCATTGCTATACACAGAGGAGTTTGATAGGATGAA
AGCAAAGGCACCAGAGAACTTCAGGGTTGATTACGCGATAAGCAGAGAACAAGCAAATGA
TAAAGGAGAGAAAATGTATATCCAGACAAGAATGGCACAATACGCACCTGAGCTATGGGA
GTTGCTGAAGAAAGACAACACGTTTGTCTACATGTGTGGGCTTAAGGGGATGGAGAAAGG
AATTGACGACATCATGGTCTCCTTAGCTGCTAATGACGGTATTGACTGGTTTGATTATAA
GAAGCAGTTGAAGAAGGCAGAGCAATGGAACGTTGAAGTTTACTGATTTGAACATTCTAT
ATGGCAAAAGTATTAGTGTAATTTTTTTCAGATCCAATGTCTCTGTAATCTGAACATAAG
TTTATGTTTTAGATATATATACATTATACCG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 4

CO CL3243Contig1 781 4 9 U
CTCGGTTTCAGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTCTGCGACAA
CGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAAATCGTCAGAGACATCAAGGAGAA
GCTCTGCTACATTGCTCTTGACTACGGGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACTAGCTCATC
TGTTGAGAAAAACTACGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGGTT
CCGTTGCCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCA
TGAAACAACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTT*GTACG
GTAACATT*GTGCTTAGTGGTGGAACCACAATGTTTCCGGGGATTGCTGATAGAATGAGC
AAAGAGATCACTGCTCTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCTCCTCCTGAG
AGGAAATACTCTGTCTGGATTGGAGGGTCTATCTTGGCCTCACTCAGTACCTTCCAGCAG
ATGTGGATCGCAAAGGCAGAGTATGATGAGTCAGGCCCATCCATTGTTCACAGGAAGTGC
TTCTAAGCTCAAAATTCATCATTTTTCTGAAAAGAAGTGGTTATGCTGCTCTTTGTTTTT
TTTTATGTTCTCTTTTATTTTGAAATTCTGGCATAAGGCATTTTCAAGGATTTATTTTCG
TAATTCTTATTTAGTTTCAACTATCTTTTTGAGTGAATAAAAGACCTCTATGATTATCAT
T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BM50TF U 1
AF RR4CW02TF U 1
AF RR4CW02JQ C 16
AF RR4BM50JQ C 50
BS 1 354 RR4BM50TF
BS 355 355 RR4CW02TF
BS 356 368 RR4BM50TF
BS 369 369 RR4CW02TF
BS 370 398 RR4BM50TF
BS 399 573 RR4CW02TF
BS 574 574 RR4CW02JQ
BS 575 657 RR4CW02TF
BS 658 781 RR4CW02JQ

RD RR4BM50TF 404 0 0
CTCGGTTTCAGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTCTGCGACAA
CGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAAATCGTCAGAGACATCAAGGAGAA
GCTCTGCTACATTGCTCTTGACTACGGGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACTAGCTCATC
TGTTGAGAAAAACTACGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGGTT
CCGTTGCCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCA
TGAAACAACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTTTGTACG
GTAACATTCGTGCTTAGTGGTGGAACCACAATGTTTCC
CGGGGA

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR4CW02TF 657 0 0
CTCGGTTTCAGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTCTGCGACAA
CGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAAATCGTCAGAGACATCAAGGAGAA
GCTCTGCTACATTGCTCTTGACTACGGGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACTAGCTCATC
TGTTGAGAAAAACTACGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGGTT
CCGTTGCCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCA
TGAAACAACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTT*GTACG
GTAACATT*GTGCTTAGTGGTGGAACCACAATGTTTCCGGGGATTGCTGATAGAATGAGC
AAAGAGATCACTGCTCTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCTCCTCCTGAG
AGGAAATACTCTGTCTGGATTGGAGGGTCTATCTTGGCCTCACTCAGTACCTTCCAGCAG
ATGTGGATCGCAAAGGCAGAGTATGATGAGTCACGCCCATCCATTGTTCACAGGAAGTGC
TTCTAAGCTCAAAATTCATCATTTTTCTGAAAAGAAGTGGTTATGCTGCTCTTTGTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4CW02JQ 766 0 0
CAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTCTGCGACAACGGAACTGGAATGGT
TAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAAATCGTCAGAGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGC
TCTTGACTACGGGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACTAGCTCATCTGTTGAGAAAAACTA
CGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGGTTCCGTTGCCCTGAGGT
TCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACAACCTATAA
CTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTT*GTACGGTAACATT*GTGCTT
AGTGGTGGAACCACAATGTTTCCGGGGATTGCTGATAGAATGAGCAAAGAGATCACTGCT
CTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCTCCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTC
TGGATTGGAGGGTCTATCTTGGCCTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATCGCAAAG
GCAGAGTATGATGAGTCAGGCCCATCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGCTCAAAAT
TCATCATTTTTCTGAAAAGAAGTGGTTATGCTGCTCTTTGTTTTTTTTTATGTTCTCTTT
TATTTTGAAATTCTGGCATAAGGCATTTTCAAGGATTTATTTTCGTAATTCTTATTTAGT
TTCAACTATCTTTTTGAGTGAATAAAAGACCTCTATGATTATCATT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BM50JQ 732 0 0
GTCTGCGACAACGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAAATCGTCAGAGAC
ATCAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTTGACTACGGGCAGGAGCTAGAGACATCCAAA
ACTAGCTCATCTGTTGAGAAAAACTACGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGT
GCTGAACGGTTCCGTTGCCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAAT
CCAGGTATCCATGAAACAACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGAAAG
GACTT*GTACGGTAACATT*GTGCTTAGTGGTGGAACCACAATGTTTCCGGGGATTGCTG
ATAGAATGAGCAAAGAGATCACTGCTCTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTG
CTCCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTCTGGATTGGAGGGTCTATCTTGGCCTCACTCAGTA
CCTTCCAGCAGATGTGGATCGCAAAGGCAGAGTATGATGAGTCAGGCCCATCCATTGTTC
ACAGGAAGTGCTTCTAAGCTCAAAATTCATCATTTTTCTGAAAAGAAGTGGTTATGCTGC
TCTTTGTTTTTTTTTATGTTCTCTTTTATTTTGAAATTCTGGCATAAGGCATTTTCAAGG
ATTTATTTTCGTAATTCTTATTTAGTTTCAACTATCTTTTTGAGTGAATAAAAGACCTCT
ATGATTATCATT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL3244Contig1 740 4 8 U
GGAAGTTAAGAGAAAAGAAGAGGAAGAAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGCTTTCCTCCGC
TGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTC
ATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAA
CGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGAC
CCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCT
CCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGA
GCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTT
GTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTA
CCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAG
TTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACATA
ATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTT
TCTCATACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATT
GCTTCTTCGTCTTGGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CP17TF U 1
AF RR4EX91TF U 23
AF RR4CW28JQ C 451
AF RR4CW28TF U 451
BS 1 209 RR4CP17TF
BS 210 210 RR4EX91TF
BS 211 665 RR4CP17TF
BS 666 666 RR4CW28TF
BS 667 688 RR4CP17TF
BS 689 689 RR4EX91TF
BS 690 723 RR4CP17TF
BS 724 740 RR4CW28TF

RD RR4CP17TF 729 0 0
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TGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTC
ATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAA
CGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTTGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGAC
CCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCT
CCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGA
GCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTT
GTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTA
CCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAG
TTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACATA
ATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTT
TCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAA*TGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATT
GCT
TCTTCG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4EX91TF 701 0 0
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CAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACC
CGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATG
AAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTT
TCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGT
GTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATAC
TATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGTT
CAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATC
ATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCA
AGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCA
TTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGAT
TGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGCT

QA 1 701 1 701
DS 

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CAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGA
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GTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCATACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTC
TGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGCTTCTTCGTCTTGGTTACT

QA 4 290 4 290
DS 

RD RR4CW28TF 290 0 0
AGG
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CAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGA
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GTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCATACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTC
TGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGCTTCTTCGTCTTGGTTACT

QA 4 290 4 290
DS 



AS 1 3

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CGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCGT
CAGCCGGTGGATCGCTCTATATGGGTGGGGCTCCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGT
GTTGTTTCGTTTAGTAGATTGAAAGAGAGATCCTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCT
CAAATCTTTACACATTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAACATTCAAAAGATTTGGTT
GAAGTG


BQ
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25 10 10 10 10 10 

AF RR4BD89JQ C 1
AF RR4BD89TF U 1
AF RR4E615TF U 180
BS 1 721 RR4BD89TF
BS 722 726 RR4BD89JQ

RD RR4BD89JQ 726 0 0
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TTTGTTCGAAATCATGTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACT
TGGTCCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTT
CAACGACACTTTCATCCATGTCAGTGATTTGTCTGGACGGGAAACACTTGTCCGTATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCGCCTTATGCTGCTATGCTTGC
TGCTCAAGATGTCGCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCT
TCGTGCCACAGGTGGTAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAG
AGCCCTTGCCCGTTCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAAC
CGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTTTGAGTTCTTTCTGGCGT
CAGCCGGTGGATCGCTCTATATGGGTGGGGGTCCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGT
GTTGTTTCGTTTAGTAGATTGAAAGAGAGATCCTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCT
CAAATCTTTACACATTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAACATTCAAAAGATTTGGTT
GAAGTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4BD89TF 726 0 0
GGACTCCTTAGCAAGCTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCT
TTTGTTCGAAATCATGTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACT
TGGTCCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTT
CAACGACACTTTCATCCATGTCACTGATTTGTCTGGACGGGAAACACTTGTCCGTATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCGCCTTATGCTGCTATGCTTGC
TGCTCAAGATGTCGCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCT
TCGTGCCACAGGTGGTAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAG
AGCCCTTGCCCGTTCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAAC
CGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCGT
CAGCCGGTGGATCGCTCTATATGGGTGGGGCTCCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGT
GTTGTTTCGTTTAGTAGATTGAAAGAGAGATCCTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCT
CAAATCTTTACACATTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAACATTCAAAAGATTTGGTT
G
AAGTG

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4E615TF 547 0 0
G
CAACGACACTTTCATCCATGTCACTGATTTGTCTGGACGGGAAACACTTGTCCGTATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCGCCTTATGCTGCTATGCTTGC
TGCTCAAGATGTCGCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCT
TCGTGCCACAGGTGGTAACAAGACGAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAG
AGCCCTTGCCCGTTCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAAC
CGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCGT
CAGCCGGTGGATCACTCTATATGGGTGGGGCTTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGT
GTTGTTTCGTTTAGTAGATTGAAAGAGAGATCCTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCT
CAAATCTTTACACATTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAAAGATTTGGTT
G
AAAAA

QA 2 542 2 542
DS 



AS 2 4

CO CL3246Contig1 837 2 13 U
GACCTAATTATAAGGATTTTTAAAAATTGATAATGGCAACGAGAAAAGAGAAGATACAAG
GCATTGCACATCTTATTAAAACGGTGTAAAAGACTAGAACAAGCGCTGCATAAACACAAC
ATACCATGAAACTCGAGCTTCTTTTTTTTCTGTGCGTGTGGATACGACTTTCCAAGCTCT
GTACTCAAAAAACATAAAAGAAAAACACACTCCTAACGTATCAGAGTTTCTTGGCATTCC
CGAGTCTCTTGCTGAAGATCTGGTAAGTCAGAACTGATGGAGAACTTGAGCCATCTCTTT
CGATCCATATGGTTTAGACAAGGATGCATCACAAACCCAATGATGAGCATTACAAAGCTC
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ACACACATGAGGATGGAACCAACGGTTCCGATAGGTATCTTGTATGGTCTGGACGCAGCC
GGGTGTTTCATCCTCATTCTAACAAACGCTATAAACTCCAAGATCATACCAACGCAGTAG
AGCAAGTTCTCCGCAGCTACGATCTCTTGAAAGCTTAGCCAAGACAAGAGCACAACACCT
GAAGCTGAGAAGAGAATCCCTAGCAACGGAGTCCCGTAACGGGACCTCTTGGCAAAGAAC
TCAGGAAGCATACCGCGCTCAGCCATTCCGAGAAGCTGGAAAGAGTCACTACTCATCTCG
GCTAAAAACATTCCCATGTTCGACGTGGCAGCAGCCGCTTGAACCCACCATCTCAACCAC
GCTCCACCCAGGCTTTAGCCACATCAGAGAAATACCCATCTGTCATAACTCACGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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AF RR4EY40JQ U 1
AF RR4GT81JQ U 51
BS 1 60 RR4EY40JQ
BS 61 61 RR4GT81JQ
BS 62 148 RR4EY40JQ
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BS 406 727 RR4EY40JQ
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BS 729 740 RR4EY40JQ
BS 741 741 RR4GT81JQ
BS 742 837 RR4EY40JQ

RD RR4EY40JQ 837 0 0
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GCTAAAA*CATTCCCATGTTTGACGTGGCAGCAGCCGCTTGAACCCACCATCTCAACCAC
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QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4GT81JQ 738 0 0
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TACAAAGCTCACTGCAGCTACTTTAAGAGACGAGAGTGCTACAACCGCACAGATCAGTAA
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GGACGCAGCCGGGTGTTTCATCCTCATTCTAACAAACGCTATAAACTCCAAGATCATACC
AACGCAGTAGAGCAAGTTCTCCGCAGCTACGATCTCTTGAAAGCTTAGCCAAGACAAGAG
CACAACACCTGAAGCTGAGAAGAGAATCCCTAGCAACGGTGTCCCGTAACGTGACCTCTT
GGCAAAGAACTCAGGAAGCATACCGCGCTCAGCCATTCCGAGAAGCTGGAAAGAGTCACT
ACTCATCTCGGCTAAAAACATTCCCATGTTCGACGTGGCAGCAGCCGCTTGAACCCACCA
TCTCAACCACGCTCCACC

QA 1 738 1 738
DS 



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CAACAACAACAATGAGGTTCCTTACACAAGCGTTGTTGATGATGAGACTCCATCTCCCAA
AGCCACCGACAAGATTAGGAAAGTCTCAATGTTACCACTCATTTTCCTAATATTCTACGA
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TCTTCTAGGCTTTATCATCTTCCCTTTCGTTTGGAGTATCCCCGAGGCGTTGATCACCGC
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AACCGGGGCGATTCCGTTAGAGCGTGAGTTATGGACAGATGGGTATTTCTCTGATGTGGC
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GTATGCTTCTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT81TF U 1
AF RR4EY40TF U 421
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BS 710 736 RR4GT81TF
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RD RR4GT81TF 736 0 0
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TTTTGCTGTCATGGGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4EY40TF 733 0 0
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GGGACCGTTCTGGGGGTTCCAGCAAGGTTGGATGAAGTGGCTAAGTGGTGTTATCGATAA
TGCCTTGTATCCTGTTCTGTTTCTTGATTATTTGAAGTCAGGAATCCCGGCTTTAGGTAG
CGGTTTACCGAGAGTTGCAGCCATCTTGGTGTTGACTCTTATGCTTACTTACTTGAACTA
CAGGGGTTTGACTATAGTTGGCTGGGCTGCTGTGCTTATGGGTGTGTTCTCTATCCTTCC
TTTTGCTGTCATGGGTTTAATTTCGATTCCGCAGCTTGAGCCTTCGAGGTGGCTTGTGAT
GGACTTAGGGAACGTGAACTGGAACTTGTATCTAAACACGCTCTTCTGGAACCTAAACTA
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TGGGAATGTTTTAGCCGAGATGAGTAGTGACTCTTTCAGCTTCTCGGATGGCTGAGCGCG
GTATGCTTCTGAG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL3247Contig1 1063 4 2 U
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CTCGGATCTGACTCGATCTGAGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGTGTCAGAGGAGGGTTCAA
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TGATTGGAGAGATCACGGTGCCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTG
CTGGAGTTTCAGCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGCTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACT
CGTCAGCCTTAGCGAACAACAGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGC
CGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAATACACCCT
CAAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAAGATGACTATCCTTACACCGGCGAGGACGGCTCCAT
CTGCAAGTTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCAT
CGACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAA
CGCTGCCTATATGCAGACTTACATCGGTGGAGTCTCCTGTCCTTACATTTGCACCAGGAG
GCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTATGGCTCCGCTGGTTATGCTCCGGCTAGGTT
CAAGGAGAAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCGTGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGG
TTTCTACAAGATCTGCAAAGGCCGTAACATTTGTGGCGTTGACAGTCTTGCCTCCACCGT
TACTGCCGCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAGCCAAAAAAAGAGGCTTTCATTTAA
TAAAATTTAATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAGCACTCTTTGACTTAACTCTCTAT
TTCTCTCTGCTTTTTTTTTAAAAGAAAGATGAAGTTTGTAAAC


BQ
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AF RR4A272TFB U 1
AF RR4A272TF U 1
AF RR4A272JQ C 242
AF RR4A272JQD C 320
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BS 778 1063 RR4A272JQ

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CGCTGCCTATATGCAGACTTACATCGGTGGAGTCTCCTGTCCTTACATTTGCAC

QA 1 714 1 714
DS 

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GAGGAGAGCGAGGCGTCACCAGAAGATGGATCCCTCTGCTCGTCACGGCGTTACACAGTT
CTCGGATCTGACTCGATCTGAGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGTGTCAGAGGAGGGTTCAA
GCTCCCCAAAGACGCCAACAAGGCTCCCATTCTCCCTACCGAGAATCTCCCTCAGGATTT
TGATTGGAGAGATCACGGTGCCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTG
CTGGAGTTTCAGCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGCTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACT
CGTCAGCCTTAGCGAACAACAGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGC
CGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAATACACCCT
CAAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAAGATGACTATCCTTACACCGGCGAGGACGGCTCCAT
CTGCAAGTTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCAT
CGACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAA
CGCTGCCTATATGCAGACTTACATCGGTGGAGTCTCCTGTCCTTACATTTGCACCAGGAG
GCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTATGGCTCCGCTGGTTATGCTCCGGCTAG
TTCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4A272JQ 822 0 0
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TGGAGTTTCAGCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGCTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACTC
GTCAGCCTTAGCGAACAACAGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCC
GGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAATACACCCTC
AAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAAGATGACTATCCTTACACCGGCGAGGACGGCTCCATC
TGCAAGTTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATC
GACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAAC
GCTGCCTATATGCAGACTTACATCGGTGGAGTCTCCTGTCCTTACATTTGCACCAGGAGG
CTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTATGGCTCCGCTGGTTATGCTCCGGCTAGGTTC
AAGGAGAAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCGTGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGT
TTCTACAAGATCTGCAAAGGCCGTAACATTTGTGGCGTTGACAGTCTTGCCTCCACCGTT
ACTGCCGCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAGCCAAAAAAAGAGGCTTTCATTTAAT
AAAATTTAATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAGCACTCTTTGACTTAACTCTCTATT
TCTCTCTGCTTTTTTTTTAAAAGAAAGATGAAGTTTGTAAAC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4A272JQD 744 0 0
GGAGCTCTTGAAGGTGCTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACTCGTCAGCCTTAGCGAACAA
CAGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCGACTCTGGT
TGCAATGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAATACACCCTCAAATCCGGAGGCCTCATG
AGAGAAGATGACTATCCTTACACCGGCGAGGACGGCTCCATCTGCAAGTTAGACAAGTCC
AAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACCAGATTGCT
GCCAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACT
TACATCGGTGGAGTCTCCTGTCCTTACATTTGCACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTA
TTGGTTGGTTATGGCTCCGCTGGTTATGCTCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGG
ATCATCAAGAACTCGTGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTACAAGATCTGCAAA
GGCCGTAACATTTGTGGCGTTGACAGTCTTGCCTCCACCGTTACTGCCGCCGTCTCTACC
ACCGCACATTAACTAAGCCAAAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAAATTTAATTCACTCTG
GTGATTTGTGTGAGCGAGCACTCTTTGACTTAACTCTCTATTTCTCTCTGCTTTTTTTTT
AAAAGAAAGATGAAGTTTGTAAAC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

CO CL3248Contig1 1308 3 7 U
GGGCCTCAAAAATAAAACAGAAGTAGTTGATAAATGTTCGGTCAAGGAGGGTCAAAGAAG
AGACTTGGAGGGTGAAGAATGGGAGGAGGAACCTCTTTTAAGGCGCAGAACCAGAGGTTT
ACTATGTTCCCCATTAGGTACAAGTCGATTTGGGAGATGTATAAGAAGGCTGAGGCCAGC
TTCTGGACTGCTGAAGAAGTTGATCTTTCGACGGATGTGCAGCACTGGGAAAAGCTGTCG
GATTCAGAGAAACATTTTATTAGCCATGTTCTGGCTTTTTTCGCCGCATCAGATGGGATT
GTTTTGGAGAATCTGGCTGCTAGATTCTTAAATGATGTCCAAGTCCCTGAGGCTCGTGCT
TTCTATGGGTTTCAAATAGCCATGGAGAACATTCATTCTGAGATGTACAGCCAACTTCTG
GAGACATTTATAAAGGATTCGCAGGAGAAGGATAGATTGTTCAATGCTATCGACACCATT
CCCTGCATTTCCAACAAGGCTAAATGGTGTTTAGATTGGATTCAAAGTCCTATGTCTTTT
GCTGTCAGGCTTGTTGCTTTTGCATGCGTCGAAGGAATCTTCTTCTCTGGAAGCTTCTGT
GCCATCTTCTGGCTGAAGAAGAGAGGTCTTATGCCGGGTTTGACTTTCTCAAACGAGCTT
ATATCGAGAGACGAGGGTCTCCTCTGTGACTTTGCCTGTCTCTTGTACAGTTTGCTGCAG
AAGAAGCTTCCTGTGGAGAAAGTTTATCAGATTGTTCATGAGGCAGTGGAAATCGAGACA
GAGTTTGTCTGCAAGTCCCTTCCATGTGATCTGATTGGAATGAACTCAAACCTCATGAGT
CAATACATTCAATTTGTTGCTGACCGTCTTCTGGTTACCTTGGGATGTGAAAGGAGATAC
AAAACAGATAATCCATTTGACTGGATGGAGTTCATATCTTTCCAAGGGAAGACAAACTTT
TTTGAGAAGAGAGTGGGAGAATATCAAAAGGCATTTGTTATGTCAAGTTTCCAAGAAGGT
AATAAGAACTACGAATTCAAGATTGATGAGGACTTTTGAATGGAATTCGCCATTGAATCT
GGGAAGGGCTCATCTCATTCTTTATGAGTTACTCCAAAATGGGAATATTGTAGTAGACTA
GAAGTAGTAGTACAAGAAACAAACTCACTTTAGATCACATTTATTTTGGTTTTGGTTTAG
CAGTAGATGTTATCTTAGTATTATTTGTGCCTTCTATAATGTCTGACATTACATCTTTGT
TAATACTTCTTTCTTTCCAAAAATAAATGTTTTTGAAAATTGCTTCAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C121TF U 1
AF RR4A765TF U 201
AF RR4C121JQ C 705
BS 1 274 RR4C121TF
BS 275 275 RR4A765TF
BS 276 493 RR4C121TF
BS 494 734 RR4A765TF
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BS 736 939 RR4A765TF
BS 940 1308 RR4C121JQ

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AGACTTGGAGGGTGAAGAATGGGAGGAGGAACCTCTTTTAAGGCGCAGAACCAGAGGTTT
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GTTTTGGAGAATCTGGCTGCTAGATTCTTAAATGATGTCCAAGTCCCTGAGGCTCGTGCT
TTCTATGGGTTTCAAATAGCCATGGAGAACATTCATTCTGAGATGTACAGCCAACTTCTG
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CCCTGCATTTCCA

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DS 

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G
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AGCCATGTTCTGGCTTTTTTCGCCGCATCAGATGGGATTGTTTTGGAGAATCTGGCTGCT
AGATTCTTAAATGATGTCCAAGTCCCTGAGGCTCGTGCTTTCTATGGGTTTCAAATAGCC
ATGGAGAACATTCATTCTGAGATGTACAGCCAACTTCTGGAGACATTTATAAAGGATTCG
CAGGAGAAGGATAGATTGTTCAATGCTATCGACACCATTCCCTGCATTTCCAACAAGGCT
AAATGGTGTTTAGATTGGATTCAAAGTCCTATGTCTTTTGCTGTCAGGCTTGTTGCTTTT
GCATGCGTCGAAGGAATCTTCTTCTCTGGAAGCTTCTGTGCCATCTTCTGGCTGAAGAAG
AGAGGTCTTATGCCGGGTTTGACTTTCTCAAACGAGCTTATATCGAGAGACGAGGGTCTC
CTCTGTGACTTTGCCTGTCTCTTGTACAGTTTGCTGCAGAAGAAGCTTCCTGTTGAGAAA
GTTTATCAGATTGTTCATGAGGCAGTGGAAATCGAGACAGAGTTTGTCTGCAAGTCCCTT
CCATGTGATCTGATTGGAATGAACTCAAACCTCATGAGTCAATACATTCAATTTGTTGCT
GACCGTCTTCTGGTTACCTTGGGATGTGAAAGGAGATACAAAACAGATAATCCATTTGAC
TGGATGGAGTTCATATCT
CTC

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DS 

RD RR4C121JQ 604 0 0
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AGTGGAAATCGAGACAGAGTTTGTTTGCAAGTCCCTTCCATGTGATTTGATTGGAATGAA
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ATGTGAAAGGAGATACAAAACAGATAATCCATTTGACTGGATGGAGTTCATATCTTTCCA
AGGGAAGACAAACTTTTTTGAGAAGAGAGTGGGAGAATATCAAAAGGCATTTGTTATGTC
AAGTTTCCAAGAAGGTAATAAGAACTACGAATTCAAGATTGATGAGGACTTTTGAATGGA
ATTCGCCATTGAATCTGGGAAGGGCTCATCTCATTCTTTATGAGTTACTCCAAAATGGGA
ATATTGTAGTAGACTAGAAGTAGTAGTACAAGAAACAAACTCACTTTAGATCACATTTAT
TTTGGTTTTGGTTTAGCAGTAGATGTTATCTTAGTATTATTTGTGCCTTCTATAATGTCT
GACATTACATCTTTGTTAATACTTCTTTCTTTCCAAAAATAAATGTTTTTGAAAATTGCT
TCAG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 4

CO CL3249Contig1 1063 4 17 U
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ATACATAAGATTGGATCTTTTGGACTAAATGTAACTAGAAGCAGTAGCTGTAACTAAAGA
TTAAGACAAACAGTAAGAAAGATTCAAACATCCAAATTGGCTTAGATGATCAGACCAATA
GCTTTGACTGTGCAAGTCAAGGAGCTGCGAATAGTGATGCTCTTATGACTAAAAGGAGAG
TTTGCCAGAGCGAAACCTCAGGTCTTGATAAACCAAGTTTCACTAGTTGTCAGGTTTCTT
TTAGAGCCTTCAGTTTTCTGTAGCCCTTGTCCGTACCAAAGATCCAGTCCATGTAGACAA
AAGTAGATGAGTAGTTCCCAGACTTTGTGTAGAGTAAACGATGATGGTAGTCATGGAAGT
CAGCACCGCCATAGAGAGGAAGAAAATTAGAGGGACTCCACGGGAAATGATAACCACAAT
GGGCTTCAACTGTCTCAATGACTCTAAGCACCAACCACAACCAAAGGGTGATTAGGTGAG
GCCCTGTGAGAGCCGGACCAATAAAGGTAGCAAAGCCCAGGAACAGAATCTCAGCGGGAT
GAGCATATTCTGACGTCAAACCAAACGGTGTGGCGTATTCATGGTGCACACTGTGCACGT
TCTTGTACAACCACTTTGTGTGCAAGATCCTATGACCCCAATAAAATACAAAATCCTCAA
TGATGAAGAAGAACAAGATCTGGGCAGACACCACTTTCCAGGAGGGGAGAGGAAAACTGC
TGCGCATGCCCATGAATTTGAAGACACGGTAAGAGAACAGCATAAGGGGAAAGTTTACAC
ATGAATGGTAAAACAGTAGCCAAGCAATGCATTTTCCTTGCGCTTCAGGGGTGTTATGTT
TTGCCTGAATTTTGTAACTGCTCAGTAAACCTGTTCTTTCAAGGAAGATGAAAGGGAGAC
CAGAGAAGAAGAAGACAGTTTCATGGACGATAAAACTCCCGATGCACGCCAGTTGAAAGT
CGCTGAAATTAGTAACAAGGTACTGCCAACCGGATTCGACGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F618JQ U 1
AF RR4F618TF C 3
AF RR4A802JQ U 28
AF RR4A802TF C 304
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BS 885 1063 RR4A802TF

RD RR4F618JQ 726 0 0
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TCTTGTACAACCACTTTGTGTGCAAGATCCTATGACCCCAATAGAATACAAAATCCTCAA
TGATGA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4F618TF 743 0 0
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QA 11 743 11 743
DS 

RD RR4A802JQ 857 0 0
C
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ATGTAACTAGAAGCAGTAGCTGTAACTAAAGATTAAGACAAACAGTAAGAAAGATTCAAA
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TAAACCAAGTTTCACTAGTTGTCAGGTTTCTTTTAGAGCCTTCAGTTTTCTGTAGCCCTT
GTCCGTACCAAAGATCCAGTCCATGTAGACAAAAGTAGATGAGTAGTTCCCAGACTTTGT
GTAGAGTAAACGATGATGGTAGTCATGGAAGTCAGCACCGCCATAGAGAGGAAGAAAATT
AGAGGGACTCCACGGGAAATGATAACCACAATGTGCTTCAACTGTCTCAATGACTCTAAG
CACCAACCAGAACCAAAGGGTGATTAGGTGAGGCCCTGTGAGAGCCGGACCAATAAAGGT
AGCAAAGCCCAGGAACAGAATCTCAGCGGGATGAGCATATTCTGACGTCAAACCAAACGG
TGTGGCGTATTCATGGTGCACACTGTGGACGTTCTTGTACAACCACTTTGTGTGCAAGAT
CCTATGACCCCAATAAAATACAAAATCCTCAATGATGAAGAAGAACAAGATCTGGGCAGA
CACCACTTTCCAGGAGGGGAGAGGAAAACTGCTGCGCATGCCCATGAATTTGAAGACACG
GTAAGAGAACAGCATAAGGGGAAAGTTTACACATGAATGGTAAAACAGTAGCCAAGCAAT
GCATTTTCCTTGCGCT

QA 2 857 2 857
DS 

RD RR4A802TF 760 0 0
AGAG
CTTCAGTTTTCTGTAGCCCTTGTCCGTACCAAAGATCCAGTCCATGTAGACAAAAGTAGA
TGAGTAGTTCCCAGACTTTGTGTAGAGTAAACGATGATGGTAGTCATGGAAGTCAGCACC
GCCATAGAGAGGAAGAAAATTAGAGGGACTCCACGGGAAATGATAACCACAATGTGCTTC
AACTGTCTCAATGACTCTAAGCACCAACCAGAACCAAAGGGTGATTAGGTGAGGCCCTGT
GAGAGCCGGACCAATAAAGGTAGCAAAGCCCAGGAACAGAATCTCAGCGGGATGAGCATA
TTCTGACGTCAAACCAAACGGTGTGGCGTATTCATGGTGCACACTGTGGACGTTCTTGTA
CAACCACTTTGTGTGCAAGATCCTATGACCCCAATAAAATACAAAATCCTCAATGATGAA
GAAGAACAAGATCTGGGCAGACACCACTTTCCAGGAGGGGAGAGGAAAACTGCTGCGCAT
GCCCATGAATTTGAAGACACGGTAAGAGAACAGCATAAGGGGAAAGTTTACACATGAATG
GTAAAACAGTAGCCAAGCAATGCATTTTCCTTGCGCTTCAGGGGTGTTATGTTTTGCCTG
AATTTTGTAACTGCTCAGTAAACCTGTTCTTTCAAGGAAGATGAAAGGGAGACCAGAGAA
GAAGAAGACAGTTTCATGGACGATAAAACTCCCGATGCACGCCAGTTGAAAGTCGCTGAA
ATTAGTAACAAGGTACTGCCAACCGGATTCGACGAG

QA 5 760 5 760
DS 



AS 2 4

CO CL3250Contig1 763 2 8 U
GCTCATCCCAAGTTCAATGGGTACAAGTCTTTGCATACCGTGGTGATGGGCGATGGAACC
ATTCCACTTGAAGTTCAGATACGGACAAAAGAGATGCATTTGCAAGCGGAATTTGGGTTT
GCAGCTCATTGGAGGTACAAGGAAGGTGATTGCAAACACTCGTCATTTGTGCTCCAGATG
GTTGAATGGGCAAGATGGGTTGTGACCTGGCATTGCGAAACCATGAGCAAAGACAGATCT
TCGATCTGCTCTTCTGAGCCCTTGTGCAGTTTCCCGTCTCACGCAGAAGACTGTCCCTTT
TCTTATAAGCCTAATGGTAACCAAGAAGGACCCGTCTATGTCATTGTAATCGAAAATGAC
AAGATGACGGTGCAAGAGTTTCCGGCGAGTTCTACGGTATCGGACCTGTTAAGCAGAGCA
GGGCCAGGGAGCTCGAGATGGTTAATGTACAGCATGCCAGCAAAGGAAGAGCTAAGGCCA
AGGCTAAACCAGACACCTGTAAGCGATCTGAAATGCAAGCTGAAGATGGGAGATGTGGTG
GAGCTGTCTCCAGCAATACCCGACGAGTCTCTGACTGAATACAGAGAGGAGATTCAGCGG
ATGTATGATCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAACGTACAGCTGCTGGCACAATGGTT
GGCTGGGGAAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGTCCAAAAAAGAGAAAAAAAACAGTT
CTTGTTTCTCATGTATGTAAGTTGTTATATATGTAATGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR92TF U 1
AF RR4DR92JQ C 253
BS 1 703 RR4DR92TF
BS 704 704 RR4DR92JQ
BS 705 714 RR4DR92TF
BS 715 715 RR4DR92JQ
BS 716 722 RR4DR92TF
BS 723 723 RR4DR92JQ
BS 724 753 RR4DR92TF
BS 754 763 RR4DR92JQ

RD RR4DR92TF 753 0 0
GCTCATCCCAAGTTCAATGGGTACAAGTCTTTGCATACCGTGGTGATGGGCGATGGAACC
ATTCCACTTGAAGTTCAGATACGGACAAAAGAGATGCATTTGCAAGCGGAATTTGGGTTT
GCAGCTCATTGGAGGTACAAGGAAGGTGATTGCAAACACTCGTCATTTGTGCTCCAGATG
GTTGAATGGGCAAGATGGGTTGTGACCTGGCATTGCGAAACCATGAGCAAAGACAGATCT
TCGATCTGCTCTTCTGAGCCCTTGTGCAGTTTCCCGTCTCACGCAGAAGACTGTCCCTTT
TCTTATAAGCCTAATGGTAACCAAGAAGGACCCGTCTATGTCATTGTAATCGAAAATGAC
AAGATGACGGTGCAAGAGTTTCCGGCGAGTTCTACGGTATCGGACCTGTTAAGCAGAGCA
GGGCCAGGGAGCTCGAGATGGTTAATGTACAGCATGCCAGCAAAGGAAGAGCTAAGGCCA
AGGCTAAACCAGACACCTGTAAGCGATCTGAAATGCAAGCTGAAGATGGGAGATGTGGTG
GAGCTGTCTCCAGCAATACCCGACGAGTCTCTGACTGAATACAGAGAGGAGATTCAGCGG
ATGTATGATCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAACGTACAGCTGCTGGCACAATGGTT
GGCTGGGGAAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGTCCAAAAA*GAGAAAAAAA*CAGTT
CT*GTTTCTCATGTATGTAAGTTGTTATATATG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4DR92JQ 511 0 0
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AATGGTAACCAAGAAGGACCCGTTTATGTCATTGTAATCGAAAATGACAAGATGACGGTG
CAAGAGTTTCCGGCGAGTTTTACGGTATCGGACCTGTTAAGCAGAGCAGGGCCAGGGAGC
TCGAGATGGTTAATGTACAGCATGCCAGCAAAGGAAGAGCTAAGGCCAAGGCTAAACCAG
ACACCTGTAAGCGATCTGAAATGCAAGCTGAAGATGGGAGATGTGGTGGAGCTGTCTCCA
GCAATACCCGACGAGTCTCTGACTGAATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGATCGA
GGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAACGTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGGAAGC
TAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGTCCAAAAAAGAGAAAAAAAACAGTTCTTGTTTCTCAT
GTATGTAAGTTGTTATATATGTAATGCTTCC

QA 1 511 1 511
DS 



CO CL3250Contig2 242 2 2 U
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GAATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGATCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAA
CGTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGGAAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGT
CC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR4EM89JQ C 1
AF RR4EM89TF U 1
BS 1 1 RR4EM89JQ
BS 2 242 RR4EM89TF

RD RR4EM89JQ 242 0 0
GCAGCAAAGGAAGAGCTGAGGCCAAGGCTAAACCAGACACCTGTAAGTGATCTGAAATGC
CAGCTGAAGATGGGAGACGTGGTGGAGCTGACTCCAGCCATACCTGACGAGTTTCTGACT
GAATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGATCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAA
CGTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGGAAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGT
CC

QA 1 242 1 242
DS 

RD RR4EM89TF 242 0 0
G
CAGCAAAGGAAGAGCTGAGGCCAAGGCTAAACCAGACACCTGTAAGTGATCTGAAATGCC
AGCTGAAGATGGGAGACGTGGTGGAGCTGACTCCAGCCATACCTGACGAGTCTCTGACTG
AATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGATCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAAC
GTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGGAAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGTC
C

QA 2 242 2 242
DS 



AS 1 4

CO CL3251Contig1 246 4 1 U
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CTCGTCTCTATTTTTGCCATAAATAAGTAAAATCCTTCCCTGAGTAATACTTTTATTAAT
CGATTTTCAACTCCTAGTTGGATTCAAAACTTTGTATTAGTTAATAATTACAAAAGGGGG
TTTTGTTATATATGCTTTCACTCAGGATTCTATCAGTCTACATATAAAAGTTCATATATA
TAACAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 

AF RR4BQ54JQ C 1
AF RR4BQ89JQ C 1
AF RR4BQ54TF U 1
AF RR4BQ89TF U 1
BS 1 246 RR4BQ54TF

RD RR4BQ54JQ 246 0 0
GATTCTCATGGAATCAAGGTCTTCGCATCCTGCATTCTTCAGAGCTCATGATTCTTCTCT
CTCGTCTCTATTTTTGCCATAAATAAGTAAAATCCTTCCCTGAGTAATACTTTTATTAAT
CGATTTTCAACTCCTAGTTGGATTCAAAACTTTGTATTAGTTAATAATTACAAAAGGGGG
TTTTGTTATATATGCTTTCACTCAGGATTCTATCAGTCTACATATAAAAGTTCATATATA
TAACAT

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR4BQ89JQ 246 0 0
GATTCTCATGGAATCAAGGTCTTCGCATCCTGCATTCTTCAGAGCTCATGATTCTTCTCT
CTCGTCTCTATTTTTGCCATAAATAAGTAAAATCCTTCCCTGAGTAATACTTTTATTAAT
CGATTTTCAACTCCTAGTTGGATTCAAAACTTTGTATTAGTTAATAATTACAAAAGGGGG
TTTTGTTATATATGCTTTCACTCAGGATTCTATCAGTCTACATATAAAAGTTCATATATA
TAACAT

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR4BQ54TF 246 0 0
GATTCTCATGGAATCAAGGTCTTCGCATCCTGCATTCTTCAGAGCTCATGATTCTTCTCT
CTCGTCTCTATTTTTGCCATAAATAAGTAAAATCCTTCCCTGAGTAATACTTTTATTAAT
CGATTTTCAACTCCTAGTTGGATTCAAAACTTTGTATTAGTTAATAATTACAAAAGGGGG
TTTTGTTATATATGCTTTCACTCAGGATTCTATCAGTCTACATATAAAAGTTCATATATA
TAACAT

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR4BQ89TF 246 0 0
GATTCTCATGGAATCAAGGTCTTCGCATCCTGCATTCTTCAGAGCTCATGATTCTTCTCT
CTCGTCTCTATTTTTGCCATAAATAAGTAAAATCCTTCCCTGAGTAATACTTTTATTAAT
CGATTTTCAACTCCTAGTTGGATTCAAAACTTTGTATTAGTTAATAATTACAAAAGGGGG
TTTTGTTATATATGCTTTCACTCAGGATTCTATCAGTCTACATATAAAAGTTCATATATA
TAACAT

QA 1 246 1 246
DS 



AS 1 4

CO CL3252Contig1 726 4 4 U
ATCTTTTGTGTTTTTTTCCTTGATCACAGCTCGTCTCCCTTGGTCCCTGCCTCTCATTTT
GATTCGTCCTCTCTGGTTTATTGCTCGTTGATCCTTTGTTTCTCTTTGCATTTTTGCGCC
ATGGATCGTGATTTTCATCGTCGTGGTGGTCCAGTGGCAAAGGATCGTTCACCGAGCAGC
CGTTTTGTTCGGTTGGATAAACCTAGATCTGTAGACGATCTTGAGATAGGCAAGAAAGGG
AAGATGCGCAGGTGGTTGTGCTGTTCTTGTCATGTCCAAGAAGCTAACCACCCTAGAGCT
GATCATAACCGATCCAGAACACCTCCTACTCGCCACTACGACTATGGACGTAACGATAAG
AAACCACCACCTCCTACGAAGCCTGCCGTGTTGAAGGAGGCTCCTCCTATTGATGTCCCT
GCAATGTCATTGGCCGAGCTCAAAGAAAAGACAGAGAACTTTGGATCAAAGGCTTTGATT
GGGGAAGGATCTTATGGAAGAGTGTACTATGCAAACTTGGGTGATGGGAAGGCCATGGCT
GTGAAAAAGCTTGATAATGCATCTGAACCTGAGACCAATGTTGAGTTCTTGACTCAAGTC
TCCAAGGTTT*CAAGGCTGAATAATGACAACTTT*GTTAAGCTTCTTGGTTATTGTGTTG
AAAGCAATCTCCGTGTCCTTGCCTATGAGTTTGCAACAATGGGATCATTGCATGATGTCT
TACACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FR21TF U 11
AF RR4B420TF U 1
AF RR4FZ18TF U 11
AF RR4B693TF U 1
BS 1 279 RR4B420TF
BS 280 280 RR4FR21TF
BS 281 716 RR4B420TF
BS 717 726 RR4B693TF

RD RR4FR21TF 649 0 0
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GGTGGTTGTGCTGTTCTTGTCATGTCCAAGAAGCTAACCACCCTAGATCTGATCATAACC
GATCCAGAACACCTCCTACTCGCCACTACGACTATGGACGTAACGATAAGAAACCACCAC
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TGGCCGAGCTCAAAGAAAAGACAGAGAACTTTGGATCAAAGGCTTTGATTGGGGAAGGAT
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*CAAGGCTGAATAATGACAACTTT*GTTAAGCTTCTTGGTTATTGTGTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4B420TF 723 0 0
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AAGATGCGCAGGTGGTTGTGCTGTTCTTGTCATGTCCAATAAGCTAACCACCCTAGAGCT
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AAACCACCACCTCCTACGAAGCCTGCCGTGTTGAAGGAGGCTCCTCCTATTGATGTCCCT
GCAATGTCATTGGCCGAGCTCAAAGAAAAGACAGAGAACTTTGGATCAAAGGCTTTGATT
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GTGAAAAAGCTTGATAATGCATCTGAACCTGAGACCAATGTTGAGTTCTTGACTCAAGTC
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AAAGCAATCTCCGTGTCCTTGCCTATGAGTTTGCAACAATGGGATCATTGCATGAT
GTCTTAC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4FZ18TF 707 0 0
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CTCTGGTTTATTGCTCGTTGATCCTTTGTTTCTCTTTGCATTTTTGCGTCATGGATCGTG
ATTTTCATCGTCGTGGTGGTCCAGTGGCAAAGGATCGTTCACCGAGCAGCCGTTTTGTTC
GGTTGGATAAACCTAGATCTGTAGACGATCTTGATATAGGCAAGAAAGGGAAGATGCGCA
GGTGGTTGTGCTGTTCTTGTCATGTCCAAGAAGCTAACCACCCTAGATCTGATCATAACC
GATCCAGAACACCTCCTACTCGCCACTACGACTATGGACGTAACGATAAGAAACCACCAC
CTCCTACGAAGCCTGCCGTGTTGAAGGAGGCTCCTCCTATTGATGTCCCTGCAATGTCAT
TGGCCGAGCTCAAAGAAAAGACAGAGAACTTTGGATCAAAGGCTTTGATTGGGGAAGGAT
CTTATGGAAGAGTGTACTATGCAAACTTGGGTGATGGGAAGGCCATGGCTGTGAAAAAGC
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*CAAGGCTGAATAATGACAACTTT*GTTAAGCTTCTTGGTTATTGTGTTGAA*GCAATCT
CCGTGTCCTTGCCTATGAGTTTGCAACAATGGGATCATTGCATGAT
A

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4B693TF 726 0 0
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GATTCGTCCTCTCTGGTTTATTGCTCGTTGATCCTTTGTTTCTCTTTGCATTTTTGCGCC
ATGGATCGTGATTTTCATCGTCGTGGTGGTCCAGTGGCAAAGGATCGTTCACCGAGCAGC
CGTTTTGTTCGGTTGGATAAACCTAGATCTGTAGACGATCTTGAGATAGGCAAGAAAGGG
AAGATGCGCAGGTGGTTGTGCTGTTCTTGTCATGTCCAATAAGCTAACCACCCTAGAGCT
GATCATAACCGATCCAGAACACCTCCTACTCGCCACTACGACTATGGACGTAACGATAAG
AAACCACCACCTCCTACGAAGCCTGCCGTGTTGAAGGAGGCTCCTCCTATTGATGTCCCT
GCAATGTCATTGGCCGAGCTCAAAGAAAAGACAGAGAACTTTGGATCAAAGGCTTTGATT
GGGGAAGGATCTTATGGAAGAGTGTACTATGCAAACTTGGGTGATGGGAAGGCCATGGCT
GTGAAAAAGCTTGATAATGCATCTGAACCTGAGACCAATGTTGAGTTCTTGACTCAAGTC
TCCAAGGTTTTCAAGGCTGAATAATGACAACTTTTGTTAAGCTTCTTGGTTATTGTGTTG
AAAGCAATCTCCGTGTCCTTGCCTATGAGTTTGCAACAATGGGATCATTGCATGATGTCT
TACACG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

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CGATCTTCCTCTTACGAGGCAGACTTTGATTCTGACTCCGACATCTCTACCTCAACCTCC
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BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AG04JQ C 1
AF RR4AG16JQ C 1
AF RR4AG04TF U 1
AF RR4AG16TF U 1
BS 1 714 RR4AG04TF

RD RR4AG04JQ 714 0 0
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TTGGTGATGAAATTTGTTGTAATGCATTCTTGTAAAAGAGAACATAAATAAAGT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AG16JQ 714 0 0
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TTGGTGATGAAATTTGTTGTAATGCATTCTTGTAAAAGAGAACATAAATAAAGT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AG04TF 714 0 0
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AGCTTTGTAATACTCTACCAGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCAGAAGTTTATGG
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CACACGTTAGTCCAATAGCTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGATAATCCTGATGATG
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TTGGTGATGAAATTTGTTGTAATGCATTCTTGTAAAAGAGAACATAAATAAAGT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AG16TF 714 0 0
AACATTTCTCTCTGCAAAGAAAAGCAGAAACCAAGAATGTGCTACTCAGACTTCCTCTCT
CGATCTTCCTCTTACGAGGCAGACTTTGATTCTGACTCCGACATCTCTACCTCAACCTCC
TGCTCACGTACAGTGAATCTGAGGAAGAGATCAACGATGACTTCAGTTATGAGCTATCAA
CAAAGAAGTTGGAGAAGAAGGATAAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAAGGGTACG
TTGTAGATTCGGTGGTGAATGATGACTTGAAGAGGACCAAGAGTTTAACGGACGATGATC
TCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTTGGTTTCGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTG
AGCTTTGTAATACTCTACCAGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCAGAAGTTTATGG
ACCAAGATCATCCTCACCATATTTCTTCGCCTTTGAAGAAGTCTAAGACGATGGTTGAGT
CACACGTTAGTCCAATAGCTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGATAATCCTGATGATG
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GAGGATATGTGGACAACAAACACAACTCTCATGAGCTGCTCAGATATGTACAAAAAGATT
TTGGTGATGAAATTTGTTGTAATGCATTCTTGTAAAAGAGAACATAAATAAAGT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 4

CO CL3254Contig1 523 2 11 U
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CTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTGTAAACTTTGT
AAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGTG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4DM56TF U 1
AF RR4FK54TF U 1
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BS 214 214 RR4FK54TF
BS 215 268 RR4DM56TF
BS 269 269 RR4FK54TF
BS 270 291 RR4DM56TF
BS 292 292 RR4FK54TF
BS 293 349 RR4DM56TF
BS 350 350 RR4FK54TF
BS 351 364 RR4DM56TF
BS 365 366 RR4FK54TF
BS 367 523 RR4DM56TF

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TATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACTGGAG
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QA 1 523 1 523
DS 

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GGGA
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CCATTTAATACCTAATATCTATTTTTT*GTTTTTTGTTGTATGAATAACACTGGAGCTGT
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CATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGT
G

QA 5 522 5 522
DS 



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ATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4FR18JQ C 1
AF RR4FR18TF U 1
BS 1 2 RR4FR18JQ
BS 3 517 RR4FR18TF
BS 518 518 RR4FR18JQ

RD RR4FR18JQ 518 0 0
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AATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGTGATGCATCTAAAGC
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CCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCGG
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TTTATTTAATACCTAATATCTATTTCGTTTTCTGTTGTATGAATAACATTGGAGCTGTCC
TTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCTTTTTTTGTAAACTTTGTAAGGC
ATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGTC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4FR18TF 518 0 0
GG
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GTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGTTGTGTCTCCC
AAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCGGCA
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TATTTAATACCTAATATCTATTTCGTTTTCTGTTGTATGAATAACATTGGAGCTGTCCTT
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ATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGT
C

QA 3 517 3 517
DS 



AS 1 2

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CGATTCTGAGGTTACCTCTCATCGATATCTTTCTTTAGAGACCAAAATTGCACATCTGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO64JQ U 1
AF RR4GZ38JQ U 11
BS 1 75 RR4FO64JQ
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BS 77 185 RR4FO64JQ
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BS 268 667 RR4FO64JQ
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BS 744 744 RR4GZ38JQ
BS 745 760 RR4FO64JQ
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RD RR4FO64JQ 760 0 0
GGGACAACAAAGAGAGACATTGTAGTTTTGGATAATGGTTTTGCGAAAGAGTTACACAAA
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CGATTTTGAGGTTACCTCTCATCGATATCTTTCTTTAGAGACCAAAATTGCACATCTGCA
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CCATGCTCACTCCCGGGTTGTAGCCTAACCCAAGCACATGCCATGACTTGTCCAGTGATT
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CATTGAGATCAAATATATTCATCCCAAAGGCCCAAGCACAAGCATTGGGGTTAAAGCTGT
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CCTTCTGCACCACAACATCATCGTCCAAGAACAAGATCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GZ38JQ 820 0 0
C
GAGAGACATTGTAGTTTTGGATAATGGTTTTGCGAAAGAGTTACACAAAATATAAATAAA
GAACAAAACTATGGCAGAGAGAACAAGGAAAACGCTTTGTAACCCTATATAATATATAAA
AGATAAACGTATATAGTTAAAGAATGCCCTGAAATGAGTGAAGACATATCGATTCTGAGG
TTACCTCTCATCGATATCTTTCTTTAGAGACCAAAATTGCACATCTGCACAAACTCCATT
TCGTTATCGACGTATATAGTCCAGAGAGACTTGTATTGGTTCATAGCAATGTCTAGCCAT
GGTTTCATGTTCCCATTGTAGTGTATCACTGCTGCCTTTTTGATCTCATCCATGCTCACT
CCCGGGTTGTAGCCTAACCCAAGCACATGCCATGACTTGTCCAGTGATTTCGTCTTTGAG
TAGAATGTGATCAGTCCCGGAGGCAGAGTTCCCAGTTTCCAGAGAGTTCTGTCTTCATTC
AGGTTCTGCCAGTAATGGTATTGATCTGTGCATTTCTCACGTCTCCAAGCATTGAGATCA
AATATATTCATCCCAAAGGCCCAAGCACAAGCATTGGGGTTAAAGTTGTCTTTGATCAGA
GGATGAGTGAAGTTTAGGTATTGACCATACCGATGAAAAGAGCCAAAGCATGTCTCAACA
GCTCCATTCACCTTTCCATCTAAGTTGATCTTCCACAACCCAGTCACGTCCTTCTGCACC
ACAACATCATCGCCCAAGAACAAGATCTTATTCAGCTTGGGATACATCTCCGGAAGTAAA
CCTGAGATGGTCAACATGGAGAGATACTTGGGGTTTTGA

QA 2 820 2 820
DS 



AS 1 3

CO CL3256Contig1 917 3 16 U
CCTAAAAAGGGCAATCGGAATCGTACATCCCTAACGCAGCGATTCCCCGGAAAAACAGCA
AAATCTAGGTTACAGGCTAAGGAAAAAAAAAACAAAAACCAAATCGAAGCAGTAAGGAAG
TAAGGTTGGGGGAAAGAAAACAGGGAAGCAAGCTTCCTCCTCCGAGGGGACGTCGTGGCT
ATCAAATCTGACTACCGGCAACTTCCCATGACCAGGACGTCCAAACC*AGCGCAAGCTCC
GCCTCCGGTTACCATCAAAGAAACCACCCTCAAAGGTGTCCCGCGGCTCCAAAACATCGA
CTCCAGCAAGAAGACCGACTCCAAACCCTCACCGCCGCAAGCTGCAAAATGCTTCCCTCC
GTCGCAGGTCCGAAACTCTGCGTGTTTCTCCTCTTCTTATGGCGGGGAAGAGACGTTTCT
AGGACGGCGAGAAACAGTTTAAGGGGAACCGCCATCCCACTCAAAAGATCCGCCGCCACC
GGAACACAAACGCTTCAATCGGAAATGGAAACCTTAGCACCGATAACTGACCAGCGGTTT
CCAGTGAAGTCTCTGTCGTCCTCTAACAGATCTCAACCACCGTACTCCCGACGAGTCACC
AGAGCTTCAGATCTCGTCTAGGGGTCCGTCGCACCATGACCCACCCGATCTCGCAAAGAA
GAAAGAGAAACACCTACTAGAGAACGCCGGATGACACGATTCCGTCATGACGTGCTGAAT
CCGAGTGGGGGAGCCTTAAAGCCACCGACAAGATCGCCGGAAACCCATAGAGCCACCGCC
CAAAAGAAAAACGAAGCTTTAGGTTGAGAGAAAAGAGAGAGAAGCGCGTGTAGTTTAGAT
GCCGTTCAAAGGCCTCTAAAAATCGGTGCGGGACCAAATGATTATCATTTTTTACGTGAT
GGTTTCTGTGTGCCCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ17JQ U 1
AF RR4CA42JQ U 1
AF RR4CQ17TF C 160
BS 1 276 RR4CA42JQ
BS 277 277 RR4CQ17JQ
BS 278 312 RR4CA42JQ
BS 313 313 RR4CQ17JQ
BS 314 371 RR4CA42JQ
BS 372 372 RR4CQ17JQ
BS 373 402 RR4CA42JQ
BS 403 403 RR4CQ17JQ
BS 404 409 RR4CA42JQ
BS 410 410 RR4CQ17JQ
BS 411 411 RR4CA42JQ
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BS 413 466 RR4CA42JQ
BS 467 467 RR4CQ17JQ
BS 468 600 RR4CA42JQ
BS 601 917 RR4CQ17TF

RD RR4CQ17JQ 502 0 0
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AGGACGGCGAGAAACAGTTTAAGGGGAACCGCCATCCCACTCAAAAGATCCGCCGCCACC
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QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4CA42JQ 600 0 0
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AAATCTAGGTTACAGGCTAAGGAAAAAAAAAACAAAAACCAAATCGAAGCAGTAAGGAAG
TAAGGTTGGGGGAAAGAAAACAGGGAAGCAAGCTTCCTCCTCCGAGGGGACGTCGTGGCT
ATCAAATCTGACTACCGGCAACTTCCCATGACCAGGACGTCCAAACC*AGCGCAAGCTCC
GCCTCCGGTTACCATCAAAGAAACCACCCTCAAAGGGGTCCCGCGGCTCCAAAACATCGA
CTCCAGCAAGAAAACCGACTCCAAACCCTCACCGCCGCAAGCTGCAAAATGCTTCCCTCC
GTCGCAGGTCCAAAACTCTGCGTGTTTCTCCTCTTCTTATGGGGGGGAAAAAACGTTTCT
AGGACGGCGAGAAACAGTTTAAGGGGAACCGCCATCCCACTCAAAAAATCCGCCGCCACC
GGAACACAAACGCTTCAATCGGAAATGGAAACCTTAGCACCGATAACTGACCAGCGGTTT
CCAGTGAAGTCTCTGTCGTCCTCTAACAGATCTCAACCACCGTACTCCCGACGAGTCACC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4CQ17TF 758 0 0
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CCCGCGGCTCCAAAACATCGACTCCAGCAAGAAGACCGACTCCAAACCCTCACCGCCGCA
AGCTGCAAAATGCTTCCCTCCGTCGCAGGTCCGAGACTCTGCGTGTTTCTCCTCTTCTTA
TGGCGGGGAAGAGACGTTTCTAGGACGGCGAGAAACAGTTTAAGGGGAACCGCCATCCCA
CTCAAAAGATCCGCCGCCACCGGAACACAAACGCTTCAATCGGAGATGGAAACCTTAGCA
CCGATAACTGACCAGCGGTTTCCAGTGAAGTCTCTGTCGTCCTCTAACAGATCTCAACCA
CCGTACTCCCGACGAGTCACCAGAGCTTCAGATCTCGTCTAGGGGTCCGTCGCACCATGA
CCCACCCGATCTCGCAAAGAAGAAAGAGAAACACCTACTAGAGAACGCCGGATGACACGA
TTCCGTCATGACGTGCTGAATCCGAGTGGGGGAGCCTTAAAGCCACCGACAAGATCGCCG
GAAACCCATAGAGCCACCGCCCAAAAGAAAAACGAAGCTTTAGGTTGAGAGAAAAGAGAG
AGAAGCGCGTGTAGTTTAGATGCCGTTCAAAGGCCTCTAAAAATCGGTGCGGGACCAAAT
GATTATCATTTTTTACGTGATGGTTTCTGTGTGCCCCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL3257Contig1 252 4 1 U
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GTTTCTACTTGG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4B992JQ C 1
AF RR4BA02JQ C 1
AF RR4B992TF U 1
AF RR4BA02TF U 1
BS 1 252 RR4B992TF

RD RR4B992JQ 252 0 0
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ACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTACTGAGCTTCTTGTATTTCC
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GTTTCTACTTGG

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4BA02JQ 252 0 0
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CCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTTTTTGTCATTGTCCGGATCCA
ACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTACTGAGCTTCTTGTATTTCC
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GTTTCTACTTGG

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4B992TF 252 0 0
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ACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTACTGAGCTTCTTGTATTTCC
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GTTTCTACTTGG

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4BA02TF 252 0 0
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ACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTACTGAGCTTCTTGTATTTCC
TGTGTACTACAAATATGTTGCAACTCAGTTGAGTCTAGTGACCAGAATCGATCAAAATCT
GTTTCTACTTGG

QA 1 252 1 252
DS 



AS 1 4

CO CL3258Contig1 1271 4 18 U
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TGTGTGGATTTGGGAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTGCTGCAGTCTTGAATGG
GCACACACAAGATGTGAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGGATGTTTTGTTTTCTTG
CAGTTATGATAACACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGTGATTATCAATG
TGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCATCCCGTT
TAACGCTACTGGGGACAAGATGGTCACCTGTAGTGATGATCTAACCTTGAAGATATGGAC
CGCAGATATTTCCAAGATGCACTCTGGTGAAGGATATGCACCGTGGACTCATCTTTGTAC
ACTTTCTGGTTATCATGACCGTACCATATTCTCAAGTCACTGGTCAAGCGATGACATTAT
TGCCAGTGGAGCTGGTGATGATGCCATAGGGTTGTTTGTGGACAGCGAACATGACTCTGT
TAATGGACCTTCGTAGAATCTTTTACTCAAGAAGGAAAAAGCACATGAAATGGATATAAA
CTCTGTTCAGTGGTCACCCAGTAAGGAGAACAGGTTGCTTGCCTCGGCCAGTGATGATGG
AATGGTGAAGATTTGGCAGCTGGAAACTAAACCGTGAATGGTATTTGTTTTGGTTAGGTT
TTGAAACTTCTTTGATGTTTATTTTTCTTGAGATATAATATTATGTAACAATATAATATC
ATAGCAACAAGAGAACTTTCTTTTCTTTTGAACAACAAGAAAACTCTAAACTTCATCTGC
CTTGATCCATGTGACACTCTCCTTTGAGGCAATTTTTATTTTAAACTTTGGTGATCGATC
AGTTCCACCAG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F957JQ C 480
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G
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CTCCTGGTCCTGCAAGGCAGTTTTAGAAGAAACGCACACAAGAACTGTGAGGTCGTGTTC
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CAAGAGCGTATCGTGGAATGCATCTGGTTCGTACCTTGCAACATGTAGCAGAGACAAATC
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CAGTTATGATAACACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGTGATTATCAATG
TGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCATCCCGTT
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CGCATATATTTCCAAGATGCACTCTGGTGAAG*ATATGCACCTTGGACTCATCTTTGTAC
ACTTTCTGGTTATCATGACCGTAC

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DS 

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GTGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCATCCCGT
TTAACGCTACTGGGGACAAGATGGTCACCTGTAGTGATGATCTAACCTTGAAGATATGGA
CCGCATATATTTCCAAGATGCACTCTGGTGAAGGATATGCACCTTGGACTCATCTTTGTA
CACTTTCTGGTTATCATGACCGTACCATATTCTCAAGTCACTGGTCAAGCGATGACATTA
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TTAATGGACCTTCGTAGAATCTTTTACTCAAGAAGGAAAAAGCACATGAAATGGATATAA
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TTTGAAACTTCTTTGATGTTTATTTTTCTTGAGATATAATATTATGTAACAATATAATAT
CATAGCAACAAGAGAACTTTCTTTTCTTTTGA
GC

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DS 

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AGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCATCTCGTTTAACGCTACTGGGGACAAGATG
GTCACCTGTAGTGATGATCTAACCTTGAAGATATGGACCGCAGATATTTCCATGATGCAC
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AAGGAGAACAGGTTGCTTGCCTCGGCCGGTGATGATGGAATGGTGAAGATTTGGCAGCTG
GAAACTAAACCGTGAATGGTATTTGTTTTGGTTAGGTTTTGAAACTTCTTTGATGTTTAT
TTTTCTTGAGATATAATATTATGTAACAATATAATATCATAGCAACAAGAGAACTTTCTT
TTCTTTTGAACAACAAGAAAACTCTAAACTTCATCTGCCTTGATCCATGTGACACTCTCC
TTTGAGGCAATTTTTATTTTAAACTTTGGTGATCGATCAGTTCCACCAG

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DS 



AS 1 2

CO CL3259Contig1 812 2 6 U
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CGATCTTCCATCTTCTTCCTTCTGTCGCGAGGTGGTAACAGTAACCGACATGCTCTCTTA
AATCCCTCCATTAATCGACCACTCAAATCCCTCCATTAATCGACCACTCACGATCCATAT
TCAATGCGACTCTTGCGACTGGAAAGCGGTGGCGTTCCACTATAAAAAGAATAGCCGCTC
TTCCTCCACCATTCAAGTTCGCCTGCTCCGTTTCTGGGACCCAGGAATGTACGCCGTGGT
GGAGATCTCATGGGAGTCACATGCTCCTTCTTGATTCTCAGTCTGTCAGTGATCTACTGC
TTAGGTTCTGGGAGCAAGAAATATGATGAGCGGAGGCAACCATATCGGTGTGTACCTTCT
CCTCCTTGATGCAAAAGTGATTCCGGCGACTCTCATCTAAGTCACCGTCCGCTTCATGGC
TGCACCTCTGTCTTCGGTGAATGCTTCTTTATTTACAGGTCAAACAACTCCTCAAAGCAT
CAGTTGAGGAAACGAGGGGATTAAATATCTCAGATTACACATAAGGCAGGGCTTATTATC
TCAGGAAAGTATGGAACATAAAAGGGTATTTTCTATCGTTGGTGATGGATTTGTAAGAGC
TATTTAGAGGGTATAACATGACATAAGTATGGATTATATTAAGGGGACTTCAAGGATTCT
TATCCTAAGAGGTACCTAAACTCTCTATTTCACCATTGATCGCATGATTCTTTGATCATT
GTATATCAACGATGATTGTATTGTATGTCAAA


BQ
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AF RR4FV05TF U 1
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AATCCCTCCATTAATCGACCACTCAAATCCCTCCATTAATCGACCACTCACGATCCATAT
TCAATGCGACTCTTGCGACTGGAAAGCGGTGGCGTTCCACTATAAAAAGAATAGCCGCTC
TTCCTCCACCATTCAAGTTCGCCTGCTCCGTTTCTGGGACCCAGGAATGTACGCCGTGGT
GGAGATCTCATGGGAGTCACATGCTCCTTCTTGATTCTCAGTCTGTCAGTGATCTACTGC
TTAGGTTCTGGGAGCAAGAAATATGATGAGCGGAGGCAACCATATCGGTGTGTACCTTCT
CCTCCTTGATGCAAAAGTGATTCCGGCGACTCTCATCTAAGTCACCGTCCGCTTCATGGC
TGCACCTCTGTCTTCGGTGAATGCTTCTTTATTTACAGGTCAAACAACTCCTCAAAGCAT
CAGTTGAGGAAACGAGGGGATTAAATATCTCAGATTACACATAAGGCAGGGCTTATTATC
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TATTTAGAGGGTATAACATGACATAAGTATGGATTATATTAAGGG*ACTTCAAG*ATTCT
TATCCTAAGAG
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ATAAGGCAGGGCTTATTATCTCAGGAAAGTATGGAACATAAAAGGGTGTTTTCTATCGTT
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AAGGGGACTTCAAGGATTCTTATCCTAAGAGGTACCTAAACTCTCTATTTCACCATTGAT
CGCATGATTCTTTGATCATTGTATATCAACGATGATTGTATTGTATGTCAAA

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DS 



AS 1 3

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TGGATCAGGATCCGAGATCCACGGCAACGGCGGCGATCGAGCATAGGTCGTTCGCTCGGA
TCGGGTTTCTGGGGAATCCAAGCGATGTATACTTGGGGCGTACAATCTCATTCACAATAG
GAAACTTCTGGGCGTCAGTAAAGCTGGAGGCATCGGAACATATGATAATAAAGCCACATC
CATTCCACGATCTCGTCCAATTCACCTCTCTTGACCATCTCGTGAAACGGTTGGAAAATG
AAGGGTATTACGGTGGTGTAAGGCTGCTAATGGCAATTTGTAAAGTGTTCCGTAACTATT
GCAAACATAATTCCATTCACCTTCATCACCGTAACTTCTCTCTTTCCTACGACACCAATA
TCCCTAGGCAGACAGGGCTTTCTGGTTCCAGCGCCATTGTCTCCGCTGCTCTTAGCTGCC
TTCTTGACTTCTACAACGTCAGGCATCTCATCAAACTACAAGTTCGCCCTAACCTTGTTC
TCAATGCTGAGAAAGAACTTGGCATTGTCGCTGGTCTTCAGGACCGAGTTGCTCAGTCTA
TGGTGGTCTTGTTCACATGGATTTTAGTAAGGAGCACATGGATAAACTTGGACATGGGAT
CTACACTCCCATGGATATCACTCTCCTTCCCCCTTTGCATCTCATCTATGCTCAGAATCC
TAGCGACTCCGGCAAGGTACATAGTAGAGTTCGGCAAAGATGGTTAGATGGCGATGAGTT
GATAATCAAATCAATGGAAGAAGTTGGAAACCTAGCAGAACAAGGTCGAACTGCATTGCT
CAAAAAGGACCATCCCAAGCTCCTGGAACTCATGAACCGTAACTTCGACCTTCGGAGGAA
GATGTTTGGGGACGAATGCTTAGGAGCGATGAACATAGAGATGGTGGAAGTTGCAAGGAG
GGTTGGTGCAGCTTCAAAGTTCACTGGAAGTGGAGGAGCAGTGGTGGTTTTCTGTCCTGA
CGGTCCATCTCAGGTGAAGCTTCTGGAAGAAGAATGCCGCAAATCGGGATTCATACTTGA
GCCGGTAAAGATTGCGCCTTCATGCTTGAATGACTCTGACATTCAAAGCCTTGGTTGAGT
CTTCTTACAGCCTCAGTTACATTACACGTGGGCTTTTATGTTCTTAGTTCCATTATTCTA
CGTCTTTGGTCTTTTCCTTGGTTTATTATATCCTCTAATCTTTTCTGTTTTGTTTTTTTC
CACATACAGTTTTTCACGTTTTTTGTCAATTTTCTTGCTCTTTCTTTTTCTTTTTGTGTA
CAACTATATATTACACAAATCTAAATATACATACATTATGAACAAAAAAAAA


BQ
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AF RR4BV55TF U 1
AF RR4D508TF U 629
AF RR4D508JQ C 630
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RD RR4BV55TF 729 0 0
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TGGATCAGGATCCGAGATCCACGGCAACGGCGGCGATCGAGCATAGGTCGTTCGCTCGGA
TCGGGTTTCTGGGGAATCCAAGCGATGTATACTTGGGGCGTACAATCTCATTCACAATAG
GAAACTTCTGGGCGTCAGTAAAGCTGGAGGCATCGGAACATATGATAATAAAGCCACATC
CATTCCACGATCTCGTCCAATTCACCTCTCTTGACCATCTCGTGAAACGGTTGGAAAATG
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GCAAACATAATTCCATTCACCTTCATCACCGTAACTTCTCTCTTTCCTACGACACCAATA
TCCCTAGGCAGACAGGGCTTTCTGGTTCCAGCGCCATTGTCTCCGCTGCTCTTAGCTGCC
TTCTTGACTTCTACAACGTCAGGCATCTCATCAAACTACAAGTTCGCCCTAACCTTGTTC
TCAATGCTGAGAAAGAACTTGGCATTGTCGCTGGTCTTCAGGACCGAGTTGCTCAGTCTA
TGGTGGTCTTGTTCACATGGATTTTAGTAAGGAGCACATGGATAAACTTGGACATGGGAT
CTACACTCCCATGGATATCACCCTCCTTCCCCCTTTGCATCTCATCTATGCTCAGA*TCC
TAGCGACTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4D508TF 744 0 0
G
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CCCCTTTGCATCTCATCTATGCTCAGAATCCTAGCGACTCCGGCAAGGTACATAGTAGAG
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ATCCTCTAATCTTTTCTGTTTTGTTTTTTTCCACATACAGTTTTTCACGTTTTTTGTCAA
TTTTCTTGCTCTTTCTTTTTCTTTTTGTGTACAACTATATATTACACAAATCTAAATATA
CATACATTATGAACAAAAAAAAA

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR4D508JQ 731 0 0
AGGAGCACATGGATAAACTTGGACATGGGATCTACACTCCCATGGATATCACTCTCCTTC
CCCCTTTGCATCTCATCTATGCTCAGAATCCTAGCGACTCCGGCAAGGTACATAGTAGAG
TTCGGCAAAGATGGTTAGATGGCGATGAGTTGATAATCAAATCAATGGAAGAAGTTGGAA
ACCTAGCAGAACAAGGTCGAACTGCATTGCTCAAAAAGGACCATCCCAAGCTCCTGGAAC
TCATGAACCGTAACTTCGACCTTCGGAGGAAGATGTTTGGGGACGAATGCTTAGGAGCGA
TGAACATAGAGATGGTGGAAGTTGCAAGGAGGGTTGGTGCAGCTTCAAAGTTCACTGGAA
GTGGAGGAGCAGTGGTGGTTTTCTGTCCTGACGGTCCATCTCAGGTGAAGCTTCTGGAAG
AAGAATGCCGCAAATCGGGATTCATACTTGAGCCGGTAAAGATTGCGCCTTCATGCTTGA
ATGACTCTGACATTCAAAGCCTTGGTTGAGTCTTCTTACAGCCTCAGTTACATTACACGT
GGGCTTTTATGTTCTTAGTTCCATTATTCTACGTCTTTGGTCTTTTCCTTGGTTTATTAT
ATCCTCTAATCTTTTCTGTTTTGTTTTTTTCCACATACAGTTTTTCACGTTTTTTGTCAA
TTTTCTTGCTCTTTCTTTTTCTTTTTGTGTACAACTATATATTACACAAATCTAAATATA
CATACATTATG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 4

CO CL3261Contig1 762 4 6 U
GGAAATCAAACTATCAAATTTTGTGTGGCTATCCGGACATTGAGATGGCAATCCTTGCTC
CGGCGAGTTTCGGGCGGTTAACCGTTCCGTCTCGTGCGCAAGTTAGGGTAAGAGTCTCTG
CTTCTCCTAACCCACGCACTTCAGTTGACTGGGTCAAGGAAACTTCAAGCTTTTTCGAAC
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AGTTTGTCCGAGACCATGATCATAACAGGAGCATAAGATTTGAAGCATTACAGAGTGAAG
CAGGAAAGAAACTGCTGATGCGGTCAGGACGTGCTCCTAATGATATATCAAGTGTCGTAC
TTGTCGAGAAAGATAGGTCTTACATAAAATCAGAAGCGGTTTTGAAGATCATGAAATACA
TTGACTTGCCATTTCCACAGCTTGCATTCTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTGTTTGTGAGGG
ACTTTCTGTATGAAAATGTTGCAAACAACCGTTATGCAATGTTTGGTCGGTCTAATTCAT
GTGAGATCTAAGAAGACATCATTGACTGGTGATCTTATTTTGTCAAAAAATAAACTAGAT
ATGTCAAAAAAATATTTCCTACAGTTTAATATATGCTTTTGTATATAGATGTATAGTTAC
AACAGCCTTTGAACAACCCATAAGTATGTACTCTCGAAAATGTATGACGTCTTGGATGAT
GATATATGTATCAAATGTGGAAATTAGCGTTCCAGTTACATC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D139TF U 1
AF RR4AE75TF U 42
AF RR4D139JQ C 68
AF RR4AE75JQ C 121
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BS 649 746 RR4D139TF
BS 747 762 RR4AE75JQ

RD RR4D139TF 753 0 0
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CGGCGAGTTTCGGGCGGTTAACCGTTCCGTCTCGTGCGCAAGTTAGGGTAAGAGTCTCTG
CTTCTCCTAACCCACGCACTTCAGTTGACTGGGTCAAGGAAACTTCAAGCTTTTTCGAAC
AAGACAAGAGACCGATCATGTTGTTCGACGGTGTTTGCAATCTCTGTAATGGTGGCGTGA
AGTTTGTCCGAGACCATGATCATAACAGGAGCATAAGATTTGAAGCATTACAGAGTGAAG
CAGGAAAGAAACTGTTGATGCGGTCAGGACGTGCTCCTAATGATATATCAAGTGTCGTAC
TTGTCGAGAAAGATAGGTCTTACATAAAATCAGAAGCGGTTTTGAAGATCATGAAATACA
TTGACTTGCCATTTCCACAGCTTGCATTCTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTGTTTGTGAGGG
ACTTTCTGTATGAAAATGTTGCAAACAACCGTTATGCAATGTTTGGTCGGTCTAATTCAT
GTGAGATCTAAGAAGACATCATTGACTGGTGATCTTATTTTGTCAAAAAATAAACTAGAT
ATGTCAAAAAAATATTTCCTACAGTTTAATATATGCTTTTGTATATATATGTATAGTTAC
AACAGCCTTTGAACAACCCATAAGTATGTACTCTCGAAAATGTATGACGTCTTGGATGAT
GATATATGTATCAAATGTGGAAATTA
ACATTCC

QA 1 746 1 746
DS 

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GG
GATGGCAATCCTTGCTCCGGCGAGTTTCGGGCGCTTAACCGTTCCGTCTCGTGCGCAAGT
TAGGGTAAGAGTCTCTGCTTCTGTTAACCCACGCACTTCAGTTGACTGGGTCAAGGAAAC
TTCAAGCTTTTTCGAACAAGACAAGAGACCGATCATGTTGTTCGACGGTGTTTGCAATCT
CTGTAATGGTGGTGTGAAGTTTGTCCGAGACCATGATCATAACAGGAGCATAAGGTTTGA
AGCATTACAGAGTGAAGCAGGAAAGAAACTGCTGATGCGGTCAGGACGTGCTCCTGATGA
TATATCAAGTGTCGTACTTGTCGAGAAAGATAGGTCTTACATAAAATCAGAATCGGTTTT
GAAGATTATGAAATACATTGACTTGCCATTTCCACAGCTTGCATTCTTTTTGCAGTTTGC
GCCTCTGTTTGTGAGGGACTTTCTGTATGAAAATGTTGCAAACAACCGTTATGCAATGTT
TGGTCGGTCTGATTCATGTGAGATCTAAGAAGACATCATTGACTGGTGATCTTATTTTGT
CAAAAAATAAACTAGATATGTCAAAAAAATATTTCCTACAGTTTAATATATGCTTTTGTA
TATAGATGTATAGTTACAACAGCCTTTGAACAACCCATAAGTATGTACTCTCGAAAATGT
ATGACGTCTTGGATGATGATATTTGTATCAAATGTGGAAATTA
GCGTTCCAGTTACA

QA 3 705 3 705
DS 

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TTTCGGGCGGTTAACCGTTCCGTCTCGTGCGCAAGTTAGGGTAAGAGTCTCTGCTTCTCC
TAACCCACGCACTTCAGTTGACTGGGTCAAGGAAACTTCAAGCTTTTTCGAACAAGACAA
GAGACCGATCATGTTGTTCGACGGTGTTTGCAATCTCTGTAATGGTGGCGTGAAGTTTGT
CCGAGACCATGATCATAACAGGAGCATAAGATTTGAAGCATTACAGAGTGAAGCAGGAAA
GAAACTGTTGATGCGGTCAGGACGTGCTCCTAATGATATATCAAGTGTCGTACTTGTCGA
GAAAGATAGGTCTTACATAAAATCAGAAGCGGTTTTGAAGATCATGAAATACATTGACTT
GCCATTTCCACAGCTTGCATTCTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTGTTTGTGAGGGACTTTCT
GTATGAAAATGTTGCAAACAACCGTTATGCAATGTTTGGTCGGTCTAATTCATGTGAGAT
CTAAGAAGACATCATTGACTGGTGATCTTATTTTGTCAAAAAATAAACTAGATATGTCAA
AAAAATATTTCCTACAGTTTAATATATGCTTTTGTATATATATGTATAGTTACAACAGCC
TTTGAACAACCCATAAGTATGTACTCTCGAAAATGTATGACGTCTTGGATGATGATATAT
GTATCAAATGTGGAAATTA
ACATTCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4AE75JQ 642 0 0
CTTCTGT
TAACCCACGCACTTCAGTTGACTGGGTCAAGGAAACTTCAAGCTTTTTCGAACAAGACAA
GAGACCGATCATGTTGTTCGACGGTGTTTGCAATCTCTGTAATGGTGGTGTGAAGTTTGT
CCGAGACCATGATCATAACAGGAGCATAAGGTTTGAAGCATTACAGAGTGAAGCAGGAAA
GAAACTGCTGATGCGGTCAGGACGTGCTCCTGATGATATATCAAGTGTCGTACTTGTCGA
GAAAGATAGGTCTTACATAAAATCAGAATCGGTTTTGAAGATTATGAAATACATTGACTT
GCCATTTCCACAGCTTGCATTCTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTGTTTGTGAGGGACTTTCT
GTATGAAAATGTTGCAAACAACCGTTATGCAATGTTTGGTCGGTCTGATTCATGTGAGAT
CTAAGAAGACATCATTGACTGGTGATCTTATTTTGTCAAAAAATAAACTAGATATGTCAA
AAAAATATTTCCTACAGTTTAATATATGCTTTTGTATATAGATGTATAGTTACAACAGCC
TTTGAACAACCCATAAGTATGTACTCTCGAAAATGTATGACGTCTTGGATGATGATATTT
GTATCAAATGTGGAAATTAGCGTTCCAGTTACATC

QA 8 642 8 642
DS 



AS 1 4

CO CL3262Contig1 908 4 14 U
GCTACAGAAACAGAAAATCAAAATGAAAACACTGAAGGAGACCAGCCACTTATTGAAGAA
GAGGAAGAGGAGACAGAACAAATAGAAGAAGATACTAAACCTTCTTTCTTGATAGACACG
GATGACTTGCTGGGCCTAAGTGAGATAAACCCAAAAGCCGCAGAGATAGAAGACCGCAAT
GCATTGGCTCTGGCAATATATCCACCAGGTCATGAAGTTCCAGGTCCATCCAATAGTTTA
AGCTTAATAGAAACCGGTGGATCCGGTTGGGAGCTAGCACTGGTCACTCCTCAAAACAAC
AACAACAACAACAACAACATTCACCGCTCAGCGCCTGACACCAAATTTGCAGGAGGATTC
GACAAGCTATTGCTTGATAGTCTTTACGAAGATGATTCAGCGAGGAGACAGATACAACTA
ACCAATGCTGGCTATGGACACGGTGGCACTGAGAGAGCAGCAGCACCACCACAAAACCCA
TTCGAGATGCAACAAGATCCCTTTGCAATGTCGAACAACATTGCTCCTCCCACTAACGTT
CAAATGGCACAACAACAGCAACAACAGATGATGATGCATCAAAATCCCTATAGTTACTCT
AATCCCCATGACTATCATCATCATCAGTTCTCAGCCGCAGGTCCTTCTCCTTCTAATCCT
TTTGGAGACCATTTCCTTGCCCTCCCAGCTCCGCCAGGCTCATCTGGTCAGCAGCAGCAG
CAGCAAAACATCCATCATAATCATATGCTCCTCTAGAGTGATAAATAAGAGCTTTATTCA
CTCTCTCGTGCATGGTTTTGAGCGTTTTCGTTTGAATACTTATTCAGGGTGCTATTCTTT
CATTCTTACTAGATACCTAACTTCACTGGTGATTTCTTAATTTGATTATATAAAACCCTC
AAATGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU04TF U 1
AF RR4D566TF U 67
AF RR4DU04JQ C 104
AF RR4D566JQ C 339
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BS 892 908 RR4D566JQ

RD RR4DU04TF 796 0 0
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GCATTGGCTCTGGCAATATATCCACCAGGTCATGAAGTTCCAGGTCCATCCAATAGTTTA
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AACAACAACAACAACAACATTCACCGCTCAGCGCCTGACACCAAATTTGCAGGAGGATTC
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TTCGAGATGCAACAAGATCCCTTTGCAATGTCGAACAACATTGCTCCTCCCACTAACGTT
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AATCCCCATGACTATCATCATCATCAGTTCTCAGCCGCAGGTCCTTCTCCTTCTAATCCT
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CTCTCTCGTGCATGGT

QA 1 796 1 796
DS 

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GCTCTGGCAATATATCCACCAGGTCATGAAGTTCCAGGTCCATCCAATAGTTTAAGCTTA
ATAGAAACCGGTGGATCCGGTTGGGAGCTAGCACTGGTCACTCCTCAAAACAACAACAAC
AACAACAACAACATTCACCGCTCAGCGCCTGACACCAAATTTGCAGGAGGATTCGACAAG
CTATTGCTTGATAGTCTTTACGAAGATGATTCAGCGAGGAGACAGATACAACTAACCAAT
GCTGGCTATGGACACGGTGGCACTGAGAGAGCAGCAGCACCACCACAAAACCCATTCGAG
ATGCGACAAGATCCCTTTGCAATGTCGAACAACATTGCTCCTCCCACTAACGTTCAAATG
GCACAACAACAGCAACAACAGATGATGATGCATCAAAATCCCTATAGTTACTCTAATCCC
CATGACTATCATCATCATCAGTTCTCAGCCGCAGGTCCTTCTCCTTCTAATCCTTTTGGA
GACCATTTCCTTGCCCTCCCAGCTCCGCCAGGCTCATCTGGTCAGCAGCAGCAGCAGCAA
AACATCCATCATAATCATATGCTCCTCTAGAGTGATAAATAAGAGCTTTATTCACTCTCT
CGTGCATGGTTTTGAGCGTTTTCGTTTGA*TACTTATTCAGG*TGCTATTCTTTCATTCT
TACTAGATAC*TAACTTCACTG
TGATTCTATTTGATA

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4DU04JQ 788 0 0
CTTTCTTGATAGACACGGATGACTTGCTGGGCCTAAGTGAGATAAACCCAAAAGCCGCAG
AGATAGAAGACCGCAATGCATTGGCTCTGGCAATATATCCACCAGGTCATGAAGTTCCAG
GTCCATCCAATAGTTTAAGCTTAATAGAAACCGGTGGATCCGGTTGGGAGCTAGCACTGG
TCACTCCTCAAAACAACAACAACAACAACAACAACATTCACCGCTCAGCGCCTGACACCA
AATTTGCAGGAGGATTCGACAAGCTATTGCTTGATAGTCTTTACGAAGATGATTCAGCGA
GGAGACAGATACAACTAACCAATGCTGGCTATGGACACGGTGGCACTGAGAGAGCAGCAG
CACCACCACAAAACCCATTCGAGATGCAACAAGATCCCTTTGCAATGTCGAACAACATTG
CTCCTCCCACTAACGTTCAAATGGCACAACAACAGCAACAACAGATGATGATGCATCAAA
ATCCCTATAGTTACTCTAATCCCCATGACTATCATCATCATCAGTTTTCAGCCGCAGGTC
CTTCTCCTTCTAATCCTTTTGGAGACCATTTCCTTGCCCTCCCAGCTCCGCCAGGCTCAT
CTGGTCAGCAGCAGCAGCAGCAAAACATCCATCATAATCATATGCTCCTCTAGAGTGATA
AATAATAGCTTTATTCACTCTCTCGTGCATGGTTTTGAGCGTTTTCGTTTGAATACTTAT
TCAGGGTGCTATTCTTTCATTCTTACTAGATACCTAACTTCACTGGTGATTTCTTAATTT
GATTATAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4D566JQ 570 0 0
CACCAAATTTGCAGGAGGATTCGACAAGCTATTGCTTGATAGTCTTTACGAAGATGATTC
AGCGAGGAGACAGATACAACTAACCAATGCTGGCTATGGACACGGTGGCACTGAGAGAGC
AGCAGCACCACCACAAAACCCATTCGAGATGCGACAAGATCCCTTTGCAATGTCGAACAA
CATTGCTCCTCCCACTAACGTTCAAATGGCACAACAACAGCAACAACAGATGATGATGCA
TCAAAATCCCTATAGTTACTCTAATCCCCATGACTATCATCATCATCAGTTTTCAGCCGC
AGGTCCTTCTCCTTCTAATCCTTTTGGAGACCATTTCCTTGCCCTCCCAGCTCCGCCAGG
CTCATCTGGTCAGCAGCAGCAGCAGCAAAACATCCATCATAATCATATGCTCCTCTAGAG
TGATAAATAAGAGCTTTATTCACTCTCTCGTGCATGGTTTTGAGCGTTTTCGTTTGAATA
CTTATTCAGGGTGCTATTCTTTCATTCTTACTAGATACCTAACTTCACTGGTGATTTCTT
AATTTGATTATATAAAACCCTCAAATGCTC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 4

CO CL3263Contig1 734 4 11 U
GGAATGCGTGTTATCGATGGAAATGGAAAGCTGGTTCCGCACTTGTACTGCATCGGTGAT
GCCAATGGGAAGCTGATGCTTGCTCATGCAGCCAGTGCCCAAGGAATTTCTGTGGTGGAG
CAAGTCACAGGTAGAGATCATGTGCTGAATCATCTTAGCATCCCAGCCGCTTGTTTTACT
CATCCTGAAATCAGCATGGTGGGATTGACAGAGCCTCAAGCGAGAGAGAAAGCTGAGAAA
GAGGGATTTAAAGTAAGTATTGCCAAGACAAGTTTCAAGGCAAACACAAAGGCTCTTGCC
GAAAATGAGGGTGAAGGACTCGCTAAGATGATATACAGACCTGACAATGGTGAAATCCTA
GGAGTTCATATCTTTGGGTTGCATGCAGCTGATCTCATCCATGAAGCATCCAACGCCATC
GCATTGGGAACACGCATTCAGGACATAAAACTTGCAGTTCATGCACATCCAACTTTATCT
GAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCTAAGGTCGAAAGTCCAGCTTCAACAACGCCA
CAAAGTGTAAAAGCTGCTGTATAAACAGAATCTTGAGATCAACAACCTGTAACAAAAGTT
TTGTGTTCCAAGACATTTGTGCTTTAGCGACATTCGCCATGACTTCACTTATGATCGTTC
TCATGTTTTT*CCTTCTTTTTCTTATTATATCTTAAGATTATTATGATAACAGAATAAAA
AAGCAAATTGTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EQ44JQ C 413
AF RR4EQ44TF U 413
AF RR4C902JQ C 1
AF RR4C902TF U 1
BS 1 413 RR4C902TF
BS 414 513 RR4EQ44TF
BS 514 514 RR4C902TF
BS 515 584 RR4EQ44TF
BS 585 585 RR4C902TF
BS 586 687 RR4EQ44TF
BS 688 699 RR4C902TF
BS 700 700 RR4C902JQ
BS 701 714 RR4C902TF
BS 715 717 RR4C902JQ
BS 718 734 RR4C902TF

RD RR4EQ44JQ 275 0 0
G
CGCCATCGCATTGGGAACACGCATTCAGGACATAAAACTTGCAGTTCATGCACATCCAAC
TTTATCTGAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCTAAG*TCGAAAGTCCAGCTTCAAC
AACGCCACAAAGTGTAAAAGCTGCTGTATAAACAGAATCTTGAGATCAACAGCCTGTAAC
AAAAGTTTTGTGTTCCAAGACATTTGTGCTTTAGCGACATTCGCCATGACTTCACTTATG
ATCGTTCTCATGTTTTT*CCTTCTTTTTCTTATT

QA 2 275 2 275
DS 

RD RR4EQ44TF 275 0 0
G
CGCCATCGCATTGGGAACACGCATTCAGGACATAAAACTTGCAGTTCATGCACATCCAAC
TTTATCTGAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCTAAG*TCGAAAGTCCAGCTTCAAC
AACGCCACAAAGTGTAAAAGCTGCTGTATAAACAGAATCTTGAGATCAACAGCCTGTAAC
AAAAGTTTTGTGTTCCAAGACATTTGTGCTTTAGCGACATTCGCCATGACTTCACTTATG
ATCGTTCTCATGTTTTT*CCTTCTTTTTCTTATT

QA 2 275 2 275
DS 

RD RR4C902JQ 734 0 0
GGAATGCGTGTTATCGATGGAAATGGAAAGCTGGTTCCGCACTTGTACTGCATCGGTGAT
GCCAATGGGAAGCTGATGCTTGCTCATGCAGCCAGTGCCCAAGGAATTTCTGTGGTGGAG
CAAGTCACAGGTAGAGATCATGTGCTGAATCATCTTAGCATCCCAGCCGCTTGTTTTACT
CATCCTGAAATCAGCATGGTGGGATTGACAGAGCCTCAAGCGAGAGAGAAAGCTGAGAAA
GAGGGATTTAAAGTAAGTATTGCCAAGACAAGTTTCAAGGCAAACACAAAGGCTCTTGCC
GAAAATGAGGGTGAAGGACTCGCTAAGATGATATACAGACCTGACAATGGTGAAATCCTA
GGAGTTCATATCTTTGGGTTGCATGCAGCTGATTTCATCCATGAAGCATCCAACGCCATC
GCGTTGGGAACACGCATTCAGGACATAAAACTTGCAGTTCATGCACATCCAACTTTGTCT
GAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCTAAGGTCGAAAGTCCAGCTTCAACAACGCCA
CAAAGTGTAAAAGCTGCTGTATAAACAGAATCTTGAGATCAACAACCTGTAACAAAAGTT
TTGTGTTCCAAGACATTTGTGCTTTAGCGACATTCGCCATGACTTCACTTATGATCGTTC
TCATTTTTTTTCCTTCTTTTTCTTATTATATCTTAAGATTATTATGATAACAGAATAAAA
AAGCAAATTGTGAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4C902TF 734 0 0
GGAATGCGTGTTATCGATGGAAATGGAAAGCTGGTTCCGCACTTGTACTGCATCGGTGAT
GCCAATGGGAAGCTGATGCTTGCTCATGCAGCCAGTGCCCAAGGAATTTCTGTGGTGGAG
CAAGTCACAGGTAGAGATCATGTGCTGAATCATCTTAGCATCCCAGCCGCTTGTTTTACT
CATCCTGAAATCAGCATGGTGGGATTGACAGAGCCTCAAGCGAGAGAGAAAGCTGAGAAA
GAGGGATTTAAAGTAAGTATTGCCAAGACAAGTTTCAAGGCAAACACAAAGGCTCTTGCC
GAAAATGAGGGTGAAGGACTCGCTAAGATGATATACAGACCTGACAATGGTGAAATCCTA
GGAGTTCATATCTTTGGGTTGCATGCAGCTGATCTCATCCATGAAGCATCCAACGCCATC
GCGTTGGGAACACGCATTCAGGACATAAAACTTGCAGTTCATGCACATCCAACTTTGTCT
GAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCTAAGGTCGAAAGTCCAGCTTCAACAACGCCA
CAAAGTGTAAAAGCTGCTGTATAAACAGAATCTTGAGATCAACAACCTGTAACAAAAGTT
TTGTGTTCCAAGACATTTGTGCTTTAGCGACATTCGCCATGACTTCACTTATGATCGTTC
TCATTTTTTT*CCTTCTTTTTCTTATTATATCTTAAGAT*ATTATGATAACAGAT**AAA
AAGCAAATTGTGAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL3264Contig1 778 3 18 U
TTCATTTACAATATTGATTGATTGGTTGACAAAAACAAACAAAAAGAAAAAAAAGATTCA
TTAATAAATAGTCCCCCGGGAAAGATTCATATCCACGTCACCAAACGCCTACCCAACCAT
GCCACCTGTCCCCGTCGCCGTTCTCCTGCTCTCCTTGATCGCCGTCTCCGCCGCAAGGCA
AAACCCCGACGACGACGTCATCAAACTCCCCTCGCAAGCTTCTAGGTTCTTCCGCCCTAA
CAACGACGACGATTCTTCATCGTCCGGCACTAGGTGGGCTGTTCTAGTCGCCGGATCGAG
TGGTTACTGGAACTACAGGCATCAGGCGGATGTTTGTCATGCTTATCAACTTCTGAGGAA
AGGAGGATTGAAAGAGGAGAATATAGTGGTGTTCATGTATGATGATATTGCTGATAACGA
AGAGAATCCGAGGAAAGGGATCATTATCAACAGTCCTCATGGAAGTGATGTCTATCAAGG
AGTTCCCAAGGATTACACTGGAGATGATGTTACTGTTGATAATCTGTTTGCTGTGATCCT
TGGAGACAAGAGTTCTGTTAAAGGAGGGAGTGGGAAGGTTGTGG*ATAGTGGTCCAAATG
ATCATATCTTTATATTCTATAGTGACCATGGTGGTCCTGGAGTTCTCGGGATGCCGACTC
CTCCTTACTTATATGCTAATGATTTGAATGATGTGTTGAAGAAAAAACATGCTTCCGAAC
CTACA*GAGCTTGGTGTTT*ATCTCGAAGCTTGTGAGTCTGGAGTATCTTTGAGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G319TF U 1
AF RR4CE40TF U 33
AF RR4C457TF U 89
BS 1 53 RR4G319TF
BS 54 54 RR4CE40TF
BS 55 190 RR4G319TF
BS 191 191 RR4CE40TF
BS 192 404 RR4G319TF
BS 405 405 RR4CE40TF
BS 406 576 RR4G319TF
BS 577 577 RR4CE40TF
BS 578 659 RR4G319TF
BS 660 660 RR4CE40TF
BS 661 706 RR4G319TF
BS 707 707 RR4CE40TF
BS 708 725 RR4G319TF
BS 726 726 RR4CE40TF
BS 727 739 RR4G319TF
BS 740 740 RR4CE40TF
BS 741 763 RR4G319TF
BS 764 778 RR4CE40TF

RD RR4G319TF 772 0 0
TTCATTTACAATATTGATTGATTGGTTGACAAAAACAAACAAAAAGAAAAAAA*GATTCA
TTAATAAATAGTCCCCCGGGAAAGATTCATATCCACGTCACCAAACGCCTACCCAACCAT
GCCACCTGTCCCCGTCGCCGTTCTCCTGCTCTCCTTGATCGCCGTCTCCGCCGCAAGGCA
AAACCCCGACTACGACGTCATCAAACTCCCCTCGCAAGCTTCTAGGTTCTTCCGCCCTAA
CAACGACGACGATTCTTCATCGTCCGGCACTAGGTGGGCTGTTCTAGTCGCCGGATCGAG
TGGTTACTGGAACTACAGGCATCAGGCGGATGTTTGTCATGCTTATCAACTTCTGAGGAA
AGGAGGATTGAAAGAGGAGAATATAGTGGTGTTCATGTATGATGGTATTGCTGATAACGA
AGAGAATCCGAGGAAAGGGATCATTATCAACAGTCCTCATGGAAGTGATGTCTATCAAGG
AGTTCCCAAGGATTACACTGGAGATGATGTTACTGTTGATAATCTGTTTGCTGTGATCCT
TGGAGACAAGAGTTCTGTTAAAGGAGGGAGTGGGAATGTTGTGG*ATAGTGGTCCAAATG
ATCATATCTTTATATTCTATAGTGACCATGGTGGTCCTGGAGTTCTCGGGATGCCGACTT
CTCCTTACTTATATGCTAATGATTTGAATGATGTGTTGAAGAAAAA*CATGCTTCCGAAC
CTACAAGAGCTTGGTGTTTTATCTCGAAGCTTGTGAGTCTGGA
AGTATCTTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4CE40TF 746 0 0
GAACG
AACAAAAAGAAAAAAAAGATTCATTAATAAATAGTCCCCCGGGAAAGATTCATATCCACG
TCACCAAACGCCTACCCAACCATGCCACCTGTCCCCGTCGCCGTTCTCCTGCTCTCCTTG
ATCGCCGTCTCCGCCGCAAGGCAAAACCCCGACGACGACGTCATCAAACTCCCCTCGCAA
GCTTCTAGGTTCTTCCGCCCTAACAACGACGACGATTCTTCATCGTCCGGCACTAGGTGG
GCTGTTCTAGTCGCCGGATCGAGTGGTTACTGGAACTACAGGCATCAGGCGGATGTTTGT
CATGCTTATCAACTTCTGAGGAAAGGAGGATTGAAAGAGGAGAATATAGTGGTGTTCATG
TATGATGATATTGCTGATAACGAAGAGAATCCGAGGAAAGGGATCATTATCAACAGTCCT
CATGGAAGTGATGTCTATCAAGGAGTTCCCAAGGATTACACTGGAGATGATGTTACTGTT
GATAATCTGTTTGCTGTGATCCTTGGAGACAAGAGTTCTGTTAAAGGAGGGAGTGGGAAG
GTTGTGG*ATAGTGGTCCAAATGATCATATCTTTATATTCTATAGTGACCATGGTGGTCC
TGGAGTTCTCGGGATGCCGACTCCTCCTTACTTATATGCTAATGATTTGAATGATGTGTT
GAAGAAAAAACATGCTTCCGA*CCTACA*GAGCTTG*TGTTT*ATCTCGAAGCTTGTGAG
TCTGGAGTATCTTTGAGGCTT

QA 6 746 6 746
DS 

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GATGTTTGTCATGCTTATCAACTTCTGAGGAAAGGAGGATTGAAAGAGGAGAATATAGTG
GTGTTCATGTATGATGATATTGCTGATAACGAAGAGAATCCGAGGAAAGGGATCATTATC
AACAGTCCTCATGGAAGTGATGTCTATCAAGGAGTTCCCAAGGATTACACTGGAGATGAT
GTTACTGTTGATAATCTGTTTGCTGTGATCCTTGGAGACAAGAGTTCTGTTAAAGGAGGG
AGTGGGAAGGTTGTGGGATAGTGGTCCAAATGATCATATCTTTATATTCTATAGTGACCA
TGGTGGTCCTGGAGTTCTCGGGATGCCGACTCCTCCTTACTTATATGCTAATGATTTGAA
TGATGTGTTGAAGAAAAAACATGCTTCCGGACCTACA*GAGCTTGGTGTTT*ATCTCGAA
GCTTGTGAGTCTGGA
GTATCTTTGA

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

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CAGTTCTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4AV87JQ C 1
AF RR4AV87TF U 1
AF RR4B306TF U 1
AF RR4B306JQ C 1
BS 1 428 RR4AV87TF

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CAGTTCTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4AV87TF 428 0 0
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GAGTGTGTGCGTATGATAGTGACCGTTGACGGGAACGGTGACGGTTTTGTTTGCTTCCGT
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CAGTTCTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4B306TF 428 0 0
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CAGTTCTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4B306JQ 428 0 0
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CAGTTCTT

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 4

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CTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATAAAAATA
TGT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR4GS81JQ C 1
AF RR4GS81TF U 1
AF RR4F148JQ C 1
AF RR4F148TF U 1
BS 1 427 RR4GS81TF
BS 428 483 RR4F148TF

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CTTTTGA
CT

QA 1 427 1 427
DS 

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CTTTTGA
CT

QA 1 427 1 427
DS 

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TTAGATAGGTTTATTTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGTTTAGGC
AAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGACTCTTAT
CTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATAAAAATA
TGT

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DS 

RD RR4F148TF 483 0 0
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GAGAACGCACGTTCCTAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTACTAATAA
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CTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATAAAAATA
TGT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 4

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TATAATTTGATTGATTATTCAAACGAGGTGAAGATATTTATGATGAAGATGCGAATCGGT
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ACCGTCCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCCTCCAGAATGGGAATGAGGGTGTGAAT
TATCAGGTCATGTCTGGAAAGGATCTAGTTGACTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCC
AACATTCTTTGCTCTGAGAAGAAAGCTGAGCAGCCTGTTGTTGATGTTGCACTTGTCTTC
ATCGGCAGAGCGTTACTATCTTCTGATGTCTCTTCCAAAAGTAGTTCCCTTGTCAACACA
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GAGGAAGAAAGGATGGAGAGTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAGCAAGCTTGCCCTCACAAT
GCAGGAGTCAGCAGCAATATTGTGTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAGGATGGAACGATT
CAGAAACTATCAGATCTTCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCCAGAAAAGAAACAAGG
AAAGAAGGAGAAACCGACTTGGTTGTGCTCTGTTCCGAGGGTTCTGAATCAAAAAGTCAA
TCTGGCCAGTTACATTCAGAGCATGAAAGCATCTCCGAGCTTGCTAGTTCTGTAGAACAA
TCTGGCAGTAAATATACAGCTCTTTATGTCTCTGACCCTTATTGGTACACATCTTACAAA
ACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAAAGTGGTACAGGAAACAGCACTGTTGGTGCTGCTACA
GCCTGTGATGAACTCTGCAAATTTAAGTCATCACTTTTGGAGGGCATACTAGTGGGAATC
GTTTTCCTTCTCATCCTGATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCGGGTATCGATACACCAACT
AGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCTTGTTGTTGACCCCTTAAAAGAGTCATCCCC
ACCCTTTGCTTTGCTTTGCCTTTTTGATTGTGACGGGTCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTA
TGGTGAAAAAGGTACTTATTACACTACTTTTAAAAACAAAAATTTGCATATGCGATTACA
AAGTCCCCTTGTAACATTTTATTCATCTTGTTCGTGTCTTTCTTAAACGTTAATAAGTCA
ATAATGGAGAACGAGTGAAAACCAGAGACACTGGAACTACTACGTACATTCTTTTATATA
TAAATGTATGATTTTATAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4G121TF U 21
AF RR4AG03TF U 1
AF RR4G121JQ C 602
AF RR4AG03JQ C 518
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TTCCGAGGGTTCTGAATCAAAAAGTCAATCTGGCCAGTTACATTCAGAGCATGAAAGCAT
CTCCGAGCTTGTTAGTTCTGTAGA

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ATGCTCGCGCTTCTGGTGACTCTCTCTGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAAC
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TATCAGGTCATGTCTGGAAAGGATCTAGTTGACTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCC
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ATCGGCAGAGCGTTACTATCTTCTGATGTTTCTTCCAAAAGTAGTTCCCTTGTCAACACA
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TCTGGCAGTAAATATACAGCTCTTTATGTCTCT

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AAGAAGGAGAAACCGACTTGGTTGTGCTCTGTTCCGAGGGTTCTGAATCAAAAAGTCAAT
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TTTTCCTTCTCATCCTGATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCGGGTATCGATACACCAACTA
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GGTGAAAAAGGTACTTATTACACTACTTTTAAAAACAAAAATTTGCATATGCGATTACAA
AGTCCCCTTGTAACATTTTATTCATCTTGTTTGTGTCTTTCTTAAACGTTAATAAGTCAA
TAATGGAGAACGAGTG

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DS 

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CTTATTGGTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAAAGTGGTACAGGAA
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TGGAGGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCTTGATCAGTGGACTTTGTTGTA
TGGCGGGTATCGATACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCTTGTTGTT
GACCCCTTAAAAGAGTCATCCCCCCCCTTTGCTTTGCTTTGCCTTTTTGATTGTGACGGG
TCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAAGGTACTTATTACACTACTTTTAAAAAC
AAAAATTTGCATATGCGATTACAAAGTCCCCTTGTAACATTTTATTCATCTTGTTCGTGT
CTTTCTTAAACGTTAATAAGTCAATAATGGAGAACGAGTGAAAACCAGAGACACTGGAAC
TACTACGTACATTCTTTTATATATAAATGTATGATTTTATAGTTT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

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AACGACCATCAAGTAAGATAGTGACAATTGCAGGCCACTCCGTGATTAAGGGGAGAGGCG
AACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAACGGAGGTTGGTTTTCTACG
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AGACCGAATCGCTTCCATATGGTTGGGAAGTCAACGTCGATCTCAAACTCTTTGTTCACA
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AGATTCTTCGTTTCTCCACCTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGATGATTTTCTCGTTG
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CCTTTGTTATCAGTGAAATGAAACTCTCTTGTTTTAACCT


BQ
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AF RR4FL09TF U 1
AF RR4FL09JQ C 594
BS 1 680 RR4FL09TF
BS 681 1120 RR4FL09JQ

RD RR4FL09TF 683 0 0
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AACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAACGGAGGTTGGTTTTCTACG
TGACTGGTAATAAAAACGACGGTGGAAATGGCTATATATCACTATACGCGAGGATGGAAG
AGACCGAATCGCTTCCATATGGTTGGGAAGTCAACGTCGATCTCAAACTCTTTGTTCACA
ACCCAAAGCAACACAAGTACTTGGCTGTTACAGATGGAACAGTGAAGCGATTCAACGCAG
CGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAAAACACGAACG
AAGGGTACATTGTGCAGGACACTTGTTCCTTTGGTGCTGAGATCCTCATCGTTAAACCGG
CCGAGAAACAAGAGAAAGTGACATTCATATCAAACCCACCGAACAATGTTTTCACTTGGA
AGATTCTTCGTTTCTCCACCTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGATGATTTTCTCGTTG
GAGACCGTTACTGGAGACTAGGCTTTAACCCCAAAGGTGATGGAGGAGGCAGACCACATG
CACTTCCAATCTTCTTATTT
GCT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4FL09JQ 527 0 0
CTCGTTGGAGACCGTTACTGGAGACTAGGCTTTAACCCCAAAGGTGATGGAGGAGGCAGA
CCACATGCACTTCCAATTTTTTTATTTGCTCAAGGCTTTAGACCAAACGCAGTTGCTACA
AACACTTGGGGTGCGGTTAATTTGAGGTTAAAGAATCAACGTAGCTCCAACCACAGACAA
ATATATTTTGCAGCTTGGTACCCGATTCGAAGCGGTTATGGTGTGGGAGTGAACAACATC
ATATTGTTGGCGGATTTAAAGGATACATCGAAAGGGTATTTGGTTAATGATGCCATTATC
TTTGAAGCTGAAATGGTTAAGATTTCAGTGACCAATATTGTCCCTGTTTAACGACCTCTT
TACTTTTTTGTCATCGATCAAACAGCGTTATAAATAAAGAGATGTTTGATGTGTTTGTAA
TAATAAGATGAAGTTGTTGATCCCTGTGGTGTAATCATCATTTCTGTTCTATGAGTTTGT
TTTTTTTCCTTTGTTATCAGTGAAATGAAACTCTCTTGTTTTAACCT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 4

CO CL3269Contig1 881 4 2 U
GGGACCGCAGATAGAACATGGCGGCTTCATCTAATCTCTTTGCAATCCCTGCGCGTCTTC
AGTCAGCTTCTTCTCCGTTTATCTCCGCACCAAACCGGAATCGAGTTCGTATCCTCGCCA
AATCATGCCCGGACAATCAGAGCTTCGGTTCCAACGATTCGGATACTTCACCGGAGGCAA
CCAACGAAACCCAGGGGGATCATAAATCGATGTCAAGGAGACAGTGGATGATGACATGTG
CGTGCTTATCTCCAGCTTTAATTACCAATGCTTATACCTTCGTCTCTGTACAAAACGCAG
CCGCTTTAGACAAGAAACCAGGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCT
GAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTTACAGAATGTC
CAAACTGTTACGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCAGCATTTTTTTTTTAATGTAG
TTTGGTTTTTGGTAACCCCTGTTTGATTTGGTTGGCTCCTGTTTGCAAACAGGTAGAGGC
AAACTTGTTTGTCCGGTTTGTTTAGGTACAGGTTTACCAAACAACAAAGGACTTCTTAGA
AGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTTGACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCTTCCCAATTCA
TGAGCAGATTGTTACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAATAGTTATGAATTATAGAAGAGG
AAGAAAGCTAATACATTGTGGACGCATGGGAAGCTATAGGAGAACATGTTTTTGTAATGC
TGCTAGCTTTGTGTTGTAAATTCGAGTTAAAAATACTCCATGCCATAATGTAAGATGTTA
GGCATAAAAAGCATATTAAAGAATTTTCTTTTCTTTTTAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A084TF U 1
AF RR4A084TFB U 1
AF RR4A084JQ C 74
AF RR4A084JQD C 171
BS 1 712 RR4A084TF
BS 713 881 RR4A084JQ

RD RR4A084TF 717 0 0
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GAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTTACAGAATGTC
CAAACTGTTACGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCAGCATTTTTTTTTTAATGTAG
TTTGGTTTTTGGTAACCCCTGTTTGATTTGGTTGGCTCCTGTTTGCAAACAGGTAGAGGC
AAACTTGTTTGTCCGGTTTGTTTAGGTACAGGTTTACCAAACAACAAAGGACTTCTTAGA
AGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTTGACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCTTCCCAATTCA
TGAGCAGATTGTTACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAATAGTTATGAATTAT
AGAAG

QA 1 712 1 712
DS 

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AGTCAGCTTCTTCTCCGTTTATCTCCGCACCAAACCGGAATCGAGTTCGTATCCTCGCCA
AATCATGCCCGGACAATCAGAGCTTCGGTTCCAACGATTCGGATACTTCACCGGAGGCAA
CCAACGAAACCCAGGGGGATCATAAATCGATGTCAAGGAGACAGTGGATGATGACATGTG
CGTGCTTATCTCCAGCTTTAATTACCAATGCTTATACCTTCGTCTCTGTACAAAACGCAG
CCGCTTTAGACAAGAAACCAGGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCT
GAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTTACAGAATGTC
CAAACTGTTACGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCAGCATTTTTTTTTTAATGTAG
TTTGGTTTTTGGTAACCCCTGTTTGATTTGGTTGGCTCCTGTTTGCAAACAGGTAGAGGC
AAACTTGTTTGTCCGGTTTGTTTAGGTACAGGTTTACCAAACAACAAAGGACTTCTTAGA
AGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTTGACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCTTCCCAATTCA
TGAGCAGATTGTTACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAATAGTTATGAATTAT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4A084JQ 808 0 0
TCCGTTTATCTCCGCACCAAACCGGAATCGAGTTCGTATCCTCGCCAAATCATGCCCGGA
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GGGGGATCATAAATCGATGTCAAGGAGACAGTGGATGATGACATGTGCGTGCTTATCTCC
AGCTTTAATTACCAATGCTTATACCTTCGTCTCTGTACAAAACGCAGCCGCTTTAGACAA
GAAACCAGGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCTGAAAATGGAAAGC
TCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTTACAGAATGTCCAAACTGTTACGG
TTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCAGCATTTTTTTTTTAATGTAGTTTGGTTTTTGGT
AACCCCTGTTTGATTTGGTTGGCTCCTGTTTGCAAACAGGTAGAGGCAAACTTGTTTGTC
CGGTTTGTTTAGGTACAGGTTTACCAAACAACAAAGGACTTCTTAGAAGGCCTGGTGCTC
GTGAGCTACTTGACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCTTCCCAATTCATGAGCAGATTGTT
ACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAATAGTTATGAATTATAGAAGAGGAAGAAAGCTAATA
CATTGTGGACGCATGGGAAGCTATAGGAGAACATGTTTTTGTAATGCTGCTAGCTTTGTG
TTGTAAATTCGAGTTAAAAATACTCCATGCCATAATGTAAGATGTTAGGCATAAAAAGCA
TATTAAAGAATTTTCTTTTCTTTTTAAG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4A084JQD 711 0 0
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ATGACATGTGCGTGCTTATCTCCAGCTTTAATTACCAATGCTTATACCTTCGTCTCTGTA
CAAAACGCAGCCGCTTTAGACAAGAAACCAGGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGT
GCTGTTCTCTGAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTT
ACAGAATGTCCAAACTGTTACGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCAGCATTTTTTT
TTTAATGTAGTTTGGTTTTTGGTAACCCCTGTTTGATTTGGTTGGCTCCTGTTTGCAAAC
AGGTAGAGGCAAACTTGTTTGTCCGGTTTGTTTAGGTACAGGTTTACCAAACAACAAAGG
ACTTCTTAGAAGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTTGACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCT
TCCCAATTCATGAGCAGATTGTTACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAATAGTTATGAATT
ATAGAAGAGGAAGAAAGCTAATACATTGTGGACGCATGGGAAGCTATAGGAGAACATGTT
TTTGTAATGCTGCTAGCTTTGTGTTGTAAATTCGAGTTAAAAATACTCCATGCCATAATG
TAAGATGTTAGGCATAAAAAGCATATTAAAGAATTTTCTTTTCTTTTTAAG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 3

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TTCACATCTAACCCCTTTCGTTCAGTCTAAGAACATCCTAAGAAATGGGATCATTGTGAA
CAGTCATGTTTTAAAAAAGCACTTTCGAACATATCCTAGTTAATAAAGTACACCCAAATC
GAACTACGGAGCAGGGAAGCGTACACCGAGCTTGACGACAACAACTTCAAAGATCCCATC
AGGTCTGAACTTTGGAGAAACCAAGCGAGGGTCCACTTGCCCCGGAAGGTTAAACGTGAT
CGAAAACGGACCTGGCGGGCAGAGCTGCTGCACTTGCATTCTGTACAAGCATCCCGACGA
GTCACTTGGGATGGCAATCTCGGGTACTACTCCTTGAATGCATACTCTTCCCTCCCTCTG
AATCTCACATTTGATCATATCTGTTTCACAGAGACAACAAGAAGAAGAAGAATAGCATTT
TGGGGTCGGAGTTATTGAACTAGAGAGATAAATAAAATGTGAAAAGTTTTACTTGGGTTT
TTATGAATGCCAGGGAGAGAGACTCTGAAGAGGTAGGCACTCTCGCTCTCACCAATGTCT
ATAAGACCAATGGGTGGACCAGCAGTGCCTTGCTTGGCAGTGCCGGTGAAAAAGACATGT
GAGATCACTTTGGAGTGATGAACCTCAGGGTTCATGGTGTTTGATTTGTTACTTCCGACA
AGGGAAAGACCCGTAGCGATTTGTTGTGGACTCTCCGGTGATGTTTGACTGCGAAGTTTC
CGGTTCAGACGTGTTTGACCGTCGTCACTCACTCGTTTACTTTACTAAAACCGGTAGTGA
ACTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ52JQ U 1
AF RR4CZ08JQ U 1
AF RR4CQ52TF C 113
BS 1 717 RR4CQ52JQ
BS 718 772 RR4CZ08JQ
BS 773 846 RR4CQ52TF

RD RR4CQ52JQ 717 0 0
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DS 

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TTCACATCTAACCCCTTTCGTTCAGTCTAAGAACATCCTAAGAAATGGGATCATTGTGAA
CAGTCATGTTTTAAAAAAGCACTTTCGAACATATCCTAGTTAATAAAGTACACCCAAATC
GAACTACGGAGCAGGGAAGCGTACACCGAGCTTGACGACAACAACTTCAAAGATCCCATC
AGGTCTGAACTTTGGAGAAACCAAGCGAGGGTCCACTTGCCCCGGAAGGTTAAACGTGAT
CGAAAACGGACCTGGCGGGCAGAGCTGCTGCACTTGCATTCTGTACAAGCATCCCGACGA
GTCACTTGGGATGGCAATCTCGGGTACTACTCCTTGAATGCATACTCTTCCCTCCCTCTG
AATCTCACATTTGATCATATCTGTTTCACAGAGACAACAAGAAGAAGAAGAATAGCATTT
TGGGGTCGGAGTTATTGAACTAGAGAGATAAATAAAATGTGAAAAGTTTTACTTGGGTTT
TTATGAATGCCAGGGAGAGAGACTCTGAAGAGGTAGGCACTCTCGCTCTCACCAATGTCT
ATAAGACCAATGGGTGGACCAGCAGTGCCTTGCTTGGCAGTGCCGGTGAAAAAGACATGT
GAGATCACTTTGGAGTGATGAACCTCAGGGTTCATGGTGTTTGATTTGTTACTTCCGACA
AGGGAAAGACCCGTAGCGATTTGTTGTGGACTCTCCGGTGATGTTTGACTGC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CQ52TF 734 0 0
CA
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CGTGATCGAAAACGGACCTGGCGGGCAGAGCTGCTGCACTTGCATTCTGTACAAGCATCC
CGACGAGTCACTTGGGATGGCAATCTCGGGTACTACTCCTTGAATGCATACTCTTCCCTC
CCTCTGAATCTCACATTTGGTCATATCTGTTTCACAGAGACAACAAGAAGAAGAAGAATA
GCATTTTGGGGTCGGAGTTATTGAACTAGAGAGATAAATAAAATGTGAAAAGTTTTACTT
GGGTTTTTATGAATGCCAGGGAGAGAGACTCTGAAGAGGTAGGCACTCTCGCTCTCACCA
ATGTCTATAAGACCAATGGGTGGACCAGCAGTGCCTTGCTTGGCAGTGCCGGTGAAAAAG
ACATGTGAGATCACTTTGGAGTGATGAACCTCAGGGTTCATGGTGTTTGATTTGTTACTT
CCGACAAGGGAAAGACCCGTAGCGATTTGTTGTGGACTCTCCGGTGATGTTTGACTGCGA
AGTTTCCGGTTCAGACGTGTTTGACCGTCGTCACTCACTCGTTTACTTTACTAAAACCGG
TAGTGAACTTTT

QA 3 734 3 734
DS 



AS 1 3

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TGGACCTTTGGATTCTCTGTTCTGTTCTGTTCTTCTTCTTGTCTTTTCCCTTTTGTAATA
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CAAGTCGTCTTCTTACATGGACTCTTTGAAGATTCTCGAGGCTGACATTGAGCACGCCAA
TGGACTGGCTGGTGAGATACCAATGGGAAAGAGCGGTGTGAGACTTCAGATGAAACTGGT
TTGCAGCAATCTGGCTCCTTTCTTCATTTTCCTGCTCCAATGGATGGATTTCTCATGTCT
CCTTCCTAGATATTTTGATTTCTTCCACATACTCATCTACAAGGTACGTGCTGACGGGAG
GTGGAATCGATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTACAATCAGAGAGTTCTACGGTGTTATATT
ACCATCGCTAGAGCGTCTTCATATCAACTTCGCGGACTTACCAAGCGACAGCTTGTGGTA
TCCGAATCCAAAAGCCATCGCCAACAAGAAGAAGTACGACGTCGAAGGCAACAGATTCGT
GACTAACAACATCGACTCGGAAAGAGAAGAGGAATGCGGGATCTGCTTAGAGCCATGCAC
CAAAATGGTGTTACCAAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAATGCTACAGGAACTGGAA
CACCAAGTCTGAGTCGTGCCCGTTTTGTCGAGGGAACATCAAGAGAGTTAACTCGGAGGA
TCTTTGGGTGCTGACTTGCGATGAAGATGTGGTGGATCCTGAGACGGTCACTAAAGAGGA
TTTGCTACGGTTCTATCTACACATTAATAGTCTGCCTAAAGATTATCCTGAAGCTGTCTT
CTTAGGGTACAACGAGTACTTGATATAATTTTATTGCAGGAAGACACATCACTGGTGGGT
GTAGAGAGGGGAGAGGAAGATTCCAGACCTTTAACTAAGTGTATATAAGAATCTGGTGAT
CTCTAATATTTTCCCCTTCATTTTTAGATTATGAATAATAATAAGATGATTGTGTACCAT
TTTGTTATGAGATATGAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH47TF U 31
AF RR4H067TF U 1
AF RR4H067JQ C 551
BS 1 316 RR4H067TF
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BS 775 791 RR4H067TF
BS 792 1160 RR4H067JQ

RD RR4CH47TF 460 0 0
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AAGGATTGTCTGTTTCCAAAACCCAACCTTTGGACCTTTGGATTCTCTGTTCTGTTCT**
***TCTTCTTGTCTTTTCCCTTTTGTAATAGTAGAGAGAAGGGATTAAAGTGTTTTAGGA
AAGGGGGAGATAGATGTATTATCAGTTGACCAAGTCGTCTTCTTACATGGACTCTTTGAA
GATTCTCGAGGCTGACATTGAGCACGCCAATGGACTGGCTGGTGAGATACCAATGGGAAA
GAGCGGTGTGAGACTTCAGATGAAACTGGTTTGCAGCAATCTGGCTCCTTTCTTCATTTT
CCTGCTCCAATGGATGGATTTCTCATGTCTCCTTCCTAGATATTTTGATTTCTTCCACAT
ACTCATCTACAAGGTACGTGCTGACGGGAGGTGGAATCGA

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4H067TF 791 0 0
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TGGACCTTTGGATTCTCTGTTCTGTTCTGTTCTTCTTCTTGTCTTTTCCCTTTTGTAATA
GTAGAGAGAAGGGATTAAAGTGTTTTAGGAAAGGGGGAGATACATGTATTATCAGTTGAC
CAAGTCGTCTTCTTACATGGACTCTTTGAAGATTCTCGAGGCTGACATTGAGCACGCCAA
TGGACTGGCTGGTGAGGTACCAATGGGAAAGAGCGGTGTGAGACTTCAGATGAAACTGGT
TTGCAGCAATCTGGCTCCTTTCTTCATTTTCCTGCTCCAATGGATGGATTTCTCATGTCT
CCTTCCTAGATATTTTGATTTCTTCCACATACTCATCTACAAGGTACGTGCTGACGGGAG
GTGGAATCGATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTACAATCAGAGAGTTCTACGGTGTTATATT
ACCATCGCTAGAGCGTCTTCATATCAACTTCGCGGACTTACCAAGCGACAGCTTGTGGTA
TCCGAATCCAAAAGCCATCGCCAACAAGAAGAAGTACGACGTCGAAGGCAACAGATTCGT
GACTAACAACATCGACTCGGAAAGAGAAGAG*AATGCGGGATCTGCTTAGAGC*ATGCAC
CAAAATGGTGTTACCAAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAATGCTACAGGA*CTGGAA
CACCAAGTCTG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4H067JQ 610 0 0
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AAAGCCATCGCCAACAAGAAGAAGTACGACGTCGAAGGCAACAGATTCGTGACTAACAAC
ATCGACTCGGAAAGAGAAGAGGAATGCGGGATCTGCTTAGAGCCATGCACCAAAATGGTG
TTACCAAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAATGCTACAGGAACTGGAACACCAAGTCT
GAGTCGTGCCCGTTTTGTCGAGGGAACATCAAGAGAGTTAACTCGGAGGATCTTTGGGTG
CTGACTTGCGATGAAGATGTGGTGGATCCTGAGACGGTCACTAAAGAGGATTTGCTACGG
TTCTATCTACACATTAATAGTCTGCCTAAAGATTATCCTGAAGCTGTCTTCTTAGGGTAC
AACGAGTACTTGATATAATTTTATTGCAGGAAGACACATCACTGGTGGGTGTAGAGAGGG
GAGAGGAAGATTCCAGACCTTTAACTAAGTGTATATAAGAATCTGGTGATCTCTAATATT
TTCCCCTTCATTTTTAGATTATGAATAATAATAAGATGATTGTGTACCATTTTGTTATGA
GATATGAAAG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

CO CL3272Contig1 905 4 10 U
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AGCAACGACTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTTTGATTTTGAGATTTTGAACTTCCTCTT
CCCGATTCAATCTCGAGAAAGGTTAGGCATCGATGCAGAGTCTTCGGTTTTTGGAATTGT
GATAAAGAACACACACAAAAAAA*GAAAAAACATAATGGGAGGCTGCTGTTGTTGTTCTT
CTTCACGAAGAGCTGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACTATCCGAGAGCAACTG
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TCCCTACTCCTTTCGATGTGGCTATAGGTGTTCCTCAAACACCCGAAATCCGTGAAGAGT
CTGCTTGTGTTGATATAAGACAAGTCTCAGTCGAAGCCGCTAATACTGAGTCAGCTCAAG
CAACAGTCGATGGTATCACTCTCGATGGTATCACTCTCGGGGGTAAAGAAATAGAAAGCA
AACCACAGGGAGAGATTGACCTTGAAGCTACTGAAGATATAGACCCCAAGAAGCTATCGA
AAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGGAGGATTGTCCCATATGCTTGGAAGAATATG
ATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAAATGTGAGCACCATTTTCACCTCGCATGCATTC
TCGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGCAACAAGGAAATGGTGTTTGACT
CTCCCCTCGACTAGCAACATGCAAGTACCCCACAGCTTAGAAGACTCGTTTCGGCTCTGA
ATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RR4BT65TF U 12
AF RR4EL61TF U 1
AF RR4EL61JQ C 173
AF RR4BT65JQ C 284
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BS 778 858 RR4EL61JQ
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BS 860 905 RR4EL61JQ

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GG
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AC*AATAGAGGAAGAGG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR4EL61TF 777 0 0
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AGCAACGACTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTTTGATTTTGAGATTTTGAACTTCCTCTT
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CTTCACGAAGAGCTGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACTATCCGAGAGCAACTG
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TTGTTGTAGTTGACACAAACTTGGAGACTTCATCTCCTGATGCTTATATACCACCGCCAC
TCCCTACTCCTTTCGATGTGGCTATAGGTGTTCCTCAAACACCCGAAATCCGTGAAGAGT
CTGCTTGTGTTGATATAAGACAAGTCTCAGTCGAAGCCGCTAATACTGAGTCAGCTCAAG
CAACAGTCGATGGTATCACTCTCGATGGTATCACTCTCGGGGGTAAAGAAATAGAAAGCA
AACCACAGGGAGAGATTGACCTTGAAGCTACTGAAGATATAGACCCCAAGAAGCTATCGA
AAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGGAGGATTGTCCCATATGCTTGGAAGAATATG
ATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAA*TGTGAGCACCATTTTCACCTCGCATGCA

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TGAAGAGTCTGCTTGTGTTGATATAAGACAAGTCTCAGTCGAAGCCGCTAATACTGAGTC
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AGAAAGCAAACCACAGGGAGAGATTGACCTTGAAGCTACTGAAGATATAGACCCCAAGAA
GCTATCGAAAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGGAGGATTGTCCCATATGCTTGGA
AGAATATGATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAAATGTGAGCACCATTTTCACCTCGC
ATGCATTCTCGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGCAACAAGGAAATGGT
GTTTGACTCTCCCCTCGACTAGCAACCTGCAAGTACCCCACAGCTTAGAAGACTCGTTTC
GGCTCTGAATCCC

QA 1 733 1 733
DS 

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TACAATCTCCTCTGGTGTTGTTGTAGTTGACACAAACTTGGAGACTTCATCTCCTGATGC
TTATATACCACCGCCACTCCCTACTCCTTTCGATGTGGCTATAGGTGTTCCTCAAACACC
CGAAATCCGTGAAGAGTCTGCTTGTGTTGATATAAGACAAGTCTCAGTCGAAGCCGCTAA
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TAAAGAAATAGAAAGCAAACCACAGGGAGAGATTGACCTTGAAGCTACTGAAGATATAGA
CCCCAAGAAGCTATCGAAAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGGAGGATTGTCCCAT
ATGCTTGGAAGAATATGATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAAATGTGAGCACCATTT
TCACCTCGCATGCATTCTCGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGCAACAA
GGAAATGGTGTTTGACTCTCCCCTCGACTAGCAACATGCAAGTACCCCACAGCTTAGAAG
ACTCGTTTCGGCTCTGAATCCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL3273Contig1 1290 4 16 U
GGACGCATAACTTCTCCATCACTCACCGGATAACCTCCGTCGTCTTCCGCCGCAGCTTCT
AACTCCATGGCCGGCGTAAACCTACAGCTCCGTCACTCGTACTCTATCGCTCAATTCCTC
CCAAATGTTTCTTCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCAGCGAGTTCGGCTCGGAATCTCACCC
TCTCGTGTTCTCTTCTCTAACCTCCGAGCCAATTCTCCAACCTTACGAACCACTCGCCGC
TCTGACACTATCGCTTCGTCTTCCGTATCTTCCGCCGTCGATTCTGATTCGTTGGTGGGA
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CATCCGGATTACGAAGTTACGGGAGGGAGTATTGAATTTAAAGGGCAGAATCTGGTTGAT
ATGGAACCGGAGGAGAGATCTCTTGCTGGTCTCTTCATGAGTTTCCAGTCCCCTGTTGAG
ATCCCTGGTGTTACCAATATGGATTTCTTGAATATGGCTTTCAATGCTCGGAAACAAAAA
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GACGAGATTGATTCAGGGTTGGATGTTGATGCTCTTCAAGATGTGGCAAAGGCGGCGAAT
GGTCTTTTGACACCAAAAAACTCTGTGCTGATGATAACCCACTACCAACGCCTACTTGAC
TACATTAAACCAACTCTCATTCACATCATGGAGAATGGAAGAATCATTAAAACCGGATAC
AACTCCTTGGCAAAATTACTGGAAAAGGAAGGCTACAAGGCCATATCCGGTTAGTTATCT
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TGATACTTTTTTTTGTAACTAACAATAAATTCAGTTAAATAACGTCATTTATGTTCAAGT
GGGGTACTAGAAAATAAAAATGTTCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY92TF U 1
AF RR4C783TF U 72
AF RR4FY92JQ C 288
AF RR4C783JQ C 676
BS 1 403 RR4FY92TF
BS 404 613 RR4C783TF
BS 614 614 RR4FY92JQ
BS 615 655 RR4C783TF
BS 656 656 RR4FY92JQ
BS 657 668 RR4C783TF
BS 669 669 RR4FY92JQ
BS 670 719 RR4C783TF
BS 720 720 RR4FY92JQ
BS 721 727 RR4C783TF
BS 728 728 RR4FY92JQ
BS 729 733 RR4C783TF
BS 734 734 RR4FY92JQ
BS 735 748 RR4C783TF
BS 749 846 RR4FY92JQ
BS 847 1290 RR4C783JQ

RD RR4FY92TF 403 0 0
GGACGCATAACTTCTCCATCACTCACCGGATAACCTCCGTCGTCTTCCGCCGCAGCTTCT
AACTCCATGGCCGGCGTAAACCTACAGCTCCGTCACTCGTACTCTATCGCTCAATTCCTC
CCAAATGTTTCTTCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCAGCGAGTTCGGCTCGGAATCTCACCC
TCTCGTGTTCTCTTCTCTAACCTCCGAGCCAATTCTCCAACCTTACGAACCACTCGCCGC
TCTGACACTATCGCTTCGTCTTCCGTATCTTCCGCCGTCGATTCTGATTCGTTGGTGGGA
GACGGCGGTGAAGTGGGGAGGATCCCTTTGCTGGAGGTTAAGGATTTGAGAGCTGTGATT
GTTGAAACGAGGCAGGAGATACTTAAAGGCGTCAACTTGGTTG

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4C783TF 687 0 0
CGGCGTAAACCTACAGCTCCGTCACTCGTACTCTATCGCTCAATTCCTCCCAAATGTTTC
TTCTCCTTCTCCTCCTCCTC***AGCGAGTTCGGCTCGGAATCTCACCCTCTCGTGTTCT
CTTCTCTAACCTCCGAGCCAATTCTCCAACCTTACGAACCACTCGCCGCTCTGACACTAT
CGCTTCGTCTTCCGTATCTTCCGCCGTCGATTCTGATTCGTTGGTGGGAGACGGCGGTGA
AGTGGGGAGGATCCCTTTGCTGGAGGTTAAGGATTTGAGAGCTGTGATTGTTGAAACGAG
GCAGGAGATACTTAAAGGCGTCAACTTGGTTGTCTACGAAGGCGAGGTTCACGCAGTGAT
GGGGAAGAATGGTTCAGGGAAGAGCACATTCTCTAAGGTTCTTGTTGGTCATCCGGATTA
CGAAGTTACGGGAGGGAGTATTGAATTTAAAGGGCAGAATCTGGTTGATATGGAACCGGA
GGAGAGATCTCTTGCTGGTCTCTTCATGAGTTTCCAGTCCCCTGTTGAGATCCCTGGTGT
TAGCAATATGGATTTCTTGAATATGGCTTTCAATGCTCGGAAACGAAAACTCGGTCAGCC
TGAGCTTGATCCAATCCAGTTTTACAGCCACTCAGTATCAAAGCTTGA*GTTGTGA*CAT
GA*GACCGATTTTCTGA
CAGATGTAAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4FY92JQ 559 0 0
TTCGTTGGTGGGAGACGGCGGTGAAGTGGGGAGGATCCCTTTGCTGGAGGTTAAGGATTT
GAGAGCTGTGATTGTTGAAACGAGGCAGGAGATACTTAAAGGCGTCAACTTGGTTGTCTA
CGAAGGCGAGGTTCACGCAGTGATGGGGAAGAATGGTTCAGGGAAGAGCACATTCTCTAA
GGTTCTTGTTGGTCATCCGGATTACGAAGTTACGGGAGGGAGTATTGAATTTAAAGGGCA
GAATCTGGTTGATATGGAACCGGAGGAGAGATCTCTTGCTGGTCTCTTCATGAGTTTCCA
GTCCCCTGTTGAGATCCCTGGTGTTACCAATATGGATTTCTTGAATATGGCTTTCAATGC
TCGGAAACAAAAACTCGGTCACCCTGAGCTTGATCCAATCCAGTTTTACAGCCACTTAGT
ATCAAAGCTTGAAGTTGTGAACATGAAGACCGATTTTCTGAACAGGAATGTTAATGAAGG
ATTTAGTGGTGGTGAAAGGAAACGCAACGAGATTCTACAGTTAGCGGTACTTGGAGCAGA
GCTGGCTATACTGGACGAG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4C783JQ 615 0 0
CTTGATCCAATCCAGTTTTACAGCCACTCAGTATCAAAGCTTGAAGTTGTGAACATGAAG
ACCGATTTTCTGAACAGGAATGTTAATGAAGGATTTAGTGGTGGTGAAAGGAAACGCAAC
GAGATTCTACAGTTAGCGGTACTTGGAGCAGAGCTGGCTATACTGGACGAGATTGATTCA
GGGTTGGATGTTGATGCTCTTCAAGATGTGGCAAAGGCGGCGAATGGTCTTTTGACACCA
AAAAACTCTGTGCTGATGATAACCCACTACCAACGCCTACTTGACTACATTAAACCAACT
CTCATTCACATCATGGAGAATGGAAGAATCATTAAAACCGGATACAACTCCTTGGCAAAA
TTACTGGAAAAGGAAGGCTACAAGGCCATATCCGGTTAGTTATCTCAGATTCATAGTAAA
CGGCTCTTCCTTCTTCTGAGAGACCAGACTGTTGTTTCATGTCTCAAAAGACATTGGAAT
CTGAAGATGATGTCTGAAAAGTCAATTTTTTTTGCTTCAGTGTTTTGATACTTTTTTTTG
TAACTAACAATAAATTCAGTTAAATAACGTCATTTATGTTCAAGTGGGGTACTAGAAAAT
AAAAATGTTCAGACC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 3

CO CL3274Contig1 913 3 15 U
GGGCTGCCTAAAGAGTAGTATCTACTAAATCTAATCGTCGAATCGTCGAGAGAGTAGGTT
TACGGTTGTCATCGTCATCTCCGTGGAACCCTGGGAGAAGTGAAGAGAGTATCATCGATT
TCTATTCCGTAGTCTTCACGGAACGCTTCTAAGTCTGTGATGATGAGCAAATCTGTTTCG
AGAAAAGGCCGTTCTAATTCCGAACCAAAACCTGTCTTTGTACTGTGGGACAAAGAGAAT
GCGGAGCTTCCCGTTGGTTATCGTCTGGAAAATCTCAGAACAAACGTTCAAGCGGCGTTG
AAAACACACAACCCGAGAATGGTGCTCCAAAAGTTTACTGCGTACGCACCCAATTTACAG
GAAGGAAGCCAGTTCGGTATTGATTTTGTGTCCATTCCCCACGAAAGTCTTGAATGTCAG
GCTGACTTTAAAGGTACAGATTGTTTGAATCTGGTCGTAGAGAACCCTTCTGGAAACCAA
GTTAGAACAATGCGTTGCACAGACATTGCAGACAAGTTCATCATACTTGAGATGTGTATG
CTATTGGCTGAGGATCCAAACAGAGCGATCCTCATCATCGCAGGTGATGGTGATTATGTC
CGTTTCATAGAAGGCTTCCCGGATGCATATCTCATGCTTGCGGAGCCGGAAAACTCAAAC
GCCGATCTCCATGTAATAGTAAAAGCCGCATGGTCTTGGGTTGCTGAAGCTAATGAGGAG
CAGATGATATTTGGAGGGACACCTCGGTACGGGACTGTTGCTAAGAGCGCCTTGAGGAGA
AGGAATTAGTGTGAGGAACTTGTTTGCTTTGTTTGCTCCGAGATGTAAAGGTCTTGATGA
CTCTTGAGTGAATGTTAGTTAAACTTTGCTAAACCTTTTGACGAATATGGTTGGAACACG
ATCAACCAACTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD95TF U 1
AF RR4G041TF U 54
AF RR4AD95JQ C 111
BS 1 107 RR4AD95TF
BS 108 108 RR4G041TF
BS 109 611 RR4AD95TF
BS 612 770 RR4G041TF
BS 771 771 RR4AD95JQ
BS 772 784 RR4G041TF
BS 785 785 RR4AD95JQ
BS 786 797 RR4G041TF
BS 798 798 RR4AD95JQ
BS 799 818 RR4G041TF
BS 819 819 RR4AD95JQ
BS 820 830 RR4G041TF
BS 831 831 RR4AD95JQ
BS 832 851 RR4G041TF
BS 852 913 RR4AD95JQ

RD RR4AD95TF 611 0 0
GGGCTGCCTAAAGAGTAGTATCTACTAAATCTAATCGTCGAATCGTCGAGAGAGTAGGTT
TACGGTTGTCATCGTCATCTCCGTGGAACCCTGGGAGAAGTGAAGAGGGTATCATCGATT
TCTATTCCGTAGTCTTCACGGAACGCTTCTAAGTCTGTGATGATGAGCAAATCTGTTTCG
AGAAAAGGCCGTTCTAATTCCGAACCAAAACCTGTCTTTGTACTGTGGGACAAAGAGAAT
GCGGAGCTTCCCGTTGGTTATCGTCTGGAAAATCTCAGAACAAACGTTCAAGCGGCGTTG
AAAACACACAACCCGAGAATGGTGCTCCAAAAGTTTACTGCGTACGCACCCAATTTACAG
GAAGGAAGCCAGTTCGGTATTGATTTTGTGTCCATTCCCCACGAAAGTCTTGAATGTCAG
GCTGACTTTAAAGGTACAGATTGTTTGAATCTGGTCGTAGAGAACCCTTCTGGAAACCAA
GTTAGAACAATGCGTTGCACAGACATTGCAGACAAGTTCATCATACTTGAGATGTGTATG
CTATTGGCTGAGGATCCAAACAGAGCGATCCTCATCATCGCAGGTGATGGTGATTATGTC
CGTTTCATAGA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4G041TF 802 0 0
GG
AGGTTTACGGTTGTCATTGTCATCTCCGTGGAACCCTGGGAGAAGTGAAGAGAGTATCAT
CGATTTCTATTCCGTAGTCTTCACGGAACGCTTCTAAGTCTTTGATGATGAGCAAATCTG
TTTCGAGAAAAGGCCGTTCTAATTCCGAACCAAAACCTGTCTTTGTACTGTGGGACAAAG
AGAATGCGGAGCTTCCCGTTGGTTATCGTCTGGAAAATCTCAGAACAAACGTTCAAGCGG
CGTTGAAAACACACAACCCGAGAATGGTGCTCCAAAAGTTTACTGCGTACGCACCCAATT
TACAGGAAGGAAGCCAGTTCGGTATTGATTTTGTGTCCATTCCCCACGAAAGTCTTGAAT
GTCAGGCTGACTTTAAAGGTACAGATTGTTTGAATCTGGTCGTAGAGAACCCTTCTGGAA
ACCAAGTTAGAACAATGCGTTGCACAGACATTGCAGACAAGTTCATCATACTTGAGATGT
GTATGCTATTGGCTGAGGATCCAAACAGAGCGATCCTCATCATCGCAGGTGATGGTGATT
ATGTCCGTTTCATAGAAGGCTTCCCGGATGCATATCTCATGCTTGCGGAGCCGGAAAACT
CAAACGCCGATCTCCATGTAATAGTAAAAGCCGCATGGTCTTGGGTTGCTGAAGCTAATG
AGGAGCAGATGATATTTGGAGGGACACCTCGGTACGGGACTGTTGCTAAGAGCGC*TTGA
GGAGAAGGA*TTAGTGTGAGGA*CTTGTTTGCTTTGTTTGCTCTGAGATGTAAAG*TCTT
GATGACTCTTGAGTGA
TGTA

QA 3 798 3 798
DS 

RD RR4AD95JQ 803 0 0
ATCATCGATTTCTATTCCGTAGTCTTCACGGAACGCTTCTAAGTCTGTGATGATGAGCAA
ATCTGTTTCGAGAAAAGGCCGTTCTAATTCCGAACCAAAACCTGTCTTTGTACTGTGGGA
CAAAGAGAATGCGGAGCTTCCCGTTGGTTATCGTCTGGAAAATCTCAGAACAAACGTTCA
AGCGGCGTTGAAAACACACAACCCGAGAATGGTGCTCCAAAAGTTTACTGCGTACGCACC
CAATTTACAGGAAGGAAGCCAGTTCGGTATTGATTTTGTGTCCATTCCCCACGAAAGTCT
TGAATGTCAGGCTGACTTTAAAGGTACAGATTGTTTGAATCTGGTCGTAGAGAACCCTTC
TGGAAACCAAGTTAGAACAATGCGTTGCACAGACATTGCAGACAAGTTCATCATACTTGA
GATGTGTATGCTATTGGCTGAGGATCCAAACAGAGCGATCCTCATCATCGCAGGTGATGG
TGATTATGTCCGTTTCATAGAAGGCTTCCCGGATGCATATCTCATGCTTGCGGAGCCGGA
AAACTCAAACGCCGATCTCCATGTAATAGTAAAAGCCGTATGGTCTTGGGTTGCTGAAGC
TAATGAGGAGCAGATGATATTTGGAGGGACACCTCGGTACGGGACTGTTGCTAAGAGCGC
CTTGAGGAGAAGGAATTAGTGTGAGGAACTTGTTTGCTTTGTTTGCTCCGAGATGTAAAG
GTCTTGATGACTCTTGAGTGAATGTTAGTTAAACTTTGCTAAACCTTTTGACGAATATGG
TTGGAACACGATCAACCAACTAT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 2 4

CO CL3275Contig1 442 2 3 U
GGAACCTAGCATCGTCGTCGTCTCCTCCAACAGCAGAGCCAGAGAAGCCAGAAGATTATC
TGTGATCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGGGCCGGGAAGGTGAGAGGTC
AGACACCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGTCGTGCTCACAAGA
GATTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAAAGAGGAC
CGAACTCATCTGAGAAGTAGACTGAAGCAATTTTTACCTTTTGGTGTGTTTTTTTTTATA
ATGCTTCTTTAGTTACGAAGCCAATATTTCTTGTTGATTTCATTTGTGTTACATTTTTTC
TGTTCGTATTATAACTTACTTTCTTGTTGTATCAGATATTTTGTTTTCTTATAATGGATT
AGAGGTGAATTTCACCTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BU21JQ C 1
AF RR4BU21TF U 1
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BS 8 429 RR4BU21TF
BS 430 442 RR4BU21JQ

RD RR4BU21JQ 442 0 0
GGAACCTAGCATCGTCGTCGTCTCCTCCAACAGCAGAGCCAGAGAAGCCAGAAGATTATC
TGTGATCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGGGCCGGGAAGGTGAGAGGTC
AGACACCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGTCGTGCTCACAAGA
GATTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAAAGAGGAC
CGAACTCATTTGAGAAGTAGACTGAAGCAATTTTTACCTTTTGGTGTGTTTTTTTTTATA
ATGCTTCTTTAGTTACGAAGCCAATATTTCTTGTTGATTTCATTTGTGTTACATTTTTTC
TGTTCGTATTATAACTTACTTTCTTGTTGTATCAGATATTTTGTTTTCTTATAATGGATT
AGAGGTGAATTTCACCTTGGGT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR4BU21TF 442 0 0
GGAACCT
AGCATCGTCGTCGTCTCCTCCAACAGCAGAGCCAGAGAAGCCAGAAGATTATCTGTGATC
GACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGGGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACACC
GAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGTCGTGCTCACAAGAGATTGCA
ACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAAAGAGGACCGAACTC
ATCTGAGAAGTAGACTGAAGCAATTTTTACCTTTTGGTGTGTTTTTTTTTATAATGCTTC
TTTAGTTACGAAGCCAATATTTCTTGTTGATTTCATTTGTGTTACATTTTTTCTGTTCGT
ATTATAACTTACTTTCTTGTTGTATCAGATATTTTGTTTTCTTATAATGGATTAGAGGTG
AA
TTTCACCTTGGGT

QA 8 429 8 429
DS 



CO CL3275Contig2 433 2 3 U
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TCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACA
CCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGTCGTGCTCACAAGAGATTG
CAACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAGAGAGGACCGAAC
TCATCTGAGGAGTAGACTGGACCGATATTTACCTTTTGGTGTGTTTATTTTTTATAATGT
TTCTTTAGTTACGAAGCCAATGTTACTTGTTGATTTCATTTGTGTTACATTTTTTCTGTT
CGGATTATAACTTACTTTCTTGTTGTATCAGATCTTTTGTTTTCTTATAATGGATTAGAG
GTGAAAACCTTGG


BQ
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV26JQ C 1
AF RR4FV26TF U 1
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BS 3 425 RR4FV26TF
BS 426 433 RR4FV26JQ

RD RR4FV26JQ 433 0 0
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TCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACA
CCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGTCGTGCTCACAAGAGATTG
CAACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAGAGAGGACCGAAC
TCATTTGAGGAGTAGACTGGACCGATATTTACCTTTTGGTGTGTTTATTTTTTATAATGT
TTCTTTAGTTACGAAGCCAATGTTACTTGTTGATTTCATTTGTGTTACATTTTTTCTGTT
CGGATTATAACTTACTTTCTTGTTGTATCAGATCTTTTGTTTTCTTATAATGGATTAGAG
GTGAAAACCTTGG

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4FV26TF 433 0 0
GG
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GACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACACC
GAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGTCGTGCTCACAAGAGATTGCA
ACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAGAGAGGACCGAACTC
ATCTGAGGAGTAGACTGGACCGATATTTACCTTTTGGTGTGTTTATTTTTTATAATGTTT
CTTTAGTTACGAAGCCAATGTTACTTGTTGATTTCATTTGTGTTACATTTTTTCTGTTCG
GATTATAACTTACTTTCTTGTTGTATCAGATCTTTTGTTTTCTTATAATGGATTAGAGGT
GAA
AACCTTGG

QA 3 425 3 425
DS 



AS 2 4

CO CL3276Contig1 1079 2 2 U
GGAAGATTTCCTGGTGGCAGATTTGAACTTTATCTACGTCGTTGCCCGTATATTTGAGTT
CCTTAGCCCTGAGTTCAGCCGTACTTCCCTGGTTGGTATTGTCAAGGACATACGTGAGTC
CATGCTCGAAGAAGTGGATTTCAACAAAGAGGCTCAAAACATTGAATCGTTTAAGAGATA
TCTTGAATCCATGGGGTTGTCAGGACAAGCCACTGCTCCGAGAGTGTATAAGCACTGCAG
CAGCCGGCGGGTGCTTACGATGGAGAGGCTATATGGAGTTCCTCTTACTGATCTTGATTC
CATAAGATCACTTGTTTCCAGTCCGGAAAACAGCCTCATCACGGCTCTTAACGTGTGGTT
CGGAAGTTCGCTTTCTTGTGAAAGTTTCCATGCTGATGTACATGCCGGGAACTTATGGCT
GTTGCGTGATGGCCGGATTGGTTTTCTTGATTTTGGCATTGTTGGTCGGATATCACCTAA
AACATGGGAAGCTGTGGAAGTGTTTTTAGCGTCCATTGCAACCGAAGAATATGAATCAAT
GGCCTCGGCTTTGATACAAATGGGCGCCACAAATAGAGATGTTGACGCCAAAGCTTTTGC
AAGAGGCTTGGAAAAGATGTTCTCTTCTATCCAGGAACTAGATACAGAGATAGTAGTGGC
TACAGCTCGCGGACCAAACTCAGACAGAACTGCTGTTGCTGCTAATGTAGTTATGGACGA
GAGACAGATGAATGCTCTTTTCCTCGACCTGGTGCGGGTTAGCGAATCATATGGGCTGAA
GTTCCCAAGAGAGTTTGCACTTCTAATGAAGCAGCTTCTGTATTTCGATCGATACACGAG
ACTATTAGCCCCCAACATGAACATGCTGCAGGATCAGCGGATTTCTGTCGTGTCCAACAA
CAGGAGGATGAATCGATACAAGGACAGCTTCAACTAAGTTCATACTCGTATACTCCACTT
ACAAGTGGTAAAAGTTAATAGTAGATTGATAAAAAAAAAAACTAGGAATGATGAATATCA
ATATTGTTACAAACATAACGAATGCTACATGAATATATACAACAGGTATCCTTTTTTGC


BQ
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AF RR4G881TF U 1
AF RR4G881JQ C 323
BS 1 738 RR4G881TF
BS 739 1079 RR4G881JQ

RD RR4G881TF 738 0 0
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CCTTAGCCCTGAGTTCAGCCGTACTTCCCTGGTTGGTATTGTCAAGGACATACGTGAGTC
CATGCTCGAAGAAGTGGATTTCAACAAAGAGGCTCAAAACATTGAATCGTTTAAGAGATA
TCTTGAATCCATGGGGTTGTCAGGACAAGCCACTGCTCCGAGAGTGTATAAGCACTGCAG
CAGCCGGCGGGTGCTTACGATGGAGAGGCTATATGGAGTTCCTCTTACTGATCTTGATTC
CATAAGATCACTTGTTTCCAGTCCGGAAAACAGCCTCATCACGGCTCTTAACGTGTGGTT
CGGAAGTTCGCTTTCTTGTGAAAGTTTCCATGCTGATGTACATGCCGGGAACTTATGGCT
GTTGCGTGATGGCCGGATTGGTTTTCTTGATTTTGGCATTGTTGGTCGGATATCACCTAA
AACATGGGAAGCTGTGGAAGTGTTTTTAGCGTCCATTGCAACCGAAGAATATGAATCAAT
GGCCTCGGCTTTGATACAAATGGGCGCCACAAATAGAGATGTTGACGCCAAAGCTTTTGC
AAGAGGCTTGGAAAAGATGTTCTCTTCTATCCAGGAACTAGATACAGAGATAGTAGTGGC
TACAGCTCGCGGACCAAACTCAGACAGAACTGCTGTTGCTGCTAATGTAGTTATGGACGA
GAGACAGATGAATGCTCT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4G881JQ 757 0 0
CCGGAAAACAGCCTCATCACGGCTCTTAACGTGTGGTTCGGAAGTTCGCTTTCTTGTGAA
AGTTTCCATGCTGATGTACATGCCGGGAACTTATGGCTGTTGCGTGATGGCCGGATTGGT
TTTCTTGATTTTGGCATTGTTGGTCGGATATCACCTAAAACATGGGAAGCTGTGGAAGTG
TTTTTAGCGTCCATTGCAACCGAAGAATATGAATCAATGGCCTCGGCTTTGATACAAATG
GGCGCCACAAATAGAGATGTTGACGCCAAAGCTTTTGCAAGAGGCTTGGAAAAGATGTTT
TCTTCTATCCAGGAACTAGATACAGAGATAGTAGTGGCTACAGCTCGCGGACCAAACTCA
GACAGAACTGCTGTTGCTGCTAATGTAGTTATGGACGAGAGACAGATGAATGCTCTTTTC
CTCGACCTGGTGCGGGTTAGCGAATCATATGGGCTGAAGTTCCCAAGAGAGTTTGCACTT
CTAATGAAGCAGCTTCTGTATTTCGATCGATACACGAGACTATTAGCCCCCAACATGAAC
ATGCTGCAGGATCAGCGGATTTCTGTCGTGTCCAACAACAGGAGGATGAATCGATACAAG
GACAGCTTCAACTAAGTTCATACTCGTATACTCCACTTACAAGTGGTAAAAGTTAATAGT
AGATTGATAAAAAAAAAAACTAGGAATGATGAATATCAATATTGTTACAAACATAACGAA
TGCTACATGAATATATACAACAGGTATCCTTTTTTGC

QA 1 757 1 757
DS 



CO CL3276Contig2 844 2 6 U
GGGGAAAGCTTTGATCGGAGTTTCTGACTTACTGCCTCGATCTCCGGCTAGCTAAGCGAT
GGCGGTCTCAGCTCTCCGTGTCACGCAGTTACCACTTCTACGCCAATCTCAGTTTCCTGT
TGCGAGGTCTAAGAAGATGATCGGATGCAGAAACTTGAAGGGTTTTGTTATCTCGGCTCA
ATATTCACAAAGCCAAGACCTTTTCACTTCTCGCCTTCAAAGCAGGATAGAGAACTTACC
CAAACTAGTTGAGGATATTGTTCAGACATCGATAAACACTGGTCCACGTGGTGCGTTACG
CCTTGTCCAAGGTGTTCAGGCCTTTCTAGGCGTTGGAGGAGAGTGGCTAAACGATCTCTC
TAAATCTACAAGAGTGTCTTCTGGTGCATTACCAACTGAAATGCAGCTTGGTCTACTCTC
TCCTCTATATTTGAGGAAACTCTTTGAACGCATGGGAGCTACTTATATTAAGCTGGGCCA
GTTTATAGCATCGGCGCCAACTTTGTTCCCACAAGAATATGTCGAAGAGTTTCAGAACTG
CTTCGACAAAGCTCCTCCAGTACCGTTTGAAGAGATTCGTAAAATCTTACAAGAGGAGCT
TGGGAGGCCCATAGAAAGCGTGTACGAATATGTTGACCCTGAACCACTTGCATCAGCCTC
AATTGCACAAGTCCATGGTGCAAGGCTTCTAGGCTCCCAAGAAGACGTAGTTATTAAGGT
CTTGAAGCCTGGAATAGAAGATTTCCTAGTGGCAGACTTGAACTTTATCTACGTTGTTGC
GCGTATATTTGAGTTCCTTAGCCCTGAGTTCAGCCGTACTTCACTGGTTGGTATTGTCAA
GGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4H338TF U 1
AF RR4AF28TF U 32
BS 1 73 RR4H338TF
BS 74 74 RR4AF28TF
BS 75 426 RR4H338TF
BS 427 427 RR4AF28TF
BS 428 684 RR4H338TF
BS 685 844 RR4AF28TF

RD RR4H338TF 687 0 0
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GGCGGTCTCAGCTTTCCGTGTCACGCAGTTACCACTTCTACGCCAATCTCAGTTTCCTGT
TGCGAGGTCTAAGAAGATGATCGGATGCAGAAACTTGAAGGGTTTTGTTATCTCGGCTCA
ATATTCACAAAGCCAAGACCTTTTCACTTCTCGCCTTCAAAGCAGGATAGAGAACTTACC
CAAACTAGTTGAGGATATTGTTCAGACATCGATAAACACTGGTCCACGTGGTGCGTTACG
CCTTGTCCAAGGTGTTCAGGCCTTTCTAGGCGTTGGAGGAGAGTGGCTAAACGATCTCTC
TAAATCTACAAGAGTGTCTTCTGGTGCATTACCAACTGAAATGCAGCTTGGTCTACTCTC
TCCTCTTTATTTGAGGAAACTCTTTGAACGCATGGGAGCTACTTATATTAAGCTGGGCCA
GTTTATAGCATCGGCGCCAACTTTGTTCCCACAAGAATATGTCGAAGAGTTTCAGAACTG
CTTCGACAAAGCTCCTCCAGTACCGTTTGAAGAGATTCGTAAAATCTTACAAGAGGAGCT
TGGGAGGCCCATAGAAAGCGTGTACGAATATGTTGACCCTGAACCACTTGCATCAGCCTC
AATTGCACAAGTCCATGGTGCAAG
CTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4AF28TF 813 0 0
GG
GCCTCGATCTCCGGCTAGCTA*GCGATGGCGGTCTCAGCTCTCTGTGTCACGCAGTTACC
ACTTCTCCGCCAATCTCAGTTTCCTGTTGCGAGGTCTAAGAAGATGATCGGATGCAGAAA
CTTGAAGGGTTTTGTTATCTCGGCTCAATATTCACAAAGCCAAGACCTTTTCACTTCTCG
CCTTCAAAGCAGGATAGAGAACTTACCCAAACTAGTTGAGGATATTGTTCAGACATCGAT
TAACACTGGTCCACGTGGTGCGTTACGCCTTGTCCAAGGTGTTCAGGCCTTTCTAGGCGT
TGGAGGAGAGTGGCTAAACGATCTTTCTAAATCTACAAGAGTGTCTTCTGGTGCATTACC
AACTGAAATGCAGCTTGGTCTACTCTCTCCTCTATATTTGAGGAAACTCTTTGAACGCAT
GGGAGCTACTTATATTAAGCTGGGCCAGTTTATAGCATCTGCGCCAACTTTGTTCCCACA
AGAATATGTCGAAGAGTTTCAGAACTGCTTCGACAAAGCTCCTCCAGTACCGTTTGAGGA
GATTCGTAAAATCTTGCAAGAGGAGCTTGGGAGGCCCATAGAAAGCGTGTACGAATATGT
TGATCCTGAACCACTTGCATCAGCCTCAATTGCACAAGTCCATGGTGCAAGGCTTCTAGG
CTCCCAAGAAGACGTAGTTATTAAGGTCTTGAAGCCTGGAATAGAAGATTTCCTAGTGGC
AGACTTGAACTTTATCTACGTTGTTGCGCGTATATTTGAGTTCCTTAGCCCTGAGTTCAG
CCGTACTTCACTGGTTGGTATTGTCAAGGAC

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 3

CO CL3277Contig1 1338 3 32 U
GGAGACGTAGTATTCAACGTAAAAGCATTTGTATTGAAGTAGAATGGATTTGCTACCATT
CAATTATGCAAAACAAATACCAGATCGAACACTGGAATGCAAAAAGAGAAGGTCATTTTC
ATGAAGTTTCAATTTCAACAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAGTATTGGAAAGCTATCGAC
ATAACAATCAATGTGGACCATTAGATCAGAACATGGTTGATGAATCGGAGGGTGAAGAAT
CAACCAAGTTGAGAATGCTATTCCAGTAGTTCTTGTTGTCCTCATAGTAGCTATACTCAC
TCTCGTTGACTGCGACGGCTCCGGCCGCCGCCTCGTAGTTTTTAACGGTGGAGAGACTCC
GATCAGCTGAATCACCGAGCAGAAAGCTGGTGAGTCCTTCTGTCGGACAGTTGATCTGCC
TCATCCAGTCGTGGTAGGAATCTTTGACATCGGAGGAGGTGGAAGAAGACACGGCGAACT
CATTCATGTTCGGAACGTTGTTATTCTCTCCCGAAGGCATGATCATCAGATGGTGATTCT
CGGAAAAAGTCACCGTCGATGTCGGTGATTCAAGCTGTTGATCTCCGTTTCCTTTGTTTG
GTTTTGTCCAATTTGCTGATGACTTGTGAGCCAAGCAATGATTAGGAG***CTGCTGCTT
TCTTGTTTTGGTAATGCTGTAAATGGAGAAGCTTTGATTCTCTAGCTAGCCTTGCTTCAG
TTTCGAGCCGAGCACTCTCCCATTGAGCCATATGGCTAAGCGTGGCTGCTGCGCTCTTGG
ACTGACCTGTGGAAGACATTAGAGTCTCGTTTTTGTGCTTGTGAGTCACTGGATCTATCC
CCATTTTAACCAGACGTTTCTTCAAGTGTGTGTTCCAGTAGTTCTTGATCTCGTTGTCTG
TCCTTTTTGCTAAGTGAGTTGCAATCGCTGACCATCTATTTCCGAGGAGAGCGTGGAGTT
GAATGATGGTTTGTTCTTCTTGTACAGTGAATTTGCCTCTCTTGATGTCAGGTCTTAGGT
AATTAGTCCATCTGAGTCTGCAACTCTTTCCACATCTCTGGAGACCAGCTTTCTCAGGCA
AAGAGCGCCAGCTTCCATGACCATGCTCTTCAATGTAAGCCAAAAGTTTCTGATCCTCTT
CTGGTGTCCATGGCCCTTTCTTTAACCCAGCCTTATCACAGCACGGCGATCTTCCCATTA
CAAAACTTAGGCTAAAGCTACTGAAGAGAGAAGGCTTTTTTTTTAATCTTATTAAATATC
TTCAACGTGATTTATGGTGTAGTGTAGTGTATGAGGTGGTAGTAGTAGTCATTAGATGAT
GATGATGATTGTCCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT32JQ U 1
AF RR4AH60JQ U 12
AF RR4AH60TF C 610
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CGGAAAATGTCACCGTCGATGTCGGTGATTCAAGCTGTTGATCTCCGTTTCCTTTGTTTG
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TGTGGACCATTAGATCAGAACATGGTTGATGAATCGGAGGGTGAAGAATCAACCAAGTTG
AGAATGCTATTCCAGTAGTTCTTGTTGTCCTCATAGTAGCTATACTCACTCTCGTTGACT
GCGACGGCTCCGGCCTCCGCCTCGTAGTTTTTAACGGTGGAGAGACTCCGATCAGCTGAA
TCACCGAGCAGAAGGCTGGTGAGTCCTTCTGTCGGACAGTTGATCTGCCTCATCCAGTCG
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C

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DS 

RD RR4AH60TF 729 0 0
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GAGCACTCTCCCATTGAGCCATATGGCTAAGCGTGGCTGCTGCGCTCTTGGACTGACCTG
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CCAGACGTTTCTTCAAGTGTGTGTTCCAGTAGTTCTTGATCTCGTTGTCTGTCCTTTTTG
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TTTGTTCTTCTTGTACAGTGAATTTGCCTCTCTTGATGTCAGGTCTTAGGTAATTAGTCC
ATCTGAGTCTGCAACTCTTTCCACATCTCTGGAGACCAGCTTTCTCAGGCAAAGAGCGCC
AGCTTCCATGACCATGCTCTTCAATGTAAGCCAAAAGTTTCTGATCCTCTTCTGGTGTCC
ATGGCCCTTTCTTTAACCCAGCCTTATCACAGCACGGCGATCTTCCCATTACAAAACTTA
GGCTAAAGCTACTGAAGAGAGAAGGCTTTTTTTTTAATCTTATTAAATATCTTCAACGTG
ATTTATGGTGTAGTGTAGTGTATGAGGTGGTAGTAGTAGTCATTAGATGATGATGATGAT
TGTCCACCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL3278Contig1 975 4 18 U
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CCTCTCTAGTCTTCTTCTAGAAACACCTTCTCTCTCATTTAGAGTCTTTCAAAAAATGGC
GGTTACACCTTCTAGAACCAGATCAACCGGTACTGCGCTACGCTCTTCGTCAGGCTTCGC
TTCCTCCACAACCTCCACCTTCTCGTCCCGTTCTTCAGCTTTCTTCAGCAACCAACAACA
ACAACCTCACCACAGATCCGCGTCCCCGACGCGCGTGAACCTCTTCGCATCATCACCGTT
AAAACAATCGTTCCGTTACTCGATCGATTCCAGATCCATATCCCCTAACCACCGATCCAT
CGCCGTTTCGAAGCCAAGCAGTGGTAGTAAGATCCCCGATTCGAGGAGGAGGTGCATGTG
CTCGCCGACGACTCACCCCGGTTCGTTCCGGTGCGCTTTACACAAGAACGTGGCGAATCC
CCACGGTCAAGGCGCCGCGGTGACGACGTATCCGACGAACAGTTTGAATATGAGAAGATC
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AGATCCGGCGAA*GGGAGCTGAGACTCGGGTCGGGTCGGGTCTGCGCGTACGGGTTGAAT
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GTTGGGTGAAGATGAATTGTACATAAGTAGTCCTTCATTTGCTATAGAAAGCGCAATAAG
TTCGAAAAAGTATCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F982TF U 1
AF RR4AN74TF U 16
AF RR4F982JQ C 195
AF RR4AN74JQ C 218
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RD RR4F982TF 410 0 0
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DS 

RD RR4AN74TF 795 0 0
G
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ACCTTCTCGTCCCGTTCTTCAGCTTTCTTCAGCAACCAACAACAACAACCTCACCACAGA
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AGCTGAGACTCGGG

QA 2 795 2 795
DS 

RD RR4F982JQ 770 0 0
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CGCTGGTGAGGATCGGTGGCGTTGAAGGTGAGTGGGTGAGGA**GGGCGTTGACGACTCT
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TGAATCGGCCTCAGGAGATATCGTTTCTGTTAGAGCTGTGGGAGATAGATCCGGCGAA*G
GGAGCTGAGACTCGGGTCGGGTCGGGTCTGCGCGTACGGGTTGAATCAGGGAGTTATGTA
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AATTGTACATAAGTAGTCCTTCATTTGCTATAGAAAGCGCAATAAGTTC
T

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DS 

RD RR4AN74JQ 758 0 0
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AACCTCTTCGCATCATCACCGTTAAAACAATCGTTCCGTTACTCGATCGATTCCAGATCC
ATATCCCCTAACCACCGATCCATCGCCGTTTCGAAGCCAAGCAGTGGTAGTATGATCCCC
GATTCGAGGAGGAGGTGCATGTGCTCGCCGACGACTCACCCCGGTTCGTTCCGGTGCGCT
TTACACAAGAACGTGGCGAATCCCCACGGTCAAGGCGCCGCGGTGACGACGTATCCGACG
AACAGTTTGAATATGAGAAGATCGGCGATGACGAATT*GCTGGTGAGGATCGGTGGCGTT
GAAGGTGAGTGGGTGAGGA**GGGCGTTGACGACTCTGATAAGGCCGTCC*TCGCATCAG
CAGAAGAGGAGGTCCGCGTATCAGCCTAGGCCTAGTAGGCTATCGTCTATGTCCAAAGCG
GATGATCT**CATTTGCTTCTTAGGGCTTTGTGTCTTTGAATCGGCCTCAGGAGATATCG
TTTCTGTTAGAGCTGTGGGAGATAGATCCGGCGAA*GGGAGCTGAGACTCGGGTCGGGTC
GGGTCTGCGCGTACGGGTTGAATCAGGGAGTTATGTAAACGGATCCCGAAACGACGCCGT
GTTAATTTTGTGTTTTGTGTTTTGTTGGGTGAAGATGAATTGTACATAAGTAGTCCTTCA
TTTGCTATAGAAAGCGCAATAAGTTCGAAAAAGTATCT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL3279Contig1 528 3 3 U
GACAAGTATGGAGACTACATCGGGATCCGAAATCTAGAGGCATGGGGTGGGTTAATGGGA
CCAGGTTACAACTACTTCGAGAGGGGTAATCTCGACATTTTCAGTGGTAGAGCGCCGTGT
CTTCCGAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTTACCTCCGACGGCTCTGGCGACCACCATGGT
TGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTTCACGCTACGTGCTCTCAGCAA
AGCTTCGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGTCACCGTATGAGCTCACTGCTGTA
AGGAATAACTGTCCGGTGTCGCTTAGGGAGAGTGTCGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGG
AAGACTCTCTCTTGGATCGTATGAAGCAATGAATGAATGGATGTTGAGTGTCTTGGAGAC
TTGTTCTATGTCGTCTTGTGAACGTGTGATGCCAATAAAGAAAAATGATTCGATCGAATA
AACATTCAGTTTTTTGGTTCTGTAAGAAGTAATCAGTTATCTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FL17JQ C 1
AF RR4BS77TF U 205
AF RR4G737TF U 285
BS 1 205 RR4FL17JQ
BS 206 476 RR4BS77TF
BS 477 528 RR4G737TF

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CTTCCGAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTTACCTCCGACGGCTCTGGCGACCACCATGGT
TGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTTCACGCTACGTGCTCTCAGCAA
AGCTTCGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGTCACCGTATGAGCTCACTGCTGTA
AGGAATAACTGTCCGGTGTCGCTTAGGGAGAGTGTCGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGG
AAGACTCTCTCTTGGATCGTATGAAGCAATGAATGAATGGATGTTGAGTGTCTTGGAGAC
TTGTTCTATGTCGTCTTGTGAACGTGTGATGCCAATAAAGAAAAATGATTCGATCG

QA 1 476 1 476
DS 

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G
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CGACTGATACGTCACCGTATGAGCTCACTGCTGTAAGGAATAACTGTCCGGTGTCGCTTA
GGGAGAGTGTCGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTATGAA
GCAATGAATGAATGGATGTTGAGTGTCTTGGAGACTTGTTCTATGTCGTCTTGTGAACGT
GTGATGCCAATAAAGAAAAATGATTCGATCG

QA 2 272 2 272
DS 

RD RR4G737TF 244 0 0
G
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GGGTCTGAGATCCGTAAGACTCTCTCTTGGATCGTATGAAGCAATGAATGAATGGATGTT
GAGTGTCTTGGAGACTTGTTCTATGTCGTCTTGTGAACGTGTGATGCCAATAAAGAAAAA
TGATTCGATCGAATAAACATTCAGTTTTTTGGTTCTGTAAGAAGTAATCAGTTATCTTTG
ATT

QA 2 244 2 244
DS 



AS 1 4

CO CL3280Contig1 1435 4 10 U
GCTTGCTAAAAAGATTAGGAGAAGTGACGTTCCAGATGTAACAGTGTTCCGTGGCTATGG
GGATATATCACACATAAAGGTTAACTCGGGTGTGAACCAGCATCTCTATGGGGATAGATC
ACATATAAAGGTTGTGAATCAGCAGATAAGACCTCCTTTTTCGGTACTACCCCACAGTGA
GAAGAAGAATCAAACAGGAAGTGCCAAAGAGAGTGAAGGTGAAGATAAAGGGAAGGATGA
TCCAAAGGTGACATGTTTGATGCAACAAGCTGAGCTTCTCAGTTCATTGGCCCAGAAAGT
TAATGCAGATAACACAGAACAAAGCATGGAGAATGCCTGGAAGGTCCTGCAGGATTTCTT
TAATAAAAGCAAAGAGAATGATTTATTCAAATACGGACTACCTGATATAGATTTCCAACT
TGAGGAATTTAAGGATCTTGTTGAAGACTTGAGGATTAGCAACGAAGATAGTCAAGCCTC
TTGGAGGCAACCTGATCTCCATGATTCACCTGCAAGCTCTGACTATAGCTCAGGATCAAC
TACAATGCCACATTCTTCTGGTGATCAAACCCAACAACCCATGTCTGGTTCTCAGACAGA
AACGCAGGAGCCAAATCCTGGGGAGTTACCACCAGCCTCTGTTGCAACTGTGGAACAAGT
GGATTTACTTTCATCTTGTAATGATGTCCTAGAAAACCCTAATGAGATTATGCCTATGTC
GGTTGAGGAAGAGTTCAAATCTCCTGTTCAAGTCACTCCATTGTTCAGATCTCTAGCAGC
AGGCATCCCAAGCCCACAATTCTCTGAAAGTGAGAGGAACTTTGTGCTGAAAACACTAGG
TGTTGAGTCCCCATGTCCAAGTGCTAATCTTTCACAACCACCTCCTTGCAAAAGAGTCCT
TCTTGATAGCTTGTAAACCAAACCAAACCCAAAAAAAAACCTGCAGTTGTGTCTCCATGG
GAGCCGACATAACTTGCATTTCTTCCCTCTCTTTTTTGCTTAGATTTTTCTTCATTAGGC
TTTGCAGCCATATCGGCCTGAAAAGTTTTTGTGAAGCGGGCGTGCCATGATCTGCATTTT
TTTGTTTTCTCCTCAGTGTTGATAATCTAGAATCCAAGAATGTTAAAGGGTAACATTTCT
AAGTCTAGACCTGAGTTTCTCTCTCAGATACTCAGGATGCCAGGAGTGTTTCTTTTTCAT
CATCACCATACTCTTAAAACCCATTTCATCAAAGGGTTTACAAGTATGTCTTTTTCTTCT
CAATTCATGACTTGTGTGTGTGTGTAAGAAACATTCTTTTGTTTGTCCTCCCTCTTTTAG
GGTCAAACCCGGATACGTAATCCGGGTCTTTGCCTTCCCAATGAATTATTGATTTGTTGT
GTTGTTGATTTTATGTACAGAAACCTATATTTTACATAAAAACAGAGTTTTTGTT


BQ
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AF RR4ER79TF U 1
AF RR4B370TF U 162
AF RR4B370JQ C 594
AF RR4ER79JQ C 765
BS 1 181 RR4ER79TF
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BS 1246 1435 RR4ER79JQ

RD RR4ER79TF 603 0 0
GCTTGCTAAAAAGATTAGGAGAAGTGACGTTCCAGATGTAACAGTGTTCCGTGGCTATGG
GGATATATCACACATAAAGGTTAACTCGGGTGTGAACCAGCATCTCTATGGGGATAGATC
ACATATAAAGGTTGTGAATCAGCAGATAAGACCTCCTTTTTCGGTACTACCCCACAGTGA
GTAGAAGAATCAAACAGGAAGTGCCAAAGAGAGTGAAGGTGAAGATAAAGGGAAGGATGA
TCCAAAGGTGACATGTTTGATGCAACAAGCTGAGCTTCTCAGTTCATTGGCCCAGAAAGT
TAATGCAGATAACACAGAACAAAGCATGGAGAATGCCTGGAAGGTCCTGCAGGATTTCTT
TAATAAAAGCAAAGAGAATGATTTATTCAAATACGGACTACCTGATATAGATTTCCAACT
TGAGGAATTTAAGGATCTTGTTGAAGACTTGAGGATTAGCAACGAAGATAGTCAAGCCTC
TTGGAGGCAACCTGATCTCCATGATTCACCTGCAAGCTCTGACTATAGCTCAGGATCAAC
TACAATGCCACATTCTTCTGGTGATCAAACCCAACAACCCATGTCTGGTTCTCAGACAGA
AAC

QA 1 603 1 603
DS 

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AAGATAAAGGGGAGGATGATCCAAAGGTGACATGTTTGATGCAACAAGCTGAGCTTCTCA
GTTCATTGGCCCAGAAAGTTAATGCAGATAACACAGAACAAAGCATGGAGAATGCCTGGA
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CTGATATAGATTTCCAACTTGAGGAATTTAAGGATCTTGTTGAAGACTTGAGGAT*AGCA
ACGAAGATAGTCAAGCCTCTTGGAGGCAACCTGATCTCCCTGATTCACCTGCAAGCTCTG
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TGTTCAGATCTCTAGCAGCAGGCATCCCAAGCCCACAATTCTCTGAAAGTGAGAGGAACT
TTGTGCTGAAAACACTAG*TGTTGAGTCCCCATGTCCAAGTGCTAATCTTTCACAACCAC
CTCCTT

QA 1 726 1 726
DS 

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AACAAGTGGATTTACTTTCATCTTGTAATGATGTCCTAGAAAACCCTAATGAGATTATGC
CTATGTCGGTTGAGGAAGAGTTCAAATCTCCTGTTCAAGTCACTCCATTGTTCAGATCTC
TAGCAGCAGGCATCCCAAGCCCACAATTCTTTGAAAGTGAGAGGAACTTTGTGCTGAAAA
CACTAGGTGTTGAGTCCCCATGTCCAAGTGCTAATCTTTCACAACCACCTCCTTGCAAAA
GAGTCCTTCTTGATAGCTTGTAAACCAAACCAAACCCAAAAAAAA*CCTGCAGTTGTGTC
TCCATGGGAGCCGACATAACTTGCATTTCTTCCCTCTCTTTTTTGCTTAGATTTTTCTTC
ATTAGGCTTTGCAGCCATATCGGCCTGAAAAGTTTTTGTGAAGCGGGCGTGCCATGATCT
GCATTTTTTTGTTTTCTCCTCAGTGTTGATAATCTAGAATCCAAGAATGTTAAAGGGTAA
CATTTCTAAGTCTAGACCTGAGTTTCTCTCTCAGATACTCAGGATGCCAGGAGTGTTTCT
TTTTCATCATCACCATACTCTTAAAACCCATTTCATCAAAGGGTTTACAAGT
G

QA 1 652 1 652
DS 

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TCAGATCTCTAGCAGCAGGCATCCCAAGCCCACAATTCTCTGAAAGTGAGAGGAACTTTG
TGCTGAAAACACTAGGTGTTGAGTCCCCATGTCCAAGTGCTAATCTTTCACAACCACCTC
CTTGCAAAAGAGTCCTTCTTGATAGCTTGTAAACCAAACCAAACCCAAAAAAAAACCTGC
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TTTTTCTTCATTAGGTTTTGCAGCCATATCGGCCTGAAAAGTTTTTGTGAAGCGGGCGTG
CCATGATCTGCATTTTTTTGTTTTCTCCTCAGTGTTGATAATCTAGAATCCAAGAATGTT
AAAGGGTAACATTTTTAAGTCTAGACCTGAGTTTCTCTTTCAGATACTCAGGATGCCAGG
AGTGTTTCTTTTTCATCATCATCATACTCTTAAAACCCATTTCATCAAAGGGTTTACAAG
TATGTCTTTTTCTTCTCAATTCATGACTTGTGTGTGTGTGTAAGAAACATTCTTTTGTTT
GTCCTCCCTCTTTTAGGGTCAAACCCGGATACGTAATCCGGGTCTTTGCCTTCCCAATGA
ATTATTGATTTGTTGTGTTGTTGATTTTATGTACAGAAACCTATATTTTACATAAAAACA
GAGTTTTTGTT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 4

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TTGATAAGTCTTGCATTGATAAGTCTTACAACACGTTAATCTAATACAAACACACACACA
CACGAAAGAGTGTTTTCATAAAAGAAGAATACACAAACGATCATGAAGAAGAGAGACCAT
CAAAATAGGTCTCCCCTTTTCTCGAACCCATTCGCTTGTATAGTATGATATAACTAAATC
TAATCAATCAAGACCACACTGAATCTCTTCTGCTTAAGGATATTATATCAGTTTCTGCTC
ACCATGCAGAGATGAGAGAGCTAGAAAAAAGCTTTTTTTTTTTAAAGTTACAATCAGAAC
CCATTAGAAGAAATGAAATGGGTTTTTCTCACTTCTGCGCCACAGTCAGCTTAGCTAGTC
GCCACAGAATCGGTTCTTAGACTTACGTTTAAGAGTTGTTGTTCCACATTCTTACCACTA
CCTGATACAGAGCTGTTGCTGTTGTTATCAACTCGAGATATAAGGTTCTCTGTTTTCCCA
GTTGCTTGCGTTTGCGTCGCTTTCAGTTGAGCCAATAAAGCTTCGTTCTCCAGCCGTAGT
TTCTCAGACTCATCGTTTAGTTGGCCTAGTTTGGACCTCAGAGTCATGTTCTCAGCAACT
AGTGCGTCAACCTTGACAGAGAGTTCTTCAGTTTCAGCCTGCTTCCTTAGTCTTGACCTT
CTAGCAGATTCTCGGTTTGACTGTTTTCTCTTCTCTCTTTTAACCTCTTTTTCATTCCAG
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GTCCCCATAGTCACTGCAGTTTTCTCATTTTCATCTCTAAGAAGAGGAACAATTTGAGAT
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CCCCCAGTTGTATTCCCATCACTACCATTGCTGGAATCATCATTCTCGGAGCTCTGAGAA
TTCCTAGGTCCACTGCTGTTTTCAGCACTCCCAGCTGCTTTGTTATTGCTTATAGACATT
GCAAGTCCATCAAATTCTTTCAACCTTTTCATGAACCCCTGATCCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
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AF RR4FA19TF C 1
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AF RR4BX22JQ U 60
AF RR4BX22TF C 239
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QA 1 718 1 718
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QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4BX22JQ 760 0 0
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CGCCACAGAATCGGTTCTTAGACTTACGTTTAAGAGTTGTTGTTCCACATTCTTACCACT
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AGTTGCTTGCGTTTGCGTCGCTTTCAGTTGAGCCAATAAAGCTTCGTTCTCCAGCCGTAG
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TCTAGCAGATTCTCGGTTTGACTGTTTTCTCTTCTCTCTTTTAACCTCTTTTTCATTCCA
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AGTCCCCATAGTCACTGCAGTTTTCTCATTTTCATCTCTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4BX22TF 828 0 0
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*CCCATTAGAAGAAATGAAATGGGTTTT*CTCACTTCTGCGCCACAGTCAGCTTAGCTAG
TCGCCACAGAATCGGTTCTTAGACTTACGTTTAAGAGTTGTTGTTCCACATTCTTACCAC
TAC*TGATACAGAGCTGTTGCTGTTGTTATCAACTCGAGATATAAGGTTCTCTGTTTTCC
CAGTTGCTTGCGTTTGCGTCGCTTTCAGTTGAGCCAATAAAGCTTCGTTCTCCAGCCGTA
GTTTCTCAGACTCATCGTTTAGTTGGCCTAGTTTGGACCTCAGAGTCATGTTCTCAGCAA
CTAGTGCGTCAACCTTGACAGAGAGTTCTTCAGTTTCAGCCTGCTTCCTTAGTCTTGACC
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AGACTTCATGAGGCGCACCATGGCATGGCTGTGGGAAATCCATACCTGTGGGCATAACAG
GAGTCCCCATAGTCACTGCAGTTTTCTCATTTTCATCTCTAAGAAGAGGAACAATTTGAG
ATGAAGGTTTCCCATCATTGTTCGGTGATCCTTCCCGGCTTCTTTTCTTCCTAGACTGTT
CTCCCCCAGTTGTATTCCCATCACTACCATTGCTGGAATCATCATTCTCGGAGCTCTGAG
AATTCCTAGGTCCACTGCTGTTTTCAGCACTCCCAGCTGCTTTGTTATTGCTTATAGACA
TTGCAAGTCCATCAAATTCTTTCAACCTTTTCATGAACCCCTGATCCC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 4

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AAGGATATGAGGTTCTCTTTTGTTTGTAAATACTCGATCCTCTGATCGATTTTGTGTTTT
CTTAGGAGAATTTCTTTTCGCTATGGCGATTTTCCTCTTCGCGTAGGCGATTTTGATGTG
TAAAGTTCACCCAAATCAGAGTTGAATATCAATCTTATCTTTCTCTGAAACGGGTTAAAC
ATAATTAAAGTTTTGGTTTAGTTCTTCTCCTTCTGTTTTAATTTGATACACCTTTTGATT
GAGAGGTTGTATTCTCTTCTTTGTTAGACATGCTTAGTTTTTGATTCAGAGGTGGTGTCA
AGCTTCGCTATGGGTTTGGGTGAAGTTTCCATGATGATCAAAACCTGGGTTTTGGACTGT
ACTTTGAAGATCCAGAACAGAATCCAGATGAGCCGGAGCTGCCATAGGGTTAGCGTTCCG
ACAAGGTTCTATTCCTGGTTCTATTAAAGCTTTTCCTTGGGCTAAAATTCTAACAAATTA
GAGAAGAAAATTTCGAGATTAACGGCGATTGGAGGAAACAAGAATATGCAAGCAGCCTCA
ACTGATCAGAGATGGAGATGGATGGATTACCGGGGAGTTAGTCGGCACCGTCTCTCTTCT
TTCTCGGCAAAGGACTTGACGCCACGAGTCTTCACACGTGTTTCTTAGCATGTGAACATA
TCTGTTTGTGTTTGGACTTTGCTGGTCAAAAAATTTGAGTCTGTTTGTAATCTTTGCCCA
ATGGGCTGGTTAATGAAACCACAAATTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G175TF U 1
AF RR4DH37TF U 45
AF RR4DH37JQ C 76
AF RR4G175JQ C 338
BS 1 99 RR4G175TF
BS 100 100 RR4DH37TF
BS 101 162 RR4G175TF
BS 163 163 RR4DH37TF
BS 164 554 RR4G175TF
BS 555 555 RR4DH37TF
BS 556 670 RR4G175TF
BS 671 671 RR4DH37TF
BS 672 713 RR4G175TF
BS 714 714 RR4DH37TF
BS 715 752 RR4G175TF
BS 753 753 RR4DH37JQ
BS 754 778 RR4DH37TF
BS 779 779 RR4DH37JQ
BS 780 792 RR4DH37TF
BS 793 811 RR4DH37JQ

RD RR4G175TF 752 0 0
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AAGGATATGAGGTTCTCTTTTGTTTGTAAATACTCGATCTTCTGATCGATTTTGTGTTTT
CTTAGGAGAATTTCTTTTCGCTATGGCGATTTTCCTCTTCGCATAGGCGATTTTGATGTG
TAAAGTTCACCCAAATCAGAGTTGAATATCAATCTTATCTTTCTCTGAAACGGGTTAAAC
ATAATTAAAGTTTTGGTTTAGTTCTTCTCCTTCTGTTTTAATTTGATACACCTTTTGATT
GAGAGGTTGTATTCTCTTCTTTGTTAGACATGCTTAGTTTTTGATTCAGAGGTGGTGTCA
AGCTTCGCTATGGGTTTGGGTGAAGTTTCCATGATGATCAAAACCTGGGTTTTGGACTGT
ACTTTGAAGATCCAGAACAGAATCCAGATGAGCCGGAGCTGCCATAGGGTTAGCGTTCCG
ACAAGGTTCTATTCCTGGTTCTATTAAAGCTTTTCCTTGGGCTAAAATTCTAACAAATTA
GAGAAGAAAATTTCTAGATTAACGGCGATTGGAGGAAACAAGAATATGCAAGCAGCCTCA
ACTGATCAGAGATGGAGATGGATGGATTACCGGGGAGTTAGTCGGCACCGTCTCTCTTCT
TTCTCGGCAA*GGACTTGACGCCACGAGTCTTCACACGTGTTTCTTAGCATGT*AACATA
TCTGTTTGTGTTTGGACTTTGCTGGTCAAAAA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4DH37TF 765 0 0
GGG
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GATTTTGTGTTTTCTTAGGAGAATTTCTTTTCGCTATGGCGATTTTCCTCTTCGCGTAGG
CGATTTTGATGTGTAAAGTTCACCCAAATCAGAGTTGAATATCAATCTTATCTTTCTCTG
AAACGGGTTAAACATAATTAAAGTTTTGGTTTAGTTCTTCTCCTTCTGTTTTAATTTGAT
ACACCTTTTGATTGAGAGGTTGTATTCTCTTCTTTGTTAGACATGCTTAGTTTTTGATTC
AGAGGTGGTGTCAAGCTTCGCTATGGGTTTGGGTGAAGTTTCCATGATGATCAAAACCTG
GGTTTTGGACTGTACTTTGAAGATCCAGAACAGAATCCAGATGAGCCGGAGCTGCCATAG
GGTTAGCGTTCCGACAAGGTTCTATTCCTGGTTCTATTAAAGCTTTTCCTTGGGCTAAAA
TTCTAACAAATTAGAGAAGAAAATTTCGAGATTAACGGCGATTGGAGGAAACAAGAATAT
GCAAGCAGCCTCAACTGATCAGAGATGGAGATGGATGGATTACCGGGGAGTTAGTCGGCA
CCGTCTCTCTTCTTTCTCGGCAAAGGACTTGACGCCACGAGTCTTCACATGTGTTTCTTA
GCATGTGAACATATCTGTTTGTGTTTGGACTTTGCTGGTCAAAAA*TTTGAGTCTGTTTG
TAATCTTTGCC*AATGGGCTGGTTA
TGAAACACAAATTGACT

QA 4 748 4 748
DS 

RD RR4DH37JQ 736 0 0
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TTTCGCTATGGCGATTTTCCTCTTCGCGTAGGCGATTTTGATGTGTAAAGTTCACCCAAA
TCAGAGTTGAATATCAATCTTATCTTTCTCTGAAACGGGTTAAACATAATTAAAGTTTTG
GTTTAGTTCTTCTCCTTCTGTTTTAATTTGATACACCTTTTGATTGAGAGGTTGTATTCT
CTTCTTTGTTAGACATGCTTAGTTTTTGATTCAGAGGTGGTGTCAAGCTTCGCTATGGGT
TTGGGTGAAGTTTCCATGATGATCAAAACCTGGGTTTTGGACTGTACTTTGAAGATCCAG
AACAGAATCCAGATGAGCCGGAGCTGCCATAGGGTTAGCGTTCCGACAAGGTTCTATTCC
TGGTTCTATTAAAGCTTTTCCTTGGGCTAAAATTCTAACAAATTAGAGAAGAAAATTTCG
AGATTAACGGCGATTGGAGGAAACAAGAATATGCAAGCAGCCTCAACTGATCAGAGATGG
AGATGGATGGATTACCGGGGAGTTAGTCGGCACCGTCTCTCTTCTTTCTCGGCAAAGGAC
TTGACGCCACGAGTCTTCACATGTGTTTCTTAGCATGTGAACATATCTGTTTGTGTTTGG
ACTTTGCTGGTCAAAAAATTTGAGTCTGTTTGTAATCTTTGCCCAATGGGCTGGTTAATG
AAACCACAAATTGACT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4G175JQ 473 0 0
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TCAAAACCTGGGTTTTGGACTGTACTTTGAAGATCCAGAACAGAATCCAGATGAGCCGGA
GCTGCCATAGGGTTAGCGTTCCGACAAGGTTCTATTCCTGGTTCTATTAAAGCTTTTCCT
TGGGCTAAAATTCTAACAAATTAGAGAAGAAAATTTCTAGATTAACGGCGATTGGAGGAA
ACAAGAATATGCAAGCAGCCTCAACTGATCAGAGATGGAGATGGATGGATTACCGGGGAG
TTAGTCGGCACCGTCTCTCTTCTTTCTCGGCAAAGGACTTGACGCCACGAGTCTTCACAC
GTGTTTCTTAGCATGTAAACATATCTGTTTGTGTTTGGACTTTGCTGGTCAAAAAATTTG
AGTCTGTTTGTAATCTTTGCCCAATGGGCTGGTTA
ATGAAACCACAAATTGGC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 4

CO CL3283Contig1 925 4 7 U
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TCACGATTCGTATCACAAACGTGCTAAAGTCTACTCTAGTGGCCTTGCTTGCAGTGATGC
TGGAAACTCTGGTTCGTCGGTGGAGAGAAGTGTGAGTTTTGGTGCTTCTTCTAGGACGGA
TGCTGATATGTTCTGTCAGAATTTCATCTTGAATTATAGTCGGAAAGATGGGAAGAAAGA
TGAGGGAGATGATAACGGTTCTTCTGAGTCGGAAGATTTTGAAGTTCATATTGATTTGAC
TGATGACCTCTTGCATATGGTGTTCTCGTTCTTGAATCACATCGACCTCTGTCGCTCTGC
TATGGTGTGTCGTCAGTGGAGAGTAGCTAGCTCTCATGACGAATTTTGGAAGGTCTTGAA
CTTTGAAAATACGAGGATTTCTATCGAGCAATTTGAAGACGTGTCTTCGCTATCCCAATG
CCACTGAAGTGAATGTTTATGGCACTCCTGCTGTTAACGCTCTGGCTATGAAAGCAGCTA
GTCTCTTTCTTCAGTCTTGTAACATGGATGAAGCAGGAGTTGAAGCAGCTATATCAGGAT
GCTGCTCACTAGAGACACTGGATCTCCGTTTCTGTCCGAAGACATCCTCGGTGAGCATGG
CGAGGTTCCGAGCAGTGTGTCCTAGTTTGAAGCGAGTCTTCAGCAGTCCAAATCTTGCAG
ATTAGGGATTTGCGCATGGGAATGTTTTATTATATACTAGTATTGAGCATGGGAATACTT
TTTTTCTTATAAATGACAATTTTCAGTTTTGTGACAAAATGTTATGTATAAAATAACTTC
GATCTATAAGAAGGAGATGTGTGTATCGAGAACAAAAACTTCAAAACATTGAAGATATAT
AGAAAATCGTTGACGAATTTGATTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DT95TF U 1
AF RR4DY80TF U 1
AF RR4DY80JQ C 137
AF RR4DT95JQ C 194
BS 1 572 RR4DT95TF
BS 573 597 RR4DY80TF
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BS 728 751 RR4DY80TF
BS 752 925 RR4DY80JQ

RD RR4DT95TF 572 0 0
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TGAGGGAGATGATAACGGTTCTTCTGAGTCGGAAGATTTTGAAGTTCATATTGATTTGAC
TGATGACCTCTTGCATATGGTGTTCTCGTTCTTGAATCACATCGACCTCTGTCGCTCTGC
TATGGTGTGTCGTCAGTGGAGAGTAGCTAGCTCTCATGACGAATTTTGGAAGGTCTTGAA
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QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4DY80TF 757 0 0
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TCACGATTCGTATCACAAACGTGCTAAAGTCTACTCTAGTGGCCTTGCTTGCAGTGATGC
TGGAAACTCTGGTTCGTCGGTGGAGAGAAGTGTGAGTTTTGGTGCTTCTTCTAGGACGGA
TGCTGATATGTTCTGTCAGAATTTCATCTTGAATTATAGTCGGAAAGATGGGAAGAAAGA
TGAGGGAGATGATAACGGTTCTTCTGAGTCGGAAGATTTTGAAGTTCATATTGATTTGAC
TGATGACCTCTTGCATATGGTGTTCTCGTTCTTGAATCACATCGACCTCTGTCGCTCTGC
TATGGTGTGTCGTCAGTGGAGAGTAGCTAGCTCTCATGACGAATTTTGGAAGGTCTTGAA
CTTTGAAAATACGAGGATTTCTATCGAGCAATTTGAAGACGTGTCTTCGCTATCCCAATG
CCACTGAAGTGAATGTTTATGGCACTCCTGCTGTTAACGCTCTGGCTATGAAAGCAGCTA
GTCTCTTTCTTCAGTCTTGTAACATGGATGAAGCAGGAGTTGAAGCAGCTATATCAG*AT
GCTGCTCACTAGAGACACTGGATCTCCGTTTCTGTCCGAAGACATCCTCGGTGAGCATGG
CGAGGTTCCGAGCAGTGTGTCCTAGTTTGAAGCGAGTCTTCAGCAGTCCAAATCTTGCAG
ATTAGG*ATTTGCGCATGGGAATGTTTTATT
TATACT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4DY80JQ 789 0 0
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CAGAATTTCATCTTGAATTATAGTCGGAAAGATGGGAAGAAAGATGAGGGAGATGATAAC
GGTTCTTCTGAGTCGGAAGATTTTGAAGTTCATATTGATTTGACTGATGACCTCTTGCAT
ATGGTGTTCTCGTTCTTGAATCACATCGACCTCTGTCGCTCTGCTATGGTGTGTCGTCAG
TGGAGAGTAGCTAGCTCTCATGACGAATTTTGGAAGGTCTTGAACTTTGAAAATACGAGG
ATTTCTATCGAGCAATTTGAAGACGTGTCTTCGCTATCCCAATGCCACTGAAGTGAATGT
TTATGGCACTCCTGCTGTTAACGCTCTGGCTATGAAAGCAGCTAGTCTCTTTCTTCAGTC
TTGTAACATGGATGAAGCAGGAGTTGAAGCAGCTATATCAGGATGCTGCTCACTAGAGAC
ACTGGATCTCCGTTTCTGTCCGAAGACATCCTCGGTGAGCATGGCGAGGTTCCGAGCAGT
GTGTCCTAGTTTGAAGCGAGTCTTCAGCAGTCCAAATCTTGCAGATTAGGGATTTGCGCA
TGGGAATGTTTTATTATATACTAGTATTGAGCATGGGAATACTTTTTTTCTTATAAATGA
CAATTTTCAGTTTTGTGACAAAATGTTATGTATAAAATAACTTCGATCTATAAGAAGGAG
ATGTGTGTATCGAGAACAAAAACTTCAAAACATTGAAGATATATAGAAAATCGTTGACGA
ATTTGATTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4DT95JQ 732 0 0
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AACGGTTCTTCTGAGTCGGAAGATTTTGAAGTTCATATTGATTTGACTGATGACCTCTTG
CATATGGTGTTCTCGTTCTTGAATCACATCGACCTCTGTCGCTCTGCTATGGTGTGTCGT
CAGTGGAGAGTAGCTAGCTCTCATGACGAATTTTGGAAGGTCTTGAACTTTGAAAATACG
AGGATTTCTATCGAGCAATTTGAAGACGTGTCTTCGCTATCCCAATGCCACTGAAGTGAA
TGTTTATGGCACTCCTGCTGTTAACGCTCTGGCTATGAAAGCAGCTAGTCTCTTTCTTCA
GTCTTGTAACATGGATGAAGCAGGAGTTGAAGCAGCTATATCAGGATGCTGCTCACTAGA
GACACTGGATCTCCGTTTCTGTCCGAAGACATCCTCGGTGAGCATGGCGAGGTTCCGAGC
AGTGTGTCCTAGTTTGAAGCGAGTCTTCAGCAGTCCAAATCTTGCAGATTAGGGATTTGC
GCATGGGAATGTTTTATTATATACTAGTATTGAGCATGGGAATACTTTTTTTCTTATAAA
TGACAATTTTCAGTTTTGTGACAAAATGTTATGTATAAAATAACTTCGATCTATAAGAAG
GAGATGTGTGTATCGAGAACAAAAACTTCAAAACATTGAAGATATATAGAAAATCGTTGA
CGAATTTGATTT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL3284Contig1 878 4 4 U
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TCGAAACCCTGACGACGACGACGACAGCCCCGACGCTCTGCTCCAACAACTGCGGCGTCA
CCGCGAGTCCTACAACCAACAACATGTGTCAGAAATGCTTCAACGCCTCCGTCGCCGCCG
CGTCCGTTGCGGACTCGAATCCGATCTCGAAGCGATCGGCCAGATCCGTCGGTCTCCGGT
CAACGCCGGCCAAAGTCGTGATCCGTCCCAGGGAGATCGAGATCGATCCGGTTAAGAGAG
ATCAGCAGCAGACGATTAACAGATGCTCCGGCTGTCGGAAGAAGGTCGGTTTGACCGGGT
TCAGGTGCCGATGCGGCGACATGTTCTGCTCCGAGCACCGGTACTCGGATCGCCACGATT
GCAGCTACGACTACAAGACCGCCGGTCGCGAGGCGATCGCTAGGGAGAATCCGGTGGTCA
AGGCGGCGAAGATGGTGAAATTGAGTTGATGTTCAGATCGGAGACGGAATCTTCTTCAGT
CGTGGTGGTGGTGGTGGTTCAACGAAGCTCCGATCAAGATCGGAGAAACGGAGGAGAGAC
ATCGGTGTTTAAAAAAAAACGAAGATGAGAGAGAATCATCTCCTGCTTGATTAAATCTGA
ACCTCATTTTATTTTTAATTATTTTTTTAGTGAATGATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTC
GTCTTTGCTTCGGATGTGATCTTTTCTCGATCATCAGGACAAAGTTGTCGAGAGTGGCAT
GTGTATGTAGATTCGCTAGAAATTAAGGGTGGTTTGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B112TF U 1
AF RR4AU55TF U 1
AF RR4B112JQ C 144
AF RR4AU55JQ C 147
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BS 818 818 RR4B112JQ
BS 819 863 RR4AU55TF
BS 864 878 RR4B112JQ

RD RR4B112TF 726 0 0
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GCAGCTACGACTACAAGACCGCCGGTCGCGAGGCGATCGCTAGGGAGAATCCGGTGGTCA
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ATCGGTGTTTAAAAAAAAACGAAGATGAGAGAGAATCATCTCCTGCTTGATTAAATCTGA
ACCTCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4AU55TF 863 0 0
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AAAAAAAATCATAAAAGATGGCGCAGAGAACGGAGAAGGAGGAGACGGAGTTCAAGGTCC
TCGAAACCCTGACGACGACGACGACAGCCCCGACGCTCTGCTCCAACAACTGCGGCGTCA
CCGCGAGTCCTACAACCAACAACATGTGTCAGAAATGCTTCAACGCCTCCGTCGCCGCCG
CGTCCGTTGCGGACTCGAATCCGATCTCGAAGCGATCGGCCAGATCCGTCGGTCTCCGGT
CAACGCCGGCCAAAGTCGTGATCCGTCCCAGGGAGATCGAGATCGATCCGGTTAAGAGAG
ATCAGCAGCAGACGATTAACAGATGCTCCGGCTGTCGGAAGAAGGTCGGTTTGACCGGGT
TCAGGTGCCGATGCGGCGACATGTTCTGCTCCGAGCACCGGTACTCGGATCGCCACGATT
GCAGCTACGACTACAAGACCGCCGGTCGCGAGGCGATCGCTAGGGAGAATCCGGTGGTCA
AGGCGGCGAAGATGGTGAAATTGAGTTGATGTTCAGATCGGAGACGGAATCTTCTTCAGT
CGTGGTGGTGGTGGTGGTTCAACGAAGCTCCGATCAAGATCGGAGAAACGGAGGAGAGAC
ATCGGTGTTTAAAAAAAAACGAAGATGAGAGAGAATCATCTCCTGCTTGATTAAATCTGA
ACCTCATTTTATTTTTAATTATTTTTTTAGTGAATGATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTC
GTCTTTGCTTCGGATGTGATCTTTTCTCGATCATCAG*ACAAAGTTGTCGAGAGTGGCAT
GTGTATGTAGATTCGCTAGAAAT

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4B112JQ 735 0 0
ACA
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TGTCAGAAATGCTTCAACGCCTCCGTCGCCGCCGCGTCCGTTGCGGACTCGAATCCGATC
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CCCAGGGAGATCGAGATCGATCCGGTTAAGAGAGATCAGCAGCAGACGATTAACAGATGC
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TGCTCCGAGCACCGGTACTCGGATCGCCACGATTGCAGCTACGACTACAAGACCGCCGGT
CGCGAGGCGATCGCTAGGGAGAATCCGGTGGTCAAGGCGGCGAAGATGGTGAAATTGAGT
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GGGTGGTTTGGC

QA 4 735 4 735
DS 

RD RR4AU55JQ 732 0 0
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TGTCAGAAATGCTTCAACGCCTCCGTCGCCGCCGCGTCCGTTGCGGACTCGAATCCGATC
TCGAAGCGATCGGCCAGATCCGTCGGTCTCCGGTCAACGCCGGCCAAAGTCGTGATCCGT
CCCAGGGAGATCGAGATCGATCCGGTTAAGAGAGATCAGCAGCAGACGATTAACAGATGC
TCCGGCTGTCGGAAGAAGGTCGGTTTGACCGGGTTCAGGTGCCGATGCGGCGACATGTTC
TGCTCCGAGCACCGGTACTCGGATCGCCACGATTGCAGCTACGACTACAAGACCGCCGGT
CGCGAGGCGATCGCTAGGGAGAATCCGGTGGTCAAGGCGGCGAAGATGGTGAAATTGAGT
TGATGTTCAGATCGGAGACGGAATCTTCTTCAGTCGTGGTGGTGGTGGTGGTTCAACGAA
GCTCCGATCAAGATCGGAGAAACGGAGGAGAGACATCGGTGTTTAAAAAAAAACGAAGAT
GAGAGAGAATCATCTCCTGCTTGATTAAATCTGAACCTCATTTTATTTTTAATTATTTTT
TTAGTGAATGATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTCGTCTTTGCTTCGGATGTGATCTTTTC
TCGATCATCAGGACAAAGTTGTCGAGAGTGGCATGTGTATGTAGATTCGCTAGAAATTAA
GGGTGGTTTGGC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL3285Contig1 984 4 12 U
GCGGATATGGGATGTGTTTCTCTCTGAGGGAGTTAAAATCGTGTTCAAAGTGGGCTTAGC
TTTGTTGAAGTATTGCCAAGATCAGCTGGTATCAAAGCGTTTGGAAGAACTGAAAGTGGA
CTATTGCCAAACCTGTTCAACCATAAGAAAACGGGTTAGGCTAATAACATGTACACATGC
GACTGGGATTCGAATTCTTTAATCATCTCTTATCTTTATCTTGTTGAAATGTATTCTTTC
TATCATCATTTTGGTCAAGTTGGGTGGGAATCTTCTTAGCAACTTCTGGGAAAGAAGAAG
GTATATATGCCCCAGCTTTGTGTAGATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTATTAAAAAAA
TCTCATTATTATTAATGTGAAAGGTATGGTTTTTTAAATCTCTTGCTTACAAAAGGAATA
AAAATGTGTGTTTGTTGCAAAATCTAATTTGAAAGAAATAATCATTTAACATGCAGAATG
ATTATTTCTCAGACGTGGTTTTTGCGACGGATTGTTCTCAATTGATGGGGGCAATGAATC
TCCGACGTAGCCTATTTCCTTTACATGTGAAGCGCTGATTTGGGCAATGGAGTGCACGAA
GACTCTGCAGTTCTCAGATGTGGTTTTTGCGACGGATTGTTCTCAATTGGTGAAGATGGT
GTCCTCACCCGAAGAATGGCCAGCATTTACTACGCATATGGAGGAATTTCGCCGAAGTAA
GACTTTTTTCCCTAATTTCAAGATCCGACATACTCAAAGGGCACAAAACACATTGGCGGA
CAAACTTGCTCATGGAGCAAGGAGTTCACCATCAGCTATGTTATATGTCGATTCGATCCC
TCCGGTTTGGCTCACTGAATCGGTGGAATCACGATAGAGTAGTTTTATTGTTGTCAAAAA
AAAAAAATAATAATCATTTAACGATTTGAGTAGAATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTA
TAAAATCTCGCTATTATTAATGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EZ75TF U 1
AF RR4EX19TF U 1
AF RR4EZ75JQ C 248
AF RR4EX19JQ C 273
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BS 742 760 RR4EX19TF
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GACTGGGATTCGAATTCTTTAATCATCTCTTATCTTTATCTTGTTGAAATGTATTCTTTC
TATCATCATTTTGGTCAAGTTGGGTGGGAATCTTCTTAGCAACTTCTGGGAAAGAAGAAG
GTATATATGCCCCAGCTTTGTGTAGATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTATTAAAAAAA
TCTCATTATTATTAATGTGAAAGGTATGGTTTTTTAAATCTCTTGCTTACAAAAGGAATA
AAAATGTGTGTTTGTTGCAAAATCTAATTTGAAAGAAATAATCATTTAACATGCAGAATG
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TCCGACGTAGCCTATTTCCTTTACATGTGAAGCGCTGATTTGGGCAATGGAGTGCACGAA
GACTCTGCAGTTCTCAGATGTGGTTTTTGCG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4EX19TF 766 0 0
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TTTGTTGAAGTATTGCCAAGATCAGCTGGTATCAAAGCGTTTGGAAGAACTGAAAGTGGA
CTATTGCCAAACCTGTTCAACCATAAGAAAACGGGTTAGGCTAATAACATGTACACATGC
GACTGGGATTCGAATTCTTTAATCATCTCTTATCTTTATCTTGTTGAAATGTATTCTTTC
TATCATCATTTTGGTCAAGTTGGGTGGGAATCTTCTTAGCAACTTCTGGGAAAGAAGAAG
GTATATATGCCCCAGCTTTGTGTAGATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTATTAAAAAAA
TCTCATTATTATTAATGTGAAAGGTATGGTTTTTTAAATCTCTTGCTTACAAAAGGAATA
AAAATGTGTGTTTGTTGCAAAATCTAATTTGAAAGAAATAATCATTTAACATGCAGAATG
ATTATTTCTCAGACGTGGTTTTTGCGACGGATTGTTCTCAATTGATGGGGGCAATGAATC
TCCGACGTAGCCTATTTCCTTTACATGTGAAGCGCTGATTTGGGCAATGGAGTGCACGAA
GACTCTGCAGTTCTCAGATGTGGTTTTTGCGACGGATTGTTCTCAATTGGTGAAGATGGT
GTCCTCACCCGAAGAATGGCCAGCATTTACTACGCATATGGAGGA*TTTCGTCGA*GTAA
GACTTTTT*CCCTAATTTCA*GATCCGACATACTCAAAGG
CAAAAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4EZ75JQ 737 0 0
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TGCCCCAGCTTTGTGTAGATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTATTAAAAAAATCTCATT
ATTATTAATGTGAAAGGTATGGTTTTTTAAATCTCTTGCTTACAAAAGGAATAAAAATGT
GTGTTTGTTGCAAAATCTAATTTGAAAGAAATAATCATTTAACATGCAGAATGATTATTT
TTCAGACGTGGTTTTTGCGACGGATTGTTCTCAATTGATGGGGGCAATGAATTTCCGACG
TAGCCTATTTCCTTTACATGTGAAGCGCTGATTTGGGCAATGGAGTGCACGAAGACTCTG
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CCCGAAGAATGGCCAGCATTTACTACGCATATGGAGGAATTTCGCCGAAGTAAGACTTTT
TTCCCTAATTTCAAGATCCGACATACTCAAAGGGCACAAAACACATTGGCGGACAAACTT
GCTCATGGAGCAAGGAGTTCACCATCAGCTATGTTATATGTCGATTCGATCCCTCCGGTT
TGGCTCACTGAATCGGTGGAATCACGATAGAGTAGTTTTATTGTTGTCAAAAAAAAAAAA
TAATAATCATTTAACGATTTGAGTAGAATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTATAAAATC
TCGCTATTATTAATGTG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4EX19JQ 712 0 0
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TACTGACTTGTGCTTTGTATTAAAAAAATCTCATTATTATTAATGTGAAAGGTATGGTTT
TTTAAATCTCTTGCTTACAAAAGGAATAAAAATGTGTGTTTGTTGCAAAATCTAATTTGA
AAGAAATAATCATTTAACATGCAGAATGATTATTTTTCAGACGTGGTTTTTGCGACGGAT
TGTTCTCAATTGATGGGGGCAATGAATTTCCGACGTAGCCTATTTCCTTTACATGTGAAG
CGCTGATTTGGGCAATGGAGTGCACGAAGACTCTGCAGTTTTCAGATGTGGTTTTTGCGA
CGGATTGTTCTCAATTGGTGAAGATGGTGTCCTCACCCGAAGAATGGCCAGCATTTACTA
CGCATATGGAGGAATTTCGCCGAAGTAAGACTTTTTTCCCTAATTTCAAGATCCGACATA
CTCAAAGGGCACAAAACACATTGGCGGACAAACTTGCTCATGGAGCAAGGAGTTCACCAT
CAGCTATGTTATATGTCGATTCGATCCCTCCGGTTTGGCTCACTGAATCGGTGGAATCAC
GATAGAGTAGTTTTATTGTTGTCAAAAAAAAAAAATAATAATCATTTAACGATTTGAGTA
GAATAGATATACTGACTTGTGCTTTGTATAAAATCTCGCTATTATTAATGTG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 4

CO CL3286Contig1 1034 4 8 U
GGACCGGAGATCATTATTTATTAGTGATGAGGAACATCATTGCCTTGAGCAAACGTCTAT
ACTCCCCTCGATTCTCCTCCTCCGGTTATCACGGAATCAACGATGCGGTATCAAAATCTG
TTTTCTCCGGTCCGATCCTTGGACGATCGTTTCAGAACCTCCGCAAGGCCGGGAGCTTCG
TAGTCCCTCGTGTCTTTCGTGTCGCGAAACCTATCGACGAATGTTTCTTCTTCTTCGAAA
CAACCTGCGTTTCTACGATGGTATTTGAGAAAGTTGGAGTCGCACCCTTTCATGACTAAG
AGCCTCACTACTTCCCTCATTTATATGGCCGCCGATCTCACTTCTCAGATGATCACGATG
CAGCCATCTGGTTCTTATGACCTGATAAGAACAGCCAGAATGGCTAGCTTTGGGTTGATA
TTCCTCGGCCCATCACAGCATCTTTGGTTCAGTTATCTCTCTAGAATACTGCCAAAGCGT
GATGTGTTGACTACCGTTAAGAAAATTATGATGGGGCAGTTTCTTTTCGGACCTTTTAGC
AACACCGTCTTCTATTCCTATAATGCTGCTTTACAAGGTGAAAATTCCGAGGAAATTCTG
GCGAGACTGAAGCGGGATCTTCTGCCAACATTGAGAAATGGACTTATATATTGGCCAGTC
TGTGATTTTGTGACATTCAAGTATGTGCCCGTTCATCTCCAGCCATTGATGAATAGCTCG
TGTGCATATATATGGACCATTTATTTGACGTATATGGCAAACCAGACAAAAGCAGATGGC
TGAATGACTGTTCTTGACCAAGACAATTGCATTTATTTTTATTTTTTTTTGTTTTTGCTA
AATTTTACTTTCTTATTATCCAACATCGAATAGTATTACAAGTATGTTTTTTTCTTTTCT
TGGGCAACAAAAATTTTGCATCTTGATCCAAGCATAGTGATACAAGTTGTGTATCAAGTC
AGAGCAAAAACAGAGGATATAAAAACCACATATTTCTTGATAATCAATGTTTGCAAGTAA
TAACAAATCTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CU73TF U 1
AF RR4CU73JQ C 386
AF RR4AR64JQ C 323
AF RR4AR64TF U 323
BS 1 529 RR4CU73TF
BS 530 530 RR4AR64TF
BS 531 762 RR4CU73TF
BS 763 763 RR4AR64TF
BS 764 770 RR4CU73TF
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BS 772 791 RR4CU73TF
BS 792 1034 RR4AR64TF

RD RR4CU73TF 799 0 0
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ACTCCCCTCGATTCTCCTCCTCCGGTTATCACGGAATCAACGATGCGGTATCAAAATCTG
TTTTCTCCGGTCCGATCCTTGGACGATCGTTTCAGAACCTCCGCAAGGCCGGGAGCTTCG
TAGTCCCTCGTGTCTTTCGTGTCGCGAAACCTATCGACGAATGTTTCTTCTTCTTCGAAA
CAACCTGCGTTTCTACGATGGTATTTGAGAAAGTTGGAGTCGCACCCTTTCATGACTAAG
AGCCTCACTACTTCCCTCATTTATATGGCCGCCGATCTCACTTCTCAGATGATCACGATG
CAGCCATCTGGTTCTTATGACCTGATAAGAACAGCCAGAATGGCTAGCTTTGGGTTGATA
TTCCTCGGCCCATCACAGCATCTTTGGTTCAGTTATCTCTCTAGAATACTGCCAAAGCGT
GATGTGTTGACTACCGTTAAGAAAATTATGATGGGGCAGTTTCTTTTCGTACCTTTTAGC
AACACCGTCTTCTATTCCTATAATGCTGCTTTACAAGGTGAAAATTCCGAGGAAATTCTG
GCGAGACTGAAGCGGGATCTTCTGCCAACATTGAGAAATGGACTTATATATTGGCCAGTC
TGTGATTTTGTGACATTCAAGTATGTGCCCGTTCATCTCCAGCCATTGATGAATAGCTCG
TGTGCATATATATGGACCATTTATTTGACGTATATGGCAAAC*AGACAAA*GCAGATGGC
TGAATGACTGT
CTGACCAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4CU73JQ 498 0 0
TAAGAACAGCCAGAATGGCTAGCTTTGGGTTGATATTCCTCGGCCCATCACAGCATCTTT
GGTTCAGTTATCTCTCTAGAATACTGCCAAAGCGTGATGTGTTGACTACCGTTAAGAAAA
TTATGATGGGGCAGTTTCTTTTCGTACCTTTTAGCAACCCCGTCTTCTATTCCTATAATG
CTGCTTTACAAGGTGAAAATTCCGAGGAAATTCTGGCGAGACTGAAGCGGGATCTTCTGC
CAACATTGAGAAATGGACTTATATATTGGCCAGTCTGTGATTTTGTGACATTCAAGTATG
TGCCCGTTCATCTCCACCCATTGATGAATAGCTCGTGTGCATATATATGGACCATTTATT
TGACGTATATGGCAAACCAGACAAAAGCAGATGGCTGAATGACTGTTCTTGACCAAGACA
ATTGCATTTATTTTTATTTTTTTTTGTTTTTGCTAAATTTTACTTTCTTATTATCCAACA
TCAAATAGTATTACAAG
C

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4AR64JQ 712 0 0
GC
ATGGCCGCCGATCTCACTTCTCAGATGATCACGATGCAGCCATCTGGTTCTTATGACCTG
ATAAGAACAGCCAGAATGGCTAGCTTTGGGTTGATATTCCTCGGCCCATCACAGCATCTT
TGGTTCAGTTATCTCTCTAGAATACTGCCAAAGCGTGATGTGTTGACTACCGTTAAGAAA
ATTATGATGGGGCAGTTTCTTTTCGGACCTTTTAGCAACACCGTCTTCTATTCCTATAAT
GCTGCTTTACAAGGTGAAAATTCCGAGGAAATTCTGGCGAGACTGAAGCGGGATCTTCTG
CCAACATTGAGAAATGGACTTATATATTGGCCAGTCTGTGATTTTGTGACATTCAAGTAT
GTGCCCGTTCATCTCCAGCCATTGATGAATAGCTCGTGTGCATATATATGGACCATTTAT
TTGACGTATGTGGCAAACCAGACAAAAGCAGATGGCTGAATGACTGTTCTTGACCAAGAC
AATTGCATTTATTTTTATTTTTTTTTGTTTTTGCTAAATTTTACTTTCTTATTATCCAAC
ATCGAATAGTATTACAAGTATGTTTTTTTCTTTTCTTGGGCAACAAAAATTTTGCATCTT
GATCCAAGCATAGTGATACAAGTTGTGTATCAAGTCAGAGCAAAAACAGAGGATATAAAA
ACCACATATTTCTTGATAATCAATGTTTGCAAGTAATAACAAATCTCACG

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR4AR64TF 712 0 0
GC
ATGGCCGCCGATCTCACTTCTCAGATGATCACGATGCAGCCATCTGGTTCTTATGACCTG
ATAAGAACAGCCAGAATGGCTAGCTTTGGGTTGATATTCCTCGGCCCATCACAGCATCTT
TGGTTCAGTTATCTCTCTAGAATACTGCCAAAGCGTGATGTGTTGACTACCGTTAAGAAA
ATTATGATGGGGCAGTTTCTTTTCGGACCTTTTAGCAACACCGTCTTCTATTCCTATAAT
GCTGCTTTACAAGGTGAAAATTCCGAGGAAATTCTGGCGAGACTGAAGCGGGATCTTCTG
CCAACATTGAGAAATGGACTTATATATTGGCCAGTCTGTGATTTTGTGACATTCAAGTAT
GTGCCCGTTCATCTCCAGCCATTGATGAATAGCTCGTGTGCATATATATGGACCATTTAT
TTGACGTATGTGGCAAACCAGACAAAAGCAGATGGCTGAATGACTGTTCTTGACCAAGAC
AATTGCATTTATTTTTATTTTTTTTTGTTTTTGCTAAATTTTACTTTCTTATTATCCAAC
ATCGAATAGTATTACAAGTATGTTTTTTTCTTTTCTTGGGCAACAAAAATTTTGCATCTT
GATCCAAGCATAGTGATACAAGTTGTGTATCAAGTCAGAGCAAAAACAGAGGATATAAAA
ACCACATATTTCTTGATAATCAATGTTTGCAAGTAATAACAAATCTCACG

QA 3 712 3 712
DS 



AS 1 4

CO CL3287Contig1 1360 4 33 U
AGAACGTTTTGGCAGTATATATAAAAATCTCTACGTAGCTTGCTTACCCAATGAGATGAC
CATTCTGTTTCATTTCACCTCTAGTCTCAGAAAAGATACAATCAGTAATCTTCTGACCCA
ATGAATCTAGCTTTTTAAGGGTTTATGTAAATTTCAAATGTGGGACACACAATGCAAATT
CCATTCGCCTTCCACGTCTTGTCAAGTCTCGGGAAAAAAACATCAGGAGTAATGATCGAG
TGACCTTGAAAAGAGATATCTCAGTCTCTGTAGAGAACAAAGTTGGCGATGTCGTTTAGT
CCAGCATCTTTGTAGCACTGAGCAACCCGTTCCAGTGACTCGTCCCATGTCCCTTCAAGT
GACACTAGATCCAATAACAACCCAGCCTCGTCGTAAGATGCCTGAGCCCTTGGCTTTCCC
CTAGATATATCCCGTTGTCGTCCTTCTCCTGTAACTTTCTCTTTGTACTGCACAATTTGC
TCTTCTCCCAACTCTGCTATTCGAGCAATTTCCTCGTATCTACATCCTAAGGTCCACCAC
GAAGATTTCAAAGCACCCCTAGCCGCATCTTTCGCTTCTAAGCTACGCCCAAGTTTTAGC
AAAACCTTTGCGTTGAAAGCAAAAGGCCGAGCAAATCCGGGAAAGTTTCCTCTCTTTGTA
TAAAACTCGGCAGCCACCAAAGCTGAAACATGGTCTCCATTCTCAATATGTCGAATAACT
TTGCGTTCTAGAGAATCTGGAAACAGTCCAACCTTTCTTAAAAGATAGAGATCTAAATCC
ATCAGTTCTGATCTGACAAAGTCACCCTTACTGTAAAGTTTCTTCCCAGCTTCACCTGCA
GCATCGAAGATCACTTGGCTGGATTCCAAGGGTTTAGAGATATCTTCTTCCACCAATATT
CTGTGAATGAACTGATCAACATTATTGGCTAAAAACCAAACCCCATGTTTCTGAACTTCC
ACCACAGGCATCTCCATACTAGGACGAGCTGTTGGCCACCGTAGTAGAGCGATTGAAGAA
CCGGGGCTCATCCTCACCAATGGAATAGTAAGAGGCAACAAACCTTGCTTAGCACCTGGA
GAAACTATGGATTTGCCTCTAGCTGTGAAAATGCTAATCAGCTGATTCAAATGCTGAGGA
GGATGAGCTTTGGCTACCTCCTTGATGAAACATTCATGATCAGATAATGGAGAAGAAGAA
GAGGAAAATGATCTGGCGGCGAAGCTCCTGCCTACGCCAAGTATCAGTCGTCGATTCCGT
CCGTTAACTACCGCGCCGCAGTGCATCTTCAAGTTTTTCCGATCGTTTCTCTTCCGATGT
GATGATAATACAGTCGTACAGTACAGAGAAGACGCACTCC


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DC44JQ U 53
AF RR4EM43JQ U 1
AF RR4EM43TF C 618
AF RR4DC44TF C 840
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BS 453 453 RR4DC44JQ
BS 454 539 RR4EM43JQ
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BS 541 550 RR4EM43JQ
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BS 582 756 RR4EM43JQ
BS 757 868 RR4EM43TF
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BS 870 933 RR4EM43TF
BS 934 934 RR4DC44TF
BS 935 1031 RR4EM43TF
BS 1032 1032 RR4DC44TF
BS 1033 1070 RR4EM43TF
BS 1071 1071 RR4DC44TF
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BS 1171 1171 RR4DC44TF
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BS 1187 1187 RR4DC44TF
BS 1188 1197 RR4EM43TF
BS 1198 1200 RR4DC44TF
BS 1201 1224 RR4EM43TF
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BS 1332 1360 RR4DC44TF

RD RR4DC44JQ 565 0 0
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CTGACCCAATGAATCTAGCTTTTTAAGGGTTTATGTAAATTTCAAATGTGGGACACACAA
TGCAAATTCCATTCGCCTTCCACGTCTTGTCAAGTCTCGGGAAAAAAACATCAGGAGTAA
TGATCGAGTGACCTTGAAAAGAGATATCTCAGTCTCTGTAGAGAACAAAGTTGGCGATGT
CGTTTAGTCCAGCATCTTTGTAGCACTGAGCAACCCGTTCCAGTGACTCGTCCCATGTCC
CTTCAAGTGACGCTAGATCCAATAACAACCCAGCCTCGTCGTAAGATGCCTGGGCCCTTG
GCTTTCCCCTAGATATATCCCGTTGTCGTCCTTCTCCTGTAACTTTCTCTTTGTACTGCA
CAATTTGCTCTTCTCCCAACTCTGCTATTCGAGCAATTTCCTCGTATCTACATCCTAAGG
TCCACCACGAAGATTTCAAAGCACCCCTAGCCGCATCTTTCGCTTCTAAGCTACGCCCAA
GTTTTAGCAAAACCTTTGCGTTGAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4EM43JQ 756 0 0
AGAACGTTTTGGCAGTATATATAAAAATCTCTACGTAGCTTGCTTACCCAATGAGATGAC
CATTCTGTTTCATTTCACCTCTAGTCTCAGAAAAGATACAATCAGTAATCTTCTGACCCA
ATGAATCTAGCTTTTTAAGGGTTTATGTAAATTTCAAATGTGGGACACACAATGCAAATT
CCATTCGCCTTCCACGTCTTGTCAAGTCTCGGGAAAAAAACATCAGGAGTAATGATCGAG
*GACCTTGAAAAGAGATATCTCAGTCTCTGTAGAGAACAAAGTTGGCGATGTCGTTTAGT
CCAGCATCTTTGTAGCACTGAGCAACCCGTTCCAGTGACTCGTCCCATGTCCCTTCAAGT
GACACTAGATCCAGTAACAACCCAGCCTCGTCGTAAGATGCCTGAGCCCTTGGCTTTCCC
CTAGATATATCCCGTTGTCGTCCTTCTCCTGTGACTTTCTCTTTGTACTGCACAATTTGC
TCTTCTCCCAACTCTGCTATTCGAGCAATTTCCTCGTATCTACATCCTAAGGTCCACCAT
GAAGATTTCAGAGCACCCCTAGCCGCATCTTTCGCTTCTAGGCTACGCCCAAGTTTTAGC
AAAACCTTTGCGTTGAAAGCAAAAGGCCGAGCAAATCCGGGAAAGTTTCCTCTCTTTGTA
TAAAACTCGGCAGCCACCAAAGCTGAAACATGGTCTCCATTCTCAATATGTCGAATAACT
TTGCGTTCTAGAGAATCTGGAAACAGTCCAACCTTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4EM43TF 716 0 0
AAGC
AAAGGCCGAGCAAATCCGGGAAAGTTTCCTCTCTTTGTATAAA*CTCGGCAGCCACCAAA
GCTGAAACATGGTCTCCATTCTCAATATGTCGAATAACTTTGCGTTCTAGAGAATCTGGA
AACAGTCCAACCTTTCTTAAAAGATAGAGATCTAAATCCATCAGTTCTGATCTGACAAAG
TCACCCTTACTGTAAAGTTTCTTCCCAGCTTCACCTGCAGCATCGAAGATCACTTGGCTG
GATTCCACGGGTTTAGAGATATCTTCTTCCACCAATATTCTGTGAATGAACTGATCAACA
TTATTGGCTAAATACCAAACCCCATGTTTCTGAACTTCCACCACAGGCATCTCCATACTA
GGACGAGCTGTTGGCCACCGTAGTAGAGCGATTGAAGAACCGGGGCTCATTCTCACCAAT
GGAATAGTAAGAGGCAACAAACCTTGCTTGGCACCTGGAGAAACTATGGATTTGCCTCTA
GCTGTGAAAATGCTAATCAGCTGATTCAAATGCTGAGGAGGATGAGCTTTGGCTACCTCC
TTGATGAAATATTCATGATCAGATAGTGGAGAAGAA***GAGGAAAATGATCTGGCGGCG
AAGTTCCTGCCTACGCCAAGTATCAGTCGTCGATTCCGTCCGTTAACTACCGCGCCGCAG
TGCATCTTCAAGTTTTTCCGATCGTTTCTCTTCCGATGTGGTGATAATAC
CC

QA 5 714 5 714
DS 

RD RR4DC44TF 521 0 0
AGCATCGAAGATCACTTGGCTGGATTCCGAGGGTTTAGAGATATCTTCTTCCACCAATAT
TCTGTGAATGAACTGATCAACATTATTGGCTAAAAACCAAACCCCATGTTTCTGAACTTC
CACCACAGGCATCTCCATACTAGGACGAGCTGTTGGCCACCGTAGTAGAGCGATTGAAGA
ACCGGGGCTCATCCTCACCAATGGAATAGTAAGAGGCAACAAACCTTGCTTAGCACCTGG
AGAAACTATGGATTTGCCTCTGGCTGTGAAAATGCTAATCAGCTGATTCAAATGCTGAGG
AGGCTGAGCTTTGGCTACCTCCTTGATGAAACATTCATGATCAGATAATGGAGAAGAAGA
AGAGGAAAATGATCTGGCGGCGAAGCTCCTGCCTACGCGAAGTATCAGTCGTCGATTCCG
TCCGTTAACTACCGCGCCGCAGTGCATCTTCAAGTTTTTCCGATCGTTTCTCTTCCGATG
TGATGATGATACAGTCGTACAGTACAGAGAAGACGCACTCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL3288Contig1 1042 2 8 U
GGGAGCTTCTTCTTCTTCAATACAAAGTCAGGCAAAAGTCAGAGAGAGAGACGTCGTCGC
GATTCTAGGCTCTCTTCCATCCACGATCAGACTTTTCTCTCTCTCATTTTTTTCTCGGTC
AGAGGAATAGAAGAAGATAAAAAGGGATACATGGCTGGATGATAAGAGCCTCATCTCCGG
AGGAGTTTCAGAGTTTTTTTGTTTTTATTAAAAGATGGCAGTCTCTTTCCCTCGTCTTCC
GAGGTGGTTGTGTGGTGGTAACTCTAAAGAGAGAGACAAGAAAAAGTCCAGAGGATCCTC
CTCTTCACTGAAGAAGAAGATTTATAATAATAATAAGACTGGATCTTCTTCTTCTTCTAC
GGTAAAGAAGATTAAGAGAGGATGGATTGGAAGAGGAGGATCAGGAGGAGAGGAGGAGAA
GATTGGGAACGTTGTCTTTCCTCAACCTGATGATCCTGAGTGGTCTATTGGCTGGGTCGA
GCCACATGGACCAGGGTTTAAATGTGAGGATGATACTGGTGGTGGTGGTGGGTTTGTGGT
TCTTGTTCCTTGTTACAAGAAATTAATTGATGGTTCAGGGAATCATATTCCAAGCGGCGG
CTTCTTCTCTCCTGCTCCTGATGGGAAGAATATGGAACAGTGGCTGTCGTCTATGGGGAA
GCTGTAATAAACTGGAGGATTGGCAAGATCAAGACTGTTTCTCATGTTATTTTCAGTTTC
AAAATAAAGAATCGAATAATCAAAAAAGAAAAAAGAGGCAATGATTCGTGGATTAGCTTA
TGGAGAAGTCTTGTGATTTTCTGTTGCAAGTGAGTGACACCAAAACATCAAGTCATCTCT
CAAGAATCTACTACTAATGGACAAAGGCGATGCTGATGGAGACTTGCCAACATAAAAGAT
TGAATGAAGAACAATGAATTGGTATGATATAAAATATGATTTGAGTATTGGATATTTTTA
ATGTGGGCTGATTCAAATGAAAGCGTTTTCTGCTTCTGTGGTCGAGATTATTGGCCGTGG
AAATAAATGTTTTTTCTGTGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ48TF U 1
AF RR4BL09JQ C 233
BS 1 363 RR4DJ48TF
BS 364 364 RR4BL09JQ
BS 365 396 RR4DJ48TF
BS 397 397 RR4BL09JQ
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BS 400 402 RR4BL09JQ
BS 403 514 RR4DJ48TF
BS 515 1042 RR4BL09JQ

RD RR4DJ48TF 514 0 0
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GATTCTAGGCTCTCTTCCATCCACGATCAGACTTTTCTCTCTCTCATTTTTTTCTCGGTC
AGAGGAATAGAAGAAGATAAAAAGGGATACATGGCTGGATGATAAGAGCCTCATCTCCGG
AGGAGTTTCAGAGTTTTTTTGTTTTTATTAAAAGATGGCAGTCTCTTTCCCTCGTCTTCC
GAGGTGGTTGTGTGGTGGTAACTCTAAAGAGAGAGACAAGAAAAAGTCCAGAGGATCCTC
CTCTTCACTGAAGAAGAAGATTTATAATAATAATAAGACTGGATCTTCTTCTTCTTCTAC
GGTGAAGAAGATTAAGAGAGGATGGATTGGAAGAGGTGG**GAGGAGGAGAGGAGGAGAA
GATTGGGAACGTTGTCTTTCCTCAACCTGATGATCCTGAGTGGTCTATTGGCTGGGTCGA
GCCACATGGACCAGGGTTTAAATGTGAGGATGAT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4BL09JQ 810 0 0
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GGATCCTCCTCTTCACTGAAGAAGAAGATTTATAATAATAATAAGACTGGATCTTCTTCT
TCTTCTACGGTAAAGAAGATTAAGAGAGGATGGATTGGAAGAGGAGGATCAGGAGGAGAG
GAGGAGAAGATTGGGAACGTTGTGTTTCCTCAACCTGATGATCCTGAGTGGTCTATTGGC
TGGGTCGAGCCACATGGACCAGGGTTTAAATGTGAGGATGATACTGGTGGTGGTGGTGGG
TTTGTGGTTCTTGTTCCTTGTTACAAGAAATTAATTGATGGTTCAGGGAATCATATTCCA
AGCGGCGGCTTCTTCTCTCCTGCTCCTGATGGGAAGAATATGGAACAGTGGCTGTCGTCT
ATGGGGAAGCTGTAATAAACTGGAGGATTGGCAAGATCAAGACTGTTTCTCATGTTATTT
TCAGTTTCAAAATAAAGAATCGAATAATCAAAAAAGAAAAAAGAGGCAATGATTCGTGGA
TTAGCTTATGGAGAAGTCTTGTGATTTTCTGTTGCAAGTGAGTGACACCAAAACATCAAG
TCATCTCTCAAGAATCTACTACTAATGGACAAAGGCGATGCTGATGGAGACTTGCCAACA
TAAAAGATTGAATGAAGAACAATGAATTGGTATGATATAAAATATGATTTGAGTATTGGA
TATTTTTAATGTGGGCTGATTCAAATGAAAGCGTTTTCTGCTTCTGTGGTCGAGATTATT
GGCCGTGGAAATAAATGTTTTTTCTGTGGC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 4

CO CL3289Contig1 1196 4 7 U
GGATTACTCATTTGAGTGAGAAAACTTCATTCCTCAGAGACATGTGGGAAGACACGAGTT
TCCAGCTGGAGAAGCTTCAGCGGCTGGCGTCTTGTGTGGAGATGGAGAAAGAAGGTTTGA
AGTTGAGGCATGAGCCTAACTGGAAACTCTCATTTACTCCTTCCTGGACCAATGATAGTT
ATATGTCTAAGGATGCTAAACCGAAGGTAGCTGTGATCCGAGAGGAAGGCAGCAATGGAG
ACAGGGAAATGTCAGCCGCATTCTACGCTGCTGGTTTTGAACCGTGGGACGTGACAGTGT
CTGACCTTCTAGCTGGAGCAATCACTCTTGACCAGTTCCGTGGGATTGTGTTTGTTGGAG
GGTTTAGTTACGCTGATGTACTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCAATAAGGTTCA
ACGAGCCACTCC*TAAGCCAGTT*CCAAGAGTTCTACAAGAGACCAGACACGTTCAGCC*
TCGGAATCTGCAATGGTTGTCAGCTAATGGCCTTGTTAGGATGGGTTCCAGGCCC*TCAA
GTCGGCGGGTCGCTCGACACGGCGCAGCCTAGGTTCGTTCACAACGAGTCGGGAAGGTTT
GAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCATCAAGGACTCGCCGTCTATAATGCTGAAAGGGATG
GAGGGAAGCACCTTGGGAGTTTGGGCGGCTCATGGAGAAGGAAGGGCGTATTTCCCGGAC
GAAGGAGTCTTGGACCGTATGCTTCACTCGGATTTGG*CTCCGTTGAGATACTGTGATGA
TGATGGGAGTGTCACTGAAGCTTACCCTTTTAACCTCAATGGTTCACCGTTGGGGATAGC
TGCTATATGCTCGCCTGATGGGAGACATCTTGCGATGATGCCTCATCCTGAACGTTGTTT
CTTGATGTGGCAGTACCCGTGGTACCCGAAGAGCTGGGAGGTTGAGAAAGCTGGGCCTAG
TCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCTAGGGACTGGTGCTCTCAGCTTTAGAGTTGTCT
TCAAGCATGTGGCGTTATAAAATCTTTTTCTACAGCATTTTGTTATGCGTTTGGTATTTG
CCGGGCTTTCAAAAGTTGGTTGCATCTTTTGTTTGGTGAGGGTGTTCGACACTTTTTTGC
TTTAATTGATATACATTTTTCATATGAAGAAGGTAAAAAAGTAATAATTCTCTAGG


BQ
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AF RR4BD09TF U 1
AF RR4B474TF U 373
AF RR4B474JQ C 310
AF RR4BD09JQ C 344
BS 1 757 RR4BD09TF
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BS 759 828 RR4BD09TF
BS 829 862 RR4B474TF
BS 863 1049 RR4B474JQ
BS 1050 1050 RR4BD09JQ
BS 1051 1196 RR4B474JQ

RD RR4BD09TF 828 0 0
GGATTACTCATTTGAGTGAGAAAACTTCATTCCTCAGAGACATGTGGGAAGACACGAGTT
TCCAGCTGGAGAAGCTTCAGCGGCTGGCGTCTTGTGTGGAGATGGAGAAAGAAGGTTTGA
AGTTGAGGCATGAGCCTAACTGGAAACTCTCATTTACTCCTTCCTGGACCAATGATAGTT
ATATGTCTAAGGATGCTAAACCGAAGGTAGCTGTGATCCGAGAGGAAGGCAGCAATGGAG
ACAGGGAAATGTCAGCCGCATTCTACGCTGCTGGTTTTGAACCGTGGGACGTGACAGTGT
CTGACCTTCTAGCTGGAGCAATCACTCTTGACCAGTTCCGTGGGATTGTGTTTGTTGGAG
GGTTTAGTTACGCTGATGTACTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCAATAAGGTTCA
ACGAGCCACTCC*TAAGCCAGTT*CCAAGAGTTCTACAAGAGACCAGACACGTTCAGCC*
TCGGAATCTGCAATGGTTGTCAGCTAATGGCCTTGTTAGGATGGGTTCCAGGCCC*TCAA
GTCGGCGGGTCGCTCGACACGGCGCAGCCTAGGTTCGTTCACAACGAGTCGGGAAGGTTT
GAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCATCAAGGACTCGCCGTCTATAATGCTGAAAGGGATG
GAGGGAAGCACCTTGGGAGTTTGGGCGGCTCATGGAGAAGGAAGGGCGTATTTCCCGGAC
GAAGGAGTCTTGGACCGTATGCTTCACTCGGATTTGGGCTCCGTTGAGATACTGTGATGA
TGATGGGAGTGTCACTGAAGCTTACCCTTTTAACCTCAATGGTTCACC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4B474TF 492 0 0
CTGATGTACTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCAATAAGGTTCAACGAGCCACTCC
CTAAGCCAGTTTCCAAGAGTTCTACAAGAGACCAGACACGTTCAGCCCTCGGAATCTGCA
ATGGTTGTCAGCTAATGGCCTTGTTAGGATGGGTTCCAGGCCCCTCAAGTCGGCGGGTCG
CTCGACACGGCGCAGCCTAGGTTCGTTCACAACGAGTCGGGAAGGTTTGAGTGCAGGTTC
ACAAGCGTGACCATCAAGGACTCGCCGTCTATAATGCTGAAAGGGATGGAGGGAAGCACC
TTGGGAGTTTGGGCGGCTCATGGAGAAGGAAGGGCGTATTTCCCGGACGAAGGAGTCTTG
GACCGTATGCTTCACTCGGATTTGG*CTCCGTTGAGATACTGTGATGATGATGGGAGTGT
CACTGAAGCTTACCCTTTTA*CCTCAATGGTTCACCGTTGGGGATAGCTGCTATATGCTC
GCCTGATGGG
GA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4B474JQ 887 0 0
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CTCGCCTGATGGGAGACATCTTGCGATGATGCCTCATCCTGAACGTTGTTTCTTGATGTG
GCAGTACCCGTGGTACCCGAAGAGCTGGGAGGTTGAGAAAGCTGGGCCTAGTCCGTGGTT
GAAGATGTTCCAGAATGCTAGGGACTGGTGCTCTCAGCTTTAGAGTTGTCTTCAAGCATG
TGGCGTTATAAAATCTTTTTTTACAGCATTTTGTTATGCGTTTGGTATTTGCCGGGCTTT
CAAAAGTTGGTTGCATCTTTTGTTTGGTGAGGGTGTTCGACACTTTTTTGCTTTAATTGA
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DS 

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TGCTTCAATAAGGTTCAACGAGCCACTCC*TAAGCCAGTT*CCAAGAGTTCTACAAGAGA
CCAGACACGTTCAGCC*TCGGAATCTGCAATGGTTGTCAGCTAATGGCCTTGTTAGGATG
GGTTCCAGGCCC*TCAAGTCGGCGGGTCGCTCGACACGGCGCAGCCTAGGTTCGTTCACA
ACGAGTCGGGAAGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCATCAAGGACTCGCCGTCTA
TAATGCTGAAAGGGATGGAGGGAAGCACCTTGGGAGTTTGGGCGGCTCATGGAGAAGGAA
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TTGAGATACTGTGATGATGATGGGAGTGTCACTGAAGCTTACCCTTTTAACCTCAATGGT
TCACCGTTGGGGATAGCTGCTATATGCTCGCCTGATGGGAGACATCTTGCGATGATGCCT
CATCCTGAACGTTGTTTCTTGATGTGGCAGTACCCGTGGTACCCGAAGAGCTGGGAGGTT
GAGAAAGCTGGGCCTAGTCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCTAGGGACTGGTGCTCT
CAGCTTTAGAGTTGTCTTCAAGCATGTGGCGTTATAAAATCTTTTTCTACAGCATTTTGT
TATGCGTTTGGTATTTGCCGGGCTTTCAAAAGTTGGTTGCATCTTTTGTTTGGTGAGGGT
GTTCGACACTTTTTTGCTTTAATTGATATACATTTTTCATATGAAGAAGGTAAAAAAGTA
ATAATTCTCTAGG

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 3

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AACCAAAAGCAAAGCTTCTGTACAAGTTGCTTACAACCTAACCAAAATTTTCAATCTTTT
TTTCTTTTCTTATTAAAAATTTGAAGGTACTATTGAATAATGACGACTTTTTTTATGTTA
ATGTACTTCTCTTTGAACGATTTTGCTCATCCTAAAATATGAATATCCCGGCGGAGTTAC
TCTGCTCGCCGGCACAAGGAGAGCTTGAAATGTCGACGTTTATGGAGATTTGCGATTTAC
ATTTCTCATTTCGTTCGTCCTGCATTATCTGCACTGATCTGCACTCTGCACTGCAGAATC
CCATCTCTCCTTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAAC
ACGCGCTCAGAAACTCTGTCGATTCCCTAAAAACCTCTCTCTTAATAACCGGCGGTTCAA
CGGGATTAACCAACGGTTTATGCTTCCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACA
GTTCAAACCCCTCATCACTGTAATACACTTTGGTCGGCCC*CCAGGGCTAGTCACGTAAG
TGTATTCCTCATCCGACAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCG
GATCGTACCGGTTACTTTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGC
TGTACCGTTTCGAGTTAACCGGCGAGGGGAATTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCG
CCGAGGAATCTTTCCGTTTGGTAGCAGATCTTCTTCCGGGAACCAACATCTCCGACAACT
TTCGGATCATTAGATGAGATCTCTTGCTTAGTGTCATAATCAAGAATCAAGAATCAAGAA
ACGCAAGCTTATAGGAAAGAATCTGAATGAAGAGGAGAAATATGGAGAAAGGTAGAGAGA
CTTTTCTTGAGCTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D227JQ U 1
AF RR4GI91JQ U 1
AF RR4GI91TF C 222
BS 1 342 RR4D227JQ
BS 343 343 RR4GI91JQ
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BS 779 976 RR4GI91TF

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TGTACCGTTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4GI91JQ 778 0 0
G
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TTCTTTTCTTATTAAAAATTTGAAGGTACTATTGAATAATGACGACTTTTTTTATGTTAA
TGTACTTCTCTTTGAACGATTTTGCTCATCCTAAAATATGAATATCCCGGCGGAGTTACT
CTGCTCGCCGGCACAAGGAGAGCTTGAAATGTCGACGTTTATGGAGATTTGCGATTTACA
TTTCTCATTTCGTTCGTCCTGCATTATCTGCACTGATCTGCACTCTGCACTGCAGAATCC
CATCTCTCCTTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACA
CGCGCTCAGAAACTCTGTCGATTCCCTAAAAACCTCTCTCTTAATAACCGGCGGTTCAAC
GGGATTAACCAACGGTTTATGCTTCCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAG
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QA 2 778 2 778
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GCACTGCAGAATCCCATCTCTCCTTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTC
TTACACAAGCAACACGCGCTCAGAAACTCTGTCGATTCCCTAAAAACCTCTCTCTTAATA
ACCGGCGGTTCAACGGGATTAACCAACGGTTTATGCTTCCTCCGATCATCATACTCCGAC
CCATTTTCAAACAGTTCAAACCCCTCATCACTGTAATACACTTTGGTCGGCCC*CCAGGG
CTAGTCACGTAAGTGTATTCCTCATCCGACAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCG
GAGTAGCAAACCGGATCGTACCGGTTACTTTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCG
ATACCACCGGAGCTGTACCGTTTCGAGTTAACCGGCGAGGGGAATTTCATATCTAACGGA
CTCCTCGGACTCGCCGAGGAATCTTTCCGTTTGGTAGCAGATCTTCTTCCGGGAACCAAC
ATCTCCGACAACTTTCGGATCATTAGATGAGATCTCTTGCTTAGTGTCATAATCAAGAAT
CAAGAATCAAGAAACGCAAGCTTATAGGAAAGAATCTGAATGAAGAGGAGAAATATGGAG
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QA 7 755 7 755
DS 



AS 1 3

CO CL3291Contig1 1079 3 2 U
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ATGCAGCATATCAAAAACAGAGGTTTGATAAATTCATAAAACACGATCTTAACTACCTAA
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GAAATTACTAAATCAACCAAAAAAAAAAAATATCTCCTTTTTCCTGATAAAATGTCTATT
GTTGTATCTAATCTACACACAACTGAAGACGGGAAGCAAACATATACTTGTCTGATCCTT
AATGCCTAACCTCAAAGATGAGGAGATGACGCAAGTTTTAACCTTTCTCAGCAGCTCCAG
CTTACTGTGGCGGTTCTGTTTTAAGAAACACTAGAGTTGCACTTAAGTTAGCTCTTCTTG
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TGGTCGATCTTCTCCTGTGTTTGAGGAATGCTTCCGGTTTGGATTGCACCGGTTACTTTG
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TTTGGATCCTTTTCTTTCTTCTTGTTTTCGTCGCCTGCCCCATCATCTTCATCATCTTCT
TATTCCTCCACTACCTTCTCTGCATCAGTCTCTTCAGTCTTTCTCCCATCTGGTTCTTTG
CCAGCTTCTTCTTCTCTCCTTTTGTCCCTGTTTTCCTCTGAAGAAGGCTTTGGATTCTCA
GCTAACGAGACCAAACTGTCGCTGTTGTTTATCTGTAATGTAGTAACTGCTGGAACTACT
CCGGTATGAATGGAGTTATTACCAAGGATGTCAGTCTGACTATGTGAAGATTGTTCCTTT
TGTCCATACACTTGAGCATCTGCATTGACTGTATGGGATTTAAAGTAGAATGAAGTTTGT
ATTGGCTGCCCGTTTCCAAAAGTTGTGCTAGAGATGCTGATGTTACTAATATGATTGAG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK23JQ U 1
AF RR4DK23TF C 6
AF RR4FA40JQ U 224
BS 1 715 RR4DK23JQ
BS 716 1079 RR4FA40JQ

RD RR4DK23JQ 717 0 0
GTACGAAATTAAACATGGAATCTGGTAAAGAACAAAAGTGTTACAAGACCAAACAAAAAA
ATGCAGCATATCAAAAACAGAGGTTTGATAAATTCATAAAACACGATCTTAACTACCTAA
TATCATGACAACACAGTTCGATAAAAAAGCAGCTTTTTGGTCTGGTTTGGCTAATTTTCA
GAAATTACTAAATCAACCAAAAAAAAAAAATATCTCCTTTTTCCTGATAAAATGTCTATT
GTTGTATCTAATCTACACACAACTGAAGACGGGAAGCAAACATATACTTGTCTGATCCTT
AATGCCTAACCTCAAAGATGAGGAGATGACGCAAGTTTTAACCTTTCTCAGCAGCTCCAG
CTTACTGTGGCGGTTCTGTTTTAAGAAACACTAGAGTTGCACTTAAGTTAGCTCTTCTTG
ACTTTGCTGATATATGCCTGAACAAGCTTGGTAAGCTTTGGTTTTGAAGCTGATAGATAA
TGGTCGATCTTCTCCTGTGTTTGAGGAATGCTTCCGGTTTGGATTGCACCGGTTACTTTG
TCAACTACCTTCTTGACTATGTTTTTGTAAGCATCTTTGTTCATCCCACCTTCTTTCCAA
GCAGGTTTTAGAAGCTCCTTAACAATCTCCACTAGAGAAAACTTGAACGCTCTCATTCCC
TTTGGATCCTTTTCTTTCTTCTTGTTTTCGTCGCCTGCCCCATCATCTTCATCAT
AC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DK23TF 712 0 0
AAATTAAACATGGAATCTGGTAAAGAACAAAAGTGTTACAAGACCAAACAAAAAAATGCA
GCATATCAAAAACAGAGGTTTGATAAATTCATAAAACACGATCTTAACTACCTAATATCA
TGACAACACAGTTCGATAAAAAAGCAGCTTTTTGGTCTGGTTTGGCTAATTTTCAGAAAT
TACTAAATCAACCAAAAAAAAAAAATATCTCCTTTTTCCTGATAAAATGTCTATTGTTGT
ATCTAATCTACACACAACTGAAGACGGGAAGCAAACATATACTTGTCTGATCCTTAATGC
CTAACCTCAAAGATGAGGAGATGACGCAAGTTTTAACCTTTCTCAGCAGCTCCAGCTTAC
TGTGGCGGTTCTGTTTTAAGAAACACTAGAGTTGCACTTAAGTTAGCTCTTCTTGACTTT
GCTGATATATGCCTGAACAAGCTTGGTAAGCTTTGGTTTTGAAGCTGATAGATAATGGTC
GATCTTCTCCTGTGTTTGAGGAATGCTTCCGGTTTGGATTGCACCGGTTACTTTGTCAAC
TACCTTCTTGACTATGTTTTTGTAAGCATCTTTGTTCATCCCACCTTCTTTCCAAGCAGG
TTTTAGAAGCTCCTTAACAATCTCCACTAGAGAAAACTTGAACGCTCTCATTCCCTTTGG
ATCCTTTTCTTTCTTCTTGTTTTCGTCGCCTGCCCCATCATCTTCATCAT
AC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4FA40JQ 856 0 0
CTGATAAAATGTCTATTGTTGTATCTAATCTACACACAACTGAAGACGGGAAGCAAACAT
ATACTTGTCTGATCCTTAATGCCTAACCTCAAAGATGAGGAGATGACGCAAGTTTTAACC
TTTCTCAGCAGCTCCAGCTTACTGTGGCGGTTCTGTTTTAAGAAACACTAGAGTTGCATT
TAAGTTAGCTCTTCTTGACTTTGCTGATATATGCCTGAACAAGCTTGGTAAGCTTTGGTT
TTGAAGCTGATAGATAATGGTCGATCTTCTCCTGTGTTTGAGGAATGCTTCCGGTTTGGA
TTGCACCGGTTACTTTGTCAACTACCTTCTTGACTATGTTTTTGTAAGCATCTTTGTTCA
TCCCACCTTCTTTCCAAGTAGGTTTTAGAAGCTCCTTAACAATCTCCACTAGAGAAAACT
TGAACGCTCTCATTCCCTTTGGATCCTTTTCTTTCTTCTTGTTTTCGTCGCCTGCCCCAT
CATCTTCATCATCTTCTTATTCCTCCACTACCTTCTCTGCATCAGTCTCTTCAGTCTTTC
TCCCATCTGGTTCTTTGCCAGCTTCTTCTTCTCTCCTTTTGTCCCTGTTTTCCTCTGAAG
AAGGCTTTGGATTCTCAGCTAACGAGACCAAACTGTCGCTGTTGTTTATCTGTAATGTAG
TAACTGCTGGAACTACTCCGGTATGAATGGAGTTATTACCAAGGATGTCAGTCTGACTAT
GTGAAGATTGTTCCTTTTGTCCATACACTTGAGCATCTGCATTGACTGTATGGGATTTAA
AGTAGAATGAAGTTTGTATTGGCTGCCCGTTTCCAAAAGTTGTGCTAGAGATGCTGATGT
TACTAATATGATTGAG

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 4

CO CL3292Contig1 853 4 4 U
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CATGGCCGCCGCCGCAGAAATCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAA
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CATTGGAGTTCAGGCAGCCAAACACGCCACCTTTGTCCCCCACACTGCGGGAAGATACTC
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GGAGATCATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGATCATCATTGATGCCATTGT
TAACAGTGGTCCTCGTGAAGATGCTACCAGAATTGGATCTGCTGGTGTCGTTAGGAGACA
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CAATGAAATTTATGTTTTGTTTTCACTATGTTACAGATGTTTTGTTCTTTTGTCTTATGA
TGTTTATTTCGTCTGAACTACTTTCGAATAGATAAGTATTTGATGCTTCAAGCGATTTCG
CATCAGTTTATCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4AZ37TF U 1
AF RR4AZ37JQ C 1
AF RR4B073JQ C 143
AF RR4B073TF U 1
BS 1 682 RR4AZ37TF
BS 683 796 RR4B073TF
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BS 798 853 RR4B073TF

RD RR4AZ37TF 682 0 0
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GGAGATCATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGATCATCATTGATGCCATTGT
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TGCTCGCGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTT
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GAGAGTTGCCAAGGCCAACCGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4AZ37JQ 853 0 0
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CATGGCCGCCGCCGCAGAAATCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAA
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GGAGATCATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGATCATCATTGATGCCATTGT
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TGCTCGCGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTT
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TGTTTATTTCGTCTGAACTACTTTCGAATAGATAAGTATTTGATGCTTCAAGCGATTTCG
CATCAGTTTATCC

QA 1 853 1 853
DS 

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GATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTACATTGGAGTTCAGGCAGCCAAA
CACGCCACCTTTGTCCCCCACACTGCGGGAAGATACTCCGTGAAGAGATTCAGGAAGGCT
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AAGAAGTTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACT
GATGCCAACCCTATTCAGATCATCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCTCGTGAAGAT
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AACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTTGATCAACGCAGCCAAGGGCTCG
TCCAACAGCTATGCCATCAAAAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGT
TAAGGAGTTTCCTCTTGCCCTGATGGATACAATCTTATCAATGAAATTTATGTTTTGTTT
TCACTATGTTACAGATGTTTTGTTCTTTTGTCTTATGATGTTTATTTCGTCTGAACTACT
TTCGAATAGATAAGTATTTGATGCTTCAAGCGATTTCGCATCAGTTTATCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4B073TF 853 0 0
GATCTCTCTCTCTCTCTCCCCGCCGTCACTCTCTCCCGCGCGTCGCTTACCGATCTCAGC
CATGGCCGCCGCCGCAGAAATCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAA
GCTCTTCTACCGCTGGACCTACGATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTA
CATTGGAGTTCAGGCAGCCAAACACGCCACCTTTGTCCCCCACACTGCGGGAAGATACTC
CGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGCTCACCAACTCTCTCAT
GATGCACGGAAGAAACAGCGGAAAGAAGTTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCAT
GGAGATCATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGATCATCATTGATGCCATTGT
TAACAGTGGTCCTCGTGAAGATGCTACCAGAATTGGATCTGCTGGTGTCGTTAGGAGACA
AGCCGTCGATATCTCCCCCCTGAGACGTGTTAACCAGGCGATCTTCTTGCTCACAACCGG
TGCTCGCGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTT
GATCAACGCAGCCAAGGGCTCGTCCAACAGCTATGCCATCAAAAAGAAGGATGAGATTGA
GAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGAGTTTCCTCTTGCCCTGATGGATACAATCTTAT
CAATGAAATTTATGTTTTGTTTTCACTATGTTACAGATGTTTTGTTCTTTTGTCTTATGA
TGTTTATTTCGTCTGA*CTACTTTCGAATAGATAAGTATTTGATGCTTCAAGCGATTTCG
CATCAGTTTATCC

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 4

CO CL3293Contig1 1015 4 23 U
GGCCGTTTCTCCAACGGAAGAACCACCGTTGACGAGATCGCTGAGCTACTTGGATTTAAT
GACTACATTCCTGCGTACAATGCTGTGAGAGGTCGACAAATACTCTCGGGAGTTAATTAC
GCATCAGCAGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACCGGTCGACAATTGGGACAAAGGATAAGC
TTTAGTGGACAAGTTAGGAACTACCAGAACACGGTTCAGCAGGTTGTGAGTCTGCTGGGA
GGAGAGACTCAAGCAGCTGATTACCTCAAAAAATGCATTTACTCTGTTGGTATGGGAAGC
AATGACTACCTCAACAACTACTTCATGCCTACGTTCTACTCTTCTAGCAGACAATTCACA
CCAGAACAATACGCTAGCGATCTCATCAGTCGCTACAGCACTCAGCTTACCGCACTATAC
AACTATGGGGCTAGGAAGTTTGCATTGATAGGAATCGGCGCAATCGGTTGTAGTCCTAAC
GCGCTCGCACGCAGTCGTGACAGTAGGACTTGCGACGAAAGAATCAACTCAGCAAACCAA
ATCTTCAACAGCAAGCTACGGTCTCTGGTTGATCAGCTCAACAACAATCACCCTGATGCG
AAGTTTACCTACATCAATGCTTATGACGTTTTCCAGGACATGATTAAAAACCCATCTAGA
TTCGGGTTTAGGGTGACGAACGCTGGATGTTGTGGCATCGGTAGAAATGCAGGTCAGATC
ACATGTTTACCGGGACAAAGACCATGTAGAGACAGAAACGCGTATGTGTTCTGGGACGCG
TTTCACCCAACTGAAGCTGCAAACATTGTTATCGCGAGGAGGTCGTACAAGGCAGAGTCG
CCTTCAGACGCTTATCCTACTGATATCGCAGGGCTGGCACGGCTTTGAAGAAAGTCAGAA
AAAAAAAAGAAACTAAAATGAAGTTCCACAAACTAATGTGATCTTCTCGTTTATCGTCAT
TTCATATGTTAATCTTTTTGTCATAAATTCGAAAATCAAGCATTTCTATATATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C734TF U 222
AF RR4FL55TF U 1
AF RR4C734JQ C 340
AF RR4EB42TF U 839
BS 1 516 RR4FL55TF
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BS 770 770 RR4C734JQ
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BS 808 826 RR4FL55TF
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BS 908 908 RR4C734JQ
BS 909 1015 RR4EB42TF

RD RR4C734TF 346 0 0
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CTCTGTTGGTATGGGAAGCAATGACTACCTCAACAACTACTTCATGCCTACGTTCTACTC
TTCTAGCAGACAATTCACACCAGAACAATACGCTAGCGATCTCATCAGTCGCTACAGCAC
TCAGCTTACCGCACTATACAACTATGGGGCTAGGAAGTTTGCATTGATAGGAATCGGCGC
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AATCAACTCAGCAAACCAAATCTTCAACAGCAAGCTACGGTCTCTG

QA 1 346 1 346
DS 

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GCATCAGCAGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACCGGTCGACAATTGGGACAAAGGATAAGC
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GGAGAGACTCAAGCAGCTGATTACCTCAAAAAATGCATTTACTCTGTTGGTATGGGAAGC
AATGACTACCTCAACAACTACTTCATGCCTACGTTCTACTCTTCTAGCAGACAATTCACA
CCAGAACAATACGCTAGCGATCTCATCAGTCGCTACAGCACTCAGCTTACCGCACTATAC
AACTATGGGGCTAGGAAGTTTGCATTGATAGGAATCGGCGCAATCGGTTGTAGTCCTAAC
GCGCTCGCACGCAGTCGTGACAGTAGGACTTGCGACTAAAGAATCAACTCAGCAAACCAA
ATCTTCAACAGCAAGCTACGGTCTCTGGTTGATCAGCTCAACAACAATCACCCTGATGCG
AAGTTTACCTACATCAATGCTTATGACGTTTTCCAGGACATGATTAAAAACCCATCTAGA
TTCGGGTTTAGGGTGTCGAACGCTGGATGTTGTGGCATCGGTAGAAATGCAG*TCAGATC
ACATGTTTACCGGGACAAAGAC*ATGTAGAGACAGAA*CGCGTATGTGT*CTGGGACGCG
TTTCACC**ACTGAAGCTGCAA*CAT*GTTATCGCGAGGAGGTCGT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4C734JQ 643 0 0
TCTTCTAGCAGACAATTCACACCAGAACAATACGCTAGCGATCTCATCAGTCGCTACAGC
ACTCAGCTTACCGCACTATACAACTATGGGGCTAGGAAGTTTGCATTGATAGGAATCGGC
GCAATCGGTTGTAGTCCTAACGCGCTCGCACGCAGTCGTGACAGTAGGACTTGCGACGAA
AGAATCAACTCAGCAAACCAAATCTTCAACAGCAAGCTACGGTCTCTGGTTGATCAGCTC
AACAACAATCACCCTGATGCGAAGTTTACCTACATCAATGCTTATGACGTTTTCCAGGAC
ATGATTAAAAACCCATCTAGATTCGGGTTTAGGTTGACGAACGCTGGATGTTGTGGCATC
GGTAGAAATGCAGGTCAGATCACATGTTTACCGGGACAAAGACCATGTAGAGACAGAAAC
GCGTATGTGTTCTGGGACGCGTTTCACCCAACTGAAGCTGCAAACATTGTTATCGCGAGG
AGGTCGTACAAGGCAGAGTCGCCTTCAGACGCTTATCCTACTGATATCGCAGGGCTGGCA
CGGCTTTGAAGAAAGTCAGAAAAAAAAAAGAAACTAAAATGAAGTTCCACAAACTAATGT
GATCTTCTCGTTTATCGTCATTTCATATGTTAATCTTTTTGTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4EB42TF 177 0 0
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AAAAAAAAA*GAAACTAAAATGAAGTTCCACAAACTAATGTGATCTTCTCGTTTATCGTC
ATTTCATATGTTAATCTTTTTGTCATAAATTCGAAAATCAAGCATTTCTATATATAT

QA 1 177 1 177
DS 



AS 1 4

CO CL3294Contig1 841 4 3 U
TTTGCATTAATAGATTGGTATACAATTACCACACAATAATTTTTTTTTTGTGGTGGGGCA
TGAACAGGTTGGTTCCAAATACACAGACTCAAGACAAGATAATGACAGAGTTGGATGCGT
TTAAGAACGCTAGTGGTATCTTCGGCCATCCCATGGCCATCAGGCAAAGAGATATCAAAA
CACCAGGTAACACACACTTACTTGAATTAATTTTTGATAATTGATCTAAATAAATACTAA
CAAGTAACAATATTTTTATTTTAATAGCCGAATGGTGGTCTTGTTATGGATCTTCTGCTC
CAAATCTCAGAGACTTTGCTGTTAAGGTCCTTAGTCTTACTTGTAGTGCTACTGGCTGTG
AAAGAAATTGGAGTGTTTTCCAACTTGTAAGTCATTTAAATCCCTTTTTATTTATATTTT
TAGGTGATTTCGTTTCACTTATAATTTTTAAACTTCATTTGAACAGCTTCATACGAAGAA
GAGAAATCGACTAGCACAACATCGGCTGAACAACATGGTTTTTGTGAAGTTTAACCGAGC
TCTAAAACGCAGAAGCATGAGAACTGATAGTGCCACAGATCCTATTCTTTTGCATGAAAT
TGATGAAAGCAGTGAGTGGTTGCTGGGAAGAATGGATGGAGATTCCTCTGATGATGATGA
TTTGGTGTGGGAAGATGATGATTTGCCATGGACTGTTGTGAGCCAAGCTATGGGTGCTGA
AGAACCCAACTATTCGACTAGAGGAGCAAAAGTTACAAGCTCATCTAAAACAGATAAAGG
AAAAGGTGTTGCTAGCTCAAATCAGAAGAAAAGCAAAGGACCATCTACATCTGCTATGAC
C


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR4BG35JQ U 4
AF RR4B637JQ U 4
AF RR4BG35TF C 1
AF RR4B637TF C 4
BS 1 3 RR4BG35TF
BS 4 781 RR4B637JQ
BS 782 841 RR4BG35TF

RD RR4BG35JQ 743 0 0
GCATTAATAGATTGGTATACAATTACCACACAATAATTTTTTTTTTGTGGTGGGGCATGA
ACAGGTTGGTTCCAAATACACAGACTCAAGACAAGATAATGACAGAGTTGGATGCGTTTA
AGAACGCTAGTGGTATCTTCGGCCATCCCATGGCCATCAGGCAAAGAGATATCAAAACAC
CAGGTAACACACACTTACTTGAATTAATTTTTGATAATTGATCTAAATAAATACTAACAA
GTAACAATATTTTTATTTTAATAGCCGAATGGTGGTCTTGTTATGGATCTTCTGCTCCAA
ATCTCAAAAACTTTGCTGTTAAGGTCCTTAGTCTTACTTGTAGTGCTACTGGCTGTGAAA
GAAATTGGAGTGTTTTCCAACTTGTAAGTCATTTAAATCCCTTTTTATTTATATTTTTAG
GTGATTTCGTTTCACTTATAATTTTTAAACTTCATTTGAACAGCTTCATACGAAGAAGAA
AAATCGACTAGCACAACATCGGCTGAACAACATGGTTTTTGTGAAGTTTAACCGAGCTCT
AAAACGCAGAAGCATGAGAACTGATAGTGCCACAGATCCTATTCTTTTGCATGAAATTGA
TGAAAGCAGTGAGTGGTTGCTGGGAAGAATGGATGGAGATTCCTCTGATGATGATGATTT
GGTGTGGGAAGATGATGATTTGCCATGGACTGTTGTGAGCCAAGCTATGGGTGCTGAAGA
ACCCAACTATTCGACTAGAGGAG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4B637JQ 778 0 0
GCATTAATAGATTGGTATACAATTACCACACAATAATTTTTTTTTTGTGGTGGGGCATGA
ACAGGTTGGTTCCAAATACACAGACTCAAGACAAGATAATGACAGAGTTGGATGCGTTTA
AGAACGCTAGTGGTATCTTCGGCCATCCCATGGCCATCAGGCAAAGAGATATCAAAACAC
CAGGTAACACACACTTACTTGAATTAATTTTTGATAATTGATCTAAATAAATACTAACAA
GTAACAATATTTTTATTTTAATAGCCGAATGGTGGTCTTGTTATGGATCTTCTGCTCCAA
ATCTCAGAGACTTTGCTGTTAAGGTCCTTAGTCTTACTTGTAGTGCTACTGGCTGTGAAA
GAAATTGGAGTGTTTTCCAACTTGTAAGTCATTTAAATCCCTTTTTATTTATATTTTTAG
GTGATTTCGTTTCACTTATAATTTTTAAACTTCATTTGAACAGCTTCATACGAAGAAGAG
AAATCGACTAGCACAACATCGGCTGAACAACATGGTTTTTGTGAAGTTTAACCGAGCTCT
AAAACGCAGAAGCATGAGAACTGATAGTGCCACAGATCCTATTCTTTTGCATGAAATTGA
TGAAAGCAGTGAGTGGTTGCTGGGAAGAATGGATGGAGATTCCTCTGATGATGATGATTT
GGTGTGGGAAGATGATGATTTGCCATGGACTGTTGTGAGCCAAGCTATGGGTGCTGAAGA
ACCCAACTATTCGACTAGAGGAGCAAAAGTTACAAGCTCATCTAAAACAGATAAAGGA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4BG35TF 841 0 0
TTTGCATTAATAGATTGGTATACAATTACCACACAATAATTTTTTTTT*GTGGTGGGGCA
TGAACAGGTTGGTTCCAAATACACAGACTCAAGACAAGATAATGACAGAGTTGGATGCGT
TTAAGAACGCTAGTGGTATCTTCGGCCATCCCATGGCCATCAGGCAAAGAGATATCAAAA
CACCAGGTAACACACACTTACTTGAATTAATTTTTGATAATTGATCTAAATAAATACTAA
CAAGTAACAATATTTTTATTTTAATAGCCGAATGGTGGTCTTGTTATGGATCTTCTGCTC
CAAATCTCAGAGACTTTGCTGTTAAGGTCCTTAGTCTTACTTGTAGTGCTACTGGCTGTG
AAAGAAATTGGAGTGTTTTCCAACTTGTAAGTCATTTAAATCCCTTTTTATTTATATTTT
TAGGTGATTTCGTTTCACTTATAATTTTTAAACTTCATTTGAACAGCTTCATACGAAGAA
GAGAAATCGACTAGCACAACATCGGCTGAACAACATGGTTTTTGTGAAGTTTAACCGAGC
TCTAAAACGCAGAAGCATGAGAACTGATAGTGCCACAGATCCTATTCTTTTGCATGAAAT
TGATGAAAGCAGTGAGTGGTTGCTGGGAAGAATGGATGGAGATTCCTCTGATGATGATGA
TTTGGTGTGGGAAGATGATGATTTGCCATGGACTGTTGTGAGCCAAGCTATGGGTGCTGA
AGAACCCAACTATTCGACTAGAGGAGCAAAAGTTACAAGCTCATCTAAAACAGATAAAGG
AAAAGGTGTTGCTAGCTCAAATCAGAAGAAAAGCAAAGGACCATCTACATCTGCTATGAC
C

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4B637TF 838 0 0
GCATTAATAGATTGGTATACAATTACCACACAATAATTTTTTTTTTGTGGTGGGGCATGA
ACAGGTTGGTTCCAAATACACAGACTCAAGACAAGATAATGACAGAGTTGGATGCGTTTA
AGAACGCTAGTGGTATCTTCGGCCATCCCATGGCCATCAGGCAAAGAGATATCAAAACAC
CAGGTAACACACACTTACTTGAATTAATTTTTGATAATTGATCTAAATAAATACTAACAA
GTAACAATATTTTTATTTTAATAGCCGAATGGTGGTCTTGTTATGGATCTTCTGCTCCAA
ATCTCAGAGACTTTGCTGTTAAGGTCCTTAGTCTTACTTGTAGTGCTACTGGCTGTGAAA
GAAATTGGAGTGTTTTCCAACTTGTAAGTCATTTAAATCCCTTTTTATTTATATTTTTAG
GTGATTTCGTTTCACTTATAATTTTTAAACTTCATTTGAACAGCTTCATACGAAGAAGAG
AAATCGACTAGCACAACATCGGCTGAACAACATGGTTTTTGTGAAGTTTAACCGAGCTCT
AAAACGCAGAAGCATGAGAACTGATAGTGCCACAGATCCTATTCTTTTGCATGAAATTGA
TGAAAGCAGTGAGTGGTTGCTGGGAAGAATGGATGGAGATTCCTCTGATGATGATGATTT
GGTGTGGGAAGATGATGATTTGCCATGGACTGTTGTGAGCCAAGCTATGGGTGCTGAAGA
ACCCAACTATTCGACTAGAGGAGCAAAAGTTACAAGCTCATCTAAAACAGATAAAGGAAA
AGGTGTTGCTAGCTCAAATCAGAAGAAAAGCAAAGGACCATCTACATCTGCTATGACC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 2 4

CO CL3295Contig1 508 2 3 U
GGATGGATACGCACACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTTTCTGCTGG
TATGGCCATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCT
CTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGCCTTAT
CGTGGGAATCATCCTCTCCTCACGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGTGTAACCC
ACCACAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCG
TTCTTTAGCATATGTATCATCGGGAATGAAAAAAAAAATTATTGGACACTTGGGAACTTT
GTTTCCTAGTTCTCTCTCGGTGGTTGCTCTCCGATGTAGGGATTTTTTATTATTTGGTTC
TGTAATAAAGAGAGCTCTGATGGAGCTTGGTATGTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGA
GGAAGTTAAATACATTTATTTGTAAAGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4DF71JQ C 1
AF RR4DF71TF U 1
BS 1 1 RR4DF71JQ
BS 2 506 RR4DF71TF
BS 507 508 RR4DF71JQ

RD RR4DF71JQ 508 0 0
GGATGGATACGCACACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTTTCTGCTGG
TATGGCCATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCT
CTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGCCTTAT
CGTGGGAATCATCCTCTCCTCACGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGTGTAACCC
ACCACAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCG
TTCTTTAGCATATGTATCATCGGGAATGAAAAAAAAAATTATTGGACACTTGGGAACTTT
GTTTCCTAGTTCTCTCTCGGTGGTTGCTCTCCGATGTAGGGATTTTTTATTATTTGGTTC
TGTAATAAAGAGAGCTCTGATGGAGCTTGGTATGTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGA
GGAAGTTAAATACATTTATTTGTAAAGC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4DF71TF 508 0 0
G
GATGGATACGCACACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTTTCTGCTGGT
ATGGCCATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTC
TTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGCCTTATC
GTGGGAATCATCCTCTCCTCACGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGTGTAACCCA
CCACAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCGT
TCTTTAGCATATGTATCATCGGGAATGAAAAAAAAAATTATTGGACACTTGGGAACTTTG
TTTCCTAGTTCTCTCTCGGTGGTTGCTCTCCGATGTAGGGATTTTTTATTATTTGGTTCT
GTAATAAAGAGAGCTCTGATGGAGCTTGGTATGTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAG
GAAGTTAAATACATTTATTTGTAAA
GC

QA 2 506 2 506
DS 



CO CL3295Contig2 848 2 4 U
GGCTGTCTCGCCAGATTTGAATCATCGACCTGATCTCAGATCCAAATCACAAGCCTTCGA
CATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGC
CGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGAGTTGGTGT
GGCTTCTATGGGAGTCATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCCGTTGTTAT
GGCTGGTGTCTTGGGTATTTACGGTTTGACATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAAC
CCCAAGGCTAAGTCCTACTACCTCTTCGATGGATACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCT
TGTGGTCTTGCTGGTCTCTCTGCTGGTATGGCCATTGGTATTGTCGGAGATGCCGGTGTC
AGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCA
GAGGCGCTTGCTCTTTACGGCCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCTTCTAGAGCTGGCCAG
TCTAGAGCTGAATGAGAATGTAACCCACCACAAGATTTTCCCCCGAAGGTACTTTTATTT
TCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCGTTCTTTAGCATATGTATCATCGGGAACTGAAGAA
AAAAATTATTGGACACTTGGGAACTTTGTTTCGGAAGCTCTCCTATTTCTCTCTCTCTCG
GTGGTTGATCTCCGATGTAGGGATTTTTTTTATTATTTGGTTCTGTAATAAAGAGAGCTC
TGATGGAGCTTGGTATGTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTAAATACATTTA
TTTGTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG27TF U 1
AF RR4EG27JQ C 190
BS 1 580 RR4EG27TF
BS 581 581 RR4EG27JQ
BS 582 633 RR4EG27TF
BS 634 848 RR4EG27JQ

RD RR4EG27TF 633 0 0
GGCTGTCTCGCCAGATTTGAATCATCGACCTGATCTCAGATCCAAATCACAAGCCTTCGA
CATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGC
CGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGAGTTGGTGT
GGCTTCTATGGGAGTCATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCCGTTGTTAT
GGCTGGTGTCTTGGGTATTTACGGTTTGACATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAAC
CCCAAGGCTAAGTCCTACTACCTCTTCGATGGATACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCT
TGTGGTCTTGCTGGTCTCTCTGCTGGTATGGCCATTGGTATTGTCGGAGATGCCGGTGTC
AGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCA
GAGGCGCTTGCTCTTTACGGCCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCTTCTAGAGCTGGCCAG
TCTAGAGCTGAATGAGAATGTAACCCACCACAAGATTTTCTCCCGAAGGTACTTTTATTT
TCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCGTTCTTTA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EG27JQ 659 0 0
GGGAGTCATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCCGTTGTTATGGCTGGTGT
CTTGGGTATTTACGGTTTGACATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCT
AAGTCCTACTACCTCTTCGATGGATACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTT
GCTGGTCTCTCTGCTGGTATGGCCATTGGTATTGTCGGAGATGCCGGTGTCAGGGCAAAT
GCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAGGCGCTT
GCTCTTTACGGCCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCTTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCT
GAATGAGAATGTAACCCACCACAAGATTTTCCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGTGT
GTTTTGTTGTTCTATCGTTCTTTAGCATATGTATCATCGGGAACTGAAGAAAAAAATTAT
TGGACACTTGGGAACTTTGTTTCGGAAGCTCTCCTATTTCTCTCTCTCTCGGTGGTTGAT
CTCCGATGTAGGGATTTTTTTTATTATTTGGTTCTGTAATAAAGAGAGCTCTGATGGAGC
TTGGTATGTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTAAATACATTTATTTGTAAA

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 4

CO CL3296Contig1 1389 4 3 U
TTTTTAAAAGTCTTTTTCTTTTTTCTTCAAAGTCTCTCCCTTTCTCTGTGATCCTTAAAC
CCATTTTCATGGCTGCCTCTATCTCAAGAGTTTTGCCAACAGATAATAGGAGATTAAGTC
AATGCAATTCATGGGTTCCTGCTACTCCTACGAGGAGAGCTCAAACTCATTTAGATTCTC
TCAAGTTCTTTCCAGTTGCTAAATCTGGAATAAGTTTGAAGGTTCAGAACGGTAGACGAC
CATTATGCTCTGTCTTTGCTCTTGATTCAGCTTCCTCCAGGATCAGCCGAGTTGCTTGCA
ATGCTGCTGCAGATGCACCTGAAAGCACTCCTAAGGAGCTTAGCCAGTACGAGAAAATTA
TTGAGCTTTTGACCACTCTTTTTCCACTCTGGGTTATTTTGGGAACACTTGTTGGCATCT
TCAAACCATCTTTAGTTACATGGTTGGAAACAGACCTCTTCACTCTAGGTCTTGGATTTC
TTATGCTCTCCATGGGTTTAACTCTTACCTTTGAAGATTTCAGAAGATGTTTACGTAATC
CCTGGACGGTTGGTGTTGGTTTTCTTGCACAGTATATGATCAAGCCATTGCTAGGTTTCC
TCATTGCAATGTCTCTTAAGCTTTCAGCACCTCTTGCAACTGGTCTTATCCTGGTCTCAT
GCTGCCCTGGAGGACAGGCCTCAAATGTTGCCACCTACATTTCCAAGGGCAACGTAGCAC
TCTCTGTACTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGAGCTATTATAATGACTCCTCTTCTCA
CCAAGCTTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCTCGTTGATGCTGCTGGACTAGCTCTTAGCACTT
TTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTTCTAGCTAATGAGTTCTTTCCTAAGT
TTACTTCCAAGATTATAACAGTGACACCTCTAATAGGAGTCATTCTTACCACTCTTCTCT
GTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGAGGTTTTGAAAACACAAGGAGGGCAACTTATAC
TCCCTGTAGCACTCCTACATGCTGCAGCCTTTGCTATTGGCTATTGGATTTCAAAGTTGT
CTTTCGGCGAGTCTACTTCCCGCACCATTTCTATAGAATGTGGAATGCAAAGTTCAGCGC
TTGGTTTCTTACTTGCACAAAAGCATTTCACAAATCCTCTAGTCGCTGTTCCTTCTGCAG
TCAGTGTTGTCTGTATGGCGCTCGGGGGGAGTGGTTTAGCCGTGTTCTGGAGAAATCAAC
CGATCCCGAAAGATGGCAAAGATGACTTCAAAGAGTGAATGGATGTGAACTAGGAAAAGT
TATTTGTCGTCGATGGGATTGGTGTAATGTTTGTAGACAATGCACCATTCTGTTTTAATT
GAAAGACTT


BQ
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BQ
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AF RR4H019TF U 1
AF RR4H019JQ C 366
AF RR4EV04JQ C 889
AF RR4EV04TF U 889
BS 1 593 RR4H019TF
BS 594 897 RR4H019JQ
BS 898 1285 RR4EV04TF

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GATGACACCGAGAACTCTTACGCGAGCTTCCAGGGGCTTTTGGCTCTTGCGCGTATCACT
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DS 

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TCAGTGTAGGAACTTTTTGAGTACGAAGGAGGAAGGGGGGAAGGATGGTGGGG*AGATTG
AAGCTGCGGTTGTGGAGGGGTTGGAGAAGGTTAGGAGGTGTGTTGGGAGAGGTGAGGTTA
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AGATTGAGAAGATTATTGCTGAGAGGTATGGGAAGAAGAAGAAGGGGAGTGGTGGTAGTA
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ATTCTGATGACGACCGGAGAAGAGTTGAGAGAAAGAGTAGGAAGGAGAAGAGGAGAAGGA
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TTGATGTCTCCATTACAAACTATCTATGTCAC

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DS 

RD RR4EV04TF 397 0 0
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GCTGCTATTTGATGTCTCCATTACAAACTATCTATGTCACAATAATGAAACCTGCCTTAT
GGGATCTGATTTGTGTTTGGCTCTTGTGGTCTCTTTGTTTCAAAAAGCATGTATGGTTGA
GATACTGTTGTGTTGTTGTTAATTGTGT

QA 10 397 10 397
DS 



AS 1 4

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CATTCGGTTTCTTTGAGAAGGAGAGAGGGAGAGTCTATTATTAATATTTTCTTTACAGTA
CCATTTCACTACTTCGAGAGAGATTAAAAAATAAAATGGCAGTTTCAGTAGCCGTCTTGC
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CGACGTTCGTTCGGATTTACAAGAGGAGGTCTTCAGAAGGCTATCAGTCTATCCCTTACG
TGATCGCATTGTTCAGTGCGATGCTATGGATATACTACGCAATGATCAAGAAGAATGTAA
TGGTTATGATCACTATCAACACCGTTTCCTTGGTCATACAAATCTTCTACATCTCCTTCT
ACCTCTTCTATGCTCCTAAAAAGGAAAAGACTCTAACGGTGAAATTCGTCCTCTTTGTGG
ATGTTTTTGCCTTCGGCCTTATCTTCTTCCTGACATACTTTCTGCTTCATGGAGAAAAAC
GGGTTCAAGTCCTCGGATATGTTTGTATGGTCTTCTCTCTATGTGTATTTGTCGCCCCCC
TTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAACCAGGAGTGCAGAGTTCACGCCATTCAGTCTAT
CCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCATGTGGTTCTTTTACGGTCTTCTCAGTAAAGACA
TGAACATAGCTCTTCCAAATGTTTTGGGTTTCATCTTCGGAGTGCTTCAGATGATACTTT
ACTTAATATACAAGAAACCTGGAACTAAGGTTTTGGAACCGCCTGTGATTAACCTCCAGG
AAATATCTGACCATGTTGTTGATGTCGTGAGGCTTAGTTCGATGGTTTGTTCCTCACAAA
TGAGAACTTTGGTGCCACAGGACAGTGCCGACATGGAAGACACCATAACCATTGATGAGA
AGATCAAAGGAGACATTGAGAAAATGAAGGAGAGCAAAGAAATGTTTCTTATATCCAAGA
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TTAATCTGAATCTCTCGCTCCTGTGTGACCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCATCTTGAATG
TAAAATAAGTTTGTATCAACTATTAAGTTAAATAAATGAATATGTTTTAT


BQ
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AF RR4H213TF U 1
AF RR4H536TF U 1
AF RR4H536JQB C 510
AF RR4H213JQ C 514
BS 1 371 RR4H213TF
BS 372 372 RR4H536TF
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RD RR4H213TF 442 0 0
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CATTCGGTTTCTTTGAGAAGGAGAGAGGGAGAGTCTATTATTAATATTTTCTTTACAGTA
CCATTTCACTACTTCGAGAGAGATTAAAAAATAAAATGGCAGTTTCAGTAGCCGTCTTGC
GTACGGTCTTTGGCATTCTAGGGAATATCATCTCCTTTTTCGTGTGTCTTGCCCCTATAC
CGACGTTCGTTCGGATTTACAAGAGGAGGTCTTCAGAAGGCTATCAGTCTATCCCTTACG
TGATCGCATTGTTCAGTGCGATGCTATGGATATACTACGCAATGATCAAGAAGAATGTAA
TGGTTATGATCGCTATCAACACCGTTTCCTTGGTCATACAAATCTTCTACATCTCCTTCT
ACCTCTTCTATGCTCCTAAAAA

QA 1 442 1 442
DS 

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CATTCGGTTTCTTTGAGAAGGAGAGAGGGAGAGTCTATTATTAATATTTTCTTTACAGTA
CCATTTCACTACTTCGAGAGAGATTAAAAAATAAAATGGCAGTTTCAGTAGCCGTCTTGC
GTACGGTCTTTGGCATTCTAGGGAATATCATCTCCTTTTTCGTGTGTCTTGCCCCTATAC
CGACGTTCGTTCGGATTTACAAGAGGAGGTCTTCAGAAGGCTATCAGTCTATCCCTTACG
TGATCGCATTGTTCAGTGCGATGCTATGGATATACTACGCAATGATCAAGAAGAATGTAA
TGGTTATGATCACTATCAACACCGTTTCCTTGGTCATACAAATCTTCTACATCTCCTTCT
ACCTCTTCTATGCTCCTAAAAAGGAAAAGACTCTAACGGTGAAATTCGTCCTCTTTGTGG
ATGTTTTTGCCTTCGGCCTTATCTTCTTCCTGACATACTTTCTGCTTCATGGAGAAAAAC
GGGTTCAAGTCCTCGGATATGTTTGTATGGTCTTCTCTCTATGTGTATTTGTCGCCCCCC
TTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAACCAGGAGTGCAGAGTTCACGCCATTCAGTCTAT
CCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCATGTGGTTCTTTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4H536JQB 681 0 0
CTGA
CATACTTTCTGCTTCATGGAGAAAAACGGGTTCAAGTCCTCGGATATGTTTGTATGGTCT
TCTCTCTATGTGTATTTGTCGCCCCCCTTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAACCAGGA
GTGCAGAGTTCACGCCATTCAGTCTATCCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCATGTGGT
TCTTTTACGGTCTTCTCAGTAAAGACATGAACATAGCTCTTCCAAATGTTTTGGGTTTCA
TCTTCGGAGTGCTTCAGATGATACTTTACTTAATATACAAGAAACCTGGAACTAAGGTTT
TGGAACCGCCTGTGATTAACCTCCAGGAAATATCTGACCATGTTGTTGATGTCGTGAGGC
TTAGTTCGATGGTTTGTTCCTCACAAATGAGAACTTTGGTGCCACAGGACAGTGCCGACA
TGGAAGACACCATAACCATTGATGAGAAGATCAAAGGAGACATTGAGAAAATGAAGGAGA
GCAAAGAAATGTTTTTTATATCCAAGAATTGATCAGCTCTTAACTATCAACTGTCGAATT
GTGTGTTTTAGTTGCTTGCGTGTTAAATTAATCTGAATCTCTCGCTCCTGTGTGACCTCT
CTCTCTCTCTTTCTCTCATCTTGAATGTAAAATAAGTTTGTATCAACTATTAAGTTAAAT
AAATGAATATGTTTTAT

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DS 

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TCTCTCTATGTGTATTTGTCGCCCCCCTTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAACCAGGA
GTGCAGAGTTCACGCCATTCAGTCTATCCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCATGTGGT
TCTTTTACGGTCTTCTCAGTAAAGACATGAACATAGCTCTTCCAAATGTTTTGGGTTTCA
TCTTCGGAGTGCTTCAGATGATACTTTACTTAATATACAAGAAACCTGGAACTAAGGTTT
TGGAACCGCCTGTGATTAACCTCCAGGAAATATCTGACCATGTTGTTGATGTCGTGAGGC
TTAGTTCGATGGTTTGTTCCTCACAAATGAGAACTTTGGTGCCACAGGACAGTGCCGACA
TGGAAGACACCATAACCATTGATGAGAAGATCAAAGGAGACATTGAGAAAATGAAGGAGA
GCAAAGAAATGTTTCTTATATCCAAGAATTGATCAGCTCTTAACTATCAACTGTCGAATT
GTGTGTTTTAGTTGCTTGCGTGTTAAATTAATCTGAATCTCTCGCTCCTGTGTGACCTCT
CTCTCTCTCTTTCTCTCATCTTGAATGTAAAATAAGTTTGTATCAACTATTAAGTTAAAT
AAATGAATATGTTTTAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 4

CO CL3299Contig1 1305 4 7 U
GGTGGTGGTGCCCAGAAAAAGTTTGATACTAAACATGAATGGAAACACATTAACATTATG
TAATAACGATCTATTTTCTTTTTCAGCAGAAACCATTGCT*ATCCATTTTGTACTAAGAT
CCTCCTATCCTCACTTAGCTTAAAGGCTCTCTGAGACAGCCTCCTGGTAGGAGAAAACGA
AAGCGGGCGGCATTCTGAATCAAAAACGCAGGTAGATGCACAGCAGATGCAGAAGGCGGG
ATCGGTCCGATTTTGCTAATCAAATCTCTGAAGCTGTATTCTTCAGGAAGCATGTCAAAG
AGATCATACCCTTTACAAATACGTTTCTGTATCCTGGAGTAGTCAAGAAACTCCTTGCGC
CTCACTCTATCCGCATGGCTATACCCTTTCATCTTGAACACAAACTCGCTGAAACGTCTG
AAACAGAAGCTACAATGCCACCCGGCGTCAGACAGTATCAAGTCGGTCTGCCGGGAGTGG
CGGTAGTGAGTCCATTTCCTGCTGTATAAATGCACGGACGCTCTCCAGCTGCTGTAATCA
ACAGGGAACTCGAAGGAGTACATGTAATCCCTCATCTCAAGATGCATCACGTCCGGTATC
CCGTCGCACCACTGTAGGAGCTTGACGGTATGAGGACTGGGAATCTCATCCGCATCAGAC
ATTATCACCGCGTCTCCATCAGAGACATCAGCTTCTCTGAGGAGCCAGTTCATAGCAACC
CGTTGCCGGCCTTCGAGCAAGAATGGATCTTCTTCTTGTAAACTACTACGCTTCTGCCCG
GGGAACACCCCGTGGACTATCTTACCCTCCGCGAAGGCGAATCTCGCCTTCGCGGAGTCG
AAAAAGAGAGGCTTGGGGATGCCAGTGAAGGTGGTGTTGGATTCAAGAATGACGAATTTT
GAAACGTAGGGTCCAAGCTCCTGCCATCTCGCCTCTAGGAGGTCGAGCTCGTTGCTGAAG
ATGATGGCGTCGAAGACTCGCCTTGGAGAAGTACGGGGAGTCCATCCGTGGAGGTGGCAG
AGGTGTGACATGGAGACGTTCTCGGCGTAGTAATGCGGGATTCGTCTGAATGGTGGTGGT
GGTTTGTCCCAGAGAGGACGGAAGAGATATGATAAGGTTTGAAGGTTTGTGAGGATGCCA
AACAAACATGTTGAGGAAAGGATAAGAAGAGCTGGCAATAGAACAAGTTTAGGTGGCGAT
TTGGGCAACGCTCTCTTACTCATTTCATTCCCTTATTCCAGATTTATCGAGGTTTCAGAT
TTTCCTTAGCTACGAGATTGGAGTAATTTAGAAGAGGAGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H129JQ U 1
AF RR4H129TF C 12
AF RR4B635JQ U 10
AF RR4B635TF C 503
BS 1 25 RR4H129JQ
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BS 701 701 RR4B635JQ
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BS 800 1305 RR4B635TF

RD RR4H129JQ 723 0 0
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TAATAACGATCTATTTTCTTTTTCAGCAGAAACCATTGCT*ATCCATTTTGTACTAAGAT
CCTCCTATCCTCACTTAGCTTAAAGGCTCTCTGAGACAGCCTCCTGGTAGGAGAAAACGA
AAGCGGGCGGCATTCTGAATCAAAAACGCAGGTAGATGCACAGCAGATGCAGAAGGCGGG
ATCGGTCCGATTTTGCTAATCAAATCTCTGAAGCTGTATTCTTCAGGAAGCATGTCAAAG
AGATCATACCCTTTACAAATACGTTTCTGTATCCTGGAGTAGTCAAGAAACTCCTTGCGC
CTCACTCTATCCGCATGGCTATACCCTTTCATCTTGAACACAAACTCGCTGAAACGTCTG
AAACAGAAGCTACAATGCCACCCGGCGTCAGACAGTATCAAGTCGGTCTGCCGGGAGTGG
CGGTAGTGAGTCCATTTCCTGCTGTATAAATGCACGGACGCTCTCCAGCTGCTGTAATCA
ACAGGGAACTCGAAGGAGTACATGTAATCCCTCATCTCAAGATGCATCACGTCCGGTATC
CCGTCGCACCACTGTAGGAGCTTGACGGTATGAGGACTGGGAATCTCATCCGCATCAGAC
ATTATCACCGCGTCTCCATCAGAGACATCAGCTTCTCTGAAGAGCCAGTTCATAGCAACC
CGT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4H129TF 742 0 0
CCAGAAAAAGTTTG*TACTAAACATGAATGGAAACACATTAACATTATGTAATAACGATC
TATTTTCTTTT*CAGCAGAAACCATTGCT*ATCCATTTTGTACTAAGATCCTCCTATCCT
CACTTAGCTTAAAGGCTCTCTGAGACAGCCTCCTGGTAGGAGAAAACGAAAGCGGGCGGC
ATTCTGAATCAAAAACGCAGGTAGATGCACAGCAGATGCAGAAGGCGGGATCGGTCCGAT
TTTGCTAATCAAATCTCTGAAGCTGTATTCTTCAGGAAGCATGTCAAAGAGATCATACCC
TTTACAAATACGTTTCTGTATCCTGGAGTAGTCAAGAAACTCCTTGCGCCTCACTCTATC
CGCATGGCTATACCCTTTCATCTTGAACACAAACTCGCTGAGACGTCTGAAACAGAAGCT
ACAATGCCACCCGGCGTCAGACAGTATCAAGTCGGTCTGCCGGGAGTGGCGGTAGTGAGT
CCATTTCCTGCTGTATAAATGCACGGACGCTCTCCAGCTGCTGTAATCAACAGGGAACTC
GAAGGAGTACATGTAATCCCTCATCTCAAGATGCATCACGTCCGGTATCCCGTCGCACCA
CTGTAGGAGCTTGACGGTATGAGGACTGGGAATCTCATCCGCATCAGACATTATCACCGC
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TTCGAGCAAGAATGGATCTTC
C

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4B635JQ 790 0 0
GC
CCAGAAAAAGTTTGATACTAAACATGAATGGAAACACATTAACATTATGTAATAACGATC
TATTTTCTTTTTCAGCAGAAACCATTGCTTATCTATTTTGTACTAAGATCCTCCTATCCT
CACTTAGCTTAAAGGCTCTCTGAGACAGCCTCCTGGTAGGAGAAAACGAAAGCGGGCGGC
ATTCTGAATCAAAAACGCAGGTAGATGCACAGCAGATGCAGAAGGCGGGATCGGTCCGAT
TTTGCTAATCAAATCTCCGAAGCTGTATTCTTCAGGAAGCATGTCAAAGAGATCATACCC
TTTACAAATACGTTTCTGTATCCTGGAGTAGTCAAGAAACTCCTTGCGCCTCACTCTATC
CGCATGGCTATACCCTTTCATCTTGAACACAAACTCGCTGAAACGTCTGAAACAGAAGCT
ACAATGCCACCCGGCGTCAGACAGTATCAAGTCGGTCTGCCGGGAGTGGCGGTAGTGAGT
CCATTTCCTGCTGTATAAATGCACGGACGCTCTCCAGCTGCTGTAATCAACAGGGAACTC
GAAGGAGTACATGTAATCCCTCATCTCAAGATGCATCACGTCCGGTATCCCGTCGCACCA
CTGTAGGAGCTTGACGGTATGAGGACTGGGAATCTCATCCGCATCAGACATTATCACCGC
GTCTCCATCAGAGGCATCAGCTTCTCTGAGGAGCCAGTTCATAGCAACCCGTTGCCGGCC
TTCGAGCAAGAATGGATCTTCTTCTTGTAAACTACTACGCTTCTGCCCGGGGAACACCCC
GTGGACTA

QA 3 790 3 790
DS 

RD RR4B635TF 803 0 0
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TGTAATCCCTCATCTCAAGATGCATCACGTCCGGTATCCCGTCGCACCACTGTAGGAGCT
TGACGGTATGAGGACTGGGAATCTCATCCGCATCAGACATTATCACCGCGTCTCCATCAG
AGGCATCAGCTTCTCTGAGGAGCCAGTTCATAGCAACCCGTTGCCGGCCTTCGAGCAAGA
ATGGATCTTCTTCTTGTAAACTACTACGCTTCTGCCCGGGGAACACCCCGTGGACTATCT
TACCCTCCGCGAAGGCGAATCTCGCCTTCGCGGAGTCGAAAAAGAGAGGCTTGGGGATGC
CAGTGAAGGTGGTGTTGGATTCAAGAATGACGAATTTTGAAACGTAGGGTCCAAGCTCCT
GCCATCTCGCCTCTAGGAGGTCGAGCTCGTTGCTGAAGATGATGGCGTCGAAGACTCGCC
TTGGAGAAGTACGGGGAGTCCATCCGTGGAGGTGGCAGAGGTGTGACATGGAGACGTTCT
CGGCGTAGTAATGCGGGATTCGTCTGAATGGTGGTGGTGGTTTGTCCCAGAGAGGACGGA
AGAGATATGATAAGGTTTGAAGGTTTGTGAGGATGCCAAACAAACATGTTGAGGAAAGGA
TAAGAAGAGCTGGCAATAGAACAAGTTTAGGTGGCGATTTGGGCAACGCTCTCTTACTCA
TTTCATTCCCTTATTCCAGATTTATCGAGGTTTCAGATTTTCCTTAGCTACGAGATTGGA
GTAATTTAGAAGAGGAGAGATCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 4

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CAAAGCAAGATGGAGGAAGACATGGCGAACCGTAGAGTGTCGAGTCGTACCCGTAAGGTT
GCTTCGAAGATGGCGGCTGCTCTTACAAGCACCGACAATCGAACCCAGGCTGCTATAGCT
AGGCTGGAAGCTTTAGAGAACGACAATGGGGCCTTGGAGGTGGTTGATTTGAACGATGAT
GAAGAAACATCTCTCGACGAAGAAGATGATCTCGGTTACGTGCAGAAGAAGCAACCCAAA
GGATCAAAGCGTAAAACTCGACAAGCGAAAGCTTTGGAAGCTCGTAAAGCTCCCAAGTCA
TTCACTGACCTCTTGCAGGAGGCAAATTTGGAGTCTTTACCGTCGCATGTTCCCACTTAC
TTGAAAGCAGCTGTGGGACCTCCGACCTCGTCTTCCCGTCGCCATTTCTGCACGGTCTGT
GGTTACATTGCAAGCTACAGTTGCTGCTTATGTGGGATGCGGTTTTGTTCTATCCGTTGC
CAAAACATTCACAAGGACACTCGTTGTCAGAAGTTTGTTGCATAAGGAGGAGAATAAATG
TAAAAACAGCATTTTTTTCAAAAAATTGTACTGAAACATCACCACATCAACTTGTGTTCT
CTCTCTGTCATGAATGTGTGAAACTAGCCAAAGAAAAAAAA*CAGCGACGTTTCTCTCTA
ACAGTGTTCTTATGATTTTAGAAAGAATTCAATCAAACGTGGGACATCTGTTGTTTGAGC
TTTTCCAGTAGCTTTCTCTTAGATTCACAGATCTGGAGAAACTCACGGAGGACACTCTGT
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C

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CCC

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AAGCAAATGTAACATAAGCAAAGTGTAGAGGAGGATGACGATATGATGATGATTTTACAT
GTAAAGGCCTTCAGGGACGCCTTCTTTCTTCTTGAACATAACCTTCTCTTTGGCTTTCTT
GAAATCCGGATGAGTCACCTTCATACGACGCTCCCTGAGAGCAAGAAGACCAGCCTCAGT
GCAAATAGCCTTGATATCAGCTCCTGAGAACTCATCCTTCGTCATCACAAACTCTTCCAA
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AGGGTCAAGACTCTCGA
CCC

QA 1 437 1 437
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CATAAGCAAAGTGTAGAGGAGGATGACGATATGATGATGATTTTACATGTAAAGGCCTTC
AGGGACGCCTTCTTTCTTCTTGAACATAACCTTCTCTTTGGCTTTCTTGAAATCCGGATG
AGTCACCTTCATACGACGCTCCCTGAGAGCAAGAAGACCAGCCTCAGTGCAAATAGCCTT
GATATCAGCTCCTGAGAACTCATCCTTCGTCATCACAAACTCTTCCAAGTTTACATCTTC
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AAGTGGGAACTCGATCTTCCTATCAATACGTCCAGGTCAAAGAAGTGCAGGGTCAAGACT
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ATACCGCTTGGTACCAACAGCATCAATCTCGTCAATGAAGACTATTGAAGGTGAAAGGTC
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CAGTTCACTACCAACAACTCTCAAGAAAGTAGCTGATGTAGAGTTCGCCACCGCCTTAGC
AAGCAGAGTCTTCCCAGTT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

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TCTTCACTCTTCGTTTAGGTTTCATGTTGTTGCTGTTTTATCTATTCCGTGATGACTTTT
TGTTTTTGCAAATTTTGGAGACTATACAATTGCCTTCGGATTATGGTTTTAAACGAATAC
CTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES34TF U 1
AF RR4H775TF U 49
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TCTTCACTCTTCGTTTAG*TTTCATGTTGTTGCTGTTTTATCTATTGCGTGATGACTTTT
GT

QA 1 780 1 780
DS 

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GG
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ACAAGGCCAAACAAGGATTTGTGGTGTACCGTGTCCGTGTGAGACGTGGTGGACGCAAGA
GGCCAGTGCCAAAGGGTATTGTGTATGGTAAGCCCACAAACCAGGGAGTCACCCAACTCA
AGTTCCAGAGGAGCAAGCGTTCTGTTGCCGAGGAGCGTGCTGGAAGGAAACTTGGCGGCC
TCAGAGTCGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACCTACAAGTACTACGAGATCA
TCTTGGTTGACCCGGCACACAACGCAGTACGTAACGACCCGAGGATCAACTGGATCTGCA
ACCCGGTTCACAAACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACGTCCGAGGGAAAGAAGAACAGAG
GACTGCGCGGAAAAGGGCACAACAACCACAAGAACCGCCCGTCTCGCAGAGCAACCTGGA
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TCTGCTGCTATCTTCACTCTTCGTTTAG*TTTCATGTTGTTGCTGTTTTATCTATTCCGT
GATGACTTTT
GTTTT

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR4H775JQB 606 0 0
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GACCTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGTTGACCCGGCACACAACGCAGTACGTAACGA
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CCCGTCTCGCAGAGCAACCTGGAAGAAGAACAACTCTCTCTCCCTTCGTCGTTACCGTTG
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TGTTGCTGTTTTATCTATTCCGTGATGACTTTTTGTTTTTGCAAATTTTGGAGACTA
CAATTGCCT

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CTGCGAGATCATCTTGGTTGACCCGGCACACAACGCAGTGCGTAACGACCCGAGGATCAA
CTGGATCTGCAACCCTGTGCACAAACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACGTCCGAGGGAAA
GAAGAACAGAGGACTGCGCGGAAAAGGGCACAACAACCACAAGAACCGCCCGTCTCGCAG
AGCAACCTGGAAGAAGAACAACTCTCTCTCCCTTCGTCGTTACCGTTGATTGCTCTTTTG
CTATCATTGTTTCTGCTGCTATCTTCACTCTTCGTTTAGGTTTCATGTTGTTGCTGTTTT
ATCTATTGCGTGATGACTTTTTGTTTTTGCAAATTTTGGAGACTATACAATTGCCTTCGG
ATTATGGTTTTAAACGAATACCTTTGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 0 0

AS 1 4

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ACACCAAATGGATTCTGAGCTGAAGCTTTCTTCGAGAGACGTTGTGAAATGCTGTGATTA
CTCCTCCTCCTCCTCCCTCGAGGCATCAGCAGACCCTTTGACTAGTAGAACGGTGAAAAG
AAAGCTCAGCGACAGGTTCCTGTTACGCGGCTCTTCTGATCTATCTTCAAACGCAGCGAA
GTCGCTAGTCGAAAACCAATGCGCTGCTTTGCTGGAGGATCTTTCTTCCCAGAGGAAGAC
GGTGAAGGATCTTCACCTGGAGCTCGAGGAAGAGAGAAAAGCCGCCGCGTCGGCAGCCAA
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TAGGCAGTTCAAAGCGTTTGCTGAGGAGAAGATGACGCATGACCAAGAAAAGCTTTTGGT
TCTGGAGGAGTTGTTGTATGAGAAAGAGCAAGCTATTGAGGCTTTGACTTATGAGGTGGA
GGCTTACAAGGATAGACTGTTGAGCTATGGGGTTACTGAAGGGGAGATGAATGATCAGAT
ACTTGGGTTTGGTAGAGACTCTAGCACGGTGGGTGTTGATGTTTACCCTTGTGAGTATAC
CCCCTTCAAGTGTAGTGTGGATGATGATAACCTGAGTGGAGTTGGTCAGTCTCCAAAATG
GCCTTATTATGATCCAAATTCGCCTTTAG*AACTGCGAAGGAGATAAAGGGGACAGAGTT
TTCTGCAGACTCTCCTATGTCTGCTACCAGTGACAGAGTTTATACTATTGACTCGATTAA
GATTGTGGACGAGCCTAGTAGGTTGAGCAAGGGGAAGTTAAACGGTGATCATTGGGATTC
TCCGAGGAACCAAGAACCGTTTGGAAAGACTCAGCAAGGAGTTAATGAGGCAGGGATTGA
GAAGCTTTACACAAAGCTTCAAGCACTTGAGGCTGATAGGGAATCGTTGAGACAGATCAT
TGTGTCTATGCGGACAGACAAAGCTCAGTTGGTGTTGCTGAAAGAATACGCACAGCGTCT
ATCAAAGGAAACTGTCGCAACGAGCAGGCGAAACCCGGTTAGCAAAATGCCATATTTCAA
AGCACTCTCTGTAGTAATGGCCTTCAAGTGGATGGTGTCTTTCGTTTCTTGGAGAAGGAA
AGCCAAGCGAAACAAGTATGTGTATGATATGTCAGCAAATAATATGGGGATGCTTATGAT
GCTAGGGGAGGGATCTCGAAGTAGGAGATGGAGTTGTTTAACAAGTTCACATGTCTTAAG
ATAATCCTTTCTTCTTCTTTTTTTCTCTCTTGTGCAATAATAGGTAGTCCAAATTGAATG
TGCATCTCTCTTTATTGTATGGATATGGTTCAGATTCTTGATGAAAATATAACAATCCAA
AGTTCATTCTTTTTTTCCTCTTTGTTTTTGGATTGTACATCTCTTCAAGGCAAAGACAAT
AACACAAAAGTCACTCTTGTCATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B076TF U 1
AF RR4B276TF U 1
AF RR4B276JQ C 655
AF RR4B076JQ C 751
BS 1 759 RR4B076TF
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BS 773 839 RR4B076TF
BS 840 1525 RR4B276JQ

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ACACCAAATGGATTCTGAGCTGAAGCTTTCTTCGAGAGACGTTGTGAAATGCTGTGATTA
CTCCTCCTCCTCCTCCCTCGAGGCATCAGCAGACCCTTTGACTAGTAGAACGGTGAAAAG
AAAGCTCAGCGACAGGTTCCTGTTACGCGGCTCTTCTGATCTATCTTCAAACGCAGCGAA
GTCGCTAGTCGAAAACCAATGCGCTGCTTTGCTGGAGGATCTTTCTTCCCAGAGGAAGAC
GGTGAAGGATCTTCACCTGGAGCTCGAGGAAGAGAGAAAAGCCGCCGCGTCGGCAGCCAA
CGAGACGATGTCGATGATACTGAGGCTGCAGAGAGAGAAGGCCGAGATACAGATGGAAGC
TAGGCAGTTCAAAGCGTTTGCTGAGGAGAAGATGACGCATGACCAAGAAAAGCTTTTGGT
TCTGGAGGAGTTGTTGTATGAGAAAGAGCAAGCTATTGAGGCTTTGACTTATGAGGTGGA
GGCTTACAAGGATAGACTGTTGAGCTATGGGGTTACTGAAGGGGAGATGAATGATCAGAT
ACTTGGGTTTGGTAGAGACTCTAGCACGGTGGGTGTTGATGTTTACCCTTGTGAGTATAC
CCCCTTCAAGTGTAGTGTGGATGATGATAACCTGAGTGGAGTTGGTCAGTCTCCAAAATG
GCCTTATTATGATCCAAATTCGCCTTTAG*AACTGCGAA*GAGATAAAGGGGACAGAGTT
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GATTGTGGACGAGCC

QA 1 839 1 839
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AAGGAAAGCCAAGCGAAACAAGTATGTGTATGATATGTCAGCAAATAATATGGGGATGCT
TATGATGCTAGGGGAGGGATCTCGAAGTAGGAGATGGAGTTGTTTAACAAGTTCACATGT
CTTAAGATAATCCTTTCTTCTTCTTTTTTTCTCTCTTGTGCAATAATAGGTAGTCCAAAT
TGAATGTGCATCTCTCTTTATTGTATGGATATGGTTCAGATTCTTGATGAAAATATAACA
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GACAATAACACAAAAGTCACTCTTGTCATGC

QA 1 871 1 871
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GGGGAAGTTAAACGGTGATCATTGGGATTCTCCGAGGAACCAAGAACCGTTTGGAAAGAC
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GGCTGATAGGGAATCGTTGAGACAGATCATTGTGTCTATGCGGACAGACAAAGCTCAGTT
GGTGTTGCTGAAAGAATACGCACAGCGTCTATCAAAGGAAACTGTCGCAACGAGCAGGCG
AAACCCGGTTAGCAAAATGCCATATTTCAAAGCACTCTCTGTAGTAATGGCCTTCAAGTG
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GTCAGCAAATAATATGGGGATGCTTATGATGCTAGGGGAGGGATCTCGAAGTAGGAGATG
GAGTTGTTTAACAAGTTCACATGTCTTAAGATAATCCTTTCTTCTTCTTTTTTTCTCTCT
TGTGCAATAATAGGTAGTCCAAATTGAATGTGCATCTCTCTTTATTGTATGGATATGGTT
CAGATTCTTGATGAAAATATAACAATCCAAAGTTCATTCTTTTTTTCCTCTTTGTTTTTG
GATTGTACATCTCTTCAAGGCAAAGACAATAACACAAAAGTCACTCTTGTCATGC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 3

CO CL3305Contig1 820 3 7 U
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AGAGTTATATAAGCTCAACAATGGTTGTAGAACAACCGAACAGGTTTGGGGTTTGGTTGG
TTACTCTGTGGCTGGTTTCTCGGTGGGTTCTTCTTCTTCTTGACTATCTTGGAGCTTGAA
AACACGGAAAATTGCTAGATTCGTATCTCCAAAGGTGATTCGGGTTCCGGGAAAGGCAGG
AGCAGCAACACCAGGGATCAGACGTTTGTCTTCGATGAATGTACCATTTGTACTGTTCAT
ATCCGTTACAAGAAGGTTGTCTCTTTGTGTATCAATTGTCGCATGTACTCCCGAGACGGT
GGCCACAGGAATCACAACGTCAGCCTTTTCAGGTAGCCGTCCGATGGTAACTTGACCGGA
AGAGATCTCGAAAGGAGCAGGCATTTCCACTTTGTAACCAATGTGTCTTGTGTCTCCATC
TCCAACTGGTTGGAGAAGCCACCGTTCTCTTTTGGTGGCAGAAGCTGGGGGTTGACTCCC
ATCCACGGAGGCGGAGGCGCGTGTTGTTGTTGTCCTCACCACCGGCGCATGGCTTCTGTG
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AACCCGTGAGCACAACTGGGATGTTGTTGATATCTCCATTTGTTTTTCTTCTTCTAAGCT
ACTTCTTTGATAAACTAAAGATTCTTGTTCTTGAAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F438JQ U 1
AF RR4BB12JQ U 10
AF RR4BB12TF C 48
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QA 1 257 1 257
DS 

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DS 

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GGGGTTTGGTTGGTTACTCTGTGGCTGGTTTCTCGGTGGGTTCTTCTTCTTCTTGACTAT
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TTGTACTGTTCATATCCGTTACAAGAAGGTTGTCTCTTTGTGTATCAATTGTCGCATGTA
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GGGGTTGACTCCCATCCACGGAGGCGGAGGCGCGTGTTGTTGTTGTCCTCACCACCGGCG
CATGGCTTCTGTGTTTCTTCTTGGCAGTGAAGCTAATGTTACCGAACTCTTTCAAGCAAT
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AGATTGAGAACTTAACCCGTGAGCACAACTGGGATGTTGTTGATATCTCCATTTGTTTTT
CTTCTTCTAAGCTACTTCTTTGATAAACTAAAGATTCTTGTTCTTGAAATTCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RR4BX41JQ U 6
AF RR4FC75TF C 1
AF RR4FC75JQ U 4
AF RR4BX41TF C 10
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AAAA
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DS 

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AGGCCTTGCGAGACTTCGTATTGGTCTTGGATAACGCTTTTGGGACATGTTTTGTTTTCG
GGTTTGGACATGGTTAGTCCCCCGCCTCGACCGCGAACTACAGGCAAGATGTAGTATTTG
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CC

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DS 

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AAAAAA
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CC

QA 7 714 7 714
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GAGACTTCGTATTGGTCTTGGATAACGCTTTTGGGACATGTTTTGTTTTCAGGTTTGGAC
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CCGTGGTGACTGATAAAGAAGACGGCTAAGAGGAGGGAGATATAGAGAAGTAGTGATGAC
ATTGTAGGAAACTTTCTTTTTATGGAAACTTTTCTTTTCAGTATGATTTCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 3

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GAACAGTGTGCTTCCATCTGCACTCCAGTTCAAGCTTGTACAGTAGTTCACCTTCTTCTG
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CGAGTAAAGCTTCTTCCCCTCAGCCAAATCCCACAACAAGATCACACCATCTTTCCCACC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4GE33JQ U 1
AF RR4GE33TF C 80
AF RR4D444JQ U 13
BS 1 24 RR4GE33JQ
BS 25 25 RR4D444JQ
BS 26 640 RR4GE33JQ
BS 641 645 RR4D444JQ

RD RR4GE33JQ 641 0 0
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CTTAGTTTTCTTTTCTGGAATTAAACAAAAATAGAGGTTCTTGGAGGGGCTAATACATAA
GAAATCTTCAAAAACACGAAAGCAGATTTGGTAACATCCATCTTCTTATCCATCTTCTTC
TTAGAGTATCTAGTAACGACCAATACCCCAGACCCTGACAACTCCATCAGTGTAACCACT
GAACAGTGTGCTTCCATCTGCACTCCAGTTCAAGCTTGTACAGTAGTTCACCTTCTTCTG
GTTACCAGTTCCGACACCACCACCATCCTTCTCCGCTTCCGCCTTAAGGTCAACCTTCAA
CTCATCAACAACGGTCTTGCTCTCAAGATCCCAGATCTTAATACTGCTATCCGTCGCAGC
ACACAGCCAGTACCTATTCGGACTAAAGCAAAGCGAGTGGATAATCGAGCCACCCTCAAG
CGAGTAAAGCTTCTTCCCCTCAGCCAAATCCCACAACAAGATCACACCATCTTTCCCACC
ACTCGCGCACAACGAACCATCGGGAGAAACCGCCACAGTGTTGAGGTAACCCGAGTGCCC
AGCGAGAGAGCTCTTCAGCTTACAGTTCTGAAGATTCCAC
C

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4GE33TF 562 0 0
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AAGCAGATTTGGTAACATCCATCTTCTTATCCATCTTCTTCTTAGAGTATCTAGTAACGA
CCAATACCCCAGACCCTGACAACTCCATCAGTGTAACCACTGAACAGTGTGCTTCCATCT
GCACTCCAGTTCAAGCTTGTACAGTAGTTCACCTTCTTCTGGTTACCAGTTCCGACACCA
CCACCATCCTTCTCCGCTTCCGCCTTAAGGTCAACCTTCAACTCATCAACAACGGTCTTG
CTCTCAAGATCCCAGATCTTAATACTGCTATCCGTCGCAGCACACAGCCAGTACCTATTC
GGACTAAAGCAAAGCGAGTGGATAATCGAGCCACCCTCAAGCGAGTAAAGCTTCTTCCCC
TCAGCCAAATCCCACAACAAGATCACACCATCTTTCCCACCACTCGCGCACAACGAACCA
TCGGGAGAAACCGCCACAGTGTTGAGGTAACCCGAGTGCCCAGCGAGAGAGCTCTTCAGC
TTACAGTTCTGAAGATTCCAC
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4D444JQ 633 0 0
G
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TCTGGAATTAAACAAAAATAGAAGTTCTTGGAGGGGCTAATACATAAGAAAACTTCAAAA
ACACGAAAGCAGATTTGGTAACATCCATCTTCTTATCCATCTTCTTCTTAGAGTATCTAG
TAACGACCAATACCCCAGACCCTGACAACTCCATCAGTGTAACCACTGAACAGTGTGCTT
CCATCTGCACTCCAGTTCAAGCTTGTGCAGTAGTTCACCTTCTTCTGGTTACCAGTTCCG
ACACCACCACCATCCTTCTCCGCTTCCGCCTTAAGGTCAACCCTCAACTCATCAACAACG
GTCTTGCTCTCAAGATCCCAGATCTTAATACTGCTCTCAGTCGCAGCACACAGCCAGTAC
CTATTCGGACTAAAGCAAAGCGAGTGAATAATCGACCCACCCTCAAGCGAGTAAAGCTTC
TTCCCCTCAGCCAAATCCCACAACAAGATCACACCATCTTTCCCACCACTCGCGCACAGC
GAACCATCAGGCGACACAGCAACAGTGTTGAGGTAACCCGAGTGCCCAGCGAGAGAGCTC
TTCAGCTTACAGTTCTGAAGGTTCCACACTTT

QA 2 633 2 633
DS 



AS 1 4

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CTTCTCCCAGGCGATTCTACAAGCATGAGTCGATCAGGTCAGCCTCCGGATCTCAAGAAG
TACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTTAATGCCAACAGAATGGTGGTTGGAACTCTC
CGTGGGTTTGACCAGTTCATGAATCTTGTTGTGGATAACACTGTTGAAGTCAATGGTGAT
GACAAAACTGACATTGGCATGGTGGTGATAAGAGGAAACAGCATTGTCACCGTTGAAGCT
CTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCTTTTCTTTTTTTATTACATTGCACTATCTGTAATG
ATTTCCTCTATTTTGACTCTCGCTGTATTGGAACTTAATTAGTAGAACTATCAGCTGAAT
CGATCATGAAGAAGTTTGATATGATGAATTTACTCTTCTTTGTCAACACTCTCCTATGTT
ATGTATGAACCTGTTAGATGGTTATATGCCAATCTGATTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4F435JQ C 31
AF RR4F435TF U 31
AF RR4F512TF U 31
AF RR4FN40TF U 1
BS 1 525 RR4FN40TF

RD RR4F435JQ 434 0 0
GAAAAACCCTAATCTCTCCTTTTCCATCGTCTTCTCCCAGGCGATTCTACAAGCATGAGT
CGATCAGGTCAGCCTCCGGATCTCAAGAAGTACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTT
AATGCCAACAGAATGGTGGTTGGAACTCTCCGTGGGTTTGACCAGTTCATGAATCTTGTT
GTGGATAACACTGTTGAAGTCAATGGTGATGACAAAACTGACATTGGCATGGTGGTGATA
AGAGGAAACAGCATTGTCACCGTTGAAGCTCTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCTTTTC
TTTTTTTATTACATTGCACTATCTGTAATGATTTCCTCTATTTTGACTCTCGCTGTATTG
GAACTTAATTAGTAGAACTATCAGCTGAATCGATCATGAAGAAGTTTGATATGATGAATT
TACTCTTCTTTG
AC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4F435TF 434 0 0
GAAAAACCCTAATCTCTCCTTTTCCATCGTCTTCTCCCAGGCGATTCTACAAGCATGAGT
CGATCAGGTCAGCCTCCGGATCTCAAGAAGTACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTT
AATGCCAACAGAATGGTGGTTGGAACTCTCCGTGGGTTTGACCAGTTCATGAATCTTGTT
GTGGATAACACTGTTGAAGTCAATGGTGATGACAAAACTGACATTGGCATGGTGGTGATA
AGAGGAAACAGCATTGTCACCGTTGAAGCTCTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCTTTTC
TTTTTTTATTACATTGCACTATCTGTAATGATTTCCTCTATTTTGACTCTCGCTGTATTG
GAACTTAATTAGTAGAACTATCAGCTGAATCGATCATGAAGAAGTTTGATATGATGAATT
TACTCTTCTTTG
AC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4F512TF 434 0 0
GAAAAACCCTAATCTCTCCTTTTCCATCGTCTTCTCCCAGGCGATTCTACAAGCATGAGT
CGATCAGGTCAGCCTCCGGATCTCAAGAAGTACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTT
AATGCCAACAGAATGGTGGTTGGAACTCTCCGTGGGTTTGACCAGTTCATGAATCTTGTT
GTGGATAACACTGTTGAAGTCAATGGTGATGACAAAACTGACATTGGCATGGTGGTGATA
AGAGGAAACAGCATTGTCACCGTTGAAGCTCTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCTTTTC
TTTTTTTATTACATTGCACTATCTGTAATGATTTCCTCTATTTTGACTCTCGCTGTATTG
GAACTTAATTAGTAGAACTATCAGCTGAATCGATCATGAAGAAGTTTGATATGATGAATT
TACTCTTCTTTG
AC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4FN40TF 525 0 0
GGAATCGAGCGGAGTTCTGAGCTGAGCTGAGAAAAACCCTAATCTCTCCTTTTCCATCGT
CTTCTCCCAGGCGATTCTACAAGCATGAGTCGATCAGGTCAGCCTCCGGATCTCAAGAAG
TACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTTAATGCCAACAGAATGGTGGTTGGAACTCTC
CGTGGGTTTGACCAGTTCATGAATCTTGTTGTGGATAACACTGTTGAAGTCAATGGTGAT
GACAAAACTGACATTGGCATGGTGGTGATAAGAGGAAACAGCATTGTCACCGTTGAAGCT
CTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCTTTTCTTTTTTTATTACATTGCACTATCTGTAATG
ATTTCCTCTATTTTGACTCTCGCTGTATTGGAACTTAATTAGTAGAACTATCAGCTGAAT
CGATCATGAAGAAGTTTGATATGATGAATTTACTCTTCTTTGTCAACACTCTCCTATGTT
ATGTATGAACCTGTTAGATGGTTATATGCCAATCTGATTTCTGTT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 4

CO CL3309Contig1 803 4 15 U
GGAGTCATATCAGAATTCACAACTCATAATAAGCAAATAAATCTCAGAACTCATATTCGA
TTGGACTCCAGGAGTAAGGGCAGGGTTTTACGACCACTTCGACAAAAATATGAAAGAAAG
GAAATCTGCGAAGCTGAATCATCAAGACAACGATGAACAACTGATCCACCACGAAAACAG
TCACCTGGGTTCCTTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGA
TCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGACAATTTGTTGGATTGCTCTGCGGATTGAT
TTGGGGTGCTATACCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTCCTGTTTCTGGTGATCTCCTC
AGGCATCGTATATGGTTACTATGCATTGATTCTAAAGATCGATGAAGAAGACTATGGGGG
TCATGCAGCTCTTCTCCAGGATGGTTTATTTGCTTCTCTAAGTGTATTCCTGCTTGCGTG
GATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTCATAGAGACGCACTGTGTCTTGCGCTTAAGT
GTTGCTTTAGCCTCTGCTCGGAAGAAGTTTAGAAGAATATGCCTTTCTTGGTTTCTCCGA
TTACAGTCTTCTTTACGCTGCTTTTGATGCTTGCTTTTGTGTTTCTTAAGATGGGAACTA
GCATTGGTAGATCTTATTGGTTTGCTTTAGTTTTGTCTACTATTTTCTTTTTTTTTTATT
TTGTTTAAAAAACTAAAAGTATTATGTGTTCATGCTACAGAATGGTAACTTTTTCCAGGG
TTTATCTAGATTTGGGTCAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD63TF U 1
AF RR4GV12TF U 39
AF RR4GV12JQ C 74
AF RR4CD63JQ C 394
BS 1 93 RR4CD63TF
BS 94 94 RR4GV12TF
BS 95 433 RR4CD63TF
BS 434 434 RR4GV12TF
BS 435 510 RR4CD63TF
BS 511 511 RR4GV12TF
BS 512 689 RR4CD63TF
BS 690 716 RR4GV12TF
BS 717 717 RR4GV12JQ
BS 718 731 RR4GV12TF
BS 732 732 RR4GV12JQ
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BS 783 783 RR4GV12JQ
BS 784 796 RR4GV12TF
BS 797 803 RR4CD63JQ

RD RR4CD63TF 689 0 0
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TTGGACTCCAGGAGTAAGGGCAGGGTTTTACGATCACTTCGACAAAAATATGAAAGAAAG
GAAATCTGCGAAGCTGAATCATCAAGACAACGATGAACAACTGATCCACCACGAAAACAG
TCACCTGGGTTCCTTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGA
TCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGACAATTTGTTGGATTGCTCTGCGGATTGAT
TTGGGGTGCTATACCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTCCTGTTTCTGGTGATCTCCTC
AGGCATCGTATATGGTTACTATGCATTGATTCTAAAGATCGATGAAGAAGACTATGGGGG
TCATGCAGCTCTTTTCCAGGATGGTTTATTTGCTTCTCTAAGTGTATTCCTGCTTGCGTG
GATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTC*TAGAGACGCACTGTGTCTTGCGCTTAAGT
GTTGCTTTAGCCTCTGCTCGGAAGAAGTTTAGAAGAATATGCCTTTCTTGGTTTCTCCGA
TTACAGTCTTCTTTACGCTGCTTTTGATGCTTGCTTTTGTGTTTCTTAAGATGGGAACTA
GCATTGGTAGATCTTATTGGTTTGCTTTA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4GV12TF 761 0 0
GG
ATCTCAGAACTCATATTCGATTGGACTCCAGGAGTAAGGGCAGGGTTTTACGACCACTTC
GACAAAAATATGAAAGAAAGGAAATCTGCGAAGCTGAATCATCAAGACAACGATGAACAA
CTGATCCACCACGAAAACAGTCACCTGGGTTCCTTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCA
GAAGCTTCCTGGGACAAGGATCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGACAATTTGTT
GGATTGCTCTGCGGATTGATTTGGGGTGCTATACCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTC
CTGTTTCTGGTGATCTCCTCAGGCATCGTATATGGTTACTATGCATTGATTCTAAAGATC
GATGAAGAAGACTATGGGGGTCATGCAGCTCTTCTCCAGGATGGTTTATTTGCTTCTCTA
AGTGTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGATAGAGACGC
ACTGTGTCTTGCGCTTAAGTGTTGCTTTAGCCTCTGCTCGGAAGAAGTTTAGAAGAATAT
GCCTTTCTTGGTTTCTCCGATTACAGTCTTCTTTACGCTGCTTTTGATGCTTGCTTTTGT
GTTTCTTAAGGTGGGAACTAGCATTGGTAGATCTTATTGGTTTGCTTTAGTTTTGTCTAC
TATTTTCTTTTTTTTT*ATTTTGTTTAAAAA*CTAAAAGTATTATGTGTTCATGCTACAG
AATGGTAACTTTTTCCAGGGTT*ATCTAGATTTGGG
CCA

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR4GV12JQ 725 0 0
GTAAGGGCAGGGTTTTACGACCACTTCGACAAAAATATGAAAGAAAGGAAATCTGCGAAG
CTGAATCATCAAGACAACGATGAACAACTGATCCACCACGAAAACAGTCACCTGGGTTCC
TTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGATCAACTAGGAGAT
GTGTTGCATTGGATCAGACAATTTGTTGGATTGCTCTGCGGATTGATTTGGGGTGCTATA
CCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTCCTGTTTCTGGTGATCTCCTCAGGCATCGTATAT
GGTTACTATGCATTGATTCTAAAGATCGATGAAGAAGACTATGGGGGTCATGCAGCTCTT
CTCCAGGATGGTTTATTTGCTTCTCTAAGTGTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTAT
AGCTTGTCTAGCTTCTGATAGAGACGCACTGTGTCTTGCGCTTAAGTGTTGCTTTAGCCT
CTGCTCGGAAGAAGTTTAGAAGAATATGCCTTTCTTGGTTTCTCCGATTACAGTCTTCTT
TACGCTGCTTTTGATGCTTGCTTTTGTGTTTCTTAAGGTGGGAACTAGCATTGGTAGATC
TTATTGGTTTGCTTTAGTTTTGTCTACTATTTTCTTTTTTTTTTATTTTGTTTAAAAAAC
TAAAAGTATTATGTGTTCATGCTACAGAATGGTAACTTTTTCCAGGGTTTATCTAGATTT
GGG
CC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CD63JQ 410 0 0
AAAGATCGATGAAGAAGACTATGGGGGTCATGCAGCTCTTTTCCAGGATGGTTTATTTGC
TTCTCTAAGTGTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTC*TA
GAGACGCACTGTGTCTTGCGCTTAAGTGTTGCTTTAGCCTCTGCTCGGAAGAAGTTTAGA
AGAATATGCCTTTCTTGGTTTCTCCGATTACAGTCTTCTTTACGCTGCTTTTGATGCTTG
CTTTTGTGTTTCTTAAGATGGGAACTAGCATTGGTAGATCTTATTGGTTTGCTTTAGTTT
TGTCTACTATTTTCTTTTTTTTTTATTTTGTTTAAAAAACTAAAAGTATTATGTGTTCAT
GCTACAGAATGGTAACTTTTTCCAGGGTTTATCTAGATTTGGGTCAAGAA

QA 1 410 1 410
DS 



AS 2 4

CO CL3310Contig1 964 2 2 U
GGGCCGGTGACGAGAGGTTTCGATAAGGACGATGGAGAACTCAGTAAACAAGAGAGAACA
ACTATCGACGCCATTGTTAACGCCAGGTGCAATAGTTCATCTTCCTCTCTGCAACTCTGC
ATTTCTAGAAGCTTAACTTTCCTCATCTCCTTTCACCTTGCAGCTCATATGCTTTGTCGA
TTGTTTTAATCGGTGTTGGAGACGGTCCATGGGAAGACATGAGGAAGTTCGATGACAAGA
TCCCTAAGCGTGAGTTCGACAACTTTCAGGTGACATCTCATTCCCAAGTTTCAGTTCCAT
CAGTATCCTTCCCCCTTTCTTCGAATCTTGATCTGCTCTCCGCAAAGTTTGTGAATTTCA
CAGAGATCATGAAGAGAGATTCATCAGAGTCAACCAAAGAAACTGCATTTGCTCTTGCTG
CTCTCATGGAGATTCCCTTTCAGTATCGAGCAGCAACCGAACTCAGCTTACTAGGGAAAA
AAACGGGCTTAGCTAAATAAACCCGAGGCCACCACCTATTCCTTACACGCCTACTATTCG
TACTGACCTACCAGCACCTGCATCAGACGAACATACTCAGAATTGCCCAATTTGTCTGAC
TAGCCGGAAAGACGTGGCTTTTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAG
GATATCAAACTGTCCCATCTGCAGAGTACCGATCACAAGCCGGCTAAAGCTTTACACGTG
ATCTCGGTGCCTTTGCCCATAACAAAAAAAAACACTTGCACATACTGTCTTTCTCCATCT
CAGAATCTCCGGTTTGGTGTTTATCAAGTGTCTCTTACATTGTTCCAGAATCAACTCGTA
CCATTCAGTTTCCTATGTACTTATAAATATTAGTTAGCTTGCAAGCAAGAATGATGAAGA
TTAGCAATGTACAAAAACATGGGTTTTACATTTTTATTCACTGTCACAAAAAATGTTTGA
AGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4A413TF U 1
AF RR4A413JQ C 161
BS 1 743 RR4A413TF
BS 744 964 RR4A413JQ

RD RR4A413TF 743 0 0
GGGCCGGTGACGAGAGGTTTCGATAAGGACGATGGAGAACTCAGTAAACAAGAGAGAACA
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TTGTTTTAATCGGTGTTGGAGACGGTCCATGGGAAGACATGAGGAAGTTCGATGACAAGA
TCCCTAAGCGTGAGTTCGACAACTTTCAGGTGACATCTCATTCCCAAGTTTCAGTTCCAT
CAGTATCCTTCCCCCTTTCTTCGAATCTTGATCTGCTCTCCGCAAAGTTTGTGAATTTCA
CAGAGATCATGAAGAGAGATTCATCAGAGTCAACCAAAGAAACTGCATTTGCTCTTGCTG
CTCTCATGGAGATTCCCTTTCAGTATCGAGCAGCAACCGAACTCAGCTTACTAGGGAAAA
AAACGGGCTTAGCTAAATAAACCCGAGGCCACCACCTATTCCTTACACGCCTACTATTCG
TACTGACCTACCAGCACCTGCATCAGACGAACATACTCAGAATTGCCCAATTTGTCTGAC
TAGCCGGAAAGACGTGGCTTTTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAG
GATATCAAACTGTCCCATCTGCAGAGTACCGATCACAAGCCGGCTAAAGCTTTACACGTG
ATCTCGGTGCCTTTGCCCATAAC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4A413JQ 804 0 0
CAGCTCATATGCTTTGTCGATTGTTTTAATCGGTGTTGGAGACGGTCCATGGGAAGACAT
GAGGAAGTTCGATGACAAGATCCCTAAGCGTGAGTTCGACAACTTTCAGGTGACATCTCA
TTCCCAAGTTTCAGTTCCATCAGTATCCTTCCCCCTTTCTTCGAATCTTGATCTGCTCTC
CGCAAAGTTTGTGAATTTCACAGAGATCATGAAGAGAGATTCATCAGAGTCAACCAAAGA
AACTGCATTTGCTCTTGCTGCTCTCATGGAGATTCCCTTTCAGTATCGAGCAGCAACCGA
ACTCAGCTTACTAGGGAAAAAAACGGGCTTAGCTAAATAAACCCGAGGCCACCACCTATT
CCTTACACGCCTACTATTCGTACTGACCTACCAGCACCTGCATCAGACGAACATACTCAG
AATTGCCCAATTTGTCTGACTAGCCGGAAAGACGTGGCTTTTGGCTGTGGTCACATGACG
TGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCATCTGCAGAGTACCGATCACAAGC
CGGCTAAGGCTTTACACGTGATCTCGGTGCCTTTGCCCATAACAAAAAAAAACACTTGCA
CATACTGTCTTTCTCCATCTCAGAATCTCCGGTTTGGTGTTTATCAAGTGTCTCTTACAT
TGTTCCAGAATCAACTCGTACCATTCAGTTTCCTATGTACTTATAAATATTAGTTAGCTT
GCAAGCAAGAATGATGAAGATTAGCAATGTACAAAAACATGGGTTTTACATTTTTATTCA
CTGTCACAAAAAATGTTTGAAGTG

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL3310Contig2 433 2 2 U
TTACGGCCGGGGCACCTATTCCTTACACGCCTACTATTCGTACTGAACTACCATCACCTG
CATCAGACGAACATACACAGAATTGCCCAATTTGTCTGACTAGCCGGAAAGACGTGGCTT
TTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCATCT
GCAGAGTACTGATCACAAGCCGGCTAAGGCTTTACACGTGACCGGCGCCTTTGTGCATAA
GAAAACACTTTGCACATACTGTCTTTCTCCATCTTAGACTCTTCAGTTTGGTTTATCAAG
TGTCTCTTACATTGTTCCAGAATCAGCTCGTACCATTTATTTTCCTTTATTTTTTTTTAA
ATTGACAAATATTTAATAAATGTCATATTTTCATATATTTGTTTTTTTTATAAAAGACTT
AGGCTTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E987JQ C 1
AF RR4E987TF U 1
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TTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCATCT
GCAGAGTACTGATCACAAGCCGGCTAAGGCTTTACACGTGACCGGCGCCTTTGTGCATAA
GAAAACACTTTGCACATACTGTCTTTCTCCATCTTAGACTCTTCAGTTTGGTTTATCAAG
TGTCTCTTACATTGTTCCAGAATCAGCTCGTACCATTTATTTTCCTTTATTTTTTTTTAA
ATTGACAAATATTTAATAAATGTCATATTTTCATATATTTGTTTTTTTTATAAAAGACTT
AGGCTTTTTATCC

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DS 

RD RR4E987TF 433 0 0
TTACGGCCGGGG
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ATACACAGAATTGCCCAATTTGTCTGACTAGCCGGAAAGACGTGGCTTTTGGCTGTGGTC
ACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCATCTGCAGAGTACTGA
TCACAAGCCGGCTAAGGCTTTACACGTGACCGGCGCCTTTGTGCATAAGAAAACACTTTG
CACATACTGTCTTTCTCCATCTTAGACTCTTCAGTTTGGTTTATCAAGTGTCTCTTACAT
TGTTCCAGAATCAGCTCGTACCATTTATTTTCCTTTATTTTTTTTTAAATTGACAAATAT
TTAATAAATGTCATATTTTCATATATTTGTTTTTTTTATAAAAGACTTAGGCTTTTTATC
C

QA 13 433 13 433
DS 



AS 1 4

CO CL3311Contig1 820 4 9 U
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TACTCTTGGGTTATCTTGTTCGTTGCATAAAGAAAGCAAACGATTCAGAAGAAGAGGATG
GAGGAGGGTATTTGTTAGAGCTTCAGCCTACAGATAAAGGAGTAGAGATTCAAGTCATCG
AAGCTGATATGGTGTTGTGGACGGTAGGGGCTAAGCCTTTGCTCACCGAGCTAGAGCCTT
CAGGTCCTAGTGTCCTTCCTCTGAACGTTAGAGGACAAGCGGAAACAGACGAGACACTCC
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GTGAGATGATGACTCTTGGAAGATATGATGCTGCTATAACGCCGAGTTTCATTGAAGGGC
TTACACTTGAAGGTCCAGTTGGTCACGCAGCAAGGAAGCTGGCGTATTTGATTAGACTGC
CAACTGATGAGCACCGGTTTAAAGTAGGCGTCAGCTGGTTTGCTAAATCTGCTGTTGAGT
CAGTTGCTTTGCTTCAGAGCAATCTTGCCAAGGTCTTTTCTAGTTCTTGATTCTAAACGG
TTCTGTTTGGTTCAGACAAATGTATCATTTTGCAAACTTGATGGAAATATATACCCTCTG
AGGATTGAGATCCAAAAAAATAATACTCCCTCCGTTTCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FS61TF U 1
AF RR4GD75TF U 1
AF RR4GD75JQ C 83
AF RR4FS61JQ C 349
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BS 694 712 RR4FS61TF
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RD RR4FS61TF 716 0 0
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CTAA

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DS 

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AAGCTGATATGGTGTTGTGGACGGTAGGGGCTAAGCCTTTGCTCACCGAGCTAGAGCCTT
CAGGTCCTAGTGTCCTTCCTCTGAACGTTAGAGGACAAGCGGAAACAGACGAGACACTCC
GTGTCAAGGGACATCCTCGGATATTCGCGTTAGGTGACTCTTCTTCCTTAAGAGACTCAA
ACGGGAAGCTTCTTCCCACAACAGCTCAGGTTGCTTTCCAAGAAGCTGACTTTACCGGTT
GGAATATATGGGCTGCCATTAATAACCGTCCTTTGTTACCATTCAGGTTTCAGAACTTAG
GTGAGATGATGACTCTTGGAAGATATGATGCTGCTATAACGCCGAGTTTCATTGAAGGGC
TTACACTTGAAGGTCCAGTTGGTCACGCAGCAAGGAAGCTGGCGTATTTGATTAGACTGC
CAACTGATGAGCACCGGTTTAAAGTAGGCGTCAGCTGGTTTGCTAAATCTGCTGTTGAGT
CAGTTGCTTTGCTTCAGAGCAATCTTGCCAAG*TCTTTTCTAGTTCTTGATTCTAAACGG
T*CTGTTTGGTTCAGACAAATGTAT

QA 1 745 1 745
DS 

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ATACTCCCTCCGTTTCAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FS61JQ 472 0 0
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ATATACCCTCTGAGGATTGAGATCCAAAAAAATAATACTCCCTCCGTTTCAT

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 4

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CGTGGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAA
AGTTCGATTATATGATGTGCGCTTATTCTCTCCTTCCTCCTTCGGTGGTTTCCTCTGGCT
TGGGTTTTTATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCATTTG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GM54TF U 1
AF RR4G425TF U 1
AF RR4G425JQ C 1
AF RR4GM54JQ C 1
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CGTGGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAA
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QA 1 711 1 711
DS 

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TGGGTTTTTATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCATTTG
TAAAATTCTATGCCTTTGTTTCCGGAGATTCTCATATGTCTGCCGGCTAATGCTTCTGGA
GGAAGGTTGTTTCCTGCCAGCTATGTTTCTAAGAGTCATTATGACTCGTTAGCTTTGTAT
CTCATCATCATGTGTATTCCTCTGTTTAGTAATGAATGAATCCTCTAGTGT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 4

CO CL3313Contig1 1429 4 14 U
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AGCTGGGTCCGTGTACCTTTGGTCTATTGGGATTACTCTGCCATGAAGGTCTTGACTTTG
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TACTTCCATGCGGATCCTCACCCAGGGAATCTAGCCATTGATGTAGACGAATCAATCATC
TACTATGACTTTGGAATGATGGGAGAGATCAAAACATTTACTCGGACGAGATTGCTTGAT
CTCTTCTATTCTGTTTATGAAAAAGATGCCAAAAAGGTCATGCAAAACCTTATAGATCTT
GAAGCACTCCAACCCACTGGAGATCTTTCATCGGTAAAGGAGATCAATTCAGTTCTTCTT
GGACAATCTATTAAGCCAATCCCCAGATCAGCAACAGACTTTGGCAGCTATTGGAGAGGA
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CATGCCATCCCGAGTGCAGCGCATAGAAGAGTTCGTTAAAGAACTTGATTCAGGCGATCT
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GATGGCGACAATGTACACAGTATTTGGAGGAACTCTGCTTAACATTGGGGTTACGTTTAG
CAACCAAGGAAGTCAGCTTGTTGCTAATGGATCCTTCGTTGGTGCAGGGATATTCATGTT
ATTGGTATTGAGATCTATGCAAAGGGTAAATAAGCTTGATAAGTTTGAGAAGATGATATG
ATTCTTTTGAAGCTCCCAAAATCAAAATATAGAATTGTGATGTATAGCAGTATAAAAATT
TATAAATGTATAAAAAAAGAACTATTTCATAAATAGAAAGTCAAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM28TF U 1
AF RR4AB44TF U 123
AF RR4AB44JQ C 621
AF RR4FM28JQ C 649
BS 1 481 RR4FM28TF
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BS 926 926 RR4AB44JQ
BS 927 959 RR4AB44TF
BS 960 1373 RR4AB44JQ
BS 1374 1429 RR4FM28JQ

RD RR4FM28TF 776 0 0
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TTTGGTACAAATGACTGGGTTGGTATATACGAAGAATGTGCCACGATCTTGTATCAAGAG
ATTGACTACATAAACGAAGCCAAGAATGCAGACAAGTTCAGAAGAGACTTCAGGAACATA
AGCTGGGTCCGTGTACCTTTGGTCTATTGGGATTACTCTGCCATGAAGGTCTTGACTTTG
GAGTACGTACCAGGTATCAAGATCAACAAGCTAGACGCCTTAGCTGCACGTGGTTATAAC
CGTTCAAGAATAGCATCACGAGCCATTGAAGCTTATCTTATCCAGATACTCAAAACGGGT
TTCTTCCATGCGGATCCTCACCCAGGGAATCTAGCCATTGATGTAGACGAATCAATCATC
TACTATGACTTTGGAATGATGGGAGAGATCAAAACATTTACTCGGACGAGATTGCTTGAT
CTCTTCTATTCTGTTTATGAAAAAGATGCCAAAAAGGTCATGCAAAACCTTATAGATCTT
GAAGCACTCCAACCCACTGGAGATCTTTCATCGGTAA**GAGATCAATTCAGTTCTTCTT
GGACA*TCTATTAAGCCAATCCCCAGATCAGCAACAGACTTTGGCAGCTAT
GGAGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AB44TF 837 0 0
G
GATATTGATCTACGAAACTTGAAGTTGATTGCTGAGTATTTCCAGAAAAGTGAAACGTTT
GGTACAAATGACTGGGTTGGTATATACGAAGAATGTGCCACGATCTTGTATCAAGAGATT
GACTACATAAACGAAGCCAAGAATGCAGACAAGTTCAGAAGAGACTTCAGGAACATAAGC
TGGGTCCGTGTACCTTTGGTCTATTGGGATTACTCTGCCATGAAGGTCTTGACTTTGGAG
TACGTACCAGGTATCAAGATCAACAAGCTAGACGCCTTAGCTGCACGTGGTTATAACCGT
TCAAGAATAGCATCACGAGCCATTGAAGCTTATCTTATCCAGATACTCAAAACGGGTTAC
TTCCATGCGGATCCTCACCCAGGGAATCTAGCCATTGATGTAGACGAATCAATCATCTAC
TATGACTTTGGAATGATGGGAGAGATCAAAACATTTACTCGGACGAGATTGCTTGATCTC
TTCTATTCTGTTTATGAAAAAGATGCCAAAAAGGTCATGCAAAACCTTATAGATCTTGAA
GCACTCCAACCCACTGGAGATCTTTCATCGGTAAAGGAGATCAATTCAGTTCTTCTTGGA
CAATCTATTAAGCCAATCCCCAGATCAGCAACAGACTTTGGCAGCTATTGGAGAGGACTT
GTTTGCAATTTCACAGGATCAGCCATTCCGCTTCCCATCAACTTTCACATTTGTCATCAG
AGCATTTTCCACACTTGAGGGTATTGGTTACATCCTTGATCCAGACTTTTCCTTTGTGAA
G*TTGCTGCTCCCTATGCGCAG*AACTCCTGGATTTAAAACAAAAGCAAAATTCGG

QA 2 837 2 837
DS 

RD RR4AB44JQ 753 0 0
AAAAGATGCCAAAAAGGTCATGCAAAACCTTATAGATCTTGAAGCACTCCAACCCACTGG
AGATCTTTCATCGGTAAAGGAGATCAATTCAGTTCTTCTTGGACAATCTATTAAGCCAAT
CCCCAGATCAGCAACAGACTTTGGCAGCTATTGGAGAGGACTTGTTTGCAATTTCACAGG
ATCAGCCATTCCGCTTCCCATCAACTTTCACATTTGTCATCAGAGCATTTTCCACACTTG
AGGGTATTGGTTACATCCTTGATCCAGACTTTTCCTTTGTGAAGGTTGCTGCTCCCTATG
CGCAGGAACTCCTGGATTTAAAACAAAAGCAAAATTCGGGAACTCAACTTGTCCAACAAA
TAAGGAAACAGGCAGACGACGCTAGGTCTTCTACACTGTCCATGCCATCCCGAGTGCAGC
GCATAGAAGAGTTCGTTAAAGAACTTGATTCAGGCGATCTAAAACTCCGTGTCAGAGTTC
TTGAGTCGGAAAGAGCAGCTAGGAAAGCGACAATACTGCAGATGGCGACAATGTACACAG
TATTTGGAGGAACTCTGCTTAACATTGGGGTTACGTTTAGCAACCAAGGAAGTCAGCTTG
TTGCTAATGGATCCTTCGTTGGTGCAGGGATATTCATGTTATTGGTATTGAGATCTATGC
AAAGGGTAAATAAGCTTGATAAGTTTGAGAAGATGATATGATTCTTTTGAAGCTCCCAAA
ATCAAAATATAGAATTGTGATGTATAGCAGTAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4FM28JQ 781 0 0
CC
TATAGATCTTGAAGCACTCCAACCCACTGGAGATCTTTCATCGGTAA*GGAGATCAATTC
AGTTCTTCTTGGACAATCTATTAAGCCAATCCCCAGATCAGCAACAGACTTTGGCAGCTA
TTGGAGAGGACTTGTTTGCAATTTCACAGGATCAGCCATTCCGCTTCCCATCAACTTTCA
CATTTGTCATCAGAGCATTTTCCACACTTGAGGGTATTGGTTACATCCTTGATCCAGACT
TTTCCTTTGTGAAGGTTGCTGCTCCCTATGCGCAGGAACTCCTGGATTTAAAACAAAAGC
AAAATTCGGGAACTCAACTTGTCCAACAAATAAGGAAACAGGCAGACGACGCTAGGTCTT
CTACACTGTCCATGCCATCCCGAGTGCAGCGCATAGAAGAGTTCGTTAAAGAACTTGATT
CAGGCGATCTAAAACTCCGTGTCAGAGTTCTTGAGTCGGAAAGAGCAGCTAGGAAAGCGA
CAATACTGCAGATGGCGACAATGTACACAGTATTTGGAGGAACTCTGCTTAACATTGGGG
TTACGTTTAGCAACCAAGGAAGTCAGCTTGTTGCTAATGGATCCTTCGTTGGTGCAGGGA
TATTCATGTTATTGGTATTGAGATCTATGCAAAGGGTAAATAAGCTTGATAAGTTTGAGA
AGATGATATGATTCTTTTGAAGCTCCCAAAATCAAAATATAGAATTGTGATGTATAGCAG
TATAAAAATTTATAAATGTATAAAAAAAGAACTATTTCATAAATAGAAAGTCAAAAGGG

QA 3 781 3 781
DS 



AS 1 4

CO CL3314Contig1 437 4 5 U
GGGTTTTACACCAATAAACGCCATTGGTGAGAACTTTTATGGAAAAACATTAACACATGA
TTGTTAGACAAAAGCACACACATAGAGCTTAACAAGTTGGAGCGTTGGGCATGTTACATT
TGCTTGGGAGTCCAGCAGCGAGCGCCGGATCAATACCGTAATAACCGAGCAATGGAGAGT
TCTTGTAGCCGCAAAGACAGCTGTAGTCAGCGTGTTTCAGATAGTCGCAGCAAAGCGTTG
ATGGGTTCGTCGGATTCCCCTTGCTCACCGCTGGTTTGCACTCATTCAACTCTGACTGGG
TCATGCCACAGATATCAATCGCCACTGACCTCTCCGCTAAAATAGCCATCACCACCACTA
TCATCATCACCATCACTCCCACCTTCTTGCTCGCCATCTTATCCTCTTTTAATTTTGTTG
ATGTTTTTGTGATGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4GZ34JQ U 1
AF RR4GZ34TF C 1
AF RR4ED59TF C 26
AF RR4ED59JQ U 226
BS 1 257 RR4GZ34JQ
BS 258 258 RR4ED59JQ
BS 259 359 RR4GZ34JQ
BS 360 360 RR4ED59JQ
BS 361 437 RR4GZ34JQ

RD RR4GZ34JQ 437 0 0
GGGTTTTACACCAATAAACGCCATTGGTGAGAACTTTTATGGAAAAACATTAACACATGA
TTGTTAGACAAAAGCACACACATAGAGCTTAACAAGTTGGAGCGTTGGGCATGTTACATT
TGCTTGGGAGTCCAGCAGCGAGCGCCGGATCAATACCGTAATAACCGAGCAATGGAGAGT
TCTTGTAGCCGCAAAGACAGCTGTAGTCAGCGTGTTTCAGATAGTCGCAGCAAAGCGTTG
ATGGGTTCGTCGGATTCTCCTTGCTCACCGCTGGTTTGCACTCATTCAACTCTGACTGGG
TCATGCCACAGATATCAATCGCCACTGACCTCTCCGCTAAAATAGCCATCACCACCACTG
TCATCATCACCATCACTCCCACCTTCTTGCTCGCCATCTTATCCTCTTTTAATTTTGTTG
ATGTTTTTGTGATGTCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4GZ34TF 437 0 0
GGGTTTTACACCAATAAACGCCATTGGTGAGAACTTTTATGGAAAAACATTAACACATGA
TTGTTAGACAAAAGCACACACATAGAGCTTAACAAGTTGGAGCGTTGGGCATGTTACATT
TGCTTGGGAGTCCAGCAGCGAGCGCCGGATCAATACCGTAATAACCGAGCAATGGAGAGT
TCTTGTAGCCGCAAAGACAGCTGTAGTCAGCGTGTTTCAGATAGTCGCAGCAAAGCGTTG
ATGGGTTCGTCGGATTCTCCTTGCTCACCGCTGGTTTGCACTCATTCAACTCTGACTGGG
TCATGCCACAGATATCAATCGCCACTGACCTCTCCGCTAAAATAGCCATCACCACCACTG
TCATCATCACCATCACTCCCACCTTCTTGCTCGCCATCTTATCCTCTTTTAATTTTGTTG
ATGTTTTTGTGATGTCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4ED59TF 412 0 0
GGTGAGAACTTTTATGGAAAAACATTAACACATGATTGTTAGACAAAAGCACACACATAG
AGCTTAACAAGTTGGAGCGTTGGGCATGTTACATTTGCTTGGGAGTCCAGCAGCGAGCGC
CGGATCAATACCGTAATAACCGAGCAATGGAGAGTTCTTGTAGCCGCAAAGACTGCTGTA
GTCAGCGTGTTTCAGATAGTCGCAGCAAAGCGTTGATGGGTTCGTCGGATTCCCCTTGCT
CACCGCTGGTTTGCACTCATTCAACTCTGACTGGGTCATGCCACAGATATCAATCGCCAC
TGACCTCTCCGCTAAAATAGCCATCACCACCACTATCATCATCACCATCACTCCCACCTT
CTTGCTCGCCATCTTATCCTCTTTTAATTTTGTTGATGTTTTTGTGATGTCC

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4ED59JQ 212 0 0
CGCAGCAAAGCGTTGATGGGTTCGTCGGATTCCCCTTGCTCACCGCTGGTTTGCACTCAT
TCAACTCTGACTGGGTCATGCCACAGATATCAATCGCCACTGACCTCTCCGCTAAAATAG
CCATCACCACCACTATCATCATCACCATCACTCCCACCTTCTTGCTCGCCATCTTATCCT
CTTTTAATTTTGTTGATGTTTTTGTGATGTCC

QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 4

CO CL3315Contig1 887 4 10 U
GACTGACTTTGAGCTCGAGAGGCATCCTCCACCGCCTCCTACGTTGAAGAACAGCTCTAA
GAAGCTGCTTAATGGCTCTGGACTCAATCTCTCGACTCAACCGTCGAATGGTGAAGCGAA
CGATCTGTCTCCCTCTAGCCAACACAAGAAGAGGAAGGACATGTTCTTTAACGGGATCCA
CGAAGAAGAGTGTTGCTTAACCGTGAACCCGCCTGCTGTTGTAGAAGTCCACCAGAACGA
GCCACCGAACTGGTCTAATGAGTTCAGCGGAGCCATGAAGAACGTGCACGGGCCTGTTAC
AGCTGCGAAGACCATATACGAGGACGAGGAAGGCTACTTGATCATAATCACACTTCCTTT
CGTGGACCTGAACAGCGTGAAAGTCTCGTGGAGGAACACTCTCACGCACGGTATCATAAA
AGTCTCGTGCGTCAGCACGTCGCGCGTGCCTTTCATCAAGAGACACGACAGGACGTTCAA
GCTGACTGATCCGAACTCCGAGCATTGCCCACCGGGGGAGTTTGTTAGAGAGGTCCCGTT
ATCGACACGTATCCCTGAGGATGCGAATATTGAGGCGTATTACGATGGACCGGGATCGGT
TCTTGAGATACTTGTCCCGAAACTGAGAGCTGGTCCGGAAGAGCATGAGGTGAGGGTGTG
TTTACGTCCGCACCTGGGAGGAAACGATCTTATGTTGACATAAAAAAAGAGAGAGAGAGA
CGTTTTCTGTTACACAGTGTTCTCGTTATGTAGAAAGCTTTATAGGAGTCAGCATATGTC
ATTGATGTTTGCCATTTGATAATATATAGACGTTTTCACTGTTTTATATGAGATTATTCA
TCACATTGCAATCTTGTGTACGTTATGTTTGAATCAACCGTAGCCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E393TF U 1
AF RR4E081TF U 1
AF RR4E393JQ C 152
AF RR4E081JQ C 173
BS 1 661 RR4E081TF
BS 662 662 RR4E393JQ
BS 663 683 RR4E081TF
BS 684 684 RR4E393JQ
BS 685 707 RR4E081TF
BS 708 708 RR4E393JQ
BS 709 724 RR4E081TF
BS 725 725 RR4E393JQ
BS 726 742 RR4E081TF
BS 743 887 RR4E393JQ

RD RR4E393TF 633 0 0
GACTGACTTTGAGCTCGAGAGGCATCCTCCACCGCCTCCTACGTTGAAGAACAGCTCTAA
GAAGCTGCTTAATGGCTCTGGACTCAATCTCTCGACTCAACCGTCGAATGGTGAAGCGAA
CGATCTGTCTCCCTCTAGCCAACACAAGAAGAGGAAGGACATGTTCTTTAACGGGATCCA
CGAAGAAGAGTGTTGCTTAACCGTGAACCCGCCTGCTGTTGTAGAAGTCCACCAGAACGA
GCCACCGAACTGGTCTAATGAGTTCAGCGGAGCCATGAAGAACGTGCACGGGCCTGTTAC
AGCTGCGAAGACCATATACGAGGACGAGGAAGGCTACTTGATCATAATCACACTTCCTTT
CGTGGACCTGAACAGCGTGAAAGTCTCGTGGAGGAACACTCTCACGCACGGTATCATAAA
AGTCTCGTGCGTCAGCACGTCGCGCGTGCCTTTCATCAAGAGACACGACAGGACGTTCAA
GCTGACTGATCCGAACTCCGAGCATTGCCCACCGGGGGAGTTTGTTAGAGAGGTCCCGTT
ATCGACACGTATCCCTGAGGATGCGAATATTGAGGCGTATTACGATGGACCGGGATCGGT
TCTTGAGATACTTGTCCCGAAACTGAGAGCTGG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4E081TF 742 0 0
GACTGACTTTGAGCTCGAGAGGCATCCTCCACCGCCTCCTACGTTGAAGAACAGCTCTAA
GAAGCTGCTTAATGGCTCTGGACTCAATCTCTCGACTCAACCGTCGAATGGTGAAGCGAA
CGATCTGTCTCCCTCTAGCCAACACAAGAAGAGGAAGGACATGTTCTTTAACGGGATCCA
CGAAGAAGAGTGTTGCTTAACCGTGAACCCGCCTGCTGTTGTAGAAGTCCACCAGAACGA
GCCACCGAACTGGTCTAATGAGTTCAGCGGAGCCATGAAGAACGTGCACGGGCCTGTTAC
AGCTGCGAAGACCATATACGAGGACGAGGAAGGCTACTTGATCATAATCACACTTCCTTT
CGTGGACCTGAACAGCGTGAAAGTCTCGTGGAGGAACACTCTCACGCACGGTATCATAAA
AGTCTCGTGCGTCAGCACGTCGCGCGTGCCTTTCATCAAGAGACACGACAGGACGTTCAA
GCTGACTGATCCGAACTCCGAGCATTGCCCACCGGGGGAGTTTGTTAGAGAGGTCCCGTT
ATCGACACGTATCCCTGAGGATGCGAATATTGAGGCGTATTACGATGGACCGGGATCGGT
TCTTGAGATACTTGTCCCGAAACTGAGAGCTGGTCCGGAAGAGCATGAGGTGAGGGTGTG
TCTACGTCCGCACCTGGGAGGAA*CGATCTTATGTTGACATAAAAAA*GAGAGAGAGAGA
CGTTCTCTGTTACACAGTGTTC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4E393JQ 736 0 0
AGGAAGGACATGTTCTTTAACGGGATCCACGAAGAAGAGTGTTGCTTAACCGTGAACCCG
CCTGCTGTTGTAGAAGTCCACCAGAACGAGCCACCGAACTGGTCTAATGAGTTCAGCGGA
GCCATGAAGAACGTGCACGGGCCTGTTACAGCTGCGAAGACCATATACGAGGACGAGGAA
GGCTACTTGATCATAATCACACTTCCTTTCGTGGACCTGAACAGCGTGAAAGTCTCGTGG
AGGAACACTCTCACGCACGGTATCATAAAAGTCTCGTGCGTCAGCACGTCGCGCGTGCCT
TTCATCAAGAGACACGACAGGACGTTCAAGCTGACTGATCCGAACTCCGAGCATTGCCCA
CCGGGGGAGTTTGTTAGAGAGGTCCCGTTATCGACACGTATCCCTGAGGATGCGAATATT
GAGGCGTATTACGATGGACCGGGATCGGTTCTTGAGATACTTGTCCCGAAACTGAGAGCT
GGTCCGGAAGAGCATGAGGTGAGGGTGTGTTTACGTCCGCACCTGGGAGGAAACGATCTT
ATGTTGACATAAAAAAAGAGAGAGAGAGACGTTTTCTGTTACACAGTGTTCTCGTTATGT
AGAAAGCTTTATAGGAGTCAGCATATGTCATTGATGTTTGCCATTTGATAATATATAGAC
GTTTTCACTGTTTTATATGAGATTATTCATCACATTGCAATCTTGTGTACGTTATGTTTG
AATCAACCGTAGCCCG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4E081JQ 715 0 0
GGGATCCACGAAGAAGAGTGTTGCTTAACCGTGAACCCGCCTGCTGTTGTAGAAGTCCAC
CAGAACGAGCCACCGAACTGGTCTAATGAGTTCAGCGGAGCCATGAAGAACGTGCACGGG
CCTGTTACAGCTGCGAAGACCATATACGAGGACGAGGAAGGCTACTTGATCATAATCACA
CTTCCTTTCGTGGACCTGAACAGCGTGAAAGTCTCGTGGAGGAACACTCTCACGCACGGT
ATCATAAAAGTTTCGTGCGTCAGCACGTCGCGCGTGCCTTTCATCAAGAGACACGACAGG
ACGTTCAAGCTGACTGATCCGAACTCCGAGCATTGCCCACCGGGGGAGTTTGTTAGAGAG
GTCCCGTTATCGACACGTATCCCTGAGGATGCGAATATTGAGGCGTATTACGATGGACCG
GGATCGGTTCTTGAGATACTTGTCCCGAAACTGAGAGCTGGTCCGGAAGAGCATGAGGTG
AGGGTGTGTTTACGTCCGCACCTGGGAGGAAACGATCTTATGTTGACATAAAAAAAGAGA
GAGAGAGACGTTTTCTGTTACACAGTGTTCTCGTTATGTAGAAAGCTTTATAGGAGTCAG
CATATGTCATTGATGTTTGCCATTTGATAATATATAGACGTTTTCACTGTTTTATATGAG
ATTATTCATCACATTGCAATCTTGTGTACGTTATGTTTGAATCAACCGTAGCCCG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL3316Contig1 455 4 8 U
CGCGAATTCAAAAAGCAATCATTTATTTTAGTGTTAACAAAGTCGGAAATTACAAACACC
AGACAAACAAGTAAGATATTGCAAATAAATACATTTCATTCACTGATGCGACGGCGCAGT
TGCTCACGAAAACGTTCCATCTCGATTTCATATTTTTCCGTGTCAATGTCCGAATTTCGC
TTGATCTTTAAGATCTTCGACATTTCCCAACCAAATTGAAGCACATATCCAACAGTAGAC
CAGACGGCAATAGTACTAGTAACATCCAAGAATGGCGTAAAGTTAAATCCTTTTCCTTTG
TCACCGATAGGATTAGGAGCTGAGGAGGATGCGGAGGAGGAACAGAAAGCACGTCCTTGA
CGAACGCGGTAAGCCTTCGCAACCAAAGATCTCAGGTTCGGCATCATGGTCGTCGGCAAT
TAGGTTTCGGCTATTGTTCTTCTTCCTTTGGCTCC


BQ
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AF RR4FC87JQ U 1
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AF RR4A645JQ U 9
AF RR4A645TF C 9
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CAGACGGCAATAGTACTAGTAACATCCAAGAATGGCGTAAAGTTCAATCCTTTTCCTTTG
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TAGGTTTCGGCTATT
CC

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4E053TF U 1
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AF RR4E053JQ C 310
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GAACTCTAAA
GCG

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DS 

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A
AGCG

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AS 1 3

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T


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G652TF U 1
AF RR4F766TF U 1
AF RR4AU32JQ C 121
BS 1 10 RR4F766TF
BS 11 11 RR4G652TF
BS 12 108 RR4F766TF
BS 109 109 RR4G652TF
BS 110 638 RR4F766TF
BS 639 639 RR4G652TF
BS 640 756 RR4F766TF
BS 757 757 RR4AU32JQ
BS 758 772 RR4F766TF
BS 773 773 RR4AU32JQ
BS 774 797 RR4F766TF
BS 798 901 RR4AU32JQ

RD RR4G652TF 741 0 0
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AGCTTGAGAAGAGGAAGAGCCAAGTGCTGCTCGAGGGATACGTAGTGGAGGCTGCTGATC
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GTTTGGATCTAGGGTTTGGGTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAACACTTTGC
CTGCTCTAGAGCTTTGTTACTCCATGAGCCAGAAGTTCTTGGATGATATGCAGAACCAAA
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GGGCACAAGCCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTATGTAGCTGAACAGCATTCATCATGATCT
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TGCATGAATGAAGT
CTCTGCC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4F766TF 812 0 0
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ACATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCATCATCAGATCAATGGACACGCTTTGTCCAAGACC
AAGAAACATCCAACACAGTTTCACCACAACACGAACAAGGAGGAGGAG***GAATCCAAG
AAGCTTGGGACGAGATCGAGACTCGCCGAGGTGGTGTTTTCGCCGGAGAGAATAAGAACA
AGCTTGAGAAGAGGAAGAGCCAAGTGCTGCTCGAGGGATACGTAGTGGAGGCTGCTGATC
AAGAAGATCTTACGAGAGGTAAGAGTTTGACGGATGACGATCTTGAGGAGCTTAAAGGCT
GTTTGGATCTAGGGTTTGGGTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAACACTTTGC
CTGCTCTAGAGCTTTGTTACTCCATGAGCCAGAAGTTCTTGGATGATAAGCAGAACCAAA
TGTGTCCAGCTGAAGAAGATTCTCAGCCACCACCACCGACCACGAGCAACCCAGTTGCAA
ACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCAAGACTCAAATACT
GGGCACAAGCCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTATGTAGCGGAACAACATTCATCATGATCT
TGTCTGAACATATTGGTTGAATCAG*AGCAAAAAAA*TCTACTGATGAAGACCTTTCCTT
TGCATGAATGAAGTCTCTGCCCCTTGTTAGCTGAGA*TGGACCTGCATTAAT*GTGTGAC
ACATGGAGTAACTGGTT
GGTTTACTTTTTTTT

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DS 

RD RR4AU32JQ 781 0 0
AAA
AAACATCCAACACAGTTTCACCACAACACGAGCAAGGAGGAGGAGGAGGAATCCAAGAAG
CTTGGGACGAGATCGAGACTCGCCGAGGTGGTTATTTCGCTGGAGAGAATAAGAACAAGC
TCGAGAAGAGGAAGAGCCAAGTGTTGCTCGAGGGATACGTAGTGGAGGCTGCTGATCAAG
AAGATCTTACGAGAGGTAAGAGTTTGACGGATGACGATCTTGAGGAGCTTAAAGGCTGTT
TGGATCTAGGGTTTGGGTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTG
CTTTGGAGCTTTGTTACTCCATGAGCCAGAAGTTCTTAGATGATAAGCAGAACCAGATGT
CTCCAGCTGAAGAAGATTTTCAGCCACCACCACCGGCCACGACCAATCCAGTTGCAAACT
GGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCAAGACTCAAATACTGGG
CACAAGCCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTATGTAGCTGAACAACATTCATCATGATCTTGT
CTGAACATATTGGTTGAATCAGGAGCAAAAAAAATCTACTGATGAAGACCTTTCCTTTGC
ATGAATGAAGTCTCTGCCCCTTGTTAGCTGAGAATGGACCTGCATTAATTGTGTGACACA
TGGAGTAACTGGTTTGGTTTTACTTTTTTTTTAATTGCATGTTATGTGTATTAGTATTAT
TCGTCTAGTGTTTGTTAATGAAAAATAAATGTGTTGCTGAATAAAAAAATTCAAATTT

QA 4 781 4 781
DS 



AS 1 3

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CTTTATCATCTAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAG
AGGAATCTGGAGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTGGCAG
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GGAAGAACTGGTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATC
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AGTTCCGAGATCGAGGATACCCATTTCTCCCTCTCCGAAAATGGTTAGCGAGGCGAGCAG
CAAAGGTTCGCATGACTTATCAGAGCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D341JQ U 1
AF RR4AW08JQ U 72
AF RR4D341TF C 1
BS 1 720 RR4D341JQ
BS 721 750 RR4D341TF

RD RR4D341JQ 720 0 0
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GAAGCTAGAGAATCAGACTGCTTCTTTCCTTTGGACAAAAATTCAAGAGTTCACTTAATC
ATTCCTGGGACCTATCCATTTTCTGAAAAGACTAAATTCAGTTGGAAGAAAGAGGTAGGT
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AGGAATCTGGAGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTGGCAG
CTTCATCTGATTTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCAT
CTTTAGCAGCGCCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCA
TCCTCCTCTCATCATCAATGGCGAAACGGGAAAGTCTAGAAGCGCCTATTCTCTTAAACA
AGGGATCCTTCACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAG
GGAAGAACTGGTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATC
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AGTTCCGAGATCGAGGATACCCATTTCTCCCTCTCCGAAAATGGTTAGCGAGGCGAGCAG

QA 1 720 1 720
DS 

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AGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAGAGGAATCTGGA
GTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTGGCAGCTTCATCTGAT
TTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCATCTTTAGCAGCG
CCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCATCCTCCTCTCA
TCATCAATGGCGAAACGGGAAAGTCTAGAAGCACCTATTCTCTTAAACAAGGGATCCTTC
CCATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAGGGAAGAACTGG
TATCAAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATCCTATTTTCCTC
TCAGCTTCTTCCTCCAATGTTAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAGAAGTTCCGAGAT
CGAGGATACCCATTTCTCCCTCTCCGAAAATGGTTAGCGAGGCGAGCAG
CAAAGG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4D341TF 750 0 0
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CTTTAGCAGCGCCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCA
TCCTCCTCTCATCATCAATGGCGAAACGGGAAAGTCTAGAAGCGCCTATTCTCTTAAACA
AGGGATCCTTCACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAG
GGAAGAACTGGTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATC
CTATTTTCCTCTCAGCTTCTTCCTCCAATGTTAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAGA
AGTTCCGAGATCGAGGATACCCATTTCTCCCTCTCCGAAAATGGTTAGCGAGGCGAGCAG
CAAAGGTTCGCATGACTTATCAGAGCTTCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 4

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CCATACTCTTCATCGTTCTCCCATCTTCTCACAGCTCATCCTCAAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCTCCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCTGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTTACTGGAAGTATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCGGGTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACG
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CCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATCTGAGCCATAACAAAATCTTCG
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ATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCT
CTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGT
GAGAAGAAATAAGTAGCAGTATGTCTTTTATCTGTACGATGATGTTGTGTTAATTATCAC
GCCACCTATCAAAAGCGAATTGTTCTATTTAATAATGAATGTTAAGAGTTTGGTAAGAAT
GTTGTTGAGATATTCAAAGTGTACTCTCTAGACAATGATAAATTACCACATAAACAATGA
TAAAT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4EN69TF U 1
AF RR4EN69JQ C 481
AF RR4F071TF U 1030
AF RR4EP74TF U 753
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TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTTACTGGAAGTATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
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ATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATTTGCTTTCT
CTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGT
GAGAAGAAATAAGTAGCAGTATGTCTTTTATCTGTACGATGATGTTGTGTTAATTATCAC
GCCACCTATCAAAAGCGAATTGTTCTATTTAATAATGAATGTTAAGAGTTTGGT

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G
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T

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DS 

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AACATGTTTGAGTTCGATCTCGCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGAT
CTGAGCCATAACAAAATCTTCGGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAG
CATTTCGACGTTAGTTACAATCATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAG
ACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCT
TGTTGATTTGGTTTAATGGCGTGAGAAGAAATAAGTAGCAGTATGTCTTTTATCTGTACG
ATGATGTTGTGTTAATTATCACGCCACCTATCAAAAGCGAATTGTTCTATTTAATAATGA
ATGTTAAGAGTTTGGTAAGAATGTTGTTGAGATATTCAAAGTGTACTCTCTAGACAATGA
TAAATTACCACATAAACAATGATAAAT

QA 7 453 7 453
DS 



AS 1 4

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TTCGCAGGTCAAACGGCTTTGAAGCCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGAGCTTCC
AACGGTGGTGGACGCGTCGTCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGG
TACGGACCAGACCGTCCCAAGTACTTAGGACCATTTTCGGAGAACACACCATCATACCTA
ACCGGTGAGTACCCCGGAGACTACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAA
ACCTTTGCAAAGAACCGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCT
TTAGGCTGCACATTCCCAGAGATTCTCCCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTG
TGGTTCAAGGCAAGTTCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGCCTTGATTACCTCGGGAACCCT
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CCGGGTGGGGCGTTTGACCCATTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAACTG
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BQ
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AF RR4AA37TF U 1
AF RR4AA37JQ C 71
AF RR4AP47JQ C 312
AF RR4AP47TF U 312
BS 1 432 RR4AA37TF
BS 433 433 RR4AP47TF
BS 434 669 RR4AA37TF
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BS 781 781 RR4AP47TF
BS 782 814 RR4AA37TF
BS 815 888 RR4AP47TF
BS 889 900 RR4AA37JQ

RD RR4AA37TF 814 0 0
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TTCGCAGGTCAAACGGCTTTGAAGCCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGAGCTTCC
AACGGTGGTGGACGCGTCGTCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGG
TACGGACCAGACCGTCCCAAGTACTTAGGACCATTTTCGGAGAACACACCATCATACCTA
ACCGGTGAGTACCCCGGAGACTACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAA
ACCTTTGCAAAGAACCGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCT
TTAGGCTGCACATTCCCAGAGATTCTCCCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTG
TGGTTCAAGGCAGGTTCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGCCTTGATTACCTCGGGAACCCT
AACTTGATCCACGCGCAAAGCATTTTAGCTATCGGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGGGC
TTAATCGAAGGGTACAGAATCGGAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTAC
CCGGGTGGGGCGTTTGACCCATTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAACTG
AAAGTGAAG*AGCTCAAGAACGGTCGTCTTGCA*TGTTCTCAATGTTTGGACTCTTTGTG
CAAGCTATTGTTACTGGTAAAGGTCCAATAGAGAATCTGTTCGATCATGTTGCGGACCCT
TTGGCTAACAATGCTTGGGCTTACGCCACCAACT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4AA37JQ 830 0 0
AAACGGCTTTGAAGCCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGAGCTTCCAACGGTGGTG
GACGCGTCGTCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAG
ACCGTCCCAAGTACTTAGGACCATTTTCGGAGAACACACCATCATACCTAACCGGTGAGT
ACCCCGGAGACTACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAAACCTTTGCAA
AGAACCGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCTTTAGGCTGCA
CATTCCCAGAGATTCTCCCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGG
CAGGTTCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGCCTTGATTACCTCGGGAACCCTAACTTGATCC
ACGCGCAAAGCATTTTAGCTATCGGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGGGCTTAATCGAAG
GGTACAGAATCGGAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGG
CGTTTGACCCATTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAACTGAAAGTGAAGG
AGCTCAAGAACGGTCGTCTTGCAATGTTCTCAATGTTTGGACTCTTTGTGCAAGCTATTG
TTACTGGTAAAGGTCCAATAGAGAATCTGTTCGATCATGTTGCGGACCCTTTGGCTAACA
ATGCTTGGGCTTACGCCACCAACTTCGTTCCCGGAAAATAGAATTGGATCGAATAAATAT
ATGTAATTTCTTTGCTTGGTGAAATAAATTCTCAAGTCTTCTGTTGTGTC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR4AP47JQ 535 0 0
GAAG
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CCAGAGATTCTCTCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAAGT
TCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGCCTTGATTACCTCGGGAACCCTAACTTGATCCACGCG
CAAAGCATTTTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGTGCTTAATCGAAGGGTAC
AGAATCGGAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACTCGGGTGGGGCGTTT
GACCCATTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAACTGAAAGTGAAGGAGCTC
AAGAACGGTCGTCTTGCAATGTTCTCAATGTTTGGATTCTTTGTGCAAGCTATTGTTACT
GGTAAAGGTCCAATAGAGAATCTGTTCGATCATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCT
TGGGCTTACGCCACCAACTTCGTTCCCGGAAAATAGAATTGGATCGAATAA

QA 5 535 5 535
DS 

RD RR4AP47TF 577 0 0
GAAG
CGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCTTTAGGCTGCACATTC
CCAGAGATTCTCTCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAAGT
TCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGCCTTGATTACCTCGGGAACCCTAACTTGATCCACGCG
CAAAGCATTTTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGTGCTTAATCGAAGGGTAC
AGAATCGGAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACTCGGGTGGGGCGTTT
GACCCATTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAACTGAAAGTGAAGGAGCTC
AAGAACGGTCGTCTTGCAATGTTCTCAATGTTTGGATTCTTTGTGCAAGCTATTGTTACT
GGTAAAGGTCCAATAGAGAATCTGTTCGATCATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCT
TGGGCTTACGCCACCAACTTCGTTCCCGGAAAATAGAATTGGATCGAATAAATATATGTA
ATTTCTTTGCTTGGTGAAATAAATTCTCAAGTC

QA 5 577 5 577
DS 



AS 1 2

CO CL3322Contig1 1126 2 6 U
GGAGTGTAAAGGTCTACCTTTGGCTCTCAAAGTTACTGGCGCTTCACTAAAAGACCGACC
TGAAATGTATTGGCATGGCGCATTGCAGAGGTTATCAAAAGGTGAACCTGCTGATGAAAC
TCACGAGAGTAGATTGCTTCATCACATGGAAGCTAGTCTACAAGATCTAGACGAAACAAC
CAGAGAGTGTTTCTTGGATCTTGGCGCATTCCCTGAAGACAGGAAGATTCCTGTTGATAT
TCTCATCAACATGTGGATTGAGATACATGATTTAGACGAGGCAATTGCTTTTGCCACTCT
TGTTGATTTGTCACACAAGAATCTCCTTACTCTTGGGAAAGATCCACGGCTTGGCTCTAC
GTATGCAAGCTACTATGATGTATTTGTGACACAGCATGATGTTCTGCGAGACTTGGCACT
TCATTTATCCAACAAAGGCAAAGTTAACAGAAGAGAGCGATTGCTGATGCCAAAAAGAGA
GAAAGAGCTTCCAAACACATGGGGAAAGAACTGTGATGAGCCATACAATGCTCAGATAGT
CTCTATTCATACACGGGAAATGGATGACATGGACTGGTCTGAATTCGACATGGACTTCCC
TAAGGCAGAGATCCTGATGCTGAATTTCTCTTCGGACAAGTACGTTCTGCCTCCTTTCCT
CAGCAAGATGACCCGGCTTAAGGTCCTCGTGATCATCAACAACGGAATGTCCCCTGCGGT
TCTCCATGACTTTTCAATGTTTGCCAATTTGTCGAAACTAAGGAGTCTCTGGCTCGAGAG
AGTTCACGTCCCTGAGCTCTACAACACAACAGTTCCCATGAAACATCTCCACAAGATGTC
TCTAATTCTGTGCAAGATCAATAACAGTTTTGATCAGACCGGAGTCGACGTCTCCAGTAT
CTTCCCAAAGCTAGGAGATCTGACGATAGATCACTGCGATGACCTCGTGACACTGCCTTC
AAGCATCTGCGGTATGACCTCTCTCAACTCGTTAAGCATAACGAACTGTCCAGGCGTCAG
TGAATTGCCTAAGAACCTAAGCAAGCTACAAGCTCTTGAACTTCTGAGCTATATGCTTGT
CCTGAGCTAAAGCATTGCCTGACGAAATCTGTGAGCTTCTCAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG67TF U 1
AF RR4BI11TF U 273
BS 1 553 RR4BG67TF
BS 554 554 RR4BI11TF
BS 555 582 RR4BG67TF
BS 583 583 RR4BI11TF
BS 584 678 RR4BG67TF
BS 679 1126 RR4BI11TF

RD RR4BG67TF 678 0 0
GGAGTGTAAAGGTCTACCTTTGGCTCTCAAAGTTACTGGCGCTTCACTAAAAGACCGACC
TGAAATGTATTGGCATGGCGCATTGCAGAGGTTATCAAAAGGTGAACCTGCTGATGAAAC
TCACGAGAGTAGATTGCTTCATCACATGGAAGCTAGTCTACAAGATCTAGACGAAACAAC
CAGAGAGTGTTTCTTGGATCTTGGCGCATTCCCTGAAGACAGGAAGATTCCTGTTGATAT
TCTCATCAACATGTGGATTGAGATACATGATTTAGACGAGGCAATTGCTTTTGCCACTCT
TGTTGATTTGTCACACAAGAATCTCCTTACTCTTGGGAAAGATCCACGGCTTGGCTCTAC
GTATGCAAGCTACTATGATGTATTTGTGACACAGCATGATGTTCTGCGAGACTTGGCACT
TCATTTATCCAACAAAGGCAAAGTTAACAGAAGAGAGCGATTGCTGATGCCAAAAAGAGA
GAAAGAGCTTCCAAACACATGGGGAAAGAACTGTGATGAGCCATACAATGCTCAGATAGT
CTCTATTCATACATGGGAAATGGATGACATGGACTGGTCTGACTTCGACATGGACTTCCC
TAAGGCAGAGATCCTGATGCTGAATTTCTCTTCGGACAAGTACGTTCTGCCTCCTTTCCT
CAGCAAGATGACCCGGCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4BI11TF 854 0 0
G
AGACGAGGCAATTGCTTTTGCCACTCTTGTTGATTTGTCACACAAGAATCTCCTTACTCT
TGGGAAAGATCCACGGCTTGGCT**ACGTATGCAAGCTACTATGATGTATTTGTGACACA
GCATGATGTTCTGCGAGACTTGGCACTTCATTTATCCAACAAAGGCAAAGTTAACAGAAG
AGAGCGATTGCTGATGCCAAAAAGAGAGAAAGAGCTTCCAAACACTTGGGGAAAGAACTG
TGATGAGCCATACAATGCTCAGATAGTCTCTATTCATACACGGGAAGTGGATGACATGGA
TTGGTCTGAATTTGACATGGACTTCCCTAAGGCAGAGATCCTGATGCTGAATTTCTCTTC
GGACAAGTACGTTCTGCCTCCTTTCCTCAGCAAGATGCCCCGGCTTAAGGTCCTCGTGAT
CATCAACAACGGAATGTCCCCTGCGGTTCTCCATGACTTTTCAATGTTTGCCAATTTGTC
GAAACTAAGGAGTCTCTGGCTCGAGAGAGTTCACGTCCCTGAGCTCTACAACACAACAGT
TCCCATGAAACATCTCCACAAGATGTCTCTAATTCTGTGCAAGATCAATAACAGTTTTGA
TCAGACCGGAGTCGACGTCTCCAGTATCTTCCCAAAGCTAGGAGATCTGACGATAGATCA
CTGCGATGACCTCGTGACACTGCCTTCAAGCATCTGCGGTATGACCTCTCTCAACTCGTT
AAGCATAACGAACTGTCCAGGCGTCAGTGAATTGCCTAAGAACCTAAGCAAGCTACAAGC
TCTTGAACTTCTGAGCTATATGCTTGTCCTGAGCTAAAGCATTGCCTGACGAAATCTGTG
AGCTTCTCAGCTT

QA 2 854 2 854
DS 



AS 1 3

CO CL3323Contig1 758 3 2 U
GGAGACCATGCATTAGGGTCTGTACTTAACAAATTTATCAATGTAGACTCTGTTGCTCTA
GTTAAAACCTAACACTAATTTCGTTTACAGTTCTCTCTGAATACACATCCTTTTTTATCA
ATCATCACACTGATGTTTTGCTTCATTTTCCATCCCTTTTTGTGTTATTCTGACACAGTT
TCTCTTGCAAGGCTGGAGTCTCCAAGCCTGAAACTTTTTGGCATTATTTCAGTTATCTCA
GCAGGAGTGTTGTTATCAGTTACAAAGGAGACTGAATTTGAGTTTTGGGGTTTCGTTTTT
GTCATGCTTGCTGCTGTCATGTCTGGTTTCCGTTGGTGTATGACCCAAGTTCTTTTGCAG
AGAGAAACGTATGGCCTGAAAAATCCGTTCACTTTTATGAGTCGCGTGTCACCAGTTATG
GCTATAGTGACTGGTCTTCTCTCTCTCCTTCTGGATCCATGGAGTGAATTTAGAGAGAAC
AGATACTTTGATAATGGAGAGCATTTTGCTCGAACTTGTTTCTTGATGCTTTTTGGTGGA
GCGCTAGCTTTTTTCATGGTTTTAACAGAGTATGTTCTTGTTTCGGTGACCAGTGCTGTA
ACTGTCACAATAGCGGGGGTCGTTAAAGAGGCTGTCATCATAGTGGTTGCAGTGTTTTAC
TTCCATGACGAATTTACGTGGCTGAAAGTTTTGGCCTGATGATTATCATGGTTGGTGTCA
GTTTGTTCAACTGGTACAAATATGATAAACTTCAGAAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GCGCTAGCTTTTTTCATGGT

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TAGCTTTTTTCATGGTTTTAACAGAGTATGTTCTTGTTTCGGTGACCAGTGCTGTAACTG
TCAC

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DS 

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TCTCTTGCAAGGCTGGAGTCTCCAAGCCTGAAACTTTTTGGCATTATTTCAGTTATCTCA
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GTCATGCTTGCTGCTGTCATGTCTGGTTTCCGTTGGTGTATGACCCAAGTTCTTTTGCAG
AGAGAAACGTATGGCCTGAAAAATCCGTTCACTTTTATGAGTCGCGTGTCACCAGTTATG
GCTATAGTGACTGGTCTTCTCTCTCTCCTTCTGGATCCATGGAGTGAATTTAGAGAGAAC
AGATACTTTGATAATGGAGAGCATTTTGCTCGAACTTGTTTCTTGATGCTTTTTGGTGGA
GCGCTAGCTTTTTTCATGGTTTTAACAGAGTATGTTCTTGTTTCGGTGACCAGTGCTGTA
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GTTTGTTCAACTGGTACAAATATGATAAACTTCAGAAG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

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ACATCTTGGTTTAGTTTGATTTAACTGGTTTATTATAATCAGCATACAAAGGTCTCTCAA
GCATAACCGAATTTGCTAGAAGAAACGAGTTGTTCCTCTCTGTGCTTCTGAACAAGTGCT
TCCAGCTTCTTTGCCTTCTCTTCTCCATCTTTGAAATGTACTCTTCTTCCATGTCCTGGT
ATCACCCAATTGAAATCCAGCTTGATCAATCTTTCTACGCTCTCGAGCTGGAGAGGCACT
GAACGATGATTGTACTTCTCTATAATGCTCATTCCAGATTCGTACTTAGTTAGATGGTCT
CCAGTGAATAATGCCTTGAGGGGTTTATGGAACAGGCACACTGATCCTTCAGTGTGACCA
GGAGTGTGTATAAGCTCCACATCTTCATAGAGTTTCCATGGTCCACTTCCTTCC*AGCTT
TAACTCCACATCAGTGGTCGAAGGTTGGACATCTCCAGAATGCAGAATTCTGGTACACTT
GAATCGATCTGCCCATTTCTTGTGATCCGCAACATCATCCCTGTGTGTCAAAAACATGTA
GCGAACACCACCC*ATCTTCTCAATCTTCCCAGCAAGTTTCTCTACGAACCTGGGACTAT
CAACAAGTATATTCCCCTCATGATGAAGTATCAAGTAGGAAGTTGCTCCGAAAGATTTCT
TGGAATGAAACCCACAATGAAAAACGCCAGGTAGTTTGTCTTCGTCCAGTGCAAGTGGAA
AGGTCTCTTGAGCTTCCCCTATGTCAGTAGGTGGAGTTTCAGTGCGGATAGATCCCGTGG
GACAAGACAACAAGGCCTGAAGAGCGTTCAGCCTTTCTTCCTTACAGGTTGGTTGTTTAA
TAACCGCAGACATGTTATCCACTCTGGTGAACACTTCCGGAACCATCCAACGACAAGTAT
CGCAATCAATACAAGTACTGTCAACATATATATCTCCTTCTACGTTCTGATTGCGTCGTC
TAGGGTTCGCCTGGCTACTCACTTGAGCTGCTCTGATAGATCCAAACGCTCTCCTTCCCG
TCAAAACCGAAGATGAACTTTTCGATGAGAAAACCGATTCTTTTGATCGAGAGTGACACA
AGAACGACGAAATCACGGAGGAAGAAGCAAAAGCCATAGCCGGTAGTGGTTGTGGTGATT
CTCGTTTCCTCTCGCTCTGATATCTTGCTAAAAGTGTAGAAAGAGACGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG85JQ U 1
AF RR4GG85TF C 10
AF RR4AD86JQ U 16
AF RR4AD86TF C 411
BS 1 727 RR4GG85JQ
BS 728 804 RR4AD86JQ
BS 805 1253 RR4AD86TF

RD RR4GG85JQ 728 0 0
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TCCAGCTTCTTTGCCTTCTCTTCTCCATCTTTGAAATGTACTCTTCTTCCATGTCCTGGT
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CCAGTGAATAATGCCTTGAGGGGTTTATGGAACAGGCACACTGATCCTTCAGTGTGACCA
GGAGTGTGTATAAGCTCCACATCTTCATAGAGTTTCCATGGTCCACTTCCTTCC*AGCTT
TAACTCCACATCAGTGGTCGAAGGTTGGACATCTCCAGAATGCAGAATTCTGGTACACTT
GAATCGATCTGCCCATTTCTTGTGATCCGCAACATCATCCCTGTGTGTCAAAAACATGTA
GCGAACACCACCC*ATCTTCTCAATCTTCCCAGCAAGTTTCTCTACGAACCTGGGACTAT
CAACAAGTATATTCCCCTCATGATGAAGTATCAAGTAGGAAGTTGCTCCGAAAGATTTCT
TGGAATG
C

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4GG85TF 719 0 0
TGCTAT
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CTAGAAGAAACGAGTTGTTCCTCTCTGTGCTTCTGAACAAGTGCTTCCAGCTTCTTTGCC
TTCTCTTCTCCATCTTTGAAATGTACTCTTCTTCCATGTCCTGGTATCACCCAATTGAAA
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TTCTCTATAATGCTCATTCCAGATTCGTACTTAGTTAGATGGTCTCCAGTGAATAATGCC
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GGTCGAAGGTTGGACATCTCCAGAATGCAGAATTCTGGTACACTTGAATCGATCTGCCCA
TTTCTTGTGATCCGCAACATCATCCCTGTGTGTCAAAAACATGTAGCGAACACCACCC*A
TCTTCTCAATCTTCCCAGCAAGTTTCTCTACGAACCTGGGACTATCAACAAGTATATTCC
CCTCATGATGAAGTATCAAGTAGGAAGTTGCTCCGAAAGATTTCTTGGAATG
C

QA 7 718 7 718
DS 

RD RR4AD86JQ 789 0 0
CGTCAAAGATTCATAATTTGAATTAAGCAAAGTACAGAGTGAAAAACATCTTGGTTTAGT
TTGATTTAACTGGTTTATTATAATCAGCATACAAAGGTCTCTCAAGCATAACCGAATTTG
CCAAAAAAAACAAGTTGTTCCTCTCTGTGCTTCTGAACAAGTGCTTCCAGCTTCTTTGCC
TTCTCTTCTCCATCTTTGAAATGTACTCTTCTTCCATGTCCTGGTATCACCCAACTGAAA
TCCAGCTTGATCAATCTTTCTACGCTCTCGAGCTGGAGAGGCACTGAACAATGATTGTAC
TTCTCTATAATGCTCATTCCAAATTCGTACTTAGTTAGATGGTCTCCAGTGAATAATGCC
TTGAGGGGTTTATGGAACAGGCACACTGATCCTTCAGTGTGACCAGGAGTGTGTATAAGC
TCCACATCTTCATAGAGTTTCCATGGTCCACTTCCTTCC*AGCTTTAACTCCACATCAGT
GGTCGAAGGTTGGACATCTCCAGAATGCAAAATTCTGGTACACTTGAATCGATCTGCCCA
TTTCTTGTGATCCGCAACATCATCCCTGTGTGTCAAAAACATGTAGCGAACACCACCC*A
TCTTCTCAATCTTCCCAGCAAGTTTCTCTACGAACCTGGGACTATCAACAAGTATATTCC
CCTCATGATGAAGTATCGAGTAGGAAGTTGCTCCGAAAGATTTCTTGGAATGAAACCCAC
AATGAAAAACGCCAGGTAGTTTGTCTTCGTCCAGTGCAAGTGGAAAGGTCTCTTGAGCTT
CCCCTATGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4AD86TF 843 0 0
AGTGTGACCAGGAGTGTGTATAAGCTCCACATCT*CATAGAGTTTCCATGGTCCACTTCC
TTCCCAGCTTTAACTCCACATCAGTGGTCGAAGGTTGGACATCTCCAGAATGCAGAATTC
TGGTACACTTGAATCGATCTGCCCATTTCTTGTGATCCGCAACATCATCCCTGTGTGTCA
AAAACATGTAGCGAACACCACCCCATCTTCTCAATCTTCCCAGCAAGTTTCTCTACGAAC
CTGGGACTATCAACAAGTATATTCCCCTCATGATGAAGTATCGAGTAGGAAGTTGCTCCG
AAAGATTTCTTGGAATGAAACCCACAATGAAAAACGCCAGGTAGTTTGTCTTCGTCCAGT
GCAAGTGGAAAGGTCTCTTGAGCTTCCCCTATGTCAGTAGGTGGAGTTTCAGTGCGGATA
GATCCCGTGGGACAAGACAACAAGGCCTGAAGAGCGTTCAGCCTTTCTTCCTTACAGGTT
GGTTGTTTAATAACCGCAGACATGTTATCCACTCTGGTGAACACTTCCGGAACCATCCAA
CGACAAGTATCGCAATCAATACAAGTACTGTCAACATATATATCTCCTTCTACGTTCTGA
TTGCGTCGTCTAGGGTTCGCCTGGCTACTCACTTGAGCTGCTCTGATAGATCCAAACGCT
CTCCTTCCCGTCAAAACCGAAGATGAACTTTTCGATGAGAAAACCGATTCTTTTGATCGA
GAGTGACACAAGAACGACGAAATCACGGAGGAAGAAGCAAAAGCCATAGCCGGTAGTGGT
TGTGGTGATTCTCGTTTCCTCTCGCTCTGATATCTTGCTAAAAGTGTAGAAAGAGACGTA
GCC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 4

CO CL3325Contig1 791 4 4 U
GACAAACCAACAAAATAGTATCATTTTCATTAGTCCCTCCCACTAGAAATTTAATAACCT
AATTAAGAAAGAAATATAAATATAGCACAGCTAAAACAAATAAAAGAGTGCACCTATCAA
ACCACCTGAAAAAGAAAATATTCATTTTTTTCTTCATCATATTGGTCTTTACTTTTTCAT
TTCTACCATCCTCTTGTTTGTTTCTCTGTTTACCCTTAAGGACTTCTACATGAACAGTTC
TGACTGCAGTAACGTGTAATAGTTAGCAGCTTCATCTTCAAGCTCCCAAAGCCCATTACC
AAAGCCATCTATTAAACTAAACTCATTAATGTAATCTTGATTAGTTGCATTGTTAATCAT
CTCATAATTACTCCCGCCAAAGTCAGTGTTAGGTATCCCTAGTTCGTCGTCCGAAGCTTC
AAGAAGATGCTTCATCACTTTCTCCTTGTCGCTTTCGTACTCCTCTTCCTTTGAAACACA
CGAAGACGAGGAGGATGAACAAGAGGAAGAAGAGAGAGCAGGATTCGCAGAAACGGCAGC
GTTTTCCTCTTCCGTAGAGATCTCTTGCTGAAGTGAGGTGATTAGAGAAACTAAATCATG
TTCTGCTTCATTTTTTTTTGTATCTTCTTGGAGCATGGTTTCTTGTTCATGTTCTTCTCT
TTGGCGTTTTAATGGCGATGATGCTGCTGTTTCTGCCATTGTTTGAGAAGAAGATAGAGA
TTACGATGTAGATAGCTTTCTTTAGCTTTTAAAATTGTAAGAGAGGGAGAGAATATCGTG
TGGGATAATCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR65JQ U 5
AF RR4CS80JQ U 1
AF RR4CS80TF C 44
AF RR4CR65TF C 73
BS 1 731 RR4CS80JQ
BS 732 732 RR4CR65JQ
BS 733 785 RR4CS80JQ
BS 786 791 RR4CR65TF

RD RR4CR65JQ 744 0 0
AACCAACAAAATAGTATCATTTTCATTAGTCCCTCCCACTAGAAATTTAATAACCTAATT
AAGAAAGAAATATAAATATAGCACAGCTAAAACAAATAAAAGAGTGCACCTATCAAACCA
CCTGAAAAAGAAAATATTCATTTTTTTCTTCATCATATTGGTCTTTACTTTTTCATTTCT
ACCATCCTCTTGTTTGTTTCTCTGTTTACCCTTAAGGACTTCTACATGAACAGTTCTGAC
TGCAGTAACGTGTAATAGTTAGCAGCTTCATCTTCAAGCTCCCAAAGCCCATTACCAAAG
CCATCTATTAAACTAAACTCATTAATGTAATCTTGATTAGTTGCATTGTTAATCATCTCA
TAATTACTCCCGCCAAAGTCAGTGTTAGGTATCCCTAGTTCGTCGTCCGAAGCTTCAAGA
AGATGCTTCATCACTTTCTCCTTGTCGCTTTCGTACTCCTCTTCCTTTGAAACACACGAA
GACGAGGAGGATGAACAAGAGGAAGAAGAGAGAGCAGGATTCGCAGAAACGGCAGCGTTT
TCCTCTTCCGTAGAGATCTCTTGCTGAAGTGAGGTGATTAGAGAAACTAAATCATGTTCT
GCTTCATTTTTTTT*GTATCTTCTTGGAGCATGGTTTCTTGTTCATGTTCTTCTCTTTGG
CGTTTTAATGGCGATGATGCTGCTGTTTCTGCCATTGTTTGAGAAGAAGATAGAGATTAC
GATGTAGATAGCTTTCTTTAGCTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4CS80JQ 790 0 0
GACAAACCAACAAAATAGTATCATTTTCATTAGTCCCTCCCACTAGAAATTTAATAACCT
AATTAAGAAAGAAATATAAATATAGCACAGCTAAAACAAATAAAAGAGTGCACCTATCAA
ACCACCTGAAAAAGAAAATATTCATTTTTTTCTTCATCATATTGGTCTTTACTTTTTCAT
TTCTACCATCCTCTTGTTTGTTTCTCTGTTTACCCTTAAGGACTTCTACATGAACAGTTC
TGACTGCAGTAACGTGTAATAGTTAGCAGCTTCATCTTCAAGCTCCCAAAGCCCATTACC
AAAGCCATCTATTAAACTAAACTCATTAATGTAATCTTGATTAGTTGCATTGTTAATCAT
CTCATAATTACTCCCGCCAAAGTCAGTGTTAGGTATCCCTAGTTCGTCGTCCGAAGCTTC
AAGAAGATGCTTCATCACTTTCTCCTTGTCGCTTTCGTACTCCTCTTCCTTTGAAACACA
CGAAGACGAGGAGGATGAACAAGAGGAAGAAGAGAGAGCAGGATTCGCAGAAACGGCAGC
GTTTTCCTCTTCCGTAGAGATCTCTTGCTGAAGTGAGGTGATTAGAGAAACTAAATCATG
TTCTGCTTCATTTTTTTTTGTATCTTCTTGGAGCATGGTTTCTTGTTCATGTTCTTCTCT
TTGGCGTTTTAATGGCGATGATGCTGCTGTTTCTGCCATTGTTTGAGAAGAAGATAGAGA
TTACGATGTAGGTAGCTTTCTTTAGCTTTTAAAATTGTAAGAGAGGGAGAGAATATCGTG
TGGGA
TATCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4CS80TF 742 0 0
ACTAGAAATTTATAA
CTAATTAAGAAAGAAATATAAATATAGCACAGCTAAAACAAATAAAAGAGTGCAC*TATC
AAACCAC*TGAAAAAGAAAATATTCATTTTTT*CTTCATCATATTGGTCTTTACTTTTTC
ATTTCTACCATCCTCTTGTTTGTTTCTCTGTTTACCCTTAAGGACTTCTACATGAACAGT
TCTGACTGCAGTAACGTGTAATAGTTAGCAGCTTCATCTTCAAGCTCCCAAAGCCCATTA
CCAAAGCCATCTATTAAACTAAACTCATTAATGTAATCTTGATTAGTTGCATTGTTAATC
ATCTCATAATTACTCCCGCCAAAGTCAGTGTTAGGTATCCCTAGTTCGTCGTCCGAAGCT
TCAAGAAGATGCTTCATCACTTTCTCCTTGTCGCTTTCGTACTCCTCTTCCTTTGAAACA
CACGAAGACGAGGAGGATGAACAAGAGGAAGAAGAGAGAGCAGGATTCGCAGAAACGGCA
GCGTTTTCCTCTTCCGTAGAGATCTCTTGCTGAAGTGAGGTGATTAGAGAAACTAAATCA
TGTTCTGCTTCATTTTTTTTTGTATCTTCTTGGAGCATGGTTTCTTGTTCATGTTCTTCT
CTTTGGCGTTTTAATGGCGATGATGCTGCTGTTTCTGCCATTGTTTGAGAAGAAGATAGA
GATTACGATGTAGGTAGCTTTCTTTAGCTTTTAAAATTGTAAGAGAGGGAGAGAATATCG
TGTGGGA

QA 16 742 16 742
DS 

RD RR4CR65TF 719 0 0
AATATAAATATAGCACAGCTAAAACAAATAAAAGAGTGCAC*TATCAAACCAC*TGAAAA
AGAAA*TATTCATTTTTT*CTTCATCATATTGGTCTTTACTTTTTCATTTCTACCATCCT
CTTGTTTGTTTCTCTGTTTACCCTTAAGGACTTCTACATGAACAGTTCTGACTGCAGTAA
CGTGTAATAGTTAGCAGCTTCATCTTCAAGCTCCCAAAGCCCATTACCAAAGCCATCTAT
TAAACTAAACTCATTAATGTAATCTTGATTAGTTGCATTGTTAATCATCTCATAATTACT
CCCGCCAAAGTCAGTGTTAGGTATCCCTAGTTCGTCGTCCGAAGCTTCAAGAAGATGCTT
CATCACTTTCTCCTTGTCGCTTTCGTACTCCTCTTCCTTTGAAACACACGAAGACGAGGA
GGATGAACAAGAGGAAGAAGAGAGAGCAGGATTCGCAGAAACGGCAGCGTTTTCCTCTTC
CGTAGAGATCTCTTGCTGAAGTGAGGTGATTAGAGAAACTAAATCATGTTCTGCTTCATT
TTTTTT*GTATCTTCTTGGAGCATGGTTTCTTGTTCATGTTCTTCTCTTTGGCGTTTTAA
TGGCGATGATGCTGCTGTTTCTGCCATTGTTTGAGAAGAAGATAGAGATTACGATGTAGA
TAGCTTTCTTTAGCTTTTAAAATTGTAAGAGAGGGAGAGAATATCGTGTGGGATAATCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL3326Contig1 1594 3 7 U
GGGCTGCCAATAAATGGAACTGTCTCCTGCGTCCGCCATGTTCAGTCAATCCTCCTCCGC
TCAGCTTCTGAGACCTAAGCTCGGGTTTACGGTTTCTATTCCCCGGAGAGCATCCATCGT
TTCATCTTCTTCTTCTTGGCCTCCCCGATTCTTGCGGATGGAAACTCAATCTCAGCCTCC
TCAATCTATCTCCTCCGCTTCTTCACCCACCAACAACGTCTCTTCTCTCTATCCAATCAG
CACGAGTTGGAGAAGTGAAGAGAGTAACAAAGGAGACGAATGTGTCAGTGAAGATCAATT
TGGATGGCACTGGAGTTGCTGACAGTTCCACCGGAATCCCTTTCCTTGACCATATGCTTG
ATCAACTTGCTTCGCACGGCTTGTTTGATGTGCACGTCAGAGCTACTGGTGATGTTCACA
TCGATGACCATCACACTAATAAAGATATTGCTCTTGCCATTGGAACCGCTCTGTTAAAGG
CACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTCCTCTTGATGAAG
CCCTTATTCATGTTTCCCTGGATTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAACTTGGAGA
TTCCAACACAGAGAGTTGGGAACTATGACACTCATTTGGTGGAGCACTTTTTCCAGTCAT
TGGTGAATACTTCCCGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTGGTAAAAACTCGCATC
ACATAATAGAGGCGACATTTAAGGCCTTTGCCAGGGCTTTAAGACAAGCAACGGAGAATG
ATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGTTCAAAAGGAGTCTTGTCACGGTCCTGAGAGA
GAGCTAAGAAATCACAAAGAAAAGCTCTCAGATTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTC
ATCGAATTGGTAAAACAAAAACAAGGATGATGCCAAAATGTCAAGAAGAAGAAGTGAATT
AGACTGAAGATCACACACACTGGGGTTCCATCTATAAAAAGAGAGATGTTCTGTATTTCT
TTTAAGCATTGCTGTATCAAACTCTAAAAACTTACTGCAAGGAAGGACTTATCGAGTAAT
TTGCTAGAATAAGTAATCAAAACGCCTGTCTTTTAATCCTTATATGGGTAGTCAACGGCA
AAACGTATTGCATCTCTTTTGTTTTGATCTTTGTTCCACATCATAATAGTTGTTTCTGGT
TATCTATCGACTCAAGTTATTAGTCCATTCCTTTTTTTGCAGGCTTATTTTTAGTATTAG
CACAATGGTAGTTTTTTTTTGGAAGTTATTTAAAATTAGGGTGCCAATATTCAATGTTAT
TTTGTTATTCCTTTTTTTTGTTTTTCTTTGAGAATGGCTGAATAGTTTGAGAAGAAGAAC
CGTGGGGCGCAGAAGTTGGGCCGGGTTTACGACCCAATCACTCATCGACAGGTGACAAAT
GAAGGGTCCTTTATGGTTATCTCGCAACCACAAGAGACTTGGACAAAGTCGATATGGACT
ATGGAGACAAAGAAGAACACCACAATCGATAGAGCTTTATAGAACTCACATGATAAAGTT
GAATTACAGTTCTCTTACTAAAGGTACACTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GQ93TF U 1
AF RR4GQ93JQ C 349
AF RR4FT37JQ U 899
BS 1 711 RR4GQ93TF
BS 712 712 RR4GQ93JQ
BS 713 725 RR4GQ93TF
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BS 913 981 RR4FT37JQ
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RD RR4GQ93TF 725 0 0
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TCAGCTTCTGAGACCTAAGCTCGGGTTTACGGTTTCTATTCCCCGGAGAGCATCCATCGT
TTCATCTTCTTCTTCTTGGCCTCCCCGATTCTTGCGGATGGAAACTCAATCTCAGCCTCC
TCAATCTATCTCCTCCGCTTCTTCACCCACCAACAACGTCTCTTCTCTCTATCCAATCAG
CACGAGTTGGAGAAGTGAAGAGAGTAACAAAGGAGACGAATGTGTCAGTGAAGATCAATT
TGGATGGCACTGGAGTTGCTGACAGTTCCACCGGAATCCCTTTCCTTGACCATATGCTTG
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TCGATGACCATCACACTAATAAAGATATTGCTCTTGCCATTGGAACCGCTCTGTTAAAGG
CACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTCCTCTTGATGAAG
CCCTTATTCATGTTTCCCTGGATTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAACTTGGAGA
TTCCAACACAGAGAGTTGGGAACTATGACACTCATTTGGTGGAGCACTTTTTCCAGTCAT
TGGTGAATACTTCCCGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTGGTAAAA*CTCGCATC
ACATA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4GQ93JQ 743 0 0
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GTGATGTTCACATCGATGACCATCACACTAATAAAGATATTGCTCTTGCCATTGGAACCG
CTCTGTTAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTC
CTCTTGATGAAGCCCTTATTCATGTTTCCCTGGATTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTT
ACAACTTGGAGATTCCAACACAGAGAGTTGGGAACTATGACACTCATTTGGTGGAGCACT
TTTTCCAGTCATTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTGGTA
AAAACTCGCATCACATAATAGAGGCGACATTTAAGGCCTTTGCCAGGGCTTTAAGACAAG
CAACGGAGAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGTTCAAAAGGAGTCTTGTCAC
GGTCCTGAGAGAGAGCTAAGAAATCACAAAGAAAAGCTCTCAGATTTTCTCTTTTTTTTT
TTTTTTTTTGTCATCGAATTGGTAAAACAAAAACAAGGATGATGCCAAAATGTCAAGAAG
AAGAAGTGAATTAGACTGAAGATCACACACACTGGGGTTCCATCTATAAAAAGAGAGATG
TTCTGTATTTCTTTTAAGCATTGCTGTATCAAACTCTAAAAACTTACTGCAAGGAAGGAC
TTATCGAGTAATTTGCTAGAAT
C

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4FT37JQ 696 0 0
GCCATCGAATTGGT
AAACAAAAACAAGGATGATGCCAAAATGTCAAGAAGAAGAAGTGAATTAGACTGAAGATC
ACACACACTTGGGTTCCATCTATAAAAAGAGAGATGTTCTGTATTTCTTTTAAGCATTGC
TGTATCAAACTCTAAAAACTTACTGCAAGGAAGGACTTATCGAGTAATTTGCTAGAATAA
GTAATCAAAACGCCTGTCTTTTAATCCTTATATGGGTAGTCAACGGCAAAACGTATTGCA
TCTCTTTTGTTTTGATCTTTGTTCCACATCATAATAGTTGTTTCTGGTTATCTATCGACT
CAAGTTATTAGTCCATTCCTTTTTTTGCAGGCTTATTTTTAGTATTAGCACAATGGTAGT
TTTTTTTTGGAAGTTATTTAAAATTAGGGTGCCAATATTCAATGTTATTTTGTTATTCCT
TTTTTTTGTTTTTCTTTGAGAATGGCTGAATAGTTTGAGAAGAAGAACCGTGGGGCGCAG
AAGTTGGGCCGGGTTTACGACCCAATCACTCATCGACAGGTGACAAATGAAGGGTCCTTT
ATGGTTATCTCGCAACCACAAGAGACTTGGACAAAGTCGATATGGACTATGGAGACAAAG
AAGAACACCACAATCGATAGAGCTTTATAGAACTCACATGATAAAGTTGAATTACAGTTC
TCTTACTAAAGGTACACTTTGG

QA 15 696 15 696
DS 



AS 2 4

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GAAGACAGAGAATAGAGAGAGAGAGAGCCAAAAAATGGTATCAAAGTTCATCTTTCTGGT
AACTCTTATCAGGCGACGAAGTTTTCAAATCAAGAAGGTATCTTGTGGCCAAGGAAGCGT
GAAGGGAAGCACCATAAGGGAGTAAATCTTCATTGACCTCCAAATAAGGCGAGTGAGGGC
TCGCCATTGGTGAATGAGCTTCGTTTTGCATTCCTAGGAAGCTGAAGTGTCCAGGCATTG
CTTCTTGGTAAAAAGAAAAATCCTCTGATCCCATCAACGGTTGCATCTCGACGTAATTCT
GAATCCCTAACATGTCTCCTGACACGTTCTTGAAAAA


BQ
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AF RR4E907TF C 1
AF RR4E907JQ U 228
BS 1 227 RR4E907TF
BS 228 289 RR4E907JQ
BS 290 290 RR4E907TF
BS 291 457 RR4E907JQ

RD RR4E907TF 447 0 0
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ATCTTTACAAGGAAGCCTCTCTAGAAAAATGACATTTCGACGAGTAGGGGGAAGGAGATA
GAAGACAGAGAATAGAGAGAGAGAGAGCCAAAAAATGGTATCAAAGTTCATCTTTCTGGT
AACTCTTATCAGGCGACGAAGTTTTCAAATCAAGAAGGTATCTTGTGGCCAAGGAAGCGT
GAAGGGAAGCACCATAAGGTAGTAAATCTTCATTGACCTCGAAATAAGGCGAGTGAGGGC
TCGCCATTGGTGAATGAGCTTCGTTTTGCATTCCTAGGAAGCTGAAGTGTCCAGGCATTG
CTTCTTGGTAGAAAGAGAAATCCTCTGATCCCATCAACGGTTGCATCTCGACGTAGTTCT
GAGTCCCTAACATGTCTCCTGACACGT

QA 1 447 1 447
DS 

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GGGGAGTGAGGGCTCGCCATTGGTGAATGAGCTTCGTTTTGCATTCCTAGGAAGCTGAAG
TGTCCAGGCATTGCTTCTTGGTAAAAAGAAAAATCCTCTGATCCCATCAACGGTTGCATC
TCGACGTAATTCTGAATCCCTAACATGTCTCCTGACACGTTCTTGAAAAA

QA 1 230 1 230
DS 



CO CL3327Contig2 1252 2 4 U
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AACCAGCTGAGGAAGGAGGAGGAGGTGCGAAGAAGATCGTGGAAGCCGGAGTATTGAAGG
ATGTGAGCGCAATCTTTGGGTTACATGTTACAAACCAACTGAGTTTAGTCCAAGTGAGCT
CAAGAGAAGGTCCGTTGTTGGCTGGTAGTGGCTTATTCGAAGCTAAGATAAGCGGGAAAG
GAGGTCACGCAGCTCTTCCTCAGCACGCCATAGATCCCATATTGACAGCTTCTAACGTTG
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CAATTGCTAAGTTTGAAGGCGGTGGTGCTTTTAATGTGATTCCAGACTCTGTTACTATCG
GGGGTACATTCAGAGCCTTTTCAACTAAAAGCTTTACCCAACTCAAGAAAAGAATTGAGC
AGGTTATCACGAGGCAAGCGAGCGTGCATATGTGCAATGCAACAGTAGATTTCCTTAATG
AGGAGAAACCTTTCTTCCCACCGACTGTTAACGAGAAAGGCTTGCACACGTTCTTCAAGA
ACGTGTCAGGAGACATGTTAGGGACTCAGAACTACGTCGAGATGCAACCATTGATGGGAT
CAGAGGATTTCTCTTTCTACCAAGAAGCAATGCCTGGACACTTCAGCTTCCTAGGAATGC
AAAACGAAGCTCATTCACCAATGGCGAGCCCTCACTCGCCTTATTTCGAGGTCAATGAAG
ATTTACTACCTTATGGTGCTTCCCTTCACGCTTCCTTGGCCACAAGATATCTTCTTGACT
TGAAAATTTCTTCGCCTGATAAGATTTACCAAAAAGATGAACTTTGATGCCATTTTTTTG
GCTCTCTCTCTATTCTCTATCTTCTATCTCCTCCCCCTACTCGTCGAAATGTCATTTTTC
TAGAGAGGCTTCCTTGTAAAGATCAATAAAGTGTAATGCAATGTGGAAATATAAGAATTT
TACTGCAAAGTGATTGTTGGGCCATTGTAATAAAAGAGTCTTTTATTGTAATGGATTTCC
TAGTGTGGAATATTAAATGTATAAACAGTTTTTTATTTATTTTATATTTCAT


BQ
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AF RR4GC02TF U 1
AF RR4GC02JQ C 609
BS 1 699 RR4GC02TF
BS 700 700 RR4GC02JQ
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GGGGTACATTCAGAGCCTTTTCAACTAAAAGCTTTACCCAACTCAAGAAAAGAATTGAGC
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ACGTGTCAG
AGACATG

QA 1 729 1 729
DS 

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CCTTTCTTCCCACCGACTGTTAACGAGAAAGGCTTGCACACGTTCTTCAAGAACGTGTCA
GGAGACATGTTAGGGACTCAGAACTACGTCGAGATGCAACCATTGATGGGATCAGAGGAT
TTCTCTTTCTACCAAGAAGCAATGCCTGGACACTTCAGCTTCCTAGGAATGCAAAACGAA
GCTCATTCACCAATGGCGAGCCCTCACTCGCCTTATTTCGAGGTCAATGAAGATTTACTA
CCTTATGGTGCTTCCCTTCACGCTTCCTTGGCCACAAGATATCTTCTTGACTTGAAAATT
TCTTCGCCTGATAAGATTTACCAAAAAGATGAACTTTGATGCCATTTTTTTGGCTCTCTC
TCTATTCTCTATCTTCTATCTCCTCCCCCTACTCGTCGAAATGTCATTTTTCTAGAGAGG
CTTCCTTGTAAAGATCAATAAAGTGTAATGCAATGTGGAAATATAAGAATTTTACTGCAA
AGTGATTGTTGGGCCATTGTAATAAAAGAGTCTTTTATTGTAATGGATTTCCTAGTGTGG
AATATTAAATGTATAAACAGTTTTTTATTTATTTTATATTTCAT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 4

CO CL3328Contig1 1061 4 8 U
AGCATGAAAAATATTCTTTATATATAAATATTTAGATCATCTTTTTCTTCTTCTTGAAAA
AGAAAAGAAAAAGATTTAACACACCAAACCTACTTACAACACTTGCTTACACTCTTATAA
CCAAAACCATAAAACATTATAAAGTAGGAACACTAAAAAAGGCTTTGGTAACTATAACCA
AGTTAATTATGATCGATCATACCCTATATGTAAAAGACCTTAAGTGTACTCTCATCATCT
CACACCATTATGATGTGATCCAGCGCACGACGACGTTTTGACCGTTCTCCACCACCAGAA
CTACGTTCCATCAAAGACTTGCTTGACCGCTCGAGCAGCGACTTGAGAGCGTTCTGTAAG
AAATGAACAGATTCGACGCCATGCATCTCTTTGTCGGCAGCTACGACAAGAACACTTCTA
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ATCTCCATGATGTCAGGCATGAGATCTGATCTGTCGTCACAGCATAAAGATGCTTTGAAG
ATTATATGACCGTCGTCTGAGTAGTCTCCATAGTGTAGAACGCTAATCTCGTCAGTCTCT
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TTGTGATTCCTCAACGCAGCAAGAGCTCTGTCTTGAGCAATCGTTTCTCCGATGCCGGAG
ATCGCTAGTGGGTAATAAGATGACGTCGACGAAGACAACCCGCACAAGCTCTGCATAGTC
GACATGTAGTCACCTGAAACGGAGAATCCTCCGCCGGAGAGTTCGTTTCCAGTGAGGAAC
GAATACAACATCTGATCTGAAGTCTCCGGTTGCATCTTTCTCTTCTTCTTTTGCGCCGCC
TTGTTTTGTTTTTAATGGAGTTTGTGGAGCTTTCGGTGGCC


BQ
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AF RR4FQ40JQ U 1
AF RR4CG83JQ U 2
AF RR4CG83TF C 271
AF RR4FQ40TF C 681
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BS 423 424 RR4FQ40JQ
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BS 426 759 RR4FQ40JQ
BS 760 876 RR4CG83TF
BS 877 877 RR4FQ40TF
BS 878 1061 RR4CG83TF

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AGAAAAGAAAAAGATTTAACACACCAAACCTACTTACAACACTTGCTTACACTCTTATAA
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ACTCGTTGAACCACTTTGGCCAGCAGTGTGGCTTTATCGGTCTTGGAGTTACAAGAAAGG
ACGTTACGGAGCTTATTGAGATGAGAATTAATCCTCTCT

QA 1 759 1 759
DS 

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GCATGAAAAATATTCTTTATATATAAATATTTAGATCATCTTTTTCTTCTTCTTGAAAAA
GAAAAGAAAAAGATTTAACACACCAAACCTACTTACAACACTTGCTTACACTCTTATAAC
CAAAACCATAAAACATTATAAAGTAGGAACACTAAAAAAGGCTTTGGTAACTATAACCAA
GTTAATTATGATCGATCATACCCTATATGTAAAAGACCTTAAGTGTACTCTCATCATCTC
ACACCATTATGATGTGATCCAGCGCACGACGACGTTTTGACCGTTCTCCACCACCAGAAC
TACGTTCCATCAAAGACTTGCTTGACCGCTCGAGCAGCGACTTGAGAGCGTTCTGTAAGA
AATGAACAGATTCGACGCCATGCATCTCTTTGTCGGCAGCTACGACAAGAACACTTCTAG
TCCGACCACCAAGAGTTGAAATCTCAGCTCGAAGTGTCTTCATGTGAAGAGACTTAAGAA
TCTCCATGATGTCAGGCATGAGATCTGATCTGTCGTCACAGCATAAAGATGCTTTGAAGA
TTATATGACCGTCGTCTGAGTAGTCTCCATAGTGTAGAACGCTAATCTCGTCAGTCTCTG
AGGGTAGAAGGGTTTGGTCGGAGTCGGAGATCTCTAGGGTTTGTTGTTTAAGTTCTTTGA
CTCGTTGAACCACTTTGGCCAGCAGTGTGGCTTTATCGGTCTTGGAGTTACAAGAAAGGA
CGTTACGGAGCTTATTGAGATG

QA 1 742 1 742
DS 

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GACGACGTTTGACCG
TCTCCACCACCAGAACTACGTTCCATCAAAGACT*GCTTGACCGCTCGAGCAGCGACTTG
AGAGCGTTCTGTAAGAAATGAACAGATTCGACGCCATGCATCTCTTTGTCGGCAGCTACG
ACAAGAACACTTCTAGTCCGACCACCAAGAGTTGAAATCTCAGCTCGAAGTGTCTTCATG
TGAAGAGACTTAAGAATCTCCATGATGTCAGGCATGAGATCTGATCTGTCGTCACAGCAT
AAAGATGCTTTGAAGATTATATGACCGTCGTCTGAGTAGTCTCCATAGTGTAGAACGCTA
ATCTCGTCAGTCTCTGAGGGTAGAAGGGTTTGGTCGGAGTCGGAGATCTCTAGGGTTTGT
TGTTTAAGTTCTTTGACTCGTTGAACCACTTTGGCCAGCAGTGTGGCTTTATCGGTCTTG
GAGTTACAAGAAAGGACGTTACGGAGCTTATTGAGATGAGAATTAATCCTCTCTCTTCTT
CTTCGCTCAGCTTCTTTGTGATTCCTCAACGCAGCAAGAGCTCTGTCTTGAGCAATCGTT
TCTCCGATGCCGGAGATCGCTAGTGGGTAATAAGATGACGTCGACGAAGACGACCCGCAC
AAGCTCTGCATAGTCGACATGTAGTCACCTGAAACGGAGAATCCTCCGCCGGAGAGTTCG
TTTCCAGTGAGGAACGAATACAACATCTGATCTGAAGTCTCCGGTTGCATCTTTCTCTTC
TTCTTTTGCGCCGCCTTGTTTTGTTTTTAATGGAGTTTGTGGAGCTTTCGGTGGCC

QA 16 791 16 791
DS 

RD RR4FQ40TF 379 0 0
CAGCAGTGTGGCTTTATCGGTCTTGGAGTTACAAGAAAGGACGTTACGGAGCTTATTGAG
ATGAGAATTAATCCTCTCTCTTCTTCTTCGCTCAGCTTCTTTGTGATTCCTCAACGCAGC
AAGAGCTCTGTCTTGAGCAATCGTTTCTCCGATGCCGGAGATCGCTAGTGGGTAATAAGA
TGACGTCGACGAAGACAACCCGCACAAGCTCTGCATAGTCGACATGTAGTCACCTGAAAC
GGAGAATCCTCCGCCGGAGAGTTCGTTTCCAGTGAGGAACGAATACAACATCTGATCTGA
AGTCTCCGGTTGCATCTTTCTCTTCTTCTTTTGCGCCGCCTTGTTTTGTTTTTAATGGAG
TTTGTGGAGCTTTCGGT
CC

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 4

CO CL3329Contig1 836 4 20 U
AGCAGGAAAGGGAGAGAGAGAGAAGATGGGAAAAGAGATGGAGTCCCCGAAAGAGCAGAG
CTCTTACACCGTTGAGCAGCTCGTCGCCGTCAATCCCTTCAACCCTGAAATCTTACCTGA
TCTCGAAAACTACGTCAACGAGCAGGTTACATC**AAACGTATAGCTTGGATGCAAATCT
CTGCTTGCTTCGTCTCTATCAGTTTGAGCCTGAGCGCATGAACACTCATATCGTGGCTCG
AATCCTGGTCAAGGCTCTTATGGCTATGCCAGCTCCAGACTTCAGCCTCTGCCTCTTCTT
GATTCCCGAAAGAGTGCAAATGGAGGAGCAGTTCAAGTCACTCATTGTGCTCTCACACTA
CCTTGAGACTGGGAGGTTCCAACAGTTCTGGGATGAAGCTGCCAAGAACCGTCACATTCT
TGAGTCTGTTCCAGGTTTTGAGCAAGCTATCCAAGCGTATGCAAGTCACCTTCTTAGCTT
AAGCTACCAAAAAGTTCCAAGATCTGTGCTTGCCGAGGCTGTCAACATGGATGGTGCATC
TCTAGACAAGTTCATTGAGCACCAAGTGACTAACATGGG*ATGGATCGTAGAGAAAGGAG
ATGGAAGTATCGTCTTACCGCAGAATGAATTTAACCATCCGGAGCTTAAGAAAAATAATA
CAGGTGAGAATGTTCCCTTGGAACACGTCGCCCGCATCTTCCCCATCCTTGGTTAAACCA
GTTTGTCAGTACTCTTCAAATTTTCCTTTTTGTCTCCCTGGCTTTTAAACTAATGCAACA
CTTTAAGACACACTGTAATGTGATTTTTGCATTAACCATTATAAGTATTTTAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GY07JQ C 430
AF RR4GY07TF U 1
AF RR4AK66TF U 3
AF RR4AK66JQ C 116
BS 1 153 RR4GY07TF
BS 154 155 RR4AK66TF
BS 156 166 RR4GY07TF
BS 167 167 RR4AK66TF
BS 168 386 RR4GY07TF
BS 387 387 RR4AK66TF
BS 388 579 RR4GY07TF
BS 580 580 RR4AK66TF
BS 581 654 RR4GY07TF
BS 655 655 RR4AK66TF
BS 656 704 RR4GY07TF
BS 705 705 RR4AK66TF
BS 706 757 RR4GY07TF
BS 758 758 RR4AK66TF
BS 759 765 RR4GY07TF
BS 766 766 RR4AK66TF
BS 767 785 RR4GY07TF
BS 786 814 RR4AK66TF
BS 815 815 RR4AK66JQ
BS 816 836 RR4AK66TF

RD RR4GY07JQ 283 0 0
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AAAAGTTCCAAGATCTGTGCTTGCCGAGGCTGTCAACATGGATGGTGCATCTCTAGACAA
GTTCATTGAGCACCAAGTGACTAACATGGG*ATGGATCGTAGAGAAAGGAGATGGAAGTA
TCGTCTTACCGCAGAATGAATTTAACCATCCGGAGCTTAAGAAAAATAATACAGGTGAGA
ATGTTCCCTTGGAACACGTCGCCCGCATCTTCCCCGTCCTTGG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4GY07TF 792 0 0
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CTCTTACACCGTTGAGCAGCTCGTCGCCGTCAATCCCTTCAACCCTGAAATCTTACCTGA
TCTCGAAAACTACGTCAACGAGCAGGTTACATCGCAAACGTATAGCCTGGATGCAAATCT
CTGCTTGCTTCGTCTCTATCAGTTTGAGCCTGAGCGCATGAACACTCATATCGTGGCTCG
AATCCTGGTCAAGGCTCTTATGGCTATGCCAGCTCCAGACTTCAGCCTCTGCCTCTTCTT
GATTCCCGAAAGAGTGCAAATGGAGGAGCAGTTCAAGTCACTCATTGTGCTCTCACACTA
CCTTGAGACTGGGAGGTTCCAACAGTCCTGGGATGAAGCTGCCAAGAACCGTCACATTCT
TGAGTCTGTTCCAGGTTTTGAGCAAGCTATCCAAGCGTATGCAAGTCACCTTCTTAGCTT
AAGCTACCAAAAAGTTCCAAGATCTGTGCTTGCCGAGGCTGTCAACATGGATGGTGCATC
TCTAGACAAGTTCATTGAGCACCAAGTGACTAACATGGGGATGGATCGTAGAGAAAGGAG
ATGGAAGTATCGTCTTACCGCAGAATGAATTTAACCATCCGGAGCTTAAGAAAA*TAATA
CAGGTGAGAATGTTCCCTTGGAACACGTCGCCCGCATCTTCCCCGTCCTTGGTTAAACCA
GTTTGTCAGTACTCTTCAAATTTTCCTTTTTGTCTCC*TGGCTTT*AAACTAATGCAACA
CTTTA
GACACAC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4AK66TF 834 0 0
AGCAAGAAA
GAGAGAGAGAGAAGATGGGAAAAGAGATGGAGTCCCCGAAAGAGCAGAGCTCTTACACCG
TTGAGCAGCTCGTCGCCGTCAATCCCTTCAACCCTGAAATCTTACCTGATCTCGAAAACT
ACGTCAACGAGCAGGTTACATC**AAACGTATAGCTTGGATGCAAATCTCTGCTTGCTTC
GTCTCTATCAGTTTGAGCCTGAGCGCATGAACACTCATATCGTGGCTCGAATCCTGGTCA
AGGCTCTTATGGCTATGCCAGCTCCAGACTTCAGCCTCTGCCTCTTCTTGATTCCCGAAA
GAGTGCAAATGGAGGAGCAGTTCAAGTCACTCATTGTGCTCTCACACTACCTTGAGACTG
GGAGGTTCCAACAGTTCTGGGATGAAGCTGCCAAGAACCGTCACATTCTTGAGTCTGTTC
CAGGTTTTGAGCAAGCTATCCAAGCGTATGCAAGTCACCTTCTTAGCTTAAGCTACCAAA
AAGTTCCAAGATCTGTGCTTGTCGAGGCTGTCAACATGGATGGTGCATCTCTAGACAAGT
TCATTGAGCACCAAGTGACTAACATGGG*ATGGATCGTAGAGAAAGGAGATGGAAGTATC
GTCTTACCGCAGAATGAATTTAACCATCCGGAGCTTAAGAAAAATAATACAGGTGAGAAT
GTTCCCTTGGAACACGTCGCCCGCATCTTCCCCATCCTTGGTTAAACCAGTTTGTCAGTA
CTCTTCAAATTTTCCTTTTTGTCTCCCTGGCTTTTAAACTAATGCAACACTTTAAGACAC
ACTGTAATGTGATTTTTGCATTA*CCATTATAAGTATTTTAAACT

QA 10 834 10 834
DS 

RD RR4AK66JQ 721 0 0
CCTGATCTCGAAAACTACGTCAACGAGCAGGTTACATC**AAACGTATAGCTTGGATGCA
AATCTCTGCTTGCTTCGTCTCTATCAGTTTGAGCCTGAGCGCATGAACACTCATATCGTG
GCTCGAATCCTGGTCAAGGCTCTTATGGCTATGCCAGCTCCAGACTTCAGCCTCTGCCTC
TTCTTGATTCCCGAAAGAGTGCAAATGGAGGAGCAGTTCAAGTCACTCATTGTGCTCTCA
CACTACCTTGAGACTGGGAGGTTCCAACAGTTCTGGGATGAAGCTGCCAAGAACCGTCAC
ATTCTTGAGTCTGTTCCAGGTTTTGAGCAAGCTATCCAAGCGTATGCAAGTCACCTTCTT
AGCTTAAGCTACCAAAAAGTTCCAAGATCTGTGCTTGTCGAGGCTGTCAACATGGATGGT
GCATCTCTAGACAAGTTCATTGAGCACCAAGTGACTAACATGGG*ATGGATCGTAGAGAA
AGGAGATGGAAGTATCGTCTTACCGCAGAATGAATTTAACCATCCGGAGCTTAAGAAAAA
TAATACAGGTGAGAATGTTCCCTTGGAACACGTCGCCCGCATCTTCCCCATCCTTGGTTA
AACCAGTTTGTCAGTACTCTTCAAATTTTCCTTTTTGTCTCCCTGGCTTTTAAACTAATG
CAACACTTTAAGACACACTGTAATGTGATTTTTGCATTAACCATTATAAGTATTTTAAAC
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL3330Contig1 696 3 1 U
GGGGACCCATACAAGCGCCTAGGGATCAGCCCCTACGCTTCCGAGGAAGAGATCTGGGCC
TCTCGCAACTTCCTCTTAGAGCAGTACGCCGGCCACGAGAGGAGCCGGGAGTCTATAGAG
GGCGCGTTCGAGAAGCTTCTCATGTCTAGTTTCGTGGCGAGGAAGAAGACTAAGATCAAC
CTCAAGACGAGGTTGAAGAAGAGAGTCGAGGAGTCTCCTCCTTGGCTCAAGGCGCTTTTC
GATTTCGTTGAGATGCCTCCGATGGATACTGTGTTCAGAAGGCTGTTTCTTTTTGCCTTC
ATGGGTGGTTGGAGTATCATGAACTCTGCAGAAGGCGGTCCTGCCTTTCAGGTGGCGGTG
TCTTTGGCTGCTTGCGTATATTTCCTGAATGAGAAGACAAAGAGCTTGGGGAGAGCTTTC
TTAATCGGGTTTGGTGCATTAGCGGCTGGATGGTTCTGCGGTTCGCTAGTCATTCCCATG
ATTCCGACTGTTTTGATTAACCCGGCATGGACACTGGAGCTCCTAACGTCACTGGTTGCT
TATGTGTTTTTGTTTCTTTCTTGTACTTTCCTCAAGTAGAGTTGCTTTTTTTGTTTCTTT
CTTGTACCTGATCTCGCCGGAAAATTGAACTTAAGTTCCATAACATTGGCTGGCTCTGTT
AAAGTGTGGAATCAAGTTGATGAGAATCTTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ13JQ C 155
AF RR4BJ13TF U 1
AF RR4DK13TF U 348
BS 1 696 RR4BJ13TF

RD RR4BJ13JQ 375 0 0
TGGCGAGGAAGAAGACTAAGATCAACCTCAAGACGAGGTTGAAGAAGAGAGTCGAGGAGT
CTCCTCCTTGGCTCAAGGCGCTTTTCGATTTCGTTGAGATGCCTCCGATGGATACTGTGT
TCAGAAGGCTGTTTCTTTTTGCCTTCATGGGTGGTTGGAGTATCATGAACTCTGCAGAAG
GCGGTCCTGCCTTTCAGGTGGCGGTGTCTTTGGCTGCTTGCGTATATTTCCTGAATGAGA
AGACAAAGAGCTTGGGGAGAGCTTTCTTAATCGGGTTTGGTGCATTAGCGGCTGGATGGT
TCTGCGGTTCGCTAGTCATTCCCATGATTCCGACTGTTTTGATTAACCCGGCAAGGACAC
TGGAGCTCCTAACGT

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR4BJ13TF 696 0 0
GGGGACCCATACAAGCGCCTAGGGATCAGCCCCTACGCTTCCGAGGAAGAGATCTGGGCC
TCTCGCAACTTCCTCTTAGAGCAGTACGCCGGCCACGAGAGGAGCCGGGAGTCTATAGAG
GGCGCGTTCGAGAAGCTTCTCATGTCTAGTTTCGTGGCGAGGAAGAAGACTAAGATCAAC
CTCAAGACGAGGTTGAAGAAGAGAGTCGAGGAGTCTCCTCCTTGGCTCAAGGCGCTTTTC
GATTTCGTTGAGATGCCTCCGATGGATACTGTGTTCAGAAGGCTGTTTCTTTTTGCCTTC
ATGGGTGGTTGGAGTATCATGAACTCTGCAGAAGGCGGTCCTGCCTTTCAGGTGGCGGTG
TCTTTGGCTGCTTGCGTATATTTCCTGAATGAGAAGACAAAGAGCTTGGGGAGAGCTTTC
TTAATCGGGTTTGGTGCATTAGCGGCTGGATGGTTCTGCGGTTCGCTAGTCATTCCCATG
ATTCCGACTGTTTTGATTAACCCGGCATGGACACTGGAGCTCCTAACGTCACTGGTTGCT
TATGTGTTTTTGTTTCTTTCTTGTACTTTCCTCAAGTAGAGTTGCTTTTTTTGTTTCTTT
CTTGTACCTGATCTCGCCGGAAAATTGAACTTAAGTTCCATAACATTGGCTGGCTCTGTT
AAAGTGTGGAATCAAGTTGATGAGAATCTTTTGCCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4DK13TF 324 0 0
G
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GGGAGAGCTTTCTTAATCGGGTTTGGTGCATTAGCGGCTGGATGGTTCTGCGGTTCGCTA
GTCATTCCCATGATTCCGACTGTTTTGATTAACCCTGCATGGACACTGGAGCTCCTAACG
TCATTGGTTGCTTATGTGTTTTTGTTTCTTTCTTGTACTTTCCTCAAGTAGAGTTGCTTT
TTTTGTTTCTTTCTTGTACCTGATCTCGTCGGAAAATTGAACTTAAGTTCCATAACATTG
GCTGGCTCTGTTAAAGTGTGGAA

QA 2 324 2 324
DS 



AS 2 4

CO CL3331Contig1 975 2 4 U
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CCAGTACGCCTACATGGCGAAGCTCGCGGAGCAGGCCGAGCGCTACGAGGAGATGGTCCA
GTTCATGGAGAGCCTCGTGACGGGCGCCACCCCGTCCTCGGAGCTCACCGTGGAGGAGGG
GAACCTCCTCTCGGTGGCCTACAAGAACGTGATCGGATCCCTGCGCGCCGCGTGGAGGAT
CGTGTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGCACGTGGGGCTGGT
CAAGGGGTACAGATCCAAGGTGGAGACGGAGCTCTCCTCCGTCTGCTCCGGGATCCTGAA
GCTACTCGAGGAGCACCTTATCCCGTCGGCGGCGGCGAGCGAGTCGAAGGTGTTTTATCT
GAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGTCGGGTGAGGAGAGGAA
AGCGGCTGCTGAGGATACCATGGTCGCTTACAAGGCTGCTCTGGATATCGCAGCTGCTGA
TATGGCGCCTACTCATCCGATTAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCTCTGTGTTTTACTA
TGAGATTCTTAATTCTTCCGACAAAGCTTGTGACATAGCCAAACAGGCTTTTGAAGAAGC
AATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGGGAAGAGTCATACAAAGACAGCACTCTCATTATGCA
GTTGCTTAGGGACAATCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGCAGGAGCAGATGGACGAGGC
GTGAGGATCTTAAGGAGGAGGGAGTGGAGAGTGTTATGAGCCATGTGTCCACCACCGTTT
TCGATATCAACATCCATCTCCCGTAACCTTTGCTCAGAAAAAAAAAGTATTTTTAAGTGT
TTATGAAGATTTATGTGCACAGCTTGTGATGATTGATCTACTCTATTAATAAGTCTTAAA
CTGTGTTCTCTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G540TF U 1
AF RR4G540JQ C 342
BS 1 646 RR4G540TF
BS 647 647 RR4G540JQ
BS 648 730 RR4G540TF
BS 731 975 RR4G540JQ

RD RR4G540TF 736 0 0
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GAACCTCCTCTCGGTGGCCTACAAGAACGTGATCGGATCCCTGCGCGCCGCGTGGAGGAT
CGTGTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGCACGTGGGGCTGGT
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GAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGTCGGGTGAGGAGAGGAA
AGCGGCTGCTGAGGATACCATGGTCGCTTACAAGGCTGCTCTGGATATCGCAGCTGCTGA
TATGGCGCCTACTCATCCGATTAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCTCTGTGTTTTACTA
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AATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGGGAAGAGTCATACAAAGACAGCACTCTCATTATGCA
GTTGCTTAGG
ACAATC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4G540JQ 634 0 0
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AGTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTA
AGTCGGGTGAGGAGAGGAAAGCGGCTGCTGAGGATACCATGGTCGCTTACAAGGCTGCTC
TGGATATCGCAGCTGCTGATATGGCGCCTACTCATCCGATTAGGCTTGGTCTTGCGTTGA
ATTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATTCTTAATTCTTCCGACAAAGCTTGTGACATAGCCA
AACAGGCTTTTGAAGAAGCAATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGGGAAGAGTCATACAAAG
ACAGCACTCTCATTATGCAGTTGCTTAGGGACAATCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGC
AGGAGCAGATGGACGAGGCGTGAGGATCTTAAGGAGGAGGGAGTGGAGAGTGTTATGAGC
CATGTGTCCACCACCGTTTTCGATATCAACATCCATCTCCCGTAACCTTTGCTCAGAAAA
AAAAAGTATTTTTAAGTGTTTATGAAGATTTATGTGCACAGCTTGTGATGATTGATCTAC
TCTATTAATAAGTCTTAAACTGTGTTCTCTAAGC

QA 1 634 1 634
DS 



CO CL3331Contig2 374 2 2 U
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TTGAAGAAGCAATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGAGAAGAGTCATACAAAGACAGCACTC
TCATTATGCAATTGCTTAGGGACAACCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGCAGGAGCAGA
TGGACGAGGCGTGAGGAGGAAGGAAGGGAGTGAAGAGAGTGTTATGCGCCATGTTTCCAC
CACCGTTTTCGATTTCAACATCCATCTCCCATAACCTTTGCTCAAAAAAGTATTTTTAAG
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AAACTGTGTTCTCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H143JQ C 1
AF RR4H143TF U 1
BS 1 1 RR4H143JQ
BS 2 374 RR4H143TF

RD RR4H143JQ 374 0 0
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TTGAAGAAGCAATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGAGAAGAGTCATACAAAGACAGCACTC
TCATTATGCAATTGCTTAGGGACAACCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGCAGGAGCAGA
TGGACGAGGCGTGAGGAGGAAGGAAGGGAGTGAAGAGAGTGTTATGCGCCATGTTTCCAC
CACCGTTTTCGATTTCAACATCCATCTCCCATAACCTTTGCTCAAAAAAGTATTTTTAAG
TGTTTATGAAGATTTATGTGCACAGCTTGTGATGATTGATCCACTCTATTAATATGTCTT
AAACTGTGTTCTCT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4H143TF 374 0 0
G
GTTTTACTATGAGATTCTTAATTCTTCCGACAAAGCTTGTGACATGGCCAAACAGGCTTT
TGAAGAAGCAATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGAGAAGAGTCATACAAAGACAGCACTCT
CATTATGCAATTGCTTAGGGACAACCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGCAGGAGCAGAT
GGACGAGGCGTGAGGAGGAAGGAAGGGAGTGAAGAGAGTGTTATGCGCCATGTTTCCACC
ACCGTTTTCGATTTCAACATCCATCTCCCATAACCTTTGCTCAAAAAAGTATTTTTAAGT
GTTTATGAAGATTTATGTGCACAGCTTGTGATGATTGATCCACTCTATTAATATGTCTTA
AACTGTGTTCTCT

QA 2 374 2 374
DS 



AS 1 3

CO CL3332Contig1 1165 3 4 U
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AGAGCTGGATTTTTTCAACTTCCCGGAGGGGTTTCCACCAAGACGTTGGGACTTTGGCTG
GATACGTGTGGAATGTGGTGAAGGGCGTATATACCCTAACTGCGCCTTGGCGAATCTTTA
TGCCAAGCTCGGCCTTCATCGCTACAACTGGTTAGAGGGGACAAACTTTGAGCTAGATAG
CTTAATGAAATTCATCATGAGTGGTGCTGCATCTCCTTACTACATGACCTTGGTTGCGCG
TCTTCCATCTACCGGTTTCCAGCAAGTGTTTCAGGTTCTCGTACGGGAAGTACAACTTGG
CATTTTGGATTTGAAATGCACCATCTCTAGACCTCAAGGAACCGAGAGTTCAAAGGAGTC
AACTCCTTTCTTACGTCCACATTCCGAGCCAGTGTCTACAACCTTCCCAGACAGATTGGC
TGGCTGGAACGGGACCAAGTCAGTAATTCCATGGCCCTCCTCTTTCAGTGACACAAAGCA
GCGTTTTTACATGTTGAATGAATCTGAGTTGCAATGTGATTGGATTTCTTTGTACGTGGA
ACTTGCAATCTGTACTTCCCATAGGTGGATTACTGCTAGGGATCTCTCCAAGTTTGACTT
GGAGATTGTCCAAGTAGCCATTGAGTCTCTAGATGATAAGGAGCCCCCAAGTCTCAAGTC
TGAAGCTGCGGTCATCTACATAGCATACAAGGACTTGGCCAAGGCTAGGACTGGTGAGCC
TTATCACTACCAAGCTGTGGTGAGACGAGTTATCAACCAGTCTACCGGAACATTGAGCAT
CCAAGGTGATTGCTGGATTGCAGAAGAAGCAGCAACGGCGGCTTGGACAGCTTCTAAGAA
GGGATCCCGAAAGCTTAACCGTCGCTTAGGAGTTCCTAAGCTGTGGAGGTTGTCTAGTCC
TAGGTGGTATCAGACGTACAAGAACCGTGGCCTCCGCTCTTCCCCCACGAGTTGACTTAC
CAACTCTATTTAGTAATTTAAGACATTTGAACATGCTTATCGGATTGTGGTAGTATTTTA
ACTATTTATTAGTGATGCTTATGTGTTGTGTGCTTTTGGTCTCTGTTTAAGACATTTGTA
TCGGATGGAGTAGTATTTAACTATC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RR4EG56TF U 1
AF RR4BP91TF U 1
AF RR4BP91JQ C 480
BS 1 148 RR4BP91TF
BS 149 149 RR4EG56TF
BS 150 648 RR4BP91TF
BS 649 1165 RR4BP91JQ

RD RR4EG56TF 394 0 0
GGG
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GCTGGATTTTTTCAACTTCCCGGAGGGGTTTCCACCAAGACGTTGGGACTTTGGCTGGAT
ACGTGTGGAATGTGGTGAAGGGCGTATATACCCTAACTGCGCCTTGGCGAATCTTTATGC
CAAGCTCGGCCTTCATCGCTACAACTGGTTAGAGGGGACAAACTTTGAGCTAGATAGCTT
AATGAAATTCATCATGCGTGGTGCTGCATCTCCTTATTACATGACCTTGGTTGCGCGTCT
TCCATCTACCGGTTTCCAGCAAGTGTTTCAGGTTCTCGTACGGGAAGTACATCTTGGCAT
TTTGGATTTGAAATGCACCATCTCTAGACCT

QA 4 394 4 394
DS 

RD RR4BP91TF 652 0 0
GGAAGACGTCTTCGCTGGAGAACATACTAAGGAGATGAGTCAGAGTTGTGTACGAAGGGA
AGAGCTGGATTTTTTCAACTTCCCGGAGGGGTTTCCACCAAGACGTTGGGACTTTGGCTG
GATACGTGTGGAATGTGGTGAAGGGCGTGTATACCCTAACTGCGCCTTGGCGAATCTTTA
TGCCAAGCTCGGCCTTCATCGCTACAACTGGTTAGAGGGGACAAACTTTGAGCTAGATAG
CTTAATGAAATTCATCATGAGTGGTGCTGCATCTCCTTACTACATGACCTTGGTTGCGCG
TCTTCCATCTACCGGTTTCCAGCAAGTGTTTCAGGTTCTCGTACGGGAAGTACAACTTGG
CATTTTGGATTTGAAATGCACCATCTCTAGACCTCAAGGAACCGAGAGTTCAAAGGAGTC
AACTCCTTTCTTACGTCCACATTCCGAGCCAGTGTCTACAACCTTCCCAGACAGATTGGC
TGGCTGGAACGGGACCAAGTCAGTAATTCCATGGCCCTCCTCTTTCAGTGACACAAAGCA
GCGTTTTTACATGTTGAATGAATCTGAGTTGCAATGTGATTGGATTTCTTTGTACGTGGA
ACTTGCAATCTGTACTTCCCATAGGTGGATTACTGCTAGGGATCTCTC
AGTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4BP91JQ 686 0 0
CTGGCTGGAACGGGACCAAGTCAGTAATTCCATGGCCCTCCTCTTTCAGTGACACAAAGC
AGCGTTTTTACATGTTGAATGAATCTGAGTTGCAATGTGATTGGATTTCTTTGTACGTGG
AACTTGCAATCTGTACTTCCCATAGGTGGATTACTGCTAGGGATCTCTCCAAGTTTGACT
TGGAGATTGTCCAAGTAGCCATTGAGTCTCTAGATGATAAGGAGCCCCCAAGTCTCAAGT
CTGAAGCTGCGGTCATCTACATAGCATACAAGGACTTGGCCAAGGCTAGGACTGGTGAGC
CTTATCACTACCAAGCTGTGGTGAGACGAGTTATCAACCAGTCTACCGGAACATTGAGCA
TCCAAGGTGATTGCTGGATTGCAGAAGAAGCAGCAACGGCGGCTTGGACAGCTTCTAAGA
AGGGATCCCGAAAGCTTAACCGTCGCTTAGGAGTTCCTAAGCTGTGGAGGTTGTCTAGTC
CTAGGTGGTATCAGACGTACAAGAACCGTGGCCTCCGCTCTTCCCCCACGAGTTGACTTA
CCAACTCTATTTAGTAATTTAAGACATTTGAACATGCTTATCGGATTGTGGTAGTATTTT
AACTATTTATTAGTGATGCTTATGTGTTGTGTGCTTTTGGTCTCTGTTTAAGACATTTGT
ATCGGATGGAGTAGTATTTAACTATC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 2 4

CO CL3333Contig1 807 2 5 U
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AAAAAAATAAAAGTTAAAGAAAGACACAACATTCATTAATTCAAAGCGTTACAGCAAGAA
CCTTAACGAACTCAGTTCCCACAGGGACTGAAAGCACACTATCAGACCACTCAAGTTTGC
CCCAACAGTCTCCATCGCGTCTTTCAAGCGATATCTCCGCACAACATATGGTCTCCCTTC
GAGTCAAGTGACAACTGAAATTGGCATTCCAGAAAACCATAATCTTTCCACCACCAAAAC
CCGTCAGTTTAACATAAGAACCATAACCAGCAAGAGGACTAGGCAACTTAGGTAGTAGCC
CAACCAAACCCTTCAAATCTCTCCACCTAGTCTTGTCGGAGTCATACCATCTCAGAGCTC
CGTGGTCAGAAACAGAGTAGAGAATATTATCAACCTCGCAGTAAGAATCTAAAAACATAG
TGCCCGTGCTTGGATATTGTTCATCAACCAGGTCCCATCTACATTGCTTTGAATTGAAAG
CAAACACGCCATCAAAGAAAGTCACCACGTGGAGCTTGCCGTCAACAATAAAAGTGATTC
TGGGGGTATCACATCCACCACAGCAAGGGAGATGCCAAGTTTGAGTATTTGTGTTGAATA
CCTCGAAGTAGCTCTTCCAGGAACCATCTTGATGGAAGCGTCCAAGTACATATATCTTTT
GATCAAGGAATGTGGTAGAAAGTTCAGTTAGCTCCACTGGCATGCGTGGAGCCTTACGCC
ACCTGTGAGTCTTGCAATCAAGATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4D995JQ U 24
AF RR4CV51JQ U 1
BS 1 361 RR4CV51JQ
BS 362 362 RR4D995JQ
BS 363 470 RR4CV51JQ
BS 471 471 RR4D995JQ
BS 472 807 RR4CV51JQ

RD RR4D995JQ 596 0 0
ATCATCAGAGAAATTGAAAAAGCCATTATTACAAAACAAAAAAATAAAAGTTAAAGAAAG
ACACAACATTCATTAATTCAAAGCGTTACAGCAAGAACCTTAACGAACTCAGTTCCCACA
GGGACTGAAAGCACACTATCAGACCACTCAAGTTTGCCCCAACAGTCTCCATCGCGTCTT
TCAAGCGATATCTCCGCACAACATATGGTCTCCCTTCGAGTCAAGTGACAACTGAAATTG
GCATTCCAGAAAACCATAATCTTTCCACCACCAAAACCCGTCAGTTTAACATAAGAACCA
TAACCAGCAAGAGGACTAGGCAACTTAGGTAGTAGCCCAACCAAACCCTTCAAATCTCTC
CACCTAGTCTTGTCGGAGTCATACCATCTCAGAGCTCCGTGGTCAGAAACAGAGTAGAGA
ATATTATCAACCTCGCAGTAAGAATCTAAAAACATAGTGCCCGTGCTTGGATATTGTTCA
TCAACCAGGTCCCATCTACATTGCTTTGAATTGAAAGCAAACACGCCATCAAAGAAAGTC
ACCACGTGGAGCTTGCCGTCAACAATAAAAGTGATTCTGGGGGTATCACATCCACC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4CV51JQ 807 0 0
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AAAAAAATAAAAGTTAAAGAAAGACACAACATTCATTAATTCAAAGCGTTACAGCAAGAA
CCTTAACGAACTCAGTTCCCACAGGGACTGAAAGCACACTATCAGACCACTCAAGTTTGC
CCCAACAGTCTCCATCGCGTCTTTCAAGCGATATCTCCGCACAACATATGGTCTCCCTTC
GAGTCAAGTGACAACTGAAATTGGCATTCCAGAAAACCATAATCTTTCCACCACCAAAAC
CCGTCAGTTTAACATAAGAACCATAACCAGCAAGAGGACTAGGCAACTTAGGTAGTAGCC
CTACCAAACCCTTCAAATCTCTCCACCTAGTCTTGTCGGAGTCATACCATCTCAGAGCTC
CGTGGTCAGAAACAGAGTAGAGAATATTATCAACCTCGCAGTAAGAATCTGAAAACATAG
TGCCCGTGCTTGGATATTGTTCATCAACCAGGTCCCATCTACATTGCTTTGAATTGAAAG
CAAACACGCCATCAAAGAAAGTCACCACGTGGAGCTTGCCGTCAACAATAAAAGTGATTC
TGGGGGTATCACATCCACCACAGCAAGGGAGATGCCAAGTTTGAGTATTTGTGTTGAATA
CCTCGAAGTAGCTCTTCCAGGAACCATCTTGATGGAAGCGTCCAAGTACATATATCTTTT
GATCAAGGAATGTGGTAGAAAGTTCAGTTAGCTCCACTGGCATGCGTGGAGCCTTACGCC
ACCTGTGAGTCTTGCAATCAAGATTGA

QA 1 807 1 807
DS 



CO CL3333Contig2 802 2 10 U
GGGGGCGAGAAGAAGAAGAAGGTCGCAAGGAACCCTAATTTCACCTGCTCAATCAATAAC
AATTGCTTTTTGTTTGTCCCGGCGCCAACCCCTAAATTGGAGCCGGAATGGAGAGGTTGA
TCAAGGGTGATACCGTATCGAGGAGGAAGAGGAAGACAACGATGACTACGAGTATTAGGG
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGGTAGCTACATCATCATCATCATTATCATTATCGT
CACTTCCCTATGACTTGTTAGTGATGATCGTGGCACGCGTTCCAAGGTCGTACTATCGGA
CTCTATCACTAGTCTCCAAGAGCTTTCGATCTATGGTGGTTGCACCTGAGCTTTACAAGG
TTAGGTCACTCTTGGGCCTCACGGAGACTTGTCTATATGTGTGCTTGAGGTTCGGGTTGA
CTTGTTATAAGTGGTACACCCTCTCCAAGACTAGTACTAGTAGTAGTGGCTATGTTTTGG
GTAGAGTCTCAATGCGCGATGTTGATGATGCTTTTGATGACGCTTCTCCTCGTGTGGTGG
GTTTGTTATATTCAGATCTTGTGGCCGTTGGTTCTGAAATCTACAACGTTGGCGTAGCAG
ATAAAGGAACCATGCCCACCTCTGGGGTCTCAATTCTTGATTGCAAGACTCACAGGTGGC
GTAACGCTCCACGCATGCCAGTGGAGCTAACTGAACTTTCTACCACATTCCTTGATCAAA
AGATATATGTACTTGGACGCTTCCATCAAGATGGTTCCTGGAAGAGCTACTTCGAGGTAT
TCACACAATACTCAAACTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CV51TF U 1
AF RR4D995TF U 25
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GG
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DS 



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BQ
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AF RR4EA60TF U 1
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QA 1 717 1 717
DS 

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TTAGTTTCTGAGTGGTTCTTATTGTCTTTGCCTGATATTTAGCAACTTACTCACTTGGTT
CTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCATGTTCTGAGTTTCTTTTTGTTGTTTT
ATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCTGATTACTGAACAATGTTCTTTTGTT
TTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGAGATATATACATC
TATATATATAACAAGTGATATATTGAAAATCTGAATAGTGAAGTCAACATAGATTCAGAA
AATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAAACTCAAGTTATCATCCCATTATAA
AAGCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTCATTTGA
TTCTCAC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4E066JQ 793 0 0
TTTTTAGTTTCTGAGTGGTTCTTATTGTCTTTGCC*GATATTTAGCAACTTACTCACTTG
GTTCTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCATGTTCTGAGTTTCTTTTTGTTGT
TTTATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCTGATTACTGAACAATGTTCTTTT
GTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGAGATATATAC
ATCTATATATATAACAAGTGATATATTGAAAATCTGAATAGTGAAGTCAACATAGATTCA
GAAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAAACTCAAGTTATCATCCCATTA
TAAAAGCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTCATTTGAATTCTCACTTATTTGGTTCTTTTAC
TGGCGTGATATTAGTCATCAAAAACGATGTGTCAGTGAGGAAGTAATTTTGTTTGTTTAC
CCCAACTCTCTCTCCTTCATCTTTTGCAGTTGCAGCTCTATTTTTGGATTGTGTTTGTGG
CGTTTGGAGAAGACTTAGAAGAAAAACATGGCATGAGGATCTTATTCGGCTCAATAGCAA
ATGCCGTGAATGTGTTCACGTCTGCTTGACTACCACGGCGATGTGTCCGTCGTCAAAACC
GAGCGTTTGTTCTCCAAGCTGATTGAAAAAAGTTTTTTGTTTTCCAATTTACTCTGTGAT
CTTTTGTACTCTGTGATCTTTTTAGAAATTCGTGTTTACTCTGTGATCTTTTGAGAAATT
TGTGTCTGGAACT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4EA60JQ 644 0 0
GATGAGCCTGATTACTGAACAATGTTCTTTTGTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTT
CTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGAGATATATACATCTATATATATAACAAGTGATATATTGA
AAATCTGAATAGTGAAGTCAACATAGATTCAGAAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAAT
ATAGATAGAAACTCAAGTTATCATCCCATTATAAAAGCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTC
ATTTGAATTCTCACTTATTTGGTTCTTTTACTGGCGTGATATTAGTCATCAAAAACGATG
TGTCAGTGAGGAAGTAATTTTGTTTGTTTACCCCAACTCTCTCTCCTTCATCTTTTGCAG
TTGCAGCTCTATTTTTGGATTGTGTTTGTGGCGTTTGGAGAAGACTTAGAAGAAAAACAT
GGCATGAGGATCTTATTCGGCTCAATAGCAAATGCCGTGAATGTGTTCACGTCTGCTTGA
CTACCACGGCGATGTGTCCGTCGTCAAAACCGAGCGTTTGTTCTCCAAGCTGATTGAAAA
AAGTTTTTTGTTTTCCAATTTACTCTGTGATCTTTTGTACTCTGTGATCTTTTTAGAAAT
TCGTGTTTACTCTGTGATCTTTTGAGAAATTTGTGTCTGGAACT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL3335Contig1 690 2 4 U
GGATAACAAGAGGATCCATGGATAAAGCCAGAAAAGTTTATTTCTAATCGTAACTAAATC
TTCAGTTCTATTTTTTGTTTGGTATAGAAAAAATTGAAGCAAAATAGCTATTAAACGAGA
ACTTTGGTTTACTAAAGACATCGACATATTATATTGTTTTAGCTCGGTGGAAACAAAATA
CTTTTCCTAAGGATTCCGTTAAATAGAAATAAAGAACGAAGTAACTAGAAAGATTTTTTG
AGTTCGCCTTTTCTATCTTCTAGAAGGACCATCTATAAAGCAAAATTTTCTGTGAAAGCA
TCCAGATCAATCTCATTGACAATGTCCCCGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATG
AGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCATGCTCTGTGTTGGGAACT
TGCTTATGTCATGGACCCCTCGTCAATTCTCCGACATCACTCCTGATAGCTTGTCTATCT
TCCGGACAATTCGACCAATTCCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACC
CGGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATCGGGATGAAGCTAGAAACCGTTG
ATTCTAGAAATGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTG
CTGCATTACTTCCGTATGGTGTTACATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC44TF U 1
AF RR4CC44JQ C 177
BS 1 627 RR4CC44TF
BS 628 628 RR4CC44JQ
BS 629 640 RR4CC44TF
BS 641 690 RR4CC44JQ

RD RR4CC44TF 646 0 0
GGATAACAAGAGGATCCATGGATAAAGCCAGAAAAGTTTATTTCTAATCGTAACTAAATC
TTCAGTTCTATTTTTTGTTTGGTATAGAAAAAATTGAAGCAAAATAGCTATTAAACGAGA
ACTTTGGTTTACTAAAGACATCGACATATTATATTGTTTTAGCTCGGTGGAAACAAAATA
CTTTTCCTAAGGATTCCGTTAAATAGAAATAAAGAACGAAGTAACTAGAAAGATTTTTTG
AGTTCGCCTTTTCTATCTTCTAGAAGGACCATCTATAAAGCAAAATTTTCTGTGAAAGCA
TCCAGATCAATCTCATTGACAATGTCCCCGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATG
AGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCATGCTCTGTGTTGGGAACT
TGCTTATGTCATGGACCCCTCGTCAATTCTCCGACATCACTCCTGATAGCTTGTCTATCT
TCCGGACAATTCGACCAATTCCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACC
CGGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATCGGGATGAAGCTAGAAACCGTTG
ATTCTAGAAATGCTGCATCAACTTACA*CATTCTGAATGA
GAGAAG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4CC44JQ 514 0 0
AATACTTTTCCTAAGGATTCCGTTAAATAGAAATAAAGAACGAAGTAACTAGAAAGATTT
TTTGAGTTCGCCTTTTCTATCTTCTAGAAGGACCATCTATAAAGCAAAATTTTCTGTGAA
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AATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCATGCTCTGTGTTGGG
AACTTGCTTATGTCATGGACCCCTCGTCAATTTTCCGACATCACTCCTGATAGCTTGTCT
ATCTTCCGGACAATTCGACCAATTCCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATT
CACCCGGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATCGGGATGAAGCTAGAAACC
GTTGATTCTAGAAATGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTT
GCTGCTGCATTACTTCCGTATGGTGTTACATCTT

QA 1 514 1 514
DS 



AS 2 4

CO CL3336Contig1 717 2 1 U
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CAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGATAAAGCACCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGG
AAGGATCCCGAAGGAAAGATCATAATGACTACTACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTT
AAATCGATCCGCGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCTAACTTCGAGGATGTTGCCACTCGC
GTTTCCGACTGTAGCTCCGCCAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAA
ATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAACATACGCACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATT
GTGGATACAGACAGTGGAGTCCATATCATTAAGAGAACTGCTTGATCTCTCCTCCAATTT
ATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTGTTCCATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAA
TAATAAGAAAAGCTTTGCTATTGTGGTTTTAATTCTGCATGATTTTTGATACAAGCAAAA
ACATGTAATAAAAACAAATTGTATCATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACAC
ATCCCTGTTGCTGACTCTGACTTGTGTTATCATTCTGTGTGAAAATTTCTCAAGCCTGCT
TTCTTGTAAACTGTTAGAAATTATACATTAATCCCAACACCTCGCTGATTCACGCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AD61JQ C 1
AF RR4AD61TF U 1
BS 1 717 RR4AD61TF

RD RR4AD61JQ 717 0 0
GGATCACCACATCCACAACAACAAGCGCCGGGAAAAGAAAAAAAGATGGCGTCGAGAGAG
CAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGATAAAGCACCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGG
AAGGATCCCGAAGGAAAGATCATAATGACTACTACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTT
AAATCGATCCGCGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCTAACTTCGAGGATGTTGCCACTCGC
GTTTCCGACTGTAGCTCCGCCAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAA
ATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAACATACGCACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATT
GTGGATACAGACAGTGGAGTCCATATCATTAAGAGAACTGCTTGATCTCTCCTCCAATTT
ATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTGTTCCATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAA
TAATAAGAAAAGCTTTGCTATTGTGGTTTTAATTCTGCATGATTTTTGATACAAGCAAAA
ACATGTAATAAAAACAAATTGTATCATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACAC
ATCCCTGTTGCTGACTCTGACTTGTGTTATCATTCTGTGTGAAAATTTCTCAAGCCTGCT
TTCTTGTAAACTGTTAGAAATTATACATTAATCCCAACACCTCGCTGATTCACGCCG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AD61TF 717 0 0
GGATCACCACATCCACAACAACAAGCGCCGGGAAAAGAAAAAAAGATGGCGTCGAGAGAG
CAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGATAAAGCACCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGG
AAGGATCCCGAAGGAAAGATCATAATGACTACTACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTT
AAATCGATCCGCGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCTAACTTCGAGGATGTTGCCACTCGC
GTTTCCGACTGTAGCTCCGCCAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAA
ATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAACATACGCACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATT
GTGGATACAGACAGTGGAGTCCATATCATTAAGAGAACTGCTTGATCTCTCCTCCAATTT
ATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTGTTCCATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAA
TAATAAGAAAAGCTTTGCTATTGTGGTTTTAATTCTGCATGATTTTTGATACAAGCAAAA
ACATGTAATAAAAACAAATTGTATCATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACAC
ATCCCTGTTGCTGACTCTGACTTGTGTTATCATTCTGTGTGAAAATTTCTCAAGCCTGCT
TTCTTGTAAACTGTTAGAAATTATACATTAATCCCAACACCTCGCTGATTCACGCCG

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL3336Contig2 271 2 3 U
GATATCATTAAGAGAACTGCTTGATCTCCTCCAATTTATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTTG
TTCCATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAATAATAAGAAAAGCTTTGCTATT
GTGGTTTTAATTCTGCATGATTTTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAAACAAATT
GTATCATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACACGTCCCTGTTGCTGACTCTGA
CTTGCGTTATCATTCTGTGTGAAAATTTTTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EZ33JQ C 1
AF RR4EZ33TF U 1
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BS 2 268 RR4EZ33TF
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GTATCATTTCAATTTTTTCTTTATAGCTTCAGAATAACACGTCCCTGTTGCTGACTTTGA
CTTGCGTTATCATTCTGTGTGAAAATTTTTC

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DS 

RD RR4EZ33TF 271 0 0
G
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TCCATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAATAATAAGAAAAGCTTTGCTATTG
TGGTTTTAATTCTGCATGATTTTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAAACAAATTG
TATCATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACACGTCCCTGTTGCTGACTCTGAC
TTGCGTTATCATTCTGTGTGAAAATTT
CTC

QA 2 268 2 268
DS 



AS 1 4

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GGAGCTGGGACAAGATATTTCCAAATGGAAGCAATGAAACTGATATGCCGGAACCGTTTT
GCCGTGGTCTTGCAACGGCGCGTCTTCATGGGAGAGCCCAAGTTGTTCACGATATAGTAT
CAGATCAAAAGGACTCGTCTGCCTCGTTGAAAACTCCATGCGGTGATCTGATCTTTTACT
TGGATGGAGCTCACAGTCCAGAGAGCATGGAGGCTTGTGGCCGATGGTTCTCTTCTGCAG
TCAGAGGAAACAAAAGCTTGCCCACTCCTGTCAGTGGCTACAGGAGAAATGGGGAGTTTG
GTAGAGACTTAAACAGAGTCTCCAAGCAGATTCTTCTGTTCAACTGCATGGAAGTGAGAG
ACCCTCAAGTCTTACTTCCGAAGCTTGTCACCACTTGCGCTTCCTCAGGCACTCATTTCT
CAAGAGCACTGTTCGTTCCGACCATGTCAACCTACAACAAAGTCATTTCAGGCGCATCAG
CAATTCCTTTAGATACACGTAGGAAGGATCTGACTTGGCAATTCAGACTACAGAAACTCT
GGGAGAGATCAATCCAAGGAACAGATACTGCGCTTGACCATACACTGAACCCTGATGGAA
TAACTTCTTTGCCACCTCATGATTTCCTGTGTGGAGATGCACCTCACTGTGGTGGACCTG
CAGGGGGGACACATATCACTTCAAGCGCTGTAATGCCTTCACTTCCGTTGACCATAAACT
GGCTACGAGACTGCGTACGCCGGAACCCTTCGCTGAAACTAGAGGTTCTGGTCACAGGAT
CGCTACATCTTGTTGGAGATGTACTCAGATTGTTAAAGAGATGATTATTCTTTTTACCAA
ATCTGAAAAAAGGCCTCCTCAAAGAGTAATCTTACAGAGGGTCCAATTGTTTCTATACAT
CACTTTGTTTTTTCATAAGTACCAATTGATTTTTTTT**AGTCAATTTAGCTTATTAACA
TGAGAAGGCTCATCTAAGCTTTGT**TATTCTGTTGCACAATTTTATATTTGCTCTCATG
TCTCTAACGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A985TF U 1
AF RR4CX08JQ C 780
AF RR4CX08TF U 780
AF RR4A985JQ C 301
BS 1 779 RR4A985TF
BS 780 1137 RR4CX08TF
BS 1138 1153 RR4A985JQ

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GGAGCTGGGACAAGATATTTCCAAATGGAAGCAATGAAACTGATATGCCGGAACCGTTTT
GCCGTGGTCTTGCAACGGCGCGTCTTCATGGGAGAGCCCAAGTTGTTCACGATATAGTAT
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GTAGAGACTTAAACAGAGTCTCCAAGCAGATTCTTCTGTTCAACTGCATGGAAGTGAGAG
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GGGAGAGATCAATCCAAGGAACAGATACTGCGCTTGACCATACACTGAACCCTGATGGAA
TAACTTCTTTGCCACCTCATGATTTCCTGTGTGGAGATGCACCTCACTGTGGTGGACCT

QA 1 779 1 779
DS 

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QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4CX08TF 358 0 0
GCAGGGGGGACACATATCACTTCAAGCGCTGTAATGCCTTCACTTCCGTTGACCATAAAC
TGGCTACGAGACTGCGTACGCCGGAACCCTTCGCTGAAACTAGAGGTTCTGGTCACAGGA
TCGCTACATCTTGTTGGAGATGTACTCAGATTGTTAAAGAGATGATTATTCTTTTTACCA
AATCTGAAAAAAGGCCTCCTCAAAGAGTAATCTTACAGAGGGTCCAATTGTTTCTATACA
TCACTTTGTTTTTTCATAAGTACCAATTGATTTTTTTT**AGTCAATTTAGCTTATTAAC
ATGAGAAGGCTCATCTAAGCTTTGT**TATTCTGTTGCACAATTTTATATTTGCTCTC

QA 1 358 1 358
DS 

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TGGATGGAGCTCACAGTCCAGAGAGCATGGAGGCTTGTGGCCGATGGTTCTCTTCTGCAG
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GTAGAGACTTAAACAGAGTCTCCAAGCAGATTCTTCTGTTCAACTGCATGGAAGTGAGAG
ACCCTCAAGTCTTACTTCCGAAGCTTGTCACCACTTGCGCTTCCTCAGGCACTCATTTCT
CAAGAGCACTGTTCGTTCCGACCATGTCAACCTACAACAAAGTCATTTCAGGCGCATCAG
CAATTCCTTTAGATACACGTAGGAAGGATCTGACTTGGCAATTCAGACTACAGAAACTCT
GGGAGAGATCAATCCAAGGAACAGATACTGCGCTTGACCATACACTGAACCCTGATGGAA
TAACTTCTTTGCCACCTCATGATTTCCTGTGTGGAGATGCACCTCACTGTGGTGGACCTG
CAGGGGGGACACATATCACTTCAAGCGCTGTAATGCCTTCACTTCCGTTGACCATAAACT
GGCTACGAGACTGCGTACGCCGGAACCCTTCGCTGAAACTAGAGGTTCTGGTCATAGGAT
CGCTACATCTTGTTGGAGATGTACTCAGATTGTTAAAGAGATGATTATTCTTTTTACCAA
ATCTGAAAAAAGGCCTCCTTAAAGAGTAATCTTACAGAGGGTCCAATTGTTTCTATACAT
CACTTTGTTTTTTCATAAGTACCAATTGATTTTTTTTTTAGTCAATTTAGCTTATTAACA
TGAGAAGGCTTATCTAAGCTTTGTATTATTCTGTTGCACAATTTTATATTTGCTCTCATG
TCTCTAACGTTGC

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 4

CO CL3338Contig1 1190 4 7 U
GGTCCGGAAGTCATCTCCGTCGCCAAGAACGTGCTTCAGCAAGCTGGATCTCTCGAAGGA
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ATCGGAGGGTACAAATGGGACAACAATGAGAAACACCTGAGACCAGAGATGGCTCTGTTT
TACCTTAGAAGAGATCTCAAAGTCTTTGCAAACCTCAGACCTGCTTCAGTTTTGCCTCAG
CTAGTAGATGCTTCCACATTGAAGAGAGAAGTGGCAGAAGGTGTTGATATGATGATTGTA
AGGGAGCTTACAGGAGGTATCTACTTTGGAGAGCCAAGGGGAATCAAGACCAACGAAAAC
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CAATGTGTTGGACGCATCAATATTGTGGAGGAAAAGAGTAACAGCGTTAGCCTCTGAGTA
TCCAGATGTTGAACTAACACATATGTATGTCGACAATGCTGCAATGCAGCTTATTCGTGA
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GAAACGTAATATGCAAGCTTCTTGATAATAAATTTGGGATCAATTCTGCG


BQ
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AF RR4H443TF U 1
AF RR4HB09TF U 65
AF RR4H443JQB C 397
AF RR4HB09JQB C 399
BS 1 418 RR4H443TF
BS 419 477 RR4HB09TF
BS 478 478 RR4H443JQB
BS 479 737 RR4HB09TF
BS 738 859 RR4H443JQB
BS 860 860 RR4HB09JQB
BS 861 1190 RR4H443JQB

RD RR4H443TF 418 0 0
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ATCGGAGGGTACAAATGGGACAACAATGAGAAACACCTGAGACCAGAGATGGCTCTGTTT
TACCTTAGAAGAGATCTCAAAGTCTTTGCAAACCTCAGACCTGCTTCAGTTTTGCCTCAG
CTAGTAGATGCTTCCACATTGAAGAGAGAAGTGGCAGAAGGTGTTGATATGATGATTGTA
AGGGAGCTTACAGGAGGTATCTACTTTGGAGAGCCAAGGGGAATCAAGACCAACGAAA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4HB09TF 673 0 0
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TGCCGGAGGATTCCTTTACAGCTGCTAAACAATCTGATGCCATACTTCTTGGAGCTATCG
GAGGGTACAAATGGGACAACAATGAGAAACACCTGAGACCAGAGATGGCTCTGTTTTACC
TTAGAAGAGATCTCAAAGTCTTTGCAAACCTCAGACCTGCTTCAGTTTTGCCTCAGCTAG
TAGATGCTTCCACATTGAAGAGAGAAGTGGCAGAAGGTGTTGATATGATGATTGTAAGGG
AGCTTACAGGAGGTATCTACTTTGGAGAGCCAAGGGGAATCAAGACCAACGAAAACGGCG
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GTTGCGTTCGAGACTGCTAGGAAACGGCGTGGCAAGCTGTGTTCCGTCGACAAAGCCAAT
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GATGTTGAACTAACACATATGTATGTCGACAATGCTGCAATGCAGCTTATTCGTGACCCC
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TCAATGATCACTG

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DS 

RD RR4H443JQB 794 0 0
AG
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AGCTGTGTTCCGTCGACAAAGCCAATGTGTTGGACGCATCAATATTGTGGAGGAAAAGAG
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CTGCAATGCAGCTTATTCGTGACCCCAAACAGTTTGACACAATAGTCACCAATAACATTT
TTGGTGATATATTATCTGATGAGGCTTCAATGATCACTGGAAGCATTGGGATGCTTCCAT
CTGCTAGTCTCGGTGTATCGGGACCTGGACTGTTTGAGCCTATACATGGTTCAGCACCAG
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TGAAATATGGACTTGGAGAAGAAAAGGCTGCAAAGAGGATTGAAGACGTGGTCTTGGCTG
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AAGTTTAACGATGATTTAAAGCAGTCGATAAAGTGTGTAGCTCTTTCGTTTTACGGTTAC
TTATATGCTAATCCATGTACTAGAAACGTAATATGCAAGCTTCTTGATAATAAATTTGGG
ATCAATTCTGCG

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DS 

RD RR4HB09JQB 792 0 0
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TCATGAGATCGATAGAATT*GCTCGTGTTGCGTTCGAGACTGCTAGGAAACGGCGTGGCA
AGCTGTGTTCCGTCGACAAAGCCAATGTGTTGGACGCATCAATATTGTGGAGGAAAAGAG
TAACAGCGTTAGCCTCTGAGTATCCAGATGTTGAACTAACACATATGTATGTCGACAATG
CTGCAATGCAGCTTATTCGTGACCCCAAACAGTTTGACACAATAGTCACCAATAACATTT
TTGGTGATATATTATCTGATGAGGCTTCAATGATCACTGGAAGCATTGGGATGCTTCCAT
CTGCTAGTCTCGGTGTATCGGGACCTGGACTGTTTGAGCCTATACATGGTTCAGCACCAG
ATATTGCTGGTCAGGACAAGGCAAACCCATTGGCGACCATTCTCAGCGCTGCAATGCTTT
TGAAATATGGACTTGGAGAAGAAAAGGCTGCAAAGAGGATTGAAGACGTGGTCTTGGCTG
CTCTGAACAAAGGTTTTAGAACCGGTGACATCTACTCTTCTGGAAATAAACTGGTGGGAT
GCAAGGAGATGGGTGAGGAGGTGCTAAAATCAGTGGACGCCAAAGTTGCAGCAACTGTTT
AAGTTTAACGATGATTTAAAGCAGTCGATAAAGTGTGTAGCTCTTTCGTTTTACGGTTAC
TTATATGCTAATCCATGTACTAGAAACGTAATATGCAAGCTTCTTGATAATAAATTTGGG
ATCAATTCTGCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 2 4

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ACTTTGTGTGTTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCTTCTTGGTTGTTTCCAATGGAATCC
CGAAGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCACCATGTACTG
AAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGTGACGGGGTGT
GTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGAAAATTTAATC
AACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTTGTAATTCACG
AATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTCCCACTGCCCAAGCCTATTTATACATG
TACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTGT


BQ
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AF RR4BI25TF U 1
AF RR4BZ56TF U 310
BS 1 401 RR4BI25TF
BS 402 402 RR4BZ56TF
BS 403 471 RR4BI25TF

RD RR4BI25TF 471 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGAACAAGAAGAAATGGCAAAGATATCCA
ACTTTGTGTGTTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCTTCTTGGTTGTTTCCAATGGAATCC
CGAAGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCACCATGTACTG
AAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGTGACGGGGTGT
GTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGAAAATTTAATC
AACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTTGTAATTCACG
AATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTCCCACTGCTCAAGCCTATTTATACATG
TACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTGT

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4BZ56TF 162 0 0
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ATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTCCCACTGCCCAAGCCTATTTATACATGTACTCTTGT
GTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTGT

QA 1 162 1 162
DS 



CO CL3339Contig2 477 2 2 U
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CCCGAAGAGCAACGCATGTCAAACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCACCATGTAC
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GTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAATACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGAAAATTTAA
TCAACCACCAAGCAAATATACGCGCAAAACATCTCGCTTTACACTTTGTCTGTAATTCAC
GTATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTCCCACTGCTCAAGCCTATTTATACGT
GTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGATTGTTTGTAACTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4H484JQB C 1
AF RR4H484TF U 1
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AACTT

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DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4D466JQ C 1
AF RR4DI78JQ C 1
AF RR4D466TF U 1
AF RR4DI78TF U 1
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DS 

RD RR4DI78TF 360 0 0
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QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 4

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TGAACAGACTTGATCTCAAGATTGAAATTCTTCAGACCCGCAGAAGATCTTATGGTAGGA
ACCGCCATTTGCAGAAGCACTATCCCAGCAGAATACATATCAAACAGATCCGGACTGTTC
AACTGCCAGAGAATGGGGGAAAGCAAAGCGGCAATAGGCTCGGGAGGAGGAGTTGGGGTT
TCCTCGGGGAGGACATAGAGCTCAGGAGGACAGTAGTCAGGATCTAGCAATGTGCGCTCA
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TGGCCCTTCTTTGTAACCACCAAGTTGGCGGGCTTCACGTCCCTGTGAACAATGCCAGTA
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ACGAGCCATTTGCCGCCTTTTGTAAAGACAGTATTGGTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D376JQ U 1
AF RR4GY48JQ U 186
AF RR4D376TF C 1
AF RR4C238TF C 136
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AACC

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DS 

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ATGATCTGGCGCATGATCTGCTTAATGATGAGTGCACGA

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TGAACAGACTTGATCTCAAGATTGAAATTCTTCAGACCCGCAGAAGATCTTATGGTAGGA
ACCGCCATTTGCAGAAGCACTATCCCAGCAGAATACATATCAAACAGATCCGGACTGTTC
AACTGCCAGAGAATGGGGGAAAGCAAAGCGGCAATAGGCTCGGGAGGAGGAGTTGGGGTT
TCCTCGGGGAGGACATAGAGCTCAGGAGGACAGTAGTCAGGATCTAGCAATGTGCGCTCA
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TCATGGATCTTCCTGAGAGATGTAATGATCTGGCGCATGATCTGCTTAATGATGAGTGCA
CGACGTTTCACAGATTCCACACCTTGAA
GAACC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4C238TF 745 0 0
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AAAGCAAAGCGGCAATAGGCTCGGGAGGAGGAGTTGGGGTTTCCTCGGGGAGGACATAGA
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CACCTTGAAGAACACGCCCAAACATGATGGACTCCAGATTTGAAGGAAAACTCCTATCTT
TCATGTAATCACCCAGATCACGGTCTCCCTCGAACCTCCAGACGAGCCATTTGCCGCCTT
TTGTAAAGACAGTATTGGTCT

QA 5 745 5 745
DS 



AS 1 4

CO CL3342Contig1 936 4 7 U
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ACATTTACAACAACCAACACATGACACAAACATCAAGATTCTAAAATGAAAAAGGTACTA
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GGAATCTTCCGGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACCCTTGCATATACACTTGATGA
TTGCCTTTATTGCAAACCCGAGGGTACAAAGTCCATGCAATATCGGGCGTGGGAATCCGG
CAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGAATGCAAAGGATTATAGTCACCAGAGAGCCTATAGA
GCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGCAGACGGTTGTGTTTGGGGGA
TTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTGCTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAATGGCTGAGATGAGT
TTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCGATTCATGCATAACAGTTCCT
CTGAACCTTGCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTTTATCCT
GCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAATGGCCTGTATA
CTTCAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGACTAGGATCATACTTAAAACCTAGCAAGT
CCAGTCCATTCGACAGAGACCCAAGTGTTAACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D867JQ U 1
AF RR4B393JQ U 108
AF RR4D867TF C 113
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RD RR4D867JQ 812 0 0
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GCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGCAGACGGTTGTGTTTGGGGGA
TTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTGCTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAATGGCTGAGATGAGT
TTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCGATTCATGCATAACAGTTCCT
CTGAACCTTGCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTTTATCCT
GCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAA

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GGAAA
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QA 6 772 6 772
DS 

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TATGCCAGAC*TTTAGATGGACAGTT*AAGGACATGAAACTTTTAAAGAGAGGATGACAG
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ATATATCACCCTCAAGCCTTGGAGCCACATTTCGGTTATCAGAGTTTCACCAGGGAAAAC
ACTCGCGAGGAATCTTCCGGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACCCTTGCATATGCA
CTTGATGATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGGGTACAAAGTCCATGCAATATCGGGCGTGG
GAATCCGGCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGAATGCAAAGGATTATAGTCACCAGAGAG
CCTATAGAGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGCAGACGGTTGTGT
TTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTGCTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAATGGCTG
AGATGAGTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCGATTCATGCATAA
CAGTTCCTCTGAACCTTGCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACC
TTTATCCTGCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAATGG
CCTGTATACTTAAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGACTAGGAT
CATC

QA 1 767 1 767
DS 

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GGCTGTTTC
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TTTAAGGACATGAAACTTTTAAAGAGAGGATGACAGACCACGAATATCAACATAACCAGA
TAACACGGCTTTGTTCCTTTCTTTCACTTTCGTCTGATATATCACCCTCAAGCCTTGGAG
CCACATTTCGGTTATCAGAGTTTCACCAGGGAAAACACTCGCGAGGAATCTTCCGGATAT
GGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACCCTTGCATATACACTTGATGATTGCCTTTATTGCAAA
CCCGAGGGTACAAAGTCCATGCAATATCGGGCGTGGGAATCCGGCAAGTTTTGCAACGTT
TGGATCAGAATGCAAAGGATTATAGTCACCAGAGAGCCTATAGAGCAATGCCTGTGATGG
TTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGCAGACGGTTGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCC
CTGGTTGCTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAATGGCTGAGATGAGTTTGAGAAACCACCAGC
TCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCGATTCATGCATAACAGTTCCTCTGAACCTTGCTCGTA
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TACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAATGGCCTGTATACTTCAATGTACTGCTG
TCCATGCAACAGGAGACTAGGATCATACTTAAAACCTAGCAAGTCCAGTCCATTCGACAG
AGACCCAAGTGTTAACAGCC

QA 10 809 10 809
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL3344Contig1 767 4 9 U
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GTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTCCCCGGTGGACGGAAGCACAA
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TACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCAGCGCTCTCAAATCGGCGACC
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TTGGCTGCAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTTGGGCTTATCAAATACTCCTGTAA
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GTCTGCTTCTGAAATTTATTATCGGATTATCACTATTTTTTTTGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

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AF RR4G016TF U 41
AF RR4BU52TF U 1
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GAACACAATGTATATATATGGTGATGATGATAATGTACTCTTGAGAAAGTCATTTACAAA
CAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAACCAAAACAAAACAGAGCTTTGCTTTTT
GCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACAAAATCTCGGCAGCAGCTGCG
GTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTCCCCGGTGGACGGAAGCACAA
ACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCACTGACACCCTCACCAAATGC
TACTTAAGTGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCAGCGCTCTCAAATCGGCGACC
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TTGGCTGCAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTTGGGCTTATCAAATACTCCTGTAA
TTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAATCTGACAGCT
CGAAAACTCATTTAGTTGGTCATTGCATTTGTAACAAGCTTTGTTTGTAAATGGTTGTAC
GTCTGCTTCTGAAATTTATTATCGGATTATCACTATTTTTTTTGACC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4G016JQ 727 0 0
GG
GAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAACCAAAACAA
AACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACAAA
ATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATTCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTCCC
CGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCACT
GACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCAGC
GCTCTCAAATCGGCGACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACGATTTCATCGCACAT
TCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCGTT
GCTGACAAGTTTGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGGAGGAGCAATGAAGAAGATCAGTGCA
TCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTGCAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTTGGGCT
TATCAAATACTCCTGTAATTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTC
TTCCATAATCTGACAGCTCGAAAACTCATTTAGTTGGTCATTGCATTTGTAACAAGCTTT
GTTTGTAAATGGTTGTACGTCTGCTTCTGAAATTTATTATCGGATTATTACTATTTTTTT
TGACC

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4G016TF 725 0 0
GG
GAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAACCAAAACAA
AACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACAAA
ATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATTCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTCCC
CGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCACT
GACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCAGC
GCTCTCAAATCGGCGACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACGATTTCATCGCACAT
TCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCGTT
GCTGACAAGTTTGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGGAGGAGCAATGAAGAAGATCAGTGCA
TCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTGCAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTTGGGCT
TATCAAATACTCCTGTAATTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTC
TTCCATAATCTGACAGCTCGAAAACTCATTTAGTTGGTCATTGCATTTGTAACAAGCTTT
GTTTGTAAATGGTTGTACGTCTGCTTCTGAAATTTATTATCGGAT*ATTACTATTTTTTT
GAC

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4BU52TF 765 0 0
GAACACAATGTATATATATGGTGATGATGATAATGTACTCTTGAGAAAGTCATTTACAAA
CAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAACCAAAACAAAACAGAGCTTTGCTTTTT
GCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACAAAATCTCGGCAGCAGCTGCG
GTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTCCCCGGTGGACGGAAGCACAA
ACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCACTGACACCCTCACCAAATGC
TACTTAAGTGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCAGCGCTCTCAAATCGGCGACC
GATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGTGACGATTTCATCGCACATTCTTCTGACAACAACGTC
ACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCGTTGCTGACAAGTTTGCCTGC
AAAGGAAACTCCAATGGAGGAGCAATGAAGAAGATCAGTGCATCAATTGGTCTACTTGGT
TTGGCTGCAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTTGGGCTTATCAAATACTCCTGTAA
TTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAATCTGACAGCT
CGAAA*CTCATTTAGTTGGTCATTGCATTTGTAACAAGCTTTGTTTGTAAATGGTTGTAC
GTCTGCTTCTGAAATTTATTATCGGAT*ATCACTATTTTTTT
GAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

CO CL3345Contig1 397 4 5 U
GGGCCGGTGGTTACGACGAGCGAGCAAAATCAGAACTGAAAATGCCTAAGCAAATCCACG
AGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGA
GAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAGGTACCTCTACACGCTATGCG
TCTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTC
AAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTCTTATGTCAATGCGACCTGCTTTGA
ATACCTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAG
ACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGAGTTTTT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4CC86JQ C 1
AF RR4CC86TF U 1
AF RR4AD15JQ C 2
AF RR4AD15TF U 2
BS 1 1 RR4CC86JQ
BS 2 358 RR4CC86TF
BS 359 359 RR4AD15TF
BS 360 392 RR4CC86TF
BS 393 397 RR4AD15JQ

RD RR4CC86JQ 392 0 0
GGGCCGGTGGTTACGACGAGCGAGCAAAATCAGAACTGAAAATGCCTAAGCAAATCCACG
AGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGA
GAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAGGTACCTCTACACGCTATGCG
TTTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTC
AAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTCTTATGTCAATGCGACCTGCTTTGA
ATACCTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCGG
ACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGAG

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR4CC86TF 392 0 0
G
GGCCGGTGGTTACGACGAGCGAGCAAAATCAGAACTGAAAATGCCTAAGCAAATCCACGA
GATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAG
AAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAGGTACCTCTACACGCTATGCGT
CTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCA
AGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTCTTATGTCAATGCGACCTGCTTTGAA
TACCTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCGGA
CTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGAG

QA 2 392 2 392
DS 

RD RR4AD15JQ 396 0 0
GGCCGGTGGTTACGACGAGCGAGCAAAATCAGAACTGAAAATGCCTAAGCAAATCCACGA
GATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGGGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAG
AAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAGGTACCTCTACACGCTATGCGT
CTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCA
AGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTCTTATGTCAATGCGACCTGCTTTGAA
TACCTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAGA
CTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGAGTTTTT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4AD15TF 396 0 0
GGCCGGTGGTTACGACGAGCGAGCAAAATCAGAACTGAAAATGCCTAAGCAAATCCACGA
GATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGGGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAG
AAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAGGTACCTCTACACGCTATGCGT
CTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCA
AGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTCTTATGTCAATGCGACCTGCTTTGAA
TACCTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAGA
CTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGAG
TTTTT

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 2

CO CL3346Contig1 984 2 6 U
GGAAGTAAAAATATCATCGCTAAAGCTCACCCAAAAAGGCTTCTTGTCTTGTTGTCGGAG
TGAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGACGGTCGTCGTTCCCCGGC
GGAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTCCTTCTCTGATAGGTAAGA
AGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCTCCAAGCACCGGTTCTTGA
CATCGGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGGAGAATGGTTCTTCGGACA
AGATCCCAAAGTGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAATGGGGGAATTGGAGGCTA
GGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCATGGGTATTTTGGTCGAAG
GTACAAGCACAGCTGCTAAGTTTCTGAGGGGGAATGGAATCACACTTTTCAAGGTGAGGG
ATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCTTCAGCCCTGAGCATCCTC
CTCTTACTGAACCCGCTCGCAAGGCCGTTGACTGGGCTGTTGACCAGAAGAAGAAATCTG
GTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCTTGGGGTTTGGTCTCAGAAGGACT
CAGCTGGCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCCACGAAGATAAAGCCAAACAAGTTA
CTGAATCGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAAACAAAGTCAATTGTGATGAGGTT
TTATTTCAATCAGCAAAAGCTTCTGTAACCTTATAATGGAGTAGCAAAAGCAATTCCTTA
TTCAAAACAACCAGTCTCACTCTTTATCAAATACGAGACACATTAGCATTTTCTGTCTGT
ACTTCGTTGCTGTTAAGTTTTATTTATTTTTTGCATTGGACAGCTATTTTGCATCTTATT
ATACAATTCACAACTTCAAAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A564TF U 1
AF RR4A564JQ C 158
BS 1 846 RR4A564TF
BS 847 849 RR4A564JQ
BS 850 870 RR4A564TF
BS 871 871 RR4A564JQ
BS 872 906 RR4A564TF
BS 907 984 RR4A564JQ

RD RR4A564TF 906 0 0
GGAAGTAAAAATATCATCGCTAAAGCTCACCCAAAAAGGCTTCTTGTCTTGTTGTCGGAG
TGAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGACGGTCGTCGTTCCCCGGC
GGAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTCCTTCTCTGATAGGTAAGA
AGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCTCCAAGCACCGGTTCTTGA
CATCGGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGGAGAATGGTTCTTCGGACA
AGATCCCAAAGTGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAATGGGGGAATTGGAGGCTA
GGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCATGGGTATTTTGGTCGAAG
GTACAAGCACAGCTGCTAAGTTTCTGAGGGGGAATGGAATCACACTTTTCAAGGTGAGGG
ATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCTTCAGCCCTGAGCATCCTC
CTCTTACTGAACCCGCTCGCAAGGCCGTTGACTGGGCTGTTGACCAGAAGAAGAAATCTG
GTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCTTGGGGTTTGGTCTCAGAAGGACT
CAGCTGGCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCCACGAAGATAAAGCCAAACAAGTTA
CTGAATCGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAAACAAAGTCAATTGTGATGAGGTT
TTATTTCAATCAGCAAAAGCTTCTGTAACCTTATAATGGAGTAGCAAAAGCAATTCCTTA
TTCAAAC**ACCAGTCTCACTCTTTATCAA*TACGAGACACATTAGCATTTTCTGTCTGT
ACTTCG

QA 1 906 1 906
DS 

RD RR4A564JQ 827 0 0
TCCTCCTTCTCTGATAGGTAAGAAGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTT
CGTCTCCAAGCACCGGTTCTTGACATCGGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCA
ACCGGAGAATGGTTCTTCGGACAAGATCCCAAAGTGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACT
GGCAATGGGGGAATTGGAGGCTAGGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCAT
TCTCATGGGTATTTTGGTCGAAGGTACAAGCACAGCTGCTAAGTTTCTGAGGGGGAATGG
AATCACACTTTTCAAGGTGAGGGATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTA
CTTCTTCAGCCCTGAGCATCCTCCTCTTACTGAACCCGCTCGCAAGGCCGTTGACTGGGC
TGTTGACCAGAAGAAGAAATCTGGTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCT
TGGGGTTTGGTCTCAGAAGGACTCAGCTGGCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCCA
CGAAGATAAAGCCAAACAAGTTACTGAATCGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAA
ACAAAGTCAATTGTGATGAGGTTTTATTTCAATCAGCAAAAGCTTCTGTAACCTTATAAT
GGAGTAGCAAAAGCAATTCCTTATTCAAAACAACCAGTCTCACTCTTTATCAAATACGAG
ACACATTAGCATTTTCTGTCTGTACTTCGTTGCTGTTAAGTTTTATTTATTTTTTGCATT
GGACAGCTATTTTGCATCTTATTATACAATTCACAACTTCAAAATAT

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL3347Contig1 866 2 2 U
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TCTTTTTTGTTGTTCCTCTAATTTCTTGGGAACTAGAGGAAAAGTTTCATAGTGAGATGA
AAAAGTACAACTGCAAGAGGAAATTTTATCTCTGCATACAAGAAAACAATCAATATCTTT
CTCTCTAAATCAAAAAAGTTACAACAGATTTAAGAGGAAGAAAAGGGATCTGTCTATGAT
GTTGGAAAACTCCTAAAAACCTAGACTCTGTCAATGTCCACAGCCCTTCTTCATCTTCTT
CCTCTTCTTCGAATGGCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGAGAAAGCAGTTCT
TGCCCGGCGTCTTTTCCCATCTTCACCATGTCCTCAAACACGTATGGTCCTTTTCTTGAG
GTCTCAAGAACTCGGGTACCGTCAGGTGATGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCT
TCTTCGTCCTTGGCCGCGTATCCAGCAATCGGAGTACGACATGAGCCGTCCAGTGTTTCA
AGAAACGCTCTCTCGCATGCAATCGCTAGTCTTGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAG
TAATTTGCCATTTTATCATCATCCGTTCTACAGGCAATTCCAATAGCTCCTTGAGCAACA
GCTGGTAGCATATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTCTCTGTCATGCTCAGTCTT
TTAAGACCTGCTAGTACTAATAGAGTTGCGTGGACTTTCCCTCCTTGAAGCTTCGATAGC
CTCGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACAGCTAACGAAGATACTTGTGGAGTA
TCTGCGACTTTCTCCTGAGAGAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H793TF C 1
AF RR4EY77JQ U 46
BS 1 46 RR4H793TF
BS 47 866 RR4EY77JQ

RD RR4H793TF 242 0 0
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AAAAGTACAACTGCAAGAGGAAATTTTATCTCTGCATACAAGAAAACAATCAATATCTTT
CTCTCTAAATCAAAAAAGTTACAACAGATTTAAGAGGAAGAAAAGGGATCTGTCTATGAT
G
C

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4EY77JQ 821 0 0
G
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CAATCAATATCTTTCTCTCTAAATCAAAAAAGTTACAACAGATTTAAGAGGAAGAAAAGG
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TTCTTCATCTTCTTCCTCTTCTTCGAATGGCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCAC
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GTCCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCGGGTACCGTCAGGTGATGCAACCAATCCTCTGA
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TCAATGAGGCTAAGTAATTTGCCATTTTATCATCATCCGTTCTACAGGCAATTCCAATAG
CTCCTTGAGCAACAGCTGGTAGCATATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTCTCTG
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GAAGCTTCGATAGCCTCGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACAGCTAACGAAG
ATACTTGTGGAGTATCTGCGACTTTCTCCTGAGAGAAGCG

QA 2 821 2 821
DS 



AS 1 3

CO CL3348Contig1 1323 3 2 U
TTTTTTTTTGGTTTTATAAGCAAGTTTTCACAATGACTTGATTTTTACAAAGCAAAAACT
TAATGTTCAACACCACCTACAAATGTAGTCCTCCTACTAAAACACAACGGCAAAAAGAAA
ACCTAAAAGAAAGAAAAGGAAAATCGTTCGCTGGACACACGATATCGTCAAGGTAAAATG
GCACTTCAGTTGTTAGAACGCAGCAGAAGAAGAAGAACGAACACCTCTCCCCGTCTGGCA
TCTCGAATGGAATCTTTTTTTTTCCTAATGAAAAGGTTTAGTGAGAGTGTGATTCGAGAA
GAATGTTGGTGGCTGCATTGACATCATTTCTGGCGTGTACAAGGGCCTGTCTAGCTGCGT
TCTGGTCAAATCCCATGGACACCAGAGTAGCTATTGCTTCCTCAGATGGCTCTATGCTTG
ACGGCACCGGTGCTTGATAAGATCTCACTGCTTGGCGACCTAAGCTGGGTGATGTCCTTC
TTGGTGGTGCTTGAGAATGGCTGCTCGAAGACATTCGGGAAAAGAAGGAAGCAATGAACT
CTGGAATCTTTGCCTTGCGGATACCAAAGATGTTCAACCGATACAATGAACCAGCAATTA
TGCCGCAAATTCCAGGTAGCATAGATCTTTTCCAAGATGATAGTAAAAGCTGGACACCAG
CAAGATATATGAATGATTTATCAGAGAAGTGAGCGCCAAATACATTGAACCTCTTTGTAA
CCGGAATGTCCAAGTAGAAGGGTACAAAGGAAGCAAATATGAGGGCGTATGGTCCAGATG
TCAGTACGTTTGCTGTAGGGTCTTTGAACAGCGATAACACAATGGTCTGTAGAATTAGTG
ATACAAGCCCAGAGAACAAGATGAAAACCGAGTGCTTATTGGAACCAATCTGTCTCTCAA
AGACACGGAAGTAGTAAAGCAGATAGACGCCAAAGAACAATTCTGGGGTGGAGGAGAAGG
CGAGATTCGATTTGATTAGCTTCCATATCTTGAACTTCTCGAATATATCCTGGTAAGACA
AGCCGAGCTTGGAAGAGCCTCCTCCTCCTCCGCGGATCCCGAAGAAGACAGTGAAGAGGG
CGCTGGTGATGACGAAGGCTCTCGTGACCGGAGCATTATTGAAACCAGAGGGACCTCCGT
TCATCGTGTAATCGGATGAACAGAGAAGTCAACAATCGCGGAGGAAAGCTCGTCGATGAT
TGAATCTCTGGAAGTGGAGATGGATGGATCGAGGGGTTTTTTTGTTTCTCTCTCGAGTCG
TGTCTTTCTTCCAAAGGAAGGATCTTTCCTGGAATTTTCAGTGATCTCTCGATTTCAGAC
TCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CG42JQ U 1
AF RR4CQ04JQ U 1
AF RR4CQ04TF C 613
BS 1 733 RR4CG42JQ
BS 734 1323 RR4CQ04TF

RD RR4CG42JQ 733 0 0
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TAATGTTCAACACCACCTACAAATGTAGTCCTCCTACTAAAACACAACGGCAAAAAGAAA
ACCTAAAAGAAAGAAAAGGAAAATCGTTCGCTGGACACACGATATCGTCAAGGTAAAATG
GCACTTCAGTTGTTAGAACGCAGCAGAAGAAGAAGAACGAACACCTCTCCCCGTCTGGCA
TCTCGAATGGAATCTTTTTTTTTCCTAATGAAAAGGTTTAGTGAGAGTGTGATTCGAGAA
GAATGTTGGTGGCTGCATTGACATCATTTCTGGCGTGTACAAGGGCCTGTCTAGCTGCGT
TCTGGTCAAATCCCATGGACACCAGAGTAGCTATTGCTTCCTCAGATGGCTCTATGCTTG
ACGGCACCGGTGCTTGATAAGATCTCACTGCTTGGCGACCTAAGCTGGGTGATGTCCTTC
TTGGTGGTGCTTGAGAATGGCTGCTCGAAGACATTCGGGAAAAGAAGGAAGCAATGAACT
CTGGAATCTTTGCCTTGCGGATACCAAAGATGTTCAACCGATACAATGAACCAGCAATTA
TGCCGCAAATTCCAGGTAGCATAGATCTTTTCCAAGATGATAGTAAAAGCTGGACACCAG
CAAGATATATGAATGATTTATCAGAGAAGTGAGCGCCAAATACATTGAACCTCTTTGTAA
CCGGAATGTCCAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4CQ04JQ 736 0 0
TTTTTTTTTGGTTTTATAAGCAAGTTTTCACAATGACTTGATTTTTACAAAGCAAAAACT
TAATGTTCAACACCACCTACAAATGTAGTCCTCCTACTAAAACACAACGGCAAAAAGAAA
ACCTAAAAGAAAGAAAAGGAAAATCGTTCGCTGGACACACGATATCGTCAAGGTAAAATG
GCACTTCAGTTGTTAGAACGCAGCAGAAGAAGAAGAACGAACACCTCTCCCCGTCTGGCA
TCTCGAATGGAATCTTTTTTTTTCCTAATGAAAAGGTTTAGTGAGAGTGTGATTCGAGAA
GAATGTTGGTGGCTGCATTGACATCATTTCTGGCGTGTACAAGGGCCTGTCTAGCTGCGT
TCTGGTCAAATCCCATGGACACCAGAGTAGCTATTGCTTCCTCAGATGGCTCTATGCTTG
ACGGCACCGGTGCTTGATAAGATCTCACTGCTTGGCGACCTAAGCTGGGTGATGTCCTTC
TTGGTGGTGCTTGAGAATGGCTGCTCGAAGACATTCGGGAAAAGAAGGAAGCAATGAACT
CTGGAATCTTTGCCTTGCGGATACCAAAGATGTTCAACCGATACAATGAACCAGCAATTA
TGCCGCAAATTCCAGGTAGCATAGATCTTTTCCAAGATGATAGTAAAAGCTGGACACCAG
CAAGATATATGAATGATTTATCAGAGAAGTGAGCGCCAAATACATTGAACCTCTTTGTAA
CCGGAATGTCCAA
GTA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4CQ04TF 711 0 0
CAGGTAGCATAGATCTTTTCCAAGATGATAGTAAAAGCTGGACACCAGCAAGATATATGA
ATGATTTATCAGAGAAGTGAGCGCCAAATACATTGAACCTCTTTGTAACCGGAATGTCCA
AGTAGAAGGGTACAAAGGAAGCAAATATGAGGGCGTATGGTCCAGATGTCAGTACGTTTG
CTGTAGGGTCTTTGAACAGCGATAACACAATGGTCTGTAGAATTAGTGATACAAGCCCAG
AGAACAAGATGAAAACCGAGTGCTTATTGGAACCAATCTGTCTCTCAAAGACACGGAAGT
AGTAAAGCAGATAGACGCCAAAGAACAATTCTGGGGTGGAGGAGAAGGCGAGATTCGATT
TGATTAGCTTCCATATCTTGAACTTCTCGAATATATCCTGGTAAGACAAGCCGAGCTTGG
AAGAGCCTCCTCCTCCTCCGCGGATCCCGAAGAAGACAGTGAAGAGGGCGCTGGTGATGA
CGAAGGCTCTCGTGACCGGAGCATTATTGAAACCAGAGGGACCTCCGTTCATCGTGTAAT
CGGATGAACAGAGAAGTCAACAATCGCGGAGGAAAGCTCGTCGATGATTGAATCTCTGGA
AGTGGAGATGGATGGATCGAGGGGTTTTTTTGTTTCTCTCTCGAGTCGTGTCTTTCTTCC
AAAGGAAGGATCTTTCCTGGAATTTTCAGTGATCTCTCGATTTCAGACTCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL3349Contig1 655 2 4 U
GATTCAAGGAGGAAGGGACATATATTGACTGAGAAAGAAAGAGATTCGGTAATGGCAGCC
TCAAGCACCGTCGCTTCTTTCCGAACCTCCGTTTCTTCAGCTCCTTCTCCATCCTCTTCC
CGAATAACCCATTTGAGATCCCCCTCCAAAGCTCTCAAATTCACACCTCTGCCATCGTCT
CGCTCAAGGCCATCCTTCTCCGTCTCCTGCACCATCGCCAAGGACTACCCTGGAGTTGGA
CCGGAGCACAGTTTCCTTAAAGACATGGGACGAGCTGAATACTTTAGCGTAACCGATGAA
GAAGCGTTGGAAGCGTTCAAGAGAGTTTCGCGGTTAGAGGGAATCATCCCGGCACTGGAG
ACCTCTCACGCACTAGCTCACCTCGAGAAGCTGTGTCCCACGTTACCGGACGGAGCTAGA
GTGGTCTTGAACTTCAGCGGAAGAGGAGATAAAGATGTTCAGACGGTGGCTAAATATCTT
GAAGTTTGAAACCTTTTGTTTGTTTGTTTTTAAAAAAAAAAAAATTTAAGACAGTGAAAT
CTTTTTGTATTTGTAATCTGTTTGTACTTCTACATGGTGGGGGACGTTTCCAAAATAACT
GGAAACAGAAAAGGACTAAGAAGAGAGCAAAAATTTGAATAAACTGTTCTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FP55TF U 1
AF RR4FP55JQ C 207
BS 1 611 RR4FP55TF
BS 612 612 RR4FP55JQ
BS 613 626 RR4FP55TF
BS 627 655 RR4FP55JQ

RD RR4FP55TF 626 0 0
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CGAATAACCCATTTGAGATCCCCCTCCAAAGCTCTCAAATTCACACCTCTGCCATCGTCT
CGCTCAAGGCCATCCTTCTCCGTCTCCTGCACCATCGCCAAGGACTACCCTGGAGTTGGA
CCGGAGCACAGTTTCCTTAAAGACATGGGACGAGCTGAATACTTTAGCGTAACCGATGAA
GAAGCGTTGGAAGCGTTCAAGAGAGTTTCGCGGTTAGAGGGAATCATCCCGGCACTGGAG
ACCTCTCACGCACTAGCTCACCTCGAGAAGCTGTGTCCCACGTTACCGGACGGAGCTAGA
GTGGTCTTGAACTTCAGCGGAAGAGGAGATAAAGATGTTCAGACGGTGGCTAAATATCTT
GAAGTTTGAAACCTTTTGTTTGTTTGTTTTTAAAAAAAAAAAAATTTAAGACAGTGAAAT
CTTTTTGTATTTGTAATCTGTTTGTACTTCTACATGGTGGGGGACGTTTCCAAAATAACT
GGAAACAGAAA*GGACTAAGAAGAGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4FP55JQ 449 0 0
CTGCACCATCGCCAA
GGACTACCCTGGAGTTGGACCGGAGCACAGTTTCCTTAAAGACATGGGACGAGGTGAATA
CTTTAGCGTAACCGATGAAGAAGCGTTGGAAGCGTTCAAGAGAGTTTCGCGGTTAGAGGG
AATCATCCCGGCACTGGAGACCTCTCACGCACTAGCTCACCTCGAGAAGCTGTGTCCCAC
GTTACCGGACGGAGCTAGAGTGGTCTTGAACTTCAGCGGAAGAGGAGATAAAGATGTTCA
GACGGTGGCTAAATATCTTGAAGTTTGAAACCTTTTGTTTGTTTGTTTTTAAAAAAAAAA
AAATTTAAGACAGTGAAATCTTTTTGTATTTGTAATCTGTTTGTACTTCTACATGGTGGG
GGACGTTTCCAAAATAACTGGAAACAGAAAAGGACTAAGAAGAGAGCAAAAATTTGAATA
AACTGTTCTTTATT

QA 16 449 16 449
DS 



AS 1 4

CO CL3350Contig1 1329 4 7 U
GGATTCCCACTTGTCTCTGCTTCTATTTATTGTCCGAAGGACAAAAAAATCCGCAACCAG
AGAAAATTCCGACAAACTTCGGCAAAACCAACGGTGACTCTCCGGCGATGAAGTAACTAT
GGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGAAGCAGGAGAAAACAACACATACGAAGAA
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TCCAAGCAAGAGACGTCCCGATGAAGAACCCTTGGACGCCGAAAAGCATGCGACAGCCGT
CGCAGCTGCCACCGCCGCGGTGGCTGAGGCGGCACTAGCGGCTGCTCATGCGGCGGCGGG
GGTCGTGAGACTCACCGGAAGAGGCGGCGGTAGAACCTCGTCGGTAACTCAAAACAATCG
GAATAATCGCCGGTTGGCTCAAGAGTATGTAGCGGCGGTCAAGATTCAATCAGCTTTCCG
TGGCTACTTGGCGAGGAGAGCGTTGAGAGCACTGAAGGCGTTAGTGAAGCTCCAAGCGGT
AGTGAAAGGGCACATAGTGAGGAAACAAACGGCTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCT
GGTTAGGCTCCAAACTCGAGCAAGATCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCC
ACATTCTCTCCACGCACGATGCGTCTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGA
CCAACACCGTTCCCATATGAGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGGATCTCTATGGAA
CGCACCGCAGTACAGCGAAGACAATGACAAGATCCTAGAAGTCGACACTTGGAAGCCTCA
CTTCGCTTCCTACTACCACAAGGAGTCGTCACCAAGTAAAAGAGGATCTCTTCCTACGAG
TCCACAAGTAAGGTCTAGACCAGGAAGCAGCAGCGGTGGTGGTTCAAGGAGAAGAACGCC
GTTCACGCCGACGAGAAGCGAGTACGAGTACTGCTCTGGGTATTACCCTAACTACATGGC
TAACACTGAGTCTTACAGAGCAAAAGTCCGGTCACAAAGCGCACCGAGGCAGAGGCTTCA
CGAGTTGCCTTCAGAGAGTGGCTACAATAGGTCAGTTCAGGGACAGTATTACTACTACAC
GGCGGCTGCAGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTATTCTTCTTCATA
TCTCAGTTCTGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAATCAGAGAGTCCA
CATACAAGTACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTGACTAGATCGATC
CTACGGTAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DT39TF U 1
AF RR4E852TF U 1
AF RR4DT39JQ C 649
AF RR4E852JQ C 701
BS 1 590 RR4DT39TF
BS 591 691 RR4E852TF
BS 692 692 RR4DT39JQ
BS 693 733 RR4E852TF
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BS 735 762 RR4E852TF
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RD RR4DT39TF 590 0 0
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GGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGAAGCAGGAGAAAACAACACATACGAAGAA
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QA 1 590 1 590
DS 

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AGAAAATTCCGACAAACTTCGGCAAAACCAACGGTGACTCTCCGGCGATGAAGTAACTAT
GGGTTTCTTCAGTCGTCTGTTCGGTAGTAAGAAGCAGGAGAAAACAACACATACGAAGAA
CAACACTCGAAAGTGGAGCTTCACCACCAGATCCTCGAATCCGGCGTCGTCGTCTTCTCA
TCCAAGCAAGAGACGTCCCGATGAAGAACCCTTGGACGCCGAAAAGCATGCGACAGCCGT
CGCAGCTGCCACCGCCGCGGTGGCTGAGGCGGCACTAGCGGCTGCTCATGCGGCGGCGGG
GGTCGTGAGACTCACCGGAAGAGGCGGCGGTAGAACCTCGTCGGTAACTCAAAACAATCG
GAATAATCGCCGGTTGGCTCAAGAGTATGTAGCGGCGGTCAAGATTCAATCAGCTTTCCG
TGGCTACTTGGCGAGGAGAGCGTTGAGAGCACTGAAGGCGTTAGTGAAGCTCCAAGCGGT
AGTGAAAGGGCACATAGTGAGGAA*CAAACGGCTGATATGCTGCGCCGGATGCAAACGCT
GGTTAGGCTCCAAACTCGAGCAAGATCATCACGTTCTTCTCATCATGTTCCTCCCTCTCC
ACATTCTCTCCACGCACGATGCGTCTCAGAG*CTGAATACAGCAAAGTCATCGCCATGGA
CCAACACCGTTCC*ATATGAGTTCGAGCCAATGGAGGAGGAC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4DT39JQ 681 0 0
TCCTCCCTCTCCACATTCTCTCCACGCACGATGCGTCTCAGAGGCTGAATACAGCAAAGT
CATCGCCATGGACCAACACCGTTCCCATATGAGTTCGAGCCAATGGAGGAGGACAGAGGG
ATCTCTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAAGACAATGACAAGATCCTAGAAGTCGACAC
TTGGAAGCCTCACTTCGCTTCCTACTACCACAAGGAGTCGTCACCAAGTAAAAGAGGATC
TCTTCCTACGAGTCCACAAGTAAGGTCTAGACCAGGAAGCAGCAGCGGTGGTGGTTCAAG
GAGAAGAACGCCGTTCACGCCGACGAGAAGCGAGTACGAGTACTGCTCTGGGTATTACCC
TAACTACATGGCTAACACTGAGTCTTACAGAGCAAAAGTCCGGTCACAAAGCGCACCGAG
GCAGAGGCTTCACGAGTTGCCTTCAGAGAGTGGCTACAATAGGTCAGTTCAGGGACAGTA
TTACTACTACACGGCGGCTGCAGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAGACGATGTA
TTCTTCTTCATATCTCAGTTCTGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAATGTGTAAA
TCAGAGAGTCCACATACAAGTACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTTTTCTATTG
ACTAGATCGATCCTACGGTAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4E852JQ 629 0 0
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ACAGAGGGATCTCTATGGAACGCACCGCAGTACAGCGAAGACAATGACAAGATCCTAGAA
GTCGACACTTGGAAGCCTCACTTCGCTTCCTACTACCACAAGGAGTCGTCACCAAGTAAA
AGAGGATCTCTTCCTACGAGTCCACAAGTAAGGTCTAGACCAGGAAGCAGCAGCGGTGGT
GGTTCAAGGAGAAGAACGCCGTTCACGCCGACGAGAAGCGAGTACGAGTACTGCTCTGGG
TATTACCCTAACTACATGGCTAACACTGAGTCTTACAGAGCAAAAGTCCGGTCACAAAGC
GCACCGAGGCAGAGGCTTCACGAGTTGCCTTCAGAGAGTGGCTACAATAGGTCAGTTCAG
GGACAGTATTACTACTACACGGCGGCTGCAGAGCGTTCGTTTGATCAGCGTTCAGATAAG
ACGATGTATTCTTCTTCATATCTCAGTTCTGATCCTAATTTGTTTTAATAGTTGAAGGAA
TGTGTAAATCAGAGAGTCCACATACAAGTACAGACAGTGATCAGTCTCTGTTTTGTATTT
TTCTATTGACTAGATCGATCCTACGGTAC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3351Contig1 1018 3 7 U
GGATTCTCTTCTCTCTTTTGATTAGATCGATCCCAATCAGTAGATTTTGATTTGATTAAT
GTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGGGTTCCAGGGACATGGACAACAAGAAGAATGAAGG
CACAGACGACGAGGGTGTTGGATCCGTTGGGAGACAGATGAGCGAGTCTTCTCTTAGCGC
TGCCGAGGAAGAAGAAGACGACGATTCAAAATTACATTTGGGCCCTCAGTACACTATCAA
GGAGCATCTCGAGAAGGACAAAGATGATGAGAGTCTGAGGAAATGGAAGGAACAGCTTCT
TGGAAGTGTTGACGTCACCAACATTGGAGAGACACTTGACCCTGAAGTGAGGATCATTAG
CCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGACATTGTTCTTATGGTACCTGAGAATGGGAA
TCCAAAGGGAATGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATT
TCAGGTTAACAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACTGG
TGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTGGAACCATA
CAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCACTCCTTCTGGCATGTTTGCTAGAGGATCATATTC
TGCAAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTT
TGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAATGAAACTCCAGAACAAATTCTTCTGAG
ATGAAGCGTTGTCAGTAGAAAGTTGTGTTTGTTTCACTCCCCATCTCTTTTTTTTCTTTT
TCACCTGATTTTAGTAATGCCGTTGTAAACCAGTATGTGTGTGTGTTTGTTCTCAAGTAT
GTTTCTCCCTATGCTTCTTAACAAGTGTTTGATTGATGACTATATGATTGTGTTGGATCC
TGAGATGTATAATGATTAATTGTCTCAGTCAAAAGCTGAAGAAGAGATGAGAGTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C021TF U 1
AF RR4D873TF U 248
AF RR4D873JQ C 250
BS 1 333 RR4C021TF
BS 334 334 RR4D873TF
BS 335 429 RR4C021TF
BS 430 430 RR4D873TF
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BS 459 990 RR4D873TF
BS 991 1018 RR4D873JQ

RD RR4C021TF 458 0 0
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GTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGGGTTCCAGGGACATGGACAACAAGAAGAATGAAGG
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GGAGCATCTCGAGAAGGACAAAGATGATGAGAGTCTGAGGAAATGGAAGGAACAGCTTCT
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TCCAAAGGGGATGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGAGCA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR4D873TF 743 0 0
GT
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TAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAATGAAACTCCAGAACAAATTCTTCTGAGATGAAGCGT
TGTCAGTAGAAAGTTGTGTTTGTTTCACTCCCCATCTCTTTTTTTTCTTTTTCACCTGAT
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TATGCTTCTTAACAAGTGTTTGATTGATGACTATATGATTGTGTTGGATCCTGAGATGTA
TAATGATTAATTGTCTCAGTC

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR4D873JQ 769 0 0
CGAGAAGGACAAAGATGATGAGAGTCTGAGGAAATGGAAGGAACAGCTTCTTGGAAGTGT
TGACGTCACCAACATTGGAGAGACACTTGACCCTGAAGTGAGGATCATTAGCCTGGCCAT
CTTATCCCCTGGAAGACCAGACATTGTTCTTATGGTACCTGAGAATGGGAATCCAAAGGG
AATGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCAGGTTAA
CAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACTGGTGTTAAAGT
GGACAGAGGAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTGGAACCATACAACCACGT
GATGCCTGAAGAGACCACTCCTTTTGGCATGTTTGCTAGAGGATCATATTCTGCAAGAAC
TAAGTTTCTTGATGATGATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTTGACATCCG
TAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAATGAAACTCCAGAACAAATTCTTTTGAGATGAAGCGT
TGTCAGTAGAAAGTTGTGTTTGTTTCACTCCCCATCTCTTTTTTTTCTTTTTCACCTGAT
TTTAGTAATGCCGTTGTAAACCAGTATGTGTGTGTGTTTGTTCTCAAGTATGTTTCTCCC
TATGCTTCTTAACAAGTGTTTGATTGATGACTATATGATTGTGTTGGATCCTGAGATGTA
TAATGATTAATTGTCTCAGTCAAAAGCTGAAGAAGAGATGAGAGTTCTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 3

CO CL3352Contig1 409 3 1 U
GGTTTAATGTGACAATATTTATTTATAACAAGCCATGTTGTTGGTCACATTACCATACTT
CCTTGGTATTGTCAACAAAAAATATTGATACAAAACTTAAATGTTGTTTTGTTAAATATA
AACTCGAATGTTACAAACAATTTAAGTTCTTTTTAAAGCAAAAAAGGAGACAACAACAAA
AATGGGGTGGATCTAAGCTAACTGTGGTACAAGTAATGGTACAAACTGTTTCTGACTGCT
TTCACCTGTTGGATGATAGGTGTGTCTGGAACTGGAGGTATAATCCATGAAGATGATCAT
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CAATGTGTATAGGCTGTGGAACATGGAATAACAATATCTCTCCGTTTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BL88JQ U 1
AF RR4CR78JQ U 1
AF RR4CR78TF C 1
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DS 

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CCTTGGTATTGTCAACAAAAAATATTGATACAAAACTTAAATGTTGTTTTGTTAAATATA
AACTCGAATGTTACAAACAATTTAAGTTCTTTTTAAAGCAAAAAAGGAGACAACAACAAA
AATGGGGTGGATCTAAGCTAACTGTGGTACAAGTAATGGTACAAACTGTTTCTGACTGCT
TTCACCTGTTGGATGATAGGTGTGTCTGGAACTGGAGGTATAATCCATGAAGATGATCAT
AAACTCTAAGTCTCTTTCTGCTACATGGTGAAAAATTGAATCAAAGCTATCGGTTATGTT
CAATGTGTATAGGCTGTGGAACATGGAATAACAATATCTCTCCGTTTGC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR4CR78TF 409 0 0
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CCTTGGTATTGTCAACAAAAAATATTGATACAAAACTTAAATGTTGTTTTGTTAAATATA
AACTCGAATGTTACAAACAATTTAAGTTCTTTTTAAAGCAAAAAAGGAGACAACAACAAA
AATGGGGTGGATCTAAGCTAACTGTGGTACAAGTAATGGTACAAACTGTTTCTGACTGCT
TTCACCTGTTGGATGATAGGTGTGTCTGGAACTGGAGGTATAATCCATGAAGATGATCAT
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CAATGTGTATAGGCTGTGGAACATGGAATAACAATATCTCTCCGTTTGC

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 4

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GTTGGGTGGAGTTCCTGTCTCCAACTTCAATATCTACAAACTACTGCAATCAAAGTCTCA
TGTGCTTTTGTACCCTGGAGGTATCCGTGAAGCTTTGCATAACAAGGGTGAAGAATACAA
GCTGTTCTGGCCAGAGCAACAAGAGTTTGTGAGAGTTGCATCTAAATTTGGAGCTAAGAT
TGTCCCTTTTGGTGTTGTTGGAGAAGACGACATCTGCCATCTTGTCCTTGATGGCGATGA
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ACCTAAGATTCCTGGGCGATTCTACTTTTATTTTGGGAAGCCAATAGAAACTGCAGGCAA
GGAACAAGAGCTAAAAGACAAAGAGAAGGCTCAAGAGTTTTACTTGCAAGTCAAGTCTGA
GGTTGAACAATGCATTGCCTATTTGAAAATGAAAAGAGAGATTGATCCATACAGACACTT
GGTGCCAAGGATGTTGTATCAGGCTTCACACGGTTCCTCTGCTGAAATTCCGACGTTTGA
TCTCTGAATTGATTCTGGCTTTGAGTATTTGCATAATTACAATATACTATAGCTATGTTG
TACGCAGACATTACTTGTTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR4AA68JQ C 1
AF RR4CL14JQ C 63
AF RR4A981TF U 243
AF RR4CL14TF U 63
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AAAAA

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DS 

RD RR4CL14TF 742 0 0
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TGGGTGGAGTTCCTGTCTCCAACTTCAATATCTACAAACTACTGCAATCAAAGTCTCATG
TGCTTTTGTACCCTGGAGGTATCCGTGAAGCTTTGCATAACAAGGGTGAAGAATACAAGC
TGTTCTGGCCAGAGCAACAAGAGTTTGTGAGAGTTGCATCTAAATTTGGAGCTAAGATTG
TCCCTTTTGGTGTTGTTGGAGAAGACGACATCTGTCATCTTGTCCTTGATGGCGATGATC
AAAGGAACATTCCTATCCTAAAGCAATTTATGGAAGAAGCAACAAAGCAAGCTGGAAACT
TAAGGGAAGGAGATGAGACTGAACTGGGAAAGCAGGACTGCTATCTCCCAGGACTTCTAC
CTAAGATTCCTGGGCGATTCTACTTTTATTTTGGGAAGCCAATAGAAACTGCAGGCAAGG
AACAAGAGCTAAAAGACAAAGAGAAGGCTCAAGAGTTTTACTTGCAAGTCAAGTCTGAGG
TTGAACAATGCATTGCCTATTTGAAAATGAAAAGAGAGATTGATCCATACAGACACTTGG
TGCCAAG*ATGTTGTATCAG*CTTCACACGGTTCCTCTGCTGAAATTCCGACGTTTGATC
TCTGAATTGATTCTGGCTTTGAGTATTTGCATAATTACAATATACTATAGCTATGTTGTA
CGCAGACATTACTTGTTG
AAAA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

CO CL3354Contig1 770 4 8 U
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TCTCACAACAAACAGGCACCTCGAGTGCCTGAACTGAGGATGGCGATCAACCATAATAAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
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AF RR4FF81JQ U 1
AF RR4FF81TF C 17
AF RR4B855JQ U 47
AF RR4B855TF C 47
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BS 141 155 RR4FF81JQ
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BS 289 359 RR4FF81JQ
BS 360 770 RR4B855JQ

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TCTCACAACAAACAGGCACCTCGAGTGCCTGAACTGAGGATGGCGATCAACCATAATAAA
ATCAAGACCGCAGCCAATTTTATCTTTGGCGTAGGGGTGAAAAGGAAAAAGCTTTTCCAT
GATAATTTTCTCATCCTCAAAGTCCAACCGTTCCCCATCCAAATATCTATCGGAGTGAA
AAA

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DS 

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CC

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DS 

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GT
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CGCCTCAAGGTTCTTCCACTTGCGATAATCAGGATCTTCGTATCGCCAATTCTCGTCATC
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CC

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DS 

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GT
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CCCACCATCCGTTCTCACAACAAACAGGCACCTCGAGTGCCTGAACTGAGGATGGCGATC
AACCATAATAAAATCAAGACCGCAGCCAATTTTATCTTTGGCGTAGGGGTGAAAAGGG*G
AAGCTTTTCCATGATAATTTTCTCATCCTCAAAGTCCAACCGTTCCCCATCCAAATATCT
ATCGGAGTGAAGAATATCTTTGGCGAGAAGAGCTATAGGTTCGACGTCTCCGAGTATCTC
CGCCTCAAGGTTCTTCCACTTGCGATAATCAGGATCTTCGTATCGCCAATTCTCGTCATC
AACAGGGGCCGTCGAGTTCACTTTCACGGGAGAATCATCCTCCTCCCGAAACTGCGGTTT
ATCAGCGAGAGAACACGACAACAGACGGCGCCGGCGAGAGAGGAAACACGCCGATGATGA
TGCGATGCTGAATTGATGATGACGGCGGTTGAGAAAACCGTTGCGGAGGAGCGGGAGTGT
CCTGGGGAGGAGTAGCGAGGGCATTGACTACCCTCTCTCTCCCTCTTCGTTGAATCACCT
AACGAGAAACGTTTCTAAACACTCGAAGAAGGAGATGAGTTGGAGATGAAAGTTTTGCAC
CC

QA 3 724 3 724
DS 



AS 1 3

CO CL3355Contig1 1206 3 8 U
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GTTTGTCTCAATAGAAGAAGATATAGAAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAAGTAAT
AAAATAAGAAGAATGAGAATCTTAGTTCTCTGCAGCATACAGAGCCTTAATCTCCTCTAC
ATCTTCGTAGCTACCTAGAAATATTGGAGAACGCTCATGGATCTTCTCGGACACAAGGTC
TAGCGCCCTTTTCTTGCCAGTGAAGGCCTGACCTCCGGCTTGCTCCATCAAGAACGACAT
CGGGAAGACTTCATACAGAACACGCAGTTTCCCATTGGGGCTTTTCTTGTCAGCCGGGTA
CAAGAAGATTCCTCCATAAAGCAGTGTGCGATGAACATCAGCTACCATACTTCCCACATA
TCTCAAAAACTTAGCGGGAGAACCATCTTTAGGAAACTTGCAGTTCTCTACATACTTTGT
GGTTGGACCATCCCAGTTCTGAGCATTGCCTTCATTCACTGAATAGATGTTCCCCTTTTT
CGGAATCTTAATGTCCGGGTGAGTTAATATGAACTCTCCTAGAGATGGGTCCAGGGTAAA
TCCATTGACACCAGTTCCAGTGCTCAACACAAGCATGCAGGAGCTTCCATACATACAGTA
ACCCGCAGCAACCATTTCATTCCCAGGTTTCAAGACATCTTCAGTAGTTGGCTCATCATT
GTGGCTCATTGTGTAAATCCCAAAGATGGTTCCAATGGAAACACCACAGTCGATGTTTGA
GGATCCATCAAGTGGATCAAAAACAACACAGTACTTTCCACGCTTGGATGACTCCACGAA
CGTTGCTTCCTCATCTTCTTCTGAGACAAGAACAGAAGTTCTGCCACTGCTAACCAAAGC
TTTGACAAAGACATCATTAGAGAGCACATCGAGTTTCTTTTACTCTTCACCCTGGATATT
TGTTTCCCCAGCAAGCCCAATTAGCTTGGCCAAACCAGCCTTGTTGACAGCACTGCAGAC
GAATTTGCATCCCAAAACGATGTTGCTGAGCAAAATGGTGAAATCCCCACGAGACTCTGG
GTACTTTGATTGCTCATTCAGCACGAACCTCGTGATGGTCATCAAATCCGTACGGTATGC
ATCTGCTTCGTGACCCATCTTTGATCCCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTCCTTTTTTTTAA
TCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY18JQ U 27
AF RR4DY37JQ U 1
AF RR4DY18TF C 503
BS 1 64 RR4DY37JQ
BS 65 65 RR4DY18JQ
BS 66 101 RR4DY37JQ
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AAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAAGTAATAAAATAAGAAGAATGAGAATCTTAGT
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GTTTCAAGACATCTTCAGTAGTTGGCTCATCATTGTGGCTCATTGTGTAAATCCCAAAGA
TGGTTCCAATGGAAACACCACAGTCGATGTTT

QA 1 752 1 752
DS 

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GTTT*TCTCAATAGAAGAAGATATAGAAATAAGAGAGAGAG******AGAGACAAGTAAT
AAAATAAGAAGAATGAGAATCTTAGTTCTCTGCAGCATACAGAGCCTTAATCTCCTCTAC
ATCTTCGTAGCTACCTAGAAATATTGGAGAACGCTCATGGATCTTCTCGGGCACAAGGTC
TAGCGCCCTTTTCTTGCCAGTGAAGGCCTGACCTCCGGCTTGCTCCATCAAGAACGACAT
CGGGAAGACTTCATACAGAACACGCAGTTTCCCATTGGGGCTTTTCTTGTCAGCCGGGTA
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TCTCAAAAACTTAGCGGGAGAACCATCTTTAGGAAACTTGCAGTTCTCTACATACTTTGT
GGTTGGACCATCCCAGTTCTGAGCATTGCCTTCATTCACTGAATAGATGTTCCCCTTTTT
CGGAATCTTAATGTCCGGGTGAGTTAATATGAACTCTCCTAGAGATGGGTCCAGGGTAAA
TCCATTGACACCAGTTCCAGTGCTCAACACAAGCATGCAGGAGCTTCCATACATACAGTA
ACCCGCAGCAACCATTTCATTCCCAGGTTTCAAGACATCTTCAGTAGTTGGCTCATCATT
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GGATCCATCAAGTGGATCAAAAA

QA 1 803 1 803
DS 

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CAAGCATGCAGGAGCTTCCATACATACAGTAACCCGCAGCAACCATTTCATTCCCAGGTT
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TTCCAATGGAAACACCACAGTCGATGTTTGAGGATCCATCAAGTGGATCAAAAACAACAC
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GAACAGAAGTTCTGCCACTGCTAACCAAAGCTTTGACAAAGACATCATTAGAGAGCACAT
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CCAAACCAGCCTTGTTGACAGCACTGCAGACGAATTTGCATCCCAAAACGATGTTGCTGA
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TCGTGATGGTCATCAAATCCGTACGGTATGCATCTGCTTCGTGACCCATCTTTGATCCCT
CTCTCTCTCTTTCTCTCTTCCTTTTTTTTAATCAGCC

QA 8 704 8 704
DS 



AS 1 4

CO CL3356Contig1 1289 4 9 U
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GCGTCTTCAAGCCCCCAACATAGCCACATCATCGAGGTCAAAGCAGGCAAATCCGTTGTA
GAAAGCACGACAAGCCTGGCGAGCAAAGCCTGTGGAGAAGCACCCTGCGGCTTCTCAGAT
CTCAACAACGCTTCCGGTGACGCCCAAGAACGCAATGCTTCCATGAGAAAGCTCTGCATC
GCCGTGGTGCTGTGTCTTCTCTTCATGACCGTTGGAGTCTTTGGTGGCATCAAAGCTAAT
AGCTTGGCTATACTCACCGACGCAGCTCACCTTCTCTCTGACGTTGCTGCTTTCGCCATC
TCCTTGTTCTCCTTGTGGGCTGCTGGCTGGGAAGCTACCCCTAGGCAGACTTGTGGGTTT
TTCAGGGTTGAGATTCTTGGTGCTCTTGTCTCTATCCAGCTCATTTGGCTGCTTACAGGG
ATTCTTGTCTATGAAGCTATCATCAGACTTCTTAGTGAGACCAGACATGATCACGGTCAC
GGTCATGGACATGGTCACGGTCATGACCATCACAGTCATGGGGTGACTGTTACCACACAT
CATCATCATGGTCATGATCATGGTCATAGTCATGGATAGGACAAGCATCATCACGCTCAC
GGGGATGTGACTGAGCAGTTGCTGGACAAATCAGAGAAGAGAAAGAGGAACATCAACGTC
CAAGGAGCTTATCTTCATGTCCTTGGAGACTCAATCCAGAGCGTTGGTGTTATGATTGGT
GGAGCTGTCATTTGGTACAAGCCGGAGTGGAAGATAGTTGATTTCATCTGCACGCTTGTC
TTTTCGGTTATTGTCTTGGGGACCACCATCAACATGATCCGAAGCATTCTTGAGGTGTTG
ATGGAGAGTACACCTAGGGAGATTGATGCTACAAAGCTGGAAAAGGGTTTGCTGGAGATG
GAAGAAGTGGTGGCTGTTCATGAGCTTCACATTTGGGCTATCACGGTGGGGAAAGTGCTG
CTTGCTTGCCATGTTAATATCACACCGGAGGCGGATGCGGACATGGTGCTCAACAAGGTG
ATTGATTACATCCGCAGGGAGTACAATATCAGTCATGTCACTATACAAATTGAGCGTTAA
AGTAAAAACATTTGAAGAGTATTTTGTATAAGCATATTCTCATTGACATGATGATAAGAT
CAATAAAGTTTCTTTCCTTTTTGTTCACTTTCTCTTGTTTCTCAGCTTTAGGTGTATTGG
TATGTTTATATGTCATCTTTGTTTGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G665TF U 1
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AF RR4BA51JQ C 876
AF RR4BA51TF U 876
BS 1 709 RR4G665TF
BS 710 710 RR4G665JQ
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RD RR4G665TF 766 0 0
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CTCAACAACGCTTCCGGTGACGCCCAAGAACGCAATGCTTCCATGAGAAAGCTCTGCATC
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AGCTTGGCTATACTCACCGACGCAGCTCACCTTCTCTCTGACGTTGCTGCTTTCGCCATC
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QA 1 766 1 766
DS 

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AGACTCAATCCAGAGCGTTGGTGTTATGATTGGTGGAGCTGTCATTTGGTACAAGCCGGA
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CATCAACATGATCCGAAGCATTCTTGAGGTGTTGATGGAGAGTACGCCTAGGGAGATTGA
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TCACATTTGGGCTATCACGGTGGGGAAAGTGCTGCTTGCTTGCCATGTTAATATCACACC
GGAGGCGGATGCGGACATGGTGCTCAACAAGGTGATTGATTACATCCGCAGGGAGTACAA
TATCAGTCATGTCACTATACAAATTGAGCGTTAAAGTAAAAACATTTGAAGAGTATTTTG
TATAAGCATATTCTCATTGACATGATGATAAGATCAATAAAGTTTCTTTCCTTTTTGT
CC

QA 1 778 1 778
DS 

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GGCTATCACGGTGGGGAAAGTGCTGCTTGCTTGCCATGTTAATATCACACCGGAGGCGGA
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DS 

RD RR4BA51TF 414 0 0
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GGCTATCACGGTGGGGAAAGTGCTGCTTGCTTGCCATGTTAATATCACACCGGAGGCGGA
TGCGGACATGGTGCTCAACAAGGTGATTGATTACATCCGCAGGGAGTACAATATCAGTCA
TGTCACTATACAAATTGAGCGTTAAAGTAAAAACATTTGAAGAGTATTTTGTATAAGCAT
ATTCTCATTGACATGATGATAAGATCAATAAAGTTTCTTTCCTTTTTGTTCACTTTCTCT
TGTTTCTCAGCTTTAGGTGTATTGGTATGTTTATATGTCATCTTTGTTTGGTGG

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 4

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ATCCAGAAAGAAAAGGAAATATACTAACCTCGCTGATGCCGAGCCCATTGTCCTGATGTC
TGTTTTAAGTAGTCTCCACGCTGGATATTTCAGAATAAGCCTTTCTCTTTGTAGCCAAGC
TTTATTGTGGAAGACAATGGTACATTTGCATAGCGATCTTCCGTCTATGCCGTCTTATCT
CCCTGTGGTATCTAGCACTTTGCAACACAAGTATCACTCTGTTTTTTGTATGCTTTCAAG
TGTATTTTCTTCTTTGACTTGGTGAAGGAGTAGTTCTCGCATTACATTGGAGTGAACTAT
CTTTATGCTCCTTCCATTTCATGCCTTCTCTTGCTTCAATCAGCTCCTCTGTTGGAGCCA
CACAGCGTTTTGTACCAGACATTATTTTGGCTGTTTACTGCACCGG*TCTTGACCCTGGA
CACAAAGCTTTATGGCCAATGGTTCACAACAGAAAAAAAGGTTTTTGTCGATAATGGCAA
ACCCGGCAAGCCAAGTTTCAGTGATAGCAAACCTAGTGGCTGCAAGAGGAGCAGCAGAGA
TGGGCTGGAGAGAGTGTGCTCTATGCTTGTTCTCGCTCGGGATGGTTCACTATTTAGTTA
TCTTTGTCACACTTTATCAACGCTTACCAGGCGGAAACAACTTCCCCAACCACTCGAGGC
CAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCTGCACCAGCCACGGGAAGTCTAGCTTGGAACTATATTT
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CTGGTATGTAGGCCAACTCTTTTGAAGAAGTCGATAAAAAGATTCAATGTTGCATGGTGG
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AAAGACCACGTGGCTTCGGCATTGATGTTTATTTTCTGCTCCATATCAGTGTTGATATTC
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TGCGATATAAATAAAATCTTAGCTGCGTAAGAATTGTATAAACTTTTTCAAAAAAAAAGA
ATTGTATAAATTTTTTTTTATAGGTTATTGTGATTAAGTTCTTATGGGTTCATGTTTTGA
CAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RR4A089TFB U 1
AF RR4A089TF U 330
AF RR4A089JQ C 509
AF RR4A089JQD C 536
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TGTTTTAAGTAGTCTCCACGCTGGATATTTCAGAATAAGCCTTTCTCTTTGTAGCCAAGC
TTTATTGTGGAAGACAATGGTACATTTGCATAGCGATCTTCCGTCTATGCCGTCTTATCT
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CACAAAGCTTTATGGCCAATGGTTCACA
ACAGAAA

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GTAGTTCTCGCATTACATTGGAGTGAACTATCTTTATGCTCCTTCCATTTCATGCCTTCT
CTTGCTTCAATCAGCTCCTCTGTTGGAGCCACACAGCGTTTTGTACCAGACATTATTTTG
GCTGTTTACTGCACCGG*TCTTGACCCTGGACACAAAGCTTTATGGCCAATGGTTCACA
CAGAAAA

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DS 

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GGCTGTTTACTGCACCGGGTCTTGACCCTGGACACAAAGCTTTATGGCCAATGGTTCACA
ACAGAAAAAAAGGTTTTTGTCGATAATGGCAAACCCGGCAAGCCAAGTTTCAGTGATAGC
AAACCTAGTGGCTGCAAGAGGAGCAGCAGAGATGGGCTGGAGAGAGTGTGCTCTATGCTT
GTTCTCGCTCGGGATGGTTCACTATTTAGTTATCTTTGTCACACTTTATCAACGCTTACC
AGGCGGAAACAACTTCCCCAACCACTCGAGGCCAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCTGCACC
AGCCACGGGAAGTCTAGCTTGGAACTATATTTCTGGAACCTTTGATACAGTAGCAGATGT
TATTCTTCTTGTCGCTCTTCATCTTTGTATCCCTGGTATGTAGGCCAACTCTTTTGAAGA
AGTCGATAAAAAGATTCAATGTTGCATGGTGGGCTTACTCGTTCCCGATCACCTTTCTTG
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CTGGACACAAAGCTTTATGGCCAATGGTTCACAACAGAAAAAA*GGTTTTTGTCGATAAT
GGCAAACCCGGCAAGCCAAGTTTCAGTGATAGCAAACCTAGTGGCTGCAAGAGGAGCAGC
AGAGATGGGCTGGAGAGAGTGTGCTCTATGCTTGTTCTCGCTCGGGATGGTTCACTATTT
AGTTATCTTTGTCACACTTTATCAACGCTTACCAGGCGGAAACAACTTCCC*AACCACTC
GAGGCCAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCTGCACCAGCCACGGGAAGTCTAGCTTGGAACTA
TATTTCTGGAACCTTTGATACAGTAGCAGATGTTATTCTTCTTGTCGCTCTTCATCTTTG
TATCCCTGGTATGTAGGCCAACTCTTTTGAAGAAGTCGATAAAAAGATTCAATGTTGCAT
GGTGGGCTTACTCGTTCCCGATCACCTTTCTTGCGTTAGACTCGGTTCAGTATGCTCAAG
AGGTGAAAGACCACGTGGCTTCGGCATTGATGTTTATTTTCTGCTCCATATCAGTGTTGA
TATTCCTCGGTGTAATGTTACTGACAGCAGCAAACGGAAAAAGACTGCTCAGACGTGATC
CTGTCCTCTGGTCTGCTACTGGTCCAAACGACAGATAAAAAAATCGCAGTATGTTAAACC
ACATGTGCGATATAAATAAAATCTTAGCTGCGTAAGAATTGTATAAACTTTTTCAAAAAA
AAAGAATTGTATAAATTTTTTTTTATAGGTTATTGTGATTAAGTTCTTATGGGTTCATGT
TTTGACAG

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 4

CO CL3358Contig1 877 4 2 U
CTGTCAAATCACGTGAACACTGAAGAAGTAAAAGACAATTCTTTATTATTATAACCAAGA
CCTTATCGATCTTGGTCAATCACAAACGGATACAAAGAGAGATAAACATTAAAATATGAA
AACAAATCCTCAAAAGACAGCTCAAAGCTCATCCCTCTTGATCATGGATGGACGAACACC
TTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTGCCCGATTCTTTCTCATATCGTGTGAGGTTATT
CTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTT
ATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTC
ATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGATAATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAAC
TGCAATTGAGTCTGCAGCCCCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTC
GGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAAC
GGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTC
CCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCATCTTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCAAGATA
GTTTGAAAACATTGAAGTATAATAGTTGAGCCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTT
TGCTTTCTGTGCATCGGTAAATTTAGGTAATCTGTGTCCAACAATATCTTTCATGATCTG
TGGATAATCTCCGTACATAGTTGTGTCCAGATGCCATCCCAAAACAAAGTCAAGTGCACG
GTCTATGGACGCACCGTCCTGTGAATCAGCAAGGTCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ73TF C 1
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AF RR4E691JQ U 25
AF RR4DW73JQ U 25
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CTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTT
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GTTTGAAAACATTGAAGTATAATAGTTG
CC

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DS 

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DS 

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TGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCCAG
TAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGAT
AATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAGTCTGCAGCCCCAAGTTCTT
CTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACT
TCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTAC
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DS 

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GAGTA
AAAAGACAATTCTTTATTATTATAACCAAGACCTTATCGATCTTGGTCAATCACAAACGG
ATACAAAGAGAGATAAACATTAAAATATGAAAACAAATCCTCAAAAGACAGCTCAAAGCT
CATCCCTCTTGATCATGGATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTGC
CCGATTCTTTCTCATATCGTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAATC
TGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCCAG
TAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGAT
AATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAGTCTGCAGCCCCAAGTTCTT
CTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACT
TCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTAC
CAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCATC
TTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCAAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAATAGTTGA
GCCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTTGCTTTCTGTGCATCGGTAAATTTAGGTA
ATCTGTGTCCAACAATATCTTTCATGATCTGTGGATAATCTCCGTACATAGTTGTGTCCA
GATGCCATCCCAAAACAAAGTCAAGTGCACGGTCTATGGACGCACCGTCCTGTGAATCAG
CAAGGTCA

QA 6 853 6 853
DS 



AS 1 4

CO CL3359Contig1 998 4 14 U
GGCACCAGAATCTTCTCTGACTCATTACATTCCATTTATCACTTAAATTCCCTAGAAGAA
AAAAAATGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCATCGTCTCCTCAGGAGATGCTA
AAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAGCCTAAGAAGAAGCCTGCAGCAGAGAAGAAGTCTC
CGAAGAAGAAGAAAGCTTCCTCTCCACCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATGATTAAAG
ATGCAATCACGACGTCGAAGGAGAGGACCGGATCCAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCA
TCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCAACTTCCTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTTAATCTCA
AGAGGCTCGTCGCTGCTGAGAAGTTGGTTAAGGTGAAAGGATCTTTCAAACTTCCCTCTG
CCAAATCCGTTTCAGCAGCGACAGCTAAACCGGCGGCGGTTAAGAAGAAACCAGCAGCTG
TATCTAAACCGAAGGCTCCGGTTAAAGCTAAACCGGCAGCTAAAGAAACTAAGAAGACTG
CCGATGTAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTAAGCCTAAAGCAAAGACGAAGAGCGTTG
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GGACTTCGAGTAGAACGTCTCCGGGGAAGAAGGCTGCTGCTCCGGCTAAGAAAGCTGTGG
CTGTGGCTAAGAAGAAGAAGGCTCCGGTTAAGAGTGCGAAGTCTCCGGCGAAAAGGGCTT
CTACGAGGACGGTTAAGAAGTGAAGATGATTTGGTGGTTTCATAGGATATGGTGGTGGTT
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TAGTTTTTTTATTTTTAACTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCTTGTTCTTGTAATTTTTT
TTTGGTTTGTCTGAAATGAAGCCCTTTAATCAATAGTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4GU77TF U 1
AF RR4EH41TF U 2
AF RR4GU77JQ C 221
AF RR4EH41JQ C 228
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BS 985 996 RR4GU77JQ
BS 997 998 RR4EH41JQ

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AAAAA*TGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCATCGTCTCCTCAGGAGATGCTA
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CGAAGAAGAAGAAAGCTTCCTCTCCACCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATGATTAAAG
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TATCTAAACCGA

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DS 

RD RR4EH41TF 733 0 0
GG
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CGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAGCCTAAGAAGAAGCCTGCAG***AGAAGAAGTCTCCGA
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GGCTCGTCGCTGCTGAGAAGTTGGTTAAGGTGAAAGGATCTTTCAAACTTCCCTCTGCCA
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TGGCTAAGA
GA

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR4GU77JQ 778 0 0
ATACGAA
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ATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCAACTTCCTTCAGGAAGCTTCTC
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AAACTTCCCTCTGCCAAATCCGTTTCAGCAGCGACAGCTAAACCGGCGGCGGTTAAGAAG
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GCGAAAAGGGCTTCTACGAGGACGGTTAAGAAGTGAAGATGATTTGGTGGTTTCATAGGA
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CTTTGCTTTTCCATAGTTTTTTTATTTTTAACTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCTTGTT
CTTGTAATTTTTTTTTGGTTTGTCTGAAATGAAGCCTTTTAATCAATAG
CG

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DS 

RD RR4EH41JQ 771 0 0
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ATTCGGAAGTTCATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCAACTTCCTTCAGGAAGCTTCTC
CTCGTTAATCTCAAGAGGCTCGTCGCTGCTGAGAAGTTGGTTAAGGTGAAAGGATCTTTC
AAACTTCCCTCTGCCAAATCCGTTTCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCGGCGGTTAAGAAG
AAACCAGCAGCTGTATCTAAACCGAAGGCTCCGGTTAAAGCTAAACCGGCAGCTAAAGAA
ACTAAGAAGACTGCCGATGTAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTAAGCCTAAAGCAAAG
ACGAAGAGCGTTGCCGCTGTGTCCAAGACTGCGGCTAAGCCTAAGGGTAAGGAGAGACCT
GCGAAAGCGGTGAGGACTTCGAGTAGAACGTCTCCGGGGAAGAAGGCTGCTGCTCCGGCT
AAGAAAGCTGTGGCTGTGGCTAAGAAGAAGAAGGCTCCGGTTAAGAGTGCGAAGTCTCCG
GCGAAAAGGGCTTCTACGAGGACGGTTAAGAAGTGAAGATGATTTGGTGGTTTTATAGGA
TATGGTGGTGGTTTAGCTTCTTTAGGATAGTCTTGTATAATTGAATCATCTTTGAAGGGG
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CTTGTAATTTTTTTTTGGTTTGTCTGAAATGAAGCCCTTTAATCAATAGTT

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DS 



AS 1 3

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ACACACAAACCATTCGAATAAACATGAGAGTGCTAGAAGAATTTGAATAAAAGAACTCAT
AAAACACACTAAAATTTAGGGAAAAAATCAGGAAGAGAAGCTTAATTAGTTCCTCCAAGC
ACACCCTTAAGCTTCTTAACCTCTTCATCGCTAAGGAACGTCGTGGCTTCAACGAGTTCT
GAAGGCAAATCATTTGCAAACAGAGCAAATGGTAGAATCTGAAGCCCTGGAGAAGAGCTT
CCAAAGACAACAAAGGCCAACGCAGGTCCTTTACCAGAGTTAAGCTGAAAATGAAGAAGC
CCTTGAGGAAACACCATGGAATCGCCTCTCGAGAGAGTCTTCAAGTAAACCTTGTTGGCA
GAGGAGATAAATCCTGCGCGTATGGTTCCTTGTATGACTACAAGGACCTCCGATGCACCA
GGATGGGTATGAAGAGGGATGACACCGCCACCGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACA
TCAAGGCCATTGAGACCTGCGAAAGCAGGTGCAAAGGCTGGAGTCACAGCGGCTTTAATG
ATGTTAGAAGTGTTTCCGGCTTTGGCGAGACCGGAGAACGCGAAGTCATTCTCGGTGACT
TGGTCAGGGTTCTTGCAAGAGTATCCTGATGGGTTTTGAGGACCCTTTGGATCAGCTACA
CAAAAGTCTAAAACAGAGGCAAAAGAGATGGGTGAAACCAAGGAGAGGATGAAGAAGATA
TGGATTATCATTTTCATTTTATTATAAGTCTTTGAAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ACCTCTTCATCGCTAAGGAACGTCGTGGCTTCAACGAGTTCTGAAGGCAAATCATTTGCA
AACAGAGCAAATGGTAGAATCTGAAGCCCTGGAGAAGAGCTTCCAAAGACAACAAAGGCC
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ATGACACCGCCACCGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACATCAAGGCCATTGAGACCT
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GAAA
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GAAGTTCC

QA 5 792 5 792
DS 



AS 1 3

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AGGGCTTTGCGAGTGGAAGTTTGGATACAGATGCGAAACCGATTAGGATGTTTGTTGCTG
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ATTGCCTTACCACTTCTACCT


BQ
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AF RR4C582TF U 1
AF RR4BH54TF U 247
AF RR4BH54JQ C 411
BS 1 262 RR4C582TF
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BS 264 406 RR4C582TF
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BS 408 568 RR4C582TF
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GTTACAACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTACTGGTCCCCTGAGAGTTGGAGGGGAGTTTTTG
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ATGGAGGAGAATTGCTCGTTGCTCAGAGTTATGCAAAGAACATGGGACTCTATGGAGAAC
GTGTTGGAGCTCTCAGCATTGTATGCAA
GCAGC

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G
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CCATGCCTGTGCTCATAACCCAACTGGTGTTGATCCAACCCTTGAACAATGGGAGCAAAT
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TACCAAAGCCCTCTGAAAACATCTCACCACCACACTACG*TTGCATACATGGTGATAATA

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DS 

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TGTTATTGCCTTACCACTTCTACCT

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DS 



AS 1 4

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CGGGAAACAAAACAGATATTTTCTATCTCATCTCATCTCGCAGTGAGAAAAAAAAAGATG
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GCAGCTTTGTTTGAAAGCTTCTCTGCCTTTAACACTTGCTCGGATGCAAGAGTAATGTGG
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GCTCAAAATGCCATAAATGAAATGAATGGTAAATGGTTAAGTAGCAGACAAATCAGATGC
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GTCGTTGAACTCACAAACGGCTCTTCAGAGGATGGTAGAGAGATCTCAATCTCAAACGAA
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AATAGTTGTAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D060TF U 1
AF RR4C548TF U 152
AF RR4BI71TF U 478
AF RR4BI71JQ C 755
BS 1 308 RR4D060TF
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BS 310 538 RR4D060TF
BS 539 542 RR4C548TF
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BS 757 1289 RR4BI71TF
BS 1290 1290 RR4BI71JQ
BS 1291 1310 RR4BI71TF
BS 1311 1632 RR4BI71JQ

RD RR4D060TF 538 0 0
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CAGAATCCGAGGCTCAAACAACAGCAGCAGTAGCAACAACAAGCAATGATGCAGCAAGCT
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CCTCCTCAGATGGAGCCTCTACCAAGTGGAAACCTTCCTCCTGGTTTTGATCCCACTACT
TGCCGCAGTGTGTATGCTGGCAACATCCACACGCAGGTCACTGAGGTTCTTCTTCAAGAG
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TATGGATTTGTTCACTACTTTGATCGACGATCTGCTGGTTTGGCTATCATGTCTCTTAAC
GGAAGGCATCTGTTTGGACAGCCTATCAAAGTTAACTGGGCGTATGCTACTGGTCAAA

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4C548TF 605 0 0
G
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TAGCCTCATGGCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCCTCAGATGGAGCCTCTACCAAGTGGAAA
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GCAGGTCACTGAGGTTCTTCTTCAAGAGATTTTCGCAAGCACCGGTCCTGTTGAGAGCTG
TAAGCTCATCAGAAAGGATAAGTCATCATATGGATTTGTTCACTACTTTGATCGACGATC
TGCTGGTTTGGCTATCATGTCTCTTAACGGAAGGCATCTGTTTGGACAGCCTATCAAAGT
TAACTGGGCGTATGCTACTGGTCAAAGGGAGGACACATCAAGCCATTTCAACATTTTTGT
TGGAGATCTTAGTCCAGATGTTACTGATGCAGCTTTGTTTGAAAGCTTCTCTGCCTTTAA
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ATGG

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR4BI71TF 842 0 0
G
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GGGAAGACACATCAAGCCATTTCAACATTTTTGTTGGAGATCTCAGTCCAGATGTTACTG
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GTGTCGTTGAACTCACAAACGGCTCTTCAGAGGATGGTAGAGAGATCTCAATCTCAAACG
AAGAAGCTCCTGAAAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTG
AAGTAACTCAGCTTGATCTACACCGCCTTTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAG
AGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGG
CTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTCTCAGCCTTTCCTCTTTAACTGGCTTTAGCCAA
GATGCACCCTCACGCTCAGCATTCTCTAAAGCATGTCAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGC
GGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGCAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTA
TCAGTAATAAACTCTTGGTGTCTTGGCGCTA*GATACCTTTTCTCCTTTTTT
CTCTCTATT

QA 2 833 2 833
DS 

RD RR4BI71JQ 878 0 0
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ACAAACATAGCTCTGATGGAAAAAGTGTCGTTGAACTCACAAACGGCTCTTCAGAGGATG
GTAGAGAGATCTCAATCTCAAACGAAGAAGCTCCTGAAAACAATCCTCAGTATACCACTG
TGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTACACCGCCTTTTCCATA
CACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTG
TGAGATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTCTCAGCCTT
TCCTCTTTAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGT
CAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGCGGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGCAGCTGC
GGCGCATCAGCAGCTCATGTACTATCAGTAATAAACTCTTGGTGTCTTGGCGCTAAGATA
CCTTTTCTCCTTTTTTTCTTCTTCTTAATTTTATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTAGAC
CTTGTTCAGAGTCTCTTATGTATGTGTGTCTCTCATTTGAAGTCGTTGATTCTATATGTA
TGCTTCTTGGTTTGTAACCTATGAGTCTTACTTGGCTTGTATGCCAAGCAATAAAATAAC
GTTGAAATAAAAGGGGGTTGGGTTTGGGTTCCAAATTTCCTGGGGTCCAGACATGTTGTT
TGTCTGAGAGGGAGGTAGTAGTAGTGTCTTGTATCGTGGTTTTGTAATGGTCAACTTGGT
CCAAGTATTTGTCTTTTGATTTATGTAATAGTTGTAAT

QA 1 878 1 878
DS 



AS 2 4

CO CL3363Contig1 1208 2 2 U
GAGATCTGTGGCCAGAGACATCGTGCAGCGTGATGGGGAAGTTAACTGGCGTGCAACTAT
TGTGGATTGGCCTGGTCTTGGTTACTCTGATAAACTTAAGATGGATTATGATACAGATGT
GATGGAGAAGTTTGTGGTTGACTTCATGAACTCACCTGAGAGCCCAATGAGCCAGGCAGG
TAACGATGATGTAGTAATAATCGGAGGAGGACATGCAGCAACACTAGCTGTCCGTGCTAC
ACAACGTGGGCTACTAAAACCATCAGCTATTGCTGCTGTTGCACCTACATGGGCTGGACC
TCTCCCTATTGTGTTTGGTCGTGATTCCTCCATGGAGACAAGGTATGGTCTGCTAAGAGG
AACGTTAAAAGCACCTGGAGTCGGTTGGATGATGTACAACATGCTAGTGAGCAACGAGAA
ATCAATCGAGTCTCAGTACAAATCCCATGTCTACGCAGACCAAAGCAACGTGACTGAGGC
CATAATCCAAAGCAGATACGAGTTGACAAAGCAGAAGGGATCACGTTACGTCCCTGCAGC
TTTTTTGACCGGTTTACTCGACCCGGTTTCATCCCGGGATGAGTTTCTACAGCTGTTTGC
TGATTTGGAAGGGAAACTTCCGGTTATGGTGATGTCAACGAAAGGTGCTCCAAAGAGATC
AAAAGCTGAGATGGAGGCACTGAGAGGAGCCAAAGGAGTTAGCAAGTTTGTGGAGGTTGA
AGGTGCACTCTTGCCTCAAGAAGAGTATCCTTCTCTTGTTGCTCAAGAGCTCTACAACTT
CTTGCAAGAGACTTGTGCTTCTCTCAAGTAGATTCATTTTGTGAGCCCAGGCCCATACAG
TGTTTTATTGATTGTTTGCTACTACTACGCTTAAAAGTCTTACTATCTAGTTTTTTTTTT
TGGTTCAAATACTATCTAGTATCTACCATGTCCTTTTCCAAATGAATACAACTTTTTTTG
CAGTACTAATTTAGTTGATGTATTACTGTCCAGTATTTTTTTTGTGTGGATGCTACGCAG
GTTCATCGCATGCCATGCGTTTACCCCACTATTTAAATGGGTCAATTTAATATCCCAAAC
GTACTAGACCAGTAGACCCTCATGTTTTACCAAACTAGGTCCTTGTTTATTTATTTATAT
ATATGTATATATTTTTTGTCAACTAATTTTATTAAATTGTAAATGGAAAATACAAGATCT
TTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD74TF U 1
AF RR4AD74JQ C 408
BS 1 640 RR4AD74TF
BS 641 1208 RR4AD74JQ

RD RR4AD74TF 640 0 0
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TGTGGATTGGCCTGGTCTTGGTTACTCTGATAAACTTAAGATGGATTATGATACAGATGT
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TAACGATGATGTAGTAATAATCGGAGGAGGACATGCAGCAACACTAGCTGTCCGTGCTAC
ACAACGTGGGCTACTAAAACCATCAGCTATTGCTGCTGTTGCACCTACATGGGCTGGACC
TCTCCCTATTGTGTTTGGTCGTGATTCCTCCATGGAGACAAGGTATGGTCTGCTAAGAGG
AACGTTAAAAGCACCTGGAGTCGGTTGGATGATGTACAACATGCTAGTGAGCAACGAGAA
ATCAATCGAGTCTCAGTACAAATCCCATGTCTACGCAGACCAAAGCAACGTGACTGAGGC
CATAATCCAAAGCAGATACGAGTTGACAAAGCAGAAGGGATCACGTTACGTCCCTGCAGC
TTTTTTGACCGGTTTACTCGACCCGGTTTCATCCCGGGATGAGTTTCTACAGCTGTTTGC
TGATTTGGAAGGGAAACTTCCGGTTATGGTGATGTCAACG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4AD74JQ 801 0 0
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ACGTGACTGAGGCCATAATCCAAAGCAGATACGAGTTGACAAAGCAGAAGGGATCACGTT
ACGTCCCTGCAGCTTTTTTGACCGGTTTACTCGACCCGGTTTCATCCCGGGATGAGTTTC
TACAGCTGTTTGCTGATTTGGAAGGGAAACTTCCGGTTATGGTGATGTCAACGAAAGGTG
CTCCAAAGAGATCAAAAGCTGAGATGGAGGCACTGAGAGGAGCCAAAGGAGTTAGCAAGT
TTGTGGAGGTTGAAGGTGCACTCTTGCCTCAAGAAGAGTATCCTTCTCTTGTTGCTCAAG
AGCTCTACAACTTCTTGCAAGAGACTTGTGCTTCTCTCAAGTAGATTCATTTTGTGAGCC
CAGGCCCATACAGTGTTTTATTGATTGTTTGCTACTACTACGCTTAAAAGTCTTACTATC
TAGTTTTTTTTTTTGGTTCAAATACTATCTAGTATCTACCATGTCCTTTTCCAAATGAAT
ACAACTTTTTTTGCAGTACTAATTTAGTTGATGTATTACTGTCCAGTATTTTTTTTGTGT
GGATGCTACGCAGGTTCATCGCATGCCATGCGTTTACCCCACTATTTAAATGGGTCAATT
TAATATCCCAAACGTACTAGACCAGTAGACCCTCATGTTTTACCAAACTAGGTCCTTGTT
TATTTATTTATATATATGTATATATTTTTTGTCAACTAATTTTATTAAATTGTAAATGGA
AAATACAAGATCTTTTTTTGC

QA 1 801 1 801
DS 



CO CL3363Contig2 364 2 1 U
GGGATGAGTTTCTACAGCTGTTTGCTGATTTGGAAGGGAAACTTCCGGTTATGGTGATGT
CAACGAAAGGAGCTCCAAAGAGATCAAAAGCTGAGATGGAGGCACTGAGAGGAGCCAAAG
GAGTTAGCAAGTTTGTGGAGGTTGAAGGTGCACTCTTGCCTCAAGAAGAGTATCCTTCTC
TTGTTGCTCAAGAGCTCTACAACTTCTTGCAAGAGACTTGTGCTTCTCTCAAGTAGATTC
ATTTAGTGAGCCCAGGTCCATACAGTGTTTTATTGATTGTTTGCTACTACAGTACTACGC
TTAAAAGTCTTACTATCTAGTATCTACCATGTCCTTTTTCAAATGAATACAACTTTTTTG
CAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RR4DL79JQ C 1
AF RR4DL79TF U 1
BS 1 364 RR4DL79TF

RD RR4DL79JQ 364 0 0
GGGATGAGTTTCTACAGCTGTTTGCTGATTTGGAAGGGAAACTTCCGGTTATGGTGATGT
CAACGAAAGGAGCTCCAAAGAGATCAAAAGCTGAGATGGAGGCACTGAGAGGAGCCAAAG
GAGTTAGCAAGTTTGTGGAGGTTGAAGGTGCACTCTTGCCTCAAGAAGAGTATCCTTCTC
TTGTTGCTCAAGAGCTCTACAACTTCTTGCAAGAGACTTGTGCTTCTCTCAAGTAGATTC
ATTTAGTGAGCCCAGGTCCATACAGTGTTTTATTGATTGTTTGCTACTACAGTACTACGC
TTAAAAGTCTTACTATCTAGTATCTACCATGTCCTTTTTCAAATGAATACAACTTTTTTG
CAGT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR4DL79TF 364 0 0
GGGATGAGTTTCTACAGCTGTTTGCTGATTTGGAAGGGAAACTTCCGGTTATGGTGATGT
CAACGAAAGGAGCTCCAAAGAGATCAAAAGCTGAGATGGAGGCACTGAGAGGAGCCAAAG
GAGTTAGCAAGTTTGTGGAGGTTGAAGGTGCACTCTTGCCTCAAGAAGAGTATCCTTCTC
TTGTTGCTCAAGAGCTCTACAACTTCTTGCAAGAGACTTGTGCTTCTCTCAAGTAGATTC
ATTTAGTGAGCCCAGGTCCATACAGTGTTTTATTGATTGTTTGCTACTACAGTACTACGC
TTAAAAGTCTTACTATCTAGTATCTACCATGTCCTTTTTCAAATGAATACAACTTTTTTG
CAGT

QA 1 364 1 364
DS 



AS 1 4

CO CL3364Contig1 1216 4 11 U
GGGGAATCGTATAATAATAAACACGAGAATCGGTCTAAAAGGTTGAAACCTAAGCTTCTC
TCTTTTCTCGATCAAAGGATGGGGAATACGAATTGCATACTGGGAGGTTGCGTCGATCAA
GCGAGCGTCGGAGTGGTAGAACGCTGGGGACGATTCGAGCACATAGCGGAGCCTGGATGC
CACTTCTTCAACCCTCTCGCCGGTCAGTGGCTCGCCGGTGTCCTCTCCACCAGGATCAAC
TCTCTCGACGTCAAAATCGAGACCAAAACCAAGGATAATGTGTTTGTGCAGCTGATATGC
TCGATTCAGTACCGTGTGGTGAAAGCAAACGCTGATGATGCTTTTTACGAGCTTCAGAAC
CCTCGAGAGCAGATCCAAGCTTACGTTTTTGATGTGGTTAGAGCTTTGGTTCCAATGATG
ACGCTAGACGCTCTTTTTGAACAAAAGGGAGAAGTCGCCAAGTCTGTTCTTGAAGAACTC
GACAAGGTGATGGGTGCTTATGGATACAGCATTGAACACATTCTCATGGTTGACATTATT
CCCGATCCTTCTGTTCGCAAGGCCATGAATGAGATCAATGCAGCACAAAGGCTCCAGCTC
GCGAGTGTTTACAAAGGAGAAGCAGAGAAGATTCTCCAAGTGAAGAGAGCCGAAGCAGAG
GCGGAAGCCAAGTACCTGGGCGGTGTGGGTGTCGCCAGACAGAGGCAAGCCATCACAGAC
GGGTTGAGGGAGAACATTATGAACTTCTCTAGCAAAGTAGAAGGCACTTCGTCCAAAGAT
ATCATGGACTTGATCATGATCACGCAGTACTTTGACACCATGAGAGACCTCGGAAGCTCA
TCTAAGAACACAACCGTGTTTCTTCCTCACGGTCCGGGGCACGTGAGGGATATCAGCGAC
CAGATTCGTAACGGTTTGATGGAGGCGTCCAGTGCTCGTGTCGGCGACGAGGTTTAAAGT
GAGATTCACTTGGGGTTGTGAATCTATCTATATTCGTGGGTTTGGGGTTCTTTGATTATG
GTTTTAATTACGGTTTAGCACTTGGGGATGTGTGAATTTATTTGGATGTTGCTTCCTTTT
TTATGTTCATGGTTTTATTAATGATATAAATAATAACCCAAAGTACTTTGAACTCTTTAT
GTAATATATTCTGATCTCTTAAAAACGGTGATGCATAAAGAGAGCTTATGAACTGTGATA
CAATTTGTTCTCGAGG


BQ
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GCGGAAGCCAAGTACCTGGGCGGTGTGGGTGTCGCCAGACAGAGGCAAGCCATCACA

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G
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AGGGAGAAGTCGCCAAGTCTGTTCTTGAAGAACTCGACAAGGTGATGGGTGCTTATGGAT
ACAGCATTGAACACATTCTCATGGTTGACATTATTCCCGATCCTTCTGTTCGCAAGGCCA
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TCTCTAGCAAAGT

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AGCTCATCTAAGAACACAACCGTGTTTCTTCCTCACGGTCCGGGGCACGTGAGGGATATC
AGCGACCAGATTCGTAACGGTTTGATGGAGGCGTCCAGTGCTCGTGTCGGCGACGAGGTT
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TATTCGTGGGTTTGGGGTTCTTTGATTATGGTTTTAATTACGGTTTAGCACTTGGGGATG
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ATGCATAAAGAGAGCTTATGAACTGTGATACAATTTGTTCTCGAGG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 4

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AAACCTTAAGCAAAAAGGAGCAACAGGGAGTGTTTAGGGAAGACATGTTCCGTAGTGAAA
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TATCTGGCAGCTAAGGAGGAAGCAGATACCTTAGGAGGTCGAGCAAACCAACTTGAAGTG
GAAATCATGGAACTGCGGAGAAAACATAAGCAAGAGTTGCAAGAATTGCTGATCCACAAC
GAGCTTATTCAAAAGGACCTAGAAAGGGAGAAGGCTACCCGTTTGGATCTTGAAAGAACT
GCCCGTATCAATTCCTCGACAGCCTCTGAACAGCTTCCCATATCAAGGCAAAATTCTACC
TACGAGAATGGAGGCTTGCAAAGAAAGCTCTCAAGCGCAAGCAGCCTTGGGAGCATGGAG
GAGAGCTATTTTCTGCAAGCTTCGCTTGATTCGTCAGATAGATCTTCTGAGAAGAGAAGC
ATGCCTGAAGCAACTATGAGTCCATACTACATGAAGAGCATCACACCTAGTGCTTATGAA
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GAGTCTATCCGAGATTCGCTAGCTGAAGAACTAGTCAAAATGACCGCAGAGTGTGAGAAA
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TTTGAGAGACAGTTGACTGAAGTCATTAGTGTTCTTCGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN20TF U 1
AF RR4GN16TF U 211
AF RR4GN16JQ C 770
AF RR4BN20JQ C 796
BS 1 559 RR4BN20TF
BS 560 902 RR4GN16TF
BS 903 903 RR4GN16JQ
BS 904 951 RR4GN16TF
BS 952 1220 RR4GN16JQ
BS 1221 1221 RR4BN20JQ
BS 1222 1464 RR4GN16JQ
BS 1465 1480 RR4BN20JQ

RD RR4BN20TF 559 0 0
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AAACCTTAAGCAAAAAGGAGCAACAGGGAGTGTTTAGGGAAGACATGTTCCGTAGTGAAA
TTGAAGACCTTCAAAGACGTTATCAGGCTAGTGAACGAAGGTGTGAGGAATTAATCACCC
AAGTTCCTGAGTCTACAAGGCCTCTCCTAAGACAGATTGAAGCAATGCAGGAAACTACTG
CCAGAAGAGCAGAAGCTTTGGAGTGCTGTAGAGAGAACCTTGAATGCCCGACTGCAGGAA
GCAGAAACTAAAGCTGCCACAGCTGAAGAGCGAGAGCGCTCTGTGAATGAGCGTCTCTCT
CAAACCTTATCAAGGAACAATGTTCTTGAGGCTCAGCTTTCATGTCTTAGAGCAGAACAG
AGCCAGTTAAGTAAGTCGCTCGAGAAGGAGAGGCAAAGAGCGACAGAGAATAGACAGGAG
TATCTGGCAGCTAAGGAGGAAGCAGATACCTTAGGAGGTCGAGCAAACCAACTTGAAGTG
GAAATCATGGAACTGCGGA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4GN16TF 753 0 0
GG
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GAGAACCTTGAATGCCCGACTGCAGGAAGCAGAAACTAAAGCTGCCACAGCTGAAGAGCG
AGAGCGCTCTGTGAATGAGCGTCTCTCTCAAACCTTATCAAGGATCAATGTTCTTGAGGC
TCAGCTTTCATGTCTTAGAGCAGAACAGAGCCAGTTAAGTAAGTCGCTCGAGAAGGAGAG
GCAAAGAGCGACAGATAATAGACAGGAGTATCTGGCAGCTAAGGAGGAAGCAGATACCTT
AGGAGGTCGAGCAAACCAACTTGAAGTGGAAATCATGGAACTGCGGAGAAAACATAAGCA
AGAGTTGCAAGAATTGCTGATCCACAACGAGCTTATTCAAAAGGACCTAGAAAGGGAGAA
GGCTACCCGTTTGGATCTTGAAAGAACTGCCCGTATCAATTCCTCGACAGCCTCTGAACA
GCTTCCCATATCAAGGCAAAATTCTACCTACGAGAATGGAGGCTTGCAAAGAAAGCTCTC
AAGCGCAAGCAGCCTTGGGAGCATGGAGGAGAGCTATTTTCTGCAAGCTTCGCTTGATTC
GTCAGATAGATCTTCTGAGAAGAGAAGCATGCCTGAAGCAACTATGAGTCCATACTACAT
GAAGAGCATCACACCTAGTGCTTATGAAGC*ACACTTCGACAGAAAGAGGGTGAACTTGC
TTCTTACATGTCCCGCTTG
CGTCATGGAGTC

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR4GN16JQ 695 0 0
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AGAAGAGAAGCATGCCTGAAGCAACTATGAGTCCATACTACATGAAGAGCATCACACCTA
GTGCTTATGAAGCCACACTTCGACAGAAAGAGGGTGAACTTGCTTCTTACATGTCCCGCT
TGGCGTCAATGGAGTCTATCCGAGATTCGCTAGCTGAAGAACTAGTCAAAATGACCGCAG
AGTGTGAGAAATTAAGGGGGGAAGCGGATAGGGTGCCGGGCATAAAAGCAGAGCTGGAAG
CACTAAGACAAAGGCATGCGGCTGCTCTGGAATTGATGGGTGAACGAGATGAGGAGTTGG
AGGAACTTCGAGCGGATATAGTAGACTTGAAGGAAATGTACAAGGAGCAAGTGAACATGC
TGGTGAACAAGATACAATGAGAAAGCAACGA*GTGTTGATAGGGTCAGGCTCATGAATAG
GACCATCATCCTTGTTTCCTCCTATTGGCTATACCACCAACCTGAGGCTCCCTGCATATT
TTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTTTTCCTTCTCAGGAAAGGCTTTGTAAAACAAAGTA
TTGCTGTTCGAACGAAGATTTTTCTTACTGTTTATTCGTAATTATTTGGACACAATGCGA
GTACCTGGTTCTTTGAGAGACAGTTGACTGAAGTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4BN20JQ 685 0 0
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ATGAGTCCATACTACATGAAGAGCATCACACCGAGTGCTTATGAAGCCACACTTCGACAG
AAAGAGGGTGAACTTGCTTTTTACATGTCCCGCTTGGCGTCAATGGAGTCTATCCGAGAT
TCGCTAGCTGAAGAACTAGTCAAAATGACCGCAGAGTGTGAGAAATTAAGGGGGGAAGCG
GATAGGGTGCGGGGCATAAAAGCAGAGCTGGAAGCACTAAGACAAAGGCATGCGGCTGCT
CTGGAATTGATGGGTGAACGAGATGAGGAGTTGGAGGAACTTCGAGCGGATATAGTAGAC
TTGAAGGAAATGTACAAGGAGCAAGTGAACATGCTGGTGAACAAGATACAATGAGAAAGC
AACGAAGTGTTGATAGGGTCAGGCTCATGAATAGGACCATCATCCTTGTTTCCTCCTATT
GGCTATACCACCAACCTGAGGCTCCCTGCATATTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT
T*CCTTCTCAGGAAAGGCTTTGTAAAACAAAGTATTGCTGTTCGAACGAAGATTTTTCTT
ACTGTTTATTCGTAATTATTTGGACACAATGCGAGTACCTGGTTCTTTGGGAGACAGTTG
ACTGAAGTCATTAGTGTTCTTCGTT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL3366Contig1 731 2 9 U
GGAAATGTAAAAATGTTTTTCTTTCAAAACAATTTTATTATTCCAACAAATATCCAAAAA
TTACAGACAAGATAAAACAGGAAAACATGAAAATACTGCAACTAAAATCGATTAAAAGAA
AAAAACTCATCTTCAAGTTGGATCACAACAAAACCTTATTCATGTCCTCAGAGCTCTTAG
AGTGGCTTACCACTTATCTTGATGTCATTTCTGATGGCTCCTTGGATCATCTTAACGACG
AACCACTGAGCGGCAATGATAAGAGGGATGAGTTTCTTTCCTTTGTCATCAGAGTAAGAT
CCATCTACCATCTTCTTGTCCACATGAATCGCTTTCTTCTGAATTGTAGCAACATCGGTT
ATGGCCTTAACCAACTTCGGGATCCACGCCTCACCATTTGGTAATGCCTTTTCGTCCTTG
TCATTCTTGCTGCATCTCCCACTGTTCTCCGCATAAACAACCTCAATTGCAGAATCCTCA
AACTGTTGTTTACGCATCTTAAAACCACCGCGGATAGTTTTGAGGAGAGAATCTGATCTC
TTTGAGGAAAAAGTTTCATAGGAAAGGTCATCGGGTGGGGAGAATTGAGCATGAGTCAAA
ACAAGTAACGTTTTGCACCATATCTCTTTGCCAAAGGTTTGGGTGATAGCTTGAACAACT
TGCTTATCTAGCTCATCCACTCTATACACATCCAGACGATCAACATACAGGAACACATCT
ATGGTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B501JQ U 311
AF RR4CI07JQ U 1
BS 1 342 RR4CI07JQ
BS 343 343 RR4B501JQ
BS 344 374 RR4CI07JQ
BS 375 375 RR4B501JQ
BS 376 429 RR4CI07JQ
BS 430 430 RR4B501JQ
BS 431 507 RR4CI07JQ
BS 508 508 RR4B501JQ
BS 509 731 RR4CI07JQ

RD RR4B501JQ 281 0 0
TCTTCTTGTCCACATGAATCGCTTTCTTCTGAATTGTAGCAACATCGGTTATGGCCTTAA
CCAACTTCGGGATCCACGCCTCACCATTTGGTAATGCCTTTTCGTCCTTGTCATTCTTGC
TGCATCTCCCACTGTTCTCCGCATAAACAACCTCAATTGCAGAATCCTCAAACTGTTGTT
TACGCATCTTAAAACCACCGCGGATAGTTTTGAGGAGAGAATCTGATCTCTTTGAGGAAA
AAGTTTCATAGGAAAGGTCATCGGGTGGGGAGAATTGAGCA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4CI07JQ 731 0 0
GGAAATGTAAAAATGTTTTTCTTTCAAAACAATTTTATTATTCCAACAAATATCCAAAAA
TTACAGACAAGATAAAACAGGAAAACATGAAAATACTGCAACTAAAATCGATTAAAAGAA
AAAAACTCATCTTCAAGTTGGATCACAACAAAACCTTATTCATGTCCTCAGAGCTCTTAG
AGTGGCTTACCACTTATCTTGATGTCATTTCTGATGGCTCCTTGGATCATCTTAACGACG
AACCACTGAGCGGCAATGATAAGAGGGATGAGTTTCTTTCCTTTGTCATCAGAGTAAGAT
CCATCTACCATCTTCTTGTCCACATGAATCGCTTTCTTCTGATTTGTAGCAACATCGGTT
ATGGCCTTAACCAAGTTCGGGATCCACGCCTCACCATTTGGTAATGCCTTTTCGTCCTTG
TCATTCTTGGTGCATCTCCCACTGTTCTCCGCATAAACAACCTCAATTGCAGAATCCTCA
AACTGTTGTTTACGCATCTTAAAACCAGCGCGGATAGTTTTGAGGAGAGAATCTGATCTC
TTTGAGGAAAAAGTTTCATAGGAAAGGTCATCGGGTGGGGAGAATTGAGCATGAGTCAAA
ACAAGTAACGTTTTGCACCATATCTCTTTGCCAAAGGTTTGGGTGATAGCTTGAACAACT
TGCTTATCTAGCTCATCCACTCTATACACATCCAGACGATCAACATACAGGAACACATCT
ATGGTTCTGTT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL3367Contig1 1423 3 21 U
AACAAATTCATTATACTCGAAATAAAAGTCAAGTCACAGAAACAAGTTATTATCAAGTCA
TAACAAAAGAACTCAAAACTGTTGCTCAGAATCAAACCGTATTTCACACCAGTTATTAGT
TTAATACTAACAGAAACAGGAGACATCAAAATTGGGAATCTAAAGTTTTGTAGCAAACAG
AGGTTACTCAGAGGAGTTGCGCCAGATCTTCACCGCTCATCTTTTCCAACTGAGTGATGA
TATCTTGAGACAGAGACTTGACAGACAGATCAACGTCTTCCAGCAGTTCACCTAAGAATG
GAATGGTCTCAGCTAGCAAGACTAGATACTCTTCTTTCAGATTATCCATCATCTGTTTCA
CGCTCCTCAAACTCAACATCCTCGCACGCAACTTCTCACTCCTTGTTTGCATTAGCACCT
CGTGGTTCAGCGGTTTCCAGAGAAGATCAGAGCCAGAGGCTACTGCCAATTGACCAATGC
ATGAAACCAACAACTCATCAACCTCTTCTACAGTTGGTACATGTGGATGTTCCTTTAAAC
CAGATGGCGGTTCAACAACAAGCTGAGATACTATAGGCTTCAGTAGCACCTGGAAGTTGT
TTGCGTCGAGGAACTTCAAACTTCCAGTATCATGCAAAGCAGTTCTTCAAAGAAGAAAGC
ACCAACGCCCTAAGATGCCAGCTTTTTGGTGGTATAGCGTCATCTGATTCTTGAAGTTTG
GCTTTCTTTTTCTTCCTTGTTGATACTGATGCTCCAGCACTGGTGAGATGCGATACAATA
CTGTCAAGCATGAACTTGAAATATGGTACAAAGATCGACAAGTGACTCTCACAGAGTCCA
TTCACTAGACCATAGAAAGAGATAGATCTGTCGACGCTCTTATTCTCATTCCCAGATCCA
TCTACAATATCCGACTCTGCCCAATCAATACTTCTTATAAAGAGGGGTTTAAACTCAGAC
TCAGTTAGCTTCTTCGTGAGTGTAACCGTCGCATTGATTACACTTCTCTCCGCAACATCA
ACATTCTGAATCGTTGCTGGATTTTGGCGTCTAATATCTAGGGCAACTAAGCATTGGTCG
AAAATCTTTGCATGGTTGCAAACAACAGATGCTCTATCCATTTTTGCAACCAGAATTTCC
AGCATATCAAAAGCAATCACCAAACTTGCATCGCCACAAGAAACAGCCTCATCATATATT
CGCAGAAGAGGTTGCAGAGTGAGGCGAACTGGTATTTTTTCAGTAAGGAGTCTCCTAATG
GCATTGGCTTTGGACTTGAGATTCTTGTCGAAGTCAGAAACATATTCAGGATGCAGAACC
ATGAGTCTAATGATATCCCCAAGATGAGGATTCAGGAAACCTCCAAGTTTATCAATCACT
GCTTCCAAAGTGACTAGAACAGACAGCATCACCAACTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C867JQ U 1
AF RR4FQ58JQ U 745
AF RR4C867TF C 739
BS 1 811 RR4C867JQ
BS 812 812 RR4FQ58JQ
BS 813 836 RR4C867JQ
BS 837 911 RR4FQ58JQ
BS 912 912 RR4C867TF
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BS 924 924 RR4C867TF
BS 925 1014 RR4FQ58JQ
BS 1015 1015 RR4C867TF
BS 1016 1022 RR4FQ58JQ
BS 1023 1023 RR4C867TF
BS 1024 1031 RR4FQ58JQ
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BS 1033 1134 RR4FQ58JQ
BS 1135 1135 RR4C867TF
BS 1136 1180 RR4FQ58JQ
BS 1181 1181 RR4C867TF
BS 1182 1202 RR4FQ58JQ
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BS 1204 1207 RR4FQ58JQ
BS 1208 1423 RR4C867TF

RD RR4C867JQ 836 0 0
AACAAATTCATTATACTCGAAATAAAAGTCAAGTCACAGAAACAAGTTATTATCAAGTCA
TAACAAAAGAACTCAAAACTGTTGCTCAGAATCAAACCGTATTTCACACCAGTTATTAGT
TTAATACTAACAGAAACAGGAGACATCAAAATTGGGAATCTAAAGTTTTGTAGCAAACAG
AGGTTACTCAGAGGAGTTGCGCCAGATCTTCACCGCTCATCTTTTCCAACTGAGTGATGA
TATCTTGAGACAGAGACTTGACAGACAGATCAACGTCTTCCAGCAGTTCACCTAAGAATG
GAATGGTCTCAGCTAGCAAGACTAGATACTCTTCTTTCAGATTATCCATCATCTGTTTCA
CGCTCCTCAAACTCAACATCCTCGCACGCAACTTCTCACTCCTTGTTTGCATTAGCACCT
CGTGGTTCAGCGGTTTCCAGAGAAGATCAGAGCCAGAGGCTACTGCCAATTGACCAATGC
ATGAAACCAACAACTCATCAACCTCTTCTACAGTTGGTACATGTGGATGTTCCTTTAAAC
CAGATGGCGGTTCAACAACAAGCTGAGATACTATAGGCTTCAGTAGCACCTGGAAGTTGT
TTGCGTCGAGGAACTTCAAACTTCCAGTATCATGCAAAGCAGTTCTTCAAAGAAGAAAGC
ACCAACGCCCTAAGATGCCAGCTTTTTGGTGGTATAGCGTCATCTGATTCTTGAAGTTTG
GCTTTCTTTTTCTTCCTTGTTGATACTGATGCTCCAGCACTGGTGAGATGCGATACAATA
CTGTCAAGCATGAACTTGAAATATGGTACAA*GATCGACAAGTGACTCTCACAGAG

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR4FQ58JQ 463 0 0
G
CTGATGCTCCAGCACTGGTGAGATGCGATACAATACCGTCGAGCATGAACTTGAAATATG
GTACAAAGATCGACATGTGACTCTCACAGAGTCCATTCACTAGACCATAGAAAGAGATAG
ATCTGTCGACGCTCTTATTCTCATTCCCAGATCCATCTACAATATCTGACTCTGCCCATT
CAATACTTCTTATAAAGAGGGGTTTAAACTCAGACTCAGTTAGCTTCTTCGTGAGTGTAA
CCGTCGCATTGATTACACTTCTCTCCGCATCATCAACGTTCTGAATTGTTGCTGGATTTT
GGCGTCTAATATCTAGGGCAACTAAGCATTGGTCGAAAATCTTTGCATGGTTGCAAACAA
CAGATGCTCTATCCATTTTTGCAACCAGATTTTCCAGCATATCAAAAGCAATCACCAAAC
TTGCATCGCCACAAGTAACAGCCTCATCATATATTCGTAGAA

QA 2 463 2 463
DS 

RD RR4C867TF 685 0 0
GTTGATA
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GTACAAAGATCGACAAGTGACTCTCACAGAGTCTATTCACTAGACCATAGAAAGAGATAG
ATCTGTCGACGCTCTTATTCTCATTCCCAGATCCATCTACAATATCCGACTCTGCCCAAT
CAATACTTCTTATAAAGAGGGGTTTAAACTCAGACTCAGTTAGCTTCTTTGTGAGTGTAA
CCGTCGCATTGATTACACTTTTCTCCGCAACATCAACATTCTGAATCGTTGCTGGATTTT
GGCGTCTAATATCTAGGGCAACTAAGCATTGGTCGAAAATCTTTGCATGGTTGCAAACAA
TAGATGCTCTATCCATTTTTGCAACCAGGATTTCTAGCATGTCAAAAGCAATCACCAAAC
TTGCGTCGCCACAAGAAACAGCCTCATCGTATATTCGCAGAAGAGGTTGCAGAGTGAGGC
GAACTGGTATTTTTTCAGTAAGGAGTCTCCTAATGGCATTGGCTTTGGACTTGAGATTCT
TGTCGAAGTCAGAAACATATTCAGGATGCAGAACCATGAGTCTAATGATATCCCCAAGAT
GAGGATTCAGGAAACCTCCAAGTTTATCAATCACTGCTTCCAAAGTGACTAGAACAGACA
GCATCACCAACTGTTCCC

QA 8 685 8 685
DS 



AS 1 4

CO CL3368Contig1 389 4 3 U
ATCCCAAAAAACAACAGTTTATTTAAAATTTTATTATTTTCTTTGACAAATAAATGATAA
TATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAGATAAAAAAAAATCAGCGAGCGCACG
GATAATGACATATACATCGCTTTTTTTT*GTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGC
CCTTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTT
TTGTTTCGTAATACCCTATTACATTGGTTGCCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATT
TCACCGAATAGAAAAATTGTGAGCATAAGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCAACT
TTCATTTTCGATAGTGAAATAATGGTCCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4EG88TF C 1
AF RR4CM46JQ U 39
AF RR4EW86JQ U 1
AF RR4EW86TF C 1
BS 1 38 RR4EW86JQ
BS 39 388 RR4CM46JQ
BS 389 389 RR4EG88TF

RD RR4EG88TF 389 0 0
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TATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAGATAAAAAAAAATCAGCGAGCGCACG
GATAATGACATATACATCGCTTTTTTTTTGTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGC
CCTTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTT
TTGTTTCGTAATACCCTATTACATTGGTTGCCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATT
TCACCGAATAGAAAAATTGTGAGCATAAGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCAACT
TTCATTTTCGATAGTGAAATAATGGTCCT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4CM46JQ 350 0 0
TTCTTTGACAAATAAATGATAATATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAGATA
AAAAAAAATCAGCGAGCGCACGGATAATGACATATACATCGCTTTTTTTT*GTCTGTTGG
ATTAGTTGTGCAACTGCCTTGCCCTTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACAC
CTGTTGGGGACATGTTCCACTTTTGTTTCGTAATACCCTATTACATTGGTTGCCACTTTT
TCCTTTCTGAGCAATCGCCATTTCACCGAATAGAAAAATTGTGAGCATAAGAAAGCCAAT
AAGCCAAGGTTTGAAAGCAACTTTCATTTTCGATAGTGAAATAATGGTCC

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4EW86JQ 388 0 0
ATCCCAAAAAACAACAGTTTATTTAAAATTTTATTATTTTCTTTGACAAATAAATGATAA
TATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAAATAAAAAAAAATCAGCGAGCGCACG
GATAATGACATATACATCGCTTTTTTTT*GTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGC
CCTTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTT
TTGTTTCGTAATACCCTATTACATTGGTTGCCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATT
TCACCGAATAGAAAAATTGTGAGCATAAGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCAACT
TTCATTTTCGATAGTGAAATAATGGTCC

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4EW86TF 388 0 0
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TATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAGATAAAAAAAAATCAGCGAGCGCACG
GATAATGACATATACATCGCTTTTTTTT*GTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGC
CCTTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTT
TTGTTTCGTAATACCCTATTACATTGGTTGCCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATT
TCACCGAATAGAAAAATTGTGAGCATAAGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCAACT
TTCATTTTCGATAGTGAAATAATGGTCC

QA 1 388 1 388
DS 



AS 1 4

CO CL3369Contig1 1313 4 4 U
GGGAGAGAGACAAAAAGTAAGCCATGTCTGTGAAAGCAATTATCGTATCATCGGTGGTTC
TGCTGATCCTCGTAGCCGCATCAGCGGAGGCTTATACAGGATTCGATGAGTCAAACCCGA
TCCGTATGGTCTCCGACGGTCTTAGGGAGATAGAAGAATCCATTGTCCAGATCTTAGGAC
AATCTCGTCACGTTCTATCCTTCGCTCGCTTCACTCACCAGTATGGGAAAAGGTATGAGA
ACGCGGAGGAGATAAAGCTCAGATTTTCGATTTTCAAGGAGAGTCTTGACTTGATCAGAT
CCACCAACAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTTGGCCTCAATCAGTTTGCTGATATGACCT
GGGAAGAATTTCAAAGTAGCAAGCTTGGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCACTTTAAAGG
GAAGCCACAAACTCACCAAAGAAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTA
TTGTTAGTCCAGTCAAAGAACAGGGCAAATGTGGATCTTGCTGGACTTTCAGTACTACTG
GAGCTCTTGAGGCAGCTTATCATCAAGCATTTGGGAAAGCAATATCTCTCTCTGAGCAAC
AGCTAGTGGATTGTGCTGGAGCTTTCAACAACTTTGGCTGCAATGGTGGCCTTCCTTCCC
AAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACA
CCGCTAAAAACTGAACCTGCAAATATTCAGCTGAAAACATCGGTGTACAAGTCCTCGACT
CTGTCAACATTACTATGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGG*TGCGA
CCAGTAAGCATAGCATTCCAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACGATGGCGGAGTTTAT
TCTGATAGTAACTGTAATAATACATCAAAGGATGTGAACCACGCGGTGTTGGCGGTTGGT
TATGGAATTGAAAAAGGTGTTCCATATTGGCTTATAAAGAACTCATGGGGAGCGAGTTGG
GGTAACAAAGGTTACTTCAAGATGGAGATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGACATGT
GCATCTTACCCGGTTGTGGCCTAGATGATCAGCGAATGTGGTCGCTCAATGACTAGATTA
CGTTCACGTTTGCATGTTTATTGGATTGAGACATTATTTCAAAGTTGGGGGTTGAGAGTG
CATAGTGTTTACTATGCTTGTTGTATGTACAATAAGGTCTGTTCATATGTACAATATAAT
TCAATAAACCACAGACGACAAATTAATAATATATATACATGTTGAACTTAAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A164TF U 1
AF RR4A164TFB U 1
AF RR4A164JQD C 392
AF RR4A164JQ C 449
BS 1 786 RR4A164TF
BS 787 787 RR4A164TFB
BS 788 856 RR4A164TF
BS 857 1313 RR4A164JQD

RD RR4A164TF 869 0 0
GGGAGAGAGACAAAAAGTAAGCCATGTCTGTGAAAGCAATTATCGTATCATCGGTGGTTC
TGCTGATCCTCGTAGCCGCATCAGCGGAGGCTTATACAGGATTCGATGAGTCAAACCCGA
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AATCTCGTCACGTTCTATCCTTCGCTCGCTTCACTCACCAGTATGGGAAAAGGTATGAGA
ACGCGGAGGAGATAAAGCTCAGATTTTCGATTTTCAAGGAGAGTCTTGACTTGATCAGAT
CCACCAACAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTTGGCCTCAATCAGTTTGCTGATATGACCT
GGGAAGAATTTCAAAGTAGCAAGCTTGGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCACTTTAAAGG
GAAGCCACAAACTCACCAAAGAAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTA
TTGTTAGTCCAGTCAAAGAACAGGGCAAATGTGGATCTTGCTGGACTTTCAGTACTACTG
GAGCTCTTGAGGCAGCTTATCATCAAGCATTTGGGAAAGCAATATCTCTCTCTGAGCAAC
AGCTAGTGGATTGTGCTGGAGCTTTCAACAACTTTGGCTGCAATGGTGGCCTTCCTTCCC
AAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACA
CCGCTAAAAACTGAACCTGCAAATATTCAGCTGAAAACATCGGTGTACAAGTCCTCGACT
CTGTCA*CATTACTATGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGG*TGCGA
CCAGTAAGCATAGCAT
CAGTTATACACTC

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR4A164TFB 874 0 0
GGGAGAGAGACAAAAAGTAAGCCATGTCTGTGAAAGCAATTATCGTATCATCGGTGGTTC
TGCTGATCCTCGTAGCCGCATCAGCGGAGGCTTATACAGGATTCGATGAGTCAAACCCGA
TCCGTATGGTCTCCGACGGTCTTAGGGAGATAGAAGAATCCATTGTCCAGATCTTAGGAC
AATCTCGTCACGTTCTATCCTTCGCTCGCTTCACTCACCAGTATGGGAAAAGGTATGAGA
ACGCGGAGGAGATAAAGCTCAGATTTTCGATTTTCAAGGAGAGTCTTGACTTGATCAGAT
CCACCAACAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTTGGCCTCAATCAGTTTGCTGATATGACCT
GGGAAGAATTTCAAAGTAGCAAGCTTGGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCACTTTAAAGG
GAAGCCACAAACTCACCAAAGAAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTA
TTGTTAGTCCAGTCAAAGAACAGGGCAAATGTGGATCTTGCTGGACTTTCAGTACTACTG
GAGCTCTTGAGGCAGCTTATCATCAAGCATTTGGGAAAGCAATATCTCTCTCTGAGCAAC
AGCTAGTGGATTGTGCTGGAGCTTTCAACAACTTTGGCTGCAATGGTGGCCTTCCTTCCC
AAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACA
CCGCTAAAAACTGAACCTGCAAATATTCAGCTGAAAACATCGGTGTACAAGTCCTCGACT
CTGTCAACATTACTATGGGTGCTGAAGATGA*CTGAAGCATGCGGTTGGATTGGGTGCGA
CCAGTAAGCATAGCAT
TCCAGGTTATACACTCGT

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR4A164JQD 922 0 0
TGCTCAAAACTGCTCTGCCACTTTAAAGGGAAGCCACAAACTCACCAAAGAAGCTCTTCC
AGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTATTGTTAGTCCAGTCAAAGAACAGGGCAAATG
TGGATCTTGCTGGACTTTCAGTACTACTGGAGCTCTTGAGGCAGCTTATCATCAAGCATT
TGGGAAAGCAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTAGTGGATTGTGCTGGAGCTTTCAACAA
CTTTGGCTGCAATGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGG
CCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACACCGCTAAAAACTGAACCTGCAAATATTCAGC
TGAAAACATCGGTGTACAAGTCCTCGACTCTGTCAACATTACTATGGGTGCTGAAGATGA
ACTGAAGCATGCGGTTGGATTGG*TGCGACCAGTAAGCATAGCATTCCAGGTTATACACT
CGTTCCGGCTTTACGATGGCGGAGTTTATTCTGATAGTAACTGTAATAATACATCAAAGG
ATGTGAACCACGCGGTGTTGGCGGTTGGTTATGGAATTGAAAAAGGTGTTCCATATTGGC
TTATAAAGAACTCATGGGGAGCGAGTTGGGGTAACAAAGGTTACTTCAAGATGGAGATGG
GGAAGAACATGTGTGGTATTGCGACATGTGCATCTTACCCGGTTGTGGCCTAGATGATCA
GCGAATGTGGTCGCTCAATGACTAGATTACGTTCACGTTTGCATGTTTATTGGATTGAGA
CATTATTTCAAAGTTGGGGGTTGAGAGTGCATAGTGTTTACTATGCTTGTTGTATGTACA
ATAAGGTCTGTTCATATGTACAATATAATTCAATAAACCACAGACGACAAATTAATAATA
TATATACATGTTGAACTTAAGG

QA 1 922 1 922
DS 

RD RR4A164JQ 865 0 0
TCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTATTGTTAGTCCAGTCAAAGAACAGGGCAA
ATGTGGATCTTGCTGGACTTTCAGTACTACTGGAGCTCTTGAGGCAGCTTATCATCAAGC
ATTTGGGAAAGCAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTAGTGGATTGTGCTGGAGCTTTCAA
CAACTTTGGCTGCAATGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGG
TGGCCTCGACACAGAGGAAGCTTATCCTTACACCGCTAAAAACTGAACCTGCAAATATTC
AGCTGAAAACATCGGTGTACAAGTCCTCGACTCTGTCAACATTACTATGGGTGCTGAAGA
TGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGG*TGCGACCAGTAAGCATAGCATTCCAGGTTATAC
ACTCGTTCCGGCTTTACGATGGCGGAGTTTATTTTGATAGTAACTGTAATAATACATCAA
AGGATGTGAACCACGCGGTGTTGGCGGTTGGTTATGGAATTGAAAAAGGTGTTCCATATT
GGCTTATAAAGAACTCATGGGGAGCGAGTTGGGGTAACAAAGGTTACTTCAAGATGGAGA
TGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGACATGTGCATCTTACCCGGTTGTGGCCTAGATGA
TCAGCGAATGTGGTCGCTCAATGACTAGATTACGTTCACGTTTGCATGTTTATTGGATTG
AGACATTATTTCAAAGTTGGGGGTTGAGAGTGCATAGTGTTTACTATGCTTGTTGTATGT
ACAATAAGGTCTGTTCATATGTACAATATAATTCAATAAACCACAGACGACAAATTAATA
ATATATATACATGTTGAACTTAAGG

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 3

CO CL3370Contig1 757 3 28 U
CTTAAAAGTTAAACTTGCCATTTAAAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACA
AACAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACA
TAAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCACACATTAGACA
CAACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATTCGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTCT
TAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATACATATATAGATAGATAG
ATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGATCGGCTTATGCAGAACC
AGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGACGGAA
TTTTGGTCCATCATAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCTTTGCA
GATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCACTTTTT
GTCTTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAGATGCC
ATGCAGCTGGTGAGTGGTGTAGTTGTACAGAAACAGAGGCAATCCAGGTGTTATCGCCCG
AACAGAGTCCCTGTATCTCGGAGGTAAACCAAAGAGGTGACGTTTCAAGTCCTCCTGCAT
GGTATCATTGTTGCAAACAAAGATGTAGCCGCCAAGA


BQ
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP70TF C 1
AF RR4AP70JQ U 107
AF RR4BR67JQ U 4
BS 1 3 RR4AP70TF
BS 4 106 RR4BR67JQ
BS 107 155 RR4AP70JQ
BS 156 156 RR4BR67JQ
BS 157 176 RR4AP70JQ
BS 177 177 RR4BR67JQ
BS 178 212 RR4AP70JQ
BS 213 213 RR4BR67JQ
BS 214 242 RR4AP70JQ
BS 243 243 RR4BR67JQ
BS 244 262 RR4AP70JQ
BS 263 263 RR4BR67JQ
BS 264 320 RR4AP70JQ
BS 321 321 RR4BR67JQ
BS 322 355 RR4AP70JQ
BS 356 356 RR4BR67JQ
BS 357 369 RR4AP70JQ
BS 370 370 RR4BR67JQ
BS 371 372 RR4AP70JQ
BS 373 373 RR4BR67JQ
BS 374 374 RR4AP70JQ
BS 375 375 RR4BR67JQ
BS 376 380 RR4AP70JQ
BS 381 381 RR4BR67JQ
BS 382 383 RR4AP70JQ
BS 384 384 RR4BR67JQ
BS 385 402 RR4AP70JQ
BS 403 757 RR4BR67JQ

RD RR4AP70TF 418 0 0
CTTAAAAGTTAGACTTGCCATTTAAAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACA
AACAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACA
TAAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCACACATTAGACA
CAACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATTCGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTCT
TAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATACATATATAGATAGATAG
ATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGATCGGCTTATGCAGAACC
AGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGACG
C

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4AP70JQ 296 0 0
ACTTTCTCTCTACATAAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAAACAAACTCAC
TCACACATTAAACACAACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATTCGGCAAAGCTTCTTCACCC
TTTTGCTCGACTCTTACCTAACTCCCAAAAGCTTACCCTCTTATGGTAATATGCATACAT
ATATAGATAGATAGATTTCACATCACTTCCCTTACCAACGTGGTATTGCAAGGTTGATCG
GCTTATGCAAAACCAGCTTGTTCCCAAAAATCTAAAAAATCCAACGTCTCAGGAAC

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR4BR67JQ 754 0 0
AAAAGTTAAACTTGCCATTTAAAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACAAAC
AGTAGCTCATACCATTGGTTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACATAA
ATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCACACATTAGACACAA
CAAGAACAAGGGTAATCGCTTATTCGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTCTTAG
CTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATACATATATAGATAGATAGATT
TCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGATCGGCTTATGCAGAACCAGC
TTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGACGGAATTT
TGGTCCATCATAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCTTTGCAGAT
CTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCACTTTTTGTC
TTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAGATGCCATG
CAGCTGGTGAGTGGTGTAGTTGTACAGAAACAGAGGCAATCCAGGTGTTATCGCCCGAAC
AGAGTCCCTGTATCTCGGAGGTAAACCAAAGAGGTGACGTTTCAAGTCCTCCTGCATGGT
ATCATTGTTGCAAACAAAGATGTAGCCGCCAAGA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 2 4

CO CL3371Contig1 816 2 4 U
GGCAACCAACCGGCGAGAGCAAAAGAAAGTACTTACGAGAGATAGAGAGAGAGAGATGTC
GAAGACGCTGGTGCAGCCGGTAGGGCAGAAGAGGTTGACGAACGTCGCAGTGGTTCGATT
GAAGAAGCAAGGCAACCGCTTCGAGATCGCTTGCTACAAGAACAAGGTCCTTTCTTGGCG
TTCCGGCGTGGAGAAGGATATAGATGAAGTGTTGCAGTCGCATACTGTTTACACAAACGT
CTCCAAGGGAGTTCTTGCTAAATCTAAAGACTTGATAAAGGTCTTTGGATCCGATGATCA
CACCAAGATCTGTTTGGAGATTTTGGAGAAAGGTGAGCTTCAAGTTGCTGGCAAAGAGAG
AGAGTCGCAGCTGTCGAGCCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGTGATGCAGAAAACCAT
TAACCCTGAGACCCAGCGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCGTCTTATGCATGAGAT
CCATTTTGCTGTTGATCCTAATAGCAATTCCAAGAAGCAGGCTCTTGATGTCATCCGTGA
GCTGCAGAAGCACTTTCCTATAAAGCGTTCTCCAATGAGACTGCGTCTCACTGTTCCTGC
TCAGAACTTCTCCTCCCTTCTGGAGAAGCTTAAAGAATGGGACGCTTCTCTTGTCTCCAA
AGACGAATCTGGAACTCACATGTCCGCTGTCTGCGAGATGGAACCAGGGCTATACCGAGA
GATAGAGATACTCGCTGTATCGGTCATGCTGAAGCGACACGAGCATGGATCATTACGATG
AGCATGACGATATGGCATGCAGACAAACAAGCCGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM05TF U 1
AF RR4DN39TF U 1
BS 1 705 RR4DM05TF
BS 706 706 RR4DN39TF
BS 707 738 RR4DM05TF
BS 739 816 RR4DN39TF

RD RR4DM05TF 738 0 0
GGCAACCAACCGGCGAGAGCAAAAGAAAGTACTTACGAGAGATAGAGAGAGAGAGATGTC
GAAGACGCTGGTGCAGCCGGTAGGGCAGAAGAGGTTGACGAACGTCGCAGTGGTTCGATT
GAAGAAGCAAGGCAACCGCTTCGAGATCGCTTGCTACAAGAACAAGGTCCTTTCTTGGCG
TTCCGGCGTGGAGAAGGATATAGATGAAGTGTTGCAGTCGCATACTGTTTACACAAACGT
CTCCAAGGGAGTTCTTGCTAAATCTAAAGACTTGATAAAGGTCTTTGGATCCGATGATCA
CACCAAGATCTGTTTGGAGATTTTGGAGAAAGGTGAGCTTCAAGTTGCTGGCAAAGAGAG
AGAGTCGCAGCTGTCGAGCCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGTGATGCAGAAAACCAT
TAACCCTGAGACCCAGCGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCGTCTTATGCATGAGAT
CCATTTTGCTGTTGATCCTAATAGCAATTCCAAGAAGCAGGCTCTTGATGTCATCCGTGA
GCTGCAGAAGCACTTTCCTATAAAGCGTTCTCCAATGAGACTGCGTCTCACTGTTCCTGC
TCAGAACTTCTCCTCCCTTCTGGAGAAGCTTAAAGAATGGGACGCTTCTCTTGTCTCCAA
AGACGAATCTGGAACTCACATGTCCGCTGTCTGCGAGATGGAACC*GGGCTATACCGAGA
GATAGAGATACTCGCTGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4DN39TF 816 0 0
GGCAACCAACCGGCGAGAGCAAAAGAAAGTACTTACGAGAGATAGAGAGAGAGAGATGTC
GAAGACGCTGGTGCAGCCGGTAGGGCAGAAGAGGTTGACGAACGTCGCAGTGGTTCGATT
GAAGAAGCAAGGCAACCGCTTCGAGATCGCTTGCTACAAGAACAAGGTCCTTTCTTGGCG
TTCCGGCGTGGAGAAGGATATAGATGAAGTGTTGCAGTCGCATACTGTTTACACAAACGT
CTCCAAGGGAGTTCTTGCTAAATCTAAAGACTTGATAAAGGTCTTTGGATCCGATGATCA
CACCAAGATCTGTTTGGAGATTTTGGAGAAAGGTGAGCTTCAAGTTGCTGGCAAAGAGAG
AGAGTCGCAGCTGTCGAGCCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGTGATGCAGAAAACCAT
TAACCCTGAGACCCAGCGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCGTCTTATGCATGAGAT
CCATTTTGCTGTTGATCCTAATAGCAATTCCAAGAAGCAGGCTCTTGATGTCATCCGTGA
GCTGCAGAAGCACTTTCCTATAAAGCGTTCTCCAATGAGACTGCGTCTCACTGTTCCTGC
TCAGAACTTCTCCTCCCTTCTGGAGAAGCTTAAAGAATGGGACGCTTCTCTTGTCTCCAA
AGACGAATCTGGAACTCACATGTCCGCTGTCTGCGAGATGGAACCAGGGCTATACCGAGA
GATAGAGATACTCGCTGTATCGGTCATGCTGAAGCGACACGAGCATGGATCATTACGATG
AGCATGACGATATGGCATGCAGACAAACAAGCCGTG

QA 1 816 1 816
DS 



CO CL3371Contig2 356 2 3 U
AACCTCAGCAAAACATTCTTCAGCAGTAAAAGGAGGGAGTTTACGAGTCTTTTGCTTCAG
GTTGTGTTTGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTGTATTGCTTAACTTCTCCAACAAA
CGTGTTGCACGTACTGCACTTGATCCCTTTTCCTTCCTTTGTGTCGTCACTAGTAATACC
AATCTCTTGCTTCTGCATTTTTGCTCAGTTCGTCGGCCTCAGTCTCAAGGGGTAACAACG
GCTTGTTTGTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCGTAATGATCCATGCTCGTGTCGC
CTTCAGCATGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTCTCGGTATAGCCCCGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DN39JQ U 1
AF RR4DM05JQ U 9
BS 1 106 RR4DN39JQ
BS 107 107 RR4DM05JQ
BS 108 356 RR4DN39JQ

RD RR4DN39JQ 356 0 0
AACCTCAGCAAAACATTCTTCAGCAGTAAAAGGAGGGAGTTTACGAGTCTTTTGCTTCAG
GTTGTGTTTGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTGTATTGCTTAGCTTCTCCAACAAA
CGTGTTGCACGTACTGCACTTGATCCCTTTTCCTTCCTTTGTGTCGTCACTAGTAATACC
AATCTCTTGCTTCTGCATTTTTGCTCAGTTCGTCGGCCTCAGTCTCAAGGGGTAACAACG
GCTTGTTTGTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCGTAATGATCCATGCTCGTGTCGC
CTTCAGCATGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTCTCGGTATAGCCCCGGTTC

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR4DM05JQ 348 0 0
CAAAACATTCTTCAGCAGTAAAAGGAGGGAGTTTACGAGTCTTTTGCTTCAGGTTGTGTT
TGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTGTATTGCTTAACTTCTCCAACAAACGTGTTGC
ACGTACTGCACTTGATCCCTTTTCCTTCCTTTGTGTCGTCACTAGTAGTACCAATCTCTT
GCTTCTGCATTTTTGCTCAGTTCGTCGGCCTCAGTCTCAAGGGGTAACAACGGCTTGTTT
GTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCGTAATGATCCATGCTCGTGTCGCCTTCAGCA
TGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTCTCGGTATAGCCCCGGTTC

QA 1 348 1 348
DS 



AS 1 4

CO CL3372Contig1 1112 4 13 U
GGAAGCTCTTTCTGATCCCAATATCAGCACAAGGGATGGAGATGGATCTGATCCGGTGGT
GATTTGCGAGATTAAACAAAGTTTTCAGATATTGTGGTGATGGCTTGGTTCAGTGGGAAA
GTATCGCAGGGAGGATTCCCAGATCTCACTGGGGCAGTCAATAAATTCCAGGAGAGCGTT
AAGAACATCGAGAAGAATTTCGACAACGCCCTTGGCTTTGATGACAAGTCCGAATCATCT
GCCGGTGAAGCTTCAAGTATGTGGCCACCTGCAGTTGATACCAAAAGTCTATTTGATCCT
GCAATGTCCTTCATGGGTAACAACTCTGATGAGAAACTTGATACATTGGAAGACTCTGCT
AGTTCAGAAAATCCACCTCAAACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGGAGGATCT
GGTGAGGTGGACACTGAAAAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGCAAATAAAGAAACAAATGTG
ACAACAGAAGCTGAGGTGGCAGAGACTGTTGTTTTAGATCCCAAAGATGGTGAACCTGAA
TCTCAGATGGCTCTTGAAGATTCTTCAGGATACTCGGTTCAACATCCTGGTGACACGAGT
AGTTTAGAACCTGATGAGAAGCAGGAATCGCGAGAGTCACAGCCAGAGGCGCCCAAGTCC
GAAGAGGGTGGATCAGAGGCAGAGGAGGCTATGCCTGAGGAGGATGCTGGAACAAATGAA
GCTTCTGTGGGAAACAGTGATGCTGTTTTCGATGGACCGCGTGAGATTGCTGATACGGAT
GAGACTAAAAATGAAGAGGATAGCCAGATTGAAAATCTGGAGAAGAGAACATCGTCTGTG
AATGTTGAAGTCTCACCTGATACAGATAATCTTAACAGGATAGAGCCCTCTGATGCTCAA
CTGTCTTTAATTACTGAGTCGTCTGGCTCTCCTAATGAGTCTTCTGTGCTGAAGAGATCT
TCCTCAGATGAAATTTCGGAGAGAATTGTAGAGTTGGTTTCTCGTGAACTGGATTCAAGA
CTTGATGGTAGTGAAGTAGTTGAGAGCCAGCGTTCGAGCTCTGCAACAAATGCTTCCGAC
TCTGTTGATGTTGTTATGGAATTGGAGAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CQ49TF U 1
AF RR4AK14TF U 6
AF RR4CQ49JQ C 309
AF RR4AK14JQ C 364
BS 1 66 RR4CQ49TF
BS 67 67 RR4AK14TF
BS 68 127 RR4CQ49TF
BS 128 128 RR4AK14TF
BS 129 301 RR4CQ49TF
BS 302 302 RR4AK14TF
BS 303 675 RR4CQ49TF
BS 676 814 RR4AK14TF
BS 815 815 RR4CQ49JQ
BS 816 823 RR4AK14TF
BS 824 824 RR4CQ49JQ
BS 825 867 RR4AK14TF
BS 868 1112 RR4CQ49JQ

RD RR4CQ49TF 675 0 0
GGAAGCTCTTTCTGATCCCAATATCAGCACAAGGGATGGAGATGGATCTGATCCGGTGGT
GATTTGTGAGATTAAACAAAGTTTTCAGATATTGTGGTGATGGCTTGGTTCAGTGGGAAA
GTATCGCTGGGAGGATTCCCAGATCTCACTGGGGCAGTCAATAAATTCCAGGAGAGCGTT
AAGAACATCGAGAAGAATTTCGACAACGCCCTTGGCTTTGATGACAAGTCCGAATCATCT
GCCGGTGAAGCTTCAAGTATGTGGCCACCTGCAGTTGATACCAAAAGTCTATTTGATCCT
GTAATGTCCTTCATGGGTAACAACTCTGATGAGAAACTTGATACATTGGAAGACTCTGCT
AGTTCAGAAAATCCACCTCAAACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGGAGGATCT
GGTGAGGTGGACACTGAAAAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGCAAATAAAGAAACAAATGTG
ACAACAGAAGCTGAGGTGGCAGAGACTGTTGTTTTAGATCCCAAAGATGGTGAACCTGAA
TCTCAGATGGCTCTTGAAGATTCTTCAGGATACTCGGTTCAACATCCTGGTGACACGAGT
AGTTTAGAACCTGATGAGAAGCAGGAATCGCGAGAGTCACAGCCAGAGGCGCCCAAGTCC
GAAGAGGGTGGATCA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4AK14TF 862 0 0
GG
CTTTCTGATCCCAATATCAGCACAAGGGATGGAGATGGATCTGATCCGGTGGTGATTTGC
GAGATTAAACAAAGTTTTCAGATATTGTGGTGATGGCTTGGTTCAGTGGGAAAGTATCGC
AGGGAGGATTCCCAGATCTCACTGGGGCAGTCAATAAATTCCAGGAGAGCGTTAAGAACA
TCGAGAAGAATTTCGACAACGCCCTTGGCTTTGATGACAAGTCCGAATCATCTGCCGGTG
AAGCTTCAAGTATGTGGCCACCTGCAGTTGATACCAAAAGTCTATTTGATCCTGCAATGT
CCTTCATGGGTAACAACTCTGATGAGAAACTTGATACATTGGAAGACTCTGCTAGTTCAG
AAAATCCACCTCAAACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGGAGGATCTGGTGAGG
TGGACACTGAAAAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGCAAATAAAGAAACAAATGTGACAACAG
AAGCTGAGGTGGCAGAGACTGTTGTTTTAGATCCCAAAGATGGTGAACCTGAGTCTCAGA
TGGCTCTTGAAGATTCTTCAGGATACTCGGTTCAACATCCTGGTGACACGAGTAGTTTAG
AACCTGATGAGAAGCAGGAATCGCGAGAGTCACAGCCAGAGGCGCCCAAGTCCGAAGAGG
GTGGATCAGAGGCAGAGGAGGCTATGCCTGAGGAGGATGCTGGAACAAATGAAGCTTCTG
TGGGAAACAGTGATGCTGTTTTCGATGGACCGCGTGAGATTGCTGATACGGATGAGACTA
AAAATGAAGAGGATAGCCAGATTGAAA*TCTGGAGA*GAGAACATCGTCTGTGAATGTTG
AAGTCTCACCTGATACAGAT

QA 3 862 3 862
DS 

RD RR4CQ49JQ 804 0 0
CTTCATGGGTAACAACTCTGATGAGAAACTTGATACATTGGAAGACTCTGCTAGTTCAGA
AAATCCACCTCAAACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGGAGGATCTGGTGAGGT
GGACACTGAAAAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGCAAATAAAGAAACAAATGTGACAACAGA
AGCTGAGGTGGCAGAGACTGTTGTTTTAGATCCCAAAGATGGTGAACCTGAATCTCAGAT
GGCTCTTGAAGATTCTTCAGGATACTCGGTTCAACATCCTGGTGACACGAGTAGTTTAGA
ACCTGATGAGAAGCAGGAATCGCGAGAGTCACAGCCAGAGGCGCCCAAGTCCGAAGAGGG
TGGATCAGAGGCAGAGGAGGCTATGCCTGAGGAGGATGCTGGAACAAATGAAGCTTCTGT
GGGAAACAGTGATGCTGTTTTCGATGGACCGCGTGAGATTGCTGATACGGATGAGACTAA
AAATGAAGAGGATAGCCAGAGTGAAAATCTGGAGAAGAGAACATCGTCTGTGAATGTTGA
AGTCTCACCTGATACAGATAATCTTAACAGGATAGAGCCCTCTGATGCTCAACTGTCTTT
AATTACTGAGTCGTCTGGCTCTCCTAATGAGTCTTCTGTGCTGAAGAGATCTTCCTCAGA
TGAAATTTCGGAGAGAATTGTAGAGTTGGTTTCTCGTGAACTGGATTCAAGACTTGATGG
TAGTGAAGTAGTTGAGAGCCAGCGTTCGAGCTCTGCAACAAATGCTTCCGACTCTGTTGA
TGTTGTTATGGAATTGGAGAAGAC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AK14JQ 749 0 0
TCAGAAAATCCACCTCAAACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGGAGGATCTGGT
GAGGTGGACACTGAAAAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGCAAATAAAGAAACAAATGTGACA
ACAGAAGCTGAGGTGGCAGAGACTGTTGTTTTAGATCCCAAAGATGGTGAACCTGAGTTT
CAGATGGCTCTTGAAGATTCTTCAGGATACTCGGTTCAACATCCTGGTGACACGAGTAGT
TTAGAACCTGATGAGAAGCAGGAATCGCGAGAGTCACAGCCAGAGGCGCCCAAGTCCGAA
GAGGGTGGATCAGAGGCAGAGGAGGCTATGCCTGAGGAGGATGCTGGAACAAATGAAGCT
TCTGTGGGAAACAGTGATGCTGTTTTCGATGGACCGCGTGAGATTGCTGATACGGATGAG
ACTAAAAATGAAGAGGATAGCCAGATTGAAAATCTGGAGAAGAGAACATCGTCTGTGAAT
GTTGAAGTCTCACCTGATACAGATAATCTTAACAGGATAGAGCCCTCTGATGCTCAACTG
TCTTTAATTACTGAGTCGTCTGGCTCTCCTAATGAGTCTTCTGTGCTGAAGAGATCTTCC
TCAGATGAAATTTCGGAGAGAATTGTAGAGTTGGTTTCTCGTGAACTGGATTCAAGACTT
GATGGTAGTGAAGTAGTTGAGAGCCAGCGTTCGAGCTCTGCAACAAATGCTTCTGACTCT
GTTGATGTTGTTATGGAATTGGAGAAGAC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 2 4

CO CL3373Contig1 146 2 1 U
GGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTCTTTTCTGTTGTGTTTTTTTCTTTTGTTCCCG
TTCTTCTCTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGACAATAATGATAA
TGATTAATCTTAGTTATTAATGCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C862TF U 1
AF RR4CX58TF U 1
BS 1 146 RR4C862TF

RD RR4C862TF 146 0 0
GGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTCTTTTCTGTTGTGTTTTTTTCTTTTGTTCCCG
TTCTTCTCTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGACAATAATGATAA
TGATTAATCTTAGTTATTAATGCTCT

QA 1 146 1 146
DS 

RD RR4CX58TF 146 0 0
GGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTCTTTTCTGTTGTGTTTTTTTCTTTTGTTCCCG
TTCTTCTCTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGACAATAATGATAA
TGATTAATCTTAGTTATTAATGCTCT

QA 1 146 1 146
DS 



CO CL3373Contig2 735 2 2 U
GGACACCAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCCCCCAAACACCAAAAGAAAAAAAATGGTT
AACCCTAAAGTTTTCTTCGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATG
GAGCTTTACGCCGACACAACCCCCGAAACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGC
GAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGC
GTGATCCCGAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGGGACCGGGGGAGAGT
CGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCA
TCCTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTT
AGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCACGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTCGAAGGGATGG
ATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAGAAGGTTG
TGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTAAGAGAAAAGTGAGAGAGAGAGAGGAG
GTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTCTTTTCTGTTGTGTTTTTTTCTTTTGTTCCCGTTCT
TCTCTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGATACCATTGAATAATAATGATAATGA
TTAATCTTAGTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4GH19JQ C 1
AF RR4GH19TF U 1
BS 1 733 RR4GH19TF
BS 734 735 RR4GH19JQ

RD RR4GH19JQ 735 0 0
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TTAATCTTAGTTACT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GH19TF 733 0 0
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GAGCTTTACGCCGACACAACCCCCGAAACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGC
GAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGC
GTGATCCCGAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGGGACCGGGGGAGAGT
CGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCA
TCCTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTT
AGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCACGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTCGAAGGGATGG
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TCTCTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGATACCATTGAATAATAATGATAATGA
TTAATCTTAGTTA

QA 1 733 1 733
DS 



AS 2 4

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CCTCTGTCCACGGAACTCCTCGTTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4D957JQ U 86
AF RR4BF92JQ U 1
BS 1 97 RR4BF92JQ
BS 98 98 RR4D957JQ
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CCTCTGTCCACGGAACTCCTCGTTTCCTC

QA 1 809 1 809
DS 



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TCATGAGCCTTCTTCCTCAGCACTCAGCATTCAACA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BF92TF U 1
AF RR4D957TF U 4
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BS 144 144 RR4D957TF
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BS 592 592 RR4D957TF
BS 593 778 RR4BF92TF
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RD RR4BF92TF 793 0 0
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ATCTCAATGAGCCTT

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DS 

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GG
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GAGGAAGAGTGTGAGTTTGAACAACTTGTCAGAGTACGAGCAGACGGAGGAGATCCCAAA
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TGTTCCGATAACTTCTAGCCGCGAGAGGAAACGAGGAGTTCCGTGGACAGAGGAAGAGCA
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AGCCTTCTTCCTCAGCACTCAGCATTCAACA

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 4

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GATTCACCTGCTGCTTCTCAACCTGTTCCTATTGGAGCTTTGGCTACATCACTCGCTAAT
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GAAACAAAGAGTGGTTCTTGAAAGTTTTGGATTTCATGTTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BB77TF U 1
AF RR4BE42TF U 1
AF RR4BE42JQ C 301
AF RR4BB77JQ C 339
BS 1 671 RR4BB77TF
BS 672 847 RR4BE42TF
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BS 862 862 RR4BE42JQ
BS 863 877 RR4BE42TF
BS 878 1182 RR4BE42JQ

RD RR4BB77TF 671 0 0
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GGTAGAAGAGGAGGAGCTCTTCCACAACCACAACAACCTTCTCCTATGATGCAGCCACAG
CAGATGCATCC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4BE42TF 881 0 0
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GAGGCTGCAGACAAGTCTCAGGGGTCCAACTTGTATGTTAAGAACTTGGATGAGTCTGTC
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GTCGCTCTTGCACAGAGGAAAGAAGGCCGCAAAGCTAGGTTACAGGCTCAATTTTCACAG
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GATTCACCTGCTGCTTCTCAACCTGTTCCTATTGGAGCTTTGGCTACATCACTCGCTAAT
GCAGCTCGGGAGCATCAGAGA*CGATGCTTGGTGAGA
TCTG

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR4BE42JQ 882 0 0
GTCGCTCTTGCACAGAGGAAAGAAGGCCGCAAAGCTAGGTTACAGGCTCAATTTTCACAG
ATGAGGCCAGTAC*TGCGGTTGGCCCAAGGATGCCAATGTATCCACCAGGTGGTCCACCA
ATGGGTCAACAACTCTTCTATGGCCGAGGACCTCCTGCTATGATTCCTCCTCAGCCTGGA
TACGGGTATCAACAACAGCTTGTGCCGGGCATGAGACCTGGTGTGGCACCAATGCCAAAC
TTCTTCATGCCTATGATGCAACAAGGCCAGCAACAACAGCAGCAGCAACGACCTGGTGGT
GGTAGAAGAGGAGGAGCTCTTCCACAACCACAACAACCTTCTCCTATGATGCAGCCACAG
CAGATGCATCCAAGGGGTAGAATGTATAGGTATCCACAGAGAGATGTAAACCCAATGCCT
GGTCTTACTCCAAACATGCTTTCTGTCCCATATGACGTGTCTGGTGGTGCTCATCTTCGT
GATTCACCTGCTGCTTCTCAACCTGTTCCTATTGGAGCTTTGGCTACATCACTCGCTAAT
GCAGCTCCGGAGCATCAGAGAACGATGCTTGGTGAGAATCTGTACCCACTTGTGGAGCAG
CTTGAGCCAGAATCAGCAGCTAAAGTCACGGGAATGCTTCTTGAAATGGACCAAACCGAA
GTACTTCACTTGCTGGAATCTCCTGATGCACTCAAAGCTAAAGTTGCAGAGGCAATGGAT
GTTTTGAGGAGTGTAGCTCAGCAGCAGCAAGCTGGTGGTGCAGCTGATCAGTTAGCTTCC
CTGTCTCTTGGAGACAACTAAGTATTTTGTTAGTCTTTATTTTGGCCTTGTGGAGAATCA
GAAACAAAGAGTGGTTCTTGAAAGTTTTGGATTTCATGTTCG

QA 1 882 1 882
DS 

RD RR4BB77JQ 844 0 0
GTTACAGGCTCAATTTTCACAGATGAGGCCAGTAC*TGCGGTTGGCCCAAGGATGCCAAT
GTATCCACCAGGTGGTCCACCAATGGGTCAACAACTCTTCTATGGCCGAGGACCTCCTGC
TATGATTCCTCCTCAGCCTGGATACGGGTATCAACAACAGCTTGTGCCGGGCATGAGACC
TGGTGTGGCACCAATGCCAAACTTCTTCATGCCTATGATGCAACAAGGCCAGCAACAACA
GCAGCAGCAACGACCTGGTGGTGGTAGAAGAGGAGGAGCTCTTCCACAACCACAACAACC
TTCTCCTATGATGCAGCCACAGCAGATGCATCCAAGGGGTAGAATGTATAGGTATCCACA
GAGAGATGTAAACCCAATGCCTGGTCTTACTCCAAACATGCTTTCTGTCCCATATGACGT
GTCTGGTGGTGCTCATCTTCGTGATTCACCTGCTGCTTCTCAACCTGTTCCTATTGGAGC
TTTGGCTACATCACTCGCTAATGCAGCTCCGGAGCATCAGAGAACGATGCTTGGTGAGAA
TCTGTACCCACTTGTGGAGCAGCTTGAGCCAGAATCAGCAGCTAAAGTCACGGGAATGCT
TCTTGAAATGGACCAAACCGAAGTACTTCACTTGCTGGAATCTCCTGATGCACTCAAAGC
TAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGTTTTGAGGAGTGTAGCTCAGCAGCAGCAAGCTGGTGG
TGCAGCTGATCAGTTAGCTTCCCTGTCTCTTGGAGACAACTAAGTATTTTGTTAGTCTTT
ATTTTGGCCTTGTGGAGAATCAGAAACAAAGAGTGGTTCTTGAAAGTTTTGGATTTCATG
TTCG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 3

CO CL3376Contig1 1081 3 7 U
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AAAATTTGTCTCCATTTGAGTATTTACAATGTTCTATTAGAATCTTAAACAGTAATACAA
AAGTAAGAAGAATCTGGCAACTTCGAGAGCCCTTTGTTCAAGGACAAAATTCTCAGCAAG
TTAAGCAACTCCAAAGGTGCTAAAACACCACACAGAACAAACCTGCGACTTATTGTTGGA
TCTTCCTGAACTCTGTGAGGACCGGGTATATATTCTCAAAGGCTTTGTAAGTCTCCTCTC
TCATCTTGGCTCCAGTGATGACCATCTTGCCAGATACAAAAATCAGTAGCACAATTTTAG
GCACTTTCATCCTGTAGATCAGCCCTGGAAACAACTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCGG
CGTGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGTCTGATAGGGAACTTGACATCACAAGAACCTACTA
TATTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTTTGCAGGAAACCCAAGCTTTTGGACAATCCGAG
CATACTTTCTTGCAGCCATCTTCGAAAAGTATTCACTCTTGGCTCCAGTACAAACCATTT
TACCAGAGGCAAAAATTAATGCAGTGGTCTTTGGTTCTCTAATCCGCATGATCACAGCAG
CAAAACGCTTGGGATTGTATTCAGCATTACGAGCTTGGAGAGCTATGGCTTTGAGATCTA
GCATACAGTCCAAGTTCACCGTTGAGACAATGTTTTGTAGAGTGGGAACAATCCCAGAAG
GATGCTCGACTAGGTCTACTGGATTACTCCCTTCCAATCCTTGATCTGTCATTTGCCTTT
TAGAGATTCGGACACGAAATCTAGGGTTTCGTGCAGATGAGATTTTGCAGAGATGGTGTG
AGGCTTTTATATACAGATCTGAGAGGATTGGGGGAGGGAAAAAGATTTGTAAAATGGGTT
GTTTATATATAAAGGAAGGAAGGGAGAGTGATTTGGCTCTCTTTTCGTTTCTCTCTTATG
TATGTATGAACGAGGGAGGGGAAGTCTTTTTAGATCTGTGAGGAAAGAGGCTATCGGTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4H116JQ U 1
AF RR4C245JQ U 63
AF RR4C245TF C 505
BS 1 508 RR4H116JQ
BS 509 509 RR4C245JQ
BS 510 722 RR4H116JQ
BS 723 723 RR4C245JQ
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BS 746 768 RR4C245JQ
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RD RR4H116JQ 745 0 0
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AAAATTTGTCTCCATTTGAGTATTTACAATGTTCTATTAGAATCTTAAACAGTAATACAA
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TTAAGCAACTCCAAAGGTGCTAAAACACCACACAGAACAAACCTGCGACTTATTGTTGGA
TCTTCCTGAACTCTGTGAGGACCGGGTATATATTCTCAAAGGCTTTGTAAGTCTCCTCTC
TCATCTTGGCTCCAGTGATGACCATCTTGCCAGATACAAAAATCAGTAGCACAATTTTAG
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CGTGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGTCTGATAGGGAACTTGACATCACAAGAACCTACTA
TATTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTTCGCAGGAAACCCAAGCTTTTGGACAATCCGAG
CATACTTTCTTGCAGCCATCTTCGAAAAGTATTCACTCTTGGCTCCAGTACAAACCATTT
TACCAGAGGCAAAAATTAATGCAGTGGTCTTTGGTTCTCTAATCCGCATGATCACAGCAG
CAAAACGCTTGGGATTGTATTCAGCATTACGAGCTTGGAGAGCTATGGCTTTGAGATCTA
GCTTACAGTCCAAGTTCACCGTTGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4C245JQ 715 0 0
AATTTGTCTCCATTTGAGTATTTACAATGTTCTATTAGAATCTTAAACAGTAATACAAAA
GTAAGAAGAATCTGGCAACTTCGAGAGCCCTTTGTTCAAGGACAAAATTCTCAGCAAGTT
AAGCAACTCCAAAGGTGCTAAAACACCACACAGAACAAACCTGCGACTTATTGTTGGATC
TTCCTGAACTCTGTGAGGACCGGGTATATATTCTCAAAGGCTTTGTAAGTCTCCTCTCTC
ATCTTGGCTCCAGTGATGACTATCTTGCCAGATACAAAAATCAGTAGCACAATTTTAGGC
ACTTTCATCCTGTAGATCAGCCCTGGAAACAACTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCGGCG
TGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGTCTGATAGGGAACTTGACATCACAAGAACCTACTATA
TTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTTTGCAGGAAACCCAAGCTTTTGGACAATCCGAGCA
TACTTTCTTGCAGCCATCTTCGAAAAGTATTCACTCTTGGCTCCAGTACAAACCATTTTA
CCAGAGGCAAAAATTAATGCAGTGGTCTTTGGTTCTCTAATCCGCATGATCACAGCAGCA
AAACGCTTGGGATTGTATTCAGCATTACGAGCTTGGAGAGCTATGGCTTTGAGATCTAGC
ATACAGTCCAAGTTCACCGTTGAGACAATGTTTTGTAGAGTGGGAA
CAATCCCAG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4C245TF 577 0 0
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AAAAGTATTCACTCTTGGCTCCAGTACAAACCATTTTACCAGAGGCAAAAATTAATGCAG
TGGTCTTTGGTTCTCTAATCCGCATGATCACAGCAGCAAAACGCTTGGGATTGTATTCAG
CATTACGAGCTTGGAGAGCTATGGCTTTGAGATCTAGCATACAGTCCAAGTTCACCGTTG
AGACAATGTTTTGTAGAGTGGGAACAATCCCAGAAGGATGCTCGACTAGGTCTACTGGAT
TACTCCCTTCCAATCCTTGATCTGTCATTTGCCTTTTAGAGATTCGGACACGAAATCTAG
GGTTTCGTGCAGATGAGATTTTGCAGAGATGGTGTGAGGCTTTTATATACAGATCTGAGA
GGATTGGGGGAGGGAAAAAGATTTGTAAAATGGGTTGTTTATATATAAAGGAAGGAAGGG
AGAGTGATTTGGCTCTCTTTTCGTTTCTCTCTTATGTATGTATGAACGAGGGAGGGGAAG
TCTTTTTAGATCTGTGAGGAAAGAGGCTATCGGTTCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 2 4

CO CL3377Contig1 814 2 9 U
GTAAAATCTAGACTCTAACCCGGAAGCCCCGTCTTTGTTACAAGCAACCAAAGTCTATAT
AAACATAGTAAAACCATATGTTTATTTTATTCAAAAGTACTTTTTTTTCTTTCTTTTTTT
TTATTCAAAAGTACTTTTATTTCCACTTCACTTATTAGGATAACAAACAACCACAAGATG
TTAACAGCTTGCAGTACTTGTTGAACCAGACAGCAATGTTGAGAAAGCTTTCATAATCCG
TCTGCGGTCTGTCTAGAGAATGATTGTCATTAGGAAAGACTAAAACTTTAACCTCGGCTC
CTTTCTCCTTTAACGCCCTAACGTATTGAAATCCATTTGAAATAGGAACACGGAGATCCA
TAGTTCCCAAAAGAAACAGAGTGGGTGTTTTCACCTTTGAGATGTGTGATATAGGAGAGA
TCTGATGAAACAAAGACATGTCTTCAGGTGAGGGGGCTTCTGTGTAGTGAGTCTGTTCAA
CATAAGCTTCAAAGAAACACCAATCAGGTATATCCGTAATCCCAACCATTGATGCAATGT
TGCATACAGGATTCCTTGCAGCTGCTGCCACAAACTTATCCGGCGCCTGGCCAATCAAGT
GTGTTGTCAGAAACCCACCATGAGAACCACCTAGGACGGTTATTCTAGACGGGTCTGCAA
GTCCCATTTCAACGGCATGATCTACAGCTGAGAGCACATCGTTCACGTCCTGTGATCCAA
TTTTTCCAGGTATAGACTGCAAAGCATCTTCCCCAAATCCCAATGAACCCCTGTATTTAC
ATCAGCAGACTGTATCCAATTGAGAGAGATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU34JQ U 126
AF RR4BM40JQ U 1
BS 1 182 RR4BM40JQ
BS 183 183 RR4EU34JQ
BS 184 283 RR4BM40JQ
BS 284 284 RR4EU34JQ
BS 285 479 RR4BM40JQ
BS 480 480 RR4EU34JQ
BS 481 505 RR4BM40JQ
BS 506 506 RR4EU34JQ
BS 507 814 RR4BM40JQ

RD RR4EU34JQ 568 0 0
CAAAAGTACTTTTATTTCCACTTCACTTATTAGGATAACAAACAATCACAAGATGTTAAC
AGCTTGCAGTACTTGTTGAACCAGACAGCAATGTTGAGAAAGCTTTCATAATCCGTCTGC
GGTCTGTCTAGAGAATGATTGTCATTAGGAAAGACTAAAACTTTAACCTCGGCTCCTTTC
TCCTTTAACGCCCTAACGTATTGAAATCCATTTGAAATAGGAACACGGAGATCCATAGTT
CCCAAAAGAAACAGAGTGGGTGTTTTCACCTTTGAGATGTGTGATATAGGAGAGATCTGA
TGAAACAAAGACATGTCTTCAGGTGAGGGGGCTTCTGTGTAGTGAGTCTGTTCAACATAA
GCTTCAAAGAAACACCAATCAGGTATATCCGTAATCCCAACCATTGATGCAATGTTGCAT
ACAGGATTCCTTGCAGCTGCTGCCACAAACTTATCCGGCGCCTGGCCAATCAAGTGTGTT
GTCAGAAACCCACCATGAGAACCACCTAG*ACGGTTATTCTAGACGGGTCTGCAAGTCCC
ATTTCAACGGCATGATCTACAGCTGAGA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4BM40JQ 814 0 0
GTAAAATCTAGACTCTAACCCGGAAGCCCCGTCTTTGTTACAAGCAACCAAAGTCTATAT
AAACATAGTAAAACCATATGTTTATTTTATTCAAAAGTACTTTTTTTTCTTTCTTTTTTT
TTATTCAAAAGTACTTTTATTTCCACTTCACTTATTAGGATAACAAACAACCACAAGATG
TTCACAGCTTGCAGTACTTGTTGAACCAGACAGCAATGTTGAGAAAGCTTTCATAATCCG
TCTGCGGTCTGTCTAGAGAATGATTGTCATTAGGAAAGACTAAGACTTTAACCTCGGCTC
CTTTCTCCTTTAACGCCCTAACGTATTGAAATCCATTTGAAATAGGAACACGGAGATCCA
TAGTTCCCAAAAGAAACAGAGTGGGTGTTTTCACCTTTGAGATGTGTGATATAGGAGAGA
TCTGATGAAACAAAGACATGTCTTCAGGTGAGGGGGCTTCTGTGTAGTGAGTCTGTTCAC
CATAAGCTTCAAAGAAACACCAATCGGGTATATCCGTAATCCCAACCATTGATGCAATGT
TGCATACAGGATTCCTTGCAGCTGCTGCCACAAACTTATCCGGCGCCTGGCCAATCAAGT
GTGTTGTCAGAAACCCACCATGAGAACCACCTAGGACGGTTATTCTAGACGGGTCTGCAA
GTCCCATTTCAACGGCATGATCTACAGCTGAGAGCACATCGTTCACGTCCTGTGATCCAA
TTTTTCCAGGTATAGACTGCAAAGCATCTTCCCCAAATCCCAATGAACCCCTGTATTTAC
ATCAGCAGACTGTATCCAATTGAGAGAGATATGC

QA 1 814 1 814
DS 



CO CL3377Contig2 669 2 4 U
CTGCAAGTCCCATTTCAACGGCATGATCTACAGCTGAGAGCACATCGTTCACGTCCTGTG
ATCCAATTTTTCCAGGTATAGACTGCAAAGCATCTTCCCCAAATCCCAATGAACCCCTGT
AATTTACAATCAGCAGACTGTATCCAATTGAGGAGAGATATGCCAACTGCTTGGAGAAGC
TGCTTGGTGCAACTGTATGAGGGCCTCCATGGAGGACAACAACTAACGGATCGCATTTCC
CATTAACCTTGGTCTTTGAAGACGATACATATATAGCTTCAAACGGTCTTTTGGCCCCTT
CGGTGAGACATTCAGATACATTACTGACTGGAACGTTTAGAATTTTAAACTGAAGAGATG
AAAGCCCTGAGGTCACCTTCTCAGAGCATTTAAAAATTGGTTTTTGGATACTTGACCAAT
GCCACGAAGGCTTTCCAGATGGATCAAGAACTTTCTTTCCGTACTTGATTTCAGGAACAC
TCACTGGACTGCTAGACACAGCAACAACATTATCACCATCTAGTGCAAGAACGCTCCATG
AAAAATCTGAATCATTAGGGCTGACGCGTGATACTTCACCACTTATCAAATTTAAGCTGA
GTATTACTCTACAACTGCGCCAGTAGGAAGACAACATAAGAGTTTGTCCTTCTGACAGCC
ACGGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU34TF C 1
AF RR4D481JQ U 406
BS 1 405 RR4EU34TF
BS 406 517 RR4D481JQ
BS 518 518 RR4EU34TF
BS 519 669 RR4D481JQ

RD RR4EU34TF 580 0 0
CTGCAAGTCCCATTTCAACGGCATGATCTACAGCTGAGAGCACATCGTTCACGTCCTGTG
ATCCAATTTTTCCAGGTATAGACTGCAAAGCATCTTCCCCAAATCCCAATGAACCCCTGT
AATTTACAATCAGCAGACTGTATCCAATTGAGGAGAGATATGCCAACTGCTTGGAGAAGC
TGCTTGGTGCAACTGTATGAGGGCCTCCATGGAGGACAACAACTAACGGATCGCATTTCC
CATTAACCTTGGTCTTTGAAGACGATACATATATAGCTTCAAACGGTCTTTTGGCCCCTT
CGGTGAGACATTCAGATACATTACTGACTGGAACGTTTAGAATTTTAAACTGAAGAGATG
AAAGCCCTGAGGTCACCTTCTCAGAGCATTTAAAAATTGGTTTTTGGATACTTGACCAAT
GCCACGAAGGCTTTCCAGATGGATCAAGAACTTTCTTTCCGTACTTGATTTCAGGAACAC
TCACTGGACTGCTAGACACAGCAACAACATTATCACCATCTAGTGCAAGAACGCTCCATG
AAAAATCTGAATCATTAGGGCTGACGCGTGATACTTCACC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4D481JQ 264 0 0
GGATACTTGACCAATGCCACGAAGGCTTTCCAGATGGATCAAGAACTTTCTTTCCGTACT
TGATTTCAGGAACACTCACTGGACTGCTAGACACAGCAACAACATTATCACCGTCTAGTG
CAAGAACGCTCCATGAAAAATCTGAATCATTAGGGCTGACGCGTGATACTTCACCACTTA
TCAAATTTAAGCTGAGTATTACTCTACAACTGCGCCAGTAGGAAGACAACATAAGAGTTT
GTCCTTCTGACAGCCACGGATCAC

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 4

CO CL3378Contig1 515 4 8 U
GGAGTGTCGTGACTTTCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAAG
AGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTCTTCAA
GAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCGTAACGGGCGTCCTCAT
CACCAAACTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACA
ACACAGGCGGTGATTGACTGATGAGAAATCTATTTCGAAGAGTGCTTCTGGCTTTCAAAC
TTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGAATCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTC
CTTTCAATTTTTTTTTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCGAGTTTGAAATGGATTG
ATTCCAATCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTCTCTGTTTGTTATGTT
GAATCGAATGTAGATGGCATACCATCATTACTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF42TF U 1
AF RR4DF42JQ C 227
AF RR4C880TF U 18
AF RR4C880JQ C 20
BS 1 111 RR4DF42TF
BS 112 113 RR4C880TF
BS 114 168 RR4DF42TF
BS 169 169 RR4C880TF
BS 170 405 RR4DF42TF
BS 406 406 RR4C880TF
BS 407 509 RR4DF42TF
BS 510 515 RR4C880JQ

RD RR4DF42TF 515 0 0
GGAGTGTCGTGACTTTCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAAG
AGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGT**TCTTCAA
GAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCGTAACAGGCGTCCTCAT
CACCAAACTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACA
ACACAGGCGGTGATTGACTGATGAGAAATCTATTTCGAAGAGTGCTTCTGGCTTTCAAAC
TTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGAATCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTC
CTTTCAATTTTTTTTTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCGATTTTGAAATGGATTG
ATTCCAATCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTCTCTGTTTGTTATGTT
GAATCGAATGTAGATGGCATACCATCATT
ACTGAC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4DF42JQ 283 0 0
AAGTTCGTCCA*CAACACAGGCGGTGATTGA*TGATGAGAAATCTATTTCGAAGAGTGCT
TCTGGCTTTCAAACTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGAATCCTACATACTTGTTTTG
TGATCTCTCGTTTCCTTTCAATTTTTTTTTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCGAT
TTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTCT
CTGTTTGTTATGTTGAATCGAATGTAGATGGCATACCATCATT

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4C880TF 498 0 0
GA
TCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGA
AGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACT
TGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCGTAACGGGCGTCCTCATCACCAAACTCACCGCTGGA
TTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATTGACT
GATGTGAAATCTATTTCGAAGAGTGTTTCTGGCTTTCAAACTTATTCTAATAAACATAAA
AAGAGAGAATCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCAATTTTTTTT*GTC
TTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCGAGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTTCCCCC
ATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTCTCTGTTTGTTATGTTGAATCGAATGTAGATGGCA
TACCATCATT
ACTGGC

QA 3 492 3 492
DS 

RD RR4C880JQ 496 0 0
TCGTTTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGA
AGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTTTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACT
TGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCGTAACGGGCGTCCTCATCACCAAACTCACCGCTGGA
TTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATTGACT
GATGTGAAATCTATTTCGAAGAGTGTTTCTGGCTTTCAAACTTATTTTAATAAACATAAA
AAGAGAGAATCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCAATTTTTTTT*GTC
TTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCGAGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTTCCCCC
ATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTCTCTGTTTGTTATGTTGAATCGAATGTAGATGGCA
TACCATCATTACTGGC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 2 4

CO CL3379Contig1 767 2 2 U
GGGGGAAGATCGAAGGGGAGCTCGCCGGGATCTGCGAGGGGATACTCAAGCTGCTGGATT
CGAGGTTGGTCCCTGCAGCTGGGTCAGGGGATTCGAAGGTGTTTTATTTGAAGATGAAGG
GGGATTATCATAGGTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGGGCAGGAGAGGAAAGATGCTGCTG
AGAATACTCTCTCCGCTTACAAATCTGCTCAGGATATTGCGAATGCAGAGCTCGCCCCAA
CTCACCCGATCCGTCTAGGTCTGGCACTGAACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCTTAA
ACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCTAACGGGCCTTTGGTGACGCGATTGCGGAGTT
GGACACACTGGGGGAAGAGTCATACAAAGACAGCACCTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGA
CAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGATACTGCGGATGAGGAGATCAAGGA
AGAGTCAGCTCCAAAGCCAGCTGATGAATAGCAGTGATAAAAAAATCCTTTTGACTGAAC
TGCTAGTTTCTAGGGGTTTGGATCTTTTATTCAATTCATCGTATCCCCTAGCATGTTGAA
CCATCATCAGTCATCATTTTTATCTCTTTGTCTGATTTTCTCTCTTTTTTTTTGTTGTTG
TTCTGTCTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTCTGGGATATGTCTATTTCAATGTCTGCTATC
AACCTTGCTTTGTGTGTTTCTAATCAAACTTGAAAGGCTCTGTCCTT


BQ
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AF RR4BJ85TF U 1
AF RR4BJ85JQ C 1
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BS 720 767 RR4BJ85JQ

RD RR4BJ85TF 719 0 0
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QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BJ85JQ 767 0 0
GGGGGAAGATCGAAGGGGAGCTCGCCGGGATCTGCGAGGGGATACTCAAGCTGCTGGATT
CGAGGTTGGTCCCTGCAGCTGGGTCAGGGGATTCGAAGGTGTTTTATTTGAAGATGAAGG
GGGATTATCATAGGTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGGGCAGGAGAGGAAAGATGCTGCTG
AGAATACTCTCTCCGCTTACAAATCTGCTCAGGATATTGCGAATGCAGAGCTCGCCCCAA
CTCACCCGATCCGTCTAGGTCTGGCACTGAACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCTTAA
ACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCTAACGGGCCTTTGGTGACGCGATTGCGGAGTT
GGACACACTGGGGGAAGAGTCATACAAAGACAGCACCTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGA
CAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGATACTGCGGATGAGGAGATCAAGGA
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TGCTAGTTTCTAGGGGTTTGGATCTTTTATTCAATTCATCGTATCCCCTAGCATGTTGAA
CCATCATCAGTCATCATTTTTATCTCTTTGTCTGATTTTCTCTCTTTTTTTTTGTTGTTG
TTCTGTCTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTCTGGGATATGTCTATTTCAATGTCTGCTATC
AACCTTGCTTTGTGTGTTTCTAATCAAACTTGAAAGGCTCTGTCCTT

QA 1 767 1 767
DS 



CO CL3379Contig2 686 2 2 U
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AACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTGAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCT
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CGGGATGATACTGCGGATGAGGAGATCAAGGAAGAGTCAGCTCCAAAGCCAGCTGATGAA
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TCAATTCATCGTATCCCCTAGCAAAGTTGAACCATCATCAGTCATCATCTTTTTTTATCA
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TTGAAAGGCTCTGTCCTTATCTTGTT


BQ
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AF RR4GK05TF U 1
AF RR4GK05JQ C 7
BS 1 558 RR4GK05TF
BS 559 686 RR4GK05JQ

RD RR4GK05TF 558 0 0
GATTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTGAGTTT
AAGACTGGGCAGGAGAGGAAAGATGCGGCTGAGAATACGCTCTCTGCTTACAAATCTGCT
CAGGATATTGCGAATGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTAGGTCTGGCACTG
AACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTGAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCT
AAACAGGCCTTTGATGACGCTATTGCGGAGTTGGACACACTAGGGGAAGAGTCATACAAA
GACAGCACCTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATG
CGGGATGATACTGCGGATGAGGAGATCAAGGAAGAGTCAGCTCCAAAGCCAGCTGATGAA
TAGCAGTAATAAAAATCCTTTTGACTGAACTGCTAGTTTCTAGGGGTTTGGATCTTTTAT
TCAATTCATCGTATCCCCTAGCAAAGTTGAACCATCATCAGTCATCATCTTTTTTTATCA
CTTTGTCTGATTTTCTCT

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DS 

RD RR4GK05JQ 680 0 0
AAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTGAGTTTAAGACT
GGGCAGGAGAGGAAAGATGCGGCTGAGAATACGCTCTCTGCTTACAAATCTGCTCAGGAT
ATTGCGAATGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTAGGTCTGGCACTGAACTTC
TCTGTGTTCTACTACGAGATCCTGAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCTAAACAG
GCCTTTGATGACGCTATTGCGGAGTTGGACACACTAGGGGAAGAGTCATACAAAGACAGC
ACCTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCGGGAT
GATACTGCGGATGAGGAGATCAAGGAAGAGTCAGCTCCAAAGCCAGCTGATGAATAGCAG
TAATAAAAATCCTTTTGACTGAACTGCTAGTTTCTAGGGGTTTGGATCTTTTATTCAATT
CATCGTATCCCCTAGCAAAGTTGAACCATCATCAGTCATCATCTTTTTTTATCACTTTGT
CTGATTTTCTCTCTTTTTTTTTTGTTGTTCTGTCTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTCTGGGA
TATGTCTATTTTAATGTCTGCTATCAACCTTGCTTTGTGTGTTTCTAATCAAATTTGAAA
GGCTCTGTCCTTATCTTGTT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL3380Contig1 919 4 5 U
GGAACAGAATTTCAGTATTTCGAGAGTAATCGGAAAACATGGCGGTTGGTCTAAGAGAGT
TCGCGCGCAGAACCGGAAACGGCTCCGGAACACCACCGGTGCTAGACGAATCAAACGGTG
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CTCCAGGAACGCTCTACATCACTTCCAGGAAATTGATTTGGCTGAGTGATGTAGACATGG
CGAAAGGCTACGCCGTCGATTTCTTATCGATATCGCTACACGCAGTGTCTAGAGATCCAG
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AAGATGAGGATGATGCATAATCTACTGGAGTTTTGGACTTGTCTAAGATCAGAGAGATGA
GGCTTGTTCCTTCTGACTCTGCCCAGTTGGATACTCTGTTTGATATGTTCTGTGAATGTG
CTGAGCCCAATCCAGAACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTGAACATAACTGGG
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TCTTATGTTAAGACAATGGCGTCTCTGTGTTCTTCAGAGTCCATGTGCTTTGTTAAATAT
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TGACGGACCAGAACATAAC


BQ
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30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE22TF U 1
AF RR4EE22JQ C 431
AF RR4AY37TF U 96
AF RR4AY37JQ C 183
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BS 379 644 RR4EE22TF
BS 645 853 RR4AY37TF
BS 854 919 RR4AY37JQ

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TCGCGCGCAGAACCGGAAACGGCTCCGGAACACCACCGGTGCTAGACGAATCAAACGGTG
AGGAACTCATGCACGTGCAGCCCTCCGTCGCCGTCGCTCTCGGCAATCGATCCCTCGAGT
CTCCAGGAACGCTCTACATCACTTCCAGGAAATTGATTTGGCTGAGTGATGTAGACATGG
CGAAAGGCTACGCCGTCGATTTCTTATCGATATCGCTACACGCAGTGTCTAGAGATCCAG
AGGCTTATTCATCTCCTTGTATATATACTCAGATTGAAGTTGAAGAAGATGAGGATGAAG
AAGATGAGGATGATGCAGAATCTACTGGAGTTTTGGACTTGTCTAAGATCAGAGAGATGA
GGCTTGTTCCTTCTGACTCTGCCCAGTTGGATACTCTGTTTGATATGTTCTGTGAATGTG
CTGAGCCCAATCCAGAACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTGAACATAACTGGG
TGTTTAGTGCTGATCAGATGGTTGTTGGTGGAGGAGCGGAAGAAGACGGCGAATGGCCAA
TATCTCAGAGCCCGACTAGTGTTATTGGTCTATCCGTTGGAGAT

QA 1 644 1 644
DS 

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TCCAGAACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGTGAACATAACTGGGTGTTTAGTGC
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GCTCCATATCAATGATCAGAGGTTTGATGATGCTGAAGAGATGGTTCATGAAAGTGAGAC
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AGACAATGGCGTCTCTGTGTTCTTCAGAG

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DS 

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G
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CTCTCGGCAATCGATCCCTCGAGTCTCCAGGAACGCTCTACATCACTTCCAGGAAATTGA
TTTGGCTGAGTGATGTAGACATGGCGAAAGGCTACGCCGTCGATTTCTTATCGATATCGC
TACACGCAGTGTCTAGAGATCCAGAGGCTTATTCATCTCCTTGTATATATACTCAGATTG
AAGTTGAAGAAGATGAGGATGAAGAAGATGAGGATGATGCATAATCTACTGGAGTTTTGG
ACTTGTCTAAGATCAGAGAGATGAGGCTTGTTCCTTCTGACTCTGCCCAGTTGGATACTC
TGTTTGATATGTTCTGTGAATGTGCTGAGCTCAATCCAGAACCAGTTGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAAGTGAACATAACTGGGTGTTTAGTGCTGATCAGATGGTTGTTGGTGGAGGAG
CGGAAGAAGACGGCGAATGGCCAATATCTCAGAGCCCGACTAGTGTTATTGGTCTATCCG
TTGGAGATGAAGGTCTTACTCAGCCTATGCTCGAGCTCCATATCAATGATCAGAGGTTTG
ATGATGCTGAAGAGATGGTTCATGAAAGTGAGACCAAAGATCACTAATCTGTCCACAAAT
GTATTACGCTAAGACAGAGTTGTTTCTTATGTTAAGACAATGGCGTCTCTGTGTTCTTCA
GAGTCCATGTGCTTTGTTAAATATGTGTTTAGACTTG

QA 2 758 2 758
DS 

RD RR4AY37JQ 737 0 0
CCAGGAACGCTCTACATCACTTCCAGGAAATTGATTTGGCTGAGTGATGTAGACATGGCG
AAAGGCTACGCCGTCGATTTCTTATCGATATCGCTACACGCAGTGTCTAGAGATCCAGAG
GCTTATTCATCTCCTTGTATATATACTCAGATTGAAGTTGAAGAAGATGAGGATGAAGAA
GATGAGGATGATGCATAATCTACTGGAGTTTTGGACTTGTCTAAGATCAGAGAGATGAGG
CTTGTTCCTTCTGACTCTGCCCAGTTGGATACTCTGTTTGATATGTTCTGTGAATGTGCT
GAGCTCAATCCAGAACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTGAACATAACTGGGTG
TTTAGTGCTGATCAGATGGTTGTTGGTGGAGGAGCGGAAGAAGACGGCGAATGGCCAATA
TCTCAGAGCCCGACTAGTGTTATTGGTCTATCCGTTGGAGATGAAGGTCTTACTCAGCCT
ATGCTCGAGCTCCATATCAATGATCAGAGGTTTGATGATGCTGAAGAGATGGTTCATGAA
AGTGAGACCAAAGATCACTAATCTGTCCACAAATGTATTACGCTAAGACAGAGTTGTTTC
TTATGTTAAGACAATGGCGTCTCTGTGTTCTTCAGAGTCCATGTGCTTTGTTAAATATGT
GTTTAGACTTGGAAGGTAGCTCATCTTGTTATCTCTCTCATTAGTCACTGGTACTCATTG
ACGGACCAGAACATAAC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL3381Contig1 1407 4 4 U
GGGCCATCCATTAACACTCAATTCTCCAAAATGTCGAACATTCATCATCAGAATCGCCGG
CCTTCGTTTTCGTCGTCGACAAAATCTTCCATAGCGAAGCGTTCGGAAAACATGACTTCG
AAACCAGCGGTTATGACGAAGAAACGAGCCCCGCTTGGTAACATCACAAATCAAAAGAAG
GGTTCACGATCTTCTTCTGATCTCGCCGCCAATAAGTCCAAGCTAGCAATTAGTGTAAAG
CCAAGCGTAAGCAAAGGAACTTCTCCTAGCAAATCTGATGATGAGGAGACGATGTCTTCG
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ATCGAAAGGAAGGCGTTGAGTAATCTTTACATAACTCCCAGTTCAGTTAACTGTTGCAGA
AGAGATGTGTTGTCTGATAAGGAGAATAGGGGTAAGGTTGTAAACATAGACAACAACGAC
GCGGATCCGCAGCTCGTTGCAACGTTTGCTTGTGATATCTACAAGCATCTTCGTGCGGCA
GAGACAAAGAAGCGGCCTGCTACTGATTTCATGGAGAGAGTTCAGAAAGATGTTAACTCA
ACTATGCGCGGAATCTTAGTTGATTGGCTTGTTGAGGTATCAGAAGAGTATAGGCTTGTA
CCCGAGACGCTTTATTTGACAGTGAACTACATTGATAGATATCTATCTGGGAATGTGATT
AGTAGACAGAAGCTTCAGTTGCTTGGTGTGGCGTGTATGATGATAGCAGCAAAATACGAG
GAGATATGTGCACCCCAAGTTGAGGAGTTCTGCTACATCACTGATAATACATACCTCAAA
GATGAGGTTCTTGACATGGAATCTGCTGTTCTGAATTACTTGAAGTTTGAAATGTCAGCG
CCAACAACCAAATGCTTTTTAAGACGCTTTGTTCGGGCTGCTCATGAGGTCCATGAGGCT
CCACTGATGCACCTGGAATGTATGGCCAGTTACATTGCGGAATTATCCCTTTTGGAGTAC
ACAATGCTTTCGCATCCTCCTTCACTTCTTGCTGCTTCAGCCATTTTCTTGGCCAAGTAC
ATTCTAGACCCGACAAGGAGACCGTGGAACTCGACATTGCAACATTATACGCAGTATAGA
GCAATGGAATTCAGAGGATGTGTTAAGGATCTTCAACGATTGTCTAGTAACGCTCATGTC
TCTACTCTTCCTGCTGTAAGAGAGAAGTACAGTCAACACAAATACAAGTTTGTGGCAAAG
AAGTTTTGTCCATCCATAATCCCTCCAGAGTTCTTCAACAACAGTTAGATCAATCCTCAA
TTAACCTTGTTCCAATCCTGCGTTGGATTGTCTGATTGTATATGATTATTCCTGCTGTTT
CTGCAGTTTCTTAAAAAAAAATTAGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4B387TF U 1
AF RR4B023TF U 1
AF RR4B387JQ C 722
AF RR4B023JQ C 738
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BS 806 838 RR4B023TF
BS 839 1407 RR4B387JQ

RD RR4B387TF 750 0 0
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AAACCAGCGGTTATGACGAAGAAACGAGCCCCGCTTGGTAACATCACAAATCAAAAGAAG
GGTTCACGATCTTCTTCTGATCTCGCCGCCAATAAGTCCAAGCTAGCAATTAGTGTAAAG
CCAAGCGTAAGCAAAGGAACTTCTCCTAGCAAATCTGATGATGAGGAGACGATGTCTTCG
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ATCGAAAGGAAGGCGTTGAGTAATCTTTACATAACTCCCAGTTCAGTTAACTGTTGCAGA
AGAGATGTGTTGTCTGATAAGGAGAATAGGGGTAAGGTTGTAAACATAGACAACAACGAC
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GAGACAAAGAAGCGGCCTGCTACTGATTTCATGGAGAGAGTTCAGAAAGATGTTAACTCA
ACTATGCGCGGAATCTTAGTTGATTGGCTTGTTGAGGTATCAGAAGAGTATAGGCTTGTA
CCCGAGACGCTTTATTTGACAGTGAACTACATTGATAGATATCTATCTGGGAATGTGATT
AGTAGACAGAAGCTTCAGTTGCTTGGTGTG

QA 1 750 1 750
DS 

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CCTTCGTTTTCGTCGTCGACAAAATCTTCCATAGCGAAGCGTTCGGAAAACATGACTTCG
AAACCAGCGGTTATGACGAAGAAACGAGCCCCGCTTGGTAACATCACAAATCAAAAGAAG
GGTTCACGATCTTCTTCTGATCTCGCCGCCAATAAGTCCAAGCTAGCAATTAGTGTAAAG
CCAAGCGTAAGCAAAGGAACTTCTCCTAGCAAATCTGATGATGAGGAGACGATGTCTTCG
TCCTACAAGAGCCCGCAAGTGGAGTACATCGAACAAGTCTCCTCCTCCGCTGTTGTTTCC
ATCGAAAGGAAGGCGTTGAGTAATCTTTACATAACTCCCAGTTCAGTTAACTGTTGCAGA
AGAGATGTGTTGTCTGATAAGGAGAATAGGGGTAAGGTTGTAAACATAGACAACAACGAC
GCGGATCCGCAGCTCGTTGCAACGTTTGCTTGTGATATCTACAAGCATCTTCGTGCGGCA
GAGACAAAGAAGCGGCCTGCTACTGATTTCATGGAGAGAGTTCAGAAAGATGTTAACTCA
ACTATGCGCGGAATCTTAGTTGATTGGCTTGTTGAGGTATCAGAAGAGTATAGGCTTGTA
CCCGAGACGCTTTATTTGACAGTGAACTACATTGATAGATATCTATCTGGGAATGTGATT
AGTAGACAGAAGCTTCAGTTGCTTGGTGTGGCGTGTATGATGATAGCAGCAAAATACGAG
GAGATATGTGCACCCCAAGTTGAG*AGTTCTGCTACATCACTGATAATACATACCTCA

QA 1 838 1 838
DS 

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ATGAGGTTCTTGACATGGAATCTGCTGTTCTGAATTACTTGAAGTTTGAAATGTCAGCGC
CAACAACCAAATGCTTTTTAAGACGCTTTGTTCGGGCTGCTCATGAGGTCCATGAGGCTC
CACTGATGCACCTGGAATGTATGGCCAGTTACATTGCGGAATTATCCCTTTTGGAGTACA
CAATGCTTTCGCATCCTCCTTCACTTCTTGCTGCTTCAGCCATTTTCTTGGCCAAGTACA
TTCTAGACCCGACAAGGAGACCGTGGAACTCGACATTGCAACATTATACGCAGTATAGAG
CAATGGAATTCAGAGGATGTGTTAAGGATCTTCAACGATTGTCTAGTAACGCTCATGTCT
CTACTCTTCCTGCTGTAAGAGAGAAGTACAGTCAACACAAATACAAGTTTGTGGCAAAGA
AGTTTTGTCCATCCATAATCCCTCCAGAGTTCTTCAACAACAGTTAGATCAATCCTCAAT
TAACCTTGTTCCAATCCTGCGTTGGATTGTCTGATTGTATATGATTATTCCTGCTGTTTC
TGCAGTTTCTTAAAAAAAAATTAGCC

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DS 

RD RR4B023JQ 670 0 0
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GGAATCTGCTGTTCTGAATTACTTGAAGTTTGAAATGTCAGCGCCAACAACCAAATGCTT
TTTAAGACGCTTTGTTCGGGCTGCTCATGAGGTCCATGAGGCTCCACTGATGCACCTGGA
ATGTATGGCCAGTTACATTGCGGAATTATCCCTTTTGGAGTACACAATGCTTTCGCATCC
TCCTTCACTTCTTGCTGCTTCAGCCATTTTCTTGGCCAAGTACATTCTAGACCCGACAAG
GAGACCGTGGAACTCGACATTGCAACATTATACGCAGTATAGAGCAATGGAATTCAGAGG
ATGTGTTAAGGATCTTCAACGATTGTCTAGTAACGCTCATGTCTCTACTCTTCCTGCTGT
AAGAGAGAAGTACAGTCAACACAAATACAAGTTTGTGGCAAAGAAGTTTTGTCCATCCAT
AATCCCTCCAGAGTTCTTCAACAACAGTTAGATCAATCCTCAATTAACCTTGTTCCAATC
CTGCGTTGGATTGTCTGATTGTATATGATTATTCCTGCTGTTTCTGCAGTTTCTTAAAAA
AAAATTAGCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL3382Contig1 1119 4 10 U
GGGCTCTTCCTCCCATCCGAAGCCTTTTAAATGGCGTCGCTTCTGTCTCCTGCTCCTCTC
TTATCTCTTCAACGTCCTTACCATTGTCTGAAAAAGGGAGTTTACGCAACTCCTTGTCTG
GTTCGAGATTCATCGTCGCCGTCTCTCTCCACCTCCAATTTGATTCCCCAGGTGGTTGTT
ACCCGAGAAAGTGGCAAGAACAAACAAATCATCAAAGCCTTGGAGAAACGTGGGATTTCA
TCTTTAGAGCTCCCACTGATTCAACATGCTCCGGGACCTGATTTCGATCGCCTCGCTTCC
GTACTAACTGATAAGAGCTTTGACTGGATCATCATAACCTCTCCACAGGCAGCTTCTGTC
TTTCTCCAGGCGTGGAAGGCAGCTTGCTCTCCAGAAGTGAAAGTAGGTGTAGTGGGAGCT
GGAACAGCCCGTGTATTTGATGAGCCAGTGCTAGCTGCACAAGGAGCGCTTCATGTTGCC
TTCACACCATCTAAAGCAACTGGTAAAGTCTTGGCTTCAGAGCTTCCAGACAATGTGGGC
AAAAGTTCATCTGTCGTATACCCGGCTTCTATAAAAGCAGGCAATGAGATTGAGGAAGGG
TTGTCCAGGCGTGGGTTTGACGTTCTGAGGCTGAATACATACACAACAGTTCCTGTGCAA
AGTGTAGATGCGATGCTTCTGCAACAGGCAATGTCTGCGCCTGTTCTTTCTGTAGCTTCA
CCTTCTGCAATCCGGGCCTGGATGAATTTGATTGAAAACGAGAAGCAATGGAGTAATAAT
CTTGCCTGCATAGGAGAGACAACTGCTTCAGCTGCAAGACGACTAGACTTTAAAAAGGTT
TACCACCCGGAGCAACCAGGGCTTGAAGGATGGGTCGAGAGCATCATGGAAGCTCTAGTC
GCTCACGAAGAAATTACACAGAATAAGTAACTCTAGCAGTAGGAACTAAGTTACGCTCAT
GAGCTGGACTTATGGTGGACTGAACTGGGACACCTGCTTGTAAGTTAGATGACTTGAAAA
ATAACCAAGTGATGTTGTTGATAAAATTCATCAACCCCTTTCAGATATCTTGGGCAGCTT
TTGTAAGATAAAAGAGGTATATAGTATTGTTTGGAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS39TF U 13
AF RR4AQ28TF U 1
AF RR4FS39JQ C 654
AF RR4AQ28JQ C 362
BS 1 762 RR4AQ28TF
BS 763 826 RR4AQ28JQ
BS 827 827 RR4FS39JQ
BS 828 897 RR4AQ28JQ
BS 898 898 RR4FS39JQ
BS 899 991 RR4AQ28JQ
BS 992 992 RR4FS39JQ
BS 993 1052 RR4AQ28JQ
BS 1053 1053 RR4FS39JQ
BS 1054 1119 RR4AQ28JQ

RD RR4FS39TF 564 0 0
GG
ATCCGAAGCCTTTTAAATGGCGTCGCTTCTGTCTCCTGCTCCTCTCTTATCTCTTCAACG
TCCTTACCATTGTCTGAAAAAGGGAGTTTACGCAACTCCTTGTCTGGTTCGAGATTCATC
GTCGCCGTCTCTCTCCACCTCCAATTTGATTCCCCAGGTGGTTGTTACCCGAGAAAGTGG
CAAGAACAAACAAATCATCAAAGCCTTGGAGAAACGTGGGATTTCATCTTTAGAGCTCCC
ACTGATTCAACATGCTCCGGGACCTGATTTCGATCGCCTCGCTTCCGTACTAACTGATAA
GAGCTTTGACTGGATCATCATAACCTCTCCACAGGCAGCTTCTGTCTTTCTCCAGGTGTG
GAAGGCAGCTTGCTCTCCAAAAGTGAAAGTAGGTGTAGTGGGAGCTGGAACAGCCCGTGT
ATTTGATGAGCCAGTGCTAGCTGCACAAGGAGCGCTTCATGTTGCCTTCACACCATCTAA
AGCAACTGGTAAAGTCTTGGCTTCAGAGCTTCCAGACAATGTGGGCAAAAGTTCATCTGT
CGTATACCCGGCTTCTATAAAA

QA 3 564 3 564
DS 

RD RR4AQ28TF 762 0 0
GGGCTCTTCCTCCCATCCGAAGCCTTTTAAATGGCGTCGCTTCTGTCTCCTGCTCCTCTC
TTATCTCTTCAACGTCCTTACCATTGTCTGAAAAAGGGAGTTTACGCAACTCCTTGTCTG
GTTCGAGATTCATCGTCGCCGTCTCTCTCCACCTCCAATTTGATTCCCCAGGTGGTTGTT
ACCCGAGAAAGTGGCAAGAACAAACAAATCATCAAAGCCTTGGAGAAACGTGGGATTTCA
TCTTTAGAGCTCCCACTGATTCAACATGCTCCGGGACCTGATTTCGATCGCCTCGCTTCC
GTACTAACTGATAAGAGCTTTGACTGGATCATCATAACCTCTCCACAGGCAGCTTCTGTC
TTTCTCCAGGCGTGGAAGGCAGCTTGCTCTCCAGAAGTGAAAGTAGGTGTAGTGGGAGCT
GGAACAGCCCGTGTATTTGATGAGCCAGTGCTAGCTGCACAAGGAGCGCTTCATGTTGCC
TTCACACCATCTAAAGCAACTGGTAAAGTCTTGGCTTCAGAGCTTCCAGACAATGTGGGC
AAAAGTTCATCTGTCGTATACCCGGCTTCTATAAAAGCAGGCAATGAGATTGAGGAAGGG
TTGTCCAGGCGTGGGTTTGACGTTCTGAGGCTGAATACATACACAACAGTTCCTGTGCAA
AGTGTAGATGCGATGCTTCTGCAACAGGCAATGTCTGCGCCTGTTCTTTCTGTAGCTTCA
CCTTCTGCAATCCGGGCCTGGATGAATTTGATTGAAAACGAG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4FS39JQ 413 0 0
TGTGCAAAGTGTAGATGCGATGCTTCTGCAACAGGCAATGTCTGCGCCTGTTCTTTCTGT
AGCTTCACCTTCTGCAATCCGGGCCTGGATGAATTTGATTGAAAACGAGAAGCAATGGAG
TAATAATCTTGCCTGCATAGGAGAGACAACTGCTTCAGCTGCAAGACGACTAGACTTTAA
AAAGGTTTACCACCCGGAGCAACCAGGGCTTGAAGGATGGGTCGAGAGCATCATGGAAGC
TCTAGTCGCTCACGAAGAAATTACACAGAATAAGTAACTCTAGCAGTAGGAACTAAGTTA
CGCTCATGAGCTGGACTTATGGTGGACTGAACTGGGACACCTGCTTGTAAGTTAGATGAC
TTGAAAAATAACCAAGTGATGTTGTTGATAAAATTCATCAACCCCTTTCAGA
C

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4AQ28JQ 758 0 0
TTCTCCAGGCGTGGAAGGCAGCTTGCTCTCCAGAAGTGAAAGTAGGTGTAGTGGGAGCTG
GAACAGCCCGTGTATTTGATGAGCCAGTGCTAGCTGCACAAGGAGCGCTTCATGTTGCCT
TCACACCATCTAAAGCAACTGGTAAAGTCTTGGCTTCAGAGCTTCCAGACAATGTGGGCA
AAAGTTCATCTGTCGTATACCCGGCTTCTATAAAAGCAGGCAATGAGATTGAGGAAGGGT
TGTCCAGGCGTGGGTTTGACGTTCTGAGGCTGAATACATACACAACAGTTCCTGTGCAAA
GTGTAGATGCGATGCTTTTGCAACAGGCAATGTTTGCGCCTGTTCTTTCTGTAGCTTCAC
CTTTTGCAATCCGGGCCTGGATGAATTTGATTGAAAACGAGAAGCAATGGAGTAATAATC
TTGCCTGCATAGGAGAGACAACTGCTTCAGCTGCAAGACGACTAGGCTTTAAAAAGGTTT
ACCACCCGGAGCAACCAGGGCTTGAAGGATGGGTCGAGAGCATCATGGAAGCTCTATTCG
CTCACGAAGAAATTACACAGAATAAGTAACTCTAGCAGTAGGAACTAAGTTACGCTCATG
AGCTGGACTTATGGTGGACTGAACTGGGACCCCTGCTTGTAAGTTAGATGACTTGAAAAA
TAACCAAGTGATGTTGTTGATAAAATTCATCGACCCCTTTCAGATATCTTGGGCAGCTTT
TGTAAGATAAAAGAGGTATATAGTATTGTTTGGAATAC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL3383Contig1 554 4 1 U
GGAAAGTAGTAAGTGGTTTCTTCGGGTTTGAGTCAGATCTGGAACTTTGTCGGGGAGAGA
TGGTTCACGAATATCCGAAGGGATTATGTTCGTTTTACAGCGATATATACGAGGTGGTGG
ATGATCCTTCGTTGGATTCAATAATCTCATGGAGCAAAAGCAACAAGGGTTTCGTCATCT
GGAATCCCCAAGAGCTAATCGAAAAAAGGATTGTTTCGAGATTCTTTTGCAGAGAGTTGT
CACAGTTTATCTCCGACGTTGAACTTTTTGGATTTAGAAGAGTCAAGGGGTCTAAGCACA
TGAAGTTTACGAATGCAAATTTCGTGAGAGGTCAGCCTGATCTCTTGAAGAAGATGCAGA
GCGAGACTTCCTTTGCGAGGTTTAAGAAAAGAAGAAGAGCAGCCAGAGCTAAAGCCCAAG
TTGAGGAACGCTTGCAACGTTTACAAATCTGAATCAAACTCCCTTGATCATCTGTCCTCT
CTAAGCTTAGTTAATAAAACATGTGGTGGTAAAGACAATGGTTACTAAATATTATCTCGT
GCTCTTATTATAGG


BQ
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AF RR4FY49JQ C 1
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AF RR4GJ77TF U 1
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BQ
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AF RR4AY10TF U 1
AF RR4AS23TF U 1
AF RR4AS23JQ C 442
AF RR4AY10JQ C 442
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DS 

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ATGTTTC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO96JQ U 209
AF RR4D828JQ U 1
AF RR4BO96TF C 203
AF RR4CK24TF C 821
BS 1 238 RR4D828JQ
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RD RR4BO96JQ 309 0 0
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GGTTTTAAAGCTATCTGTGCATCCACATCATGCTTTGAAACGTCTGGCTCAAACTGTTCA
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GATCCATCCGTGAAAACAAACCGAACACCTTGCTTGGATGCAACACTTCCATCAACAGGG
TCCGTGTATGAAAAGTCATCTGCAAACTGGAGGACATAGTTTCCATAATTTTCCCCGCCC
TTGCTCTTA

QA 1 309 1 309
DS 

RD RR4D828JQ 775 0 0
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GTTACATAGATAAGCATTTCATTGCTCTTGAATTTTTGAATAAACATGGCAGACAAAACT
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TCCTGTCATTTCTCATGTAATGACAGTGGGCTTCTCCCTCCCTGTGAATTCCTTCAGCCT
TGATACAGACAATGCAAGATCAATCAAAGGTTTTAGAGCTATCTGTGCATCCACATCATG
CTTTGAAACGTCTGGCTCAAACTGTTCAATGTATATTCGAACTGTAGCACCAGCTGAACC
AGTTCCGGATAAACGAAATATGATTCTGGATCCATCCGTGAAGACAAACCGAACACCTTG
CTTGGATGCAACACTTCCATCAACAGGGTCCGTGTATGAAAAGTCATCTGCAAACTGGAG
GACATAGTTTCCATAATTTTCCCCGCCCTTGCTCTTAGACACGATATCTCGAAGATACTC
CATCATTTTATTGGCTCCTTCAGATTCACATTCCTCGTAGTCGTATCTAGAAAAAAAGTT
CCTTCCATATGTCGCCCAGTACTCTTTCACAACATCTGCAACAGAAACCAACTTCTCCCC
TGATTTCTTGTCCTTATTGCGATGAGCTAGGATCGAAAGCCACGCCAACACAGCCCATAT
GCCATCCTTCTCACGGATGTGATCAGAACCTGTTCCAAAGCTCTCCTCTCCACAG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4BO96TF 756 0 0
ACAGTG
GGCTTCTCCCTCCCTGTGAATTC*TTCAGCTTTGATACAGACAATGCAAGATCAATCAAA
GGTTT*AGAGCTATCTGTGCATCCACATCATGCTTTGAAACGTCTGGCTCAAACTGTTCA
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GATCCATCCGTGAAGACAAACCGAACACCTTGCTTGGATGCAACACTTCCATCAACAGGG
TCCGTGTATGAAAAGTCATCTGCAAACTGGAGGACATAGTTTCCATAATTTTCCCCGCCC
TTGCTCTTAGACACGATATCTCGAAGATACTCCATCATTTTATTGGCTCCTTCAGATTCA
AATTCCTCGTAGTCGTATCTAGAAAAAAAGTTCCTTCCATATGTCGCCCAGTACTCTTTC
ACAACATCTGCAACAGAAACCAACTTCTCCCCTGATTTCTTGTCCTTATTGCGATGAGCT
AGGATCGAAAGCCACGCTAACACAGCCCATATGCCATCCTTCTCACGGATGTGATCAGAA
CCTGTTCCAAAGCTCTCCTCTCCACAGATTGACAACTTTCCAGCATCCATAAGATTTCCA
AAAATTTCCATCCGGTGGGAACCTCGAAGAAAGGAAGCTTCAACTTCTCGGCAACACGAT
CCAGGGCACCACTAGTTGGCATAGAACGTGCTAGACCCTTAGGACCAGCACGGAAATAGG
GAATTGCTTCTTGTGCATTGGCTGCAATGA

QA 7 756 7 756
DS 

RD RR4CK24TF 775 0 0
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TAGTTGGTATAGAACGTGCTAGACCCTTAGGACCAGCACGGAAATATGGAATTGCTTCTT
GTGCATTGGCTGCAATGATAGCAACAGAATCTGAAGGCGTGACAAAGAATTTGTTTCCGA
GAACCATATTTCTGTCACCATCACCATCACTTGCTGCCCCAAAATCAGGCCCGTCGTCAC
GATACATGACATCAACCAAATCCTTTGCGTATGTCAGATTAGGATCTGGATGGCCATGCC
CAAAATCTTCCAGGGGAACTCAGTTGGAAATTGAATCCGGTTTGGCTCCAAGATTATCAA
CAAAAATTGGTTTCGCATAAGCACCAGTAACAGCATGCATGGCATCAAACATGAACCCAA
AATCTGATCTTGAGAGAAGACCTCTGATAAGATCAAAGTCAAACACATCCTCCATGAGCT
CCAAGTAGTCGGAAACAGGATCTATAACTTCCACACTGAAATTTCCATACTTGGTAACCC
CAACATGAGACAGATCAATGTCTGGAATCTCTGCCACCTTAATCTCAGAGATTGAAAGTG
TATTTCCATAAATTTTGTCAGTAATGGATTCCGGAGCTGGCAGACCACTGCTGTAATTGA
ACTTGATACCCCAGTCATATTCAGGTCCACCAGGATTATGACTTGCACTCATAATAAATC
CTCCATTTGCCTTCCGTTTCCTGATTACAGCGGAAACCGCTGGGGTTGACAAAAT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL3386Contig1 677 4 18 U
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TCTATCCTATCCAAAAGAAGAAGATAAATCGTTTTTAAAATGGCGAAGAAAGGAGGAGGA
GGAGCAACAACACTCGCCGAGGACGCACCATGGCGTGTCTCCTCGGTAAAACCAGTACCT
CGAATCAGCCGCTCACCGGTTCTCTCCATCTCTCAAAGTCCAGAGACCGATTACGCCATT
GCCGTCATGAAGCATCCGAATCCAGTGGGAGGTGGTTTGTCGATGGAAGCAGTGCTTGAA
TCTGCAGTACCTGAATGCGTTGTTCCTGGTCTAGTCACGCCTCTTCGTCTTCTTGGTGTT
AAGTTGTGGCCTGTTGAAGTTGATCTCAAGTTCCTGGAACCAGTGGGGAAAGAGCTTAAG
ATGCTTGGGAAGTTCATGGATAATGCTGTCGACCTGATGAATAAGTCTTTTATCGACCGT
TCAGCACCATGGAAAAGGCGCTAAGGTATACGGCTAGAGTTTTGGAATGGGGAACTTATA
ACAGGCAGAGAAAGATATGATCTGAGAGCAAAGTTGAATATGGTGTGTGTGTGTGTCAGT
GTATAGAGGATTATCTCCTTTCAAATATTATTACAGACAAAA*TCTATATGCTATCAAAT
CATCATTGGTTTGAATT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

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AF RR4CF43TF U 1
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TCA

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A

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CATCATTGGTTTG

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TACAGACAAAAATCTATATGCTATCAAATCATCATTGGTTTGAATT

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DS 



AS 1 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF06TF U 1
AF RR4FF06JQ C 162
AF RR4BF79TF U 167
AF RR4BF79JQ C 343
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AAACTGGAATGTATCTTCTTCTCTTGAATAGTATAAGTGAGAGATCGTTGC
G

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GCGGTGAGTAATCTGATTAACCAAGCGGTTGGTGATGCTATAAGTGGGTTGCTCTTGGTT
GAAGTGATTCTGCAGCACATGGGGTGGTCAGTGCAGAAGTGGAATGAGCTGCACAAGGAC
CTCCCTAGCAGACAGGTTAAGGTGGAAGTTCCAGACAGAACAGCGGTTGTGACAACTAGC
GAAGAAACCGAGGCGTTGAAACCTTTGGGGATTCAGGATGCTATTAATGGTGAGATCAAG
AAATACAAGCGTGGCAGAGCTTTCATAAGGCCGTCAGGCACAGAAGATGTGGTGAGAGTG
TATGCAGAAGCATCCACACAAGAAGATGCTGATTCTTTGGGTGATTCTGTGGCTCAGCTT
GTCAAAAGCTTCCTTGGTTCAGGCTAAAGGTCCATCTGAATGAATCTTTCATGCAATGCT
AATTAAGAGGTCTTTCTTGTTCATCTCTTAGGTTTCCCTTTTCTTTCCAATAAAGTTCTT
AAACTGGGATGTATCTTCTTCTCTTGAATAGTATAAGTGAGAGATCGTTGCTAAGAGCTC
AGTACCAGGTACTTATATTAAGATCATAACTGTGAACTTAATCTCTGGCTTAAG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4BF79JQ 648 0 0
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GGTTGAAGTGATTCTGCAGCACATGGGGTGGTCAGTGCAGAAGTGGAATGAGCTGCACAA
GGACCTCCCTAGCAGACAGGTTAAGGTGGAAGTTCCAGACAGAACAGCGGTTGTGACAAC
TAGCGAAGAAACCGAGGCGTTGAAACCTTTGGGGATTCAGGATGCTATTAATGGTGAGAT
CAAGAAATACAAGCGTGGCAGAGCTTTCATAAGGCCGTCAGGCACAGAAGATGTGGTGAG
AGTGTATGCAGAAGCATCCACACAAGAAGATGCTGATTCTTTGGGTGATTCTGTGGCTCA
GCTTGTCAAAAGCTTCCTTGGTTCAGGCTAAAGGTCCATCTGAATGAATCTTTCATGCAA
TGCTAATTAAGAGGTCTTTCTTGTTCATCTCTTAGGTTTCCCTTTTCTTTCCAATAAAGT
TCTTAAACTGGGATGTATCTTCTTCTCTTGAATAGTATAAGTGAGAGATCGTTGCTAAGA
GCTCAGTACCAGGTACTTATATTAAGATCATAACTGTGAACTTAATTTCTGGCTTAAGAA
GGGAACTTAGCACATGCCTTTGTCTTCCTGTTTTATCTCTCAACAACT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 2 4

CO CL3388Contig1 456 2 3 U
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TTCTTCTTGTTATGGGCACTAGATCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTC
TTTCTATCCATCTTGTTGTTCCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGC
ACCTTAACCTTTATTCCACCTTCATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGT
GCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTGCTGCGCAGAT
TCAGTCAAAAGGAGAACAAGCAGATTAAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTG
CAAGAACATGGGTGGAGAACCAGAATGATTTGAACCAGAAGAACCACCAGTGGCAATCCG
AACATCACATGTTACCCCCTTCTTCGTCACCCCACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG05TF U 1
AF RR4CG05JQ C 1
BS 1 1 RR4CG05JQ
BS 2 280 RR4CG05TF
BS 281 456 RR4CG05JQ

RD RR4CG05TF 280 0 0
G
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TCTTCTTGTTATGGGCACTAGATCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTCT
TTCTATCCATCTTGTTGTTCCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGCA
CCTTAACCTTTATTCCACCTTCATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTG
CAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGCCTCTTA

QA 2 280 2 280
DS 

RD RR4CG05JQ 456 0 0
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TTCTTCTTGTTATGGGCACTAGATCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTC
TTTCTATCCATCTTGTTGTTCCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGC
ACCTTAACCTTTATTCCACCTTCATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGT
GCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTGCTGCGCAGAT
TCAGTCAAAAGGAGAACAAGCAGATTAAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTG
CAAGAACATGGGTGGAGAACCAGAATGATTTGAACCAGAAGAACCACCAGTGGCAATCCG
AACATCACATGTTACCCCCTTCTTCGTCACCCCACC

QA 1 456 1 456
DS 



CO CL3388Contig2 700 2 4 U
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TCAGTTTTTAGGATCGAGTCAGTCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACCTTATTCTGTGTTG
ATCACTAACCACCTCGTGCTTTAGTTGTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGAAAGAC
ACACATTTGGACCTGGAACACCCTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCC
GATCAGGTTGCACTGGGTAGACTTAACTCCACCTAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAAT
TCTTCTTGTTATAGGCACTAGATCAGGGAAACGAGAACTCCACTCAGGACTTCTTATTCT
TTCTATCCATCTTGTGGTTCCTGAGTGGTTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGCG
CCTTAGCCTTTATTCCACCTTCATGCATTTGCGTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTG
CAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTGCTGCGCAGATT
CAGTCAGAAGGAGAACAAGCAGATTGAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGC
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ACATCACACGTTACCTCCTTCTTCATCACCTCACCACTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV14JQ C 1
AF RR4DV14TF U 1
BS 1 602 RR4DV14TF
BS 603 603 RR4DV14JQ
BS 604 690 RR4DV14TF
BS 691 700 RR4DV14JQ

RD RR4DV14JQ 700 0 0
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TCAGTTTTTAGGATCGAGTCAGTCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACCTTATTCTGTGTTG
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ACACATTTGGACCTGGAACACCCTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCC
GATCAGGTTGCACTGGGTAGACTTAACTCCACCTAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAAT
TCTTCTTGTTATAGGCACTAGATCAGGGAAACGAGAACTCCACTCAGGACTTCTTATTCT
TTCTATCCATCTTGTGGTTCCTGAGTGGTTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGCG
CCTTAGCCTTTATTCCACCTTCATGCATTTGCGTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTG
CAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTGCTGCGCAGATT
CAGTCAGAAGGAGAACAAGCAGATTGAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGC
AGGAACATGGGTGGAGAACCATAATGATTTGAACCAGGAGAACCACCAGTGGCAATCTAA
ACATCACACGTTACCTCCTTCTTCATCACCTCACCACTTC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4DV14TF 699 0 0
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TCAGTTTTTAGGATCGAGTCAGTCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACCTTATTCTGTGTTG
ATCACTAACCACCTCGTGCTTTAGTTGTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGAAAGAC
ACACATTTGGACCTGGAACACCCTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCC
GATCAGGTTGCACTGGGTAGACTTAACTCCACCTAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAAT
TCTTCTTGTTATAGGCACTAGATCAGGGAAACGAGAACTCCACTCAGGACTTCTTATTCT
TTCTATCCATCTTGTGGTTCCTGAGTGGTTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGCG
CCTTAGCCTTTATTCCACCTTCATGCATTTGCGTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTG
CAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTGCTGCGCAGATT
CAGTCAGAAGGAGAACAAGCAGATTGAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGC
AG*AACATGGGTGGAGAACCATAATGATTTGAACCAGGAGAACCACCAGTGGCAATCTAA
ACATCACACGTTACCTCCTTCTTCATCACC
TCACACTTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL3389Contig1 1191 4 7 U
AAGAGTTCGAAACACATTTAGATCGTTAATTGTCTTCTGAAGAATCGAATGGGTGTTAGA
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GAAGAGCTTCTTGTTCAGTATCTCTGTCGGAAAGTTGCAGGCTATCATTTCTCTCTCCAA
GTCATAGGAGACATCGATCTCTACAAGTTCGATCCTTGGGATTTGCCAAGTAAGGCCTTG
TTTGGGGAGAAGGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGACCGTAAATATCCAAACGGGTCG
AGACCCAACAGAGTAGCCGGGTCGGGTTACTGGAAGGCGACGGGTACGGACAAAATCATC
ACGTCTGACGGCCACCGCGTCGGGATTAAAAAAGCTCTGGTTTT*CTACGCGGGAAAAGC
TCCAAAAGGCACCAAAACGAACTGGATCATGCACGAGTATCGCCTCTTCGAGCATTCTCG
TAGCCACGGAAGCTCCAAGTTGGATGATTGGGTGTTGTGTCGAATCTACAAGAAGACGTC
GGGGTCTCAGAGACAACAAGCCGTTGCTCCGGTTCAACCTGAACACAGCACGAACGGGTC
GTCGTCCTCTTCGTCGTCTCACCACGAGGACGTTCTCGACTCGTTCCCGGATATGAAGGA
TCGGTCTTTCGATCTTCCTCGGGTGAATTCTCTCAGGACGCTTCTCAACGGGAATTTCGA
CTGGGCGAGCTTAGCCGGTCTTAATCCCATCCCGGAGCTAGCTCCGGCGAGCAACAACGG
TTACGGCGGAGGAGGGTACGACGCGTTTCGAGCGGCGGAGGGAGAGGCGGAGAGCGGGTT
GAGAAATTCGCAGGTGAACTCGAGCGAGTTGACTCAGAGTTTCGGGTACAGCTCGAGCGG
GTTGAGTAGTGGCGGGTTCGGACCTTCGGGTCAGACATATGAGTTTAGGCAATGAGAGAT
AGATCATTTGGTTTGGTTGGTAACTCTCATGATAATCTTTGAGAGGGTAGAGTGGTAATT
AATGTAAATAAATAGGGATTTATATGGGCCTTTTAGGCTTTGGATTCCAGAAAGGCAATG
GGCTTTTGATTAGTTTTGATGGGCGATAAATGTTATAATAATTGTTCCACTATACCTTGA
TGGATTCGTCGAATTCTTAAAAAATAAAATGGTTGTTTCATGTTTGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A106TF U 265
AF RR4A106TFB U 1
AF RR4A106JQ C 284
AF RR4A106JQD C 418
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BS 696 696 RR4A106JQ
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BS 1130 1157 RR4A106JQ
BS 1158 1191 RR4A106JQD

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GGTTACTGGAAGGCGACGGGTACGGACAAAATCATCACGTCTGACGGCCACCGCGTCGGG
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DS 

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TTTGGGGAGAAGGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGACCGTAAATATCCAAACGGGTCG
AGACCCAACAGAGTAGCCGGGTCGGGTTACTGGAAGGCGACGGGTACGGACAAAATCATC
ACGTCTGACGGCCACCGCGTCGGGATTAAAAAAGCTCTGGTTTT*CTACGCGGGAAAAGC
TCCAAAAGGCACCAAAACGAACTGGATCATGCACGAGTATCGCCTCTTCGAGCATTCTCG
TAGCCACGGAAGCTCCAAGTTGGATGATTGGGTGTTGTGTCGAATCTACAAGAAGACGTC
GGGGTCTCAGAGACAACAAGCCGTTGCTCCGGTTCAACCTGAACACAGCACGAACGGGTC
GTCGTCCTCTTCGTCGTCTCACCACGAGGACGTTCTCGACTCGTTCCCGGATATGAAGGA
TCGGTCTTTCGATCTTCCTCGGGTGAATTCTCTCACGACGCTTCTCAACGGGAAT

QA 1 715 1 715
DS 

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AATATCCAAACGGGTCGAGACCCAACAGAGTAGCCGGGTCGGGTTACTGGAAGGCGACGG
GTACGGACAAAATCATCACGTCTGACGGCCACCGCGTCGGGATTAAAAAAGCTCTGGTTT
T*CTACGCGGGAAAAGCTCCAAAAGGCACCAAAACGAACTGGATCATGCACGAGTATCGC
CTCTTCGAGCATTCTCGTAGCCACGGAAGCTCCAAGTTGGATGATTGGGTGTTGTGTCGA
ATCTACAAGAAGACGTCGGGGTCTCAGAGACAACAAGCCGTTGCTCCGGTTCAACCTGAA
CACAGCACGAACGGGTCGTCGTCCTCTTCGTCGTCTCACCACGAGGACGTTCTCGACTCG
TTCCCGGATATGAAGGATCGGTCTTTCGATCTTCCTCGGGTGAATTCTCTCAGGACGCTT
CTCAACGGGAATTTCGACTGGGCGAGCTTAGCCGGTCTTAATCCCATCCCGGAGCTAGCT
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GAGGCGGAGAGCGGGTTGAGAAATTCGCAGGTGAACTCGAGCGAGTTGACTCAGAGTTTC
GGGTACAGCTCGAGCGGGTTGAGTAGTGGCGGGTTCGGACCTTCGGGTCAGACATATGAG
TTTAGGCAATGAGAGATAGATCATTTGGTTTGGTTGGTAACTCTCATGATAATCTTTGAG
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ATTCCAGAAAGGCAATGGGCTTTTGATTAGTTTTGATGGGCGATAAATGTTATAATAATT
GTTCCCCTATACCTTGATGGATTCGTCGAATTCT

QA 1 874 1 874
DS 

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GCTCCA
AAAAGGCACCAAAACGAACTGGATCATGCACGAGTATCGCCTCTTCGAGCATTCTCGTAG
CCACGGAAGCTCCAAGTTGGATGATTGGGTGTTGTGTCGAATCTACAAGAAGACGTCGGG
GTCTCAGAGACAACAAGCCGTTGCTCCGGTTCAACCTGAACACAGCACGAACGGGTCGTC
GTCCTCTTCGTCGTCTCACCACGAGGACGTTCTCGACTCGTTCCCGGATATGAAGGATCG
GTCTTTCGATCTTCCTCGGGTGAATTCTCTCAGGACGCTTCTCAACGGGAATTTCGACTG
GGCGAGCTTAGCCGGTCTTAATCCCATCCCGGAGCTAGCTCCGGCGAGCAACAACGGTTA
CGGCGGAGGAGGGTACGACGCGTTTCGAGCGGCGGAGGGAGAGGCGGAGAGCGGGTTGAG
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GAGTAGTGGCGGGTTCGGACCTTCGGGTCAGACATATGAGTTTAGGCAATGAGAGATAGA
TCATTTGGTTTGGTTGGTAACTCTCATGATAATCTTTGAGAGGGTAGAGTGGTAATTAAT
GTAAATAAATAGGGATTTATATGGGCCTTTTAGGCTTTGGATTCCAGAAAGGCAATGGGC
TTTTGATTAGTTTTGATGGGCGATAAATGTTATAATAATTGTTCCACTATACCTTGATGG
ATTCGTCGAATTCTTAAAAAATAAAATGGTTGTTTCATGTTTGAGATT

QA 7 774 7 774
DS 



AS 1 4

CO CL3390Contig1 1235 4 2 U
GATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCCGGAATCATTGTTATCTGCCTTGACGAGCTTCTTCA
GAAGGGATACGGTCTCGGCTCAGGAATCTCCCTTTTCATTGCCACCAACATCTGTGAGAG
CATTATCTGGAAGGCGTTTAGCCCAACTACAATCAACACTGGACGTGGAGCTGAGTTTGA
AGGTGCTGTTATCGCGCTGTTCCACATGCTGATAACTAAGTCCAACAAGGTTGCTGCTCT
CCGCCAAGCGTTCTACCGGCATAACCTTCCGAACGTCACCAACTTGCTTGCCACGGTATT
GATCTTCCTGATTGTCATCTACTTCCAAGGGTTCCGTGTGGTTTTGCCTGTGAGATCAAA
GAATGCACGTGGGCAACAGGGTTCTTACCCGATCAAGCTGTTCTACACCTCTAACATGCC
CATCATTCTCCAATCCGCTCTCGTCTCAAATCTTTACTTCATCTCTCAGCTTCTATACAG
GAAGTTCAGTGGAAATTTCTTTGTAAACCTTTTGGGACAATGGAAAGAATCTGAGTACAG
TGGGCAGTCTATTCCAGTTAGTGGACTTGCTTACCTCATAACAGCTCCAGCAAGCTTCTC
AGACATGGCAGCACACCCATTCCATGCACTGTTCTACATTGTCTTCATGCTCACTGCTTG
TGCTCTTTTCTCAAAGACATGGATTGAGGTCTCCGGATCATCAACAAGGACGTAGCCAAG
CAGCCCAAGGAACAACAAATGGTGATGCCGGGACACAGAGAGTCGAACTTGCAGAAGGAG
CTGAACAGGTATATCCCAACAGCAGCAGCTTTCGGTGGAGTTTGTATCGGTGCGCTGACT
GTTCTTGCTGATTTCATGGGAGCCATTGGGTCCGGGACTGGAATTCTCCTGGCGGTGACA
ATCATATATCAGTATTTCGAGACATTCGAGAAGGAGAAAGCAATTGAACTTGGCTTCTTC
GGGTTCTAAGTTAGCGTAAAAGTTGTAAACTCTGCAGAGTCTCAAAGGCACGTTAGCTAC
TACTGTGGCAACTTCAAAAAGGGTTGAACACAGTTTGAGGAGAGCTTAGACATTTTTTTT
TCTTTTTTTGTTGTTTGAACAAAATTTTCGCTTGGTAGTTTTTCGTGTAATACAGTTTTA
TGCTTTTTCTAATGTATGTTTCTAGTTATTTCACTTGTGACCCCAAATAAACAATTTACA
TATTTGAAGTTCAACAGAGCAACTTCCTTGTGGGC


BQ
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AF RR4EB83TF U 1
AF RR4DV74TF U 1
AF RR4DV74JQ C 475
AF RR4EB83JQ C 570
BS 1 731 RR4DV74TF
BS 732 1235 RR4DV74JQ

RD RR4EB83TF 691 0 0
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GAAGGGATACGGTCTCGGCTCAGGAATCTCCCTTTTCATTGCCACCAACATCTGTGAGAG
CATTATCTGGAAGGCGTTTAGCCCAACTACAATCAACACTGGACGTGGAGCTGAGTTTGA
AGGTGCTGTTATCGCGCTGTTCCACATGCTGATAACTAAGTCCAACAAGGTTGCTGCTCT
CCGCCAAGCGTTCTACCGGCATAACCTTCCGAACGTCACCAACTTGCTTGCCACGGTATT
GATCTTCCTGATTGTCATCTACTTCCAAGGGTTCCGTGTGGTTTTGCCTGTGAGATCAAA
GAATGCACGTGGGCAACAGGGTTCTTACCCGATCAAGCTGTTCTACACCTCTAACATGCC
CATCATTCTCCAATCCGCTCTCGTCTCAAATCTTTACTTCATCTCTCAGCTTCTATACAG
GAAGTTCAGTGGAAATTTCTTTGTAAACCTTTTGGGACAATGGAAAGAATCTGAGTACAG
TGGGCAGTCTATTCCAGTTAGTGGACTTGCTTACCTCATAACAGCTCCAGCAAGCTTCTC
AGACATGGCAGCACACCCATTCCATGCACTGTTCTACATTGTCTTCATGCTCACTGCTTG
TGCTCTTTTCTCAAAGACATGGATTGAGGTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4DV74TF 731 0 0
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GAAGGGATACGGTCTCGGCTCAGGAATCTCCCTTTTCATTGCCACCAACATCTGTGAGAG
CATTATCTGGAAGGCGTTTAGCCCAACTACAATCAACACTGGACGTGGAGCTGAGTTTGA
AGGTGCTGTTATCGCGCTGTTCCACATGCTGATAACTAAGTCCAACAAGGTTGCTGCTCT
CCGCCAAGCGTTCTACCGGCATAACCTTCCGAACGTCACCAACTTGCTTGCCACGGTATT
GATCTTCCTGATTGTCATCTACTTCCAAGGGTTCCGTGTGGTTTTGCCTGTGAGATCAAA
GAATGCACGTGGGCAACAGGGTTCTTACCCGATCAAGCTGTTCTACACCTCTAACATGCC
CATCATTCTCCAATCCGCTCTCGTCTCAAATCTTTACTTCATCTCTCAGCTTCTATACAG
GAAGTTCAGTGGAAATTTCTTTGTAAACCTTTTGGGACAATGGAAAGAATCTGAGTACAG
TGGGCAGTCTATTCCAGTTAGTGGACTTGCTTACCTCATAACAGCTCCAGCAAGCTTCTC
AGACATGGCAGCACACCCATTCCATGCACTGTTCTACATTGTCTTCATGCTCACTGCTTG
TGCTCTTTTCTCAAAGACATGGATTGAGGTCTCCGGATCATCAACAAGGACGTAGCCAAG
CAGCCCAAGGA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4DV74JQ 761 0 0
ATACAGGAAGTTCAGTGGAAATTTCTTTGTAAACCTTTTGGGACAATGGAAAGAATCTGA
GTACAGTGGGCAGTCTATTCCAGTTAGTGGACTTGCTTACCTCATAACAGCTCCAGCAAG
CTTCTCAGACATGGCAGCACACCCATTCCATGCACTGTTCTACATTGTCTTCATGCTCAC
TGCTTGTGCTCTTTTCTCAAAGACATGGATTGAGGTCTCCGGATCATCAACAAGGACGTA
GCCAAGCAGCCCAAGGAACAACAAATGGTGATGCCGGGACACAGAGAGTCGAACTTGCAG
AAGGAGCTGAACAGGTATATCCCAACAGCAGCAGCTTTCGGTGGAGTTTGTATCGGTGCG
CTGACTGTTCTTGCTGATTTCATGGGAGCCATTGGGTCCGGGACTGGAATTCTCCTGGCG
GTGACAATCATATATCAGTATTTCGAGACATTCGAGAAGGAGAAAGCAATTGAACTTGGC
TTCTTCGGGTTCTAAGTTAGCGTAAAAGTTGTAAACTCTGCAGAGTCTCAAAGGCACGTT
AGCTACTACTGTGGCAACTTCAAAAAGGGTTGAACACAGTTTGAGGAGAGCTTAGACATT
TTTTTTTCTTTTTTTGTTGTTTGAACAAAATTTTCGCTTGGTAGTTTTTCGTGTAATACA
GTTTTATGCTTTTTCTAATGTATGTTTCTAGTTATTTCACTTGTGACCCCAAATAAACAA
TTTACATATTTGAAGTTCAACAGAGCAACTTCCTTGTGGGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EB83JQ 666 0 0
CTTACCTCATAACAGCTCCAGCAAGCTTCTCAGACATGGCAGCACACCCATTCCATGCAC
TGTTCTACATTGTCTTCATGCTCACTGCTTGTGCTCTTTTCTCAAAGACATGGATTGAGG
TCTCCGGATCATCAACAAGGACGTAGCCAAGCAGCCCAAGGAACAACAAATGGTGATGCC
GGGACACAGAGAGTCGAACTTGCAGAAGGAGCTGAACAGGTATATCCCAACAGCAGCAGC
TTTCGGTGGAGTTTGTATCGGTGCGCTGACTGTTCTTGCTGATTTCATGGGAGCCATTGG
GTCCGGGACTGGAATTCTCCTGGCGGTGACAATCATATATCAGTATTTCGAGACATTCGA
GAAGGAGAAAGCAATTGAACTTGGCTTCTTCGGGTTCTAAGTTAGCGTAAAAGTTGTAAA
CTCTGCAGAGTCTCAAAGGCACGTTAGCTACTACTGTGGCAACTTCAAAAAGGGTTGAAC
ACAGTTTGAGGAGAGCTTAGACATTTTTTTTTCTTTTTTTGTTGTTTGAACAAAATTTTC
GCTTGGTAGTTTTTCGTGTAATACAGTTTTATGCTTTTTCTAATGTATGTTTCTAGTTAT
TTCACTTGTGACCCCAAATAAACAATTTACATATTTGAAGTTCAACAGAGCAACTTCCTT
GTGGGC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

CO CL3391Contig1 930 4 18 U
TTTTTCAGGCTCTAAGTATCCTACATCAAATGTTTATTTCACTGAGGTGTGGAGGATAGA
AAGATTGTTGAAGAAATATGCTCACTGTGATGATGATGGGATAAGAGGAATGATTCAGCC
AATGCAAGCTAAATTCAGTAAGTACTGGGAGGATTATAATATGATTCTCGCTATGGGAGC
TGTGTTAGATCCGAGAATGAAGATTGAGGTTATTGAAAAAGCTTATGAAACTGTGGATCC
TACTACTGCTGTCTTAAAGATCACTGCGCTTAAGAAAAACTTGGAGAATTTCTACAAAGA
CTATCAAGCTAGAAAGTGGGCTAGCTCATCAGGTTCTCCATCTTCACAAACTCCATGAGA
TAGTGAATGAATCACCACTAGAAGAAGAATATGATAATGATCTTTTTGAGTTAGAAAGAA
GCATTGCAGCTGGTGTGGGCAACCCAAAGTCACATTTAGATATTTATTTAGAGGAGCCAA
GAGTAAACAGAAGAAATTATCCAAACTTGGATGTCTTAGGCTTTTGGAAAGAGAATCATC
ATCGACTGAGTGATTTAGCTGACATGGCGAGGGATTTGCTTACCATTCCTCTTACTACAG
TCGCCTCTGAGTCGGCTTTTAGTATTGGTACCATTGAAGAGGATACTGATGGGAAAAAAA
ACAAGTAACTCAGGAGCAGAAAGTTCAAGGTCAGAAGAATCAAACATGTCATGAGAATGA
GCATGAGCGTGTCATAGACTGTGACACATAGTGAAGAGATCAAGAG*AGGTCGTTTGTCA
ACTAGGAAGAAGTTGGTTTATGTCTTGTCTCTATCCATCCTGAAAACGAATTATGGTTTG
TTGAGTACAGACACAAGCTTTATGTACTTGTTTATGTATTGACTGGTTTATGTCTTGTTT
CTATCTAGGTCTGGTCGTTAAATTTCAGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DL94TF U 1
AF RR4DK42TF U 1
AF RR4DK42JQ C 81
AF RR4DL94JQ C 334
BS 1 660 RR4DK42TF
BS 661 661 RR4DK42JQ
BS 662 673 RR4DK42TF
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BS 690 690 RR4DK42JQ
BS 691 695 RR4DK42TF
BS 696 696 RR4DK42JQ
BS 697 703 RR4DK42TF
BS 704 704 RR4DK42JQ
BS 705 716 RR4DK42TF
BS 717 717 RR4DK42JQ
BS 718 754 RR4DK42TF
BS 755 755 RR4DK42JQ
BS 756 766 RR4DK42TF
BS 767 767 RR4DK42JQ
BS 768 779 RR4DK42TF
BS 780 930 RR4DK42JQ

RD RR4DL94TF 693 0 0
TTTTTCAGGCTCTAAGTATCCTACATCAAATGTTTATTTCACTGAGGTGTGGAGGATAGA
AAGATTGTTGAAGAAATATGCTCACTGTGATGATGATGGGATAAGAGGAATGATTCAGCC
AATGCAAGCTAAATTCAGTAAGTACTGGGAGGATTATAATATGATTCTCGCTATGGGAGC
TGTGTTAGATCCGAGAATGAAGATTGAGGTTATTGAAAAAGCTTATGAAACTGTGGATCC
TACTACTGCTGTCTTAAAGATCACTGCGCTTAAGAAAAACTTGGAGAATTTCTACAAAGA
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ATCGACTGAGTGATTTAGCTGACATGGCGAGGGATTTGCTTACCATTCCTCTTACTACAG
TCGCCTCTGAGTCGGCTTTTAGTATTGGTACCATTGAAGAGGATACTGATGGGAAAAAAA
*CAAGTAACTCAG*AGCAGAAAGTTCAAG
TCAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DK42TF 779 0 0
TTTTTCAGGCTCTAAGTATCCTACATCAAATGTTTATTTCACTGAGGTGTGGAGGATAGA
AAGATTGTTGAAGAAATATGCTCACTGTGATGATGATGGGATAAGAGGAATGATTCAGCC
AATGCAAGCTAAATTCAGTAAGTACTGGGAGGATTATAATATGATTCTCGCTATGGGAGC
TGTGTTAGATCCGAGAATGAAGATTGAGGTTATTGAAAAAGCTTATGAAACTGTGGATCC
TACTACTGCTGTCTTAAAGATCACTGCGCTTAAGAAAAACTTGGAGAATTTCTACAAAGA
CTATCAAGCTAGAAAGTGGGCTAGCTCATCAGGTTCTCCATCTTCACAAACTCCATGAGA
TAGTGAATGAATCACCACTAGAAGAAGAATATGATAATGATCTTTTTGAGTTAGAAAGAA
GCATTGCAGCTGGTGTGGGCAACCCAAAGTCACATTTAGATATTTATTTAGAGGAGCCAA
GAGTAAACAGAAGAAATTATCCAAACTTGGATGTCTTAGGCTTTTGGAAAGAGAATCATC
ATCGACTGAGTGATTTAGCTGACATGGCGAGGGATTTGCTTACCATTCCTCTTACTACAG
TCGCCTCTGAGTCGGCTTTTAGTATTGGTACCATTGAAGAGGATACTGATGGGAAAAAAA
*CAAGTAACTCAG*AGCAGAAAGTTCAAG*TCAGA*GAATCAA*CATGTCATGAGA*TGA
GCATGAGCGTGTCATAGACTGTGACACATAGTGA*GAGATCAAGAGGAGGTCGTTTGTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4DK42JQ 850 0 0
CTCACTGTGATGATGATGG*ATAAGAGGAATGATTCAGCCAATGCAAGCTAAATTCAGTA
AGTACTGGGAGGATTATAATATGATTCTCGCTATGGGAGCTGTGTTAGATCCGAGAATGA
AGATTGAGGTTATTGAAAAAGCTTATGAAACTGTGGATCCTACTACTGCTGTCTTAAAGA
TCACTGCGCTTAAGAAAAACTTGGAGAATTTCTACAAAGACTATCAAGCTAGAAAGTGGG
CTAGCTCATCAGGTTCTCCATCTTCACAAACTCCATGAGATAGTGAATGAATCACCACTA
GAAGAAGAATATGATAATGATCTTTTTGAGTTAGAAAGAAGCATTGCAGCTGGTGTGGGC
AACCCAAAGTCACATTTAGATATTTATTTAGAGGAGCCAAGAGTAAACAGAAGAAATTAT
CCAAACTTGGATGTCTTAGGCTTTTGGAAAGAGAATCATCATCGACTGAGTGATTTAGCT
GACATGGCGAGGGATTTGCTTACCATTCCTCTTACTACAGTCGCCTCTGAGTCGGCTTTT
AGTATTGGTACCATTGAAGAGGATACTGATGGGAAAAAAAACAAGTAACTCAGGAGCAGA
AAGTTCAAGGTCAGAAGAATCAAACATGTCATGAGAATGAGCATGAGCGTGTCATAGACT
GTGACACATAGTGAAGAGATCAAGAG*AGGTCGTTTGTCAACTAGGAAGAAGTTGGTTTA
TGTCTTGTCTCTATCCATCCTGAAAACGAATTATGGTTTGTTGAGTACAGACACAAGCTT
TATGTACTTGTTTATGTATTGACTGGTTTATGTCTTGTTTCTATCTAGGTCTGGTCGTTA
AATTTCAGAC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4DL94JQ 597 0 0
TTCTCCATCTTCACAAACTCCATGAGATAGTGAATGAATCACCACTAGAAGAAGAATATG
ATAATGATCTTTTTGAGTTAGAAAGAAGCATTGCAGCTGGTGTGGGCAACCCAAAGTCAC
ATTTAGATATTTATTTAGAGGAGCCAAGAGTAAACAGAAGAAATTATCCAAACTTGGATG
TCTTAGGCTTTTGGAAAGAGAATCATCATCGACTGAGTGATTTAGCTGACATGGCGAGGG
ATTTGCTTACCATTCCTCTTACTACAGTCGCCTCTGAGTCGGCTTTTAGTATTGGTACCA
TTGAAGAGGATACTGATGGGAAAAAAAACAAGTAACTCAGGAGCAGAAAGTTCAAGGTCA
GAAGAATCAAACATGTCATGAGAATGAGCATGAGCGTGTCATAGACTGTGACACATAGTG
AAGAGATCAAGAG*AGGTCGTTTGTCAACTAGGAAGAAGTTGGTTTATGTCTTGTCTCTA
TCCATCCTGAAAACGAATTATGGTTTGTTGAGTACAGACACAAGCTTTATGTACTTGTTT
ATGTATTGACTGGTTTATGTCTTGTTTCTATCTAGGTCTGGTCGTTAAATTTCAGAC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 4

CO CL3392Contig1 552 4 5 U
GCTTTATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAAAGCTGGATGCTCTTCA
GGCAAACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTATACTGTCGACAATCCTACTAAAAATTGGAA
AGGAGGAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGGCTCTGAAAGGATTACCTCTTCCTGCTGA
CGACACACTTATCCTCGTATGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAACATGTATCCGGAGGCAA
AGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAGGAACTCGGATTCACAGA
GCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTATGAATCAAAGTTCCTTAGTTTCTACTCTT
GACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGCGGCCCCTAGGCAAACATTAATTGATGCATGAT
GAGCTTGACACAGGATCTATCAAGCTTTGAAAATAAACAAATCAAAAGGTTCAGTTAGTC
TTTTGTCTCTGGAGGGTTTTAGCTAGCGGGACCTTTGCTATACTTGATTTTGATGATAAA
TTTCTATGCAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4EU43TF U 210
AF RR4EU37TF U 210
AF RR4EX95JQ C 1
AF RR4EX95TF U 1
BS 1 211 RR4EX95TF
BS 212 372 RR4EU37TF
BS 373 373 RR4EX95TF
BS 374 476 RR4EU37TF
BS 477 552 RR4EX95TF

RD RR4EU43TF 136 0 0
GG
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GGGATACTCAAGGAACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTA
TGAATCAAAGTTCC

QA 3 136 3 136
DS 

RD RR4EU37TF 267 0 0
GG
GGGATGATGGAACATGTATCCGGAGGCAAAGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAG
GGGATACTCAAGGAACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTA
TGAATCAAAGTTCCTTAGTTTCTACTCTTGACGAGGTTTCACTTCATGTAATAAAGCGGC
CCCTAGGCAAACATTAATTGATGCATGATGAGCTTGACACAGGATCTATCAAGCTTTGAA
AATAAACAAATCAAAAGGTTCAGTT

QA 3 267 3 267
DS 

RD RR4EX95JQ 549 0 0
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AGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAGGAACTCGGATTCACAGA
GCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTATGAATCAAAGTTCCTTAGTTTCTACTCTT
GACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGCGGCCCCTAGGCAAACATTAATTGATGCATGAT
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TTTTGTCTCTGGAGGGTTTTAGCTAGCGGGACCTTTGCTATACTTGATTTTGATGATAAA
TTTCTATGC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4EX95TF 552 0 0
GCTTTATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAAAGCTGGATGCTCTTCA
GGCAAACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTATACTGTCGACAATCCTACTAAAAATTGGAA
AGGAGGAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGGCTCTGAAAGGATTACCTCTTCCTGCTGA
CGACACACTTATCCTCGTATGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAACATGTATCCGGAGGCAA
AGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAGGAACTCGGATTCACAGA
GCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTATGAATCAAAGTTCCTTAGTTTCTACTCTT
GACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGCGGCCCCTAGGCAAACATTAATTGATGCATGAT
GAGCTTGACACAGGATCTATCAAGCTTTGAAAATAAACAAATCAAAAGGTTCAGTTAGTC
TTTTGTCTCTGGAGGGTTTTAGCTAGCGGGACCTTTGCTATACTTGATTTTGATGATAAA
TTTCTATGCAAA

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 4

CO CL3393Contig1 855 4 44 U
GGAGCGTTGCTTATCGTCAGATTCTTCGAATACATTTCATCCATGGCTTCTTCTCCTTCT
GTTTTAGAGGATCGCCCAGCTCCGCTCGATGCCACAGCCGATCCACCCGCTCTGTTCGAC
GGAACCACGAGATTGTACACAAGTTACGGTTGTCCATATGCTCAACGTGTTTGGATCACC
AGAAACTTTAAGGGTCTGAAAGAAAAGATTAAACTAGTTCCTTTGGATCTTGGGAACAGG
CCTGCTTGGTACAAGGACAAAGTCTATCCAGAAAACAAGGTGCCAGCACTTGAGCACAAT
GGTAAAATCATAGGTGAGAGTCTTGATTTGATCAAGTATCTCGATAACACTTTTGAGGGT
CCTTCGCTTTTTTTGCCCTGAGGATCAAACAAAAAGAGAGTTTGGAGAAGAGTTGTTGAA
GTACACTGATACGTTCATCAAGACTATGTGGGCGTCCCTCAAAAGTGATCCTTTTAAAGA
AACTGCACCTGTGTTGGATTATCTGGAGAACTCTCTGTACAAGTTTGATGAGGGACCATT
CTTCCTCGGCCAGATTAGCTTGGTTGATATCGCTTATATCCCCTTCATTGAGAGGTTTCA
AATCGTACTCAATGAACTGTTTAAGTGTGAAGTTACTGCAGAACGTCCCAAACTATCAGC
TTGGATCGAGGAAATGAACAAGATTGATGCCTATGCACAAACAAAGACCGACTCTAAGGA
GATTGTGGAGATTTTCAAGAGAAAACTCATGTAAGGAAAGAGCACTAACCAGTAAAAGTG
TATGAACTAAGACGTATAATTTAAAGTCAGCAACAACTTGATCTGTACTTTTACTGTTAA
TCAATAATATATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR77TF U 27
AF RR4G712TF U 37
AF RR4BD44TF U 1
AF RR4AB58TF U 60
BS 1 107 RR4BD44TF
BS 108 108 RR4AR77TF
BS 109 143 RR4BD44TF
BS 144 144 RR4AR77TF
BS 145 164 RR4BD44TF
BS 165 165 RR4AR77TF
BS 166 198 RR4BD44TF
BS 199 199 RR4AR77TF
BS 200 224 RR4BD44TF
BS 225 225 RR4AR77TF
BS 226 236 RR4BD44TF
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RD RR4AR77TF 620 0 0
G
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GATGCCACAGCCGATCCACCCGCTCTGTTCGACGGAACCACGAGATTGTACACAAGTTAC
GGTTGTCCATATGCTCGACGTGTTTGGATCACCAGAAACTTTAAGGGTCTGAAAGAAAAG
ATTAAACTAGTTCCTTTGGATCTTGGGAACAGGCCTGCTTGGTACAAGGACAAAGTCTAT
CCAGAAAACAAGGTGCCAGCACTTGAGCACAATGGTAAAATCATAGGTGAGAGTCTTGAT
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AACAAAAAGAGAGTTTGGAGAAGAGTTGTTGAAGTACACTGATACGTTCATCAAGACTAT
GTGGGCGTCCCTCAAAAGTGATCCTTTTAAAGAAACTGCACCTGTGTTGGATTATCTGGA
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TATCGCTTATATCCCCTTCATTGAGAGGTTTCAAATCGTACTCAATGAACTGTTTAAGTG
TGAAGTTACTGCAGAACGT

QA 2 620 2 620
DS 

RD RR4G712TF 660 0 0
GG
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CGATCCACCCGCTCTGTTCGACGGAACCACGAGATTGTACACAAGTTACGGTTGTCCATA
TGCTCAACGTGTTTGGATCACCAGAAACTTTAAGGGTCTGAAAGAAAAGATTAAACTAGT
TCCTTTGGATCTTGGGAACAGGCCTGCTTGGTACAAGGACAAAGTCTATCCAGAAAACAA
GGTGCCAGCACTTGAGCACAATGGTAAAATCATAGGTGAGAGTCTTGATTTGATCAAGTA
TCTCGATAACACTTTTGAGGGTCCTTCGCTTTTTT*GCCCTGAGGATCAAACAAAAAGAG
AGTTTGGAGAAGAGTTGTTTAAGTACACTGATACGTTCATCAAGACTATGTGGGCGTCCC
TCAAAAGTGATCCTTTTAAAGAAACTGCACCTGTGTTGGATTATCTGGAGAACTCTCTGT
ACAAGTTTGATGAGGGACCATTCTTCCTCGGCCAGATTAGCTTGGTTGATATCGCTTATA
TCCCCTTCATTGAGAGGTTTCAAATCGTACTCAATGAACTGTTTAAGTGTGAAGTTACTG
CAGAACGTCCCAAACTATCAGCTTGGATCGAGGAAATGAACAAGATTGATGCCTATGC

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4BD44TF 837 0 0
GGAGCGTTGCTTATCGTCAGATTCTTCGAATACATTTCATCCATGGCTTCTTCTCCTTCT
GTTTTAGAGGATCGCCCAGCTCCGCTCGATGCCACAGCCGATCCACCGGCTCTGTTCGAC
GGAACCACGAGATTGTACACAAGCTACGGTTGTCCATATGCTCAGCGTGTTTGGATCACC
AGAAACTTTAAGGGTCTGCAAGAAAAGATTAAACTAGTTCCTTTAGATCTTGGGAATAGG
CCTGCTTGGTATAAGGACAAAGTCTATCCAGAAAACAAGGTGCCAGCACTTGAGCACAAT
GGTAAAATCATAGGTGAGAGTCTTGATTTGATCAAGTATCTCGACAACACTTTTGAGGGT
CCTTCGCTTTTTTT*CCCTGAGGATCAAACAAAAAGAGAGTTTGGCGAAGAGTTGTTGAA
GTACACTGATACATTCATCAAGACTATGTGGGCGTCCCTCAAAAGTGATCCTTTTAAAGA
AACTGCACCTGTGTTGGATTATCTGGAGAACTCTCTGTACAAGTTTGATGACGGACCATT
CTTCCTTGGCCAGTTTAGCTTGGTTGATATCGCTTATATCCCCTTCATTGAGAGGTTTCA
AATCGTACTCAACGAACTGTTTAAGTGTGAAATTACTGCAGAACGTCCCAAACTATCAGC
TTGGATCGAGGAAATGAACAAGATTGATGCCTATGCACAAACAAAGACCGACTCTAAGGA
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TATGAACTAAGATGTATAATTTAA*GTCAGCAACAACTTGATCTGTACTTTTACTGT

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4AB58TF 796 0 0
G
GTTTTAGAGGATCGCCCAGCTCCGCTCGATGCCACAGCCGATCCACCCGCTCTGTTCGAC
GGAACCACGAGATTGTACACAAGTTACGGTTGTCCATATGCTCAACGTGTTTGGATCACC
AGAAACTTTAAGGGTCTGAAAGAAAAGATTAAACTAGTTCCTTTGGATCTTGGGAACAGG
CCTGCTTGGTACAAGGACAAAGTCTATCCAGAAAACAAGGTGCCAGCACTTGAGCACAAT
GGTAAAATCATAGGTGAGAGTCTTGATTTGATCAAGTATCTCGATAACACTTTTGAGGGT
CCTTCGCTTTTTT*GCCCTGAGGATCAAACAAAAAGAGAGTTTGGAGAAGAGTTGTTGAA
GTACACTGATACGTTCATCAAGACTATGTGGGCGTCCCTCAAAAGTGATCCTTTTAAAGA
AACTGCACCTGTGTTGGATTATCTGGAGAACTCTCTGTACAAGTTTGATGAGGGACCATT
CTTCCTCGGCCAGATTAGCTTGGTTGATATCGCTTATATCCCCTTCATTGAGAGGTTTCA
AATCGTACTCAATGAACTGTTTAAGTGTGAAGTTACTGCAGAACGTCCCAAACTATCAGC
TTGGATCGAGGAAATGAACAAGATTGATGCCTATGCACAAACAAAGACCGACTCTAAGGA
GATTGTGGAGATTTTCAAGAGAAAACTCATGTAAGGAAAGAGCACTAACCAGTAAAAGTG
TATGAACTAAGACGTATAATTTAAAGTCAGCAACAACTTGATCTGTACTTTTACTGTTAA
TCAATAATATATCCC

QA 2 796 2 796
DS 



AS 1 3

CO CL3394Contig1 1117 3 7 U
GTAGTGTGAACAAAATGCATTATTTTACAAACAGAACAGCACACATTACAACAGAAAAAA
TTATTACAAGTGATATACTATCTTACACGAGGAGATTGACTATTGTGAGAAGGCAAAGGA
GAAGCAACTGGAGTTAAGTGCAAGAAAGGCCGATCATAACTATACCTCCTTGGAGATTTC
TGTACAACAGATCCATTGCTACCTCTAGGAAAATCAATCTGTCCTTGTCTGGTTCCACCA
CCATTACTACTACCTCAAGGAGAATCAATCTGGCCTTGTCTTGTTCCAGTTCCACTACCT
CTAGGAGAAATAAACTGAGCTTGTCTGGTTCCACTACCTCTTGGAAAATCAATCTGAGCT
TGTCTATTAACTCCAGGTTTGGTGGTAGTTGTTGCTGATTCAAGCTGATCAAGTTTGGCC
AAAACTTCGGACATCTTCGGTCTGAGTTTTGCATCAGGGTTTAAGCACTGCAACGCAAGA
CTAGCAGCTGTGTATGCTCTTTTCTGAGGATACTGACCTCCTAACCTCGTGTCCATTATT
CGGAAAAGCTTCCTCTTGTCGCCGAGATAAGGTGTTGCCCAGTCAACTAGACTCTGCTCC
ACTCCCACTTTAGATTTGTCCACCGCTCTTCGCCCTGAGAGCAGTTCCAGTAGTACCACA
CCGAAAACTGTAGACGTCGCTCTTAGCTGTTAATCGACCAGTGGCTACATATTCAGGTGC
TGCGTAACCATGAGTACCCATGACTTGTGTGGACACATGTGTCCTGTCACCGGTAGGACC
TGCTTTGGCTAGACCAAAGTCTGAGAGTTTAGCGTTGAATTCAGCGTCGAGTAGAATGTT
AGCAGCTTTGAAGTCTCTGTAAATCACTTGGGACTTAGCATCATGAAGAAACGTAAGCCC
TTTGGCTGCTCCTATTGCAACTTTCATCCTTATAGCCCATGTTAGTGGCTGCGCACCACG
TCTAAAGAGATGATTCTCCAAGCTTCCTTTTGGCATGAACTCGTACACAAGTAACCGGTC
TTCACCCTCCACACAGTACCCAGCTAGTTTGACAAGATTTGGGTGACTCAGCTGACCAAG
ATAGTTCACTTCAGTCGACCACTCCTTGTGACCTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E967JQ U 1
AF RR4GS29JQ U 154
AF RR4GS29TF C 551
BS 1 313 RR4E967JQ
BS 314 314 RR4GS29JQ
BS 315 377 RR4E967JQ
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BS 668 768 RR4GS29JQ
BS 769 1117 RR4GS29TF

RD RR4E967JQ 377 0 0
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TTATTACAAGTGATATACTATCTTACACGAGGAGATTGACTATTGTGAGAAGGCAAAGGA
GAAGCAACTGGAGTTAAGTGCAAGAAAGGCCGATCATAACTATACCTCCTTGGAGATTTC
TGTACAACAGATCCATTGCTACCTCTAGGAAAATCAATCTGTCCTTGTCTGGTTCCACCA
CCATTACTACTACCTCAAGGAGAATCAATCTGGCCTTGTCTTGTTCCAGTTCCACTACCT
CTAGGAGAAATAATCTGAGCTTGTCTGGTTCCACTACCTCTTGGAAAATCAATCTGAGCT
TGTCTATTAACTCCAGG

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR4GS29JQ 615 0 0
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TCAATCTGTCCTTGTCTGGTTCCACCACCATTACTACTACCTCTAGGAGAATCAATCTGG
CCTTGTCTTGTTCCAGTTCCACTACCTCTAGGAGAAATAAACTGAGCTTGTCTGGTTCCA
CTACCTCTTGGAGAATCAATCTGAGCTTGTCTATTAGCTCCAGGTTTGGTGGTAGTTGTT
GCTGATTCAAGCTGATCAAGTTTGGCCAAAACTTCGGACATCTTCGGTCTGAGTTTTGCA
TCAGGGTTTAAGCACTGCAACGCAAGACTAGCAGCTGTGTATGCTCTTTTCTGAGGATAC
TGACCTCCTAACCTCGTGTCCATTATTCGGAAAAGCTTCCTCTTGTCGCCGAGATAAGGT
GTTGCCCAGTCAACTAGACTCTGCTCCACTCCCACTTTAGATTTGTCCACCGCTCTTCGC
CCTGAGAGCAGTTCCAGTAGTACCACACCGAAA*CTGTAGACGTCGCTCTTAGCTGTTAA
TCGACCAGTGGCTACATATTCAGGTGCTGCGTAACCATGAGTACCCATGACTTGTGTGGA
CACATGTGTCCTGTC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4GS29TF 567 0 0
CTCCTC
TGTCGCCGAGATAAGGTGT*GCCCAGTCAACTAGACTCTGCTCCACTCCCACTTTAGATT
TGTCCACCGCTCTTCGCC*TGAGAGCAGTTCCAGTAGTACCACACCGAAAACTGTAGACG
TCGCTCTTAGCTGTTAATCGACCAGTGGCTACATATTCAGGTGCTGCGTAACCATGAGTA
CCCATGACTTGTGTGGACACATGTGTCCTGTCACCGGTAGGACCTGCTTTGGCTAGACCA
AAGTCTGAGAGTTTAGCGTTGAATTCAGCGTCGAGTAGAATGTTAGCAGCTTTGAAGTCT
CTGTAAATCACTTGGGACTTAGCATCATGAAGAAACGTAAGCCCTTTGGCTGCTCCTATT
GCAACTTTCATCCTTATAGCCCATGTTAGTGGCTGCGCACCACGTCTAAAGAGATGATTC
TCCAAGCTTCCTTTTGGCATGAACTCGTACACAAGTAACCGGTCTTCACCCTCCACACAG
TACCCAGCTAGTTTGACAAGATTTGGGTGACTCAGCTGACCAAGATAGTTCACTTCAGTC
GACCACTCCTTGTGACCTTGA

QA 7 567 7 567
DS 



AS 1 3

CO CL3395Contig1 559 3 2 U
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TTGAAACCGGCGGGTTTCTCGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGATTACCGTCGCTCGCA
AGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCCAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAAG
CCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAAG
GGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTCGATGGATAC
AGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTC
ACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTCGCCGGAATCCTAGCCGGAGGAGCTCTTCTT
*GTGTACAACACAAGTGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTGTAACTCATGT
TTCTTTCTATGTTTGTGTTCTTTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTGAACTTTATAA
AAGAACTCTAGTATTTGTG


BQ
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AF RR4CI76JQ C 1
AF RR4CI76TF U 1
AF RR4CS71TF U 327
BS 1 551 RR4CI76TF
BS 552 559 RR4CS71TF

RD RR4CI76JQ 552 0 0
GGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACG
TTGAAACCGGCGGGTTTCTCGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGATTACCGTCGCTCGCA
AGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCCAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAAG
CCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAAG
GGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTCGATGGATAC
AGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTC
ACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTCGCCGGAATCCTAGCCGGAGGAGCTCTTCTT
*GTGTACAACACAAGTGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTGTAACTCATGT
TTCTTTCTATGTTTGTGTTCTTTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTGAACTTTATAA
AAGAACTCTAG
C

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4CI76TF 552 0 0
GGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACG
TTGAAACCGGCGGGTTTCTCGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGATTACCGTCGCTCGCA
AGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCCAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAAG
CCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAAG
GGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTCGATGGATAC
AGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTC
ACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTCGCCGGAATCCTAGCCGGAGGAGCTCTTCTT
*GTGTACAACACAAGTGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTGTAACTCATGT
TTCTTTCTATGTTTGTGTTCTTTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTGAACTTTATAA
AAGAACTCTAG
C

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4CS71TF 233 0 0
GTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGAC
GCTCGCTGGAATCCTAGCCGGAGGAGCTCTTCTTTGTGTACAACACAAGTGCTTTGGCTC
AGTAAATCTTTTAAAGGACATGTGTAACTCATGTTTCTCCCTATGTTTGTGTTCTTTTCT
CTGTAATGCTCAGAACATACTTTGAACTTTATAAAAGAACTCTAGTATTTGTG

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 4

CO CL3396Contig1 997 4 10 U
TAAATAAACCCATCAGAAAACGTTTTAACCTAAATCTCTGCGATCATGCCGGCCAGAAAC
ATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAGCGCACTTAGGGCGGCCCTC
GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGTGCCACCACTCCTTCAGGCCTCGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCCGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGTTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCGTTCGGTCTCTCCGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCCATAGGTTTCATCGTTGGA
GCTAACATCCTCGCGGGGGGAGCTTTCAGGGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTT
GGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTT
GTCGGTGGGGGGCTCGCCGGAATCATTTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAGCGGTCAC
GAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTT
GTTTTTATTTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGGCTGTTGGATTTTCTTTTCAGATGA
ACCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTGTCCTTG
AAGGCTTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTTT


BQ
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TG

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ATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTGTCCTTGAAGGCTTTTTAGATGAAT
GTGAATTATGCATGCTTTT

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DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RR4C789TF U 132
AF RR4C660TF U 1
AF RR4C660JQ C 277
AF RR4C789JQ C 412
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RD RR4C789TF 167 0 0
ACTTGCCCAAGTCTTATCCCATTCACTGCAACGTGGCTTTTTCACCGAGCAGTACATTCG
GGTTAGGTCCTCTCAAGCTGCACAACAGAGGCTTTCGTCTAAGGCCATGTCGAGTCAAAC
GGGAAGAGAACAACCAAACCGCTGATGTTAAAAGCATATCATTGGAT

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR4C660TF 671 0 0
GGGGATTCTCATCTTTGGGATTGATTTCAATTCCTTTCTTTCCATGGCGCTTCATGGGTG
TGGATTCTTATGCAAAGTTTCAAACACAGTAGCGAGCACTTCTCTGCTTGTTGGTTCGAC
GAGGCTGCTTCACTTGCCCAAGTCTTATCCCATTCACTGCAACGTGGCTTTTTCACCGAG
CAGTACATTCGGGTTAGGTCCTCTCAAGCTGCACAACAGAGGCTTTCGTCTAAGGCCATG
TCGAGTCAAACGGGAAGAGAACAACCAAACCGCTGATGTTAAAAGCATATCATTGGATGA
GAACACGTTGAAGCAAGATCTGGAGAGTGCGATCCAGGATGAGAACTATGTGGAGGCAGC
TAGGATCCGGGATAGATTAAAAGAGCTTCAAGAAGACAGCAGAGCTTCTGCTCTGTCTGC
CAACACTCGGTTCTACCAAGCTTTCAGAAACGGGGATTTAGCTGCGATGCAATCTTTATG
GTCGAAATCAGGAAAGCCCTGCTGTGTCCATCCTGGAGCTAAAGGGATAACCGGGTACGA
TGACGTGGTGGAAAGCTGGGAGGTTGTGTGGATGAACTACGAGTTTCCGTTACTGATCGA
GCTGAAAGATGTTGAGGTTCATGTCCGAGGGGAAGTAGGGTATGTGACGTGTATGGAGTT
TGTGAAGACGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4C660JQ 728 0 0
TGTTAAAAGCATATCATTGGATGAGAACACGTTGAAGCAAGATCTGGAGAGTGCGATCCA
GGATGAGAACTATGTGGAGGCAGCTAGGATCCGGGATAGATTAAAAGAGCTTCAAGAAGA
CAGCAGAGCTTCTGCTCTGTCTGCCAACACTCGGTTCTACCAAGCTTTCAGAAACGGGGA
TTTAGCTGCGATGCAATCTTTATGGTCGAAATCAGGAAAGCCCTGCTGTGTCCATCCTGG
AGCTAAAGGGATAACCGGGTACGATGACGTGGTGGAAAGCTGGGAGGTTGTGTGGATGAA
CTACGAGTTTCCGTTACTGATCGAGCTGAAAGATGTTGAGGTTCATGTCCGAGGGGAAGT
AGGGTATGTGACGTGTATGGAGTTTGTGAAGACGAAAGGGAGTAGTAGCTGGGGAGCTCA
GTTTGTGTCCAATGTGTTTGAAAAGATCGATGGGGAATGGTTTATATGCATTCACCATGC
TTCTCCTGTTGATCTTTGATCCTAAGAACCAGAGAAATGGCCGTGGGATATAGATTGGGG
GTTGCTGAAATGAGATGAAGGGCTGTTCTGTTTTTTTATCTTTGCGGTTGGGTGATTGAG
ACCAAAGCATTAGAGGGAAACAAGAAGATGCATAAGTTCTGACGTTTGATGTTGTTGTCT
TTGTAATCTGTATGATGTTTATTTTCTTGTAGGCGCAACAGTTTTTTTTAATCTAACATT
CTAAACCG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4C789JQ 550 0 0
TCTGTCTGCCAACACTCGGTTCTACCAAGCTTTCAGAAACGGGGATTTAGCTGCGATGCA
ATCTTTATGGTCGAAATCAGGAAAGCCCTGCTGTGTCCATCCTGGAGCTAAAGGGATAAC
CGGGTACGATGACGTGGTGGAAAGCTGGGAGGTTGTGTGGATGAACTACGAGTTTCCGTT
ACTGATCGAGCTGAAAGATGTTGAGGTTCATGTCCGAGGGGAAGTAGGGTATGTGACGTG
TATGGAGTTTGTGAAGACGAAAGGGAGTAGTAGCTGGGGAGCTCAGTTTGTGTCCAATGT
GTTTGAAAAGATCGATGGGGAATGGTTTATATGCATTCACCATGCTTCTCCTGTTGATCT
TTGATCCTAAGAACCAGAGAAATGGCCGTGGGATATAGATTGGGGGTTGCTGAAATGAGA
TGAAGGGCTGTTCTGTTTTTTTATCTTTGCGGTTGGGTGATTGAGACCAAAGCATTAGAG
GGAAACAAGAAGATGCATAAGTTCTGACGTTTGATGTTGTTGTCTTTGTAATCTGTATGA
TGTTTATTTT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 4

CO CL3398Contig1 550 4 1 U
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GACATACAAAGATGTCGTCTCTTCTTCTGACTCAGAGTTAACTACAGTGTCAGATTTCTA
CTACACCAAGTACAAGAGCTCAGCTCCATTGCTTGGGTGGATTCAACGAATCCAAAACGG
ACAGATACAAGTTGATGAGGAAGTTGTAAAAGATCCCAACACACTCCTTAGGAGTGGTTC
CAAGTTAGTTTACCATAGGCTTCCTTGGAAGGAACCTGACACGCCACACTTGCTTGATAT
TCTGTATCGAGACCATGATTTGATCGCTTTAAACAAACCGTCCGGACTCCAAGTATTGCC
AGGAGGACTTTTCCAGCAAAGAAGGTGTTTTGGTGAATCACACCCTGTCCCTGTACATCG
ACTTGGGAGAGGCACATCAGGTATACTTCTCTGTGCTAAGACAAAGCTGATACGTTTTAC
TGTATCGAACTTGTAACAAGGATCAAGCTAAGGGAACTCCAACGATTTTATTGATAAAAA
GAGAATTACG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4GG01JQ C 1
AF RR4GG01TF U 1
AF RR4GH07TF U 1
AF RR4GH07JQ C 1
BS 1 550 RR4GG01TF

RD RR4GG01JQ 550 0 0
GTGGACCAAGATGTCGCCGCAGCAAATTGGCTTGCCATGGCCCGAGCTCAACGATGGTTT
GACATACAAAGATGTCGTCTCTTTTTTTGACTCAGAGTTAACTACAGTGTCAGATTTTTA
CTACACCAAGTACAAGAGCTCAGCTCCATTGCTTGGGTGGATTCAACGAATCCAAAACGG
ACAGATACAAGTTGATGAGGAAGTTGTAAAAGATCCCAACACACTCCTTAGGAGTGGTTC
CAAGTTAGTTTACCATAGGCTTCCTTGGAAGGAACCTGACACGCCACACTTGCTTGATAT
TTTGTATCGAGACCATGATTTGATCGCTTTAAACAAACCGTCCGGACTCCAAGTATTGCC
AGGAGGACTTTTCCAGCAAAGAAGGTGTTTTGGTGAATCACACCCTGTCCCTGTACATCG
ACTTGGGAGAGGCACATCAGGTATACTTCTCTGTGCTAAGACAAAGCTGATACGTTTTAC
TGTATCGAACTTGTAACAAGGATCAAGCTAAGGGAACTCCAACGATTTTATTGATAAAAA
GAGAATTACG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4GG01TF 550 0 0
GTGGACCAAGATGTCGCCGCAGCAAATTGGCTTGCCATGGCCCGAGCTCAACGATGGTCT
GACATACAAAGATGTCGTCTCTTCTTCTGACTCAGAGTTAACTACAGTGTCAGATTTCTA
CTACACCAAGTACAAGAGCTCAGCTCCATTGCTTGGGTGGATTCAACGAATCCAAAACGG
ACAGATACAAGTTGATGAGGAAGTTGTAAAAGATCCCAACACACTCCTTAGGAGTGGTTC
CAAGTTAGTTTACCATAGGCTTCCTTGGAAGGAACCTGACACGCCACACTTGCTTGATAT
TCTGTATCGAGACCATGATTTGATCGCTTTAAACAAACCGTCCGGACTCCAAGTATTGCC
AGGAGGACTTTTCCAGCAAAGAAGGTGTTTTGGTGAATCACACCCTGTCCCTGTACATCG
ACTTGGGAGAGGCACATCAGGTATACTTCTCTGTGCTAAGACAAAGCTGATACGTTTTAC
TGTATCGAACTTGTAACAAGGATCAAGCTAAGGGAACTCCAACGATTTTATTGATAAAAA
GAGAATTACG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4GH07TF 550 0 0
GTGGACCAAGATGTCGCCGCAGCAAATTGGCTTGCCATGGCCCGAGCTCAACGATGGTCT
GACATACAAAGATGTCGTCTCTTCTTCTGACTCAGAGTTAACTACAGTGTCAGATTTCTA
CTACACCAAGTACAAGAGCTCAGCTCCATTGCTTGGGTGGATTCAACGAATCCAAAACGG
ACAGATACAAGTTGATGAGGAAGTTGTAAAAGATCCCAACACACTCCTTAGGAGTGGTTC
CAAGTTAGTTTACCATAGGCTTCCTTGGAAGGAACCTGACACGCCACACTTGCTTGATAT
TCTGTATCGAGACCATGATTTGATCGCTTTAAACAAACCGTCCGGACTCCAAGTATTGCC
AGGAGGACTTTTCCAGCAAAGAAGGTGTTTTGGTGAATCACACCCTGTCCCTGTACATCG
ACTTGGGAGAGGCACATCAGGTATACTTCTCTGTGCTAAGACAAAGCTGATACGTTTTAC
TGTATCGAACTTGTAACAAGGATCAAGCTAAGGGAACTCCAACGATTTTATTGATAAAAA
GAGAATTACG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4GH07JQ 550 0 0
GTGGACCAAGATGTCGCCGCAGCAAATTGGCTTGCCATGGCCCGAGCTCAACGATGGTTT
GACATACAAAGATGTCGTCTCTTTTTTTGACTCAGAGTTAACTACAGTGTCAGATTTTTA
CTACACCAAGTACAAGAGCTCAGCTCCATTGCTTGGGTGGATTCAACGAATCCAAAACGG
ACAGATACAAGTTGATGAGGAAGTTGTAAAAGATCCCAACACACTCCTTAGGAGTGGTTC
CAAGTTAGTTTACCATAGGCTTCCTTGGAAGGAACCTGACACGCCACACTTGCTTGATAT
TTTGTATCGAGACCATGATTTGATCGCTTTAAACAAACCGTCCGGACTCCAAGTATTGCC
AGGAGGACTTTTCCAGCAAAGAAGGTGTTTTGGTGAATCACACCCTGTCCCTGTACATCG
ACTTGGGAGAGGCACATCAGGTATACTTCTCTGTGCTAAGACAAAGCTGATACGTTTTAC
TGTATCGAACTTGTAACAAGGATCAAGCTAAGGGAACTCCAACGATTTTATTGATAAAAA
GAGAATTACG

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 4

CO CL3399Contig1 1255 4 23 U
TATTGTCTCATTAAAAAACCATAATAGCATCACTACAAGCTTAAGTCAAAAGGAGAAGAG
AAACTTATCAAAAAAAAAAAGAGAAGAGAAACGATATGAAGCCATCTTATTATTGATCCA
CGTTCCCATTTCCGATACTTTTCAAATATTATTAAAAAACAATACGATTTTATTATTAAG
AAGAAAAATATGAAATCTTCTTAAGGAAAAAAAGAAACAAACCCATCAAATCAAACTAAT
TGACACGTGAACAATCCCTTCGAATCTCACCAGCATTACCAGTCATAACCCCAACACGAC
CCAACTTCGTGATGGCTGAAATAAAAGCTTGTCTAAAAGCTGTTTCACTGTTGGCAAACG
AATTAACCGTAGCTCTAGACCGTTGGTCTGTGAACAATACTTGATCAGACGTGAAAAGAC
CCTTTCCTTGTTGAAGGTTCTTGAAGTAAGCGTTGTCGAAAGTACGTGGCGAGGTCGGAT
CCATGTTGATCGCGATACGTGGGTCCACACGTTGCGGGCACATCTGGCGAAGCTGAAGCG
CGTAGCCACTGTTCAAACTCGGGTCGATACGGGTTCTAGGGCTAAAATTGTAAATTCGGT
TCGAGAATTTTCCGCAATGTGCGAATCCGAGAGTGTGCGCTCCTGAGAGGGCGATCATGT
CGGTTTGAGAGAGACCGTGACGGTTGAACATGGCATTGAGCTGGTTTAGGTTAAACCCGG
GCTGTGGCAAATTATTTTGAACGCTTGCCTTCGTAGATAATCTGCCATCTCTCCTCCCTA
GCTCCACCGGGTAGCTAGGTCCTCCGGTCAAAACGACGACTTCACGAGTAGCGAGAGCCA
AAATGTCAGCACATGAGACTTTGTTGCGGCATCTAGGATCTCTATCAACGGCCTGCTTCG
CCTTCACCACTGTGTCAAATCCGTCTCCGGCCAATGACATGTCATCCGGATGGTCTCTCT
CCGATGGAGATGCTATCATTATCGAAGCATCACATCCACGAACGAAGCAATCGTGGAAGA
AGAGGCGGAGGGTGGCTGGAGCAGTGACAAAAGTCTGCGGGAATTTTTGACGGACGGCGT
TACGGACAATGCTTTCTAAGTTCGGGCACGAGTTCTGGTAGAAACCTGTCCGAAGCTGAG
CAGAGACACATGAAGAAAAAAGAAGAAGAAGAGTAAATATGGAGAAAATGGTTTGGTTAG
TCTTCTTCTCCATGGCTAATTATAATTTTTATTGTAATGGTTTGGAGGGGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE71JQ U 85
AF RR4FL94JQ U 1
AF RR4FL94TF C 446
AF RR4EE71TF C 647
BS 1 142 RR4FL94JQ
BS 143 143 RR4EE71JQ
BS 144 212 RR4FL94JQ
BS 213 213 RR4EE71JQ
BS 214 295 RR4FL94JQ
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BS 297 319 RR4FL94JQ
BS 320 320 RR4EE71JQ
BS 321 709 RR4FL94JQ
BS 710 710 RR4FL94TF
BS 711 753 RR4FL94JQ
BS 754 1098 RR4FL94TF
BS 1099 1099 RR4EE71TF
BS 1100 1108 RR4FL94TF
BS 1109 1109 RR4EE71TF
BS 1110 1149 RR4FL94TF
BS 1150 1150 RR4EE71TF
BS 1151 1155 RR4FL94TF
BS 1156 1156 RR4EE71TF
BS 1157 1186 RR4FL94TF
BS 1187 1187 RR4EE71TF
BS 1188 1223 RR4FL94TF
BS 1224 1255 RR4EE71TF

RD RR4EE71JQ 543 0 0
CGG
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ATTATTAAAAA*CAATACGATTTTATTATTAAGAAGAAAAATATGAAATCTTCTTAAGGA
AAAAAAGAAACAAACCCATCAAATCAAACTAATTGAGACGTGAACAATCCCTTCGAATCT
CACCAGCATTACCAGTCATAACCCCAACACGACCCAACTTCGTGATGGCTGAAATAAAAG
CTTGTCTAAAAGCTGTTTCACTGTTGGCAAACGAGTTAACCGTAGCTCTAGACCGTTGGT
CTGTGAACAATACTTGATCAGACGTGAAAAGACCCTTTCCTTGTTGAAGGTTCTTGAAGT
AAGCGTTGTCGAAAGTACGTGGCGAGGTCGGATCCATGTTGATCGCGATACGTGGGTCCA
CACGTTGCGGGCACATCTGGCGAAGCTGAAGCGCGTAGCCACTGTTCAAACTCGGGTCGA
TACGGGTTCTAGGGCTAAAATTGTAAATTCGGTTCGAGAATTTTCCGCAATGTGCGAATC

QA 4 543 4 543
DS 

RD RR4FL94JQ 753 0 0
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AAACTTATCAAAAAAAAAAAGAGAAGAGAAACGATATGAAGCCATCTTATTATTGATCCA
CGTTCCCATTTCCGATACTTTTGAAATATTATTAAAAAACAATACGATTTTATTATTAAG
AAGAAAAATATGAAATCTTCTTAAGGAAAAAA*GAAACAAACCCATCAAATCAAACTAAT
TGACACGTGAACAATCCCTTCGAATCTCACCAGCATTACCAGTCATAACCCCAACCCGAC
CCAACTTCGTGATGGCTGAGATAAAAGCTTGTCTAAAAGCTGTTTCACTGTTGGCAAACG
AATTAACCGTAGCTCTAGACCGTTGGTCTGTGAACAATACTTGATCAGACGTGAAAAGAC
CCTTTCCTTGTTGAAGGTTCTTGAAGTAAGCGTTGTCGAAAGTACGTGGCGAGGTCGGAT
CCATGTTGATCGCGATACGTGGGTCCACACGTTGCGGGCACATCTGGCGAAGCTGAAGCG
CGTAGCCACTGTTCAAACTCGGGTCGATACGGGTTCTAGGGCTAAAATTGTAAATTCGGT
TCGAGAATTTTCCGCAATGTGCGAATCCGAGAGTGTGCGCTCCTGAGAGGGCGATCATGT
CGGTTTGAGAGAGACCGTGACGGTTGAACATGGCATTGAGCTGGTTTAG*TTAAACCCGG
GCTGTGGCAAATTATTTTGAACGCTTGCCTTCG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4FL94TF 780 0 0
AGTAAGCG
TGTCGAAAGTACGTGGCGAGGTCGGATCCATGTTGATCGCGATACGTGGGTCCACACGTT
GCGGGCACATCTGGCGAAGCTGAAGCGCGTAGCCACTGTTCAAACTCGGGTCGATACGGG
TTCTAGGGCTAAAATTGTAAATTCGGTTCGAGAATTTTCCGCAATGTGCGAATCCGAGAG
TGTGCGCTCCTGAGAGGGCGATCATGTCGGTTTGAGAGAGACCGTGACGGTTGAACATGG
CATTGAGCTGGTTTAGGTTAAACCCGGGCTGTGGCAAATTATTTTGAACGCTTGCCTTCG
TAGATAATCTGCCATCTCTCCTCCCTAGCTCCACCGGGTAGCTAGGTCCTCCGGTCAAAA
CGACGACTTCACGAGTAGCGAGAGCCAAAATGTCAGCACATGAGACTTTGTTGCGGCATC
TAGGATCTCTATCAACGGCCTGCTTCGCCTTCACCACTGTGTCAAATCCGTCTCCGGCCA
ATGACATGTCATCCGGATGGTCTCTCTCCGATGGAGATGCTATCATTATCGAAGCATCAC
ATCCACGAACGAAGCAATCGTGGAAGAAGAGGCGGAGGGTGGCTGGAGCAGTGACAAAAG
TCTGCGGGAATTTTTGACGGACGGCGTTACGGACAATGCTTTCTACGTTCGGGCATGAGT
TCTGGTAGAAACCTGTCCGAAGCTGAGCAGAGACACTTGAAGCAAAAAGAAGAAGAAGAG
TAAATATGGAGAAGATGGTTTGGTTAGTCTTCTTCTCCATGGCTAATTAT
CC

QA 9 778 9 778
DS 

RD RR4EE71TF 609 0 0
GAGGGCGATCATGTCGGTTTGAGAGAGACCGTGACGGTTGAACATGGCATTGAGCTGGTT
TAGGTTAAACCCGGGCTGTGGCAAATTATTTTGAACGCTTGCCTTCGTAGATAATCTGCC
ATCTCTTCTCCCTAGCTCCACCGGGTAGCTAGGTCCTCCGGTCAAAACGACGACTTCACG
AGTAGCGAGAGCCAAAATGTCAGCACATGAGACTTTGTTGCGGCATCTAGGATCTCTATC
AACGGCCTGCTTCGCCTTCACCACTGTGTCAAATCTGTCTCCGGCCAATGACATGTCATC
CGGATGGTCTCTCTCCGATGGAGATGCTATCATTATCGAAGCATCACATCCACGAACGAA
GCAATCGTGGAAGAAGAGGCGGAGGGTGGCTGGAGCAGTGACAAAAGTCTGCTGGAATTT
TTGACGGACGGCGTTACGGACAATGCTTTCTAAGTTCGGGCACGAGTTCTGGTAGAAACC
TGTCCGAAGCTGAGCAGAGACACATGAAGAGAAAAGAAGAAGAAGAGTAAATATGGAGAA
AATGGTTTGGTTAGTCTTCTTCTCCATGGCTAATTATAATTTTTATTGTAATGGTTTGGA
GGGGGTCCC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 3

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GTGTTACAAGAAACAAAAGCAAAGGAAACTGAACAGTCTGTTGGTGTCTCAAGTACCCAA
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GTAAACCAGAGACCACAATGCAGATGCCTAGTGACAATATACTGTACCACGCGACTCGCG
AGTTTGTTATTTCACTCACAATCCTCATGTCTGCTTCTCTGTTTCGGAGGTAAAGTAGGT
TTTCATGTATGGCCTCAACTGAACCTTCGAGTTTCCTAAGCTCAAGCTCCACACCCTCGA
TCTTCTCTTTTCTAGCAATGGAGTCCCAATCCTTGGCCGCGATTCCAGTTTTCCAGTCAA
GGTTGATACTAATATCCTTGTTACCGTGACTATTCCCTACGGCCTCAAAACAGGCAAAGT
AGGTTCCTGATTCCTGGGTTGTAAACGCAAACTGACCATGCGTAGCATTTTCGCTATGGT
GCAAAACGCTGCCATATGGTGATGTAACCTTGAGAGAAACAGTAGGGAAGATGGAATGTT
CGTCGGAGATGACGAGGTAATCGGCCAAAACGACGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW86JQ U 2
AF RR4GM48JQ U 1
AF RR4GM48TF C 489
BS 1 475 RR4GM48JQ
BS 476 476 RR4FW86JQ
BS 477 626 RR4GM48JQ
BS 627 636 RR4GM48TF

RD RR4FW86JQ 599 0 0
G
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GTTACAAGAAA*AAAAGCAAAGGAAACTGAACAGTCTGTTGGTGTCTCAAGTACCCATGG
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AAACCAGAGACCACAATGCAGATGCCTAGTGACATTATACTGTACCATGCGACTCGCGAG
TTTGTTTTTTCACTCACAATCCTCATGTCTGCTTCTCTGTTTCGGAGGTAAAGTAGGTTT
TCATGTATGGCCTCAACTGAACCTTCGAGTTTCCTAAGCTCAAGCTCCACACCCTCGATC
TTCTCTTTTCTAGCAATGGGGTCCCAATCCTTGGCCGCGATTCCAGTTTTCCAGTCAAGG
TTGATACTAATATCCTTGTTACCGTGACTATTCCCTACGGCCTCAAAACAGGCAAAGTAG
GTTCCTGATTCCTGGGTTGTAAACGCAAACTGACCATGCGTAGCATTTTCGCTATGGTGC
AAAACGCTGCCATATGGTGATGTAACCTTGAGAGAAACAGTAGGGAAGATGGGATGTT

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR4GM48JQ 626 0 0
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GTAAACCAGAGACCACAATGCAGATGCCTAGTGACAATATACTGTACCACGCGACTCGCG
AGTTTGTTATTTCACTCACAATCCTCATGTCTGCTTCTCTGTTTCGGAGGTAAAGTAGGT
TTTCATGTATGGCCTCAACTGAACCTTCGAGTTTCCTAAGCTCAAGCTCCACACCCTCGA
TCTTCTCTTTTCTAGCAATGGAGTCCCAATCCTTGGCCGCGATTCCAGTTTTCCAGTCAA
GGTTGATACTAATATCCTTGTTACCGTGACTATTCCCTACGGCCTCAAAACAGGCCAAGT
AGGTTCCTGATTCCTGGGTTGTAAACGCAAACTGACCATGCGTAGCATTTTCGCTATGGT
GCAAAACGCTGCCATATGGTGATGTAACCTTGAGAGAAACAGTAGGGAAGATGGAATGTT
CGTCGGAGATGACGAGGTAATCGGCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4GM48TF 148 0 0
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CTGCCATATGGTGATGTAACCTTGAGAGAAACAGTAGGGAAGATGGAATGTTCGTCGGAG
ATGACGAGGTAATCGGCCAAAACGACGA

QA 1 148 1 148
DS 



AS 1 4

CO CL3401Contig1 525 4 11 U
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AAAAAAAAGAGAGGTTTCAGTGCTTAGCTCAAGATGATCATCCCTGTTCGCTGCTTTACC
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ATGACTCACGTTGATCTTATTGAGAAGCTTCTCAACTATAACACTCTGGAAAAATCAGAC
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TATACATTATGGAATATGTATGAATCTCTTGTGTGTTTGGTGTAGAAAATTAAATCAATC
TGAATCATGTTGGTTTTAGACTACGTCAGGGATTTTGTCATATGCATGTCGGGTGTCTCT
ACGTGTTATGATTTTCTGAGCTGAAAGATTTGTACTTCTAAGTAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4G579JQ C 1
AF RR4B706TF U 35
AF RR4BI91TF U 35
AF RR4G579TF U 1
BS 1 36 RR4G579TF
BS 37 140 RR4B706TF
BS 141 141 RR4G579TF
BS 142 242 RR4B706TF
BS 243 243 RR4G579TF
BS 244 364 RR4B706TF
BS 365 365 RR4G579TF
BS 366 423 RR4B706TF
BS 424 424 RR4G579TF
BS 425 523 RR4B706TF
BS 524 525 RR4G579JQ

RD RR4G579JQ 525 0 0
GGGCCTATTAAAAAGGAAAGCGTGAAGTGAAGCAGTAAACCCTAAAACTCCCAAGCTGAG
AAAAAAAAGAGAGGTTTCAGTGCTTAGCTCAAGATGATCATCCCTGTTCGCTGCTTTACC
TGTGGAAAGGTGATTGGAAACAAGTGGGATGCCTATCTTGATCTTCTCCAGCTTGACTAC
ACTGAAGGGGATGCACTTGATGCGCTCAACTTGGTGAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTT
ATGACTCACGTTGATCTTATTGAGAAGCTTCTCAACTATAACACTCTGGAAAAATCAGAC
AACAGTTGAAAAAGAGAGGATGCAAATCTGTTGAAAGAGTGTTGTTACTCGTCAGAGGGC
TATACATTATGGAATATGTATGAATCTCTTGTGTGTTTGGTGTAGAAAATTAAATCAATC
TGAATCATGTTGGTTTTAGACTACGTCAGGGATTTTGTCATATGCATGTCGGGTGTCTCT
ACGTGTTATGATTTTCTGAGCTGAAAGATTTGTACTTCTAAGTAA

QA 1 525 1 525
DS 

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GG
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ATCATCCCTGTTCGCTGCTTTACCTGTGGAAAGGTGATTGGAAATAAGTGGGATGCCTAT
CTTGATCTTCTCCAGCTTGACTACACTGAAGGGGATGCACTTGATGCGCTCAACTTGGTG
AGATACTGCTGCAGGCGTATGCTTATTACTCACGTTGATCTTATTGAGAAGCTTCTCAAC
TATAACACTCTGGAAAAATCAGACAACAGTTGAAAAAGAGAGGATGCAAATCTGTTGAAA
GAGTGTTGTTACTCGTCAGAGGGCTATATATTATGGAATATGTATGAATCTCTTGTGTGT
TTGGTGTAGAAAATTAAATCAATCTGAGTCATGTTGGTTTTAGACTACGTCAGGGATTTT
GTCATATGCATGTCGGGTGTCTCTACGTGTTATGATTTTCTGAGCTGAAAGATTTGTACT
TCTAAGT

QA 3 489 3 489
DS 

RD RR4BI91TF 489 0 0
GG
AAACCCTAAAACTCCCAAGCTGAGAAAAAAAAGAGAGGTTTCAGTGCTTAGCTCAAGATG
ATCATCCCTGTTCGCTGCTTTACCTGTGGAAAGGTGATTGGAAATAAGTGGGATGCCTAT
CTTGATCTTCTCCAGCTTGACTACACTGAAGGGGATGCACTTGATGCGCTCAACTTGGTG
AGATACTGCTGCAGGCGTATGCTTATTACTCACGTTGATCTTATTGAGAAGCTTCTCAAC
TATAACACTCTGGAAAAATCAGACAACAGTTGAAAAAGAGAGGATGCAAATCTGTTGAAA
GAGTGTTGTTACTCGTCAGAGGGCTATATATTATGGAATATGTATGAATCTCTTGTGTGT
TTGGTGTAGAAAATTAAATCAATCTGAGTCATGTTGGTTTTAGACTACGTCAGGGATTTT
GTCATATGCATGTCGGGTGTCTCTACGTGTTATGATTTTCTGAGCTGAAAGATTTGTACT
TCTAAGT

QA 3 489 3 489
DS 

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GGGCCTATTAAAAAGGAAAGCGTGAAGTGAAGCAGTAAACCCTAAAACTCCCAAGCTGAG
AAAAAAAAGAGAGGTTTCAGTGCTTAGCTCAAGATGATCATCCCTGTTCGCTGCTTTACC
TGTGGAAAGGTGATTGGAAACAAGTGGGATGCCTATCTTGATCTTCTCCAGCTTGACTAC
ACTGAAGGGGATGCACTTGATGCGCTCAACTTGGTGAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTT
ATGACTCACGTTGATCTTATTGAGAAGCTTCTCAACTATAACACTCTGGAAAAATCAGAC
AACAGTTGAAAAAGAGAGGATGCAAATCTGTTGAAAGAGTGTTGTTACTCGTCAGAGGGC
TATACATTATGGAATATGTATGAATCTCTTGTGTGTTTGGTGTAGAAAATTAAATCAATC
TGAATCATGTTGGTTTTAGACTACGTCAGGGATTTTGTCATATGCATGTCGGGTGTCTCT
ACGTGTTATGATTTTCTGAGCTGAAAGATTTGTACTTCTAAGT
AA

QA 1 523 1 523
DS 



AS 2 4

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TTTATTATTATGGATGTGTCGGAATCAAACATGTCTTTAGCATTCCATAGGGTCGACAAT
AATGTACTTTTTTGACAAGAGGTTTCTATGAATAGACAAAGAAATACTTGTTTTTTTTCG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4F465JQ C 1
AF RR4F465TF U 1
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BS 3 298 RR4F465TF
BS 299 300 RR4F465JQ

RD RR4F465JQ 300 0 0
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AAGATGTTTGACGACCAAGACCTTGGATTCTTTGCTAACTTTCTTGGGATTTTCATCTTC
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TTTATTATTATGGATGTGTCGGAATCAAACATGTCTTTAGCATTCCATAGGGTCGACAAT
AATGTACTTTTTTGACAAGAGGTTTCTATGAATAGACAAAGAAATACTTGTTTTTTTTCG

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4F465TF 300 0 0
GG
GGTTGCGATCTGTTTCACTAACACTGTTGAGGAAGAAGTGTCTGCCTCTACGCTCTCGAA
GATGTTTGACGACCAAGACCTTGGATTCTTTGCTAACTTTCTTGGGATTTTCATCTTCAT
ATTGGTCATTGCTTACCATTTCGTTGTGGCCGACCCAAAATTCGAATGACAGAACAGTTT
TATTATTATGGATGTGTCGGAATCAAACATGTCTTTAGCATTCCATAGGGTCGACAATAA
TGTACTTTTTTGACAAGAGGTTTCTATGAATAGACAAAGAAATACTTGTTTTTTTT
CG

QA 3 298 3 298
DS 



CO CL3402Contig2 600 2 2 U
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GTTCGATTCCGACACATCCATAATAATAAAACTGTTCTGTCATTCGAATTTTGGGTCGGC
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CGACAGTGTTAACGAAACAGATCGCAACCAAGAAAAAGAAGAAACTCCGGTTATATAAAT
GAACGAGGTTACGACGTCGTTTACAAAAATTAAGAGGAAAAAATTGATGTGGCTGCTGGG
ATTCGAGCCCAGGTCTCCACGGCCACAACGTGGAATTATTACCACTAAACTACAGCCACT
TTGTTGTTCTATGATTCACTCAACTTTTTCCTGTAATATTTGTCTATCGCTCATCAGCTT
AGCAACTATGGATGAAACTCCATCTTCAAAGGTCACAACAACGACAACAAACTTCTTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FU28TF C 1
AF RR4FU28JQ U 3
BS 1 2 RR4FU28TF
BS 3 600 RR4FU28JQ

RD RR4FU28TF 600 0 0
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CACAACGAAATGGTAAGCAATGACCAAAATGAAGATGAAAATCCCAAAAAAGTTAGCAAA
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ATTCGAGCCCAGGTCTCCACGGCCACAACGTGGAATTATTACCACTAAACTACAGCCACT
TTGTTGTTCTATGATTCACTCAACTTTTTCCTGTAATATTTGTCTATCGCTCATCAGCTT
AGCAACTATGGATGAAACTCCATCTTCAAAGGTCACAACAACGACAACAAACTTCTTTCC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4FU28JQ 598 0 0
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ATCCAAGGTCTTGGTCGTCAAACATCTTCGAGAGCGTAAAGGCAGACACTTCTTCCCTCG
ACAGTGTTAACGAAACAGATCGCAACCAAGAAAAAGAAGAAACTCCGGTTATATAAATGA
ACGAGGTTACGACGTCGTTTACAAAAATTAAGAGGAAAAAATTGATGTGGCTGCTGGGAT
TCGAGCCCAGGTCTCCACGGCCACAACGTGGAATTATTACCACTAAACTACAGCCACTTT
GTTGTTCTATGATTCACTCAACTTTTTCCTGTAATATTTGTCTATCGCTCATCAGCTTAG
CAACTATGGATGAAACTCCATCTTCAAAGGTCACAACAACGACAACAAACTTCTTTCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 4

CO CL3403Contig1 845 4 9 U
GGTAACAAGGCCGAGGAGAGTATGGAAAAGGGTATGCAGATTTGGGAAGAGATGGAAGAG
CGTCGTGTAAATGGACTCTCTGATTCTGATAAACATAAAACACAGCTGGAGAAGCTGGGA
TTAGACGGGGTCTTTAGCGAAGCGTCTGATGAAGATAACGCAGAGAAAACAGCTAATATG
ACTTCTCAGATTAATCTTTTGTGGGGTTCGTTGCTGTATGAACGGTCTATCGTGGAGTAT
AAGCTTGGCCTACCGACTTGGGATGAATGCTTGGAGGTTGCAGTGGAGAAATTTGAACTA
GCTGGAGCTTCTGCAACCGATATAGCTGTTATGGTAAAGAACCATTGCTCAAACGAAAAT
GCACTTGAAGGTATGGGGTTCAAGATCGATGAGATAGTACAGGCGTGGAACGAGATGTAT
GATGCCAAAAGATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTTCCGGCTAGAACCTTTGTTCCGGAGA
CGGTCACCGAAGCTGCATGATATTTTAGAGAATGTGTTTTCAGGGCCTCAGTGACGAAAA
CATTCATCGTATATATATGAACAGAGCATATCAGCTGGTATTGTATTTACTGGGAGAGTG
GGAGTTGTATGCAATTTTTCTTCTATTTTTGGTTTGGTTTCTCAATTTTTTGGAAGCAAT
TTTTTTTATCTTGGCAGTGATGATTTTTTTTTGTGCAGAATACTTTTTGGAATTGTTTTG
TGCAGAATATTTTTGGAACCTTTGGTGAATTTTTGGAATTAATAATTTCTATATTCGTTT
TGGTCGTTTGTAATCATATTACAGTTTTGTAATTTCTTTATTGATTGTTTTGATTAGTTC
GTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR4FY16TF U 1
AF RR4G807TF U 1
AF RR4G807JQ C 17
AF RR4FY16JQ C 50
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BS 652 666 RR4FY16TF
BS 667 667 RR4G807JQ
BS 668 691 RR4FY16TF
BS 692 753 RR4G807TF
BS 754 754 RR4G807JQ
BS 755 773 RR4G807TF
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RD RR4FY16TF 691 0 0
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TTAGACGGGGTCTTTAGCGAAGCGTCTGATGAAGATAACGCAGAGAAAACAGCTAATATG
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AAGCTTGGCCTACCGACTTGGGATGAATGCTTGGAGGTTGCAGTGGAGAAATTTGAACTA
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GCACTTGAAGGTATGGGGTTCAAGATCGATGAGATAGTACAGGCGTGGAACGAGATGTAT
GATGCCAAAAGATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTTCCGGCTAGAACCTTTGTTCCGGAGA
CGGTCACCGAAGCTGCATGATATTTTAGAGAATGTGTTTTCAGGGCCTCAGTGACGAAAA
CATTCATCGTATATATATGAACAGAGCATATCAGCTGGTATTGTATTTACTGGGAGAGTG
GGAGTTGTATGCAATTTTTCTTCTATTTTTGGTTTGGTTTCTCAATTTTT*GGAAGCAAT
TTTTTT*ATCTTGGCAGTGATGATTTTTTTT

QA 1 691 1 691
DS 

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CGTCGTGTAAATGGACTCTCTGATTCTGATAAACATAAAACACAGCTGGAGAAGCTGGGA
TTAGACGGGGTCTTTAGCGAAGCGTCTGATGAAGATAACGCAGAGAAAACAGCTAATATG
ACTTCTCAGATTAATCTTTTGTGGGGTTCGTTGCTGTATGAACGGTCTATCGTGGAGTAT
AAGCTTGGCCTACCGACTTGGGATGAATGCTTGGAGGTTGCAGTGGAGAAATTTGAACTA
GCTGGAGCTTCTGCAACCGATATAGCTGTTATGGTAAAGAACCATTGCTCAAACGAAAAT
GCACTTGAAGGTATGGGGTTCAAGATCGATGAGATAGTACAGGCGTGGAACGAGATGTAT
GATGCCAAAAGATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTTCCGGCTAGAACCTTTGTTCCGGAGA
CGGTCACCGAAGCTGCATGATATTTTAGAGAATGTGTTTTCAGGGCCTCAGTGACGAAAA
CATTCATCGTATATATATGAACAGAGCATATCAGCTGGTATTGTATTTACTGGGAGAGTG
GGAGTTGTATGCAATTTTTCTTCTATTTTTGGTTTGGTTTCTCAATTTTTTGGAAGCAAT
TTTTTT*ATCTTGGCAGTGATGATTTTTTTTTGTGCAGAATACTTTTTGGAATTGTTTTG
TGCAGAATATTTTTGGAACCTTTGGTGAATTTT*GGAATTAATAATTTCTATA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4G807JQ 829 0 0
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TCTCTGATTCTGATAAACATAAAACACAGCTGGAGAAGCTGGGATTAGACGGGGTCTTTA
GCGAAGCGTCTGATGAAGATAACGCAGAGAAAACAGCTAATATGACTTCTCAGATTAATC
TTTTGTGGGGTTCGTTGCTGTATGAACGGTCTATCGTGGAGTATAAGCTTGGCCTACCGA
CTTGGGATGAATGCTTGGAGGTTGCAGTGGAGAAATTTGAACTAGCTGGAGCTTCTGCAA
CCGATATAGCTGTTATGGTAAAGAACCATTGCTCAAACGAAAATGCACTTGAAGGTATGG
GGTTCAAGATCGATGAGATAGTACAGGCGTGGAACGAGATGTATGATGCCAAAAGATGGC
AGATCGGTGTCCCATCTTTCCGGCTAGAACCTTTGTTCCGGAGACGGTCACCGAAGCTGC
ATGATATTTTAGAGAATGTGTTTTCAGGGCCTCAGTGACGAAAACATTCATCGTATATAT
ATGAACAGAGCATATCAGCTGGTATTGTATTTACTGGGAGAGTGGGAGTTGTATGCAATT
TTTCTTCTATTTTTGGTTTGGTTTCTCAATTTTTTGGAAGCAATTTTTTTTATCTTGGCA
GTGATGATTTTTTTTTGTGCAGAATACTTTTTGGAATTGTTTTGTGCAGAATATTTTTGG
AACCTTTGGTGAATTTTTGGAATTAATAATTTCTATATTCGTTTTGGTCGTTTGTAATCA
TATTACAGTTTTGTAATTTCTTTATTGATTGTTTTGATTAGTTCGTGTT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4FY16JQ 796 0 0
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AGAAGCTGGGATTAGACGGGGTCTTTAGCGAAGCGTCTGATGAAGATAACGCAGAGAAAA
CAGCTAATATGACTTCTCAGATTAATCTTTTGTGGGGTTCGTTGCTGTATGAACGGTCTA
TCGTGGAGTATAAGCTTGGCCTACCGACTTGGGATGAATGCTTGGAGGTTGCAGTGGAGA
AATTTGAACTAGCTGGAGCTTCTGCAACCGATATAGCTGTTATGGTAAAGAACCATTGCT
CAAACGAAAATGCACTTGAAGGTATGGGGTTCAAGATCGATGAGATAGTACAGGCGTGGA
ACGAGATGTATGATGCCAAAAGATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTTCCGGCTAGAACCTT
TGTTCCGGAGACGGTCACCGAAGCTGCATGATATTTTAGAGAATGTGTTTTCAGGGCCTC
AGTGACGAAAACATTCATCGTATATATATGAACAGAGCATATCAGCTGGTATTGTATTTA
CTGGGAGAGTGGGAGTTGTATGCAATTTTTCTTCTATTTTTGGTTTGGTTTCTCAATTTT
TTGGAAGCAATTTTTTTTATCTTGGCAGTGATGATTTTTTTTTGTGCAGAATACTTTTTG
GAATTGTTTTGTGCAGAATATTTTTGGAACCTTTGGTGAATTTTTGGAATTAATAATTTC
TATATTCGTTTTGGTCGTTTGTAATCATATTACAGTTTTGTAATTTCTTTATTGATTGTT
TTGATTAGTTCGTGTT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL3404Contig1 1344 4 26 U
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GTTGGTGGCAACATGATCTTTATGATGGTGATGGAGAGGCTACGAGATTTGGATTTGGAG
ATTGATTGGGATGATATTCCGCAAGATGACTCTAGTAGAGGCATGTTTGATATGGAACTT
GAAGATGGTATGAATGAAGGAGACGAGCTTCCAGCGGGGTCTGTAAATCAGGATACATCA
AGTGGAAAGATAGCTTTTGAGTCGTTGGACAAATTGATGGTCACATCTTTTGATCATCTT
GAATCCTGTCAAGATGCTGGTCGTTTGGATCAGGTGTTTGAAAAGCTCTTCGAGTCATTT
GAGAACTTCATCCTGAATACCTACAAATCCAAAGTTTCCCAGTTTCTCATGTTCTATGCA
TGTTCACTGGATCCTGAAAATTGTGGTGTGAAATTTGGGAGTAAGCTGCTGGACATTTTT
CTCTCCAGCAACAAGCCTCGACCTACTAGGATGAGTGCGGTGGCTTATCTAGCTAGCTAC
TTGGCTCGCGGAAAGTTTTTACCTGTTTCCTATGTGGCTAGCATGTTAAAAAGGTTAGTA
GATGAGTGTGCGGATTACTGTAGAATCTGCAATGATGATACAAGGCCTGAAGCACATCAG
CTTTTCTATTCAGGATGTCAGGCGATCATGTATGTGCTGTGCTTCCGCATGAGATCCATC
CTAGATGTTCCTCGCTTTCGGTCCGAGCTTATACCATTGGAGTCAATTTTAATGCACAAA
CTAAACCCATTGATGGTATGCCTTCCATCGGTAGTTGCAGAGTTCCTTAAACAAGCTAAA
GCAGTTGGTCTGTTCGTCGTCTCAGACTCCTTCATTTT*CGATGACCTGCTTGAGTCTGA
GCTTTCTCGTGCGTTTGGCGGGCGTGAGAGACTT*GATACATTCTTCCCCTTT*GACCCT
TACTT*GCTGAAAAGATCTAACAGCGTCATCTCCCC*GAATTTCATCTACTGGTCAACGG
TGATGAACCAAGATGACGATGATGATGAGGACGATGCTGAGATAATTGTGAATGGGGATG
AGGAGAGTGATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGTGATCTTGATTACGCAATGGACAAGATGT
CCATAACGCCTAAGCACTCTTTCAAGAACAAGATGGAAAGAGACAGACTTATGGAAATGC
CTTCCATGATCAGACCTTCTACTAGTCCTCAATCCCTTTAAATCTTTTTTGGTACGCATT
TTTTGTAAGCAACATCGACTCAAAAACTCTTTTAATATATGGAAACAGTGCTTGTTCTTG
AAAGAAACGTATGCTTAAACTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C958TF U 1
AF RR4HB19TF U 827
AF RR4HB19JQB C 503
AF RR4C958JQ C 574
BS 1 513 RR4C958TF
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BS 724 826 RR4HB19JQB
BS 827 878 RR4HB19TF
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BS 880 934 RR4HB19TF
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BS 966 966 RR4HB19JQB
BS 967 996 RR4HB19TF
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BS 1319 1344 RR4C958JQ

RD RR4C958TF 622 0 0
GAGGTGGTAGTGACTTATGTGGAGAACTTATTGAAGTTGGAGAGTAGCTCAATCGGTCAA
GTTGGTGGCAACATGATCTTTATGATGGTGATGGAGAGGCTACGAGATTTGGATTTGGAG
ATTGATTGGGATGATATTCCGCAAGATGACTCTAGTAGAGGCATGTTTGATATGGAACTT
GAAGATGGTATGAATGAAGGAGACGAGCTTCCAGCGGGGTCTGTAAATCAGGATACATCA
AGTGGAAAGATAGCTTTTGAGTCGTTGGACAAATTGATGGTCACATCTTTTGATCATCTT
GAATCCTGTCAAGATGCTGGTCGTTTGGATCAGGTGTTTGAAAAGCTCTTCGAGTCATTT
GAGAACTTCATCCTGAATACCTACAAATCCAAAGTTTCCCAGTTTCTCATGTTCTATGCA
TGTTCACTGGATCCTGAAAATTGTGGTGTGAAATTTGGGAGTAAGCTGCTGGACATTTTT
CTCTCCAGCAACAAGCCTCGACCTACTAGGATGGGTGCGGTGGCTTATCTAGCTAGCTAC
TTGGCTCGTGGAAAGTTTTTACCTGTTTCCTATGTGGCTAGCATGTTAAAAAGGTTAGTA
GATGAGTGTGCGGATTACTGTA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4HB19TF 409 0 0
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CTGCTTGAGTCTGAGCTTTCTCGTGCGTTTGGCGGGCGTGAGAGACTTTGATACATTCTT
CCCCTTTTGACCCTTACTTTGCTGAAAAGATCTAACAGCGTCATCTCCCCCGAATTTCAT
CTACTGGTCAACGGTGATGAACCAAGATGACGATGATGATGAGGACGATGCTGAGATAAT
TGTGAATGGGGATGAGGAGAGTGATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGTGATCTTGATTACGC
AATGGACAAGATGTCCATAACGCCTAAGCACTCTTTCAAGAACAAGATGGAAAGAGACAG
ACTTATGGAAATGCCTTCCATGATCAGACCTTCTACTAGTCCT
GATCCC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4HB19JQB 819 0 0
G
TACTAGGATGAGTGCGGTGGCTTATCTAGCTAGCTACTTGGCTCGCGGAAAGTTTTTACC
TGTTTCCTATGTGGCTAGCATGTTAAAAAGGTTGGTAGATGAGTGTGCGGATTACTGTAG
AATTTGCAATGATGATACAAGGCCTGAAGCACATCAGCTTTTCTATTCAGGATGTCAGGC
GATCATGTATGTGCTGTGCTTCCGTATGAGATCCATCCTTGATGTTCCTCGCTTTCGGTC
CGAGCTTATACCATTGGAGTCAATTTTAATGCACAAACTAAACCCATTGATGGTATGCCT
TCCATCGGTAGTTGCAGAGTTCCTTAAACAAGCTAAAGCAGTTGGTCTGTTCGTCGTCTC
AGACTCCTTCATTTT*CGATGACCTGCTTGAGTCTGAGCTTTCTCGTGCGTTTGGCGGGC
GTGAGAGACTT*GATACATTCTTCCCCTTT*GACCCTTACTT*GCTGAAAAGATCTAACA
GCGTCATCTCCCC*GAATTTCATCTACTGGTCAACGGTGATGAACCAAGATGACGATGAT
GATGAGGACGATGCTGAGATAATTGTGAATGGGGATGAGGAGAGTGATGAAGAAGAGGAG
GAAGAAGGTGATCTTGATTACGCAATGGACAAGATGTCCATAACGCCTAAGCACTCTTTC
AAGAACAAGATGGAAAGAGACAGACTTATGGAAATGCCTTCCATGATCAGACCTTCTACT
AGTCCTGAATCCCTTTAAATCTTTTTTGGTACGCATTTTTTGTAAGCAACATCGACTCAA
AAACTCTTTTAATATATGGAAACAGTGCTTGTTCT
CGG

QA 2 816 2 816
DS 

RD RR4C958JQ 771 0 0
GTGGCTAGCATGTTAAAAAGGTTAGTAGATGAGTGTGCGGATTACTGTAGGATCTGCAAT
GATGATATAAGGCCTGAAGCACATCAGCTTTTCTATTCAGGATGTCAGGCGATCATGTAT
GTGCTGTGCTTCCGCATGAGATCCATCCTAGATGTTCCTCGCTTTCGGTCCGAGCTTATA
CCATTGGAGTCAATTTTAATGCACAAACTAAACCCATTGATGGTATGCCTTCCATCGGTA
GTTGCAGAGTTCCTTAAACAAGCTAAAGCAGTTGGTCTGTTCGTCGTTTCAGACTCCTTC
ATTTT*CGAGGACCTGCTTGAGTCTGAGCTTTCTCGTGCGTTTGGCGGGCGTGAGAGACT
T*GATACATTCTTCCCCTTT*GACCCTTACTT*GCTGAAAAGCTCTAACAGCGTCATCTC
CCC*GAATTTCATCTACTGGTCAACGGTGATGAACCAAGATGACGATGATGATGA***CG
ATGCTGAGATAATTGTGAATGGGGATGAGGAGAGTGATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGTG
ATCTTGATTACGCAATGGACAAGATGTCCATAACGCCTAAGCACTCTTTCAAGAACAAGA
TGGAAAGAGACAGACTTATGAAAATGCCTTCCATGATCAGACCTTCTACTAGTCCTCAAT
CCCTTTAA*TCTTTTT*GGTACGCATTTTTTGTAAGTAACATCGACTCAAAAACTCTTTT
AATATATGGAAACAGTGCTTGTTCTTGAAAGAAACGTATGCTTAAACTCGG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 4

CO CL3405Contig1 710 4 4 U
TTTTTGCATCTTATGCACCAAAATCTCAAAATATCGATGCGATGCCCAGAGTTCAAAGAG
TACTGAGGAGCACATACACAAAGAGATACCATCAACAGAGGCCAAAAGAGCGTACAGAAA
CAAATGTATTACGGAGTATGACCCTCAGATTCTAGCTAATTTGTTGTTGAGAAACAAGAA
CGAGAAGTCCCTGTGGACCAACCAAAATCTCACTAAGGAAACTCACAAGCCCGAACCAAA
CCACTGGAGTTACATCGACTCCTGCAAGTGGCGGAATCACTTTCCTCGTCTGAACAAGGA
TTGGTTCGGTAGGAGCGTACGCCAAAACGTAAGGGAACTTGTCAACGGGAAGCTTCGGGT
ACCAAGACATAACAATCCTCAAAATAAAGAGAAACCCAAAAGCTGATAAGGCAGGACCCA
AGATCCCAATCGCAAGCTTTGCAGTTCCTGGATCCAGATCTGCTAGAGATATGTTATGCA
AGGCCTCCGAGATCGGTTTTGACGAGATAATACTTGAATAGAGGCTTGTTGTTGCTGTGT
CTACTTCGACTTGGGTTAACGATGAGGAAACTACAGGAAGACATGCAGACCGAGTTCCAA
TGTTGCGACAGGACCGTCGAGATTTGGCCAGATACAGCGCCGGCGAAAATGATACGAAGC
CGGAGGCTACTGTTGTCATCGCGAACTCTGTACTAAGTGAACCAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E632JQ U 11
AF RR4FQ52JQ U 5
AF RR4FQ52TF C 1
AF RR4E632TF C 5
BS 1 12 RR4FQ52TF
BS 13 167 RR4E632JQ
BS 168 378 RR4FQ52JQ
BS 379 710 RR4FQ52TF

RD RR4E632JQ 157 0 0
TA
ATGCACCAAAATCTCAAAATATCGATGCGATGCCCAGAGTTCAAAGAGTACTGAGGAGCA
CATACACAAAGAGATACCATCAACAGAGGCCAAAAGAGCGTACAGAAACAAATGTATTAC
GGAGTATGACCCTCAGATTCTAGCTAATTTGTTGT

QA 3 157 3 157
DS 

RD RR4FQ52JQ 374 0 0
GCATCTTA
ATGCACCAAAATCTCAAAATATCGATGCGATGCCCAGAGTTCAAAGAGTACTGAGGAGCA
CATACACAAAGAGATACCATCAACAGAGGCCAAAAGAGCGTACAGAAACAAATGTATTAC
GGAGTATGACCCTCAGATTCTAGCTAATTTGTTGTTGAGAAACAAGAACGAGAAGTCCCT
GTGGACCAACCAAAATCTCACTAAGGAAACTCACAAGCCCGAACCAAACCACTGGAGTTA
CATCGACTCCTGCAAGTGGCGGAATCACTTTCCTCGTCTGAACAAGGATTGGTTCGGTAG
GAGCGTACGCCAAAACGTAAGGGAACTTGTCAACGGGAAGCTTCGGGTACCAAGACATAA
CAATCC

QA 9 374 9 374
DS 

RD RR4FQ52TF 710 0 0
TTTTTGCATCTTATGCACCAAAATCTCAAA*TATCGATGCGATGCCCAGAGT*CAAAGAG
TACTGAGGAGCACATACACAAAGAGATACCATCAACAGAGGCCAAAAGAGCGTACAGAAA
CAAATGTATTACGGAGTATGACCCTCAGATTCTAGCTAATTTGTTGTTGAGAAACAAGAA
CGAGAAGTCCCTGTGGACCAACCAAAATCTCACTAAGGAAACTCACAAGCCCGAACCAAA
CCACTGGAGTTACATCGACTCCTGCAAGTGGCGGAATCACTTTCCTCGTCTGAACAAGGA
TTGGTTCGGTAGGAGCGTACGCCAAAACGTAAGGGAACTTGTCAACGGGAAGCTTCGGGT
ACCAAGACATAACAATCCTCAAAATAAAGAGAAACCCAAAAGCTGATAAGGCAGGACCCA
AGATCCCAATCGCAAGCTTTGCAGTTCCTGGATCCAGATCTGCTAGAGATATGTTATGCA
AGGCCTCCGAGATCGGTTTTGACGAGATAATACTTGAATAGAGGCTTGTTGTTGCTGTGT
CTACTTCGACTTGGGTTAACGATGAGGAAACTACAGGAAGACATGCAGACCGAGTTCCAA
TGTTGCGACAGGACCGTCGAGATTTGGCCAGATACAGCGCCGGCGAAAATGATACGAAGC
CGGAGGCTACTGTTGTCATCGCGAACTCTGTACTAAGTGAACCAAAAAAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4E632TF 692 0 0
GCATCTTA
ATGCACCAAAATCTCAAAATATCGATGCGATGCCCAGAGTTCAAAGAGTACTGAGGAGCA
CATACACAAAGAGATACCATCAACAGAGGCCAAAAGAGCGTACAGAAACAAATGTATTAC
GGAGTATGACCCTCAGATTCTAGCTAATTTGTTGTTGAGAAACAAGAACGAGAAGTCCCT
GTGGACCAACCAAAATCTCACTAAGGAAACTCACAAGCCCGAACCAAACCACTGGAGTTA
CATCGATTCCTGCAAGTGGCGGAATCACTTTCCTCGTCTGAACAAGGATTGGTTCGGTAG
GAGCGTACGCCAAAACGTAAGGGAACTTGTCAACGGGAAGCTTCGGGTACCAAGACATAA
CAATCCTCAGAATAAAGAGAAACCCAAAAGCTGATAAGGCAGGACCCAAGATCCCAATCG
CAAGCTTTGCAGTTCCTGGATCCAGATCTGCTAGAGATATGTTATGCAAGGCCTCCGAGA
TCGGTTTTGACGAGATAATACTTGAATAGAGGCTTGTTGTTGCTGTGTCTACTTCGACTT
GGGTTAACGATGAGGAAACTACAGGAAGACATGCAGACCGAGTTCCAATGTTGCGACAGG
ACCGTCGAGATTTGGCCAGATACAGCGCCGGCGAAAATGATACGAAGCCGGAGGCTACTG
TTGTCATCGCGAACTCTGTACT
CC

QA 9 690 9 690
DS 



AS 1 4

CO CL3406Contig1 654 4 2 U
AGTCCTTGTAAACCACACACTGCATTTATTTGATTTAAAGCGTTATTTTAATTTTACATT
ACATTTTTTTTTCTCACAAATACACTCGAAACAGATTGCTTCTCTTCAATTTTACATAGC
TGCAACGGAGGCAA*TGTTGGGCTGAGAAGACTTGGTGGCAA*TGCCGTTGCAGACGTTA
AAGCCGTACCAAACAGAGTTAGGTAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATG
TACGAGCCATAGATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGG
TAGAGATAACAGACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACAT
CTTTCAAATGCCCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTCGTTGCCGTAG
ACATCACCAAACGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTC
TTAATGATCACCGTGTAAGAACACCCACCGGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGTAGAAAC
GAATCAATAGGCTGAGGTTTAATGGTGATGAAGGATCTCGCCGAGGAAGACGTTGTGAGA
AAACATAATGCCAAGAGAAACAAAGTTAACCACCTGAGCATTTTTCTAAGTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A354TF C 1
AF RR4A354TFB C 1
AF RR4A354JQD U 10
AF RR4A354JQ U 101
BS 1 9 RR4A354TF
BS 10 654 RR4A354JQD

RD RR4A354TF 462 0 0
AGTCCTTGTAAACCACACACTGCATTTATTTGATTTAAAGCGTTATTTTAATTTTACATT
ACATTTTTTTTTCTCACAAATACACTCGAAACAGATTGCTTCTCTTCAATTTTACATAGC
TGCAACGGAGGCAAATGTTGGGCTGAGAAGACTTGGTGGCAAATGCCGTTGCAGACGTTA
AAGCCGTACCAAACAGAGTTAGGTAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATG
TACGAGCCATAGATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGG
TAGAGATAACAGACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACAT
CTTTCAAATGCCCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTCGTTGCCGTAG
ACATCACCAAACGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAGAC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4A354TFB 654 0 0
AGTCCTTGTAAACCACACACTGCATTTATTTGATTTAAAGCGTTATTTTAATTTTACATT
ACATTTTTTTTTCTCACAAATACACTCGAAACAGATTGCTTCTCTTCAATTTTACATAGC
TGCAACGGAGGCAA*TGTTGGGCTGAGAAGACTTGGTGGCAA*TGCCGTTGCAGACGTTA
AAGCCGTACCAAACAGAGTTAGGTAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATG
TACGAGCCATAGATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGG
TAGAGATAACAGACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACAT
CTTTCAAATGCCCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTCGTTGCCGTAG
ACATCACCAAACGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTC
TTAATGATCACCGTGTAAGAACACCCACCGGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGTAGAAAC
GAATCAATAGGCTGAGGTTTAATGGTGATGAAGGATCTCGCCGAGGAAGACGTTGTGAGA
AAACATAATGCCAAGAGAAACAAAGTTAACCACCTGAGCATTTTTCTAAGTTCC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4A354JQD 645 0 0
AAACCACACACTGCATTTATTTGATTTAAAGCGTTATTTTAATTTTACATTACATTTTTT
TTTCTCACAAATACACTCGAAACAGATTGCTTCTCTTCAATTTTACATAGCTGCAACGGA
GGCAA*TGTTGGGCTGAGAAGACTTGGTGGCAA*TGCCGTTGCAGACGTTAAAGCCGTAC
CAAACAGAGTTAGGTAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATGTACGAGCCA
TAGATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGGTAGAGATAA
CAGACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACATCTTTCAAAT
GCCCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTCGTTGCCGTAGACATCACCA
AACGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTCTTAATGATC
ACCGTGTAAGAACACCCACCGGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGTAGAAACGAATCAATA
GGCTGAGGTTTAATGGTGATGAAGGATCTCGCCGAGGAAGACGTTGTGAGAAAACATAAT
GCCAAGAGAAACAAAGTTAACCACCTGAGCATTTTTCTAAGTTCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4A354JQ 554 0 0
TCTCTTCAATTTTACATAGCTGCAACGGAGGCAA*TGTTGGGCTGAGAAGACTTGGTGGC
AA*TGCCGTTGCAGACGTTAAAGCCGTACCAAACAGAGTTAGGTAAGAAGAGGTTATAGT
AGAAAGTGGCTGATCTGATGTACGAGCCATAGATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGT
CGTATCCTTGTCTGAGTAGGTAGAGATAACAGACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCT
TGTATGTGTCCGAAGAACATCTTTCAAATGCCCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCA
CGTATACCTCGTTGCCGTAGACATCACCAAACGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAG
ACACCGAGGAACAGCTTGTCTTAATGATCACCGTGTAAGAACACCCACCGGCATTCTCTA
GCTGTGGTTTAGGTAGAAACGAATCAATAGGCTGAGGTTTAATGGTGATGAAGGATCTCG
CCGAGGAAGACGTTGTGAGAAAACATAATGCCAAGAGAAACAAAGTTAACCACCTGAGCA
TTTTTCTAAGTTCC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 3

CO CL3407Contig1 1200 3 7 U
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TAAGAGATGGAAGGAATTGAGCGGCAATAGCAAATGGAAAGACCTGCTTGATCCTCTTGA
CTTGGATCTACGCCGATACATCCTCCACTACGGCGACATGGTTCAAGTCGGGTACATTAC
CTTCAATAGTGGCCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTTCTACACCAAGGAAGATCT
CTTTGCTCGAACCGGCTACCTTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACAAAGTACAT
ATATGGAACATCGTCGATAAAGTTACCAGAATGTTTCATGATCAACTCATTGTCAAGGGA
AGCATGGAACAAAGAGTCTAACTGGTTAGGTTATGTTGCGGTGGCTACTGACGAAGGCAA
GGAGTTGTTAGGGAGAAGAGACATTGTTGTGGCATGGCGAGGGACTATACAACCGTACGA
GTGGGCTAACGATTTTGATTTCCCACTTGAATCAGCTATCTCCGTATTCCCTCGAGCTGA
CCCGAGTGATCCACCTCGCATTGCTAGTGGTTGGCTGTCTCTTTATACAACCACTGATCC
ACGCTCACGTTTTGACAAGACCAGTGCACGAGAACAGGTTCAAGGAGAGCTCAAAAGGTT
ACTCGAATTGTACAAACATGAAGAAGTTAGCAACACACTGAAATCAGAGTACCTGAAACG
GTTTCTTAACCTGGCACATTTCCACAACCTGAAGGCCTACTTGCAAGGCGTGGCGGAGAC
ACAACACAATCGATCAGAACTCAAGCTGGAGATTAACCGGGATATCGGGATGGTTAAAAA
TGGTTTAGATGCTCTTGAAGATAAGTACTTAGTCCCTGGGGATTCGTGGGCTTTTGGGAA
CAAAGGAATGGTTAAAACTCATGACGGGACATGGATTCTCAATGGTGATATGGCAAAGGA
GGACGTAAAAGAAGAAGAAGACGAATGTGTACCATGGATTTAGTAGCTACAATAAAATTA
AATATTTACCTATTTTCAAAACAAGAACAATAAATAAAAAACAACAAAATCTGAGGCGCC
AAATCTTGGATTATTCAATAGATGGAATTTGTGAATAGGGAAGTGGATTATTAATGTACA
TGGAAGAAAAAGAAGATCGTGTATGTGAACCACTTCATAACATGAAATGGTGCTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C253TF U 1
AF RR4F132TF U 7
AF RR4C253JQ C 416
BS 1 318 RR4C253TF
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BS 320 582 RR4C253TF
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BS 641 1200 RR4C253JQ

RD RR4C253TF 582 0 0
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TAAGAGATGGAAGGAATTGAGCGGCAATAGCAAATGGAAAGACCTGCTTGATCCTCTTGA
CTTGGATCTACGCCGATACATCCTCCACTACGGCGACATGGTTCAAGTCGGGTACATTAC
CTTCAATAGTGGCCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTTCTACACCAAGGAAGATCT
CTTTGCTCGAACCGGCTACCTTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACAAAGTACAT
ATATGGAACATCGTCGATGAAGTTACCAGAATGTTTCATGATCAACTCATTGTCAAGGGA
AGCATGGAACAAAGAGTCTAACTGGTTAGGTTATGTTGCGGTGGCTACTGACGAAGGCAA
GGAGTTGTTAGGGAGAAGAGACATTGTTGTGGCATGGCGAGGGACTATACAACCGTACGA
GTGGGCTAACGATTTTGATTTCCCACTTGAATCAGCTATCTCCGTATTCCCTCGAGCTGA
CCCGAGTGATCCACCTCGCATTGCTAGTGGTTGGCTGTCTCT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4F132TF 634 0 0
G
GGAGAGGGAGGAGGTTTGGATCAGAAGAAAATGGAAATGGTGGAAGATATCGCTAAGAGA
TGGAAGGAATTGAGCGGCAATAGCAAATGGAAAGACCTGCTTGATCCTCTTGACTTGGAT
CTACGCCGATAC**CCTCCACTACGGCGACATGGTTCAAGTCGGGTGCATTACCTTCAAT
AGTGGCCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTTCTACACCAAGGAAGATCTCTTTGCT
CGAACCGGCTACCTTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACAAAGTACATATATGGA
ACATCGTCGATAAAGTTACCAGAATGTTTCATGATCAACTCATTGTCAAGGGAAGCATGG
AACAAAGAGTCTAACTGGTTAGGTTATGTTGCGGTGGCTACTGACGAAGGCAAGGAGTTG
TTAGGGAGAAGAGACATTGTTGTGGCATGGCGAGGGACTATACAACCGTACGAGTGGGCT
AACGATTTTGATTTCCCACTTGAATCAGCTATCTCCGTATTCCCTCGAGCTGACCCGAGT
GATCCACCTCGCATTGCTAGTGGTTGGCTGTCTCTTTATACAACCGCTGATCCACGCTCA
CGTTTTGACAAGACCAGTGCACGAGAACAGGTT

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR4C253JQ 785 0 0
GGCAAGGAGTTGTTAGGGAGAAGAGACATTGTTGTGGCATGGCGAGGGACTATACAACCG
TACGAGTGGGCTAACGATTTTGATTTCCCACTTGAATCAGCTATCTCCGTATTCCCTCGA
GCTGACCCGAGTGATCCACCTCGCATTGCTAGTGGTTGGCTGTCTCTTTATACAACCACT
GATCCACGCTCACGTTTTGACAAGACCAGTGCACGAGAACAGGTTCAAGGAGAGCTCAAA
AGGTTACTCGAATTGTACAAACATGAAGAAGTTAGCAACACACTGAAATCAGAGTACCTG
AAACGGTTTCTTAACCTGGCACATTTCCACAACCTGAAGGCCTACTTGCAAGGCGTGGCG
GAGACACAACACAATCGATCAGAACTCAAGCTGGAGATTAACCGGGATATCGGGATGGTT
AAAAATGGTTTAGATGCTCTTGAAGATAAGTACTTAGTCCCTGGGGATTCGTGGGCTTTT
GGGAACAAAGGAATGGTTAAAACTCATGACGGGACATGGATTCTCAATGGTGATATGGCA
AAGGAGGACGTAAAAGAAGAAGAAGACGAATGTGTACCATGGATTTAGTAGCTACAATAA
AATTAAATATTTACCTATTTTCAAAACAAGAACAATAAATAAAAAACAACAAAATCTGAG
GCGCCAAATCTTGGATTATTCAATAGATGGAATTTGTGAATAGGGAAGTGGATTATTAAT
GTACATGGAAGAAAAAGAAGATCGTGTATGTGAACCACTTCATAACATGAAATGGTGCTT
TGGCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 2 4

CO CL3408Contig1 839 2 8 U
GAGAGAAGAAGAAGAAGAAGATGCCTAGTCCAGGTCCAAGACCTTACGAGTGTGTGAAAC
GAGCTTGGCATAGCGATCGTCACCAACCCATTCGAGGTTCCATCATCCGCCAGATCTTCA
GACTCGCCATGGAAGCACACAGTGCGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATGGCAGGAGAAGC
TTCCTGTTGTTGTCTTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAATCCAACTCCGAGGAAG
AGTATACAGATGCTGATACTATGTGGAATAGAGTCAATGATGCCATTGACACCATTATTA
GACGAGATGAAAGCACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGAAGGTAACCTTT
CTTTCTTCTGTTAAAATGTTTAGAAAGTTTTGCATTATGTGTTTATTTTTGGTCTGTGGT
CAGCTGTTCTTAACCTTGGGTGTATTGCTGTAAGAGTTTCAAGAAGCCAACGACATAGTA
ACGTCAGGACTTACCTCTCTCCAAAATACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGC
CGCAAAAGACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAATCCCAGTGGAGGTTCTTG
AGGACAGCAACAACCGAGGAGCAGCGTTTCTACATGAAATGCCATTGGCTAGAAAAATAG
GGACTATCAATGCTGCTCCTGGTACAGCACCAGCGCCAATTAACTTGGGTTCGGTGTATC
CTTTGTATTATGGAGGTATTAATCAGACTCAGCAAGGGGACTTGTCTTCAAGAGTCCCTG
AGACGCCTATAATCATTGGCATGCCTATTAGTATAAAGGCTCCGGAAGAAAGAACAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH16TF U 1
AF RR4BH16JQ C 536
BS 1 656 RR4BH16TF
BS 657 657 RR4BH16JQ
BS 658 669 RR4BH16TF
BS 670 670 RR4BH16JQ
BS 671 756 RR4BH16TF
BS 757 757 RR4BH16JQ
BS 758 780 RR4BH16TF
BS 781 839 RR4BH16JQ

RD RR4BH16TF 780 0 0
GAGAGAAGAAGAAGAAGAAGATGCCTAGTCCAGGTCCAAGACCTTACGAGTGTGTGAAAC
GAGCTTGGCATAGCGATCGTCACCAACCCATTCGAGGTTCCATCATCCGCCAGATCTTCA
GACTCGCCATGGAAGCACACAGTGCGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATGGCAGGAGAAGC
TTCCTGTTGTTGTCTTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAATCCAACTCCGAGGAAG
AGTATACAGATGCTGATACTATGTGGAATAGAGTCAATGATGCCATTGACACCATTATTA
GACGAGATGAAAGCACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGAAGGTAACCTTT
CTTTCTTCTGTTAAAATGTTTAGAAAGTTTTGCATTATGTGTTTATTTTTGGTCTGTGGT
CAGCTGTTCTTAACCTTGGGTGTATTGCTGTAAGAGTTTCAAGAAGCCAACGACATAGTA
ACGTCAGGACTTACCTCTCTCCAAAATACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGC
CGCAAAAGACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAATCCCAGTGGAGGTTCTTG
AGGACAGCAACAACCGAGGAGCAGCGTTTCTACATGAAATGCCATTGGCTAGAAAACTAG
GGACTATCACTGCTGCTCCTGGTACAGCACCAGCGCCAATTAACTTGGGTTCGGTGTATC
CTTTGTATTATGGAGGTATTAATCAGACTCAGCAAGTGGACTTGTCTTCAAGAGTCCCTG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4BH16JQ 304 0 0
TGAGCCGCAAAAGACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAATCCCAGTGGAGGT
TCTTGAGGACAGCAACAACCGAGGAGCAGCGTTTCTACATGAAATGCCATTGGCTAGAAA
AATAGGGACTATCAATGCTGCTCCTGGTACAGCACCAGCGCCAATTAACTTGGGTTCGGT
GTATCCTTTGTATTATGGAGGTATTAATCAGACTCAGCAAGGGGACTTGTCTTCAAGAGT
CCCTGAGACGCCTATAATCATTGGCATGCCTATTAGTATAAAGGCTCCGGAAGAAAGAAC
AGAG

QA 1 304 1 304
DS 



CO CL3408Contig2 781 2 2 U
GCGATGGAGACGCAGTAACAACTGAGAGATTCCCACCAACATGGAGATGCCTTTATAAGT
TTTCAACAAGCTTCAGATCTGTTTCACCTTCTCCCATTCTAAGCTCCCCAAAAACACACT
TGTGCGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGATGCCTAGGCCAGGTCCAAGACCTTACGA
GTGTGTGAAACGAGCTTGGCATAGCGATCGTCACCAACCCATTCGAGGTTCCATCATCCG
CCAGATCTTCAGACTCGCCATGGAAGCACACAGTGCGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATG
GCAGGAGAAGCTTCCTGTTGTTGTCTTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAATCCAA
CTCCGAGGAAGAGTATACAGATGCTGATACTATGTGGAATAGAGTCAATGATGCCATTGA
CACCATTATTAGACGAGATGAAAGCACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGA
AGCTGCTCTTAACCTTGGGTGTATTGCTGTAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGACATAGTAA
CGTCAGGACTTACCTCTCTCCAAAATACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGCC
GCAAAAGACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAATCCCAGTGGAGGTTCTTGA
GGACAGCAACAACCGAGGAGCAGCGTTTCTACATGAAATGCCATTGGCTAGAAAACTAGG
GACTATCACTGCTGCTCCTGGTACAGCACCAGCGCCAATTAACTTGGGTTCGGTGTATCC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DY27TF U 1
AF RR4F026TF U 84
BS 1 643 RR4DY27TF
BS 644 781 RR4F026TF

RD RR4DY27TF 643 0 0
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TTTCAACAAGCTTCAGATCTGTTTCACCTTCTCCCATTCTAAGCTCCCCAAAAACACACT
TGTGCGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGATGCCTAGGCCAGGTCCAAGACCTTACGA
GTGTGTGAAACGAGCTTGGCATAGCGATCGTCACCAACCCATTCGAGGTTCCATCATCCG
CCAGATCTTCAGACTCGCCATGGAAGCACACAGTGCGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATG
GCAGGAGAAGCTTCCTGTTGTTGTCTTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAATCCAA
CTCCGAGGAAGAGTATACAGATGCTGATACTATGTGGAATAGAGTCAATGATGCCATTGA
CACCATTATTAGACGAGATGAAAGCACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGA
AGCTGCTCTTAACCTTGGGTGTATTGCTGTAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGACATAGTAA
CGTCAGGACTTACCTCTCTCCAAAATACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGCC
GCAAAAGACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAATC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4F026TF 698 0 0
GG
ACCTTCTCCCATTCTAAGCTCCCCAAAAACACACTTGTGCGAGAGAGAGAGAAGAAGAAG
AAGAAGATGCCTAGGCCAGGTCCAAGACCTTACGAGTGTGTGAAACGAGCTTGGCATAGC
GATCGTCACCAACCCATTCGAGGTTCCATCATCCGCCAGATCTTCAGACTCGCCATGGAA
GCACACAGTGCGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATGGCAGGAGAAGCTTCCTGTTGTTGTC
TTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAATCCAACTCCGAGGAAGAGTATACAGATGCT
GATACTATGTGGAATAGAGTCAATGATGCCATTGACACCATTATTAGACGAGATGAAAGC
ACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGAAGCTGCTCTTAACCTTGGGTGTATT
GCTGTAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGACATAGTAACGTCAGGACTTACCTCTCTCCAAAA
TACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGCCGCAAAAGACTAACAAGCCAATCCAT
ACCGCTCAACCTGCAATCCCAGTGGAGGTTCTTGAGGACAGCAACAACCGAGGAGCAGCG
TTTCTACATGAAATGCCATTGGCTAGAAAACTAGGGACTATCACTGCTGCTCCTGGTACA
GCACCAGCGCCAATTAACTTGGGTTCGGTGTATCCT

QA 3 698 3 698
DS 



AS 1 4

CO CL3409Contig1 693 4 5 U
TTTTTTGAAAAAAATGCGAATTTTTAAACAAAATGGAGCGACAACAGGAACAAAAGCAAA
ACTAATTTACAAAAGACGACAAGACAATCACCGCTATCTCTCTTTCTCTCTATCTGATTT
TCACTTAACTTCTATCAGCCAATCACGTAATGCCAAACCCACGTCAGCTTAAAGTCACCA
CAAGCCTAGTAATACCAATGTGATGAAGCTGTAAAGTAAGAAGTGGACCAAGTGGTGCGG
GTACTCGAGTAAAGCTGATGATGAGTCGTTGGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGG
CATGCCGTCACCTCCCAGAGAACATGACCGTGGCTCCCCGTTTTGGTTGAGCATGACCGC
TCTGAGGACAGAAGTGACAGTGTGGAAATAAGCCGTACGGTTCTTAGATAGAAGCCAAGT
AAGACCCATCAGGACACAGTCTTTATTATGCATCTCCATGGTCCTGTTTCTATCCTCCTT
CGATGGGTTTCTTGTCGCTGAAGTTTTCTTCGGATTTAGCTTGTAGAGGCTGTTCAAGCA
CTTGTTACAGCTACCAAGAGTAGATTCTCTATCACCATTGGCGTGTCTTCCACTCAAACA
ATCATTCTCTAATCTATCAACACTCTCGTCTCCAACGAGCCTTCCTTCTCCGTTCACACT
AAAAGCCTCGGAACAGCTCGGGTGATGCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FG15TF C 1
AF RR4FG15JQ U 7
AF RR4AJ45JQ U 26
AF RR4AJ45TF C 26
BS 1 6 RR4FG15TF
BS 7 603 RR4FG15JQ
BS 604 604 RR4AJ45JQ
BS 605 645 RR4FG15JQ
BS 646 693 RR4AJ45JQ

RD RR4FG15TF 645 0 0
TTTTTTGAAAAAAATGCGAATTTTTAAACAAAATGGAGCGACAACAGGAACAAAAGCAAA
ACTAATTTACAAAAGACGACAAGACAATCACCGCTATCTCTCTTTCTCTCTATCTGATTT
TCACTTAACTTCTATCAGCCAATCACGTAATGCCAAACCCACGTCAGCTTAAAGTCACCA
CAAGCCTAGTAATACCAATGTGATGAAGCTGTAAAGTAAGAAGTGGACCAAGTGGTGCGG
GTACTCGAGTAAAGCTGATGATGAGTCGTTGGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGG
CATGCCGTCACCTCCCAGAGAACATGACCGTGGCTCCCCGTTTTGGTTGAGCATGACCGC
TCTGAGGACAGAAGTGACAGTGTGGAAATAAGCCGTACGGTTCTTAGATAGAAGCCAAGT
AAGACCCATCAGGACACAGTCTTTATTATGCATCTCCATGGTCCTGTTTCTATCCTCCTT
CGATGGGTTTCTTGTCGCTGAAGTTTTCTTCGGATTTAGCTTGTAGAGGCTGTTCAAGCA
CTTGTTACAGCTACCAAGAGTAGATTCTCTATCACCATTGGCGTGTCTTCCACTCAAACA
ATCGTTCTCTAATCTATCAACACTCTCGTCTCCAACGAGCCTTCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4FG15JQ 639 0 0
GAAAAAAATGCGAATTTTTAAACAAAATGGAGCGACAACAGGAACAAAAGCAAAACTAAT
TTACAAAAGACGACAAGACAATCACCGCTATCTCTCTTTCTCTCTATCTGATTTTCACTT
AACTTCTATCAGCCAATCACGTAATGCCAAACCCACGTCAGCTTAAAGTCACCACAAGCC
TAGTAATACCAATGTGATGAAGCTGTAAAGTAAGAAGTGGACCAAGTGGTGCGGGTACTC
GAGTAAAGCTGATGATGAGTCGTTGGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGGCATGCC
GTCACCTCCCAGAGAACATGACCGTGGCTCCCCGTTTTGGTTGAGCATGACCGCTCTGAG
GACAGAAGTGACAGTGTGGAAATAAGCCGTACGGTTCTTAGATAGAAGCCAAGTAAGACC
CATCAGGACACAGTCTTTATTATGCATCTCCATGGTCCTGTTTCTATCCTCCTTCGATGG
GTTTCTTGTCGCTGAAGTTTTCTTCGGATTTAGCTTGTAGAGGCTGTTCAAGCACTTGTT
ACAGCTACCAAGAGTAGATTCTCTATCACCATTGGCGTGTCTTCCACTCAAACAATCGTT
CTCTAATCTATCAACACTCTCGTCTCCAACGAGCCTTCC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AJ45JQ 668 0 0
G
AACAAAATGGAGCGACAACAGGAACAAAAGCAAAACTAATTTACAAAAGACGACAAGACA
ATCACCGCTATCTCTCTTTCTCTCTATCTGATTTTCACTTAACTTCTATCAGCCAATCAC
GTAATGCCAAACCCACGTCAGCTTAAAGTCACCACAAGCCTAGTAATACCAATGTGATGA
CGCTGTAAAGTAAGAAGTGGACCAAGTGGTGCGGGTACTCGAGTAAAGCTGATGATGAGT
CGTTGGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGGCATGCCGTCACCTCCCAGAGAACATG
GCCGTGGCTCGCCGTTTTGGTTGAGCATGACCGCTCTGAGGACAGAAGTGACAGTGTGGA
AATAAGCCGTACGGTTCTTAGATAGAAGCCAAGTAAGACCCATCAGGACACAGTCTTTAT
TATGCATCTCCATGGTCCTGTTTCTATCCTCCTTCGATGGGTTTCTTGTCGCTGAAGTTT
TCTTCGGGTTTAGCTTGTAGAGGCTGTTCAAGCACTTGTTACAGCTACCAAGAGTAGATT
CTCTATCACCATTGGCGTGTCTTCCACTCAAACAATCATTCTCTGATCTATCAACACTCT
CGTCTCCAACGAGCCTTCCTTCTCCGTTCACACTAAAAGCCTCGGAACAGCTCGGGTGAT
GCAATCC

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR4AJ45TF 668 0 0
G
AACAAAATGGAGCGACAACAGGAACAAAAGCAAAACTAATTTACAAAAGACGACAAGACA
ATCACCGCTATCTCTCTTTCTCTCTATATGATTTTCACTTAACTTCTATCAGCCAATCAC
GTAATGCCAAACCCACGTCAGCTTAAAGTCACCACAAGCCTAGTAATACCAATGTGATGA
CGCTGTAAAGTAAGAAGTGGACCAAGTGGTGCGGGTACTCGAGTAAAGCTGATGATGAGT
CGTTGGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGGCACGCCGTCACCTCCCAGAGAACATG
GCCGTGGCTCGCCGTTTTGGTTGAGCATGACCGCTCTGAGGACAGAAGTGACAGTGTGGA
AATAAGCCGTACGGTTCTTAGATAGAAGCCAAGTAAGACCCATCAGGACACAGTCTTTAT
TATGCATCTCCATGGTCCTGTTTCTATCCTCCTTCGATGGGTTTCTTGTCGCTGAAGTTT
TCTTCGGGTTTAGCTTGTAGAGGCTGTTCAAGCACTTGTTACAGCTACCAAGAGTAGATT
CTCTATCACCATTGGCGTGTCTTCCACTCAAACAATCATTCTCTGATCTATCAACACTCT
CGTCTCCAACGAGCCTTCCTTCTCCGTTCACACTAAAAGCCTCGGAACAGCTCGGGTGAT
GCAATCC

QA 2 668 2 668
DS 



AS 1 4

CO CL3410Contig1 1152 4 6 U
GCATCAAAAAGCAGAGCAGCTTTCTTTCAGGAATAAACATATTGTTGGCATTTTTTTTAA
ATTTTCTCACAAGTCTTTTGCTCAAATAAAAACATTTTTCAACATCATACAGACTTCTGC
TGCATCTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTTCATCAGGAATAAACCTTCCCCAGAACCAG
TGTGCCTTCCACACTCTATTCATCTCTTCAATGGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATC
AAGTAGATAAATATCGTCATTATGAAGACAAACACCGCAAAGAAGAAGAATAGTACAAAC
TTCATGTGACAGAGCATTGTCAGGAAGAGCTGAGCTACAAGGAACGTGAAGAACATGTTG
ACCGCTACGTTCATAGCTTGAGCTGCTGATCGGATCTCTAGTGGAGATATCTCACTAGGT
ACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCGAAACCCGCCACATAGATGCAGATCAGC
GCCACGATCAGATTAGCATCTGTTTTCCCTATGTTCCCTGCCCCAACCGTTCCAAATTTG
ACTCCAATCATGACTCCGATAGCAATCTGAGAGATAAGCATCTGGATTCCTCCCTGGAGG
AACAAGACTCTTCTTCCAAACCTATCCACTGTGAAAACAGAGACAAAAGTACACAAGAGC
TCGATGATCCCCGTTACCATAGCCGATAAGAGCGAGGCTTTGCTACCGAACCCTAGTGTC
TGAAACAGAACCGGCGCATAAAATGTAATGACATTGATTCCGGTAAGCTGTTGGAAGAAA
GGAATGAAGCATGTCATGATCAACTGTGGTCTGTAACGAGGAAGCATGATATTCTTCCAC
GGGTGTTTCACTTGCTTAGACTCCTCACTCGCATCGATGAGATCTTGAAACTCTTCATCG
ACTTCACTCGTTCCTCGGATAGATTGAAGCATTTTCTTGGCATCTTCGGTGAAGCCACGT
TCGATGAGAGAGTTGGGTGTGTCGGGAAGGACAAGAGCTCCGATCATGATCATCATCGCA
GGGACACAAGCTAGCCCTAGCGAGATTCTCCATCCCATGTTGCCTTTGATCTGTGCGGTG
AAGTAGTTGATGATCGTTGCAACAACGATACCGAATATAATCGCTACTTGAAACCCATTG
TTGAACGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN63JQ U 1
AF RR4EI82JQ U 31
AF RR4GN63TF C 223
AF RR4EI82TF C 338
BS 1 371 RR4GN63JQ
BS 372 372 RR4EI82JQ
BS 373 697 RR4GN63JQ
BS 698 775 RR4EI82JQ
BS 776 916 RR4GN63TF
BS 917 1152 RR4EI82TF

RD RR4GN63JQ 697 0 0
GCATCAAAAAGCAGAGCAGCTTTCTTTCAGGAATAAACATATTGTTGGCATTTTTTTTAA
ATTTTCTCACAAGTCTTTTGCTCAAATAAAAACATTTTTCAACATCATACAGACTTCTGC
TGCATCTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTTCATCAGGAATAAACCTTCCCCAGAACCAG
TGTGCCTTCCACACTCTATTCATCTCTTCAATGGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATC
AAGTAGATAAATATCGTCATTATGAAGACAAACACCGCAAAGAAGAAGAATAGTACAAAC
TTCATGTGACAGAGCATTGTCAGGAAGAGCTGAGCTACAAGGAACGTGAAGAACATGTTG
ACCGCTACGTTTATAGCTTGAGCTGCTGATCGGATCTCTAGTGGAGATATCTCACTAGGT
ACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCGAAACCCGCCACATAGATGCAGATCAGC
GCCACGATCAGATTAGCATCTGTTTTCCCTATGTTCCCTGCCCCAACCGTTCCAAATTTG
ACTCCAATCATGACTCCGATAGCAATCTGAGAGATAAGCATCTGGATTCCTCCCTGGAGG
AACAAGACTCTTCTTCCAAACCTATCCACTGTGAAAACAGAGACAAAAGTACACAAGAGC
TCGATGATCCCCGTTACCATAGCCGATAAGAGCGAGG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4EI82JQ 745 0 0
GG
ATAAACATATTGTTGGCATTTTTTTTAAATTTTCTCACAAGTCTTTTGCTCAAATAAAAA
CATTTTTCAACATCATACAGACTTCTGCTGCATCTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTTC
ATCAGGAATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTATTCATCTCTTCAAT
GGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATAAATATCGTCATTATGAAGACAAA
CACCGCAAAGAAGAAGAATAGTCCAAACTTCATGTGACAGAGCATTGTCAGGAAGAGCTG
AGCTACAAGGAACGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTCATAGCTTGAGCTGCTGATCG
GATCTCTAGTGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGC
GAAACCCGCCACATAGATGCAGATCAGCGCCACGATCAGATTAGCATCTGTTTTCCCTAT
GTTCCCTGTCCCAACCGTTCCAAATTTGACTCCAATCATGACTCCGATAGCAATCTGAGA
GATAAGCATCTGGATTCCTCCCTGGAGGAACAAGACTCTTCTTCCAAACCTATCCACTGT
GAAAACAGAGACAAAAGTACACAAGAGCTCGATGATCCCCGTTACCATAGCCGATAAGAG
CGAGGCTTTGCTACCGAACCCTAGTGTCTGAAACAGAACCGGCGCATAAAATGTAATGAC
ATTGATTCCGGTAAGCTGTTGGA

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR4GN63TF 694 0 0
TTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATAAATATCGTCATTATGAAGACAAACACCGCAAAG
AAGAAGAATAGTACAAACTTCATGTGACAGAGCATTGTCAGGAAGAGCTGAGCTACAAGG
AACGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTTATAGCTTGAGCTGCTGATCGGATCTCTAGT
GGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCGAAACCCGCC
ACATAGATGCAGATCAGCGCCACGATCAGATTAGCATCTGTTTTCCCTATGTTCCCTGCC
CCAACCGTTCCAAATTTGACTCCAATCATGACTCCGATAGCAATCTGAGAGATAAGCATC
TGGATTCCTCCCTGGAGGAACAAGACTCTTCTTCCAAACCTATCCACTGTGAAAACAGAG
ACAAAAGTACACAAGAGCTCGATGATCCCCGTTACCATAGCCGATAAGAGCGAGGCTTTG
CTACCGAACCCCAGTGTCTGAAACAGAACCGGCGCATAAAATGTAATGACATTGATTCCG
GTAAGCTGTTGGAAGAAAGGAATGAAGCATGTCATGATCAACTGTGGTCTGTAACGAGGA
AGCATGATATTCTTCCACGGGTGTTTCACTTGCTTAGACTCCTCACTCGCATCGATGAGA
TCTTGAAACTCTTCATCGACTTCACTCGTTCCTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4EI82TF 815 0 0
CAAGGAACGTGAAGAACATGT*GACCGCTACGTTCATAGCT*GAGCTGCTGATCGGATCT
CTAGTGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCGAAAC
CCGCCACATAGATGCAGATCAGCGCCACGATCAGATTAGCATCTGTTTTCCCTATGTTCC
CTGTCCCAACCGTTCCAAATTTGACTCCAATCATGACTCCGATAGCAATCTGAGAGATAA
GCATCTGGATTCCTCCCTGGAGGAACAAGACTCTTCTTCCAAACCTATCCACTGTGAAAA
CAGAGACAAAAGTACACAAGAGCTCGATGATCCCCGTTACCATAGCCGATAAGAGCGAGG
CTTTGCTACCGAACCCTAGTGTCTGAAACAGAACCGGCGCATAAAATGTAATGACATTGA
TTCCGGTAAGCTGTTGGAAGAAAGGAATGAAGCATGTCATGATCAACTGTGGTCTGTAAC
GAGGAAGCATGATATTCTTCCACGGGTGTTTCACTTGCTTAGACTCCTCACTCGCATCGA
TGAGATCTTGAAACTCTTCATCGACTTCACTCGTTCCTCGGATAGATTGAAGCATTTTCT
TGGCATCTTCGGTGAAGCCACGTTCGATGAGAGAGTTGGGTGTGTCGGGAAGGACAAGAG
CTCCGATCATGATCATCATCGCAGGGACACAAGCTAGCCCTAGCGAGATTCTCCATCCCA
TGTTGCCTTTGATCTGTGCGGTGAAGTAGTTGATGATCGTTGCAACAACGATACCGAATA
TAATCGCTACTTGAAACCCATTGTTGAACGCTCCC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 2 4

CO CL3411Contig1 809 2 7 U
GGACCACCTTGTGTCTCCTTTGAAATGAAGAAACTTTTATGGAGTCTGACTCTCTTTGGT
GACATCTTAAGCCTCCGTGCTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTT
AATGGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAAGGCTACA
ATGGTAGGACTCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTAGATGGA
AGTCCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTT
CATTTGGAGGGAGGCGAATGGTGTAGTGACATTGAAAGTTGTGAATACAGCAAAGAAACT
CGTCACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGAC
AAAGCCTCCGAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGAC
GGTGGATCCTTTATGGGAGACAATGAAAATAAGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAAG
GCAATATGGACTGCTTTGATGACAGATTTGTTGTGGAATGGAATGAGAGAAGCAAAGCAG
GGTCTGCTCTCTGGATGTTCTGCCGGAGGCCTTGCAGCAATATTCCAATGTGATGACTTT
AAGCTTTATCTCAGTTCTTCCACTAGAACTAAATGTCTGAGTGATGCTGGCTTTTTCGTT
GATGCCACCGATGTCTCTGGAGATCGATCTCTTAGAAAGTTATACAACGATGTATACATT
ACAGAGTATTACAAACGATCTCCCTGATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GH79TF U 1
AF RR4DT80TF U 1
BS 1 61 RR4DT80TF
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BS 437 628 RR4DT80TF
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AATGGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAAGGCTACA
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AGTCCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTT
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CGTCACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGAC
AAAGCCTCCGAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGAC
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GGTCTGCTCTCTGGATGTTCTGCCGGAGGCCTTGCAGCAATATTCCAATGTGATGACTTT
AAGCTTTATCTCAGTTCTTCCACTAGAACTAAATGTCTGAGTGATGCTGGC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4DT80TF 809 0 0
GGACCACCTTGTGTCTCCTTTGAAATGAAGAAACTTTTATGGAGTCTGACTCTCTTTGGT
GTCATCTTAAGCCTCCGTGCTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTT
AATGGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAAGGCTACA
ATGGTAGGACTCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTAGATGGA
AGTCCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTT
CATTTGGAGGGAGGCGAATGGTGTAGTGACATTGAAAGTTGTGAATACAGCAAAGAAACT
CGTCACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGAC
AAAGCCTCCGAAAATTCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGAC
GGTGGATCCTTTATGGGAGACAATGAAAATAAGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAAG
GCAATATGGACTGCTTTGATGACAGATTTGTTGTGGAATGGAATGAGAGAAGCAAAGCAG
GGTCTGCTCTCTGGATGTTCTGCCGGAG*CCTTGCAGCAATATTCCAATGTGATGACTTT
AAGCTTTATCTCAGTTCTTCCACTAGAACTAAATGTCTGAGTGATGCTGGCTTTTTCGTT
GATGCCACCGATGTCTCTGGAGATCGATCTCTTAGAAAGTTATACAACGATGTATACATT
ACAGAGTATTACAAACGATCTCCCTGATG

QA 1 809 1 809
DS 



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TGAACTACTGCTATTAGAAAACTTCTG


BQ
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AF RR4GH79JQ C 1
AF RR4CP86TF U 548
BS 1 547 RR4GH79JQ
BS 548 687 RR4CP86TF

RD RR4GH79JQ 618 0 0
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CTGTGCTTATCCTTGTGACAAGACTTGCCGCAATTTAATCTAAAGGATAAATTTGTTTTG
GTTTCTATTTTTTTGGCATTCAAATCCTTCTTTCATTATTCTTTACAACAAAAAAAACCG
AAATAAAGTAGAATAACC

QA 1 618 1 618
DS 

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GTAGAATAACCAAAACGATTTCCCTAACCAAATTGGTCGTGTAAAAATTAGTATGAACTA
CTGCTATTAGAAAACTTCTG

QA 1 140 1 140
DS 



AS 1 4

CO CL3412Contig1 852 4 3 U
GAAAACACAAATCACAAAGCAAAAACAAAAAATGAAGATCTTGTCACGACCAACGTTCAT
TTCCATACTCTATCTTATCTATCTTATCACAATCCCACCAGTCTCCTCATCATCACCGGC
GTTAACCGTGCCACAACATTTCCTCCAATGTCTCGACACTCAGCCGGCCGACCACGGCAG
TCCTAACTCCGCAACCGCCGTGATTCCCACAAACTCATCCTTCTCCTACACCGAGACCCA
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CCATGGGGAGGGAGAATGGGTGAGATTCCCTCTGACGCGACGGCGTTTGTTCACAGAGGA
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AACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTACAGAGACGTTGATATTGGTATCACGGTGCCGGGA
TATAATGCGACGTATGAAGGAGCTAAGGTTTATGGGGAGAAGTATTTCAAAGGGAATTAT
TTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCGGTTCGACCGGACTAACTTTTTCCGGTCTCAGCAA
GGGATTCCGGTTCTTGCTTAGTCCCGGATTTGAGACTGGGGAGTATCATAAGAAATAAAT
GATAAAATTTGGGACTGGATTTGCGTTATTTCCGTGGTCAACGTGTATTGTTAAACTGTG
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TGTTTTTGTTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EU20TF U 1
AF RR4F079TF U 1
AF RR4EU20JQ C 147
AF RR4F079JQ C 331
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BS 708 852 RR4EU20JQ

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TTCCATACTCTATCTTATCTATCTTATCACAATCCCACCAGTCTCCTCATCATCACCGGC
GTTAACCGTGCCACAACATTTCCTCCAATGTCTCGACACTCAGCCGGCCGACCACGGCAG
TCCTAACTCCGCAACCGCCGTGATTCCCACAAACTCATCCTTCTCCTACACCGAGACCCA
CATCAGAGCCACAATCTCCTGCTGCAAACTCCTCAACCTCGAGTTTGGATGCAGTGGAAC
CCATGGGGAGGGAGAATGGGTGAGATTCCCTCTGACGCGACGGCGTTTGTTCACAGAGGA
GGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTTCATGAACTGGTATAGACCTGGAGATGAGCTTGAG
GAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAGCTTTA

QA 1 451 1 451
DS 

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TTCCATACTCTATCTTATCTATCTTATCACAATCCCACCAGTCTCCTCATCATCACCGGC
GTTAACCGTGCCACAACATTTCCTCCAATGTCTCGACACTCAGCCGGCCGACCACGGCAG
TCCTAACTCCGCAACCGCCGTGATTCCCACAAACTCATCCTTCTCCTACACCGAGACCCA
CATCAGAGCCACAATCTCCTGCTGCAAACTCCTCAACCTCGAGTTTGGATGCAGTGGAAC
CCATGGGGAGGGAGAATGGGTGAGATTCCCTCTGACGCGACGGCGTTTGTTCACAGAGGA
GGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTTCATGAACTGGTATAGACCTGGAGATGAGCTTGAG
GAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAGCTTTAAAGAAGCGATGGCTCCTTATGTTTCAAAG
AACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTACAGAGACGTTGATATTGGTATCACGGTGCCGGGA
TATAATGCGACGTATGAAGGAGCTAAGGTTTATGGGGAGAAGTATTTCAAAGGGAATTAT
TTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCGGTTCGACCGGACTAACTTTTTCCGGTCTCAGCAA
GGGATTCCGGTTCTTGCTTAGTCCCGGATTTGAGACTGGGGAGTATC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EU20JQ 706 0 0
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CCACAAACTCATCCTTCTCCTACACCGAGACCCACATCAGAGCCACAATCTCCTGCTGCA
AACTCCTCAACCTCGAGTTTGGATGCAGTGGAACCCATGGGGAGGGAGAATGGGTGAGAT
TCCCTCTGACGCGACGGCGTTTGTTCACAGAGGAGGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTT
CATGAACTGGTATAGACCTGGAGATGAGCTTGAGGAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAG
CTTTAAAGAAGCGATGGCTCCTTATGTTTCAAAGAACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTA
CAGAGACGTTGATATTGGTATCACGGTGCCGGGATATAATGCGACGTATGAAGGAGCTAA
GGTTTATGGGGAGAAGTATTTCAAAGGGAATTATTTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCG
GTTCGACCGGACTAACTTTTTCCGGTCTCAGCAAGGGATTCCGGTTCTTGCTTAGTCCCG
GATTTGAGACTGGGGAGTATCATAAGAAATAAATGATAAAATTTGGGACTGGATTTGCGT
TATTTCCGTGGTCAACGTGTATTGTTAAACTGTGATTTATTTTAGTCTCTAGGATAAGTC
ATCGTTGTAACTTCAGTCTATAATAAATGGAATGTGTTTTTGTTTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4F079JQ 522 0 0
TCTGACGCGACGGCGTTTGTTCACAGAGGAGGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTTCATG
AACTGGTATAGACCTGGAGATGAGCTTGAGGAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAGCTTT
AAAGAAGCGATGGCTCCTTATGTTTCAAAGAACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTACAGA
GACGTTGATATTGGTATCACGGTGCCGGGATATAATGCGACGTATGAAGGAGCTAAGGTT
TATGGGGAGAAGTATTTCAAAGGGAATTATTTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCGGTTC
GACCGGACTAACTTTTTCCGGTCTCAGCAAGGGATTCCGGTTCTTGCTTAGTCCCGGATT
TGAGACTGGGGAGTATCATAAGAAATAAATGATAAAATTTGGGACTGGATTTGCGTTATT
TCCGTGGTCAACGTGTATTGTTAAACTGTGATTTATTTTAGTCTCTAGGATAAGTCATCG
TTGTAACTTCAGTCTATAATAAATGGAATGTGTTTTTGTTTC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 3

CO CL3413Contig1 1632 3 7 U
TTCTCATTTCGTCATCAATCCTCCGCACTGCAAAACCACCGGATCTATTTGTCTCTCTTC
CGCTCGTCTCGTCACTGTCACACCTCTATCTCGTCTCGTCACTGTCGCTCTCCTACAACG
CCTCGCCGTCATCACTCCTCCTCTCGCCGTCGTCACTCCTCCTCTCGCCGTCGTCACTCC
CGCATCCCTTTTCACCGTCGTCACTACCCCATCCCGTCTCACCGTCGTCACTCCCCCATC
CCGCCTCGCCGTCGTCACTTCTACATCTCGTCTCGCCGCCGTCCCTCCTCCATCTCGCCT
CGCCGCCGCTCTTCCATCTCGCCTTGCCGCCGCTCCTCCATCACGTCTCGACTTTGCTTC
CCCAGTTCGTCTTGCCGCCGTTCCTTCCAAGCGCATCGTTGAGACCGCGACTCCACCTAG
TTCGAGCGGAAACCCCGGAGCTTCTCAGTCTGAGCGTGGGCCCAACAGAGTCATTCATTG
TTCTGTGGCCGCCGCACCTCCGCCTGCTCTCCTCCTCCGACTGGAACGAGCTAGGTTCAG
ACAAGGAGTCGCCGCTCTGCTGTGCTTTTTCACCCTTGATAGCTGCCTCTCCGGTCTTTC
TACCACAAACTTTATACCTGACATCGAGGCAGGCCTATCTAGCCAAGGTTTCTATGGAGC
TAAGTTACATTGTCTTAATCTCATTCTCCTAGTGACCGCCGGATCTATTGTGCAAGAGTG
TTGTTTCGCCAGGTTAACTCATTATTATTTCACCGATGCGACTCTATCACACTACGCCGT
TTCAAGCATCGACGGTTCTTCACATGGTCGGACCTATGGCCCTCCCATTCTCCTCGTCGC
TAGAACTACTGTGCAAGAGTGTAGACTCGCCAGATCTATAAACTCCATCACCATTGCGAG
TCCATCACATTATGCCGTCTCAAGCATCGACGGTTCTTCACAGAGTCAACTACACGACCT
AACTGAAACTGCTATCCTCAACAGAGGTTCCCCATGGAAGATTACACCAACTCAATCACT
GTACTTCAACTACAACTCAGATGGTCTATGCCTCATCTCCAAGTTGACAGGTTCCGTAAA
TCAACTCGGTTTCACAAAAGCTCGCGTACCCCGGCACGGTAATGTTGGTGTTAGATGCTT
TGACTTGACCAAAGTTCTGGCTGTATCATCGTATCCAGTTAACCTCCTCTCTATTGGCTG
CTCTGAAGCAAGTATTGGTATTTTTGAGACTCACCTAGTCTCATCATCTTCCTCACGGAT
AGTTATGTTCTTCATTGTACTTGAGATTCACAGTCTCTTCAGTGAGTTTTGCCGGTTTCA
GAGTTAATCATGGTTGTTTCAATGCCAAATCAAGTCAGTTAGGACTTCATATCCTCGATG
AGTATGTTGCATACGGATCTGGAGCTTCTCACCAAAAGTTCTTGCCAGCCAACATTCCAG
TCTCAACGGTGCATCAACGTCGTTTCGACTATCATCAATTGTTCTATGAAACAATAGTTT
TTGGACCTCAAGTGAAGTATCTCTCCGGGTTCCTTCACTCCTTAAACACATCTATCTCTC
TTGTTGTAGTGTTTGTTTTTCAGCTTGTTGCCGTTGAGTTTTCCTCCGGTTGTACTCTTT
TAAGTTTCTCGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH24TF U 1
AF RR4H436TF U 459
AF RR4H436JQB C 970
BS 1 602 RR4DH24TF
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BS 1120 1632 RR4H436JQB

RD RR4DH24TF 722 0 0
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CGCATCCCTTTTCACCGTCGTCACTACCCCATCCCGTCTCACCGTCGTCACTCCCCCATC
CCGCCTCGCCGTCGTCACTTCTACATCTCGTCTCGCCGCCGTCCCTCCTCCATCTCGCCT
CGCCGCCGCTCTTCCATCTCGCCTTGCCGCCGCTCCTCCATCACGTCTCGACTTTGCTTC
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ACAAGGAGTCGCCGCTCTGCTGTGCTTTTTCACCCTTGATAGCTGCCTCTCCGGTCTTTC
TATCACAAACTTTATACCTGACATCGAGGCAGGCCTATCTAGCCAAG*TTTCTATGGAGC
TAAGTTACATTGTCTTAATCTCATTCTCCTAGTGACCGCCGGATCTATTGTGCAAGAGTG
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4H436TF 661 0 0
GGCCCAACAGAGTCATTCATTGTTCTGTGGCCGCCGCACCTCCGCCTGCTCTCCTCCTCC
GACTGGAACGAGCTAGGTTCAGACAAGGAGTCGCCGCTCTGCTGTGCTTTTTCACCCTTG
ATAGCTGCCTCTCCGGTCTTTCTACCACAAACTTTATACCTGACATCGAGGCAGGCCTAT
CTAGCCAAGGTTTCTATGGAGCTAAGTTACATTGTCTTAATCTCATTCTCCTAGTGACCG
CCGGATCTATTGTGCAAGAGTGTTGTTTCGCCAGGTTAACTCATTATTATTTCACCGATG
CGACTCTATCACACTACGCCGTTTCAAGCATCGACGGTTCTTCACATGGTCGGACCTATG
GCCCTCCCATTCTCCTCGTCGCTAGAACTACTGTGCAAGAGTGTAGACTCGCCAGATCTA
TAAACTCCATCACCATTGCGAGTCCATCACATTATGCCGTCTCAAGCATCGACGGTTCTT
CACAGAGTCAACTACACGACCTAACTGAAACTGCTATCCTCAACAGAGGTTCCCCATGGA
AGATTACACCAACTCAATCACTGTACTTCAACTACAACTCAGATGGTCTATGCCTCATCT
CCAAGTTGACAGGTTCCGTAAATCAACTCGGTTTCACAAAAGCTCGCGTACCCCGGCACG
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4H436JQB 663 0 0
TGCTATCCTCAACAGAGGTTCCCCATGGAAGATTACACCAACTCAATCACTGTACTTCAA
CTACAACTCAGATGGTCTATGCCTCATCTCCAAGTTGACAGGTTCCGTAAATCAACTCGG
TTTCACAAAAGCTCGCGTACCCCGGCACGGTAATGTTGGTGTTAGATGCTTTGACTTGAC
CAAAGTTCTGGCTGTATCATCGTATCCAGTTAACCTCCTCTCTATTGGCTGCTCTGAAGC
AAGTATTGGTATTTTTGAGACTCACCTAGTCTCATCATCTTCCTCACGGATAGTTATGTT
CTTCATTGTACTTGAGATTCACAGTCTCTTCAGTGAGTTTTGCCGGTTTCAGAGTTAATC
ATGGTTGTTTCAATGCCAAATCAAGTCAGTTAGGACTTCATATCCTCGATGAGTATGTTG
CATACGGATCTGGAGCTTCTCACCAAAAGTTCTTGCCAGCCAACATTCCAGTCTCAACGG
TGCATCAACGTCGTTTCGACTATCATCAATTGTTCTATGAAACAATAGTTTTTGGACCTC
AAGTGAAGTATCTCTCCGGGTTCCTTCACTCCTTAAACACATCTATCTCTCTTGTTGTAG
TGTTTGTTTTTCAGCTTGTTGCCGTTGAGTTTTCCTCCGGTTGTACTCTTTTAAGTTTCT
CGG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 3

CO CL3414Contig1 682 3 11 U
CAGCTTCATCCGTTCTCTATTACTTAATTCTCTCGCTGCTTGCTGTTGCTGTTCGTTTGC
TTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATT
ACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATC
CGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTACCGGGACACTCCTGCTCCTTTCAATTGCC
TCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCCGGTGTAGCTGCTGTTG
TTGCTTGCATGACTCCATTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCC
TCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAAT
CAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCACTCCCTG
CATGATATAAGACTGCATTCTTTTTTT***********TCTTGTTAATATTACTTGTGAA
GTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTAA
AATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGTGATTCGTGAATTGCA
CCGTTTAGTGTCTTGATTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E535TF U 63
AF RR4BN32JQ C 1
AF RR4BV67TF U 51
BS 1 53 RR4BN32JQ
BS 54 211 RR4BV67TF
BS 212 212 RR4E535TF
BS 213 217 RR4BV67TF
BS 218 218 RR4E535TF
BS 219 503 RR4BV67TF
BS 504 504 RR4E535TF
BS 505 642 RR4BV67TF
BS 643 643 RR4BN32JQ
BS 644 672 RR4BV67TF
BS 673 682 RR4BN32JQ

RD RR4E535TF 533 0 0
GGATC
TTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTACGCGGG
GCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCCGATGGG
TGCTCCGATCCATCAAACGTTTTACCGGGACACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTCTATTG
CGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCTGGTGTAGCTGCTGTTGTTGCTTG
CATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTTCCCTTCCATGGATTGCCTCTGGAA
CAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCAGATCC
CTGCCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCACTCCCTGCATGATA
TAAGACTGCATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTTCTTGTTAATATTACTTGTGAAGTTGAGA
CCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCCGAATAAACCC

QA 6 533 6 533
DS 

RD RR4BN32JQ 682 0 0
CAGCTTCATCCGTTCTCTATTACTTAATTCTCTCGCTGCTTGCTGTTGCTGTTCGTTTGC
TTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATT
ACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATTTATGGAGATC
CGATGGGTGTTCCGATCCATCAAACGTTTTACCGGGACACTCCTGCTCCTTTCAATTGCC
TTTATTGCGGCAATACTGGTTTCACCCATATCAGATCAAAACCCGGTGTAGCTGCTGTTG
TTGCTTGCATGACTCCATTTATTCTTGGATTCTGTTTTTTCTGCCCTTCAATGGATTGCC
TCTGGAACAAACAGCATCATTACCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAAT
CAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGCACGCAACCGAGCTTTGCACTCCCTG
CATGATATAAGACTGCATTCTTTTTTT***********TCTTGTTTATATTACTTGTGAA
GTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTAA
AATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGTGATTCGTGAATTGCA
CCGTTTAGTGTCTTGATTCTCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4BV67TF 622 0 0
GGG
CGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTA
CCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTAT
GGAGATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTC
AATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCCGGTGTAGCT
GCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCATTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATG
GATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTT
GAGAAATCAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCA
CTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTCTTT***********TCTTGTTAATATTAC
TTGTGAAGTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAAC
CCTGTAAAATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCGGTGATTCGTG
AATTGCACCGTTTAGTGTC

QA 4 622 4 622
DS 



AS 1 2

CO CL3415Contig1 793 2 7 U
TGTCGGTCTCGACGATATGAGCTCCACCGAGCTAGCCTCACTTAGAAGTATGTTGGATGA
GGGCTTCCGCATCGTGGACAAACAAACAGATCAGGCACACGAGGATTTAACAGTCAATCA
GATTGTTGAGTACGATCTTATGGGGGGAATGGACTGGATTCGAAGACTAGAGAAGATTTG
GCCTACCAATCCCTTCTAGCAGGGAGAAGAAGAGCTTTGAGGAACAAGGCTAGAGAATTC
CGCCTCAGCCCTCCAGAAACCCAACCTTGGCGTAGCAATGACCCCTGAAAGACTGAAGAC
AGACATCGACTCTCTAAAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTGTTTTCAACCAGAGAATGAT
TGGTAAAGAGCTTGATGGTATGGGTTACTTGGAACTGACTGTGTTTAGCTTTGAGATATC
GGGTGCTATAATGAAAGTCGAAGGGATGATGAAGATAAAACGTGCCGAAGAGATGGAAAA
GACAAAACGTCCAAGGCCGACGGTCAACAAGGAACTAATCTCCCTGGGACAGATATGATC
GTGGCTTTAGGTGGCAGGTTCTTGGCTCGTGCCAACATTAAAGAGATGAAAATCGTTTTG
TTTAATAAGAGAGGCTTGTGACTATGTACTTAGATAATGTTTTTTTCTGGCTCTTTGTGT
TATGTCTCTCTGGTGATATGATTAAACTAAAAACTTATGGTTTTGTTAGATTCTATATAA
AACCCATGTTAGGCTCCAGTTTTCAAAGGATCAGAATGTACAATACCATAAATACTTTCG
CATTATAAACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C647TF U 260
AF RR4C647JQ C 1
BS 1 260 RR4C647JQ
BS 261 479 RR4C647TF
BS 480 480 RR4C647JQ
BS 481 495 RR4C647TF
BS 496 496 RR4C647JQ
BS 497 511 RR4C647TF
BS 512 793 RR4C647JQ

RD RR4C647TF 259 0 0
C
CCAACCTTGGCGTAGCAATGACCCCTGAAAGACTGAAGACAGACATCGACTCTCTAAAGA
TCGAGAAAGAGAGACTACGTGTTTTCAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTTGATGGTA
TGGGTTACTTGGAACTGACTGTGTTTAGCTTTGAGATATCGGGTGCTATAATGAAAGTCG
AAGGGATGATGAAGATAAAACGTGCCGAAGAGATGGAAA*GACAAAACGTCCAAG*CCGA
CGGTCAACAAG
AACTAAT

QA 2 252 2 252
DS 

RD RR4C647JQ 793 0 0
TGTCGGTCTCGACGATATGAGCTCCACCGAGCTAGCCTCACTTAGAAGTATGTTGGATGA
GGGCTTCCGCATCGTGGACAAACAAACAGATCAGGCACACGAGGATTTAACAGTCAATCA
GATTGTTGAGTACGATCTTATGGGGGGAATGGACTGGATTCGAAGACTAGAGAAGATTTG
GCCTACCAATCCCTTCTAGCAGGGAGAAGAAGAGCTTTGAGGAACAAGGCTAGAGAATTC
CGCCTCAGCCCTCCAGAAACCCAACCTTGGCGTAGCAATGACCC*TGAAAGACTGAAGAC
AGACATCGACTCTCTAAAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTGTTTTCAACCAGAGAATGAT
TGGTAAAGAGCTTGATGGTATGGGTTACTTGGAACTGACTGTGTTTAGCTTTGAGATATC
GGGTGCTATAATGAAAGTCGAAGGGATGATGAAGATAAAACGTGCCGAAGAGATGGAAAA
GACAAAACGTCCAAGGCCGACGGTCAACAAGGAACTAATCTCCCTGGGACAGATATGATC
GTGGCTTTAGGTGGCAGGTTCTTGGCTCGTGCCAACATTAAAGAGATGAAAATCGTTTTG
TTTAATAAGAGAGGCTTGTGACTATGTACTTAGATAATGTTTTTTTCTGGCTCTTTGTGT
TATGTCTCTCTGGTGATATGATTAAACTAAAAACTTATGGTTTTGTTAGATTCTATATAA
AACCCATGTTAGGCTCCAGTTTTCAAAGGATCAGAATGTACAATACCATAAATACTTTCG
CATTATAAACACC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 4

CO CL3416Contig1 702 4 1 U
GGTCGTTCATATATTCCACCATTCCCTAGTTCGTGAGGCTTGAGATTCCATTAGGAGATC
AAATGGAAATGACAACAGTACCAGGACAGTTGGTGTGGGAGATAGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGACCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCCTACAAACACTCTGGTTTGGCGAACAAAAAGACAGTGA
CCATTCAAGTAGCTGACAAGGAACTAGGTGTGGTACTCGGAACCACAAAGACCAAGAAAC
AAAACAAGCCTAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCCAGGATGG
CCAATGCCGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATCTGAAGAAGGCAG
CACTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGTCTTAGAGTCGCTAAGTCTGGTCCCAAGA
GGAGAAACAGACAGGCCTGAAGAATCCGCCATTGGATGAAATATTTTACTTCTTATAAAT
CTTTGTTTCGAGAGCTTAGTTCGGACAATGCTTGTAGGTTTAATGATTTCTCCTGAACAG
CTGAGAGTTTTGTTTGAACGACCTCCTTTTTTATCATCCTTTTTTCACAAAATGATATAA
AAAATTAATTAGTATGGTTATGATGATGACTAATCTAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FV35TF U 7
AF RR4FV35JQ C 442
AF RR4FC02TF U 1
AF RR4FC02JQ C 30
BS 1 702 RR4FC02TF

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GG
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ATGACAACAGTACCAGGACAGTTGGTGTGGGAGATAGTGAAGAGAAACAACTGTTTCTTG
GTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTTCA

QA 3 162 3 162
DS 

RD RR4FV35JQ 167 0 0
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GAATCCGCCATTGGATGAAATATTTTACTTTTTATAAATCTTTGTTTCGAGAGCTTAGTT
CGGACAATGCCTGTAGGTTTAATGATTTCTCCTGAACAGCTGAGAGT

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR4FC02TF 702 0 0
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GTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGACCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCCTACAAACACTCTGGTTTGGCGAACAAAAAGACAGTGA
CCATTCAAGTAGCTGACAAGGAACTAGGTGTGGTACTCGGAACCACAAAGACCAAGAAAC
AAAACAAGCCTAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCCAGGATGG
CCAATGCCGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATCTGAAGAAGGCAG
CACTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGTCTTAGAGTCGCTAAGTCTGGTCCCAAGA
GGAGAAACAGACAGGCCTGAAGAATCCGCCATTGGATGAAATATTTTACTTCTTATAAAT
CTTTGTTTCGAGAGCTTAGTTCGGACAATGCTTGTAGGTTTAATGATTTCTCCTGAACAG
CTGAGAGTTTTGTTTGAACGACCTCCTTTTTTATCATCCTTTTTTCACAAAATGATATAA
AAAATTAATTAGTATGGTTATGATGATGACTAATCTAACTCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4FC02JQ 673 0 0
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TTGGTGTGGGAGATAGTGAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGC
AATGCCAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGACCAACAACCTCTGCAACCTCAACTCCTACAAA
CACTCTGGTTTGGCGAACAAAAAGACAGTGACCATTCAAGTAGCTGACAAGGAACTAGGT
GTGGTACTCGGAACCACAAAGACCAAGAAACAAAACAAGCCTAAGCTTTCTGTTAACAAG
TCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCCAGGATGGCCAATGCCGTTGCCAACCAGGTTGTGGAC
AACTACTACAGGCCTGATCTGAAGAAGGCAGCACTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAA
GGTCTTAGAGTCGCTAAGTCTGGTCCCAAGAGGAGAAACAGACAGGCCTGAAGAATCCGC
CATTGGATGAAATATTTTACTTCTTATAAATCTTTGTTTCGAGAGCTTAGTTCGGACAAT
GCTTGTAGGTTTAATGATTTCTCCTGAACAGCTGAGAGTTTTGTTTGAACGACCTCCTTT
TTTATCATCCTTTTTTCACAAAATGATATAAAAAATTAATTAGTATGGTTATGATGATGA
CTAATCTAACTCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 4

CO CL3417Contig1 562 4 7 U
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AAGAAATGTCGGGAAGAGGAAAAGGAGGGAAGGGATTGGGGAAGGGAGGAGCGAAGAGGC
ACAGGAAGGTGCTTAGGGATAACATCCAGGGTATCACCAAGCCTGCCATTCGTCGTCTTG
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TTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTAGTAAAAAGTAAAACAAGGAGCTGTGTCTTGTTA
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ATGAAAATTCTGTTTGAAAACG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC17TF U 1
AF RR4EL70JQ C 1
AF RR4FK31TF U 1
AF RR4EL70TF U 1
BS 1 88 RR4BC17TF
BS 89 89 RR4EL70TF
BS 90 353 RR4BC17TF
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BS 356 402 RR4BC17TF
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BS 404 562 RR4BC17TF

RD RR4BC17TF 562 0 0
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AAGAAATGTCGGGAAGAGGAAAAGGAGGAAAGGGATTGGGGAAGGGAGGAGCGAAGAGGC
ACAGGAAGGTGCTTAGGGATAACATCCAGGGTATCACCAAGCCTGCCATTCGTCGTCTTG
CTCGCAGAGGTGGTGTCAAGCGTATTAGCGGCCTCATTTACGAGGAGACCAGAGGAGTCC
TCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACGGAGCACGCTAGGA
GGAAGACTGTTACGGCTATGGATGTTGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGACGC**TCTCT
ACGGATTCGGCGGTTAATCGAACGGTTGAGATTTTAATAGGAAACGGAATTAGTGTGTTG
TTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTAGTAAAAAGTAAAACAAGGAGCTGTGTCTTGTTA
AGCCAATTTGATGTTCCATGTAGCTAGCTAAAATTCAGCAATCTCTGATTGGATTCTTAA
ATGAAAATTCTGTTTGAAAACG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4EL70JQ 556 0 0
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AAGAAATGTCGGGAAGAGGAAAAGGAGGGAAGGGATTGGGGAAGGGAGGAGCGAAGAGGC
ACAGGAAGGTGCTTAGGGATAACATCCAGGGTATCACCAAGCCTGCCATTCGTCGTCTTG
CTCGCAGAGGTGGTGTCAAGCGTATTAGCGGCCTCATTTACGAGGAGACCAGAGGAGTCC
TCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACGGAGCACGCTAGGA
GGAAGACTGTTACGGCTATGGATGTTGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCT
ACGGATTCGGCGGTTAATCGAACGGTTGAGATTTTAATAGGAGACGGAATTAGTGTGTTG
TTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTAGTAAAAAGTAAAACAAGGAGCTGTGTCTTGTTA
AGCCAATTTGATGTTCCATGTAGCTAGCTAAAATTCAGCAATCTCTGATTGGATTCTTAA
ATGAAAATTCTGTTTG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4FK31TF 556 0 0
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CTCGCAGAGGTGGTGTCAAGCGTATTAGCGGCCTCATTTACGAGGAGACCAGAGGAGTCC
TCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACGGAGCACGCTAGGA
GGAAGACTGTTACGGCTATGGATGTTGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGTACGCACTCTCT
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TTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTAGTAAAAAGTAAAACAAGGAGCTGTGTCTTGTTA
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ATGAAAATTCTGTTTG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4EL70TF 556 0 0
GGATATCGTCAAACTCGTTTTACTATCCTCTCCGATCGATTATTCAGGAGCTTCGGAATC
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CTCGCAGAGGTGGTGTCAAGCGTATTAGCGGCCTCATTTACGAGGAGACCAGAGGAGTCC
TCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACGGAGCACGCTAGGA
GGAAGACTGTTACGGCTATGGATGTTGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCT
ACGGATTCGGCGGTTAATCGAACGGTTGAGATTTTAATAGGAGACGGAATTAGTGTGTTG
TTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTAGTAAAAAGTAAAACAAGGAGCTGTGTCTTGTTA
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ATGAAAATTCTGTTTG

QA 1 556 1 556
DS 



AS 2 4

CO CL3418Contig1 367 2 2 U
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TGATAGCAGTGGGACCTGGATCAAGGGATAAGGATGGAAAATTGATTCCAGTCTCTGTTA
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AGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGCTGCACGAAGATTGAGAAA
GGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATT
TATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTACTTTAATGGACTATATT
TGTCCCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A987JQ C 1
AF RR4A987TF U 1
BS 1 1 RR4A987JQ
BS 2 367 RR4A987TF

RD RR4A987JQ 367 0 0
GCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCCGAGAAGGCCTCCAAGCTGAACTCGGGAAAGG
TGATAGCAGTGGGACCTGGATCAAGGGATAAGGATGGAAAATTGATTCCAGTTTCTGTTA
AGGAAGGGGACACTGTTTTTCTCCCAGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAGCTAGGCGAGA
AGGAGTACCATTTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGCTGCACGAAGATTGAGAAA
GGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATT
TATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTACTTTAATGGACTATATT
TGTCCCT

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4A987TF 367 0 0
G
CAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCCGAGAAGGCCTCCAAGCTGAACTCGGGAAAGGT
GATAGCAGTGGGACCTGGATCAAGGGATAAGGATGGAAAATTGATTCCAGTCTCTGTTAA
GGAAGGCGACACTGTTCTTCTCCCAGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAGCTAGGCGAGAA
GGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGCTGCACGAAGATTGAGAAAG
GCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTT
ATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTACTTTAATGGACTATATTT
GTCCCT

QA 2 367 2 367
DS 



CO CL3418Contig2 556 2 1 U
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GCTAGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGA
AGATTGAGAAAGGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACA
AACAAGTTATTTATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTCCTTTAA
TGGACTATATTTGTCCCTTCTGAGTCGGTCGTTCCAGTTTTTCCAAATTGTCATCAATCC
TAAGATAAGTTAAGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FJ21JQ C 1
AF RR4FJ21TF U 1
BS 1 556 RR4FJ21TF

RD RR4FJ21JQ 556 0 0
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CTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCAAGGGATAAGGACGGGAAATTGATCCC
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GCTAGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGA
AGATTGAGAAAGGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACA
AACAAGTTATTTATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTCCTTTAA
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TAAGATAAGTTAAGTG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4FJ21TF 556 0 0
GGGTCTTCTTAAAAGCCCTAGAGTTCAGTTCCTCCGACTCAGCCCCGAGCGAAAGAGAGA
GAGAGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGCAGAGAGT
CATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAGGCCTCCAAGCTGAA
CTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCAAGGGATAAGGACGGGAAATTGATCCC
AGTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTCCCAGAGTATGGCGGTACTCGGGTCAA
GCTAGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGA
AGATTGAGAAAGGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACA
AACAAGTTATTTATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTCCTTTAA
TGGACTATATTTGTCCCTTCTGAGTCGGTCGTTCCAGTTTTTCCAAATTGTCATCAATCC
TAAGATAAGTTAAGTG

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 4

CO CL3419Contig1 678 4 5 U
GGCTTCATCTTAAAGAATAATAATGGCAAAACTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCT
ATGTTTGACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACTTCGACCGCTTCCA
CATCAAGGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAA
ATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAACTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGAC
ACTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGA
CCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCAGACGCAGAGTGTAGTGA
AGTGAACAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGG
AATTGTCTCCAATGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTCCTCT
CGCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGC
TCTATATATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCA
TTCTATCTCTTATATAAAACATTCTTTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAAC
GGTGTTTTCTTTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4H054JQ C 1
AF RR4H054TF U 1
AF RR4B290JQ C 5
AF RR4B290TF U 5
BS 1 6 RR4H054JQ
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BS 205 205 RR4B290TF
BS 206 677 RR4H054TF
BS 678 678 RR4H054JQ

RD RR4H054JQ 678 0 0
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ATGTTTGACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACTTCGACCGCTTCCA
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ATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGAC
ACTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGA
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AATTGTCTCCAATGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTCCTCT
CGCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTTTAAGC
TCTATATATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCA
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GGTGTTTTCTTTTGTTTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4H054TF 678 0 0
GGCTTC
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TTCTTTTGTTT
G

QA 7 677 7 677
DS 

RD RR4B290JQ 673 0 0
GG
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CGAAGGGGCAAAGGTAAAACTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAG
CAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGA
AGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCAGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAA
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CTCCAATGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGA
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TATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCATTCTAT
CTCTTATATAAAACATTCTTTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTT
TTCTTTTGTTT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR4B290TF 673 0 0
GG
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GACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACTTCGACCGCTTCCACATCAA
GGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCT
CGAAGGGGCAAAGGTAAAACTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAG
CAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGA
AGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCAGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAA
CAATCAAGAGTTCCTAAGAAGCGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGT
CTCCAATGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGA
TTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATA
TATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCATTCTAT
CTCTTATATAAAACATTCTTTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTT
TTCTTTTGTTT

QA 3 673 3 673
DS 



AS 1 4

CO CL3420Contig1 644 4 8 U
CAACATCTTAAGACAAGAAATAAAAGTGATAAATATTAAAACTTTCCGACACCAAACACG
TAAACATAGCAAAACATAAGTTCTTAGATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAA
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AAACGAGAACGAGCACCACGACCACCAAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCC
ACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAACCAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCG
TCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCACGAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAG
ACCTGGGAAGTGTGAACACCACCCTTGACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGG
TGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTCGTAGATCTCGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAG
AGCTCGATCGGGGCACCGTTGAGCTTGATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACA
GCCACAGCCGTCTTCTTCCTCCCGAAGCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCC
ATGGTTGGGGGTTTGCTCTTTCGTCCGCCGCTGGAAATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BV74JQ U 28
AF RR4H249JQ U 1
AF RR4BV74TF C 25
AF RR4H249TF C 340
BS 1 375 RR4H249JQ
BS 376 376 RR4BV74JQ
BS 377 382 RR4H249JQ
BS 383 383 RR4BV74JQ
BS 384 454 RR4H249JQ
BS 455 455 RR4BV74JQ
BS 456 606 RR4H249JQ
BS 607 644 RR4BV74TF

RD RR4BV74JQ 455 0 0
GG
TAAATATTAAAACTTTCCGACACCAAACACGTAAACATAGCAAAACATAAGTTCTTAGAT
ATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGTTCCGAAACAAAAACAAC
ACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGAGAACGAGCACCACGACCACCAAA
CTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAACCAG
GATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCACGAG
CGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAAACCTGGGAAGTGTGAACACCACCCTTGAC
GCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTCGTA
AATCTCGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAA
AAA

QA 3 452 3 452
DS 

RD RR4H249JQ 606 0 0
CAACATCTTAAGACAAGAAATAAAAGTGATAAATATTAAAACTTTCCGACACCAAACACG
TAAACATAGCAAAACATAAGTTCTTAGATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAA
ACCTTGCAACGTTCCGAAACAAAAACAACACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGG
AAACGAGAACGAGCACCACGACCACCAAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCC
ACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAACCAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCG
TCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCACGAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAG
ACCTGGGAAGTGTGACCACCACTCTTGACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGG
TGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTCGTAGATCTTGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAG
AGCTCGATCGGGGCACCGTTGAGCTTGATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACA
GCCACAGCCGTCTTCTTCCTCCCGAAGCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCC
ATGGTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4BV74TF 620 0 0
TTTGG
TAAATATTAAAACTTTCCGACACCAAACACGTAAACATAGCAAAACATAAGTTCTTAGAT
ATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGTTCCGAAACAAAAACAAC
ACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGAGAACGAGCACCACGACCACCAAA
CTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAACCAG
GATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCACGAG
CGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAGACCTGGGAAGTGTGAACACCACCCTTGAC
GCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTCGTA
GATCTCGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTAGATCGGGGCACCGTTGAGCTTGAT
GAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACCGCCGTCTTCTTCCTCCCGAAGCA
TTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTGCTCTTTCGTCCGCC
GCTGGAAATGAAAAA

QA 6 620 6 620
DS 

RD RR4H249TF 305 0 0
ATACTCTGACGGATGGCGTAGACCTGGGAAGTGTGACCACCACTCTTGACGCGGATCCTC
ATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTCGTAGATCTTGTAC
CGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTCGATCGGGGCACCGTTGAGCTTGATGAGACCGCAT
CCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACAGCCGTCTTCTTCCTCCCGAAGCATTGCACGGAT
GCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTGCTCTTTCGTCCGCCGCTGGAAATG
AAAAA

QA 1 305 1 305
DS 



AS 1 4

CO CL3421Contig1 723 4 6 U
GGGGACACGCGTCGCACATGTACGCTTCGTACTCTCTCTTCTCTATCTCTCTCCCCACTT
CGTGTACTCCGTCGGTTTCGATTCCAGATCGTGGTGATTGATCTCTCCTCTCCATCTCGA
CTCAGTCAACGATTTCGGGTCTCGTCTTTGATCTTTCGGTGGTCGGTGTCTCCGTCGGTG
TCTCTCTGGTGGTTGTCGTCTGATGAATCCGCCTATCATCTGTGATCTCTCCTCGACACA
GAGAATCACTCGGCGTCTCCGCTCTCGGAGTCTCTCCTCGACGACTCCGCCTCTGTTCTT
TCATAGACGATTAAACCATCCGTCTCTCTATCGACGGTTCTCCTCGACGGTCGGTCGAAT
CGAAAGATTTTTCTGGCCATCGTTCAATCTCTTTATGATTCATGTCTCTGGATTGTGTGC
TTTACTTGACGTATCTGGGCTTTGCAAGATGCTTGAGCCTAACCGTGAGCGCTTTAACCG
TGGTTGTAACTGGATATTAACATGACTACAGTTTTCGAGTGATGCAAAGTTCAAACAGTC
ACGAGCCATACTTGTATAAAGACTAGACTTGTGTAGTCACAGTCTTCTGTCTATGTCTTC
TCTCATTTGTAGTCACTTTTGTAATCTTGTGTAGTCACTTGTTTACTAGTGACTTGTGTA
CTCTCATTCTCTATATAAAGTTTGTGATCAGCACTTTTGTTTTCTCATCACTTTTGTATT
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4EI56TF U 1
AF RR4DW92JQ C 24
AF RR4DW92TF U 16
AF RR4D584TF U 59
BS 1 123 RR4EI56TF
BS 124 125 RR4DW92TF
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BS 128 128 RR4DW92TF
BS 129 707 RR4EI56TF
BS 708 723 RR4D584TF

RD RR4EI56TF 707 0 0
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CGTGTACTCCGTCGGTTTCGATTCCAGATCGTGGTGATTGATCTCTCCTCTCCATCTCGA
CTC**TCGACGATTTCGGGTCTCGTCTTTGATCTTTCGGTGGTCGGTGTCTCCGTCGGTG
TCTCTCTGGTGGTTGTCGTCTGATGAATCCGCCTATCATCTGTGATCTCTCCTCGACACA
GAGAATCACTCGGCGTCTCCGCTCTCGGAGTCTCTCCTCGACGACTCCGCCTCTGTTCTT
TCATAGACGATTAAACCATCCGTCTCTCTATCGACGGTTCTCCTCGACGGTCGGTCGAAT
CGAAAGATTTTTCTGGCCATCGTTCAATCTCTTTATGATTCATGTCTCTGGATTGTGTGC
TTTACTTGACGTATCTGGGCTTTGCAAGATGCTTGAGCCTAACCGTGAGCGCTTTAACCG
TGGTTGTAACTGGATATTAACATGACTACAGTTTTCGAGTGATGCAAAGTTCAAACAGTC
ACGAGCCATACTTGTATAAAGACTAGACTTGTGTAGTCACAGTCTTCTGTCTATGTCTTC
TCTCATTTGTAGTCACTTTTGTAATCTTGTGTAGTCACTTGTTTACTAGTGACTTGTGTA
CTCTCATTCTCTATATAAAGTTTGTGATCAGCACTTTTGTTTTCTCA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DW92JQ 669 0 0
TTCGTACT
CTCTCTCTTCTCTATCTCTCTCCCCACTTCGTGTACTCCGTCGGTTTCGATTCCAGATCG
TGGTGATTGATCTCTCCTCTCCATCTCGACTCAGTCAACGATTTCGGGTCTCGTCTTTGA
TCTTTCGGTGGTCGGTGTCTCCGTCGGTGTCTCTCTGGTGGTTGTCGTCTGATGAATCCG
CCTATCATCTGTGATCTCTCCTCGACACAGAGAATCACTCGGCGTCTCCGCTCTCGGAGT
CTCTCCTCGACGACTCCGCCTCTGTTCTTTCATAGACGATTAAACCATCCGTCTCTCTAT
CGACGGTTCTCCTCGACGGTCGGTCGAATCGAAAGATTTTTCTGGCCATCGTTCAATCTC
TTTATGATTCATGTCTCTGGATTGTGTGCTTTACTTGACGTATCTGGGCTTTGCAAGATG
CTTGAGCCTAACCGTGAGCGCTTTAACCGTGGTTGTAACTGGATATTAACATGACTACAG
TTTTCGAGTGATGCAAAGTTCAAACAGTCACGAGCCATACTTGTATAAAGACTAGACTTG
TGTAGTCACAGTCTTCTGTCTATGTCTTCTCTCATTTGTAGTCACTTTTGTAATCTTGTG
TAGTCACTTGTTTACTAGTGACTTGTGTACTCTCATTCTCTATATAAAGTTTGTGATCAG
C

QA 9 669 9 669
DS 

RD RR4DW92TF 677 0 0
GGGGACGCTTCGTACT
CTCTCTCTTCTCTATCTCTCTCCCCACTTCGTGTACTCCGTCGGTTTCGATTCCAGATCG
TGGTGATTGATCTCTCCTCTCCATCTCGACTCAGTCAACGATTTCGGGTCTCGTCTTTGA
TCTTTCGGTGGTCGGTGTCTCCGTCGGTGTCTCTCTGGTGGTTGTCGTCTGATGAATCCG
CCTATCATCTGTGATCTCTCCTCGACACAGAGAATCACTCGGCGTCTCCGCTCTCGGAGT
CTCTCCTCGACGACTCCGCCTCTGTTCTTTCATAGACGATTAAACCATCCGTCTCTCTAT
CGACGGTTCTCCTCGACGGTCGGTCGAATCGAAAGATTTTTCTGGCCATCGTTCAATCTC
TTTATGATTCATGTCTCTGGATTGTGTGCTTTACTTGACGTATCTGGGCTTTGCAAGATG
CTTGAGCCTAACCGTGAGCGCTTTAACCGTGGTTGTAACTGGATATTAACATGACTACAG
TTTTCGAGTGATGCAAAGTTCAAACAGTCACGAGCCATACTTGTATAAAGACTAGACTTG
TGTAGTCACAGTCTTCTGTCTATGTCTTCTCTCATTTGTAGTCACTTTTGTAATCTTGTG
TAGTCACTTGTTTACTAGTGACTTGTGTACTCTCATTCTCTATATAAAGTTTGTGATCAG
C

QA 17 677 17 677
DS 

RD RR4D584TF 665 0 0
GGG
GTGTACTCCGTCGGTTTCGATTCCAGATCGTGGTGATTGATCTCTCCTCTCCATCTCGAC
TCAGTCGACGATTTCGGGTCTCGTCTTTGATCTTTCGGTGGTCGGTGTCTCCGTCGGTGT
CTCTCTGGTGGTTGTCGTCTGATGAATCCGCCTATCATCTGTGATCTCTCCTCGACACAG
AGAATCACTCGGCGTCTCCGCTCTCGGAGTCTCTCCTCGACGACTCCGCCTCTGTTCTTT
CATAGACGATTAAACCATCCGTCTCTCTATCGACGGTTCTCCTCGACGGTCGGTCGAATC
GAAAGATTTTTCTGGCCATCGTTCAATCTCTTTATGGTTCATGTCTCTGGATTGTGTGCT
TTACTTGACGTATCTGGGCTTTGCAAGATGCTTGAGCCTAACCGTGAGCGCTTTAACCGT
GGTTGTAACTGGATATTAACATGACTACAGTTTTCGAGTGATGCAAAGTTCAAACAGTCA
CGAGCCATACTTGTATAAAGACTAGACTTGTGTAGTCACAGTCTTCTGTCTATGTCTTCT
CTCATTTGTAGTCACTTTTGTAATCTTGTGTAGTCACTTGTTTACTAGTGACTTGTGTAC
TCTCATTCTCTATATAAAGTTTGTGATCAGCACTTTTGTTTTCTCATCACTTTTGTATTC
TC

QA 4 665 4 665
DS 



AS 1 3

CO CL3422Contig1 673 3 47 U
GGCTACACACCAATCAAGAGAGAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAA
TGGTTTTGGTGATGATACTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACT
TGGACTCATGGGGTATCCCGGTTAATGCTAAGGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACT
CTTTCAAGATCGGTGACTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTC
AAGTGACACCTTCCAACTTCAAGAGCTACAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACG
ACGGCAACTCTCTCTTCAACCTCACCCAAAACGGAACATTTTACTTCACCAGCGGACATC
CTGGCCACTGTCAAAAGTACCAGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTACTCCGCCGAAG
CAGACGCCTTGTCTCCCTCGTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCAT
TTGGATCTATCCCACTCTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTTGCTGCGATTTTCCACCGTCG
TTGCTTCGCTGGCCTGCGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAAATTATTG
AATATTTTATTAATTTTGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTGATTGGTTCTTTTTGAAGAGG
GCAATTTTGAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ73JQ C 1
AF RR4BH57TF U 15
AF RR4GQ73TF U 1
BS 1 16 RR4GQ73JQ
BS 17 20 RR4BH57TF
BS 21 21 RR4GQ73TF
BS 22 26 RR4BH57TF
BS 27 27 RR4GQ73TF
BS 28 31 RR4BH57TF
BS 32 32 RR4GQ73TF
BS 33 46 RR4BH57TF
BS 47 47 RR4GQ73TF
BS 48 76 RR4BH57TF
BS 77 77 RR4GQ73TF
BS 78 91 RR4BH57TF
BS 92 92 RR4GQ73TF
BS 93 143 RR4BH57TF
BS 144 144 RR4GQ73TF
BS 145 151 RR4BH57TF
BS 152 152 RR4GQ73TF
BS 153 218 RR4BH57TF
BS 219 221 RR4GQ73TF
BS 222 267 RR4BH57TF
BS 268 268 RR4GQ73TF
BS 269 337 RR4BH57TF
BS 338 338 RR4GQ73TF
BS 339 358 RR4BH57TF
BS 359 359 RR4GQ73TF
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BS 373 373 RR4GQ73TF
BS 374 395 RR4BH57TF
BS 396 396 RR4GQ73TF
BS 397 409 RR4BH57TF
BS 410 410 RR4GQ73TF
BS 411 436 RR4BH57TF
BS 437 437 RR4GQ73TF
BS 438 439 RR4BH57TF
BS 440 440 RR4GQ73TF
BS 441 519 RR4BH57TF
BS 520 520 RR4GQ73TF
BS 521 525 RR4BH57TF
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BS 527 575 RR4BH57TF
BS 576 576 RR4GQ73TF
BS 577 593 RR4BH57TF
BS 594 594 RR4GQ73TF
BS 595 639 RR4BH57TF
BS 640 640 RR4GQ73TF
BS 641 653 RR4BH57TF
BS 654 673 RR4GQ73TF

RD RR4GQ73JQ 669 0 0
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TGGTTTTGGTGATGATACTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACT
TGGACTCATGGGGTATCCCGGTTAATGCTAAGGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACT
CTTTCAAGATCGGTGACTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTC
AAGTGACACCTTCCAACTTCAAGAGCTACAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACG
ACGGCAACTCTCTCTTCAACCTCACCCAAAACGGAACATTTTACTTCACCAGCGGACATC
CTGGCCACTGTCAAAAGTACCAGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTACTCCGCCGAAG
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TTGGATCTATCCCACTCTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTTGCTGCGATTTTCCACCGTCG
TTGCTTCGCTGGCCTGCGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAAATTATTG
AATATTTTATTAATTTTGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTGATTGGTTCTTTTT
GAAGAGGGCAATTTTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4BH57TF 645 0 0
GG
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CCTGTTAGTGCAAGTGTCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACTTGGACTCATGGGGTAT
CCCGGTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTCTTTCAAGATCGGTGA
CTCCCTCTTGTTCTTGTACCCA***AGCGAAGATTCAATGATTCAAGTGACACCTTCCAA
CTTCAAGAGCTGCAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACGACGGCAACTCTCTCTT
CAACCTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGCCTGGCCACTGTCTAAA
GTACCAGAAGCTCATTGTCCCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAGCAGACGCCTTGTCTCC
TTCTTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCATTTGGATCTATCCCACT
CTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCGTTGCTTCGCTGGCCTG
CGCTGTCGTCGTCGGTGCTCTCATGTGAAAATGGCAA*TTATTGAATATTTTATTAATTT
TGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTT
CAGATA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4GQ73TF 673 0 0
GGCTACACACCAATCA
AGAGAGAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAATGGTTTTGGTGATGAT
ACTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACTTGGACTCATGGGGTAT
CCCGGTTAATGCTAAGGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTCTTTCAAGATCGGTGA
CTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTCAAGTGACACCTTCCAA
CTTCAAGAGCTACAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACGACGGCAACTCTCTCTT
CAACCTCACCCAAAACGGAACATTTTACTTCACCAGCGGACATCCTGGCCACTGTCAAAA
GTACCAGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTACTCCGCCGAAGCAGACGCCTTGTCTCC
CTCGTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCATTTGGATCTATCCCACT
CTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTTGCTGCGATTTTCCACCGTCGTTGCTTCGCTGGCCTG
CGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAAATTATTGAATATTTTATTAATTT
TGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTGATTGGTTCTTTTTGAAGAGGGCAATTTTGAATA

QA 17 673 17 673
DS 



AS 1 4

CO CL3423Contig1 906 4 11 U
GGATCATAAATACCATCACCGGATTCACATGATTCCACAACTCTTCTGAATCTGTCACTT
TCTTTTTTCATGTATCATTGTCTTATTAATTTTTGAATTTGTTTTTATTAGAGGTGGTGG
AGTATTGAAAGCTATATGTCTTGAAGGGTGTATGTATTAATGCCAGAGCCAGTCTTGCTT
CTTAGCTTATTGTCAAGTTGTTTTCTTTCTTAGTTACTTGACATATAAGGAACAAACGAT
ATGAATAGTGGTTCTTGTTCGTCTTTAATGGATGTGGGTTATGATCATCATCATCATCAT
CATCATAATGGTCATGAAGAGCTTCATGTTTTGGCCGTGGATGATAATCTTATTGACCGT
AAACTCGTAGAGAAGTTGCTCAAGATCTCCTCTTGCAAAGTTACAACAGCAGAGAATGCG
ATTAGAGCATTGGAGTATTTGGGTTTGGGAGATCAAAATCAGCATATTGATACACTGGCC
AATAATGATTTGAAGGTTAATCTAATCATCACAGACTATTGCATGCCAGGGATGACAGGC
TTCGAGCTACTAAAGAAGGTGAAGCAGGAGTCATCATATCTGAAAGAGGTCCCTGTTGTG
ATAATGTCTTCAGAGAACATTCCTACTCGCATCAACAAATGTTTAGCTAGTGGAGCTCAA
ATGTTTACGCAGAAGCCTCTGAAACTATCGGATGTTGAGAAACTTAAATGCCATCTCATG
AACTGTAGAAGCTGACAATTACATGTAGCCCTAACCATAAAATATTTCCGTATCTTGGTT
CCTTATTTGATTGTGTTACACGTTTTTTGTGTCTTCTGAAAATCAAGTCATGTTTTCAAA
ATAGCAAATCTTAAGCTACACACACAAAAAGAAATGTAAGGAATATATAAAATGATTATG
GTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 

AF RR4AO24TF U 69
AF RR4GN37TF U 1
AF RR4AO24JQ C 166
AF RR4GN37JQ C 185
BS 1 306 RR4GN37TF
BS 307 307 RR4AO24TF
BS 308 549 RR4GN37TF
BS 550 550 RR4AO24TF
BS 551 564 RR4GN37TF
BS 565 567 RR4AO24TF
BS 568 667 RR4GN37TF
BS 668 668 RR4AO24TF
BS 669 777 RR4GN37TF
BS 778 904 RR4AO24JQ
BS 905 906 RR4GN37JQ

RD RR4AO24TF 626 0 0
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AAGCTATATGTCTTGAAGGGTGTATGTATTAATGCCAGAGCCAGTCTTGCTTCTTAGCTT
ATTGTCAAGTTGTTTTCTTTCTTAGTTACTTGACATATAAGGAACAAACGATATGAATAG
TGGTTCTTGTTCGTCTTTAATGGATGTGGGTTATGATCATCATCATCATCATCATCATA*
**GTCATGAAGGGCTTCATGTTTTGGCCGTGGATGATAATCTTATTGACCGTAAACTCGT
AGAGAAGTTGCTCAAGATCTCCTCTTGCAAAGTTACAACAGCAGAGAATGCGATTAGAGC
ATTGGAGTATTTGGGTTTGGGAGATCAAAATCAGCATATTGATACACTGGCCAATAGTGA
TTTGAAGGTTAATCTAATCATCACAGACTATTGCATGCCAGGGATGACAGGCTTCGAGCT
ACTAAAGAAGGTGAAGCAGGAGTCATCATATCTGAAAGAGGTCCCTGTTGTGATAATGTC
TTCAGAGAACATTCCTACTCGCATCAACAAATGTTTAGCTAGTGGAGCTCAAATGTTTAC
GCAGAAGCCTCTGAAACTATCGGATG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4GN37TF 777 0 0
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TCTTTTTTCATGTATCATTGTCTTATTAATTTTTGAATTTGTTTTTATTAGAGGTGGTGG
AGTATTGAAAGCTATATGTCTTGAAGGGTGTATGTATTAATGCCAGAGCCAGTCTTGCTT
CTTAGCTTATTGTCAAGTTGTTTTCTTTCTTAGTTACTTGACATATAAGGAACAAACGAT
ATGAATAGTGGTTCTTGTTCGTCTTTAATGGATGTGGGTTATGATCATCATCATCATCAT
CATCATCATGGTCATGAAGAGCTTCATGTTTTGGCCGTGGATGATAATCTTATTGACCGT
AAACTCGTAGAGAAGTTGCTCAAGATCTCCTCTTGCAAAGTTACAACAGCAGAGAATGCG
ATTAGAGCATTGGAGTATTTGGGTTTGGGAGATCAAAATCAGCATATTGATACACTGGCC
AATAATGATTTGAAGGTTAATCTAATCATCACAGACTATTGCATGCCAGGGATGACAGGC
TTCGAGCTATTAAAGAAGGTGAAG***GAGTCATCATATCTGAAAGAGGTCCCTGTTGTG
ATAATGTCTTCAGAGAACATTCCTACTCGCATCAACAAATGTTTAGCTAGTGGAGCTCAA
ATGTTTATGCAGAAGCCTCTGAAACTATCGGATGTTGAGAAACTTAAATGCCATCTCATG
AACTGTAGAAGCTGACAATTACATGTAGCCCTAACCATAAAATATTTCCGTATCTTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4AO24JQ 739 0 0
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TAAGGAACAAACGATATGAATAGTGGTTCTTGTTCGTCTTTAATGGATGTGGGTTATGAT
CATCATCATCATCATCATCATA***GTCATGAAGGGCTTCATGTTTTGGCCGTGGATGAT
AATCTTATTGACCGTAAACTCGTAGAGAAGTTGCTCAAGATCTCCTCTTGCAAAGTTACA
ACAGCAGAGAATGCGATTAGAGCATTGGAGTATTTGGGTTTGGGAGATCAAAATCAGCAT
ATTGATACACTGGCCAATAGTGATTTGAAGGTTAATCTAATCATCACAGACTATTGCATG
CCAGGGATGACAGGCTTCGAGCTACTAAAGAAGGTGAAGCAGGAGTCATCATATCTGAAA
GAGGTCCCTGTTGTGATAATGTCTTCAGAGAACATTCCTACTCGCATCAACAAATGTTTA
GCTAGTGGAGCTCAAATGTTTACGCAGAAGCCTCTGAAACTATCGGATGTTGAGAAACTT
AAATGCCATCTCATGAACTGTAGAAGCTGACAATTACATGTAGCCCTAACCATAAAATAT
TTCCTTATCTTGGTTCCTTATTTGATTGTGTTACACGTTTTTTGTGTCTTCTGAAAATCA
AGTCATGTTTTCAAAATAGCAAATCTTAAGCTACACACACAAAAAGAAATGTAAGGAATA
TATAAAATGATTATGGTTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GN37JQ 722 0 0
GCTTATTGTCAAGTTGTTTTCTTTCTTAGTTACTTGACATATAAGGAACAAACGATATGA
ATAGTGGTTCTTGTTCGTCTTTAATGGATGTGGGTTATGATCATCATCATCATCATCATC
ATCATGGTCATGAAGAGCTTCATGTTTTGGCCGTGGATGATAATCTTATTGACCGTAAAC
TCGTAGAGAAGTTGCTCAAGATCTCCTCTTGCAAAGTTACAACAGCAGAGAATGCGATTA
GAGCATTGGAGTATTTGGGTTTGGGAGATCAAAATCAGCATATTGATACACTGGCCAATA
ATGATTTGAAGGTTAATCTAATCATCACAGACTATTGCATGCCAGGGATGACAGGCTTCG
AGCTATTAAAGAAGGTGAAG***GAGTCATCATATCTGAAAGAGGTCCCTGTTGTGATAA
TGTCTTCAGAGAACATTCCTACTCGCATCAACAAATGTTTAGCTAGTGGAGCTCAAATGT
TTATGCAGAAGCCTCTGAAACTATCGGATGTTGAGAAACTTAAATGCCATCTCATGAACT
GTAGAAGCTGACAATTACATGTAGCCCTAACCATAAAATATTTCCGTATCTTGGTTCCTT
ATTTGATTGTGTTACACGTTTTTTGTGTCTTCTGAAAATCAAGTCATGTTTTCGAAATAG
CAAATCTTAAGCTACACACACAAAAAGAAATGTAAGGAATATATAAAATGATTATGGTTC
TG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

CO CL3424Contig1 1214 4 5 U
AGTATCATTTAGCTCTGAGTTCTCAAGTCAGACCAACATGGAAGAACGGTATATGATCAA
GAACGATGTTACCGAATTGATTGGTAACACACCAATGGTATATCTGAATAAAATAGTTGA
CGGTTGCGTGGCCCTTATAGCCGCCAAGCTTGAGATGATGGAGCCTTGCTCTAGCATAAA
AGACAGAATCGCATATAGTATGATCAAAGATGCAGAAGACAGAGGATTGATTACTCCTGG
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GGCTGCAAGAGGCTACAGAGTGATACTTTTGATGCCGTCAACGATGAGCTTAGAGAGGAG
AATCATTCTGAGAGCATTAGGTGCAGAGGTTCATCTCACAGATCCGAACATAGGCATTAA
AGGAATGCTGGAGAAAGCTGAAGAAATATTCAGCAAAACTCCTGGTGGTTACATACCACA
TCAATTTCTAAACCCTGAGAACCCTGAGATTCATTACAGAACCACTGGTCCAGAGATATG
GAGAGATTCAGCAGGTGAAGTAGATATTTTGGTCGCTGGTGCTGGAACTGGTGGAACGGT
TAGTGGAACAGGAAGGTTTCTTAAGAAGATGAACAAAAACATTAAGGTTTATATGGTGGA
ACCTACAGAAAGTGCAGTACTTAGCGGAGGAGAACCAGGTCCACATTTGATCCAGGGGAT
TGGTCCTGGTGTCATTCCAACCAATTTGGATTTAAGCATTGTTGATGAAGTCATTCAGGT
GACAAGTGAAGAAGCTATTGAAACAGCCAAGCTTCTTGCCCTCAAAGAAGGATTGTTGGT
GGGAATATCGTCAGGAGCTGCAGCAGCCGCTGCATTAAAGGTTGCTAAACGGCCAGAAAA
CGCTGGAAAACTCATTGTGGTGACTTTTCCCAGTGGAGGAGAGCGTTATTTATCAACAGA
ACTGTTCGAGTCGGTTAGATATGAAGCAGAGCATTTGTCGGTTGAATGACTGGCAAATGT
GTGATTCGTTTTGGTTCGATAAGAGTGTTGGTACGAAAATACGGTTTGATTGTTGCAGAA
CATTGTAAAATCTGTAATAGTTGCATATTAGATGATGGATAATTATAGCTATTCTTCATT
GTCTCTTCCCATGTAATCCCTGGCCTAAAACTGTTTAAAGATGATCCTAATCTATGTTAG
TAGCTTCATCTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BR10TF U 1
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AF RR4BR10JQ C 508
AF RR4AW33JQ C 508
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TAG

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G
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GAGATTCATTACAGAACCACTGGTCCAGAGATATGGAGAGATTCAGCAGGTGAAGTAGAT
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AAGATGAACAAAAACATTAAGGTTTATATGGTGGAACCTACAGAAAGTGCAGTACTTAGC
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CTCATT

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CC

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DS 

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TTTGGTCGCTGGTGCTGGAACTGGTGGAACGGTTAGTGGAACAGGAAGGTTTCTTAAGAA
GATGAACAAAAACATTAAGGTTTATATGGTGGAACCTACAGAAAGTGCAGTACTTAGCGG
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GGATTTAAGCATTGTTGATGAAGTCATTCAGGTGACAAGTGAAGAAGCTATTGAAACAGC
CAAGCTTCTTGCCCTCAAAGAAGGATTGTTGGTGGGAATATCGTCAGGAGCTGCAGCAGC
CGCTGCATTAAAGGTTGCTAAACGGCCAGAAAACGCTGGAAAACTCATTGTGGTGACTTT
TCCCAGTGGAGGAGAGCGTTATTTATCAACAGAACTGTTCGAGTCGGTTAGATATGAAGC
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TTAGATGATGGATAATTATAGCTGTTCTTCATTGTCTCTTCCCATGTAATCCCTGGCCTA
AAACTGTTTAAAGATGATCCTAATCTATGTTAGTAGCTTCATCTACC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

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AGCGTCATCAGTTTGGTACAATGTGAGAGTACGTCACCCGACGAAAGAAGTACCAATCTT
GGACTATGATCTTGCTCTCCTCTTTCAACCAATGCTTCTTCTGGGAATCACTGTTGGTGT
TTCTCTAAGCGTTGTTTTCCCTTACTGGCTCATCACTGTCCTCATCATCATCCTCTTCGT
TGGTACCTCCTCGAGATCTTTTTTCAAAGGGATTGAGATGTGGAAGGAGGAGACTTTGTT
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AATCGACACTCAGTATGAGCCGCTTTATCCAAGAGAAGAGAAGTCAGAACTGGAAATAAT
AAGGTCTAACATTAATTGGAAACGGCTTCTGCTTTTGGGAACTGTGTGGTCAGCTTTCTT
GCTCATCCAAGTTATCAAGAATGAAATCACAGTTTGCAGCACAATATATTGGGTGCTTTT
CATCTTACAGTTCCCAGTTGCTTTGGGGGTGTATGGATTTGAAGCGGTGAGATTGTATAG
AGAGAACCAGAAGAGGCTAAGAAGTGGAAACACTGAATCAATCTGTGAGGCTACAATAGA
GTGGACTCCTCTGAGTCTTATCTTCTGTGCTCTATGTGGACTTGTTGGAGGAGTTGTAGG
TGGTCTCCTTGGATCCGGTGGTGGGTTTGTTCTCGGTCCGTTGCTTCTTGAGATTGGTGT
CATCCCACAGGTTGCTAGCGCGACAGCTACATTTGTGATGATGTTTTCGTCGTCCTTATC
CGTGGTTGAGTTCTATCTCCTCAATAGATTCCCAATCCCATACGCATTGTACTTGATGTC
GGTATCGATCCTTGCCGGTTTCTGGGGACGGTTCTTCATTAGAAAGCTCGTGGCAATCCT
CAGAAGAGCTTCCATCATCGTCTTTGTCCTATCAGGAGTCATTTGTGCCAGTACTCTCAC
AATGGGAGTGATTGGTATAGAGAATAGCATTAAGATGATACATAACCATGAGTTCATGGG
ATTCTTAGGGTTCTGCAGCAGTCAGTGAATCATTATTCTACATTCTGCTTGAAGAATATT
TTGAACACAAATCTTTTTCTTTTGATTTATTGGATAATTTCGGTTGTCCAACATTATCAT
TGTTATAAGTTATAAAATTAGACTGTATTCTCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ71TF U 1
AF RR4E089TF U 399
AF RR4DZ71JQ C 451
AF RR4E089JQ C 684
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BS 720 720 RR4E089TF
BS 721 751 RR4DZ71TF
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BS 1091 1135 RR4E089TF
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BS 1146 1173 RR4DZ71JQ
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DS 

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G
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GTTGCTTCTTGAGATTGGTGTCATCCCACAGGTTGCTAGCGCGACAGCTACATTTGTGAT
GATGTTTTCGTCGTCCTTATCCGTGGTTGAGTTCTATCTCCTCAATAGATTCCCAATCCC
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CCCAATCCCATACGCATTGTACTTGATGTCGGTATCGATCCTTGCCGGTTTCTGGGGACA
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TCG

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TGT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 2 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS06JQ U 1
AF RR4GD90JQ U 45
BS 1 76 RR4DS06JQ
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BS 78 424 RR4DS06JQ
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RD RR4DS06JQ 791 0 0
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AACAATTTCTT

QA 1 791 1 791
DS 

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C
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CCTGCTAAACCAGCCATGGCTGCTCCTCCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTG
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CATTGCAAAAGAGAGGTTCTCAAACTTTCCTGATCCTGAACCAATTTTTCTAGCTCTTGT
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CGGGCACTTGTCCTGTAATTGTCAGCAACACGAGTAAAGAGAGTGACGGTGTAAAGAGCA
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ATAACATGCTAGCCAGTCTTTCTGGGAGTACTTTGGA

QA 2 818 2 818
DS 



CO CL3426Contig2 791 2 5 U
GGGGAGAAGAAGAAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGTCAGATTGAGAGAAACAATGACTTC
GAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCCACCTCGTGGAATCGTCT
TCAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGATACTCCTCTTTATCGGTTCAACATCCCTAA
TCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTTCTCGCCCTCGGCGATGATCTGCTCAAGTCGAA
TAGCTTTGTGGAAGGAGTTTCTCAGAAGATCAGGAGACAGATCGAGGAGCTGGAGAGGAT
TTCTGGTGTTGAGAGCAATGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCAC
CAGGTTTGTCTGGGATGAAGCTAAGTACCCAACAATGTCACCTTTGAAGGAGGTTGTGGA
GAATATTCAGTCTCAGGTTGCCAAAATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTCGCTGAGTA
TAACAATGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCAGAGTGGAAGCTTAGCTGT
TCGTGACCTCTCGAACTTGGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGCGTCAGAACATCTCGTGAC
TCTCCTTGCTGTTGTTCCAAAGTACTCCCAGAAAGACTGGCTAGCATGTTATGAGACATT
AACCGAGTATGTGGTTCCTATGTCCTCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGAGTATGCTCT
TTACACCGTCACTCTCTTTACTCGTGTTGCTGACATTACAGGACAGTGCCCGTGAGAAAG
GGTCCAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD90TF U 36
AF RR4DS06TF U 1
BS 1 563 RR4DS06TF
BS 564 564 RR4GD90TF
BS 565 680 RR4DS06TF
BS 681 681 RR4GD90TF
BS 682 791 RR4DS06TF

RD RR4GD90TF 723 0 0
GG
AGATTGAGAGAAACAATGACTTCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCT
TCTTCCACCTCGTGGAATCGTCTTCAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGATACTCCT
CTTTATCGGTTCAACATCCCTAATCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTTCTCGCCCTC
GGCGATGATCTGCTCAAGTCGAATAGCTTTGTGGAAGGAGTTTCTCAGAAGATCAGGAGA
CAGATCGAGGAGCTGGAGAGGATTTCTGGTGTTGAGAGCAATGCTCTTACTGTTGATGGA
GTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTTGTCTGGGATGAAGCTAAGTACCCAACAATG
TCACCTTTGAAGGAGGTTGTGGAGAATATTCAGTCTCAGGTTGCCAAAATTGAGGATGAT
CTCAAGGTTCGTGTCGCTGAGTATAACAATGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGA
AAGCAGAGTGGAAGCTTAGCTGTTCGTGACCTCTCGAACTTGGTTAAGCCAGAAGATATT
GTCGCGTCAGAACATCTCGTGACTCTCCTTGCTGTTGTTCCAAAGTACTCCCAGAAAGAC
TGGCTAGCATGTTATGAGACATTAACCGAGTATGTGGTTCCTATGTCCTCGAAGAAATTG
TTTGAGGATAATGAGTATGCTCTTTACACCGTCACTCTCTTTACTCGTGTTGCTGACA
ATT

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR4DS06TF 791 0 0
GGGGAGAAGAAGAAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGTCAGATTGAGAGAAACAATGACTTC
GAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCCACCTCGTGGAATCGTCT
TCAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGATACTCCTCTTTATCGGTTCAACATCCCTAA
TCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTTCTCGCCCTCGGCGATGATCTGCTCAAGTCGAA
TAGCTTTGTGGAAGGAGTTTCTCAGAAGATCAGGAGACAGATCGAGGAGCTGGAGAGGAT
TTCTGGTGTTGAGAGCAATGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCAC
CAGGTTTGTCTGGGATGAAGCTAAGTACCCAACAATGTCACCTTTGAAGGAGGTTGTGGA
GAATATTCAGTCTCAGGTTGCCAAAATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTCGCTGAGTA
TAACAATGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCAGAGTGGAAGCTTAGCTGT
TCGTGACCTCTCGAACTTGGTTAGGCCAGAAGATATTGTCGCGTCAGAACATCTCGTGAC
TCTCCTTGCTGTTGTTCCAAAGTACTCCCAGAAAGACTGGCTAGCATGTTATGAGACATT
AACCGAGTATGTGGTTCCTA*GTCCTCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGAGTATGCTCT
TTACACCGTCACTCTCTTTACTCGTGTTGCTGACATTACAGGACAGTGCCCGTGAGAAAG
GGTCCAAATCC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL3427Contig1 873 2 2 U
GGAATGTAAAAATCAACTCCAATCCTTCCCGATTCCCGTCACCGTCGCCGGTGAGCTTCT
TCTTCTTCCTCCCCCTTCGAACGATCATGGAGGAACATCGTTGCTGCTTTTACTCCAAGA
TGCTCTCAAGATTCAGCATCGGTTCCCTCATGCTTAGTTTGGTGATTGTTCTAGTTGTCC
GTGTGCTAGATGTTTTGTACCGGTGTGGCAAACCCTTTCCCAAAGGAGCTTCACGATCGT
TTACTACTCTCATTGTTCTTGGTTCTGGGGGACACACGGCGGAGATGTTGAGCCTCCTCT
CTGTTTTGCGCATGGACAGATTCGCACCAAGGTTTTACATTGCTGCAGCTACTGATAACA
TGAGTCTCCACAAAGCTCGTTCCTTTGAAGATTCTCTACTACCTGACAAGCCTGCTCTTA
AGGAAGACGTCTCCTTACAGTTCACGCAAATTTACCGGAGTCGAGAAGTTGGTCAGTCTT
ATGTTACTTCTGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCC
GGATCAGACCCCAAGTGATTATTTGCAATGGTCCTGGGACATGTATTCCTCTCTGTGTCA
TCGCTTTCTTGTTCAAGGTGGTGGGAATCAGATGGTCATCGATCTTTTACGTTGAGAGTG
TAGCAAGAGTTAAGAAGCTCTCATTAAGTTGTTTGCTTCTTTACAAGTTAAGGATAGCTG
ATCAGTTCTTTGTTCAATGGCCACAACTGCAAAACAAGTATCCTCGGGCTCACTATGTTG
GTTGCCTGATGTAAGCTGAATTTTTGGGAACTATCCTTATACATAGATTTGCATTACAAT
AACTTAGAAAAGCTACAAAGTTTTACACAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO72TF U 1
AF RR4DO72JQ C 230
BS 1 598 RR4DO72TF
BS 599 873 RR4DO72JQ

RD RR4DO72TF 598 0 0
GGAATGTAAAAATCAACTCCAATCCTTCCCGATTCCCGTCACCGTCGCCGGTGAGCTTCT
TCTTCTTCCTCCCCCTTCGAACGATCATGGAGGAACATCGTTGCTGCTTTTACTCCAAGA
TGCTCTCAAGATTCAGCATCGGTTCCCTCATGCTTAGTTTGGTGATTGTTCTAGTTGTCC
GTGTGCTAGATGTTTTGTACCGGTGTGGCAAACCCTTTCCCAAAGGAGCTTCACGATCGT
TTACTACTCTCATTGTTCTTGGTTCTGGGGGACACACGGCGGAGATGTTGAGCCTCCTCT
CTGTTTTGCGCATGGACAGATTCGCACCAAGGTTTTACATTGCTGCAGCTACTGATAACA
TGAGTCTCCACAAAGCTCGTTCCTTTGAAGATTCTCTACTACCTGACAAGCCTGCTCTTA
AGGAAGACGTCTCCTTACAGTTCACGCAAATTTACCGGAGTCGAGAAGTTGGTCAGTCTT
ATGTTACTTCTGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCC
GGATCAGACCCCAAGTGATTATTTGCAATGGTCCTGGGACATGTATTCCTCTCTGTGT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4DO72JQ 644 0 0
TTCACGATCGTTTACTACTCTCATTGTTCTTGGTTCTGGGGGACACACGGCGGAGATGTT
GAGCCTCCTCTCTGTTTTGCGCATGGACAGATTCGCACCAAGGTTTTACATTGCTGCAGC
TACTGATAACATGAGTCTCCACAAAGCTCGTTCCTTTGAAGATTCTCTACTACCTGACAA
GCCTGCTCTTAAGGAAGACGTCTCCTTACAGTTCACGCAAATTTACCGGAGTCGAGAAGT
TGGTCAGTCTTATGTTACTTCTGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTG
CCTAATGATCCGGATCAGACCCCAAGTGATTATTTGCAATGGTCCTGGGACATGTATTCC
TCTCTGTGTCATCGCTTTCTTGTTCAAGGTGGTGGGAATCAGATGGTCATCGATCTTTTA
CGTTGAGAGTGTAGCAAGAGTTAAGAAGCTCTCATTAAGTTGTTTGCTTCTTTACAAGTT
AAGGATAGCTGATCAGTTCTTTGTTCAATGGCCACAACTGCAAAACAAGTATCCTCGGGC
TCACTATGTTGGTTGCCTGATGTAAGCTGAATTTTTGGGAACTATCCTTATACATAGATT
TGCATTACAATAACTTAGAAAAGCTACAAAGTTTTACACAGTGT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 3

CO CL3428Contig1 595 3 20 U
GGAGGGTTTCCTCTACTCATACTTCACTTCGGCTGCACCTCTAAACCCTAGCCATGGCGA
CTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAAGAAGACGGCCGTCGCCGTCA
CCCACTGCAAGCGCGGCTGCGGTCTGATCAAGCTCAACGGTGCCCCGATCGAGCTGTTCA
ACCCAGAGATCCTCAGGTTCAAGATCTTCGAGCCGGTGCTCCTCCTCGGTAAGCACCGTT
TCGCGGGCGTGGACATGAGGATCCGCGTCAACGGCGGTGGTCACACTTCACAGGTGTACG
CGATTCGTCAGAGCATCGCCAAGGCGCTAGTTGCTTTCTACCAGAAGTATGTGGACGAGC
AGTCGAAGAAGGAGATCAAGGATATCATGATAAGGTATGATAGGACTTTGCTTGTGGCGG
ATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGACGTTGTGCTCGTTCTCGTTTCCAGA
AGAGTTACCGTTAAAACAAATCTCTGGTTTGCTCTTTTCTCAACCGGAAATGAGTTGTTG
AATTGTGAGACGTTAGATTCTCATTTGGGTTTTCTTTTTTTTTTAATTGTTGTTG


BQ
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AF RR4EG32TF U 1
AF RR4D224TF U 1
AF RR4EG32JQ C 1
BS 1 79 RR4D224TF
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BS 196 205 RR4D224TF
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QA 1 289 1 289
DS 

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CCCACTGCAAGCGCGGCTGCGGTCTGATCAAGCTCAACGGTTCCCCGATCGAGCTGTTCA
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A

QA 1 421 1 421
DS 

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CCCACTGCAAGCGCGGCTGCGGTCTGATCAAGCTCAACGGTGCCCCGATCGAGCTGTTCA
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CGATTCGTCAGAGCATCGCTAAGGCGCTAGTTGCTTTCTACCAGAAGTATGTGGATGAGC
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AATTGTGAGACGTTAGATTCTCATTTGGGTTTTCTTTTTTTTTTAATTGTTGTTG

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 4

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TTCCAGATTACAAGAATTGTTCCCTCCCTATCTCACAACTGATAATAAACACATCAAAAC
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CTACTATTGGAGCTCCTCAGGTGGCTCCGCGACGGAGTTGTCTCCTGAGCAGCCGACATA
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AAAGGGGAGGCTATTTTATTATGGTGGTTCATGGGGTCAGAGCCAAGCC


BQ
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AF RR4H460JQB U 1
AF RR4H460TF C 1
AF RR4E247JQ U 39
AF RR4E247TF C 724
BS 1 389 RR4H460JQB
BS 390 828 RR4E247JQ
BS 829 1369 RR4E247TF

RD RR4H460JQB 389 0 0
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TTTAGGCTTTTTCCCCATCACGTCTCTGACTCTTCTGCTTCTTCATCTTCAACTACAGTC
GGGAGCGTTCCCTCTCTGCTGAAACTAGGGTTTAAGAACTTTGCCACAAAAGCCCACAAC
TTATAAACATCTTCAAAGTTCGTCAAAAA

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4H460TF 389 0 0
CAGAGCTAATGCTTTTAATCTAAACGTGAAAAATCTTTGGACCAAACACTGTTTCTCCCT
TTCCAGATTACAAGAATTGTTCCCTCCCTATCTCACAACTGATAATAAACACATCAAAAC
GCAACCCAAAAAAGAAAAACACTATATAGCAGCAGCAAATCTCAACCTCACATCTCTCAC
TTCCATTTCCATAAGCATGCTCTATGACGCAGCCTCTTCTCCGAGTCATATTCAAAAAGT
TTTAGGCTTTTTCCCCATCACGTCTCTGACTCTTCTGCTTCTTCATCTTCAACTACAGTC
GGGAGCGTTCCCTCTCTGCTGAAACTAGGGTTTAAGAACTTTGCCACAAAAGCCCACAAC
TTATAAACATCTTCAAAGTTCGTCAAAAA

QA 1 389 1 389
DS 

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CTGATAATAAACACATCAAAACGCAACCCAAAAAAGAAAAACACTATATAGCAGCAGCAA
ATCTCAACCTCACATCTCTCACTTCCATTTCCATAAGCATGCTCTATGACGCAGCCTCTT
CTCCGAGTCATATTCAAAAAGTTTTAGGCTTTTTCCCCATCACGTCTCTGACTCTTCTGC
TTCTTCATCTTCAACTACAGTCGGGAGCGTTCCCTCTCTGCTGAAACTAGGGTTTAAGAA
CTTTGCCACAAAAGCCCACAACTTATAAACATCTTCAAAGTTCGTCAAAAAGCTCAAAGA
TGCCGTCACAACCTCAAATCTCACATACCCTCCTCCTCCTCTCTTACCACCACCTTCTCT
CTGCAGATGCAAAGAGCCCTCCTCCTTCATCCTACCTCCTCCTCCCCCACGTTGATGATG
GTTTCTCGGCACATCCATCATCCGTATGTGACTCAATATCCCAATACCAAGACACACACC
TTCTCTCTCAGCAAGTTTCAGCACAACCTCTGGACTCACAAACCCTTTGCTCTTGTCCTT
CACGTTGAAAGCAACCGCCGCTCCTCTCTCGTACTTTATCTTCGGCCCATATATCTGCAC
AAGACTCCCTGTTTCAGGCACCTTGAGCTGCAGCAAAGAGATCACAAGCCAGTTTATCAG
AAACCTCAGCCTAGTCGTGGTTTTACTAAGACCTAACATATTCACATGATCGATATGGCT
GCAAACAATC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4E247TF 646 0 0
AGCTGCAGCAAAGAGATCACAAGCCAGTTTATCAGAAACCTCAGCCTAGTCGTGGTTTTA
CTAAGACCTAACATATTCACATGATCGATATGGCTGCAAACAATCTCAGGCTCCCTTCTC
TCCCAATCATCCTCGTTCTGATTCTCACCATCATCACCACTTTCTTCGTTATACAAAGCT
TCACCTTGGTCCAGACTATGACTGACACGGTCCACGTTAAACGAGACCCTTGTCCCTCTG
CTCGGCTGTTCATCTTCAACACCCATAAGCCTCCCTCCTCTTCTTCCAAGTAACCTAAAC
TCCCCTTCCGTCTCTCGTCTAATAGCATTCTCTTTCATATCAGAGCAAATCTTGGAGCTT
GTCCCAAACCCACACTGCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTGTATCTCTCGCGTCAGGAGACTA
CTATTGGAGCTCCTCAGGTGGCTCCGCGACGGAGTTGTCTCCTGAGCAGCCGACATAACC
GCAGCATCAAACGAGAGGACATCTTTACCATCATACATAGGACTGCTGTAATAACAACTC
TTTGCCGCAGCAGCAGGTCTAGGCGACTGGCGTTTGCTTGTGAACCAGAACGGTGGCAAA
GGGGAGGCTATTTTATTATGGTGGTTCATGGGGTCAGAGCCAAGCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 3

CO CL3430Contig1 876 3 2 U
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ATCGAATCATATATGTTTGCTTTTTTGGCTACTCTTGAAATTTCATAATGAAACCAATTT
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AGGTGTATTCCAACTGAGGTCATGACACCTGTAATACCATAGCTTGTTTCTCCCTTTGGC
AGTTCCTTGCGAGTCAAGCAAGATCTTAGAGGCCTTGATGTCTCGGTATATGACTTTTAA
CAGGGTTGCCACGAAGGAATGCGAGCTCTTTAGATGTGAACAGATGATCCTCAAAACTAC
CCTTATGCATAAACTCGTACAAAAGAGGCTGTTGTTCATCTTCCAAGCAATAACCAATCA
GTTTAACTAAGTTCTAATGACTTTCACTGCCCCAAGTAGTTGATCTCGTCAGCCATTCTC
GGTGACCTTGAAATCCATCAGGGTTAAGACGCTCGACAGGAACTTTAACAATCTTGGGTT
TATGCTTGTAGTAAAACTAACTTTTGGATCACCACGCATGCCCTCAAGCTTCTTGTGAAA
AGAAACAGCCTGATTGTCTAAGAGGCTCAGTGTAACAGACACATCAGTAAACATCCACAG
GAGCATATCAATCCACATGAGCTCACCACCATGCTTGACAATTCTCGCCTCCCAGTACCG
CATCAACGTAGCCTCGACGACAGACGACGGAGGAGTAACTTGCTGGACTTCAAGCCGGAG
AAGAAAACCCTCGAAATAGTCACTATTTTATACAGATCTCACATCGAGTCTGAGCGACGA
ACGAAATCAATCGAATAAACGATCTCATAACTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM63JQ U 1
AF RR4BM63TF C 8
AF RR4D930JQ U 68
BS 1 745 RR4BM63JQ
BS 746 876 RR4D930JQ

RD RR4BM63JQ 745 0 0
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TATGCTTGTAGTAAAACTAACTTTTGGATCACCACGCATGCCCTCAAGCTTCTTGTGAAA
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CATCAACGTAGCCTCGACGACAGAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4BM63TF 791 0 0
CCCATTA
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GTTTGCTTTTT*GGCTACTCTTGAAATTTCATAATGAAACCAATTTGGTATATGAGAATT
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AGGAATGCGAGCTCTTTAGATGTGAACAGATGATCCTCAAAACTACCCTTATGCATAAAC
TCGTACAAAAGAGGCTGTTGTTCATCTTCCAAGCAATAACCAATCAGTTTAACTAAGTTC
TAATGACTTTCACTGCCCCAAGTAGTTGATCTCGTCAGCCATTCTCGGTGACCTTGAAAT
CCATCAGGGTTAAGACGCTCGACAGGAACTTTAACAATCTTGGGTTTATGCTTGTAGTAA
AACTAACTTTTGGATCACCACGCATGCCCTCAAGCTTCTTGTGAAAAGAAACAGCCTGAT
TGTCTAAGAGGCTCAGTGTAACAGACACATCAGTAAACATCCACAGGAGCATATCAATCC
ACATGAGCTCACCACCATGCTTGACAATTCTCGCCTCCCAGTACCGCATCAACGTAGCCT
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AAT
C

QA 8 790 8 790
DS 

RD RR4D930JQ 809 0 0
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TGCGAGTCAAGCAAGACCTTAGAGGCCTTGATGTCTCGGTATATGACTTTTAACAGGGTT
GCCATGAAGGAATGCGAGCTCTTTAGATGTGAACAGATGATCCTCAAAACTACCCTTATG
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GCCTGATTGTCTAAGAGGCTCAGTGTAACAGACACATCAGTAAACATCCAAAGGAGCATA
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CCCTCGAAATAGTCACTATTTTATACAGATCTCACATCGAGTCTGAGCGACGAACGAAAT
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QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 4

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ACGCGATTTGATGCTGCAGCTGTGCATCATGTAGCATTGCTGAACTTTATGAGGATCAGA
AGCTGAGCTTCTTCCACAAGATTTTTCACTACCTCTCCAGCCGGTAAAATCTCTTTGATG
AGGCCTACGCTTTGACCTGCATACATCGCCATGCTCTCTAAGTCACCCGTTGTTGTCATG
TTGGGTACAGTTCCTGCAAATCGTCTTATCTCCTTTTCGACGCCGTGTATGGTGGAACGT
CCGATAATAGGTTGGTTAACTTCACTCTCATCTGAAGAAAGAGATCTCCAGTCGTCGAAG
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TCATGAGTCGCCACAAACCTTGTGCCGAGACAGACACCTTGAGCACCAAGTGACAAAGCT
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CCAACAAGATCAACTACTCTTGGCAACAATGAAAAGAGACCATCCTTCCCACTAACATGC
CCTCCTGCTTCATGCCCTTGAACAATAATTGCGTCTACTCCTACATCAACAGCCTTTCTA
GCTTCTTCAACACTCCCCACCTGAGGAACAACTTTGACTCCAGCACGGTGAGCATCATCC
ACAAGCTCCTTAGAACATTCACCCCAGTAAAGCTGCAACACAGCAACCTTCTCTTCCAAG
ATTGTCTTCACGTTGAGCTCATGAGGAAACGCAAGAACAACACCGATCCCAAATGGTCTG
TCAGTCAATGTCTTCGTCTTCCTGATCATCTCTCTCACGTAATCAGGACACTCCCAATCA
GGACATCGGAGAAGACCGATCCCTCCGGCGTTAGCCACAGCGGCTACAAGCTCCGGACCG
GAGATATCTGGACCTAGTGGCGCCTGAACTATTCCGTATTCGAAACCTAGAATCCCTTTC
AAAGCCATAAGTGTGTCTCTCTCGGTGTGTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE07JQ U 4
AF RR4GV20JQ U 1
AF RR4GV20TF C 581
AF RR4FE07TF C 487
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BS 426 426 RR4FE07JQ
BS 427 576 RR4GV20JQ
BS 577 577 RR4FE07JQ
BS 578 725 RR4GV20JQ
BS 726 726 RR4FE07JQ
BS 727 782 RR4GV20JQ
BS 783 1054 RR4FE07TF
BS 1055 1056 RR4GV20TF
BS 1057 1231 RR4FE07TF

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AACACTATATTTCTCTCGAGAGCAAACAACACAGAATATCCAGAAAGGGTACCTTATTAT
ATACTAAGATGATACTATCCACATCCGATTCCAAAAACAGTAAAGTTTTTTTTTCTCACG
CGATTTGATGCTGCAGCTGTGCATCATGTAGCATTGCTGAACTTTATGAGGATCAGAAGC
TGAGCTTCTTCCACAAGATTTTTCACTACCTCTCCAGCCGGTAAAATCTCTTTGATGAGG
CCTACGCTTTGACCTGCATACATCGCCATGCTCTCTAAGTCACCCGTTGTTGTCATGTTG
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ATAATAGTTTGGTTAACTTCACTCTCATCTGCAGAAAGAGATCTCCAGTCGTCGAAGAAA
GGTGTTTGCAGAACACGTTGTGGCGCACCAGGCCACCTTGCTCGTCCGAAGATATCTGTG
TACTCGGTTTTCTCGTATTCGACCAACTTCCTTCTGTATATTGGGTGTGCGTAGCTCTCA
TGAGTCGCCACAAACCTTGTGCCGAGACAGACACCTTGAGCACCAAGTGACAAAGCTGCA
ACGTAACCACGTGCGTCAACAATTCCTCCAGCAGCGATAACCGGAATATCGCATTCCCCA
ACAAGATCAACTACTCTTGGCAACAATGAAA
GAGACC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4GV20JQ 782 0 0
GGTGGAGAAATAGCTATGTATGATTAAATGGTATGGTTGTAAAAGGAGGAATTACACAGT
AAGAACACTATATTTCTCTCGAGAGCAAACAACACAGAATATCCAGAAAGGGTACCTTAT
TATATACTAAGATGATACTATCCACATCCGATTCCAAAAACAGTAAAGTTTTTTTTTCTC
ACGCGATTTGATGCTGCAGCTGTGCATCATGTAGCATTGCTGAACTTTATGAGGATCAGA
AGCTGAGCTTCTTCCACAAGATTTTTCACTACCTCTCCAGCCGGTAAAATCTCTTTGATG
AGGCCTACGCTTTGACCTGCATACATCGCCATGCTCTCTAAGTCACCCGTTGTTGTCATG
TTGGGTACAGTTCCTGCAAATCGTCTTATCTCCTTTTCGACGCCGTGTATGGTGGAACGT
CCGATGATAGGTTGGTTAACTTCACTCTCATCTGAAGAAAGAGATCTCCAGTCGTCGAAG
AAAGGTGTTTGCAGAACACGTTGTGGCGCACCAGGCCACCTTGCTCGTCCGAAGATATCT
GTGTACTCGGTTTTCTCGTATTCGACCAACTTCCTTTTGTATATTGGGTGTGCGTAGCTC
TCATGAGTCGCCACAAACCTTGTGCCGAGACAGACACCTTGAGCACCAAGTGACAAAGCT
GCAACGTAACCACGTGCGTCAACAATTCCTCCAGCAGCGATAACCGGAATATCGCATTCC
CCAACCAGATCAACTACTCTTGGCAACAATGAAAAGAGACCATCCTTCCCACTAACATGC
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4GV20TF 535 0 0
ATATTGGGTGTGCGTAGCTCTCATGAGTCGCCACAAACCTTGTGCCGAGACAGACACCTT
GAGCACCAAGTGACAAAGCTGCAACGTAACCACGTGCGTCAACAATTCCTCCAGCAGCGA
TAACCGGAATATCGCATTCCCCAACCAGATCAACTACTCTTGGCAACAATGAAAAGAGAC
CATCCTTCCCACTAACATGCCCTCCTGCTTCATGCCCTTGAACAATAATTGCGTCTACTC
CTACATCAACAGCCTTTCTAGCTTCTTCAACACTCCCCACCTGAGGAACAACTTTGACTC
CAGCACGGTGAGCATCATCCACAAGCTCCTTAGAACATTCACCCCAGTAAAGCTGCAACA
CAGCAACCTTCTCTTCCAAGATTGTCTTCACGTTGAGCTCATGAGGAAACGCAAGAACAA
CACCGATCCCAAATGGTCTGTCAGTCAATGTCTTCGTCTTCCTGATCATCTCTCTCACGT
AATCAGGACACTCCCAATCAGGACATCGGAGAAGACCGATCCCTCCGGCGTTAGC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4FE07TF 745 0 0
GTTTGCAGAACACGTTGTGGCGCACCAGGCCAC*TTGCTCGTC*GAAGATATCTGTGTAC
TCGGTTTTCTCGTATTCGACCAACTTC*TTCTGTATATTGGGTGTGCGTAGCTCTCATGA
GTCGCCACAAACTTTGTGCCGAGACAGACACCTTGAGCACCAAGTGACAAAGCTGCAACG
TAACCACGTGCGTCAACAATTCCTCCAGCAGCGATAACCGGAATATCGCATTCCCCAACA
AGATCAACTACTCTTGGCAACAATGAAAAGAGACCATCCTTCCCACTAACATGCCCTCCT
GCTTCATGCCCTTGAACAATAATTGCGTCTACTCCTACATCAACAGCCTTTCTAGCTTCT
TCAACACTCCCCACCTGAGGAACAACTTTGACTCCAGCACGGTGAGCATCATCCACAAGC
TCCTTAGAACATTCACCCCAGTAAAGCTGCAACACAGCAACCTTCTCTTCCAAGATTGTC
TTCACGTTGAGCTCATGAGGAAACGCAAGAACAACACCGATCCCAAATGGTCTGTCAGTC
AATGTCTTCGTCTTCCTGATCATCTCTC**ACGTAATCAGGACACTCCCAATCAGGACAT
CGGAGAAGACCGATCCCTCCGGCGTTAGCCACAGCGGCTACAAGCTCCGGACCGGAGATA
TCTGGACCTAGTGGCGCCTGAACTATTCCGTATTCGAAACCTAGAATCCCTTTCAAAGCC
ATAAGTGTGTCTCTCTCGGTGTGTC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

CO CL3432Contig1 1369 3 10 U
GGGCCCTTTAGCCAATCTCGTGGCGAACGAAACCCTAATCATCACTCTCTCTCACGAATT
CGATTCGATTTCTTCGTAATCCGCCATGGATGCTCAACGAGCTCTGCTGGACGAACTCAT
GGGCGCAGCTCGTGATCTGACGGACGAAGAGAGGAGAGGATTCAAAGAGATCAAGTGGGA
TGACAGAGAGGTTTGTGCATTCTACATGGTTCGATTTTGTCCTCATGACCTCTTCGTCAA
CACCAAGAGCGATCTCGGTGCGTGCTCGAGGATTCATGATCCCAAGCTCAAAGAGAGCTT
TGAGAACTCTCCGAGGCATGATTCGTATGTTCCTAAGTTCGAGGCTGAGCTTGTTCAATT
CTGCGAGAAGCTGGTGAATGATCTTGACAGGAAGGTAAGGCGTGGACAAGAACGCCTTGC
GCAAGAGCTTGAACCTCCTCCACCACCTTCTCTGTCTGGGGAGAAAGCTGAGCAGCTCTC
TGTTTTGGAGGAGAAGATTAAGAACCTTCTTGAGCAAGTGGAAGCACTTGGTGAAGAAGG
CAAAGTCGATGAAGCTGAAGCCCTGATGAGAAAGGTGGAAGGGCTTAATACGGAGAAGGC
AATGTTGATACAGAGACCAAATGACAAGGTACTAGCGATGGTACAGGAGAAGAAGATGGC
ACTGTGTGATGTTTGTGGTTCGTTCCTTGTCTCTAATGATGCTGTAGAAAGGACTCAGTC
TCATGTCACTGGGAAGCAGCATGTTGGCTATGGCGTGGTCCGGGATTTTCTTGCTGAACA
AAAAGCTGCTAAAGATAAAGGAAGGGAAGAAGAAAGGCAAGTCAGAGGAAAAGAAGCAGA
TGATAAGAGGAAACCGAGGGAGAGGGAAAGCGAGAGTAGGAGGAGTGGTTCTAGTGATAG
AGAGAGATACCGTGATAGTGATAGAGATAGGGACAGACACAGAGACCATGGTAGGAATCA
TAGAAAGCATTACGACAGGAGACCCAGGAGTGGGAGAGATGGTCGTGACCGAAGCAGGTC
TCGGTCTCCTCATGGAAGGTCTGGTCGCAGAAGGGTGTCGAGAAGTCCGGCTCGCTAGTA
CTAGTTTGAGAGAACTTTGCAAACTCAAGAGGTAGAACTTGTGACTTCTCCCTAAGTTTC
TTCATTGGCATGTGTGTTTTCTTTATTTGGAACCTGTTAAAATTTGAAGGATAAAATTGT
GTTTCTACCCGTTCAGACAGCTATTGTAAGAGTTTAAGACCCTTATCCGACCTCCATCGG
TTATTTGTTAAGAGGTCAAAAGCGTTGAGGTAGGTAAAACCTGTATAACCTTTTTTACAT
TTTTCATTGTATTTCTCGACATTGGAGATGCTATAGCTTTCTTTTATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ83TF U 8
AF RR4GT83TF U 1
AF RR4GT83JQ C 589
BS 1 53 RR4GT83TF
BS 54 54 RR4BQ83TF
BS 55 221 RR4GT83TF
BS 222 222 RR4BQ83TF
BS 223 518 RR4GT83TF
BS 519 519 RR4BQ83TF
BS 520 783 RR4GT83TF
BS 784 784 RR4GT83JQ
BS 785 796 RR4GT83TF
BS 797 1369 RR4GT83JQ

RD RR4BQ83TF 760 0 0
GG
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GGTTTGTGCATTCTACATGGTTCGATTTTGTCCTCATGACCTCTTCGTCAACACCAAGAG
CGATCTCGGTGCGTGCTCGAGGATTCATGATCCCAAGCTCAAAGAGAGCTTTGAGAACTC
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GCTGGTGAATGATCTTGACAGGAAGGTAAGGCGTGGACAAGAACGCCTTGCGCAATAGCT
TGAACCTCCTCCACCACCTTCTCTGTCTGGGGAGAAAGCTGAGCAGCTCTCTGTTTTGGA
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TGAAGCTGAAGCCCTGATGAGAAAGGTGGAAGGGCTTAATACGGAGAAGGCAATGTTGAT
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TGTTTGTGGTTCGTTCCTTGTCTCTAATGATGCTGTAGAAAGGACTCAGTCTCATGTCAC
TGGGAAGCAGCATGTTGGCTATGGCATGGTCCGGGATT

QA 3 760 3 760
DS 

RD RR4GT83TF 796 0 0
GGGCCCTTTAGCCAATCTCGTGGCGAACGAAACCCTAATCATCACTCTCTCTCTCGAATT
CGATTCGATTTCTTCGTAATCCGCCATGGATGCTCAACGAGCTCTGCTGGACGAACTCAT
GGGCGCAGCTCGTGATCTGACGGACGAAGAGAGGAGAGGATTCAAAGAGATCAAGTGGGA
TGACAGAGAGGTTTGTGCATTCTACATGGTTCGATTTTGTCTTCATGACCTCTTCGTCAA
CACCAAGAGCGATCTCGGTGCGTGCTCGAGGATTCATGATCCCAAGCTCAAAGAGAGCTT
TGAGAACTCTCCGAGGCATGATTCGTATGTTCCTAAGTTCGAGGCTGAGCTTGTTCAATT
CTGCGAGAAGCTGGTGAATGATCTTGACAGGAAGGTAAGGCGTGGACAAGAACGCCTTGC
GCAAGAGCTTGAACCTCCTCCACCACCTTCTCTGTCTGGGGAGAAAGCTGAGCAGCTCTC
TGTTTTGGAGGAGAAGATTAAGAACCTTCTTGAGCAAG*GGAAGCACTTGGTGAAGAAGG
CAAAGTCGATGAAGCTGAAGCCCTGATGAGAAAGGTGGAAGGGCTTAATACGGAGAAGGC
AATGTTGATACAGAGACCAAATGACAAGGTACTAGCGATGGTACAGGAGAAGAAGATGGC
ACTGTGTGATGTTTGTGGTTCGTTCCTTGTCTCTAATGATGCTGTAGAAAGGACTCAGTC
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AAA*GCTGCTAAAGAT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4GT83JQ 781 0 0
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GAAGAAGATGGCACTGTGTGATGTTTGTGGTTCGTTCCTTGTCTCTAATGATGCTGTAGA
AAGGACTCAGTCTCATGTCACTGGGAAGCAGCATGTTGGCTATGGCGTGGTCCGGGATTT
TCTTGCTGAACAAAAAGCTGCTAAAGATAAAGGAAGGGAAGAAGAAAGGCAAGTCAGAGG
AAAAGAAGCAGATGATAAGAGGAAACCGAGGGAGAGGGAAAGCGAGAGTAGGAGGAGTGG
TTCTAGTGATAGAGAGAGATACCGTGATAGTGATAGAGATAGGGACAGACACAGAGACCA
TGGTAGGAATCATAGAAAGCATTACGACAGGAGACCCAGGAGTGGGAGAGATGGTCGTGA
CCGAAGCAGGTCTCGGTCTCCTCATGGAAGGTCTGGTCGCAGAAGGGTGTCGAGAAGTCC
GGCTCGCTAGTACTAGTTTGAGAGAACTTTGCAAACTCAAGAGGTAGAACTTGTGACTTC
TCCCTAAGTTTCTTCATTGGCATGTGTGTTTTCTTTATTTGGAACCTGTTAAAATTTGAA
GGATAAAATTGTGTTTCTACCCGTTCAGACAGCTATTGTAAGAGTTTAAGACCCTTATCC
GACCTCCATCGGTTATTTGTTAAGAGGTCAAAAGCGTTGAGGTAGGTAAAACCTGTATAA
CCTTTTTTACATTTTTCATTGTATTTCTCGACATTGGAGATGCTATAGCTTTCTTTTATA
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 4

CO CL3433Contig1 843 4 9 U
GGATATAACATTCAATTAATTAAAAAAATCGTAAAGAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAA
AGAGAAAAAGTAGTTTCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGGT
AATTTATAACACAGTTTATAAGTGTTGTGAATGGTTTATGGTTTTGCAATTTATAGATTT
TTATGTATTCTCTATTTTTGTCAACTTCTATTCTCACTTAAAGTCACTATTTCAATAGAA
AGAATAAATGCTTATAGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAGTCCACTCAAA
AATGCACCGCCGGATATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAATGTGTGCGTCGTTGC
AAGGCGTCATCCGGAAAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTT
CACTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGC
AAGAACGGAAAATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAACTTCTCATTAA
TACTATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTTTAAACAAGAAATAATA
ACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAA
TTTGTTGTAAAACTTAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGTA
TTTCACCTCTATGGATTTGCAATAATACAGAATTCACATTAAATGTGACTTCCTTTGTAA
ATCGCCAACTTATTATTTTGTAAGAGGCTCATGTACTAATAAAGCAATTTTTTTTCTTTT
ACG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4C237TF U 1
AF RR4C126JQ C 4
AF RR4C126TF U 4
AF RR4C237JQ C 105
BS 1 240 RR4C237TF
BS 241 241 RR4C126TF
BS 242 590 RR4C237TF
BS 591 647 RR4C126TF
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BS 673 701 RR4C126TF
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RD RR4C237TF 590 0 0
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TTATGTATTCTCTATTTTTGTCAACTTCTATTCTCACTTAAAGTCACTATTTCAATAGAA
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TACTATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTTTAAACA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4C126JQ 716 0 0
G
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AAAAAGTAGTTTCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGGTAATT
TATAACACAGTTTATAAGTGTTGTGAATGGTTTATGGTTTTGCAATTTATAGATTTTTAT
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ACGGAAAATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAACTTTTCATTAATACT
ATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTTTAAACAAGAAATAATAACTA
TATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAATTTG
TTGTAAAACTTAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAA
ATAATATTCGTAGAAAGT

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4C126TF 714 0 0
G
ATAACATTCAATTAATTAAAAAAATCGTAAAGAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAG
AAAAAGTAGTTTCCTTCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGTTAATTTTGACAGGTAATT
TATAACACAGTTTATAAGTGTTGTGAATGGTTTATGGTTTTGCAATTTATAGATTTTTAT
GTATTCTCTATTTTTGTCAACTTCTATTCTCACTTAAAGTCACTATTTCAATAGAAAGAA
TAAATGCTTATAGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGAAG*CCACTCAAAAATG
CACCGCCGGATATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGAATGTGTGCGTCGTTGCAAGG
CGTCATCCGGAAAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAACAATGTTCACT
ATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGA
ACGGAAAATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAACTTCTCATTAATACT
ATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTTTAAACAAGAAATAATAACTA
TATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGAAAA*TATAATTTATAATTTG
TTGTAAA*CTTAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAA
TATATTCGTAGAAAGT

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4C237JQ 739 0 0
GTTAATTTTGACAGGTAATTTATAACACAGTTTATAAGTGTTGTGAATGGTTTATGGTTT
TGCAATTTATAGATTTTTATGTATTCTCTATTTTTGTCAACTTCTATTCTCACTTAAAGT
CACTATTTCAATAGAAGGAATAAATGCTTATAGTCATAAAGATTTCGAGCGCCGTTGTCG
TGGAAGTCCACTCAAAAATGCACCGCCGGATATGTGTACGAAACTAAATGCTCGTGCTGA
ATGTGTGCGTCGTTGCAAGGCGTCATCCGGAAAAACCGGATTTGTAAGAGGTGAGTGTGT
TGTTAGGAACAATGTTCACTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACC
ACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCC
AATAACTTCTCATTAATACTATTTTTAATATGAAACTATAAAATAAGATCTTTTGGTTTT
TAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCGGGA
AAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTTAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATA
ATATTCGTAGAAAGTATTTCACCTCTATGGATTTGCAATAATACAGAATTCACATTAAAT
GTGACTTCCTTTGTAAATCGCCAACTTATTATTTTGTAAGAGGCTCATGTACTAATAAAG
CAATTTTTTTTCTTTTACG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL3434Contig1 765 4 4 U
GGAGTCAAGTTCCTCTCATGATCCTCCATACAGTGGATGACAAGAAGTACCTGAAAACAA
ATGTGGAGGTCGACCAGATTGAATCTTGGATCAATGACTTCAAAGATGGAAAAGTTCCAC
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CTGAGAGCCTTGACGAGATGGTATTCAACTCTGGAAAGAACGTCTTGCTTGAGTTCTATG
CTCCATGGTGTGGACACTGCCAAAACCTTGTTCCAATCTTGGACGAGGTAGCTGTTTCGT
ACCAAAGCGATCCAAGTGTAGTCATAGCTAAGTTTGACGCAACCGCAAACGACTTCCACG
TGACACCTTTGATGTGAAGGGCTTCCCGACCATTTACTTAAGAACAACGAGTGGAAACAC
TGTGCTTTATGTAGGAGACAGGACAAAGGAAGATATCATAAGCTTTATTGACAAGAACAA
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GAATTTAAATATGCAACATGCAGAACAATAACGGCTGCTTCTTTTGTTTTTGTATTTGTC
AATTTTGAACTATGTTCTCTCTTAATATTATGAGCAGTTTGATGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H905TF U 1
AF RR4H029TF U 1
AF RR4H905JQB C 1
AF RR4H029JQ C 37
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BS 642 656 RR4H029TF
BS 657 765 RR4H905JQB

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CTCCATGGTGTGGACACTGCCAAAACCTTGTTCCAATCTTGGACGAGGTAGCTGTTTCGT
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QA 1 527 1 527
DS 

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ATGTGGAGGTCGACCAGATTGAATCTTGGATCAATGACTTCAAAGATGGAAAAGTTCCAC
AGCACAAAAAGTCTCAACCTATACCAACTGAAAACAACGAGCCAGTGAAGGTTGTTGTTG
CTGAGAGCCTTGACGAGATGGTATTCAACTCTGGAAAGAACGTCTTGCTTGAGTTCTATG
CTCCATGGTGTGGACACTGCCAAAACCTTGTTCCAATCTTGGACGAGGTAGCTGTTTCGT
ACCAAAGCGATCCAAGTGTAGTCATAGCTAAGTTTGACGCAACCGCAAACGACTTCCACG
TGACACCTTTGATGTGAAGGGCTTCCCGACCATTTACTTAAGAACAACGAGTGGAAACAC
TGTGCTTTATGTAGGAGACAGGACAAAGGAAGATATCATAAGCTTTATTGACAAGAACAA
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AATACACAGAAGAAGACAGGGCTTTGAGTAGATAGAGAAG*TCTCTTTATCTATTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4H905JQB 765 0 0
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ATGTGGAGGTCGACCAGATTGAATCTTGGATCAATGACTTCAAAGATGGAAAAGTTCCAC
AGCACAAAAAGTCTCAACCTATACCAACTGAAAACAACGAGCCAGTGAAGGTTGTTGTTG
CTGAGAGCCTTGACGAGATGGTATTCAACTCTGGAAAGAACGTCTTGCTTGAGTTCTATG
CTCCATGGTGTGGACACTGCCAAAACCTTGTTCCAATCTTGGACGAGGTAGCTGTTTCGT
ACCAAAGCGATCCAAGTGTAGTCATAGCTAAGTTTGACGCAACCGCAAACGACTTCCACG
TGACACCTTTGATGTGAAGGGCTTCCCGACCATTTACTTAAGAACAACGAGTGGAAACAC
TGTGCTTTATGTAGGAGACAGGACAAAGGAAGATATCATAAGCTTTATTGACAAGAACAA
GGACACATCTGCAGAGATTAAGACGGATGAAAAGATAACTGAGGAAGTTAAGGACGAGCT
CTGAGAAGACAAGTGTGTTACGTCTCTTAGCTGCTAGCTTAGTTTGGTAGTTTTGAGGAA
AATACACAGAAGAAGACAGGGCTTTGAGTAGATAGAGAAGGTCTCTTTATCTATTTATTG
GAATTTAAATATGCAACATGCAGAACAATAACGGCTGCTTCTTTTGTTTTTGTATTTGTC
AATTTTGAACTATGTTCTCTCTTAATATTATGAGCAGTTTGATGC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4H029JQ 729 0 0
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ACTTCAAAGATGGAAAAGTTCCACAGCACAAAAAGTCTCAACCTATACCAACTGAAAACA
ACGAGCCAGTGAAGGTTGTTGTTGCTGAGAGCCTTGACGAGATGGTATTCAACTCTGGAA
AGAACGTCTTGCTTGAGTTCTATGCTCCATGGTGTGGACACTGCCAAAACCTTGTTCCAA
TCTTGGACGAGGTAGCTGTTTCGTACCAAAGCGATCCAAGTGTAGTCATAGCTAAGTTTG
ACGCAACCGCAAACGACTTCCACGTGACACCTTTGATGTGAAGGGCTTCCCGACCATTTA
CTTAAGAACAACGAGTGGAAACACTGTGCTTTATGTAGGAGACAGGACAAAGGAAGATAT
CATAAGCTTTATTGACAAGAACAAGGACACATCTGCAGAGATTAAGACGGATGAAAAGAT
AACTGAGGAAGTTAAGGACGAGCTCTGAGAAGACAAGTGTGTTACGTTTCTTAGCTGCTA
GCTTAGTTTGGTAGTTTTGAGGAAAATACACAGAAGAAGACAGGGCTTTGAGTAGATAGA
GAAGGTCTCTTTATCTATTTATTGGAATTTAAATATGCAACATGCAGAACAATAACGGCT
GCTTCTTTTGTTTTTGTATTTGTCAATTTTGAACTATGTTCTCTCTTAATATTATGAGCA
GTTTGATGC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL3435Contig1 907 4 3 U
AAGTTAAACGAAGAAGAGAGCGGCTTAAAACTGTGTCAACCACCAAAAATCGCCATCTCC
CGCGGGCGGTTCTCCGGCCAGAAAAAATCTGTAAAATCGAATAATAATGATAAAGCTTTG
GAGATGGTACCAGCGATGCCTGACGGTTCATCCAGTGAAAACGCAGGTCATCAGCTCCGG
CTTCCTCTGGGGATTTGGCGATGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACC
TCCTCCTCCTCTTCTCCGTCTCTCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGAATT
CAAGGTCAACTGGAAGCGAGTAGCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGCTTTGTCGGACC
TGTTGGCCACTTCTGGTACGAAGGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATATGT
ACCAAAGTCCACACGTTTTGTAGCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCC
CATAGATCTACTGGTTTTCTTCACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCTGA
AGTGAAAGAAGGACTCAAGAGGGATTTTCTCCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATG
GCCGCTTCTTCAGATCGCAAACTTCAGATACGTTCCCGTGCAGTACCAGCTTCTTTACGT
CAACATCTTTTGCCTTATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGC
AGCTTGGAAGCAATGGTTCACTGCTTCGTTTCTAACGCTTAAAGAACGAGGTGGCACAGG
TGGCGTTTGATTCGTTTTTCCTATGTCGTGAACTTTGAATGAAAACAAAACAGAGTGTAA
TTTGACGATTCTCAACAACGAAAGTTGCCCTTACAGATTCTTGAATCAAATTTATTATTT
CGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX84TF U 1
AF RR4BP02TF U 14
AF RR4BP02JQ C 144
AF RR4EX84JQ C 250
BS 1 711 RR4EX84TF
BS 712 885 RR4BP02JQ
BS 886 907 RR4EX84JQ

RD RR4EX84TF 711 0 0
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TCCTCCTCCTCTTCTCCGTCTCTCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGAATT
CAAGGTCAACTGGAAGCGAGTAGCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGCTTTGTCGGACC
TGTTGGCCACTTCTGGTACGAAGGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATATGT
ACCAAAGTCCACACGTTTTGTAGCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCC
CATAGATCTACTGGTTTTCTTCACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCTGA
AGTGAAAGAAGGACTCAAGAGGGATTTTCTCCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATG
GCCGCTTCTTCAGATCGCAAACTTCAGATACGTTCCCGTGCAGTACCAGCTTCTTTACGT
CAACATCTTTTGCCTTATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BP02TF 698 0 0
G
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CGGTCAGAAAAAATCTGTAAAATCGAATAATAATGATAAAGCTTTGGAGATGGTACCAGC
GATGCCTGACGGTTCATCCAGTGAAAACGCAGGTCATCAGCTCCGGCTTCCTCTGGGGAT
TTGGCGATGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTC
TCCGTCTCTCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGAATTCAAGGTCAACTGGA
AGCGAGTAGCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGCTTTGTCGGACCTGTTGGCCACTTCT
GGTACGAAGGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATATGTACCAAAGTCCACAC
GTTTTGTAGCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCCCATAGATCTACTGG
TTTTCTTCACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCTGAAGTGAAAGAAGGAC
TCAAGAGGGATTTTCTCCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATGGCCGCTTCTTCAGA
TCGCAAACTTCAGATACGTTCCCGTGCAGTACCAGCTTCTTTACGTCAACATCTTTTGCC
TTATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR4BP02JQ 744 0 0
CGGTTCATCCAGTGAAAACGCAGGTCATCAGCTCCGGCTTCCTCTGGGGATTTGGCGATG
TCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTCTCCGTCTCT
CCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGAATTCAAGGTCAACTGGAAGCGAGTAG
CTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGCTTTGTCGGACCTGTTGGCCACTTCTGGTACGAAG
GCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATATGTACCAAAGTCCACACGTTTTGTAG
CAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCCCATAGATCTACTGGTTTTCTTCA
CATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCTGAAGTGAAAGAAGGACTCAAGAGGG
ATTTTCTCCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATGGCCGCTTCTTCAGATCGCAAACT
TCAGATACGTTCCCGTGCAGTACCAGCTTCTTTACGTCAACATCTTTTGCCTTATAGACA
GCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGCAGCTTGGAAGCAATGGTTCACTG
CTTCGTTTCTAACGCTTAAAGAACGAGGTGGCACAGGTGGCGTTTGATTCGTTTTTCCTA
TGTCGTGAACTTTGAATGAAAACAAAACAGAGTGTAATTTGACGATTCTCAACAACGAAA
GTTGCCCTTACAGATTCTTGAA
CC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4EX84JQ 658 0 0
TCTTCTCCGTCTCTCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGAATTCAAGGTCAA
CTGGAAGCGAGTAGCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGCTTTGTCGGACCTGTTGGCCA
CTTCTGGTACGAAGGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATATGTACCAAAGTC
CACACGTTTTGTAGCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCCCATAGATCT
ACTGGTTTTCTTCACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCTGAAGTGAAAGA
AGGACTCAAGAGGGATTTTCTCCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATGGCCGCTTCT
TCAGATCGCAAACTTCAGATACGTTCCCGTGCAGTACCAGCTTCTTTACGTCAACATCTT
TTGCCTTATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGCAGCTTGGAA
GCAATGGTTCACTGCTTCGTTTCTAACGCTTAAAGAACGAGGTGGCACAGGTGGCGTTTG
ATTCGTTTTTCCTATGTCGTGAACTTTGAATGAAAACAAAACAGAGTGTAATTTGACGAT
TCTCAACAACGAAAGTTGCCCTTACAGATTCTTGAATCAAATTTATTATTTCGTTTTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 4

CO CL3436Contig1 1020 4 22 U
GGATCCAACTTTCTCTGGGTTTGTTTGCCAGAAAGGTTACTTCTTTGAGTATCATCGTGT
CCAAGGTTCAGCGAAGAAGAAAAGATCCAAATTTGATATTTGGAGCCTCCATCAATGGCT
TCGTTTCTGGCTCGCAGGTCGCTCAATGCTCTCCGGACCCGACACATCGTTTCTTCAGGG
CAAGCTTTACAGGGATCTCATCTCGTTGGGCTACAGTCCCGTGCTATATCGTATGGCACA
AACAAAGATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACG
GTCTTCGAGCGGAGCATGAGCACCCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGCCGCTG
ACTCTCAAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAAGGTCCA
TT*GAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACG
CTGCATT*GCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGG
CAGAGGAGAGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGT
GCATCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCAATCGTGGAAGGACCCA
ACTTT*GAGTTTGCAACCGAGACTCATGAGGAACTTCTGTATGACAAAGAGAAGCTTCTT
GAGAATGGAGATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTAC
CGCTGAATTCTTTAAGGGTCTTTTTGCCTAATAAATTTATTCAGAGAATGTTTTGGTCTG
AATAAAAGATGCTTCAGCATTTGCAAACCGTTACTGACTTGCTGTATTGCTCTGCTTGCA
AGTGGTCCATACTGATGTGAAAAAGGTTTGGTTTTGTTTCTGGTTTAAATTTGACCATAA
ATACCATACCAAACACTTTGGAATATGAAGTTATGAATACATGGAGTTGTTACTCTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 0 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FP21TF U 1
AF RR4AS66TF U 1
AF RR4AS66JQ C 164
AF RR4FP21JQ C 329
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BS 666 666 RR4FP21TF
BS 667 786 RR4AS66TF
BS 787 787 RR4FP21TF
BS 788 830 RR4AS66TF
BS 831 831 RR4AS66JQ
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CGCTGAATTCTT

QA 1 792 1 792
DS 

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TCGTTTCTGGCTCGCAGGTCGCTCAATGCTCTCCGGACCCGACACATCGTTTCTTCAGGG
CAAGCTTTACAGGGATCTCATCTCGTTGGGCTACAGTCCCGTGCTATATCGTATGGCACA
AACAAAGATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACG
GTCTTCGAGCGGAGCATGAGCACCCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGCCGCTG
ACTCTCAAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCA
TTTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACG
CTGCATTTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGG
CAGAGGAGAGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGT
GCATCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCAATCGTGGAAGGACCCA
ACTTTTGAGTTTGCAACCGAGACTCATGAGGAACTTCTGTATGACAAAGAGAAGCTTCTT
GAGAATGGAGATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTAC
CGCTGAGTTCTTTAAGGGTCTTTTTGCCTAATAAATTTATTCAGAGAATGGTTTGGTCTG
AATAAAAGATGCTTCAGCATTTGCAAACCGT*ACTGACTTGCTGTATTGCTCTG

QA 1 894 1 894
DS 

RD RR4AS66JQ 857 0 0
AC
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ATATCGTATGGCACAAACAAAGATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCC
AAGGACTGGAGTACGGTCTTCGAGCGGAGCATGAGCACCCTGTTTCTCACTGAAATGGTC
CGGGGTTTGCCGCTGACTCTCAAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCT
TTTGAAAAGGGTCCATT*GAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCC
AACTGGGGAAGAACGCTGCATT*GCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAG
CAATCACCATAGAGGCAGAGGAGAGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATA
TAGACATGACAAAGTGCATCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCAA
TCGTGGAAGGACCCAACTTT*GAGTTTGCAACCGAGACTCATGAGGAACTTCTGTATGAC
AAAGAGAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAG
TCGGAGAGCCTCTACCGCTGAGTTCTTTAAGGGTCTTTTTGCCTAATAAATTTATTCAGA
GAATGTTTTGGTCTGAATAAAAGATGCTTCAGCATTTGCAAACCGTTACTGACTTGCTGT
ATTGCTCTGCTTGCAAGTGGTCCATACTGATGTGAAAAAGGTTTGGTTTTGTTTCTGGTT
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GTTGTTACTCTCTCC

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DS 

RD RR4FP21JQ 686 0 0
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TTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAAGGTCCATT*GAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAGCAC
GCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATT*GCCTGCAAACTCTGTGAAGC
TGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAGAGGGAAGATGGAAGCCGCAG
AACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGC
TTGCCCTGTTGATGCAATCGTGGAAGGACCCAACTTT*GAGTTTGCAACCGAGACTCATG
AGGAATTTCTGTATGACAAAGAGAAGTTTCTTGAGAATGGAGATCGGTGGGAGACAGAGA
TTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCT**ACCGCTGAATTCTTTAAAGGTCTTTTTGTC
TAATAAATTTATTCAGAGAATGTTTTGGTCTGAATAAAAGATGCTTCAGCATTTGCAAAC
CGTTACTGACTTGCTGTATTGCTCTGCTTGCAAGTGGTCCATACTGATGTGAAAAAGGTT
TGGTTTTGTTTCTGGTTTAAATTTGACCATAAATACCATACCAAACACTTTGGAATATGA
AGTTATGAATACATGGAGTTGTTACT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 4

CO CL3437Contig1 822 4 22 U
GGCCACAATCCACACATATGGCAAACCTCATCCTCATCATCGCCTCCCAAATACTCTTTC
TCGCAGCCGTTGTCCCCGCCGGAAGCGGCGATGACTTTGCAAAAGTCATTGACCGGAAAC
TCCTAGGCCTCCGTAAAGAGAAACTCACTTTCTCCCGTGTCTACTGGCACGACATTCAAA
GCGGCTCAAACCCTACCTCCGTCGCGCTGAGACCTCCTGTCACCAACTCATCCTTCTTCG
GAGCCGTCTTTGTGATCGATAACCGGTTAACCACGGAGGTCTCGATAAACTCGACTTTGG
TTGGCCAGGCCCAAGGGGTTTACGCTGCTGTGGGACTACACGACTCGTCTGCGCTTATGG
TTATGAACTTTGCGTTCAAGACAGGGAAGTATAACGGAAGTACGATCTCGATACTTGGTC
GGAACGAGGTGTTGACCAAGGTTAGGGAGATGCCGGTGATTGGAGGAAGTGGACTGTTCC
GGTTCGCTAGAGGTTATGTCGAGGCTAGGACTATGTGGTTTGATCAAAAGACAGGAGATG
CTACTGTTGAGTACAGCTGTTACGTCTTGCACTACTAGCTTGCTAATATAATCGTGTTTG
CGTTTTTGTTTATGGTGATTGTCATTTACTTAAGTAACATTTTGCATTGACGAGTGTTGT
TGTTTGGCGTTTGTTGCATGTCACGTTGTGTGGTCTGGTCATTGACAGGGGCAAACGTTA
GTTTTTTTTTTCTAATATGTTTTATACTGTATTGTAATAGTTTTATTTCATTTACAAAAT
AAAAGTGGGTGTTTCTACATGAAACAGACCATATTTTGGGTC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4D437TF U 1
AF RR4B620TF U 4
AF RR4B620JQ C 5
AF RR4D437JQ C 182
BS 1 74 RR4D437TF
BS 75 75 RR4B620TF
BS 76 153 RR4D437TF
BS 154 154 RR4B620TF
BS 155 166 RR4D437TF
BS 167 167 RR4B620TF
BS 168 200 RR4D437TF
BS 201 201 RR4B620TF
BS 202 710 RR4D437TF
BS 711 711 RR4B620TF
BS 712 730 RR4D437TF
BS 731 731 RR4B620TF
BS 732 734 RR4D437TF
BS 735 735 RR4B620TF
BS 736 763 RR4D437TF
BS 764 766 RR4B620TF
BS 767 772 RR4D437TF
BS 773 775 RR4B620TF
BS 776 778 RR4D437TF
BS 779 779 RR4B620JQ
BS 780 804 RR4D437TF
BS 805 822 RR4B620JQ

RD RR4D437TF 806 0 0
GGCCACAATCCACACATATGGCAAACCTCATCCTCATCATCGCCTCCCAAATACTCTTTC
TCGCAGCCGTTGTCTCCGCCGGAAGCGGCGATGACTTTGCAAAAGTCATTGACCGGAAAC
TCCTAGGCCTCCGTAAAGAGAAACTCACTTTCTTCCGTGTCTACTG*CACGACATTCAAA
GCGGCTCAAACCCTACCTCC*TCGCGCTGAGACCTCCTGTCACCAACTCATCCTTCTTCG
GAGCCGTCTTTGTGATCGATAACCGGTTAACCACGGAGGTCTCGATAAACTCGACTTTGG
TTGGCCAGGCCCAAGGGGTTTACGCTGCTGTGGGACTACACGACTCGTCTGCGCTTATGG
TTATGAACTTTGCGTTCAAGACAGGGAAGTATAACGGAAGTACGATCTCGATACTTGGTC
GGAACGAGGTGTTGACCAAGGTTAGGGAGATGCCGGTGATTGGAGGAAGTGGACTGTTCC
GGTTCGCTAGAGGTTATGTCGAGGCTAGGACTATGTGGTTTGATCAAAAGACAGGAGATG
CTACTGTTGAGTACAGCTGTTACGTCTTGCACTACTAGCTTGCTAATATAATCGTGTTTG
CGTTTTTGTTTATGGTGATTGTCATTTACTTAAGTAACATTTTGCATTGACGAGTGTTGT
TGTTTGGCGTTTGTTGCATGTCACGTTGTGTGGTCTGGTCATTGACAGGG*CAAACGTTA
GTTTTTTTTT*CTA*TATGTTTTATACTGTATTGTAATAGTTT**ATTCATTACAAAA*T
AAAAGTGGGTGTTTCTACATGAAA
AA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4B620TF 810 0 0
G
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AGCCGTTGTCCCCGCCGGAAGCGGCGATGACTTTGCAAAAGTCATTGACCGGAAACTCCT
AGGCCTCCGTAAAGAGAAACTCACTTTCTCCCGTGTCTACTGGCACGACATTCAAAGCGG
CTCAAACCCTACCTCGGTCGCGCTGAGACCTCCTGTCACCAACTCATCCTTCTTCGGAGC
CGTCTTTGTGATCGATAACCGGTTAACCACGGAGGTCTCGATAAACTCGACTTTGGTTGG
CCAGGCCCAAGGGGTTTACGCTGCTGTGGGACTGCACGACTCGTCTGCGCTTATGGTTAT
GAACTTTGCGTTCAAGACAGGGAAGTATAACGGAAGTACGATCTCGATACTTGGTCGGAA
CGAGGTGTTGACCAAGGTTAGGGAGATGCCGGTGATTGGAGGAAGTGGACTGTTCCGGTT
CGCTAGAGGTTATGTCGAGGCTAGGACTATGTGGTTTGATCAAAAGACAGGAGATGCTAC
TGTTGAGTACAGCTGTTACGTCTTGCACTACTAGCTTGCTAATATAATCGTGTTTGCGTT
TTTGTTTATGGTGATTGTCATTTACTTAAGTAACATTTTGCATTGACGAGTGTTGTTGTT
TGGCGTTTGTTGCATGTCACGTTGTGTGGTCTGGTCATTGACAGGGGCAAACGTTAGTTT
TTTTTTTCTAATATGTTTTATACTGTATTGTAATAGTTTTATTTCATTTACAAA*TAAAA
GTGGGTGTTTCTACATGAAA
CAGACCATA

QA 2 801 2 801
DS 

RD RR4B620JQ 818 0 0
ACAATCCACACATATGGCAAACCTCATCCTCATCATCGCCTCCCAAATACTCTTTCTCGC
AGCCGTTGTCCCCGCCGGAAGCGGCGATGACTTTGCAAAAGTCATTGACCGGAAACTCCT
AGGCCTCCGTAAAGAGAAACTCACTTTCTCCCGTGTCTACTGGCACGACATTCAAAGCGG
CTCAAACCCTACCTCGGTCGCGCTGAGACCTCCTGTCACCAACTCATCCTTCTTCGGAGC
CGTCTTTGTGATCGATAACCGGTTAACCACGGAGGTCTCGATAAACTCGACTTTGGTTGG
CCAGGCCCAAGGGGTTTACGCTGCTGTGGGACTGCACGACTCGTCTGCGCTTATGGTTAT
GAACTTTGCGTTCAAGACAGGGAAGTATAACGGAAGTACGATCTCGATACTTGGTCGGAA
CGAGGTGTTGACCAAGGTTAGGGAGATGCCGGTGATTGGAGGAAGTGGACTGTTCCGGTT
CGCTAGAGGTTATGTCGAGGCTAGGACTATGTGGTTTGATCAAAAGACAGGAGATGCTAC
TGTTGAGTACAGCTGTTACGTCTTGCACTACTAGCTTGCTAATATAATCGTGTTTGCGTT
TTTGTTTATGGTGATTGTCATTTACTTAAGTAACATTTTGCATTGACGAGTGTTGTTGTT
TGGCGTTTGTTGCATGTCACGTTGTGTGGTCTGGTCATTGACAGGGGCAAACGTTAGTTT
TTTTTTTTTAATATGTTTTATACTGTATTGTAATAGTTTTATTTCATTTACAAAATAAAA
GTGGGTGTTTCTACATGAAACAGACCATATTTTGGGTC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4D437JQ 641 0 0
CGGCTCAAACCCTACCTCC*TCGCGCTGAGACCTCCTGTCACCAACTCATCCTTCTTCGG
AGCCGTCTTTGTGATCGATAACCGGTTAACCACGGAGGTCTCGATAAACTCGACTTTGGT
TGGCCAGGCCCAAGGGGTTTACGCTGCTGTGGGACTACACGACTCGTCTGCGCTTATGGT
TATGAACTTTGCGTTCAAGACAGGGAAGTATAACGGAAGTACGATCTCGATACTTGGTCG
GAACGAGGTGTTGACCAAGGTTAGGGAGATGCCGGTGATTGGAGGAAGTGGACTGTTCCG
GTTCGCTAGAGGTTATGTCGAGGCTAGGACTATGTGGTTTGATCAAAAGACAGGAGATGC
TACTGTTGAGTACAGCTGTTACGTCTTGCACTACTAGCTTGCTAATATAATCGTGTTTGC
GTTTTTGTTTATGGTGATTGTCATTTACTTAAGTAACATTTTGCATTGACGAGTGTTGTT
GTTTGGCGTTTGTTGCATGTCACGTTGTGTGGTCTGGTCATTGACAGGGGCAAACGTTAG
TTTTTTTTTTCTAATATGTTTTATACTGTATTGTAATAGTTTTATTTCATTTACAAAATA
AAAGTGGGTGTTTCTACATGAAACAGACCATATTTTGGGT
T

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 4

CO CL3438Contig1 695 4 14 U
GGGAAAAAAAATGAGCGGAGCCGGTAAGAAAATAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAG
GACAATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTTCTTGTAACCGACGAGGCTCGAAGAGAGTT
CTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACACTCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCA
GGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGA
CATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTCGTGGACACTGTTACTCC
TGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAATC
GCTCAAGCAGTCTGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTCCAGGAGATAAGCAAAAA
GCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTT
TGATGATGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATCATTGCTTCTTGTATCTTCGGC
CTGTGAAACATACATTCACTTTTCTTTCTCATTTTTCTCTCTTTCTTTTACTGTGATTTT
GTGATAATAATAAGTACACTCAGCTGTTGAGATTCATTGGAGACCCAATGAGACAATGAC
GATAAACCCATTTGGCAGTGCATGTCCGGATTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ94JQ C 97
AF RR4FZ94TF U 97
AF RR4DJ60JQ C 1
AF RR4DJ60TF U 1
BS 1 97 RR4DJ60TF
BS 98 225 RR4FZ94TF
BS 226 226 RR4DJ60TF
BS 227 357 RR4FZ94TF
BS 358 358 RR4DJ60TF
BS 359 367 RR4FZ94TF
BS 368 368 RR4DJ60TF
BS 369 381 RR4FZ94TF
BS 382 382 RR4DJ60TF
BS 383 589 RR4FZ94TF
BS 590 590 RR4DJ60TF
BS 591 635 RR4FZ94TF
BS 636 674 RR4DJ60TF
BS 675 695 RR4DJ60JQ

RD RR4FZ94JQ 539 0 0
G
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GATGTCCAGGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAG
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TCTCTTTCTTTTGCTGTGATTTTGTGATAATAATAAGTACACTCAGCTGTTGAGATTC

QA 2 539 2 539
DS 

RD RR4FZ94TF 539 0 0
G
ACCGACGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACACT
CAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAG
GGTATTGGGTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCC
AAGTTCGTGGACACTGTTACTCCTGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAA
CTGAAAGAAGCAGAACAGAACTCGCTCAAGGAGTCTGAACGTCTTGAGAAAGAAATTGTT
GATGTCCAGGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAG
CACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGATGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGA
TCATTGCTTCTTGTATCTTCGGCCTGTGAAACATACATTCACTTTTCTTTCTCATTTTTC
TCTCTTTCTTTTGCTGTGATTTTGTGATAATAATAAGTACACTCAGCTGTTGAGATTC

QA 2 539 2 539
DS 

RD RR4DJ60JQ 695 0 0
GGGAAAAAAAATGAGCGGAGCCGGTAAGAAAATAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAG
GACAATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTTCTTGTAACCGACGAGGCTCGAAGAGAGTT
CTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACACTCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCA
GGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAA*GGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGA
CATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTCGTGGACACTGTTACTCC
TGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACATAAATC
GCTCAAGCAGTCTGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTCCAGGAGATTAGCAAAAA
GCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTT
TGATGATGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATCATTGTTTCTTGTATCTTCGGC
CTGTGAAACATACATT*ACTTTTCTTTCTCATTTTTCTCTCTTTCTTTTACTGTGATTTT
GTGATAATAA***GTACACTCGGCTGTTGAGATTCATTGGAGACCCAATGAGACAATGAC
GATAAACCCATTTGGCAGTGCATGTCCGGATTTGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4DJ60TF 674 0 0
GGGAAAAAAAATGAGCGGAGCCGGTAAGAAAATAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAG
GACAATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTTCTTGTAACCGACGAGGCTCGAAGAGAGTT
CTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACACTCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCA
GGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAA*GGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGA
CATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTCGTGGACACTGTTACTCC
TGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACATAAATC
GCTCAAGCAGTCTGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTCCAGGAGATTAGCAAAAA
GCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTT
TGATGATGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATCATTGTTTCTTGTATCTTCGGC
CTGTGAAACATACATT*ACTTTTCTTTCTCATTTTTCTCTCTTTCTTTTACTGTGATTTT
GTGATAATAA***GTACACTCGGCTGTTGAGATTCATTGGAGACCCAATGAGACAATGAC
GATAAACCCATTTG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

CO CL3439Contig1 1117 4 16 U
GGAAAACGGCGACCAGTGTTTTCGAAACTCTCTCCTTACCTTCGAGACGAGACGAGACAA
TGGCATCTTCCACCGTCGCCGGAGCTCTGCTTACCGGTGGTTCTCGATTACCATGTTCGT
CCTCTCAAATACCTAGAAAGCTTTCTTCTTCTTCTTCATCACCACTCTTATGCCTCAACA
ATGGAGACCTCTCCGCACCGTATAATTCCCCTCTGCGACTATCTAGAGGCAGAGTTCAGA
CAACTCTCAGAAGTAACTCGAAGAGCTTGGCTGTGGGAAAGGGAGCTGAAGATGGCTTCG
TCTCGGATGTAAGTGAAGATAGTGATGAGATGTTCGACGACTTGTTCAACAAATATGGGA
AGGTTGTTTACAAGAGCGACGATGTAAAGTCTCCATCAGCTGAAGCTGATGATGACGCTG
AAAGTTTAGCATTTGCCGTTGAAATGGCTAAGGTTGCTAGTGAAGTGAAAGCCGGAGACA
TTAAGGTTCTCTTTGTGAAGCCTCTCGTCTACTGGACTCGTTTTTTCATCATAACCACTG
CATTTTCCCGCCCTCAAATCGATGCAATCGGGTCTAGGATGAGAGACCTAGCTGAGAAGA
AGTATGGGAGAGTTGCTAATGGAGATGTAAAGCCAAATGCATGGACATTGTTGGACTATG
GAGATGTGGTGATCCATATTTTCTTACCTCCACAAAGAACCTTCTATAACTTGGAAGATT
TCTACGGAAATGCCATGTCAGTTCCACTTCCATTTCAAGATGAACCACCACCTCGAAGTT
GATGCTATATTTGCTCCAGAAACAAAACAAAAGGCAAATAGTTTGTAAGAACTCTGTTGA
TCAGTGCCATTGTTCTGATGCTTTTACACAGCTCTCGGCTTAAGGGGTTCATGGATTTTG
TTGGCTAAGATGGTTCAACAACTCTCAGGGTATCTCGGATATGTTTTGTAGTTTCTATAT
AGATTAGAGTGAGACCATCTTTTTTTAAGGCTAGCTTGGCTCTTCATGGTGTTATGTACT
CAAGCTGTGTATTTTAGCCTATTAGATAGAATATTTTTAGTCCATGTTCAAATGAAATGA
ATTCAAAACTTATTTATCACAACCATTGGACGCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BI02TF U 4
AF RR4DE34TF U 1
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AF RR4DE34JQ C 368
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GGTG
GGCGACCAGTGTTTTCGAAACTCTCTCCTTACCTTCGAGACGAGACGAGACAATGGCATC
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C

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CGGATATGTTTTGTAGTTTCTATATAGATTAGAGTGAGACCATCTTTTTTTAAGGCTAGC
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TTTAGTCCATGTTCAAATGAAATGAATTCAAAACTTATTTATCACAACCATTGGACGCTA
CC

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DS 

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CCGCCCTCAAATCGATGCAATCGGGTCTAGGATGAGAGACCTGGCTGAGAAGAAGTATGG
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GGTGATCCATATTTTCTTACCTCCACAAAGAACCTTCTATAACTTGGAAGATTTCTACGG
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ACTTATTTATCAC

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DS 



AS 1 3

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AAGAACTAGACTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CW29JQ U 1
AF RR4EV23TF C 315
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BS 790 798 RR4CW29JQ
BS 799 799 RR4EV23JQ
BS 800 809 RR4CW29JQ
BS 810 810 RR4EV23TF
BS 811 821 RR4CW29JQ
BS 822 822 RR4EV23TF
BS 823 857 RR4CW29JQ
BS 858 858 RR4EV23TF
BS 859 862 RR4CW29JQ
BS 863 914 RR4EV23TF

RD RR4EV23JQ 558 0 0
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AGACCCAGCTTTGCTTCCACCAGACTCTTCCACGGAGCTTATATACCATCTTGGTGAGGA
TCTTCGTGTACAAAGAAACTGGCAGCAACTATCAAGTAACAAAGAATGAGCATCAATCCT
TTGAAGTAATTAGATGTCCCTTCCTGGAGGAAAAAAGCTACAACTATCACAGTTATGAAC
AGCATTGCCGTCTCAAAGAGCTGGAAGTTGAGGTCCATCTGCTCACCCATCATCCATCCA
ATCACCACACAGAACGGGACCACGAACATGGAGATCTGGATAGAGGAACCAATAGCCACA
CCTAATGACAGATCCAGTTTATCTTTCATGGCAAACATAATAGCTCCTGCATGCTCCGCT
GCATTCCCAACGATAGGAAGCAATATGACACTGATGAAGGCTATTGGTATGTTCCAAGAA
ACCGATGCACCCTCAATGGCATCAACAAGATAGCCAGAGAGAAGAGAGACCCAAGCAGTC
AAGATTGAGAGC
CATATT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4CW29JQ 862 0 0
GCTCCACAACGAATGTTAATTAACTAAATGTGTTCTCGGAAATTTAAAAAAAAAAATCGA
AACATGGTTGCTTGTTGTTCATTACAAGTCAGAGCAACGTGACAGCAAGAACACGAGAAA
CAAATCTTCGAACTTATGACACAGCAGATAAACAAAACGTGCAACCTTCTAAGGGACTAA
GGGAATGCCAAGAGGAATTAACTTTGAAAAGTTAAACAAATTCAAGTTTATGGAAAAACC
ACATTAGAATCAGGTTTACATCTTTAGCATTTCTCCCCTCAAAACTTCGTGTTCATGGAA
TCATCAGCGTGTAATTAAGACCCAGCTTTGCTTCCACCAGACTCTTCCACGGAGCTTATA
TACCATCTTGGTGAGGATCTTCGTGTACAAAGAAACTGGCAGCAACTATCAAGTAACAAA
GAATGAGCATCAATCCTTTGAAGTAATTCGATGTCCCTTCCTGGAGGAAAAAAGCTACAA
CTATCACAGTTATGAACAGCATTGCCGTCTCAAAGAGCTGGAAGTTGAGGTCCATCTGCT
CACCCATCATCCATCCAATCACCACACAGAACGGGACCACGAACATGGAGATCTGGATAG
AGGAACCAATAGCCACACCTAATGACAGATCCAGTTTATCCTTCATGGCAAACATAATAG
CTCCTGCATGCTCCGCTGCATTCCCAACGATAGGAAGCAATATGACACTGATGAAGGCTA
TTGGTATGTTCCAAGAAACCGATGCACCCTCAATGGCATCAACAAGATAGCCAGAGAGAA
GAGAGACC*AAGCAGTCA*GATTGAGAGC*ATATTATAGCT*CCCACTTAGAGATCTCTG
GATCTTCATCTTCAGCACATGT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4EV23TF 600 0 0
TTAAGACCCAGCTTTGCTTCCACCAGACTCTTCCACGGAGCTTATATACCATCTTGGTGA
GGATCTTCGTGTACAAAGAAACTGGCAGCAACTATCAAGTAACAAAGAATGAGCATCAAT
CCTTTGAAGTAATTAGATGTCCCTTCCTGGAGGAAAAAAGCTACAACTATCACAGTTATG
AACAGCATTGCCGTCTCAAAGAGCTGGAAGTTGAGGTCCATCTGCTCACCCATCATCCAT
CCAATCACCACACAGAACGGGACCACGAACATGGAGATCTGGATAGAGGAACCAATAGCC
ACACCTAATGACAGATCCAGTTTATCTTTCATGGCAAACATAATAGCTCCTGCATGCTCC
GCTGCATTCCCAACGATAGGAAGCAATATGACACTGATGAAGGCTATTGGTATGTTCCAA
GAAACCGATGCACCCTCAATGGCATCAACAAGATAGCCAGAGAGAAGAGAGACCCAAGCA
GTCAAGATTGAGAGCCATATTATAGCTTCCCACTTAGAGATCTCTGGATCTTCATCTTCA
GCAAATGTCTCTTCGGTCTGGTTCGTTTCCTCTTCAAGAGGGCTATAAGAACTAGACTGC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL3441Contig1 1363 3 3 U
GGATTTTCATGTTCATTTCATTCGCCTAAAGTTCTAGTTTCTCCATGCGCGTTGTTGAAT
TGAAGCTTCTACCATTTTCAAGTCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTC
AAAATATATGTAACTAATGCGTTGAATAATAATACGTTTCGAGAAGGCTTTGAAGCTATC
TCGTTAGAGATTACAATATTGTTAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCGCACCAGCC
TGATGATGGTTCTCAGCATGATAACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCT
CTCTGGACATAGTTCAGTATTCTGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATCTGGCTGCTCG
TAACTGGAATGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAAC
ATACAAACCTCAAGAGATCCGATGGAATGAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGCAAAGT
TTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGGGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATT
ACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGC
AATCCTCAATCTTCCCAAGGGACAAGAACAAATGCCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTG
GTCTATGGCTACTAATGTCCCTATGAAAACAACACGAGAGATCGTCTACATTCTACAGAA
TCATTACCCTGAGAGACTCGGTATTGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGC
AGTCTACAAG*CTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGT
GTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAGAATCT
TCCCAAGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACA
AATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTTCTGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCC
GAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTTTATTGCATC
AGCAGCTAGCTGAGTTATATATATACACACAGAAACAAGAAGAGATGAATAGTAAAGGTT
TATTTTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATTAATAAGGTT
CCAAGTCTTTGCTTAGTGAGCCAAATACATTTTAAAATATGTTATAATTAACAGAGACGT
TCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATGTGTAATTGTTTTGTGTT
TAGTAATTGAAGCTAGCAGAGTAATCCTTTTATTTATGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A023TFB U 1
AF RR4A023TF U 286
AF RR4C701JQ C 758
BS 1 823 RR4A023TFB
BS 824 848 RR4A023TF
BS 849 1363 RR4C701JQ

RD RR4A023TFB 823 0 0
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TGAAGCTTCTACCATTTTCAAGTCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTC
AAAATATATGTAACTAATGCGTTGAATAATAATACGTTTCGAGAAGGCTTTGAAGCTATC
TCGTTAGAGATTACAATATTGTTAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCGCACCAGCC
TGATGATGGTTCTCAGCATGATAACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCT
CTCTGGACATAGTTCAGTATTCTGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATCTGGCTGCTCG
TAACTGGAATGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAAC
ATACAAACCTCAAGAGATCCGATGGAATGAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGCAAAGT
TTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGGGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATT
ACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGC
AATCCTCAATCTTCCCAAGGGACAAGAACAAATGCCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTG
GTCTATGGCTACTAATGTCCCTATGAAAACAACACGAGAGATCGTCTACATTCTACAGAA
TCATTACCCTGAGAGACTCGGTATTGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGC
AGTCTACAAG*CTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4A023TF 563 0 0
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GTATCTGGCTGCTCGTAACTGGAATGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCT
TAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATCCGATGGAATGAAGTAGCACATGAAGG
TGAGACCGGCAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGGGTAGTGCTTAT
AATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTA
TCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGACAAGAACAAATGCCTTGGCTCAT
TGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTACTAATGTCCCTATGAAAACAACACGAGAGATCGT
CTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATTGCCTTTCTCTACAATCCACC
AAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAG*CTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCA
AAAGGTCAAATTTGTGTACCCTA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4C701JQ 606 0 0
AATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGT
ACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATGACA
TCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAAGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTAT
GATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTTCTGG
GGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCT
GAGCCAGCCACTTTTATTGCATCAGCAGCTAGCTGAGTTATATATATACACACAGAAACA
AGAAGAGATGAATAGTAAAGGTTTATTTTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGT
TTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAGCCAAATACATTTTAAAA
TATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTT
ACCATGTGTAATTGTTTTGTGTTTAGTAATTGAAGCTAGCAGAGTAATCCTTTTATTTAT
GATGAC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 4

CO CL3442Contig1 697 4 1 U
GGATCAAACCTTGTTCATTAGATATTTCTTCTTATTATTCTAAGCAAACAAAAGAGTTTT
TTTTTATAGTAATTAAGGAAATGGAGGAAACGAAGGAGAGAAAGATTGTAGTAGCCGTGG
ACGAAAGCGAAGAGAGCATGGAAGCACTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATG
GTTCCAATAACACCCTAATCCTCCTTTACGTCAAGCCCCCTCTTCCTGTTTACTCTTCCA
TTGACACCGCAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCGCTGAAGAAATATGAAC
ACGAGCTTGTGGAATCGGTCACGGCTCGATCTCGAACCGTCTATCAAGATTTTGAGTCCG
ATATTAATATAGAGAGAAGAGTTGAAAGAGGAGATGCTAAGGAAGTCATATGTAACGCAG
TTCAGAAACTTAAGGCTGATATGTTAGTTATTGGCACACATGACTATGGCTTCTTTAAAA
GGGCTTTGCTAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAAAGAGTGAAATGTCCTGTGATTA
TCGTGAAGAAGAATCCTCAATACAATTGAACGCAAAAGTCTTACTTCTTAGGATTGTGTG
TATGTTTCAAAGCAATTAATGTAACAGTTAAATCAATCTTCGATATATATATTAATGATC
AGTTTAAATTCTAAATAAAATTGGCGGATTATGATCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GM31TF U 1
AF RR4DN58JQ C 1
AF RR4DN58TF U 1
AF RR4GM31JQ C 1
BS 1 697 RR4DN58TF

RD RR4GM31TF 658 0 0
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QA 1 658 1 658
DS 

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QA 1 697 1 697
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QA 1 697 1 697
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AGTTTAAATTCT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 4

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TTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4EM49TF U 1
AF RR4FH75JQ C 144
AF RR4FH75TF U 1
AF RR4EZ89TF U 1
BS 1 41 RR4EM49TF
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QA 1 629 1 629
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TTT

QA 1 486 1 486
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TTT

QA 1 629 1 629
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AATTAATGTTTATGAAACTTGAGTTTTTTTCTTCTTGTCATTTCAGCCAAGTTATCTTTC
GAGCTTGGTATTAGAAGCTATACATATACACCAGATTATTGTAATAAGATATGAGTCTCA
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TTGAT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 4

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BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FN76TF U 1
AF RR4F713TF U 1
AF RR4FN76JQ C 150
AF RR4F713JQ C 4
BS 1 336 RR4F713TF
BS 337 339 RR4FN76TF
BS 340 347 RR4F713TF
BS 348 348 RR4FN76TF
BS 349 353 RR4F713TF
BS 354 354 RR4FN76TF
BS 355 454 RR4F713TF
BS 455 455 RR4FN76TF
BS 456 465 RR4F713TF
BS 466 466 RR4FN76TF
BS 467 699 RR4F713TF
BS 700 803 RR4F713JQ

RD RR4FN76TF 586 0 0
GGA
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AATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAAT

QA 4 586 4 586
DS 

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CTCTACAGACTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCA
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CATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGC
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GCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAA
AAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGAT
GTTTACTGTTATCTTGAACTGTCTAACAATATGATGTTCTTGGTAAATGTGAAGTGTAGT
TAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGT

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DS 

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GAGACCGATGAGAGGAAATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATA
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C

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DS 

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CCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATGGATTTC
TCTAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGCGCCAGTCTTGGC
AACGACGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGTTGATAATGCTAAG
CCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAAC***AAAACCCATAATGAGTTCTCTCAT
CACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTT
AAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACGGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCT
GTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAA
AATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGATGTT
TACTGTTATCTTGAACTGTCTAACAATATGATGTTCTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAG
TTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATA
TTGTGTAATGCCATCATAGCAGATATGTGATACATATATGTGATACATTACCACGATGCA
TTCAGATTATAAAAGTAAAA

QA 1 800 1 800
DS 



AS 2 4

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CGAAGCCTCGTCTACTTTCTTCGTCGCTGCCAATAGCCTACTTTCCCCTACAGAACCCTA
ACAGCAAGGTGAAGGTAAAGAGATTAATTTGCAGAGCGGAGTTTTCCCAGGACGCGCCGC
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TCAGCTCAAACCTATCCATATCCCCGGAAGAAAGCTGGTTGCCTGTTACAAGCATCGTCT
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GGAATAAAATTAAAAAATGTTTTGATGATGAGTTAAGTTTTGTAACAGGCTCTTTTTTTT
TTAACCCAAACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW45TF U 1
AF RR4CW45JQ C 19
BS 1 684 RR4CW45TF
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RD RR4CW45TF 710 0 0
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GGCTTGACACTGGGAAAACGCGTTACTCTGTCTATGCTCTCGTTTATCTCCTTCCCTATC
TCAGCTCAAACCTATCCATATCCCCGGAAGAAAGCTGGTTGCCTGTTACAAGCATCGTCT
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CATTCTTCAAAGACGCATCTCAAA*CTTTTCTTCAA
GAGAACTCCATTTG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4CW45JQ 834 0 0
T
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CAAAATCAAAATCAAAATCAAAATCAAGGAAGCTGAGAGCTGAAGAAAATCAATGGCGTC
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TTCGTCGCTGCCAATAGCCTACTTTCCCCTACAGAACCCTAACAGCAAGGTGAAGGTAAA
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ATCCCCGGAAGAAAGCTGGTTGCCTGTTACAAGCATCGTCTTGGGAATCATTCATGTTCA
GCTTGAAGCAAGTTTTGCAAATGGTGATATTCAGACTCTTGCATTCTTCAAAGACGCATC
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TTTTGATGATGAGTTAAGTTTTGTAACAGGCTCTTTTTTTTTTAACCCAAACG

QA 2 834 2 834
DS 



CO CL3445Contig2 777 2 2 U
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CTAGGTGGCTTTCATTCCACCACGGTTCTCTTTATGCGAAACCTCGTCTACTTTCTTCGT
CGCTGCCGCTAGCCTACTATCTCCTACAAAACCCTAGCAACAAGGTGAGTAGGAAGGTGA
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TGGGAATCATCAGCTTCATCCCTTACTTCAATTGGCTGAGTTGGGTCTTCGCTTGGCTTG
ACACTGGGAAAACGCGTTACTCTGTCTATGCTCTCGTTTATCTCCTTCCCTATCTCAGCT
CAAACCTATCGATATCCCCGGAAGAAAGCTGGTTGCCTATTACAAGCATCGTCTTGGGAA
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TCAAAGACGCATCTCAACACTTTTCTTCAAAGAAGAAACTCCATTTTGATTCCAAGGAGA
AAGACGGTGACGATTAAAAAAACCTAAAGGAAGGCCCCAAAGACACCAAGATGGGAATAA
AATGAAATAATGTTATGATGATTGAGTTAAGTTTTGTAACAGGTCCTTTTTTAACCC


BQ
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DS 



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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G267TF U 1
AF RR4EH32TF U 598
AF RR4G267JQ C 1047
AF RR4EH32JQ C 885
BS 1 682 RR4G267TF
BS 683 683 RR4EH32TF
BS 684 707 RR4G267TF
BS 708 708 RR4EH32TF
BS 709 735 RR4G267TF
BS 736 736 RR4EH32TF
BS 737 741 RR4G267TF
BS 742 742 RR4EH32TF
BS 743 754 RR4G267TF
BS 755 1168 RR4EH32TF
BS 1169 1169 RR4EH32JQ
BS 1170 1226 RR4EH32TF
BS 1227 1227 RR4EH32JQ
BS 1228 1247 RR4EH32TF
BS 1248 1579 RR4EH32JQ

RD RR4G267TF 754 0 0
GGGATCTTTACTGTTTTCGAGGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAA
CCCTAACTTCATCTCTCTGATTCTTATCGGCCTTGTCGCGATCGCATCTGCTAGCGTTAT
CTTCGAGGAGAAATTCGATGATGGATGGGAGAACAGATGGGTGAAATCTGACTGGAAGAA
AGATGACAACACTGCTGGGGAATGGAGCCACACTGCTGGGAACTGGTCTGGTGACGCTAA
CGACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATATCAGCTGAGTTCCC
TGAGTTCACCAACAAGGACAAGACCCTTGTTTTCCAGCTCTCCGTCAAGCACGAGCAGAA
GCTGGACTGTGGTGGAGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAAGT
CGGTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTCGGTCCTGATATCTGTGGCTACGACACCAA
GAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCC
ATGTGAGACTGATCAGCTCACACACGTCTACACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTA
CAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGATCT
CCTCCCAGCCAAGAAGATTAAG*ATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGGCTGGGATGACAA
AGAGTACATTCCTGATCCTGA*GACACAAAGCCA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4EH32TF 650 0 0
G
TACAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAATCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGAT
CTCCTCCCAGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGAC
AAAGAGTACATTCCTGACCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATACGATGACATCCCAAAG
GAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGATGAAGAAAATGGTGAG
TGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATC
AAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAG
GATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTCGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTG
AAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGACTACGCTAAGAAG
TTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCT
GAGAAGAAGCGAGAGGAAGAGGAATCAAAG*ATGCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAG
GATGAACAAGATGACGATGACCATGAAG*AGATGAATCCGACACTGAAT

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR4G267JQ 391 0 0
TAGTCTGCGATGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCA
AGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAA
AGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAG
GAGATGAATCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACA
AGGATGATGCCGCCCATGACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCA
ACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTT
TGTTGGGGATGTTAGAACTTTTTTAGCTACC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR4EH32JQ 695 0 0
AGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACA
ACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTCGGAGTAG
AGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTG
ACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAG
CATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGCGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTG
ATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTG
AATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATG
ACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGT
ATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGAAC
TTTTTTAGCTACCAAAAAAAAGAATATGGTGAAATGATGGGCGTGGCAGCTTCTTTTAGA
CTTTGATAAATTCCTGACTTTCTGATACCCTCTCATCTGTACGTTCTTTCTATGGACCAA
CAATAGATCCACTCTTGAGCAACCCATTGAGACTC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

CO CL3447Contig1 693 4 11 U
GACCCACAATAAGACTGAAGCAAACACAGAATATGTACCGATCCGCAAGCTGGAGCCGTG
TGACTGAGGATTACTCAGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTAGATG
AAGACGAGCCGACTACATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAGTCGC
GCGCCAAGTTTGCTGAAAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTC
TAGTCCTTTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGGGTAAAAGAGGAATCCATTG
CGGCTAGGATCAAAGGATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACATCGACGGAACTC
AGACCGGCTTCTTAGGCACTGCCGCAGAAGTGGGAGGTTCATACAAGTCGAAGCTAAAAC
GCGACGTTAATAAGCGTCATCGGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGGTTTT
ATTAGTTTTTTGGGTAAAAAAGGAGTTCCCTACATTAGTTAACACCTTAATCGATTTTTA
TTTCCTAGTTTCCCGTATTTTGATTGAGATGTGTTACTTTGGTTACGTTTTGCTTTATGT
TTTCACAAATTTTGACCCGCCCTTTTGAAGCGCGGGATATTTTACGATGAAAAATTTCAC
TAATAATTTAACAAATATTTTGGTTATTTTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GO81JQ C 68
AF RR4GO81TF U 82
AF RR4G556JQ C 1
AF RR4G556TF U 1
BS 1 81 RR4G556TF
BS 82 162 RR4GO81TF
BS 163 163 RR4G556TF
BS 164 181 RR4GO81TF
BS 182 182 RR4G556TF
BS 183 348 RR4GO81TF
BS 349 349 RR4G556TF
BS 350 490 RR4GO81TF
BS 491 491 RR4G556TF
BS 492 545 RR4GO81TF
BS 546 693 RR4G556TF

RD RR4GO81JQ 230 0 0
GGATTATTCAGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTAGATGAAGACGA
GCCGACTACATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAATAAAGAAAGAGAAGTCGCGTGCCAA
GTTTGCTGAAAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTCTAGTCCT
TTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGGGTAAAAGAGGAATCCA

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR4GO81TF 464 0 0
CTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTAGATGAAGACGAGCCGACTACATACG
ATCCTACGAGCCAGGAGGTAATAAAGAAAGAGAAGTCGCGTGCCAAGTTTGCTGAAAATG
CTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTCTAGTCCTTTGGTTTTTCTCTA
ATCCAAATGTGGATGTTGGGGTAAAAGAGGAATCCATTGCGGCTAGGATCAAAGGATTGA
CGATTGAAGGAGACATTGACAACGACAGCGACGGAACTCAGACCGGCTTCTTAGGCACTG
CCGCAGAAGTGGGAGGTTCATACAAGTCGAAGCTAAAACGCGACGTTAATAAGCGTCATC
GGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGGTTTTATTAGTTTTTGGGGTAAAAAA
GGAGTTCCCTACATTAGTTAACACCTTAATCGATTTTTATTTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4G556JQ 693 0 0
GACCCACAATAAGACTGAAGCAAACACAGAATATGTACCGATCCGCAAGCTGGAGCCGTG
TGACTGAGGATTACTCAGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTAGATG
AAGACGAGCCGACTACATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAGTCGC
GCGCCAAGTTTGCTGAAAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTC
TAGTCCTTTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGGGTAAAAGAGGAATCCATTG
CGGCTAGGATCAAAGGATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACATCGACGGAACTC
AGACCGGCTTCTTAGGCACTGCCGCAGAAGTGGGAGGTTCATACAAGTCGAAGCTAAAAC
GCGACGTTAATAAGCGTCATCGGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGGTTTT
ATTAGTTTTTTGGGTAAAAAAGGAGTTCCCTACATTAGTTAACACCTTAATCGATTTTTA
TTTCCTAGTTTCCCGTATTTTGATTGAGATGTGTTACTTTGGTTACGTTTTGCTTTATGT
TTTCACAAATTTTGACCCGCCCTTTTGAAGCGCGGGATATTTTACGATGAAAAATTTCAC
TAATAATTTAACAAATATTTTGGTTATTTTTAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4G556TF 693 0 0
GACCCACAATAAGACTGAAGCAAACACAGAATATGTACCGATCCGCAAGCTGGAGCCGTG
TGACTGAGGATTACTCAGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTAGATG
AAGACGAGCCGACTACATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAGTCGC
GCGCCAAGTTTGCTGAAAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTC
TAGTCCTTTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGGGTAAAAGAGGAATCCATTG
CGGCTAGGATCAAAGGATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACATCGACGGAACTC
AGACCGGCTTCTTAGGCACTGCCGCAGAAGTGGGAGGTTCATACAAGTCGAAGCTAAAAC
GCGACGTTAATAAGCGTCATCGGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGGTTTT
ATTAGTTTTTTGGGTAAAAAAGGAGTTCCCTACATTAGTTAACACCTTAATCGATTTTTA
TTTCCTAGTTTCCCGTATTTTGATTGAGATGTGTTACTTTGGTTACGTTTTGCTTTATGT
TTTCACAAATTTTGACCCGCCCTTTTGAAGCGCGGGATATTTTACGATGAAAAATTTCAC
TAATAATTTAACAAATATTTTGGTTATTTTTAT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 4

CO CL3448Contig1 927 4 6 U
GGATTTACGTAAAAGATCAATAACAATGAAATTTTCATTTTCTCTATCCAAACGATTTTC
TTTGCCTATTTTGATTCTACAATTCCTCATCATACATAGTGTTTCATCTTTAAACCTTAC
CAATGAGTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTAATCAAGGGAAGTATAAGCCTGGAAGTCA
GTATGAGGAAAACCTCATCTGGATCTTCGATCGTATTCGTAATTATCCTTATAAGCTCAC
CAGTTCCTCACACTTAACAGTTGAAGAAACGCCAGCCGATTTTGTTACCGTCACTTCCCA
GTGTCGTGGTGACACTCATGAGTCTAAATGCCGTACATGCATTGATACCGCAATTTCAGG
GTTTCAAAAGAGATGTCCAAATAACAAAGGAGGAATAATATGGTACGATCAATGTCTTCT
CTATATTAATACAATCAGAGAAAAAGATCTAGCCCCGACTAACTACAAGAATATTATTTC
TATGCACAACCCAAATAATGTGAGAGGGGATGCAAAACTGTTCGCCATGAGGGTGATGGA
ATTTTTCTCTGAGTTAACACTTAAAGCCATGAAAACCACCAAGTATAGCATCATATTTTA
TGCGGCAGGGGAAAAGAAGCTCGGAAAAAATAAATTATATGCAATGGTGCAATGTTTAGA
ACTAACAATGGATTGCAAAGGTTGTTTGACATGGAGTATTTCAAAGCTTTTCGAGAACGG
GATTAAACAAGGAGCAAGAGTTTTGGGTACAGACTGTGATGTAAGGTATGAGCTATACCC
TTTTTTTAGGAGTTGAGCATTTTTAAGTTATGTTTTAGTTTTTTTTTTTTTGCTGAAATG
TAATATCTTATCAATAAAAAGAGTGTTTACAGATCGAAAGAATTTGTTTAGAAGTTCAAA
ATTGAATATTAACAATGATTTTCAACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS47TF U 1
AF RR4FQ59TF U 1
AF RR4FS47JQ C 578
AF RR4FQ59JQ C 417
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BS 701 705 RR4FQ59TF
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CAGTTCCTCACACTTAACAGTTGAAGAAACGCCAGCCGATTTTGTTACCGTCACTTCCCA
GTGTCGTGGTGACACTCATGAGTCTAAATGCCGTACATGCATTGATACCGCAATTTCAGG
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DS 

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DS 

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TTTATGCGGCAGGGGAAAAGAAGCTCGGAAAAAATAAATTATATGCAATGGTGCAATGTT
TAGAACTAACAATGGATTGCAAAGGTTGTTTGACATGGAGTATTTCAAAGCTTTTCGAGA
ACGGGATTAAACAAGGAGCAAGAGTTTTGGGTACAGACTGTGATGTAAGGTATGAGCTAT
ACCCTTTTTTTAGGAGTTGAGCATTTTTAAGTTATGTTTTAGTTTTTTTTTTTTTGCTGA
AATGTAATATCTTATCAATAAAAAGAGTGTTTACAGATCGAAAGAATTTGTTTAGAAGTT
CAAAATTGAATATTAACAATGATTTTCAACT

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DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RR4BL87JQ C 1
AF RR4CY84JQ C 1
AF RR4BL87TF U 1
AF RR4CY84TF U 1
BS 1 401 RR4BL87TF

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DS 

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QA 1 401 1 401
DS 

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TTTAGTTTTGGCCTCGTTTGGCTCTCGTGCCATGAGGCGTTTTGGAATGTTGTTGATTTG
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QA 1 401 1 401
DS 

RD RR4CY84TF 401 0 0
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TGTATAAATATAACCAAGTGAATCATGAAGAGTTACAGACG

QA 1 401 1 401
DS 



AS 1 4

CO CL3450Contig1 1330 4 14 U
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AGGGTGTTCGTCTCGTTAATGTAGCTAGAGGCGGCGTCATCGATGAGGATGCGTTAGTTA
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CATCGAAAGAGAGTAGATTGATTCAACATGAGAATGTTACAGTCACACCTCATCTCGGAG
CTAGCACCAAAGAGGCACAGGAAGGTGTAGCCATCGAGATAGCAGAGGCTGTAGCAGGGG
CACTAAAAGGCGAGCTATCAGCAACTGCAGTCAACGCTCCAATGGTTGCTCCCGAGGTCT
TATCTGAGCTGGCTCCTTACATCGTCTTAGCCGAGAAGCTTGGTAGGTTAGCTGTGCAGC
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GAGACGATTTGGACACTAGACTACTTCGTGCTATGATCACGAAGGGAATCATTGAACCCA
TCTCAGACTCTTATGTCAACCTGGTGAACGCTGACTTCATAGCTAAGCAAAAGGGTCTCA
GAATCAGCGAGGAACGAACCGTGGTCGAGTCATCACCGGAGTACCCTGTTGACTCCATCT
AAGTTCAGATCTCTAACGTGGAGTCAAGTTTCGCTGGGGCTGTCTCTGATGGTGGTGCTA
TAAGCATCGAAGGGAAGGTGAAATATGGAGTGCCGCATTTGACTTGCGTTGGGTCGTTCG
GTGTGGACGTGACCCTTGAAGGGAATCTGATACTGTGCAGACAGGTGGATCAGCCAGGGA
TGATTGGACAAGTAGGTAACATTCTCGGAGAGCAGAACGTGAATGTGAGCTTCATGAGTG
TTGGAAGAACGGTTGTTAGGAAGCAAGCTATCATGGCGATAGGAGTGGATGAAGAACCAG
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AACTATGAAAGTTCGAGATTGGTGGCGTCTGAGAATAAATGGTGACCCGGATTTTAAAGG
TGTTTGTGTCCAGTGGTCAAGCTGTAGGAAAATGTGTGGCATTGCGATTTGAATGTGGTA
CTTTTGTTCTTGTTTTGGTAATGATGCTTTTGGTTAATATAATGTTTCACTTGTTTCTTG
ATATTCACTAATATGTTACTATGATCTGTAACCACTATTTTGATGTATGAATTGGCATTA
AGTTTGATAAAACATATATGATGTAATCCAAGAAGCCTTTTTATTGTTATAAATCAAAAT
TGTTGGGGAG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GAGGCGGCGTCATCGATGAGGATGCGTTAGTTAGGGCTCTTGACTCGGGAGTTGTGGCCC
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TAGCCATCGAGATAGCAGAGGCTGTAGCAGGGGCACTAAAAGGCGAGCTATCAGCAACTG
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TAGCCGAGAAGCTTGGTAGGTTAGCTGTGCAGCTAGCATCTGGAGGTAAGGGAGTACAGT
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AGGGAGTACAGTCCATCAAGGTCGTGTACCGCTCAGCTCGTGACAGAGACGATTTGGACA
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TCAACCTGGTGAACGCTGACTTCATAGCTAAGCAAAAGGGTCTCAGAATCAGCGAGGAAC
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DS 

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CACTATTTTGATGTATGAATTGGCATTAAGTTTGATAAAACATATATGATGTAATCCAAG
AAGCCTTTTTATTGTTATAAATCAAAATTGTTGGGGAG

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DS 



AS 0 0

AS 1 4

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GGGAGAAAAGCAAGGTCCTCGGATTCCCTGCCGGAGTCTGTCCGACGGTCGGCGTCGGAG
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TGAGAGCCACTGTGGTGGCTCTGTACTTAGGGAAAGCAGACGACGTCGTTTCGCTGCTTA
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AGTCTGCTCTGTGGTGGGACAATCGCGTCAACGCAACTGAGACCGATCCCAAAGTGTTTC
TTGATCGGAATCTCGACTCCTCTAGCCCCGGGAAGAGGAAGTCGGATTACGTGGAGACAG
AGATTCCAAGAAACGGGTTAGAGTCTCTGTTCAATAAGATGATTGAGTTAGGGAAGATCG
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TCCCGCACAGGAACATGCTTTACAAGATTCAGTACTCTGTGAACTGGAAAGAATCGTCTC
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TTGTGAGCAAGAACCCTAGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTGATGTGGATATTGGGG*TG
AATGATCATGGGGAGGATAGTTACAAGGAAGGAGAGGTGTATGGAAGGATGTATTTTGGT
AAGAACTTTGATCGGTTAGTGAAGATTAAAACGGCTGTGGATCCAGATAATTTCTTCAGG
AATGAGCAGAGTATACCTACCTTGCCAAGTAAGGCATAATAAGATACATATATTGTTTAT
CATTTTGATATAAAGATTGGTTTTTACTTTTAATGTAATGCTTTGGTGAAGCAATATGGA
ATGTATGGTTTTGGATATTTGTATATTGAAATAGTTTCTATGTTTCATGG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DB77TF U 1
AF RR4AI67TF U 367
AF RR4AI67JQ C 432
AF RR4DB77JQ C 610
BS 1 700 RR4DB77TF
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BS 1018 1018 RR4AI67JQ
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BS 1045 1306 RR4AI67JQ
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GGGAGAAAAGCAAGGTCCTCGGATTCCCTGCCGGAGTCTGTCCGACGGTCGGCGTCGGAG
GTCACCTGAGCGGCGGCGGGTACGGTAACATGGTGAGGAAGTTCGGATTGACTGTCGATC
ACTTCATCGATGCGAAGATTGTTGATGTAAACGGCGCCGTTTTGGACCGGAAAGCGATGG
GGGAAGATCTTTTTTGGGCTATCTCCGGCGGCGGGGGAGGAAGCTTCGGCGTCGTTTTGG
GTTACAAGGTCAAGCTCGTCCCGGTACCAGCAACCGTGACGGTGTTCCGGGTGGAGCAGT
TGATGGCTGACGGAGCGGTGGACATGGTTCACAAGTGGCAGTTCGTTGGTCCTAAAACCG
ACAAGAATCTGTTCATGAGGATGCTGATTCAGCCGGTGACGAGGAACAAGAAGAAGACGG
TGAGAGCCACTGTGGTGGCTCTGTACTTAGGGAAAGCAGACGACGTCGTTTCGCTGCTTA
GTAAAGAGCTTCCTGAGCTGGCTCTTAAGAAGGAGAACTGTACGGAGATGACTTGGTTCC
AGTCTGCTCTGTGGTGGGACAATCGCGTCAACGCAACTGAGACCGATCCCAAAGTGTTTC
TTGATCGGAATCTCGACTCCTCTAGCCCCGGGAAGAGGAA

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DS 

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CCACTGTGGTGGCTCTGTACTTAGGGAAAGCAGACGACGTCGTTTCGCTGCTTAGTAAAG
AGCTTCCTGAGCTGGCTCTTAAGAAGGAGAACTGTACGGAGATGACTTGGTTCCAGTCTG
CTCTGTGGTGGGACAATCGCGTCAACGCAACTGAGACCGATCCCAAAGTGTTTCTTGATC
GGAATCTCGACTCCTCTAGCCCCGGGAAGAGGAAGTCGGATTACGTGGAGACAGAGATTC
CAAGAAACGGGTTAGAGTCTCTGTTCAATAAGATGATTGAGTTAGGGAAGATCGGGCTCG
TTTTCAACCCTTACGGTGGAAGAATGACGGAGATAGCGGAGGACGCGACGCCGTTCCCGC
ACAGGAACATGCTTTACAAGATTCAGTACTCTGTGAACTGGAAAGAATCGTCTCCGGAGC
TAGAGAAGGGTTACTTGAACGAAGCCAGAGTGCTTCACAGTTTCATGACCGGGTTTGTGA
GCAAGAACCCTAGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTGATGTGGATATTGGGGGTGAATGAT
CATGGGGAGGATAGTTAC

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DS 

RD RR4AI67JQ 876 0 0
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GTGGTGGCTCTGTACTTAGG*AAAGCAGACGACGTCGTTTCGCTGCTTAGTAAAGAGCTT
CCTGAGCTGGCTCTTAAGAAGGAGAACTGTACGGAGATGACTTGGTTCCAGTCTGCTCTG
TGGTGGGACAATCGCGTCAACGCAACTGAGACCGATCCCAAAGTGTTTCTTGATCGGAAT
CTCGACTCCTCTAGCCCCGGGAAGAGGAAGTCGGATTACGTGGAGACAGAGATTCCAAGA
AACGGGTTAGAGTCTCTGTTCAATAAGATGATTGAGTTAGGGAAGATCGGGCTCGTTTTC
AACCCTTACGGTGGAAGAATGACGGAGATAGCGGAGGACGCGACGCCGTTCCCGCACAGG
AACATGCTTTACAAGATTCAGTACTCTGTGAACTGGAAAGAATCGTCTCCGGAGCTAGAG
AAGGGTTACTTGAACGAAGCCAGAGTGCTTCACAGTTTCATGACCGGGTTTGTGAGCAAG
AACCCTAGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTGATGTGGATATTGGGG*TGAATGATCATGG
GGAGGATAGTTACAAGGAAGGAGAGGTGTATGGAAGGATGTATTTTGGTAAGAACTTTGA
TCGGTTAGTGAAGATTAAAACGGCTGTGGATCCAGATAATTTCTTCAGGAATGAGCAGAG
TATACCTACCTTGCCAAGTAAGGCATAATAAGATACATATATTGTTTATCATTTTGATAT
AAAGATTGGTTTTTACTTTTAATGTAATGCTTTGGTGAAGCAATATGGAATGTATGGTTT
TGGATATTTGTATATTGAAATAGTTTCTATGTTTC
C

QA 1 875 1 875
DS 

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ATCTCGACTCCTCTAGCCCCGGGAAGAGGAAGTCGGATTACGTGGAGACAGAGATTCCAA
GAAACGGGTTAGAGTCTCTGTTCAATAAGATGATTGAGTTAGGGAAGATCGGGCTCGTTT
TCAACCCTTACGGTGGAAGAATGACGGAGATAGCGGAGGACGCGACGCCGTTCCCGCACA
GGAACATGCTTTACAAGATTCAGTACTCTGTGAACTGGAAAGAATCGTCTCCGGAGCTAG
AGAAGGGTTACTTGAACGAAGCCAGAGTGCTTCACAGTTTCATGACCGGGTTTGTGAGCA
AGAACCCTAGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTTATGTGGATATTGGGG*TGAATGATCAT
GGGGAGGATAGTTACAAGGAAGGAGAGGTGTATGGAAGGATGTATTTTGGTAAGAACTTT
GATCGGTTAGTGAAGATTAAAACGGCTGTGGATCCAGATAATTTCTTCAGGAATGAGCAG
AGTATACCTACCTTGCCAAGTAAGGCATAATAAGATACATATATTGTTTATCATTTTGAT
ATAAAGATTGGTTTTTACTTTTAATGTAATGCTTTGGTGAAGCAATATGGAATGTATGGT
TTTGGATATTTGTATATTGAAATAGTTTCTATGTTTCATGG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 4

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TTTTACCAACACTTTGGTGTTTTTTTAAATCTTTAAGTGAGCAATGGGAAGAAAGGCTGG
AAATTTGTACATAAACCCGAAAAAGCTAGGCGGTATAGCGAAACCATGTATGAAGGAGAT
GGTGTCGTTCCTCAACTGCATGGCTCTCAACAAATGCAAAGATGATAACTGCGAGAAACA
GAAGAACCTCCTTAGCGTTTGTATGAACGGACATGCGGAGAAGTCCAAGCCGTGGGGAAA
CATTAACTACCATTTGCAGAGGCTAACCCGCGGAAGAAAGTAATGTGGCATATGGATCCA
TAGCCTGATGGGTCAATTGGTAGTTATAATGGTCTTATTGATTTCTATGTTTCTTTCCCA
GTGTTTTTGGGGTACTTCATATTTATATGTTGTTGGCATCTAGAATAAGAAGTAGAAACT
TTGGACATATTGTTCACTTAAAGAGAAAGGATTTGGTCTCTTTGTTTTTGCAATAAACAT
GTCTTCTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4BD95JQ C 1
AF RR4BD95TF U 1
BS 1 6 RR4BD95JQ
BS 7 550 RR4BD95TF
BS 551 552 RR4BD95JQ

RD RR4BD95JQ 552 0 0
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TTTTACCAACACTTTGGTGTTTTTTTAAATCTTTAAGTGAGCAATGGGAAGAAAGGCTGG
AAATTTGTACATAAACCCGAAAAAGCTAGGCGGTATAGCGAAACCATGTATGAAGGAGAT
GGTGTCGTTCCTCAACTGCATGGCTCTCAACAAATGCAAAGATGATAACTGCGAGAAACA
GAAGAACCTCCTTAGCGTTTGTATGAACGGACATGCGGAGAAGTCCAAGCCGTGGGGAAA
CATTAACTACCATTTGCAGAGGCTAACCCGCGGAAGAAAGTAATGTGGCATATGGATCCA
TAGCCTGATGGGTCAATTGGTAGTTATAATGGTCTTATTGATTTCTATGTTTCTTTCCCA
GTGTTTTTGGGGTACTTCATATTTATATGTTGTTGGCATCTAGAATAAGAAGTAGAAACT
TTGGACATATTGTTCACTTAAAGAGAAAGGATTTGGTCTCTTTGTTTTTGCAATAAACAT
GTCTTCTGAGCC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4BD95TF 552 0 0
GGACCT
GCGATTCTTCTCCATTTCTCCAGCGTCTTGTCAAAAATCAATCCTTGATTCCGCTTTTAC
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GTTCCTCAACTGCATGGCTCTCAACAAATGCAAAGATGATAACTGCGAGAAACAGAAGAA
CCTCCTTAGCGTTTGTATGAACGGACATGCGGAGAAGTCCAAGCCGTGGGGAAACATTAA
CTACCATTTGCAGAGGCTAACCCGCGGAAGAAAGTAATGTGGCATATGGATCCATAGCCT
GATGGGTCAATTGGTAGTTATAATGGTCTTATTGATTTCTATGTTTCTTTCCCAGTGTTT
TTGGGGTACTTCATATTTATATGTTGTTGGCATCTAGAATAAGAAGTAGAAACTTTGGAC
ATATTGTTCACTTAAAGAGAAAGGATTTGGTCTCTTTGTTTTTGCAATAAACATGTCTTC
TGAG
CC

QA 7 550 7 550
DS 



CO CL3453Contig2 692 2 2 U
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TACCAACACTTTGGTGTCTTTTTAATCTTTGAGTGAACAATGGGAAGAAAGGCTGGAAAT
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TCGTTCCTCAACTGCATGGCTCTCAACAAATGCAAAGATGATAACTGCGAGAAACAGAAG
AACCTCCTGAGCGTTTGTATGAACGGACATGCGGAGAAGTCCAAGTCGTGGGGAAACATT
AACTACCATTTGCAGAGGTTGACCCGCGGAAGAAAGTAATGTGGCATATGGATCCATAGC
CTGATGGGTCAATTGGTAGTTATAATGGTCTTATTGATTTCTATGTTTCTTTCCCAGTGT
TTTTGGGGTACTTCATATTTATATGTTGTTGGCATCTAGAAGAAGAAGTAGAAACTTTGG
ACATATTGTTCACTTAAAGAGAAAGGATTTGGTCTCTTTGTTTTTGCAATAAACATGTCT
TCTGAGTCAAGGCGGAAAGGGCCATGAGTATTAATGTTCTCTAGAAACATATACTACATC
TATGAAACACAGCAATGAGGTGTATATGCTTAAGTTTGTACAGGTTTTACATAATATTTA
TTAAAATTTATTGATAATACCGTGTTAGTGGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CA20JQ C 1
AF RR4CA20TF U 1
BS 1 2 RR4CA20JQ
BS 3 692 RR4CA20TF

RD RR4CA20JQ 692 0 0
GGGCGATTCTTCTCCATTTCTCCAGCGTCTTGTCAAAAATCAATCCTTGATTGCCGCTTT
TACCAACACTTTGGTGTCTTTTTAATCTTTGAGTGAACAATGGGAAGAAAGGCTGGAAAT
TTGTACATAAACCCGAAAAAGCTAGGCGGTATAGCGAAACCATGTATGAAGGAAATGGTG
TCGTTCCTCAACTGCATGGCTCTCAACAAATGCAAAGATGATAACTGCGAGAAACAGAAG
AACCTCCTGAGCGTTTGTATGAACGGACATGCGGAGAAGTCCAAGTCGTGGGGAAACATT
AACTACCATTTGCAGAGGTTGACCCGCGGAAGAAAGTAATGTGGCATATGGATCCATAGC
CTGATGGGTCAATTGGTAGTTATAATGGTCTTATTGATTTCTATGTTTCTTTCCCAGTGT
TTTTGGGGTACTTCATATTTATATGTTGTTGGCATCTAGAAGAAGAAGTAGAAACTTTGG
ACATATTGTTCACTTAAAGAGAAAGGATTTGGTCTCTTTGTTTTTGCAATAAACATGTCT
TCTGAGTCAAGGCGGAAAGGGCCATGAGTATTAATGTTCTCTAGAAACATATACTACATC
TATGAAACACAGCAATGAGGTGTATATGCTTAAGTTTGTACAGGTTTTACATAATATTTA
TTAAAATTTATTGATAATACCGTGTTAGTGGC

QA 1 692 1 692
DS 

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GG
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GTTCCTCAACTGCATGGCTCTCAACAAATGCAAAGATGATAACTGCGAGAAACAGAAGAA
CCTCCTGAGCGTTTGTATGAACGGACATGCGGAGAAGTCCAAGTCGTGGGGAAACATTAA
CTACCATTTGCAGAGGTTGACCCGCGGAAGAAAGTAATGTGGCATATGGATCCATAGCCT
GATGGGTCAATTGGTAGTTATAATGGTCTTATTGATTTCTATGTTTCTTTCCCAGTGTTT
TTGGGGTACTTCATATTTATATGTTGTTGGCATCTAGAAGAAGAAGTAGAAACTTTGGAC
ATATTGTTCACTTAAAGAGAAAGGATTTGGTCTCTTTGTTTTTGCAATAAACATGTCTTC
TGAGTCAAGGCGGAAAGGGCCATGAGTATTAATGTTCTCTAGAAACATATACTACATCTA
TGAAACACAGCAATGAGGTGTATATGCTTAAGTTTGTACAGGTTTTACATAATATTTATT
AAAATTTATTGATAATACCGTGTTAGTGGC

QA 3 692 3 692
DS 



AS 1 4

CO CL3454Contig1 1060 4 8 U
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TGCATCAGATTTATAAGCCGATGCTATGCACACATAGAGCGTGGACTTGTAGTCACATCT
CCTTTTATTCTCACACAATCTTCCAAAGCTTTTCATATCATTACATTATTATAAATTATA
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GCTCCTAACCTGACGTGGCGGGTCAGTCGCGCTATCGTTAAGCTTGACACCTGTGTAGAC
GGCTGCACCAGATATGGCACCAAGTGTAGGAGCCACCAGATAAACCCAAAGTGACCTGTA
GTTTCCAGATGCAAGAGCTGGTCCTAGAGTCCTAACCGGGTTCATAGATCCACCACTCGA
TGGCCCTGCGACAAGAATGTTGAGCATGACAGTGGCTCCAACAGCTATACCAGCTAGTTC
TCCAACTGCACGAGTGTCGGTGGCAACGGCGGTAACAACAAAGAGGAGAATAAAAGTAAT
GATGAACTCGAGAGCAAAGGCTTGTCCAACACTAACAGACGGAACAGTAACACCTCCCGA
CATGAAAGGATGGAAAACTGCTTTGAGTGCGAATGAAGCGCAAATGGAAGCTGAGACTTG
GGCAGCTATGTAAGCAGGCACGTGGGCCCAAGGGAAGTGCCTTAGAGCTGCGAATGCTAT
GGTCAGTGAAGGGTTTAAGTGAGCCCCTGAGATGTGACCGGTTGACAGAATTATGATCAT
CACTGCGAGTCCTGCGCAGGCCGCGTTACCAATTAGGGTTTCAGCTCCGTCGTATTTCTG
ATTCACGATTGGACCGGCCGTCGCGGTGAATATCAAGATAAATGTTCCCACGAACTCGGC
TCCAAGCTTGCGAGTAAGGGAGACAACAGGAGGGAAAATCGGCGAAGCACGTGTCGGGTT
GACCCCAAGTGTGTCCCATCACCGGCAAGCATTTGCATGGAGGCATCGGTTTCCGATGAT
CGAACGACATAGAATCCACTCTCGTCCCCGTGATCAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE22JQ U 1
AF RR4CE11JQ U 36
AF RR4DE22TF C 431
AF RR4CE11TF C 482
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QA 1 599 1 599
DS 

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QA 1 648 1 648
DS 

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GGCCCGGCCGTCGCGGTGAATATCAAGATAAATGTTCCC

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DS 

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TTCACGATTGGACCGGCCGTCGCGGTGAATATCAAGATAAATGTTCCCACGAACTCGGCT
CCAAGCTTGCGAGTAAGGGAGACAACAGGAGGGAAAATCGGCGAAGCACGTGTCGGGTTG
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GAACGACATAGAATCCACTCTCGTCCCCGTGATCAACGC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

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AGTGATCATCTGTTTTCTTATATTCATTGAAGCAAAATGAGACGAGGGAATTCAGGAACC
GACCATGAACTTGGCATCGGAGCCACGCCTATGATCAGCATCGTCAAGGACATCATCAAC
AACATGAAAACTGATGCCCGCGACAGCGACATCGAGAACAACAATAGTAATGGGAATAGT
AAAGGGTTTAGGACGAGGAAAGCTTATTTCTACTGGGTTACAAGAGAGCAAGGATCGTTC
GAGTGGTTTAAGGGAATAATGGACGAGGTTTCTGAGCTGGACGAGGAAGGTATCATCGAG
CTCCATAATTATTGCACGAGCGTGTACGAGGATGGTGACGCTAGGGTTGCTCTTATTGCC
ATGCTTCAGTCGTTGCAACACGCTAAGAACGGTGTTGATGTCGTATCCGGGACACGTGTC
AAGTCCCATTTCGCTAAACCTAACTGGAGACAAGTCTACAAGAGGATCGCAGTTCAGCAT
CCCGGCAAACGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCGGGATTGACAAAGGAACTAAAA
AATCTGGCTTTGGATTTCTCTCGCAAGACAACCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAAC
TTCTAATCTGAATTATATAAGTTGGGGGTCAAAAGTAGAAAAATAAGACAAGAAACTGCA
TATAGATATTAAATTTTAAAATTCTTTTCCTTTCATAAAAACATCATATGAGCTGTATTC
TTTCGTTTCTTTTTTTGTTTCCTGCTTATTTTTGTTTCTTTATTATGTAACTTCGTTCAT
TGTCAAATTAAGTATAAGATAATAGAAGCATATAGTTTTAGAATTAGTATTGTAAACATG
TAATTATGGAGTTACTTCAACATTATTATCTGCTTATCCTCTAATCTATATTTGAGAAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E562TF U 1
AF RR4DW70TF U 1
AF RR4DW70JQ C 260
AF RR4E562JQ C 423
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BS 653 661 RR4DW70TF
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BS 687 705 RR4DW70TF
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ACGTCCCATTT

QA 1 551 1 551
DS 

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GACCATGAACTTGGCATCGGAGCCACGCCTATGATCAGCATCGTCAAGGACATCATCAAC
AACATGAAAACTGATGCCCGCGACAGCGACATCGAGAACAACAATAGTAATGGGAATAGT
AAAGGGTTTAGGACGAGGAAAGCTTATTTCTACTGGGTTACAAGAGAGCAAGGATCGTTC
GAGTGGTTTAAGGGAATAATGGACGAGGTTTCTGAGCTGGACGAGGAAGGTATCATCGAG
CTCCATAATTATTGCACGAGCGTGTACGAGGATGGTGACGCTAGGGTTGCTCTTATTGCC
ATGCTTCAGTCGTTGCAACACGCTAAGAACGGTGTTGATGTCGTATCCGGGACACGTGTC
AAGTCCCATTTCGCTAAACCTAACTGGAGACAAGTCTACAAGAGGATCGCAGTTCAGCAT
CCCGGCAAACGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCGGGATTGACAAAG*AACTAAAA
A*TCTGGCTTTGGATTTCTCTCGCA*GACAACCACCAAGTTTGAC

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DS 

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ACGCTAAGAACGGTGTTGATGTCGTATCCGGGACACGTGTCAAGTCCCATTTCGCTAAAC
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AGTTGGGGGTCAAAAGTAGAAAAATAAGACAAGAAACTGCATATAGATATTAAATTTTAA
AATTCTTTTCCTTTCATAAAAACATCATATGAGCTGTATTCTTTCGTTTCTTTTTTTGTT
TCCTGCTTATTTTTGTTTCTTTATTATGTAACTTCGTTCATTGTCAAATTAAGTATAAGA
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GTCCCATTTCGCTAAACCTAACTGGAGACAAGTCTACAAGAGGATCGCAGTTCAGCATCC
CGGCAAACGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCGGGATTGACAAAGGAACTAAAAAA
TCTGGCTTTGGATTTCTCTCGCAAGACAACCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAACTT
CTAATCTGAATTATATAAGTTGGGGGTCAAAAGTAGAAAAATAAGACAAGAAACTGCATA
TAGATATTAAATTTTAAAATTCTTTTCCTTTCATAAAAACATCATATGAGCTGTATTCTT
TCGTTTCTTTTTTTGTTTCCTGCTTATTTTTGTTTCTTTATTATGTAACTTCGTTCATTG
TCAAATTAAGTATAAGATAATAGAAGCATATAGTTTTAGAATTAGTATTGTAAACATGTA
ATTATGGAGTTACTTCAACATTATTATCTGCTTATCCTCTAATCTATATTTGAGAAGC

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DS 



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AATTCGACAAGAAGTGAAAAAGAGAATGCGATTCAACTCTTCAGATGTTTGGGTTTGTGT
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AGTTGTTCGACG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BN89JQ C 1
AF RR4F535JQ C 1
AF RR4F535TF U 1
AF RR4BN89TF U 1
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AGTTGTTCGACG

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AGTTGTTCGACG

QA 1 552 1 552
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QA 1 552 1 552
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AATTCGACAAGAAGTGAAAAAGAGAATGCGATTCAACTCTTCAGATGTTTGGGTTTGTGT
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AGTTGTTCGACG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 4

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GR91JQ C 1
AF RR4B223JQ C 13
AF RR4B223TF U 13
AF RR4GR91TF U 1
BS 1 14 RR4GR91TF
BS 15 450 RR4B223TF
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RD RR4GR91JQ 465 0 0
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CCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTCATGT
CATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAATGATGAGACTAGAGAGTGAGACTGAGTTTAAGTAC
ACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGTTTTCAA
TTTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAAAAAGTTCCAGTTTCTCG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4B223JQ 445 0 0
GG
ATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGGTTCAGTTAGCTAAAA
GGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCAGCTGCAAGCATGCGTA
GGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGAGGAGGAGGAGCCTCTGGTGGTGGTGGTGCTGCAGGAT
CAATGCTTCAGTTCTACACGGATGACGCACCGGGTCTCAAGATCTCCCCTAATGTTGTCC
TTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTCATGTCATGGGCAAGCTCT
ACTTTGTCAAATGATGAGACTAGAGAGTGAGACTGAGTTTAAGTACACCCAAGTGATTGC
TAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGTTTTCAATTTTTGTGAGAGAC
TATCTATAAAAAAAAA
GTTCCAG

QA 3 438 3 438
DS 

RD RR4B223TF 445 0 0
GG
ATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGGTTCAGTTAGCTAAAA
GGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCAGCTGCAAGCATGCGTA
GGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGAGGAGGAGGAGCCTCTGGTGGTGGTGGTGCTGCAGGAT
CAATGCTTCAGTTCTACACGGATGACGCACCGGGTCTCAAGATCTCCCCTAATGTTGTCC
TTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTCATGTCATGGGCAAGCTCT
ACTTTGTCAAATGATGAGACTAGAGAGTGAGACTGAGTTTAAGTACACCCAAGTGATTGC
TAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGTTTTCAATTTTTGTGAGAGAC
TATCTATAAAAAAAAA
GTTCCAG

QA 3 438 3 438
DS 

RD RR4GR91TF 465 0 0
GGAAAGATCCGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGGT
TCAGTTAGCTAAAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCAGC
TGCAAGCATGCGTAGGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGAGGAGGAGGAGCCTCTGGTGGTGG
TGGTGCTGCAGGATCAATGCTTCAGTTCTACACGGATGACGCACCGGGTCTCAAGATCTC
CCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTCATGT
CATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAATGATGAGACTAGAGAGTGAGACTGAGTTTAAGTAC
ACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGTTTTCAA
TTTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAAAAAGTTCCAGTTTCTCG

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 4

CO CL3458Contig1 1323 4 12 U
GGCCCTCTGTTTCTGTAAACCGTCAAGTAGAAACACGACAAACGCGTTCTCCACCCTCCA
TTCCCATCCCTCTTCCCCTTCTTCTACGTCGTGCTCTCAGTTTCTATTTTTGGTTCTCGA
TCCGCACTGCGTGTAAGCTTAATCAAAATCTTCAATTGTTCCGATGGTATTTGGATCGCT
TTTCGCTCCTCTCAAATTCTGGGGAAATACTCAGGAACAAGAGCCGCAGAGAGGAAGGAT
GCAAGAGATAGATCTTGGCATTCACACAATAAGAAGCCATGGAGGAGGTCTCGCCTCCAA
ACACAAGCACGACTGGATCATACTCGTGATCTTGGTAGCCATCGAGATCGGCTTGCAACT
CATCTCTCCTTTCTACAGATACGTCGGCAAAGACATGATGACAGATCTCAAGTACCCTTT
CAACGACAACACCGTCCCTATCTGGTCAGTGCCCATCTACGCAGTCCTGCTTCCTATCAT
AGTCTTCCTCTGCTTCTACATGAAGAGAACATGTGTGTACGATCTTCACCACAGCGTTCT
CGGACTGCTGTTCACTGTTTTGATTACCGGTATCATCACCGACTCCATCAAGCTCGCAAC
CGGACGACCTCGTCCTAACTTCTACTGGCGCTGCTTCCCTGACGGGAAAGAGGTGTACGA
TGCTTTAGGCGGTGTGGTATGCCATGGTGAACCGGGAGAAGTTAAAGAAGGTCACAAAAG
CTTCCCTAGTGGACACACGTCTTGGTCATTCGCGGGACTTGGTTTCCTCTCGCTCTACTT
GTCTGGCAAAGTCAAGGCCTTTAACAGAGAAGGACATGTGGCTAAGCTCTGCATCGTGTT
CGCTCCTCTGCTCGCGGCTTGCCTCGTGGGGATATCTCGTGTGGATGACTACTGGCACCA
CTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGCTCTCATCGGTCTCTTTGTCGCCGCTTTTTGTTACCG
TCAGTTTTACCCTAACCCTTACCACGAAGAAAGATGGGGTCCTTACGCTTATTTCAGAGC
AGCACAGGAACGAGGGTCGTCGCAACAAAACGGTGACGCGTTGAGGACAATGTCTCTCCA
GGTCGAACCAACCTCTCTTGAAAACATGGAATCTGGCACTTCCACTGCTCCAAGATGATT
TAATTCTTCTATTTTCATTATTTGCTATTTTCATTTTGGTCGATGGTGAGAGCCTGTGTG
GATGCTATAGTTTGCACGTGTGTACTTTTCTCTAACTGCTACGTGTACTCTTTTACATTT
GTAAGTAAATCAACGCCTTTTGACTGGAGAATCTCGAGATTCTAGTTCAAACAGCTGTTT
GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4D638TF U 1
AF RR4CH46TF U 408
AF RR4CH46JQ C 443
AF RR4D638JQ C 1101
BS 1 651 RR4D638TF
BS 652 652 RR4CH46TF
BS 653 664 RR4D638TF
BS 665 1086 RR4CH46TF
BS 1087 1087 RR4CH46JQ
BS 1088 1103 RR4CH46TF
BS 1104 1104 RR4CH46JQ
BS 1105 1154 RR4CH46TF
BS 1155 1231 RR4CH46JQ
BS 1232 1232 RR4D638JQ
BS 1233 1287 RR4CH46JQ
BS 1288 1323 RR4D638JQ

RD RR4D638TF 664 0 0
GGCCCTCTGTTTCTGTAAACCGTCAAGTAGAAACACGACAAACGCGTTCTCCACCCTCCA
TTCCCATCCCTCTTCCCCTTCTTCTACGTCGTGCTCTCAGTTTCTATTTTTGGTTCTCGA
TCCGCACTGCGTGTAAGCTTAATCAAAATCTTCAATTGTTCCGATGGTATTTGGATCGCT
TTTCGCTCCTCTCAAATTCTGGGGAAATACTCAGGAACAAGAGCCGCAGAGAGGAAGGAT
GCAAGAGATAGATCTTGGCATTCACACAATAAGAAGCCATGGAGGAGGTCTCGCCTCCAA
ACACAAGCACGACTGGATCATACTCGTGATCTTGGTAGCCATCGAGATCGGCTTGCAACT
CATCTCTCCTTTCTACAGATACGTCGGCAAAGACATGATGACAGATCTCAAGTACCCTTT
CAACGACAACACCGTCCCTATCTGGTCAGTGCCCATCTACGCAGTCCTGCTTCCTATCAT
AGTCTTCCTCTGCTTCTACATGAAGAGAACATGTGTGTACGATCTTCACCACAGCGTTCT
CGGACTGCTGTTCACTGTTTTGATTACCGGTATCATCACCGACTCCATCAAGCTCGCAAC
CGGACGACCTCGTCCTAACTTCTACTGGCGCTGCTTCCCTGACGGGAAAGAAGTGTACGA
TGCT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4CH46TF 750 0 0
G
CAAGTACCCTTTCAACGACAACACCGTCCCTATCTGGTCAGTGCCCATCTACGCAGTCCT
GCTTCCTATCATAGTCTTCCTCTGCTTCTACATGAAGAGAACATGTGTGTACGATCTTCA
CCACAGCGTTCTCGGACTGCTGTTCACTGTTTTGATTACCGGTATCATCACCGACTCCAT
CAAGCTCGCAACCGGACGACCTCGTCCTAACTTCTACTGGCGCTGCTTCCCTGACGGGAA
AGAGGTGTACGATGCTTTAGGCGGTGTGGTATGCCATGGTGAACCGGGAGAAGTTAAAGA
AGGTCACAAAAGCTTCCCTAGTGGACACACGTCTTGGTCATTCGCGGGACTTGGTTTCCT
CTCGCTCTACTTGTCTGGCAAAGTCAAGGCCTTTAACAGAGAAGGACATGTGGCTAAGCT
CTGCATCGTGTTCGCTCCTCTGCTCGCGGCTTGCCTCGTGGGGATATCTCGTGTGGATGA
CTACTGGCACCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGCTCTCATCGGTCTCTTTGTCGCCGC
TTTTTGTTACCGTCAGTTTTACCCTAACCCTTACCACGAAGAAAGATGGGGTCCTTACGC
TTATTTCAGAGCAGCACAGGAACGAGGGTCGTCGCAACAAAACGGTGACGCGTTGAGGAC
AATGTCTCTCCAGGTCGA*CCAACCTCTCTTGAAA*CATGGAATCTGGCACTTCCACTGC
TCCAAGATGATTTAATTCTTCTATTT
CAT

QA 2 747 2 747
DS 

RD RR4CH46JQ 845 0 0
CT
GTCAGTGCCCATCTACGCAGTC*TGCTTCCTATCATAGTCTTCCTCTGCTTCTACATGAA
GAGAACATGTGTGTACGATCTTCACCACAGCGTTCTCGGACTGCTGTTCACTGTTTTGAT
TACCGGTATCATCACCGACTCCATCAAGCTCGCAACCGGACGACCTCGTCCTAACTTCTA
CTGGCGCTGCTTCCCTGACGGGAAAGAGGTGTACGATGCTTTAGGCGGTGTGGTATGCCA
TGGTGAACCGGGAGAAGTTAAAGAAGGTCACAAAAGCTTCCCTAGTGGACACACGTCTTG
GTCATTCGCGGGACTTGGTTTCCTCTCGCTCTACTTGTCTGGCAAAGTCAAGGCCTTTAA
CAGAGAAGGACATGTGGCTAAGCTCTGCATCGTGTTCGCTCCTCTGCTCGCGGCTTGCCT
CGTGGGGATATCTCGTGTGGATGACTACTGGCACCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGC
TCTCATCGGTCTCTTTGTCGCCGCTTTTTGTTACCGTCAGTTTTACCCTAACCCTTACCA
CGAAGAAGGATGGGGTCCTTACGCTTATTTCAGAGCAGCACAGGAACGAGGGTCGTCGCA
ACAAAACGGTGACGCGTTGAGGACAATGTCTCTCCAGGTCGAACCAACCTCTCTTGAAAA
CATGGAATCTGGCACTTCCACTGCTCCAAGATGATTTAATTCTTCTATTTTCATTATTTG
CTATTTTCATTTTGGTCGATGGTGAGAGCCTGTGTGGATGCTATAGTTTGCACGTGTGTA
CTTTTCTTTAACTGCTACGTGTACTCTTTTACATTTGTAAGTAAATCAACGCCTTTTGAC
TGG

QA 3 845 3 845
DS 

RD RR4D638JQ 223 0 0
A
AAACATGGAATCTGGCACTTCCACTGCTCCAAGATGATTTAATTTTTCTATTTTCATTAT
TTGCTATTTTCATTTTGGTCGATGGTGAGAGCCTGTGTGGATGCTATAGTTTGCATGTGT
GTACTTTTCTCTAACTGCTACGTGTACTCTTTTACATTTGTAAGTAAATCAACGCCTTTT
GACTGGAGAATCTCGAGATTCTAGTTCAAACAGCTGTTTGCC

QA 2 223 2 223
DS 



AS 1 4

CO CL3459Contig1 491 4 3 U
GGAAAACACTATCATTTCATTAGCAAAGATGAAAAACACGTTTAAACCTTTGCTTATTGG
TTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAACGGTGATTGCTCATAGAGGAAAACC
ATGTCATTCAGAATTGCCGGACAAAACATGTGAAAGCAAGCGCTGCAAAGCTCACT*TGT
CAAAGAGCATAAGAATGTACTGGTGCGTGTTAGCGGGTGCCTTAAAAAAAGTAAACGGAG
AAGTGTTTTGCCGATTTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTTTATCTACACTAGAACT
CAAATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGAATAAAACTTTTAATAA
TTTTTTGCTGGTGTTTTTGGCGTAGTAAGGTGTATTATGTAACTAACAAAGAATTAATAT
TGTGTATTCCCTTTATATTTTTTGTACAATTGCTTGAATTCACATAAAATATATTAGAAT
AAATTGTTCAG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES78TF U 1
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TTTGCTGGTGTTTTTGGCGTAGTAAGGTGTATTATGTAACTAAC

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DS 

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TTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAACGGTGATTGCTCATAGAGGAAAACC
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AAGTGTTTTGCCGATTTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTTTATTTACACTAGAACT
CAAATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGAATAAAACTTTTAATAA
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TGTGTATTCCCT

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G
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AAAAAAGTAAACGGAGAAGTGTTTTGCCGATGTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTT
TATCTACACTAGAACTCAAATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGA
ATAAAACTTTTAATAATTTTTTGCTGGTGTTTTTGGCGTAGTAAGATGTATTATGTAACT
AACAAAGAATTAATATTGTGTATTCCCTTTATATTTTTTGTACAATTGCTTGAATTC

QA 2 298 2 298
DS 

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GG
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TGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAACGGTGATTGCTCAGAGAGGAAAACCATG
TCATTCAGAATTGCCGGACAAAACATGTGAAAGTAAGCGCTGCAAAGCTCACTGTGTCAA
AGAGCATAAGAATGTACTGGTGCGTGTTAGCGGGTGGCTTAAAAAA*GTAAACGGAGAAG
TGTTTTGCCGATGTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTTTATCTACACTAGAACTCAA
ATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGAATAAAACTTTTAATAATTT
TT*GCTGGTGTTTTTGGCGTAGTAAGGTGTATTATGTAACTAACAAAGAATTAATATTGT
GTATTCCCTTTATATTTTTTGTACAATTGCTTGAATTCACATAAAATATATTAGAATAAA
TTGTTCAG

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DS 



AS 1 3

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TTCAAAATCTTCATTATTATTTCACAATATTATTAATAGAACCTACCAACAAACAAAACA
ACAAAACAGAGTAAAAGTCACGACAACACGAACATAATGTGCTTCAAACTGGTCTAAACT
AGAGGCTATATATATCCTAATTGACTCCCTTAAAACACTCCATAAGCTAATACACAACCT
CAAGACCCACTTTAACCAAACAAAACACTAGACTTTACAATCAAAAGATTTTTTCAGGTT
ATGCTCGGTCTCATATGCTATCCACTTGATGCATTTCTCCAAAATCTGAGAGATCCCAGA
GATCATCACTTTGACAAGTCAAACCACCTTGAAACTCCCAACCAAGCAACTCATCACCAA
TCCCAAATCCAACTTCCGAAGAATCACATAGACCAACCCACCAGTCTTTATCACCATTTT
CATTTGAATTCGAACTTAAAATACTCTCCTCTCTTTCCTTTTCAGTATTCATGTCTTGAT
CAACCTGTAGGCTACCAAGCTTTCCCTGTTCTTCATCAAACAAATCCACACAACAACTAC
TAGTGTCCCCACTCTCACACACCTTGTTCTGATCAGAGTCATCATCATTCACTCTAGTCA
CAGCCTCTTCACTAGTACATTCCCAGACGAAAGTACTCATGAGCCGCTCTATCTCACCAT
CCAACCCACTCATATGCTCCCAAAGACTTTCCTTCGTAGTTCCCGCTGTTCCCTCCCTCG
TTGATATCACTCTCTAGCTCATTCGGTTGTGGGAGACATTGTGAGGCCGTCACCATTTGC
TTGTGTTTCTTCATGGGACGACCTACTAGTTCTTCCTTTCTTCTTCTTGGTCTTGTTCGT
GTTCTTGGCTCCCAAAGAAAAGAAAGAAAGGGAGGTTTATTCAGCATTAAAATCGTCGAC
CTTTAGACTGTGCTCATCTCCGGGTGACGGGCAGTGAAAGGCGTAGATTTTGCGGCTTAG
AATGTGAAATTCCAAATAGTTTTTAAATTTCGTTGTCTGTTCTTCCTGGTAGATGTGTTG
CAATATGCGACCATCTGTTGCCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D071JQ U 1
AF RR4A954JQ U 56
AF RR4A954TF C 600
BS 1 632 RR4D071JQ
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ATGCTCGGTCTCATATGCTATCCACTTGATGCATTTCTCCAAAATCTGAGAGATCCCAGA
GATCATCACTTTGACAAGTCAAACCACCTTGAAACTCCCAACCAAGCAACTCATCACCAA
TCCCAAATCCAACTTCCGAAGAATCACATAGACCAACCCACCAGTCTTTATCACCATTTT
CATTTGAATTCGAACTTAAAATACTCTCCTCTCTTTCCTTTTCAGTATTCATGTCTTGAT
CAACCTGTAGGCTACCAAGCTTTCCCTGTTCTTCATCAAACAAATCCACACAACAACTAC
TAGTGTCCCCACTCTCACACACCTTGTTCTGA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4A954JQ 867 0 0
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AAACAACAAAACAGAGTAAAAGTCACGACAACACGAACATAATGTGCTTCAAACTGGTCT
AAACTAGAGGCTATATATATCCTAATTGACTCCCTTAAAACACTCCATAAGCTAATACAC
AACCTCAAGACCCACTTTAACCAAACAAAACACTAGACTTTACAATCAAAAGATTTTTTC
AGGTTATGCTCGGTCTCATATGCTATCCACTTGATGCATTTCTCCAAAATCTGAGAGATC
CCAGAGATCATCACTTTGACAAGTCAAACCACCTTGAAACTCCCAACCAAGCAACTCATC
ACCAATCCCAAATCCAACTTCCGAAGAATCACATAGACCAACCCACCAGTCTTTATCACC
ATTTTCATTTGAATTCGAACTTAAAATACTCTCCTCTCTTTCCTTTTCAGTATTCATGTC
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ACTACTAGTGTCCCCACTCTCACACACCTTGTTCTGATCAGAGTCATCATCATTCACTCT
AGTCACAGCCTCTTCACTAGTACATTCCCAGACGAAAGTACTCATGAGCCGCTCTATCTC
ACCATCCAACC*ACTCATATGCTCCCAAAGACTTTCCTTCGTAGTTCCCGCTGTTCCCTC
CCTCGTTGATATCACTCTCTAGCTCATTCGGTTGTGGGAGACATTGTGAGGCCGTCACCA
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TTCGTGTTCTTGGCTCCCAA
GAAAGAA

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DS 

RD RR4A954TF 505 0 0
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ACAGC*TCTTCACTAGTACATTCCCAGACGAAAGTACTCATGAGCCGCTCTATCTCACCA
TCCAACCCACTCATATGCTCCCAAAGACTTTCGTTCGTAGTTCCCGCTGTTCCCTCCCTC
GTTGATATCACTCTCTAGCTCATTCGGTTGTGGGAGACATTGTGAGGCCGTCACCATTTG
CTTGTGTTTCTTCATGGGACGACCTACTAGTTCTTCCTTTCTTCTTCTTGGTCTTGTTCG
TGTTCTTGGCTCCCAAAGAAAAGAAAGAAAGGGAGGTTTATTCAGCATTAAAATCGTCGA
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GAATGTGAAATTCCAAATAGTTTTTAAATTTCGTTGTCTGTTCTTCCTGGTAGATGTGTT
GCAATATGCGACCATCTGTTGCCGA

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 4

CO CL3461Contig1 726 4 1 U
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ACTCTTTTTCAACTTTGTCTAATTTGTTCCTAGAGCGGTTTGGTTTGATTTTCGAATCAA
TTATCTTATTTCTTCTTCTCCATTGAGCTAATGATTGGATCTTATTTACCACCACTGGTA
ACTTCTCTCTGTCGTCACCTAATCTCCACCTCCACCTTCTTTCAGTCAGAAACTCGTCAC
CTCTCTCTCTCTCTCGATCCTGATTTCGTCTCTGTTTTTTTTGTAAATGATTTGCCGTGA
AAGTTTGAATCTTTTTTCGGTTTTGTGTATAGAAAACTAGTTTTCAGGAAGAGACCGCGG
GTTGAGGCAGGAAGACGACGACTGTTTTGGTGTCTCTACTTCTGTAGATCCGTAAAACCT
AGAGTTTAAGGAAATATGGAGTTTGAGTCGAGCAAGATAAAAAGAGGAGATGGAGTTGGT
TCAGAGGCAAGGGAAGAGAGACAGATAAGAAGTTTCGATGGTGGTGGAAGAGCACAGATT
GATGGAGTTAGTTGACGGCGGCGAAGAGTTTGGTGCTGAGATAGGGTTAATTTTTTTTTT
AATGTTAAACCGGTTTAGTTTTTTAGATTTCTAAACCAGGTTTATCTTTAAACCATAGGA
TAATTATGGTTTGGTTTAATGTTTGTAATTAGTTTTTGGTTTAATGTATTCTCTAATTTT
TGTAAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 

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AF RR4A379TFB U 1
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QA 1 726 1 726
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AGAGTTTAAGGAAATATGGAGTTTGAGTCGAGCAAGATAAAAAGAGGAGATGGAGTTGGT
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QA 1 726 1 726
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ACTCTTTTTCAACTTTGTCTAATTTGTTCCTAGAGCGGTTTGGTTTGATTTTCGAATCAA
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AAGTTTGAATCTTTTTTCGGTTTTGTGTATAGAAAACTAGTTTTCAGGAAGAGACCGCGG
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AGAGTTTAAGGAAATATGGAGTTTGAGTCGAGCAAGATAAAAAGAGGAGATGGAGTTGGT
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TGTAAG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

CO CL3462Contig1 1007 4 4 U
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GATTTGCACCGGTTGTGCAAATCGACGGTTGTGATGGTAGTAGCGCTGACTTCGAGTGGA
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AGCGAGAGTTACAGAGGCAAGATGCAGAAATTGATCGATTTCTCAAGATTCAAGGAGACC
AACTACTCCATGCGATCCTCGACAAGATCCAGAGGAGTCAGTACAAAACCGTGGCCTTCA
TGGAGGAAAGAGTTGTCCAGAAACTCATTGAGAAAGATGAGGAACTCGAGATGATAAACC
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ACATGTGATGTGATATTTGCCTTAAACTAAAAAACCTCTAATTAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DG74TF U 1
AF RR4D006TF U 1
AF RR4DG74JQ C 332
AF RR4D006JQ C 603
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BS 704 726 RR4D006TF
BS 727 1007 RR4DG74JQ

RD RR4DG74TF 607 0 0
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QA 1 607 1 607
DS 

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CAACTAATCTCCATGATCAATCTCAGCATCCTCCGTATATTCCTCCGTTCCACGTTGCTG
GATTTGCACCGGTTGTGCAAATCGACGGTTGTGATGGTAGTAGCGCTGACTTCGAGTGGA
ACAGCGTTGGTCGGAAGAGAATAAAAGAAATGGATTTTTTAGAGAACAATTCTCAGATAT
CTTCAATTGATTTTCGGCAAGGCCGGTCTGTCTCAACCGGGTTGGGTCTCTCACTCGATA
GTGCTCGTATCGCTTCTTCTGATGGCTCTGCTTTGCTGTCCCTCCTCGGAGACGATGTTG
AGCGAGAGTTACAGAGGCAAGATGCAGAAATTGATCGATTTCTCAAGATTCAAGGAGACC
AACTACTCCATGCGATCCTCGACAAGATCCAGAGGAGTCAGTACAAAACCGTGGCCTTCA
TGGAGGAAAGAGTTGTCCAGAAACTCATTGAGAAAGATGAGGAACTCGAGATGATAAACC
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AACAACGTGCAAAGTACAACGAGAACATGATCGCTGCTCTAA*CTACAATCTCGAGCGAG
CTCACG
TCGA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4DG74JQ 676 0 0
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TTTGCTGTCCCTCCTCGGAGACGATGTTGAGCGAGAGTTACAGAGGCAAGATGCAGAAAT
TGATCGATTTCTCAAGATTCAAGGAGACCAACTACTCCATGCGATCCTCGACAAGATCCA
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GAAAGATGAGGAACTCGAGATGATAAACCGAAAGAACAAGGAACTCGAGGTGCGGATTGA
ACAGATGACAATGGAAGCGGAGGCATGGCAACAACGTGCAAAGTACAACGAGAACATGAT
CGCTGCTCTAAACTACAATCTCGAGCGAGCTCACGGTCGACCAAGAGATAGCATTGAAGG
ATGTGGAGACAGCGAAGTGGATGACACGGCTTCTTGCTTCAATGGTAGAAACAGTAAGAC
AGCGATGATGATGTGCAGGTTTTGTGGAGTGAGGGAGGTGTGTATGTTGTTGTTGCCATG
TAAGCATATGTGTTTGTGTAAGGAGTGTGAGAGGAACCTGAGCTCTTGTCCTTTGTGTCA
ATGTTCCAAGTTTCTAGGGATGGAAGTATACATGTGATGTGATATTTGCCTTAAACTAAA
AAACCTCTAATTAGCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4D006JQ 405 0 0
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CAACGTGCAAAGTACAACGAGAACATGATCGCTGCTCTAAACTACAATCTCGAGCGAGCT
CACGGTCGACCAAGAGATAGCATTGAAGGATGTGGAGACAGCGAAGTGGATGACACGGCT
TCTTGCTTCAATGGTAGAAACAGTAAGACAGCGATGATGATGTGCAGGTTTTGTGGAGTG
AGGGAGGTGTGTATGTTGTTGTTGCCATGTAAGCATATGTGTTTGTGTAAGGAGTGTGAG
AGGAACCTGAGCTCTTGTCCTTTGTGTCAATGTTCCAAGTTTCTAGGGATGGAAGTATAC
ATGTGATGTGATATTTGCCTTAAACTAAAAAACCTCTAATTAGCT

QA 1 405 1 405
DS 



AS 1 4

CO CL3463Contig1 1257 4 5 U
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TGTCTTATCCTGTTCTAAAAACGTCAAAACCGAGATGAAATTGAAACCATTGTAAGATAT
GATTTGTTATACAATAGAAAGCTTAGAAACCTTTTAACTCACATTGAAAGATATGAATCA
TCGAACTAAACTCTAAATAAGTGAGTCCGGAATCTTCAGGAGGGGACTGGTTCGAGCATG
GCCTGTTCGTGCCACTCACCATTTAAGTTGGACTGCCACAATCTGACCATCCCATCACTT
CCAGTGGTAGCTAAAGTCATGCCACTCATGTCCCACTCCATCTGCCAAACCTCGCCTTGA
TGACCAGAAAGCGAGGCGGCCTTCTTTACAGGAAGCCTTCCATCAAGGTCAGGAGCTAGA
CCAACTTGCCATATCCCTATGCCTTTATGAGTTGCAACAGCAACAACCTCGTATGGTCGG
CCAATATTTGGGGCCCATGAGACAGCATAAACTGGATCACCTTTGTCTTCTGGCGAGGCT
AATTCTGCTACAGCCAACCATCTGTTATGAGATTCGTCAAACTCCCAGATCTTGGAAGAA
TTAAGATGAGGAGAATCAGAGTTGAAAGCTAAAACAAAGCTGGGTTCTTGCTCCCCACTC
CTCATTGGATTCCAAGAAACAGATGCAGAGAGGGTTGATGGTTTACCCAGAGCCGACAGA
GAATCAATAACATTCTGAAATTCAGCCTGAAGTTGCCAGTTTTTTAACTCCAAAGGATTC
AAGAGCCCAAAGACCCTAATGTACCCATCTGAATATGCTGCAACCATCTTTAGACTCTTT
CTGGAGACTCCAAACTGAACATCAAGCACTTGGGTAGACTTGTTCATCATGCTCTTACAC
AGTTTCCACTCAAGAGCATGCGTGTCTTGAGAGACCTCCTCCCAAATGGATCAGCTGCCG
TCTTCGCAAATGCAGGCTACCGCATCGCCGTATTCCGAAGGAAGCCAGAGGATCTTTACA
AGACTCGATTCGCTAACCCTAACTTTGGAACTGCGCGCGAAAGAAGAAGAGGAAGACGAG
GGAACGGGAGAGTCGTAAACGGAGAGGGTTCCGTCTATGGATCCGGCGGCTAATCGGTGG
CCGGAGTAGTTCCAGGAGGAACAGGTTGTGCCAGAATCAAGCGTCGCCATCGATTTCGCC
GCCATATCTCTCTCTCTCGACTCTCGGTCGTGCACACTGACGACCCAGAGAATCACC


BQ
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AF RR4CH90JQ U 1
AF RR4CH90TF C 1
AF RR4BT13JQ U 80
AF RR4BT13TF C 480
BS 1 145 RR4CH90JQ
BS 146 146 RR4BT13JQ
BS 147 351 RR4CH90JQ
BS 352 937 RR4BT13JQ
BS 938 1257 RR4BT13TF

RD RR4CH90JQ 352 0 0
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TGTCTTATCCTGTTCTAAAAACGTCAAAACCGAGATGAAATTGAAACCATTGTAAGATAT
GATTTGTTATACAATAGAAAGCTTAAAAACCTTTTAACTCACATTGAAAGATATGAATCA
TCGAACTAAACTCTAAATAAGTGAGTCCGGAATCTTCAGGAGGGGACTGGTTCGAGCATG
GCCTGTTCGTGCCACTCACCATTTAAGTTGGACTGCCACAATCTGACCATCCCATCACTT
CCAGTGGTAGCTAAAGTCATGCCACTCATGTCCCACTCCATCTGCCAAACC
C

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4CH90TF 352 0 0
CCAAAACTGGTTTTATTACGGGTTTAAGGATATCTTAACTTTCATCAAACATGGTTCAGT
TGTCTTATCCTGTTCTAAAAACGTCAAAACCGAGATGAAATTGAAACCATTGTAAGATAT
GATTTGTTATACAATAGAAAGCTTAGAAACCTTTTAACTCACATTGAAAGATATGAATCA
TCGAACTAAACTCTAAATAAGTGAGTCCGGAATCTTCAGGAGGGGACTGGTTCGAGCATG
GCCTGTTCGTGCCACTCACCATTTAAGTTGGACTGCCACAATCTGACCATCCCATCACTT
CCAGTGGTAGCTAAAGTCATGCCACTCATGTCCCACTCCATCTGCCAAACC
C

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4BT13JQ 858 0 0
AACGTCAAAACCGAGATGAAATTGAAACCATTGTAAGATATGATTTGTTATACAATAGAA
AGCTTAGAAACCTTTTAACTCACATTGAAAGATATGAATCATCGAACTAAACTCTAAATA
AGTGAGTCCGGAATCTTCAGGAGGGGACTGGTTCGAGCATGGCCTGTTCGTGCCACTCAC
CATTTAAGTTGGACTGCCACAATCTGACCATCCCATCACTTCCAGTGGTAGCTAAAGTCA
TGCCACTCATGTCCCACTCCATCTGCCAAACCTCGCCTTGATGACCAGAAAGCGAGGCGG
CCTTCTTTACAGGAAGCCTTCCATCAAGGTCAGGAGCTAGACCAACTTGCCATATCCCTA
TGCCTTTATGAGTTGCAACAGCAACAACCTCGTATGGTCGGCCAATATTTGGGGCCCATG
AGACAGCATAAACTGGATCACCTTTGTCTTCTGGCGAGGCTAATTCTGCTACAGCCAACC
ATCTGTTATGAGATTCGTCAAACTCCCAGATCTTGGAAGAATTAAGATGAGGAGAATCAG
AGTTGAAAGCTAAAACAAAGCTGGGTTCTTGCTCCCCACTCCTCATTGGATTCCAAGAAA
CAGATGCAGAGAGGGTTGATGGTTTACCCAGAGCCGACAGAGAATCAATAACATTCTGAA
ATTCAGCCTGAAGTTGCCAGTTTTTTAACTCCAAAGGATTCAAGAGCCCAAAGACCCTAA
TGTACCCATCTGAATATGCTGCAACCATCTTTAGACTCTTTCTGGAGACTCCAAACTGAA
CATCAAGCACTTGGGTAGACTTGTTCATCATGCTCTTACACAGTTTCCACTCAAGAGCAT
GCGTGTCTTGAGAGACCT

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR4BT13TF 778 0 0
TCGGCATATTT
GGGCCCATGAGACAGCATAAACTGGATCAC*TTTGTCT*CTG*CGAGGCTAAT*CTGCTA
CAGCCAACCATCTGTTATGAGATTCGTCAAACTCCCAGATCTTGGAAGAATTAAGATGAG
GAGAATCAGAGTTGAAAGCTAAAACAAAGCTGGGTTCTTGCTCCCCACTCCTCATTGGAT
TCCAAGAAACAGATGCAGAGAGGGTTGATGGTTTACCCAGAGCCGACAGAGAATCAATAA
CATTCTGAAATTCAGCCTGAAGTTGCCAGTTTTTTAACTCCAAAGGATTCAAGAGCCCAA
AGACCCTAATGTACCCATCTGAATATGCTGCAACCATCTTTAGACTCTTTCTGGAGACTC
CAAACTGAACATCAAGCACTTGGGTAGACTTGTTCATCATGCTCTTACACAGTTTCCACT
CAAGAGCATGCGTGTCTTGAGAGACCTCCTCCCAAATGGATCAGCTGCCGTCTTCGCAAA
TGCAGGCTACCGCATCGCCGTATTCCGAAGGAAGCCAGAGGATCTTTACAAGACTCGATT
CGCTAACCCTAACTTTGGAACTGCGCGCGAAAGAAGAAGAGGAAGACGAGGGAACGGGAG
AGTCGTAAACGGAGAGGGTTCCGTCTATGGATCCGGCGGCTAATCGGTGGCCGGAGTAGT
TCCAGGAGGAACAGGTTGTGCCAGAATCAAGCGTCGCCATCGATTTCGCCGCCATATCTC
TCTCTCTCGACTCTCGGTCGTGCACACTGACGACCCAGAGAATCACC

QA 12 778 12 778
DS 



AS 1 2

CO CL3464Contig1 902 2 2 U
GGTCTTCTGGGGTTTGGACAAAAAGCTTGCCCAGAGAAAGCATTTTCCTTCTGTTAATTG
GCTGATTTCCTACTCAAAGTATTCAACGGCATTGGAATCTTTCTATGAGAAGTTCGATCC
GGATTTCATCAACATCAGGACAAAGGCAAGAGAGGTGTTGCAGAGGGAAGATGATCTTAA
TGAAATTGTCCAGCTTGTGGGAAAAGATGCGCTAGCGGAAGGTGACAAAATCACCTTGGA
AACCGCTAAGCTATTGAGGGAAGACTACCTTGCTCAAAACGCTTTCACACCGTATGACAA
ATTCTGCCCTTTCTACAAGTCAGTGTGGATGATGCGTAACATTATTCATTTCTACAACCT
AGCCAATCAGGCGGTTGAAAGAGCGGCGGGAATGGACGGTCAAAAGATTACATACACTCT
CATCAAGCATCGCTTGGGAGATCTTTTCTACCGTTTAGTGTCACAGAAGTTCGAAGATCC
AGCAGAAGGTGAGGCTGCTCTCGTGGCTAAATTCAAGAAACTGTACGAGGATCTCACTGC
TGGATTCCGTGCCTTGGAGGATGAAACTCGGTAAGCTGTCGTCAGTCTTTCCACAAGTCT
ACAACAGTCCTCCGAGTTGGGTTGTTTGGAAAAAAGGAGTATCATCATCTTCTCGTGTTT
TTTGAGCCAACAACTATCATAGCGGTCGGTGTTTTTGGGTCGAGTATAGCTCTGTGAACG
TCCATATGATTCTCCGGCTGTGCTGTGTAATTTGTTTGATTTGTTTATAAATATTAAGTT
TAATAAGGTGTACACAGCCTAAGTGAGTCATCTGTTTGATTTGATGTACCTCCCTCAGTT
CAATAAGTTATTATTACTCTCCAAATGTACTGAAACCTATTGAGGATACTTTTTACTTGC
TC


BQ
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10 10 

AF RR4EE77TF U 1
AF RR4EE77JQ C 506
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BS 585 902 RR4EE77JQ

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GCTGATTTCCTACTCAAAGTATTCAACGGCATTGGAATCTTTCTATGAGAAGTTCGATCC
GGATTTCATCAACATCAGGACAAAGGCAAGAGAGGTGTTGCAGAGGGAAGATGATCTTAA
TGAAATTGTCCAGCTTGTGGGAAAAGATGCGCTAGCGGAAGGTGACAAAATCACCTTGGA
AACCGCTAAGCTATTGAGGGAAGACTACCTTGCTCAAAACGCTTTCACACCGTATGACAA
ATTCTGCCCTTTCTACAAGTCAGTGTGGATGATGCGTAACATTATTCATTTCTACAACCT
AGCCAATCAGGCGGTTGAAAGAGCGGCGGGAATGGACGGTCAAAAGATTACATACACTCT
CATCAAGCATCGCTTGGGAGATCTTTTCTACCGTTTAGTGTCACAGAAGTTCGAAGATCC
AGCAGAAGGTGAGGCTGCTCTCGTGGCTAAATTCAAGAAACTGTACGAGGATCTCACTGC
TGGATTCCGTGCCTTGGAGGATGAAACTCGGTAAGCTGTCGTCA
GTCTTT

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DS 

RD RR4EE77JQ 397 0 0
GCT
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CGGTAAGCTGTCGTCAGTCTTTCCACAAGTCTACAACAGTCCTCCGAGTTGGGTTGTTTG
GAAAAAAGGAGTATCATCATCTTCTCGTGTTTTTTGAGCCAACAACTATCATAGCGGTCG
GTGTTTTTGGGTCGAGTATAGCTCTGTGAACGTCCATATGATTCTCCGGCTGTGCTGTGT
AATTTGTTTGATTTGTTTATAAATATTAAGTTTAATAAGGTGTACACAGCCTAAGTGAGT
CATCTGTTTGATTTGATGTACCTCCCTCAGTTCAATAAGTTATTATTACTCTCCAAATGT
ACTGAAACCTATTGAGGATACTTTTTACTTGCTC

QA 4 397 4 397
DS 



AS 1 4

CO CL3465Contig1 1400 4 3 U
GGAGCATCGTAACTCGTAAAACCCTAGAACCGTCTTCTTAAAGAAACCAATTCCTCTGTT
TCTCCCCCCCCCCCTTTCTCTTTTCCTCTGCGGCGATCTGAGCGTTCTCTCCTCTCAACC
TAATCAATTTCAGATGGATTCTCCGACTGAAACTGGACTTGAGATCTCTGACGATTCACG
CGAGTGGTTAGAGAATTCTCTTGAAGAAGAAGAAGAAGTCTCATCAGGTTTAGACCGAAG
TGCATCGTCCCCTGTAACCCCAGAGTCTGACAGAAGAATAAATGTAGCTCTCAGCTTTGG
TAACGGAAGTCCGGATGTTTCTCCGAATCATGAGTCTGAGTCTTCTTACTCCGAGTTAGA
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AATGGATAGTGAGAAGCCAATGAGCTACAGCGAATCTACGCGCTGAGGTCGATGCTGCGA
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TGGAACGACAGGTGGTTGATTTGGAATCTCAGCTCTCAGACTTGCGTTTCAATGTAGGGA
ATGTAGTGGATGAGCTTCATGCGAGTAAAGTGGGTTTAGCTGCAGCAGATGCTGAGATCT
CAAAGCTAGAGGTGATGTTGTGTACTGAGAAAACAAAGCTGGAGAGTGATGTTTCTAGTT
TGTTGGAGAAGCAGCCTTTCTTGGACGATCAGATTAAGCATTATGATGCAGAGAACATGG
AGATGAAGGCTAAAGAGGTGAAGCTGGAAGCTGAGATCAATGCATTGGAGACAGACTTGG
CCTCACGAGATGAGCGTATGGACGTTGAACAAAGATTTCGACAAGCATAAGCTGAGGTAT
GACATGTTGATGGCAGAGAAAGATGGAGTTTGCGCTGAAGTAGACAATCTAAAATCAGAG
ATGAGAACAAGAGACATCCAAATCGAGCAAATGGAAGAGCAAGTTAACCAGCTTGTGCTT
GAATCAGGAAGTGCCAAGAACGCTGTGGAAGAACTGAGAGCTATGGTTAAAGAGCTAGAG
AAGCAAGCAGAGCTACGGAGGAGTGTGATATCAGAAGGTGAGGAAGAGAAACGAGAGGCG
ATAAGACAGCTTTGTTACTCTCTGGATCATTACAAAACCGGATACAGACAGCTTCTGCGG
TTTCTTTCGAGGGATAAAAAAGCAGTAACAGTCGTCTGAATTGGATCAGTGCTTTCTTTC
TCTCTCGCCTTTGCTTATTCGTTAAACCATATTTAATATGTCTTCCTTTGTCTCTCATGT
CATACTCTGTGCTTCTCTCTCGTCTCAGACATTCATCAGAATCTTTAGTAAGAAATGCTA
TTTATATGAAACCTAAGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4ES50TF U 1
AF RR4FN22TF U 1
AF RR4FN22JQ C 560
AF RR4ES50JQ C 576
BS 1 394 RR4ES50TF
BS 395 692 RR4FN22TF
BS 693 1400 RR4FN22JQ

RD RR4ES50TF 394 0 0
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TCTCCCCCCCCCCCTTTCTCTTTTCCTCTGCGGCGATCTGAGCGTTCTCTCCTCTCAACC
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CGAGTGGTTAGAGAATTCTCTTGAAGAAGAAGAAGAAGTCTCATCAGGTTTAGACCGAAG
TGCATCGTCCCCTGTAACCCCAGAGTCTGACAGAAGAATAAATGTAGCTCTCAGCTTTGG
TAACGGAAGTCCGGATGTTTCTCCGAATCATGAGTCTGAGTCTTCTTACTCCGAGTTAGA
CTCGGAAGCTGAGGCCTTTTACTCATCTCTCAAC

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4FN22TF 696 0 0
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TCTCCCCCCCCCCCTTTCTCTTTTCCTCTGCGGCGATCTGAGCGTTCTCTCCTCTCAACC
TAATCAATTTCAGATGGATTCTCCGACTGAAACTGGACTTGAGATCTCTGACGATTCACG
CGAGTGGTTAGAGAATTCTCTTGAAGAAGAAGAAGAAGTCTCATCAGGTTTAGACCGAAG
TGCATCGTCCCCTGTAACCCCAGAGTCTGACAGAAGAATAAATGTAGCTCTCAGCTTTGG
TAACGGAAGTCCGGATGTTTCTCCGAATCATGAGTCTGAGTCTTCTTACTCCGAGTTAGA
CTCGGAAGCTGAGGCCTTTTACTCATCTCTCAACCACCAACTGGTCGTCTCATCAGGGAC
AATGGATAGTGAGAAGCCAATGAGCTACAGCGAATCTACGCGCTGAGGTCGATGCTGCGA
GGAGGGAGATAGAGAGTAAGGACACAGACATTGAGAATGAGAAAAGGCGTGCCCTGGAGT
TGGAACGACAGGTGGTTGATTTGGAATCTCAGCTCTCAGACTTGCGTTTCAATGTAGGGA
ATGTAGTGGATGAGCTTCATGCGAGTAAAGTGGGTTTAGCTGCAGCAGATGCTGAGATCT
CAAAGCTAGAGGTGATGTTGTGTACTGAGAAA
CAAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4FN22JQ 841 0 0
ATTTGG
ATCTCAGCTCTCAGACTTGCGTTTCAATGTAGGGAATGTAGTGGATGAGCTTCATGCGAG
TAAAGTGGGTTTAGCTGCAGCAGATGCTGAGATCTCAAAGCTAGAGGTGATGTTGTGTAC
TGAGAAAACAAAGCTGGAGAGTGATGTTTCTAGTTTGTTGGAGAAGCAGCCTTTCTTGGA
CGATCAGATTAAGCATTATGATGCAGAGAACATGGAGATGAAGGCTAAAGAGGTGAAGCT
GGAAGCTGAGATCAATGCATTGGAGACAGACTTGGCCTCACGAGATGAGCGTATGGACGT
TGAACAAAGATTTCGACAAGCATAAGCTGAGGTATGACATGTTGATGGCAGAGAAAGATG
GAGTTTGCGCTGAAGTAGACAATCTAAAATCAGAGATGAGAACAAGAGACATCCAAATCG
AGCAAATGGAAGAGCAAGTTAACCAGCTTGTGCTTGAATCAGGAAGTGCCAAGAACGCTG
TGGAAGAACTGAGAGCTATGGTTAAAGAGCTAGAGAAGCAAGCAGAGCTACGGAGGAGTG
TGATATCAGAAGGTGAGGAAGAGAAACGAGAGGCGATAAGACAGCTTTGTTACTCTCTGG
ATCATTACAAAACCGGATACAGACAGCTTCTGCGGTTTCTTTCGAGGGATAAAAAAGCAG
TAACAGTCGTCTGAATTGGATCAGTGCTTTCTTTCTCTCTCGCCTTTGCTTATTCGTTAA
ACCATATTTAATATGTCTTCCTTTGTCTCTCATGTCATACTCTGTGCTTCTCTCTCGTCT
CAGACATTCATCAGAATCTTTAGTAAGAAATGCTATTTATATGAAACCTAAGCTC

QA 7 841 7 841
DS 

RD RR4ES50JQ 825 0 0
TCAGACTTGCGTT*CAATGTAGGGAATGTAGTGGATGAGCTTCATGCGAGTAAAGTGGGT
TTAGCTGCAGCAGATGCTGAGATCTCAAAGCTAGAGGTGATGTTGTGTACTGAGAAAACA
AAGCTGGAGAGTGATGTTTCTAGTTTGTTGGAGAAGCAGCCTTTCTTGGACGATCAGATT
AAGCATTATGATGCAGAGAACATGGAGATGAAGGCTAAAGAGGTGAAGCTGGAAGCTGAG
ATCAATGCATTGGAGACAGACTTGGCCTCACGAGATGAGCGTATGGACGTTGAACAAAGA
TTTCGACAAGCATAAGCTGAGGTATGACATGTTGATGGCAGAGAAAGATGGAGTTTGCGC
TGAAGTAGACAATCTAAAATCAGAGATGAGAACAAGAGACATCCAAATCGAGCAAATGGA
AGAGCAAGTTAACCAGCTTGTGCTTGAATCAGGAAGTGCCAAGAACGCTGTGGAAGAACT
GAGAGCTATGGTTAAAGAGCTAGAGAAGCAAGCAGAGCTACGGAGGAGTGTGATATCAGA
AGGTGAGGAAGAGAAACGAGAGGCGATAAGACAGCTTTGTTACTCTCTGGATCATTACAA
AACCGGATACAGACAGCTTCTGCGGTTTCTTTCGAGGGATAAAAAAGCAGTAACAGTCGT
CTGAATTGGATCAGTGCTTTCTTTCTCTCTCGCCTTTGCTTATTCGTTAAACCATATTTA
ATATGTCTTCCTTTGTCTCTCATGTCATACTCTGTGCTTCTCTCTCGTCTCAGACATTCA
TCAGAATCTTTAGTAAGAAATGCTATTTATATGAAACCTAAGCTC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL3467Contig1 791 4 8 U
GGACTCTACTCCGTTATCCTCTTCTTCTCTAAAGCTTCCTCCAGCGACAATGGCGTTATC
GGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGG
ACCAACCACCCTTTCCTTCCCCCGGACGAACTCGGCGTTCTCACTGCCGGCGAAATCAGC
TCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACCGCCACGGTGGAAGCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGA
TACGATGGAGCTGAAGAATTACGTGAAATCGAGGCTCCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAA
AATCATAGGCACGGGACGCCGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCAC
CGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTACAGGGCAACCCATTGTG
GCTTCAGTACGTTAAA*GTGCCATTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGT
TTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGTTG
CTCGTGCCCTTCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGC
TCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAG
CACCACAGTTCTCCAAGCGTTAACGAGCCTTCTTTTGTTTTTTTTATTATTGTTGTTTTG
GATATCAACTCTTCTAAGTACACTTCTTTGCCTCCAATTCTGTCTCTAAGTTGATGTGTA
GATGATGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H927TF U 301
AF RR4F853TF U 1
AF RR4F853JQ C 80
AF RR4H927JQB C 186
BS 1 649 RR4F853TF
BS 650 650 RR4F853JQ
BS 651 704 RR4F853TF
BS 705 705 RR4F853JQ
BS 706 756 RR4F853TF
BS 757 757 RR4F853JQ
BS 758 785 RR4F853TF
BS 786 791 RR4F853JQ

RD RR4H927TF 173 0 0
AATCATAGGCACGGGACGCCGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCAC
CGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTACAGGGCAACCCATTGTG
GCTTCAGTACGTTAAAAGTGCCATTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAG
CTAC

QA 1 169 1 169
DS 

RD RR4F853TF 785 0 0
GGACTCTACTCCGTTATCCTCTTCTTCTCTAAAGCTTCCTCCAGCGACAATGGCGTTATC
GGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGG
ACCAACCACCCTTTCCTTCCCCCGGACGAACTCGGCGTTCTCACTGCCGGCGAAATCAGC
TCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACCGCCACGGTGGAAGCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGA
TACGATGGAGCTGAAGAATTACGTGAAATCGAGGCTCCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAA
AATCATAGGCACGGGACGCCGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCAC
CGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTACAGGGCAACCCATTGTG
GCTTCAGTACGTTAAA*GTGCCATTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGT
TTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGTTG
CTCGTGCCCTTCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGC
TCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAAGCCCGTAAAG
CACCACAGTTCTCCAAGCGTTAACGAGCCTTCTTTTGTTTTTTT*ATTATTGTTGTTTTG
GATATCAACTCTTCTAAGTACACTTCTTTGCCTCCA*TTCTGTCTCTAAGTTGATGTGTA
GATGA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4F853JQ 712 0 0
TCACTCTCCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGGACCAACCACCCTTTCCTTC
CCCCGGACGAACTCGGCGTTCTCACTGCCGGCGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCA
ATCACCGCCACGGTGGAAGCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAGAAT
TACGTGAAATCGAGGCTCCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACGGGACGC
CGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAAC
TATCGCGATGCCAAGGAGTACCTACAGGGCAACCCATTGTGGCTTCAGTACGTTAAA*GT
GCCATTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGTGG
CGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTTCTCAAGGT
GAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGACGCGAGAGT
CGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAAGCG
TTAACGAGCCTTCTTTTGTTTTTTTTATTATTGTTGTTTTGGATATCAACTCTTCTAAGT
ACACTTCTTTGCCTCCAATTCTGTCTCTAAGTTGATGTGTAGATGATGAACC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4H927JQB 606 0 0
GCGCCTCTCTCTCAATCACCGCCACGGTGGAAGCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGA
TGGAGCTGAAGAATTACGTGAAATCGAGGCTCCCGGGAGGCTTCGCAGTTCAGAAAATCA
TAGGCACGGGACGCCGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTTTCCAAGAAGGCACCGGCA
AAGTTATTATTAACTATCGGGATGCCAAGGAGTACCTACAGGGCAACCCATTGTGGCTTC
AGTACGTTAAA*GTGCCATTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGTTACGACGTGTTTGTG
AAAGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGT
GCCCTTCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACC
AGAGACGTGAGAGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCA
CAGTTCTCCAAGCGTTAACGAGCCTTCTTTTGTTTTTTTTATTATTGTTGTTTTGGATAT
TAACTCTTCTAAGTACACTTCTTTGCCTCCAATTCTGTTTTTAAGTTGATGTGTAGATGA
TGAACC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL3468Contig1 508 3 3 U
GGATATAAGCTCATCCCATCTTAAGCCATCACCTCTCTCTCGATATATTTGATCTGATCT
GCTTCATATTTATAACAGAAGTCGAATAGTACTTAGTCACATCATAAAATGGCTAAGTTC
ACAACTTTCTTCTTCATCATTGCTCTCCTCCTCTGCTCCACGGTAGCAAACGCATCAGCC
CGGCCTACTCCTACGTCCGTTTATCCAGGAGAAATCTCCGTTGAGAAATTAGAAGAAGGA
GAGGAGAACTGCGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAATGCGTCTTGATACGAAGAACTTTGGCT
GCTCATACTGATTACATTTACACACAAAACCACAATCCCTAAATGATTAATTAGCTTATA
GTCATTCATTGGAATATTTTGGTAAATGATATATTGTGTCATTGTACTTTCTTTATAACT
AGTCAAACTACTTCACGTTTGTATTTATATATATCACTTGATCTGAAAATATGTGTATTG
ATTATTAGTGTGAAAGTTACGTACTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ72TF U 1
AF RR4AK20TF U 62
AF RR4FJ72JQ C 157
BS 1 479 RR4FJ72TF
BS 480 492 RR4AK20TF
BS 493 508 RR4FJ72JQ

RD RR4FJ72TF 479 0 0
GGATATAAGCTCATCCCATCTTAAGCCATCACCTCTCTCTCGATATATTTGATCTGATCT
GCTTCATATTTATAACAGAAGTCGAATAGTACTTAGTCACATCATAAAATGGCTAAGTTC
ACAACTTTCTTCTTCATCATTGCTCTCCTCCTCTGCTCCACGGTAGCAAACGCATCAGCC
CGGCCTACTCCTACGTCCGTTTATCCAGGAGAAATCTCCGTTGAGAAATTAGAAGAAGGA
GAGGAGAACTGCGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAATGCGTCTTGATACGAAGAACTTTGGCT
GCTCATACTGATTACATTTACACACAAAACCACAATCCCTAAATGATTAATTAGCTTATA
GTCATTCATTGGAATATTTTGGTAAATGATATATTGTGTCATTGTACTTTCTTTATAACT
AGTCAAACTACTTCACGTTTGTATTTATATATATCACTTGATCTGAAAATATGTGTATT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4AK20TF 431 0 0
CTTCATATTTATAACAGAAGTCGTATAGTACTTAGTCATATCATAAAATGGCTAAGTTCA
CAACTTTCTTCTTCATCATTGCTCTCCTCCTCTGCTCCACGGTAGCAAACTCATCAGCCC
GGCCTACTCCTACGTCCGTTTATCCAGGAGAAATCTCCGTTGAGAAATTAGAAGAAGGAG
AGGAGAACTGCGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAATGCGTCTTGATACGAAGAACTTTGGCTG
CTCATACTGATTACATTTACACACAAAACCACAATCCCTAAATGATTAATTAGCTTATAG
TCATTCATTGGAATATTTTGGTAAATGATATATTGTGTCATC*TACTTTCTTTATAACTA
GTCAAACTACTTCACGTTTGTATTTATATATATCACTTGATCTGAAAATATGTGTATTGA
TTATTAGTGTG

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4FJ72JQ 352 0 0
TCCACGGTAGCAAACGCATCAGCCCGGCCTACTCCTACGTCCGTTTATCCAGGAGAAATT
TCCGTTGAGAAATTAGAAGAAGGAGAGGAGAACTGCGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAATGC
GTCTTGATACGAAGAACTTTGGCTGCTCATACTGATTACATTTACACACAAAACCACAAT
CCCTAAATGATTAATTAGCTTATAGTCATTCATTGGAATATTTTGGTAAATGATATATTG
TGTCATTGTACTTTCTTTATAACTAGTCAAACTACTTCACGTTTGTATTTATATATATCA
CTTGATCTGAAAATATGTGTATTGATTATTAGTGTGAAAGTTACGTACTAGC

QA 1 352 1 352
DS 



AS 1 4

CO CL3469Contig1 614 4 8 U
GGATCAAAGAAGAGGACCGAAAGAGAGAAAGAGAGAGAGATATCTAGAGGAAGAAGAAGA
AAAATGGCATTGCAATGGCTGATTCTATCGTACGTGGTTGCAGCTGAGGTAGCGATCGCA
GTCATTTTGACTCTACCTTACCCGATGCTGGTGAAGAAACGCATCGTGTCACTTGTCTCG
CTCATACTCCAGCCTGCCGCCTCCATCGTCGCCTTCGCTGGATTTCAACTCCTCGATCTT
TACTGGAAGAATGAGCATAGACTAATGTGCTCATCTGAGGTTTGCACTGCCACCGAGCGT
GATCGCTACGAGAAATCAATCTACAAGGCTCAGCGAAATGTGGTTCTGTGTGCGGCTGGG
ATCCTTCTCTACTGGTGTATTTTCCGCATCTGCAAGTACAATAAAGACCTTGAGCATTTG
GAGGAGCTAGAGAAGAGTTACAAGGCAGAGTAGTAGTAGTCTCCCCC*AAGTCTGGTTCT
TCTGTTATAAATATAACCTCGTCTT*GTGAGTAGTTCC*GAAATTTGAAACAAGACAATG
ATTTATCTCCACAATATCATTGCACAGACCTTATTTGTATTTATTCATCTTGCATCTTTG
TTTTACTTTTTGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A339JQ C 1
AF RR4A339TF U 454
AF RR4A339JQD C 1
AF RR4A339TFB U 1
BS 1 453 RR4A339TFB
BS 454 467 RR4A339TF
BS 468 468 RR4A339TFB
BS 469 505 RR4A339TF
BS 506 506 RR4A339TFB
BS 507 518 RR4A339TF
BS 519 519 RR4A339TFB
BS 520 614 RR4A339TF

RD RR4A339JQ 614 0 0
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AAAATGGCATTGCAATGGCTGATTCTATCGTACGTGGTTGCAGCTGAGGTAGCGATCGCA
GTCATTTTGACTCTACCTTACCCGATGCTGGTGAAGAAACGCATCGTGTCACTTGTCTCG
CTCATACTCCAGCCTGCCGCCTCCATCGTCGCCTTCGCTGGATTTCAACTCCTCGATCTT
TACTGGAAGAATGAGCATAGACTAATGTGCTCATCTGAGGTTTGCACTGCCACCGAGCGT
GATCGCTACGAGAAATCAATCTACAAGGCTCAGCGAAATGTGGTTCTGTGTGCGGCTGGG
ATCCTTCTCTACTGGTGTATTTTCCGCATCTGCAAGTACAATAAAGACCTTGAGCATTTG
GAGGAGCTAGAGAAGAGTTACAAGGCAGAGTAGTAGTAGTCTCCCCC*AAGTCTGGTTCT
TCTGTTATAAATATAACCTCGTCTT*GTGAGTAGTTCC*GAAATTTGAAACAAGACAATG
ATTTATCTCCACAATATCATTGCACAGACCTTATTTGTATTTATTCATCTTGCATCTTTG
TTTTACTTTTTGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4A339TF 161 0 0
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GTTCCCGAAATTTGAAACAAGACAATGATTTATCTCCACAATATCATTGCACAGACCTTA
TTTGTATTTATTCATCTTGCATCTTTGTTTTACTTTTTGAG

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR4A339JQD 614 0 0
GGATCAAAGAAGAGGACCGAAAGAGAGAAAGAGAGAGAGATATCTAGAGGAAGAAGAAGA
AAAATGGCATTGCAATGGCTGATTCTATCGTACGTGGTTGCAGCTGAGGTAGCGATCGCA
GTCATTTTGACTCTACCTTACCCGATGCTGGTGAAGAAACGCATCGTGTCACTTGTCTCG
CTCATACTCCAGCCTGCCGCCTCCATCGTCGCCTTCGCTGGATTTCAACTCCTCGATCTT
TACTGGAAGAATGAGCATAGACTAATGTGCTCATCTGAGGTTTGCACTGCCACCGAGCGT
GATCGCTACGAGAAATCAATCTACAAGGCTCAGCGAAATGTGGTTCTGTGTGCGGCTGGG
ATCCTTCTCTACTGGTGTATTTTCCGCATCTGCAAGTACAATAAAGACCTTGAGCATTTG
GAGGAGCTAGAGAAGAGTTACAAGGCAGAGTAGTAGTAGTCTCCCCC*AAGTCTGGTTCT
TCTGTTATAAATATAACCTCGTCTT*GTGAGTAGTTCC*GAAATTTGAAACAAGACAATG
ATTTATCTCCACAATATCATTGCACAGACCTTATTTGTATTTATTCATCTTGCATCTTTG
TTTTACTTTTTGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4A339TFB 614 0 0
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AAAATGGCATTGCAATGGCTGATTCTATCGTACGTGGTTGCAGCTGAGGTAGCGATCGCA
GTCATTTTGACTCTACCTTACCCGATGCTGGTGAAGAAACGCATCGTGTCACTTGTCTCG
CTCATACTCCAGCCTGCCGCCTCCATCGTCGCCTTCGCTGGATTTCAACTCCTCGATCTT
TACTGGAAGAATGAGCATAGACTAATGTGCTCATCTGAGGTTTGCACTGCCACCGAGCGT
GATCGCTACGAGAAATCAATCTACAAGGCTCAGCGAAATGTGGTTCTGTGTGCGGCTGGG
ATCCTTCTCTACTGGTGTATTTTCCGCATCTGCAAGTACAATAAAGACCTTGAGCATTTG
GAGGAGCTAGAGAAGAGTTACAAGGCAGAGTAGTAGTAGTCTCCCCC*AAGTCTGGTTCT
TCTGTTATAAATATAACCTCGTCTT*GTGAGTAGTTCC*GAAATTTGAAACAAGACAATG
ATTTATCTCCACAATATCATTGCACAGACCTTATTTGTATTTATTCATCTTGCATCTTTG
TTTTACTTTTTGAG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL3470Contig1 852 2 16 U
GTGGAAAGAAACGGTTGGGCCTTGGGAAGAAAGACCTGGACATTTTGGTGATGTTTGGAA
GTATTGGACCGATGATGGCCTTGGCCACTTTGAGTTCTTTCAATTGGCAGAAGACATTGG
CGCAGCCCCCATATGGGTGTTCAACAACGGTATTAGTCACAACGATGAAGTTGAAACTGC
TAGTATCATGCCCTTTGTTCAGGAAGCACTTGATGGTATTGAGTTTGCTAGGGGAGATGC
TAACTCTACATGGGGATCGGTTCGAGCTGCAATGGGACGTCAAGAGCCTTTTGAATTGAA
GTATGTTGCTATTGGGAACGAGGATTGTGGAAAGACTTACTACAGAGGAAACTATATTGT
GTTCTATGATGCTATCAAAAAGGCTTATCCAGATATCAAAATCATCTCTAACTGTGATGG
ATCTTCTCGTCCGCTTGACCATCCTGCCGATTACTATGATTTCCACATTTACACTTCTGC
TAGCAATTTGTTTTCCATGTATCATCAGTTTGACCGCACTTCGCGTAAGGGTCCAAAGGC
TTTTGTGAGTGAATATGCTGTGACAGGAAAAGATGCTGGTAAAGGAAGCCTTGTCGCCGC
TCTTGCAGAAGCTGCCTTTCTCATTGGTCTCGAAAAGAACAGTGACATTGTGGAAATGGC
GAGCTACGCACCACTCTTTGTGAACACAAACGACAGAAGGTGGAACCCTGATGCAATAGT
CTTCAACTCATCTCATCTATACGGAACACCTAGCTACTGGGTCCAACGGTTCTTCGCAGA
GTCAAGCGGGTCAACTCTTCTCGCTTCAACACTAAAAGAAACTCTTCTTCTCTCGTCGCA
TCTGCATCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX54TF U 1
AF RR4CA21TF U 118
BS 1 638 RR4FX54TF
BS 639 639 RR4CA21TF
BS 640 683 RR4FX54TF
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BS 685 699 RR4FX54TF
BS 700 700 RR4CA21TF
BS 701 715 RR4FX54TF
BS 716 716 RR4CA21TF
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BS 726 726 RR4CA21TF
BS 727 743 RR4FX54TF
BS 744 744 RR4CA21TF
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BS 750 750 RR4CA21TF
BS 751 765 RR4FX54TF
BS 766 852 RR4CA21TF

RD RR4FX54TF 771 0 0
GTGGAAAGAAACGGTTGGGCCTTGGGAAGAAAGACCTGGACATTTTGGTGATGTTTGGAA
GTATTGGACCGATGATGGCCTTGGCCACTTTGAGTTCTTTCAATTGGCAGAAGACATTGG
CGCAGCCCCCATATGGGTGTTCAACAACGGTATTAGTCACAACGATGAAGTTGAAACTGC
TAGTATCATGCCCTTTGTTCAGGAAGCACTTGATGGTATTGAGTTTGCTAGGGGAGATGC
TAACTCTACATGGGGATCGGTTCGAGCTGCAATGGGACGTCAAGAGCCTTTTGAATTGAA
GTATGTTGCTATTGGGAACGAGGATTGTGGAAAGACTTACTACAGAGGAAACTATATTGT
GTTCTATGATGCTATCAAAAAGGCTTATCCAGATATCAAAATCATCTCTAACTGTGATGG
ATCTTCTCGTCCGCTTGACCATCCTGCCGATTACTATGATTTCCACATTTACACTTCTGC
TAGCAATTTGTTTTCCATGTATCATCAGTTTGACCGCACTTCGCGTAAGGGTCCAAAGGC
TTTTGTGAGTGAATATGCTGTGACAGGAAAAGATGCTGGTAAAGGAAGCCTTGTCGCCGC
TCTTGCAGAAGCTGCCTTTCTCATTGGTCTCGAAAAGA*CAGTGACATTGTGGAAATGGC
GAGCTACGCACCACTCTTTGTGA*CACAAACGACAGAAG*TGGAACCCTGATGCA*TAGT
CTTCA*CTCATCTCATCTATACG*AACAC*TAGCTACTGGGTCCA
CGGTTC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4CA21TF 735 0 0
G
GGCGCAGCCCCCATATGGGTGTTCAACAACGGTATTAGTCACAACGATGAAGTTGAAACT
GCTAGTATCATGCCCTTTGTTCAGGAAGCACTTGATGGTATTGAGTTTGCTAGGGGAGAT
GCTAACTCTACATGGGGATCGGTTCGAGCTGCAATGGGACGTCAAGAGCCTTTTGAATTG
AAGTATGTTGCTATTGGGAACGAGGATTGTGGAAAGACTTACTACAGAGGAAACTATATT
GTGTTCTATGATGCTATCAAAAAGGCTTATCCAGATATCAAAATCATCTCTAACTGTGAT
GGATCTTCTCGTCCGCTTGACCATCCTGCCGATTACTATGATTTCCACATTTACACTTCT
GCTAGCAATTTGTTTTCCATGTATCATCAGTTTGACCGCACTTCGCGTAAGGGTCCAAAG
GCTTTTGTGAGTGAATATGCTGTGACAGGAAAAGATGCTGGTAAAGGAAGCCTTGTCGCC
GCTCTTGCAGAAGCTGCCTTTCTCATTGGTCTCGAAAAGAACAGTGACATTGTGGAAATG
GCGAGCTACGCACCACTCTTTGTGAACACAAACGACAGAAGGTGGAACCCTGATGCAATA
GTCTTCAACTCATCTCATCTATACGGAACACCTAGCTACTGGGTCCAACGGTTCTTCGCA
GAGTCAAGCGGGTCAACTCTTCTCGCTTCAACACTAAAAGAAACTCTTCTTCTCTCGTCG
CATCTGCATCTCAT

QA 2 735 2 735
DS 



AS 1 4

CO CL3471Contig1 990 4 7 U
GAAAACATAAGCACTTGTCTCTTTTATTGCAAGGCAAAAACTCCAACGAAAGAATTTGAA
GCTGGCATATATATGTAATCTCCAAATTTTAATGATTGAAACTAGCACTTTTCATCGTCA
TCAATAGAAAGCGTATAATGCGACAAAAGTTTTTCGATGTACACTGCGAAAATGCACCAA
GTTATAACGAGCATGTAGGTAGTTCACTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCG
TAAAGATCCATGGAGTCCTTAATCGCGTCTATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCA
ACATCCACTTTCTTGTTCTCGTTCTTATTGTAATCCTCGAAGAAGCGGCGGATTTCAGCT
AGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATCATCTGCA
CAAACTGCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATGGGCATTAACCCAATA
GCACGAGCACGAAGGAAGGATCCAGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACCAGGACATCT
ATAGGATCACTGTCTTCACAAATGGTTCGAGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACA
ATGGATGAGTACAGGACACGATCAACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGCAT
TTCACCTTGCCACCTTTGCTAATCTCAACAACACTGTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGA
CCAATCTCCAAGTCATGCCAAGGATGAGCAGCAGCTGATCTGTGTGTGAAGGCTGCAAAG
TTCCTTTCGTTAAGGGTAACATTAGGGTTCCTCAGAGGGGAAGAAGCAGAGCTCTTGGGG
GTTCATTCATCCTTGATATCAGCCATATCGATATGTTCAAGATTCAATTTTGAAGCTTCG
ATCGCGCAGCTGAATAAGAGATTCCGTAACGTAACTTTTTTGTTCCTTTCTTTCGCTTGT
AGAGCAGTTACAGTAGCAGTATTCGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GW77JQ U 1
AF RR4CD70JQ U 198
AF RR4GW77TF C 216
AF RR4CD70TF C 234
BS 1 326 RR4GW77JQ
BS 327 327 RR4CD70JQ
BS 328 515 RR4GW77JQ
BS 516 801 RR4CD70JQ
BS 802 844 RR4GW77TF
BS 845 845 RR4CD70TF
BS 846 990 RR4GW77TF

RD RR4GW77JQ 515 0 0
GAAAACATAAGCACTTGTCTCTTTTATTGCAAGGCAAAAACTCCAACGAAAGAATTTGAA
GCTGGCATATATATGTAATCTCCAAATTTTAATGATTGAAACTAGCACTTTTCATCGTCA
TCAATAGAAAGCGTATAATGCGACAAAAGTTTTTCGATGTACACTGCGAAAATGCACCAA
GTTATAACGAGCATGTAGGTAGTTCACTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCG
TAAAGATCCATGGAGTCCTTAATCGCGTCTATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCA
ACATCCACTTTCTTGTTCTCGTTCTTCTTGTAATCCTCGAAGAAGCGGCGGATTTCAGCT
AGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATCATCTGCA
CAAACTGCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATGGGCATTAACCCAATA
GCACGAGCACGAAGGAAGGATCCAGTCAGCACAGG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4CD70JQ 604 0 0
GGTAGTTCACTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATGGAGTC
CTTAATCGCGTCTATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCAACATCCACTTTCTTGTT
CTCGTTCTTATTGTAATCCTCGAAGAAGCGGCGGATTTCAGCTAGACGGTGAGGAGGAAG
CTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATCATCTGCACAAACTGCAATGATCTT
GTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATGGGCATTAACCCAATAGCACGAGCACGAAGGAA
GGATCCAGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACCAGGACATCTATAGGATCACTGTCTTC
ACAAATGGTTCGAGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGATGAGTACAGGAC
ACGATCAACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGCATTTCACCTTGCCACCTTT
GCTAATCTCAACAACACTGTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGACCAATCTCCAAGTCATG
CCAAGGATGAGCAGCAGCTGATCTGTGTGTGAAGGCTGCAAAGTTCCTTTCGTTAAGGGT
AACA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4GW77TF 775 0 0
CAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATGGAGTC*TTAATCGCGTCTATGGC
AGCTTGAGCAGGGAGGAAAC*TTCAACATCCACTTTCTTGTTCTCGTTCTTCTTGTAATC
CTCGAAGAAGCGGCGGATTTCAGCTAGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTA
ATGACGGAACTCGGGATCATCTGCACAAACTGCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTG
ATCAATCATGGGCATTAACCCAATAGCACGAGCACGAAGGAAGGATCCAGTCAGCACAGG
CTCCTGCATGAGTACCAGGACATCTATAGGATCACTGTCTTCACAAATGGTTCGAGGAAT
GAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGATGAGTACAGGACACGATCAACCTTAATAAG
GCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGTATTTCACCTTGCCACCTTTGCTAATCTCAACAACACA
GTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGACCAATCTCCAAGTCATGCCAAGGATGAGCAGCAGC
TGATCTATGCATGAAGGCTGCAAAGTTCCTTTCGTTAAGGGTAACATTAGGGTTCCTCAG
AGGGGAAGAAGCAGAGCTCTTGGGGGTTCCTTCATCCTTGATATCAGCCATATCGATATG
TTCAAGATTCAATTTTGAAGCTTCGATCGCGCAGCTGAATAAGAGATTCCGTAACGTAAC
TTTTTTGTTCCTTTCTTTCGCTTGTAGAGCAGTTACAGTAGCAGTATTCGGGTCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4CD70TF 757 0 0
AGCTGCGTAAAGATCCATGGAGTC**TAATCGCGTCTATG*CAGCT*GAGCAGGGAG*AA
ACCTTCAACATCCACTTTCT*GTTCTCGT*CTTATTGTA*TCCTCGAAGAAGCGGCGGAT
TTCAGCTAGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATC
ATCTGCACAAACTGCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATGGGCATTAA
CCCAATAGCACGAGCACGAAGGAAGGATCCAGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACCAG
GACATCTATAGGATCACTGTCTTCACAAATGGTTCGAGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGG
GTACACAATGGATGAGTACAGGACACGATCAACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAG
CTCGCATTTCACCTTGCCACCTTTGCTAATCTCAACAACACTGTTGAAAACAGCAGGAGC
TTCCGGACCAATCTCCAAGTCATGCCAAGGATGAGCAGCAGCTGATCTGTGTGTGAAGGC
TGCAAAGTTCCTTTCGTTAAGGGTAACATTAGGGTTCCTCAGAGGGGAAGAAGCAGAGCT
CTTGGGGGTTCATTCATCCTTGATATCAGCCATATCGATATGTTCAAGATTCAATTTTGA
AGCTTCGATCGCGCAGCTGAATAAGAGATTCCGTAACGTAACTTTTTTGTTCCTTTCTTT
CGCTTGTAGAGCAGTTACAGTAGCAGTATTCGGGTCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 4

CO CL3472Contig1 435 2 6 U
GGGAGCTGCGGGAGGCTTTAAATGATGAGGTGGATACAAGCAGTGAGGAGGTTGTTGCAG
CCATCATGCAAGATGTTGACACCGACAAGGATGGAAGAATAAGCTACGAAGAGTTTGCAG
CGATGATGAAAGCTGGGACGGACTGGAGGAAAGCATCGAGACAGTATTCGAGGGAAAGGT
TCAACAGTTTGAGCCTCAAGTTAATGAGAGATGGATCATTGCAATTAGAAGGCGAGACAT
GAGAAAGCATGTGGTCTTTTTCAAAAGCATAGTAAATGTTCTGTTTGTGTTTCTCTTAAA
GAAGTAAAAAAAAATGAAAAATAAAGAATATGTAGTCTTCTTTTGTTGTTTCGTTAGATC
AGGGTTTTCAAATGCTTTAGTGACTTTGCATAGCGAGCCACCATGCATGTACGAAATATG
AAAATATTTTGTCTT


BQ
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AF RR4BD91JQ C 1
AF RR4BD91TF U 262
BS 1 261 RR4BD91JQ
BS 262 352 RR4BD91TF
BS 353 353 RR4BD91JQ
BS 354 392 RR4BD91TF
BS 393 393 RR4BD91JQ
BS 394 435 RR4BD91TF

RD RR4BD91JQ 435 0 0
GGGAGCTGCGGGAGGCTTTAAATGATGAGGTGGATACAAGCAGTGAGGAGGTTGTTGCAG
CCATCATGCAAGATGTTGACACCGACAAGGATGGAAGAATAAGCTACGAAGAGTTTGCAG
CGATGATGAAAGCTGGGACGGACTGGAGGAAAGCATCGAGACAGTATTCGAGGGAAAGGT
TCAACAGTTTGAGCCTCAAGTTAATGAGAGATGGATCATTGCAATTAGAAGGCGAGACAT
GAGAAAGCATGTGGTCTTTTTCAAAAGCATAGTAAATGTTCTGTTTGTGTTTCTCTTAAA
GAAGTAAAAAAAAATGAAAAATAAAGAATATGTAGTCTTCTTTTGTTGTTTCGTTAGATC
AGGGTTTTCAAATGCTTTAGTGACTTTGCATAGCGAGCCACCATGCATGTACGAAATATG
AAAATATTTTGTCTT

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR4BD91TF 174 0 0
CAAAAGCATAGTAAATGTTCTGTTTGTGTTTCTCTTAAAGAAGTAAAAAAAAATGAAAAA
TAAAGAATATGTAGTCTTCTTTTGTTGTTTCTTTAGATCAGGGTTTTCAAATGCTTTAGT
GACTTTGCATATCGAGCCACCATGCATGTACGAAATATGAAAATATTTTGTCTT

QA 1 174 1 174
DS 



CO CL3472Contig2 887 2 2 U
GCAAGGCTCAAACAGTTTTCTGTTATGAACAAGCTCAAGAAACGAGCTCTACGGGTGATA
GCCGAACACTTGTCAGTGGAGGAAGTAGCTGGCATTAAGGAAGCTTTTGAGACGATGGAC
AGAAGAAAGACGGGGAAGATAAACCTCGAATAGCTTAAACATGGACTTCATAAACTCGGA
CAGCAGCAGATACCTGATACTGATCTACAGATTTTGATGGAAGCTGCTGATGTAGATGGG
GACGGGACTTTAAACTATGGCGAGTTTGTGGCAGTCTCTGTGCATCTTAAGAAGATGGCG
AACGACGAACACTTGCATAAGGCGTTTAGCTTTTTTGACAAGAACCAGAGCGAATACATA
GAGATTGAGGAGCTGCGGGAGGCTTTAAATGATGAGGTGGATACAAGCAGTGAGGATGTT
GTTGCAGCCATCATGCAAGATGTTGACACCGACAAGGATGGGAGAATAAGCTACGAGGAG
TTTGCAGCGATGATGAAAGCTGGGACGGACTGGAGGAAAGCGTCTAGACAGTATTCGAGG
GAAAGGTTCAACAGCTTGAGCCTCAAGTTAATGAGAGATGGCTCATTGCAATTAGAAGGC
GAGACCTGAGAGATAGCATGGGGTCTCTCTTTCAAAAGCCATAGTAAAGGTTCTGTTTGT
GTTTCTCTTAAAGAAGTAAAAAGAACAAAAAAAATACAGTATTCTTTGAAAATGTAGTGT
CTTCTTTTGTTGTTTTCGTTAGATCAGGGTTTTCAAATGCGTTAGCGACTTGAATAGCGA
GCCACCATGTACGAGATGTGAAGATGTTTTAAATTTTCTGACTTTTGTTTTAGTGTTGTC
TGGATACTTAACTATATTACGTGTAAGAAGAGTACATAGTTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF54TF U 1
AF RR4DF54JQ C 198
BS 1 593 RR4DF54TF
BS 594 887 RR4DF54JQ

RD RR4DF54TF 593 0 0
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GCCGAACACTTGTCAGTGGAGGAAGTAGCTGGCATTAAGGAAGCTTTTGAGACGATGGAC
AGAAGAAAGACGGGGAAGATAAACCTCGAATAGCTTAAACATGGACTTCATAAACTCGGA
CAGCAGCAGATACCTGATACTGATCTACAGATTTTGATGGAAGCTGCTGATGTAGATGGG
GACGGGACTTTAAACTATGGCGAGTTTGTGGCAGTCTCTGTGCATCTTAAGAAGATGGCG
AACGACGAACACTTGCATAAGGCGTTTAGCTTTTTTGACAAGAACCAGAGCGAATACATA
GAGATTGAGGAGCTGCGGGAGGCTTTAAATGATGAGGTGGATACAAGCAGTGAGGATGTT
GTTGCAGCCATCATGCAAGATGTTGACACCGACAAGGATGGGAGAATAAGCTACGAGGAG
TTTGCAGCGATGATGAAAGCTGGGACGGACTGGAGGAAAGCGTCTAGACAGTATTCGAGG
GAAAGGTTCAACAGCTTGAGCCTCAAGTTAATGAGAGATGGCTCATTGCAATT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4DF54JQ 690 0 0
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TGGCGAGTTTGTGGCAGTCTCTGTGCATCTTAAGAAGATGGCGAACGACGAACACTTGCA
TAAGGCGTTTAGCTTTTTTGACAAGAACCAGAGCGAATACATAGAGATTGAGGAGCTGCG
GGAGGCTTTAAATGATGAGGTGGATACAAGCAGTGAGGATGTTGTTGCAGCCATCATGCA
AGATGTTGACACCGACAAGGATGGGAGAATAAGCTACGAGGAGTTTGCAGCGATGATGAA
AGCTGGGACGGACTGGAGGAAAGCGTCTAGACAGTATTCGAGGGAAAGGTTCAACAGCTT
GAGCCTCAAGTTAATGAGAGATGGCTCATTGCAATTAGAAGGCGAGACCTGAGAGATAGC
ATGGGGTCTCTCTTTCAAAAGCCATAGTAAAGGTTCTGTTTGTGTTTCTCTTAAAGAAGT
AAAAAGAACAAAAAAAATACAGTATTCTTTGAAAATGTAGTGTCTTCTTTTGTTGTTTTC
GTTAGATCAGGGTTTTCAAATGCGTTAGCGACTTGAATAGCGAGCCACCATGTACGAGAT
GTGAAGATGTTTTAAATTTTCTGACTTTTGTTTTAGTGTTGTCTGGATACTTAACTATAT
TACGTGTAAGAAGAGTACATAGTTTTGTTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL3473Contig1 935 4 12 U
TCTTTGATTATATGCTAAAAAATCTTGGCAATTAGTTCATCGGCATCTAATCAAAATGAA
TCATGATATCCAGTAAACTTACATACAATACAAGGGATCAAACACCAGCAAACTCACCAG
CACTATTCTTATCATGAATCTCCTATGGCATTTCTCTCTTCCAGTCTCTCAACTATATAG
CCATAAACCAAACTCACTTGGCTTAACAACCAGATCACTATAGAACAGTGATCGAACCTA
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TATTTCTTAAGTTGTGGTCGGTCCAATGGGTCCAAAATCTTGAAATGGCCAAACCCGCCA
AAGCACTCTGCCTTGAATAAGACCATAAGGTAAAGGACCAAAGGTTCTCGAGTCTTTCGA
GTTCTGAGTATAGTCACCTTGCACCCACACATGCCCTTTAGGAACCACGATGGTTCTTCT
TGATTCATCTTTATCAACCACAAAGCTTATACAATCTCCTTCAAGTCCAATCACTCTCTT
GATGGGAAGCTTATTAGGGTCTTGTGGAGATCGGAAAAAAACGACATCTCCACGACTCAG
TTTGGAGATTCGTTCGGTCAGTACGACATTCCCGGAAGGATGAAGCGTGGGGATCATGCT
CGGACCAAAAGCATAAGCAGGGAAGGCGAGATAGTTCGTGGTCACATGGAGAAAGGAGTA
TACTTTCGCGACAAGCACACCGCTTCTCATGGCTTGTTGATATGCTATGTTCCAGAACGA
AGACGCCATTGCTGGCTCAATCGAGAGATTCGACTACGAGAATCAAAGTTAACGCCTTTC
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AGTCTGAGAGAGGGAGAGGAATCTGATTCTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FS43JQ U 37
AF RR4GN71JQ U 1
AF RR4GN71TF C 172
AF RR4FS43TF C 378
BS 1 115 RR4GN71JQ
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BS 392 427 RR4GN71JQ
BS 428 935 RR4GN71TF

RD RR4FS43JQ 341 0 0
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ATCAAACACCAGCAAACTCACCAGCACTATTCTTATCATGAATCTCCTATGGCATTTCTC
TCTTCCAGTCTCTCAACTATATAGCCATAAACCAAACTCACTTGGCTTAACAACCAGATC
ACTATAAAACAGTGATCGAACCTAACAAACCGCCCCGATCATCTGCCAAAAAAAACCAAC
CAAGCTAACTCCTGAGCCAAACCATATTTCTTAAGTTGTGGTCGGTCCAATGGGTCCAAA
ATCTTGAAATGGCCAAACCCGCCAAAGCACTCTGCCTTGAA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR4GN71JQ 427 0 0
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TCATGATATCCAGTAAACTTACATACAATACAAGGGATCAAACACCAGCAAACTCCCCAG
CACTATTCTTATCATGAATCTCCTATGGCATTTCTCTCTTCCAGTCTCTCAACTATATAG
CCATAAACCAAACTCACTTGGCTTAACAACCAGATCACTATAGAACAGTGATCGAACCTA
ACAAACCGCCCCGATCATCTGCCAAAAAGAACCAACCAAGCTAACTCCTGAGCCAAACCA
TATTTCTTAAGTTGTGGTCGGGCCAATGGGTCCAAAATCTTGAAATGGCCAAACCCCCCA
AAGCACTCTGCCTTGAATAAAACCATAAGGGAAAGGACCAAAGGTTCTCGAGTCTTTCGA
GTTCTGA

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4GN71TF 764 0 0
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GTCTTTCGAGTTCTGAGTATAGTCACCTTGCACCCACACATGCCCTTTAGGAACCACGAT
GGTTCTTCTTGATTCATCTTTATCAACCACAAAGCTTATACAATCTCCTTCAAGTCCAAT
CACTCTCTTGATGGGAAGCTTATTAGGGTCTTGTGGAGATCGGAAAAAAACGACATCTCC
ACGACTCAGTTTGGAGATTCGTTCGGTCAGTACGACATTCCCGGAAGGATGAAGCGTGGG
GATCATGCTCGGACCAAAAGCATAAGCAGGGAAGGCGAGATAGTTCGTGGTCACATGGAG
AAAGGAGTATACTTTCGCGACAAGCACACCGCTTCTCATGGCTTGTTGATATGCTATGTT
CCAGAACGAAGACGCCATTGCTGGCTCAATCGAGAGATTCGACTACGAGAATCAAAGTTA
ACGCCTTTCAGATTTCAACAATCAAACCTTCTTTGTTGCGGCGGCGAGGACAAGTATCTT
CGAGATTAGAGTCTGAGAGAGGGAGAGGAATCTGATTCTCCTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4FS43TF 558 0 0
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CCACAAAGCTTATACAATCTCCTTCAAGTCCAATCACTCTCTTGATGGGAAGCTTATTAG
GGTCTTGTGGAGATCGGAAAAAAACGACATCTCCACGACTCAGTTTGGAGATTCGTTCGG
TCAGTACGACATTCCCGGAAGGATGAAGCGTGGGGATCATGCTCGGACCAAAAGCATAAG
CAGGGAAGGCGAGATAGTTCGTGGTCACATGGAGAAAGGAGTATACTTTCGCGACAAGCA
CACCGCTTCTCATGGCTTGTTGATATGCTATGTTCCAGAACGAAGACGCCATTGCTGGCT
CAATCGAGAGATTCGACTACGAGAATCAAAGTTAACGCCTTTCAGATTTCAACAATCAAA
CCTTCTTTGTTGCGGCGGCGAGGACAAGTATCTTCGAGATTAGAGTCTGAGAGAGGGAGA
GGAATCTGATTCTCCTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 4

CO CL3474Contig1 687 4 8 U
AAATAAAACTGGTATGGTAAAATGAATTGTCTCAGCAAAAAGAGAACCATTAACAAACAC
AAGAATAAAA*GATAAAAGTATACTTAGACCGCAGCCTTGTCTTTAAAACTCGATTAGAA
AAACAGACTAAGCGACCCATAGGATCATCAAAACACAAGTCACCGAAGCAAAACTCATAT
GAGAGAGCGTATCAAACCAAAACCAATAATCTTTTTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAG
AGAGCTTCACCTTCAAACGGCTCTACGTCCTCGATCATCTGGCTAACACGCTCCTTCTGG
GCTTCATCGGAGATGTCGACCTTAGTCCACTCGTACAGCTCCATGTCGTACACCCCATCC
ATAACGAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAACGGA
CCTTCTGCCCCGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTACTTGCGTGCCAAATCCATTCTC
TGCAGGAATCCACCAACCTTGTTGAGGGTGACGAATGACACAGTGTTCACGTCATTGTAT
TTGTAGTCGCAGAACCACAGTGAGTATCCCTCTGGATCATACATGTCCCAGAATCCTTTG
ATAGCAACCTCACGGAAGTTGGACTTGGTGTTTGAGTACAGCCTCTTCCACTCATCGAGA
ACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAGTCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV04TF C 1
AF RR4CV04JQ U 1
AF RR4G584JQ U 29
AF RR4FM69JQ U 29
BS 1 21 RR4CV04JQ
BS 22 22 RR4CV04TF
BS 23 459 RR4CV04JQ
BS 460 485 RR4FM69JQ
BS 486 486 RR4G584JQ
BS 487 528 RR4FM69JQ
BS 529 529 RR4G584JQ
BS 530 687 RR4FM69JQ

RD RR4CV04TF 124 0 0
AAATAAAACTGGTATGGTAAAATGAATTGTCTCAGCAAAAAGAGAACCATTAACAAACAC
AAGAATAAAAAGATAAAAGTATACTTAGACCGCAGCCTTGTCTTTAAAACTCGATTAGAA
AAA
A

QA 1 123 1 123
DS 

RD RR4CV04JQ 460 0 0
AAATAAAACTGGTATGGTAAA*TGAATTGTCTCAGCAAAAAGAGAACCATTAACAAACAC
AAGAATAAAA*GATAAAAGTATACTTAGACCGCAGCCTTGTCTTTAAAACTCGATTAGAA
AAACAGACTAAGCGACCCATAGGATCATCAAAACACAAGTCACCGAAGCAAAACTCATAT
GAGAGAGCGTATCAAACCAAAACCAATAATCTTTTTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAG
AGAGCTTCACCTTCAAACGGCTCTACGTCCTCGATCATCTGGCTAACACGCTCCTTCTGG
GCTTCATCGGAGATGTCGACCTTAGTCCACTCGTACAGCTCCATGTCGTACACCCCATCC
ATAACGAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAACGGA
CCTTCTGCCCCGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTAC
C

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR4G584JQ 607 0 0
GC
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CGCAGCCTTGTCTTTAAAACTCGATTAGAAAAACAGACTAAGCGACCCATAGGATCATCA
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TCGATCATCTGGCTAACACGCTCCTTCTGGGCTTCATCGGAGATGTCGACCTTAGTCCAC
TCGTACAGCTCCATGTCGTACACCTCATCCATAACGAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGG
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AAGGCGTACTTGCGTGCCAAATCCATTCTCTGCAGGAATCCACCAACCTTGTTGAGGGTG
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TCTGGGTCATACATGTCCCAGAATCCTTTGATAGCAACCTCACGGAAGTTGGACTTGGTG
TTTGA

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR4FM69JQ 659 0 0
GT
CTCAGCAAAAAGAGAACCATTAACAAACACAAGAATAAAA*GATAAAAGTATACTTAGAC
CGCAGCCTTGTCTTTAAAACTCGATTAGAAAAACGGACTAAGCGACCCATAGGATCATCA
AAACACAAGTCACCGAAGCAAAACTCATATGAGAGAGCGTATCAAACCAAAACCAATAAT
CTTTTTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAGAGAGCTTCACCTTCAAACGGCTCTACGTCC
TCGATCATCTGGCTAACACGCTCCT***GGGCTTCATCGGAGATGTCGACCTTAGTCCGC
TCGTACAGCTCCATGTCGTACACCCCATCCATAACGAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGG
AACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAACGGACCTTCTGCCCCGCAAATCAGCATCTTTCCA
AAGGCGTACTTGCGTGCCAAATCCATTCTCTGCAG*AATCCACCAACCTTGTTGAGGGTG
ACGAATGACACAGTGTTCTCGTCATTGTATTTGTAGTCGCAGAACCACAGTGAGTATCCC
TCTGGATCATACATGTCCCAGAATCCTTTGATAGCAACCTCACGGAAGTTGGACTTGGTG
TTTGAGTACAGCCTCTTCCACTCATCGAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAGTCA

QA 3 659 3 659
DS 



AS 1 2

CO CL3475Contig1 874 2 10 U
GGAACCTCAGGCGAGTGATCATGTTCTTGGTTCTATATCTAACCGTCGGTACTCTCTGTT
TCTACCTCGTGAGAAACCAGATCTCCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCTGTCT
ACTTCTGCGTTGTAACAATGACAACCGTTGGATACGGCGACCTTGTCCCTAGTAGCTCTG
CATCTATACTACTCGCTTGTGCCTTTGTCTTCTCAGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTCT
TAAGCCGAGCAGCGGATTATCTAGTGGAGAAGCAAGAGACTTTGCTGGTCAGGGCTTTCC
ATTTGCGTCAAAGCTCCGGTCCACTAGACGTTCTCAAGGAGTTGCAAACTAACAAGATGA
GATACAAATGCTACGTCACGTTCATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCCTTGCCGGTACTGTTT
TCCTTGTAACGTTTGAGAATATGCCGGTTATTGAAGCCTTCTACTGTGTTTGCTCCACGG
TTACTACATTGGGTTATGGAGACAAAAGCTTTAACTCGGGAACCGGACGCCTTTTCGCTG
TGTTTTGGATCTTGACGAGTACTATATGTTTGGCTCAGCTTCTACTCTATGTAGCTGAGT
TAAATGCAGAAACCAAGCAGAGGGAGTTGGTGAAAGGTGTTTTGACAAGGAGGATCACAA
ACAATGATCTTGAAGCTGCTGATCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTTA
TTGTATATAAGCTGAAAGAAATGGGGAAGATAGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATGG
AAGAGTTTGAGCAACTTGATTACGATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCGTTC
TAGCTCAGATCCAAAGGTAAGCAGCATTCATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC23TF U 1
AF RR4E663TF U 237
BS 1 338 RR4BC23TF
BS 339 339 RR4E663TF
BS 340 356 RR4BC23TF
BS 357 357 RR4E663TF
BS 358 490 RR4BC23TF
BS 491 491 RR4E663TF
BS 492 635 RR4BC23TF
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BS 637 802 RR4BC23TF
BS 803 874 RR4E663TF

RD RR4BC23TF 804 0 0
GGAACCTCAGGCGAGTGATCATGTTCTTGGTTCTATATCTAACCGTCGGTACTCTCTGTT
TCTACCTCGTGAGAAACCAGATCTCCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCTGTCT
ACTTCTGCGTTGTAACAATGACAACCGTTGGATACGGCGACCTTGTCCCTAGTAGCTCTG
CATCTATACTACTCGCTTGTGCCTTTGTCTTCTCAGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTCT
TAAGCCGAGCAGCGGATTATCTAGTGGAGAAGCAAGAGACTTTGCTGGTCAGGGCTTTCC
ATTTGCGTCAAAGCTCCGGTCCACTAGACGTTCTCAAGTAGTTGCAAACTAACAAGCTGA
GATACAAATGCTACGTCACGTTCATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCCTTGCCGGTACTGTTT
TCCTTGTAACGTTTGAGAATATGCCGGTTATTGAAGCCTTCTACTGTGTTTGCTCCACGG
TTACTACATTTGGTTATGGAGACAAAAGCTTTAACTCGGGAACCGGACGCCTTTTCGCTG
TGTTTTGGATCTTGACGAGTACTATATGTTTGGCTCAGCTTCTACTCTATGTAGCTGAGT
TAAATGCAGAAACCAAGCAGAGGGAGTTGGTGAAATGTGTTTTGACAAGGAGGATCACAA
ACAATGATCTTGAAGCTGCTGATCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTTA
TTGTATATAAGCTGAAAGAAATGGGGAAGATAGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATGG
AAGAGTTTGAGCAACTTGATTA
TG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4E663TF 638 0 0
TTT
TTAAGCCGAGCAGCGGATTATCTAGTGGAGAAGCAAGAGACTTTGCTTGTCAGGGCTTTC
CATTTGCGTCAAAGCTCCGGTCCACTAGACGTTCTCAAGGAGTTGCAAACTAACAAGATG
AGATACAAATGCTACGTTACGTTCATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCCTTGCTGGTACTGTT
TTCCTTGTAACGTTTGAGAATATGCCGGTTATTGAAGCCTTCTACTGTGTTTGCTCCACG
GTTACTACATTGGGTTATGGAGACAAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGCCTTTTCGCT
GTGTTTTGGATCTTGACGAGTACTATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGCTGAG
TTAAATGCGGAAACTAAGCAGAGGGAGTTGGTGAAAGGT**TTTGACAAGGAGGATCACA
AACAATGATCTTGAAGCTGCTGATCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTT
ATTGTATATAAGCTGAAAGAAATGGGGAAGATAGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATG
GAAGAGTTTGAGCAACTTGATTACGATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCGTT
CTAGCTCAGATCCAAAGGTAAGCAGCATTCATTTA

QA 4 638 4 638
DS 



AS 1 4

CO CL3476Contig1 761 4 5 U
GATCCCAGAGTCATCAATGGATTCAACCATGAGAAGAAGATTCCTGTGTGGCAAAAGATT
TTGGTAAGCAGACAAAGGTCAACAAATGTTAATCCACTATACAAAAATGTTGCAGCTTGC
TCTCACAGTCACAATCCAGTTTCCCAAAGTTTAGTGAAAACTGGAGGATAAGGTCAAAAA
GAAACTGAAGAGACTGTAGACAACTCATTGTGTTAAATGCGGAAACAGAGTACTGGCTTT
TAACTATTCACACTACAAACGAATTCACAGATCCGAGGAAATTTTAAGCTCTGAACAAAT
TCCAACTCAGACAGGTAGTAATTACAGATGAGAGATGAGAGATGCTGCGGTGATTCTCAC
AATGAAAGAGAAAAGAATATACATAACCAAATCCACAGGACTGAAATAAAGAGTAGGTAG
AGTGACCTACTGTCAAATAAATTTGCATGCCTCTCAGGACATATTTGTTCTCCTCCAGGA
AGCTCTTCATACTCGTAATCCTCTGAGGTTTCAGCCGGCACTGGTGTGTAACCAGCGTAA
GGATCCAAATTAGGGAAATACACAAACAAGAGAGTCCCAAATGCAACCTGGATCCAAAAG
CCACCTTCTACGTCATTATCAAAATAAGTTGTATAATCTACAATCTAATTTATAGATACA
GCACATGGTAAATAGAAGTTTAGAGAATGCAAAAAGGAGTGTTACAAATGTGCAAACCTG
AACTGCCACCTCGCTTATGTAAAGATACAGTTTGAAACTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CZ03JQ C 1
AF RR4CQ59TF U 51
AF RR4CZ03TF U 1
AF RR4CQ59JQ C 48
BS 1 50 RR4CZ03TF
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RD RR4CZ03JQ 761 0 0
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QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CQ59TF 697 0 0
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ACCAGCGTAAGGATCCAAATTAGGGAAATACACAAACAAGAGAGTCCCAAATGCAACCTG
GATCCAAAAGCCACCTTCTACGTCATTATCAAAATAAGTTGTATAATCTACAATCTAATT
TATAGATACAGCACATGGTAAATAGAAGTTTAGAGA*TGCAAAAAGGAGTGTTACAAATG
TGCAAACCTGAACTGCCACCTCGCTTATGTAA
AGATA

QA 1 692 1 692
DS 

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TTGGTAAGCAGACAAAGGTCAACAAATGTTAATCCACTATACAAAAATGTTGCAGCTTGC
TCTCACAGTCACAATCCAGTTTCCCAAAGTTTAGTGAAAACTGGAGGATAAGGTCAAAAA
GAAACTGAAGAGACTGTAGACAACTCATTGTGTTAAATGCGGAAACAGAGTACTGGCTTT
TAACTATTCACACTACAAACGAATTCACAGATCCGAGGAAATTTTAAGCTCTGAACAAAT
TCCAACTCAGACAGGTAGTAATTACAGATGAGAGATGAGAGATGCTGCGGTGATTCTCAC
AATGAAAGAGAAAAGAATATACATAACCAAATCCACAGGACTGAAATAAAGAGTAGGTAG
AGTGACCTACTGTCAAATAAATTTGCATGCCTCTCAGGACATATTTGTTCTCCTCCAGGA
AGCTCTTCATACTCGTAATCCTCTGAGGTTTCAGCCGGCACTGGTGTGTAACCAGCGTAA
GGATCCAAATTAGGGAAATACACAAACAAGAGAGTCCCAAATGCAACCTGGATCCAAAAG
CCACCTTCTACGTCATTATCAAAATAAGTTGTATAATCTACAATCTAATTTATAGATACA
GCACATGGTAAATAGAAGTTTAGAGAATGCAAAA*GGAGTGTTACAAATGTGCAAACCTG
AACTGCCACCTCGCTTATGTAA
G

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4CQ59JQ 714 0 0
GTG
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TACTGGCTTTTAACTATTCACACTACAAACGAATTCACAGATCCGAGGAAATTTTAAGCT
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TGATTCTCACAATGAAAGAGAAAAGAATATACATAACCAAATCCACAGGACTGAAATAAA
GAGTAGGTAGAGTGACCTACTGTCAAATAAATTTGCATGCCTCTCAGGACATATTTGTTT
TCCTCCAGGAAGCTCTTCATACTCGTAATCCTCTGAGGTTTCAGCCGGCACTGGTGTGTA
ACCAGCGTAAGGATCCAAATTAGGGAAATACACAAACAAGAGAGTCCCAAATGCAACCTG
GATCCAAAAGCCACCTTTTACGTCATTATCAAAATAAGTTGTATAATCTACAATCTAATT
TATAGATACAGCACATGGTAAATAGAAGTTTAGAGAATGCAAAAAGGAGTGTTACAAATG
TGCAAACCTGAACTGCCACCTCGCTTATGTAAAGATACAGTTTGAAACTGC

QA 4 714 4 714
DS 



AS 1 4

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GCAGGTCGTCTCTCTTCAGGATTGATCGTGTACTTGCGTTTACGAGTAGATGTCTTAAAT
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CTTTATTAAACCGACCACTTTTCACTTGACTGTGCTTATGCTAAAGCTATGGAACAAAGA
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GACCGGTTATTACCGCTGCTGTGCTTCCATACCCTTTCCCGGAGAACACAGAGACTGAGA
AGAAACGTCAAACCGGCCAGAATCTCAAGTCTCAAGCTGTACCTGAGTCCCAACATGTTT
CTGCTATGTGTGTGACCACTATGAAATTCTACAACTTTGAGAAGTGAACCGAATTGTAAA
ATTAATCATATATTAATAAAAACAAATCTTATATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E601TF U 1
AF RR4E672TF U 1
AF RR4E601JQ C 355
AF RR4E672JQ C 524
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RD RR4E601TF 695 0 0
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GCAGGTCGTCTCTCTTCAGGATTGATCGTGTACTTGCGTTTACGAGTAGATGTCTTAAAT
CGAAACAAGAAAGTTTCAGTATAATGAGTTATAAGAGAAACGCTGCAATGGATGGAAGCA
AGAAGGTGGATCAGTGGACTGTGTGAGCAAAGCCTCAGAACGAATAGCTACCGCTATCGA
TGAGGTTGTAAAGAGTCCGAGTCTTTACTACTCACACTTTGTATCACTTCCACTAGCCAT
ACACCCTGAGTTAGTGGGAAAGCTAGTCAACTTTCAAAACTCTATACTCGGTGACCATAG
CATAGCTGTTGATGAAGCAAGGTCATCTACTTTATTTGACTTGGGAATTGAAAAGTCAAT
CTTTATTAAACCGACCACTTTTCACTTGACTGTGCTTATGCTAAAGCTATGGAACAAAGA
TAGAATCAATGCGGCCCGTGATGTTCTGAAGAGTATATCTCCTAGTGTGATGGATGCTTT
GGATAACCGGCCGTTATTCATTAGACTTAAAGGACTGGATTGTATGAGAGGATTACTAGC
TAAGGCTCGTGTGCTCTACATTCCTGTTGAAGAAATTGGTGATGAAAGCAGGCTTTTACG
TGCTTGCAAAGTTATCACTGATGCATTTGTGAAAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4E672TF 753 0 0
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GCAGGTCGTCTCTCTTCAGGATTGATCGTGTACTTGCGTTTACGAGTAGATGTCTTAAAT
CGAAACAAGAAAGTTTCAGTATAATGAGTTATAAGAGAAACGCTGCAATGGATGGAAGCA
AGAAGGTGGATCAGTGGACTGTGTGAGCAAAGCCTCAGAACGAATAGCTACCGCTATCGA
TGAGGTTGTAAAGAGTCCGAGTCTTTACTACTCACACTTTGTATCACTTCCACTAGCCAT
ACACCCTGAGTTAGTGGGAAAGCTAGTCAACTTTCAAAACTCTATACTCGGTGACCATAG
CATAGCTGTTGATGAAGCAAGGTCATCTACTTTATTTGACTTGGGAATTGAAAAGTCAAT
CTTTATTAAACCGACCACTTTTCACTTGACTGTGCTTATGCTAAAGCTATGGAACAAAGA
TAGAATCAATGCGGCCCGTGATGTTCTGAAGAGTATATCTCCTAGTGTGATGGATGCTTT
GGATAACCGGCCGTTATTCATTAGACTTAAAGGACTGGATTGTATGAGAGGATTACTAGC
TAAGGCTCGTGTGCTCTACATTCCTGTTGAAGAAATTGGTGATGAA*GCAGGCTTTTACG
TGCTTGCAA*GTTATCACTGATGCATTTGTGAAAGCTGGACTTGTTCTTGAAAA*GATGC
AA*CCAAAGCTTGAAGCTGCACGCGACTGTGAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4E601JQ 761 0 0
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GTCAATCTTTATTAAACCGACCACTTTTCACTTGACTGTGCTTATGCTAAAGCTATGGAA
CAAAGATAGAATCAATGCGGCCCGTGATGTTCTGAAGAGTATATCTCCTAGTGTGATGGA
TGCTTTGGATAACCGGCCGTTATTCATTAGACTTAAAGGACTGGATTGTATGAGAGGATT
ACTAGCTAAGGCTCGTGTGCTCTACATTCCTGTTGAAGAAATTGGTGATGAAGGCAGGCT
TTTACGTGCTTGCAAAGTTATCACTGATGCATTTGTGAAAGCTGGACTTGTTCTTGAAAA
AGATGCAAACCAAAGCTTGAAGCTGCACGCGACTGTGATGAACGCTAGACACAGGAAAAG
AAAGGACAAAAGAAAGAAGATGGATACGTTTGATGCAAGGGAGATACATCAACAGTTTGG
AAATGAAGACTGGGGAGAGTATCTGATCCAAGAAGCTCATCTCTCGCAGCGTTTTGTGTT
TGACCAGACCGGTTATTACCGCTGCTGTGCTTCCATACCCTTTCCCGGAGAACACAGAGA
CTGAGAAGAAACGTCAAACCGGCCAGAATCTCAAGTCTCAAGCTGTACCTGAGTCCCAAC
ATGTTTCTGCTATGTGTGTGACCACTATGAAATTCTACAACTTTGAGAAGTGAACCGAAT
TGTAAAATTAATCATATATTAATAAAAACAAATCTTATATC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4E672JQ 592 0 0
AGTGTGATGGATGCTTTGGATAACCGGCCGTTATTCATTAGACTTAAAGGACTGGATTGT
ATGAGAGGATTACTAGCTAAGGCTCGTGTGCTCTACATTCCTGTTGAAGAAATTGGTGAT
GAAGGCAGGCTTTTACGTGCTTGCAAAGTTATCACTGATGCATTTGTGAAAGCTGGACTT
GTTCTTGAAAAAGATGCAAACCAAAGCTTGAAGCTGCACGCGACTGTGATGAACGCTAGA
CACAGGAAAAGAAAGGACAAAAGAAAGAAGATGGATACGTTTGATGCAAGGGAGATACAT
CAACAGTTTGGAAATGAAGACTGGGGAGAGTATCTGATCCAAGAAGCTCATCTCTCGCAG
CGTTTTGTGTTTGACCAGACCGGTTATTACCGCTGCTGTGCTTCCATACCCTTTCCCGGA
GAACACAGAGACTGAGAAGAAACGTCAAACCGGCCAGAATCTCAAGTCTCAAGCTGTACC
TGAGTCCCAACATGTTTCTGCTATGTGTGTGACCACTATGAAATTCTACAACTTTGAGAA
GTGAACCGAATTGTAAAATTAATCATATATTAATAAAAACAAATCTTATATC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 4

CO CL3478Contig1 1107 4 8 U
GGCCAATATTTTCCGATCGCAGCGGAGCTTAAACAGTGGGAACCATGCTACTTTTGACGG
TTTCTAGCTCCGCGCCCATCTTCCGCATCGGTGAACCACCAGCGTCCGTAATTGGTTGGA
AGCAAGCGTTGAGATTCCGGAGGACGAAGAAGCCTAGGGCTATCATCTCTTGCGATTATT
CATGCATCGAGGTTAGGGATATATGCTACTGTCCTCCTGGAACAGAGTTGAATATTTTGA
ATGGTGTTAATCTTTCTCTCCGTGAGAAGAGCTTTGGATTGATTTTTGGCAAGAGTGGGA
GCGGCAAAACTACGCTTTTGCAGCTTCTTGCTGGGCTGAACAAACCTACGTCAGGTTCCA
TTTGTATCCAAAGATATGGGGATGATGGCCAGCTAAAGGCGGATCCTGAGTTGTTGCCCA
CTGAGAAAGTGGGAATTGTTTTCCAGTTTCCAGAGAGATTCTTTGTTGCAGATAATGTGC
TTGACGAGATTACTTTTGGTTGGCCAAGGCAAAAGGGTAGTTTGCAATTAAGGGAGCATC
TGACTTCAAACCTCCAGAGGGCATTTAATTGGGTTGGGTTAGACAGCATCCCACTTGATA
AAGACCCCCAGTTACTAAGTGGAGGCTATAAGCGTCGGCTTGCACTAGCTATTCAACTGG
TGCAAACTCCTGATTTATTGATTCTGGATGAGCCCCTCGCTGGTCTTGATTGGAAAGCAC
GCGCAGATGTTGCGAAGCTCTTGAAGCACCTAAAGAAGGAACTGACTTTACTTGTTGTAA
GTCATGACTTAAGAGAGTTAGCAACCTTGGTCGACCAGTCATGGAGAATGGAATCAGGTG
GTGTTCTTGTTGCAGAGCGTCCACCAGTTTAGTTCGATATTTATTACTGCCGAAGGTCCC
TACCAGCTCCAACACCAAGTCTGCAAAGCAATTTTGGATTATTATCTGGTTCAATCACAA
GCAGAAAACTAGTGCATGCCTAAATGCCAATGTATCAAAAAAAATTGTCTTTTCGAGTAA
AGATCCTACATACTTTTTTGAAAATACAGAATCACATTCTTTCTTTGAAATAAATGGGCT
TATGTAAATATTATAAATTAGTTTTGT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AJ17TF U 1
AF RR4A066TFB U 4
AF RR4AJ17JQ C 297
AF RR4A066JQD C 350
BS 1 757 RR4AJ17TF
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BS 759 759 RR4AJ17TF
BS 760 760 RR4A066TFB
BS 761 827 RR4AJ17TF
BS 828 945 RR4AJ17JQ
BS 946 946 RR4A066JQD
BS 947 1107 RR4AJ17JQ

RD RR4AJ17TF 834 0 0
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AGCAAGCGTTGAGATTCCGGAGGACGAAGAAGCCTAGGGCTATCATCTCTTGCGATTATT
CATGCATCGAGGTTAGGGATATATGCTACTGTCCTCCTGGAACAGAGTTGAATATTTTGA
ATGGTGTTAATCTTTCTCTCCGTGAGAAGAGCTTTGGATTGATTTTTGGCAAGAGTGGGA
GCGGCAAAACTACGCTTTTGCAGCTTCTTGCTGGGCTGAACAAACCTACGTCAGGTTCCA
TTTGTATCCAAAGATATGGGGATGATGGCCAGCTAAAGGCGGATCCTGAGTTGTTGCCCA
CTGAGAAAGTGGGAATTGTTTTCCAGTTTCCAGAGAGATTCTTTGTTGCAGATAATGTGC
TTGACGAGATTACTTTTGGTTGGCCAAGGCAAAAGGGTAGTTTGCAATTAAGGGAGCATC
TGACTTCAAACCTCCAGAGGGCATTTAATTGGGTTGGGTTAGACAGCATCCCACTTGATA
AAGACCCCCAGTTACTAAGTGGAGGCTATAAGCGTCGGCTTGCACTAGCTATTCAACTGG
TGCAAACTCCTGATTTATTGATTCTGGATGAGCCCCTCGCTGGTCTTGATTGGAAAGCAC
GCGCAGATGTTGCGAAGCTCTTGAAGCACCTAAAGAA*GGACTGACTTTACTTGTTGTAA
GTCATGACTTAAGAGAGTTAGCAACCTTGGTCGACCAGTCATGGAGA
TGGAATC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4A066TFB 820 0 0
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CTAGCTCCGCGCCCATCTTCCGCATCGGTGAACCACCAGCGTCCGTAATTGGTTGGAAGC
AAGCGTTGAGATTCCGGAGGACGAAGAAGCCTAGGGCTATCATCTCTTGCGATTATTCAT
GCATCGAGGTTAGGGATATATGCTACTGTCCTCCTGGAACAGAGTTGAATATTTTGAATG
GTGTTAATCTTTCTCTCCGTGAGAAGAGCTTTGGATTGATTTTTGGCAAGAGTGGGAGCG
GCAAAACTACGCTTTTGCAGCTTCTTGCTGGGCTGAACAAACCTACGTCAGGTTCCATTT
GTATCCAAAGATATGGGGATGATGGCCAGCTAAAGGCGGATCCTGAGTTGTTGCCCACTG
AGAAAGTGGGAATTGTTTTCCAGTTTCCAGAGAGATTCTTTGTTGCAGATAATGTGCTTG
ACGAGATTACTTTTGGTTGGCCAAGGCAAAAGGGTAGTTTGCAATTAAGGGAGCATCTGA
CTTCAAACCTCCAGAGGGCATTTAATTGGGTTGGGTTAGACAGCATCCCACTTGATAAAG
ACCCCCAGTTACTAAGTGGAGGCTATAAGCGTCGGCTTGCACTAGCTATTCAACTGGTGC
AAACTCCTGATTTATTGATTCTGGATGAGCCCCTCGCTGGTCTTGATTGGAAAGCACGCG
CAGATGTTGCGAAGCTCTTGAAGCACCTAAAGAAAGAACTGACTTTACTTGTTGTAAGTC
ATGACTTAAGAGAGTTAGCAACCTTGGTCGACCAGTCATG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4AJ17JQ 811 0 0
GGGAGCGGCAAAACTACGCTTTTGCAGCTTCTTGCTGGGCTGAACAAACCTACGTCAGGT
TCCATTTGTATCCAAAGATATGGGGATGATGGCCAGCTAAAGGCGGATCCTGAGTTGTTG
CCCACTGAGAAAGTGGGAATTGTTTTCCAGTTTCCAGAGAGATTCTTTGTTGCAGATAAT
GTGCTTGACGAGATTACTTTTGGTTGGCCAAGGCAAAAGGGTAGTTTGCAATTAAGGGAG
CATCTGACTTCAAACCTCCAGAGGGCATTTAATTGGGTTGGGTTAGACAGCATCCCACTT
GATAAAGACCCCCAGTTACTAAGTGGAGGCTATAAGCGTCGGCTTGCACTAGCTATTCAA
CTGGTGCAAACTCCTGATTTATTGATTCTGGATGAGCCCCTCGCTGGTCTTGATTGGAAA
GCACGCGCAGATGTTGCGAAGCTCTTGAAGCACCTAAAGAAGGAACTGACTTTACTTGTT
GTAAGTCATGACTTAAGAGAGTTAGCAACCTTGGTCGACCAGTCATGGAGAATGGAATCA
GGTGGTGTTCTTGTTGCAGAGCGTCCACCAGTTTAGTTCGATATTTATTACTGCCGAAGG
TCCCTACCAGCTCCAACACCAAGTCTGCAAAGCAATTTTGGATTATTATTTGGTTCAATC
ACAAGCAGAAAACTAGTGCATGCCTAAATGCCAATGTATCAAAAAAAATTGTCTTTTCGA
GTAAAGATCCTACATACTTTTTTGAAAATACAGAATCACATTCTTTCTTTGAAATAAATG
GGCTTATGTAAATATTATAAATTAGTTTTGT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4A066JQD 758 0 0
GTCAGGTTCCATTTGTATCCAAAGATATGGGGATGATGGCCAGCTAAAGGCGGATCCTGA
GTTGTTGCCCACTGAGAAAGTGGGAATTGTTTTCCAGTTTCCAGAGAGATTCTTTGTTGC
AGATAATGTGCTTGACGAGATTACTTTTGGTTGGCCAAGGCAAAAGGGTAGTTTGCAATT
AAGGGAGCATCTGACTTCAAACCTCCAGAGGGCATTTAATTGGGTTGGGTTAGACAGCAT
CCCACTTGATAAAGACCCCCAGTTACTAAGTGGAGGCTATAAGCGTCGGCTTGCACTAGC
TATTCAACTGGTGCAAACTCCTGATTTATTGATTCTGGATGAGCCCCTCGCTGGTCTTGA
TTGGAAAGCACGCGCAGATGTTGCGAAGCTCTTGAAGCACCTAAAGAAGGAACTGACTTT
ACTTGTTGTAAGTCATGACTTAAGAGAGTTAGCAACCTTGGTCGACCAGTCATGGAGAAT
GGAATCAGGTGGTGTTCTTGTTGCAGAGCGTCCACCAGTTTAGTTCGATATTTATTACTG
CCGAAGGTCCCTACCAGCTCCAACACCAAGTCTGCAAAGCAATTTTGGATTATTATCTGG
TTCAATCACAAGCAGAAAACTAGTGCATGCCTAAATGCCAATGTATCAAAAAAAATTGTC
TTTTCGAGTAAAGATCCTACATACTTTTTTGAAAATACAGAATCACATTCTTTCTTTGAA
ATAAATGGGCTTATGTAAATATTATAAATTAGTTTTGT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL3479Contig1 445 4 1 U
GGACAAGAATGGATACTTCTTGTTGTTGGGTCCGAAGACGGTGACGAATTACGGGTTCAG
GGGATGTCGTGTGTATCTTGTGAAATCAAAGGACTACAAATGCAACAAAGTGTCAAAGCT
TTTTGGTGGAGATGTAGGTGCCGTACTCAAGCCGGAGAAAAGGAAGGGCAAATCTGCGGT
GGTCATCAACCAGCTCATCTACGGTATCTCTAACGTTGGACCGTTTGCGTTCGACCCGGT
CTGCCCCAAATGAAGATGCTGATGCTCTGTTACTTTCTTGATTATGTCATTCTCGAAAGA
GTTCAAGGGAGAGAGTTATGTGTTTATGCGTTCGAATTGTAATGTTAGCTATAGTTTTAA
GCTAAATGCTTGTGTGTTTTATTTATGAGTGTGTCCTTAAGTGGCCTCGTTTGGATTTCG
TTTGAATAAAAAAGTCGTCAGCTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4DS96JQ C 1
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QA 1 445 1 445
DS 

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GCTAAATGCTTGTGTGTTTTATTTATGAGTGTGTCCTTAAGTGGCCTCGTTTGGATTTCG
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QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 3

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TCCACTCTCTTCAGGACTGTGGTTTAGAACTCCACGAACCTACACACATATTTGCTCACT
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CCTGTCCCCCAAGATAACAGCCTCCCAAAGGGTTGAACAAGCTGCTTAGCAATAATAGCA
ATTGGAGTCCTCCAGAACCAGAGTACCAAGATTATATATACCACAACCTTTGAAGCAAGC
AGAACCTTTCCATACAGATCGTATGACAGATTAATTTCTTTATTGTGATGCTCCAAATAT
TGTGCAAGTTCTTTCTCTTAACTAGCTGCAGACCTCCTAAGCTTAGCCGCTTGCGCAAAC
GTGGCTGGCTGAGACAACTCAGTGGCCTCTCTCAAAAGCTGCTTAATCTCAGATCTCAGC
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ATCAGATTCTCTCCTTCCATGATTTACCGATTAATTTTTTCCCGTCGTAGATTTCCACAA
TCTCAATACTTCTTCAAGCGGAAGACATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D781JQ U 1
AF RR4FN27JQ U 50
AF RR4FN27TF C 156
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RD RR4D781JQ 698 0 0
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CCTGTCCCCCAAGATAACAGCCTCCCAAAGGGTTGAACAAGCTGCTTAGCAATAATAGCA
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AACTGGAAGACGACGACGACGAAGAACGTCAGAGGAGC

QA 1 698 1 698
DS 

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CAAAAAAGTGTCAAGGTAGATGATGAGAAAAATAACAAGTCTGACAACAAGCGACTCCTA
AAACATTAGACTCCACTCTCTTCAGGACTGTGGTTTAGAACTCCACGAACCTACACACAT
ATTTGCTCACTCTGGTTGAGAGTATTAGCCACGGTATGATCCCAACCATCACATGGCCCG
TCAAGTGACCTCCTGTCCCCCAAGATAACAGCCTCCCAAAGGGTTGAACAAGCTGCTTAG
CAATAATAGCAATTGGAGTCCTCCAGAACCAGAGTACCAAGATTATATATACCACAACCT
TTGAAGCAAGCAGAACCTTTCCATACAGATCGTATGACAGATTAATTTCTTTATTGTGAT
GCTCCAAATATTGTGCAAGTTCTTTCTCTTAACTAGCTGCAGACCTCCTAAGCTTAGCCG
CTTGCGCAAACGTGGCTGGCTGAGACAACTCAGTGGCCTCTCTCAAAAGCTGCTTAATCT
CAGATCTCAGCTCCGCTTCCCTCGTGTTCTTCGACCCTTTCTTCTTCAACTGGTCTAGCC
TCTTTGACAGCAACTGGAAGACGACGACGACGAAGAACGTCAGAGGAGCGGCCACAAAGC
CGCGATCTTTAATCAGATTCTCTCCTTCCATGATTTACCGATTAATTTTTTCCCGTCGTA
GATTTCCACAATCTCAATACTTCTTCAAGCGGA
GACATC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4FN27TF 656 0 0
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AACAAGCTGCTTAGCAATAATAGCAATTGGAGTCCTCCAGAACCAGAGTACCAAGATTAT
ATATACCACAACCTTTGAAGCAAGCAGAACCTTTCCATACAGATCGTATGACAGATTAAT
TTCTTTATTGTGATGCTCCAAATATTGTGCAAGTTCTTTCTCTTAACTAGCTGCAGACCT
CCTAAGCTTAGCCGCTTGCGCAAACGTGGCTGGCTGAGACAACTCAGTGGCCTCTCTCAA
AAGCTGCTTAATCTCAGATCTCAGCTCCGCTTCCCTCGTGTTCTTCGACCCTTTCTTCTT
CAACTGGTCTAGCCTCTTTGACAGCAACTGGAAGACGACGACGACGAAGAACGTCAGAGG
AGCGGCCACAAAGCCGCGATCTTTAATCAGATTCTCTCCTTCCATGATTTACCGATTAAT
TTTTTCCCGTCGTAGATTTCCACAATCTCAATACTTCTTCAAGCGGAAGACATCCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 4

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AGGAATAATGTCGATGGAGGTCACAGTTCTCCGTCCTCTCGTTATAGCCGGCAAACCCAC
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CCCCCATCTATCTTCTTCTTCCACCTCTCGTCTCACTTCTCCCATATTATTCGCTACACA
GGAGGGTAACCTGAGCGAAAGTGATACGAGTGAGTGGGTGATGCAAGATTTTTATACATT
GAGGAAGGATGTAGAAATAGCATCAGCTCGCGTTGAAGAGATTAGAGCTTCTGTTGGGTT
GCAGCAATTACAAGACGAAATTGCACTTTTGGAGTCAAAAGCTACTGATAACTCCTTCTG
GGATGACCGTGCCAAAGCTCAAGAAACGCTTTCCGCCTTGAACGATCTCAAAGACCGGTT
CCGATTGCTCTCTGAATTCAAATCTATGGTTGAAGATGCGGATACGATTGTTAAGCTAAC
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AGAAGGCGCTGTAGTCACCATTACTGCTGTAGCTGGAGGAATAGATGCTCAGGATTGGGC
CGACATGCTTCTTAGGATGTATATGAGATGGGGGGAGAAGCAGCGGTACAATACTAAAAT
TGTTGAAATGTCGGCTGGAGAGGAAGCAGGGATTAAGTCAGCCACGCTTGAGATCCAAGG
GCGTTATGCCTATGGTTACCTTTCAGGGG*AGAAAGGAACTCATAGGATTGTACGACAGT
CACCATTCAATTCAAAAGGCCTTCGCCAGACAAGCTTTTCTGGTGTGGAGGTGATGCCGC
TTCTGCCTGATGAAGCAGTAGGAGTTGAAATACCAGAGGAGGACCTTGAGATTACTTTTA
CGAGGGCAGGTGGAAAAGGAGGACAGAATGTCAACAAAGTTGAAACTGCTGTTCGCATTA
CTCACATCCCTACTGGTGTTGCGGTTCGTTGCTCAGAGGAGAGAAGTCAATCGGCAAACA
AGACGAGAGGTCTGGCCCGACTAAAGGCCAAACTGTTGGTGATTGCGGAGGAGCAGCGTG
CAACTGAAATCAAGGAAATAAGAGGAGATGTAGTGAAAGCCGAGTGGGGACAGCAGATCA
GGAACTACGTGTTTCATCCGTACAAACTGGTTAAGGATGTCCGAACAAGTCATGAGACTT
CAGATACCACATCTGTAATGGATGGTGACTTGGACCCTTTCATCAAAGCTTACCTTAAGC
ATAAGTACACCTTAGCCATGGCTTCTGTTGTCGCCAATTAGAACATACTGATAGGTTTCT
TGTCTTTTATTTCTCTCATTCGATAGAATCGAATCATCTCCTACACTGGTCAGTTTACTA
TAAAATCTTGAAATTACAAACAGAAGCTTAAGCAAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4ER57JQ C 829
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AGGAATAATGTCGATGGAGGTCACAGTTCTCCGTCCTCTCGTTATAGCCGGCAAACCCAC
GCTTCCTCTTCCCCTCTCGAAGAATCTCCATCTTCTTCGTCTCTCACTTCCGCTTCGTCT
CCCCCATCTATCTTCTTCTTCCACCTCTCGTCTCACTTCTCCCATATTATTCGCTACACA
GGAGGGTAACCTGAGCGAAAGTGATACGAGTGAGTGGGTGATGCAAGATTTTTATACATT
GAGGAAGGATGTAGAAATAGCATCAGCTCGCGTTGAAGAGATTAGAGCTTCTGTTGGGTT
GCAGCAATTACAAGACGAAATTGCACTTTTGGAGTCAAAAGCTACTGATAACTCCTTCTG
GGATGACCGTGCCAAAGCTCAAGAAACGCTTTCCGCCTTGAACGATCTCAAAGACCGGTT
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AGAAGAGATGGATTCTACTGATGTTAGCCTGCTTGAAGAGGCCATGGGAATCATCAAAGA
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DS 

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G
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AAATTGCACTTTTGGAGTCAAAAGCTACTGATAACTCCTTCTGGGATGACCGTGCCAAAG
CTCAAGAAACGCTTTCCGCCTTGAACGATCTCAAAGACCGGTTCCGATTGCTCTCTGAAT
TCAAATCTATGGTTGAAGATGCGGATACGATTGTTAAGCTAACAGAAGAGATGGATTCTA
CTGATGTTAGCCTGCTTGAAGAGGCCATGGGAATCATCAAAGAGTTGAACAAATCCGTTG
ATCGATTTGAGCTAACACAGCTTCTATCAGGACCTTATGATAAAGAAGGCGCTGTAGTCA
CCATTACTGCTGTAGCTGGAGGAATAGATGCTCAGGATTGGGCCGACATGCTTCTTAGGA
TGTATATGAGATGGGGGGAGAAGCAGCGGTACAATACTAAAATTGTTGAAATGTCGGCTG
GAGAGGAAGCAGGGATTAAGTCAGCCACGCTTGAGATCCAAGGGCGTTATGCCTATGGTT
ACCTTTCAGGGGGAGAAAGGAACTCATAGGATTGTACGACAGTCACCATTCAATTCAAAA
GGCCTTCGCCAGACAAGCTTTTCTGGTGTGGAGGTGATGCCGCTTCTGCCTGATGAAGCA
GTAG*AGTTGAAATACCAGAGA**GACCTTGAGAT*ACTTTTACGAGGGCA

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GCAGGGATTAAGTCAGCCACGCTTGAGATCCAAGGGCGTTATGCCTATGGTTACCTTTCA
GGGG*AGAAAGGAACTCATAGGATTGTACGACAGTCACCATTCAATTCAAAAGGCCTTCG
CCAGACAAGCTTTTCTGGTGTGGAGGTGATGCCGCTTCTGCCTGATGAAGCAGTAGGAGT
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GAATGTCAACAAAGTTGAAACTGCTGTTCGCATTACTCACATCCCTACTGGTGTTGCGGT
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GGCCAAACTGTTGGTGATTGCGGAGGAGCAGCGTGCAACTGAAATCAAGGAAATAAGAGG
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TGACTTGGACCCTTTCATCAAAGCTTACCTTAAGCATAAGTGCACCTTAGCCATGGCTTC
TGTTGTCGCCAATTAGAACATACTGATAGGTTTCTTGTCTTTTATTTCTCTCATTCGATA
GAATCGAATCATCTCCTACACTGGTCAGTTTACTATAAAATCTTGAAATTACAAACAGAA
GCTTAAGCAAGACT

QA 1 854 1 854
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AGGTGATGCCGCTTCCGCCTGATGAAGCAGTAGGAGTTGAAATACCAGAGGAGGACCTTG
AGATTACTTTTACGAGGGCAGGTGGAAAAGGAGGACAGAATGTCAACAAAGTTGAAACTG
CTGTTCGCATTACTCACATCCCTACTGGTGTTGCGGTTCGTTGCTCAGAGGAGAGAAGTC
AATCGGCAAACAAGACGAGAGGTCTGGCCCGACTAAAGGCCAAACTGTTGGTGATTGCGG
AGGAGCAGCGTGCAACTGAAATCAAGGAAATAAGAGGAGATGTAGTGAAAGCCGAGTGGG
GACAGCAGATCAGGAACTACGTGTTTCATCCGTACAAACTGGTTAAGGATGTCCGAACAA
GTCATGAGACTTCAGATACCACATCTGTAATGGATGGTGACTTGGACCCTTTCATCAAAG
CTTACCTTAAGCATAAGTACACCTTAGCCATGGCTTCTGTTGTCGCCAATTAGAACATAC
TGATAGGTTTCTTGTCTTTTATTTCTCTCATTCGATAGAATCGAATCATCTCCTACACTG
GTCAGTTTACTATAAAATCTTGAAATTAC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL3482Contig1 921 3 4 U
GTTTTAAACCAAAATACTCTGCAGGTTTTATTGAACTAATTGTTACAGTTGAGTTTGCTA
CATACATAAACGCATTAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAACT
CTATTACTCAATCAGATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAACA
CAACATTGAAGAACCAAACAGCAAGCAATGTCGCCTTGATAGGTCCAAGCCAATACACAA
GTAAATGCTCCTGTGTTATATGTTCACCTCGTGCGTAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTG
GATTCATGCATCCGCCGGTTAGATCAGCTCCAAGAACATGGAGACTTAATTTAGCAATGC
TACCAATCCAAGTCTTCATGAAGAAACTTCCAGGGATCTTTCTTGCTAGTCCCAATGAGA
GCATTACAATGAAGAATGTTAGTACCCCCTCGGTTAAAGCACCGCGATGGATCGCTACAT
TTAGTTTTGGTCCTTTCCCAATCTCTGGGAAAACATGAATGATATGTTTAACCCCAAGGA
TTGATCCCATCACCTCAACGGGGATTCGAACCAGGACGGTGAAGATGAAACTACCGAAGC
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TCTGAAGGAAAGCGAAGACGAACATGGAGATGACGGAGAATAGATACCGGACGATCTCGC
CGGGGGTATCTTTCCGGCTGAATCCGAGTACTCCGTGAACTAAGATGTTGACAAGAACTC
CTACCCATGTCCACATAAATGACAATACCAGATCAGAAGCCACTATACTGATTCGACCCA
TTTTCGATTCTAACGATGAGAATTGAGAAACAAGAAGAAGATACACAGAAAGAATATAAA
TTAGGAAGCTTTTGTTTATCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C943JQ U 7
AF RR4A530JQ U 1
AF RR4A530TF C 60
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BS 764 921 RR4A530TF

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TAAACGCATTAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAACTCTATTA
CTCAATCAAATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAACACGACAT
TGAAGAACCAAACAGCAAGCAATGTCGCCTTTATAGGTCCAAGCCAATACACAAGTAAAT
GCTCCTGTGTTATATGCTCACCGCGTGCATAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTGGATTCA
TGCATCCGCCGGTTAGATCAGCTCCAAGAACATGGAGACTTAATTTAGCAATGCTACCAA
TCCAAGTCTTCATGAAAAAACTTCCAGGGATCTTTCTTGCTAGTCCCATCGAGAGCATTA
CAATGAAGAATGTTAGTACCCCCTCGGTTAAAGCACCGTGATGGATCGCTACATTTAGCT
TTGGTCCTTTCCCAATCTCAGGGAAAACATGAATGATATGTTTAACCCCAAGGATTGATC
CCATCACCTCAACGGGGATTCGAACCAGGACGGTGAAGATGAAACTACCGAAGCCACCGG
TGACACCGGCAGCCAAAGCGGTCAAGGGGTTGTAAAGTCCGCCTTTGGTGAGTTTCTGAA

QA 1 660 1 660
DS 

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CATACATAAACGCATTAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAACT
CTATTACTCAATCAGATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAACA
CAACATTGAAGAACCAAACAGCAAGCAATGTCGCCTTGATAGGTCCAAGCCAATACACAA
GTAAATGCTCCTGTGTTATATGTTCACCTCGTGCGTAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTG
GATTCATGCATCCGCCGGTTAGATCAGCTCCAAGAACATGGAGACTTAATTTAGCAATGC
TACCAATCCAAGTCTTCATGAAGAAACTTCCAGGGATCTTTCTTGCTAGTCCCAATGAGA
GCATTACAATGAAGAATGTTAGTACCCCCTCGGTTAAAGCACCGCGATGGATCGCTACAT
TTAGTTTTGGTCCTTTCCCAATCTCTGGGAAAACATGAATGATATGTTTAACCCCAAGGA
TTGATCCCATCACCTCAACGGGGATTCGAACCAGGACGGTGAAGATGAAACTACCGAAGC
CACCGGTGACACCGGCAGCCAAAGCGGTCAAAGGGTTGTAAAGTCCGCCTTTGGTGAGTT
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CGGGGGTATCTTTCCGGCTGAATCCGAGTACTCCGTGAACTAA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4A530TF 862 0 0
ACATACATAAACGCATTAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAAC
TCTATTACTCAATCAGATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAAC
ACAACATTGAAGAACCAAACAGCAAGCAATGTCGCCTTGATAGGTCCAAGCCAATACACA
AGTAAATGCTCCTGTGTTATATGTTCACCTCGTGCGTAAGCCCATCCCATAACCGCTGCT
GGATTCATGCATCCGCCGGTTAGATCAGCTCCAAGAACATGGAGACTTAATTTAGCAATG
CTACCAATCCAAGTCTTCATGAAGAAACTTCCAGGGATCTTTCTTGCTAGTCCCAATGAG
AGCATTACAATGAAGAATGTTAGTACCCCCTCGGTTAAAGCACCGCGATGGATCGCTACA
TTTAGTTTTGGTCCTTTCCCAATCTCTGGGAAAACATGAATGATATGTTTAACCCCAAGG
ATTGATCCCATCACCTCAACGGGGATTCGAACCAGGACGGTGAAGATGAAACTACCGAAG
CCACCGGTGACACCGGCAGCCAAAGCGGTCAAAGGGTTGTAAAGTCCGCCTTTGGTGAGT
TTCTGAAGGAAAGCGAAGACGAACATGGAGATGACGGAGAATAGATACCGGACGATCTCG
CCGGTGGTATCTTTCCGGCTGAATCCGAGTACTCCGTGAACTAAGATGTTGACAAGAACT
CCTACCCATGTCCACATAAATGACAATACCAGATCAGAAGCCACTATACTGATTCGACCC
ATTTTCGATTCTAACGATGAGAATTGAGAAACAAGAAGAAGATACACAGAAAGAATATAA
ATTAGGAAGCTTTTGTTTATCC

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 4

CO CL3483Contig1 1170 4 28 U
GGAACACAAAGCTTCGGTCTCGGGTGACAGTTCACACAGTTAATGCCGAGTCTCACTTCT
TTTTGCCTCTGCTCCTAATGGTCTTCTCTGGATAACCTCTACTGAGGCATCATCCAATGT
TGAAGGGAGAGGCAGAGCCTAAGCAGAAGAAAGGTTGGTCAGAGTCGCTGCTAGAGTTTC
GGGAAAAGATGAAAACTGAGCCAAAGAAACGTTGGAGATCTCTTGCACCGCTTCATCTGA
AAAGCAAATCAGTTGCGCGGTTTTGCTTCTTTTCGAAACTCAAGTCGAACATCTACGGTC
CAGGCCGTGCACCAGTCTATCTCAATGTTTATGACTTAACTCCTATTAACGGATATATCT
ATTGGGCAGGCCTCGGTATATTTCACTCTGGTGTAGAAGTTCATGGAGTAGAATATGCTT
TTGGTGCACACGATTATGCAAACAGTGGTGTTTTTGAGGTTGAACCAAGGCAATGCCCAG
GCTTCAAATTTAAGAAGTCGATATTCATTGGAACCACGAACTTAAATCCGGCACAAGTTA
GAGAGTTCATGGAGAACATGGCTTGCAGTTACTATGGGAATACGTATCACTTGATCGTTA
AGAACTGCAACCACTTCTGCCAGGACGCTTGCTACAAGCTTACAGGCAAAAAGATCCCAA
AATGGGTGAACCGGCTTGCAGAAATAGGTTCCGTGTGTAGTTGCATACTTCCTGAATCAC
TCAAGATCACAGCGGTTTGCCATGATCCAGACGAGCAGATTCCCGAAGAAGAAAACGAAA
AGAGGAGTCTTACAAGCTCGTTCAGTTGCTTGTCTTCCATCTCCATGAGACAAAAACAGC
TTTCGACGTCATCCTTATTCCTACAGTCACCTCTCAGAGGCTGCTTACCTCCATTTCAGC
TCAAACGATCAAAATCTAACAGCAGTTCCTTAAAAGAAAGGTAGAAGGACCACATTTGTC
TTTTGTAAGAGTGTTGGAAAACATGCTTAACTATTCTTCAATCTGTTTGTATTGAATCCA
AAGCTTGGAACCATTTCATCTTTCCATGTATTGCCTCAACTCTGTTTATAATATCTAAAC
TAGCTGTCTTAGTTGTTTTGAGAGAGACATTGTACCAAAACATCAGTGTAGTAATAAGCA
GACAAGAAAAAAAAACCTTTATTCAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL37TF U 1
AF RR4A481TF U 65
AF RR4A481JQ C 250
AF RR4CL37JQ C 396
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BS 123 249 RR4CL37TF
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BS 768 769 RR4CL37TF
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BS 811 835 RR4A481TF
BS 836 836 RR4A481JQ
BS 837 910 RR4A481TF
BS 911 1088 RR4A481JQ
BS 1089 1170 RR4CL37JQ

RD RR4CL37TF 826 0 0
GGAACACAAAGCTTCGGTCTCGGGTGACAGTTCACACAGTTAATGCCGAGTCTCACTTCT
TTTTGCCTCTGCTCCTAATGGTCTTCTCTGGATAACCTCTACTGAGGCATCATCCAATGT
TTAAGGGAGAGGCAGAGCCTAAGCAGAAGAAAGGTTGGTCAGAGTCGCTGCTAGAGTTTC
GGGAAAAGATGAAAACTGAGCCAAAGAAACGTTGGAGATCTCTTGCACCGCTTCATCTGA
AAAGCAAATTAGTTGCGCGGTTTTGCTTCTTTTCGAAACTCAAGTCGAACAGCTACGGTC
CAGGCCGTGCACCAGTCTATCTCAATGTTTATGACTTGACTCCTATTAACGGATATATCT
ATTGGGCAGGCCTCGGTATATTTCACTCTGGTGTAGAAGTTCATGGAGTAGAATATGCTT
TTGGTGCACACGATTATGCAAACAGTGGTGTTTTTGAGGTTGAACCAAGGCAATGCCCAG
GCTTCAAATTTAAGAAGTCGATATTCATTGGAACCACGAACTTAAATCCGGCACAAGTTA
GAGAGTTCATGGAGAACATGGCTTGCAGTTACTATGGGAATATGTATCACTTGATCGTTA
AGAACTGCAACCACTTCTGCCAGGACGCTTGCTACAAGCTTACAGGCAAAA*GATCCCAA
AATGGGTGAACCGGCTTGCAGAAATAG*TTCCGTGTGTAGTTGCATACTTCCTGAATCAC
TCA*GATCACAGCGGTTTGCCATGATCCAGACGAGCAGATTCCCGA*GAG**AAACGAAA
AGAGGAGTCT*ACAAGCTCGTTCAGTTGCT
GTCTCCATCTCCATGA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4A481TF 846 0 0
GCCTCTGCTCCTAATGGTCTTCTCTGGATAACCTCTACTGAGGCATCATCCAATGTTGAA
GGGAGAGGCAGAGCCTAAGCAGAAGAAAGGTTGGTCAGAGTCGCT***AGAGTTTCGGGA
AAAGATGAAAACTGAGCCAAAGAAACGTTGGAGATCTCTTGCACCGCTTCATCTGAAAAG
CAAATCAGTTGCGCGGTTTTGCTTCTTTTCGAAACTCAAGTCGAACATCTACGGTCCAGG
CCGTGCACCAGTCTATCTCAATGTTTATGACTTAACTCCTATTAACGGATATATCTATTG
GGCAGGCCTCGGTATATTTCACTCTGGTGTAGAAGTTCATGGAGTAGGATATGCTTTTGG
TGCACACGATTATGCAAACAGTGGTGTTTTTGAGGTTGAACCAAGGCAATGCCCAGGCTT
CAAATTTAAGAAGTCGATATTCATTGGAACCACGAACTTAAATCCGGCACAAGTTAGAGA
GTTCATGGAGAACATGGCTTGCAGTTACTATGGGAATACGTATCACTTGATCGTTAAGAA
CTGCAACCACTTCTGCCAGGACGCTTGCTACAAGCTTACAGGCAAAAAGATCCCAAAATG
GGTGAACCGGCTTGCAGAAATAGGTTCCGTGTGTAGTTGCATACTTCCTGAATCACTCAA
GATCACAGCGGTTTGCCATGATCCAGACGAGCAGATTCCCGAAGAAGAAAACGAAAAGAG
GAGTCTTACAAGCTCGTTCAGTTGCTTGTCTTCCATCTCCATGAGACAAAA*CAGCTTTC
GACGTCATCCTTATTCCTACAGTCACCTCTCAGAGGCTGCTTACCTCCATTTCAGCTCAA
ACGATC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4A481JQ 840 0 0
C
AGTTGCGCGGTTTTGCTTCTTTTCGAAACTCAAGTCGAACATCTACGGTCCAGGCCGTGC
ACCAGTCTATCTCAATGTTTATGACTTAACTCCTATTAACGGATATATCTATTGGGCAGG
CCTCGGTATATTTCACTCTGGTGTAGAAGTTCATGGAGTAGGATATGCTTTTGGTGCACA
CGATTATGCAAACAGTGGTGTTTTTGAGGTTGAACCAAGGCAATGCCCAGGCTTCAAATT
TAAGAAGTCGATATTCATTGGAACCACGAACTTAAATCCGGCACAAGTTAGAGAGTTCAT
GGAGACCATGGCTTGCAGTTACTATGGGAATACGTATCACTTGATCGTTAAGAACTGCAA
CCACTTCTGCCAGGACGCTTGCTACAAGCTTACAGGCAAAAAGATCCCAAAATGGGTGAA
CCGGCTTGCAGAAATAGGTTCCGTGTGTAGTTGCATACTTCCTGAATCACTCAAGATCAC
AGCGGTTTGCCATGATCCAGACGAGCAGATTCCCGAAGAAGAAAACGAAAAGAGGAGTCT
TACAAGCTCGTTCAGTTGCTTGTCTTCCATCTCCATGAGACAAAAACAGCTTTCGACGTC
ATCCTTATTCCTACAGTCACCTCTCAGAGGCTGCTTACCTCCATTTCAGCTCAAACGATC
AAAATCTAACAGCAGTTCCTTAAAAGAAAGGTAGAAGGACCACATTTGTCTTTTGTAAGA
GTGTTGGAAAACATGCTTAACTATTCTTCAATCTGTTTGTATTGAATCCAAAGCTTGGAA
CCATTTCATCTTTCCATGTATTGCCTCAACTCTGTTTATAATATCTAAACTAGCTGTC
C

QA 2 839 2 839
DS 

RD RR4CL37JQ 775 0 0
GAAGTTCATGGAGTAGAATATGCTTTTGGTGCACACGATTATGCAAACAGTGGTGTTTTT
GAGGTTGAACCAAGGCAATGCCCAGGCTTCAAATTTAAGAAGTCGATATTCATTGGAACC
ACGAACTTAAATCCGGCACAAGTTAGAGAGTTCATGGAGAACATGGCTTGCAGTTACTAT
GGGAATATGTATCACTTGATCGTTAAGAACTGCAACCACTTCTGCCAGGACGCTTGCTAC
AAGCTTACAGGCAAAAAGATCCCAAAATGGGTGAACCGGCTTGCAGAAATAGGTTCCGTG
TGTAGTTGCATACTTCCTGAATCACTCAAGATCACAGCGGTTTGCCATGATCCAGACGAG
CAGATTCCCGAAGAAGAAAACGAAAAGAGGAGTCTTACAAGCTCGTTCAGTTGCTTGTTT
TCCATCTCCATGAGACAAAAACCGCTTTGGACGTCATCCTTATTCCTACAGTCACCTTTC
AGAGGCTGCTTACCTCCATTTCAACTCAAACGATCAAAATTTAACAGCAGTTCCTTAAAA
GAAAGGTAGAAGGACCACATTTGTCTTTTGTAAGAGTGTTGGAAAACATGCTTAACTATT
TTTCAATCTGTTTGTATTGAATCCAAAGCTTGGAACCATTTCATCTTTCCATGTATTGCC
TCAACTCTGTTTATAATATCTAAACTAGCTGTCTTAGTTGTTTTGAGAGAGACATTGTAC
CAAAACATCAGTGTAGTAATAAGCAGACAAGAAAAAAAAACCTTTATTCAAGACC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 2 4

CO CL3484Contig1 504 2 3 U
AAAGAAATATTAAATTTTGAAAACTTAAATGAAAAAAAAAAAACACTAACAAAAATAGCA
ATAATAGAAACAAAATTGTCATTTAAGAAATTTTGATCCTACCAAGTAAGGATTCTGGAA
GTAAACCAAAAAGAAAAAAGCTCACGACAGAAATGAAAATCAAATCTAATCTCAGCCTTT
GATGATACATTAAAAAAAACTTTGAAATAATAATAATCTTAAAACACACGGTTAGGTGGA
CCCATTGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTGAG
ACGAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTTCTCCTCCATGTCAAGG
TTCCCAACGGCGACACCCATGCAAAAAACCTTCTTGAACTGGAACTTCACTGTTGCCTTT
GTCTCGTTCACTTTGGATTCCAAAAACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTCGGGAACTTTCCT
GCCTTGTTGAAACAGGACCAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW87JQ U 1
AF RR4AM71JQ U 285
BS 1 397 RR4BW87JQ
BS 398 398 RR4AM71JQ
BS 399 504 RR4BW87JQ

RD RR4BW87JQ 504 0 0
AAAGAAATATTAAATTTTGAAAACTTAAATGAAAAAAAAAAAACACTAACAAAAATAGCA
ATAATAGAAACAAAATTGTCATTTAAGAAATTTTGATCCTACCAAGTAAGGATTCTGGAA
GTAAACCAAAAAGAAAAAAGCTCACGACAGAAATGAAAATCAAATCTAATCTCAGCCTTT
GATGATACATTAAAAAAAACTTTGAAATAATAATAATCTTAAAACACACGGTTAGGTGGA
CCCATTGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTGAG
ACGAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTTCTCCTCCATGTCAAGG
TTCCCAACGGCGACACCCATGCAAAAAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCCTTT
GTCTCGTTCACTTTGGATTCCAAAAACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTCGGGAACTTTCCT
GCCTTGTTGAAACAGGACCAAGAA

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4AM71JQ 200 0 0
CTTCTTCAATAGTGAGACGAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTT
CTCCTCCATGTCAAGGTTCCCAACGGCGACACCCATGCAAAAAACCTTCTTGAACTGGAA
CTTCACTGTTGCCTTTGTCTCGTTCACTTTGGATTCCAAAAACTCTTGGTGGCTAACAAG
AGTCGGGAACTTTCCTGCCT

QA 1 200 1 200
DS 



CO CL3484Contig2 822 2 15 U
GGAGCATCTGAGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGC
GATATCCGCCATGATCACTCACTGCAAGGAGACGAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCAT
CGAACTCCAGATTGGTCTTAAGAACTACGACCCTCAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTTC
CGTCAAGTTGCCTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGATGCCCA
GCACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAA
GCTGAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCTAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGC
TTCTGAATCCGTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGG
AAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAACGAGACAAA
GGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCCGTTGGGAACCT
TGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTC
ACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCC
ACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAATGTATCATCAAA
GCTGAGATTAGATTTGATTTTCATTTCTGTCGTGAGCTTTCTTCTTTTGGTTACTTCAGA
TCCTTACTTGGTAGGATCAAATTCTTAAATGACATTTGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB55TF U 11
AF RR4BW87TF U 1
BS 1 59 RR4BW87TF
BS 60 60 RR4GB55TF
BS 61 66 RR4BW87TF
BS 67 67 RR4GB55TF
BS 68 147 RR4BW87TF
BS 148 148 RR4GB55TF
BS 149 240 RR4BW87TF
BS 241 241 RR4GB55TF
BS 242 255 RR4BW87TF
BS 256 256 RR4GB55TF
BS 257 404 RR4BW87TF
BS 405 405 RR4GB55TF
BS 406 696 RR4BW87TF
BS 697 697 RR4GB55TF
BS 698 822 RR4BW87TF

RD RR4GB55TF 725 0 0
G
GGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGCGATATCCGCCA
TGATCACTCACTGCAAGGAGACGAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCATCGAACTCCAGA
TTGGTCTTAAGAACTACGACCCTCAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTTCCGTCAAGTTGC
CTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGATGCCCAGCACGTTGAAG
AGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAGA
ACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCTAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTGAATCTG
TTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTCCCGA
CTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAACGAGACAAAGGCAACAGTGA
AGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCCGTTGGGAACCTTGACATGGAGG
AGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCACTATTGAAGA
AGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCACCTAACCGT*
TGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAATGTATCATCAAAGCTGAGATTAG
ATTT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4BW87TF 822 0 0
GGAGCATCTGAGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGT
GATATCTGCCATGATCACTCACTGCAAGGAGACGAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCAT
CGAACTCCAGATTGGTCTTAAGAACTATGACCCTCAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTTC
CGTCAAGTTGCCTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGATGCCCA
TCACGTTGAAGAGGC*GAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAA
GCTGAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCTAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGC
TTCTGAATCCGTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTG*TCTCAACAAGGCAGG
AAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAACGAGACAAA
GGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCCGTTGGGAACCT
TGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTC
ACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCC
ACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAA*GTTTCTCTTAATGTATCATCAAA
GCTGAGATTAGATTTGATTTTCATTTCTGTCGTGAGCTTTCTTCTTTTGGTTACTTCAGA
TCCTTACTTGGTAGGATCAAATTCTTAAATGACATTTGTTCT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 4

CO CL3485Contig1 1200 4 2 U
GTCGTTAAGATGAAGTATAATTTTGATGTTTACCATTTTTTTTACTATTATTGATGTTCT
CACCACTAAAGAAATATTTACAAAAATACATTCTTTATATTAAAAAAAGCAAAAGACACT
TACACCTATATTCTCTATATATAGTAACTAAATATTTAAATAAATAATTTTTTTCATGTT
TTCGAATTATATTTTTTCGAAATTCAAACTCTAAACTCTCAACCGTAAATCCTCAACTAT
AAACTCTAAATTATTAACCTTAAGTCTTACCCCACTTCTCAACTCAAAATTCTAAATTTA
AATTAGTTAATCCTAGAGTTATAAATGTGTTTTCTGCTTTTTAAAAATAATAGTAGTATT
GATTAGTATATACATGAAAAATAGTATTATGAAAAATATATTTTTGACAATTTCCATAAA
ATAAAAACGTTGTCCTGGTGAGTATAGTCAATGCCAAATTATCTGCTTAATTAAATAAAT
TAATATTTCTCTTATTATATCCAAAATTTAATAAAACTAAAAAACAATAAAATTAAAATA
ATACTAATGAGAAATTATCCACTTAATCTAAACTAGATATCGATCTTTCATTTTTTTACA
AATTTTAATAAATTATTTTTAATTAAATTAATTTATAAGATTGTGTTTAGGTTTTGTGTA
CATTTATCCGAAATCGCAAACCAAACTGGTCAAATTGAAACCAAAACAAAGGGTATCTGA
ATTTTTATCATAAATAGCTGAACGAACACTATATTTCTGGGATCCAAAACTGAAACCGAA
CCGTGAACCAAAGGGCACCTGGACTTTTAAAATAAAAAGTATACACCAACAAATATTAAT
TATATTTAATTTCAAAATAACCAAATATCTTAAAAAGATTATTTATAAACTGAATTATCA
AAAAAAATTCGATTACCCAAATATTTTTAATTCAAATATTAAAATTTATCCAATATTTTT
TATCCTAACAATCCAAATTATGTGATATTTAAACTGAGAACCCTAAAGTATCCAAGATTT
TTATCTAAAATCAGAAATTACATGAGAAACAAAAGTGAACTGGAACCAAATTGGATCTGA
ATTTTTCTTTTGGATATTAACCGGTTTCCAACTTTGCTAACAAACCAAAATAACCCAACT
AAAAACAACCCAAACTTTGTAAATATCTGAATGGTTCCTAAATTTCTAGAAACAAAACAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TTCGAATTATATTTTTTCGAAATTCAAACTCTAAACTCTCAACCGTAAATCCTCAACTAT
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GATTAGTATATACATGAAAAATAGTATTATGAAAAATATATTTTTGACAATTTCCATAAA
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TT

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ACAAAACAC

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CTTTTGGATATTAACCGGTTTCCAACTTTGCTAACAAACCAAAATAACCCAACTAAAAAC
AACCCAAACTTTGTAAATATCTGAATGGTTCCTAAATTTCTAGAAACAAAACAC

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DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4BY03TF U 1
AF RR4EN19TF U 91
AF RR4BY03JQ C 740
BS 1 174 RR4BY03TF
BS 175 175 RR4EN19TF
BS 176 247 RR4BY03TF
BS 248 248 RR4EN19TF
BS 249 519 RR4BY03TF
BS 520 520 RR4EN19TF
BS 521 562 RR4BY03TF
BS 563 563 RR4EN19TF
BS 564 570 RR4BY03TF
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BS 572 573 RR4BY03TF
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BS 686 701 RR4BY03TF
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BS 703 711 RR4BY03TF
BS 712 767 RR4EN19TF
BS 768 768 RR4BY03JQ
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BS 834 834 RR4BY03JQ
BS 835 870 RR4EN19TF
BS 871 871 RR4BY03JQ
BS 872 884 RR4EN19TF
BS 885 1504 RR4BY03JQ

RD RR4BY03TF 711 0 0
GGGCCGAAACTTACTGTACTCTGTTCTTGTCCTGATCATCTGTGTCCTTGTTCCACAAGC
TTTGTCTGTCTTCAAGTTGCTTTTTTAATCTGAAATGGGTAATTGCTTAGATTCATCAGC
TAAGGTGGATAGCAGCAACCATAGTCCACATGCTAATTCTGGTTCGTCGGCGTCGAAAGT
CTCTAGCAACACAAGCCGTTCAACGGATCCTTCAGGAAGAAGCACAAGCTCTTACAGCAC
AGGAAGCGGTAGTTTAGGATCATCATTACAAACGAAGCCAAGAACAGAAGGAGAGATACT
TTCATCTCCAAATCTAAAAGCTTTCTCTTTCAACGAACTAAAGAACGCAACCAAGAACTT
CCGTCCTGATAGTCTACTGGGCGAAGGAGGTTTCGGCTGTGTATTCAAAGGATGGATCGA
TGAAACAACTCTCACTGCTTCACGACCTGGTTCTGGTATCGTTGTTGCTGTTAAGAAGCT
TAAGCCTGAAGGCTTCCAAGGTCATAAAGAGTGGTTGACTGAAGTAAACTATCTTGGTCA
ACTTAGTCACCCAAATCTTGTATTACTAGTTGGTTATTGCCTAGAAGGCGAGAACCGGCT
CCTTGTATATGAGTTCATGCCTAAAGGAAGCTTGGAGAATCATCTTTTTAGACGTGGTGC
ACAGCCACTTACATGGGCGATAAG*ATGAAAGTGGCAGTAG*TGCAGCTAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4EN19TF 794 0 0
G
GAAATGGGTAATTGCTTAGATTCATCAGCTAAGGTGGATAGCAGCAACCATAGTCCACAT
GCTAATTCTGGTTCGTCGGCGTCCAAAGTCTCTAGCAACACAAGCCGTTCAACGGATCCT
TCAGGAAGAAGCACAAGCTCTTACAGCACAGGAAGCAGTAGTTTAGGATCATCATTACAA
ACGCAGCCAAGAACAGAAGGAGAGATACTTTCATCTCCAAATCTAAAAGCTTTCTCTTTC
AACGAACTAAAGAACGCAACTAAGAACTTCCGTCCTGATAGTCTACTGGGCGAAGGAGGT
TTCGGCTGTGTATTCAAAGGATGGATTGATGAAACAACTCTCACTGCTTCACGACCTGGT
TCTGGTATCGTTGTTGCTGTTAAGAAGCTTAAGCCTGAAGGTTTCCAAGGTCATAAAGAG
TGGTTGACAGAAGTGAACTATCTTGGTCAACTTAGTCACCCAAATCTTGTACTACTAGTA
GGGTATTGCCTAGAAGGCGAGAACCGGCTCCTTGTATATGAGTTCATGCCTAAAGGAAGC
TTGGAGAATCATCTTTTTAGACGTGGTGCACAGCCACTTACTTGGGCGATAAGGATGAAA
GTGGCAGTAGGTGCAGCTAAAGGGCTTAATTTTCTGCATGAAGCAAAGTCGCAAGTGATA
TATAGAGACTTTAAAGTTGCTAACATTCTACTCGACGCTGAGTTCAATGCTAAGCTTTCA
GATTTCGGTT*GGCTAAAGCAG*TCCTACTGGTGATAACACACATGTGACCACAAAGGT*
ATGGGTACTCAAG

QA 2 794 2 794
DS 

RD RR4BY03JQ 765 0 0
TCA
CAAGTGATATATAGAGACTTTAAAGCTGCTAACATTCTACTCGACGCTGAGTTCAATGCT
AAGCTTTCAGATTTCGGTTTGGCTAAAGCAGGTCCTACTGGTGATAACACACATGTGACC
ACAAAGGTTATGGGTACTCAAGGATATGCAGCTCCTGAATATATAGCCACAGGTAGATTA
ACGGCAAAGAGTGATGTGTACAGCTTTGGTGTGGTACTACTGGAACTCATATCAGGAAGA
CGTGCCATGGAAAACTCAAATGGAGGAGTTGAATATAGTCTTGTGGACTGGGCTAAACCT
TACCTTGACGATAAGCGAAAGCTTTTCCGCATAATGGACACAAAACTAGGCGGCCAGTAT
CCACAAAAGGGAGCTCTCGCAGCTGCAGGCCTCGCGTTGCAGTGCTTAAACCCTGATGCA
AAGCTCAGGCCAAAAATGTCAGAGGTTTTAGTCACGTTAGAGGAGCTGGAATCCGCTGCT
AAACCTGGAGGGAATAAACACACGCAAATGGAATCTCCAAGAGCTCGTCATTGCTCTGGT
ATGCAGAAATCTCCGGTAAGATTTGGTCAAGATCGGCCTATGCAGCACATAACTCCTGGT
GCATCGCCTTTGCCTTCTTATAGTAAGTCTCCACGTGTGAGATGAAAGTAAACAGATCAT
ATATGATTGTATGCGTAATGTATGTAAAATGCGGTTTGTCTGTGTACTTGTATGTATGAT
TGGAGATGAGTGAAGAAATGATTAATTTATCAGAGTAAAGTG

QA 4 765 4 765
DS 



AS 1 4

CO CL3487Contig1 662 4 9 U
GGATTGCATAAAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGAGT
TTGCTAATCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGG
AAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTG
GCGGCTCAGACGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTAC
AAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTAC
TACAATTGAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTG
ATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGG
TAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAA
GCTACTCTTCCAACTTTCGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAAT
TCTAAATGTTGCCCATATCTTTCTGGAAATACTACTTTATTTTGTTCGTTTAGATTAAAT
ATGGTACATACTTTCGATAGTCTCTTTTACAACTTACTTGCTTTAATAGAAGACATTAAA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4AB94JQ C 4
AF RR4AB94TF U 4
AF RR4F949TF U 3
AF RR4AC11TF U 1
BS 1 57 RR4AC11TF
BS 58 58 RR4AB94TF
BS 59 124 RR4AC11TF
BS 125 125 RR4AB94TF
BS 126 185 RR4AC11TF
BS 186 186 RR4AB94TF
BS 187 400 RR4AC11TF
BS 401 401 RR4AB94TF
BS 402 662 RR4AC11TF

RD RR4AB94JQ 563 0 0
GGGCATA
AAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGAGTTTGCTAATCA
AGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGGAAGAAAGTAA
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GCCCATATCTTTCTGG

QA 8 563 8 563
DS 

RD RR4AB94TF 563 0 0
GGGCATA
AAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGAGTTTGCTAATCA
AGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGGAAGAAAGTAA
GGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCTCAGA
CGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCACA
TCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTGAG
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CTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTT
CTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTC
CAACTTTCGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAATTCTAAATGTT
GCCCATATCTTTCTGG

QA 8 563 8 563
DS 

RD RR4F949TF 564 0 0
GGGGGCAT
AAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGGGTTTGCTAATCA
AGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGGAAGAAAGTAA
GGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGA
CGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCACA
TCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTGAG
GCGAACCGGAGGGGGTGCTAAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACAC
CTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTT
CTGATTATGCATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTC
CAACTTTCGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAATTCTAAATGTT
GCCCATATCTTTCTGG

QA 9 564 9 564
DS 

RD RR4AC11TF 662 0 0
GGATTGCATAAAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGGGT
TTGCTAATCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGG
AAGAGAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTG
GCGGCGCAGACGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTAC
AAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTAC
TACAATTGAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTG
ATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAA*GTACGTCTGTAAAATTGGG
TAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAA
GCTACTCTTCCAACTTTCGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAAT
TCTAAATGTTGCCCATATCTTTCTGGAAATACTACTTTATTTTGTTCGTTTAGATTAAAT
ATGGTACATACTTTCGATAGTCTCTTTTACAACTTACTTGCTTTAATAGAAGACATTAAA
CT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL3488Contig1 849 4 2 U
GGAACTCTTCTTCTCCTTTGTATTCTCTGCAACGACTCTTTAGGGTTTACCGATTGTGCA
AAGAGGAAGAGAGCGATTTCAATGGCTGACGATGATTATAACGAAGTTGATGATTTGGGT
TATGAGGATGAGCCAGTGGAGCCTGAAATTGAAGAAGGAGTAGAGGAAGATGTTGATATG
AAGGATAACGAGGATATCAATGGAGAGCCTTTGAAACTGAAGATAAGGCCGAAACAGAAC
CTCTTCAACGTCCTCGTAAAACCTCCAAGTTTATGACCAAGTATGAACGTGCACGTATCC
TCGGCACTCGCGCTCTCCAGATCAGCATGAATGCTCCTGTCATGGTAGAGCTGGAGGGTG
AGACTGACCCACTTGAGATTGCGATGAAGGAGTTGAGGCAAAGGAAGATACCATTCACTA
TTAGACGTTACCTACCTGATGGGAGTTTTGAGGAGTGGGGAGTTGATGAGTTGATCGTTG
AAGACTCATGGAAACGTCAAGTTGGTGGTGATTGATAATCTTGTTATTGCCCAAATACTA
ATATGTATTTTTACAAGAAGCTTGTTACTTCTCATGACGTTGATGAATTCTTCTCTGCTA
ATGTTAGCTCCAAAGTTATAATGTAGTTAACCGGCATGTTACTTTTTGCCTTAACCTATT
TAACCGAATGGAGGAGAAAGTGAACCGGAAGTATAAAGACATCTTATTAACCACTACCAT
ATTGGTTTTCTGTCTTGTTATATTCAAATTAGTCTCGGCTATTGTCTATTATTAGAATTT
AGAAACATGTGTAAGAACTTGACAAATGATTCGAATTTCAAAATTGAAGTTTGGTTTTTA
GTTAATGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DY66TF U 1
AF RR4DO08TF U 1
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AF RR4DY66JQ C 31
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BS 678 849 RR4DO08JQ

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TTAGACGTTACCTACCTGATGGGAGTTTT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR4DO08TF 677 0 0
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AAGAGGAAGAGAGCGATTTCAATGGCTGACGATGATTATAACGAAGTTGATGATTTGGGT
TATGAGGATGAGCCAGTGGAGCCTGAAATTGAAGAAGGAGTAGAGGAAGATGTTGATATG
AAGGATAACGAGGATATCAATGGAGAGCCTTTGAAACTGAAGATAAGGCCGAAACAGAAC
CTCTTCAACGTCCTCGTAAAACCTCCAAGTTTATGACCAAGTATGAACGTGCACGTATCC
TCGGCACTCGCGCTCTCCAGATCAGCATGAATGCTCCTGTCATGGTAGAGCTGGAGGGTG
AGACTGACCCACTTGAGATTGCGATGAAGGAGTTGAGGCAAAGGAAGATACCATTCACTA
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AAGACTCATGGAAACGTCAAGTTGGTGGTGATTGATAATCTTGTTATTGCCCAAATACTA
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QA 1 677 1 677
DS 

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CTCTGC
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AGGAGTGGGGAGTTGATGAGTTGATCGTTGAAGACTCATGGAAACGTCAAGTTGGTGGTG
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AGTCTCGGCTATTGTCTATTATTAGAATTTAGAAACATGTGTAAGAACTTGACAAATGAT
TCGAATTTCAAAATTGAAGTTTGGTTTTTAGTTAATGTT

QA 7 825 7 825
DS 

RD RR4DY66JQ 819 0 0
AACGACTCTTTAGGGTT*ACCGATTGTGCAAAGAGGAAGAGAGCGATTTCAATGGCTGAC
GATGATTATAACGAAGTTGATGATTTGGGTTATGAGGATGAGCCAGTGGAGCCTGAAATT
GAAGAAGGAGTAGAGGAAGATGTTGATATGAAGGATAACGAGGATATCAATGGAGAGCCT
TTGAAACTGAAGATAAGGCCGAAACAGAACCTCTTCAACGTCCTCGTAAAACCTCCAAGT
TTATGACCAAGTATGAACGTGCACGTATCCTCGGCACTCGCGCTCTCCAGATCAGCATGA
ATGCTCCTGTCATGGTAGAGCTGGAGGGTGAGACTGACCCACTTGAGATTGCGATGAAGG
AGTTGAGGCAAAGGAAGATACCATTCACTATTAGACGTTACCTACCTGATGGGAGTTTTG
AGGAGTGGGGAGTTGATGAGTTGATCGTTGAAGACTCATGGAAACGTCAAGTTGGTGGTG
ATTGATAATCTTGTTATTGCCCAAATACTAATATGTATTTTTACAAGAAGCTTGTTACTT
CTCATGACGTTGATGAATTCTTCTCTGCTAATGTTAGCTCCAAAGTTATAATGTAGTTAA
CCGGCATGTTACTTTTTGCCTTAACCTATTTAACCGAATGGAGGAGAAAGTGAACCGGAA
GTATAAAGACATCTTATTAACCACTACCATATTGGTTTTCTGTCTTGTTATATTCAAATT
AGTCTCGGCTATTGTCTATTATTAGAATTTAGAAACATGTGTAAGAACTTGACAAATGAT
TCGAATTTCAAAATTGAAGTTTGGTTTTTAGTTAATGTT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 4

CO CL3489Contig1 1370 4 8 U
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TCCATTTTGATTTTTGTGCTCACTTCGAGCTCTACATGCCACTGTAGAAGACAGATACCA
ATCTTTCTGGGGTTCATCAGGGCAGGAACTGATGAACAACCATGTGCCCTATCATGTTGT
CAACTCTGGTGGTGTATATCTGTCCGGATTCTGCAACGTTTCTGCCGTCCCAACTCATGG
AAGGACTTCCCAAACACAGCCACCTGTATCCACCATGCCAAGTGACAGATCCTCTATGCA
GGATTGCCAACAATCCTCTTCATTGATTGATCATCACCCTCAGGAGTTTTTAGATCCACT
TGATGAGCTCTTTGACTTTTCTGACCATGTTTCTGCTCCAAATCCACAAGCAGAGAGTAG
TGGAGTAAAGGTGGGTTCATCCGTGGAGGTCCATGAGAAAAGCGAGTGGCAAAATTGGGC
AGATCAGTTGATGTCTGTTGACAATGGTTCGGAGCCAAACTGGTCTGAACTTCTTGGAGA
TCCAAGTCCAAACAATCCAAACTCACAGGCTCAGTTTCATCAGCGTTCACAACAGATACC
GACACCATCTCC*AGATGTACAAAGGCAAGAGATAATAGCTAACCAGCAGCAGCAGCAGC
ATCAGGTGGTTGCGTTGGAGGAGCAGCTCAGTGCAAGAAACTCATCAGCTAGTGCTGCCA
CATCTAAA*CAGAGGATGCGTTGGACACCAGAGCTTCATGAGGCGTTTGTTGAATCTGTT
AATCAGCTTGGTGGTAGTGAACGAGCCACGCCTAAGGCTGTTTTGAAGCTCTTGAAGAAC
CCTGGCTTAACCATATATCATGTTAAAAGCCATCTGCAGAAATACAGAACAGCTAGGTAT
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ATGGAAGTTCAGAAACGTCTCCATGAGCAGCTCGAGATCCAACGGTCCCTGCAGTTACAG
ATTGAAAAACAAGGCCGATACCTACAGATGATGTTTGAGAAACAACAACAGTTGCAAGAG
AACAATGGCTCTTCCTCAGAGCCATCACCAAAGCAATGCAATGGCATATCTGCAGAAGTT
GGGTTTGGTCTGGAGACACAAGCAGTGAACCAAACTGAATCTGCTTTAGCATCAAGGAAA
CGGGCCAGAGATGATTAGTACATTAAAAATATGTTTTATGGTTGATTTGTGGAAACCAAG
AGATGCAATAACTCCAGTTTTGTTATAAAGAAAAGTTGTTTCTTCCTAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A801TF U 1
AF RR4BB42TF U 1
AF RR4BB42JQ C 463
AF RR4A801JQ C 535
BS 1 807 RR4A801TF
BS 808 815 RR4BB42TF
BS 816 816 RR4BB42JQ
BS 817 892 RR4BB42TF
BS 893 1056 RR4BB42JQ
BS 1057 1057 RR4A801JQ
BS 1058 1184 RR4BB42JQ
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RD RR4A801TF 811 0 0
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CAACTCTGGTGGTGTATATCTGTCCGGATTCTGCAACGTTTCTGCCGTCCCAACTCATGG
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TGATGAGCTCTTTGACTTTTCTGACCATGTTTCTGCTCCAAATCCACAAGCAGAGAGTAG
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CATCTAAA*CAGAGGATGCGTTGGACACCAGAGCTTCATGAGGCGTTTGTTGAATCTGTT
AATCAGCTTGGTGGTAGTGAACGAGCC
GCGC

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DS 

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TCCATTTTGATTTTTGTGCTCACTTCGAGCTCTACATGCCACTGTAGAAGACAGATACCA
ATCTTTCTGGGGTTCATCAGGGCAGGAACTGATGAACAACCATGTGCCCTATCATGTTGT
CAACTCTGGTGGTGTATATCTGTCCGGATTCTGCAACGTTTCTGCCGTCCCAACTCATGG
AAGGACTTCCCAAACACAGCCACCTGTATCCACCATGCCAAGTGACAGATCCTCTATGCA
GGATTGCCAACAATCCTCTTCATTGATTGATCATCACCCTCAGGAGTTTTTAGATCCACT
TGATGAGTTCTTTGACTTTTCTGACCATGTTTCTGCTCCAAATCCACAAGCAGAGAGTAG
TGGAGTAAAGGTGGGTTCATCCGTGGAGGTCCATGAGAAAAGCGAGTGGCAAAATTGGGC
AGATCAGTTGATGTCTGTTGACAATGGTTCGGAGCCAAACTGGTCTGAACTTCTTGGAGA
TCCAAGTCCAAACAATCCAAACTCACAGGCTCAGTTTCATCAGCGT*CACAACAGATACC
GACACCATCTCC*AGATGTACAAAGGCAAGAGATAATAGCTAACCAGCAGCAGCAGCAGC
ATCAGGTGGTTGCGTTGGAGGAGCAGCTCAGTGCAAGAAACTCATCAGCTAGTGCTGCCA
CATCTAAA*CAGAGGATGCGTTGGACACCAGAGCTTCATGAGGCGTTTGTTGAATCTGTT
AATCAGCTTGGTGGTAGTGAACGAGCCACGCCTAAAGCTGTTTTGAAGCTCTTGAAGAAC
CCTGGCTTAACCATATATCATGTTAAAAGCCATCTGCAGAAATACAGAACAG

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DS 

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AGCGAGTGC
AAATTGGGCAGATCAGTTGATGTCTGT*GACAATGGTTCGGAGCCAAACTGGTCTGAACT
TCTTGGAGATCCAAGTCCAAACAATCCAAACTCACAGGCTCAGTTTCATCAGCGT*CACA
ACAGATACCGACACCATCTCCCAGATGTACAAAGGCAAGAGATAATAGCTAACCAGCAGC
AGCAGCAGCATCAGGTGGTTGCGTTGGAGGAGCAGCTCAGTGCAAGAAACTCATCAGCTA
GTGCTGCCACATCTAAAACAGAGGATGCGTTGGACACCAGAGCTTCATGAGGCGTTTGTT
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TTGAAGAACCCTGGCTTAACCATATATCATGTTAAAAGCCATCTGCAGAAATACAGAACA
GCTAGGTATAAACCGGAGACTTCAGAAGCTACAGGAGAACCTCAAGAGAAGAAGATCACA
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TTGCAAGAGAACAATGGCTCTTCCTCAGAGCCATCACCAAAGCAATGCAATGG

QA 10 722 10 722
DS 

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TGGAGATCCAAGTCCAAACAATCCAAACTCACAGGCTCAGTTTCATCAGCGTTCACAACA
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AGCAGCATCAGGTGGTTGCGTTGGAGGAGCAGCTCAGTGCAAGAAACTCATCAGCTAGTG
CTGCCACATCTAAA*CAGAGGATGCGTTGGACACCAGAGCTTCATGAGGCGTTTGTTGAA
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AAGAACCCTGGCTTAACCATATATCATGTTAAAAGCCATCTGCAGAAATACAGAACAGCT
AGGTATAAACCGGAGACTTCAGAAGCTACAGGAGAACCTCAAGAGAAGAAGATCACATCC
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TTACAGATTGAAAAACAAGGCCGATACCTACAGATGATGTTTGAGAAACAACAACAGTTG
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GAAGTTGGGTTTGGTCTGGAGACACAAGCAGTGAACCAAACTGAATCTGCTTTAGCATCA
AGGAAACGGGCCAGAGATGATTAGTACATTAAAAATATGTTTTATGGTTGATTTGTGGAA
ACCAAGAGATGCAATAACTCCAGTTTTGTTATAAAGAAAAGTTGTTTCTTCCTAAT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 4

CO CL3490Contig1 1040 4 5 U
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GAGGGGCTGCAATTTCCGCCCATAAGGGGAGTGCCTTCGCCACCGGTAATGTGTGGAAGA
GCTAATAAACCGAATTGGGAACAATGAGAAGGCCAGACCAGAAGGGAAAACGACCCCAAT
GGGGAGATTACCGATTTTATAAATAAAAAGAAGTTCTTAAAGCGGGCCCGTGATAACACA
AAGAATGAGAACGAGGGCCAGATGAACATCTGAGGTGAGATTCGGATTCGGGCCATCGTC
AATCAGTGTTATGAAAATGATAAGAGTGAGAACTCATTTTCATTTTATCTTGTGACTCAT
TCTCTTCTTTCTTTTCGTCTATTTGTGCATCTTTCTTTCTCCCATGCTTTCCGTCGGTCA
AACCAACGATTCTCTTCTCAAAGTAATAGAGAGATCCTTTTCTAGTTAGACTTCTATCAA
TGCAATGAAAGAACCATCCCTTCCTATTAGTTTGTCCTGTCAGATAGAAAGAAAATTAGA
CCCCAAAGAGAAAGAGCCCGTTGGGGGGTGAAGGGTGGGGGTTTACATACAACCGAGACA
AAGTGGTTTATGATTGAATCTCAGAGGCATTCTTATCATTTGGTAGATCCAAGTCCATGG
CCTATTTCGGGTTCACTCGGAGCTTTGGCAACCACCGTAGGAGGTGTGATGTACATGCAC
TCATTTCAAGGGGGTGCAAGACTTCTAAGTTTGGGCCTCATATTTCTCCTATATACCATG
TTCGTATGGTGGCGCGATGTTCTACGTGAATCCACGTTGGAAGGACATCATACCAAAGTC
GTACAATTAGGACTTCGATATGGTTTTATTCTGTTCATCGTATCGGAGGTTATGTTCTTT
TTTGCTTTTTTTTGGGCTTTTTTTCATTCTTCTTTGGCACCTGCGGTAGAGATCGGAGGT
ATTTGGCCCCCAAAAGGGATTGGGGTTTTAGATCCTTGGGAAATCCCTTTTCTTAATACC
CTTATTCTCCTTTCATCCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H239TF U 1
AF RR4H239JQ C 78
AF RR4AR91TF U 8
AF RR4AR91JQ C 235
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RD RR4H239TF 545 0 0
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GAGGGGCTGCAATTTCCGCCCATAAGGGGAGTGCCTTCGCCACCGGTAATGTGTGGAAGA
GCTAATAAACCGAATTGGGAACAATGAGAAGGCCAGACCAGAAGGGAAAACGACCCCAAT
GGGGAGATTACCGATTTTATAAATAAAAAGAAGTTCTTAAAGCGGGCCCGTGATAACACA
AAGAATGAGAACGAGGGCCAGATGAACATCTGAGGTGAGATTCGGATTCGGGCCATCGTC
AATCAGTGTTATGAAAATGATAAGAGTGAGAACTCATTTTCATTTTATCTTGTGACTCAT
TCTCTTCTTTCTTTTCGTCTATTTGTGCATCTTTCTTTCTCCCATGCTTTCCGTCGGTCA
AACCAACGATTCTCTTCTCAAAGTAATAGAGAGATCCTTTTCTAGTTAGACTTCTATCAA
TGCAATGAAAGAACCATCCCTTCCTATTAGTTTGTCCTGTCAGATAGAAAGAAAATTAGA
CCCC
T

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4H239JQ 468 0 0
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GGAACAATGAGAAGGCCAGACCAGAAGGGAAAACGACCCCAATGGGGAGATTACCGATTT
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TGATAAGAGTGAGAACTCATTTTCATTTTATCTTGTGACTCATTTTTTTCTTTCTTTTCG
TCTATTTGTGCATCTTTCTTTCTCCCATGCTTTCCGTCGGTCAAACCAACGATTTTTTTT
TCAAAGTAATAGAGAGATCCTTTTCTAGTTAGACTTCTATCAATGCAATGAAAGAACCAT
CCCTTCCTATTAGTTTGTCCTGTCAGATAGAAAGAAAATTAGACCCC
T

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR4AR91TF 794 0 0
G
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GCAATTTCCGCCCATAAGGGGAGTGCCTTCGCCACCGGTAATGTGTGGAAGAGCTAATAA
ACCGAATTGGGAACAATGAGAAGGCCAGACCAGAAGGGAAAACGACCCCAATGGGGAGAT
TACCGATTTTATAAATAAAAAGAAGTTCTTAAAGCGGGCCCGTGATAACACAAAGAATGA
GAACGAGGGCCAGATGAACATCTGAGGTGAGATTCGGATTCGGGCCATCGTCAATCAGTG
TTATGAAAATGATAAGAGTGAGAACTCATTTTCATTTTATCTTGTGACTCATTCTCTTCT
TTCTTTTCGTCTATTTGTGCATCTTTCTTTCTCCCATGCTTTCCGTCGGTCAAACCAACG
ATTCTCTTCTCAAAGTAATAGAGAGATCCTTTTCTAGTTAGACTTCTATCAATGCTATGA
AAGAACCATCCCTTCCTATTAGTTTGTCCTGTCAGATAGAAAGAAAATTAGACCCCAAAG
AGAAAGAGCCCGTTGGGGGGTGAAGGGTGGGGGTTTACATACAACCGAGACAAAGTGGTT
TATGATTGAATCTCAGAGGCATTCTTATCATTTGGTAGATCCAAGTCCATGGCCTATTTC
GGGTTCACTCGGAGCTTTGGCAACCACCGTAG*AGGTGTGATGTACATGCACTCATTTCA
AGGGGGTGCAAGACTTCTAAGTTTGGGCCTCATATTTCTCCTATATACCATGTTCGTATG
GTGGCGCGATGTT

QA 2 794 2 794
DS 

RD RR4AR91JQ 806 0 0
AACACAAAGAATGAGAACGAGGGCCAGATGAACATCTGAGGTGAGATTCGGATTCGGGCC
ATCGTCAATCAGTGTTATGAAAATGATAAGAGTGAGAACTCATTTTCATTTTATCTTGTG
ACTCATTCTCTTCTTTCTTTTCGTCTATTTGTGCATCTTTCTTTCTCCCATGCTTTCCGT
CGGTCAAACCAACGATTCTCTTCTCAAAGTAATAGAGAGATCCTTTTCTAGTTAGACTTC
TATCAATGCTATGAAAGAACCATCCCTTCCTATTAGTTTGTCCTGTCAGATAGAAAGAAA
ATTAGACCCCAAAGAGAAAGAGCCCGTTGGGGGGTGAAGGGTGGGGGTTTACATACAACC
GAGACAAAGTGGTTTATGATTGAATCTCAGAGGCATTCTTATCATTTGGTAGATCCAAGT
CCATGGCCTATTTCGGGTTCACTCGGAGCTTTGGCAACCACCGTAGGAGGTGTGATGTAC
ATGCACTCATTTCAAGGGGGTGCAAGACTTCTAAGTTTGGGCCTCATATTTCTCCTATAT
ACCATGTTCGTATGGTGGCGCGATGTTCTACGTGAATCCACGTTGGAAGGACATCATACC
AAAGTCGTACAATTAGGACTTCGATATGGTTTTATTCTGTTCATCGTATCGGAGGTTATG
TTCTTTTTTGCTTTTTTTTGGGCTTTTTTTCATTCTTCTTTGGCACCTGCGGTAGAGATC
GGAGGTATTTGGCCCCCAAAAGGGATTGGGGTTTTAGATCCTTGGGAAATCCCTTTTCTT
AATACCCTTATTCTCCTTTCATCCGG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 4

CO CL3491Contig1 983 4 19 U
GCTTCATATCGACGCAGGGGTGGGACTCGGAGATGGTGGTGGATTACAGGATAAACAAAG
AGGAGTTCCATAAGATCAGCTTGCTGGACTGCGATTTCTTCATCAGGAAGCCGCCTGATC
CTGATAACGATGTTTATGACTTCAGAGAGATGTATGTTACTCCTCCGGATACGGATATTT
ACTCGATTCCAAGAGTTCTTGCTCCAATGCCTCAAAAGTATATTCGATGTGCGATGAGTG
ACTATGGATGCTACGATGTCACTGAACCGCCTATTGATGCTCCCCGGGATCCACTTTACA
AATCTGAGAGGGAAATATCCAAGGTTTTCTTGACAAAGCATTATCGGAACAGAAGGTTAA
ACGACCCAGAGTTTGTGCTAGATCTTGAAGAGATCTATGTTATTGATTCCAAGACAAAGT
CAATCACCAGGGCCAGAGTTCTGGTAACAGTTCCGGGAGGAAGAAAAAGGGATAGGAAGG
ATGACTTGCTTGTGATACGCGATAATGGAAACTCCTTTAAAATTATACACGCGGGAGAAA
GAGATGACCCAACAACGGTAATAGAAAGGGAAGAGTGGACTAAAACTCGAGAAGACATGG
AGAAACATTTCAGAAAGCTACGAGACTTCAGTGTCTCAAATTGGTTCTAGAAAATATCCC
GAGAGAAACCAAGCGACAAAAAATCTTCCTGGAGTGGAAAACGAGAGTAGATGGTGTTAA
TCAATGATACGGTGGAGGGACCAAAGATGTGCTGTTCCATGGTATACAATGTTTTCTGGC
CTCAGGTATTTTATTAGGTAGCAGCAGTGGTGAATGCATTCGGTGTATTGAATGATATGG
CTTGTAGAATATGTGTGTGCAGAGATGCAATAGTTTTGATGAAATTACATATTCAATGAC
TAGAGAAGGTAGCTTCTCTGTTTTGTTGGTTAACAATAGTTTCATTATTTCCAACTAAGG
TGTTTCAGCGGTGTTTAATTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C169TF U 1
AF RR4FP68TF U 40
AF RR4FP68JQ C 444
AF RR4C169JQ C 319
BS 1 56 RR4C169TF
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BS 58 194 RR4C169TF
BS 195 195 RR4FP68TF
BS 196 215 RR4C169TF
BS 216 608 RR4FP68TF
BS 609 609 RR4C169JQ
BS 610 682 RR4FP68TF
BS 683 683 RR4C169JQ
BS 684 731 RR4FP68TF
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BS 733 738 RR4FP68TF
BS 739 741 RR4C169JQ
BS 742 757 RR4FP68TF
BS 758 758 RR4C169JQ
BS 759 784 RR4FP68TF
BS 785 883 RR4C169JQ
BS 884 884 RR4FP68JQ
BS 885 983 RR4C169JQ

RD RR4C169TF 215 0 0
GCTTCATATCGACGCAGGGGTGGGACTCGGAGATGGTGGTGGATTACAGGATAAACGAAG
AGGAGTTCCATAAGATCAGCTTGCTGGACTGCGATTTCTTCATCAGGAAGCCGCCTGATC
CTGATAACGATGTTTATGACTTCAGAGAGATGTATGTTACTCCTCCGGATACGGATATTT
ACTCGATTCCAAGA*TTCTTGCTCCAATGCCTCAA

QA 1 215 1 215
DS 

RD RR4FP68TF 745 0 0
G
GGATTACAGGATAAACAAAGAGGAGTTCCATAAGATCAGCTTGCTGGACTGCGATTTCTT
CATCAGGAAGCCGCCTGATCCTGATAACGATGTTTATGACTTCAGAGAGATGTATGTTAC
TCCTCCGGATACGGATATTTACTCGATTCCAAGAGTTCTTGCTCCAATGCCTCAAAAGTA
TATTCGATGTGCGATGAGTGACTATGGATGCTACGATGTCACTGAACCGCCTATTGATGC
TCCCCGGGATCCACTTTACAAATCTGAGAGGGAAATATCCAAGGTTTTCTTGACAAAGCA
TTATCGGAACAGAAGGTTAAACGACCCAGAGTTTGTGCTAGATCTTGAAGAGATCTATGT
TATTGATTCCAAGACAAAGTCAATCACCAGGGCCAGAGTTCTGGTAACAGTTCCGGGAGG
AAGAAAAAGGGATAGGAAGGATGACTTGCTTGTGATACGCGATAATGGAAACTCCTTTAA
AATTATACACGCGGGAGAAAGAGATGACCCAACAACGGTAATAGAAAGGGAAGAGTGGAC
TAAAACTCGAGAAGACATGGAGAAACATCTCAGAAAGCTACGAGACTTCAGTGTCTCAAA
TTGGTTCTAGAAAATATCCCGAGAGAAACCAAGCGACAAAAA*TCTTCCTGGAGTGGAAA
ACGAGAGTAGATGGTGTTAATCAATGATACG*TGGAGG**ACAAAGATGTGCTGTTC*AT
GGTATACAATGTTTTCTGGCCTCA

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR4FP68JQ 508 0 0
GTAACAGTTCCGGGAGGAAGAAAAAGGGATAGGAAGGATGACTTGCTTGTGATACGCGAT
AATGGAAACTCCTTTAAAATTATACACGCGGGAGAAAGAGATGACCCAACAACGGTAATA
GAAAGGGAAGAGTGGACTAAAACTCGAGAAGACATGGAGAAACATTTCAGAAAGCTACGA
GACTTCAGTGTTTCAAATTGGTTTTAGAAAATATCCCGAGAGAAACCAAGCGACAAAAAA
TTTTCCTGGAGTGGAAAACGAGAGTAGATGGTGTTAATCAATGATACGGTGGAGGGACCA
AAGATGTGCTGTTCCATGGTATACAATGTTTTTTGGCCTCAGGTATTTTATTAGGTAGCA
GCAGTGGTGAATGCATTCGGTGTATTGAATGATATGGCTTGTAGAATATGTGTGTGCAGA
GATGCAATAGTTTTGATGAAATTACATATTCAATGACTAGAGAAGGTAGCTTCTCTGTTT
*GTTGGTTAACAATAGTTTCATTATTTC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4C169JQ 665 0 0
CCAAGGTTTTCTTGACAAAGCATTATCGGAACAGAAGGTTAAACGACTCAGAGTTTGTGC
TAGATCTTGAAGAGATCTATGTTATTGATTCCAAGACAAAGTCAATCACCAGGGCCAGAG
TTCTGGTAACAGTTCCTGGAGGAAGAAAAAGGGATAGGAAGGATGACTTGCTTGTGATAC
GCGATAATGGAAACTCCTTTAAAATTATACACGCGGGAGAAAGATATGACCCAACAACGG
TAATAGAAAGGGAAGAGTGGACTAAAACTCGAGAAGACATGGAGAAACATTTCAGAAAGC
TACGAGGCTTCAGTGTCTCAAATTGGTTCTAGAAAATATCCCGAGAGAAACCAAGCGACA
AAAAATCTTCCTGGAGTGGAAAACGAGAGTAGATGGTGTTAATCAATGATACGGTGGAGG
GACCAAAGATGTGTTGTTCCATGGTATACAATGTTTTCTGGCCTCAGGTATTTTATTAGG
TAGCAGCAGTGGTGAATGCATTCGGTGTATTGAATGATATGGCTTGTAGAATATGTGTGT
GCAGAGATGCAATAGTTTTGATGAACTTACATATTCAATGACTAGAGAAGGTAGCTTCTC
TGTTTTGTTGGTTAACAATAGTTTCATTATTTCCAACTAAGGTGTTTCAGCGGTGTTTAA
TTCAC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL3492Contig1 1118 3 9 U
GGCCCCAATCTCTCTCTCTCAGGTTTCTCTCTCCTCTCTCCAGAAGGGAAAAAAATTCCC
TTAAAGAAACCCGCTTGTTTGTTTAACCAAATCTCTCATATCTGTGCGATGGATGATGAT
GGGTTTCGTAATTGGGGTTACTACGAACCAGCGGCCGCTACATCATTCAAAGGTAACCTC
GGTTTGCAGCTAATGCCAACCATTGATCGGAACACTAAACCGTTTCTACCCGGTCGAGAC
CCTAATCTAATGATTGGGCAAACCGGTTCATACCACCACCACCCTGAGCCCCACATGAGC
TACAATTGGATTAACCAACACAAAGACAAGTTCTTCAACATGTTGCCTGTCACAACCACT
CCTAATTACGGAAATGTCCTTCCCCAAACTTCCTCATCCCCATCCATGCACATGAATCTC
CACCATCATCATCACCAAACCGAGGAGCACCTGGTTAAATGCGAACCGGACATTGTCGAA
ACTAAGAAGCGGAAGCCTAATTCCAAAGCTGCTGGGGGCGCAACTAAGGCGAAGAAGCCT
CGTAAACCAAAAGAGGAGAACGACAACAACACGAATGTTTCACGAGTTAAACCGGCTAAG
AAAAGCTTCGACCTGGTTATTAACGGAGTGAATATGGACATTTCCGGTTTACCAGTCCCG
GTCTGCACATGCACTGGAGCTCCTCAGCAGTGCTACCGTTGGGGATGTGGCGGTTGGCAA
TCTGCGTGTTGCACCACGAACATATCGATGCATCCGTTGCCGATGAGTACTAAGCGGCGT
GGAGCGAGGATCTCTGGGAGGAAGATGAGTCAAGGCGCGTTTAAGAAGGTTCTTGAGAAA
CTTGCTTCTGATGGGTTTAACTTTGGGAACCCCATCGATCTTAAGAGTCACTGGGCAAGA
CATGGAACTAACAAGTTCGTCACCATCAGATGATTAGTTATCTTTAATTTTTGCTGGAAT
CTGTTTGTTTGTCTGAGAGGAAGAATGTGACTTAGAAAATCTGCAGGGAAGTTTGAATTC
TTCTTTCTTTTTTTTTTGTATTTTTCCCCTTCCTTCTGTTATCTTTATAAACATTTTACT
GACTTGTAATAGTAAGTTGTGTAACAGATAATTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H659TF U 1
AF RR4B863TF U 79
AF RR4B863JQ C 384
BS 1 238 RR4H659TF
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BS 240 353 RR4H659TF
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BS 355 645 RR4H659TF
BS 646 646 RR4B863TF
BS 647 656 RR4H659TF
BS 657 824 RR4B863TF
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RD RR4H659TF 656 0 0
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CCTAATTACGGAAATGTCCTTCCCCAAACTTCCTCATCCCCATCCATGCACATGAATCTC
CACCATCATCATCACCAAACCGAGGAGCACCTGGTTAAATGCGAACCGGACATTGTCGAA
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QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4B863TF 746 0 0
GG
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CATTGATCGGAACACTAAACCGTTTCTACCCGGTCGAGACCCTAATCTAATGATTGGGCA
AACCGGTTCATACCACCACCACCCTGAGCCCCACATGAGCTACAATTGGATTAACCAACA
CAAAGACAAGTTCTTCAACATGTTGCCTGTCACAACCACTCCTAATTACGGAAATGTCCT
TCCCCAAACTTCCTCATCCCCATCCATGCACATGAATCTCCACCATCATCATCACCAAAC
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DS 

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CAACAACACGAATGTTTCACGAGTTAAACCGGCTAAGAAAAGCTTCGACCTGGTTATTAA
CGGAGTGAATATGGACATTTCCGGTTTACCAGTCCCGGTCTGCACATGCACTGGAGCTCC
TCAGCAGTGCTACCGTTGGGGATGTGGCGGTTGGCAATCTGCGTGTTGCACCACGAACAT
ATCGATGCATCCGTTGCCGATGAGTACTAAGCGGCGTGGAGCGAGGATCTCTGGGAGGAA
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TGGGAACCCCATCGATCTTAAGAGTCACTGGGCAAGACATGGAACTAACAAGTTCGTCAC
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TTCCCCTTCCTTCTGTTATCTTTATAAACATTTTACTGACTTGTAATAGTAAGTTGTGTA
ACAGATAATTCTTTT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RR4AS39JQ C 1
AF RR4AS39TF U 1
AF RR4B291JQ C 1
AF RR4B291TF U 1
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DS 

RD RR4B291TF 691 0 0
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DS 



AS 1 3

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK05JQ U 52
AF RR4DH15JQ U 1
AF RR4FK05TF C 356
BS 1 241 RR4DH15JQ
BS 242 244 RR4FK05JQ
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BS 504 504 RR4FK05JQ
BS 505 719 RR4DH15JQ
BS 720 954 RR4FK05TF

RD RR4FK05JQ 541 0 0
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CGTGTTTAGCTTCTTTATCTTCGCATCTCCCTAAAGTACAACCACAAATTTTCTTTCTTC
AAACAAAAACCTTTTTCAGTTTCCCCTCCCCCAATAAGTTTTTGGTTTCTTTTTATACAG
CCACTTTTTCACTTACTGTCCTTGTTGTTGCTTGATCCTCAACCTTGGCTGCTTTGAACA
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TGCGTGTTCCAAGAGCAATGGCATTGGATGCTCCATGGATAAGGTCAGCAGCATGCAGCC
CAAAGATATGAACTCCTAGAATTTCACCGTTGTCAGGTCGGTATATCATCTTGGCTATTC
C

QA 1 541 1 541
DS 

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AGTCGCCCATATTCGAAACAGTTAAACAAATACACGTGAAACCAAAGACAAGACTCGAGC
ATAAATATCCTCAACGAAAGAAGACAGGCTTGTGGATCTAACAACCAAGTCTTTACTAAC
CGAAGGTTGTTTCTCATCATCTCTTCTCCCACTTCTTGGATCATCCTCGTTCGTGTTTAG
C***TTTATCTTCGCATCTCCCTAAAGTACAACCAAAAATTTTCTTTCTTCAAACAAAAA
CCTTTTTCAGTTTCCCCTCCCCCAATAAGTTTTTGGTTTCTTTTTATACAGCCACTTTTT
CACTTACTGTCCTTGTTGTTGCTTGATCCTCAACCTTGGCTGCTTTGAACAGTTCGTCGA
GAACCTCAGACAATGTTGGATGCGCATGAACTGCCAATTTTATGTCCTGAATGCGTGTTC
CAAGAGCAATGGCATTGGATGCTTCATGGATAAGGTCAGCAGCATGCAGCCCAAAGATAT
GAACTCCTAGAATTTCACCGTTGTCAGGTCGGTATATCATCTTGGCTATTCCTTCTCCTT
CGTTTTCAGCTAGAGCCTTTGTGTTAGCCTTGAAACTTGTCTTGGCAACACTAACTTTAA
ATCCTTCCTTCTCTCCTTTCTCCCTAGCTTGTGGCTCTGTTAATCCCACCATGCTAATT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FK05TF 599 0 0
TTTTTCACTTACTGTCCTTGTTGTTGCTTGATCCTCAACCTTGGCTGCTTTGAACAGTTC
GTCGAGAACCTCAGACAATGTTGGATGCGCATGAACTGCCAATTTTATGTCCTGAATGCG
TGTTCCAAGAGCAATGGCATTGGATGCTCCATGGATAAGGTCAGCAGCATGCAGCCCAAA
GATATGAACTCCTAGAATTTCACCGTTGTCAGGTCGGTATATCATCTTGGCTATTCCTTC
TCCTTCGTTTTCAGCTAGAGCCTTTGTGTTAGCCTTGAAACTTGTCTTGGCAACACTAAC
TTTAAATCCTTCCTTCTCTCCTTTCTCCCTAGCTTGTGGCTCTGTTAATCCCACCATGCT
AATTTCAGGATGAGTAAAGCAAGCAGCTGGGATGCTTAGATGATTAAGCACATGATCTCT
ACCTGTGACTTGCTCAACCACAGATATTCCTTGGGCACTGGCTGCATGTGCAAGCATGAG
TTTACCATTGGCATCACCGATGCAGTACAAGTTCGGAACCAGTTTCCCATTTCCATCGAT
CACACGCATTCGCTCATCAACCGGAATGAAGCCCCTCTGCGTCACAACATTGACATTTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 3

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ATCCTGATTAGTACTACCACCCGGTTTGTCCTGAAGCAACACATCTTTCTGCTGTTTCAA
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AAGCTCCTTTAGGCGTTTGTATGCTTTCTTCTTTTCCTTTCTCTCCGCAAGATACTCCAT
ATTAGCAACAGACATGGCGTCATCCTCGCTGATGCCATTCTTGGTCAGTTCAAGAACCCG
GCAACCATAAACGCGTGCTGGATCTGGAATAAACGCCGAAACCTTGTTGGGGTCGACGAG
TTTGGCTTCAGGATGCTACGAGCGAATCTACGAACGTAGGGATCTTCAGGGAGAACAATC
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BQ
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AF RR4DO84JQ U 66
AF RR4B375JQ U 1
AF RR4B375TF C 65
BS 1 752 RR4B375JQ
BS 753 769 RR4B375TF

RD RR4DO84JQ 467 0 0
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TAACTAGCCTGCGGACGCTAGGAGGATCCGCAGGTGCTTTCTTCTCTTGAGTTTGCATCT
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CTACAGACATGGCGTCATCCTCGCTGATGCCATTTTTGGTCAGTTCAAGAACCCGGCAAC
CATAAAAGCGTGCTGGATCTGGAATAAACGCCGAAACCTTGTTGGGG

QA 1 467 1 467
DS 

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TTGTTGAAAATGATCTGTAAACAATCAAATGGGAATAACAACAATTGTCATCATGTATAA
AACGACTG*AACTTGCATAAAAAGAAAAGGGTGATGGAGAATCTATTCGTCTATCCAATG
ATCCTGATTAGTACTACCACCCGGTTTGTCCTGAAGCAACACATCTTTCTGCTGTTTCAA
CTGGTTAACTAGCCTGCGGACGCTAGGAGGATCCGCAGGTGCTTTCTTCTCTTGAGTTTG
CATCTCCTTTTTGGTACTAAGATACGGTTTAGGAGGAGGAGCCTTGTCTTGCAGTACCGC
AAGCTCCTTTAGGCGTTTGTATGCTTTCTTCTTTTCCTTTCTCTCCGCAAGATACTCCAT
ATTAGCAACAGACATGGCGTCATCCTCGCTGATGCCATTCTTGGTCAGTTCAAGAACCCG
GCAACCATAAACGCGTGCTGGATCTGGAATAAACGCCGAAACCTTGTTGGGGTCGACGAG
TTTGGCTTCAGGATGCTACGAGCGAATCTACGAACGTAGGGATCTTCAGGGAGAACAATC
TTCTTGAGGTTCCCATTAGAGCGAGGAAAGACAGGAGGTGGTGATGCTTCCATGGCTTTA
AGCCAAACAGGCTCTCTTGTAGCGAGTCCACCAACAAGCCTCCTGGTTTTGGAAAGTAAA
TCTCCTTTCATCCACGACATGGTTGCTTCACC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4B375TF 705 0 0
T
GAAAATGATCTGTAAACAATCAAATGGGAATAACAACAATTGTCATCATGTATAAAACGA
CTG*AACTTGCATAAAAAGAAAAGGGTGATGGAGAATCTATTCGTCTATCCAATGATCCT
GATTAGTACTACCACCCGGTTTGTCCTGAAGCAACACATCTTTCTGCTGTTTCAACTGGT
TAACTAGCCTGCGGACGCTAGGAGGATCCGCAGGTGCTTTCTTCTCTTGAGTTTGCATCT
CCTTTTTGGTACTAAGATACGGTTTAGGAGGAGGAGCCTTGTCTTGCAGTACCGCAAGCT
CCTTTAGGCGTTTGTATGCTTTCTTCTTTTCCTTTCTCTCCGCAAGATACTCCATATTAG
CAACAGACATGGCGTCATCCTCGCTGATGCCATTCTTGGTCAGTTCAAGAACCCGGCAAC
CATAAACGCGTGCTGGATCTGGAATAAACGCCGAAACCTTGTTGGGGTCGACGAGTTTGG
CTTCAGGATGCTACGAGCGAATCTACGAACGTAGGGATCTTCAGGGAGAACAATCTTCTT
GAGGTTCCCATTAGAGCGAGGAAAGACAGGAGGTGGTGATGCTTCCATGGCTTTAAGCCA
AACAGGCTCTCTTGTAGCGAGTCCACCAACAAGCCTCCTGGTTTTGGAAAGTAAATCTCC
TTTCATCCACGACATGGTTGCTTCACCTGGACTTCTTCGCTTCC

QA 2 705 2 705
DS 



AS 2 4

CO CL3496Contig1 760 2 2 U
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AATTTTTTTTTTTTTGGTTCTGTTCATTTGGTTGGGTTGATTTTCGAGCAAGAATGAAAC
CAGTGATAGGCACAGTGGTATCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACA
GACTCTTCCACAACAAGCTCTACAACCGCTACGTCAAGCGCACTTCCAAGTTCATGGCTC
ACGACGAGAAAGACTCCTGCAGCATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGT
TGAGCAAGAATAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAAGAAAGCTCGCATCTATTCTC
CTCAAGCCGCAGCCGCTGCTATTGCTCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCATCCATTCC
TGATTCTACTGCTCAGTCTCAGGCTCCTCCAACTTCTTCTACTTCTTCTTAAGTTTTGTT
AGGAGTCCGCATGCATAGACAAGGGATATGTGTGTCTTGGATACTCTATTTCATGAGCTA
CTAAGGAAGACAGCTTTGTACCGATCAACATTATTATCGATCTAAGTTGATTTTTCAGGA
TGATGATGTCTACGATATTTGGTTTTCCTCCTGGGATGATTACGAGTTATTTGATGGTAC
TAATAGATAATGTAGTGAACATTTTATGAATAAGACTGTAATGCTTCTTTATTCTTGATG
ATGTAATGCTTCTTTATTCTACAAATGCACATAACTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BT10TF U 1
AF RR4BT10JQ C 77
BS 1 640 RR4BT10TF
BS 641 760 RR4BT10JQ

RD RR4BT10TF 640 0 0
GGAGACAAGACAAGAATCATTCCTTTCTTCTCCTCCGATCTCTGTTTGATTGTCAAGAAC
AATTTTTTTTTTTTTGGTTCTGTTCATTTGGTTGGGTTGATTTTCGAGCAAGAATGAAAC
CAGTGATAGGCACAGTGGTATCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACA
GACTCTTCCACAACAAGCTCTACAACCGCTACGTCAAGCGCACTTCCAAGTTCATGGCTC
ACGACGAGAAAGACTCCTGCAGCATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGT
TGAGCAAGAATAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAAGAAAGCTCGCATCTATTCTC
CTCAAGCCGCAGCCGCTGCTATTGCTCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCATCCATTCC
TGATTCTACTGCTCAGTCTCAGGCTCCTCCAACTTCTTCTACTTCTTCTTAAGTTTTGTT
AGGAGTCCGCATGCATAGACAAGGGATATGTGTGTCTTGGATACTCTATTTCATGAGCTA
CTAAGGAAGACAGCTTTGTACCGATCAACATTATTATCGATCTAAGTTGATTTTTCAGGA
TGATGATGTCTACGATATTTGGTTTTCCTCCTGGGATGAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4BT10JQ 684 0 0
GTTCTGTTCATTTGGTTGGGTTGATTTTCGAGCAAGAATGAAACCAGTGATAGGCACAGT
GGTATCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACAACAA
GCTCTACAACCGCTACGTCAAGCGCACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAAGACTC
CTGCAGCATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGTTGAGCAAGAATAAGCA
TTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAAGAAAGCTCGCATCTATTCTCCTCAAGCCGCAGCCGC
TGCTATTGCTCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCATCCATTCCTGATTCTACTGCTCAG
TCTCAGGCTCCTCCAACTTCTTCTACTTCTTCTTAAGTTTTGTTAGGAGTCCGCATGCAT
AGACAAGGGATATGTGTGTCTTGGATACTCTATTTCATGAGCTACTAAGGAAGACAGCTT
TGTACCGATCAACATTATTATCGATCTAAGTTGATTTTTCAGGATGATGATGTCTACGAT
ATTTGGTTTTCCTCCTGGGATGATTACGAGTTATTTGATGGTACTAATAGATAATGTAGT
GAACATTTTATGAATAAGACTGTAATGCTTCTTTATTCTTGATGATGTAATGCTTCTTTA
TTCTACAAATGCACATAACTCTTC

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL3496Contig2 652 2 2 U
CGAGCAAGAATGAAGCCAGTGATAGGCACAGTGGTCTCGAACAAGATGCGGAAATCAGTG
GTCGTAGCCGTGGACAGACTGTTCCACAACAAGCTCTACAACCGCTACATCAAGCGCACT
TCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAAGACTCCTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTA
GATCCTTCGAGGCCGTTGAGCAAGAATAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATTAAGAAA
GCTCGCATTTATTTTCCTCAAGCTGCCGCCGCTGCTATTACTGCTTTTGCACCAACTTCC
TCAGCCTCCGTTGCTGATTTTACTGCTCAGTTTCAGGCTCCTCCAACTTTTTTTACTTTT
TTTTAAGTTTTGTTAGAGTCCGCATGCATAGACAAGGGATATGTGTGTCTTGATACTTTA
TTTCATGAGCTACTAAGGAAGACAGCTTTGTACCGATCAACATTATTATCGATTTAAGTT
GATTTTTCAGGATGATGATGTTTACGATATTTGGTTTTCCTCCTGGGATGATTACGAGTT
ATTTGATGGTATTAATAGAGAATGTAGTGAACATTTTATGAATAAGACTGTAATGCTTCT
TTATTTTTGATGATGTAATGCTTTTTTATTTTACAAATGCACATAACTTTTC


BQ
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AF RR4HB90TF U 1
AF RR4HB90JQB C 65
BS 1 180 RR4HB90TF
BS 181 652 RR4HB90JQB

RD RR4HB90TF 180 0 0
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GTCGTAGCCGTGGACAGACTGTTCCACAACAAGCTCTACAACCGCTACATCAAGCGCACT
TCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAAGACTCCTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTA

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR4HB90JQB 588 0 0
TAGCCGTGGACAGACTGTTCCACAACAAGCTTTACAACCGGTACATCAAGCGCACTTCCA
AGTTCATGGCTCACGACGAGAAAGACTCCTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATC
CTTCGAGGCCGTTGAGCAAGAATAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATTAAGAAAGCTC
GCATTTATTTTCCTCAAGCTGCCGCCGCTGCTATTACTGCTTTTGCACCAACTTCCTCAG
CCTCCGTTGCTGATTTTACTGCTCAGTTTCAGGCTCCTCCAACTTTTTTTACTTTTTTTT
AAGTTTTGTTAGAGTCCGCATGCATAGACAAGGGATATGTGTGTCTTGATACTTTATTTC
ATGAGCTACTAAGGAAGACAGCTTTGTACCGATCAACATTATTATCGATTTAAGTTGATT
TTTCAGGATGATGATGTTTACGATATTTGGTTTTCCTCCTGGGATGATTACGAGTTATTT
GATGGTATTAATAGAGAATGTAGTGAACATTTTATGAATAAGACTGTAATGCTTCTTTAT
TTTTGATGATGTAATGCTTTTTTATTTTACAAATGCACATAACTTTTC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 4

CO CL3497Contig1 787 2 8 U
GCTTCAATTTTCCTTCCCTGCTGACTCCCAAGTCTGCAGCTTTACCTCTTGCTTCAGCAG
AATCTCAGATCCATAAAGCTAAATCCTTTCGGCGTATGTGGAGGAAGTTAAGAGAGAAAG
AGTGTTTCTTTTGATGACATGAGGGATGTTAGCTACGTTAATGAAACTACTGAGTGCTTG
TCTGTGGCCTTCTTCTTCCTCCTCCTCGGGCAGCAAGTCATCTGATTCAGCAGGGAGACA
AGATGGGTTGCTCTGGTACAAAGACTCTGGTCAGCACCTACTCGGCGAGTTCTCAATGGC
GGTTGTTCAGGCCAACAATCTTCTCGAGGATCAGAGCCAAGTCGAGTCTGGCCCTTTGAG
CACGCTTGATTCTTCTGGTCCTTACGGAACTTTCGTTGGAGTATACGACGGTCATGGCGG
CCCTGAGACTTCACGCTTTGTTAATGATCATCTCTTTCAGCATTTAAAGAGATTTGCAGC
AGAGGAAGCCTCTATGTCGATGGATGTAATTAGAAAGGCTTACGAGGCGACGGAAGAAGG
GTTTCTAGGGGTTGTGACGAAGCAGTGGCCTGTGAAGCCACAGATTGCAGCTGTTGGGTC
TTGCTGCTTGGTTGGTGTTATATGCGGAGGGAAGCTCTACATCGCTAACGTTGGGGATTC
CCGTGCTGTTCTTGGAAGGCTGTGAGGGCGACAGGTGAGTTATTGCGCTTCAGCTCTCAG
CGGAACATACGTGAGCATAGAGAGTGTAGACAGGAGATGCACTCTTACATCCGATGACTC
TCATATG


BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY17TF U 1
AF RR4F519TF U 1
BS 1 694 RR4EY17TF
BS 695 695 RR4F519TF
BS 696 701 RR4EY17TF
BS 702 702 RR4F519TF
BS 703 724 RR4EY17TF
BS 725 725 RR4F519TF
BS 726 747 RR4EY17TF
BS 748 787 RR4F519TF

RD RR4EY17TF 748 0 0
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TCTGTGGCCTTCTTCTTCCTCCTCCTCGGGCAGCAAGTCATCTGATTCAGCAGGGAGACA
AGATGGGTTGCTCTGGTACAAAGACTCTGGTCAGCACCTACTCGGCGAGTTCTCAATGGC
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CCGTGCTGTTCTTGGAAGGCTGTGAGGGCGACAG*TGAGTT*TTGCGCTTCAGCTCTCAG
CGGA*CATACGTGAGCATAGAGAGTGT
T

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4F519TF 787 0 0
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AATCTCAGATCCATAAAGCTAAATCCTTTCGGCGTATGTGGAGGAAGTTAAGAGAGAAAG
AGTGTTTCTTTTGATGACATGAGGGATGTTAGCTACGTTAATGAAACTACTGAGTGCTTG
TCTGTGGCCTTCTTCTTCCTCCTCCTCGGGCAGCAAGTCATCTGATTCAGCAGGGAGACA
AGATGGGTTGCTCTGGTACAAAGACTCTGGTCAGCACCTACTCGGCGAGTTCTCAATGGC
GGTTGTTCAGGCCAACAATCTTCTCGAGGATCAGAGCCAAGTCGAGTCTGGCCCTTTGAG
CACGCTTGATTCTTCTGGTCCTTACGGAACTTTCGTTGGAGTATACGACGGTCATGGCGG
CCCTGAGACTTCACGCTTTGTTAATGATCATCTCTTTCAGCATTTAAAGAGATTTGCAGC
AGAGGAAGCCTCTATGTCGATGGATGTAATTAGAAAGGCTTACGAGGCGACGGAAGAAGG
GTTTCTAGGGGTTGTGACGAAGCAGTGGCCTGTGAAGCCACAGATTGCAGCTGTTGGGTC
TTGCTGCTTGGTTGGTGTTATATGCGGAGGGAAGCTCTACATCGCTAACGTTGGGGATTC
CCGTGCTGTTCTTGGAAGGCTGTGAGGGCGACAGGTGAGTTATTGCGCTTCAGCTCTCAG
CGGAACATACGTGAGCATAGAGAGTGTAGACAGGAGATGCACTCTTACATCCGATGACTC
TCATATG

QA 1 787 1 787
DS 



CO CL3497Contig2 807 2 10 U
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TCAGTAGTGTGTGGCTTTTCACGTTACAAATTATACATTCTTATACCAACAACAACAACA
AAGAGTGACACATTTTTTTTATACGTAGCTACAAAAGATGGGAATCTAAAAAAAAAAAAA
AAAAAGAGGAAGGAAGCAACTTTTAAAGTTTCTTGGGGAAAGTCATACCGCCGCCTCGGA
TAGAAAGAGAAGGTCCTTTGGCAGAGCTCACTACATTGGTATCAAGGAAGATGACCACCA
CAGTGATGTCATCGTGGAAATGCCTCCTCACGCCTCTCTCTATCTTCTTCAGATCAGTAT
ATCTCATTTCCCTCTTCTTCGCTGCAGCTTGCAGTGCCATCTTCACCAGTCTACGCGCTA
TCCCGTTTCGTGGGTGGTTCTGAACGATGTCAACAGCTTCTTGGTTGCTCATCTGTTCCC
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CCGGATGTAAGGAGTGCATCTCCTGTCTAACACTCTCTATGCTCACGTTATGTTCCGCTG
AGAGCTGAAGCGCAATAACCTCACCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 
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15 15 15 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F519JQ U 1
AF RR4FY94JQ U 17
BS 1 116 RR4F519JQ
BS 117 119 RR4FY94JQ
BS 120 288 RR4F519JQ
BS 289 289 RR4FY94JQ
BS 290 370 RR4F519JQ
BS 371 371 RR4FY94JQ
BS 372 421 RR4F519JQ
BS 422 422 RR4FY94JQ
BS 423 649 RR4F519JQ
BS 650 807 RR4FY94JQ

RD RR4F519JQ 649 0 0
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TCAGTAGTGTGTGGCTTTTCACGTTACAAATTATACATTCTTATACCAACAACAAC***A
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AAAAAGAGGAAGGAAGCAACTTTTAAAGTTTCTTGGGGAAAGTCATACCGCCGCCTCGGA
TAGAAAGAGAAGGTCCTTTGGCAGAGCTCACTACATTGGTATCAAGGATGATGACCACCA
CAGTGATGTCATCGTGGAAATGCCTCCTCACGCCTCTCTCTATCTTCTTCAGATCAGTAT
ATCTCATTTCTCTCTTCTTCGCTGCAGCTTGCAGTGCCATCTTCACCAGTCTACGCGCTA
TGCCGTTTCGTGGGTGGTTCTGAACGATGTCAACAGCTTCTTGGTTGCTCATCTGTTCCC
ATAGACCGTCTGAAGCAAATATCAGAAACTGATCATGCGGTTGGAGCTCATGCTCTGTTA
TCGACGGTTCCCCACTCAAGATTGGCCTTTTCATCGGCTCCCGGAGTCTATACTTTGTGT
ACAATGGTTCCCTGTTGAACTCCGGTTTCTTAAGATACACGTCGCCTAT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4FY94JQ 791 0 0
GG
ATAAATAAAAATTAATGATTACTGGAATTGAGTTTCCAAACGTCAGTAGTGTGTGGCTTT
TCACGTTACAAATTATACATTCTTATACCAACAACAACAACAAAGAGTGACACATTTTTT
T*ATACGTAGCTACAAAAGATGGGAATCTAAAAATAAAAAAAAAA**GAGGGAGGAAGCA
ACTTTTAGAGTTTCTTGGGGAAAGTCATACCGCCGCCTCGGATAGAAAGAGAAGGTCCTT
TGGCAGAGCTCACTACATTGGTATCAAGGAAGATGACCACCACAGTGATGTCATCGTGGA
AATGCCTCCTCACGCCTCTCTCTATCTTCTTCAGATCAGTATATCTCATTTCCCTCTTCT
TCGCTGCAGCTTGCAGTGCCATCTTCACCAGTCTACGCGCTATCCCGTTTCGTGGGTGGT
TCTGAACGATGTCAACAGCTTCTTGGTTGCTCATCTGTTCCCATAGACCGTCTGAAGCAA
ATATCAGAAACTGATCATGCGGTTGGAGGTCGTGCTCTGTTATCGACGGTTCCCCACTCA
AGATTGGCCTTTTCATCGGCTCGCGGAGTCTATACTTTGTGTACAGTGGTTCCCTGTTGA
ACTCCGGTTTCTTAAGATACACGTCGCCTATGGATCTAGATATCTGAATAAGTCCCTTAA
CGCGCCACACATTATGCTTCAACACAACAATATGAGAGTCATCCGGATGTAAGGAGTGCA
TCTCCTGTCTAACACTCTCTATGCTCACGTTATGTTCCGCTGAGAGCTGAAGCGCAATAA
CCTCACCTG

QA 3 791 3 791
DS 



AS 2 4

CO CL3498Contig1 539 2 1 U
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AGTACGCTATCAAAGTTTAAATTCGTTCTATTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTTTGTTGTG
TTTTTGATGCAAACTTGTTTTGTTCTTCGCTTTGTACTCTTTTCTCAAACAGTTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E133TF U 1
AF RR4E133JQ C 23
BS 1 539 RR4E133TF

RD RR4E133TF 539 0 0
GGAGGGTTTCTGATTTCTCTGAGCCAAAGAAGAGTAGTGGCGGCGTAACACGAGTGAAGA
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AGAACCAGCTTCAGGATCTGAAAGCTGAGCTCGCTCTCCTCCATGTCGCTAAAGTCACCG
GTGGTGCCCCCAACAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTCAGGAAATCCATAGCTCAGGTGT
TGACAGTGACCTCACAGAAGCAGAAATCTGCACTCAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGT
TCATCCCTCTTTATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAAC
ATCAGCTCTCTTTGAAGACCGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAA
AGTACGCTATCAAAGTTTAAATTCGTTCTATTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTTTGTTGTG
TTTTTGATGCAAACTTGTTTTGTTCTTCGCTTTGTACTCTTTTCTCAAACAGTTTCACC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4E133JQ 517 0 0
GCC
AAAGAAGAGTAGTGGCGGCGTAACACGAGTGAAGAAGATCACGATGGCAAGGATTAAGGT
TCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGATCTGAAAGC
TGAGCTCGCTCTCCTCCATGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCCCCAACAAGCTCTCTAA
AATCAAGGTTGTCAGGAAATCCATAGCTCAGGTGTTGACAGTGACCTCACAGAAGCAGAA
ATCTGCACTCAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTTATCTCCGTCCTAA
GAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCTCTTTGAAGACCGAGCG
TGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCAAAGTTTAAATTCG
TTCTATTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTTTGTTGTGTTTTTGATGCAAACTTGTTTTGTTC
TTCGCTTTGTACTCTTTTCTCAAACAGTTTCACC

QA 4 517 4 517
DS 



CO CL3498Contig2 585 2 1 U
GAGGGCTCCTGATTCTCTGAGCCAAAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGAA
GATCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCA
GAACCAGCTTCAGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGG
TGGTGCTCCCAACAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTCCGGAAATCCATAGCTCAGGTGTT
GACCGTGACCTCACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTT
CATCCCTCTTGATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACA
TCAGCTCTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAA
GTACGCTATCAAAGTTTAAGTTCGTTCTACTAGAAACTCTGTTTCACCTTTTGTTGTGTT
TTTGATGCAAACTTGTTTTGTTCTTCTTCGCTTTATGCTCTTTTCTCAAACAGTTTCACC
AACTTTGATTATGGTTACCATTGATATTTTGCATTTTCTTAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GR27TF U 1
AF RR4GR27JQ C 20
BS 1 585 RR4GR27TF

RD RR4GR27TF 585 0 0
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GATCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCA
GAACCAGCTTCAGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGG
TGGTGCTCCCAACAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTCCGGAAATCCATAGCTCAGGTGTT
GACCGTGACCTCACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTT
CATCCCTCTTGATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACA
TCAGCTCTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAA
GTACGCTATCAAAGTTTAAGTTCGTTCTACTAGAAACTCTGTTTCACCTTTTGTTGTGTT
TTTGATGCAAACTTGTTTTGTTCTTCTTCGCTTTATGCTCTTTTCTCAAACAGTTTCACC
AACTTTGATTATGGTTACCATTGATATTTTGCATTTTCTTAACGC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4GR27JQ 566 0 0
AGCCA
AAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGAAGATCACGATGGCAAGGATTAAGGT
TCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGATCTCAAGGC
TGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCTCCCAACAAGCTCTCTAA
AATCAAGGTTGTCCGGAAATCCATAGCTCAGGTGTTGACCGTGACCTCACAGAAGCAGAA
ATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTGATCTCCGTCCTAA
GAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCTCTTTGAAGACAGAGCG
TGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCAAAGTTTAAGTTCG
TTCTACTAGAAACTCTGTTTCACCTTTTGTTGTGTTTTTGATGCAAACTTGTTTTGTTCT
TCTTCGCTTTATGCTCTTTTCTCAAACAGTTTCACCAACTTTGATTATGGTTACCATTGA
TATTTTGCATTTTCTTAACGC

QA 6 566 6 566
DS 



AS 2 4

CO CL3499Contig1 778 2 3 U
TTTTTATTCCATATTAATGTACCACCTCTCAACTCATAATAGCTCGGAAATAGCCAAAAG
TAAAATCAAATAGAGGAAAATAGCTTTAAATCTCAAAGACACAAGCGAACGTGGAAGAAA
TACGATCAAAACAATCCTAATTCTACCTCACCGTGGTTGACAAAAACTCTACAAGTGAGA
GTTTATCTTTGGTTTATCATATCGATCAATAATCATATTAATAGTATATGTAACTCATCA
GCTATTCCTTTTACTGCCTTCCACGTCTCTCCTTATGAGCTCCAACACCATTTCGTTCCA
TGTATCAACCGGTCCCGGCATGCACCAGTGCAAGCAGTCTTGAGGTGGAGGTCGTCCATC
CGGTCCCCTTTTAGTGATCTTCTTTGGGTCAGGACTCCTGTACGGACCAGGATGACCATC
ATGTCGATATCCGAAAGCCTCTGTAATATCCATCAGCTTTAACTTAAGTTTCGAGCTGTC
CGCCACTCCCTCCAAAGCTCTGTTAAACCCCGTTGCTTGCTTCTCGTGCATTATCTCCGT
GAACCCGTTTTTCACTAGCTTCCCTGGGAGGATGGGTTCTTCTTTCCCGGTGCATGAACC
TCCTGTGTTCCAAGCCCCACCCTCGTAGTGATCAGGCGACCATGTTCTCACGATGGTTAA
ACCGGTGTAGTTCGGGTGTGTAGCCATGGACTTTAAAATTGTTTCAACCGATATTCCGAA
TGCTTCCACGTTATTGACTTTCATGGGCTTTGATTTGTCCGCCACCATAATTGGCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D777JQ U 128
AF RR4GW66JQ U 1
BS 1 299 RR4GW66JQ
BS 300 300 RR4D777JQ
BS 301 778 RR4GW66JQ

RD RR4D777JQ 534 0 0
G
AAACAATCCTAATTCTACCTCACCGTGGTTGACAAAAACTCTACAAGTGAGAGTTTATCT
TTGGTTTATCATATCGATCAATAATCATATTAATAGTATATGTAACTCATCAGCTATTCC
TTTTACTGCCTTCCACGTCTCTCCTTATGAGCTCCAACACCATTTCGTTCCATGTATCAA
CCGGTCCCGGCATGCATCAGTGCAAGCAGTCTTGAGGTGGAGGTCGTCCATCCGGTCCCC
TTTTAGTGATCTTCTTTGGGTCAGGACTCCTGTACGGACCAGGATGACCATCATGTCGAT
ATCCGAAAGCCTCTGTAATATCCATCAGCTTTAACTTAAGTTTCGAGCTGTCCGCCACTC
CCTCCAAAGCTCTGTTAAACCCCGTTGCTTGCTTCTCGTGCATTATCTCCGTGAACCCGT
TTTTCACTAGCTTCCCTGGGAGGATGGGTTCTTCTTTCCCGGTGCATGAACCTCCTGTGT
TCCAAGCCCCACCCTCGTAGTGATCAGGCGACCATGTTCTCACGATGGTTAAA

QA 2 534 2 534
DS 

RD RR4GW66JQ 778 0 0
TTTTTATTCCATATTAATGTACCACCTCTCAACTCATAATAGCTCGGAAATAGCCAAAAG
TAAAATCAAATAGAGGAAAATAGCTTTAAATCTCAAAGACACAAGCGAACGTGGAAGAAA
TACGATCAAAACAATCCTAATTCTACCTCACCGTGGTTGACAAAAACTCTACAAGTGAGA
GTTTATCTTTGGTTTATCATATCGATCAATAATCATATTAATAGTATATGTAACTCATCA
GCTATTCCTTTTACTGCCTTCCACGTCTCTCCTTATGAGCTCCAACACCATTTCGTTCCG
TGTATCAACCGGTCCCGGCATGCACCAGTGCAAGCAGTCTTGAGGTGGAGGTCGTCCATC
CGGTCCCCTTTTAGTGATCTTCTTTGGGTCAGGACTCCTGTACGGACCAGGATGACCATC
ATGTCGATATCCGAAAGCCTCTGTAATATCCATCAGCTTTAACTTAAGTTTCGAGCTGTC
CGCCACTCCCTCCAAAGCTCTGTTAAACCCCGTTGCTTGCTTCTCGTGCATTATCTCCGT
GAACCCGTTTTTCACTAGCTTCCCTGGGAGGATGGGTTCTTCTTTCCCGGTGCATGAACC
TCCTGTGTTCCAAGCCCCACCCTCGTAGTGATCAGGCGACCATGTTCTCACGATGGTTAA
ACCGGTGTAGTTCGGGTGTGTAGCCATGGACTTTAAAATTGTTTCAACCGATATTCCGAA
TGCTTCCACGTTATTGACTTTCATGGGCTTTGATTTGTCCGCCACCATAATTGGCCTC

QA 1 778 1 778
DS 



CO CL3499Contig2 1126 2 4 U
GATCCGGAGGGACCTGTGTACACGAACAACTCTTGCCCCGTCCTGACGCAGATGCAGAAC
TGCCAGGGCAATGGACGACCTGACAAGGGATACGAGAACTGGAGATGGAAACCTTCTCAG
TGTGACCTTCCTCGGTTTGATGCCAGGAAATTTCTAGAGCTAATGAGAGGCAAGACATTA
GCCTTCATAGGTGATTCGGTTGCTCGTAACCAGATGGAGTCCATGATGTGCCTTCTTTGG
CAGGTTGAAACACCGGTCAACCGTGGGAGCCGGAAGATGCGGAGATGGTTATTTAAGTCA
TCATCAGTAATGATTGCTCGTATATGGTCATCTTGGCTCGTACATCAGTTCAACGAAAAA
TTCGACTATGCGCCTGAAGGTGTCACCAAACTAAAGCTGGACCTTCCTGATGAGCGCATT
ATAGAAGCTCTTCCGAAGTTCGACGTGGTTGTCCTGTCATCAGGTCACTGGTTTGCAAAG
CAATCTGTCTACGTTCTAAATGACGAGATCATCGGAGGCCAATTATGGTGGCCGGACAAA
TCAAAGCCCATGAAAGTCAATAACGTGGAAGCATTCGGAATATCAGTTGAAACAATTTTA
AAGTCCATGGCTACACACCCGAACTACACCGGTTTAACCATCGTGAGAACATGGTCGCCT
GATCACTACGAGGGTGGGGCTTGGAACACAGGAGGTTCATGCACCGGGAAAGAAGAACCC
ATCCTCCCAGGGAAGCTAGTGAAAAACGGGTTCACGGAGATAATGCACGAGAAGCAAGCA
ACGGGGTTTAACAGAGCTTTGGAGGGAGTGGCGGACAGCTCGAAACTTAAGTTAAAGCTG
ATGGATATTACAGAGGCTTTCGGATATCGACATGATGGTCATCCTGGTCCGTACAGGAGT
CCTGACCCAAAGAAGATCACTAAAAGGGGACCGGATGGACGACCTCCACCTCAAGACTGC
TTGCACTGATGCATGCCGGGACCGGTTGATACATGGAACGAAATGGTGTTGGAGCTCATA
AGAGAGACGTGGAAGCAGTAAAAGAATAGCTGATGAGTACATATACTATTATATGATTAT
TGATCGATATGATAAACAAAGATAACTCTCACTTGTAGAGTTTTGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW66TF U 1
AF RR4D777TF U 334
BS 1 584 RR4GW66TF
BS 585 585 RR4D777TF
BS 586 682 RR4GW66TF
BS 683 1126 RR4D777TF

RD RR4GW66TF 682 0 0
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TGTGACCTTCCTCGGTTTGATGCCAGGAAATTTCTAGAGCTAATGAGAGGCAAGACATTA
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CAGGTTGAAACACCGGTCAACCGTGGGAGCCGGAAGATGCGGAGATGGTTATTTAAGTCA
TCATCAGTAATGATTGCTCGTATATGGTCATCTTGGCTCGTACATCAGTTCAACGAAAAA
TTCGACTATGCGCCTGAAGGTGTCACCAAACTAAAGCTGGACCTTCCTGATGAGCGCATT
ATAGAAGCTCTTCCGAAGTTCGACGTGGTTGTCCTGTCATCAGGTCACTGGTTTGCAAAG
CAATCTGTCTACGTTCTAAATGACGAGATCATCGGAGGCCAATTATGGTGGCCGGACAAA
TCAAAGCCCATGAAAGTCAATAACGTGGAAGCATTCGGAATATCGGTTGAAACAATTTTA
AAGTCCATGGCTACACACCCGAACTACACCGGTTTAACCATCGTGAGAACATGGTCGCCT
GATCACTACGAGGGTGGGGCTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4D777TF 793 0 0
G
GGCTCGTACATCAGTTCAACGAAAAATTCGACTATGTGCCTGAAGGTGTCACCAAACTAA
AGCTGGACCTTCCTGATGAGCGCATTATAGAAGCTCTTCCGAAGTTCGACGTGGTTGTCC
TGTCATCAGGTCACTGGTTTGCAAAGCAATCTGTCTACGTTCTAAATGACGAGATCATCG
GAGGCCAATTATGGTGGCCGGACAAATCAAAGCCCATGAAAGTCAATAACGTGGAAGCAT
TCGGAATATCAGTTGAAACAATTTTAAAGTCCATGGCTACACACCCGAACTACACCGGTT
TAACCATCGTGAGAACATGGTCGCCTGATCACTACGAGGGTGGGGCTTGGAACACAGGAG
GTTCATGCACCGGGAAAGAAGAACCCATCCTCCCAGGGAAGCTAGTGAAAAACGGGTTCA
CGGAGATAATGCACGAGAAGCAAGCAACGGGGTTTAACAGAGCTTTGGAGGGAGTGGCGG
ACAGCTCGAAACTTAAGTTAAAGCTGATGGATATTACAGAGGCTTTCGGATATCGACATG
ATGGTCATCCTGGTCCGTACAGGAGTCCTGACCCAAAGAAGATCACTAAAAGGGGACCGG
ATGGACGACCTCCACCTCAAGACTGCTTGCACTGATGCATGCCGGGACCGGTTGATACAT
GGAACGAAATGGTGTTGGAGCTCATAAGAGAGACGTGGAAGCAGTAAAAGAATAGCTGAT
GAGTACATATACTATTATATGATTATTGATCGATATGATAAACAAAGATAACTCTCACTT
GTAGAGTTTTGT

QA 2 793 2 793
DS 



AS 1 4

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AGTTGGGAAGAGTTCTCACGAAACAGTAACTGCATAAAATCAATGGCACCGACTCACTGC
AACCACACAAATTCACTTTTCAATACAGTACTATTTTTAAACGGTGATAATAAATGATAT
TATGAAGAGTTGGGCAACAACTTCAAGCCTTAGCCACCGTTTCCGAAAGCTATGAGCGTG
GTTCTTGCTTGGCAAAGAGGTCGTCCGGCCACTGTTGTTACCATCGGATCCTGCGGTTGG
AGATATACTTGTGGGCTCAGGGGCCGAACCGGCAGGAGCAGAGGCTGGGCTAGTTTTGTT
TAAACCGTTTGCCAGCTGATAGAACACTTGGGCTTCTTGAGATTTTGGGTCCATATGAAG
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GAGAGAGACGTTGATCTGGAGACCCAAGTCAGGATCATTCCTGTCTTGGATGATCACACA
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AGTCTTTGCCTGTCCTTGCACGTAAGGAAGACATGTGGCCATACCCACAAGCTGCTCGGT
ACACTCTTCCTTATCCTTCGCCTTGTCCTCACCAGCAGCCACCATCGTCGCCATTATTAA
TGCTATTGCTATCGCCACTAGACTAATCCTCCAAAACTCCATTTTTATTGTTCATGCACG
ATTTAACCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G669JQ U 1
AF RR4D201JQ U 76
AF RR4G669TF C 84
AF RR4D201TF C 135
BS 1 655 RR4G669JQ
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BS 713 844 RR4G669TF
BS 845 853 RR4D201TF

RD RR4G669JQ 655 0 0
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AGATATACTTGTGGGCTCAGGGGCCGAACCGGCAGGAGCAGAGGCTGGGCTAGTTTTGTT
TAAACCGTTTGCCAGCTGATAGAACACTTGGGCTTCTTGAGATTTTGGGTCCATATGAAG
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AAGACACTTCTTGTCGGATTTGAGAACCTGTTTTAAGCCTGAGCAACAGTCCGGC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4D201JQ 637 0 0
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TCACGAAACAGTAACTGCATAAAATCAATGGCACCGACTCACTGCAACCGCACAAATTCA
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AACAACTTCAAGCCTTAGCCACCGTTTCCGAAAGCTATGAGCGTGGTTCTTGCTTGGCAA
AGAGGTCGTCCGGCCACTGTTGTTACCATCGGATCCTGCGGTTGGAGATATACTTGTGGG
CTCAGGGGCCGAACCGGCAGGAGCAAAGGCTGGGCTAGTTTTGTTTAAACCGTTTGCCAG
CTGATAGAACACTTGGGCTTCTTGAGATTTTGGGTCCATATGAAGCAAAGCAGGGCACTT
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QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4G669TF 763 0 0
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TGTCCTCACCAGCAGCCACCATCGTCGCCATTATTAATGCTATTGCTATCGCCACTAGAC
TAATCCTCCAAAACTCCATTTTTATTGTTCATGCACGATTT
CC

QA 1 761 1 761
DS 

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CTCACGAAACAGTAACTGCATAAAATCAATGGCACCGACTCACTGCAACCGCACAAATTC
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AAGAGGTCGTCCGGCCACTGTTGTTACCATCGGATCCTGCGGTTGGAGATATACTTGTGG
GCTCAGGGGCCGAACCGGCAGGAGCAGAGGCTGGGCTAGTTTTGTTTAAACCGTTTGCCA
GCTGATAGAACACTTGGGCTTCTTGAGATTTTGGGTCCATATGAAGCAAAGCAGGGCACT
TGGTGACGTCAGCAACGGCGTGGCAAACAGTAGGAAGAGCAAGAGCGAGAGAGACGTTGA
TCTGGAGACCCAAGTCAGGATCATTCCTGTCTTGGATGATCACACAAAGACACTTCTTGT
CGGATTTGAGAACCTGTTTTAAGCCTGAGCAACAGTCCGGCGTCGGAGTCTTTGCCTGTC
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CCTTCGCCTTGTCCTCACCAGCAGCCACCATCGTCGCCATTATTAATGCTATTGCTATCG
CCACTGGACTAATCCTCCAAAACTCCATTTTTATTGTTCATGCACGATTTAACCTTTCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 4

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GGAAATCGTATGCTGCGATGGTTCAATCAATGTTGAGGAACGCTGCTCCCTTCCAAGTTA
AAGCAGCCCCCGTTCAGACACCTAAAACCATGGCACCATCCAAAGGGCGTGCAGCTCCAG
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AACCAGGCACTTCGGTATTTGTGTCAAATCTGCCAATGGATGCAAAGGCACCTCAGCTCT
ATGAACTGTTCAAGGCTTTTGGCCCTATCAAAGAAGGTGGAGTTCAAATCAGAAGCTCCA
GGGCTAGTGGAAGATGCTTCGGTTTTGTTTCCTTTGAATCTATTGCATCTGTCCAGAGCA
TGCTTAAGGCTGCCAAGAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTTCGTGTAAAAG
AAAAGCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACAGTCTGGTGGGAGAAGTGGAGGTGGAGGAA
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AGAGCAAGACACCGACTGGTTCTGCAGATGGAAGCAAGTCTGAGAATGGCTCTTCTGCTG
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AAAACAGTGAAGTAGCTCCTAAGGTCAAAGCTTGATATAATCTCCCTCACCTCCTCTGCT
GCAAAAACACCAACAAGTACAAGAAAGAGTGTTAGAGTTTTCAAAGCCTTTTGATAGATA
ATTAAATTGGTTTAAAGAGAGAGATAAGGGAAGAGATTTGCAACTTGAGATAAATTTTTC
AGACATTACAGATTTACATCTCTTTTACTTGTTTAGGTCTTTTTTTTTTCCCTTTCTTAC
TCATGGAACTCATCATAGTTGTTCTGTTGTTTTTTGTTTTCTGTCTTTTCACCAGACAAA
TTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DO87TF U 77
AF RR4BM54TF U 1
AF RR4DO87JQ C 203
AF RR4BM54JQ C 250
BS 1 438 RR4BM54TF
BS 439 439 RR4DO87TF
BS 440 663 RR4BM54TF
BS 664 664 RR4DO87JQ
BS 665 683 RR4BM54TF
BS 684 684 RR4DO87JQ
BS 685 699 RR4BM54TF
BS 700 700 RR4DO87JQ
BS 701 726 RR4BM54TF
BS 727 727 RR4DO87JQ
BS 728 730 RR4BM54TF
BS 731 731 RR4DO87JQ
BS 732 735 RR4BM54TF
BS 736 736 RR4DO87JQ
BS 737 760 RR4BM54TF
BS 761 830 RR4DO87JQ
BS 831 964 RR4BM54JQ

RD RR4DO87TF 556 0 0
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ATTTGTGTCAAATCTGCCAATGGATGCAAAGGCACCTCAGCTCTATGAACTGTTCAAGGC
TTTTGGCCCTATCAAAGAAGGTGGAGTTCAAATCAGAAGCTCCAGGGCTAGTGGAAGATG
CTTTGGTTTTGTTTCCTTTGAATCTGTTGCATCTGTCCAGAGCATGCTTAAGGCTGCCAA
GAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTTCGTGTAAAAGAAAAGCAAGTTGAGTA
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CTCTGTAGAGGAGAGCAAGACTCCGACTGGTTCTGTTGTAGATGAGAGCAAGACACCGAC
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TGATGGCTTCTAGACT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4BM54TF 768 0 0
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AAGCAGCCCCCGTTCAGACACCTAAAACCATGGCACCATCCAAAGGGCGTGCAGCTCCAG
CACCTGCTGCTTCTGCTGTTGGTAAACCTGAAAAGAAAAGTGACCAGAGGATCGTCGACG
AACCAGGCACTTCGGTATTTGTGTCAAATCTGCCAATGGATGCAAAGGCACCTCAGCTCT
ATGAACTGTTCAAGGCTTTTGGCCCTATCAAAGAAGGTGGAGTTCAAATCAGAAGCTCCA
GGGCTAGTGGAAGATGCTTCGGTTTTGTTTCCTTTGAATCTATTGCATCTGTCCAGAGCA
TGCTTAAGGCTGCCAAGAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTTCGTGTAAAAG
AAAAGCAAGTTGAGTATGTTGGAAGCAAACAGTCTGGTGGGAGAAGTGGAGGTGGAGGAA
GCAAGGCACAGAATGGCTCTGTAGAGGAGAGCAAGACTCCGACTGGTTCTGTTGTAGATG
AGAGCAAGACACCGACTGGTTCTGCAGATGGAAGCAAGTCTGAGAATGGCTCTTCTGCTG
GTGGTGGGGAAGATGATGATGGCTTCAAGACTATCAGAAACCGTAAGAACAGAAACAAGA
AAA*CAGTGAAGTAGCTCCTAAG*TCAAAGCTTGATATA*TCTCCCTCACCTCCTCTGCT
GCAAAA*CAC*AACA*GTACAAGAAAGAGTGTTAGAGTTT
CAAGCTTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4DO87JQ 628 0 0
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CCCTATCAAAGAAGGTGGAGTTCAAATCAGAAGCTCCAGGGCTAGTGGAAGATGCTTTGG
TTTTGTTTCCTTTGAATCTGTTGCATCTGTCCAGAGCATGCTTAAGGCTGCCAAGAGCAA
TCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTTCGTGTAAAAGAAAAGCAAGTTGAGTATGATGG
AAGCAAACAGTCTGGTGGGAGAAGTGGAGGTGGAGGAAGCAAGGCACAGAATGGCTCTGT
AGAGGAGAGCAAGACTCCGACTGGTTCTGTTGTAGATGAGAGCAAGACACCGACTGGTTC
TGCAGATGGAAGCAAGTCTGAGAATGGCTCTTCTGCTGGTGGTGGGGAAGATGATGATGG
CTTCAAGACTATCAGAAACCGTAAGAACAGAAACAAGAAAAACAGTGAAGTAGCTCCTAA
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GAAAGAGTGTTAGAGTTTTCAAAGCCTTTTGATAGATAATTAAATTGGTTTAAAGAGAGA
GATAAGGGAAGAGATTTGCAACTTGAGA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4BM54JQ 715 0 0
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CTGCCAAGAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTTCGTGTAAAAGAAAAGCAAG
TTGAGTATGTTGGAAGCAAACAGTCTGGTGGGAGAAGTGGAGGTGGAGGAAGCAAGGCAC
AGAATGGCTCTGTAGAGGAGAGCAAGACTCCGACTGGTTCTGTTGTAGATGAGAGCAAGA
CACCGACTGGTTCTGCAGATGGAAGCAAGTCTGAGAATGGCTCTTCTGCTGGTGGTGGGG
AAGATGATGATGGCTTCAAGACTATCAGAAACCGTAAGAACAGAAACAAGAAAAACAGTG
AAGTAGCTCCTAAGGTCAAAGCTTGATATAATCTCCCTCACCTCCTCTGCTGCAAAAACA
CCAACAAGTACAAGAAAGAGTGTTAGAGTTTTCAAAGCCTTTTGATAGATAATTAAATTG
GTTTAAAGAGAGAGATAAGGGAAGAGATTTGCAACTTGAGATAAATTTTTCAGACATTAC
AGATTTACATCTCTTTTACTTGTTTAGGTCTTTTTTTTTTCCCTTTCTTACTCATGGAAC
TCATCATAGTTGTTCTGTTGTTTTTTGTTTTCTGTCTTTTCACCAGACAAATTTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL3502Contig1 568 4 1 U
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AAAAATCCACTCCTGGCCCGATTTACTTGCACCATGTTGAAGATCTCTTGCACGCATTTC
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TTTGCAAGAAATTGCATAGTCTGGGATTTAAACCTCAGACCTGGATGTAGAAGCCTTTAA
ACTTTAACCACTAAGCTACGGTGTTTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4D813JQ C 1
AF RR4DA03JQ C 1
AF RR4D813TF U 1
AF RR4DA03TF U 1
BS 1 568 RR4D813TF

RD RR4D813JQ 568 0 0
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ACTTTAACCACTAAGCTACGGTGTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4DA03JQ 568 0 0
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AAAAATCCACTCCTGGCCCGATTTACTTGCACCATGTTGAAGATCTCTTGCACGCATTTC
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ACTTTAACCACTAAGCTACGGTGTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 

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AAAAATCCACTCCTGGCCCGATTTACTTGCACCATGTTGAAGATCTCTTGCACGCATTTC
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ACTTTAACCACTAAGCTACGGTGTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4DA03TF 568 0 0
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AAAAATCCACTCCTGGCCCGATTTACTTGCACCATGTTGAAGATCTCTTGCACGCATTTC
TTCTGTTGTCTACGTTAATAAACCACTCTCTCCGGGATTTGAAACCTTGATTTCTTGAAA
TTTGCAAGAAATTGCATAGTCTGGGATTTAAACCTCAGACCTGGATGTAGAAGCCTTTAA
ACTTTAACCACTAAGCTACGGTGTTTCC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 3

CO CL3503Contig1 1144 3 27 U
GGATCAGAGAGATTGTCAGGACAGGAAAGATAGCACTGAGAAGGGAAAAGATGGGTGCTA
CTGCTCCTTTTTGGCGATTTTCAGCAGCATCCTATCCAGATCTCAAGGAGCAAGCACCTG
TTAATGTTCTTCGAGGTAGCAAAACAGGAGCTATAGTCCCGCCAAGTGAAACAACAGCAG
GGGGAGATGTTTATCCCGTTGAGTCAACTTCTGACCTAAAGGTACATCGTGTTCTTGACG
CTCACTGGGGACTTCTCACGGACGAAGATACGAGTGGACTACGGTCACATACTCTATATT
TGCTTGTAAACGATGTTCCAGGAGTCCTTAATCTTGTTACTGGTGTTTTCGCTCGAAGAG
GATACAACATTCAGAGCTTGGCGGTAGGACATGCTGAAGCACAGGGCATTTCACGCATTA
CAACAGTTGTTCCTGCAACAGATGAATCAGTCAGCAAATTGGTGCAGCAACTTTATAAAC
TCGTAGATGTGCATGAGGTCCATGATCTTACTCATTTGCCATTTTCTGAAAGAGGACTGA
TGCTGATTAAGATTGCTGTGAACGCTGCTGCAAGAAGAGATGTCCTGGACATTGCTAGTA
TTTTCAGGGCAAAAGCTGTTGACGTATCCGATCATACAATTACTTTGCAGCTTACTGGGG
ATCTTGACAAGATGGTTGCACTGCAGAGGTTGTTGGAGCCTTACGGTATATGCGAGGTTG
CAAGAACAGGGCGTGTTGCATTGGCTCGTGAATCAGGAGTGGACTCTAAGTATCTTCGTG
GATACTCCTTCCCTTTAACAGGTTAATAACCCAATCGCAGAGTAGGATACAAAGCTGTAT
CCATGGAACAGAAAAGAAAAAGACCTTTGGAGAAAAAAAGGGTTTCATTACACACTTATG
AGCCACAACCAAAAGACCGATCCAGAGAGACTAGATATGTTTAGGACTTTGTGTTTGAAG
AGTTTTATGGTAATTGTTGCTAAAGCATTTTACATAAGTTTGGGAATGGTAATCATTAAT
TAATTATTAAAAAAAAATTGTTTCGTGGTTGTTATTGTAATAATGTTATTTTTTATTAGT
AAAATATATGATGTAATGGGGAGCTAATGCTTCATGGTTGTTATTGTAATAATGTTACCT
TTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RR4BJ61TF U 1
AF RR4GB47TF U 164
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GGGGAGATGTTTATCCCGTTGAGTCAACTTCTGACCTAAAGGTACATCGTGTTCTTGACG
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TCGTAGATGTGCATGGGGTTCATGATCTTACTCATTTGCCATTTGCTGAAAGAGAACTGA
TGCTGATTAAGATTGCTGTGAACGCTGCTGCAAGAAGAGATGTCCTGGACATTGCTATTA
TTTTCAGGGCAAAAGCTGTTGACGTATCCGATCACACAATTACTTTGCAGCTTACTGGGG
ACCTTGACAAGATGGTTGCACTGCAAAGGTTGTTGGAGCCTTACGGTATATGCGAGGTTG
CAAGA

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G
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CATCGTGTTCTTGACGCTCACTGGGGACTTCTCACGGACGAAGATACGAGTGGACTACGG
TCACATACTCTATATTTGCTTGTAAACGATGTTCCAGGAGTCCTTAATCTTGTTACTGGT
GTTTTCGCTCGAAGAGGATACAACATTCAGAGCTTGGCGGTAGGACATGCTGAAGCACAG
GGCATTTCACGCATTACAACAGTTGTTCCTGCAACAGATGAATCAGTCAGCAAATTGGTG
CAGCAACTTTATAAACTCGTAGATGTGCATGAGGTCCATGATCTTACTCATTTGCCATTT
TCTGAAAGAGGACTGATGCTGATTAAGATTGCTGTGAACGCTGCTGCAAGAAGAGATGTC
CTGGACATTGCTAGTATTTTCAGGGCAAAAGCTGTTGACGTATCCGATCATACAATTACT
TTGCAGCTTACTGGGGATCTTGACAAGATGGTTGCACTGCAGAGGTTGTTGGAGCCTTAC
GGTATATGCGAGGTTGCAAGAACAGGGCGTGTTGCATTGGCTCGTGAATCAGGAGTGGAC
TCTAAGTATCTTCGTGGATACTCCTTCCCTTTA

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR4GB47JQ 785 0 0
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ACAACAGTTGTTCCTGCAACAGATGAATCAGTCAGCAAATTGGTGCAGCAACTTTATAAA
CTCGTAGATGTGCATGAGGTCCATGATCTTACTCATTTGCCATTTTCTGAAAGAGGACTG
ATGCTGATTAAGATTGCTGTGAACGCTGCTGCAAGAAGAGATGTCCTGGACATTGCTAGT
ATTTTCAGGGCAAAAGCTGTTGACGTATCCGATCATACAATTACTTTGCAGCTTACTGGG
GATCTTGACAAGATGGTTGCACTGCAGAGGTTGTTGGAGCCTTACGGTATATGCGAGGTT
GCAAGAACAGGGCGTGTTGCATTGGCTCGTGAATCAGGAGTGGACTCTAAGTATCTTCGT
GGATACTCCTTCCCTTTAACAGGTTAATAACCCAATCGCAGAGTAGGATACAAAGCTGTA
TCCATGGAACAGAAAAGAAAAAGACCTTTGGAGAAAAAAAGGGTTTCATTACACACTTAT
GAGCCACAACCAAAAGACCGATCCAGAGAGACTAGATATGTTTAGGACTTTGTGTTTGAA
GAGTTTTATGGTAATTGTTGCTAAAGCATTTTACATAAGTTTGGGAATGGTAATCATTAA
TTAATTATTAAAAAAAAATTGTTTCGTGGTTGTTATTGTAATAATGTTATTTTTTATTAG
TAAAATATATGATGTAATGGGGAGCTAATGCTTCATGGTTGTTATTGTAATAATGTTACC
TTTAT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 4

CO CL3504Contig1 798 4 3 U
GGACATCCAAATCCAATACCAACAAAAAAGGGTCTGCTCCTTAGTTTCATATACAATCTT
TAGCAATCTTAACAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGAT
CTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGG
GACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTAC
TAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCA
AAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGT
ATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGGC
CCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAA
TCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCTT
TAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTTTGGTTACGGTGTTTTT
CCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACCTGTATGCTTACGTATGCATG
CATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGGTTGTAACTTC
TTGTCCAGGTCTTCTTTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTAACGAATGAAAATAAA
ATAGTTTCCCTTTTATGT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4ER23TF U 1
AF RR4ER23JQ C 46
AF RR4BD03JQ C 110
AF RR4BD03TF U 110
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BS 795 798 RR4ER23JQ

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TAGCAATCTTAACAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGAT
CTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGG
GACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTAC
TAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCA
AAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGT
ATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGGC
CCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAA
TCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCTT
TAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTTTGGTTACG
TGTTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4ER23JQ 753 0 0
TTCATATACAATCTTTAGCAATCTTAACAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACAT
GGCCTTCTCACTGATCTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATT
TGGTGGGCTTCCTGGGACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAA
TGGCAGCGTCTCTACTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCT
TCAGTGTGCTGGGCAAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTT
TCCTTCCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAG
GGTCATTGTCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCT
CACGGCACCGGTAAATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATT
CGTCAATGGCCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTTT
GGTTACGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACCTGTAT
GCTTACGTATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGCAT
TGTGGTTGTAACTTCTTGTCCAGGTCTTCTTTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTA
ACGAATGAAAATAAAATAGTTTCCCTTTTATGT

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DS 

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G
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GGCTTCCTGGGACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCA
GCGTCTCTACTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGT
GTGCTGGGCAAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTT
CCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCA
TTGTCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGG
CACCGGTAAATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCA
ATGGCCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTTTGGTTA
CGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACCTGTATGCTTA
CGTATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGG
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TGAAAATAAAATAGTTTCCCTTTT

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4BD03TF 685 0 0
G
TCTCACTGATCTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTG
GGCTTCCTGGGACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCA
GCGTCTCTACTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGT
GTGCTGGGCAAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTT
CCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCA
TTGTCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGG
CACCGGTAAATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCA
ATGGCCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTTTGGTTA
CGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACCTGTATGCTTA
CGTATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGG
TTGTAACTTCTTGTCCAGGTCTTCTTTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTAACGAA
TGAAAATAAAATAGTTTCCCTTTT

QA 2 685 2 685
DS 



AS 1 4

CO CL3505Contig1 1121 4 17 U
GGGTCTCTCTTCTCTCGCCCAACAACACTACCCACACGCCTTTCATCATCCTTTCTCTAC
TCCCTTCTTTTATTTATCTTCTTACCGCCACAGCTCTAGCTTGCTTGCAACAGAGGCTCT
AAAGTTAACCTTAAGGTTTTATTAGGTTTTTTGTTTGTTGGAAAAGAAAGAAACGATGAA
TCAGTGGGCGGTCCAGCCAAACGATCAGATTATTGTTGTTTGCCCAAAACCACGTCGTAT
TGCTATCCGTAACCCTTCCCCTTACCACCATCCCGCTCGTCCTCTCCGTTGTTACTTCAG
CCATCAACAAGTGGAGGTCTGTGAATCCGAGGCAGAGACTGATATCTTAGATATCATACT
CACAAAGGATGGTTATGGTGCGGAACAAGTTCATCACACGAAGATACTAGACTCGCCGTC
CCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCG
TTTCAGAGATGAGCTCTCACTGGTCTCCTCACCGATGCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCA
GTCCTCCTCAGGGAGGAATGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGT
TAGGATAGAAGGGTTCGATTGTCTCGACAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTGCCTT
GGCATGAGAACCCAACCTTAAAAAACACCACCATACTCTGTTGAATTAGCTCAAAAAACC
CATTAGTGTCTCGTGTGTATATATAACGAGTTAAGGGTCTGGAAAATTGAATTCGTTGAA
AATCTTTGAGGGAAGCTGAGAGAGTAAACGAGAGATCGATCCTTTTGGAGTTCTTAAAGA
GTGTAAATTAGGTGCAATTTTCTGGGCTGAGTTTGTAGTAATAATGGTCATTTTGTAAAA
ATAGTATTAAGGCAGAAAAACAGTTGTTGAGGAGAGAATAAAAAGATTATTAGGTTTTTG
GAGAAATATTAATATTAGGTTATTGTGTAAATAGAGAGATGGAGACAGAAAAGAAGTCTT
CTTTTGTTTTTCTTTTGGTTGAGTTTGTTTAGGAAGAATATGAGAAAAAAAAAAATTTGT
ACAAAAGGAAAGAAATTCAAATGATACTGTATTTTACTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FZ13TF U 1
AF RR4FN93TF U 7
AF RR4FN93JQ C 324
AF RR4FZ13JQ C 344
BS 1 90 RR4FZ13TF
BS 91 91 RR4FN93TF
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BS 539 684 RR4FN93TF
BS 685 697 RR4FN93JQ
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BS 699 729 RR4FN93JQ
BS 730 730 RR4FZ13JQ
BS 731 832 RR4FN93JQ
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BS 1073 1075 RR4FZ13JQ
BS 1076 1121 RR4FN93JQ

RD RR4FZ13TF 538 0 0
GGGTCTCTCTTCTCTCGCCCAACAACACTACCCACACGCCTTTCATCATCCTTTCTCTAC
TCCCTTCTTTTATTTATCTTCTTACCGCCATAGCTCTAGCTTGCTTGCAACAGAGGCTCT
AAAGTTAACCTTAAGGTTTTATTAGGTTTTTTGTTTGTTGGAAAAGAAAGAAACGATGAA
TCAGTGGGCGGTCCAGCCAAACGATCAGATTATTGTTGTTTGCCCAAAACCACGTCGTAT
TGCTATCCGTAACCCTTCCCCTTACCAGCATCCCGCTCGTCCTCTCCGTTGTTACTTCAG
CCATCAACAAGTGGAGGTCTGTGAATCCGAGGCAGAGACTGATATCTTAGATATCATACT
CACAAAGGATGGTTATGGTGCGGAACAAGTTCATCACACGAAGATACTAGACTCGCCGTC
CCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCG
TTTCAGAGATGAGCTCTCACTGGTCTCCTCACCGATGCCGACTCCGCTGGGCCAACCT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4FN93TF 678 0 0
GG
CTTCTCTCGCCTAACAACACTACCTACACGCCTTTCATCATCCTTTCTCTACTCCCTTCT
TTTATTTATCTTCTTACCGCCACAGCTCTAGCTTGCTTGCAACAGAGGCTCTAAAGTTAA
CCTTAAGGTTTTATTAGGTTTTTTGTTTGTTGGAAAAGAAAGAAACGATGAATCAGTGGG
CGGTCCAGCCAAACGATCAGATTGTTGTTGTTTGCCCAAAACCACGTCGTATTGCTATCC
GTAACCCTTCCCTTTACCACCATCCCGCTCGTTCTCTCCGTTGTTACTTCAGCCATCAAC
AAGTGGAGGTCTGTGAATCCGAGGCAGAGACTGATATCTTAGATATCATACTCACAAAGG
ATGGTTATGGTGCGGAACAAGTTCATCACACGAAGATACTAGACTCGCCGTCCCCGTTTT
TATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCGTTTCAGAG
ATGAGCTCTCACTGGTCTCCTCACCGATGCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCAGTCCTCCT
CAGGGAGGAATGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTAGGATAG
AAGGGTTCGATTGTCTCGACAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTGCCTTGGCATGAG
AACCCAACCTTAAAAA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR4FN93JQ 798 0 0
AATCCGAGGCAGAGACTGATATCTTAGATATCATACTCACAAAGGATGGTTATGGTGCGG
AACAAGTTCATCACACGAAGATACTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGC
CGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCGTTTCAGAGATGAGCTCTCACTGG
TCTCCTCACCGATGCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCAGTCCTCCTCAGGGAGGAATGGAG
GATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTAGGATAGAAGGGTTCGATTGTC
TCGACAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTGCCTTGGCATGAGAACCCAACCTTAAAA
AACACCACCATACTTTGTTGAATTAGCTCAAAAAACCCATTAGTGTTTCGTGTGTATATA
TAACGAGTTAAGGGTCTGGAAAATTGAATTCGTTGAAAATCTTTGAGGGAAGCTGAGAGA
GTAAACGAGAGATCGATCCTTTTGGAGTTTTTAAAGAGTGTAAATTAGGTGCAATTTTTT
GGGCTGAGTTTGTAGTAATAATGGTCATTTTGTAAAAATAGTATTAAGGCAGAAAAACAG
TTGTTGAGGAGAGAATAAAAAGATTATTAGGTTTTTGGAGAAATATTAATATTAGGTTAT
TGTGTAAATAGAGAGATGGAGACAGAAAAGAAGTCTTCTTTTGTTTTTCTTTTGGTTGAG
TTTGTTTAGGAAGAATATGAGAAAAAAAA***TTTGTACAAAAGGAAAGAAATTCAAATG
ATACTGTATTTTACTTTG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4FZ13JQ 778 0 0
ATCTTAGATATCATACTCACAAAGGATGGTTATGGTGCGGAACAAGTTCATCACACGAAG
ATACTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCT
TTAACACAGGATGCTCGTTTCAGAGATGAGCTCTCACTGGTCTCCTCACCGATGCCGACT
CCGCTGGGCCAACCTCAGTCCTCCTCAGGGAGGAATGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTT
GGCAACAGCCCAGCGGTTAGGATAGAAGGGTTCGATTGTCTCGACAGGGACAGTAGAAAC
TGCAGCATCCCTGCCTTGGCATGAGAACCCAACCTTAAAAAACACCACCATACTCTGTTG
AATTAGCTCAAAAA*CCCATTAGTGTCTCGTGTGTATATATAACGAGTTAAGGGTCTGGA
AAATTGAATTCGTTGAAAATCTTTGAGGGAAGCTGAGAGAGTAAACGAGATATCGATCCT
TTTGGAGTTCTTAAAGAGTGTAAATTAGGTGCAATTTTCTGGGCTGAGTTTGTAGTAATA
ATGGTCATTTTGTAAAAATAGTATTAAGGCAGAAAAACAGTTGTTGAGTAGAGAATAAAA
AGATTATTAGGTTTTTGGAGAAATATTAATATTAGGTTATTGTGTAAATAGAGAGATGGA
GACAGAAAAGAAGTCTTCTTTTGTTTTTCTTTTGGTTGAGTTTGTTTAGGAAGAATATGA
GAAAAAAAAAAATTTGTACAAAAGGAAAGAAATTCAAATGATACTGTATTTTACTTTG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

CO CL3506Contig1 1381 4 10 U
GGAATTTCGTGTTACCTGATCGTGGGTTCCCCTGCAGGAAAAATCCGATCTTTCTTTCTG
GGTTTCTCCAATTAGCGATTTATCTGATCATGGCGGTCGTTGAGAAAGTCGGAGGAGCTG
ATACAGAGGTTGGTGCTGCGATCTCCCCATCGCCGCCATCTTCCGTCACTAGTCAAGGAT
CAGGAGATCAGGGTGAAAATGGTGAGATCAGATCCGATGGTGGAGAGAGCTTCAAGCGTG
AGATGAGAGAGCTGAATGAGCTTTTAACTAAGCTCAACCCCATGGCTAAAGAGTTTGTTC
CTCCCTCCCTCACTAAGCAAGGAGCTAACGGTGGTTTCTCCACCGTCGCTGATTCTTTCC
CCGTCAACGAAGACGGCGGTTTTCGACGGAAGAAGCCGTTCGGAGGACCACAAGGGAAAC
GGAGGATGAATCCTCGGACAAGTATGGCTCAGCGTGAAGACGTCATTCGAAGAGCTGTCT
ATGTGTCTGATATTGACCAACAGGTCACTGAGGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTCATCGGCT
TTGGACAGGTTGTTGACTGTCGCATTTGCGGGGACCCAAACTCAGTACTTAAGTTTGCTT
TCATCGAGTTCACTGATGAAGTGGGTTCAAGAGCTGCGCTGAATCTGTCCGGGACGGTAC
TGGGATTCTATCCTGTGAAGGTTATGCCGTCCAAAACTGCTATTGCACCGGTTAACCCGA
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ACATCGACAAGAAGGTTACTCAAACGGACATTAAACTCTTCTTTGAGGCTGTGTGTGGAG
AGGTGTTACGTCTGAGGCTTTTGCGAGATTATCATCATCCAACTAGAATCGGTTTCGTTG
AGTTTGTCATGGCTGAAAGTGCAATAACGGCTCTCAATTGCAGTGGCGTGCTTCTTGGTT
CTTTACCGATAAGGGTGAGTCCCTCAAAGACACCTGTTCATTCCCGTGCTGTCCCTCGTC
AACAACAGCAACAGCTACAAGTTTATTATACATATATATATATCTCTGCTCTCACCGGCA
TGTAAAGATGTTTGTCTGAAACTCTTAAAGTCTTTTGTTTTCCACTGTGTAATGCTTGGA
AGCTTGATGATGCTTCTGTTGTCTTTTGCTTTGGGATACCTTTGGGTCGTAGGGAGTTTT
AATTTCGATGTGGGTTTTAACTTTTAGAGAAAAGAAGTTACACAGAGCAGAAGAGAGAAA
CACTGAGAGTGAGGTTTGAAGATTGTCTCTGTTTAATGGGAGTTTTTAGTTATTTATACT
GTTGTGTTGGTCATGGACTTATTAGAAACCTGCTTTTGTTCGTAAATGTTCTACATTTTA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4F868TF U 1
AF RR4GG79TF U 698
AF RR4GG79JQ C 698
AF RR4F868JQ C 510
BS 1 648 RR4F868TF
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BS 699 796 RR4GG79TF
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BS 1080 1381 RR4F868JQ

RD RR4F868TF 648 0 0
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GGTTTCTCCAATTAGCGATTTATCTGATCATGGCGGTCGTTGAGAAAGTCGGAGGAGCTG
ATACAGAGGTTGGTGCTGCGATCTCCCCATCGCCGCCATCTTCCGTCACTAGTCAAGGAT
CAGGAGATCAGGGTGAAAATGGTGAGATCAGATCCGATGGTGGAGAGAGCTTCAAGCGTG
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CTCCCTCCCTCACTAAGCAAGGAGCTAACGGTGGTTTCTCCACCGTCGCTGATTCTTTCC
CCGTCAACGAAGACGGCGGTTTTCGACGGAAGAAGCCGTTCGGAGGACCACAAGGGAAAC
GGAGGATGAATCCTCGGACAAGTATGGCTCAGCGTGAAGACGTCATTCGAAGAGCTGTCT
ATGTGTCTGATATTGACCAACAGGTCACTGAGGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTCATCGGCT
TTGGACAGGTTGTTGACTGTCGCATTTGCGGGGACCCAAACTCAGTACTTAAGTTTGCTT
TCATCGAGTTCACTGATGAAGTGGGTTCAAGAGCTGCGCTGAATCTGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4GG79TF 130 0 0
G
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GCGAGAACTATCTATTGCACTAACATCGACAAGAAGGT*ACTCAAACGGACATTAAACTC
TTCTTTGAG

QA 2 130 2 130
DS 

RD RR4GG79JQ 664 0 0
G
GCTATTGCACCGGTTAACCCGACGTTATTGCCTAGGACTGAAGATGAGCGTGAGAAGTGT
GCGAGAACTATCTATTGCACTAACATCGACAAGAAGGTTACTCAAACGGACATTAAACTC
TTCTTTGAGGCTGTGTGTGGAGAGGTGTTACGTCTGAGGCTTTTGCGAGATTATCATCAT
CCAACTAGAATCGGTTTCGTTGAGTTTGTCATGGCTGAAAGTGCAATAACGGCTCTCAAT
TGCAGTGGCGTGCTTCTTGGTTCTTTACCGATAAGGGTGAGTCCCTCAAAGACACCTGTT
CATTCCCGTGCTGTCCCTCGTCAACAACAGTAACAGCTACAAGTTTATTATACATATATA
TATATCTCTGCTCTCACCGGCATGTAAAGATGTTTGTCTGAAACTCTTAAAGTCTTTTGT
TTTCCACTGTGTAATGCTTGGAAGCTTGATGATGCTTCTGTTGTCTTTTGCTTTGGGATA
CCTTTGGGTCGTAGGGAGTTTTAATTTCGATGTGGGTTTTAACTTTTAGAGAAAAGAAGT
TACACAGAGCAGAAGAGAGAAACACTGAGAGTGAGGTTTGAAGATTGTCTCTGTTTAATG
GGAGTTTTTAGTTATTTATACTGTTGTGTTGGTCATGGACTTATTAGAAACCTGCTTTTG
T
CC

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR4F868JQ 872 0 0
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GGG*ACCCAAACTCAGTACTTAAGTTTGCTTTCATCGAGTTCACTGATGAAGTGGGTTCA
AGAGCTGCGCTGAATCTGTCCGGGACGGTACTGGGATTCTATCCTGTGAAGGTTATGCCG
TCCAAAACTGCTATTGCACCGGTTAACCCGACGTTATTGCCTAGGACTGAAGATGAGCGT
GAGAAGTGTGCGAGAACTATCTATTGCACTAACATCGACAAGAAGGTTACTCAAACGGAC
ATTAAACTCTTCTTTGAGGCTGTGTGTGGAGAGGTGTTACGTCTGAGGCTTTTGGGAGAT
TATCATCATCCAACTAGAATCGGTTTCGTTGAGTTTGTCATGGCTGAAAGTGCAATAACG
GCTCTCAATTGCAGTGGCGTGCTTCTTGGTTCTTTACCGATAAGGGTGAGTCCCTCAAAG
ACACCTGTTCATTCCCGTGCTGTCCCTCGTCAACAACAGCAACAGCTACAAGTTTATTAT
ACATATATATATATCTCTGCTCTCACCGGTATGTAAAGATGTTTGTCTGAAACTCTTAAA
GTCTTTTGTTTTCCACTGTGTAATGCTTGGAAGCTTGATGATGCTTCTGTTGTCTTTTGC
TTTGGGATACCTTTGGGTCGTAGGGAGTTTTAATTTCGATGTGGGTTTTAACTTTTAGAG
AAAAGAAGTTACACAGAGCAGAAGAGAGAAACACTGAGAGTGAGGTTTGAAGATTGTCTC
TGTTTAATGGGAGTTTTTAGTTATTTATACTGTTGTGTTGGTCATGGACTTATTAGAAAC
CTGCTTTTGTTCGTAAATGTTCTACATTTTAT

QA 1 872 1 872
DS 



AS 1 4

CO CL3507Contig1 750 4 14 U
TTTTTTTTGTGATAAAAGCTGTTTTTTGTCTCATTTTACCATTGGAACAATTACATAAAC
AAACACACACAACGATTAAAGTTCCAGCAAAACCAGTACAAGAGCAACTGTCTGTTGAAT
CATTCTTCTTCTTATTACCCAGTGAAAAAGATAAAACAAAAACATGTTATTAACCCTCAC
TGAAACAATTCATTCATTCATCACCATCATCATCATCAAATGCATTTGTGAGAAACTGAG
AAGACGATCACCAAACATCAGGACGGAGTTCCCCAGTCGCCGGTGGCATCCAACGACCAG
AATTATAAACGTTCTCGCCAACTTTCCATCCCGGAACATCCTTCATTACATCTGCCTCGT
AGTCCAGATACTTTTTCCACTCAGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGG
GAAGTATAGCTCTACGAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAAAGCCCTGCGGATCTTGTTAC
CCTGGCCGACCTGGTACATCCCCCAAGCAAATGCACCAGAAACGGCAAGGAAAATAGCCA
TCGCGCTAGGACCCGTATTGGATATCCGGCGAGCATATCGAACCGGCGCGAATCCACCCG
GCGGCGGACCATCTTGAAGCAGAGGCATGTCCTTCACGCTCGCCATCCCTGCCTTCTTCC
TTATCATCGCCTCTGTCATCTTTGCTCGGTCGAATTTGACTCTCTGGTCGATCACTGAGA
TTCCGATTCGCTAACCGATTAGTGTCCTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC26JQ U 11
AF RR4EC26TF C 1
AF RR4G813JQ U 57
AF RR4G813TF C 57
BS 1 10 RR4EC26TF
BS 11 159 RR4EC26JQ
BS 160 160 RR4G813JQ
BS 161 215 RR4EC26JQ
BS 216 218 RR4G813JQ
BS 219 244 RR4EC26JQ
BS 245 245 RR4G813JQ
BS 246 253 RR4EC26JQ
BS 254 254 RR4G813JQ
BS 255 525 RR4EC26JQ
BS 526 526 RR4G813JQ
BS 527 623 RR4EC26JQ
BS 624 730 RR4G813JQ
BS 731 750 RR4EC26TF

RD RR4EC26JQ 613 0 0
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AACGATTAAAGTTCCAGCAAAACCAGTACAAGAGCAACTGTCTGTTGAATCATTCTTCTT
CTTATTACCCAGTGAAAAAGATAAAACAAGAACATGTTATTAACCCTCACTGAAACAATT
CATTCATTCATCACCATCATCATCA***AATGCATTTGTGAGAAACTGAGAAGAGGATCA
CCAGACATCAGGACGGAGTTCCCCAGTCGCCGGTGGCATCCAACGACCAGAATTATAAAC
GTTCTCGCCAACTTTCCATCCCGGAACATCCTTCATTACATCTGCCTCGTAGTCCAGATA
CTTTTTCCACTCAGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGGGAAGTATAGC
TCTACGAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAAAGCCCTGCGGATCTTGTTACCCTGGCCGAC
CTGGTACATCCCCCAAGCAAATGCACCAGAAACGGTAAGGAAAATAGCCATCGCGCTAGG
ACCCGTATTGGATATCCGGCGAGCATATCGAACCGGCGCGAATCCACCCGGCGGCGGACC
ATCTTGAAGCAGA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4EC26TF 750 0 0
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AAACACACACAACGATTAAAGTTCCAGCAAAACCAGTACAAGAGCAACTGTCTGTTGAAT
CATTCTTCTTCTTATTACCCAGTGAAAAAGATAAAACAAGAACATGTTATTAACCCTCAC
TGAAACAATTCATTCATTCATCACCATCATCATCA***AATGCATTTGTGAGAAACTGAG
AAGAGGATCACCAGACATCAGGACGGAGTTCCCCAGTCGCCGGTGGCATCCAACGACCAG
AATTATAAACGTTCTCGCCAACTTTCCATCCCGGAACATCCTTCATTACATCTGCCTCGT
AGTCCAGATACTTTTTCCACTCAGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGAATGG
GAAGTATAGCTCTACGAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAAAGCCCTGCGGATCTTGTTAC
CCTGGCCGACCTGGTACATCCCCCAAGCAAATGCACCAGAAACGGTAAGGAAAATAGCCA
TCGCGCTAGGACCCGTATTGGATATCCGGCGAGCATATCGAACCGGCGCGAATCCACCCG
GCGGCGGACCATCTTGAAGCAGAGGCATGTCCTTCACGCTCGCCATCCCTGCCTTCTTCC
TTATCATCGCCTCCGTCATCTTTGCTCGATCGAATTTGACTCTCTGGTCGATCACTGAGA
TTCCGATTCGCTAACCGATTAGTGTCCTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4G813JQ 685 0 0
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GAATCATTCTTCTTCTTATTACCCAGTGAAAAAGATAAAACAAAAACATGTTATTAACCC
TCACTGAAACAATTCATTCATTCATCACCATCATCATCATCAAATGCATTTGTGAGAAAC
TGAGAAGAC*ATCACCAAACATCAGGACGGAGTTCCCCAGTCGCCGGTGGCATCCAACGA
CCAGAATTATAAACGTTCTCGCCAACTTTCCATCCCGGAACATCCTTCATTACATCTGCC
TCGTAGTCCAGATACTTTTTCCACTCAGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGA
ATGGGAAGTATAGCTCTACGAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAACGCCCTGCGGATCTTG
TTACCCTGGCCGACCTGGTACATCCCCCAAGCAAATGCACCAGAAACGGCAAGGAAAATA
GCCATCGCGCTAGGACCCGTATTGGATATCCGGCGAGCATATCGAACCGGCGCGAATCCA
CCCGGTGGCGGACCATCTTGAAGCAGAGGCATGTCCTTCACGCTCGCCATCCCTGCCTTC
TTCCTTATCATCGCCTCTGTCATCTTTGCTCGGTCGAATTTGACTCTCTGGTCGATCACT
GAGATTCCGATTCG
ATTTTTGCTCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4G813TF 685 0 0
AAACAAGCACACACAACGATTAAATTTCCAGCAAAACCAGTGCAAGAGCAACTGTCTGTT
GAATCATTCTTCTTCTTATTACCCAGTGAAAAAGATAAAACAAAAACATGTTATTAACCC
TCACTGAAACAATTCATTCATTCATCACCATCATCATCATCAAATGCATTTGTGAGAAAC
TGAGAAGAC*ATCACCAAACATCAGGACGGAGTTCCCCAGTCGCCGGTGGCATCCAACGA
CCAGAATTATAAACGTTCTCGCCAACTTTCCATCCCGGAACATCCTTCATTACATCTGCC
TCGTAGTCCAGATACTTTTTCCACTCAGACACAAACCTTTCATCTTCTTCAGCTTGAAGA
ATGGGAAGTATAGCTCTACGAGCAGCATATTTCTCTTCCTTCAACGCCCTGCGGATCTTG
TTACCCTGGCCGACCTGGTACATCCCCCAAGCAAATGCACCAGAAACGGCAAGGAAAATA
GCCATCGCGCTAGGACCCGTATTGGATATCCGGCGAGCATATCGAACCGGCGCGAATCCA
CCCGGTGGCGGACCATCTTGAAGCAGAGGCATGTCCTTCACGCTCGCCATCCCTGCCTTC
TTCCTTATCATCGCCTCTGTCATCTTTGCTCGGTCGAATTTGACTCTCTGGTCGATCACT
GAGATTCCGATTCG
ATTTTTGCTCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

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CGCCACAAGGCGGCTAAACCTCTGCAACGACTTTCTCCCTGTCTGCATCATCCCCGAGAA
ATCCTGACCACCGTTGATTTGTCTACCCGAGCTCCCGCTCTCTCTAGCCACCACAATAGG
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TATCACACTCCTAACCGCTTTCAGATAAGAGTTCATGTCATGGTCCCTCTGTATGGTCCC
GCTCGACCCGTAAGCCGACCTGTCGCCAAGAATGTCGAGAGGATGCGGCGTGTTCAAGAA
AACCGTCTGCGCGGCTCTCAACCTCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCGTATCTTCGAGAAG
ATACAAACCGTTTCCCGGAGGAAGCAGATCGTGTCCGGGAGAGAATGACTCATCAGGCTG
AAGGATCAGAAGCTCTCCCATGGGAGAATACAACATGCTCTGCTTGTTGAGACAAGGATG
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4F880JQ U 1
AF RR4F880TF C 1
AF RR4DN69JQ U 15
AF RR4DN69TF C 15
BS 1 152 RR4F880JQ
BS 153 153 RR4DN69JQ
BS 154 569 RR4F880JQ
BS 570 721 RR4DN69JQ

RD RR4F880JQ 569 0 0
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CGCCACAAGGCGGCTAAACCTCTGCAACGACTTTCTCCCTGTCTGCATCATCCCCGAGAA
ATCCTGACCACCGTTGATTTGTCTACCCGAGCTCCCGCTCTCTCTAGCCACCACAATAGG
CCACCAGAGACTCCGGCGATGCTCCCTCTTAGCTCTCCTTATCTGACTCACTTCTTTTCT
TATCACACTCCTAACCGCTTTCAGATAAGAGTTCATGTCATGGTCCCTCTGTATGGTCCC
GCTCGACCCGTAAGCCGACCTGTCGCCAAGAATGTCGAGAGGATGCGGCGTGTTCAAGAA
AACCGTCTGCGCGGCTCTCAACCTCTCTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4F880TF 569 0 0
AGCAAGAAAAAGCCTTTCCAATGGGGCCCCCCAACAAACAAACAAAATACACATGAATAA
AGAATGATCTAAACCTGGTCATTACCAGAACCCGGTCTAAACCGGTATAAGCCGATAACG
ACTTTAACCCGCCAAAAACAAAACAAAACATTTTCAACGGAAATTAAAGACGTTGAAAGC
TCCAAAGAACATCAACTTAACCGGAAACAACAGAACAACAATCAAAGGCATATGCTGAGA
CGCCACAAGGCGGCTAAACCTCTGCAACGACTTTCTCCCTGTCTGCATCATCCCCGAGAA
ATCCTGACCACCGTTGATTTGTCTACCCGAGCTCCCGCTCTCTCTAGCCACCACAATAGG
CCACCAGAGACTCCGGCGATGCTCCCTCTTAGCTCTCCTTATCTGACTCACTTCTTTTCT
TATCACACTCCTAACCGCTTTCAGATAAGAGTTCATGTCATGGTCCCTCTGTATGGTCCC
GCTCGACCCGTAAGCCGACCTGTCGCCAAGAATGTCGAGAGGATGCGGCGTGTTCAAGAA
AACCGTCTGCGCGGCTCTCAACCTCTCTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4DN69JQ 707 0 0
TTTCCAATGGGGCCCCCCAACAAACAAACAAAATACACATGAATAAAGAATGATCTAAAC
CTGGTCATTACCAGAACCCGGTCTAAACCGGTATAAGCCGATAACGACTTTAACCCGCCA
AAAACAAAACAAAACATTCTCAACGGAAATTAAAGACGTTGAAAGCTCCAAAGAACATCA
ACTTAACCGGAAACAACAGAACAACAATCAAAGGCATATGCTGAGACGCCACAAGGCGGC
TAAACCTCTGCAACGACTTTCTCCCTGTCTGCATCATCCCCGAGAAATCCTGACCACCGT
TGATTTGTCTCCCCGAGCTCCCGCTCTCTCTAGCCACCACAATAGGCCACCAGAGACTCC
GGCGATGCTCCCTCTTAGCTCTCCTTATCTGACTCACTTCTTTTCTTATCACACTCCTAA
CCGCTTTCAGATAAGAGTTCATGTCATGGTCCCTCTGTATGGTCCCGCTCGACCCGTAAG
CCGACCTGTCGCCAAGAATGTCGAGAGGATGCGGCGTGTTCAAGAAAACCGTCTGCGCGG
CTCTCAACCTCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCGTATCTTCGAGAAGATACAAACCGTTTC
CCGGAGGAAGCAGATCGTGTCCGGGAGAGAATGACTCATCAGGCTGAAGGATCAGAAGCT
CTCCCATGGGAGAATACAACATGCTCTGCTTGTTGAGACAAGGATGC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DN69TF 707 0 0
TTTCCAATGGGGCCCCCCAACAAACAAACAAAATACACATGAATAAAGAATGATCTAAAC
CTGGTCATTACCAGAACCCGGTCTAAACCGGTATAAGCCGATAACGACTTTAACCCGCCA
AAAACAAAACAAAACATTCTCAACGGAAATTAAAGACGTTGAAAGCTCCAAAGAACATCA
ACTTAACCGGAAACAACAGAACAACAATCAAAGGCATATGCTGAGACGCCACAAGGCGGC
TAAACCTCTGCAACGACTTTCTCCCTGTCTGCATCATCCCCGAGAAATCCTGACCACCGT
TGATTTGTCTCCCCGAGCTCCCGCTCTCTCTAGCCACCACAATAGGCCACCAGAGACTCC
GGCGATGCTCCCTCTTAGCTCTCCTTATCTGACTCACTTCTTTTCTTATCACACTCCTAA
CCGCTTTCAGATAAGAGTTCATGTCATGGTCCCTCTGTATGGTCCCGCTCGACCCGTAAG
CCGACCTGTCGCCAAGAATGTCGAGAGGATGCGGCGTGTTCAAGAAAACCGTCTGCGCGG
CTCTCAACCTCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCGTATCTTCGAGAAGATACAAACCGTTTC
CCGGAGGAAGCAGATCGTGTCCGGGAGAGAATGACTCATCAGGCTGAAGGATCAGAAGCT
CTCCCATGGGAGAATACAACATGCTCTGCTTGTTGAGACAAGGATGC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL3509Contig1 1049 4 9 U
GGAGGATCAAGAGAATCTTGGCCTTCTGCGATCGAAGCATGGTAGGAGGAAGAGTGATGG
CGACGGCAGCTAAGGTAGCTGGAATCGGAGTCGCCAAAGGTGGATTCAAAGGAGTACTCG
GTATCCCCGCGGCTGCGAATGGTCAGTTTAACGTTAGAAACACCGCCGTTTCCGCTTCGT
TGTCATCGGCGATTCATCCTTCTGTTGAAGCAGACGCGATGGTTATGCAAAGTGCGAGCT
GGGAAGAAGACTGGGAGTTCGCGGAAGTGGAGACCACGACGACGATTCCTAGGGTTGTTT
TCAGCAAACCTCCGTCTCTTCAAGAGGCTAAAGAAGCCACCGATGATCTCAAAGATGCTA
TCAATATGGTGTGTATGGAAGGTTCAAGTGAAGCTGGTTCTGTTTCCACAATGTTGTCAA
GTTTTCAACTTTCTGACAAGAGAGCTGTTGAATCAGCTGTTCCACAAGTTGCCCTTACGG
CATTTAGTTTTCTCAGTGAAAGCTCTGCCGCGCAGTCTGTTGTTGCTTCCATTGCGTCTG
ACCCAAAAGTGTGGGATGCTGTTATGGAAAACAAGGATCTCATGAAACTTCTCGACACCA
ACAGTACCGCTGCTTCAACTCCGGTTGAAGGTGACAATGACGACAAATCTGAAGATTCTA
GCGAGACTAAAAGCGAGGAAGACGGTGAAGCAAAGCGAATCCAACTCTTGGAGATTCTGC
AGGACATAAAGCTAAAAGCTGTTCAGTTGATGGAAAATGTCTCTTCCTACTTTGGGGGTT
TGTTCCGGTTAGAATATTTCACAGAAAATGGAGAAGAGAGGGAGCGGACGTTGCTCAACG
ACCCTACTTCTCTGTTTGGACTAGCTGTTTGCGTTATCTTTATGGTAGTTATGAAACGTG
CTTAAGCTCCAGGTTTTTTATAACTTGCCGACATAGCAAAACAAAAAAACTACTGTTATC
TCTTTCTGCAACTACGTTACCGTTTAGACTTTTAACTTCTTTTGTTTCGGAAATTTTTCA
TATATTGAAGGAACCTTTGGTTGTTTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E289TF U 1
AF RR4E947TF U 1
AF RR4E289JQ C 230
AF RR4E947JQ C 352
BS 1 569 RR4E289TF
BS 570 684 RR4E947TF
BS 685 685 RR4E289JQ
BS 686 722 RR4E947TF
BS 723 723 RR4E289JQ
BS 724 736 RR4E947TF
BS 737 737 RR4E289JQ
BS 738 754 RR4E947TF
BS 755 1049 RR4E289JQ

RD RR4E289TF 569 0 0
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ACCCAAAAGTGTGGGATGCTGTTATGGAA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4E947TF 754 0 0
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CGACGGCAGCTAAGGTAGCTGGAATCGGAGTCGCCAAAGGTGGATTCAAAGGAGTACTCG
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TGTCATCGGCGATTCATCCTTCTGTTGAAGCAGACGCGATGGTTATGCAAAGTGCGAGCT
GGGAAGAAGACTGGGAGTTCGCGGAAGTGGAGACCACGACGACGATTCCTAGGGTTGTTT
TCAGCAAACCTCCGTCTCTTCAAGAGGCTAAAGAAGCCACCGATGATCTCAAAGATGCTA
TCAATATGGTGTGTATGGAAGGTTCAAGTGAAGCTGGTTCTGTTTCCACAATGTTGTCAA
GTTTTCAACTTTCTGACAAGAGAGCTGTTGAATCAGCTGTTCCACAAGTTGCCCTTACGG
CATTTAGTTTTCTCAGTGAAAGCTCTGCCGCGCAGTCTGTTGTTGCTTCCATTGCGTCTG
ACCCAAAAGTGTGGGATGCTGTTATGGAAAACAAGGATCTCATGAAACTTCTCGACACCA
ACAGTACCGCTGCTTCAACTCCGGTTGAAGGTGACAATGACGACAAATCTGAAGATTCTA
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DS 

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AATGTTGTCAAGTTTTCAACTTTCTGACAAGAGAGCTGTTGAATCAGCTGTTCCACAAGT
TGCCCTTACGGCATTTAGTTTTCTCAGTGAAAGCTCTGCCGCGCAGTCTGTTGTTGCTTC
CATTGCGTCTGACCCAAAAGTGTGGGATGCTGTTATGGAAAACAAGGATCTCATGAAACT
TCTCGACACCAACAGTACCGCTGCTTCAACTCCGGTTGAAGGTGACAATGACGACAAATC
TGAAGATTCTAGCGAGACTAAAAGCGAGGAAGACGGTGAAGCAAAGCGAATCCAACTCTT
GGAGATTCTGCAGGACATAAAGCTAAAAGCTGTTCAGTTGATGGAAAATGTCTCTTCCTA
CTTTGGGGGTTTGTTCCGGTTAGAATATTTCACAGAAAATGGAGAAGAGAGGGAGCGGAC
GTTGCTCAACGACCCTACTTCTCTGTTTGGACTAGCTGTTTGCGTTATCTTTATGGTAGT
TATGAAACGTGCTTAAGCTCCAGGTTTTTTATAACTTGCCGACATAGCAAAACAAAAAAA
CTACTGTTATCTCTTTCTGCAACTACGTTACCGTTTAGACTTTTAACTTCTTTTGTTTCG
GAAATTTTTCATATATTGAAGGAACCTTTGGTTGTTTTTC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4E947JQ 698 0 0
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TTGCGTCTGACCCAAAAGTGTGGGATGCTGTTATGGAAAACAAGGATCTCATGAAACTTC
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AAGATTCTAGCGAGACTAAAAGCGAGGAAGACGGTGAAGCAAAGCGAATCCAACTCTTGG
AGATTCTGCAGGACATAAAGCTAAAAGCTGTTCAGTTGATGGAAAATGTCTCTTCCTACT
TTGGGGGTTTGTTCCGGTTAGAATATTTCACAGAAAATGGAGAAGAGAGGGAGCGGACGT
TGCTCAACGACCCTACTTCTCTGTTTGGACTAGCTGTTTGCGTTATCTTTATGGTAGTTA
TGAAACGTGCTTAAGCTCCAGGTTTTTTATAACTTGCCGACATAGCAAAACAAAAAAACT
ACTGTTATCTCTTTCTGCAACTACGTTACCGTTTAGACTTTTAACTTCTTTTGTTTCGGA
AATTTTTCATATATTGAAGGAACCTTTGGTTGTTTTTC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

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GTGTCGGAATTGCAGATCGGGGTTAAGTTTAAGCCAACAACGTGTGAAGTGAAGGCTCAC
AAAGGTGATATGATCAAGGTCCACTACAGGGGGAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGAT
TCGAGCTTTGAAAGGGATGAACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAA
GGTTGGGATCAAGGTTTGCTAGGTGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCT
GCAAAACTTGGATATGGTGAACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCC*GGTGGGGCAACACT
GATATTT*GACACAGAGCTTATT*GCGGTAAATGAAAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAA
GGCGGAGAAGAAGACGACGGAGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGA
TTCGATTTCCATTTTCCAACCGTTTAGCTTCAGAGTTTTCTACTAATAAGCAGCAGTCTA
TGGCCATTTGTGTCTTTTAATTTTGGATGCTTTAGTTTTTCTTCTACTATTATGAACGCC
AACTTTATTCTGGGTTAGCCTTTTTTTTCAAAAAAGAAAACTATATTTTGGTTTGGC


BQ
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AF RR4H904TF U 345
AF RR4GK09JQ C 1
AF RR4GK09TF U 1
BS 1 344 RR4GK09TF
BS 345 405 RR4H904TF
BS 406 406 RR4GK09TF
BS 407 427 RR4H904TF
BS 428 428 RR4GK09TF
BS 429 443 RR4H904TF
BS 444 444 RR4GK09TF
BS 445 482 RR4H904TF
BS 483 483 RR4GK09TF
BS 484 487 RR4H904TF
BS 488 488 RR4GK09TF
BS 489 492 RR4H904TF
BS 493 687 RR4GK09TF
BS 688 717 RR4GK09JQ

RD RR4H904TF 148 0 0
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CCGGTGGGGCAACACTGATATTTTGACACAGAGCTTATTTGCGGTAAATGAAAAACGAGG
TGGTGGTGCAGCAGAAGGAGGAGGAGAA

QA 1 148 1 148
DS 

RD RR4GK09JQ 717 0 0
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CTTTGCTTGATCTTCTTCTCTCTCAGCTTACTCCAAGGTTTCGCGAAGAAGACAGGAGAT
GTGTCGGAATTGCAGATCGGGGTTAAGTTTAAGCCAACAACGTGTGAAGTGAAGGCTCAC
AAAGGTGATATGATCAAGGTCCACTACAGGGGGAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGAT
TCGAGCTTTGAAAGGGATGAACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAA
GGTTGGGATCAAGGTTTGCTAGGTGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCT
GCAAAACTTGGATATGGTGAACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCC*GGTGGGGCAACACT
GATATTT*GACACAGAGCTTATT*GCGGTAAATGAAAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAA
GGCGGAGAAGAAGACGACGGAGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGA
TTCGATTTCCATTTTCCAACCGTTTAGCTTCAGAGTTTTCTACTAATAAGCAGCAGTCTA
TGGCCATTTGTGTCTTTTAATTTTGGATGCTTTAGTTTTTCTTCTACTATTATGAACGCC
AACTTTATTCTGGGTTAGCCTTTTTTTTCAAAAAAGAAAACTATATTTTGGTTTGGC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4GK09TF 690 0 0
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CTTTGCTTGATCTTCTTCTCTCTCAGCTTACTCCAAGGTTTCGCGAAGAAGACAGGAGAT
GTGTCGGAATTGCAGATCGGGGTTAAGTTTAAGCCAACAACGTGTGAAGTGAAGGCTCAC
AAAGGTGATATGATCAAGGTCCACTACAGGGGGAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGAT
TCGAGCTTTGAAAGGGATGAACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAA
GGTTGGGATCAAGGTTTGCTAGGTGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCT
GCAAAACTTGGATATGGTGAACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCC*GGTGGGGCAACACT
GATATTT*GACACAGAGCTTATT*GCGGTAAATGAAAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAA
GGCGGAGAAGAAGACGACGGAGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGA
TTCGATTTCCATTTTCCAACCGTTTAGCTTCAGAGTTTTCTACTAATAAGCAGCAGTCTA
TGGCCATTTGTGTCTTTTAATTTTGGATGCTTTAGTTTTTCTTCTACTATTATGAACGCC
AACTTTATTCTGGGTTAGCCTTTTTTT
CAA

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 4

CO CL3511Contig1 907 4 3 U
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AACTTTAATCCTTCATACAATGTAGGGTAGGATACGGTCTATCTACTTTGATACATAATC
TAAAATGAATTCTTTCGATAATTTAACGCCTAGAAAAGGCAACTAAAATCAGCATCGACA
TGGAGACAACAACCTTGAAACCTGATTTGTCCCAAAAGTTTTGGTTGCTAAAAGGATCAG
CTTCATGCTGCTTTTTCGCAGCCAGTTGCTTCTTGAGTTCTTGTATCGCCACGTCGTTTC
GCTCTCCTATCTTACGAAGTTTTCGAGTTTGGATGCGTGTTTCGCCAAGGCAAAACTCTA
GCTTCAGCACCTTCTTTTTAAGCTCCTGGTTAATCCTCCTTTGATTCTCCACCTGATCTT
CTAACTCCTGTGTCTTAAACCTCCAGTGAGCAGATATAATCTTTAGTTCATCTCTCAGTC
TTGCTATCTCATCATCTTTGACCCTCAAAAGTTTGTCGATTCTTTCAAAATTCTTTGGAG
AATCTTCATCTAGCTCCGAATTCTCCTTTGTACTGACCTCTGACGCAAGTACAACACGCA
TAACGTCACCTTCAACTTTCGAAACATCATCTCTTAGCTGCTTCTGTGAAGATTCTCTAG
CTTTCAGCTCCTTTTGTAGATTCTCTAGCTGCTCACCGAGTCGAGTTACTTGGTCCTCTT
GCTCTTTCAATGAACCAGTCCTCTCGTGCAAATGTTTGGAGAGCAGCGTGCACTGAGACT
GAGCTGATTCAGCTGACAAAGCACTTGCCTGCAGTTGCCTGTGTGCTGCAAGCTGTGACT
TGATATCACCTAGTTCCTTCACATACTTCTCAGTAGCACATCCGAGGCACGGATCTGCTC
AACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G691TF C 1
AF RR4C257JQ U 28
AF RR4C257TF C 181
AF RR4CX83JQ U 28
BS 1 27 RR4G691TF
BS 28 716 RR4C257JQ
BS 717 907 RR4CX83JQ

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AACTTTAATCCTTCATACAATGTAGGGTAGGATACGGTCTATCTACTTTGATACATAATC
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GCTTCAGCACCTTCTTTTTAAGCTCCTGGTTAATCCTCCTTTGATTCTCCACCTGATCTT
CTAACTCCTGTGTCTTAAACCTCCAGTGAGCAGATATAATCTTTAGTTCATC
C

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GCTTCTTGAGTTCTTGTATCGCCACGTCGTTTCGCTCTCCTATCTTACGAAGTTTTCGAG
TTTGGATGCGTGTTTCGCCAAGGCAAAACTCTAGCTTCAGCACCTTCTTTTTAAGCTCCT
GGTTAATCCTCCTTTGATTCTCCACCTGATCTTCTAACTCCTGTGTCTTAAACCTCCAGT
GAGCAGATATAATCTTTAGTTCATCTCTCAGTCTTGCTATCTCATCATCTTTGACCCTCA
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TTGTACTGACCTCTGACGCAAGTACAACACGCATAACGTCACCTTCAACTTTCGAAACAT
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GCTGCTCACCGAGTCGAGTTACTTGGTCC
C

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DS 

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GCTCTCCTATCTTACGAAGTTTTCGAGTTTGGATGCGTGTTTCGCCAAGGCAAAACTCTA
GCTTCAGCACCTTCTTTTTAAGCTCCTGGTTAATCCTCCTTTGATTCTCCACCTGATCTT
CTAACTCCTGTGTCTTAAACCTCCAGTGAGCAGATATAATCTTTAGTTCATCTCTCAGTC
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TAACGTCACCTTCAACTTTCGAAACATCATCTCTTAGCTGCTTCTGTGAAGATTCTCTAG
CTTTCAGCTCCTTTTGTAGATTCTCTAGCTGCTCACCGAGTCGAGTTACTTGGTCC
C

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DS 

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TAGGATACGGTCTATCTACTTTGATACATAATCTAAAATGAATTCTTTCGATAATTTAAC
GCCTAGAAAAGGCAACTAAAATCAGCATCGACATGGAGACAACAACCTTGAAACCTGATT
TGTCCCAAAAGTTTTGGTTGCTAAAAGGATCAGCTTCATGCTGCTTTTTCGCAGCCAGTT
GCTTCTTGAGTTCTTGTATCGCCACGTCGTTTCGCTCTCCTATCTTACGAAGTTTTCGAG
TTTGGATGCGTGTTTCGCCAAGGCAAAACTCTAGCTTCAGCACCTTCTTTTTAAGCTCCT
GGTTAATCCTCCTTTGATTCTCCACCTGATCTTCTAACTCCTGTGTCTTAAACCTCCAGT
GAGCAGATATAATCTTTAGTTCATCTCTCAGTCTTGCTATCTCATCATCTTTGACCCTCA
AAAGTTTGTCGATTCTTTCAAAATTCTTTGGAGAATCTTCATCTAGCTCCGAATTCTCCT
TTGTACTGACCTCTGACGCAAGTGCAACACGCATAACGTCACCTTCAACTTTCGAAACAT
CATCTCTTAGCTGCTTCTGTGAAGATTCTCTAGCTTTCAGCTCCTTTTGTAGATTCTCTA
GCTGCTCACCGAGTCGAGTTACTTGGTCCTCTTGCTCTTTCAATGAACCAGTCCTCTCGT
GCAAATGTTTGGAGAGCAGCGTGCACTGAGACTGAGCTGATTCAGCTGACAAAGCACTTG
CCTGCAGTTGCCTGTGTGCTGCAAGCTGTGACTTGATATCACCTAGTTCCTTCACATACT
TCTCAGTAGCACATCCGAGGCACGGATCTGCTCAACTTTC

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 2

CO CL3512Contig1 1039 2 4 U
TTACTCGAAGAGCCCCACGGTAACTCTCCCGAGGATTCGAGCTCCTGCTTTGGGCTAAGG
AAGAAGAATAGCACCAAGGAGAAACCGAAGATGACACAGACCAACGCCGGAGCTTCAACG
GAAGCCGCCGCGACGACGGAGCTTCCTCCTCAGCCGCAGAGAAACGAGATGGTGTTGCAC
ACGGGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCACATGTCGAGAGAAGACGAGGAGATGACTCGTTCT
GCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGGAGGATGGAGGTTCGT
GAACGGATCCAGGCTCAGTTGGGTCGGGTCGAGGAAGAAACCCGACGACTCTCCACCCTT
CGCGAGGAGCTTGAGTCTATGCCAGATCCTATGAGGAAGGAAGTGTCTGTGGTTCGTAAG
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AGGGAATACAAAGAAGCGCTTGATACATTCAACGAGAAGAACAGAGAGAAAGTGCAGCTG
ATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGAGAAAGCGAGAAGTTGAGGATGAAGAAGTTGGAG
GAGCTGAGCAAGAGCATTGAAGAAACCGTGTGAATGTGGTTCAATGATACTAATTGGGTT
TAGGATCGGCTTGGTTCTTTGTGTGGTGTACCTAGCTTTTACATTTTTTCTCTTCATTTT
GTAACATGTGTGGTTGTGGGTGATTTTTATTTTGTTAGTTTATGGGAAGAGATCATGAGA
CACGAACCGGAAGCGTCGGGAAGGGAACCGGTGATTTACATTGTGAGCTGGAATGATCAT
TTTTTCGTCCTACTTGTTGACCACGATGCTTACTACATCATAGACACGCTTGGGGAGAGG
CTTTACGAAGGGTGTAACCAAGCTTATGTCTTGAAGTTTGACAAAGAAGCAGAGATCCAG
AGATTGAAACCAGAGAGTAAGGAGCAAGGAAACCAGAAAGCAAGTGGTAAGAATAAGTCA
GAGCAAGCCGAGAGATCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB03TF U 1
AF RR4FB03JQ C 258
BS 1 643 RR4FB03TF
BS 644 644 RR4FB03JQ
BS 645 659 RR4FB03TF
BS 660 1039 RR4FB03JQ

RD RR4FB03TF 659 0 0
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GCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGGAGGATGGAGGTTCGT
GAACGGATCCAGGCTCAGTTGGGTCGGGTCGAGGAAGAAACCCGACGACTCTCCACCCTT
CGCGAGGAGCTTGAGTCTATGCCAGATCCTATGAGGAAGGAAGTGTCTGTGGTTCGTAAG
AAGATTGATGGTGTTAACAAAGAACTCAAACCTTTAGGTTCCACTGTTCAAAAGAAGGAA
AGGGAATACAAAGAAGCGCTTGATACATTCAACGAGAAGAACAGAGAGAAAGTGCAGCTG
ATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGAGAAAGCGAGAAGTTGAGGATGAAGAAGTTGGAG
GAGCTGAGCAAGAGCATTGAAGAAACCGTGTGAATGTGGTTCA*TGATACTAATTGGGT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4FB03JQ 782 0 0
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GTTGGGTCGGGTCGAGGAAGAAACCCGACGACTCTCCACCCTTCGCGAGGAGCTTGAGTC
TATGCCAGATCCTATGAGGAAGGAAGTGTCTGTGGTTCGTAAGAAGATTGATGGTGTTAA
CAAAGAACTCAAACCTTTAGGTTCCACTGTTCAAAAGAAGGAAAGGGAATACAAAGAAGC
GCTTGATACATTCAACGAGAAGAACAGAGAGAAAGTGCAGCTGATCACCAAACTCATGGA
GTTGGTAGGAGAAAGCGAGAAGTTGAGGATGAAGAAGTTGGAGGAGCTGAGCAAGAGCAT
TGAAGAAACCGTGTGAATGTGGTTCAATGATACTAATTGGGTTTAGGATCGGCTTGGTTC
TTTGTGTGGTGTACCTAGCTTTTACATTTTTTCTCTTCATTTTGTAACATGTGTGGTTGT
GGGTGATTTTTATTTTGTTAGTTTATGGGAAGAGATCATGAGACACGAACCGGAAGCGTC
GGGAAGGGAACCGGTGATTTACATTGTGAGCTGGAATGATCATTTTTTCGTCCTACTTGT
TGACCACGATGCTTACTACATCATAGACACGCTTGGGGAGAGGCTTTACGAAGGGTGTAA
CCAAGCTTATGTCTTGAAGTTTGACAAAGAAGCAGAGATCCAGAGATTGAAACCAGAGAG
TAAGGAGCAAGGAAACCAGAAAGCAAGTGGTAAGAATAAGTCAGAGCAAGCCGAGAGATC
AG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL3513Contig1 1012 4 8 U
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ATATTTGATTAAAAAAACCATCCAGAATGAAGTAATGTTATTAAAACCAAAACCAAACAC
AAAAAGCTGCAAAGATAAACTCCTAATACATACACAAATGTGTATGAAAATGTATAGAAG
AGGAGATCCAAACATCAAGAATTTGAAACTCAGGCCGTCCCAGGAATTTCAATCTCCGGC
TTCGTTTTACTCTCATCCTTCGGAGTAGCGTTGCGGTACATGAAGTAAACAATTAGCTGA
GATGCACACAAGGTCGTTCCAAGACCATTGCTTATGAGAACGTAGAGATCGAGTTTGTAG
ATCAAAGAGTAGGCAGTCCAAATCCCAGCGTTAACGAAACTAACGAAAGATAACAGAAAG
GGCATGTACTCTACACTCCTTGTCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTGAAGGAGCCCCA
TACATAGCAATGTTGAAGATATCGCAGATGACACCAACGAAGGTCTGTTTGGCAAAGGCA
TTTTGAATAGCGAAAAGGGTAATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAACCTCAGCCACA
AGGTACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGATTAAGAAGATG
GTAATGTAGATGGCTTCGAAACCCATGCCGACCGCATTAATGGTGGTGACAAGTAGACTA
TCCTTGTGAACGACAGGGAGTCCGTAGAAAACCCAAAGCATACAGTTCATCATGGTTGCC
ACGTAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCCTCCAAAAAGTT
GGAGCTGGCGAGAAGAATAGACCGAAAGAGATTACGTTCCCGATAACTCCGACGATGAAG
CGGACTTGTTTAGCGTCAACCATCGTGCAAATCGAAACGAGAGAGAGAGCGAGTTTGGTG
AAGAAGAAGTGTAGAAGGAAACCTAATCGAGAGGGTGTAATGTATAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO45JQ U 52
AF RR4DG55JQ U 1
AF RR4AO45TF C 262
AF RR4DG55TF C 294
BS 1 729 RR4DG55JQ
BS 730 731 RR4AO45JQ
BS 732 787 RR4DG55JQ
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BS 789 836 RR4DG55JQ
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BS 838 853 RR4DG55JQ
BS 854 1012 RR4AO45TF

RD RR4AO45JQ 781 0 0
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AGTAGACTATCCTTGTGAACGACAGGGAGTCCGTAGAAAACCCAAAGCATACAGTTCATC
ATGGTTGCCACGTAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCCTC
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4DG55JQ 863 0 0
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AGGTACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGATTAAGAAGATG
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TCCTTGTGA**GACAGGGAGTCCGTAGAAAACCCAAAGCATACAGTTCATCATGGTTGCC
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GGAGCTGGCGAGA
GATAGACGAA

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR4AO45TF 751 0 0
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AGACCATTGCTTATGAGAACGTAGAGATCGAGTTTGTAGATCAAAGAGTAGGCAGTCCAA
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GTCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTGAAGGAGCCCCATACATAGCAATGTTGAAGATA
TCGCAGATGACACCAACG***GTCTGTTTGGCAAAGGCATTTTGAATAGCGAAAAGGGTA
ATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAACCTCAGCCACAAGGTACAGCCCAATCTTCCTC
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CCCATGCTGACCGCATTAATGGTGGTGACAAGTAGACTATCCTTGTGAACGACAGGGAGT
CCGTAGAAAACCCAAAGCATACAGTTCATCATGGTTGCCACGTAAGGCCACGGCTGAAAC
TCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCCTCCAAAAAGTTGGAGCTGGCGAGAAGAATAGA
CCGAAAGAGATTACGTTCCCGATAACTCCGACGATGAAGCGGACTTGTTTAGCGTCAACC
ATCGTGCAAATCGAAACGAGAGAGAGAGCGAGTTTGGTGAAGAAGAAGTGTAGAAGGAAA
CCTAATCGAGAGGGTGTAATGTATAGTTTCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4DG55TF 714 0 0
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CAGAAAGGGCATGTACTCTACACTCCTTGTCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTGAAGG
AGCCCCATACATAGCAATGTTGAAGATATCGCAGATGACACCAACGAAGGTCTGTTTGGC
AAAGGCATTTTGAATAGCGAAAAGGGTAATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAACCTC
AGCCACAAGGTACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGATTAA
GAAGATGGTAATGTAGATGGCTTCGAAACCCATGCCGACCGCATTAATGGTGGTGACAAG
TAGACTATCCTTGTGA**GACAGGGAGTCCGTAGAAAACCCAAAGCATACAGTTCATCAT
GGTTGCCACGTAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCCTCCA
AAAAGTTGGAGCTGGCGAGAAGAATAGACCGAAAGAGATTACGTTCCCGATAACTCCGAC
GATGAAGCGGACTTGTTTAGCGTCAACCATCGTGCAAATCGAAACGAGAGAGAGAGCGAG
TTTGGTGAAGAAGAAGTGTAGAAGGAAACCTAATCGAGAGGGTGTAATGTAT
CC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL3514Contig1 1024 3 9 U
GGGCGTCGCGCCTTCTCGTCTTCTACTCAATCTATGTATCAGCATATTCCTCTGCAAATC
CCTTCCTGCCTCCTTTTTCTTTTGTTGGCTTCTCTCCGAGAAAACAGGATTACTGAAACC
ATATGTTTGCTCTAGTTTAATCTTCAATATTCCTTCCCGCTTCTCTATTTTTCCCCTGAT
GGCATTCCTTGTCCGTTCGCCGGAGATACCTAACGTATCGACAAGAATCTTCTCCGGTTC
GAGTTCGAGTGCAAGACATGAGTTTACGAGGAGGAAGGTTACGGTTTCAGCTAGAGACAT
GTCTGGTGTGAAGAATCAGCAGAAATCAAGATTGTACGTGAAGTTCTCAGCTCCGGTGGT
GAAAGAAGACTGCGAGATTAGTACAGAGAACTACTACGTGAACATGGGTCACGCCGTTCG
GTGTCTCAGAGAGGAGCTTCCTTCCTTGTTCTACAAGGAGCCCAACTTTGACATTTACAG
GGGTGATATCGTGTTCAAAGACCCTATGAATACTTTCATGGGAATTGATAATTACAAATC
CGTATTATGGGCGTTACGTTTCCATGGAAGGATATTCTTCAGAGCACTCTGTATCGACAT
CGTTAGTGTTTGGCAACCAACAGACAACACTCTGATGATTCGATGGACTGTTCACGGGAT
TCCTCGTGGTCCTTGGCAGACTCGTGGCCGGTTTGATGGCACTTCAGAGTATAAATTCGA
CAAGAGCGGGAAGATTTATCAACATAAAGTCGATAACATCGCCGTTAACTCGCCTCCAAA
GTTTCGAATGCTTAATGTTCAAGAGCTTGTTGTAGCCATTAGCTACACTTCCACACCAAA
GCCGACATATTTTGTTTACAGAGATTCATCATTATGGTTGCCAGAAACATTTTAGTGTGT
TGTTTATATAAGCTCTTTTGTGTGGTTATAGATAGAGTTCAAGTGCGCTGCGCGGGTGGG
CTAGTTTGGCGTGTGTAATATAGATAAAGAATAATGAAATAAACTAAGCAATGATAGATA
AATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4EE58TF U 1
AF RR4EL77TF U 193
AF RR4EL77JQ C 217
BS 1 482 RR4EE58TF
BS 483 483 RR4EL77TF
BS 484 573 RR4EE58TF
BS 574 574 RR4EL77TF
BS 575 684 RR4EE58TF
BS 685 865 RR4EL77TF
BS 866 866 RR4EL77JQ
BS 867 910 RR4EL77TF
BS 911 1024 RR4EL77JQ

RD RR4EE58TF 684 0 0
GGGCGTCGCGCCTTCTCGTCTTCTACTCAATCTATGTATCAGCATATTCCTCTGCAAATC
CCTTCCTGCCTCCTTTTTCTTTTGTTGGCTTCTCTCCGAGAAAACAGGATTACTGAAACC
ATATGTTTGCTCTAGTTTAATCTTCAATATTCCTTCCCGCTTCTCTATTTTTCCCCTGAT
GGCATTCCTTGTCCGTTCGCCGGAGATACCTAACGTATCGACAAGAATCTTCTCCGGTTC
GAGTTCGAGTGCAAGACATGAGTTTACGAGGAGGAAGGTTACGGTTTCAGCTAGAGACAT
GTCTGGTGTGAAGAATCAGCAGAAATCAAGATTGTACGTGAAGTTCTCAGCTCCGGTGGT
GAAAGAAGACTGCGAGATTAGTACAGAGAACTACTACGTGAACATGGGTCACGCCGTTCG
GTGTCTCAGAGAGGAGCTTCCTTCCTTGTTCTACAAGGAGCCCAACTTTGACATTTACAG
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CGTATTATGGGCGTTACGTTTCCATGGAAGGATCTTCTTCAGAGCACTCTGTATCGACAT
CGTTAGTGTTTGGCAACCAACAGACAACACTCTGATGATTCGATGGACTGTTCACGGGAT
TCCTCGTGGTCCTTGGCAGACTCG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4EL77TF 718 0 0
G
CGTTCGCCGGAGATACCTAACGTATCGACAAGAATCTTCTCCGGTTCGAGTTCGAGTGCA
AGACATGAGTTTACGAGGAGGAAGGTTACGGTTTCAGCTAGAGACATGTCTGGTGTGAAG
AATCAGCAGAAATCAAGATTGTACGTGAAGTTCTCAGCTCCGGTGGTGAAAGAAGACTGC
GAGATTAGTACAGAGAACTACTACGTGAACATGGGTCACGCCGTTCGGTGTCTCAGAGAG
GAGCTTCCTTCCTTGTTCTACAAGGAGCCCAACTTTGACATTTACAGGGGTGATATCGTG
TTCAAAGACCCTATGAATACTTTCATGGGAATTGATAATTACAAATCCGTATTATGGGCG
TTACGTTTCCATGGAAGGATATTCTTCAGAGCACTCTGTATCGACATCGTTAGTGTTTGG
CAACCAACAGACAACACTCTGATGATTCGATGGACTGTTCACGGGATTCCTCGTGGTCCT
TGGCAGACTCGTGGCCGGTTTGATGGCACTTCAGAGTATAAATTCGACAAGAGCGGGAAG
ATTTATCAACATAAAGTCGATAACATCGCCGTTAACTCGCCTCCAAAGTTTCGAATGCTT
AATGTTCAAGAGCTTGTTGTAGCCATTAGCTACACTTCCACACCAAAGCCGACATATTTT
GTTTACAGAGAT*CATCATTATGGTTGCCAGAAACATTTTAGTGTGTTGTTTATATA

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR4EL77JQ 808 0 0
ATCGACAAGAATCTTCTCCGGTTCGAGTTCGAGTGCAAGACATGAGTT*ACGAGGAGGAA
GGTTACGGTTTCAGCTAGAGACATGTCTGGTGTGAAGAATCAGCAGAAATCAAGATTGTA
CGTGAAGTTCTCAGCTCCGGTGGTGAAAGAAGACTGCGAGATTAGTACAGAGAACTACTA
CGTGAACATGGGTCACGCCGTTCGGTGTCTCAGAGAGGAGCTTCCTTCCTTGTTCTACAA
GGAGCCCAACTTTGACATTTACAGGGGTGATATCGTGTTCAAAGACCCTATGAATACTTT
CATGGGAATTGATAATTACAAATCCGTATTATGGGCGTTACGTTTCCATGGAAGGATATT
CTTCAGAGCACTCTGTATCGACATCGTTAGTGTTTGGCAACCAACAGACAACACTCTGAT
GATTCGATGGACTGTTCACGGGATTCCTCGTGGTCCTTGGCAGACTCGTGGCCGGTTTGA
TGGCACTTCAGAGTATAAATTCGACAAGAGCGGGAAGATTTATCAACATAAAGTCGATAA
CATCGCCGTTAACTCGCCTCCAAAGTTTCGAATGCTTAATGTTCAAGAGCTTGTTGTAGC
CATTAGCTACACTTCCACACCAAAGCCGACATATTTTGTTTACAGAGATTCATCATTATG
GTTGCCAGAAACATTTTAGTGTGTTGTTTATATAAGCTCTTTTGTGTGGTTATAGATAGA
GTTCAAGTGCGCTGCGCGGGTGGGCTAGTTTGGCGTGTGTAATATAGATAAAGAATAATG
AAATAAACTAAGCAATGATAGATAAATG

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 4

CO CL3515Contig1 1031 4 2 U
GGATCAAATCCTCAAACGACTCTAAGAACAAAGGGAACTTCTTGAGGCTTAAACACACAA
AACTTAAAATGGCATTCTCCAAGAAACTCGTTTTTGCGATGACTTTTACAGTATTTGTGA
TAGTTAAGCCCTCAGAAGCTGCTCTTGATGCTCATTACTATGACCGATCGTGCCCTGCTG
CCGAGAAAATCATACTTGAAACTGTTAAGAAGGCTATCTTGCATGATCCCAAAGTGCCTG
CTCGTCTACTCAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTCATCAGAGGGTGTGATGCGTCTATTC
TACTAGATTCGACCAAGTCAAACCAAGCTGAGAAGGACGGCCCACCAAACATTTCGGTAC
GATCATTTTACGTGATAGATAATGCCAGGACAAAGCTTGAAGAGGTTTGTCCTCGTACTG
TTTCTTGTGCGGACGTGATCGCCATTGCAGCTAGAGATGTGGTCACCCTGTCCGGTGGTC
CTTACTGGAGCGTACTGAAAGGGCGAAAAGATGGGAGAATGTCACGAGCAACCGAGACGA
TCAATCTCCCAGGACCAACATTCAACGTGTCTCAACTGATCCAAAGCTTTGCAGCAAGAG
GCTTGTCAGTGAAAGACATGGTTACACTCTCCGGCGGCCACACGATAGGATTCTCTCATT
GTTCTTCTTTCGAGGCACGTCTTCATAACTTCAGCAAGTTCCACGATATCGATCCTTCTA
TTAACTTTGCATTTGCGCAAAGTCTGAAAAAGAAATGCCCGAGATCTAACATCCGAGGCA
AGAACGCAGGGACTTTCTTGGACTCTACGACCTCGGTTTTCGATAACGATTACTACAAGC
AGATACTATCAGGAAAAGGTGTGTTTGGATCTGATCAGGCGCTTCTAGGAGACTACCGGA
CTAAGTGGATCGTTGAGACATATGCTCAAGACCAAAAGGCTTTTTTCAGAGAGTTTGCAA
CTTCCATGGTGAAACTTGGGAACTTTGGTGTCAAGGAGACAGGAGAAGTGAGAGCCAACA
CTCGTTTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4C830TF U 133
AF RR4CU24TF U 1
AF RR4C830JQ C 242
AF RR4CU24JQ C 389
BS 1 751 RR4CU24TF
BS 752 1031 RR4C830JQ

RD RR4C830TF 585 0 0
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GAATGTTCTTCCACGACTGCTTCATCAGAGGGTGTGATGCGTCTATTCTACTAGATTCGA
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ACGTGATCGCCATTGCAGCTAGAGATGTGGTCACCCTGTCCGGTGGTCCTTACTGGAGCG
TACTGAAAGGGCGAAAAGATGGGAGAATGTCACGAGCAACCGAGACGATCAATCTCCCAG
GACCAACATTCAACGTGTCTCAACTGATCCAAAGCTTTGCAGCAAGAGGCTTGTCAGTGA
AAGACATGGTTACACTCTCCGGCGGCCACACGATAGA**TCTCTCATTGTTCTTCTTTCG
AGGCACGTCTTCATA*CTTCAGCAAGT*CCACGATATCGATCCTT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4CU24TF 751 0 0
GGATCAAATCCTCAAACGACTCTAAGAACAAAGGGAACTTCTTGAGGCTTAAACACACAA
AACTTAAAATGGCATTCTCCAAGAAACTCGTTTTTGCGATGACTTTTACAGTATTTGTGA
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CCGAGAAAATCATACTTGAAACTGTTAAGAAGGCTATCTTGCATGATCCCAAAGTGCCTG
CTCGTCTACTCAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTCATCAGAGGGTGTGATGCGTCTATTC
TACTAGATTCGACCAAGTCAAACCAAGCTGAGAAGGACGGCCCACCAAACATTTCGGTAC
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TTTCTTGTGCGGACGTGATCGCCATTGCAGCTAGAGATGTGGTCACCCTGTCCGGTGGTC
CTTACTGGAGCGTACTGAAAGGGCGAAAAGATGGGAGAATGTCACGAGCAACCGAGACGA
TCAATCTCCCAGGACCAACATTCAACGTGTCTCAACTGATCCAAAGCTTTGCAGCAAGAG
GCTTGTCAGTGAAAGACATGGTTACACTCTCCGGCGGCCACACGATAGGATTCTCTCATT
GTTCTTCTTTCGAGGCACGTCTTCATAACTTCAGCAAGTTCCACGATATCGATCCTTCTA
TTAACTTTGCATTTGCGCAAAGTCTGAAAAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4C830JQ 790 0 0
TCGTCTACTCAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTCATCAGAGGGTGTGATGCGTCTATTCT
ACTAGATTCGACCAAGTCAAACCAAGCTGAGAAGGACGGCCCACCAAACATTTCGGTACG
ATCATTTTACGTGATAGATAATGCCAGGACAAAGCTTGAAGAGGTTTGTCCTCGTACTGT
TTCTTGTGCGGACGTGATCGCCATTGCAGCTAGAGATGTGGTCACCCTGTCCGGTGGTCC
TTACTGGAGCGTACTGAAAGGGCGAAAAGATGGGAGAATGTCACGAGCAACCGAGACGAT
CAATCTCCCAGGACCAACATTCAACGTGTCTCAACTGATCCAAAGCTTTGCAGCAAGAGG
CTTGTCAGTGAAAGACATGGTTACACTCTCCGGCGGCCCCACGATAGGATTCTCTCATTG
TTCTTCTTTCGAGGCACGTCTTCATAACTTCAGCAAGTTCCACGATATCGATCCTTCTAT
TAACTTTGCATTTGCGCAAAGTCTGAAAAAGAAATGCCCGAGATCTAACATCCGAGGCAA
GAACGCAGGGACTTTCTTGGACTCTACGACCTCGGTTTTCGATAACGATTACTACAAGCA
GATACTATCAGGAAAAGGTGTGTTTGGATCTGATCAGGCGCTTCTAGGAGACTACCGGAC
TAAGTGGATCGTTGAGACATATGCTCAAGACCAAAAGGCTTTTTTCAGAGAGTTTGCAAC
TTCCATGGTGAAACTTGGGAACTTTGGTGTCAAGGAGACAGGAGAAGTGAGAGCCAACAC
TCGTTTCGTC

QA 1 790 1 790
DS 

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AGCTAGAGATGTGGTCACCCTGTCCGGTGGTCCTTACTGGAGCGTACTGAAAGGGCGAAA
AGATGGGAGAATGTCACGAGCAACCGAGACGATCAATCTCCCAGGACCAACATTCAACGT
GTCTCAACTGATCCAAAGCTTTGCAGCAAGAGGCTTGTCAGTGAAAGACATGGTTACACT
CTCCGGCGGCCACACGATAGGATTCTCTCATTGTTCTTCTTTCGAGGCACGTCTTCATAA
CTTCAGCAAGTTCCACGATATCGATCCTTCTATTAACTTTGCATTTGCGCAAAGTCTGAA
AAAGAAATGCCCGAGATCTAACATCCGAGGCAAGAACGCAGGGACTTTCTTGGACTCTAC
GACCTCGGTTTTCGATAACGATTACTACAAGCAGATACTATCAGGAAAAGGTGTGTTTGG
ATCTGATCAGGCGCTTCTAGGAGACTACCGGACTAAGTGGATCGTTGAGACATATGCTCA
AGACCAAAAGGCTTTTTTCAGAGAGTTTGCAACTTCCATGGTGAAACTTGGGAACTTTGG
TGTCAAGGAGACAGGAGAAGTGAGAGCCAACACTCGTTT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 2 4

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CAAAAGTAATACTCCCACAAAGTGAGAAACGAACAGCTAAAGACATGTAGAAGGAGCAAA
AGACAAAGTTGAGGCCACAACATCAAACTCCCACAAATAATTCTGTTGCATTATGTTCCC
AACCACATTAGTAGCCGGCGTTCCCGCCGACACAAACCCTAAACACTTCACTCCATGCGC
AGCATCTACTAGGTAGCTTCTCCGATGCGGCTCAAAACGTGCACCACCGTCGAAATGAAA
CATCAACTGCGGCAGCTTGCTCTCGTTGAACCCTGACGTGACATCAAAACAATACTCTAT
CGGTACTCCTTCTGGTTTAACTCTCTTCAGCCCCACAAGGTAACGCTCAAGCCCCGAAAC
CACCGGCTTGTACGCGGCGTCAGCCAATAACGTTAGGCTGGTTCCAGAGTCCAAGATTGT
CCCACCACCGTTTGTTGCGTCCCATACTTGCGAGGGGATATCAAGCATGTCATCGCCGAG
GGAGATTCCAATGATGTTGATGGCGTAGAAGG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C087JQ U 1
AF RR4BU34JQ U 1
BS 1 572 RR4BU34JQ

RD RR4C087JQ 185 0 0
GG
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AAAGTAATACTCCCACAAAGTGAGAAACGAACAGCTAAAGACATGTAGAAGGAGCAAAAG
ACAAAGTTGAGGCCACAACATCAAACTCCCACAAATAATTCTGTTGCATTATGTTCCCAA
CCA

QA 3 185 3 185
DS 

RD RR4BU34JQ 572 0 0
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CAAAAGTAATACTCCCACAAAGTGAGAAACGAACAGCTAAAGACATGTAGAAGGAGCAAA
AGACAAAGTTGAGGCCACAACATCAAACTCCCACAAATAATTCTGTTGCATTATGTTCCC
AACCACATTAGTAGCCGGCGTTCCCGCCGACACAAACCCTAAACACTTCACTCCATGCGC
AGCATCTACTAGGTAGCTTCTCCGATGCGGCTCAAAACGTGCACCACCGTCGAAATGAAA
CATCAACTGCGGCAGCTTGCTCTCGTTGAACCCTGACGTGACATCAAAACAATACTCTAT
CGGTACTCCTTCTGGTTTAACTCTCTTCAGCCCCACAAGGTAACGCTCAAGCCCCGAAAC
CACCGGCTTGTACGCGGCGTCAGCCAATAACGTTAGGCTGGTTCCAGAGTCCAAGATTGT
CCCACCACCGTTTGTTGCGTCCCATACTTGCGAGGGGATATCAAGCATGTCATCGCCGAG
GGAGATTCCAATGATGTTGATGGCGTAGAAGG

QA 1 572 1 572
DS 



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CACCGGGACACTCTCTTCCCAACATCATCCCACCGCATCGAAGACATTATCAACGAGGAC
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CCATTGAGATCAGGTTCCGACTATGGAGCGGCGCAGTACTTTGCTGATGTCAAGGTTGGA
ACGCCGGCGAAGAGGTTCAGGGTGGTGGTGGATACAGGGAGCGAGCTGACGTGGGTGAAC
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GCAGAAGAGTCTTCGAGCTTCAGACAAGTTGGATGTTTGACTCAGACTTGTAAAGTTGAT
CTCATAAATCTCTTCTCCCTCAGTAATTGCCCTACTCCTTCAACTCCATGCTCCTACGAT
TATAGATACGCGGACGGGTCAGCAGCACAAGGAGTATTCGCAAAGGAAACATTCACAGTT
GATCTCACCAACGGTCGTGTAGCTAGACTCCGTGGCCTCCTCATAGGTTGCAGCAGCTCT
TTCAATGGAGATAGCTTCCAAGGAGCCGATGGAGTTCTTGGTCTAGCCTTGAGTGATTAC
TCCTTCACTTCCAAAGCCACTAACCTTTTCGGTGGTAAATTTTCATACTGCCTCGTTGAC
CATCGCTCCACAAAAACGTCTCCAGCTATCTCATCTTCGGCTCTACCACCAAACCAACCG
CCACACGGACCACCCCTCTTGATCTCAACCTCATTCCTCCCTTCTACGCCATCAACATCA
TTGGAATCTCCCTCGGCGATGACATGCTTGATATCCCCTCGCAAGTATGGGACGCAACAA
ACGGTGGTGGGACAATCTTGGACTCTGGAACCAGCCTAACGTTATTGGCTGACGCCGCGT
ACAAGCCGGTGGTTTCGGGGCTTGAGCGTTACCTTGTGGGGCTGAAGAGAGTTAAACCAG
AAGGAGTACCGATAGAGTATTGTTTTGATGTCACGTCAGGGTTCAACGAGAGCAAGCTGC
CGCAGTTGATGTTTCATTTCGACGGTGGTGCACGTTTTGAGCCGCATCGGAGAAGCTACC
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TAATGTGGTTGGGACATATGCACAGATTATTTGTGGGAGTTTGATGTGTGGCCTCACTTT
GTCTTTTGCTCTTCTACATGTCTTTAGCTG


BQ
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AF RR4C087TF U 1
AF RR4BU34TF U 559
BS 1 730 RR4C087TF
BS 731 1350 RR4BU34TF

RD RR4C087TF 730 0 0
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CACCGGGACACTCTCTTCCCAACATCATCCCACCGCATCGAAGACATTATCAACGAGGAC
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TGCAGGTTCCGAGGGAAAGGAAAAGGGAAAGAGAAAGAGAAGAAACGTCGAGTGTTCAGA
GCAGAAGAGTCTTCGAGCTTCAGACAAGTTGGATGTTTGACTCAGACTTGTAAAGTTGAT
CTCATAAATCTCTTCTCCCTCAGTAATTGCCCTACTCCTTCAACTCCATGCTCCTACGAT
TATAGATACGCGGACGGGTCAGCAGCACAAGGAGTATTCGCAAAGGAAACATTCACAGTT
GATCTCACCAACGGTCGTGTAGCTAGACTCCGTGGCCTCCTCATAGGTTGCAGCAGCTCT
TTCAATGGAGATAGCTTCCAAGGAGCCGATGGAGTTCTTGGTCTAGCCTTGAGTGATTAC
TCCTTCACTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4BU34TF 792 0 0
GG
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AGCTAGACTCCGTGGCCTCCTCATAGGTTGCAGCAGCTCTTTCAATGGAGATAGCTTCCA
AGGAGCCGATGGAGTTCTTGGTCTAGCCTTGAGTGATTACTCCTTCACTTCCAAAGCCAC
TAACCTTTTCGGTGGTAAATTTTCATACTGCCTCGTTGACCATCGCTCCACAAAAACGTC
TCCAGCTATCTCATCTTCGGCTCTACCACCAAACCAACCGCCACACGGACCACCCCTCTT
GATCTCAACCTCATTCCTCCCTTCTACGCCATCAACATCATTGGAATCTCCCTCGGCGAT
GACATGCTTGATATCCCCTCGCAAGTATGGGACGCAACAAACGGTGGTGGGACAATCTTG
GACTCTGGAACCAGCCTAACGTTATTGGCTGACGCCGCGTACAAGCCGGTGGTTTCGGGG
CTTGAGCGTTACCTTGTGGGGCTGAAGAGAGTTAAACCAGAAGGAGTACCGATAGAGTAT
TGTTTTGATGTCACGTCAGGGTTCAACGAGAGCAAGCTGCCGCAGTTGATGTTTCATTTC
GACGGTGGTGCACGTTTTGAGCCGCATCGGAGAAGCTACCTAGTAGATGCTGCGCATGGA
GTGAAGTGTTTAGGGTTTGTGTCGGCGGGAACGCCGCTACTAATGTGGTTGGGACATATG
CACAGATTATTTGTGGGAGTTTGATGTGTGGCCTCACTTTGTCTTTTGCTCTTCTACATG
TCTTTAGCTG

QA 3 792 3 792
DS 



AS 1 3

CO CL3517Contig1 1269 3 5 U
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GTTTTATTTTTGCGATAATGAACTATGAACTGGTAAATACTGAGGCCAAAATTAATAAAA
CCGAATCAAATCGAGACTGGTACACGAAGACCATCATAGCTTAACTTGACATCAAGGCCT
TCTGTGTCCATGAGTTTCTCCAGCTCTTGGCTCACCTTCTCGTGGTCCATCAAATGCATC
ATTCCGGTGAAAAGGGTTCTTTTTGGTTTAATTTTCCGAACTTCCTCCAACGCCCTTGGG
AGGCCAAAGTGTGTTGCTGAAGAACGATCAGGCCTCAGAGCATCCATGATTAAGAGATCA
CAATCTCTAAGGAGCGGATAAGTTTCTTCAGGTATGTCACTCACATCGCTTATGTAGCAG
ACGTCACCAAACCTGAAACCAAGAGAACGGTAGTTACTTCCATGCCACACTGGTAATGGG
ATGATCTTTAGATCTTTTACCATGAATGGCTGATCCTCGTGAATGATTTTAAACTCCAAC
TCTGAGACTGCAGCGCCAGGTATGATCACACTCGTATCAACCAAGTAGTAATGGGTCTTC
TTCATCACCTCAAAATCACGCAGAGCGGTGTAAATTGGAATGTGAGGTTGGACATTGTTT
GTCCAATCACGGAGATCATCAAGACCTCCAATTGCATCAGCATGAGAATGAGTGATTACA
ACCGCATCAAGTGTTCTTAGCCCGAAAGTGGGAAACCATTTAAGGGCACTGTGGTAGAAG
AACTTGCCACAGTCAATAAGGAGTTACTTGTTCCGGATGGTCTAGTGTACCGAACAAGAA
TGCTGGTGTTAAGTCTCCTGTTCTTGTTTCCAGGCTCTGTTGCTTTTTTGCATACCGAAC
ATGTTTTGAGAGGATTAGTGAGGCAGCTGACACGAGGGATCCCTTCACTAGTTCCAGTAC
CCAAAAACACAATCTCAGAATGGTCTCCAGATGATGTAACCGGAGCAGCATCAGCATTTG
CATAACTGGATTGAAGGGAAGCTTGAAGAGCCCTGTTAAGCGGAGACTTCGAAAGGACAA
GACTTTGGCATCGAAGAAGTGATGTCTGTTGCCGGAGAGAATTGAAAGAGGAGAAGGAAA
GGCGCGAAGCGCGAAGTGATCCGAAACCAAGAGACAGAACCGCTGAAAGAGCTGTCATTT
TAGCACCAAGTCTGAAAAGCTCTGCCTCCAACGATTGGGGATGCGACGCGACCTTCTTCT
TCTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D722JQ U 1
AF RR4DK24JQ U 29
AF RR4DK24TF C 542
BS 1 466 RR4D722JQ
BS 467 467 RR4DK24JQ
BS 468 707 RR4D722JQ
BS 708 759 RR4DK24JQ
BS 760 1269 RR4DK24TF

RD RR4D722JQ 707 0 0
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TCTGTGTCCATGAGTTTCTCCAGCTCTTGGCTCACCTTCTCGTGGTCCATCAAATGCATC
ATTCCGGTGAAAAGGGTTCTTTTTGGTTTAATTTTCCGAACTTCCTCCAACGCCCTTGGG
AGGCCAAAGTGTGTTGCTGAAGAACGATCAGGCCTCAGAGCATCCATGATTAAGAGATCA
CAATCTCTAAGGAGCGGATAAGTTTCTTCAGGTATGTCACTCACATCGCTTATGTAGCAG
ACGTCACCAAACCTGAAACCAAGAGAACGGTAGTTACTTCCATGCCGCACTGGTAATGGG
ATGATCTTTAGATCTTTTACCATGAATGGCTGATCCTCGTGAATGATTTTAAACTCCAAC
TCTGAGACTGCAGCGCCAGGTATGATCACACTCGTATCAACCAAGTAGTAATGGGTCTTC
TTCATCACCTCAAAATCACGCAGAGCGGTGTAAATTGGAATGTGAGGTTGGACATTGTTT
GTCCAATCACGGAGATCATCAAGACCTCCAATTGCATCAGCATGAGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DK24JQ 731 0 0
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ACTGGTAAATACTGAGGCCAAAATTAATAAAACCGAATCAAATCGAGACTGGTACACGAA
GACCATCATAGCTTAACTTGACATCAAGGCCTTCTGTGTCCATGAGTTTCTCCAGCTCTT
GGCTCACCTTCTCGTGGTCCATCAAATGCATCATTCCGGTGAAAAGGGTTCTTTTTGGTT
TAATTTTCCGAACTTCCTCCAACGCCCTTGGGAGGCCAAAGTGTGTTGCTGAAGAACGAT
CAGGCCTCAGAGCATCCATGATTAAGAGATCACAATCTCTAAGGAGCGGATAAGTTTCTT
CAGGTATGTCACTCACATCGCTTATGTAGCAGACGTCACCAAACCTGAAACCAAGAGAAC
GGTAGTTACTTCCATGCCACACTGGTAATGGGATGATCTTTAGATCTTTTACCATGAATG
GCTGATCCTCGTGAATGATTTTAAACTCCAACTCTGAGACTGCAGCGCCAGGTATGATCA
CACTCGTATCAACCAAGTAGTAATGGGTCTTCTTCATCACCTCAAAATCACGCAGAGCGG
TGTAAATTGGAATGTGAGGTTGGACATTGTTTGTCCAATCACGGAGATCATCAAGACCTC
CAATTGCATCAGCATGAGAATGAGTGATTACAACCGCATCAAGTGTTCTTAGCCCGAAAG
TGGGAAACCAT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4DK24TF 728 0 0
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TCATCAC*TCAAAATCACGCAGAGCGGTGTAAATTGGAATGTGAGGTTGGACATTGTTTG
TCCAATCACGGAGATCATCAAGACCTCCAATTGCATCAGCATGAGAATGAGTGATTACAA
CCGCATCAAGTGTTCTTAGCCCGAAGGTGGGAAACCATTTAAGGGCACTGTGGTAGAAGA
ACTTGCCACAGTCAATAAGGAGTTACTTGTTCCGGATGGTCTAGTGTACCGAACAAGAAT
GCTGGTGTTAAGTCTCCTGTTCTTGTTTCCAGGCTCTGTTGCTTTTTTGCATACCGAACA
TGTTTTGAGAGGATTAGTGAGGCAGCTGACACGAGGGATCCCTTCACTAGTTCCAGTACC
CAAAAACACAATCTCAGAATGGTCTCCAGATGATGTAACCGGAGCAGCATCAGCATTTGC
ATAACTGGATTGAAGGGAAGCTTGAAGAGCCCTGTTAAGCGGAGACTTCGAAAGGACAAG
ACTTTGGCATCGAAGAAGTGATGTCTGTTGCCGGAGAGAATTGAAAGAGGAGAAGGAAAG
GCGCGAAGCGCGAAGTGATCCGAAACCAAGAGACAGAACCGCTGAAAGAGCTGTCATTTT
AGCACCAAGTCTGAAAAGCTCTGCCTCCAACGATTGGGGATGCGACGCGACCTTCTTCTT
CTTCCCCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 4

CO CL3518Contig1 1116 4 3 U
GGAGAACCCTTCATTGTTGCATTTATTCATCGAGAAAATGAGGACCAAATCCCAATCTTC
TGTTAATCTGAAGGTCATATTCACATGTTGCTCAATCTTGATCTTTCTTGTCATCTTCTT
TGCAAGATCAAACATCTCTTCTTCAAAGCCCATCTCCAGAACCAATCTCTCTCAAGAGAA
AGAAGAGCAAAACCAGGCTACACCAGAAGGATGTCCAACAACACAACAATGCACGAAGAT
GCCAATTTCTTTATCCGACGCGTTGGTTCACTACGCCACCAGTAACGTCACTCCACAACA
GACATTCGACGAAATCTCTGTCTCAAAGAGAGTCTTGGACAAGAAGTCACCATGTAACTT
CCTCGTCTTTGGTTTAGGTCACGATAGCCCGATGTGGGCTTCTCTCAACCATGGTGGTCG
TACCTTGTTTATTGAGGAAGACAAGGCCTGGATCGAGATAGTGACCAAGAAATTCCCAAG
CTTGGAAGCTTACCACGTCGTTTACGACACGAAAGTGAAACATTCAGACAAACTGATGGA
GCTAGGAAGATCAGAGGAGTGCAGATCCGTGACCGATCCAAGAAACTCGAAATGTGAACT
ATCGTTGAAAGATTTCCCGGCCGATTTTTACGAGACGAAATGGGATCTGATCATGGTCGA
TGCTCCGACTGGTTACCACGAGGAAGCTCCGGGGAGGATGAGTGCTATTTACACGGCGGG
GCTTTTGGCTCGTAACCGCGAAGACGGAGAGACAGACGTTTTTGTTCACGACGTTAACCG
TCCTGTGGAAGATGAGTTCTCGGCGACTTTCTTGTGTAAAGGTTACATGAGGGAGCAAAA
CGGGAGGCTAAGGCATTTCACAATCCCTAGCCATCGGGCTCGTGCTGGCAGACCGTTTTG
TCCGGTGGATGTTAATCGCCGCCGTTGATTTCGTGCCGGGAAATATCTCTGTGTTGTGGA
CCAAGAGTGACTATGCTTAGCTGGCTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCTTTTATCTTGATGA
TTACGTTTTTTTATGGATTCAGTGCATTTACTGAAACGCTATAGTAAAATAGTATTCTTC
ATATAATTATTTGAATACAAAATAATGAATTACCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AR12TF U 1
AF RR4CA37TF U 1
AF RR4AR12JQ C 356
AF RR4CA37JQ C 366
BS 1 438 RR4AR12TF
BS 439 711 RR4CA37TF
BS 712 1116 RR4AR12JQ

RD RR4AR12TF 438 0 0
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TACCTTGTTTATTGAGGA

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DS 

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TGCAAGATCAAACATCTCTTCTTCAAAGCCCATCTCCAGAACCAATCTCTCTCAAGAGAA
AGAAGAGCAAAACCAGGCTACACCAGAAGGATGTCCAACAACACAACAATGCACGAAGAT
GCCAATTTCTT***CCGACGCGTTGGTTCACTACGCCACCAGTAACGTCACTCCACAACA
GACATTCGACGAAATCTCTGTCTCAAAGAGAGTCTTGGACAAGAAGTCACCATGTAACTT
CCTCGTCTTTGGTTTAGGTCACGATAGCCCGATGTGGGCTTCTCTCAACCATGGTGGTCG
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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4AR12JQ 761 0 0
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GCGGGGCTTTTGGCTCGTAACCGCGAAGACGGAGAGACAGACGTTTTTGTTCACGACGTT
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GATGATTACGTTTTTTTATGGATTCAGTGCATTTACTGAAACGCTATAGTAAAATAGTAT
TCTTCATATAATTATTTGAATACAAAATAATGAATTACCTG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CA37JQ 749 0 0
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AAGCTTACCACGTCGTTTACGACACGAAAGTGAAACATTCAGACAAACTGATGGAGCTAG
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ATTATTTGAATACAAAATAATGAATTACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

CO CL3519Contig1 935 4 6 U
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AGAGGAAAGCTGCTAGCTTGTTGGAGATCATTCAGCAACTTGAAGGTGTTGTGATATCTA
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TGTGTATAGGGAACCTTTGGATTGACTCTGACTAAAGAAGCTTATGTTAATGTCTACTCA
GTTTTGTGTATACAATAAAAACCTCTTTAATTAGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DT62TF U 1
AF RR4EA21TF U 1
AF RR4DT62JQ C 173
AF RR4EA21JQ C 435
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G

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DS 

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TCACGGATATAGTGGAAGTGCTTAAAAACGGAAGCATGGAGGCTAGAGAGAACGCAGCTG
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CAACGGCTATATTCAATCTGTGCATATACCAAGGGAACAAATCAAGAGCCATCAAGGGAG
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QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4DT62JQ 763 0 0
AGGAGCCATCACGGATATAGTGGAAGTGCTTAAAAACGGAAGCATGGAGGCTAGAGAGAA
CGCAGCTGCGACTCTTTTCAGCTTATCTGTTGTGGATGAGAACAAAGTGGCGATAGGTGC
TGCTGGAGCTATCCAGGCCCTTATAACCTTGCTCGAGGAAGGAACAAGAAGAGGGAAAAA
AGACGCTGCAACGGCTATATTCAATCTGTGCATATACCAAGGGAACAAATCAAGAGCCAT
CAAGGGAGGTATCGTTGATCCTCTGACGAGGTTACTGAAAGATGCAGGTGGAGGAATGGT
GGATGAAGCTTTGGTTATCCTGGCGATACTTTCAACGAACCAAGAAGGGAAGGGAGCTAT
AGGTGAAGCAGATACTATTCCTGTTTTGGTTGAGATTATAAGGACAGGGTCACCGAGGAA
CAGGGAGAACGCTGTTGCGATACTTTGGTATCTATGTGTTGGGAATATGGAGAGGTTGAA
TGTAGCGAGAGAGGTTGGTGCAGATGTTGCGTTGAAGGAACTTACCGAGAATGGGACTGA
TAGAGCAAAGAGGAAAGCTGCTAGCTTGTTGGAGATCATTCAGCAACTTGAAGGTGTTGT
GATATCTACTGTTCCATGAACGGTCTCGCTCTTGTGGTATCTTTATCTGTTTCAGTATAG
ATTATATATGTGTATAGGGAACCTTTGGATTGACTCTGACTAAAGAAGCTTATGTTAATG
TCTACTCAGTTTTGTGTATACAATAAAAACCTCTTTAATTAGC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4EA21JQ 501 0 0
CTGACGAGGTTACTGAAAGATGCAGGTGGAGGAATGGTGGATGAAGCTTTGGTTATCCTG
GCGATACTTTCAACGAACCAAGAAGGGAAGGGAGCTATAGGTGAAGCAGATACTATTCCT
GTTTTGGTTGAGATTATAAGGACAGGGTCACCGAGGAACAGGGAGAACGCTGTTGCGATA
CTTTGGTATCTATGTGTTGGGAATATGGAGAGGTTGAATGTAGCGAGAGAGGTTGGTGCA
GATGTTGCGTTGAAGGAACTTACCGAGAATGGGACTGATAGAGCAAAGAGGAAAGCTGCT
AGCTTGTTGGAGATCATTCAGCAACTTGAAGGTGTTGTGATATCTACTGTTCCATGAACG
GTCTCGCTCTTGTGGTATCTTTATCTGTTTCAGTATAGATTATATATGTGTATAGGGAAC
CTTTGGATTGACTCTGACTAAAGAAGCTTATGTTAATGTCTACTCAGTTTTGTGTATACA
ATAAAAACCTCTTTAATTAGC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 4

CO CL3520Contig1 541 4 6 U
GCTGTAAATCGGTGGTGAACCATTTATTTTGGACGGTAAAACTTTATCGTCACTGCATAA
ACGAGCGCAATATAAAAAAGACGGGAGCAACGTAACTGTTTTTATAACAACAGAACACCA
AATCTGACAGTTTTATCACTCTCTGAACCCAAACTAAACATTTCCATCATAAGTCAGAAC
ATCAAACCATCCTATCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCA
TTTTCTGCATGAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGT
AAGCAAGCATTGGGTAGTGGCCAATGTATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTG
CCCACTCAAATCTGCTTAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCT
CAAGCTGAGAATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCCGCATCGTTGGTAGCAGCCGACGAA
GAAAGGGAAAGAGTCCTCTCTTCCTTCAAAGTCTCTCCAGCAAATCCCTGTTAAACGTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 

AF RR4EU13TF C 1
AF RR4EU13JQ U 6
AF RR4DE69JQ U 11
AF RR4DE69TF C 11
BS 1 10 RR4EU13TF
BS 11 71 RR4EU13JQ
BS 72 72 RR4DE69JQ
BS 73 455 RR4EU13JQ
BS 456 456 RR4DE69JQ
BS 457 541 RR4EU13JQ

RD RR4EU13TF 541 0 0
GCTGTAAATCGGTGGTGAACCATTTATTTTGGACGGTAAAACTTTATCGTCACTGCATAA
ACGAGCGCAATGTAAAAAAGACGGGAGCAACGTAACTGTTTTTATAACAACAGAACACCA
AATCTGACAGTTTTATCACTCTCTGAACCCAAACTAAACATTTCCATCATAAGTCAGAAC
ATCAAACCATCCTATCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCA
TTTTCTGCATGAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGT
AAGCAAGCATTGGGTAGTGGCCAATGTATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTG
CCCACTCAAATCTGCTTAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCT
CAAGCTGAGAATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCTGCATCGTTGGTAGCAGCCGACGAA
GAAAGGGAAAGAGTCCTCTCTTCCTTCAAAGTCTCTCCAGCAAATCCCTGTTAAACGTTC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4EU13JQ 536 0 0
AAATC
GGTGGTGAACCATTTATTTTGGACGGTAAAACTTTATCGTCACTGCATAAACGAGCGCAA
TGTAAAAAAGACGGGAGCAACGTAACTGTTTTTATAACAACAGAACACCAAATCTGACAG
TTTTATCACTCTCTGAACCCAAACTAAACATTTCCATCATAAGTCAGAACATCAAACCAT
CCTATCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCATTTTCTGCAT
GAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGTAAGCAAGCAT
TGGGTAGTGGCCAATGTATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTGCCCACTCAAA
TCTGCTTAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCTCAAGCTGAGA
ATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCTGCATCGTTGGTAGCAGCCGACGAAGAAAGGGAAA
GAGTCCTCTCTTCCTTCAAAGTCTCTCCAGCAAATCCCTGTTAAACGTTCC

QA 6 536 6 536
DS 

RD RR4DE69JQ 531 0 0
GGTGGTGAACCATTTATTTTGGACGGTAAAACTTTATCGTCACTGCATAAACGAGCGCAA
TATAAAAA*GACGGGAGCAACGTAACTGTTTTTATAACAACAGAACACCAAATCTGACAG
TTTTATCACTCTCTGAACCCAAACTAAACATTTCCATCATAAGTCAGAACATCAAACCAT
CCTCTCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCATTTTCTGCAT
GAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGTAAGCAGGCAT
TGGGTAGTGGCCAAT**ATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTGCCCACTCAAA
TCTGCTTAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCTCAAGCTGAGA
ATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCCGCATCGTTGGTAGCAGCCGACGAAGAAAGGGAAA
GAGTCTTCTCTTCCTTCAAAGTCTCTCCAGCAAATCCCTGTTAAACGTTCC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4DE69TF 531 0 0
GGTGGTGAACCATTTATTTTGGACGGTAAAACTTTATCGTCACTGCATAAACGAGCGCAA
TATAAAAA*GACGGGAGCAACGTAACTGTTTTTATAACAACAGAACACCAAATCTGACAG
TTTTATCACTCTCTGAACCCAAACTAAACATTTCCATCATAAGTCAGAACATCAAACCAT
CCTCTCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCATTTTCTGCAT
GAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGTAAGCAGGCAT
TGGGTAGTGGCCAAT**ATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTGCCCACTCAAA
TCTGCTTAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCTCAAGCTGAGA
ATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCCGCATCGTTGGTAGCAGCCGACGAAGAAAGGGAAA
GAGTCTTCTCTTCCTTCAAAGTCTCTCCAGCAAATCCCTGTTAAACGTTCC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 4

CO CL3521Contig1 826 4 11 U
CTGTAAATATAGTAGTAATGATTAATGAAATTAGGAAAGGGTTATTTTAGTCACGCAATA
CACTCACTTATGGAAAGTACAATTTTACATATCAATTAAAAATACAAAAAGAAACTTTGA
GGAAGTGATGAGTTTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCAAGCCCTTGACGATACCGC
AGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAAAGATTTCTCAGGTGAGAGGA
CACTGACGTACATCTGCTGTCCCAAGTATCTTCTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCC
ACATACCAGCATTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCGGACCAGGACTTGGGGAACACTTGCA
CGGTGTGTCTGCTGACGGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGTTTCTCTTCTCTGGTGTCCATG
TTCCGGGCTCAGAGGCGACTGAGAAGAATGAGTAACCATCCAAATTGAAGGATTGCATGC
TCTTCTCATGGTTCTCGAAGACGATTTCCACAAAGGTACGGAAAATGATGTTCAAAACAT
TGGGCTCGACGGTTAGTGTTGTGATCTTGGCTGCTGGCTCGTCCTTGATGACGTTGTATT
TGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAAGGGAGTCTCGGTATCAA
TGTGTGATACACCGTTGAGTCCAAACCTGACCTTTCCGTCCACCAAGTTCTTGCTGTTGG
CGAGCTTGATGGTACGGGTGATGTTGATCTTTCCGTAATGGTAAGATCCTTGGGGGTTAG
GTCTAGCCGCGCTGGCGGTTAAGTTCCACCTGAAGGATCTGAACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP65JQ U 57
AF RR4GC47JQ U 1
AF RR4GC47TF C 1
AF RR4FP65TF C 52
BS 1 431 RR4GC47JQ
BS 432 432 RR4GC47TF
BS 433 442 RR4GC47JQ
BS 443 443 RR4GC47TF
BS 444 445 RR4GC47JQ
BS 446 446 RR4GC47TF
BS 447 499 RR4GC47JQ
BS 500 524 RR4GC47TF
BS 525 525 RR4FP65TF
BS 526 658 RR4GC47TF
BS 659 826 RR4FP65TF

RD RR4FP65JQ 323 0 0
A
ATACACTCCCTTATGGAAAGTACAATTTTACATATCAATTAAAAATACAAAAAAAAACTT
TGAGGAAGTGATGAGTTTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCAAGCCCTTGACAATAC
CCCAAAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCCTCTCTTAAAAATTTCTCAGGGGAAA
GGACACTGACGTACATCTGCTGTCCCAAGTATCTTCTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGT
TCCACATACCACCATTGTCAAATGTCAAGAGGATGGCGGACCAGGACTTGGGGAACACTT
GCACGGTGTGTCTGCTGACGGC

QA 2 323 2 323
DS 

RD RR4GC47JQ 499 0 0
CTGTAAATATAGTAGTAATGATTAATGAAATTAGGAAAGGGTTATTTTAGTCACGCAATA
CACTCACTTATGGAAAGTACAATTTTACATATCAATTAAAAATACAAAAAGAAACTTTGA
GGAAGTGATGAGTTTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCAAGCCCTTGACGATACCGC
AGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAAAGATTTCTCAGGTGAGAGGA
CACTGACGTACATCTGCTGTCCCAAGTATCTTCTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCC
ACATACCAGCATTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCGGACCAGGACTTGGGGAACACTTGCA
CGGTGTGTCTGCTGACGGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGTTTCTCTTCTCTGGTGTCCATG
TTCCGGGCTCAAAGGCGACTGAAAAAAATGAGTAACCATCCAAATTGAAGGATTGCATGC
TCTTCTCATGGTTCTCGAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4GC47TF 659 0 0
CTGTAAATATAGTAGTAATGATTAATGAAATTAGGAAAGGGTTATTTTAGTCACGCAATA
CACTCACTTATGGAAAGTACAATTTTACATATCAATTAGAAATACAAAAAGAAACTTTGA
GGAAGTGATGAGTTTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCAAGCCCTTGACGATACCGC
AGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGAGATTTCTCAGGTGAGAGGA
CACTGACGTACATCTGCTGTCCCAAGTATCTTCTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCC
ACATACCAGCATTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCGGACCAGGACTTGGGGAACACTTGCA
CGGTGTGTCTGCTGACGGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGTTTCTCTTCTCTGGTGTCCATG
TTCCGGGCTCAGAGGCGACTGAGAAGAATGAGTAACCATCCAAATTGAAGGATTGCATGC
TCTTCTCATGGTTCTCGAAGACGATTTCCACAAAGGTACGGAAAGTGATGTTCAAAACAT
TGGGCTCGACGGTTAGTGTTGTGATCTTGGCTGCTGGCTCGTCCTTGATGACGTTGTATT
TGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAAGGGAGTCTCGGTATC
C

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4FP65TF 775 0 0
TCACGC
ATACACTCACTTATGGAAAGTACAATTTTACATATCAATTAGAAATACAAAA*GAAACTT
*GAGGAAGTGATGAGTTTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCAAGCCCTTGACGATAC
CGCAGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGAGATTTCTCAGGTGAGA
GGACACTGACGTACATCTGCTGTCCCAAGTATCTTCTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGT
TCCACATACCAGCATTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCGGACCAGGACTTGGGGAACACTT
GCACGGTGTGTCTGCTGACGGC**CGAGCAAGTTGTAGTTGTTTCTCTTCTCTGGTGTCC
ATGTTCCGGGCTCAGAGGCGACTGAGAAGAATGA**ACCCATCCAAATTGAAGGATTGCA
TGCTCTTCTCATGGTTCTCGAAGACGATTTCCACAAAGGTACGGAAAATGATGTTCAAAA
CATTGGGCTCGACGGTTAGTGTTGTGATCTTGGCTGCTGGCTCGTCCTTGATGACGTTGT
ATTTGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAAGGGAGTCTCGGTAT
CAATGTGTGATACACCGTTGAGTCCAAACCTGACCTTTCCGTCCACCAAGTTCTTGCTGT
TGGCGAGCTTGATGGTACGGGTGATGTTGATCTTTCCGTAATGGTAAGATCCTTGGGGGT
TAGGTCTAGCCGCGCTGGCGGTTAAGTTCCACCTGAAGGATCTGAACTC

QA 7 775 7 775
DS 



AS 1 4

CO CL3522Contig1 917 4 4 U
GGAATAAAGCCACGCGGTGGGGTGGTGATTGTGATTCATATCGGAAAACCTCCATCGATT
CGCTTGTTGTTTGATTTTGCATCTGAGAAAGAGAGATCAGATCCGAAGAAAAAAAATGCA
ATCAAGGCATGGCCAATTGTCGTATCGAGATCGGACGGAGGAGTTCTTCGGTATCGTTGA
AACTCTGAGGAGATCAATCGGAGTTCAAAAAGAGAGCTGCTGTCATCGGTTTAGCTATCA
ACCAGACGTCTCTGAAGCTTTCGAAACTCGCTCAACTGGCAAAGAGATCATCAGTTTTTG
ATGATCCCACACGGGAGATACAAGAGCTGACGGCTGTTATCAAACAAGAGATCTCTTCTC
TGAATTCCGCTCTGATCGACCTTCAAGCTGTACGCAACTCCCATAATGATGAACGGACCA
TCTCCCGAGACACAACAACAGATGGTCCCGTTGCAAGACACTTATATGGAGAGCCGCGCA
GAAGCTCTACACAACGTAGAATCAACAATCCATGAGCTTAGCAATATCTTCACACAACTA
GCTACCATGGTGTCTCAGCAAGGGGAGATCGCTATCAGGATCGATCAGAACATGGAAGAT
ACATTGGCTAACGTGGAAGGTGCACAGAGCCAATTGGCCAGGTATCTCAACAGTATATCT
TCAAACCGATGGCTCATGATTAAGATTTTCTTCGTACTGATTGCATTTCTCATGGTTTTC
CTCTTCTTCGTGGCCTAATATTGAGATCTTAAAAAGACATATATTCTAAAAAAGAGTTTC
AAACATCTAGACATGGTTCTCTTTTCTGTCGTATCTTATTGACATGTAAAGACTAGATAA
AAGGATCTTTATGCTCTATGTTCAGATCAGTGGATATATATTGCCAAATTTTTATGTAAA
ATTGATTTTTGCTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL21TF U 1
AF RR4GL21JQ C 201
AF RR4CE64JQ C 658
AF RR4CE64TF U 658
BS 1 754 RR4GL21TF
BS 755 755 RR4CE64TF
BS 756 773 RR4GL21TF
BS 774 917 RR4CE64TF

RD RR4GL21TF 773 0 0
GGAATAAAGCCACGCGGTGGGGTGGTGATTGTGATTCATATCGGAAAACCTCCATCGATT
CGCTTGTTGTTTGATTTTGCATCTGAGAAAGAGAGATCAGATCCGAAGAAAAAAAATGCA
ATCAAGGCATGGCCAATTGTCGTATCGAGATCGGACGGAGGAGTTCTTCGGTATCGTTGA
AACTCTGAGGAGATCAATCGGAGTTCAAAAAGAGAGCTGCTGTCATCGGTTTAGCTATCA
ACCAGACGTCTCTGAAGCTTTCGAAACTCGCTCAACTGGCAAAGAGATCATCAGTTTTTG
ATGATCCCACACGGGAGATACAAGAGCTGACGGCTGTTATCAAACAAGAGATCTCTTCTC
TGAATTCCGCTCTGATCGACCTTCAAGCTGTACGCAACTCCCATAATGATGAACGGACCA
TCTCCCGAGACACAACAACAGATGGTCCCGTTGCAAGACACTTATATGGAGAGCCGCGCA
GAAGCTCTACACAACGTAGAATCAACAATCCATGAGCTTAGCAATATCTTCACACAACTA
GCTACCATGGTGTCTCAGCAAGGGGAGATCGCTATCAGGATCGATCAGAACATGGAAGAT
ACATTGGCTAACGTGGAAGGTGCACAGAGCCAATTGGCCAGGTATCTCAACAGTATATCT
TCAAACCGATGGCTCATGATTAAGATTTTCTTCGTACTGATTGCATTTCTCATGGTTTTC
CTCTTCTTCGTGGCCTAATATTGAGATCTTAAAA*GACATATATTCTAAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4GL21JQ 696 0 0
GAGTTCAAAAAGAGAGCTGCTGTCATCGGTTTAGCTATCAACCAGACGTCTCTGAAGCTT
TCGAAACTCGCTCAACTGGCAAAGAGATCATCAGTTTTTGATGATCCCACACGGGAGATA
CAAGAGCTGACGGCTGTTATCAAACAAGAGATCTCTTCTCTGAATTCCGCTCTGATCGAC
CTTCAAGCTGTACGCAACTCCCATAATGATGAACGGACCATCTCCCGAGACACAACAACA
GATGGTCCCGTTGCAAGACACTTATATGGAGAGCCGCGCAGAAGCTCTACACAACGTAGA
ATCAACAATCCATGAGCTTAGCAATATCTTCACACAACTAGCTACCATGGTGTCTCAGCA
AGGGGAGATCGCTATCAGGATCGATCAGAACATGGAAGATACATTGGCTAACGTGGAAGG
TGCACAGAGCCAATTGGCCAGGTATCTCAACAGTATATCTTCAAACCGATGGCTCATGAT
TAAGATTTTCTTCGTACTGATTGCATTTCTCATGGTTTTCCTCTTCTTCGTGGCCTAATA
TTGAGATCTTAAAAAGACATATATTCTAAAAAAGAGTTTCAAACATCTAGACATGGTTCT
CTTTTCTGTCGTATCTTATTGACATGTAAAGACTAGATAAAAGGATCTTTATGCTCTATG
TTCAGATCAGTGGATATATATTGCCAAATTTTTATG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4CE64JQ 260 0 0
GCG
TCAAACCGATGGCTCATGATTAAGATTTTCTTCGTACTGATTGCATTTCTCATGGTTTTC
CTCTTCTTCGTGGCCTAATATTGAGATCTTAAAAAGACATATATTCTAAAAAAGAGTTTC
AAACATCTAGACATGGTTCTCTTTTCTGTCGTATCTTATTGACATGTAAAGACTAGATAA
AAGGATCTTTATGCTCTATGTTCAGATCAGTGGATATATATTGCCAAATTTTTATGTAAA
ATTGATTTTTGCTGCCG

QA 4 260 4 260
DS 

RD RR4CE64TF 260 0 0
GCG
TCAAACCGATGGCTCATGATTAAGATTTTCTTCGTACTGATTGCATTTCTCATGGTTTTC
CTCTTCTTCGTGGCCTAATATTGAGATCTTAAAAAGACATATATTCTAAAAAAGAGTTTC
AAACATCTAGACATGGTTCTCTTTTCTGTCGTATCTTATTGACATGTAAAGACTAGATAA
AAGGATCTTTATGCTCTATGTTCAGATCAGTGGATATATATTGCCAAATTTTTATGTAAA
ATTGATTTTTGCTGCCG

QA 4 260 4 260
DS 



AS 2 4

CO CL3523Contig1 697 2 3 U
GATTGGGGAGAGTGTGGACAGAGAGGTGGATACTTTGAGATGACTAACATCCCTCCCAGG
GTTGTTGAAGAGATATACAAGGTGGCATCAATTGCTCTCAGCCCCAATGTATCTGCTCAG
ATCTTTATGGGTTTGATGGTTAGTCCTCCAAGCCTGGAGACATTTCATATGACCAGTTCG
CTCGTGAAAGCAAGGGGATTCTTGAATCTTTGAGAAGAAGAGCAAAGATCATGACTGATG
GATTCAACAGCTGCAAGAACGTTGTCTGCAATTTCACAGAAGGTGCAATGTATTCGTTTC
CTCAAATACGGTTACCAACGGGAGCTCTCCAAGCTGCGAAGCAAGCAGGAAAAGTGCCAG
ACGTTTTCTATTGTCTAAAGCTCTTAGAAGCCACAGGAATCTCCACAGTGCCTGGCTCTG
GATTTGGACAGAAAGAAGGTGTGTTCCATCTGAGGACAACGATCTTGCCTGCGGAAGAGG
AGATGCCGGAGATCATGGATAGTTTCAAGAAGTTCAACGACGAGTTCATGACTCAGTATG
ATAATGGCTTTGGTTATTCCAGAATGTGATTTACTTTCTTTCTCCTTTCTTCTTCTTCTT
GTTATGATATGATGGAACAAACCTATTGTGTTCTGCTACACTCTTTAAAGCTAAATCTCT
GTAGTACTCTTCTCTTTCTATAAAACTCTTCCATGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4B327JQ C 1
AF RR4B327TF U 1
BS 1 1 RR4B327JQ
BS 2 696 RR4B327TF
BS 697 697 RR4B327JQ

RD RR4B327JQ 697 0 0
GATTGGGGAGAGTGTGGACAGAGAGGTGGATACTTTGAGATGACTAACATCCCTCCCAGG
GTTGTTGAAGAGATATACAAGGTGGCATCAATTGCTTTCAGCCCCAATGTATCTGCTCAG
ATCTTTATGGGTTTGATGGTTAGTCCTCCAAGCCTGGAGACATTTCATATGACCAGTTCG
CTCGTGAAAGCAAGGGGATTCTTGAATCTTTGAGAAGAAGAGCAAAGATCATGACTGATG
GATTCAACAGCTGCAAGAACGTTGTCTGCAATTTCACAGAAGGTGCAATGTATTCGTTTC
CTCAAATACGGTTACCAACGGGAGCTCTCCAAGCTGCGAAGCAAGCAGGAAAAGTGCCAG
ACGTTTTTTATTGTCTAAAGCTCTTAGAAGCCACAGGAATCTCCACAGTGCCTGGCTCTG
GATTTGGACAGAAAGAAGGTGTGTTCCATCTGAGGACAACGATCTTGCCTGCGGAAGAGG
AGATGCCGGAGATCATGGATAGTTTCAAGAAGTTCAACGACGAGTTCATGACTCAGTATG
ATAATGGCTTTGGTTATTCCAGAATGTGATTTACTTTCTTTCTCCTTTCTTCTTCTTCTT
GTTATGATATGATGGAACAAACCTATTGTGTTCTGCTACACTCTTTAAAGCTAAATCTCT
GTAGTACTCTTCTCTTTCTATAAAACTCTTCCATGCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4B327TF 696 0 0
G
ATTGGGGAGAGTGTGGACAGAGAGGTGGATACTTTGAGATGACTAACATCCCTCCCAGGG
TTGTTGAAGAGATATACAAGGTGGCATCAATTGCTCTCAGCCCCAATGTATCTGCTCAGA
TCTTTATGGGTTTGATGGTTAGTCCTCCAAGCCTGGAGACATTTCATATGACCAGTTCGC
TCGTGAAAGCAAGGGGATTCTTGAATCTTTGAGAAGAAGAGCAAAGATCATGACTGATGG
ATTCAACAGCTGCAAGAACGTTGTCTGCAATTTCACAGAAGGTGCAATGTATTCGTTTCC
TCAAATACGGTTACCAACGGGAGCTCTCCAAGCTGCGAAGCAAGCAGGAAAAGTGCCAGA
CGTTTTCTATTGTCTAAAGCTCTTAGAAGCCACAGGAATCTCCACAGTGCCTGGCTCTGG
ATTTGGACAGAAAGAAGGTGTGTTCCATCTGAGGACAACGATCTTGCCTGCGGAAGAGGA
GATGCCGGAGATCATGGATAGTTTCAAGAAGTTCAACGACGAGTTCATGACTCAGTATGA
TAATGGCTTTGGTTATTCCAGAATGTGATTTACTTTCTTTCTCCTTTCTTCTTCTTCTTG
TTATGATATGATGGAACAAACCTATTGTGTTCTGCTACACTCTTTAAAGCTAAATCTCTG
TAGTACTCTTCTCTTTCTATAAAACTCTTCCATGC

QA 2 696 2 696
DS 



CO CL3523Contig2 953 2 6 U
GGGATATCAGTAAGGGCAATGGTGATCATTAACCCTGGGAACCCAACTGGTCAGTGTCTA
AGCGAAGCCAACTTAAAAGAGATACTGAGGTTCTGTTACAACGAGAAACTGGTTCTTCTG
GGAGACGAGGTTTATCAGCAGAACATATACCAGGATGAGCGTCCCTTTATCAGCTCCAAG
AAGGTTTTGATGGAGATGGGTTCGCCGTTCAACAAGGAAGTCCAGCTTGTGTCTTTCCAC
ACTGTCTCTAAAGGTTATTGGGGAGAGTGTGGACAGAGAGGTGGATACTTTGAGATGACT
AACATCCCTCCCAGGGTTGTTGAAGAGATATACAAGGTTGCTTCAATCGCACTCAGCCCC
AATGTCTCCGCACAGATCTTTATGGGTTTGATGGTTAGTCCTCCAAAGCCTGGGGACATC
TCATATGATCAATTTGCCCGTGAAAGCAAGGGAATTCTTGAATCTTTGAGAAGAAGAGCA
AAGATCATGACTGATGGATTCAACAGCTGCAAGAACGTTGTCTGCAATTTCACAGAAGGT
GCAATGTATTCGTTTCCCCAAATACGGTTACCAACGGGAGCTCTCCAAGCTGCGAAGCAA
GCAGGAAAAGTGCCAGACGTTTTCTATTGTCTAAAGCTCTTAGAAGCCACAGGAATCTCC
ACAGTGCCTGGCTCTGGATTTGGACAGAAAGAAGGTGTGTTCCATCTGAGGACAACGATC
TTGCCTGCGGAAGAGGAGATGCCGGAGATCATGGATAGTTTCAAGAAGTTCAACGACGAG
TTCATGACTTAGTATGATAATGGCTTTGGTTATTCCAGAATGTGATTTACTTTCTTTCTC
CTTTCTTCTTCTTCTTGTTATGATATGATGGAACAAACCTATTGTGTTCTGCTACACTCT
TTAAAGCTAAATCTCTGTAGTACTCTTCTCTTTCTATAAAACTCTTCCATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CH69TF U 1
AF RR4CH69JQ C 169
BS 1 538 RR4CH69TF
BS 539 539 RR4CH69JQ
BS 540 566 RR4CH69TF
BS 567 567 RR4CH69JQ
BS 568 604 RR4CH69TF
BS 605 953 RR4CH69JQ

RD RR4CH69TF 615 0 0
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GGAGACGAGGTTTATCAGCAGAACATATACCAGGATGAGCGTCCCTTTATCAGCTCCAAG
AAGGTTTTGATGGAGATGGGTTCGCCGTTCAACAAGGAAGTCCAGCTTGTGTCTTTCCAC
ACTGTCTCTAAAGGTTATTGGGGAGAGTGTGGACAGAGAGGTGGATACTTTGAGATGACT
AACATCCCTCCCAGGGTTGTTGAAGAGATATACAAGGTTGCTTCAATCGCACTCAGCCCC
AATGTCTCCGCACAGATCTTTATGGGTTTGATGGTTAGTCCTCCAAAGCCTGGGGACATC
TCATATGATCAATTTGCCCGTGAAAGCAAGGGAATTCTTGAATCTTTGAGAAGAAGAGCA
AAGATCATGACTGATGGATTCAACAGCTGCAAGAACGTTGTCTGCAATTTCACAGAAG*T
GCAATGTATTCGTTTCCCCAAATACG*TTACCAACGGGAGCTCTCCAAGCTGCGAAGCAA
GCAG
AAAGTGCAGAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4CH69JQ 785 0 0
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GTGTCTTTCCACACTGTCTCTAAAGGTTATTGGGGAGAGTGTGGACAGAGAGGTGGATAC
TTTGAGATGACTAACATCCCTCCCAGGGTTGTTGAAGAGATATACAAGGTTGCTTCAATC
GCACTCAGCCCCAATGTCTCCGCACAGATCTTTATGGGTTTGATGGTTAGTCCTCCAAAG
CCTGGGGACATCTCATATGATCAATTTGCCCGTGAAAGCAAGGGAATTCTTGAATCTTTG
AGAAGAAGAGCAAAGATCATGACTGATGGATTCAACAGCTGCAAGAACGTTGTCTGCAAT
TTCACAGAAGGTGCAATGTATTCGTTTCCCCAAATACGGTTACCAACGGGAGCTCTCCAA
GCTGCGAAGCAAGCAGGAAAAGTGCCAGACGTTTTCTATTGTCTAAAGCTCTTAGAAGCC
ACAGGAATCTCCACAGTGCCTGGCTCTGGATTTGGACAGAAAGAAGGTGTGTTCCATCTG
AGGACAACGATCTTGCCTGCGGAAGAGGAGATGCCGGAGATCATGGATAGTTTCAAGAAG
TTCAACGACGAGTTCATGACTTAGTATGATAATGGCTTTGGTTATTCCAGAATGTGATTT
ACTTTCTTTCTCCTTTCTTCTTCTTCTTGTTATGATATGATGGAACAAACCTATTGTGTT
CTGCTACACTCTTTAAAGCTAAATCTCTGTAGTACTCTTCTCTTTCTATAAAACTCTTCC
ATGCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL3524Contig1 1104 2 2 U
GGCTGCTGCTGAAGCACTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCTGCTTTCCCTCT
TCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACCGATGCCGTTGAGGGATGCACGGGAGTCAACGTTGC
TGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGATGTGATGACCAA
GAATGTCTCCATTTACAAGTCTCAGGCTACTGCTTTGGAGAAGCATGCCGCTCCAAACTG
CAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCAAACACCAATGCATTGATCCTGAAGGAATTTGC
ACCATCCATCCCTGAAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCACAACAGTGCCTT
GGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAGCGTGCCCGTGTCTGATGTTAAGAACGTGATCATCTG
GGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGCAGACATCGGC
TGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGCGAAGAACGATGAATACTTGAATGGAGAATTCAT
CACCACCGTTCAACAGCGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCAAGTGCACT
TTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGACCACATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGG
TACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGTTCCAGCTGGACTTAT
CTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGCTTCCGAT
CGATGAAATGTCAAGGAAGAAGATGGACTTGACAGCAGAGGAGCTGAAGGAAGAGAAGGA
CTTGGCGTACTCATGCCTCTCTTAAACAACCAATGCTCTTCTTCTGAAGCCATTTTCAGC
TGTCAGGTGTGACGTGTGAGATCAATCATAGCTTTTACGGCTGTGTCTGAATAAGATCTC
CAAACACTGTTTTAAAACCTCTTTGTTGGTTTGTCTTCCTATTGAGCATTGTCCCTGGTC
TGTTTCTAAACCAGGATATCGTTTACTCTGTTTCATGTCTCTTGTTTGGTTTTATCCATA
ATAAAATTTTTAAAAATTGATAAC


BQ
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AF RR4AX60TF U 1
AF RR4AX60JQ C 315
BS 1 741 RR4AX60TF
BS 742 1104 RR4AX60JQ

RD RR4AX60TF 745 0 0
GGCTGCTGCTGAAGCACTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCTGCTTTCCCTCT
TCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACCGATGCCGTTGAGGGATGCACGGGAGTCAACGTTGC
TGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGATGTGATGACCAA
GAATGTCTCCATTTACAAGTCTCAGGCTACTGCTTTGGAGAAGCATGCCGCTCCAAACTG
CAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCAAACACCAATGCATTGATCCTGAAGGAATTTGC
ACCATCCATCCCTGAAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCACAACAGTGCCTT
GGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAGCGTGCCCGTGTCTGATGTTAAGAACGTGATCATCTG
GGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGCAGACATCGGC
TGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGCGAAGAACGATGAATACTTGAATGGAGAATTCAT
CACCACCGTTCAACAGCGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCAAGTGCACT
TTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGACCACATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGG
TACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGTTCCAGCTGGACTTAT
CTACTCCTTCCCTGTCACTTG
CCGC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4AX60JQ 790 0 0
AAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCACAACAGTGCCTTGGGTCAGATCTCCG
AGAGGTTGAGCGTGCCCGTGTCTGATGTTAAGAACGTGATCATCTGGGGAAACCACTCGT
CATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGCAGACATCGGCTGGAGAGAAGTCAG
TCCGTGAGCTCGCGAAGAACGATGAATACTTGAATGGAGAATTCATCACCACCGTTCAAC
AGCGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCAAGTGCACTTTCTGCTGCTAGCT
CTGCTTGTGACCACATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGGTACATTTGTTTCAA
TGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGTTCCAGCTGGACTTATCTACTCCTTCCCTG
TCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGCTTCCGATCGATGAAATGTCAA
GGAAGAAGATGGACTTGACAGCAGAGGAGCTGAAGGAAGAGAAGGACTTGGCGTACTCAT
GCCTCTCTTAAACAACCAATGCTCTTCTTCTGAAGCCATTTTCAGCTGTCAGGTGTGACG
TGTGAGATCAATCATAGCTTTTACGGCTGTGTCTGAATAAGATCTCCAAACACTGTTTTA
AAACCTCTTTGTTGGTTTGTCTTCCTATTGAGCATTGTCCCTGGTCTGTTTCTAAACCAG
GATATCGTTTACTCTGTTTCATGTCTCTTGTTTGGTTTTATCCATAATAAAATTTTTAAA
AATTGATAAC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 4

CO CL3525Contig1 738 4 20 U
AGTAAAATTAGTGGAATAAAATTTAGTAAAATAGAGTTAAGTGAAATAGAAAAACAAAAG
TTTGTACTTTAGGACAACGGGGGATACAACATCTGCCGGAAATAGGATAGATTTGAATTG
TAAATGATACGAGAATTCAAATCAAGCAAGATTTAAAACCCTTCTCTAGCTCCTCACGGT
TCAAATTCTTGCCAATGAAGACCAGCTTGTTGACTCTAGCCTCGTCTTTGCCCCATAACC
GGTCTGGGGATCCTTGAAAGATGTCATGGACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCATGG
TGTGGACCGAGAGCAGACCTTTCATCCTGTAGATATCCTCACTTCGTTCCATCAGTAAAG
TCCCTAGCCACATGTTTGCCTTCTCAAGGTCTAAGCTCCCTTCGCAAACTATACTGACTG
AAGAAACACCGGGATCATGGGTGTGATCATGATCATGAGAATGAGAATGATTATGCTCAT
GTTCATTGTGGTGACGATGGTCATGATGATCATGGTGATGTTCGTCGTGACACTCATTAT
GACCTTCCTTAACATCTTCGGTGGTCACAGAGCTTTCGATTCTCTCAAGATCAAAACCTC
CAATTCCAAGAACATAATCCAAGTCAACGTTTCCGTAATTTGTCCTCGTCATCTGAGCCA
TGCTGTTTATTGTCTTTATGCGTTGCACCACTGAACCTAACTCTGACTCACCAACAAGAT
CAATCTTGTTAACTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D567JQ U 1
AF RR4AD14JQ U 207
AF RR4AD14TF C 25
AF RR4CX41JQ U 8
BS 1 33 RR4D567JQ
BS 34 34 RR4CX41JQ
BS 35 48 RR4D567JQ
BS 49 49 RR4CX41JQ
BS 50 109 RR4D567JQ
BS 110 110 RR4CX41JQ
BS 111 132 RR4D567JQ
BS 133 133 RR4CX41JQ
BS 134 199 RR4D567JQ
BS 200 200 RR4CX41JQ
BS 201 229 RR4D567JQ
BS 230 230 RR4CX41JQ
BS 231 287 RR4D567JQ
BS 288 344 RR4CX41JQ
BS 345 345 RR4AD14TF
BS 346 494 RR4CX41JQ
BS 495 495 RR4AD14TF
BS 496 552 RR4CX41JQ
BS 553 553 RR4AD14TF
BS 554 738 RR4CX41JQ

RD RR4D567JQ 287 0 0
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TCAAATTCTTGCCAATGAAAACCAGCTTGTTGACTCTAGCCTCGTCTTTACCCCATAACC
GGTCTGGGGATCCTTGAAAGATGTCATGGACTCCTTGAAACACGAAT

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR4AD14JQ 123 0 0
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TGGACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCATGGGGTGGACCGAGAGCAGACCTTTCATC
CTG

QA 1 123 1 123
DS 

RD RR4AD14TF 610 0 0
GGTAG
AATAGAGTTAAGTGAAATAGAAAAACAAAAGTTTGTACTTTAGGACAACGGGGGATACAA
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GATTTAAAACCCTTCTCTAGCTCCTCACGGTTCAGATTCTTGCCAATGAAGACCAGCTTG
TTGACTCTAGCCTCGTCTTTGCCCCATAACCGGTCTGGGGATCCTTGAAAGATGTCATGG
ACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCATGGTGTGGACCGAGAGCAGACCTTTCATCCTG
TAGATATCCTCACTTCGTTCCATCAGTAACGTCCCTAGCCACATGTTTGCCTTCTCAAGG
TCTAAGCTCCCTTCGCAAACTATACTGACTGAAGAAACACCGGGATCATGGGTGTGATCA
TGATCATGAGAATGAGAATGATTATGCTCATGTTCATTGTGGTGACGATGGTCATGATGA
TCATGGTGATGTTCGTCGTGACACTCATTATGACCTTCCTTAACATCTTCGGTGGTCACA
GAGCTTTCGATTCTCTCCAGATCAAAACCTCCAATTCCAAGCACATAATCCAAGTCAACG
TTTCC

QA 6 610 6 610
DS 

RD RR4CX41JQ 731 0 0
C
TAGTGGAATAAAATTTAGTAGAATAGAGTTAAGTGAAATAGGAAAACAAAAGTTTGTACT
TTAGGACAACGGGGGATACAACATCTGCCGGAAATAGGATAGATTTGAATTGTAAATGAT
ACGAGAATTCAAATCAAGCAAGATTTAAAACCCTTCTCTAGCTCCTCACGGTTCAAATTC
TTGCCAATGAAGACCAGCTTGTTGACTCTAGTCTCGTCTTTGCCCCATAACCGGTCTGGG
GATCCTTGAAAGATGTCATGGACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCATGGTGTGGACC
GAGAGCAGACCTTTCATCCTGTAGATATCCTCACTTTGTTCCATCAGTAAAGTCCCTAGC
CACATGTTTGCCTTCTCAAGGTCTAAGCTCCCTTCGCAAACTATACTGACTGAAGAAACA
CCGGGATCATGGGTGTGATCATGATCATGAGAATGAGAATGATTATGCTCATGTTCATTG
TGGTGATGATGGTCATGATGATCATGGTGATGTTCGTCGTGACACTCATTATGACCTTCC
TTAATATCTTCGGTGGTCACAGAGCTTTCGATTCTCTCAAGATCAAAACCTCCAATTCCA
AGAACATAATCCAAGTCAACGTTTCCGTAATTTGTCCTCGTCATCTGAGCCATGCTGTTT
ATTGTCTTTATGCGTTGCACCACTGAACCTAACTCTGACTCACCAACAAGATCAATCTTG
TTAACTATGA

QA 2 731 2 731
DS 



AS 1 4

CO CL3526Contig1 903 4 27 U
GGAACCGTCCCGTCCCCGTCTTTATAGAAACGAAATAGATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCT
TCTCTTCTCCTCTCTGCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTCAATGTC
TTACGCTTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCT
TCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGGTGTTGA
ATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATAC
GGCTGGTCAAGAATTTTTCAGGTCTATTACAAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCAGGTGC
ATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGCTAGA
GGATGCGAGGCAGCATGCAAATGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAAGTCTGA
TCTTGACCACAGGAGGGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGG
TCTTATTTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATAAA
GACAGCGGCAACAATATACAAAAAGATCGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAATGAGTC
GTATGGAATTAAAGTTGGATATGGAGGAATCCCGGGGCCATCAGGTGGAAGAGACGGATC
CACATCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCGGCTAAGATGGGGAATAGTGTCTTTTTTATCATAT
AAGCAAAAATCTCTTCTGTTTAAACTATATAATAGTTGTAAATCGTTTGGTTTTCGGTTT
GGTGACTTGTCTTGTGGTGGATTTCGGATTATTCATTTATATATAATATGTGTTTTGCAT
ACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4A093TFB U 1
AF RR4A093TF U 1
AF RR4BO56TF U 74
AF RR4BO56JQ C 75
BS 1 314 RR4A093TF
BS 315 315 RR4BO56TF
BS 316 542 RR4A093TF
BS 543 543 RR4BO56TF
BS 544 701 RR4A093TF
BS 702 704 RR4BO56TF
BS 705 705 RR4BO56JQ
BS 706 737 RR4BO56TF
BS 738 738 RR4BO56JQ
BS 739 750 RR4BO56TF
BS 751 751 RR4BO56JQ
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BS 782 782 RR4BO56JQ
BS 783 788 RR4BO56TF
BS 789 789 RR4BO56JQ
BS 790 800 RR4BO56TF
BS 801 802 RR4BO56JQ
BS 803 811 RR4BO56TF
BS 812 812 RR4BO56JQ
BS 813 821 RR4BO56TF
BS 822 822 RR4BO56JQ
BS 823 833 RR4BO56TF
BS 834 834 RR4BO56JQ
BS 835 839 RR4BO56TF
BS 840 840 RR4BO56JQ
BS 841 856 RR4BO56TF
BS 857 903 RR4BO56JQ

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TCTCTTCTCCTCTCTGCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTCAATGTC
TTACGCTTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCT
TCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGGTGTTGA
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GGCTGGTCAAGAATCTTTCAGGTCTATTACAAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCAGGTGC
ATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGCTAGA
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TCCTATTTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGT

QA 1 582 1 582
DS 

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GGAACCGTCCCGTCCCCGTCTTTATAGAAACGAAATAGATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCT
TCTCTTCTCCTCTCTGCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTCAATGTC
TTACGCTTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCT
TCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGGTGTTGA
ATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATAC
GGCTGGTCAAGAATCTTTCAGGTCTATTACAAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCAGGTGC
ATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGCTAGA
GGATGCGAGGCAGCATGCAAATGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAAGTCTGA
TCTTGACCACAGGAGGGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGG
TCCTATTTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATAAA
GACAGCGGCAACAATATACAAAAAGATCGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAATGAGTC
GTATGGAATTAAAGTTGGATATGGAGGAATCCCGGGGCCAT

QA 1 701 1 701
DS 

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GG
GCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTCAATGTCTTACGCTTACCTCTT
CAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCTTCTGCTACAGTTCAC
GGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGGTGTTGAATTTGGGGCTAGGAT
GATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACGGCTGGTCAAGAATT
TTTCAGGTCTATTACAAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCAGGTGCATTGCTTGTCTATGA
TATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGCTAGAGGATGCGAGGCAGCA
TGCAAATGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAAGTCTGATCTTGACCACAGGAG
GGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATTTTCATGGA
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ATACAAAAAGATCGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAATGAGTCGTATGGAATTAAAGT
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CTGTT**AACTATATA*TAGTTGTAA*TCGTTTGGTTT*CGGTT*GGTGACTTGTCTTGT
G
TG

QA 3 783 3 783
DS 

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G
GCCTATCAATCATAGG*GGGGATCAGGGATCTCGATTTCAATGTCTTACGCTTACCTCTT
CAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCTTCTGCTACAGTTCAC
GGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGGTGTTGAATTTGGGGCTAGGAT
GATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACGGCTGGTCAAGAATT
TTTCAGGTCTATTACAAGGTCTTACTATAGAGGTGCTGCAGGTGCATTGCTTGTCTATGA
TATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGCTAGAGGATGCGAGGCAGCA
TGCAAATGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAAGTCTGATCTTGACCACAGGAG
GGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATTTTCATGGA
AGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATAAAGACAGCGGCAACAAT
ATACAAAAAGATCGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAATGAGTCGTATGGAATTAAAGT
TGGATATGGAGGAATCCCGGGGCCATCAGGTGGAAGAGACGGATCCACATCGCAAGGAGG
AGGTTGCTGCGGCTAAGATGGGGAATAGTGTCTTTTTTATCATATAAGCAAAAATCTCTT
CTGTTTAAACTATATAATAGTTGTAAATCGTTTGGTTTTCGGTTTGGTGACTTGTCTTGT
GGTGGATTTCGGATTATTCATTTATATATAATATGTGTTTTGCATACC

QA 2 829 2 829
DS 



AS 1 2

CO CL3527Contig1 1159 2 2 U
ACCGTTTCATAATCTCTGACTCGATTCTTAGTTCTCAGAGTTTTAGAGATTCTAAGTTTT
TCGCTTCTTAAATTTTTGTGTTAAAAAAAATTTTTTTTTTACAGAGAATTTGAAGGTGGA
AGGGTAAATTAAGAGGAGGATCATCGGGAGTAAAAGCAAACAAGATCATTATTGTTATCC
TTCTCTTCTCTCTCCTCTTAAATTCACACATAGCTGAGATTTTCTTTTTCAAATAAAGCA
ACAACCGATTTTCTTTGTGCAGGTAACGATGTTCGAGAATAGGTATTCGTTCAGAGGATC
TTCTTCCGCCGGCAAATACTCTTCGCCACCGCCGCCACAGACTGTCAATGTGGCACACCT
AAGAGTCGGATCTTATTACGAAATCGATCACTCTGTTCTCCCTCTCAGAGTCTCAGATCG
CCACAGCAACTCAAGTCCATCTGAATCGTCATGGTGAGCAAAATCACTAGAAGCGATTAA
CTCTCCTGGTGGAGAATGTATATGTGTAATAATCAATGTTTTTCCTGGTGGAGTACTGAA
TCATTAACTCTCCAAGCAGGAATCTATGTATATATGAGTTACTTTGCCCAGGAAAGAGAA
AGCGTGCCTTAAAGTTTATGGTTTGTATTTTTTTGGTTATTCTCGGGATTTAATGGTTTT
TGGTTTTCTCAATTTACAGCGAGAGAAAGGTTAGCTTTTTACTTGATGCGGAGGACACTA
TTGCTGAATACGAGAATAATGCAAAGGCGAAAAGAACAGAAAAACTGGAGAAACAGGAAG
GCGAAGCACTTGATCGTTTGAACAATCTCGACCATGTAACTAAAGTTGAGTTTTTACACC
GCCTCAATGACTTAAAAGGAGTCTGTTGGTACTTCAAGGGCGATAACGTCTGAAGATGTT
GAGCAGATGTTCTCAAAGATGAAAAATAAACGGAAAAGGATGGAGTGAGTTTAGTAGTCA
ATGATCAGAGGAGGTATGAGTATAATAAAGGTATTAAAGTCGTTTCGTTTACACATAAAG
ATGTGTGCTTCGTTAGTTCGTCTCCGCTCTTTTAACTACCTTTAGCTCCTAAGTTATGCA
AACAACTATGTACTTCAGGTATGGAGCTTGAAGCTTTTGTGTAACTGCTCTGATTAATTG
ATGTTATATTGGATTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT86TF U 1
AF RR4EU83JQ C 446
BS 1 689 RR4GT86TF
BS 690 1159 RR4EU83JQ

RD RR4GT86TF 689 0 0
ACCGTTTCATAATCTCTGACTCGATTCTTAGTTCTCAGAGTTTTAGAGATTCTAAGTTTT
TCGCTTCTTAAATTTTTGTGTTAAAAAAAATTTTTTTTTTACAGAGAATTTGAAGGTGGA
AGGGTAAATTAAGAGGAGGATCATCGGGAGTAAAAGCAAACAAGATCATTATTGTTATCC
TTCTCTTCTCTCTCCTCTTAAATTCACACATAGCTGAGATTTTCTTTTTCAAATAAAGCA
ACAACCGATTTTCTTTGTGCAGGTAACGATGTTCGAGAATAGGTATTCGTTCAGAGGATC
TTCTTCCGCCGGCAAATACTCTTCGCCACCGCCGCCACAGACTGTCAATGTGGCACACCT
AAGAGTCGGATCTTATTACGAAATCGATCACTCTGTTCTCCCTCTCAGAGTCTCAGATCG
CCACAGCAACTCAAGTCCATCTGAATCGTCATGGTGAGCAAAATCACTAGAAGCGATTAA
CTCTCCTGGTGGAGAATGTATATGTGTAATAATCAATGTTTTTCCTGGTGGAGTACTGAA
TCATTAACTCTCCAAGCAGGAATCTATGTATATATGAGTTACTTTGCCCAGGAAAGAGAA
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TGGTTTTCTCAATTTACAGCGAGAGAAAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4EU83JQ 714 0 0
TCGTCATGGTGAGCAAAATCACTAGAAGCGATTA*CTCTCCTGGTGGAGAATGTATATGT
GTAATAATCAATGTTTTTCCTGGTGGAGTACTGAATCATTAACTCTCCAAGCAGGAATCT
ATGTATATATGAGTTACTTTGCCCAGGAAAGAGAAAGCGTGCCTTAAGGTTTATGGTTTG
TATTTTTTTGGTTATTCTCGGGATTTAATGGTTTTTGGTTTTCTCAATTTACAGCGAGAG
AAAGGTTAGCTTTTTACTTGATGCGGAGGACACTATTGCTGAATACGAGAATAATGCAAA
GGCGAAAAGAACAGAAAAACTGGAGAAACAGGAAGGCGAAGCACTTGATCGTTTGAACAA
TCTCGACCATGTAACTAAAGTTGAGTTTTTACACCGCCTCAATGACTTAAAAGGAGTCTG
TTGGTACTTCAAGGGCGATAACGTCTGAAGATGTTGAGCAGATGTTCTCAAAGATGAAAA
ATAAACGGAAAAGGATGGAGTGAGTTTAGTAGTCAATGATCAGAGGAGGTATGAGTATAA
TAAAGGTATTAAAGTCGTTTCGTTTACACATAAAGATGTGTGCTTCGTTAGTTCGTCTCC
GCTCTTTTAACTACCTTTAGCTCCTAAGTTATGCAAACAACTATGTACTTCAGGTATGGA
GCTTGAAGCTTTTGTGTAACTGCTCTGATTAATTGATGTTATATTGGATTGTAC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL3528Contig1 1074 4 2 U
GTGGGAATCATTCAATGAAGCGTCTCCTTCTGCAAATGAAGCTGGTACGTTTGCAAGAAA
CGGGCTTGTGGAACAGATAAGCATGACTTGGGACAAGTCTGACTATTTCTGGTATCTAAC
AGACATCACAATTGGTGCTGGTGAGAGGTTTTTGAAGACTGGTGATTTGCCTCTTCTTAC
CGTCTGGTCAGCTGGACATGCTCTTCATGTGTTTGTAAATGGCCAGCTTGCAGGAAGTGC
TTATGGAGGGCTTTCTCACCCAAAACTAACCTTTAGCCAGAAGATCAAACTACACGCAGG
TGTCAACAAGCTTGCTCTGTTGAGTGTTGCAGTTGGTCTTCCGAATGTTGGTCAACACTT
TGAGACGTGGAATAAAGGGGTTCTTGGACCGGTCACACTGAAGGGAGTTAACTCGGGAAC
ATGGGATATGTCGAAATGGAAATGGTCCTATATGATTGGTGTGAAGGGTGAAGCTATGAG
TCTTCATACGGACAGTTCCTCTGTGAGATGGAATCAAGGATCATACGTGGCCAAGAAGCA
ACCATTGACCTGGTACAAGTCTATTTTTGCCGCACCAGCTGGAAATGAACCGTTGGCCAT
AGACATGAACACTATGGGGAAAGGTCTAGTTTGGATAAACGGTCGAAACATTGGACGTCA
TTGGCCTGCTTATAAAGCTCAAGGAAACTGTGGACGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGA
CGCAAAGAAATGCTTGAGTAATTGTGGTGAAGCTTCTCAAAGATGGTACCATATACCTCG
TTCATGGCTCAAGTCTCAGAACATTATAGTTGTGTTTGAAGAGTGGGGTGGTGATCCTTA
TGGAATCTCACTGGTGAAAAGAACCTGAAAGCTTCTTCTTGATTTTTATCCTGAGTTTTC
AAGACAAGTAAGATTGTTTGTCTCTCTTGGCTCTGCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGA
CAACTACAATAATTGAATTGTGCAGTTACTACAGCATATTATACAACATGTACATTACTG
TTTTTTTCCTTTTTGGTCAACTACATGTACATTACTGATCATCATAAATATTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DC10TF U 1
AF RR4D501TF U 1
AF RR4DC10JQ C 441
AF RR4D501JQ C 515
BS 1 679 RR4D501TF
BS 680 1074 RR4DC10JQ

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AGACATGAACACTATGGGG

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DS 

RD RR4D501TF 679 0 0
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CGGGCTTGTGGAACAGATAAGCATGACTTGGGACAAGTCTGACTATTTCTGGTATCTAAC
AGACATCACAATTGGTGCTGGTGAGAGGTTTTTGAAGACTGGTGATTTGCCTCTTCTTAC
CGTCTGGTCAGCTGGACATGCTCTTCATGTGTTTGTAAATGGCCAGCTTGCAGGAAGTGC
TTATGGAGGGCTTTCTCACCCAAAACTAACCTTTAGCCAGAAGATCAAACTACACGCAGG
TGTCAACAAGCTTGCTCTGTTGAGTGTTGCAGTTGGTCTTCCGAATGTTGGTCAACACTT
TGAGACGTGGAATAAAGGGGTTCTTGGACCGGTCACACTGAAGGGAGTTAACTCGGGAAC
ATGGGATATGTCGAAATGGAAATGGTCCTATATGATTGGTGTGAAGGGTGAAGCTATGAG
TCTTCATACGGACAGTTCCTCTGTGAGATGGAATCAAGGATCATACGTGGCCAAGAAGCA
ACCATTGACCTGGTACAAGTCTATTTTTGCCGCACCAGCTGGAAATGAACCGTTGGCCAT
AGACATGAACACTATGGGGAAAGGTCTAGTTTGGATAAACGGTCGAAACATTGGACGTCA
TTGGCCTGCTTATAAAGCT

QA 1 679 1 679
DS 

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CTATTTTTGCCGCACCAGCTGGAAATGAACCGTTGGCCATAGACATGAACACTATGGGGA
AAGGTCTAGTTTGGATAAACGGTCGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTATAAAGCTC
AAGGAAACTGTGGACGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGACGCAAAGAAATGCTTGAGTA
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TGCAGTTACTACAGCATATTATACAACATGTACATTACTGTTTTTTTCCTTTTTGGTCAA
CTACATGTACATTACTGATCATCATAAATATTTG

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DS 

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ATAAACGGTCGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTATAAAGCTCAAGGAAACTGTGGA
CGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGACGCAAAGAAATGCTTGAGTAATTGTGGTGAAGCT
TCTCAAAGATGGTACCATATACCTCGTTCATGGCTCAAGTCTCAGAACATTATAGTTGTG
TTTGAAGAGTGGGGTGGTGATCCTTATGGAATCTCACTGGTGAAAAGAACCTGAAAGCTT
CTTCTTGATTTTTATCCTGAGTTTTCAAGACAAGTAAGATTGTTTGTCTCTCTTGGCTCT
GCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGACAACTACAATAATTGAATTGTGCAGTTACTACAG
CATATTATACAACATGTACATTACTGTTTTTTTCCTTTTTGGTCAACTACATGTACATTA
CTGATCATCATAAATATTTG

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 4

CO CL3529Contig1 986 4 23 U
GCTCCGCGGAGAGCTTCAAGGTAGGGTTCATCGGAGCTGGAAAGATGGCGGAGAGTATAG
CCAGAGGCGTGGTCGCCTCCGGGATGCTTCCACCGAATCGTATCTCCACCGCCGTTCACT
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CGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAATGGTCTGGTCAAGATCGTTTCATAAGGGTGA
TGCCTAATACACCTGCTGCAGTTGGCGAGGCAGCTTCAGTAATGAGCCTTGGAACAGCGG
CTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTTTGGCTCGGTGGGGAAGATATTAA
GGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTTAGTGGAAGTGGACCAGCGTACA
TATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGTAGCTGCTGGTTTACCCCGAGAAC
TCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTCTTGGAGCTGCAACAATGGTAAGCAAAACCG
GGAAGCATCCTGGTGTGTTGAAAGATGATGTTACTTCACCAGGCGGGACAACAATAGCTG
GAGTTCATGAACTGGAGAAAGGTTCTTTCCGTGCAACACTTATGAATGCTGTTGTTGCAG
CAGCTAATCGAAGCCGCGAGCTCTCACAGAGCTAAATGACATAAAA*GAGAGTTGCTACT
ATTATTTCACCTCACAGATTCTT*CATCACAATAAGGGGTTATGATATTACTTTGGTAGG
TGTTGAGACTATTTATCTTGACTCTGTATTGGTTCAGATCTTAGCTACTTTGTTTTCATT
CTTATATCTAATAAAAACTTCATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ26TF U 1
AF RR4CM20JQ C 117
AF RR4CJ26JQ C 244
AF RR4BG03TF U 377
BS 1 193 RR4CJ26TF
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BS 905 918 RR4BG03TF
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BS 920 941 RR4BG03TF
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BS 950 981 RR4BG03TF
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RD RR4CJ26TF 631 0 0
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CCAGAGGCGTGGTCGCCTCCGGGATGCTTCCACCGAATCGTATCTCCACCGCCGTTCACT
CGAATCAGAATCGCCGTCAAGTCTTCGAGTCCTTTGGCGTCAATGTCTTCTCCAGTAGCG
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CGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAATGGTCTGGTCAAGATCGTTTCATAAGGGTGA
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CTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTTTGGCTCGGTGGGGAAGATATTAA
GGGCCGGTGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTTAGTGGAAGTGGACCAGCGTACA
TATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGTAGCTGCTGGTTTACCCCGAGAAC
TCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4CM20JQ 865 0 0
CGTCACTCGATCAGATCG
CGTCAAGTCTTCGAGTC*TTTGGCGTCAATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAA
GAAAGTGACGTTGTGATCTTCTCTGTGAAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATCACGGAA
GTAAGGTCAACGCTCTCCAAGGATAAGGTTCTTGTTTCTGTTGCAGCGGGGATCAAGTTG
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GCTGCAGTTGGCGAGGCAGCTTCAGTAATGAGCCTTGGAACAGCGGCTACAGAAGAAGAC
GGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTTTGGCTCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAA
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AAACTTC

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CCGGTGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTTAGTGGAAGTGGACCAGCGTACATAT
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CATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTCTTGGAGCTGCAACAATGGTAAGCAAAACCGGGA
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ATTTCACCTCACAGATTCTT*CATCACAATAAGGGGTTATGATATTACTTTGGTAGGTGT
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ATATCTAATAAAAACTTCATATG

QA 1 743 1 743
DS 

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G
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GAGCTCTCACAGAGCTAAATGACATAAAAAGAGAGTTGCTACTATTATTTCACCTCACAG
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CTTC
ACGT

QA 2 605 2 605
DS 



AS 1 4

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TTAAAATATATTTCAATGGAGAGTAGTCATCTAAGTGGTAAAGAAACTGATTCTGCTGGT
GAGGATGAATCTAGTTTGCAAGTTTCAGGTGAAACCAGTTTGTTAAGTCAGAAGTCAGAT
GAGTTTTTAGCTGAGGAAAAAGATGTTACACTCAATGATGATGATGCTTTCAGCGATGAG
GATGCTTCAGTCAGTGATGACGATGAAGAAAAGGACATATGCAACAACGAGGATTATCTT
CAGACTGAAGATGTTGATTCTTTAGAGGCAAGTAATGAAAATCAGAAAAAATCTGAACTA
TGCATCGGAATGGAGTTTAGCTCTGATGAGTCTGCATATAAAGCTTATAGAAAGTATGGA
GGAAATCATGGTTTCGACGTGAGGAGACAGCGGACTTCGAGAAAAAACCAGAAGCTAGTA
AGGATGGTATAAGCCAGACAGTTCTTGGACCATTCTTGCCAAGATTGAAATACTTTCAGT
GACCAATAAAAGTTTTATTATAAAACGGTGAACAGATCTTCTTAATTAAGTTTTAGAGTA
ACCCTGAGAATAGTTTTATCATCTATGTTTAATGGCAGAAAATAAAGGTCTGAGAACATG
AAAGCAAAACAGGACATAGTAAAGCTTTAAAAGAACAGAGCAAGGACATAAAATCTAAAC
CTAAAGCAAATAGAGTTTTAACCTCGGCACTACACAAGCGATTCGAGCTTTAACGGTGGA
GCACCAATCTCAGATGATCATGAAAATTATTTCGTTTATAGAACAAGCGTGTTGGTCAAA
AGAACAAAAATTAATGAGAGTCCAAACCACTAGCTTCTTAAGTCTATATGTTCTTATTGA
TATTCACGTTTCTTCTTTACTCTTCCGTTTCTTGCGCCTCAAGTCTCTTCTTCTTCTTCC
TTCCTTGTAACTTGTTCTCTGCTACTCTTCTTTGCTTTTATTATTAGGAACTTCTTCTTA
GATCAACGTTTGTAGATATAATCAAAAGTTTATTTACAATAAAAAATTTATCTTTTAACT
TGATGCTCTTCTTCTCCATCTTCTTCTTTGTTATTTGATACTCTGTCCTAAGCTTATGAT
CACATCATACATAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FX75TF U 1
AF RR4GG46TF U 1
AF RR4FX75JQ C 378
AF RR4GG46JQ C 393
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BS 710 1155 RR4FX75JQ

RD RR4FX75TF 709 0 0
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QA 1 709 1 709
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GATGCTTCAGTCAGTGATGACGATGAAGAAAAGGACATATGCAACAACGAGGATTATCTT
CAGACTGAAGATGTTGATTCTTTAGAGGCAAGTAATGAAAATCAGAAAAAATCTGAACTA
TGCATCGGAATGGAGTTTAGCTCTGATGAGTCTGCATATAAAGCTTATAGAAAGTATGGA
GGAAATCATGGTTTCGACGTGAGGAGACAGCGGACTTCGAGAAAAAACCAGAAGCTAGTA
AGGATGGTATAAGCCAGACAGTTCTTGGACCATTCTTGCCAAGATTGAAATACTTTCAGT
GACCAATAAAAGTTTTATTATAAAACGGTGAACAGATCTTCTTAATTAAGTTTTAGAGTA
ACCCTGAGAATAGTTTTATCATCTATGTTTAATGGCAGAAAATAAAGGTCTGAGAACATG
AAAGCAAA*CAGGACATAGTAAAGCTTTA

QA 1 689 1 689
DS 

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GAGTCCAAACCACTAGCTTCTTAAGTCTATATGTTCTTATTGATATTCACGTTTCTTCTT
TACTCTTCCGTTTCTTGCGCCTCAAGTCTCTTCTTCTTCTTCCTTCCTTGTAACTTGTTC
TCTGCTACTCTTCTTTGCTTTTATTATTAGGAACTTCTTCTTAGATCAACGTTTGTAGAT
ATAATCAAAAGTTTATTTACAATAAAAAATTTATCTTTTAACTTGATGCTCTTCTTCTCC
ATCTTCTTCTTTGTTATTTGATACTCTGTCCTAAGCTTATGATCACATCATACATAGC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4GG46JQ 763 0 0
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TTCTTGCCAAGATTGAAATACTTTCAGTGACCAATAAAAGTTTTATTATAAAACGGTGAA
CAGATCTTCTTAATTAAGTTTTAGAGTAACCCTGAGAATAGTTTTATCATCTATGTTTAA
TGGCAGAAAATAAAGGTCTGAGAACATGAAAGCAAAACAGGACATAGTAAAGCTTTAAAA
GAACAGAGCAAGGACATAAAATCTAAACCTAAAGCAAATAGAGTTTTAACCTCGGCACTA
CACAAGCGATTCGAGCTTTAACGGTGGAGCACCAATCTCAGATGATCATGAAAATTATTT
CGTTTATAGAACAAGCGTGTTGGTCAAAAGAACAAAAATTAATGAGAGTCCAAACCACTA
GCTTCTTAAGTCTATATGTTCTTATTGATATTCACGTTTCTTCTTTACTCTTCCGTTTCT
TGCGCCTCAAGTCTCTTCTTCTTCTTCCTTCCTTGTAACTTGTTCTCTGCTACTCTTCTT
TGCTTTTATTATTAGGAACTTCTTCTTAGATCAACGTTTGTAGATATAATCAAAAGTTTA
TTTACAATAAAAAATTTATCTTTTAACTTGATGCTCTTCTTCTCCATCTTCTTCTTTGTT
ATTTGATACTCTGTCCTAAGCTTATGATCACATCATACATAGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

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AGTAGACCTTGTTGTTTTGTTTTATTGCAAGAATTCTAAATTCATGACTTGTAGGGAGGG
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GTATAAATTGAATTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGC
ATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGC
TGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGACCG
TTACAAAGGCCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGC
GTATGTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGGTCTGTTACTAACATGTTTACCTC
AATTGTGGGTAACGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCG
AATCCCTCCGGCTTATACTAAAACTTTCCAGGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAG
AGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCTAAGTTGGG
GTTATCCGCGAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTT
TACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTT
ATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTA
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ATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAG
TTTGGCTCATTACTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGC
TGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACG
TCTATCGGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGTAAACTTGAAGGAGACAGG
AGTCACTTTGGGCTTGTTGATTTACTGCGCGATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE96TF U 1
AF RR4AN91TF U 52
AF RR4AN91JQ C 86
AF RR4H630TF U 365
BS 1 109 RR4BE96TF
BS 110 810 RR4AN91TF
BS 811 811 RR4H630TF
BS 812 817 RR4AN91TF
BS 818 1176 RR4H630TF

RD RR4BE96TF 109 0 0
ATAATTTTGTGAAAGATTCCTGTGAAAAAGGTTAATTAAATCTATTCCTAATTTATGTCG
AGTAGACCTTGTTGTTTTGTTTTATTGCAAGAATTCTAAATTCATGACT

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR4AN91TF 766 0 0
AGGG
TGTCGAGTAGACCTTGTTGTTTTGTTTTATTGCAAGAATTCTAAATTCATGACTTGTAGG
GAGGGACTTATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTT
AAAGAGTATAAATTGAATTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTG
GCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTA
GCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTT
GACCGTTACAAAGGCCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTT
ATTGCGTATGTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGGTCTGTTACTAACATGTTT
ACCTCAATTGTGGGTAACGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGAT
CTGCGAATCCCTCCGGCTTATACTAAAACTTTCCAGGGACCACCTCATGGTATCCAAGTT
GAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCTAAG
TTGGGGTTATCCGCGAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTT
GATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGT
TTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACACGCTGAA

QA 5 766 5 766
DS 

RD RR4AN91JQ 792 0 0
TGCAAGAATTCTAAATTCATGACTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACAGAGACT
AAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTATAAATTGAATTATTATACTCCT
GAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGA
GTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACA
ACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGACCGTTACAAAGGCCGATGCTACCACATC
GAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATGTAGCTTACCCCTTAGACCTT
TTTGAAGAAGGGTCTGTTACTAACATGTTTACCTCAATTGTGGGTAACGTATTTGGGTTC
AAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCCTCCGGCTTATACTAAAACT
TTCCAGGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGT
CCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCTAAGTTGGGGTTATCCGCGAAGAACTATGGTAGA
GCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAAC
TCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAA
TCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTATTTGAATGCTACTGCGGGTACATGC
GAAGAAATGA
CG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4H630TF 812 0 0
G
AAGGCCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATG
TAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGGTCTGTTACTAACATGTTTACCTCAATTG
TGGGTAACGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCC
CTCCGGCTTATACTAAAACTTTCCAGGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATA
AATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCTAAGTTGGGGTTAT
CCGCGAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCA
AATATGATGAGAATGTGAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTT
GTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTATTTGA
ATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATGAAAAGAGCTATATTTGCCAGAGAATTGG
GAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTGG
CTCATTACTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTTA
TTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTAT
CGGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGTAAACTTGAAGGAGACAGGAGTCA
CTTTGGGCTTGTTGATTTACTGCGCGATGAT

QA 2 812 2 812
DS 



AS 1 3

CO CL3532Contig1 623 3 8 U
GGGTGCTCCATCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGT
TTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGCCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACGGTGGAGAACT
TTCTTGAACGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATC
ACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAAGTGGTGGACATTC
CTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCT
TCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAG
CCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGC
TTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCA
GACCATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGCCGAAACTTTCTCGAGTTATATTTTATTTTCA
GACATAATATGATCGTTCTTGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO75JQ C 1
AF RR4FW55TF U 192
AF RR4BO75TF U 1
BS 1 196 RR4BO75TF
BS 197 293 RR4FW55TF
BS 294 294 RR4BO75TF
BS 295 327 RR4FW55TF
BS 328 328 RR4BO75TF
BS 329 605 RR4FW55TF
BS 606 607 RR4BO75TF
BS 608 623 RR4BO75JQ

RD RR4BO75JQ 623 0 0
GGGTGCTCCATCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGT
TTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGCCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACGGTGGAGAACT
TTCTTGAACGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATC
ACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAAGTGGTGGACATTC
CTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCT
TCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAG
CCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCCCCTGC
TTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCA
GACCATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGCCGAAACTTTCTCGAGTTATATTTTATTTTCA
GACATAATATGATCGTTCTTGCT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4FW55TF 414 0 0
GGTCT
TCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCAT
CAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAAGTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAG
ACTTGACTCGCTGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCC
AGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGC
TGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCA
CTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCAGACCATTGTTTTGTGG
TTTCTTTGTGTGCCGAAACTTTCTCGAGTTATATTTTATTTTCAGACAT

QA 6 414 6 414
DS 

RD RR4BO75TF 623 0 0
GGGTGCTCCATCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGT
TTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGCCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACGGTGGAGAACT
TTCTTGAACGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATC
ACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCGAGTGGTGGACATTC
CTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCT
TCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAG
CCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGC
TTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCA
GACCATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGCCGAAACTTTCTCGAGTTATATTTTATTTTCA
GACATAA
TATGATCGTTCTTGCT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

CO CL3533Contig1 695 4 6 U
TTTTTTTTTCTGGAGAAATCAAATCATAAACTCAAATGTGTGAACTTTACAACAAGTTTT
TCAAAGTAAAACAAACAAACAATTAATCTGAAAATCATCTCTTGGTGAAACGTATGTAGC
TATCATTTTCCAACAGTGAGATATTGCAGTAGTAAAAAAAACACTCTTTCTTTCTTTTAC
TCTCTTCAAATCAATTAGCTCTGACTCTTTGAATGTAAATCAGCTTTTGGTGGCGGCTCT
CGGTTTATATATAACTAACCGGATCGAAACCTCTTCTGGTTAGCTTTCCCATCCGATTTC
AAGGTTCCACTAGATTCACCTTCCGATGAAGCCTCCATCGATCTTGCGAAAGAATGAGAG
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ACGTTTCGACCCAGGTTATCAGGCTGTTTGGACTCGTGGTTCTGATTGATCTCGTTGATC
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BQ
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AF RR4BE14TF C 6
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TATTTTTAGCAATAATTTATAGTCC

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CCCAG
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ATAACTAACCGGATCGAAACCTCTTCTGGTTAGCTTTCCCATCCGATTTCAAGGTTCCAC
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AGAGGCTAGCCACTCTTCTGATGTTGTTGTTGAGCTCTTTGATGAGACCGACGTTTCGAC
CCAGGTTATCAGGCTGTTTGGACTCGTGGTTCTGATTGATCTCGTTGATCAACAGCCGGT
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CATCCATGTTGTGTCTCTCTCCAAAGCCTGAGAACACATCTCCTTCCATCTTCAGAGCCA
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TATTTTTAGCAATAATTTATAGTCC

QA 6 690 6 690
DS 



AS 1 4

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A


BQ
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10 

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BS 477 477 RR4DJ77TF
BS 478 575 RR4DQ27TF
BS 576 576 RR4DJ77TF
BS 577 647 RR4DQ27TF
BS 648 648 RR4DJ77TF
BS 649 681 RR4DQ27TF
BS 682 772 RR4DJ77TF
BS 773 773 RR4E413TF
BS 774 1170 RR4DJ77TF
BS 1171 1201 RR4E413TF

RD RR4DQ27TF 683 0 0
GGGTCCGCTCGGTAATAGTTTTAAGGTTGTTCTCTGTGAGAATCAACCGATGTCGGCTTC
ATGTGCTGTTACACCGTCTGTTAGAACAGAACTATTCAGCTCATTATCAAAAAGGCCCAC
CTTTCCTGCTCGTCAACCAAGGAACAAATGTGAAATCAGCAGAAGGGGTTTTACAGTGAG
AGGGATCGTTGCTTCTGGAGTTTCAGTCATGGGTACTCCTCCTCCTTCACCATCAGCTGC
TTCTCGGCCAATTCAAGGTGGGGAGAGATTAGCTTTTAAGCCAGAAGGATATAACTTTTG
GGAATGGAGAGGTCACAAGATTCATTATGTGGTTCAAGGAGAAGGCTTGCCTCTTGTTCT
TATTCATGGCTTTGGTGCTTCTGTCTTTCACTGGAGGTATAACATTCCTGAACTGGCAAA
GAAGTACAAAGTGTACGCCTTGGACTTACTCGGTTTCGGATGGAGTGACAAAGCTCTCAT
AGAGTATGATGCCATGGTTTGGACTGATCAAGTTATTGACTTCATCAAAGAGATTGTCAA
AGAGCCTTCTGTTGTCGTTGGAAACAGCCTGGGGGGATTCACAGCTTTGTCAGTTGCGGT
GGGATTACCAGAGCAAGTCACTGGAGTTGCGCTTCTAAACTCTGCAG*ACAGTTTGCATC
CGAGAGTAGAAAGCAAGAGGA
GC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4DJ77JQ 240 0 0
TACATAAACGCTGCTAACGTTGATGACTACCTCGTTGAATCCATTTCAAAACCTGCAACA
GACCCAAACGCTGGAGAAGTTTACTACAGATTGATGATAAGGTTTTTAACGAACCAGAGT
AGGTATACGTTGGATAGTGTTTTAAGTAAGATGACTTGTCCGCTTTTGTTGCTTTGGGGA
GATCTTGACCCGTGGGTTGGTCCTGCTAAAGCCGAGAAAATCAAAGCGTTTTACTCCAAC

QA 1 240 1 240
DS 

RD RR4DJ77TF 735 0 0
G
GGACTTACTCGGTTTCGGATGGAGTGACAAAGCTCCCATAGAGTATGATGCCATGGTTTG
GACTGATCAAGTTATTGACTTCATCAAAGAGATTGTCAAAGAGCCTTCTGTTGTCGTTGG
AAACAGCCTGGGGGAATTCACAGCTTTGTCAGTTGCGGTGGGATTACCAGAGCAAGTCAC
TGGAGTTGCGCTTCTAAACTCTGCAGGACAGTTTGCATCCGAGAGTAGAAAGCAAGAGGA
AGCTGAGGAGCCCTCCGCGTTAACCAAGTTTATAGTTAAGCCACTCAAAGAGATCTTCCA
ACGCGTGGTTCTTGGGTTCTTGTTCTGGCAATCCAAGCAGCCTTCTCGTATCGAATCTGT
CTTAAAGAGTGTGTACATAAACGCTGCTAACGTTGATGACTACCTCGTTGAATCCATTTC
AAAACCTGCAACAGACCCAAACGCTGGAGAAGTTTACTACAGATTGATGATAAGGTTCTT
AACGAACCAGAGTAGGTATACGTTGGATAGTGTTCTAAGTAAGATGACTTGTCCGCTTCT
GTTGCTTTGGGGAGATCTTGACCCGTGGGTTGGTCCTGCTAAAGCCGAGAAAATCAAAGC
GTTTTACTCCAACTCGTCGCTGGTGCACTTACAAGCAGGGCATTGTCCTCATGACGAGGT
CCCTGAAGCTGTAAACGTAGCTTTGTTGGATTGGTTGTCTAATGTAGTTTCCAAACCATC
CTCCCCTGA
GTCTC

QA 2 730 2 730
DS 

RD RR4E413TF 598 0 0
ATTACCAGAGCAAGTCACTGGAGTTGCGCTTCTAAACTCTGCAGGACAGTTTGCATCCGA
GAGTAGAAAGCAAGAGGAAGCTGAGGAGCCCTCCGCGTTAACCAAGTTTATAGTTAAGCC
ACTCAAAGAGATCTTCCAACGCGTGGTTCTTGGGTTCTTGTTCTGGCAAGCCAAGCAGCC
TTCTCGTATCGAATCTGTCTTAAAGAGTGTGTACATAAACGCTGCTAACGTTGATGACTA
CCTCGTTGAATCCATTTCAAAACCTGCAACAGACCCAAACGCTGGAGAAGTTTACTACAG
ATTGATGACAAGGTTCTTAACGAACCAGAGTAGGTATACGTTGGATAGTGTTCTAAGTAA
GATGACTTGTCCGCTTCTGTTGCTTTGGGGAGATCTTGACCCGTGGGTTGGTCCTGCTAA
AGCCGAGAAAATCAAAGCGTTTTACTCCAACTCGTCGCTGGTGCACTTACAAGCAGGGCA
TTGTCCTCATGACGAGGTCCCTGAAGCTGTAAACGTAGCTTTGTTGGATTGGTTGTCTAA
TGTAGTTTCCAAACCATCCTCCCCTGAAGTCTCAGAGTGTAAAGACTTTTTTTTTTAA

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL3535Contig1 845 2 2 U
GAAGTCAGGTTCTACCGCAACTATGGCAAGACCTTCAAGAAGCCGCGACGTCCTTACGAG
AAGGAGCGTCTTGACGCCGAGCTGAAGCTTGTCGGAGAATACGGTCTTCGTTGCAAGAGA
GAGCTGTGGAGGGTTCAGTACGCGCTTAGCCGTATCCGCAACGCTGCCAGAGAGCTTCTC
ACCCTCGACGAGAAAAACCCTCGTCGGATCTTTCAAGGTGAAGCTCTTCTTAGGAGGATG
AACACGAATGGGCTTCTTGATGAATCCCAGAACAAGCTCGACTACATTCTTGCTTTGACT
GTTGAGAATTTCCTCGAGCGCCGTCTCCAGACTCTTGTCTTCAAGTCCGGTATGGCCAAG
TTCATTCACCACGCCCGTGTCCTTATCCGACAAAGACACATCAGGGTTGGGAGGCAACTG
GTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAAAGTAGACTCGCAGAAACACATTGACTTTTCTCTG
ACCAGTCCATTTGGTGGTGGTCGACCTGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAGAGCTGGA
GCCAAGAAAGCCGGTGGTGGTGGTGATGGAGATGAGGATGATGAAGAGTGAAAGTACCAA
ACCTTTTAAAACCCTCCATTGTTAGATAAATAATGTATTTGGAGTTGTTTTCTTGAACTA
GATGAAGTCAAGTGTGTTGGTTTGTAATGGATTTAGCCTTTATGTGGTGTGTGTTTTGCA
ATAATGTGGTAGTGGACCTCTATGTTCTTGCTTGAACAATGATGCCACTTTCAGATCTTG
CTCCTCTACTCTGGTTTTACTTTTGTATTTGCTCTTGTTTCTTTAAGTAATGTATGTTGT
GGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4CI70TF U 1
AF RR4CI70JQ C 58
BS 1 659 RR4CI70TF
BS 660 845 RR4CI70JQ

RD RR4CI70TF 665 0 0
GAAGTCAGGTTCTACCGCAACTATGGCAAGACCTTCAAGAAGCCGCGACGTCCTTACGAG
AAGGAGCGTCTTGACGCCGAGCTGAAGCTTGTCGGAGAATACGGTCTTCGTTGCAAGAGA
GAGCTGTGGAGGGTTCAGTACGCGCTTAGCCGTATCCGCAACGCTGCCAGAGAGCTTCTC
ACCCTCGACGAGAAAAACCCTCGTCGGATCTTTCAAGGTGAAGCTCTTCTTAGGAGGATG
AACACGAATGGGCTTCTTGATGAATCCCAGAACAAGCTCGACTACATTCTTGCTTTGACT
GTTGAGAATTTCCTCGAGCGCCGTCTCCAGACTCTTGTCTTCAAGTCCGGTATGGCCAAG
TTCATTCACCACGCCCGTGTCCTTATCCGACAAAGACACATCAGGGTTGGGAGGCAACTG
GTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAAAGTAGACTCGCAGAAACACATTGACTTTTCTCTG
ACCAGTCCATTTGGTGGTGGTCGACCTGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAGAGCTGGA
GCCAAGAAAGCCGGTGGTGGTGGTGATGGAGATGAGGATGATGAAGAGTGAAAGTACCAA
ACCTTTTAAAACCCTCCATTGTTAGATAAATAATGTATTTGGAGTTGTTTTCTTGAACT
AGATGA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4CI70JQ 788 0 0
CGAG
AGGAGCGTCTTGACGCCGAGCTGAAGCTTGTCGGAGAATACGGTCTTCGTTGCAAGAGAG
AGCTGTGGAGGGTTCAGTACGCGCTTAGCCGTATCCGCAACGCTGCCAGAGAGCTTCTCA
CCCTCGACGAGAAAAACCCTCGTCGGATCTTTCAAGGTGAAGCTCTTCTTAGGAGGATGA
ACACGAATGGGCTTCTTGATGAATCCCAGAACAAGCTCGACTACATTCTTGCTTTGACTG
TTGAGAATTTCCTCGAGCGCCGTCTCCAGACTCTTGTCTTCAAGTCCGGTATGGCCAAGT
TCATTCACCACGCCCGTGTCCTTATCCGACAAAGACACATCAGGGTTGGGAGGCAACTGG
TGAACATTCCATCGTTCATGGTGAAAGTAGACTCGCAGAAACACATTGACTTTTCTCTGA
CCAGTCCATTTGGTGGTGGTCGACCTGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAGAGCTGGAG
CCAAGAAAGCCGGTGGTGGTGGTGATGGAGATGAGGATGATGAAGAGTGAAAGTACCAAA
CCTTTTAAAACCCTCCATTGTTAGATAAATAATGTATTTGGAGTTGTTTTCTTGAACTAG
ATGAAGTCAAGTGTGTTGGTTTGTAATGGATTTAGCCTTTATGTGGTGTGTGTTTTGCAA
TAATGTGGTAGTGGACCTCTATGTTCTTGCTTGAACAATGATGCCACTTTCAGATCTTGC
TCCTCTACTCTGGTTTTACTTTTGTATTTGCTCTTGTTTCTTTAAGTAATGTATGTTGTG
GTCT

QA 5 788 5 788
DS 



AS 1 4

CO CL3536Contig1 949 4 10 U
GGAGACTCGGGAAAGCCAACAAAGTAGACCAAGACATCAAAGCGAAGTTCTAATAAGAAA
GGATCTTCTGGAAGTAAGCATAAGAATTTAGATGCCTTACGAAGGGATGAAGACCCAATT
CCTACTACGCCAAAAGGGAAAAGAACTCCAAAGAAATACACAAGACATAAGCACCCTGAA
GAAACACCAGGAAGTCCCTCTTTAGAACATGAGAAACTAGAGAGCAGAACCAAGAAAAAC
CGATCTACTGCCATTATAGTCGGTGAAGTTGCTGAAAAAACAAATGAAAAGAATGTGGAA
TCAACCACAGAGCAGATGACAGAGGATGAGGAATATGGTAATAAGGAGGCTGGCGAAGAG
AAACCAGAGTCGGAAGGAAAGTCGTGGAAAGAAGGCGAGGATGATGATGAGGAAGTTGAT
TTACAGGAGGCAAAAGCAGAGTCGAGTGGAAACCCTGAGGGAAAAGAAACTGATATTGAC
AACTCAGGTTCTGAGAAGAAACAAGAAAACGATGATATGGAGACAGAAGCTGAAGCTGAA
GATGAAGATGATGAAGG*AGATGCTGACGCATCTGACAATGAGACTCTTGGAGCATGGAG
AA*GTAAAGTGGTCAAGTCAAGCTCCAAGAAAGCAGCATAGGTGTGTCCTATACCATTAT
GTAGAAGAAATACAGAGAATAGAATTTGCGGTGTTTGTCCCCAAGTATTGGTGGTCTCTG
CATTGATGTGGTGTATATGTGAGATTTGTAGGGTTAGTGATACATACTTGTTCTAACCAC
CATGATGGAATGAATGAATAACACGCAAAACAAGCTCCTCGAGACATTTTATGTACTCAT
GTATTGTAGTATCTATATGTGTGTTTATTTGTAGGGTTGTTTCATGTTTTATGTAATACT
TGACCACTCTTATTACATTCCTAAACCCAAAGTGCTCCCTTTTGAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4CO41TF U 1
AF RR4CO41JQ C 194
AF RR4AU94TF U 212
AF RR4AU94JQ C 220
BS 1 509 RR4CO41TF
BS 510 510 RR4AU94TF
BS 511 511 RR4CO41TF
BS 512 512 RR4AU94TF
BS 513 557 RR4CO41TF
BS 558 558 RR4AU94TF
BS 559 602 RR4CO41TF
BS 603 603 RR4AU94TF
BS 604 629 RR4CO41TF
BS 630 949 RR4AU94TF

RD RR4CO41TF 629 0 0
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GGATCTTCTGGAAGTAAGCATAAGAATTTAGATGCCTTACGAAGGGATGAAGACCCAATT
CCTACTACGCCAAAAGGGAAAAGAACTCCAAAGAAATACACAAGACATAAGCACCCTGAA
GAAACACCAGGAAGTCCCTCTTTAGAACATGAGAAACTAGAGAGCAGAACCAAGAAAAAC
CGATCTACTGCCATTATAGTCGGTGAAGTTGCTGAAAAAACAAATGAAAAGAATGTGGAA
TCAACCACAGAGCAGATGACAGAGGATGAGGAATATGGTAATAAGGAGGCTGGCGAAGAG
AAACCAGAGTCGGAAGGAAAGTCGTGGAAAGAAGGCGAGGATGATGATGAGGAAGTTGAT
TTACAGGAGGCAAAAGCAGAGTCGAGTGGAAACCCTGAGGGAAAAGAAACTGATATTGAC
AACTCAGGTTCTGAGAAGAAACAAGAAAATGTTGATATGGAGACAGAAGCTGAAGCTGAA
GATGAAGATGATGAAGGGAGATGCTGACGCATCTGACAATGAGACTCTTGGAGCATGGAG
AAAGTAAAGTGGTCAAGTCAAGCTCCAAG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4CO41JQ 756 0 0
GTCCCTCTTTAGAACATGAGAAACTAGAGAGCAGAACCAAGAAAAACCGATCTACTGCCA
TTATAGTCGGTGAAGTTGCTGAAAAAACAAATGAAAAGAATGTGGAATCAACCACAGAGC
AGATGACAGAGGATGAGGAATATGGTAATAAGGAGGCTGGCGAAGAGAAACCAGAGTCGG
AAGGAAAGTCGTGGAAAGAAGGCGAGGATGATGATGAGGAAGTTGATTTACAGGAGGCAA
AAGCAGAGTCGAGTGGAAACCCTGAGGGAAAAGAAACTGATATTGACAACTCAGGTTCTG
AGAAGAAACAAGAAAATGTTGATATGGAGACAGAAGCTGAAGCTGAAGATGAAGATGATG
AAGG*AGATGCTGACGCATCTGACAATGAGACTCTTGGAGCATGGAGAA*GTAAAGTGGT
CAAGTCAAGCTCCAAGAAAGCAGCATAGGTGTGTCCTATTCCATTATGTAGAAGAAATAC
AGAGAATAGAAGTTGCGGTGTTTGTCCCCAAGTATTGGTGGTCTCTGCATTGATGTGGTG
TATATGTGAGATTTGTAGGGTTAGTGATACATACTTGTTCTAACCACCATGATGGAATGA
ATGAATAATACGCAAAACAAGCTCCTCAAGACATTTTATGTGCTCATGTATTGTAGTATC
TATATGTGTGTTTATTTGTAGGGTTGTTTCATGTTTTCTGTAATACTTGACCACTCTTAT
TACATTCCTAAACCCAAAGTGCTCCCTTTTGAACTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4AU94TF 738 0 0
G
GAAACTAGAGAGCAGAACCAAGAAAAACCGATCTACTGCCATTATAGTCGGTGAAGTTGC
TGAAAAAACAAATGAAAAGAATGTGGAATCAACCACAGAGCAGATGACAGAGGATGAGGA
ATATGGTAATAAGGAGGCTGGCGAAGAGAAACCAGAGTTGGAAGGAAAGTCGTGGAAAGA
AGGCGAGGATGATGATGAGGAAGTTGATTTACAGGAGGCAAAAGCAGAGTCGAGTGGAAA
CCCTGAGGGAAAAGAAACTGATATTGACAACTCAGGTTCTGAGAAGAAACAAGAAAACGA
TGATATGGAGACAGAAGCTGAAGCTGAAGATGAAGATGATGAAGG*AGATGCTGACGCAT
CTGACAATGAGACTCTTGGAGCATGGAGAA*GTAAAGTGGTCAAGTCAAGCTCCAAGAAA
GCAGCATAGGTGTGTCCTATACCATTATGTAGAAGAAATACAGAGAATAGAATTTGCGGT
GTTTGTCCCCAAGTATTGGTGGTCTCTGCATTGATGTGGTGTATATGTGAGATTTGTAGG
GTTAGTGATACATACTTGTTCTAACCACCATGATGGAATGAATGAATAACACGCAAAACA
AGCTCCTCGAGACATTTTATGTACTCATGTATTGTAGTATCTATATGTGTGTTTATTTGT
AGGGTTGTTTCATGTTTTATGTAATACTTGACCACTCTTATTACATTCCTAAACCCAAAG
TGCTCCCTTTTGAACTC

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4AU94JQ 730 0 0
GAGAGCAGAACCAAGAAAAACCGATCTACTGCCATTATAGTCGGTGAAGTTGCTGAAAAA
ACAAATGAAAAGAATGTGGAATCAACCACAGAGCAGATGACAGAGGATGAGGAATATGGT
AATAAGGAGGCTGGCGAAGAGAAACCAGAGTTGGAAGGAAAGTCGTGGAAAGAAGGCGAG
GATGATGATGAGGAAGTTGATTTACAGGAGGCAAAAGCAGAGTCGAGTGGAAACCCTGAG
GGAAAAGAAACTGATATTGACAACTCAGGTTCTGAGAAGAAACAAGAAAACGATGATATG
GAGACAGAAGCTGAAGCTGAAGATGAAGATGATGAAGG*AGATGCTGACGCATCTGACAA
TGAGACTCTTGGAGCATGGAGAA*GTAAAGTGGTCAAGTCAAGCTCCAAGAAAGCAGCAT
AGGTGTGTCCTATACCATTATGTAGAAGAAATACAGAGAATAGAATTTGCGGTGTTTGTC
CCCAAGTATTGGTGGTCTCTGCATTGATGTGGTGTATATGTGAGATTTGTAGGGTTAGTG
ATACATACTTGTTCTAACCACCATGATGGAATGAATGAATAACACGCAAAACAAGCTCCT
CGAGACATTTTATGTACTCATGTATTGTAGTATCTATATGTGTGTTTATTTGTAGGGTTG
TTTCATGTTTTATGTAATACTTGACCACTCTTATTACATTCCTAAACCCAAAGTGCTCCC
TTTTGAACTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL3537Contig1 791 2 19 U
GGAAAGACTTTAATTAAGAGCTAAGAAACACACAGACAGCGAAACCAGATCGGAAGCCAT
GGCGGATTTGGAAGATGTTCAGACCGTGGATCTCATGTCCGAACTCCTCCGCCGTCTCAA
ATGTTCACAGAAACCTGACAAACGCCTCATCTTCATAGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGG
TACACAATCTCCAATAGTGAAGGATGAGTTTTGCTTGTGTCATCTATCCACTGGAGACAT
GTTAAGAGCTGCTGTTGCTTCTAAAACCCCTCTTGGTCTCAAAGCCAAAGAAGCTATGGA
CACGGGAGCGCTTGTCACTGATGAATTGGTTGTTGGTATAATTGATGAAGCCATGAACAA
GCCAAAATGTCAGAAAGGCTTTATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCAGGCTGA
GAAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTAAACTTTGC
TATCGATGACTCAGTCCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGG
CAGGAGCTACCACACCAAATTTGCGCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATTACCGG
AGAGCCTCTGATCCAACGGAAAGATGACAATGCTGAGGTTCTAACGTCAAGACTTGCAGC
TTTCCACACTCAACTGAACCGGTGATCGATTACTACGCAAAGAAGCCGTTCTTACAACAT
CCACGCCGAGAAGCTCTACAGAAGTGACGTCAGAGTACAGAAGCATTGTCCCGATGACGA
AGAAAGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D210TF U 14
AF RR4EY64TF U 1
BS 1 45 RR4EY64TF
BS 46 46 RR4D210TF
BS 47 57 RR4EY64TF
BS 58 58 RR4D210TF
BS 59 102 RR4EY64TF
BS 103 103 RR4D210TF
BS 104 234 RR4EY64TF
BS 235 235 RR4D210TF
BS 236 351 RR4EY64TF
BS 352 352 RR4D210TF
BS 353 534 RR4EY64TF
BS 535 535 RR4D210TF
BS 536 546 RR4EY64TF
BS 547 547 RR4D210TF
BS 548 618 RR4EY64TF
BS 619 619 RR4D210TF
BS 620 627 RR4EY64TF
BS 628 628 RR4D210TF
BS 629 791 RR4EY64TF

RD RR4D210TF 621 0 0
GG
AAGAGCTAAGAAACACACAGACAGCGAAACCAGATCGGAAGCCATGGCGGATTTGGAAGA
TGTTCAGACTGTGGATCTCATGTCCGAACTCCTCCGCCGTCTCAAATGTTCACAGAAACC
TGACAAACGCCTCATCTTCATAGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAAT
AGTGAAGGATGAGTTTTGCTTGTGTCATTTATCCACTGGAGACATGTTAAGAGCTGCTGT
TGCTTCTAAAACCCCTCTTGGTCTCAAAGCCAAAGAAGCTATGGACACGGGAGCGCTTGT
CACTGATGAATTGGTTGTTGGTATAATTGATGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGTCAGAA
AGGTTTTATCCTTGATGGGTTTCCCATGACTGTTGCTCAGGCTGAGAAGCTAGATGAGAT
GCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTAAACTTTGCTATCGATGACTCAGT
CCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGCAGGAGCTACCACAC
CAAATTTGCGCCTCCTAAAACCCCTGGAGTTGATGATGTTACCGGAGAGCCTCTGATCCA
ACGGAAAGATGACAATGCT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR4EY64TF 791 0 0
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GGCGGATTTGGAAGATGTTCAGACCGTGGATCTCATGTCCGAGCTCCTCCGCCGTCTCAA
ATGTTCACAGAAACCTGACAAACGCCTCATCTTCATAGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGG
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GTTAAGAGCTGCTGTTGCTTCTAAAACCCCTCTTGGTCTCAAAGCCAAAGAAGCTATGGA
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GCCAAAATGTCAGAAAGGCTTTATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCAGGCTGA
GAAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTAAACTTTGC
TATCGATGACTCAGTCCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCTAGTGG
CAGGAGTTACCACACCAAATTTGCGCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATTACCGG
AGAGCCTCTGATCCAACGTAAAGATGATAATGCTGAGGTTCTAACGTCAAGACTTGCAGC
TTTCCACACTCAACTGAACCGGTGATCGATTACTACGCAAAGAAGCCGTTCTTACAACAT
CCACGCCGAGAAGCTCTACAGAAGTGACGTCAGAGTACAGAAGCATTGTCCCGATGACGA
AGAAAGACTGC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 4

CO CL3538Contig1 1101 4 5 U
GTGAAAAAAAGAATTGATGAGTAACATTCAAAAATAATACACACATTACATGTTAGTAGA
TATTTTTTGATTGCTTTCGCTGAGAAACACACCAAAACTAGTAAAACATGACATAAAAGC
ATTGATTTACAAAGACAGTGGTTCAAATGAAACCCCAGACAAACATCTCAAAACTCATGA
GGGATGATGATTAATAAATTTAAGATTCAACTGTATTGCAAATAATCCTTTTCGTTTTGC
GTTTTAGTACACTACTAATGCTCTCTTTTAGGGGCTTTTGTGGTGGGAAGTGTCCCAAAC
ACTATGTCCCATAGCGACGATGTTATACCAAAACCCTTGTCCTGAATCCTGAAGTGATGG
TTCAAATGGTATTTCTTGAGGTTTTTGGTCACTGCTTTAGTTGGTTGGGCATGATGAAGG
TAGTAGTGAGTAACATCGTACATCACGTACCCGAGCATGCCGCCTCCAAACAACGCTGGT
GTGACTGCAGGAGTAGTGAATAGCTTCACAAGGTTCCAGAAAGGAAAGCATAAAATTGCT
GTTGCAGTAGGAGGAAAGACGAGACGGAGATGGTCCATGGGGTGCTTGTGATGGCATCCG
TGAAGAAGATAGTGTGCCGTGTTTCCCCAGTAACTCTTGGTCTTTATGTGGAAAAGGAAC
CGGTGGAGAGTGTATTCTATAAACGTCCAGATAAATATTCCCAAGGGTATCAATGGGACG
ATCTCTGGAAGTGAAAGGCCCCTGCTTACTGACATGGAGATGCACCAGAGTGAAACTGGC
AACCAAATTACAGGAACCACCCACCATCTTGTAAGGGTCAAGAACTCCCAAAAGTCACTG
TGGAAAAACCGAGGGCCTTCCTTTGACACAATAGGTTGGTGAACCCATTCCTCGTACTCT
TCACCAAGATGGCCAACCTGAAATACAAGGGGCTTGTTAAGATCCACAGTGAATCCCTGA
CAACCATTTTGCAGACCTTTTACTGAACTGATGAGAATGCCGGATCTCAAGGCGACTCTG
ACGAAGCGACAGCCGTCGGGGGAGACGAGAGAATCGCCGGAGATATTTTTAATTCTCTGT
TCTGGTTTGCGTTGGTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H538JQB U 1
AF RR4H538TF C 1
AF RR4B885JQ U 52
AF RR4B885TF C 387
BS 1 83 RR4H538JQB
BS 84 84 RR4B885JQ
BS 85 561 RR4H538JQB
BS 562 773 RR4B885JQ
BS 774 1101 RR4B885TF

RD RR4H538JQB 562 0 0
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GTTTTAGTACACTACTAATGCTCTCTTTTAGGGGCTTTTGTGGTGGGAAGTGTCCCAAAC
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GTTGCAGTAGGAGGAAAGACG
C

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DS 

RD RR4H538TF 562 0 0
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TATTTTTTGATTGCTTTCGCTGAGAAACACACCAAAACTAGTAAAACATGACATAAAAGC
ATTGATTTACAAAGACAGTGGTTCAAATGAAACCCCAGACAAACATCTCAAAACTCATGA
GGGATGATGATTAATAAATTTAAGATTCAACTGTATTGCAAATAATCCTTTTCGTTTTGC
GTTTTAGTACACTACTAATGCTCTCTTTTAGGGGCTTTTGTGGTGGGAAGTGTCCCAAAC
ACTATGTCCCATAGCGACGATGTTATACCAAAACCCTTGTCCTGAATCCTGAAGTGATGG
TTCAAATGGTATTTCTTGAGGTTTTTGGTCACTGCTTTAGTTGGTTGGGCATGATGAAGG
TAGTAGTGAGTAACATCGTACATCACGTACCCGAGCATGCCGCCTCCAAACAACGCTGGT
GTGACTGCAGGAGTAGTGAATAGCTTCACAAGGTTCCAGAAAGGAAAGCATAAAATTGCT
GTTGCAGTAGGAGGAAAGACG
C

QA 1 561 1 561
DS 

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GC
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AATTGCTGTTGCAGTAGGAGGAAAGACGAGACGGAGATGGTCCATGGGGTGCTTGTGATG
GCATCCGTGAAGAAGATAGTGTGCCGTGTTTCCCCAGTAACTCTTGGTCTTTATGTGGAA
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TGGGACGATCTCTGGAAGTGAAAGGCCCCTGCTTACTGACATGGAGATGCACCAGAGTGA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4B885TF 715 0 0
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GTACCCGAGCATGCCGCCTCCAAACAACGCTGGTGTGACTGCAGGAGTAGTGAATAGCTT
CACGAGGTTCCAGAAAGGAAAGCATAAAATTGCTGTTGCAGTAGGAGGAAAGACGAGACG
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CCAGTAACTCTTGGTCTTTATGTGGAAAAGGAACCGGTGGAGAGTGTATTCTATAAACGT
CCAGATAAATATTCCCAAGGGTATCAATGGGACGATCTCTGGAAGTGAAAGGCCCCTGCT
TACTGACATGGAGATGCACCAGAGTGAAACTGGCAACCAAATTACAGGAACCACCCACCA
TCTTGTAAGGGTCAAGAACTCCCAAAAGTCACTGTGGAAAAACCGAGGGCCTTCCTTTGA
CACAATAGGTTGGTGAACCCATTCCTCGTACTCTTCACCAAGATGGCCAACCTGAAATAC
AAGGGGCTTGTTAAGATCCACAGTGAATCCCTGACAACCATTTTGCAGACCTTTTACTGA
ACTGATGAGAATGCCGGATCTCAAGGCGACTCTGACGAAGCGACAGCCGTCGGGGGAGAC
GAGAGAATCGCCGGAGATATTTTTAATTCTCTGTTCTGGTTTGCGTTGGTTTTCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL3539Contig1 889 3 3 U
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CTTACTGTTCTACTACTACTACAATTGCTTTATGGTGAAACTTAGCAAACATCTTTTAAC
ATCATTCCAAGTCTCCAAGCTTTGTACTTCTTAAAACTTCAGTTCTGTTTCTTTGTTTTT
ACGCTGGTTCTCTTGGACGAGCTGCCCAAAGAGAGCTAAGAGCACGAAGTCTGTGAAGAT
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GCTGCAATGTTTGCTGCCTTAGATGATCCGCTTGATTAACAAAACCCTCTAATGCTTGGA
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GTTGAGATGATTGTTGGAGGTTTCTCACTTCCAAGACTTGCTGATCAGTTAATGGCTGAA
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ATCTTTCAGTAGAAGTTCGCCACATGCCCGATATCAAGTAGAAAACATCCGCTTTAGCTG
CATCAGATTTCATTCTGAAGAGGTTGGCGTAATGGTTCAAGCAACTCTCTACAAGCATCC
TTAGCTCTATGTCACTTATATGAGCTTGAAGCGCTATTCGTAGCTCGCTAACCCTCCTGC
TTTGTTCTTCAAGCCAGTGTGAATACTCCATCTCAAATTTAGCAATCCTTGTGTTTATAA
TGCTTCCAGATGGTATTGAGTTGCTTACACGTAATCCCTGTTGCTTAAC


BQ
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AF RR4GX53JQ U 1
AF RR4GX95JQ U 1
AF RR4GX95TF C 265
BS 1 614 RR4GX53JQ
BS 615 663 RR4GX95JQ
BS 664 889 RR4GX95TF

RD RR4GX53JQ 614 0 0
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GTTGAGATGATTGTTGGAGGTTTCTCACTTCCAAGACTTGCTGATCAGTTAATGGCTGAA
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ATCTTTCAGTAGAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4GX95JQ 663 0 0
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ATCATTCCAAGTCTCCAAGCTTTGTACTTCTTAAAACTTCAGTTCTGTTTCTTTGTTTTT
ACGCTGGTTCTCTTGGACGAGCTGCCCAAAGAGAGCTAAGAGCACGAAGTCTGTGAAGAT
ACTCTCCTAATGCAAGCAAACCTCTAGCCGCTTGTCTTGTCGTCAAGATCTTCGCCATTT
GCTGCAATGTTTGCTGCCTTAAATGATCCGCTTGATTAACAAAACCCTCTAATGCTTGGA
GATTCTCTAACGCTGCAGCCATTTGAGGAGGGTAATCCATAGAAACCGCATCAACCACAA
TGTTTTCAACTAGACTCTGTTGAAGCTTTTCTATCCCTTGAGAGAGAGCATCCTCTGCTT
GTTGAGATGATTGTTGGAGGTTTCTCACTTCCAAGACTTGCTGATCAGTTAATGGCTGAA
GATACGGCATCACAACGTTCAAAAGCTCAGATGGACGAAACCCTCCAATCCATTGGAAGA
ATCTTTCAGTAGAAGTTCGCCACATGCCCGATATCAAGTAGAAAACATCCGCTTTAGCTG
CAT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4GX95TF 625 0 0
TAGCCGCTTGTCTTGTCGTCAAGATCTTCGCCATTTGCTGCAATGTTTGCTGCCTTAGAT
GATCCGCTTGATTAACAAAACCCTCTAATGCTTGGAGATTCTCTAACGCTGCAGCCATTT
GAGGAGGGTAATCCATAGAAACCGCATCAACCACAATGTTTTCAACTAGACTCTGTTGAA
GCTTTTCTATCCCTTGAGAGAGAGCATCCTCTGCTTGTTGAGATGATTGTTGGAGGTTTC
TCACTTCCAAGACTTGCTGATCAGTTAATGGCTGAAGATACGGCATCACAACGTTCAAAA
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TGCCCGATATCAAGTAGAAAACATCCGCTTTAGCTGCATCAGATTTCATTCTGAAGAGGT
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TTACACGTAATCCCTGTTGCTTAAC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 4

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TGTTGATGTGATCTGTAAACGCGCTGAAAATGGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTGCC
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CTTAGCCCAAGGAAACGTTGACGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGAC
TCTAAAGCTTTTTGAGTTTCTTCCTCAAACAATTCAGGAACAACTGATGCTTGAGAGAGA
TCCACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAAAATAGAGACAGTGAAAATGCTGATTCAAATGGT
TGAAACCGAGCTAGAGAAAAAGAAGAAGGATGGTTCATATAAACGCGAGTTCATGGGCAA
ATCGCACTTCTTTGGGTATGAGGGAAGATGTGGATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTA
CTGCTACGCATTGGGTTGCGGTGCTGGATCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAAT
CTCATCGGTTGGGAATTTGGCTGCTCCTGTTGAGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCT
AACTTCATTGATGGATGTTGAGAGAAGACATGGTAAATTCAAGCCTGTTATCAAGAAAGC
TATGGTTGAACTTGAAGGTGCACCGTTTAAGAAATTTGCATCGCAGCGTGAAGAATGGGC
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TTGAGTTAAGTAAACCAGCAGGTGATCATTGTGTCGTGTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4AZ24TF U 1
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AF RR4AX86JQ C 64
AF RR4AZ24JQ C 375
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TGTTGATGTGATCTGTAAACGCGCTGAAAATGGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTGCC
TGAAGGTCTAATCGATTTCATCCCTGAGGTCCAAGAGCTTATTTCAGAACTGAACGAAAT
CTTAGCCCAAGGAAACGTTGACGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGAC
TCTAAAGCTTTTTGAGTTTCTTCCTCAAACAATTCAGGAACAACTGATGCTTGAGAGAGA
TCCACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAAAATAGAGACAGTGAAAATGCTGATTCAAATGGT
TGAAACCGAGCTAGAGAAAAAGAAGAAGGATGGTTCATATAAACGCGAGTTCATGGGCAA
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AACTTCATTGATGGATGTTGAGAGAAGACATGGTAAATTCAAGCCTGTTATCAAGAAAGC
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GATAAATCACACTTTACTGCTCGA
CT

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR4AX86JQ 938 0 0
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GCACTTCTTTGGGTATGAGGGAAGATGTGGATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTACTG
CTACGCATTGGGTTGCGGTGCTGGATCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAATCTC
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DS 

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ACATTAGTCCTGGTCCGATTCAGTTCAAGGGACCGGGATCTGATGCGATAAATCACACTT
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DS 



AS 1 4

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ACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTTCCAACCTTCTTCCGACTCGAAATGGCTGCTGCAA
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CTTCTTCTAGGGCTTCCACTTCTTCTTCGAAACTAATCATCCACTGCATGTCTAGTGTTA
CCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACAAGCGACCAA
TCCCCAGCATCTACAACACCGTCCTCCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATTTGATGAGGT
ATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACTGTCTACGATC
AGCTCATGGATGGCTATCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAAGCCTACGTCC
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TCTTCGCTGTTGGCTTGTTTCGCTTGCTTGAGCTTGCAGGTGCTACTGATCCCACCGTCC
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TGTATCGCAACCTGCTTTCAAAGCTTGTCCAAGCCAAGGAACTACTCAAGGAGTATGTCG
AGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGGGAAAGAGCAGCCGAATCCCAGAAAGCTAACGAATCAA
TCTCCAAGTCTCTGGGAGATAATACCTTATCTTTCTTGGTTTAATGGATATCATAAACAA
TCAATTTGTGAATTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTATTGTTCTTAGTAACAACTACAACTA
CTTGACCTAAGACATACGTGTGCCCATTCCTAAGAACAAATATATCTCTTTCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ63TF U 1
AF RR4AG82TF U 19
AF RR4GZ63JQ C 273
AF RR4AG82JQ C 384
BS 1 481 RR4GZ63TF
BS 482 482 RR4AG82TF
BS 483 644 RR4GZ63TF
BS 645 645 RR4AG82TF
BS 646 671 RR4GZ63TF
BS 672 695 RR4AG82TF
BS 696 1073 RR4GZ63JQ
BS 1074 1074 RR4AG82JQ
BS 1075 1088 RR4GZ63JQ
BS 1089 1136 RR4AG82JQ

RD RR4GZ63TF 678 0 0
GGGATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCAATA
ACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTTCCAACCTTCTTCCGACTCGAAATGGCTGCTGCAA
TCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATTTCCAATTCAACCACGC
CTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCGCCACTCTTTGA
CTTCTTCTAGGGCTTCCACTTCTTCTTCGAAACTAATCATCCACTGCATGTCTAGTGTTA
CCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACAAGCGACCAA
TCCCCAGCATCTACAACACCGTCCTCCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATTTGATGAGGT
ATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACTGTCTACGATC
ATCTCATGGATGGCTATCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAAGCCTACGTCC
AAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATGGAGGAATGGG
CGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCTAAG*AGGGAGAAGTCGAAA
CGATTCTTAAG
ACATTTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4AG82TF 677 0 0
G
ATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCAATAACAAAACTCTCCTCTCTCT
CTCTCTTCCAACCTTCTTCCGACTCGAAATGGCTGCTGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCC
GGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATTTCCAATTCAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTC
CGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCGCCACTCTTTGACTTCTTCTAGGGCTTCCAC
TTCTTCTTCGAAACTAATCATCCACTGCATGTCTAGTGTTACCGATGTGCCACCTGTATC
GGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACAAGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACAC
CGTCCTCCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATTTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTA
CGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACTGTCTACGATCAGCTCATGGATGGCTATCC
CAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCC
TAACCAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGC
TTCACTAGTTGACTTCTCGTCTAAGGAGGGAGAAGTCGAAGCGATTCTTAAGGACATTTC
AGAAAGAGCTGGCAGT

QA 2 677 2 677
DS 

RD RR4GZ63JQ 817 0 0
ACT
ATCATCCACTGCATGTCTAGTGT*ACCGATGTGCCAC*TGTATCGGAGACAAAGTCAAAC
T*CCTAAAAGCGTACAAGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCCTCCAGGAGCTC
ATCGTACAGCAGCATTTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCC
CTCGGCTTCGTCACTGTCTACGATCATCTCATGGATGGCTATCCCAGCGATCAGGATCGT
GATTCCATTTTTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACT
GATGCGCAGAAGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTC
TCGTCTAAGGAGGGAGAAGTCGAAACGATTCTTAAGGACATTTCAGAAAGAGCTGGCAGT
AAGGAAGGTTTCAGTTACAGCAGGTTCTTCGCTGTTGGCTTGTTTCGCTTGCTTGAGCTT
GCAGGTGCTACTGATCCCACCGTCCTTGACAAGCTTTGTGCGCCCCTAAATATCAACAAG
AAAAGCGTGGATCGGGACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTTTCAAAGCTTGTCCAAGCC
AAGGAACTACTCAAGGAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGGGAAAGAGCAGCC
GAATCCCAGAAAGCTAACGAATCAATCTCCAAGTCTCTGGGAGATAATACCTTATCTTTC
TTGGTTTAATGGATATCATAAACAATCAATTTGTGAATTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTA
TTGTTCTTAGTAACAACTGCAACTACTTGACCT
G

QA 4 816 4 816
DS 

RD RR4AG82JQ 753 0 0
CTCCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATTTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTACGAC
CCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACTGTCTACGATCAGCTCATGGATGGCTATCCCAGC
GATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAAC
CAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCA
CTAGTTGACTTCTCGTCTAAGGAGGGAGAAGTCGAAGCGATTCTTAAGGACATTTCAGAA
AGAGCTGGCAGTAAGGAAGGTTTCAGTTACAGCAGGTTCTTCGCTGTTGGCTTGTTTCGC
TTGCTTGAGCTTGCAGGTGCTACTGATCCCACCGTCCTTGACAAGCTTTGTGCGTCCCTA
AATATCAACAAGAAAAGCGTGGATCGGGACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTTTCAAAG
CTTGTCCAAGCCAAGGAACTACTCAAGGAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGG
GAAAGAGCAGCCGAATCCCAGAAAGCTAACGAATCAATCTCCAAGTCTCTGGGAGATAAT
ACCTTATCTTTCTTGGTTTAATGGATATCATAAACAATCAATTTGTGAATTTTTGTTTTT
GTTTTTTGTTTATTGTTCTTAGTAACAACTACAACTACTTGACCTAAGACATACGTGTGC
CCATTCCTAAGAACAAATATATCTCTTTCGATC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 4

CO CL3542Contig1 843 4 4 U
GAACTGGAGATATTGAAAAGCATTGTATACGGAGGTCTGATTGAAGCCATCACAAGCCTC
GGTGTTATCTCATCTGCCGCTGGTTCTGGTGCTTCAACATTGAACATTTTGGTATTGGGG
CTTGCAAACTTGTTTGGCGGGCTTATTCTCATTATTCATAATCTCCAAGAACTTAGAGAG
GAGGAACCCATAATAACGACGACAACAACAACAGAGGATAACCAGACTAACCTGCAAGAA
GAAGGTCGGTACAAGCGACTCCAGGAAGAAGAGAAAACTTCACGCTTCACGTAACTGTCG
CAATCATATCCTTCATAATCACGGGACTACTCCCTCCCATAGTCTACTACTTCTCATTCA
GCAAAACACACAACAGAGACTACAAAGTGGCATCAGTCTTCGGGGCATCTCTGCTATGCA
TCGTCTTGCTGGCAATAGCCAAAGCTCACGTGAGGAGCCCGAGAGGAAGCCACCTGAAGA
GCGTTCTGAAATACGCGATGATAGCTGTGTCGGTGTCGGGGATATCTTACGTGGTGGGTA
ACTTTGTGGATCAGTTGCTTGAGAAGTACGGATGGTCTGATGGAACCGAGAATCCAGCGG
GAGAGATGATGCTTTCACTTATGGGGAGAAAGGCTGGTAGCTTCGGATACTCATCATCTT
ACTGAACCACCCGAATCTAGTCAAACCTCATGCTACTTTTTTTTTCTTCCACTCTGTTTT
GAGAGCACTCGTTAGACTTTTTTACTTGCTTTTAAAACCAAACCTTTGTTGTGACTTGTG
AGTGTAGAAGCCGTTTCCAAAAGTGTACTAAGCACACAAATAAATTGCGAAAATGTTTGC
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4A256TF U 138
AF RR4A256TFB U 1
AF RR4A256JQ C 415
AF RR4A256JQD C 62
BS 1 703 RR4A256TFB
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BS 705 797 RR4A256TFB
BS 798 843 RR4A256JQD

RD RR4A256TF 100 0 0
CGGGCTTATTCTCATTATTCATAATCTCCAAGAACTTAGAGAGGAGGAACCCATAATAAC
GACGACAACAACAACAGAGGATAACCAGACTAACCTGCAA

QA 1 100 1 100
DS 

RD RR4A256TFB 797 0 0
GAACTGGAGATATTGAAAAGCATTGTATACGGAGGTCTGATTGAAGCCATCACAAGCCTC
GGTGTTATCTCATCTGCCGCTGGTTCTGGTGCTTCAACATTGAACATTTTGGTATTGGGG
CTTGCAAACTTGTTTGGCGGGCTTATTCTCATTATTCATAATCTCCAAGAACTTAGAGAG
GAGGAACCCATAATAACGACGACAACAACAACAGAGGATAACCAGACTAACCTGCAAGAA
GAAGGTCGGTACAAGCGACTCCAGGAAGAAGAGAAAACTTCACGCTTCACGTAACTGTCG
CAATCATATCCTTCATAATCACGGGACTACTCCCTCCCATAGTCTACTACTTCTCATTCA
GCAAAACACACAACAGAGACTACAAAGTGGCATCAGTCTTCGGGGCATCTCTGCTATGCA
TCGTCTTGCTGGCAATAGCCAAAGCTCACGTGAGGAGCCCGAGAGGAAGCCACCTGAAGA
GCGTTCTGAAATACGCGATGATAGCTGTGTCGGTGTCGGGGATATCTTACGTGGTGGGTA
ACTTTGTGGATCAGTTGCTTGAGAAGTACGGATGGTCTGATGGAACCGAGAATCCAGCGG
GAGAGATGATGCTTTCACTTATGGGGAGAAAGGCTGGTAGCTTCGGATACTCATCATCTT
ACTGAACCACCCGAATCTAGTCAAACCTCATGCTACTTTTTTTCTCTTCCACTCTGTTTT
GAGAGCACTCGTTAGACTTTTTTACTTGCTTTTAAAACCAAACCTTTGTTGTGACTTGTG
AGTGTAGAAGCCGTTTC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4A256JQ 397 0 0
TATGCATCGTCTTGCTGGCAATAGCCAAAGCTCACGTGAGGAGCCCGAGAGGAAGCCACC
TGAAGAGCGTTCTGAAATACGCGATGATAGCTGTGTCGGTGTCGGGGATATCTTACGTGG
TGGGTAACTTTGTGGATCAGTTGCTTGAGAAGTACGGATGGTCTGATGGAACCGAGAATC
CAGCGGGAGAGATGATGCTTTCACTTATGGGGAGAAAGGCTGGTAGCTTCGGATACTCAT
CATCTTACTGAACCACCCGAATCTAGTCAAACCTCATGCTACTTTTTTTTTCTTCCACTC
TGTTTTGAGAGCACTCGTTAGACTTTTTTACTTGCTTTTAAAACCAAACCTTTGTTGTGA
CTTGTGAGTGTAGAAGCCGTTTCCAAAAGTGTACTAA

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR4A256JQD 782 0 0
GTGTTATCTCATCTGCCGCTGGTTCTGGTGCTTCAACATTGAACATTTTGGTATTGGGGC
TTGCAAACTTGTTTGGCGGGCTTATTCTCATTATTCATAATCTCCAAGAACTTAGAGAGG
AGGAACCCATAATAACGACGACAACAACAACAGAGGATAACCAGACTAACCTGCAAGAAG
AAGGTCGGTACAAGCGACTCCAGGAAGAAGAGAAAACTTCACGCTTCACGTAACTGTCGC
AATCATATCCTTCATAATCACGGGACTACTCCCTCCCATAGTCTACTACTTCTCATTCAG
CAAAACACACAACAGAGACTACAAAGTGGCATCAGTCTTCGGGGCATTTCTGCTATGCAT
CGTCTTGCTGGCAATAGCCAAAGCTCACGTGAGGAGCCCGAGAGGAAGCCACCTGAAGAG
CGTTCTGAAATACGCGATGATAGCTGTGTCGGTGTCGGGGATATCTTACGTGGTGGGTAA
CTTTGTGGATCAGTTGCTTGAGAAGTACGGATGGTCTGATGGAACCGAGAATCCAGCGGG
AGAGATGATGCTTTCACTTATGGGGAGAAAGGCTGGTAGCTTCGGATACTCATCATCTTA
CTGAACCACCCGAATCTAGTCAAACCTCATGCTACTTTTTTTTTCTTCCACTCTGTTTTG
AGAGCACTCGTTAGACTTTTTTACTTGCTTTTAAAACCAAACCTTTGTTGTGACTTGTGA
GTGTAGAAGCCGTTTCCAAAAGTGTACTAAGCACACAAATAAATTGCGAAAATGTTTGCC
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL3543Contig1 865 4 9 U
GGGGAGCCCTAATAGCCGCACGATTGTGTCTAAGCTGGAGGCTATATAAAGAACTCACCC
CCACCTTGTATTCTTACAACATATCACAAACTCGTTTCTTTCCATACTTAAGGGTTTCGA
GTTTTCAGAACCTCCTGAATCAGGTTTCATACGTTTTGATATCTTTGGATAATTGTTTTC
TGGTTGTACTAAGAGATTAAAACTCCAGATCGTGATCAACATTTTTATACATCTAACAGA
AGAGCGTGAATGAGATTATGATGGAATCGAAAGCTGGTAATAACAAGTCTAAAAGTTCCT
TATTTTACGAAGCCCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTTTCGGTGGAATCA
AGAAATTCAAATCTTCTGTCTACTCTAACTGCTCTAAGAGGCCATCCTAGTCAACTCGGA
CATCCCTCGTAGTTTAACTTGCTTTCTAGTTTCAATCTCTTTCAAGAAGATCTTTTCATC
TCACAACAAAAAAAAA*GCGAGAAGACAATGTCAGTCTCTTCAATAGGGTTCGAAGGCTA
CGAGAAGCGCCTTGAAGTAACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGGTT
AGGGCTCCGTACCCTAACCAAGTCTCAAATCGACGAGATCCTCCAGCCAGCTGAGTGTAC
CATCGTTTCATCACTCTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAAGCCT
CTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGCTCCTCCTCTC
TATCGAACCACTCTTGAGGTTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCGAGTCTGTTCGCTA
CACTCGTGGGAGCTTCATCTGCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4E339TF U 74
AF RR4BZ68TF U 74
AF RR4B057TF U 1
AF RR4E317TF U 74
BS 1 86 RR4B057TF
BS 87 87 RR4E317TF
BS 88 101 RR4B057TF
BS 102 102 RR4E317TF
BS 103 148 RR4B057TF
BS 149 149 RR4E317TF
BS 150 179 RR4B057TF
BS 180 180 RR4E317TF
BS 181 865 RR4B057TF

RD RR4E339TF 655 0 0
GGACAC
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TCAGGTTTCATACGTTT*GATATCTTTGGATAATTGTTTTCTGGTTGTACTAAGAGATTA
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GATGGAATCGAAAGCTGGTAATAACAAGTCTAAAAGTTCCTTATTTTACGAAGCTCCCCT
CGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTTTCGGTGGAATCAAGAAATTCAAATCTTCTGT
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QA 7 655 7 655
DS 

RD RR4BZ68TF 711 0 0
GG
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ATTAAAACTCCAGATCGTGATCAACATTTTTATACATCTAACAGAAGAGCGTGAATGAGA
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CCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTTTCGGTGGAATCAAGAAATTCAAATCTT
CTGTCTACTCTAACTGCTCTAAGAGGCCATCCTAGTCAACTCGGACATCCCTCGTAGTTT
AACTTGCTTTCTAGTTTCAATCTCTTTCAAGAAGATCTTTTCATCTCACAACAAAAAAAA
AAGCGAGAAGACAATGTCAGTCTCTTCAATAGGGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGCCTTGA
AGTAACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGGTTAGGGCTCCGTACCCT
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CTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTA
CAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGCTCCTCCTCTCTATC

QA 3 711 3 711
DS 

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CCACCTTGTATTCTTACAACATATCATAAACTCGTTTCTTTTCATACTTAAGGGTTTCGA
GTTTTCAGAACCTCCTGAATCAGGTTTCCTACGTTTTGATATCTTTGGATAATTGTTTTG
TGGTTGTACTAAGAGATTAAAACTCCAGATCGTGATCAACATTTTTATACATCTAACAGA
AGAGCGTGAATGAGATTATGATGGAATCGAAAGCTGGTAATAACAAGTCTAAAAGTTCCT
TATTTTACGAAGCCCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTTTCGGTGGAATCA
AGAAATTCAAATCTTCTGTCTACTCTAACTGCTCTAAGAGGCCATCCTAGTCAACTCGGA
CATCCCTCGTAGTTTAACTTGCTTTCTAGTTTCAATCTCTTTCAAGAAGATCTTTTCATC
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CGAGAAGCGCCTTGAAGTAACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGGTT
AGGGCTCCGTACCCTAACCAAGTCTCAAATCGACGAGATCCTCCAGCCAGCTGAGTGTAC
CATCGTTTCATCACTCTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAAGCCT
CTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGCTCCTCCTCTC
TATCGAACCACTCTTGAGGTTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCGAGTCTGTTCGCTA
CACTCGTGGGAGCTTCATCTGCCCT

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4E317TF 791 0 0
GGACAC
CATATCACAAACTCGTTTCTTTCCATACTTA*GGGTTTCGAGTTTTCAGAACCTCCTGAA
TCAGGTTTCATACGTTT*GATATCTTTGGATAATTGTTTTCTGGTTGTACTAAGAGATTA
AAACTCCAGAT**TGATCAACATTTTTATACATCTAACAGAAGAGCGTGAATGAGATTAT
GATGGAATCGAAAGCTGGTAATAACAAGTCTAAAAGTTCCTTATTTTACGAAGCTCCCCT
CGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTTTCGGTGGAATCAAGAAATTCAAATCTTCTGT
CTACTCTAACTGCTCTAAGAGGCCATCCTAGTCAACTCGGACATCCCTCGTAGTTTAACT
TGCTTTCTAGTTTCAATCTCTTTCAAGAAGATCTTTTCATCTCACAACAAAAAAAAA*GC
GAGAAGACAATGTCAGTCTCTTCAATAGGGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGCCTTGAAGTA
ACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGGTTAGGGCTCCGTACCCTAACC
AAGTCTCAAATCGACGAGATCCTCCAGCCAGCTGAGTGTACCATCGTTTCATCACTCTCC
AACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTACAAG
ATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGCTCCTCCTCTCTATCGA*CCACTCTTGAG*
TTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCGAGTCTGT*CGCTACACTCGTGGGAGCT*CATC
TGCCC

QA 7 791 7 791
DS 



AS 1 4

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GTGTAATGGAACTAGTATGGTGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCA
AGTTGCAAACTTTTTTACTAA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4A243JQ C 1
AF RR4A243TF U 103
AF RR4A243JQD C 1
AF RR4A243TFB U 1
BS 1 102 RR4A243TFB
BS 103 559 RR4A243TF
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RD RR4A243JQ 561 0 0
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TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATACCTGAGATTGT
CTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCCCGGTTTAACCAATGGGTTAA
CTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATTCTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAAT
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QA 1 561 1 561
DS 

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ATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAAAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGG
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TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATACCTGAGATTGT
CTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCCCGGTTTAACCAATGGGTTAA
CTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATTCTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAAT
GTGTAATGGAACTAGTATGGTGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCA
AGTTGCAAACTTTTTTACT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4A243TFB 559 0 0
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CTCGTTTCGCTGTGGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGC
TCATCGGTGCGAAAACGCAGGTTGTGGCAGGAACGATGCACCATCTGACTGTGGAGGTGG
CTGATGGTGAAAAGAAGAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATC
TCAAGAAGTTGGAGTCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTTCATACCTGAGATTGT
CTATTAAACACATCGCATTCTACGTGATAATTAAGAGTCCCGGTTTAACCAATGGGTTAA
CTCGTTAAAATAATAAGTGAATGCGAAATTCTACTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTAAT
GTGTAATGGAACTAGTATGGTGTTTATCTATTATGACTTTCGTTCTATGTATTTATTGCA
AGTTGCAAACTTTTTTACT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 3

CO CL3545Contig1 809 3 11 U
GGATCGTCTCCAAACAGAGAGAGAGAGAACGGCTTGCAAGACGATTCTGCGCTCCGTATT
TCTATCGGAATCACGCCGGACCTCCGCCGCAGGAAGAAGATGCTTCTTCTTCCCAACTTC
TCCGGCGTCTGTTACAGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAAGCTTCAGCGG
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GAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTCGCTGATGATTCTGCTCA
AGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACTGC
AATTGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTCCTTGCTGTTGAATCTGTTAT
TCAACGCCAAATTCCTGAGGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGT
ATCGGTGAACATTGGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGTGTATAA
TGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGGTA
GAATCATAGCTCTTCCCTCTTACTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTATGCGGGT
GTAAGGCCATCATTTATTTCTTCGTGCTTATTTACACCAACTTTTAAGTCTTCCTTCTTC
AATTATTATATTAAAGATAACTTATATGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F025TF U 1
AF RR4AF37TF U 4
AF RR4AF37JQ C 59
BS 1 123 RR4F025TF
BS 124 124 RR4AF37TF
BS 125 544 RR4F025TF
BS 545 545 RR4AF37TF
BS 546 549 RR4F025TF
BS 550 550 RR4AF37TF
BS 551 666 RR4F025TF
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BS 668 702 RR4F025TF
BS 703 717 RR4AF37TF
BS 718 809 RR4AF37JQ

RD RR4F025TF 702 0 0
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TCTATCGGAATCACGCCGGACCTCCGCCGCAGGAAGAAGATGCTTCTTCTTCCCAACTTC
TCCAGCGTCTGTTACAGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAAGCTTCAGCGG
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GAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTCGCTGATGATTCTGCTCA
AGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACTGC
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ATCGTTGAATATTGGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGTGTATAA
TGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGGTA
GAATCACAGCTCTTCCCTCTTACTCTATTCTCCATTGCGACT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AF37TF 714 0 0
GG
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CGGAATCACGCCGGACCTCCGCCGCAGGAAGAAGATGCTTCTTCTTCCCAACTTCTCCGG
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CCTCAGTTCCGGACCGGCTCCCTCGTCTCAATTGCAGTCACAACGATCAATCGGAGCAAG
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TTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTCGCTGATGATTCTGCTCAAGATT
GGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACTGCAATTG
GGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTCCTTGCTGTTGAATCTGTTATTCAAC
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TGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGGTAGAATC
ATAGCTCTTCCCTCTTACTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTATGCG

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR4AF37JQ 751 0 0
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TCTCCGGCGTCTGTTACAGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAAGCTTCAGC
GGTTTCGCCTCAGTTCCGGACCGGCTCCCTCGTCTCAATTGCAGTCACAACGATCAATCG
GAGCAAGGTCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCGATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGAT
GGGAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTCGCTGATGATTCTGCT
CAAGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACT
GCAATTGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTCCTTGCTGTTGAATCTGTT
ATTCAACGCCAAATTCCTGAGGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATAT
GTATCGGTGAACATTGGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGTGTAT
AATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGG
TAGAATCATAGCTCTTCCCTCTTACTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTATGCGG
GTGTAAGGCCATCATTTATTTCTTCGTGCTTATTTACACCAACTTTTAAGTCTTCCTTCT
TCAATTATTATATTAAAGATAACTTATATGC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 3

CO CL3546Contig1 758 3 15 U
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GCAGTCGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGAACTCATGATCCTCTCTTTG
CGCTTCTCCAAGAACTGAGCCAGCGATGCTTTACGAGCTTGTGGAACTGAAGGAATCATA
TTGCTAGGACCTGCATTAAATGTTTCGATCATGGTCATTGCAGTAGCCGCACCAACGTGT
TTGTCTTTACACCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTGGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4EV46JQ U 1
AF RR4CX62JQ U 64
AF RR4CX62TF C 64
BS 1 83 RR4EV46JQ
BS 84 86 RR4CX62JQ
BS 87 237 RR4EV46JQ
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BS 742 758 RR4EV46JQ

RD RR4EV46JQ 758 0 0
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ACAGACATGACAAACATGCATCTGTTAGAATTTGAGGTAATAAAATAATCTTACAACAAT
GATCAAATAGTAGACATACGCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAACATACTAAATGGTAGC
TATAACAATAATCATCTATTGATTATATTTCAAATTACCATCGTGAGAAAAACCTCAAAG
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GCAGTCGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGAACTCATGATCCTCTCTTTG
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TTGCTAGGACCTGCATTAAATGTTTCGATCATGGTCATTGCAGTAGTCGCACCAATGTGT
TTGTCTTTACACCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTGGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGCA
GTTGCTTTATGGATTTGTTTTCCATAGACGACTCCCTCAGTTTCTCGAACTGGTTTCTCC
AAACTGCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCGA
GCCTTATCAGGTGATATGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGGCATATAAGATTGTGAGC
TGAGGAGATGATCCTGAGGAAGCCACTCGTGGATCCGT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4CX62JQ 692 0 0
GG
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TAAAAAACCACCGAGAAGAAGAAGGTTTTAGGTATGAGAAGCAGCACTAGATTCTGCAGT
CGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGAACTCATGATCCTCTCTTTGCGCTT
CTCCAAGAACTGAGCCAGCGATGCTTTACGAGCTTGTGGAACTGAAGGAATCATATTGCT
AGGACCTGCATTAAATGTTTCGATCATGGTCATTGCAGTAGCCGCACCAACGTGTTTGTC
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QA 3 692 3 692
DS 

RD RR4CX62TF 692 0 0
GG
CATGACAAACATGCATCT***AGAATTTGAGGTAATAAAATAATCTTACAACAATGATCA
AATAGTAGACATACGCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAACATACTAAATGGTAGCTATAA
CAATAATCATCTATTGATTATATTTCAAATTACCATCGTGAGAAAAACCTCAGAGAGGTT
TAAAAAACCACCGAGAAGAAGAAGGTTTTAGGTATGAGAAGCAGCACTAGATTCTGCAGT
CGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGAACTCATGATCCTCTCTTTGCGCTT
CTCCAAGAACTGAGCCAGCGATGCTTTACGAGCTTGTGGAACTGAAGGAATCATATTGCT
AGGACCTGCATTAAATGTTTCGATCATGGTCATTGCAGTAGCCGCACCAACGTGTTTGTC
TTTACACCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTGGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGCAGTTGC
TTTATGGATTTGTTTTCCATAGACGACTCCCTCAGTTTCTCGAACTGGTTTCTTCAAACT
GCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCGAGCCTT
ATCAGGTGATATGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGGCATATAAGATTGTGAGCTGAGG
AGATGATCCTGAGGAGGCCACTCGTGGATC

QA 3 692 3 692
DS 



AS 1 3

CO CL3547Contig1 1216 3 5 U
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TTGTGTAATACGGCTGCAAAAACAAGCCTGCATTTAAATCCTACTAATTCCAGTGATGCT
GTTTCTTCCGAAAAGACTGAAATAGTTTCTGTAGGCGATACATCGAGTTGTCCACCTAAT
ATTTCGACTGAGGGAGCTCTTGCGGACCAGATTATGACTGAAGAGACTTCTTGTGGTGTT
ATCATTCCCGGATCAATCTCAGATGTTGCTCACACTGGGTCTGGTGGTCCGATTGGATTG
GTTACAGACAAAGATGGTGGCACTGAGTTGTCTGTGGATGCTGGGAATGACCTTCTCAAG
ATTCCTGGTGTTGAAGCGGATTCTTCTATGGTACAACCGTCGTCAGGAGATGTTTTACCT
GATGCTGTTGCATCATTAGAAACTACAGAACCTTTGCCAACAGAACAGCAAGAAACAAGT
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ATTCCTGTAGAACAGATGAATATGCAGCCCACGGTTGGGTCTCATGAGCTTAAGACAAGT
TATGAGGAATCTCAAGGATCTCCAATGAAGATTGATGAAATTTCACATGTGGATGGCAAA
TCTTTCGATACTACAAATCAGACGGGTAAAGAGGTCGAAGCAAAAAGTCAAAAAGGTGAG
AGTCCGGATGATCAGATTTCCAATGTTGGACCAAGTTCGGCTTCAATCCAATTATCGATG
CCGCACACTGATGGACTAAAGACCCACACTAGCAATAAGAACTCTATTTCACTTGTTCAT
GAAGATTATGGTAGTCCTCTATCTGATTCTGCTAATGCAGAACAGGATTCTGGAGAATCT
GCTTCGGTTCTAGGAGAAGCTAGTACCGCTGACACAGAGATGGTGGAGGCATCAGTTCAA
TTACCTATCTCTGCCGAGCAAGTAGCAGTAGGTACAGACTCCCCTTCGTGTCAACCAGTG
ATAGAGGAAGAAAAGGCCGAGAACCCATCGGACGAGAGAAACATGATTGATGGTGAAGCC
AGCGGTATAAATCCTTCGGTTCAGCCAGAGGATTTGTCCAGCAGCCTAGTTGAAACTGAG
GAGCCTGCACAGATGGGAGAAGTTAGTGATGCAAGTGACCATGCTGAAGATAATGTCGCC
GTTAGTGTCTTGGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS37TF U 1
AF RR4H359TF U 355
AF RR4DS37JQ C 422
BS 1 378 RR4DS37TF
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BS 380 680 RR4DS37TF
BS 681 989 RR4H359TF
BS 990 1216 RR4DS37JQ

RD RR4DS37TF 680 0 0
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ATCATTCCCGGATCAATCTCAGATGTTGCTCACACTGGGTCTGGTGGTCCGATTGGATTG
GTTACAGACAAAGATGGTGGCACTGAGTTGTCTGTGGATGCTGGGAATGACCTTCTCAAG
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GATGCTGTTGCATCATTAGAAACTACAGAACCTTTGCCAACAGAACAGCAAGAAACAAGT
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ATTCCTGTAGAACAGATGAATATGCAGCCCACGGTTGGGTCTCATGAGCTTAAGACAAGT
TATGAGGAATCTCAAGGATCTCCAATGAAGATTGATGAAATTTCACATGTGGATGGCAAA
TCTTTCGATACTACAAATCA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4H359TF 635 0 0
G
TCAAGATTCCTGGTGTTGAAGCGGATTCTTCTATGGTACAACCGTCGTCAGGAGATGTTT
TACCTGATGCTGTTGCATCATTAGAAACTACAGAACCTTTGCCAACAGAACAGCAAGAAA
CAAGTCTATCTATTGATGCTAAGGGTGAAGAAATCGATGGTGACGAAAAAGGAACTACCC
CCTTGATTCCTGTAGAACAGATGAATATGCAGCCCACGGTTGGGTCTCATGAGCTTAAGA
CAAGTTATGAGGAATCTCAAGGATCTCCAATGAAGATTGATGAAATTTCACATGTGGATG
GCAAATCTTTCGATACTACAAATCAGACGGGTAAAGAGGTCGAAGCAAAAAGTCAAAAAG
GTGAGAGTCCGGATGATCAGATTTCCAATGTTGGACCAAGTTCGGCTTCAATCCAATTAT
CGATGCCGCACACTGATGGACTAAAGACCCACACTAGCAATAAGAACTCTATTTCACTTG
TTCATGAAGATTATGGTAGTCCTCTATCTGATTCTGCTAATGCAGAACAGGATTCTGGAG
AATCTGCTTCGGTTCTAGGAGAAGCTAGTACCGCTGACACAGAGATGGTGGAGGCATCAG
TTCAATTACCTATCTCTGCCGAGCAAGTAGCAGT

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR4DS37JQ 795 0 0
ATGCTGTTGCATCATTAGAAACTACAGAACCTTTGCCAACAGAACAGCAAGAAACAAGTC
TATCTATTGATGTTAAGGGTGAAGAAATCGATAGTGACGAAAAAGGAACTACCCCCTTGA
TTCCTGTAGAACAGATGAATATGCAGCCCACGGTTGGGTCTCATGAGCTTAAGACAAGTT
ATGAGGAATCTCAAGGATCTCCAATGAAGATTGATGAAATTTCACATGTGGATGGCAAAT
CTTTCGATACTACAAATCAGACGGGTAAAGAGGTCGAAGCAAAAAGTCAAAAAGGTGAGA
GTCCGGATGATCAGATTTCCAATGTTGGACCAAGTTCGGCTTCAATCCAATTATCGATGC
CGCACACTGATGGACTAAAGACCCACACTAGCAATAAGAACTCTATTTCACTTGTTCATG
AAGATTATGGTAGTCCTCTATCTGATTCTGCTAATGCAGAACAGGATTCTGGAGAATCTG
CTTCGGTTCTAGGAGAAGCTAGTACCGCTGACACAGAGATGGTGGAGGCATCAGTTCAAT
TACCTATCTCTGCCGAGCAAGTAGCAGTAGGTACAGACTCCCCTTCGTGTCAACCAGTGA
TAGAGGAAGAAAAGGCCGAGAACCCATCGGACGAGAGAAACATGATTGATGGTGAAGCCA
GCGGTATAAATCCTTCGGTTCAGCCAGAGGATTTGTCCAGCAGCCTAGTTGAAACTGAGG
AGCCTGCACAGATGGGAGAAGTTAGTGATGCAAGTGACCATGCTGAAGATAATGTCGCCG
TTAGTGTCTTGGGGT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 4

CO CL3548Contig1 1105 4 16 U
ACGCTTGGAAACATACTTCAAAAGTCATAGATGCATTACATAATAAGGCATTCAAAATAC
AACTCGAAACATCATTAGGTTCAAATGGTTTCTTGGGGATAAGGAAAGTACTACTAAGAT
AAAACTTAAGACACCTAAAACAAACAAAAAGCCATATAGAACTCATGATAGTGAATAAGT
GATGAACTGATATCAACCACGAGTGATTGTGATCTTGATTGAGTGAACTTTGTTCCTGAT
ATGAAGCATCTCACAGTGTGCAGTATCATTATCTTTAACCCTGTTCCTTCTACAAATCCT
GCTCCACCCTGTGAAGTGAATGCTATATTTAGACTGTTTCGCTCTAACCCCATTGAAGAT
CCATTCTCCATCGATGATGTACTTGATGCGGTCACAAAATGTAAGTTCACGATCATTCAC
AACATCTTTAGGAATCAACAGATTCCTCCTGTGCTTGAGGGTAGTAGTAAAGCATGGATT
AGACTCAACCTCCAAATCCGAAAACCCTGCAGCAACTACAGCAACAGATACTGTGTCATC
ACTGTCAACAGGGTTGATACTCTGGCTGACCACATCATCTTCACCAGCATGGAAAGAAGG
ATCATCATCCTCATTGGAATCAGCAGCAACCACTGAAGAAGAATCTTCTTCTTCGTCAGA
ATTAGCAGCATCAGAGAGGTTGACTGTCTCCACGACAGCTCTTATCTCCTTACATACCGA
ACGACCAAAGACACTGACTTCAAAAGTGTGAGAACCGTCGTAGACAAAGGTCAAGTACTC
TCCGTCCTTGAGCTCATGGTCCTCTGCAAATTTTGGACATCCAGAAGTGAAATACTCACG
GTCACGTATTTTCTTGAAGTTTACAGTCCAAACACCACCTCCAGTGCCTTGGAGCTTAGC
TGTTTGTGGCAATGGGTCTTCAAGATGCTCACTGAAAGACATTGGAATCGCCATTGATTC
AGAATCAGTTACTGAGACGAAGGCCTTGAAGAAACGGGGAAGATCAACATCTTCTTCACT
TTCAGACATGGAGAGAGATCTGTTGTAAGAGAATTCTCAAAAATGGGTTGGAGAGAGAGA
GAGAGATCTTAGAGACTATGTTTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4H368JQ U 1
AF RR4B985JQ U 15
AF RR4B985TF C 292
AF RR4H368TF C 376
BS 1 244 RR4H368JQ
BS 245 245 RR4B985JQ
BS 246 264 RR4H368JQ
BS 265 265 RR4B985JQ
BS 266 306 RR4H368JQ
BS 307 307 RR4B985JQ
BS 308 362 RR4H368JQ
BS 363 363 RR4B985JQ
BS 364 517 RR4H368JQ
BS 518 518 RR4B985JQ
BS 519 744 RR4H368JQ
BS 745 745 RR4B985JQ
BS 746 762 RR4H368JQ
BS 763 1084 RR4B985TF
BS 1085 1086 RR4H368TF
BS 1087 1105 RR4B985TF

RD RR4H368JQ 764 0 0
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GA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4B985JQ 748 0 0
G
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TAAAACAAACAAAAAGCCATATAGAACTCATGATAGTGAATAAGTGATGAACTGATATCA
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GTG**CAGTATCATTATCTTTAACCCTGTTCCTTCTACAAATCCTGCTCCACCCTGTGAA
GTGAATGCTATATTTAGACTGTTTCGCTCTAACCCCATTGAAGATCCATTCTCCATCGAT
GATGTACTTGATGCGGTCACAAAATGTAAGTTCACGATCATTCACAACATCTTTAGGAAT
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GACTTCAAAAGTGTGAGAACCGTCGTA

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DS 

RD RR4B985TF 814 0 0
TACAAAT
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TTAGACTCAACCTCCAAATCCGAAAACCCTGCAGCAACTACAGCAACAGATACTGTGTCA
TCACTGTCAACAGGGTTGTTACTCTGGCTGACCACATCATCTTCACCAGCATGGAAAGAA
GGATCATCATCCTCATTGGAATCAGCAGCAACCACTGAAGAA***TCTTCTTCTTCGTCA
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GAACGACCAAAGACACTGACTTCAAAAGTGTGAGAACCGTCGTAGACAAAGGTCAAGTAC
TCTCCGTCCTTGAGCTCATGGTCCTCTGCAAATTTTGGACATCCAGAAGTGAAATACTCA
CGGTCACGTATTTTCTTGAAGTTTACAGTCCAAACACCACCTCCAGTGCCTTGGAGCTTA
GCTGTTTGTGGCAATGGGTCTTCAAGATGCTCACTGAAAGACATTGGAATCGCCATTGAT
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CTTTCAGACATGGAGAGAGATCTGTTGTAAGAGAATTCTCAAAAATGGGTTGGAGAGAGA
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QA 8 814 8 814
DS 

RD RR4H368TF 730 0 0
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CAACAGATTCCTCCTGTGCTTGAGGGTAGTAGTAAAGCATGGATTAGACTCAACCTCCAA
ATCCGAAAACCCTGCAGCAACTTCAGCAACAGATACTGTGTCATCACTGTCAACAGGGTT
GATACTCTGGCTGACCACATCATCTTCACCAGCATGGAAAGAAGGATCATCATCCTCATT
GGAATCAGCAGCAACCACTGAAGAAGAATCTTCTTCTTCGTCAGAATTAGCAGCATCAGA
GAGGTTGACTGTCTCCACGACAGCTCTTATCTCCTTACATACCGAACGACCAAAGACACT
GACTTCAAAAGTGTGAGAACCGTCGTAGACAAAGGTCAAGTACTCTCCGTCCTTGAGCTC
ATGGTCCTCTGCAAATTTTGGCCATCCAGAAGTGAAATACTCACGGTCACGTATTTTCTT
GAAGTTTACAGTCCAAACACCACCTCCAGTGCCTTGGAGCTTAGCTGTTTGTGGCAATGG
GTCTTCAAGATGCTCACTGAAAGACATTGGAATCGCCATTGATTCAGAATCAGTTACTGA
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AGATCTGTTGTAAGAGAATTCTCAAAAATGGGTTGGAGAGAGAGAGAGAGATCTTAGAGA
CTATGTTTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 4

CO CL3549Contig1 894 4 13 U
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CCGCGGTGATTGAATTTTGGAGTGGATTTGTGTGGTTGGTTGGGATGACACTAGTCATCG
CATTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACCATTGAGGACGCATCGGAATCATGGGGACTAT
CAGTGAGTTTCATAAGTATCATATTGCTTCCTATTGTTGGAAACGCAGCTGAACACGCTG
GAGCCATCATTTTCGCTTTTAAGAACAAGCTTGATATATCTTTGGGAGTTGCCTTAGGTT
CTGCAACTCAGATTGGCTTATTTGTCGTCCCCTTGACCATTATCGTAGCGTGGATTATAG
GAATTAACATGGATCTCAATTTCAATCTCCTTGAAACCGGTTCTCTTGCTCTTTCCATTA
TAATCACAGCCTTCACATTACAGGATGGGACTTCTCACTACATGAAGGGATTGGTTCTAT
TGCTTTGCTACATCATTATTGCCATTTGTTTCTTCGTTGACAAACTTCCTCAGAAACAAC
CAAATGTTATTCACTTGGGACATCAAGTGATGAACAATGTTCCCGCTGCTGTCGGTGAAG
GAGTTTTCTCATCTTAAATCTGGACTACTGTCAATGTGTTGAAACAAAAACTCTCAAAGG
GACACAGTGGAGATGATAAATTTTCCCAATTTCTTGATTCATTTCAAATATCAAAGAACT
TGTCAGAGAGATTTCTGAGATTCAGTGAGTGTATTCTCACATTATGCTTTGTGTTGTGAT
CTTGATGATGATGAGTTTTGAGAAGTTTTTGTGATGTTCATGTGTGGGTTTAGATGAACT
ATATATCTATTAATATTTTATTTTGTCTAATGATCTATCTCATTATTTTATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4DH94TF U 1
AF RR4DH94JQ C 2
AF RR4CP91TF U 130
AF RR4CP91JQ C 390
BS 1 72 RR4DH94TF
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BS 811 892 RR4CP91TF
BS 893 894 RR4DH94JQ

RD RR4DH94TF 650 0 0
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CAAATGTTATTCACTTGGGACATCAAGTGATGAACAATGTTGCCGCTGCTGTCGGTGAAG
GAGTTTTCTCATCTTAAATCTGGACTACTGTCAATGTGTTGAGACAAAAA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DH94JQ 893 0 0
GATTG
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TCATTTTCGCTTTTAAGAACAAGCTTGATATATCTTTGGGAGTTGCCTTAGGTTCTGCAA
CTCAGATTGGCTTATTTGTCGTCCCCTTGACCATTATCGTAGCGTGGATTATAGGAATTA
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CAGCCTTCACATTACAGGATGGGACTTCTCACTACATGAAGGGATTGGTTCTATTGCTTT
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TCTCATCTTAAATCTGGACTACTGTCAATGTGTTGAGACAAAAACTCTCAAAGGGACACA
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CTATTAATATTTTCTTTTGTCTAATGCTCTATCTCATTATTTTATGAT

QA 6 893 6 893
DS 

RD RR4CP91TF 763 0 0
G
AGAGTATGTTGTGGCCACCATTGAGGACGCATCGGAATCATGGGGACTATCAGTGAGTTT
CATAAGTATCATATTGCTTCCTATTGTTGGAAACGCAGCTGAACACGCTGGAGCCATCTT
TTTCGCTTTTAAGAACAAGCTTGATATATCTTTGGGAGTTGCCTTAGGTTCTGCAACTCA
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GGATCTCAATTTCAATCTCCTTGAAACCGGTTCTCTTGCTCTTTCCATTATAATCACAGC
CTTCACATTACAGGATGGGACTTCTCACTACATGAAGGGATTGGTTCTATTGCTTTGCTA
CATCATTATTGCCATTTGTTTCTTCGTTGACAAACTTCCTCAGAAACAACCAAATGTTAT
TCACTTGGGACATCAAGTGATGAACAATGTTCCCGCTGCTGTCGGTGAAGGAGTTTTCTC
ATCTTAAATCTGGACTACTGTCAATGTGTTGAAACAAAAACTCTCAAAGGGACACAGTGG
AGATGATAAATTTTCCCAATTTCTTGATTCATTTCAAATATCAAAGAACTTGTCAGAGAG
ATTTCTGAGATTCAGTGAGTGTATTCTCACATTATGCTTTGTGTTGTGATCTTGATGATG
ATGAGTTTTGAGAAGTTTT*GTGATGTTCATGTGTGGGTTTAGATGAACTATATATCTAT
TAATATTTTATTTTGTCTAATGATCTATCTCATTATTTTATG

QA 2 763 2 763
DS 

RD RR4CP91JQ 486 0 0
CTTGAAACCGGTTTTCTTGCTCTTTCCATTATAATCACAGCCTTCACATTACAGGATGGG
ACTTCTCACTACATGAAGGGATTGGTTTTATTGCTTTGCTACATCATTATTGCCATTTGT
TTTTTCGTTGACAAACTTCCTCAGAAACAACCAAATGTTATTCACTTGGGACATCAAGTG
ATGAACAATGTTCCCGCTGCTGTCGGTGAAGGAGTTTTTTCATTTTAAATCTGGACTACT
GTCAATGTGTTGAAACAAAAACTTTCAAAGGGACACAGTGGAGATGATAAATTTTCCCAA
TTTCTTGATTCATTTCAAATATCAAAGAACTTGTCAGAGAGATTTTTGAGATTCAGTGAG
TGTATTCTCACATTATGCTTTGTGTTGTGATCTTGATGATGATGAGTTTTGAGAAGTTTT
TGTGATGTTCATGTGTGGGTTTAGATGAACTATATATCTATTAATATTTTATTTTGTCTA
ATG
ATC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 3

CO CL3550Contig1 795 3 6 U
GGTTTCAGAAAGCATACTTCTTTACAAATAAATGTATTTGAAATTCCTCAGGACAATACA
AGAATACAAAAAATTATCAAAGCTCCTCTGAGCTCTTTATTACATAACCAAACAATAAAT
AACCCATATCTGGTTTTGTTTCTGAAACAAAGCTCCAAGAATCCAGTAAATGTTTCAGTT
TCGATGATACATACTAAAAGAACGCACACAGAAAGTAGTACAATTGGGGTAATTCTTGAG
ATAACATTCTCATTCCGCTCTAGACTGACCAGCTCTAGAGGAAAGAATGATACCTACAAT
AAGCCCATAAAGAGCAAGCGCTCCTGCGAAAATAAGGATAAGAATCATCCCAACAAAGAG
CTTAGGCTGCTGAGCATTTGCCCTGACACCAGCATCGCCGACAATACCAATGGCCATTCC
AGCGGAAAGACCAGCAAGACCACAGGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTAGCCGTCGAA
GAGGTAGTAAGACTTAGCCTTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAA
ACCGTAGATACCCAACACACCAGCCATAACGACAGGGACGATGGATTTCATCACAAGCTC
GGGTCTCATCACTCCCATCGAAGCCACACCTACACCACTCTTTGCTGTTCCGTATGCAGC
TCCCATACAGGAGAAGACGAGTGCGGCTGCGGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAGGGAGCTGT
TTCATCGCCGCTGAAGGTAGACATGTTCGGAGTTTGTATCTCGGATCTGAAATCGAGTCG
ATGATTGAAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D626JQ U 1
AF RR4CP92TF C 326
AF RR4CP92JQ U 76
BS 1 331 RR4D626JQ
BS 332 332 RR4CP92JQ
BS 333 471 RR4D626JQ
BS 472 472 RR4CP92JQ
BS 473 482 RR4D626JQ
BS 483 795 RR4CP92JQ

RD RR4D626JQ 482 0 0
GGTTTCAGAAAGCATACTTCTTTACAAATAAATGTATTTGAAATTCCTCAGGACAATACA
AGAATACAAAAAATTATCAAAGCTCCTCTGAGCTCTTTATTACATAACCAAACAATAAAT
AACCCATATCTGGTTTTGTTTCTGAAACAAAGCTCCAAGAATCCAGTAAATGTTTCAGTT
TCGATGATACATACTAAAAGAACGCACACAGAAAGTAGTACAATTGGGGTAATTCTTGAG
ATAACATTCTCATTCCGCTCTAGACTGACCAGCTCTAGAGGAAAGAATGATACCTACAAT
AAGCCCATAAAGAGCAAGCGCTCCTGCGAAATTAAGGATAAGAATCATCCCAACAAAGAG
CTTAGGCTGCTGAGCATTTGCCCTGACACCAGCATCGCCGACAATACCAATGGCCATTCC
AGCGGAAAGACCAGCAAGACCACAGGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCGTCGAA
GA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4CP92TF 384 0 0
GCGAAAATAAGGATAAGAATCATCCCAACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCATTTGCCCTG
ACACCAGCATCGCCGACAATACCAATGGCCATTCCAGCGGAAAGACCAGCAAGACCACAG
GCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTAGCCGTCGAAGAGGTAGTAAGACTTAGCCTTGGGG
TTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAGATACCCAACACACCAGCC
ATAACGACAGGGACGATGGATTTCATCACAAGCTCGGGTCTCATCACTCCCATCGAAGCC
ACACCTACACCACTCTTTGCTGTTCCGTATGCAGCTCCCATACAGGAGAAGACGAGTGCG
GCTGCGGCGCCGAGGAAGCCGAAG

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4CP92JQ 720 0 0
G
TCAAAGCTCCTCTGAGCTCTTTATTACATAACCAAACAATAAATAACCCATATCTGGTTT
TGTTTCTGAAACAATGCTCCAAGAATCCAGTAAATGTTTCAGTTTCGATGATACATACTA
AAAGAACGCACACAGAAAGTAGTACAATTGGGGTAATTCTTGAGATAACATTCTCATTCC
GCTCTAGACTGACCAGCTCTAGAGGAAAGAATGATACCTACAATAAGCCCATAAAGAGCA
AGCGCTTCTGCGAAAATAAGGATAAGAATCATCCCAACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCA
TTTGCCCTGACACCAGCATCGCCGACAATACCAATGGCCATTCCAGCGGAAAGACCAGCA
AGACCACAGGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTAGCCGTCGAAGAGGTAGTAAGACTTA
GCCTTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAGATACCCAAC
ACACCAGCCATAACGACAGGGACGATGGATTTCATCACAAGCTCGGGTCTCATCACTCCC
ATCGAAGCCACACCTACACCACTCTTTGCTGTTCCGTATGCAGCTCCCATACAGGAGAAG
ACGAGTGCGGCTGCGGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAGGGAGCTGTTTCATCGCCGCTGAAG
GTAGACATGTTCGGAGTTTGTATCTCGGATCTGAAATCGAGTCGATGATTGAAATCTCC

QA 2 720 2 720
DS 



AS 2 4

CO CL3551Contig1 804 2 9 U
GAAAAGGCCTTTTCAGATCGTCTTATTAATACAAATTTTAAGGGGTCAAATAAAAGGTCA
AAGAAACAGAACAAATCAGGTTTTGCTCCAATCACAAACCCCAAAACACAAAAAGATTAA
AAGAAAGGCCCCAAACCACAAACCCCGGTAACATCAACCCGGTAATTGCTTAAATAATTA
TAGAAAACACAAACTTGAAACCCCAAAAGATTCAAGTTATATTATTGTCATATTTCTTCA
AGGATTCCAAAGGATAGTAATCTCTGCAACCATGGAAGTAACAATGTAAGGGTCCATGTT
GGAAGCTGGCCTCCTATCCTCAAAGTATCCTTTCCCTTCCTTCTCCGTGTCACGTCCTAC
TCGGATTGATGCTCCACGGTTTGCAACACCCCATTTGAAAGTGTTGATGTCAGCAGTTTC
ATGGTGCCCGGTGAGACGGCGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAAATGTGCTCCTTGTG
TCTCAGTCCGAGCTTATCGATTGCCTTCTTGATTATCTCGTATCCTCCTTCCTCCCTCAT
CGACTTAGTACTGTAGTTGGTGTGAGCACCAGCTCCGTTCCAGTCACCAGGAATTGGTTT
TGGGTCAAAAGATACAACCACACCAGCAATCTCTGTGATCCTCTCCAAAATGTAACGAGC
GATCCACACTTCATCAGCAGCTGAGATACCAACAGATGGTCCGACTTGGAACTCCCACTG
ACTAGGCATGACTTCTCCATTGATCCCACTGATGTTAATTCCGGATACAAACAAGCCTTG
TAGTGAGCATCAACAATGTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F965JQ U 5
AF RR4CI09JQ U 1
BS 1 70 RR4CI09JQ
BS 71 71 RR4F965JQ
BS 72 112 RR4CI09JQ
BS 113 113 RR4F965JQ
BS 114 259 RR4CI09JQ
BS 260 260 RR4F965JQ
BS 261 426 RR4CI09JQ
BS 427 427 RR4F965JQ
BS 428 804 RR4CI09JQ

RD RR4F965JQ 534 0 0
GT
GCCTTTTCAGATCGTCTTATTAATACAAATTTTAAGGGGTCAAATAAAAGGTCAAGGAAA
CAGAACAAATCAGGTTTTGCTCCAATCACAAATCCCAAAACACAAAAAGATTAAAAGAAA
GGCCCCAAACCACAAACCCCGGTAACATCAACCCGGTAATTGCTTAAATAATTATAGAAA
ACACAAACTTGAAACCCCAAAAGATTCAAGTTATATTATTGTCATATTTCTTCAAGGATT
CCAAAGGATAGTAATCTCTGCAACCATGGAAGTAACAATGTAAGGGTCCATGTTGGAAGC
TGGCCTCCTATCCTCAAAGTATCCTTTCCCTTCCTTCTCCGTGTCACGTCCTACTCGGAT
TGATGCTCCACGGTTTGCAACACCCCCTTTGAAAGTGTTGATGTCAGCAGTTTCATGGTG
CCCGGTGAGACGGCGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAAATGTGCTCCTTGTGTCTCAG
TCCTAGCTTATCGATTGCCTTCTTGATTATCTCGTATCCTCCTTCCTCCCTC

QA 3 534 3 534
DS 

RD RR4CI09JQ 804 0 0
GAAAAGGCCTTTTCAGATCGTCTTATTAATACAAATTTTAAGGGGTCAAATAAAAGGTCA
AAGAAACAGAGCAAATCAGGTTTTGCTCCAATCACAAACCCCAAAACACAAAGAGATTAA
AAGAAAGGCCCCAAACCACAAACCCCGGTAACATCAACCCGGTAATTGCTTAAATAATTA
TAGAAAACACAAACTTGAAACCCCAAAAGATTCAAGTTATATTATTGTCATATTTCTTCA
AGGATTCCAAAGGATAGTAGTCTCTGCAACCATGGAAGTAACAATGTAAGGGTCCATGTT
GGAAGCTGGCCTCCTATCCTCAAAGTATCCTTTCCCTTCCTTCTCCGTGTCACGTCCTAC
TCGGATTGATGCTCCACGGTTTGCAACACCCCATTTGAAAGTGTTGATGTCAGCAGTTTC
ATGGTGTCCGGTGAGACGGCGCTCGTTGCCTTCACCATAAGCAGAAATGTGCTCCTTGTG
TCTCAGTCCGAGCTTATCGATTGCCTTCTTGATTATCTCGTATCCTCCTTCCTCCCTCAT
CGACTTAGTACTGTAGTTGGTGTGAGCACCAGCTCCGTTCCAGTCACCAGGAATTGGTTT
TGGGTCAAAAGATACAACCACACCAGCAATCTCTGTGATCCTCTCCAAAATGTAACGAGC
GATCCACACTTCATCAGCAGCTGAGATACCAACAGATGGTCCGACTTGGAACTCCCACTG
ACTAGGCATGACTTCTCCATTGATCCCACTGATGTTAATTCCGGATACAAACAAGCCTTG
TAGTGAGCATCAACAATGTCTTTT

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL3551Contig2 694 2 20 U
GGATCATCTCATAAACCAAAAACCACATTATCCGAGATTTAATTATTTCTCACTACAACC
TTCTTGTCAGTTTTTTTCAGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGACCT
CTCAGACAACACTGAGAAAATCATCGCTGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATGGA
CATGAGAAGCAAAGCTAGGACTCTCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAACTCCCAAA
GTGGAATTATGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATCTT
ATACCCTCAAGCGATTTTCAAGGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTCTTGTCATGTG
TGATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCAGCTCA
GATCTTTAGCCACCCTGATGTTGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAGTA
CACTCTCTTGCAGAAGGATGTGAAGTGGCCTGTTGGATGGCCCATTGGTGCCTTCCCTGG
CCCTCAGGACCATACTACTGCAGTGTTGGAGCTGACAAATCTTTTGGAAGAGACATTGTT
GATGCTCACTACAAAGCTTGTTTGTATGCCGGAATTAACATCAGTGGGATCAATGGAGAA
GTCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCTAAGTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI09TF U 1
AF RR4F965TF U 9
BS 1 40 RR4CI09TF
BS 41 41 RR4F965TF
BS 42 56 RR4CI09TF
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BS 60 69 RR4CI09TF
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BS 313 313 RR4F965TF
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BS 415 415 RR4F965TF
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BS 454 454 RR4F965TF
BS 455 471 RR4CI09TF
BS 472 472 RR4F965TF
BS 473 530 RR4CI09TF
BS 531 531 RR4F965TF
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BS 579 579 RR4F965TF
BS 580 640 RR4CI09TF
BS 641 694 RR4F965TF

RD RR4CI09TF 640 0 0
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TTCTTGTCA*TTTTTTTCAGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGACCT
CTCAGACAACACTGAGAAAATCATCGCTGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATGGA
CATGAGAAGCAAAGCTAGGACTCTCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAACTCCCAAA
GTGGAATTATGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATCTT
ATACCCTCAAGCTATTTTCAAGGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTCTTGTCATGTG
TGATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCTGCTCA
GATCTTTAGCCACCCTGATGTTGTAGCTGAAGTTCCATGGTATGGAATCGAGCAAGAGTA
CACTCTCTTGCAGAAGGATGTGAAGTGGCCTGTTGGATGGCCCATTGGTGGCTTCCCTGG
CCCTCAGGACCATACTACTGCAGTGTTGGAGCTGACAAGTCTTTTGGAAGAGACATTGTT
GATGCTCACTACAAAGCTTGTTTGTATGCCGGAATTAACA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4F965TF 686 0 0
TCATAAACGAAAAACCACATTGTCCGAGATTTAATTGTTTCTCACTACAACCTTCTTGTC
AGTTTTTTTCTGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGACCTCTCAGACA
ACACTGAGAAAATCATCGCTGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATGGACATGAGAA
GCAAAGCTAGGACTCTCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAACTCCCAAAGTGGAATT
ATGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATCTTATACCCTC
AAGCGATTTTCAAGGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTTTTGTCATGTGTGATACTT
ACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCAGCTCAGATCTTTA
GCCACCCTGATGTTGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAGTACACTCTCT
TGCAGAAGGATGTGAAGTGGCCTGTTGGATGGCCCATTGGTGCCTTCCCTGGCCCTCAGG
ACCATACTACTGCAGTGTTGGAGCTGACAAATCTTTTGGAAGAGACATTGTTGATGCTCA
CTACAA*GCTTGTTTGTATGCCGGAATTAACATCAGTGGGATCAATGGAGAAGTCATGCC
TGGTCAGTGGGAGTTCTAAGTCGACC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL3552Contig1 859 3 5 U
TAATATAAGATCAAAGCCTCTTAGTGAAAATATGACAAAAAAGCAAGTTATATCATATAT
CCTATAACAAAATTATTACAGAACACAGAGTGAATACTGTGGCAAAAGCTCTAAACTTTC
AGATGAAACCAGAACGTTTATGACAAAAGAAAAATGATCCGGAGTTCCATCAGTTATCTT
CTTCGTGATCCCGGTTCCGTGAGTTCTGAGAGCCTGCCTGAAGGTTAATGAACTGAGAGA
CCAGTAGCTTCGAGATTCCACTTATAGCTGCTTCCACCTCATCTGGTTCCTTTGACCCTC
TCAACCCACAGTACTCCCCTGCTGCAACTTGCGTCTTCTTCGACGTTGCAAGAACTTTCT
CCAAATCCAACTGTGACAACGGCCTAGGGACAGGACATGGTCTCCCTTTTCTCTCTTCCT
CTAGAATCTCTCTGATAGGGAAGTAAGCCGCTTTCTTGCAGAGCTCGAAGATGTCTGATC
CGGTGTAGCCTTCACATAAACGAGCTACGTGGTCATAGTCAATATCGGGCTCCACCCTCT
CTCCTTTCAGTGTCACTTTCAGTATCTCTGCTCTCTCCTTGCGATCAGGCATTCCAATCT
CAAAGGCTTGAGGAAGACGCCTCAATATCGCTTCATCGAGCTCTGATGGTCTGTTAGTTG
CAGCAAGAACCATCACCCTCGCATTCGGATCAGTAGAGAAACCATCCCATAAAGCCATAA
ACTCAGTCTTCATGTTTGCCATGGCTTCATGATCTGTTGAACGGCGCTGGCCAAGAAAGC
TATCCACCTCATCGATAAAAATGATAGCAGGTTGGAGTTTGTACGCCAAGCTAAACACAG
CAGCAACAAGCTTCTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES22JQ U 1
AF RR4F871JQ U 34
AF RR4ES22TF C 150
BS 1 640 RR4ES22JQ
BS 641 667 RR4F871JQ
BS 668 668 RR4ES22TF
BS 669 693 RR4F871JQ
BS 694 859 RR4ES22TF

RD RR4ES22JQ 640 0 0
TAATATAAGATCAAAGCCTCTTAGTGAAAATATGACAAAAAAGCAAGTTATATCATATAT
CCTATAACAAAATTATTACAGAACACAGAGTGAATACTGTGGCAAAAGCTCTAAACTTTC
AGATGAAACCAGAACGTTTATGACAAAAGAAAAATGATCCGGAGTTCCATCAGTTATCTT
CTTCGTGATCCCGGTTCCGTGAGTTCTGAGAGCCTGCCTGAAGGTTAATGAACTGAGAGA
CCAGTAGCTTCGAGATTCCACTTATAGCTGCTTCCACCTCATCTGGTTCCTTTGACCCTC
TCAACCCACAGTACTCCCCTGCTGCAACTTGCGTCTTCTTCGACGTTGCAAGAACTTTCT
CCAAATCCAACTGTGACAACGGCCTAGGGACAGGACATGGTCTCCCTTTTCTCTCTTCCT
CTAGAATCTCTCTGATAGGGAAGTAAGCCGCTTTCTTGCAGAGCTCGAAGATGTCTGATC
CGGTGTAGCCTTCACATAAACGAGCTACGTGGTCATAGTCAATATCGGGCTCCACCCTCT
CTCCTTTCAGTGTCACTTTCAGTATCTCTGCTCTCTCCTTGCGATCAGGCATTCCAATCT
CAAAGGCTTGAGGAAGACGCCTCAATATCGCTTCATCGAG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4F871JQ 660 0 0
GG
CAAAAAAGCAAGTTATATCATATATCCTATAACAAAATTATTACAGAACACAGAGTGAAT
ACTGTGGCAAAAGCTCTAAACTTTCAGATGAAACCAGAACGTTTATGACAAAAGAAAAAT
GATCCGGAGTTTCATCAGTTATCTTCTTCGTGATCCCAGTTCCGTGAGTCCTGAGAGCCT
GCCTGAAGGTTAATGAACTGAGAGACCAGTAGCTTCGAGATTCCACTTATAGCTGCTTCC
ACTTCATCTGGTTCCTTTGACCCTCTCAACCCGCAGTACTCCCCTGCTGCAACTTGCGTC
TTCTTCGACGTTGCAAGAACTTTCTCCAAATCCAGCTGTGACAACGGCCTAGGGACAGGA
CATGGTCTCCCTTTTCTCTCTTCCTCTAGGATCTCTCTGATAGGTAAGTAAGCCGCTTTC
TTGCAGAGCTCGAAGATGTCTGATCCGGTGTAGCCTTCACATAAACGAGCTACGTGGTCA
TAGTCAATATCCGGTTCCACCCTCTCTCCTTTCAGTGTCACTTTTAGTATCTCTGCTCTC
TCCTTGCGATCAGGCATTCCAATCTCAAAGGCTTGAGGAAGACGCCTCAATATCGCTTCA
TCGAGCTCTGATGGTCTGTTAGTTGCAGCAAGGACCATCACCCTCGCATTCGGATCAG

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4ES22TF 710 0 0
AGAAAATGAT
CGGAGTTCCATCAGTTATCT*CTTCGTGATCCCGGTTCCGTGAGTTCTGAGAGC*TGC*T
GAAGGTTAATGAACTGAGAGACCAGTAGCTTCGAGATTCCACTTATAGCTGCTTCCACCT
CATCTGGTTCCTTTGACCCTCTCAACCCACAGTACTCCCCTGCTGCAACTTGCGTCTTCT
TCGACGTTGCAAGAACTTTCTCCAAATCCAACTGTGACAACGGCCTAGGGACAGGACATG
GTCTCCCTTTTCTCTCTTCCTCTAGAATCTCTCTGATAGGGAAGTAAGCCGCTTTCTTGC
AGAGCTCGAAGATGTCTGATCCGGTGTAGCCTTCACATAAACGAGCTACGTGGTCATAGT
CAATATCGGGCTCCACCCTCTCTCCTTTCAGTGTCACTTTCAGTATCTCTGCTCTCTCCT
TGCGATCAGGCATTCCAATCTCAAAGGCTTGAGGAAGACGCCTCAATATCGCTTCATCGA
GCTCTGATGGTCTGTTAGTTGCAGCAAGAACCATCACCCTCGCATTCGGATCAGTAGAGA
AACCATCCCATAAAGCCATAAACTCAGTCTTCATGTTTGCCATGGCTTCATGATCTGTTG
AACGGCGCTGGCCAAGAAAGCTATCCACCTCATCGATAAAAATGATAGCAGGTTGGAGTT
TGTACGCCAAGCTAAACACAGCAGCAACAAGCTTCTGAGC

QA 11 710 11 710
DS 



AS 1 2

CO CL3553Contig1 656 2 2 U
GTATAAAAGCATCAACATAGATAAGGGCTAAAGAGTCAAACTCATAATCCAAATTGAAAT
GAAACGTACCCATGTCCGACAAAACAAAATTTAAAACACAAAAGTACTTGCTTATGATTT
AAACTTAAAAGACAAAACACCTTACTCAAATCAACTCTTTGTTTTAATCAACGTTCTGCA
TAACATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTCCTTGTCCGCGGCAGCTCGTCCCTTGG
CCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTATCAAGACGAAGCTTCGTAATCACCACTT
TCGACGGCTGAACACCGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCT
CGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACAACCTTTCCCTCACGTCCCTTGT
AGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGTATAGGCATGGATCTGACGTTGT
ACTTCGCGCGGAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATG
AGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGAGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACT
TCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4CK79TF C 1
AF RR4CK79JQ U 2
BS 1 4 RR4CK79TF
BS 5 656 RR4CK79JQ

RD RR4CK79TF 656 0 0
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GAAACGTACCCATGTCCGACAAAACAAAATTTAAAACACAAAAGTACTTGCTTATGATTT
AAACTTAAAAGACAAAACACCTTACTCAAATCAACTCTTTGTTTTAATCAACGTTCTGCA
TAACATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTCCTTGTCCGCGGCAGCTCGTCCCTTGG
CCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTATCAAGACGAAGCTTCGTAATCACCACTT
TCGACGGCTGAACACCGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCT
CGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACAACCTTTCCCTCACGTCCCTTGT
AGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGTATAGGCATGGATCTGACGTTGT
ACTTCGCGCGGAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATG
AGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGAGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACT
TCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTAT
CC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4CK79JQ 655 0 0
ATA
AAAAGCATCAACATAGATAAGGGCTAAAGAGTCAAACTCATAATCCAAATTGAAATGAAA
CGTACCCATGTCCGACAAAACAAAATTTAAAACACAAAAGTACTTGCTTATGATTTAAAC
TTAAAAGACAAAACACCTTACTCAAATCAACTCTTTGTTTTAATCAACGTTCTGCATAAC
ATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTCCTTGTCCGCGGCAGCTCGTCCCTTGGCCTT
CCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTATCAAGACGAAGCTTCGTAATCACCACTTTCGA
CGGCTGAACACCGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGAT
GTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACAACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGT
ACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGTATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTT
CGCGCGGAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATGAGGC
TGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGAGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACTTCAT
CTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATCC

QA 4 655 4 655
DS 



AS 1 4

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ACACTAAACATCCATTATTTAATCTAATGGAAGCTTTCTAGGTTCTATATTGACATATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR75JQ C 1
AF RR4FR75TF U 1
AF RR4EI53TF U 1
AF RR4EI53JQ C 37
BS 1 216 RR4EI53TF
BS 217 218 RR4FR75TF
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BS 300 300 RR4FR75TF
BS 301 344 RR4EI53TF
BS 345 345 RR4FR75TF
BS 346 599 RR4EI53TF
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GTACTTGTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTTCTTTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTGA
AACCATCATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTTTTATTTATAAATCATTTCTC
C

QA 1 538 1 538
DS 

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CAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTTAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACTCTT
TCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCACTCTC
AAACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGTAAAG
CCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATGATATTTCTCACGTTA
ATCATCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTTCAGTTTGCTTTA
GTACTTGTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTTCTTTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTGA
A

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR4EI53TF 599 0 0
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CAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTTAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACTCTT
TCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACA**ACGACGGTGTTCAGCCACTCTC
AAACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGTAAAT
CCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATTATATTTCTCACGTTA
ATCATCTTTTCACAAATGTCGCAGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTTCAGTTTGCTTTA
GTACTTGTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTTCTTTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTGA
AACCATCATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTTTTATTTATAAATCATTTCTCGA
ATCGCATCAACCGTCTTGTTTATTGTCTACATGTCTCTCGTTTGTCACTCGTTGAATTA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4EI53JQ 623 0 0
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**ACGACGGTGTTCAGCCACTCTCAAACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTC
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GAGAGAATTATATTTCTCACGTTAATCATCTTTTCACAAATGTCGCAGTGAGAAAGAAGT
CGGATCTTTTTTCAGTTTGCTTTAGTACTTGTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTTCTTTT
TTTTTGATTATGAGAAGATTTTGAAACCATCATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTT
TTTTATTTATAAATCATTTCTCGAATCGCATCAACCGTCTTGTTTATTGTCTACATGTCT
CTCGTTTGTCACTCGTTGAATTAAACACTAAACATCCATTATTTAATCTAATGGAAGCTT
TCTAGGTTCTATATTGACATATT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 4

CO CL3555Contig1 1344 4 9 U
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TATCACAAAGGTGATTAAAATCCCTGGAGAAAGTTTCATCCCCACAAGTATCTCTTTAAG
CACATCTACACTATGGATGGTATCTGGAGCCTCAAATGGTTCGAGCCAGCCTGGTTATTC
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ATTCCTGGAGGGACAAAACTGTTGGAGAAATTGCAAGGTAAAATTTCAGTAGAAGAGAGT
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TGATTTTCAATTTGCTGAACTTTTGTTTTAGGCTTATCATCGTGTTTTCGCCACTTTCAT
CACTGTACTGTTACATTATGATACAGTTGTAGTTTACAGCAGTTGCAATTCAGAGGCTAA
TGTGAACCTTTTTTGTTTTCAATACTAAAAGAAGATCCTCTATATGATTACAACAATAGT
CGAGCTTTCATAATTCTCTTAGAAAAGGTGCAAGACATTACAAACACTGCAAAGATGCAA
AACATTAGTTGTCCTTCTGAGAAGGCATGAGACGTAGTCTTTCTTCCGAGACTTGTCCAC
GATCACCACCAAAGTACCTCTCTTCAGCGAGCAACGACTGTAAATCACTTCCGTTGGCTA
AGCTATTGAACTCAACAGCTTTAGAAGGCATAGTTGGATAACGTCTCTGGCAGAACGTCA
TCAATCTTTTAACCAACTGAAGATACTTGCGAGTGGTCTCGTCGTTCATGATGTGAGCAA
CACTGTTGGTGTGAATCTTCTCTCGCGCGGAACGCTCGTGGATACCAACCATAGTCACAC
CGATGGGCCACGGTGCGTTCCCTATGGCTAGTTTGATGTAGTGATCCATCGCAGCGAGGT
AGTCTCGCTTTATGCAGTGCTTAACCATCACCATTAAAGCTTGACGAATATCAGATGGCA
AACCCTAGCACACTGCTTAAAAGTGGCAACATTCTTCTTCCCTTTAGCAGTTCTCCTCTC
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AAGTATCTTATCCTCATCACATAGATCCTCGAAATTAGACTTCAAACGCTTCAGATCCTT
ATCAGCATCAACATCACTAGACTCATCACCACTAAGCTCATCATCATCCCTCGTCTCACC
TTCCTCTCTCCAGTCTCGTCTCTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FE87JQ C 1
AF RR4FE87TF U 1
AF RR4F724JQ U 433
AF RR4GQ18JQ U 531
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G

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TATCACAAAGGTGATTAAAATCCCTGGAGAAAGTTTCATCCCCACAAGTATCTCTTTAAG
CACATCTACACTATGGATGGTATCTGGAGCCTCAAATGGTTCGAGCCAGCCTGGTTATTC
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ATTCCTGGAGGGACAAAACTGTTGGAGAAATTGCAAGGTAAAATTTCAGTAGAAGAGAGT
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TGATTTTCAATTTGCTGAACTTTTGTTTTAGGCTTATCATCGTGTTTTCGCCACTTTCAT
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G

QA 1 560 1 560
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C
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CATTATGATACAGTTGTAGTTTACAGCAGTTGCAATTCAGAGGCTAATGTGAACCTTTTT
TGTTTTCAATACTAAAAGAAGATCCTCTATATGATTACAACAATAGTCGAGCTTTCATAA
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TGCGTTCCCTATGGCTAGTTTGATGTAGTGATCCATCGCAGCGAGGTAGTCTCGCTTTAT
GCAGTGCTTAACCATCACCATTAAAGCTTGACGAATA

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AGATGGCAAACCCTAGCACACTGCTTAAAAGTGGCAACATTCTTCTTCCCTTTAGCAGTT
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AGATCCTTATCAGCATCAACATCACTAGACTCATCACCACTAAGCTCATCATCATCCCTC
GTCTCACCTTCCTCTCTCCAGTCTCGTCTCTA

QA 3 814 3 814
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AD59TF U 1
AF RR4FS77TF U 105
BS 1 305 RR4AD59TF
BS 306 306 RR4FS77TF
BS 307 703 RR4AD59TF
BS 704 872 RR4FS77TF

RD RR4AD59TF 703 0 0
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TTTCATGATCTGACTTTGGTCTCTTCTTCTCCCCTCTCTTTTTTTGTTCTTTCTTTTACT
TGGTCTACTTCTGAACATGCCACGCCCTTTCTTCCACAAGCTGATTTTCTCATCCACTAT
CCAAGAAAAACGTCTGAGAGTTCCAGATAAGTTTGCGAGTAAATTCAAGGACGAGCTATC
GGTTGCAGTCGCACTCACAGTACCAGACGGTCATGTTTGGCGTGTAGGACTCAGGAAAGC
TGACAGCAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTCGTCGACCGTTACTCTAT
CCGCATTGGCTATCTTTTGGTCTTTAGATACGAAGGCAACTCTGCCTTCAGCGTCTACAT
TTACAACTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCTCCGGTCTCATGGACACTCCACA
CAACCACCTCAAACGCGCCCGTTTGTTTGAAGACCTTGAAGACGAAGACGCCGCCGCCGA
GGTTGTTGTTTACTCTTCTTCTTCTTCGGTGTATCCACCATCATCACATCATCCTGGAGT
TACTGTAGCCGTTAATAAAGGATATGCTAGTAGTCCAGCTATACAGAGCTTCTTCGCTGG
ACCTGTTAAAGCTGAAGAGACAACACCAACCCCAAAAGTTGCT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FS77TF 768 0 0
G
GTTCTTTCTTTTACTTGGTCTACTTCTGAACATGCCACGCCCTTTCTTCCACAAGCTGAT
TTTCTCATCCACTATCCAAGAAAAACGTCTGAGAGTTCCAGATAAGTTTGCGAGTAAATT
CAAGGACGAGCTATCGGTTGCAGTTGCACTCACAGTACCAGACGGTCATGTTTGGCGTGT
AGGACTCAGGAAAGCTGACAACAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTCGT
CGACCGTTACTCTATCCGCATTGGCTATCTTTTGGTCTTTAGATACGAAGGCAACTCTGC
CTTCAGCGTCTACATTTACAACTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCTCCGGTCT
CATGGACACTCCACACAACCACCTCAAACGCGCCCGTTTGTTTGAAGACCTTGAAGACGA
AGACGCCGCCGCCGAGGTTGTTGTTTACTCTTCTTCTTCTTCGGTGTATCCACTGTCATC
ACATCATCCTGGAGTTACTGTAGCCGTTAATAAAGGGTATGCTAGTAGTCCAGCTATCCA
GAGCTTCTTCGCTGGACCTGTTAAAGCTGAAGAGACAACACCAGCTCCTAAAGTTGCTAA
AAAGAGAGGGAGGAAGAAGAAGAACGCTGTTCCTGAGAAATAAACTCATCTGCTCCACGA
GATGATGATCCAGAGAGCCGTTCAAGTTCTACGAGAGTGCTTCTGCGAGAAAGAGAACGT
GACTGCAGAGAAAGAGAGAGGGCCATCATGCAGCCAAACGTTCGAGC

QA 2 768 2 768
DS 



AS 1 3

CO CL3557Contig1 969 3 13 U
AACCCAGAGAATCAAACAGAAACATTTAGCACAATGCAAATTCAAATTCACATATGCTAA
TCCAAATATGTTTACACCATTCATACACATCGAATTTCTAAACAAAGCCATAGGAAAACA
AATCAAACCGGTACGAAAAACACAACGACAAACGAGAAAACTACAAATCCGGTACGGTAA
AATCAACCGGTATAGATGTGGATGCGAATGGCTATGGTGAAAATAGTGATGAAAGCGAAG
TAAATGATGGTGTGGACGAAAATAGCGGCGCCGCTAGTGTGCATGTTCCCGAACTCCACG
ATTCGACCTCTCGCCGGGATCTGAAAGAGAAGTCCCGGAGTCAGAAGCACGAACAGTATC
ACAGCCACCACCACAGGTCCCCAGTCCGCCATACTTTACCACTAGAGAGAGAGAAATACA
CGAGAAGACATTAAAGAGAGAGGAAAAATGGTTGAAGGTCTTTCTTTTTGGTTTTGGTTT
TGCTTTTGAAGAGTTCAAAACTTCCTTGTGCCAGGTGAAAAGGAAACTACCGGTGGCGAT
GGCACGTGCGAATACGTTGTTTTCGAAAGACGTGACACGCGACTCCGTGTGTCAAAGATG
ATGTGTTTTTGTCTGCTGGTGAATGACGGGAGGAAGATTAAACTGGGCTCGTCTTGGATC
TAATTCTATATGGGCTGAGAATGTTAACTTAACCAGTACAGTTGAATTAAAATCTGTGTA
TTTGTTAATCGTTTTACCATGTTGGATTTACATACATAATCTTCCAATCCACTTGGGTTC
TTGCACAGTTGCATTGAGTCACTCACCTATACTTCTCTTGAAAACTTCTCTTTTTCAAGA
GAAGTGAGGACAAGAAAACTTTCTAAAATAAAATCATGCAATTATGTATGTATGAGACAT
ATTCCTGAGAGTTGTGCCGTTCCTAGCAGATGGTTACCTATCAACTTAACGATCAAAGAT
GTCTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA07JQB U 1
AF RR4GJ10TF U 172
AF RR4GJ10JQ C 324
BS 1 328 RR4HA07JQB
BS 329 329 RR4GJ10TF
BS 330 343 RR4HA07JQB
BS 344 344 RR4GJ10TF
BS 345 423 RR4HA07JQB
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BS 425 429 RR4HA07JQB
BS 430 430 RR4GJ10TF
BS 431 448 RR4HA07JQB
BS 449 867 RR4GJ10TF
BS 868 868 RR4GJ10JQ
BS 869 897 RR4GJ10TF
BS 898 969 RR4GJ10JQ

RD RR4HA07JQB 448 0 0
AACCCAGAGAATCAAACAGAAACATTTAGCACAATGCAAATTCAAATTCACATATGCTAA
TCCAAATATGTTTACACCATTCATACACATCGAATTTCTAAACAAAGCCATAGGAAAACA
AATCAAACCGGTACGAAAAACACAACGACAAACGAGAAAACTACAAATCCGGTACGGTAA
AATCAACCGGTATAGATGTGGATGCGAATGGCTATGGTGAAAATAGTGATGAAAGCGAAG
TAAATGATGGTGTGGACGAAAATAGCGGCGCCGCTAGTGTGCATGTTCCCGAACTCCACG
ATTCGACCTCTCGCCGGGATCTGAAAGAAAAGTCCCGGAGTCAAAAGCACGAACAGTATC
ACAGCCACCACCACAGGTCCCCAGTCCGCCATACTTTACCACTAGAGAGAGAGAAATACA
CGAAAAGACGTTAAAGAGAGAGGAAAAA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4GJ10TF 726 0 0
GA
ACGGTAAAATCAACCGGTATAGATGTGGATGCGAATGGCTATGGTGAAGATAGTGATGAG
AGCGAAGTAAATGATGGTGTGGACGAGAATAGCGGCGCCGCTAGTGTGCATGTTCCCGAA
CTCCACGATTCGACCTCTCGCCGGGATCTGAAAGAGAAGTCCCGGAGTCAGAAGCACGAA
CAGTATCACAGCCACCACCACAGGTCCCCAGTCCGCCATACTTTACCACTAGAGAGAGAG
AAATACACGAGAAGACATTAAAGAGAGAGGAAAAATGGTTGAAGGTCTTTCTTTTTGGTT
TTGGTTTTGCTTTTGAAGAGTTCAAAACTTCCTTGTGCCAGGTGAAAAGGAAACTACCGG
TGGCGATGGCACGTGCGAATACGTTGTTTTCGAAAGACGTGACACGCGACTCCGTGTGTC
AAAGATGATGTGTTTTTGTCTGCTGGTGAATGACGGGAGGAAGATTAAACTGGGCTCGTC
TTGGATCTAATTCTATATGGGCTGAGAATGTTAACTTAACCAGTACAGTTGAATTAAAAT
CTGTGTATTTGTTAATCGTTTTACCATGTTGGATTTACATACATAATCTTCCAATCCACT
TGGGTTCTTGCACAGTTGCATTGAGTCACTCACCTATACTTCTCTTGAAAACTTCTCTTT
TTCAAGAGAAGTGAGGACAAGAAAACTTTCTAAA*TAAAATCATGCAATTATGTATGTAT
GAGA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR4GJ10JQ 646 0 0
AAAGAGAAGTCCCGGAGTCAGAAGCACGAACAGTATCACAGCCACCACCACAGGTCCCCA
GTCCGCCATACTTTACCACTAGAGAGAGAGAAATACACGAGAAGACATTAAAGAGAGAGG
AAAAATGGTTGAAGGTCTTTCTTTTTGGTTTTGGTTTTGCTTTTGAAGAGTTCAAAACTT
CCTTGTGCCAGGTGAAAAGGAAACTACCGGTGGCGATGGCACGTGCGAATACGTTGTTTT
CGAAAGACGTGACACGCGACTCCGTGTGTCAAAGATGATGTGTTTTTGTCTGCTGGTGAA
TGACGGGAGGAAGATTAAACTGGGCTCGTCTTGGATCTAATTCTATATGGGCTGAGAATG
TTAACTTAACCAGTACAGTTGAATTAAAATCTGTGTATTTGTTAATCGTTTTACCATGTT
GGATTTACATACATAATCTTCCAATCCACTTGGGTTCTTGCACAGTTGCATTGAGTCACT
CACCTATACTTTTCTTGAAAACTTTTCTTTTTCAAGAGAAGTGAGGACAAGAAAACTTTC
TAAAATAAAATCATGCAATTATGTATGTATGAGACATATTCCTGAGAGTTGTGCCGTTCC
TAGCAGATGGTTACCTATCAACTTAACGATCAAAGATGTCTTTCCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL3558Contig1 703 4 4 U
TTTTTTTTAAGAGTATTAACTTTCTTTTAACAGCTTCCCTCCACCTCCAACCAAATCTTT
TCACAAATCCGAAAACACTTAGGAAAAAAAAACAGAGTTCTTCTTAGCCTGATAGAAGAG
AACACACATCCCACTCCAAGTATGCAATTTTTCAGCCAAATAAGCTGGCAATCTTAATCT
GGCCGACCTCAAAGCCACTTCTCCGAAGCTTCAACTTCTTCATCATTACTTTGTAAATTT
ATACAGTAATCCCACTGATAACTCTCATCGAAATAGTTGTATATAAAAAAAAAAAGCTCA
AAAGCCAAGGAAAGAAACACGGATCTCGAGCTATCACCAAAACGACGGGAGAAGGTGTCG
TTTCAGCCTTGTACAAAATAAATCTTCTTCTTTTTTAAGCTCTGTGCTTTTGGTTTTGTT
ATAAGCTTATGATCAGGAAATGAGAAAGAAAGTGATGGGCATGCAACTGCTCAACTGTTA
CACAACATGTGTACAGAAGGAATAATATTCAGACAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAGACTG
TTTTTTGTTTTTAAATTTTAATTATGTTTAGAATGGTTTCTCCGGTAGCGAGAAGTGGCG
GCGGCGTGGCGGGGATAGCTTCTGCTGATATTATTATTATTATTATTCTCAGCTCGAAAG
TTTACTAACTTCTCTCTCCTGTTTGAATGAGAAGGGAGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4GN40JQ U 9
AF RR4GN40TF C 1
AF RR4GJ42TF C 8
AF RR4GJ42JQ U 9
BS 1 8 RR4GN40TF
BS 9 443 RR4GJ42JQ
BS 444 444 RR4GN40JQ
BS 445 703 RR4GJ42JQ

RD RR4GN40JQ 642 0 0
AAGAGTATTAACTTTCTTTTAACAGCTTCCCTCCACCTCCAACCAAATCTTTTCACAAAT
CCGAAAACACTTAGGAAAAAAAAACAGAGTTCTTCTTAGCCTGATAGAAGAGAACACACA
TCCCACTCCAAGTATGCAATTTTTCAGCCAAATAAGCTGGCAATCTTAATCTGGCCGACC
TCAAAGCCACTTCTCCGAAGCTTCAACTTCTTCATCATTACTTTGTAAATTTATACAGTA
ATCCCACTGATAACTCTCATCGAAATAGTTGTATATAAAAAAAAAAAGCTCAAAAGCCAA
GGAAAGAAACACGGATCTCGAGCTATCACCAAAACGACGGGAGAAGGTGTCGTTTCAGCC
TTGTACAAAATAAATCTTCTTCTTTTTTAAGCTCTGTGCTTTTGGTTTTGTTATAAGCTT
ATGATCAGGAAATGAGAAAGAAAGTGATGGGCATGCAACTGCTCAACTGTTACACAACAT
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GCGGGGATAGCTTCTGCTGATATTATTATTATTATTATTCTC

QA 1 642 1 642
DS 

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ATACAGTAATCCCACTGATAACTCTCATCGAAATAGTTGTATATAAAAAAAAAAAGCTCA
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CACAACATGTGTACAGAAGGAATAATATTCAGACAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAGACTG
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QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4GJ42TF 696 0 0
T
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TCCCACTCCAAGTATGCAATTTTTCAGCCAAATAAGCTGGCAATCTTAATCTGGCCGACC
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ATCCCACTGATAACTCTCATCGAAATAGTTGTATATAAAAAAAAAAAGCTCAGAAGCCAA
GGAAAGAAACACGGATCTCGAGCTATCACCAAAACGACGGGAGAAGGTGTCGTTTCAGCC
TTGTACAAAATAGATCTTCTTCTTTTTTAAGCTCTGTGCTTTTGGTTTTGTTATAAGCTT
ATGATCAGGAAATGAGAAAGAAAGTGATGGGCATGCAACTGCTCAACTGTTACACAACAT
GTGTACAGAAGGAATAATATTCAGACAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAGACTGTTTTTTGT
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GCGGGGATAGCTTCTGCTGATATTATTATTATTATTATTCTCAGCTCGAAAGTTTACTAA
CTTCTCTCTCCTGTTTGAATGAGAAGGGAGAAAGC

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR4GJ42JQ 695 0 0
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CCGAAAACACTTAGGAAAAAAAAACAGAGTTCTTCTTAGCCTGATAGAAGAGAACACACA
TCCCACTCCAAGTATGCAATTTTTCAGCCAAATAAGCTGGCAATCTTAATCTGGCCGACC
TCAAAGCCACTTCTCCGAAGCTTCAACTTCTTCATCATTACTTTGTAAATTTATACAGTA
ATCCCACTGATAACTCTCATCGAAATAGTTGTATATAAAAAAAAAAAGCTCAAAAGCCAA
GGAAAGAAACACGGATCTCGAGCTATCACCAAAACGACGGGAGAAGGTGTCGTTTCAGCC
TTGTACAAAATAAATCTTCTTCTTTTTTAAGCTCTGTGCTTTTGGTTTTGTTATAAGCTT
ATGATCAGGAAATGAAAAAGAAAGTGATGGGCATGCAACTGCTCAACTGTTACACAACAT
GTGTACAGAAGGAATAATATTCAGACAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAGACTGTTTTTTGT
TTTTAAATTTTAATTATGTTTAGAATGGTTTCTCCGGTAGCGAGAAGTGGCGGCGGCGTG
GCGGGGATAGCTTCTGCTGATATTATTATTATTATTATTCTCAGCTCGAAAGTTTACTAA
CTTCTCTCTCCTGTTTGAATGAGAAGGGAGAAAGC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 4

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TCGAAGCCGTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGTACACTTTCCGATCTGAACCGAAGA
TCAGGACCGGACTCCGACAGTGACTCCGATGGACCTCAAGAGTACTACACCGGCGGAGAG
AAAAGTGGTATGCTAGTTCGGGATCCTTCGAAAGAACCGAAACACACGATGATGTTGATG
AGATATTCAACCAAGCAAGGCAACTAGGAGCGGTGGAAGGACCTCTTGAGCGTCCTTCCA
GTTCCAGCAGAAGCTTCACTGGAACCGGGAGATTGCTTTCAGGAGAAAGCGTGCCAACCG
CTCTTCAACCGCCCGAGCCTGTGATTCACAGTATCGTTTTCTGGTCTAATGGTTTCACTG
TTGATGATGGACCCTTGAGGAAGTTGGACGATCCAGAGAACGCCTCTTTTCTCGACAGCA
TTCGAAAGTCTGAATGTCCTAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAAAAGAGCTCCTGTACATG
TTAATCTTATGAGAAGAGACGAGATATGCCCCGAACGTGAGAAACCTACGGTTGCATTTC
AAGGAGTGGGAAGGACACTCGGAGGCGGTGCTAGCTCATCAACCCCTCCAAGCCTAAGCA
ACCCAACCAATGTAGCCGCGGCTCCATCACCGTCACACAGTCTTGTTGTAGTTGATGAAA
CTCTTCCATCCACATCTATCCAGCTTAGACTCTCTGACGGGACACGCATGGTGGCTAAGT
TCAATAACCATCACACGGTCGACGACATTCGTGCTTTTATTGACTTTTCTCGACCTGGGA
ATCCGATCAACTACGGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCACCTAAGCCGCTTACTGATCCTT
TTCAGACCATTGATGAAGCCGGTCTCGCAAACTCTGTAGTCATTCAGAAATTCTAGAAAC
TTTTTTTGTTTCTTTTGTTGTTCTTAAAGAGAGTATTGTTACACTCCAAGATTATCCAAG
AAATGTTCTGATTTGTAAGAAAAGTGCATAATCGGCTTATTATGGCAAGAAGGAAAAAAC
ATCATATGGTTTCTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF50TF U 1
AF RR4AF50JQ C 287
BS 1 851 RR4AF50TF
BS 852 1098 RR4AF50JQ

RD RR4AF50TF 851 0 0
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TCGAAGCCGTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGTACACTTTCCGATCTGAACCGAAGA
TCAGGACCGGACTCCGACAGTGACTCCGATGGACCTCAAGAGTACTACACCGGCGGAGAG
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TTAATCTTATGAGAAGAGACGAGATATGCCCCGAACGTGAGAAACCTACGGTTGCATTTC
AAGGAGTGGGAAGGACACTCGGAGGCGGTGCTAGCTCATCAACCCCTCCAAGCCTAAGCA
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ATCCGATCAAC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4AF50JQ 812 0 0
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TAATGGTTTCACTGTTGATGATGGACCCTTGAGGAAGTTGGACGATCCAGAGAACGCCTC
TTTTCTCGACAGCATTCGAAAGTCTGAATGTCCTAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAAAAG
AGCTCCTGTACATGTTAATCTTATGAGAAGAGACGAGATATGCCCCGAACGTGAGAAACC
TACGGTTGCATTTCAAGGAGTGGGAAGGACACTCGGAGGCGGTGCTAGCTCATCAACCCC
TCCAAGCCTAAGCAACCCAACCAATGTAGCCGCGGCTCCATCACCGTCACACAGTCTTGT
TGTAGTTGATGAAACTCTTCCATCCACATCTATCCAGCTTAGACTTTCTGACGGGACACG
CATGGTGGCTAAGTTCAATAACCATCACACGGTCGACGACATTCGTGCTTTTATTGACTT
TTCTCGACCTGGGAATCCGATCAACTACGGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCACCTAAGCC
GCTTACTGATCCTTTTCAGACCATTGATGAAGCCGGTCTCGCAAACTCTGTAGTCATTCA
GAAATTCTAGAAACTTTTTTTGTTTCTTTTGTTGTTCTTAAAGAGAGTATTGTTACACTC
CAAGATTATCCAAGAAATGTTCTGATTTGTAAGAAAAGTGCATAATCGGCTTATTATGGC
AAGAAGGAAAAAACATCATATGGTTTCTACTC

QA 1 812 1 812
DS 



CO CL3559Contig2 549 2 3 U
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TACATGTTAATTTTATGAGAAGAGACGAGATATGCCCCGAACGTGAGAAACCTACGGTTG
CATTTCAAGGAGTGGGAAGGACACTAGGAGGCGGTGCTAGCTCATCAACCCCTCCAAGCC
TAAGCAACCCAACCGATGTAGCCGCGGCTCCATCACCGTCACAGAGTCCTGTTGTAGTAG
ATGAAACTCTTCCATCCACTTCTATCCAGCTTAGACTCGCTGACGGGACACGCATGGTGG
CTAAGTTCAACAACCAGCACACGGTCAACGACATTCGTGCTTTTATCGACTTTTCTCGAC
CAGGGAGTCCAATCAACTCCAGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCCCCTAAGCCGCTTACTG
ATCCTTTTCAGACCATTGATGAAGCCGGTCTCGCAAACTCTGTAGTCATTCAGAAATTCT
AGAAACTTTTTGTTTCTTTTGTTGTTCTTAAAGAGAGTACTGTTACCCTCCAAGATTATC
CAAGAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV41TF U 178
AF RR4GV41JQ C 1
BS 1 177 RR4GV41JQ
BS 178 378 RR4GV41TF
BS 379 549 RR4GV41JQ

RD RR4GV41TF 209 0 0
GCCTAAGCAACCCAACCGATGTAGCCGCGGCTCCATCACCGTCACAGAGTCCTGTTGTAG
TAGATGAAACTCTTCCATCCACTTCTATCCAGCTTAGACTCGCTGACGGGACACGCATGG
TGGCTAAGTTCAACAACCAGCACACGGTCAACGACATTCGTGCTTTTATCGACTTTTCTC
GACCAGGGAGTCCAATCAACT
CCAGCCTT

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR4GV41JQ 549 0 0
GCAGCATTCGAAAGTCTGAATGTCCTAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAAAAGAGCTCCTG
TACATGTTAATTTTATGAGAAGAGACGAGATATGCCCCGAACGTGAGAAACCTACGGTTG
CATTTCAAGGAGTGGGAAGGACACTAGGAGGCGGTGCTAGCTCATCAACCCCTCCAAGCC
TAAGCAACCCAACCGATGTAGCCGCGGCTCCATCACCGTCACAGAGTCCTGTTGTAGTAG
ATGAAACTCTTCCATCCACTTCTATCCAGCTTAGACTCGCTGACGGGACACGCATGGTGG
CTAAGTTCAACAACCAGCACACGGTCAACGACATTCGTGCTTTTATCGACTTTTCTCGAC
CAGGGAGTCCAATCAACTCCAGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCCCCTAAGCCGCTTACTG
ATCCTTTTCAGACCATTGATGAAGCCGGTCTCGCAAACTCTGTAGTCATTCAGAAATTCT
AGAAACTTTTTGTTTCTTTTGTTGTTCTTAAAGAGAGTACTGTTACCCTCCAAGATTATC
CAAGAAATG

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 4

CO CL3560Contig1 940 4 6 U
GGTCCAATCTGCTGTCTTTATAATTTATCAGAATCGCCGATTGATCGATAGAGAACAACG
ACCATCCGTTAATCGCCGACGGAGAAATCGTGGCCGTCTAAATTAGGCGAAGAAGATCCG
ATTCCGATTTCTAGAAGAATCAATCTTTAAGAGATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCG
ACGAGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCG
TTATCTCAGCTTTATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAA
CGCCATGGTCTCGAAAAATTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGA
GTGACGTCTATGGATATAATTAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAG
CCCCCAATTTCCCCAAGAGCGCCGCCAACACAACCGGCAATGAATGCCGGGCTCATGGCC
TCTTCAGGCACGTCTTGCCC***AGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAAC
CAGGTGAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAA
AACTACCAAATTCCGCAGGGAGGCTACATATCTGGCGCAACCAGAAGCAGTGAACTGAAC
AGGGGATCTAACTCTCCAGGCTCTTTTGATTCCTCAATGGACATGCATGCAGACTAATAA
CTTTGATGTAATACACTCTCGTTTGATGATGTTTGCTTTTATACAAAACTGGTTTTATTC
TTCATAATGTATCAATTGGTCCTTATCTGATGGTTTGCTGTTATTTTGGTTAGGGTGTCA
CATGTAAATCATTGCGTCTGTGATTTTTATCACTCTTTCAACTCTTTACTGTTAATTTTT
CGAACTACTCAAAGATCATCTATCAAATCGTTCTTATCAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER96TF U 34
AF RR4G188TF U 5
AF RR4BW20TF U 1
AF RR4BW20JQ C 134
BS 1 639 RR4BW20TF
BS 640 640 RR4BW20JQ
BS 641 664 RR4BW20TF
BS 665 665 RR4BW20JQ
BS 666 675 RR4BW20TF
BS 676 940 RR4BW20JQ

RD RR4ER96TF 184 0 0
TCGCCGATTGATCGATAGAGAACAACGACCATCCGTTAATCGCCGACGGAGAAATCGTGG
CCGTCTAAATTAGGCGAAGAAGATCCGATTCCGATTTCTAGAAGAATCAATCTTTAAGAG
ATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTAC
GCCT

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR4G188TF 592 0 0
G
AATCTGCTGTCTTTATAATTTATCAGAATCGCCGATTGATCGATAGAGAACAACGACCAT
CCGTTAATCGCCGACGGAGAAATCGTGGCCGTCTAA*TTAGGCGAAGAAGATCCGATTCC
GATTTCTAGAAGAATCAATCTTTAAGAGATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAG
CCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTGTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCGTTATC
TCAGCTTTATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCA
TGGTCTCGAAAAATTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGAC
GTCTATGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAGCCCCC
AATTTCCCCAAGAGCGCCGCCAACACAACCAGCAATGAATGCCGGGCTCATGGCCTCTTC
AGGCACGTCTTGCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAACCAGGT
GAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGCCCCATACGCCGTAGCCT

QA 2 592 2 592
DS 

RD RR4BW20TF 675 0 0
GGTCCAATCTGCTGTCTTTATAATTTATCAGAATCGCCGATTGATCGATAGAGAACAACG
ACCATCCGTTAATCGCCGACGGAGAAATCGTGGCCGTCTAAATTAGGCGAAGAAGATCCG
ATTCCGATTTCTAGAAGAATCAATCTTTAAGAGATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCG
ACGAGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCG
TTATCTCAGCTTTATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAA
CGCCATGGTCTCGAAAAATTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGA
GTGACGTCTATGGATATAATTAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAG
CCCCCAATTTCCCCAAGAGCGCCGCCAACACAACCGGCAATGAATGCCGGGCTCATGGCC
TCTTCAGGCACGTCTTGCCC***AGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAAC
CAGGTGAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAA
AACTACCAAATTCCGCAGGGAGGCTACATATCTGGCGCA*CCAGAAGCAGTGAACTGAAC
AGGG*ATCTAACTCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4BW20JQ 807 0 0
GAAGAATCAATCTTTAAGAGATGGG*AAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTCGATG
AGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCGTTATCTCAGCTTT
ATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTCTCG
AAAAATTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACGTCTATGG
ATATAATTAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAGCCCCCAATTTCCC
CAAGAGCGCCGCCAACACAACCGGCAATGAATGCCGGGCTCATGGCCTCTTCAGGCACGT
CTTGCCC***AGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAACCAGGTGAAGAACT
CGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAAAACTACCAAATTC
CGCAGGGAGGCTACATATCTGGCGCAACCAGAAGCAGTGAACTGAACAGGGGATCTAACT
CTCCAGGCTCTTTTGATTCCTCAATGGACATGCATGCAGACTAATAACTTTGATGTAATA
CACTCTCGTTTGATGATGTTTGCTTTTATACAAAACTGGTTTTATTCTTCATAATGTATC
AATTGGTCCTTATCTGATGGTTTGCTGTTATTTTGGTTAGGGTGTCACATGTAAATCATT
GCGTCTGTGATTTTTATCACTCTTTCAACTCTTTACTGTTAATTTTTCGAACTACTCAAA
GATCATCTATCAAATCGTTCTTATCAG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 2 4

CO CL3561Contig1 768 2 2 U
GATAGGAAGCAACGATATGGCATAAATGGCGTATCATTCGTTCCTGCTGATACACCACTG
AAGCTAGCAGATTACTTTAAGATCAAAGGTGTTTACAAAGTAGGAAGCATCCCTGATAAG
CCTGGAAGAGAAGGGATGAGACTAGAAACAGCAGTGATGGGAGTGCACCACAAAGATTTT
ATTGAGATCGTCTTTCAAAACCGAGAGAATATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGACAC
AACTTCTGGGTTGTCGGGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGA
GATTATAACCTCAAGGATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGG
ACAGCTGTATATGTGTCATTAGATAACGTCGGTATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGG
GCAAGACAATACTTAGGTCAACAATTCTACATCCGAGTTCACTCTCCGGCAAACTCTATC
AGAGATGAATATCCTTTGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACGC
AGGCGCGACTTCACTCCCTAGCTTATATTGACATGATGCCGTTCATATCATCTTGAAGGA
ATTAACCAATATATTTTAATCAGTAATATAATATATCCACACCAAAAAGATAAAAGTTTA
CCTTTATTTTACACCCATAAGCTTCAAAGTACGTAGCTTCTGTCTATGTACTTCAAAATA
CAATTCACATTATGTTTGTAATCCTTCTTAATGTATAACTGGATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE22TF U 1
AF RR4FE22JQ C 248
BS 1 760 RR4FE22TF
BS 761 768 RR4FE22JQ

RD RR4FE22TF 763 0 0
GATAGGAAGCAACGATATGGCATAAATGGCGTATCATTCGTTCCTGCTGATACACCACTG
AAGCTAGCAGATTACTTTAAGATCAAAGGTGTTTACAAAGTAGGAAGCATCCCTGATAAG
CCTGGAAGAGAAGGGATGAGACTAGAAACAGCAGTGATGGGAGTGCACCACAAAGATTTT
ATTGAGATCGTCTTTCAAAACCGAGAGAATATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGACAC
AACTTCTGGGTTGTCGGGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGA
GATTATAACCTCAAGGATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGG
ACAGCTGTATATGTGTCATTAGATAACGTCGGTATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGG
GCAAGACAATACTTAGGTCAACAATTCTACATCCGAGTTCACTCTCCGGCAAACTCTATC
AGAGATGAATATCCTTTGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACGC
AGGCGCGACTTCACTCCCTAGCTTATATTGACATGATGCCGTTCATATCATCTTGAAGGA
ATTAACCAATATATTTTAATCAGTAATATAATATATCCACACCAAAAAGATAAAAGTTTA
CCTTTATTTTACACCCATAAGCTTCAAAGTACGTAGCTTCTGTCTATGTACTTCAAAATA
CAATTCACATTATGTTTGTAATCCTTCTTAATGTATAACT
GGA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4FE22JQ 521 0 0
GGGTTGTCGGGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGAGATTATA
ACCTCAAGGATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGGACAGCTG
TATATGTGTCATTAGATAACGTCGGTATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGGGCAAGAC
AATACTTAGGTCAACAATTTTACATCCGAGTTCACTTTCCGGCAAACTTTATCAGAGATG
AATATCCTTTGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACGCAGGCGGG
ACTTCACTCCCTAGCTTATATTGACATGATGCCGTTCATATCATCTTGAAGGAATTAACC
AATATATTTTAATCAGTAATATAATATATCCACACCAAAAAGATAAAAGTTTACCTTTAT
TTTACACCCATAAGCTTCAAAGTACGTAGCTTCTGTTTATGTACTTCAAAATACAATTCA
CATTATGTTTGTAATCCTTCTTAATGTATAACTGGATTGAT

QA 1 521 1 521
DS 



CO CL3561Contig2 771 2 6 U
GCAGATTACTTTAAGATCAGAGGTGTTTACAAAGTAGGAAGCATCCCTGATAAGCCTGGA
AGAGAAGGGATGAGACTAGAAACAGCAGTGATGGGTGTACACCACAAGGATTTTCTTGAG
ATTGTCTTTCAAAACCGCGAGAAGATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGATACAACTTC
TGGGTTGTCGGGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGAGATTAT
AACCTCAAGGATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGGACAGCT
GTATATGTGGCATTAGATAATGTTGGTATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGGGCAAGA
CAATACTTAGGTCAACAATTCCACATCCGAGTTCACTCTCCGGCTAACTCTATCAGAGAT
GAATATCCTTTGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACACAGGCGC
GACTTCACTCCCTAGCTCCTATTGACATGATGCCGTTCATATCATCTTGAAGAAATTAAC
CAATATATCTTAATCAGTAATATAATATATCCACACCAAAAAAGATAAAAAAATTACCTT
TATTTTACACCCATAAGCTTCAAAGTACGTAGCTTCTGTCTATGTACTTCAAAGTACAAT
TCACATTATGTTTGTAATCATTCTTAATGTATAACTAGACGATAATTTGCACCCTGCGCG
GATGAGTTTTTTAAAGTATGTTGTCTTTAAACATTATAAAAAATATTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY26TF U 1
AF RR4FY26JQ C 11
BS 1 676 RR4FY26TF
BS 677 677 RR4FY26JQ
BS 678 731 RR4FY26TF
BS 732 732 RR4FY26JQ
BS 733 747 RR4FY26TF
BS 748 771 RR4FY26JQ

RD RR4FY26TF 747 0 0
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AGAGAAGGGATGAGACTAGAAACAGCAGTGATGGGTGTACACCACAAGGATTTTCTTGAG
ATTGTCTTTCAAAACCGCGAGAAGATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGATACAACTTC
TGGGTTGTCGGGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGAGATTAT
AACCTCAAGGATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGGACAGCT
GTATATGTGGCATTAGATAATGTTGGTATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGGGCAAGA
CAATACTTAGGTCAACAATTCCACATCCGAGTTCACTCTCCGGCTAACTCTATCAGAGAT
GAATATCCTTTGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACACAGGCGC
GACTTCACTCCCTAGCTCCTATTGACATGATGCCGTTCATATCATCTTGAAGAAATTAAC
CAATATATCTTAATCAGTAATATAATATATCCACACCAAAAAAGATAAAAAAATTACCTT
TATTTTACACCCATAAGCTTCAAAGTACGTAGCTTCTGTCTATGTACTTCAAAGTACAAT
TCACATTATGTTTGTA*TCATTCTTAATGTATAACTAGACGATAATTTGCACCCTGCGCG
GATGAGTTTTT*AAAGTATGTTGTCTT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4FY26JQ 761 0 0
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TGAGACTAGAAACAGCAGTGATGGGTGTACACCACAAGGATTTTCTTGAGATTGTCTTTC
AAAACCGCGAGAAGATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGATACAACTTCTGGGTTGTCG
GGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGAGATTATAACCTCAAGG
ATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGGACAGCTGTATATGTGG
CATTAGATAATGTTGGTATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGGGCAAGACAATACTTAG
GTCAACAATTCCACATCCGAGTTCACTCTCCGGCTAACTCTATCAGAGATGAATATCCTT
TGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACACAGGCGCGACTTCACTC
CCTAGCTCCTATTGACATGATGCCGTTCATATCATCTTGAAGAAATTAACCAATATATCT
TAATCAGTAATATAATATATCCACACCAAAAAAGATAAAAAAATTACCTTTATTTTACAC
CCATAAGCTTCAAAGTACGTAGCTTCTGTCTATGTACTTCAAAGTACAATTCACATTATG
TTTGTAATCATTCTTAATGTATAACTAGACGATAATTTGCACCCTGCGCGGATGAGTTTT
TTAAAGTATGTTGTCTTTAAACATTATAAAAAATATTAAGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL3562Contig1 711 4 12 U
TTTTTTTTTGGTTAAAACCAAAACTTCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCGACTA
ACAAGTTCTGTATTCAATATCAAAAACAACGAAGAAGAAAAAAGAGGAACAGAAAGTGGA
CACAAGAAAAATGAAATGGATTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAACATATGGTTGAGAGATC
CGACTTTGCTGATTTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTC
TCCTCACCGTAATCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCC
TCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCGAGGGTTTTAGCGCTTGGAACAGTA
AGCAAGTTGATGCTGTGATCAGCGCAAAGAGCTTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGG
TTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTT
TCATGGAGACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTCAACTCCAAT
GCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATGACAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACA
GCAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGTAAAA
GCAAAAGCTCCTTTTTAAATCTTAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F563JQ U 10
AF RR4F563TF C 1
AF RR4AU45JQ U 14
AF RR4AU45TF C 16
BS 1 15 RR4F563TF
BS 16 149 RR4F563JQ
BS 150 150 RR4AU45JQ
BS 151 162 RR4F563JQ
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BS 451 451 RR4AU45JQ
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BS 649 693 RR4AU45JQ
BS 694 711 RR4F563TF

RD RR4F563JQ 639 0 0
GGTTAA
AACCAAAACTTCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCGACTAACAAGTTCTGTATTC
AATATCAAAAACAACGAAGAAGAAAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAA
ATGGATTTTTTTTT*GGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGATTT
TAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCC
TTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTG
CAAAGACCAGCCCACTCTCCGAGGGTTTTAGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGCTG
TGATCAGCGCAAAGAGCTTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCC
AAGACACAGAGCTGAACAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTTATGGAGACCACGA
ACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTCAACTCCAATGCAGTCAACAGATCC
ATGTCCTCTGGAATGACAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGCAGGAGCAGCAGCA
GCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGA

QA 7 639 7 639
DS 

RD RR4F563TF 711 0 0
TTTTTTTTTGGTTAAAACCAAAACTTCATTTTCCAAACAAATCTCAAGAC*TGTCGACTA
ACAAGTTCTGTATTCAATATCAAAAACAACGAAGAAGAAAAAAGAGGAACAGAAAGTGGA
CACAAGAAAAATGAAATGGATTTTTTTTT*GGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATC
CGACTTTGCTGATTTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTC
TCCTCACCGTAATCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCC
TCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCGAGGGTTTTAGCGCTTGGAACAGTA
AGCAAGTTGATGCTGTGATCAGCGCAAAGAGCTTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGG
TTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTT
TTATGGAGACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTCAACTCCAAT
GCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATGACAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACA
GCAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGTAAAA
GCAAAAGCTCCTTTTTAAATCTTAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4AU45JQ 695 0 0
AG
AACCAAAACTTCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCGACTAACAAGTTCTGTATTC
AATATCAAAAACAACGAAGAAGAAAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAA
ATGGATTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAACATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGATTT
TAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCC
TTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTG
CAAAGACCAGCCCACTCTCCGAGGGTTTTAGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGCTG
TGATCAGCGCAAAGAGCTTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCC
AAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCACGA
ACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTCAACTCCAATGCAGTCAACAGATCC
ATGTCCTCTGGAATGACAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGCAGGAGCAGCAGCA
GCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGTAAAAGCAAAAGCTCCTTTT
TAAATCTTAGAGAGAGAG
AGAGAGGCGCTACCC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR4AU45TF 693 0 0
AACCAAAACTTCATTTTCCAAACAAATCTCAAGAC*TGTCGACTAACAAGTTCTGTATTC
AATATCAAAAACAACGAAGAAGAAAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAA
ATGGATTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAACATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGATTT
TAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCC
TTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTG
CAAAGACCAGCCCACTCTCCGAGGGTTTTAGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGCTG
TGATCAGCGCAAAGAGCTTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCC
AAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCACGA
ACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTCAACTCCAATGCAGTCAACAGATCC
ATGTCCTCTGGAATGACAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGCAGGAGCAGCAGCA
GCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGTAAAAGCAAAAGCTCCTTTT
TAAATCTTAGAGAGAGAG
AGAGAGGCGCTACCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 4

CO CL3563Contig1 1382 4 3 U
AATGTAAATTATTTTAGGGAAAAAATCCCTCGTAGCATGACGAGATTAAACATTCACAGT
AGGGGTTTTTCTCAATCCAACACTTTTTTGATGCAACAAAGGCAAACCACAGTATCTTTG
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ATGCGTCTGCACAAGAATCCTCATCAATGAACAAACTTGATAAAACACACAAATATTTCA
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AGCAATGACAAGATAATCATATCCAAAGACAAGCCCATCGGCCGTGACTACTTGAGAGTT
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CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 

AF RR4DP56JQ U 1
AF RR4CE02JQ U 93
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AF RR4DP56TF C 806
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GT
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ACCATCAGCCTTCCTTTACCATCCAAACCATCTTTCAGAACAGTTCCTTTTAGCCATTCT
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ACAAACTCCAATAACCTCGGTCCATTGTGTACTAGAGTAACC

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CGGTCCATTGTGTACTAGAGTAACCTTCTTCTCCGGGAAATCGACTGCAATCTCAGCGGC
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GGTCTGGTTTTGGGAAGCACATCGTTGTGACCTGTAGCAATGACAAGATAATCATATCCA
AAGACAGGCCCATCGGCCGTGACTACTTGAGAGTTGGTGATATTGACAGCTGGAGAAGTC
ACGACACG*CCGTTTTGAAGGTACTTTTTGTGGTTGATCAACGTTCTTTCCGCAAAAGAA
GGCTCCACCATGGACCTCAAACTTGCCCATGTGATCTCAAAGTATTCCTTCGGATCGATA
AGGGTGACGTCGGAATCGAACTGAAGGGATTTGGAGGCCAACGAGCCGGCGATTCCGCCG
CCGATAACCACCACCCTCCGCCCATTTCCTGATTCGGATTCTGTTCTTTCCATTTTTATC
GATTAGGATTCCAGATGAATAATGTTTGTTCGATTCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 4

CO CL3564Contig1 816 4 18 U
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TTTTCGATGGTTGCACAACCAACAAAGTGGCAGATTCTTTGATTCAAAAATCATGCAAAA
AAGCTTCAAAGTTTCCAGGTGGGAACATGATTCCAGATTTTGAAAAAGTTTGCCTTGCAT
CTCTCAAAGAGAATCCGAAGAGCCAGAAAGTGAGAAATCTCGGTGATTTGACCATAGTAG
GAGCACATAACGCCATATCAAACTTAACGAATGTGAAAAGAATGGTGGAGAAGATTATAA
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BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4DZ38TF U 1
AF RR4DZ38JQ C 74
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4B080TF U 1
AF RR4AX49JQ C 1
AF RR4B080JQ C 1
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AS 1 4

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TAATTTGGCTCAAGAAACTTTATTATACACATGTGATTACGAACCTCGCTGCATTTGCTA
CATATGCGATGATGTATACGAAGTATGTGACGAATTCATCACTCATCTCAAGAGTGAAGA
GCACAGAAAAGAGTTGTTTCTACTTCAAGAAGAGGCAAGACGCCATCTTTTGGACCTTTT
GGAAGAAGAAGAAATCTCTTTGATCGAGGCGGAAAAGAAGAGGCAAGAAGCTGCATCCCC
ATGGGGTCTTTGTGTTAAAGAGTTTACTGAATGGAAATAAATGGGAACCCTTGTCTTTTT
TTCTCCTATTTCATATAGCATATCAATATGTTTCCATGTATGATTGCTTTATGAGCCTAA
TAATATTTCTTAAAACTTGAGTTTGAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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TA

QA 1 796 1 796
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ATCTCTGTTCCCAAATTCGAACCCAAGAGGACCCAGCGAGATTCGATTCTCCAACAGATG
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TCAAATTCGTTGTTGCGAGAAGGCAGGAGGAGGAGGTGATGTGTCAAAAAAAACGGGAGT
GTGGTGGGACTTGAACACGTGTCCTCTTCCGGCTGGTTTTGACCCTCGTTGGGTCCGTCC
GTGTATAGAATCTGCCGTGGAAGAGGATATTGGTTTTCGTACTGAAGTCACCATATTTGC
AATGGGCAACCTAGAATACATCTCTATTGACCTCTTGGAAAAGATCTCTTCCTCTGGGAT
CATTCTTACTCACTCCCCCTGCGATTGTAAAACAAACAACCCCAAAGGCTTAATGTTATT
TATGGACGACTGGTTTGGTGATGACTTTAGCAACCCACATCCTCCGGGTTACGTAATGAT
CATCTCGGGTGATCAGAAAATTCTTGATCCTTGGCGTTTTCGGAGTTTTGGGCACACTAC
TTTTGTTGCATTTCCAAAAGGTGTTCGCCTACTTGCACCTCATGCCGAACTACAATTTAT
TGGCGAACTGTTTGAGTACGTGTTTGCCAAACAGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGACTGA
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CATATGCGATGATGTA

QA 1 796 1 796
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CTGGTTTGGTGATGACTTTAGCAACCCACATCCTCCGGGTTACGTAATGATCATCTCGGG
TGATCAGAAAATTCTTGATCCTTGGCGTTTTCGGAGTTTTGGGCACACTACTTTTGTTGC
ATTTCCAAAAGGTGTTCGCCTACTTGCACCTCATGCCGAACTACAATTTATTGGCGAACT
GTTTGAGTACGTGTTTGCCAAACAGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGACTGATAATTTGGC
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QA 1 859 1 859
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TTGGCGTTTTCGGAGTTTTGGGCACACTACTTTTGTTGCATTTCCAAAAGGTGTTCGCCT
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ATGTGATTACGAACCTCGCTGCATTTGCTACATATGCGATGATGTATACGAAGTATGTGA
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GGAAAAGAAGAGGCAAGAAGCTGCATCCCCATGGGGTCTTTGTGTTAAAGAGTTTACTGA
ATGGAAATAAATGGGAACCCTTGTCTTTTTTTCTCCTATTTCATATAGCATATCAATATG
TTTCCATGTATGATTGCTTTATGAGCCTAATAATATTTCTTAAAACTTGAGTTTGAGT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 2 4

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AGCATTCCTTTGACACTCCAGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACAT
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AACTCAATGCCACTAACCGAAAGCAAAGTGGAAGTTTAGCTGTTCGCGACCTATCAAGCT
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ACGCTCATTCTTGACGCTTGTGCGATCTACTAACAGTTTATACTGGAAAGCGAGGAGGAT
GCAGGAGCATGGCTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM74TF U 1
AF RR4FI16TF U 214
BS 1 356 RR4CM74TF
BS 357 357 RR4FI16TF
BS 358 381 RR4CM74TF
BS 382 382 RR4FI16TF
BS 383 604 RR4CM74TF
BS 605 605 RR4FI16TF
BS 606 685 RR4CM74TF
BS 686 1036 RR4FI16TF

RD RR4CM74TF 701 0 0
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AGCATTCCTTTGACACTCCAGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACAT
TAGATTCTCTGCACGCCCTCGGCGATGATCTGCTGAAGTCAAACAGCTTTGTGGAAGGAG
TATCGCAGAAGATAAGGAGACAGATCGAAGAGTTGGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCA
ACGCTCTAACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACTAGGTTTGTCTGGGATG
AAGCTAAGTACCCAACAATGTCACCTCTCAAGGAGGTTGTGGACAACATTCAGTCT*AGG
TTGCAAAGATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTTGCTGAATATAACAATGTCCGCGGTC
AACTCAATGCCACTAACCGAAAGCAAAGTGGAAGTTTAGCTGTTCGCGACCTATCAAGCT
TGGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGCATCGGAACATCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTC
CAAAGTATTCCCAAAAAGACTGGCTAGCATGCTATGAGACATTGACCGACTTTGTGGTTC
CTAG*TCATCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGAGTATGCTCTTTACACCGTCACTCTCT
TCACTCGTGTTGCAGATAATTTCAG
ACTATGCGCGTGAGAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FI16TF 823 0 0
G
GGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCAACGCTCTAACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTC
TTATCTCACTAGGTTTGTGTGGGATGAAGCTAAGTACCCAACAATGTCACCTCTCAAGGA
GGTTGTGGACAACATTCAGTCTCAGGTTGCAAAGATTGAGGATGATCCCAAGGTTCGTGT
TGCTGAATATAACAATGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCAAAGTGGAAG
TTTAGCTGTTCGCGACCTATCAAGCTTGGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGCATCGGAACA
TCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTCCAAAGTATTCCCAAAAAGACTGGCTAGCATGCTA
TGAGACATTGACCGACTTTGTGGTTCCTAGGTCATCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGA
GTATGCTCTTTACACCGTCACTCTCTTCACTCGTGTTGCAGATAATTTCAGGACTAATGC
GCGTGAGAAAGGGTTCCAAGTTCGTGATTTTGAACATAGCGTTGAAGCACAAGAGACTCG
TAAACAAGAGCTAGAGAAGCTGGTTCATGATCAGGAAAGTTTGAGAAGCTCTCTTTTGCA
GTGGTGCTACACCAATTACGGAGAGGTTTTCAGCTCATGGATGCATTTCTGTGCTGTGCG
TATATTCGCTGAGAGCATAATGAGATATGGTTTACCTCCGCGTTCTTGGCATGTGTCTTA
TCTCCGCTGTTAAAGCGAGAAGAAGTACGCTCATTCTTGACGCTTGTGCGATCTACTAAC
AGTTTATACTGGAAAGCGAGGAGGATGCAGGAGCATGGCTGG

QA 2 823 2 823
DS 



CO CL3567Contig2 949 2 18 U
GAGTGAAAACGAATCTGCGTAATATAAACAAGGCATCCAAGTAACATGGCAAAAGGTTTT
AACAATACTGTATAACCTTCCCTCTTCCACAAGTATCAGAAATTCATCGGAATCTACAAG
ACTCCGGCCAAAATAAAACTACAGTCACATGTCTCTCTAGAGTGCCACCTTTACTTTTAT
TTCGAATAATCAAAACAAATCACGAATAATAAAATGGAATACATATATGGAACATAAACA
AATAGAAAAGATGAAGTGTGAGATGTAAAAAAAGCATCTCTCATCAACTTTTTTAAGCAA
GGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGG
CTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTAGTAAAATCGCACAAGCGTTCAA
GAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAACG
CCGGAGGCAAACCATATCTCATTATGCTCTCAGCGAATATACGCACAGCACAGAAATGCA
TCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGTAACTGGTGTAGCACCACTGCAAAAGAGAGCTTCTCA
AACTTTCCTGATCATGAACCAGCTTCTCTAGCTCTTGTTTACGAGTCTATTGTGCTTCAA
CGCTATGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCTTTCTCACGCGCATTAGTCCTGAAATTAT
CTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACGGTGTAAAGAGCATACTCATTATCCTCAAACAATT
TCTTCGATGACCTAGGAACCACAAAGTCGGTCAATGTCTCATAGCATGCTAGCCAGTCTT
TTTGGGAATACTTTGGAACAACTGCAAGGAGAGTCTCGAGATGTTCCGATGCGACAATAT
CTTCTGGCTTAACCAAGCTTGATAGGTCGCGAACAGCTAAACTTCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FI16JQ U 1
AF RR4CM74JQ U 155
BS 1 247 RR4FI16JQ
BS 248 248 RR4CM74JQ
BS 249 267 RR4FI16JQ
BS 268 268 RR4CM74JQ
BS 269 270 RR4FI16JQ
BS 271 271 RR4CM74JQ
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BS 402 402 RR4CM74JQ
BS 403 487 RR4FI16JQ
BS 488 488 RR4CM74JQ
BS 489 566 RR4FI16JQ
BS 567 567 RR4CM74JQ
BS 568 648 RR4FI16JQ
BS 649 649 RR4CM74JQ
BS 650 746 RR4FI16JQ
BS 747 747 RR4CM74JQ
BS 748 760 RR4FI16JQ
BS 761 949 RR4CM74JQ

RD RR4FI16JQ 760 0 0
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AACAATACTGTATAACCTTCCCTCTTCCACAAGTATCAGAAATTCATCGGAATCTACAAG
ACTCCGGCCAAAATAAAACTACAGTCACATGTCTCTCTAGAGTGCCACCTTTACTTTTAT
TTCGAATAATCAAAACAAATCACGAATAATAAAATGGAATACATATATGGAACATAAACA
AATAGAACAGATGAAGTGTGAGATGTAGAAGAAGCATCTCTCATCAACTTTTTTAAGCAA
GGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGG
CTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTAGTAGAATCGCACAAGCGTTCAA
GAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAACG
CCGGAGGTAAACCATATCTCATTATGCTCTCAGCGAATATACGCACAGCACAGAAATGCA
TCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGTAATTGGTGTAGCACCACTGCAAAAGAGAGCTTCTCA
AACTTTCCTGATCATGAACCAGCTTCTCTAGCTCTTGTTTACGAGTCTCTTGTGCTTCAA
CGCTATGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCTTTCTCACGCGCATTAGTCCTGAAATTAT
CTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACG*TGTAAAGAGCATA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4CM74JQ 795 0 0
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TGGAATACATATATGGAACATAAACAAATAGAAAAGATGAAGTGTGAGATGTAAAAAAAG
CATCTCTCATCAACTTTTTTAAGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTC
GGAGTCACCGGCTGAACCAGCCATGGCTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACT
GTTAGTAAAATCGCACAAGCGTTCAAGAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGC
CGGAGATAAGACACATGCCAAGAAGGCCGGAGGCAAACCATATCTCATTATGCTCTCAGC
GAATATACGCACAGCACAGAAATGCATCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGTAACTGGTGTA
GCACCACTGCAAAAGAGAGCTTCTCAAACTTTCCTGATCATGAACCAGCTTCTCTAGCTC
TTGTTTACGAGTCTATTGTGCTTCAACGCTATGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCTTT
CTCACGCGCATTAGTCCTGAAATTATCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACGGTGTAAAG
AGCATACTCATTATCCTCAAACAATTTCTTCGATGACCTAGGAACCACAAAGTCGGTCAA
TGTCTCATAGCATGCTAGCCAGTCTTTTTGGGAATACTTTGGAACAACTGCAAGGAGAGT
CTCGAGATGTTCCGATGCGACAATATCTTCTGGCTTAACCAAGCTTGATAGGTCGCGAAC
AGCTAAACTTCCACT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 4

CO CL3568Contig1 965 4 13 U
GAAGGTTTGATTTTGTGGATAACGCTGATATAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAA
ACTTCCACTTCAACGTTATCAGCGGCAAGAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTG
CTCCAGCTGAAAGCCCCAACACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGA
TCCTCAACACTAAGATCGCCACAGGAGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGA
ATCTCCTCATTGAGAAAGTTGTGTGCGGTCCAGGACATGGAATCAGTGTTGGAAGCCTTG
GAAGGTACGGATGGGAGCAAGATGTAAATGACATTAAGGTTATGAACTGCACCCTCCTGG
GAACCGATAACGGTCTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTACGGCTTGCGCCACAACCGCTA
CCGGTATTCATTTTGAGGATATCATCCTTGACAATGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACC
AGGAGTACTGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGG
ACATTACCTTCAGGAAGATTAGAGGAACATCAGGGAACAAGGACGCAGTGAAGCTATTGT
GCAGCAAGGGACATCCATGTGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAG
GAGCTGATGGTCCACCCACTTTCGAGTGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACTC
AGAACCCAAAGGCTTGCGGTGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGCAAAGTGTAAAATGTTG
AAGTTCATATCAAGACACTAGGGCTTTCACGTCCAAATTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACC
CTTTTTCAAGTCACGTAAGGGAGACTTTTACAAAGCTGTAACAAAAAAAATGTTTCTATC
CGATGCCAACACATATATAGATGTGTGAGTGCATTATGATTTAATAAAACTAAAAAGATT
AATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGAGCTGATGGTCCACCCACTTTCGAGTGC
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CATCCAAATTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACCCTTTTTCAAGTCACGTAAGGGAGACTTTT
ACAAAGCTGTAACAAAAAAAATGTTTCTATCCGATGCCAACACATATATAGATGTGTGAG
TGCATTATGATTTAATAAAACTAAAAAGATTAAT
CT

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DS 



AS 1 4

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CCTCTTCCCCTCTCTCTCTAACTCTCGCCGTAAGTGATTTTTTTTTCGGTAGCGACGGCG
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ATGGCTATGAACTACGTTCAGAAGGTTTCCGATAAGGTCTCACTTGCCACCGATTTTATG
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU38TF U 98
AF RR4AY64TF U 1
AF RR4BU38JQ C 586
AF RR4AY64JQ C 432
BS 1 162 RR4AY64TF
BS 163 163 RR4BU38TF
BS 164 226 RR4AY64TF
BS 227 227 RR4BU38TF
BS 228 800 RR4AY64TF
BS 801 873 RR4AY64JQ
BS 874 875 RR4BU38JQ
BS 876 1269 RR4AY64JQ

RD RR4BU38TF 569 0 0
TTTTTTTTTCGGTAGCGACGGCGATGGCGGATCTTTTCCCACCTCTCGTGACGGCTCAAA
TCGACGACAAGCCTAAAGTCGACGAGAAAGTCGATTACTCGAATCTCCCTTGCCCTGTTC
CCTATGAAGAACTCCACCGCGAAGCTTACATGTCTTTAAAGCCAGACACTTTCGAGGGTC
TACGCTTCGACTTTACCAAGGGGTTGAATCAGAAGTTTGGTCTCTGCCACAGTGTAATGA
TGGGGCCAACCGAAGTTCCTTCTCAGTCGCCTGACACGGTGATTAAAATTCCAACTGCCC
ATTATGAGTTTGGTGCCAATTATATTGACCCGAAGTTGATGCTTGTTGGAAGGGTTATGA
CTGATGGTAGACAAAGTGCAAGAGTGAGAGCTGATTTAACTGATAAGTTGATGGTGAAGG
CGAATGCTCAGCTTGCAAATGAGCCTCATATGTCACAAGCAATGTTCAACTTTGATTACA
TGGGATCAGACTACAGAGCCCAACTTCAATTTGGGAACAATGCTCTAGTTGGAGCAAACT
ATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATCT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4AY64TF 800 0 0
GGGGATCTCTCGCCCCCAAATCCTCCTCACAAGAGAAAACCCTTAACACACTTCCTTCTT
CCTCTTCCCCTCTCTCTCTAACTCTCGCCGTAAGTGATTTTTTTTTCGGTAGCGACGGCG
ATGGCGGATCTTTTCCCACCTCTCGTGACGGCTCAAATCGACTACAAGCCTAAAGTCGAC
GAGAAAGTCGATTACTCGAATCTCCCTTGCCCTGTTCCCTATGAAGGACTCCACCGCGAA
GCTTACATGTCTTTAAAGCCAGACACTTTCGAGGGTCTACGCTTCGACTTTACCAAGGGG
TTGAATCAGAAGTTTGGTCTCTGCCACAGTGTAATGATGGGGCCAACCGAAGTTCCTTCT
CAGTCGCCTGACACGGTGATTAAAATTCCAACTGCCCATTATGAGTTTGGTGCCAATTAT
ATTGACCCGAAGTTGATGCTTGTTGGAAGGGTTATGACTGATGGTAGACAAAGTGCAAGA
GTGAGAGCTGATTTAACTGATAAGTTGATGGTGAAGGCGAATGCTCAGCTTGCAAATGAG
CCTCATATGTCACAAGCAATGTTCAACTTTGATTACATGGGATCAGACTACAGAGCCCAA
CTTCAATTTGGGAACAATGCTCTAGTTGGAGCAAACTATATTCAGAGTGTGACACCCCGT
CTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTCTGGGTTGGTGTCCCTCGGAAGTCGGGTATAGGTTAC
GCTGCAAGATACGAAACTGGTAGGATGGTCGCCTCTGGGCAAGTTGCTAGCACTGGTCTT
ATGGCTATGAACTACGTTCA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4BU38JQ 587 0 0
GACTACAGAGCCCAACTTCAATTTGGGAACAATGCTCTAGTTGGAGCAAACTATATTCAG
AGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTCTGGGTTGGTGTCCCTCGGAAG
TCGGGTATAGGTTACGCTGCAAGATACGAAACTGATAAGATGGTCGCCTCTGGGCAAGTT
GCTAGCACTGGTCTTATGGCTATGAACTATGTTCAGAAGGTTTCCGATAAGGTCTCACTT
GCCACTGATTTTATGTACAACTACTTTTCAAGAGAAGCTGTAGCTAGTGTTGGGTATGAC
TACATGCTCAGACAGTCTCGTGTGCGGGGAAAGATAGATTCGAACGGTGTTGCATCCGCT
CTTCTGGAAGAAAGATTGAGTATGGGACTCAATTTTCTTATGTCTGCAGAGCTTGACCAT
AAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTAATAAGCACAGCGACGC
ACGGAATAAGCCCTGGCAGCTGCAGCTGTTGTGCGGGGGGATCGGTTCAATTTTATTATA
TTCTCCCTTCAAGATTTTCAGTTTAGGCTATTTTCGTTGGGAAGTTG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4AY64JQ 838 0 0
GTTGATGCTTGTTGGAAGGGTTATGACTGATGGTAGACAAAGTGCAAGAGTGAGAGCTGA
TTTAACTGATAAGTTGATGGTGAAGGCGAATGCTCAGCTTGCAAATGAGCCTCATATGTC
ACAAGCAATGTTCAACTTTGATTACATGGGATCAGACTACAGAGCCCAACTTCAATTTGG
GAACAATGCTCTAGTTGGAGCAAACTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGG
TGGGGAAGTTTTCTGGGTTGGTGTCCCTCGGAAGTCGGGTATAGGTTACGCTGCAAGATA
CGAAACTGGTAGGATGGTCGCCTCTGGGCAAGTTGCTAGCACTGGTCTTATGGCTATGAA
CTACGTTCAGAAGGTTTCCGATAAGGTCTCACTTGCCACCGATTTTATGTACAACTACTT
TTCAAGAGAAGCTGTAGCTAGT**TGGGTATGACTACATGCTCAGACAGTCTCGTGTGCG
GGGAAAGATAGATTCGAACGGTGTCGCATCCGCTCTTCTGGAAGAAAGATTGAGTATGGG
ACTCAATTTTCTTATGTCTGCAGAGCTTGACCATAAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATT
CGGTTTAACAGTCGGCTAATAAGCACAGCGACGCACGGAATAAGCCCTGGCAGCTGCAGC
TGTTGTGCGGGGGGATCGGTTCAATTTTATTATATTCTCCCTTCAAGATTTTCAGTTTAG
GCTATTTTCGTTGGGAAGTTGAACAAAAAACAAAGGAAATATTGTGTTGTTTATTTGCGG
TTTAGGTTTTCTCTCCAAGAACATCCAATTAAAGGAGGTTTTTTTTTGTGTTTTAAAG

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 4

CO CL3570Contig1 744 4 8 U
GGAGAGACGCAGCCCCTTCCCTTCCTTACCCTACCTTGAACGCTTCTCTCAGATCTCTTC
TAGAAATCAAAACCATCTCACAAAAGATGTCGACGAAGAAGATTGTGTTGAAAAGCTCCG
ACGGCGAGTCCTTCGAGGTGGACGAGGCCGTGGCTCTCGAGTCTCAGACCATAGCCCACA
TGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGGATCCCTCTCCCCAACGTCACGAGCAAGATCC
TCGCCAAGGTGATTGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGACCGAGG
CCGTCGACGGCGGCGCTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCGTGGGACGGCGAGTTCATGA
AGATCGATCAGGCCACCCTCTTCGAGCTCATTCTGGCTGCTAACTATTTGAACATCAAGA
ACCTTCTTGACCTGACATGCCAGACGGTTGCTGATATGATCAAGGGCAAGACTCCAGAGG
AGATTCGCCAGACCTTCAACATCAAGAACGACTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGC
GCAGAGAGAACCAGTGGGCTTTTGAATGATCAATGGCCTGTCATTGGAAGCAAAACCCCC
TTTTATGTTATTGTCCTTCTCTTTACTCTGTGGATGATGATAGACTTGGTTTTCTTTCTG
TTTTCGCTTTGCAATCCATGACTGTTTTCGTCCCTATTTATTAAATATTAAGAACCTATG
CTTGCTCAATCGGTTTTTAAGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ03TF U 26
AF RR4CJ75TF U 1
AF RR4F005TF U 26
AF RR4F005JQ C 203
BS 1 169 RR4CJ75TF
BS 170 170 RR4BZ03TF
BS 171 310 RR4CJ75TF
BS 311 311 RR4F005TF
BS 312 693 RR4CJ75TF
BS 694 694 RR4F005TF
BS 695 728 RR4CJ75TF
BS 729 744 RR4F005JQ

RD RR4BZ03TF 667 0 0
GG
ACCCTACCTTGAACGCTTCTCTCAGATCTCTTCTAGAAATCAAAACCATCTCACAAAAGA
TGTCGACGAAGAAGATTGTGTTGAAAAGCTCCGACGGCGAGTCTTTCGAGGTGGACGAGG
CCGTGGCTCTCGAGTCTCAGACCATAGCCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACG
GGATCCCTCTCCCCAACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATTGAGTACTGCAAGA
AGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGACCGAGGCCGTCGACGGTGGCGCTTCCTCCGACG
ATGACCTCAAGGCGTGGGACGGCGAGTTCATGAAGATCGATCAGGCCACCCTCTTCGAGC
TCATCCTGGCTGCTAACTACTTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTGACATGCCAGACGG
TTGCTGATATGATAAAGGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCCAGACCTTCAACATCAAGA
ACGACTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGCGCAGAGAGAACCAGTGGGCTTTTGAAT
GATCAATGGCCTGTCATTGGAAGCAAAACCCCCTTTTATGTTATTGTCCTTCTCTTTACT
CTGTGGATGATGATAGACTTGGTTTTCTTTCTGTTTTCGCTTTGCAATCCATGACTGTTT
TCGTC

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR4CJ75TF 732 0 0
GGAGAGACGCAGCCCCTTCCCTTCCTTACCCTACCTTGAACGCTTCTCTCAGATCTCTTC
TAGAAATCAAAACCATCTCACAAAAGATGTCGACGAAGAAGATTGTGTTGAAAAGCTCCG
ACGGCGAGTCCTTCGAGGTGGACGAGGCCGTGGCTCTCGAGTCTCAGACTATAGCCCACA
TGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGGATCCCTCTCCCCAACGTCACGAGCAAGATCC
TCGCCAAGGTGATTGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGACCGAGG
CCGTCGACGGTGGCGCTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCGTGGGACGGCGAGTTCATGA
AGATCGATCAGGCCACCCTCTTCGAGCTCATTCTGGCTGCTAACTATTTGAACATCAAGA
ACCTTCTTGACCTGACATGCCAGACGGTTGCTGATATGATCAAGGGCAAGACTCCAGAGG
AGATTCGCCAGACCTTCAACATCAAGAACGACTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGC
GCAGAGAGAACCAGTGGGCTTTTGAATGATCAATGGCCTGTCATTGGAAGCAAAACCCCC
TTTTATGTTATTGTCCTTCTCTTTACTCTGTGGATGATGATAGACTTGGTTTTCTTTCTG
TTTTCGCTTTGCAATCCATGACTGTTTTCGTCC*TATTTATTAAATATTAAGAACCTATG
CTTGCTCA
TCGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4F005TF 714 0 0
GG
ACCCTACCTTGAACGCTTCTCTCAGATCTCTTCTAGAAATCAAAACCATCTCACAAAAGA
TGTCGACGAAGAAGATTGTGTTGAAAAGCTCCGACGGCGAGTCCTTCGAGGTGGACGAGG
CCGTGGCTCTCGAGTCTCAGACCATAGCCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACG
GGATCCCTCTCCCCAACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATTGAGTACTGCAAGA
AGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGACCGAGGCCGTCGACGGCGGCGCTTCCTCCGACG
ATGACCTCAAGGCGTGGGACGGCGAGTTCATGAAGATCGATCAGGCCACCCTCTTCGAGC
TCATTCTGGCTGCTAACTATTTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTGACATGCCAGACGG
TTGCTGATATGATCAAGGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCCAGACCTTCAACATCAAGA
ACGACTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGCGCAGAGAGAACCAGTGGGCTTTTGAAT
GATCAATGGCCTGTCATTGGAAGCAAAACCCCCTTTTATGTTATTGTCCTTCTCTTTACT
CTGTGGATGATGATAGACTTGGTTTTCTTTCTGTTTTCGCTTTGCAATCCATGACTGTTT
TCGTCCCTATTTATTAAATATTAAGAACCTATGCTTGCTCA
ATCGGTTTTAA

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR4F005JQ 542 0 0
CAACGGGATCCCTCTCCCCAACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATTGAGTACTG
CAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGACCGAGGCCGTCGACGGCGGCGCTTCCTC
CGACGATGACCTCAAGGCGTGGGACGGCGAGTTCATGAAGATCGATCAGGCCACCCTCTT
CGAGCTCATTCTGGCTGCTAACTATTTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTGACATGCCA
GACGGTTGCTGATATGATCAAGGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCCAGACCTTCAACAT
CAAGAACGACTTTACACCCGAGGAAGAGGAGGAGGTGCGCAGAGAGAACCAGTGGGCTTT
TGAATGATCAATGGCCTGTCATTGGAAGCAAAACCCCCTTTTATGTTATTGTCCTTCTCT
TTACTCTGTGGATGATGATAGACTTGGTTTTCTTTCTGTTTTCGCTTTGCAATCCATGAC
TGTTTTCGTCCCTATTTATTAAATATTAAGAACCTATGCTTGCTCAATCGGTTTTTAAGG
GC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 2 4

CO CL3571Contig1 725 2 2 U
AGAACTCAGACTGCCTTATACTATATTGGTCCAAACCTGATGCAAAGACAATCATACAAC
ACATAGCATTTTCAAAAACCTTAAAACCCAAAATCAGATTCACACTGATCAAGAAGAGAG
ACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCACTTTTTGAAACTTTCAGACAAATAG
TTTTAAACAGTACATACAAGAAGAAGAAGAGTTGAAATAAGTCTTAATAGTTACTACTCC
TGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCGAAACCTTGAGCGTCTCTACCCCGG
TTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCACGAGGACTGAGGATGATAAGATCCT
TGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTGATACCCGAGCACA
TAACCTTGTTATGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAAAGGTGCACCGTTGTAGAATTGCTG
AGACGATCCATCAGTTGTTGGATAAGGCGGAAAGCTAAACTGCTGAGGCAAACGATTGTT
GGGAATGGGCGTGGTGGGCGGTGGTTGCATCATATTCATAGGCAGAGGGTAGTCAGGGAA
CCGGATTCCAGGTTTAGGACTAGCGGTTTCGAAACCGGGAGGACGAGAGTTATCGTTGTT
ATCTGCAGGGTAACTCCCAAATCGAGAGAGTGACTTTGACAAGGAAGGTGACCTGTGTAG
TAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RR4BL50JQ U 1
AF RR4CI35JQ U 13
BS 1 570 RR4BL50JQ
BS 571 725 RR4CI35JQ

RD RR4BL50JQ 570 0 0
AGAACTCAGACTGCCTTATACTATATTGGTCCAAACCTGATGCAAAGACAATCATACAAC
ACATAGCATTTTCAAAAACCTTAAAACCCAAAATCAGATTCACACTGATCAAGAAGAGAG
ACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCACTTTTTGAAACTTTCAGACAAATAG
TTTTAAACAGTACATACAAGAAGAAGAAGAGTTGAAATAAGTCTTAATAGTTACTACTCC
TGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCGAAACCTTGAGCGTCTCTACCCCGG
TTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCACGAGGACTGAGGATGATAAGATCCT
TGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTGATACCCGAGCACA
TAACCTTGTTATGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAAAGGTGCACCGTTGTAGAATTGCTG
AGACGATCCATCAGTTGTTGGATAAGGCGGAAAGCTAAACTGCTGAGGCAAACGATTGTT
GGGAATGGGCGTGGTGGGCGGTGGTTGCAT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4CI35JQ 713 0 0
GCCTTATACTATATTGGTCCAAACCTGATGCAAAGACAATCATACAACACATAGCATTTT
CAAAAACCTTAAAACCCAAAATCAGATTCACACTGATCAAGAAGAGAGACATTGGTTCTA
AAGATAGAAGCATTAGAGAGCCACTTTTTGAAACTTTCAGACAAATAGTTTTAAACAGTA
CATACAAGAAGAAGAAGAGTTGAAATAAGTCTTAATAGTTACTACTCCTGCCCAAAGCCA
TCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCGAAACCTTGAGCGTCTCTACCCCGGTTAACCTGTTGA
GGCGGTTCCATACCAGGATTCCACGAGGACTGAGGATGATAAGATCCTTGGAAACTCAGA
TTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTGATACCCGAGCACATAACCTTGTTAT
GTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAAAGGTGCACCGTTGTAGAATTGCTGAGACGATCCATC
AGTTGTTGGATAAGGCGGAAAGCTAAACTGCTGAGGCAAACGATTGTTGGGAATGGGCGT
GGTGGGCGGTGGTTGCATCATATTCATAGGCAGAGGGTAGTCAGGGAACCGGATTCCAGG
TTTAGGACTAGCGGTTTCGAAACCGGGAGGACGAGAGTTATCGTTGTTATCTGCAGGGTA
ACTCCCAAATCGAGAGAGTGACTTTGACAAGGAAGGTGACCTGTGTAGTAAAG

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL3571Contig2 772 2 5 U
GGGTTCGAAATCATTCTGAAATCAAGTGCTATGAATCACCCTTCTTACAGAAACCTTCGA
TTTCATCTATAGCAGAAGCCTTTTATTCCATCTTCTTCATTCTAAAAAAATCTGGATTCA
GACTATCAAGATGATGGAAGGTATCTTCATTTGTGCTGCTCCTCACTGTCTCAGGTCTTT
CCTCAAGAAACCTGACTTTGTATCCCATGTCCATCACCTCCACGCCTCCCTTTTACTACC
CGATGCTCCTCTTGATAAAGAAGATGGCAACGACTCTGACCTTCAGACCACAAAGCACCA
ATCTTCTGCTTCTTCTGACTCCACACTCATGAGAGGTCCCTTAAGATCCCACCAGCAGCA
GCAGCCTCCTCCTTTACTACACAGGTCACCTTCCTTGTCAAAGTCACTCTCTCGATTTGG
GAGTTACCCTGCAGATAACAACGATAACTCTCGTCCTCCCGGTTTCGAAACCGCTAGTCC
TAAACCTGGAATCCGGTTTCCCTGACTACCCTCTGCCTATGAATATGATGCAACCACCGC
CCACCACGCCCATTCCCAACAATCGTTTGCCTCAGCAGTTTAGCTTTCCGCCTTATCCAA
CAACTGATGGATCGTCTCAGCAATTCTACAACGGTGCACCTTTTGAGATGACAAGACCTG
AAGACATAACAAGGTATGTGCTCGGGTATCAGCAGAGCAGCAGCAGCCTGCGCCAACGAT
GAATCTGAGTTCCAAGGATCTATCATCCTCAGTCCTCGTGGAATCTGGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CI35TF U 1
AF RR4BL50TF U 33
BS 1 498 RR4CI35TF
BS 499 499 RR4BL50TF
BS 500 713 RR4CI35TF
BS 714 714 RR4BL50TF
BS 715 772 RR4CI35TF

RD RR4CI35TF 772 0 0
GGGTTCGAAATCATTCTGAAATCAAGTGCTATGAATCACCCTTCTTACAGAAACCTTCGA
TTTCATCTATAGCAGAAGCCTTTTATTCCATCTTCTTCATTCTAAAAAAATCTGGATTCA
GACTATCAAGATGATGGAAGGTATCTTCATTTGTGCTGCTCCTCACTGTCTCAGGTCTTT
CCTCAAGAAACCTGACTTTGTATCCCATGTCCATCACCTCCACGCCTCCCTTTTACTACC
CGATGCTCCTCTTGATAAAGAAGATGGCAACGACTCTGACCTTCAGACCACAAAGCACCA
ATCTTCTGCTTCTTCTGACTCCACACTCATGAGAGGTCCCTTAAGATCCCACCAGCAGCA
GCAGCCTCCTCCTTTACTACACAGGTCACCTTCCTTGTCAAAGTCACTCTCTCGATTTGG
GAGTTACCCTGCAGATAACAACGATAACTCTCGTCCTCCCGGTTTCGAAACCGCTAGTCC
TAAACCTGGAATCCGGTT*CCCTGACTACCCTCTGCCTATGAATATGATGCAACCACCGC
CCACCACGCCCATTCCCAACAATCGTTTGCCTCAGCAGTTTAGCTTTCCGCCTTATCCAA
CAACTGATGGATCGTCTCAGCAATTCTACAACGGTGCACCTTTTGAGATGACAAGACCTG
AAGACATAACAAGGTATGTGCTCGGGTATCAGCAGAGCAGCAGCAGCCTGCGC*AACGAT
GAATCTGAGTTCCAAGGATCTATCATCCTCAGTCCTCGTGGAATCTGGTATG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4BL50TF 714 0 0
GAATCACCCTTCTTACAGAAACCTTCGATTTCATCTATAGCAGAAGCCTTTTATTCCATC
TTCTTCATTCTAAAAAAATCTGGATTCAGACTATCAAGATGATGGAAGGTATCTTCATTT
GTGCTGCTCCTCACTGTCTCAGGTCTTTCCTCAAGAAACCTGACTTTGTATCCCATGTCC
ATCACCTCCACGCCTCCCTTTTACTACCCGATGCTCCTCTTGATAAAGAAGATGGCAACG
ACTCTGACCTTCAGACCACAAAGCACCAATCTTCTGCTTCTTCTGACTCCACACTCATGA
GAGGTCCCTTAAGATCCCACCAGCAGCAGCAGCCTCCTCCTTTACTACACAGGTCACCTT
CCTTGTCAAAGTCACTCTCTCGATTTGGGAGTTACCCTGCAGATAACAACGATAACTCTC
GTCCTCCCGGTTTCGAAACCGCTAGTCCTAAACCTGGAATCCGGTTTCCCTGACTACCCT
CTGCCTATGAATATGATGCAACCACCGCCCACCACGCCCATTCCCAACAATCGTTTGCCT
CAGCAGTTTAGCTTTCCGCCTTATCCAACAACTGATGGATCGTCTCAGCA*TTCTACAAC
GGTGCACCTTTTGAGATGACAAGACCTGAAGACATAACAAGGTATGTGCTCGGGTATCAG
CAGAGCAGCAGCAGCCTGCGCCAACGATGAATCTGAGTT
TCCAAGATCTTATCA

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL3572Contig1 1089 2 8 U
GGAACACTAACACGATTGTCAAAAGGTGTGGGGGAAGCATAATCTACTTCTATCTGATCG
ATCAGTCATACTTTTCAATCAAATCACACCCTCTCTTACTCTTTTCTTTTTGTTTGAAAA
AGGAAAAGCAAAAAGAGTCTATGTCGAGCATGTCGATGTCGTCCTCCTCAGCTCCAACTT
ATCCACCGGACCACATCTCATCTTCAGACCAGCTCTGTTACGTCCATTGCAGCTTCTGCG
ACACCGTCCTAGCTGTAAGTGTTCCACCGAGTAGTTTGTTCAAGACCGTAACGGTGAGAT
GCGGCCACTGCTCAAATCTTTTGTCGGTGACTGTGAACATGAGAGCTCTTCTTCTTCCCT
CCGTTTCAAATATTGGCCATTCGTATCTACCTTCTCCTCCTCCTCCCAATCTCTTGGAGG
AGATGCGAAACGAAGGACAGAATATAAACATGAACATGATGATGAACCACCAGCCAGCAG
CTCACCACTCCAATGAGTCTTTCGTTATGGCCACTCGCAACGGAAGAGTCGATCTGCAGG
AAATGCCTCGCCCACCACCAGCCAATAGACCCCCAGAGAAGCGACAAAGAGTACCATCTG
CTTACAACCGATTCATCAAGGAGGAGATCCAACGTATAAAGGCAGGAAACCCTGATATCA
GCCACAGAGAGGCCTTCAGTGCTGCTGCCAAAAATTGGGCTCATTTTCCTCACATACACT
TTGGTCTCATGCCTGATCATCCTCCTACCAAGAAGGCTAACGTACGCCAGCAGGAAGGAG
AGGAAGTGATGATGGGAAGAGAAGGGTTTTACGGCTCAGCTGCAAATGTTGGAGTGACCC
ATAACTAGCTATAGTTTCTTCTTTTTTCTTAATTAAGGTTTCTTCATGTTCCCAATAATC
TTTTAATTTTCAGAATGTGGTTAATTTCAGCTCAAAAATTTAACTGATTATTATGGTTAC
GTTGACAATGATAATCTCGATCAGGAAAGACTTTTCTTGTTAGAAATTTGGGAACTAGTG
TAAAATTTTCTGTTGGGAATGTATTTCCAATTGATTTACTTCCTCTGTTTTTAAATAAGT
GTTAGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW94TF U 1
AF RR4FN14JQ C 352
BS 1 432 RR4GW94TF
BS 433 433 RR4FN14JQ
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BS 695 744 RR4GW94TF
BS 745 1089 RR4FN14JQ

RD RR4GW94TF 744 0 0
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TTGGTCTCATGCCTGATCATCCTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FN14JQ 738 0 0
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TCTTGGAGGAGATGCGAAACGAAGGACAGAATATAAACATGAACATGATGATGAACCACC
AGCCAGCAGCTCACCACTCCAATGAGTCTTTCGTTATGGCCACTCGCAACGGAAGAGTCG
ATCTGCAGGAAATGCCTCGCCCACCACCAGCCAATAGACCCCCAGAGAAGCGACAAAGAG
TACCATCTGCTTACAACCGATTCATCAAGGAGGAGATCCAACGTATAAAGGCAGGAAACC
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ACATACACTTTGGTCTCATGCCTGATCATCCTCCTACCAAGAAGGCTAACGTACGCCAGC
AGGAAGGAGAGGAAGTGATGATGGGAAGAGAAGGGTTTTACGGCTCAGCTGCAAATGTTG
GAGTGACCCATAACTAGCTATAGTTTCTTCTTTTTTCTTAATTAAGGTTTCTTCATGTTC
CCAATAATCTTTTAATTTTCAGAATGTGGTTAATTTCAGCTCAAAAATTTAACTGATTAT
TATGGTTACGTTGACAATGATAATCTCGATCAGGAAAGACTTTTCTTGTTAGAAATTTGG
GAACTAGTGTAAAATTTTCTGTTGGGAATGTATTTCCAATTGATTTACTTCCTCTGTTTT
TAAATAAGTGTTAGTTCG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

CO CL3573Contig1 943 4 7 U
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AGAAATAGTTTCAACGAGAGAAAGCAACAGAAAAGCCGAGAAAAACGATTAGCTGCAGAC
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AAGTGGAGGCATCTCTGCATCAGCTTCAACGGCATCATCCTCGTCAATGCTCAATCCAAG
CTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTCCCGAAAGTGTTTGGCTCGTCTAGGCTGAAACCTGA
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GTCGGCTTCAGCTCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATAGCATTCTCTGGGTTGATCTCCAT
TGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCAGCCATGCTGCTGTCTCTCAAGGCCTGCGCTTTCAT
GATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCCGTATTCACCTGTTACCAGACAGCATGGTGAGTC
CACAACACGGTCAGAGACAATGACCTTCTCGACCTTGTCTCCGAGAACATCCTTTATCAC
TTTGCAGAGTCCTTCGAACTTCTCCTTGAGCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTCGTCCTCTGA
CTCACCCAGTTTCAGACCTTCCTTGGTTGCAGACACGAGCTTCTTTCCCTCGAATTCCTT
GAGCAGGCCAATGGCGTACTCATCGATAGCATCAACCATGTAGAGAACTTCATACCCTTT
CTTCTTGAGCTTCTCGAGGAATGGAGAGTTCTCCACAGCCTTCTTGCTCTCACCGGTGAT
GTAGAAGATATCCTCCTGACCTTCCTTCCTCCTAGTCACGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BV51TF C 1
AF RR4E229JQ U 7
AF RR4E229TF C 208
AF RR4BE24JQ U 58
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DS 

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QA 1 756 1 756
DS 

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CATGCTGCTGTCTCTCAAGGCCTGCGCTTTCATGATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCC
GTATTCACCTGTTACCAGACAGCATGGTGAGTCCACAACACGGTCAGAGACAATGACCTT
CTCGACCTTGTCTCCGAGAACATCCTTTATCACTTTGCAGAGTCCTTCGAACTTCTCCTT
GAGCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTCGTCCTCTGACTCACCCAGTTTCAGACCTTCCTTGGT
TGCAGACACGAGCTTCTTTCCCTCGAATTCCTTGAGCAGGCCAATGGCGTACTCATCG
C

QA 1 598 1 598
DS 

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CTCAAGTGGAGGCATCTCTGCATCAGCTTCAACGGCATCATCCTCGTCAATGCTCAATCC
AAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTCCCGAAAGTGTTTGGCTCGTCTAGGCTGAAACC
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CTTGTCGGCTTCAGCTCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATAGCATTCTCTGGGTTGATCTC
CATTGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCAGCCATGCTGCTGTCTCTCAAGGCCTGCGCCTT
CATGATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCCGTATTCACCTGTTACCAGACAGCATGGTGA
GTCCACAACACGGTCAGAGACAATGACCTTCTCGACCTTGTCTCCGAGAACATCCTTTAT
CACTTTGCAGAGTCCTTCGAACTTCTCCTTGAGCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTCGTCCTC
TGACTCACCCAGTTTCAGACCTTCCTTGGTTGCAGACACGAGCTTCTTTCCCTCGAATTC
CTTGAGCTGGCCAATGGCGTACTCATCGATAGCATCAACCATGTAGAGAACTTCATACCC
TTTCTTCTTGAGCTTCTCGAGGAATGGAGAGTTCTCCACAGCCTTCTTGCTCTCACCGGT
GATGTAGAAGATATCCTCCTGACCTTCCTTCCTCCTAGTCACGTAA

QA 1 886 1 886
DS 



AS 2 4

CO CL3574Contig1 885 2 6 U
GGAAACACCTGAATGGGAAAGGATAGCAAAGGAGGCGGCAAGGACAGTACCTGGAAGAGA
AAACGGAGGAACCTGTGATATTAAAAACCTAAGCACAGGCTCTAAGATATATCTTCCGGT
GTTTGTAGAAGGTGCTAATCTAAGCACTGGTGATATGCATTTCTCTCAAGGTGACGGTGA
GATTTCCTTCTGTGGAGCCATTGAGATGAGTGGCTTTCTAGAACTCAAGTGTGAAATCAT
AAGGAATGGGATGCAAGAGTACCTCGCGCCAATGGGACCTACTCCTCTCCATGTGAACCC
AATATTTGAGATAGGTCCAGTGGAACCGAGATTCTCAGAGTGGCTTGTCTTTGAAGGTAT
CAGTGTGGATGAGAGTGGGAGACAGCACTATCTTGATGCAACGGTTGCTTATAAACGGGC
GGTTCTTAACGCCATAGACTATCTATTCAAATTTGGTTACTCAAAAGAACAGGCATACCT
GTTGCTCTCATGTTGTCCATTTGGAGGAAGAATCTCTGGGATCGTTGATTCTCCCAATGC
TGTTGCTACACTAGCAATACCTATTGCCATCTTTGATCAGGACATTCGGCCAAAGACTCG
GAAGGTTCCATCAGGACCGAGGATAGTGAGGGAGCCGGACGTACTGAAGAGCATATGATG
GCAATCTTCCGATTACAAAGAATCCAAGCTGTTCAACATAGCTTCTACAACAGAGAAGCT
ATATATTATATCTAGACAGTTTAATTATGAAATAAAGAGACAAAAAATGTGGTTTTCGTT
AGTTGGAAACTACTAAACTCAAAGTAACTAGAAGGTAATGAATAAGGCGTCTGTAATGTT
TATTATGCACTCTCATTTCAGAGTGAATGCATCAGGTTCTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AV68TF U 1
AF RR4AV68JQ C 56
BS 1 814 RR4AV68TF
BS 815 815 RR4AV68JQ
BS 816 826 RR4AV68TF
BS 827 827 RR4AV68JQ
BS 828 865 RR4AV68TF
BS 866 885 RR4AV68JQ

RD RR4AV68TF 869 0 0
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GTTTGTAGAAGGTGCTAATCTAAGCACTGGTGATATGCATTTCTCTCAAGGTGACGGTGA
GATTTCCTTCTGTGGAGCCATTGAGATGAGTGGCTTTCTAGAACTCAAGTGTGAAATCAT
AAGGAATGGGATGCAAGAGTACCTCGCGCCAATGGGACCTACTCCTCTCCATGTGAACCC
AATATTTGAGATAGGTCCAGTGGAACCGAGATTCTCAGAGTGGCTTGTCTTTGAAGGTAT
CAGTGTGGATGAGAGTGGGAGACAGCACTATCTTGATGCAACGGTTGCTTATAAACGGGC
GGTTCTTAACGCCATAGACTATCTATTCAAATTTGGTTACTCAAAAGAACAGGCATACCT
GTTGCTCTCATGTTGTCCATTTGGAGGAAGAATCTCTGGGATCGTTGATTCTCCCAATGC
TGTTGCTACACTAGCAATACCTATTGCCATCTTTGATCAGGACATTCGGCCAAAGACTCG
GAAGGTTCCATCAGGACCGAGGATAGTGAGGGAGCCGGACGTACTGAAGAGCATATGATG
GCAATCTTCCGATTACAAAGAATCCAAGCTGTTCAACATAGCTTCTACAACAGAGAAGCT
ATATATTATATCTAGACAGTTTAATTATGAAATAAAGAGACAAAAAATGTGGTTTTCGTT
AGTTGGAAACTACTAAACTCAAAGTAACTAGAAG*TAATGAATAAG*CGTCTGTAATGTT
TATTATGCACTCTCATTTCAGAGTG
AATG

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4AV68JQ 830 0 0
AGAGAAAACGGAGGAACCTGTGATATTAAAAACCTAAGCACAGGCTCTAAGATATATCTT
CCGGTGTTTGTAGAAGGTGCTAATCTAAGCACTGGTGATATGCATTTCTCTCAAGGTGAC
GGTGAGATTTCCTTCTGTGGAGCCATTGAGATGAGTGGCTTTCTAGAACTCAAGTGTGAA
ATCATAAGGAATGGGATGCAAGAGTACCTCGCGCCAATGGGACCTACTCCTCTCCATGTG
AACCCAATATTTGAGATAGGTCCAGTGGAACCGAGATTTTCAGAGTGGCTTGTCTTTGAA
GGTATCAGTGTGGATGAGAGTGGGAGACAGCACTATCTTGATGCAACGGTTGCTTATAAA
CGGGCGGTTCTTAACGCCATAGACTATCTATTCAAATTTGGTTACTCAAAAGAACAGGCA
TACCTGTTGCTCTCATGTTGTCCATTTGGAGGAAGAATCTCTGGGATCGTTGATTCTCCC
AATGCTGTTGCTACACTAGCAATACCTATTGCCATCTTTGATCAGGACATTCGGCCAAAG
ACTCGGAAGGTTCCATCAGGACCGAGGATAGTGAGGGAGCCGGACGTACTGAAGAGCATA
TGATGGCAATCTTCCGATTACAAAGAATCCAAGCTGTTCAACATAGCTTCTACAACAGAG
AAGCTATATATTATATCTAGACAGTTTAATTATGAAATAAAGAGACAAAAAATGTGGTTT
TCGTTAGTTGGAAACTACTAAACTCAAAGTAACTAGAAGGTAATGAATAAGGCGTCTGTA
ATGTTTATTATGCACTCTCATTTCAGAGTGAATGCATCAGGTTCTGTCCC

QA 1 830 1 830
DS 



CO CL3574Contig2 883 2 2 U
GTGTAGATTGAGAAGGAAACACATGAATGGGAAAGGATAGCAAAGGAGGCTGCAAGGACA
GTACCTGGAAGAGAAAACGGAGGAAACTGCGATATTAAAAACCTAAGCGCAGGCTCTAAG
ATATATTTTCCGGTGTTTGTGGAAGGTGCTAATCTAAGCACTGGTGATATGCATTTCTCT
CAAGGTGATGGTGAGATCTCCTTCTGCGGAGCCATTGAGATGAGTGGCTTCCTAGAACTC
AAGTGTGAAATCATAAGGAATGGGATGCAAGAGTACCTTACGCCAATGGGGCCTACTCCT
CTCCATGTGAATCCAATCTTTGAGATAGGGCCAGTGGAACCGAGATTCTCAGAGTGGCTT
GTCTTTGAGGGTATCAGTGTGGATGAGAGTGGGAGACAGCACTATCTTGATGCAACAGTT
GCTTACAAACGGGCGGTGCTTAACGCCATAGATTATCTCCACAAATTCGGTTACTCAAAA
GAACAGGCATACCTGTTGCTCTCATGTTGTCCATGTGAAGGAAGAATCTCTGGGATCGTT
GATTCTCCCAATGCTGTTGCTACACTAGCAATACCTATTGCCATCTTTGATCAGGACATT
CGGCCAAAGACTCGGAAGGTTCCATCACGACCGAGGATAGTGAGGAAGCCGGACGTACTG
AAGAGCACATATGATGGCAATCTTCCGATTACAAAGAATCCAAGCTGTTCAACATAGCTT
CTACAACAGAGAAGCTATATATATTAAATCTAGACTGTTTAATTATGAAATAAAGAGACA
AAATGTGGTTTTCGTTAGTTGGAAAACTACTAAACTCAATGTAACCAGAAGGTAATGAAT
AAGGCGTCTGTAATGTTTATTATGCACTCTCATTTCAGAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ24TF U 1
AF RR4BJ24JQ C 207
BS 1 771 RR4BJ24TF
BS 772 883 RR4BJ24JQ

RD RR4BJ24TF 771 0 0
GTGTAGATTGAGAAGGAAACACATGAATGGGAAAGGATAGCAAAGGAGGCTGCAAGGACA
GTACCTGGAAGAGAAAACGGAGGAAACTGCGATATTAAAAACCTAAGCGCAGGCTCTAAG
ATATATTTTCCGGTGTTTGTGGAAGGTGCTAATCTAAGCACTGGTGATATGCATTTCTCT
CAAGGTGATGGTGAGATCTCCTTCTGCGGAGCCATTGAGATGAGTGGCTTCCTAGAACTC
AAGTGTGAAATCATAAGGAATGGGATGCAAGAGTACCTTACGCCAATGGGGCCTACTCCT
CTCCATGTGAATCCAATCTTTGAGATAGGGCCAGTGGAACCGAGATTCTCAGAGTGGCTT
GTCTTTGAGGGTATCAGTGTGGATGAGAGTGGGAGACAGCACTATCTTGATGCAACAGTT
GCTTACAAACGGGCGGTGCTTAACGCCATAGATTATCTCCACAAATTCGGTTACTCAAAA
GAACAGGCATACCTGTTGCTCTCATGTTGTCCATGTGAAGGAAGAATCTCTGGGATCGTT
GATTCTCCCAATGCTGTTGCTACACTAGCAATACCTATTGCCATCTTTGATCAGGACATT
CGGCCAAAGACTCGGAAGGTTCCATCACGACCGAGGATAGTGAGGAAGCCGGACGTACTG
AAGAGCACATATGATGGCAATCTTCCGATTACAAAGAATCCAAGCTGTTCAACATAGCTT
CTACAACAGAGAAGCTATATATATTAAATCTAGACTGTTTAATTATGAAAT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4BJ24JQ 677 0 0
C
GGAGCCATTGAGATGAGTGGCTTCCTAGAACTCAAGTGTGAAATCATAAGGAATGGGATG
CAAGAGTACCTTACGCCAATGGGGCCTACTCCTCTCCATGTGAATCCAATCTTTGAGATA
GGGCCAGTGGAACCGAGATTTTCAGAGTGGCTTGTCTTTGAGGGTATCAGTGTGGATGAG
AGTGGGAGACAGCACTATCTTGATGCAACAGTTGCTTACAAACGGGCGGTGCTTAACGCC
ATAGATTATCTCCACAAATTCGGTTACTCAAAAGAACAGGCATACCTGTTGCTCTCATGT
TGTCCATGTGAAGGAAGAATTTCTGGGATCGTTGATTCTCCCAATGCTGTTGCTACACTA
GCAATACCTATTGCCATCTTTGATCAGGACATTCGGCCAAAGACTCGGAAGGTTCCATCA
GGACCGAGGATAGTGAGGAAGCCGGACGTACTGAAGAGCACATATGATGGCAATTTTCCG
ATTACAAAGAATCCAAGCTGTTCAACATAGCTTTTACAACAGAGAAGCTATATATATTAA
ATTTAGACTGTTTAATTATGAAATAAAGAGACAAAATGTGGTTTTCGTTAGTTGGAAAAC
TACTAAACTCAATGTAACCAGAAGGTAATGAATAAGGCGTCTGTAATGTTTATTATGCAC
TCTCATTTCAGAGTGG

QA 2 677 2 677
DS 



AS 1 4

CO CL3575Contig1 944 4 37 U
GGCTACAAAAACCCTAGATCTAACACCCCCCAGCCGTCAGATCAGATCAATGGGGAGATC
TCTTCTCAACCGTTGGAGACAGCAACGGTGTAGGTAGAAGAAGCGCATTTGTGGGATATC
CAAAAAGAGTCGTGAAAGATTGTTGTCCCGTCGACTAGGCTCTGTCTGCTTTTTTGTTTT
CTTCATCCTCCTCATCTTAGATGGCTAACAATTCGAATTTCGTCTAGCTATATATTTTTT
CTTTTTTGTTATTTC****GGTGGTGGTGATGTGTGATTTGGTTGCCCGTACGGGCCGGC
TTCAGCAACGGTTCAAGGATGGATCGCGTCTCATTGCCGGGTGTATTCCGTTTAGGTATA
TAAAAGATGGTAATTCTGAATCTGGGGAAGTGGTTCAAGTGTTGATGATCAGCTCATCTA
GTGGACCGGGACTTTTGTTTCCTAAGGGTGGATGGGAGAATGATGAGACTGTCAAAGAAG
CTGCGGTTAGAGAAGCTGTGGAAGAAGCAGGAGTCCGTGGGATTTTGATGGATTTCTTGG
GAGATTATGAGTTCAAGAGCAAAACACACCAAGATGAGTTTAGCCCGGAAGGTTTATGTA
AAGCGGCAATGTACGCCTTGTATGTCAAGGAAGAGCTAGAAACTTGGCCGGAACAGAAGA
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TGAAGGATGCGTTGGTTGATGGATTCTGTAAATGGCATAAGGAGAAGATGGGCAAAGAAG
GAGATGAAGATTGAAGTTTTAAAGTGTGCATAAAATCCTCAAATTGGTTTTCTTTCCTTT
CGATTTTGGTTTTTTTTTTTTAACTCTGAAGTTGGTTTCGTTTCCTTGTCACTTCTCATC
GTTAACAATGTCAACGCTGTATGATTTATTAAGAGTTCTGAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
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25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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DS 

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GG
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CGTGGGATTTTGATGGATTTCTTGGGAGATTATGAGTTCAAGAGCAAAACACACCAAGAT
GAGTTTAGCCCGGAAGGTTTATGTAAAGCGGCAATGTACGCCTTGTATGTCAAGGAAGAG
CTAGAAACTTGGCCGGAACAGAAGACAAGAACAAGGACGTGGTTGACAATTGGAGAAGCT
GTAGGGAGTTGCACGCACGCTTGGATGAAG*ATGCGTTGGTTGATGGATTCTGTAAATGG
CA

QA 3 664 3 664
DS 

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GTATATAAAAGATGGTAATTCTGAATCTGGGGAAGTGGTTCAAGTGTTGATGATCAGCTC
ATCTAGTGGACCGGGACTTTTGTTTCCTAAGGGTGGATGGGAGAATGATGAGACTGTCAA
AGAAGCTGCGGTTAGAGAAGCTGTGGAAGAAGCAGGAGTCCGTGGGATTTTGATGGATTT
CTTGGGAGATTATGAGTTCAAGAGCAAAACACACCAAGATGAGTTTAGCCCGGAAGGTTT
ATGTAAAGCGGCAATGTACGCCTTGTATGTCAAGGAAGAGCTAGAAACTTGGCCGGAACA
GAAGACAAGAACAAGGACGTGGTTGACAATTGGAGAAGCTGTAGGGAGTTGCAGGCACGC
TTGGATGAAGGATGCGTTGGTTGATGGATTCTGTAAATGGCATAAGGAGAAGATGGGCAA
AGAAGGAGATGAAGATTGAAGTTTTAAAGTGTGCATAAAATCCTCAAGTTGGTTTTCTTT
CCTTTCGATTTTGGTTTTTTTT***TAACTCTGAAGTTGGTTTCGTTTCCTTGTCACTTC
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AGCGGCAATGTACCCCTTGTATGTCAAGGAAGAGCTGGAAACTTGGCCGGAACAGAAGAC
GAGAACAAGGACGTGGTTGACAATTGGAGAAGCTGTAGGGAGTTGCAGGCACGCTTGGAT
GAAGGATGCGTTGGTTGATGGATTCTGTAAATGGCATAAGGAGAAGATGGGCAAAGAAGG
AGATGAAGATTGAAGTTTTAAAGTGTGCATAAAATCCTCAAATTGGTTTTCTTTCCTTTC
GATTTTGGTTTTTTTTTTTTAACTCTGAAGTTGGTTTCGTTTCCTTGTCACTTCTCATCG
TTAACAATGTCAACGCTGTATGATTTATTAAGAGTTCTGAAC

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 4

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CGGAAGTCATAGAAAATCTAGGACAATGCGGTGAATTTGCACCAGACCAAGGCGTTACTG
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CTGAATCTGTTGAAAGCGGTGAAAAGATGAGCAACGTAAATGCGTTGATGAACGAAGATA
GTGTTCACCCATCATTGTCGTGCAATGCGATTGTGTGTTCTGGTTTTGAAGCATCTAAAG
AAGAAGTGACCCAGACGTGGAACGAGTCCCCGCTCAACGCTGGCTTTGCACTCCCTGGAT
CAAGTTACACTGCTAATGACCAAGGACCTCCGAACGGAGATAGCAACGATGAAATTGTGG
AATTTGATCCAATAAAGTATCACAACTGTTACTGCCCTTGGGTAAATGAAAACGTGGCTG
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GGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGTTCCAGTCACTCGAGAATGCTCAAATCCAAC
CAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCACTCCTTCCCAGA
AGCTCTTGAAACGCCACTCTTTTATCAGCCGCCATGGGAAAAAATAAGAAATCTAATTGC
AAGGTACTATTGCAAAAAGACACTCGATTTCAGACGATATATATAAATAGACCAGTATGG
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CATAAATCTTTCGGGTCTGCAACCTGTGTTTTTTTCTTTGTTTTTTTCTTCAAGTTTGTG
TAGTAGTCAAGTTAAAGATACCTAAACAGAGGTGAGAGGATGATACTCAATAATCTTATA
TTCGATTCTTGTTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BZ16JQ C 444
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TTTTCTTCAAGTTTGTGTAGTAGTCAAGTTAAAGATACCTAAACAGAGGTGAGAGGATGA
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GATTCGTTCCAGTCACTCGAGAATGCTCAAATCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCA
TCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCACTCCTTCCCAGAAGCTCTTGAAACGCCACTCTTTT
ATCAGCCGCCATGGGAAAAAATAAGAAATCTAATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAGACAC
TCGATTTCAGACGATATATATAAATAGACCAGTATGGTCACTGGTTAGGTTCTCTAGCTT
GGGTTTATCTCTTAGCAGTATAAATAAAAGAACTCTGCATAAATCTTTCGGGTCTGCAAC
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QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

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AAAACAATGTTTTTTTGTATGTAATATTCTCCCCGAAAAAATAAAGTAAAATAAGTAAAT
AACAGTCACAACAAAAAACAAGGGATCTTCAATTAGCAAGAGACTGCTAACAATAGCTCT
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TAAGCTGTTGTTGCAGCTACTAAGAACTTTCCCCATTTTCAGAAGTCTCCAGCTTTCCAT
TAATCTTAAGTGAATCTAAAACACTTCTTCTGCTAATACACATCCAAGTTCTTGAAGACT
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ACCAATCATCGTTGAAACCTGGTGGAGTCGCATACAAGACACCGTTGTTAATCCATTCAT
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CTCTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DS67JQ U 15
AF RR4FZ03JQ U 1
AF RR4FZ03TF C 612
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RD RR4DS67JQ 621 0 0
TA
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CCACTTTTGAAAAAAACTGTTCCCCAAGAGTTCAAAAATGTGATCTCTCATCTCATCATT
TGTCACAAGCAAACACCTGAGTTTAGCAGCAGCATAGAGCCAATACCAATCATCGTTGAA
ACCTGGTGGAGTCGCATAC

QA 3 621 3 621
DS 

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GAAACAATGTTTTTT*GTATGTA***TTCTTCCCGGAAAAATAAAGTAAAATAAGTAAAT
AACAGTCACAACAAAGAACAAGGGATCTTCAATTAGCAAGAGACTGCTAACAATAGCTCT
CCATTGTCCTATTCCAGAATCTCAATTCTCATCATTACCTGCAGCATCACATGAATTCAA
TAAGCTGTTGTTGCAGCTACTAAGAACTTTCCCCATTTTCAGAAGTTTCCAGCTTTCCAT
TAATCTTAAGTGAATCTAAAACACTTCTTCTGCTAATACACATCCAAGTTCTTGAAGACT
CCTCATTGTTTTGGCTTGCAACAGGAACATGCCATGACCCTTTATCTGATTCCTGAATGG
CAACAGAAAAAGGAGGCGGCATTTCAAGCTTCAGATTACCTTTCGTAAATGTATACCGAA
CCTGATGCCTTTCTTTCCACTTTTGGAAAAAACTGTTCCCCAAGAGTTCAAAAATGTGAT
CTCTCATCTCATCATTTGTCACAAGTAAACACTTGAGTTTAGCAGCAGCATAGAGCCAAT
ACCAATCATCGTTGAAACCTGGTGGAGTCGCATACAAGACACCGTTGTTAATCCATTCAT
CAACCAGATTCCTGTGAGTTGGGTTCTCTAAAAGCGTCCTGACCCGTTTCTTATGCA

QA 1 717 1 717
DS 

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CTGTGAGTTGGGTTCTCTAAAAGCGTCCTGACCCGTTTCTTATGCAAGAGGACCAGGGGC
CACTTGTTATCACCACTCTTATGGTACAGTTCGTTTACCACAGCCTCAAGCTGTGAAAGA
CTGAAACCACCGTCTGCAAAATTTTGTTGATAGAGACCAATATTTGCTCCATCTACTATA
GCTTCGTAATCTCCATGTTTTCAAGACAGTCCTGAAACTCGCTGAAGTCCACCTTTGTCT
CGGAACAATTCATCTTTGCCTTCCTCTCCATAGCCAAAGCCACCAAAGAATCCACAAACT
TCTGTGTTTCAACCTCATCGGTATCAACACAAGCCAGCTGCTCACTGCAGCTCAAACATC
TTCCGGTTGAGCTAACATTACCTTTCTTCACAATCCATTTACCTTCCCCAACCCATCCAC
GCCCATGCCACCCACCTCCATTCCTCAAAACAGCTTCTCTAAGCATCCCAACATCAGAAC
CAATCCCATTACCACTAACCTCACCAGCTTTCTCTCCACAGAACCATTCCTCTC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 4

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GTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCA
TTCATGTTACTGATCTGTCGGGACGAGAAACTCTCGTTCGTATCACCGGGGGGATGAAGG
TGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCAGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTG
CTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTAAAGCTCCGTGCCACTGGAG
GAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCCCAGTCAGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTT
CTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTA
GAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGCCTCATGATCGTTCAG
TTGTGCCCTTGACTCGTGTAATTCCTTGGGTACACACACTTTGAAGTTAGTTTTGTCTCT
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TTATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTATTTACAGCA


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EG76JQ C 1
AF RR4EG76TF U 1
AF RR4BX61JQ C 2
AF RR4BX61TF U 2
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RD RR4EG76JQ 696 0 0
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TTATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCT
TT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4EG76TF 694 0 0
G
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TATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCT

QA 2 694 2 694
DS 

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TCATGTTACTGATCTGTCGGGACGAGAAACTCTCGTTCGTATCACCGGTGGGATGAAGGT
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TCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTAAAGCTCCGTGCCACTGGAGG
AAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCCCAGTCAGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTC
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AAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGCCTCATGATCGTTCAGT
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CATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACCTGAGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACAT
TATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTATTTACAGC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4BX61TF 705 0 0
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TGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCAT
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GAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCAGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGC
TCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTAAAGCTCCGTGCCACTGGAGG
AAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCCCAGTCAGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTC
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AAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGCCTCATGATCGTTCAGT
TGTGCCCTTGACTCGTGTAGTTCCTTGGGTACACACACTTTGAAGTTGGTTTTGTCTCTC
CATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACCTGAGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACAT
TATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTATTTACAGCA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

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AAGATGAAGATGAAATGATATCCCATTAATATGATCATGTTTCTTACCAACCCTAACAAT
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ATCAAAGAAGAGGGAAGTGAAGAAGACACAAGTGTTGACTTCGTAAACAAGCTTCAAGTT
CTCATGGTTTCGTCTCCTAATCGTCATGATCTTGTCTTCCCAAAGGGAGGATGGGAAGAT
GATGAGACAGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAAGCCATGGAAGAAGCTGGAGTTAAAGGA
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CAAGAAGATGAAGAAAGAAAATTGACAACAGAGGAAGAGACAGTGCAGGATGATTCTTCA
AAGCTAGAGGAGTGTCAAATAGATCCTTGTTACTGTTTTATAGTTAATTAGTTCTTTTTT
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ACAAGTTGAAACATAAGAAGCAAACAATGACTTCAGTTGCATGTGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW11TF U 1
AF RR4C232TF U 20
AF RR4C232JQ C 171
AF RR4BW11JQ C 168
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BS 228 228 RR4C232TF
BS 229 274 RR4BW11TF
BS 275 599 RR4C232TF
BS 600 949 RR4BW11JQ

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AAGATGAAGATGAAATGATATCCCATTAATATGATCATGTTTCTTACCAACCCTAACAAT
CAAGAAGAGGGCTTTTCAAGAACGTAACAGACAGCATTCTCTGTTCTTTTTTTGGTTTGG
TGTTAGAAATCTTTTATTGCAGATTCATCAATGTCCGTTATATCATCGCGGACAGGACGA
GATCGTCAACGTTACGACAACAACTTTCGTCTCG

QA 1 274 1 274
DS 

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ATCCCATTAATATGATCATGTTTCTTACCAACCCTAACAATCAAGAAGAGGGCTTTTCAA
GAACGTAACAGACAGCATTCTCTGTTCTTTTTTTGGTTTGGTGTTAGAAATCTTTTATTG
CAGATTCATCAATGTCCGTTATATCATCTCGGACAGGACGAGATCGTCAACGTTACGACA
ACAACTTTCGTCTCGTTTCTGGATGCATTCCGTATAGGCTGATCAAAGAAGAGGGAAGTG
AAGAAGACACAAGTGTTGACTTCGTAAACAAGCTTCAAGTTCTCATGGTTTCGTCTCCTA
ATCGTCATGATCTTGTCTTCCCAAAGGGAGGATGGGAAGATGATGAGACAGTTCTTGAAG
CTGCTTCTCGTGAAGCCATGGAAGAAGCTGGAGTTAAAGGAAGCCTTAGAGAAGTTCCTT
TAGGAGTTTGGGAATTTAGAAGCAAAAGTAGTTGTAACGAAGAGAATGAATGTTTTGGTG
GATGCAAAGGATATATGTTTGCATTAGAGGTAACCGAAGA
CTCCAGG

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DS 

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GACAGGACGAGATCGTCAACGTTACGACAACAACTTTCGTCTCGTTTCTGGATGCATTCC
GTATAGGCTGATCAAAGAAGAGGGAAGTGAAGAAGACACAAGTGTTGACTTCGTAAACAA
GCTTCAAGTTCTCATGGTTTCGTCTCCTAATCGTCATGATCTTGTCTTCCCAAAGGGAGG
ATGGGAAGATGATGAGACAGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAAGCCATGGAAGAAGCTGG
AGTTAAAGGAAGCCTTAGAGAAGTTCCTTTAGGAGTTTGGGAATTTAGAAGCAAAAGTAG
TTGTAACGAAGAGAATGAATGTTTTGGTGGATGCAAAGGATATATGTTTGCATTAGAGGT
AACCGAAGAACTCCAGGAATGGCCAGAACGTGAGAATCGTGAGAGGAAATGGTTGAATGT
TAAAGAAGCATTGGAGCTGTGTCGGTATGAATGGATGCAGAGAGCACTTGAAGAGTTTTT
AAGAGTAATGCAAGAAGATGAAGAAAGAAAATTGACAACAGAGGAAGAGACAGTGCAGGA
TGATTCTTCAAAGCTAGAGGAGTGTCAAATAGATCCTTGTTACTGTTTTATAGTTAATTA
GTTCTTTTTTCAATCTTTATTTTTTAGCTTTTGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BW11JQ 782 0 0
TTT
TTTGGTTTGGTGTTAGAAATCTTTTATTGCAGATTCATCAATGTCCGTTATATCATCTCG
GACAGGACGAGATCGTCAACGTTACGACAACAACTTTCGTCTCGTTTCTGGATGCATTCC
GTATAGGCTGATCAAAGAAGAGGGAAGTGAAGAAGACACAAGTGTTGACTTCGTAAACAA
GCTTCAAGTTCTCATGGTTTCGTCTCCTAATCGTCATGATCTTGTCTTCCCAAAGGGAGG
ATGGGAAGATGATGAGACAGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAAGCCATGGAAGAAGCTGG
AGTTAAAGGAAGCCTTAGAGAAGTTCCTTTAGGAGTTTGGGAATTTAGAAGCAAAAGTAG
TTGTAACGAAGAGAATGAATGTTTTGGTGGATGCAAAGGATATATGTTTGCATTAGAGGT
AACCGAAGAACTCCAGGAATGGCCAGAACGTGAGAATCGTGAGAGGAAATGGTTGAATGT
TAAAGAAGCATTGGAGCTGTGTCGGTATGAATGGATGCAGAGAGCACTTGAAGAGTTTTT
AAGAGTAATGCAAGAAGATGAAGAAAGAAAATTGACAACAGAGGAAGAGACAGTGCAGGA
TGATTCTTCAAAGCTAGAGGAGTGTCAAATAGATCCTTGTTACTGTTTTATAGTTAATTA
GTTCTTTTTTCAATCTTTATTTTTTAGCTTTTGGATTCAGATGAAAAAGCTGCTTCTAAT
ACTAATGTAAACAAGTTGAAACATAAGAAGCAAACAATGACTTCAGTTGCATGTGATGT

QA 4 782 4 782
DS 



AS 1 4

CO CL3580Contig1 1311 4 8 U
GGGGGGGTTTAAGATTGAACACCAAAAGAAGTTGTCAAAACTTCAAAGTCAAGAGTACAA
GGGAGATAATGAGACTAAGCTGGACAAGACTAAGGGCTCTATAACTAGGTTACAGTCTCT
TATTATCGTTACTTCCCAGGCCGTCACCACTACATCTACTGCCATTGTCAGCCTTCGAGA
TACTGATCTTGTCCCGCAGCTCGTTGAACTCTGTCACGGTTTCATGTACATGTGGAAAGC
AATGCATCAGTTCCACGAGATTCAGAACAACATCGTACAGCAAGTTCAGGGGCTCATTAA
CAGGTCAGGCAAAGGGGAATCAACGTCTGAACTACACCGACAAGCAACACGTGACTTGGA
AACAGCCGTGTCTCTATGGCACTCCAGTTTCTGTCGGCTGATTAAATTCCAAAGGGAGTT
CATACGTTCGGTTCAAGCCTGGTTCAAGTTGACTCTCCTCCCAGTTTGCCACGACGAGAA
CCTCGGTCACAAAGAGCCAGTAGATGCCTACGCGTTTTGCGATGAGTGGAAGCTTACTCT
AGACCGAGTCCCGGACACAGTGGCTTCAGAAGCAATCAAGAGCTTCATCAACGTTGTCCA
CGTGATATCCGCGAAACAATCCGAGGAGCTAAAGATAAAGAAACGAACTGAATCAGCATC
AAAGGAGCTTGAGAAGAAAGCCTCGTCGCTTAGGAACATCGAAAGGAAATACTACCAGTC
ATACTCCACAGTCGGGTTTGGTCTCCCTGATTCAGGACCAGACAACGGGCACGGGCTAGA
CGCTCGTGACCCGCTCACGGAGAAAAAGTTAGAGCTAGGAGCATGTCAGAGAAGAGTGGA
GGAAGAGATGCTGAAACATTCAAAGGCAATAGAAGTGACAAGAGCCATGACTTTGAATAA
TTTGCAGACGGGTTTGCCAGGTGTGTTCCAAGCTTTAACCAGTTTCGCAGCTCTGTTCAC
GGAGTCCTTACAAACGGTATGCACTCGCTCATACTCCATCAAATAGCACCACTATATTAT
TACTATATAGTTGAAGAAGATACAAATACTATATAGTTAAAAGTTTTTGATGAGGGAAAA
GGGCTCCCCATGGTTATGTCTCTTATTATTTCGGGCTGGTTGTTTGGATAATGTTTATTT
CTGAAGAGGAAATGTATATATTATGGAGTCTATATTTAAAAGAAGTTCTAGGACTTGGCG
TTTTGATTTCTATGTATGAAATGTGGATGTTTTTGTTTGTTCATGTAATTCTCAGCTACA
TGTTCTAAAGAAATTCCAGGACAAGAATAAACAACGTTCTCTTGCTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4BQ48TF U 1
AF RR4A552TF U 27
AF RR4A552JQ C 512
AF RR4BQ48JQ C 676
BS 1 457 RR4BQ48TF
BS 458 458 RR4A552TF
BS 459 524 RR4BQ48TF
BS 525 751 RR4A552TF
BS 752 1250 RR4A552JQ
BS 1251 1251 RR4BQ48JQ
BS 1252 1308 RR4A552JQ
BS 1309 1311 RR4BQ48JQ

RD RR4BQ48TF 524 0 0
GGGGGGGTTTAAGATTGAACACCAAAAGAAGTTGTCAAAACTTCAAAGTCAAGAGTACAA
GGGAGATAATGAGACTAAGCTGGACAAGACTAAGGGCTCTATAACTAGGTTACAGTCTCT
TATTATCGTTACTTCCCAGGCCGTCACCACTACATCTACTGCCATTGTCAGCCTTCGAGA
TACTGATCTTGTCCCGCAGCTCGTTGAACTCTGTCACGGTTTCATGTACATGTGGAAAGC
AATGCATCAGTTCCACGAGATTCAGAACAACATCGTACAGCAAGTTCAGGGGCTCATTAA
CAGGTCAGGCAAAGGGGAATCAACGTCTGAACTACACCGACAAGCAACACGTGACTTGGA
AACAGCCGTGTCTCTATGGCACTCCAGTTTCTGTCGGCTGATTAAATTCCAAAGGGAGTT
CATACGTTCGGTTCAAGCCTGGTTCAAGTTGACTCTC*TCCCAGTTTGCCACGACGAGAA
CCTCGGTCACAAAGAGCCAGTAGATGCCTACGCGTTTTGCGATG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4A552TF 725 0 0
G
GAAGTTGTCAAAACTTCAAAGTCAAGAGTACAAGGGAGATAATGAGACTAAGCTGGACAA
GACTAAGGGCTCTATAACTAGGTTACAGTCTCTTATTATCGTTACTTCCCAGGCCGTCAC
CACTACATCTACTGCCATTGTCAGCCTTCGAGATACTGATCTTGTCCCGCAGCTCGTTGA
ACTCTGTCACGGTTTCATGTACATGTGGAAAGCAATGCATCAGTTCCACGAGATTCAGAA
CAACATCGTACAGCAAGTTCAGGGGCTCATTAACAGGTCAGGCAAAGGGGAATCAACGTC
TGAACTACACCGACAAGCAACACGTGACTTGGAAACAGCCGTGTCTCTATGGCACTCCAG
TTTCTGTCGGCTGATTAAATTCCAAAGGGAGTTCATACGTTCGGTTCAAGTCTGGTTCAA
GTTGACTCTCCTCCCAGTTTGCCACGACGAGAACCTCGGTCACAAAGAGCCAGTAGATGC
CTACGCGTTTTGCGATGAGTGGAAGCTTACTCTAGACCGAGTCCCGGACACAGTGGCTTC
AGAAGCAATCAAGAGCTTCATCAACGTTGTCCACGTGATATCCGCGAAACAATCCGAGGA
GCTAAAGATAAAGAAACGAACTGAATCAGCATCAAAGGAGCTTGAGAAGAAAGCCTCGTC
GCTTAGGAACATCGAAAGGAAATACTACCAGTCATACTCCACAGTCGGGTTTGGTCTCCC
TGAT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR4A552JQ 798 0 0
GCGTTTTGCGATGAGTGGAAGCTTACTCTAGACCGAGTCCCGGACACAGTGGCTTCAGAA
GCAATCAAGAGCTTCATCAACGTTGTCCACGTGATATCCGCGAAACAATCCGAGGAGCTA
AAGATAAAGAAACGAACTGAATCAGCATCAAAGGAGCTTGAGAAGAAAGCCTCGTCGCTT
AGGAACATCGAAAGGAAATACTACCAGTCATACTCCACAGTCGGGTTTGGTCTCCCTGAT
TCAGGACCAGACAACGGGCACGGGCTAGACGCTCGTGACCCGCTCACGGAGAAAAAGTTA
GAGCTAGGAGCATGTCAGAGAAGAGTGGAGGAAGAGATGCTGAAACATTCAAAGGCAATA
GAAGTGACAAGAGCCATGACTTTGAATAATTTGCAGACGGGTTTGCCAGGTGTGTTCCAA
GCTTTAACCAGTTTCGCAGCTCTGTTCACGGAGTCCTTACAAACGGTATGCACTCGCTCA
TACTCCATCAAATAGCACCACTATATTATTACTATATAGTTGAAGAAGATACAAATACTA
TATAGTTAAAAGTTTTTGATGAGGGAAAAGGGCTCCCCATGGTTATGTCTCTTATTATTT
CGGGCTGGTTGTTTGGATAATGTTTATTTCTGAAGAGGAAATGTATATATTATGGAGTCT
ATATTTAAAAGAAGTTCTAGGACTTGGCGTTTTGATTTCTATGTATGAAATGTGGATGTT
TTTGTTTGTTCATGTAATTTTCAGCTACATGTTCTAAAGAAATTCCAGGACAAGAATAAA
CAACGTTCTCTTGCTTG
C

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4BQ48JQ 636 0 0
GAAAGCTTCGTCGCTTAGGAACATCGAAAGGAAATACTACCAGTCATACTCCACAGTCGG
GTTTGGTCTCCCTGATTCAGGACCAGACAACGGGCACGGGCTAGACGCTCGTGACCCGCT
CACGGAGAAAAAGTTAGAGCTAGGAGCATGTCAGAGAAGAGTGGAGGAAGAGATGCTGAA
ACATTCAAAGGCGATAGAAGTGACAAGAGCCATGACTTTGAATAATTTGCAGACGGGTTT
GCCAGGTGTGTTCCAAGCTTTAACCAGTTTCGCAGCTCTGTTCACGGAGTCCTTACAACC
GGTATGCACTCGCTCATACTCCATCAAATAGCACCACTATATTATTACTATATAGTTGAA
GAAGATACAAATACTATATAGTTAAAAGTTTTTGATGAGGGAAAAGGGCTCCCCATGGTT
ATGTCTCTTATTATTTCGGGCTGGTTGTTTGGATAATGTTTATTTCTGAAGAGGAAATGT
ATATATTATGGAGTCTATATTTAAAAGAAGTTCTAGGACTTGGCGTTTTGATTTCTATGT
ATGAAATGTGGATGTTTTTGTTTGTTCATGTAATTCTCAGCTACATGTTCTAAAGAAATT
CCAGGACAAGAATAAACAACGTTCTCTTGCTTGTTC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 4

CO CL3581Contig1 1016 4 7 U
GGCCGACAAGGGTTTCTCTCAATCTTCACCCGAAGGTTCACACTCATTCCCGGAGAATGA
TAAGCAGAGCTATGGTACAAGAGGCAGCTCAAGGCATCCCTTCAGTTTACGCCAGAGAAA
TGGAGCGTCTCTCCGCTAAAGAATCGCTCATTCTCGCCTTCAATGATGCTGGAGGCTTTG
AGGCTTTAGTTACAGGGAAGATCACTGATTTTCAAAAGATTGATGTGAATGAGAGGATAA
CTACGCTAGAGCGGCTTAACCCGACTCCTAGACCCACCACGTCTCCTTACCTAGAAGGGA
GATGGAGTTTTGAGTGGTTTGGATCCAACACTCCTGGTCCACTTGCCGCTCGGCTTATAT
TCGAGAGGTTTCCTTCTTCATTTGTGAGTCTATCAAGTATGGACATTGTCATCAAAGATG
CTAGCACAAGGGCCACCGCCAACGTTAAGCTGCTAAACATGATAGAAAACAAAGTCATCT
TGACGTCGAAATTGACAGTAGAAGGGCCTTTAAGGATGAAGGAAGAGTATCTGGAGGGAA
TGCTAGAGTCGCCAACTGTTATTGAAGAAGCAGTACCGGAGCAGCTAAGAGGTTTGCTTG
GTCAAGCTACCACTACGTTGCAGCAGCTTCCTGAACCTGTTAAGGGTACTCTAGCCAATG
GTCTAAGAATTCCACTTGGTGGATCTTACCAGAGATTCTTCATGATATCTTATCTAGACG
ACGAGATTCTTATTGTAAGAGATACTTTGGGTGTGCCTGAAGTTCTAACGAGAGTTGAAA
CATCGTCTTCACCGAACGTTGTAGAGAATCTTGAATACAACAGTTAAAAAGAACAGCTCC
TTATGTTCCCTCTGTTTATGTCTGTAAATGTCAAACAAACTGAATACAACTTACTATATC
TCTCCGGACACAGAGATATTGTTTCGTTATCCATTATTTAACACTTTGAGAAACGAAATT
AAATGTTACATGTCCTCCTTCATTTCTAAGAAATAAATATTTTACATTTTCTATGC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G101TF U 3
AF RR4G035TF U 1
AF RR4G101JQ C 393
AF RR4G035JQ C 490
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G
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GGAGTTTTGAGTGGTTTGGATCCAACACTCCTGGTTCACTTGCCGCTCGGCTTATATTCG
AGAGGTTTCCTTCTTCATTTGTGAGTCTATCAAGTATGGACATTGTCATCAAAGATGCTA
GCACAAGGGCCACCGCCAACGTTAAGCTGCTAAACATGATAGAAAACAAAGTCATCTTGA
CGTCGAAATTGACAGTAGAAGGGCCTTTAAGGATGAAGGAAGAGTGTCTGGAGGGAATGC
TAGAGTCGCCAACTGTTATTGAAGAAGCAGTACCGGAGCAGCTAAGAGGTTTGCTTGGTC
AAGCTACCACTACGTTGCAGCAGCTTCCTGAACCTGT

QA 2 638 2 638
DS 

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TAAGCAGAGCTATGGTACAAGAGGCAGCTCAAGGCATCCCTTCAGTTTACGCCAGAGAAA
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AGGCTTTAGTTACAGGGAAGATCACTGATTTTCAAAAGATTGATGTGAATGAGAGGATAA
CTACGCTAGAGCGGCTTAACCCGACTCCTAGACCCACCACGTCTCCTTACCTAGAAGGGA
GATGGAGTTTTGAGTGGTTTGGATCCAACACTCCTGGTCCACTTGCCGCTCGGCTTATAT
TCGAGAGGTTTCCTTCTTCATTTGTGAGTCTATCAAGTATGGACATTGTCATCAAAGATG
CTAGCACTAGGGCCACCGCCAACGTTAAGCTGCTAAACATGATAGAAAACAAAGTCATCT
TGACGTCGAAATTGACAGTAGAAGGGCCTTTAAGGATGAAGGAAGAGTATCTGGAGGGAA
TGCTAGAGTCGCCAACTGTTATTGAAGAAGCAGTACCGGAGCAGCTAAGAGGTTTGCTTG
GTCAAGCTACCACTACGTTGCAGCAGCTTCCTGAACCTGTTAAGGGTACTCTAGCCAATG
GTCTAAGAATTCCACTTGGTGGATCTTACCAGAGATTCTTCATGATATCTTATCTAGACG
ACGAGATTCTTATTGTAAGAGATACTTTGGGTGTGCCTGAAGTTCTA

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DS 

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AGGATGAAGGAAGAGTGTCTGGAGGGAATGCTAGAGTCGCCAACTGTTATTGAAGAAGCA
GTACCGGAGCAGCTAAGAGGTTTGCTTGGTCAAGCTACCACTACGTTGCAGCAGCTTCCT
GAACCTGTTAAGGATACTCTAGCCAATGGTCTAAGAATTCCACTTGGTGGATCTTACCAG
AGATTCTTCATGATATCTTATCTAGACGACGAGATTCTTATTGTAAGAGATACTTTGGGT
GTGCCTGAAGTTCTAACGAGAGTTGAAACATCGTCTTCACCGAACGTTGTAGAGAATCTT
GAATACAACAGTTAAAAAGAACAGCTCCTTATGTTCCCTCTGTTTATGTCTGTAAATGTC
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ATTATTTAACACTTTGAGAAACGAAATTAAATGTTACATGTCCTCCTTC

QA 1 589 1 589
DS 

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CGCCAACTGTTATTGAAGAAGCAGTACCGGAGCAGCTAAGAGGTTTGCTTGGTCAAGCTA
CCACTACGTTGCAGCAGCTTCCTGAACCTGTTAAGGGTACTCTAGCCAATGGTCTAAGAA
TTCCACTTGGTGGATCTTACCAGAGATTCTTCATGATATCTTATCTAGACGACGAGATTC
TTATTGTAAGAGATACTTTGGGTGTGCCTGAAGTTCTAACGAGAGTTGAAACATCGTCTT
CACCGAACGTTGTAGAGAATCTTGAATACAACAGTTAAAAAGAACAGCTCCTTATGTTCC
CTCTGTTTATGTCTGTAAATGTCAAACAAACTGAATACAACTTACTATATCTCTCCGGAC
ACAGAGATATTGTTTCGTTATCCATTATTTAACACTTTGAGAAACGAAATTAAATGTTAC
ATGTCCTCCTTCATTTCTAAGAAATAAATATTTTACATTTTCTATGC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 4

CO CL3582Contig1 1131 4 5 U
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AAATTGTTACTAGATTCTATTAAGTAGCCTTTGAAGTTTTACCAGAAACTGAGCATGACG
ATGATCTGTTACAGGTAACCAAAAAAAAAAAAAAATTCATACTCTCTTCTTCCTTGGTGA
TGTATATGCAGTGCAAAGCCCTTGAGATTCCACTGATGTGGCTTGTTTTGTTTTATAATC
TTTGGCTGAAGTACATGTTCATGAAATATCTTGACGGGTTGAATCCACTTAAGATCAAAA
TAGGGGACAGGACAATCACGATCCCAATAGGGTAGAGGAAGAAGGTTGTTCGTTCCAAAA
ATGGAAGCACGTCATATCCTAGGAAGTTAAAATAATGGTAATACGAAGCCCCGACCATGA
AAAGCAAATTTGAAAGTAGTAGAGCGATGAATCCATGAGTTATCAGGAGTGGTGATAAGA
AATAGTGTACGACGTAAAGCAGCACAAACATTGGAAAGAACGAGTTGCAGTGAACATCAA
ACGTATACAGCCATTCAACACGTTGTTCCACCACATGACTGTTAGGAGCCTCCTCGCGAA
GGTAAGAGTTCGTCAGAAACCAACAGCATGTAGCTATAACTGCACCAGTGATTAAGAAAT
GGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGACAGCATGAGAGCCACTATGGTCATACGTGG
CACAGTAGGCTAAAGTTGCAACAATAAGAAGCAGGCTACAGATCACAATAAAAGCAGGGT
CATAACGTGCCCATTGGTTTTTCGTCTGTTTGTGATACTTAGTGTGTTGATAGACAACTT
TGGGAGATGTACAGAGGTTAAGCATTTGCCAGAAAGTATATTCAACATCCATTTGCTGCC
ACTTGACGATCCGGCGAAAATAATGAAGGAACATTGGGTTGGCTCGGGATGAAGAAGGTG
ATGAGCGAGATCTGGAAGTTGTGGGCAACATTTTCTCCTCCCTTGATCTTCTTCTTCCTC
TTCTTCTTCTTCTTAGTTTTCTCCTCCTCCTTGTCTTCTTCTTCCCTCGAGAGGTTTGGG
AGATCGTTTGATCCAAGATCTCTCTCTCTCGAGGCAATTCCTCTCATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI93JQ U 1
AF RR4BG69JQ U 56
AF RR4EI93TF C 358
AF RR4BG69TF C 299
BS 1 441 RR4EI93JQ
BS 442 442 RR4BG69JQ
BS 443 654 RR4EI93JQ
BS 655 917 RR4BG69JQ
BS 918 1131 RR4BG69TF

RD RR4EI93JQ 654 0 0
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AAATTGTTACTAGATTCTATTAAGTAGCCTTTGAAGTTTTACCAGAAACTGAGCATGACG
ATGATCTGTTACAGGTAACCAAAAAAAAAAAAAAATTCATACTCTCTTCTTCCTTGGTGA
TGTATATGCAGTGCAAAGCCCTTGAGATTCCACTGATGTGGCTTGTTTTGTTTTATAATC
TTTGGCTGAAGTACATGTTCATGAAATATCTTGACGGGTTGAATCCACTTAAGATCAAAA
TAGGGGACAGGACAATCACGATCCCAATAGGGTAGAGGAAGAAGGTTGTTCGTTCCAAAA
ATGGAAGCACGTCATATCCTAGGAAGTTAAAATAATGGTAATACGAAGCCCCGACCATGA
AAAGCAAATTTGAAAGTAGTAAAGCGATGAATCCATGAGTTATCAGGAGTGGTGATAAGA
AATAGTGTACGACGTAAAGCAGCACAAACATTGGAAAGAACGAGTTGCAGTGAACATCAA
ACGTATACAGCCATTCAACACGTTGTTCCACCACATGACTGTTAGGAGCCTCCTCGCGAA
GGTAAGAGTTCGTCAGAAACCAACAGCATGTAGCTATAACTGCACCAGTGATTA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BG69JQ 862 0 0
CAA
AAAAATTGTTACTAGATTCTATTAAGTAGCCTTTGAAGTTTTACCAGAAACTGAGCATGA
CGATGATCTGTTACAGGTAACCAAAAAAAAAAAAAAATTCATACTCTCTTCTTCCTTGGT
GATGTATATGCAGTGCAAAGCCCTTGAGATTCCACTGATGTGGCTTGTTTTGTTTTATAA
TCTTTGGCTGAAGTACATGTTCATGAAATATCTTGACGGGTTGAATCCACTTAAGATCAA
AATAGGGGACAGGACAATCACGATCCCAATAGGGTAAAGGAAAAAGGTTGTTCGTTCCAA
AAATGGAAGCACGTCATATCCTAGGAAGTTAAAATAATGGTAATACAAAGCCCCGACCAT
GAAAAGCAAATTTGAAAGTAGTAGAGCGATGAATCCATGAGTTATCAGGAG*GGTGATAA
GAAATAGTGTACGACGTAAAGCAGCACAAACATTGGAAAGAACGAGTTGCAGTGAACATC
AAACGTATACAGCCATTCAACACGTTGTTCCACCACATGACTGTTAGGAGCCTCCTCGCG
AAGGTAAGAGTTCGTCAAAAACCAACAGCATGTAGCTATAACTGCACCAGTGATTAAGAA
ATGGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGACAGCATGAGAGCCACTATGGTCATACGT
GGCACAGTAGGCTAAAGTTGCAACAATAAGAAGCAGGCTACAGATCACAATAAAAGCAGG
GTCATAACGTGCCCATTGGTTTTTCGTCTGTTTGTGATACTTAGTGTGTTGATAGACAAC
TTTGGGAGATGTACAGAGGTTAAGCATTTGCCAGAAAGTATATTCAACATCCATTTGCTG
CCACTTGACGATCCGGCGA

QA 4 862 4 862
DS 

RD RR4EI93TF 722 0 0
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TGAAAAGCAGATTTGAAAGTAGTAGAGCGATGAATCCATGAGTTATCAGGAGTGGTGATA
AGAAATAGTGTACGACGTAGAGCAGCACAAACATTGGAAAGAACGAGTTGCAGTGAACAT
CAAACGTATACAGCCATTCAACACGTTGTTCCACCACATGACTGTTAGGAGCCTCCTCGC
GAAGGTAAGAGTTCGTCAGAAACCAACAGCATGTAGCTATAACTGCACCAGTGATTAAGA
AATGGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGACAGCATGAGAGCCACTATGGTCATACG
TGGCACAGTAGGCTAAAGTTGCAACAATAAGAAGCAGGCTACAGATCACAATAAAAGCAG
GGTCATCACGTGCCCATTGGTTTTTCGTCTGTTTGTGATACTTAGTGTGTTGATAGACAA
CTTTGGGAGATGTACAGAGGTTAAGCATTTGCCAGAAAGTATATTCAACATCCATTTGCT
GCCACTTGACGATCCGGCGAAAATACTGAAG**ACATTGGGTTGGCTCGGGATGAAGAAG
GTGATGAGCGAGATCTGGAAGTTGTGGGCAACATTTTCTCCTCCCTTGATCTTCTTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTAGTTTTCTCCTCCTCCTTGTCTTCTTCTTCCCTCGAGAGGTTT
CC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4BG69TF 833 0 0
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AAATGGAAGCACGTCATATCCTAGGAAGTTAAGATAATGGTAATACGAAGCCCCGACCAT
GAAAAGCAGATTTGAAAGTAGTAGAGCGATGAATCCATGAGTTATCAGGAG*GGTGATAA
GAAATAGTGTACGACGTAGAGCAGCACAAACATTGGAAAGAACGAGTTGCAGTGAACATC
AAACGTATACAGCCATTCAACACGTTGTTCCACCACATGACTGTTAGGAGCCTCCTCGCG
AAGGTAAGAGTTCGTCAGAAACCAACAGCATGTAGCTATAACTGCACCAGTGATTAAGAA
ATGGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGACAGCATGAGAGCCACTATGGTCATACGT
GGCACAGTAGGCTAAAGTTGCAACAATAAGAAGCAGGCTACAGATCACAATAAAAGCAGG
GTCATAACGTGCCCATTGGTTTTTCGTCTGTTTGTGATACTTAGTGTGTTGATAGACAAC
TTTGGGAGATGTACAGAGGTTAAGCATTTGCCAGAAAGTATATTCAACATCCATTTGCTG
CCACTTGACGATCCGGCGAAAATAATGAAGGAACATTGGGTTGGCTCGGGATGAAGAAGG
TGATGAGCGAGATCTGGAAGTTGTGGGCAACATTTTCTCCTCCCTTGATCTTCTTCTTCC
TCTTCTTCTTCTTCTTAGTTTTCTCCTCCTCCTTGTCTTCTTCTTCCCTCGAGAGGTTTG
GGAGATCGTTTGATCCAAGATCTCTCTCTCTCGAGGCAATTCCTCTCATGCCC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 4

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CTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATG
CCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATA
ATGATTTGCGTCTGATCAACCGGAGAGGTGACCGAGCTTTTAGCACAAGACATGAAAGAC
TCTTTTGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTTTTCTTTCTTTTTTTCTGTCTTTTGGAAACAT
GGCAGTCTTATGGACTGAAGATTCATGTAATGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCT
ACACTCAACATTAGTCTCTCGTTATCAAATAAGTCTCCTTTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RR4FQ65JQ C 1
AF RR4GF22JQ C 1
AF RR4FQ65TF U 1
AF RR4GF22TF U 1
BS 1 523 RR4FQ65TF

RD RR4FQ65JQ 523 0 0
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CGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGATCCGGCGAATCCGTACAAGGATCCGGTGGCGAT
GGTGGAGATGAGAGAGCACATCGTGCGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGAAGGCGAAGAT
CTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATG
CCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATA
ATGATTTGCGTCTGATCAACCGGAGAGGTGACCGAGCTTTTAGCACAAGACATGAAAGAC
TCTTTTGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTTTTCTTTCTTTTTTTCTGTCTTTTGGAAACAT
GGCAGTCTTATGGACTGAAGATTCATGTAATGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCT
ACACTCAACATTAGTCTCTCGTTATCAAATAAGTCTCCTTTCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4GF22JQ 523 0 0
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CGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGATCCGGCGAATCCGTACAAGGATCCGGTGGCGAT
GGTGGAGATGAGAGAGCACATCGTGCGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGAAGGCGAAGAT
CTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATG
CCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATA
ATGATTTGCGTCTGATCAACCGGAGAGGTGACCGAGCTTTTAGCACAAGACATGAAAGAC
TCTTTTGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTTTTCTTTCTTTTTTTCTGTCTTTTGGAAACAT
GGCAGTCTTATGGACTGAAGATTCATGTAATGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCT
ACACTCAACATTAGTCTCTCGTTATCAAATAAGTCTCCTTTCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4FQ65TF 523 0 0
GGGAATCAATCAACGAAAGAGAAGAGAAGCAATGGGGAGAAAGAAGGGATTGCCGGAGTT
CGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGATCCGGCGAATCCGTACAAGGATCCGGTGGCGAT
GGTGGAGATGAGAGAGCACATCGTGCGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGAAGGCGAAGAT
CTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATG
CCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATA
ATGATTTGCGTCTGATCAACCGGAGAGGTGACCGAGCTTTTAGCACAAGACATGAAAGAC
TCTTTTGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTTTTCTTTCTTTTTTTCTGTCTTTTGGAAACAT
GGCAGTCTTATGGACTGAAGATTCATGTAATGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCT
ACACTCAACATTAGTCTCTCGTTATCAAATAAGTCTCCTTTCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4GF22TF 523 0 0
GGGAATCAATCAACGAAAGAGAAGAGAAGCAATGGGGAGAAAGAAGGGATTGCCGGAGTT
CGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGATCCGGCGAATCCGTACAAGGATCCGGTGGCGAT
GGTGGAGATGAGAGAGCACATCGTGCGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGAAGGCGAAGAT
CTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATG
CCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATA
ATGATTTGCGTCTGATCAACCGGAGAGGTGACCGAGCTTTTAGCACAAGACATGAAAGAC
TCTTTTGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTTTTCTTTCTTTTTTTCTGTCTTTTGGAAACAT
GGCAGTCTTATGGACTGAAGATTCATGTAATGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCT
ACACTCAACATTAGTCTCTCGTTATCAAATAAGTCTCCTTTCC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 4

CO CL3584Contig1 1168 4 8 U
TTTTTCTTTTTTTCTCTGTCCTCATTAATGTAAACTTTGATCATCTGATTTGGTGAAACA
TCTAAACCACTGAAAGTACTCTTTTCCTTTTCTGGTATTGATTTGAGAATCAGTGTTAGC
TTTCTTGATCCTCTTCTGTCGGTGTGTTCCGTTTGATGGGAGTTATTATTTCCCGGGGAA
ATTCACTTTTGACATGGCTGCCAAACTGTCTTTCAAGGACTCTCTTAAAGCTCTTGAAGC
CGATATTCAACACGCTAACACTCTAGCTTTAGATCACCCTCGGGAAAGGATGGAGGACGT
GTTCAGATGAGATTGTCCTACAGCCCAGCTGCTCAGTTCTTTCTTTTTCTTGTACAATGG
ACTGATTGTCACCTCGCTGGTACCCTCGGCTTGCTCAGAGTCCTTATCTATATGACATAT
GCGGATGGGAAAACCACAATGTCGGTTTACGAAAGAAAAGCCAGTATAAGAGAGTTCTAT
GCTGTTATATTCCCTTCCTTGTTACAACTACAAAGGGGAATCACAGACCTCGAAGACCGT
AAACAAAAAGAGGTCTGCAGCATGCGGTACAGAAAGAAAGATGAGAGTACAAAGTGTGAG
CTCTCGGAGATTGAGATGGAGCGGGAAGAAGAATGTGGAATCTGCATGGAGATGAACAGC
TTGGTCGTGCTGCCTAACTGTACTCATTCTCTTTGCATCAAATGTTATCACGATTGGAGA
GGGAGGTCGCAGTCATACCCTTTCTGTAGAGACAGTCGTAAGAGAGTGGATTCAGGTGAT
CTCTGGATGTTCTTGGAGAACACCGATACAGTGAATCCCTCTGTGATCGCTAGAGAGAAT
CAGAGACGGTTGTTTGTGTATATTGAGAAGTTACCACTGGTGGTTCCAGATCAAGCGTTT
GCCTCTTCTCCTTACGATTCCCATGTGAGGTGAAACAAAAAAGGAAAAAAAAGGTGTAAA
CCGGTTCTGGTGAATCTTTACATGTATCTATTTATTAGAAGTTAGCAGAAGTAGTAGCAG
TCTTGTCCTTTTTTAAACTCTGTTTTCTTTACCATATTTTCTTGGGAAAGTTCCACTTCC
TTCGTGCCTTTTTGCGCATTTGGTTGTTGGTTCCCATTTACTTATTTACAAGCATAAACC
TCTCTTCAAAAAGTGTCGATTCACAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
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AF RR4E950TF U 1
AF RR4DX56TF U 1
AF RR4E950JQ C 414
AF RR4DX56JQ C 644
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GCGGATGGGAAAACCACAATGTCGGTTTACGAAAGAAAAGCCAGTATAAGAGAGTTCTAT
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DS 

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ATTCACTTTTGACATGGCTGCCAAACTGTCTTTCAAGGACTCTCTTAAAGCTCTTGAAGC
CGATATTCAACACGCTAACACTCTAGCTTTAGATCACCCTCGGGAAAGGATGGAGGACGT
GTTCAGATGAGATTGTCCTACAGCCCAGCTGCTCAGTTCTTTCTTTTTCTTGTACAATGG
ACTGATTGTCACCTCGCTGGTACCCTCGGCTTGCTCAGAGTCCTTATCTATATGACATAT
GCGGATGGGAAAACCACAATGTCGGTTTACGAAAGAAAAGCCAGTATAAGAGAGTTCTAT
GCTGTTATATTCCCTTCCTTGTTACAACTACAAAGGGGAATCACAGACCTCGAAGACCGT
AAACAAAAAGAGGTCTGCAGCATGCGGTACAGAAAGAA*GATGAGAGTACAAAGTGTGAG
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QA 1 742 1 742
DS 

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DS 

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GAAAAAAAAGGTGTAAACCGGTTCTGGTGAATCTTTACATGTATCTATTTATTAGAAGTT
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GGGAAAGTTCCACTTCCTTCGTGCCTTTTTGCGCATTTGGTTGTTGGTTCCCATTTACTT
ATTTACAAGCATAAACCTCTCTTCAAAAAGTGTCGATTCACAACC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 4

CO CL3585Contig1 1305 4 18 U
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GGAAGCACCAGCTTGCCATGCTCGCATCAATAGTGCACATCGTGAATGGTGATTGGTCCT
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CACCACTGGTAGCATCATCAAGGGATGAAACGTCTGTCCATAGCAGTTCAAATCAAACGG
AAAAAGATGTTGACACTGTAAGTTTGGTCATGAAGCTTTTGGCATCCAAAGACGGCGTGG
TTCTTAGAAGACTTTTAATGGCTGCGAACGGGACTTCACTGATCAGGGCATTTATTTCAA
GTGAGGCACATGCCATCCGCAAGAAACTTTGCACAATGGTTGCAGACACACTGTACCAAT
GGATGGTCGGGATCTCCGGAGTTACATCCCTTAAATTCATCTCTCTTTCAGACCAACCAC
CATCTTCAGGAACCAACAGTACAGTAAAAGATTTCAAGAGTTTGATGGGTGACAAACGCG
TCAGAGTGATACTGAGAAAGATACTGGAATCCGCAAAGAGTGACCGAGTGTTGACGGTCA
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CTTCATACCTGAACAGAACGAGAAACATCTTTTAATGTATATTGTTGTCAAGCCCCAGGC
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CTATCATACAATTGTTGTCAGAGTTGTACTGATATGAATATATGTTACTGTCACAAGCAT
AATATTCGTGACATCAAAGAAACTTATGCTCTGCTTTAAGAAGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H229TF U 1
AF RR4BI15TF U 36
AF RR4ES92TF U 471
AF RR4H229JQ C 836
BS 1 39 RR4H229TF
BS 40 40 RR4BI15TF
BS 41 208 RR4H229TF
BS 209 209 RR4BI15TF
BS 210 707 RR4H229TF
BS 708 708 RR4BI15TF
BS 709 725 RR4H229TF
BS 726 726 RR4BI15TF
BS 727 776 RR4H229TF
BS 777 845 RR4BI15TF
BS 846 965 RR4ES92TF
BS 966 966 RR4H229JQ
BS 967 1072 RR4ES92TF
BS 1073 1073 RR4H229JQ
BS 1074 1097 RR4ES92TF
BS 1098 1098 RR4H229JQ
BS 1099 1110 RR4ES92TF
BS 1111 1305 RR4H229JQ

RD RR4H229TF 776 0 0
GGTACACGACATCAAGACAAATAGGGTTTCTGGACTTTGTTTTAGTTTGTCGGATGGAAA
GGAAGCACCAGCTTGCCATGCTCGCATCAATAGTGCACATCGTGAATGGTGATTGGTCCT
CTCTTGTTGAAGCGTTGACTGATATGGATGTCATCAGGCCAGGCGTCAATACGCGTCGTT
TTACGCTGGATCTGGAATTGGCGTTGGCGGAGGTTGAACTTAAAAATGGGATTCCTGATA
TCGAATTCACCAAGGTGCTAAGTAAAATAGTCCAAGTGGCCCTGAAGTATCAGCTACGCA
TGCCACCATACTTCACACTTGTCCTGCGTTCTCTTGCTTGCTTGGAAGGTCTGGCTGCAG
CTGGGGATCCAAATTTTAAGACATTTGAAGCTGCATACCCTTTTGTGGTTCAAAAACTCC
TTACTGAAAATTCAGCTGCAACAAGGAAAATTCTTCATTCGGCAGTTCTGAACCGAAAGA
AGGAGTTCAGATGGGAAAGGGTTGCTCTTTTCCTGAGTAAAAGCTCTGCGAGGAAAGGTT
CACCACTGGTAGCATCATCAAGGGATGAAACGTCTGTCCATAGCAGTTCAAATCAAACGG
AAAAAGATGTTGACACTGTAAGTTTGGTCATGAAGCTTTTGGCATCCAAAGACGGCGTGG
TTCTTAGAAGACTTTTAATGGCTGCGAACGGGACTTCACTGATCAGG*CATTTATTTCAA
GTGAG*CACATGCCATCCGCAAGAAACTTTGCACAATGGTTGCAGACACACTGTAC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4BI15TF 810 0 0
TTTGGTTTAGTTTGTCGGATGGAAAGGAAGCACCAGCTTGCCATGCTCGCATCAATAGTG
CACATCGTGAATGGTGATTGGTCCTCTCTTGTTGAAGCGTTGACTGATATGGATGTCATC
AGGCCAGGCGTCAATACGCGTCGTTTTACGCTGGATCTGGAATTGGCGTTGGCAGAGGTT
GAACTTAAAAATGGGATTCCTGATATCGAATTCACCAAGGTGCTAAGTAAAATAGTCCAA
GTGGCCCTGAAGTATCAGCTACGCATGCCACCATACTTCACACTTGTCCTGCGTTCTCTT
GCTTGCTTGGAAGGTCTGGCTGCAGCTGGGGATCCAAATTTTAAGACATTTGAAGCTGCA
TACCCTTTTGTGGTTCAAAAACTCCTTACTGAAAATTCAGCTGCAACAAGGAAAATTCTT
CATTCGGCAGTTCTGAACCGAAAGAAGGAGTTCAGATGGGAAAGGGTTGCTCTTTTCCTG
AGTAAAAGCTCTGCGAGGAAAGGTTCACCACTGGTAGCATCATCAAGGGATGAAACGTCT
GTCCATAGCAGTTCAAATCAAACGGAAAAAGATGTTGACACTGTAAGTTTGGTCATGAAG
CTTTTGGCATCCAAAGACGGCGTGGTTCTTAGAAGACTTTTAATGGCTGCGAACGGGACT
TCACTGATCAGGGCATTTATTTCAAGTGAGGCACATGCCATCCGCAAGAAACTTTGCACA
ATGGTTGCAGACACACTGTACCAATGGATGGTCGGGATCTCCGGAGTTACATCCCTTAAA
TTCATCTCTCTTTCAGACCAACCACCATCT

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4ES92TF 642 0 0
G
ACCGAAAGAAGGAGTTCAGATGGGAAAGGGTTGCTCTTTTCCTGAGTAAAAGCTCTGCGA
GGAAAGGTTCACCACTGGTAGCATCATCAAGGGATGAAACGTCTGTCCATAGCAGTTCAA
ATCAAACGGAAAAAGATGTTGACACTGTAAGTTTGGTCATGAAGCTTTTGGCATCCAAAG
ACGGCGTGGTTCTTAGAAGACTTTTAATGGTTGCGAACGGGACTTCACTGATCAGGGCAT
TTATTTCAAGTGAGGCACATGCCATCCGCAAGAAACTTTGCACAATGGTTGCAGACACAC
TGTACCAATGGATGGTCGGGATCTCCGGAGTTACATCCCTTAAATTCATCTCTCTTTCAG
ACCAACCACCATCTTCAGGAACCAACAGTACAGTAAAAGATTTCAAGAGTTTGATGGGTG
ACAAACGCGTCAGAGTGATACTGAGAAAGATACTGGAATCCGCAAAGAGTGACCGAGTGT
TGACGGTCAAATTCTGCTTGACGTCCTTTGTTATGTTTCTCACCGCCTCTGCTCTTGCTT
GCCATCGGTTTGTGATCTCAGTCTCTGAAAGGTTACGTCAATTACTTAACTCTGTCTGCT
C*TGTCGCACTTCATACCTGAACAGA*CGAGAAACATCT
CT

QA 2 640 2 640
DS 

RD RR4H229JQ 470 0 0
ACCACCATCTTCAGGAACCAACAGTACAGTAAAAGATTTCAAGAGTTTGATGGGTGACAA
ACGCGTCAGAGTTATACTGAGAAAGATACTGGAATCCGCAAAGAGTGACCGAGTGTTGAC
GGTCAAATTCCGCTTGACGTCCTTTGTTATGTTTCTCACCGCCTCTGCTCTTGCTTGCCA
TCGGTTTGTGATCTCAGTCTCTGAA*GGTTACGTCAATTACTTAACTCTGTCTGCTCCTG
TCGCACTTCATACCTGAACAGAACGAGAAACATCTTTTAATGTATATTGTTGTCAAGCCC
CAGGCAAAAGATTCCATAGAAAGTTTCCGAGATTTGAGTGTATAGATTCGGCTCCATGTC
TAATACTATCATACAATTGTTGTCAGAGTTGTACTGATATGAATATATGTTACTGTCACA
AGCATAATATTCGTGACATCAAAGAAACTTATGCTCTGCTTTAAGAAGAT

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 4

CO CL3586Contig1 956 4 4 U
GGCCAGTCATAAACCAAAAAATGGACAAAAGATGGAGTCTTGAAGGTACGACGGCTCTTG
TAACCGGTGGAGCAAGCGGCATCGGGCATGCCATAGTAGAGGAACTAGCCGGTTTTGGGT
GTAAAGTTCATGCATGTGATCTATCCGAAACTCTGCTCAATCAGAGTTTATGTGAATGGA
AGAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCGGTCTGTGATGTATCATCTCGTTCCGAGAGAG
AAAAACTCATGCAAACCGTCTCAACTATGTTCAACGGCAAGCTCAACATTCTTGTGAACA
ACGTTGCCTCAGCTCGCGTAAAACCAACAACTGAATATCATGAAGATGATTTCTCGTTTC
ATATCTCAACAAACTTGGAGTCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTTTTCTAA
AAGCTTCAGAATCTGGAAGCATTGTCTTCATTTCTTCAATTGCAGGGATTGTTTCAATTA
ATTGTGGATCCATGTATAGTTTAACCAAAGGAGCTTTGAATCAACTAGCAAGAAATCTGG
CTTGTGAATGGGCCAAAGATGGAATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATTTTATCTATA
CTGCTCTGGCTAAACCTTTTCTTGATGATGCCGGTTTTAACAAGAGTTTGTCCAGTAGAA
CTCCACTTGGTCGCCCTGGAGAGCCAAAAGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCTTGTGTC
TACCTGCGACTTCATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACGGTCA
ATGGCTTCTCCTATCAACCACAGGCTTGAGCTGAGAGTTGCGTGGTGATGATGCAGTACA
AGCCTATTTTCTTCTGGTGTTGGGTTCTCCTATTAGGGTTGGCAGTGTATTCGTGCCTTC
GTTTATGTTTTGTTTTCAACTTTGCTTTTGATCATTAATAAAACCCAAAATGAAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GN48TF U 1
AF RR4FR32TF U 1
AF RR4FR32JQ C 389
AF RR4GN48JQ C 455
BS 1 692 RR4FR32TF
BS 693 693 RR4FR32JQ
BS 694 743 RR4FR32TF
BS 744 956 RR4FR32JQ

RD RR4GN48TF 530 0 0
GGCCAGTCATAAACCAAAAAATGGACAAAAGATGGAGTCTTGAAGGTACGACGGCTCTTG
TAACCGGTGGAGCAAGCGGCATCGGGCATGCCATAGTAGAGGAACTAGCCGGTTTTGGGT
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AGAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCGGTCTGTGATGTATCATCTCGTTCCGAGAGAG
AAAAACTCATGCAAACCGTCTCAACTATGTTCAACGGCAAGCTCAACATTCTTGTGAACA
ACGTTGCCTCAGCTCGCGTAAAACCAACAACTGAATATCATGAAGATGATTTCTCGTTTC
ATATCTCAACAAACTTGGAGTCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTTTTCTAA
AAGCTTCAGAATCTGGAAGCATTGTCTTCATTTCTTCAATTGCAGGGATTGTTTCAATTA
ATTGTGGATCCATGTATAGTTTAACCAAAGGAGCTTTGAATCAACTAGCA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4FR32TF 743 0 0
GGCCAGTCATAAACCAAAAAATGGACAAAAGATGGAGTCTTGAAGGTACGACGGCTCTTG
TAACCGGTGGAGCAAGCGGCATCGGGCATGCCATAGTAGAGGAACTAGCCGGTTTTGGGT
GTAAAGTTCATGCATGTGATCTATCCGAAACTCTGCTCAATCAGAGTTTATGTGAATGGA
AGAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCGGTCTGTGATGTATCATCTCGTTCCGAGAGAG
AAAAACTCATGCAAACCGTCTCAACTATGTTCAACGGCAAGCTCAACATTCTTGTGAACA
ACGTTGCCTCAGCTCGCGTAAAACCAACAACTGAATATCATGAAGATGATTTCTCGTTTC
ATATCTCAACAAACTTGGAGTCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTTTTCTAA
AAGCTTCAGAATCTGGAAGCATTGTCTTCATTTCTTCAATTGCAGGGATTGTTTCAATTA
ATTGTGGATCCATGTATAGTTTAACCAAAGGAGCTTTGAATCAACTAGCAAGAAATCTGG
CTTGTGAATGGGCCAAAGATGGAATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATTTTATCTATA
CTGCTCTGGCTAAACCTTTTCTTGATGATGCCGGTTTTAACAAGAGTTTGTCCAGTAGAA
CTCCACTTGGTCGCCCTGGAGAGCCAAAAGAG*TTGCATCACTTGTGGCTTTCTTGTGTC
TACCTGCGACTTCATATATTACT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4FR32JQ 568 0 0
TCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTTTTCTAAAAGCTTCAGAATCTGGAAGCATTGTCTT
CATTTCTTCAATTGCAGGGATTGTTTCAATTAATTGTGGATCCATGTATAGTTTAACCAA
AGGAGCTTTGAATCAACTAGCAAGAAATCTGGCTTGTGAATGGGCCAAAGATGGAATAAG
AGCCAACGCTGTTGCTCCTAATTTTATCTATACTGCTCTGGCTAAACCTTTTCTTGATGA
TGCCGGTTTTAACAAGAGTTTGTCCAGTAGAACTCCACTTGGTCGCCCTGGAGAGCCAAA
AGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCTTGTGTCTACCTGCGACTTCATATATTACTGGTCA
GACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACGGTCAATGGCTTCTCCTATCAACCACAGGCTTG
AGCTGAGAGTTGCGTGGTGATGATGCAGTACAAGCCTATTTTCTTCTGGTGTTGGGTTCT
CCTATTAGGGTTGGCAGTGTATTCGTGCCTTCGTTTATGTTTTGTTTTCAACTTTGCTTT
TGATCATTAATAAAACCCAAAATGAAGG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4GN48JQ 502 0 0
TTCAATTGCAGGGATTGTTTCAATTAATTGTGGATCCATGTATAGTTTAACCAAAGGAGC
TTTGAATCAACTAGCAAGAAATCTGGCTTGTGAATGGGCCAAAGATGGAATAAGAGCCAA
CGCTGTTGCTCCTAATTTTATTTATACTGCTCTGGCTAAACCTTTTCTTGATGATGCCGG
TTTTAACAAGAGTTTGTCCAGTAGAACTCCACTTGGTCGCCCTGGAGAGCCAAAAGAGGT
TGCATCACTTGTGGCTTTCTTGTGTCTACCTGCGACTTCATATATTACTGGTCAGACCAT
TTGTGTTGATGGAGGTCTCACGGTCAATGGCTTCTCCTATCAACCACAGGCTTGAGCTGA
GAGTTGGGTGGTGATGATGCAGTACAAGCCTATTTTCTTCTGGTGTTGGGTTCTCCTATT
AGGGTTGGCAGTGTATTCGTGCCTTCGTTTATGTTTTGTTTTCAACTTTGCTTTTGATCA
TTAATAAAACCCAAAATGAAGG

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 4

CO CL3587Contig1 954 4 12 U
CGCTTAACGCATGAGGAATATATTAAGAGACTAACTCTACTCTCGTGTCTGATAAAAAAG
ATACATATACAATAAATAGAACTGAATAGAATTACAACAATGCCAATGACCTGCCTTCGC
ATCTTTTTATTTTTCAGAAGAAGTCACATCCATCATCAAACATAGCTGACGACAATAGTC
CCTGTACAAACTCACACTTCTTTGCCTTCTCCAGTTGTTCACCATCAGACAATGGCGTTG
ACAGCTTCATGTCTTTTCCTGCCGAAGAATCCTCAATCAAAGTCTTGTTTTCTACACTTG
AATCCACCTCCACCACAGGCTTGGTTTGGTTCGGCAATGGAGAATTGCTGAGGAAAGATA
AGAACTGATCGGTTTTAGAGGTATGATAATGATTCATAGATGGCGACAAATCATCTTGAC
GATATGAATATGGATCTTCCGCGTAAGTCTCCTTCTGCCCGCTCTTCAAGACATCTCTAT
GATGTGTGGTTATATGATCCACCATACGCGTCTTCACCATTTTGCTACAAACAGGACATG
CTCCATAGGTAGCTTCAAGATGATGTTCTACGTCGATATGGTGACACAATTCGACTAAAT
CATAGTCATCGGAGCAAAACGGGCATGGGTATTCCACTTCAACATCATCATCCTCCTCTT
CTTCTTCGAAATCACCCGAATCTCGATAAGATTCATAAGAACCAGATTGGTACTTAGCAG
TGGTTGCTGCTGATCGATGACTTCTCGAAGAACCAGAAGAGGAAACAGCCCACATATCGT
CATCCATCTTATTCGATTCTGAATCTCCACAAAAGAAAAACCTCGAGCTCCTTTATATAG
TCTCTCTCGGACAAGAACTTTTGATTTAGGTAAAGTAGACCTCGTCGTCGTGTGGTTTAC
TTGGACATGTCAGCTTTTAGAAGCTTGACGACTTTGTGACAAAGAAAACGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW19JQ U 14
AF RR4GU14TF C 186
AF RR4GU14JQ U 1
AF RR4DW19TF C 269
BS 1 161 RR4GU14JQ
BS 162 162 RR4DW19JQ
BS 163 569 RR4GU14JQ
BS 570 570 RR4DW19JQ
BS 571 739 RR4GU14JQ
BS 740 740 RR4DW19JQ
BS 741 802 RR4GU14JQ
BS 803 803 RR4GU14TF
BS 804 819 RR4GU14JQ
BS 820 820 RR4DW19TF
BS 821 865 RR4GU14JQ
BS 866 954 RR4DW19TF

RD RR4DW19JQ 736 0 0
AGGAATATATTAAGAGACTAACTCTACTCTCGTGTCTGATAAAAAAGATACATATACAAT
AAATAGAACTGAATAGAATTACAACAATGCCAATGACCTGCCTTCGCATCTTTTTATTTT
TCAGAAGAAGTCACATCCATCATCAAACATAGCTGACGACAATAGTCCCTGTACAAACTC
ACACTTCTTTGCCTTCTCCAGTTGTTCACCATCAGACAATGGCGTTGACAGCTTCATGTC
TTTTCCTGCCGAAGAATCCTCAATCAAAGTCTTGTTTTCTACACTTGAATCCACCTCCAC
CACAGGCTTGGTTTGGTTCGGCAATGGAGAATTGCTGAGGAAAGATAAGAACTGATCGGT
TTTAGAGGTATGATAATGATTCATAGATGGCGACAAATCATCTTGACGATATGAATATGG
ATCTTCCGCGTAAGTCTCCTTCTGCCCGCTCTTCAAGACATCTCTATGATGTGTGGTTAT
ATGATCCACCATACGCGTCTTCACCATTTTGCTACAAACAGGACATGCTCCATAGGTAGC
TTCAAGATGATGTTCTACGTCGATATGGTGACACAATTCGACTAAATCATAGTCATCGGA
GCAAAACGGGCATGGGTATTCCACTTCAACATCATCATCCTCCTCTTCTTCTTCGAAATC
ACCCGAATCTCGATAAGATTCATAAGAACCAGATTGGTACTTAGCAGTGGTTGCTGCTGA
TCGATGACTTCTCGAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4GU14TF 635 0 0
ACAAACTCACACTTCTTTGCCT*CTCCAGTTGT*CACCATCAGACAATGGCGT*GACAGC
TTCATGTCTTT*CCTGCCGAAGAATCCTCAATCAAAGTCTTGTTTTCTACACTTGAATCC
ACCTCCACCACAGGCTTGGTTTGGTTCGGCAATGGAGAATTGCTGAGGAAAGATAAGAAC
TGATCGGTTTTAGAGGTATGATAATGATTCATAGATGGCGACAAATCATCTTGACGATAT
GAATATGGATCTTCCGCGTAAGTCTCCTTCTGCCCGCTCTTCAAGACATCTCTATGATGT
GTGGTTATATGATCCACCATACGCGTCTTCACCATTTTGCTACAAACAGGACATGCTCCA
TAGGTAGCTTCAAGATGATGTTCTTCGTCGATATGGTGACACAATTCGACTAAATCATAG
TCATCGGAGCAAAACGGGCATGGGTATTCCACTTCAACATCATCATCCTCCTCTTCTTCT
TCGAAATCACCCGAATCTCGATAAGATTCATAAGAACCAGATTGGTACTTAGCAGTGGTT
GCTGCTGATCGATGGCTTCTCGAAGAACCAGAAGAGGAAACAGCCCACATATCGTCATCC
ATCTTATTCGATTCTGAATCTCCACAAAAGAAAA
A

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GU14JQ 865 0 0
CGCTTAACGCATGAGGAATATATTAAGAGACTAACTCTACTCTCGTGTCTGATAAAAAAG
ATACATATACAATAAATAGAACTGAATAGAATTACAACAATGCCAATGACCTGCCTTCGC
ATCTTTTTATTTTTCAGAAGAAGTCACATCCATCATCAAACGTAGCTGACGACAATAGTC
CCTGTACAAACTCACACTTCTTTGCCTTCTCCAGTTGTTCACCATCAGACAATGGCGTTG
ACAGCTTCATGTCTTTTCCTGCCGAAGAATCCTCAATCAAAGTCTTGTTTTCTACACTTG
AATCCACCTCCACCACAGGCTTGGTTTGGTTCGGCAATGGAGAATTGCTGAGGAAAGATA
AGAACTGATCGGTTTTAGAGGTATGATAATGATTCATAGATGGCGACAAATCATCTTGAC
GATATGAATATGGATCTTCCGCGTAAGTCTCCTTCTGCCCGCTCTTCAAGACATCTCTAT
GATGTGTGGTTATATGATCCACCATACGCGTCTTCACCATTTTGCTACAAACAGGACATG
CTCCATAGGTAGCTTCAAGATGATGTTCTTCGTCGATATGGTGACACAATTCGACTAAAT
CATAGTCATCGGAGCAAAACGGGCATGGGTATTCCACTTCAACATCATCATCCTCCTCTT
CTTCTTCGAAATCACCCGAATCTCGATAAGATTCATAAGAACCAGATTGGTACTTAGCAG
TGGTTGCTGCTGATCGATGGCTTCTCGAAGAACCAGAAGAGGAAACAGCCCACATATCGT
CATCCATCTTATTCGATTCTGA*TCTCCACAAAAGAAAA*CCTCGAGCTCCTTTATATAG
TCTCTCTCGGACAAGAACTTTTGAT

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4DW19TF 686 0 0
AAT
CTCAATCAAAGTCTTGTTTTCTACACTTGAATCCACCTCCACCACAGGCTTGGTTTGGTT
CGGCAATGGAGAATTGCTGAGGAAAGATAAGAACTGATCGGTTTTAGAGGTATGATAATG
ATTCATAGATGGCGACAAATCATCTTGACGATATGAATATGGATCTTCCGCGTAAGTCTC
CTTCTGCCCGCTCTTCAAGACATCTCTATGATGTGTGGTTATATGATCCACCATACGCGT
CTTCACCATTTTGCTACAAACAGGACATGCTCCATAGGTAGCTTCAAGATGATGTTCTAC
GTCGATATGGTGACACAATTCGACTAAATCATAGTCATCGGAGCAAAACGGGCATGGGTA
TTCCACTTCAACATCATCATCCTCCTCTTCTTCTTCGAAATCACCCGAATCTCGATAAGA
TTCATAAGAACCAGATTGGTACTTAGCAGTGGTTGCTGCTGATCGATGACTTCTCGAAGA
ACCAGAAGAGGAAACAGCCCACATATCGTCATCCATCTTATTCGATTCTGAATCTCCACA
AAAGAAAAACCTCGAGCTCCTTTATATAGTCTCTCTCGGACAAGAACTTTTGATTTAGGT
AAAGTAGACCTCGTCGTCGTGTGGTTTACTTGGACATGTCAGCTTTTAGAAGCTTGACGA
CTTTGTGACAAAGAAAACGCCCC

QA 4 686 4 686
DS 



AS 1 4

CO CL3588Contig1 528 4 2 U
CCTAGAAAAATATTTGAAACTTGTATATCTTTTTCAAAGAATAGTATAGTTTTCTTTACA
TTCTACTTGTCTGCATAATATAACGCGGAGAAACAATCAGAAGATGAGGACTCAAGAGAG
AGCAGAGGAAACTTCATCTCGAGGAGCTTCCATTGGAAGGATAGGAACAGAGAGAGGTGG
TGTTCTCTTTGTTACAGTCAATTTCAGTCCTTCTGTAGTATGTATTGTAGCTCCTGTAGT
CATCTTCACCGGAGGAGCTCCTGGTGCAGTCTGAAAGTTAAATCTTCGAATAAGCATTGC
GATTGCTACCACATTCTCAAACGAAGCAAACATGTCGCCTATGCATTTCCTTGGTCCTCC
ACCAAACGGTAAGTAACTGAAGTTTTGGTTTGTCTCATTTGGGTTTGGTCCATCAAGAGG
CCATCTCTCTGGATTAAACTCTTCTGCGTCATCCCAATGAAGAGGACTTCGATGTAGATT
CCAAACAGATATGAAGATATCCTCATTTCTTTTGATGGGATAGGGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BV46TF C 1
AF RR4CC14TF C 1
AF RR4BV46JQ U 183
AF RR4CC14JQ U 187
BS 1 186 RR4BV46TF
BS 187 528 RR4BV46JQ

RD RR4BV46TF 528 0 0
CCTAGAAAAATATTTGAAACTTGTATATCTTTTTCAAAGAATAGTATAGTTTTCTTTACA
TTCTACTTGTCTGCATAATATAACGCGGAGAAACAATCAGAAGATGAGGACTCAAGAGAG
AGCAGAGGAAACTTCATCTCGAGGAGCTTCCATTGGAAGGATAGGAACAGAGAGAGGTGG
TGTTCTCTTTGTTACAGTCAATTTCAGTCCTTCTGTAGTATGTATTGTAGCTCCTGTAGT
CATCTTCACCGGAGGAGCTCCTGGTGCAGTCTGAAAGTTAAATCTTCGAATAAGCATTGC
GATTGCTACCACATTCTCAAACGAAGCAAACATGTCGCCTATGCATTTCCTTGGTCCTCC
ACCAAACGGTAAGTAACTGAAGTTTTGGTTTGTCTCATTTGGGTTTGGTCCATCAAGAGG
CCATCTCTCTGGATTAAACTCTTCTGCGTCATCCCAATGAAGAGGACTTCGATGTAGATT
CCAAACAGATATGAAGATATCCTCATTTCTTTTGATGGGATAGGGTCC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4CC14TF 528 0 0
CCTAGAAAAATATTTGAAACTTGTATATCTTTTTCAAAGAATAGTATAGTTTTCTTTACA
TTCTACTTGTCTGCATAATATAACGCGGAGAAACAATCAGAAGATGAGGACTCAAGAGAG
AGCAGAGGAAACTTCATCTCGAGGAGCTTCCATTGGAAGGATAGGAACAGAGAGAGGTGG
TGTTCTCTTTGTTACAGTCAATTTCAGTCCTTCTGTAGTATGTATTGTAGCTCCTGTAGT
CATCTTCACCGGAGGAGCTCCTGGTGCAGTCTGAAAGTTAAATCTTCGAATAAGCATTGC
GATTGCTACCACATTCTCAAACGAAGCAAACATGTCGCCTATGCATTTCCTTGGTCCTCC
ACCAAACGGTAAGTAACTGAAGTTTTGGTTTGTCTCATTTGGGTTTGGTCCATCAAGAGG
CCATCTCTCTGGATTAAACTCTTCTGCGTCATCCCAATGAAGAGGACTTCGATGTAGATT
CCAAACAGATATGAAGATATCCTCATTTCTTTTGATGGGATAGGGTCC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4BV46JQ 346 0 0
TTCT
CTTTGTTACAGTCAATTTCAGTCCTTCTGTAGTATGTATTGTAGCTCCTGTAGTCATCTT
CACCGGAGGAGCTCCTGGTGCAGTCTGAAAGTTAAATCTTCGAATAAGCATTGCGATTGC
TACCACATTCTCAAACGAAGCAAACATGTCGCCTATGCATTTCCTTGGTCCTCCACCAAA
CGGTAAGTAACTGAAGTTTTGGTTTGTCTCATTTGGGTTTGGTCCATCAAGAGGCCATCT
CTCTGGATTAAACTCTTCTGCGTCATCCCAATGAAGAGGACTTCGATGTAGATTCCAAAC
AGATATGAAGATATCCTCATTTCTTTTGATGGGATAGGGTCC

QA 5 346 5 346
DS 

RD RR4CC14JQ 342 0 0
CTTTGTTACAGTCAATTTCAGTCCTTCTGTAGTATGTATTGTAGCTCCTGTAGTCATCTT
CACCGGAGGAGCTCCTGGTGCAGTCTGAAAGTTAAATCTTCGAATAAGCATTGCGATTGC
TACCACATTCTCAAACGAAGCAAACATGTCGCCTATGCATTTCCTTGGTCCTCCACCAAA
CGGTAAGTAACTGAAGTTTTGGTTTGTCTCATTTGGGTTTGGTCCATCAAGAGGCCATCT
CTCTGGATTAAACTCTTCTGCGTCATCCCAATGAAGAGGACTTCGATGTAGATTCCAAAC
AGATATGAAGATATCCTCATTTCTTTTGATGGGATAGGGTCC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 4

CO CL3589Contig1 1059 4 15 U
CAGCGAAGAAGAAAAGAATCATCTTTTAACTCTTTGCCTAACTGTGACGAATCCAAAGTG
TAAGGATGCTTAGCTTGAGGTATTCATTACCGTATCTTCCTCAAACAAAGGAATCAACTA
AACTCTTCTCCAGGAGGCCTAGCAATGTTGTGGTTTGTGCGGCTAGAAGTCCAAGACCTC
GATCTCCTCGAGTATGGAAAACAAGGAAGAGAATTGGAAGTATCTCCAAGGCTGCCAAGA
TGATTGCTTGTATAAAAGAATTGTCGAACGTTAAAGAAGAAGTATACGGAGCGCTTGACT
CCTTCATTGCCTGGGAGTTAGAGTTCCCTCTTGTCATTGTCAAGAAGGCTTTAGCTATTC
TTGAAGACGAAAGAGGATGGAAGAAGATTATTCAGGTGACAAAATGGATGCTGAGCAAAG
GCCAAGGAAGAACAATGGGAACTTACTTCTCATTACTAAACGCTCTAGCTGAAGATAACC
GGCTTGACGAAGCTGAGGAACTGTGGAACAAATTGTTCACGGAGCATTTAGAAGGAACTC
CAAGAAAGTTTTTCAACAAAATGATCTCTATCTATTACAAGAGAGACATGCACCACAAAC
TCTTTGAGGTGTTTGCCGACATGGAAGAGCTTGGAGTGAAACCTAACATTGCGATTGTGG
ACATGGTTGGGAAAGTGTTTTTGAAACTTGGGATGAATGATAAGTACGAGAAGCTGATGA
AGAAGTATCCTCCACCACAGTGGGAGTTCAGATATATCAAGGGAAGACGTGTTAAGGTCA
AGGCTAAGCAGCTGAATGAGCTAAGCGAAGGGGAAGGAGGTTTAAGCAGCGACGAAGACA
AGATTGAGAGTAAAACTGAGGAAGCAAACCAAGATGGTGATGATTTCAGTGAAGAGGAAG
AAGAAGGTTTGGGGGCGAATCAAAGACAGATTGGAACATCTAGAGAACCATGTCTTGATC
ATTTGGACTCTTTTTGACTTATAAGTGTTCACTTAATGAGCCTTTGAGATTTTGTATATA
CTATTGGATCATGCATGGAAACATCTTGAGTCACGTTTC


BQ
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CC

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DS 



AS 1 4

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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4A302TF U 1
AF RR4A302TFB U 1
AF RR4A302JQ C 555
AF RR4A302JQD C 500
BS 1 807 RR4A302TF
BS 808 1205 RR4A302JQD

RD RR4A302TF 808 0 0
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TCAATGAGAAGCTGAGTGAAGAAGCTCTGGTTACGTTGTCCTCTCGGGTTAAAATGCAGA
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C

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DS 

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AGCACGTCATAGAGGTTCAGACTCGAGAAAACTTGTTATAAAGGGCGTTAGAGGCAGGTG
TCAATGAGAAGCTGAGTGAAGAAGCTCTGGTTACGTTGTCCTCTCGGGTTAAAATGCAGA
TTGATGTGGTAAAGTCCTTCAGCGATTCTGAAGGAGCACCATGGAAGCTTTCCTTGTTTG
GAAATCCAAATGATTCAGAGACATCCAGGAGAAGATGTGAAATATTGGAGACTCTTGTTG
AGAAAAACTTTGACTTGGCTTTTCAAGTTATATATGAATTTAAGCTCTCAGCTGTTGATA
TATATGCTGGTGTTGCTGCATCACTCGCCGATAGGAAGAAAGGCAGTCAGTTGACAGAAC
TATTCAAAAACATCAAAGGAACGATCCAAGATGATGACTGGGATCAGGTCCTGGGTGCTG
CCATCAATGTATATGCCCACAAGCACAAAGAGCGCCCTGACCGTCTCATAGACATGTTAA
CAAGCAGCCATCGAAAGGTGCTGGCTTGCGTGGTATGTGGCCGCCTGAAAAGGGCGTTCC
AGATTGCGTCCAAAAGCGGTAATGTGGGCTGATGTTCAATATGTAGCTCATCAAGCCTCA
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AGCCTTGTAATCTCCATGACATCGGTC

QA 1 807 1 807
DS 

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GCCCACAAGCACAAAGAGCGCCCTGACCGTTTCATAGACATGTTAACAAGCAGCCATCGA
AAGGTGCTGGCTTGCGTGGTATGTGGCCGCCTGAAAAGGGCGTTCCAGATTGCGTCCAAA
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CACTGTACTCGGTATGTGCAAGCAATGGCTATCTCAAAACATGTAAAGCCTTGTAATCTC
CATGACATCGGTCCAAAGGCAACGTAAAAAAAAACTCTCGAGGTACACATCGTTTTGGCT
GATTCGCGATTAGTCTTGCCTCAGCTTTTATTTTGTTCACTTTTAGTAAAATAGAAAGAC
TACATATGTTTTTTGTTTAAAATATCGAGGGCAGGTTGTTTAAAAAGAACCTGGTGGAAA
ATAGTTTAATCACTCATATGAAGATCATTGACTGATGATTTTGTTCTGCGAGAGATTGTG
CAAATGGAGAAAATGCATAGGTATACTTGT

QA 1 510 1 510
DS 

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CAAGCACAAAGAGCGCCCTGACCGTCTCATAGACATGTTAACAAGCAGCCATCGAAAGGT
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CATCGGTCCAAAGGCAACGTAAAAAAAAACTCTCGAGGTACACATCGTTTTGGCTGATTC
GCGATTAGTCTTGCCTCAGCTTTTATTTTGTTCACTTCTAGTAAAATAGAAAGACTACAT
ATGTTTTTTGTTTAAAATATCGAGGGCAGGTTGTTTAAAAAGAACCTGGTGGAAAATAGT
TTAATCACTCATATGAAGATCATTGACTGATGATTTTGATCTGCGAGAGATTGTGCAAAT
GGAGAAAATGCATAGGTATACTTGTAAAAAAAATTTGGGTTCACCATGGTTGGCATTTAC
TATTTAATGTGAGATGGTGTCCTCGTTTTGTGTTGGATTATAGAACTATTTTAACAAAGA
AACCGTCTAACTTTATTGGAAAGGTGTATTCTCATCATAAAAGTAA

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

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CAAAGAATGGTGAGAAACTTCTGCTTGAGCGTTGGCACATCTAACAACACTCGATCGACG
GTTGTTTCGGGAATGAACGAGTTTGGAATCCGTGTGCTTCGTATAAGAGCCAGCACGAAC
CAAATGGAACGGTTCTGTGTGCAGCCACCAGCTTCTGGCTCCCAGGTTCTCCACTTATCG
TATTCAATTTCCTCAAAGATGAAAGAACTCGTCCTGAGTGGGACGTTCTTTTGAATGGAA
GTTCAGTTCAAGAAGTAGCTCATATCGCAAACGGTTCACATCCAGGAAACTGCATTTCTG
TTCTTCGTGGATTCAATGCATCATCATCGCAATAACATGTTGATACTACAAGAAAGTTGC
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GCGATGAGCGGTCAAGACACATCTTATATTCCCATTCTACCCTCTGGTTTTGCTATTTTA
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AATATGGAGTCAATGGAAACAGTTAATAACCTCATCAGTTCCACTGTCCACCACATTAAA
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TCTGATTTCTGAGAAGGGTCTTTAATGATCAGAGGAGTGAAAGTTATTAAGCACTTATTT
TGCCTTCAGTGCCAGCAAAGAGTGTAAGAAAATCATTACTCTTCTGGTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4AV73TF U 292
AF RR4AW38TF U 1
AF RR4AW38JQ C 1
AF RR4AV73JQ C 123
BS 1 30 RR4AW38TF
BS 31 31 RR4AW38JQ
BS 32 829 RR4AW38TF
BS 830 889 RR4AW38JQ

RD RR4AV73TF 461 0 0
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GCTATTTTACCAGATGGAAGCAGGAATAAACAAACACCAGAGCTTAAAGCTGAAGGAGGA
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GGGAAATTGAATATGGAGTCAATGGAAACAGTTAATAACCTCATCAGTTCCACTGTCCAC
CACATTAAAACCACCTTGAATTGTCCTTCAACTGCTTGAGG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4AW38TF 829 0 0
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CAAATGGAACGGTTCTGTGTGCAGCCACCAGCTTCTGGCTCCCAGGTTCTCCACTTATCG
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GTAGACTCATCAGGCTCGCTTGTGGTCTACACTCCAGTGGATCTACCAGCACTAAACATG
GCGATGAGCGGTCAAGACACATCTTATATTCCCATTCTACCCTCTGGTTTTGCTATTTTA
CCAGATGGAAGCAGGAATAAACAAACACCAGAGCTTAAAGCTGAAGGAGGAGGAGGAGGA
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ACCACCTTGAATTGTCCTTCAACTGCTTGAGGACGCCACTAATAGCTCATTTTTTTCCCA
TCTGATTTCTGAGAAGGGTCTTTAATGATCAGAGGAGTGAAAGTTATTA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4AW38JQ 889 0 0
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GTTGTTTCGGGAATGAACGAGTTTGGAATCCGTGTGCTTCGTATAAGAGCCAGCACGAAC
CAAATGGAACGGTTCTGTGTGCAGCCACCAGCTTCTGGCTCCCAGGTTCTCCACTTATCG
TATTCAATTTCCTCAAAGATGAAAGAACTCGTCCTGAGTGGGACGTTCTTTTGAATGGAA
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GTAGACTCATCAGGCTCGCTTGTGGTCTACACTCCAGTGGATCTACCAGCACTAAACATG
GCGATGAGCGGTCAAGACACATCTTATATTCCCATTCTACCCTCTGGTTTTGCTATTTTA
CCAGATGGAAGCAGGAATAAACAAACACCAGAGCTTAAAGCTGAAGGAGGAGGAGGAGGA
GGTTCATTGATAACGGTTGGGTTTCAGATCATGGTGAGTAGTTTGCAGTCAGGGAAATTG
AATATGGAGTCAATGGAAACAGTTAATAACCTCATCAGTTCCACTGTCCACCACATTAAA
ACCACCTTGAATTGTCCTTCAACTGCTTGAGGACGCCACTAATAGCTCATTTTTTTCCCA
TCTGATTTCTGAGAAGGGTCTTTAATGATCAGAGGAGTGAAAGTTATTAAGCACTTATTT
TGCCTTCAGTGCCAGCAAAGAGTGTAAGAAAATCATTACTCTTCTGGTT

QA 1 889 1 889
DS 

RD RR4AV73JQ 767 0 0
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AATGGAACGGTTCTGTGTGCAGCCACCAGCTTCTGGCTCCCAGGTTCTCCACTTATCGTA
TTCAATTTCCTCAAAGATGAAAGAACTCGTCCTGAGTGGGACGTTCTTTTGAATGGAAGT
TCAGTTCAAGAAGTAGCTCATATCGCAAACGGTTCACATCCAGGAAACTGCATTTCTGTT
CTTCGTGGATTCAATGCATCATCATCGCAATAACATGTTGATACTACAAGAAAGTTGCGT
AGACTCATCAGGCTCGCTTGTGGTCTACACTCCAGTGGATCTACCAGCACTAAACATGGC
GATGAGCGGTCAAGACACATCTTATATTCCCATTCTACCCTCTGGTTTTGCTATTTTACC
AGATGGAAGCAGGAATAAACAAACACCAGAGCTTAAAGCTGAAGGAGGAGGAGGAGGAGG
TTCATTGATAACGGTTGGGTTTCAGATCATGGTGAGTAGTTTGCAGTCAGGGAAATTGAA
TATGGAGTCAATGGAAACAGTTAATAACCTCATCAGTTCCACTGTCCACCACATTAAAAC
CACCTTGAATTGTCCTTCAACTGCTTGAGGACGCCACTAATAGCTCATTTTTTTCCCATC
TGATTTCTGAGAAGGGTCTTTAATGATCAGAGGAGTGAAAGTTATTAAGCACTTATTTTG
CCTTCAGTGCCAGCAAAGAGTGTAAGAAAATCATTACTCTTCTGGTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 4

CO CL3592Contig1 724 4 1 U
GGAGAGCGAAATATACCAAGGGATTTGAGTGAAGGATCTAATTGTCCATAACCTAACCCT
AATATCGGGGGCTCTGTTTCCGTCGGAGCACCCTTCTCTGATCAGAAGAGAGAGACTTCA
TATAGCTCACTTGAGTCTGTTTCCTTCTGAAATAAAATAGGGTTATGGAAACCCAGAAGA
AAGCTAGGGAACATAACCTACGCCGTATAGTTGATGACATCGGTGGGGCATTTGGAATGG
GAGCTATTGGAGGTTCTGTGGTCCACTTCATAAAAGGGACACAGAGTTCCCCGAATGGCC
GTCGTTTTGTTGGAGGAGCACAAGCTGTGAACATGAATGCTCCTCGTATAGGAGGTAGTT
TTGCTGTGTTCGGAGGTCTTTTCTCTGCGTTTGACTACACAATGGTGTACATTAGGAAGA
AGGAAGATCCATGGAACTCTATCGTAGCTGGCGCTGCTACAGGAGGGTTTCTGTCAATGC
GACAAGGACTTGCTGCTGCTTCAAGATCAGCTCTTATGGGAGGGCTTTTGCTTGCTTTGA
TCAAAGGGGTCCATTAATGTTAAAAAACAAGTAAAAGCTTTTTATTGGGATGTGCTTGTT
GAGCTTCCTCTGCTCAATCTTGGAATCTAGATACTCTTTTGTTAAAATCCTTTTCTACAG
TAATTCATGTGTTCGTGGTTTATTATGCCAACTTTTTAAGTACATGAAATCTTTGAGCAA
GACC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 

AF RR4B889JQ C 1
AF RR4BG89JQ C 1
AF RR4B889TF U 1
AF RR4BG89TF U 1
BS 1 724 RR4B889TF

RD RR4B889JQ 724 0 0
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GACC

QA 1 724 1 724
DS 

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GACC

QA 1 724 1 724
DS 

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GACC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BG89TF 724 0 0
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AAGCTAGGGAACATAACCTACGCCGTATAGTTGATGACATCGGTGGGGCATTTGGAATGG
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GACAAGGACTTGCTGCTGCTTCAAGATCAGCTCTTATGGGAGGGCTTTTGCTTGCTTTGA
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TAATTCATGTGTTCGTGGTTTATTATGCCAACTTTTTAAGTACATGAAATCTTTGAGCAA
GACC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G177JQ U 1
AF RR4G177TF C 1
AF RR4GE94JQ U 82
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TTGTACCTAATGTTAATGTCACCGATCTCCACGTTCTTGCATGGGAATCCCTTGCTGCAC
AAAAGCTTAACTGCGTCTTTGTTCGCTGATGTTCCTCTGATATTCTTGAAGCTTATGTCC
ACCAGCTCGATAGATGATGGTTTGTTCTTGTTGCATTGGTTCCAGGGGCAGTACTCTTGG
TCGATGAGGATAGGGTTAGTAACGTTCCTGAGGAAAATATTCTCGAAATGGATACCCGAG
GCGGTCGTGGAGCAAGCTGAGGACGGCCATGTCTTGATCCTTACACCATTGTCAGTGTTT
GTGAGGGTGCAGTTCACGACCCT
C

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DS 

RD RR4GE94JQ 588 0 0
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AGGTTGGAGCATTGGAATGTTGCTGGACCGTCGGCTCCGTTGTACCTAATGTTAATGTCA
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QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 4

CO CL3594Contig1 383 2 2 U
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GACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAG
GACATTGTCAAGTTCAATGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGCTATGCGTCTTCGAC
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TGAAGATCTTCTTGAAGTCGAGTAATATGTCAAGGCGACATTTTGATTTTTGTTACCTTT
TGAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGTTTTTATTTTGT
TATTTGCTATCAACGTGGTTACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AY75JQ C 1
AF RR4AY75TF U 1
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BS 382 383 RR4AY75JQ

RD RR4AY75JQ 383 0 0
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GACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAG
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CAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTT
TGAAGATCTTCTTGAAGTCGAGTAATATGTCAAGGCGACATTTTGATTTTTGTTACCTTT
TGAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGTTTTTATTTTGT
TATTTGCTATCAACGTGGTTACG

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR4AY75TF 383 0 0
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GACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAG
GACATTGTCAAGTTCAATGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGCTATGCGTCTTCGAC
CAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTT
TGAAGATCTTCTTGAAGTCGAGTAATATGTCAAGGCGACATTTTGATTTTTGTTACCTTT
TGAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTGAGTTTTTATTTTGT
TATTTGCTATCAACGTGGTTA
CG

QA 1 381 1 381
DS 



CO CL3594Contig2 462 2 1 U
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AGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGA
TAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGCTATGCG
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AAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCGAGTGATGTGTCAAGGCGACATTTTGATTTTTG
TTTTTTAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTTTGAGTTTTTA
TTTTGTTATTTGCTATCAACGTGGTTAGTAAACATGAATGGTTCAAAATATTTTGGCAAG
AGTTTAAGAGCAGACTTTGAGTAGAATATAAATTTGTTAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EL79JQ C 1
AF RR4EL79TF U 1
BS 1 462 RR4EL79TF

RD RR4EL79JQ 462 0 0
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AGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGA
TAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGCTATGCG
TCTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTC
AAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCGAGTGATGTGTCAAGGCGACATTTTGATTTTTG
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TTTTGTTATTTGCTATCAACGTGGTTAGTAAACATGAATGGTTCAAAATATTTTGGCAAG
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DS 

RD RR4EL79TF 462 0 0
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TAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGCTATGCG
TCTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTC
AAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCGAGTGATGTGTCAAGGCGACATTTTGATTTTTG
TTTTTTAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACTTTGAGTTTTTA
TTTTGTTATTTGCTATCAACGTGGTTAGTAAACATGAATGGTTCAAAATATTTTGGCAAG
AGTTTAAGAGCAGACTTTGAGTAGAATATAAATTTGTTAAGC

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

CO CL3595Contig1 742 2 2 U
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TTGTCGGATACGAAACCGAACCCTCCCCTTTCTTTAAATCCACACTTGCCTTTGTCCGAA
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TTCACCCCTGACATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCTGTGAACACAATAAGAATTGTACTGC
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GCTTGTGGGGGTGGATTTAAAAAAAAAAAAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGA
AATAAAGGTCTCTTCAAGTATCGTTGTATGGTTCTGGTTCAACTGGTGTTTGGTTTAATA
ATATACTGAAACATTTGCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D245TF U 1
AF RR4D245JQ C 96
BS 1 618 RR4D245TF
BS 619 742 RR4D245JQ

RD RR4D245TF 618 0 0
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TTGTCGGATACGAAACCGAACCCTCCCCTTTCTTTAAATCCACACTTGCCTTTGTCCGAA
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ATGGATATGATGAAGGAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATC
GGCCTCGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTAC
ATCGTTGATCTGAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGGAAAATACGAAGGAGGGAAAGTGGGT
GCTACTTTCTCCTTCAAAGATGATGACTTTGTAAAAGTTGCTACTGGCAAGATGAATCCT
CAGATTGCTTTCATCAGGGGTGCAATGAAGATCAAGGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAG
TTCACCCCTGACATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCTGTGAACACAATAAGAATTGTACTGC
AAACCCCTTTGACCCAGGCTCAATTTATGTCTTTTCAAAAGGGTTTTGTTTACCGTTTTA
GCTTGTGGGGGTGGATTT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4D245JQ 647 0 0
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CGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCGGCCTCGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAA
ATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACATCGTTGATCTGAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGG
AAAATACGAAGGAGGGAAAGTGGGTGCTACTTTCTCCTTCAAAGATGATGACTTTGTAAA
AGTTGCTACTGGCAAGATGAATCCTCAGATTGCTTTCATCAGGGGTGCAATGAAGATCAA
GGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAGTTCACCCCTGACATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCT
GTGAACACAATAAGAATTGTACTGCAAACCCCTTTGACCCAGGCTCAATTTATGTCTTTT
CAAAAGGGTTTTGTTTACCGTTTTAGCTTGTGGGGGTGGATTTAAAAAAAAAAAAAGAAG
CAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAAATAAAGGTCTCTTCAAGTATCGTTGTATGGTTCT
GGTTCAACTGGTGTTTGGTTTAATAATATACTGAAACATTTGCTTCG

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL3596Contig1 872 4 13 U
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TACACCTTTGGTTGCATCAACCAAGCCACTGGAACATCGTTGCCAGCACAAGGACTCATG
GGTTTAGGTCGTGGTCCATTGTCTTTAATCTCACAGACACAAAGTCTTTATATGTCTACG
TTCTCGTATTGCTTGCCTAATAGTAAGTCCAGCAACTTCTCGGGATCGTTGAGATTGGGA
CCTAAGTTTCAACCACTTAGGATTAAGACAACTCCATTGCTAAAGAACCCTAGGAGGTCC
TCTCTTTATTATGTTAACTTGGCTGGGATTCGTGTCGGGAATAAGATTGTGGATATTCC*
TACAAGTGCACTCGCCTTTGATCCGGCCACAGGAGCTGGCACCATCTTTGACTCTGGAAC
GGTCTTCACGAGGCTAGTTGAACCAGCTTACATT*GCCGTAAGAGATGAGTTCAGACGAC
GCGTCAAGAACGCAAACGCAACATCACTCGGAGGTTTTGACACTTGCTACTCCGGCTCTG
TTGTCTTCCCACCTGTCACGTTTATGTTTGCGGGAATGAACGTGACTCTGCCTCCGGACA
ATCTTCTCATCCACAGCTCCTCCGGTAACACCAGTTGCCTCGCCATGGCCGCAGCTCCGA
ACAACGTAAACTCCGTCCTTAACGTTATCGCTAGTATGCAGCAGCAGAACCACCGTGTCC
TCATCGACGTGCCTAATTCCAGGCTCGGCATTTCCCGTGAAACATGCACCTAATTAAAAT
ATGTGCG*TGATTGTGTTTTTGTACTATCTATCTTTCGCATTTTAAATTTCTTGAGTTTG
GAAACAATATAAATTGAAGATTTTGTGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B657TF U 1
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AF RR4CW58JQ C 110
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BS 839 872 RR4B657JQ

RD RR4B657TF 797 0 0
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DS 

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G
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CTTGAGTT
GGAAAAA

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DS 

RD RR4B657JQ 766 0 0
CACA
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DS 

RD RR4CW58JQ 747 0 0
G
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GCAGCTCCGAACAACGTAAACTCCGTCCTTAACGTTATCGCTAGTATGCATCAGCAGAAC
CACCGTGTCCTCATCGACGTGCCTAATTCCAGGCTCGGCATTTCCCGTGAAACATGCACC
TAATTAAAATATGTGCG*TGATTGTGTTTTTGTACTATCTATCTTTCGCATTTTAAATTT
CTTGAGTTTGGAAACAATATAAAT
CG

QA 2 745 2 745
DS 



AS 1 4

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ATTGAATTCCTCAATCCCACGGAATTTCTCGCTAATCTCGTGGCCGAGTGTGAGTATGTG
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CACCGTGCTGCAAAACTTATCATCAATTCGCAAATGGAGAATGGAGATTTCCCTCAACAG
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AGCAAAAGTAAACGAATAATAATATAATATGTCTCCTCTGTTTTTGGCTAACTTTTATTT
TTTTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL61TF U 1
AF RR4ER40JQ C 249
AF RR4ER40TF U 180
AF RR4DL61JQ C 126
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RD RR4DL61TF 764 0 0
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QA 1 764 1 764
DS 

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AGTAATGGGTCTGATTCACGCTGGACAGGCTGAGAGAGATCCAGTACCTCTTCACCGTGC
TGCAAAACTTATCATCAATTCGCAAATGGAGAATGGAGATTTCCCTCAACAGGAGATAGT
AGGAGTGTTCATGAGGAATTGCTTGATACACTATGCTACCTACAGAAACACTTTCCCATT
ATGGGCACTTGCTGAGTACCGAAAAGCTACCTTCCCAATCCCAGCTCAACAACATCATCT
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TAAACGAATAATAATATAATATGTCTCCTCTGTTTT
TGGGC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4ER40TF 709 0 0
G
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ACGCCAGATGGTTCATGGTATGGGAATTGGGGAGTTTGTTTCATTTACGGAACATGGTTT
GCTCTTGCCGGCCTAGCAGCCGCTGGTGAAACATATAAAAACAGTCTGGCTATGCGTAAA
GGTGTTCAGTTTTTACTCAGGACACAGAGAGACGATGGAGGCTGGGGCGAAAGCTATCTG
TCATGTCCTGAACAGAGATACATACCATTAGAAGGGGAAACATCAAACTTGGTGCAAACA
GCTTGGGCAGTAATGGGTCTGATTCACGCTGGACAGGCTGAGAGAGATCCAGTACCTCTT
CACCGTGCTGCAAAACTTATCATCAATTCGCAAATGGAGAATGGAGATTTCCCTCAACAG
GAGATAGTAGGAGTGTTCATGAGGAATTGCTTGATACACTATGCTACCTACAGAAACACT
TTCCCATTATGGGCACTTGCTGAGTACCGAAAAGCTACCTTCCCAATCCCAGCTCAACAA
CATCATCTTCAGCTTCCTTAGTAAATGTTTACAGATTATAGATAAAAAGAACAAAACAAT
GTCTACATATGGATGAAATCTCCTGTGTCTTTGGCTACTTATTCAGATGTATGTTTATTC
AGCAAAAGTAAACGAATAATAATATAATATGTCTCCTCTGTTTT
GGGC

QA 2 705 2 705
DS 

RD RR4DL61JQ 785 0 0
GCA
CTCATCTGTTATACAAGCTTTGATTCTGTTCAAGCAACTCTATCCAGACCACAGGACAAA
AGAGATAAGCAGGTCCATCGAGAAAGCTGTGCAATTCATAGAAAACGAACAGACGCCAGA
TGGTTCATGGTATGGGAATTGGGGAGTTTGTTTCATTTACGGAACATGGTTTGCTCTTGC
CGGCCTAGCAGCCGCTGGTGAAACATATAAAAACAGTCTGGCTATGCGTAAAGGTGTTCA
GTTTTTACTCAGGACACAGAGAGACGATGGAGGCTGGGGCGAAAGCTATCTGTCATGTCC
TGAACAGAGATACATACCATTAGAAGGGAAAACATCAAACTTGGTGCAAACAGCTTGGGC
AGTAATGGGTCTGATTCACGCTGGGCAGGCTGAGAGAGATCCAGTACCTCTTCACCGTGC
TGCAAAACTTATCATCAATTCGCAAATGGAGAATGGAGATTTCCCTCAACAGGAGATAGT
AGGAGTGTTCATGAGGAATTGCTTGATACACTATGCTACCTACAGAAACACTTTCCCATT
ATGGGCACTTGCTGAGTACCGAAAAGCTACCTTCCCAATCCCAGCTCAACAACATCATCT
TCAGCTTCCTTAGTAAATGTTTACAGATTATAGATAAAAAGAACAAAACAATGTCTACAT
ATGGATGAAATCTCCTGTGTCTTTGGCTACTTATTCAGATGTATGTTTATTCAGCAAAAG
TAAACGAATAATAATATAATATGTCTCCTCTGTTTTTGGCTAACTTTTATTTTTTTTTAA
CC

QA 4 785 4 785
DS 



AS 2 4

CO CL3598Contig1 801 2 12 U
AGTTTCAATCATAAATAGTATACACACACAAAGAAATGTGTTACATATCAAAAACAAACA
CGAAAGTACTAAATCATAAGCAAGTGAAAACATATATCAAAGCACCCACCATTTGTTGCA
TTGTTTCTCATCAAATTTTCATTAACATGTAATAAACTTTACCATAATTTTGATCAAAGG
TGGAAATGACTAGGGTGTGATTTTGTCATCCTAGCCTCACCGCCCGGCTCATCGTTATCA
ATCCTCTTGACATTCCTGTAAGCCGCATAAGCGATCACGTAGAAGATAACGAGAATAATA
AGCACCACGATGTTGATCACGGACACTTTTCTCCAGCTTTTCTTCAAGCTCCCTAGAACA
CCCGCTTTACAAGCACTGCACTGGTAACAGAGCATGCTCTGCTCGTTATTCCACAACATA
CAGTCCGGGTTTGCCCCTACCAGCCCTCCTCCTTGCGTCCAAAACGTCTCGTTACCATAT
GCATACCCGCAATCTGATGGCGGCTTGCAACAGCCAGACTCAACAGGGCTAAGGCTTCTC
TGGAAAAACATATCAGCACTTTCAGGGACGCCATTAAAGTTCCTTCCGATCTTCCTACAA
GCTCCAGAATCTCTAATACACGAGCTGATTTTTCCCCAGTATCCATCATCAGAAACCCTA
TCCTCCAACCAACCGGAATAATCTTGAAGATAATAGTCAAGATAACCCCTGTTCAGCACG
TTTCGACCAGATCCTTTATCGGTGACTGCATAAGCAAAGATGATGAATCCTATAAAGCTG
CGATGATGAGAAGCATTGCCA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV68JQ U 1
AF RR4H209JQ U 1
BS 1 108 RR4BV68JQ
BS 109 109 RR4H209JQ
BS 110 110 RR4BV68JQ
BS 111 111 RR4H209JQ
BS 112 401 RR4BV68JQ
BS 402 402 RR4H209JQ
BS 403 434 RR4BV68JQ
BS 435 435 RR4H209JQ
BS 436 561 RR4BV68JQ
BS 562 562 RR4H209JQ
BS 563 788 RR4BV68JQ
BS 789 801 RR4H209JQ

RD RR4BV68JQ 788 0 0
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TGGAAATGACTAGGGTGTGATTTTGTCATCCTAGCCTCACCGCCCGGCTCATCGTTATCA
ATCCTCTTGACATTCCTGTAAGCCGCATAAGCGATCACGTAGAAGATAACGAGAATAATA
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CCCGCTTTACAAGCACTGCACTGGTAACAGAGCATGCTCTGTTCGTTATTCCACAACATA
CAGTCCGGGTTTGCTCCTACCAGCCCTCCTCCTTGCGTCCAAAACGTCTCGTTACCATAT
GCATACCCGCAATCTGATGGCGGCTTGCAACAGCCAGACTCAACAGGGCTAAGGCTTCTC
TGGAAAAACATATCAGCACTT*CAGGGACGCCATTAAAGTTCCTTCCGATCTTCCTACAA
GCTCCAGAATCTCTAATACACGAGCTGATTTTTCCCCAGTATCCATCATCAGAAACCCTA
TCCTCCAACCAACCGGAATAATCTTGAAGATAATAGTCAAGATAACCCCTGTTCAGCACG
TTTCGACCAGATCCTTTATCGGTGACTGCATAAGCAAAGATGATGAATCCTATAAAGCTG
CGATGATG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4H209JQ 801 0 0
G
GTTTCAATCATAAATAGTATACACACACAAAGAAATGTGTTACATATCAAAAACAAACAC
GAAAGTACTAAATCATAAGCAAGTGAAAACATATATCAAAGCACCCACCATTTGTTGCAT
TGTTTCTCATCAGATTTTCATTAACATGTAATAAACTTTACCATAATTTTGATCAAAGGT
GGAAATGACTAGGGTGTGATTTTGTCATCCTAGCCTCACCGCCCGGCTCATCGTTATCAA
TCCTCTTGACATTCCTGTAAGCCGCATAAGCGATCACGTAGAAGATAACGAGAATAATAA
GCACCACGATGTTGATCACGGACACTTTTCTCCAGCTTTTCTTCAAGCTCCCTAGAACAC
CCGCTTTACAAGCACTGCACTGGTAACAGAGCATGCTCTGCTCGTTATTCCACAACATAC
AGTCCGGGTTTGCCCCTACCAGCCCTCCTCCTTGCGTCCAAAACGTCTCGTTACCATGTG
CATACCCGCAATCTGATGGCGGCTTGCAACAGCCAGACTCAACAGGGCTAAGGCTTCTCT
GGAAGAACATATCAGCACTTTCAGGGACGCCATTAAAGTTCCTTCCGATCTTCCTACAAG
CTCCAGAATCTCTAATACACGAGCTGATTTTTCCCCAGTATCCATCATCAGAAACCCTAT
CCTTCAACCAACCGGAATAATCTTGAAGATAATAGTCAAGATAACCCCTGTTCAGCACGT
TTCGACCAGATCCTTTATCGGTGACTGCATAAGCAAAGATGATGAATCCTATCAGGCTGC
GATGATGAGAAGCATTGCCA

QA 2 801 2 801
DS 



CO CL3598Contig2 791 2 15 U
GGACAAAAAAAAAATTACATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAAACCTGAGAAGAGCTAT
GAGATCGAGCAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCC
AATCCTAGGCGGAGGGATATGGCTAAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTT
CCTCCAGTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCCCCATCATGGTGGTATCCCTAGCCGGATT
CGCCGGAGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCT
CATCATCGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATC
TGGTCGAAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTG
GTTGAAGGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGA
TTCTGGAGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATAT
GTTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTG
CGGGTATGCACATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGAGCAAA
CCCGGACTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTG
TAAAGCGGGTGTTCTAGGAGCTTGAAGAAAGCTGGAGAAAAGTGTCCGTGATCAACATCG
TGGTGCTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H209TF U 3
AF RR4BV68TF U 1
BS 1 44 RR4BV68TF
BS 45 45 RR4H209TF
BS 46 159 RR4BV68TF
BS 160 160 RR4H209TF
BS 161 315 RR4BV68TF
BS 316 316 RR4H209TF
BS 317 424 RR4BV68TF
BS 425 425 RR4H209TF
BS 426 529 RR4BV68TF
BS 530 530 RR4H209TF
BS 531 610 RR4BV68TF
BS 611 611 RR4H209TF
BS 612 680 RR4BV68TF
BS 681 683 RR4H209TF
BS 684 791 RR4BV68TF

RD RR4H209TF 747 0 0
GGAC
AAAAAAAATTACATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAAACCTGAGAAGAGCTATGAGATC
GAGCAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATCCT
AGGCGGAGGGATATGGCTAAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCA
GTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTGGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGG
AGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCAT
CGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCG
AAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAA
GGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGG
AGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTT
CCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTA
TGCACATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGGGCAAACCCGGA
CTGTATGTTGTGGAATAACGAGCAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGC
GGGTGTTCTAGGAGCTTGAAGAA

QA 5 747 5 747
DS 

RD RR4BV68TF 791 0 0
GGACAAAAAAAAAATTACATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAA*CCTGAGAAGAGCTAT
GAGATCGAGCAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCC
AATCCTAGGCGGAGGGATATGGCTAAGCAGCAGAGCTAATTCAACCGACTGTTTACGTTT
CCTCCAGTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCCCCATCATGGTGGTATCCCTAGCCGGATT
CGCCGGAGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCT
CATCATCGCAGCCTTTATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATC
TGGTCGAAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTG
GTTGGAGGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGA
TTCTGGAGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAA*GTGCTGATAT
GTTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTG
CGGGTATGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGAGCAAA
CCCGGACTGTATGTTGTGGAT**ACGAACAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTG
TAAAGCGGGTGTTCTAGGAGCTTGAAGAAAGCTGGAGAAAAGTGTCCGTGATCAACATCG
TGGTGCTTATA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 4

CO CL3599Contig1 807 4 12 U
GGGTCGGGGCAACCCGAGTTTGATTACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGT
GTTGGCAAAAGCTCTCTTTTGCTTAGTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC
ACAATCGGAGTTGATTTCAAAGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTT
GCGATTTGGGACACAGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGA
GGAGCTCAGGGCATCATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTA
TCAGATATATGGGCTAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAAATG
CTTGTTGGGAATAAAGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGTATCTAAAAAAGAAGGCATT
GACTTTGCTCGGGAGTATGGATGTTTG**TTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCC*GAGTC
AATGTTGAGCAATGTTTTGAAGAGCTT*GTTCTTAAGATTTT*GGAAACGCCCAGTCTTA
CTGCTGAAGGTTCGTCTGGAGGGAAGAAGAACATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCA
GCAATGCTTCATCGAGTTACTGCTGCTCGTCTTAGACACGGCTTTACGGTTTATGACACA
AACTCCACTCTTGTTTGTCTTCTTGCTCTTGATTGTCTGTCTCTCTGTTTCCCAGAAAAA
CTGCAGCATCTTGGATGTAAATCTTAACCCTACTTTCAGAGTTGTGTTCACTGGTTTTCT
AATTTGAGATCATCCCATCTTATTCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A191TF U 115
AF RR4A191JQ C 1
AF RR4A191TFB U 418
AF RR4A191JQD C 1
BS 1 114 RR4A191JQ
BS 115 405 RR4A191TF
BS 406 423 RR4A191JQ
BS 424 446 RR4A191TFB
BS 447 449 RR4A191JQ
BS 450 474 RR4A191TFB
BS 475 475 RR4A191JQ
BS 476 507 RR4A191TFB
BS 508 508 RR4A191JQ
BS 509 522 RR4A191TFB
BS 523 523 RR4A191JQ
BS 524 807 RR4A191TFB

RD RR4A191TF 291 0 0
TCTCCCACAATCGGAGTTGATTTCAAAGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTG
AAGCTTGCGATTTGGGACACAGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGACGTTAACAAGTTCGTAT
TACAGAGGAGCTCAGGGCATCATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACC
AATCTATCAGATATATGGGCTAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATC
AAAATGCTTGTTGGGAATAAAGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGTATCT

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR4A191JQ 807 0 0
GGGTCGGGGCAACCCGAGTTTGATTACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGT
GTTGGCAAAAGCTCTCTTTTGCTTAGTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC
ACAATCGGAGTTGATTTCAAAGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTT
GCGATTTGGGACACAGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGA
GGAGCTCAGGGCATCATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTA
TCAGATATATGGGCTAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAAATG
CTTGTTGGGAATAAAGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGTATCTAAAAAAGAAGGCATT
GACTTTGCTCGGGAGTATGGATGTTTG**TTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCC*GAGTC
AATGTTGAGCAATGTTTTGAAGAGCTT*GTTCTTAAGATTTT*GGAAACGCCCAGTCTTA
CTGCTGAAGGTTCGTCTGGAGGGAAGAAGAACATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCA
GCAATGCTTCATCGAGTTACTGCTGCTCGTCTTAGACACGGCTTTACGGTTTATGACACA
AACTCCACTCTTGTTTGTCTTCTTGCTCTTGATTGTCTGTCTCTCTGTTTCCCAGAAAAA
CTGCAGCATCTTGGATGTAAATCTTAACCCTACTTTCAGAGTTGTGTTCACTGGTTTTCT
AATTTGAGATCATCCCATCTTATTCAG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4A191TFB 390 0 0
TTGACT
TTTGCTCGGGAGTATGGATGTTTTGTTTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCCCGAGTCAAT
GTTGAGCAATGTTTTGAAGAGCTTTGTTCTTAAGATTTTTGGAAACGCCCAGTCTTACTG
CTGAAGGTTCGTCTGGAGGGAAGAAGAACATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCAGCA
ATGCTTCATCGAGTTACTGCTGCTCGTCTTAGACACGGCTTTACGGTTTATGACACAAAC
TCCACTCTTGTTTGTCTTCTTGCTCTTGATTGTCTGTCTCTCTGTTTCCCAGAAAAACTG
CAGCATCTTGGATGTAAATCTTAACCCTACTTTCAGAGTTGTGTTCACTGGTTTTCTAAT
TTGAGATCATCCCATCTTATTCAG

QA 7 390 7 390
DS 

RD RR4A191JQD 807 0 0
GGGTCGGGGCAACCCGAGTTTGATTACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGT
GTTGGCAAAAGCTCTCTTTTGCTTAGTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC
ACAATCGGAGTTGATTTCAAAGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTT
GCGATTTGGGACACAGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGA
GGAGCTCAGGGCATCATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTA
TCAGATATATGGGCTAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAAATG
CTTGTTGGGAATAAAGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGTATCTAAAAAAGAAGGCATT
GACTTTGCTCGGGAGTATGGATGTTTG**TTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCC*GAGTC
AATGTTGAGCAATGTTTTGAAGAGCTT*GTTCTTAAGATTTT*GGAAACGCCCAGTCTTA
CTGCTGAAGGTTCGTCTGGAGGGAAGAAGAACATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCA
GCAATGCTTCATCGAGTTACTGCTGCTCGTCTTAGACACGGCTTTACGGTTTATGACACA
AACTCCACTCTTGTTTGTCTTCTTGCTCTTGATTGTCTGTCTCTCTGTTTCCCAGAAAAA
CTGCAGCATCTTGGATGTAAATCTTAACCCTACTTTCAGAGTTGTGTTCACTGGTTTTCT
AATTTGAGATCATCCCATCTTATTCAG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 4

CO CL3600Contig1 883 4 4 U
GGAGGATATCAGAGAATTGGAGAAAATGTAACCAAGGGAAAACCAGATATTCACGAAGCC
ATTGATGGTTACAGAGAGTTTAAGCAAGGGAAGTATGGTAATATAGGCAAAGCCATGGAA
GGGCCAAACCAGTGGCCAGAGAATCCTCATGAGTTCAAAGAGTTGATGGAGGAGTATCTA
AGGCTCTGTACAGATATTTCGAGAAACATATTGAGGGGAATTGCATTAGCTCTTGGAGGA
TCACCTTATGAGTTTGAAGGAAAGATTGCTGGAGAGCCTTTTTGGGTGATGCGTCTTATT
GGCTATCCTGGTACTCCCTTCACCAATGGCAAGCTCGAAAACGAAGTTGGATGTGGAGCT
CACACTGACTATGGCTTGTTAACTCTTGTAAATCAAGATGATGACAAAACTGCTCTCCAG
GTGAGAAATTTGGGAGGTGATTGGATATCAGCCATTCCCATCCCTGGATCATTTGTGTGC
AACTTCGGCGACATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGTATATGAATCCACACTTCATAGA
GTGATCAATAACTCTCCTCTATACCGTGTCTGCGTTGCATTCTTCTATGAGACTAATTTT
GACGCGGTGGTGGAGCCATTGGATGTTTGTAAAAATAAGTACCCTGCAGTGAGAGGGGAA
TCACAAGTTTTCAAAAGAGCTGTCTACGGAGAGCATCTGGTGAGCAAAGTCCAGACCAAC
TTTGCAATGTAATGAAACATAGATCTCTCTTCCTCACCTTCTTTGTACTCGATCATCAGT
AGTTCACCTTCAGGTTTGGCTTGTAAATTATAATAAGGGCTTCCCCACGTCTGTATTATT
AATCAACATAAAAGGTTTTGTTCAAATTCGTTTGAGCATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DT71TF U 1
AF RR4E603TF U 126
AF RR4DT71JQ C 46
AF RR4E603JQ C 381
BS 1 66 RR4DT71TF
BS 67 67 RR4DT71JQ
BS 68 748 RR4DT71TF
BS 749 883 RR4DT71JQ

RD RR4DT71TF 748 0 0
GGAGGATATCAGAGAATTGGAGAAAATGTAACCAAGGGAAAACCAGATATTCACGAAGCC
ATTGATTGTTACAGAGAGTTTAAGCAAGGGAAGTATGGTAATATAGGCAAAGCCATGGAA
GGGCCAAACCAGTGGCCAGAGAATCCTCATGAGTTCAAAGAGTTGATGGAGGAGTATCTA
AGGCTCTGTACAGATATTTCGAGAAACATATTGAGGGGAATTGCATTAGCTCTTGGAGGA
TCACCTTATGAGTTTGAAGGAAAGATTGCTGGAGAGCCTTTTTGGGTGATGCGTCTTATT
GGCTATCCTGGTACTCCCTTCACCAATGGCAAGCTCGAAAACGAAGTTGGATGTGGAGCT
CACACTGACTATGGCTTGTTAACTCTTGTAAATCAAGATGATGACAAAACTGCTCTCCAG
GTGAGAAATTTGGGAGGTGATTGGATATCAGCCATTCCCATCCCTGGATCATTTGTGTGC
AACTTCGGCGACATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGTATATGAATCCACACTTCATAGA
GTGATCAATAACTCTCCTCTATACCGTGTCTGCGTTGCATTCTTCTATGAGACTAATTTT
GACGCGGTGGTGGAGCCATTGGATGTTTGTAAAAATAAGTACCCTGCAGTGAGAGGGGAA
TCACAAGTTTTCAAAAGAGCTGTCTACGGAGAGCATCTGGTGAGCAAAGTCCAGACCAAC
TTTGCAATGTAATGAAACATAGATCTCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4E603TF 628 0 0
AAACCAGTGGCCAGAGAATCCTCATGAGTTCAAAGAGTTGATGGAGGAGTATCTAAGGCT
CTGTACAGATATTTCGAGAAACATATTGAGGGGAATTGCATTAGCTCTTGGAGGATCACC
TTATGAGTTTGAAGGAAAGATTGCTGGAGAGCCTTTTTGGGTGATGCGTCTTATTGGCTA
TCCTGGTACTCCCTTCACCAATGGCAAGCTCGAAAACGAAGTTGGATGTGGAGCTCACAC
TGACTATGGCTTGTTAACTCTTGTAAATCAAGATGATGACAAAACTGCTCTCCAGGTGAG
AAATTTGGGAGGTGATTGGATATCAGCCATTCCCATCCCTGGATCATTTGTGTGCAACTT
CGGCGACATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGTATATGAATCCACACTTCATAGAGTGAT
CAATAACTCTCCTCTATACCGTGTCTGCGTTGCATTCTTCTATGAGACTAATTTTGACGC
GGTGGTGGAGCCATTGGATGTTTGTAAAAATAAGTACCCTGCAGTGAGAGGGGAATCACA
AGTTTC**AAAGAGCTGTCTACG*AGAGCATCTGGTGAGCAAAGTCCAGAC*AACTTTGC
A*TGTA*TGAAACATAGATCTCT
CTTCC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4DT71JQ 838 0 0
GATATTCACGAAGCCATTGATG**TACAGAGAGTTTAAGCAAGGGAAGTATGGTAATATA
GGCAAAGCCATGGAAGGGCCAAACCAGTGGCCAGAGAATCCTCATGAGTTCAAAGAGTTG
ATGGAGGAGTATCTAAGGCTCTGTACAGATATTTCGAGAAACATATTGAGGGGAATTGCA
TTAGCTCTTGGAGGATCACCTTATGAGTTTGAAGGAAAGATTGCTGGAGAGCCTTTTTGG
GTGATGCGTCTTATTGGCTATCCTGGTACTCCCTTCACCAATGGCAAGCTCGAAAACGAA
GTTGGATGTGGAGCTCACACTGACTATGGCTTGTTAACTCTTGTAAATCAAGATGATGAC
AAAACTGCTCTCCAGGTGAGAAATTTGGGAGGTGATTGGATATCAGCCATTCCCATCCCT
GGATCATTTGTGTGCAACTTCGGCGACATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGTATATGAA
TCCACACTTCATAGAGTGATCAATAACTCTCCTCTATACCGTGTCTGCGTTGCATTCTTC
TATGAGACTAATTTTGACGCGGTGGTGGAGCCATTGGATGTTTGTAAAAATAAGTACCCT
GCAGTGAGAGGGGAATCACAAGTTTTCAAAAGAGCTGTCTACGGAGAGCATCTGGTGAGC
AAAGTCCAGACCAACTTTGCAATGTAATGAAACATAGATCTCTCTTCCTCACCTTCTTTG
TACTCGATCATCAGTAGTTCACCTTCAGGTTTGGCTTGTAAATTATAATAAGGGCTTCCC
CACGTCTGTATTATTAATCAACATAAAAGGTTTTGTTCAAATTCGTTTGAGCATACCC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4E603JQ 503 0 0
AACTCTTGTAAATCAAGATGATGACAAAACTGCTCTCCAGGTGAGAAATTTGGGAGGTGA
TTGGATATCAGCCATTCCCATCCCTGGATCATTTGTGTGCAACTTCGGCGACATGTTAAA
GATACTTTCAAATGGAGTATATGAATCCACACTTCATAGAGTGATCAATAACTCTCCTCT
ATACCGTGTCTGCGTTGCATTCTTCTATGAGACTAATTTTGACGCGGTGGTGGAGCCATT
GGATGTTTGTAAAAATAAGTACCCTGCAGTGAGAGGGGAATCACAAGTTTTCAAAAGAGC
TGTCTACGGAGAGCATCTGGTGAGCAAAGTCCAGACCAACTTTGCAATGTAATGAAACAT
AGATCTCTCTTCCTCACCTTCTTTGTACTCGATCATCAGTAGTTCACCTTCAGGTTTGGC
TTGTAAATTATAATAAGGGCTTCCCCACGTCTGTATTATTAATCAACATAAAAGGTTTTG
TTCAAATTCGTTTGAGCATACCC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 2 4

CO CL3601Contig1 733 2 4 U
AAAAGTGAGAAAAGGCAAGGAAAATAGAAAATGTGATCTTACAAGTTGTTTCCTCTAAAA
TCATTCACACACACACATCACACATGTCTAACATTTACACGATCAGAAATCCATTACTAT
TGAGAGCGGTTGAGTCGATTCTTGACCATTGTTGTATCAGTCAATCAATCCCCAGTGTCG
AAAATGGCTCAATGTCTCCAGAACAATCATCATGAACACGCCATATGGTCTCCGCGAGAA
GGTTTGCTACTGAGAGAACTGTAAGCTGAGGAAAGTAGTTTTGCTCCGACAGTGGAATCG
TGTTGGTTATGATCACCTCTTGGAACAGACCGCTCGATAGTCTACTGATTGCAGGAGGGC
TGAAAACGGCATGAGTAGTACATGCGTAGACTTCTCTTGCTCCTTCTTGGTGTAACAGAG
CTGCACCTCTGCTTATGGTTCCGGCTGTGTCAATCATGTCATCCACCATTATAGCTACTT
TCCCTTTAACATCCCCAATTAAGTTCATCACCTCGGCAACATTGTGTCCATGACGTCTTT
TGTCAACTATGGCTAAAGGAGCATCGGATAGCTTCTTGGCAAAAGCGCGAGCTCTTGCGA
CTCCACCAACATCAGGCGAAACAACCACCAAATCATCAGAGGATATGCCTTTGCTTGCCA
GGTAATCAAGTATCACAGGCTGGCCATAAACATGGTCAACTGGAATATCAAAGTAACCCA
TAGACTGTCCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO44JQ U 1
AF RR4BV70JQ U 16
BS 1 428 RR4DO44JQ
BS 429 429 RR4BV70JQ
BS 430 597 RR4DO44JQ
BS 598 733 RR4BV70JQ

RD RR4DO44JQ 597 0 0
AAAAGTGAGAAAAGGCAAGGAAAATAGAAAATGTGATCTTACAAGTTGTTTCCTCTAAAA
TCATTCACACACACACATCACACATGTCTAACATTTACACGATCAGAAATCCATTACTAT
TGAGAGCGGTTGAGTCGATTCTTGACCATTGTTGTATCAGTCAATCAATCCCCAGTGTCG
AAAATGGCTCAATGTCTCCAGAACAATCATCATGAACACGCCATATGGTCTCCGCGAGAA
GGTTTGCTACTGAGAGAACTGTAAGCTGAGGAAAGTAGTTTTGCTCCGACAGTGGAATCG
TGTTGGTTATGATCACCTCTTGGAACAGACCGCTCGATAGTCTACTGATTGCAGGAGGGC
TGAAAACGGCATGAGTAGTACATGCGTAGACTTCTCTTGCTCCTTCTTGGTGTAACAGAG
CTGCACCTTTGCTTATGGTTCCGGCTGTGTCAATCATGTCATCCACCATTATAGCTACTT
TCCCTTTAACATCCCCAATTAAGTTCATCACCTCGGCAACATTGTGTCCATGACGTCTTT
TGTCAACTATGGCTAAAGGAGCATCGGATAGCTTCTTGGCAAAAGCGCGAGCTCTTG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4BV70JQ 718 0 0
CAAGGAAAATAGAAAATGTGATCTTACAAGTTGTTTCCTCTAAAATCATTCACACACACA
CATCACACATGTCTAACATTTACACGATCAGAAATCCATTACTATTGAGAGCGGTTGAGT
CGATTCTTGACCATTGTTGTATCAGTCAATCAATCCCCAGTGTCGAAAATGGCTCAATGT
CTCCAGAACAATCATCATGAACACGCCATATGGTCTCCGCGAGAAGGTTTGCTACTGAGA
GAACTGTAAGCTGAGGAAAGTAGTTTTGCTCCGACAGTGGAATCGTGTTGGTTATGATCA
CCTCTTGGAACAGACCGCTCGATAGTCTACTGATTGCAGGAGGGCTGAAAACGGCATGAG
TAGTACATGCGTAGACTTCTCTTGCTCCTTCTTGGTGTAACAGAGCTGCACCTCTGCTTA
TGGTTCCGGCTGTGTCAATCATGTCATCCACCATTATAGCTACTTTCCCTTTAACATCCC
CAATTAAGTTCATCACCTCGGCAACATTGTGTCCATGACGTCTTTTGTCAACTATGGCTA
AAGGAGCATCGGATAGCTTCTTGGCAAAAGCGCGAGCTCTTGCGACTCCACCAACATCAG
GCGAAACAACCACCAAATCATCAGAGGATATGCCTTTGCTTGCCAGGTAATCAAGTATCA
CAGGCTGGCCATAAACATGGTCAACTGGAATATCAAAGTAACCCATAGACTGTCCAGA

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL3601Contig2 780 2 8 U
TTTTTCTAAAAAATAAAAACCCTAAAAATCTCTCAAATCGAAAATCAAAATGGCGTATCT
TCTCCACGCTCAATCTTCACCTAGTTTACCGACGGCGAATCTCCGGCGATCTTCTCCTCT
GACTCATCGTCCTCCTCCTACTTCCGTTCGTTTTCCTCTTAGGTGTAAGGCGGTGGATTC
GTACGGCGGGAACTCCGACGATTTGTATCTGCTTACAGGCGACACGGTTCCCGAGAGCGC
TCTTCTCTCGAGGACGCGGTTGGAAGATGCGATTAACAAGAACTCTACGCGGCTCCGTAT
CTTCTCCGGCACTGCTAATCCTTCCTTGGCTCAGGAGATTTCATGCTATTCGGGACTGGA
ACTAGGGAAAATCAAGATTAAACGGTTTGCTGATGGGGAGATCTATGTTCAGCTTCAAGA
GAGTGTTAGGGGATGCGATGTGTTTCTTGTACAGCCTACGTGTCCACCTGCCAATGAGAA
CCTTATGGAACTGCTCGTTATGATTGATGCCTGTCGTAGAGCATCTGCCAAAACCATCAC
CGCTGTGATTCCTTACTTTGGCTATGCTCGAGCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATC
TATTGCTGCCAAGCTTGTGGCTAATCTGATAACAGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGC
TTGTGACCTTCACTCTGGACAGTCTATGGGTTACTTTGATATTCCAGTTGACCATGTTTA
TGGCCAGCCTGTGATACTTGATACCTGGCAAGCAAAGCATATCCTCTGATGATTTGTGGT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO44TF U 1
AF RR4BV70TF U 4
BS 1 139 RR4DO44TF
BS 140 140 RR4BV70TF
BS 141 685 RR4DO44TF
BS 686 686 RR4BV70TF
BS 687 712 RR4DO44TF
BS 713 713 RR4BV70TF
BS 714 736 RR4DO44TF
BS 737 780 RR4BV70TF

RD RR4DO44TF 736 0 0
TTTTTCTAAAAAATAAAAACCCTAAAAATCTCTCAAATCGAAAATCAAAATGGCGTATCT
TCTCCACGCTCAATCTTCACCTAGTTTACCGACGGCGAATCTCCGGCGATCTTCTCCTCT
GACTCATCGTCCTCCTCCTGCTTCCGTTCGTTTTCCTCTTAGGTGTAAGGCGGTGGATTC
GTACGGCGGGAACTCCGACGATTTGTATCTGCTTACAGGCGACACGGTTCCCGAGAGCGC
TCTTCTCTCGAGGACGCGGTTGGAAGATGCGATTAACAAGAACTCTACGCGGCTCCGTAT
CTTCTCCGGCACTGCTAATCCTTCCTTGGCTCAGGAGATTTCATGCTATTCGGGACTGGA
ACTAGGGAAAATCAAGATTAAACGGTTTGCTGATGGGGAGATCTATGTTCAGCTTCAAGA
GAGTGTTAGGGGATGCGATGTGTTTCTTGTACAGCCTACGTGTCCACCTGCCAATGAGAA
CCTTATGGAACTGCTCGTTATGATTGATGCCTGTCGTAGAGCATCTGCCAAAACCATCAC
CGCTGTGATTCCTTACTTTGGCTATGCTCGAGCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATC
TATTGCTGCCAAGCTTGTGGCTAATCTGATAACAGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGC
TTGTGACCTTCACTCTGGACAGTCTGTGGGTTACTTTGATATTCCAGTTGAC*ATGTTTA
TGGCCAGCCTGTGATA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4BV70TF 777 0 0
TTCTAAAAAATAAAAACCCTAAAAATCTCTCAAATCGAAAATCAAAATGGCGTATCTTCT
CCACGCTCAATCTTCACCTAGTTTACCGACGGCGAATCTCCGGCGATCTTCTCCTCTGAT
TCATCGTCCTCCTCCTACTTCCGTTCGTTTTCCTCTTAGGTGTAAGGCGGTGGATTCGTA
CGGCGGGAACTCCGACGATTTGTATCTGCTTACAGGCGACACGGTTCCCGAGAGCGCTCT
TCTCTCGAGGACGCGGTTGGAAGATGCGATTAACAAGAACTCTACGCGGCTCCGTATCTT
CTCCGGCACTGCTAATCCTTCCTTGGCTCAGGAGATTTCATGCTATTTGGGACTGGAGCT
AGGGAAAATCAAGATTAAACGGTTTGCTGATGGGGAGATCTATGTTCAGCTTCAAGAGAG
TGTTAGGGGATGCGATGTGTTT**TGTACAGCCTACGTGTCCACCTGCCAATGAGAACCT
TATGGAACTGCTCGTTATGATTGATGCCTGTCGTAGAGCATCTGCCAAAACCATCACCGC
TGTGATTCCTTACTTTGGCTATGCTCGAGCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATCTAT
TGCTGCCAAGCTTGTGGCTAATCTGATAACAGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCTTG
TGACCTTCACTCTGGACAGTCTATGGGTTACTTTGATAT*CCAGTTGACCATGTTTATGG
CCAGCCTGTGATACTTGATACCTGGCAAGCAAAGCATATCCTCTGATGATTTGTGGT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL3602Contig1 999 2 4 U
GGGATAGACATACGTGGCGGATATCTAGAGAGACTAGAGAGAGAGGAAAAGAAGGAGTTT
CGTCGTTCGTCAATGGAGATCTCTGCTGCGTCTGCTTCTCTAACTTCCTCTGGACTCGTT
CCTCGACTTCTCCCTCCCTTGTTCTATCCTCCTCAAGCTCGAACTACTTCCTGTGCACCA
TTTTCCTCTGCTAAACTCATTTCTCCTCCTCACAGACGTATACCTCCCTCTCCCTGTCTC
GCTGATCAGTCTGCCTCCACCGGGGTCAATGTTGTTGATTCAGATCCCATTGATGCTGTT
AAGAGGAAAGCTATAGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCAATATTTCTGGTTGGG
ATTAATAACCACATTAAAACCAACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATATTAC
TACTTTGATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATACATCTGTTCAAGCT
TTGAAGGAGGCTGATGAGATGGTTTTTAAGGAATCAGAGACAGAAGTGCCGAAGCAGCTA
TCATCTATGGGTCGGCTTGTAGTTTGCGCTGGAGACGGTGCAGTCCAGAGCTTGACAAAT
CTTGCGCTTCTAAGACACGGGATCTCCATTTGGATCGATGTTCCTCTAGAAATCGCAGCT
AAAGGAGATGATCCATTCAGCTCGGAACCTTCCCCTGAGTTGTATGAGGCATTAAAAGCA
AATTACGAAAAATCAAGAAAGGGTTACGATACAGCAGATGCAGTTATTTCCCTTGAGAGA
ATAGCTACAAAGCTGGGATGGGAAGACTTGGAAACAGTAACTTCTGAAGAGCTTGCTTTG
GAGGTCTTGAAAGAAATAGAGAAGTTGACGAGAGTGAAGAAAATGATGGAGGAAGCTTCT
CGACCTTTCTAGGTTGATATTTTACTCACTCAATCATGCATCGCAAAATCTGTGAATTTT
TTTAGGGTTTCTATCATGTTGTATATCATGAACATGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DC78TF U 1
AF RR4DC78JQ C 295
BS 1 664 RR4DC78TF
BS 665 665 RR4DC78JQ
BS 666 686 RR4DC78TF
BS 687 999 RR4DC78JQ

RD RR4DC78TF 690 0 0
GGGATAGACATACGTGGCGGATATCTAGAGAGACTAGAGAGAGAGGAAAAGAAGGAGTTT
CGTCGTTCGTCAATGGAGATCTCTGCTGCGTCTGCTTCTCTAACTTCCTCTGGACTCGTT
CCTCGACTTCTCCCTCCCTTGTTCTATCCTCCTCAAGCTCGAACTACTTCCTGTGCACCA
TTTTCCTCTGCTAAACTCATTTCTCCTCCTCACAGACGTATACCTCCCTCTCCCTGTCTC
GCTGATCAGTCTGCCTCCACCGGGGTCAATGTTGTTGATTCAGATCCCATTGATGCTGTT
AAGAGGAAAGCTATAGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCAATATTTCTGGTTGGG
ATTAATAACCACATTAAAACCAACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATATTAC
TACTTTGATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATACATCTGTTCAAGCT
TTGAAGGAGGCTGATGAGATGGTTTTTAAGGAATCAGAGACAGAAGTGCCGAAGCAGCTA
TCATCTATGGGTCGGCTTGTAGTTTGCGCTGGAGACGGTGCAGTCCAGAGCTTGACAAAT
CTTGCGCTTCTAAGACACGGGATCTCCATTTGGATCGATGTTCCTCTAGAAATCGCAGCT
AAAG*AGATGATCCATTCAGCTCGGA
CCTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DC78JQ 705 0 0
GCTGTTAAGAGGAAAGCTATAGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCAATATTTCTG
GTTGGGATTAATAACCACATTAAAACCAACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGA
TATTACTACTTTGATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATACATCTGTT
CAAGCTTTGAAGGAGGCTGATGAGATGGTTTTTAAGGAATCAGAGACAGAAGTGCCGAAG
CAGCTATCATCTATGGGTCGGCTTGTAGTTTGCGCTGGAGACGGTGCAGTCCAGAGCTTG
ACAAATCTTGCGCTTCTAAGACACGGGATCTCCATTTGGATCGATGTTCCTCTAGAAATC
GCAGCTAAAGGAGATGATCCATTCAGCTCGGAACCTTCCCCTGAGTTGTATGAGGCATTA
AAAGCAAATTACGAAAAATCAAGAAAGGGTTACGATACAGCAGATGCAGTTATTTCCCTT
GAGAGAATAGCTACAAAGCTGGGATGGGAAGACTTGGAAACAGTAACTTCTGAAGAGCTT
GCTTTGGAGGTCTTGAAAGAAATAGAGAAGTTGACGAGAGTGAAGAAAATGATGGAGGAA
GCTTCTCGACCTTTCTAGGTTGATATTTTACTCACTCAATCATGCATCGCAAAATCTGTG
AATTTTTTTAGGGTTTCTATCATGTTGTATATCATGAACATGTTA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 3

CO CL3603Contig1 1124 3 15 U
GGAAAAGGGAAAAGATGTCGACAGTTTCACCCTCCTCGCAACTAGTTCAGGTGGTTCCAG
ACAACAAGAACAACACTGGCGACTCCTCTGATAAGGTCAAGTACGAAGATCTTGTCCTTA
ACCCGGACATCTTCCTGGAACATCTCAGAGCTCTGCTCGGAATGCTGGGGAACCCACTCA
AGGTTCCTACGGTGGGAGGGAGCTCTCTGGACCTGCATCGGCTTTTCGTGGAGGTTACAT
CTCGTGGTGGGATTGCAAAGGTGATTAAGGATCGGAGATGGAGGGAAGTGATCGGTGCAT
TCAACTTTCCAAACACAATCACAAGTGCGTCGTTTGTGCTGAGGAGGTACTACTTCAAGT
TCCTTTTCCAGATGGAGCATGTTTATTACCTCGACCAATCTGTTTCTACTATGAAATCAG
CAGAGGAAGCAATGCATAGCCTGTCCCTAAACCTCGAGGAAGGAGGCGCTGATGAACCGG
GAATTGGGAGTGTGGTAAACGGAGTCATTGATGCGAAGTTCGAAGGTGGATATCTAGTGA
CGATGAAAGTGGGTTCTAAAGTGATGAAAGGAGTGCTTTACCATGGTGTTAAAAGGCCAA
GTCAGCAGCCACAGCAAACCATGGGAACACCACCTTCAGGCATGGCATTAGCATCGCAAC
GCCGAGCTAAGAAGAAAGCAAGAGGGGCAGCTGAAGTTGATTCTCAGAAACCCAAATGCC
ACAGGAGTGGCTACAACTTCTTCTTCGCTGAGCAGTACGCTAGGCTCAAACCTGAGTACC
ATGGCAAAGAAAGGTTCATCACCAAGATGATTGGACGCATGTGGGGTGATCTCTCCGAGT
TTGAGAAACAGGTTTATCAAGACAAAGGAGTTAAGGATGTGGAGAGGTACAGAACTGAGA
TGATGGAGCACAAGTCTGCGCATGAAGCTGGAGCTTCTGCTTTTGCTGCAGCCGCCACCG
TGGCTCAGCAGTCTTTTTTCCCTTTATGCTGTTGTCTTCTTTCTCTCTCTCCCTCTCTCT
CTGGACAAGTTCTCTTTCTTTATTTCTCTCCCTGGACAAGTTATCTTTCCTTTATAATGG
ATTTTATGTGTTCTGATCACTTGCAGAGCATGCCATGTTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD25TF U 1
AF RR4F923TF U 91
AF RR4F923JQ C 460
BS 1 301 RR4DD25TF
BS 302 302 RR4F923TF
BS 303 459 RR4DD25TF
BS 460 460 RR4F923TF
BS 461 535 RR4DD25TF
BS 536 536 RR4F923TF
BS 537 604 RR4DD25TF
BS 605 605 RR4F923TF
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BS 615 635 RR4DD25TF
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BS 795 817 RR4F923TF
BS 818 1124 RR4F923JQ

RD RR4DD25TF 635 0 0
GGAAAAGGGAAAAGATGTCGACAGTTTCACCCTCCTCGCAACTAGTTCAGGTGGTTCCAG
ACAACAAGAACAACACTGGCGACTCCTCTGATAAGGTCAAGTACGAAGATCTTGTCCTTA
ACCCGGACATCTTCCTGGAACATCTCAGAGCTCTGCTCGGAATGCTGGGGAACCCACTCA
AGGTTCCTACGGTGGGAGGGAGCTCTCTGGACCTGCATCGGCTTTTCGTGGAGGTTACAT
CTCGTGGTGGGATTGCAAAGGTGATTAAGGATCGGAGATGGAGGGAAGTGATCGGTGCAT
TTAACTTTCCAAACACAATCACAAGTGCGTCGTTTGTGCTGAGGAGGTACTACTTCAAGT
TCCTTTTCCAGATGGAGCATGTTTATTACCTCGACCAATCTGTTTCTACTATGAAATCAG
CAGAGGAAGCAATGCATAGCCTGTCCCTAAACCTCGAGGGAGGAGGCGCTGATGAACCGG
GAATTGGGAGTGTGGTAAACGGAGTCATTGATGCGAAGTTCGAAGGTGGATATCTGGTGA
CGATGAAAGTGGGTTCTAAAGTGATGAAAGGAGTGCTTTACCATGGTGTTAAAAGGCCAA
GTCATCAGCCACAACAAACCATGGGAACACCACCT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4F923TF 727 0 0
GG
AAGGTCAAGTACGAAGATCTTGTCCTTAACCCGGACATCTTCCTGGAACATCTCAGAGCT
CTGCTCGGAATGCTGGGGAACCCACTCAAGGTTCCTACGGTGGGAGGGAGCTCTCTGGAC
CTGCATCGGCTTTTCGTGGAGGTTACATCTCGTGGTGGGATTGCAAAGGTGATTAAGGAT
CGGAGATGGAGGGAAGTGATCGGTGCATTCAACTTTCCAAACACAATCACAAGTGCGTCG
TTTGTGCTGAGGAGGTACTACTTCAAGTTCCTTTTCCAGATGGAGCATGTTTATTACCTC
GACCAATCTGTTTCTACTATGAAATCAGCAGAGGAAGCAATGCATAGCCTGTCCCTAAAC
CTCGAGGAAGGAGGCGCTGATGAACCGGGAATTGGGAGTGTGGTAAACGGAGTCATTGAT
GCGAAGTTCGAAGGTGGATATCTAGTGACGATGAAAGTGGGTTCTAAAGTGATGAAAGGA
GTGCTTTACCATGGTGTTAAAAGGCCAAGTCAGCAGCCACAGCAAACCATGGGAACACCA
CCTTCAGGCATGGCATTAGCATCGCAACGCCGAGCTAAGAAGAAAGCAAGAGGGGCAGCT
GAAGTTGATTCTCAGAAACCCAAATGCCACAGGAGTGGCTACAACTTCTTCTTCGCTGAG
CAGTACGCTAGGCTCAAACCTGAGTACCATGGCAAAGAAAG*TTCATCACCAAGATGATT
GGACG

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR4F923JQ 665 0 0
A
AGGAGGCGCTGATGAACCGGGAATTGGGAGTGTGGTAAACGGAGTCATTGATGCGAAGTT
CGAAGGTGGATATCTAGTGACGATGAAAGTGGGTTCTAAAGTGATGAAAGGAGTGCTTTA
CCATGGTGTTAAAAGGCCAAGTCAGCAGCCACAGCAAACCATGGGAACACCACCTTCAGG
CATGGCATTAGCATCGCAACGCCGAGCTAAGAAGAAAGCAAGAGGGGCAGCTGAAGTTGA
TTTTCAGAAACCCAAATGCCACAGGAGTGGCTACAACTTCTTCTTCGCTGAGCAGTACGC
TAGGCTCAAACCTGAGTACCATGGCAAAGAAAGGTTCATCACCAAGATGATTGGACGCAT
GTGGGGTGATCTCTCCGAGTTTGAGAAACAGGTTTATCAAGACAAAGGAGTTAAGGATGT
GGAGAGGTACAGAACTGAGATGATGGAGCACAAGTCTGCGCATGAAGCTGGAGCTTCTGC
TTTTGCTGCAGCCGCCACCGTGGCTCAGCAGTCTTTTTTCCCTTTATGCTGTTGTCTTCT
TTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTGGACAAGTTCTCTTTCTTTATTTCTCTCCCTGGACAAG
TTATCTTTCCTTTATAATGGATTTTATGTGTTCTGATCACTTGCAGAGCATGCCATGTTT
ATGG

QA 2 665 2 665
DS 



AS 1 4

CO CL3604Contig1 850 4 6 U
GACTAAGAACTTGGTTCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGAATCTCTGTTCAGAA
TGAAGATGGAACCAAGACTGAATACAGGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGC
TGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCTATACCT
TGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATTGTTGGACCTGAGGGATG
TGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAA
GAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAATACAGAATGCT
TGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAGGATCGT
GGCTTTGAACTCAAGCTTCTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATCTCCATCAAGGC
GAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTCCAGAGTGAAGTAAAGAAGCT
GCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGACGCTCGAGCCATTTGAGCGTGACCA
TGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCGCCTAAGAAGAACAAGGTTGCTGCTTAGAAGTT
TCATGTGTTGGGAATTGGTTCTTTGGATATTTCGTTAGGGTTTTATCTAGTATTGTGGTT
TGTAATCGTTTTGAACCTGAATAGGCTTTTTTCTATGTTTTTACTTTAAGACTTAAAACT
CGGTATTTATATAACCTATATTTTTCTCATTTGAGAAAGTTTATAGTATTTTGTACGACT
CATTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF62TF U 1
AF RR4AH36TF U 36
AF RR4AH36JQ C 92
AF RR4DF62JQ C 197
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BS 84 84 RR4AH36TF
BS 85 299 RR4DF62TF
BS 300 786 RR4AH36TF
BS 787 806 RR4AH36JQ
BS 807 850 RR4DF62JQ

RD RR4DF62TF 299 0 0
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TGAAGATGGAACCAAGACTGAATGCAGGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGC
TGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCTATACCT
TGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATTGTTGGACCTGAGGGATG
TGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGA

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4AH36TF 751 0 0
G
CGAGAAGAGAATCTCTGTTCAGAATGAAGATGGAACCAAGACTGAATACAGGGTGTGGAA
TCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAA
ACCTGGTGCTAAAGTTCTATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTC
TGACATTGTTGGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAG
AGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAG
ACACCCTGCTAAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGC
TCAGCCTGATCAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCAAGCTTCTTCCTCAAAACAGGAGG
TCACTTTGTTATCTCCATCAAGGCGAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAGGCAGT
GTTCCAGAGTGAAGTAAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGAC
GCTCGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCGCCTAAGAA
GAACAAGGTTGCTGCTTAGAAGTTTCATGTGTTGGGAATTGGTTCTTTGGATATTTCGTT
AGGGTTTTATCTAGTATTGTGGTTTGTAATCGTTTTGAACCTGAATAGGCTTTTTTCTAT
GTTTTTACTTTAAGACTTAAAACTCGGTAT

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR4AH36JQ 717 0 0
TGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCAC
ATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCTATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCAT
GTCTCTGACATTGTTGGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGT
GGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGAT
GCTAGACACCCTGCTAAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGAT
GTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCAAGCTTCTTCCTCAAAACA
GGAGGTCACTTTGTTATCTCCATCAAGGCGAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAG
GCAGTGTTCCAGAGTGAAGTAAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAA
GTGACGCTCGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCGCCT
AAGAAGAACAAGGTTGCTGCTTAGAAGTTTCATGTGTTGGGAATTGGTTCTTTGGATATT
TCGTTAGGGTTTTATCTAGTATTGTGGTTTGTAATCGTTTTGAACCTGAATAGGCTTTTT
TCTATGTTTTTACTTTAAGACTTAAAACTCGGTATTTATATAACCTATATTTTTC
GC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DF62JQ 654 0 0
ACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATTGTTGGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAG
TTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATT
CCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGAT
GTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCAAGC
TTCTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATCTCCATCAAGGCGAACTGTATTGACTCG
ACGGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTCCAGAGTGAAGTAAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTC
AAGCCAGCTGAGCAGGCGACGCTCGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCCTGTGTCGTCGGT
ACCTACCGTGCGCCTAAGAAGAACAAGGTTGCTGCTTAGAAGTTTCATGTGTTGGTAATT
GGTTCTTTGGATATTTCGTTAGGGTTTTATCTAGTATTGTGGTTTGTAATCGTTTTGAAC
CTGAATAGGCTTTTTTCTATGTTTTTACTTTAAGACTTAAAACTCGGTATTTATATAACC
TATATTTTTCTCATTTGAGAAAGTTTATAGTATTTTGTACGACTCATTTGTTTG

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 4

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GGATACAGATCACTGAAAGCAGAACAACCACAAAGACAGAGAGAGAGAAAAGAAGAAGAA
ACATGGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCAGGTGA
CGGTGGAAAACATTCCGATGGCAGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACGGACTTCAT
GTTCGTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGAG
AGCAGAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCCGAGGAACCCTGCCCTCCGCCAATACGTTAACT
CTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCAT
GATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTCA
GGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCATG
CTTTAACGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCTTT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 0 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ70JQ C 1
AF RR4G892JQ C 2
AF RR4G892TF U 15
AF RR4GQ70TF U 5
BS 1 4 RR4GQ70JQ
BS 5 14 RR4GQ70TF
BS 15 42 RR4G892TF
BS 43 45 RR4GQ70TF
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BS 47 48 RR4GQ70TF
BS 49 53 RR4G892TF
BS 54 54 RR4GQ70TF
BS 55 114 RR4G892TF
BS 115 115 RR4GQ70TF
BS 116 131 RR4G892TF
BS 132 132 RR4GQ70TF
BS 133 287 RR4G892TF
BS 288 288 RR4GQ70TF
BS 289 419 RR4G892TF
BS 420 420 RR4GQ70TF
BS 421 511 RR4G892TF
BS 512 512 RR4GQ70TF
BS 513 531 RR4G892TF
BS 532 537 RR4GQ70JQ

RD RR4GQ70JQ 537 0 0
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ACATGGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCAGGTGA
CGGTGGAAAACATTCCGATGGCAGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACTGACTTCAT
GTTCGTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGAG
AGCAGAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCTGAGGAACCCTGCCCTTCGCCAATACGTTAACT
CTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCAT
GATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTCA
GGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCATG
CTTTAATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCTTT

QA 1 537 1 537
DS 

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GAT
ACAGATCACTGAAAGCAGAACAACCACAAAGACAGAGA***ATCAAAGAGGAAGAAACAT
GGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCTGGTGACGGT
GGAAAACTTTCCGATGGCAGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACGGACTTCATGTTC
GTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCA
GAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCCGAGGAACCCTGCCCTCCGCTAATACGTTAACTCTCC
AAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCATGATT
ATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTCTGGTC
CTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCATGCTTT
AACGTTATGTCATGTTATGCTACGTATGTTATGTTATGTATGTTTCT

QA 4 530 4 530
DS 

RD RR4G892TF 517 0 0
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ATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCTGGTGACGGTGGAAAACTTT
CCGATGGCAGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACGGACTTCATGTTCGTCGGCGTTT
ATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCAGAAGCCATGC
CTTTGTGGGTATCCGAGGAACCCTGCCCTCCGCTAATACGTTAACTCTCCAAACGCCAAA
AAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCATGATTATTTAGTGAC
AAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTCTGGTCCTCGACACTA
CTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCATGCTTTAACGTTATGT
CATGTTATGCTACGTATGTTATGTTATGTATGTTTCT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR4GQ70TF 533 0 0
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GGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCAGGTGACGGT
GGAAAACATTCCGATGGCAGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACTGACTTCATGTTC
GTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCA
GAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCTGAGGAACCCTGCCCTTCGCCAATACGTTAACTCTCC
AAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCATGATT
ATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTCAGGTC
CTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCATGCTTT
AATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCT
ATCTTT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 4

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ATCGCTCTCCTTGCTAGAGACCCGTTAATCCTCATACGGTCGGAGAGAATGGAAGGAGTG
ATGAGCTTGAACTTGGGAGCTTCAGTGAGAAGCTTGTCGTAAGTAGCCTGATCAAACAAC
ACAATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTCTTCTGCTTG
CCACCTCCGGATTTCGCTGGCTTTGATGATGGTGGTGGAACCTTGTCCTTCTTTGGCGCC
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GGAGGAGGAGGAGGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR4C207TF C 1
AF RR4EI74JQ U 26
AF RR4EI74TF C 26
AF RR4C207JQ U 42
BS 1 25 RR4C207TF
BS 26 266 RR4EI74JQ
BS 267 267 RR4C207JQ
BS 268 362 RR4EI74JQ
BS 363 363 RR4C207JQ
BS 364 558 RR4EI74JQ
BS 559 559 RR4C207JQ

RD RR4C207TF 559 0 0
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ATGAGCTTGAACTTGGGAGCTTCAGTGAGAAGCTTGTCGTAAGTAGCCTGATCAAACAAC
ACAATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTCTTCTGCTTG
CCACCTCCGGATTTCGCTGGCTTTGATGATGGTGGTGGAACCTTGTCCTTCTTTGGCGCC
ATGTTGACTTCGACGGAGACGGAGGATCGAACTAGAGGTTTTGTAAAATGAGGAGGAGAA
GGAGGAGGAGGAGGCTCC
C

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4EI74JQ 533 0 0
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GAACCAAACAAAGGAGATAATAAGAAACAAGTCCACGGCCAAGCCGGATCAAAAACCAAA
AAAAACATTCTTAGGTGTTTGTGGCACGAGTGTAGATCTGCTGGCTCGAATGAGCAGCGA
CCATCCTGATCACACCCTTCGCCATTAGATCCCTAATCGCTCTCCTTGCTAGAGACCCGT
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GCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTCTTCTGCTTGCCACCTCCGGATTTCGCTGGCTTTG
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QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4EI74TF 533 0 0
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GAACCAAACAAAGGAGATAATAAGAAACAAGTCCACGGCCAAGCCGGATCAAAAACCAAA
AAAAACATTCTTAGGTGTTTGTGGCACGAGTGTAGATCTGCTGGCTCGAATGAGCAGCGA
CCATCCTGATCACACCCTTCGCCATTAGATCCCTAATCGCTCTCCTTGCTAGAGACCCGT
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ATGATGGTGGTGGAACCTTGTCCTTCTTTGGCGCCATGTTGACTTCGACGGAGACGGAGG
ATCGAACTAGAGGTTTTGTAAAATGAGGAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGGCTCC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4C207JQ 518 0 0
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GGAGAGAATGGAAGGAGTGATGAGCTTGAACTTGGGAGCTTCAGTGAGAAGCTTGTCGTA
AGTAGCCTGATCAAACAACACAATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCA
CTTCTTCTTCTTCTGCTTGCCACCTCCGGATTTCGCTGGCTTTGATGATGGTGGTGGAAC
CTTGTCCTTCTTTGGCGCCATGTTGACTTCGACGGAGACGGAGGATCGAACTAGAGGTTT
TGTAAAATGAGGAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGGCTCCC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 4

CO CL3607Contig1 1231 4 8 U
GGAGAGTTCCCCTGTTTCTCTATGTATCTCTGTTCTTCTTATAACTGTTTTGCTGATGGA
TTCTTGGAGCTATGGGACAAGTGTTTTCTTGCCTAATGAAACCTCCCTTCCACCTTCTGA
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TGATGTTAATGGATTCAGCTTGTTACACGCTAATGAGAACCTGTCTTCTTCTTCTTCTTC
AAACTTGTCTAGGCAAGATTTCAAACTTAGGAGCTTTATGGATTACGGGAACTATGATGG
TAGAGACTTTACTCTTGCGGCTAAAAAGCCTCGAGCTTCAAGCTCTCCCTTGTGTCAAGT
CTATGGTTGCAATATGGATCTCAGCTCTTCTAAAGATTACCACAAAAGGCATAGAGTTTG
CGAGACTCACTCAAAGTCTTCTATGGTTATAGTTAACGGTATTGAACAGAGGTTCTGCCA
ACAGTGCAGCAGGTTTCATTTCCTCTCAGAGTTTGATGATGGGAAAAGAAGTTGCAGAAG
ACGATTAGCCGGTCACAATGAGCGAAGAAGGAAGCCTTCTTTCTATTTCCTACCCGGTAA
GCAGCAGCAGAACCGGCATAAGCCTGTTCCTCAAGGTAACAAGTTTCCTGGTAGTTTCTT
GTACAGAGTAATGGATGAGCAAGACCACCACCATGCAAGTAGACTCGTGAGTTTCAGAGA
TGAACCTACTTGTGGTGCTCACTTCATCTGTCAGCTCACTCCCAACAACACTTCTCCGAA
ACTCCAAACAAAAGTTTCTCAATTACTCAACCAAACCAAATTTTGAGTCACTTAGCAATA
GGCTATCATCACATGCAACCACCGTTGAGGACCGATCTTGGCAAGACCAAAACTAGTACT
TCATCATCCACAGTTAATCTGCTGCAGCTGTCATTGCATCTTAGAAGAATCAAGCAACAA
CAAAGGAGTTTCACTGATGATGTGAAACAGGAATATAATAATGAGCTTTATTTCCCCTAG
CTCCTAACATAAAAGGTTACAACATTCTTACTTCTATAAGACCGGCTTGAGAAGGATAAG
GCAAATCTAAGGCTGCATGGTTTGTTTAGTTTCTGAGATGGTTAGATTAGTAGAATAAAG
ATTTAAGTATGGTTACAACTTACAAGTGTTTTTAAAACTGATCTTGTTTATTATTCACCA
GTCTGAAAAAAATAATTTGATTCAGATATCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A187TFB U 1
AF RR4A187TF U 1
AF RR4A187JQ C 353
AF RR4A187JQD C 536
BS 1 792 RR4A187TF
BS 793 793 RR4A187TFB
BS 794 837 RR4A187TF
BS 838 838 RR4A187JQ
BS 839 841 RR4A187TF
BS 842 842 RR4A187JQ
BS 843 857 RR4A187TF
BS 858 1231 RR4A187JQ

RD RR4A187TFB 807 0 0
GGAGAGTTCCCCTGTTTCTCTATGTATCTCTGTTCTTCTTATAACTGTTTTGCTGATGGA
TTCTTGGAGCTATGGGACAAGTGTTTTCTTGCCTAATGAAACCTCCCTTCCACCTTCTGA
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AAACTTGTCTAGGCAAGATTTCAAACTTAGGAGCTTTATGGATTACGGGAACTATGATGG
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CTATGGTTGCAATATGGATCTCAGCTCTTCTAAAGATTACCACAAAAGGCATAGAGTTTG
CGAGACTCACTCAAAGTCTTCTATGGTTATAGTTAACGGTATTGAACAGAGGTTCTGCCA
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GTACAGAGTAATGGATGAGCAAGACCACCACCATGCAAGTAGACTCGTGAGTTTCAGAGA
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ACTCCAAACAAAAGTTTCTCAATTACT

QA 1 807 1 807
DS 

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TTCTTGGAGCTATGGGACAAGTGTTTTCTTGCCTAATGAAACCTCCCTTCCACCTTCTGA
TTCTTTTCCTGAGAATCCAAGATCCATGTCTCAGGGACTCTCTAATGAGTTTGACAAGGA
TGATGTTAATGGATTCAGCTTGTTACACGCTAATGAGAACCTGTCTTCTTCTTCTTCTTC
AAACTTGTCTAGGCAAGATTTCAAACTTAGGAGCTTTATGGATTACGGGAACTATGATGG
TAGAGACTTTACTCTTGCGGCTAAAAAGCCTCGAGCTTCAAGCTCTCCCTTGTGTCAAGT
CTATGGTTGCAATATGGATCTCAGCTCTTCTAAAGATTACCACAAAAGGCATAGAGTTTG
CGAGACTCACTCAAAGTCTTCTATGGTTATAGTTAACGGTATTGAACAGAGGTTCTGCCA
ACAGTGCAGCAGGTTTCATTTCCTCTCAGAGTTTGATGATGGGAAAAGAAGTTGCAGAAG
ACGATTAGCCGGTCACAATGAGCGAAGAAGGAAGCCTTCTTTCTATTTCCTACCCGGTAA
GCAGCAGCAGAACCGGCATAAGCCTGTTCCTCAAGGTAACAAGTTTCCTGGTAGTTTCTT
GTACAGAGTAATGGATGAGCAAGACCACCACCATGCAAGTAGACTCGTGAGTTTCAGAGA
TGAACCTACTTGTGGTGCTCACTTCATCTGTCAGCTCACTCCCAACAACACTTCTCCGAA
ACTCCAAACAAA*GTTTCTCAATTACTCAACCAAACCAAATTTTGAGTCACTTAGCA*TA
G*CTATCATCACATGCA
CCA

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR4A187JQ 879 0 0
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TTCTGCCAACAGTGCAGCAGGTTTCATTTCCTCTCAGAGTTTGATGATGGGAAAAGAAGT
TGCAGAAGACGATTAGCCGGTCACAATGAGCGAAGAAGGAAGCCTTCTTTCTATTTCCTA
CCCGGTAAGCAGCAGCAGAACCGGCATAAGCCTGTTCCTCAAGGTAACAAGTTTCCTGGT
AGTTTCTTGTACAGAGTAATGGATGAGCAAGACCACCACCATGCAAGTAGACTCGTGAGT
TTCAGAGATGAACCTACTTGTGGTGCTCACTTCATCTGTCAGCTCACTCCCAACAACACT
TTTCCGAAACTCCAAACAAAAGTTTCTCAATTACTCAACCAAACCAAATTTTGAGTCACT
TAGCAATAGGCTATCATCACATGCAACCACCGTTGAGGACCGATCTTGGCAAGACCAAAA
CTAGTACTTCATCATCCACAGTTAATCTGCTGCAGCTGTCATTGCATCTTAGAAGAATCA
AGCAACAACAAAGGAGTTTCACTGATGATGTGAAACAGGAATATAATAATGAGCTTTATT
TCCCCTAGCTCCTAACATAAAAGGTTACAACATTCTTACTTCTATAAGACCGGCTTGAGA
AGGATAAGGCAAATCTAAGGCTGCATGGTTTGTTTAGTTTCTGAGATGGTTAGATTAGTA
GAATAAAGATTTAAGTATGGTTACAACTTACAAGTGTTTTTAAAACTGATCTTGTTTATT
ATTCACCAGTCTGAAAAAAATAATTTGATTCAGATATCT

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR4A187JQD 696 0 0
AGAAGACGATTAGCCGGTCACAATGAGCGAAGAAGGAAGCCTTCTTTCTATTTCCTACCC
GGTAAGCAGCAGCAGAACCGGCATAAGCCTGTTCCTCAAGGTAACAAGTTTCCTGGTAGT
TTCTTGTACAGAGTAATGGATGAGCAAGACCACCACCATGCAAGTAGACTCGTGAGTTTC
AGAGATGAACCTACTTGTGGTGCTCACTTCATCTGTCAGCTCACTCCCAACAACACTTCT
CCGAAACTCCAAACAAAAGTTTCTCAATTACTCAACCAAACCAAATTTTGAGTCACTTAG
CAATAGGCTATCATCACATGCAACCACCGTTGAGGACCGATCTTGGCAAGACCAAAACTA
GTACTTCATCATCCACAGTTAATCTGCTGCAGCTGTCATTGCATCTTAGAAGAATCAAGC
AACAACAAAGGAGTTTCACTGATGATGTGAAACAGGAATATAATAATGAGCTTTATTTCC
CCTAGCTCCTAACATAAAAGGTTACAACATTCTTACTTCTATAAGACCGGCTTGAGAAGG
ATAAGGCAAATCTAAGGCTGCATGGTTTGTTTAGTTTCTGAGATGGTTAGATTAGTAGAA
TAAAGATTTAAGTATGGTTACAACTTACAAGTGTTTTTAAAACTGATCTTGTTTATTATT
CACCAGTCTGAAAAAAATAATTTGATTCAGATATCT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

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GACGAGTAAGGATGCTCAGGACCTATTCCGTTCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTCC
CACTAATCTTAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTCTGATCCA
GGTGGCTTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCGTTTAACTCATTCCTATCTGGAGTCCT
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GGTCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTTGGATAGGTGTCCATCTCCTAGTCCTATCT
TAAATGTTGCTATTCATGTCATGGATCTTTTAGGTGTCACTTTGGTATCCAAATTGTAGT
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ACATTCTCATGCACTAATGTGACACTGGTCCGCTCAGGCCTGTATTGTTACACGTGTCAA
TATTCAGAGTCTTTAAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C685JQ C 255
AF RR4E557JQ C 1
AF RR4E557TF U 5
AF RR4C685TF U 286
BS 1 4 RR4E557JQ
BS 5 528 RR4E557TF
BS 529 619 RR4C685TF

RD RR4C685JQ 139 0 0
CGGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGG
ATTTGGCACCTGAACGAGCGTTTGCAGATTTTGTCTTTTGCAACTTGGTCCTCCACTTGG
TGATCATCAACTTCCTTGG

QA 1 139 1 139
DS 

RD RR4E557JQ 528 0 0
GGAGAAGGAAGGAGAAATAGATATTTGTGTGTTTGATTTTTTGAGAAGAATGGTGAAATC
GACGAGTAAGGATGCTCAGGACCTATTCCGTTCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTCC
CACTAATCTTAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTCTGATCCA
GGTGGCTTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCGTTTAACTCATTCCTATCTGGAGTCCT
CTCTTGTATTGGAACGGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATTCAAGTGAACAAAGAAAA
CAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCTGAACGAGCGTTTGCAGATTTTGTCCTCTGCAACTT
GGTCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTTGGATAGGTGTCCATCTCCTAGTCCTATCT
TAAATGTTGCTATTCATGTCATGGATCTTTTAGGTGTCACTTTGGTATCCAAATTGTAGT
TTGAGATATTTATATTTCTGTCAGAATCATATACCTATTTAGACTTTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4E557TF 524 0 0
AAGGAAGGAGAAATAGATATTTGTGTGTTTGATTTTTTGAGAAGAATGGTGAAATCGACG
AGTAAGGATGCTCAGGACCTATTCCGTTCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTCCCACT
AATCTTAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTCTGATCCAGGTG
GCTTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCGTTTAACTCATTCCTATCTGGAGTCCTCTCT
TGTATTGGAACGGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATTCAAGTGAACAAAGAAAACAAG
GAATTCAAGGATTTGGCACCTGAACGAGCGTTTGCAGATTTTGTCCTCTGCAACTTGGTC
CTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTTGGATAGGTGTCCATCTCCTAGTCCTATCTTAAA
TGTTGCTATTCATGTCATGGATCTTTTAGGTGTCACTTTGGTATCCAAATTGTAGTTTGA
GATATTTATATTTCTGTCAGAATCATATACCTATTTAGACTTTT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4C685TF 334 0 0
AGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCTGAACGAGCGTTTGCAGATTT
TGTCCTCTGCAACTTGGTCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTTGGATAGGTGTCCAT
CTCCTAGTCCTATCTTAAATGTTGCTATTCATGTCATGGATCTTTTAGGTGTCACTTTGG
TATCCAAATTGTAGTTTGAGATATTTATATTTCTGTCAGAACCATATACCTATTTAGACT
TTTAGTCTCTCAAGAACATTCTCATGCACTAATGTGACACTGGTCCGCTCAGGCCTGTAT
TGTTACACGTGTCAATATTCAGAGTCTTTAAGTT

QA 1 334 1 334
DS 



AS 1 4

CO CL3609Contig1 870 4 2 U
AAGAACACAACTCCTGTGTTCATTTGTGCATCTGGCAGGGACATACATATCTCATTGTAA
TTTAGATTTTGAGTTATAAGCAGAGAGAAGAAATAAAAAGCAGAATGGTTGAATCTTTAT
TAAGTGGCTAAACATAGTCGTTTGAAAAACAAAAGTCTTCAAATCACTAAGCTCACAGCA
ATGGATGATCAGATGGAGAAAACTTCATGAGAAGTTGAGAGTTACAGAGGAAGCTCACCA
CTGTCAACAATCACAACTTTACTCTTAGGAGTTCCACTCTGAGTACCCTCAGCTTCGATT
TTGTACACCACGTCCATTCCTGTCACTACCTTCCCGAACACTACGTGCCTCCCGTCCAAC
CAGCTTGTTGTAACTGTTGTGATGAAAAACTGTGATCCGTTGGTGTCTTCACCGGCGTTT
GCCATTGATAGATACCCTGGACCAGTGTGCTTGAGTTTGAAGTTCTCATCAGCAAACTTT
TCACCATAAATAGATTCACCACCCATACCATTACCATCAGTAAAGTCACCTCCCTGGAGC
ATAAAGCTTGGTATGATCCTATGGAAGGAACTCCCCTTGTAATGTAGAGCCTTCCCTTTC
TTTCCCATTCCTTTCTCCCCTGTGCACAAAGCTCGGAAATTCTCTGCAGTTTTAGGGACT
GTCTTGCCAAATAGACCCATGACAATACGACCAGCTTCTTTGCCATTAATTTCGACATCG
AAATAAACCTTGTGTGTGATCTTTTCCTTCTTTTTGGCCTGAATAGAGATTAGGGTTCCC
AGAAGAAGAAGACTCCATAGAAGCAGCTTCACTGACCTCGCCATCTCTGATCTCTCTCTC
TCGCACCCTCAAACTGTTTCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG86JQ U 1
AF RR4CI63TF C 119
AF RR4CI63JQ U 98
AF RR4FG86TF C 101
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RD RR4FG86JQ 449 0 0
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TA
TAAGTGG*TAAACATAGTCGTT**GAAAACAAAAGTCTTCAAATCACTAAGCTCACAGCA
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TTGTACACCACGTCCATTCCTGTCACTACCTTCCCGAACACTACGTGCCTCCCGTCCAAC
CAGCTTGTTGTAACTGTTGTGATGAAAAACTGTGATCCGTTGGTGTCTTCACCGGCGTTT
GCCATTGATAGATACCCTGGACCAGTGTGCTTGAGTTTGAAGTTCTCATCAGCAAACTTT
TCACCATAAATAGATTCACCACCCATACCATTACCATCAGTAAAGTCACCTCCCTGGAGC
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GAG
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GAGTACCCTCAGCTTCGATTTTGTACACCACGTCCATTCCTGTCACTACCTTCCCGAACA
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AGTTCTCATCAGCAAACTTTTCACCATAAATAGATTCACCACCCATACCATTACCATCAG
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TCTCTGCAGTTTTAGGGACTGTCTTGCCAAATAGACCCATGACAATACGACCGGCTTCTT
TGCCATTAATTTCGACATCGAAATAAACCTTGTGTGTGATCTTTTCCTTCTTTTTGGCCT
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CCATCTCTGATCTCTCTCTCTC
TCTCAAACTGTTTCTCC

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DS 



AS 1 4

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TCCAAGAGCTGGGCTACTGTTGCCAAGAAGAGCCAAGTCGAAACCATGGAGTTTGATGTG
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GGAGATGGGTTTAGTTTTTTATTGTTTAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G291TF U 1
AF RR4B957TF U 4
AF RR4B957JQ C 200
AF RR4G291JQ C 213
BS 1 294 RR4G291TF
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TTTCTCTTGAGACTTGGGACTT

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DS 

RD RR4B957JQ 670 0 0
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TGAACCGGTCTACAAACACTAAAATGGCATGGTTGAGTTTACTCTCTTTGTTCGTCTGCA
TAGGAGTGGCAGCAATGCAGTATGTACACTTGAAGACTTTTTTCGAGAAGAAGAAAGTCA
TCTAAAGGTTTATTATAGGCAGTCAAGTCAGTCACCCACGCCCTCAATTTACTCTTCTTT
CTTTGGATGTTGTATATTAGTTCAATGCCTTTGCTGCAAGCATGTTTTTCTTGAGACTTG
GGACTTTTTTAATTTATGTGGCAGTATTTGTCCTTTTTCTTGGAGATGGGTTTAGTTTTT
TATTGTTTAG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4G291JQ 630 0 0
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CGCGTACCATCACGCGGATCAAGTGGCGTCTGGGCAGTTCGCGTTCTCGGCAGTGGAAGC
AGGGGACTCCATGGCGTGTTTCTCCGCCGTTGATCATAAGCCTGAGGTGACTCTTAGCAT
TGATTTTGAGTGGAGTACGGGTGTTCAATCCAAGAGCTGGGCTACTGTTGCCAAGAAGAG
CCAAGTCGAAACCATGGAGTTTGATGTGAAGAGCCTTCTTGATACTGTCAACTCGATTCA
TGAAGAGATGTTTTACCTTAGAGAAAGGGAAGAGCAAATGCAAGATTTGAACCGGTCTAC
AAACACTAAAATGGCATGGTTGAGTTTAC*CTCTTTGTTCGTCTGCATAGGAGTGGCAGC
AATGCAGTATGTACACTTGAAGACTTTTTTCGAGAAGAAGAAAGTCGTCTAAAGGTTTAT
TATAGGCAGTCAAGTCAGTCACACACGCTCTCAATCTACTCTTCTTTCTTTGGATGTTGT
ATATTAGTTCAATGCCTCTGCTGCAAGCATGTTTCTCTTGAGACTTGGGACTTTTTTAAT
TTATGTGGCAGTATTTGTCCTTTTTCTTGG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 4

CO CL3611Contig1 397 4 5 U
GGGATCCGCGACTCATCTTCTCCAAAAAAGCAGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCTACT
TTGGGATGACATTGGCTGCTTTCGCCTTCTGGCAATCCATGGACAAAGTCCACGTCTGGA
TCGCTCTCCACCAAGACGAGAAGCAAGAGAGGATGGAGAAGGAGGCTGAGGTAAAGCGGG
TTAGAGCTGAGCTGCTGCGGAAAGCTAGAGAGGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTTCTT
CAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATGTACGAGTTCTTTTTTTTTCCATTGTTATG
GACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAATACCATATACGCTATTGAATTTGGGAATG
ATGATGATCATGAATAAGTAGCTTCCTCTTTGTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4FZ67JQ C 1
AF RR4FZ67TF U 1
AF RR4DP91JQ C 32
AF RR4DP91TF U 32
BS 1 107 RR4FZ67TF
BS 108 108 RR4DP91TF
BS 109 288 RR4FZ67TF
BS 289 289 RR4DP91TF
BS 290 397 RR4FZ67TF

RD RR4FZ67JQ 370 0 0
GGGATCCGCGACTCATCTTCTCCAAAAAAGCAGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCTACT
TTGGGATGACATTGGCTGCTTTCGCCTTCTGGCAATCCATGGACAAATTCCACGTCTGGA
TCGCTCTCCACCAAGACGAGAAGCAAGAGAGGATGGAGAAGGAGGCTGAGGTAAAGCGGG
TTAGAGCTGAGCTGCTGCGGAAAGCTAGAGAGGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTTCTT
CAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATGTACGAGTTCTTTTTTTT*CCATTGTTATG
GACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAATACCATATACGCTATTGAATTTGGGAATG
ATGATGATCA

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR4FZ67TF 397 0 0
GGGATCCGCGACTCATCTTCTCCAAAAAAGCAGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCTACT
TTGGGATGACATTGGCTGCTTTCGCCTTCTGGCAATCCATGGACAAATTCCACGTCTGGA
TCGCTCTCCACCAAGACGAGAAGCAAGAGAGGATGGAGAAGGAGGCTGAGGTAAAGCGGG
TTAGAGCTGAGCTGCTGCGGAAAGCTAGAGAGGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTTCTT
CAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATGTACGAGTTCTTTTTTTT*CCATTGTTATG
GACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAATACCATATACGCTATTGAATTTGGGAATG
ATGATGATCATGAATAAGTAGCTTCCTCTTTGTTGTT

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR4DP91JQ 366 0 0
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GGAGGATCCTCTTGCCTGATAATTTTTTTCAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATG
TACGAGTTCTTTTTTTTTCCATTGTTATGGACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAA
TACCATATATGCTATTGAATTTGGGAATGATGATGATCATGAATAAGTAGCTTCCTCTTT
GTTGTT

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR4DP91TF 366 0 0
AGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCTACTTTGGGATGACATTGGCTGCTTTCGCCTTCTG
GCAATCCATGGACAAAGTCCACGTCTGGATCGCTCTCCACCAAGACGAGAAGCAAGAGAG
GATGGAGAAGGAGGCTGAGGTAAGGCGGGTTAGAGCTGAGCTGCTGCGGAAAGCTAGAGA
GGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTTCTTCAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATG
TACGAGTTCTTTTTTTTTCCATTGTTATGGACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAA
TACCATATATGCTATTGAATTTGGGAATGATGATGATCATGAATAAGTAGCTTCCTCTTT
GTTGTT

QA 1 366 1 366
DS 



AS 1 4

CO CL3612Contig1 1399 4 3 U
GGGCCAGGAGAAAAGATTCATCAAGAGGAATCTTTACCTTCTAGACTGTTTCGCTCGGCC
TTTCTTTTGTAGTATAGCTGCGATAGAGTGGCTTTGTTTGCGCATGGAGTTGCTTTCCAC
GCTTGTGTTTGCTTTTTGTATGGTTTTGCTCGTTAGTTTCCCTCATGGAACCATTGATCC
GAGTATGGCAGGGCTTGCTGTGACATATGGGCTTAACTTGAACGGGCGTCTATCACGGTG
GATACTTAGCTTCTGTAAGCTTGAAAACAAAATCATCTCGATCGAAAGGATTTATCAGTA
CAGTCAGCTTTTAGGAGAATCACCAGCTGTTATAGAAGATTCCCGACCACCTTCTAACTG
GCCTGAAAGAGGAACTATTGAGCTGCTTGATGTTAAGGTTCGTTATGCTGAGAATCTTCC
AACGGTACTCCACGGGATAAGCTGTGTGTTCCCTGGTGGTAAGAAGATTGGTATTGTTGG
AAGAACGGGAAGCGGGAAATCGACTTTGATTCAAGCTTTGTTTCGGCTGATTGAGCCAAC
TGCTGGAAAGATCACTATAGACAACATTGATATCTCTCAAATCGGTCTTCATGATCTCCG
TAGTCGCCTTGGTATCATACCTCAGGATCCTACATTGTTTGAAGGAACGATCCGTGCGAA
TCTCGACCCTCTTGAAGAGCATTCAGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAGTCCCA
GCTTGGTGACGTTGTTAGAGGAAAAGACTTAAAACTCGACTCTCCAGTGCTGGAAAATGG
AGATAACTGGAGTGTTGGGCAGAGACAGCTAGTGTCGCTTGGGAGAGCATTACTTAAACA
AGCAAGAATACTTGTTCTTGATGAAGCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGACAATTT
AATCCAGAAGATTATCAGAACTGAGTTTCAGGACTGCACAGTCTGCACCATTGCTCACCG
GATCCCAACTGTTATCGACAGTGACCTTGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGA
GTTTGATACTCCTGCACGGCTCTTAGAAGACAAATCATCCATGTTCTTAAAACTTGTGAG
CGAATACTCCTCAAGATCTAGTGGGATGCCTGACTTGTGATCATTCATGTTAAAAAATTT
GAGGTTAGGGGTTTTTGTTTCTCAAGAGAAACATAAAAAAACTGAAAAATGTGACAAAGC
TTAAAGTCTCTAAGCAAGATAGAAAGTTCCACTGGGTAGAAGAAAGAAAAAAAAGAATGA
CATGATGCAGTCGTCGTGCTCATATTATACTTTTAAAGCCACTCTTTTGAACATTGAAAG
AGACCTTTTTTGTAAGGAACAAAGCTTCTGTGGTGATCTTTTTAAATGTTATTTGATAAT
CTGCAAAAACAGTTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF78TF U 1
AF RR4BF78JQ C 495
AF RR4G394JQ C 866
AF RR4G394TF U 834
BS 1 855 RR4BF78TF
BS 856 1384 RR4G394TF
BS 1385 1399 RR4BF78JQ

RD RR4BF78TF 859 0 0
GGGCCAGGAGAAAAGATTCATCAAGAGGAATCTTTACCTTCTAGACTGTTTCGCTCGGCC
TTTCTTTTGTAGTATAGCTGCGATAGAGTGGCTTTGTTTGCGCATGGAGTTGCTTTCCAC
GCTTGTGTTTGCTTTTTGTATGGTTTTGCTCGTTAGTTTCCCTCATGGAACCATTGATCC
GAGTATGGCAGGGCTTGCTGTGACATATGGGCTTAACTTGAACGGGCGTCTATCACGGTG
GATACTTAGCTTCTGTAAGCTTGAAAACAAAATCATCTCGATCGAAAGGATTTATCAGTA
CAGTCAGCTTTTAGGAGAATCACCAGCTGTTATAGAAGATTCCCGACCACCTTCTAACTG
GCCTGAAAGAGGAACTATTGAGCTGCTTGATGTTAAGGTTCGTTATGCTGAGAATCTTCC
AACGGTACTCCACGGGATAAGCTGTGTGTTCCCTGGTGGTAAGAAGATTGGTATTGTTGG
AAGAACGGGAAGCGGGAAATCGACTTTGATTCAAGCTTTGTTTCGGCTGATTGAGCCAAC
TGCTGGAAAGATCACTATAGACAACATTGATATCTCTCAAATCGGTCTTCATGATCTCCG
TAGTCGCCTTGGTATCATACCTCAGGATCCTACATTGTTTGAAGGAACGATCCGTGCGAA
TCTCGACCCTCTTGAAGAGCATTCAGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAGTCCCA
GCTTGGTGACGTTGTTAGAGGAAAAGACTTAAAACTCGACTCTCCAGTGCTGGAAAATGG
AGATAACTGGAGTGTTGGGCAGAGACAGCTAGTGTCGCTTGGGAGAGCATTACTTAAACA
AGCAAGAATACTTGT
CTGA

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4BF78JQ 905 0 0
GGAAATCGACTTTGATTCAAGCTTTGTTTCGGCTGATTGAGCCAACTGCTGGAAAGATCA
CTATAGACAACATTGATATCTCTCAAATCGGTCTTCATGATCTCCGTAGTCGCCTTGGTA
TCATACCTCAGGATCCTACATTGTTTGAAGGAACGATCCGTGCGAATCTCGACCCTCTTG
AAGAGCATTCAGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAGTCCCAGCTTGGTGACGTTG
TTAGAGGAAAAGACTTAAAACTCGACTCTCCAGTGCTGGAAAATGGAGATAACTGGAGTG
TTGGGCAGAGACAGCTAGTGTCGCTTGGGAGAGCATTACTTAAACAAGCAAGAATACTTG
TTCTTGATGAAGCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGACAATTTAATCCAGAAGATTA
TCAGAACTGAGTTTCAAGACTGCACAGTCTGCACCATTGCTCACCGGATCCCAACTGTTA
TCGACAGTGACCTTGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGAGTTTGATACTCCTG
CACGGCTCTTAGAAGACAAATCATCCATGTTCTTAAAACTTGTGAGCGAATACT***CAA
GATCTAGTGGGATGCCTGACTTGTGATCATTCATGTTAAAAAATTTGAGGTTAGGGGTTT
TTGTTTCTCAAGAGAAACATAAAAAAACTGAAAAATGTGACAAAGCTTAAAGTCTCTAGG
CAAGATAGAAAGTTCCACTGGGTAGAAGAAAGAAAAAAAAGAATGACATGATGCAGTCGT
CGTGCTCATATTATACTTTTAAAGCCACTCTTTTGAACATTGAAAGAGACCTTTTTTGTA
AGGAACAAAGCTTCTGTGGTGATCTTTTTAAATGTTATTTGATAATCTGCAAAAACAGTT
CTTTT

QA 1 905 1 905
DS 

RD RR4G394JQ 519 0 0
GCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGACAATTTAATCCAGAAGATTATCAGAACTGAG
TTTCAGGACTGCACAGTCTGCACCATTGCTCACCGGATCCCAACTGTTATCGACAGTGAC
CTTGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGAGTTTGATACTCCTGCACGGCTCTTA
GAAGACAAATCATCCATGTTCTTAAAACTTGTGAGCGAATACTCCTCAAGATCTAGTGGG
ATGCCTGACTTGTGATCATTCATGTTAAAAAATTTGAGGTTAGGGGTTTTTGTTTCTCAA
GAGAAACATAAAAAAACTGAAAAATGTGACAAAGCTTAAAGTCTCTAAGCAAGATAGAAA
GTTCCACTGGGTAGAAGAAAGAAAAAAAAGAATGACATGATGCAGTCGTCGTGCTCATAT
TATACTTTTAAAGCCACTCTTTTGAACATTGAAAGAGACCTTTTTTGTAAGGAACAAAGC
TTCTGTGGTGATCTTTTTAAATGTTATTTGATAATCTGC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4G394TF 551 0 0
G
TAAACAAGCAAGAATACTTGTTCTTGATGAAGCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGA
CAATTTAATCCAGAAGATTATCAGAACTGAGTTTCAGGACTGCACAGTCTGCACCATTGC
TCACCGGATCCCAACTGTTATCGACAGTGACCTTGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGT
AGCAGAGTTTGATACTCCTGCACGGCTCTTAGAAGACAAATCATCCATGTTCTTAAAACT
TGTGAGCGAATACTCCTCAAGATCTAGTGGGATGCCTGACTTGTGATCATTCATGTTAAA
AAATTTGAGGTTAGGGGTTTTTGTTTCTCAAGAGAAACATAAAAAAACTGAAAAATGTGA
CAAAGCTTAAAGTCTCTAAGCAAGATAGAAAGTTCCACTGGGTAGAAGAAAGAAAAAAAA
GAATGACATGATGCAGTCGTCGTGCTCATATTATACTTTTAAAGCCACTCTTTTGAACAT
TGAAAGAGACCTTTTTTGTAAGGAACAAAGCTTCTGTGGTGATCTTTTTAAATGTTATTT
GATAATCTGC

QA 2 551 2 551
DS 



AS 1 3

CO CL3613Contig1 862 3 8 U
CTGTGAATCGTTTAACATTAATATACGAATGTAGTTGGAAAAAATAGTAATAAAAATCGT
TCAAAATCATGGACTCGGTTTCAATACAACAGCAAGATAAACGGTTTAACCTGTTTTCAT
TAGACTAGGCAGATATATTGAGATGTCCATACTTTTACATCACTCTTTTGGTGGCCATGG
CGGCTGCTTCACTTGCTCTAAGTGTGCCTTGCGCCATGAGAGCTGCAAACTCACGGGTAA
TCTCTTCCTGAATCTTGGTCCTAGCATCACCCAATGGATCCTCCTTCACCTTCTCTTTAC
TAGAAGAAGCTTGAGCAACACCAGGTGCCACTTTTTCAGCTGGAACCGAGGTTTTGGCAT
CCTCAGACTTCGAGTTATTCTCCTTGGGCTTGCTCGGTAGTTTTGGACCTTCATCCTTGC
CAAAAGCACCAAAAGGCTGTGCCTGAGGCCTAAGCTGGGG*AGCGTTAGGAACAGCGCCG
GCTCTCAGAGTCGTCTCCAGGTTTTGAATCATAGG*CATTATAAGACCACCCATGGGGCT
GTTCATGACCTCGTTCGGAAGGTCAAG**AATGTAGTCTGGAATCCCTTTACCGACCAGA
AA*CTGAGCGACCTCGTTGCTGAAGTTGTTACAGTTGTGAGCCAGCAGATTGTATGATTC
AGCAGTGTAACGTGGACTGATCTCCTCCAAAGTACATCTCGAACACATCTTTAGGAACAT
GTGTTTCACCCAGCTCTACCGTTCGCAGCGGTGCTCCGTATGGGGTGGTTCCAGCAGGCA
GATGCTGGATGCCTACTCCGAAAAAGTATTCACTTCCATACACAACCACTCCCGTACGCC
AGACACCTTCGATAACCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF53JQ U 47
AF RR4AK76JQ U 1
AF RR4AK76TF C 330
BS 1 53 RR4AK76JQ
BS 54 54 RR4AF53JQ
BS 55 183 RR4AK76JQ
BS 184 184 RR4AF53JQ
BS 185 690 RR4AK76JQ
BS 691 691 RR4AK76TF
BS 692 790 RR4AK76JQ
BS 791 862 RR4AK76TF

RD RR4AF53JQ 592 0 0
GTAATAAAAATCGTTCAAAATCATGGACTCGGTTTCAATACAACAGCAAGATAAACGGTT
TAATCTGTTTTCATTAGACTAGGCAGATATATTGAGATGTCCATACTTTTGCATCACTCT
TTTGGTGGCCATGGCGGCTGCTTCACTTGCTCTTAGTGTGCCTTGTGCCATGAGAGCTGC
AAACTCACGGGTAATCTCTTCCTGAATCTTGGTCCTAGCATCACCCAATGGATCCTCCTT
CACCTTCTCTTTACTAGAGGAAGCTTGAGCAACAGCAGGTGCCACTTTTTCAGCTGGAAC
CGAGGTTTTGCCATCCTCAGATTTGGAGTTATTCTCCTTGGGCTTGCTCGGTAGTTTTGG
ACCTTCATCCTTGCCAAAAGCACCAAAAGGCTGCGCCTGAGGCCTAAACTGGGG*AGCGT
TAGGAACAGCGCCGGCTCTCAGAGTCGTCTCCAGGTTTTGAATCATAGG*CATTATAAGA
CCACCCATGGGGCTGTTCATGACCTCGTTCGGAAGGTCAAG**AATGTAGTCTGGAATCC
CTTTACCAACAAGAAA*CTGAGCGACCTCGTTGCTGAAGTTGTTGCAGTTGT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4AK76JQ 798 0 0
CTGTGAATCGTTTAACATTAATATACGAATGTAGTTGGAAAAAATAGTAATAAGAATCGT
TCAAAATCATGGACTCGGTTTCAATACAACAGCAAGATAAACGGTTTAACCTGTTTTCAT
TAGACTAGGCAGATATATTGAGATGTCCATACTTTTACATCACTCTTTTGGTGGCCATGG
CGGTTGCTTCACTTGCTCTAAGTGTGCCTTGCGCCATGAGAGCTGCAAACTCACGGGTAA
TCTCTTCCTGAATCTTGGTCCTAGCATCACCCAATGGATCCTCCTTCACCTTCTCTTTAC
TAGAAGAAGCTTGAGCAACACCAGGTGCCACTTTTTCAGCTGGAACCGAGGTTTTGGCAT
CCTCAGACTTCGAGTTATTCTCCTTGGGCTTGCTCGGTAGTTTTGGACCTTCATCCTTGC
CAAAAGCACCAAAAGGCTGTGCCTGAGGCCTAAGCTGGGG*AGCGTTAGGAACAGCGCCG
GCTCTCAGAGTCGTCTCCAGGTTTTGAATCATAGG*CATTATAAGACCACCCATGGGGCT
GTTCATGACCTCGTTCGGAAGGTCAAG**AATGTAGTCTGGAATCCCTTTACCGACCAGA
AA*CTGAGCGACCTCGTTGCTGAAGTTGTTACAGTTGTGAGCCAGCAGATTGTATGATTC
AGCAGTGTAACGTGGACTGATCTCCTCCAA*GTACATCTCGAACACATCTTTAGGAACAT
GTGTTTCACCCAGCTCTACCGTTCGCAGCGGTGCTCCGTATGGGGTGGTTCCAGCAGGCA
GATGCTGGAT
GCCTACTC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4AK76TF 533 0 0
CAC
TTTTCAGCTGGAACCGAGGTTTTGGCATCCTCAGACTTCGAGTTATTCTCCTTGGGCTTG
CTCGGTAGTTTTGGACCTTCATCCTTGCCAAAAGCACCAAAAGGCTGTGCCTGAGGCCTA
AGCTGGGGGAGCGTTAGGAACAGCGCCGGCTCTCAGAGTCGTCTCCAGGTTTTGAATCAT
AGGGCATTATAAGACCACCCATGGGGCTGTTCATGACCTCGTTCGGAAGGTCAAAGAAAT
GTAGTCTGGAATCCCTTTACCGACCAGAAAACTGAGCGACCTCGTTGCTGAAGTTGTTAC
AGTTGTGAGCCAGCAGATTGTATGATTCAGCAGTGTAACGTGGACTGATCTCCTCCAAAG
TACATCTCGAACACATCTTTAGGAACATGTGTTTCACCCAGCTCTACCGTTCGCAGCGGT
GCTCCGTATGGGGTGGTTCCAGCAGGCAGATGCTGGATGCCTACTCCGAAAAAGTATTCA
CTTCCATACACAACCACTCCCGTACGCCAGACACCTTCGATAACCTTCCC

QA 4 533 4 533
DS 



AS 1 4

CO CL3614Contig1 353 4 1 U
GGCTCGCCCCTTCCACTCGTGTTTGAAATCACCGCATAAACCCTAGCTTTGTGGTGATTC
GTTTCGTTAATCATGGATCAACAGCCCGAACCAGTCACTTACGTCTGCGGAGATTGTGGA
CAAGAGAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATTCAGTGCAGAGAGTGTGGCTATCGTATT
CTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTTCAGTATGAAGCTCGCTGAGAACCCCTAAAG
ATTGATTCCAAGTATGCTAAGATGGCAATAAGTTTCCTGCATCTGTTTGTAATATATCTG
GACTAGAAAATCTGTTTCTGAATTTGGCTAAGTGGTTTGATTTGATTATAAAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4BG07JQ C 1
AF RR4BG92JQ C 1
AF RR4BG07TF U 1
AF RR4BG92TF U 1
BS 1 353 RR4BG07TF

RD RR4BG07JQ 353 0 0
GGCTCGCCCCTTCCACTCGTGTTTGAAATCACCGCATAAACCCTAGCTTTGTGGTGATTC
GTTTCGTTAATCATGGATCAACAGCCCGAACCAGTCACTTACGTCTGCGGAGATTGTGGA
CAAGAGAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATTCAGTGCAGAGAGTGTGGCTATCGTATT
CTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTTCAGTATGAAGCTCGCTGAGAACCCCTAAAG
ATTGATTCCAAGTATGCTAAGATGGCAATAAGTTTCCTGCATCTGTTTGTAATATATCTG
GACTAGAAAATCTGTTTCTGAATTTGGCTAAGTGGTTTGATTTGATTATAAAT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4BG92JQ 353 0 0
GGCTCGCCCCTTCCACTCGTGTTTGAAATCACCGCATAAACCCTAGCTTTGTGGTGATTC
GTTTCGTTAATCATGGATCAACAGCCCGAACCAGTCACTTACGTCTGCGGAGATTGTGGA
CAAGAGAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATTCAGTGCAGAGAGTGTGGCTATCGTATT
CTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTTCAGTATGAAGCTCGCTGAGAACCCCTAAAG
ATTGATTCCAAGTATGCTAAGATGGCAATAAGTTTCCTGCATCTGTTTGTAATATATCTG
GACTAGAAAATCTGTTTCTGAATTTGGCTAAGTGGTTTGATTTGATTATAAAT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4BG07TF 353 0 0
GGCTCGCCCCTTCCACTCGTGTTTGAAATCACCGCATAAACCCTAGCTTTGTGGTGATTC
GTTTCGTTAATCATGGATCAACAGCCCGAACCAGTCACTTACGTCTGCGGAGATTGTGGA
CAAGAGAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATTCAGTGCAGAGAGTGTGGCTATCGTATT
CTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTTCAGTATGAAGCTCGCTGAGAACCCCTAAAG
ATTGATTCCAAGTATGCTAAGATGGCAATAAGTTTCCTGCATCTGTTTGTAATATATCTG
GACTAGAAAATCTGTTTCTGAATTTGGCTAAGTGGTTTGATTTGATTATAAAT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4BG92TF 353 0 0
GGCTCGCCCCTTCCACTCGTGTTTGAAATCACCGCATAAACCCTAGCTTTGTGGTGATTC
GTTTCGTTAATCATGGATCAACAGCCCGAACCAGTCACTTACGTCTGCGGAGATTGTGGA
CAAGAGAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATTCAGTGCAGAGAGTGTGGCTATCGTATT
CTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTTCAGTATGAAGCTCGCTGAGAACCCCTAAAG
ATTGATTCCAAGTATGCTAAGATGGCAATAAGTTTCCTGCATCTGTTTGTAATATATCTG
GACTAGAAAATCTGTTTCTGAATTTGGCTAAGTGGTTTGATTTGATTATAAAT

QA 1 353 1 353
DS 



AS 1 4

CO CL3615Contig1 919 4 8 U
GGTCTTACAAATAATCTCAAGTATACATTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAAA
CAAAACTTTTCCCGATAACTATGACAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTAG
AGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCT
CGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGGCTGAGAAGGAGGCGAAGAAGCTCC
GGGATGAGATTGCTCAGAAGAGGGATGGGATTGAGGAGGTGGAGAAGGAGGTTGTTGCGT
TGAGGAGTGGGAAGGAGGAGAACGAGAAGAGGATGAAGGAGTTGGAAGGAAAGCTCGGTG
CTTTGGAGGCCAAGGAGTTGGAGGAGAGGAACAAGAAGGTGAGAGCTGAGGAAGAGATGA
GGGATAGGATTGATAACAAGGATAAGGAGGTTGATGAGTTGAAGGAGAAGATCAAGGGGT
TGGAATCTAATGTAGCCGAAGGGAAAGCAGAGTTGGAGAAGTGGAGAACGGAGAAGAAGG
TTGTGGAGGATTCGTTGAGAGAGTCTGAGAAGAGAGTGAAGGATATGGAATCGGAGATTG
TGGAGCTGGAGAGACAGATGGATGAGTCTGAGAAGATGATCAGTGGGTTGAAGAACATGG
TTGAGCAGCCGGTGAATGGCGTGGAGGTTAGTAGTAGGTCGTGGTCTCCGACGACTGCTG
CTGTGAGTGGTGGTTATGGTGGAGCTTTGGCTGCTGTTGGGGTTGCAGTTGCGGGAGCAG
CTGTTGTCTTCTATGTTTACCGCTCGAAGAAGGCTTAATTCTCTCGGAGGTAGAAGTTGA
TTTTGTTTGTTTTTGGAGTGTTTCTTACGATACCTATCTTTGTTATATTTGCTTTTGAGA
ATGTGATTTGATTTCACGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY13TF U 1
AF RR4G223TF U 1
AF RR4GX51JQ C 304
AF RR4GX51TF U 304
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TGATTT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 4

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CGACGACTCATTTGATAATGCAGTCATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG38TF U 264
AF RR4G139TF U 1
AF RR4GG38JQ C 356
AF RR4G139JQ C 356
BS 1 296 RR4G139TF
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RD RR4GG38TF 232 0 0
TATCATCAAGCTTCACAGCCTCCTTGGAAACAAATGGTCGTTAATTGCGGCGAGGTTACC
TGGAAGAACATATAACGAGATCAAGAATTACTGGAACACACATATAAAGAGGAAACTTTT
GAGCAAAGGGATTGATCCCAACACTCAGGGATCAATCATCGCCGCGAAAGATCATGATTT
GAAGAAAACAGGGGACCAAATTGTAAAAGATGTGTCTTTTGGGTCTCTGTTT

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR4G139TF 731 0 0
GGAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAACCATGGGAAGATCTCCTTGCTGTGAGAAA
GAACACATGAACAAAGGTGCTTGGACTAAAGAAGAAGACGAGAGACTCGTCTCATACATC
AAATCACACGGAGAAGGCTGCTGGCGATCTCTCCCTAGAGCTGCCGGTCTCCTCCGTTGC
GGCAAGAGCTGCCGTCTCCGGTGGATTAACTATCTCCGGCCTGATCTCAAAAGAGGAAAC
TTTACCCACGACGAAGATGAAGTTATCATCAAGCTTCACAGCCTCCTTGGAAACAAGTGG
TCTTTAATTGCGGCGAGGTTACCTGGAAGAACAGATAACGAGATCAAGAATTACTGGAAC
ACACATATAAAGAGGAAACTTTTGAGCAAAGGGATTGATCCCAACACTCACGGATCAATC
AACGCCGCGAAAGATCATGATTTGAAGAAAACAGGGGACCAAATTGTAAAAGATGTGTCT
TTTGGGTCTCTGTTTGAGAAAACAGAAAAGTCTGAGGAGCAGAAGCAAAATAAAAACCAA
AAGCAGAATCTAATCAATGGGTTCGTTTGCAAAGAAGAGAGGGTTGAGCATCACCCAGTT
GTTGTTGTTGTCCAAGAAAAGATTTGCCCAGAATTGAATCTCGAGCTTAGGATCAGTCCA
CCGTGGCAAAACAAGAATTATGATGATCAGACAAAAGAGAGATTTGCCTGCACTGCATCC
CATCTTTACGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4GG38JQ 545 0 0
GGAACACACATATAAAGAGGAAACTTTTGAGCAAGGGGATTGATCCCAACACTCACGGAT
CAATCAACGCCGCGAAAGATCATGATTTGAAGAAAACAGGGGACCAAATTGTAAAAGATG
TGTCTTTTGGGTCTCTGTTTGAGAAAACAGAAAAGTCTGAGGAGCAGAAGCAAAATAAAA
ACCAAAAGCAGAATTTAATCAATGGGTTCGTTTGCAAAGAAGAGAGGGTTGAGCATCACC
CAGTTGTTGTTGTTGTCCAAGAAAAGATTTGCCCAGAATTGAATCTCGAGCTTAGGATCA
GTCCACCGTGGCAAAACAAGAATTATGATGATCAGACAAAAGAGAGATTTGCCTACACTG
CATCCCATCTTTACGTGGAAAACGGCATGGAGTCTAGTAGTGATACTGCAAAATGTCAAA
CAGAGGATAGCAGTAGCATTAGCCATTCTTCACTTGACATTAGTAGTATTAGCAGCATTG
GTTATGACTTCTTGGGTTTGAATACGAGGTTTATGGATTTTCGGAGCTTGGAAATGAACT
AAACA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4G139JQ 695 0 0
GGAACACACATATAAAGAGGAAACTTTTGAGCAAAGGGATTGATCCCAACACTCACGGAT
CAATCAACGCCGCGAAAGATCATGATTTGAAGAAAACAGGGGACCAAATTGTAAAAGATG
TGTCTTTTGGGTCTCTGTTTGAGAAAACAGAAAAGTCTGAGGAGCAGAAGCAAAATAAAA
ACCAAAAGCAGAATCTAATCAATGGGTTCGTTTGCAAAGAAGAGAGGGTTGAGCATCACC
CAGTTGTTGTTGTTGTCCAAGAAAAGATTTGCCCAGAATTGAATCTCGAGCTTAGGATCA
GTCCACCGTGGCAAAACAAGAATTATGATGATCAGACAAAAGAGAGATTTGCCTGCACTG
CATCCCATCTTTACGTGGAAAACGGCATGGAGTCTAGTAGTGATACTGCAAAATGTCAAA
CAGAGGATAGCAGTAGCATTAGCCATTCTTCACTTGACATTAGTAGTATTAGCAGCATTG
GTTATGACTTCTTGGGTTTGAATACGAGGTTTATGGATTTTCGGAGCTTGGAAATGAACT
AAACAAATAATCAAAAATAAATTTGTAGATCTGATAATGTTACTCTATATCTCGCTTTTA
CTTTATTTTAATGTCTTTCTCCTAATCTTTGTACATAAACTTCAAAATATTATGATCAAT
TGTATCGACGACTCATTTGATAATGCAGTCATATG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

CO CL3617Contig1 880 4 6 U
GGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGATCAACTCATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAG
AGAGTGAGCTCTGAGAAAATCACCAATGGCTTCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCAT
CCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATTGCCGCTGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAA
GGTTGTAACGGACACTGAGAAGACATATGAGTACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTAC
GAGCTATGGAGCTGGTGCATTCCTTCTCCTCTTTATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGC
TAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCCCTAACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCT
CCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGC
ATCAATCAGAAACGCGTACCACACGAAATACAGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCC
TAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTTGCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCAC
CGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTACTCTCGTGCTAGAGATGCTTACCAGAA
TCCGTCCTACTAAAACATGTCATACTTTCACAGCAAGCTACGTTTAGGCTTCGAGAGTTG
GAAACCATATTCATGTGGGCAGTTGTGAGTTTGTTTAGTTTCAAGTGATACTACTTATCC
GATGTGATGTTAAAAATTTGATGGTTTGTCTTGAGGATGATACATTGAGAAGTGATTGTT
TCTTGTGACGTAGGTATATTTGTCGTGCGTCTCGTAATGTATAAGGAGTAAAAAACATGC
TTTTATATTTAAACAGAAAAACAGAGAAAACATGCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ12TF U 1
AF RR4CB41TF U 29
AF RR4CB41JQ C 30
AF RR4CQ12JQ C 272
BS 1 643 RR4CQ12TF
BS 644 730 RR4CB41TF
BS 731 731 RR4CB41JQ
BS 732 735 RR4CB41TF
BS 736 850 RR4CB41JQ
BS 851 880 RR4CQ12JQ

RD RR4CQ12TF 643 0 0
GGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGATCAACTCATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAG
AGAGTGAGCTCTGAGAAAATCACCAATGGCTTCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCAT
CCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATTGCCGCTGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAA
GGTTGTAACGGACACTGAGAAGACATATGAGTACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTAC
GAGCTATGGAGCTGGTGCATTCCTTCTCCTCTTTATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGC
TAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCCCTAACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCT
CCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGC
ATCAATCAGAAACGCGTACCACACGAAATACAGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCC
TAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTTGCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCAC
CGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTACTCTCGTGCTAGAGATGCTTACCAGAA
TCCGTCCTACTAAAACATGTCATACTTTCACAGCAAGCTACGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4CB41TF 707 0 0
GGA
ACTCATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAATCACCAATGGCT
TCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATT
GCCGCTGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAAGGTTGTAACGGACACTGAGAAGACATATGAG
TACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCATTCCTTCTCCTC
TTTATGAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCCCTA
ACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTC
CTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACGAAATAC
AGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCTAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTT
GCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGC
TACTCTCGTGCTAGAGATGCTTACCAGAATCCGTCCTACTAAAACATGTCATACTTTCAC
AGCAAGCTACGTTTAGGCTTCGAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTTGTGAGTT
TGTTTAGTTTCAAGTGATACTACTTATCCGATGTGATGTAAAAA

QA 4 707 4 707
DS 

RD RR4CB41JQ 821 0 0
GG
ACTCATCAGAAAGCTACTT*GAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAATCACCAATGGCT
TCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATT
GCCGCTGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAAGGTTGTAACGGACACTGAGAAGACATATGAG
TACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCATTCCTTCTCCTC
TTTATGAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCCCTA
ACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTC
CTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACGAAATAC
AGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCTAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTT
GCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGC
TACTCTCGTGCTAGAGATGCTTACCAGAATCCGTCCTACTAAAACATGTCATACTTTCAC
AGCAAGCTACGTTTAGGCTTCGAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTTGTGAGTT
TGTTTAGTTTCAAGTGATACTACTTATCCGATGTGATGTTAAAAATTTGATGGTTTGTCT
TGAGGATGATACATTGAGAAGTGATTGTTTCTTGTGACGTAGGTATATTTGTCGTGCGTC
TCGTAATGTATAAGGAGTAAAAAACATGCTTTTATATTT

QA 3 821 3 821
DS 

RD RR4CQ12JQ 609 0 0
TTTATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCCCTA
ACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTC
CTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGCATCAATCAGAAACGCGTACCCCACGAAATAC
AGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCTAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTT
GCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTTTTCACCGCCATCGTCTTTCAGTTTTATTACGTTTGC
TACTCTCGTGCTAGAGATGCTTACCAGAATCCGTCCTATTAAAACATGTCATACTTTCAC
AGCAAGCTACGTTTAGGCTTCGAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTTGTGAGTT
TGTTTAGTTTCAAGTGATACTACTTATCCGATGTGATGTTAAAAATTTGATGGTTTGTCT
TGAGGATGATACATTGAGAAGTGATTGTTTCTTGTGACGTAGGTATATTTGTCGTGCGTC
TCGTAATGTATAAGGAGTAAAAAACATGCTTTTATATTTAAACAGAAAAACAGAGAAAAC
ATGCTTTGC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 4

CO CL3618Contig1 695 4 4 U
CATTCAATACACCCCCTCAATTCATTTGTTCTGTGAATCTAAAGCTATAAATATGTGAGT
TTCTTTATGTGAAATCACAAGTTTTATCCTCTCAATCATTCCCAAACTTTTAGAGATTAG
AATGTCAAACTTCTTCTCATGCTCTCTAGCTTGAAAGCCGTCGTTGTAGCGCGACCTTCG
AGGTTCGCCTGCTGAGATTTTAGGAGTCGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTGTAGTATGCGT
TTTTTTTTGGGTTTCTTCTTTCTCTCGCTTGAAAGTTTTGAATTTTTGTTGTTGAATTCA
ACATTGAACTTGCTGAGACAAGAGTCATGTGCTTTGAAAGAATATATTACTTTTTTTTTT
GACAGATATCAAAGATTATGTCACAGGATTTGAGGATCTTGAACAGATGAACCTGCACAA
GTCAAATCTGTGTTAGTATCAGTACACAAGCTGTTTATGTATAAGTTTATTAGGTTACTA
CTTCTTCAATGACTTTTACAGCGTGGTCGCAGCATTAGGATCTATATTTGTGTTCTCTCT
GGTGAGCCACGTCTTGCAAAGACAACCTCTCAATGGAATTACTACAGCTGCTGGTTTTGA
TGTCTTCCAACTAATATTTTTCACAGCGAGTTATTATTCTTT*ACTTGCTTACCTGTAGG
TACATATATAATATCGAAGGTTTCATTTGTGTTCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4B547JQ C 1
AF RR4B550TF U 263
AF RR4B547TF U 1
AF RR4B550JQ C 1
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BS 643 643 RR4B547TF
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TACATATATAATATCGAAGGTTTCATTTGTGTTCG

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DS 

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TACACAAGCTGTTTATGTATAAGTTTATTAGGTTACTACTTCTTCAATGACTTTTACAGC
GTGGTCGCAGCATTAGGATCTATATTTGTGTTCTCTCTGGTGAGCCACGTCTTGCAAAGA
CAACCTCTCAATGGAATTACTACAGCTGCTGGTTTTGATGTCTTCCAACTAATATTTTTC
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TCATTTGTGTTCG

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4B547TF 695 0 0
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TTCTTTATGTGAAATCACAAGTTTTATCCTCTCAATCATTCCCAAACTTTTAGAGATTAG
AATGTCAAACTTCTTCTCATGCTCTCTAGCTTGAAAGCCGTCGTTGTAGCGCGACCTTCG
AGGTTCGCCTGCTGAGATTTTAGGAGTCGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTGTAGTATGCGT
TTTTTTTTGGGTTTCTTCTTTCTCTCGCTTGAAAGTTTTGAATTTTTGTTGTTGAATTCA
ACATTGAACTTGCTGAGACAAGAGTCATGTGCTTTGAAAGAATATATTACTTTTTTTTTT
GACAGATATCAAAGATTATGTCACAGGATTTGAGGATCTTGAACAGATGAACCTGCACAA
GTCAAATCTGTGTTAGTATCAGTACACAAGCTGTTTATGTATAAGTTTATTAGGTTACTA
CTTCTTCAATGACTTTTACAGCGTGGTCGCAGCATTAGGATCTATATTTGTGTTCTCTCT
GGTGAGCCACGTCTTGCAAAGACAACCTCTCAATGGAATTACTACAGCTGCTGGTTTTGA
TGTCTTCCAACTAATATTTTTCACAGCGAGTTATTATTCTTT*ACTTGCTTACCTGTAGG
TACATATATAATATCGAAGGTTTCATTTGTGTTCG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4B550JQ 695 0 0
CATTCAATACACCCCCTCAATTCATTTGTTCTGTGAATCTAAAGCTATAAATATGTGAGT
TTCTTTATGTGAAATCACAAGTTTTATCCTCTCAATCATTCCCAAACTTTTAGAGATTAG
AATGTCAAACTTCTTCTCATGCTCTCTAGCTTGAAAGCCGTCGTTGTAGCGCGACCTTCG
AGGTTCGCCTGCTGAGATTTTAGGAGTCGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTGTAGTATGCGT
TTTTTTTTGGGTTTCTTCTTTCTCTCGCTTGAAAGTTTTGAATTTTTGTTGTTGAATTCA
ACATTGAACTTGCTGAGACAAGAGTCATGTGCTTTGAAAGAATATATTACTTTTTTTTTT
GACAGATATCAAAGATTATGTCACAGGATTTGAGGATCTTGAACAGATGAACCTGCACAA
GTCAAATCTGTGTTAGTATCAGTACACAAGCTGTTTATGTATAAGTTTATTAGGTTACTA
CTTCTTCAATGACTTTTACAGCGTGGTCGCAGCATTAGGATCTATATTTGTGTTCTCTCT
GGTGAGCCACGTCTTGCAAAGACAACCTCTCAATGGAATTACTACAGCTGCTGGTTTTGA
TGTCTTCCAACTAATATTTTTCACAGCGAGTTATTATTCTTT*ACTTGCTTACCTGTAGG
TACATATATAATATCGAAGGTTTCATTTGTGTTCG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

CO CL3619Contig1 887 4 3 U
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AACCACATCTACGGTCTTTCTTTAACTGGACTCCGGTTCTTTACAGTTTACGGTCCTTGG
GGAAGACCCGACATGGCTTACTTCTTCTTTACTAAAGCCATACTCCACGGGAAGTCGATA
GATATTTACCGAACGCAAGACAATCAAGAAGTGGCGCGTGACTTCACCTACATAGACGAT
ATAGTTAAAGGATGTGTCGGTGCGTTGGACACGGCGGAGAAAAGCACGGGAAGCGGCGGA
AGAAGCGAGGACCGGCTCAGTTACGTGTTTACAATCTCGGGAACACTTCTCCGGTTCCTG
TCGGGAGACTGGTCTCGATCTTGGAAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGA
TCAAAATGCCTAGGAACGGTGACGTGCCTTACACGCATGCGAATGTGAGCTTGGCGTATA
AAGACTTTGGGTATAAACCAACAACGGACCTCGCGGCGGGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGT
GGTACGTTAGTTATTACGGGATACAGCCGAGGGTGAAAAGGGAAAACTCTCACGCCGATG
ATTCTGCTTAAATAATGCCACCCTGCTCTTCATCAACATCACGTGCTTGTTTTTATTTCT
TTACAACCCAAAAAAGATAATTATTTACAGGGACATATTTCTGTATTTTTCTGTTTTTAG
TTTCAAAAATGCCAAAAGATCATTAATGGTGGTCCTTTTTTAAGGGGGATCGAAGTGGGA
ATTAAATTGTTACAGCTGTATGTTATAATAGAAAGATATTTGTGAGTGTAATTGGAAATA
TATGTGGGTTTGTTATGCAATAAATGATGGGATAATGATCTTGCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D642TF U 1
AF RR4FK28JQ C 302
AF RR4FK28TF U 302
AF RR4D642JQ C 381
BS 1 566 RR4D642TF
BS 567 829 RR4FK28TF
BS 830 887 RR4D642JQ

RD RR4D642TF 566 0 0
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ATAGTTAAAGGATGTGTCGGTGCGTTGGACACGGCGGAGAAAAGCACGGGAAGCGGCGGA
AGAAGCGAGGACCGGCTCAGTTACGTGTTTACAATCTCGGGAACACTTCTCCGGTTCCTG
TCGGGAGACTGGTCTCGATCTTGGAAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGA
TCAAAATGCCTAGGAACGGTGACGTGCCTTACACGCATGCGAATGTGAGCTTGGCGTATA
AAGACTTTGGGTATAAACCAACAACGGACCTCGCGGCGGGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGT
GGTACGTTAGTTATTACGGGATACAG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4FK28JQ 528 0 0
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CGGGAGACTGGTCTCGATCTTGGAAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGAT
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AGACTTTGGGTATAAACCAACAACGGATCTCGCGGCGGGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGTG
GTACGTTAGTTATTACGGGATACAGCCGAGGGTGAAAAGGGAAAACTCTCACGCCGATGA
TTCTGCTTAAATAATGCCACCCTGCTCTTCATCAACATCACGTGCTTGTTTTTATTTCTT
TACAACCCAAAAAAGATAATTATTTACAGGGACATATTTCTGTATTTTTCTGTTTTTAGT
TTCAAAAATGCCAAAAGATCATTAATGGTGGTCCTTTTTTAAGGGGGATCGAAGTGGGAA
TTAAATTGTTACAGCTGTATGTTATAATAGAAAGATATTTGTGAGTGT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4FK28TF 528 0 0
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CGGGAGACTGGTCTCGATCTTGGAAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGAT
CAAAATGCCTAGGAACGGTGACGTGCCTTACACGCATGCGAATGTGAGCTTGGCGTATAA
AGACTTTGGGTATAAACCAACAACGGATCTCGCGGCGGGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGTG
GTACGTTAGTTATTACGGGATACAGCCGAGGGTGAAAAGGGAAAACTCTCACGCCGATGA
TTCTGCTTAAATAATGCCACCCTGCTCTTCATCAACATCACGTGCTTGTTTTTATTTCTT
TACAACCCAAAAAAGATAATTATTTACAGGGACATATTTCTGTATTTTTCTGTTTTTAGT
TTCAAAAATGCCAAAAGATCATTAATGGTGGTCCTTTTTTAAGGGGGATCGAAGTGGGAA
TTAAATTGTTACAGCTGTATGTTATAATAGAAAGATATTTGTGAGTGT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4D642JQ 507 0 0
TTGGAAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGGAACGGT
GACGTGCCTTACACGCATGCGAATGTGAGCTTGGCGTATAAAGACTTTGGGTATAAACCA
ACAACGGACCTCGCGGCGGGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGTGGTACGTTAGTTATTACGGG
ATACAGCCGAGGGTGAAAAGGGAAAACTCTCACGCCGATGATTCCGCTTAAATAATGCCA
CCCTGCTCTTCATCAACATCACATGCTTGTTTTTATTTCTTTACAACCCAAAAAAGATAA
TTATTTACAGGGACATATTTCTGTATTTTTCTGTTTTTAGTTTCAATAATGCCAAAAGAT
CATTAATGGTGGTCCTTTTTTAAGGGGGATCGAAGTGGGAATTAAATTGTTACAGCTGTA
TGTTATAATAGAAAGATATTTGTGAGTGTAATTGGAAATATATGTGGGTTTGTTATGCAA
TAAATGATGGGATAATGATCTTGCTAG

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 4

CO CL3620Contig1 515 4 1 U
GATCTTCGGAAACGCTGCCGTCGTTCTCCAAGATTGTGACATCCATGCTCGCCGACCAAA
CTCCGGCCAGAAAAACATGGTCACAGCCCAAGGAAGGACCGATCCTAACCAGAACACAGG
GATTGTTATCCAAAAATGTAGGATCGGTGCCACGTCGGATTTGCAGCCCGTGGAAAGAGT
ACTCGCAGACAGTGATCATGCAGTCGGATATCTCCGACGTGATCCGACCAGAAGGGTGGT
CCGATTGGACCGGGACTTTTGCGTTGAACACTTTGACATATAGAGAGTATGCGAACAAAG
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CTGCTGAAGCCCAGAGATATACTGCTGGTCAGTTTATCGGTGGTGGGGGCTGGTTAGGTT
CGACCGGTTTCCCTTTCTCGCTCGGTCTTTGAGATGTTATTGTTGTGAAGTGTAACCTAC
ATGTTGTTGGTCGAATAATTATTGATTTTATCAGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR4A042JQD C 1
AF RR4A786JQ C 1
AF RR4A042TFB U 1
AF RR4A786TF U 1
BS 1 515 RR4A042TFB

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QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 4

CO CL3621Contig1 758 4 4 U
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AATCGAAACAAGCTCAGCATAATAGTACATGTTATATCCAACCCCAAAAACCAAGCTAAG
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TCAGAGAACGGTCCGAACGGTGTCTGTCCAACGCTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC25JQ U 106
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AF RR4CO74JQ U 1
AF RR4EC25TF C 190
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RD RR4EC25JQ 516 0 0
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QA 1 516 1 516
DS 

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AATCGAAACAAGCTCAGCATAATAGTACATGTTATATCCAACCCCAAAAACCAAGCTAAG
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CCTCCATAAGCAACCGCTGAATCAATAACATCGATCGCGCTCGAGATAGTCGTGTTCAAC
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TCAGA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4CO74JQ 728 0 0
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TACATTTGAGATACTCCTGGTTAACTAATTTCAAGTTTCTGTCTTAACTATTCAAAAATA
AATAGACAACCAGAAGAAGAAAAGATCCAACATTTGTTTTTCTTTAGTTCAACATTACCA
AATCGAAACAAGCTCAGCATAATAGTACATGTTATATCCAACCCCAAAAACCAAGCTAAG
TCTTCATCCAATGTAAGGACTTGGATTCTTCAGAACTGTTTTCTTTTGCTCTTGAAGAGC
CTATCTCTTTTAGCGTACACGTAACTCAAAGCCACTAACCCTACTCCAGACACTGAAACA
GCTCCCCACGGGAACGGAGGATCTTTAAAACAGTTGAGACTCGCTTCCACCTCTTGTGAC
GCCAGGTACACCACTGAATGCATCGAGTACAAGTCGTGAGAAGCTGATCTCAGGTAGAAC
AAAGCCATCTCGAAGTCATTATGCGACAGAGCGGAAACAGATTTCTCCATCTTGTACTTC
AAAAGATTCCACCTCTGCATAAACCCAGAGTGCCGGTTCT**TTCACAAGGATCGCCTCT
CCTCCATAAGCAACCGCTGAATCAATAACATCGATCGCGCTCGAGATAGTCGTGTTCAAC
GACGTCAGAATAACGTTTCTCTTAGCAGCGTCTTTCTGAACAAACGATAGAGACGAGATA
TCAGA
GAA

QA 1 725 1 725
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AATGTAAGGACTTGGATTCTTCAGAACTGTTTTCTTTTGCTCTTGAAGAGCCTATCTCTT
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ATAACGTTTCTCTTAGCAGCGTCTTTCTGAACAAACGATAGAGACGAGATATCAGAGAAC
GGTCCGAACGGTGTCTGTCCAACGCTCCC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 4

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AATCGGGTAAAGCTTCTCCACACTAGCATCAACCCTCTCTAGCTCTTTGAGAATCGTAGT
ACTCCTACCCGAAGACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAAC
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AAACCTCTCGGTGGATCTTGTGCTCTGCTCATTTTGATAGACAGGATTTAAAGTTGTTGG
AAATGAAGAAATCAAACGAGGAGAGTGTGGTGGAAATGACCTTCTAAATTCTAATGCTTC
CC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RR4G730JQ U 1
AF RR4G730TF C 1
AF RR4DG84JQ U 5
AF RR4DG84TF C 434
BS 1 478 RR4G730JQ
BS 479 479 RR4DG84JQ
BS 480 528 RR4G730JQ
BS 529 752 RR4DG84JQ
BS 753 1142 RR4DG84TF

RD RR4G730JQ 529 0 0
GCTCAAACAGAAGTTTTATATATTTTGTATTGATTTCAATCAGTACAGACAAGACCAACA
CACTTAGACCAAACATACAAAAGCTCAACAGATGCACACTTTCAGAGACCTAGACTCTGC
CTTTCTTGTCAGGCTCACACTTGTTTACTCTAACTCCACATTTGCATTGCCAGAGAATGA
GTCACTAGACCTAAGATTACATAGCAACACATCTCTTCCGCTTAAAGTCATTTTGAAGAA
ACTGTCAACTTCCTCTAGTAACTGATCTAACCCTCGAGACAACTTCTCAGCCTGCGTCCC
CAGCTCCATCACATAGTCATTAAAAGTTTCATCTTCAACAGGATCAACACCGTCTTGTAT
AATCGGGTAAAGCTTCTCCACACTAGCATCAACCCTCTCTAGCTCTTTGAGAATCGTAGT
ACTCCTACCCGAAGACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAGC
GAAAGCCTTCCCCCACAGCGGTTTATCAGAGACGGTTAAATCGAAAAG
C

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4G730TF 529 0 0
GCTC
AAACAGAAGTTTTATATATTTTGTATTGATTTCAATCAGTACAGACAAGACCAACACACT
TAGACCAAACATACAAAAGCTCAACAGATGCACACTTTCAGAGACCTAGACTCTGCCTTT
CTTGTCAGGCTCACACTTGTTTACTCTAACTCCACATTTGCATTGCCAGAGAATGAGTCA
CTAGACCTAAGATTACATAGCAACACATCTCTTCCGCTTAAAGTCATTTTGAAGAAACTG
TCAACTTCCTCTAGTAACTGATCTAACCCTCGAGACAACTTCTCAGCCTGCGTCCCCAGC
TCCATCACATAGTCATTAAAAGTTTCATCTTCAACAGGATCAACACCGTCTTGTATAATC
GGGTAAAGCTTCTCCACACTAGCATCAACCCTCTCTAGCTCTTTGAGAATCGTAGTACTC
CTACCCGAAGACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAGCGAAA
GCCTTCCCCCACAGCGGTTTATCAGAGACGGTTAAATCGAAAAG
C

QA 5 528 5 528
DS 

RD RR4DG84JQ 748 0 0
AAACAGAAGTTTTATATATTTTGTATTGATTTCAATCAGTACAGACAAGACCAACACACT
TAGACCAAACATACAAAAGCTCAACAGATGCACACTTTCAGAGACCTAGACTCTGCCTTT
CTTGTCAGGCTTACACTTGTTTACTCTAACTCCACATTTGCATTGCCAGAGAATGAGTCA
CTAGACCTAAGATTACATAGCAACACATCTCTTCCGCTTAAAGTCATTTTGAAGAAACTG
TCAACTTCCTCTAGTAACTGATCTAACCCTCGAGACAACTTCTCAGCCTGCGTCCCCAGC
TCCATCACATAGTCCTTAAAAGTTTCATCTTCAACAGGATCAACACCGTCTTGTATAATC
GGGTAAAGCTTCTCCACACTAGCATCAACCCTCTCTAGCTCTTTGAGAATCGTAGTACTC
CTACCCGAAGACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAACGAAA
GCCTTCCCCCACAGCGGTTTATCAGAGACGGTTAAATCGAAAAGATCGTTGGTGGAATCA
GACCAGGCCGCGGTAAATACACTGCAGATATAAACCGTTTGAACCTTCACACCGTAGAAA
GCTCTCATCAGAACCTTCCCTTTAGGAGAGTTCTTGACCTTAGGCAAGCTCAGAGTCTTC
ACAAGAGAGTCTAGAACCGCACGGCAGTTTCCAACTCTAGCGTTGTTGGCATTAACATGC
TGCCTCCAGCTATCGAGAGAAGACCTAG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DG84TF 709 0 0
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CACAGCGGTTTATCAGAGACGGTTAAATCGAAAAGATCGTTGGTGGAATCAGACCAGGCC
GCGGTAAATACACTGCAGATATAAACCGTTTGAACCTTCACACCGTAGAAAGCTCTCATC
AGAACCTTCCCTTTAGGAGAGTTCTTGACCTTAGGCAAGCTCAGAGTCTTCACAAGAGAG
TCTAGAACCGCACGGCAGTTTCCAACTCTAGCGTTGTTGGCATTAACATGCTGCCTCCAG
CTATCGAGAGAAGACCTAGCCTGGAGATACTTCTCACCAGAACCAGACTGTAAACTATGC
AGCACGCACTTAAGGTAGAGATCTCCTTGGTTGAGACGTCGACCCATTTCTCTTCCCAGT
CGGAGACGGGGAGCTGGAGGTCGGTGATGTCGTCTTTGGACTTAGGCATGAGTTTCTTTA
GCCTCTCTGCTAAAAGTAACTCGAAGTTGTTCAGTAGAGAGAGCAGCCACGGGGATAAAG
CTGAGCCCTTGGGGGATAGGATGCGAAAGGGGTTCCCAAATGGGAAGAAACCTCTCGGTG
GATCTTGTGCTCTGCTCATTTTGATAGACAGGATTTAAAGTTGTTGGAAATGAAGAAATC
AAACGAGGAGAGTGTGGTGGAAATGACCTTCTAAATTCTAATGCTTCCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 3

CO CL3623Contig1 856 3 2 U
CAAAAGAACTATCAATCATACCCACAGTCACCAAATCTGTCTCGGGTAAAACAATCTATG
ATTGTCATTACAAACACCTCATTGTGCTGTAAGAAAATATCAAGAATCAGGTCCAAAACC
AAACCAGTGACAAAGTAAATGAGTCGAAAGTAAAATAATATTTGAAGAAGAGAAACTAAT
AAAAGAACACTCTTCAAACAACCAACAACAAATTGACTGACCACATAAAAAACCATTCCG
TATAAACTGAGTTTCAGGTGTGATAAACGATCTTTGAGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTGCA
TTGGTGTAGGGAGTTTCTAGAACAAGTCGAATTTCTTCTTAAGCAAATCTTGCTTCCAAC
GAGGTAAGTTGTTGAATGCTTCTTTCTCCATCCCAAACACACTCTGGAACTCTTCCTCAG
ATAGATAAGCCTCTCTGCGCTTGTAATCGATTCCAGTCACAGGGTTTTCAGATTTAGCTC
TCAGCTGTTCATAGGTGAAAGTTGCACCACTTGCGTCTATAACAGAATCATCTTGCTCCC
CTGTTTCTTTCTGCTCTGCTTCTGGCTCCTCTGCTGCAGGTGAAACTTCCTCTTCTACCT
TAGTTTCATCACCAGCTTCTTCTGAAGCATCTGCTTCTTCATTCTCATCTGCTGGGTTGG
AGCTAGTGGATCTCCTTGTTGGAGAGGTGTCAGTTGATTTCGGATTCTCAGCAACGAGAA
CTTGCGAGAGAGCAGCCACTGCTGCTGCTCTCTGTGAAGCCTGACTCGTTCCCGCTGGCC
TCGGTGGTGGAGGAGATTTAGTTGATGATGAAGAAGAAGACTGAACGCGGATGTCATGCA
GCTAAGCTTCAGCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV74JQ U 298
AF RR4DN14JQ U 1
AF RR4DN18JQ U 1
BS 1 810 RR4DN14JQ
BS 811 856 RR4DN18JQ

RD RR4FV74JQ 364 0 0
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AACGAGGTAAGTTGTTGAATGCTTCTTTCTCCATCCCAAACACACTCTGGAACTCTTCCT
CAGATAGATAAGCCTCTCTGCGCTTGTAATCGATTCCAGTCACAGGGTTTTCAGATTTAG
CTCTCAGCTGTTCATAGGTGAAAGTTGCAACACTTGCGTCTATAACAGAATCATCTTGCT
CCCCTGTTTCTTTCTGCTCTGCTTCTGGCTCCTCTGCTGCAGGTGAAACTTCCTCTTCTA
CCTTAGTTTCATCACCAGCTTCTTCTGAAGCATCTGCTTCTTCATTCTCATCTGCTGGGT
TGGA

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR4DN14JQ 810 0 0
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ATTGTCATTACAAACACCTCATTGTGCTGTAAGAAAATATCAAGAATCAGGTCCAAAACC
AAACCAGTGACAAAGTAAATGAGTCGAAAGTAAAATAATATTTGAAGAAGAGAAACTAAT
AAAAGAACACTCTTCAAACAACCAACAACAAATTGACTGACCACATAAAAAACCATTCCG
TATAAACTGAGTTTCAGGTGTGATAAACGATCTTTGAGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTGCA
TTGGTGTAGGGAGTTTCTAGAACAAGTCGAATTTCTTCTTAAGCAAATCTTGCTTCCAAC
GAGGTAAGTTGTTGAATGCTTCTTTCTCCATCCCAAACACACTCTGGAACTCTTCCTCAG
ATAGATAAGCCTCTCTGCGCTTGTAATCGATTCCAGTCACAGGGTTTTCAGATTTAGCTC
TCAGCTGTTCATAGGTGAAAGTTGCACCACTTGCGTCTATAACAGAATCATCTTGCTCCC
CTGTTTCTTTCTGCTCTGCTTCTGGCTCCTCTGCTGCAGGTGAAACTTCCTCTTCTACCT
TAGTTTCATCACCAGCTTCTTCTGAAGCATCTGCTTCTTCATTCTCATCTGCTGGGTTGG
AGCTAGTGGATCTCCTTGTTGGAGAGGTGTCAGTTGATTTCGGATTCTCAGCAACGAGAA
CTTGCGAGAGAGCAGCCACTGCTGCTGCTCTCTGTGAAGCCTGACTCGTTCCCGCTGGCC
TCGGTGGTGGAGGAGATTTAGTTGATGATG

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4DN18JQ 856 0 0
CAAAAGAACTATCAATCATACCCACAGTCACCAAATCTGTCTCGGGTAAAACAATCTATG
ATTGTCATTACAAACACCTCATTGTGCTGTAAGAAAATATCAAGAATCAGGTCCAAAACC
AAACCAGTGACAAAGTAAATGAGTCGAAAGTAAAATAATATTTGAAGAAGAGAAACTAAT
AAAAGAACACTCTTCAAACAACCAACAACAAATTGACTGACCACATAAAAAACCATTCCG
TATAAACTGAGTTTCAGGTGTGATAAACGATCTTTGAGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTGCA
TTGGTGTAGGGAGTTTCTAGAACAAGTCGAATTTCTTCTTAAGCAAATCTTGCTTCCAAC
GAGGTAAGTTGTTGAATGCTTCTTTCTCCATCCCAAACACACTCTGGAACTCTTCCTCAA
ATAGATAAGCCTCTCTGCGCTTGTAATCGATTCCAGTCACAGGGTTTTCAAATTTAGCTC
TCAGCTGTTCATAGGTGAAAGTTGCACCACTTGCGTCTATAACAGAATCATCTTGCTCCC
CTGTTTCTTTCTGCTCTGCTTCTGGCTCCTCTGCTGCAGGTGAAACTTCCTCTTCTACCT
TAGTTTCATCACCAGCTTCTTCTGAAGCATCTGCTTCTTCATTCTCATCTGCTGGGTTGG
AGCTAGTGGATCTCCTTGTTGGAGAGGTGTCAGTTGATTTCGGATTCTCAGCAACGAGAA
CTTGCGAGAGAGCAGCCACTGCTGCTGCTCTCTGTGAAGCCTGACTCGTTCCCGCTGGCC
TCGGTGGTGGAGGAGATTTAGTTGATGATGAAGAAGAAGACTGAACGCGGATGTCATGCA
GCTAAGCTTCAGCTCT

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 4

CO CL3624Contig1 1424 4 16 U
GCCATCTATTAGATTAATAGAAGGTTCAAGCATTAACTTACACACAAAATCAGCAAAGGT
ATACTACCTTTCTGAAACCATAAGCCGGCGTAGATACAAGTTACTACCCGGAAACCAAGA
CTGAAGCAGACACTTACCGCAACAAACTAGCTTAAACTAACAGGAACAAGATAGCTAAGC
GCCAAAAAAGAACCAATAATACAATCAAGAAAGGAGAAGCAACCAGCACTTGAAGCAGGA
TTGATCGAAAAAGCATAGCAGGCTCATATTATTGGGGTTGAAGGAGGAACCACGAACAAA
CACCACATTTACCTTTGATTCACCTCAAAGAAGCTAGGAACCATCAAATTCCAACCCGAG
CAGCCAACGAAGATACAGGTTTGGCTATCGACTACTCCAAGACCTCACGCGATTGAGCAT
AAGCTCCACAGTCCCTTACCAAGTAATCCGGAAGAACCCGTCGGTTGCAGACCAAGGGAC
AGCACAACTTCACAACACTGGCACTTCACCCACTGAATCATAAACGAAAGACCGAGGTAA
AACGGCGAGACGAAAGACAACCGCAAAGAGTCACCATACGCTCCAAGGAAGAGGGTTTCA
ACCCGAAGACCACAGAGAAGAACCTAACCGCAGCTCCGAGAGAAGACACCCTCCACACTT
GCCGCAAGACCATACAAACTCCCAGGCGCTTAAGAAATCTGATTCACATATTAGAACTAG
GACCACGAAGATATAAAAGCAGAGCAAAGAAGGCTTTTGATGCATAAACGAAAGGGACGA
GCTGGAGAAACTAGCATAGCGCACCATCACTGACCAACTGGAAACCGACACACCAGGATC
GATGAAAGAATTACCATCCCACATCAGAGCCGGCTTAAACTGCCACCGCGCACCAGAAAA
TTATTACGAGCCTAGCGAGACCTCCCAATCAATCCGATAGAAACACAGACACATACCCTC
ACAACAATGCCTTTCAAAAACAACAGAAGCCCCACAACAGACGTAAGACTTAAATTAAAA
GATCAACCGAAGCTCGACACCAACTTTATGGCCAGAAACGGGAGAAACCAGAAAGTATAC
AACTATAGAGCTTCACCGGAGACGGGATCTACCCATCGCAACCGCACCAAAGCCATCCAG
CCTTATACCGTTCTCCATCTGAACAAAGACAAGCATGAACCAACCATCACTTACCCTAAA
CTCAGATCTGAATCCACAGTGAACAGATGATGTCGGAAGCTTGTGATTGACACCGAAAGG
GACTAAAGACAGATACGACGGGACCGCTCCCGACGGCGGTGAGATCCACCAACCACCGGA
GCAGCAGGCGAACGGAAGGCGACTTCTTTCTTCTTCTAGAGTTTTACCGTCAACGAGCCG
GCACCTTTAAAATCATTTAAAATCATTTTAATTTTTTTTGACTG


BQ
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AF RR4CU86JQ U 1
AF RR4AQ39JQ U 38
AF RR4CU86TF C 686
AF RR4AQ39TF C 763
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BS 869 948 RR4CU86TF
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BS 957 957 RR4AQ39TF
BS 958 1128 RR4CU86TF
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ATACTACCTTTCTGGAACCATAAGCCGGCGTAGATACAAGTTACTACCCGGAAACCAAGA
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GCCGAAAAAGAACCAATAATACAATCAAGAAAGGAGAAGCAACCAGCACTTGAAGCAGGA
TTGATCGAAAAAGCATAGCAGGCTCATATTATTGGGGTTGAAGGAGGAACCACGAACAAA
CACCACATTTACCTTTGATTCACCTCAAAGAAGCTAGGAACCATCAAATTCCAACCCGAG
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AAGCTCCACAGTCCCTTACCAAGTAATCCGGAAGAACCCGTCGGTTGCAGACCAAGGGAC
AGCACAACTTCACAACACTGGCACTTCACCCACTGAATCATAAACGAAAGACCGAGGTAA
AACGGCGAGACGAAAGACAACCGCAAAGAGTCACCATACGCTCCA

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AAGTTACTACCCGGAAACCAAGACTGAAGCAGACACTTACCGCAACAAACTAGCTTAAAC
TAACAGGAACAAGATAGCTAAGCGCCAAAAAAGAACCAATAATACAATCGAGAAAGGAGA
AGCAACCAGCACTTGAAGCAGGATTGATCGAAAAAGCATAGCAGGCTCATATTATTGGGG
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TCATAAACGAAAGACCGAGGTAAAACGGCGAGACGAAAGACAACCGCAAAGAGTCACCAT
ACGCTCCAAGGAAGAGGGTTTCAACCCGAAGACCACAGAGAAGAACCTAACCGCAGCTCC
GAGAGAAGACACCCTCCACACTTGCCGCAAGACCATACAAACTCCCAGGCGCTTAAGAAA
TCTGATTCACATATTAGAACTAGGACCACGAAGATATAAAAGCAGAGCAAAGAAGGCTTT
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AGGGC
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CGGCTTAAACTGCCACCGCGCACCAGAAAATTATTACGAGCCTAGCGAGACCTCCCAATC
AATCCGATAGAAACACAGGCACATACTCTCACAACAATGCCTTTCAAAAACAACAGAAGC
CCCACAACAGACGTAAGACTTAAATTAAAAGATCAACCGAAGCTCGACACCAACTTTATG
GCCAGAAACGGGAGAAACCAGAAAGTATACAACTATAGAGCTTCACCGGAGACGGGATCT
ACCCATCGCAACCGCACCGAAGCCATCCAGCCTTATACCGTTCTCCATCTGAACAAAGAC
AAGCATGAACCAACCATCACTTACCCTAAACTCAGATCTGAATCCACAGTGAACAGATGA
TGTCGGAAGCTTGTGATTGACACCGAAAGGGACTAAAGACAGATACGACGGGACCGCTCC
CGACGGCGGTGAGATCCACCGACCACCGGAG

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DS 

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AACCGACACACCAGGATCGATGAAAGAATTACCATCCCACATCAGAGCCGGCTTAAACTG
CCACCGCGCACCAGAAAATTATTACGAGCCTAGCGAGACCTCCCAATCAATCCGATAGAA
ACACAGACACATGCCCTCACAACAATGCCTTTCAAAAACAACAGAAGCCCCACAACAGAC
GTAAGACTTAAATTAAAAGATCAACCGAAGCTCGACACCAACTTTATGGCCAGAAACGGG
AGAAACCAGAAAGTATACAACTATAGAGCTTCACCGGAGACGGGATCTACCCATCGCAAC
CGCACCAAAGCCATCCAGCCTTATACCGTTCTCCATCTGAACAAAGACAAGCATGAACCA
ACCATCACTTACCCTAAACTCAGATCTGAATCCACAGTGAACAGATGATGTCGGAAGCTT
GTGATTGACACCGAAAGGGACTAAAGACAGATACGACGGGACCGCTCCCGACGGCGGTGA
GATCCACCAACCACCGGAGCAGCAGGCGAACGGAAGGCGACTTCTTTCTTCTTCTAGAGT
TTTACCGTCAACGAGCCGGCACCTTTAAAATCATTTAAAATCATTTTAATTTTTTTTGAC
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL3625Contig1 788 4 10 U
TAGGTGCACTAGCGAACCCCTCGAGATCAGGTGAGGTTCTTGAGATAGTAAAGGGTCTAG
GCATCGACGTTGGTGCGGCTTCTCTCTTTGCGTTCCTCTACTTCCGTGAGAACAAGACCA
AGAACGCTCAAATGGCTAGGCTCTCTAGGGAAGAGAATCTCGCAAAGCTTAAAATGAGGG
TCGAGGAGAATAACAAGGTTATATCCGTAGGTGATCTGAGGGGGATCGCTAGGCTTGTGA
TCTGCGCTGGTCCTGGGGGTTACGTAGAAGAAGCGTTTAAGAGAAGTAAAGAGTTTACTC
AGGGGCTTGTTGAGAGAGGTGTGGTTGTTGTGGCTTATGCTACTGATGGGAACACTCCGG
TTTTGGAGTTTGATGAGACTGATAGTGAGGATGAAGAAGTGAGTCAGAGTAGGAGGAGAT
TGTGGCGTGTGGCTCCAGTTTTTGTTTCGGAATGGGAAAGGTGGTTAGATGAGCAGAAGA
AGCTTGCTGGTGTGTCTTCAGACTCTCCGGTGTATTTGTCATTACGTTTAGACGGGCGTG
TAAGAGGAAGTGGAGTGGGTTATCCTCCATGGCAAGCCTTTGTTGCACAGCTTCCTCCGG
TTAAGGGAATCTGGACCGGTCTTCTTGACGGTATGGATGGTAGAGTGTAAATATTTTCAA
GATTAGGGACCCTTATTGTATACTTTTAAGGGGGAAATGTAAAGTTATGGAAACATTTTT
TAACTTGAAAATTATTATTTTGGTAATTTAATCTGGAAAAAATTATGAAGCGGTATGGTT
GAAGATTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL25TF U 95
AF RR4DD88TF U 47
AF RR4DD88JQ C 208
AF RR4BL25JQ C 1
BS 1 47 RR4BL25JQ
BS 48 101 RR4DD88TF
BS 102 205 RR4BL25TF
BS 206 206 RR4BL25JQ
BS 207 591 RR4DD88TF
BS 592 670 RR4BL25JQ
BS 671 672 RR4DD88JQ
BS 673 713 RR4BL25JQ
BS 714 714 RR4DD88JQ
BS 715 788 RR4BL25JQ

RD RR4BL25TF 112 0 0
CTCTACT
TTCCGTGAGAACAAGACCAAGAACGCTCAAATGGCTAGGCTCTCTAGGGAAGAGAATCTC
GCAAAGCTTAAAATGAGGGTCGAGGAGAATAACAAGGTTATATC
C

QA 8 111 8 111
DS 

RD RR4DD88TF 545 0 0
G
GTAAAGGGTCTAGGCATCGACGTTGGTGCGGCTTCTCTCTTTGCGTTCCTCTACTTCCGT
GAGAACAAGACCAAGAACGCTCAAATGGCTAGGCTCTCTAGGGAAGAGAATCTCGCAAAG
CTTAAGATGAGGGTCGAGGAGAATAACAAGGTTATATCTGTAGGTGATCTGAGGGGGATC
GCTAGGCTTGTGATCTGCGCTGGTCCTGGGGGTTACGTAGAAGAAGCGTTTAAGAGAAGT
AAAGAGTTTACTCAGGGGCTTGTTGAGAGAGGTGTGGTTGTTGTGGCTTATGCTACTGAT
GGGAACACTCCGGTTTTGGAGTTTGATGAGACTGATAGTGAGGATGAAGAAGTGAGTCAG
AGTAGGAGGAGATTGTGGCGTGTGGCTCCAGTTTTTGTTTCGGAATGGGAAAGGTGGTTA
GATGAGCAGAAGAAGCTTGCTGGTGTGTCTTCAGACTCTCCGGTGTATTTGTCATTACGT
TTAGACGGGCGTGTAAGAGGAAGTGGAGTGGGTTATCCTCCATGGCAAGCCTTTGTTGCA
CAGC

QA 2 545 2 545
DS 

RD RR4DD88JQ 547 0 0
TAGGTGATCTGAGGGGGATCGCTAGGCTTGTGATCTGCGCTGGTCCTGGGGGTTACGTAG
AAGAAGCGTTTAAGAGAAGTAAAGAGTTTACTCAGGGGCTTGTTGAGAGAGGTGTGGTTG
TTGTGGCTTATGCTACTGATGGGAACACTCCGGTTTTGGAGTTTGATGAGACTCATAGTG
AGGATGAAGAAGTGAGTCAGAGTAGGAGGAGATTGTGGCGTGTGGCTCCAGTTTTTGTTT
CGGAATGGGAAAGGTGGTTAGATGAGCAGAAGAAGCTTGCTGGTGTGTCTTCAGACTCTC
CGGTGTATTTGTCATTACGTTTAGACGGGCGTGTAAGAGGAAGTGGAGTGGGTTATCCTC
CATGGCAAGCCTTTGTTGCACAGCTTCCTCCGGTTAAGGGAATCTGGACCGGTCTTCTTG
ACGGTATGGATGGTAGAGTGTAAATATTTTCAAGATTAGGGACCCTTATTGTATACTTTT
AAGGGGGAA*TGTAAAGTTATGGAAACATTTTTTAACTTGAAAATTATTATTTTGGTAAT
TTAA
ATC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4BL25JQ 788 0 0
TAGGTGCACTAGCGAACCCCTCGAGATCAGGTGAGGTTCTTGAGATAGTAAAGGGTCTAG
GCATCGACGTTGGTGCGGCTTCTCTCTTTGCGTTCCTCTACTTCCGTGAGAACAAGACCA
AGAACGCTCAAATGGCTAGGCTCTCTAGGGAAGAGAATCTCGCAAAGCTTAAAATGAGGG
TCGAGGAGAATAACAAGGTTATATCCGTAGGTGATCTGAGAGGGATCGCTAGGCTTGTGA
TCTGCGCTGGTCCTGGGGGTTACGTAGAAGAAGCGTTTAAGAGAAGTAAAGAGTTTAGTC
AGGGGCTTGTTGAGAGAGGTGTGGTTGTTGTGGCTTATGCTACTGATGGGAACACTCCGG
TTTTGGAGTTTGATGAGACTGATAGTGAGGATGAAGAAGTGAGTCAGAGTAGGAGGAGAT
TGTGGCGTGTGGCTCCAGTTTTTGTTTCGGAATGGGAAAGGTGGTTAGATGAGCAGAAGA
AGCTTGCTGGTGTGTCTTCAGACTCTCCAGTGTATTTGTCACTACGTTTAGACGGGCGTG
TAAGAGGAAGTGGAGTGGGTTATCCTCCATGGCAAGCCTTTGTTGCACAGCTTCCTCCGG
TTAAGGGAATCTGGACCGGTCTTCTTGACGGTATGGATGGTAGAGTGTAAATATTTTCAA
GATTAGGGACT*TTATTGTATACTTTTAAGGGGGAAATGTAAAGTTATGGAAATATTTTT
TAACTTGAAAATTATTATTTTGGTAATTTAATCTGGAAAAAATTATGAAGCGGTATGGTT
GAAGATTT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL3626Contig1 522 4 2 U
GGGTAGTTCAGCCTAAACCCTAGCTTTGTTCGACTCGAGTCGATAGCAATGGATCAACAG
CCCGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGCGACTGTGGACAGGAGAACACTTTGAAGTCTGGG
GATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGA
GTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACCACAATCCCAAAAGATGATTGCAAGTCTGTTA
AGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTCTAATATAACCTTGACTAGAAAGTCTGTCGTTATT
TTTGCTAAGTGGCTTGTTTTGGTGTGGTTTGATTACAACTGAGCGTGCCTTTGTAATAAT
GGTGCTGTTCGTTTGCTCATCTGGGTGATCCATCTGGGTGAAGATGCAAGTTGATGTTTG
TTTTGTACCTTAAAATGCTACATCCAAATGGATCACCCAACTGCATTTATGAAAACTCAT
CTCAAATTCTCACCCAAATGAGGGTGAGTCTTCACGGAGCAA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR4AY13TF U 1
AF RR4B284JQ C 1
AF RR4B284TF U 1
AF RR4AY13JQ C 85
BS 1 520 RR4AY13TF
BS 521 522 RR4AY13JQ

RD RR4AY13TF 520 0 0
GGGTAGTTCAGCCTAAACCCTAGCTTTGTTCGACTCGAGTCGATAGCAATGGATCAACAG
CCCGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGCGACTGTGGACAGGAGAACACTTTGAAGTCTGGG
GATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGA
GTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACCACAATCCCAAAAGATGATTGCAAGTCTGTTA
AGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTCTAATATAACCTTGACTAGAAAGTCTGTCGTTATT
TTTGCTAAGTGGCTTGTTTTGGTGTGGTTTGATTACAACTGAGCGTGCCTTTGTAATAAT
GGTGCTGTTCGTTTGCTCATCTGGGTGATCCATCTGGGTGAAGATGCAAGTTGATGTTTG
TTTTGTACCTTAAAATGCTACATCCAAATGGATCACCCAACTGCATTTATGAAAACTCAT
CTCAAATTCTCACCCAAATGAGGGTGAGTCTTCACGGAGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4B284JQ 520 0 0
GGGTAGTTCAGCCTAAACCCTAGCTTTGTTCGACTCGAGTCGATAGCAATGGATCAACAG
CCCGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGCGACTGTGGACAGGAGAACACTTTGAAGTCTGGG
GATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGA
GTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACCACAATCCCAAAAGATGATTGCAAGTCTGTTA
AGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTCTAATATAACCTTGACTAGAAAGTCTGTCGTTATT
TTTGCTAAGTGGCTTGTTTTGGTGTGGTTTGATTACAACTGAGCGTGCCTTTGTAATAAT
GGTGCTGTTCGTTTGCTCATCTGGGTGATCCATCTGGGTGAAGATGCAAGTTGATGTTTG
TTTTGTACCTTAAAATGCTACATCCAAATGGATCACCCAACTGCATTTATGAAAACTCAT
CTCAAATTCTCACCCAAATGAGGGTGAGTCTTCACGGAGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4B284TF 520 0 0
GGGTAGTTCAGCCTAAACCCTAGCTTTGTTCGACTCGAGTCGATAGCAATGGATCAACAG
CCCGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGCGACTGTGGACAGGAGAACACTTTGAAGTCTGGG
GATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGA
GTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACCACAATCCCAAAAGATGATTGCAAGTCTGTTA
AGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTCTAATATAACCTTGACTAGAAAGTCTGTCGTTATT
TTTGCTAAGTGGCTTGTTTTGGTGTGGTTTGATTACAACTGAGCGTGCCTTTGTAATAAT
GGTGCTGTTCGTTTGCTCATCTGGGTGATCCATCTGGGTGAAGATGCAAGTTGATGTTTG
TTTTGTACCTTAAAATGCTACATCCAAATGGATCACCCAACTGCATTTATGAAAACTCAT
CTCAAATTCTCACCCAAATGAGGGTGAGTCTTCACGGAGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4AY13JQ 438 0 0
GGCGACTGTGGACAGGAGAACACTTTGAAGTCTGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGT
GGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGA
GAACCACAATCCCAAAAGATGATTGCAAGTCTGTTAAGATGACTCTTTCCTGCCTATGTT
TCTAATATAACCTTGACTAGAAAGTCTGTCGTTATTTTTGCTAAGTGGCTTGTTTTGGTG
TGGTTTGATTACAACTGAGCGTGCCTTTGTAATAATGGTGCTGTTCGTTTGCTCATCTGG
GTGATCCATCTGGGTGAAGATGCAAGTTGATGTTTGTTTTGTACCTTAAAATGCTACATC
CAAATGGATCACCCAACTGCATTTATGAAAACTCATCTCAAATTCTCACCCAAATGAGGG
TGAGTCTTCACGGAGCAA

QA 1 438 1 438
DS 



AS 2 4

CO CL3627Contig1 346 2 2 U
GGGATGTGTTTGCTGAGATTCTGGAGAAGACTCACGTGGTTACAACTCCAGGGAGCGGGT
TTGGACCTGGAGGTGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGCGCCTTTGGTCACAGAGAGAACATCT
TGGAGGCATGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAATGAAGGAGAGTCTTGTAACCATTCA
TCTATCTTTATCCTCTATAATGACTTGGACTAGGATTAAAATAATGTCGTCTCCTTTGTG
TTTTCTTGAATTGCAGACAACAAAGTAACAAATGTTTCAATCAGTTGCGAAAGAAATAAT
TCTAGTCATGTTTTAAATTGGTATGAAAAGGATATTTTCGTAGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C109TF U 1
AF RR4C178TF U 1
BS 1 278 RR4C109TF
BS 279 346 RR4C178TF

RD RR4C109TF 278 0 0
GGGATGTGTTTGCTGAGATTCTGGAGAAGACTCACGTGGTTACAACTCCAGGGAGCGGGT
TTGGACCTGGAGGTGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGCGCCTTTGGTCACAGAGAGAACATCT
TGGAGGCATGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAATGAAGGAGAGTCTTGTAACCATTCA
TCTATCTTTATCCTCTATAATGACTTGGACTAGGATTAAAATAATGTCGTCTCCTTTGTG
TTTTCTTGAATTGCAGACAACAAAGTAACAAATGTTTC

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR4C178TF 346 0 0
GGGATGTGTTTGCTGAGATTCTGGAGAAGACTCACGTGGTTACAACTCCAGGGAGCGGGT
TTGGACCTGGAGGTGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGCGCCTTTGGTCACAGAGAGAACATCT
TGGAGGCATGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAATGAAGGAGAGTCTTGTAACCATTCA
TCTATCTTTATCCTCTATAATGACTTGGACTAGGATTAAAATAATGTCGTCTCCTTTGTG
TTTTCTTGAATTGCAGACAACAAAGTAACAAATGTTTCAATCAGTTGCGAAAGAAATAAT
TCTAGTCATGTTTTAAATTGGTATGAAAAGGATATTTTCGTAGTTT

QA 1 346 1 346
DS 



CO CL3627Contig2 757 2 3 U
GGCGCTGCTGCAACGAGGGATCAACTGACTCAGTTAGTACAGTTTGCAAAGAAGAATGGA
TCAATCATAGTGTATGATTCCGCATATGCAATGTACATGTCTGATGATAACCCACGCTCC
ATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGGAGAGGTCGCTATGGAGACAGCTTCCTTCAGTAAATAC
GCTGGTTTCACTGGAGTTAGACTTGGTTGGACAGTCATCCCGAAAAAGCTGCTCTATTCA
GACGGCTTCCCTGTTGCAAAAGACTTCAATCGAATTGTCTGCACTTGTTTCAACGGTGCC
TCCAATCTCTCTCAAGCTGGTGCTCTTGCTTGCCTCACACCAGAAGGACTTGAGGCAATG
CACAAGGTGGTTGGGTTCTACAAAGAGGACACAAACATAATCATAGACACATTCACTTCT
CTCGGATATGATGTGTATGGAGGAAAGAATGCGCCTTACGTTTGGGTTCACTTCCCGAAG
CAAAGCTCGTGGGATGTGTTTGCTGAGATTCTGGAGAAGACTCACGTGGTTACAACGCCA
GGGAGCGGGTTTGGACCTGGAGGTGAAGGGTTTTGTTCGTGTTAGCGCATTTGGTCACAG
AGAGAACATCTTGGAGGCATGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAATGAAGGAGATTCTT
GTAATCATTCATCTATCTTTGTCCTCTTTAATGACTTGAACTTGAATTGAAATAATATCG
TCTCCTTTGTTATTTCTTGAATTGCAGACAACAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU94TF U 522
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BS 1 521 RR4CU94JQ
BS 522 654 RR4CU94TF
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RD RR4CU94TF 133 0 0
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ACAAATGAAGGAG

QA 1 133 1 133
DS 

RD RR4CU94JQ 757 0 0
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TCAATCATAGTGTATGATTCCGCATATGCAATGTACATGTCTGATGATAACCCACGCTCC
ATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGGAGAGGTCGCTATGGAGACAGCTTCCTTCAGTAAATAC
GCTGGTTTCACTGGAGTTAGACTTGGTTGGACAGTCATCCCGAAAAAGCTGCTCTATTCA
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TCCAATCTCTCTCAAGCTGGTGCTCTTGCTTGCCTCACACCAGAAGGACTTGAGGCAATG
CACAAGGTGGTTGGGTTCTACAAAGAGGACACAAACATAATCATAGACACATTCACTTCT
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TCTCCTTTGTTATTTCTTGAATTGCAGACAACAAAGT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 4

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AAAATCAAATTTCTTATGATACCTTAAAAGATAAAACAAAAATCTTAGAAAACACGGGTG
GGTGGACTCATTGTGCTCTTCAAGTACAAGCACCTCACACCTTGCCAGTTTTTCTTCAAG
AGGGAAACAAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGGAAGATCTGCTTCTCCTCCATG
CCGAGATTTCCAACAGCGACACCCATGCAAAGAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTT
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TTTCCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACGGGGAATCTGCTTGATGACCGATTCA
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AGCTTCTTAAGAGCTTCCACATCCATAGACTCTAACCCAATCTTCTCAGCCTCTTCAACG
TGCTGGGCGTCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTTAGGCCTAGGAATGTGAGGCAACTTA
ACGGAACCGCTAAACCTCTTGTCCTTTTGAGGGTCATAGTTCTTAAGACCAATCTGGAGC
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ATCGCCTCTCTCACTGCTTCACTCTGGAGCTTACTCATTTTGGCACTTCCTCTATTCTCT
CCTTTGTGATAGATCGGAGACAGAGAGAGAGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EA29JQ U 1
AF RR4AB87JQ U 16
AF RR4AB87TF C 19
AF RR4EA29TF C 106
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RD RR4EA29JQ 697 0 0
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AGCTTCTTAAGTGCTTCCACATCCATAGACTCTAACCCAATCTTCTCAGCCTCTTCAACG
TGCTGGGCGTCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTTAGGCCTAGGAATGTGAGGCAACTTG
ACGGAACCGCTAAACCTCTTGTCCTTTTGAGGGTCAT

QA 1 697 1 697
DS 

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GCG
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TCACTCTGGAGCTTACTCATTTTGGCACTTCCT

QA 4 816 4 816
DS 

RD RR4AB87TF 858 0 0
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ATACGTTAAAAGATAAAACAAAAATCTTAGAAAACACGGGTGGGTGGACTCATTGTGCTC
TTCAAGTACAAGCACCTCACACTTTGCCAGTTTTTCTTCAAGAGGGAAACAAGGAAGTTG
ACGCTCATCTGAACATTCTGGAAGATCTGCTTCTCCTCCATGCCGAGATTTCCAACAGCG
ACACCCATGCAAAGAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCCTTTGTCTCATTCACT
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CCAGGACCAAGAAGACGGGGAATCTGCTTGATGACCGATTCAGAAGCAAGGAGAGCATGG
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ACATCCATAGACTCTAACCCAATTTTCTCAGCCTCTTCAACGTGCTGGGCGTCACCGAGC
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TTGTCCTTTTGAGGGTCATAGTTCTTAAGACCAATCTGGAGCTCGATTGTCTCGGTGAAC
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GACAGAGAGAGAGAACCC

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR4EA29TF 758 0 0
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TAGAAAACACGGGTGGGTGGACTCATTGTGCTCTTCAAGTACAAGCACCTCACATCTTGC
CAGTTTT*CTTCAAGAGGGAAACAAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGGAAGATC
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ACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACGGGGAATCTGC
TTGATGACCGATTCAGAAGCAAGGAAAGCATGGAACTTCTTAGCTAGCTTCTTAACAAGC
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AGACCAATCTGGAGCTCGATTGTCTCGGTGAACTTGCGAGGCTTTGTCTCCTTGCAGTGA
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CTTCCTCTATTCTCTCCTTTGTGATAGATCGGAGAC
CC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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CCACCATGGACCAGTCCCCACGACCTTCATAACCAAAGGAAGGACTCGTAGTACCATTCC
ACACCTCCAAGTGGACTTCAACACCTACAGCTGGAGCACCACGTGAGACGTCTAAAACAT
GAGTGGTGATGGGTGGCCTACTTCTCTTGGGAGGAGCTTCTGCAACATTCAAATGTCCTC
CTATGATTCTCAGACGATCTAGAGGTTTAGTGGACTCAGTTTGTGAAACACCTTTGGCCT
TCTCGGAGAAGAGCTTTGCCATCCGGAGCTCAGTTATTTTCATCTGCTCCTTAGCAGCAA
TCTCGAGCTCCACTATTGGTCTGTTTGCATACCTTCCCTTTAACTCGGCGAGCATCTCGG
CGTGAGTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW68JQ U 60
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AAAAAGCCCCCTGGGCAATACTTCCCAGTGTTGAAGCTTATCCTATACGTCCCTGGCTTC
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TG

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DS 

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AGCTCTAGCTCTAGCTCCCACGGTATGTGGTGAAAGAAAAGGGTGAAAGTAACAGCGGGA
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AGAAGCCTCCTGGGCAATACTTCCCAGTGTTGAAGCTTATCCTATACGTCCCTGGCTTCA
AAGCCTCGACCAAATCCATCAGTGGCCCGCTACGCCCATCTTTATCAGTAGCTGAAGTTC
CCACCATGGACCAGTCCCCACGACCTTCATAACCAAAGGAAGGACTCGTAGTACCATTCC
ACACCTCCAAGTGGACTTCAACACCTACAGCTGGAGCACCACGTGAGACGTCTAAGACAT
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CTATGATTCTCAGACGATCTAGAGGTTTAGTGGACTCAGTTTGTGAAACACCTTTGGCCT
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TCTCGAGCTCCACTATTGGTCTGTTTGCATACCTTCCCTTTAACTCGGCGAGCATCTCGG
CGTGAGTCCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL3630Contig1 1249 3 27 U
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CGGATCCAAACAAGTTGAAATAGGGACGAAACTGTCTGAGGACAGCAGAAAATATGGTTC
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GCAGCCACCTCCATACAATATGCCGCCACCTCCATCATATGAGGAAGCGAATGGAGTGTT
TGCATCTCACATGCATGACACGTCAACAGATAGCATGGGTTACTTCTTAGGAGAGGTCTT
GTTCCCATATCACGGTGTGACAGATGTCGAGCTGAGCTTAACAGCTGGTGGATACGTTGT
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CTTCTGAGAAATTGGAAGTAAAACTTTGTGGTTCCCTTTGCTGGTTTGCTTCTGTAGAAG
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GATAGTGATGCCACCTGAGGGAGAGTTCAATTTTATGTATTTATTTCGATATTGGATTTG
GATCTTGTCTTTTGCATTTGATGTTAATGCCTAATCTCAATTTATATCC


BQ
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AF RR4C076TF U 1
AF RR4EE81TF U 93
AF RR4EE81JQ C 587
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BS 757 766 RR4EE81TF
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TGAGCCATTACGGGCAATGGTCATGGGAGCTCCGCTGGAGGATGCTAGACATCTTGCACA
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AGCGAAACTTCAAGACTTAAAATCAAATATGACAACACTGGGGAAGGAAGCCGCTTCTGC
TTTATCTTCCGTTGAGGATCAACAACAAAAATTGACTCTTGAACGACTTATATCAATGGT
TGAATCCGAACGTGCCTACCATCAAAGGGTCCTCCAAATACTTGATCAGCTCGAAGGAGA
GATGGTATCTGAGAGGCAACGTATTGAAGCCCCCACTACTCCCTCAAGTGCAGACAATAT
GCCGCCACCTCCATACAATATGCCGCCACCTCCATCATATGAG**AGCAAATGGAGTGTT
TGCATCTCATATGCATGACACGTCA*CAGATAGCAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4EE81TF 674 0 0
G
GTCTGAGGATAGCAGGAAATATGGTTCTGAAAACACGTGTACAAATGGTAACGTCTTGAC
TAAGGCTGCACTGAGCTTTGGCCGTGCTCGTGCACAGATGGAGAAAGAGCGTGGAAATAT
GTTGAAGGCTCTTGGCACACAGGTTGCTGAGCCATTACGGGCAATGGTCATGGGAGCTCC
ACTATAGGATGCTAGACATCTTGCACAACGTTATGATAGAATTCGCCAAGAAGCTGAAGC
TCAGGCTACAGAAGTTGCCAGACGCCAAGCGAAGGCGAGAGAGTCTAACGGCCATCCTGA
CATCTTGACGAAACTGGAATCTGCTGAAGCGAAACTTCAAGACCTAAAATCAAATATGAC
AACACTGGGGAAGGAAGCCGCTTCTGCTTTATCTTCCGTTGAGGATCAACAACAAAAATT
GACTCTTGAACGACTTATATCAATGGTTGAATCTGAGCGTGCCTACCATCAAAGAGTCCT
CCAAATACTTGATCAGCTCGAAGGAGAGATGGTATCTGAGAGGCAACGTATTGAAGCCCC
CACAACTCCCTCAAGTGCAGACAATATGCAGCCACCTCCATACAATATGCCGCCACCTCC
ATCATATGAGGAAGCGAATGGAGTGTTTGCATCTCACATGCATGACACGTCAACAGATAG
CATGGGTTACTTC

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR4EE81JQ 663 0 0
CAGCTCGAAGGAGAGATGGTATCTGAGAGGCAACGTATTGAAGCCCCCACAACTCCCTCA
AGTGCAGACAATATGCAGCCACCTCCATACAATATGCCGCCACCTCCATCATATGAGGAA
GCGAATGGAGTGTTTGCATCTCACATGCATGACACGTCAACAGATAGCATGGGTTACTTC
TTAGGAGAGGTCTTGTTCCCATATCACGGTGTGACAGATGTCGAGCTGAGCTTAACAGCT
GGTGGATACGTTGTTGTTAGAAAGGTTACTGGTAGCGGATGGGCGGAAGGTGAATGCAAA
GGCAAAGCCGGTTGGTTTCCTTATGAGTACATTGAAAGGAGGGAACGAGTTCTTGCTAGC
AAAGTCTCTGAAGTCTTCTGAGAAATTGGAAGTAAAACTTTGTGGTTCCCTTTGCTGGTT
TGCTTCTGTAGAAGAGATGTGTGTTCTGTAGAAAGAAAAATAAAAAGAGAAGAAAAGATT
CACCGGGCAAAACAGAAGTCCATGTTTATGAGATGATAAAGAGCTGATGCAGGTTTCTGT
GATTTTTTGAATTTGATAGTGATGCCACCTGAGGGAGAGTTCAATTTTATGTATTTATTT
CGATATTGGATTTGGATCTTGTCTTTTGCATTTGATGTTAATGCCTAATCTCAATTTATA
TCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 3

CO CL3631Contig1 760 3 13 U
TTTTTAAGTTCTCTCAGTCAAACTAACTTCTTCAACAACAGCAACTCTCTGCAAAATAAA
ATTCTGAAGTTGAACCCTGTCCATTACTTTTTTTCTTTCTCTTGAATCTCCTTATCATGG
CTTCTGATTCTCAGACCGCAACTGCAACTACATCTGAAAAGCCACTGGATAACAAGGTCG
ACGAGGAGGCTAAGTTGATGGAAAAAGAGATTGTTTTGGAGGAAACTGTGGATGTTGTGA
AGGATAATAAACCGGTTTCAGATTCAAGCCTGAGTGTTACTAAGGAGGAGAGCCTTGATC
AAACTCCTGGTGGTGAGCCGGAGAAGGAACCACATGCAGATGTGGAAGAGGTTGTAGCAG
TTGTGAAAGCAGAGGAATCTACAGA**AGGTGGCAGATGTAAATGGTGAGAAGAAGGTGG
AACTTGAAGAACCAACCCCTGTGAAACAGAGTGTTGAAGAAGTTATTGTTGAAGCTGCTG
ATGCAGAGAAAGAAGAAGGGAAAGGAAAAGAAGAAAATGGTGAGGATAAGGCAGGTGAAC
AAGTGGAACTTAAAGAACCAGTCCCTGTGAGTGTTGAAGAAGTTAGTCTTGAAGTTGCTG
ATGCAGAGAAAGCAAAAGGGAAAGGAAAGATGAAGATGGTGAGGAGAAGTAGCTGACAAG
TAGAGCTTAAGAACCAAGCCTTGTGAAAGCAGAGAGAAGCAACGTTGAAAGTGTAGCTGA
GAGACAGAAGATAGAGAGACAAGTGGTTGATGTTTCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI17JQ C 35
AF RR4DI17TF U 35
AF RR4DX28TF U 1
BS 1 109 RR4DX28TF
BS 110 110 RR4DI17TF
BS 111 385 RR4DX28TF
BS 386 387 RR4DI17TF
BS 388 495 RR4DX28TF
BS 496 496 RR4DI17TF
BS 497 553 RR4DX28TF
BS 554 554 RR4DI17TF
BS 555 563 RR4DX28TF
BS 564 564 RR4DI17TF
BS 565 583 RR4DX28TF
BS 584 584 RR4DI17TF
BS 585 760 RR4DX28TF

RD RR4DI17JQ 579 0 0
GG
AACAGCAACTCTCTGCAAAATAAAATTCTGAAGTTGAACCCTGTCCATTACTTTTTTTCT
TTCTCTTGAATCTCCTTATCATGGCTTCTGATTCTCAGACCGCAACTGCAACTACATCTG
AAAAGCCACTGGATAACAAGGTCGACGAGGAGGCTAAGTTGATGGAAAAAGAGATTGTTT
TGGAGGAAACTGTGGATGTTGTGAAGGATAATAAACCGGTTTCAGATTCAAGCCTGAGTG
TTACTAAGGAGGAGAGCCTTGATCAAACTCCTGGTGGTGAGCCGGAGAAGGAACCACATG
CAGATGTGGAAGAGGTTGTAGCAGTTGTGAAAGCAGAGGAATCTACAGA**AGGTGGCAG
ATGTAAATGGTGAGAAGAAGGTGGAACTTGAAGAACCAACCCCTGTGAAACAGAGTGTTG
AAGAAGTTATTGTTGAAGCTGCTGATGCAGAGAAAGAAGAAGGGAAAGGAAAAGAAGAAA
ATGGTGAGGATAAGGCAGGTGAACAAGTGGAACTTAAAGAACCAGTCCCTGTGAGTGTTG
AAGAAGTTAGTCTTGAAGTTGCTGATGCAGAGAAAGC

QA 3 579 3 579
DS 

RD RR4DI17TF 579 0 0
GG
AACAGCAACTCTCTGCAAAATAAAATTCTGAAGTTGAACCCTGTCCATTACTTTTTTTCT
TTCTCTTGAATCTCCTTATCATGGCTTCTGATTCTCAGACCGCAACTGCAACTACATCTG
AAAAGCCACTGGATAACAAGGTCGACGAGGAGGCTAAGTTGATGGAAAAAGAGATTGTTT
TGGAGGAAACTGTGGATGTTGTGAAGGATAATAAACCGGTTTCAGATTCAAGCCTGAGTG
TTACTAAGGAGGAGAGCCTTGATCAAACTCCTGGTGGTGAGCCGGAGAAGGAACCACATG
CAGATGTGGAAGAGGTTGTAGCAGTTGTGAAAGCAGAGGAATCTACAGA**AGGTGGCAG
ATGTAAATGGTGAGAAGAAGGTGGAACTTGAAGAACCAACCCCTGTGAAACAGAGTGTTG
AAGAAGTTATTGTTGAAGCTGCTGATGCAGAGAAAGAAGAAGGGAAAGGAAAAGAAGAAA
ATGGTGAGGATAAGGCAGGTGAACAAGTGGAACTTAAAGAACCAGTCCCTGTGAGTGTTG
AAGAAGTTAGTCTTGAAGTTGCTGATGCAGAGAAAGC

QA 3 579 3 579
DS 

RD RR4DX28TF 760 0 0
TTTTTAAGTTCTCTCAGTCAAACTAACTTCTTCAACAACAGCAACTCTCTGCAAAATAAA
ATTCTGAAGTTGAACCCTGTCCATTACTTTTTTTCTTTCTCTTGAATCTTCTTATCATGG
CTTCTGATTCTCAGACCGCAACTGCAACTACATCTGAAAAGCCACTGGATAACAAGGTCG
ACGAGGAGGCTAAGTTGATGGAAAAAGAGATTGTTTTGGAGGAAACTGTGGATGTTGTGA
AGGATAATAAACCGGTTTCAGATTCAAGCCTGAGTGTTACTAAGGAGGAGAGCCTTGATC
AAACTCCTGGTGGTGAGCCGGAGAAGGAACCACATGCAGATGTGGAAGAGGTTGTAGCAG
TTGTGAAAGCAGAGGAATCTACAGAGAAGGTGGCAGATGTAAATGGTGAGAAGAAGGTGG
AACTTGAAGAACCAACCCCTGTGAAACAGAGTGTTGAAGAAGTTATTGTTGAAGCTGCTG
ATGCAGAGAAAGAAGGAGGGAAAGGAAAAGAAGAAAATGGTGAGGATAAGGCAGGTGAAC
AAGTGGAACTTAA*GAACCAGTCTCTGTGAGTGTTGAAGAAGT*AGTCTTGAAGTTGCTG
ATGCAGAGAAAGCAAAAGGGAAAGGAAAGATGAAGATGGTGAGGAGAAGTAGCTGACAAG
TAGAGCTTAAGAACCAAGCCTTGTGAAAGCAGAGAGAAGCAACGTTGAAAGTGTAGCTGA
GAGACAGAAGATAGAGAGACAAGTGGTTGATGTTTCTGAT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL3632Contig1 756 3 6 U
GGAAGTCCACTCTCTCTCACGAACAACAAAAGGAGCAGCAGATAGCGAGAAATCAAAAAG
GCTAATAATGGATGCTAAGATCGGAAAATTCTTTGACTCCGTCGGTTCTTTCTTCAGCGG
CGGCGATAAGATCCCTTGGTCCGAGGGAGATGTCATCGCTGGATGTGAAAGAGAGGTTCG
AGAGACCACAAACTCTGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCGTG
GGCTCTTGTTCATTCCCATCAACAGTATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAAGC
ATCTCTTGCGAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAGCTTTATCTTCTTGCTGT
TGGTTACTACAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTTGTCGACCGCTGCGTCCA
GATGCAACCCGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATCAC
TAAGGATGGAGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGCCGTAGGTCTCAT
AGCCGGTGGTATTGTAGCGGCGCTGGCTCGCAAGAAATGAACACGATGATCCTTTTAACT
TGTTAAGCTTGTTTGTGCATACAATAGCAGCAAGATGCTCTCTTTTAGTTTCTCTTTGTT
GAGAAAACTTTGTTTCCCTCTGCCTGCTTCTTGACATTTTGAATAACCAAGTTTTGTGAT
GCATAAAAAAAAGCTTGAGTTGGATTTTTCATCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GK89TF U 1
AF RR4E377JQ C 182
AF RR4E377TF U 182
BS 1 399 RR4GK89TF
BS 400 400 RR4E377TF
BS 401 415 RR4GK89TF
BS 416 416 RR4E377TF
BS 417 726 RR4GK89TF
BS 727 756 RR4E377TF

RD RR4GK89TF 726 0 0
GGAAGTCCACTCTCTCTCACGAACAACAAAAGGAGCAGCAGATAGCGAGAAATCAAAAAG
GCTAATAATGGATGCTAAGATCGGAAAATTCTTTGACTCCGTCGGTTCTTTCTTCAGCGG
CGGCGATAAGATCCCTTGGTCCGAGGGAGATGTCATCGCTGGATGTGAAAGAGAGGTTCG
AGAGACCACAAACTCTGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCGTG
GGCTCTTGTTCATTCCCATCAACAGTATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAAGC
ATCTCTTGCGAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAGCTTTATCTTCTTGCTGT
TGGTTACTACAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCATCTTGTCGACCGCTGCATCCA
GATGCAACCCGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATCAC
TAAGGATGGAGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGCCGTAGGTCTCAT
AGCCGGTGGTATTGTAGCGGCGCTGGCTCGCAAGAAATGAACACGATGATCCTTTTAACT
TGTTAAGCTTGTTTGTGCATACAATAGCAGCAAGATGCTCTCTTTTAGTTTCTCTTTGTT
GAGAAAACTTTGTTTCCCTCTGCCTGCTTCTTGACATTTTGAATAACCAAGTTTTGTGAT
GCATAA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4E377JQ 575 0 0
GAGACCACAAACTCTGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCGTGG
GCTCTTGTTCATTCCCATCAACAGTATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAAGCA
TCTCTTGCGAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAGCTTTATCTTCTTGCTGTT
GGTTACTACAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTTGTCGACCGCTGCGTCCAG
ATGCAACCCGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATCACT
AAGGATGGAGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGCCGTAGGTCTCATA
GCCGGTGGTATTGTAGCGGCGCTGGCTCGCAAGAAATGAACACGATGATCCTTTTAACTT
GTTAAGCTTGTTTGTGCATACAATAGCAGCAAGATGCTCTCTTTTAGTTTCTCTTTGTTG
AGAAAACTTTGTTTCCCTCTGCCTGCTTCTTGACATTTTGAATAACCAAGTTTTGTGATG
CATAAAAAAAAGCTTGAGTTGGATTTTTCATCTCT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4E377TF 575 0 0
GAGACCACAAACTCTGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCGTGG
GCTCTTGTTCATTCCCATCAACAGTATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAAGCA
TCTCTTGCGAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAGCTTTATCTTCTTGCTGTT
GGTTACTACAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTTGTCGACCGCTGCGTCCAG
ATGCAACCCGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATCACT
AAGGATGGAGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGCCGTAGGTCTCATA
GCCGGTGGTATTGTAGCGGCGCTGGCTCGCAAGAAATGAACACGATGATCCTTTTAACTT
GTTAAGCTTGTTTGTGCATACAATAGCAGCAAGATGCTCTCTTTTAGTTTCTCTTTGTTG
AGAAAACTTTGTTTCCCTCTGCCTGCTTCTTGACATTTTGAATAACCAAGTTTTGTGATG
CATAAAAAAAAGCTTGAGTTGGATTTTTCATCTCT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3634Contig1 420 3 3 U
CACCAATAGAAAAGCATCCTAATAACTCAAGATCATAAACCAAAACATGAGGCAAAATTA
TCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAGAGATTCAAAAACAAGGTAAAAA
AAAATTAAAAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCAA
AGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTTGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGCA
CCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCATG
TCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAGAAAGTCTCGACAACCATGGGC
TTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CT20JQ U 1
AF RR4CP96JQ U 49
AF RR4CP96TF C 49
BS 1 338 RR4CT20JQ
BS 339 339 RR4CP96JQ
BS 340 420 RR4CT20JQ

RD RR4CT20JQ 420 0 0
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TCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAGAGATTCAAAAACAAGGTAAAAA
AAAATTAAAAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCAA
AGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTTGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGCA
CCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCATG
TCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAAAAAGTCTCGACAACCATGGGC
TTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTTC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4CP96JQ 352 0 0
GAGGCAAAATTATCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAAAGATTCAAAA
ACAAGGTAAAAAAAAATTAAAAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCA
AAGAAAAACCAAAGACGAAAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTTGACTGCGGCCTTG
GTGACCTTAGCACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACC
GTCTGCCTCATGTCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGGGGGTACTCGGAGAAAGTCTCG
ACAACCATGGGCTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCAC
CATTCC

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR4CP96TF 346 0 0
GAGGCAAAATTATCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAGAGATTCAAAA
ACAAGGTAGAAGAAAATTAAGAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCA
AAGAAAAACCAAAGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTTGACTGCGGCCTTG
GTGACCTTAGCACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACC
GTCTGCCTCATGTCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAGAAAGTCTCG
ACAACCATGGGCTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCAC

QA 1 346 1 346
DS 



AS 1 2

CO CL3635Contig1 954 2 2 U
GTACGGCCGGGGGGGGATGGAGAGGAATCGGTTCATCGTGCGTCTATCAGAGAATCTCGT
GTTCTGAGTCCTCTCCGGGGAGATGCTCGTCGAGCCGTCCTTTGACCCTACGAAGAACAA
GGACCACGAGTGGAGATACGCGACGCGACGGTGAAGTTGGGAGAAGTCAGCGTGGAGAAG
CCGACCTTGTACTCTGATGATAAAGGAGCTTTGTGTTTCTCCCCAGGCCTTCAGGACATT
GACTTACTCCGGGAGGATGAAAGTTAATGTCGATGTTGAGGTGTTCGTTAAGAAAGTGTT
TAAAAGAGACAAGTTCAAGACGGGACAAGACGAGTATGTCGAGAGGCAGATCCTCTCTAA
GAAGACGCAGGACATCCCTATTGGTAGGATACCCGTGATGGTGAGGTCTCTGCTTTGCAA
CTCAACGGAAGACACTCAGGTCACAAACGAAGAGTCTGTGGAAGTTGGAAACCAGCCAAA
TGATCTAAGCCTTGCCCCACTCTCACCTGGAGTCAGGAGTTGTGTTCCTCCCTCCGTGGT
GAGAAAGTAGTGTCAACCATCAACCTTGGCTTCACCGTCACTGCTTTGGCCGTAACACCT
CATGGAACCGAAGCTATTAGACACAATACTCTCTGTTGAGTCTTATATTTATGGCTTATC
AGATTACTGATAGAGACGTGGAGTTGAGATTGTGGCTTCTCTTCTTTGCTCAGTGATGGC
GATGGTGATGGTGATGGTGATGGCGATGGTGAAGGTGAAGGCAAATTACCATCATTTGAG
TCCATTGTCAATGGGGAAGATGAAGATTGATTGGATGTTTTGCTTTACTTCAATTTGGTG
TTTTGCTTTATTTGGATTTAGAGTTTTATCTTAGTTGGATTTGGTGTTTTGCTTTGTTCA
ATTTACACATTGCTTGTTAGAGATGCTTGAATACTATCATTTGAAGTTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC86TF U 1
AF RR4DC86JQ C 409
BS 1 717 RR4DC86TF
BS 718 954 RR4DC86JQ

RD RR4DC86TF 719 0 0
GTACGGCCGGGGGGGGATGGAGAGGAATCGGTTCATCGTGCGTCTATCAGAGAATCTCGT
GTTCTGAGTCCTCTCCGGGGAGATGCTCGTCGAGCCGTCCTTTGACCCTACGAAGAACAA
GGACCACGAGTGGAGATACGCGACGCGACGGTGAAGTTGGGAGAAGTCAGCGTGGAGAAG
CCGACCTTGTACTCTGATGATAAAGGAGCTTTGTGTTTCTCCCCAGGCCTTCAGGACATT
GACTTACTCCGGGAGGATGAAAGTTAATGTCGATGTTGAGGTGTTCGTTAAGAAAGTGTT
TAAAAGAGACAAGTTCAAGACGGGACAAGACGAGTATGTCGAGAGGCAGATCCTCTCTAA
GAAGACGCAGGACATCCCTATTGGTAGGATACCCGTGATGGTGAGGTCTCTGCTTTGCAA
CTCAACGGAAGACACTCAGGTCACAAACGAAGAGTCTGTGGAAGTTGGAAACCAGCCAAA
TGATCTAAGCCTTGCCCCACTCTCACCTGGAGTCAGGAGTTGTGTTCCTCCCTCCGTGGT
GAGAAAGTAGTGTCAACCATCAACCTTGGCTTCACCGTCACTGCTTTGGCCGTAACACCT
CATGGAACCGAAGCTATTAGACACAATACTCTCTGTTGAGTCTTATATTTATGGCTTATC
AGATTACTGATAGAGACGTGGAGTTGAGATTGTGGCTTCTCTTCTTTGCTCAGTGAT
GG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4DC86JQ 546 0 0
TCTGCTTTGCAACTCAACGGAAGACACTCAGGTCACAAACGAAGAGTCTGTGGAAGTTGG
AAACCAGCCAAATGATCTAAGCCTTGCCCCACTCTCACCTGGAGTCAGGAGTTGTGTTCC
TCCCTCCGTGGTGAGAAAGTAGTGTCAACCATCAACCTTGGCTTCACCGTCACTGCTTTG
GCCGTAACACCTCATGGAACCGAAGCTATTAGACACAATACTCTCTGTTGAGTCTTATAT
TTATGGCTTATCAGATTACTGATAGAGACGTGGAGTTGAGATTGTGGCTTCTCTTCTTTG
CTCAGTGATGGCGATGGTGATGGTGATGGTGATGGCGATGGTGAAGGTGAAGGCAAATTA
CCATCATTTGAGTCCATTGTCAATGGGGAAGATGAAGATTGATTGGATGTTTTGCTTTAC
TTCAATTTGGTGTTTTGCTTTATTTGGATTTAGAGTTTTATCTTAGTTGGATTTGGTGTT
TTGCTTTGTTCAATTTACACATTGCTTGTTAGAGATGCTTGAATACTATCATTTGAAGTT
TTTCTT

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 3

CO CL3636Contig1 922 3 4 U
GACTCGCCTCTTTCCCTCGTTTAATCCACTCCGCTTGGCTCCAAACCCGCTCAGTTCGCC
GAAGAGGAGAGCGACAGTCTTTTCATACCAATCGCCTTCGTCTCCTCTTCTCTACGGTTT
CCAGATCAGAGGATCTAAGGCACCATTCACCGCGACATCTTCCTATCCAACGTCTCCTGG
CTCCTCCGGTGATAGTGAGGTGGCAAAGAGATTAGAGAAGACTTCAAGATACTTCGGAGG
CTGGGGAGCATTGGTTTCTGGGGACAGCTTGTTTCAACTCTTGTGGCGGCTGTCATTCTA
TCCTTCTCCATTGCTGTCACTGGGAAACCCACTTCACCTGCTACTTTCTATGCCACTGCT
AGTGGCATCGCTGCTGCTTTTGTCTCCGTCTTTTGGTCCTTTGGCTATATCCGTCTCTCT
GATAGGCTCCGTCGAACTGCCGCTGACCCTTCCAAGGCCCCTCCTCGTGCTGATGTTGTG
AAAGGGTTGAGAAGTGGGATAATGGTGAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCAATCCTCGGG
ATGCAAGCAACTGTTGGGTTCTTAGTCGCAAAGGCTTTAACTACTTCAGCAACCCCTTTC
TACCAAGGAGTCTCTCAAGGATACAGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTCCTCGTTCAG
GCATCGGCAAACACATTGCTTTCTCATTTCCTAGGCCTTGTTTGTTCGTTAGAGCTGTTG
CGCTCCGTGACAGTGGCTACCTCGGAATCTATCGCAGTTCCCAGAGTTGCATGAGTTTCT
ACCCTTTTTAGGCATCATTCCTATTCATAAACCTCAAAGTCTGAGACTTGTTTACTATTG
TCATTGAGAACCAACCGTTGTGGACTCAACAACTTTATTATTACTGAATTACAGATGTGA
TTTATGGTTAAATTATCTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED37TF U 1
AF RR4E846TF U 412
AF RR4ED37JQ C 565
BS 1 660 RR4ED37TF
BS 661 661 RR4E846TF
BS 662 690 RR4ED37TF
BS 691 922 RR4E846TF

RD RR4ED37TF 698 0 0
GACTCGCCTCTTTCCCTCGTTTAATCCACTCCGCTTGGCTCCAAACCCGCTCAGTTCGCC
GAAGAGGAGAGCGACAGTCTTTTCATACCAATCGCCTTCGTCTCCTCTTCTCTACGGTTT
CCAGATCAGAGGATCTAAGGCACCATTCACCGCGACATCTTCCTATCCAACGTCTCCTGG
CTCCTCCGGTGATAGTGAGGTGGCAAAGAGATTAGAGAAGACTTCAAGATACTTCGGAGG
CTGGGGAGCATTGGTTTCTGGGGACAGCTTGTTTCAACTCTTGTGGCGGCTGTCATTCTA
TCCTTCTCCATTGCTGTCACTGGGAAACCCACTTCACCTGCTACTTTCTATGCCACTGCT
AGTGGCATCGCTGCTGCTTTTGTCTCCGTCTTTTGGTCCTTTGGCTATATCCGTCTCTCT
GATAGGCTCCGTCGAACTGCCGCTGACCCTTCCAAGGCCCCTCCTCGTGCTGATGTTGTG
AAAGGGTTGAGAAGTGGGATAATGGTGAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCAATCCTCGGG
ATGCAAGCAACTGTTGGGTTCTTAGTCGCAAAGGCTTTAACTACTTCAGCAACCCCTTTC
TACCAAGGAGTCTCTCAAGGATACAGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTCCTCGTTCAG
*CATCGGCAAACACATTGCTTTCTCATTTC
CTAGCCTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4E846TF 511 0 0
G
GTCTCTCTGATAGGCTCCGTCGAACTGCCGCTGACCCTTCCAAGGCCCCTCCTCGTGCTG
ATTTTGTGAAAGGGTTGAGAAGTGGGATAATGGTGAATCTTCTTGGAATGGGAGCTGCAA
TCCTCGGGATGCAAGCAACTGTTGGGTTCTTAGTCGCAAAGGCTTTAACTACTTCAGCAA
CCCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCAAGGATACAGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTCC
TCGTTCAGGCATCGGCAAACACATTGCTTTCTCATTTCCTAGGCCTTGTTTGTTCGTTAG
AGCTGTTGCGCTCCGTGACAGTGGCTACCTCGGAATCTATCGCAGTTCCCAGAGTTGCAT
GAGTTTCTACCCTTTTTAGGCATCATTCCTATTCATAAACCTCAAAGTCTGAGACTTGTT
TACTATTGTCATTGAGAACCAACCGTTGTGGACTCAACAACTTTATTATTACTGAATTAC
AGATGTGATTTATGGTTAAATTATCTATAG

QA 2 511 2 511
DS 

RD RR4ED37JQ 344 0 0
GTCGCAAAGGCTTTAACTACTTCAGCAACCCCTTTCTACCAAGGAGTCTCTCAAGGATAC
AGTCCCGTTCTTGCTCTTGATGTCTTCCTCGTTCAGGCATCGGCAAACACATTGCTTTTT
CATTTCTTAGGCCTTGTTTGTTCGTTAGAGCTGTTGCGCTCCGTGACAGTGGCTACCTCG
GAATCTATCGCAGTTCCCAGAGTTGCATGAGTTTCTACCCTTTTTAGGCATCATTCCTAT
TCATAAACCTCAAAGTCTGAGACTTGTTTACTATTGTCATTGAGAACCAACCGTTGTGGA
CTCAACAACTTTATTATTACTGAATTACAGATGTGATTTATGG
C

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 3

CO CL3637Contig1 695 3 8 U
AAATCAAAAAAATCTCACAAAACTAATTAAGCTTCTCTAAACACATTGCCCAAACAAAAA
TAAAATAAAAATAAAACATATTCTTAACATTAACAATCAAAAATCACATTTGTAATGCTT
GAGAAGTCTATCGGCTTCCCTCAAACCACTATAGTAAGCACCATGCGTAGTGGAGTAATG
AGTTCTATGCGTTGCTTCCCCTGCAAACATGACTTGAAGCTCATGTACTTTAGCTTGACC
ATGACCATTGACCTGACCATTGTTCTCGTTAATCTGTGGCAATGGCTCAGCCATGGCGTC
CAAGTCATCCCCGCTTGACCCGACCGCGACATACGAATACGAACCCCTGAAGAGAGGATC
ACCTCCCCATTTGCTCGTCAAGACCTTCGTGATTTTGATAACTTCATCATCATCCTCACG
CAAAGAACCATTGGTCAAAGTCTTAGGAGTTTTCCCCGTGTCTTTCTTCACTTCCTTGCC
TGTCAAGCAAGAGACAGTGGTCACGACACCGTCAATGATCTCCTCGTCGGTTAGTTTCTC
CAGCTCGAGAGCTT**TTGCCTGCAAACCAAGAAAGCAAGACCTTCGAATTGCTGTGTAT
TGGGGCCAAGGTCGCGGTTCTCCTCATCCACCACGGGATTTTCACGAACCTAAACTCAGA
ATCCTCCTTCTCGAACACAAGCTGCATAGACGGGC


BQ
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25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DX54JQ U 1
AF RR4CV83TF C 9
AF RR4CV83JQ U 10
BS 1 266 RR4DX54JQ
BS 267 267 RR4CV83JQ
BS 268 270 RR4DX54JQ
BS 271 271 RR4CV83JQ
BS 272 554 RR4DX54JQ
BS 555 556 RR4CV83JQ
BS 557 606 RR4DX54JQ
BS 607 695 RR4CV83JQ

RD RR4DX54JQ 606 0 0
AAATCAAAAAAATCTCACAAAACTAATTAAGCTTCTCTAAACACATTGCCCAAACAAAAA
TAAAATAAAAATAAAACATATTCTTAACATTAACAATCAAAAATCACATTTGTAATGCTT
GAGAAGTCTATCGGCTTCCCTCAAACCACTATAGTAAGCACCATGCGTAGTGGAGTAATG
AGTTCTATGCGTTGCTTCCCCTGCAAACATGACTTGAAGCTCATGTACTTTAGCTTGACC
ATGACCATTGACCTGACCATTGTTCTTGTTTATCTGTGGCAATGGCTCAGCCATGGCGTC
CAAGTCATCCCCGCTTGACCCGACCGCGACATACGAATACGAACCCCTGAAGAGAGGATC
ACCTCCCCATTTGCTCGTCAAGACCTTCGTGATTTTGATAACTTCATCATCATCCTCACG
CAAAGAACCATTGGTCAAAGTCTTAGGAGTTTTCCCCGTGTCTTTCTTCACTTCCTTGCC
TGTCAAGCAAGAGACAGTGGTCACGACACCGTCAATGATCTCCTCGTCGGTTAGTTTCTC
CAGCTCGAGAGCTTCTTTGCCTGCAAACCAAGAAAGCAAGACCTTCGAATTGCTGTGTAT
TGGGGC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4CV83TF 637 0 0
TC
AATCTCACAAAACTAATTAAGCTTCTCTAAACACATTGCCCAAACAAAAATAAAATAAAA
ATAAAACATATTCTTAACATTAACAATCAAAAATCACATTTGTAATGCTTGAGAAGTCTA
TCGGCTTCCCTCAAACCACTATAGTAAGCACCATGCGTAGTGGAGTAATGAGTTCTATGC
GTTGCTTCCCCTGCAAACATGACTTGAAGCTCATGTACTTTAGCTTGACCATGACCATTG
ACCTGACCATTGTTCTCGTTAATCTGTGGCAATGGCTCAGCCATGGCGTCCAAGTCATCC
CCGCTTGACCCGACCGCGACATACGAATACGAACCCCTGAAGAGAGGATCACCTCCCCAT
TTGCTCGTCAAGACCTTCGTGATTTTGATAACTTCATCATCATCCTCACGCAAAGAACCA
TTGGTCAAAGTCTTAGGAGTTTTCCCCGTGTCTTTCTTCACTTCCTTGCCTGTCAAGCAA
GAGACAGTGGTCACGACACCGTCAATGATCTCCTCGTCGGTTAGTTTCTCCAGCTCGAGA
GCTT**TTGCCTGCAAACCAAGAAAGCAAGACCTTCGAATTGCTGTGTATTGGGGCCAAG
GTCGCGGTTCTCCTCATCCACCACGGGATTTTCAC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR4CV83JQ 686 0 0
C
AATCTCACAAAACTAATTAAGCTTCTCTAAACACATTGCCCAAACAAAAATAAAATAAAA
ATAAAACATATTCTTAACATTAACAATCAAAAATCACATTTGTAATGCTTGAGAAGTCTA
TCGGCTTCCCTCAAACCACTATAGTAAGCACCATGCGTAGTGGAGTAATGAGTTCTATGC
GTTGCTTCCCCTGCAAACATGACTTGAAGCTCATGTACTTTAGCTTGACCATGACCATTG
ACCTGACCATTGTTCTCGTTAATCTGTGGCAATGGCTCAGCCATGGCGTCCAAGTCATCC
CCGCTTGACCCGACCGCGACATACGAATACGAACCCCTGAAGAGAGGATCACCTCCCCAT
TTGCTCGTCAAGACCTTCGTGATTTTGATAACTTCATCATCATCCTCACGCAAAGAACCA
TTGGTCAAAGTCTTAGGAGTTTTCCCCGTGTCTTTCTTCACTTCCTTGCCTGTCAAGCAA
GAGACAGTGGTCACGACACCGTCAATGATCTCCTCGTCGGTTAGTTTCTCCAGCTCGAGA
GCTT**TTGCCTGCAAACCAAGAAAGCAAGACCTTCGAATTGCTGTGTATTGGGGCCAAG
GTCGCGGTTCTCCTCATCCACCACGGGATTTTCACGAACCTAAACTCAGAATCCTCCTTC
TCGAACACAAGCTGCATAGACGGGC

QA 2 686 2 686
DS 



AS 1 2

CO CL3638Contig1 973 2 6 U
ACGACAACCCATCAACATATCAAGCAATACACAACGTGAATAAAACATACACACATACAG
AAGATAAAGTAAAAATAACAAAGAAGGCGAAGGAATGTGTGATTTTAACAAGGCTCTTCT
TAATACAAAAAAGGCTCACTTCAATGACTGCGGAGCAGAAGAGGTAGTGACAAGACTAGA
CAAGAGACCAACGAGTAAGGCATTGTTATAAGTAGTCGGCTCGTTCTGCCTCACATTGTC
TCGTGCGTCACGGAACGTCTCGTTCAAGAAAGGTCCACCTACTAGTGCACCATTTGCTAC
GTTTGGGTTTGGTTTGGTCGAGTTGAAATACTCAAACCCATCTAAGCATCCTGTGGTTGC
ATCTGCAGGCATCGAAGCGCCTCTATGATGGATATATTGTGGGTACTTGTCTCCATAACC
AACCACGAAGCTCATTCCCATCGGATTCTTCCCCAATATGTAATCAGCCTGTGATTTGGC
GAAGTCTCTGAGCTCTGTTGCTTTGAATATCTTCCCGTCGCAAGATATCTTATGGAGACG
GGAAGTGAGCATGTAATCACTAAACAGTGAGGCTAAGAATGCTGCGGAAACGGATTGTTG
CAGCGCGTTCCACTCACTGACCAATACAAGACCACCGTTTGATCTACTAGTTGTAGCTGT
TGGAGATTTTGGTAGAAGACCACACATGACAGCTTTAGCTGTATCCCTGTAACTTCCAAG
TCCCTTGCTTCCTGACAAATCTTTCTTAAAGAAGAGTAACCTCGATAACAGCACCTGTGT
TCCCGCAAGCTTATTGTCCCAACTGAACCAAGTCGGGTTACCGAAACTAGCAAACTCGTT
TCCATGCTTAGTAACATAGTCAAGATAAGTTTTGTCCTCCGTCGCGTGGTACAACCAGCT
AGCCGCCCATAGAAGCTCATCCCCATAACCCGTAGAGTTGTAATAGTCCTGAACCTTAGG
TATGTTGACACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO25JQ U 1
AF RR4DK59TF C 199
BS 1 524 RR4DO25JQ
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BS 750 973 RR4DK59TF

RD RR4DO25JQ 749 0 0
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AAGATAAAGTAAAAATAACAAAGAAGGCGAAGGAATGTGTGATTTTAACAAGGCTCTTCT
TAATACAAAAAAGGCTCACTTCAATGACTGCGGAGCAGAAGAGGTAGTGACAAGACTAGA
CAAGAGACCAACGAGTAAGGCATTGTTATAAGTAGTCGGCTCGTTCTGCCTCACATTGTC
TCGTGCGTCACGGAACGTCTCGTTCAAGAAAGGTCCACCTACTAGTGCACCATTTGCTAC
GTTTGGGTTTGGTTTGGTCGAGTTGAAATACTCAAACCCATCTAAGCATCCTGTGGTTGC
ATCTGCAGGCATCGAAGCGCCTCTATGATGGATATATTGTGGGTACTTGTCTCCATAACC
AACCACGAAGCTCATTCCCATCGGATTCTTCCCCAATATGTAATCAGCCTGTGATTTGGC
GAAGTCTCTGAGCTCTGTTGCTTTGAATATCTTCCCGTCGCAAGGTATCTTATGGAGACG
GGAAGTGAGCATGTAATCACTAAACAGTGAGGCTAAGAATGCTGCGGAAACGGATTGTTG
CAGCGCGTTCCATTCACTGACCAATACAAGACCACCGTTTGATCTACTAGTTGTAGCTGT
TGGAGATTTTGGTAGAAGACCACACATGACAGCTTTAGCTGTATCCCTGTAACTTCCAAG
TCCCTTGCTTCCTGACAAATCTTTCTTAA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4DK59TF 775 0 0
TAGGCATG
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AGAAAGGTCCAC*TACTAGTGCACCATTTGCTACGTTTGGGTTTGGTTTGGTCGAGTTGA
AATACTCAAACCCATCTAAGCATCCTGTGGTTGCATCTGCAGGTATCGAAGCGCCTCTAT
GATGGATATATTGTGGGTACTTGTCTCCATAACCAACCACGAAGCTCATTCCCATCGGAT
TCTTCCCCAATATGTAATCAGCCTGTGATTTGGCGAAGTCTCTGAGCTCTGTTGCTTTGA
ATATCTTCCCGTCGCAAGATATCTTATGGAGACGGGAAGTGAGCATGTAATCACTGAACA
GTGAGGCTAAGAATGCTGCGGAAACGGATTGTTGCAGCGCGTTCCACTCACTGACCAATA
CAAGACCACCGTTTGATCTACTAGTTGTAGCTGTTGGAGATTTTGGTAGAAGACCACACA
TGACAGCTTTAGCTGTATCCCTGTAACTTCCAAGTCCCTTGCTTCCTGACAAATCTTTCT
TAAAGAAGAGTAACCTCGATAACAGCACCTGTGTTCCCGCAAGCTTATTGTCCCAACTGA
ACCAAGTCGGGTTACCGAAACTAGCAAACTCGTTTCCATGCTTAGTAACATAGTCAAGAT
AAGTTTTGTCCTCCGTCGCGTGGTACAACCAGCTAGCCGCCCATAGAAGCTCATCCCCAT
AACCCGTAGAGTTGTAATAGTCCTGAACCTTAGGTATGTTGACACTC

QA 9 775 9 775
DS 



AS 1 3

CO CL3639Contig1 1088 3 6 U
GGGCTCCACCCGTATTCCCAAGGTTCAGCAATTGCTTCAGGACTTCTTCAACGGCAAAGA
GCTTTGCAAGTCTATCAACCCCGATGAGGCTGTTGCTTACGGTGCTGCAGTCCAGGGAGC
TATTCTCAGCGGTGAAGGAAACGAGAAGGTCCAAGATCTTCTCTTGCTTGATGTCACTCC
TCTCTCACTCGGTCTTGAAACCGCCGGTGGTGTCATGACCACTTTGATCGCAAGGAACAC
CACCATTCCGACCAAAAGGGAGCAAGTGTTCTCAACCTATTCAGACAACCAGCCAGGTGT
GTTGATCCAGGTTTTCGAGGGGGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACCTACTCGGGAA
GTTTGAGCTCTCTGGAATCCCTCCAGCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTGTCTGCTT
TGACATTGACGCCAATGGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACCGGACAGAA
GAACAAGATCACCATCACCAACGACAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTGAGAAGAT
GGTCCAGGAGGCTGAGAAGTCCAAGTCTGAGGACGAGGAGCACAAGAAGAAGGTGGAAGC
CAAGAACGCTCTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACCATCCAGGACGAGAAGAT
TGGTGAGAAGCTACCGGCTGCAGACAAGAGGAAGATCGAGGACTCGATTGAGCAGGCGAT
TCAGTGGCTAGAGAATAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTCGAAGACAAGATGAAGGA
GTTGGAGAGCATCTGCAACCCAATCATTGCCTAGATGTACCAAGGAGCTGGCGGTGAAGC
TGCAGGGATGGACGATGATGCTCCTCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGCCCTAAGATCGAAGA
GGTCGACTAATCTGCTGATTCCTGACGTCTCTCTATCTATTTCACTGCTTATTTCGATTT
CTTAAGAACTTTTTTATGTTGGGCCTTTTTGATAGGCCCGTTTTGCTATTATTTTTGTTA
CAACTTTTTGAACTCTGGATTTTCTGTCCAGCTATGATGACGGATAAGTAAAACGTTTTG
GCCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT86TF U 1
AF RR4H337JQ C 552
AF RR4H337TF U 526
BS 1 560 RR4DT86TF
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RD RR4DT86TF 645 0 0
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GCTTTGCAAGTCTATCAACCCCGATGAGGCTGTTGCTTACGGTGCTGCAGTCCAGGGAGC
TATTCTCAGCGGTGAAGGAAACGAGAAGGTCCAAGATCTTCTCTTGCTTGATGTCACTCC
TCTCTCACTCGGTCTTGAAACCGCCGGTGGTGTCATGACCACTTTGATCGCAAGGAACAC
CACCATTCCGACCAAAAGGGAGCAAGTGTTCTCAACCTATTCAGACAACCAGCCAGGTGT
GTTGATCCAGGTTTTCGAGGGGGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACCTACTCGGGAA
GTTTGAGCTCTCTGGAATCCCTCCAGCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTGTCTGCTT
TGACATTGACGCCAATGGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACCGGACAGAA
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GGTCCAGGAGGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGACGAGGAGCACAAGAAGAAAGTGGAAGC
CAAGAACGCTCTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACCAT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4H337JQ 352 0 0
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TCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACCATCCAGGACGAGAAGATTGGTGAGAAGC
TACCGGCTGCAGACAAGAGGAAGATCGAGGACTCGATTGAGCAGGCGATTCAGTGGCTAG
AGAATAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTCGAAGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGCA
TCTGCAACCCAATCATTGCCTAGATGTACCAAGGAGCTGGCGGTGAAGCTGCAGGGATGG
ACGATGATGCTCCTCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGCCCTAAGATCGAAGAGGT

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR4H337TF 563 0 0
G
GATATTGAGAAGATGGTCCAGGAGGCTGAGAAGTCCAAGTCTGAGGACGAGGAGCACAAG
AAGAAGGTGGAAGCCAAGAACGCTCTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACCATC
CAGGACGAGAAGATTGGTGAGAAGCTACCGGCTGCAGACAAGAGGAAGATCGAGGACTCG
ATTGAGCAGGCGATTCAGTGGCTAGAGAATAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTCGAA
GACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGCATCTGCAACCCAATCATTGCCTAGATGTACCAAGGA
GCTGGCGGTGAAGCTGCAGGGATGGACGATGATGCTCCTCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGC
CCTAAGATCGAAGAGGTCGACTAATCTGCTGATTCCTGACGTCTCTCTATCTATTTCACT
GCTTATTTCGATTTCTTAAGAACTTTTTTATGTTGGGCCTTTTTGATAGGCCCGTTTTGC
TATTATTTTTGTTACAACTTTTTGAACTCTGGATTTTCTGTCCAGCTATGATGACGGATA
AGTAAAACGTTTTGGCCTTTCC

QA 2 563 2 563
DS 



AS 1 3

CO CL3640Contig1 894 3 2 U
GATTATTTATAGAAAAGTAACTCAAATATGAACCTTAGTTATGCAAATCTATCAGTAATT
TCCAGTACTAATAGATCCTTTAAACACAAAAAGAGTGTCACCATTCTCAACACCATGCCA
ACGAAGGCTACAATTCTCTCACATAATCCGTTGCTTGTGTACGAATATATACTCGTCGCT
TGGCAACGTCTTGTTAGCTTGTAACCCTTCTCTCATCTCCGATATGGTACAAGAATCCTT
AATCTCCACAGGGATTCTTGCACCGTTGAATAAACTCGATGACGTCTGCACCAAGAAACA
TAGTTTCCTCACCGGAGCAACGTCTTTGGCTCGGTTGATTGACTTGAGAAACACGACAAT
CTCTGAGAACTCACCGATTCCATATTCGTTTAGGTTTCGAAAATCGTCAGCCAGCTCGAT
TCCAGAGAAGTATAATTGCATTCGCTTTATAGGTGTGTTCTCCACAAGGTGTATCTTGTC
CTTCAAGCTACTTACCGTTTCGGTTCTGTCTACTTCGATGGAGAACTGCTTTGATGGGAA
CTTGACGGTGACGTGGATCTTTTTAACCGCGGGGTTAGTAAAAGAAGGTACGGTGAAAAG
GGGAGTAACGGTGAGGTCGATTCTCGTGCCGTCTGAGATGATCGGGTAGTCATCGATGTC
GAGACCGTCGAGGGGTTCCCAACAAGAGACAAAGAGGGTTAACGATGATGTTGGGATCTG
AAGAAACTGTTCTAAACGTTTCTTGATGTCCAACACAGGTTCTTGTTCACTGATTTCCAT
AGTGAATTCTTGGCTGTATGAGACTATTGTCACTATCATATTTACAAATAAAAAGGGCTA
GTTATGTTTTGGTATATTTATGGGAAGCAAAAGTATTGTGATTTCACAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A108JQD U 1
AF RR4A108JQ U 63
AF RR4A108TFB C 34
BS 1 829 RR4A108JQD
BS 830 894 RR4A108TFB

RD RR4A108JQD 829 0 0
GATTATTTATAGAAAAGTAACTCAAATATGAACCTTAGTTATGCAAATCTATCAGTAATT
TCCAGTACTAATAGATCCTTTAAACACAAAAAGAGTGTCACCATTCTCAACACCATGCCA
ACGAAGGCTACAATTCTCTCACATAATCCGTTGCTTGTGTACGAATATATACTCGTCGCT
TGGCAACGTCTTGTTAGCTTGTAACCCTTCTCTCATCTCCGATATGGTACAAGAATCCTT
AATCTCCACAGGGATTCTTGCACCGTTGAATAAACTCGATGACGTCTGCACCAAGAAACA
TAGTTTCCTCACCGGAGCAACGTCTTTGGCTCGGTTGATTGACTTGAGAAACACGACAAT
CTCTGAGAACTCACCGATTCCATATTCGTTTAGGTTTCGAAAATCGTCAGCCAGCTCGAT
TCCAGAGAAGTATAATTGCATTCGCTTTATAGGTGTGTTCTCCACAAGGTGTATCTTGTC
CTTCAAGCTACTTACCGTTTCGGTTCTGTCTACTTCGATGGAGAACTGCTTTGATGGGAA
CTTGACGGTGACGTGGATCTTTTTAACCGCGGGGTTAGTAAAAGAAGGTACGGTGAAAAG
GGGAGTAACGGTGAGGTCGATTCTCGTGCCGTCTGAGATGATCGGGTAGTCATCGATGTC
GAGACCGTCGAGGGGTTCCCAACAAGAGACAAAGAGGGTTAACGATGATGTTGGGATCTG
AAGAAACTGTTCTAAACGTTTCTTGATGTCCAACACAGGTTCTTGTTCACTGATTTCCAT
AGTGAATTCTTGGCTGTATGAGACTATTGTCACTATCATATTTACAAAT

QA 1 829 1 829
DS 

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CAGTACTAATAGAACCTTTAAACACAAAAAGAGTGTCACCATTCTCAACACCATGCCAAC
GAAGGGTACAATTCTCTCACATAATCCGTTGCTTGTGTACGAATATATACTCGTCGCTTG
GCAACGTCTTGTTAGCTTGTAACCCTTCTCTCATCTCCGATATGGTACAAGAATCCTTAA
TCTCCACAGGGATTCTTGCACCGTTGAATAAACTCGATGACGTCTGCACCAAGAAACATA
GTTTCCTCACCGGAGCAACGTCTTTGGCTCGGTTGATTGACTTGAGAAACACGACAATCT
CTGAGAACTCACCGATTCCATATTCGTTTAGGTTTCGAAAATCGTCAGCCAGCTCGATTC
CAGAGAAGTATAATTGCATTCGCTTTATAGGTGTGTTCTCCACAAGGTGTATCTTGTCCT
TCAAGCTACTTACCGTTTCGGTTCTGTCTACTTCGATGGAGAACTGCTTTGATGGGAACT
TGACGGTGACGTGGATCTTTTTAACCGCGGGGTTAGTAAAAGAAGGTACGGTGAAAAGGG
GAGTAACGGTGAGGTCGATTCTCGTGCCGTCTGAGATGATCGGGTAGTCATCGATGTCGA
GACCGTCGAGGGGTTCCCAACAAGAGACAAAGAGGGTTAACGATGATGTTGGGATCTGAA
GAAACTGTTCTAAACGTTTCTTGATGTCCAACACAGGTTCTTGTTCACTGATTTCCATAG
TGAATTCTTGGCTGTATGAGACTATTGTCACTATCA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4A108TFB 861 0 0
CTTAGTTATGCAAATCTATCAGTAATTTCCAGTACTAATAGATCCTTTAAACACAAAAAG
AGTGTCACCATTCTCAACACCATGCCAACGAAGGCTACAATTCTCTCACATAATCCGTTG
CTTGTGTACGAATATATACTCGTCGCTTGGCAACGTCTTGTTAGCTTGTAACCCTTCTCT
CATCTCCGATATGGTACAAGAATCCTTAATCTCCACAGGGATTCTTGCACCGTTGAATAA
ACTCGATGACGTCTGCACCAAGAAACATAGTTTCCTCACCGGAGCAACGTCTTTGGCTCG
GTTGATTGACTTGAGAAACACGACAATCTCTGAGAACTCACCGATTCCATATTCGTTTAG
GTTTCGAAAATCGTCAGCCAGCTCGATTCCAGAGAAGTATAATTGCATTCGCTTTATAGG
TGTGTTCTCCACAAGGTGTATCTTGTCCTTCAAGCTACTTACCGTTTCGGTTCTGTCTAC
TTCGATGGAGAACTGCTTTGATGGGAACTTGACGGTGACGTGGATCTTTTTAACCGCGGG
GTTAGTAAAAGAAGGTACGGTGAAAAGGGGAGTAACGGTGAGGTCGATTCTCGTGCCGTC
TGAGATGATCGGGTAGTCATCGATGTCGAGACCGTCGAGGGGTTCCCAACAAGAGACAAA
GAGGGTTAACGATGATGTTGGGATCTGAAGAAACTGTTCTAAACGTTTCTTGATGTCCAA
CACAGGTTCTTGTTCACTGATTTCCATAGTGAATTCTTGGCTGTATGAGACTATTGTCAC
TATCATATTTACAAATAAAAAGGGCTAGTTATGTTTTGGTATATTTATGGGAAGCAAAAG
TATTGTGATTTCACAAAATCC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 3

CO CL3641Contig1 595 3 2 U
GGAACGTTTCGAATAAACTCTTGAGAGAGAAGAGAGCGAGAATGATAGAGGAAGGTCCAC
CAGCTCCGAAGGTTCTCCGGATGGTCTACTTCGTCGGCGCCGGATTTTTATGTACTTTCG
CGATCAACAAATGGCTTGAGATGGAGAAAAAATCAAATCTGAAACAGCAGCAGCTGGAGA
AGAAGAATGAACAAGGAGATGGAGCTTTGTTTCCTTCAGATTCGGTTCACAAAACTATGA
AATAAGATCATCTTCATCTGTATTATTGATTTTGATCCAGATGCAAAAGATATCGCAACT
CTTTAAGTACTATTATACTATCTTTGACCTCAAAGTTTGCATTATCTCTCGAATTTTTGT
TTGCGTTTCCATAAAAGATCCGCAGTTGTGAGATTTGGACACAATGGTTTGCTTGCTGCT
TGTGCACACAGTACGAAAGATTGTTGCTTTGAGAGCTAAGTGAGAATCAAGTCTTGATTT
TGATTTCCCTATCTACTTTTTATCCTTGAAAAACATGGAAAAGGATTTGTACTCTCTATA
ACTAGGTGGTGGGGTTTAAGACTTGTTTAGTCATATTTTGCTAAATTAACCCTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD49JQ C 1
AF RR4GD49TF U 1
AF RR4G663TF U 21
BS 1 329 RR4GD49TF
BS 330 595 RR4G663TF

RD RR4GD49JQ 329 0 0
GGAACGTTTCGAATAAACTCTTGAGAGAGAAGAGAGCGAGAATGATAGAGGAAGGTCCAC
CAGCTCCGAAGGTTCTCCGGATGGTCTACTTCGTCGGCGCCGGATTTTTATGTACTTTCG
CGATCAACAAATGGCTTGAGATGGAGAAAAAATCAAATCTGAAACAGCAGCAGCTGGAGA
AGAAGAATGAACAAGGAGATGGAGCTTTGTTTCCTTCAGATTCGGTTCACAAAACTATGA
AATAAGATCATCTTCATCTGTATTATTGATTTTGATCCAGATGCAAAAGATATCGCAACT
CTTTAAGTACTATTATACTATCTTTGACC

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR4GD49TF 329 0 0
GGAACGTTTCGAATAAACTCTTGAGAGAGAAGAGAGCGAGAATGATAGAGGAAGGTCCAC
CAGCTCCGAAGGTTCTCCGGATGGTCTACTTCGTCGGCGCCGGATTTTTATGTACTTTCG
CGATCAACAAATGGCTTGAGATGGAGAAAAAATCAAATCTGAAACAGCAGCAGCTGGAGA
AGAAGAATGAACAAGGAGATGGAGCTTTGTTTCCTTCAGATTCGGTTCACAAAACTATGA
AATAAGATCATCTTCATCTGTATTATTGATTTTGATCCAGATGCAAAAGATATCGCAACT
CTTTAAGTACTATTATACTATCTTTGACC

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR4G663TF 575 0 0
GG
GAGAGAGAAGAGAGCGAGAATGATAGAGGAAGGTCCACCAGCTCCGAAGGTTCTCCGGAT
GGTCTACTTCGTCGGCGCCGGATTTTTATGTACTTTCGCGATCAACAAATGGCTTGAGAT
GGAGAAAAAATCAAATCTGAAACAGCAGCAGCTGGAGAAGAAGAATGAACAAGGAGATGG
AGCTTTGTTTCCTTCAGATTCGGTTCACAAAACTATGAAATAAGATCATCTTCATCTGTA
TTATTGATTTTGATCCAGATGCAAAAGATATCGCAACTCTTTAAGTACTATTATACTATC
TTTGACCTCAAAGTTTGCATTATCTCTCGAATTTTTGTTTGCGTTTCCATAAAAGATCCG
CAGTTGTGAGATTTGGACACAATGGTTTGCTTGCTGCTTGTGCACACAGTACGAAAGATT
GTTGCTTTGAGAGCTAAGTGAGAATCAAGTCTTGATTTTGATTTCCCTATCTACTTTTTA
TCCTTGAAAAACATGGAAAAGGATTTGTACTCTCTATAACTAGGTGGTGGGGTTTAAGAC
TTGTTTAGTCATATTTTGCTAAATTAACCCTTT

QA 3 575 3 575
DS 



AS 1 3

CO CL3642Contig1 760 3 9 U
GGTCTCCTCTTCTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGGAGA
AAATCGAAGGTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATAC
AGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGA
TCATATGGAAAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCT
CCGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGGGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGG
ACCCGATTCGAGCTGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTG
TTCATCGTGTCATTAAGGTTCATGAAAGGGACAATACAGGAGATGTCGATGTTTTGACAA
AAGGTGACAATAACTATGGAGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTC
ATCGACATCATATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTA
TAATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGCTTACTTG
TTATAACGTCCAAGGATTGAAGTCTTTTAGAGATGGGACTCTCCAAACCTTTGTGTGTTG
TGTTATCATCCTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTTATGGTTTAGACCACTTC
TAAAACAGTATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
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AF RR4H101TF U 1
AF RR4G631TF U 12
AF RR4B681JQ C 41
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BS 543 588 RR4H101TF
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BS 630 750 RR4G631TF
BS 751 760 RR4B681JQ

RD RR4H101TF 588 0 0
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AAATCGAAGGTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATAC
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TCATATGGAAAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCT
CCGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGGGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGG
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TTCATCGTGTCATTAAGGTTCATGAAAGGGACAATACAGGAGATGTCGATGTTTTGACAA
AAGGTGACAATAACTATGGAGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTC
ATCGACATCATATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTA
TCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCAT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4G631TF 739 0 0
GG
GCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGGAGAAAATCGAAGGTGG
AAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATACAGATCCGTCAGCT
TCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGATCATATGGAAAGC
TTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTTTTCTCTCCGGAAGCATGGA
ACCTGGTTTCAAG**GGGGGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTCGAGC
TGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTGTTCATCGTGTCAT
TAAGGTTCATGAAAGGGACAATACAGGAGATGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACAATAA
CTATGGAGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCATAT
AATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTATAATTATGACAGA
AAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGTTATAACGTCCAA
GGATTGAAGTCTTTTGGAGATGGGACTCTCCAAACCTTTGTGTGTTGTGTTATCATCCTT
CATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTTATGGTTTAGACCACTTCTAAAACAGTATAA
TCAATCAGAAGCTAACT

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR4B681JQ 720 0 0
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AGATTCAATAAAATCTATACAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGAT
GATTGTGACGTCAGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGGGTGTGACTGGAAGTGAATC
TCCCGTGGTTGTTGTTCTCTCCGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGGGATATATT
GTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTCGAGCTGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGA
TGGTCGTGATATTCCAATTGTTCATCGTGTCATTAAGGTACACGAAAGAGACAATACAGG
AGAAGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACAATAACTATGGGGATGACAGACTTCTCTATGC
TGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCATATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCC
TTATGTTGGATGGGTGACTATAATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCAT
AGGTGCATTGGGCTTACTTGTTATAACGTCCAAGGATTGAAGTCTTTTAGAGATGGGACT
CTGCAAGCCTTTGTGTGTTGTGTTATCATCCTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCAT
TTTGTGGTTTAGACCACTTCTAAAACAGTATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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CAAAAAGGGAGTGAAAGCTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTGACGAATCCGTTGTT
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CCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
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AACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAAGA
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CATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTGACGTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTTGTCATTGCTCACGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTGGAACGGT
TGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTTGACGACAAGTACGGGGGGTA
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ATTGTGGGTTTTGTTTAGGGGTTTCATGAAATATTTTAAAACTTTATGCTTTTACTACTA
TCAATGTTGCACACTTGAGGATATTATGCAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CB71TF U 1
AF RR4CB71JQ C 529
BS 1 688 RR4CB71TF
BS 689 934 RR4CB71JQ

RD RR4CB71TF 688 0 0
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CCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
AACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAAGA
TCGTCTTTTGAAGAAAGCTCAAGCCGAGGCCGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTGACGTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTTGTCATTGCTCACGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTGGAACGGT
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CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4CB71JQ 406 0 0
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GACCAAAGCTAAGGATAGGGTTTTTGCCAAGGGGGCTGCCCAGAGAATGAAATAAGCAGA
AACTTTATTATGATTGTGGGTTTTGTTTAGGGGTTTCATGAAATATTTTAAAACTTTATG
CTTTTACTACTATCAATGTTGCACACTTGAGGATATTATGCAGTTT

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 2

CO CL3644Contig1 577 2 1 U
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AAAAAAAAAAAACAAAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCT
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GGCGATGAAGCTGGCCCCATGTGTAGGAGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGG
CGGTTGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAGGTGTCTCTGCGCCGTTCT
TCTCTCCGACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCAAA
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AAGTGTTCAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCTAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCGTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGTGGTTGT
AATTAATAAATATATCAATAATATAAGAAATGATTCC


BQ
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AF RR4FZ17JQ C 1
AF RR4FZ17TF U 1
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DS 

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QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4C674JQ U 1
AF RR4BU45JQ U 172
AF RR4BU45TF C 172
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QA 1 631 1 631
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CAGTGGTTTCGTCCATGAGAATGTATATCTCAGATCTGAGACGTACTTCTCCTTCTTCGG
TGAAGATGAGTTCGAGAGTATGTTGTCTAGATAAGCTGTCTCGTAATCCATCAACTGATC
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QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D684TF U 1
AF RR4A919TF U 1
AF RR4A919JQ C 350
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AS 0 0

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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4A646TF C 1
AF RR4A646JQ U 2
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BS 824 828 RR4CS44JQ

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CCGTTGATGATCTCTCCGTAGGCTAACCATCTTGGCTCAATGAACCCTCCAGTACCCTCT
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GAGAGACTCTGTGAT***GCAAACCACAATTGCCTGTTTGCTCCTTGCTTGACAGGTGGA
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GAGCTGAATATCTGTCTAGCGGTCTGAACATAGGAGGTGAGTCAAGAAGACACAAGTGCT
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DS 

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CTCTAAATGAAAGCAAGTATTTAACATGTTTCTCCCTTCCTCTTCACTCAACGGTCCTCT
GCTCCTTTCTTCTCTGTTTCTCTGCGCACAAAGACCCTATCAAGCTTATCAGAATCAGAC
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CGTTGATGATCTCTCCGTAGGCTAACCATCTTGGCTCAATGAACCCTCCAGTACCCTCTG
GGTCTGAAAGACCAAGTGGGTCGAAACCAAAGTCACCAGGTAAACTGCCATCCAAGTAAG
AGAGACTCTGTGAT***GCAAACCACAATTGCCTGTTTGCTCCTTGCTTGACAGGTGGAG
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AGCTGAATATCTGTCTAGCGGTCTGAACATAGGAGGTGAGTCAAGAAGACACAAGTGCTT
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TTGTTCAGTAATGGTCTAAAATAAGTGTTAAGAGCACAAGGA
ACCC

QA 1 822 1 822
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GAAAGACTCTGACTCAAACCAAGTGTTTGCTTATTTGAAAGACTCTAAATGAAAGCAAGT
ATTTAACATGTTTCTTCCTTCCTCTTCACTCAACGGTCCTCTGCTCCTTTCTTCTCTGTT
TCTCTGCGCACAAAGACCCTATCAAGCTTATCAGAATCAGACCGGCCTTTCCCAGAATCT
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GGTCGAAACCAAAGTCACCAGGTAAACTGCCATCCAAGTAAGAGAGACTCTGTGATGATG
CAAACCACAACTGCCTGTTTGCTCCTTGCTTGACAGGTGGAGTTGAAGCAGCCTTAACAA
TAAAGGAAGTCTTCCTCTGTGATATGGACACAGATGATTTTGAGCTGAATATCTGTCTAG
CGGTCTGAACATAGGAGGTGAGTCAAGAAGACACAAGTGCTTGTGCTGCCATTTTTTGCT
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AAATAAGTGTTAAGAGCACAAGGACACCC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

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AAATGGCAGCGAAAATCTCTCAGCTTGCTTGTCTCTCCTCCACCCATCGCCAATTCCAAA
TCCAGAACCGATCGTTTCCGGGACTTAGGTTCGTCCGGAGTTTTTGTAGTTAGAAGCGTT
GATGGGAACAGCTCAGAAACAACACCAGCTTCTCTGAGCTATACAGCTGAGGTTTCTAAA
CCTTTCATTGTGAAAACATCGAACTCCACAGTGGATGGAGCTGCTACGGGTAAAGAGATT
ACTACAGAGCCAGTAGAGGAACATGTTGCTTCAACACAGCCTAAAAGAGCAGCAAAGACC
CATGACTTCTGTTTTGGCATTCCTTATGGTGGTCTGGTTATGAGTGGAGGATTGCTTGGA
TTTGCGTTTTCAAGAAATCTTACAAGTTTAAGTACTGGAGTCCTCTATGGTGGTGGCCTT
CTTGCTCTTAGTACATTGAGCATGAAGATTTGGCGACAGGGAAAATCTAGTTTCCCTTAC
ATACTAGGTCAAGCAGTGCTTTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCACAGCTTACTCT
ATGACTAAGAAGCTGTTTCCTGCCGGGCTATTTGCTGTTGTCAGTGCTGCCATGTTGTGT
TTCTATTCCTATGTGGTGCTCTCCGGTGGAAACCCAGCTCCAAAGAAACTGAAACCATCT
TCTAGTCCTTCATACTGAAGAAACTTAACATAGGGTTCTTCTCTCTTTTGATGGTGTGGT
TGGATTCCTGATGTAATCTTATTATACTTTTGAGAAGCAACAACTATTGCATGTGTCATT
ATTAAAATTTTGTTTACTGGTAACATATGTTTGTGCTCGTCTTTAATCTTAATCGAACTA
TAAATGCTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU63TF U 1
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G

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DS 

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TAG
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TTTCCCTTACATACTAGGTCAAGCAGTGCTTTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCAC
AGCTTACTCTATGACTAAGAAGCTGTTTCCTGCCGGGCTATTTGCTGTTGTCAGTGCTGC
CATGTTGTGTTTCTATTCCTATGTGGTGCTCTCCGGTGGAAACCCAGCTCCAAAGAAACT
GAAACCATCTTCTAGTCCTTCATACTGAAGAAACTTAACATAGGGTTCTTCTCTCTTTTG
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ATGTGTCATTATTAAAATTTTGTTTACTGGTAACATATGTTTGTGCTCGTCTTTAATCTT
AATCGAACTATAAATGCTAAAAAAAA

QA 4 749 4 749
DS 



AS 1 2

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GAAAACTTCCACGTGGAAGTTTCGGATCCTGCTCATGAGGTGGTTCATTTTTATTTGCTT
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TACTTCACCTGTTTGGGACAAGAACTAACCAGAAGAGCATACGTGTTTGTTTTGTGTTAT
GTATTGGTTTCACTAATACTCTTTTTTTTTTACATATGTTGAAAGTAATAAATAAGGAAG
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GATTTTTTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW89TF U 1
AF RR4AW89JQ C 189
BS 1 824 RR4AW89TF
BS 825 1030 RR4AW89JQ

RD RR4AW89TF 824 0 0
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CAAGCACATGGTGTAATGGTTAGCAATTCGCACAAAGAACTACTGCAATGGCACGAGGAG
AATGCAAAGGACAACCCGAAGATAATTCTTGCGTCCGAGAGATGTGGAGCTGGGATGATA
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GAAAACTTCCACGTGGAAGTTTCGGATCCTGCTCATGAGGTGGTTCATTTTTATTTGCTT
TACGAGAAATGGCGCCGTGGAGAGGTGGAGAAGTCTGATAAGTATCTTCAGAACTTGAAA
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GAGTGGATAAATAATTTGGAGAATTTACATGGGGAAGGGAAGGAGAAGCAGTTTCGCATT
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CAGGAGGAAAAGGAAAAGCTGACTTGGATGCACATCCAACAATCATGGTTAGATGGTTCC
TGTCCAGATGATCAGGAAAATTGGATTTTCTGAAACTGGACACTGACATATCAAAGCTGT
TACTTCACCTGTTTGGGACAAGAACTAACCAGAAGAGCATACGTGTTTGTTTTGTGTTAT
GTATTGGTTTCACTAATACTCTTTTTTTTTTACATATGTTGAAA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4AW89JQ 842 0 0
ACAGAGGTTTAATCTGGGACCAAGCGTCTCTCCGAGAGATGTTTTGGATACTGAAAACTT
CCACGTGGAAGTTTCGGATCCTGCTCATGAGGTGGTTCATTTTTATTTGCTTTACGAGAA
ATGGCGCCGTGGAGAGGTGGAGAAGTCTGATAAGTATCTTCAGAACTTGAAATCGCTCTC
CAGTCCACTTGGTATGTTTGTTCATCCGTCTGGAGTGGAGAAACTGATACATGAGTGGAT
AAATAATTTGGAGAATTTACATGGGGAAGGGAAGGAGAAGCAGTTTCGCATTTGGCTGGA
TAGAGTCTCGTCTTCTCTTATAAGCCCAGAAACATGGATTGTAAAATTTGACAAGCATGA
GTTATCTGATGGAAAAGTACGGTCATGTTCGACGAGAGTCTTACTAAGTTGTCAGGAGGA
AAAGGAAAAGCTGACTTGGATGCACATCCAACAATCATGGTTAGATGGTTCCTGTCCAGA
TGATCAGGAAAATTGGATTTTCTGAAACTGGACACTGACATATCAAAGCTGTTACTTCAC
CTGTTTGGGACAAGAACTAACCAGAAGAGCATACGTGTTTGTTTTGTGTTATGTATTGGT
TTCACTAATACTCTTTTTTTTTTACATATGTTGAAAGTAATAAATAAGGAAGATTGTGGT
CTGTATTGGATTCATAACTGGACAGGGAGAGTTCCTGGGGTCTCTACAACAAAACCCTAC
ATTTATTTGGTTCATGTAATCTGCTAACACATTGATTGGTTTGCTCCTTTGTTTCATACA
CTTGTTGATTGTTGTCTTCATGACACTGATGACTAAGAAAGAATTCGTGTTTGATTTTTT
GG

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 3

CO CL3651Contig1 740 3 7 U
GGAGTTCGGGAGTGAAGTCATCTTGTTACTTCTTCCGACATAGCCCCACAATGCTTAGCC
TCTCCATCGCCTCGCCGGGAACGGCGGTAACTCTCCTCCGAGGAACTGGCTCGTCGAGTT
CAACCTCGTCTTCGTTCCATGGCGTCAGAATCAATCGCGTGCCGACGATATCTTCTTCGT
CGTCTGGTAAACCAATGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGCTGAAAGATATAAGAG
AAAAAAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTCAAAGGAGAGCTCTTTA
TGCTCCGTCTCCAGAAATCCGCGAGGAACGAGTTCAAGTCTAGCGACTTTCGCCGTATGA
AGAAACAAGTTGCGAGGATATTGACGGTAAGGAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAGGGATAG
GGAAGAGGTTGTCTAGGAAACTTGACAGGCAGTGGAAGAAGAGCATTGTAGTGAGACCAC
CTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAGGAAGCTGCTGAAGAAGCAGCTGAAGCCGCCA
AATCTGCCTGATAACCCCAGACATTTGATGTTTGGTCCCTTCTTTTTGTTCCTTGGGATG
TGACAGACATTTGATGTTTGGTCTCTTCTTGTTCATTGGGATGTGACTCTCTCTTGTTGT
TGTTTTTTTGGTTTATATAATAAACCTCCCCTCATCAAGTAGTTTGCATATGAATTCTAT
GGTTTAATGTTTTTGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE50TF U 1
AF RR4G203TF U 6
AF RR4G203JQ C 193
BS 1 261 RR4CE50TF
BS 262 262 RR4G203TF
BS 263 645 RR4CE50TF
BS 646 668 RR4G203TF
BS 669 669 RR4G203JQ
BS 670 688 RR4G203TF
BS 689 740 RR4G203JQ

RD RR4CE50TF 648 0 0
GGAGTTCGGGAGTGAAGTCATCTTGTTACTTCTTCCGACATAGCCCCACAATGCTTAGCC
TCTCCATCGCCTCGCCGGGAACGGCGGTAACTCTCCTCCGAGGAACTGGCTCGTCGAGTT
CAACCTCGTCTTCGTTCCATGGCGTCAGAATCAATCGCGTGCCGACGATATCTTCTTCGT
CGTCTGGTAAACCAATGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGCTGAAAGATATAAGAG
AAAAAAAGACGACGGAGGAGCCGAACGAGGAGGTGATTGACCTCAAAGGAGAGCTCTTTA
TGCTCCGTCTCCAGAAATCCGCGAGGAACGAGTTCAAGTCTAGCGACTTTCGCCGTATGA
AGAAACAAGTTGCGAGGATATTGACGGTAAGGAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAGGGATAG
GGAAGAGGTTGTCTAGGAAACTTGACAGGCAGTGGAAGAAGAGCATTGTAGTGAGACCAC
CTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAGGAAGCTGCTGAAGAAGCAGCTGAAGCCGCCA
AATCTGCCTGATAACCCCAGACATTTGATGTTTGGTCCCTTCTTTTTGTTCCTTGGGATG
TGACAGACATTTGATGTTTGGTCTCTTCTTGTTCATTGGGATGTG
GCT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4G203TF 683 0 0
GG
GGGAGTGAAGTCATCTTGTTACTTCTTCCGACATAGCCCCACAATGCTTAGCCTCTCCAT
CGCCTCGCCGGGAACGGCGGTAACTCTCCTCCGAGGAACTGGCTCGTCGAGTTCAACCTC
GTCTTCGTTCCATGGCGTCAGAATCAATCGCGTGCCGACGATATCTTCTTCGTCGTCTGG
TAAACCAATGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGCTGAAAGATATAAGAGAAAAAAA
GACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTCAAAGGAGAGCTCTTTATGCTCCG
TCTCCAGAAATCCGCGAGGAACGAGTTCAAGTCTAGCGACTTTCGCCGTATGAAGAAACA
AGTTGCGAGGATATTGACGGTAAGGAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAGGGATAGGGAAGAG
GTTGTCTAGGAAACTTGACAGGCAGTGGAAGAAGAGCATTGTAGTGAGACCACCTCCTTC
TCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAGGAAGCTGCTGAAGAAGCAGCTGAAGCCGCCAAATCTGC
CTGATAACCCCAGACATTTGATGTTTGGTCCCTTCTTTTTGTTCCTTGGGATGTGACAGA
CATTTGATGTTTGGTCTCTTCTTGTTCATTGGGATGTGACTCTCTCTTGTTGTTGTTTTT
T*GGTTTATATAATAAACCTC

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR4G203JQ 548 0 0
CAATGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGCTGAAAGATATAAGAGAAAAAAAGACGA
CGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTCAAAGGAGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCC
AGAAATCCGCGAGGAACGAGTTCAAGTCTAGCGACTTTCGCCGTATGAAGAAACAAGTTG
CGAGGATATTGACGGTAAGGAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGT
CTAGGAAACTTGACAGGCAGTGGAAGAAGAGCATTGTAGTGAGACCACCTCCTTCTCTCA
AGAAGCTTCAAGAGGAGGAAGCTGCTGAAGAAGCAGCTGAAGCCGCCAAATCTGCCTGAT
AACCCCAGACATTTGATGTTTGGTCCCTTCTTTTTGTTCCTTGGGATGTGACAGACATTT
GATGTTTGGTCTCTTCTTGTTCATTGGGATGTGACTCTCTCTTGTTGTTGTTTTTTTGGT
TTATATAATAAACCTCCCCTCATCAAGTAGTTTGCATATGAATTCTATGGTTTAATGTTT
TTGATACC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 3

CO CL3652Contig1 941 3 4 U
GGTAGATTAATAGTAGTCTTGATACCAACACAAAATGAAATTCTGATGATAAAAAACCGT
TTGAGAAGAAAAAAACAGCGATCAACATAACAGCGATCAACATAACGTTCTCTGTCACTT
CTATGGGAATATTTCATTACCATCCAATAATCTCAAAACTGTAATTTCCACTGAATACAA
ATATCTTGGGGTGACTTCTTCAATCAGGGGTTACTAGACCCAGAAGCAGCAGCCTCTGCC
GCTTTCTTCTTCTCCCTCTTCTTCTTGTTTCTAAGAGCGTTCTTGCTCATCTCTACTGCT
GGGTTTACTCCAAGCAACTCAGCTTGAATGGCGGCTGCGTGCTTAGCATGAGGAGGTTGA
TATGCAGCTGGTTTTTTTACGGTGGGGATGGAAACAACAGGTTTCTTCTGAGCTGATCCT
TGTCCTTGCGATTTGCCCCCTTCGAGTTTCAATGATTCAACTGACTTGAGAAGCTCACTG
ATCTCATCGAACCTCTCTGGAGACTCCGGTTTCCATTCAACCTGGTACAGTCTCTCAAAC
ATCTTCTTGAAATAACGCTTTCCGTCATAGTTGAAGATTTTAATCCCATTGTCGATTTGA
CGTCTTGGTGCTGTTGAGGCAGTAAGGAAATAACGCCCATCAGGAGACCATTCACTTACT
ACAGACCACTCGGCTTTATTACTTCCTAGTTGCTTCTTAGTGACAACGTCCCAGAATGTC
ATATCACCAGGTAAGTTACCGAATCCAGCCACACATAAAATTCTCCCTTTTGGATTCCAT
CGAAGAGTGTTGTAAGGACCTTCACCAAGTTCCATCAAAGGTTTGCACTTCTTGTCAAAG
ATTGTCACACAAGCAGGCATAAAGCCATATACAACTGCGAACTCTGAACCCGAGAGGGAC
CACTGAACATCATGAACTGGACCCTCTTTACGTAAAGGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU88JQ U 1
AF RR4H428TF C 70
AF RR4B594JQ U 63
BS 1 103 RR4FU88JQ
BS 104 104 RR4B594JQ
BS 105 273 RR4FU88JQ
BS 274 941 RR4B594JQ

RD RR4FU88JQ 273 0 0
GGTAGATTAATAGTAGTCTTGATACCAACACAAAATGAAATTCTGATGATAAAAAACCGT
TTGAGAAGAAAAAAACAGCGATCAACATAACAGCGATCAACATGACGTTCTCTGTCACTT
CTATGGGAATATTTCATTACCATCCAATAATCTCAAAACTGTAATTTCCACTGAATACAA
ATATCTTGGGGTGACTTCTTCAATCAGGGGTTACTAGACCCAGAAGCAGCAGCCTCTGCC
GCTTTCTTCTTCTCCCTCTTCTTCTTGTTTCTA

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR4H428TF 650 0 0
AAAAAACAGCGATCAACATAACAGCGATCAACATAACGTTCTCTGTCACTTCTATGGGAA
TATTTCAT*ACCATCCAATAATCTCAAAACTGTAATTTCCACTGAATACAAATATCTTGG
AGTGACTTCTTCAATCAGGGGTTACTAGACCCAGAAGCAGCAGCCTCTGCCGCTTTCTTC
TTCTCCCTCTTCTTCTTGTTTCTAAGAGCGTTCTTGCTCATCTCTCCTGCTGGGTTTACT
CCAAGCAACTCAGCTTGAATGGCGGCTGCGTGCTTAGCATGAGGAGGTTGATATGCAGCT
GGTTTTTTTACGGTGGGGATGGAAACAACAGGTTTCTTCTGAGCTGATCCTTGTCCTTGC
GATTTGCCCCCTTCGAGTTTCAATGATTCAACTGACTTGAGAAGCTCACTGATCTCATCG
AACCTCTCTGGAGACTCCGGTTTCCATTCAACCTGGTACAGTCTCTCAAACATCTTCTTG
AAATAACGCTTTCCGTCATAGTTGAAGATTTTAATCCCATTGTCGATTTGACGTCTTGGT
GCTGTTGAGGCAGTAAGGAAATAACGCCCATCAGGAGACCATTCACTTACTACAGACCAC
TCGGCTTTATTACTTCCTAGTTGCTTCTTAGTGACAACGTCCCAGAA
CGC

QA 1 647 1 647
DS 

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GAGAAGA
AAAAAACAGCGATCAACATAACAGCGATCAACATAACGTTCTCTGTCACTTCTATGGGAA
TATTTCATTACCATCCAATAATCTCAAAACTGTAATTTCCACTGAATACAAATATCTTGG
GGTGACTTCTTCAATCAGGGGTTACTAGACCCAGAAGCAGCAGCCTCTGCCGCTTTCTTC
TTCTCCCTCTTCTTCTTGTTTCTAAGAGCGTTCTTGCTCATCTCTACTGCTGGGTTTACT
CCAAGCAACTCAGCTTGAATGGCGGCTGCGTGCTTAGCATGAGGAGGTTGATATGCAGCT
GGTTTTTTTACGGTGGGGATGGAAACAACAGGTTTCTTCTGAGCTGATCCTTGTCCTTGC
GATTTGCCCCCTTCGAGTTTCAATGATTCAACTGACTTGAGAAGCTCACTGATCTCATCG
AACCTCTCTGGAGACTCCGGTTTCCATTCAACCTGGTACAGTCTCTCAAACATCTTCTTG
AAATAACGCTTTCCGTCATAGTTGAAGATTTTAATCCCATTGTCGATTTGACGTCTTGGT
GCTGTTGAGGCAGTAAGGAAATAACGCCCATCAGGAGACCATTCACTTACTACAGACCAC
TCGGCTTTATTACTTCCTAGTTGCTTCTTAGTGACAACGTCCCAGAATGTCATATCACCA
GGTAAGTTACCGAATCCAGCCACACATAAAATTCTCCCTTTTGGATTCCATCGAAGAGTG
TTGTAAGGACCTTCACCAAGTTCCATCAAAGGTTTGCACTTCTTGTCAAAGATTGTCACA
CAAGCAGGCATAAAGCCATATACAACTGCGAACTCTGAACCCGAGAGGGACCACTGAACA
TCATGAACTGGACCCTCTTTACGTAAAGGAAC

QA 8 879 8 879
DS 



AS 1 3

CO CL3653Contig1 1128 3 7 U
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CTCCAAGGCGGCGCCACCACCCAGTTCTCCTCCCTCCCTCTCAACCTCTGCGCATCCTCC
TACGATCCCGCCGACTACGTCGTCACCGGATCCTGGGGAGACAAGGCCTTCAAGGAGGCC
CAGAAGTACTGCGACCCGAGCGTCGTATGGTCAGGTAAGTCAGAGAAGTACACTAAAGTC
CCGTCCTTTGATGCGTTTGAGCAGAACCCGCACGCCAAGTATTTGCATATATGCGCCAAT
GAGACTATCCATGGCGTTGAGTTTAAAGACTACCCTGTTCCTAAAAACCCTAACGGTGTT
TTGATAGCTGATATGTCTTCGAACTTCTGTTCGAAGCCTGTTGATGTCTCCAAGTTCGGT
GTCATCTACGCCGGCGCGCAGAAGAACGTTGGTCCTTCGGGTGTTACCATTGTGATTATT
AGAAAAGATTTGATCGGGAAGGCTAGGGAGGTTACTCCAGTGATGCTTGATTACAAGATC
CACGACTAGAGCAGTTCCTTGTACAACACGCCGCCGTGCTTCGGGATCTACATGTGCGGT
CTCGTGTTTGACGATCTGTTGGCGCAGGGTGGGTTGGAGGAAGTGGAGAGGAAGAACCAG
AGGAAGGCTAAGATTCTGTACGATGCGATTGATGAGAGCGGAGGGTTTTTCAGGTGTCCG
GTTGAGAAGTCTGTGAGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAGGGCGGAGCTG
GAAGGGGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGGAGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGGCATAGA
TCGGTGGGAGGTATGAGGGCTTCTATTTACAATGCGATGCCTTTGGCTGGCGTTGAGAAG
CTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCTAGGCATGCTTGATTCCAATCTTCTTCGTTG
TTTGAGTGATTATAATAAGCGTTGAATGCTTATGATTTGAGTTTTCTTTTTGCCAATTGT
GTGCGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAGCTTATATGCTAGATGTCATGTTTAAGCAA
TAATTATTTACGCGTGTTTTTATGTTACTCTTATTTGTCTGAGACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F023TF U 1
AF RR4BP14TF U 249
AF RR4F023JQ C 436
BS 1 344 RR4F023TF
BS 345 345 RR4BP14TF
BS 346 623 RR4F023TF
BS 624 696 RR4BP14TF
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BS 699 780 RR4BP14TF
BS 781 1128 RR4F023JQ

RD RR4F023TF 623 0 0
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CTCCAAGGCGGCGCCACCACCCAGTTCTCCTCCCTCCCTCTCAACCTCTGCGCATCCTCC
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CAGAAGTACTGCGACCCGAGCGTCGTATGGTCAGGTAAGTCAGAGAAGTACACTAAAGTC
CCGTCCTTTGATGCGTTTGAGCAGAACCCGCACGCCAAGTATTTGCATATATGCGCCAAT
GAGACTATCCATGGCGTTGAGTTTAAAGACTACCCTGTTCCTAAGAACCCTAACGGTGTT
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CTCGTGTTTGACGATCTGTTGGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4BP14TF 532 0 0
GGG
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TGGCGTTGAGTTTAAAGACTACCCTGTTCCTAAAAACCCTAACGGTGTTTTGATAGCTGA
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CGGCGCGCAGAAGAACGTTGGTCCTTCGGGTGTTACCATTGTGATTATTAGAAAAGATTT
GATCGGGAAGGCTAGGGAGGTTACTCCAGTGATGCTTGATTACAAGATCCACGACGAGAA
CAGTTCCTTGTACAACACGCCGCCGTGCTTCGGGATCTACATGTGCGGTCTCGTGTTTGA
CGATCTGTTGGCGCAGGGTGGGTTGGAGGAAGTGGAGAGGAAGAACCAGAGGAAGGCTAA
GATTCTGTACGATGCGATTGATGAG**CGGAGGGTTTTTCAGGTGTCCGGTTGAGAAGTC
TGTGAGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAGGGCGGAGCTG

QA 4 532 4 532
DS 

RD RR4F023JQ 693 0 0
GCGCAGAAGAACGTTGGTCCTTCGGGTGTTACCATTGTGATTATTAGAAAAGATTTGATC
GGGAAGGCTAGGGAGGTTACTCCAGTGATGCTTGATTACAAGATCCACGACTAGAGCAGT
TCCTTGTACAACACGCCGCCGTGCTTCGGGATCTACATGTGCGGTCTCGTGTTTGACGAT
CTGTTGGCGCAGGGTGGGTTGGAGGAAGTGGAGAGGAAGAACCAGAGGAAGGCTAAGATT
CTGTACGATGCGATTGATGAGAGCGGAGGGTTTTTCAGGTGTCCGGTTGAGAAGTCTGTG
AGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAGGGCGGAGCTGGAAGGGGAGTTTATC
AAGGAAGCTGCTAAGGAGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGGCATAGATCGGTGGGAGGTATG
AGGGCTTCTATTTACAATGCGATGCCTTTGGCTGGCGTTGAGAAGCTCGTTGCTTTCATG
AAAGAGTTCCAGGCTAGGCATGCTTGATTCCAATCTTCTTCGTTGTTTGAGTGATTATAA
TAAGCGTTGAATGCTTATGATTTGAGTTTTCTTTTTGCCAATTGTGTGCGGAACTGTTTC
AGTAATAATCTTTTAGCTTATATGCTAGATGTCATGTTTAAGCAATAATTATTTACGCGT
GTTTTTATGTTACTCTTATTTGTCTGAGACTGG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL3654Contig1 1196 3 6 U
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AATCGCTAAACTTTTCGAAACCGTAGCGTTCGAGGATGATGAATCAAATGCAAAGGATCC
TCGCTGCTCGTCGGTTATCTCCCTCAATCATACCTCCGTCGTGCTTCCTTCACCGGCGGT
GGTTCCCGACCTTAGAAACTGATGCTTCTTCTAGGCATCAAAAGATCGAAACTTTGGAAG
ACAAAGCTTCTTCTAACAAAAGCCGAATCACACCGACGTCAACGTCTTCTCTCAATGAAC
AAGAACTCGCCAAATTCTCTGCCATTGCTGATACCTGGTGGCATTCTGAAGGGCCCTTTA
AACCGTTGCATCTGATGAACCCAACTCGGTTGGCTTTCATCCGCTCCACCTTATGCAGGC
ATTTCAGTAAGGATCCGAGTTCCGCTAGGCCTTTTGAAGGACTGAGACTTATTGATGTTG
GTTGTGGCGGTGGACTTCTTTCCGAGCCTCTAGCACGGATGGGAGCAACTGTCACAGGAA
TTGATGCTGTTGGTAAGAATGTCAAGATTGCTCGTCTTCACGCTGATATGGATCCAATGA
CTTCAACTATTGAATACCAATGTACTACAGCAGAAAAGCTAGTGGATGAGGGGAGGACGT
TTGATGCTGTTCTTGCCTTAGAGGTCATCGAGCATGTAGCCAACCCTGCAGAGTTCTGCA
AGTCCTTATCAGCATTGACCATCCCCAACGGAGCCACGTTACTTTCTACAATTAACCGCT
CTATGCGAGCGTATGCATCAGCCATCGTTGCAGCAGAGTACATTCTACAATGGCTTCCTA
AAGGCACACACGAGTGGTCAAGTTTTTTTAACTCCTGAAGAACTTACTATGATACTAAAA
CGCGCTTCAATCGATGTGAAGGAGATGGCTGGATTTGTGTACAACCCTATAACAGGAAAA
TGGTTACTGTCAGATGACACAAGTGTGAACTTCATCGCTTATGGAACGAGAAAGAATGAT
ATTGGAGACGTCTAATAGATTTGTTTCTGCATATCTGCCTCTGGAAGTTACTTAGGACAA
CAGAACAGTAGTTAGATTTGCAATAAGTGAGAGTGATCTGAGGTTACAGTTCCAAACTTT
ACTTGTCTTGTTGTTATCCATTCAGTTCTTAAATTCGCAGTAAGTAAGAGTGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B360TF U 1
AF RR4B360JQ C 411
AF RR4G160TF U 645
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ACAAAGCTTCTTCTAACAAAAGCCGAATCACACCGACGTCAACGTCTTCTCTCAATGAAC
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TTGATGCTGTTCTTGCCTTAGAGGTCATCGAGCATGTAGCCAACCCTGCAGAGTTCTGCA
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ATTGATGTTGGTTGTGGCGGTGGACTTCTTTCCGAGCCTCTAGCACGGATGGGAGCAACT
GTCACAGGAATTGATGCTGTTGGTAAGAATGTCAAGATTGCTCGTCTTCACGCTGATATG
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GGGAGGACGTTTGATGCTGTTCTTGCCTTAGAGGTCATCGAGCATGTAGCCAACCCTGCA
GAGTTCTGCAAGTCCTTATCAGCATTGACCATCCCCAACGGAGCCACGTTACTTTCTACA
ATTAACCGCTCTATGCGAGCGTATGCATCAGCCATCGTTGCAGCAGAGTACATTCTACAA
TGGCTTCCTAAAGGCACACACGAGTGGTCAAGTTTTTTTAACTCCTGAAGAACTTACTAT
GATACTAAAACGCGCTTCAATCGATGTGAAGGAGATGGCTGGATTTGTGTACAACCCTAT
AACAGGAAAATGGTTACTGTCAGATGACACAAGTGTGAACTTCATCGCTTATGGAACGAG
AAAGAATGATATTGGAGACGTCTAATAGATTTGTTTCTGCATATCTGCCTCTGGAAGTTA
CTTAGGACAACAGAACAGTAGTTAGATTTGCAATAAGTGAGAGTGATCTGAGGTTACAGT
TCCAAACTTTACTTGTCTTGTTGTTATCCATTCAGTTCTT

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TCTACAATTAACCGCTCTATGCGAGCGTATGCATCAGCCATCGTTGCAGCAGAGTACATT
CTACAATGGCTTCCTAAAGGCACACACGAGTGGTCAAGTTTTTT*AACTCCTGAAGAACT
TACTATGATACTAAAACGCGCTTCAATCGATGTGAAGGAGATGGCTGGATTTGTGTACAA
CCCTATAACAGGAAAATGGTTACTGTCAGATGACACAAGTGTGAACTTCATCGCTTATGG
AACGAGAAAGAATGATATTGGAGACGTCTAATAGATTTGTTTCTTCATATCTGCCTCTGG
AAGTTACTTAGGACAACAGAACAGTAGTTAGATTTGCAATAAGTGAGAGTGATCTGAGGT
TACAGTTCCAAACTTTACTTGTCTTGTTGTTATCCATTCAGTTCTTAAATTCGCAGTAAG
TAAGAGTGATCT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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TTTGTTCCTAGCAAGATGATATAAAACAAACAACGAAACTACTCCATTCCTCAAATGTCA
AAAGTGATCTTATGTACTTTAACCTGACAAATATAGAAAGGGGGCAGAAATTGTTTTGTT
TCTCACTATTTCTTCTTTTTTTTGAAATCCTTAACTTGAGTTCTCATTGACCTGAGACGA
CCCTGATGTTGATCCTGATGACGAAGAGGAGGAAGAGAACAATCCACTCAACGGCCACGG
TAATGAGAACCTTCTCTCGTTCCCACTAATATTCCTCGCATCCCTTTCCACATTCTCATT
ACTCAAGTTGACCCCTACACTTCTTGTCGCCGGTCTCACCAGATCAGCCTTCACCTCATC
ATCAGGAGGTAGTTCATATCGGCACACAGGACACGAACTGTGAAGCTCAAGCCACGGCAC
TATACACCGGCTATGAAACTTGTGCTTACACGGCATCTCTTTAGCCTCACTTCCTTTCTC
AAACTCCTCCAAACAAACCGAACATTGCAACGGCTCGCATACTTTAACCGTTGGGAGATT
CTCCACTGCTTCTTTCCGCGCTGGAAGTGTCCCTTGTCGCCTTATCAGATCGTTATCAGC
TAGATTTCGAAGCAAGCTGTCAAACTCCGGCCGAGCTAAGTAATCTCCAATGGCAGACCG
AGAAGCAGTGTTCCCGTCCGAGCTCTCGTGATCCGAGTTAATCCCTTCGCGAATACCTTG
AAGCAACTGCAGTATCGCAGCTGAGCTTCTCCGTCTCCTCCTGATGATGGAATCAACCTC
CCTGCCTAAATCAAATCTCCCCATCATGTTCCCTGTGGCGATGATGATGACGACGATTGT
GATGAGGGATTGTCGACAGTGCTGCTGCTGATGTCATCATCATTATCAAGACCAAAACTC
TGTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP73JQ U 1
AF RR4HB74JQB U 84
AF RR4HB74TF C 645
BS 1 168 RR4CP73JQ
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RD RR4CP73JQ 693 0 0
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TCTCACTATTTCTTCTTTTTTTTGAAATCCTTAACTTGAGTTCTCATTGACCTGAGACGA
CCCTGATGTTGATCCTGATGACGAAGAGGAGGAAGAGAACAATCCACTCAACGGCCACGG
TAATGAGAACCTTCTCTCGTTCCCACTAATATTCCTCGCATCCCTTTCCACATTCTCATT
ACTCAAGTTGACCCCTACACTTCTTGTCGCCGGTCTCACCAGATCAGCCTTCACCTCATC
ATCAGGAGGTAGTTCATATCGGCACACAGGACACGAACTGTGAAGCTCAAGCCACGGCAC
TATACACCGGCTATGAAACTTGTGCTTACACGGCATCTCTTTAGCCTCACTTCCTTTCTC
AAACTCCTCCAAACAAACCGAACATTGCAACGGCTCGCATACTTTAACCGTTGGGAGATT
CTCCACTGCTTCTTTCCGCGCTGGAAGTGTCCCTTGTCGCCTTATCAGATCGTTATCAGC
TAGATTTCGAAGCAAGCTGTCAAAATCCGGCC
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4HB74JQB 778 0 0
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CTGACAAATATAGAAAGGGGGCAGAAATTGTTTTGTTTCTCACTATTTCTTCTTTTTTTT
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AAGAGGAGGAAGAGAACAATCCACTCAACGGCCACGGTAATGAGAACCTTCTCTCGTTCC
CACTAATATTCCTCGCATCCCTTTCCACATTCTCATTACTCAAGTTGACCCCTACACTTC
TTGTCGCCGGTCTCACCAGATCAGCCTTCACCTCATCATCAGGAGGTAGTTCATATCGGC
ACACAGGACACGAACTGTGAAGCTCAAGCCACGGCACTATACACCGGCTATGAAACTTGT
GCTTACACGGCATCTCTTTAGCCTCACTTCCTTTCTCAAACTCCTCCAAACAAACCGAAC
ATTGCAACGGCTCGCATACTTTAACCGTTGGGAGATTCTCCACTGCTTCTTTCCGCGCTG
GAAGTGTCCCTTGTCGCCTTATCAGATCGTTATCAGCTAGATTTCGAAGCAAGCTGTCAA
ACTCCGGCCGAGCTAAGTAATCTCCAATGGCAGACCGAGAAGCAGTGTTCCCGTCCGAGC
TCTCGTGATCCGAGTTAATCCCTTCGCGAATACCTTGAAGCAACTGCAGTATCGCAGCTG
AGCTTCTCCGTCTCCTCCTGATGATGGAATCAACCTCCCTGCCTAAATCAA
TCTCCCC

QA 1 771 1 771
DS 

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TCAGATCGTTATCAGCTAGATTTCGAAGCAAGCTGTCAAACTCCGGCCGAGCTAAGTAAT
CTCCAATGGCAGACCGAGAAGCAGTGTTCCCGTCCGAGCTCTCGTGATCCGAGTTAATCC
CTTCGCGAATACCTTGAAGCAACTGCAGTATCGCAGCTGAGCTTCTCCGTCTCCTCCTGA
TGATGGAATCAACCTCCCTGCCTAAATCAAATCTCCCCATCATGTTCCCTGTGGCGATGA
TGATGACGACGATTGTGATGAGGGATTGTCGACAGTGCTGCTGCTGATGTCATCATCATT
ATCAAGACCAAAACTCTGTCCTCC

QA 1 324 1 324
DS 



AS 1 3

CO CL3657Contig1 882 3 35 U
GGAATCTGAAGGGAATGGCTGGAGAAGAGCAAAGACGAAGATGGAGCCTTAAAGGCAAAA
CCGCACTTGTCACCGGTGGAACCAAAGGCATTGGGCATGCTATAGTAGAGGAACTTGCAG
GATTTGGAGCAATAATACATACGTGTGCTAGAGATGAAGCACATCTCAACGAGTGTTTGA
GCGACTGGAAAAATAAAGGGTTTCAAGTCACTGGTTCAGTCTGTGACGCATCGTCCTGGA
CCGAAAGAGAGAAACTGATGCAGACTGTGTCCACTTTGTTTGATGCCAAACTCAGTATCC
TCATCAACAATGTTGGCGCAATCCGGTCAAAGCCAACAATTGAAAACACGGCCGAGGATT
TCTCGTTCCACATTTCCACCAACTTGGAATCTGCTTACCATTTTAGCCTGCTTGCACATC
CTCTGCTCAAGTCTTCAGGGTGTGGTAATATCGTGTTCATATCCTCTCTCGCTGGGGTCG
TGTCGTTTGGCGTCAGCTCCATCTACTGTGCAACAAAAGGGGCAATGAATCAGCTAGCAA
GGAGTTTGGCATGCGAATGGGCTAGCGACGGCATTAGGGCTAATGCTGTAGCTCCTACAG
TCATTGCCACTCCTCTCGTTGATGCGTTTGATGATGAATTCAAGAAAGCAGTGGAATCAA
CAAATCCCTTGGGGCTCTTAGGGAAGCCGGAGGAGGTAGCATCGCTTGTGGCATTTCTTT
GTATGCCTGCAGCTCCTTATATAACGGGTCAGACCATCTGTGACGATGGAGGTCTTTCTG
TAAATGGCTTCTCGTATCAGCCACATGCTTAAAACCAAATTGCCAAAACAAATCACAATT
TCAAGTTTCTACTTCATATGAATAATCTATTTTACTGGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX80TF U 1
AF RR4G883TF U 6
AF RR4G883JQ C 193
BS 1 127 RR4FX80TF
BS 128 128 RR4G883TF
BS 129 130 RR4FX80TF
BS 131 131 RR4G883TF
BS 132 134 RR4FX80TF
BS 135 135 RR4G883TF
BS 136 253 RR4FX80TF
BS 254 254 RR4G883TF
BS 255 262 RR4FX80TF
BS 263 263 RR4G883TF
BS 264 272 RR4FX80TF
BS 273 273 RR4G883TF
BS 274 289 RR4FX80TF
BS 290 290 RR4G883TF
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BS 295 394 RR4FX80TF
BS 395 395 RR4G883TF
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BS 409 409 RR4G883TF
BS 410 427 RR4FX80TF
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BS 468 468 RR4G883TF
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BS 639 675 RR4FX80TF
BS 676 676 RR4G883TF
BS 677 684 RR4FX80TF
BS 685 695 RR4G883TF
BS 696 696 RR4G883JQ
BS 697 707 RR4G883TF
BS 708 882 RR4G883JQ

RD RR4FX80TF 684 0 0
GGAATCTGAAGGGAATGGCTGGAGAAGAGCAAAGACGAAGATGGAGCCTTAAAGGCAAAA
CCGCACTTGTCACCGGTGGAACCAAAGGCATTGGGCATGCTATAGTAGAGGAACTTGCAG
GATTTGGGGCGATAGTACATACGTGTGCTAGAGATGAAGCACATCTCAACGAGTGTTTGA
GCGACTGGAAAAATAAAGGGTTTCAAGTCACTGGTTCAGTCTGTGACGCATCGTCCTGGA
CCGAAAGAGAGAAGCTGATGCAAACTGTGTCCGCTTTGTTTGATGCCAAGCTCGGTATCC
TCATCAACAATGTTGGCGCAATCCGGTCAAAGCCAACAATTGAAAACACGGCCGAGGATT
TCTCGTTCCACATTTCCACCAACTTGGAATCTGCGTACCATTTTAGCCAGCTTGCACATC
CTCTGCTGAAGTCTTCAGGGTGTGGTAATATCGTGTTCATATCCTCTGTCGCTGGGGTCG
TGTCGTTTGGCGTCAGCTCCATCTACTGTGCAACAAAAGGGGCAATGAATCAGCTAGCAA
GGAGTTTGGCATGCGAATGGGCTAGCGACGGCATTAGGGCTAATGCTGTAGCTCCTACAG
TCATTGCCACTCCTCTCGTTGATGCGTTTGCTGATGA*TTCAAGAAAGCAGTGGAATCAA
CAAATCCCTTGGGGCGCTTAGGGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4G883TF 702 0 0
GGGAG
GGGAATGGCTGGAGAAGAGCAAAGACGAAGATGGAGCCTTAAAGGCAAAACCGCACTTGT
CACCGGTGGAACCAAAGGCATTGGGCATGCTATAGTAGAGGAACTTGCAGGATTTGGAGC
AATAATACATACGTGTGCTCGCGATGAAGCACATCTCAACGAGTGTTTGAGTGACTGGAA
AAATAAAGGGTTTCAAGTCACTGGTTCAGTCTGTGACGCATCGTCCTGGACCGAAAGAGA
GAAACTGATGCAGACTGTGTCCACTTTGTTTGATGCCAAACTCAGTATCCTCATCAACAA
TGTTGGCGCAATCCGGTCAAAGCCAACAATTGAAAACACGGCCGAGGATTTCTCGTTCCA
CATTTCCACCAACTTGGAATCTGCTTACCATTTTAGCCTGCTTGCACATCCTCTGCTCAA
GTCTTCAGGGTGTGGTAATATCGTGTTCATATCCTCTCTCGCTGGGGTCGTGTCGTTTGG
CGTCAGCTCCATCTACTGTGCAACAAAAGGGGCAATGAATCAGCTAGCAAGGAGTTTGGC
ATGCGAATGGGCTAGCGACGGCATTAGGGCTAATGCTGTAGCTCCTACAGTCATTGCCAC
TCCTCTCGTTGATGCGTTTGATGATGAATTCAAGAAAGCAGTGGAATCAACAAATCCCTT
GGGGCTCTTAGGGAAGCCGGAGGAG*TAGCATCGCTT

QA 6 702 6 702
DS 

RD RR4G883JQ 690 0 0
ATAAAGGGTTTCAAGTCACTGGTTCAGTCTGTGACGCATCGTCCTGGACCGAAAGAGAGA
AACTGATGCAGACTGTGTCCACTTTGTTTGATGCCAAACTCAGTATCCTCATCAACAATG
TTGGCGCAATCCGGTCAAAGCCAACAATTGAAAACACGGCCGAGGATTTCTCGTTCCACA
TTTCCACCAACTTGGAATCTGCTTACCATTTTAGCCTGCTTGCACATCCTCTGCTCAAGT
CTTCAGGGTGTGGTAATATCGTGTTCATATCCTCTCTCGCTGGGGTCGTGTCGTTTGGCG
TCAGCTCCATCTACTGTGCAACAAAAGGGGCAATGAATCAGCTAGCAAGGAGTTTGGCAT
GCGAATGGGCTAGCGACGGCATTAGGGCTAATGCTGTAGCTCCTACAGTCATTGCCACTC
CTCTCGTTGATGCGTTTGATGATGAATTCAAGAAAGCAGTGGAATCAACAAATCCCTTGG
GGCTCTTAGGGAAGCCGGAGGAGGTAGCATCGCTTGTGGCATTTCTTTGTATGCCTGCAG
CTCCTTATATAACGGGTCAGACCATCTGTGACGATGGAGGTCTTTCTGTAAATGGCTTCT
CGTATCAGCCACATGCTTAAAACCAAATTGCCAAAACAAATCACAATTTCAAGTTTCTAC
TTCATATGAATAATCTATTTTACTGGAGGG

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL3658Contig1 575 3 2 U
GGCTTTTAAGATGGTTAATCCTTTGATAACAACTTCAAGATAGTTTTCAAGGCGACAACA
CAATGACTGATGCTTGTCATGTTAATGTCATTTAATGAAAGCTCATCCCAAAGAACTTGT
CTAAAGCAGGTACTACACTAGAGGGGAGTTTAAACGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTC
ATAAACCGGGTAAAAGCAAAGTCAATTTGCACTTGCGTAAGACAAAACAAAAGAACAACT
TCACGATGTAATCATCGGCTCTGGTTCTGACGGGTCGCTGGGAGTTTTGTCGGACTGGCG
TGCTGAGTTGAACAATATGTCTTTGATAACCTGTGACATTAATCCATGGACCTGCTCAAC
AGTTATCTTTGCACTATCCCGAGTTATCTTAGCCAGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCT
GTGAAGACTGGCCGGTATTCCTCCAAACCGGGAGTGAGCCAGCTGACTCTCGGCTTGCTC
AAGCTTCTCAGCCAAGTCTGATATCTGTCCGGCCACATAGTCTCCATTGCCCAGCAGTGG
GGAAGAAGAAAGAGTGTTCACCCAGTACTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CC10JQ U 1
AF RR4FN13JQ U 72
AF RR4H656JQB U 84
BS 1 574 RR4CC10JQ
BS 575 575 RR4H656JQB

RD RR4CC10JQ 574 0 0
GGCTTTTAAGATGGTTAATCCTTTGATAACAACTTCAAGATAGTTTTCAAGGCGACAACA
CAATGACTGATGCTTGTCATGTTAATGTCATTTAATGAAAGCTCATCCCAAAGAACTTGT
CTAAAGCAGGTACTACACTAGAGGGGAGTTTAAACGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTC
ATAAACCGGGTAAAAGCAAAGTCAATTTGCACTTGCGTAAGACAAAACAAAAGAACAACT
TCACGATGTAATCATCGGCTCTGGTTCTGACGGGTCGCTGGGAGTTTTGTCGGACTGGCG
TGCTGAGTTGAACAATATGTCTTTGATAACCTGTGACATTAATCCATGGACCTGCTCAAC
AGTTATCTTTGCACTATCCCGAGTTATCTTAGCCAGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCT
GTGAAGACTGGCCGGTATTCCTCCAAACCGGGAGTGAGCCAGCTGACTCTCGGCTTGCTC
AAGCTTCTCAGCCAAGTCTGATATCTGTCCGGCCACATAGTCTCCATTGCCCAGCAGTGG
GGAAGAAGAAAGAGTGTTCACCCAGTACTTGTTC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4FN13JQ 476 0 0
GCTTGTCATGTTAATGTCATTTAATGAAAGCTCATCCCAAAGAACTTGTCTAAAGCAGGT
ACTACACTAGAGGGGAGAGTAAACGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTCATAAACCGGGT
AAAAGCAAAGTCAATTTGCACTTGCGTAAGACAAAACAAAAAAACAACTTCATGATGTAA
TCATCGGCTCTGGTTCTGACGGGTCGCTGGGAGTTTTGTCGGACTGGCGTGCTGAGTTGA
ACAATATGTCTTTGATAACCTGTGACATTAATCCATGGACCTGCTCAACAGTTATCTTTG
CACTATCCCGAGTAATCTTAGCCAGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCTGTGAAGACTGG
CCGGTATTCCTCCAAACCGGGAGTGCGCCAGCTGACTCTCGGCTTGCTCAAGCTTCTCAG
CCAAGTCTGATATCTGTCCGGCCACATAGTCTCCATTGCCCAGCAGTGGGGAAGAA

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4H656JQB 492 0 0
AATGTCATTTAATGAAAGCTCATCCCAAAGAACTTGTCTAAAGCAGGTACTACACTAGAG
GGGAGTTTAAACGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTCATAAACCGGGTAAAAGCAAAGTC
AATTTGCACTTGCGTAAGACAAAACAAAAGAACAACTTCACGATGTAATCATCGGCTCTG
GTTCTGACGGGTCGCTGGGAGTTTTGTCGGACTGGCGTGCTGAGTTGAACAATATGTCTT
TGATAACCTGTGACATTAATCCATGGACCTGCTCAACAGTTATCTTTGCACTATCCCGAG
TTATCTTAGCCAGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCTGTGAAGACTGGCCGGTATTCCTC
CAAACCGGGAGTGAGCCAGCTGACTCTCGGCTTGCTCAAGCTTCTCAGCCAAGTCTGATA
TCTGTCCGGCCACATAGTCTCCATTGCCCAGCAGTGGGGAAGAAGAAAGAGTGTTCACCC
AGTACTTGTTCC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL3659Contig1 800 2 2 U
GCAAGAATTTCGTCGGCGGTATGTCTATTGTTACTAGTAGCACTAAGTACGGTTTATGAA
GTGCAAGGGACGTTTTTATTAAGGCACTTCCTTAGAAAAATTCCCAGAAGATCTAGGGGG
CTTAGGCCGTTCGCTTGCAAGGGTATGCTGAAGTTTGTGAACCTGTTGGAGTTGAAGTGC
CCATTGAAGCCTGTGTACAAGAACTTATTTGGAAATTTAAGGTCTTACGTGGGCGCAATA
AGTTCGGGGTCGAATGTTGACTTGAAAGGGGAAGCTGAGGGCGTCCAAAGTGCTCTGTCT
GCACTGGGTGGCACCGCCACCGGCACAGCCACTGGCACCGCCACCGGCACAGCCACCGGA
ACCGCCACCGGCACCGGCACCGGTACCGGTACCGCCACCGGCACTACCACTGGCACTGTC
CCTGTACTGGAATGGCTGGTGGACCTGCTACTTCAACGGAAGGAGGAAGCTCTTTTGGTA
GATCCTTTTCCGGAAAAACAGGGTCAACTAATTATGCAGGTTCTGTCAACTATCAATCAG
GCCACAAGTCTTCCCAACAAACTACCACAAGCAACTCAGGATCCCCAGGCGGCACGGTAT
CCCCAGGCAGCTTCTAGAAGGATTTGATTCAGCTCCAAGTACTAGAAAGACCGACCTTAG
AATATATATTTGATAATTATGTTTGCTTAAATAAGAAAACGGCCCTGCTAACATTCACAA
CAGCAAGCTGTAGAATGCCTGGCTTTATTACGCCTACCTTAAATAATACGGGAAAGATTT
TTTTGTTAACATTTTTTTTT


BQ
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BQ
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AAATTGGCAAAGAAACTGACATGTCCAGAGCTCATGTGCATTATGTGGTGACGGTTTACA
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BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG91TF U 1
AF RR4CB35TF U 58
AF RR4DG91JQ C 119
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BS 748 849 RR4DG91JQ

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GA
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CTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTTATGAGACCTGAGTTGGTGATGA
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TTATCATCAGCACCGGTATCAACCCGAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACG
CGCACCTCTCGTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCAGCTGGAATGGCCATTG
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TGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATTA
TCTTGTCCTCTCGAGCTGGTCAATCCAGAGCAGAATGAGAAACAAAACAAACGTCAGGTG
ATGATTATTATTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCACTTGCTCTCGTCTGTTTGTTTGGGG
TTGCGATCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTT
GGTTGGCTAATAATAAGACAAGTGTGCA
TGTTT

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DS 

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AAGTCCATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGACTCATCATCGCT
GTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCGAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATAC
GCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCATT
GGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTTAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGG
ATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATT
ATCTTGTCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAAAACAAACGTCAGGT
GATGATTATTATTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCACTTGCTCTCATCTGTTTGTTTGGG
GTTGCGATCTCCGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTT
TGGTTGGCTAATAATAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGA
ACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGTTA
TGATATTCCCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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TTTATTTTTTTCGACGATATATATGCATATATGATCTGGTTTTAGAGTCCTTTTGGCTAT
ATTTCATTTAAAATGGGAGAATTTATGATTAGTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G558TF U 1
AF RR4G558JQ C 387
BS 1 684 RR4G558TF
BS 685 685 RR4G558JQ
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RD RR4G558TF 735 0 0
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TTGGTAAAGTTTACAGAGGTTGGATCGATACCAAGACTCTTGCTCCTTCTAAAGCCGGTT
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GGCGATCGGAAGTTAACTTCTTGGGGATGCTTTCACACCCAAATCTGGTGAAGTTATTAG
GATACTGCCGTGAAGACAAAGAGCTTCTGCTTGTTTACGAGTTCATGCCCAAAGGAAGCC
TTGAAAGTCATCTTTTTCGAAGGAACGAGCCATTTCCTTGGGACCTAAGGATCAAGATTG
TGCTTGGTGCAGCTCGTGGCCTTGCGTTTCTACACGGCTTACAAAGAGAAGTCATATATA
GAGACTTCAAAGCCTCCAATATACTTCTGGACTCGAATTTTGATGCAAAGCTTTCAGATT
TCGGTTTAGCAAAGTTAGGACCATCACAAGAGAAGTCACACGTTACGACTAGGACCATGG
GCACGTTTGGTTACGCTGCTCCTGAATACATGGCAACAGGCCATTTATACGTTAAGAGTG
ATGTATATGCCTTTGGTGTAGTACTACTAGAAGTGATGACCGGACAAAGGGCATATAACC
CAAAACGCCCCAAGGGACAAGAGA*TCTAGTCGAATGGTTAAGACCAGAACTCTTGAGAA
A*CACAGAGTGAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4G558JQ 733 0 0
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DS 



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AATAGTGTGCAAAGCTTTAAATCCG


BQ
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QA 1 742 1 742
DS 

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AGTCGCTTGTTAATTCAGTAGCTAGAGAAGGCGTGGCTGGTGCTGATGAAGGACTAGAAA
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TTTTGCCCATCAATTAATAATAGTGTGCAAAGCTTTAAATCCG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

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TCAGTGTTTCTTATGCTAGTCCCGGCGATGCTGATCCAATTTACAGGGCATGTGTTAGAG
AATGCGAGGTAAGCGGTTGCGTTGGACAGTTATGCTTTCCTCAGTGCAACTCTTCGTCCA
AAGGTGGTCCATGGTACACACAAGAGCCTCTGTATCTACAATGGCAAAAGTGGGGCTGCC
AAGGCGATTGCCGTTATCACTGTATGGTTAACAGAGAGAAAGAACGCGAAACTCTCGGTC
ATTCCCCACTCAAGTATCATGGTAAATGGCTTTTCAAGCGTCTCCTTGGGTTCCAGGAGC
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TCTTCGCCACGCTATACTATAAGTTGCCTCTCAAACAAGACAAGACTGCTTACTATGAGT
ACGTCGGTTTGTGGCATATCTACGGTTTCCTGTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAG
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CAAGAGTCATGGTATCTGCTCCAGTACTAGCTTTTGTCACCACCCACATACTCTGTATTA
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AGCTTCTCCTATGGGCAAGATGGGCTGCTGTCTCTAGACATCCTTCTAACTGGAAACTGT
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ACACACTTTTTTCTATCTTATTGGAGTCTAGACTTTTGTCT


BQ
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AF RR4EK49TF U 1
AF RR4BX20JQ C 491
BS 1 718 RR4EK49TF
BS 719 1301 RR4BX20JQ

RD RR4EK49TF 718 0 0
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TGTTGCCTCTGGATTCTATTCGATCGTTTATCATATCTCTATGTGTTCTCCTGCGTAATC
ACTAGATCTCTATGGCAGCACGTTATTGTACATCCCTGTTTGTAGCCTTGTCATGTCTTC
TCAGTGTTTCTTATGCTAGTCCCGGCGATGCTGATCCAATTTACAGGGCATGTGTTAGAG
AATGCGAGGTAAGCGGTTGCGTTGGACAGTTATGCTTTCCTCAGTGCAACTCTTCGTCCA
AAGGTGGTCCATGGTACACACAAGAGCCTCTGTATCTACAATGGCAAAAGTGGGGCTGCC
AAGGCGATTGCCGTTATCACTGTATGGTTAACAGAGAGAAAGAACGCGAAACTCTCGGTC
ATTCCCCACTCAAGTATCATGGTAAATGGCTTTTCAAGCGTCTCCTTGGGTTCCAGGAGC
CTGCTTCTGTTGCTTTCTCCGTGCTAAACCTAGCCATGCATTTCCACGGCTGGCTCTCCT
TCTTCGCCACGCTATACTATAAGTTGCCTCTCAAACAAGACAAGACTGCTTACTATGAGT
ACGTCGGTTTGTGGCATATCTACGGTTTCCTGTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAG
TTTTCCACACTCGGGACGTTGACATCACAGAGAGGTTGGACTACTCATCTGCGATAGC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4BX20JQ 811 0 0
TGCTTTCTCCGTGCTAAACCTAGCCATGCATTTCCACGGCTGGCTCTC*TTCTTCGCCAC
GCTATACTATAAGTTGCCTCTCAAACAAGACAAGACTGCTTACTATGAGTACGTCGGTTT
GTGGCATATCTACGGTTTCCTGTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAGTTTTCCACAC
TCGGGACGTTGACATCACAGAGAGGTTGGACTACTCATCTGCGATAGCCGTTCTTGGGTT
CTCACTCATTGTATCCATCTTAAGAACCTTTGATGTTCGGGTCGAGGCTTCAAGAGTCAT
GGTATCTGCTCCAGTACTAGCTTTTGTCACCACCCACATACTCTGTATTAACTTCTACGA
ACTCGACTATGGTTGGAACATGATTGTGTGTGTGGCCATGGGAATAGCTCAGCTTCTCCT
ATGGGCAAGATGGGCTGCTGTCTCTAGACATCCTTCTAACTGGAAACTGTGGGTGGTTGT
GATAGCTTCAGGCTTAGCTATGCTTTTGGAGATATATGACTTTCCTCCATATGAAGGCTA
TTTCGATGCTCACTCCATTTGGCACGCTGCCACGGTTCCTCTAGCCGTTCTCTGGTGGAG
CTTTATTAGAGACGATGCTGAGTTCAGAACTTCCAGTCTTCTCAAGAAATCTAAGACAAA
GGCGAAGTGAGATTTGTCTTTAGTGTTTTTTCAATGTTTTTTATTCAGAGATTTGTCTTG
TCCTTGCTTTTTGCCGGTTGAGTTTTTGATATTAGTTTCTCATTCATTACACACACTTTT
TTCTATCTTATTGGAGTCTAGACTTTTGTCT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 3

CO CL3665Contig1 1178 3 10 U
TTTTTTTTCGGTACAATTGATACGGTTTCCGGTTTACCTTAATAAGTCAAAGAACATGAG
TCTGAAAGGCTGATTAAAACCAACAAAATCTCTCAGCAAGATAGTTAAGAGAATGATGAA
AACTTTTGAAAACACAGAGTACCGTCTAGAACAAAAAAAAACATAGCTAATCTGATTAGA
TCATCGAGGTTGTGATCTTTCCACCTAATTGAGTTAAAATAAAAAAAAAAGATAATAATA
ATACTAGACTACTAGTAGTTCAGCTTTGAAACAGAGTAGTAGTTTGATATCCAGCGGACT
GGTTCTTGTTTAAATAGCTTGCTTTGCCTCATGATCCTTAGGCTTGCAACACTCTGACTT
CTTCTTGAAGTTAAGCTTCCTGGTGAAGTTCTTCCAGCTTCTCTTAAACCTCACCAACTT
CTGAAGCTCTTGTTTCATGTTCATACACTCTTTCTCCAGCCCAAAAACCCTCTCTCTCAC
GTTCTCTCCTCTCGGCTTAAGTAAACCACCGTTCCCGCCATTCTGGTGCTCCGGGTTGTC
TAGATTCTCAGAGACAAAGAACCAGCTCGATATAGATGTCCTGAGCCTAAGCTGTTCGAA
AAACAGAACCTGGACAATCACCCTAAGAGGCAGCCTCTCGTTCTGTGCTGCATGTGCGCT
TGCTTCCAGTGAGAGCTTCTGGCAGTTCATGAGCCTACATATATGCTCCCTTTCCGAATC
CGTAATCCACGGATGTGCCTTCAAGAACACGTCAACTGCGTGATAGACTCCATCATCTAG
TGGTCTTGCGTACTCAGGGATTGCAGCAGCGATGGCTTCAAACTTCGCTAGCTTCAAGTT
AACATCAGGAGCAACCTCAGCTAGATAACCATCGACGAGAGTTGCCACTAGCGTTGGAGG
AGTTAGCATTTCGGCGCCATCTTTCACCAAATGTCCCTCTTCTACGATGCAAGGAGAAGG
GACCATGCCTGCTTGTTCCGTCGAAGAGACAAACTGTTCGATCATTCTCAGCACGCACTC
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TTGCTCAAGTTGGTTTCCTATGAGTCTCTCAAGATTCTCCCTCGAGGATTGGCTTGTGTG
CAACACCATCGCTGTCTGAAGCAGCCTGAGGAGAAACC


BQ
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AF RR4GP60JQ U 151
AF RR4BR78JQ U 1
AF RR4BR78TF C 480
BS 1 154 RR4BR78JQ
BS 155 155 RR4GP60JQ
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BS 465 724 RR4BR78JQ
BS 725 1178 RR4BR78TF

RD RR4GP60JQ 365 0 0
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GAGTTAAAATAAAAAAAAAAGATAATAATAATACTAGACTACTAGTAGTTCAGCTTTGAA
ACAGAGTAGTAGTTTGATATCCAGCGGACTGGTTCTTGTTTAAATAGCTTGCTTTGCCTC
ATGATCCTTAGGCTTGCAACACTCTGACTTCTTCTTGAAGTTAAGCTTCCTGGTGAAGTT
CTTCCAGCTTCTCTTAAACCTCACCAACTTCTGAAGCTCTTGTTTCATGTTCATACACTC
TTTCTCCAGCTCAAAAACCCTCTCTCTCACGTTCTCTCCTCTCGGCTTAAGTAAACCACC
GTTCC

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4BR78JQ 724 0 0
TTTTTTTTCGGTACAATTGATACGGTTTCCGGTTTACCTTAATAAGTCAAAGAACATGAG
TCTGAAAGGCTGATTAAAACCAACAAAATCTCTCAGCAAGATAGTTAAGAGAATGATGAA
AACTTTTGAAAACACAGAGTACCGTCTAGAACAAGAAAAAACATAGCTAATCTGATTAGA
TCATCGAGGTTGTGATCTTTCTACCTAATTGAGTTAAAATAAGAAAAAAAGATAATAATA
ATACTAGACTACTAGTAGTTCAGCTTTGAAACAGAGTAGTAGTTTGATATCCAGCGGACT
GGTTCTTGTTTAAATAGCTTGCTTTGCCTCATGATCCTTAGGCTTGCAACACTCTGACTT
CTTCTTGAAGTTAAGCTTCCTGGTGAAGTTCTTCCAGCTTCTCTTAAACCTCACCAACTT
CTGAAGCTCTTGTTTCATGTTCATACACTCTTTCTCCAGCCCAGAAACCCTCTCTCTCAC
GTTCTCTCCTCTCGGCTTAAGTAAACCACCGTTCCCGCCATTCTGGTGCTCCGGGTTGTC
TAGATTCTCAGAGACAAAGAACCAGCTCGATATAGATGTCCTGAGCCTAAGCTGTTCGAA
AAACAGAACCTGGACAATCACCCTAAGAGGCAGCCTCTCGTTCTGTGCTGCATGTGCGCT
TGCTTCCAGTGAGAGCTTCTGGCAGTTCATGAGCCTACATATATGCTCCCTTTCCGAATC
CGTA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BR78TF 699 0 0
ACG
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ACAGAACCTGGACAATCACCCTAAGAGGCAGCCTCTCGTTCTGTGCTGCATGTGCGCTTG
CTTCCAGTGAGAGCTTCTGGCAGTTCATGAGCCTACATATATGCTCCCTTTCCGAATCCG
TAATCCACGGATGTGCCTTCAAGAACACGTCAACTGCGTGATAGACTCCATCATCTAGTG
GTCTTGCGTACTCAGGGATTGCAGCAGCGATGGCTTCAAACTTCGCTAGCTTCAAGTTAA
CATCAGGAGCAACCTCAGCTAGATAACCATCGACGAGAGTTGCCACTAGCGTTGGAGGAG
TTAGCATTTCGGCGCCATCTTTCACCAAATGTCCCTCTTCTACGATGCAAGGAGAAGGGA
CCATGCCTGCTTGTTCCGTCGAAGAGACAAACTGTTCGATCATTCTCAGCACGCACTCGA
CATCATAAAGTGTTTCAGAGTATCCCATGTTTGGTATAAGAAGATCCACTAGAGCAGCTT
GCTCAAGTTGGTTTCCTATGAGTCTCTCAAGATTCTCCCTCGAGGATTGGCTTGTGTGCA
ACACCATCGCTGTCTGAAGCAGCCTGAGGAGAAACC

QA 4 699 4 699
DS 



AS 1 3

CO CL3666Contig1 1489 3 20 U
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TTTCATAATCCCATTAGCCCTTGGGTCAAACCACCCTAACTGTGACCTCACCAACAATCA
AGACCAAGGCTCCACCCTAAAAATCTTCCACATAGATAGCCCTTGCTCACCATTCAAATC
ATCCTCCCCACTCTCATGGGAAGCACGTGTACTAAAGACACTGGCTCAAGACCAGGCCCG
TCTCCAGTACTTGACCAGTCTCATCGCCGGGAGATCTGTGGTTCCCGTCGCCTCAGGCCA
TCAAATGTTGCAGAGCGCAACGTACATTGTCAAGGCTAAGATCGGTACTCCGGCTCAGAC
CCTACTCTTAGCCATGGACACGAGCAGTGACGTGGCGTGGTTACCTTGCTCTGGCTGCGT
TGGCTGTCCTTCAACCACCGCCTTTTCTCCAGCCAAGTCCACCACTTTCAAGAACGTCAG
TTGCAACGCTCCTCAGTGTAAGCAGATACCTAACCCCACATGCGGATCAAGCGCGTGCGC
TTTCAACCTCACATACGGAAGCTCTTCCATCGCAGCTAACCCCTCTCAGGACACGATCCG
ACTCGCCGCCGATCCGATCGAGGCCTTCACCTTTGGATGCGTCAACGAGGTCGCCGGTGG
AGGAACCATCCCTCCGCCACAAGGCTTGCTGGGCCTGGGAAGAGGCCCATTATCACTCAT
GACTCAAGCTCAGTCACTTTACCAGTCCACCTTCTCATACTGTTTACCGAGTTTCAGGTC
CCTCGCCTTCTCTGGTTCGTTGAGACTCGGTCCCACTTCTCAGCCCCTGCGCTTGAAGTA
CATGCCACTCTTGAGAAACCCGAGAAGGTCCTCTTTGTATTACGTCAACCTCGTTGCGAT
ACGTGTTGGTAATAAAGTCCTCGACTTACCTCAGGAAGCTATTGCTTTTAATCCCACCAC
CGGCGCTGGAACCATCTTTGACTCCGGGACCGTGTACACGCGGTTGGCTAAGCCGGTTTA
CGAGGCGGTGAGGGACGAGTTCAGGAGGCGCGTGAAGCCAAATAACGCTGTGGTGACGTC
ACTCGGAGGATTCGACACGTGCTACTCAGGGCAAGTCACAGTGCCGGCGATAACATTCAT
GTTGAAGGGAGTAAACATGACGATGCCAGCGGATAACCTGATGCTACACAGCACCGCCGG
GAGCACGTCGTGCCTCGCCATTGCTGTGGCGCCGGAAAACGTGAACTCGGTGGTCAACGT
GATCGCAAGCATGCAGCAGCAGAACCACCGTGTCTTGATCGATGTTCCCAATGGACGGAT
CGGGTTGGCACGTGAATTATGCTCTTAAAAAGTTGAAACCGACGAAAATTAATTAAGAGA
GCAGAGAGCCTTTTTTAATATATATATCTTGTTTGTTTGTTTTTGTGTTTTCATTTTTGT
TCTTCTCGTTATGTTTGTTACACAATATGGCACTATTCATCTGATTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ60TF U 1
AF RR4AC59TF U 1
AF RR4AC59JQ C 673
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BS 7 7 RR4FQ60TF
BS 8 19 RR4AC59TF
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BS 21 111 RR4AC59TF
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BS 113 204 RR4AC59TF
BS 205 205 RR4FQ60TF
BS 206 213 RR4AC59TF
BS 214 214 RR4FQ60TF
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BS 236 236 RR4FQ60TF
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BS 299 396 RR4AC59TF
BS 397 397 RR4FQ60TF
BS 398 587 RR4AC59TF
BS 588 588 RR4FQ60TF
BS 589 813 RR4AC59TF
BS 814 1489 RR4AC59JQ

RD RR4FQ60TF 641 0 0
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TTTCATAATCCCATTAGCCCTTGGGTCAAACCACCCTAACTGTGACCTCACCAACAATCA
AGACCAAGGCTCCACCCTAAGAATCTTCCACATAGATAGCCCTTGCTCACCATTCAAATC
ATCCTCCCCACTCTCATGGGAAGCACGTGTACTAAAGACACTGGCTCAAGACCAGGCCCG
TCTCCAGTACTTGACCAGTCTCATCGCCGGGAGATCTGTGGTTCCCGTCGCCTCAGGCCG
TCAAATGTTGCAGAGCGCAACGTACATTGTCAAGGCTAAGATCGGTACTCCGGCTCAGAC
CCTACTCTTGGCCATGGACACGAGCAGTGACGTGGCGTGGTTACCTTGCTCTGGCTGCGT
TGGCTGTCCTTCAACCACCGCCTTTTCTCCAGCCAAGTCCACCACTTTCAAGAACGTCAG
TTGCAACGCTCCTCAGTGTAAGCAGGTACCTAACCCCACATGCGGATCAAGCGCGTGCGC
TTTCAACCTCACATACGGAAGCTCTTCCATCGCTGCTAACCTCTCTCAGGACACGATCCG
CCTCGCCGCCGATCCGATCGAGGCCTTCACCTTTGGATGCG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4AC59TF 813 0 0
GGACATGTAACCCAAAACA*ATAATACAATGACCACTCTAGTTATATTCCTTCAGCTTCT
TTTCATAATCCCATTAGCCCTTGGGTCAAACCACCCTAACTGTGACCTCACGAACAATCA
AGACCAAGGCTCCACCCTAAAAATCTTCCACATAGATAGCCCTTGCTCACCATTCAAATC
ATCCTCCCCACTCTCATGGGAAGCGCGTGTACTGAAGACACTGGCTCAAGACCAGTCCCG
TCTCCAGTACTTGACCAGTCTCATCGCCGGGAGATCTGTGGTTCCCGTCGCCTCAGGGCA
TCAAATGTTGCAGAGCGCAACGTACATTGTCAAGGCTAAGATCGGTACTCCGGCTCAGAC
CCTACTCTTAGCCATGGACACGAGCAGTGACGTGGCTTGGTTACCTTGCTCTGGCTGCGT
TGGCTGTCCTTCAACCACCGCCTTTTCTCCAGCCAAGTCCACCACTTTCAAGAACGTCAG
TTGCAACGCTCCTCAGTGTAAGCAGATACCTAACCCCACATGCGGATCAAGCGCGTGCGC
TTTCAACCTCACATACGGAAGCTCTTCCATCGCAGCTAACCCCTCTCGGGACACGATCCG
ACTCGCCGCCGATCCGATCGAGGCCTTCACCTTTGGATGCGTCAACGAGGTCGCCGGTGG
AGGAACCATCCCTCCGCCACAAGGCTTGCTGGGCCTGGGAAGAGGCCCATTATCACTCAT
GACTCAAGCTCAGTCACTTTACCAGTCCACCTTCTCATACTGTTTACCGAGTTTCAGGTC
CCTCGCCTTCTCTGGTTCGTTGAGACTCGGTCC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4AC59JQ 817 0 0
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GTCACTTTACCAGTCCACCTTCTCATACTGTTTACCGAGTTTCAGGTCCCTCGCCTTCTC
TGGTTCGTTGAGACTCGGTCCCACTTCTCAGCCCCTGCGCTTGAAGTACATGCCACTCTT
GAGAAACCCGAGAAGGTCCTCTTTGTATTACGTCAACCTCGTTGCGATACGTGTTGGTAA
TAAAGTCCTCGACTTACCTCAGGAAGCTATTGCTTTTAATCCCACCACCGGCGCTGGAAC
CATCTTTGACTCCGGGACCGTGTACACGCGGTTGGCTAAGCCGGTTTACGAGGCGGTGAG
GGACGAGTTCAGGAGGCGCGTGAAGCCAAATAACGCTGTGGTGACGTCACTCGGAGGATT
CGACACGTGCTACTCAGGGCAAGTCACAGTGCCGGCGATAACATTCATGTTGAAGGGAGT
AAACATGACGATGCCAGCGGATAACCTGATGCTACACAGCACCGCCGGGAGCACGTCGTG
CCTCGCCATTGCTGTGGCGCCGGAAAACGTGAACTCGGTGGTCAACGTGATCGCAAGCAT
GCAGCAGCAGAACCACCGTGTCTTGATCGATGTTCCCAATGGACGGATCGGGTTGGCACG
TGAATTATGCTCTTAAAAAGTTGAAACCGACGAAAATTAATTAAGAGAGCAGAGAGCCTT
TTTTAATATATATATCTTGTTTGTTTGTTTTTGTGTTTTCATTTTTGTTCTTCTCGTTAT
GTTTGTTACACAATATGGCACTATTCATCTGATTGTT

QA 1 817 1 817
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3668Contig1 1086 3 5 U
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TTGAGAATGTAGAGGGACTAACCCACTTTGATGAGATTCTTCAAGAAGCTGATGGAATTA
TTCTTTCTCGTGGGAATTTGGGTATAGATCTACCCCCAGAGAAGGTGTTTTTGTTTCAAA
AGGCGGCTCTTTACAAGTGCAACATGGCTGGAAAGCCAGCCGTTCTTACCCGTGTTGTTG
ATAGTATGACTGACAACTTGCGACCAACTCGTGCGGAGGCAACTGATGTTGCTAATGCTG
TTTTAGATGGAAGTGATGCTATTCTTCTTGGTGCTGAGACTCTTCGTGGATTGTATCCTG
TTGAGACTATATCAATTGTCGGAAAGATCTGTGCTGAGGCAGAGAAGGTTTTCAATCAAG
ATTTGTACTTCAAGAAGACTGTCAAGTATGTTGGAGAACCGATGTCTCATCTGGAATCCA
TTGCTTCTTCAGCTGTACGGGCAGCCATCAAGGTCAAGGCATCCGTTATTATATGCTTCA
CGTCTTCTGGAAGAGCAGCAAGGTTAATTGCCAAATACAGGCCAACAATGCCGGTTATTT
CTGTTGTCATTCCAAGAGTTAAGACAAATCAGCTGAAATGGAGCTTTAGTGGAGCATTTG
AGGCGAGGCAGTCACTTATTGTCAGAGGACTCTTCCCCATGCTTGCTGACCCTCGTCACC
CTGCGGAATCAACAAGTGCAACGAACGATTCAGTCCTGAAGGTTGCACTAGACCACGGGA
AGCAAGCAGGAGTGATCAAGTCGCATGACAGAGTAGTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGATG
CATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGAAGATTAATAAATGGGAGGAAGAAAACAAACTC
TGCTACCTACTTTGTTTTTGCTTTGATCCAATGCCGGAGTTAAAGTATATACTAATCTTC
GGGACTTTTGGTTTTTGTACTTGGGAGATCTGATGTCTCTAACTTTTCCCTTTCTTTCTC
TTCGCTATACATTTAGTTGGTTTCAGATTAATGCTACGGTAAGAAAAAAGAAGTATACGA
TGTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER85TF U 1
AF RR4ER85JQ C 346
AF RR4E385TF U 972
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BS 692 971 RR4ER85JQ
BS 972 1086 RR4E385TF

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ATTTGTACTTCAAGAAGACTGTCAAGTATGTTGGAGAACCGATGTCTCATCTGGAATCCA
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CGTCTTCTGGAAGAGCAGCAAGGTTAATTGCCAAATACAGGCCAACAATGCCGGTTATTT
CTGTTGTCATTCCAAGAGTTAAGACAAATCAGCTGAAATGGAGCTTTAGTGGAGCATTTG
AG*CGAGGCAGTCACTTATTGTCAGAGGACT

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DS 

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AGGTTTTCAATCAAGATTTGTACTTCAAGAAGACTGTCAAGTATGTTGGAGAACCGATGT
CTCATCTGGAATCCATTGCTTCTTCAGCTGTACGGGCAGCCATCAAGGTCAAGGCATCCG
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TTAGTGGAGCATTTGAGGCGAGGCAGTCACTTATTGTCAGAGGACTCTTCCCCATGCTTG
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AGAAAGTTGGTGATGCATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGAAGATTAATAAATGGGAG
GAAGAAAACAAACTCTGCTACCTACTTTGTTTTTGCTTTGATCCAATGCCGGAGTTAAAG
TATATACTAATCTTCGGGACTTTTGGTTTTTGTACTTGGGAGATCTGATGTCTCTAACTT
TTCCCTTTCTTTCTCTTCGCTATACATTTAGTTGGTTTCAGATTAATGCTACGGT

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DS 

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TTTTTGTACTTGGGAGATCTGATGTCTCTAACTTTTCCCTTTCTTTCTCTTCGCTATACA
TTTAGTTGGTTTCAGATTAATGCTACGGTAAGAAAAAAGAAGTATACGATGTTAC

QA 1 115 1 115
DS 



AS 1 2

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AAAGGAGCGTGGTGCTGGGCATTGATTATTGTTTTGCTTTCTCTGTTCGTCCAATCCTCG
ACGGCCATTTATTGCGGCGAAGACGATTGCTATGCTCTCCTCGGAGTGGCTCAAGATGCA
AACGCATCGGATATAAAGAGATCTTACTACAAGCTTTCTCTCGAACATCATCCAGATAAG
AATCCAGATCCTGAATCCAAGAAGCTCTTTGTCAGAATCGCCACTGCTTATGAGATTTTG
AAGGATAACGAGACGCGTTCACAGTATGATTATGCTATTGAGCATCCAAGTGAGGTGTTT
TACAACACTGCTCAATACTACCGAGCCAAATATGGACATAAGTCGGATCCTCGTGCTGTT
CTTGTTGGTCTTCTGGTAGTTTTGTCTGCGTTTCAGTATCCGAACAACGTTGCTAGGTAT
AATGAGGCTTTGGCAACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTACAAAAACAGGCTCAAGGCCTTG
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AAACTACAGGAAGAGCTAAGCAACGAACTCGACCTGCAAATCAAAGGAGCTGAAAAACCA
TCAGTCTGGGATCTTCTCGGTGTTCGATTTGTTCTCCTCCCTTATACTATCATCAAGCTT
CTAGTATGGTACAGCAGCTGGGTATGGAGATATAAGGTTAAGAAAGCTCCTTATTCATGG
GAAGACGCATCTTACTTAACACGAAGATCACTTGGGGTGCCTCTTGACGCCTGGACTAAT
CTCGATGAATACAAAAAGGAAGATCTGGTGCAGAGAAGGCTATGGGAGAAGCAGAACCTT
GAGAACTACTATGCAGAAATGCGTAAAGAATCAAAGCGGAGAAGATAGATCCACTTATCA
CTTACCATGCAAGGAGGACATGGGAACTCAAGTTTCACAGAAGCACTTTTGTTACCTTTA
TTACTTTAAGGTTATTAAGATATCTGAACAAACAAACCAGTTACAAGAAGAGACGGTATA
ATTTGTATGGTACAAGGAACCAAATCTCAATTTAGCATATACAAGTTGGGTCATGTCTGA
TAATGGGCATGTTCCGGTTTTGACTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC68TF U 1
AF RR4DC68JQ C 538
BS 1 656 RR4DC68TF
BS 657 657 RR4DC68JQ
BS 658 756 RR4DC68TF
BS 757 757 RR4DC68JQ
BS 758 774 RR4DC68TF
BS 775 1168 RR4DC68JQ

RD RR4DC68TF 774 0 0
GGGCTCTCATTTCAGTTTCTCCCAATACGCAGCGAGAAAGAGAGAGATGGCGCCGCCGGC
AAAGGAGCGTGGTGCTGGGCATTGATTATTGTTTTGCTTTCTCTGTTCGTCCAATCCTCG
ACGGCCATTTATTGCGGCGAAGACGATTGCTATGCTCTCCTCGGAGTGGCTCAAGATGCA
AACGCATCGGATATAAAGAGATCTTACTACAAGCTTTCTCTCGAACATCATCCAGATAAG
AATCCAGATCCTGAATCCAAGAAGCTCTTTGTCAGAATCGCCACTGCTTATGAGATTTTG
AAGGATAACGAGACGCGTTCACAGTATGATTATGCTATTGAGCATCCAAGTGAGGTGTTT
TACAACACTGCTCAATACTACCGAGCCAAATATGGACATAAGTCGGATCCTCGTGCTGTT
CTTGTTGGTCTTCTGGTAGTTTTGTCTGCGTTTCAGTATCCGAACAACGTTGCTAGGTAT
AATGAGGCTTTGGCAACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTACAAAAACAGGCTCAAGGCCTTG
GAACTCGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAAGGGTCCAAAGCAGATCGACCAG
AAACTACAGGAAGAGCTAAGCAACGAACTCGACCTGCAAATCAAAGGAGCTGAAAA*CCA
TCAGTCTGGGATCTTCTCGGTGTTCGATTTGTTCTCCTCCCTTATACTATCATCAAGCTT
CTAGTATGGTACAGCAGCTGGGTATGGAGATATAAG*TTAAGAAAGCTCCTTAT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4DC68JQ 631 0 0
TTGGAACTCGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAAGGGTCCAAAGCAGATCGAC
CAGAAACTACAGGAAGAGCTAAGCAACGAACTCGACCTGCAAATCAAAGGAGCTGAAAAA
CCATCAGTCTGGGATCTTCTCGGTGTTCGATTTGTTCTCCTCCCTTATACTATCATCAAG
CTTCTAGTATGGTACAGCAGCTGGGTATGGAGATATAAGGTTAAGAAAGCTCCTTATTCA
TGGGAAGACGCATCTTACTTAACACGAAGATCACTTGGGGTGCCTCTTGACGCCTGGACT
AATCTCGATGAATACAAAAAGGAAGATCTGGTGCAGAGAAGGCTATGGGAGAAGCAGAAC
CTTGAGAACTACTATGCAGAAATGCGTAAAGAATCAAAGCGGAGAAGATAGATCCACTTA
TCACTTACCATGCAAGGAGGACATGGGAACTCAAGTTTCACAGAAGCACTTTTGTTACCT
TTATTACTTTAAGGTTATTAAGATATCTGAACAAACAAACCAGTTACAAGAAGAGACGGT
ATAATTTGTATGGTACAAGGAACCAAATCTCAATTTAGCATATACAAGTTGGGTCATGTC
TGATAATGGGCATGTTCCGGTTTTGACTCCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 3

CO CL3670Contig1 709 3 8 U
GGATATCTACGAGTGGCAATCCACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGT
TAATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCAC
TGTTAAGTCTGCTAGCTTTGGGACGCCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAG
TTGTCATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTG
TTCTGTAACTGTAGCACCAGCCATATTTGGTGGTGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAA
ACTCGCAGTAGAAGCGGTTTGTGGTTAAACCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAATTTCACATT
CTTACAGGTTTTTACTTTATTTCTGATCGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCG
GTGGAAGTTGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTATATGTGAA
TAAGCTTTGTGTGGTAATTGTAACCCTAAGAGAGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGGAGA
ATAAGGTGTCCATGTGTTGATGATTCTTTGAGGGCAAAACTGGGATTATATTGTTCTCTG
AGTTTTGCTTCCAACCTTGTGTTTGTTGTTGTTGCTGTAGTAATTGTATTAGCTGAGACA
TTTCTCTGCAATTATCTCATTGCTGTACTTATGTAACGTTTTTATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4FS56TF U 173
AF RR4G527TF U 1
AF RR4FS56JQ C 411
BS 1 374 RR4G527TF
BS 375 375 RR4FS56TF
BS 376 511 RR4G527TF
BS 512 512 RR4FS56TF
BS 513 587 RR4G527TF
BS 588 588 RR4FS56JQ
BS 589 706 RR4G527TF
BS 707 709 RR4FS56JQ

RD RR4FS56TF 365 0 0
G
AAGGAAGTTGTCATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGA
ACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCAGCCATGTTTGGTGGTGATCCGTGTCCAAATGTGA
TGAAGAAACTCGCAGTAGAAGCGGTTTGTGGTTAAACCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAATT
TCACATTCTTACAGGTTTTTACTTTATTTCTGATCGTATTAGTATGTTTGTG*CTATTTT
ACAAGCGGTGGAAGTTGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTAT
ATGTGAATAAGCTTTGTGTGGTAATTGTAACCCTAAGAGAGAAGAAGAAGCACATTGAGA
CTGG

QA 2 365 2 365
DS 

RD RR4G527TF 706 0 0
GGATATCTACGAGTGGCAATCCACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGT
TAATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCAC
TGTTAAGTCTGCTAGCTTTGGGACGCCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAG
TTGTCATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTG
TTCTGTAACTGTAGCACCAGCCATATTTGGTGGTGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAA
ACTCGCAGTAGAAGCGGTTTGTGGTTAAACCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAATTTCACATT
CTTACAGGTTTTTATTTTATTTCTGATCGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCG
GTGGAAGTTGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTATATGTGAA
TAAGCTTTGTGTGGTAATTGTAACCCTAAGAAAGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGGAGA
ATAAGGTGTCCATGTGTTGATGATTCTTTGAGGGCAAAACTGGGATTGTATTGTTCTCTG
AGTTTTGCTTCCAACCTTGTGTTTGTTGTTGTTGCTGTAGTAATTGTATTAGCTGAGACA
TTTCTCTGCAATTATCTCATTGCTGTACTTATGTAACGTTTTTATT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FS56JQ 299 0 0
TTTACAAGCGGTGGAAGTTGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATT
TATATGTGAATAAGCTTTGTGTGGTAATTGTAACCCTAAGAGAGAAGAAGAAGCACATTG
AGACTGGAGAATAAGGTGTCCATGTGTTGATGATTCTTTGAGGGCAAAACTGGGATTATA
TTGTTTTTTGAGTTTTGCTTCCAACCTTGTGTTTGTTGTTGTTGCTGTAGTAATTGTATT
AGCTGAGACATTTCTCTGCAATTATTTCATTGCTGTACTTATGTAACGTTTTTATTTCT

QA 1 299 1 299
DS 



AS 1 2

CO CL3671Contig1 1233 2 8 U
GGGAAAGAGGTACTATCTCCATATACATAGGAAACAAAGGACCATCCAACCTCAGATTTT
CCCAATTTTTCCGAGAAAGGGACGGGCATAGATTAGCTGCAGCTAGGATCTAGCCAGTAG
CTGATGAAGAGACGAAGAGCGACGAATAAATCTTCGGTGATGGTGACTGTTATCAATTCG
AAACGATTCGAGACGAGAATTGTAAGGAGATTGATGAAGTTCGAGGAATTGCCTGGTTAT
TTGCAGGATAACGAGTTTATACACGACCATTATCGATGCCAATGGTCTCTCAGAGATACC
TTACTCAGCACCTTCTCTTGGCATAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTGATCGGA
TTTGTGTTATTTCTGTGGATGATGGTGGTGAGTTCATTAGAGACGACGGAGCTCGGCCTC
GCCGGACTCTTCAATGGAATGTCCGGAGCGTGGATGATTAGCCTCTCAAGCAATCAGAGT
CTGCTTCATCATGATTCGAACGTGACACATCTCCCGCAGGATTCGAACGTGACACAGTAT
ATGTCACTGCTAAACTTTCAAGCAGAAGTGAACCATCACATCCACCACCAAGAAGTTGTT
CCGAAATGGCCATGGCTTGTGTACTTAGCCGGAGCCATGGGTTGCTTGATCTGTAGCACT
GTTTCGCACCTCCTCGCTTGCCACTCAAAACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGTTTAGAC
TACTCAGGAATCTCACTCATGATTGTCTCCTCTTTCTTTGCGCCTATCTACTACGCATTC
TCTTGCCACACTAACTTCCGTTTCCTCTACCTATCCTCAATCTCAATCCTCGGCCTCCTC
GCCATCATCACCCTCCTCTCTCCAGCTCTCTCATCACCACGTTTCAGACCATTCAGGGCA
GCCCTTTTCCTTGCAATGGGATTCTCTAGTGTGGTGCCTGCTTCACAAGTGCTTTGCCTT
TACTGGGGCCACCCTAATGTGCTCTTCGCCCTCGCTTGCGAGCTTATCACTGGTATCTCA
TATGCTGTGGGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATTGAAGCCTGGGGCG
TTTGACACTGCAGGACATAGCCATCAAATATTCCATGTGTTTGTAGTTTTGGGAGCTCTT
GTTCATTGTGTTGCCACTCTTCTCATTGTAGATTTTCGACGAAAGTCTCTTTCTTGTGGG
TTTTAGCCAGAGAGTAAGCATTAGTTTGTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DI05TF U 1
AF RR4DI05JQ C 481
BS 1 689 RR4DI05TF
BS 690 690 RR4DI05JQ
BS 691 715 RR4DI05TF
BS 716 716 RR4DI05JQ
BS 717 763 RR4DI05TF
BS 764 764 RR4DI05JQ
BS 765 784 RR4DI05TF
BS 785 1233 RR4DI05JQ

RD RR4DI05TF 784 0 0
GGGAAAGAGGTACTATCTCCATATACATAGGAAACAAAGGACCATCCAACCTCAGATTTT
CCCAATTTTTCCGAGAAAGGGACGGGCATAGATTAGCTGCAGCTAGGATCTAGCCAGTAG
CTGATGAAGAGACGAAGAGCGACGAATAAATCTTCGGTGATGGTGACTGTTATCAATTCG
AAACGATTCGAGACGAGAATTGTAAGGAGATTGATGAAGTTCGAGGAATTGCCTGGTTAT
TTGCAGGATAACGAGTTTATACACGACCATTATCGATGCCAATGGTCTCTCAGAGATACC
TTACTCAGCACCTTCTCTTGGCATAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTGATCGGA
TTTGTGTTATTTCTGTGGATGATGGTGGTGAGTTCATTAGAGACGACGGAGCTCGGCCTC
GCCGGACTCTTCAATGGAATGTCCGGAGCGTGGATGATTAGCCTCTCAAGCAATCAGAGT
CTGCTTCATCATGATTCGAACGTGACACATCTCCCGCAGGATTCGAACGTGACACAGTAT
ATGTCACTGCTAAACTTTCAAGCAGAAGTGAACCATCACATCCACCACCAAGAAGTTGTT
CCGAAATGGCCATGGCTTGTGTACTTAGCCGGAGCCATGGGTTGCTTGATCTGTAGCACT
GTTTCGCACCTCCTCGCTTGCCACTCAAA*CGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGTT*AGAC
TACTCAGGAATCTCACTCATGATTGTCTCCTCTTTCTTTGCGC*TATCTACTACGCATTC
TCTT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4DI05JQ 753 0 0
CTGCTTCATCATGATTCGAACGTGACACATCTCCCGCAGGATTCGAACGTGACACAGTAT
ATGTCACTGCTAAACTTTCAAGCAGAAGTGAACCATCACATCCACCACCAAGAAGTTGTT
CCGAAATGGCCATGGCTTGTGTACTTAGCCGGAGCCATGGGTTGCTTGATCTGTAGCACT
GTTTCGCACCTCCTCGCTTGCCACTCAAAACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGTTTAGAC
TACTCAGGAATCTCACTCATGATTGTTTCCTCTTTCTTTGCGCCTATTTACTACGCATTC
TCTTGCCACACTAACTTCCGTTTCCTCTACCTATCCTCAATCTCAATCCTCGGCCTCCTC
GCCATCATCACCCTCCTCTCTCCAGCTCTCTCATCACCACGTTTCAGACCATTCAGGGCA
GCCCTTTTCCTTGCAATGGGATTCTCTAGTGTGGTGCCTGCTTCACAAGTGCTTTGCCTT
TACTGGGGCCACCCTAATGTGCTCTTCGCCCTCGCTTGCGAGCTTATCACTGGTATCTCA
TATGCTGTGGGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATTGAAGCCTGGGGCG
TTTGACACTGCAGGACATAGCCATCAAATATTCCATGTGTTTGTAGTTTTGGGAGCTCTT
GTTCATTGTGTTGCCACTCTTCTCATTGTAGATTTTCGACGAAAGTCTCTTTCTTGTGGG
TTTTAGCCAGAGAGTAAGCATTAGTTTGTGACC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

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TTCTATAATCTCAAGAGTGCTATTATCTTCTACAAAATTGCGATGCATTCGTTGATGCTT
TCATCAAAACTGGCAGAAGTTCTGATCTATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACTC
TGCAGGGCATTCGTTTCAGCGTCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGC
CAAAAGGTGAAAGAAGCAGCAGAGG*AGTGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACC
ACCGAGTATATCCACGATGTCGCTTCTACTACGGCTAATCGTGTGAGCAAGATGACAAAG
GATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAACGGATACTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCT
GTATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAAACGCTACTGATATCATCAAAAAAAAATTCTTG
GTGGTGATTAGTTACTACTTATAAATATTTAATATGTTTATGTATGTTTCAATAAAATTA
GTATTCAAAATATTTGTAAACTTTAATTGGCAACAAATGCTTCAATGATATTTCTGACTA
AATTTTAAGAATAAATCATAACTGTCTAAATTTGGT


BQ
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AF RR4GX77TF U 1
AF RR4GX77JQ C 89
AF RR4F950TF U 2
BS 1 591 RR4GX77TF
BS 592 636 RR4F950TF

RD RR4GX77TF 591 0 0
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TTCTATAATCTCAAGAGTGCTATTATCTTCTACAAAATTGCGATGCATTCGTTGATGCTT
TCATCAAAACTGGCAGAAGTTCTGATCTATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACTC
TGCAGGGCATTCGTTTCAGCGTCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGC
CAAAAGGTGAAAGAAGCAGCAGAGG*AGTGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACC
ACCGAGTATATCCACGATGTCGCTTCTACTACGGCTAATCGTGTGAGCAAGATGACAAAG
GATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAACGGATACTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCT
GTATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAAACGCTACTGATATCATCAAAAAAAAATTCTTG
GTGGTGATTAGTTACTACTTATAAATATTTAATATGTTTATGTATGTTTCAATAAAATTA
GTATTCAAAATATTTGTAAACTTTAATTGGCAACAAATGCTTCAATGATAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4GX77JQ 486 0 0
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TGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACCACCGAGTATATCCACGATGTCGCTTCTA
CTACGGCTAATCGTGTGAGCAAGATGACAAAGGATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAA
CGGATACTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCTGTATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAA
ACGCTACTGATATCATCAAAAAAAAATTCTTGGTGGTGATTAGTTACTACTTATAAATAT
TTAATATGTTTATGTATGTTTCAATAAAATTAGTATTCAAAATATTTGTAAACTTTAATT
GGCAAC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR4F950TF 635 0 0
GGATAGGATTCAAACCAGAAGTTCTAATTTGTGAGGGGTTCATTTATTCTCTCTAACGTT
TCTATAATCTCAAGAGTGCTATTATCTTCTACAAAATTGCGATGCATTCGTTGATGCTTT
CATCAAAACTGGCAGAAGTTCTGATCTATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACTCT
GCAGGGCATTCGTTTCAGCGTCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGCC
AAAAGGTGAAAGAAGCAGCAGAGGCAGTGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACCA
CCGAGTATATCCACGATGTCGCTTCTACTACGGCTAATCGTGTGAGCAAGATGACAAAGG
ATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAACGGATACTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCTG
TATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAAACGCTACTGATATCATCAAAAAAAAATTCTTGG
TGGTGATTAGTTACTACTTATAAATATTTAATATGTTTATGTATGTTTCAATAAT*TTAG
TATTCAAAATATTTGTAAACTTTAATTGGCAACAAATGCTTCAATGATATTTCTGACTAA
ATTTTAAGAATAAATCATAACTGTCTAAATTTGGT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL3673Contig1 996 2 2 U
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GTCTTGGCATCTCCAAAGTGGTGGAGAACAAAGAAATTAAAGGCACTCTCACTGGAGTCA
CCATTGGGACTGTCACATCGAGTGGGACCGTGACACCTACTCAGAAAGTCTGGAGAACTT
TTCAGTCTCTTGGGAACATTGCCTTTGCCTATGCTTACTCCATGATCCTCATCGAGATCC
AGGACACGTTGAAATCACCACCTGCAGAGGAAAACACAATGAGGAAAGCGACGCTCATAA
GTGTAGCGGTGACAACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTAGGGTATGCAGCTTTTG
GGGACTCCTCACCTGGAAACCTCCTCGCCGCTGGAGGATTCAGAAACCCCTATTGGTTAC
TCGACATAGCCAACCTCGCCATAGTGATCCACCTTGTCGGAGCATACCAAGTCTACTGCC
AGCCACTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTATCCAGAGAGCAAGTTCA
TCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTCCCAGGATCAAAGCCTTTCAACTTGAACCTCT
TTAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATTACAACAACGTTGATCTCTATGCTGATGC
CTTTCTTCAACGATGTGCTTGGTCTCTTGGGGGCCATCGGGTTCTGGCCTCTAACGGTAT
ATTTCCCTGTCGAGATGTACATTGTGCAGAAGAATGTGCGGAGATGGAGCACGATGTGGG
TTTGTCTTCAGGTTTTAAGTCTGGCTTGTCTTGTTGTGTCTGTGGCCGCGGCCGCAGGAT
CTGTGGTTGGGATTGTTACTGATCTCCAGAGTTACAGACCTTTCAAGACGGATTTTTGAG
AGCCCTTTCGGAACAAATAAACTCCGCAATAGGGATGCAGTTATATATAAAATTGGATGT
TGTGACTTGATCTTTTAAGTTAGTTAAAACTTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G611TF U 1
AF RR4EH09JQ C 345
BS 1 696 RR4G611TF
BS 697 996 RR4EH09JQ

RD RR4G611TF 696 0 0
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GTCTTGGCATCTCCAAAGTGGTGGAGAACAAAGAAATTAAAGGCACTCTCACTGGAGTCA
CCATTGGGACTGTCACATCGAGTGGGACCGTGACACCTACTCAGAAAGTCTGGAGAACTT
TTCAGTCTCTTGGGAACATTGCCTTTGCCTATGCTTACTCCATGATCCTCATCGAGATCC
AGGACACGTTGAAATCACCACCTGCAGAGGAAAACACAATGAGGAAAGCGACGCTCATAA
GTGTAGCGGTGACAACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTAGGGTATGCAGCTTTTG
GGGACTCCTCACCTGGAAACCTCCTCGCCGCTGGAGGATTCAGAAACCCCTATTGGTTAC
TCGACATAGCCAACCTCGCCATAGTGATCCACCTTGTCGGAGCATACCAAGTCTACTGCC
AGCCACTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTATCCAGAGAGCAAGTTCA
TCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTCCCAGGATCAAAGCCTTTCAACTTGAACCTCT
TTAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATTACAACAACGTTGATCTCTATGCTGATGC
CTTTCTTCAACGATGTGCTTGGTCTCTTGGGGGCCA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4EH09JQ 652 0 0
GGGTATGCAGCTTTTGGGGACTCCTCACCTGGAAACCTCCTCGCCGCTGGAGGATTCAGA
AACCCCTATTGGTTACTCGACATAGCCAACCTCGCCATAGTGATCCACCTTGTCGGAGCA
TACCAAGTCTACTGCCAGCCACTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTAT
CCAGAGAGCAAGTTCATCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTCCCAGGATCAAAGCCT
TTCAACTTGAACCTCTTTAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATTACAACAACGTTG
ATCTCTATGCTGATGCCTTTCTTCAACGATGTGCTTGGTTTCTTGGGGGCCATCGGGTTC
TGGCCTCTAACGGTATATTTCCCTGTCGAGATGTACATTGTGCAGAAGAATGTGCGGAGA
TGGAGCACGATGTGGGTTTGTCTTCAGGTTTTAAGTCTGGCTTGTCTTGTTGTGTCTGTG
GCCGCGGCCGCAGGATCTGTGGTTGGGATTGTTACTGATCTCCAGAGTTACAGACCTTTC
AAGACGGATTTTTGAGAGCCCTTTCGGAACAAATAAACTCCGCAATAGGGATGCAGTTAT
ATATAAAATTGGATGTTGTGACTTGATCTTTTAAGTTAGTTAAAACTTTTTT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 3

CO CL3674Contig1 866 3 7 U
GGACTAGGAACTTGTCACCTCAACGGAAAGTTTGATCACAAGCCCATTGAGTTAGTTGTG
TCTACTTACCAGGCTGCTGTTCTTCTGCTGTTCAACACCATAGACAAATTGAGCTACAAC
GATATCCTAACTCAACTGAACCTAAGCCACGAAGATCTAGTGAGGTTGCTTCATTCCCTG
TCATGTGCTAGGTACAAGATCCTTCTCAAGGAGCCAAGCACAAAGACCGTTACGCAGACT
GATTCATTTGAATTCAATGCCAAATTCACAGACAGAATGCGCAGAATCAAGATCCCTCTC
CCTCCTGTTGATGAAAGGAAGAAGGTTGTGGAAGATGCGGACAAAGACAGACGCTATGCG
ATTGATGCTGCCATTGTTAGGATCATGAAGAGCAGGAAAGTATTGGGACATCAACAACTC
GTCTCTGAGTGCGTTGAGCAACTGAGCCGAATGTTCAAGCCTGATATCAAAGCGATCAAG
AAGCGTATGGAGGATCTAATTACGAGGGATTATTTGGAGAGGGACAAGGAGAACCCTAAC
ATGTTTAGGTACTTGGCTTAGAGGCAAAGAAAAAACAACTATGG*AGGTGGTTTGCTGGC
TCATGAAAGAACGAAGCATCTCTCTGCTCTTCTCTGCTTGTATATGAAAATCTTATTTGG
ATACTTCTACCCTAAGAAAAAACTTTGGTTTCTTTATTAACAATCGGTCTGTGCTTTTTT
ATTCTTGGGATGCAAATTACTTTTTGGGGGGTTTTTGTTTCTTGGATATGAATGAATGGA
GATGGAACTGATGATCTCTGCTGTTAAATACGTTCATCTTCCTTTTGACGATTCTGTTTG
GAGTTTATTGCATCTTTGCTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DY52TF U 1
AF RR4DU58TF U 278
AF RR4DY52JQ C 147
BS 1 574 RR4DY52TF
BS 575 575 RR4DU58TF
BS 576 584 RR4DY52TF
BS 585 585 RR4DU58TF
BS 586 681 RR4DY52TF
BS 682 802 RR4DU58TF
BS 803 866 RR4DY52JQ

RD RR4DY52TF 681 0 0
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TCTACTTACCAGGCTGCTGTTCTTCTGCTGTTCAACACCATAGACAAATTGAGCTACAAC
GATATCCTAACTCAACTGAACCTAAGCCACGAAGATCTAGTGAGGTTGCTTCATTCCCTG
TCATGTGCTAGGTACAAGATCCTTCTCAAGGAGCCAAGCACAAAGACCGTTACGCAGACT
GATTCATTTGAATTCAATGCCAAATTCACAGACAGAATGCGCAGAATCAAGATCCCTCTC
CCTCCTGTTGATGAAAGGAAGAAGGTTGTGGAAGATGCGGACAAAGACAGACGCTATGCG
ATTGATGCTGCCATTGTTAGGATCATGAAGAGCAGGAAAGTATTGGGACATCAACAACTC
GTCTCTGAGTGCGTTGAGCAACTGAGCCGAATGTTCAAGCCTGATATCAAAGCGATCAAG
AAGCGTATGGAGGATCTAATTACGAGGGATTATTTGGAGAGGGACAAGGAGAACCCTAAC
ATGTTTAGGTACTTGGCTTAGAGGCAAAGAAAAA*CAACTATGGGAGGTGGTTTGCTGGC
TCATGAAAGAACGAAGCATCTCTCTGCTCTTCTCTGCTTGTATATGAAAATCTTATTTGG
ATACTTCTACCCTAAGAAAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4DU58TF 527 0 0
G
GCGCAGAATCAAGATCCCTCTCCCTCCTGTTGATGAAAGGAAGAAGGTTGTGGAAGATGT
GGACAAAGACAGACGCTATGCGATTGATGCTGCCATTGTTAGGATCATGAAGAGCAGGAA
AGTATTGGGACATCAACAACTCGTCTCTGAGTGCGTTGAGCAACTGAGCCGAATGTTCAA
GCCTGATATCAAAGCGATCAAGAAGCGTATGGAGGATCTAATTACGAGGGATTATTTGGA
GAGGGACAAGGAGAACCCTAACATGTTTAGGTACTTGGCTTAGAGACAAAGAAAAAACAA
CTATGG*AGGTGGTTTGCGGGCTCATGAAAGAACGAAGCATCTCTCTGCTCTTCTCTGCT
TGTATATGAAAATCTTATTTGGATACTTCTACCCTAAGAAAAAACTTTGGTTTCTTTATT
AACAATCGGTCTGTGCTTTTTTATTCTTGGGATGCAAATTACTTTTTGGGGGGTTTTTGT
TTCTTGGATATGAATGAATGGAGATGGAACTGATGATCTCTGCT
TT

QA 2 525 2 525
DS 

RD RR4DY52JQ 720 0 0
CCACGAAGATCTAGTGAGGTTGCTTCATTCCCTGTCATGTGCTAGGTACAAGATCCTTCT
CAAGGAGCCAAGCACAAAGACCGTTACGCAGACTGATTCATTTGAATTCAATGCCAAATT
CACAGACAGAATGCGCAGAATCAAGATCCCTCTCCCTCCTGTTGATGAAAGGAAGAAGGT
TGTGGAAGATGCGGACAAAGACAGACGCTATGCGATTGATGCTGCCATTGTTAGGATCAT
GAAGAGCAGGAAAGTATTGGGACATCAACAACTCGTTTCTGAGTGCGTTGAGCAACTGAG
CCGAATGTTCAAGCCTGATATCAAAGCGATCAAGAAGCGTATGGAGGATCTAATTACGAG
GGATTATTTGGAGAGGGACAAGGAGAACCCTAACATGTTTAGGTACTTGGCTTAGAGGCA
AAGAAAAAACAACTATGG*AGGTGGTTTGCTGGCTCATGAAAGAACGAAGCATCTTTCTG
CTCTTTTCTGCTTGTATATGAAAATCTTATTTGGATACTTCTACCCTAAGAAAAAACTTT
GGTTTCTTTATTAACAATCGGTCTGTGCTTTTTTATTCTTGGGATGCAAATTACTTTTTG
GGGG*TTTTTGTTTCTTGGATATGAAT****GGAGATGGAACTGATGATCTCTGCTGTTA
AATACGTTCATCTTCCTTTTGACGATTCTGTTTGGAGTTTATTGCATCTTTGCTTTAATC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 3

CO CL3675Contig1 1203 3 9 U
GGCAGTTAGAGCTCGGTTTCTTCAGTTGAATCGGAAGGATATGGCTGCTTCATTCTCAAG
AAGAATTGTCCGCACTTTTGGATCCTTCACAGCTTTAGGACGCATCAGCATCAGCAGCAG
CAGCAGCACGAATGCATCTGGAAATGGTTTAAGCCCTCTTCCTAGTCATCTCAAGTGGGG
TGGAATAAGTTTGCTTTCCGACCGAAAGCACTCCACTTCTATCTTGACTCCTGATGACAA
ATTTCCTTATGATTTACTTTCCAAGAAGACAGTCATTACACCAGACCGAACCATAGGACA
ATATCAAGACTTGGTCATTCCGGTCACAAATTTTCAGAACGAAGACAAGGGTTTCATGGT
TCTAGCTGGTGATGTCTTTGATGTTCCTATCAGGAAAGATATCATTCACCACGTCGTCAG
ATGGCAGCTTGCCAAACGCCAGCAGGGAACTCATTCGACCAAAACAATAAGCGAGGTTAG
CGGAACTGGTAGAAAGCCATGGAACCAGAAGGGTACAGGCCGAGCTAGACATGGTACACT
GCGTGGCCCCCAGTTCCGAGGTGGTTGTGTGATGCATGGGCCCAAACCAAGAAGCCATGC
AATAAAGATGAATAAGCAGGTCCGAAGGCTTGGCCTGAAGATAGCACTCTCAGCCCGAGC
CGCAGAAGGAAAACTCCTCGTGTTTGATGATTTGGCATTGCCAACGCATAAAACAAAGAA
CATTGTCAACTATTACAATCAAATGGAGGACACGAAGAAAGTCCTCGTTGTAGAAGGTGG
TCCTATCGATGAGAAGCTGAAGCTAGCCACCCAGAATCTCCACTATGTCAACATACTTCC
ATCAATAGGGCTTAACGTTTACAGCATTTTGCTTCACGACACGCTTGCGATGTCACGTGA
TGCTGTGGATAAGATCATTGAGCGTATGCACACTCCAATTAACCGTTAAAGAGAGAAAAT
TTCTTCAAATAGCATTCCCAATAAGACACTAGATCACAAGGAAGACAGCTCCAAGAAATT
CTGCATGTAGTTTCTGTACCCGCAATTTATATCCGTTATATGTACTGGTTATCTTGTCCA
TGGCTTGGTCGGTTCATTGTTTGTTTGGTTTTTGCAGTTTCGAATGCAAAAATATTTGTT
TTCTTTTGGTATACACAATTTCTTCCTTTTTATAGACGCTCTGCCCTTTTTTATTACAAA
TTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FP53TF U 1
AF RR4FP53JQ C 382
AF RR4B120TF U 666
BS 1 615 RR4FP53TF
BS 616 666 RR4FP53JQ
BS 667 1037 RR4B120TF
BS 1038 1038 RR4FP53JQ
BS 1039 1145 RR4B120TF
BS 1146 1147 RR4FP53JQ
BS 1148 1152 RR4B120TF
BS 1153 1153 RR4FP53JQ
BS 1154 1203 RR4B120TF

RD RR4FP53TF 615 0 0
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AAGAATTGTCCGCACTTTTGGATCCTTCACAGCTTTAGGACGCATCAGCATCAGCAGCAG
CAGCAGCACGAATGCATCTGGAAATGGTTTAAGCCCTCTTCCTAGTCATCTCAAGTGGGG
TGGAATAAGTTTGCTTTCCGACCGAAAGCACTCCACTTCTATCTTGACTCCTGATGACAA
ATTTCCTTATGATTTACTTTCCAAGAAGACAGTCATTACACCAGACCGAACCATAGGACA
ATATCAAGACTTGGTCATTCCGGTCACAAATTTTCAGAACGAAGACAAGGGTTTCATGGT
TCTAGCTGGTGATGTCTTTGATGTTCCTATCAGGAAAGATATCATTCACCACGTCGTCAG
ATGGCAGCTTGCCAAACGCCAGCAGGGAACTCATTCGACCAAAACAATAAGCGAGGTTAG
CGGAACTGGTAGAAAGCCATGGAACCAGAAGGGTACAGGCCGAGCTAGACATGGTACACT
GCGTGGCCCCCAGTTCCGAGGTGGTTGTGTGATGCATGGGCCCAAACCAAGAAGCCATGC
AATAAAGATGAATAA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4FP53JQ 814 0 0
ATG
TCCTATCAGGAAAGATATCAT*CACCACGTCGTCAGATG*CAGCTTGCCAAACGCCAGCA
GGGAACTCATTCGACCAAAACAATAAGCGAGGTTAGCGGAACTGGTAGAAAGCCATGGAA
CCAGAAGGGTACAGGCCGAGCTAGACATGGTACACTGCGTGGCCCCCAGTTCCGAGGTGG
TTGTGTGATGCATGGGCCCAAACCAAGAAGCCATGCAATAAAGATGAATAAGCAGGTCCG
AAGGCTTGGCCTGAAGATAGCACTCTCAGCCCGAGCCGCAGAAGGAAAACTCCTCGTGTT
TGATGATTTGGCATTGCCAACGCATAAAACAAAGAACATTGTCAACTATTACAATCAAAT
GGAGGACACGAAGAAAGTCCTCGTTGTAGAAGGTGGTCCTATCGATGAGAAGCTGAAGCT
AGCCACCCAGAATCTCCACTATGTCAACATACTTCCATCAATAGGGCTTAACGTTTACAG
CATTTTGCTTCACGACACGCTTGCGATGTCACGTGATGCTGTGGATAAGATCATTGAGCG
TATGCACACTCCAATTAACCGTTAAAGAGAGAAAATTTCTTCAAATAGCATTCCCAATAA
GACACTAGATCACAAGGAAGACAGCTCCAAGAAATTCTGCATGTAGTTTCTGTACCCGCA
ATTTATATCCGTTATATGTACTGGTTATCTTGTCCATGGCTTGGTCGGTTCATTGTTTGT
TTGGTTTTTGCAGTTTCGAATGCAAAAATATTTGTTTTCTTTTGGTATACACAATTTCTT
CCTTTTTATAGACGCTCTGCCCTTTTTTATT

QA 4 814 4 814
DS 

RD RR4B120TF 538 0 0
G
AGGAAAACTCCTCGTGTTTGATGATTTGGCATTGCCAACGCATAAAACAAAGAACATTGT
CAACTATTACAATCAAATGGAGGACACGAAGAAAGTCCTCGTTGTAGAAGGTGGTCCTAT
CGATGAGAAGCTGAAGCTAGCCACCCAGAATCTCCACTATGTCAACATACTTCCATCAAT
AGGGCTTAACGTTTACAGCATTTTGCTTCACGACACGCTTGCGATGTCACGTGATGCTGT
GGATAAGATCATTGAGCGTATGCACACTCCAATTAACCGTTAAAGAGAGAAAATTTCTTC
AAATAGCATTCCCAATAAGACACTAGATCACAAGGAAGACAGCTCCAAGAAATTCTGCAT
GTAGTTTCTGTTCCCGCAATTTATATCCGTTATATGTACTGGTTATCTTGTCCATGGCTT
GGTCGGTTCATTGTTTGTTTGGTTTTTGCAGTTTCGAATGCAAAAATATTTGTTTTCTT*
*GGTATGCACAATTTCTTCCTTTTTATAGACGCTCTGCCCTTTTTTATTACAAATTA

QA 2 538 2 538
DS 



AS 1 2

CO CL3676Contig1 789 2 2 U
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TCAGATCCATGTCAATGTAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGGAG
AAGAAGAATAAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGATACGTTGAGAATCTCGCCACG
TTGGACAACCAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCGAAGAT
CTCAAAGGTTGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGC
AGCACTTTACCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGTCAGAGATTCTCTGACGACAAC
AAGCAGATCAATGCCAACAACAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGAT
TCTCCGGCGCCTCCGATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCCGGTGATCATCCGGATGAT
GTGAAAGCTCGGCTCAAGTACTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGTGCAGC
TGAATGATTCATTGTCACGTCTGAAGCAGGAACTCTAGTGAAGATGTGATATCTACATGA
ACATTATCTCAGGCACTGTTTAGCTGAGAAGAGATCTCAGAAAGGCATTGAAAGGTCTGA
AATTTAACTGAACACCTAGTAGTATGATTTTTTATTATCATTCCATCTATATCCGTAGTA
GTATCAAGTCTAGTAATTTTTGTGAACGGAAAATAAAGGTATCATTGAATAAAAACAGCA
CATTCTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT41TF U 1
AF RR4DT41JQ C 1
BS 1 565 RR4DT41TF
BS 566 789 RR4DT41JQ

RD RR4DT41TF 565 0 0
GGAATCACACAAACTAAAAAAAGAAAACAGTGAGTGATGGCTTGTGTTCCTTACAAATCA
TCAGATCCATGTCAATGTAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGGAG
AAGAAGAATAAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGATACGTTGAGAATCTCGCCACG
TTGGACAACCAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCGAAGAT
CTCAAAGGTTGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGC
AGCACTTTACCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGTCAGAGATTCTCTGACGACAAC
AAGCAGATCAATGCCAACAACAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGAT
TCTCCGGCGCCTCCGATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCCGGTGATCATCCGGATGAT
GTGAAAGCTCGGCTCAAGTACTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGTGCAGC
TGAATGATTCATTGTCACGTCTGAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4DT41JQ 789 0 0
GGAATCACACAAACTAAAAAAAGAAAACAGTGAGTGATGGCTTGTGTTCCTTACAAATCA
TCAGATCCATGTCAATGTAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGGAG
AAGAAGAATAAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGATACGTTGAGAATCTCGCCACG
TTGGACAACCAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCGAAGAT
CTCAAAGGTTGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGC
AGCACTTTACCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGTCAGAGATTCTCTGACGACAAC
AAGCAGATCAATGCCAACAACAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGAT
TTTCCGGCGCCTCCGATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCCGGTGATCATCCGGATGAT
GTGAAAGCTCGGCTCAAGTACTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGTGCAGC
TGAATGATTCATTGTCACGTCTGAAGCAGGAACTCTAGTGAAGATGTGATATCTACATGA
ACATTATCTCAGGCACTGTTTAGCTGAGAAGAGATCTCAGAAAGGCATTGAAAGGTCTGA
AATTTAACTGAACACCTAGTAGTATGATTTTTTATTATCATTCCATCTATATCCGTAGTA
GTATCAAGTCTAGTAATTTTTGTGAACGGAAAATAAAGGTATCATTGAATAAAAACAGCA
CATTCTTTC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 3

CO CL3677Contig1 1053 3 6 U
CGTAAATAAATATTATACAAACTTCAAGACTCCCATACAAGTTCAAAATATACTACAAAG
CCAAACCCATCGACTACATTATTTTTCTTTCAAAGTCGAATAAGTTGTTGGCCCACTCGA
TCCCTTCCATTTAGTTCATCTTATTAGGCCGTAGACCTTATATCAGTAGAAAACGAGTTC
CTGAGAGGGTATGAAGCTCGCATCGCAATACCACAGACGCCTCTTGGATCGACAGTGTTG
CGAGCCATCTTCATGTAGCCATCCTCTCCCCAAGTGTTGCCCCACGAATTTCTCACGATC
CAGTAGTCAAGTCCTTTCTCTGTTCCATACCCGACCACAACAACTCCATGGTTTAGGTTT
GTTCCGCACGTTCCATCAAAAACTCCCGACTCGTAAAGCTGAAATTCCCGGCTGCTGGAA
TCGATAACTGCAGTTACAGGCTGGTGAGCAACCGCTTTCCTAAGAGCATGTTCGTCGTTT
GCAGGCAAGTTCTCATACCCATCAATCATAACATTCTTGTTGTTTGCCTTGAGGCTCGCG
TCACAGACACCATTAACAGCCTTGTAAGGATAATCGTTGTTTGTACGAAGACCACCATTT
ATAACTATGAACTCATAGGCAGTTTCGACTTTGCCTCCTCCGCAACCATTATTTTCTTTG
TTGCAATTGATCAGGTCCTGCTCGGACAAAGTGACTAACTCTCCTGTCACGATCTTGTTT
AAGCCTTCCACTGCCCCCACAGTCGAGAAAGCCCAACAACTTCTGCAATTGCCTTGATAT
TTGATTTCAGTCACTGCGCCCTTTTTCCTCCAGTCGACAGACTTGGGAAGAACATCACCA
ACACTAGTCTTGTATCGGTCACTGCTAGTCATGATAACGTGGTTCTTGGATGGTCCTGGA
TCAGCCCCGTGACAAACTTCTTTGTACTCACGTAGAGATAAATCAGCAAACCGGGTCAAA
CCAAGCCGATAACTAAGATTCTCAGCGTTTCGGTTAGTGATGAAACGTAGGTTGTCCTTG
AAAATCGTTAAACGCAATTCCCTCTCGGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU53JQ U 51
AF RR4FV75JQ U 1
AF RR4FV75TF C 283
BS 1 65 RR4FV75JQ
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BS 722 1053 RR4FV75TF

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QA 1 590 1 590
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CTGAGAGGGTATGAAGCTCGCATCGCAATACCACAGACGCCTCTTGGATCGACAGTGTTG
CGAGCCATCTTCATGTATCCATCCTCTCCCCAAGTGTTGCCCCACGAATTTCTCACGATC
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GTTCCGCACGTTCCATCAAAAACTCCCGACTCGTAAAGCTGAAATTCCCGGCTGCTGGAA
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GCAGGCAAGTTCTCATACCCATCAATCATAACATTCTTGTTGTTTGCCTTGAGGCTCGCG
TCACAGACACCATTAACAGCCTTGTAAGGATAATCGTTGTTTGTACGAAGACCACCATTT
ATAACTATGAACTCATAGGCAGTTTCGACTTTGCCTCCTCCGCAACCATTATTTTCTTTG
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A

QA 1 721 1 721
DS 

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AGAGCATGTTCGTCGTTTGCAGGCAAGTTCTCATACCCATCAATCATAACATTCTTGTTG
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CAACCATTATTTTCTTTGTTGCAATTGATCAGGTCCTGCTCGGACAAAGTGACTAACTCT
CCTGTCACGATCTTGTTTAAGCCTTCCACTGCCCCCACAGTCGAGAAAGCCCAACAACTT
CTGCAATTGCCTTGATATTTGATTTCAGTCACTGCGCCCTTTTTCCTCCAGTCGACAGAC
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TTCTTGGATGGTCCTGGATCAGCCCCGTGACAAACTTCTTTGTACTCACGTAGAGATAAA
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AAACGTAGGTTGTCCTTGAAAATCGTTAAACGCAATTCCCTCTCGGCAACC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL3678Contig1 942 2 2 U
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CTCAAGATCAACGATTGTATCGAAACCTCCAGCACCGATGTTTCTTCTCCCAGAGAAGGA
AAGAAAGATGAGATCACTGGACTTCAAGAAAAGGATTTTGACTCATTCAGCTCTGACGAT
GTGGATGATGAAGAAGAATCTGGTGAACAGCTTTTGTCTATACGCGATGCTCTCGAATCT
CTCGAGTCTCAGCTTGCTGCTTTACAGAATCTACGGCAAAGACAACAGTATGAGAAGCAA
GTAGCTCTCTCTGAGATTGATTACAGCAGGAAGATGTTGCTTGAGAAGCTCAAGGAGTAC
AAAGGGAAAGAACTTGAAGTGCTAAGCGAGGCTTCAACTTTTGCTGGCGAAAGAGTTGAC
TATGAGAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCTGTTTACCCTCCTCTTCTCTCCCCGGTT
TACATAATAACAATGGCTACTTACCTCATTTACCGTCAAAACAGAAGAAATCTGCAGATG
CAAATGGGTTTGGCTCAGCAGAGGTCAAGGGTCCTAATGGAGTTGTTCGCTTCTTAGGCT
CTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGTCATTTCAGTCTTGTCTGCTTCCGGTT
ATGGTCCAGAGATCAAGAAAAGAGGTGTGTCATTCAAACTTCTGGGGCTTCTCCCTCAAC
GATTAGTCAGAGCACCTAATCAATGCCCGCCTGGGAAAGTTCTAGTGATTGAAGACGGTG
AAGCAAGGTGTCTTGTGAAGGAAAGAGTCGAAATACCTTTTGACTCGGTGGTTGCAAAAC
GAGATGTAACATACGGATACGGTTGAACTGAATGAAAAAGAAAAAACACCTTTCTCTGTA
ATCTTTACTGCCTCCACTGTGTAACGTTTCAACCTTTTACCC


BQ
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AF RR4DF75TF U 1
AF RR4DF75JQ C 455
BS 1 562 RR4DF75TF
BS 563 942 RR4DF75JQ

RD RR4DF75TF 562 0 0
GGGAAAATGGAAGACGAAGAAGGCATCGGGTTAATTCTAGCCAGAGCCACCGAGCTAAGA
CTCAAGATCAACGATTGTATCGAAACCTCCAGCACCGATGTTTCTTCTCCCAGAGAAGGA
AAGAAAGATGAGATCACTGGACTTCAAGAAAAGGATTTTGACTCATTCAGCTCTGACGAT
GTGGATGATGAAGAAGAATCTGGTGAACAGCTTTTGTCTATACGCGATGCTCTCGAATCT
CTCGAGTCTCAGCTTGCTGCTTTACAGAATCTACGGCAAAGACAACAGTATGAGAAGCAA
GTAGCTCTCTCTGAGATTGATTACAGCAGGAAGATGTTGCTTGAGAAGCTCAAGGAGTAC
AAAGGGAAAGAACTTGAAGTGCTAAGCGAGGCTTCAACTTTTGCTGGCGAAAGAGTTGAC
TATGAGAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCTGTTTACCCTCCTCTTCTCTCCCCGGTT
TACATAATAACAATGGCTACTTACCTCATTTACCGTCAAAACAGAAGAAATCTGCAGATG
CAAATGGGTTTGGCTCAGCAGA

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4DF75JQ 488 0 0
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GTCAAAACAGAAGAAATCTGCAGATGCAAATGGGTTTGGCTCAGCAGAGGTCAAGGGTCC
TAATGGAGTTGTTCGCTTCTTAGGCTCTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGT
CATTTCAGTCTTGTCTGCTTCCGGTTATGGTCCAGAGATCAAGAAAAGAGGTGTGTCATT
CAAACTTCTGGGGCTTCTCCCTCAACGATTAGTCAGAGCACCTAATCAATGCCCGCCTGG
GAAAGTTCTAGTGATTGAAGACGGTGAAGCAAGGTGTCTTGTGAAGGAAAGAGTCGAAAT
ACCTTTTGACTCGGTGGTTGCAAAACGAGATGTAACATACGGATACGGTTGAACTGAATG
AAAAAGAAAAAACACCTTTCTCTGTAATCTTTACTGCCTCCACTGTGTAACGTTTCAACC
TTTTACCC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 3

CO CL3679Contig1 776 3 2 U
CTATATAAGTTTACTAAAGATATATTTAAAAAGTTACAGCATTCGGATTCTACATTACAT
CTGAAAACAAAAAAAA*CAAAAACGAGCGGTAATAGCTAGGAATGTTACTTGATTCCGAA
AAGCAGGAAGCTGTTTATTCTTAAATACAAAGCTGAAGCATGTTTTCAATCCTGAATAGT
CTTTTTAAGTGGTCACAAGATGAGGAGCTCCTGGTCGAGGAAGGGCACAAGAGTATGTCA
CATACTTTGCACTGTCCTGAAGCACGACAACAAAAGCTCGGGACAGTGATTTTGGTCCCC
CAATCATCCCATCGATATCTCCATCACCACCTTCTCTGGGGTCAACAAGCACTGACACAA
CCATTGACGAGGCCGGCTTGATTTCTTTGCTAGAGCTGTTTCTTTGGTGCTCTTTGGTGA
AATTAAAATCTGATCCTGGGAGTGGAATGGCCAGACCACGAAGGGTTCTTCTGTGTTTTC
GCCTGTGTGCGTCTGTGGCGTTCTTTCTGTGTTCAGAAGAGACGTTGGTTGCCGGAGATG
CAGGAATAATGGCTCCAGAGGTCGAGGAGACATCGAACTGAAACACTTCAGTGCACATCC
CGGAGCTAAACATCGGCCCTGCAACACCTTCACGAAACCATTGCTGCATTTCACCATTAG
CTGCTTTTGTCTTAATCGAGTCATTCAGAGTATCAGCAGATCCAGAAGATAAAGCTTTCT
GTTTTTCAGCCTTAGTTCTAATGAGATGCTTAGCCATATCCTCGATCATTCCCACG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E693JQ U 1
AF RR4E703JQ U 1
AF RR4DS61JQ U 2
BS 1 515 RR4E693JQ
BS 516 776 RR4DS61JQ

RD RR4E693JQ 518 0 0
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AAA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4E703JQ 518 0 0
CT
ATATAAGTTTACTAAAGATATATTTAAAAAGTTACAGCATTCGGATTCTACATTACATCT
GAAAACAAAAAAAA*CAAAAACGAGCGGTAATAGCTAGGAATGTTACTTGATTCCGAAAA
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TTTTAAGTGGTCACAAGATGAGGAGCTCCTGGTCGAGGAAGGGCACAAGAGTATGTCACA
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ATCATCCCATCGATATCTCCATCACCACCTTCTCTGGGGTCAACAAGCACTGACACAACC
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CTGTGTGCGTCTGTGGCGTTCTTTCTGTGTTCA
GAA

QA 3 515 3 515
DS 

RD RR4DS61JQ 775 0 0
C
ATATAAGTTTACTAAAGATATATTTAAAAAGTTACAGCATTCGGATTCTACATTACATCT
GAAAACAAAAAAAAACAAAAACGAACGGTAATAGCTAGGAATGTTACTTGATTCCGAAGA
GCAGGAAGCTGTTTATTCTTAGATACAAAGCTGAAGCATGTTTTCAATCCTGAATAGTCT
TTTTAAGTGGTCACAAGATGAGGAGCTCCTGGTCGAGGTAGGGCACAAGAGTATGTCACA
TACTTTGCACTGTCCTGAAGCACGACAACAAAAACTCGGGACAGTGATTTTGGTCCCCCA
ACCATCCCATCGATATCTCCATCACCACCTTCTCTGGGGTCAACAAGCACTGACACAACC
ATTGACGAGGCCGGCTTGATTTCTTTGCTAGAGCTGTTTCTTTGGTGCTCTTTGGTGAAA
TTAAAATCTGATCCTGGGAGTGGAATGGCCAGACCACGAAGGGTTCTTCTGTTTTTTCGC
CTGTGTGTGTCTGTGGCGTTCTTTCTGTGTTCAGAAGAGACGTTGGTTGCCGGAGATGCA
GGAATAATGGCTCCAGAGGTCGAGGAGACATCGAACTGAAACACTTCAGTGCACATCCCG
GAGCTAAACATCGGCCCTGCAACACCTTCACGAAACCATTGCTGCATTTCACCATTAGCT
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QA 2 775 2 775
DS 



AS 1 3

CO CL3680Contig1 848 3 2 U
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AAAGACGAAAACAAAATACATAGTTTCGTACATTTTCTTCTTTGGGATTTATCTGTGGTA
AAATAAGCGTCTGCCAGTTTCAAAACACCGAAGATATATGTCACTTTGAGAACATAACAT
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AGGCCTCCATTTTCTACATCTCCTACGAGACTCCTCCTCTTCCTCAGCAGCCTTTGCTGC
AGCTTCTCCGGCAAATCTCTCCGCCTCTAGTTCCCTGAGAAAGTCGCCGAAAGAGGCCAA
AGTTGTTTCTCCTTTGCCTTGGACGTCACCACCGGCGTTTAACTGGAAGAGAATGAGTTT
CTCTAACTCGTCTCTCCTTAGAACAATCTTCACCTTCCTATCTTTTCTGTTGTAATCTTT
CTTCACTTCTTTTTCTTCTTCTTGGACCATTCTTTTAAGGTTGCTTCCTCCATTCAAACA
GTTTCCCATTTTTATAAAATATAAAAGAAAATTTTGACACAAAAAGGAAAATGATATTTT
TGGGAAATGCCCACAAAAAAAAGTTTGTAGAAGAAAAAAGAAAACTTGGGAAATGCCCAA
GAAAAAATAATCTTTCTTCTTCTCCTTTTCTTCTGTGTGAATCAATCTGATGGAAGTTGG
AGACTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM11JQ U 1
AF RR4FK27JQ U 1
AF RR4FM11TF C 268
BS 1 691 RR4FK27JQ
BS 692 848 RR4FM11TF

RD RR4FM11JQ 635 0 0
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AAAGACGAAAACAAAATACATAGTTTCGTACATTTTCTTCTTTGGGATTTATCTGTGGTA
AAATAAGCGTCTGCCAGTTTCAAAACACCGAAGATATATGTCACTTTGAGAACATAACAT
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TTCTCCCACAAAAAAATCCCATCTTAAACAGAAAAAAAACTTAATGATCTAAAATAAAAG
GATTAAGAAAAGCAATTACGCAAGTGTTTCTTCAGGCCATTCAATGATTCTGTCCAATGA
AGGCCTCCATTTTCTACATCTCCTACGAGACTCCTCCTCTTCCTCAGCAGCCTTTGCTGC
AGCTTCTCCGGCAAATCTCTCCGCCTCTAGTTCCCTGAGAAAGTCGCCGAAAGAGGCCAA
AGTTGTTTCTCCTTTGCCTTGGACGTCACCACCGGCGTTTAACTGGAAGAGAATGAGTTT
CTCTAACTCGTCTCTCCTTAGAACAATCTTCACCTTCCTATCTTTTCTGTTGTAATCTTT
CTTCACTTCTTTTTCTTCTTCTTGGACCATTCTTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4FK27JQ 691 0 0
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AAAGACGAAAACAAAATACATAGTTTCGTACATTTTCTTCTTTGGGATTTATCTGTGGTA
AAATAAGCGTCTGCCAGTTTCAAAACACCGAAGATATATGTCACTTTGAGAACATAACAT
TTCTCAAGTGAAAAAAAAAATCCATCGGGAAAAAGGTAGGGAAAAACAGGCAAAAACAAA
TTCTCCCACAAAAAAATCCCATCTTAAACAGAAAAAAAACTTAATGATCTAAAATAAAAG
GATTAAGAAAAGCAATTACGCAAGTGTTTCTTCAGGCCATTCAATGATTCTGTCCAATGA
AGGCCTCCATTTTCTACATCTCCTACGAGACTCCTCCTCTTCCTCAGCAGCCTTTGCTGC
AGCTTCTCCGGCAAATCTCTCCGCCTCTAGTTCCCTGAGAAAGTCGCCGAAAGAGGCCAA
AGTTGTTTCTCCTTTGCCTTGGACGTCACCACCGGCGTTTAACTGGAAGAGAATGAGTTT
CTCTAACTCGTCTCTCCTTAGAACAATCTTCACCTTCCTATCTTTTCTGTTGTAATCTTT
CTTCACTTCTTTTTCTTCTTCTTGGACCATTCTTTTAAGGTTGCTTCCTCCATTCAAACA
GTTTCCCATTTTTATAAAATATAAAAGAAAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FM11TF 581 0 0
ACAGAAAAAAAACTTAATGATCTAAAATAAAAGGATTAAGAAAAGCAATTACGCAAGTGT
TTCTTCAGGCCATTCAATGATTCTGTCCAATGAAGGCCTCCATTTTCTACATCTCCTACG
AGACTCCTCCTCTTCCTCAGCAGCCTTTGCTGCAGCTTCTCCGGCAAATCTCTCCGCCTC
TAGTTCCCTGAGAAAGTCGCCGAAAGAGGCCAAAGTTGTTTCTCCTTTGCCTTGGACGTC
ACCACCGGCGTTTAACTGGAAGAGAATGAGTTTCTCTAACTCGTCTCTCCTTAGAACAAT
CTTCACCTTCCTATCTTTTCTGTTGTAATCTTTCTTCACTTCTTTTTCTTCTTCTTGGAC
CATTCTTTTAAGGTTGCTTCCTCCATTCAAACAGTTTCCCATTTTTATAAAATATAAAAG
AAAATTTTGACACAAAAAGGAAAATGATATTTTTGGGAAATGCCCACAAAAAAAAGTTTG
TAGAAGAAAAAAGAAAACTTGGGAAATGCCCAAGAAAAAATAATCTTTCTTCTTCTCCTT
TTCTTCTGTGTGAATCAATCTGATGGAAGTTGGAGACTTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 3

CO CL3681Contig1 871 3 9 U
GGGTTGTTAGATCCACAGATTGTAGCAAGAGTCTTGTTAAATCTTTTGGGTTGTAGGATC
ACACGGGTGAGGTAAGAGATAGTCATTTGTTATATGAGAGCTTGATTCCAGCTAGATTTT
TACTTGACGCAGAGTCCTCAATATGCGAAAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTATCAGCTA
ATAAACCCGAGGTAAGGAGGAGAGCTCGGAGAACCGCGAGTGTATCTACTCATGATCGTT
CAGATGAAGAAGATGCAGAGACAGAAGCCGGCCAATCTGAAATGACTAATGATCCCAATG
CTCTAAAACGATGTACTCAAACAGAGAATCCGCAAGGCGGTCAAGGAGAAGGAAGCAAGA
ACAGTTGGCAGATCTTGAATCTCAGGTTGATTCTTTGAAAGGAGAGAACTCAACACTGTA
TAAGCAGCTCATTGACGCAACGCAACTGTTTCGTAGTGCTGGAACAAATAACAGAATCTT
AAAATCAGATGTTGAAACTCTCAGAATCAAGGTGAAACTAGCAGAAGATTTGGTAGCTAG
AGGGTCCTTCAGTAGCAGCTTGAATCAGCTTCTGCAAACTCATCTACGTCCATCACCACA
GTCTATCAACAGTCTGCACTACATAGGAAGTACCTCACCCGCCGTTACAGTCCACAGCAA
CCAATCTATGTTCCCTGGAATCACACTTTCTGGACAGAACTCAAGCCCTGGACTTGGTAA
TGTATCAAGCGAAGCTGTTAGCTGCGTCTCAGACATCTGGCCATGACCCTCTTCTTCACA
ATATGTAACGATCACTCTGAAACTTTCATGTATGTGTTATCACTATAAAACTATAAACAT
TTATATTCGTTATTGAACTCAAGTTTCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL66TF U 1
AF RR4EL66JQ C 4
AF RR4C586TF U 531
BS 1 47 RR4EL66TF
BS 48 48 RR4EL66JQ
BS 49 801 RR4EL66TF
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BS 846 871 RR4EL66JQ

RD RR4EL66TF 829 0 0
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TAAGCAGCTCATTGACGCAACGCAACTGTTTCGTAGTGCTGGAACAAATAACAGAATCTT
AAAATCAGATGTTGAAACTCTCAGAATCAAGGTGAAACTAGCAGAAGATTTGGTAGCTAG
AGGGTCCTTCAGTAGCAGCTTGAATCAGCTTCTGCAAACTCATCTACGTCCATCACCACA
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TGTATCAAGCGAAGCTGTTAGCTGCGTCTCAGACATCTGGCCATGACCCTCTTCTTCACA
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QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4EL66JQ 868 0 0
GGTG
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CGCAGAGTCCTCAATATGCGAAAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTATCAGCTAATAAACC
CGAGGTAAGGAGGAGAGCTCGGAGAACCGCGAGTGTATCTACTCATGATCGTTCAGATGA
AGAAGATGCAGAGACAGAAGCCGGCCAATCTGAAATGACTAATGATCCCAATGCTCTAAA
ACGATGTACTCAAACAGAGAATCCGCAAGGCGGTCAAGGAGAAGGAAGCAAGAACAGTTG
GCAGATCTTGAATCTCAGGTTGATTCTTTGAAAGGAGAGAACTCAACACTGTATAAGCAG
CTCATTGACGCAACGCAACTGTTTCGTAGTGCTGGAACAAATAACAGAATCTTAAAATCA
GATGTTGAAACTCTCAGAATCAAGGTGAAACTAGCAGAAGATTTGGTAGCTAGAGGGTCC
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ATGTTCCCTGGAATCACACTTTCTGGACAGAACTCAAGCCCTGGACTTGGTAATGTATCA
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ACGATCACTCTGAAACTTTCATGTATGTGTTATCACTATAAAACTATAAACATTTATATT
CGTTATTGAACTCAAGTTTCTTCT

QA 5 868 5 868
DS 

RD RR4C586TF 315 0 0
TGGTAGCTAGAGGGTCCTTCAGTAGCAGCTTGAATCAGCTTCTGCAAACTCATCTACGTC
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TCCACAGTGACCAATCTATGTTCCCTGGAATCACACTTTCTGGACAGAACTCAAGCCCTG
GACTTGGTAATGTATCAAGCGAAGCTGTTAGCTGCGTCTCAGACATCTGGCCATGACCCT
CTTCTTCACAATATGTAACGATCACTCTGAAACTTTCATGTATGTGTTATCACTATAAAA
CTATAAACATTTATA

QA 1 315 1 315
DS 



AS 1 3

CO CL3682Contig1 1005 3 6 U
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GTTTCATCATCAAAAAGTAATCTTCAAAGCCTCCTTCCTTCTTACTGTCAAAGTTCTCTG
TTCCTCTGTGGTTGATAGATCTTGAACAATGACTTGCAGCTGATTTGGATTATTCTCGTC
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GACTCCCATCATATTTTTTTGGGACATCGAGAATTGTCAATTTCAAATACGATATAAAGG
CCATAGATATACCAGCACACATAGCCAAATAGCCTCATTTGAGTTAAATCTATTTACTGT
ATCCATGATCTTTTATATCGTTCTGAAACTCACAGTTCCAATGTCCCAAAGAATTATGAT
GGGAGCTTGATCGTAAGAAGCACAAGCCGAACGAGTGCCCATAATTATGCTATAAAAAAA
AACAAAATCGTTTATGAAAAACGGATTTATAAGAAAAATCAACAAAACAAGGCTAAATCG
TCTATGATAATTTTGACTATTCATTCTCAAGTAAATGGGAAAACAAAAACTTTGCGGACT
TACTAAAAGCAGATCCAAGTACATTAGTTATATAATCAGTTGGCCAGACAAAAAAAAAAA
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GTGGGGAGGAAGGAGCTCTTGGTGAGGAAAGGAGAGATAAACTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BK42JQ U 1
AF RR4FI06JQ U 1
AF RR4FI06TF C 246
BS 1 439 RR4BK42JQ
BS 440 440 RR4FI06JQ
BS 441 485 RR4BK42JQ
BS 486 486 RR4FI06JQ
BS 487 653 RR4BK42JQ
BS 654 1005 RR4FI06TF

RD RR4BK42JQ 653 0 0
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TAGAACCAGACATCTCTTGACGACCCTACACCGTTATTTCAGCATCTAGTCATGAAAAAA
AAAGCTATAACCGGAGTCTCGACTAATAGTAAAAATTAAAACAGTTTTCCCTTTGGGACA
ACCATGTATTAAAGAGATTAGCAGCACTCCAAAAATATCTGCTGAAGAGATCAAAAAGGC
GTTTCATCATCAAAAAGTAATCTTCAAAGCCTCCTTCCTTCTTACTGTCAAAGTTCTCTG
TTCCTCTGTGGTTGATAGATCTTGAACAATGACTTGCAGCTGATTTGGATTATTCTCGTC
CACCGATTGGGAACACATAGAGACTCTTCTTGATTTGTTCAAATGCTGCGCCTATTTTTA
GACTCCCATCATATTTTTT*GGGACATCGAGAATTGTCAATTTCAAATACGATATAAAGG
CCATAAATATACCAGCACACATAGCCAAATAGCCTCATTTGAGTTAAATCTATTTACTGT
ATCCATGATCTTTTATATCGTTCTGAAACTCACAGTTCCAATGTCCCAAAGAATTATGAT
GGGAGCTTGATCGTAAGAAGCACAAGCCGAACGAGTGCCCATAATTATGCTAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4FI06JQ 653 0 0
GCACCGCAAAGAAAGCAATTGTATTAGCTGAAGAAACAAACATGGAACACATGGAACACA
TAGAACCAGACATCTCTTGACGACCCTACACCGTTATTTCAGCATCTAGTCATGAAAAAA
AA*GCTATAACCGGAGTCTCGACTAATAGTAAAAATTAAAA*AGTTTTCCCTTTGGGACA
ACCATGTATTAAAGAGATTAGCAGCACTCCAAAAATATCTGCTGAAGAGATCAAAAAGGC
GTTTCATCATCAAAAAGTAATCTTCAAAGCCTCCTTCCTTCTTACTGTCAAAGTTCTCTG
TTCCTCTGTGGTTGATAGATCTTGAACAATGACTTGCAGCTGATTTGGATTATTCTCGTC
CACCGATTGGGAACACATAGAGACTCTTCTTGATTTGTTCAAATGCTGCGCCTATTTTTA
GACTCCCATCATATTTTTTTGGGACATCGAGAATTGTCAATTTCAAATACGATATAAAGG
CCATAGATATACCAGCACACATAGCCAAATAGCCTCATTTGAGTTAAATCTATTTACTGT
ATCCATGATCTTTTATATCGTTCTGAAACTCACAGTTCCAATGTCCCAAAGAATTATGAT
GGGAGCTTGATCGTAAGAAGCACAAGCCGAACGAGTGCCCATAATTATGCTAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4FI06TF 760 0 0
ATCATCAAAAAGTAATCTTCAAAGCCTCCT*CCTTCTTACTGTCAAAGTTCTCTGTTCCT
CTGTGGTTGATAGATCTTGAACAATGACTTGCAGCTGATTTGGATTATTCTCGTCCACCG
ATTGGGAACACATAGAGACTCTTCTTGATTTGTTCAAATGCTGCGCCTATTTTTAGACTC
CCATCATATTTTTTTGGGACATCGAGAATTGTCAATTTCAAATACGATATAAAGGCCATA
GATATACCAGCACACATAGCCAAATAGCCTCATTTGAGTTAAATCTATTTACTGTATCCA
TGATCTTTTATATCGTTCTGAAACTCACAGTTCCAATGTCCCAAAGAATTATGATGGGAG
CTTGATCGTAAGAAGCACAAGCCGAACGAGTGCCCATAATTATGCTATAAAAAAAAACAA
AATCGTTTATGAAAAACGGATTTATAAGAAAAATCAACAAAACAAGGCTAAATCGTCTAT
GATAATTTTGACTATTCATTCTCAAGTAAATGGGAAAACAAAAACTTTGCGGACTTACTA
AAAGCAGATCCAAGTACATTAGTTATATAATCAGTTGGCCAGACAAAAAAAAAAATTTGC
GATGTAAATCAACTAAAGTGATCAAAATCAACTAAAGAGATCAAAAGTAAAAAAGTTGGA
GAAGAGTTCGTGCTGGTGATGAATGAAGAATGAGGAGTCGCGTTCATTAATAGTAGTGGG
GAGGAAGGAGCTCTTGGTGAGGAAAGGAGAGATAAACTTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL3683Contig1 1043 3 19 U
GGACATCAACAATAGACATCAGATATCTACAAATAAAAATGAAGTTTTCTTACGGTACAA
GGTTCGCTTTCTTGGCTCTCTCCCTCTTTGCGCTACAATCTGTGTGCGTCTATGCGGGTA
GCTTCCACAAAGACGTTCAGATACATTGGGGTGATGGCCGTGGAAAGGTTCAAGACAATG
AAGGAAAACTTCTTTCTCTTTCGCTTGACAAATCCTCCGGATCCGGTTTTCAATCCAATC
AAGAGTTTCTTTATGGCAAAGCTGAGGTTCAAATGAAGCTTGTCCCTGGTAACTCTGCTG
GAACTGTCACAACTTTCTATCTTAAAGCGCCTGGAACTATGTGGGATGAGATCGATTTCG
AGTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACTTCATACTAATGTTTACACAAAAG
GCACAGGAGACAAAGAACAACAGTTTCATTTATGGTTCGACCCAACCGCTGGCTTTCACA
CTTACTGCATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTTTACCGTAGATGGCATTCCAATTA
GAGAATTCAGGAACTCTGAGCCTATTGGAATTCCATTCCCAAAAGACCAACCAATGAGAG
TCTACGCGAGCCTTTGGGAGGCCGAGCATTGGGCTACAAGAGAAGGATTAGAGAAAACAG
ATTGGTCCAAGGCTCCTTTTACTGCTTTTTACAGAAACTACAATGTGGAAGGATGTGTTT
GGGCTAATGGAAAATCATCTTGCCCGGCGAATTCCCCATGGTTCACTCAGAAATTGGACC
AGAGCGGCATAGATAAAGTGAAATGGGCGCAGAGTAAGTACATGGTCTATAACTATTGCA
CCGATACAAAGAGGTTTCCTAAAGGTGTTCCTAAAGTGTGCACTTAACAATTGATTCTTT
GATTCGTCAATAAGTTACTGGCATTGTCTTTATAATTCAAATAAGTTTTATTTATTCTGT
TTCATTCATTTGTTTCTCATGTATGTGTGTGTGCTGGTGTATGTACAAGATTTTTAAATT
AAATAAGTGAATAATAAATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA17TF U 1
AF RR4CA96TF U 7
AF RR4FA17JQ C 242
BS 1 30 RR4FA17TF
BS 31 31 RR4CA96TF
BS 32 34 RR4FA17TF
BS 35 35 RR4CA96TF
BS 36 172 RR4FA17TF
BS 173 173 RR4CA96TF
BS 174 202 RR4FA17TF
BS 203 203 RR4CA96TF
BS 204 217 RR4FA17TF
BS 218 218 RR4CA96TF
BS 219 550 RR4FA17TF
BS 551 551 RR4CA96TF
BS 552 619 RR4FA17TF
BS 620 620 RR4CA96TF
BS 621 634 RR4FA17TF
BS 635 643 RR4CA96TF
BS 644 645 RR4FA17JQ
BS 646 664 RR4CA96TF
BS 665 1043 RR4FA17JQ

RD RR4FA17TF 634 0 0
GGACATCAACAATAGACATCAGATATCTACCAATTAAAATGAAGTTTTCTTACGGTACAA
GGTTCGCTTTCTTGGCTCTCTCCCTCTTTGCGCTACAATCTGTGTGCGTCTATGCGGGTA
GCTTCCACAAAGACGTTCAGATACATTGGGGTGATGGCCGTGGAAAGGTTCACGACAATG
AAGGAAAACTTCTTTCTCTTTCTCTTGACAAATCCTCTGGATCCGGTTTTCAATCCAATC
AAGAGTTTCTTTATGGCAAAGCTGAGGTTCAAATGAAGCTTGTCCCTGGTAACTCTGCTG
GAACTGTCACAACTTTCTATCTTAAAGCGCCTGGAACTATGTGGGATGAGATCGATTTCG
AGTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACTTCATACTAATGTTTACACAAAAG
GCACAGGAGACAAAGAACAACAGTTTCATTTATGGTTCGACCCAACCGCTGGCTTTCACA
CTTACTGCATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTTTACCGTAGATGGCATTCCAATTA
GAGAATTCAG*AACTCTGAGCCTATTGGAATTCCATTCCCAAAAGACCAACCAATGAGAG
TCTACGCGAGCCTTTGGGAAGCCGAGCATTGGGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4CA96TF 658 0 0
GG
ACAATAGACATCAGATATCTACAAATAAAAATGAAGTTTTCTTACGGTACGAGGTTCGCT
TTCTTGGCTCTCTTCCTCTTTGCGCTACAATCTGTGTGCGTCTATGCGGGTAGCTTCCAC
AAAGACGTTCAGATACATTGGGGTGATGGCCGTGGAAAGGTTCAAGACAATGAAGGAAAA
CTTCTTTCTCTTTCGCTTGACAAATCCTCCGGATCCGGTTTTCAATCCAATCAAGAGTTT
CTTTATGGCAAAGCTGAGGTTCAAATGAAGCTTGTCCCTGGCAACTCTGCTGGAACTGTC
ACAACTTTCTATCTTAAAGCGCCTGGAACTATGCGGGATGAGATCGATTTCGAGTTCTTG
GGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACTTCATACTAATGTTTACACAAAAGGCACAGGA
GACAAAGAACAACAGTTTCATTTATGGTTCGACCCAACCGCTGGCTTTCACACTTACTGC
ATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTTTACCGTAGATGGCATTCCAATTAGAGAATTC
AGGAACTCTGAGCCTATTGGAATTCCATTCCCAAAAGGCCAACCAATGAGAGTCTACGCG
AGCCTTTGGGAGGCCGAGCATTGGGCTACAAGAGA**GATTAGAGAAAACAGATTG

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR4FA17JQ 802 0 0
AGAGTTTCTTTATG*CAAAGCTGAGGTTCAAATGAAGCTTGTCCCTGGTAACTCTGCTGG
AACTGTCACAACTTTCTATCTTAAAGCGCCTGGAACTATGTGGGATGAGATCGATTTCGA
GTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACTTCATACTAATGTTTACACAAAAGG
CACAGGAGACAAAGAACAACAGTTTCATTTATGGTTCGACCCAACCGCTGGCTTTCACAC
TTACTGCATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTTTACCGTAGATGGCATTCCAATTAG
AGAATTCAGGAACTTTGAGCCTATTGGAATTCCATTCCCAAAAGACCAACCAATGAGAGT
TTACGCGAGCCTTTGGGAGGCCGAGCATTGGGCTACAAGAGGAGGATTAGAGAAAACAGA
TTGGTCCAAGGCTCCTTTTACTGCTTTTTACAGAAACTACAATGTGGAAGGATGTGTTTG
GGCTAATGGAAAATCATCTTGCCCGGCGAATTCCCCATGGTTCACTCAGAAATTGGACCA
GAGCGGCATAGATAAAGTGAAATGGGCGCAGAGTAAGTACATGGTCTATAACTATTGCAC
CGATACAAAGAGGTTTCCTAAAGGTGTTCCTAAAGTGTGCACTTAACAATTGATTCTTTG
ATTCGTCAATAAGTTACTGGCATTGTCTTTATAATTCAAATAAGTTTTATTTATTCTGTT
TCATTCATTTGTTTCTCATGTATGTGTGTGTGCTGGTGTATGTACAAGATTTTTAAATTA
AATAAGTGAATAATAAATTATG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 3

CO CL3684Contig1 864 3 5 U
GTAATCTCTTTCTTCTGTAAATCTGTAGAGAGATTACACTTCTTGTCCTATATATTTATA
TCATATCATATTACATCATCTTCTGAGGTCCATAAACATTACACATTAAAACTAGAGAAA
TGGTACAACAATCTTTTTTTCTTTCTTCTCTTCACGTCTCTATCTCTTACATCAATTTTC
CTGCTTTACTTTTATACCTCTGCATCTTTTTGTTATTAAGAGTCTCTACATTATTAGTTT
TTTTTAACTTACCTCAGTTTCTTTCTTTCTCACTTCTCTTCCTGTTTATATCCCAACACG
ACATGCTGGTCCACCCCTACCGGGTAACATCCCAAATGCCGGCGACCTAGGCATTTGGCA
GTTGAAAGAGTTGAAGGAGTCAGAAAGTGTAGAAGGAGTAGAATTATCATCATTATCAGA
AGAAGGAGACCACAGATCTGATCCATTATTGTCCACCGAATCAGCAAACAGAAGCAAATG
ATTAGTTGACGATGCAAATGGACTATCTGGCAAGCATTCCTCCAACTTCTCTTGTAAATT
TATTGTATCATCATCAAATCCTTCTTTGGAACTTCCTTTCCCTATTTCTCCTCCTGCTTT
AACCCCACCTGGGCGTGGAGACACAAGTGTCTGGCTAAAAGGATTTGGAGAATGAATGTG
TGTAGATGAGGAATTGAGCTGGAAATGATTCTTGACGTCATGAAGCTGCAGATTCATTAG
CCTTCTGCTTTGAAGCTCAAGAATCTCTTCTTCAAACTTACTCCTCCAGATAACATCTTG
GGGGTTGTTATAGAACCCTCTCCCTCCTAAAACATCTCTGGGGCTAGAATCAAGCCCTGT
TGGGGACAACTCTAGCTCTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E553JQ U 1
AF RR4CU62JQ U 30
AF RR4B232JQ U 386
BS 1 382 RR4E553JQ
BS 383 556 RR4CU62JQ
BS 557 557 RR4B232JQ
BS 558 711 RR4CU62JQ
BS 712 864 RR4B232JQ

RD RR4E553JQ 386 0 0
GTAATCTCTTTCTTCTGTAAATCTGTAGAGAGATTACACTTCTTGTCCTATATATTTATA
TCATATCATATTACATCATCTTCTGAGGTCCATAAACATTACACATTAAAACTAGAGAAA
TGGTACAACAATCTTTTTTTCTTTCTTCTCTTCACGTCTCTATCTCTTACATCAATTTTC
CTGCTTTACTTTTATACCTCTGCATCTTTTTGTTATTAAGAGTCTCTACATTATTAGTTT
TTTTTAACTTACCTCAGTTTCTTTCTTTCTCACTTCTCTTCCTGTTTATATCCCAACACG
ACATGCTGGTCCACCCCTACCGGGTAACATCCCAAATGCCGGCGACCTAGGCATTTGGCA
GTTGAAAGAGTTGAAGGAGTCA
AAAA

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR4CU62JQ 682 0 0
GG
GATTACACTTCTTGTCCTATATATTTATATCATATCATATTACATCATCTTCTGAGGTCC
ATAAACATTACACATTAAAACTAGAGAAATGGTACAACAATCTTTTTTTCTTTCTTCTCT
TCACTTCTCTATCTCTTACATCAATTTTCCTGCTTTACTTTTATACCTCTGCATCTTTTT
GTTATTAAGAGTCTCTACATTATTAGTTTTTTTTAACTTACCTCAGTTTCTTTCTTTCTC
ACTTCTCTTCCTGTTTATATCCCAACACGACATGCTGGTCCACCCCTACCGGGTAACATC
CCAAATGCCGGCGACCTAGGCATTTGGCAGTTGAAAGAGTTGAAGGAGTCAGAAAGTGTA
GAAGGAGTAGAATTATCATCATTATCAGAAGAAGGAGACCACAGATCTGATCCATTATTG
TCCACCGAATCAGCAAACAGAAGCAAATGATTAGTTGACGATGCAAATGGACTATCTGGC
AAGCATTCCTCCAACTTCTCTTGTAAATTTATTGTATCATCATCAGATCCTTCTTTGGAA
CTTCCTTTCCCTATTTCTCCTCCTGCTTTAACCCCACCTGGGCGTGGAGACACAAGTGTC
TGGCTAAAAGGATTTGGAGAATGAATGTGTGTAGATGAGGAATTGAGCTGGAAATGATTC
TTGACGTCATGAAGCTGCAG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR4B232JQ 479 0 0
AGTGTAGAAGGAGTAGAATTATCATCATTATCAGAAGAAGGAGACCACAGATCTGATCCA
TTATTGTCCACCGAATCAGCAAACAGAAGCAAATGATTAGTTGACGATGCAAATGGACTA
TCTGGCAAGCATTCCTCCAACTTCTCTTGTAGATTTATTGTATCATCATCAAATCCTTCT
TTGGAACTTCCTTTCCCTATTTCTCCTCCTGCTTTAACCCCACCTGGGCGTGGAGACACA
AGTGTCTGGCTAAAAGGATTTGGAGAATGAATGTGTGTAGATGAGGAATTGAGCTGGAAA
TGATTCTTGACGTCATGAAGCTGCAGATTCATTAGCCTTCTGCTTTGAAGCTCAAGAATC
TCTTCTTCAAACTTACTCCTCCAGATAACATCTTGGGGGTTGTTATAGAACCCTCTCCCT
CCTAAAACATCTCTGGGGCTAGAATCAAGCCCTGTTGGGGACAACTCTAGCTCTGTTGT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL3685Contig1 383 2 2 U
GGAGAGGTTGAGGATACGGATGGAGATAGCATGAAGAAGGGGAAGCTATCAAAGAACAAA
ACCGGATTCTTGTTTAGAAAGATTGTGTCCATGAGATGTTCCTACGGAGGACTTTTTAGG
GCAGCCGTAGTTGCAGTCCTGTTCTTGATGTCAGTGTGCGGTCTGACCGCAGACTTCCGA
GCTTCCGTGATGATCTGAAAACTGAATCCTTTATTATATATATAGTTCTCGAACCAGGTT
CTTTTTTTTTGTTATTTGGTTTTGGTTTCAGTTTTCACCTTATCAAGGGTGAGTGTATGT
CTGTATTTTATGTTTATATACATTGTATAACGTTCTGATGAGATGTTAAGACTCTAGCTA
CTTCTATGACTTTATTAGACAGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EO49JQ C 1
AF RR4EO49TF U 1
BS 1 1 RR4EO49JQ
BS 2 383 RR4EO49TF

RD RR4EO49JQ 383 0 0
GGAGAGGTTGAGGATACGGATGGAGATAGCATGAAGAAGGGGAAGCTATCAAAGAACAAA
ACCGGATTCTTGTTTAGAAAGATTGTGTCCATGAGATGTTCCTACGGAGGACTTTTTAGG
GCAGCCGTAGTTGCAGTCCTGTTCTTGATGTCAGTGTGCGGTCTGACCGCAGACTTCCGA
GCTTCCGTGATGATCTGAAAACTGAATCCTTTATTATATATATAGTTCTCGAACCAGGTT
CTTTTTTTTTGTTATTTGGTTTTGGTTTCAGTTTTCACCTTATCAAGGGTGAGTGTATGT
CTGTATTTTATGTTTATATACATTGTATAACGTTCTGATGAGATGTTAAGACTCTAGCTA
CTTCTATGACTTTATTAGACAGT

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR4EO49TF 383 0 0
G
GAGAGGTTGAGGATACGGATGGAGATAGCATGAAGAAGGGGAAGCTATCAAAGAACAAAA
CCGGATTCTTGTTTAGAAAGATTGTGTCCATGAGATGTTCCTACGGAGGACTTTTTAGGG
CAGCCGTAGTTGCAGTCCTGTTCTTGATGTCAGTGTGCGGTCTGACCGCAGACTTCCGAG
CTTCCGTGATGATCTGAAAACTGAATCCTTTATTATATATATAGTTCTCGAACCAGGTTC
TTTTTTTTTGTTATTTGGTTTTGGTTTCAGTTTTCACCTTATCAAGGGTGAGTGTATGTC
TGTATTTTATGTTTATATACATTGTATAACGTTCTGATGAGATGTTAAGACTCTAGCTAC
TTCTATGACTTTATTAGACAGT

QA 2 383 2 383
DS 



AS 1 2

CO CL3686Contig1 874 2 6 U
GAAGCACAAGAGGATGATGAGGATGATGCGTATAACGATGAAGTGACCGTTGAAGAAACT
CCGGTGATAGGATTTTAGAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTGGAATGACACTCGTCATCGCA
TTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACAATCGAGGACGCATCGGAATCATGGGGACTATCA
GTGAGTTTCATAAGCATCATATTGCTTCCCATTGTTGGAAATGCGGCTGAGCATGCTGGA
GCCATCATCTTCGCATTCAAAAACAAGCTTGATATATCTCTAGGGGTGGCCTTGGGCTCT
GCAACTCAGATTTCTTTGTTTGTGGTCCCTTTGAGTGTTATCGTTGCGTGGATCATGGGA
ATCAAAATGGATCTCAACTTCAACATCCTTGAAACAAGCTGTCTAGCCCTGGCAATTATC
ATCACAGCATTCACTTTACAGGATGGAACATCTCATTACATGAAGGGACTTGTCCTAGTG
ATGTGCTATGTCATCATCGCCGCATGTTTCTTTGTCGATCAAATTCCTCAACCAAAAGGT
ACCGGCCTGCGGATGCAACCCAAGAACAGTGTGGGAGGAGGATTTGTTTCTGCTTAGAAT
GGATAAAATAAATCATCAAATGACTAGGAAAGAAAAAGATAATATGGATTTGATTGATTT
GTCAGACAAAACGGAAAAGACTTGTTAGAGAGATTCCTCAGCATGAACGAGTGAGAGGTA
GCTTGGTGAAAACAGGTTTCTTTGATGTTTTATAAGAGGGTTACATTTCTTTCTTTTTTG
TTTGTTGGGATTTTATGTTTCATCTTGTATATTATATGTTCTTTTGATCAAACTATATGT
ATAAAAGAGGAGCTGGTTCTGTCATACACCCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ42TF U 1
AF RR4FA79TF U 335
BS 1 480 RR4EZ42TF
BS 481 481 RR4FA79TF
BS 482 578 RR4EZ42TF
BS 579 579 RR4FA79TF
BS 580 607 RR4EZ42TF
BS 608 874 RR4FA79TF

RD RR4EZ42TF 607 0 0
GAAGCACAAGAGGATGATGAGGATGATGCGTATAACGATGAAGTGACCGTTGAAGAAACT
CCGGTGATAGGATTTTAGAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTGGAATGACACTCGTCATCGCA
TTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACAATCGAGGACGCATCGGAATCATGGGGACTATCA
GTGAGTTTCATAAGCATCATATTGCTTCCCATTGTTGGAAATGCGGCTGAGCATGCTGGA
GCCATCATCTTCGCATTCAAAAACAAGCTTGATATATCTCTAGGGGTGGCCTTGGGCTCT
GCAACTCAGATTTCTTTGTTTGTGGTCCCTTTGAGTGTTATCGTTGCGTGGATCATGGGA
ATCAAAATGGATCTCAACTTCAACATCCTTGAAACAAGCTGTCTAGCCCTGGCAATTATC
ATCACAGCATTCACTTTACAGGATGGAACATCTCATTACATGAAGGGACTTGTCCTAGTG
TTGTGCTATGTCATCATCGCCGCATGTTTCTTTGTCGATCAAATTCCTCAACCAAAAGGT
ACCGGCCTGCGGATGCAACCCAAGAACAGTGTGGGAGGCGGATTTGTTTCTGCTTAGAAT
GGATAAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FA79TF 540 0 0
GTGTTATTGTTGCGTGGATCATGGGAATCAAAATGGATCTCAACTTCAACATCCTTGAAA
CAAGCTGTCTAGCCCTGGCAATTATCATCACAGCATTCACTTTACAGGATGGAACATCTC
ATTACATGAAGGGACTTGTCCTAGTGATGTGCTATGTCATCATCGCCGCATGTTTCTTTG
TCGATCAAATTCCTCAACCAAAAGGTACCGGCCTGCGGATGCAACCCAAGAACAGTGTGG
GAGGAGGATTTGTTTCTGCTTAGAATGGATAAAATAAATCATCAAATGACTAGGAAAGAA
AAAGATAATATGGATTTGATTGATTTGTCAGACAAAACGGAAAAGACTTGTTAGAGAGAT
TCCTCAGCATGAACGAGTGAGAGGTAGCTTGGTGAAAACAGGTTTCTTTGATGTTTTATA
AGAGGGTTACATTTCTTTCTTTTTTGTTTGTTGGGATTTTATGTTTCATCTTGTATATTA
TATGTTCTTTTGATCAAACTATATGTATAAAAGAGGAGCTGGTTCTGTCATACACCCCAA

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 3

CO CL3687Contig1 387 3 1 U
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AAGTGTAGAATTCAAAAGCTTCCAAAAAAAGCATTATATTAAGCTTACAACACAATCCAT
TGAACTAAAATGTTTTCAACTCACACGATTAACAAACACCACAGTATATCGTAGCATCCA
TATTTCACTTGTTTTCAACATTCTTCTTCTGCTCTCCTTTCGTAACGTTCTGTAAGACGA
TGCCGACCGCGATCCCGGCAACTACAGCTGCTCCGAGGATAACCGGTGGACCGGAAAGCA
GACTCCACTTTCGGTATATCATCTTCTTCTTCGTTTAGCTTCTCTTGTTGTCTTCTCCGG
CGATGGATCTCTGAGGATTTACTCTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A064JQD U 1
AF RR4A064TFB C 1
AF RR4A064JQ U 216
BS 1 387 RR4A064JQD

RD RR4A064JQD 387 0 0
GGGGGAGAAATGAATTTATCATTATTAGCAGCAACAAGAAACTGAAAAAAAAAGATACAC
AAGTGTAGAATTCAAAAGCTTCCAAAAAAAGCATTATATTAAGCTTACAACACAATCCAT
TGAACTAAAATGTTTTCAACTCACACGATTAACAAACACCACAGTATATCGTAGCATCCA
TATTTCACTTGTTTTCAACATTCTTCTTCTGCTCTCCTTTCGTAACGTTCTGTAAGACGA
TGCCGACCGCGATCCCGGCAACTACAGCTGCTCCGAGGATAACCGGTGGACCGGAAAGCA
GACTCCACTTTCGGTATATCATCTTCTTCTTCGTTTAGCTTCTCTTGTTGTCTTCTCCGG
CGATGGATCTCTGAGGATTTACTCTCC

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4A064TFB 387 0 0
GGGT
GAGAAATGAATTTATCATTATTAGCAGCAACAAGAAACTGAAAAAAAAAGATACACAAGT
GTAGAATTCAAAAGCTTCCAAAAAAAGCATTATATTAAGCTTACAACACAATCCATTGAA
CTAAAATGTTTTCAACTCACACGATTAACAAACACCACAGTATATCGTAGCATCCATATT
TCACTTGTTTTCAACATTCTTCTTCTGCTCTCCTTTCGTAACGTTCTGTAAGACGATGCC
GACCGCGATCCCGGCAACTACAGCTGCTCCGAGGATAACCGGTGGACCGGAAAGCAGACT
CCACTTTCGGTATATCATCTTCTTCTTCGTTTAGCTTCTCTTGTTGTCTTCTCCGGCGAT
GGATCTCTGAGGATTTACTCTCC

QA 5 387 5 387
DS 

RD RR4A064JQ 172 0 0
CCTTTCGTAACGTTCTGTAAGAAGATGCCGACCGCGATCCCGGCAACTACAGCTGCTCCG
AGGATAACCGGGGGACCGGAAAGCAGACTCCACTTTCGGTATATCATCTTCTTCTTCGTT
TAGCTTCTCTTGTTGTCTTCTCCGGCGATGGATCTCTGAGGATTTACTCTCC

QA 1 172 1 172
DS 



AS 1 3

CO CL3688Contig1 865 3 34 U
CAATTTAGTGACGATGCAAAACATTGAAAAGAAACAACTTTCCCAAAGTTTTCGAGTCCT
CCTAAAGTCCAGACACGCGTTATTCACAAATTTCGCATGTTTCATCAACAGGTAACCATC
AATACGCACTAGGTTACGAAATCACTTTCAACCAAAAGAAAAAAAAAATATTACAGAATG
AAATCAGAAGTTATTAAATCGTAGCTTTATGTCGTAATTGCTGCTACTCCAATAGATACT
GATGATATTGGAGAGCAGGGGGTTTGTGGACTTGACGACGCCTGAGGATAAGAGAGAAAT
CAAGATCGAAGATTTGGATTTCAAGGCCGAATCCATCACCAACGACTATCACTAAGCGTC
CTTTGCTCAAGACACCGCTCCTGATTAGTTCCGCTGCAAATGTCTTACCACGAAGACAGG
AAACAAGAATCCCAGCCATGTTCTGTCTAAACTCCTCAATGGAAAGCCAGAAGACAGGAA
CATGAATGCCCTTGCCAGTGATTGATCCTTTTACTCCAAGAAACTCCTTTTCCAACATGG
TGTACATTACTCTTCCACTTTTACTGAGAAGTGATACCTTGTTTAGAGCCTCCCCTTGCG
CTGAAGCAGAGTGCGAGCCGACATTCTTGAAAAAGTGAGCAATGTAGTTTAGCCAATCAA
TCAAAACCGGAATGGTCACTCCCCGAATCAAAAGCGAAGTGACAATGATACACACCCACC
ACTGAGAAAAGGTGAAAGCATTAAGCAAGGCGAGCAAGTGTTGAAGTGAAGTAAGAGCAT
CAGCAACATTGTGTAAAGCATAGACATTAGAAACCGCAGATTTCAAAACCCAATCGGTGA
GGATTTCGACAGACCCGATCGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C750JQ U 1
AF RR4FT40JQ U 85
AF RR4FT40TF C 286
BS 1 259 RR4C750JQ
BS 260 262 RR4FT40JQ
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BS 664 664 RR4FT40JQ
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BS 773 796 RR4C750JQ
BS 797 797 RR4FT40TF
BS 798 807 RR4C750JQ
BS 808 808 RR4FT40TF
BS 809 827 RR4C750JQ
BS 828 865 RR4FT40TF

RD RR4C750JQ 830 0 0
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AAATCAGAAGTTATTAAATCGTAGCTTTATGTCGTAATTGCTGCTACTCCAATAGATACT
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TGTACATTACTCTTCCACTTTTACTGAGAAGTGATACCTTGTTTAGAGCCTCCCCTTGCG
CTGGAGCAGAGTGGGAGCCAACATTCTTGAAAAAGTCAGCAATGTTGTTTAGCCAATCAA
TCATAACCGGAATGGTCACTCCCCGAATCAAAAGCGAAGTGACAATGATACACACCCACC
ACTGAGAAAAGGTGAAAGCATTGAGCAAGGCGAGCAAGTGTTGAAGTGAAGAAAGAGCAT
CAGCAACATTGTGTAA*GCATAGACAT*AGAAACCGCAGATTTCAAA
CCC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4FT40JQ 726 0 0
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CTTTCAACCAAAAGAAAAAAAAATTATTACAGAATGAAATCAGAAGTTATTAAATCGTAG
CTTTATGTCGTAATTGCTGCTACTCCAATAGATACTGATGGTATTGGAGAGCCGGGGGTT
TGTGGACTTGACGACGCCTGAGGATAAAAGAGAAATCAAGATCGAAAATTTGGATTTCAA
GGCCGAATCCATCACCAACGACTATCACTAAGCGTCCTTTGCTCAAGACACCGCTCCTGA
TTAGTTCCGCTGCAAATGTCTTACCACGAAGACAGGAAACAAGAATCCCAGCCATGTTCT
GTCTAAACTCCTCAATGGAAAGCCAGAAGACAGGAACATGAATGCCCTTGCCAGTGATTG
ATCCTTTTACTCCAAGAAACTCCTTTTCCAACATGGTGTACATTACTCTTCCACTTTTAC
TGAGAAGTGATACCTTGTTTAGAGCCTCCCCTTGCGCTGAAGCAGAGTGCGAGCCGACAT
TCTTGAAAAAGTGAGCAATGTAGTTTAGCCAATCAATCAAAACCGGAATGGTCACTCCCC
GAATCAAAAGCGAAGTGACAATGATACACACCCACCACTGAGAAAAGGTGAAAGCATTAA
GCAAGGCGAGCAAGTGTTGAAGTGAAGTAAGAGCATCAGCAACATTGTGTAA
AGCATAGACGTTAG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4FT40TF 580 0 0
GGATAAGAGAGAAATCAAGATCGAAGATTTGGATTTCAAGGCCGAATCCATCACCAACGA
CTATCACTAAGCGTCCTTTGCTCAAGACACCGCTCCTGATTAGTTCCGCTGCAAATGTCT
TACCACGAAGACAGGAAACAAGAATCCCAGCCATGTTCTGTCTAAACTCCTCAATGGAAA
GCCAGAAGACAGGAACATGAATGCCCTTGCCAGTGATTGATCCTTTTACTCCAAGAAACT
CCTTTTCCAACATGGTGTACATTACTCTTCCACTTTTACTGAGAAGTGATACCTTGTTTA
GAGCCTCCCCTTGCGCTGAAGCAGAGTGCGAGCCGACATTCTTGAAAAAGTGAGCAATGT
AGTTTAGCCAATCAATCAAAACCGGAATGGTCACTCCCCGAATCAAAAGCGAAGTGACAA
TGATACACACCCACCACTGAGAAAAGGTGAAAGCATTAAGCAAGGCGAGCAAGTGTTGAA
GTGAAGTAAGAGCATCAGCAACATTGTGTAAAGCATAGACGTTAGAAACCGCAGATTTCA
AAACCCAATCGGTGAGGATTTCGACAGACCCGATCGAGCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 3

CO CL3689Contig1 722 3 17 U
GGGCATTGTGATTCACGAAAACATGTCTCGTCTTCTCAACACGTCATTCCTTCCTTCTTC
CACTTACAGAACCCGATCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCATTTCCATGTTAACAATCCACG
AATCGTCACCGTCCGAGCGAAGATCCGGGAGATCTTCATGCCTGCTCTCAGCTCCACCAT
GACCGAGGGCAAAATAGTATCCTGGGTCAAATCCGAAGGCGACAAGCTCAACAAGGGAGA
GAGCGTTGTGGTCGTCGAATCCGACAAGGCCGATATGGACGTCGAGACTTTCTACGACGG
TTATCTCGCCGCCATCATGGTCGAAGAAGGCGGCGTGGCTCCCGTTGGATCCGCCATTGC
TTTGTTAGCTGAGACTGAGGATGAAATCGCCGACGCTAGGGCTAAAGCTTCCGGTGGTGG
TGGTGGAGGAGCCACTTCTCCTTCTCCACCTCCGCCTGTATCCGAAGCACCTCCTCATGT
TGTTGTTGAAGAGAATGTTAAGGTTTCGGTTTCGGCTTCGCCGAGAGTCGTGTCTGCTTC
TGCGGTGCATCCGGCGTCTGAAGGAGGGAAGAGAGTGGTGGCTTCTCCTTACGCGAAGAA
GCTAGCACAGGAGTTGAAAGTGGAGTTGGCTGGTTTAGTGGGAAGTGGGCCTATGGGAAG
GATTGTGGCTAAAGATGTTGAAGCCGCTGTTTCTGTTGCTGCTGCTTCACCTGTTAAAAC
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4E092TF U 6
AF RR4DY15TF U 6
AF RR4BG60TF U 1
BS 1 100 RR4BG60TF
BS 101 101 RR4E092TF
BS 102 114 RR4BG60TF
BS 115 115 RR4E092TF
BS 116 147 RR4BG60TF
BS 148 148 RR4E092TF
BS 149 171 RR4BG60TF
BS 172 172 RR4E092TF
BS 173 186 RR4BG60TF
BS 187 187 RR4E092TF
BS 188 234 RR4BG60TF
BS 235 235 RR4E092TF
BS 236 294 RR4BG60TF
BS 295 295 RR4E092TF
BS 296 345 RR4BG60TF
BS 346 346 RR4E092TF
BS 347 722 RR4BG60TF

RD RR4E092TF 411 0 0
GGGTGG
TTCACGAAAACATGTCTCGTCTTCTCAACACGTCATTCCTTCCTTCTTCCACTTACAGAA
CCCGATCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCATTTCCATGTTAACAATCCACGAATCGTCACCG
TCCGAGCGAAGATCCGGGAGATCTTCATGCCTGCTCTCAGCTCCACCATGACCGAGGGCA
AAATAGTATCCTGGGTCAAATCCGAAGGCGACAAGCTCAACAAGGGAGAGAGCGTTGTGG
TCGTCGAATCCGACAAGGCCGATATGGACGTCGAGACTTTCTACGACGGTTATCTCGCCG
CCATCATGGTCGAAGAAGGCGGCGTGGCTCCCGTTGGATCCGCCATTGCTTTGTTAGCTG
AGACTGAGGATGAAATCGCCGACGCTAGGGCTAAAGCT
TCCGGTG

QA 7 404 7 404
DS 

RD RR4DY15TF 404 0 0
GGGTGG
TTCACGAAAACATGTCTCGTCTTCTCAACACGTCATTCCTTCCTTCTTCCACTTACAGAA
CCCGATCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCATTTCCATGTTAACAATCCACGAATCGTCACCG
TCCGAGCGAAGATCCGGGAGATCTTCATGCCTGCTCTCAGCTCCACCATGACCGAGGGCA
AAATAGTATCCTGGGTCAAATCCGAAGGCGACAAGCTCAACAAGGGAGAGAGCGTTGTGG
TCGTCGAATCCGACAAGGCCGATATGGACGTCGAGACTTTCTACGACGGTTATCTCGCCG
CCATCATGGTCGAAGAAGGCGGCGTGGCTCCCGTTGGATCCGCCATTGCTTTGTTAGCTG
AGACTGAGGATGAAATCGCCGACGCTAGGGCTAAAGCT

QA 7 404 7 404
DS 

RD RR4BG60TF 722 0 0
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CACTTACAGAACCCGATCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTCATCTCCATGTTAACAAGCCACG
AATCGTCACCGTCCGAGCGAAGATCCGAGAGATCTTCATGCCTGCTCTCAGTTCCACCAT
GACCGAAGGCAAAATAGTATCCTGGGTCAAATCCGAAGGCGACAAGCTCAACAAAGGAGA
GAGCGTTGTGGTCGTCGAATCCGACAAGGCCGATATGGACGTCGAGACTTTCTATGACGG
TTATCTCGCCGCCATCATGGTCGAAGAAGGCGGCGTGGCTCCCGTCGGATCCGCCATTGC
TTTGTTAGCTGAGACTGAGGATGAAATCGCCGACGCTAGGGCTAAAGCTTCCGGTGGTGG
TGGTGGAGGAGCCACTTCTCCTTCTCCACCTCCGCCTGTATCCGAAGCACCTCCTCATGT
TGTTGTTGAAGAGAATGTTAAGGTTTCGGTTTCGGCTTCGCCGAGAGTCGTGTCTGCTTC
TGCGGTGCATCCGGCGTCTGAAGGAGGGAAGAGAGTGGTGGCTTCTCCTTACGCGAAGAA
GCTAGCACAGGAGTTGAAAGTGGAGTTGGCTGGTTTAGTGGGAAGTGGGCCTATGGGAAG
GATTGTGGCTAAAGATGTTGAAGCCGCTGTTTCTGTTGCTGCTGCTTCACCTGTTAAAAC
TG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3690Contig1 676 3 1 U
GGGATCTTTCTCCAGTTTCCAAATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTA
GCTTCGACGAATCGCTTACCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCTAAGA
GCTCTTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAG
AGAAGTACCCTGACAGAGTCCCGGTGATTGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTG
ACATTGACAAGAAGAAGTATCTCGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACG
TGGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGGATA
CATTGCCTCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCGATTTATGAAGAACACAAAGATGAAGATG
GGTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATTGCTGCTTGAA
ATAAGTAAAATTTCCATCTTTTCATTAATGTACATAGATAAAAAGGAGGAAGATCAGATG
TACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTGCTTTTGCTTTGAATCTTTGACAT
TTCGGTTTATTATTATCTTCACAAACCTTTTCCTTATATACCTTCTTTTGCATTTTCAAA
TTGGAATGTTGAATCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F004JQ C 2
AF RR4F004TF U 2
AF RR4FQ71TF U 1
BS 1 676 RR4FQ71TF

RD RR4F004JQ 631 0 0
GGATCTTTCTCCAGTTTCCAAATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTAG
CTTCGACGAATCGCTTACCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCTAAGAG
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GAAGTACCCTGACAGAGTCCCGGTGATTGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTGA
CATTGACAAGAAGAAGTATCTCGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACGT
GGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGGATAC
ATTGCCTCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCGATTTATGAAGAACACAAAGATGAAGATGG
GTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATTGCTGCTTGAAA
TAAGTAAAATTTCCATCTTTTCATTAATGTACATAGATAAAAAGGAGGAAGATCAGATGT
ACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTGCTTTTGCTTTGAATCTTTGACATT
TCGGTTTATTATTATCTTCACAAACCTTT
CC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4F004TF 634 0 0
GGATCTTTCTCCAGTTTCCAAATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTAG
CTTCGACGAATCGCTTACCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCTAAGAG
CTCTTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAGA
GAAGTACCCTGACAGAGTCCCGGTGATTGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTGA
CATTGACAAGAAGAAGTATCTCGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACGT
GGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGGATAC
ATTGCCTCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCGATTTATGAAGAACACAAAGATGAAGATGG
GTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATTGCTGCTTGAAA
TAAGTAAAATTTCCATCTTTTCATTAATGTACATAGATAAAAAGGAGGAAGATCAGATGT
ACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTGCTTTTGCTTTGAATCTTTGACATT
TCGGTTTATTATTATCTTCACAAACCTTT
CCAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4FQ71TF 676 0 0
GGGATCTTTCTCCAGTTTCCAAATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTA
GCTTCGACGAATCGCTTACCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCTAAGA
GCTCTTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAG
AGAAGTACCCTGACAGAGTCCCGGTGATTGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTG
ACATTGACAAGAAGAAGTATCTCGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACG
TGGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGGATA
CATTGCCTCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCGATTTATGAAGAACACAAAGATGAAGATG
GGTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATTGCTGCTTGAA
ATAAGTAAAATTTCCATCTTTTCATTAATGTACATAGATAAAAAGGAGGAAGATCAGATG
TACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTGCTTTTGCTTTGAATCTTTGACAT
TTCGGTTTATTATTATCTTCACAAACCTTTTCCTTATATACCTTCTTTTGCATTTTCAAA
TTGGAATGTTGAATCA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 3

CO CL3691Contig1 756 3 2 U
CGCAAATCGTCCAATAAAACGTTTCAAACAACTACTAGGTTTTGTAATGGTGATACAGAT
TTGCTGGTGTTCAAGTATGTATGGAATATAATGTAAAGAGAGAGGGAGAGACTCGATATT
ACTACGACCGTTTGCATAGCAGCAAACCTGGTCGCTTATTCTTCTGTAAAATTGACTTGT
GATATGTTTTTGTTCATGACTTGATGTCTTCTTTCGCGTCAGCAGTATCGTTGCCTCCAT
CATCCTTGGCAACTGATGCGCTAGCTTGGTCATCGAGAGGTTCGTTGTTGTCAGCATCAG
CGTCTTCAGTGTTGTCGCCTGAAGATAAAGCCATCCGTCTAGCTCTAGGCTGCTGGTGCG
GGGTTGGCTGCAGTTTTGGTCGGAGAGCTTCCAAAGGCCCTTTAGGCTTTTGTCCTTTTT
GCTTGCCTAATGCCCAATCAGCAGAGTCAAAAAATGCGCGCTCATGATCCTTGGATATCA
AAGGAATCTTCTTTGGCAATAATCCTCCATACTTTTTCTTGATCGCATTTTCCTCTGACT
CAGATGATGGCTGTTTATGAATCTCAGTTTCATTCTTGTTATCATTTTGGTCAACAGGAG
GTGGAGTATCATCAACAAGCTCCTTTCCCTTGACGTCTTCCATGACAACGAAAGGTTGTG
GATGAGGAACGCCGGTTAACCGTGAAGAGATTCCGACGAGAACCGGGGGTTAGATCGGAT
CTTGTTTAGTTATGTGAGCTCCACGTTCCACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H625JQB U 117
AF RR4H185JQ U 1
AF RR4H185TF C 187
BS 1 693 RR4H185JQ
BS 694 756 RR4H185TF

RD RR4H625JQB 438 0 0
TATTACTACGACCGTTTGCATAGCAGCAAACCTGGTCGCTTATTCTTCTGTAAAATTGAC
TTGTGATATGTTTTTGTTCATGACTTGATGTCTTCTTTCGCGTCAGCAGTATCGTTGCCT
CCATCATCCTTGGCAACTGATGCGCTAGCTTGGTCATCGAGAGGTTCGTTGTTGTCAGCA
TCAGCGTCTTCAGTGTTGTCGCCTGAAGATAAAGCCATCCGTCTAGCTCTAGGCTGCTGG
TGCGGGGTTGGCTGCAGTTTTGGTCGGAAAGCTTCCAAAGGCCCTTTAGGCTTTTGTCCT
TTTTGCTTGCCTAATGCCCAATCAGCAGAGTCAAAAAATGCGCGCTCATGATCCTTGGAT
ATCAAAGGAATCTTCTTTGGCAATAATCCTCCATACTTTTTCTTGATCGCATTTTCCTCG
GACTCAGATGATGGCTGT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR4H185JQ 693 0 0
CGCAAATCGTCCAATAAAACGTTTCAAACAACTACTAGGTTTTGTAATGGTGATACAGAT
TTGCTGGTGTTCAAGTATGTATGGAATATAATGTAAAGAGAGAGGGAGAGACTCGATATT
ACTACGACCGTTTGCATAGCAGCAAACCTGGTCGCTTATTCTTCTGTAAAATTGACTTGT
GATATGTTTTTGTTCATGACTTGATGTCTTCTTTCGCGTCAGCAGTATCGTTGCCTCCAT
CATCCTTGGCAACTGATGCGCTAGCTTGGTCATCGAGAGGTTCGTTGTTGTCAGCATCAG
CGTCTTCAGTGTTGTCGCCTGAAGATAAAGCCATCCGTCTAGCTCTAGGCTGCTGGTGCG
GGGTTGGCTGCAGTTTTGGTCGGAGAGCTTCCAAAGGCCCTTTAGGCTTTTGTCCTTTTT
GCTTGCCTAATGCCCAATCAGCAGAGTCAAAAAATGCGCGCTCATGATCCTTGGATATCA
AAGGAATCTTCTTTGGCAATAATCCTCCATACTTTTTCTTGATCGCATTTTCCTCTGACT
CAGATGATGGCTGTTTATGAATCTCAGTTTCATTCTTGTTATCATTTTGGTCAACAGGAG
GTGGAGTATCATCAACAAGCTCCTTTCCCTTGACGTCTTCCATGACAACGAAAGGTTGTG
GATGAGGAACGCCGGTTAACCGTGAAGAGATTC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4H185TF 570 0 0
TTTTTGTTCATGACTTGATGTCTTCTTTCGCGTCAGCAGTATCGTTGCCTCCATCATCCT
TGGCAACTGATGCGCTAGCTTGGTCATCGAGAGGTTCGTTGTTGTCAGCATCAGCGTCTT
CAGTGTTGTCGCCTGAAGATAAAGCCATCCGTCTAGCTCTAGGCTGCTGGTGCGGGGTTG
GCTGCAGTTTTGGTCGGAGAGCTTCCAAAGGCCCTTTAGGCTTTTGTCCTTTTTGCTTGC
CTAATGCCCAATCAGCAGAGTCAAAAAATGCGCGCTCATGATCCTTGGATATCAAAGGAA
TCTTCTTTGGCAATAATCCTCCATACTTTTTCTTGATCGCATTTTCCTCTGACTCAGATG
ATGGCTGTTTATGAATCTCAGTTTCATTCTTGTTATCATTTTGGTCAACAGGAGGTGGAG
TATCATCAACAAGCTCCTTTCCCTTGACGTCTTCCATGACAACGAAAGGTTGTGGATGAG
GAACGCCGGTTAACCGTGAAGAGATTCCGACGAGAACCGGGGGTTAGATCGGATCTTGTT
TAGTTATGTGAGCTCCACGTTCCACGATCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GGGTCCATGAACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGAAAAGAACCTTCGACAAAAATAA
TTCAAGTAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTG
CCATACAACTACTCCTTATAAACAGCGAATTGTCCGTAAACACGACCAATGAGTATCTCA
GCCACACATGTTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACGGGAAGTGAGTACGAGAAACGTT
TAAAAAATATCATGAAAATGTTCTATAAAAACAGTATTAAAGGTTACGACTTTTTTGGCG
ATTCTACTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCCC*AAGTGCCAC
GACTGCTTTGTCACCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAGGAGAT*GTCCATGGTACAAGGGGAG
AATAATATGGTATGACCTATGTCCTCTCTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGAT
CGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCGAAGAAGGTGGTAGACAATAGAGTCCC
CCTCGGATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGATCTGACGGAATTAGCCACCAC
TGGAGATAATTCTACATTGTACTCTGTGGGGGAGAAGCGGTACAAGGGTGAGATGGTATA
CGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGACTTATCGCAAAAAGCTTGTAAGGAGTGTTTGTGGTA
TAAAACCTTTCATTTTCACCATTGCGTGGATAATTTTCGAGGAGCGAGGGTTGTAGGTAG
GAGCTGTACTTTTAGGCTTGAATTTTACCCTTTTATTACCAAGTCGGTCCGTAATATTTA
AAAGAACTAAAAGTATAAAAAATCAATTTATGTAAAATTAATTCAATCATAAGGTTTCTT
TCTTTTTTGCTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET73TF U 1
AF RR4H068TF U 5
AF RR4H068JQ C 322
BS 1 48 RR4ET73TF
BS 49 49 RR4H068TF
BS 50 443 RR4ET73TF
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BS 445 508 RR4ET73TF
BS 509 509 RR4H068TF
BS 510 532 RR4ET73TF
BS 533 533 RR4H068TF
BS 534 583 RR4ET73TF
BS 584 658 RR4H068TF
BS 659 915 RR4H068JQ

RD RR4ET73TF 583 0 0
GGGTCCATGAACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGAAAAGAACCTTTGACAAAAATAA
TTCAAGTAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTG
CCATACAACTACTCCTTATAAACAGCGAATTGTCCGTAAACACGACCAATGAGTATCTCA
GCCACACATGTTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACGGGAAGTGAGTACGAGAAACGTT
TAAAAAATATCATGAAAATGTTCTATAAAAACAGTATTAAAGGTTACGACTTTTTTGGCG
ATTCTACTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCCC*AAGTGCCAC
GACTGCTTTGTCACCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAGGAGAT*GTCCATGGTACAAGGGGAG
AATAATATGGTATGACCTATGTCTTCTCTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGAT
CGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCGACGCGAAGAAGGTGGTAGACAATGGAGTCCC
CCTCGGATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGATCTG

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4H068TF 654 0 0
GG
ATGAACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGAAAAGAACCTTCGACAAAAATAATTCAAG
TAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATAC
AACTACTCCTTATAAACAGCGAATTGTCCGTAAACACGACCAATGAGTATCTCAGCCACA
CATGTTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACGGGAAGTGAGTACGAGAAACGTTTAAAAA
ATATCATGAAAATGTTCTATAAAAACAGTATTAAAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTA
CTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCCC*AAGTGCCACGACTGC
TTTGTCACCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAGGAGAT*GTCCATGGTACAAGGGGAGAATAAT
ATGGTATGACCTATGTCCTCTCTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGATCGATTA
CGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCGAAGAAGGTGGTAGACAATAGAGTCCCCCTCGG
ATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGATCTGACGGAATTAGCCACCACTGGAGA
TAATTCTACATTGTACTCTGTGGGGGAGAAGCGGTACAAGGGTGAGATGGTA

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR4H068JQ 594 0 0
TCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCACCGCCCTC
GCTGCGCTTCGTAGGAGATTGTCCATGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCTATG
TCCTCTCTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTG
TATTACCAACGCGAAGAAGGTGGTAGACAATAGAGTCCCCCTCGGATTTATAAAAGTTTG
GAATATTCTCGTTGACGATCTGACGGAATTAGCCACCACTGGAGATAATTCTACATTGTA
CTCTGTGGGGGAGAAGCGGTACAAGGGTGAGATGGTATACGGAATGGTGCAGTGTGCGAG
AGACTTATCGCAAAAAGCTTGTAAGGAGTGTTTGTGGTATAAAACCTTTCATTTTCACCA
TTGCGTGGATAATTTTCGAGGAGCGAGGGTTGTAGGTAGGAGCTGTACTTTTAGGCTTGA
ATTTTACCCTTTTATTACCAAGTCGGTCCGTAATATTTAAAAGAACTAAAAGTATAAAAA
ATCAATTTATGTAAAATTAATTCAATCATAAGGTTTCTTTCTTTTTTGCTGGAT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 3

CO CL3694Contig1 1040 3 13 U
GGATCGATTCGATCTCAAAAGAAAAAAAAAGATTACATTCTCTCCTTCCGATCTAGAAAA
ACGAAAGAGATGGCCGGTGGTGGTTCGAAATCAACTGCGCCCAAGGCGAGGAAGAGAGTG
GATGCTGAAACCAAACCCGAAACCACCGCTAACAACAACAACAACATCAACACCTTACTT
CGCGCCAAAGACGGTAGCGCCTTCGTTCGATGTGAGGGATGCAACAAGAACGTAGCTGTT
GCGCTTATCAGTATGCATAATTGTAGCCTCGACGCCAAGATTCGAGTCAATCTCGAAGCT
CAAGTTGTTGAGACACAAACCGAGGCTAAGAAGAAACCTGCTGAGAGGAAGAAGTCAACA
TCTGATGAACCTAAGGCAAAGAGAGTAAGGAAGGCCAAGGATGAGAATAAGAAGAAGAGC
TCTTCTTCCTCCTCTAACAAGCCCAAGCGACCTCTTACTGCCTTCTTCATCTTCATGTCC
GATTTCCGCAAAACTTTCAAAGAAGAGAATCCTGACGCTGGCGTTAAGGATGTTGCAAAA
CAGGGTGGTGAAAAGTGGAAGTCTTTGGATGAGGAAGAGAAGAAAGTTTATTTGGATAAA
GCTGCTGAACTAAAGGTAGAGTATAACAAGTCACTTGAGAGCAGCAACGATGCTGATGAG
GAAGAAGTGGATGAGGAGAAAGAAGCTACTGATGTTGATGATGCTGATGAGAAAAAGCAA
ACTGATGAGGCTGAGGAGAATGAAGGTGAAAACAAAGAGGCTGAAGGTAAAGAAGAGGAA
GATGAGATTTTGGATGACTACTAGACATATTAAAATCTTTCTTTGGTTTAATCTCAATGA
AATGGATTCAACTCTTTATCCTGATGGTGCATTGTAAATTTTGAACTTTCATTAGTTATC
TTAATATGGTTGGTGTGAGCATGTGAGGTTTCTGTAGTTCACTCCTTTTGTTTAGACAAG
TATTGAAGGTTAATGTTTTTAGTTTCACCACTGTTGTAGAACTGAAAGCTATTGTTTGTT
CTAGTCTTAGCGCTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F755TF U 1
AF RR4A515TF U 11
AF RR4A515JQ C 207
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BS 737 766 RR4A515TF
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DS 

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TGGCCGGTGGTGGTTCGAAATCAACTGCGCCCAAGGCGAGGAAGAGAGTGGATGTTGAAA
CCAAACCCGAAACCACCGCTAACAACAACAACAACATCAACACCTTACTTCGCGCCAAAG
ACGGTAGCGCCTTCGTTCGATGTGAGGGATGCAACAAGAACGTAGCTGTTGCGCTTATCA
GTATGCATAATTGTAGCCTCGACGCCAAGATTCGAGTCAATCTCGAAGCTCAAGTTGTTG
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ACCACTGTTGTAGAACTGAAAGCTATTGTTTGTTCTAGTCTTAGCGCTTTAATC

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DS 



AS 1 3

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TCACTAAACCCATCCGTTCTCTTTCTCACTTGTCAATTTTTTTTTGCATATGTCATTCTT
CTCTTTTTAAGTTTCTTCTACTGACCACTGGTAGGTGTATGGATTTGTGAGTGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGCTTTAAATGGATTGGAACTTCAAACCCAGCTCCGGTTATTTCTCCG
AGTTCGACCAAGAATCTGTACCGGATATAACCCCAGTCCATGCATCGATCTCGTTTAGTG
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GACACTCCTCTGCTTTTGGTAACGCAGAGCAAGTGATAAGTCTTGGTAAGTTGAAAGAGA
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AGATCCCGGTTTGTCTGGTTGATGGATGTGATTCTGATTTTAGTAACTGTAGAGAGTATC
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ATAAACAGAGGTTTTGTCAACAATGCAGCAGGTTTCATGCTTTGGAAGAGTTTGATGAAG
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CCGACCATATCGGTCGTTCTGCAACTTTCTTCCAAGGTAGCAAATTGCTGGATTTTTCTA
GCTCTCCACATGTGTTTCCAACTACAAAATCTGTTGCGAGTCCGAGCTGGGGAAACGGTC
TTGTAAGCGTAGCAATGGCGAACGGTTCAAGTTACGGGCAGAACCAGAGCTATGCTGGTT
CTTGTCCCGCAAAGACAGGCATTACGTTCCCAATATCTTCTTCTCCAAACAACAGAGGGA
AACAGTTTCCTTTCTTGCACGAAGAAGAAGACTGCTCGAGAATGACGAGTTGCATCCATG
ACTCTGATTGCGCTCTCTCTCTTCTGTCATCATCTTCCTCTCATTTGCTTCAGCCACCAC
TTTCTTTGTCCCAAGAGACGGGTTTTTATGGGTCCGGATTGTTTGAGAACGCGAGTGCAG
TCTCTGATGGATCTGGTAATGAGGCTGTGGCTCTTCCACAGACGTTCCCGTTTCACTGGG
AGTAGTAGTAGTAGTAGGCAGAGAGAATCAGCAAGATGCATGTCTGCTGTCTCTTTCTAT
ATCCTCTTCTCTTTCTCTCTAGTTTTCCAAAGTTTTGTAATTTATAAGCAGTACGCTGTT
GCAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX02TF U 1
AF RR4AR67TF U 134
AF RR4AR67JQ C 495
BS 1 176 RR4AX02TF
BS 177 177 RR4AR67TF
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BS 753 954 RR4AR67TF
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TCACTAAACCCATCCGTTCTCTTTCTCACTTGTCAATTTTTTTTTGCATATGTCATTCTT
CTCTTTTTAAGTTTCTTCTACTGACCACTGGTAGGTGTATGGATTTGTGAGTGAAGGAGA
AGAAGAAGAAGAAGCTTTAAATGGATTGGAACTTCAAACCCAGCTCCGGTTATTTCTCCG
AGTTCGACCAAGAATCTGTACCGGATATAACCCCAGTCCATGCATC*ATCTCGTTTAGTG
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GACACTCCTCTGCTTTTGGTAACGCAGAGCAAGTGATAAGTCTTGGTAAGTTGAAAGAGA
GCGCACCAGAGGCTTCAAGAAGCTCCTCTGGTTCGTCCAAGAGGACAAGAGGGAACAACC
AGATCCCGGTTTGTCTGGTTGATGGATGTGATTCTGATTTTAGTAACTGTAGAGAGTATC
ATAAAAGACATAAGGTCTGTGATGTACGTTCAAAAACTCCTGTGGTTACAATCAATGGCC
ATAAACAGAGGTTTTGTCAACAATGCAGCAGGTTTCATGCTTTGGAAGAGTTTGATGAAG
AAAAGAAAAGTTGTAGGAAACGTCTTGATGGACACAACAGAAGAAGACGGAAGCCTCAGC
CCGACCATATCGGTCGTTCTGCAACTTTCTTC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4AR67TF 821 0 0
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GTGATAAGTCTTGGTAAGTTGAAAGAGAGCGCACCAGAGGCTTCAAGAAGCTCCTCTGGT
TCGTCCAAGAGGACAAGAGGGAACAACCAGATCCCGGTTTGTCTGGTTGATGGATGTGAT
TCTGATTTTAGTAACTGTAGAGAGTATCATAAAAGACATAAGGTCTGTGATGTACATTCA
AAAACTCCTGTGGTTACAATCAATGGCCATAAACAGAGGTTTTGTCAACAATGCAGCAGG
TTTCATGCTTTGGAAGAGTTTGATGAAGAAAAGAAAAGTTGTAGGAAACGTCTTGATGGA
CACAACAGAAGAAGACGGAAGCCCCAGCCCGACCATATCGGTCGTTCTGCAACTTTCTTC
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TACGGGCAGAACCAGAGCTATGCTGGTTCTTGTCCCGCAAAGACAGGCATTACGTTCCCA
ATATCTTCTTCTCCAAACAACA

QA 20 821 20 821
DS 

RD RR4AR67JQ 832 0 0
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GTCTGTGATGTACATTCAAAAACTCCTGTGGTTACAATCAATGGCCATAAACAGAGGTTT
TGTCAACAATGCAGCAGGTTTCATGCTTTGGAAGAGTTTGATGAAGAAAAGAAAAGTTGT
AGGAAACGTCTTGATGGACACAACAGAAGAAGACGGAAGCCCCAGCCCGACCATATCGGT
CGTTCTGCAACTTTCTTCCAAGGTAGCAAATTGCTGGATTTTTCTAGCTCTCCACATGTG
TTTCCAACTACAAAATCTGTTGCGAGTCCGAGCTGGGGAAACGGTCTTGTAAGCGTAGCA
ATGGCGAACGGTTCAAGTTACGGGCAGAACCAGAGCTATGCTGGTTCTTGTCCCGCAAAG
ACAGGCATTACGTTCCCAATATCTTCTTCTCCAAACAACAGAGGGAAACAGTTTCCTTTC
TTGCACGAAGAAGAAGACTGCTCGAGAATGACGAGTTGCATCCATGACTCTGATTGCGCT
CTCTCTCTTCTGTCATCATCTTCCTCTCATTTGCTTCAGCCACCACTTTCTTTGTCCCAA
GAGACGGGTTTTTATGGGTCCGGATTGTTTGAGAACGCGAGTGCAGTCTCTGATGGATCT
GGTAATGAGGCTGTGGCTCTTCCACAGACGTTCCCGTTTCACTGGGAGTAGTAGTAGTAG
TAGGCAGAGAGAATCAGCAAGATGCATGTCTGCTGTCTCTTTCTATATCCTCTTCTCTTT
CTCTCTAGTTTTCCAAAGTTTTGTAATTTATAAGCAGTACGCTGTTGCAGCC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GGTCACTGCATTGAATTTCATATCAGAGAGACTCGTAAATGTCTTGACAAAGGAAAATAA
GTAAGTGAATGTCTGCCAACAACTCTTCAACTGCAATCACAATTTTCTAAATATCTTATT
TACTGATAGTAAAAATATAATTTCTCCTGTTAGGAAAAATTACAAAAAATACCAGAAACC
ACCACCGACTATAGTTTTTATGATCATTAAATCATTATTAGGGTAAAAACATGAGTCATG
ACAATCAAACTCATTGATCCACCGTTACATAAACCTGTGCAGTAACAGGTGCGTTTGTCT
GAACCACCACTCGATTATCCGAGACGTTCCTTACTGCGTGAACAGGAAATGCGCCATCTT
CACGTGCTACGAGCGTGTACTGAACGTGCTTGATTAAATTCGGGAACAACAAAACCGGGT
TAAAGTCAACGGTCCAAGACGTTCCATTTCCATCGACCGATGCTTTAGCTACCGTCGATC
TCACTGCCATCCCATTCACATTGTTCCGGTCAACAACCACCTGATCAACATTCTCAAACG
CTTTATTCGTCTGATCCAATTGAACAATCTGGACCCCATTACCCGACCCGGAAAACATAT
TGTCAACAATATTAACCCCACGAACCACACCGTTTATCGACTTCAACAAAATAAACGCAT
CTCCTAAGAAAAACGTCCCGGAAACCTGCAGCTGAACCGGGTCTTCCGCAACGATACCGG
TGTAATCCAAGTAGGAATTCACAATCCGGTTCTGAGTCAAACCGGGTAATTTCAAATAGA
TTCCGGTTCCACCAAAACCGGTTGCTTTGTTATAACAATGCACACCGGACAAAAGGTTTG
CCTGTCCTGATATCATGGCCCCAATCCCGGCTGAGAATATAACGGTGTCCGTGACGGCGT
TATCATTACCCACCAAGTTTACGGCAGTTCCGGAGAAGTTTCTCTCTCCTTTGTCTCCAC
CGGCGGTTATGTGTTGACCGAGAAAAGAGTTTCGAATGTAAGTTTCATGTCCTTTTTGGA
CAAGAATCCCGTTCGTGTCTCCAAACCGTGTGATGTAGCAGTTGTCTATGCTTGTCCGGA
GAGAATTGATGACGGCGATTGCTCCGCCGCGATAGTTGCAGTCGATGAGAAGATCTCTGA
GAGTTATGTATTCGAAAATGTACTGTAACTTTGACGATTCGTCGTTGAGTTCGATTAAGT
ACTTGTCTACTGGAAAATCATCAGATGCCCTTAATGTCCCTCCGCTTATCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DU54JQ U 1
AF RR4FP44JQ U 107
AF RR4DU54TF C 690
BS 1 202 RR4DU54JQ
BS 203 203 RR4FP44JQ
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BS 276 673 RR4DU54JQ
BS 674 831 RR4FP44JQ
BS 832 1251 RR4DU54TF

RD RR4DU54JQ 673 0 0
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GTAAGTGAATGTCTGCCAACAACTCTTCAACTGCAATCACAATTTTCTAAATATCTTATT
TACTGATAGTAAAAATATAATTTCTCCTGTTAGGAAAAATTACAAAAAATACCAGAAACC
ACCACCGACTATAGTTTTTATGGTCATTAAATCATTATTAGGGTAAAAACATGAGTCATG
ACAATCAAACTCATTGATCCACCGTTACATAAACTTGTGCAGTAACAGGTGCGTTTGTCT
GAACCACCACTCGATTATCCGAGACGTTCCTTACTGCGTGAACAGGAAATGCGCCATCTT
CACGTGCTACGAGCGTGTACTGAACGTGCTTGATTAAATTCGGGAACAACAAAACCGGGT
TAAAGTCAACGGTCCAAGACGTTCCATTTCCATCGACCGATGCTTTAGCTACCGTCGATC
TCACTGCCATCCCATTCACATTGTTCCGGTCAACAACCACCTGATCAACATTCTCAAACG
CTTTATTCGTCTGATCCAATTGAACAATCTGGACCCCATTACCCGACCCGGAAAACATAT
TGTCAACAATATTAACCCCACGAACCACACCGTTTATCGACTTCAACAAAATAAACGCAT
CTCCTAAGAAAAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FP44JQ 725 0 0
CTAAATATCTTATTTACTGATAGTAAAAATATAATTTCTCCTGTTAGGAAAAATTACAAA
AAATACCAGAAACCACCACCGACTATAGTTTTTATGATCATTAAATCATTATTAGGGTAA
AAACATGAGTCATGACAATCAAACTCATTGATCCACCGTTACATAAACCTGTGCAGTAAC
AGGTGCGTTTGTCTGAACCACCACTCGATTATCCGAGACGTTCCTTACTGCGTGAACAGG
AAATGCGCCATCTTCACGTGCTACGAGCGTGTACTGAACGTGCTTGATTAAATTCGGGAA
CAACAAAACCGGGTTAAAGTCAACGGTCCAAGACGTTCCATTTCCATCGACCGATGCTTT
AGCTACCGTCGATCTCACTGCCATCCCATTCACATTGTTCCGGTCAACAACCACCTGATC
AACATTCTCAAACGCTTTATTCGTCTGATCCAATTGAACAATCTGGACCCCATTACCCGA
CCCGGAAAACATATTGTCAACAATATTAACCCCACGAACCACACCGTTTATCGACTTCAA
CAAAATAAACGCATCTCCTAAGAAAAACGTCCCGGAAACCTGCAGCTGAACCGGGTCTTC
CGCAACGATACCGGTGTAATCCAAGTAGGAATTCACAATCCGGTTCTGAGTCAAACCGGG
TAATTTCAAATAGATTCCGGTTCCACCAAAACCGGTTGCTTTGTTATAACAATGCACACC
GGACA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4DU54TF 562 0 0
AGCTGAACCGGGTCTTCCGCAACGATACCGGTGTAATCCAAGTAGGAATTCACAATCCGG
TTCTGAGTCAAACCGGGTAATTTCAAATAGATTCCGGTTCCACCAAAACCGGTTGCTTTG
TTATAACAATGCACACCGGACAAAAGGTTTGCCTGTCCTGATATCATGGCCCCAATCCCG
GCTGAGAATATAACGGTGTCCGTGACGGCGTTATCATTACCCACCAAGTTTACGGCAGTT
CCGGAGAAGTTTCTCTCTCCTTTGTCTCCACCGGCGGTTATGTGTTGACCGAGAAAAGAG
TTTCGAATGTAAGTTTCATGTCCTTTTTGGACAAGAATCCCGTTCGTGTCTCCAAACCGT
GTGATGTAGCAGTTGTCTATGCTTGTCCGGAGAGAATTGATGACGGCGATTGCTCCGCCG
CGATAGTTGCAGTCGATGAGAAGATCTCTGAGAGTTATGTATTCGAAAATGTACTGTAAC
TTTGACGATTCGTCGTTGAGTTCGATTAAGTACTTGTCTACTGGAAAATCATCAGATGCC
CTTAATGTCCCTCCGCTTATCT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL3698Contig1 614 2 9 U
AGCTCTTATAACGTCTTGTTGATGCTTGTTGGTACTGCCAGAGAAACTGAGTTCACAAAA
TGCTCCTATAACTCATGTCAAAGTGGAATATACAATTACAAAACACAGCTATGAAGACCA
GTTTCTTGAATGTTCTTCAAATCCAAGAGTCGACGCAAAAAGCCCCAGACAGTGACTGAC
TCTATTTCATCAAGTGTGAGCTGATTGTGAAGACAGCAGTTTTGAATGGTTATGCTCGCC
TTCGTAAGTCACAATTAACATCGAAGTTTCATCTACACATCGCTCCACATGCTTACTTGC
AGGACAGCCTCTCACACTGCTGCACTTGTAGTATCCCCGTGGATGTGGTGAGCCCTTGAT
CGGTTTCTGACCATACTTCCTCCATGAATACTCATCTGGAGGTATATCTGCAATCTTGTT
ACTTATTGCAGGTACCTTGATCGATCGTTTCACTCTAAGTTTCCTTTTCTTGGAACAATG
ACATTTGCTTCGACTTCCACACTTCGAACTACCAGAGCACATCTTCTTAAATATCTGGTC
AGACCCACGTGACAATCCACTTAGATGAAACGAACTCCTATCGTAATCCACCACACTAGT
ATCCATGCTAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4F553JQ U 1
AF RR4D355JQ U 49
BS 1 65 RR4F553JQ
BS 66 66 RR4D355JQ
BS 67 499 RR4F553JQ
BS 500 500 RR4D355JQ
BS 501 529 RR4F553JQ
BS 530 530 RR4D355JQ
BS 531 573 RR4F553JQ
BS 574 574 RR4D355JQ
BS 575 614 RR4F553JQ

RD RR4F553JQ 614 0 0
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TGCTCTTATAACTCATGTCAAAGTGGAATATACAATTACAAAACACAGCTATGAAGACCA
GTTTCTTGAATGTTCTTCAAATCCAAGAGTCGACGCAAAAAGCCCCAGACAGTGACTGAC
TCTATTTCATCAAGTGTGAGCTGATTGTGAAGACAGCAGTTTTGAATGGTTATGCTCGCC
TTCGTAAGTCACAATTAACATCGAAGTTTCATCTACACATCGCTCCACATGCTTACTTGC
AGGACAGCCTCTCACACTGCTGCACTTGTAGTATCCCCGTGGATGTGGTGAGCCCTTGAT
CGGTTTCTGACCATACTTCCTCCATGAATACTCATCTGGAGGTATATCTGCAATCTTGTT
ACTTATTGCAGGTACCTTGATCGATCGTTTCACTCTAAGTTTCCTTTTCTTGGAACAATG
ACATTTGCTTCGACTTCCATACTTCGAACTACCAGAGCACATCTTCTTAGATATCTGGTC
AGACCCACGTGACAATCCACTTAGATGAAACGAGCTCCTATCGTAATCCACCACACTAGT
ATCCATGCTAAGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4D355JQ 563 0 0
C
AGTTCACAAAATGCTCCTATAACTCATGTCAAAGTGGAATATACAATTACAAAACACAGC
TATGAAGACCAGTTTCTTGAATGTTCTTCAAATCCAAGAGTCGACGCAAAAAGCCCCAGA
CAGTGACTGACTCTATTTCATCAAGTGTGAGCTGATTGTGAAGACAGCAGTTTTGAATGG
TTATGCTCGCCTTCGTAAGTCACAATTAACATCGAAGTTTCATCTACACATCGCTCCACA
TGCTTCCTTGCAGGACAGCCTCTCACACTGCTGCACTTGTAGTATCCCCGTGGATGTGGT
GAGCCCTTGATCGGTTTCTGACCATACTTCCTCCATGAATACTCATCTGGAGGTATATCT
GCAATCTTGTTACTTATTGCAGGTACCTTGATCGATCGTTTCACTCTAAGTTTCCTTTTC
TTGGAACAATGACATTTGCTTCGACTTCCACACTTCGAACTACCAGAGCACATCTTCTTA
AATATCTGGTCAGACCCACGTGACAATCCACTTAGATGAAACGAACTCCTATCGTAATCC
ACCACACTAGTATCCATGCTAA

QA 2 563 2 563
DS 



AS 1 3

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ACAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCATCCGC
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GATGACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTT
ACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGC
TTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTT
TAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTGAGA
TCAATGGATAACTGTTTTAAACC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4DC18TF U 1
AF RR4DC18JQ C 124
AF RR4FH34TF U 553
BS 1 682 RR4DC18TF
BS 683 683 RR4DC18JQ

RD RR4DC18TF 683 0 0
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ACAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCATCCGC
CGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAGACCATCTTC
GGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGCGGCGGACGCGTCACTGCCATGGCCACATACAAGGTC
AAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTC
GACGCTGCGGAGGAAGCAGGGATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTCG
AGCTGCGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTACCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGAT
GATGACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTT
ACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGC
TTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTT
TAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTGAGA
TCAATGGATAACTGTTTTAAAC
C

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4DC18JQ 560 0 0
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CTCAAGTCAGGAACCGCACGCGGCGGACGCGTCACTGCCATGGCCACATACAAGGTCAAG
TTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGAC
GCTGCGGAGGAAGCAGGGATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTCGAGC
TGCGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTACCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGAT
GACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACC
ATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGCTTT
TGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTAG
TATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTGAGATCA
ATGGATAACTGTTTTAAACC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4FH34TF 131 0 0
G
GTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTAGTATAATCTAT
TGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTGAGATCAATGGATAACT
GTTTTAAAC
T

QA 2 130 2 130
DS 



AS 1 3

CO CL3700Contig1 1277 3 9 U
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TTTTACTCCGTCGTCATGGGTTTAGCTCTCGGTGTTTACATATCTGCAGAGTTCTTTCTA
CAAGCGGCTGTTCTTCATGTTCTGATTATTGTAACGATGGTGTGTGCCTCAGTTTTTGTC
ATCTTCACCCATTTTCCATCTGCCTCAAGCACAAAGCTGCTCCCCTGGGTGTTTGCTCTT
CTCGTGGCACTATTTCCAGTGACATATTTGTTAGAAGGGCAGGTCAGAATTAAAACTCTC
AGTGATAATGTTGCCTGGGGTTGGGATGCAGGGGAGGAGGATAAGAAAGTCACAACGTTG
TTGGCAATTGAAGGTGCAAGAACATCTCTTCTAGGTCTCTACGCAGCAATATTCATGCTC
ATAGCTCTCTTGATCAAGCTTGAGCTCACTTCGCTTTTGCGTGAGAAAGTCTCTGAGAGC
AGTGGTCAGTCAAAAACCCAAGGCGGCGCAAGGGGGATGTTCCCAACACGAATGAGGTTG
ATGCAACAACGCCGAGCCACATCAATCCAAAGCTTTGCAATAGAGAAAATGTCAGAAGAT
GGAGCGGCCTGGATGCCAGCGGTTGGTAACGTTGCCACCATCGTCTGCTTTGCCATATGC
TTAATTCTCAACATCCACATTTCAGGCGGCTCAAGCCAAGCGATCTTCTTCCTGGCTCCT
ATCTTACTTCTCCTGAACCAAGACTCTGATCTCTTATCTGGGTTCGGCGATAAACAGAGA
TACTTCCCGGTTATTCTAGCCATATCAACATACTTGGCTTTATCCTCTCTCTATACTATA
TGGGAAGAAGTTTGGTTCGGTGGAAACACAGGTTGGGGAATAGAAATTGGAGGCCGTGAA
TGGTTCTTTGCGGTGAAGAACCTGGCTCTCCTAATACTCACGGCCCCAGGTCACATTATA
TTCAACAGGTACGTGTGGAGTTACACCAGTAAACAGTCAGACGCGTCGCCGATGCTTACC
CTGCCACTTAGCTTTGCAGCCGTGGTGATAACGGACGTGTTTCAGGTTCGGCTTCTTGGA
GTTTTAGGCATTGTTTACTCTGTTGCTCAGTATGTAATATCTAGGCAACAATACATGAAA
GGGCTGAGGTATATTTAGACAGCCGTTAGGATTTCCTCGTTTTTCTTGTGTAACAATGTT
TCATTTTCGCTACCTTTCTTAGACCTTTTTGTTTCACGGTTGATGCATTGAAAATTGCAG
AGATACGTTTACATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H043TF U 1
AF RR4FZ69TF U 185
AF RR4FZ69JQ C 644
BS 1 685 RR4H043TF
BS 686 686 RR4FZ69TF
BS 687 738 RR4H043TF
BS 739 739 RR4FZ69TF
BS 740 761 RR4H043TF
BS 762 871 RR4FZ69TF
BS 872 872 RR4FZ69JQ
BS 873 895 RR4FZ69TF
BS 896 1277 RR4FZ69JQ

RD RR4H043TF 761 0 0
GTGATTCTTGCTGCTGCTACATCTCTAATCCCAATCAAATACGTGGTAGAATTGCGAGCA
TTTTACTCCGTCGTCATGGGTTTAGCTCTCGGTGTTTACATATCTGCAGAGTTCTTTCTA
CAAGCGGCTGTTCTTCATGTTCTGATTATTGTAACGATGGTGTGTGCCTCAGTTTTTGTC
ATCTTCACCCATTTTCCATCTGCCTCAAGCACAAAGCTGCTCCCCTGGGTGTTTGCTCTT
CTCGTGGCACTATTTCCAGTGACATATTTGTTAGAAGGGCAGGTCAGAATTAAAACTCTC
AGTGATAATGTTGCCTGGGGTTGGGATGCAGGGGAGGAGGATAAGAAAGTCACAACGTTG
TTGGCAATTGAAGGTGCAAGAACATCTCTTCTAGGTCTCTACGCAGCAATATTCATGCTC
ATAGCTCTCTTGATCAAGCTTGAGCTCACTTCGCTTTTGCGTGAGAAAGTCTCTGAGAGC
AGTGGTCAGTCAAAAACCCAAGGCGGCGCAAGGGGGATGTTCCCAACACGAATGAGGTTG
ATGCAACAACGCCGAGCCACATCAATCCAAAGCTTTGCAATAGAGAAAATGTCAGAAGAT
GGAGCGGCCTGGATGCCAGCGGTTGGTAACGTTGCCACCATCGTCTGCTTTGCCATATGC
TTAATTCTCAACATCCACATTTCAG*CGGCTCAAGCCAAGCGATCTTCTTCCTGGCTCCT
ATCTTACTTCTCCTGAAC*AAGACTCTGATCTCTTATCTGG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4FZ69TF 711 0 0
G
CACCCATTTTCCATCTGCCTCAAGCACAGAGCTGCTCCCCTGGGTGTTTGCTCTTCTCGT
GGCTCTATTTCCAGTGACATATTTGTTAGAAGGGCAGGTCAGAATTAAAACTCTCAGTGA
TAATGTTGCCTGGGGTTGGGATGCAGGGGAGGAGGATAAGAAAGTCACAACGTTGTTGGC
AATTGAAGGTGCAAGAACATCTCTTCTAGGTCTCTACGCAGCAATATTCATGCTCATAGC
TCTCTTGATCAAGTTTGAGCTCACTTCGCTTTTGCGTGAGAAAGTCTCTGAGAGCAGTGT
TCAGTCAAAAACCCAAGGCGGCGCAAGGGGGATGTTCCCAACACGAATGAGGTTGATGCA
ACA**GCCGAGCCACATCAATCCAAAGCTTTGCAATAGAGAAAATGTCAGAAGATGGAGC
GGCCTGGATGCCAGCGGTTGGTAACGTTGCCACCATCGTCTGCTTTGCCATATGCTTAAT
TCTCAACATCCACATTTCAGGCGGCTCAAGCCAAGCGATCTTCTTCCTGGCTCCTATCTT
ACTTCTCCTGAACCAAGACTCTGATCTCTTATCTGGGTTCGGCGATAAACAGAGATACTT
CCCGGTTATTCTAGCCATATCAACATACTTGGCTTTATCCTCTCTCTATACTATATGGGA
AGAAGTTTGGTTCGGTGGAAACACAG*TTGGGGAATAGAAATTGGAGGCC

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR4FZ69JQ 634 0 0
TCTGCTTTGCCATATGCTTAATTCTCAACATCCACATTTCAGGCGGCTCAAGCCAAGCGA
TCTTCTTCCTGGCTCCTATCTTACTTCTCCTGAACCAAGACTCTGATCTCTTATCTGGGT
TCGGCGATAAACAGAGATACTTCCCGGTTATTCTAGCCATATCAACATACTTGGCTTTAT
CCTCTCTCTATACTATATGGGAAGAAGTTTGGTTCGGTGGAAACACAGGTTGGGGAATAG
AAATTGGAGGCCGTGAATGGTTCTTTGCGGTGAAGAACCTGGCTCTCCTAATACTCACGG
CCCCAGGTCACATTATATTCAACAGGTACGTGTGGAGTTACACCAGTAAACAGTCAGACG
CGTCGCCGATGCTTACCCTGCCACTTAGCTTTGCAGCCGTGGTGATAACGGACGTGTTTC
AGGTTCGGCTTCTTGGAGTTTTAGGCATTGTTTACTCTGTTGCTCAGTATGTAATATCTA
GGCAACAATACATGAAAGGGCTGAGGTATATTTAGACAGCCGTTAGGATTTCCTCGTTTT
TCTTGTGTAACAATGTTTCATTTTCGCTACCTTTCTTAGACCTTTTTGTTTCACGGTTGA
TGCATTGAAAATTGCAGAGATACGTTTACATGAC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL3701Contig1 775 2 11 U
GGGCGCCGCGCAACCTCTCCCTCTATCTCTCTATCAGCTCTCCTCTTCCTCTCAAAGAGA
CATGTCTGATTCAAAGATGGTGGTTCCAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAAGAGGGAAGA
GGAATGGGCACTGGCCAAGAAACAAGAAGCTGAAGCTCTAAGAAGAAGAGCGTTGTGACC
CGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTGAGCAGTACGCCAAAGAATACGCCGAGAAGGATAAT
GAGTTGATCCGTTTGAAGCGAGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCTGAG
GCAAAGCTTCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAAACCAAG
AAAATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTCAAGGTGAAC
AAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGTTGAACCTTACGTGACTTACGGATACCCAAAC
TTGAAGAGTGTCAAGGAGCTGATCTACAAGAGGGGGTTACGGAAAGCTGAACCATCAGAG
GATAGCACTTACAGACAACTCAATAGTGGCTGAAGGTCTAGGCAAGCACGAGATCATCTG
TGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAGGCCAACAA
CTTCCTTTGGCCATTCCAGTTGAAAGTGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCA
CTACGTTGAAAGTGGTGATGCCCGGAAACAGGAGAATTTCATCAACGAGCTTGTC


BQ
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AF RR4CM94TF U 251
AF RR4BH35TF U 1
BS 1 410 RR4BH35TF
BS 411 411 RR4CM94TF
BS 412 430 RR4BH35TF
BS 431 431 RR4CM94TF
BS 432 452 RR4BH35TF
BS 453 453 RR4CM94TF
BS 454 515 RR4BH35TF
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BS 520 520 RR4CM94TF
BS 521 775 RR4BH35TF

RD RR4CM94TF 287 0 0
GTTTGAAGCGAGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTGCGTTGATCCTGAGGCAAAGCTTC
TCTTTATCATTCGTATCCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAAACCAAGAAAATTCTGC
AGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTCAAGGTGAACAAGGCAACAA
TCAACATGTTGCGTCGTGTTGAACCTTACGTGACTTACGGATACCCAAACTTGAAGAGTG
TCAAGGAGCTGATCTACAAGAGGGGGTTACGGAAAGCTGAACCA
CCA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4BH35TF 775 0 0
GGGCGCCGCGCAACCTCTCCCTCTATCTCTCTATCAGCTCTCCTCTTCCTCTCAAAGAGA
CATGTCTGATTCAAAGATGGTGGTTCCAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAAGAGGGAAGA
GGAATGGGCACTGGCCAAGAAACAAGAAGCTGAAGCTCTAAGAAGAAGAGCGTTGTGACC
CGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTGAGCAGTACGCCAAAGAATACGCCGAGAAGGATAAT
GAGTTGATCCGTTTGAAGCGAGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCTGAG
GCAAAGCTTCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAAACCAAG
AAAATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAAC
AAGGCAACAA*CAACATGTTGCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGATACCCAAAC
TTGAAGAGTGTCAAGGAGCTGATCTACAAGAGGGG*TTATGGAAAGCTGAACCATCAGAG
GATAGCACTTACAGACAACTCAATAGTGGCTGAAGGTCTAGGCAAGCACGAGATCATCTG
TGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAGGCCAACAA
CTTCCTTTGGCCATTCCAGTTGAAAGTGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCA
CTACGTTGAAAGTGGTGATGCCCGGAAACAGGAGAATTTCATCAACGAGCTTGTC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 3

CO CL3702Contig1 587 3 2 U
GGATTCAACAAATTACAAAGATCTCATTATCTAATTCCGATCATCAATCTCAAAGCTTTT
CGGCTCGTTTCATCTAATTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCAAGGCTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCTTGGGGAAAATGGAAGGGGTTGAGTC
TTTTGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGACAGTGAAAGGTAATGTTGAACCTGAAGC
AGTTTTTCAAACGGTTTCAAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCTGTGGAGGCTGA
GGCTGCGACTGAGAGTAAAACCGAGACTGAGACTAAGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAC
GGCTGATGTTGAGCCAAAACTCGCTGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAATACA
AAAGATGACAGTGAGGCTTCTTATCCGTATTTCCAGTACTTCTATTATCTTTGGCTTGTT
TGTTGTTGTAAGAACTAAGAGCCTTATGGTTTCTCTATGTACCTAATACTTTTCTACTAT
TGAAAACAAGATGTTGGAGACCCATGTTGTTCCAACTTCTTTTATTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BB57TF U 1
AF RR4BC61TF U 1
AF RR4GS74TF U 37
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BS 580 587 RR4BC61TF

RD RR4BB57TF 579 0 0
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DS 

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CGGCTCGTTTCATCTAATTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCAAGGCTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCTTGGGGAAAATGGAAGGGGTTGAGTC
TTTTGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGACAGTGAAAGGTAATGTTGAACCTGAAGC
AGTTTTTCAAACGGTTTCAAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCTGTGGAGGCTGA
GGCTGCGACTGAGAGTAAAACCGAGACTGAGACTAAGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAC
GGCTGATGTTGAGCCAAAACTCGCTGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAATACA
AAAGATGACAGTGAGGCTTCTTATCCGTATTTCCAGTACTTCTATTATCTTTGGCTTGTT
TGTTGTTGTAAGAACTAAGAGCCTTATGGTTTCTCTATGTACCTAATACTTTTCTACTAT
TGAAAACAAGATGTTGGAGACCCATGTTGTTCCAACTTCTTTTATTA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4GS74TF 548 0 0
TCCGAA
ATCAATCTCAAAGCTTTTCGGCTAGTTTCATCTAATTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGG
CCTCAAAGTTGGTATGTCATGCCAAGGCTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCTTGGGGAA
AATGGAAGGGGTTTATTCTTTTGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGACAGTGAAAGG
TAATGTTGAACCTGAAGCAGTTTTTCAAACGGTTTCAAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTA
CTGGCCTGTGGAGGCTGAGGCTGCGACTGAGAGTAAAACCGAGACTGAGACTAAGACTGA
GGCTAAGGTTGATGCAACGGCTGATGTTGAGCCAAAACTCGCTGAAGCTGAGACTAAGCC
ATCACAAGTTTAAATACAAAAGATGACAGTGAGGCTTCTTATCCGTATTTCCAGTACTTC
TATTATCTTTGTCTTGTTTGTTGTTGTAAGAACTAAGAGCTTTATGGTTTCTCTATGTAC
CTAATACTTTTCTACTATTGAAAACAAGATGTTGGAGACCCATGTTGTTCCAACTTC
TTTTA

QA 7 543 7 543
DS 



AS 1 3

CO CL3703Contig1 913 3 5 U
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TTATCGACTCAAAGGACGTTTGCATCCTTGTATTTCTCCTTCTGAGTCCGGACTAGTCAA
CGGCAAGGTACTAACTGGCTTAACAGAAGCTCAGTTAAAGAATTTAGATATGATACAAGG
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AGTGGAAGCTCTAATATGGGCCAACAAGGATGATCCAGACATGTATGGAGAATGGAATTT
CGAGGAGTGGAAACGGCTTCACATGGATAAATTCATAGAGGCGTCAAAGAAATTCATCGA
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CAAAATAGAAAGGTCTCTCACTTCAACTTCAAGTGCAATATAAGATTATAAGTTCTAGTA
CATGATCATTGAGTTGTGGATCAGTTCGTAACACAAGGTAATCAATGTTGTCGTATCTAC
TTCATGAACATTGAGTTGCATTGCTTGTTATTGTTTTTATCGTTTCTAATCATTATGTCA
TCAATCGACCTGGTCTGGTAAATACGCTTAAACGTATCTAAAATTGTACTTGTTGATAGA
AAAAAAAAGGTGTTCAAGAAAAAAAAAATTGTACTGGAAAGGAGAAAGAAAATCTAGTTT
TAAATGGAATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F572TF U 1
AF RR4GB83TF U 27
AF RR4GB83JQ C 233
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RD RR4F572TF 609 0 0
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GAGTTTGATTCTAGAGTGCACTCCGGTCATCGTCTCCGCCCAACTCCATGGCTTTCATCT
TTATCGACTCAAAGGACGTTTGCATCCTTGTATTTCTCCTTCTGAGTCCGGACTAGTCAA
CGGCAAGGTACTAACTGGCTTAACAGAAGCTCAGTTAAAGAATTTAGATATGATACAAGG
AGCTGAATACGTGAGGAAGACTGTTGAGGTTGTTTTAACTGAGACATCCGAGAAAATGCA
AGTGGAAGCTCTAATATGGGCCAACAAGGATGATCCAGACATGTATGGAGAATGGAATTT
CGAGGAGTGGAAACGGCTTCACATGGATAAATTCATAGAGGCGTCAAAGAAATTCATCGA
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TCGTCCTCCTGTGGTGTGAAGAATATGTCTGCCTTTTCTTGATATCTTAATCGTTTACCA
CAAAATAGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4GB83TF 722 0 0
GG
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AGGGAAGAGTTTGAGAAATTTGTACACGAGGATCGTCCTCCTGTGGTGTGAAGAATATGT
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TCAAGTGCAATATAAGATTATAAGTTCTAGTACATGATCATTGAGTTGTGGATCAGTTCG
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QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4GB83JQ 681 0 0
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AAAATGCAAGTGGAAGCTCTAATATGGGCCAACAAGGATGATCCAGACATGTATGGAGAA
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TTCATCGAATGGAAGAAGAATCCAGATGGTAAAACAAGGGAAGAGTTTGAGAAATTTGTA
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TTATGTCATCAATCGACCTGGTCTGGTAAATACGCTTAAACGTATCTAAAATTGTACTTG
TTGATAGAAAAAAAAAGGTGTTCAAGAAAAAAAAAATTGTACTGGAAAGGAGAAAGAAAA
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QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL3704Contig1 737 3 3 U
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CTCTGTTTTCCCATCGACTTCCGCCGCAACCAGATGCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCT
CTCGACGGTCCGTGGTTTGTTCCCGGCGGCAAAGAGTCTAAGTTTCAATGGTTTTGCCTC
TGTCCCTCGTCTCAACTGCACTCTCAATAACGAGGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGA
AGCTGTTCTCAAGGCCATTTCAGAAGTATCCAAGACTGATGGGAGAGTTGGCAAAACTAC
TAACATGATTATCGGAGGCACTGTGGCTGACGATTCTGCTCCAGATTGGCTCGAACTTGA
CCAAAAGGTCAATACTTACCCAACAGATAGAGGGTTTACTGCAATCGGGACCGGTGGCGA
TGACTTTGTCCATGCTATGGTTGTCGCTGTTGAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCT
GGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCC
TATTCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTACAAGCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGA
AAGGATGAAATATTTCTTGTAGGTTTTAAGGTGTGGTAGAATCACAGGGTCTGCCCCTCT
TCTCTCTTTTCCACTGCGACTATGTAAATTATGCTGTGTAAGCCATCATTTATATTTTAT
TATTTTGCTTATCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D649JQ C 404
AF RR4AF70TF U 338
AF RR4D649TF U 1
BS 1 341 RR4D649TF
BS 342 342 RR4AF70TF
BS 343 737 RR4D649TF

RD RR4D649JQ 123 0 0
ATCGGGACCGGGGGGGATGACTTTGTCCATGCTATGGTTGTCGCTGTTGAGTCTGTTATT
GAACGTCAAATCCCTTTGGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTG
TCG

QA 1 123 1 123
DS 

RD RR4AF70TF 155 0 0
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ACTGCAATCGGGACCGGTGGCGATGACTTTGTCCATGCTATGGTTGTTGCTGTTGAGTCT
GTTATTGAACGTCAAATCCCTCTGGATTGTGTAAA

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR4D649TF 737 0 0
GGGGTTTCAAGGCTTTGAATTAAAAAAAAAAAAAGGAATGGCTTGCAAAACGATCCTGCG
CTCTGTTTTCCCATCGACTTCCGCCGCAACCAGATGCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCT
CTCGACGGTCCGTGGTTTGTTCCCGGCGGCAAAGAGTCTAAGTTTCAATGGTTTTGCCTC
TGTCCCTCGTCTCAACTGCACTCTCAATAACGAGGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGA
AGCTGTTCTCAAGGCCATTTCAGAAGTATCCAAGACTGATGGGAGAGTTGGCAAAACTAC
TAACATGATTATCGGAGGCACTGTGGCTGACGATTCTGCTCGAGATTGGCTCGAACTTGA
CCAAAAGGTCAATACTTACCCAACAGATAGAGGGTTTACTGCAATCGGGACCGGTGGCGA
TGACTTTGTCCATGCTATGGTTGTCGCTGTTGAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCT
GGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCC
TATTCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTACAAGCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGA
AAGGATGAAATATTTCTTGTAGGTTTTAAGGTGTGGTAGAATCACAGGGTCTGCCCCTCT
TCTCTCTTTTCCACTGCGACTATGTAAATTATGCTGTGTAAGCCATCATTTATATTTTAT
TATTTTGCTTATCTACT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

CO CL3705Contig1 851 3 4 U
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TTTTTAGTCGTTGTCGTCGCTTCAAATCTCTCTTTTATCTTTTCATAAAGATTTGCATCT
TCAAGTAACTTCTTTTGCAGAAATGAAGTCCGTTGGAAACTGCTCAGGTACTCATGTATA
TGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCATTTGCTCAAGAATT
ATCATCTCAGGTTAAGGTTACTTCTTATACATTGACCAATAGGTGCCTACATCTCAGCGT
TTTTGTGTGTAATGTTATTGGTTTAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGTTCA
AAGAAAAGGAAGAGTGCGAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTATGTT
GTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACCCATCGCAAGAATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGA
GCGGAGATTCCTCAGAATCTGACGCAAGTCCTCAAGGTTATAATGGCAATAGAACTTATA
TGTATCGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCTCAAG
AATCATCATCTCACGTAACGGTGGAGAACTCACAAGATAACGATTTCAAACAGATCGATG
ACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAGGATGATATTGGAGAGGTGTGTTGTGTTTGTGGAC
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TGCTTTAGACAAGCCGAAGTGGAGTGGCTAGGGTTATTTGGTAATCTAGCATCATATGTG
TTAATCTCTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP61TF U 1
AF RR4CJ92TF U 1
AF RR4CJ92JQ C 203
BS 1 686 RR4CJ92TF
BS 687 687 RR4CJ92JQ
BS 688 754 RR4CJ92TF
BS 755 851 RR4CJ92JQ

RD RR4FP61TF 417 0 0
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TTTTTAGTCGTTGTCGTCGCTTCAAATCTCTCTTTTATCTTTTCATAAAGATTTGCATCT
TCAAGTAACTTCTTTTGCAGAAATGAAGTCCGTTGGAAACTGCTCAGGTACTCATGTATA
TGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTTGCTCAAGAATT
ATCATCTCAGGTTAAGGTTACTTCTTGTACATTGACCAATAGGTGCCTACATCTCAGCGT
TTTTGTGTGTAATGTTATTGGTTTAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGTTCA
AAGAAAAGGAAGAGTGCGAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTAT

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4CJ92TF 754 0 0
GGACCCCTGAAACGTCCCTCTGCCTTCTGCTTCTCTCTCATATTGTCAGCCCATAAATCT
TTTTTAGTCGTTGTCGTCGCTTCAAATCTCTCTTTTATCTTTTCATAAAGATTTGCATCT
TCAAGTAACTTCTTTTGCAGAAATGAAGTCCGTTGGAAACTGCTCAGGTACTCATGTATA
TGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCATTTGCTCAAGAATT
ATCATCTCAGGTTAAGGTTACTTCTTATACATTGACCAATAGGTGCCTACATCTCAGCGT
TTTTGTGTGTAATGTTATTGGTTTAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGTTCA
AAGAAAAGGAAGAGTGCGAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTATGTT
GTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACCCATCGCAAGAATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGA
GCGGAGATTCCTCAGAATCTGACGCAAGTCCTCAAGGTTATAATGGCAATAGAACTTATA
TGTATCGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCTCAAG
AATCATCATCTCACGTAACGGTGGAGAACTCACAAGATAACGATTTCAAACAGATCGATG
ACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAG*ATGATATTGGAGAGGTGTGTTGTGTTTGTGGAC
TCATCAAGAGACACATCGCAAGAATGATCGAGTT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4CJ92JQ 649 0 0
GCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCATTTGCTCAAGAATTATCATCTCAGGTTAAGGTTACT
TCTTATACATTGACCAATAGGTGCCTACATCTCAGCGTTTTTGTGTGTAATGTTATTGGT
TTAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGTTCAAAGAAAAGGAAGAGTGCGAGCA
CTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTATGTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAG
ACCCATCGCAAGAATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGAGCGGAGATTCCTCAGAATCTGA
CGCAAGTCCTCAAGGTTATAATGGCAATAGAACTTATATGTATCGAGTTAGTGAAGAAGA
AGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCTCAAGAATCATCATCTCAGGTAACGGT
GGAGAACTCACAAGATAACGATTTCAAACAGATCGATGACTGTGTTCACTCCTTCATCTT
CAAGGATGATATTGGAGAGGTGTGTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACACATCGCAAG
AATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGGACGACATGTTATTGCTTTAGACAAGCCGAAGTGG
AGTGGCTAGGGTTATTTGGTAATCTAGCATCATATGTGTTAATCTCTAG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 3

CO CL3706Contig1 636 3 2 U
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ACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGTCTGCTACTCAACCGCGTCCCTTCCACAG
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TACTGACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAGAAAGATG
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TCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAATCATCTCAGACAT
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TATATTATTTTTATTGGAAGGATTAGTATTCTTCTTCATGAATACAATACATAGTGTGTT
AAGGAATAAGAGTCTGCTTTTATTGTGGTGTATGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C015TF U 173
AF RR4DZ24TF U 1
AF RR4DZ24JQ C 1
BS 1 540 RR4DZ24TF
BS 541 636 RR4DZ24JQ

RD RR4C015TF 285 0 0
G
CCCGCGATTCTACCTGCTGAAGCCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTGTTTGGGATCACA
GATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGGCAACGTC
CATGTTTTACTGACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAG
AAAGATGATCCTGATCTCTACGGTACATGGGATTTCGAGGAATGGAAGCAAGTTCACATG
GAAGGTTTCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAA

QA 2 285 2 285
DS 

RD RR4DZ24TF 540 0 0
GGGGATCAAAGTCAGCGATGAGTGGTGGTGGTACAGTGGCACTGCACAGCGTGTTCGTCT
ACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGTCTGCTACTCAACCGCGTCCCTTCCACAG
CCTCCGCGACCCTCCCTGATTTCCATAGATTTAGCATCAAAGGACGTGTTTACCCCGCGA
TTCTACCTGCTGAAGCCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTGTTTGGGATCACAGATGATG
AACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGGCAACGTCCATGTTT
TACTGACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAGAAAGATG
ATCCTGATCTCTACGGTACATGGGATTTCGAGGAATGGAAGCAAGTTCACATGGAAGGTT
TCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAATCATCTCAGACAT
GATTTGAATCAGTAGGATGAGATTCGGATCTTGAAATGGAAAACGCTGGAATTGGGTTGA

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4DZ24JQ 636 0 0
GGGGATCAAAGTCAGCGATGAGTGGTGGTGGTACAGTGGCACTGCACAGCGTGTTCGTCT
ACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGTCTGCTACTCAACCGCGTCCCTTCCACAG
CCTCCGCGACCCTCCCTGATTTCCATAGATTTAGCATCAAAGGACGTGTTTACCCCGCGA
TTCTACCTGCTGAAGCCGATAAAGTTTCTGGCAAGGTACTGTTTGGGATCACAGATGATG
AACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGGCAACGTCCATGTTT
TACTGACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAGAAAGATG
ATCCTGATCTTTACGGTACATGGGATTTCGAGGAATGGAAGCAAGTTCACATGGAAGGTT
TCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAATCATTTCAGACAT
GATTTGAATCAGTAGGATGAGATTCGGATCTTGAAATGGAAAACGCTGGAATTGGGTTGA
TATATTATTTTTATTGGAAGGATTAGTATTCTTCTTCATGAATACAATACATAGTGTGTT
AAGGAATAAGAGTCTGCTTTTATTGTGGTGTATGGC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL3707Contig1 853 2 12 U
GGAAGAGGATCGGGTGGGCAAAAGACTAACGCGAAACCTCTGAGTTTCTTCGTCTTCTCG
ACTCGTGAGATTGTGATCACAGTAGGGCAAAAGACTTTTAACTTTAAAGATTCTACGAGG
TGGTTGATCGATTTAGTCATCTGGGTAGTGGTTTTGAGGATGGATCAAGCTTCGTCTTCA
TCGAATGTTAAGGATCATGTGACCGTCGATGATAACGAGGAGAGAGAAGCTATAGAGATT
CCTCTCTTCCAAGTGCCTGAATGCTATGTTTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCAGCT
TCCTACAGAGCGGATGAATGGGACGTGAACAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGTG
GTGAGCAAAGGAGAAGAATGCATTATCAAACTTGTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTAC
GCTCAGGCCTTTCTCCGAGATGGTGAGCTTCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGC
AGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCGCGTCATGCTTTTATT
GGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCACTACATGACCAC
ATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACTTTCAGCACACA
TCATCTGTTGATTACAGCTTAAAGGAAGGAGAAACCATTGTTCTCCAACTCAAAACATGA
GCGAAAAGACACAAAGACTAAGTTGGTAGAGAGAGTCTGACCAATCTGTCCTTGGAGGAT
AAGGCAAGTCTATAGAAACCACCATTCCTTCACTCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGAC
CGCTTTCTCCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM95TF U 1
AF RR4H638TF U 59
BS 1 114 RR4BM95TF
BS 115 115 RR4H638TF
BS 116 524 RR4BM95TF
BS 525 525 RR4H638TF
BS 526 545 RR4BM95TF
BS 546 546 RR4H638TF
BS 547 632 RR4BM95TF
BS 633 633 RR4H638TF
BS 634 659 RR4BM95TF
BS 660 660 RR4H638TF
BS 661 681 RR4BM95TF
BS 682 853 RR4H638TF

RD RR4BM95TF 681 0 0
GGAAGAGGATCGGGTGGGCAAAAGACTAACGCGAAACCTCTGAGTTTCTTCGTCTTCTCG
ACTCGTGAGATTGTGATCACAGTAGGGCAAAAGACTTTTAACTTTAAAGATTCTGCGAGG
TGGTTGATCGATTTAGTCATCTGGGTAGTGGTTTTGAGGATGGATCAAGCTTCGTCTTCA
TCGAATGTTAAGGATCATGTGACCGTCGATGATAACGAGGAGAGAGAAGCTATAGAGATT
CCTCTCTTCCAAGTGCCTGAATGCTATGTTTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCAGCT
TCCTACAGAGCGGATGAATGGGACGTGAACAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGTG
GTGAGCAAAGGAGAAGAATGCATTATCAAACTTGTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTAC
GCTCAGGCCTTTCTCCGAGATGGTGAGCTTCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGC
AGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCTCGTCATGCTTTTATT
GGACTTGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCACTACATGACCAC
ATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGA*GAGATGGAACAACACTTTCAGCACACT
TCATCTGTTGATTACAGCTTA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4H638TF 795 0 0
G
GACTCGTGAGATTGTGATCACAGTAGGGTAAAAGACTTT*AACTTTAAAGATTCTACGAG
TTGGTTGATCGATTTAGTCATCTGGGTAGTGGTTTTGAGGATGGATCAAGCTTCGTCTTC
ATCGAATGTTAAGGATCATGTGACCGTCGATGATAACGAGGAGAGAGAAGCTATAGATAT
TCCTCTCTTCCAAGTGCCTGAATGCTATGTTTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCAGC
TTCCTACAGAGCGGATGAATGGGACGTGAACAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGT
GGTGAGCAAAGGAGAAGAATGCATTATCAAACTTGTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTA
CGCTCAGGCCTTTCTCCGAGATGGTGAGCTTCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAG
CAGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCGCGTCATGCTTTTAT
TGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCATTACATGACCA
CATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACTTTCAGCACAC
ATCATCTGTTGATTACAGCTTAAAGGAAGGAGAAACCATTGTTCTCCAACTCAAAACATG
AGCGAAAAGACACAAAGACTAAGTTGGTAGAGAGAGTCTGACCAATCTGTCCTTGGAGGA
TAAGGCAAGTCTATAGAAACCACCATTCCTTCACTCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGA
CCGCTTTCTCCTTG

QA 2 795 2 795
DS 



AS 1 3

CO CL3708Contig1 830 3 1 U
GATTAATTTGTTTATCACTAGAAAACATACAAAATCGAAACATCCACGAAATAAAATAAA
AAGGTCACTAATCAAACCATATACTTATGCTTTCAATCCTTGGGTCAATGCCAACAAACC
GAAACAAGAATCAGATAATCTAACTTTCTCAATTGTGATCGCATTGCTATACAAGAAGTT
AGTTCCCGATATGCCCCCACATTCCAAAACGTTCTTGGGTTGGTGATGGGGCACTTATTG
ATGATTATGCTCCTCTTTGCTGTTGCTATGCTTTACTCGGTCAAAAAAACTACACACAAG
TCCTTTGATTCAGGGCCAATCTGGTGAGACGTGTAGACACTCTCATTCAGCTGTGAAGTA
GCTGTCGTAAATGGAGAGTTTATCAAACGCCTCGAAGTTTGCTTTCAACCCAACAAACTG
GCTCCCGGTCTGAGCACAACAA*CCCGCATCAGGCCATCGACAA*GTTCCTTCTCTTGCA
CGCAAC**GGACACAACAA*TGCTTCACAAA*CTTTTTCTTCACTCGCTGATGAGATAGA
TTCTGAGACATCTTTTTGTTTTTGGGGAATCGAGTGAGAACATTTCTGTGGCCCGTCTTC
TACTTCGAGTGTACATTCTCCGTTCTTTGTGAAGTTCACCTTGCAGCCTAGTGATTGCAG
GGCTCTCGATATGACCCCTCGCTCTTTGATAGCTCTCTTTGCTGATTCTCTAGCTGCACG
GCTTATATTTCTTTCTTTGCGCAACTCTTCGCTCAGCGACTCCACGGTAGAGGATAAAGC
ATCTATCTTCCTCTCTGCTTCTTCTTTCCCCTTTTTCATCTCTAAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A033TFB C 103
AF RR4A033JQ U 190
AF RR4A033JQD U 1
BS 1 830 RR4A033JQD

RD RR4A033TFB 436 0 0
GGTCAATGCCAACAAACCGAAACAAGAATCAGATAATCTAACTTTCTCAATTGTGATCGC
ATTGCTATACAAGAAGTTAGTTCCCGATATGCCCCCACATTCCAAAACGTTCTTGGGTTG
GTGATGGGGCACTTATTGATGATTATGCTCCTCTTTGCTGTTGCTATGCTTTACTCGGTC
AAAAAAACTACACACAAGTCCTTTGATTCAGGGCCAATCTGGTGAGACGTGTAGACACTC
TCATTCAGCTGTGAAGTAGCTGTCGTAAATGGAGAGTTTATCAAACGCCTCGAAGTTTGC
TTTCAACCCAACAAACTGGCTCCCGGTCTGAGCACAACAAACCCGCATCAGGCCATCGAC
AAAGTTCCTTCTCTTGCACGCAAACGGGACACAACAAATGCTTCACAAAACTTTTTCTTC
ACTCGCTGATGAGATA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4A033JQ 459 0 0
TATGCCCCCACATTCCAAAACGTTCTTGGGTTGGTGATGGGGCACTTATTGATGATTATG
CTCCTCTTTGCTGTTGCTATGCTTTACTCGGTCAAAAAAACTACACACAAGTCCTTTGAT
TCAGGGCCAATCTGGTGAGACGTGTAGACACTCTCATTCAGCTGTGAAGTAGCTGTCGTA
AATGGAGAGTTTATCAAACGCCTCGAAGTTTGCTTTCAACCCAACAAACTGGCTCCCGGT
CTGAGCACAACAA*CCCGCATCAGGCCATCGACAA*GTTCCTTCTCTTGCACGCAAC**G
GACACAACAA*TGCTTCACAAA*CTTTTTCTTCACTCGCTGATGAGATAGATTCTGAGAC
ATCTTTTTGTTTTTGGGGAATCGAGTGAGAACATTTCTGTGGCCCGTCTTCTACTTCGAG
TGTACATTCTCCGTTCTTTGTGAAGTTCACCTTGCAGCC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR4A033JQD 830 0 0
GATTAATTTGTTTATCACTAGAAAACATACAAAATCGAAACATCCACGAAATAAAATAAA
AAGGTCACTAATCAAACCATATACTTATGCTTTCAATCCTTGGGTCAATGCCAACAAACC
GAAACAAGAATCAGATAATCTAACTTTCTCAATTGTGATCGCATTGCTATACAAGAAGTT
AGTTCCCGATATGCCCCCACATTCCAAAACGTTCTTGGGTTGGTGATGGGGCACTTATTG
ATGATTATGCTCCTCTTTGCTGTTGCTATGCTTTACTCGGTCAAAAAAACTACACACAAG
TCCTTTGATTCAGGGCCAATCTGGTGAGACGTGTAGACACTCTCATTCAGCTGTGAAGTA
GCTGTCGTAAATGGAGAGTTTATCAAACGCCTCGAAGTTTGCTTTCAACCCAACAAACTG
GCTCCCGGTCTGAGCACAACAA*CCCGCATCAGGCCATCGACAA*GTTCCTTCTCTTGCA
CGCAAC**GGACACAACAA*TGCTTCACAAA*CTTTTTCTTCACTCGCTGATGAGATAGA
TTCTGAGACATCTTTTTGTTTTTGGGGAATCGAGTGAGAACATTTCTGTGGCCCGTCTTC
TACTTCGAGTGTACATTCTCCGTTCTTTGTGAAGTTCACCTTGCAGCCTAGTGATTGCAG
GGCTCTCGATATGACCCCTCGCTCTTTGATAGCTCTCTTTGCTGATTCTCTAGCTGCACG
GCTTATATTTCTTTCTTTGCGCAACTCTTCGCTCAGCGACTCCACGGTAGAGGATAAAGC
ATCTATCTTCCTCTCTGCTTCTTCTTTCCCCTTTTTCATCTCTAAATGCT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL3709Contig1 747 2 14 U
GGGACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTTAATACGATTC
TGATTCTATTTTTTTCACCAGCCATTCTCCAATTTTCTCAGCCATGGGACACGGAACAAT
GGCGACACCACCGACCACCACCACCATCCCCGCCAAGACGACGCTCACCTTCACGTACGG
AACCCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGGCGA
CGCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACCGTA
CAGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCAGGCCATCGTGTCACGGGAGAGCTTTA
CGCGGTCTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTCGAAGGGATCACTCGAGGCCA
TTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTAGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTAGAGTC
GTGCGTGGTGGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAGAGGAG
TAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCGTAA
GGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTTCTCCATG
TGATTGATTTTTTTAATTTTCCTTGTGTGTGTCTCTCTCTATCTCTCACCGCCTTTTTTA
AACCTTTTCTCGGGAAATGAAATAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS72TF U 1
AF RR4BO49JQ C 82
BS 1 99 RR4BS72TF
BS 100 100 RR4BO49JQ
BS 101 167 RR4BS72TF
BS 168 168 RR4BO49JQ
BS 169 183 RR4BS72TF
BS 184 184 RR4BO49JQ
BS 185 241 RR4BS72TF
BS 242 242 RR4BO49JQ
BS 243 346 RR4BS72TF
BS 347 347 RR4BO49JQ
BS 348 373 RR4BS72TF
BS 374 374 RR4BO49JQ
BS 375 638 RR4BS72TF
BS 639 747 RR4BO49JQ

RD RR4BS72TF 638 0 0
GGGACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTTAATACGATTC
TGATTCTATTTTTTTCACCAGCCATTCTCCAATTTTCTCTGCCATGGGACACGGAACAAT
GGCGACACCACCGACCACCACCACCATCCCCGCCAAGACGACGCTCATCTTCACGTACGG
AACTCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGGCGA
CTCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACCGTA
CAGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCAGGCCATCGTGTCCCGGGAGAGCTTTA
CGCGGTCTCTCCT*GCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTCGAAGGGATCACTCGAGGCCA
TTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTAGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTAGAGTC
GTGCGTGGTGGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAGAGGAG
TAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCGTAA
GGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4BO49JQ 666 0 0
CCATTCTCCAATTTTCTCAGCCATGGGACACGGAACAATGGCGACACCACCGACCACCAC
CACCATCCCCGCCAAGACGACGCTCACCTTCACGTACGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTC
GAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGGCGACGCATCTTTCAAAGGAGTCTA
CCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACCGTACAGAGTCCCTTTCCTCCTCAA
CAAGCCTGGATCAGGCCATCGTGTCACGGGAGAGCTTTACGCGGTCTCTCCTCGCGGTCT
CTCGCGTCTCGACGAGCTCGAAGGGATCACTCGAGGCCATTACGTGAGGCAGCCAATCCG
CCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTAGAGTCGTGCGTGGTGGAGGCGTATTA
TGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAGAGGAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGC
GTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTAC
CTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTTCTCCATGTGATTGATTTTTTTAATTTTC
CTTGTGTGTGTCTCTCTCTATCTCTCACCGCCTTTTTTAAACCTTTTCTCGGGAAATGAA
ATAAGG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL3710Contig1 452 2 3 U
GGAAAGGTGAATCGAGAAAAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGATGGGAGGAGGAATGG
AGACGAACAAGAACAAGTTCATCGAGGATTGGGGATCCGCTAGGGAGAATCTCGAGCACA
ACTTCCGATGGACACGTCGCAACTTCGCTCTCATCGGAATCTTCGGCATCGCCCTCCCCA
TCATCGTCTACAAGGGCATCGTCAAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCAGGCAGGC
CACACAGGAAGTTCCTATGAGCTTGTTTGCGACAACACTCTCTTCTGCAAAATGTCTCAG
CTGTGTGAAGTTTTCAAGAAGCTGATGCTATCACTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTACATTT
TTATTCAGAATAAAAGAACATCTGAATGATTATAATTGCTGTATTTGACAAGTTTGTTTT
GATTGGCAAATAAAAAAACTTAGGTTCGCCCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4H614JQB C 1
AF RR4H614TF U 1
BS 1 1 RR4H614JQB
BS 2 451 RR4H614TF
BS 452 452 RR4H614JQB

RD RR4H614JQB 452 0 0
GGAAAGGTGAATCGAGAAAAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGATGGGAGGAGGAATGG
AGACGAACAAGAACAAGTTCATCGAGGATTGGGGATCCGCTAGGGAGAATCTCGAGCACA
ACTTCCGATGGACACGTCGCAACTTCGCTTTCATCGGAATTTTCGGCATCGCCCTCCCCA
TCATTGTTTACAAGGGCATCGTCAAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCAGGCAGGC
CACACAGGAAGTTCCTATGAGCTTGTTTGCGACAACACTTTTTTTTGCAAAATGTTTCAG
CTGTGTGAAGTTTTCAAGAAGCTGATGCTATCACTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTACATTT
TTATTCAGAATAAAAGAACATTTGAATGATTATAATTGCTGTATTTGACAAGTTTGTTTT
GATTGGCAAATAAAAAAACTTAGGTTCGCCCG

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4H614TF 452 0 0
G
GAAAGGTGAATCGAGAAAAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGATGGGAGGAGGAATGGA
GACGAACAAGAACAAGTTCATCGAGGATTGGGGATCCGCTAGGGAGAATCTCGAGCACAA
CTTCCGATGGACACGTCGCAACTTCGCTCTCATCGGAATCTTCGGCATCGCCCTCCCCAT
CATCGTCTACAAGGGCATCGTCAAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCAGGCAGGCC
ACACAGGAAGTTCCTATGAGCTTGTTTGCGACAACACTCTCTTCTGCAAAATGTCTCAGC
TGTGTGAAGTTTTCAAGAAGCTGATGCTATCACTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTACATTTT
TATTCAGAATAAAAGAACATCTGAATGATTATAATTGCTGTATTTGACAAGTTTGTTTTG
ATTGGCAAATAAAAAAACTTAGGTTCGCCC
G

QA 2 451 2 451
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3712Contig1 809 3 3 U
GAGGTTTCGATGTGAATATAGCTAAGTGAAACAAAAGAAGAAAAATAAGAAGAATAAAGA
AACATGTTTGATGGTGGAGTACCGGAACAGATCCAGCAGTTCATAGCATCTCCACAGCCA
CCTCCTCCGCCGCATCAACCGGCGACTGAAAGTTCACTTTCTTTTCCTGTCTCATTCGCT
TCTTTTAACTCCAACCATCAAGCCCAGCATATGTTGAGCCTCGATAGCCTTAAGATAATT
CACCATCATCACCATGACATCAAAGATGGGGGTGTTACTTCTGAGTGGATAGGTCATACG
GATCATGATGGCGAAGATCATCGTCACTTTCATCATCATCCATGGTGTAGTGATGAAGTT
CTTGCTCTTCTTAGGTTCAGATCTACGGTGGAGAATTGGTTCCCTGAATTCACTTGGGAG
CTCACCTCAAGAAAGTTGGCAGAAGTTGGGTTTAAGAGGAGTCCACAAGAGTGCAAAGAG
AAATTTGAAGAAGAAGAGAGAAGATATTTTAATAGTAACAGCGCTAATGACCATCACATC
AGCAATTACAACAACAAAGGAAGTTATAGGATGTTTAGTGAGGTTGAAGAGTTTTATCAT
CATGGTCATAATGATGATGAGCATGTCCCATCAGAAGTTGGGGATAACCAAAACAAGAGT
AACAATTCACTAGAGGGAAAAGAAACGTTGAGGAACGGGACAGACTTATTGGATGACAAA
GAGATCATCAGGTCAAGTAGAGATCATCATGGGGAAAAAGTAACACGTTGATAATGTTGG
AACATGAAGATGATGGAAGTCGTCATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4F545JQ C 49
AF RR4F545TF U 49
AF RR4D934TF U 1
BS 1 229 RR4D934TF
BS 230 230 RR4F545TF
BS 231 809 RR4D934TF

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GG
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C

QA 3 483 3 483
DS 

RD RR4F545TF 483 0 0
GG
AGAATAAAGAAACATGTTTGATGGTGGAGTACCGGAACAGATCCAGCAGTTCATAGCATC
TCCACAGCCACCTCCTCCGCCGCATCAACCGGCGACTGAAAGTTCACTTTCTTTTCCTGT
CTCATTCGCTTCTTTTAACTCCAACCATCAAGCCCAGCATATGTTGAGCCTCGATAGCCT
TAAGATAATTCACCATCATCACCATGACATCAAAGATGGGGGTGTTACTTCTGAGTGGAT
AGGTCATACGGATCATGATGGCGAAGATCATCGTCACTTTCATCATCATCCATGGTGTAG
TGATGAAGTTCTTGCTCTTCTTAGGTTCAGATCTACGGTGGAGAATTGGTTCCCTGAATT
CACTTGGGAGCTCACCTCAAGAAAGTTGGCAGAAGTTGGGTTTAAGAGGAGTCCACAAGA
GTGCAAAGAGAAATTTGAAGAAGAAGAGAGAAGATATTTTAATAGTAACAGCGCTAATGA
C

QA 3 483 3 483
DS 

RD RR4D934TF 809 0 0
GAGGTTTCGATGTGAATATAGCTAAGTGAAACAAAAGAAGAAAAATAAGAAGAATAAAGA
AACATGTTTGATGGTGGAGTACCGGAACAGATCCAGCAGTTCATAGCATCTCCACAGCCA
CCTCCTCCGCCGCATCAACCGGCGACTGAAAGTTCACTTTCTTTTCCTGTCTCATTCGCT
TCTTTTAACTCCAACCATCAAGCCCAGCATATGTTGAGCCTCGATAGCCGTAAGATAATT
CACCATCATCACCATGACATCAAAGATGGGGGTGTTACTTCTGAGTGGATAGGTCATACG
GATCATGATGGCGAAGATCATCGTCACTTTCATCATCATCCATGGTGTAGTGATGAAGTT
CTTGCTCTTCTTAGGTTCAGATCTACGGTGGAGAATTGGTTCCCTGAATTCACTTGGGAG
CTCACCTCAAGAAAGTTGGCAGAAGTTGGGTTTAAGAGGAGTCCACAAGAGTGCAAAGAG
AAATTTGAAGAAGAAGAGAGAAGATATTTTAATAGTAACAGCGCTAATGACCATCACATC
AGCAATTACAACAACAAAGGAAGTTATAGGATGTTTAGTGAGGTTGAAGAGTTTTATCAT
CATGGTCATAATGATGATGAGCATGTCCCATCAGAAGTTGGGGATAACCAAAACAAGAGT
AACAATTCACTAGAGGGAAAAGAAACGTTGAGGAACGGGACAGACTTATTGGATGACAAA
GAGATCATCAGGTCAAGTAGAGATCATCATGGGGAAAAAGTAACACGTTGATAATGTTGG
AACATGAAGATGATGGAAGTCGTCATCAT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 3

CO CL3713Contig1 1036 3 4 U
GGACTGGATGGGAGCCTGTAGATAATAAACATGTCAGTTGTGAAAATACAGCATTGGTAA
CATGCACATCACCTAAGTTTGTCTTGGTAGCCACTCAGCGTTTTTATAACAACATGCACA
TCAACCTTACAAAATCCATTTCCTTCATCTCTTGAATAATCTAATCCAACTAAACAAACA
AGAAACAATAGAAACAACATCAACTCAGTCTCAACAGAAGGCGTGGGCTATATCCACTCC
TTGGGGTTGATACAAGCATCCAACAGCTTCCACTCTTCCGTCCCCTCTTCCGGTTTATGG
TCATATTCCCATCTTGCTGACAGTGGAAGAGAGACAAGAATACTCTCTACTCTCCCTCCT
GTCTTCAGACCAAATGTCGTTCCACGATCATATACCAAGTTGAATTCGACATATCTTCCT
CGCCGCAGCTGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAAACTCCATGTCTTTCCTCTTCTCT
AATATAGGTATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCACATTCAGTGGAGAATGCAAGAAGC
ATTTCCTGATCATAGTCATTAAGATCGTCAAAAAATATCCCTCCAAGTCCTCGTCTCTCA
TCACGGTGCTTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACTTCTTGAATCGTGGATAGAAGGAA
GGGTCAAACTTGTCACACGCTTGTTTTTGAATCGAATGGAAATGCTTGACATCGTCTTCG
AGGATGTAAGCTGGTGTGAAATCAGTTCCACCACCGAACCACCACTGCCTCGGAGCTCCA
GGAACATCCTTGGGAGCATCAGTCTCGAAATAACGATAGTTAAAATGCAGAGTCGGAGCG
AAAGGGTTCTTGGGATGCAAAACCGAGCTAACCCCAGCTGCGAAGAACGGAACCGGACCA
GGCTTCTGATCCGAAGAAGCAGAGCCTTTAGCTGCTCTGTACGCCTCGGGAGGCATCACA
CCGTAAACCACAGAGACGTTCACCCCAGCTTTCTCGAACACGTTCCCGTCCTGCAGAACT
CTGCTGATCCCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A020JQD U 1
AF RR4A020JQ U 106
AF RR4A020TFB C 218
BS 1 221 RR4A020JQD
BS 222 222 RR4A020JQ
BS 223 710 RR4A020JQD
BS 711 1036 RR4A020TFB

RD RR4A020JQD 717 0 0
GGACTGGATGGGAGCCTGTAGATAATAAACATGTCAGTTGTGAAAATACAGCATTGGTAA
CATGCACATCACCTAAGTTTGTCTTGGTAGCCACTCAGCGTTTTTATAACAACATGCACA
TCAACCTTACAAAATCCATTTCCTTCATCTCTTGAATAATCTAATCCAACTAAACAAACA
AGAAACAATAGAAACAACATCAACTCAGTCTCAACAGAAGGGGTGGGCTATATCCACTCC
TTGGGGTTGATACAAGCATCCAACAGCTTCCACTCTTCCGTCCCCTCTTCCGGTTTATGG
TCATATTCCCATCTTGCTGACAGTGGAAGAGAGACAAGAATACTCTCTACTCTCCCTCCT
GTCTTCAGACCAAATGTCGTTCCACGATCATATACCAAGTTGAATTCGACATATCTTCCT
CGCCGCAGCTGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAAACTCCATGTCTTTCCTCTTCTCT
AATATAGGTATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCACATTCAGTGGAGAATGCAAGAAGC
ATTTCCTGATCATAGTCATTAAGATCGTCAAAAAATATCCCTCCAAGTCCTCGTCTCTCA
TCACGGTGCTTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACTTCTTGAATCGTGGATAGAAGGAA
GGGTCAAACTTGTCACACGCTTGTTTTTGAATCGAATGGAAATGCTTGAC
ATCGTCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4A020JQ 605 0 0
ATAACAACATGCACATCAACCTTACAAAATCCATTTCCTTCATCTCTTGAATAATCTAAT
CCAACTAAACAAACAAGAAACAATAGAAACAACATCAACTCAGTCTCAACAGAAGGCGTG
GGCTATATCCACTCCTTGGGGTTGATACAAGCATCCAACAGCTTCCACTCTTCCGTCCCC
TCTTCCGGTTTATGGTCATATTCCCATCTTGCTGACAGTGGAAGAAAGACAAGAATACTC
TCTACTCTCCCTCCTGTCTTCAGACCAAATGTCGTTCCACGATCATATACCAAGTTGAAT
TCGACATATCTTCCTCGCCGCAGCTGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAAACTCCATG
TCTTTCCTCTTCTCTAATATAGGTATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCACATTCAGTG
GAGAATGCAAGAAGCATTTCCTGATCATAGTCATTAAGATCGTCAAAAAATATCCCTCCA
AGTCCTCGTCTCTCATCACGGTGCTTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACTTCTTGAAT
CGTGGATAGAAGGAAGGGTCAAACTTGTCACACGCTTGTTTTTGAATCGAATGGAAATGC
TTGAC

QA 1 605 1 605
DS 

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CCGTCCCCTCTTCCGGTTTATGGTCATATTCCCATCTTGCTGACAGTGGAAGAGAGACAA
GAATACTCTCTACTCTCCCTCCTGTCTTCAGACCAAATGTCGTTCCACGATCATATACCA
AGTTGAATTCGACATATCTTCCTCGCCGCAGCTGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAA
ACTCCATGTCTTTCCTCTTCTCTAATATAGGTATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCAC
ATTCAGTGGAGAATGCAAGAAGCATTTCCTGATCATAGTCATTAAGATCGTCAAAAAATA
TCCCTCCAAGTCCTCGTCTCTCATCACGGTGCTTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACT
TCTTGAATCGTGGATAGAAGGAAGGGTCAAACTTGTCACACGCTTGTTTTTGAATCGAAT
GGAAATGCTTGACATCGTCTTCGAGGATGTAAGCTGGTGTGAAATCAGTTCCACCACCGA
ACCACCACTGCCTCGGAGCTCCAGGAACATCCTTGGGAGCATCAGTCTCGAAATAACGAT
AGTTAAAATGCAGAGTCGGAGCGAAAGGGTTCTTGGGATGCAAAACCGAGCTAACCCCAG
CTGCGAAGAACGGAACCGGACCAGGCTTCTGATCCGAAGAAGCAGAGCCTTTAGCTGCTC
TGTACGCCTCGGGAGGCATCACACCGTAAACCACAGAGACGTTCACCCCAGCTTTCTCGA
ACACGTTCCCGTCCTGCAGAACTCTGCTGATCCCTCCTC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 3

CO CL3714Contig1 1143 3 25 U
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GATTCAATTGACCATGAGTTCCATCTTGTCAAAAGTCCTTCCTGCTGCGGAAGATCCTGT
TCTCAGTGTTATTTTTGCTTGTAGAGATGATCCTTGTCCGGTTAAGCTGAATTTGAGTGT
CGGTGCCTATCGAACCGAGGAGGGAAAACCTCTTGTTCTTGAGGTGGTGAGAAGAGCAGA
GCAACAGTTAGCAAATAACAGGTCTTGTGACAAGGGATATCTCCCAATCGATGGACTTGC
TGATTTTAACAAATTGGGCGCCAAGCTTGTGCACATAACCCCACAGGAATCGACCCAACT
CTGGAACAATGGGAACAGATTCGACAAATCGTGAGATCTAAAGGCTTACTACCTTTTTTT
GATAATGCATATCAGGGTTTTGCTAGTGGTAGCCTTGACTCAGATGCACAATCGGTTCGT
ATGTTTGTTGCTGATGGAGGTGAATGTTTGATAGCTCAAAGTTTTGCTAAAAACATGGGT
CTTTATGGAGAGCGTATTGGTGCTCTTACCATTGTATGCACCTCAGAGGACGTGGCTAGG
AAAGTTCACGGCCAACTATTACTTGTTGTTAGGCCTATGTATCTTACCCCACCAATTCAT
GGAGCATCCATTGTTACCACAATTCTTAAAAACAGTGATATGTACAAGGACTGGACCATC
GAGCTGAAAGGCATGGCTGACCGCATCATTAGCATGCGCCAACAGTTATATGAAGCTATA
CAAGCTAGAGGCACACCTGGTGATTGGAGTCACATTATCAAACAGATTGGGATGTTTTCT
TTTACAGGATTAAATGAGAAGCAAGTTCGCTGGATGGCCAAAGAATATCACATTTACATG
ACTTATGATGGGAGGATAAGCATGGCAGGTCTAAGTTCAAAGACAGTGCCTCAACTTGCT
GATGCTATACATGCTGCAATCACCCGCATTCCATAGTATAGCGATTATGGTCTTTGTCGT
TTCATGAATAATCAGAAAAAAAACCAGATTTCTTTTCTTTGGGCAAAACAGATTTCTTGG
TTAAAATTTCATAAGCGAAAAACAAAGAACGCATACCACTGACTCATTACCAAGCAAGCA
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4G963TF U 1
AF RR4F681TF U 353
AF RR4G963JQ C 460
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BS 1069 1143 RR4G963JQ

RD RR4G963TF 815 0 0
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CGGTGCCTATCGAACCGAGGAGGGAAAACCTCTTGTTCTTGAGGTGGTGAGAAGAGCAGA
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GATAATGCATATCAGGGTTTTGCTAGTGGTAGCCTTGACTCAGATGCACAATCGGTTCGT
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CTTTATGGAGAGCGTATTGGTGCTCTTACCATTGTATGCACCTCAGAGGACGTGGCTAGG
AAAGTTCACGGCCAACTATTACTTGTTGTTAGGCCTATGTATCTTACCCCACCAATTCAT
GGAGCATCCATTGTTACCACAATTCTTAAAA*CAGTGATATGTACAAG*ACTGGACCATC
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CAAGCTAGAG*CACACCTGGTGATTGGAGTCACAT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4F681TF 717 0 0
G
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TTTTTTTGATAATGCATATCAGGGTTTTGCTAGTGGTAGCCTTGACTCAGATGCACAATC
GGTTCGTATGTTTGTTGCTGATGGAGGTGAATGTTTGATAGCTCAAAGTTTTGCCAAAAA
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GGCTAGGAAAGTTCACGGCCAACTATTACTTGTTGTTAGGCCTATGTATCTTACCCCACC
AATTCATGGAGCATCCATTGTTACCACAATTCTTAAAAACAGTGATATGTACAAGGACTG
GACCATCGAGCTGAAAGGCATGGCTGACCGCATCATTAGCATGCGCCAACAGTTATATGA
AGCTATACAAGCTAGAGGCACACCTGGTGATTGGAGTCACATTATTAAACAGATTGGGAT
GTTTTCTTTTACAGGATTAAATGAGAAGCAAGTTCGTTGGATGGCCAAAGAATATCACAT
TTACATGACTTATGATGGGAGGATAAGCATGGCAG*TCTAAGTTCAAAGACAGTGCCTCA
ACTTGCTGATGCTATACATGCTGCAATCACCCGCATTCCATAGTATAGCGATTATGGTCT
TTGTCGTTTCATGAATACTCAGAAAAAAAACCAGATTTCTTT*CTTTGGGCAAAA
A

QA 2 716 2 716
DS 

RD RR4G963JQ 684 0 0
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AGTTTTGCTAAAAACATGGGTCTTTATGGAGAGCGTATTGGTGCTCTTACCATTGTATGC
ACCTCAGAGGACGTGGCTAGGAAAGTTCACGGCCAACTATTACTTGTTGTTAGGCCTATG
TATCTTACCCCACCAATTCATGGAGCATCCATTGTTACCACAATTCTTAAAAACAGTGAT
ATGTACAAGGACTGGACCATCGAGCTGAAAGGCATGGCTGACCGCATCATTAGCATGCGC
CAACAGTTATATGAAGCTATACAAGCTAGAGGCACACCTGGTGATTGGAGTCACATTATC
AAACAGATTGGGATGTTTTCTTTTACAGGATTAAATGAGAAGCAAGTTCGCTGGATGGCC
AAAGAATATCACATTTACATGACTTATGATGGGAGGATAAGCATGGCAGGTCTAAGTTCA
AAGACAGTGCCTCAACTTGCTGATGCTATACATGCTGCAATCACCCGCATTCCATAGTCT
AGCGATTATGGTCTTTGTCGTTTCATGAATAATCTGAGAAAAAAC*AGATTTCTTTTCTT
TGGGCAAAACAGATTTCTTGGTTAAAATTTCATAAGCGAAAAACAAAGAACGCATACCAC
TGACTCATTACCAAGCAAGCAACC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL3715Contig1 830 2 2 U
GGGGGTTTTGAATTTCTGTTGAACAATAAAGAAGCTGACAAAGAGGAGCAAAGATCAAGA
CAAAGATCTTCTTTTGCATCAAGACAAGAACTAAAAGTGTTTATCCTAAAACGATCTTCA
GAATTATTCAGACAAGTCTCTCTCTCTCTCAAGACCGAATCTTTCCGGCAAAGCTTAAAC
CCCTCACCACAGTCAAGTGAAAAAATCAGATGAACTCACATCTCTTCCGCGTAATCTGTA
TCCTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGTGGGACCCTGATGATGTTCTACACGGAGAAAG
CATCCATCTTTGGCCACGGCAGCGACATAGCCAACAAGCTCAAAGGCTCAACGCCTCACG
ACGAGCTGCTCATCCAGATCCCTCAGTCTTTCTCCGGCTTGCTCCTCTTTGCGATAGGTT
TGGTGCTGTTCATGGTGTCGTTTGTTAAGGATAGAGAGTTTCATGGCTTCTTCGCCGGAG
GGTCTGTGGTTCTCTATGTGCTTATGGCTCTGTGGAGAGTTGTGTTTGAGTGGAAGATTG
AAGATCTTGCGTTTGAGTGTCCTAAGCAAGCGCTTGGAGATATTGCTTTGGCTGTTTCTT
GGGTGTTCTTCCTTGTTTATACTTGGAGGGAGAAGTATGATTGATTGATGCAAAAAAAAA
AAAAGATGAGGGCTTTTATGCAAACTGGAGATTAAGAGAACCACTAGCTTTCTGTAGATC
ATACTATTGTCAGTTTCATAGTTTGTCAGAAGAAGATCAAGTGTGAAAAAAATTGGATTT
TGTAGTTGAAAATTAGAGAAAAATTGTCAATGATAATAATTTGGTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EV21TF U 1
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TCCTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGTGGGACCCTGATGATGTTCTACACGGAGAAAG
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TATGGCTCTGTGGAGAGTTGTGTTTGAGTGGAAGATTGAAGATCTTGCGTTTGAGTGTCC
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AACTGGAGATTAAGAGAACCACTAGCTTTCTGTAGATCATACTATTGTCAGTTTCATAGT
TTGTCAGAAGAAGATCAAGTGTGAAAAAAATTGGATTTTGTAGTTGAAAATTAGAGAAAA
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QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

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TATTTTTTC


BQ
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AF RR4G309TF U 1
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BS 767 849 RR4G309JQ

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AGAGAAGAAGGAGAAAACGCCGACGCAGGCTGAGCTTGACGACTTCTTCTCGGCGGCGGA
GAGACGCCAACAGAAACGATTCACGGACAAGTACAACTACGACATCGTGAATGATACGCC
GCTTGAAGGTCGTTACGAGTGGGTTAGTCTCAAGCCATAAAAGGCTAAGAAGCAGAAGAA
GACAACGACGTCGTAGGTACTCTGTGAGTTTTGTCACAGACAGAGAGAATCATAGCTTAG
GACCGTTTTGTTTCGTTATTGTACAGTCGGTCAGTCCTCTCTAGCTTAGCTTATTGTAGT
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QA 1 766 1 766
DS 

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TTGTCACAGACAGAGAGAATCATAGCTTAGGACCGTTTTGTTTCGTTATTGTACAGTCGG
TCAGTCCTCTCTAGCTTAGCTTATTGTAGTTTCCTTATTTATCTTCTTATGTTCTTCGTA
CCATGAGAAACAAAAAAGGACGCTGCTTTCTTTTCGAAATTTATCATTTTTAATGTCTAG
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QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 3

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AAAAAAGAGATGAAAACTGTGCTCACTCTCCTTTGTTCTCTGCGTGCAGAGAAGCTTTAA
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TATCATACCCATTAGCATGATACTTGATCTTGTAACCACCTGTCAAC


BQ
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER06JQ U 1
AF RR4BV29JQ U 52
AF RR4ER06TF C 178
BS 1 172 RR4ER06JQ
BS 173 173 RR4BV29JQ
BS 174 279 RR4ER06JQ
BS 280 280 RR4BV29JQ
BS 281 662 RR4ER06JQ
BS 663 664 RR4BV29JQ
BS 665 665 RR4ER06TF
BS 666 703 RR4BV29JQ
BS 704 887 RR4ER06TF

RD RR4ER06JQ 662 0 0
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AAAAGTTTTGTTTGTAAAAATATGGTTGTTCATACATCGCAATCAAAAGTAATTTGAGAA
CCGCTGCGCTGGTTGCATAATAGCACTTTCACTACCAAACTTCAAAGGCCTTGACAGGCA
AAAAAAGAGATGAAAACTGTGCTCACTCTCCTTTGTTCTCTGCGTGCAGAGAAGCTTTAA
CGGCTGCTGGATCGTCTTGTGGCCTCATTGCAGGGAAGAAAATAACCTCCTTGATGTTCT
GAGAGTCGGTGAATAGCATGGCAAGCCTGTCAATACCCAACCCCCAGCCACCCGTAGGAG
CCAGCCCATATTCCAAAGCATTGCAGAAAGTCTCATCTAAAGCCATGGCCTCATCGTCTC
CAGACTGCCTATCTTTGAGTTGATCAGCAAACCTTTGACGCTGAACCACTGGATCGTTCA
GCTCGGTGTAGGCATTGCAGAGTTCATGTTGGTTGATAAAGAGCTCGAATCTCTCGGTGA
GAACGTTGTTTGGTCTGTGCCACTTTGCCAACGGAGACATGATCTCGGGATGGTTGATGA
TGAATGTCGGGTTCACACATGTCACTTCCAGAAATTCTCCAACAAGTTTATCTAGCAGAC
GA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4BV29JQ 652 0 0
TTTT
TAATAAAAAGTTTTGTTTGTAAAAATATGGTTGTTCATACATCGCAATCAAAAGTAATTT
GAGAACCGCTGCGCTGGTTGCATAATAGCACTTTCACTACCAAACTTCAAAGGCCTTAAC
AGGCAAAAAAAGAGATGAAAACTGTGCTCACTCTCCTTTGTTCTCTGCTTGCAGAGAAGC
TTTAACGGCTGCTGGATCGTCTTGTGGCCTCATTGCAGGGAAGAGAATAACCTCCTTGAT
GTTCTGAGAGTCGGTGAATAGCATGGCAAGCCTGTCAATACCCAACCCCCACCCACCCGT
AGGAGCCAACCCATATTCCAAAGCATTGCAGAAAGTCTCATCTAAAGCCATCGCCTCATC
GTCTCCAGACTGCCTATCCTTGAGTTGATCAGCGAACCTTTGACGCTGAACCACAGGATC
GTTCAACTCGGTGTAAGCATTGCAGAGTTCATGTTGGTTGATAAAGAGCTCGAATCTCTC
GGTGAGAACATTGTTCGATCTGTGCCACTTTGCCAAGGGAGACATGATCTCGGGATGGTT
GATGATGAAAGTCGGGTTCACACATGTCACTTCCAGAAATTCTCCAACAAGTTTATCTAG
CAGACGAGCTGTTGCCTGAGGAGGAGGGCATTTCACGTCGAACTTGGC

QA 5 652 5 652
DS 

RD RR4ER06TF 710 0 0
AGC
AAAAAAGAGATGAAAACTGTGCTCACTCTCCTTTGT*CTCTGCGTGCAGAGAAGCTTTAA
CGGCTGCTGGATCGTCTTGTGGCCTCATTGCAGGGAAGAGAATAACCTCCTTGATGTTCT
GAGAGTCGGTGAATAGCATGGCAAGCCTGTCAATACCCAACCCCCAGCCACCCGTAGGAG
CCAGCCCATATTCCAAAGCATTGCAGAAAGTCTCATCTAAAGCCATGGCCTCATCGTCTC
CAGACTGCCTATCTTTGAGTTGATCAGCAAACCTTTGACGCTGAACCACTGGATCGTTCA
GCTCGGTGTAGGCATTGCAGAGTTCATGTTGGTTGATAAAGAGCTCGAATCTCTCGGTGA
GAACGTTGTTTGGTCTGTGCCACTTTGCCAACGGAGACATGATCTCGGGATGGTTGATGA
TGAATGTCGGGTTCACACATGTCACTTCCAGAAATTCTCCAACAAGTTTATCTAGCAGAC
GAGCAGTTGTCTGAGGAGGAGGGCATTTCACGTCGAACTTGGCACACGCATCAATCAAAT
ACTTGTTGGCTTCTTCACTAGCCAAATCTTTTGGTACATTAAGGTTAGCCACCTTCTCCA
ACTCTCCAATCATCTCAATCCTCCTGAATGGAGGAGTGAAGTCGATTTCGGTTGGCTCCT
TATCATACCCATTAGCATGATACTTGATCTTGTAACCACCTGTCAAC

QA 4 710 4 710
DS 



AS 1 3

CO CL3718Contig1 660 3 9 U
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CTTTTGTTTGGTCTCAACAAGGTAGTTTGAAACCCATGTAACTGCCAGAGATAAAATCAT
TCCAAACATCAAGAGCTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTTAGTGCCATGACGATAC
CAACCGAGAACACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCA
TCAGTCCAACGAGTGATGCCACAAAACACACAATCGCAAATAGACTCGCAGTTCCAGTAT
GTTCCATGCCTAGTAACAAGTATTGAATCGCAGACATTGTCGATGAAAACAATACCGTGA
AAGAACAAGTTGCTGCAGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAGAGGGCTAA
TGAGCATACCGCCTCCAATACCAAAAACACCACCCAAAACTCCAGCTAATAGAGCCATTA
CTGGAAACATGCACTTGTTTGATCTTCCTCCATCATTTGATCTCAGATTTTCTACATCCT
TTACTGGGACTTGGTGATCACAACATTGGCTGCCTTGAACATTTTCGCTGAAGCAGGTCC
AAAGAGTGAAGAAGAGAGTGAGGGGTATTTGAGTTGATGAGAGGAGCCAGTAAGTGATTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT64JQ U 8
AF RR4BT64TF C 1
AF RR4D035JQ U 1
BS 1 7 RR4BT64TF
BS 8 14 RR4BT64JQ
BS 15 15 RR4D035JQ
BS 16 109 RR4BT64JQ
BS 110 110 RR4D035JQ
BS 111 332 RR4BT64JQ
BS 333 333 RR4D035JQ
BS 334 412 RR4BT64JQ
BS 413 660 RR4D035JQ

RD RR4BT64JQ 405 0 0
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GAACACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCATCAGTCC
AACGAGTGATGCCACAAAACACACAATCGCAAATAGACTCGCAGTTCCAGTATGTTCCAT
GCCTAGTAACAAGTATTGAATCGCAAACATTGTCGATGAAAACAATACCGTGAAAGAACA
AGTTGCTGCAGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAG

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR4BT64TF 422 0 0
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CTTTTGTTTGGTCTCAACAAGGTAGTTTGAAACCCATGTAACTGCCAGAGATAAAATCAT
TCCAAACATCAAGAGCTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTTAGTGCCATGACGATAC
CAACCGAGAACACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCA
TCAGTCCAACGAGTGATGCCACAAAACACACAATCGCAAATAGACTCGCAGTTCCAGTAT
GTTCCATGCCTAGTAACAAGTATTGAATCGCAGACATTGTCGATGAAAACAATACCGTGA
AAGAACAAGTTGCTGCAGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAGAGGGCTAA
TG

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR4D035JQ 660 0 0
AGGATTG
AACACGGTGGGTATACACATATATTATGAACTATTAACCAAAGAAATCAAAACCTTTTGT
TTGGTCTCAACAAGGTAATTTGAAACCCATGTAACTGCCAGAGATAAAATCATTCCAAAC
ATCAAGAGCTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTTAGTGCCATGACGATACCAACCGA
GAACACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCATCAGTCC
GACGAGTGATGCCACAAAACACACAATCGCAAATAGACTCGCAGTTCCAGTATGTTCCAT
GCCTAGTAACAAGTATTGAATCGCAGACATTGTCGATGAAAACAATACCATGAAAGAACA
AGTTGCTGCAGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAGAGGGCTAATGAGCAT
ACCGCCTCCAATACCAAAAACACCACCCAAAACTCCAGCTAATAGAGCCATTACTGGAAA
CATGCACTTGTTTGATCTTCCTCCATCATTTGATCTCAGATTTTCTACATCCTTTACTGG
GACTTGGTGATCACAACATTGGCTGCCTTGAACATTTTCGCTGAAGCAGGTCCAAAGAGT
GAAGAAGAGAGTGAGGGGTATTTGAGTTGATGAGAGGAGCCAGTAAGTGATTC

QA 8 660 8 660
DS 



AS 1 3

CO CL3719Contig1 1283 3 7 U
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AAGCATTTTATTAGTTATTGTTACTGCTAGTAAGTGGTACATTAACAAGGATTGCTCTCA
AGTATCCAAGAACTGGATTAGTTTCAAGCGTTCCTCCTCCAAAAGCTCAGGGTCTTCACT
CGATAACCTCTCCCTCGTTGCACTATCCACGCTCGTTGGATCATCCACCACTTTTACGTA
GTTATTGGTATGACCATCTTTGTTAGGTCCTGTAAAAGGCTCTTGCTCATTGTGTGTCCA
TTCACCGTCTATGATATATTTATATTCAAACTGTCCTTCAGGCAATTCTCTCTTTAGGCT
CCAGAGTCCTGTTCCATTGTCCAGTGTCAGAGGTATCCTCTGTCCCCATCCAATGTCAAG
GCCAAAAACTTCTACTGTGGAGAACCCCTTGTCTTCCAGTGTCAGAGTAACAATCTTCTT
CTTGAGTCCTGTAAGAATATCAATTGTTGCGTTTCCGATAGCATCGAGGTTCGGAGAGCA
GGTTCGTTTGCTCATAAGTAATCTGTGAGCTTCCATAAGTTTGTAGCCTTGCACCCAGAA
CATGTATGTCAACGCAACAGCAGGAGCCCTTCCCATTCCAGCAGTGCAGTGGACGTATGT
AACTCCTCCGTTTCGCTTAACAGCTTTGTAGAGTGTGCTAACCACGGCAGGAAGGCGCAG
TCTCAGATCAAACGCATCAAAGTCTCTTATTTGACAGCGAATATGCTCAACATCAGTAAA
CGTCTTGGCATATGCTTGAATGCTGCTTATATCTACTCCAAAATATTCCAAGTCAGGATC
TTGTTGCAAGCAGAAGATGGTTTTGACACCGATTTTACGGAGCTTGTCAACATCTTCAGG
GGTCTGTAAGCAGGATCCAACAATTAAATCAGGACGAATAAAGCTGTAGTTCATTCCTAA
CTCATGCCTGTAAGTTAAAACAGCACCCATAGCTTGAGTCATGTCTTGGCTATATTCATC
AGATTTCTCTTCCTCTTCTTTTGCAACATCACTCACCTCTAAGCTGGATTTCGAATCTGA
TACCGCCTGTAAGACAATTCTACACTTAGGATAATTGGCTTTGATAGGTAGCAGCATCAT
TTTCAAAGAAGAAGGATCTCTTTGATTGCCCACAAAGCCCAACAAAGGTGAGACTGAGGA
TCTGGGAAGATTCTGAAGGCAATTCATCTTTAAAGAGGTAGTCTCACTCGTCGGTCACTC
GTTAGTCCCAAGTTCGACGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D069JQ U 1
AF RR4CR45JQ U 27
AF RR4CR45TF C 553
BS 1 123 RR4D069JQ
BS 124 124 RR4CR45JQ
BS 125 375 RR4D069JQ
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BS 377 463 RR4D069JQ
BS 464 818 RR4CR45JQ
BS 819 1283 RR4CR45TF

RD RR4D069JQ 463 0 0
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AAGCATTTTATTAGTTATTGTTACTGCTAGTAAGTGGTACATTAACAAGGATTGCTCTCA
AGTCTCCAAGAACTGGATTAGTTTCAAGCGTTCCTCCTCCAAAAGCTCAGGGTCTTCACT
CGATAACCTCTCCCTCGTTGCACTATCCACGCTCGTTGGATCATCCACCACTTTTACGTA
GTTATTGGTATGACCATCTTTGTTAGGTCCTGTAAAAGGCTCTTGCTCATTGTGTGTCCA
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GCCAAAAACTTCTACTGTGGAGAACCCCTTGTCTTCCAGTGTC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4CR45JQ 792 0 0
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AGCGTTCCTCCTCCAAAAGCTCAGGGTCTTCACTCGATAACCTCTCCCTCGTTGCACTAT
CCACGCTCGTTGGATCATCCACCACTTTTACGTAGTTATTGGTATGACCATCTTTGTTAG
GTCCTGTAAAAGGCTCTTGCTCATTGTGTGTCCATTCACCGTCTATGATATATTTATATT
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CCTTGTCTTTCAGTGTCAGAGTAACAATCTTCTTCTTGAGTCCTGTAAGAATATCAATTG
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GAGCTTCCATAAGTTTGTAGCCTTGCACCCAGAACATGTATGTCAACGCAACAGCAGGAG
CCCTTCCCATTCCAGCAGTGCAGTGGACGTATGTAACTCCTCCGTTTCGCTTAACAGCTT
TGTAGAGTGTGCTAACCACGGCAGGAAGGCGCAGTCTCAGATCAAACGCATCAAAGTCTC
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TTATATCTACTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4CR45TF 731 0 0
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CGCATCAAAGTCTCTTATTTGACAGCGAATATGCTCAACATCAGTAAACGTCTTGGCATA
TGCTTGAATGCTGCTTATATCTACTCCAAAATATTCCAAGTCAGGATCTTGTTGCAAGCA
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GGATCCAACAATTAAATCAGGACGAATAAAGCTGTAGTTCATTCCTAACTCATGCCTGTA
AGTTAAAACAGCACCCATAGCTTGAGTCATGTCTTGGCTATATTCATCAGATTTCTCTTC
CTCTTCTTTTGCAACATCACTCACCTCTAAGCTGGATTTCGAATCTGATACCGCCTGTAA
GACAATTCTACACTTAGGATAATTGGCTTTGATAGGTAGCAGCATCATTTTCAAAGAAGA
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CTGAAGGCAATTCATCTTTAAAGAGGTAGTCTCACTCGTCGGTCACTCGTTAGTCCCAAG
TTCGACGACCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

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AATGGGCAAAGTATTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCGA
TTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATCTATTGAAGAAAAAG
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TGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTAGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAATA
CTAATAACATATTTGGTATAATGCCTTTTATAT


BQ
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AF RR4CP78TF U 1
AF RR4CP78JQ C 241
AF RR4FG23TF U 490
BS 1 399 RR4CP78TF
BS 400 490 RR4CP78JQ
BS 491 867 RR4FG23TF
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BS 869 933 RR4FG23TF

RD RR4CP78TF 399 0 0
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QA 1 399 1 399
DS 

RD RR4CP78JQ 677 0 0
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CTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATTTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAAGT
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TTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTTATTAATACGTTATGGG
TGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTAGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAATA
CTAATAACATATTTGG
G

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FG23TF 444 0 0
G
CAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAAGTTCAAGGAGGG
ATTGGGCTTGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTAGATGTGTTCGCTGGAATGGGCAAA
GTATTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCGATTCGTTGCTC
CCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATCTATTGAAGAAAAAGCATGGCATCG
TCTATGGTGATGAATAATCTGCATCTTTTGGGTTTTTTTTTTCAGTTATGTTAGGAATCT
TGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTTATTAATACGTTATGGGTGATAATCAT
GTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAATACTAATAACAT
ATTTGGTATAATGCCTTTTATAT

QA 2 444 2 444
DS 



AS 1 3

CO CL3721Contig1 660 3 19 U
ACTTTGAACTCCTTTGGTTTTCTGTTTTTACACTGGGAGACCATCACATGTAAAGATGTT
AAAATGCATTGCACATTTTCCAGAGTTGGGCTTTTACATTAATACATGGAAAAGTCACCA
TTTCAAGTGATCAAATCATAGACACAGTAAAAAGTTTCTAGAGTCTGGGAGACAGAGAGG
AGGGAATGTGAGCGATTTTGTTAAAATCCAAACAAGAAGAAAGCGCAGTGATGAGTTTCT
TCACATCCTCTGAGGTATGCGTTGCACTCAATGTCACCCTTAACCTGCAAGAATTGGGTG
GCACTGTAGGTGGTCTTATTGCCATTACATGGAAGACTGACTTCAGTAGATACCGGCTCC
CTTGAAGGGCTTTCTCTTGATTGCCGACAACAAGCGAGATAATGGGGCTTGAGATTTGAA
CTCCAGATAATGCCTCGAACTCTTTCACCCTCTCCCATATTGCCTTTCTTCTCCATCCCT
CTTTCCTCGCCACTACAACGGCAGCATAAGCAGCTGCAGCCATAGGGATAGGTATCGCTG
TTGAAAATATGAATGAACGTCCTCTCGACTGGATCAGTTGCTTCCACTTCTTGCTGCAAG
CTATGAATCCGCCAAGACACCCTGCTGCCTTACTCAGTGTGCCCACACATAAATCTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE59JQ U 67
AF RR4BE59TF C 67
AF RR4E103JQ U 1
BS 1 80 RR4E103JQ
BS 81 81 RR4BE59JQ
BS 82 94 RR4E103JQ
BS 95 95 RR4BE59JQ
BS 96 144 RR4E103JQ
BS 145 146 RR4BE59JQ
BS 147 228 RR4E103JQ
BS 229 229 RR4BE59JQ
BS 230 252 RR4E103JQ
BS 253 253 RR4BE59JQ
BS 254 259 RR4E103JQ
BS 260 260 RR4BE59JQ
BS 261 307 RR4E103JQ
BS 308 308 RR4BE59JQ
BS 309 335 RR4E103JQ
BS 336 336 RR4BE59JQ
BS 337 430 RR4E103JQ
BS 431 431 RR4BE59JQ
BS 432 660 RR4E103JQ

RD RR4BE59JQ 387 0 0
CATTGCACATTTTCCAGAGTTGGGCTTTTACATTAATACATGGAAAAGTCACCATTTCAA
GTGATCAAATCATAGACACAGTAAAAAGTTTCTAGAGTCTGGGAGACAGAGAGGAGGGAA
TGTGAGCGATTTTGTTAAAATCCAAACAAGAAGAAAGCGCAGTGATGAGTTTCTTCACAT
CCTCTGAGGTATGCGTTGCACTCAATGTCACCCTTAACCTGCAAGAATTGGGTGGCACTG
TAGGTGGTCTTATTGCCATTACATGGAAAACTGACTTCAGTAAATACCGGCTCCCTTGAA
GGGCTTTCTCTTGATTGCCGACAACAAGCGAGATAATGGGGCTTGAGATTTGAACTCCAG
ATAATGCCTCGAACTCTTTCACCCTC
C

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4BE59TF 387 0 0
CATTGCACATTTTCCAGAGTTGGGCTTTTACATTAATACATGGAAAAGTCACCATTTCAA
GTGATCAAATCATAGACACAGTAAAAAGTTTCTAGAGTCTGGGAGACAGAGAGGAGGGAA
TGTGAGCGATTTTGTTAAAATCCAAACAAGAAGAAAGCGCAGTGATGAGTTTCTTCACAT
CCTCTGAGGTATGCGTTGCACTCAATGTCACCCTTAACCTGCAAGAATTGGGTGGCACTG
TAGGTGGTCTTATTGCCATTACATGGAAGACTGACTTCAGTAGATACCGGCTCCCTTGAA
GGGCTTTCTCTTGATTGCCGACAACAAGCGAGATAATGGGGCTTGAGATTTGAACTCCAG
ATAATGCCTCGAACTCTTTCACCCTC
C

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4E103JQ 660 0 0
ACTTTGAACTCCTTTGGTTTTCTGTTTTTACACTGGGAGACCATCACATGTAAAGATGTT
AAAATGCATTGCACATTTTC*AGAGTTGGGCTTTAACATTAATACATGGAAAAGTCACCA
TTTCAAGTGATCAAATCATAGACA**GTAAAAAGTTTCTAGAGTCTGGGAGACAGAGAGG
AGGGAATGTGAGCGATTTTGTTAAAATCCAAACAAGAAGAAAGCGCAGAGATGAGTTTCT
TCACATCCTCTGTGGTATGTGTTGCACTCAATGTCACCCTTAACCTGCAAGAATTGGGTG
GCACTGTGGGTGGTCTTATTGCCATTACATGGAAGCCTGACTTCAGTAGATACCGGCTCC
CTTGAAGGGCTTTCTCTTGATTGCCGACAACAAGCGAGATAATGGGGCTTGAGATTTGAA
CTCCAGATAAAGCCTCGAACTCTTTCACCCTCTCCCATATTGCCTTTCTTCTCCATCCCT
CTTTCCTCGCCACTACAACGGCAGCATAAGCAGCTGCAGCCATAGGGATAGGTATCGCTG
TTGAAAATATGAATGAACGTCCTCTCGACTGGATCAGTTGCTTCCACTTCTTGCTGCAAG
CTATGAATCCGCCAAGACACCCTGCTGCCTTACTCAGTGTGCCCACACATAAATCTACAT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL3722Contig1 773 2 6 U
AATATTACAAATAGTAAAACCACATAGAATTCAAGCTCACACGAAGCAGTCGATCACCAA
GACAAAACATCATAGGTTTCACAATCTGTATTTTCATTACAGAGAGTTTTGATACACATG
AAGCTCATCATAGGACACATTACTATCATTTTTTTACAAGCCACTAGTTCAGAGGGATAA
CAATATCGCCAATGTTTTTGTGCCATGGATCAGCCAAGTGAGTAGCCAAGTTCTCCAATG
GTCCTGTCCCTGGGTAAGCCGATTGCTGCACACAGAAGCCTACAAAGGCCAACAACGCAA
GCCTCCCGTTCTTGATCTCCTTAACTTTCAACTCCTCAAACTTCTAAGGGTCTTTGGAGT
ATCCAAGAGGGTCAAATGCACCTCCAGGGTACTTCTTTTTCTCAGGGTCTTTCTCCATGC
TCCTCTGGTGCTCAACAAAGGCAATAGCTAAGAACTCTATAGCCAAGATTGTGGGCAGAG
TACCCCATGGGACCGGGTTGCCCAAGTAAGTGGCTTGTCCTCCAGGTACTGCTGCCCATT
CTTGAGCCTTGACCCAGTTTCCGTATCCCAAAGCCTCTGGTACCAAAATCCCTGGAACAG
CAAGCATAGCCCATCTACAGTGGATGAGCTCTGATTCTTTGTATCTCTCAAGATTCTCTG
GAACCTCTCCAAGTCCAAGAGGGTCAAACCCAAAGTCACCAGGAGCAGAACCGTCGAGGT
AAGCTGGACGCGGCTCGCCGGGCATCCAGTGAGCAGCCATTCTGATACGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE90JQ U 1
AF RR4A428TF C 79
BS 1 146 RR4CE90JQ
BS 147 148 RR4A428TF
BS 149 345 RR4CE90JQ
BS 346 346 RR4A428TF
BS 347 706 RR4CE90JQ
BS 707 773 RR4A428TF

RD RR4CE90JQ 706 0 0
AATATTACAAATAGTAAAACCACATAGAATTCAAGCTCACACGAAGCAGTCGATCACCAA
GACAAAACATCATAGGTTTCACAATCTGTATTTTCATTACAGAGAGTTTTGATACACATG
AAGCTCATCATAGGACACATTACTAT**TTTTTTTACAAGCCACTAGTTCAGAGGGATAA
CAATATCGCCAATGTTTTTGTGCCATGGATCAGCCAAGTGAGTAGCCAAGTTCTCCAATG
GTCCTGTCCCTGGGTAAGCCGATTGCTGCACACAGAAGCCTACAAAGGCCAACAACGCAA
GCCTCCCGTTCTTGATCTCCTTAACTTTCAACTCCTCAAACTTCTTAGGGTCTTTGGAGT
ATCCAAGAGGGTCAAATGCACCTCCAGGGTACTTCTTTTTCTCAGGGTCTTTCTCCATGC
TCCTCTGGTGCTCAACAAAGGCAATAGCTAAGAACTCTATAGCCAAGATTGTGGGCAGAG
TACCCCATGGGACCGGGTTGCCCAAGTAAGTGGCTTGTCCTCCAGGTACTGCTGCCCATT
CTTGAGCCTTGACCCAGTTTCCGTATCCCAAAGCCTCTGGTACCAAAATCCCTGGAACAG
CAAGCATAGCCCATCTACAGTGGATGAGCTCTGATTCTTTGTATCTCTCAAGATTCTCTG
GAACCTCTCCAAGTCCAAGAGGGTCAAACCCAAAGTCACCAGGAGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4A428TF 695 0 0
TCACAATCTGTCTTTTCATTACAGAGAGTTTTGATACACATGCAGCTCAT***AGGACAC
ATTACTATCATTTTTTTACAAGTCACTAGTTCAGAGGGATAACAATATCGCCAATGTTTT
TGTGCCATGGATCCGCCAAGTGAGTAGCCAAGTTCTCCAATGGTCCTGTCCCTGGGTAAG
CCGATTGCTGCACACAGAAGCCTACAAAGGCCAACAACGCAAGCCTCCCGTTCTTGATCT
CCTTAACTTTCAACTCCTCAAACTTCTAGGGGTCTTTGGAGTATCCAAGAGGGTCAAATG
CACCTCCAGGGTACTTCTTTTTCTCAGGGTCTTTCTCCATGCTCCTCTGGTGCTCAACGA
AGGCAATAGCTAAGAACTCTATAGCCAAGATTGTGGGCAGAGTACCCCATGGGACCGGGT
TGCCCAAGTAAGTGGCTTGTCCTCCAGGTACTGCTGCCCATTCTTGAGCCTTGACCCAGT
TTCCGTATCCCAAAGCCTCTGGTACCAAAATCCCTGGAACAGCGAGCATAGCCCATCTAC
AGTGGATGAGCTCTGATTCTTTGTATCTCTCAAGGTTCTCTGGAACCTCTCCAAGTCCAA
GAGGGTCAAATCCAAAGTCACCTGGAGCAGAACCGTCGAGGTAAGCTGGACGCGGCTCGC
CGGGCATCCAGTGAGCAGCCATTCTGATACGGCCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

CO CL3723Contig1 935 3 13 U
GGAATGTGAACTGTGTTTCCATAGTCTCTCTGCAAGCATGAAAATGGAAGAGTTTGGGGC
AAAGAAGAATGAGAATCAAGCTTTGGAAACGGATTTTGCAGAGAGACCAATGTGGCTAAT
GAAAAGCCCTTCTCTCATCGCTTCTGCTCTCCAATCTCTTCCTTCTATGGACGACCCATA
CCTTCCTGTCGCCAAAGTCATCCTCTCCGTCGATCCTCTCGCTGCCGTGGACGAAGAAAC
CAAATTTGGAATGGAATTAGCTAGGGCTGGATCTGGAAACATTCCAAAACGTTTTGGCTT
AGATATGTCTAAAGATTTCATTCCCTTGGCTGTTTTCTCTGAGTCTTCCTCACAAGGGAA
AACGTCAGTAGAAGGGAAGATTAAAAACAAATTCCACATGAGTCCTCGTACTGAAAACAT
GGAGAGCTATGGCAAACTTTGCCGTGAAAGGGCAACCAAGTCTATGTGCAAAAACAAACA
GATCCAGGTCATTGATAACGCCACCGGAATGTATATGTGGCCAACACCGGGAACTGTAGC
TCCCACGGGAACTTTTGAAAAGAAGAAAGTGACAACCAAGACAACGGAAATGAAGAGAAC
AAGAAGGGACCGAAGAGAGATGGAGGAGGTCATGTTTAATCTCTTTGAAAGACAATCTCA
TTGGACTCTGAGGAACCTCATTCAAGATACCGACCAACCAGAGCAATTCCTGAAAGACTT
GCTTAGAGGTCTTTGCATTTACAACAACAAAGGGAGTAACCAAGGAACTTATGAACTGAA
GCCTGAGTACAAGAGAGCCACACAAGAATAAGTATATGGTCAAGAGGGTTTGTCCAGGTT
TTGGATGTGGTTAACTGAATAAAATTGATTCCAAGTAAAGGGACAACCTGGTGACTTTCT
AAAATATTTCTCATAAATTTGATTTCAACTTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC01TF U 1
AF RR4GV19TF U 9
AF RR4DC01JQ C 346
BS 1 124 RR4DC01TF
BS 125 125 RR4GV19TF
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BS 241 300 RR4DC01TF
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BS 302 668 RR4DC01TF
BS 669 699 RR4GV19TF
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TCCCACGGGAACTTTTGAAAAGAAGAAAGTGACAACCAAGACAACGGAAATGAAGAGAAC
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TTGGACTC

QA 1 668 1 668
DS 

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QA 1 691 1 691
DS 

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ATTCCTGAAAGACTTGCTTAGAGGTCTTTGCATTTACAACAACAAAGGGAGTAACCAAGG
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GGGTTTGTCCAGGTTTTGGATGTGGTTAACTGAATAAAATTGATTCCAAGTAAAGGGACA
ACCTGGTGACTTTCTAAAATATTTCTCATAAATTTGATTTCAACTTCCGC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

CO CL3724Contig1 965 3 9 U
GGAGGGGTTGCTGTTTGGTTTACGATACGGTTACGGATGAGTCCACTGATCTGCTCTGTG
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AGTTGAAGAAGATTATGGGTTCTAATTACTTCACTATTACTCCTGAGATGGTAGCTCCCG
TTGAAGCAGCAGCGGCTGCATCTGGTGGTAACTATGGTGCTTTCCAAGTCGCTGGTGACA
GTGAACAAAAGGAAGAAGACGCATCAAACTATAAAGAACAAGAATCTGCTGTTAATGATC
AACCTGAGCAACCAAAGGACGAGTCAGTGACTGAAGGAGAGGTGGTCCAAGAACAGCAGG
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TGCCTCGTGGGACCCACCAGAACCAGAGAGGTCATAGAGGTGCTCGAAGAGGTCATTCCA
ATGGCCCCCGAGGAGGTCGAGGTGGTGGCGGTGGAGGCTACTCGAATGGGCGGTATGAAT
CTTATGATAACGCCGGTGGAAACGGTCACCAAAGGAGCTACTACAACAACAGAGGAAGGG
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CTGTTGCGTCTTAGCCTTACTACCTTTTTTAGCTTTTGCGTTGCGTCTCTTTGTTTTCCG
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TATGTATGAACTTTTGTTTTCTTTTCTTTTGTGGCCGTTAGTCAATATAATCCTTTGTTC
TCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4BW38TF U 1
AF RR4GI15TF U 241
AF RR4BW38JQ C 148
BS 1 612 RR4BW38TF
BS 613 613 RR4GI15TF
BS 614 636 RR4BW38TF
BS 637 637 RR4GI15TF
BS 638 680 RR4BW38TF
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BS 820 924 RR4GI15TF
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RD RR4BW38TF 680 0 0
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QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GI15TF 686 0 0
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TTGAAGCAGCAGCGGCTGCATCTGGTGGTAACTATGGTGCTTTCCAAGTCGCTGGTGACA
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AACCTGAGCAACCAAAGGACGAGTCAGTGACTGAAGGAGAGGTGGTCCAAGAACAGCAGG
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TGCCTCGTGGGACCCACCAGAACCAGAGAGGTCATAGAGGTGCTCGAAGAGGTCATTCCA
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CTTATGATAACGCCGGTGGAAACGGTCACCAAAGGAGCTACTACAACAACAGAGGAAGGG
GACGTGGTGGTGGTGGAGGAAATGGTCATTCATACAACAACCACCAAGACTCGAATGTAA
CTGTTGCGTCTTAGCCTTACTACCTTTTTTAGCTTTTGGGTTGCGTCTCTTTGTTTTCCG
CTATAACTCATATAAAGCCTTATCTCGTGGTTTGGAACCTTTGTCAATTGCTCTTTTGTT
TATGTATGAACTTTTGTTTTCTTT
CC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BW38JQ 818 0 0
GAGCG
TGCGTCGAGCATGCTAAGCTTTGGTTGGCTAATTCCGACCAGCCGATTGCTTCTAACTGC
AATGTTTCATATGCCGGATTGAGAGAGAAGTTGAAGAAGATTATGGGTTCTAATTACTTC
ACTATTACTCCTGAGATGGTAGCTCCCGTTGAAGCAGCAGCGGCTGCATCTGGTGGTAAC
TATGGTGCTTTCCAAGTCGCTGGTGACAGTGAACAAAAGGAAGAAGACGCATCAAACTAT
AAAGAACAAGAATCTGCTGTTAATGATCAACCTGAGCAACCAAAGGACGAGTCAGTGACT
GAAGGAGAGGTGGTCCAAGAACAGCAGGAGCAAGGCTATACTCAGGTGGAAGGAGGGAGG
CCAAGGAGAGATTATCAGCAACAGTATGTGCCTCGTGGGACCCACCAGAACCAGAGAGGT
CATAGAGGTGCTCGAAGAGGTCATTCCAATGGCCCCCGAGGAGGTCGAGGTGGTGGCGGT
GGAGGCTACTCGAATGGGCGGTATGAATCTTATGATAACGCCGGTGGAAACGGTCACCAA
AGGAGCTACTACAACAACAGAGGAAGGGGACGTGGTGGTGGTGGAGGAAATGGTCATTCA
TACAACAACCACCAA**TTCGAATGTAACTGTTGCGTCTTAGCCTTACTACCTTTTTTAG
CTTTTGCGTTGCGTCTCTTTGTTTTCCGCTATAACTCATATAAAGCCTTATCTCGTGGTT
TGGAACCTTTGTCAATTGCTCTTTTGTTTATGTATGAACTTTTGTTTTCTTTTCTTTTGT
GGCCGTTAGTCAATATAATCCTTTGTTCTCTCG

QA 6 818 6 818
DS 



AS 1 3

CO CL3725Contig1 849 3 2 U
GAACGTGATACGTATATTCTCATAAGCAAATATCCATTATTTATATGTTTCTTTGTTTCA
TCTCAAGAAACCCAACGAAGAGTGAACAAGATCACCATAGGAGACAACAAAGATCCCAAA
AGAAAGAACATAAACTTAAGAAGAACAAAACCAATTTTTATATTATGGATCGATCGAGGG
TAGTGACACTATTGGTTCTTCAAGGGTCAAAATGAACTGTTTTTTTTTTCATTTTTTTTT
CAAGCAGCGTCCACTTTGTCCTTTGCGGTATTATCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTT
CCTTTCTCCTCGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCT
ATGTAATTCGAAGGACTTATCGTGCATCCACCATGTGTACACTTGAAGCAGCTCTTGTGG
TACAATGTCCCATTCACCGACACCTTCTCAATTGGATACACGGTTTTGTCACAACCAACG
CATTTTTCTCGTGTTCCACCAAACATATTAGACACTTTGGTACCAGCTGGTCTCTCTCCC
TCCAAAGGTCTATCCGGTTTTCAGATCTTTGGTGTCCCCTCGAAGCTCTTCTCAAGACTT
CCAGTTCTCTTGAAGTTCTGATCAAAATGTGGTCTGCAGTAGAGAACTCCCTCAAATGAG
TTATAGTTGCTAAGCTTGAGAGTTCCTTTGCAATGGTGACAACGGAAACATGCTTTGTGG
TAAACCCGGTTATCTGCGGTTAGCTTGTCGACGAGATAAACGGTTTTGTCACAGGCCATG
CATTTCTGTGTTGTTCCTGCGGACGCCATTTTTGTGCTCTTTCTTGTAAGAGATCAGACC
AAGAGTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG32JQ U 1
AF RR4FW96JQ U 1
AF RR4GG32TF C 127
BS 1 508 RR4FW96JQ
BS 509 849 RR4GG32TF

RD RR4GG32JQ 239 0 0
GAACGTGATACGTATATTCTCATAAGCAAATATCCATTATTTATATGTTTCTTTGTTTCA
TCTCAAGAAACCCAACGAAGAGTGAACAAGATCACCATAGGAGACAACAAAGATCCCAAA
AGAAAGAACATAAACTTAAGAAGAACAAAACCAATTTTTATATTATGGATCGATCGAGGG
TAGTGACACTATTGGTTCTTCAAGGGTCAAAATGAACTGTTTTTTTTTTCATTTTTTTT

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR4FW96JQ 508 0 0
GAACGTGATACGTATATTCTCATAAGCAAATATCCATTATTTATATGTTTCTTTGTTTCA
TCTCAAGAAACCCAACGAAGAGTGAACAAGATCACCATAGGAGACAACAAAGATCCCAAA
AGAAAGAACATAAACTTAAGAAGAACAAAACCAATTTTTATATTATGGATCGATCGAGGG
TAGTGACACTATTGGTTCTTCAAGGGTCAAAATGAACTGTTTTTTTTTTCATTTTTTTTT
CAAGCAGCGTCCACTTTGTCCTTTGCGGTATTATCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTT
CCTTTCTCCTCGATAAGCTGAATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCT
ATGTAATTCGAAGGACTTATCGTGCATCCACCATGTGTACACTTGAAGCAGCTCTTGTGG
TACAATGTCCCATTCACCGACACCTTCTCAATTGGATACACGGTTTTGTCACAACCAACG
CATTTTTCTCGTGTTCCACCAAACATAT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4GG32TF 723 0 0
AGAACATAACTTAAG
AGAACAAAACCAATTTT*ATATTATGGATCGATCGAGGGTAGTGACACTATTGGTTCTTC
AAGGGTCAAAATGAACTGTTTTTTTTT*CATTTTTTTT*CAAGCAGCGTCCACTTTGTCC
TTTGCGGTATTATCTCCTCCTTCGAGCTGGCTCAAGTTTCCTTTCTCCTCGATAAGCTGA
ATATGATGATGCTTGCAATAAAGCTTCCCCTCGTGAGCTATGTAATTCGAAGGACTTATC
GTGCATCCACCATGTGTACACTTGAAGCAGCTCTTGTGGTACAATGTCCCATTCACCGAC
ACCTTCTCAATTGGATACACGGTTTTGTCACAACCAACGCATTTTTCTCGTGTTCCACCA
AACATATTAGACACTTTGGTACCAGCTGGTCTCTCTCCCTCCAAAGGTCTATCCGGTTTT
CAGATCTTTGGTGTCCCCTCGAAGCTCTTCTCAAGACTTCCAGTTCTCTTGAAGTTCTGA
TCAAAATGTGGTCTGCAGTAGAGAACTCCCTCAAATGAGTTATAGTTGCTAAGCTTGAGA
GTTCCTTTGCAATGGTGACAACGGAAACATGCTTTGTGGTAAACCCGGTTATCTGCGGTT
AGCTTGTCGACGAGATAAACGGTTTTGTCACAGGCCATGCATTTCTGTGTTGTTCCTGCG
GACGCCATTTTTGTGCTCTTTCTTGTAAGAGATCAGACCAAGAGTCCC

QA 16 723 16 723
DS 



AS 1 3

CO CL3726Contig1 753 3 4 U
GGGCATCTCTGCTCACCTCTTTTCCTTTAACAAACTATATATTTGAATATAATTTCAAAT
TTATTTGTTAAGGGAAAAATTAAACTGAGCTCTAGTCATGGCAAAGATCTCCTTATTGCT
TTTCGTCATGGCCCTTGTTGCCTCTCTCCACGCTTATGAAGCTCACCGCATGGGAAAATT
CGATGAAGCAATTGAAAAAGACTTGCACAAAGCCGAGGCCAGATCGAGGAAGACATAAAG
GCAACAAAAACGAGCATTCAAGGTTTGACAACTGAGATGAAAACCTTGAGCAAATCTGAA
GAGATGTTAAATCAACTTGGAAAAGATCACAAAACGGATATGGAGGTAGCTCCTTATGGA
AAGAAACTCAGAACATTCAGCAGGGCAGCAAAAAAAGTCACGAAAGCACAACCTGCAAAA
AACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAACAAG
AAACCTGCATCACCTGCAAAAGACAAGAAACCTGCATCCGTAATCCAAACGATCTTGCAG
GATTTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGATTGACAAAACATAATAATCAGGGTCTGATTAGTG
TTTTGAGTGAGTTTTAAGGAGTATTGAACTTGTTCATGGAGTTTAGCTTTACAAGTGAGA
GGAGCAAATAATTCCCCACATAGTATATAAGTTGCGTTGCTGTCATTTTGTAATTAATAA
TACAACTAAATGAAATATTATAACTACTTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT36TF U 1
AF RR4A588TF U 227
AF RR4FT36JQ C 476
BS 1 395 RR4FT36TF
BS 396 396 RR4A588TF
BS 397 449 RR4FT36TF
BS 450 753 RR4A588TF

RD RR4FT36TF 449 0 0
GGGCATCTCTGCTCACCTCTTTTCCTTTAACAAACTATATATTTGAATATAATTTCAAAT
TTATTTGTTAAGGGAAAAATTAAACTGAGCTCTAGTCATGGCAAAGATCTCCTTATTGCT
TTTCGTCATGGCCCTTGTTGCCTCTCTCCACGCTTATGAAGCTCACCGCATGGGAAAATT
CGATGAAGCAATTGAAAAAGACTTGCACAAAGCCGAGGCCAGATCGAGGAAGACATAAAG
GCAACAAAAACGAGCATTCAAGGTTTGACAACTGAGATGAAAACCTTGAGCAAATCTGAA
GAGATGTTAAATCAACTTGGAAAAGATCACAAAACGGATATGGAGGTAGCTCCTTATGGA
AAGAAACTCAGAACATTCAGCAGGGCAGCAAAAAATGTCACGAAAGCACAACCTGCAAAA
AACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAA

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR4A588TF 527 0 0
G
GGAAGACATAAAGGCAACAAAAACGAGCATTCAAGGTTTGACAACTGAGATGAAAACCTT
GAGCAAATCTGAAGAGATGTTAAATCAACTTGGAAAAGATCACAAAACGGATATGGAGGT
AGCTCCTTATGGAAAGAAACTCAGAACATTCAGCAGGGCAGCAAAAAAAGTCACGAAAGC
ACCACCTGCAAAAAACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAACAAGAAACCTGCACCACC
TGCAAAAAACAAGAAACCTGCATCACCTGCAAAAGACAAGAAACCTGCATCCGTAATCCA
AACGATCTTGCAGGATTTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGATTGACAAAACATAATAATCAG
GGTCTGATTAGTGTTTTGAGTGAGTTTTAAGGAGTATTGAACTTGTTCATGGAGTTTAGC
TTTACAAGTGAGAGGAGCAAATAATTCCCCACATAGTATATAAGTTGCGTTGCTGTCATT
TTGTAATTAATAATACAACTAAATGAAATATTATAACTACTTATGA

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR4FT36JQ 262 0 0
C
CAAGAAACCTGCATCACCTGCAAAAGACAAGAAACCTGCATCCGTAATCCAAACGATCTT
GCAGGATTTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGATTGACAAAACCTAATAATCAGGGTCTGATT
AGTGTTTTGAGTGAGTTTTAAGGAGTATTGAACTTGTTCATGGAGTTTAGCTTTACAAGT
GAGAGGAGCAAATAATTCCCCACATAGTATATAAGTTGCGTTGCTGTCATTTTGTAATTA
ATAATACGACTAAATGAAATA

QA 2 262 2 262
DS 



AS 1 3

CO CL3727Contig1 849 3 2 U
GCTTGGTAATTCTTACCAAACTTTTTCACCAAACAAGACTAAAAAAGTTGGAAACAAAAA
CATCAATAGATTCGAAAACCTACAACAGGTTCAACTGTTATCACACTATAAATAAAACAT
TAAAAAAAACTTTGAAGTATCTTCTTTTGACAATACACACCATCTTGTATATCATAAACT
TTGGATGTTATACAATATGGTGAGATCAACGCATTGTGAGAGGCCCTGTGTTAGCAGGTT
TCTGGAAAACTCCGACCAGAGGCATCCCATCTCCATCCTCTGTGTTTTTAACCCTCCAGT
TCCTATCCTTCTTCCTCTGCGGCTTCTTGTGCTGTTTATGTGAAGCTGTTTCCTTCTTCA
CCCTCACTTTCTTAGTAGACGCAAGCCCGTTCGCCAGATCAAACGAGCTCAGATCCTCCA
GCACGTCATCAATACCAGGAACTTGCTCGCCTTCTTCCTCATCATCTGAACCTTCTTCAG
AATCTGAACCTGTTTCTGGATTAGTGTTGTCCTCTTCGGTCATCCCAGGCGGCATTGCAA
AATGCGGCAGCTTACCTCCAATGTAATCTTTTAGAATCTGCCTCGCTGCTTTGGTTTCAT
CAGGTAGTCCACTAGATGCGACGTAGCCACGTGAAGCACAGTAAGCTCTCAGAAGCTCAG
CAGCAAGAGGAGGACGGGACTGACGCTCATATGTTTTGGGTTTGGGGAGAGTAATGTTGT
AGACGCTTTCGATAGGAAGTGCTTTGTTTTTCCCGGGGTGGAGGTGACACCTGTTCATTT
CTGACCGACCAATGCGTTGATCGTAGAGCTCTTCCCCACGTTAGGGTACCCTACAAATCC
AACCACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ11JQ U 42
AF RR4EB24JQ U 1
AF RR4EB24TF C 109
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BS 614 849 RR4EB24TF

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CACACTATAAATAAAACATTAAAAAAAACTTTGAAGTATCTTCTTTTGACAATACACACC
ATCTTGTATATCATAAACTTTGGATGTTATACAATATGGTGAGATCAACGCATTGTGAGA
GGCCCTGTGTTAGCAGGTTTCTGGAAAACTCCGACCAGAGGCATCCCATCTCCATCCTCT
GTGTTTTTAACCCTCCAGTTCCTATCCTTCTTCCTCTGCGGCTTCTTGTGCTGTTTATGT
GAAGCTGTTTCCTTCTTCACCCTCACTTTCTTAGTAGACGCAAGCCCGTTCGCCAGATCA
AACGAGCTCAGATCCTCCAGCACGTCATCAATACCAGGAACTTGCTCGCCTTCTTCCTCA
TCATCTGAACCTTCTTCAGAATCTGAACCTGTTTCTGGA

QA 1 459 1 459
DS 

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CATCAATAGATTCGAAAACCTACAACAGGTTCAACTGTTATCACACTATAAATAAAACAT
TAAAAAAAACTTTGAAGTATCTTCTTTTGACAATACACACCATCTTGTATATCATAAACT
TTGGATGTTATACAATATGGTGAGATCAACGCATTGTGAGAGGCCCTGTGTTAGCAGGTT
TCTGGAAAACTCCGACCAGAGGCATCCCATCTCCATCCTCTGTGTTTTTAACCCTCCAGT
TCCTATCCTTCTTCCTCTGCGGCTTCTTGTGCTGTTTATGTGAAGCTGTTTCCTTCTTCA
CCCTCACTTTCTTAGTAGACGCAAGCCCGTTCGCCAGATCAAACGAGCTCAGATCCTCCA
GCACGTCATCAATACCAGGAACTTGCTCGCCTTCTTCCTCATCATCTGAACCTTCTTCAG
AATCTGAACCTGTTTCTGGATTAGTGTTGTCCTCTTCGGTCATCCCAGGCGGCATTGCAA
AATGCGGCAGCTTACCTCCAATGTAATCTTTTAGAATCTGCCTCGCTGCTTTGGTTTCAT
CAGGTAGTCCACT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4EB24TF 741 0 0
ATAAAT
AAACATTAAAAAAAACTTTGAAGTATCTTCTTT*GACAATACACACCATCTTGTATATCA
TAAACTTTGGATGTTATACAATATGGTGAGATCAACGCATTGTGAGAGGCCCTGTGTTAG
CAGGTTTCTGGAAAACTCCGACCAGAGGCATCCCATCTCCATCCTCTGTGTTTTTAACCC
TCCAGTTCCTATCCTTCTTCCTCTGCGGCTTCTTGTGCTGTTTATGTGAAGCTGTTTCCT
TCTTCACCCTCACTTTCTTAGTAGACGCAAGCCCGTTCGCCAGATCAAACGAGCTCAGAT
CCTCCAGCACGTCATCAATACCAGGAACTTGCTCGCCTTCTTCCTCATCATCTGAACCTT
CTTCAGAATCTGAACCTGTTTCTGGATTAGTGTTGTCCTCTTCGGTCATCCCAGGCGGCA
TTGCAAAATGCGGCAGCTTACCTCCAATGTAATCTTTTAGAATCTGCCTCGCTGCTTTGG
TTTCATCAGGTAGTCCACTAGATGCGACGTAGCCACGTGAAGCACAGTAAGCTCTCAGAA
GCTCAGCAGCAAGAGGAGGACGGGACTGACGCTCATATGTTTTGGGTTTGGGGAGAGTAA
TGTTGTAGACGCTTTCGATAGGAAGTGCTTTGTTTTTCCCGGGGTGGAGGTGACACCTGT
TCATTTCTGACCGACCAATGCGTTGATCGTAGAGCTCTTCCCCACGTTAGGGTACCCTAC
AAATCCAACCACGGC

QA 7 741 7 741
DS 



AS 1 3

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TCAAACTTATTAGGTGAAGATATGAAAATCAAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACAT
AATATATATTGCGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTTTTAAGACCAAGCAT
TAAGAGGACAAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAGGTGAGCTTGAA
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CTTCTCGTGACTGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTGTTCCACTCTC
TCCCACTCC*CCAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAGGT
AACACTTCCAGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTCAGTTTGTCGTCCTTGGTGAA
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ACGTAATGTGATGATTGGGAGAATTGGACCAAATATTTCTTCATTCATTATCTCAGAATC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C835JQ U 10
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AF RR4H808JQB U 1
BS 1 89 RR4H808JQB
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BS 490 490 RR4C835JQ
BS 491 765 RR4H808JQB

RD RR4C835JQ 541 0 0
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TTAGGTGAAGATATGAAAATCAAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACATAATATATAT
TGCGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTTTTAAGACCAAGCATTAAGAGGAC
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TGGAGGGCATCGAGCTTCAAGATCCATTGCTAAACTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCGTG
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AGCAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTCTTGGATGTCACGTAATGT
C

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4C835TF 541 0 0
ATGTGAAAGTTGCTTATATAGAATATCTCATAGCTTGAATGACATATATTATCAAACTTA
TTAGGTGAAGATATGAAAATCAAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACATAATATATAT
TGCGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTTTTAAGACCAAGCATTAAGAGGAC
AAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAGGTGAGCTTGAAGGTGTTCCA
TGGAGGGCATCGAGCTTCAAGATCCATTGCTAAACTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCGTG
ACTGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTGTTCCACTCTCTCCCACTCC
*CCAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAGGTAACACTTCC
AGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTCAGTTTGTCGTCCTTGGTGAATGCATAGAT
AGCAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTCTTGGATGTCACGTAATGT
C

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4H808JQB 765 0 0
CTAAAATATATGTGAAAGTTGCTTATATAGAATATCTCATAGCTTGAATGACATATATTA
TCAAACTTATTAGGTGAAGATATGAAAATAAAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACAT
AATATATATTGCGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTTTTAAGACCAAGCAT
TAAGAGGACAAGCTCGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAGGTGAGCTTGAA
GGTGTTCCATGGAGGGTATCGAGCTTCAAGATCCATTGCTAAACTTCCTTCCATTATTGC
CTTCTCGTGACTGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTGTTCCACTCTC
TCCCACTCCTCCAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAGGT
AACACTTCCAGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTCAGTTTGTCGTCCTTGGTGAA
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ACGTAATGTGATGATTGGGAGAATTGGACCAAATATTTCTTCATTCATTATCTCAGAATC
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GGACTTGTAAGACAGATACCGTGTGACGCAAGAAACATGATTAAATCAAAACTATACAGC
TTCTCTTCATCCATGGAGCCTCCATAGACGATTGAAGCTTGAACA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

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GGTTACCACTTACCACAAGTAAAGAGAAACAGAAGACAACGAAACCTAATAGTTTCAAAT
TACATGACGAATGTATCTAATACCTAAACATGTAAATAAAAGAGAGAGAGACGATGCGTT
TGTGTGTACCCATGTATGCACCTAGTGAACATTTCTTTTACTACTTTCAAAAACCACTAG
AATAAAGGAGATTCATTTGGTGAATTTCGCGATCAATTTGTCGACGTGGATAATGATATC
GCCAATGCGCGGCCGAACCGCGGCCTGAGGTTGCAACATCCAAGTCACGAACTGGTGAAG
AGCTTCAGGATAAGAAGCCTTTGGTCATGCATTTGGCCATTTAATCTGAGCGTTCACGAT
TGCTAGCTGAAGACTTCCACCAGATTCTCCAAGTGCATATTCAAATGGAGGCATACCATA
CATTATTGCATATAATGTGCAGCCTAGTGACCAGATGTCTGTTCTCTCATCGATATCTAC
ATGGCTTGGGCAGTCCCAGAGCTCGGGAGCTCGAAACGGTGCTGAACAATGTTCAGAGGC
CCATTCCTGTAACTGTAAAGCCTCTTGACGGGAGCGGATTTGCTTCCGTGAAGGACGAGC
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GTTTCCAGGTTTGACATCGTTGTGAGCATATGGTGGATCCAGAGAGTGCATGTGTTCGAG
TCCATCACAAAGCTGACGAAATATATGCAAAACATCAGTTGTTGAGAATGATTCCTTTCT
AGCCTTCATAGAAGTGGAGTTATCCAGTAAGGTCCCATCCAGGTGAACAGGAAATAGCAA
GAAGGCCTCGTGTTTACAAGCAGCCCCTTGGCCGTCCTTAACAGAGATAATGGCGTGATC
AAGGAGAGGAAGCAAATTAGGGTGGTTGAACAAGGATGAAACACGAATCTCCTCCCGTAC
AAGTTCCAGCTGCTCCTTGTTCTGAATCAGAACTTTCTTCACAGCATAAGTTCCATCAGC
GGAGCGATGAGACGGATCCTTTAGAGTTAAGCATTCAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B479JQ U 1
AF RR4B820JQ U 1
AF RR4B820TF C 251
BS 1 863 RR4B479JQ
BS 864 1121 RR4B820TF

RD RR4B479JQ 866 0 0
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CCA

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TACATGACGAATGTATCTAATACCTAAACATGTAAATAAAAGAGAGAGAGACGATGCGTT
TGTGTGTACCCATGTATGCACCTAGTGAACATTTCTTTTACTACTTTCAAAAACCACTAG
AATAAAGGAGATTCATTTGGTGAATTTCGCGATCAATTTGTCGACGTGGATAATGATATC
GCCAATGCGCGGCCGAACCGCGGCCTGAGGTTGCAACATCCAAGTCACGAACTGGTGAAG
AGCTTCAGGATAAGAAGCCTTTGGTCATGCATTTGGCCATTTAATCTGAGCGTTCACGAT
TGCTAGCTGAAGACTTCCACCAGATTCTCCAAGTGCATATTCAAATGGAGGCATACCATA
CATTATTGCATATAATGTGCAGCCTAGTGACCAGATGTCTGTTCTCTCATCGATATCTAC
ATGGCTTGGGCAGTCCCAGAGCTCGGGAGCTCGAAACGGTGCTGAACAATGTTCAGAGGC
CCATTCCTGTAACTGTAAAGCCTCTTGACGGGAGCGGATTTGCTTCCGTGAAGGACGAGC
ACTCCCAAAGTCCATCAAAATCGCAAGAGGAGGCTGTCCGTTTCTACGTGTTAAAAGCAC
GTTTCCAGGTTTGACATCGTTGTGAGCATATGGTGGATCCAGAGAGTGCATGTGTTCGAG
TCCATCACAAAGCTGACGAAATATATGCAAAACATCAGTTGTTGAGAATGATTCCTTTCT
AGCCTTCATAGAAGTGGAGTTAT

QA 1 863 1 863
DS 

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AGAGATCATTGTG
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C*TGAGGTTGCAACATCCAAGTCACGAACTGGTGAAGAGCTTCAGGATAAGAAGC*TTTG
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ATTCTCCAAGTGCATATTCAAATGGAGGCATACCATACATTATTGCATATAATGTGCAGC
CTAGTGACCAGATGTCTGTTCTCTCATCGATATCTACATGGCTTGGGCAGTCCCAGAGCT
CGGGAGCTCGAAACGGTGCTGAACAATGTTCAGAGGCCCATTCCTGTAACTGTAAAGCCT
CTTGACGGGAGCGGATTTGCTTCCGTGAAGGACGAGCACTCCCAAAGTCCATCAAAATCG
CAAGAGGAGGCTGTCCGTTTCTACGTGTTAAAAGCACGTTTCCAGGTTTGACATCGTTGT
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TATGCAAAACATCAGTTGTTGAGAATGATTCCTTTCTAGCCTTCATAGAAGTGGAGTTAT
CCAGTAAGGTCCCATCCAGGTGAACAGGAAATAGCAAGAAGGCCTCGTGTTTACAAGCAG
CCCCTTGGCCGTCCTTAACAGAGATAATGGCGTGATCAAGGAGAGGAAGCAAATTAGGGT
GGTTGAACAAGGATGAAACACGAATCTCCTCCCGTACAAGTTCCAGCTGCTCCTTGTTCT
GAATCAGAACTTTCTTCACAGCATAAGTTCCATCAGCGGAGCGATGAGACGGATCCTTTA
GAGTTAAGCATTCAATCC

QA 14 871 14 871
DS 



AS 1 3

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CAACAGAGAAGACATCAAAGCGGGTAAAAGGAAAAATGGTGGTGAAACCAACGGTAGCTT
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CTGCTGGGGGTGTTAAGCTCGGTGCAGCTGCTACAGCCATGACCGTGGCTGCAACCGCAG
CTGTGTCTGGATCTAAGCAAGATCAAAAGGATGATGCCCTCAAGAAGAAGACACCACCTT
CTAAATGAATAATGTTACTCATCTATGTAATTCTTCTTCCTTGAACCAGATCAATAAAAT
AAGAGGAAACTTCATGGTAGTTTTATTGAAGTACTTCGGTTTCTTCTGCAACAAAATTGT
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ATAAGGATTTAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D726JQ C 11
AF RR4D726TF U 11
AF RR4F605TF U 1
BS 1 245 RR4F605TF
BS 246 246 RR4D726TF
BS 247 348 RR4F605TF
BS 349 349 RR4D726TF
BS 350 492 RR4F605TF

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GG
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CATGGTAGTTTTATTGAAGTACTTCGGTTTCTTCTGCAACAAAATTGTTTTGGTTGTTGA
ATATTTTCATGAGTATCTACAACTTCTT
GC

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DS 

RD RR4D726TF 452 0 0
GG
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CATCAAAGCGGGTAAAAGGAAAAATGGTGGTGAAACCAACGGTAGCTTTGAGAGGCATCC
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CATGGTAGTTTTATTGAAGTACTTCGGTTTCTTCTGCAACAAAATTGTTTTGGTTGTTGA
ATATTTTCATGAGTATCTACAACTTCTT
GC

QA 3 450 3 450
DS 

RD RR4F605TF 492 0 0
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CTGCTGGGGGTGTTAAGCTCGGTGCAGCTGCTACAGCCATGACCGTGGCTGCAACCGCAG
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CTAAATGAATAATGTTACTCATCTATGTAATTCTTCTTCCTTGAACCAAATCAATAAAAT
AAGAGGAAACTTCATGGTAGTTTTATTGAAGTACTTCGGTTTCTTCTGCAACAAAATTGT
TTTGGTTGTTGAATATTTTCATGAGTATCTACAACTTCTTACAAGCATTATTTTTATAAC
ATAAGGATTTAT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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CCTTGCCGTGTCCGAGAAATAAAAATAGTTGAAACTTTGCCTCAATTCCCCTCCTTCAAA
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CTGGTTCTCTAAGTTATATAGAAAAGTTTAGAGCTTTGATTGGGCAGAGAGATCATAAGA
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TGAGGGAGAAGATACTAAGTTTGTTAGATACGTGGCAAGAAGCTTTTGGTGGACGTGATG
GTCAATACCCACAATACTACAATGCATAATGAACTCAGTCTACTGGGAATTGAGTTTCCA
CCAAGAACGGAAAGTAGTATGTCCTTCTTTACTCCACCTCAGACTCAGCCCATTCCATTA
GACGAAGATGCTGCTATTGAGGCGTCACTGCAAGGAGATGATGCTTCTAGCTTCAGTATG
GAAGAGATTCAGAGTGCTGAGGGATCTGTTGATGTTTTGATGGACATTCTTGGAGCACTT
GATCCCGCTAATCCTGATGGATTGAAAGAAGATCTTATAGTTGATTTAGTTGAGCAATGT
CGTACTTATCAAAAACGTGTTATGACTCTTGTCAACACCACAACAGACGAGGAGCTTCTT
TGCCAGGGATTGGCATTGAACGATAACTTGCAGCGTGTTCTTCAGCGTCACGACGATATC
GCCTCTGTTCCTTTAAATGAAAGCAGCACAACAACTCCTCCAGCTCAGCTAGTCAGCATC
AATCATGATGATGACGAAGACGATGAATCAGATGATGATTTTGCTCAGCTATCTCACAGG
TCTAAAAGAGATTCCAGCCCTATTCTTCCTCCACCACCACCACCTCCAGTACACGGTACT
ACTGAGTCAAGTATGGTGGATTTCCTTAGTGGTGATGTCTATAAACCTCAAGGCTCCTCA
CAGGGAGTAGTCAAGCAGCAGCGGCCTTCTCCTCCTCATCCTGCTCCTCCTACTACTACT
GCTGCTGCTGCGTCGTCTTCTCCGCTAAGAAAATCTCCTGTGCAACCTCCTCCTGCACCA
TGGGATACTGAGGTTATCAGGAATCTTCCACCTCCGCCTTCAAGGCACAACCAGAGGCAA
CAGTTCTTTGAGCATCATCATCACTCGAGTAGCGGCTCTGATTCCTCTTACGATGGTCTT
GTTGGACAGACCAGGAACCTCTCTATGAATAATAGCGAAACCAAGAAAGCAGGGGATACG
CTTTTCAAAGACTTGGTTGAGTTTGCCAAAACTAGGTCATCCAAGCCCAAACATTAGGTC
TCTTTGAGTCTTTTGCTTTGTGTGACAATCATTGCTTTAACAAACATATGATATTACAGT
ATGCCTTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI58TF U 1
AF RR4DT96TF U 663
AF RR4FI58JQ C 1059
BS 1 744 RR4FI58TF
BS 745 1094 RR4DT96TF
BS 1095 1095 RR4FI58JQ
BS 1096 1193 RR4DT96TF
BS 1194 1194 RR4FI58JQ
BS 1195 1222 RR4DT96TF
BS 1223 1691 RR4FI58JQ

RD RR4FI58TF 744 0 0
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CCTTGCCGTGTCCGAGAAATAAAAATAGTTGAAACTTTGCCTCAATTCCCCTCCTTCAAA
TTGTTTCCTCTCTTTCCGAATCCTGAGCCATTACGATTCTTCTCTTGTTCCACTCTTCTT
CTGGTTCTCTAAGTTATATAGAAAAGTTTAGAGCTTTGATTGGGCAGAGAGATCATAAGA
TGGCGAATGATGCGGCTGCATGTGCAGAGAGAGCTACAAACGATATTTTGATTGGTCCTG
ACTGGGCTATTAACATTGAACTATGTGATATTATCAACATGAACCCTAGTCAAGCGAAAG
AAGCAGTGAAGGTGCTTAAGAATCGGTTAGGAAGTAGAAACTCTAAAGTCCAGATTCTTG
CTCTTTATGCGTTGGAGACTTTAAGTAAGAACTGTGGGGAGAACGTGTGTAAGCTTATCA
TAGACCGTAATGTTTTGACTGATATGGTCAAAATAGTGAAGAAAAAGCCGGATTTGAATG
TGAGGGAGAAGATACTAAGTTTGTTAGATACGTGGCAAGAAGCTTTTGGTGGACGTGATG
GTCAATACCCACAATACTACAATGCATAATGAACTCAGTCTACTGGGAATTGAGTTTCCA
CCAAGAACGGAAAGTAGTATGTCCTTCTTTACTCCACCTCAGACTCAGCCCATTCCATTA
GACGAAGATGCTGCTATTGAGGCG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DT96TF 560 0 0
GC
GAACGGAAAGTAGTATGTCCTTCTTTACTCCACCTCAGACTCAGCCCATTCCATTAGATG
AAGATGCTGCTATTGAGGCGTCACTGCAAGGAGATGATGCTTCTAGCTTCAGTATGGAAG
AGATTCAGAGTGCTGAGGGATCTGTTGATGTTTTGATGGACATTCTTGGAGCACTTGATC
CCGCTAATCCTGATGGATTGAAAGAAGATCTTATAGTTGATTTAGTTGAGCAATGTCGTA
CTTATCAAAAACGTGTTATGACTCTTGTCAACACCACAACAGACGAGGAGCTTCTTTGCC
AGGGATTGGCATTGAACGATAACTTGCAGCGTGTTCTTCAGCGTCACGACGATATCGCCT
CTGTTCCTTTAAATGAAAGCAGCACAACAACTCCTCCAGCTCAGCTAGTCAGCATCAATC
ATGATGATGATGAAGACGATGAATCAGATGATGATTTTGCTCAGCTATCTCACAGGTCTA
AAAGAGATTCCAGCCCTATTCTTCCTCCACCACCACCACCTCCAGTACATGGTACTACTG
AGTCAAGTATGGTGGATT

QA 3 560 3 560
DS 

RD RR4FI58JQ 633 0 0
TCCAGCTCAGCTAGTCAGCATCAATCATGATGATGACGAAGACGATGAATCAGATGATGA
TTTTGCTCAGCTATCTCACAGGTCTAAAAGAGATTCCAGCCCTATTCTTCCTCCACCACC
ACCACCTCCAGTACACGGTACTACTGAGTCAAGTATGGTGGATTTCCTTAGTGGTGATGT
CTATAAACCTCAAGGCTCCTCACAGGGAGTAGTCAAGCAGCAGCGGCCTTCTCCTCCTCA
TCCTGCTCCTCCTACTACTACTGCTGCTGCTGCGTCGTCTTCTCCGCTAAGAAAATCTCC
TGTGCAACCTCCTCCTGCACCATGGGATACTGAGGTTATCAGGAATCTTCCACCTCCGCC
TTCAAGGCACAACCAGAGGCAACAGTTCTTTGAGCATCATCATCACTCGAGTAGCGGCTC
TGATTCCTCTTACGATGGTCTTGTTGGACAGACCAGGAACCTCTCTATGAATAATAGCGA
AACCAAGAAAGCAGGGGATACGCTTTTCAAAGACTTGGTTGAGTTTGCCAAAACTAGGTC
ATCCAAGCCCAAACATTAGGTCTCTTTGAGTCTTTTGCTTTGTGTGACAATCATTGCTTT
AACAAACATATGATATTACAGTATGCCTTTTTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 3

CO CL3733Contig1 1474 3 21 U
GGGGACAAAGATAGCTAGAGACTGACTCTTGTCTCATTCTTCACTCTCTTTCGGACACGG
ACACCCGAAAGGCTCGTCCTTTATTTTCTCCGACACAAACAACCGGAACCGTCGTTAGGA
GAGTAATGGGTTACATAGGAGCACATGGTGTAGCAGCTCTTCATAGGTACAAATACAGTG
GAGTGGATCACTCTTATCTTGCCAAATACCTTCTCAACCCTTTTTGGACTCGTTTTGTCA
AAGTCTTCCCTCTATGGATGCCACCAAACATGGTAACGCTTATGGGGTTCATGTTTCTAG
TCACATCTTCACTCCTAGGATACATATATTCACCTCAGTTGGATTCTCCTTCTCCACGAT
GGGTGCACTTCGCACATGGTTTGCTTCTTTTCTTGTATCAGACATTTGATGCGGTTGATG
GGAAGCAAGCAAGAAGAACGAACTCCTCCAGCCCCCTAGGAGAGCTTTTTGATCATGGTT
GCGATGCACTTGCTTGTGCGTTTGAAGCAATGGCGTTTGGAAGCACTGCAATGTGTGGAA
GAGATACTTTCTGGTTCTGGGTTATTTCAGCTATTCCCTTCTATGGAGCTACATGGGAAC
ACTATTTCACCAACACGCTTATTCTTCCGGTCATTAATGGACCTACAGAGGGTCTTGCAC
TCATATATGTCAGCCACTTATTCACAGCCCTTGTCAGTGCTGAATGGTGGGCTCAGCAGT
TAGGGGAGTCCATACCCTTGTTTAGTTGGGTGCCATTTGTGAATGCCATCCAAACTTCAA
GAGCAGTACTATGCATGATGATCGCTTTTGCTGTTATACCAACC*GTTGCATTCAATGTG
TCAAATGTCTATAAAGTTGTTCAATCAAGAAAAGGGAGCATGGTGCTAGCATTAGCTATG
CTGTATCCTTTCGTGGTTCTTCTTGGAGGTGTTTTGATATGGGATTACTTGTCTCCAATC
AATCTCATAGCAACATACCCTCACTTAGTTGTACTTGGAACTGGACTTGCCTTTGGACTT
CTAGTGGGAAGAATGATTCTTGCTCATTTGTGTGATGAGCCTAAAGGATTGAAAACAAAC
ATGTGCTTGTCTCTAGTCTATCTTCCTTTTGCACTTGCAAACGCTCTAACCGCAAGATTA
AATGCTGGGGTTCCTCTTGTCGACGAGTTATGGGTTCTTCTTGGCTACTGCATATTCACA
GTGTCGTTATGCTTGCACTTTGCCACATCGGTCATACATGAGATCACTGCGGCTCTTGGA
ATCTACTGCTTCAGGATCACTAAGAAGCTTGAAAAGAAACCCTGAGGGTAATGTTAATTG
TTTTCTTTGGACCGTTTGATCAATACGGAGAATGATCAATGTGGACCTCCTCCCTGGATC
GGTGATGTATTTCTTCTTATTCATCTTGTGTTTGTTTATTTGATCAGGATAGATGAATTT
ATGTAGAAAACTTTGTATAATGTTTTTTTTTTCG


BQ
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AF RR4A308TFB U 1
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TTTTCG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

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CCAATCACTCCCTCCGAAAATGATTTTGTTGGTCGACGGCAGCTTCTCTCCTCCGCATGC
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BQ
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BS 153 234 RR4EB49TF
BS 235 235 RR4GY81TF
BS 236 482 RR4EB49TF
BS 483 483 RR4GY81TF
BS 484 524 RR4EB49TF
BS 525 525 RR4GY81TF
BS 526 530 RR4EB49TF
BS 531 531 RR4GY81TF
BS 532 688 RR4EB49TF

RD RR4H513TF 514 0 0
GGA
GAGTTTGCCGGAGAAAGATGCAGGTGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGATCCAATCA
CTCCCTCCGAAAATGATTTTGTTGGTCGACGGCAGCTTCTCTCCTCCGCATGCTCCAGGA
TCTCCCAAGGCGACGTCGTTTCAGTCCGACCAGCTTCTTCAGTCAAGATTGGTCGAGATT
GCAAGTCGAGTTTGCATGAGTTAGCCATGAAAAGTGTCCCAAGGCGAATCTTGTTGACAA
GTATATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCG
ATCCATCTGTTGCGACAGTTGAAGATGTAAGCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTC
TTTTCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAACACTTACTCTGTTGTCA
ACATATTTGATGTGACATTACGTCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATGCCTG
AAGGAAATGGCTCTGGAGTAGTTTGGGATGA

QA 4 514 4 514
DS 

RD RR4GY81TF 635 0 0
GGA
GAGTTTGCCGGAGAAAGATGCAGGTGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGATCCAATCA
CTCCCTCCGAAAATGATTTTGTTGGTCGACGGCAGCTTCTCTCCTCCGCATGCTCCAGGA
TCTCCCAAGGCGACGTCGTTTCAGTCCGACCAGCTTCTTCAGTCAAGATTGGTCGAGATT
GCAAGTCGAGTTTGCATGAGTTAGCCATGAAAAGTGTCCCAAGGCGAATCTTGTTGACAA
GTATATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCG
ATCCATCTGTTGCGACAGTTGAAGATGTAAGCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTC
TTTTCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAACACTTACTCTGTTGTCA
ACATATTTGATGTGACATTACGTCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATGCCTG
AAGGAAATGGCTCTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGATACATCGTGACTAATTATCACG
TTATTGGCAATGCTCTTTCAAGAAATCCAAGTCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATA
TTCTTACATCTGATGGGGTGCAGAA
AGATTTC

QA 4 628 4 628
DS 

RD RR4EB49TF 688 0 0
GGGGTCTGAGTTTGCCAGAGAAAGATGCAGGTGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGAT
CCAATCACTCCCTCCGAGAATGACTTTGTTGGTCGACGGCAGCTTCTCTCCTCCGCATGC
TCCAGAATCTCCCAAGGCGACGTCGTTTCAGACCGACCAGCTTCTTCAGTCAAGATTGGT
CGAGATTGCAAGTCGAGTTTGCATGAGTTAGCCATGAAAAGTGTCCCAAGGCGAGTCTTG
TTGACAAGTATATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCA
CTTGGCGATCCATCTGTTGCGACAGTTGAAGATGTAAGCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCT
GGACCTCTTTTCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAACACTTACTCT
GTTGTCAACATATTTGATGTGACATTACGTCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAG
ATACCTGAAGGAAATGGCTCTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGGTACATTGTGACCAAT
TATCACGTTATTGGCAATGCTCTCTCAAGAAATCCAAGCCCTGGTGATGTAGTTGGTCGT
GTCAATATTCTTACATCTGATGGGGTGCAGAAGAATTTCGAAGGGAAACTTGTTGGTGCT
GATCGTGCTAAGATCTTGCTGTCTTGAA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL3735Contig1 916 2 2 U
GGTCTGGTTCAATTATTTCATAAGATTTGACAGCAAATAACAAAGTTAAAAGGGAGAATC
TAAAGAGTCAAAAGTACATTGAAGACGAAAACAAAAGTTGATGGAACATATGCTGCTAAA
GAAAGTCTAATTGTAGACCATATACTTGGGAGTGGCACTGAACTTCTGATAACCTTTGAT
GACTTTGTTCACTGCGTCCAGAAAGTCTTTCTCAGTCACAGTCTTTCTCCTAGCTCTGAT
CGCATACATTCCAGCCTCAGTGCACACACTTCTGATATCAGCTCCAGTTGAGTTCGGGCA
GAAACGAACAAGGAGTTCGTAACGGATGTCTCTCTCGCAGTTCATGGTTCTTGTGTGAAT
CTTGAAGATCTGTGTTCTGCTCTCCAGATCAGGAAGACCAAACTCAACCTTACGGTCAAG
ACGTCCAGGACGTAAAAAAACAGGGTCCAGCGTGTCAGGCCTGTTTGTTGCCATAAGAAC
CTTGATGTTACCCCGTGCGTCAAACCCATCAAGCTGATTCACAATCTCAAGCATAGTACG
TTGGACTTCGTTATCACCTCCCGCACCGTCATCAAATCTTGCACCACCAATGGCATCAAC
TTCATCAAAGAACACAATGCAAGCTTTTTTGGACCGAGCCATCTGAAACAATTCACGAAC
CATCCTAGCTCCCTCACCGACATACTTCTGGACAAGCTCACTGCCAATAACTCTGATAAA
GCAAGCATCGGTTCTATTAGCAACGGCTCTTGCCAAAAGGGTTTTACCGGTACCAGGAGG
ACCGTAGCAGAGAACTCCCTTGGGAGGATCTATTCCAAGCTTCACAAACTTCTCTGGATG
AAGCATTGGCAGCTCAACCACCTCTCTCATCTTCTCAATCTGCTCCTTGCAGCCACCAAC
GTCATTGTACGTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY76JQ U 1
AF RR4CF40TF C 185
BS 1 718 RR4CY76JQ
BS 719 916 RR4CF40TF

RD RR4CY76JQ 718 0 0
GGTCTGGTTCAATTATTTCATAAGATTTGACAGCAAATAACAAAGTTAAAAGGGAGAATC
TAAAGAGTCAAAAGTACATTGAAGACGAAAACAAAAGTTGATGGAACATATGCTGCTAAA
GAAAGTCTAATTGTAGACCATATACTTGGGAGTGGCACTGAACTTCTGATAACCTTTGAT
GACTTTGTTCACTGCGTCCAGAAAGTCTTTCTCAGTCACAGTCTTTCTCCTAGCTCTGAT
CGCATACATTCCAGCCTCAGTGCACACACTTCTGATATCAGCTCCAGTTGAGTTCGGGCA
GAAACGAACAAGGAGTTCGTAACGGATGTCTCTCTCGCAGTTCATGGTTCTTGTGTGAAT
CTTGAAGATCTGTGTTCTGCTCTCCAGATCAGGAAGACCAAACTCAACCTTACGGTCAAG
ACGTCCAGGACGTAAAAAAACAGGGTCCAGCGTGTCAGGCCTGTTTGTTGCCATAAGAAC
CTTGATGTTACCCCGTGCGTCAAACCCATCAAGCTGATTCACAATCTCAAGCATAGTACG
TTGGACTTCGTTATCACCTCCCGCACCGTCATCAAATCTTGCACCACCAATGGCATCAAC
TTCATCAAAGAACACAATGCAAGCTTTTTTGGACCGAGCCATCTGAAACAATTCACGAAC
CATCCTAGCTCCCTCACCGACATACTTCTGGACAAGCTCACTGCCAATAACTCTGATA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4CF40TF 732 0 0
TTT
TTCACTGCGTCCAGAAAGTCTTTCTCAGTCACAGTCTTTCTCCTAGCTCTGATCGCATAC
ATTCCAGCCTCAGTGCACACACTTCTGATATCAGCTCCAGTTGAGTTCGGGCAGAGACGA
GCAAGGAGTTCGTAACGGATGTCTCTCTCGCAGTTCATGGTTCTTGTGTGAATCTTGAAG
ATCTGTGTTCTGCTCTCCAGATCAGGAAGACCAAACTCAACCTTACGGTCAAGACGTCCA
GGACGTAGAAGAGCAGGGTCCAGCGTGTCAGGCCTGTTTGTTGCCATAAGAACCTTGATG
TTACCCCGTGCGTCAAACCCATCAAGCTGATTCACAATCTCAAGCATAGTACGTTGGACT
TCGTTATCACCTCCCGCACCGTCATCAAATCTTGCACCACCAATGGCATCAACTTCATCA
AAGAACACAATGCAAGCTTTTTTGGACCGAGCCATCTGAAACAATTCACGAACCATCCTA
GCTCCCTCACCGACATACTTCTGGACAAGCTCACTGCCAATAACTCTGATAAAGCAAGCA
TCGGTTCTATTAGCAACGGCTCTTGCCAAAAGGGTTTTACCGGTACCAGGAGGACCGTAG
CAGAGAACTCCCTTGGGAGGATCTATTCCAAGCTTCACAAACTTCTCTGGATGAAGCATT
GGCAGCTCAACCACCTCTCTCATCTTCTCAATCTGCTCCTTGCAGCCACCAACGTCATTG
TACGTAACC

QA 4 732 4 732
DS 



AS 1 3

CO CL3736Contig1 1391 3 7 U
GGAGTGACCTTTTGTCTTTTCTTCAATTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTTTCATTCTGGTTC
CAACAATATGTATGCAATGAAAGAAGAAGACTGTCTTCAAACGTTTCACAACTTACAAGA
CTATCAAGACCCGTTTCTTCTTCAACACCATCCACAAATCCTGCCTTGGTCATCTCTACC
TTCATTTGACCCGAGCTATTTCCCATCCAACCAGACCCGTCATCCTGATCCTGTCCCCTA
TTTCAATAGAAGAGCTTCTTCGTCCTCTTTTTTTGACTATACCGATGGTTTCGTCTCTCC
CCCTTCCATGGATCGTCATCATCCCAATCATCTAAGGGTTTTATCGGAAGCTCTTGGACC
CATCATGCGACGTGGCTCATCCTTCGGGTTTGAAGATGAGATTATGGGAAAACTGAGTGC
ACAAGAAGTCATGGATGCTAAGGCACTGGCTGCTTCGAAGAGTCATAGTGAAGCTGAGAG
AAGAAGACGAGAGAGAATCAACACTCATCTAGCTAACTTGCGAAGTATTTTACCAAATAC
AACCAAAACGGACAAAGCTTCGCTGCTAGCGGAAGTGATCCAACACATGAAGGAGTTAAA
ACGACAGACATCACTGATCACAGACACCAGTCAACTCCCAACAGAGTGCGATGATCTGAC
CGTTGACTCTACTTACAACGACGAAGAAAGAAACTTGATGATAAGAGTTTCCTTTTGCTG
CGAAGACAGGACTGAACTCATGCATGACATCATCACTGCCTTAAAGTCTCTTCATCTCCG
AACTCTCAAAGCCGAGATCGCAACCGTAGGTGGTCGAATCAAGAACGTCTTGTTCTTGAG
CCGAGAAGACGATGATGAATATCGTAGAAACTTCGATGGTATTGACGTGGATAATGATGA
TGAAGAGAAGAGATGTAATCGCGTGAGTTCTATAGAAGAAGCGTTAAAAGCGGTTATAGA
GAAATGTGTCAAAAACGATGATGATAACAATAACTTGGATAAATCATCTTCAGGGAGTAC
TAAGAGGCAAAGGACTAGCAAGATGGTAAACCGAGGTTATAATTAGTTAATCCTCCCACA
ATATTATTGTTTAGATCATCGTCTTTAATTAATGTGTTAATTAGACTTGCAAATTGGGAT
TATGTGATAATTAGTATTTTTGGAGGGAGGGGGGGGGGGGGGATCGCTAGTCCTTTTTAA
TTGTATTTGGGTTTCTTCTTTTATGTTTTTAATCTATGAAGGACCCTTTATCTAGGGTTT
AATAGTGATGGGTTTGGTTTATATATGTATTATCATCAATATATTTTTCTCGTCTTGATT
AATATATGAAATGTAAAGAGGTTGGGTTTGTATTACTTGATGGAGTGGAATCAAGAACCT
TTCTTAATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV36TF U 1
AF RR4H326TF U 601
AF RR4H326JQ C 779
BS 1 720 RR4AV36TF
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BS 752 809 RR4AV36TF
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RD RR4AV36TF 809 0 0
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TTTCAATAGAAGAGCTTCTTCGTCCTCTTTTTTTGACTATACCGATGGTTTCGTCTCTCC
CCCTTCCATGGATCGTCATCATCCCAATCATCTAAGGGTTTTATCGGAAGCTCTTGGACC
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AACTCTCAAAGCCGAGATCGCAACCGTAG

QA 1 809 1 809
DS 

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AGGG
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CTCAAAGCCGAGATCGCAACCGTAGGTGGTCGAATCAAGAACGTCTTGTTCTTGAGCCGA
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AGGCAAAGGACTAGCAAGATGGTAAACCGAGGTTATAATTAGTTAATCCTCCCACAATAT
TATTGTTTAGATCATCGTCTTTAATTAATGTGTTAATTAGACTTGCAAATTGGGATTATG
TG

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ATTATGTGATAATTAGTATTTTTGGAGGGAGGGGGGGGGGGGGGATCGCTAGTCCTTTTT
AATTGTATTTGGGTTTCTTCTTTTATGTTTTTAATCTATGAAGGACCCTTTATCTAGGGT
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TTAATATATGAAATGTAAAGAGGTTGGGTTTGTATTACTTGATGGAGTGGAATCAAGAAC
CTTTCTTAATTAG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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ATTAGGAAGAAGAAGAAGATTATGCGATCTGTGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAG
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ACCATCCCTATCTCTTCTTATCTTTCTCTCCTCGCATTGCCTTGTATGGTTTGAATATTA
ATTTAAAAGAAAAAAACGATTGTGTTGTGAT


BQ
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AF RR4ED39TF U 1
AF RR4ED39JQ C 12
BS 1 589 RR4ED39TF
BS 590 631 RR4ED39JQ

RD RR4ED39TF 589 0 0
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AACAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCTCAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTA
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TGGGACAGATTGTTGAGAAGGTTTCTGAGGAGCGACTTATAACGCTGTTGGAACAAATAA
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ATTAGGAAGAAGAAGAAGATTATGCGATCTGTGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAG
ATGTACTTACTGTGAAATATGTTTATTGTGGGTGAATCTTAATACTCTTCCAAATGAGAT
CATAAAAGTAATCTCAAACTGAAACTCTTTATTTTATCCTTTTTGGCATTTCTTCTGTGA
ACCATCCCTATCTCTTCTTATCTTTCTCTCCTCGCATTGCCTTGTATGG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4ED39JQ 620 0 0
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CTTAGTCAAATATTGTCTTCCCAAGCCCGTGAGAGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAA
CCGGAGAAAGCTAAAGGTGTAGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATT
GTTGAGAAGGTTTCTGAGGAGCGACTTATAACGCTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACA
ACCAAACAGACAAAGGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAA
GAAGAAGATTATGCGATCTGTGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAGATGTACTTACT
GTGAAATATGTTTATTGTGGGTGAATCTTAATACTCTTCCAAATGAGATCATAAAAGTAA
TCTCAAACTGAAACTCTTTATTTTATCCTTTTTGGCATTTCTTCTGTGAACCATCCCTAT
CTCTTCTTATCTTTCTCTCCTCGCATTGCCTTGTATGGTTTGAATATTAATTTAAAAGAA
AAAAACGATTGTGTTGTGAT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL3738Contig1 673 2 6 U
ACAAATGGTTAGAAGAGGGGTTTACTGAGAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTTACTGATTC
AGAAATGGGGTCGATCTTCTGCTGCTTCTACAGCTGTTTCCATTGTTGATGCTATAAAGT
CTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTGACTGGTTTTCGACTGGGGTGTACACAAATGGAA
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AGTCGGAAGCAGAACTGTTGGCTGAGAAGCAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGAGGGCA
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CTCATTTATGTGTGATTTTACTTGAGAAATCCATCAAAAGTCATATACAGTAGTGTTTGT
AAAACATCTGCTTTATTTTAGTTCCAAACACACAAACTATGTAATGCATATCTAATGTCA
AACACACAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR06TF U 1
AF RR4BF54JQ C 17
BS 1 266 RR4CR06TF
BS 267 267 RR4BF54JQ
BS 268 446 RR4CR06TF
BS 447 447 RR4BF54JQ
BS 448 507 RR4CR06TF
BS 508 673 RR4BF54JQ

RD RR4CR06TF 507 0 0
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AGAAATGGGGTCGATCTTCTGCTGCTTCTACAGCTGTTTCCATTGTTGATGCTATAAAGT
CTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTGACTGGTTTTCGACTGGGGTGTACACAAATGGAA
ATCCTTATGGTATTGCTGAAGACCTTGTTTTCAGCATGCCATGCAGGTCAAAGGGGGATG
GAGATTATGAACTTGTCAAGGATGTA*AAATTGATGACTACCTTCGCAAACGAATCGCCA
AGTCGGAAGCAGAACTGTTGGCTGAGAAGCAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGAGGGCA
TTGCCTTCTGTGATCTTGGTCCAGTAGATACTATGCTTCCTGGTGAAGTTTGATTTGGGT
GAGGACGTTGAGAATCTCAACTCAAA*GTAAGCATATTATCTTCTGGGTGTTAAGCTGTA
CAGAGCACACCCACTTTACTCATGTTG

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4BF54JQ 657 0 0
GGGGTTTACTGAGAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTTACTGATTCAGAAATGGGGTCGATC
TTCTGCTGCTTCTACAGCTGTTTCCATTGTTGATGCTATAAAGTCTCTTGTAACTCCTAC
TCCTGAGGGTGACTGGTTTTCGACTGGGGTGTACACAAATGGAAATCCTTATGGTATTGC
TGAAGACCTTGTTTTCAGCATGCCATGCAGGTCAAAGGGGGATGGAGATTATGAACTTGT
CAAGGATGTAGAAATTGATGACTACCTTCGCAAACGAATCGCCAAGTCGGAAGCAGAACT
GTTGGCTGAGAAGCAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGAGGGCATTGCCTTCTGTGATCT
TGGTCCAGTAGATACTATGCTTCCTGGTGAAGTTTGATTTTGGTGAGGACGTTGAGAATC
TCAACTCAAAAGTAAGCATATTATCTTCTGGGTGTTAAGCTGTACAGAGCACACCCACTT
TACTCATGTTGATTGGTCGCCGGAATAAGTGAATGAACTCTTCTCTCATTTATGTGTGAT
TTTACTTGAGAAATCCATCAAAAGTCATATACAGTAGTGTTTGTAAAACATCTGCTTTAT
TTTAGTTCCAAACACACAAACTATGTAATGCATATCTAATGTCAAACACACAAACCG

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL3739Contig1 990 2 6 U
ACTCCTCGGTGAAATTCATTGATTCATAACAACATTACAGGGTAGAATAACAAAGCCAGC
GAGCCTACAAAGCCCCCGGAGACAACAGCTAGCGGAATACAACTTCCCTAGAGACTAAGC
CGGCGGACAAAGAACAAGTCCCCAGAAACTATAAACAGTCATACAAGCTAATACTTTAAA
AATACAGTTCAGATCTAACCACAAACAGCAACTAAAAGGCTAAGAACAAACGGGATAAGG
AGGACATGAAGGAACACCACCTTCCCAAGTCGTAATTATTGATGGAGACCAAACGCAAGA
CTCTTACTAATGCTCCAACCCACACTAACCCACAATAGGAGCCCTGAGCCAAACCGAACT
GGAACTCCAAGGAAGTCTCAGAGAAGACCTTTCTTTTACCTGACGACTTCCAAACGACGA
GATGATCAAAGAGCATAAGCTCCACATCCAAAGAAAGAAGCCGGAGATCCTCTGTAACAG
AAGAAGAAACCGGCAAAAGAGATAACCGAACCGTTGCAACGATTCAAGGATGAGCGTTCC
TCCTGAACCCGTTTTCTTCACCAACAGCGCTGACAATAACACCGACGAAACTAGAGAGGA
TTAACATGGAGAAAGAGGCGGAGCAGACCAAGAAACCCTAGATCTCAGATCCGATGACCT
AAAGCCAAGGATAATCAACAATAGCAATGAAGCGAGGTCTCAGAATGGATGCAACCAAAC
CACAACCCAAAGAACCACTCTCACGGAATCGATCCAGATCTAGATTTGAAATTTTTAAAA
GCAAAGCTTGATCAAAAGGATATAAACAACTAAAAAGGAAACAGAGCAAAGAAATAAACA
AGATCCGACCGACGCCGTTGCTAAGAGAGCCAACCAACGTCGGTCAGACAACAGATAATT
TGATCGGAGGCAAGGAGAGAAGACAGAGTTTTTCTAGAGAGAGGTAAGTTCAGATCTTTA
CTAGAAAGTATCTAATGGATTCTATTTGAG


BQ
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AF RR4FJ15JQ U 1
AF RR4CF75TF C 247
BS 1 497 RR4FJ15JQ
BS 498 498 RR4CF75TF
BS 499 584 RR4FJ15JQ
BS 585 585 RR4CF75TF
BS 586 761 RR4FJ15JQ
BS 762 990 RR4CF75TF

RD RR4FJ15JQ 761 0 0
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GAGCCTACAAAGCCCCCGGAGACAACAGCTAGCGGAATACAACTTCCCTAGAGACTAAGC
CGGCGGACAAAGAACAAGTCCCCAGAAACTATAAACAGTCATACAAGCTAATACTTTAAA
AATACAGTTCAGATCTAACCACAAACAGCAACTAAAAGGCTAAGAACAAACGGGATAAGG
AGGACATGAAGGAACACCACCTTCCCAAGTCGTAATTATTGATGGAGACCAAACGCAAGA
CTCTTACTAATGCTCCAACCCACACTAACCCACAATAGGAGCCCTGAGCCAAACCGAACT
GGAACTCCAAGGAAGTCTCAGAGAAGACCTTTCTTTTACCTGACGACTTCCAAACGACGA
GATGATCAAAGAGCATAAGCTCCACATCCAAAGAAAGAAGCCGGAGATCCTCTGTAACAG
AAGAAGAAACCGGCAAACGAGATAACCGAACCGTTGCAACGATTCAAGGATGAGCGTTCC
TCCTGAACCCGTTTTCTTCACCAACAGCGCTGACAATAACACCGGCGAAACTAGAGAGGA
TTAACATGGAGAAAGAGGCGGAGCAGACCAAGAAACCCTAGATCTCAGATCCGATGACCT
AAAGCCAAGGATAATCAACAATAGCAATGAAGCGAGGTCTCAGAATGGATGCAACCAAAC
CACAACCCAAAGAACCACTCTCACGGAATCGATCCAGATCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CF75TF 744 0 0
ACATGAAGGACACCAC
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CACTAACCCACAATAGGAGCC*TGAGCCAAACCGAACTGGAACTCCAAGGAAGTCTCAGA
GAAGACCTTTCTTTTACCTGACGACTTCCAAACGACGAGATGATCAGAGAGCATAAGCTC
CACATCCAAAGAAAGAAGCCGGAGATCCTCTGTAACAGAAGAAGAAACCGGCAAAAGAGA
TAACCGAACCGTTGCAACGATTCGAGGATGAGCGTTCCTCCTGAACCCGTTTTCTTCACC
AACAGCGCTGACAATAACACCGACGAAACTAGAGAGGATTAACATGGAGAAAGAGGCGGA
GCAGACCAAGAAACCCTAGATCTCAGATCCGATGACCTAAAGCCAAGGATAATCAACAAT
AGCAATGAAGCGAGGTCTCAGAATGGATGCAACCAAACCACAACCCAAAGAACCACTCTC
ACGGAATCGATCCAGATCTAGATTTGAAATTTTTAAAAGCAAAGCTTGATCAAAAGGATA
TAAACAACTAAAAAGGAAACAGAGCAAAGAAATAAACAAGATCCGACCGACGCCGTTGCT
AAGAGAGCCAACCAACGTCGGTCAGACAACAGATAATTTGATCGGAGGCAAGGAGAGAAG
ACAGAGTTTTTCTAGAGAGAGGTAAGTTCAGATCTTTACTAGAAAGTATCTAATGGATTC
TATTTGAG

QA 17 744 17 744
DS 



AS 1 3

CO CL3740Contig1 786 3 8 U
GCTTCAAAGGCTATTTTTACTTATCATCTTCAAGTCCCAATATTTTGAGGCCATTACATT
GGTTTATTTCAAATTCAGTTCCACAAATTTTCAAAACACTCTCCATGTGAGGACATGTAT
TATTGAAACAAAGAAATAAACATGTTCTACGAGTGAGAACATAATAAAAAGGTCTGAAAT
GGATTTAACTTGTCACATTTCAAGCGGCATGCGTCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTT
TCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAG
CTTATAGAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACC
TCCTCCTAAGAAGGACAACGCAGCACCATGTGGACTCCTCGAGTATTTCCAGGCAAAAGC
GGCTGTAGATACAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGCAACACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGC
GGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGAAGCTATGAACTCCTCAACGTCAGATGA
AGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCGCGTTTAGTGAACCTCGTGTAATTCTCCAGGAACGA
CAACCTCTCCTCCAAGAACCCCTTGAATCCCTCCGCAAACGACCTCGAATCTCCCATCTT
CGTTTTGATTCTTCGCACTCTTTTTTTTTTTGTTTCTCTCTTCTTTCCTCAGATCGAAAA
ATATTGAAATCGATATCACCAGACACAACACAAACAAATGTTTTCGCTCCCTACTCCTCT
ACGCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW83JQ U 1
AF RR4BE17JQ U 1
AF RR4DW83TF C 34
BS 1 92 RR4BE17JQ
BS 93 93 RR4DW83JQ
BS 94 397 RR4BE17JQ
BS 398 398 RR4DW83JQ
BS 399 588 RR4BE17JQ
BS 589 589 RR4DW83JQ
BS 590 691 RR4BE17JQ
BS 692 786 RR4DW83TF

RD RR4DW83JQ 643 0 0
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GGTTTATTTCAAATTCAGTTCCACAAATTTTCAAAACACTCTCCATGTGAGGACATGTAT
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GGATTTAACTTGTCACATTTCAAGCGGCATGCGTCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTT
TCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAG
CTTATAGAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACC
TCCTCCTAAGAAGGACAACGCAGCACCATGTGGACTCCTCGAGTATTTCCAGGCAAAAGC
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CAACCTCTCCTCCAAGAACCCCTTGAATCCCTCCGCAAACGAC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BE17JQ 696 0 0
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GGTTTATTTCAAATTCAGTTCCACAAATTTTCGAAACACTCTCCATGTGAGGACATGTAT
TATTGAAACAAAGAAATAAACATGTTCTACGAGTGAGAACATAATAAAAAGGTCTGAAAT
GGATTTAACTTGTCACATTTCAAGCGGCATGCGTCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTT
TCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAG
CTTATAGAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACC
TCCTCCTAAGAAGGACAACGCAGCACCATGTGGACTCATCGAGTATTTCCAGGCAAAAGC
GGCTGTAGATACAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGCAACACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGC
GGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGAAGCTATGAACTCCTCAACGTCAGATGA
AGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCGCGTTTAGTGAACCTCGTGTAATTATCCAGGAACGA
CAACCTCTCCTCCAAGAACCCCTTGAATCCCTCCGCAAACGACCTCGAATCTCCCATCTT
CGTTTTGATTCTTCGCACTCTTTTTTTTTTT
TTGTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4DW83TF 753 0 0
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TGAGAACATAATAAAAAGGTCTGAAATGGATTTAACTTGTCACATTTCAAGCGGCATGCG
TCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTTTCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAA
CTTAACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATAGAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTC
TTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACCTCCTCCTAAGAAGGACAACGCAGCACCATGTGG
ACTCCTCGAGTATTTCCAGGCAAAAGCGGCTGTAGATACAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGC
AACACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGCGGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGA
AGCTATGAACTCCTCAACGTCAGATGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCGCGTTTAGT
GAACCTCGTGTAATTCTCCAGGAACGACAACCTCTCCTCCAAGAACCCCTTGAATCCCTC
CGCAAACGACCTCGAATCTCCCATCTTCGTTTTGATTCTTCGCACTCTTTTTTTTTTTGT
TTCTCTCTTCTTTCCTCAGATCGAAAAATATTGAAATCGATATCACCAGACACAACACAA
ACAAATGTTTTCGCTCCCTACTCCTCTACGCCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3741Contig1 839 3 11 U
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TATCTTCGTGGTACGCCATAGCTCGTCTTCAAAGTCGTCTTTTCTTTTCTTTTCTTGTTT
CAATCAGATCTCTTGGTCACTTGTTAACCAAAAGAATCATGGAACTCAACTTCCTATCTA
GAGCTCTTACATCATTCATCCTTGTACTCACAGTACTTGCATCCTTCTCATCTTCAAGTT
TCATCTCTGATGGTGTGTTCGAACCGCAGAATTTGGCTATTGGAAGAAACCTACTTCAGA
CCAAGAAAGCATGTCCTGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAAT
GCAAAGGTCCCAAATTCCCACCCAAGGAATGCTGTGGCGCTTTCAAGGACTTTGCATGTC
CTTACACTGATGAGATCAACGACTTGAGTAATGAGTGTGCTACCACTATGTTCAGTTACA
TCAATCTCTATGGAAAATACCCACCGGGACTTTTCGCAAACCAGTGCCAAGAAGGTAAAG
AAGGTCTCGCCTGCCCCGCTCTGTCTCCCACCGCAGCAAGCGACACAAACGCAGCCACCA
CAGCTGCTTCTCGTCTTTGGCTGGCCGTCTTCACAGCTTTCTTGGTGTTTGTTAACTTGC
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TTTGTTTTATCCGTACCATCTCATTCTTTTGATTTTTGGAGCTTCAAAAAATTCTAAATT
GATAATATGTATCGACTTTTGTGCGTCTCATATACTCTATAAATCTCGACCAAAGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH49TF U 1
AF RR4FE88TF U 12
AF RR4FE88JQ C 287
BS 1 138 RR4CH49TF
BS 139 139 RR4FE88TF
BS 140 467 RR4CH49TF
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BS 632 745 RR4FE88TF
BS 746 839 RR4FE88JQ

RD RR4CH49TF 631 0 0
GGATTATTTATTTATTTCAAAAATTTCATAATATTCACTCTCTCTCTCTTGTCTCTCTCA
TATCTTCGTGGTACGCCATAGCTCGTCTTCAAAGTCGTCTTTTCTTTTCTTTTCTTGTTT
CAATCAGATCTCTTGGTCCCTTGTTAACCAAAAGAATCATGGAACTCAACTTCCTATCTA
GAGCTCTTACATCATTCATCCTTGTACTCACAGTACTTGCATCCTTCTCATCTTCAAGTT
TCATCTCTGATGGTGTGTTCGAACCGCAGAATTTGGCTATTGGAAGAAACCTACTTCAGA
CCAAGAAAGCATGTCCTGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAAT
GCAAAGGTCCCAAATTCCCACCCAAGGAATGCTGTGGCGCTTTCAAGGACTTTGCATGTC
CTTACACTGATGAGATCAACGACTTGAGTAATGAGTGTGCTACCACTTTGTTCAGTTACA
TCAATCTCTATGGGAAATACCCACCGGGACTTTTCGCAAACCAGTGCCAAGAAGGTAAAG
AAGGTCTCGCCTGCCCCGCTCTGTCTCCCACCTCAGCAAGCGACACAAACGCAGCCACCA
CAGCTGCTTCTCGTCTTTGGCTGGCCGTCTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4FE88TF 734 0 0
GG
ATTTCAAAAATTTCATAATATTCACTCTCTCTCTCTTGTCTCTCTCATATCTTCGTGGTA
CGCCATAGCTCGTCTTCAAAGTCGTCTTTTCTTTTCTT*****GTTTCAATCAGATCTCT
TGGTCACTTGTTAACCAAAAGAATCATGGAACTCAACTTCCTATCTAGAGCTCTTACATC
ATTCATCCTTGTACTCACAGTACTTGCATCCTTCTCATCTTCAAGTTTCATCTCTGATGG
TGTGTTCGAACCGCAGAATTTGGCTATTGGAAGAAACCTACTTCAGACCAAGAAAGCATG
TCCTGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAATGCAAAGGTCCCAA
ATTCCCACCCAAGGAATGCTGTGGCGCTTTCAAGGACTTTGCATGTCCTTACACTGATGA
GATCAACGACTTGAGTAATGAGTGTGCTACCACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGG
AAAATACCCACCGGGACTTTTCGCAAACCAGTGCCAAGAAGGTAAAGAAGGTCTCGCCTG
CCCCGCTCTGTCTCCCACCGCAGCAAGCGACACAAACGCAGCCACCACAGCTGCTTCTCG
TCTTTGGCTGGCCGTCTTCACAGCTTTCTTGGTGTTTGTTAACTTGCTCTAAGTCCCATG
TCTGTAATATAGCAACTTGAGGAAGCTGGATCTCTGTATATCCACGATTTGTTTTATCCG
TACCATCTCATT

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR4FE88JQ 553 0 0
AAACCTACTTCAGACCAAGAAAGCATGTCCTGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAAT
CATAACAAGCCAATGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCCAAGGAATGCTGTGGCGCTTTCAA
GGACTTTGCATGTCCTTACACTGATGAGATCAACGACTTGAGTAATGAGTGTGCTACCAC
TATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGAAAATACCCACCGGGACTTTTCGCAAACCAGTG
CCAAGAAGGTAAAGAAGGTCTCGCCTGCCCCGCTCTGTCTCCCACCGCAGCAAGCGACAC
AAACGCAGCCACCACAGCTGCTTTTCGTCTTTGGCTGGCCGTCTTCACGGCTTTCTTGGT
GTTTGTTAACTTGCTCTAAGTCCCATGTCTGTAATATAGCAACTTGAGGAAGCTGGATCT
CTGTATATCCACGATTTGTTTTATCCGTACCATCTCATTCTTTTGATTTTTGGAGCTTCA
AAAAATTCTAAATTGATAATATGTATCGACTTTTGTGCGTCTCATATACTCTATAAATCT
CGACCAAAGAAGC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL3742Contig1 888 2 8 U
GGACTGGCCACAGTTAGGCCACAGAGTCTATGCGGAGAGAAAGGAAAGCACATCATCATC
TTCGCGACAAAAGTTGATTGATTCTCTATGGCTTCATCGATCGTTTTCGCTGCAACTCCA
GCTACTGCTGGGTTCCTCTCCTCTGTTCCTCCTTGGAAGGCGCCTAGGAGATTTCATGTT
AGGTCTTCACTTGACGCAGACGTTTCCGACATGAGTGTTAACGCTCCAAAGGGGCTGTTT
CCTCCAGAGCCTGTACCTTACAAGGGACCGAAGCTGAAAGTAGCTATCATAGGAGCTGGA
CTTGCTGGCATGTCAACTGCTGTTGAGCTTCTCGATCAGGGTCACGAGGTGGATATATAT
GATTCAAGGACTTTCATTGGTGGCAAAGTTGGTTCTTTTGTAGATAGACGAGGGAACCAC
ATCGAAATGGGTCTACATGTCTTCTTCGGATGCTATAACAATCTCTTCCGCTTGATGAAA
AAGGTGGGAGCTGATAAGAACCTTCTTGTCAAAGACCACACTCATACATTTATAAACAAA
GGCAGCGAAATTGGAGAGCTTGATTTTCGGTTTCCTGTTGGAGCTCCAATTCACGGTATC
CGCGCCTTTTTAGTCACAAATCAACTCAAGCCATATGACAAGCTGAGGAACTCACTAGCT
CTTGCATTGAGCCCTGTCGTTAAAGCTCTTGTTAACCCTGATGGAGCAATGCAAGACATT
CGCAACCTAGACAGCATAAGTTTCTCGGATTGGTTCCTCTCTAAAGGTGGGACGAGGGAG
AGTATCCAGAGAATGTGGGATCCTGTTGCGTACGCACTCGGTTTCATAGACTGTGATACA
TGAGTGCAGATGCATGCTTACCATATTCTCATTGTTCGCCACAAAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E945TF U 1
AF RR4A621TF U 14
BS 1 750 RR4E945TF
BS 751 751 RR4A621TF
BS 752 766 RR4E945TF
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BS 780 802 RR4E945TF
BS 803 888 RR4A621TF

RD RR4E945TF 805 0 0
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TGT

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DS 

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GG
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GATTGATTCTCTATGGCTTCATCGATCGTTTTCGCTGCAACTCCAGCTACTGCTGGGTTC
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GCAGACGTTTCCGACATGAGTGTTAACGCTCCAAAGGGGCTGTTTCCTCCAGAGCCTGTA
CCTTACAAGGGACCGAAGCTGAAAGTAGCTATCATAGGAGCTGGACTTGCTGGCATGTCA
ACTGCTGTTGAGCTTCTCGATCAGGGTCACGAGGTGGATATATATGATTCAAGGACTTTC
ATTGGTGGCAAAGTTGGTTCTTTTGTAGATAGACGAGGGAACCACATCGAAATGGGTCTA
CATGTCTTCTTCGGATGCTATAACAATCTCTTCCGCTTGATGAAAAAGGTGGGAGCTGAT
AAGAACCTTCTTGTCAAAGACCACACTCATACATTTATAAACAAAGGCAGCGAAATTGGA
GAGCTTGATTTTCGGTTTCCTGTTGGAGCTCCAATTCACGGTATCCGCGCCTTTTTAGTC
ACAAATCAACTCAAGCCATATGACAAGCTGAGGAACTCACTAGCTCTTGCATTGAGCCCT
GTCGTTAAAGCTCTTGTTAACCCTGATGGAGCAATGCAAGACTTTCGCAACCTAGACAGC
ATAAGTTTCTCGGATTGGTTCCTCTCTAAAGGTGGGACGAGGGAGAGTATCCAGAGAATG
TGGGATCCTGTTGCGTACGCACTCGGTTTCATAGACTGTGATACATGAGTGCAGATGCAT
GCTTACCATATTCTCATTGTTCGCCACAAAACA

QA 3 875 3 875
DS 



AS 1 3

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TTTTTTTTTTTACGGTTGTTTCAAAAATTGAACATAACTTTAATAGCATTGCTTCCACGA
GCACTGGTTTCAAAGGCATCTTCCACTTCCTTCTGAAAGAAACCAAATCTGTGGGTTATG
AGTGGCTTAACATCAATCTTACCACTTGTAAGGAACTCGAGACATAAAGGCCATGTGTTC
TTGTACCTGAACACACCCACCACATCTACCTCCCTTGCAGCTGCGGGTGTGAGAGGGACA
GTCATTATACCATGACCCATTCCGACAGGGCAAACTTTACCGCCGCATCGAGTGGCTGCT
AATGCCGTCGACATTGTTTTGTTGAAACCCGCACAATCGAATGTCACATCGATCTTTGAC
CCTATAGCTTTCTTAATTTGTTCAACCTCAAAACCAACATCCTCTAAGCTTGTTGTCACT
TTGACAATCCCATCTGCACCTAGCTGTTTGGCTACAGATAAACGGTTATCATCAACATCC
ACAATCACAATCCTTGGCACACCAAAAGCACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATA
GGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTCTCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCA
TGCACGCCAACACTTAGTGGTTCACACATTGCTCCTTCCTCCAAACTCACATTCTCAGGC
AATTTGAAGCATAGATCCGCAGGGTGAACCACTTGGTTAGCTAGAGAGCCATGAACCGGT
GGGGTCGCAAAGAACTTCATCTCAGGACAAAGATTGTATCTTCCTTCCTTGCAGAGGTTG
CATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCAAGAGCCACTCGGTCACCGACCACTAGATGCTTC
ACTCCTTCACCTACCTCTTCAATGATCCCAGCGCATTCATGTCCAATCACCATCGGTTCT
TTCACAATGAAATCCGCACATCTCATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4H070JQ U 1
AF RR4FI54JQ U 33
AF RR4FI54TF C 337
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TTTTTTT

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR4FI54JQ 680 0 0
GG
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AATGTTCTTAGAAGAGCAAATACTTTTTTTTTTTTTTACGGTTGTTTCAAAAATTGAACA
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GAAAGAAACCAAATCTGTGGGTTATGAGTGGCTTAACATCAATCTTACCACTTGTAAGGA
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CAGATAAACGGTTATCATCAACATCCACAATCACAATCCTTGGCACACCAAAAGCACGAG
CAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTCTCAG
GACCAACCTCAGCTCGGC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR4FI54TF 713 0 0
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GATAAACGGTTATCATCAACATCCACAATCACAATCCTTGGCACACCAAAAGCACGAGCA
GCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTCTCAGGA
CCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGTTCACACATTGCTCCT
TCCTCCAAACTCACATTCTCAGGCAATTTGAAGCATAGATCCGCAGGGTGAACCACTTGG
TTAGCTAGAGAGCCATGAACCGGTGGGGTCGCAAAGAACTTCATCTCAGGACAAAGATTG
TATCTTCCTTCCTTGCAGAGGTTGCATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCAAGAGCCACT
CGGTCACCGACCACTAGATGCTTCACTCCTTCACCTACCTCTTCAATGATCCCAGCGCAT
TCATGTCCAATCACCATCGGTTCTTTCACAATGAAATCCGCACATCTCATGGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

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TACCTTCGTTTCCGACATATTGCAGGTCCTGGTGTAGGGTTTCTAACCGGTGGTGCTCCC
TGTGCAAGAGCTTCTTCCCGGTGATGTTCCTGCTGCTACTGGTTCCGCAGTGAGGTTGTC
GAGGTGTAGATTAGCGGAGTAGTCGGCTTTTTTGAGTTGGGAGAGGATCGATTTTCAGTC
TCTAGATCTTCTTCGCTTCATTTCACCATCGTTATTGATGAGGCTCGGTTTTGATTCCGA
CTGAGCGGTGGTTCTCTGCCGGTTTCTGGTTGGGAAGCAATCTTCTACGGGGTTAAGGTT
CTTCGGGCTCCTTCGGTGTCGCAGCGGTCCAGGCCTTCTTTCTGGTAGTTAGGTGAGCTC
TGATGGTTTCCCTGGCCAACAGAGGCGAGTCGTGAGCTTCAGTGTGCAGGAGGAGATGGC
GCTCAGCTCTGTTCAGATTCGTGTGGGTGTGGCTAGCTGTTGTATTCACTTTCTGGTGGA
TTTCGTTTGTCGTCTATGGCTGTCGAAGGCATCTTTCCACGCTACATCACCTCAGTCCTT
TTCAATACGGCTGCCTATCAGTTCATCCGAATGTTTAAGGCGGCAGCTTTCATTTTGGAT
TCGAGTCTCTATGCTTTTTGGTTTATCCTAGTTCTCATTGACACGGGTCTGGGTTCTTAC
GACAGAGTAATCGACTTCCGGTTCTCGGCGGTCACAAATGTGGAATCGATTCTCGGGGGG
ACATTAATCGTTTCCGTGTCAAACATTTGGTCATATTCATTTCCCGGTGCCGTAATGTTC
GCTTGATCCCTTGCGGTAGTGTGTTATGACTTACTTTGCAGGTGATTGGAGATAACCTGA
TTTGGTGGTGATGGTGAGATCAACTCGTTTTTTGCATGGTCCATGGCGAAATATAGGTGT
GTAAAGCTCTGTTTCTCGGAGCTCTTTTGGTAAGAGTAACTTGAAACCTCCACTTCTATT
TCTGTCAAGCGCTTCATCGACGGTGATGGTTATAAGTTTTGAAGAGTTCATCGGAAGCTA
GCTACACCGAAGACGACTTGAGAAATCCCGGCATCCTAGGAAACTAGGAGAACCTCACTT
TCTCGAGGCTGTCGTCGATGGTGAGAACGGCAACTGATTCCTAAGGATGTTAAAAAACTG
ATTAGTGGAATGTGCCGGGTTTAGTGGGCGGGCGAAGTTAGGATGTAATACACTGATATG
GGAAATTTTGTTCAAATCATGCTTGTAACCGGATCTAAATTCCCGTATTTCGGGTTGAAT
AAAATTTTAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS78TF U 1
AF RR4BK35TF U 223
AF RR4BK35JQ C 557
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BS 372 372 RR4BK35TF
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BS 510 549 RR4CS78TF
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BS 633 817 RR4BK35TF
BS 818 1273 RR4BK35JQ

RD RR4CS78TF 639 0 0
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TGTGCAAGAGCTTCTTCCCGGTGATGTTCCTGCTGCTACTGGTTCCGCAGTGAGGTTGTC
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TTCAATACG*CTGCCTATCAGTTCATCCGAATGTTTAAG**CGCAGCTTTCATTTTGGAT
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CTCATTG

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DS 

RD RR4BK35TF 595 0 0
GGCTCGG
TTTGATTCCGACTGAGCGGTGGTTCTCTGCCGGTTTCTGGTTGGGAAGCAATCTTCTACG
GGGTTAAGGTTCTTCGGGCTCCTTCGGTGTCGCAGCGGTCCAGGCCTTCTTTCTGGTAGT
TAGGTGAGCTCTGATGGTTTCCCTGGCCAACAGAGGCGAGTCGTGAGCTTCAGTGTGCAG
GAGGAGATGGCGCTCAGCTCTGTTCAGATTCGTGTGGGTGTGGCTAGCTGTTGTATTTAC
TTTCTGGTGGATTTCGTTTGTCGTCTATGGCTGTCGAAGGCATCTTTCCACGCTACATCA
CCTCGGTCCTTTTCAATACGGCTGCCTATCAGTTCATCCGAATGTTTAAGGCGGCAGCTT
TCATTTTGGATTCGAGTCTCTATGCTTTTTGGTTTATCCTAGTTCTCATTGACACGGGTC
TGGGTTCTTACGACAGAGTAATCGACTTCCGGTTCTCGGCGGTCACAAATGTGGAATCGA
TTCTCGGGGGGACATTAATCGTTTCCGTGTCAAACATTTGGTCATATTCATTTCCCGGTG
CCGTAATGTTCGCTTGATCCCTTGCGGTAGTGTGTTATGACTTACTTT

QA 8 595 8 595
DS 

RD RR4BK35JQ 717 0 0
ATCAGTTCATCCGAATGTTTAAGGCGGCAGCTTTCATTTTGGATTCGAGTCTCTATGCTT
TTTGGTTTATCCTAGTTCTCATTGACACGGGTCTGGGTTCTTACGACAGAGTAATCGACT
TCCGGTTCTCGGCGGTCACAAATGTGGAATCGATTCTCGGGGGGACATTAATCGTTTCCG
TGTCAAACATTTGGTCATATTCATTTCCCGGTGCCGTAATGTTCGCTTGATCCCTTGCGG
TAGTGTGTTATGACTTACTTTGCAGGTGATTGGAGATAACCTGATTTGGTGGTGATGGTG
AGATCAACTCGTTTTTTGCATGGTCCATGGCGAAATATAGGTGTGTAAAGCTCTGTTTCT
CGGAGCTCTTTTGGTAAGAGTAACTTGAAACCTCCACTTCTATTTCTGTCAAGCGCTTCA
TCGACGGTGATGGTTATAAGTTTTGAAGAGTTCATCGGAAGCTAGCTACACCGAAGACGA
CTTGAGAAATCCCGGCATCCTAGGAAACTAGGAGAACCTCACTTTCTCGAGGCTGTCGTC
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GGGTTTAGTGGGCGGGCGAAGTTAGGATGTAATACACTGATATGGGAAATTTTGTTCAAA
TCATGCTTGTAACCGGATCTAAATTCCCGTATTTCGGGTTGAATAAAATTTTAATCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL3745Contig1 773 2 11 U
GGAGCTTAAACCAGAGCGTTCGTTTCATCCTCATCATCTTCTTCTCCACCGGCTCTTCAC
TGCAAAGAGAGACAGCAAAAGATGGAGAACCTAACCCTAGTTTCTTGCTCAGCTTCTTCT
CCCAAGCTCTTAATCGGATGCAATTTCACTTCCTCTATTACTAAACCCCCACTAGGGTTC
TCCCGCCGGACTCCCAAAATTCTCCTCCGCTGCTCCAAAACCTCTGCCTCCGCACAATCT
CAGCCTCCGTCTTCGCGTAGCTCAAATAACGCTGGAGAAATCGTGGTAGTGACGCACAAA
AACAAAGCTTTCGCAAGTATATTCTCTTCGAGTCGTGATAAACAGACAACCTCCGTTGCT
TCCCCTAGCACAGCAGTGCCACCACCATCATCTTCATCAACCGTAGGATCACCACTTTTC
TGGATTGGTGTTGGGGTTGGTCTATCAACTTTGTTCTCATGGGTAACGTCAAACTTAAAG
AAATATGCGATGCAAACAGCTATGAAGACAATGATGAACCAGATGAATACGCAAAACAGC
CAGTTTAATAATCCTGGATTCCCCACAGGATCAGGATCAGGATCACCTTTTCCGTTTCCA
TTTCCTCCTCAAACAAGTCCTACTTCATCACCGTTCCAAACTCAATCCCAGTCTTCAGGT
GCTACTGTTGATGTGACGGCTACAAAAGTAGATAGGCCTCCGACGTTTAAACCTACACCT
ACACCTCCTACAAAGAATATAGAAGTGGATAAGCAGAGTGTTGTTCTAGAGGA


BQ
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AF RR4EV49TF U 1
AF RR4BA01TF U 1
BS 1 187 RR4BA01TF
BS 188 188 RR4EV49TF
BS 189 263 RR4BA01TF
BS 264 265 RR4EV49TF
BS 266 372 RR4BA01TF
BS 373 373 RR4EV49TF
BS 374 447 RR4BA01TF
BS 448 448 RR4EV49TF
BS 449 467 RR4BA01TF
BS 468 468 RR4EV49TF
BS 469 773 RR4BA01TF

RD RR4EV49TF 563 0 0
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CCCAAGCTCTTAATCGGATGCAATTTCACTTCCTCTCTTACTAAACCCCCACTAGGGTTC
TCCCGCCGGACTCCCAAAATTCTCCTCCGCTGCTCCAAAACCTCTGCCTCCGCGCAATCT
CAGCCTCCGTCTTCGCGTAGCTCAAATAACGCTGGAGAAATCGTGGTAGTGACGCACAAA
AACAAAGCTTTCGCAAGTATATTCTCTTCGAGTCGTGATAAACAGACAACCTCCGTTGCT
TCCCCTAGCACAGCAGTGCCACCACCATCATCTTCATCAACCGTAGGATCACCACTTTTC
TGGATTGGTGTTGGGGTTGGTCTATCAACTTTGTTCTCATGGGTAACGTCAAACTTAAAG
AAATATGCGATGCAAACAGCTATGAAGACAATGATGAACCAGATGAATACGCAAAACAGC
CAGTTTAATAATCCTGGATTCCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4BA01TF 773 0 0
GGAGCTTAAACCAGAGCGTTCGTTTCATCCTCATCATCTTCTTCTCCACCGGCTCTTCAC
TGCAAAGAGAGACAGCAAAAGATGGAGAACCTAACCCTAGTTTCTTGCTCAGCTTCTTCT
CCCAAGCTCTTAATCGGATGCAATTTCACTTCCTCTATTACTAAACCCCCACTAGGGTTC
TCCCGCCTGACTCCCAAAATTCTCCTCCGCTGCTCCAAAACCTCTGCCTCCGCACAATCT
CAGCCTCCGTCTTCGCGTAGCTCGGATAACGCTGGAGAAATCGTGGTAGTGACGCACAAA
AACAAAGCTTTCGCAAGTATATTCTCTTCGAGTCGTGATAAACAGACAACCTCCGTTGCT
TCCCCTAGCACATCAGTGCCACCACCATCATCTTCATCAACCGTAGGATCACCACTTTTC
TGGATTGGTGTTGGGGTTGGTCTATCAGCTTTGTTCTCATGGGTAACTTCAAACTTAAAG
AAATATGCGATGCAAACAGCTATGAAGACAATGATGAACCAGATGAATACGCAAAACAGC
CAGTTTAATAATCCTGGATTCCCCACAGGATCAGGATCAGGATCACCTTTTCCGTTTCCA
TTTCCTCCTCAAACAAGTCCTACTTCATCACCGTTCCAAACTCAATCCCAGTCTTCAGGT
GCTACTGTTGATGTGACGGCTACAAAAGTAGATAGGCCTCCGACGTTTAAACCTACACCT
ACACCTCCTACAAAGAATATAGAAGTGGATAAGCAGAGTGTTGTTCTAGAGGA

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL3746Contig1 377 2 3 U
GGGGAATCAGAACAGAGATGCTGATCTTGAATCAAAAGCTACTCTTCAGAAGTTCTCGGG
CCTATCAGCTATTTCAAGTGATCTTTTTGGTCATGGACAAGATGATTCCAACGTTGATAT
CACTGCAAGCGATCTCATCAACCGAATTTCTTTCCAGGCGCAGCAAGATGTGTCGTCCCT
TGTTAACATAGCGGAAGAAACGACCAAGAAGCTGGGGTCATTGGCATCTGGTATATTCAG
TGATCTTCAGGATAGAATGCTCTAAGAAAACATACAAAGATCTTTGTCTTTTGATTGACA
GAGACAACACATTGTGGTATTTGAAAGGTTTTGTGTTTTGTTCTGTAGCAATTTAATAAC
ACAAAACTTATATGCAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4FD22JQ C 1
AF RR4FD22TF U 1
BS 1 1 RR4FD22JQ
BS 2 375 RR4FD22TF
BS 376 377 RR4FD22JQ

RD RR4FD22JQ 377 0 0
GGGGAATCAGAACAGAGATGCTGATCTTGAATCAAAAGCTACTCTTCAGAAGTTCTCGGG
CCTATCAGCTATTTCAAGTGATCTTTTTGGTCATGGACAAGATGATTCCAACGTTGATAT
CACTGCAAGCGATCTCATCAACCGAATTTCTTTCCAGGCGCAGCAAGATGTGTCGTCCCT
TGTTAACATAGCGGAAGAAACGACCAAGAAGCTGGGGTCATTGGCATCTGGTATATTCAG
TGATCTTCAGGATAGAATGCTCTAAGAAAACATACAAAGATCTTTGTCTTTTGATTGACA
GAGACAACACATTGTGGTATTTGAAAGGTTTTGTGTTTTGTTCTGTAGCAATTTAATAAC
ACAAAACTTATATGCAC

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR4FD22TF 377 0 0
G
GGGAATCAGAACAGAGATGCTGATCTTGAATCAAAAGCTACTCTTCAGAAGTTCTCGGGC
CTATCAGCTATTTCAAGTGATCTTTTTGGTCATGGACAAGATGATTCCAACGTTGATATC
ACTGCAAGCGATCTCATCAACCGAATTTCTTTCCAGGCGCAGCAAGATGTGTCGTCCCTT
GTTAACATAGCGGAAGAAACGACCAAGAAGCTGGGGTCATTGGCATCTGGTATATTCAGT
GATCTTCAGGATAGAATGCTCTAAGAAAACATACAAAGATCTTTGTCTTTTGATTGACAG
AGACAACACATTGTGGTATTTGAAAGGTTTTGTGTTTTGTTCTGTAGCAATTTAATAACA
CAAAACTTATATGC
AC

QA 2 375 2 375
DS 



AS 1 2

CO CL3747Contig1 779 2 3 U
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TAACCAACAAAAGAACTTGGAGGATTGTGGTTGATGCTGAAAAACAAAAGAGCACCGTCT
CAAGATCTTCTTCTTCGCTTCCTCTTGTCTCTGTCGCTTTCATCCGAACTAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGACGATGAATCTGACTCAGAATCAGACTCGGAACCAGAACTGTCTGATTCT
GATTCTGCAACTTGCTTCTGTTGTTGCATGATGAGTCGTGGCATGTTCTTCAGGTACTCT
CTCAGATTCTCTGTGATGCCTCCAAGACCAATGGAGGTAAAGAAATTGATTGCAAACCTA
GTGTTCTTTGGATTGTCTTTAGGGAATATGGATTCAAGTGACTCCTGCATTGTTGGATCC
TGAAGCCCCTCATTAAGCAGCCTAATCCCCAAATGTTCTGACAGTTCCTGAAAGAGGATC
TTAATGAAGATACGAGAGGATGAAGTAGTGTCCTCCTCAGTTAGCCGAATGTAAGCAAGC
ACATGCCCAGGGGAGTGCATCTGTGCCCAGTAAATGGGCGAAGAACTTAGCCACATTACG
CAGCTTGTTCGTCTCAAGCCCGGTGGATCATGGAGTACTGCTGAACAAAACACTTCTCAA
AATTCTCCTGATGGATTTTTGTTGATCATACAGAAACGCTGACCCAACAAACCGTAGTAG
CGCAGGTATGTTCTCTCCTGAGAGCAACATTCCAGAAGCATTATGCACAGCTCCATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA53JQ U 518
AF RR4BA53TF C 1
BS 1 525 RR4BA53TF
BS 526 700 RR4BA53JQ
BS 701 779 RR4BA53TF

RD RR4BA53JQ 183 0 0
AGTTAGCC
CGAATGTAAGCAAGCACATGCCCAGGGGAGTGCATCTGTGCCCAGTAAATGGGCGAAGAA
CTTAGCCACATTACGCAGCTTGTTCGTCTCAAGCCCGGTGGATCATGGAGTACTGCTGAA
CAAAACACTTCTCAAAATTCTCCTGATGGATTTTTGTTGATCATACAGAAACGCT

QA 9 183 9 183
DS 

RD RR4BA53TF 779 0 0
GTTCATCAGAGCTTATGCAGTAACAGAACCACATGACTGAGCATGTAAATTCAAGTTGAA
TAACCAACAAAAGAACTTGGAGGATTGTGGTTGATGCTGAAAAACAAAAGAGCACCGTCT
CAAGATCTTCTTCTTCGCTTCCTCTTGTCTCTGTCGCTTTCATCCGAACTAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGACGATGAATCTGACTCAGAATCAGACTCGGAACCAGAACTGTCTGATTCT
GATTCTGCAACTTGCTTCTGTTGTTGCATGATGAGTCGTGGCATGTTCTTCAGGTACTCT
CTCAGATTCTCTGTGATGCCTCCAAGACCAATGGAGGTAAAGAAATTGATTGCAAACCTA
GTGTTCTTTGGATTGTCTTTAGGGAATATGGATTCAAGTGACTCCTGCATTGTTGGATCC
TGAAGCCCCTCATTAAGCAGCCTAATCCCCAAATGTTCTGACAGTTCCTGAAAGAGGATC
TTAATGAAGATACGAGAGGATGAAGTAGTGTCCTCCTCAGTTAGCCGAATGTAAGCAAGC
ACATGCC*AGGGGAGTGCATCTGTGCCCAGTAAATGGGCGAAGAACTTAGCCACATTACG
CAGCTTGTTCGTCTCAAGCC*GGTGGATCATGGAGTACTGCTGAACAAAACACTTCTCAA
AATTCTCCTGATGGATTTT*GTTGATCATACAGAAACGCTGACCCAACAAACCGTAGTAG
CGCAGGTATGTTCTCTCCTGAGAGCAACATTCCAGAAGCATTATGCACAGCTCCATCTC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 3

CO CL3748Contig1 688 3 9 U
CGGTTTCCATCTCCTCCGGCTGCAGAACCAGTGAAACTCTCCGAGTTACTACAGCACGGT
CTAAGGGAAGATCATGTTGCTTTGGAGGAGTTTGATGAGAACCGTGTAAATGGAAAAGAG
TCGGAAATGCATGAAGACACTGAGGAGATCAATGCATTGCTCTATTCAGATGATGATGAT
GATTGCGAGAGTGATGATGAAGTAATGAGCACTAGTCACTCTCCTTATCAAGTTTGCAGC
AAAAGGGCGTTGGAAGAAATAGATAATAGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAG
GTAGGAACCATCAGTGGCTCATCATCATCATCATCATCATCA***CTTGTGGGCAGCAAG
GATGAAAAGCTCCCTGAATCAAACATCTCGACCAAAGAAGACACTGGTTCGGGTCTGAGC
AACGAGCAGTCGAGAAAAGACAAAATCCGCACAGCCCTCAAGATACTCGAGAGCATAGTT
CCAGGTGCAAAAGGAAACGAAGCTCTCTCACTTCTAGACGAAGCCATTGATTACCTAAAG
TTGCTGAAACGGGACTTAATCTCCACCACAGAGATTAAGAACCATTGCTAAACCAAAAAA
ACCTCCACCACTCACCAAGTCACAAGTCACCACAACATGGGGAACAAGAAATCTACGACA
GATCAGCTTGAGATCTCACGTGTGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP27JQ C 189
AF RR4EP27TF U 189
AF RR4CO85TF U 1
BS 1 213 RR4CO85TF
BS 214 214 RR4EP27TF
BS 215 238 RR4CO85TF
BS 239 239 RR4EP27TF
BS 240 342 RR4CO85TF
BS 343 345 RR4EP27TF
BS 346 455 RR4CO85TF
BS 456 456 RR4EP27TF
BS 457 688 RR4CO85TF

RD RR4EP27JQ 323 0 0
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GTTGGAAGAAATAGATAATAGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTAGGAAC
CATCAGTGGCTCATCATCATCATCATCATCATCA***CTTGTGGGCAGCAAGGATGAAAA
GCTCCCTGAATCAAACATCTCGACCAAAGAAGACACTGGTTCGGGTTTGAGCAACGAGCA
GTCGAGAAAAGACAAAATCCGCACAGCCCTCAAGATACTCGAGAGCATAGTTCCAGGTGC
AAAAGGAAACGAAGCT
TCTCACT

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR4EP27TF 406 0 0
GAGTGATGATGAAGTAATGAGCACTAGTCACTCTCCTTATCAAGTTTGCAGCAAAAGGGC
GTTGGAAGAAATAGATAATAGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTAGGAAC
CATCAGTGGCTCATCATCATCATCATCATCATCA***CTTGTGGGCAGCAAGGATGAAAA
GCTCCCTGAATCAAACATCTCGACCAAAGAAGACACTGGTTCGGGTCTGAGCAACGAGCA
GTCGAGAAAAGACAAAATCCGCACAGCCCTCAAGATACTCGAGAGCATAGTTCCAGGTGC
AAAAGGAAACGAAGCT*TCTCACTTCTAGACGAAGCCATTGATTACCTAAAGTTGCTGAA
ACGGGACTTAATCTCCACCACAGAGATTAAGAACCATTGCTAAACC

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR4CO85TF 688 0 0
CGGTTTCCATCTCCTCCGGCTGCAGAACCAGTGAAACTCTCCGAGTTACTACAGCACGGT
CTAAGGGAAGATCATGTTGCTTTGGAGGAGTTTGATGAGAACCGTGTAAATGGAAAAGAG
TCGGAAATGCATGAAGACACTGAGGAGATCAATGCATTGCTCTATTCAGATGATGATGAT
GATTGCGAGAGTGATGATGAAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCAAGTTTGCAAC
AAAAGGGCGTTGGAAGAAATAGATAATAGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAG
GTAGGAACCATCAGTGGCTCATCATCATCATCATCATCATCATCACTTGTGGGCAGCAAG
GATGAAAAGCTCCCTGAATCAAACATCTCGACCAAAGAAGACACTGGTTCGGGTCTGAGC
AACGAGCAGTCGAGAAAAGACAAAATCCGCACAGCTCTCAAGATACTCGAGAGCATAGTT
CCAGGTGCAAAAGGAAACGAAGCTCTCTCACTTCTAGACGAAGCCATTGATTACCTAAAG
TTGCTGAAACGGGACTTAATCTCCACCACAGAGATTAAGAACCATTGCTAAACCAAAAAA
ACCTCCACCACTCACCAAGTCACAAGTCACCACAACATGGGGAACAAGAAATCTACGACA
GATCAGCTTGAGATCTCACGTGTGGAGT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 3

CO CL3749Contig1 1014 3 3 U
TCTTAAAAAAAGCAAAATTTCAATTTTCTCCAAGGCCATCTCTCTTCTCTGTCTTCTTCT
CAATCTATCTTAGTTATCTACTCGCAAAGAAGTCTCCTCAAGAAGCCCAGTTTTTGAGAA
ATGGCTGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTTCCCACCGTTACAATGCTGGGCGTAATG
AAAGCTCGTCTCGTTGGTGCCACAAGAGGCCACGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGACGCT
TTAACCGTTCAGTTCAGGGCCCTTCTCAAGAAGATCGTAACGGCCAAGGAATCAATGGGA
GACATGATGAAGACATCGTCTTTCGCTCTCACCGAAGTCAAGTACGTCGCTGGAGAGAAT
GTGAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTTCGGTCCAGACAA
GAGAACATCGCTGGCGTGAAGCTCCCCAAGTTCGATCACTTCTCCGAAGGCGAGACCAAG
AATGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGACAGCAGGTGCAAGCGTGCCGTGTGGCTTAC
GTGAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTT
GATGAAGCGATCAAGACGACTAACCGGAGGGTTAACGCTTTGGAGAATGTGGTGAAACCG
AAGATAGAGAATACGATTAGTTACATCAAGGGAGAGCTTGATGAGCTTGAGAGAGAAGAC
TTCTTTAGGTTGAAGAAAATTCAGGGGTACAAGAGGAGGGAAGTGGAGAGACAAGCAGCT
AACGCGAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTTCTTGAAGGGATCTCCATGCAGAGAGGGATA
TCGATAAACGCTGCTAGGAACTTGCTTGTTGGTGGTGGAGAGAAGGATGCAGACATTATT
TTCTGAGCTGATTGCTTGGTTTCTATTTTCTTTATTCATCAGACTGACGTTTCTTCAAAT
AAATTGGATTTTGATGCAGATGAAATATTGAATCATCTTTGGATTGTGCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E551TF U 1
AF RR4E979TF U 60
AF RR4E551JQ C 469
BS 1 625 RR4E551TF
BS 626 728 RR4E979TF
BS 729 1014 RR4E551JQ

RD RR4E551TF 625 0 0
TCTTAAAAAAAGCAAAATTTCAATTTTCTCCAAGGCCATCTCTCTTCTCTGTCTTCTTCT
CAATCTATCTTAGTTATCTACTCGCAAAGAAGTCTCCTCAAGAAGCCCAGTTTTTGAGAA
ATGGCTGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTTCCCACCGTTACAATGCTGGGCGTAATG
AAAGCTCGTCTCGTTGGTGCCACAAGAGGCCACGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGACGCT
TTAACCGTTCAGTTCAGGGCCCTTCTCAAGAAGATCGTAACGGCCAAGGAATCAATGGGA
GACATGATGAAGACATCGTCTTTCGCTCTCACCGAAGTCAAGTACGTCGCTGGAGAGAAT
GTGAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTTCGGTCCAGACAA
GAGAACATCGCTGGCGTGAAGCTCCCCAAGTTCGATCACTTCTCCGAAGGCGAGACCAAG
AATGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGACAGCAGGTGCAAGCGTGCCGTGTGGCTTAC
GTGAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTT
GATGAAGCGATCAAGACGACTAACC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4E979TF 670 0 0
GG
AATCTATCTTAGTTATCTACTCGCAAAGAAGTCTCCTCAAGAAGCCCAGTTTTTGAGAAA
TGGCTGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTTCCCACCGTTACAATGCTGGGCGTAATGA
AAGCTCGTCTCGTTGGTGCCACAAGAGGCCACGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGACGCTT
TAACCGTTCAGTTCAGGGCCCTTCTCAAGAAGATCGTAACGGCCAAGGAATCAATGGGAG
ACATGATGAAGACATCGTCTTTCGCTCTCACCGAAGTCAAGTACGTCGCTGGAGAGAATG
TGAAACACGTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTTCGGTCCAGACAAG
AGAACATCGCTGGCGTGAAGCTCCCCAAGTTCGATCACTTCTCCGAAGGCGAGACCAAGA
ATGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGACAGCAGGTGCAAGCGTGCCGTGTGGCTTACG
TGAAAGCTGTTGAAGTGCTTGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTG
ATGAAGCGATCAAGACGACTAACCGGAGGGTTAACGCTTTGGAGAATGTGGTGAAACCGA
AGATAGAGAATACGATTAGTTACATCAAGGGAGAGCTTGATGAGCTTGAGAGAGAAGACT
TCTTTAG
T

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR4E551JQ 546 0 0
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CGTGTGGCTTACGTGAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCG
TTCTTGACGCTTGATGAAGCGATCAAGACGACTAACCGGAGGGTTAACGCTTTGGAGAAT
GTGGTGAAACCGAAGATAGAGAATACGATTAGTTACATCAAGGGAGAGCTTGATGAGCTT
GAGAGAGAAGACTTCTTTAGGTTGAAGAAAATTCAGGGGTACAAGAGGAGGGAAGTGGAG
AGACAAGCAGCTAACGCGAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTTCTTGAAGGGATCTCCATG
CAGAGAGGGATATCGATAAACGCTGCTAGGAACTTGCTTGTTGGTGGTGGAGAGAAGGAT
GCAGACATTATTTTCTGAGCTGATTGCTTGGTTTCTATTTTCTTTATTCATCAGACTGAC
GTTTCTTCAAATAAATTGGATTTTGATGCAGATGAAATATTGAATCATCTTTGGATTGTG
CTTTGC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 3

CO CL3750Contig1 553 3 7 U
GGATCACTAAGCTAAGAGAAGAGCAAAAACAATTGGTGGAAAA*CTCTCTCAAAGTACTC
AAAAGCCATGGAGCCAAACACTAAGCTTGTCTTTATTACCTTGGTTCTTGCCTTGACACT
CACGGCAGCAACCGCACAGTTCTGCGGCATGTCTGTTGCTGGTCTGTACTCTTGCAAGCC
GTATGCGCAGACTAAGAACCCATTGACCACGGCCATAGATCCCAAGGGCCCTTGCTGCAC
TGCCCTGTCTGGGGCAGACATCCAGTGTCTGTGCAAGCAGAAATCCAAAACCAAAACCAA
TCCGTTTCTCAGTGGGGTTGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGATGTGTGGTTT
ATCTACGGCAACTTGCTAAGACAAGGTTTTTCTTTGTGTTTTGATTTTCTTCATGAGTCC
ATTGTTTTTGTACTTGTTTCTGTTGTTGTTCTTTGTTGGCTTGATGTTGTTTTCAGTTGT
TGACTTAACTGCATTGAATCGCTGTAGCTTGATTTCTTCAAAATAATAAAACCAAAAAAA
AGATATTCGTAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL16JQ C 9
AF RR4CL16TF U 1
AF RR4B369TF U 1
BS 1 43 RR4B369TF
BS 44 44 RR4CL16TF
BS 45 185 RR4B369TF
BS 186 186 RR4CL16TF
BS 187 316 RR4B369TF
BS 317 317 RR4CL16TF
BS 318 553 RR4B369TF

RD RR4CL16JQ 541 0 0
AAGT
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GCCAAACACTAAGCTTGTCTTTATTACCTTGGTTCTTGCCTTGACACTCACGGCAGCAAC
CGCACAGTTTTGCGGCATGTCTGTTGCTGGTCTGTACTCTTGCAAGCCGTATGCGCAGAC
TAAGAACCCATTGACCACGGCCATAGATCCCAAGGGCCCTTGCTGCACTGCCCTGTCTGG
GGCAGACATCCAGTGTCTGTGCAAGCAGAAATCCAAAACCAAAACCAATCCGTTTCTCAG
TGGGGTTGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGATGTGTGGTTTATTTACGGCAAC
TTGTTAAGACAAGGTTTTTCTTTGTGTTTTGATTTTCTTCATGAGTCCATTGTTTTTGTA
CTTGTTTCTGTTGTTGTTCTTTGTTGGCTTGATGTTGTTTTCAGTTGTTGACTTAACTGC
ATTGAATCGCTGTAGCTTGATTTCTTCAAAATAATAAAACCAAAAAAA
GATATTCGC

QA 5 532 5 532
DS 

RD RR4CL16TF 549 0 0
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AAAAGCCATGGAGCCAAACACTAAGCTTGTCTTTATTACCTTGGTTCTTGCCTTGACACT
CACGGCAGCAACCGCACAGTTCTGCGGCATGTCTGTTGCTGGTCTGTACTCTTGCAAGCC
GTATGCGCAGACTAAGAACCCATTGACCACGGCCATAGATCCCAAGGGCCCTTGCTGCAC
TGCCCTGTCTGGGGCAGACATCCAGTGTCTGTGCAAGCAGAAATCCAAAACCAAAACCAA
TCCGTTTCTCAGTGGGGTTGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGATGTGTGGTTT
ATCTACGGCAACTTGCTAAGACAAGGTTTTTCTTTGTGTTTTGATTTTCTTCATGAGTCC
ATTGTTTTTGTACTTGTTTCTGTTGTTGTTCTTTGTTGGCTTGATGTTGTTTTCAGTTGT
TGACTTAACTGCATTGAATCGCTGTAGCTTGATTTCTTCAAAATAATAAAACCAAAAAAA
GATATTCGC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4B369TF 553 0 0
GGATCACTAAGCTAAGAGAAGAGCAAAAACAATTGGTGGAAAAACTCTCTCAAAGTACTC
AAAAGCCATGGAGCCAAACACTAAGCTTGTCTTTATTACCTTGGTTCTTGCCTTGACACT
CACGGCAGCAACCGCACAGTTCTGCGGCATGTCTGTTGCTGGTCTGTACTCTTGCAAGCC
GTATGTGCAGACTAAGAACCCATTGACCACGGCCATAGATCCCAAGGGCCCTTGCTGCAC
TGCCCTGTCTGGGGCAGACATCCAGTGTCTGTGCAAGCAGAAATCCAAAACCAAAACCAA
TCCGTTTCTCAGTGGGATTGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGATGTGTGGTTT
ATCTACGGCAACTTGCTAAGACAAGGTTTTTCTTTGTGTTTTGATTTTCTTCATGAGTCC
ATTGTTTTTGTACTTGTTTCTGTTGTTGTTCTTTGTTGGCTTGATGTTGTTTTCAGTTGT
TGACTTAACTGCATTGAATCGCTGTAGCTTGATTTCTTCAAAATAATAAAACCAAAAAAA
AGATATTCGTAAG

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 3

CO CL3751Contig1 868 3 8 U
GGATCACAATAGCCGCCTCCTTTCTTGCGCTCATCTAAACTTCTTTTTGTCATCGATTCC
TTCAGATATCGCTTCTATGGCGACGAATCCTTTAATTATAGCTTATGTTTGTAATAGAGA
GCCCTTTGTTCTACACATCGGTGTTGATTTTTCAGCGATTTAACCGTTTTGAGGTCTCGC
ATCGGCAGATCTGACGCAGATCTCATGAAAGCCATGTTTCCTCTACAGATCTGCGGGTGG
AATCATCTCTTGAGGGTTTCTAAGATGTGAATCGGTTGCGTTGAAGCGCTCTGAGGCTGA
AACGGATTCATGACGGACGCGAAGGGTTGTTCATGTGTGGGTTAAGTTAAAAAAATTAGG
ATGTAGAAGATGTTGAATTGCATCTTTTGTCATCCCGACCTTTGCCATGTCAGGTGCGCT
TGCATGGCAGGTCAAAAACTGATCCTTAATAAAAAAAAATATTTTGTGGTTGGGAGAGGA
GTTCGCACGGGTGATTTTTTATTTTATCCCGGGTTCTCCTCTCCTTGTGTGCGTGTCTTG
CTCTCTGCTTTCTCACCCTCTATTTATTTATTATGCACCGAAACACAAAGAGACCATCAT
GAAACACCAGCTAGTTGAAAGCTAGCTTATCAACCTGGAGCTGTGGCCCTCATATCTCTT
CATGAACCCAAGTTGGCACCCGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGCAGGTTGTAGTGGGC
AAGTAAATGTTTGATGTTCCTCGATTTCATAAACGGTTTATTGAAAAAGGAGGTATTATC
AAGCAAATATGTCATTGTTGTAATTTTTAAATTTTGTAATCTATATCTATTTATTTAATT
TTGAAAGAATGTTTATGATGTTAACTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD29TF U 4
AF RR4AH61TF U 1
AF RR4AH61JQ C 547
BS 1 67 RR4AH61TF
BS 68 68 RR4DD29TF
BS 69 178 RR4AH61TF
BS 179 179 RR4DD29TF
BS 180 502 RR4AH61TF
BS 503 504 RR4DD29TF
BS 505 745 RR4AH61TF
BS 746 868 RR4AH61JQ

RD RR4DD29TF 563 0 0
GG
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ATATCGCTTCTATGGCGACGAATCTTTTAATTATAGCTTATGTTTGTAATAGAGAGCCCT
TTGTTCTACACATCGGTGTTGATTTTTCAGCGATTTAACCGTTTTGAGGTCTCGCATCGG
CAGATCTGACGCAGATCTCATGAAAGCTATGTTTCCTCTACAGATCTGCGGGTGGAATCA
TCTCTTGAGGGTTTCTAAGATGTGAATCGGTTGCGTTGAAGCGCTCTGAGGCTGAAACGG
ATTCATGACGGACGCGAAGGGTTGTTCATGTGTGGGTTAAGTTAAAAAA*TTAGGATGTA
GAAGATGTTGAATTGCATCTTTTGTCATCCCGACCTTTGCCATGTCAGGTGCGCTTGCAT
GGCAGGTCAAAAACTGATCCTTAATAAAAAAAAATATTTTGTGGTTGGGAGAGGAGTTCG
CACGGGTGATTTTTTTTTTTATCCCGGGTTCTCCTCTCCTTGTGTGCGTGTCTTGCTCTC
TGCTTTCTCACCCTCTATTTA

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR4AH61TF 747 0 0
GGATCACAATAGCCGCCTCCTTTCTTGCGCTCATCTAAACTTCTTTTTGTCATCGATTCC
TTCAGATCTCGCTTCTATGGCGACGAATCCTTTAATTATAGCTTATGTTTGTAATAGAGA
GCCCTTTGTTCTACACATCGGTGTTGATTTTTCAGCGATTTAACCGTTTTGAGGTCTCTC
ATCGGCAGATCTGACGCAGATCTCATGAAAGCCATGTTTCCTCTACAGATCTGCGGGTGG
AATCATCTCTTGAGGGTTTCTAAGATGTGAATCGGTTGCGTTGAAGCGCTCTGAGGCTGA
AACGGATTCATGACGGACGCGAAGGGTTGTTCATGTGTGGGTTAAGTTAAAAAAATTAGG
ATGTAGAAGATGTTGAATTGCATCTTTTGTCATCCCGACCTTTGCCATGTCAGGTGCGCT
TGCATGGCAGGTCAAAAACTGATCCTTAATAAAAAAAAATATTTTGTGGTTGGGAGAGGA
GTTCGCACGGGTGATTTTTTAT**TATCCCGGGTTCTCCTCTCCTTGTGTGCGTGTCTTG
CTCTCTGCTTTCTCACCCTCTATTTATTTATTATGCACCGAAACACAAAGAGACCATCAT
GAAACACCAGCTAGTTGAAAGCTAGCTTATCAACCTGGAGCTGTGGCCCTCATATCTCTT
CATGAACCCAAGTTGGCACCCGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGCAGGTTGTAGTGGGC
AAGTAAATGTTTGATGTTCCTCGAT
CT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4AH61JQ 322 0 0
GCTTTCTCCCCCTTTATTTATTTATTATGCACCGAAACACAAAGAGACCATCATGAAACC
CCAGCTAGTTGAAAGCTAGCTTATCAACCTGGAGCTGTGGCCCTCATATCTTTTCATGAA
CCCAAGTTGGCCCCCGAAGTTCGGAGCCAGTGATATATGCAGGTTGTAGTGGGCAAGTAA
ATGTTTGATGTTCCTCGATTTCATAAACGGTTTATTGAAAAAGGAGGTATTATCAAGCAA
ATATGTCATTGTTGTAATTTTTAAATTTTGTAATCTATATCTATTTATTTAATTTTGAAA
GAATGTTTATGATGTTAACTTT

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 3

CO CL3752Contig1 540 3 1 U
ATCTGAATGAAATTATGATAAGACTACTGAGCAAAAATAGAAAATTGTTCAAAATTAAGT
AGACATAATATCCAAAAAAGGCATTCTAAAAGAGTTTCTCGAGTACAAAGGAGTGAAAAG
AAGTATCAAACCATTGACAAAAGCAAATTTGTTTAGGTGTTGGTGGCACGAGTGTAGATC
TGCTGGCTCGAGTGGGCAGCGACCATCCTGATCACACCTTTTGCCATTAACTCCCTAATG
GCCTTCCTTGCTAGAGACCCGTTGATCCTCATACGGTCGGAGAGAGTGGAAGGGGTGATG
AGCTTGAATTTGGGAGCTTCAGTGAGAAGCTTGTCGTAAGTTGCCTGATCAAACAACACC
ATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTCTTCTGTTTTCCA
CCTCCGGATTTGGCCGGCTTCGATGACGGCGGCGGAACCTTATCCTTCTTTGGCGCCATG
ATGTTGAATGTTGAGTAGATTAGAGGCCGAAATATGAAGAAGCTCTCACGAAGACGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR4BL07JQ U 1
AF RR4C554JQ U 47
AF RR4BL07TF C 1
BS 1 540 RR4BL07JQ

RD RR4BL07JQ 540 0 0
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AAGTATCAAACCATTGACAAAAGCAAATTTGTTTAGGTGTTGGTGGCACGAGTGTAGATC
TGCTGGCTCGAGTGGGCAGCGACCATCCTGATCACACCTTTTGCCATTAACTCCCTAATG
GCCTTCCTTGCTAGAGACCCGTTGATCCTCATACGGTCGGAGAGAGTGGAAGGGGTGATG
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ATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTCTTCTGTTTTCCA
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ATGTTGAATGTTGAGTAGATTAGAGGCCGAAATATGAAGAAGCTCTCACGAAGACGACCC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4C554JQ 491 0 0
GG
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CGAGTGTAGATCTGCTGGCTCGAGTGAGCAGCGACCATCCTGATCACACCTTTTGCCATT
AACTCCCTAATGGCCTTCCTTGCTAGAGACCCGTTGATCCTCATACGGTCGGAGAGAATG
GAAGGGGTGATGAGCTTGAATTTGGGAGCTTCAGTGAGAAGCTTGTCGTAAGTTGCCTGA
TCAAACAACACCATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTC
TTCTGTTTTCCACCTCCGGATTTGGCCGGCTTCGATGACGGCGGCGGAACCTTATCCTTC
TTTGGCGCCATGATGTTGAATGTTGAGTAGATTAGAGGCCGAAATATGAAGAAGCTCTCA
CGAAGAC
CC

QA 3 489 3 489
DS 

RD RR4BL07TF 540 0 0
ATCTGAATGAAATTATGATAAGACTACTGAGCAAAAATAGAAAATTGTTCAAAATTAAGT
AGACATAATATCCAAAAAAGGCATTCTAAAAGAGTTTCTCGAGTACAAAGGAGTGAAAAG
AAGTATCAAACCATTGACAAAAGCAAATTTGTTTAGGTGTTGGTGGCACGAGTGTAGATC
TGCTGGCTCGAGTGGGCAGCGACCATCCTGATCACACCTTTTGCCATTAACTCCCTAATG
GCCTTCCTTGCTAGAGACCCGTTGATCCTCATACGGTCGGAGAGAGTGGAAGGGGTGATG
AGCTTGAATTTGGGAGCTTCAGTGAGAAGCTTGTCGTAAGTTGCCTGATCAAACAACACC
ATGTTGTTCACCTTCTCCTTTTGCTTTCCCTTGCTCCACTTCTTCTTCTTCTGTTTTCCA
CCTCCGGATTTGGCCGGCTTCGATGACGGCGGCGGAACCTTATCCTTCTTTGGCGCCATG
ATGTTGAATGTTGAGTAGATTAGAGGCCGAAATATGAAGAAGCTCTCACGAAGAC
GACCC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 3

CO CL3753Contig1 475 3 3 U
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GGGTTGATTCCAGACAAGGAGATCCTGAAGATCGTGAAGGAGACCTTCGATTTCAGACCA
GGGATGATGACGATCAACTTGGACTTGAAGAGAGGAGGCAATGGGAGGTTTTTGAAAACG
GCGGCGTATGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACTTCACCTGGGAGGTCGTGAAGCCA
CTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTAATGATTTAATATCATTTCATATGCTTGTTT
CTCTTATCTTTTTCACTTTAAAAACATTTACCGTGAACAATAATCAATCCTTATGTTTCT
GTTTTCTTTTTCTTTTTGTACTTTTGGAATGAAAGTTTCTGGTTTGTTTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H092TF U 1
AF RR4FB79JQ C 114
AF RR4FB79TF U 114
BS 1 276 RR4H092TF
BS 277 277 RR4FB79TF
BS 278 475 RR4H092TF

RD RR4H092TF 475 0 0
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GTCTCCTACGCCATTGGAGTTCCCGAGCCTCTGTCTGTGTTCGTGGACACTTACGGAACA
GGGTTGATTCCAGACAAGGAGATCCTGAAGATCGTGAAGGAGACCTTCGATTTCAGACCA
GGGATGATGACGATCAACTTGGACTTGAAGAGAGGAGGCAATGGGAGGTTTTTGAAAACG
GCGGCGTATGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACCTCACCTGGGAGGTCGTGAAGCCA
CTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTAATGATTTAATATCATTTCATATGCTTGTTT
CTCTTATCTTTTTCACTTTAAAAACATTTACCGTGAACAATAATCAATCCTTATGTTTCT
GTTTTCTTTTTCTTTTTGTACTTTTGGAATGAAAGTTTCTGGTTTGTTTATTATT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4FB79JQ 356 0 0
G
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AAAACGGCGGCGTATGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACTTCACCTGGGAGGTCGTG
AAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTAATGATTTAATATCATTTCATATGC
TTGTTTCTCTTATCTTTTTCACTTTAAAAACATTTACCGTGAACAATAATCAATCCTTAT
GTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTGTACTTTTGGAATGAAAGTTTCTGGTTTG
GTT

QA 2 353 2 353
DS 

RD RR4FB79TF 356 0 0
G
GGAACAGGGTTGATTCCAGACAAGGAGATCCTGAAGATCGTGAAGGAGACCTTCGATTTC
AGACCAGGGATGATGACGATCAACTTGGACTTGAAGAGAGGAGGCAATGGGAGGTTTTTG
AAAACGGCGGCGTATGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACTTCACCTGGGAGGTCGTG
AAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTAATGATTTAATATCATTTCATATGC
TTGTTTCTCTTATCTTTTTCACTTTAAAAACATTTACCGTGAACAATAATCAATCCTTAT
GTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTGTACTTTTGGAATGAAAGTTTCTGGTTTG
GTT

QA 2 353 2 353
DS 



AS 1 3

CO CL3754Contig1 952 3 7 U
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GGAATCGGCCACGCGCTGGCTCGTGAGTTCTCGGCGAATGGTTTTCGAGTGATGGCTGAT
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GCCGGAGTTCAATGTATCGGACCACTCGCGGAGATTCCAATTCAGGCCATGGAAAACACC
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TCTAAGAAAAAGGGGAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCATCATGGCACC*GCACCT
TGGGCTGGGGTTTATACTGCATCCAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACCGATACATTAAGG
TTGGAGCTTAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAATCA
AACATAGCCGACTCAGCGATAGCGAGCTTCAACAACTTGCCTGAGCTGAAACTATACAAA
CCTTTCCAGGAATCTATCCGTGAAAGGGCGTTTTTGTCGCAAAACATAAAACCAACACCT
GCCGCCACATTTGCGAAAGAGACGGTATCGTTAGTGTTGAAGAAAAACCCGCCGGCTTGG
TTCTCTACAGGACGGCTGTCTACCGTCATGGCGATCATGCACCATATGCCCATTTTCGTC
AAAGATTTTCTTCTGACGAGGAGCTTTATGAAAAAGGGAGCAAAGACTGAGTAGGAGTAG
TCACTAAAACTGTTTCAATGTATTTAACAAGCCAAAATGTTGCATAACCATGTTTATATT
TTATACAAGCCACATAAAATTTAAAGTAATAATAATCGGCCCATAGCCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG24TF U 1
AF RR4D472TF U 217
AF RR4GG24JQ C 366
BS 1 647 RR4GG24TF
BS 648 686 RR4D472TF
BS 687 687 RR4GG24JQ
BS 688 759 RR4D472TF
BS 760 760 RR4GG24JQ
BS 761 903 RR4D472TF
BS 904 952 RR4GG24JQ

RD RR4GG24TF 647 0 0
GGAAGAATGGGAAGCAGCGATGAGATGCCAGTGGTTCTCATCACGGGATGCTCTCAGGGA
GGAATCGGCCACGCGCTGGCTCGTGAGTTCTCGGCGAATGGTTTTCGAGTGATGGCTGAT
TTGGAGAAAGATCCCAAGTTCTTTTTGCAAGAGCTCGATGTTCAGTCGGAACAGAGCGTG
AGTAAAGTTGTGTCGGAAGTTATAGACAAGTTTGGTCAGATCGATGTTCTGGTCAATAAC
GCCGGAGTTCAATGTATCGGACCACTCGCGGAGATTCCAATTCAGGCCATGGAAAACACC
TTCAACACCAATGTGTTTGGCTCAATGAGGATGACTCAAGCTGTTGTACCTCACATGGCG
TCTAAGAAAAAGGGGAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCATCATGGCACC*GCACCT
TGGGCTGGGGTTTATACTGCATCCAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACCGATACATTAAGG
TTGGAGCTTAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAATCA
AACATAGCCGACTCAGCGATAGCGAGCTTCAACAACTTGCCTGAGCTGAAACTATACAAA
CCTTTCCAGGAATCTATCCGTGAAAGGGCGTTTTTGTCGCAAAACAT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4D472TF 687 0 0
G
AGATCGATGTTCTGGTCAATAACGCCGGAGTTCAATGTATCGGACCACTCGCGGAGATTC
CAATTCAGGCCATGGAAAACACCTTCAACACCAATGTGTTTGGCTCAATGAGGATGACTC
AAGCTGTTGTACCTCACATGGCGTCTAAGAAAAAGGGGAAGATTGTGAACATAGGAAGTA
TCAGCATCATGGCACCTGCACCTTGTGCTGGGGTTTATACTGCATCCAAAGCTGCTCTTC
ATGCTCTTACCGATACATTAAGGTTGGAGCTTAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACA
TTGTCCCAGGAGGTATTCAATCAAACATAGCCGACTCAGCGATAGCGAGCTTCAACAACT
TGCCTGAGCTGAAACTATACAAACCTTTCCAGGAATCTATCTGTGAAAGGGCGTTTTTGT
CGCAAAACATAAAACCAACACCTGCCGCCACATTTGCGAAAGAGACGGTGTCGTTAGTGT
TGAAGAAAAACCCGCCGGCTTGGTTCTCTACAGGACGGCTGTCTACCGTCATGGCGATCA
TGTACCATATGCCCATTTTCGTCAAAGATTTTCTTCTGACGAGGAGCTTTATGAAAAAGG
GAGCAAAGACTGAGTAGGAGTAGTCACTAAAACTGTTTCAATGTATTTAACAAGCCAAAA
TGTTGCATAACCATGTTTATATTTTA

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR4GG24JQ 587 0 0
GAAAAAGGGGAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCATCATGGCACC*GCACCTTGGGC
TGGGGTTTATACTGCATCCAAAGCTGCTCTTCATGTTCTTACCGATACATTAAGGTTGGA
GCTTAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAATCAAACAT
AGCCGATTCAGCGATAGCGAGCTTCAACAACTTGCCTGAGCTGAAACTATACAAACCTTT
CCAGGAATCTATCCGTGAAAGGGCGTTTTTGTCGCAAAACATAAAACCAACACCTGCCGC
CACATTTGCGAAAGAGACGGTATCGTTAGTGTTGAAGAAAAACCCGCCGGCTTGGTTCTC
TACAGGACGGCTGTCTACCGTCATGGCGATCATGCACCATATGCCCATTTTCGTCAAAGA
TTTTCTTCTGACGAGGAGCTTTATGAAAAAGGGAGCAAAGACTGAGTAGGAGTAGTCACT
AAAACTGTTTCAATGTATTTAACAAGCCAAAATGTTGCATAACCATGTTTATATTTTATA
CAAGCCACATAAAATTTAAAGTAATAATAATCGGCCCATAGCCCACC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL3755Contig1 700 2 4 U
GGAAAAGTAACAGTTTCACGTAACTCAGAACTCAGAAGTGAATTTCAGAGAAGAAAACGA
TGAGCACCGGAGGAAATGGCGGAGCGACGGCGACGAACAAGCAGGTGATACTGAGAGACT
ACGTGAGTGGTTTCCCAAAGGAATCGGACTTTGATATAACAACCACCACCACCGTCGAGC
TTAAGCCTCCCAAGGGGTCTAACTCTGTTCTTGTGAAGAATCTCTACCTGTCATGCGATC
CTTACATGCGGTCTCGCATAGGGAAGCCTGCTGCTTCTGGTATTGCTCAGGCTTACACTC
CCGGCAAGCCAATCTTAGGGTTTGGAGTGTCTAGAGTGATAGAATCAGGCCATCCGGATT
ACAAAGAAGGCGACTTAATGTGGGGAATCGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTGGTTACTC
CTATTCCTGACATGCATTTCAAGATCCATCACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTG
GACTTCTCGGTATGCCCGGTATGACCGCCTATGCCGGATTCTATGAAGTTTGTTCTCCGA
AGAAAGGAGAGACAGTCTATGTGTCGGCTGCATCTGGTGCAGTTGGCCAGCTTGTGGGAC
AGTTTGCTAAGATGGTGGGTTGCTATGTCGTTGGAAGCGCTGGAAGTAAAGAAAAGTTGA
TCTCCTCAAAACAAGTTTGGGTTTGATGATGCGTTTAACT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH29TF U 1
AF RR4FF82TF U 2
BS 1 144 RR4CH29TF
BS 145 145 RR4FF82TF
BS 146 270 RR4CH29TF
BS 271 700 RR4FF82TF

RD RR4CH29TF 277 0 0
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ACGTGAGTGGTTTCCCAAAGGAATTGGACTTTGATATAACAACCACCACCACCGTCGAGC
TTAAGCCTCCCAAGGGGTCTAACTCTGTTCTTGTGAAGAATCTCTACCTGTCATGCGATC
CTTACATGCGGTCTCGCATAGGGAAGCCTG
TGCTTCT

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR4FF82TF 699 0 0
GG
AAAGTAACAGTTTCACGTAACTCAGAACTCAGAAGTGAATTTCAGAGAAGAAAACGATGA
GCACCGGAGGAAATGGCGGAGCGACGGCGACGAACAAGCAGGTGATACTGAGAGACTACG
TGAGTGGTTTCCCAAAGGAATCGGACTTTGATATAACAACCACCACCACCGTCGAGCTTA
AGCTTCCCAAGGGGTCTAACTCTGTTCTTGTGAAGAATCTCTACCTGTCATGCGATCCTT
ACATGCGGTCTCGCATGGGGAAGCCTGCTGCTTCTGGTATTGCTCAGGCTTACACTCCCG
GCAAGCCAATCTTAGGGTTTGGAGTGTCTAGAGTGATAGAATCAGGCCATCCGGATTACA
AAGAAGGCGACTTAATGTGGGGAATCGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTGGTTACTCCTA
TTCCTGACATGCATTTCAAGATCCATCACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGAC
TTCTCGGTATGCCCGGTATGACCGCCTATGCCGGATTCTATGAAGTTTGTTCTCCGAAGA
AAGGAGAGACAGTCTATGTGTCGGCTGCATCTGGTGCAGTTGGCCAGCTTGTGGGACAGT
TTGCTAAGATGGTGGGTTGCTATGTCGTTGGAAGCGCTGGAAGTAAAGAAAAGTTGATCT
CCTCAAAACAAGTTTGGGTTTGATGATGCGTTTAACT

QA 3 699 3 699
DS 



AS 1 3

CO CL3756Contig1 714 3 1 U
GGATTCTCTGTCTTTCCTATGTCATCTTATCCTAACTAGTAACCATTGTTTCTTTTTTTT
CTTTACAGAATCAAATTTCTTTATTTGTATATGCAAAGCTTCTCATCTCATCTTTTAGAG
ATGTCGTCACATCTGCAGTGGAATCCTTTCCGAGAGACTGCGGTGTACTGGCGGAGAAGA
AATTAAGTAACAGCTATGGATTCTCTCTTTTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTATTTGATTAT
GATATTTTTTTTTCTTGGTAAAGAAAGGTGGATGAGGCAGAAAAAGATGATGTTTGGTTG
TGAAGAGGAACCTTGCTATCTCTCCTGGTCTCGTGATGCCTCTCAGCTTCAAGCCATCTG
GATTTGTGGTGTTTGTTGACCTTCATGGCCTGCTCTGCATCCGGCTCGGCTCAAGAGAAT
CTTTCTGACCTGAGACAATGAGACATGCTTAAGAGAATCAAGATGTGGAAGCGTTACTAT
CGGACTTCTCTCCGCCAGTCGCAGTGCAGTAGTGGTGCTCCCAAGTCACAGGGTTGTGGT
GGTGGTCGCTGTAAGTCCAATTGAAGAGGCGGCGGTGAAGATGTGGTTTATTTTTTTTTT
TTTTTAGATTTTTCTTTTGATGTGGTTTATTTTTGTAAACCAATTTAATTTGTAAACCAA
TTTAGTTTGTAAACCAAATTTAATTTATAAAACAAAAATTTCATTGGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI26TF U 1
AF RR4AH91TF U 254
AF RR4CK67TF U 148
BS 1 714 RR4EI26TF

RD RR4EI26TF 714 0 0
GGATTCTCTGTCTTTCCTATGTCATCTTATCCTAACTAGTAACCATTGTTTCTTTTTTTT
CTTTACAGAATCAAATTTCTTTATTTGTATATGCAAAGCTTCTCATCTCATCTTTTAGAG
ATGTCGTCACATCTGCAGTGGAATCCTTTCCGAGAGACTGCGGTGTACTGGCGGAGAAGA
AATTAAGTAACAGCTATGGATTCTCTCTTTTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTATTTGATTAT
GATATTTTTTTTTCTTGGTAAAGAAAGGTGGATGAGGCAGAAAAAGATGATGTTTGGTTG
TGAAGAGGAACCTTGCTATCTCTCCTGGTCTCGTGATGCCTCTCAGCTTCAAGCCATCTG
GATTTGTGGTGTTTGTTGACCTTCATGGCCTGCTCTGCATCCGGCTCGGCTCAAGAGAAT
CTTTCTGACCTGAGACAATGAGACATGCTTAAGAGAATCAAGATGTGGAAGCGTTACTAT
CGGACTTCTCTCCGCCAGTCGCAGTGCAGTAGTGGTGCTCCCAAGTCACAGGGTTGTGGT
GGTGGTCGCTGTAAGTCCAATTGAAGAGGCGGCGGTGAAGATGTGGTTTATTTTTTTTTT
TTTTTAGATTTTTCTTTTGATGTGGTTTATTTTTGTAAACCAATTTAATTTGTAAACCAA
TTTAGTTTGTAAACCAAATTTAATTTATAAAACAAAAATTTCATTGGAAAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AH91TF 455 0 0
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TGCTATCTCTCCTGGTCTCGTGATGCCTCTCAGCTTCAAGCCATCTGGATTTGTGGTGTT
TGTTGACCTTCATGGCCTGCTCTGCATCCGGCTCGGCTCAAGAGAATCTTTCTGACCTGA
GACAATGAGACATGCTTAAGAGAATCAAGATGTGGAAGCGTTACTATCGGACTTCTCTCC
GCCAGTCGCAGTGCAGTAGTGGTGCTCCCAAGTCACAGGGTTGTGGTGGTGGTCGCTGTA
AGTCCAATTGAAGAGGCGGCGGTGAAGATGTGGTTTATTTTTTTTTTTTTTTAGATTTTT
CTTTTGATGTGGTTTATTTTTGTAAACCAATTTAATTTGTAAACCAATTTAGTTTGTAAA
CCAAATTTAATTTATAAAACAAAAATTTCATTGG
T

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4CK67TF 561 0 0
G
TCCGAGAGACTGCGGTGTACTGGCGGAGAAGAAATTAAGTAACAGCTATGGATTCTCTCT
TTTCCTTTCTCTCTCTCTCT**ATTTGATTATGATATTTTTTTTTCTTGGTAAAGAAAGG
TGGATGAGGCAGAAAAAGATGATGTTTGGTTGTGAAGAGGAACCTTGCTATCTCTCCTGG
TCTCGTGATGCCTCTCAGCTTCAAGCCATCTGGATTTGTGGTGTTTGTTGACCTTCATGG
CCTGCTCTGCATCCGGCTCGGCTCAAGAGAATCTTTCTGACCTGAGACAATGAGACATGC
TTAAGAGAATCAAGATGTGGAAGCGTTACTATCGGACTTCTCTCCGCCAGTCGCAGTGCA
GTAGTGGTGCTCCCAAGTCACAGGGTTGTGGTGGTGGTCGCTGTAAGTCCAATTGAAGAG
GCGGCGGTGAAGATGTGGTTTATTTTTTTTTTTTT**AGATTTTTCTTTTGATGTGGTTT
ATTTTTGTAAACCAATTTAATTTGTAAACCAATTTAGTTTGTAAACCAAATTTAATTTAT
AAAACAAAAATTTCATTGG
T

QA 2 560 2 560
DS 



AS 1 3

CO CL3757Contig1 300 3 1 U
CGGATAAATTCAACTTTACATCTCTTAACTTTTATAAGTAGAATTTGCTTTCTCATAAAA
ATATTCTCCATAAAGTACAATTTTCCAATTCCAAGAATCAATTGGAACGCCAAGTTGACA
AAGAGAAGAACATATCACTTAGAGAGATAACATTCTAGAATTTACATATTCGCACCGTAT
TTATTTGGTTTAAAAACCCCATTAGAAATTTTGGATATAGGAAAATATGTTGAAACATAT
ATAATCCTAGATAGATAGATTATTTATCAACCAACGATCAATAACGTTTTTCGATCTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A004JQD U 1
AF RR4A004TFB C 1
AF RR4A004JQ U 49
BS 1 300 RR4A004JQD

RD RR4A004JQD 300 0 0
CGGATAAATTCAACTTTACATCTCTTAACTTTTATAAGTAGAATTTGCTTTCTCATAAAA
ATATTCTCCATAAAGTACAATTTTCCAATTCCAAGAATCAATTGGAACGCCAAGTTGACA
AAGAGAAGAACATATCACTTAGAGAGATAACATTCTAGAATTTACATATTCGCACCGTAT
TTATTTGGTTTAAAAACCCCATTAGAAATTTTGGATATAGGAAAATATGTTGAAACATAT
ATAATCCTAGATAGATAGATTATTTATCAACCAACGATCAATAACGTTTTTCGATCTCTC

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4A004TFB 300 0 0
CGGATAAATTCAACTTTACATCTCTTAACTTTTATAAGTAGAATTTGCTTTCTCATAAAA
ATATTCTCCATAAAGTACAATTTTCCAATTCCAAGAATCAATTGGAACGCCAAGTTGACA
AAGAGAAGAACATATCACTTAGAGAGATAACATTCTAGAATTTACATATTCGCACCGTAT
TTATTTGGTTTAAAAACCCCATTAGAAATTTTGGATATAGGAAAATATGTTGAAACATAT
ATAATCCTAGATAGATAGATTATTTATCAACCAACGATCAATAACGTTTTTCGATCTCTC

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4A004JQ 252 0 0
TTTCTCATAAAAATATTCTCCATAAAGTACAATTTTCCAATTCCAAGAATCAATTGGAAC
GCCAAGTTGACAAAGAGAAGAACATATCACTTAGAGAGATAACATTCTAGAATTTACATA
TTCGCACCGTATTTATTTGGTTTAAAAACCCCATTAGAAATTTTGGATATAGGAAAATAT
GTTGAAACATATATAATCCTAGATAGATAGATTATTTATCAACCAACGATCAATAACGTT
TTTCGATCTCTC

QA 1 252 1 252
DS 



AS 1 3

CO CL3758Contig1 814 3 21 U
GGGAAGCTATTCAGGTTCTCCTCTCTCTCTCCTCTCCTATGCTTTCTGTCTCCTCATCTC
TTAGAGTGAGTCCTTTACAGGTTCAGCTTCAGTTTCGAGTAGATATGGAAGTGGTTGCCG
CTAGGTCAATGGAGGAGACGCAGAGACAGCAGACATGGGCTTGTTCTGCCACTGAGACGC
TTCTCATCCTCCTTGGAAGGAACCTGACTTGTCTGCTCCTCGCGGCGGAATCTTTGCTGA
TTGGGTTGATTGCTGAAGATCAGAGGCTTTCTGTGAAAAAGGGTTACAAAAAAGGACGCC
CTGATGAGGAGAACAAAGATGGCAGCGACTCTGATGATAACGATGACGACGACGATGAAG
ACGCTGACGCTGATGATGATGACGACGACGATGATGCTAATGATGAAAATTTCTCTGGGG
ATGAAGTGGAGGAGGAAGCTGATCCAGAGGATGACCCAGCGCCCAATGGTGGAGCAGGAA
GCGATGATGATGAAGATGATGATGGTGATGATGAGAGCGATAGTGATGATGATGATGACG
ACGAGGATGAGGATGACGAAGATGATGAGGAGGAGGAAGATGACGAAGATGTTCGCCAGC
CACCTGCTAAGAAGAGGAAATGAAACATGGGATTAAGTGGGGAGTGTTTTTTATGTGTGG
GTGGTTAAAGACTTGAAGAGGATCTCGTATGTGTTATGGTTTTAAGTAGTTCAGTGAAAA
CCTCCTCTTTATTCAGTTTCATCTTGTTGTGTTACTACCATTTGTTGTTATCTCAGACTT
TTCGACCTCGGATTTTAGTTTATGTTTCCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
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25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F403TF U 1
AF RR4GL66TF U 37
AF RR4GL66JQ C 194
BS 1 206 RR4F403TF
BS 207 207 RR4GL66TF
BS 208 356 RR4F403TF
BS 357 357 RR4GL66TF
BS 358 426 RR4F403TF
BS 427 427 RR4GL66TF
BS 428 553 RR4F403TF
BS 554 554 RR4GL66TF
BS 555 575 RR4F403TF
BS 576 576 RR4GL66TF
BS 577 663 RR4F403TF
BS 664 719 RR4GL66TF
BS 720 720 RR4GL66JQ
BS 721 732 RR4GL66TF
BS 733 733 RR4GL66JQ
BS 734 747 RR4GL66TF
BS 748 748 RR4GL66JQ
BS 749 752 RR4GL66TF
BS 753 753 RR4GL66JQ
BS 754 773 RR4GL66TF
BS 774 814 RR4GL66JQ

RD RR4F403TF 663 0 0
GGGAAGCTATTCAGGTTCTCCTCTCTCTCTCCTCTCCTATGCTTTCTGTCTCCTCATCTC
TTAGAGTGAGTCCTTTACAGGTTCAGCTTCAGTTTCGAGTAGATATGGAAGTGGTTGCCG
CTAGGTCAATGGAGGAGACGCAGAGACAGCAGACATGGGCTTGTTCTGCCACTGAGACGC
TTCTCATCCTCCTTGGAAGGAACCTGGCTTGTCTGCTCCTCGCGGCGGAATCTTTGCTGA
TTGGGTTGATTGCTGAAGATCAGAGGCTTTCTGTGAAAAAGGGTTACAAAAAAGGACGCC
CTGATGAGGAGAACAAAGATGGCAGCGACTCTGATGATAACGATGACGACGACGATTAAG
ACGCTGACGCTGATGATGATGACGACGACGATGATGCTAATGATGAAAATTTCTCTGGGG
ATGAAGGGGAGGAGGAAGCTGATCCAGAGGATGACCCAGCGCCCAATGGTGGAGCAGGAA
GCGATGATGATGAAGATGATGATGGTGATGATGAGAGCGATAGTGATGATGATGATGACG
ACGAGGATGAGGAGGACGAAGATGATGAGGAGGAG*AAGATGACGAAGATGTTCGCCAGC
CACCTGCTAAGAAGAGGAAATGAAACATGGGATTAAGTGGGGAGTGTTTTTTATGTGTGG
GTG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4GL66TF 737 0 0
GG
ATGCTTTCTGTCTCCTCATCTCTTAGAGTGAGTCCTTTACAGGTTCAGCTTCAGTTTCGA
GTAGATATGGAAGTGGTTGCCGCTAGGTCAATGGAGGAGACGCAGAGACAGCAGACATGG
GCTTGTTCTGCCACTGAGACGCTTCTCATCCTCCTTGGAAGGAACCTGACTTGTCTGCTC
CTCGCGGCGGAATCTTTGCTGATTGGGTTGATTGCTGAAGATCAGAGGCTTTCTGTGAAA
AAGGGTTACAAAAAAGGACGCCCTGATGAGGAGAACAAAGATGGCAGCGACTCTGATGAT
AACGATGACGACGACGATGAAGACGCTGACGCTGATGATGATGACGACGACGATGATGCT
AATGATGAAAATTTCTCTGGGGATGAAGTGGAGGAGGAAGCTGATCCAGAGGATGACCCA
GCGCCCAATGGTGGAGCAGGAAGCGATGATGATGAAGATGATGATGGTGATGATGAGAGC
GATAGTGATGATGATGATGACGACGAGGATGAGGATGACGAAGATGATGAGGAGGAGGAA
GATGACGAAGATGTTCGCCAGCCACCTGCTAAGAAGAGGAAATGAAACATGGGATTAAGT
GGGGAGTGTTTTT*ATGTGTGGGTGGTTAAAGACTTGAAGAGGATCTCGTATGTGTTATG
GTTTTAAGTAGTTCAGTGAAA*CCTCCTCTTTAT*CAGTTTCATCTTGT*GTGT*ACTAC
CATTTGTTGTTATCT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR4GL66JQ 621 0 0
TGGAAGGAACCTGACTTGTCTGCTCCTCGCGGCGGAATCTTTGCTGATTGGGTTGATTGC
TGAAGATCAGAGGCTTTCTGTGAAAAAGGGTTACAAAAAAGGACGCCCTGATGAGGAGAA
CAAAGATGGCAGCGACTCTGATGATAACGATGACGACGACGATGAAGACGCTGACGCTGA
TGATGATGACGACGACGATGATGCTAATGATGAAAATTTCTCTGGGGATGAAGTGGAGGA
GGAAGCTGATCCAGAGGATGACCCAGCGCCCAATGGTGGAGCAGGAAGCGATGATGATGA
AGATGATGATGGTGATGATGAGAGCGATAGTGATGATGATGATGACGACGAGGATGAGGA
TGACGAAGATGATGAGGAGGAGGAAGATGACGAAGATGTTCGCCAGCCACCTGCTAAGAA
GAGGAAATGAAACATGGGATTAAGTGGGGAGTGTTTTTTATGTGTGGGTGGTTAAAGACT
TGAAGAGGATCTCGTATGTGTTATGGTTTTAAGTAGTTCAGTGAAAACCTCCTCTTTATT
CAGTTTCATCTTGTTGTGTTACTACCATTTGTTGTTATCTCAGACTTTTCGACCTCGGAT
TTTAGTTTATGTTTCCTTTGC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 3

CO CL3759Contig1 1176 3 19 U
GTGTACAATAATGTATAGATGATTATTTATGTGTCCTGCAAATAACATTTATTGATTTTC
AAAAGTTGTATACATCCAAATGAGAGACTTACTAATACACATCACAACAACAGCTATATA
AATAATCATCTCTCAGCTTATAGATAAACGAATCCAAGCGCCTTTATAACTCTTCTCTTA
CATAACCCATTCCTCGAATCTACCAAGTTTATTGGACGCATTCTTCTTCCAGAAGGGCTT
GATCTCTGTGACATTACCAGTTTTCTTAAGGCAAAGGCTTCTGGTTGTGTCACAGACAGG
GTAATCACGAGGACAACAATGACGACCGTCTTTGCAACACACAGCAAACTCTAACTCGCA
GCATTTCCACGAGAAACACAAACCGAACAAGTTTCTAGCACAGCAACAAGTCTCGTTAGC
CGAACAATAGGTGAAAAGGTTGCACTTCGTGGGGCCTGGAGGTGACGGTGGAGGAGGGTT
CGGATGCGTCTTGACGGGATACGAAGCGAGCATGTTGATTCCACATACTCCTTCTGAACT
TCCCGTGTTACGCTGCATGTGCATAAACCCATCCATTCCCCAGCTTTTCCCCCACGAGTT
CTTCACGATCCAGTAGTCAACTCCGTTCTGTGAACCGTATCCTACGATGAGCACTGCGTG
GTCTAATGATGTTGAACACGGGCCAGAGAATATTCCCTTGGAGTATAGCTGAAACGCTCT
CTCGCTACCACAGATACCAACACTAACAGGCTGAGCCGCTACAGCTTCAAGTAACGCTTT
CTCGTCATTTGATTTCACACCAGCATAGCTATCAATTGTCACAACCCGTGTTTTCAACTT
ATCCTTCTTGCAGGTGCCATCACGTTCTTGATAAGGATAATCTTTCTCAGTGTCGATTCC
ATGGTTTTTAATGACAAATTCAAAAGCGTAGTCCATGAGACCACCATTGCATCCATCGTT
GTAGGACTTGTCTTTAAAGATTTGGATTCTGCGTTGTCTCTCTGTTTCAGAAGCGTACGT
TTTGCCGTGTCTCTGGCACCAAGCGTCGAACAGCTCGGAGATGTCATCGGAAGATGGTGA
CGAGAAGCTAGGAGAAATAACTAGAAGAAGGAAGAAGAAAGTGAGAGAGAGAAAGTAAGA
AGATGACGATGATGGTGACATCTCTTTTCCTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD27JQ U 1
AF RR4H926JQB U 30
AF RR4FD27TF C 533
BS 1 58 RR4FD27JQ
BS 59 59 RR4H926JQB
BS 60 99 RR4FD27JQ
BS 100 100 RR4H926JQB
BS 101 138 RR4FD27JQ
BS 139 139 RR4H926JQB
BS 140 297 RR4FD27JQ
BS 298 298 RR4H926JQB
BS 299 346 RR4FD27JQ
BS 347 347 RR4H926JQB
BS 348 374 RR4FD27JQ
BS 375 375 RR4H926JQB
BS 376 444 RR4FD27JQ
BS 445 445 RR4H926JQB
BS 446 480 RR4FD27JQ
BS 481 481 RR4H926JQB
BS 482 692 RR4FD27JQ
BS 693 829 RR4H926JQB
BS 830 1176 RR4FD27TF

RD RR4FD27JQ 692 0 0
GTGTACAATAATGTATAGATGATTATTTATGTGTCCTGCAAATAACATTTATTGATTT*C
AAAAGTTGTATACATCCAAATGAGAGACTTACTAATACATATCACAACAACAGCTATATA
AATAATCATCTCTCAGCT*ATAGATAAACGAATCCAAGCGCCTTTATAACTCTTCTCTTA
CATAACCCATTCCTCGAATCTACCAAGTTTATTGGACGCATTCTTCTTCCAGAAGGGCTT
GATCTCTGTGACATTACCAGTTTTCTTAAGGCAAAGGCTTCTGGTTGTGTCACAGACGGG
GTAATCACGAGGACAACAATGACGACCGTCTTTGCAACACACAGCAGACTCTAACTCGCA
GCATTTCCACGAGAGACACAAACCGAACAAGTTTCTAGCACAGCAACAAGTCTCGTTAGC
CGAACAATAGGTGAAAAGGTTGCATTTCGTGGGGCCTGGAGGTGACGGTGGAGGAGGGTT
TGGATGCGTCTTGACGGGATACGAAGCGAGCATGTTGATTCCACATACTCCTTCTGAACT
TCCCGTGTTACGCTGCATGTGCATAAACCCATCCATTCCCCAGCTTTTCCCCCACGAGTT
CTTCACGATCCAGTAGTCAACTCCGTTCTGTGAACCGTATCCTACGATGAGCACTGCGTG
GTCTAATGATGTTGAACACGGGCCAGAGAATA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4H926JQB 800 0 0
CGTCCTGCAAAT
ATAACATTTATTGATTTTCAAAAGTTGTATACATCCAAATGAGAGACTTACTAATACACA
TCACAACAACAGCTATATAAATAATCATCTCTCAGCTTATAGATAAACGAATCCAAGCGC
CTTTATAACTCTTCTCTTACATAACCCATTCCTCGAATCTGCCAAGTTTATTGGACGCAT
TCTTCTTCCAGAAGGGCTTGATCTCTGTGACATTACCAGTTTTCTTAAGGCAAAGGCTTC
TGGTTGTGTCACAGACAGGGTAATCACGAGGACAACAATGACGACCGTCTTTGCAACACA
CAGCAAACTCTAACTCGCAGCATTTCCACGAGAAACACAAACCGAACAAGTTTCTCGCAC
AGCAACAAGTCTCGTTAGCTGAGCAATAGGTGAAAAGGTTGCACTTCGTGGGGCCTGGAG
GTGACGGTGGAGGAGGGTTCGGATGCGTCTTGACGGGATACGAAGCGAGCATGTTGATTC
CACATACTCCTTCTGAACTTCCCGTGTTACGCTGCATGTGCATAAACCCATCCATTCCCC
AGCTTTTCCCCCACGAGTTCTTCACGATCCAGTAGTCAACTCCGTTCTGTGAACCGTATC
CTACGATGAGCACTGCGTGGTCTAATGATGTTGAACACGGGCCAGAGAATATTCCCTTGG
AGTATAGCTGAAACGCTCTCTCGCTACCACAGATACCAACACTAACAGGCTGAGCCGCTA
CAGCTTCAAGTAACGCTTTCTCGTCATTTGATTTCACACCAGCATAGCTATCAATTGTCA
CAACCCGT

QA 13 800 13 800
DS 

RD RR4FD27TF 644 0 0
TTCTG
ACTTCCCGTGTTACGCTGCATGTGCATAAACCCATCCATTCCCCAGCTTTTCCCCCACGA
GTTCTTCACGATCCAGTAGTCAACTCCGTTCTGTGAACCGTATCCTACGATGAGCACTGC
GTGGTCTAATGATGTTGAACACGGGCCAGAGAATATTCCCTTGGAGTATAGCTGAAACGC
TCTCTCGCTACCACAGATGCCAACACTAACAGGCTGAGCCGCTACAGCTTCCAGTAACGC
TTTCTCGTCGTTTGATTTCACACCAGCATAGCTATCAATTGTCACAACCCGTGTTTTCAA
CTTATCCTTCTTGCAGGTGCCATCACGTTCTTGATAAGGATAATCTTTCTCAGTGTCGAT
TCCATGGTTTTTAATGACAAATTCAAAAGCGTAGTCCATGAGACCACCATTGCATCCATC
GTTGTAGGACTTGTCTTTAAAGATTTGGATTCTGCGTTGTCTCTCTGTTTCAGAAGCGTA
CGTTTTGCCGTGTCTCTGGCACCAAGCGTCGAACAGCTCGGAGATGTCATCGGAAGATGG
TGACGAGAAGCTAGGAGAAATAACTAGAAGAAGGAAGAAGAAAGTGAGAGAGAGAAAGTA
AGAAGATGACGATGATGGTGACATCTCTTTTCCTTACCC

QA 6 644 6 644
DS 



AS 1 3

CO CL3760Contig1 803 3 2 U
TTGAGGAGGTCCCCTGTACAGGGGAGATAATCAGAAGGTGTAGGAACATTCATAAACCAG
TGATTGTCGCCACAAACATGCTAGAGAGTATGATTAATCATCCAACACCTACAAGAGCTG
AAGTATCTGACATTGCAATTGCAGTGCGTGAAGGTGCTGATGCAATCATGCTTTCTGGTG
AAACCGCACACGGAAAGTTTCCTCTGAAAGCTGTTAACGTGATGCACACCGTGGCTTTGA
GAACTGAGGCTAGTCTACCTGTCAGAACCTCAGCAATCCGCACTACTGCTTACAAGGGTC
GCATGGGCCAGATGTTCGCTTTCCATGCTTCTATAATGGCGAATACACTGAACACACCGA
TCATTGTGTTTACGAGAACTGGATCCATGGCAGTCCTTCTGAGTCATTACCGCCCTTCCT
CAACAATTTTCGCCTTCACAAACCAGAGAAGAATAATGCAGAGGCTGGCTCTTTACCAAG
GTGTCATGCCTATATACATGGAGTTTTCTGATGATGCAGAAGATACATACGCCCGTTCTT
TGAAACTCTTACAGGACGAGAATATGCTCAAGGAAGGACAACATGTAACGCTTGTCCAAA
GCGGTGCGCAACCCATTTGGCGTGAAGAATCAACACATCTCATACAAGTCCGTAAGATTA
AGATAGGTTGATGGTTTTTACTACTTGAGCTTCTTTCTACATCTCTGACTTCGTTTTTCT
CTACACGACATATTGTTTTAAGTCACTCACAGTGAAACCATATATATTTTTTTGTTTTAA
GTTATTGAACAGTCTTTTCGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4DX25JQ C 1
AF RR4A285TF U 222
AF RR4A285TFB U 222
BS 1 222 RR4DX25JQ
BS 223 803 RR4A285TF

RD RR4DX25JQ 803 0 0
TTGAGGAGGTCCCCTGTACAGGGGAGATAATCAGAAGGTGTAGGAACATTCATAAACCAG
TGATTGTCGCCACAAACATGCTAGAGAGTATGATTAATCATCCAACACCTACAAGAGCTG
AAGTATCTGACATTGCAATTGCAGTGCGTGAAGGTGCTGATGCAATCATGCTTTCTGGTG
AAACCGCACACGGAAAGTTTCCTCTGAAAGCTGTTAACGTGATGCACACCGTGGCTTTGA
GAACTGAGGCTAGTCTACCTGTCAGAACCTCAGCAATCCGCACCACTGCTTACAAGGGTC
GCATGGGCCAGATGTTCGCTTTCCATGCTTCTATAATGGCGAATACACTGAACACACCGA
TCATTGTGTTTACGAGAACTGGATCCATGGCAGTCCTTTTGAGTCATTACCGCCCTTCCT
CAACAATTTTCGCCTTCACAAACCAGAGAAGAATAATGCAGAGGCTGGCTCTTTACCAAG
GTGTCATGCCTATATACATGGAGTTTTCTGATGATGCAGAAGATACATACGCCCGTTCTT
TGAAACTCTTACAGGACGAGAATATGCTCAAGGAAGGACAACATGTAACGCTTGTCCAAA
GCGGTGCGCAACCCATTTGGCGTGAAGAATCAACACATCTCATACAAGTCCGTAAGATTA
AGATAGGTTGATGGTTTTTACTACTTGAGCTTCTTTCTACATCTCTGACTTCATTTTTCT
CTACACGACATATTGTTTTAAGTCACTCACAGTCAAACCATATATATTTTTTCGTTTTAA
GTTATTGAACAGTCTTTTCGATG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4A285TF 582 0 0
G
TGCACACCGTGGCTTTGAGAACTGAGGCTAGTCTACCTGTCAGAACCTCAGCAATCCGCA
CTACTGCTTACAAGGGTCGCATGGGCCAGATGTTCGCTTTCCATGCTTCTATAATGGCGA
ATACACTGAACACACCGATCATTGTGTTTACGAGAACTGGATCCATGGCAGTCCTTCTGA
GTCATTACCGCCCTTCCTCAACAATTTTCGCCTTCACAAACCAGAGAAGAATAATGCAGA
GGCTGGCTCTTTACCAAGGTGTCATGCCTATATACATGGAGTTTTCTGATGATGCAGAAG
ATACATACGCCCGTTCTTTGAAACTCTTACAGGACGAGAATATGCTCAAGGAAGGACAAC
ATGTAACGCTTGTCCAAAGCGGTGCGCAACCCATTTGGCGTGAAGAATCAACACATCTCA
TACAAGTCCGTAAGATTAAGATAGGTTGATGGTTTTTACTACTTGAGCTTCTTTCTACAT
CTCTGACTTCGTTTTTCTCTACACGACATATTGTTTTAAGTCACTCACAGTGAAACCATA
TATATTTTTTTGTTTTAAGTTATTGAACAGTCTTTTCGATG

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR4A285TFB 582 0 0
G
TGCACACCGTGGCTTTGAGAACTGAGGCTAGTCTACCTGTCAGAACCTCAGCAATCCGCA
CTACTGCTTACAAGGGTCGCATGGGCCAGATGTTCGCTTTCCATGCTTCTATAATGGCGA
ATACACTGAACACACCGATCATTGTGTTTACGAGAACTGGATCCATGGCAGTCCTTCTGA
GTCATTACCGCCCTTCCTCAACAATTTTCGCCTTCACAAACCAGAGAAGAATAATGCAGA
GGCTGGCTCTTTACCAAGGTGTCATGCCTATATACATGGAGTTTTCTGATGATGCAGAAG
ATACATACGCCCGTTCTTTGAAACTCTTACAGGACGAGAATATGCTCAAGGAAGGACAAC
ATGTAACGCTTGTCCAAAGCGGTGCGCAACCCATTTGGCGTGAAGAATCAACACATCTCA
TACAAGTCCGTAAGATTAAGATAGGTTGATGGTTTTTACTACTTGAGCTTCTTTCTACAT
CTCTGACTTCGTTTTTCTCTACACGACATATTGTTTTAAGTCACTCACAGTGAAACCATA
TATATTTTTTTGTTTTAAGTTATTGAACAGTCTTTTCGATG

QA 2 582 2 582
DS 



AS 1 3

CO CL3761Contig1 833 3 5 U
GGATTAAGAAAAGCTGCTGTCTTCATATAAAAAAGCCAGAGCTATCTCAAGTTTATCTTA
CAAAAATTAAAGCATCTTTCTTCCCAAAAAGGGTTCAAACGATAAACAGGAAAAAACCAA
CAACGTAGCAAAAACTTAAAATGTTTTATTTAAGTAAAAGGAGCAAACACAACTCTGATC
TTCTTCTTCTCGTCACAAAGAAACTGGCACTTTGTCTAGTAGGGCTCCACAGGTTTGCGG
AAGTTAGCTCCAGCGTAAACTGCCTCTGATCCCAACTCCTCCTCAATACGCAAAAGCTGG
TTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCAAGGAGCTCCAGTCTTGATTTGTCCAGTAGAC
AAGCCAACAGCTAGGTCAGCGATGAAGGTGTCCTCGGTTTCACCACTTCTGTGGCTGGTC
ATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCCTCACTGCCTCAATACTCTCTGTCACTGAC
CCGATTTGGTTAACCTTCAAGAGAAGAGCATTGCAAGACTTCTCTGCGATTGCCTTCGCA
ACCCTCTTGGGGTCGGTGACCAACAAGTCATCACCGACAATCTGAACATTGTCTCCACAC
TCAGCGGTCATCTTAACGTAATGCTCCCAGTCATCTTGGTCAAATGGATCCTCAATAGAC
ACGATTGGGTACTCCGAAACAAAGGACTTGTAGAGGTCCTTGAGTGCATCACCAGAAATC
TTCTGAGAGCCATTGTTGTTCTCTTCCTTGAAATTCAAGTCGTAGGTCTTGTCTGATGAG
TAGAACTCGGAAGCGGCAACATCCATTCCAATGACAACCTTGCCAGTGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4G814JQ U 6
AF RR4B941JQ U 1
AF RR4FW53JQ U 44
BS 1 245 RR4B941JQ
BS 246 246 RR4G814JQ
BS 247 654 RR4B941JQ
BS 655 655 RR4FW53JQ
BS 656 833 RR4B941JQ

RD RR4G814JQ 246 0 0
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ATTAAAGCATCTTTCTTCCCAAAAAGGGTTCAAACGATAAACAGGAAAAAACCAACAACG
TAGCAAAAACTTAAAATGTTTTATTTAAGTAAAAGGAGCAAACACAACTCTGATCTTCTT
CTTCTCGTCACAAAAAAACTGGCACTTTGTCTAGTGGGGCTCCACAGGTTTGCGGAAGTT
AGCTCC

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR4B941JQ 833 0 0
GGATTAAGAAAAGCTGCTGTCTTCATATAAAAAAGCCAGAGCTATCTCAAGTTTATCTTA
CAAAAATTAAAGCATCTTTCTTCCCAAAAAGGGTTCAAACGATAAACAGGAAAAAACCAA
CAACGTAGCAAAAACTTAAAATGTTTTATTTAAGTAAAAGGAGCAAACACAACTCTGATC
TTCTTCTTCTCGTCACAAAGAAACTGGCACTTTGTCTAGTAGGGCTCCACAGGTTTGCGG
AAGTTGGCTCCAGCGTAAACTGCCTCTGATCCCAACTCCTCCTCAATACGCAAAAGCTGG
TTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCAAGGAGCTCCAGTCTTGATTTGTCCAGTAGAC
AAGCCAACAGCTAGGTCAGCGATGAAGGTGTCCTCGGTTTCACCACTTCTGTGGCTGGTC
ATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCCTCACTGCCTCAATACTCTCTGTCACTGAC
CCGATTTGGTTAACCTTCAAGAGAAGAGCATTGCAAGACTTCTCTGCGATTGCCTTCGCA
ACCCTCTTGGGGTCGGTGACCAACAAGTCATCACCGACAATCTGAACATTGTCTCCACAC
TCAGCGGTCATCTTAACGTAATGCTCCCAGTCATCTTGGTCAAATGGATCCTCAGTAGAC
ACGATTGGGTACTCCGAAACAAAGGACTTGTAGAGGTCCTTGAGTGCATCACCAGAAATC
TTCTGAGAGCCATTGTTGTTCTCTTCCTTGAAATTCAAGTCGTAGGTCTTGTCTGATGAG
TAGAACTCGGAAGCGGCAACATCCATTCCAATGACAACCTTGCCAGTGTAGCC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4FW53JQ 787 0 0
ATCTCAAGTTTATCTTACAAAAATTAAAGCATCTTTCTTCCCAAAAAGGGTTCAAACGAT
AAACAGGAAAAAACCAACAACGTAGCAAAAACTTAAACTGTTTTATTTAAGTAAAAGGAG
CAAACACAACTCTGATCTTCTTCTTCTCGTCACAAAGAAACTGGCACTTTGTCTAGTAGG
GCTCCACAGGTTTGCGGAAGTTAGCTCCAGCGTAAACTGCCTCTGATCCCAACTCCTCCT
CAATACGCAAAAGCTGGTTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCGAGGAGCTCCAGTCT
TGATTTGTCCAGTAGACAAGCCAACAGCTAGGTCAGCGATGAAGGTGTCCTCGGTTTCAC
CACTTCTGTGGCTGGTCATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCCTCACTGCCTCAA
TACTCTCTGTCACTGACCCGATTTGGTTAACCTTCAAGAGAAGAGCATTGCAAGACTTCT
CTGCGATTGCCTTCGCAACCCTCTTGGGGTTGGTGACCAACAAGTCATCACCGACAATCT
GAACATTGTCTCCACACTCAGCGGTCATCTTAGCGTAGTGCTCCCAGTCATCTTGGTCAA
ATGGATCCTCAATAGACACGATTGGGTACTCCGAAACAAAGGACTTGTAGAGGTCCTTGA
GTGCATCACCAGAAATCTTCTGAGAGCCATTGTTGTTCTCTTCCTTGAAATTCAAGTCGT
AGGTCTTGTCTGATGAGTAGAACTCGGAAGCGGCAACATCCATTCCAATGACA*CCTTGC
CAGTGTA

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL3762Contig1 687 2 3 U
GGATCGAAACATCTAATTTAATGGAGTCATCTTCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCT
CTTACTTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCTTCACTTTCTTATCCATCAATGCAGAAAT
TTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCTAACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAG
AAGCTTCACCGGAGGCTAAGGCAGCGAAGCATCTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAG
TGAGGATAGTGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTATAACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAG
AATTCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGTGATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTC
GATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGAATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTA
AAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACAGCGCCTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCA
ACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAGACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATA
AGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACCGTTTGTACATACACATAAGTATATATAC
CATTGTTCTTGTTAAACTCAGGGTTTTAATCATAGACTATTTGCTTGAAAATGACATAAG
TAATAATCAAGAATCAAGATTGATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H753TF U 9
AF RR4DS16TF U 1
BS 1 247 RR4DS16TF
BS 248 249 RR4H753TF
BS 250 687 RR4DS16TF

RD RR4H753TF 595 0 0
GG
ATCTAATTTAATGGAGTCATCTTCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCTCTTACTTCAA
TCCTCCAAAACTTAGAAAGCCTTCACTTTCTTATCCATCAATGCAGAAATTTCGAAATCG
CAAACCAACTCGCATTTGTTCTAACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAGAAGCTTCACC
GGAGGCTAAGGCAGCGAAGCATCTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAGTGAGGATAGT
GTCTGCTCAGCTTGAGAGTTATAACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAGAATTCTTAGA
CACAAACTCTGTTAGTGACGGTGATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTCGATCTTCACG
TCACATGAACTTAGCCCTTCGAATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTAAAAACGATTT
CGAATGGGACAATTTACAGCGCCTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCAACACAAAACT
CATGCGTGAATACGTCTTGGAGACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATAAGTGAAAGCT
CAGAGTATACACACATGAAACCGTTTGTACATACACATAAGTATATATACCAT

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR4DS16TF 687 0 0
GGATCGAAACATCTAATTTAATGGAGTCATCTTCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCT
CTTACTTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCTTCACTTTCTTATCCATCAATGCAGAAAT
TTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCTAACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAG
AAGCTTCACCGGAGGCTAAGGCAGCGAAGCATCTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAG
TGAGGAT**TGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTATAACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAG
AATTCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGTGATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTC
GATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGAATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTA
AAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACAGCGCCTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCA
ACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAGACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATA
AGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACCGTTTGTACATACACATAAGTATATATAC
CATTGTTCTTGTTAAACTCAGGGTTTTAATCATAGACTATTTGCTTGAAAATGACATAAG
TAATAATCAAGAATCAAGATTGATTTG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL3763Contig1 538 3 5 U
GAACTCAGGATTTGGCCGAAGCAGACTGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCAAA
GCCCCCTGGAGAGGCGACGACGATGACTCCGATAAATTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGGTC
ACCAAGGAATCTGACGGTATGTCGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAGGT
AGTCTCGCCGATGACGATGATTCCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCTTCAAT
CGAAACTATCAGTTCCTGCAAAGAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTCTTCCT
CCTACCATGGCTTACAATGTCTCTCGCAACTTGAGCTTCTTCACCCGCATTTTCACTCAG
TTCTTTGATCCTGAAGGCATTGCAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGAAGAC
AAAGCTCGTCGTGTTAGTTGAGATTTGAATGGACGCTGCGTTCTTGTTATGTTATTTAAA
ATAAAGATAATTTGTATCCTTTTTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4CO34TF U 1
AF RR4G488JQ C 21
AF RR4G488TF U 21
BS 1 343 RR4CO34TF
BS 344 344 RR4G488TF
BS 345 458 RR4CO34TF
BS 459 459 RR4G488TF
BS 460 538 RR4CO34TF

RD RR4CO34TF 538 0 0
GAACTCAGGATTTGGCCGAAGCAGACTGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCAAA
GCCCCCTGGAGAGGCGACGACGATGACTCCGATAAATTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGGTC
ACCAAGGAATCTGACGGTATGTCGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAGGT
AGTCTCGCCGATGACGATGATTCCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCTTCAAT
CGAAACTATCAGTTCCTGCAAAGAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTCTTCCT
CCTACCATGGCTTACAATGTCTCTCGCAACTTGAGCTTCTTCAGCCGCATTTTCACTCAG
TTCTTTGATCCTGAAGGCATTGCAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGAAGAC
AAAGCTCGTCGTGTTAGTTGAGATTTGAATGGACGCTGTGTTCTTGTTATGTTATTTAAA
ATAAAGATAATTTGTATCCTTTTTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGCACT

QA 1 538 1 538
DS 

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GG
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ATGACTCCGATAAATTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGGTCACCAAGGAATCTGACGGTATGT
CGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAGGTAGTCTCGCCGATGACGATGATT
CCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCTTCAATCGAAACTATCAGTTCCTGCAAA
GAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTCTTCCTCCTACCATGGCTTACAATGTCT
CTCGCAACTTGAGCTTCTTCACCCGCATTTTCACTCAGTTCTTTGATCCTGAAGGCATTG
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ATTTGAATGGACGCTGCGTTCTTGTTATGTTATTTAAAATAAAGATAATTTGTATCCTTT
TTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGCAC
C

QA 3 517 3 517
DS 

RD RR4G488TF 518 0 0
GG
AGACTGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCAAAGCCCCCTGGAGAGGCGACGACG
ATGACTCCGATAAATTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGGTCACCAAGGAATCTGACGGTATGT
CGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAGGTAGTCTCGCCGATGACGATGATT
CCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCTTCAATCGAAACTATCAGTTCCTGCAAA
GAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTCTTCCTCCTACCATGGCTTACAATGTCT
CTCGCAACTTGAGCTTCTTCACCCGCATTTTCACTCAGTTCTTTGATCCTGAAGGCATTG
CAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGAAGACAAAGCTCGTCGTGTTAGTTGAG
ATTTGAATGGACGCTGCGTTCTTGTTATGTTATTTAAAATAAAGATAATTTGTATCCTTT
TTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGCAC
C

QA 3 517 3 517
DS 



AS 1 2

CO CL3764Contig1 1302 2 4 U
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GTGGAGGAAGGCAAAGAAGGTAGCGATGGAAGACCATCCGTTGGACCTGTGTACCGAAGT
ATCTTCGCCAAGGACGGCTTCCCGGAGCCGATCGAAGGAATGGATAGCTGCTGGGATGTT
TTCCGGATGGCTGTTGAGAAGTATCCAGAGAATCCGATGCTTGGCCGCCGTGAGATTGTT
GACGGAAAGCCGGGGAAGTATGTATGGCAAACGTACCAAGAAGTGTACGACATTGTTATA
AAGCTGGGAAACTCTCTCCGAAGTTGTGGATATACGCCTTGAATCTGTACCCGAGATGGA
ATATGATGCTCTTGCAAGTACTCCACGTGGTGAAATCTGCATTAGGGGAAAGACCCTTTT
CTCTGGATACTACAAACGTGAAGACCTCACAAAAGAGGTTCTTATCGATGGATGGCTGCA
CACAGGTGATGTTGGTGAATGGCAACCAAATGGAAGCATGAAGATAATTGACAGGAAGAA
GAATATCTTTAAACTCTCACAAGGAGAGTATGTTGCGGTAGAGAACTTGGAAAACATCTA
TGGTGAAGTTCAAGCTGTTGATTCCGTGTGGGTGTACGGGAACAGCTTTGAATCATTCCT
AGTGGCAGTCGCCAATCCAAACCAGCATATCCTTGAAAAATGGGCTGCAGAAAACGGTGT
GAGCGGTGACTACAACGCTCTCTGTCAAAACGCCAAGGCAAAGGAGTTCATACTCGGAGA
ACTTGTGAAAATGGGCAAAGAGAAGAAGATGAAGGGGTTCGAGATCATCAAGGCGGTTCA
TCTAGACCCAGTGCCATTTGACATGGAACGCGACCTTCTCACTCCGACCTACAAAAAGAA
GAGGCCTCAATTGCTGAAACACTTCCAGGTATAACATATAATGCGATTATAAGCGGTATT
TTACAATCTAATGATGTTAAGTGTTAACTCAAGTTTCTTTCCCATTTGACAGAGTGTGAT
CGATGAAATGTACAAGACTACCAATGAGAGCTTAGCTTCCAGAAAGTAAATCCCTCCTCA
AATATCCGGTCTCTTTTGTTTTTTCTTTGGGTCTCTCACTGTTCACGACGATGACTTTGT
CAGTAGGCTCTTCTATCATTTGTGTACAATATTTCGTAGCATCAGATCAGAGCTTGCTAA
ACACTGTCTTCTTTTCAAATCTGACTTTTATCTGTTAAATTACTAAGTTTAATTGTTAAT
CCTTTCAAACTCTTGAGCATAAAGTATCCTATCTTGTGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F120TF U 1
AF RR4EE32TF U 613
BS 1 699 RR4F120TF
BS 700 700 RR4EE32TF
BS 701 721 RR4F120TF
BS 722 1302 RR4EE32TF

RD RR4F120TF 721 0 0
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GTGGAGGAAGGCAAAGAAGGTAGCGATGGAAGACCATCCGTTGGACCTGTGTACCGAAGT
ATCTTCGCCAAGGACGGCTTCCCGGAGCCGATCGAAGGAATGGATAGCTGCTGGGATGTT
TTCCGGATGGCTGTTGAGAAGTATCCAGAGAATCCGATGCTTGGCCGCCGTGAGATTGTT
GACGGAAAGCCGGGGAAGTATGTATGGCAAACGTACCAAGAAGTGTACGACATTGTTATA
AAGCTGGGAAACTCTCTCCGAAGTTGTGGATATACGCCTTGAATCTGTACCCGAGATGGA
ATATGATGCTCTTGCAAGTACTCCACGTGGTGAAATCTGCATTAGGGGAAAGACCCTTTT
CTCTGGATACTACAAACGTGAAGACCTCACAAAAGAGGTTCTTATCGATGGATGGCTGCA
CACAGGTGATGTTGGTGAATGGCAACCAAATGGAAGCATGAAGATAATTGACAGGAAGAA
GAATATCTTTAAACTCTCACAAGGAGAGTATGTTGCGGTAGAGAACTTGGAAAACATCTA
TGGTGAAGTTCAAGCTGTTGATTCCGTGTGGGTGTACGGGAACAGCTTTGAATCATTCCT
AGTGGCAGTCGCCAATCCAAACCAGCATATCCTTGAAAA*TGGGCTGCAGAAAACGGTGT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4EE32TF 690 0 0
G
GCTGTTGATTCCGTGTGGGTGTACGGGAACAGCTTTGAATCATTCCTAGTGGCAGTCGCC
AATCCAAACCAGCATATCCTTGAAAAATGGGCTGCAGAAAACGGTGTGAGCGGTGACTAC
AACGCTCTCTGTCAAAACGCCAAGGCAAAGGAGTTCATACTCGGAGAACTTGTGAAAATG
GGCAAAGAGAAGAAGATGAAGGGGTTCGAGATCATCAAGGCGGTTCATCTAGACCCAGTG
CCATTTGACATGGAACGCGACCTTCTCACTCCGACCTACAAAAAGAAGAGGCCTCAATTG
CTGAAACACTTCCAGGTATAACATATAATGCGATTATAAGCGGTATTTTACAATCTAATG
ATGTTAAGTGTTAACTCAAGTTTCTTTCCCATTTGACAGAGTGTGATCGATGAAATGTAC
AAGACTACCAATGAGAGCTTAGCTTCCAGAAAGTAAATCCCTCCTCAAATATCCGGTCTC
TTTTGTTTTTTCTTTGGGTCTCTCACTGTTCACGACGATGACTTTGTCAGTAGGCTCTTC
TATCATTTGTGTACAATATTTCGTAGCATCAGATCAGAGCTTGCTAAACACTGTCTTCTT
TTCAAATCTGACTTTTATCTGTTAAATTACTAAGTTTAATTGTTAATCCTTTCAAACTCT
TGAGCATAAAGTATCCTATCTTGTGGTGG

QA 2 690 2 690
DS 



AS 1 3

CO CL3765Contig1 1042 3 3 U
GGAAAACCCAATGGTACAGAGACGGTGTTTCTTACTGGGAAGGTGTCGAAGCATCTGTTG
ATGGAGTATTAGGAGGATATTGGCATGTTAATGATGCTGATATTACAGGGAGTGAGGTTT
TTCTCAAGACTCTTATGCAAGAAAGATTATTAGTCAATGGAGGAACAAATCAGCATCTAG
TGGCTCTTGTTTGTGGTTCTGGTATTGGAAGGATCACCAAGAATCTTCCGATACGGTATT
TCAATGAGGTTGATCTTCTTGAGCCTGTAGCGCAGTTTCTTGATGCCGCACGTGAGAATT
TGGCATCCATTGGCTCAGAAACCCACAAAGCAACTAACTTTTTCTGTGTACCTCTTCAGG
AGTTTACTCCAGCCGCTCAAAGGTACGATGTCATATGGGTTCAATGGTGCATTGGTCATC
TCACTGATGATGATTTTGTTTCTTTCTTCAACCGGGCAAAGGGATGCCTTAAACCCGGTG
GGTTTTTTGTTGTGAAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGATTTGTTTTGGACAAAGAGGATC
GTAGCATCACCAGATCCAATCCGTACTTTAAAGAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTTACATG
TCTATCAAACAAAGGATCAGAAGGGTCTTCCTCAGGAGTTATTTGCTGTGAAAATGTATG
CTTTAACAGTTGATACACCACCAAAAGTCCACAGAACCAGATCCAATACTCGCAGTAACC
GACCACAAATCATCAAATGATGACAGGCTTCTGGTTTGTGTGTTTACGAGTTTTTCACCT
TTGATTTAAAGAGAGAAGCTATCAAAGTTATTGTAAGATATGTGAATCAAGGCTTAGCTG
GTTCAGGAACGGTTCAGAGTTACGTTGTTTGGTTTTGGCCGGTTCGAATCTCCTGTCCTC
GCTTGGTTTTATGCACCTTCTTGTTCATTGTCTGATAATTTGCTCGAACCTGACGATATA
TGTACTATTCAAATGGCGATTTGTAATCAGAATCGAAGTTGCTTCTTATTAAATCATCTT
TGCAACTGAGAAGCCTTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK82TF U 1
AF RR4CC89TF U 483
AF RR4EK82JQ C 356
BS 1 722 RR4EK82TF
BS 723 1007 RR4CC89TF
BS 1008 1042 RR4EK82JQ

RD RR4EK82TF 722 0 0
GGAAAACCCAATGGTACAGAGACGGTGTTTCTTACTGGGAAGGTGTCGAAGCATCTGTTG
ATGGAGTATTAGGAGGATATTGGCATGTTAATGATGCTGATATTACAGGGAGTGAGGTTT
TTCTCAAGACTCTTATGCAAGAAAGATTATTAGTCAATGGAGGAACAAATCAGCATCTAG
TGGCTCTTGTTTGTGGTTCTGGTATTGGAAGGATCACCAAGAATCTTCCGATACGGTATT
TCAATGAGGTTGATCTTCTTGAGCCTGTAGCGCAGTTTCTTGATGCCGCACGTGAGAATT
TGGCATCCATTGGCTCAGAAACCCACAAAGCAACTAACTTTTTCTGTGTACCTCTTCAGG
AGTTTACTCCAGCCGCTCAAAGGTACGATGTCATATGGGTTCAATGGTGCATTGGTCATC
TCACTGATGATGATTTTGTTTCTTTCTTCAACCGGGCAAAGGGATGCCTTAAACCCGGTG
GGTTTTTTGTTGTGAAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGATTTGTTTTGGACAAAGAGGATC
GTAGCATCACCAGATCCAATCCGTACTTTAAAGAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTTACATG
TCTATCAAACAAAGGATCAGAAGGGTCTTCCTCAGGAGTTATTTGCTGTGAAAATGTATG
CTTTAACAGTTGATACACCACCAAAAGTCCACAGAACCAGATCCAATACTCGCAGTAACC
GA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CC89TF 525 0 0
TTTTTTGTTGTGAAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGATTTGTTTTGGACAAAGAGGATCGT
AGCATCACCAGATCCAATCCGTACTTTAAAGAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTTACATGTC
TATCAAACAAAGGATCAGAAGGGTCTTCCTCAGGAGTTATTTGCTGTGAAAATGTATGCT
TTAACAGTTGATACACCACCAAAAGTCCACAGAACCAGATCCAATACTCGCAGTAACCGA
CCACAAATCATCAAATGATGACAGGCTTCTGGTTTGTGTGTTTACGAGTTTTTCACCTTT
GATTTAAAGAGAGAAGCTATCAAAGTTATTGTAAGATATGTGAATCAAGGCTTAGCTGGT
TCAGGAACGGTTCAGAGTTACGTTGTTTGGTTTTGGCCGGTTCGAATCTCCTGTCCTCGC
TTGGTTTTATGCACCTTCTTGTTCATTGTCTGATAATTTGCTCGAACCTGACGATATATG
TACTATTCAAATGGCGATTTGTAATCAGAATCGAAGTTGCTTCTT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4EK82JQ 687 0 0
TCAGGAGTTTACTCCAGCCGCTCAAAGGTACGATGTCATATGGGTTCAATGGTGCATTGG
TCATCTCACTGATGATGATTTTGTTTCTTTCTTCAACCGGGCAAAGGGATGCCTTAAACC
CGGTGGGTTTTTTGTTGTGAAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGATTTGTTTTGGACAAAGA
GGATCGTAGCATCACCAGATCCAATCCGTACTTTAAAGAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTT
ACATGTCTATCAAACAAAGGATCAGAAGGGTCTTCCTCAGGAGTTATTTGCTGTGAAAAT
GTATGCTTTAACAGTTGATACACCACCAAAAGTCCACAGAACCAGATCCAATACTCGCAG
TAACCGACCACAAATCATCAAATGATGACAGGCTTCTGGTTTGTGTGTTTACGAGTTTTT
CACCTTTGATTTAAAGAGAGAAGCTATCAAAGTTATTGTAAGATATGTGAATCAAGGCTT
AGCTGGTTCAGGAACGGTTCAGAGTTACGTTGTTTGGTTTTGGCCGGTTCGAATCTCCTG
TCCTCGCTTGGTTTTATGCACCTTCTTGTTCATTGTCTGATAATTTGCTCGAACCTGACG
ATATATGTACTATTCAAATGGTGATTTGTAATCAGAATCGAAGTTGCTTCTTATTAAATC
ATCTTTGCAACTGAGAAGCCTTTCATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL3766Contig1 780 2 3 U
GGAGTCAAAGTCCTCACTGTTATTATAGTGTAGATTAGGTGTCCACTGAGTAACAATAAG
TGCATGAACTCATAAGATCTTAAAAACTAAAAAATACCAAAACAAAAGAGAAGAAATGCC
AACAGAGCCCCAAAACACCGTCAGGAACTGTTTCCTGTTCTTTATTTGATCATGAAACAT
AAAACCTTGAGAAGATGAGGATGATGATTAGGCAAAAAGATCACTTGACCACACAGATCT
TGTTAACAGAAGCAGCTCCAATACGGTGCAGAGCCACCACAGAATCACCGTGGTTACAGA
GTCCTTTCTCAGTAGCCGACTTCAAAGCAGACTCGATAATCTCCTCCGTAAATTCACTGT
CAGTAGCTTTCGCAAAACCTTCAGCCAAAACCGGAATCAAACCTCTGTATATCAAACTAT
GCCTCGCTGGCGACTCATCGCTGCAGCTCCAGTTAAACGTATCGCTGGTGAAAACCGGAA
CAACCACCGAGAGAATCGGAACAGCTGGTCTGTACTTAGCCACTAGTTTCGCCGTTGTAC
CTCCTCTGGTCAACACGATGATGAGTTTGGCCCTGGCTTTGTTTGCCGTTCTCACAGCGG
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AGATTGTGTTGTAGTCAAGCGATGACTCAGCTTCGATGCAGATTTTAGCCATAGTTTTCA
CTACTATCTCAGGGTAGGCTCCCGCAGCGCTTTCACCGCTGAGCATGACGCAGTCCGTGC


BQ
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AF RR4BS26JQ U 275
AF RR4BS26TF C 1
BS 1 278 RR4BS26TF
BS 279 521 RR4BS26JQ
BS 522 780 RR4BS26TF

RD RR4BS26JQ 247 0 0
CACC
ACAGAATCACCGTGGTTACAGAGTCCTTTCTCAGTAGCCGACTTCAAAGCAGACTCGATA
ATCTCCTCCGTAAATTCACTGTCAGTAGCTTTCGCAAAACCTTCAGCCAAAACCGGAATC
AAACCTCTGTATATCAAACTATGCCTCGCTGGCGACTCATCGCTGCAGCTCCAGTTAAAC
GTATCGCTGGTGAAAACCGGAACAACCACCGAGAGAATCGGAACAGCTGGTCTGTACTTA
GCC

QA 5 247 5 247
DS 

RD RR4BS26TF 780 0 0
GGAGTCAAAGTCCTCACTGTTATTATAGTGTAGATTAGGTGTCCACTGAGTAACAATAAG
TGCATGAACTCATAAGATCTTAAAAACTAAAAAATACCAAAACAAAAGAGAAGAAATGCC
AACAGAGCCCCAAAACACCGTCAGGAACTGTTTCCTGTTCTTTATTTGATCATGAAACAT
AAAACCTTGAGAAGATGAGGATGATGATTAGGCAAAAAGATCACTTGACCACACAGATCT
TGTTAACAGAAGCAGCTCCAATACGGTGCAGAGCCACCACAGAATCACCGTGGTTACAGA
GTCCTTTCTCAGTAGCCGACTTCAAAGCAGACTCGATAATCTCCTCCGTAGATTCACTGT
CAGTAGCTTTCGCAGAACCTTCAGCCAAAACCGGAATCAAACCTCTGTATATCAAACTAT
GCCTCGCTGGCGACTCATCGCTGCAGCTCCAGTTAAACGTATCGCTGGTGAAAACCGGAA
CAACCACCGAGAGAATCGGAACAGCTGGTCTGTACTTAGCCACTAGTTTCGCCGTTGTAC
CTCCTCTGGTCAACACGATGATGAGTTTGGCCCTGGCTTTGTTTGCCGTTCTCACAGCGG
ATGACGCAAGACTCTCCAGCGTGCTCATCGGAAGTGGAGTTGCTCTAATCATCTCCTTGA
AGATTGTGTTGTAGTCAAGCGATGACTCAGCTTCGATGCAGATTTTAGCCATAGTTTTCA
CTACTATCTCAGGGTAGGCTCCCGCAGCGCTTTCACCGCTGAGCATGACGCAGTCCGTGC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 3

CO CL3767Contig1 644 3 1 U
GGAGGCGCGAGCCTCTTAAGCTTGTGGATGGTGGTGAATCACAGAGAACTTTCATCTACA
TCAAAGATGCCATTGAAGCTGTCCTCTTGATGATTGAAAACCCAGAGAGAGCCAATGGGC
ATATCTTCAATGTAGGAAACCCAAACAATGAAGTGACAGTAAGGCAGCTTGCGGAAATGA
TGACTAAGGTCTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACGGCTATAGAGAGTCCAACTATA*ATG
TGAGCTCCAAAGAATTCTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCCAGACA
TGACCATCATCAACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACATCTCTTTGGGACTTGCTTG
AGTCGACCTTAACATACCAGCACAGGACCTATGCTGAAGCTGTTAAGAAGGCCACTTCAA
AACCAGTCGCATCTTAGAGGTCATCATCACCTCGAACCATTTGGCGGCTACTATTTCCAT
TATTTTTGTTTCTACACAATATTTCCCTTAATAGGCCACTCACTCTAAGCGAATGATATA
TCATATGGTGGTTGGTTCTAGTTAACGTTTTATTGTTATATAGAGTATTACTGTTAATGT
TTTTGAGTTCGTTGTTGAAGCTTTATATCTTTGTATTTGTCCCC


BQ
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AF RR4DH90JQ C 1
AF RR4DH90TF U 1
AF RR4BH07TF U 12
BS 1 644 RR4DH90TF

RD RR4DH90JQ 644 0 0
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TCAAAGATGCCATTGAAGCTGTCCTCTTGATGATTGAAAACCCAGAGAGAGCCAATGGGC
ATATCTTCAATGTAGGAAACCCAAACAATGAAGTGACAGTAAGGCAGCTTGCGGAAATGA
TGACTAAGGTCTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACGGCTATAGAGAGTCCAACTATA*ATG
TGAGCTCCAAAGAATTCTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCCAGACA
TGACCATCATCAACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACATCTCTTTGGGACTTGCTTG
AGTCGACCTTAACATACCAGCACAGGACCTATGCTGAAGCTGTTAAGAAGGCCACTTCAA
AACCAGTCGCATCTTAGAGGTCATCATCACCTCGAACCATTTGGCGGCTACTATTTCCAT
TATTTTTGTTTCTACACAATATTTCCCTTAATAGGCCACTCACTCTAAGCGAATGATATA
TCATATGGTGGTTGGTTCTAGTTAACGTTTTATTGTTATATAGAGTATTACTGTTAATGT
TTTTGAGTTCGTTGTTGAAGCTTTATATCTTTGTATTTGTCCCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4DH90TF 644 0 0
GGAGGCGCGAGCCTCTTAAGCTTGTGGATGGTGGTGAATCACAGAGAACTTTCATCTACA
TCAAAGATGCCATTGAAGCTGTCCTCTTGATGATTGAAAACCCAGAGAGAGCCAATGGGC
ATATCTTCAATGTAGGAAACCCAAACAATGAAGTGACAGTAAGGCAGCTTGCGGAAATGA
TGACTAAGGTCTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACGGCTATAGAGAGTCCAACTATA*ATG
TGAGCTCCAAAGAATTCTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCCAGACA
TGACCATCATCAACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACATCTCTTTGGGACTTGCTTG
AGTCGACCTTAACATACCAGCACAGGACCTATGCTGAAGCTGTTAAGAAGGCCACTTCAA
AACCAGTCGCATCTTAGAGGTCATCATCACCTCGAACCATTTGGCGGCTACTATTTCCAT
TATTTTTGTTTCTACACAATATTTCCCTTAATAGGCCACTCACTCTAAGCGAATGATATA
TCATATGGTGGTTGGTTCTAGTTAACGTTTTATTGTTATATAGAGTATTACTGTTAATGT
TTTTGAGTTCGTTGTTGAAGCTTTATATCTTTGTATTTGTCCCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4BH07TF 633 0 0
G
CTCTTAAGCTTGTGGATGGTGGTGAATCACAGAGAACTTTCATCTACATCAAAGATGCCA
TTGAAGCTGTCCTCTTGATGATTGAAAACCCAGAGAGAGCCAATGGGCATATCTTCAATG
TAGGAAACCCAAACAATGAAGTGACAGTAAGGCAGCTTGCCGAAATGATGACTAAGGTCT
ACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACAGCTATAGAGAGCCCAACTATAGATGTGAGCTCCAAAG
AATTCTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCCAGACATGACCATCATCA
ACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACATCTCTTTGGGACTTGCTTGAGTCGACCTTAA
CATACCAGCACAGGACCTATGCTGAAGCTGTTAAGAAGGCCACTTCAAAACCAGTCGCAT
CTTAGGGGTCATCATCACCTCGAACCATTTGGCGGCTACTATTTCCATTATTTTTGTTTT
TACACAATATTTCCCTTAATAGGCCACTCACTCTAAGCGAATGATATATCATATGGTGGT
TGGTTCTAGTTAACGTTTTATTGTTATATAGAGTATTACTGTTAATGTTTTTGAGTTCGT
TGTTGAAGCTTTATATCTTTGTATTTGTCCCC

QA 2 633 2 633
DS 



AS 1 3

CO CL3768Contig1 936 3 2 U
GGAGACACCTTCAATTCAATTTCTAAAACCCTAATTTTTCTCGCTTCAGTCAACCACCAC
TGCACTGTACACATCGATGGTGAAGAAGCCATGATGATTTGAAAAAGAGTGAAGTATCTG
TTTTTTCTTTTCTTACATTTCTTATTAATTTTCAGAATGGGGGATTCCGACAAGGACTCC
GGTGGAGGACAAAACGGACAGCCTCCGTTGTCTCCAAGAGAGCAAGACAGGTTCCTACCG
ATCGCTAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAGGCCTTGCCGGCAAACGCCAAGATCTCCAAA
GATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGTGCGTCTCCGAGTTTATAAGCTTCGTCACGGGAGAG
GCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGGAAGACGATCAACGGCGACGATTTGCTTTGG
GCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGGATTACGTTGAGCCGCTGAAGATTTACTTGCAGAGG
TTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAAGGCTGGACTTGGGAGGCCACATACAGGTGGCGAAGCT
GGAGAGCATCAGAGAGATGCAGGTGTTGGTGAGGGCGGTGGGTTTTACGGTGGTGGGATG
CAGTATCACCAGCATCAGTTTCTTCACCACCAGCATAACCATATGTATGGGTCAACAGGC
GGTGACGGTGGAGGAGGAGCTGCCTCCGGTAGGACAAGGACCTGAGAGATTGGTGAGAGT
GGATCTCTGTATATAGATACATTTATAAACATGCCTATTCATACCCATAAGAGTTCGCAA
CATCAATCTATTTAAATATCATGTTGGTTATGTAGGCTGTGTAAAGAGGATCAAGTGTGT
CTGGAACTATATGATTCGCTAACGAATCTGCTCCGTTTAATCTTGTATTTAAACTATTGG
ATTTGGATCACATTGAATGCAAATGTTTTCAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EJ29TF U 26
AF RR4D164TF U 1
AF RR4D164JQ C 218
BS 1 689 RR4D164TF
BS 690 936 RR4D164JQ

RD RR4EJ29TF 630 0 0
AAACCCTAATTTTTCTCGCTTCAGTCAACCACCACTGCACTGTACACATCGATGGTGAAG
AAGCCATGATGATTTGAAAAAGAGTGAAGTATCTGTTTTTTCTTTTCTTACATTTCTTAT
TAATTTTCAGAATGGGGGATTCCGACAAGGACTCCGGTGGAGGACAAAACGGACAGTCTC
CGTTGTCTCCAAGAGAGCAAGACAGGTTCCTACCGATCGCTAACGTGAGCCGGATCATGA
AGAAGGCCTTGCCGGCAAACGCCAAGATCTCCAAAGATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGT
GCGTCTCCGAGTTTATAAGCTTCGTCACGGGAGAGGCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGA
AGAGGAAGACGATCAACGGCGACGATTTGCTTTGGGCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGG
ATTACGTTGAGCCGCTGAAGGTTTACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAGGG
CTGGACTTGGGAGGCCACATACAGGTGGCGAAGCTGGAGATCATCAGAGAGATTCAG*TG
TTGGTGAGGGCGGTGGGTTTTACGGTGGTGGGATGCAGTATCACCAGCATCAGTTTCTTC
ACCACCAGCATAACCATATGTATGGGTCAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4D164TF 689 0 0
GGAGACACCTTCAATTCAATTTCTAAAACCCTAATTTTTCTCGCTTCAGTCAACCACCAC
TGCACTGTACACATCGATGGTGAAGAAGCCATGATGATTTGAAAAAGAGTGAAGTATCTG
TTTTTTCTTTTCTTACATTTCTTATTAATTTTCAGAATGGGGGATTCCGACAAGGACTCC
GGTGGAGGACAAAACGGACAGCCTCCGTTGTCTCCAAGAGAGCAAGACAGGTTCCTACCG
ATCGCTAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAGGCCTTGCCGGCAAACGCCAAGATCTCCAAA
GATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGTGCGTCTCCGAGTTTATAAGCTTCGTCACGGGAGAG
GCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGGAAGACGATCAACGGCGACGATTTGCTTTGG
GCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGGATTACGTTGAGCCGCTGAAGATTTACTTGCAGAGG
TTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAAGGCTGGACTTGGGAGGCCACATACAGGTGGCGAAGCT
GGAGAGCATCAGAGAGATGCAGGTGTTGGTGAGGGCGGTGGGTTTTACGGTGGTGGGATG
CAGTATCACCAGCATCAGTTTCTTCACCACCAGCATAACCATATGTATGGGTCAACAGGC
GGTGACGGTGGAGGAGGAGCTGCCTCCGG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4D164JQ 719 0 0
GAGAGCAAGACAGGTTCCTACCGATCGCTAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAGGCCTTGC
CGGCAAACGCCAAGATCTCCAAAGATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGTGCGTCTCCGAGT
TTATAAGCTTCGTCACGGGAGAGGCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGGAAGACGA
TCAACGGCGACGATTTGCTTTGGGCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGGATTACGTTGAGC
CGCTGAAGATTTACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAAGGCTGGACTTGGGA
GGCCACATACAGGTGGCGAAGCTGGAGAGCATCAGAGAGATGCAGGTGTTGGTGAGGGCG
GTGGGTTTTACGGTGGTGGGATGCAGTATCACCAGCATCAGTTTCTTCACCACCAGCATA
ACCATATGTATGGGTCAACAGGCGGTGACGGTGGAGGAGGAGCTGCCTCCGGTAGGACAA
GGACCTGAGAGATTGGTGAGAGTGGATCTCTGTATATAGATACATTTATAAACATGCCTA
TTCATACCCATAAGAGTTCGCAACATCAATCTATTTAAATATCATGTTGGTTATGTAGGC
TGTGTAAAGAGGATCAAGTGTGTCTGGAACTATATGATTCGCTAACGAATCTGCTCCGTT
TAATCTTGTATTTAAACTATTGGATTTGGATCACATTGAATGCAAATGTTTTCAGATTC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL3769Contig1 480 2 4 U
GGAACACGAAAATATGTTTTCATCTTTCAATACAAACCTCCATATGCTCAACCTAAGTTG
CACATACTTCTACCGTATCTTAATCTAATGTAGCAAAGATCTTATTACACAAACTCACTC
TCTAGAGCTTTTTATTTGTCTTCTGATAAAATATAAAATGTAGGAGAAACCAATAGCGTA
GAAGTTTTTTTTAGTTGGGTTGAGAAGGCAGGTCCTGTAATCCACATACCATGTTTGCTG
GTACTGCAACATCAATCATCTTCGGATACGCCAGATTCAGATTTGACATGATGGTTTTGA
ATGTTTCTTTGTCTTTAGTTAAACGAGGGTTGTGTTGCATCTCTTCTCCGACTGTACTTA
CCTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATA
TCTGTGAGTGCACAGACTCATAGAGCTGATCCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCGGTTCTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C003JQ U 1
AF RR4B352TF C 2
BS 1 111 RR4C003JQ
BS 112 112 RR4B352TF
BS 113 192 RR4C003JQ
BS 193 480 RR4B352TF

RD RR4C003JQ 192 0 0
GGAACACGAAAATATGTTTTCATCTTTCAATACAAACCTCCATATGCTCAACCTAAGTTG
CACATACTTCTACCGTATCTTAATCTAATGTAGCAAAGATCTTATTACACAGACTCACTC
TCTAGAGCTTTTTATTTGTCTTCTGATAAAATATAAAATGTAGGAGAAACCAATAGCGTA
GAAGTTTTTTTT

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR4B352TF 479 0 0
GAACACGAAAATATGTTTTCATCTTTCAATACAAACCTCCATATGCTCAACCTAAGTTGC
ACATACTTCTACCGTATCTTAATCTAATGTAGCAAAGATCTTATTACACAAACTCACTCT
CTAGAGCTTTTTATTTGTCTTCTGATAAAATATAAAATGTAGGAGAAACCAATAGCGTAG
AAGTTTTTTTTAGTTGGGTTGAGAAGGCAGGTCCTGTAATCCACATACCATGTTTGCTGG
TACTGCAACATCAATCATCTTCGGATACGCCAGATTCAGATTTGACATGATGGTTTTGAA
TGTTTCTTTGTCTTTAGTTAAACGAGGGTTGTGTTGCATCTCTTCTCCGACTGTACTTAC
CTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATAT
CTGTGAGTGCACAGACTCATAGAGCTGATCCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCGGTTCTAC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 3

CO CL3770Contig1 704 3 3 U
GGCTACCAATCCGAAACTCTGAGATTCCTTTGTTTCAAGAACTGAGTAAACATAACAAAA
AAAAA*TGACATCATGGAAGAAAACAATAGCAACACCATTCAAAAAGGCTGCAACACTCT
TCAACCAACCGCAGCAATTGCCAAGAAAGGGTTGCGGCGGTGGGAAAATGGATGCCAAAG
CTAGGGAAGAGCACGAGAGGAGGATGGTAAGAGAGCTTCAAGGAGAAGTCATGGCTTGTG
GATACGATGATGTTCTCGTAATGTGGTCTATTCTCGACAAATCTAACTCCTCCAATAACC
TCACTTCTTAACCCAAACCAAACTTAGACAAATGGTTTTCTTAATCTGCTTTTTGTACAT
ATATATCAAAAGTGGTATAAGCGCGCCTTATAGCGATCACCTCCTTCTCCTCTTCTTCTT
CCTATAGTTACCCTTTCATGTCTCTTTGTAAGGTCTAGTGAACTTTTTTCGACGAATTAT
CGTCGAGAATTTAGATGTTGCTCTTTCCTCTTTTGATAACCCACGTGATTCTGTTACAGT
GGGATTTTTTTAAAAGAGAAATAAGCCTTTATTGAGTTCTATATCATTTGTATGGTATGA
TTAGCATTATATTTGTATAAGAACTCAAGAACTAGTTCTCCATAATGTAAAAGCCATGTG
TATTGACCGAAGTTGCACATGAGTTAAATTATTAATCAGAAGAA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM10JQ C 1
AF RR4GM10TF U 1
AF RR4AN93TF U 2
BS 1 4 RR4GM10JQ
BS 5 580 RR4GM10TF
BS 581 704 RR4AN93TF

RD RR4GM10JQ 580 0 0
GGCTACCAATCCGAAACTCTGAGATTCCTTTGTTTCAAGAACTGAGTAAACATAACAAAA
AAAAA*TGACATCATGGAAGAAAACAATAGCAACACCATTCAAAAAGGCTGCAACACTCT
TCAACCAACCGCAGCAATTGCCAAGAAAGGGTTGCGGCGGTGGGAAAATGGATGCCAAAG
CTAGGGAAGAGCACGAGAGGAGGATGGTAAGAGAGCTTCAAGGAGAAGTCATGGCTTGTG
GATACGATGATGTTCTCGTAATGTGGTCTATTCTCGACAAATCTAACTCCTCCAATAACC
TCACTTCTTAACCCAAACCAAACTTAGACAAATGGTTTTCTTAATCTGCTTTTTGTACAT
ATATATCAAAAGTGGTATAAGCGCGCCTTATAGCGATCACCTCCTTCTCCTCTTCTTCTT
CCTATAGTTACCCTTTCATGTCTCTTTGTAAGGTCTAGTGAACTTTTTTCGACGAATTAT
CGTCGAGAATTTAGATGTTGCTCTTTCCTCTTTTGATAACCCACGTGATTCTGTTACAGT
GGGATTTTTTTAAAAGAGAAATAAGCCTTTATTGAGTTCT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4GM10TF 580 0 0
GGCT
ACCAATCCGAAACTCTGAGATTCCTTTGTTTCAAGAACTGAGTAAACATAACAAAAAAAA
A*TGACATCATGGAAGAAAACAATAGCAACACCATTCAAAAAGGCTGCAACACTCTTCAA
CCAACCGCAGCAATTGCCAAGAAAGGGTTGCGGCGGTGGGAAAATGGATGCCAAAGCTAG
GGAAGAGCACGAGAGGAGGATGGTAAGAGAGCTTCAAGGAGAAGTCATGGCTTGTGGATA
CGATGATGTTCTCGTAATGTGGTCTATTCTCGACAAATCTAACTCCTCCAATAACCTCAC
TTCTTAACCCAAACCAAACTTAGACAAATGGTTTTCTTAATCTGCTTTTTGTACATATAT
ATCAAAAGTGGTATAAGCGCGCCTTATAGCGATCACCTCCTTCTCCTCTTCTTCTTCCTA
TAGTTACCCTTTCATGTCTCTTTGTAAGGTCTAGTGAACTTTTTTCGACGAATTATCGTC
GAGAATTTAGATGTTGCTCTTTCCTCTTTTGATAACCCACGTGATTCTGTTACAGTGGGA
TTTTTTTAAAAGAGAAATAAGCCTTTATTGAGTTCT

QA 5 580 5 580
DS 

RD RR4AN93TF 703 0 0
GGG
ACCAATCCGAAACTCTGAGATTCCTTTGTTTCAAGAACTGAGTAAACATAACAAAAAAAA
AATGGCATCATGGAAGAAAACAATAGCAACACCATTCAAAAAGGCTGCAACACTCTTCAA
CCAACCGCAGCAATCGCCAAGAAAGGGTTGCGGCGGTGGGAAAATGGATGCCAAAGCTAG
GGAAGATCACGAGAGGAGGATGGTAAGAGAGCTTCAAGGAGAAGTCATGGCTTGTGGATA
CGATGATGTTCTCGTAATGTGGTCTATTCTCGACAAATCTAACTCCTCCAATAACCTCAC
TTCTTAACCCAAACCAAACTTAGACAAATGGTTTTCTTAATCTGCTTTTTGTACATATAT
ATCAAAAGTGGTATAAGCGCGCCTTATAGCGATCACCTCCTTCTCCTCTTCTTCTTCCTA
TAGTTACCCTTTCATGTCTCTTTGTAAGGTCTAGTGAACTTTTTTCGACGAATTATCGTC
GAGAATTTAGATGTTGCTCTTTCCTCTTTTGATAACCCACGTGATTCTGTTACAGTGGGA
TTTTTTTAAAAGAGAAATAAGCCTTTATTGAGTTCTATATCATTTGTATGGTATGATTAG
CATTATATTTGTATAAGAACTCAAGAACTAGTTCTCCATAATGTAAAAGCCATGTGTATT
GACCGAAGTTGCACATGAGTTAAATTATTAATCAGAAGAA

QA 4 703 4 703
DS 



AS 1 2

CO CL3771Contig1 725 2 3 U
ACTTGGTTTTATAATGCCTCTTGTTCTCATGGCTTGTTCTATGATGAGTGTGGAACGTTA
AGTTTTATCTGAGGATTATCACGTACCTCCTTAAGCCTATTCACCACGTTTTGAGCTAAA
ATCTTCATAAGCTTTTAATACTACAAAACCAGGTGAAAAAAAAATCACAGGAACACCTTC
ATCAAAACCTTCTCTGATCTTCATTTCCAATGGAATATTAGGATAGCTATATATTGGAAT
CTCCAAACGCAATATCCTTTTGACAGTGTATGAGCTGGGACTTCCAGGTGCACCTTGCCA
ATCCATTGTCATTCCAGGTGTTCCATTAAGTCTCTCCTGAGAGAGAGCTCTGTTCCAAGC
AGCTAAACCGGATTAGGAGAAGCCATTGGACTGGGACTTCTGTGTCTGAGTCTATCAAAA
TCGCCGCCAAATCCTCTTGGTTAGGCATCATTCCAGATACCCTGAACATCTCTTGATTCA
ACAGGCGGCTGCATATGGGCAAGACTTGCATAAAAGGTGTAAGCTTTTGATGTTCAACGA
GAAGCTCCGTCAAGTACTGAGAGCTGTCGATCTCAGGAGTGCTTCTGATCTGAGGAGAAG
CAGCTCTAGCAGGAGAAAAGTAAGACGAGTTGTTGTTGTATAATCCAGACATGACTCATC
TTCTTCTTCTTCTTCATCTTTCTCTAGAAGCGTACACAATACAAGAGCGAGAAAGGAGAG
ATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DT59JQ U 62
AF RR4DT59TF C 1
BS 1 62 RR4DT59TF
BS 63 314 RR4DT59JQ
BS 315 725 RR4DT59TF

RD RR4DT59JQ 253 0 0
T
TTTTATCTGAGGATTATCACGTACCTCCTTAAGCCTATTCACCACGTTTTGAGCTAAAAT
CTTCATAAGCTTTTAATACTACAAAACCAGGTGAAAAAAAAATCACAGGAACACCTTCAT
CAAAACCTTCTCTGATCTTCATTTCCAATGGAATATTAGGATAGCTATATATTGGAATCT
CCAAACGCAATATCCTTTTGACAGTGTATGAGCTGGGACTTCCAGGTGCACCTTGCCAAT
CCATTGTCATTC

QA 2 253 2 253
DS 

RD RR4DT59TF 725 0 0
ACTTGGTTTTATAATGCCTCTTGTTCTCATGGCTTGTTCTATGATGAGTGTGGAACGTTA
AGTTTTATCTGAGGATTATCACGTAGCTCCTTAAGCCTATTCACCACGTTTTGAGCTAGA
ATCTTCATAAGCTTTTAATACTACAGAACCAGGTGAAGAAAAAATCACAGGAACACCTTC
ATCAGAACCTTCTCTGATCTTCATTTCCAATGGAATATTAGGATAGCTATATATTGGAAT
CTCCAGACGCAATATCCTTTTGACAGTGTATGAGCTGGGACTTCCAGGTGCACCTTGCCA
ATCCATTGTCATTCCAGGTGTTCCATTAAGTCTCTCCTGAGAGAGAGCTCTGTTCCAAGC
AGCTAAACCGGATTAGGAGAAGCCATTGGACTGGGACTTCTGTGTCTGAGTCTATCAAAA
TCGCCGCCAAATCCTCTTGGTTAGGCATCATTCCAGATACCCTGAACATCTCTTGATTCA
ACAGGCGGCTGCATATGGGCAAGACTTGCATAAAAGGTGTAAGCTTTTGATGTTCAACGA
GAAGCTCCGTCAAGTACTGAGAGCTGTCGATCTCAGGAGTGCTTCTGATCTGAGGAGAAG
CAGCTCTAGCAGGAGAAAAGTAAGACGAGTTGTTGTTGTATAATCCAGACATGACTCATC
TTCTTCTTCTTCTTCATCTTTCTCTAGAAGCGTACACAATACAAGAGCGAGAAAGGAGAG
ATCCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 3

CO CL3772Contig1 998 3 6 U
CAATATTACAAAGGCATAATAATCCATATGATCTTTGAAGGCTTTGGGAACGTTACAAAG
AGAAGAAAGGACCAAACTTGCTATAGCTTATTTCTGTACATACAAAGAGAATTGATCTTA
CAACTTTCATGTTTCTTTGTTCATCTTCTTCTCACTTGCGTGCAGAGTGATAGAGCTCAA
TGTACTCAAGTGCAGGACGATTCCATGACCAGTCTTGCTCCATCACCGTCTTACACGGCG
AGTTAAACCACTCTCTCCCATCGTACCAAGCCGATATCGCCCTATTGAGAGCATAGTCCA
CACCAGGAGCATCAGCTCCATCAAAACTGAAGCCATTAGGTTCTAGAACTTGAGCTTGTG
CTCTTTCTTTATCATGGTCCACATCAAACACCGTGTCATAGAGTCCTCCAGTTTTTCTTA
CGACAGGAACAGCACCGTATCTCATGGCAATGAGCTGCGTCAGTCCACACGGCTCAAATA
TTGACGGTACAAGAATAAAGTCAGCCCCAGCATAGATCAAGTGGGAAAGAGGCTCGTCGT
AGGTTAGAACAAGCCTAGCTCGATCACCGTGAGTAGAATGTAACTGATTCGCCAAGTTCA
CGAAATCATTTTGGATCCTAGGATCAGGAGCTGAACCTAGCAATACAACCTGTCCACTGC
GTTCCAAGGTACGCCAAATAGCGTGTTTGATCAAATGTATTCCTTTCTGGTGAGTTAAGC
GTGTGATGATTCCTACTAAAGGAAGATCAGCGCTCTTTAGTCCAAGCCTGTTTTGCAGTT
CTTCCTTGGCTGCTCTTTTGCCTTCTAATACGTTCTCTGAAGTATAAGGCACCGGAATGA
AGTTATCGTTGTATGGATCCCATATGTCTGGATCGATTCCATTTACTATTCCGTGGAACT
TGTATAAGTGTGGAGAGATTACAGAGTTTCCAGCAACTTCCTTGGCATATGTTCGTGAAA
CCGTTGTAGCTTTGTCTGCAAACGTCATGGCTTTACCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH26JQ U 1
AF RR4B564JQ U 2
AF RR4BH26TF C 133
BS 1 39 RR4BH26JQ
BS 40 40 RR4B564JQ
BS 41 400 RR4BH26JQ
BS 401 401 RR4B564JQ
BS 402 832 RR4BH26JQ
BS 833 998 RR4BH26TF

RD RR4BH26JQ 832 0 0
CAATATTACAAAGGCATAATAATCCATATGATCTTTGAATGCTTTGGGAACGTTACAAAG
AGAAGAAAGGACCAAACTTGCTATAGCTTATTTCTGTACATACAAAGAGAATTGATCTTA
CAACTTTCATGTTTCTTTGTTCATCTTCTTCTCACTTGCGTGCAGAGTGATAGAGCTCAA
TGTACTCAAGTGCAGGACGATTCCATGACCAGTCTTGCTCCATCACCGTCTTACACGGCG
AGTTAAACCACTCTCTCCCATCGTACCAAGCCGATATCGCCCTATTGAGAGCATAGTCCA
CACCAGGAGCATCAGCTCCATCAAAACTGAAGCCATTAGGTTCTAGAACTTGAGCTTGTG
CTCTTTCTTTATCATGGTCCACATCAAACACCGTGTCATAAAGTCCTCCAGTTTTTCTTA
CGACAGGAACAGCACCGTATCTCATGGCAATGAGCTGCGTCAGTCCACACGGCTCAAATA
TTGACGGTACAAGAATAAAGTCAGCCCCAGCATAGATCAAGTGGGAAAGAGGCTCGTCGT
AGGTTAGAACAAGCCTAGCTCGATCACCGTGAGTAGAATGTAACTGATTCGCCAAGTTCA
CGAAATCATTTTGGATCCTAGGATCAGGAGCTGAACCTAGCAATACAACCTGTCCACTGC
GTTCCAAGGTACGCCAAATAGCGTGTTTGATCAAATGTATTCCTTTCTGGTGAGTTAAGC
GTGTGATGATTCCTACTAAAGGAAGATCAGCGCTCTTTAGTCCAAGCCTGTTTTGCAGTT
CTTCCTTGGCTGCTCTTTTGCCTTCTAATACGTTCTCTGAAGTATAAGGCAC

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4B564JQ 823 0 0
AATATTACAAAGGCATAATAATCCATATGATCTTTGAAGGCTTTGGGAACGTTACAAAGA
GAAGAAAGGACCAAACTTGCTATAGCTTATTTCTGTACATACAAAGAGAATTGATCTTAC
AACTTTCATGTTTCTTTGTTCATCTTCTTCTCACTTGCGTGCAGAGTGATAGAGCTCAAT
GTACTCAAGTGCAGGACGATTCCATGACCAGTCTTGCTCCATCACCGTCTTACACGGCGA
GTTAAACCACTCTCTCCCATCGTACCAAGCCGATATCGCCCTATTGAGAGCATAGTCCAC
ACCAGGAGCATCAGCTCCATCAAAACTGAAGCCATTAGGTTCTAGAACTTGAGCTTGTGC
TCTTTCTTTATCATGGTCCACATCAAACACCGTGTCATAGAGTCCTCCAGTTTTTCTTAC
GACAGGAACAGCACCGTATCTCATGGCAATGAGCTGCGTCAGTCCACACGGCTCAAATAT
TGACGGTACAAGAATAAAGTCAGCCCCAGCATAAATCAAGTGGGAAAGAGGCTCGTCGTA
GGTTAAAACAAGCCTAGCTCGATCACCGTGAGTAGAATGTAACTGATTCGCCAAGTTCAC
GAAATCATTTTGGATCCTAGGATCAGGAGCTGAACCTAGCAATACAACCTGTCCACTGCG
TTCCAAGGTACGCCAAATAGCGTGTTTGATCAAATGTATTCCTTTCTGGTGAGTTAAGCG
TGTGATGATTCCTACTAAAGGAAGATCAGCGCTCTTTAGTCCAAGCCTGTTTTGCAGTTC
TTCCTTGGCTGCTCTTTTGCCTTCTAATACGTTCTCTGAAGTA

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4BH26TF 866 0 0
GTTTCTTTGTCATC
TCTTCTCACTTGCGTGCAGAGTGATAGAGCTCAATGTACTCAAGTGCAGGACGATTCCAT
GACCAGTCTTGCTCCATCAC*GTCTTACACGGCGAGTTAAACCACTCTCTCCCATCGTAC
CAAGCCGATATCGCCCTATTGAGAGCATAGTCCACACCAGGAGCATCAGCTCCATCAAAA
CTGAAGCCATTAGGTTCTAGAACTTGAGCTTGTGCTCTTTCTTTATCATGGTCCACATCA
AACACCGTGTCATAGAGTCCTCCAGTTTTTCTTACGACAGGAACAGCACCGTATCTCATG
GCAATGAGCTGCGTCAGTCCACACGGCTCAAATATTGACGGTACAAGAATAAAGTCAGCC
CCAGCATAGATCAAGTGGGAAAGAGGCTCGTCGTAGGTTAGAACAAGCCTAGCTCGATCA
CCGTGAGTAGAATGTAACTGATTCGCCAAGTTCACGAAATCATTTTGGATCCTAGGATCA
GGAGCTGAACCTAGCAATACAACCTGTCCACTGCGTTCCAAGGTACGCCAAATAGCGTGT
TTGATCAAATGTATTCCTTTCTGGTGAGTTAAGCGTGTGATGATTCCTACTAAAGGAAGA
TCAGCGCTCTTTAGTCCAAGCCTGTTTTGCAGTTCTTCCTTGGCTGCTCTTTTGCCTTCT
AATACGTTCTCTGAAGTATAAGGCACCGGAATGAAGTTATCGTTGTATGGATCCCATATG
TCTGGATCGATTCCATTTACTATTCCGTGGAACTTGTATAAGTGTGGAGAGATTACAGAG
TTTCCAGCAACTTCCTTGGCATATGTTCGTGAAACCGTTGTAGCTTTGTCTGCAAACGTC
ATGGCTTTACCC

QA 15 866 15 866
DS 



AS 1 2

CO CL3773Contig1 771 2 2 U
GGAACACCTCTCTCTCTCTCGTACCTCACCAAAAACACACAAAGAGCAAGAGAAAGAGAA
CGAACTCACAATGGCCACTTCCTTCTCCGCCGCGACGCCTTTTCTTTTCATCCTCCTCCT
CTCCGTCTCCTCCGTCTCCGTTCACGGCGCATCTCACCACCACACGGCGGCTCCGGCTCC
GGCGGTAGACTGTTCGACTCTCATACTCAACATGGCGCCTTGTCTGGACTTCGTAACAGC
CGGAGGCAAGGAGGCAAAACCGAAGAGTGCGTGTTGCGACGGGCTTAAGACAGTGCTCAA
GGCTAACGCCGAGTGTCTATGCGAGGGGTTTAAAAGCAGCGCTTCTTTCGGAGTCACCTT
GAACATGACCAAGGCTGCTACACTTCCCACCGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCTATTTC
TAACTGTGGATTGTCTGTGACTCCTGCTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGT
TGCTGCTGGACCCGGCGCAGCTGGAACAACCCTAGCTCCAAACCAATCTCCAGGGAACGA
CGGATCTTCCTTGATTCCGATCTCATTTACCACCACCCTATTCAGCGCTTTATTCTTCGT
ATTGTTCTTGTCTCGTGTGTAAAAAGAGCGTGAGCCTTTTCTCACCATCTATAGATTTGG
CTTTATGGATATGCTTTAGGGTTTCTGCAGTAGTTTTTTACTCTTAATTTATGTTACTAT
TCTGTCGCACATTTGGTCTTTTTATATTTATGGTATCTCTGATTCCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV09TF U 1
AF RR4GV09JQ C 115
BS 1 346 RR4GV09TF
BS 347 771 RR4GV09JQ

RD RR4GV09TF 348 0 0
GGAACACCTCTCTCTCTCTCGTACCTCACCAAAAACACACAAAGAGCAAGAGAAAGAGAA
CGAACTCACAATGGCCACTTCCTTCTCCGCCGCGACGCCTTTTCTTTTCATCCTCCTCCT
CTCCGTCTCCTCCGTCTCCGTTCACGGCGCATCTCACCACCACACGGCGGCTCCGGCTCC
GGCGGTAGACTGTTCGACTCTCATACTCAACATGGCGCCTTGTCTGGACTTCGTAACAGC
CGGAGGCAAGGAGGCAAAACCGAAGAGTGCGTGTTGCGACGGGCTTAAGACAGTGCTCAA
GGCTAACGCCGAGTGTCTATGCGAGGGGTTTAAAAGCAGCGCTTCT
TT

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR4GV09JQ 657 0 0
CT
TCCTCTCCGTCTCCTCCGTCTCCGTTCACGGCGCATCTCACCACCACACGGCGGCTCCGG
CTCCGGCGGTAGACTGTTCGACTCTCATACTCAACATGGCGCCTTGTCTGGACTTCGTAA
CAGCCGGAGGCAAGGAGGCAAAACCGAAGAGTGCGTGTTGCGACGGGCTTAAGACAGTGC
TCAAGGCTAACGCCGAGTGTCTATGCGAGGGGTTTAAAAGCAGCGCTTCTTTCGGAGTCA
CCTTGAACATGACCAAGGCTGCTACACTTCCCACCGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCTA
TTTCTAACTGTGGATTGTCTGTGACTCCTGCTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAG
CTGTTGCTGCTGGACCCGGCGCAGCTGGAACAACCCTAGCTCCAAACCAATCTCCAGGGA
ACGACGGATCTTCCTTGATTCCGATCTCATTTACCACCACCCTATTCAGCGCTTTATTCT
TCGTATTGTTCTTGTCTCGTGTGTAAAAAGAGCGTGAGCCTTTTCTCACCATCTATAGAT
TTGGCTTTATGGATATGCTTTAGGGTTTCTGCAGTAGTTTTTTACTCTTAATTTATGTTA
CTATTCTGTCGCACATTTGGTCTTTTTATATTTATGGTATCTCTGATTCCTCTCC

QA 3 657 3 657
DS 



AS 1 3

CO CL3774Contig1 902 3 2 U
GGGCCGAGAGGAAAAGAAAAAAAAACTCAGAGAGACAATCAAAAATGGCCATGATTACGC
GCAACACCGCCACGCGCCTCCCTCTCCTCCTCCACTCTCACCGCGCCGCCGCGGTCTCTC
ACCTCCACACATCCCTTCCCGCTCTCTCCCCCGCGACAACACCGACTTCCTACACCAGAC
CAGGTCCTCCTTCGACCTCTCCTCCTCCGCCGGGACTCTCGAAGACGGCGGAGTTCGTGA
TCTCGAAGGTAGATGATCTGATGAACTGGGCTCGCAGGGGATCGATCTGGCCTATGACCT
TCGGGCTAGCCTGCTGCGCGGTGGAGATGATGCATACGGGTGCAGCTCGCTACGATCTGG
ATCGGTTCGGTATCATCTTCAGGCCGAGTCCTCGCCAATCCGACTGTATGATTGTCGCCG
GGACGCTTACTAACAAGATGGCTCCCGCTCTTCGCAAGGTTTATGACCAGATGCCGGAGC
CGAGGTGGGTGATATCGATGGGAAGCTGTGCCAACGGAGGTGGATACTATCACTACTCCT
ACTCCGTGGTTCGTGGGTGTGACAGAATCGTGCCTGTGGACATTTACGTCCCTGGGTGTC
CTCCAACCGCTGAGGCTCTGCTCTATGGACTCCTCCAGCTTCAGAAGAAAATCAACAGGC
GCAAGGATTTCTTGCACTGGTGGAACAAGTGAATTACAAATTTCAAACAAAAAAAAATCA
AATCCTTCTTCCTATGTTGGAGAAGTTTTGTCAGACAATTCTTTTAACCAAAGTTTGGGG
GCTAATAAAAACGTGGACGTTTCAAAGCATGTCTGATTGTGGTGGAGATGCCATGTAAAC
TAAAGGATTGCGTTTGTTTCTGTGGAAACTTAAAATAAACATAAAGTTCTGTTGTCTGCG
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4GH95TF U 1
AF RR4GH95JQ C 298
AF RR4H574TF U 543
BS 1 654 RR4GH95TF
BS 655 902 RR4H574TF

RD RR4GH95TF 654 0 0
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GCAACACCGCCACGCGCCTCCCTCTCCTCCTCCACTCTCACCGCGCCGCCGCGGTCTCTC
ACCTCCACACATCCCTTCCCGCTCTCTCCCCCGCGACAACACCGACTTCCTACACCAGAC
CAGGTCCTCCTTCGACCTCTCCTCCTCCGCCGGGACTCTCGAAGACGGCGGAGTTCGTGA
TCTCGAAGGTAGATGATCTGATGAACTGGGCTCGCAGGGGATCGATCTGGCCTATGACCT
TCGGGCTAGCCTGCTGCGCGGTGGAGATGATGCATACGGGTGCAGCTCGCTACGATCTGG
ATCGGTTCGGTATCATCTTCAGGCCGAGTCCTCGCCAATCCGACTGTATGATTGTCGCCG
GGACGCTTACTAACAAGATGGCTCCCGCTCTTCGCAAGGTTTATGACCAGATGCCGGAGC
CGAGGTGGGTGATATCGATGGGAAGCTGTGCCAACGGAGGTGGATACTATCACTACTCCT
ACTCCGTGGTTCGTGGGTGTGACAGAATCGTGCCTGTGGACATTTACGTCCCTGGGTGTC
CTCCAACCGCTGAGGCTCTGCTCTATGGACTCCTCCAGCTTCAGAAGAAAATCA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4GH95JQ 599 0 0
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TGGATCGGTTCGGTATCATCTTCAGGCCGAGTCCTCGCCAATCCGACTGTATGATTGTCG
CCGGGACGCTTACTAACAAGATGGCTCCCGCTCTTCGCAAGGTTTATGACCAGATGCCGG
AGCCGAGGTGGGTGATATCGATGGGAAGCTGTGCCAACGGAGGTGGATACTATCACTACT
CCTACTCCGTGGTTCGTGGGTGTGACAGAATCGTGCCTGTGGACATTTACGTCCCTGGGT
GTCCTCCAACCGCTGAGGCTCTGCTCTATGGACTCCTCCAGCTTCAGAAGAAAATCAACA
GGCGCAAGGATTTCTTGCACTGGTGGAACAAGTGAATTACAAATTTCAAACAAAAAAAAA
TCAAATCCTTCTTCCTATGTTGGAGAAGTTTTGTCAGACAATTCTTTTAACCAAAGTTTG
GGGGCTAATAAAAACGTGGACGTTTCAAAGCATGTCTGATTGTGGTGGAGATGCCATGTA
AACTAAAGGATTGCGTTTGTTTCTGTGGAAACTTAAAATAAACATAAAGTTCTGTTGTC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4H574TF 360 0 0
G
CCGTGGTTCGTGGGTGTGACAGAATCGTGCCTGTGGACATTTACGTCCCTGGGTGTCCTC
CAACCGCTGAGGCTCTGCTCTATGGACTCCTCCAGCTTCAGAAGAAAATCAACAGGCGCA
AGGATTTCTTGCACTGGTGGAACAAGTGAATTACAAATTTCAAACAAAAAAAAATCAAAT
CCTTCTTCCTATGTTGGAGAAGTTTTGTCAGACAATTCTTTTAACCAAAGTTTGGGGGCT
AATAAAAACGTGGACGTTTCAAAGCATGTCTGATTGTGGTGGAGATGCCATGTAAACTAA
AGGATTGCGTTTGTTTCTGTGGAAACTTAAAATAAACATAAAGTTCTGTTGTCTGCGTG

QA 2 360 2 360
DS 



AS 1 3

CO CL3775Contig1 1467 3 12 U
GGGCCCCACTCTTCTCTTCTCTTCTCTTGAGCTCCATCGAAACGGCAGCGGATTGTCTGC
GATCGATCCCCGGAAACAAAGAAGAGAAGATGGCGGCGCCGGAAGATCCAGTCAAGTACG
TCGGAATCATAAAGGAATCCGCCGCTTTCCGCCTAATGAAATCCATGGGATGGGAAGAAG
GAGAAGGACTTGGTAAAGACAAGCAAGGGATCAAAGGCTATGTCCGTGTCAAGAACAAGC
AAGACACAACCGGTGTTGGTGTTGACAAGCCAAATCCATGGGCATTTGATACTACTCAGT
TCGATAACATTCTCAAGAAACTGAAAGTGCAAGCAGCACCTATCAAGAAAGATAATGCTT
CGGAGAAGGAAGCTGAAAGTGAAGATGAAGCTGCCAAATCCGAGCCTGTCAAGCCCAATG
TTGCTAAGGTTACTCGTCCACAAGGAAGGTATAAACGTAGAGAGAAGGGGAAGCTTGTCA
ATTCTTACTCCTCTAAAGATCTTGAAGGCATACTTGTTAAGCGAACTGAGGAGCCTTCTC
CTGCGGTTTGTGACATAGCCGATGCTATGGAGATTGAAATCATATCTGAGGACCAACATC
CTGATGTTAAAGAACAGAAAATCGAAGAACCTTCTTCAGACTGGTGGGGATTTAAATCTG
GGTTTGTCTCGGGCGGTCCTCTTGGAGCTAAGCCTGGCAAAAAGAAATTATCCAAGTCTA
ACGAGAGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCACGATA
AAGCCACGGCTGGAAAACAAGGACTGGGTATCAAGGACCGGCCTAAGAAAATAGCTGGTG
TTCGTTACCAAGGAAAGAAAACTTCTTTTGATAACAGTGATGATGATACTGATGACGAGG
AAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTGAAGAAGATGATGACAAGAACTCTGCTATAG
AAAGTTCTCTCCCAGCAAAAAGGAAGCGTGATGAAATCACTGAACCTAAAATCAAGTTGA
AGAAACTGTGCAAGCAGATTCTTAAAAAGGAAGCTGGTAGTGGTGGAACCATGAAGCTGA
AACAGCTTAAATCTCTAATTGATGAACAAGCACCATCGCTTCTCTCGGAGTTTTCTTCAA
GGAAAGAGGCTATTGCTTACTTGAAGCTTAAGCTGGAGCGAAGTGGGAAGTTTATTGTGG
AGGGAAAGAAGATCAGTCTCGTATCTAAAAACAAGTGAGGACAATTATCGTTATACTACC
TGCATAGGACAGTGGAGATTAGGGCAAGTTTTGTTACTGAATCATCACCATGCGGTATGC
ATAACAAATATCTTTCATTTTGAAATTTTGATGTGTTTGTAATTTTTTCATACAATTATA
GTATGAGAGTCTGCTTTAAAACTTCACCATAGCAAGTCAAAACTAATCTCTTTTATTTAG
GAGCAAATATAGAACAAACTCTTCTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GC40TF U 69
AF RR4A158TFB U 1
AF RR4A158JQD C 688
BS 1 163 RR4A158TFB
BS 164 164 RR4GC40TF
BS 165 208 RR4A158TFB
BS 209 209 RR4GC40TF
BS 210 301 RR4A158TFB
BS 302 302 RR4GC40TF
BS 303 319 RR4A158TFB
BS 320 321 RR4GC40TF
BS 322 796 RR4A158TFB
BS 797 797 RR4A158JQD
BS 798 822 RR4A158TFB
BS 823 1467 RR4A158JQD

RD RR4GC40TF 270 0 0
G
CCGGAAACAAAGAAGAGAAGATGGCGGCGCCGGAAGCTCCAGTCAAGTACGTCGGTATCC
TAAAGGAATCCGCCGCTTTCCGCCTAATGAAATCCATGGGATGGGAAGAAGGAGAAGGAC
TTGGTAAAGACAAGCAAGGGATCAAAGGCTATGTCCGTGTCAAGAACAAGCAAGACACAA
CCGGTGTTGGTGTTGACAAGCCGAATCCATGGGCATTTGATACTACTCATTTCGATAACA
TTCTCAAGAAACTGAAAGTGCAAGCAGCA

QA 2 270 2 270
DS 

RD RR4A158TFB 822 0 0
GGGCCCCACTCTTCTCTTCTCTTCTCTTGAGCTCCATCGAAACGGCAGCGGATTGTCTGC
GATCGATCCCCGGAAACAAAGAAGAGAAGATGGCGGCGCCGGAAGATCCAGTCAAGTACG
TCGGAATCATAAAGGAATCCGCCGCTTTCCGCCTAATGAAATCGATGGGATGGGAAGAAG
GAGAAGGACTTGGTAAAGACAAGCAAGGTATCAAAGGCTATGTCCGTGTCAAGAACAAGC
AAGACACAACCGGTGTTGGTGTTGACAAGCCAAATCCATGGGCATTTGATACTACTCAGT
TTGATAACATTCTCAAGAAGTTGAAAGTGCAAGCAGCACCTATCAAGAAAGATAATGCTT
CGGAGAAGGAAGCTGAAAGTGAAGATGAAGCTGCCAAATCCGAGCCTGTCAAGCCCAATG
TTGCTAAGGTTACTCGTCCACAAGGAAGGTATAAACGTAGAGAGAAGGGGAAGCTTGTCA
ATTCTTACTCCTCTAAAGATCTTGAAGGCATACTTGTTAAGCGAACTGAGGAGCCTTCTC
CTGCGGTTTGTGACATAGCCGATGCTATGGAGATTGAAATCATATCTGAGGACCAACATC
CTGATGTTAAAGAACAGAAAATCGAAGAACCTTCTTCAGACTGGTGGGGATTTAAATCTG
GGTTTGTCTCGGGCGGTCCTCTTGGAGCTAAGCCTGGCAAAAAGAAATTATCCAAGTCTA
ACGAGAGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCACGATA
AAGCCACGGCTGGAAA*CAAGGACTGGGTATCAAGGACCGGC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4A158JQD 780 0 0
CTAAGCCTGGCAAAAAGAAATTATCCAAGTCTAACGAGAGAAAAATGTTTTGTGAGGACG
ATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAAGCCACGGCTGGAAAACAAGGACTGG
GTATCAAGGACCGGCCTAAGAAAATAGCTGGTGTTCGTTACCAAGGAAAGAAAACTTCTT
TTGATAACAGTGATGATGATACTGATGACGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGA
GTGAAGAAGATGATGACAAGAACTCTGCTATAGAAAGTTCTCTCCCAGCAAAAAGGAAGC
GTGATGAAATCACTGAACCTAAAATCAAGTTGAAGAAACTGTGCAAGCAGATTCTTAAAA
AGGAAGCTGGTAGTGGTGGAACCATGAAGCTGAAACAGCTTAAATCTCTAATTGATGAAC
AAGCACCATCGCTTCTCTCGGAGTTTTCTTCAAGGAAAGAGGCTATTGCTTACTTGAAGC
TTAAGCTGGAGCGAAGTGGGAAGTTTATTGTGGAGGGAAAGAAGATCAGTCTCGTATCTA
AAAACAAGTGAGGACAATTATCGTTATACTACCTGCATAGGACAGTGGAGATTAGGGCAA
GTTTTGTTACTGAATCATCACCATGCGGTATGCATAACAAATATCTTTCATTTTGAAATT
TTGATGTGTTTGTAATTTTTTCATACAATTATAGTATGAGAGTCTGCTTTAAAACTTCAC
CATAGCAAGTCAAAACTAATCTCTTTTATTTAGGAGCAAATATAGAACAAACTCTTCTCT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL3776Contig1 878 2 8 U
GGTGACTCTGAGTTTCAGTATGTTGTAGCTGTAAATGATATGGACATTGGATCAAGAAGC
AACTCAACTCTCAATGGATCTGCTAACAATTTAGCTGAGATGGATGTTAGGAACAACACT
GAGGCCATCAACATCAACAACGGTGTTGCCCCTTCGCAGTTACAATCCTCTTTACAGTAT
TCTGACTCTGCGCCACAAAGCTCGTTGCTGCAGTATCCTCAATCTATCCCACCCCATGCT
GCGTTTCAGTTTCAGCAAGCTGTTCCTCCGAGTTCTACTCTTCAGTATGCTCAGTCCATT
CCGCCAAGTCCTTCTCTTCAGTATCCTCAGTCTGTTCTCCCAGGTTCCACTCTTCAGTAT
CCACCAAGCTCTTATGGAATGTACCCACAATATTATGAAGAAAGGCAGCAGTTTCCGATG
CATCATGAACACAGTTCGTCCAATTACTCTATCTCCATACCTTTCCAAGGGCAGCCATAC
CCTCACCCTGGGGGTGCCGTACAGCAAAACGCAGCAGTGCAGGGAAGAGAGCTAAACACT
AAACCTGAGATGAGAGTTCGTGAGAATATAGAGCCTGAATCTCGCCAGAATCCTCCTCAA
GTGGACAATCTCGAGGTTAAGAATCACTGCGAAGCTCTTCCGGAGCCATCAGTTTCTGCA
ACTGTGCCTAGCCAGGATGCTACACATATGTTGCCCCCAAGAAGAGACGAAAGTTGAACA
GTTTAGGCCTTTTGATCAGAAAAAAAATAGAACTCTTTAAGCTTCAGACGAAATTAGGGT
TAGTAAACTGGGCTTGCGTTGGGCCAGTTTCGAATTTCATTCGACCAAAAAAAATGATGT
GGCAAAATTTTTGATTTTTATTGATTGATTTTCCTATC


BQ
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AF RR4BR35TF U 1
AF RR4BR35JQ C 455
BS 1 491 RR4BR35TF
BS 492 492 RR4BR35JQ
BS 493 697 RR4BR35TF
BS 698 698 RR4BR35JQ
BS 699 702 RR4BR35TF
BS 703 703 RR4BR35JQ
BS 704 717 RR4BR35TF
BS 718 878 RR4BR35JQ

RD RR4BR35TF 728 0 0
GGTGACTCTGAGTTTCAGTATGTTGTAGCTGTAAATGATATGGACATTGGATCAAGAAGC
AACTCAACTCTCAATGGATCTGCTAACAATTTAGCTGAGATGGATGTTAGGAACAACACT
GAGGCCATCAACATCAACAACGGTGTTGCCCCTTCGCAGTTACAATCCTCTTTACAGTAT
TCTGACTCTGCGCCACAAAGCTCGTTGCTGCAGTATCCTCAATCTATCCCACCCCATGCT
GCGTTTCAGTTTCAGCAAGCTGTTCCTCCGAGTTCTACTCTTCAGTATGCTCAGTCCATT
CCGCCAAGTCCTTCTCTTCAGTATCCTCAGTCTGTTCTCCCAGGTTCCACTCTTCAGTAT
CCACCAAGCTCTTATGGAATGTACCCACAATATTATGAAGAAAGGCAGCAGTTTCCGATG
CATCATGAACACAGTTCGTCCAATTACTCTATCTCCATACCTTTCCAAGGGCAGCCATAC
CCTCACCCTGGTGGTGCCGTACAGCAAAACGCAGCAGTGCAGGGAAGAGAGCTAAACACT
AAACCTGAGATGAGAGTTCGTGAGAATATAGAGCCTGAATCTCGCCAGAATCCTCCTCAA
GTGGACAATCTCGAGGTTAAGAATCACTGCGAAGCTCTTCCGGAGCCATCAGTTTCTGCA
ACTGTGCCTAGCCAGGATGCTACACATATGTTGCCCC*AAGA*GAGACGAAAGTTGA
CAGTCTAGCCT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4BR35JQ 424 0 0
CCATACCTTTCCAAGGGCAGCCATACCCTCACCCTGGGGGTGCCGTACAGCAAAACGCAG
CAGTGCAGGGAAGAGAGCTAAACACTAAACCTGAGATGAGAGTTTGTGAGAATATAGAGC
CTGAATCTCGCCAGAATCCTCCTCAAGTGGACAATTTCGAGGTTAAGAATCACTGGGAAG
CTTTTCCGGAGCCATCAGTTTTTGCAACTGTGCCTAGCCAGGATGCTACACATATGTTGC
CCCCAAGAAGAGACGAAAGTTGAACAGTTTAGGCCTTTTGATCAGAAAAAAAATAGAACT
CTTTAAGCTTCAGACGAAATTAGGGTTAGTAAACTGGGCTTGCGTTGGGCCAGTTTCGAA
TTTCATTCGACCAAAAAAAATGATGTGGCAAAATTTTTGATTTTTATTGATTGATTTTCC
TATC

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 2

CO CL3777Contig1 868 2 3 U
TGATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCCTCATAATGGATGCTGGAACTG
GATTCAACTCTCAAGTTTATGAGTTGTCACCGGTCTTCCTACATAAGGACTGGATTATGG
AGCAGTGGGAAAAGAACTACTATATAAGCTCCATAGCTGGTTCAGATAACGGGAGCTCGT
TAGTTGTTATGTCAAAAGGAACTACTTATAGTCAGCAGTCATACAAAGTCAGCGACTCGT
TTCCATTCAAGTGGATAAATAAGAAATGGAAAGAAGATTTTCATGTAACTTCCATGACAA
CTGCTGGTAATCGTTGGGGTGTGGTGATGTCTAGAAACTCTGGCTTCTCTGATCAGGTGG
TGGAGCTTGACTTTTTGTACCCAAGCGATGGGATACATAGGAGGTGGGAGAATGGGTATA
GGATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGATTCAAGCAGCTTTTCATATTAAGCATACCAAA
GCGTAAAATGGTGGATGAAAACCCAAGAGACTCTTCGCACCACCCGCTTTTTCCAAGCAC
ACATGTCAAGGACAAATGGGCGAAGAATCTGTACATTTGCATCAATATGCTATGGCAGGA
CAGTGTGCTGATACACACTTAGCAAGCATCATGTGTTGTGTTAGAAAGCCAAGCGAGCCT
CAGGGTCGTCATAATACCAATCAAAAAACGTAAAACCAGACAAAACCTCTTTTTGGTTGA
ATGTAATGAAAGGGATGTGTCTTGGTATCTAATGTATGTACGAGTAACAAAAGAGAAGAT
GGAATTAGTAGTAGAGAAAGATTTGAGAGCTTTTTAAGCCCTTCAAGTGTGTGCTTATAT
AAACCAGACCATTTGCTTTGTTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC44TF U 414
AF RR4BC44JQ C 1
BS 1 413 RR4BC44JQ
BS 414 682 RR4BC44TF
BS 683 868 RR4BC44JQ

RD RR4BC44TF 269 0 0
GGGTATAGGATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGATTCAAGCAGCTTTTCATATTAAGCA
TACCAAAGCGTAAAATGGTGGATGAAAACCCAAGAGACTCTTCGCACCACCCGCTTTTTC
CAAGCACACATGTCAAGGACAAATGGGCGAAGAATCTGTACATTTGCATCAATATGCTAT
GGCAGGACAGTGTGCTGATACACACTTAGCAAGCATCATGTGTTGTGTTAGAAAGCCAAG
CGAGCCTCAGGGTCGTCATAATACCAATC

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR4BC44JQ 868 0 0
TGATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCCTCATAATGGATGCTGGAACTG
GATTCAACTCTCAAGTTTATGAGTTGTCACCGGTCTTCCTACATAAGGACTGGATTATGG
AGCAGTGGGAAAAGAACTACTATATAAGCTCCATAGCTGGTTCAGATAACGGGAGCTCGT
TAGTTGTTATGTCAAAAGGAACTACTTATAGTCAGCAGTCATACAAAGTCAGCGACTCGT
TTCCATTCAAGTGGATAAATAAGAAATGGAAAGAAGATTTTCATGTAACTTCCATGACAA
CTGCTGGTAATCGTTGGGGTGTGGTGATGTCTAGAAACTCTGGCTTCTCTGATCAGGTGG
TGGAGCTTGACTTTTTGTACCCAAGCGATGGGATACATAGGAGGTGGGAGAATGGGTATA
GGATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGAT*CAAGCAGCTTT*CATATTAAGCATACCAAA
GCGTAAAATGGTGGATGAAA*CCCAAGAGACTCTTCGCACCACC*GCTTTT*CCAAGCAC
ACATGTCAAGGACAAATGGGCGAAGAATCTGTACATT*GCATCAATATGCTATGGCAGGA
CAGTGTGCTGATACACACTTAGCAAGCATCATGTGTTGTGTTAGAAAGCCAAGCGAGCCT
CAGGGTCGTCATAATACCAATCAAAAAACGTAAAACCAGACAAAACCTCTTTTTGGTTGA
ATGTAATGAAAGGGATGTGTCTTGGTATCTAATGTATGTACGAGTAACAAAAGAGAAGAT
GGAATTAGTAGTAGAGAAAGATTTGAGAGCTTTTTAAGCCCTTCAAGTGTGTGCTTATAT
AAACCAGACCATTTGCTTTGTTTTGTCC

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 3

CO CL3778Contig1 280 3 4 U
GATATATCCTCGAGATCGCTCATGAGGCAATGAAAAGGAATGAGTATTACATCGCCTCTT
GATATAATAGTAAAAATAAAGAAAACCAAATACATGATTGAGTTTAAGAGGTATAGATTA
TATGATATCGATAAATTATCACTGGAAGATAAACCAAATTGCTTGGAAACAGTTTGGAGA
AAAAGATTGGAATCAAGCTTCATAGACTTTGCATTCCTCGTCGGCTGGGTTTGTCTTGCA
GAAATCTTCCAAAGGGTCTCCGCTTCCAGCAGCAACCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FH60JQ U 1
AF RR4FA21JQ U 17
AF RR4FA21TF C 17
BS 1 214 RR4FH60JQ
BS 215 215 RR4FA21JQ
BS 216 271 RR4FH60JQ
BS 272 280 RR4FA21JQ

RD RR4FH60JQ 277 0 0
GATATATCCTCGAGATCGCTCATGAGGCAATGAAAAGGAATGAGTATTACATCGCCTCTT
GATATAATAGTAAAAATAAAGAAAACCAAATACATGATTGAGTTTAAGAGGTATAGATTA
TATGATATCGATAAATTATCACTGGAAGATAAACCAAATTGCTTGGAAACAGTTTGGAGA
AAAAGATTGGAATCAAGCTTCATAGACTTTGCATCCCTCGTCGGCTGGGTTTGTCTTGCA
GAAATCTTCCAAAGGGTCTCCGCTTCCAGCA
ACCTCC

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR4FA21JQ 264 0 0
G
GCTCATGAGGCAATGAAAAGGAATGAGTATTACATCGCCTCTTGATATAATAGTAAAAAT
AAAGAAAACCAAATACATGATTGAGTTTAAGAGGTATAGATTATATGATATCGATAAATT
ATCACTGGAAGATAAACCAAATTGCTTGGAAACAGTTTGGAGAAAAAGATTGGAATCAAG
CTTCATAGACTTTGCATTCCTCGTCGGCTGGGTTTGTCTTGCAGAAATCTTCCAAAGGGT
CTCCGCTTCCAGCAGCAACCTCT

QA 2 264 2 264
DS 

RD RR4FA21TF 264 0 0
G
GCTCATGAGGCAATGAAAAGGAATGAGTATTACATCGCCTCTTGATATAATAGTAAAAAT
AAAGAAAACCAAATACATGATTGAGTTTAAGAGGTATAGATTATATGATATCGATAAATT
ATCACTGGAAGATAAACCAAATTGCTTGGAAACAGTTTGGAGAAAAAGATTGGAATCAAG
CTTCATAGACTTTGCATTCCTCGTCGGCTGGGTTTGTCTTGCAGAAATCTTCCAAAGGGT
CTCCGCTTCCAGCA
GCAACCTCT

QA 2 255 2 255
DS 



AS 1 3

CO CL3779Contig1 1085 3 5 U
GGAAGGAGGGTCGGAGTGGAAGCATAATAATGGGCGGTGGCGGATCATCGAGATCGGAGC
TTCTCGGTGGAGCTACTGATCGGAAACGAATCAACGAAGCTTTAGACAAACATCTCAAAA
AGTCTTCACCTTCCACTTCTAAAGACAGAGATTCATTCCCTTCAACCTCAACTACTGTTA
AATCTCAACTTCATGAAGGAGTTGAATCTGACACGGATAGTGAAGGATCGGATGTGAGTG
GGTCAGAAGGTGAAACGTCATGGATCTCGTGGTTTTGTAACTTGAGAGGGAATTTTTTTC
TGTGAAGTGGATGAAGATTATGTACAGGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCAA
GTTCCTTATTATGATTATGCACTTGATCTCATCTTAGATATTGAATCCTCAAACAGTGAT
ATGTTTACTGAAGAACAGAATGAGTTAGTAGAATCGGCTGCGGAAATGTTATATGGACTT
ATTCATGTTCGTTACATTCTCACTACTAAAGGACTAACTGCTATGTTGGAGAAGTACAAG
AACTATGATTTTGGAAGATGTCCGAGAGTTTTCTGCTGCGGTCAGTCTTGTCTTCCTGTT
GGACAATCCGATATCCCTAGGTCGAGCACGGTGAAGATATACTGCCCTAAATGCGAGGAT
CTTTACTACCCTCGATCTAAATACCAAGACATTGATGGAGCTTATTTTGGGACTACTTTC
CCACATTTGTTTCTCATGGCCCATGGGAACATGAAACCGCAGAAGCCGAGTCAAAGCTAT
GTTCCTAAAATCTTTGGCTTTAAGGTACACAAGAAGCAATGATGATGATGATACTCTCTT
CTCTCACCAGTCCAACGAGTTATATAAACACAATCTTGGTGGCGAAGCCCCTTCTTCTTA
ATGGTGTTTGGAGGATGACAAGAGCTCTTATGGGAAAAAACATCTTGAAGAGTTGAGTTT
TCTGTATGTAATCTTGAATTAAACTGATCTGATATAGAACCTGTCTTTGGCTGGGTTGGG
AGAGAAACGAAAACATGAGGTCTTGTTGATTCATTTACCTGTTGAGATTCAAGTAAATCA
TTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4D738TF U 1
AF RR4G515TF U 369
AF RR4D738JQ C 758
BS 1 600 RR4D738TF
BS 601 939 RR4G515TF
BS 940 940 RR4D738JQ
BS 941 1027 RR4G515TF
BS 1028 1085 RR4D738JQ

RD RR4D738TF 600 0 0
GGAAGGAGGGTCGGAGTGGAAGCATAATAATGGGCGGTGGCGGATCATCGAGATCGGAGC
TTCTCGGTGGAGCTACTGATCGGAAACGAATCAACGAAGCTTTAGACAAACATCTCAAAA
AGTCTTCACCTTCCACTTCTAAAGACAGAGATTCATTCCCTTCAACCTCAACTACTGTTA
AATCTCAACTTCATGAAGGAGTTGAATCTGACACGGATAGTGAAGGATCGGATGTGAGTG
GGTCAGAAGGTGAAACGTCATGGATCTCGTGGTTTTGTAACTTGAGAGGGAATTTTTTTC
TGTGAAGTGGATGAAGATTATGTACAGGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCAA
GTTCCTTATTATGATTATGCACTTGATCTCATCTTAGATATTGAATCCTCAAACAGTGAT
ATGTTTACTGAAGAACAGAATGAGTTAGTAGAATCGGCTGCGGAAATGTTATATGGACTT
ATTCATGTTCGTTACATTCTCACTACTAAAGGACTAACTGCTATGTTGGAGAAGTACAAG
AACTATGATTTTGGAAGATGTCCGAGAGTTTTCTGCTGCGGTCAGTCTTGTCTTCCTGTT

QA 1 600 1 600
DS 

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G
TATGATTATGCACTTGATCTCATCTTAGATATTGAATCCTCAAACAGTGATATGTTTACT
GAAGAACAGAATGAGTTAGTAGAATCGGCTGCGGAAATGTTATATGGACTTATTCATGTT
CGTTACATTCTCACTACTAAAGGACTAACTGCTATGTTGGAGAAGTACAAGAACTATGAT
TTTGGAAGATGTCCGAGAGTTTTCTGCTGCGGTCAGTCTTGTCTTCCTGTTGGACAATCC
GATATCCCTAGGTCGAGCACGGTGAAGATATACTGCCCTAAATGCGAGGATCTTTACTAC
CCTCGATCTAAATACCAAGACATTGATGGAGCTTATTTTGGGACTACTTTCCCACATTTG
TTTCTCATGGCCCATGGGAACATGAAACCGCAGAAGCCGAGTCAAAGCTATGTTCCTAAA
ATCTTTGGCTTTAAGGTACACAAGAAGCAATGATGATGATGATACTCTCTTCTCTCACCA
GTCCAACGAGTTATATAAACACAATCTTGGTGGCGAAGCCCCTTCTTCTTAATGGTGTTT
GGAGGATGACAAGAGCTCTTATGGGAAAAA*CATCTTGAAGAGTTGAGTTTTCTGTATGT
AATCTTGAATTAAACTGATCTGATATAGAACCTGTCTTTGGCTGGGTTGGGAGAGAAA

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4D738JQ 328 0 0
CGCAGAAGCCGAGTCAAAGCTATGTTCCTAAAATCTTTGGCTTTAAGGTACACAAGAAGC
AATGATGATGATGATACTCTCTTCTCTCACCAGTCCAACGAGTTATATAAACACAATCTT
GGTGGCGAAGCCCCTTCTTCTTAATGGTGTTTGGAGGATGACAAGAGCTCTTATGGGAAA
AAACATCTTGAAGAGTTGAGTTTTCTGTATGTAATCTTGAATTAAACTGATCTGATATAG
AACCTGTCTTTGGCTGGGTTGGGAGAGAAACGAAAACATGAGGTCTTGTTGATTCATTTA
CCTGTTGAGATTCAAGTAAATCATTTAC

QA 1 328 1 328
DS 



AS 1 3

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GGAGACCGAGAATCCATCCTCAGAAACCCCAAAAAAGAAAAAAAAAAACACTCGAGCACA
AATCCAAATCTCATCCTTCTTCTTCTTGCATTCCTTAGATTGTTTGCTTTGCTTTCAATG
GACGCTTGATTTGCTCTGGTAACTTCGTTTAGTGAGAGAGAGTTTACTATTATGGATCCT
GAAACTGAAAGTACCATGGTGGCTGATGGGACTACTGACTCTGCTCTTGCGAATGGTGGT
TTAACAGTGGAGAGTGTCGTCGTTGTGGAAGGAAATGGTGTTGCTTCTGATGAAACTTTG
GATACTAATTCAGGAAGTCAGAATGAGAATTCCGGAGACAGTTCCGCTTTGGATGCAGTT
GAACAGCCGAAGGAGGCAGCTGAGGGCACACAAGTTGAAAGTGTAGACGGGCCAAAGTAT
GTTAATGGCCAAAAGGCTCAACGGAAGCTAAAGCCGGAGAAACTCTCTGGTGGTAAGAAT
GGTCCATCGGTTCTTATCAAGAAGAAGAAAGAGATTAAAGGTGCAGATGCTAAAGTGGCA
TCATCTAATGGCTCTGTTGCTCCTACTGCACAAACAACAAAGTCTCTGAAGAGTACATCT
TTCAATGGTAGAGCGGCTAAGGTCACTGAGCATGGAAAGCAAGACCGTGGACCAGCTGAA
AGCGCCGCCGGGGACAAGGTGAAACCAAAGCCTCGAAGAAACAAGTCCAGGAGACACCTG
AAGATGATGCTCAGTCTTCTAATAGCCCGAAAGCAGAAGATGGGAAACCTCGTAAAGTTG
GTGCACTTCCAAATTACGGGTTCAGTTTCAAATGTGACCAACGTGCTGAAAAGAGAAGAG
AGTTCTATGTTAAGCTTGAGGAGAAGACTCATTAGCTTGCATTAATTAAGGAGGACAAGA
GGAAAAAGAAACCGTATGATATTTTTATTTTATATTATATCTTCGACCAAAACTTATGTG
AGAAGAAATGGTTAAAAAGAGTGAAAAGAGTCATATGGGGTTTGGTTCTAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG07TF U 1
AF RR4EU88TF U 216
AF RR4EU88JQ C 383
BS 1 407 RR4EG07TF
BS 408 408 RR4EU88TF
BS 409 416 RR4EG07TF
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BS 496 496 RR4EU88TF
BS 497 621 RR4EG07TF
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BS 623 666 RR4EG07TF
BS 667 764 RR4EU88TF
BS 765 1015 RR4EU88JQ

RD RR4EG07TF 666 0 0
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GAAACTGAAAGTACCATGGTGGCTGATGGGACTACTGACTCTGCTCTTGCGAATGGTGGT
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GTTAATGGCCAAAAGGCTCAACGGAAGCTAAAGCCGGAGAAACTCTCTGGTGGTAAGAAT
GGTCCATCGGTTCTTCTCAAGAAGAAGAAAGAGATTAAAGGTGCAGATGCTAAAGTGGCA
TCATCTAATGGCTCTGTTGCTCCTACTGCACAAACAACAAAGTCTCTGAAGAGTACATCT
TTCAATGGTAGAGCGGCTAAG*TCACTGAGCATGGAAAGCAAGACCGTGGACCAGCTGAA
AGCGCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4EU88TF 549 0 0
G
GACTCTGCTCTTGCGAATGGTGGTTTAACAGTGGAGAGTGTCGTCGTTGTGGAAGGAAAT
GGTGTTGCTTCTGATGAAACTTTGGATACTAATTCAGGAAGTCAGAATGAGAATTCCGGA
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GAGAAACTCTCTGGTGGTAAGAATGGTCCATCGGTTCTTATCAAGAAGAAGAAAGAGATT
AAAGGTGCAGATGCTAAAGTGGCATCATCTAATGGCTCTGTTGCTCCTACTGCACAAACA
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AGAAACAAGTCCAGGAGACACCTGAAGATGATGCTCAGTCTTCTAATAGCCCGAAAGCAG
AAGATGGG

QA 2 549 2 549
DS 

RD RR4EU88JQ 633 0 0
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GGAAGCTAAAGCCGGAGAAACTCTCTGGTGGTAAGAATGGTCCATCGGTTCTTATCAAGA
AGAAGAAAGAGATTAAAGGTGCAGATGCTAAAGTGGCATCATCTAATGGCTCTGTTGCTC
CTACTGCACAAACAACAAAGTCTCTGAAGAGTACATCTTTCAATGGTAGAGCGGCTAAGG
TCACTGAGCATGGAAAGCAAGACCGTGGACCAGCTGAAAGCGCCGCCGGGGACAAGGTGA
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CAGTTTCAAATGTGACCAACGTGCTGAAAAGAGAAGAGAGTTCTATGTTAAGCTTGAGGA
GAAGACTCATTAGCTTGCATTAATTAAGGAGGACAAGAGGAAAAAGAAACCGTATGATAT
TTTTATTTTATATTATATCTTCGACCAAAACTTATGTGAGAAGAAATGGTTAAAAAGAGT
GAAAAGAGTCATATGGGGTTTGGTTCTAAATGT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL3781Contig1 1321 2 2 U
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ATATCCATCTTCTTCCTTTCACCTGAACGATCGGAGCTTCGAGATATCGAACTTGCCTTC
ATCGCGCGCGGAGAAGCTGATCCGAGAGCTGAACCTTTTTCCGAAGCTTGACTTGAACGT
GATCGATGTCGGCGATTCGACTCTCGCTTCTTTCGCGGAGGAAGTGCCTTCGATTGTTGA
ACGGAACTTCAGATTCCCGAGTATCGTATCCGATGGTGGAGATACCGTCGAGGATTTAGG
TCATCATGCTGGCTATTTCAAGCTCCCGAAATCTCAGGGCGCAAGGATGTTTTACTTCTT
CTTCGAGTCACGCAAGAAGAAGGATGATGCGCCTGTTGTGATTTGGTTGACCGGAGGGCC
TGGATGTAGCAGTGAATTAGCTATGTTCTATGAGAACGGTCCTTTCAAGATTGATAAGAA
TATGTCTCTTGCTTGGAATGAGTATGGATGGGATCAGGCTTCCAATCTACTGTATGTCGA
CCAGCCTGTTGGGACTGGTTTCAGCTACACCACAGACAAAAGTGATATCCGTCATGATGA
AACTGGAGTCAGCGATGATCTGTATGATTTTCTGCAGGCGTTCTTTGCGGAGCACCCTAA
GCTTGCAAACAACGACTTTTACATAACTGGGGAGTCATATGCTGGGCATTACATTCCGGC
ATTTGCTGCACGTGTCCATAAAGGAAACAAGGCTAATGAGGGAATTCATGTTAACCTTAA
GGGTTTCGCCATTGGAAATGGGCTTACAGATCCCGCAATCCAATACCCAGCCTATCCTGA
CTATGCGCTGGAAATGGGTTTGATTACGCAAGCAGAGCATGGTCGTTTAGAAAAGATTGT
CCCACTGTGCGAACTATCCATTAAGCTTTGTGGAACTTTAAGGCGAGTAAGGAAGTTCCC
TTTGTGGTTGATGGGAAAGAAGCTGGCAAGTTGAAGAGTTATGGAAAACTCAGGTTCCTC
AAGGTGCACGATGCGGGACACATGGTTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGGAAATG
TTGAAGGGATGGATGGAGAATTCACTTAGTGGTGGAGGTGCTGTAACTACTAGTACTACT
GCAGATGGAGAGGATCTGGTTGCTCAGATGTGATCCCATCGTATTTTTACATTGCAGAAA
CATCTATATAGCAGCAACCAAAGAAACAATGTGGACTGTGTTTATGTAAACACTTTTCCT
TCTGTAACTTTGATTACAATATTGTACAAACATAATTTAATTCCAATTTGGCATTGAAAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4DN53TF U 1
AF RR4DN53JQ C 549
BS 1 714 RR4DN53TF
BS 715 1321 RR4DN53JQ

RD RR4DN53TF 714 0 0
GGAAACGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTTGCCCATCGTCGTCCTCATCGCTTGTAC
ATATCCATCTTCTTCCTTTCACCTGAACGATCGGAGCTTCGAGATATCGAACTTGCCTTC
ATCGCGCGCGGAGAAGCTGATCCGAGAGCTGAACCTTTTTCCGAAGCTTGACTTGAACGT
GATCGATGTCGGCGATTCGACTCTCGCTTCTTTCGCGGAGGAAGTGCCTTCGATTGTTGA
ACGGAACTTCAGATTCCCGAGTATCGTATCCGATGGTGGAGATACCGTCGAGGATTTAGG
TCATCATGCTGGCTATTTCAAGCTCCCGAAATCTCAGGGCGCAAGGATGTTTTACTTCTT
CTTCGAGTCACGCAAGAAGAAGGATGATGCGCCTGTTGTGATTTGGTTGACCGGAGGGCC
TGGATGTAGCAGTGAATTAGCTATGTTCTATGAGAACGGTCCTTTCAAGATTGATAAGAA
TATGTCTCTTGCTTGGAATGAGTATGGATGGGATCAGGCTTCCAATCTACTGTATGTCGA
CCAGCCTGTTGGGACTGGTTTCAGCTACACCACAGACAAAAGTGATATCCGTCATGATGA
AACTGGAGTCAGCGATGATCTGTATGATTTTCTGCAGGCGTTCTTTGCGGAGCACCCTAA
GCTTGCAAACAACGACTTTTACATAACTGGGGAGTCATATGCTGGGCATTACAT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DN53JQ 773 0 0
TTGGGACTGGTTTCAGCTACACCACAGACAAAAGTGATATCCGTCATGATGAAACTGGAG
TCAGCGATGATCTGTATGATTTTCTGCAGGCGTTCTTTGCGGAGCACCCTAAGCTTGCAA
ACAACGACTTTTACATAACTGGGGAGTCATATGCTGGGCATTACATTCCGGCATTTGCTG
CACGTGTCCATAAAGGAAACAAGGCTAATGAGGGAATTCATGTTAACCTTAAGGGTTTCG
CCATTGGAAATGGGCTTACAGATCCCGCAATCCAATACCCAGCCTATCCTGACTATGCGC
TGGAAATGGGTTTGATTACGCAAGCAGAGCATGGTCGTTTAGAAAAGATTGTCCCACTGT
GCGAACTATCCATTAAGCTTTGTGGAACTTTAAGGCGAGTAAGGAAGTTCCCTTTGTGGT
TGATGGGAAAGAAGCTGGCAAGTTGAAGAGTTATGGAAAACTCAGGTTCCTCAAGGTGCA
CGATGCGGGACACATGGTTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGGAAATGTTGAAGGG
ATGGATGGAGAATTCACTTAGTGGTGGAGGTGCTGTAACTACTAGTACTACTGCAGATGG
AGAGGATCTGGTTGCTCAGATGTGATCCCATCGTATTTTTACATTGCAGAAACATCTATA
TAGCAGCAACCAAAGAAACAATGTGGACTGTGTTTATGTAAACACTTTTCCTTCTGTAAC
TTTGATTACAATATTGTACAAACATAATTTAATTCCAATTTGGCATTGAAATC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL3782Contig1 641 3 19 U
GGGACTTCCTCTGATTATTTTCGGTAGAGGAGCAAATAAAAAAAAATGGCGTCGAAGCTG
GTGAAAGCCCTAATCCGATCGCAGATTCTTCCATCTACGAGGAGGCACTTTAGTGCACCG
GCTACCACACAATTAGGCGTGCCAACAGACGATCTAGTCGGAAATCACACCGCCAAATGG
ATGCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCGGTGGAGCTGATCAATGAGGTCCCACCTATTAAA
GTTGATGGAAGGATTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAATCCAGCACTCGGTCATCCAATT
GAGTTCATTTGCCTCGACCTAGACGAGCCTACCGTCTGCAAGTACTGTGGCCTTCGCTAT
GTTCAGGATCATCATCACTAAGCCAACATTCTGAAAGTCATGAAAAGTCTCCAGTCTCTT
TTTTCTCCTTTTTTAAAATTTATTGTCAAGTTTGCGCGATGCATCGGCATCTTCAGAACA
TCTTATGTAATAAAGGTTTCGATCAGTGTTTGATTATGTATGTTTGACCTCAGAGTCTTT
TTCATGTCACTGAGCCTAAAAAGGCTTTGGGGATTTGCTATATAACCAGTGCCAAGTTTG
TTCCATCTTGATAAAATGATATTAGTGTCGATATTTATTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CQ91TF U 1
AF RR4H095JQ C 100
AF RR4H095TF U 1
BS 1 110 RR4CQ91TF
BS 111 111 RR4H095TF
BS 112 164 RR4CQ91TF
BS 165 165 RR4H095TF
BS 166 207 RR4CQ91TF
BS 208 208 RR4H095TF
BS 209 236 RR4CQ91TF
BS 237 237 RR4H095TF
BS 238 330 RR4CQ91TF
BS 331 331 RR4H095TF
BS 332 365 RR4CQ91TF
BS 366 366 RR4H095TF
BS 367 406 RR4CQ91TF
BS 407 407 RR4H095TF
BS 408 440 RR4CQ91TF
BS 441 441 RR4H095TF
BS 442 477 RR4CQ91TF
BS 478 478 RR4H095TF
BS 479 641 RR4CQ91TF

RD RR4CQ91TF 641 0 0
GGGACTTCCTCTGATTATTTTCGGTAGAGGAGCAAATAAAAAAAAATGGCGTCGAAGCTG
GTGAAAGCCCTAATCCGATCGCAGATTCTTCCATCTACGAGGAGGCACTTCAGTGCACCG
GCTACCACACAATTAGGCGTGCCAACAGACGATCTAGTCGGAAACCACACCGCCAAATGG
ATGCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCGATGGAGCTGATCAATGAGGTCCCACCTATCAAA
GTTGATGGAAGGATTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAATCCAGCACTCGGTCATCCAATT
GAGTTCATTTGCCTCGACCTAGACGAGCCTGCCGTCTGCAAGTACTGTGGCCTTCGCTAT
GTTCAAGATCATCATCACTAAGCCAACATTCTGAAAGTCATGAAAAATCTCCAGTCTCTT
TTTTCTCCTTTTTTAAAATTCATTGTCAAGTTTGCGCGATGCATCGGCATCTTCAGA*CA
TCTTATGTAATAAAGGTTTCGATCAGTGTTTGATTATGTATGTTTGACCTCAGAGTCTTT
TTCATGTCACTGAGCCTAAAAAGGCTTTGGGGATTTGCTATATAACCAGTGCCAAGTTTG
TTCCATCTTGATAAAATGATATTAGTGTCGATATTTATTCG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4H095JQ 505 0 0
AGGAGGCACTTTAGTGCACCGGCTACCACACAATTAGGCGTGCCAACAGACGATTTAGTC
GGAAATCACACCGCCAAATGGATGCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCGGTGGAGCTGATC
AATGAGGTCCCACCTATTAAAGTTGATGGAAGGATTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAAT
CCAGCACTCGGTCATCCAATTGAGTTCATTTGCCTCGACCTAGACGAGCCTACCGTTTGC
AAGTACTGTGGCCTTCGCTATGTTCAGGATCATCATCACTAAGCCAACATTCTGAAAGTC
ATGAAAAGTCTCCAGTTTCTTTTTTCTCCTTTTTTAAAATTTATTGTCAAGTTTGCGCGA
TGCATCGGCATTTTCAGAACATCTTATGTAATAAAGGTTTCGATCAGTGTTTGATTATGT
ATGTTTGACCTCAGAGTCTTTTTCATGTCATTGAGCCTAAAAAGGCTTTGGGGATTTGCT
ATATAACCAGTGCCAAGTTTGTTCC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4H095TF 604 0 0
GGGACTTCCTCTGATTATTTTCGGTAGAGGAGCAAATAAAAAAAAATGGCGTCGAAGCTG
GTGAAAGCCCTAATCCGATCGCAGATTCTTCCATCTACGAGGAGGCACTTTAGTGCACCG
GCTACCACACAATTAGGCGTGCCAACAGACGATCTAGTCGGAAATCACACCGCCAAATGG
ATGCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCGGTGGAGCTGATCAATGAGGTCCCACCTATTAAA
GTTGATGGAAGGATTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAATCCAGCACTCGGTCATCCAATT
GAGTTCATTTGCCTCGACCTAGACGAGCCTACCGTCTGCAAGTACTGTGGCCTTCGCTAT
GTTCAGGATCATCATCACTAAGCCAACATTCTGAAAGTCATGAAAAGTCTCCAGTCTCTT
TTTTCTCCTTTTTTAAAATTTATTGTCAAGTTTGCGCGATGCATCGGCATCTTCAGAACA
TCTTATGTAATAAAGGTTTCGATCAGTGTTTGATTATGTATGTTTGACCTCAGAGTCTTT
TTCATGTCACTGAGCCTAAAAAGGCTTTGGGGATTTGCTATATAACCAGTGCCAAGTTTG
TTCC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 3

CO CL3783Contig1 773 3 2 U
GGAAAACATTCAAACACAAGATAAAGAAACAGTCTTACAAGAACTACATACGTTGTTTCA
AAGCTCTTTGTTTTTCAAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTCTGT
ACTTTACTCCGTATCATCATCTCACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGCGG
AGGAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTTCT
TCACTCGGTGATTCCACCACCACCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTCGC
CAATGACGCGACGTGTCTTCGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTTAA
CCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATCTC
ACTATGCAAAGCCAGTCCCGCGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACTCC
AAAAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCTTC
AACATCCACACCAACAAGCTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTGGACTAAGCTTCGCATC
GACTATTGTGGCATTTGCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATATTATTACATA
ACGTCTTTATTCATTATTAGATTGGTTTAATTTGTTTGAAATTATGTTTGGTAACTTAAT
ATTCATATGTAATGAAAAAATTCTAATAATATTAATGACTTCCAACAGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C008TF U 1
AF RR4H759TF U 467
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CAATGACGCGACGTGTCTTCGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTTAA
CCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATCTC
ACTATGCAAAGCCAGTCCCGCGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACTCC
AAAAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCTTC
AACATCCACACCAACAAGCTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTGGACTAAGCTTCGCATC
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TCATCAGCTTCTTCAACATCCACACCAACAAGCTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTGGA
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TATATTATTACATAACGTCTTTATTCATTATTAGATTGGTTTAATTTGTTTGAAATTATG
TTTGGTAACTTAATATTCATATGTAATGAAAAAATTCTAATAATATTAATGACTTCCAAC
AGCTTTT

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DS 

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TTACATAACGTCTTTATTCATTATTAGATTGGTTTAATTTGTTTGAAATTATGTTTGGTA
ACTTAATATTCATATGTAATGAAAAAATTCTAATAATATTAATGACTTCCAACAGC

QA 1 176 1 176
DS 



AS 1 3

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GATAAAAAGAAAGACCTAATCTCAGAGATAAACTAGGTCAGACAATTCTTTACACAACAC
ATATAACACTTTTGTCTCAATGCCTCTCTCTATTTGTGATAATGTCATACAAATCGAGTT
TCTTCTTCACAAGCTACTTATCCCCAACGCTGCGAATACGTTTCTGCAGATGCTCCAAAC
TCGCAACTCTCCTCATCGACTCTGTCCTGTTCATTTTGCAACCGACCAAGGCCTTGCTTT
TGTTGTTGCTTGAGCTGGGGGTCTCAGGTGTGGTTACTTGGGAGCTTGTGTCCAGAAACT
TTGATGTCTCTGAAGGATTAGAGACACTTGAAACCTGAGGTATGGTGTGGAACATTGGGT
TGAATCCTGTGATTCTCTTCACTGTCTCCTCAGCCATTTTCACTTTAGCTCGTAGTGTCT
CTAGATTGGCTTTCAAAACTCTGTTTTCTACAGATGCGTCATTGAATGTCTGAGTTACGT
CAGTGAGACCTTTCATGAGGTTTGAGTTCTCTACACGCAGCTGTGAAACTTGTGTCTCTA
GCTCACTAGGGTGTGCTTGCTTTCTTCTTCTGGATCTTCTAGCTGATTCCCTGTTAGAGA
GCATCCTTTTGACACGCTTGACGTTAGTAGGATTCATATTAGTTTCACCATCAGCTTCTT
CTTCATCATCACCAGAGAACTCGGATCCACTTGTTATGGTACTGCTCATCACTGGTGTAT
CTTTGGGAGAAGCTAAGGAGCCTTGGTCTGATGTATAGGCTCCTCCACCATTCTCAGATC
TACCAGAGGTATCCTGAGGTTTGATGAAACCTCCTCTTTTCATGGAGACAACAGCAGCAC
AAGCTAGATTGAGTTTACTCTTCAGAATCTCTCTGTATTCATGAGAATCATCCACCGGAG
AAGAAGGTCCAGAGACGGAGACGCCATACGCCGTCGCCGCTGCACCGGCACTGGCGTCGG
AGGATTCTTGTAAGAAGCGACGGAATGCCCACTCTGACTCACTACGATTCATTCCCGACG
TTCCATCAGAAGTTTCTTTAGCCGGCTCTGACCAAAGATGGTTATTACCGGACATTTTTT
GTTGTTAAATTTGTTTTTTTTTTTGCCC


BQ
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AF RR4GU34JQ U 149
AF RR4D435JQ U 1
AF RR4D435TF C 501
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BS 613 1228 RR4D435TF

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TAAACTAGGTCAGACAATTCTTTACACAACACATATAACACTTTTGTCTCAATGCCTCTC
TCTATTTGTGATAATGTCATACAAATCGAGTTTCTTCTTCACAAGCTACTTATCCCCAAC
GCTGCGAGTACGTTTCTGCAGATGCTCCAAACTCGCAACTCTCCTCATCGACTCTGTCCT
GTTCATTTTGCAACCGACCAAGGCCTTGCTTTTGTTGTTGCTTGAGCTGGGGGTCTCAGG
TGTGGTTACTTGGGAGCTTGTGTCCAGAAACTTTGATGTCTC
CGAA

QA 1 282 1 282
DS 

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GATAAAAAGAAAGACCTAATCTCAGAGATAAACTAGGTCAGACAATTCTTTACACAACAC
ATATAACACTTTTGTCTCAATGCCTCTCTCTATTTGTGATAATGTCATACAAATCGAGTT
TCTTCTTCACAAGCTACTTATCCCCAACGCTGCGAATACGTTTCTGCAGATGCTCCAAAC
TCGCAACTCTCCTCATCGACTCTGTCCTGTTCATTTTGCAACCGACCAAGGCCTTGCTTT
TGTTGTTGCTTGAGCTGGGGGTCTCAGGTGTGGTTACTTGGGAGCTTGTGTCCAGAGACT
TTGATGTCTCTGAAGGATTAGAGACACTTGAAACCTGAGGTATGGTGTGGAACATTGGGT
TGAATCCTGTGATTCTCTTCACTGTCTCCTCAGCCATTTTCACTTTAGCTCGTAGTGTCT
CTAGATTGGCTTTCAAAACTCTGTTTTCTACAGATGCGTCATTGAATGTCTGAGTTACGT
CAGTGAGACCTT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4D435TF 728 0 0
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CTGTTTTCTACAGATGCGTCATTGAATGTCTGAGTTACGTCAGTGAGACCTTTCATGAGG
TTTGAGTTCTCTACACGCAGCTGTGAAACTTGTGTCTCTAGCTCACTAGGGTGTGCTTGC
TTTCTTCTTCTGGATCTTCTAGCTGATTCCCTGTTAGAGAGCATCCTTTTGACACGCTTG
ACGTTAGTAGGATTCATATTAGTTTCACCATCAGCTTCTTCTTCATCATCACCAGAGAAC
TCGGATCCACTTGTTATGGTACTGCTCATCACTGGTGTATCTTTGGGAGAAGCTAAGGAG
CCTTGGTCTGATGTATAGGCTCCTCCACCATTCTCAGATCTACCAGAGGTATCCTGAGGT
TTGATGAAACCTCCTCTTTTCATGGAGACAACAGCAGCACAAGCTAGATTGAGTTTACTC
TTCAGAATCTCTCTGTATTCATGAGAATCATCCACCGGAGAAGAAGGTCCAGAGACGGAG
ACGCCATACGCCGTCGCCGCTGCACCGGCACTGGCGTCGGAGGATTCTTGTAAGAAGCGA
CGGAATGCCCACTCTGACTCACTACGATTCATTCCCGACGTTCCATCAGAAGTTTCTTTA
GCCGGCTCTGACCAAAGATGGTTATTACCGGACATTTTTTGTTGTTAAATTTGTTTTTTT
TTTTGCCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3785Contig1 721 3 3 U
GGATTCTTCGTCTTCGATATCTCTCATCGTCTCGTCTAAGAAAAGAGAGCGTTTTGTTTA
CAAGAGGTAACAGTTTCGAGCCTTGCAAGTGGAAGAAACAATCGAAAGTTTGAAGCTTTC
TTTTATGTCTGACAAGATTTCACCGTTTTGCTATCAATCTGGTTGCGTGGAAACTACTAT
CCTGCATCCGGAGCTACGTACCACCACAAGCTCTTTCATCACTCTAGGCTCTCGCATCTT
CGAACCCGAGATTCCCCCACCTCTCTCTGACTAAAAAAAAAAAAAAACATGGCGCTGCAG
AACATCGGTGCATCCAACCGCAACGATGCCTTTTACAGGTACAAGATGCCCAAGATGGTT
ACCAAGATTGAAGGCAAAGGTAACGGCATCAAGACCAACATCGTCAACAACGTAAAGATT
GCAAGGGCCCTGGGGAGGCCTGCTTCCTACACGACCAAGTACTTTGGTTGCGAGCTTGGA
GCGCAGTCCAAGTTCGATGAGAAGACTGGGACTTCGCTTGTGAATGGAGCTCACAGCACG
TCTAAGCTCGCTTCTCTTCTCGAGGCTTTTATTAAGAGGTATGTCCAGTGCTATGGATGT
GGGAACCCTGAGACTGAGGTTATTGTTACGAAGACGCAGATGGTGAATCTCAAGTGTGCC
GCTTGTGGGTTTATCTCTGAGTTGACATGAGGGATAGCTGACGACGTTCGTTCTGAAGAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4H787JQB C 7
AF RR4H787TF U 1
AF RR4G158TF U 1
BS 1 100 RR4G158TF
BS 101 101 RR4H787TF
BS 102 721 RR4G158TF

RD RR4H787JQB 266 0 0
TTCGTTTTCGATATCTCTCATCGTCTCGTCTAAGAAAAGAGAGCGTTTTGTTTACAAGAG
GTAACAGTTTCGAGCCTTGCAAGTGGAAGAAACAATCGAAAGTTTGAAGCTTTCTTTTAT
GTCTGACAAGATTTCACCGTTTTGCTATCAATCTGGTTGCGTGGAAACTACTATCCTGCA
TCCGGAGCTACGTACCACCACAAGCTCTTTCATCACTCTAGGCTCTCGCATCTTCGAACC
CGAGATTCCCCCACCTCTCTCTGACT

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR4H787TF 272 0 0
GGATTC
TTCGTCTTCGATATCTCTCATCGTCTCGTCTAAGAAAAGAGAGCGTTTTGTTTACAAGAG
GTAACAGTTTCGAGCCTTGCAAGTGGAAGAAACAATCGAAAGTTTGAAGCTTTCTTTTAT
GTCTGACAAGATTTCACCGTTTTGCTATCAATCTGGTTGCGTGGAAACTACTATCCTGCA
TCCGGAGCTACGTACCACCACAAGCTCTTTCATCACTCTAGGCTCTCGCATCTTCGAACC
CGAGATTCCCCCACCTCTCTCTGACT

QA 7 272 7 272
DS 

RD RR4G158TF 721 0 0
GGATTCTTCGTCTTCGATATCTCTCATCGTCTCGTCTAAGAAAAGAGAGCGTTTTGTTTA
CAAGAGGTAACAGTTTCGAGCCTTGCAAGTGGAAGAAACAGTCGAAAGTTTGAAGCTTTC
TTTTATGTCTGACAAGATTTCACCGTTTTGCTATCAATCTGGTTGCGTGGAAACTACTAT
CCTGCATCCGGAGCTACGTACCACCACAAGCTCTTTCATCACTCTAGGCTCTCGCATCTT
CGAACCCGAGATTCCCCCACCTCTCTCTGACTAAAAAAAAAAAAAAACATGGCGCTGCAG
AACATCGGTGCATCCAACCGCAACGATGCCTTTTACAGGTACAAGATGCCCAAGATGGTT
ACCAAGATTGAAGGCAAAGGTAACGGCATCAAGACCAACATCGTCAACAACGTAAAGATT
GCAAGGGCCCTGGGGAGGCCTGCTTCCTACACGACCAAGTACTTTGGTTGCGAGCTTGGA
GCGCAGTCCAAGTTCGATGAGAAGACTGGGACTTCGCTTGTGAATGGAGCTCACAGCACG
TCTAAGCTCGCTTCTCTTCTCGAGGCTTTTATTAAGAGGTATGTCCAGTGCTATGGATGT
GGGAACCCTGAGACTGAGGTTATTGTTACGAAGACGCAGATGGTGAATCTCAAGTGTGCC
GCTTGTGGGTTTATCTCTGAGTTGACATGAGGGATAGCTGACGACGTTCGTTCTGAAGAC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL3786Contig1 703 3 2 U
GGTTCAAATTTAGCGAAGCAATTACTAAAGCGCAATGTAATGATACATAAAGAGTTAAAA
AAGTAGGAAAGAGCTCATCGACTTGTGTGTTTCTCATTGTATCTTCTGCCGGAAACACAC
AAGAAAAAGAGAAGAAAAAAGGAAGCATATCAAACAAAAGATTACAGATAGGGTGAGGAG
AGAAAGGACATTCAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGACTTAGGGCAGAGATTCCAA
CGACCCTTGGCACGTCGGCGCTTGATGGTGGCCCTACCACTGGTGGTTCTCATCCTCAAA
CGGAAACCATGAGTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTCCTCTTAGTTTGACACAGA
GCAGCTTTTCCAGCTCTCACCACAAGCCCTCTGCGTTTCTGGCTACTCAGACCACTGGTT
CCACTGCTGAGATCAAACGCAATGGACAAACCAGAAAATGTGGAAGAGAGGGAAAGAGGT
GAAGAGAGAAAGGAGCAATGGAGCAGCTGAGAAGAAGCTGAGGCAGATGTTGAAGAGCTG
AGAGAAAAAGCTCCCCGTCTCGAACCCGAGCGTAGAGAAAGCGAAGCGGAAGGGACGCCA
ATCTTCCCGGTGGAGGAAGAAGGAAGACACAAACGCGACGAAGCCGAAGAAACAACAACG
GAGCCTGTGGATAAGGAGGCCATTGAAATTCTTATTTTCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D170JQ U 1
AF RR4FZ01JQ U 13
AF RR4D170TF C 1
BS 1 510 RR4D170JQ
BS 511 703 RR4D170TF

RD RR4D170JQ 518 0 0
GGTTCAAATTTAGCGAAGCAATTACTAAAGCGCAATGTAATGATACATAAAGAGTTAAAA
AAGTAGGAAAGAGCTCATCGACTTGTGTGTTTCTCATTGTATCTTCTGCCGGAAACACAC
AAGAAAAAGAGAAGAAAAAAGGAAGCATATCAAACAAAAGATTACAGATAGGGTGAGGAG
AGAAAGGACATTCAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGACTTAGGGCAGAGATTCCAA
CGACCCTTGGCACGTCGGCGCTTGATGGTGGCCCTACCACTGGTGGTTCTCATCCTCAAA
CGGAAACCATGAGTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTCCTCTTAGTTTGACACAGA
GCAGCTTTTCCAGCTCTCACCACAAGCCCTCTGCGTTTCTGGCTACTCAGACCACTGGTT
CCACTGCTGAGATCAAACGCAATGGACAAACCAGAAAATGTGGAAGAGAGGGAAAGAGGT
GAAGAGAGAAAGGAGCAATGGAGCAGCTGA
GAAGAAGC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4FZ01JQ 504 0 0
GCGAAGCAATTACTAAAGCGCAATGCAATGATACATAAAGAGTTAAAAAAGTAGGAAAGA
GCTCATCGACTTGTGTGTTTCTCATTGTATCTTCTGCCGGAAACACACAAGAAAAAGAGA
AGAAAAAAGGAAGCATATCAAACAAAAGATTACAGATAGGGGGAGGAGAGAAAGGACATT
CAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGACTTAGGGCAGAAATTCCAACGACCCTTGGCA
CGTCGGCGCTTGATGGTGGCTCTACCACTGGTGGTTCTCATCCTCAAACGGAAACCATGA
GTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTCCTCTTAGTTTGACACAGAGCAGCTTTTCCA
GCTCTCACCACAAGCCCTCTGCGTTTCTGGCTACTCAGACCACTGGTTCCACTGCTGAGA
TCAAACGCAATGGACAAACCAGAAAATGTGGAAGAGAGGGAAAGAGGTGAAGAGAGAAAG
GAGCAATGGAGCAGCTGA
AAAAAA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4D170TF 703 0 0
GGTTCAAATTTAGCGAAGCAATTACTAAAGCGCAATGTAATGATACATAAAGAGTTAAAA
AAGTAGGAAAGAGCTCATCGACTTGTGTGTTTCTCATTGTATCTTCTGCCGGAAACACAC
AAGAAAAAGAGAAGAAAAAAGGAAGCATATCAAACAAAAGATTACAGATAGGGTGAGGAG
AGAAAGGACATTCAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGACTTAGGGCAGAGATTCCAA
CGACCCTTGGCACGTCGGCGCTTGATGGTGGCCCTACCACTGGTGGTTCTCATCCTCAAA
CGGAAACCATGAGTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTCCTCTTAGTTTGACACAGA
GCAGCTTTTCCAGCTCTCACCACAAGCCCTCTGCGTTTCTGGCTACTCAGACCACTGGTT
CCACTGCTGAGATCAAACGCAATGGACAAACCAGAAAATGTGGAAGAGAGGGAAAGAGGT
GAAGAGAGAAAGGAGCAATGGAGCAGCTGAGAAGAAGCTGAGGCAGATGTTGAAGAGCTG
AGAGAAAAAGCTCCCCGTCTCGAACCCGAGCGTAGAGAAAGCGAAGCGGAAGGGACGCCA
ATCTTCCCGGTGGAGGAAGAAGGAAGACACAAACGCGACGAAGCCGAAGAAACAACAACG
GAGCCTGTGGATAAGGAGGCCATTGAAATTCTTATTTTCTTCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 3

CO CL3787Contig1 1120 3 12 U
GGATATTCTACTGATGTTGACGCTGTGGTCTATCTAATGCTGGTGAACGATATGATTCAT
GGGCTATACCCTGAGGCTATTGTTGTCGGCGAAGATGTTAGCGGGATGCCAGCTTTCTGC
ATTCCTGTCCAAGACGGTGGTGTGGGTTTTGACTACCGTCTGCACATGGCAGTGGCTGAT
AAATGGATTGAGCTTCTCAAGAAGAGAGACGAGGACTGGCAGGTTGGTGATATAGTTTTC
ACGCTTACCAACAGAAGGTGGGGCGAAAAATGTGTCGTATATGCGGAAAGTCATGATCAA
GCTCTTGTTGGAGACAAAACGATTGCGTTCTGGCTGATGGACAAGGACATGTATGATTTC
ATGGCGGTGGACAAACAGGCCACTCCACGTGTAGACCGCGGGATAGCCTTACACAAAATG
ATACGCCTCATCACGATGGAACTAGGTGGAGAAGGATACCTCAATTTCATGGGGAAACGA
ATTTGGACACCCTGAATGGATCGACTTCCCAAGGACTGACCAGCACCTTCCTGACGGCAG
AGTCATCCCCGGGGAACAACGGTAGTTATGATAAATGCAGGCGTAGGTTCGATCTCGGAG
ACGCAGAGTATCTTAGGTACCACGGACTACAAGAGTTTGATCAAGCGATGCAACATCTCG
AGGAGAAGTATGGTTTCATGACTTCAGAGCATCAGTACATATCCCGCAAGGATGAAGGAG
ACAGAGTCATTGTATTTGAGAGAGGTAACTTGGTGTTTGTCTTCAACTTCCACTGGACCA
ACAGCTACTCTGACTACCGTATCGGTTGCTCTGTTCCGGGGAAGTACAAGATCGTTTTGG
ACTCGGATGATTCTCTATTCGGTGGATTCAGACGGCTAGATGACTCCGCTGAGTTCTTCG
CCTCCGATGGAAGGTACGACGATAGGCCTTGCTCCCTCATGGTGTATGCGCCGTGCAGAA
CTGCTGTAGTTTATGCTGCAGTAGATGGTAATGAAGATTCTTCTCTGGTGCCCATAGGCC
TTGTTCCCGAGGATGTTTAGGATCAATAGAAGAACGTCTTGAGTTGCCTACTGTAAGCTT
CTTTGTACTACGAAGATTTACTTCTTATCTCCTCCTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES87TF U 280
AF RR4AD58TF U 1
AF RR4ES87JQ C 549
BS 1 331 RR4AD58TF
BS 332 332 RR4ES87TF
BS 333 425 RR4AD58TF
BS 426 426 RR4ES87TF
BS 427 439 RR4AD58TF
BS 440 440 RR4ES87TF
BS 441 507 RR4AD58TF
BS 508 508 RR4ES87TF
BS 509 642 RR4AD58TF
BS 643 643 RR4ES87JQ
BS 644 701 RR4AD58TF
BS 702 1120 RR4ES87JQ

RD RR4ES87TF 277 0 0
G
ATGCGGAAAGTCATGATCAAGCTCTTGTTGGAGACAAAACGATTGCGTTCTGGCTGATGG
ACAAGGACATGTATGATTTCATGGCGGTGGACAAACAGGCCACTCCACGTGTAGACCGCG
GGATAGCCTTACACAAAATGATACGCCTCATCACGATGGAACTAGGTGGAGAAGGATACC
TCAATTTCATGGG*AAACGAATTTGGACACCCTGAATGGATCGACTTCCCAAGGACTGAC
CAGCACCTTCCTGACGGCAGAGTCATCCCCGGG
AAC

QA 2 274 2 274
DS 

RD RR4AD58TF 701 0 0
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GGGCTATACCCTGAGGCTATTGTTGTCGGCGAAGATGTTAGCGGGATGCCAGCTTTCTGC
ATTCCTGTCCAAGACGGTGGTGTGGGTTTTGACTACCGTCTGCACATGGCAGTGGCTGAT
AAATGGATTGAGCTTCTCAAGAAGAGAGACGAGGACTGGCAGGTTGGTGATATAGTTTTC
ACGCTTACCAACAGAAGGTGGGGCGAAAAATGTGTCGTATATGCGGAAAGTCATGATCAA
GCTCTTGTTGGAGACAAAACGATTGCGTTCTTGCTGATGGACAAGGACATGTATGATTTC
ATGGCGGTGGACAAACAGGCCACTCCACGTGTAGACCGCGGGATAGCCTTACACAAAATG
ATACGTCTCATCACGATGGGACTAGGTGGAGAAGGATACCTCAATTTCATGGGGAAACGA
ATTTGGACACCCTGAATGGATCGACTTTCCAAGGACTGACCAGCACCTTCCTGACGGCAG
AGTCATCCCCGGGGAACAACGGTAGTTATGATAAATGCAGGCGTAGGTTCGATCTCGGAG
ACGCAGAGTATCTTAGGTACCACGGACTACAAGAGTTTGATCGAGCGATGCAACATCTCG
AGGAGAAGTATGGTTTCATGACTTCAGAGCATCAGTACATA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4ES87JQ 572 0 0
CCC
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CTTAGGTACCACGGACTACAAGAGTTTGATCAAGCGATGCAACATCTCGAGGAGAAGTAT
GGTTTCATGACTTCAGAGCATCAGTACATATCCCGCAAGGATGAAGGAGACAGAGTCATT
GTATTTGAGAGAGGTAACTTGGTGTTTGTCTTCAACTTCCACTGGACCAACAGCTACTCT
GACTACCGTATCGGTTGCTCTGTTCCGGGGAAGTACAAGATCGTTTTGGACTCGGATGAT
TCTCTATTCGGTGGATTCAGACGGCTAGATGACTCCGCTGAGTTCTTCGCCTCCGATGGA
AGGTACGACGATAGGCCTTGCTCCCTCATGGTGTATGCGCCGTGCAGAACTGCTGTAGTT
TATGCTGCAGTAGATGGTAATGAAGATTCTTCTCTGGTGCCCATAGGCCTTGTTCCCGAG
GATGTTTAGGATCAATAGAAGAACGTCTTGAGTTGCCTACTGTAAGCTTCTTTGTACTAC
GAAGATTTACTTCTTATCTCCTCCTTAGT

QA 4 572 4 572
DS 



AS 1 3

CO CL3788Contig1 874 3 2 U
ATATAAGACAAACCAATTGTATAGGTCATATCGACGCTGAAACATTCACACCGAAGTCTG
TCTATATCTAAATATGAAATCAAAAAGTGCATTACTCTCTTGCAACCCTTTGAAATGATA
TCACTGCCTTTCTGGAGCATTTGAACAATCTTTCAAGAAACTAAAACCGTACAGGTGAGG
TAAAAGAGCCGTTCACAACTGCTCCTTTGACTCAGCGGAGGCAGCAGCAGAGCATCAATC
ATCTGCCATGAGTTCTTCAAGTGAGAACCCATCTGCATCGACCACCTCTCCGTCCTTACC
ATCCCAAGCTTCTGTCTTCACTATCTCCAGTGTTCCGTCTATGGGCAGATTCCCTTTCCC
TCCTGCCTTAGCTTCCTTCACGAATTCTATGAGGTGTTTAACCTCAAAACCGCTTTTAAG
TGGAGCATAAGCTCCTTTCTTTGCATTCAAGGCTACCATTGCTGGGTAACCATATCCTCC
GACACCAACACGCTTCTCCAAATCAGGTTGCTTCCCAGCAGCCACCCACACAAAGCTGTA
AGGGTCCTTCTTAAACTTCTCCGCAACTGATAATAGCATCTCCAGATACTTGTTCCTTCC
TTCAGCTTTTGAGTCTAGAATGTCAGGTACGAAAGAAACAAAGCAAATAGCAGCAGGACC
ACACTTCTCTTCCATGACATCCGGCCCAGTTAGTTCAGTTACTTCAACAGGTCCAGCATT
GGATTCAAGCTGTTCCAGGGCAAAAGATTCGATGGCCGATGCAGATCTAGCACCCTCATA
AGCAATGGGCTGCTTTTGTCAGCACAAAGACCAAGATAGTGGGGAATCCTTTCACCTTGA
CCTGCTCTGTATCGCCTTGTCGCATCACAGTCGA


BQ
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DL18JQ U 1
AF RR4DL18TF C 1
AF RR4CG33JQ U 47
BS 1 520 RR4DL18JQ
BS 521 874 RR4CG33JQ

RD RR4DL18JQ 521 0 0
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TCTATATCTAAATATGAAATCAAAAAGTGCATTACTCTCTTGCAACCCTTTGAAATGATA
TCACTGCCTTTCTGGAGCATTTGAACAATCTTTCAAGAAACTAAAACCGTACAGGTGAGG
TAAAAGAGCCGTTCACAACTGCTCCTTTGACTCAGCGGAGGCAGCAGCAGAGCATCAATC
ATCTGCCATGAGTTCTTCAAGTGAGAACCCATCTGCATCGACCACCTCTCCGTCCTTACC
ATCCCAAGCTTCTGTCTTCACTATCTCCAGTGTTCCGTCTATGGGCAGATTCCCTTTCCC
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TGGAGCATAAGCTCCTTTCTTTGCATTCAAGGCTACCATTGCTGGGTAACCATATCCTCC
GACACCAACACGCTTCTCCAAATCAGGTTGCTTCCCAGCA
C

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4DL18TF 521 0 0
ATATAAGACAAACCAATTGTATAGGTCATATCGACGCTGAAACATTCACACCGAAGTCTG
TCTATATCTAAATATGAAATCAAAAAGTGCATTACTCTCTTGCAACCCTTTGAAATGATA
TCACTGCCTTTCTGGAGCATTTGAACAATCTTTCAAGAAACTAAAACCGTACAGGTGAGG
TAAAAGAGCCGTTCACAACTGCTCCTTTGACTCAGCGGAGGCAGCAGCAGAGCATCAATC
ATCTGCCATGAGTTCTTCAAGTGAGAACCCATCTGCATCGACCACCTCTCCGTCCTTACC
ATCCCAAGCTTCTGTCTTCACTATCTCCAGTGTTCCGTCTATGGGCAGATTCCCTTTCCC
TCCTGCCTTAGCTTCCTTCACGAATTCTATGAGGTGTTTAACCTCAAAACCGCTTTTAAG
TGGAGCATAAGCTCCTTTCTTTGCATTCAAGGCTACCATTGCTGGGTAACCATATCCTCC
GACACCAACACGCTTCTCCAAATCAGGTTGCTTCCCAGCA
C

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4CG33JQ 828 0 0
CG
CACCGAAGTCTGTCTATATCTAAATATGAAATCAAAAAGTGCATTACTCTCTTGCAACCC
TTTGAAATGATATCACTGCCTTTCTGGAGCATTTGAACAATCTTTCAAGAAACTAAAACC
GTACAGGTGAGGTAAAAGAGCTGTTCACAACTGCTCCTTTGACTCAGCGGAGGCAGCAGC
AGAGCATCAATCATCTGCCATGAGTTCTTCAAGTGAGAACTCATCTGCATCGACCACCTC
TCCGTCCTTACCATCCCAAGCTTCTGTCTTCACTATCTCCAGTGTTCCGTCTATGGGCAG
ATTCCCTTTCCCTCCTGCCTTAGCTTCCTTCACGAATTCTATGAGGTGTTTAACCTCAAA
ACCGCGTTTAAGTGGAGCGTAAGCTCCTTTCTTTGCATTCAAGGCTACCATTGCTGGGTA
ACCATATCCTCCAACACCAACACGCTTCTCCAAATCAGGTTGCTTCCCAGCAGCCACCCA
CACAAAGCTGTAAGGGTCCTTCTTAAACTTCTCCGCAACTGATAATAGCATCTCCAGATA
CTTGTTCCTTCCTTCAGCTTTTGAGTCTAGAATGTCAGGTACGAAAGAAACAAAGCAAAT
AGCAGCAGGACCACACTTCTCTTCCATGACATCCGGCCCAGTTAGTTCAGTTACTTCAAC
AGGTCCAGCATTGGATTCAAGCTGTTCCAGGGCAAAAGATTCGATGGCCGATGCAGATCT
AGCACCCTCATAAGCAATGGGCTGCTTTTGTCAGCACAAAGACCAAGATAGTGGGGAATC
CTTTCACCTTGACCTGCTCTGTATCGCCTTGTCGCATCACAGTCGA

QA 3 828 3 828
DS 



AS 1 3

CO CL3789Contig1 874 3 6 U
GTCCTGGGAATCAGTATGTTACAGCTGCTAAGATGATTCTTCAAAACAGCGAGGCAATGG
TTTCGATTGATATGCCTGCTGGCCCTTCAGAAGTTCTAGTCATCGCTGATGAACATGCTA
ATCCAGTTTACATTGCAGCAGACTTGCTTTCTCAGGCTGAGCATGGTCCAGATAGTCAAG
TTGTTCTTGTCGTTGTAGGCGACGGTGTAGACCTCAAAGCCATCGAAGACGAAATCTCCA
AACAGTGCAAAAGCCTTCCTAGAGGAGAGTTTGCTTCAAAAGCACTTAGTCACAGTTTCA
CCGTATTTGCTCGAGATATGATTGAGGCAATAACTTTCTCAAGCCTGTATGCACCCGAAC
ACTTGATCATCAACGTCAAAGACGCTGAGAAATGGGAAGGACTGATCGAAAACGCAGGTT
CCGTTTTCGTAGGGCCGTGGACGCCAGAGAGTGTTGGCGATTACGCTAGCGGCACAAACC
ACGTTCTTCCAACGTATGGTTACGCGAGAATGTACAGCGGCGTCTCTCTCGACTCTTTCT
TGAAGTTCATGACTGTGCAGTCCTTGACGGAGGAAGGTCTGAGAAACCTTGGTCCTTATG
TGGCGACTATGGCTGAGATCGAAGGTCTAGATGCACACAAGAGAGCCGTTACTCTCAGAC
TGAAGGATATTGAAGCTAAACAGCCTTCTCAGACCTCCAAGTGAATGAACGCCAAAGTTT
CAGATTTCAAAGGAGGCAAACTTGGTTTCTTTAGATTGTTTGATGATATAAATAAAGAGA
TGTCACAACACTCTTTTGTCACAACCTGGATTGGTTTCTTTACTAATGACACAGACACTT
AAGTTTATACAGTAAGTAAGCTTCTCTTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA61TF U 1
AF RR4B809JQ C 257
AF RR4B809TF U 257
BS 1 342 RR4AA61TF
BS 343 343 RR4B809TF
BS 344 707 RR4AA61TF
BS 708 708 RR4B809TF
BS 709 735 RR4AA61TF
BS 736 874 RR4B809TF

RD RR4AA61TF 735 0 0
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TGAAGGATATTGAAGCTAAACAGCCTTCTCAGACCTCCAAGTGAATGTACGCCAAAGTTT
CAGATTTCAAAGGAG

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DS 

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G
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CAGTCCTTGACGGAGGAAGGTTTGAGAAACCTTGGTCCTTATGTGGCGACTATGGCTGAG
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QA 2 571 2 571
DS 

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G
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ATGATTGAGGCAATAACTTTCTCAAGCCTGTATGCACCCGAACACTTGATCATCAACGTC
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TGGACGCCAGAGAGTGTTGGCGATTACGCTAGCGGCACAAACCACGTTCTTCCAACGTAT
GGTTACGCGAGAATGTACAGCGGCGTCTCTCTCGACTCTTTCTTGAAGTTCATGACTGTG
CAGTCCTTGACGGAGGAAGGTCTGAGAAACCTTGGTCCTTATGTGGCGACTATGGCTGAG
ATCGAAGGTCTAGATGCACACAAGAGAGCCGTTACTCTCAGACTGAAGGATATTGAAGCT
AAACAGCCTTCTCAGACCTCCAAGTGAATGAACGCCAAAGTTTCAGATTTCAAAGGAGGC
AAACTTGGTTTCTTTAGATTGTTTGATGATATAAATAAAGAGATGTCACAACACTCTTTT
GTCACAACCTGGATTGGTTTCTTTACTAATGACACAGACACTTAAGTTTATACAGTAAGT
AAGCTTCTCTTTGATCC

QA 2 618 2 618
DS 



AS 1 2

CO CL3790Contig1 943 2 2 U
GGGACCAAATGCTAATAATGGCTACTAGGGAAGAGAGAGATAAGTATAGATCTGTTCTTA
ACGATGTAGGAGATGTTCAATGGAGGTATGGTCACCCTCCAGCTTTTGACCTTGTGAACC
AGCTCTTTGAAGAAGGCCAGACCAAGGTATGGCCAGAAGGATCCTTGGAAGAGACGGTTC
AAAACGCAATCAAGTCATGGGAGATGGAGCTCTCACACAAGATCCGTTTACAAGACTTCA
AGACTATAAACCCTGATAAGTTTAAGCTTTTTGTCAATGGGAGAGAAGGATTATCGGCTG
AAGAAACGCTTAGGCTTGGGAGTTACAATGCTTTGCTCAAGACCTCTCTGCCTGGAGAGT
TTCAGTACTATAAACCAGAAGAAGAGAGCTTCGAGTCATCACATGACGCCTTTAGATCTG
CTTTACCACGTGGGTTTGCTTTTGAGATACTTTCTGTGTATTCAGGGCCGCCTAATATAG
CCTTCAAGTTTAGACACTGGGGATACTTTGAAGGAAATTTCAAAGGCCATGCTCCTACCG
GGGAAATGGTTCAGTTCCTCGGCTTGGGAGTTCTAAAGGTTGATGAACTGCTTAGAGCAG
AGGAGATTGAGATTTATTATGATCCAGGAGAGCTGTTCGGGGGACTGCTCAAGGGACCAT
CTATATCAGAGACCAAAACCACAGACCCTGGAGACAACACTGCAGAGAAACAGAGCTGTC
CCTTCACACATTAAGAAAACTTAAGGAACTATGACTGTTGATTTACTGTATCACTGGGCC
ATACTGGAAAAATAAGGAAAGCAGAAGTGTGTAGACTCTTTATAAAATATATTGTAATAG
TCACTTGGATGCATGGAATAAGTTATATATTATGTTTTCAAGAGTCACAATGATAGTACA
GATAAATTACAGTACGAACTAGAATAAGACGGTTGATTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DV25TF U 1
AF RR4DV25JQ C 402
BS 1 600 RR4DV25TF
BS 601 943 RR4DV25JQ

RD RR4DV25TF 600 0 0
GGGACCAAATGCTAATAATGGCTACTAGGGAAGAGAGAGATAAGTATAGATCTGTTCTTA
ACGATGTAGGAGATGTTCAATGGAGGTATGGTCACCCTCCAGCTTTTGACCTTGTGAACC
AGCTCTTTGAAGAAGGCCAGACCAAGGTATGGCCAGAAGGATCCTTGGAAGAGACGGTTC
AAAACGCAATCAAGTCATGGGAGATGGAGCTCTCACACAAGATCCGTTTACAAGACTTCA
AGACTATAAACCCTGATAAGTTTAAGCTTTTTGTCAATGGGAGAGAAGGATTATCGGCTG
AAGAAACGCTTAGGCTTGGGAGTTACAATGCTTTGCTCAAGACCTCTCTGCCTGGAGAGT
TTCAGTACTATAAACCAGAAGAAGAGAGCTTCGAGTCATCACATGACGCCTTTAGATCTG
CTTTACCACGTGGGTTTGCTTTTGAGATACTTTCTGTGTATTCAGGGCCGCCTAATATAG
CCTTCAAGTTTAGACACTGGGGATACTTTGAAGGAAATTTCAAAGGCCATGCTCCTACCG
GGGAAATGGTTCAGTTCCTCGGCTTGGGAGTTCTAAAGGTTGATGAACTGCTTAGAGCAG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4DV25JQ 542 0 0
CATGACGCCTTTAGATCTGCTTTACCACGTGGGTTTGCTTTTGAGATACTTTCTGTGTAT
TCAGGGCCGCCTAATATAGCCTTCAAGTTTAGACACTGGGGATACTTTGAAGGAAATTTC
AAAGGCCATGCTCCTACCGGGGAAATGGTTCAGTTCCTCGGCTTGGGAGTTCTAAAGGTT
GATGAACTGCTTAGAGCAGAGGAGATTGAGATTTATTATGATCCAGGAGAGCTGTTCGGG
GGACTGCTCAAGGGACCATCTATATCAGAGACCAAAACCACAGACCCTGGAGACAACACT
GCAGAGAAACAGAGCTGTCCCTTCACACATTAAGAAAACTTAAGGAACTATGACTGTTGA
TTTACTGTATCACTGGGCCATACTGGAAAAATAAGGAAAGCAGAAGTGTGTAGACTCTTT
ATAAAATATATTGTAATAGTCACTTGGATGCATGGAATAAGTTATATATTATGTTTTCAA
GAGTCACAATGATAGTACAGATAAATTACAGTACGAACTAGAATAAGACGGTTGATTTAA
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 3

CO CL3791Contig1 651 3 2 U
GACTTGTTCTGTTATTCCTCTCTCTCTCTCTCACAAATTCTCTCATCATCGAGCTCCCAA
ATTTCGCATAGCGAAGAGTAGGATAGAATGGCAACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTG
AACAGTCCGGTTGGCCCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCTATCGCTAACTGGGGTTTT
GTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAAGCCTCCAGAAATGATATCTGGAAACATGTCC
TCAGCCATGTGTATTTACTCTGCACTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTGCAACCACGC
AACTATCTACTGCTTGCCTGCCATGCTTCCAATGAGACTGTTCAGCTCTATCAACTCTCT
CGTTGGGCTCGAGCCCAGGGGTATCTATCCTCCACGAAAGAAGAAGAGAAACCGTCTCAG
TAAAACAAAATGAGGAAGGAAAAGTCTTTAATTCTGATTCTGATCAGCATTTGTTCTTTT
GGAATTATTGAACTCCATCCGTTTGATTTCCCTCGAAACATGTTTATGTAGATTGTTGTT
TTACTTGTTGGATCTTTCATTGACGTTATCTCTTTGGTTTTCATAAGTAAAACTTGTTGG
AGCCAGTAGTCCGCATTTCCTGCTACTGCCAACACAAATTGCTCTTGAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO90JQ C 1
AF RR4AO90TF U 1
AF RR4A879TF U 41
BS 1 567 RR4AO90TF
BS 568 651 RR4A879TF

RD RR4AO90JQ 567 0 0
GACTTGTTCTGTTATTCCTCTCTCTCTCTCTCACAAATTCTCTCATCATCGAGCTCCCAA
ATTTCGCATAGCGAAGAGTAGGATAGAATGGCAACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTG
AACAGTCCGGTTGGCCCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCTATCGCTAACTGGGGTTTT
GTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAAGCCTCCAGAAATGATATCTGGAAACATGTCC
TCAGCCATGTGTATTTACTCTGCACTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTGCAACCACGC
AACTATCTACTGCTTGCCTGCCATGCTTCCAATGAGACTGTTCAGCTCTATCAACTCTCT
CGTTGGGCTCGAGCCCAGGGGTATCTATCCTCCACGAAAGAAGAAGAGAAACCGTCTCAG
TAAAACAAAATGAGGAAGGAAAAGTCTTTAATTCTGATTCTGATCAGCATTTGTTCTTTT
GGAATTATTGAACTCCATCCGTTTGATTTCCCTCGAAACATGTTTATGTAGATTGTTGTT
TTACTTGTTGGATCTTTCATTGACGTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4AO90TF 567 0 0
GACTTGTTCTGTTATTCCTCTCTCTCTCTCTCACAAATTCTCTCATCATCGAGCTCCCAA
ATTTCGCATAGCGAAGAGTAGGATAGAATGGCAACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTG
AACAGTCCGGTTGGCCCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCTATCGCTAACTGGGGTTTT
GTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAAGCCTCCAGAAATGATATCTGGAAACATGTCC
TCAGCCATGTGTATTTACTCTGCACTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTGCAACCACGC
AACTATCTACTGCTTGCCTGCCATGCTTCCAATGAGACTGTTCAGCTCTATCAACTCTCT
CGTTGGGCTCGAGCCCAGGGGTATCTATCCTCCACGAAAGAAGAAGAGAAACCGTCTCAG
TAAAACAAAATGAGGAAGGAAAAGTCTTTAATTCTGATTCTGATCAGCATTTGTTCTTTT
GGAATTATTGAACTCCATCCGTTTGATTTCCCTCGAAACATGTTTATGTAGATTGTTGTT
TTACTTGTTGGATCTTTCATTGACGTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4A879TF 611 0 0
TCTCATCATCGAGCTCCCAAATTTCGCATAGCGAAGAGTAGGATAGAATGGCAACAGCAT
CAAGGTTCCAAGCATTCTTGAACAGTCCGGTTGGCCCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTC
CTATCGCTAACTGGGGTTTTGTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAAGCCTCCAGAAA
TGATATCTGGAAACATGTCCTCAGCCATGTGTATTTACTCTGCACTGTTCATGAGGTTTG
CCTGGATGGTGCAACCACGCAACTATCTACTGCTTGCCTGCCATGCTTCCAATGAGACTG
TTCAGCTCTATCAACTCTCTCGTTGGGCTCGAGCCCAGGGGTATCTATCCTCCACGAAAG
AAGAAGAGAAACCGTCTCAGTAAAACAAAATGAGGAAGGAAAAGTCTTTAATTCTGATTC
TGATCAGCATTTGTTCTTTTGGAATTATTGAACTCCATCCGTTTGATTTCCTTCGAAACA
TGTTTATGTAGATTGTTGTTTTACTTGTTGGATCTTTCATTGACGTTATCTCTTTGGTTT
TCATAAGTAAAACTTGTTGGAGCCAGTAGTCCGCATTTCCTGCTACTGCCAACACAAATT
GCTCTTGAAGC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 3

CO CL3792Contig1 628 3 2 U
CTGGAGTGCTCTTCATCACTCTGCTTAACGCCGAGTGCACTCCCCTATTCATAATCGCTC
CCCTCGTTCGATCAATTCCTTCCCCCAGGTGTTTCCGAATCAAGAAACAATGGTTGGAAT
AACCAAACTGAGGATAAAGTTTGGACCTGGAGGCTCTGTCAAAGCTATCCAAACGTTTAA
CAACTGCACTAACGCCGAGAGCACTGACAAACCAGTCGGTAAAGAAGAAGATGTAGTTAA
ACCCGCGAATCAGTCGAGGAAGCGTGGACCTGACGAGCTAGAGGGGGTTCAAGCTAACAA
GAAGCAGAAGCTGAACCGTGTTTTGTCTAGTCAGTGTCTTGCCCTCTTGAAATCGTTGAG
GGGGCACAAGTTCGGGTGGCTGTTTGGCGAGCCTGTGGATCCCGTTAAGATGAAGATTCC
TGATTACTTCTCTGTGATATCGAAGCCCATGGATCTAGGCACGATCTGTTCCAAGCTTTT
GAAGAATGTGTATAGCAGTGCGGATGAGTTTGCAGCGGATGTCAGGTTGACTTTTGATAA
TGCGTTGAGCTATAATCCTCCGGATAATTTTGTTCACGATGTGGCCAAGGAGCTTCTGGA
GAGTTTTGAGGCTAGATGGGGATCGCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY29TF U 37
AF RR4BX50TF U 1
AF RR4BY17TF U 1
BS 1 521 RR4BX50TF
BS 522 628 RR4BY17TF

RD RR4BY29TF 177 0 0
GCACTCCCCTATTCATAATCGCTCCCCTCGTTCGATCAATTCCTTCCCCCAGGTGTTTCC
GAATCAAGAAACAATGGTTGGAATAACCAAACTGAGGATAAAGTTTGGACCTGGAGGCTC
TGTCAAAGCTATCCGAACGTTTAACAACTGCACTAACCCCAAGAGCACTGACAAACC

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR4BX50TF 521 0 0
CTGGAGTGCTCTTCATCACTCTGCTTAACGCCGAGTGCACTCCCCTATTCATAATCGCTC
CCCTCGTTCGATCAATTCCTTCCCCCAGGTGTTTCCGAATCAAGAAACAATGGTTGGAAT
AACCAAACTGAGGATAAAGTTTGGACCTGGAGGCTCTGTCAAAGCTATCCAAACGTTTAA
CAACTGCACTAACGCCGAGAGCACTGACAAACCAGTCGGTAAAGAAGAAGATGTAGTTAA
ACCCGCGAATCAGTCGAGGAAGCGTGGACCTGACGAGCTAGAGGGGGTTCAAGCTAACAA
GAAGCAGAAGCTGAACCGTGTTTTGTCTAGTCAGTGTCTTGCCCTCTTGAAATCGTTGAG
GGGGCACAAGTTCGGGTGGCTGTTTGGCGAGCCTGTGGATCCCGTTAAGATGAAGATTCC
TGATTACTTCTCTGTGATATCGAAGCCCATGGATCTAGGCACGATCTGTTCCAAGCTTTT
GAAGAATGTGTATAGCAGTGCGGATGAGTTTGCAGCGGATG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4BY17TF 628 0 0
CTGGAGTGCTCTTCATCACTCTGCTTAACGCCGAGTGCACTCCCCTATTCATAATCGCTC
CCCTCGTTCGATCAATTCCTTCCCCCAGGTGTTTCCGAATCAAGAAACAATGGTTGGAAT
AACCAAACTGAGGATAAAGTTTGGACCTGGAGGCTCTGTCAAAGCTATCCAAACGTTTAA
CAACTGCACTAACGCCGAGAGCACTGACAAACCAGTCGGTAAAGAAGAAGATGTAGTTAA
ACCCGCGAATCAGTCGAGGAAGCGTGGACCTGACGAGCTAGAGGGGGTTCAAGCTAACAA
GAAGCAGAAGCTGAACCGTGTTTTGTCTAGTCAGTGTCTTGCCCTCTTGAAATCGTTGAG
GGGGCACAAGTTCGGGTGGCTGTTTGGCGAGCCTGTGGATCCCGTTAAGATGAAGATTCC
TGATTACTTCTCTGTGATATCGAAGCCCATGGATCTAGGCACGATCTGTTCCAAGCTTTT
GAAGAATGTGTATAGCAGTGCGGATGAGTTTGCAGCGGATGTCAGGTTGACTTTTGATAA
TGCGTTGAGCTATAATCCTCCGGATAATTTTGTTCACGATGTGGCCAAGGAGCTTCTGGA
GAGTTTTGAGGCTAGATGGGGATCGCTT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL3793Contig1 426 2 2 U
CAAGGGTTATCCGATGTTACTAATGGAGCTGATGTGAATTTCTCTGATAGGGCACGCAGA
GGAACTCTCAGATGTTTGTCGCCGAAACCGTACTGTTCAAGAACTTGTTCAGGCAGCTTT
GAAGCCTCTTGAGTTGAATCTGGTTGCTCCTGTATCATAAAGATGATGAGATAACACACA
AAGAAAAAAGAAAGTAAAAGAAGAGTGGAGAGAGAGCCGCTAAAGAAGGTCAATTTTTGC
GTAGACTTCTTTTGATGGCTATTTTTTTTTCTAAAAGGTGAAAGAGATTTCATGTTTTAT
CTTTTGCATTGTTTTACTGTTTTAGTTGTTCATAAAGATTCTTTTTATATACATTTATTT
TCTTTCCGGTGTGAACCGTTTGTTCCATTGTTTGAGGAAAACAGAGGCCCTTCAAGGATT
GGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB20TF U 1
AF RR4AB20JQ C 239
BS 1 412 RR4AB20TF
BS 413 426 RR4AB20JQ

RD RR4AB20TF 412 0 0
CAAGGGTTATCCGATGTTACTAATGGAGCTGATGTGAATTTCTCTGATAGGGCACGCAGA
GGAACTCTCAGATGTTTGTCGCCGAAACCGTACTGTTCAAGAACTTGTTCAGGCAGCTTT
GAAGCCTCTTGAGTTGAATCTGGTTGCTCCTGTATCATAAAGATGATGAGATAACACACA
AAGAAAAAAGAAAGTAAAAGAAGAGTGGAGAGAGAGCCGCTAAAGAAGGTCAATTTTTGC
GTAGACTTCTTTTGATGGCTATTTTTTTTTCTAAAAGGTGAAAGAGATTTCATGTTTTAT
CTTTTGCATTGTTTTACTGTTTTAGTTGTTCATAAAGATTCTTTTTATATACATTTATTT
TCTTTCCGGTGTGAACCGTTTGTTCCATTGTTTGAGGAAAACAGAGGCCCTT

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR4AB20JQ 188 0 0
GCGTAGACTTCTTTTGATGGCTATTTTTTTT*CTAAAAGGTGAAAGAGATTTCATGTTTT
ATCTTT*GCATTGTTTTACTGTTTTAGTTGTTCATAAAGATTCTTTTTATATACATTTAT
TTTCTTTCCGGTGTGAACCGTTTGTTCCATTGTTTGAGGAAAACAGAGGCCCTTCAAGGA
TTGGTACG

QA 1 188 1 188
DS 



AS 1 2

CO CL3794Contig1 1008 2 2 U
GGATCTTTCTCCTTTTCCGATCGCTTCCCTTAGCTTCCGTCGAGCCTTAGTAATCATCAC
CTATCGAGAAGATGTTTTCAAACAGTCAATTCGAGCCCAATTCCGCTTTCTCCGGCGGCG
GATTCATGTCCTCTCAACCCACTCAGCCCTACGAATCCTCCTCCTCCTCCACTACTAAGG
GAATAGTTCCAGTGACGGTGAAGCAAATCAACGAATCTTCTCACTCCGGTGGTGAAAAAT
CCGGTATCGTCATCAACGGAATCGAACTCACAAACGTGTCACTCGTTGGGCTAGTGTGTG
ACAAAGACGTCTCTAAAGTCACTGAAGTTAAGTTCACTCTTGATGATGGCACTGGTCGCA
TCGACTGTAAAAGATGGGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGGAGTCAGTTCAAG
ATGGAACCTATGTGCGTCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAAGGGAATAAGCAGCTTC
TTGTTTTCTCTGTCAGACCCATTGCGGATTTCAACGAGGTGACCTTTCACTATATTGAGT
GTATTCACTTCTATTCCAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGCCA
CTCAATCCCATACGCTCAACGCAAACCAGGCAACCACATTGAACCCTGTGACTCCCTCTC
AAAACAGTGATGGAAATTGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTTGACTATCTAAAGC
AACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACACCTGGATGAAATTGCCCAGCAGTTGA
AGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCAGTCACTGGAAGGGGATGGCCTTATAT
ACTCAACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGTCGAGCTTTGATCATCAGTAGGGAAGA
GTCGGTTGAATCTTCTTTTCATCTAGTATCATTCTGCAATTACTTTAGCTTATGTGCTTG
CTTAAACTAAAAATGGATTGATTTTCCTAATGATGTTCTTGGTTTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A827TF U 1
AF RR4A827JQ C 172
BS 1 742 RR4A827TF
BS 743 1008 RR4A827JQ

RD RR4A827TF 742 0 0
GGATCTTTCTCCTTTTCCGATCGCTTCCCTTAGCTTCCGTCGAGCCTTAGTAATCATCAC
CTATCGAGAAGATGTTTTCAAACAGTCAATTCGAGCCCAATTCCGCTTTCTCCGGCGGCG
GATTCATGTCCTCTCAACCCACTCAGCCCTACGAATCCTCCTCCTCCTCCACTACTAAGG
GAATAGTTCCAGTGACGGTGAAGCAAATCAACGAATCTTCTCACTCCGGTGGTGAAAAAT
CCGGTATCGTCATCAACGGAATCGAACTCACAAACGTGTCACTCGTTGGGCTAGTGTGTG
ACAAAGACGTCTCTAAAGTCACTGAAGTTAAGTTCACTCTTGATGATGGCACTGGTCGCA
TCGACTGTAAAAGATGGGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGGAGTCAGTTCAAG
ATGGAACCTATGTGCGTCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAAGGGAATAAGCAGCTTC
TTGTTTTCTCTGTCAGACCCATTGCGGATTTCAACGAGGTGACCTTTCACTATATTGAGT
GTATTCACTTCTATTCCAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGCCA
CTCAATCCCATACGCTCAACGCAAACCAGGCAACCACATTGAACCCTGTGACTCCCTCTC
AAAACAGTGATGGAAATTGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTTGACTATCTAAAGC
AACCTGCTTGCACTGCAAGACA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4A827JQ 837 0 0
CTACTAAGGGAATAGTTCCAGTGACGGTGAAGCAAATCAACGAATCTTCTCACTCCGGTG
GTGAAAAATCCGGTATCGTCATCAACGGAATCGAACTCACAAACGTGTCACTCGTTGGGC
TAGTGTGTGACAAAGACGTCTCTAAAGTCACTGAAGTTAAGTTCACTCTTGATGATGGCA
CTGGTCGCATCGACTGTAAAAGATGGGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGGAGT
CAGTTCAAGATGGAACCTATGTGCGTCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAAGGGAATA
AGCAGCTTCTTGTTTTCTCTGTCAGACCCATTGCGGATTTCAACGAGGTGACCTTTCACT
ATATTGAGTGTATTCACTTCTATTCCAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAGTTG
GTGATGCCACTCAATCCCATACGCTCAACGCAAACCAGGCAACCACATTGAACCCTGTGA
CTCCCTCTCAAAACAGTGATGGAAATTGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTTGACT
ATCTAAAGCAACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACACCTGGATGAAATTGCCC
AGCAGTTGAAGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCAGTCACTGGAAGGGGATG
GCCTTATATACTCAACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGTCGAGCTTTGATCATCAG
TAGGGAAGAGTCGGTTGAATCTTCTTTTCATCTAGTATCATTCTGCAATTACTTTAGCTT
ATGTGCTTGCTTAAACTAAAAATGGATTGATTTTCCTAATGATGTTCTTGGTTTAAC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 3

CO CL3795Contig1 1138 3 4 U
GGAAAAATATCTACAGAAGCTTAGTGACATGAAGCTTGAGAAAAAGAAGCTGGAAAATGA
GGTGGTAAGGATGGAGACGGATCATAAAGATTGCTCAGTGAAAGTCGACAAGCTCGTTGA
GAAGCATACATGGATAGCATCTGAAAAGCAACTTTTTGGAAAAGGAGGGACAGATTATGA
TTTTGAATCTTGTAATCCGTACGTAGCTAAAGAAAAGCTCGAAAAGCTCCAGACAGATCA
ATCAAGCTTGGAAAAAAGAGTGAACAAGAAGGTTATGGCTATGTTTGAGAAAGCAGAAGA
TGAATACAATGCGCTGATATCGAAGAAGAATACAATCGAGAATGACAAATCCAAAATCAC
GAAAGTGATCGAGGAGCTCGATGAGAAGAAGAAAGAAACCCTGAAAGTTACATGGGTTAA
AGTGAACCAGGACTTCGGGTCAATCTTTTCAACTCTACTACCTGGTACCATGGCAAAGCT
AGAACCTCCTGAAGGCGGTACCTTCCTTGATGGTCTTGAGGTGCGTGTTGCCTTCGGCAA
AGTATGGAAGCAGTCTTTATCAGAACTCAGCGGAGGGCAAAGATCTCTTCTTGCGCTATC
GTTAATCTTGGCATTGCTTCTCTTCAAACCTGCTCCTCTCTATATTTTAGACGAGGTTGA
TGCAGCTCTTGATCTCAGTCACACACAGAACATAGGAAGAATGATAAAAGCTCATTTCCC
TCACTCGCAGTTCATCGTGGTTTCGCTGAAAGAAGGAATGTTCAACAATGCAAATGTTCT
TTTCCGGACAAAGTTCGTTGATGGAGTTTCAACAGTCCAGAGGACAGTAACAAAGCAGAC
CAAGTGATCTCTGCTTATGCATCAATCGAATCATTAGATAAATAAGTATCCATCACTGCT
CGGAAATGTTTTCCTTGGTGTATCATTGTCCATAATTTATCTTTATGTTTTCTTCTTGCT
CTTTGCTCTGCTGTGAAGAGATACTCGGTTTAGTTGTGTGTGTCTTAATTGGATCCAAAG
GCGGTTCGGTTTTTTATCGGTTTTGTTTGTTTTGTAACAGATGTTTCTTTGTAGCTGAAC
GGTATTTGATGTTATACCTAACGAGAGAAGAAACAGTATAATCATGGTTTTACTATGT


BQ
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AF RR4CJ18TF U 153
AF RR4GK37TF U 1
AF RR4GK37JQ C 494
BS 1 168 RR4GK37TF
BS 169 169 RR4CJ18TF
BS 170 697 RR4GK37TF
BS 698 1138 RR4GK37JQ

RD RR4CJ18TF 264 0 0
TTTTTGGAAAAGGAGGGACAGATTATGATTTTGAATCTTGTAATCCGTATGTAGCTAGAG
AAAAGCTCGAAAAGCTCCAGTCAGATCAATCAAGCTTGGAAAAAAGAGTGAACAAGAAGG
TTATGGCTATGTTTGAGAAAGCAGAAGATGAATACAATGCGCTGATATCGAAGAAGAATA
CAATCGAGAATGACAAATCCAAAATCACGAAAGTGATCGAGGAGCTCGATGAGAAGAAGA
AAGAAACCCTGAAAGTTACATGGG

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR4GK37TF 699 0 0
GGAAAAATATCTACAGAAGCTTAGTGACATGAAGCTTGAGAAAAAGAAGCTGGAAAATGA
GGTGGTAAGGATGGAGACGGATCATAAAGATTGCTCAGTGAAAGTCGACAAGCTCGTTGA
GAAGCATACATGGATAGCATCTGAAAAGCAACTTTTTGGAAAAGGAGGTACAGATTATGA
TTTTGAATCTTGTAATCCGTACGTAGCTAAAGAAAAGCTCGAAAAGCTCCAGACAGATCA
ATCAAGCTTGGAAAAAAGAGTGAACAAGAAGGTTATGGCTATGTTTGAGAAAGCAGAAGA
TGAATACAATGCGCTGATATCGAAGAAGAATACAATCGAGAATGACAAATCCAAAATCAC
GAAAGTGATCGAGGAGCTCGATGAGAAGAAGAAAGAAACCCTGAAAGTTACATGGGTTAA
AGTGAACCAGGACTTCGGGTCAATCTTTTCAACTCTACTACCTGGTACCATGGCAAAGCT
AGAACCTCCTGAAGGCGGTACCTTCCTTGATGGTCTTGAGGTGCGTGTTGCCTTCGGCAA
AGTATGGAAGCAGTCTTTATCAGAACTCAGCGGAGGGCAAAGATCTCTTCTTGCGCTATC
GTTAATCTTGGCATTGCTTCTCTTCAAACCTGCTCCTCTCTATATTTTAGACGAGGTTGA
TGCAGCTCTTGATCTCAGTCACACACAGAACATAGGA
GA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4GK37JQ 645 0 0
GGCGGTACCTTCCTTGATGGTCTTGAGGTGCGTGTTGCCTTCGGCAAAGTATGGAAGCAG
TCTTTATCAGAACTCAGCGGAGGGCAAAGATCTCTTCTTGCGCTATCGTTAATCTTGGCA
TTGCTTCTCTTCAAACCTGCTCCTCTCTATATTTTAGACGAGGTTGATGCAGCTCTTGAT
CTCAGTCACACACAGAACATAGGAAGAATGATAAAAGCTCATTTCCCTCACTCGCAGTTC
ATCGTGGTTTCGCTGAAAGAAGGAATGTTCAACAATGCAAATGTTCTTTTCCGGACAAAG
TTCGTTGATGGAGTTTCAACAGTCCAGAGGACAGTAACAAAGCAGACCAAGTGATCTCTG
CTTATGCATCAATCGAATCATTAGATAAATAAGTATCCATCACTGCTCGGAAATGTTTTC
CTTGGTGTATCATTGTCCATAATTTATCTTTATGTTTTCTTCTTGCTCTTTGCTCTGCTG
TGAAGAGATACTCGGTTTAGTTGTGTGTGTCTTAATTGGATCCAAAGGCGGTTCGGTTTT
TTATCGGTTTTGTTTGTTTTGTAACAGATGTTTCTTTGTAGCTGAACGGTATTTGATGTT
ATACCTAACGAGAGAAGAAACAGTATAATCATGGTTTTACTATGT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL3796Contig1 1255 2 4 U
TCCTGCTTTCTGTGGATTAAACTTTGATTCCACGTACTCTTTGGATAATATTTTACATAA
ACAAATAGCTAATAGTTCTGGATCGTATCAATCATAGACTATCGATTGATCGTTTGTTTT
TCTTTACTTTTGCTCCTTTTGGTAGACACATTGGATATTTTGTCGTCGAGTGTTTTATTC
ACATGATACACAATAGAGATAAAACATCATGTAGTGAAAGCAGAATCCCACGAGACCTTC
AAGTTTACATTAAATCTCTGGATTCACATGGAGTTTTTGGGGAGGGAGAAACTAACATGC
GTTGTTGAACTTCTTCTCATTGGCATCACCGTCATGATCAACATCAACTACAAGCTCGAG
TGATCCCTTGTTCTTCTCATCATCCGATTTGCTCATCACTGTTTTTGTAATCAGTGCCTC
CTTGTTCTTGTACTTAAAGTAAAGGATAAGTTGGAAAATCCCCAGTGGAGTCCCCACCAT
ATTAGGTGACGCAAGAAAGAGATCATGGCTGAGTAAACCATAGGCCAGCCAAAGGGAGCT
TGCCAGAAATGAAAAGAATGACAAGTAAAATGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTCTAT
CACTTTTTTCATAACGACGAAAGGAGAACCATACATGGAGATAGAAGCCACGAGGCCGAC
ACTTCCGACAAATGATTTCCGGTGACGGTGATCGTCAAACACTACGGCTGAGATTAAAGC
CGTTACCCCGAACAAAACGATCACCACCGGAACAAATATAAGACCAACCTTAACCTTTTC
TTTGGGCGACGCGTAGCAGAAATATATGAAAATGAAGAGTAATTCGAGAAGGATGCCGAC
TCCATTGATGGTGACGAGAGGAAGATTCTCCCAAAGATGACTCACAATCGGTAAGCCATA
CCAAGTGTAAATCAAACAGTTTAAGAGTGTCATAACGTAAGGAAAACATGAGAATTCCTC
TGTGCTTTTCTTCTTAAACACCCTTGAAAATGTTAATATTGGAGCGGTATAGAGCAGCAT
GGAAGCTCCATTTCCAAGATTGAAGTCAGTAGGTCGCCAAGTAGGAGTTGTAGGTTGATT
AGTGATCTGTTGAGAACCATTGCTGCATCATGCGAGAAGAGTTCCTAGGATTTTGAGCTC
GCCGACTGCATATTCTGTTCCGGATTGAAGAGTCAATCTGTAGAAAAATGCTTTTTTACA
ATTGCTTTTTTCAGATTTTTGAAATGCACACAATTGTCATTCATCCCACGCGGCT


BQ
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AF RR4DN64JQ U 1
AF RR4AF04TF C 480
BS 1 620 RR4DN64JQ
BS 621 621 RR4AF04TF
BS 622 657 RR4DN64JQ
BS 658 1255 RR4AF04TF

RD RR4DN64JQ 657 0 0
TCCTGCTTTCTGTGGATTAAACTTTGATTCCACGTACTCTTTGGATAATATTTTACATAA
ACAAATAGCTAATAGTTCTGGATCGTATCAATCATAGACTATCGATTGATCGTTTGTTTT
TCTTTACTTTTGCTCCTTTTGGTAGACACATTGGATATTTTGTCGTCGAGTGTTTTATTC
ACATGATACACAATAGAGATAAAACATCATGTAGTGAAAGCAGAATCCCACGAGACCTTC
AAGTTTACATTAAATCTCTGGATTCACATGGAGTTTTTGGGGAGGGAGAAACTAACATGC
GTTGTTGAACTTCTTCTCATTGGCATCACCGTCATGATCAACATCAACTACAAGCTCGAG
TGATCCCTTGTTCTTCTCATCATCCGATTTGCTCATCACTGTTTTTGTAATCAGTGCCTC
CTTGTTCTTGTACTTAAAGTAAAGGATAAGTTGGAAAATCCCCAGTGGAGTCCCCACCAT
ATTAGGTGACGCAAGAAAGAGATCATGGCTGAGTAAACCATAGGCCAGCCAAAGGGAGCT
TGCCAGAAATGAAAAGAATGACAAGTAAAATGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTCTAT
CACTTTTTTCATAACGACGAGAGGAGAACCATACATGGAGATAGAAGCCACGAGGCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4AF04TF 776 0 0
TATTAG
GTGACGCAAGAAAGAGATCATGGCTGAGTAAACCATAGGCCAGCCAAAGGGAGCTTGCCA
GAAATGAAAAGAATGACAAGTAAAATGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTCTATCACTT
TTTTCATAACGACGAAAGGAGAACCATACATGGAGATAGAAGCCACGAGGCCGACACTTC
CGACAAATGATTTCCGGTGACGGTGATCGTCAAACACTACGGCTGAGATTAAAGCCGTTA
CCCCGAACAAAACGATCACCACCGGAACAAATATAAGACCAACCTTAACCTTTTCTTTGG
GCGACGCGTAGCAGAAATATATGAAAATGAAGAGTAATTCGAGAAGGATGCCGACTCCAT
TGATGGTGACGAGAGGAAGATTCTCCCAAAGATGACTCACAATCGGTAAGCCATACCAAG
TGTAAATCAAACAGTTTAAGAGTGTCATAACGTAAGGAAAACATGAGAATTCCTCTGTGC
TTTTCTTCTTAAACACCCTTGAAAATGTTAATATTGGAGCGGTATAGAGCAGCATGGAAG
CTCCATTTCCAAGATTGAAGTCAGTAGGTCGCCAAGTAGGAGTTGTAGGTTGATTAGTGA
TCTGTTGAGAACCATTGCTGCATCATGCGAGAAGAGTTCCTAGGATTTTGAGCTCGCCGA
CTGCATATTCTGTTCCGGATTGAAGAGTCAATCTGTAGAAAAATGCTTTTTTACAATTGC
TTTTTTCAGATTTTTGAAATGCACACAATTGTCATTCATCCCACGCGGCT

QA 7 776 7 776
DS 



AS 1 3

CO CL3797Contig1 623 3 14 U
GGCTCGATTAAAGCAAAGCGTAGATCAGATGGCAGCACCTTTCACGTTGAGGAAGATCGG
AGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTCACGGAGGCTCGCCGCCGTGTTTTCGATTACTTCAG
AGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATCATGGACATTTACAATCTACAAGACGTCGTCGC
GCCTTCTCAGCTCCGCTTTGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACCGA
TCCTAAGGTGATTGATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTTACTGACATAGTGGA
TCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATTGGTCAATACGTGGTGGGTGAAGGGCTCGTCCA
GAATACTGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAA
CTACTTTTGAACTGGTGATTTGTTTTCTCTACTGGCTTTTTTCATGCTACCAAGTTCTTG
CATAAGTCTTTTTCAGTATTGTATTTTCGACTTAGGAAGAAGTCTTCTTCCTGAGAATAA
TTTGTATGAATTTCGCCAAACCTCTCTATAAGTTGTAGCTGTGACAGTCTTTGCTGTGCA
AATATTGCTATGATTTCAAGATA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D283TF U 1
AF RR4ES11TF U 1
AF RR4AT62TF U 7
BS 1 72 RR4D283TF
BS 73 73 RR4ES11TF
BS 74 104 RR4D283TF
BS 105 105 RR4ES11TF
BS 106 454 RR4D283TF
BS 455 455 RR4ES11TF
BS 456 465 RR4D283TF
BS 466 466 RR4ES11TF
BS 467 601 RR4D283TF
BS 602 602 RR4ES11TF
BS 603 609 RR4D283TF
BS 610 610 RR4ES11TF
BS 611 616 RR4D283TF
BS 617 623 RR4ES11TF

RD RR4D283TF 616 0 0
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AGTTCCGCCGAATTCAGCTAACCTCACGGAGGCTCGCCGCCGTGCTTTCGATTACTTCAG
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A*TATTGCTGTGATTT

QA 1 616 1 616
DS 

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GGCTCGATT
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ATGATTTCAAGATA

QA 10 623 10 623
DS 

RD RR4AT62TF 614 0 0
GGG
AAAGCAAAGCGTAGATCAGATGGCAGCACCTTTCACGTTGAGGAAGATCGGAGTTCCGCC
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GATTGATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTTACTGACATAGTGGATCACGCAAA
GCAGCGTCACCACATTATTGGTCAATACGTGGTGGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACTGG
AAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTACTTTTG
AACTGGTGATTTGTTTTCTCTACTGGCTTTTTTCATGCTACCAAGTTCTTGCATAAGTCT
TTTTCAGTATTGTATTTTCGACTTAGGAAGAAGTCTTCTTCCTGAGAATAATTTGTATGA
ATTTCGCCAAACCTCTCTATAAGTTGTAGCTGTGACAGTCTTTGCTGTGCAAATATTGCT
ATGATTT
CAAG

QA 4 610 4 610
DS 



AS 1 3

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GAATAAAATGTTGTCATAAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4GD03JQ C 1
AF RR4GD03TF U 1
AF RR4FJ08TF U 277
BS 1 561 RR4GD03TF
BS 562 562 RR4FJ08TF

RD RR4GD03JQ 520 0 0
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TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
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CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
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QA 1 520 1 520
DS 

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TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
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CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
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ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTGGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4FJ08TF 286 0 0
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QA 1 286 1 286
DS 



AS 1 2

CO CL3799Contig1 661 2 3 U
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AATATCATTAGAAACTAAATTTCATCTTTTAGTGAAAAAAGATTTTCAGCTTCCTCCAAA
CCCAGCTGCAAAATGGTGTTTTTGTTTTTTACCTGCCTTTCTTGGCCATTTTAGGATTCT
TGCACATCCTTATACTAAGAGGTGTAATTTCCACAAGTTCATCCTCTTCAATGTATTCAA
TGCAGTCGTCCAGACTATAAGTCAAGGGAGTGTCAAGAACCACTGTTACATCTTTGTTGG
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4GH01JQ U 133
AF RR4GH01TF C 1
BS 1 132 RR4GH01TF
BS 133 606 RR4GH01JQ
BS 607 661 RR4GH01TF

RD RR4GH01JQ 474 0 0
AACTAAATTTCATCTTTTAGTGAAAAAAGATTTTCAGCTTCCTCCAAACCCAGCTGCAAA
ATGGTGTTTTTGTTTTTTACCTGCCTTTCTTGGCCATTTTAGGATTCTTGCACATCCTTA
TACTAAGAGGTGTAATTTCCACAAGTTCATCCTCTTCAATGTATTCAATGCAGTCGTCCA
GACTATAAGTCAAGGGAGTGTCAAGAACCACTGTTACATCTTTGTTGGAGCGAATGTTTG
TTGCTGCCTTCTTCTTGCAGATGTTAAGTCCCAAGTCCCCAGGTCTCTGGTGGATCCCAA
CTATCTGACCTTTGTATACGTCCACACCTGCACCTACAAACATTTGCCCTCTCTCTTGTG
CACTTGCTAGAGCATACGATGTTGATGTTCCATCTTAAAAGGCAACCAGCGAACCAAGAT
CACGGGTGCTAATATCTCCAGCCCAAGGTCCATAACTGTCGAATACCGTGTTGA

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4GH01TF 661 0 0
GGTCCAAATGGGATATAAGGGGTTTTCCAAAAAGCATTAGTTTGAATTACATCCGAGGAC
TCAACCCCCCTCATAAGAATTTAAGACTTATGTATAAGAATCAAACAAGCCCTATATAAA
AATATCATTAGAAACTAGATTTCATCTTTTAGTGAAAAAAGATTTTCAGCTTCCTCCAAA
CCCAGCTGCAAAATGGTGTTTTTGTTTTTTACCTGCCTTTCTTGGCCATTTTAGGATTCT
TGCACATCCTTATACTAAGAGGTGTAATTTCCACAAGTTCATCCTCTTCAATGTATTCAA
TGCAGTCGTCCAGACTATAAGTCAAGGGAGTGTCAAGAACCACTGTTACATCTTTGTTGG
AGCGAATGTTTGTTGCTGCCTTCTTCTTGCAGATGTTAAGTCCCAAGTCCCCAGGTCTCT
GGTGGATCCCAACTATCTGACCTTTGTATACGTCCACACCTGCACCTACAAACATTTGCC
CTCTCTCTTGTGCACTTGCTAGAGCATACGATGTTGATGTTCCATCTTAAAAGGCAACCA
GCGAACCAAGATCACGGGTGCTAATATCTCCAGCCCAAGGTCCATAACTGTCGAATACCG
TGTTGAGGATAGCTGTCCCACGAGAAGCTGTCAAAATTGCATTCCTCAATCCAAGAAGTC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL3800Contig1 1182 2 2 U
GGCTCTCTCTAAAGCTTCAATGGCTTTCTCCTTCTCCTTAACTTCGCCTTCACCAAGCTC
GACTCTTTCCTATTCCAACATCCACCATCAGTTCCCCAACCCGTCTTCTTCATTTCCCGT
CTCGTTATCAGTCTCGTCCCCGAGCAACACCCGCCGCCATCTTCGTCTCTCCATCACCTC
CGCGTTGAATCCTCAGACGAAGAAAGCTTCAACGGGTGGTAGTAACGGGAACGGTGGTAG
TACCAACAAGAAACGGAAGAAAAAGGGTAAAAGTTCGAATCTTAAGGAGAATTGGGAAGT
GAGAGATGCTGTTGTTCTTAAAGAGGAAGAAGATTATAATGATGACGATGATGATGCTTC
TCTTGCAAACTCTCCTCCCACCATACCCAAACCACCTGCTGGGTTCGTCATTGATGAAAC
CGGTAGAGTTCTTATGGCCTCCAAGAAGCGAATCGCCACTGTGGTTGATCCGACAAACAA
TAGCCCTTTGGATTGTGTAATAAGAAGAGTGTTTACAAGTAGTAAAGGAGAGGATTGTAT
GCTTCTTTGCCCTGTTGATACGCCAGTTCAGATTTTGAAGAGCACAAACATAGATGGATG
GTCAGCTGTCAGTGATGAAAAGGTTTAATCTCTTCTTCCTGCTGCTGCTTATGCTCTTGC
AAAGATCCATATGCATCTTGTACACAGCGGATTCTGTTACACTGCAAGGGGAGGCTTTTG
CTACACTGAAGATAATGTCTTCGATTTTCGCACAGATGATGGCCAAGATGTTGAAGGTTT
GCCAACGGAAGGGGTTGAGATTACATGTTTTCATCTGGATGGATCACACTATATGGTCTA
CACGCCTTCAGATCCACTTCTCTTTGTTGCTGCTAAGGATCCGAATGGGCTGCTTCAAAT
TGCTGATGATGAGCTCCTAGACGACCCAGCCGTGATCTGCGCCATAGACGAGGAAACCGA
ATTCAATGCCTTGGTGGAGGAAGGGGCGGCTCTTCTTGAATCATTGCTTGGGGAAGAAAT
TTAAAAGCTTTCATAGGGAGACCGACCTACTTACTTAGCTTTCTTTCTTTCTTTTTTATA
TGTTTCATGTCAATGCTATCTATTCCTTATGATGTTTTCCTGTTTATCATGAAAGAAAAA
AAAATGTTTTTCCTATTGCAATCTTCATCTTTGGGAAAGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BM74TF U 1
AF RR4GV27TF U 558
BS 1 625 RR4BM74TF
BS 626 1182 RR4GV27TF

RD RR4BM74TF 629 0 0
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GACTCTTTCCTATTCCAACATCCACCATCAGTTCCCCAACCCGTCTTCTTCATTTCCCGT
CTCGTTATCAGTCTCGTCCCCGAGCAACACCCGCCGCCATCTTCGTCTCTCCATCACCTC
CGCGTTGAATCCTCAGACGAAGAAAGCTTCAACGGGTGGTAGTAACGGGAACGGTGGTAG
TACCAACAAGAAACGGAAGAAAAAGGGTAAAAGTTCGAATCTTAAGGAGAATTGGGAAGT
GAGAGATGCTGTTGTTCTTAAAGAGGAAGAAGATTATAATGATGACGATGATGATGCTTC
TCTTGCAAACTCTCCTCCCACCATACCCAAACCACCTGCTGGGTTCGTCATTGATGAAAC
CGGTAGAGTTCTTATGGCCTCCAAGAAGCGAATCGCCACTGTGGTTGATCCGACAAACAA
TAGCCCTTTGGATTGTGTAATAAGAAGAGTGTTTACAAGTAGTAAAGGAGAGGATTGTAT
GCTTCTTTGCCCTGTTGATACGCCAGTTCAGATTTTGAAGAGCACAAACATAGATGGATG
GTCAGCTGTCAGTGATGAAAAGGTT
GTAT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4GV27TF 625 0 0
ATACGCCAGTTCAGATTTTGAAGAGCACAAACATAGATGGATGGTCAGCTGTCAGTGATG
AAGAGGTTTAATCTCTTCTTCCTGCTGCTGCTTATGCTCTTGCAAAGATCCATATGCATC
TTGTACACAGCGGATTCTGTTACACTGCAAGGGGAGGCTTTTGCTACACTGAAGATAATG
TCTTCGATTTTCGCACAGATGATGGCCAAGATGTTGAAGGTTTGCCAACGGAAGGGGTTG
AGATTACATGTTTTCATCTGGATGGATCACACTATATGGTCTACACGCCTTCAGATCCAC
TTCTCTTTGTTGCTGCTAAGGATCCGAATGGGCTGCTTCAAATTGCTGATGATGAGCTCC
TAGACGACCCAGCCGTGATCTGCGCCATAGACGAGGAAACCGAATTCAATGCCTTGGTGG
AGGAAGGGGCGGCTCTTCTTGAATCATTGCTTGGGGAAGAAATTTAAAAGCTTTCATAGG
GAGACCGACCTACTTACTTAGCTTTCTTTCTTTCTTTTTTATATGTTTCATGTCAATGCT
ATCTATTCCTTATGATGTTTTCCTGTTTATCATGAAAGAAAAAAAAATGTTTTTCCTATT
GCAATCTTCATCTTTGGGAAAGGAT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 3

CO CL3801Contig1 1026 3 8 U
GGGAAGCGCCTAGGTAGGAAGTTGTGGTTGTTGATGTTGTACATGAACCTCGTCCTGCGC
CACCAGAGGAACCCCTTGGTGAAAAATCCAAGATGAGTTATGCTTCCATTCTACGGGTCG
CAAAGGAAGCAGCTGCTGTGCCTGTAGCTGCTACACAACCATCATATAACAGGAACTCTC
AAGAGAATAACGAGTGGGATCAACCACTACGGACTCCTTCCCCTCAGTTGGCTGCGCCTC
CTCAGCAGTCAAACGCTTTTGCTGACTATGGAGCAGAGGCGGATGGTGGCTTTGGATTTG
AAGACTTTGAGATCAAATCAGTGTACGTTAGGAATCTGCCTTCCAACATATCTGCTTCAG
AGATCGAGGAAGAGTTTAAGAACTTCGGTACAATCAAGCCTGATGGTGTTTTCCTCAGAA
CCCGCAAGGATGTTATTGGCGTTTGCTATGCTTTTGTCGAGTATGAAGACATGACTTCCG
TTGAGAATGCTATTAAGGCTTCTCCTATATATTTGGGTGGAAGACAAGTATACATTGAGG
GACGAAGACCCAATCCCGCTGGTGTTCGCGGAGCAAGGGGAAGAGGGCGTGGGAGAGGCG
GTTACCCAACAGAAGCACCAAGAGGCCGATTTGGTTCCCGTGGTGTGTCTGGGAGAGGAA
ACCAGGAA*GGAGGTGATTACAGGCCAAGAGGCAACGGTAACTACCGTGGTGGTGGCCGC
TAAGGTAAAAAAAGAAAATAAGAAACGCATATGAATCTCTTGGTTAAGTTCTAGAACATC
CGAGAATGAATGATTCAGAGGTTCTCGTTGTTCCTTCATCTACCACCGGAGTAGTTTGTA
ACATTTTGTTGGGTTTGGTTTCGTGGTTCAATTTGAAAAAAAAGATCTTAGTTCATATGT
TTTCTTTTAATTTGTTATAGATTTAGGGCTTGGACTCTCTTACTCCCTTTCCTTTGAGAA
TGGCTTTAGTTATGTGTAACAATTTCAAATTTTTGTTTTCCTTCTATATTGGCTTGATTT
GCAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4F322TF U 1
AF RR4BR43JQ C 373
AF RR4BR43TF U 324
BS 1 457 RR4F322TF
BS 458 458 RR4BR43TF
BS 459 668 RR4F322TF
BS 669 669 RR4BR43TF
BS 670 708 RR4F322TF
BS 709 882 RR4BR43TF
BS 883 883 RR4BR43JQ
BS 884 1026 RR4BR43TF

RD RR4F322TF 708 0 0
GGGAAGCGCCTAGGTAGGAAGTTGTGGTTGTTGATGTTGTACATGAACCTCGTCCTGCGC
CACCAGAGGAACCCCTTGGTGAAAAATCCAAGATGAGTTATGCTTCCATTCTACGGGTCG
CAAAGGAAGCAGCTGCTGTGCCTGTAGCTGCTACACAACCATCATATAACAGGAACTCTC
AAGAGAATAACGAGTGGGATCAACCACTACGGACTCCTTCCCCTCAGTTGGCTGCGCCTC
CTCAGCAGTCAAACGCTTTTGCTGACTATGGAGCAGAGGCGGATGGTGGCTTTGGATTTG
AAGACTTTGAGATCAAATCAGTGTACGTTAGGAATCTGCCTTCCAACATATCTGCTTCAG
AGATCGAGGAAGAGTTTAAGAACTTCGGTACAATCAAGCCTGATGGTGTTTTCCTCAGAA
CCCGCAAGGATGTTATTGGCGTTTGCTATGCTTTTGTTGAGTATGAAGACATGACTTCCG
TTGAGAATGCTATTAAGGCTTCTCCTATATATTTGGGTGGAAGACAAGTATACATTGAGG
GACGAAGACCCAATCCCGCTGGTGTTCGCGGAGCAAGGGGAAGAGGGCGTGGGAGAGGCG
GTTACCCAACAGAAGCACCAAGAGGCCGATTTGGTTCCCGTGGTGTGTCTGGGAGAGGAA
ACCAGGAAAGGAGGTGATTACAGGCCAAGAGGCAACGGTAACTACCGT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BR43JQ 612 0 0
AGTTTAAGAACTTCGGTACAATCAAGCCTGATGGTGTTTTCCTCAGAACCCGCAAGGATG
TTATTGGCGTTTGCTATGCTTTTGTCGAGTATGAAGACATGACTTCCGTTGAGAATGCTA
TTAAGGCTTCTCCTATATATTTGGGTGGAAGACAAGTATACATTGAGGGACGAAGACCCA
ATCCCGCTGGTGTTCGCGGAGCAAGGGGAAGAGGGCGTGGGAGAGGCGGTTACCCAACAG
AAGCACCAAGAGGCCGATTTGGTTCCCGTGGTGTGTCTGGGAGAGGAAACCAGGAA*GGA
GGTGATTACAGGCCAAGAGGCAACGGTAACTACCGTGGTGGTGGCCGCTAAGGTAAAAAA
AGAAAATAAGAAACGCATATGAATCTCTTGGTTAAGTTCTAGAACATCCGAGAATGAATG
ATTCAGAGGTTCTCGTTGTTCCTTCATCTACCACCGGAGTAGTTTGTAACATTTTGTTGG
GTTTGGTTTCGTGGTTCAATTTGAAAAAAAAGATCTTAGTTCATATGTTTTCTTTTAATT
TGTTATAGATTTAGGGCTTGGACTCTCTTACTCCCTTTCCTTTGAGAATGGCTTTAGTTA
TGTGTAACAATT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4BR43TF 703 0 0
G
ACGTTAGGAATCTGCCTTCCAACATATCTGCTTCAGAGATCGAGGAAGAGTTTAAGAACT
TCGGTACAATCAAGCCTGATGGTGTTTTCCTCAGAACCCGCAAGGATGTTATTGGCGTTT
GCTATGCTTTTGTCGAGTATGAAGACATGACTTCCGTTGAGAATGCTATTAAGGCTTCTC
CTATATATTTGGGTGGAAGACAAGTATACATTGAGGGACGAAGACCCAATCCCGCTGGTG
TTCGCGGAGCAAGGGGAAGAGGGCGTGGGAGAGGCGGTTACCCAACAGAAGCACCAAGAG
GCCGATTTGGTTCCCGTGGTGTGTCTGGGAGAGGAAACCAGGAA*GGAGGTGATTACAGG
CCAAGAGGCAACGGTAACTACCGTGGTGGTGGCCGCTAAGGTAAAAAAAGAAAATAAGAA
ACGCATATGAATCTCTTGGTTAAGTTCTAGAACATCCGAGAATGAATGATTCAGAGGTTC
TCGTTGTTCCTTCATCTACCACCGGAGTAGTTTGTAACATTTTGTTGGGTTTGGTTTCGT
GGTTCAATTTGAAAAAAA*GATCTTAGTTCATATGTTTTCTTTTAATTTGTTATAGATTT
AGGGCTTGGACTCTCTTACTCCCTTTCCTTTGAGAATGGCTTTAGTTATGTGTAACAATT
TCAAATTTTTGTTTTCCTTCTATATTGGCTTGATTTGCAAAA

QA 2 703 2 703
DS 



AS 1 3

CO CL3802Contig1 995 3 14 U
GGGACGGCCCCGTTCTGTGCTTGAGCTTCTCGATCTCTCTCTCTCGATCTCAGGATATGA
ATTCTCTGACATCGTGGGTAGGTGTGACTGTCGGTCCCGATGATAATTTAGTGTTGGTCG
TGGAGGCTCCGTACCGGTTTCAACAAGGCGGAACTTGTTGGGTGTTCGGAATAGGCCGAT
ACCACAATGCCCTATGCAGACTCCATGGTTTGTTCGGAAATGTTAGCGTGTGCTTTGCTT
CTTTTTATGATGGTTTATCTTCTACTGTTCAACTTTTGGAAGGTGGTGGTATCCCCAACC
TTGAAGCAGCCAGAGATTGTTTGGTAAATCATGGACTTCCATTGGAGAGTGCTATTCCCT
GGGAGGGTCCACTGTATGCCTTACGCGATATGATTGTCCATCACGCCCAACGATACCCAA
CTTATCAAGAGTTTGAGCAGCATCTCTTCACTCTCATGCTTGGTTCTCCTGTTGCGGCTG
CAGTACTTTCATTTCCTTCTTTGTTCCAAGGTCCAGATCGTAATGGTCTTCATTACCCCA
CGCCTGCTGAGAGGCTCTTGGGTTTGGATGCATATGTATCTCACGTGATGCTCGCTACCG
GGAGAGGTTCCATGCGCGAGAGAGGTCCCACACGAGAGCTTTTAGAGTTTCTTGAGTTCC
AAGACAGCATGCCAGGTAATGGTGGTGTGATCAAACTCCGACTGGGTCGCAATGAGAGGA
CCGTTCTTAGGTTTGTGGAGCTGATCGGTCCCTATATCAGACCTGAAGATGAAGAAGATG
AAGAAGACTACTCTGATTCTGACATGGAGGAATAGGAGTAGAGAGTATCTTATTGCTTAT
TCTTATGACTATTGGGATATGGGTAATGTCTGAAAAGGAGTTGATACAATCTTCTTGCTT
GTTCTTATGGATGTTTGACATTTTTATCTTTTTGAACCGGTGTTAATTTTCAAATGGACA
AAAGATGAATCTAAGTTATTGAACAGCAGATTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CW32TF U 1
AF RR4AU69TF U 1
AF RR4AU69JQ C 247
BS 1 730 RR4AU69TF
BS 731 731 RR4AU69JQ
BS 732 766 RR4AU69TF
BS 767 767 RR4AU69JQ
BS 768 772 RR4AU69TF
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BS 776 781 RR4AU69TF
BS 782 784 RR4AU69JQ
BS 785 811 RR4AU69TF
BS 812 812 RR4AU69JQ
BS 813 815 RR4AU69TF
BS 816 816 RR4AU69JQ
BS 817 852 RR4AU69TF
BS 853 995 RR4AU69JQ

RD RR4CW32TF 287 0 0
GGGACGGCCCCGTTCTGTGCTTGAGCTTCTCG*TCTCTCTCTCTCG*TCTCAGGATATGA
ATTCTCTGAC*TCGTGGGTAGGTGTGGCTGTCGGTCCCGATGATAATTTA*TGTTGGTCG
TGGAGGCTCCGTACCGGTTTCAACAAGGCGGAACTTGTTGGGTGTTCGGAATAGGCCGAT
ACCACAATGCCCTATGCA*ACTCCATGGTTTGTTCGGAAATGTTAGCGTGTGCTTTGCTT
CTTTTTATGATGGTGTATCTTCTACTGTTCAACTTTTGGAAGGTGGT

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR4AU69TF 856 0 0
GGGACGGCCCCGTTCTGTGCTTGAGCTTCTCGATCTCTCTCTCTCGATCTCAGGATATGA
ATTCTCTGACATCGTGGGTAGGTGTGACTGTCGGTCCCGATGATAATTTAGTGTTGGTCG
TGGAGGCTCCGTACCGGTTTCAACAAGGCGGAACTTGTTGGGTGTTCGGAATAGGCCGAT
ACCACAATGCCCTATGCAGACTCCATGGTTTGTTCGGAAATGTTAGCGTGTGCTTTGCTT
CTTTTTATGATGGTTTATCTTCTACTGTTCAACTTTTGGAAGGTGGTGGTATCCCCAACC
TTGAAGCAGCCAGAGATTGTTTGGTAAATCATGGACTTCCATTGGAGAGTGCTATTCCCT
GGGAGGGTCCACTGTATGCCTTACGCGATATGATTGTCCATCACGCCCAACGATACCCAA
CTTATCAAGAGTTTGAGCAGCATCTCTTCACTCTCATGCTTGGTTCTCCTGTTGCGGCTG
CAGTACTTTCATTTCCTTCTTTGTTCCAAGGTCCAGATCGTAATGGTCTTCATTACCCCA
CGCCTGCTGAGAGGCTCTTGGGTTTGGATGCATATGTATCTCACGTGATGCTCGCTACCG
GGAGAGGTTCCATGCGCGAGAGAGGTCCCACACGAGAGCTTTTAGAGTTTCTTGAGTTCC
AAGACAGCATGCCAGGTAATGGTGGTGTGATCAAACTCCGACTGGGTCGCAATGAGAGGA
CCGTTCTTAG*TTTGTGGAGCTGATCGGTCCCTATATCAGACCTGA*GATGA**GAGATG
A**GAGACTACTCTGATTCTGACATGGAGGA*TAG*AGTAGAGAGTATCTTATTGCTTAT
TCTTATGACTAT
GGAT

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4AU69JQ 749 0 0
ATGATGGTTTATCTTCTACTGTTCAACTTTTGGAAGGTGGTGGTATCCCCAACCTTGAAG
CAGCCAGAGATTGTTTGGTAAATCATGGACTTCCATTGGAGAGTGCTATTCCCTGGGAGG
GTCCACTGTATGCCTTACGCGATATGATTGTCCATCACGCCCAACGATACCCAACTTATC
AAGAGTTTGAGCAGCATCTCTTCACTCTCATGCTTGGTTCTCCTGTTGCGGCTGCAGTAC
TTTCATTTCCTTCTTTGTTCCAAGGTCCAGATCGTAATGGTCTTCATTACCCCACGCCTG
CTGAGAGGCTCTTGGGTTTGGATGCATATGTATCTCACGTGATGCTCGCTACCGGGAGAG
GTTCCATGCGCGAGAGAGGTCCCACACGAGAGCTTTTAGAGTTTCTTGAGTTCCAAGACA
GCATGCCAGGTAATGGTGGTGTGATCAAACTCCGACTGGGTCGCAATGAGAGGACCGTTC
TTAGGTTTGTGGAGCTGATCGGTCCCTATATCAGACCTGAAGATGAAGAAGATGAAGAAG
ACTACTCTGATTCTGACATGGAGGAATAGGAGTAGAGAGTATCTTATTGCTTATTCTTAT
GACTATTGGGATATGGGTAATGTCTGAAAAGGAGTTGATACAATCTTCTTGCTTGTTCTT
ATGGATGTTTGACATTTTTATCTTTTTGAACCGGTGTTAATTTTCAAATGGACAAAAGAT
GAATCTAAGTTATTGAACAGCAGATTTAC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL3803Contig1 268 2 2 U
GTACCTCGCTTCTTGTCTGAAAAATGATGAACTTCTTTACTTAAAAGCCCTTCCTGGGAA
CAATGGACGGGCCTGACTCGTCATACTCTGCGTTGATACCCCTGCTTTATCTGCATATGA
AATCATTTCCAAAATTCATACTTAAAATTAGGGTTTCTTTAAAAACCTTATGCAAGTAAA
GTCAAATGCTTTTTATATCATCCCTAGGAGCAAAACCCAAACCCTAAAAAAATATTAAAA
AATATGGTCTTTCTTCTTACACACTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A083JQD U 1
AF RR4A083JQ U 108
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DS 

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AAAAATATTAAAAAATATGGTCTTTCTTCTTACACACTTAC

QA 1 161 1 161
DS 



AS 1 3

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AACATCGACGATTTCACCAATTTCTTTGAAGAATTTCTCTAAGTCAGATTTCTCAATTTG
AAAGGGAAGATGTCCAGCAAATAGCGTCTTGGGTTCTTTTGCAATTGATTTCTGCTCTGC
CTCCACCATTTCACCATTAGTATTCTTCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTATTCTTTTTCTT
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TGGGATGTCTGAATCAACTTCCGCATCTCTCTTATTTTTCTTCGATGGCTTCGTCTTTGA
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TGGCGACTGCTGCTGTGCTGTTTTAGGGTTTTCGAGCGGTTTGCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F003JQ U 1
AF RR4H968JQB U 14
AF RR4F003TF C 484
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AACGCTATCTTTGCTGGGTGTTGTACGGTCACCATTGCCTCTTCCAGGTCCTCTTTTGAG
GCTGTCACGGTCGCCACGTTCAGGTCCTCTCTTAGAGGTGTCATCATTGCTGCCACGGCC
ACTATTCCCATCAGCATTCTTTTCTTTTGGTCTAGCTTCAATCACCACAATGTTCCGTCC
TCCTAGTGCACTTCCGTTTAGTTCCAATGCCTTGATGAACCCATCCTCACTAAAATCTAG
GTAAGCCACCCCCTTGCTATCACCAGTCTCTTGGTAATAAGGAAGAGAAATCCTTTTGAT
CTCTCCACAAGCACCAAAATGATTCCTCAAGGAAGTTTTCATATCATCTTCACTCACAGA
CTTGTTGAATCCTGTAACAAAAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4H968JQB 748 0 0
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AGAAAAACAATACTACAAATCCAAGAGTAACCAACTCATCATATAAGCTTTGTGTTTTTT
CTCATAGACTAGGCAAAAAAAGGGACTGAAAGATAGAACAAAAGAAGAGCCAAGGTCTTT
CACTACTCATCAAAGACGATCTTCTTCCCATGAGCTGCTGAGGCAATAACGCTATCTTTG
CTGGGTGTTGTACGGTCACCATTGCCTCTTCCAGGTCCTCTTTTGAGGCTGTCACGGTCG
CCACGTTCAGGTCCTCTCTTAAAGGTGTCATCATTGCTGCCACGGCCACTATTCCCATCA
GCATTCTTTTCTTTTGGTCTAGCTTCAATCACCACAATGTTCCGTCCTCCTAGTGCACTT
CCGTTTAGTTCCAATGCCTTGATGAACCCATCCTCACTAAAATCTAGGTAAGCCACCCCC
TTGCTATCACCAGTCTCTTGGTAATAAGGAAAAAAAATCCTTTTGATCTCTCCACAAGCA
CCAAAATGATTCCTCAAGGAAGTTTTCATATCATCTTCACTCACAGACTTGTTGAATCCT
GTAACAAAAATCGTTTTAACTTTGTTTCCTGGACGTGAAGCAGGTCTCGCCTTAGCAAAA
TCAAGCAGAATATTGCGGCCTAGTAATGGTTTACCATTCAGTTCCAATGCCTTGTGAGCA
GCTTCTTCAGAAGCAAACTCTACATGTG

QA 1 748 1 748
DS 

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GTTGAATCCTGTAACAAAAATCGTTTTAACTTTGTCTCCTGGACGTGAAGCAGGTCTCGC
CTTAGCAAAATCAAGCAGAATATTGCGGCCTAGTAATGGTTTACCATTCAGTTCCAATGC
CTTGTGAGCAGCTTCTTCAGAAGCAAACTCTACATGTGCGAATCCCTTAGCAAGTCTAAC
ATCGACGATTTCACCAATTTCTTTGAAGAATTTCTCTAAGTCAGATTTCTCAATTTGAAA
GGGAAGATGTCCAGCAAATAGCGTCTTGGGTTCTTTTGCAATTGATTTCTGCTCTGCCTC
CACCATTTCACCATTAGTATTCTTCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTATTCTTTTTCTTTGG
TGGTGGTGCCTTTTCCACAGCTTGAATCAACTCTTTCTTCTGCTTCTTGGGATCCTTTGG
GATGTCTGAATCAACTTCCGCATCTCTCTTATTTTTCTTCGATGGCTTCGTCTTTGAGTC
AAGTGGTGCTGCTGCTTCGACTTTGGTAATGGATTCTTTCTTAGACTTGGCCATGGCTGG
CGACTGCTGCTGTGCTGTTTTAGGGTTTTCGAGCGGTTTGCTGCCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 3

CO CL3805Contig1 954 3 13 U
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AGAATGATCCGAAGATCGCTGGAATATTGTGGGTTGGTTATCCCGGAGAAGCTGGTGGTA
TAGCCATCGCTGACGTCATCTTTGGCCGTTATAACCCAAGTGGAAGATTACCGATGACGT
GGTATCCACAATCCTACGTGGAGAAAGTTCCGATGACTAATATGAACATGAGGCCCGATA
CATCAAACGGATATCCGGGTCGGACTTACCGGTTCTACACCGGAGAAACGGTTTACTCCT
TCGGTGATGGACTCAGCTACACCAAGTTCAGCCACAGCTTAGTCAAAGCTCCTCCACGTG
CCGTCTCTCTCCGTGTCGAAGAGAATCATGTTTGTCGATCATCGGAGTGTCAATCTTTGG
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GAAACGGCGGAGATAGAGAGGGGGTTCACACGGTGTTTCTGTTCACGACGCCTCCGGAGG
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AAGAAGCTGTTGTTAAGTTTAAGGTTGACGTCTGTAAAGACCTTAGCGTTGTGGATGAGG
TCGGTAAGAGGAAGGTTGGTTTGGGACAGCATCTTCTTCATGTGGGGGACTTGAAACATT
CTTTGAGCATTAGAATCTGATTCCAATGGAACTTTTTCTTTTTAACTTCAAATGAAAAAA
AATTGTAAACAAGGTTAAAGCTTATGCTAATTGGAATAAAAAAATGAAAATTGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN20TF U 1
AF RR4GN20JQ C 204
AF RR4F196TF U 289
BS 1 694 RR4GN20TF
BS 695 695 RR4F196TF
BS 696 703 RR4GN20TF
BS 704 704 RR4F196TF
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BS 715 715 RR4F196TF
BS 716 757 RR4GN20TF
BS 758 805 RR4F196TF
BS 806 806 RR4GN20JQ
BS 807 918 RR4F196TF
BS 919 919 RR4GN20JQ
BS 920 929 RR4F196TF
BS 930 954 RR4GN20JQ

RD RR4GN20TF 759 0 0
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GAGTTGATTTGAATCTTCCCGGACAACATGAAGAGCTGGTGACACAAGTTGCTAAAGCTG
CTAAAGGTCCTGTCCTGCTTGTGATCATGTCTGGTGGAGGTTTCGACATTACGTTCGCTA
AGAATGATCCGAAGATCGCTGGAATATTGTGGGTTGGTTATCCCGGAGAAGCTGGTGGTA
TAGCCATCGCTGACGTCATCTTTGGCCGTTATAACCCAAGTGGAAGATTACCGATGACGT
GGTATCCACAATCCTACGTGGAGAAAGTTCCGATGACTAATATGAACATGAGGCCCGATA
CATCAAACGGATATCCGGGTCGGACTTACCGGTTCTACACCGGAGAAACGGTTTACTCCT
TCGGTGATGGACTCAGCTACACCAAGTTCAGCCACAGCTTAGTCAAAGCTCCTCCACGTG
CCGTCTCTCTCCGTGTCGAAGAGAATCATGTTTGTCGATCATCGGAGTGTCAATCTTTGG
ACGCGTTCGGACCGCACTGCGAGAACACTGTCTCCGGTTTCGAGGTTCAGATAAAGGTAC
GAAACGGCGGAGATAGAGAGGGGGTTCACACGGTGTTTCTGTTCACGACGCCTCCGGAGG
TTCACGGGTCGCCGAGGAAGCATCTTTTGGGGTT*GAGAAGAT*CGTTTGGGGA*GATGG
AAGAAGCTGTTGTTAAGTTTAAGGTTGACGTCTGTAA
GA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GN20JQ 751 0 0
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GGCCGTTATAACCCAAGTGGAAGATTACCGATGACGTGGTATCCACAATCCTACGTGGAG
AAAGTTCCGATGACTAATATGAACATGAGGCCCGATACATCAAACGGATATCCGGGTCGG
ACTTACCGGTTCTACACCGGAGAAACGGTTTACTCCTTCGGTGATGGACTCAGCTACACC
AAGTTCAGCCACAGCTTAGTCAAAGCTCCTCCACGTGCCGTCTCTCTCCGTGTCGAAGAG
AATCATGTTTGTCGATCATCGGAGTGTCAATCTTTGGACGCGTTCGGACCGCACTGCGAG
AACACTGTCTCCGGTTTCGAGGTTCAGATAAAGGTACGAAACGGCGGAGATAGAGAGGGG
GTTCACACGGTGTTTCTGTTCACGACGCCTCCGGAGGTTCACGGGTCGCCGAGGAAGCAT
CTTTTGGGGTTTGAGAAGATTCGTTTGGGGAAGATGGAAGAAGCTGTTGTTAAGTTTAAG
GTTGACGTCTGTAAAGACCTTAGCGTTGTGGATGAGGTCGGTAAGAGGAAGGTTGGTTTG
GGACAGCATCTTCTTCATGTGGGGGACTTGAAACATTCTTTGAGCATTAGAATCTGATTC
CAATGGAACTTTTTCTTTTTAACTTCAAATGAAAAAAAATTGTGAACAAGGTTAAAGCTT
ATGCTAATTGGAATAAAAAAATGAAAATTGC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4F196TF 641 0 0
G
ACCGATGACGTGTTATCCACAATCTTACGTGGAGAAAGTTCCGATGACTAATATGAACAT
GAGGCCCGATACATCAAACGGATATCCGGGTCGGACTTACCGGTTCTACACCGGAGAAAC
GGTTTACGCCTTCGGTGATGGACTCAGCTACACCAAGTTCAGCCACAGCTTAGTCAAAGC
TCCTCCACGTGTCGTCTCTCTCCGTGTCGAAGAGAATCATGTTTGTCGATCATCGGAGTG
TCAATCTTTGGACGCGTTCGGACCGCACTGCGAGAACACTGTCTCCGGTTTCGAGGTTCA
GATAAAGGTACGAAACGGCGGAGATAGAGAAGGGGTTCACACGGTGTTTCTGTTCACGAC
GCCGCCGGAGGTTCACGGGTCGCCGAGGAAGCATCTTTTGGGGTTTGAGAAGATTCGTTT
GGGGAAGATGGAAGAAGCTGTTGTTAAGTTTAAGGCTGACGTCTGTAAAGACCTTAGCGT
TGTGGATGAGGTCGGTAAGAGGAAGGTTGGTTTGGGTCAGCATCTTCTTCATGTGGGGGA
CTTGAAACATTCTTTGAGCATTAGAATCTGATTCCAATGGAACTTTTTCTTTTTAACTTC
AAATGAAAAAAAATTGTAAACAAGGTTAA*GCTTATGCTA

QA 2 641 2 641
DS 



AS 1 3

CO CL3806Contig1 791 3 9 U
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GACGGTGGATTTAAAGCGTTTCATACAAATAATTACAAAAACAGAAGCTGTCGACGAATG
TTACAAACAAACATGTAAAGTTTGGTGAAAATGTGAAATGTATCTAATTTTGTGTTTGTC
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TGCTGAGTCTTCCAAAGATATGAAGAGTGACCTTCCACCATATCGGTTACATCCACATTT
TCGATTCCAGGGATGCAAATTGGTTGGATTCCGGCTAATCCTTGAGATAATAGACTTGCG
CGAAATGCAACACCGAGTGTCCAATCATTTGTTGCATATACATTGATGAATCTTCCAGCT
ACCATCTTCCTTACGTCTCGCCAGTTTTCATTATTGATTGAAATGGGTGCTCCAAGAATA
ACAACTCTTTCCACAAGTTCAGCGTTTTGTTCTGTCTCGGCCAGAGTCTGAAGGCATTTG
AAGATGACCCGCGCACCAAGTGAAAATCCCACGAGTGTGATGGGTCTATTTCCTTGCAAG
CCTTTTTGTAGCACTTCGGCTAGAAGTTTTCCCGCTTTATCCGACCTATCAATAGCAATA
CTCCATTTGCTATCTATGAAATCTGCAGCTACTAAGATTGTCGCTGGCCATGCCAATGCC
AATAAAAGAGAGCTCAGAACAGTGTGCATTGCTCCTTGTTTCATCAATTCCATGGCCAAT
CTTGAAGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C929JQ U 15
AF RR4C929TF C 15
AF RR4CX75JQ U 1
BS 1 22 RR4CX75JQ
BS 23 23 RR4C929JQ
BS 24 75 RR4CX75JQ
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BS 207 364 RR4CX75JQ
BS 365 365 RR4C929JQ
BS 366 791 RR4CX75JQ

RD RR4C929JQ 606 0 0
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AGCGTTTCATACAAATAATTACAAAAACAGAAGCTGTCGACGAATGTTACAAACAAACAT
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GCAAATTGGTTGGATTCCGGCTAATCCTTGAGATAATAGACTTGCGCGAAATGCAACACC
GAGTGTCCAATCATTTGTTGCATATACATTGATGAATCTTCCAGCTACCATCTTCCTTAC
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TTCGGC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4C929TF 606 0 0
CAGTTCGCCTTTTCTATAAAAAGGAAACAAGAACCGTTCAACGCAAGACGGTGGATTTAA
AGCGTTTCATACAAATAATTACAAAAACAGAAGCTGTCGACGAATGTTACAAACAAACAT
GTAAAGTTTGGTGAAAATGTGAAATGTATCTAATTTTGTGTTTGTCGTTTAGAGAGTGTC
CCGAAAAACAGGGTAATAAGTGTCGATTTCGAGCCTCTCTAGAATTTGCTGAGTCTTCCA
AAGATATGAAGAGTGACCTTCCACCATATCGGTTACATCCACATTTTCGATTCCAGGGAT
GCAAATTGGTTGGATTCCGGCTAATCCTTGAGATAATAGACTTGCGCGAAATGCAACACC
GAGTGTCCAATCATTTGTTGCATATACATTGATGAATCTTCCAGCTACCATCTTCCTTAC
GTCTCGCCAGTTTTCATTATTGATTGAAATGGGTGCTCCAAGAATAACAACTCTTTCCAC
AAGTTCAGCGTTTTGTTCTGTCTCGGCCAGAGTCTGAAGGCATTTGAAGATGACCCGCGC
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TTCGGC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4CX75JQ 791 0 0
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GACGGTGGATTTAAAACGTTTCATACAAATAATTACAAAAACAGAAGCTGTCGACGAATG
TTACAAACAAACATGTAAAGTTTGGTGAAAATGTGAAATGTATCTAATTTTGTGTTTGTC
GTTTAGAGAGTGTCCCGAAAAACAGTGTAATAAGTGTCGATTTCGAGCCTCTCTAGAATT
TGCTGAGTCTTCCAAAGATATGAAGAGTGACCTTCCACCATATCGGTTACATCCACATTT
TCGATTCCAGGGATGCAAATTGGTTGGATTCCGGCTAATCCTTGAGATAATAGACTTGCG
CGAAGTGCAACACCGAGTGTCCAATCATTTGTTGCATATACATTGATGAATCTTCCAGCT
ACCATCTTCCTTACGTCTCGCCAGTTTTCATTATTGATTGAAATGGGTGCTCCAAGAATA
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AAGATGACCCGCGCACCAAGTGAAAATCCCACGAGTGTGATGGGTCTATTTCCTTGCAAG
CCTTTTTGTAGCACTTCGGCTAGAAGTTTTCCCGCTTTATCCGACCTATCAATAGCAATA
CTCCATTTGCTATCTATGAAATCTGCAGCTACTAAGATTGTCGCTGGCCATGCCAATGCC
AATAAAAGAGAGCTCAGAACAGTGTGCATTGCTCCTTGTTTCATCAATTCCATGGCCAAT
CTTGAAGTAAG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL3807Contig1 1263 2 2 U
GACAAACCCATCGGTTCTGCAGATAATTGTCATATCTCTGCTCATACTAATTCTCATACG
AATGCTACACACGCAGTTGTTTCTGAGCCAAAGCCGACAAGAGAACTTAGAAAAGCATGG
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ATACCACCTAGTACAAAGCCCCAGGAAGCTGCTCAGAGCTCACAGATTTCCAGTCCAGTT
TCCTCAATACGAACCTTTGACAATCCCATCAGTTTTGGCCTCCCATCGCCATTCACCATA
CCGGTGTACTCTAGTGGATCCATTACCAGTAGTTCAGGTTTCTCACCTCCAACAGAGATT
GTTTTACCTCAACCTGGTGAAGATGAACATTTTGAAGATCCGTGTTATGTTCCGGATCCG
ATATCTCTACTGGGACCTGTTTCAGAATCACTTGATTTAAGGGCTGGGTATGAAACTGGC
ATAGGATTGGTGAAACACCGTGCAATGAAGAATACACCTACTCGTGAAATCAGCAAGCCA
TCCCCAATTGAATCTCCTTTGTCCAAATCACGGGCTGCTGATGAAAAACAAGCTAATGAC
GGAAGCTGGCAAATGTGGAAGAGCCCCCTTGGCCAAAACGGTCTTGGTTTAGTTGGTGGG
TCAGCAAACTGGATTATACCTTCAGAGACAAGTAGATCTAACGAGGAAAGTCATCATATA
GCATCGTCATTATTTGCAAAAGAGGATGCTTATTCACATAGGGACAGTCCTGAAAGTGAT
CACCAAAACGGCGTATTCAGCCCCATTACAAACAACCATGATCCTTGGTCACAGAATATG
TTCTTCCCTGCGTTATCTGGCACAGAGAGTCCTTTTTCTTGTAGCATACCAACAGAAAGC
ATTCTCTTGAACAACAGGAGTCCAACTGGATCATCAGCTCAAGACAATCCATTTCAACAC
CCTTCTCCGAATCACTGGCTCAAGAAGGTGAAAGGCTCAGGGGATGGGGCCGGGAAGCAA
TTTGTGGCGGCAGGTGATGTTGAGAACCACCAAGATGTAGAATCGTTTTGGTAGTCACAA
ATACAAACAGGAAAAAAAAATGAGGAGAGTTTTTGCAGATGTGTATTTTGTCTGTCTATA
TTTGCCTCTCGTGTCTCTAACGGAGACTTTTGAGTTTTTACTACAAAACTGCTCCACTGA
ACACTCGACGCATAACTATAGTCAGGTACTCTTTACTCTGATAAAGTCTCTCTCACTTAA
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4DK35TF U 1
AF RR4DK35JQ C 522
BS 1 636 RR4DK35TF
BS 637 1263 RR4DK35JQ

RD RR4DK35TF 636 0 0
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AATGCTACACACGCAGTTGTTTCTGAGCCAAAGCCGACAAGAGAACTTAGAAAAGCATGG
CACCAACTGTTTACCCGTTCAACCTCTGTTCCTGTTTCCTCGAATGTTAGTAAAATAAGT
ATACCACCTAGTACAAAGCCCCAGGAAGCTGCTCAGAGCTCACAGATTTCCAGTCCAGTT
TCCTCAATACGAACCTTTGACAATCCCATCAGTTTTGGCCTCCCATCGCCATTCACCATA
CCGGTGTACTCTAGTGGATCCATTACCAGTAGTTCAGGTTTCTCACCTCCAACAGAGATT
GTTTTACCTCAACCTGGTGAAGATGAACATTTTGAAGATCCGTGTTATGTTCCGGATCCG
ATATCTCTACTGGGACCTGTTTCAGAATCACTTGATTTAAGGGCTGGGTATGAAACTGGC
ATAGGATTGGTGAAACACCGTGCAATGAAGAATACACCTACTCGTGAAATCAGCAAGCCA
TCCCCAATTGAATCTCCTTTGTCCAAATCACGGGCTGCTGATGAAAAACAAGCTAATGAC
GGAAGCTGGCAAATGTGGAAGAGCCCCCTTGGCCAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4DK35JQ 742 0 0
TC
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AAAAACAAGCTAATGACGGAAGCTGGCAAATGTGGAAGAGCCCCCTTGGCCAAAACGGTC
TTGGTTTAGTTGGTGGGTCAGCAAACTGGATTATACCTTCAGAGACAAGTAGATCTAACG
AGGAAAGTCATCATATAGCATCGTCATTATTTGCAAAAGAGGATGCTTATTCACATAGGG
ACAGTCCTGAAAGTGATCACCAAAACGGCGTATTCAGCCCCATTACAAACAACCATGATC
CTTGGTCACAGAATATGTTCTTCCCTGCGTTATCTGGCACAGAGAGTCCTTTTTCTTGTA
GCATACCAACAGAAAGCATTCTCTTGAACAACAGGAGTCCAACTGGATCATCAGCTCAAG
ACAATCCATTTCAACACCCTTCTCCGAATCACTGGCTCAAGAAGGTGAAAGGCTCAGGGG
ATGGGGCCGGGAAGCAATTTGTGGCGGCAGGTGATGTTGAGAACCACCAAGATGTAGAAT
CGTTTTGGTAGTCACAAATACAAACAGGAAAAAAAAATGAGGAGAGTTTTTGCAGATGTG
TATTTTGTCTGTCTATATTTGCCTCTCGTGTCTCTAACGGAGACTTTTGAGTTTTTACTA
CAAAACTGCTCCACTGAACACTCGACGCATAACTATAGTCAGGTACTCTTTACTCTGATA
AAGTCTCTCTCACTTAAACC

QA 3 742 3 742
DS 



AS 1 3

CO CL3808Contig1 706 3 8 U
GGTCGCATTCAAAGAAAGAAGGGGTAATCGGCACTAACACAGGAGGAGATTACATCGAGG
GAGATACCATTTTCCTCCCACGTCGGAGGTTTGGTACTACACGTCTCCTAAGTTTGTCCT
GTCAGAATGGAAGGTTCAAGCAGTCTATCCAACGCAGGAAATTTTGGATCTATTGGAAGA
CAATCACAAGCTTCCCCAAATAACAGGGATAATAGTATTTCTCCTCCAAGTAATATGCAC
CATCATCATAGTGCTTCTTTAAATAATCTTCTCATAGATGAGCAACCAGCTTGGCTCGAT
GATCTCCTAAGCGAGCCAGCGTCTCCCAAGATCAACAAAGGTCACAGGCGTTCAGCTAGT
GACACATCTGCCTACTTAAACTCGTCTTTAATGCCTTTTAGAGAAGATGACCTTCTGAAT
AGTCATTTTTCTGGGCCATCTTGGCTAGTCCAGAATATTCACCAGCATGATGATTTGTGG
CATCCTAACTCTTACGACAACCACAGTAAATTGGG*ATGGGAGTTTTCTAACAAAACTGG
AACTAACCTCCAAACACATGTGTCATGGGGAGCTGTAAATAGAGCAGGTACCTCTGCCTC
GAAATCAGCTGAAATACAAGCAAGTAAAATGAAAGAAGGCTCTTTAACAAAACCAGACGT
CCTGGATCAAAATTGACTCTAAACGTATCAAACACCAAATGCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DT65TF U 1
AF RR4BO73TF U 5
AF RR4F509TF U 3
BS 1 515 RR4DT65TF
BS 516 516 RR4F509TF
BS 517 583 RR4DT65TF
BS 584 586 RR4F509TF
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BS 588 620 RR4F509TF
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BS 622 706 RR4F509TF

RD RR4DT65TF 583 0 0
GGTCGCATTCAAAGAAAGAAGGGGTAATCGGCACTAACACAGGAGGAGATTACATCGAGG
GAGATACCATTTTCCTCCCACGTCGGAGGTTTGGTACTACACGTCTCCTAAGTTTGTCCT
GTCAGAATGGAAGGTTCAAGCAGTCTATCCAACGCAGGAAATTTTGGATCTATTGGAAGA
CAATCACAAGCTTCCCCAAATAACAGGGATAATAGTATTTCTCCTCCAAGTAATATGCAC
CATCATCATAGTGCTTCTTTAAATAATCTTCTCATAGATGAGCAACCAGCTTGGCTCGAT
GATCTCCTAAGCGAGCCAGCGTCTCCCAAGATCAACAAAGGTCACAGGCGTTCAGCTAGT
GACACATCTGCCTACTTAAACTCGTCTTTAATGCCTTTTAGAGAAGATGACCTTCTGAAT
AGTCATTTTTCTGGGCCATCTTGGCTAGTCCAGAATATTCACCAGCATGATGATTTGTGG
CATCCTAACTCTTACGACAACCACAGTAAATTGGGGATGGGAGTTTTCTAACAAAACTGG
AACTAACCTCCAAACACATGTGTCATGGGGAGCTGTAAATAGA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4BO73TF 631 0 0
GG
ATTCAAAGAAAGAAGGGGTAATCGGCACTAACACAGGAGGAGATTACATCGAGGGAGATA
CCATTTTCCTCCCACGTCGGAGGTTTGGTACTACACGTCTCCTAAGTTTGTCCTGTCAGA
ATAGAAGGTTCGAGCAGTCTATCCAACGCAGGAAATTTTGGATCTATTGGAAGACAATCA
CAAGCTTCCCCAAATAACAGGGATAATAGTATTTCTCCTCCAAGTAATATGCACCATCAT
CATAGTGCTTCTTTAAATAATCTTCTCATAGATGAGCAACCAGCTTGGCTCGATGATCTC
CTAAGCGAGCCAGCGTCTCCCAAGATCAACAAAGGTCACAGGCGTTCAGCTAGTGACACA
TCTGCCTACTTAAACTCGTCTTTAATGCCTTTTAGAGAAGATGACCTTCTGAATAGTCAT
TTTTCTGGGCCATCCTGGCTAGTCCAGAATATTCACCAGCATGATGATTTGTGGCATCCT
AACTCTTACGACAACCACAGTAAATTGGG*ATGGGAGTTTTCTAACAAAACTGGAACTAA
CCTCCAAACACATGTGTCATGGGGAGCTGTAAATAGAGCAGGTACCTCTGCCTCGAAATC
AGCTGAAATACAAGCAAGTAAAATGAAAG

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR4F509TF 704 0 0
GGGC
ATTCAAAGAAAGAAGGGGTAATCGGCACTAACACAGGAGGAGATTACATCAAGGGAGATA
CCATTTTCCTCC*ACGTCGGAGGTTTGGTACTACACGTCTCCTAAGTTTGTCCTGTCAGA
ATGGAAGGTTCAAGCAGTCTATCCAACGCAGGAAATTTTGGATCTATTGGAAGACAATCA
CAAGCTTCCCCAAATAACAGGGATAATAGTATTTCTCCTCCAAGTAATATGCACCATCAT
CATAGTGCTTCTTTAAATAATCTTCTCATAGATGAGCAACCAGCTTGGCTCGATGATCTC
CTAAGCGAGCCAGCGTCTCCCAAGATCAACAAAGGTCACAGGCGTTCAGCTAGTGACACA
TCTGCCTACTTAAACTCGTCTTTAATGCCTTTTAGAGAAGATGACCTTCTGAATAGTCAT
TTTTCTGGGCCATCTTGGCTAGTCCAGAATATTCACCAGCATGATGATTTGTGGCATCCT
AACTCTTACGACAACCACAGTAAATTGGG*ATGGGAGTTTTCTAACAAAACTGGAACTAA
CCTCCAAACACATGTGTCATGGGGAGCTGTAAATAGAGCATGTACCTCTGCCTCGAAATC
AGCTGAAATACAAGTAAGTAAAATGAAAGAAGGCTCTTTAACAAAACCAGACGTCCTGGA
TCAAAATTGACTCTAAACGTATCAAACACCAAATGCTCAC

QA 5 704 5 704
DS 



AS 1 3

CO CL3809Contig1 735 3 7 U
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AAATTGGTTTACAAAAATAAACTAAATTAAAATAAAAAACTAAACTAAATAAAAAATCCT
AAACCTAAAATAAGGCTCTATCTTCTACGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCT
ACAGTAACGGCTACCGCGACCACCACCCGGTGACTGCGAGTACCACCGCTGTACTGCGAC
TGCGGAGAGAAGTCCGACTGTCAGGCTTCCAGAACGTAATTCTCTTTAGCATATCTCATT
GTCTCAGGTCAAAGCGATTCTCTTGAGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAG
TAACACAAAGCCAGATGGCTTGAAGCCGTAAAGGTCAACAAGGATTCGCGCTCCACCACA
AGGTTCCTCTTCTCCACCAAACATTATCATCTTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAA
CAAAAAAAATCATAAACAAAAGAGAGAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACA
GAGAGAGATAGAGAAGCCATATCTGTTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTA
CACCACCGATTCCGAACAAGTCTCCAGGAAAGGATTCCACTACAGATGCGGTGGCATCTT
TAAAAGATGTAATAGGAAGCTTTGCATATACAAATTAAAAATTTTGAGTCTGTATACGAA
GAAAAGGGGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK64JQ U 26
AF RR4FC15JQ U 26
AF RR4FC15TF C 1
BS 1 25 RR4FC15TF
BS 26 135 RR4BK64JQ
BS 136 136 RR4FC15JQ
BS 137 139 RR4BK64JQ
BS 140 140 RR4FC15JQ
BS 141 147 RR4BK64JQ
BS 148 735 RR4FC15TF

RD RR4BK64JQ 131 0 0
AAATTGGGTTTACAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTACAAAAATAAACTAA
ATTAAAATAAAAAACTAAACTAAATAAAAAATCCTAAACCTAAAATAAGGGTCTTTCTTC
TA
TGCATTTTC

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR4FC15JQ 131 0 0
AAATTGGGTTTACAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTACAAAAATAAACTAA
ATTAAAATAAAAAACTAAACTAAATAAAAAATCCTAAACCTAAAATAAGGCTCTATCTTC
TA
CCCATCTTC

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR4FC15TF 735 0 0
GCCAATGAATTTTTGTTTATAAACTAAATTGGGTTTACAAACTAAATAAATT*ACAAATT
AAATTGGTTTACAAAA*TAAACTAAATTAAAATAAAAA*CTAAACTAAATAAAAA*TCCT
AAACCTAAAATAAGGCTCTATCTTCTACGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCT
ACAGTAACGGCTACCGCGACCACCACCCGGTGACTGCGAGTACCACCGCTGTACTGCGAC
TGCGGAGAGAAGTCCGACTGTCAGGCTTCCAGAACGTAATTCTCTTTAGCATATCTCATT
GTCTCAGGTCAAAGCGATTCTCTTGAGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAG
TAACACAAAGCCAGATGGCTTGAAGCCGTAAAGGTCAACAAGGATTCGCGCTCCACCACA
AGGTTCCTCTTCTCCACCAAACATTATCATCTTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAA
CAAAAAAAATCATAAACAAAAGAGAGAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACA
GAGAGAGATAGAGAAGCCATATCTGTTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTA
CACCACCGATTCCGAACAAGTCTCCAGGAAAGGATTCCACTACAGATGCGGTGGCATCTT
TAAAAGATGTAATAGGAAGCTTTGCATATACAAATTAAAAATTTTGAGTCTGTATACGAA
GAAAAGGGGAAGTCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL3810Contig1 766 2 5 U
GGGTAAGCAGTAAGCTGACTTCTTCTTCTTCCACAGCAAACTTTCAGAAAATAAATAAAA
AATCTGATAGGTGGATTTTACAACTTGCATTGTATTCTGATTCTTTTTGTGAAGTATGTT
GTTCTGTGCTAAGAACTCTATTATGATGTTTATCACCATATAAGCTCTAATGGTGACTAT
GATAACCCCGGATTGGTGAAATTCACTTTCTATTGAATCAAGAATATACACAACAGGAGT
GTATATATATAGATTATCTTTAAGGTGTCACAAAAATGGAAAAGAAACTTAAAAACTCTA
ATAAGATGTCTCTAATAAGAATGTTGAGAGGTATAGCATGTCTGATGGTGTTGGTTTCAA
CAGCTTTTATGATGTTGATTTTCTGGGGTTTCCTATCAGCTGTAGTGGTGAGGCTTTTCA
GCTTACACTACAGCCGTAGATGTGTTTCTTTCTTCTTTGGCTCCTGGCTCGCCTTGTGGC
CTTTCCTCTTCGAGAAGATCAACAGAACCAAAGCTGTCTTCTCTGGAGATAAGGTTCCTT
GCGAGGAACGAGTGTTGCTCATTGCCAATCACCGAACAGAGGTCGATTGGATGTACTTCT
GGGATCTTGCACTGCGTAAAGGACAGATTGGGAATATGAAGTATGTGCTCAAGAGCAGTT
TGATGAAGTTGCCTCTGTTTGGTTGGGCGTTTCACCTCTTTGAGTTTATCCCCGTTGAGC
GGAGATGGAAAGTAGATGAAGCAACTTGAGCAGATGGTTTCCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ65TF U 6
AF RR4C725TF U 1
BS 1 52 RR4C725TF
BS 53 53 RR4DZ65TF
BS 54 118 RR4C725TF
BS 119 121 RR4DZ65TF
BS 122 766 RR4C725TF

RD RR4DZ65TF 274 0 0
GGGAGTC
AGCTGTCTTCTTCTTCTTCCA**GCAAACTTTCAGAAAATAAATAAAAAATCTGATAGGT
GGATTTTACAACTTGCATTGTATTCTGATTCTTTTTGTGAAGTATGTTGTTCTGTGCTAA
GAACTCTATTATGATGTT*ATCACCATATAAGCTCTAATGGTGACTATGATAACCCCGGA
TTGGTGAAATTCACTTTCTATTGAATCAAGAATATACACAACAGGAGTGTATATATATAG
ATTATCTTTAAGGTGTCACAAAAATGG

QA 8 274 8 274
DS 

RD RR4C725TF 766 0 0
GGGTAAGCAGTAAGCTGACTTCTTCTTCTTCCACAGCAAACTTTCAGAAAATTAATAAAA
AATCTGATAGGTGGATTTTACAACTTGCATTGTATTCTGATTCTTTTTGTGAAGTATG**
*TTCTGTGCTAAGAACTCTATTATGATGTTTATCACCATATAAGCTCTAATGGTGACTAT
GATAACCCCGGATTGGTGAAATTCACTTTCTATTGAATCAAGAATATACACAACAGGAGT
GTATATATATAGATTATCTTTAAGGTGTCACAAAAATGGAAAAGAAACTTAAAAACTCTA
ATAAGATGTCTCTAATAAGAATGTTGAGAGGTATAGCATGTCTGATGGTGTTGGTTTCAA
CAGCTTTTATGATGTTGATTTTCTGGGGTTTCCTATCAGCTGTAGTGGTGAGGCTTTTCA
GCTTACACTACAGCCGTAGATGTGTTTCTTTCTTCTTTGGCTCCTGGCTCGCCTTGTGGC
CTTTCCTCTTCGAGAAGATCAACAGAACCAAAGCTGTCTTCTCTGGAGATAAGGTTCCTT
GCGAGGAACGAGTGTTGCTCATTGCCAATCACCGAACAGAGGTCGATTGGATGTACTTCT
GGGATCTTGCACTGCGTAAAGGACAGATTGGGAATATGAAGTATGTGCTCAAGAGCAGTT
TGATGAAGTTGCCTCTGTTTGGTTGGGCGTTTCACCTCTTTGAGTTTATCCCCGTTGAGC
GGAGATGGAAAGTAGATGAAGCAACTTGAGCAGATGGTTTCCAGTT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL3811Contig1 955 2 6 U
ACATGAAATGATCTTTTATTTAATAAAAAAATGAAGTAAGATACAACGATCCGAATTTCA
CAAAAGGGATTTTATCATTCGAATCCTCAAATTAAAAACCTCAAACAACGATGGAACTCT
CACCATATGATTATTACTTATTAAAAGAAACCAAGATATCGTACAATGACGATTTATGAC
AACATAAATGCAATAACAAACCACACGACAACCCTTTGTCACGCGGAAAGGTAGTCGAAG
CCGCCTGCGTCGCTGTAATAAAAGCCAAGGTTACTAATCACCTCTAGCCTCCTCAGATTC
AAGCAAAAACTGAATATCATCATCATCATGAGCCTCCTGAGCCATTGGTTTAGCCGCGGA
AACAGCCTCGAAGATCAAAACCGAATGATGAGAGACTATCGCTCTCCCGCTCTCGCTGCA
TATCACCGGATGCTTCACGGATCTCCTGTCGCAAACAGACTTAACAGAACCCACAACAGC
TTCAGCATACTCCTCGAGAGTATAACCAACAGAGAGATCAGACTCTCCGGACTTAGAACC
ATCATAGTCAATCCCTAACCCGCCACCAACATCGATAACCTTCATACCGGCACCGAGACG
CACGAGCTCGCAGTAAAGCTGAGCAGCTTCCCCAACACCGTCAGAGAGCAACTCCGTCGT
TGGAATCTGCGAGCCGATGTGGAAATGCAGAAGCTGGAGACAATCAAGCATACAAGACTC
CTTAAGCTTCCTCACAACACGAACGATCTGAGTACTCGTCAAACCGAACTTCCCCTTCTC
TCCAGACGTCGCTCCGAAATGACCAGAGTGTTTGGTCCTCAGCTTAGCTCGCAACCCAAT
CACAGCCTACATTCATCTTCCTACTCAGATCGATACGAGATCAAGCTCTCTCTGCTCTAG
CACGATCACAGTGTCACGCTAGCTTCTCCGAGGAGAGCGAGAGAGACATACTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A063JQD U 1
AF RR4A063JQ U 46
BS 1 66 RR4A063JQD
BS 67 67 RR4A063JQ
BS 68 115 RR4A063JQD
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BS 117 841 RR4A063JQD
BS 842 955 RR4A063JQ

RD RR4A063JQD 841 0 0
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CAAAAGTGATTTTATCATTCGAATCCTCAAATTAAAAACCTCAAACAACGATGGATCTCT
CACCATATGATTATTACTTATTAAAAGAAACCAAGATATCGTACAATGACGATTTATGAC
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TATCACCGGATGCTTCACGGATCTCCTGTCGCAAACAGACTTAACAGAACCCACAACAGC
TTCAGCATACTCCTCGAGAGTATAACCAACAGAGAGATCAGACTCTCCGGACTTAGAACC
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TCCAGACGTCGCTCCGAAATGACCAGAGTGTTTGGTCCTCAGCTTAGCTCGCAACCCAAT
C

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DS 

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ATGACGATTTATGACAACATAAATGCAATAACAAACCACACGACAACCCTTTGTCACGCG
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AGCCTCCTCAGATTCAAGCAAAAACTGAATATCATCATCATCATGAGCCTCCTGAGCCAT
TGGTTTAGCCGCGGAAACAGCCTCGAAGATCAAAACCGAATGATGAGAGACTATCGCTCT
CCCGCTCTCGCTGCATATCACCGGATGCTTCACGGATCTCCTGTCGCAAACAGACTTAAC
AGAACCCACAACAGCTTCAGCATACTCCTCGAGAGTATAACCAACAGAGAGATCAGACTC
TCCGGACTTAGAACCATCATAGTCAATCCCTAACCCGCCACCAACATCGATAACCTTCAT
ACCGGCACCGAGACGCACGAGCTCGCAGTAAAGCTGAGCAGCTTCCCCAACACCGTCAGA
GAGCAACTCCGTCGTTGGAATCTGCGAGCCGATGTGGAAATGCAGAAGCTGGAGACAATC
AAGCATACAAGACTCCTTAAGCTTCCTCACAACACGAACGATCTGAGTACTCGTCAA*CC
GAACTTCCCCTTCTCTCCAGACGTCGCTCCGAA*TGACCAGAGTGTTTGGTCCTCAGCTT
AGCTCGCAACCCAATCACAGCCTACATTCATCTTCCTACTCAGATCGATACGAGATCAAG
CTCTCTCTGCTCTAGCACGATCACAGTGTCACGCTAGCTTCTCCGAGGAGAGCGAGAGAG
ACATACTCAG

QA 1 910 1 910
DS 



AS 1 3

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TACGACAATAATGACCAGGCTGTTTCCGTGCTACTTGGTAATGCAGGCCGTGAGACTTGA
AAGCCTACCTCGGAAATAGTTGACAACTACGTTGAGGTAAATTGACAGCAAGTTATAGAA
CTCTCAAGTCATGTAATCTCACTTTATTTTTCCATTAATGTTACGCCAATCCAGATCTTG
GTGCTGACC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA93TF U 2
AF RR4AJ03TF U 1
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ATGTGTCCAAAG
TGCAGAACACACGG

QA 1 432 1 432
DS 

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CGTTTTCCTGCGTCTATCTCAAAAAAAAA***ACAGAGACCCTTGCCCTCAGTTCAGTGT
CATCCTCGCATGTCTTTTATGTACTACGATGTCCAACCCACCATTGATTAACTCAACTGA
TTGGGTTCTAAACCAGAGATTGCAGAGAGCTGGTGAATGCAGAGGAGGTTACTAAGGCTG
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TTGGTATTATATTGCCTGCAGCGACGGCAAAACTAAGGCCACCAGAGGACCTTCTTTGTT
GATGTGTCCAAAGAACACACGGTGGTGGCAGATGCGGGAGAGGAAGGGAAGCAAGCGGCA
GCGCTAAGGGTAACAGGGGACAAAGCAATGTTCTATAAAGTTAGGGTTTTGGGATCACAA
GACACTCGTAATGATGGAACTGGTTCTCACTACTTTTACCAATGCCACATCCAAGGAAGT
GTCGATTTCATCTTCGGCAACGCCAAGTCGCTTTACCATGCAACAATCACATTCATCTTT
TTATTTAATCCTTTTTCTGTATATAAAAAAATATGTACACAATGTTGATCTGACGTTTTG
TGTAAACAACACCACAGGACTGTGATATCCGCTCAAACGCAAAGAGATTCGGCGCCATTG
CAGCTCACCATAGAAGTGAAGAGAATGACGATACTGGTTTCTCCTTTGTGAACTGTGACA
TCGGAG
AAC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4AJ03JQ 812 0 0
TGCAGAGGAGGTTACTAAGGCTGTGATAGTAACAGCTGGACAAATCTATGCTTATATCAA
AAAGGAATTCGACAGGTGACTGCTTGGTATTATATTGCCTGCAGCGACGGCAAAACTAAG
GCCACCAGAGGACCTTCTTTGTTGATGTGTCCAAAGAACACACGGTGGTGGCAGATGCGG
GAGAGGAAGGGAAGCAAGCGGCAGCGCTAAGGGTAACAGGGGACAAAGCAATGTTCTATA
AAGTTAGGGTTTTGGGATCACAAGACACTCGTAATGATGGAACTGGTTCTCACTACTTTT
ACCAATGCCACATCCAAGGAAGTGTCGATTTCATCTTCGGCAACGCCAAGTCGCTTTACC
ATGCAACAATCACATTCATCTTTTTATTTAATCCTTTTTCTGTATATAAAAAAATATGTA
CACAATGTTGATCTGACGTTTTGTGTAAACAACACCACAGGACTGTGATATCCGCTCAAA
CGCAAAGAGATTCGGCGCCATTGCAGCTCACCATAGAAGTGAAGAGAATGACGATACTGG
TTTCTCCTTTGTGAACTGTGACATCGGAGGAACATGAAAGGTTTACCTGGGGAGAGCTTG
GAGAATCTGCTAAGGTTTTTTTTTACGACAATAATGACCAGGCTGTTTCCGTGCTACTTG
GTAATGCAGGCCGTGAGACTTGAAAGCCTACCTCGGAAATAGTTGACAACTACGTTGAGG
TAAATTGACAGCAAGTTATAGAACTCTCAAGTCATGTAATCTCACTTTATTTTTCCATTA
ATGTTACGCCAATCCAGATCTTGGTGCTGACC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 3

CO CL3813Contig1 798 3 1 U
GAACATCAATCACAACGACATTACTCCATGACAGAAGCTGTAACTGGTGCTATTTTACAA
GTGAAGATGGATACTAGTCTCTTACTGTAGCAACAATGTGGGTTAAGCTACAGGTCTGAG
TAAAACTAAAAAAGCAAAAAAAAAAAACTCAAAGGGACTTTGCTACAAACAAACTAAACA
ATCTCTAAATCATGACTTGACCATATCACAGGACAACAAAGAGGTATCATCAAAGCTTTA
ACAAATGGCCTCTGGGGATGAGCTCCGGTTTTCTTTTGTGATTTGAGCAAGTCATGGGCA
CAACATAACATCAACAAGCAAATCCTGAATGTGGAGATTGATGGTCTTGAGCTGCTGCTG
CTGCTGCTTCTTCTTCTGATATATTATTCTGAGAGCCAGGACCTGGCAAAGCAGCTGGAT
CAAGCTCATACCAACCTTCCAACACACCTCTCCCTTCTGTTCCCTTCAGTCTAAAAGACG
GAACCCTATGCGAGAATCCAGACAACTCATGAGGTGGAATCTCAAAAATGTCTGCTTCCT
CCTCTGGCATTGGACTGTACACATATTTAAACCCTTCCACTTTAGACAAGAACCCCACAG
ACACCGTTGCTCCCTCCCCATGATGATCAGACAGTATCTCAACAAACTCATACTCACGAG
GAGAATCTGAGGAGGACAACAAGTCCACGTCCCAGTTCTTGAAAAGAGCCCACGTTTCTC
CTTTCCCCGGGAACACCTTAAAGTTCCGAGCATTCCTTCTCGTCTTGATTTGCACCAAAT
GAGAGAATAAGTCACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C093JQ U 36
AF RR4C094JQ U 50
AF RR4CK02JQ U 1
BS 1 798 RR4CK02JQ

RD RR4C093JQ 146 0 0
AGCTGTAACTGGTGCTATTTTACAAGTGAAGATGGATACTAGTCTCTTACTGTAGCAACA
ATGTGGGTTAAGCTACAGGTCTGAGTAAAACTAAAAAAGCAAAAAAAAAAAACTCAAAGG
GACTTTGCTACAAACAAACTAAACA
A

QA 1 145 1 145
DS 

RD RR4C094JQ 131 0 0
CTATTTTACAAGTGAAGATGGATACTAGTCTCTTACTGTAGCAACAATGTGGGTTAAGCT
ACAGGTCTGAGTAAAACTAAAAAAGCAAAAAAAAAAAACTCAAAGGGACTTTGCTACAAA
CAAACTAAACA

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR4CK02JQ 798 0 0
GAACATCAATCACAACGACATTACTCCATGACAGAAGCTGTAACTGGTGCTATTTTACAA
GTGAAGATGGATACTAGTCTCTTACTGTAGCAACAATGTGGGTTAAGCTACAGGTCTGAG
TAAAACTAAAAAAGCAAAAAAAAAAAACTCAAAGGGACTTTGCTACAAACAAACTAAACA
ATCTCTAAATCATGACTTGACCATATCACAGGACAACAAAGAGGTATCATCAAAGCTTTA
ACAAATGGCCTCTGGGGATGAGCTCCGGTTTTCTTTTGTGATTTGAGCAAGTCATGGGCA
CAACATAACATCAACAAGCAAATCCTGAATGTGGAGATTGATGGTCTTGAGCTGCTGCTG
CTGCTGCTTCTTCTTCTGATATATTATTCTGAGAGCCAGGACCTGGCAAAGCAGCTGGAT
CAAGCTCATACCAACCTTCCAACACACCTCTCCCTTCTGTTCCCTTCAGTCTAAAAGACG
GAACCCTATGCGAGAATCCAGACAACTCATGAGGTGGAATCTCAAAAATGTCTGCTTCCT
CCTCTGGCATTGGACTGTACACATATTTAAACCCTTCCACTTTAGACAAGAACCCCACAG
ACACCGTTGCTCCCTCCCCATGATGATCAGACAGTATCTCAACAAACTCATACTCACGAG
GAGAATCTGAGGAGGACAACAAGTCCACGTCCCAGTTCTTGAAAAGAGCCCACGTTTCTC
CTTTCCCCGGGAACACCTTAAAGTTCCGAGCATTCCTTCTCGTCTTGATTTGCACCAAAT
GAGAGAATAAGTCACAGC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

CO CL3814Contig1 531 3 1 U
AGAAAGCTATTAATGAAAATTGTGTATTATGATTTGTGACAGACCAATCATAGTTATGTC
GAACAAAATCTCTAGCCAAAGCAGATAAGAGGGGAAAAACATTTGCAACAACCAAACCTA
TAATAAAACCATGTCTTAAACTGATAATACTCAAAACTCATTAAGGTAGTACAATCTTTA
AGCTTGGTCTTCAACCTCGGTAATAACCTTGGCCACAGAATCAGTCTTACTAGACAAGAA
ATCAGTGTACTCTTGGTATGGAGATTTCTTGAATGACGTCTCTTTCCAGAACTCTGGTGT
AAGGAAACCATATGTCTTCTGTAGACAATCAAATGTAGCCTTAACAAAGTTTCCGAGCGT
TTTGGTAGATCCTCTGGAGGAAGTGAAGACATCATCAATACCAGCGAACTGAAGAACCTT
CTTAGGAACCCTAGCCGCCACAATACCAGCACCTCTCGGAGCAGGAACCATCCTCACAGT
AACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACAGTATACGGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GY56JQ U 86
AF RR4H778JQB U 1
AF RR4H778TF C 429
BS 1 531 RR4H778JQB

RD RR4GY56JQ 134 0 0
TAAGAGGGGAAAAACATTTGCAACAACCAAACCTATAATAAAACCATGTCTTAAACTGAT
AATACTCAAAACTCATTAAGGTAGTACAATCTTTAAGCTTGGTCTTCAACCTCGGTAATA
ACCTTGGCCAC
GGA

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR4H778JQB 531 0 0
AGAAAGCTATTAATGAAAATTGTGTATTATGATTTGTGACAGACCAATCATAGTTATGTC
GAACAAAATCTCTAGCCAAAGCAGATAAGAGGGGAAAAACATTTGCAACAACCAAACCTA
TAATAAAACCATGTCTTAAACTGATAATACTCAAAACTCATTAAGGTAGTACAATCTTTA
AGCTTGGTCTTCAACCTCGGTAATAACCTTGGCCACAGAATCAGTCTTACTAGACAAGAA
ATCAGTGTACTCTTGGTATGGAGATTTCTTGAATGACGTCTCTTTCCAGAACTCTGGTGT
AAGGAAACCATATGTCTTCTGTAGACAATCAAATGTAGCCTTAACAAAGTTTCCGAGCGT
TTTGGTAGATCCTCTGGAGGAAGTGAAGACATCATCAATACCAGCGAACTGAAGAACCTT
CTTAGGAACCCTAGCCGCCACAATACCAGCACCTCTCGGAGCAGGAACCATCCTCACAGT
AACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACAGTATACGGCTTCCC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4H778TF 103 0 0
CCCTAGCCGCCACAATACCAGCACCTCTCGGAGCAGGA*CCATCCTCACAGTAACGGAAC
CACACTTCCCCGTA*CCTTACAAGGAACAGTATACGGCTTCCC

QA 1 103 1 103
DS 



AS 1 3

CO CL3815Contig1 1302 3 5 U
GGTTAAGTAACTAAATTTTATTGAAATACTTATATTATTATGCTTGGATACAAAATCGTT
TTATAGGACCCCTGATATTATTAAGTAGGTCTTAAAGCAACAAGGACTACTACAAAATGA
ACACAACAGAAACAGATTATTCTCTGTTTAATTTGTTATTACATAGAAGATCGATGGACC
AAACGGCGTCCACCACCGTTTAACCCACAAAGCAGACTAGCATACCGCCGTTTAGGTTTC
CCTTGATCGTTACAAGCGCCTTGCATGGCCTTTTGTACGTTTGCGGTGACATCTTGAACC
GGAGTGACAGTGAGTGAAGCGGAGTCGCCGGTACGATCATCAAGCCAAGTAATGATGTCA
GCAAAAACGAGGTCAACGTTAGCATCAGGCTCACCAGAAGTCAACCCATGCCACATCCCT
GGATAAAGTTTAATAGTTTTGTCACGTGAGCTTGCTTTCTGGAACAGAGCTTTGCTGATC
TCTGGATCGGTCAATATGTCTGCTTCACCGTGAAGAACAAGGAACGGTAATGTGATCTCG
TGGAGACTGTCTTCGAGGTTCATGCTCGTTCTAAGCATCTCAAGTGCTGTTTTGAGCCTT
GGTTTGTCTTGATATATCAGCTTGTTGTTCCTTATCTCTTCGCGCTTGACCGGATCTTTG
AAGGCAGCATCGATAACATCTTTGGTGGGCACGATCCTCCATTTTGGTATAATCTCTTCC
ACTCTCGTTAGTAGATTAATCACCACTCGATGTGGTTTTGCCTTCTCTGATATCTTACAC
ATAGGAGCAACGAGAAGGGCAGCATTCCAGAAAGAAGGATCTTTCTTGTGAAGCAACAAA
GCAACTGCACCTCCCATGGATTCTCCATACAAGAATCTGCCTTTTTCTTTGTATTCTGCT
AGCGCAGAGATCGAAGTGTAATAGTCGTAGCAGTCGTTTACTATGTTACTAAACTTCTTG
ATGTAACAACGAGCTCCTTTGGACCGACCATGACCTTCGTAATCCATTCCAAATACCGCA
TATCCTGCTGAAGCCAGACGTATCCCGCATTCTCTCATGAAGCCACTGCACTCCATCCCA
TAGCCATGGCAGAGGAAGATGAGAGCTTTGGGAGGAGAAGAAGATGGAACCCATCTGCAA
GCGAACAACTCAACGTCTCTCGAGTTTCTTATATATTCCTCATGGTAATCAAACTTTAAC
TTCATCGCCATGCTCGTTCGTTGGTGTATGCTATATGCTTTCACATATTATCTCGATTTA
CTGTCGCCAGGTAAGAGAATGGAGAAAACTAGCTAACTGCCC


BQ
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AF RR4EB53JQ U 1
AF RR4ET95JQ U 23
AF RR4EB53TF C 654
BS 1 165 RR4EB53JQ
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BS 762 1302 RR4EB53TF

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TTATAGGACCCCTGATATTATTAAGTAGGTCTTAAAGCAACAAGGACTACTACAAAATGA
ACACAACAGAAACAGATTATTCTCTGTTTAATTTGTTATTACATA
AAA

QA 1 165 1 165
DS 

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AAGTAGGTCTTAGAGCAACAAGGACTACTACAAAATGAACACAACAGAAACAGATTATTC
TCTGTTTAATTTGTTATTACATAGAAGATCGATGGACCAAACGGCGTCCACCACCGTTTA
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GCATGGCCTTTTGTACGTTTGCGGTGACATCTTGAACCGGAGTGACAGTGAGTGAAGCGG
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CACGTGAGCTTGCTTTCTGGAACAGAGCTTTGCTGATCTCTGGATCGGTCAATATGTCTG
CTTCACCGTGAAGAACAAGGAACGGTAATGTGATCTCGTGGAGACTGTCTTCGAGGTTCA
TGCTCGTTCTAAGCATCTCAAGTGCTGTTTTGAGCCTTGGTTTGTCTTGATATATCAGCT
TGTTGTTCCTTATCTCTTCGCGCTTGACCGGATCTTTGAAGGCAGCATCGATAACATCTT
TGGTGGGCACGATCTTCCATTTTGGTATAATCTCTTCCACTCTCGTTAGTAGATTAATCA
CCACTCGATGTGGTTTTGC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4EB53TF 649 0 0
ATCTTTGAAGGCAGCATCGATAACATCTTTGGTGGGCACGATCCTCCATTTTGGTATAAT
CTCTTCCACTCTCGTTAGTAGATTAATCACCACTCGATGTGGTTTTGCCTTCTCTGATAT
CTTACACATAGGAGCAACGAGAAGGGCAGCATTCCAGAAAGAAGGATCTTTCTTGTGAAG
CAACAAAGCAACTGCACCTCCCATGGATTCTCCATACAAGAATCTGCCTTTTTCTTTGTA
TTCTGCTAGCGCAGAGATCGAAGTGTAATAGTCGTAGCAGTCGTTTACTATGTTACTAAA
CTTCTTGATGTAACAACGAGCTCCTTTGGACCGACCATGACCTTCGTAATCCATTCCAAA
TACCGCATATCCTGCTGAAGCCAGACGTATCCCGCATTCTCTCATGAAGCCACTGCACTC
CATCCCATAGCCATGGCAGAGGAAGATGAGAGCTTTGGGAGGAGAAGAAGATGGAACCCA
TCTGCAAGCGAACAACTCAACGTCTCTCGAGTTTCTTATATATTCCTCATGGTAATCAAA
CTTTAACTTCATCGCCATGCTCGTTCGTTGGTGTATGCTATATGCTTTCACATATTATCT
CGATTTACTGTCGCCAGGTAAGAGAATGGAGAAAACTAGCTAACTGCCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL3816Contig1 1367 2 4 U
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TTTCACGTATGCAAATCTGTGGACTCTGCATTTTTGATAGTTTGCAATTGGATAATGTGT
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AGTCAAGCTCATTTGACAAGGCTCTAGAAAGTGTAGATGAAGCTCTCGTGAGACTGGAAA
GCTTGCTACAGCAGTTGCATGCATCAAGCTCATCCTCTGGAAAGGAACAAATAAAAACTG
CTTGCTCTGACCTGGAGAAAATAAGGAAGCTGAAGAAAGAGGCTGAATTTTTAGAGGCAT
CTTTCAGAGCCAAAGCAGCTTCCCTGCAAGAGGGAGATGGTGACAGTGACTCTCAGGTGT
CTTTTGAGGAGCAAAAACAGAATCTAAAAGGAAAAGACACAAAGAATTCAGTTAGCTCTG
TAGATCAAGGCACAAGTAGGAGTCGTGGATTCTGGGGTTTCTTTGAGCGCCCACCAAAGA
AGAAGCCTGCCCCCAAGGTTGATGAATATATTGAGAAATCCAGAGAAAACGTAGATAGCG
TGGATTCCGAATCCAATGAGATATATCGGTTCGAACTTCTAAGGAATGAACTGATAGAGC
TGGAGAAGCGGGTCCAAGGAAGTACAGATGAGTCGGTGAATGAAGAGGGAAGAAGCTCTG
GGGATCCTACTCCTAAATCAAGCAGTAGCATGAAAGGTGTGGAGTTGGTTCAGAGCTCAA
AGAAAGAAAGCGTCATTGAGAAAACACTCGACCAGATCAAAGAAACAAGCACAGACGTGT
GGCAAGGTACCCAGCTTCTTGCATTCGATTCAGCTGCTGCTATGGAGCTGCTTCGGAGGT
CTGTAATAGGAGATGGGTTAACAGAGAAAGAAAAGAAAGCTCTGCGCAGAACCATGACCG
ACTTAGCATCAGTTGTTCCCATTGGTGTTCTTATGCTTCTTCCTGTCACAGCAGTTGGTC
ATGCGGCCATGCTGGCTGCAATTCAAAGATATGTACCAGGCTTGATACCTTCGACCTACG
GAACAGAAAGGTTGAACCTATTAAGACAGCTCGAGAAAGTCAAGCAAATGCAAAATGAAA
CAGAGCCTGAGGAAGGCAAGGATGAAACAGAATCATGAATATATAGATTCAAGATGCAAA
AATCAGTTTACAAACATCACCTTGTTCTATATAATTCATTGACAAGAGGGTGTGCATAGA
GAATCTCGTTCCATATGTCGGGTACACCAGTGGCTGCAGTCTTGAGGAGAGCATCAACAG
GAGTACCACTTGAGTACCATCTCTCCTATACTCTTGTCAGATTATGT


BQ
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AF RR4GZ07TF U 1
AF RR4AE40TF U 528
BS 1 678 RR4GZ07TF
BS 679 679 RR4AE40TF
BS 680 710 RR4GZ07TF
BS 711 1367 RR4AE40TF

RD RR4GZ07TF 711 0 0
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TTTCACGTATGCAAATCTGTGGACTCTGCATTTTTGATAGTTTGCAATTGGATAATGTGT
GATGCAGTTTGGCAATAACAGAAGCAGGGTTTATTGACATGAATGCATTATCAACTGAAG
AGTCAAGCTCATTTGACAAGGCTCTAGAAAGTGTAGATGAAGCTCTCGTGAGACTGGAAA
GCTTGCTACAGCAGTTGCATGCATCAAGCTCATCCTCTGGAAAGGAACAAATAAAAACTG
CTTGCTCTGACCTGGAGAAAATAAGGAAGCTGAAGAAAGAGGCTGAATTTTTAGAGGCAT
CTTTCAGAGCCAAAGCAGCTTCCCTGCAAGAGGGAGATGGTGACAGTGACTCTCAGGTGT
CTTTTGAGGAGCAAAAACAGAATCTAAAAGGAAAAGACACAAAGAATTCAGTTAGCTCTG
TAGATCAAGGCACAAGTAGGAGTCGTGGATTCTGGGGTTTCTTTGAGCGCCCACCAAAGA
AGAAGCCTGCCCCCAAGGTTGATGAATATATTGAGAAATCCAGAGAAAACGTAGATAGCG
TGGATTCCGAATCCAATGAGATATATCGGTTCGAACTTCTAAGGAATGAACTGATAGAGC
TGGAGAAGCGGGTCCAAG*AAGTACAGATGAGTCGGTGAATGAAGAGGGA
G

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4AE40TF 840 0 0
G
GCCCACCAAAGAAGAAGCCTGCCCCCAAGGTTGATGAATATATTGAGAAATCCAGAGAAA
ACGTAGATAGCGTGGATTCCGAATCCAATGAGATATATCGGTTCGAACTTCTAAGTAATG
AACTGATAGAGCTGGAGAAGCGGGTCCAAGGAAGTACAGATGAGTCGGTGAATGAAGAGG
GAAGAAGCTCTGGGGATCCTACTCCTAAATCAAGCAGTAGCATGAAAGGTGTGGAGTTGG
TTCAGAGCTCAAAGAAAGAAAGCGTCATTGAGAAAACACTCGACCAGATCAAAGAAACAA
GCACAGACGTGTGGCAAGGTACCCAGCTTCTTGCATTCGATTCAGCTGCTGCTATGGAGC
TGCTTCGGAGGTCTGTAATAGGAGATGGGTTAACAGAGAAAGAAAAGAAAGCTCTGCGCA
GAACCATGACCGACTTAGCATCAGTTGTTCCCATTGGTGTTCTTATGCTTCTTCCTGTCA
CAGCAGTTGGTCATGCGGCCATGCTGGCTGCAATTCAAAGATATGTACCAGGCTTGATAC
CTTCGACCTACGGAACAGAAAGGTTGAACCTATTAAGACAGCTCGAGAAAGTCAAGCAAA
TGCAAAATGAAACAGAGCCTGAGGAAGGCAAGGATGAAACAGAATCATGAATATATAGAT
TCAAGATGCAAAAATCAGTTTACAAACATCACCTTGTTCTATATAATTCATTGACAAGAG
GGTGTGCATAGAGAATCTCGTTCCATATGTCGGGTACACCAGTGGCTGCAGTCTTGAGGA
GAGCATCAACAGGAGTACCACTTGAGTACCATCTCTCCTATACTCTTGTCAGATTATGT

QA 2 840 2 840
DS 



AS 1 2

CO CL3817Contig1 1086 2 6 U
GGGATTCAAAGCAAAAAGAAAAAGAAAACGAGAGAAAAAAATGGCTGCCATATCAGAGAA
AGACGCTGCGGCTTATCTGGACGCAAGGCCGAGGTATCCCATCGATTGGTACAAGAAGAT
AGCTGCACGGACACAAGACCACAAATTTGCTTGGGATGTCGGAACCGGTAACGGTCAGGC
TGCTATTGGGCTTGTTGAACATTACGAGAACGTGGTGGCTACCGATATAAACGAGGCACA
GCTTAAACGAGCATTCAAACACCCAAGAATCAACTACCATCACACTCCAAAAAACATGTC
AGAAGACGAAATGGTCGCTTTAATCGGTGGAGAAAACTCTATGGATCTCATAGTTGCTGC
ACAAGCTGTCCATTTCTTCGACTTAACCACGTTTTACAATGTTGCAAAACGTGTACTTCG
TAAGGATGGTGGCCTAATCGCCATTTGGGTCTACAACGATATCATTATCTCGTCCGAGAT
AGATCCCATTATGAAGAGCCTTGTGGACTCTACTCTTCCTTTTAGAACTCCTATTATGAA
TTCGGCTTTCGATAGTTATAAAACGCTGCCGTTTCCTTTCGAGGGCATAGGGATGGGATC
TGAGGGAAAGCCTGTTACGCTTGACATTCCGCATAAGCTTTCACTTAAAGGGTTTATAGG
ATTCTTGAAATCTTGGCAGCCTGCTATGAAGGCCAAGGAACAAAGAGTGGAGCTTGTTGA
TGAAGATCTTATAACCAAGTTTGAGGAAGCTTGGGGTGATGAAAACCAAGTCAAAGATGT
TCACTACAAGGCTCATATGATTGTTGGGAAAATTCCGGAAATGAGAAGTGAAACTGATAA
AGTGTCTGGAGACAGTAACAAAGATAACTTGCTGCAAACGGATGTTGGGAGAAAGCAAGA
AAGGCGACAACCATCAGATGAAGAAAATAGACAAAGTAAGAAACAAAACACAAGTGAAGA
TGAGGCATGCTAGAGAATAATGTGCTAGCGATATAAGTTATTAAACTTTGTATTAACGAA
AGGATGATCACCGCGTCAGTATTTTGCCAATTCAATAAGGGTTTTAAATAAATTATGTTG
TACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4H836TF U 1
AF RR4DQ66JQ C 514
BS 1 564 RR4H836TF
BS 565 565 RR4DQ66JQ
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BS 693 721 RR4H836TF
BS 722 1086 RR4DQ66JQ

RD RR4H836TF 721 0 0
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AGACGCTGCGGCTTATCTGGACGCAAGGCCGAGGTATCCCATCGATTGGTACAAGAAGAT
AGCTGCACGGACACAAGACCACAAATTTGCTTGGGATGTCGGAACCGGTAACGGTCAGGC
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GCTTAAACGAGCATTCAAACACCCAAGAATCAACTACCATCACACTCCAAAAAACATGTC
AGAAGACGAAATGGTCGCTTTAATCGGTGGAGAAAACTCTATGGATCTCATAGTTGCTGC
ACAAGCTGTCCATTTCTTCGACTTAACCACGTTTTACAATGTTGCAAAACGTGTACTTCG
TAAGGATGGTGGCCTAATCGCCATTTGGGTCTACAACGATATCATTATCTCGTCCGAGAT
AGATCCCATTATGAAGAGCCTTGTGGACTCTACTCTTCCTTTTAGAACTCCTATTATGAA
TTCGGCTTTCGATAGTTATAAAACTCTGCCGTTTCCTTTCGAGGGCATAGGGATGGGATC
TGAGGGAAAGCCTGTTACGCTTGACATTCCGCATAAGCTTTCACTTAAAGGGTTTATAGG
ATTCTTGAAATCTTGGCAGCCTGCTATGAAG*CCAAGGAACAAAGAGTGGAGCTTGTTGA
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4DQ66JQ 573 0 0
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TCCTTTCGAGGGCATAGGGATGGGATCTGAGGGAAAGCCTGTTACGCTTGACATTCCGCA
TAAGCTTTCACTTAAAGGGTTTATAGGATTCTTGAAATCTTGGCAGCCTGCTATGAAGGC
CAAGGAACAAGGAGTGGAGCTTGTTGATGAAGATCTTATAACCAAGTTTGAGGAAGCTTG
GGGTGATGAAAACCAAGTCAAAGATGTTCACTACAAGGCTCATATGATTGTTGGGAAAAT
TCCGGAAATGAGAAGTGAAACTGATAAAGTGTCTGGAGACAGTAACAAAGATAACTTGCT
GCAAACGGATGTTGGGAGAAAGCAAGAAAGGCGACAACCATCAGATGAAGAAAATAGACA
AAGTAAGAAACAAAACACAAGTGAAGATGAGGCATGCTAGAGAATAATGTGCTAGCGATA
TAAGTTATTAAACTTTGTATTAACGAAAGGATGATCACCGCGTCAGTATTTTGCCAATTC
AATAAGGGTTTTAAATAAATTATGTTGTACACC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL3818Contig1 903 2 12 U
GGTGTCGAAAACTTCACATTACAGATCCCATTGATGCAACAAGAAAACACGATAATGTTG
TTGATACAGAAATTACAAGTTTCTTTACTTCCGCCGGATAACACTCGCAGTACATTCTTA
ATGTCCAGACAACAACACAAAGAAAAAGGAAGTTACAAGTTTTATGATGGAAACGAGACC
AGTTACGCCTCTGCTCTGCTTCTGTCAGAACAAGAAGATGATCAAACTGAACATTGTGAG
TTTGTAGGTTTTGTTGCTTATCTTTCACCTCTCTTTTTTTTTGATTAAGCACATCCAAAG
AACTGCTCTATTGACTGCGAGGTGAACACGTTGGGAGCCGTTCGCTCTGGTTTCAATGCA
GACACGTGAAGCTGGTATTTGATGAACCGAGCTAGTTGTGTGCTGATCTCTGGGTTTGTA
TCAATATGCCAGTCAGGTTCTATTTGTCTAACAAAGGATGTTCTTCCGATCTCTGTACTA
CAGAACAGGACCTTATCTTTGACCAAACCACCAGAGGTGAAAACACCTGCAGTCTCTAAA
GCCTGTAGAACTCTGGCTTCACTTTCGTCGTCAAGAACTCTTTCCATGAGATATAAATCA
GAATACTTTGTAATCTCTAGGAGAACTTCCAGAACCGATGACCTCACTGTTGCTTGTTTT
TGGAGTTCTTCTGGACTTGATTCCTCAAGAATGACTCCAAGAAGACGGCATGTTACCTTC
CTTCCTTCACTAAGCTTCGCCTAACAATCTGCCCCAGTGTAGGTTTGACAGGCTGGAAGA
AGTGATCAACAACATCTTGCACTCCGTTATCCTCATGAGGCAAAGAAACATCTGACTGAG
CAGCAGCAGCAGCAGCACTAGAGGAGGAGGATTCAGCTGACTGCTGCACCCTGCGTTTTG
GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4CR77JQ U 1
AF RR4BA54TF C 101
BS 1 281 RR4CR77JQ
BS 282 282 RR4BA54TF
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BS 700 703 RR4CR77JQ
BS 704 903 RR4BA54TF

RD RR4CR77JQ 703 0 0
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AGTTACGCCTCTGCTCTGCTTCTGTCAGAACAAGAAGATGATCAAACTGAACATTGTGAG
TTTGTAGGTTTTGTTGCTTATCTTTCACCTCTCTTTTTTTT*GATTAAGCACATCCAAAG
AACTGCTCTATTGGCTGCGAGGTGAACACGTTGGGAGCCGTTCGCTCTGGTTTCAATGCA
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TCAATA*GCCAGTCAGGTTCTATTTGTCTAACAAAGGATGTTCTTCCGATCTCTGTACTA
CAGAACAGGACCTTATCTTTGACCAAACCACCAGAGGTGAAAACACCTGCAGTCTCTAAA
GCCTGTAGAACTCTGGCTTCACTTTCGTCGTCAAGAACTCTTTCCATGAGATATAAATCA
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TGGAGTTCTTCTGGACTTGATTCCTCAAGAATGACTCCCAGAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4BA54TF 803 0 0
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TTTATGATGGAAACGAGACCAGTTACGCCTCTGCTCTGCTTCTGTCAGAACAAGAAGATG
ATCAAACTGAACATTGTGAGTTTGTAGGTTTTGTTGCTTATCTTTCACCTCTCTTTTTTT
TTGATTAAGCACATCCAAAGAACTGCTCTATTGACTGCGAGGTGAACACGTTGGGAGCCG
TTCGCTCTGGTTTCAATGCAGACACGTGAAGCTGGTATTTGATGAACCGAGCTAGTTGTG
TGCTGATCTCTGGGTTTGTATCAATATGCCAGTCAGGTTCTATTTGTCTAACAAAGGATG
TTCTTCCGATCTCTGTACTACAGAACAGGACCTTATCTTTGACCAAACCACCAGAGGTGA
AAACACCTGCAGTCTCTAAAGCCTGTAGAACTCTGGCTTCACTTTCGTCGTCAAGAACTC
TTTCCATGAGATATAAATCAGAATACTTTGTAATCTCTAGGAGAACTTCCAGAACCGATG
ACCTCACTGTTGCTTGTTTTTGGAGTTCTTCTGGACTTGATTCCTCAAGAATGACTCCAA
GAAGACGGCATGTTACCTTCCTTCCTTCACTAAGCTTCGCCTAACAATCTGCCCCAGTGT
AGGTTTGACAGGCTGGAAGAAGTGATCAACAACATCTTGCACTCCGTTATCCTCATGAGG
CAAAGAAACATCTGACTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCACTAGAGGAGGAGGATTCAGCTGA
CTGCTGCACCCTGCGTTTTGGCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL3819Contig1 978 2 4 U
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TACTCTCCCTCCCTCCATTTCAATTCAAAAATTCATCAACAGAAGTAGTAGTGTCTTCTT
GTTCCTTGTTCGTGTTTTTCCCATCAGCCTCAAACGTTTTCCAGATACTCCTCTTCAATA
GTGTCTTTGAGGATGAAAAGCCGCTGAATAACGATAGGTTGGCTCATCTGTTTAGCTTCT
CTAATGTCAGTCTCTTCTTTGTTGAGATGGTAAGCATCAAGCATTATCTTTATCCACTTA
TGCAGCTCCTTTGGCGTCGTGTATAATGCCTTAGGGTCCTTAGCTTCATGGTCATCCCCA
GGAGAGAACGCTGTTGCTAGAGCAGAAAAACGTTCTTCCGGGTCTGTTATATTGAGCAAG
TACTTTAATAATTTGATCTCTTTCGGCGTTATGCTTCTAAGACTACTCTTTGTTGCTTTG
TATAACTGATACATTATGTCTTTGGCCTCGTTTGTAACCGTTTGAGACTCTTTAGCAGCA
GCGTAAGCAGAGTTTATTAATAAGATCAATGAGGAATCTAGCTCCTTGGCCTTAGCAAGG
CTCCTGATCTTTTCACAGGCAGCATCGACAGAAGAAGAGTTCAAGATATCATCAAACTTG
GCTTGAGCATTATCTAAAGTCTCAACGTTCTCCAGTGTATTGTCGTAAGCACTCACTGCA
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TCTGATAACAAAGCAACATAGCGGAAAAACTCTCCGGTGAAGTCTCTGCGTCTCTTGGCA
GCGATTGCGTTTATGTCAGTTGGGCTCTCTTGAATCTCCTTCAAAAGATCATTGTGCTTC
TCCATTTCCTCATCTATCTTCTTGACTTTCCTCTCCAGAGAAACAAGTTTCTGCTTCAGT
AAAGAATCGGTTTCAGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H444JQB U 1
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TACTCTCCCTCCCTCCATTTCAATTCAAAAATTCATCAACAGAAGTAGTAGTGTCTTCTT
GTTCCTTGTTCGTGTTTTTCCCATCAGCCTCAAACGTTTTCCAGATACTCCTCTTCAATA
GTGTCTTTGAGGATGAAAAGCCGCTGAATAACGATAGGTTGGCTCATCTGTTTAGCTTCT
CTAATGTCAGTCTCTTCTTTGTTGAGATGGTAAGCATCAAGCATTATCTTTATCCACTTA
TGCAGCTCCTTTGGCGTCGTGTATAATGCCTTAGGGTCCTTAGCTTCATGGTCATCCCCA
GGAGAGAACGCTGTTGCTAGTGCAGAAAAACGTTCTTCCGGGTCTGTTATATTGAGCAAG
TACTTTAATAATTTGATCTCTTTCGGCGTTATGCTTCTAAGACTACTCTTTGTTGCTTTG
TATAACTGATACATTATGTCTTT

QA 1 503 1 503
DS 

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CTGCTCTTTGTTGCTTTGTATAACTGATACATTATGTCTTTGGCCTCGTTTGTAACCGTT
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AAGATATCATCAAACTTGGCTTGAGCATTATCTAAAGTCTCAACGTTCTCCAGTGTATTG
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TCTAAGCCATCAAGAGTTTCTGATAACAAAGCAACATAGCGGAAAAACTCTCCGGTGAAG
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ACAAGTTTCTGCTTCAGTAAAGAATCGGTTTCAGAA

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 3

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TCGGTTCGTGCTCATCTCTTCCTTGGTTCCCGGCTCTTGAAGACCTCTACTTTTGTCTTG
TCTTATGGATCCTTCTCAGGTATTACCTTCTCTGACTTCTCCTTGATTAGCGGATCCTTA
GCTGCGATTCGTTCTGTCTTTGGATTATATGGCATGTCTGTTCGTATTTCATGGAATCGC
TGGTGGTGCTGTTCTGATTTGCCTTCGTGGGCAACGGGTATTGGCTCAAGGCGTGACCCT
CGGGTTTCAGTTGTGTATTCCCGCCTCTTCTTTTATTATTCAGTCTCCACCCCGTCAGGT
TAGGAGTCTTGCTCTTCAAATGGTGGTCTCGTGTATCCGGTATCCTGTCGCTCCATCTAT
CTTTGATGGCCTCGTTCGTAGAAGAGGTTGTAAGTGATGAGGCTCTGTGCCTTTAGTTTG
GATCCGGTTCAAGCAAGTGGTTTTTGTCATCTCCAGGAGGCTTTGTGTTCTTGATGTGGT
TTCAGTCAAGCCGCAGGTTGGATTTGGGTTGGATGGGTCAGCTTCCCTTTGTTCTTGTGC
TTTTGTTCTTGATGCTTACGTCCGGTCTCGTTTGGCTTATTCAGATATTGCCTCTAAGGC
TCTTGGCGCCTCTAGTGGTTATGCTGATGCAGCGTTGTAGAAGTGTGATTCTGGTGAAGG
ATTTGTGTTGTGTTGTTTAATGTTTCCGAAAGTGTCGACTTATGGCTCCGGTTTCTATCC
GGCGTAGTCTTTTCTTAAGGCTCTTCCTAGTCTTAGTTTTTTGATCAATCTATCCTAGTA
TAGGATGTGATGATTGTGTATTAAACTCTTGATCCTTCGGTTTTAATTTTTAAT


BQ
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AF RR4H160TF U 23
AF RR4GQ91TF U 1
AF RR4H160JQ C 582
BS 1 658 RR4GQ91TF
BS 659 659 RR4H160JQ
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BS 701 724 RR4GQ91TF
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GG
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QA 3 113 3 113
DS 

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GGTGATCTTTGGTTCTCCTTCTTCGGCGTCCGGCGAATCTCGTCGGCGTCGGGAGAGGGC
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TTCTTCCATCAGATCGGGTCTCGTCTTTGTCATTTGAGTCGTCTGTGGTCTGCGATTTAG
TCGGTTCGTGCTCATCTCTTCCTTGGTTCCCGGCTCTTGAAGACCTCTACTTTTGTCTTG
TCTTATGGATCCTTCTCAGGTATTACCTTCTCTGACTTCTCCTTGATTAGCGGATCCTTA
GCTGCGATTCGTTCTGTCTTTGGATTATATGGCATGTCTGTTCGTATTTCATGGAATCGC
TGGTGGTGCTGTTCTGATTTGCCTTCGTGGGCAACGGGTATTGGCTCAAGGCGTGACCCT
CGGGTTTCAGTTGTGTATTCCCGCCTCTTCTTTTATTATTCAGTCTCCACCCCGTCAG*T
TAGGAGTCTTGCTCTTCAAATGGTGGTCTCGTGTATCCG*TATCCTGTCGCTCCATCTAT
CTTT

QA 1 724 1 724
DS 

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TGGCTCAAGGCGTGACCCTCGGGTTTCAGTTGTGTATTCCCGCCTCTTCTTTTATTATTC
AGTCTCCACTCCGTCAGGTTAGGAGTCTTGCTCTTCAAATGGTGGTCTCGTGTATCCGGT
ATCCTGTCGCTCCATCTATCTTTGATGGCCTCGTTCGTAGAAGAGGTTGTAAGTGATGAG
GCTCTGTGCCTTTAGTTTGGATCCGGTTCAAGCAAGTGGTTTTTGTCATCTCCAGGAGGC
TTTGTGTTCTTGATGTGGTTTCAGTCAAGCCGCAGGTTGGATTTGGGTTGGATGGGTCAG
CTTCCCTTTGTTCTTGTGCTTTTGTTCTTGATGCTTACGTCCGGTCTCGTTTGGCTTATT
CAGATATTGCCTCTAAGGCTCTTGGCGCCTCTAGTGGTTATGCTGATGCAGCGTTGTAGA
AGTGTGATTCTGGTGAAGGATTTGTGTTGTGTTGTTTAATGTTTCCGAAAGTGTCGACTT
ATGGCTCCGGTTTCTATCCGGCGTAGTCTTTTCTTAAGGCTCTTCCTAGTCTTAGTTTTT
TGATCAATCTATCCTAGTATAGGATGTGATGATTGTGTATTAAACTCTTGATCCTTCGGT
TTTAATTTTTAAT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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CTCCTTTTTATGAAGAATTACAGAATTTTTGTGGTGCTAACTCTGCTAATAATTCTCAAT
GGGCAGAGCAGTTTGGTGGCACGAGCTAGTGCTGACAGAAAGGTTCATATAGTGTATTTG
GGTGAGAAGCAGCATGATGATCCTGATTTTGTCACGGAATCTCATCATCAGATGTTGTGG
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GAGGTTGTTCATGTCACACCTAATAGTGTCTACGAACTGGCAACAACTCGGACGTGGGAC
TACTTAGGACTTTCAGTCGCCACTCCGAAAAATCTTCTAAATGACAGTAATATGGGTGAA
GAAGTTATCATTGGCGTTGTGGACACAGGAGTATGGCCAGAGTCTGAAGTCTTTAACGAC
AATGGGATTGGACCGGTGCCAAAACACTGGAAAGGAGGCTGTGAATCAGGAGAGGAATTC
AACTCCTCTAACTGCAACAAAAAGCTCATAGGAGCCAAATATTTCATCAATGGGTTTCTT
GCGGAGAACGAAAGCTTCAACGAGACAGAATCGCTAGACTTTATTTCCCCTAGAGACTAT
GATGGTCATGGCACGCATGTTTCAACTATAGCAGGCGGTTCTTTCTTGCCTGGCATAAGC
TACAAGGGCCTAGCCGGAGGGACTGTGAGAGGCGGGGCTCCTCGTGCTCGTATAGCAATG
TACAAGGTTTGTTGGGACGATTCTGGTTGTTATTCAGCTGACATCTTGAAAGCTATGGAT
GAAGCTATACATGATGGTGTTGATGTTTTGTCCATTTCTCTTGGCTCTCAAGTCCCTTAC
TACTCGGAAACTGATGTTTGAGATGAGATGGCTACATGGGCGTTCCATGCCGTTTTAAAG
GGTATCACAGTTGTTTGTTCAGGTGGTAACTCTGGCCCAGCTGCTCAGACTGTGGGAAAC
GCGGCTCCTTGGATCTTGACAGTGGCTGCAACTACTTTAGACCGGTCCTTCCCCACACCT
CTTACACTTGGGAACAATAAAGTCATATTGGGTCAAGCAATGTACACAGGTCCAGAAGTT
GGTTTCACTAGCTTGGTTTACCCAGATGATTCAGTGGACAGCAACCAAACTTTTTCTGAT
CAAGTGGAGGGAAAAGTTGTGTTGTCCTTTACAACATCAAAACGTTCAGGCGCTGTATTA
AACGATGCAAGTACTGTGAAAAGGGCTGGTGGGTGTTGGGTGTAATTGTCGCAAAAACCC
AGGAGACACTCTCTCACCATGTGTAGATGATTTCCCTTGTGTTGCTGTTGACTACGAGCT
GGGGACAAATATACTCTCTACATACGTTCTAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F319TF U 1
AF RR4B856TF U 677
BS 1 754 RR4F319TF
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BS 756 767 RR4F319TF
BS 768 1473 RR4B856TF

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GAGGTTGTTCATGTCACACCTAATAGTGTCTACGAACTGGCAACAACTCGGACGTGGGAC
TACTTAGGACTTTCAGTCGCCACTCCGAAAAATCTTCTAAATGACAGTAATATGGGTGAA
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AATGGGATTGGACCGGTGCCAAAACACTGGAAAGGAGGCTGTGAATCAGGAGAGGAATTC
AACTCCTCTAACTGCAACAAAAAGCTCATAGGAGCCAAATATTTCATCAATGGGTTTCTT
GCGGAGAACGAAAGCTTCAACGAGACAGAATCGCTAGACTTTATTTCCCCTAGAGACTAT
GATGGTCATGGCACGCATGTTTCAACTATAGCAG*CGGTTCTTTCTT

QA 1 767 1 767
DS 

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AGGGG
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TCAACTATAGCAGGCGGTTCTTTCTTGCCTGGCATAAGCTACAAGGGCCTAGCCGGAGGG
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TCTGGTTGTTATTCAGCTGACATCTTGAAAGCTATGGATGAAGCTATACATGATGGTGTT
GATGTTTTGTCCATTTCTCTTGGCTCTCAAGTCCCTTACTACTCGGAAACTGATGTTTGA
GATGAGATGGCTACATGGGCGTTCCATGCCGTTTTAAAGGGTATCACAGTTGTTTGTTCA
GGTGGTAACTCTGGCCCAGCTGCTCAGACTGTGGGAAACGCGGCTCCTTGGATCTTGACA
GTGGCTGCAACTACTTTAGACCGGTCCTTCCCCACACCTCTTACACTTGGGAACAATAAA
GTCATATTGGGTCAAGCAATGTACACAGGTCCAGAAGTTGGTTTCACTAGCTTGGTTTAC
CCAGATGATTCAGTGGACAGCAACCAAACTTTTTCTGATCAAGTGGAGGGAAAAGTTGTG
TTGTCCTTTACAACATCAAAACGTTCAGGCGCTGTATTAAACGATGCAAGTACTGTGAAA
AGGGCTGGTGGGTGTTGGGTGTAATTGTCGCAAAAACCCAGGAGACACTCTCTCACCATG
TGTAGATGATTTCCCTTGTGTTGCTGTTGACTACGAGCTGGGGACAAATATACTCTCTAC
ATACGTTCTAGT

QA 6 797 6 797
DS 



AS 1 3

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GAACCTACGAATCACACTGTCCATCATTGATAACTCAGTTTGCTCTGAGATATGCAAAGA
CTATGGCCAGTAGAATCACAAGCATTACAATATAGACATTGGCAGATTGTCCTTTGTCAT
TAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT74TF C 1
AF RR4EB01JQ U 47
AF RR4GT74JQ U 19
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GTATATGATTATTCGAACTACATAGGTAGAAACCAAGCCAAGTTTAAAACTTTCTTGTTC
TGGAAACAATCTTGAATAGGACTTCAGTTCTAAGAAAAAGAGAGTGGCGTGAATAAGAAT
GAACCTACGAATCACACTGTCCATCATTGATAACTCAGTTTGCTCTGAGATATGCAAAGA
CTATG

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DS 

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GCGTGAATAAAAATGAACCTACGAATCACACTGTCCATCATTGATAACTCAGTTTGCTCT
GAAATATGCAAAGACTATGGCCAGTAGAATCACAAGCATTACAATA

QA 1 226 1 226
DS 

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TACATAGGTAGAAACCAAGCCAAGTTTAAAACTTTCTTGTTCTGGAAACAATCTTGAATA
GGACTTCAGTTCTAAGAAAAAGAGAGTGGCGTGAATAAAAATGAACCTACGAATCACACT
GTCCATCATTGATAACTCAGTTTGCTCTGAGATATGCAAAGACTATGGCCAGTAGAATCA
CAAGCATTACAATATAGACATTGGCAGATTGTCCTTTGTCATTAATCC

QA 1 288 1 288
DS 



AS 1 3

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CCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATGCTGATTTGA
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ATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGAGGG
CGGTTCTCGGGAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCG
TGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTATCTCACTCAAAGTATTGTCAGACTCG
GTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAATCCATTTATA
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TGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTCTGCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BE84TF U 1
AF RR4AU81JQ C 50
AF RR4AU81TF U 50
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RD RR4BE84TF 811 0 0
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GGGGGAGAAAGCATTGGTTTCTGTGCTCACATTCTAGGATCTTCTAAGCGAGGGCAACAG
ATCAGCGCCTTCGAGTGATGGCTACTGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTAGTTGGTGTGG
ACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATGGAGTGGACTCTCGATCGTTTCTTCGCTCCCT
ACGCTCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAACGCCGTCTCCG
CCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATGCTGATTTGA
AGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAATCACTCTGTCAGAGCAAGTCGGTTT
ATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATCCAAGGAATATCCTTTGCGAGGTTGTTG
ATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGAGGG
CGGTTCTCGGGAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCG
TGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTATCTCACTCAAAGTATTGTCAGACTCG
GTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAATCCATTTATA
TGTGTAATTGTGTTATACATTGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACTATAACTTCA
TGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTCT

QA 1 811 1 811
DS 

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GG
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TTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATGGAGTGGACTCTCGATCGTTTCT
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AGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCTA
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TCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAAT
CCATTTATATGTGTAATTGTGTTATACATTGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACT
ATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTCTGCAAAA

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR4AU81TF 764 0 0
GG
ATCTACGGGGGGGGAGAAAGCATTGGTTTCTGTGCTCACATTCTAGGATCTTCTAAGCGA
GGGCAACAGATCAGCGCCTTCGAGTGATGGCTACTGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTAG
TTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATGGAGTGGACTCTCGATCGTTTCT
TCGCTCCCTACGCTCCCAACTCCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAACG
CCGTCTCCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATG
CTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAATCACTCTGTCAGAGCA
AGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGGTCCAAGGAATATCCTTTGCG
AGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCTA
TCAAGAGGGCGGTTCTCGGGAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCATTGCTCGG
TGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTATCTCACTCAAAGTATTG
TCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAAT
CCATTTATATGTGTAATTGTGTTATACATTGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACT
ATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTCT
GC

QA 3 762 3 762
DS 



AS 1 2

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TTGGAGAGAGAAGAGAAGATACTTGTCTACGAGTTTGTGTCTAACAAAAGTCTGGACTAC
TTCTTGTTTGACTCTAGTAAGCAGAGCCAGCTGGATTGGACTACACGGTACAAGATCATA
GGAGGAATAGCTAGAGGAATTCTATATCTTCATCAAGATTCACGACTCACAATCATACAT
CGTGACCTCAAAGCGGGCAACATCCTATTGGATGCTGATATGGACCCAAAAGTTGCAGAT
TTTGGAATGGCTAGAATTTTTGAAATAGACCAAACCGAAGCCAATACTAGAAGAGTTGTT
GGAACCTATGGCTACATGTCTCCTGAGTATGCGATGTATGGCCAATTTCTCAATGAAATC
AGATGTATATAGCTTCGGAGTTTTAGTCCTTGAGATTATAAGTGGAAGGAAGAACAGCAG
CCTTTATCAGATGGATGGTAGTGTTTGCAACTTGGTTACACATACCTGGAGGCTATGGAG
CAAGGGGTCTCCATTAGAGCTTGTGGATGTTTCTTTTTGGAGATAACTATCAAAGAAACG
AAATAAGTAGATGCATTCATATTGCCTTATTATGTGTCCAAGAAGATACTGGGAGATCGT
CCAACCATGTCGGCTATCGTCCAAATGCTTACTACTAGCTCTATCTCCCTTGCAGTGCCT
AGACCACCTGGACTTTTCTTTAAGAGTAATCAGGAGCATACAGGTCCATCAATGGATAAG
TCTGTTCTCTGTTCCATTGATAATGCACCGATTACTTCTGTAACTGCTCGTTGAAGACTA
GCTCGTTTCTTTTTTGGTGCATAGACTAGCTCATTTCATAAACCAAAAATCATGCCAGTT
CCAAAATCTACTGCTTTGGGTTCAATTCAGAATATAGGTGTAGGTAATTTTCTTTGACGC
CACGTTTATGATTGATTATAAGCCATGAATCTTGATGAGGATAAAAAAAATCCTCGAGGA
ATGCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B002TF U 1
AF RR4B002JQ C 224
BS 1 731 RR4B002TF
BS 732 1028 RR4B002JQ

RD RR4B002TF 731 0 0
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TTGGAGAGAGAAGAGAAGATACTTGTCTACGAGTTTGTGTCTAACAAAAGTCTGGACTAC
TTCTTGTTTGACTCTAGTAAGCAGAGCCAGCTGGATTGGACTACACGGTACAAGATCATA
GGAGGAATAGCTAGAGGAATTCTATATCTTCATCAAGATTCACGACTCACAATCATACAT
CGTGACCTCAAAGCGGGCAACATCCTATTGGATGCTGATATGGACCCAAAAGTTGCAGAT
TTTGGAATGGCTAGAATTTTTGAAATAGACCAAACCGAAGCCAATACTAGAAGAGTTGTT
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AGATGTATATAGCTTCGGAGTTTTAGTCCTTGAGATTATAAGTGGAAGGAAGAACAGCAG
CCTTTATCAGATGGATGGTAGTGTTTGCAACTTGGTTACACATACCTGGAGGCTATGGAG
CAAGGGGTCTCCATTAGAGCTTGTGGATGTTTCTTTTTGGAGATAACTATCAAAGAAACG
AAATAAGTAGATGCATTCATATTGCCTTATTATGTGTCCAAGAAGATACTGGGAGATCGT
CCAACCATGTCGGCTATCGTCCAAATGCTTACTACTAGCTCTATCTCCCTTGCAGTGCCT
AGACCACCTGG

QA 1 731 1 731
DS 

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ACCCAAAAGTTGCAGATTTTGGAATGGCTAGAATTTTTGAAATAGACCAAACCGAAGCCA
ATACTAGAAGAGTTGTTGGAACCTATGGCTACATGTCTCCTGAGTATGCGATGTATGGCC
AATT*CTCAATGAAATCAGATGTATATAGCTTCGGAGTTTTAGTCCTTGAGATTATAAGT
GGAAGGAAGAACAGCAGCCTTTATCAGATGGATGGTAGTGTTTGCAACTTGGTTACACAT
ACCTGGAGGCTATGGAGCAAGGGGTCTCCATTAGAGCTTGTGGATGTTTCTTTT*GGAGA
TAACTATCAAAGAAACGAAATAAGTAGATGCATTCATATTGCCTTATTATGTGTCCAAGA
AGATACTGG*AGATCGTCCAACCATGTCGGCTATCGTCCAAATGCTTACTACTAGCTCTA
TCTCCCTTGCAGTGCCTAGACCACCTGGACTTTTCTTTAAGAGTAATCAGGAGCATACAG
GTCCATCAATGGATAAGTCTGTTCTCTGTTCCATTGATAATGCACCGATTACTTCTGTAA
CTGCTCGTTGAAGACTAGCTCGTTTCTTTTTTGGTGCATAGACTAGCTCATTTCATAAAC
CAAAAATCATGCCAGTTCCAAAATCTACTGCTTTGGGTTCAATTCAGAATATAGGTGTAG
GTAATTTTCTTTGACGCCACGTTTATGATTGATTATAAGCCATGAATCTTGATGAGGATA
AAAAAAATCCTCGAGGAATGCATCC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 3

CO CL3825Contig1 833 3 9 U
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GAATGTGTTGGAAACAAAATGTAAATGAAGTTTGCAAAAGCACTTGAACAAAGACTCGAA
AGAGCACACTAGTAACTAAACATAACATCATAGCAAAGACTTCACACAACAGCTACTCCG
CGAGAGAGACGTCATCTGCTCGGTCATACACGGACAAGTCCGATCATTCTTCTGCTGGAG
GCGAACGAGAGTGGCTCTCGCGTATCGGGCTTTCTGCACCATCATATCCTCTTCCAGCTT
CTTCTTCTTCCATTATCGGTCCAGGGCTTTCGACTTGACCATTCTCAGGGCTAGACTTCG
ACCTTGACCTCTCCCTCTCCCTCCTCTTCTCATACGGAGGAGGACTCCTGCTTTCACCAC
GTCCGTTTCTTGGACTACGGTCCCTCACAGCTCCGTTCTCTGGGCTAGCCTCCTTCTCCC
TCCTACGGTCATCTCTCTTGTAATCAGGGCTAGCCACCCTCTCCCTCCTGCGATCGTCCC
TCTTGTAGTCAGGGCTAACCCTGCCTCTCCTGTAAGGACTGGGGCTGCGCCTTCCTCTGC
CGTAATCAGGGCTAGTCCTTTCCTTCCTGTGTCCAACAGGACTAGCACCTCGGCCGTAGT
CAGGACTGCCTCTTTCTCTTCTGTAAGGACTAGGTGATCGCCTTCTCCTATCGGGAGACC
TATCACGACGTCTCTCGGGACTGTATCCGTTTCCTCTCGATCATCATCCTTCATTGCATA
CTCAACTGAGATCACCTTGTCCATCAGCTTACTCGAGTTAGTAGCTTCCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4DK50TF C 28
AF RR4DK50JQ U 36
AF RR4H977JQB U 1
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BS 138 190 RR4H977JQB
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TTTCTGCACCATCATATCCTCTTCCAGCTTCTTCTTCTTCCATTATCGGTCCAGGGCTTT
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GTCCAACAGGACTA
C

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AAGTCCGATCATTCTTCTGCTGGAGGCGAACGAAAGTGGCTCTCGCGTATCGGGCTTTCT
GCACCATCATATCCTCTTCCAGCTTCTTCTTCTTCCATTATCGGTCCAGGGCTTTCGACT
TGACCATTCTCAGGGCTAGACTTCGACCTTGACCTCTCCCTCTCCCTCCTCTTCTCATAC
GGAGGAGGACTCCTGCTTTCACCACGTCCGTTTCTTGGACTACGGTCCCTCACAGCTCCG
TTCTCTGGGCTAGCCTCCTTCTCCCTCCTACGGTCATCTCTCTTGTAATCAGGGCTAGCC
ACCCTCTCCCTCCTGCGATCGTCCCTCTTGTAGTCAGGGCTAACCCTGCCTCTCCTGTAA
GGACTGGGGCTGCGCCTTCCTCTGCCGTAATCAGGGCTAGTCC

QA 1 583 1 583
DS 

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CGAGAGAGACATCATCTGCTCGGTCATACACGGACAAGTCCGATCATTCTTCTGCTGGAG
GCGAACGAGAGTGGCTCTCGCGTATCGGGCTTTCTGCACCATCATATCCTCTCCCAGCTT
CTTCTTCTTCCATTATCGGTCCAGGGCTTTCGACTTGACCATTCTCAGGGCTAGACTTCG
ACCTTGACCTCTCCCTCTCCCTCCTCTTCTCATACGGAGGAGGACTCCTGCTTTCACCAC
GTCCGTTTCTTGGACTACGGTCCCTCACAGCTCCGTTCTCTGGGATAGCCTCCTTCTCCC
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TCTTGTAGTCAGGGCTAACCCTGCCTCTCCTGTAAGGACTGGGGCTGCGCCTTCCTCTGC
CGTAATCAGGGCTAGTCCTTTCCTTCCTGTGTCCAACAGGACTAGCACCTCGGCCGTAGT
CAGGACTGCCTCTTTCTCTTCTGTAAGGACTAGGTGATCGCCTTCTCCTATCGGGAGACC
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CTCAACTGAGATCACCTTGTCCATCAGCTTACTCGAGTTAGTAGCTTCCATGC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 3

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AAAATTAAGTATCCAGGCTCCGTTTAGCAAAAATCCAATTGATAATTAATATATAATATT
TTTATAATTACTACTTAATATGGTATGAATATGATATCAAAATTATGATAAAAATTCTAT
TAAAAAATATAAAAAATACAAAAAATTGAAACAGGGTGATCTAAAACTGTTGATCAAATC
AAATAATATAATTAAAAATTTGTTGACTATTTGACAGAAGACATGTGAAAGAAATTAATT
GAAAAAAAAGAAGGAGTAGTAAAAAAAAAAAAAAGACACGGTATTTGGTTCATTTGTCCT
ATATGTGCAAATCAAAATCGGGCAAATTTTTCCTTTTACTCGGAGTAGAGCATAAACCTA
AAAAACGGAATAAAAAAAGGAAGAAGCCCATTCAGGAACAAGAAAAAAACATCCCCATTT
CAACTGAATCTGGATGAAAAAAAAATATCAATGAATCAAGGTAGTCTGACAGGCCTAATC
AATCGTTTTATTATTTTATTATTAGGATTATAATATCTAATAAATAAAAGGGGCCAAAAC
TTATTTATTTTTTCTTTTACTTTTAAAAGGGAAGCAAGCCCTTCCCTTATTAAGGGAGAA
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TGTTGAACCGTATGCATCAAAAGGTGCCTGTACGGCTCCTAAGGAATAAAATTTTATCCT
AATCAACCGACTTTATCGAGAAAGATTGTTTTTTTTAGGCCAAGAGGTTGATACCGAAAT
CTCGAATCAACTTATTATTCTTATGATATATCTCAGTATAGAAAAGGATACCAAAGATCT
TTATTTGTTTATAAACTCTCCTGGTGGATGGGTAATATCTGGAATGGCTATTTATGATAC
TATGCAATTTGTGCGACCCGACGTACAGACAATATGCATGGGATTGGCCGCTTCAATAGC
ATCCTTTATCCTAGTCGGAGGAGAAATTACCAAACGTATAGCATTCCCTCACGCTTGGCG
CCAATGAGTTTTTTATTTTCGATAAAAAATACTATGCCTTCGCCCTCGGAGATATGAATT
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TTAGATTATATATTGAAAGAGTAGTATGGGATAAGAAAGGGGTATTTAAAACGAAATCTT
CCCTATTCGGGCACATCTCAGCGTCACAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H023TF U 1
AF RR4H023JQ C 189
AF RR4EM11TF U 728
BS 1 624 RR4H023TF
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RD RR4H023TF 715 0 0
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AAAATTAAGTATCCAGGCTCCGTTTAGCAAAAATCCAATTGATAATTAATATATAATATT
TTTATAATTACTACTTAATATGGTATGAATATGATATCAAAATTATGATAAAAATTCTAT
TAAAAAATATAAAAAATACAAAAAATTGAAACAGGGTGATCTAAAACTGTTGATCAAATC
AAATAATATAATTAAAAATTTGTTGACTATTTGACAGAAGACATGTGAAAGAAATTAATT
GAAAAAAAAGAAGGAGTAGTAAAAAAAAAAAAAAGACACGGTATTTGGTTCATTTGTCCT
ATATGTGCAAATCAAAATCGGGCAAATTTTTCCTTTTACTCGGAGTAGAGCATAAACCTA
AAAAACGGAATAAAAAAAGGAAGAAGCCCATTCAGGAACAAGAAAAAAACATCCCCATTT
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AATCGTTTTATTATTTTATTATTAGGATTATAATATCTAATAAATAAAAGGG
CCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4H023JQ 608 0 0
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TACTACTTAATATGGTATGAATATGATATCAAAATTATGATAAAAATTCTATTAAAAAAT
ATAAAAAATACAAAAAATTGAAACAGGGTGATCTAAAACTGTTGATCAAATCAAATAATA
TAATTAAAAATTTGTTGACTATTTGACAGAAGACATGTGAAAGAAATTAATTGAAAAAAA
AGAAGGAGTAGTAAAAAAAAAAAAAAGACACGGTATTTGGTTCATTTGTCCTATATGTGC
AAATCAAAATCGGGCAAATTTTTCCTTTTACTCGGAGTAGAGCATAAACCTAAAAAACGG
AATAAAAAAAGGAAGAAGCCCATTCAGGAACAAGAAAAAAACATCCCCATTTCAACTGAA
TCTGGATGAAAAAAAAATATCAATGAATCAAGGTAGTCTGACAGGCCTAATCAATCGTTT
TATTATTTTATTATTAGGATTATAATATCTAATAAATAAAAGGGGCCAAAACTTATTTAT
TTTTTCTTTTACTTTTAAAAGGGAAGCAAGCCCTTCCCTTATTAAGGGAGAAAGAAAAGC
CTTCTC
GG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4EM11TF 684 0 0
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CAACTTATTATTCTTATGATATATCTCAGTATAGAAAAGGATACCAAAGATCTTTATTTG
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TTTGTGCGACCCGACGTACAGACAATATGCATGGGATTGGCCGCTTCAATAGCATCCTTT
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GTTTTTTATTTTCGATAAAAAATACTATGCCTTCGCCCTCGGAGATATGAATTAGTTAAG
TAATAATAGCATGGCACTTCGAATTCGATATGAAATTTTTTAGATTAAAAAAATTAGATT
ATATATTGAAAGAGTAGTATGGGATAAGAAAGGGGTATTTAAAACGAAATCTTCCCTATT
CGGGCACATCTCAGCGTCACAAAC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL3827Contig1 857 2 14 U
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ACCAAACTGGTATCCTCAAAACCACTGTCAACATTTTCAACCAAACACAAAAGTACAAAA
ACCAAAGAAAAACAGACATCAATAAGCTCAAAAAGCTTTACAAACTTACAAACAAGGAAA
AAAGATGGTTTAGTGTCTTGAACCTGTGTTTAGTTACAGTAATATGATCATCTCATCGTC
TTCTTCCATGAAATGTCTTAAAAACAGCTTTCATGCCTTGAAAATCTTTGAAGCAAACAA
AGTGAACTAACGTTTTCCCATTGGGATAAACAGCAAAAACGCTTGCCCCAATCTTCTTGT
TGCACAACGAACACATGCTACCGCTTGTTACTTGCACCACTCCTTTCCTATGTTTGTACA
GTTCCTCCTTCACCTGTAAGTTTTCGCTCTGCCTCAAACTCTTGATGACTGAATAGTTCC
TGTGTGCTTCACTTGAGTTTCTAAGAAGGGGTGCAAGAAACGGGAGCAGGTTCTGGAGTT
TAGTTTCTCTAGGCAAAAGCTTGAGGGCTTGTGCACCATTGATCCTCTCCCACCTTTGGC
TCAACAGATCAAGAACTTCAGAAATCATAACGGTGGAGTTTCCTTCTTCCATGGGCTCTA
CTTCAGCATCAACGTCGCTTCTTCCGCTGTCAGTGCTGCTACTGAGACCAGCTCTCAGCA
TATCCTCAGCACCTTCTATCGCAACAATCTTCTTGGACCTGCTGCCTCCTTTAACTTTTG
AAGACAGAACAGACTCCATCATCTTCGTGGTGTCTGAGCTCTCGAATGATCCTAGAGCTA
CAATACGTTTCGCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN18JQ U 1
AF RR4A726JQ U 3
BS 1 90 RR4FN18JQ
BS 91 91 RR4A726JQ
BS 92 217 RR4FN18JQ
BS 218 218 RR4A726JQ
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BS 224 225 RR4A726JQ
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BS 321 349 RR4FN18JQ
BS 350 350 RR4A726JQ
BS 351 427 RR4FN18JQ
BS 428 428 RR4A726JQ
BS 429 447 RR4FN18JQ
BS 448 857 RR4A726JQ

RD RR4FN18JQ 447 0 0
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ACCAAACTGGTATCCTCAAAACCACTGTCACCATTTTCAACCAAACACAAAAGTACAAAA
ACCAAAGAAAAACAGACATCAATAAGCTCAAAAAGCTTTACAAACTTACAAACAAGGAAA
AAAGATGGTTTAGTGTCTTGAACCTGTGTTTAGTTACTGTAAT**GATCATCTCATCGTC
TTCTTCCATGAAATGTCTTAAAAACAGCTTTCATGCCTTGAAAATCTTTGAAGCAAACAA
AGTGAACTAACGTTTTCCCGTTGGGATAAACAGCAAAAACGCTTGCCCCGATCTTCTTGT
TGCACAACGAACACATGCTACCGCTTGTTACTTGCACCACTCCTTTCCTATGTTTGTACA
GTTCCTCTTTCACCTGTAAGTTTTCGC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4A726JQ 855 0 0
CGCT
CACAAAATCATTTTTATAAATTATTTTCCAACCGAAACGGGTTTTACAACAAGA*CCAAA
CTGGTATCCTCAAAACCACTGTCGACATTTTCAACCAAACACAAAAGTACAAAA*CCAAA
GAAGAACAGACATCAATAAGCTCAAAAAGCTTTACAAACTTACAAACAAGGAAGAAAGAT
GGTTTAGTGTCTTGAACCTGTGTTTAGTTACAGTAATATGATCATCTCATCGTCTTCTTC
CATGAGATGTCTTAAAAACAGCTTTCATGCCTTGAGAATCTTTGAAGCAGACAAAGTGAA
CTAACGTTTTCCCATTGGGATAAACAGCAAACACGCTTGCCCCAATCTTCTTGTTGCACA
ACGAACACATGCTATCGCTTGTTACTTGCACCACTCCTTTCCTATGTTTGTACAGTTCCT
CCTTCACCTGTAAGTTTTCGCTCTGCCTCAAACTCTTGATGACTGAATAGTTCCTGTGTG
CTTCACTTGAGTTTCTAAGAAGGGGTGCAAGAAACGGGAGCAGGTTCTGGAGTTTAGTTT
CTCTAGGCAAAAGCTTGAGGGCTTGTGCACCATTGATCCTCTCCCACCTTTGGCTCAACA
GATCAAGAACTTCAGAAATCATAACGGTGGAGTTTCCTTCTTCCATGGGCTCTACTTCAG
CATCAACGTCGCTTCTTCCGCTGTCAGTGCTGCTACTGAGACCAGCTCTCAGCATATCCT
CAGCACCTTCTATCGCAACAATCTTCTTGGACCTGCTGCCTCCTTTAACTTTTGAAGACA
GAACAGACTCCATCATCTTCGTGGTGTCTGAGCTCTCGAATGATCCTAGAGCTACAATAC
GTTTCGCAAAG

QA 5 855 5 855
DS 



AS 1 3

CO CL3828Contig1 897 3 11 U
GGACAAGACCCAACCATTAAAAAAAAACTTACTTTCTCTGAGAAGCAGAGTTCCATCGAA
AATGGGTCGAATAAGTTTAGTGGTTTCTGATCTGGTTCCGTCGTTCATGTGGATATGGGC
AGGAGTTCTGGTCAACATCTTAGTCCACGGAGTACTCGGGTTTAGTCGGAAAGATACGAC
CGGCGATATCGTCCGTTATCTATTCTCCGTCATCTCTATGTTCCTCTTCGCTTTCCTTCA
GAAACTCACCAAAGGTGGACTCTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTTCTGGTGTCTCCGG
TGGCTTCCGCAGTTTCATCTTCTCCGTCGTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTGGTGGGATC
AGTCCTTGCGGTTAAACATATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGACCAAAACT
GAACGTAGCAATCCATCACGGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTCATAGTAAT
GCTCTCACTGGGACTTACAAGGAAGATCCCAGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTGGATTGC
TAGTATTGCTAAGTTGACTCTTCATGTTCTTGGATCTGATTTAACCGGTGGATGCATGAA
CCCAGCTGCTGTGATGGGATGGGCTTATGCTCGAGGTGAACAGATAACAAAGGAGCATTT
ACTTGTGTATTGGCTTGGACCTGTCAAGGCTACTTTGCTCGCTGTTTGGTTCTTCAATGT
TGTGTTTAAGCCTCTCACCGAAGAACAACAAGAGAAACCTAAGGCCAAATCTGAGTGAGT
AATGAGGTCACACCTCTAACAACACACACGAAGGGTGATATTGTTGTATCCAGGGATGAT
TTCGTTGTAGCAAACTCAGTTGTATCAATCGGTTCAATAAAAATGTGAATTCTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS04TF U 1
AF RR4DL40TF U 54
AF RR4DL40JQ C 318
BS 1 98 RR4DS04TF
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BS 100 559 RR4DS04TF
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BS 671 741 RR4DL40TF
BS 742 897 RR4DL40JQ

RD RR4DS04TF 671 0 0
GGACAAGACCCAACCATTAAAAAAAAACTTACTTTCTCTGAGAAGCAGAGTTCCATCGAA
AATGGGTCGAATAAGTTTAGTGGTTTCTGATCTGGTTCTGTCGTTCATGTGGATATGGGC
AGGAGTTCTGGTCAACATCTTAGTCCACGGAGTACTCGGGTTTAGTCGGAAAGATACGAC
CGGCGATATCGTCCGTTATCTATTCTCCGTCATCTCTATGTTCCTCTTCGCTTTCCTTCA
GAAACTCACCAAAGGTGGACTCTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTTCTGGTGTCTCCGG
TGGCTTCCGCAGTTTCATCTTCTCCGTCGTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTGGTGGGATC
AGTCCTTGCGGTTAAACATATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGACCAAAACT
GAACGTAGCAATCCATCACGGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTCATAGTAAT
GCTCTCACTGGGACTTACAAGGAAGATCCCAGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTGGATTGC
TAGTATTGCTAAGTTGACT*TTCATGTTCTTGGATCTGATTTAACCGGTGGATGCATGAA
CCCAGCTGCTGTGATGGGATGGGCTTATGCTCGAGGTGAACACATAACAAAG*AGCATTT
ACTTGTGTAT
G

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4DL40TF 688 0 0
G
ATCGAAAATGGGTCGAATAAGTTTAGTGGTTTCTGATCTGGTTCCGTCGTTCATGTGGAT
ATGGGCAGGAGTTCTGGTCAACATCTTAGTCCACGGAGTACTCGGGTTTAGTCGGAAAGA
TACGACCGGCGATATCGTCCGTTATCTATTCTCCGTCATCTCTATGTTCCTCTTCGCTTT
CCTTCAGAAACTCACCAAAGGTGGACTCTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTTCTGGTGT
CTCCGGTGGCTTCCGCAGTTTCATCTTCTCCGTCGTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTGGT
GGGATCAGTCCTTGCGGTTAAACATATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGACC
AAAACTGAACGTAGCAATCCATCACGGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTCAT
AGTAATGCTCTCACTGGGACTTACAAGGAAGATCCCAGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTG
GATTGCTAGTATTGCTAAGTTGACTCTTCATGTTCTTGGATCTGATTTAACCGGTGGATG
CATGAACCCAGCTGCTGTGATGGGATGGGCTTATGCTCGAGGTGAACAGATAACAAAGGA
GCATTTACTTGTGTATTGGCTTGGACCTGTCAAGGCTACTTTGCTCGCTGTTTGGTTCTT
CAATGTTGTGTTTAAGCCTCTCACCGA

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR4DL40JQ 580 0 0
TCTTCTCCGTCGTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTGGTGGGATCAGTCCTTGCGGTTAAAC
ATATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGACCAAAACTGAACGTAGCAATCCATC
ACGGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTCATAGTAATGCTCTCACTGGGACTTA
CAAGGAAGATCCCAGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTGGATTGCTAGTATTGCTAAGTTGA
CTCTTCATGTTCTTGGATCTGATTTAACCGGTGGATGCATGAACCCAGCTGCTGTGATGG
GATGGGCTTATGCTCGAGGTGAACAGATAACAAAGGAGCATTTACTTGTGTATTGGCTTG
GACCTGTCAAGGCTACTTTGCTCGCTGTTTGGTTCTTCAATGTTGTGTTTAAGCCTCTCA
CCGAAGAACAACAAGAGAAACCTAAGGCCAAATCTGAGTGAGTAATGAGGTCACACCTCT
AACAACACACACGAAGGGTGATATTGTTGTATCCAGGGATGATTTCGTTGTAGCAAACTC
AGTTGTATCAATCGGTTCAATAAAAATGTGAATTCTGGCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 3

CO CL3829Contig1 1274 3 2 U
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ATACTGTAAGAGCTTCAAAATGTCTTAGGCCAGAATCTGAAATTTTTGAAGAAGAACAAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
TCAC

QA 1 781 1 781
DS 

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TGGGAACACAGCCATGGGTGCATCATCTCCAGCAAAA

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DS 



AS 1 2

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CAAGAGAGTATGCTGGTTGGTAGCAGCCGGATAATCACGAAAACATGGTGAAAGTTGAAT
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AACAAGCACAATTTATGAAGATTTAGATACAG


BQ
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AF RR4FU48TF U 1
AF RR4FU48JQ C 512
BS 1 590 RR4FU48TF
BS 591 1232 RR4FU48JQ

RD RR4FU48TF 590 0 0
GGGAGTGAAAGGGCTTTTGTCTCCAAATGTTTCCGAGATTAGGTCGAGCTGTCACTCAAA
TCTCAAAGCTCCCATCTTTCTCCTCAAATGGATCGCCTAAAAATCTCTCCTTTTTCTCCC
GCTGTGGCTACGCGACTGTAGCTCACGCGGATGATGCTCCCTCGCCGAATGATTTCCCCG
GCAGATCTCCGGTGAACTTGGATAAGATGTTTTGGTCAAAGCCATGCTCACTTGCTCTGC
CTAAAGACTCTCCTCTCAGAATTGATGAGCCTGACTACCAAGGGGTTCGTCGCTTTATAC
TAAAGATGCTTTTGTTCTACAGCAAACAGAGCACATCTATCCGTGGCGCTAACGTTATCT
ACAAGCGAATCATTGCTCAAGTCGACACTCCTGCCATTTATGATGTGTTCAACTTGGAGA
AAACATTCAAAATAACATATTCGTTACTTGTCCTTCATATGTGGCTTGTTTTACGCCGCT
TAAAGGCAGAGGGTAAGGAAGGTGTTGATCTTGGTCAATATGTTTATGAGATCTACAATC
ATAATGTGGAAGTCAGGGTATCTAAAGCCGGGGTTAACTTGCTTCTCTTG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4FU48JQ 721 0 0
TGGTCAATATGTTTATGAGATCTACAATCATAATGTGGAAGTCAGGGTATCTAAAGCCGG
GGTTAACTTGCTTCTCTTGACATGGATGAAGGAATTGGAGAGAATATTCTATGGAAACGT
TGTTGCCTATGATGCGGCACTACTTCCAGATGCTAAACCAAATGATCTACAAATCAAATT
ATGGAGGAATATATTTTCTGATGATGGAGCAACAACACCTGATGAAACGGAATTAAAAGC
AGCAAAGGCAATGGCAAGATATGTCCGGAGAGAAGTTGGTTCTCTTTCTTTAACAGATAA
AGAGTCCATATTTTCCGGCAACTTCTCCTTCACCCCCTTGGAGAACAAAGCCTCGATGAC
TTAAAGGAGCTGTGGCGCTTTGAGCATCAATCTTTCATTTGTTTCTTTTTTTTTTAATAT
TTTCTTTATAACCAACGAGAGAAACTACACAAGAGAGTATGCTGGTTGGTAGCAGCCGGA
TAATCACGAAAACATGGTGAAAGTTGAATAAGATTACTGCTGTGTATCATTTGCTTTCAT
TTGTACATCTGGTCTTTTTGTATTATGCAATATTTGGCGGTATTTAGAAAGACAACTCGA
CAATAGTAATAGGTTAGGACAACAAATCAGTCATGTCAGTGGAATCAAGCTAAGTTGGTG
ACTTGTGAGTGTAACGCTGTATGTAAAGAAACAAGCACAATTTATGAAGATTTAGATACA
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL3831Contig1 734 2 2 U
GAATTGTTGAGGGTCTTATGACTACCGTCCACTCTATCACTGCTACTCAGAAGACCGTTG
ATGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACATCATTCCCA
GCAGCACCGGGGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAGCTGA
CCGGAATGTCCTTCCGTGTGCCCACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCACGGTTAGAC
TCTAGAAAGCTGCAACCTACGACGATATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGGCA
AGCTTAAGGGAATCCTTGGATACACTGAGGATGATGTCGTCTCAACTGACTTCATTGGTG
ACAGCAGGTCAAGCATTTTCGACGCAAAGGCTGGAATCGCTTTGAGTGACAACTTCGTGA
AGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTGGTCGACTTGATCG
TCCACATGTCCAAGTGCTAAATCTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCC
TGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTCTTGGGATT
TCAATCTCCTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGTTCTTTTATGT
TTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCTCAGGATTCTAAGTTTCGTATAACAAATTA
CAATGTTTTAGTAC


BQ
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AF RR4CZ73JQ C 1
AF RR4A803TF U 530
BS 1 529 RR4CZ73JQ
BS 530 734 RR4A803TF

RD RR4CZ73JQ 717 0 0
GAATTGTTGAGGGTCTTATGACTACCGTCCACTCTATCACTGCTACTCAGAAGACCGTTG
ATGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACATCATTCCCA
GCAGCACCGGGGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAGCTGA
CCGGAATGTCCTTCCGTGTGCCCACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCACGGTTAGAC
TCTAGAAAGCTGCAACCTACGACGATATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGGCA
AGCTTAAGGGAATCCTTGGATACACTGAGGATGATGTCGTCTCAACTGACTTCATTGGTG
ACAGCAGGTCAAGCATTTTCGACGCAAAGGCTGGAATCGCTTTGAGTGACAACTTCGTGA
AGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTGGTCGACTTGATCG
TCCACATGTCCAAGTGCTAAATCTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCC
TGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTCTTGGGATT
TCAATCTCCTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGTTCTTTTATGT
TTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCTCAGGATTTTAAGTTTCGTATAACAAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4A803TF 205 0 0
GGAAGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAAT
TTCTTGGGATTTCAATCTCCTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGG
TTCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCTCAGGATTCTAAGTTTCGT
ATAACAAATTACAATGTTTTAGTAC

QA 1 205 1 205
DS 



AS 1 3

CO CL3832Contig1 1182 3 4 U
GATTAATTAAAACTCGATAATATGAGTTTTCCGAAGATAACATCTAATAAGACATCCCCG
AAAAGGTCATGGTAGTGGCCGTGCCTTGGCGTCATCATGCCTCCAAAAATGAGGCTTTTC
CATATATATATGAGGTTTAAGGGCTATCGGGCCAGCTCCACTATTGACAAAAGAAAAACA
TCTAATAAGACATCGAGTTTGCATATTGTTTAGTCAAGAGCTATCACAGCTTAACGAAAA
TCTAAAATATCTACGCTCTGAAGCTGATCAGTGACCACACTCTTAAACGACTCACTCTAG
TCTGTATAATAATCAAAGAAGCAAAAAACAAGGTTTCGTATGACCAATCAATATATAAAT
TTATCAGACATATCAACTGAAAAAAACCAGAAAATTATTATCCTACAAAAATACAAAGAT
AAGTAAATCGAAGCCAAATTAAAAAACATGCCACCTAAAATTGCAATCGGGGGTTATTCC
CAAAACTTAGAAACAAGAGGTAAAATTTATACTTGGTAAATAATCCACAAGCAGTCATAT
ATGTATTATATAATAAATCCCAATTTTAAACCCATAAAGATTTTTTTTGTCAACAAACCC
ATAAAGATTTTAAAAAAAAACTTATCAAACTTTACCTTATCTGTATATTTTTGGGTTAAA
AAGAAGCTATGAGAAGTTTTAAGGAAGGTGGAGACCATTCCGATCATCTTGGTGGTCAGA
AGACCTCCATTGACTTTGACTCCAGTATGCATGATCAACGGTACTCGTTAGATCAAATAG
TGTTTGATCTCCTCCCCCACTTCCCCAATCCAACGGTTCATATCCCATATTCGGATCAAT
CTGAGCCGTTGGATCTCCAAACTGCTGCTGTACAGTATTACCTTCCAACTTCGGATGGCT
ATACACAGTTGATTTACTGAACCACCCCCGTATCCAAACGACGTCGGTTCAATCCCCCCA
GCCGAAAACCCGCCGACCTCCGAGGAAGCTCCACGGTCTGATGAACCTTGCCCGAACGAC
CCCGACCATTCTGTCCCGTTTCCGTACAGTTTAAGATTAGACTTGTCGGTGTCTACAAAC
CCCGAAGGTGCAACCTTCACGGCGGCGGCGGTAGCGGTGGTGGTTGTGGTGACGGCGGTG
GGGACAGTGGTGTTAGAGGCGGTAAGAGAAGAGCTCTCGCTC


BQ
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AF RR4GA25JQ U 1
AF RR4BS40JQ U 892
AF RR4GA25TF C 462
BS 1 662 RR4GA25JQ
BS 663 897 RR4GA25TF
BS 898 1053 RR4BS40JQ
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RD RR4GA25JQ 662 0 0
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AAAAGGTCATGGTAGTGGCCGTGCCTTGGCGTCATCATGCCTCCAAAAATGAGGCTTTTC
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TCTAATAAGACATCGAGTTTGCATATTGTTTAGTCAAGAGCTATCACAGCTTAACGAAAA
TCTAAAATATCTACGCTCTGAAGCTGATCAGTGACCACACTCTTAAACGACTCACTCTAG
TCTGTATAATAATCAAAGAAGCAAAAAACAAGGTTTCGTATGACCAATCAATATATAAAT
TTATCAGACATATCAACTGAAAAAAACCAGAAAATTATTATCCTACAAAAATACAAAGAT
AAGTAAATCGAAGCCAAATTAAAAAACATGCCACCTAAAATTGCAATCGGGGGTTATTCC
CAAAACTTAGAAACAAGAGGTAAAATTTATACTTGGTAAATAATCCACAAGCAGTCATAT
ATGTATTATATAATAAATCCCAATTTTAAACCCATAAAGATTTTTTTTGTCAACAAACCC
ATAAAGATTTTAAAAAAAAACTTATCAAACTTTACCTTATCTGTATATTTTTGGGTTAAA
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4BS40JQ 162 0 0
TGATCA
GCTATACACAGTTGATTTACTGAACCACCCCCGTATCCAAACGACGTCGGTTCAATCCCC
CCAGCCGAAAACCCGCCGACCTCCGAGGAAGCTCCACGGTCTGATGAACCTTGCCCGAAC
GACCCCGACCATTCTGTCCCGTTTCCGTACAGTTTA

QA 7 162 7 162
DS 

RD RR4GA25TF 721 0 0
TGCAATCGGGGGTTATTCCCAAAACTTAGAAACAAGAGGTAAAATTTATACTTGGTAAAT
AATCCACAAGCAGTCATATATGTATTATATAATAAATCCCAATTTTAAACCCATAAAGAT
TTTTTTTGTCAACAAACCCATAAAGATTTTAAAAAAAAACTTATCAAACTTTACCTTATC
TGTATATTTTTGGGTTAAAAAGAAGCTATGAGAAGTTTTAAGGAAGGTGGAGACCATTCC
GATCATCTTGGTGGTCAGAAGACCTCCATTGACTTTGACTCCAGTATGCATGATCAACGG
TACTCGTTAGATCAAATAGTGTTTGATCTCCTCCCCCACTTCCCCAATCCAACGGTTCAT
ATCCCATATTCGGATCAATCTGAGCCGTTGGATCTCCAAACTGCTGCTGTACAGTATTAC
CTTCCAACTTCGGATGGCTATACACAGTTGATTTACTGAACCACCCCCGTATCCAAACGA
CGTCGGTTCAATCGCCCCAGCCGAAAACCCGCCGACCTCCGAGGAAGCTCCACGGTCTGA
TGAACCTTGCCCGAGCGACCCCGACCATTCTGTCCCGTTTCCGTACAGTTTAAGATTAGA
CTTGTCGGTGTCTACAAACCCCGAAGGTGCAACCTTCACGGCGGCGGCGGTAGCGGTGGT
GGTTGTGGTGACGGCGGTGGGGACAGTGGTGTTAGAGGCGGTAAGAGAAGAGCTCTCGCT
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL3833Contig1 957 3 13 U
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GTTCTTAGAATTTATTACAAGTCGATTCAGTTCTTGGTTACATTTGAGAAAGAGAGGGAG
GCTCGTATCTGCAAACACAGTCATATATGTTTCCCTTTATTAGCTTGTCAGCCAATCTCT
GATTCTTAACCATTGCTAGCTTGAGAGACTCGCATTTGAATTGAGCGTTGAAGTTTGTGT
GAAGAGCTCTTCCCATACCTTCCAAGATAACAAGATCAGCGTCTTTGGCAGCAGCTGCAA
GCTCGGAGCTGACTTGTCTAAGGTCAATGCAAGGACTTCCACATCCATTTTCAACAACCA
CCAATGGTGCTGAAGTTGAATCCTTCTTTGACCCATCCCCTGGATTTACCATCGCATCAA
CAAGTAAGCCTCCCATTTCTGCAGCTCTCCTCAGGATGTCACAGTGCTTAACAGCCCCGG
CTACTATATCAGGAAGTTCCATAGCAGTCACATCGTTTAAAGCAGGAAGAAAGTTTGCCA
CCAGAACAACTTAAGTCCCACGGCGAAAAAACTCTCGGGCAAGAGGAAGCATCCCAAGAA
TGACATCTGCTCCTGAGTTATCAACAAAGAGTAACGCTCTTTTATGTCGATGAGGCTGCT
TACCTCCTCCAGACCCAAGCATCCTTTCTTTGAAAGCATCAAAATCATCTACCCTCCAAG
GTCTCTGCATCTTGTTACGACTCATTCTGTATATTTCAATAATGGTTCCTTTGCGGTATA
GATCAACACATGCTCGAGATCCCCAGTCGAATATGTTCGCAGCAAGAACACCTTCTATTA
GTGTAAGCAACCTCGCCTCCTCGTTCATTGAATCAAGCTCCTCCAGTAAATCAGGTAGAA
CAGCAAGTGATGCCTCGTTCTCCCTTTGCTTGATGCTACTATAGGCATCAACAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EY37JQ U 1
AF RR4BV53JQ U 16
AF RR4BV53TF C 588
BS 1 25 RR4EY37JQ
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BS 554 564 RR4EY37JQ
BS 565 717 RR4BV53JQ
BS 718 957 RR4BV53TF

RD RR4EY37JQ 564 0 0
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GTTCTTAGAATTTATTACAAGTCGATTCAGTTCTTGGTTACATTTGAGAAAGAGAGGGAG
GCTCGTATCTGCAAACACAGTCATATATGTTTCCCTTTATTAGCTTGTCAGCCAATCTCT
GATTCTTAACCATTGCTAGCTTGAGAGACTCGCATTTGAATTGAGCGTTGAAGTTTGTGT
GAAGAGCTCTTCCCATACCTTCCAAGATAACAAGATCAGCGTCTTTGGCAGCAGCTGCAA
GCTCGGAGCTGACTTGTCTAAGGTCAATGCAAGGACTTCCACATCCATTTTCAACAACCA
CCAATGGTGCTGAAGTTGAATCCTTCTTTGACCCATCCCCTGGATTTACCATCGCATCAA
CAAGTAAGCCTCCCATTTCTGCAGCTCTCCTCAGGATGTCACAGTGCTTAGCAGCCCCGG
CTACTATATCAGGAAGTTCCATAGCAGTCACATCGTTTAGAGCAGGAAGAGAGTTTGCCA
CCAGAACAACTTCAGTCCCACGGC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4BV53JQ 702 0 0
GC
TGTATTATCGCATGTATTGCATTATAAATCGTCGCAAAACCTTGTTCTTAGAATTTATTA
CAAGTCGATTCAGTTCTTGGTTACATTTGAGAAAGAGAGGGAGGCTCGTATCTGCAAACA
CAGTCATATATGTTTCCCTTTATTAGCTTGTCAGCCAATCTCTGATTCTTAACCATTGCT
AGCTTGAGAGACTCGCATTTGAATTGAGCGTTGAAGTTTGTGTGAAGAGCTCTTCCCATA
CCTTCCAAGATAACAAGATCAGCGTCTTTGGCAGCAGCTGCAAGCTCGGAGCTGACTTGT
CTAAGGTCAATGCAAGGACTTCCACATCCATTTTCAACAACCATCAATGGTGCTGAAGTT
GAATCCTTCTTTGACCCATCCCCTGGATTTACCATCGCATCAACAAGTAAGCCTCCCATT
TCTGCAGCTCTCCTCAGGATGTCACAGTGCTTAACAGCCCCGGCTACTATATCAGGAAGT
TCCATAGCAGTCACATCGTTTAAAGCAGGAAGAAAGTTTGCCACCAGAACAGCTTAAGTC
CCACGGCGAAAAAACTCTCGGGCAAGAGGAAGCATCCCAAGAATGACATCTGCTCCTGAG
TTATCAACAAAGAGTAACGCTCTTTTATGTCGATGAGGCTGCTTACCTCCTCCAGACCCA
AGCATCCTTTCTTTGAAAGCATCAAAATCATCTACCCTCC

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR4BV53TF 370 0 0
AGCATCCCAAGAATGACATCTGCTCCTGAGTTATCAACAAAGAGTAACGCTCTTTTATGT
CGATGAGGCTGCTTACCTCCTCCAGACCCAAGCATCCTTTCTTTGAAAGCATCAAAATCA
TCTACCCTCCAAGGTCTCTGCATCTTGTTACGACTCATTCTGTATATTTCAATAATGGTT
CCTTTGCGGTATAGATCAACACATGCTCGAGATCCCCAGTCGAATATGTTCGCAGCAAGA
ACACCTTCTATTAGTGTAAGCAACCTCGCCTCCTCGTTCATTGAATCAAGCTCCTCCAGT
AAATCAGGTAGAACAGCAAGTGATGCCTCGTTCTCCCTTTGCTTGATGCTACTATAGGCA
TCAACAAACT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 3

CO CL3834Contig1 782 3 2 U
GACTTCATGAAAGATCAAATCAATTGTATATGTCAAAGCTTATTATTCTCTACCATTATT
ACTTTTTTCTATTAAAAACAGTACTTAAAAGAGAAGCAGAGATCGAAATCTTGAGAATAT
CCTTGATTCATCCACCTCCATAGACCAAGATTTCGCTTTTTGTTTTGATCTTCGTTTGAG
AAAACAACAAACTCTGTTGCAGTGAAAGTTTCTAGAAGACAAAGAAAAGCCCAGTGCTTG
GCGTCCCCTTCTTCACAGAACTTAGAGTACTTGTCTGAATCCATCAGCTTCTCCACCTCG
CCTGCATCACTCAGCTCCACTTTTATAATCCATCCTTCTTCATAAGGGCTCGTGTTCACC
AATCCAGGGGACTCAGTCAGAGCCTCATTGACTTCAACCACCTTACCAGAGACAGGAGAG
TTGATATCACTAGTAGCTTTCACACTTTCAACTGCTCCAAAACTCTCACCTTGAGACACC
GAACGTCCCAGATCAGGCAACTCAACATAGACAACATCGCCCAAGTGGTCCTGCGCGTGA
TCCGTTATACCAAACGTTGCTTTATTCCCATCAATCTTCACCCATTCATGTGAATCAGCA
TATTTCAAATCCTTCAATACCACTGAAGCGAACCCTCGTTGGGCAACGGAGATCCTTAGA
TGAGAAGCAACCCTAGAAGCCCACAAGAACCTAGCTGCCGCCATTGTTTTCGTGGAGATC
GAGAAAACGCCGATTACACACAACACCAACAGTGAAACACAAAGAGAAAGCGCACTCACC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4E467JQ U 1
AF RR4E467TF C 1
AF RR4BK38JQ U 7
BS 1 196 RR4E467JQ
BS 197 782 RR4BK38JQ

RD RR4E467JQ 197 0 0
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ACTTTTTTCTATTAAAAACAGTACTTAAAAGAGAAGCAGAGATCGAAATCTTGAGAATAT
CCTTGATTCATCCACCTCCATAGACCAAGATTTCGCTTTTTGTTTTGATCTTCGTTTGAG
AAAACAACAAACTCTG
C

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR4E467TF 197 0 0
GACTTCATGA
AAGATCAAATCAATTGTATATGTCAAAGCTTATTATTCTCTACCATTATTACTTTTTTCT
ATTAAAAACAGTACTTAAAAGAGAAGCAGAGATCGAAATCTTGAGAATATCCTTGATTCA
TCCACCTCCATAGACCAAGATTTCGCTTTTTGTTTTGATCTTCGTTTGAGAAAACAACAA
ACTCTG
C

QA 11 196 11 196
DS 

RD RR4BK38JQ 776 0 0
ATGG
AAGATCAAATCAATTGTATATGTCAAAGCTTATTATTCTCTACCATTATTACTTTTTTCT
ATTAAAAACAGTACTTAAAAGAGAAGCAGAGATCGAAATCTTGAGAATATCCTTGATTCA
TCCACCTCCATAGACCAAGATTTCGCTTTTTGTTTTGATCTTCGTTTGAGAAAACAACAA
ACTCTGTTGCAGTGAAAGTTTCTAGAAGACAAAGAAAAGCCCAGTGCTTGGCGTCCCCTT
CTTCACAGAACTTAGAGTACTTGTCTGAATCCATCAGCTTCTCCACCTCGCCTGCATCAC
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ACTCAGTCAGAGCCTCATTGACTTCAACCACCTTACCAGAGACAGGAGAGTTGATATCAC
TAGTAGCTTTCACACTTTCAACTGCTCCAAAACTCTCACCTTGAGACACCGAACGTCCCA
GATCAGGCAACTCAACATAGACAACATCGCCCAAGTGGTCCTGCGCGTGATCCGTTATAC
CAAACGTTGCTTTATTCCCATCAATCTTCACCCATTCATGTGAATCAGCATATTTCAAAT
CCTTCAATACCACTGAAGCGAACCCTCGTTGGGCAACGGAGATCCTTAGATGAGAAGCAA
CCCTAGAAGCCCACAAGAACCTAGCTGCCGCCATTGTTTTCGTGGAGATCGAGAAAACGC
CGATTACACACAACACCAACAGTGAAACACAAAGAGAAAGCGCACTCACCCC

QA 5 776 5 776
DS 



AS 1 3

CO CL3835Contig1 812 3 14 U
GGAAGAGGCACACAAAAAGAAGTGAGGACAGACACCCAAACTTGCAAGCAAAAACAAAAC
ACCATTTCAAACATCTTTCGAACAGATTCTTCTTCTTCATC***AAAGTTTGAATCTTTC
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ATTTCGATCGGCGAATTAAAAAAAAA**TGGTGATGCGGACGGAAGCTAGGGTTAGTGTA
GCAAGCTCAGGTCAAAGCGTCGTCGGTAACAAAGCAGCCTCCACCTCTCATCGTCTAACT
CAGGATCAGAGATCTCATATCGAATCTGCTTCTCAGCTCTTAGCCGGTGGTATCGCCGGA
GCTTTTAGCAAAACCTGCACCGCCCCTCTCTCTCGCCTCACCATCCTCTTCCAGGTGCAA
GGAATGCACACAAATGCAGCAGCGTTGAAAAAGCCGAGCATATTACACGAGGCTTCACGG
ATATTGAATGAAGAAGGTCTCAAAGCGTTCTGGAAAGGGAACCTTGTTACCATAGCTCAC
CGCCTTCCTTATTCTTCCGTTAATTTCTACACTTATGAACACTACAAGAAGTTCTTGTAT
ATGGTAACTGGGATGGAAAATCGACACAGGGAGAGTATAAGCTCAAACGTTTTTGTGCAT
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GTTAGGACTCGTCTTGCTGCTCAGAATGGGTATTGCAGACAATGTATATACTACACGGGT
ATCTGGCATACTCTGCGCACTATCAGCACCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ71TF U 1
AF RR4ER45TF U 26
AF RR4D945TF U 26
BS 1 25 RR4CQ71TF
BS 26 27 RR4D945TF
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BS 650 666 RR4CQ71TF
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BS 686 812 RR4D945TF

RD RR4CQ71TF 666 0 0
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ACCATTTCAAACATCTTTCGAACAGATTCTTCTTCTTCATC***AAAGTTTGAATCTTTC
TGCGTCTGTCGAAGTTGGGTATTCATTCTCCAATCCTCTCCGGCGGCGAGATTTGAGAAA
ATTTCGATCGGCGAATTAAAAAAAAA**TGGTGATGCGGACGGAAGCTAGGGTTAGTGTA
GCAAGCTCAGGTCAAAGCGTCGTCGGTAACAAAGCAGCCTCCACCTCTCATCGTCTAACT
CAGGATCAGAGATCTCATATCGAATCTGCTTCTCAGCTCTTAGCCGGTGGTATCGCCGGA
GCTTTTAGCAAAACCTGCACCGCCCCTCTCTCTCGCCTCACCATCCTCTTCCAGGTGCGA
GGAATGCACACAAATGCAGCAGCGTTGAAAAAGCCGAGCATATTACACGAGGCTTCACGG
ATATTGAATGAAGAAGGTCTCAAAGCGTTCTGGAAAGGGAACCTTGTTACCATAGCTCAC
CGCCTTCCTTATTCTTCCGTTAATTTCTACACTTATGAACACTACAAGAAGTTCTTGTAT
ATGGTAACTGGGATGGAAAATCGACACAGGGAGAGTATAAGCTCAAACATTTTTGTGCAT
TTTGTA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4ER45TF 680 0 0
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ATTCTTCTTCTTCATC***AAAGTTTGAATCTTTCTGCGTCTGTCGAAGTTGGGTATTCA
TTCTCCAATCCTCTCCGGCGGCGAGATTTGAGAAAATTCCGATCGGCGAATTAAAAAAAA
A**TGGTGATGCGGACGGAAGCTAGGGTTAGTGTAGCAAGCTCAGGTCAAAGCGTCGTCG
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CTGCTTCTCAGCTCTTAGCCGGTGGTATCGCCGGAGCTTTTAGCAAAACCTGCACCGCCC
CTCTCTCTCGCCTCACCATCCTCTTCCAGGTGCAAGGAATGCACACAAATGCAGCAGCGT
T**AAAAGCCGAGCATATTACACGAGGCTTCACGGATATTGAATGAAGAAGGTCTCAAAG
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TCACTGCTGCTTCTGCTACT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4D945TF 787 0 0
GGACAGACACCCAAACTTGCAAGCAAAAACAAAACACCATTTCAAACATCTTTCGAACAG
ATTCTTCTTCTTCATCATCAAAGTTTGAATCTTTCTGCGTCTGTCGAAGTTGGGTATTCA
TTCTCCAATCCTCTCCGGCGGCGAGATTTGAGAAAATTTCGATCGGCGAATTAAAAAAAA
AAATGGTGATGCGGACGGAAGCTAGGGTTAGTGTAGCAAGCTCAGGTCAAAGCGTCGTCG
GTAACAAAGCAGCCTCCACCTCTCATCGTCTAACTCAGGATCAGAGATCTCATATCGAAT
CTGCTTCTCAGCTCTTAGCCGGTGGTATCGCCGGAGCTTTTAGCAAAACCTGCACCGCCC
CTCTCTCTCGCCTCACCATCCTCTTCCAGGTGCAAGGAATGCACACAAATGCAGCAGCGT
TGAAAAAGCCGAGCATATTACACGAGGCGTCACGGATATTGAATGGAGAAGGTCTCAAGG
CTTTTTGGAAAGGGAACCTTGTCACCATAGCTCACCGCCTTCCTTATTCTTCTGTCAATT
TCTACACTTATGAACACTACAAGAAGTTCTTGTATATGGTAACTGGGATGGAAAATCGAC
ACAGGGAGAGTATAAGCTCAAACGTTTTTGTGCATTTTGTAGCC*GTGGTTTGGCTGGTG
TCACTGCTGCTTCTGCTACTTACCCACTTGATCTTGTTAGGACTCGTCTTGCTGCTCAGA
ATGGGTATTGCAGACAATGTATATACTACACGGGTATCTGGCATACTCTGCGCACTATCA
GCACCGA

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 3

CO CL3836Contig1 915 3 6 U
GGATCTTATCTTTTCTCAGACACAGCTGCTCCCCTGCTTTTATCTTCTCGCCGGCGAGAG
AACAAAAAATGGCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTCTGCATAC
CTTATTCAACTACTTCGCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGGCCTGCACTCTCTGTGCGAA
TTTCTACTCGAACCAACAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCA
AAGCAGGAACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTTCATG
TCAAACCAGGAAAAGGAGCGGCATTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAACGGTA
GCACAGTTGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAG
AAACCAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACAT
ACGAAGAAACACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGATGGCTGAAAGAAG
GAATGGAATGCAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCGAATA
CGGTTACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTTCGCGGTGACACTGCACAAGGTG
GATCAAAGCCGGCTACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACA
TAGGCGAAGAAATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCG
TGTCTACACCTACTTAATTCGGATCCAGAATTCAATCCGATGAGGCAATTATAATCATTT
TTGTGTATGTATATGCAAATATGCAATGTTCGAATCGAGGATGTTATATGTTTTGAAAAA
TAAATTTTGAACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D436TF U 6
AF RR4BX42TF U 1
AF RR4BX42JQ C 219
BS 1 112 RR4BX42TF
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BS 210 709 RR4BX42TF
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RD RR4D436TF 530 0 0
GG
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AATGGCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTCTGCATACCTTATTC
AACTACTTCGCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGGCCTGCACTCTCTGTGCGAATTTCTAC
TCGAACCAACAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGCAGG
AACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTTCATGTCAAACC
AGGAAAAGGAGCGGCATTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAACGGTAGCACAGT
TGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAGAAACCAA
ACAGTTCACATACAAAGACGGGCCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGAAGA
AACACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGATGGCTGAA

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR4BX42TF 709 0 0
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AACAAAAAATGGCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTTTGCATAC
CTTATTCAACTACTTCGCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGGCCTGCACTCTCTGTGCGAA
TTTCTACTCGAACCAACAGATTTTCCGGTATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCA
AAGCAGGAACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTTCATG
TCAAACCAGGAAAAGGAGCGGCATTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAACGGTA
GCACAGTTGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAG
AAACCAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACAT
ACGAAGAAACACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGATGGCTGAAAGAAG
GAATGGAATGCAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCGAATA
CGGTTACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTTCGCGGTGACACTGCACAAGGTG
GATCAAAGCCGGCTACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4BX42JQ 697 0 0
TCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGCAGGAACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGG
CGTGTACTTGAGTTTCTTCATGTCAAACCAGGAAAAGGAGCGGCATTTGTGAGAACTAAG
ATCAGGAACTATGTTAACGGTAGCACAGTTGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTC
GAGGAAGCAAATGTATTCAAAGAAACCAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTT
GTTTTCATGGATTTGAGCACATACGAAGAAACACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGAC
AAGACGAGATGGCTGAAAGAAGGAATGGAATGCAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTT
ATCGATTTCGAACTACCGAATACGGTTACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTT
CGCGGTGACACTGCACAAGGTGGATCAAAGCCGGCTACAGTGGAAACGGGGGCAGTAGTT
ACCGTACCACTCTTTGTTAACATAGGCGAAGAAATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATG
TACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTCTACACCTACTTAATTCGGATCCAGAATTCAATCC
GATGAGGCAATTATAATCATTTTTGTGTATGTATATGCAAATATGCAATGTTCGAATCGA
GGATGTTATATGTTTTGAAAAATAAATTTTGAACAGC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 3

CO CL3837Contig1 887 3 10 U
GGGGACCATCGAAACTTTGCATCTAACTCTAGGCTGGCGATAATGGCGTCGAAGCAAGAA
TACGGCATCCCTTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTC
ATCGTTCTAACTCCTTATCGCCGCCACCGTCGCCCTTCCTTCCTCCGCACCCTCCGCTGC
TCTCTCCTCTTCACCGCCTCAATCCTCTTCCTCTCCGCCGCCGTTTACTTCCTCTACCCT
TCCGATCCAGAAATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACATATGAGTACTCGATTCG
TTTAAACCCACCCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCACGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTC
TTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCGTGGTCTCGATTGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGG
CTTGTCAAGTCTAATGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTATGTTAATGCAACT
CTTGAACTCGATGGTCTTGAGGTTGTTCACGATGTTATTTATTTGATCGGTGATTTGGCT
AGAGGTGTTATCCCTTTTGATACGATCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTC
TTCCAAATCCCAATTCAGGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAA
AAAATTTCACACCAAGATTGTCATCGTAAGTGAAACAAAATCCTGAGCTGGTCCAAACAT
GAGAGAGGAGTAGACCAGATATACATATGTTGAATCCTTGAATATCTTTTGGGTATGGAG
AAATGATTTGTAAGATATTTGTATAGATAAATACTACTGGATTGCCATTTCTTAGTCGTG
TAATTTCGTACGTGAACTATACTTTAACGAGATAGTAACAATTGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4D371TF U 23
AF RR4CY70TF U 1
AF RR4CY70JQ C 163
BS 1 663 RR4CY70TF
BS 664 664 RR4CY70JQ
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BS 695 697 RR4CY70JQ
BS 698 713 RR4CY70TF
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BS 737 753 RR4CY70TF
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RD RR4D371TF 593 0 0
GG
AACTCTAGGCTGGCGATAATGGCGTCGAAGCAAGAATACGGCATCCCTTATACACCTCTT
CCTTCATCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTCATCGTTCTAACTCCTTATCGCCGC
CACCGTCGCCCTTCCTTCCTCCGCACCCTCCGCTGCTCTCTCCTCTTCACCGCCGCAATC
CTCCTCCTCTCCGCCGCCGTTTACTTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAAATCAAAGTCTCT
CGAATCCAGCTCAACCACATACGAGTACTCGATTCGTTTAAACCCACCCTCGATCTCTCG
TTCTCCCTCACGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTC
GTGGTCTCGATTGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGGCTTGTCAAGTCTAATGGCGGACAC
CTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTATGTTAATGCGACTCTTGAACTCGATGGTCTTGAGGTT
GTTCACGATGTTATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAGAGGTGTTATCCCTTTTGATACG
ATCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTCTTCCAAATCCCAATT

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR4CY70TF 767 0 0
GGGGACCATCGAAACTTTGCATCTAACTCTAGGCTGGCGATAATGGCGTCGAAGCAAGAA
TACGGCATCCCTTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTC
ATCGTTCTAACTCCTTATCGCCGCCACCGTCGCCCTTCCTTCCTCCGCACCCTCCGCTGC
TCTCTCCTCTTCACCGCCTCAATCCTCTTCCTCTCCGCCGCCGTTTACTTCCTCTACCCT
TCCGATCCAGAAATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACATATGAGTACTCGATTCG
TTTAAACCCACCCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCACGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTC
TTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCGTGGTCTCGATTGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGG
CTTGTCAAGTCTAATGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTATGTTAATGCAACT
CTTGAACTCGATGGTCTTGAGGTTGTTCACGATGTTATTTATTTGATCGGTGATTTGGCT
AGAGGTGTTATCCCTTTTGATACGATCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTC
TTCCAAATCCCAATTCAGGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAA
AAA*TTTCACACCAAGATTGTCATCGTAAGTGAA**CAAATCCTGAGCTGGTC*AAACAT
GAGAGAGGAGTAGAC*AGATATACATATGTTGA
TCCTTGATATCTTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4CY70JQ 725 0 0
CTCCGCACCCTCCGCTGCTCTCTCCTCTTCACCGCCTCAATCCTCTTCCTCTCCGCCGCC
GTTTACTTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAAATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCAC
ATATGAGTACTCGATTCGTTTAAACCCACCCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCACGATCAAA
GTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCGTGGTCTCGATTGGGTAT
AGAGGGAGAGAGCTAGGGCTTGTCAAGTTTAATGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGC
TCTTATGTTAATGCAACTCTTGAACTCGATGGTCTTGAGGTTGTTCACGATGTTATTTAT
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GATCTTGGTGTTCTTTTCTTCCAAATCCCAATTCAGGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTT
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CTGAGCTGGTCCAAACATGAGAGAGGAGTAGACCAGATATACATATGTTGAATCCTTGAA
TATCTTTTGGGTATGGAGAAATGATTTGTAAGATATTTGTATAGATAAATACTACTGGAT
TGCCATTTCTTAGTCGTGTAATTTCGTACGTGAACTATACTTTAACGAGATAGTAACAAT
TGGGG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 3

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AAAGAGCACTTTTGATGAAAGAGACCAAATCAGACAACGTAGAAGATTGCAGTATGCTTC
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TCTAGGGGAGGATTCTGATTTCTTCAAAGAGCTTGAAAGCAGAGGACCGTTGGACGAGAA
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GACACTGGTGTTCTACGAGAAGAAGGAGAACTTGTCTAAGCTTTGGGACATTCTAGCTCT
TTACGCCTGGATAGACAACGACGTTGGGTATTGCCAAGGAATGAGCGATCTTTGCTCCCC
TATGATCATGCTTCTTGAAGACGAAGCTGATGCTTTTTGGTGTTTTGAAAGATTAATGCG
AAGATTGAGAGGAAACTTCAGGAGCACGGGAAGATCAGTTGGAGTGGAAGCACAGCTTAC
TCATTTGTCTACAATCACTCAGATTATTGACCCTAAACTTCACCATCACTTAGAGAATCT
TGGTGGAGGTGACTATCTCTTTGCGATTCGGATGATAATGGTTCATTTCAGAAGAGAATT
CTCTTTTTGCGACTCCTTGTACCTTTGGGAGATGATGTGGGGATTAGAGTATGACCCTGA
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TGGAAAAGGCAGCGCAGAAGGTCCATTGCCTATATCGGTTTTCTTAGTGGCGAGTGTTTT
GAAAGACAAGAGTTCTAAGCTTATGACTGAAGCTTGAGGACTTGATGATGTTGTTAAGAT
CTTAAACGACATAACCGGAAACTTGGATGCTAAAAAGGCATGTTCTGGTGCAATGAAACT
ACACAAGAAGTATCTAAAAAAGCAGGCCAAGAAATAGCACTGGAGAAGCGCCGCACGAGT
AGCGTTTTTATGTGTGTTTACTTTTTACATAACTGTATTTGATAACTCACAAAAATCTGG
CGACAACAAAGGTTTTAGAGATTAACGATTCCTTGGGTGGCAAGCATTCTTCAAAGGGAA
ATACCATGGAGTCCTTGTTTACCCAAGGAGCACAACTTTTCGTTGTGCAGTGTTCATACA
AAATCCATGTTGTAATATTTTTTATTTAACAAACCATTTGTTTCTT


BQ
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AF RR4CH28TF U 126
AF RR4DN73TF U 1
AF RR4DN73JQ C 642
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G
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CTGG*TAGACAACGAC
TTG

QA 2 317 2 317
DS 

RD RR4DN73TF 735 0 0
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TCATTTGTCTACAATCACTCAGATTATTGACCCTAAACTTCACCATCACTTAGAGAATCT
TGGTGGAG*TGACTATCTCTTTGCGATTCGGATGATAATGGTTCATTTCAGAAGAGAATT
CTCTTTTTGCGACTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4DN73JQ 725 0 0
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TTCATTTCAGAAGAGAATTCTCTTTTTGCGACTCCTTGTACCTTTGGGAGATGATGTGGG
GATTAGAGTATGACCCTGAGATGTATTCACTGTACGAGGAACCTGAGTTCGAGGGAGAGA
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GAGAGAACATGAAGAACGCTGGAAAAGGCAGCGCAGAAGGTCCATTGCCTATATCGGTTT
TCTTAGTGGCGAGTGTTTTGAAAGACAAGAGTTCTAAGCTTATGACTGAAGCTTGAGGAC
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TTCTT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

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TTTTCTTCTATACTTTCTTGGATCATGCTTGGAAACACATATCATTTCATCATCGCTTCT
TGCATGCCCCACAAGTGCATCTCTCCATCCCCTTTTTCAGCGACTCTACTTGGTGTTGCA
GACCTTTGATATGCTCAACAGCCAAATCCAACATATCTGCATAGCTCGTTTGTTTGTCCA
TATTGGGCACCAGTTCTTGTAGCTTCTTCAGCTTCCCGCTTATTCTCGTTCTTCTCTCCC
TTTCAGCAATGCTGCGCGGGTGAGTAGCACAGCCACGCTTGGCCCTAGCCCTACAAGGCA
CCGAATCCTCTGGTATGTTCATCATACTCTCCATCCTCGCCACTTCCAGAGACGTTTGCG
GCATACTAAACTGCGTTTCTAAGGTGAAAAAGTCGGTGGTCTTGGACCGTTTTCCGGGTT
CATCAATGGTGAAACTGATATGAGAAGACGAGTTGTCCCAGTTGTTGTGATCATTTCCAA
AAGTCATACTCGTCGATGCGACACCTTTTACAGCCGCCGCAGCCGCTTCCACCTCTGTGA
TTCGTGGTAGAGAGCTATGCTCTTGATGACTACTACTACTACCGCCGGAAAATCTCAGCT
CCGGCTTCAACCTCGACGGCCCTCTCTCTCCTCCTCCGCCGTATCCTCCGTTTGGCCGGC
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GGGTCTTGCTCGAGACTCGAGGACTCCTTCCTTTGTCTCCACTTAGATTTTATTTATCTC
CAATTCGATAGAGAATAACAATTCATCACCAAATAATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GO63JQ U 1
AF RR4B980TF C 59
BS 1 374 RR4GO63JQ
BS 375 882 RR4B980TF

RD RR4GO63JQ 374 0 0
ATATCACTAAAAACCTTTTGTTGCTCTAATTTCTGTCTTTGGATTGATTCATTAATCTCT
TTTTCTTCTATACTTTCTTGGATCATGCTTGGAAACACATATCATTTCATCATCGCTTCT
TGCATGCCCCACAAGTGCATCTCTCCATCCCCTTTTTCAGCGACTCTACTTGGTGTTGCA
GACCTTTGATATGCTCAACAGCCAAATCCAACATATCTGCATAGCTCGTTTGTTTGTCCA
TATTGGGCACCAGTTCTTGTAGCTTCTTCAGCTTCCCGCTTATTCTCGTTCTTCTCTCCC
TTTCAGCAATGCTGCGCGGGTGAGTAGCACAGCCACGCTTGGCCCTAGCCCTACAAGGCA
CCGAATCCTCTGGT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4B980TF 824 0 0
CTCTTTTC
TCTATACTTTCTTGGATCATGCTTGGAAACACATATCATTTCATCATCGCTTCTTGCATG
CCCCACAAGTGCATCTCTCCATCCCCTTTTTCAGCGACTCTACTTGGTGTTGCAGAC*TT
TGATATGCTCAACAGCCAAATCCAACATATCTGCATAGCTCGTTTGTTTGTCCATATTGG
GCACCAGTTCTTGTAGCTTCTTCAGCTTCCCGCTTATTCTCGTTCTTCTCTCCCTTTCAG
CAATGCTGCGCGGGTGAGTAGCACAGCCACGCTTGGCCCTAGCCCTACAAGGCACCGAAT
CCTCTGGTATGTTCATCATACTCTCCATCCTCGCCACTTCCAGAGACGTTTGCGGCATAC
TAAACTGCGTTTCTAAGGTGAAAAAGTCGGTGGTCTTGGACCGTTTTCCGGGTTCATCAA
TGGTGAAACTGATATGAGAAGACGAGTTGTCCCAGTTGTTGTGATCATTTCCAAAAGTCA
TACTCGTCGATGCGACACCTTTTACAGCCGCCGCAGCCGCTTCCACCTCTGTGATTCGTG
GTAGAGAGCTATGCTCTTGATGACTACTACTACTACCGCCGGAAAATCTCAGCTCCGGCT
TCAACCTCGACGGCCCTCTCTCTCCTCCTCCGCCGTATCCTCCGTTTGGCCGGCCTAGAG
AAAAACCGTTTCGCTCATATTTAAAACGTATATTTATACAAAAGAGAAGAGAATGGGTCT
TGCTCGAGACTCGAGGACTCCTTCCTTTGTCTCCACTTAGATTTTATTTATCTCCAATTC
GATAGAGAATAACAATTCATCACCAAATAATCTTCC

QA 9 824 9 824
DS 



AS 1 3

CO CL3840Contig1 938 3 19 U
GGGAGTTTCTCTAACTCTTGAGATAACCGAGAACTACAACAGCATGATGGTATCCGCTTC
AGGGGAGAAACCGGCTTTTGATCCCGTCCTCTCTGCACTGCTCGACCCTATCATTAAGAT
GTGCGAGCAAGCGGCAGAGGCGCACAAATCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAA
CAGAACAAGTTCCGACTCAAGCCAGTTAACATCAGTCGATGCTCTACTCTCTAGCAGCTC
GGCCCCACCACAGAACAATGAAACACCTTCGAAGATATTCCTCATCAACTGTTTATGCGC
GATCCAACAACCTTTGCTAAGACACGATGTGGCGTCGCAGTACGTGACCAACATCGGATC
AATGATCGAGAACCACATAAACCTCCTTGTCCAGAAAGAAGTCGACACGCTCCTCCAAAG
ATGCGGTCTTTCAGACAAAATGCAAATCTTCCGCTCCTCCACCACAACTGAACTTCCTTT
GTCTGAACGACAGGAGACGTCACCCGCAATGCTGTCGGAATGCCTCAAGGCCTTCTTCGG
CCTCGTTTTGGGAAGCGAAGGCTCTCTTCCTGAGTTCGAGCAGATACAAGTCCCTAAACT
CAGGTCAGAAGCTTGCGTGCGGGTGGCTAAAACGTTAGCTGAAGATTATGAAGTTATATA
CCGAGCAGTGACGGATCAGCAAAACGGATATCCAGATCCGAAATCCCTCGCTCGACATCC
ACCGGATCAGATCCGAACCATTCTCGGTATATGAATGCAAGCTTCTTCTACCCGAATTTT
TTTCCTGGTTTTTTCTTGTCATCTTATGAAATCAATACTTGTAAACCAGACTTTAAATGT
TGTATTTTCATATAAAGTTCACACTTTCTTTATCTATTGTTTGTTATATATAAAGGTAGG
CTTGAGCTTGATTTCACTCAAGAGTATCCTGTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C392TF U 1
AF RR4C967TF U 24
AF RR4C392JQ C 147
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BS 816 826 RR4C967TF
BS 827 938 RR4C392JQ

RD RR4C392TF 279 0 0
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AGGGGAGAAACCGGCTTTTGATCCCGTCCTCTCTGCACTGCTCGACCCTATCATTAAGAT
GTGTGAGCAAGCGGCAGAGGCGCACAAATCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAA
CAGAACAAGTTCCGACTCAAGCCAGTTAACATCAGTCGATGCTCTACTCTCTAGCAGCTC
GGCCCCACCACAGAACAATGAAACACCTTCGAAGATATT

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR4C967TF 810 0 0
GAAT
CGAGAACTACAACAGCATGATGGTATCCGCTTCAGGGGAGAAACCGGCTTTTGATCCCGT
CCTCTCTGCACTGCTCGACCCTATCATTAAGATGTGCGAGCAAGCGGCAGAGGCGCACAA
ATCGAAAATGAGCGGACAATTAACCAGACGAAGCAGAACAAGTTCCGACTCAAGCCAGTT
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TTCGAAGATATTCCTCATCAACTGTTTATGCGCTATCCAACAACCTTTGCTAAGACACGA
TGTGGCGTCGCAGTACGTGACCAACATCGGATCAATGATCGAGAACCACATAAACCTCCT
TGTCCAGAAAGAAGTCGACACGCTCCTCCAAAGATGCGGTCTTTCAGACAAAATGCAAAT
CTTCCGCTCCTCCACCACAACTGAACTTCCTTTGTCTGAACGACAGGAGACGTCACCCGC
AATGCTGTCGGAATGCCTCAAGGCCTTCTTCGGCCTCGTTTTGGGAAGCGAAGGCTCTCT
TCCTGAGTTCGAGCAGATACAAGTCCCTAAACTCAGGTCCGAAGCTTGCGTGCGTGTGGC
TAAAACGTTAGCTGAAGATTATGAAGTTATATACCGAGCAGTGACGGATCAGCAAAACGG
ATATCCAGATCCGAAATCCCTCGCTCGACATCCACCGGATCAGATCCGAACCATTCTCGG
TATATGAATGCAAGCTTCTTCTACCCGAATTTTTT*CCTGGTTTTT*CTTGTCATCTTAT
GAAATCA*TACTTGTAAAC
AGACTTT

QA 5 803 5 803
DS 

RD RR4C392JQ 792 0 0
AATCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAACAGAACAAGTTCCGACTCAAGCCAGT
TAACATCAGTCGATGCTCTACTCTCTAGCAGCTCGGCCCCACCACAGAACAATGAAACAC
CTTCGAAGATATTCCTCATCAACTGTTTATGCGCGATCCAACAACCTTTGCTAAGACACG
ATGTGGCGTCGCAGTACGTGACCAACATCGGATCAATGATCGATAACCACATAAACCTCC
TTGTCCAGAAAGAAGTCGACACGCTCCTCCAAAGATGCGGTCTTTCAGACAAAATGCAAA
TCTTCCGCTCCTCCATCACAACTGAACTTCCTTTGTCTGAACGACAGGAGACGTCACCCG
CAATGCTGTCGGAATGCCTCAAGGCCTTCTTCGGCCTCGTTTTGGGAAGCGAAGGCTCTC
TTCCTGAGTTCGAGCAGATACAAGTCCCTAAACTCAGGTCAGAAGCTTGCGTGCGGGTGG
CTAAAACGTTAGCTGAAGATTATGAAGTTATATACCGAGCAGTGACGGATCAGCAAAACG
GATATCCAGATCCGAAATCCCTCGCTCGACATCCACCGGATCAGATCCGAACCATTCTCG
GTATATGAATGCAAGCTTCTTCTACCCGATTTTTTTTCCTGGTTTTTTCTTGTCATCTTA
TGAAATCAATACTTGTAAACCAGACTTTAAATGTTGTATTTTCATATAAAGTTCACACTT
TCTTTATCTATTGTTTGTTATATATAAAGGTAGGCTTGAGCTTGATTTCACTCAAGAGTA
TCCTGTACTTCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL3841Contig1 589 2 1 U
GGTTACTCTAAGATGGTCGAAGTCAGCTGGATACTCTACTTTGTATCCATAGCTGTCTAC
CTTGTTTTAGTCGAGTTTGGTATTTATTGGATGCACAGAGAGCTCCATGACATTAAGCCT
CTCTACAAATATCTCCATGCCACCCATCATATCTACAACAAGCAGAACACACTCTCTCCC
TTTGCCGGGCTTGCGTTCCACCCACTAGACGGGATACTTCAAGCAGTTCCGCATGTGGTA
GCTCTGTTCATAGTGCCAATTCATTTCACAACCCATCTAGGTCTCTTGTTCATGGAAGCC
ATATGGACAGCGAACATCCATGACTGCATCCACGGTAACATATGGCCTGTGATGGGTGCA
GGGTACCATACGATACACCACACCACTTACAAGCATAACTATGGTCACTACACCATATGG
ATGGATTGGATGTTTGGCTCTCTTAGAGACCCTCTATTACAAGAAGAAGATAATAAAACA
GAGTGAGAATGCCCCTTTTGTGTTTTCCTTTTCTTGTTCAAAGTTGCAACCTTTTTATGT
TTCTCTGTCAAACCGTTCCAGTTATTTTTTGTTCAGAGATGTTGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BG61TF U 1
AF RR4BG61JQ C 280
BS 1 589 RR4BG61TF

RD RR4BG61TF 589 0 0
GGTTACTCTAAGATGGTCGAAGTCAGCTGGATACTCTACTTTGTATCCATAGCTGTCTAC
CTTGTTTTAGTCGAGTTTGGTATTTATTGGATGCACAGAGAGCTCCATGACATTAAGCCT
CTCTACAAATATCTCCATGCCACCCATCATATCTACAACAAGCAGAACACACTCTCTCCC
TTTGCCGGGCTTGCGTTCCACCCACTAGACGGGATACTTCAAGCAGTTCCGCATGTGGTA
GCTCTGTTCATAGTGCCAATTCATTTCACAACCCATCTAGGTCTCTTGTTCATGGAAGCC
ATATGGACAGCGAACATCCATGACTGCATCCACGGTAACATATGGCCTGTGATGGGTGCA
GGGTACCATACGATACACCACACCACTTACAAGCATAACTATGGTCACTACACCATATGG
ATGGATTGGATGTTTGGCTCTCTTAGAGACCCTCTATTACAAGAAGAAGATAATAAAACA
GAGTGAGAATGCCCCTTTTGTGTTTTCCTTTTCTTGTTCAAAGTTGCAACCTTTTTATGT
TTCTCTGTCAAACCGTTCCAGTTATTTTTTGTTCAGAGATGTTGACTGC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4BG61JQ 310 0 0
GGTCTCTTGTTCATGGAAGCCATATGGACAGCGAACATCCATGACTGCATCCACGGTAAC
ATATGGCCTGTGATGGGTGCAGGGTACCATACGATACACCACACCACTTACAAGCATAAC
TATGGTCACTACACCATATGGATGGATTGGATGTTTGGCTCTCTTAGAGACCCTCTATTA
CAAGAAGAAGATAATAAAACAGAGTGAGAATGCCCCTTTTGTGTTTTCCTTTTCTTGTTC
AAAGTTGCAACCTTTTTATGTTTCTCTGTCAAACCGTTCCAGTTATTTTTTGTTCAGAGA
TGTTGACTGC

QA 1 310 1 310
DS 



AS 1 2

CO CL3842Contig1 1139 2 2 U
GATTCTCTGGTATAGCTCAAGTTGTCGTGGCAGCTCGTAAGAAGCGAAAGATGAAACTCC
CTGCGGAAGATGACGGCACTGTGACCTACTATGACCCGCCAGTCAAAGATAGCGTGTTAT
CCAAGTTACACCATAGTAACCAATTCAGGTTTCTAGACAAAGCGGCGGTGATAATAGAAG
GTGACCTAACACCCGAGGGAGTTCCGGCGAACGAGTGGCGGCTATGCAGCATTCAAGAAG
TGGAGGAAGTAAAGTGTTTGATCCGAATAGTTCCTGTTTGGTCGGCCGGAATAATCTCGC
TGGCTGCAATGTCACAGCAAGGAACGTTCACCGTCTCTCAAGCGTTGAAAATGGACCGAC
ATATGGGTCCCAACTTCGAGATTCCGGCAGGTTCACTCTCCGTCATCTCTCTCCTCACCA
TCGGCGTCTTTCTTCCCCTATACGACCGCGTTTTAGTCCCGTTCTTCCGCCGTATCACCG
GCCATAAATCAGGTATCACACTCCTCCAACGTATCGGGACAGGCATCGTTTTCGCTATCC
TTTCCATGATCGTCGCCGGGATAGTGGAGCGCATGAGTCGCATACGCTCCATCAACGCCG
GAGATCCGGCCGGTATGACTCCGATGTCGGTGTTTTGGCTCTCTCCACAGCTAATCTTGA
TGGGACTATGCGAAGCGTTTAGCATCATCGGACAGATTGAGTTCTTCAACAGCCAGTTTC
CGGAGCACATGAGAAGCATCGCTAACTCTCTCTTCTCTTTGTCCTTCGCCGGTTCGAACT
ACCTAAGCAGTTTGATAGTCACGACGGTTCATAGGTTCTCCGGTGGCCATGACCGTCCTG
ATTGGCTGAACAAGAATCTCAACGCGGGAAAGTTGGACTACTTCTACTATCTGATTGCGG
TTTTGGGTGTGTTTAATCTGGTTTACTTTTGGTATTGTGCTCGAGGATACCGGTACAAGG
TCGGTTTACAGATGGGAGATTTCGAAGAGAACAAGAGTTTCTCTGATGTTGAGATGAGTT
CCAAAAAACAGCTGAAGTGATTTAATAATGTGGTTAGGAGCAATAAAAAGATGATCGATG
TTGTTTTATAATTATGACAATGTATTTATTGTGTAATATATAAGAACTAAATTCTAAGT


BQ
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AF RR4F737TF U 1
AF RR4F737JQ C 476
BS 1 596 RR4F737TF
BS 597 1139 RR4F737JQ

RD RR4F737TF 596 0 0
GATTCTCTGGTATAGCTCAAGTTGTCGTGGCAGCTCGTAAGAAGCGAAAGATGAAACTCC
CTGCGGAAGATGACGGCACTGTGACCTACTATGACCCGCCAGTCAAAGATAGCGTGTTAT
CCAAGTTACACCATAGTAACCAATTCAGGTTTCTAGACAAAGCGGCGGTGATAATAGAAG
GTGACCTAACACCCGAGGGAGTTCCGGCGAACGAGTGGCGGCTATGCAGCATTCAAGAAG
TGGAGGAAGTAAAGTGTTTGATCCGAATAGTTCCTGTTTGGTCGGCCGGAATAATCTCGC
TGGCTGCAATGTCACAGCAAGGAACGTTCACCGTCTCTCAAGCGTTGAAAATGGACCGAC
ATATGGGTCCCAACTTCGAGATTCCGGCAGGTTCACTCTCCGTCATCTCTCTCCTCACCA
TCGGCGTCTTTCTTCCCCTATACGACCGCGTTTTAGTCCCGTTCTTCCGCCGTATCACCG
GCCATAAATCAGGTATCACACTCCTCCAACGTATCGGGACAGGCATCGTTTTCGCTATCC
TTTCCATGATCGTCGCCGGGATAGTGGAGCGCATGAGTCGCATACGCTCCATCAAC

QA 1 596 1 596
DS 

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CACCGGCCATAAATCAGGTATCACACTCCTCCAACGTATCGGGACAGGCATCGTTTTCGC
TATCCTTTCCATGATCGTCGCCGGGATAGTGGAGCGCATGAGTCGCATACGCTCCATCAA
CGCCGGAGATCCGGCCGGTATGACTCCGATGTCGGTGTTTTGGCTCTCTCCACAGCTAAT
CTTGATGGGACTATGCGAAGCGTTTAGCATCATCGGACAGATTGAGTTCTTCAACAGCCA
GTTTCCGGAGCACATGAGAAGCATCGCTAACTCTCTCTTCTCTTTGTCCTTCGCCGGTTC
GAACTACCTAAGCAGTTTGATAGTCACGACGGTTCATAGGTTCTCCGGTGGCCATGACCG
TCCTGATTGGCTGAACAAGAATCTCAACGCGGGAAAGTTGGACTACTTCTACTATCTGAT
TGCGGTTTTGGGTGTGTTTAATCTGGTTTACTTTTGGTATTGTGCTCGAGGATACCGGTA
CAAGGTCGGTTTACAGATGGGAGATTTCGAAGAGAACAAGAGTTTCTCTGATGTTGAGAT
GAGTTCCAAAAAACAGCTGAAGTGATTTAATAATGTGGTTAGGAGCAATAAAAAGATGAT
CGATGTTGTTTTATAATTATGACAATGTATTTATTGTGTAATATATAAGAACTAAATTCT
AAGT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 3

CO CL3843Contig1 1526 3 11 U
GCTGTGTGAATACTAGTGCACAAAATGTGGGATCCGAAGAAACGACTCCATTTGAATCAG
ATAGAGAACCGACCTGGTCAGATAAATCAGTGGTTGAACAATCATCCCTTGAACCTTGTG
AAGATCAAATACCAGCACGTGAAGCTCCTGTTAGTGTGGTCTTTTCCCGCAACATCACTT
TCCACGAAGATCACGATGCTCCTGAGGATACAGCCGAGTTATCTTGTTTGACATCTGACA
CATCCTCATCTCCGGCAGAGTCTCCTGAGTACGAAACACCTATGGTTGGTGAAGGCTCGA
AGGCGGACTTCTTCCAAGAAACTGTTAATGAGGGGCTTGACCATGAAGTCGAGCGGTTAG
ATCATCTTACAGATTTACGTGCAATATCTCAAAGTCCTCCTGAAGTTATCACCGAAGAAG
CAGAGCGGTTAGATCAGCTTACAGATTTACATGCAATATCTCAAAGTCCTCCTGAAGTTA
TCACTGAAGAGGCAGGCGAGATAAAAGAGATTGATGAAGAAGGATTGTTGTCTGAACTTG
ACACGAGTTTAGACTTCAGTGCTAAAGAAGTTGTGCCAAATTCTGAACCTAAGCCATCTT
CAATAGGATCAGACACTGCTAATGAACAGACGGAAGCTCTGCCTGTTCTTGAAGCGAGAT
CTGTTGAAGACATAGAATCTGCTTTCCAGCAGATCCATGAAGGATCTGAGGTTGAGGATG
TTATACTCCCAAGCACCATTCAAGACCAGTTGGCTCATGAAAATTCTGAAAACTCAACAG
AGGCCAAGTCAGATTTAACAGTGGTGGAAGCTACGTCGAAAGATGATCTAGATACTGCTA
TGAATCAGGCTGTTGTAGAGAGCATGGGCAAGCAACCAATGTCGCCAGGATCAGATGGTG
GGTCTGAAGAAACCAAACGTGCAGTTGAAAGGGAACCGTCAGGGTCTTTAGTTGAAGAAA
GATCTCTTGATGAGACAAATGTTCATCTGACGAACACACCTGAGAAAGAAGAAGAGGAAA
GTAGACCGAAAGAGATAACCACATCATCCGATGCATCGTCTATAGAAACTCGACCACTGG
AGGAAATTCCAAAACCTTCAGAACCAAAGGAGGAGATGGCAATGGAAGTAATTTCTGAAA
GAGAGGTGGTACCCACAGAAGCCATCGAGTGTAGTAATGTAACACTAAGCGATGAAGTTG
TGACTGAAGAAGCAAAAGCTGAGACCTCAAGCAACATTGATGGGATTTTAGAGAGTCCTG
AGTCCAAAGAAACTCCTGAAGATTCAGGGGAAAGCATCGCAAGTATAAAGTAAAGACAGA
GGAGGAGAAGGGGAAGGGTAAGTCCGATTCTTCAAGCTCAAGCTCTAGTTCAAGTGACTC
AGATTGAAAAATAATTCTAAGGGTAATACAACTCAACTCCTAGTGAATATATGTTTGTTA
CACGGTAATGGTAGGCACTTCTTGGTTTTGTTTTTTCATCAGACTGTGTGCTCTGTTTTA
AAAGGGGCAGGAAGAAGCCGCTATCC


BQ
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AF RR4FB11TF U 1
AF RR4DN05TF U 425
AF RR4DN05JQ C 813
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C

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TGAAGACATAGAATCTGCTTTCCAGCAGATCCATGAAGGATCTGAGGTTGAGGATGTTAT
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TGAAGAAACCAAACGTGCAGTTGAAAGGGAACCGTCAGGGTCTTTAGTTGAAGAAAGATC
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ACCGAAAGAGATAACCACATCATCCGATGCATCGTCTATAGAAACTCGACCACTGGAGGA
AATTCCAAAACCTTCAGAACCAAAGGAG
AGAT

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TCAACTCCTAGTGAATATATGTTTGTTACACGGTAATGGTAGGCACTTCTTGGTTTTGTT
TTTTCATCAGACTGTGTGCTCTGTTTTAAAAGGGGCAGGAAGAAGCCGCTATCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 3

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AAACAAACAAAGCAAAACAAAGCAGACCCCACTAGTTGAAGGAGACCTCGAGAACCTTTG
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CTGCTGCACTTGGAAGAGGAACACGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGCAG
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CTGTTTCAGAGGTTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGAAAGCTCGACAGACTCGG
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AGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGAAA
AGAGTCATCTCCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGCTGC
GGTTTGTTTGATGTGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGAACATGAGGAGGAAATCAT
TCAGCAAACAGTGGGCATCAAAAGCTACATGGTCATCAGTAGATTATTTTCTGTACATTC
AGCCATTAATGTTTCTGCTAGATAATAATGAGAGTGTTTTTGAAAAAGATATAAGAACAA
GAACAAAGGTTATTTTCTATTCATGTAAGGAGTTTTGAAAAAACATAGTTATGTATTTCT
TTTGTGTGATATATATTGTCTTATGATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH96TF U 1
AF RR4FM54TF U 170
AF RR4AH96JQ C 418
BS 1 377 RR4AH96TF
BS 378 378 RR4FM54TF
BS 379 676 RR4AH96TF
BS 677 677 RR4FM54TF
BS 678 762 RR4AH96TF
BS 763 863 RR4FM54TF
BS 864 864 RR4AH96JQ
BS 865 889 RR4FM54TF
BS 890 890 RR4AH96JQ
BS 891 945 RR4FM54TF
BS 946 1110 RR4AH96JQ

RD RR4AH96TF 762 0 0
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AAACAAACAAAGCAAAACAAAGCAGACCCCACTAGTTGAAGGAGACCTCGAGAACCTTTG
GAGTGAACGAACCAACACCTAACCCACTCCTTCGATTTTTTTTTTTCATTTGCTGTTCGT
TCACAATCCATTTGATCATGCCGTCTGGTGCCAAGAAGAGAAAGGCCTTGAAGAAAAAGA
AGGAACAAGAAGCCTTTGGAGGCAGCCCAAGCAACAAAAGCTTCAATGGTCATGGGTATG
ATGAACATCATGGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTTCCCCTGGTT
CTCAAGGAAACGGAGAAGTCTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTATCTGGTCTGA
GGAAGGACACTTTTAAAGAGAAAACAGAGGGACAAGAAGCTAAAGGTGAAGACGTTGCTG
CTGCTGCACTTGGAAGAGGAACACGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGCAG
CATCTAAAGAGTCTGGTGGTGGTACTTTGGAAATTGCACCTGTCAAGCCTGTGGACTCTT
CTGTTTCAGAGGTTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGAAAGCTCGACAGACTCGG
CTTCTGTCCAACATAAAGCTAGTGAAAGCCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAAGCAAAGG
AGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4FM54TF 780 0 0
GG
GCTGTTCGTTCACAATCCATTTGATCATGCCGTCTGGTGCCAAGAAGAGAAAGGCCTTGA
AGAAAAAGAAGGAACAAGAAGCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAAGCTTCAATGGTC
ATGGGTATGATGAACATCATGGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTT
CCCCTGGTTCTCAAGGAAACGGAGAAATCTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTAT
CTGGTCTGAGGAAGGACACTTTTAAAGAGAAAACAGAGGGACAAGAAGCTAAAGGTGAAG
ACGTTGCTGCTGCTGCACTTGGAAGAGGAACACGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACG
GAAAAGCAGCATCTAAAGAGTCTGGTGGTGGTACTTTGGAAATTGCACCTGTCAAGCCTG
TGGACTCTTCTGTTTCAGAGGTTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGAAAGCTCGA
CAGACTCGGCTCCTGTCCAACATAAGGCTAGTGAAAGCCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAG
AAGCAAAGGAGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGCCAGAATGTT
CTGAAGAAAAGAGTCATCTCCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTT
AGTTGCTGCGGTTTGTTTGATGTGATGGCAGG*TCAGAAAGATAATACAGAACATGAG*A
GGAAATCATTCAGCAAACAGTGGGCATCAAAAGCTACATGGTCATCAGTAGATT
TTTT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR4AH96JQ 693 0 0
TGAGGAAGGACACTTTTAAAGAGAAAACAGAGGGACAAGAAGCTAAAGGTGAAGACGTTG
CTGCTGCTGCACTTGGAAGAGGAACACGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAG
CAGCATCTAAAGAGTCTGGTGGTGGTACTTTGGAAATTGCACCTGTCAAGCCTGTGGACT
CTTCTGTTTCAGAGGTTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGAAAGCTCGACAGACT
CGGCTTCTGTCCAACATAAGGCTAGTGAAAGCCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAAGCAA
AGGAGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAG
AAAAGAGTCATCTCCC*TTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGC
TGCGGTTTGTTTGATGTGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGAACATGAGGAGGAAAT
CATTCAGCAAACAGTGGGCATCAAAAGCTACATGGTCATCAGTAGATTATTTTCTGTACA
TTCAGCCATTAATGTTTCTGCTAGATAATAATGAGAGTGTTTTTGAAAAAGATATAAGAA
CAAGAACAAAGGTTATTTTCTATTCATGTAAGGAGTTTTGAAAAAACATAGTTATGTATT
TCTTTTGTGTGATATATATTGTCTTATGATTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL3845Contig1 823 3 2 U
GGGTTAATCCTCATACACATCAGGTCAAGCTCTGCGACTTTGGTAGCGCTAAAGTTCTGG
TGAAGGGCGAACCAAACATCTCATACATCTGTTCCCGTTACTACCGAGCACCTGAGCTTA
TATTTGGAGCTACAGAATACACAACAGCTATTGACATATGGTCTGCAGGGTGTGTTCTTG
CTGAGTTGCTCCTTGGACAGCCTCTGTTTCCAGGTGAGAGTGGAGTCGACCAACTAGTAG
AGATCATTAAGGTTCTTGGAACACCAACTCGAGAGGAAATCAAATGTATGAATCCAAACT
ACACTGAATTCAAGTTCCCGCAAATTAAGGCTCACCCTTGGCACAAAATATTCCATAAGC
GTACACCTCCAGAAGCTGTAGATCTAGCCTCAAGACTTCTCCAGTATTCTCCAAACCTCA
GATCAACCGCTATGGAGGCAATAGTTCACCCGTTCTTCGATGAGCTACGTGATCCCAATA
CACGTCTACCTAATGGTCGTCCCTTGCCTCCTCTCTTCAACTTCAAACCTTAAGAGCTTA
AAGGAGCAAGCGTAGAGCTGTTGTCCAAGCTTATACCTGAACACGCCCGAAAGCAGTGTT
CCTTCCTCGCTGTCTGAGTGACTAAACCTCTCTGTGTGTATGTATGTATGT****ATGCA
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TTAGCTTTTCATCTTCTATTAATGTAGCCTGTGTCGTTTATTGTCAGGGTCCCACGGATG
ATCAAACATTATTTATTTATCAAAAAAAGCTATGTTCTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD47TF U 1
AF RR4CD47JQ C 37
AF RR4A028TFB U 310
BS 1 678 RR4CD47TF
BS 679 823 RR4A028TFB

RD RR4CD47TF 678 0 0
GGGTTAATCCTCATACACATCAGGTCAAGCTCTGCGACTTTGGTAGCGCTAAAGTTCTGG
TGAAGGGCGAACCAAACATCTCATACATCTGTTCCCGTTACTACCGAGCACCTGAGCTTA
TATTTGGAGCTACAGAATACACAACAGCTATTGACATATGGTCTGCAGGGTGTGTTCTTG
CTGAGTTGCTCCTTGGACAGCCTCTGTTTCCAGGTGAGAGTGGAGTCGACCAACTAGTAG
AGATCATTAAGGTTCTTGGAACACCAACTCGAGAGGAAATCAAATGTATGAATCCAAACT
ACACTGAATTCAAGTTCCCGCAAATTAAGGCTCACCCTTGGCACAAAATATTCCATAAGC
GTACACCTCCAGAAGCTGTAGATCTAGCCTCAAGACTTCTCCAGTATTCTCCAAACCTCA
GATCAACCGCTATGGAGGCAATAGTTCACCCGTTCTTCGATGAGCTACGTGATCCCAATA
CACGTCTACCTAATGGTCGTCCCTTGCCTCCTCTCTTCAACTTCAAACCTTAAGAGCTTA
AAGGAGCAAGCGTAGAGCTGTTGTCCAAGCTTATACCTGAACACGCCCGAAAGCAGTGTT
CCTTCCTCGCTGTCTGAGTGACTAAACCTCTCTGTGTGTATGTATGTATGT****ATGCA
ATATGTACGCATGCGTAT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4CD47JQ 772 0 0
ACTTTGGTAGCGCTAAAGTTCTGGTGAAGGGCGAACCAAACATCTCATACATCTGTTCCC
GTTACTACCGAGCACCTGAGCTTATATTTGGAGCTACAGAATACACAACAGCTATTGACA
TATGGTCTGCAGGGTGTGTTCTTGCTGAGTTGCTCCTTGGACAGCCTCTGTTTCCAGGTG
AGAGTGGAGTCGACCAACTAGTAGAGATCATTAAGGTTCTTGGAACACCAACTCGAGAGG
AAATCAAATGTATGAATCCAAACTACACTGAATTCAAGTTCCCGCAAATTAAGGCTCACC
CTTGGCACAAAATATTCCATAAGCGTACACCTCCAGAAGCTGTAGATCTAGCCTCAAGAC
TTCTCCAGTATTCTCCAAACCTCAGATCAACCGCTATGGAGGCAATAGTTCACCCGTTCT
TCGATGAGCTACGTGATCCCAATACACGTCTACCTAATGGTCGTCCCTTGCCTCCTCTCT
TCAACTTCAAACCTTAAGAGCTTAAAGGAGCAAGCGTAGAGCTGTTGTCCAAGCTTATAC
CTGAACACGCCCGAAAGCAGTGTTCCTTCCTCGCTGTCTGAGTGACTAAACCTCTCTGTG
TGTATGTATGTATGT****ATGCAATATGTACGCATGCGTATGCTTAAGTAATGGAGTTA
GCCCGTACTCAAAGATTATTATTGTTAGCTTTTCATCTTCTATTAATGTAGCCTGTGTCG
TTTATTGTCAGGGTCCCACGGATGATCAAACATTATTTATTTATCAAAAAAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4A028TFB 514 0 0
GG
AAGTTCCCGCAAATTAAGGCTCACCCTTG*CACAAAATATTCCATAAGCGTACACCTCCA
GAAGCTGTAGATCTAGCCTCAAGACTTCTCCAGTATTCTCCAAACCTCAGATCAACCGCT
ATGGAGGCAATAGTTCACCCGTTCTTCGATGAGCTACGTGATCCCAATACACGTCTACCT
AATGGTCGTCCCTTGCCTCCTCTCTTCAACTTCAAACCTCAAGAGCTTAAAGGAGCAAGC
GTAGAGCTGTTGTCCAAGCTTATACCTGGACACGCCCGAAAGCAGTGTTCCTTCCTCGCT
GTCTGAGTGACTAAACCTCTCTGTGTGTATGTATGTATGTATGTATGCAATATGTACGCA
TGCGTATGCTTAAGTAATGGAGTTAGCCCGTACTCAAAGATTATTATTGTTAGCTTTTCA
TCTTCTATTAATGTAGCCTGTGTCGTTTATTGTCAGGGTCCCACGGATGATCAAACATTA
TTTATTTATCAAAAAAAGCTATGTTCTCTACC

QA 3 514 3 514
DS 



AS 1 2

CO CL3846Contig1 1286 2 2 U
GATAGCGACTCCTGGGCGTCTTCTTGACCATCTTCAACATACCAAGGGTTTCATCTATAA
ACACCTAAAGTGCCTTGTGATTGATGAAGCTGATAGGATACTGGAAGAAAATTTTGAGGA
AGACATGAATAAGATTCTAAAAATTCTGCCAAAGACTAGGCAAACTGCACTATTCTCTGC
CACCCAGACTTCGAAGGTTCAAGATCTTGCTAGGGTGTCATTGACGTCTCCCGTTCTTGT
TGATGTCGATGATGGTAGACGCAAGGTGACAAATGAAGGATTAGAGCAAGGCTATTGCGT
TGTTCCGAGCGAGAAGAGACTTCTCCTTCTAATTTCTTTTTTGAAGAAGAACCTAAATAA
GAAAATAATGGTCTTCTTCTCGACGTGCAAGTCGGTGCAGTTCCACGCCGAAATCATGAA
GCTTATCAACGTGGACAGCTGTGACATCCATGGAGGACTGGATCAGAACCGAAGAACTAA
AACCTTTTTCGACTTTATGAAAGCAGAAAAAGGTATTCTGTTGTGTACTGATGTTGCTGC
TCGTGGTCTCGACATTCCTGCCGTGGACTGGATTATACAATATGATCCTCCAGACAAGCC
AACGGAATATATTCACAGGGTTGGTCGAACAGCCCGGGGAGAAGGAGCAAAGGGAAAGGC
ATTGCTTGTCTTGATCCCTGAAGAGCTTCAGTTTATTCGATACCTTAAGGCGGCAAAAGT
GCCTGTGAAAGAGCTTGAGTTCAATGAGAAGAAGCTTTTGAATGTTAGATCTGCTCTGGA
GAAGTATGTTGCCAAGGACTATAACCTGAACAAGATAGCCAAGGAAGCGTACCGAGCTTA
TATCGCAGCATACAATTCACATTCTCTGAAAGACATCTTTAATGTTCACCGGCTTGATCT
TCAGGCGGTTGCTCTATCGTTCTGCTTCTCTTCGCCGCCAAAAGTGCATCTGAACATAGA
AAGCGGAGCTGGGAAGGTGAGGAAGGCGAGGAATCAGCAAGGTCGCAATGGCTTCTCTCC
TTACACTCCCTATGGCAAAACCAAGTCCACACCCAAAGCGGCGTGAAGTGTCTTGTGACC
AAATTAAAGATTATTTGCCTCTCGTTTGGATCAAAAAGTGTTTTTATGAATCACCACCAA
GTTTTGCCTCAACAGTTCTGTGTGGTTTTTTAGTTTAGATGTTATGTTTCTTTTAATACT
TCAGATCTCTCTCTGTTTCGTTATAAGAATTGTTTAATCAACTAATGGCAGCTTTCTATA
GATATTATTTGGTTATGAAATATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A730TF U 1
AF RR4A730JQ C 413
BS 1 708 RR4A730TF
BS 709 1286 RR4A730JQ

RD RR4A730TF 716 0 0
GATAGCGACTCCTGGGCGTCTTCTTGACCATCTTCAACATACCAAGGGTTTCATCTATAA
ACACCTAAAGTGCCTTGTGATTGATGAAGCTGATAGGATACTGGAAGAAAATTTTGAGGA
AGACATGAATAAGATTCTAAAAATTCTGCCAAAGACTAGGCAAACTGCACTATTCTCTGC
CACCCAGACTTCGAAGGTTCAAGATCTTGCTAGGGTGTCATTGACGTCTCCCGTTCTTGT
TGATGTCGATGATGGTAGACGCAAGGTGACAAATGAAGGATTAGAGCAAGGCTATTGCGT
TGTTCCGAGCGAGAAGAGACTTCTCCTTCTAATTTCTTTTTTGAAGAAGAACCTAAATAA
GAAAATAATGGTCTTCTTCTCGACGTGCAAGTCGGTGCAGTTCCACGCCGAAATCATGAA
GCTTATCAACGTGGACAGCTGTGACATCCATGGAGGACTGGATCAGAACCGAAGAACTAA
AACCTTTTTCGACTTTATGAAAGCAGAAAAAGGTATTCTGTTGTGTACTGATGTTGCTGC
TCGTGGTCTCGACATTCCTGCCGTGGACTGGATTATACAATATGATCCTCCAGACAAGCC
AACGGAATATATTCACAGGGTTGGTCGAACAGCCCGGGGAGAAGGAGCAAAGGGAAAGGC
ATTGCTTGTCTTGATCCCTGAAGAGCTTCAGTTTATTCGATACCTTAA
AGCGGCAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4A730JQ 874 0 0
ATCATGAAGCTTATCAACGTGGACAGCTGTGACATCCATGGAGGACTGGATCAGAACCGA
AGAACTAAAACCTTTTTCGACTTTATGAAAGCAGAAAAAGGTATTCTGTTGTGTACTGAT
GTTGCTGCTCGTGGTCTCGACATTCCTGCCGTGGACTGGATTATACAATATGATCCTCCA
GACAAGCCAACGGAATATATTCACAGGGTTGGTCGAACAGCCCGGGGAGAAGGAGCAAAG
GGAAAGGCATTGCTTGTCTTGATCCCTGAAGAGCTTCAGTTTATTCGATACCTTAAGGCG
GCAAAAGTGCCTGTGAAAGAGCTTGAGTTCAATGAGAAGAAGCTTTTGAATGTTAGATCT
GCTCTGGAGAAGTATGTTGCCAAGGACTATAACCTGAACAAGATAGCCAAGGAAGCGTAC
CGAGCTTATATCGCAGCATACAATTCACATTCTCTGAAAGACATCTTTAATGTTCACCGG
CTTGATCTTCAGGCGGTTGCTCTATCGTTCTGCTTCTCTTCGCCGCCAAAAGTGCATCTG
AACATAGAAAGCGGAGCTGGGAAGGTGAGGAAGGCGAGGAATCAGCAAGGTCGCAATGGC
TTCTCTCCTTACACTCCCTATGGCAAAACCAAGTCCACACCCAAAGCGGCGTGAAGTGTC
TTGTGACCAAATTAAAGATTATTTGCCTCTCGTTTGGATCAAAAAGTGTTTTTATGAATC
ACCACCAAGTTTTGCCTCAACAGTTCTGTGTGGTTTTTTAGTTTAGATGTTATGTTTCTT
TTAATACTTCAGATCTCTCTCTGTTTCGTTATAAGAATTGTTTAATCAACTAATGGCAGC
TTTCTATAGATATTATTTGGTTATGAAATATAAA

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 3

CO CL3847Contig1 604 3 1 U
GGATCGTATAACTACATTCACAAGTACGGTTACAAGTCCAAGCTGATGGCTGCTGCTGTC
AGAAACAAACAAGACTTGTTCAGTCTTCTCGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGAAG
GTGCTGCAGTCTCTCAAAGACTCACCAGCCATTCCTGACGATGAGAAATACTCGTTCGTT
CGGAAACTTTCTCCTGAGACCGCGACGCACTACAACTTCACCAACAAGGAGCTGATCAAA
TGGGACCAGCTGAGCTTGGCTTCAGCTGTGGGTCCTGCATCAGTGGAGCTTTTATCAGCT
GGTGTGGAAGGTTATGCGAACCAAGCGAAACGTGTTGAAGAGTTCTTTGGGAAGATTTGG
CCACCTCCAAATGTTTAAGCGAAGCTTTGATCTTCGTCTCTACGGATCTTAAATCAATAA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGACTCCATGCTACTTAACCTCTTTGTCTGCGTTATT
TCGTTTTCTTGTTCCTTGTTAATCACGGCTCCTGGTCTGAAACTTGAGCCACAAGATAAA
GAGACCAATGAAGCTGAAGTAAAATCAATCAATTATCATGTTGTCTGTTCTAAAAATTCC
AATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
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10 10 10 10 

AF RR4DP79JQ C 59
AF RR4AS78TF U 22
AF RR4DP79TF U 1
BS 1 604 RR4DP79TF

RD RR4DP79JQ 539 0 0
TCAGAAACAAACAAGACTTGTTCAGTCTTCTCGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGA
AGGTGCTGCAGTCTCTCAAAGACTCACCAGCCATTCCTGACGATGAGAAATACTCGTTCG
TTCGGAAACTTTCTCCTGAGACCGCGACGCACTACAACTTCACCAACAAGGAGCTGATCA
AATGGGACCAGCTGAGCTTGGCTTCAGCTGTGGGTCCTGCATCAGTGGAGCTTTTATCAG
CTGGTGTGGAAGGTTATGCGAACCAAGCGAAACGTGTTGAAGAGTTCTTTGGGAAGATTT
GGCCACCTCCAAATGTTTAAGCGAAGCTTTGATCTTCGTCTCTACGGATCTTAAATCAAT
AAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGACTCCATGCTACTTAACCTCTTTGTCTGCGTTA
TTTCGTTTTCTTGTTCCTTGTTAATCACGGCTCCTGGTCTGAAACTTGAGCCACAAGATA
AAGAGACCAATGAAGCTGAAGTAAAATCAATCAATTATCATGTTGTCTGTTCTAAAAAT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4AS78TF 567 0 0
G
AGTACGGTTACAAGTCCAAGCTGATGGCTGCTGCTGTCAGAAACAAACAAGACTTGTTCA
GTCTTCTCGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGAAGGTGCTGCAGTCTCTCAAAGACT
CACCAGCCATTCCTGACGATGAGAAATACTCGTTCGTTCGGAAACTTTCTCCTGAGACCG
CGACGCACTACAACTTCACCAACAAAGAGCTGATCAAATGGGACCAGCTGAGCTTGGCTT
CAGCTATGGGTCCTGCATCAGTGGAGCTTTTATCAGCTGGTGTGGAAGGTTATGCGAACC
AAGCGAAACGTGTTGAAGAGTTCTTTGGGAAGATTTGGCCACCTCCAAATGTTTAAACGA
AGCTTTGATCTTCGTCTCTACGGATCTTAAATCAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**
TAGACTCCATGCTACTTAACCTCTTTGTCTGCGTTATTTCGTTTTCTTGTTCCTTGTTAA
TCACGGCTCCTGGTCTGAAACTTGAGCCACAAGATAAAGAGACCAATGAAGCTGAAGTAA
AATCAATCAATTATCATGTTGTCTGT

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR4DP79TF 604 0 0
GGATCGTATAACTACATTCACAAGTACGGTTACAAGTCCAAGCTGATGGCTGCTGCTGTC
AGAAACAAACAAGACTTGTTCAGTCTTCTCGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGAAG
GTGCTGCAGTCTCTCAAAGACTCACCAGCCATTCCTGACGATGAGAAATACTCGTTCGTT
CGGAAACTTTCTCCTGAGACCGCGACGCACTACAACTTCACCAACAAGGAGCTGATCAAA
TGGGACCAGCTGAGCTTGGCTTCAGCTGTGGGTCCTGCATCAGTGGAGCTTTTATCAGCT
GGTGTGGAAGGTTATGCGAACCAAGCGAAACGTGTTGAAGAGTTCTTTGGGAAGATTTGG
CCACCTCCAAATGTTTAAGCGAAGCTTTGATCTTCGTCTCTACGGATCTTAAATCAATAA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGACTCCATGCTACTTAACCTCTTTGTCTGCGTTATT
TCGTTTTCTTGTTCCTTGTTAATCACGGCTCCTGGTCTGAAACTTGAGCCACAAGATAAA
GAGACCAATGAAGCTGAAGTAAAATCAATCAATTATCATGTTGTCTGTTCTAAAAATTCC
AATA

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL3848Contig1 1153 2 2 U
GGGACATGGTCATAGAGGCGGTGATTGAAAACATTCAGTTGAAACAAAAGATATTCAAAG
AAATCGAAGAGGTCTGTCCACCAAACTGCATTTTGGCTAGCAACACATCCACTATCGACC
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CGGCACATCTGATGACACTTCTGGAGATAGTTCGTACAGAGAACACATCTGCTCAGGTGA
TTCTTGATCTCATGGCGCTTGGGAAGGCCATAAAGAAAGTCCCCGTGGTGGTTGGGAACT
GCATAGGCTTTGCAGTGAATAGGACATTCTTTCCATATACACAATCTGCACACATGTAGG
TCAATCTTGGTGTTGATTTGTTCAGAGTAGACAGTGTTATCACCTCTTTCGGCTTGCCGT
TGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGACACGGGATTGGAATAGCAGTCAAGGATA
TATACACCAAGGCCTATGGTGACCGAATGTTCGCCTCTCCGTTGACAGAGCTTCTGCTCA
AGAGCGGGAGAAACGGGAAGATCAACGGGAGAGGATACTATAGCTACGAAAAGGGAAGCA
GACCAAAACCTAACTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCGAGGAGACTTACAAATA
TCATGCCCGGTGGGAAGCCTATATCAGTAACTGATAAAGAGATTGTTGAGATGATATTGT
TCCCTGTGGTTAACGAGGCGTGCCGTGTCCTGGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCAG
ACTTGGACGTTGCTTCTGTCCTTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGACTTATAT
TCTGGGCAGACACGGTTGGACCAAAGTACATATATGAAAGGCTGAAGAGATTGTCGGAGA
CTTATGGTGCCTTTTTCAAACCATCGAGTTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAACGGAATGC
TTTTGAGTGAACCTAAATCGTCGAGGTCTCGGCTGTGAATGCACAAAAAGGGAACTTAAG
AAGTAAGCAACAAAAGATGGGTTGGAACATGTTTATGCTGAAATTGTTAAGTCACTAAAT
GAGATGATTGTTTTAAACACTCGAAAAGCGAGTTTTATGTTCTTAAATAAAATATTCGTT
ACGACATCAAAAG


BQ
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AF RR4AI52TF U 1
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BS 751 1153 RR4AI52JQ

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TCAATCTTGGTGTTGATTTGTTCAGAGTAGACAGTGTTATCACCTCTTTCGGCTTGCCGT
TGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGACACGGGATTGGAATAGCAGTCAAGGATA
TATACACCAAGGCCTATGGTGACCGAATGTTCGCCTCTCCGTTGACAGAGCTTCTGCTCA
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GACCAAAACCTAACTCATCAGTGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCGAGGAGACTTACAAATA
TCATGCCCGGTGGGAAGCCTATATCAGTAACTGATAAAGAGATTGTTGAGATGATATTGT
TCCCTGTGGTTAACGAGGCGTGCCGTGTCC

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DS 

RD RR4AI52JQ 772 0 0
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TCAACGGGAGAGGATACTATAGCTACGAAAAGGGAAGCAGACCAAAACCTAACTCATCAG
TGCTTTCAGTTGTTGAGGAATCGAGGAGACTTACAAATATCATGCCCGGTGGGAAGCCTA
TATCAGTAACTGATAAAGAGATTGTTGAGATGATATTGTTCCCTGTGGTTAACGAGGCGT
GCCGTGTCCTGGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCAGACTTGGACGTTGCTTCTGTCC
TTGGAATGAGTTTTCCTTCTTACCGCGGGGGACTTATATTCTGGGCAGACACGGTTGGAC
CAAAGTACATATATGAAAGGCTGAAGAGATTGTCGGAGACTTATGGTGCCTTTTTCAAAC
CATCGAGTTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAACGGAATGCTTTTGAGTGAACCTAAATCGT
CGAGGTCTCGGCTGTGAATGCACAAAAAGGGAACTTAAGAAGTAAGCAACAAAAGATGGG
TTGGAACATGTTTATGCTGAAATTGTTAAGTCACTAAATGAGATGATTGTTTTAAACACT
CGAAAAGCGAGTTTTATGTTCTTAAATAAAATATTCGTTACGACATCAAAAG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4F783JQ C 1
AF RR4F783TF U 1
AF RR4EZ80TF U 4
BS 1 5 RR4F783JQ
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AAAGCCATTGTTGAGCAAACTTAACTCATCAAAGGACAAATCAGTCTCCGAGGATGCAAC
AGCTCCTCCCGCGGCCGACGCTGACACAGCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACAGCTCC
TCCTGCGACTGACGATGCCACAGCTCCTTCCACGTCCGACGCCTAAAAGGTGAGAATAGC
CTCTGCGGGAGACATGTCTTACTATAATATTTATAAGCAATATATGTTTTGTGTGTGCTA
TGTTGTTGTTTTCTTCTACGTAAAATATTGTTCGGTTTTAATTTATTGCCTTGACGATGA
TTTTAAGTTAAGGTAATCTTGTTTTTTCTTTTGTTTTGTAATAAAATTCCGAGATGGAAT
AATAGGTCAATGACATACGATGTAATTGATTTGC

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CTCCCGCGGCCGACGCTGACACAGCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACAGCTCCTCCTG
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QA 6 574 6 574
DS 

RD RR4EZ80TF 585 0 0
GG
CTGAAGAAAAACAGAAAAAGAAGAAGAAGCGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGGAAGAAATGG
ATAAAGCACCAGAAATTCATTTTCCAAAACTGGAGAAACCTTCAGGCAAGAAACAAACAA
CGACAGTTGTTGTCGGAGCTTTGGCTGTCGCATGGTTGGCGGTGGAGTTCGTGTTAAAGC
CATTGTTGAGCAAACTTAACTCATCAAAGGACAAATCAGTCTCCGAGGATGCAACAGCTC
CTCCCGCGGCCGACGCTGACACAGCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACAGCTCCTCCTG
CGACTGACGATGCCACAGCTCCTTCCACGTCCGACGCCTAAAAGGTGAGAATAGCCTCTG
CGGGAGACATGTCTTACTATAATATTTATAAGCAATATATGTTTTGTGTGTGTTATGTTG
TTGTTTTCTTCTACGTAAAATATTGTTCGGTTTTAATTTATTGCCTTGACGATGATTTTA
AGTTAAGGTAATCTTGTTTTTTCTTTTGTTTTGTAATAAAATTCCGAGATGGAATAATAA
GTCAATGACATACGATGTAATTGATTTGCATTTCTTAGTTGCC

QA 3 585 3 585
DS 



AS 1 2

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AGTCTTTGACTGTCCAGGCCAGATAGAGATTTTCACACATGTACCTGTGCTCAAAAACTT
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GTTTGTAACAGATGTAACCAAGTTTATCAGCGGATGTATGGTTTCTCTTTCTGCAATGAT
CCAGCTTGAACTGCCTCATGTTAACATCCTCTCTAAGATGGATCTCTTACAGGACAAAAG
CAACATTGATGAATACTTGGATCCGGAGCCACACACGATGCTGGCTGGGTTAAACCAAAG
GATGGCTCCTCAATATGCAAAACTGAACAAAGCCTTGATTGAATTGGTCGAACAGTACAG
CATGGTGAGATTCACGCCGCTTGATTTGAGGAAAGAAAGGAGCATACAATATGTACTCTC
TGAAATCGACAAGTGCATTCAGTTTGGTGAAGACGCAGAGGTCAAGATCAAAGAACTTGA
TGAAGACATGGATCAACTAGAGCTCTAGAAGAAAACTTGGAAGTTAACTTCTTTGTGAAG
GAAGAGTAATGGGTAGTCAGTCAGTAGTGACATTATGTGTTTGTTCATTACTCTTTTAAC
TTTTTATATTTCAGAAACTGATGCTAAAGACAATTGCAAATTCAAGATTTTATAACAATA
GTGTGTGTTGTTT


BQ
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AF RR4CJ44TF U 1
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DS 

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GTGGAGCATCTGAAGAAGAATAGCTTCAATGTCTGTGCTGTGTATTTGCTTGACTCGCAG
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ATGGCTCCTCAATATGCAAAACTGAACAAAGCCTTGATTGAATTGGTCGAACAGTACAGC
ATGGTGAGATTCACGCCGCTTGATTTGAGGAAAGAAAGGAGCATACAATATGTACTCTCT
GAAATCGACAAGTGCATTCAGTTTGGTGAAGACGCAGAGGTCAAGATCAAAGAACTTGAT
GAAGACATGGATCAACTAGAGCTCTAGAAGAAAACTTGGAAGTTAACTTCTTTGTGAAGG
AAGAGTAATGGGTAGTCAGTCAGTAGTGACATTATGTGTTTGTTCATTACTCTTTTAACT
TTTTATATTTCAGAAACTGATGCTAAAGACAATTGCAAATTCAAGATTTTATAACAATAG
TGTGTGTTGTTT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

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GACCAGATATTCATTCACCCTATCAGGATTCAGAAAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATAAC
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AGGGATTCGAGACCTCATCATCAACTCCATTAAGATCGGCTACCGCCACCTCGACTGCGC
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CCTCGTTCATTTCCCCGTTGCAACTAGGCACACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCTTT
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CATGGAAAAGCTTGTTTCTATGGGTCTCGTCCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGT
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GACGCATCCTTACTTCCAACGCGACTCTCTTGTAAAGTTCTGCCAGAAGCATGGTATTTG
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CTCATGTCTCGATGACCCAGCTCTCAAGGAAGTGGCGGAGAAGTACAAAAAGACAGTGGC
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GGCTGAGAGGTTGGAAGAGAATTTCAAGGTTTTCGACTTCGAACTGACGAAAGAGGACAT
GGAGGTGATCAAGAGCATGGACAGGAAGTACCGTACTAACCAACCGGCCAAGTTTTGGGG
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GAAGAAGCTAAGGCGTTTAGCTTCTTCACCTGTGGGACATTCTCAATGGTTGTAAACCTA
TTTTATTTAAAATTCGTATGTTGAACATGTTATAGTTTTTAATATTACTCACATTTGATG
C


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4CN40TF U 379
AF RR4E882TF U 1
AF RR4CN40JQ C 426
BS 1 703 RR4E882TF
BS 704 704 RR4CN40JQ
BS 705 736 RR4E882TF
BS 737 1201 RR4CN40JQ

RD RR4CN40TF 234 0 0
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TGCAACTAGGCACACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCTTTGGGAGATGATGGAGTATT
GGACATAGATACTACCATCTCTCTTGAAACTACATGGCATGACATGGAAAAGCTTGTTTC
TATGGGTCTCGTCCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGTGTTTCTAACGAG

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR4E882TF 736 0 0
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GACCAGATATTCATTCACCCTATCAGGATTCAGAAAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATAAC
CCTGAACAGTGGCTACAAGATGCCGATCGTCGGCTTAGGAGTGTGGAGAATGGAGAAAGA
AGGGATTCGAGACCTCATCATCAACTCCATTAAGATCGGCTACCGCCACCTCGACTGCGC
TGCTGATTATAGGAACGAAGCTGAAGTTGGTGAGGCTCTCTCAGAAGCATTCAAGACTGG
TTTAGTCAAGAGAGAGGATCTCTTCGTTACAACCAAGCTATGGAATTCAGACCATGGACA
TGTAATTGAAGCTTGCAAGGACAGTCTGAAGAAACTTCAACTTGATTATCTCGACCTTTA
CCTCGTTCATTTCCCCGTTGCAACTAGGCACACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCTTT
GGGAGATGATGGAGTATTGGACATAGATACTACCATCTCTCTTGAAACTACATGGCATGA
CATGGAAAAGCTTGTTTCTATGGGTCTCGTCCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGT
GTTTCTAACGAGGGATTGCTTGGCTTATTCCAAGATAAAGCCAGCGGTGAATCAGATTGA
GACGCATCCTTACTTCCAACGCGACTCTCTTGTAAAGTTCTGC*AGAAGCATGGTATTTG
TGTCACAGCTCATACT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4CN40JQ 776 0 0
TTCATTTCCCCGTTGCAACTAGGCACACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCTTTGGGAG
ATGATGGAGTATTGGACATAGATACTACCATCTCTCTTGAAACTACATGGCATGACATGG
AAAAGCTTGTTTCTATGGGTCTCGTCCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGTGTTTC
TAACGAGGGATTGCTTGGCTTATTCCAAGATAAAGCCAGCGGTGAATCAGATTGAGACGC
ATCCTTACTTCCAACGCGACTTTCTTGTAAAGTTCTGCCAGAAGCATGGTATTTGTGTCA
CAGCTCATACTCCTTTCGGAGGTGCCGCGGCCAATGCAGAGTGGTTTGGTACCGTCTCAT
GTCTCGATGACCCAGCTCTCAAGGAAGTGGCGGAGAAGTACAAAAAGACAGTGGCACAGG
TGGTGCTGAGGTGGGGAATACAGAGGAACACAGTGGTGATACCAAAGACATCCAAGGCTG
AGAGGTTGGAAGAGAATTTCAAGGTTTTCGACTTCGAACTGACGAAAGAGGACATGGAGG
TGATCAAGAGCATGGACAGGAAGTACCGTACTAACCAACCGGCCAAGTTTTGGGGGATTG
ATCTCTACGCTTGAATGAATTGATCACCGCGGCTCTTGTCTCTATATGAATAAGAGAAGA
AGCTAAGGCGTTTAGCTTCTTCACCTGTGGGACATTCTCAATGGTTGTAAACCTATTTTA
TTTAAAATTCGTATGTTGAACATGTTATAGTTTTTAATATTACTCACATTTGATGC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 3

CO CL3852Contig1 564 3 1 U
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AAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGCGACCAGAGAGTACACAATCAACCTTCACAGACGCCTC
CACAGCTGCGCCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATTAAGGAGATAAGGAAGTTTGCA
GAGAAAGCAATGGGAACCAAGGACGTTAGGGTAGACGTGAAGTTGAACAAGCAGATATGG
AGCAAAGGTATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATCAGGGTCCGCGTTGCACGTAAGAGGAAC
GACGATGAAGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCGCTTGTCACCGTTGCTGAAATCCCTGCT
GAAGGACTAAGTGGACTCGGCACAAAGGTCATTGATGAGGAGGATTGAGAAGGGACTATC
TACTCTGTGGCTTTTAGACAAGTTTTGGTGTTTTTCTCTTAAATTTCTTGTTGGGTTTTC
ATTCAAAGAAGTCACAGATGCAGTTTATTATTGGAAAGACTCGTTTACTATTAGACCTTG
CGATGAATCTTTTTTGTCTTCTGG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 

AF RR4H102JQ C 1
AF RR4H102TF U 1
AF RR4H473TF U 1
BS 1 564 RR4H102TF

RD RR4H102JQ 564 0 0
GCGCAAAGGTAAGATTTTGAAGAAGTACATCACAGGACAAAAGAGAAGATGTTTGAGAAA
AAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGCGACCAGAGAGTACACAATCAACCTTCACAGACGCCTC
CACAGCTGCGCCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATTAAGGAGATAAGGAAGTTTGCA
GAGAAAGCAATGGGAACCAAGGACGTTAGGGTAGACGTGAAGTTGAACAAGCAGATATGG
AGCAAAGGTATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATCAGGGTCCGCGTTGCACGTAAGAGGAAC
GACGATGAAGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCGCTTGTCACCGTTGCTGAAATCCCTGCT
GAAGGACTAAGTGGACTCGGCACAAAGGTCATTGATGAGGAGGATTGAGAAGGGACTATT
TACTCTGTGGCTTTTAGACAAGTTTTGGTGTTTTTTTTTTAAATTTCTTGTTGGGTTTTC
ATTCAAAGAAGTCACAGATGCAGTTTATTATTGGAAAGACTCGTTTACTATTAGACCTTG
CGATGAATCTTTTTTGTTTTCTGG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4H102TF 564 0 0
GCGCAAAGGTAAGATTTTGAAGAAGTACATCACAGGACAAAAGAGAAGATGTCTGAGAAA
AAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGCGACCAGAGAGTACACAATCAACCTTCACAGACGCCTC
CACAGCTGCGCCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATTAAGGAGATAAGGAAGTTTGCA
GAGAAAGCAATGGGAACCAAGGACGTTAGGGTAGACGTGAAGTTGAACAAGCAGATATGG
AGCAAAGGTATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATCAGGGTCCGCGTTGCACGTAAGAGGAAC
GACGATGAAGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCGCTTGTCACCGTTGCTGAAATCCCTGCT
GAAGGACTAAGTGGACTCGGCACAAAGGTCATTGATGAGGAGGATTGAGAAGGGACTATC
TACTCTGTGGCTTTTAGACAAGTTTTGGTGTTTTTCTCTTAAATTTCTTGTTGGGTTTTC
ATTCAAAGAAGTCACAGATGCAGTTTATTATTGGAAAGACTCGTTTACTATTAGACCTTG
CGATGAATCTTTTTTGTCTTCTGG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4H473TF 564 0 0
GCGCAAAGGTAAGATTTTGAAGAAGTACATCACAGGACAAAAGAGAAGATGTCTGAGAAA
AAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGCGACCAGAGAGTACACAATCAACCTTCACAGACGCCTC
CACAGCTGCGCCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATTAAGGAGATAAGGAAGTTTGCA
GAGAAAGCAATGGGAACCAAGGACGTTAGGGTAGACGTGAAGTTGAACAAGCAGATATGG
AGCAAAGGTATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATCAGGGTCCGCGTTGCACGTAAGAGGAAC
GACGATGAAGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCGCTTGTCACCGTTGCTGAAATCCCTGCT
GAAGGACTAAGTGGACTCGGCACAAAGGTCATTGATGAGGAGGATTGAGAAGGGACTATC
TACTCTGTGGCTTTTAGACAAGTTTTGGTGTTTTTCTCTTAAATTTCTTGTTGGGTTTTC
ATTCAAAGAAGTCACAGATGCAGTTTATTATTGGAAAGACTCGTTTACTATTAGACCTTG
CGATGAATCTTTTTTGTCTTCTGG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 3

CO CL3853Contig1 957 3 2 U
GGGTTAAAGCATATGCATTTGTACTTGGTCACATACAACCATATTTGACCAATAATTGGT
CTTTTCTTTACATGTCCTAACCGTTAGAAAATGTTTTTGCACCCCATAGGCCCATACAAA
GTTCACCAGACAAAACTTCCTAGCAAACGTTAAGATTCACAGCCAGAGGAAGACTAAAAC
TGTTCAGGTTGCGCATCTACCATGACCAACTGTCTTTTTAGCTCGGCGATATCAGCTTGT
ACCTTCTGACGAGTTGCGGTAAGTTTGAAAAGCTCATCTGCTTCTGAGAACTTCAAAAAC
CAATGGCTAAGAGGATGATCTTTGGTGTCTCCTTTCTTCATCTTATAGTAACTTCCATCA
GCAGCGTCTCCTGGAGGAGGCAGGTTGAGTCCCTCTGGGAGCTTAGAGACGTGAACAGCA
GGGTGATTACACACACGGGCGAGGAAACACTCAAAAGGGTCAGGGAAGACAATCTCATTG
TATGACTCAGTGACGACAGGTACGTTGGGAGACTGAGGACCACTGTAAATCTCCGGGTTC
AGCTTCAACAAGTGAGACAGCTCTAGCTTCCTTTCACAGGCCTCAGACTGAAAGAAGACG
GTGATATCGATCTTGAACTCTCCCCACCCACATTCAGACAAAGTAAAAGGAGGCGAGTCA
ACAACTCTAGTAGGGCCCTTGAAACTTGGATGCAGGTGGAAGATGACCTTTTTTATAACC
ACACCAAGATCCTCATTTGTAGCTCCACGTACATAGACAGTCCAGTTATGTGTTCGGTAT
TCTTTAGCTTTCTTGCCACGGAAAAAAGCAATCGATCCACACACAATGGGAACAGAGACT
TCAACGCCATTGACCCTTCTTCTCCAATTCTTATTATCATCGCCACCATCAATGCCAATG
CGTAGCTTCGGCTTAGAAGCAGAGAAGTTCTCGACATGAGAATCCTCCATGATTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GM40JQ U 1
AF RR4FS13JQ U 1
AF RR4GM40TF C 215
BS 1 720 RR4FS13JQ
BS 721 957 RR4GM40TF

RD RR4GM40JQ 598 0 0
GGGTTAAAGCATATGCATTTGTACTTGGTCACATACAACCATATTTGACCAATAATTGGT
CTTTTCTTTACATGTCCTAACCGTTAGAAAATGTTTTTGCACCCCATAGGCCCATACAAA
GTTCACCAGACAAAACTTCCTAGCAAACGTTAAGATTCACAGCCAGAGGAAGACTAAAAC
TGTTCAGGTTGCGCATCTACCATGACCAACTGTCTTTTTAGCTCGGCGATATCAGCTTGT
ACCTTCTGACGAGTTGCGGTAAGTTTGAAAAGCTCATCTGCTTCTGAGAACTTCAAAAAC
CAATGGCTAAGAGGATGATCTTTGGTGTCTCCTTTCTTCATCTTATAGTAACTTCCATCA
GCAGCGTCTCCTGGAGGAGGCAGGTTGAGTCCCTCTGGGAGCTTAGAGACGTGAACAGCA
GGGTGATTACACACACGGGCGAGGAAACACTCAAAAGGGTCAGGGAAGACAATCTCATTG
TATGACTCAGTGACGACAGGTACGTTGGGAGACTGAGGACCACTGTAAATCTCCGGGTTC
AGCTTCAACAAGTGAGACAGCTCTAGCTTCCTTTCACAGGCCTCAGACTGAAAGAAGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4FS13JQ 720 0 0
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CTTTTCTTTACATGTCCTAACCGTTAGAAAATGTTTTTGCACCCCATAGGCCCATACAAA
GTTCACCAGACAAAACTTCCTAGCAAACGTTAAGATTCACAGCCAGAGGAAGACTAAAAC
TGTTCAGGTTGCGCATCTACCATGACCAACTGTCTTTTTAGCTCGGCGATATCAGCTTGT
ACCTTCTGACGAGTTGCGGTAAGTTTGAAAAGCTCATCTGCTTCTGAGAACTTCAAAAAC
CAATGGCTAAGAGGATGATCTTTGGTGTCTCCTTTCTTCATCTTATAGTAACTTCCATCA
GCAGCGTCTCCTGGAGGAGGCAGGTTGAGTCCCTCTGGGAGCTTAGAGACGTGAACAGCA
GGGTGATTACACACACGGGCGAGGAAACACTCAAAAGGGTCAGGGAAGACAATCTCATTG
TATGACTCAGTGACGACAGGTACGTTGGGAGACTGAGGACCACTGTAAATCTCCGGGTTC
AGCTTCAACAAGTGAGACAGCTCTAGCTTCCTTTCACAGGCCTCAGACTGAAAGAAGACG
GTGATATCGATCTTGAACTCTCCCCACCCACATTCAGACAAAGTAAAAGGAGGCGAGTCA
ACAACTCTAGTAGGGCCCTTGAAACTTGGATGCAGGTGGAAGATGACCTTTTTTATAACC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GM40TF 743 0 0
C
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ATCTGCTTCTGAGAACTTCAAAAACCAATGGCTAAGAGGATGATCTTTGGTGTCTCCTTT
CTTCATCTTATAGTAACTTCCATCAGCAGCGTCTCCTGGAGGAGGCAGGTTGAGTCCCTC
TGGGAGCTTAGAGACGTGAACAGCAGGGTGATTACACACACGGGCGAGGAAACACTCAAA
AGGGTCAGGGAAGACAATCTCATTGTATGACTCAGTGACGACAGGTACGTTGGGAGACTG
AGGACCACTGTAAATCTCCGGGTTCAGCTTCAACAAGTGAGACAGCTCTAGCTTCCTTTC
ACAGGCCTCAGACTGAAAGAAGACGGTGATATCGATCTTGAACTCTCCCCACCCACATTC
AGACAAAGTAAAAGGAGGCGAGTCAACAACTCTAGTAGGGCCCTTGAAACTTGGATGCAG
GTGGAAGATGACCTTTTTTATAACCACACCAAGATCCTCATTTGTAGCTCCACGTACATA
GACAGTCCAGTTATGTGTTCGGTATTCTTTAGCTTTCTTGCCACGGAAAAAAGCAATCGA
TCCACACACAATGGGAACAGAGACTTCAACGCCATTGACCCTTCTTCTCCAATTCTTATT
ATCATCGCCACCATCAATGCCAATGCGTAGCTTCGGCTTAGAAGCAGAGAAGTTCTCGAC
ATGAGAATCCTCCATGATTCCC

QA 2 743 2 743
DS 



AS 1 3

CO CL3854Contig1 596 3 3 U
GATTCTGAAAATCTGCAACTAATTTCATTGTTGTTGTGTTGTATACAATTCACACGCTGA
ATGATGAGCTTGAAGTAAGCTTTAGCCACTGCAGATTCTCTTTTGATTTTTTTTTTTTTT
TGGTACAAACGAGTGTGAGTTTTATAACAGTAAACCGAGAAAGAAGAAGATACAAATCCA
AAAAAAATAAGTAGTTCTCAGGTCTAGTTTCTAAAACCCTCTTTCTGTTGCATCTGCTTT
CTCAGGTTTCCAAGAGGTCCATATCCTTTATCCTTCTCTTCACTGCCACAATCACACTTC
CTCTTATTCAGATTAGCACCGCATTTCAAGCACATTCCTTTACACGCAGGATCACATATA
GCATTCATCGTGATCTCCAAATGCACCAAATCTCTTATATGCTTTGATATATCTATCTCT
TTCACCTCTGGCGGAAAATGGAGCTTATCCTCCCAGTCTATCTCATCATCCTCATCTTCA
CCTCTGTCGTCCAAAGAGAAGGAATTGGGTTTGTCATTACCGGATGTGAATCCTAAATCA
ATGACATCCGGTTCTTCAACCGGCTCTTCGGTTAGTAGCAACGAGAAGTTGGAGAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO43JQ U 5
AF RR4AF06JQ U 1
AF RR4DO43TF C 122
BS 1 187 RR4AF06JQ
BS 188 188 RR4DO43JQ
BS 189 596 RR4AF06JQ

RD RR4DO43JQ 303 0 0
CTGAAAATCTGCAACTAATTTCATTGTTGTTGTGTTGTATACCATTCACACGCTGAATGA
TGAGCTTGAAGTAAGCTTTAGCCACTGCAGATTCTCTTTTGATTTTTTTTTTTT***GGT
ACAAACGAGTGTGAGTTTTATAACAGTAAACCGAGAAAGAAGAAAATACAAATCCAAAAA
AAATAAGTAGTTCTCAGGTCTAGTTTCTAAAACCCTCTTTCTGTTGCATCTGCTTTCTCA
GGTTTCCAAAAGGTCCATATCCTTTATCCTTCTCTTCACTGCCACAATCACACTTCCTCT
TAT

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR4AF06JQ 596 0 0
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ATGATGAGCTTGAAGTAAGCTTTAGCCACTGCAGATTCTCTTTTGATTTTTTTTTTTTTT
TGGTACAAACGAGTGTGAGTTTTATAACAGTAAACCGAGAAAGAAGAAGATACAAATCCA
AAAAAAA*AAGTAGTTCTCAGGTCTAGTTTCTAAAACCCTCTTTCTGTTGCATCTGCTTT
CTCAGGTTTCCAAGAGGTCCATATCCTTTATCCTTCTCTTCACTGCCACAATCACACTTC
CTCTTATTCAGATTAGCACCGCATTTCAAGCACATTCCTTTACACGCAGGATCACATATA
GCATTCATCGTGATCTCCAAATGCACCAAATCTCTTATATGCTTTGATATATCTATCTCT
TTCACCTCTGGCGGAAAATGGAGCTTATCCTCCCAGTCTATCTCATCATCCTCATCTTCA
CCTCTGTCGTCCAAAGAGAAGGAATTGGGTTTGTCATTACCGGATGTGAATCCTAAATCA
ATGACATCCGGTTCTTCAACCGGCTCTTCGGTTAGTAGCAACGAGAAGTTGGAGAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4DO43TF 462 0 0
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AAAAAATAAGTAGTTCTCAGGTCTAGTTTCTAAGACCCTCTTTCTGTTGCATCTGCTTTC
TCAGGTTTCCAAGAGGTCCATATCCTTTATCCTTCTCTTCACTGCCACAATCACACTTCC
TCTTATTCAGATTAGCACCGCATTTCAAGCACATTCCTTTACACGCAGGATCACATATAG
CATTCATCGTGATCTCCAAATGCACCAAATCTCTTATATGCTTTGATATATCTATCTCTT
TCACCTCTGGCGGAAAATGGAGCTTATCCTCCCAGTCTATCTCATCATCCTCATCTTCAC
CTCTGTCGTCCAAAGAGAAGGAATTGGGTTTGTCATTACCGGATGTGAATCCTAGATCAA
TGACATCCGGTTCTTCAACCGGCTCTTCGGTTAGTAGCAAC
C

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 3

CO CL3855Contig1 577 3 2 U
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CGTAACAGTCGAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACACTGCCTCAGTTTAACGGTC
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GACGCAAGGGAAATGGTGCATTGGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCAC
CATCAACAAATAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGATCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTC
ATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTAT
TTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGG
GGG*AGATCTAAATAAATATTTAAGTGTCTTTATGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4B267JQ C 1
AF RR4B267TF U 1
AF RR4FT78TF U 1
BS 1 576 RR4B267TF
BS 577 577 RR4FT78TF

RD RR4B267JQ 576 0 0
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CGTAACAGTCGAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACACTGCCTCAGTTTAACGGTC
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ATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCAC
CATCAACAAATAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGATCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTC
ATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTAT
TTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGG
GGG*AGATCTAAATAAATATTTAAGTGTCTTTATGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4B267TF 576 0 0
GGAGAACCAAAAAAGAAAACTAAAAAAACAGATCGCACAGTAAAATTTAAGTTTGTTTAA
CGTAACAGTCGAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACACTGCCTCAGTTTAACGGTC
TTCGTGCCAGCAAGATCTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGA
GACGCAAGGGAAATGGTGCATTGGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCAC
CATCAACAAATAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGATCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTC
ATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTAT
TTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGG
GGG*AGATCTAAATAAATATTTAAGTGTCTTTATGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4FT78TF 577 0 0
GGAGAACCAAAAAAAAAAACTGAAAAA*CAGATCGCACAGTAAAATTTAAGTTTGTTTAA
CGTAACAGTCAAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACCCTGCCTCAGTTCAATGGTC
TTCGTGCCAGCAAGATCTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGA
GACGTAAGGGAAATGGTGCATTAGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCAC
CATCAGCAAATAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCAGGTCTAC
AAACGGGTGATCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTC
ATATCATCAGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAAAAACATTGGTGCTATATAAAACTTAT
TTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGG
GGGGAGATCTAAATAAATATTTAAGTGTCTTTATGTT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL3856Contig1 798 2 10 U
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CAGCTTGTTACAACAATGTCACGACCACTACCCCTTGATGAAATGATGGCAGCGTTAAAA
GAAAAACACAAAACAAGTCACTTCTGGAAGATAGAAAATTTCTCATTAGTCAAAAAACAC
ACCAACAGGGTCGAATCCTCTGTTTTTTATTCTTGGTGGTTACAGATGGAAACTCACGAT
GCTCCCATATGGGTTGGAGGGTAATGTCTTTCATAATGTCGCCTTGGTCTTAGAGAGGCA
ATTCCCCTCATTAATTATTCAACTTACAGTTGAGTTATTTGCCGTTAATCAACTATCGCA
AATATGGCATTCGTCAGGAAACATAGTCTTACCAGTAGACCGGAACTGGGTTTGGGATCC
AAATTTGATGTCACATGCCAATTCCGAGTACCTAGGGCAACTCGTTGGAGATTGTTGTAT
CTTTGGTGTCAGGCTTTTTGGGGTTGAAACGGCGGCTTCTGGAACAGCTGAATGTTTTAG
CGTGATTGAGAAACCTCTCAATCACAAAGTCACTTGGATGATGAACAGGTTCTCGTCTTT
CGAGCCTGATAAGGCTCATCATTCTAATGAATTCGTCGTTGGAAACCGGAAATGGAGAAT
TCAAGTGCACCCAAGAGGGTTTAAAGAGGGAAAGACAATCATTTTCTGTGTATCTAGTAG
AGTGAGTTTATCAACAATGTGCCGCATGTGGCAACACTTACGCCATGTTTAGCTGCGTGT
ATTGGATCAGTAACCGCA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP61TF U 1
AF RR4GW14TF U 3
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ACCAACAGGGTCGAATCCTCTGTTTTTTAT*CTTGGTGGTTACAGATGGAAACTCACGAT
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ATTCCCCTCCTTAATTATTCAACTTACAGTTGAGTTATTTGCCGTTAATCAACTATCGCA
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AAATTTGATGTCACATGCCAATTCCGAGTACCTAGGGCAACTCGTTGGAGATTGTTGTAT
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DS 

RD RR4GW14TF 796 0 0
GGG
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*GTTACAACAATGTCACGACCAGTATCCCTTGATGAAATGATGGCAGCGTTAAAAGAAAA
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CAGGGTCGAATCCTCTGTTTTTTTTTCTTGGTGGTTACAGATGGAAACTCATGGTGCTCC
CATATGGGTTGGAGGGTAATGTCTTTCATAATGTTGCCTTGGTTTTAGAGAGGCAATTCC
CCTCATTAATTATTCAACTTACAGTTGAGTTATTTGTCGTTAATCAACTATCGCAAATAT
GGCATTCGTCAGGAAACATAGTCTTACCAGTAGACCGGAACTGGGTTTGGGATCCAAATT
TGATGTCACATGCCAATTCTGAGTACCTAGGGCAACTCGTTGGAGATTGTTGTATCTTTG
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TTGAGAAACCTCTCAATCACAAAGTCACTTGGATGATGAACAGGTTCTCGTCTTTCGAGC
CTGATAAGGCTCATCATTCTAATGAATTCGTCGTTGGAAACCGGAAATGGAGAATTCAAG
TGCACCCAAGAGGGTTTAAAGAGGGAAAGACAATCATTTTCTGTGTATCTAGTAGAGTGA
GTTTATCAACAATGTGCCGCATGTGGCAACACTTACGCCATGTTTAGCTGCGTGTATTGG
ATCAGTAACCGCA

QA 4 796 4 796
DS 



AS 1 3

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ACCAATATAGTGATGTAGTCTAGTATCACCTTGAATCACTGAAGATGGATCCAACGCATC
ATAACTGAACATCACTGCATTTTTTGACACACTGAGAAAAACGGACACTCCAAGACCCGA
AATAAACTCTTTTCTTAAACCCCTAAATTCGACCTCAATGACACTAGAACAGTTGCAGAC
ACAGAGAACCATCTAGCTATACTGATAACATTAAACTTGAACCAACTATTGGGTCCTAAA
GATCAGAATGTAGTGCTTGTCCAATAATATCAACACCAGAGGCGCATGCATAATCAGCTA
GGCTTAAATTCTCCGACTTCACTGCTCCGGTCCTCAGCCTAAAATGGACAGAGACAGCCG
ACTGAAATCCGGGCTTCAGCAAAGGACGCGAGATGGTATAGCAAATCCACATTTCCAGAG
TTATGAGTCTCTTAACGTAGATATGGCCATTAAGAACTTCCGGACGCTAGGTGTAGAAAC
TCCTTCATGAACCGACAGTAGGAAGACTCCTCCGGTAGACGACTCTTTCGTCGTCGGTCT
TGATTCATGTTGTCCCCAAGAGCCCGGGAACCAAAGCTCTGTCCATTGACCTTTGAGAAT
CCTCCTCCATACGTCTCACCGTCGCAGAGGAGCGTAGATCCATGATAGAGGAGACGTCAC
CACCGTGTCATGCGCCTTCCCCGGAAAGGATTCGTCACAGATCTGAAAATAGGGAAAATT
AGATCTGACTCCTCCTTAGCTCTAAAAGCCGACCCTCTCTTCTTCCGCCGTTACTCCAGT
AAAGGCAAGAAATTTGTACCGTCGCGACGCATAGCAGCTCTCCGGTAAAGTTCCACCGAC
CCAGAGTGACTTACATCTCGGCACAGATAAGACGACAGGGGGGAGAGAAAAAGGAAAAGA
AGAAAAATGAAGGGAAAAAGAGCCTCCGCACCGGAGAGGCTGGGCCGGAACTAGATTTGG
TCAGAGTTCTAGAGAGAAGTTGGAGTTTTTTGGTTAGAGAGATTGGCGAATTACTTCTTT
AAAATCCTCTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D884JQ U 1
AF RR4FL93JQ U 4
AF RR4FL93TF C 463
BS 1 340 RR4D884JQ
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BS 709 1153 RR4FL93TF

RD RR4D884JQ 368 0 0
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ACCAATATAGTGATGTAGTCTAGTATCACCTTGAATCACTGAAGATGGATCCAACGCATC
ATAACTGAACATCACTGCATTTTTTGACACACTGAGAAAAACGGACACTCCAAGACCCGA
AATAAACTCTTTTCTTAAACCCCTAAATTCGACCTCAATGACACTAGAACAGTTGCAGAC
ACAGAGAACCATCTAGCTATACTGATAACATTAAACTTGACCCAACTATTGGGTCCTAAA
GATCA
AAA

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4FL93JQ 705 0 0
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ATCTCAATCATTCATCAGAATCAAAGAGACACTTACATTGACCACAACAGACCTTAAACC
AATATAGTGATGTAGTCTAGTATCACCTTGAATCACTGAAGATGGATCCAACGCATCATA
ACTGAACATCACTGCATTTTTTGCCACACTGAGAAGAACGGACACTCCAAGACCCGAAAT
AAACTCTTTTCTTAGACCCCTAAATTTGACCTCAATGATACTAGAACAGTTGCAGACACA
GAGAACCATCTAGCTATACTGATAACATTAAACTTGAACCAACTATTGGGTCCTAAAGAT
CAGAATGTAGTGCTTGTCCAATAATATCAACACCAGAGGCGCATGCATAATCAGCTAGGC
TTAAATTCTCCGACTTCACTGCTCCGGTCCTCAGCCTAAAATGGACAGAGACAGCCGACT
GAAATCCGGGCTTCAGCAAAGGACGCGAGATGGTATAGCAAATCCACATTTCCAGAGTTA
TGAGTCTCTTAACGTAGATATGGCCATTAAGAACTTCCGGACGCTAGGTGTAGAAACTCC
TTCATGAACCGACAGTAGGAAGACTCCTCCGGTAGACGACTCTTTCGTCGTCGGTCTTGA
TTCATGTTGTCCCCAAGAGCCCGGGAACCAAAGCTCTGTCCATTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4FL93TF 691 0 0
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AAATCCACATTTCCAGAGTTATGAGTCTCTTAACGTAGATATGGCCATTAAGAACTTCCG
GACGCTAGGTGTAGAAACTCCTTCATGAACCGACAGTAGGAAGACTCCTCCGGTAGACGA
CTCTTTCGTCGTCGGTCTTGATTCATGTTGTCCCCAAGAGCCCGGGAACCAAAGCTCTGT
CCATTGACCTTTGAGAATCCTCCTCCATACGTCTCACCGTCGCAGAGGAGCGTAGATCCA
TGATAGAGGAGACGTCACCACCGTGTCATGCGCCTTCCCCGGAAAGGATTCGTCACAGAT
CTGAAAATAGGGAAAATTAGATCTGACTCCTCCTTAGCTCTAAAAGCCGACCCTCTCTTC
TTCCGCCGTTACTCCAGTAAAGGCAAGAAATTTGTACCGTCGCGACGCATAGCAGCTCTC
CGGTAAAGTTCCACCGACCCAGAGTGACTTACATCTCGGCACAGATAAGACGACAGGGGG
GAGAGAAAAAGGAAAAGAAGAAAAATGAAGGGAAAAAGAGCCTCCGCACCGGAGAGGCTG
GGCCGGAACTAGATTTGGTCAGAGTTCTAGAGAGAAGTTGGAGTTTTTTGGTTAGAGAGA
TTGGCGAATTACTTCTTTAAAATCCTCTCCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 3

CO CL3858Contig1 1334 3 13 U
GGATAACGACGAGGAGAAGAAGAAGAAGGGCCCCAATATAGTCGTCTCCGCCCCTGATTC
TTTGTTCAACTTGATTTTTCATTCAACTCGTAGTAAAAAAGATAGCGCCACCTGCATTTG
GCTTTCCTCTAATCTGGACCAGTTGATCGAACAATCATGGAATGAATGACTTGTTGTAGT
AAATCATCCACACAAACCCTATCAGCTTAATAATTTTTTTATTTTGGAATGGCTGAGACT
GATCCAGACTCCTCAGATACGTCTGATCTCAAACCCATTAGCAGCAGCGCCCCACTCTTT
AGCATCCCTCGCTTTTTTGTCGCTAAAGACTCTGATGCAGCAGGGAGGAGCCCTACTTCT
CCTCTTGATTTTTCACTCTTTGGTGGTCTCTTTAGCCCCAGGTCTCCTCCTGCTGCTGCT
GCTCCCTCATCTCCCAGGTTCCGTAACAGATGGGCTTTTGACAAAGTCGGCCTCTCTCTT
CTAAGCTCCAGCGTTGGAGACGAAGAAGGGGGGCATGAGGAGGGTTTATTCAACAACATC
GTGCTTGCCCCTCAAATCAAGCCCAGGCTGTTTGGTTCTTGCGTTAAATCCAACTCGTTG
CCTAAAAACTATGCCGCCCCTTCCATGTCTTCTGACGCGGCGGATCCTCTTCCGTATGGT
TCTATCACCGGTGTTGTGGAGGAACTTGACCCTCCAAGGAGGTCAAGCTCATCTCCTGTG
GATATAATCTCCAGTCAGGCTTATTCTCGCTCGCTCTCTGCACGTGAGATGGCACTCTCT
GAGGACTATACCTGTATCATTTCTCATGGGCCGAACCCAAAAACAACTCATATATTTGGT
GATTGCATCCTGGATTGTGACCCCAAAGAGTTGGGAACCAAGGATGAAAATGAGAAACCA
GAAGGGGATGATGATGATTCTTTCACCGACAACCACATTCATATGCAGGGGGAGGCATCG
TCAGCAGCAGGAGCAGCAGGGAAGGAAAGTGACAAGGGAGGTGTTGAAGATTGTTTGGAG
ATATCGCCTGGATCAAGTTACAACGAGGATCTGTTTCCTATGGCCTCTTAACCCAGGCAA
AGCTGTTCTCATTTTCTTGAGGCTTTTTTGGGGGAGATCATATGTGAGTTTATTAGTGTT
GTAAGATTTTCGTGTTTTTTTTGTTTTGTGAGATTTTTGCAGGCGTGCTCTGAATAAAAG
CTTGTTGTTGATCCAAGGGGGATTGAGTTTTGGTGTGGCCTGATGCCCCCGGCTCATCCT
TTCTTTTGTTTGTACTACTACTACCATTGTATTTGTGACTTTATTATCATATTTGAAGGG
AAACCATTTGTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI70TF U 1
AF RR4EI13TF U 595
AF RR4AI70JQ C 577
BS 1 738 RR4AI70TF
BS 739 739 RR4EI13TF
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BS 1163 1175 RR4EI13TF
BS 1176 1334 RR4AI70JQ

RD RR4AI70TF 859 0 0
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TTTGTTCAACTTGATTTTTCATTCAACTCGTAGTAAAAAAGATAGCGCCACCTGCATTTG
GCTTTCCTCTAATCTGGACCAGTTGATCGAACAATCATGGAATGAATGACTTGTTGTAGT
AAATCATCCACACAAACCCTATCAGCTTAATAATTTTTTTATTTTGGAATGGCTGAGACT
GATCCAGACTCCTCAGATACGTCTGATCTCAAACCCATTAGCAGCAGCGCCCCACTCTTT
AGCATCCCTCGCTTTTTTGTCGCTAAAGACTCTGATGCAGCAGGGAGGAGCCCTACTTCT
CCTCTTGATTTTTCACTCTTTGGTGGTCTCTTTAGCCCCAGGTCTCCTCCTGCTGCTGCT
GCTCCCTCATCTCCCAGGTTCCGTAACAGATGGGCTTTTGACAAAGTCGGCCTCTCTCTT
CTAAGCTCCAGCGTTGGAGACGAAGAAGGGGGGCATGAGGAGGGTTTATTCAACAACATC
GTGCTTGCCCCTCAAATCAAGCCCAGGCTGTTTGGTTCTTGCGTTAAATCCAACTCGTTG
CCTAAAAACTATGCCGCCCCTTCCATGTCTTCTGACGCGGCGGATCCTCTTCCGTATGGT
TCTATCACCGGTGTTGTGGAGGAACTTGACCCTCCAAGGAGGTCAAGCTCATCTCCTGTG
GATATAATCTCCAGTCAG*CTTATTCTCGCTCGCTCTCTGCACGTGAGATGGCACTCTCT
GAGGACTATACCTGTATCATTTCTCATGGGCCGAACCCAAAA**CACTCATATATTTGGT
GAT*GCATCCTGGAT
GTGA

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4EI13TF 581 0 0
G
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ATGGTTCTATCACCGGTGTTGTGGAGGAACTTGACCCTCCAAGGAGGTCAAGCTCATCTC
CTGTGGATATAATCTCCAGTCAGGCTTATTCTCGCTCGCTCTCTGCACGTGAGATGGCAC
TCTCTGAGGACTATACCTGTATCATTTCTCATGGGCCGAACCCAAAAACAACTCATATAT
TTGGTGATTGCATCCTGGATTGTGACCCCAAAGAGTTGGGAACCAAGGATGAAAATGAGA
AACCAGAAGGGGATGATGATGATTCTTTCACCGACAACCACATTCATATGCAGGGGGAGG
CATCGTCAGCAGCAGGAGCAGCAGGGGAGGAAAGTGACAAGGGAGGTGTTGAAGATTGTT
TGGAGATATCGCCTGGATCAAGTTACAACGAGGATCTGTTTCCTATGGCCTCTTAACCCA
GGCAAAGCTGTTCTCATTTTCTTGAGGCTTTTTTGGGGGAGATCATATGTGAGTTTATTA
GTGTTGTAAGATTTTCGTGTTTTTTT*GTTTTGTGAGATT

QA 2 581 2 581
DS 

RD RR4AI70JQ 758 0 0
TCTTGCGTTAAATCCAACTCGTTGCCTAAAAACTATGCCGCCCCTTCCATGTCTTCTGAC
GCGGCGGATCCTCTTCCGTATGGTTCTATCACCGGTGTTGTGGAGGAACTTGACCCTCCA
AGGAGGTCAAGCTCATCTCCTGTGGATATAATCTCCAGTCAGGCTTATTCTCGCTCGCTC
TCTGCACGTGAGATGGCACTCTCTGAGGACTATACCTGTATCATTTCTCATGGGCCGAAC
CCAAAAACAACTCATATATTTGGTGATTGCATCCTGGATTGTGACCCCAAAGAGTTGGGA
ACCAAGGATGAAACTGAGAAACCAGAAGGGGATGATGATGATTCTTTCACCGACAACCAC
ATTCATATGCAGGGGGAGGCATCGTCAGCAGCAGGAGCAGCAGGGAAGGAAAGTGACAAG
GGAGGTGTTGAAGATTGTTTGGAGATATCGCCTGGATCAAGTTACAACGAGGATCTGTTT
CCTATGGCCTCTTAACCCAGGCAAAGCTGTTCTCATTTTCTTGAGGCTTTTTTGGGGGAG
ATCATGTGTGAGTTTATTAGTGTTGTAAGATTTTCGTGTTTTTTTTGTTTTGTGAGATTT
TTGCAGGCGTGCTCTGAATAAAAGCTTGTTGTTGATCCAAGGGGGATTGAGTTTTGGTGT
GGCCTGATGCCCCCGGCTCATCCTTTCTTTTGTTTGTACTACTACTACCATTGTATTTGT
GACTTTATTATCATATTTGAAGGGAAACCATTTGTATT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL3859Contig1 451 3 9 U
ATAAAAAATATACAACGTTTTTATTAATCGAGATTGGCCATGTATGGTCCATGAACAAAA
GTTCAACAGATACTAGGATATATACACATCATATTAGATTTTGTATCCGTTTTTTTCAAC
ACATGCATATATGTGAAACTAAAAACCATGGATGAAAAAAGAAACACACACACACACGAT
ATATATAGTTTAACAAAGTTTTATAGTCTGATCAGTTGCCAGATCCGGGTTGACAGTTCT
CCGAGCGTGTGCACCTGGGTGGTGAGCCGTAAATGGATTGGCAGTATACGGTAGTAGTGC
ACGTAAAATGATAACAGTTGGAAAAGTACAAAAAGCATGGCTGACAAAAAAAAAACAGGT
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TCCCGCCCCCGCAATGCATTGATCTGCTTGC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4A151TFB C 1
AF RR4A151JQ U 1
AF RR4A151JQD U 1
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BS 69 69 RR4A151JQD
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ATAG
AAAATATACAACGTTTTTATTAATCGAGATTGGCCATGTATGGTCCATGAACAAAAGTTC
AACAGATACTAGGATATATACACATCATATTAGATTTTGTATCCGTTTTTTTCAACACAT
GCATATATGTGAAACTAAGAACCATGGATGAAAAAAGAAACACACACACACACGATATAT
ATAGTTTAACAAAGTTTTATAGTCTGATCAGTTGCCAGATCCGGGTTGACAGTTCTCCGA
GCGTGTGCACCTGGGTGGTGAGCCGTA
G

QA 5 271 5 271
DS 

RD RR4A151JQ 451 0 0
ATAAAAAATATACAACGTTTTTATTAATCGAGATTGGCCATGTATGGTCCATGAACAAAA
GTTCAACAAATACTAGGATATATACACATCATATTAAATTTTGTATCCGTTTTTTTCAAC
ACATGCATATATGTGAAACTAAAAACCATGGATGAAAAAAAAAACACACACACACACGAT
ATATATAGTTTAACAAAGTTTTATAGTCTGATCAGTTGCCAAATCCGGGTTGACAGTTCT
CCGAGCGTGTGCACCTGGGTGGTGAGCCGTAAATGGATTGGCAGTATACGGTAGTAGTGC
ACGTAAAATGATAACAGTTGGAAAAGTACAAAAAGCATGGCTGACAAAAAAAAAACAGGT
ATCCTCCTGGAAAATGACCATGATTAGTACGATAAGTGGTTGCCATGTTTTGAAAAGCTT
TCCCGCCCCCGCAATGCATTGATCTGCTTGC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4A151JQD 451 0 0
ATAG
AAAATATACAACGTTTTTATTAATCGAGATTGGCCATGTATGGTCCATGAACAAAAGTTC
AACAGATACTAGGATATATACACATCATATTAGATTTTGTATCCGTTTTTTTCAACACAT
GCATATATGTGAAACTAAAAACCATGGATGAAAAAAGAAACACACACACACACGATATAT
ATAGTTTAACAAAGTTTTATAGTCTGATCAGTTGCCAGATCCGGGTTGACAGTTCTCCGA
GCGTGTGCACCTGGGTGGGGAGCCGTAAATGGATTGGCAGTATACGGTAGTAGTGCACGT
AAAATGATAACAGTTGGAGAAGTACGAAAAGCATGGCTGACAGAAAGAAAACAGGTATCC
TCCTGGAAGATGACCATGATTAGTACGATAAGTGGTTGCCATGTTTTGAAAAGCTTTCCC
GCCCCCGCAATGCATTGATCTGCTTGC

QA 5 451 5 451
DS 



AS 1 3

CO CL3860Contig1 699 3 3 U
GGACACAATCTCATTCTTAATCATCTTATACAAGAATCAGAAAGAAGAAGAAAAGAGAGA
GTTTCAATATGGCGATCGTGAACCCTAACTTTTGTGCACCGTACCCGGTAGAATTGGGAA
TCGTACGAAAGGTGATGACGATCACAGATGGTAACTTCGCTGTCACAGACGTCAACGGCA
ATCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACCAATGTTTAGCCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTCG
ACGCATCAGACACTCCAATTTTGACTTTGAAAGAAAATAAGGTGAGTCTTCACGATAGGT
GGCAAGTGTTTAGAGGAAAGAGTACAGACCAAAATGATTTGGTATACACATTGAAACGAT
CATCGATGTTTCAGCTGATTAAGCCAAAGCTAGATGTTTTCTTGGCTCCTAATAAGGAAA
TGAAGGAATGCGACTTCCATGTCAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCCTCTACCATCTATG
CTGGAAAATCTGACGTCATTGTTGCACAGATGCACAAGAAACATACCGCGCAGAGCATAT
TGATAGGGAAGAGTAATTTCTCGGTTACAGTTTATCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAG
TCTCTCTCATTGTAATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGGAGAGTAAACACAAT
TTTCTTGTGAATGATTCTTGATATTTCTTTTGCTACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A559TF U 300
AF RR4A559JQ C 101
AF RR4EY22TF U 1
BS 1 375 RR4EY22TF
BS 376 376 RR4A559TF
BS 377 699 RR4EY22TF

RD RR4A559TF 215 0 0
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TCGTCGATGTTTCAGCTGATTAAGCCAAAGCTAGATGTTTTCTTGGCTCCTAATAAGGAA
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GCTGGAAAATCTGACGTCATTGTTGCACAGATGCA

QA 1 215 1 215
DS 

RD RR4A559JQ 535 0 0
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TGTCACAGACGTCAACGGCAATCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACCAATGTTTAGCCTCTC
CGACAAAAGGATCTTACTGGACGCATCAGACACTCCAATTTTGACTTTGAAAGAAAATAA
GGTGAGTCTTCACGATAGGTGGCAAGTGTTTAGAGGAAAGAGTACAGACCAAAATGATTT
GGTATACACATTGAAACGATCATCGATGTTTCAGCTGATTAAGCCAAAGCTAGATGTTTT
CTTGGCTCCTAATAAGGAAATGAAGGAATGCGACTTCCATGTCAAAGGAAGTTGGATCGA
CCGGTCCTCTACCATGTAGGCTGGAAAATCTGACGTCATTGTTGCACAGATGCACAAGAA
ACATACCGCGCAGAGCATATTGATAGGGAAGAGTAATTTTTCGGTTACAGTTTATCCGAA
TGTTGATTATGCGTTTATAGTCTCTCTCATTGTAATTCTCGATGACATTAACCGA

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4EY22TF 699 0 0
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GTTTCAATATGGCGATCGTGAACCCTAACTTTTGTGCACCGTACCCGGTAGAATTGGGAA
TCGTACGAAAGGTGATGACGATCACAGATGGTAACTTCGCTGTCACAGACGTCAACGGCA
ATCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACCAATGTTTAGCCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTCG
ACGCATCAGACACTCCAATTTTGACTTTGAAAGAAAATAAGGTGAGTCTTCACGATAGGT
GGCAAGTGTTTAGAGGAAAGAGTACAGACCAAAATGATTTGGTATACACATTGAAACGAT
CATCGATGTTTCAGCCGATTAAGCCAAAGCTAGATGTTTTCTTGGCTCCTAATAAGGAAA
TGAAGGAATGCGACTTCCATGTCAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCCTCTACCATCTATG
CTGGAAAATCTGACGTCATTGTTGCACAGATGCACAAGAAACATACCGCGCAGAGCATAT
TGATAGGGAAGAGTAATTTCTCGGTTACAGTTTATCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAG
TCTCTCTCATTGTAATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGGAGAGTAAACACAAT
TTTCTTGTGAATGATTCTTGATATTTCTTTTGCTACATT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

CO CL3861Contig1 1380 3 19 U
GGAAAGGCAAGCCTTCCTTTATCTCTTTCCCTTTACAACATTTTTTTTTTGATAAGACCC
CTTTACAACTTCTTTCATCTCCGATATCATAACATGGCGGCAAAGCTAATATCCACCGGT
TTCCGTCATACTCTTTGCCGGAAAACTATGTCCGGCCACTCTCTGACCGTCCACGTCTCT
CTCAAGTTTCTCAGCTTGAAGATTTCCCTCTCATCGATATATCTTCCACAGATCGATCTC
GGCTCGTCCAACAAATCCACCAAGCTTGCGCCCGGCTTGGTTTCTTTCAGGTTATAGATC
ATGGTGTTAGAAAAGCAACTATAGATGAGATGGTGAGTGTTGCGCATGAGTTTTTTGGCA
TGTCTATGGACGAAAAAATGAAGCTATACTCGGACGATCCAACGAAGACACCGAGATTAT
CGACGAGTTTTAATGTGAAGGAAGAAGAGGTTAACAATTGGAGAGACTATCTAAGACTCC
ATTGTTATCCTATCGACAAATATGTCCATGAGTGGCCTTCCAACCCACCTTCTTTCAAGG
AAGTTGTGAGTAAATACTGTAGAGAAGTAAGAGAATTGGGATTTACAATAGAGGAATTGA
TATCAGAGAGTTTAGGTTTAGAAAAAGATTACATGAAGAATGTGCTTGGTGAACAAGGTC
AACACATGGCAGTCAACTATTATCCTCCATGTCCTGAGCCTGAGCTCACCTATGGTTTAC
CTGCTCATACCGACCCAAATGCCCTCACCATTCTTCTCCAAGATGCTACCGTTTGCGGTC
TCCAGATCTTGATCGACGGTCACTGGTTCGCTATTAATCCTCGTTCCTGATGCTTTTGCC
ATCAACATTGGTGACCAGTTACAGGCATTGAGTAACGGAGTTTACAAAAGTGTTTGGCAT
CGCGCAGTGACAAACACCGAAAAACCGAGACTATCGATCGCATCATTTATGTGCCCTGAT
AACGGTGCTGTCATAAGCCCGGCAAAGCCCTTGCGGGAAGCCAAAGAGGAAGAGGCCAAG
CCAATCTACAGAGACTACACTTATGCAGAGTACTACAAGAAGTTTTGGAGTCGGAATCTG
GACCAAGAACATTGCCTCGAGAACTTTCTAAACGACTAGGTACCACCAATGTCGGCTCTG
AGCTAAATCCCATGAAACAGGAGCTTTAGGCGCTAGACGTTATAAGTAAATTGTGGGACG
CCATTTACCGAGAATTTCTTTGGTATAGATGGTTGAGGCTTTGGATTCGATACCTCTAAA
GGGCAGCTTTTCTTTATTTGTGCTTTAGGAGTTGAGTTGTTCTAGACCGGATACTGGGTA
CCACATATACATATGTCTATCTTTGTGTTTACGAAGAGTACTACAATAAGTAGCAGCATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C935TF U 1
AF RR4CG22TF U 585
AF RR4C935JQ C 796
BS 1 615 RR4C935TF
BS 616 616 RR4CG22TF
BS 617 657 RR4C935TF
BS 658 658 RR4CG22TF
BS 659 726 RR4C935TF
BS 727 838 RR4CG22TF
BS 839 839 RR4C935JQ
BS 840 917 RR4CG22TF
BS 918 918 RR4C935JQ
BS 919 929 RR4CG22TF
BS 930 930 RR4C935JQ
BS 931 961 RR4CG22TF
BS 962 962 RR4C935JQ
BS 963 993 RR4CG22TF
BS 994 994 RR4C935JQ
BS 995 1135 RR4CG22TF
BS 1136 1136 RR4C935JQ
BS 1137 1156 RR4CG22TF
BS 1157 1380 RR4C935JQ

RD RR4C935TF 726 0 0
GGAAAGGCAAGCCTTCCTTTATCTCTTTCCCTTTACAACATTTTTTTTTTGATAAGACCC
CTTTACAACTTCTTTCATCTCCGATATCATAACATGGCGGCAAAGCTAATATCCACCGGT
TTCCGTCATACTCTTTGCCGGAAAACTATGTCCGGCCACTCTCTGACCGTCCACGTCTCT
CTCAAGTTTCTCAGCTTGAAGATTTCCCTCTCATCGATATATCTTCCACAGATCGATCTC
GGCTCGTCCAACAAATCCACCAAGCTTGCGCCCGGCTTGGTTTCTTTCAGGTTATAGATC
ATGGTGTTAGAAAAGCAACTATAGATGAGATGGTGAGTGTTGCGCATGAGTTTTTTGGCA
TGTCTATGGACGAAAAAATGAAGCTATACTCGGACGATCCAACGAAGACACCGAGATTAT
CGACGAGTTTTAATGTGAAGGAAGAAGAGGTTAACAATTGGAGAGACTATCTAAGACTCC
ATTGTTATCCTATCGACAAATATGTCCATGAGTGGCCTTCCAACCCACCTTCTTTCAAGG
AAGTTGTGAGTAAATACTGTAGAGAAGTAAGAGAATTGGGATTTACAATAGAGGAATTGA
TATCAGAGAGTTTAG*TTTAGAAAAAGATTACATGAAGAATGTGCTTGGTGAACAAG*TC
AACACATGGCAGTCAACTATTATCCTCCATGTCCTGAGCCTGAGCTCACCTATGGTTTAC
CTGCTC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4CG22TF 572 0 0
G
CAATAGAGGAATTGATATCAGAGAGTTTAGGTTTAGAAAAAGATTACATGAAGAATGTGC
TTGGTGAACAAGGTCAACACATGGCAGTCAACTATTATCCTCCATGTCCTGAGCCTGAGC
TCACCTATGGTTTACCTGCTCATACCGACCCAAATGCCCTCACCATTCTTCTCCAAGATG
CTACCGTTTGCGGTCTCCAGATCTTGATCGACGGTCACTGGTTCGCTATTAATCCTCGTT
CCTGATGCTTTTGTCATCAACATTGGTGACCAGTTACAGGCATTGAGTAACGGAGTTTAC
AAAAGTGTTTGGCATCGCGCAGTGACAAACACTGAAAAACCGAGGCTATCGATCGCATCA
TTTATGTGCCCTGATAGCGGTGCTGTCATAAGCCCGGCAAAGCCCTTGTGGGAAGCCAAA
GAGGAAGAGGCCAAGCCAATCTACAGAGACTACACTTATGCAGAGTACTACAAGAAGTTT
TGGAGTCGGAATCTGGACCAAGAACATTGCCTCGAGAACTTTCTAAACGACTAGGTACCA
CCAATGTCGGTTCTGAGCTAAATCCCATGAA

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR4C935JQ 585 0 0
ACGGTCACTGGTTCGCTATTAATCCTCGT*CCTGATGCTTTTGCCATCAACATTGGTGAC
CAGTTACAGGCATTGAGTAACGGAGTTTACAAAAGTGTTTGGCATCGCGCAGTGACAAAC
ACCGAAAAACCGAGACTATCGATCGCATCATTTATGTGCCCTGATAACGGTGCTGTCATA
AGCCCGGCAAAGCCCTTGCGGGAAGTCAAAGAGGAAGAGGCCAAGCCAATCTACAGAGAC
TACACTTATGCAGAGTACTACAAGAAGTTTTGGAGTCGGAATCTGGACCAAGAACATTGC
CTCGAGAACTTTCTAAACGACTAGGTACCACCAATGTCGGCTCTGAGCTAAATCCCATGA
AACAGGAGCTTTAGGCGCTAGACGTTATAAGTAAATTGTGGGACGCCATTTACCGAGAAT
TTCTTTGGTATAGATGGTTGAGGCTTTGGATTCGATACCTCTAAAGGGCAGCTTTTCTTT
ATTTGTGCTTTAGGAGTTGAGTTGTTCTAGACCGGATACTGGGTACCACATATACATATG
TCTATCTTTGTGTTTACGAAGAGTACTACAATAAGTAGCAGCATA

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL3862Contig1 906 2 2 U
GGAGACAGTGGTTTAGTAGCAATAATAAAGATGGAGGGGATAGGGAACGACAAGAGTTCG
AGTTCGAGTTCAGGCCCGGGTCCTTGTCTGAGCAAATACGTGGATCCATCGAGCGAAGAG
TCTCACAGATACTATCTAGCGCGGCGGAACGCCTTGGAGATGCTCAGAGACAGAGGCTAC
GAAGTCTCCCTCGAAGACATCAATCTCTCCCTCGAGGATTTTCGAACTGTTTATGGCGAG
CGTCCCGACGTCGACCGTCTCCGTATCTCCGCTCACCATCGCTCTGATTCTTCCAATAAG
GTGAAGGTTGTCTTTTTTGGTACTGGTAAGGTTAAAGTCAACACAATCCGCAGTGTTGCA
GCAGAGATACTTAGCCAAGAGATCATAACCGGGCTGATACTGGTTCTGCAAAACCAAGTA
ACCGATAGAGCCTTGAAAGCCATTGAGCTTTTCACTTTCAAGGTCGAGTTATTCCAGATA
ACCGACTTGCTAGTCAATCTAACCGAGCATGTACTGAGCCTGCGTCATCGTGTTCTGAAT
GATGGAGAGAAGAAAGCACTTCTCAAGCAGTACAATATCGAGGAAAAACAGCTTCCTCGA
ATCTCAAAGAAGGATGCGGTTGTGCGGTACTATGGATTAGAGAAGGGACAAGTTGTGAAA
GTGAATTACAGAGGCGAACTCACTGAGTCCTATGTTGCCTACAGATGTGTATGGTGAAGA
AATGCAGCCAATAAAAACAAATCATTTTGTGTACTTATTTTCGGCATAAAAAAACTTATG
AAGATGCTTTGGACAAGATCCTTTGCTTTAAACACAAGACTTTAGTTTTTTCTTTTTTCA
AGTAAAAAAATGTATTAAAGATCCTTTGCTTGTTCTTGAAAACATTTCCCATTATGTGCT
TCCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO43TF U 1
AF RR4AO43JQ C 40
BS 1 641 RR4AO43TF
BS 642 906 RR4AO43JQ

RD RR4AO43TF 641 0 0
GGAGACAGTGGTTTAGTAGCAATAATAAAGATGGAGGGGATAGGGAACGACAAGAGTTCG
AGTTCGAGTTCAGGCCCGGGTCCTTGTCTGAGCAAATACGTGGATCCATCGAGCGAAGAG
TCTCACAGATACTATCTAGCGCGGCGGAACGCCTTGGAGATGCTCAGAGACAGAGGCTAC
GAAGTCTCCCTCGAAGACATCAATCTCTCCCTCGAGGATTTTCGAACTGTTTATGGCGAG
CGTCCCGACGTCGACCGTCTCCGTATCTCCGCTCACCATCGCTCTGATTCTTCCAATAAG
GTGAAGGTTGTCTTTTTTGGTACTGGTAAGGTTAAAGTCAACACAATCCGCAGTGTTGCA
GCAGAGATACTTAGCCAAGAGATCATAACCGGGCTGATACTGGTTCTGCAAAACCAAGTA
ACCGATAGAGCCTTGAAAGCCATTGAGCTTTTCACTTTCAAGGTCGAGTTATTCCAGATA
ACCGACTTGCTAGTCAATCTAACCGAGCATGTACTGAGCCTGCGTCATCGTGTTCTGAAT
GATGGAGAGAAGAAAGCACTTCTCAAGCAGTACAATATCGAGGAAAAACAGCTTCCTCGA
ATCTCAAAGAAGGATGCGGTTGTGCGGTACTATGGATTAGA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4AO43JQ 867 0 0
ATAGGGAACGACAAGAGTTCGAGTTCGAGTTCAGGCCCGGGTCCTTGTCTGAGCAAATAC
GTGGATCCATCGAGCGAAGAGTCTCACAGATACTATCTAGCGCGGCGGAACGCCTTGGAG
ATGCTCAGAGACAGAGGCTACGAAGTCTCCCTCGAAGACATCAATCTCTCCCTCGAGGAT
TTTCGAACTGTTTATGGCGAGCGTCCCGACGTCGACCGTCTCCGTATCTCCGCTCACCAT
CGCTCTGATTCTTCCAATAAGGTGAAGGTTGTCTTTTTTGGTACTGGTAAGGTTAAAGTC
AACACAATCCGCAGTGTTGCAGCAGAGATACTTAGCCAAGAGATCATAACCGGGCTGATA
CTGGTTCTGCAAAACCAAGTAACCGATAGAGCCTTGAAAGCCATTGAGCTTTTCACTTTC
AAGGTCGAGTTATTCCAGATAACCGACTTGCTAGTCAATCTAACCGAGCATGTACTGAGC
CTGCGTCATCGTGTTTTGAATGATGGAGAGAAGAAAGCACTTCTCAAGCAGTACAATATC
GAGGAAAAACAGCTTCCTCGAATCTCAAAGAAGGATGCGGTTGTGCGGTACTATGGATTA
GAGAAGGGACAAGTTGTGAAAGTGAATTACAGAGGCGAACTCACTGAGTCCTATGTTGCC
TACAGATGTGTATGGTGAAGAAATGCAGCCAATAAAAACAAATCATTTTGTGTACTTATT
TTCGGCATAAAAAAACTTATGAAGATGCTTTGGACAAGATCCTTTGCTTTAAACACAAGA
CTTTAGTTTTTTCTTTTTTCAAGTAAAAAAATGTATTAAAGATCCTTTGCTTGTTCTTGA
AAACATTTCCCATTATGTGCTTCCCTT

QA 1 867 1 867
DS 



AS 1 2

CO CL3863Contig1 326 2 2 U
GGGCAGGAGTGTGAGTGTGAAGGGCTCCCGAGACTCGGATCTTTCGCCTCAAAGAAAAAC
CGTGTCCAGGAGTTCCAATTTTGATAGCTCTCCCCCAAGGAGACCACCCATACAATCACC
ACTTCCTCAAACAAGCAAGGAGCAACGGAAGACTGGGCTAATTAGTGGCAAAGACATTGG
AAGTGAATATCGAAAGAAGAAGCAGGATGAACAGTTGAGGTTTAAAAATATGGATTCCGA
GCTAACTGGTCAGAATGCAGAAGCTGTCTTCCGTGATAAGATTACAGGAAAGCGTATATC
GAAAGAAGAATATCTTCAATCAAAGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G322JQ C 1
AF RR4G322TF U 1
BS 1 2 RR4G322JQ
BS 3 326 RR4G322TF

RD RR4G322JQ 326 0 0
GGGCAGGAGTGTGAGTGTGAAGGGCTCCCGAGACTCGGATCTTTCGCCTCAAAGAAAAAC
CGTGTCCAGGAGTTCCAATTTTGATAGCTCTCCCCCAAGGAGACCACCCATACAATCACC
ACTTCCTCAAACAAGCAAGGAGCAACGGAAGACTGGGCTAATTAGTGGCAAAGACATTGG
AAGTGAATATCGAAAGAAGAAGCAGGATGAACAGTTGAGGTTTAAAAATATGGATTCCGA
GCTAACTGGTCAGAATGCAGAAGCTGTCTTCCGTGATAAGATTACAGGAAAGCGTATATC
GAAAGAAGAATATCTTCAATCAAAGC

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR4G322TF 326 0 0
GG
GCAGGAGTGTGAGTGTGAAGGGCTCCCGAGACTCGGATCTTTCGCCTCAAAGAAAAACCG
TGTCCAGGAGTTCCAATTTTGATAGCTCTCCCCCAAGGAGACCACCCATACAATCACCAC
TTCCTCAAACAAGCAAGGAGCAACGGAAGACTGGGCTAATTAGTGGCAAAGACATTGGAA
GTGAATATCGAAAGAAGAAGCAGGATGAACAGTTGAGGTTTAAAAATATGGATTCCGAGC
TAACTGGTCAGAATGCAGAAGCTGTCTTCCGTGATAAGATTACAGGAAAGCGTATATCGA
AAGAAGAATATCTTCAATCAAAGC

QA 3 326 3 326
DS 



AS 1 2

CO CL3864Contig1 1033 2 2 U
GTACCCACTAGTCTCCACGTCGAGTGGGCTATATGCGCCGCCGAGAAAGGGAAACACATC
CTTCTTGAGAAGCCCGTCGCGTTGAATGTAGCTGAGTTTGATAAGATCGTTGCGGCTTGT
GAAGCTAATGGTGTTCAGATTATGGATGGTACTATGTGGGTTCATAATCCTAGAACTGCT
ATGCTTAAGGAGTTTCTGTCTGATTCCGACCGCTTTGGTCAGCTCAAAACCGTACAGAGT
TGCTTCTCATTTGCTGGAGACGAAGATTTTCTCAAAAACGACATCCGTGTGAAGCCAGGT
CTTGATGGGCTTGGTGCGCTCGGAGACGCTGGATGGTACACGATCCGAGCAACTCTCTTA
GCCAACAACTTCGAGCTTCCCAATACTGTCACAGCCTTTCCGGGCGCTATGCTTAATGAT
GCAGGAGTGATTCTCTCATGTGGAGCTTCTCTGACTTGGGAAGACGGACGAACCGCTACC
ATATACTGTTCCTTCTTGGCAAACTTGACTATGGAGATAAACGCCATTGGAACCAACGGC
ACGCTTAGTGTTCATGATTTCATTATCCCGTTTAAGGAGACCGAGGCATCGTTCACAACG
AGCACTAAAGCTTGGTTCAATGAATTCGTGACCGCGTGGGTGAATCCCCCGAGCGAGCAG
ACGGTTAAGACGGAGCTTCCGCAAGAGGCATGTATGGTGAGAGAGTTTGCTCGATTGTTT
GGTGAAGTCAAGAACAAAGGTGCAAGGCCTGATGGGTTTTGGCCGAGCATTAGCCGGAAG
ACACAGCTAGTGGTTGATGCTGTTAAGGAGTCTGTTGATAAAAACTGTGAACAGATTAGT
CTCTCTGGTCGCTGAAGGGAAGGGCTAAAATTAGTAATGTTGTCATCAGTCCTCTCATCT
CTCTGTTTTCAAACTTTGATCATCCGTTAAGTGTTGTTATCCTTCTGCCCGGTTGCGCTT
GTATCCGTTCTGTTGTATGTGTGTTGTTGCTATTAATATTTTGAGTTTAATGTTGTTATA
CTATTTGTTACCC


BQ
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CTTGATGGGCTTGGTGCGCTCGGAGACGCTGGATGGTACACGATCCGAGCAACTCTCTTA
GCCAACAACTTCGAGCTTCCCAATACTGTCACAGCCTTTCCGGGCGCTATGCTTAATGAT
GCAGGAGTGATTCTCTCATGTGGAGCTTCTCTGACTTGGGAAGACGGACGAACCGCTACC
ATATACTGTTCCTTCTTGGCAAACTTGACTATGGAGATAAACGCCATTGGAACCAACGGC
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ACG
TTAA

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DS 

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TCTCATGTGGAGCTTCTCTGACTTGGGAAGACGGACGAACCGCTACCATATACTGTTCCT
TCTTGGCAAACTTGACTATGGAGATAAACGCCATTGGAACCAACGGCACGCTTAGTGTTC
ATGATTTCATTATCCCGTTTAAGGAGACCGAGGCATCGTTCACAACGAGCACTAAAGCTT
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AGCTTCCGCAAGAGGCATGTATGGTGAGAGAGTTTGCTCGATTGTTTGGTGAAGTCAAGA
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GAAGGGAAGGGCTAAAATTAGTAATGTTGTCATCAGTCCTCTCATCTCTCTGTTTTCAAA
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DS 



AS 1 3

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AAAAAAAAA


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED74JQ C 1
AF RR4ED74TF U 1
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TATCTAAGCAAGCCCTATGTGTACTACTTTTCCAAGAACTTTAAGATGGCCGTTAATGTG
T

QA 1 601 1 601
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TATCCAGATAGGATTCCGGTGATTGTTGAGAAGGGTGAGAAGAGTGATATACCAACCATC
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CGCAAAAGAATCAAACTGAGTGCAGAGAAGGCTATCTTTATCTTTGTGGACAATGTTCTT
CCTCCAACAGGTGCACTAATGTCGGCTGTGTACGAAGAGAAAAAGGATGATGATGGCTTC
CTCTATGTCACTTACAGCGGAGAGAACACATTTGGATCTCCATAGAAAGATCTTTTGCTG
GATACTCCGTTTCTCTTTTTAATTATATCGCCGAGTATTTTATATCTTCTTATTAGTAGT
TATCTAAGCAAGCCCTATGTGTACTACTTTTCCAAGAACTTTAAGATGGCCGTTAATGTG
T

QA 1 601 1 601
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ATGTCGGCTGTGTACGAAGAGAAAAATGATGATGATGGCTTCCTCTATGTCACTTACAGC
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ATAAAAATAATGTATATAAAATCTCAAACCTACTTTATCACGAAAAAAAAA

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 3

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TTTAAATAATAATCCACCTGGAGTGTGCTGAGAAATAGAGAAAGGA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CK23JQ U 1
AF RR4CK23TF C 1
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C

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TTCAGTTTTGCTTTTTAGCTTAACTAATACACTCGTTACTAGATTGAAGTCAACGGTTAA
CTAGAGTTGACCATACGAATGAGCAAAGTAGGCAAGAGCTCCAACGAGTGGTGAATTGAT
GTAAGTAGCTGGCTCTGACTGCTCGTAGTCAGACCGAACGTCCGGAAAGCGATCATGCTT
GTCCGGACCACCAACGACTGCACCAACGAGGAAATTAGGGTTTGGAGATTGAGAGTGCAT
AATGGAGAACCCTTGGTGACATTGGATTTTGGCCGGGTGACTTGCAACGCAAGGTAAGGA
GGAGCCACGGTGGTGGATTCGCCGTGGGAATTTTGGACCATAACCAACCATGTAAGACGT
CCGTAACGGGTTGTCTCCAAGTAGGTAATCAACCTGTCTTTTGGCGATTGCGCGGAGGCG
G

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DS 

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TTAGCTTAACTAATACACTCGTTACTAGATTGAAGTCAACGGTTAACTAGAGTTGACCAT
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CGACTGCACCAACGAGGAAATTAGGGTTTGGAGATTGAGAGTGCATAATGGAGAACCCTT
GGTGACATTGGATTTTGGCCGGG*GACTTGCAACGCAAGGTAAGGAGGAGCCACGGTGGT
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CTCCAAGTAGGTAATCAACCTGTCTTTTGGCGATTGCGCGGAGGCGGCCGGGAGTGTAGA
CGGAGCCACCGCAATGGACGACGGTTCTTGCGGAGGTTAAGTATTTGGCGTAGGTTAAGA
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CACCTGGAGTGTGCTGAGAAATAGAGAAAGGA

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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CACGAAAGTGGCGGTCCGTACAGCTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTT
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ATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTTGTTACAAATTGCAGAATTCTA


BQ
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AF RR4F956TF U 1
AF RR4FM19TF U 87
BS 1 404 RR4F956TF

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CACGAAAGTGGCGGTCCGTACAGCTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTT
TGTGAAGCTCATCTTTATTCCCATCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAGC
CAGGGACGATGAAGAAGGGTAGTAGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTT
ATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTTGTTACAAATTGCAGAATTCTA

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DS 

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GG
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AACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAGCCAGGGACGATGAAGAAGGGTAGTAGTTA
CAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTTATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTTGTTAC
AAATTGCAGAATT
CTA

QA 3 315 3 315
DS 



AS 1 3

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TGCTCATCTCTCTCCTTCCTCCGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAA
GGAAGAGAGTAGAACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCAC
CAATGCTTCCCTCTGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAG
AAGAAAGCCACCACGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCG
TTGAACCAACGAGCTCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTG
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AAGCTGTTTAAGTTGCAGAACTGAAGAAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAG
AATAGACAGTACAAAGCAGCGATTATAGGTGCAGGGATTGACGCAAACACAGCTCCAAAT
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GTACCAAACAGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H268JQ U 4
AF RR4C427JQ U 1
AF RR4H268TF C 112
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BS 262 684 RR4C427JQ
BS 685 852 RR4H268TF

RD RR4H268JQ 565 0 0
GG
AAACCAAACTAAAGACTAAGAAACTAATCAAAAATCACAAAGTTGT**ACCATTGGATTT
ACAGAGTCAAAAGCATTAGAAAGAGTAAACAACAATGCTCTTTAAGGTTCATGATCATTA
ATTTTGTAAATAAGACTATAGAATGCAAGATACTTTTTAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAA
GGAACAGAACAAAAGAACTCAGAGGCAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTC
ATCTCTCTCCTTCCTCCGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAGGAAG
AAAGTAGAACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCACCAATG
CTTCCCTCTGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAGAAGAA
AGCCACCACGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCGTTGAA
CCAACGAGCTCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTGAAGTA
CTGAGGGATGGACAAGCCGAGGA

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR4C427JQ 684 0 0
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GATTTACAGAGTCAAAAGCATTAGAAAGAGTAAACAACAATGCTCTTTAAGGTTCATGAT
CATTAATTTTGTAAATAAGACTATAGAATGCAAGATACTTTTTAGAAGTTTCCAAAGTTG
TGAAAGGAACAGAACAAAAGAACTCAGAGGCAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTT
TGCTCATCTCTCTCCTTCCTACGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAA
GGAAGAGAGTAGAACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCAC
CAATGCTTCCCTCTGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAG
AAGAAAGCCACCACGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCG
TTGAACCAACGAGCTCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTG
AAGTACTGAGGGATGGACAAGCCGAGGAAGACAGAGAAGCCTAAGATGAACTTGGTCCTG
AAGCTGTTTAAGTTGCAGAACTGAAGAAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAG
AATAGACAGTACAAAGCAGCGATT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4H268TF 741 0 0
GTTCATGATCATTAATTTTGTAAATAAGACTATAGAATGCAAGATACTTTT*AGAAGTTT
CCAAAGTTGTGAAAGGAACAGAACAAAAGAACTCAGAGGCAACAATGGTGAAACTCTGAG
TAAACTCTTTGCTCATCTCTCTCCTTCCTCCGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTG
AGATTGAAAGGAAGAGAGTAGAACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAAC
TTATCCCACCAATGCTTCCCTCTGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTG
TTGTCCAAGAAGAAAGCCACCACGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTC
ACCATATCGTTGAACCAACGAGCTCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTG
TACTCGTTGAAGTACTGAGGGATGGACAAGCCGAGGAAGACAGAGAAGCCTAAGATGAAC
TTGGTCCTGAAGCTGTTTAAGTTGCAGAACTGAAGAAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACG
TAGGCAAAGAATAGACAGTACAAAGCAGCGATTATAGGTGCAGGGATTGACGCAAACACA
GCTCCAAATTTTCCGAGAATAGAGAAGAAGATCATGAAGCCTGCAGCTATCTGAACAACC
CTTCTGCTACCAACTCTTGTCAGTGCTAACAGTCCAGCGTTTTCTATAGAGACAGAGGAA
CCAGCACCAGTACCAAACAGC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

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TATTCTGCATCTGTCCAGCTTAATGATTCTGATTGGTATCTTTGGTTTCCTCTGTACGCA
CTAGCTTCTGCAGTTAATCTGACCAACTCCAGAAGAATATGTAAATCAAGAAGAGTTAGA
CAGATGACGAGAATAGCTCTTAGCTTGGGTTTGTTCTTGTTGGTTAAAGTCATTACAGAG
GATGTCACAACAGAAAGACTTGGAATCTTGTCTTTGGATCTCACTCATGGAGTTGTAAGA
GAGAAGATCGGAAGTGGTTTGGTGATAGCTTCTATGGTTCTGCAAGTACAAGCTTCTTAT
TCAAATCCAAAAGAGAAGTTCGTTGACTTTGGGATGGCTGCAACTGTAGTCTTTGGTTAT
GGACTTCCCTTTTGGTTCTTCACAATAGAGAATGAAGAAATCAAGATTTGACTCCTTTTC
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GAACAATATTTGGTCGATCAACATTTGAATAGACATAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BE80JQ C 1
AF RR4H709TF U 1
AF RR4BE80TF U 1
BS 1 37 RR4H709TF
BS 38 38 RR4BE80TF
BS 39 136 RR4H709TF
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BS 138 288 RR4H709TF
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BS 511 628 RR4H709TF
BS 629 638 RR4BE80TF

RD RR4BE80JQ 638 0 0
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TCAAATCCAAAAGAGAAGTTCGTTGACTTTGGGATGGCTGCAACTGTAGTCTTTGGTTAT
GGACTTCCCTTTTGGTTCTTCACAATAGAGAATGAAGAAATCAAGATTTGACTCCTTTTC
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GACTGGTCTCAAATTGTTAATTTATATCTCTAGAAATTTTAACTAGCTCTAAATACAAAC
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QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4H709TF 630 0 0
ATGGAAAAACCAAGAAATCTTTTAAGGGTTTCTTCTCCTTTAATGGCGTTTTTGTTTGCT
TATTCTGCATCTGTCCAGCTTAATGATTCTGATTGGTATCTTTGGTTTCCTCTGTACGCA
CTAGCTTCTGCAGTTATTCTGACCAACTCCAGAAGAATATGTAAATCAAGAAGAGTTAGA
CAGATGACGAGAATAGCTCTTAGCTTGGGTTTGTTCTTGTTGGTTAAAGTCATTACAGAG
GATGTCACAACAGAAAGACTTGGAATCTTGTCTTTGGATCTCACTCATAGAGTTGTAAGA
GAGAAGATCGGAAGTGGTTTGGTGATAGCTTCTATGGTTCTGCAAGTACAAGCTTCTTAT
TCAAATCCAAAAGAGAAGTTCGTTGACTTTGGGATGGCTGCAACTGTAGTCTTTGGTTAT
GGACTTCCCTTTTGGTTCTTCACAATAGAGAATGAAGAAATCAAGATTTGACTCCTTTTC
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GACTGGTCTCAAATTGTTAATTTATATCTCTAGAAATTTTAACTAGCTCTAAATACAAAC
GAACAATATTTGGTCGATCAACATTTGA
TA

QA 1 628 1 628
DS 

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CAGATGACGAGAATAGCTCTTAGCTTGGGTTTGTTCTTGTTGGTTAAAGTCATTACAGAG
GATGTCACAACAGAAAGACTTGGAATCTTGTCTTTGGATCTCACTCATGGAGTTGTAAGA
GAGAAGATCGGAAGTGGTTTGGTGATAGCTTCTATGGTTCTGCAAGTACAAGCTTCTTAT
TCAAATCCAAAAGAGAAGTTCGTTGACTTTGGGATGGCTGCAACTGTAGTCTTTGGTTAT
GGACTTCCCTTTTGGTTCTTCACAATAGAGAATGAAGAAATCAAGATTTGACTCCTTTTC
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GACTGGTCTCAAATTGTTAATTTATATCTCTAGAAATTTTAACTAGCTCTAAATACAAAC
GAACAATATTTGGTCGATCAACATTTGAATAGACATAC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL3870Contig1 995 2 10 U
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CACTTCCGTAGCCATAACATCCTTATCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCT
GGTAATGTCAAGCGGTTTTTACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACAT
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CTAGACGATCCACGAACAGTGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAGGACAACATTCTC
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AATATTGCTGCAAAAGATTTTCTTGCCAACATTGAACACATGGAGATTCCACATCAAGCA
GGGATAGGACATTTTTATCATATCTTCTATGAAGGATGCCTCACTGATCATGAAATCAGA
GAAGATGAAGAAGCATCAAATCTCTATCCAGATGTTAAGTACAAGCGTATGGATAATTAT
TTAAGAATGTACCTATGATTACACTTTGGTCAAAGTCATATCTATGATAAATATGCATAT
CATAAGTTTGAAGTTTTTATATTCATGTATTTTCGTGTTACTCAAAGTTGAATGTATCCA
TTATGTAACAAATATAAATGGTTTCTTATTATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E618TF U 1
AF RR4E618JQ C 184
BS 1 537 RR4E618TF
BS 538 538 RR4E618JQ
BS 539 588 RR4E618TF
BS 589 589 RR4E618JQ
BS 590 592 RR4E618TF
BS 593 593 RR4E618JQ
BS 594 607 RR4E618TF
BS 608 608 RR4E618JQ
BS 609 624 RR4E618TF
BS 625 995 RR4E618JQ

RD RR4E618TF 630 0 0
AGGTCACGAGACTTACGTTTTGCAGCGGCCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAGTCCA
ACTCCTTCTCTCTTTCAAGAAACTCGGCGCTCGTCTCTCGAAGCTTCTTTCTCCGACCAC
CAAAGCCTCGTATCAGCGGTGAAACTCGTAGATGTCGTTGTCTCCGCCATGTCGGGCGTT
CACTTCCGTAGCCATAACATCCTTATCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCT
GGTAATGTCAAGCGGTTTTTACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACAT
GCATTACCACCAGGAAGAGAAACGTTTGGCCAAAAATGGAAGTGCGTCATGCTATTGAAG
CTGTCGGAATACCTTACACTTACGTCGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAA
ACTTATCTCAGATGGAAGCTTTACTTCCTCCAAAGAAAAAAACTAATATATATGGAGATG
GAAACATAAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGACGATATCGCAAAATACACCGCAAAA*CA
CTAGACGATCCACGAACAGTGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAG*ACA*CATTCTC
ACGCAAA*TGAACTGGTTAAGATT
TGGGAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4E618JQ 812 0 0
CTT
CGTAGCCATAACATC*TTATCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCTGGTAAT
GTCAAGCGGTTTT*ACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACATGCATTA
CCACCAGGAAGAGAAACGTTTGGCCAAAAATGGAAGTGCGTCATGCTATTGAAGCTGTCG
GAATACCTTACACTTACGTCGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAACTTAT
CTCAGATGGAAGCTTTACTTCCTCCAAAGAAAAAAACTAATATATATGGAGATGGAAACA
TAAAA*GTGGTGTTCGCCGATGAAGACGATATCGCAAAATACACCGCAAAAACACTAGAC
GATCCACGAACAGTGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAGGACAACATTCTCACGCAA
AATGAACTGGTTAAGATTTGGGAAAACCTAACCGGAAATGAATTGGAAAAGAAAAATATT
GCTGCAAAAGATTTTCTTGCCAACATTGAACACATGGAGATTCCACATCAAGCAGGGATA
GGACATTTTTATCATATCTTCTATGAAGGATGCCTCACTGATCATGAAATCAGAGAAGAT
GAAGAAGCATCAAATCTCTATCCAGATGTTAAGTACAAGCGTATGGATAATTATTTAAGA
ATGTACCTATGATTACACTTTGGTCAAAGTCATATCTATGATAAATATGCATATCATAAG
TTTGAAGTTTTTATATTCATGTATTTTCGTGTTACTCAAAGTTGAATGTATCCATTATGT
AACAAATATAAATGGTTTCTTATTATATT

QA 4 812 4 812
DS 



AS 1 3

CO CL3871Contig1 850 3 10 U
GCGGAAAGATGTTACTTTGGATTTTAGTATTTAACTCTTTGGCTCACCCACAAGTACTAG
TTGATACATTTTGAATTCGGAATTACAAATTGTTCATTGTTCAACAACGTGAAATAGCTT
AAACTTCACACTTTTTTTATTTGACTTAATGCCTTCATTGCTTCTCTGTATTCAACTTTG
TGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGTGCATTAAATAAGTCATCAACAGAGT
CTCCTCTCTCAAAAACTGCCGCAGCTCCCATACCAGTACCTATGCACATTGAAATAACTC
CAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGCAGCAATGTTGCAACACATCGAG
CTCCTGTAGCACCAAGAGGATGACCAATGGCAATGGCTCCTCCATTAACATTGACCTTTT
CCACATCCAGCTCTAGCTTCTTGCAACAGTACACATACTGAGATGCAAATGCCTCATTGA
TCTCAAATAGATCAATGTCGCTAACTTTGAGTCCTGCTAGGTTTGCTGCAGCAGGAATGG
CATAAGCTGGACCAATACCCATTACAGCCGGATCCACACCAGTAACAGCAAAGCTCCTGA
ATACTCCAAGAATGGGAAGTCCCTTCTTCATCGCCAAGCTCCTCTTCATTAGCAGTACGG
CTCCAGCACCATCACTAATCTGACTAGCATTACCTGCTGTGGTTGAACCATCAGGTTTAA
AGACTGTCTTCAGCTTTGCCAAATCAGCCATGTTTGAGTTTGGACGTACACCATCATCAA
CAGAAACAACAATTGGCTTCTCTGCTTTTGTCACGGGGTCAACAATCTTAGTAGCAACTG
GTACTATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BN53JQ U 48
AF RR4D109JQ U 1
AF RR4BT41JQ U 45
BS 1 135 RR4D109JQ
BS 136 136 RR4BT41JQ
BS 137 138 RR4D109JQ
BS 139 140 RR4BT41JQ
BS 141 221 RR4D109JQ
BS 222 222 RR4BT41JQ
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BS 447 447 RR4BT41JQ
BS 448 707 RR4D109JQ
BS 708 850 RR4BT41JQ

RD RR4BN53JQ 480 0 0
CCC
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GAAATAGCTTAAACTTCACACTTTTTTTATTTGACTTAATGCCTTCATTGCTTCTCTGTA
TTCAACTTTGTGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGTGCATTAAATAAGTCA
TCAACAGAGTCTCCTCTCTCAAAAACTGCCGCAGCTCCCATACCAGTACCTATGCACATT
GAAATAACTCCAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGCAGCAATGTTGCA
ACACATCGAGCTCCTGTAGCACCAAAAGGATGACCAATGGCAATGGCTCCTCCATTAACA
TTGACCTTTTCCACACCCAGCTCTAGCTTCTTGCAACAGTACACATACTGAGATGCAAAT
GCCTCATTGATCTCAAATAAATCAATGTCGCTAACTTTGAGTCCTGCTAGGTTTGCT

QA 4 480 4 480
DS 

RD RR4D109JQ 707 0 0
GCGGAAAGATGTTACTTTGGATTTTAGTATTTAACTCTTTGGCTCACCCACAAGTACTAG
TTGATACATTTTGAATTCGGAATTACAAATTGTTCATTGTTCAACAACGTGAAATAGCTT
AAACTTCACACTTTTCTT**TTGACTTAATGCCTTCATTGCTTCTCTGTATTCAACTTTG
TGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGTGCATTAGATAAGTCATCAACAGAGT
CTCCTCTCTCAAAAACTGCCGCAGCTCCCATACCAGTACCTATGCACATTGAAATAACTC
CAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGCAGCAATGTTGCAACACATCGAG
CTCCTGTAGCACCAAGAGGATGACCAATGGCAATGGCTCCTCCATTAACATTGACCTTTT
CCACATCCAGCTCTAGCTTCTTGCAA*AGTACACATACTGAGATGCAAATGCCTCATTGA
TCTCAAATAGATCAATGTCGCTAACTTTGAGTCCTGCTAGGTTTGCTGCAGCAGGAATGG
CATAAGCTGGACCAATACCCATTACAGCCGGATCCACACCAGTAACAGCAAAGCTCCTGA
ATACTCCAAGAATGGGAAGTCCCTTCTTCATCGCCAAGCTCCTCTTCATTAGCAGTACGG
CTCCAGCACCATCACTAATCTGACTAGCATTACCTGCTGTGGTTGAA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4BT41JQ 806 0 0
CACCCA
CAAGTACTAGTTGATACATTTTGAATTCGGAATTACAAATTGTTCATTGTTCAACAACGT
GAAATAGCTTAAACTTCACACTTTTTTTATTTGACTTAATGCCTTCATTGCTTCTCTGTA
TTCAACTTTGTGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGTGCATTAAATAAGTCA
TCAACAGAGTCTCCTCTCTCAAAAACTGCCGCAGCTCCCATACCAGTACCTATGCACATT
GAAATAACTCCAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGCAGCAATGTCGCA
ACACATCGAGCTCCTGTAGCACCAAGAGGATGACCAATGGCAATGGCTCCTCCATTAACA
TTGACCTTTTCCACATCCAGCTCTAGCTTCTTGCAACAGTACACATACTGAGATGCAAAT
GCCTCATTGATCTCAAATAGATCAATGTCGCTAACTTTGAGTCCTGCTAGGTTTGCTGCA
GCAGGAATGGCATAAGCTGGACCAATACCCATTACAGCCGGATCCACACCAGTAACAGCA
AAGCTCCTGAATACTCCAAGAATGGGAAGTCCCTTCTTCATCGCCAAGCTCCTCTTCATT
AGCAGTACGGCTCCAGCACCATCACTAATCTGACTAGCATTACCTGCTGTGGTTGAACCA
TCAGGTTTAAAGACTGTCTTCAGCTTTGCCAAATCAGCCATGTTTGAGTTTGGACGTACA
CCATCATCAACAGAAACAACAATTGGCTTCTCTGCTTTTGTCACGGGGTCAACAATCTTA
GTAGCAACTGGTACTATCTC

QA 7 806 7 806
DS 



AS 1 3

CO CL3872Contig1 917 3 4 U
CCCAAAACAGTAACAATTTTATTTTGGTTTCTTGATTTGCCTTTTGGTAATTTAACAAAT
TATTATTATTCATGATACATCTATCACCAGTTAAAAAAATAAATTGAAGTACCTTGCTGA
AGTATTTTGTGGGGGTCTTCTTCAGTGTTCCCTTTTGCTTTCTTGAAGCGTTTTATGCAA
CTTCTTAGCTTGACTCAAAACACACTCTTGGTCGAACAAAGCCGACACAACCGCTACTCC
TTTAAGATTCGGTTCATCGATCCTCATAACAGACTCTGCGTTTGAGATACCAATACCTCC
GATGGCAACCACTGGTAATTTCGACGCCTTGCATACTTCTTTGAGTCCGTCGAGTCCAAT
GGTACGATTGTTGGCCTTTGTGTTCGTTGGAAAAACTCCTCCTGACCCAATGTAGTCCGC
ACCATCTTTCCATGCTTGGTGGGCTTGTTCTTGTGTTTTACATGAGACGCCTATGATCTT
GTCCGGGCCAAGAAGAGACCGTACTTGATCAACCGGCATGTCTGATTGGCCGACATGGAC
TCCATCAGCATCACAGGCAAGGGCAATGTCGATCCTGTCGTTTATCAGCAGACAAACTCC
GTTGGACCGGCATATGTCAACACACGCTTTTGCTTCTTCGAGAAACTCACGAGTTTCAGC
TTCTTTCTCCCTTATCTGTACGATTGTGGCTCCTCCTTCTATAGCAGCTTTGACGGCATC
CACGATGGACCGGTTCCATTTTTTGTTCATTCTAGAATCTGTGACAGCGTATAGGAACAG
GTCATCTGGATTGAATGTGCTTTGAGGACCCTTGTTAAAACTGAAAAAGTGGTCAAATGG
TCCTTGCATCCCACTGCCGATCACAATATCTTTGCTATAGTTTAGGGCAGTGTCTACGAA
GCGTTTAGCCAACTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B492JQ U 1
AF RR4B835JQ U 1
AF RR4B835TF C 156
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TTTAAGATTCGGTTCATCGATCCTCATAACAGACTCTGCGTTTGAGATACCAATACCTCC
GATGGCAACCACTGGTAATTTCGACGCCTTGCATACTTCTTTGAGTCCGTCGAGTCCAAT
GGTACGATTGTTGGCCTTTGTGTTCGTTGGAAAAACTCCTCCTGACCCAATGTAGTCCGC
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TCATTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4A978JQ C 1
AF RR4A978TF U 644
AF RR4GR18JQ U 622
BS 1 621 RR4A978JQ
BS 622 1207 RR4GR18JQ

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ACTT*CTTTAGTCTCTTAGTGTTACATATACATCATTTTCTATGTAAATTCTGTAATAAT
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GAGTCTCTGATTCATTCCCTGAGAAATCAGAGGAGCTTATGACAGAGTGATCTCCACTAT
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CTTGGTTGTACTGCCCTGAGTTATAAGTTGTGCTTTTCCCAACTTTGATTCCGTTGCTAA
TATCTCCCGAGTCTTCGTCACAGTCCAATGCTCTCACAACCTGAACCATGCGTGGACGTT
TTGGACCAAAATGTCTAACGCATGCAGCGGCCGTCTCAATCATTCT

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DS 



AS 1 3

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4EK31TF U 87
AF RR4DE54TF U 360
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TGCTATTAAAATCCTCGACCGAGATAAGGTTCTACGTCACAAAATGGTTGAGCAGCTTAA
AAGAGAAATATCGACAA***AACTGATTAAACATCCAAATGTGGTTGAAATCATTGAGGT
TATGGCGAGCAAAACGAAGATCTATATAGTTCTTGAGCTTGTCAATGGAGGTGAACTCTT
TGATAAAATCGCTCAACAAGGGAGACTTAAGGAGGATGAAGCTAGGAAATATGTTCAGCA
GCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCGAGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGCC
TGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGATTTTAAAAGTTTCTGATTTTGGGTTAAGCGC
TTTCTCACTACAAATTCGAGAAGATGGTTTGCTTCACACAGCTTGTGGAACGCCCAACTA
TGTTGCTC

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DS 

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GG
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AGAGTGGGGAACTACGAGATGGGACGAACTCTAGGCGAAGGTAGCTTCGCTAAGGTCAAA
TACGCAAGGAACACCGTCACTGGAGATATAGCTGCTATTAAAATCCTCGACCGAGATAAG
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AAACATCCAAATGTGGTTGAAATCATTGAGGTTATGGCGAGCAAAACGAAGATCTATATA
GTTCTTGAGCTTGTCAATGGAGGTGAACTCTTTGATAAAATCGCTCAACAAGGGAGACTT
AAGGAGGATGAAGCTAGGAAATATGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCAC
AGTCGAGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGG
ATTTTAAAAGTTTCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGAGAAGATGGT
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GGCTATGACGGTGCAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATG
GCTGGTTACTTGCCCTTTGACGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGTATAT

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DS 

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GG
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GATAAAATCGCTCAACAAGGGAGACTTAAGGAGGATGAAGCTAGGAAATATGTTCAGCAG
CTAATCAATGCCGCTGATTACTGCCACAGTCGAGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGCCT
GAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGATTTTAAAAGTTTCTGATTTTGGGTTAAGCGCT
TTCTCACTACAAATTCGAGAAGATGGTTTGCTTCACACAGCTTGTGGAACGCCCAACTAT
GTTGCTCCTGAGGTTCTGTCGGACAAAGGCTATGACGGTGCAGCAGCAGATGTATGGTCA
TGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATGGCTGGTTACTTGCCCTTTGACGAGCCAAATCTC
ATGACACTATACAAACGTATATGCAAGGCTGAATTCAACTGCCCACCATGGTTCTCGCCA
GGTGCCAAGAGTGCATTAAGCGTATTCTTGATCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTATCG
CAGAGTTACTAGAAGA

QA 3 558 3 558
DS 



AS 1 3

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TCTGCAACTATGACACTGCGTCGCATGCTCAACCTTGAGACTGCGGATGAATGAAGATCA
GGAGTCTTCAGGGGAACAAGGGTTTTAGTTTTAGTTTTGTGGATATATAAATAAGGTGGT
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ATGGTGGAACAGCTGGTTATAGTGAGCAGAAACGTTCAGAAAGCAGATTGATTCTTGGTT
TAGGATATGTGTTGGCTAAAAAGTTACCCTGGGTGATTGATAAGTTCATGTGGTGGTGCC
CTTTGTATAGTTTCTCTTTAGAGTCAGTCTTTTTCTCTTTGGCTTCTTTTCTTTAAGTGG
GTTAGATTAGCAACTAGGTTCCTGTTCTCATAACTCCCTCCTTGTCCATATCTTTTCTTT
CAACCCTTTGTCTACTTTCATGTTCTTGAGTCTTATTTTCCTTTCTGTCTTAAAGATGAA
CCTTACTACTTGTGTTTTAGTGGTCTTCCTCTTCAGCTCTTTTCCTGAGTTTTTTTTGTA
AAGGAAGAAGGGAATAGGAAGTTCTTTCTTATGTCTCTCTTAGACTATCTCTACCGGTAA
AAGATTCATCCTGATGAAAGCCGATACTTCTTCTCAAGAAAAGATAGTCCTCAGGTTCTT
CTTGACACCGGTCTTACCTAAAATACTTACAAGTTTCCTTGGGAGTTTCGTGATCCCTTC
TAATCTGCTCACCAGGTACCTATAGAAGCTGCTGCTCCGCTCTGCTTTTGATGCTTCATC
GTAGTTTCTTTATCACTCTGCTATCTTTTGGCTATGTTGCTTTGTTACGCAGTGGCAAGT
ATTGTCCCTGTACGTATGTTTTCTTCTCGTCTTTGTTTGTAGTATGTGACAGTGTAGTAG
ACGTTTTGCTATCTTGTTTTGTGTTTTAGTGTTGAAGGAGATGTATCCCTTGTTCCCTAT
AACTATTAGTAATTTAGTACTATCATTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D902TF U 1
AF RR4CS12TF U 98
AF RR4CS12JQ C 619
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RD RR4D902TF 731 0 0
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ACTTACTCCAACTCTCCTCCGCCCACTTCTGTTCCCATTCCCAAGTTCTCTCTCCGGCAA
AAGAGGACGGTATCTCTGACCTTTCCAGCTCCTGACCCTGATGTTGATCTTCCTGAAGTT
GCCAAGTCTGCTCCGGTCTCTCCAACCTCGTCGGGTGTCAACCCTTTTCACAGTACTGTC
TCTGCAACTATGACACTGCGTCGCATGCTCAACCTTGAGACTGCGGATGAATGAAGATCA
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TAG
CATATAGG

QA 1 723 1 723
DS 

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ACTCTGAGCTATGGGCAGGACCTACTTACTCCAACTCTCCTCCGCCCACTTCTGTTCCCA
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CTTATGTTGATCTTCCTGAAGTTGCCAAGTCTGCTCCGGTCTCTCCAACCTCGTCTGGTG
TCAACCCGTTTCACAGTACTGTCTCTGCAACTATGACACTGCGTCGCATGCTCAACCTTG
AGACTGCGGATGAATGAAGATCAGGAGTCTTTAGGGGAACAAGGGTTTTAGTTTTAGTTT
TGTGGATATATAAATAAGGTGGTTAGTCGCCAAGTTGGTGTGAGTTTGTTAATGGCGATG
GTAAAAGGAACACAGAAGCAGTCTTGAGACTCAGAGTTGGTCAGCAGTTAGTGGCTCTCC
TATGCAAGATTGAGGTGTTACTAATGGTGGAACAGCTGGTTATAGTGAGCAGAAACGTTC
AGAAAGCAGATTGATTCTTGGTTTAG*ATATGTGTTGGCTAAAAAGTTACCCTGGGTGAT
TGATAAGTTCATGTGGTGGTGCCCTTTGTATAGTTTCTCTTTAGAGTCAGTCTTTT*CTC
TTTGGCTTCTTTTCTTTAAGTGGGTTAGATTAGCAA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4CS12JQ 853 0 0
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ATAGTGAGCAGAAACGTTCAGAAAGCAGATTGATTCTTGGTTTAGGATATGTGTTGGCTA
AAAAGTTACCCTGGGTGATTGATAAGTTCATGTGGTGGTGCCCTTTGTATAGTTTCTCTT
TAGAGTCAGTCTTTTTCTCTTTGGCTTCTTTTCTTTAAGTGGGTTAGATTAGCAACTAGG
TTCCTGTTCTCATAACTCCCTCCTTGTCCATATCTTTTCTTTCAACCCTTTGTCTACTTT
CATGTTCTTGAGTCTTATTTTCCTTTCTGTCTTAAAGATGAACCTTACTACTTGTGTTTT
AGTGGTCTTCCTCTTCAGCTCTTTTCCTGAGTTTTTTTTGTAAAGGAAGAAGGGAATAGG
AAGTTCTTTCTTATGTCTCTCTTAGACTATCTCTACCGGTAAAAGATTCATCCTGATGAA
AGCCGATACTTCTTCTCAAGAAAAGATAGTCCTCAGGTTCTTCTTGACACCGGTCTTACC
TAAAATACTTACAAGTTTCCTTGGGAGTTTCGTGATCCCTTCTAATCTGCTCACCAGGTA
CCTATAGAAGCTGCTGCTCCGCTCTGCTTTTGATGCTTCATCGTAGTTTCTTTATCACTC
TGCTATCTTTTGGCTATGTTGCTTTGTTACGCAGTGGCAAGTATTGTCCCTGTACGTATG
TTTTCTTCTCGTCTTTGTTTGTAGTATGTGACAGTGTAGTAGACGTTTTGCTATCTTGTT
TTGTGTTTTAGTGTTGAAGGAGATGTATCCCTTGTTCCCTATAACTATTAGTAATTTAGT
ACTATCATTCTCC

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 3

CO CL3877Contig1 1281 3 11 U
GGACGCTGCCTTCCAATTAAAAACAAGCCATTATGAAACATTGTTAAGAGAAGCGAAAAA
GAACAGAGAAAGCTGGAAAATTAAAAAAAAATCCCTTCTTTCCTGCAGAAGAGAAGAGAG
AATCTATCGACAGGCTTTGCTGTGTTTTGTTAATTAGTGAAGATGATGGCAGCAGCTATT
AACAGCTTCGATCTTTGGCAAAAGGATGTGTTTTTCTCAGCAGCAGAGGAGGTTCAAGAA
TCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTTGGACTAAAGAGAAGAGACAAGGTCGA
TCAGACCAGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTTTGAGCACTGCTAAATGGCAGCTGGAA
GAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCACCATGGACATTGCCGAGACGACACCACCTTG
ACTCGGCATAAACAGTTTGTCAACGCTATCGAGAACCAGATTCACCGAGTGCAGTCCGCA
CTGCAAGAGGCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGCCTCTGCGTTTGGTTGATCTCAACAAA
GAAGAGCGTGATGACCTTGCCATGTTTCTCTCTGGATCTTCTCTTACCTCAGAGAGTAGC
ATCAACTTGAGAGACTCCTCAACAAGTTCCTTGGCTGAAAATTCGCGTGGGATCAACAGC
TGTGTGATAGACATTGTTGACGAGGGAGGTAGCCCTGAAAGTGCTGATGCTGTAATCCGC
GTGCAGCAGGGTGCGGATAAAAGGTCGGGGACGAGAAGAACATGGAGTTCACCGAATTTT
CCTAACGTAACTGCGTTGAGGATTAATGTGGAAGAAGAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGA
CTTGTGTTAGACATTGAAGACACTCCTAAGGAGAAAGGATCTAAACCTCTGTTTTCAATG
CAGAGATGTCGTGATTATAACCTTATCTTTGACAGAGTCAGCCAATGTCGAAGGAGGTTT
CGTGCTCCCTTTAGCAGACCGGTCCAGCTCATTCTTTCCTTCACGCTAATCTTGTTTCTT
CTATTGCTGTTTGGAGTTTATTAGTCTTGACAACTTAAAACTTTGGTTTCCTGAAACCCT
CGAGAACATTTGACAAGGTTACATATTCTTGCTTGTTGGTCACACACATTCGAAGAACAA
GCCTGCATTTTCTTTACTTTCTTTTGTCCTCAAGGAAACATATATAGGAACTTGTAACTT
TGTAGGTCTATTGTAAAGTATACTAAAAAGAATTTCCTGTGTTGTTGTTACAAATCGATG
CGGTTAAGGTTGTTGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR09TF U 1
AF RR4AR63TF U 48
AF RR4FR09JQ C 580
BS 1 301 RR4FR09TF
BS 302 302 RR4AR63TF
BS 303 307 RR4FR09TF
BS 308 308 RR4AR63TF
BS 309 357 RR4FR09TF
BS 358 358 RR4AR63TF
BS 359 686 RR4FR09TF
BS 687 743 RR4AR63TF
BS 744 744 RR4FR09JQ
BS 745 818 RR4AR63TF
BS 819 1281 RR4FR09JQ

RD RR4FR09TF 686 0 0
GGACGCTGCCTTCCAATTAAAAACAAGCCATTATGAAACATTGTTAAGAGAAGCGAAAAA
GAACAGAGAAAGCTGGAAAATTAAAAAAAAATCCCTTCTTTCCTGCAGAAGAGAAGAGAG
AATCTATCGACAGGCTTTGCTGTGTTTTGTTAATTAGTGAAGATGATGGCAGCAGCTATT
AACAGCTTCGATCTTTGGCAAAAGGATGTGTTTTTCTCAGCAGCAGAGGAGGTTCAAGAA
TCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTTGGACTAAAGAGAAGAGACAAGGTCGA
TTAGACCGGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTTTGAGCACTGCTAAATGGCAGCTGTAA
GAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCACCATGGACATTGCCGAGACGACACCACCTTG
ACTCGGCATAAACAGTTTGTCAACGCTATCGAGAACCAGATTCACCGAGTGCAGTCCGCA
CTGCAAGAGGCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGCCTCTGCGTTTGGTTGATCTCAACAAA
GAAGAGCGTGATGACCTTGCCATGTTTCTCTCTGGATCTTCTCTTACCTCAGAGAGTAGC
ATCAACTTGAGAGACTCCTCAACAAGTTCCTTGGCTGAAAATTCGCGTGGGATCAACAGC
TGTGTGATAGACATTGTTGACGAGGG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4AR63TF 771 0 0
GG
GAAGCGAAAAAGAACAGAGAAAGCTGGAAAATTAAAAAAAAATCCCTTCTTTCCTGCAGA
AGAGAAGAGAGAGTCTATCGATAGGTTTTGCTGTGTTTTGTTAATTAGTGAAGATGATGG
TAGCAGCTATTAACAGCTTCGATCTTTGGCAAAAGGATGTGTTTTTCTCAGCAGCAGAGG
AGGTTCAAGAATCTGCCGATACAATGGAATCTGCGTATAGGGTTTGGACTAAAGAGAAGA
GACAAGGTCGATCAGACCAGCTCTGCATTGAACTTCAAGCTGCTTTGAGCACTGCTAAAT
GGCAGCTGGAAGAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCCCCATGGACATTGCCGAGACG
ACACTACCTTGACTCGGCATAAACAGTTTGTCAACGCT*TCGAGAACCAGATTCACCGAG
TGCAGTCTGCACTGCAAGAGGCTTTGGCCGAGAACGGGAAACAGCCTCTGCGTTTGGTTG
ATCTCAACAAAGAAGAGCGTGATGACCTTGCCATGTTTCTCTCTGGATCTTCTCTTACCT
CAGAGAGTAGCATCAACTTGAGAGACTCCTCAACAAGTTCCTTGGCTGAAAATTCGCGTG
GGATCAACAGCTGTGTGATAGACATTGTTGACGAGGGAGGTAGCCCTGAAAGTGCTGATG
CTGTAATCCGCGTGCAGCAGGGTGCGGATAAAAG*TCGGGGACGAGAAGAACATGGAGTT
CACCGAATTTTCCTAACGTAACTGCGTTGAGGATTAATGTGGAAGAAGA

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR4FR09JQ 702 0 0
TCTCTTACCTCAGAGAGTAGCATCAACTTGAGAGACTCCTCAACAAGTTCCTTGGCTGAA
AATTCGCGTGGGATCAACAGCTGTGTGATAGACATTGTTGACGAGGGAGGTAGCCCTGAA
AGTGCTGATGCTGTAATCCGCGTGCAGCAGGGTGCGGATAAAAGGTCGGGGACGAGAAGA
ACATGGAGTTCACCGAATTTTCCTAACGTAACTGCGTTGAGGATTAATGTGGAAGAAGAA
GAGGAGAAGAAGAAGAAGAGACTTGTGTTAGACATTGAAGACACTCCTAAGGAGAAAGGA
TCTAAACCTCTGTTTTCAATGCAGAGATGTCGTGATTATAACCTTATCTTTGACAGAGTC
AGCCAATGTCGAAGGAGGTTTCGTGCTCCCTTTAGCAGACCGGTCCAGCTCATTCTTTCC
TTCACGCTAATCTTGTTTCTTCTATTGCTGTTTGGAGTTTATTAGTCTTGACAACTTAAA
ACTTTGGTTTCCTGAAACCCTCGAGAACATTTGACAAGGTTACATATTCTTGCTTGTTGG
TCACACACATTCGAAGAACAAGCCTGCATTTTCTTTACTTTCTTTTGTCCTCAAGGAAAC
ATATATAGGAACTTGTAACTTTGTAGGTCTATTGTAAAGTATACTAAAAAGAATTTCCTG
TGTTGTTGTTACAAATCGATGCGGTTAAGGTTGTTGAAGTCC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL3878Contig1 819 3 3 U
GGATATGGATATAAAAGGAAGACCTCTCGCGTATACTCCTTTTTGTGACAACAACAAGGA
AATGGATGGCTATCGGTTTTGGAGACAGGGTTTCTGGAGAGAACATTTACGTGGTAGGCC
ATACCATATCAGTGCTCTGTACGTTGTTGACTTGGTTAAATTCCGAGAGACGGCGGCAGG
AGACAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGCAAGGATCCAAACAGTTTGTCCAATCT
AGATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCACACTGTTCCTATATTTTCACTTCCCCAAGA
GTGGTTATGGTGTGAATCATGGTGTGGAAACGCCACCAAATCAAAGGCTAGAACAATAGA
CCTGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAAGCTTCAGGGTGCCAGAAGAATTGTAAC
TGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGGAAGTTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGA
TTTGGAACTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGCTGCTACGGATAAGCCTAATCCTCCTCC
ATCAAGTGACATCTCTGAAGATTCAGAACAAGACTTGGAATCTAAGGATGAACTTTAAAT
GCAGGTTCCTGTAGCTTTTAAAGAGGAGAAGATAGCATCATCACGCGTTGTTATTTTCAA
TGGATGGGGCTAGATAAGGTTTCTAGTATTTTTGTACCATTTTCCAAGACATAATATTTT
CAGCAGAACTATAGTTTAGCAGGGAGAATGAACAAACAACTACAGTTCGCAATGTTAGAT
TCAACATTATCTGAAGGTTACTTAACACTTGTGCAGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CJ50TF U 1
AF RR4CJ50JQ C 43
AF RR4H389TF U 333
BS 1 558 RR4CJ50TF
BS 559 809 RR4H389TF
BS 810 819 RR4CJ50JQ

RD RR4CJ50TF 563 0 0
GGATATGGATATAAAAGGAAGACCTCTCGCGTATACTCCTTTTTGTGACAACAACAAGGA
AATGGATGGCTATCGGTTTTGGAGACAGGGTTTCTGGAGAGAACATTTACGTGGTAGGCC
ATACCATATCAGTGCTCTGTACGTTGTTGACTTGGTTAAATTCCGAGAGACGGCGGCAGG
AGACAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGCAAGGATCCAAACAGTTTGTCCAATCT
AGATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCACACTGTTCCTATATTTTCACTTCCCCAAGA
GTGGTTATGGTGTGAATCATGGTGTGGAAACGCCACCAAATCAAAGGCTAGAACAATAGA
CCTGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAAGCTTCAGGGTGCCAGAAGAATTGTAAC
TGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGGAAGTTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGA
TTTGGAACTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGCTGCTACGGATAAGCCTAATCCTCCTCC
ATCAAGTGACATCTCTGA
GATTC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4CJ50JQ 777 0 0
TTGTGACAACAACAAGGAAATGGATGGCTATCGGTTTTGGAGACAGGGTTTCTGGAGAGA
ACATTTACGTGGTAGGCCATACCATATCAGTGCTCTGTACGTTGTTGACTTGGTTAAATT
CCGAGAGACGGCGGCAGGAGACAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGCAAGGATCC
AAACAGTTTGTCCAATCTAGATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCACACTGTTCCTAT
ATTTTCACTTCCCCAAGAGTGGTTATGGTGTGAATCATGGTGTGGAAACGCCACCAAATC
AAAGGCTAGAACAATAGACCTGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAAGCTTCAGGG
TGCCAGAAGAATTGTAACTGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGGAAGTTCACAGC
AAAAATCTTGGGTGAAGATTTGGAACTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGCTGCTACGGA
TAAGCCTAATCCTCCTCCATCAAGTGACATCTCTGAAGATTCAGAACAAGACTTGGAATC
TAAGGATGAACTTTAAATGCAGGTTCCTGTAGCTTTTAAAGAGGAGAAGATAGCATCATC
ACGCGTTGTTATTTTCAATGGATGGGGCTAGATAAGTTTTTTAGTATTTTTGTACCATTT
TCCAAGACATAATATTTTCAGCAGAACTATAGTTTAGCAGGGAGAATGAACAAACAACTA
CAGTTCGCAATGTTAGATTCAACATTATCTGAAGGTTACTTAACACTTGTGCAGGTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4H389TF 477 0 0
G
CACCAAATCAAAGGCTAGAACAATAGACCTGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAA
GCTTCAGGGTGCCAGAAGAATTGTAACTGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGGAA
GTTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGATTTGGAACTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGC
TGCTACGGATAAGCCTAATCCTCCTCCATCAAGTGACATCTCTGAAGATTCAGAACAAGA
CTTGGAATCTAAGGATGAACTTTAAATGCAGGTTCCTGTAGCTTTTAAAGAGGAGAAGAT
AGCATCATCACGCGTTGTTATTTTCAATGGATGGGGCTAGATAAGGTTTCTAGTATTTTT
GTACCATTTTCCAAGACATAATATTTTCAGCAGAACTATAGTTTAGCAGGGAGAATGAAC
AAACAACTACAGTTCGCAATGTTAGATTCAACATTATCTGAAGGTTACTTAACACT

QA 2 477 2 477
DS 



AS 1 3

CO CL3879Contig1 1068 3 4 U
GATTACAAGCGTAACTGTAAGCTTCGGGCTGTATGTTGTGATCAGTTGTTCACTTGTAGG
TTTTGCCATGACAAAGTAAGCGACCACTCAATGGACAGAAAATTGGTGAAGGAAATGCTC
TGCATGCGGTGCCTCAAGGTGCAACCTGTTGGCCCCATTTGCACAACGCCTTCATGCGAT
GGATTCCCAATGGCAAAGCACTATTGCAGTATCTGCAAACTTTTCGATGATGAAAGGGCT
GTTTACCACTGTCCATTCTGCAACCTTTGCCGGGTCGGTGAGGGACTGGGAATAGATTAT
TTCCATTGCATGACATGTAACTGTTGCCTGGGGATGAAGTTAGTAAACCACAAGTGTCTC
GAGAAAAGTCTTGAGACAAATTGCCCCATTTGCTGCGAGTTTCTTTTCACATCAAGTGAA
ACAGTCAGAGCCTTACCCTGTGGTCACTACATGCACTCAGCTTGCTTCCAGGCTTACACT
TGCAGCCACTACACATGTCCAATCTGTGGGAAAACACTAGGAGATATGGGGGTTTATTTC
GGTATGCTTGATGCACTGTTAGCTGCAGAAGAACTTCCTGAAGAATACAAAGATCGCTGT
CAGGACATTTTATGTAATGACTGTCAACGCAAAGGAACGACACGGTTCCATTGGTTGTAC
CATAAATACGGTACCTGCGGTTCTTACAATATCCGTGTGATCAGGTCAGAAACAACCGCC
CCAGACTGCCCCACCTCATCCTGAAAACAATGTAAGAGGTTCTTCACTCGTTTCTTCTTC
TGTTGGCTTCACTCTCTGTTCCGCACAGCAATGTCTTTTCAAGAGCCTGTCGATATAATT
TTTATTTGTATAGTTTCTGAGATATTAAAAGATTTTGAAGAGTCTTATATTAGGTTACCA
CCATACATTGTGGCTTTTGGGCAAAGCCAAAACTCGTTTGTTTATGAAACATTCCCTCCT
TTTCTCCACATATCCGCTATTTGTTTTTCCTTTTCTTGCATAAGCTGAGACTTTCTTTGA
AGAGTGTAAATAGTTACAATTTTTAATGTAAGAAACTTTTTATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS71TF U 68
AF RR4AG06TF U 1
AF RR4AG06JQ C 395
BS 1 127 RR4AG06TF
BS 128 128 RR4GS71TF
BS 129 754 RR4AG06TF
BS 755 1068 RR4AG06JQ

RD RR4GS71TF 607 0 0
ATGACAAAGTAAGCGACCACTCAATGGACAGAAAATTGGTGAAGGAAATGCTCTGCATGC
GGTGCCTCAAGGTGCAACCTGTTGGCCCCATTTGCACAACGCCTTCATGCGATGGATTCC
CAATGGTAAAGCACTATTGCAGTATCTGCAAACTTTTCGATGATGAAAGGGCTGTTTACC
ACTGTCCATTCTGCAACCTTTGCCGGGTCGGTGAGGGACTGGGAATAGATTATTTCCATT
GCATGACATGTAACTGTTGCCTGGGGATGAAGTTAGTAAACCACAAGTGTCTCGAGAAAA
GTCTTGAGACAAATTGCCCCATTTGCTGCGAGTTTCTTTTCACATCAAGTGAAACAGTCA
GAGCCTTACCCTGTGGTCACTACATGCACTCAGCTTGCTTCCAGGCTTACACTTGCAGCC
ACTACACATGTCCAATCTGTGGGAAAACACTAGGAGATATGGGGGTTTATTTCGGTATGC
TTGATGCACTGTTAGCTGCAGAAGAACTTCC*GAAGAATACAAAGATCGCTGTCAG*ACA
TTTTATGTAATGACTGTCAACGCAAAG*AACGACACG*TTCCATTGGTTGTACCATAA
TGCGGTACC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4AG06TF 754 0 0
GATTACAAGCGTAACTGTAAGCTTCGGGCTGTATGTTGTGATCAGTTGTTCACTTGTAGG
TTTTGCCATGACAAAGTAAGCGACCACTCAATGGACAGAAAATTGGTGAAGGAAATGCTC
TGCATGCTGTGCCTCAAGGTGCAACCTGTTGGCCCCATTTGCACAACGCCTTCATGCGAT
GGATTCCCAATGGCAAAGCACTATTGCAGTATCTGCAAACTTTTCGATGATGAAAGGGCT
GTTTACCACTGTCCATTCTGCAACCTTTGCCGGGTCGGTGAGGGACTGGGAATAGATTAT
TTCCATTGCATGACATGTAACTGTTGCCTGGGGATGAAGTTAGTAAACCACAAGTGTCTC
GAGAAAAGTCTTGAGACAAATTGCCCCATTTGCTGCGAGTTTCTTTTCACATCAAGTGAA
ACAGTCAGAGCCTTACCCTGTGGTCACTACATGCACTCAGCTTGCTTCCAGGCTTACACT
TGCAGCCACTACACATGTCCAATCTGTGGGAAAACACTAGGAGATATGGGGGTTTATTTC
GGTATGCTTGATGCACTGTTAGCTGCAGAAGAACTTCCTGAAGAATACAAAGATCGCTGT
CAGGACATTTTATGTAATGACTGTCAACGCAAAGGAACGACACGGTTCCATTGGTTGTAC
CATAAATACGGTACCTGCGGTTCTTACAATATCCGTGTGATCAGGTCAGAAACAACCGCC
CCAGACTGCCCCACCTCATCCTGAAAACAATGTA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AG06JQ 674 0 0
GCGAGTTTCTTTTCACATCAAGTGAAACAGTCAGAGCCTTACCCTGTGGTCACTACATGC
ACTCAGCTTGCTTCCAGGCTTACACTTGCAGCCACTACACATGTCCAATCTGTGGGAAAA
CACTAGGAGATATGGGGGTTTATTTCGGTATGCTTGATGCACTGTTAGCTGCAGAAGAAC
TTCCTGAAGAATACAAAGATCGCTGTCAGGACATTTTATGTAATGACTGTCAACGCAAAG
GAACGACACGGTTCCATTGGTTGTACCATAAATACGGTACCTGCGGTTCTTACAATATCC
GTGTGATCAGGTCAGAAACAACCGCCCCAGACTGCCCCACCTCATCCTGAAAACAATGTA
AGAGGTTCTTCACTCGTTTCTTCTTCTGTTGGCTTCACTCTCTGTTCCGCACAGCAATGT
CTTTTCAAGAGCCTGTCGATATAATTTTTATTTGTATAGTTTCTGAGATATTAAAAGATT
TTGAAGAGTCTTATATTAGGTTACCACCATACATTGTGGCTTTTGGGCAAAGCCAAAACT
CGTTTGTTTATGAAACATTCCCTCCTTTTCTCCACATATCCGCTATTTGTTTTTCCTTTT
CTTGCATAAGCTGAGACTTTCTTTGAAGAGTGTAAATAGTTACAATTTTTAATGTAAGAA
ACTTTTTATTTCCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

CO CL3880Contig1 902 3 8 U
CAGTTGAGAAATGGTTTATGACAATGCAATCTTACAATATTATTGTTTGCACATGATCAC
AAAAAAAGAGAGGACATTAACCAATCCACAGTAACACAAAAGGCAAAAAAAAAAAAAGAG
AGAGAGAGACAAACAACATTAGAAACACAGCAACTTAACAAGGAGGAAACTCAAAACTTG
TAGACACAAGTTCCATCGTCACTTCTAGCTGTTGGATCAAAGTTTTCGGCTTGAGGATCA
GTACACCCTTCTGGAACAGGAACGTTCACTTGCTGTGCTGCTTTCCAATAGAAAGTTACG
CGGCCAATGGCGTCAGCGTTTGCGTCTCCCAACGCAGCCTCGTTAAGGTATTGGTCAGCA
AGTTGGACTCTCTTGACGTTCTCTTGCTCCATCACAAGCATGTTTCCATACTCCATAAGC
TTCTCAAGAGTCATCTTCGGTTGCTCGAACACCGGAGGAGCTTCCCTTGAGTTCACCAGC
CTCTTGCTTATCTTCTCCACTCCAAGTCCCTCAACGAACTTCCCATAGGAGCTTGGAAGA
CAGAGTCTACCATACCTTTGCCTCTGGTGATGTCTTGTTGATCATCAGACACGTCGTAGG
CAAGTCCCCTCCATCTGTCACCATCGGTCTGTTTGTCTTCTTTCACAGCAACCACTTTGA
ATGATCCGTTGCTCTTCTTGTTGTTGCTCTGTGTGAATCTCGATGCGGTTACAACTTTCT
TTCCCAAGAAGGTCGTAGCTGGGACTGAAGCAGCTCCTGCTCCTGACCCGTTCAAGCTCA
ACGGAGCTCTGTTGATGGCACCGATGGTGGAAACTGCGGTGGCCATTTCTCACGAGTGTG
CGTCACACAAGAAGCTGAGAGAGAGAGAGAGATTCTGATCGGAGAAGATGGATAGATGTT
CC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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10 10 

AF RR4G308JQ U 140
AF RR4BK77JQ U 1
AF RR4G308TF C 120
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TAGA
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TTCTCAAGAGTCATCTTCG
CT

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GCGTCACACAAGAAGCTGAGAGAGAGAGAGAGATTCTGATCGGAGAAGATGGATAGATGT
TCC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 3

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TATATGTCTTTTAGCTTTTGGATGATGA***ATCAATTCAGATCATTTTTATGAACTCAT
TTCGACTAATCAATATGGCCAATCAATTCAAGTATTTGAGGTTACTAG


BQ
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AF RR4AI34JQ C 1
AF RR4AI34TF U 1
AF RR4H887TF U 68
BS 1 648 RR4AI34TF

RD RR4AI34JQ 648 0 0
GGGCTTGCCCAGAAAGTCGCAGAGAGGAAGCTAAGCTATAGAAGAAGGTAAGAAGTGAGA
AAGGAAGGTAAGCAAAAAGAAAAAAAAATGGAGTCAGCGAAGAAGATAGCTCATGAGATC
GGTGGTGTGAAGAGAGACGCTCTCCGGTTTGGTCTAAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTC
GGATCTCACCCACTCGAATCCTCATACGAATCTGGAAAGAGATCGCATGAGGCGATGAAG
AGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGATATGGACACG
CAAATCCTCTCACGGTTTCAGAGACCTTCTGGACCAATTCCTTCGTCAATGCCCGGTTTA
GAAGTCTACACTGGAGCCATTGATAACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGATCCGCGT
GACTTTGAGACATTCAAGCCTGTAGACTTGCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGTATG
TCAAAGGGCCCTGTTGCCCCAAGTTTCATGTAGGGGATGGGGG*TTTTTATTGGATATGT
TATATGTCTTTTAGCTTTTGGATGATGA***ATCAATTCAGATCATTTTTATGAACTCAT
TTCGACTAATCAATATGGCCAATCAATTCAAGTATTTGAGGTTACTAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4AI34TF 648 0 0
GGGCTTGCCCAGAAAGTCGCAGAGAGGAAGCTAAGCTATAGAAGAAGGTAAGAAGTGAGA
AAGGAAGGTAAGCAAAAAGAAAAAAAAATGGAGTCAGCGAAGAAGATAGCTCATGAGATC
GGTGGTGTGAAGAGAGACGCTCTCCGGTTTGGTCTAAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTC
GGATCTCACCCACTCGAATCCTCATACGAATCTGGAAAGAGATCGCATGAGGCGATGAAG
AGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGATATGGACACG
CAAATCCTCTCACGGTTTCAGAGACCTTCTGGACCAATTCCTTCGTCAATGCCCGGTTTA
GAAGTCTACACTGGAGCCATTGATAACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGATCCGCGT
GACTCTGAGACATTCAAGCCTGTAGACTTGCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGTATG
TCAAAGGGCCCTGTTGCCCCAAGTTTCATGTAGGGGATGGGGG*TTTTTATTGGATATGT
TATATGTCTTTTAGCTTTTGGATGATGA***ATCAATTCAGATCATTTTTATGAACTCAT
TTCGACTAATCAATATGGCCAATCAATTCAAGTATTTGAGGTTACTAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4H887TF 540 0 0
GG
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AAGAGAGACGCTCTCCGGTTTGGTCTAAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCAC
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ATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTTCCACTGAAGATGGATATGGGCACGCAAATCCTC
TCACGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTAC
ACAGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGATCCGCGTGACTCTGAG
ACATTCAAGCCTGTAGACTTGCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGTATGTCAAAGGGC
CCTGTTGCCCCAAGTTTCATGTAGGGGATGGGGGGTTTTTATTCCAT**GTTATATGTCT
TTTAGCTTTTGGATGATGATGAATCAATTCAGATCATTTTTATGAACTCATTTCGACT

QA 3 540 3 540
DS 



AS 1 3

CO CL3882Contig1 341 3 3 U
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CATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCAATATCCTTGCCCTCCCTAATT
TTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATAATTTTAATAATACAACGGCTTTGTCAAATAAA
TGAATAAAACTTTTAATAAATTTGTGTTGGTGTTTTTAGCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ19TF U 1
AF RR4CJ19JQ C 1
AF RR4CM64TF U 30
BS 1 268 RR4CJ19TF
BS 269 314 RR4CM64TF
BS 315 341 RR4CJ19JQ

RD RR4CJ19TF 268 0 0
GAAAAACGCGTTTAAACTTTCGCTTATTGGTTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGG
AGAAATGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACCATGTTATTCAAAGAAAATGGGAACATGTGA
AACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCAAAAAGCATAAAAAAGATCTTTTTAGTGCATG
CATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCAATATCCTTGCCCTCCCTAATT
TTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATA

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR4CJ19JQ 341 0 0
GAAAAACGCGTTTAAACTTTCGCTTATTGGTTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGG
AGAAATGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACCATGTTATTCAAAGAAAATGGGAACATGTGA
AACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCAAAAAGCATAAAAAAGATCTTTTTAGTGCATG
CATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCAATATCCTTGCCCTCCCTAATT
TTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATAATTTTAATAATACAACGGCTTTGTCAAATAAA
TGAATAAAACTTTTAATAAATTTGTGTTGGTGTTTTTAGCG

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR4CM64TF 285 0 0
GTTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAATGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAAC
CATGTTATTCAAAGAAAATGGGAACATGTGAAACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCA
AAAAGCATAAAAAAGATCTTTTTAGTGCATGCATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATT
GCCGATGTCAATATCCTTGCCCTCCCTAATTTTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATAA
TTTTAATAATACAACGGCTTTGTCAAATAAATGAATAAAACTTTT

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 3

CO CL3883Contig1 739 3 7 U
GGAGAACACAAAAACTCTTGTTTGGTCTGCAATGGCGGAAGCTTCTAATCCCGACACCGG
CAT*GAGAACTCGACATTCAAGATCCGAAGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAAGGATA
CATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCGCCGGACCACTCACCGACGACGAATTCGATCG
GCGATTCGAGGAAATCAGCTCGTACGGAGACGACCACTTCATATGCGTGATCGAAGACGA
GTCTTCGGGGAAGATCGTCGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCTTAAGAAG
CTGCGGGAAAGTCGGACACGTAGAGGACGTGGTCGTGGATTCGGAGTTTCGCGGGAAGAA
TCTGGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTGACGGAACATAGCAGATCTATGGGTTGCTACAA
GGTGATGCTTGATTGTAGCGTGGAGAAGAAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCAA
TAGAGCCATTCAGATGACCAAGTACTTCGATTGAACACTCTCTCTCTCCGATCACTATCA
TCTTGTTTGATTACTTCGATTGAACACTCTCCTTCCTCTGCTTCATCTTCCTTTTCTCGT
CACCATCAGCCCTAGTTTTAAAACAGTCCCCTTTTCCACACTTTCCCAATTATGTAATGT
AATCTTATACGTATCATCTTCGTTTTCTTTCTTCACTTCTTGGCTCGTTGTAATTTCAAT
TCTTATCTAGTCCTCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG45TF U 27
AF RR4EG45JQ C 27
AF RR4A519TF U 1
BS 1 62 RR4A519TF
BS 63 64 RR4EG45TF
BS 65 297 RR4A519TF
BS 298 298 RR4EG45TF
BS 299 402 RR4A519TF
BS 403 403 RR4EG45TF
BS 404 739 RR4A519TF

RD RR4EG45TF 601 0 0
GG
GCAATGGCGGAAGCTTCTAATCCCGACACCGGCAT*GAGAACTCGACATTCAAGATCCGA
AGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAAGGATACATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTC
GCCGGACCACTCACCGACGACGAATTCGATCGGCGATTCGAGGAAATCAGCTCGTACGGA
GACGACCACTTCATATGCGTGATCGAAGACGAGTCTTCGGGGAAGATCGTCGCGACGGGG
AGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCTTAAGAAGCTGCGGGAAAGTCGGACACGTAGAGGAC
GTGGTCGTGGATTCGGAGTTTCGCGGGAAGAATCTGGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTG
ACGGAACATAGCAGATCTATGGGTTGCTACAAGGTGATGCTTGATTGTAGCGTGGAGAAG
AAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCAATAGAGCCATTCAGATGACCAAGTACTTC
GATTGAACACTCTCTCTCTCCGATCACTATCATCTTGTTTGATTACTTCGATTGAACACT
CTCCTTCCTCTGCTTCATCTTCCTTTTCTCGTCACCATCAGCCCTAGTTTTAAAACAGT

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR4EG45JQ 661 0 0
GG
GCAATGGCGGAAGCTTCTAATCCCGACACCGGCAT*GAGAACTCGACATTCAAGATCCGA
AGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAAGGATACATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTC
GCCGGACCACTCACCGACGACGAATTCGATCGGCGATTCGAGGAAATCAGCTCGTACGGA
GACGACCACTTCATATGCGTGATCGAAGACGAGTCTTCGGGGAAGATCGTCGCGACGGGG
AGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCTTAAGAAGCTGCGGGAAAGTCGGACACGTAGAGGAC
GTGGTCGTGGATTCGGAGTTTCGCGGGAAGAATCTGGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTG
ACGGAACATAGCAGATCTATGGGTTGCTACAAGGTGATGCTTGATTGTAGCGTGGAGAAG
AAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCAATAGAGCCATTCAGATGACCAAGTACTTC
GATTGAACACTCTCTCTCTCCGATCACTATCATCTTGTTTGATTACTTCGATTGAACACT
CTCCTTCCTCTGCTTCATCTTCCTTTTCTCGTCACCATCAGCCCTAGTTTTAAAACAGTC
CCCTTTTCCACACTTTCCCAATTATGTAATGTAATCTTATACGTATCATCTTCGTTT
CC

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR4A519TF 739 0 0
GGAGAACACAAAAACTCTTGTTTGGTCTGCAATGGCGGAAGCTTCTAATCCCGACACCGG
CAAAGAGAACTCGACATTCAAGATCCGAAGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAAGGATA
CATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCGCCGGACCACTCACCGACGACGAATTCGATCG
GCGATTCGAGGAAATCAGCTCGTACGGAGACGACCACTTCATATGCGTGATCGAAGACGA
GTCTTCGGGGAAGATCGTCGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCTTAAGGAG
CTGCGGGAAAGTCGGACACGTAGAGGACGTGGTCGTGGATTCGGAGTTTCGCGGGAAGAA
TCTGGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTGACGGAACATAGCAGGTCTATGGGTTGCTACAA
GGTGATGCTTGATTGTAGCGTGGAGAAGAAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCAA
TAGAGCCATTCAGATGACCAAGTACTTCGATTGAACACTCTCTCTCTCCGATCACTATCA
TCTTGTTTGATTACTTCGATTGAACACTCTCCTTCCTCTGCTTCATCTTCCTTTTCTCGT
CACCATCAGCCCTAGTTTTAAAACAGTCCCCTTTTCCACACTTTCCCAATTATGTAATGT
AATCTTATACGTATCATCTTCGTTTTCTTTCTTCACTTCTTGGCTCGTTGTAATTTCAAT
TCTTATCTAGTCCTCAACT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL3884Contig1 1197 3 10 U
GAGCAAAAGAATATTTGAATATCAGAATATATGAATATGGTTTTCATACATACCAAGTTG
GCTTTTTGCGTTACATTCCAATAAAAGATCAATTTGAGAATCAAATTTTTTCTTAACAGA
CGGTTAGAATCTCAGCTCCATCTTTGGTAATAAGAATGGTATGCTCGAATTGCGCAGAGA
GGCTAGCATCTTCTGTTACCACGGTCCAATTATCATCCCACATAACCGGTTTTCTGCTTC
CTATGGTAAGCATTAGTTCAATAGTGAAGGTTTGATTCAAGACCATACGTCCAGCTTCAT
TGTTCCGAAAGTGAAGAACAACAGGATCAGCATGGAAGACACGTCCAATACCGTGGCCTA
CAAATTCTCTAACCACTCCATACTTATGCTTATCTGCATGCTCATGAATGATTTTGCCAA
TTTTCTTGTACTCAACACCAGGACCACATATAGACATGGCTTTGTCAAGAGACTCTTTAG
TCACCTGAACAAGCTTTTTAGCTTTCTCGTCGACATCACCACAGAAGAAAGTAGCTGAGG
TATCACCGTGATAGCCGTTCAAATAAACAGTGACATCAATGTTGATTATATCTCCATCCT
CAAGCGGTCGTGAATCAGGGATGCCATGGCAAATGCACTCATTCACAGACGTGCAAACAC
TTTTAGGGAAACCTCCGTAGCCAAGAGGCGAAGGATAAGCTCCGTTCTCGATAATCATGT
TGTGAACCGCTTCATCAATCTCATCTGTGGTCACACCTGGCTTAACCAAAGTCCCAGCGT
ATTCACGAACTCTAGCAGCGAGCCTCCCAGAAGCTCACATCCTCTCTATACCTTCCCTGT
CGCGAATCTCGAGCCCACTTGAGATTCCGGGGACTTTAAAAGACTCAACGTAAGGAGGTT
TGGTTATGTGGGGAGGGACAGGGCGACGTGGAGACACGTTTCCTGGTTTCAGACGTTTTC
TCTTCCCGTCAACAACTTCATCTACGTTTCTTGTATTAAACAGAAGATTGGTTAATCCTG
AAAAGGTTCTTGATAATTGCATCGAAACATGCCTTCTTCCTGAATGGAAGCGGAAGAGAT
GGGGAAGAGGCTGCGTTGATCGAATAGAGTTGTTGTTTCCGAGGAAGGAAGAGATGATTC
TTGGTTGCAGAGATTTGGCGGTCGCCATTTTTGCGGCGAAGTTTTGGTTTTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ88JQ U 62
AF RR4BM70JQ U 1
AF RR4EJ88TF C 532
BS 1 254 RR4BM70JQ
BS 255 255 RR4EJ88JQ
BS 256 451 RR4BM70JQ
BS 452 452 RR4EJ88JQ
BS 453 454 RR4BM70JQ
BS 455 455 RR4EJ88JQ
BS 456 637 RR4BM70JQ
BS 638 638 RR4EJ88TF
BS 639 686 RR4BM70JQ
BS 687 1197 RR4EJ88TF

RD RR4EJ88JQ 559 0 0
T
TTTTTGCGTTACATTCCAATAAAGGATCAATTTGAGAATCAATTTTTTTCTTAACAGTCG
GTTAGAATCTCAGCTCCATCTTTGGTAATAAGAATGGTATGCTCGAATTGCGCAGAGAGG
CTAGCATCTTCTGTTACCACGGTCCAATTATCATCCCACATAACCGGTTTTCTGCTTCCT
ATGGTAAGCATTAGTTCAATAGTGAAGGTTTGATTCAAGACCATACGTCCAGCTTCATTG
TTCCGAAAGTGAAGAACAACAGGATCAGCATGGAAGACACGTCCAATACCGTGGCCTACA
AATTCTCTAACCACTCCATACTTATGCTTATCTGCATGCTCATGAATGATTTTGCCAATT
TTCTTGTACTCAACACCAGGACCACATATAGACATGGCTTTGTCAAGAGACTCTTTAGTC
ACCTGAACTAGCTTTTTAGCTTTCTCGTCGACATCACCACAGAAGAAAGTAGCTGAAGTA
TCACCGTGATAGCCGTTCAAATAAACAGTGACATCAATGTTGATTATATCTCCATCCTCA
AGCGGTCGTGAATCA
AGG

QA 2 556 2 556
DS 

RD RR4BM70JQ 686 0 0
GAGCAAAAGAATATTTGAATATCAGAATATATGAATATGGTTTTCATACATACCAAGTTG
GCTTTTTGCGTTACATTCCAATAAAAGATCAATTTGAGAATCAAATTTTTTCTTAACAGA
CGGTTAGAATCTCAGCTCCATCTTTGGTAATAAGAATGGTATGCTCGAATTGCGCAGAGA
GGCTAGCATCTTCTGTTACCACGGTCCAATTATCATCCCACATAACCGGTTTTCTGCTTC
CTATGGTAAGCATTGGTTCAATAGTGAAGGTTTGATTCAAGACCATACGTCCAGCTTCAT
TGTTCCGAAAGTGAAGAACAACAGGATCAGCATGGAAGACACGTCCAATACCGTGGCCTA
CAAATTCTCTAACCACTCCATACTTATGCTTATCTGCATGCTCATGAATGATTTTGCCAA
TTTTCTTGTACTCAACACCAGGACCACATATCGATATGGCTTTGTCAAGAGACTCTTTAG
TCACCTGAACAAGCTTTTTAGCTTTCTCGTCGACATCACCACAGAAGAAAGTAGCTGAGG
TATCACCGTGATAGCCGTTCAAATAAACAGTGACATCAATGTTGATTATATCTCCATCCT
CAAGCGGTCGTGAATCAGGGATGCCATGGCAAATGCATTCATTCACAGACGTGCAAACAC
TTTTAGGGAAACCTCCGTAGCCAAGA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4EJ88TF 666 0 0
TAGCTGAGGTATCACCGTGATAGCCGTTCAAATAAACAGTGACATCAATGTTGATTATAT
CTCCATCCTCAAGCGGTCGTGAATCAGGGATGCCATGGCAAATGCACTCATTCACAGACG
TGCAAACACTTTTAGGGAAACCTCCGTAGCCAAGAGGCGAAGGATAAGCTCCGTTCTCGA
TAATCATGTTGTGAACCGCTTCATCAATCTCATCTGTGGTCACACCTGGCTTAACCAAAG
TCCCAGCGTATTCACGAACTCTAGCAGCGAGCCTCCCAGAAGCTCACATCCTCTCTATAC
CTTCCCTGTCGCGAATCTCGAGCCCACTTGAGATTCCGGGGACTTTAAAAGACTCAACGT
AAGGAGGTTTGGTTATGTGGGGAGGGACAGGGCGACGTGGAGACACGTTTCCTGGTTTCA
GACGTTTTCTCTTCCCGTCAACAACTTCATCTACGTTTCTTGTATTAAACAGAAGATTGG
TTAATCCTGAAAAGGTTCTTGATAATTGCATCGAAACATGCCTTCTTCCTGAATGGAAGC
GGAAGAGATGGGGAAGAGGCTGCGTTGATCGAATAGAGTTGTTGTTTCCGAGGAAGGAAG
AGATGATTCTTGGTTGCAGAGATTTGGCGGTCGCCATTTTTGCGGCGAAGTTTTGGTTTT
TCCCCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 3

CO CL3885Contig1 745 3 3 U
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GCGAGTGTTAATATGAGGAATGTGTTCAACGGGGTGAGACCAGAGAATAGGCGTCATCCT
CCTCAGCAACCAACGGCTTTTAGTCAACGGTGGTCAACGTTTGGACGTCTTGTCCGTTCT
GCGGGCAGGTATGAGTATGGAAGGGAGCATATCAATAGAGAAGTTGCTTGCCACCAGTCT
TGCAAGAAACAGTTCATTGCTTTTGAAGTCGCTTTTGTACCACCGGCGAATGGATCGTAT
AATCATCAGACTACTTCTTCTTTCATGTTTCCAGGCCAAAGGGCTTCTTGTCCTGAGCCT
CACAAGCGTCCAGATGATACTGTTCCCTTTGGAAAAGCGACGGCTTCTTCTACTGCTGGA
AACAATAAGGGAAAGAGGAAGAGAAAGGATATGGATGAAGTTAGTGAAAGCTCTGACAGT
GAAAGTAGTAGCGAATCAGAAGATGATGATGATGATACTATGGCAGGAGGGGATATGGGG
TCCAGTAGAGGAGGGCAGGAGCGTCGGAGGTCAGTACGTAGCAAGCGTCAGTCTCTTACA
ATGAGAGTTTGAGCGATGACAATGATGTTGACTTACCCAACGACATTGTTGAAGGGTCTG
GGAAAATCTAGATACTGAAAAGAAGAGAGGATCATCATGACCAGTCTACTGAAACCTTAA
ACCCAAAGAGAGATACAGAGACAGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CK02TF U 1
AF RR4C094TF U 1
AF RR4C093TF U 1
BS 1 639 RR4C093TF
BS 640 640 RR4C094TF
BS 641 745 RR4C093TF

RD RR4CK02TF 588 0 0
GCACCAGCACCAGCACCATCGTATAGACCCCAACAGGTGCCTAGTTATCGTGCGCAGCAG
GCGAGTGTTAATATGAGGAATGTGTTCAACGGGGTGAGACCAGAGAATAGGCGTCATCCT
CCTCAGCAACCAACGGCTTTTAGTCAACGGTGGTCAACGTTTGGACGTCTTGTCCGTTCT
GCGGGCAGGTATGAGTATGGAAGGGAGCATATCAATAGAGAAGTTGCTTGCCACCAGTCT
TGCAAGAAACAGTTCATTGCTTTTGAAGTCGCTTTTGTACCACCGGCGAATGGATCGTAT
AATCATCAGACTACTTCTTCTTTCATGTTTCCAGGCCAAAGGGCTTCTTGTCCTGAGCCT
CACAAGCGTCCAGATGATACTGTTCCCTTTGGAAAAGCGACGGCTTCTTCTACTGCTGGA
AACAATAAGGGAAAGAGGAAGAGAAAGGATATGGATGAAGTTAGTGAAAGCTCTGACAGT
GAAAGTAGTAGCGAATCAGAAGATGATGATGATGATACTATGGCAGGAGGGGATATGGGG
TCCAGTAGAGGAGGGCAGGAGCGTCGGAGGTCAGTACGTAGCAAGCGT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4C094TF 650 0 0
GCACCAGCACCAGCACCATCGTATAGACCCCAACAGGTGCCTAGTTATCGTGCGCAGCAG
GCGAGTGTTAATATGAGGAATGTGTTCAACGGGGTGAGACCAGAGAATAGGCGTCATCCT
CCTCAGCAACCAACGGCTTTTAGTCAACGGTGGTCAACGTTTGGACGTCTTGTCCGTTCT
GCGGGCAGGTATGAGTATGGAAGGGAGCATATCAATAGAGAAGTTGCTTGCCACCAGTCT
TGCAAGAAACAGTTCATTGCTTTTGAAGTCGCTTTTGTACCACCGGCGAATGGATCGTAT
AATCATCAGACTACTTCTTCTTTCATGTTTCCAGGCCAAAGGGCTTCTTGTCCTGAGCCT
CACAAGCGTCCAGATGATACTGTTCCCTTTGGAAAAGCGACGGCTTCTTCTACTGCTGGA
AACAATAAGGGAAAGAGGAAGAGAAAGGATATGGATGAAGTTAGTGAAAGCTCTGACAGT
GAAAGTAGTAGCGAATCAGAAGATGATGATGATGATACTATGGCAGGAGGGGATATGGGG
TCCAGTAGAGGAGGGCAGGAGCGTCGGAGGTCAGTACGTAGCAAGCGTCAGTCTCTTACA
ATGAGAGTTTGAGCGATGACAATGATGTTGACTTAGCCAACGACATTGTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4C093TF 745 0 0
GCACCAGCACCAGCACCATCGTATAGACCCCAACAGGTGCCTAGTTATCGTGCGCAGCAG
GCGAGTGTTAATATGAGGAATGTGTTCAACGGGGTGAGACCAGAGAATAGGCGTCATCCT
CCTCAGCAACCAACGGCTTTTAGTCAACGGTGGTCAACGTTTGGACGTCTTGTCCGTTCT
GCGGGCAGGTATGAGTATGGAAGGGAGCATATCAATAGAGAAGTTGCTTGCCACCAGTCT
TGCAAGAAACAGTTCATTGCTTTTGAAGTCGCTTTTGTACCACCGGCGAATGGATCGTAT
AATCATCAGACTACTTCTTCTTTCATGTTTCCAGGCCAAAGGGCTTCTTGTCCTGAGCCT
CACAAGCGTCCAGATGATACTGTTCCCTTTGGAAAAGCGACGGCTTCTTCTACTGCTGGA
AACAATAAGGGAAAGAGGAAGAGAAAGGATATGGATGAAGTTAGTGAAAGCTCTGACAGT
GAAAGTAGTAGCGAATCAGAAGATGATGATGATGATACTATGGCAGGAGGGGATATGGGG
TCCAGTAGAGGAGGGCAGGAGCGTCGGAGGTCAGTACGTAGCAAGCGTCAGTCTCTTACA
ATGAGAGTTTGAGCGATGACAATGATGTTGACTTACCCA*CGACATTGTTGAAGGGTCTG
GGAAAATCTAGATACTGAAAAGAAGAGAGGATCATCATGACCAGTCTACTGAAACCTTAA
ACCCAAAGAGAGATACAGAGACAGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

CO CL3886Contig1 591 3 8 U
GGGGACGCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAG
AAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACC
GTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGAAGGAAGTTCAAA
GGTGTGACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTC
CCCAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACCCATGATG
CACAACAGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCAACAAAGAAGAGGGAAGCC
ATTGTGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGT
AGCCAGGAAGATGAGTGATGAACGAAAGCCCTATGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCA
CATTTCTCATTTGATCATAACTTAATTTTTGCGGATTAAAGAGTTAAAGGCTGAATGTTT
TTATGGGTTTCTGTTTTCAATATATGACCACCAATTCACAATCGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG37TF U 1
AF RR4F925JQ C 5
AF RR4F925TF U 5
BS 1 292 RR4BG37TF
BS 293 293 RR4F925TF
BS 294 354 RR4BG37TF
BS 355 355 RR4F925TF
BS 356 528 RR4BG37TF
BS 529 530 RR4F925TF
BS 531 543 RR4BG37TF
BS 544 591 RR4F925TF

RD RR4BG37TF 543 0 0
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AAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACC
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GGTGTGACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTC
CCCAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATG
CACAACAGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCAACAAAGAAGAGGAAAGCC
ATTGTGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGT
AGCCAGGAAGATGAGTGATGAACGAAAGCCCTATGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCA
CATTTCTCATTTGATCATAACTTAATTTTTGCGGATTAAAGAGTTAAATACTGAATGTTT
TTA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4F925JQ 580 0 0
GG
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GTGAAGAAGAGGTCTGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCAAG
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ACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATTTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCAAC
GGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTTTGCTGATCTTGAGTTACCCATGATGCACAAC
AGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCAACAAAGAAGAGGGAAGCCATTGTG
GAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGCCAG
GAAGATGAGTGATGAACGAAAGCCCTATGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCACATTTC
TCATTTGATCATAACTTAATTTTTGCGGATTAAAGAGTTAAAGGCTGAATGTTTTTATGG
GTTTCTGTTTTCAATATATGACCACCAATTCACAATCG

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR4F925TF 587 0 0
GG
GCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGGTG
GTGAAGAAGAGGTCTGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCAAG
GAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGAAGGAAGTTCAAAGGTGTG
ACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCAAC
GGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACCCATGATGCACAAC
AGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCAACAAAGAAGAGGGAAGCCATTGTG
GAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGCCAG
GAAGATGAGTGATGAACGAAAGCCCTATGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCACATTTC
TCATTTGATCATAACTTAATTTTTGCGGATTAAAGAGTTAAAGGCTGAATGTTTTTATGG
GTTTCTGTTTTCAATATATGACCACCAATTCACAATCGAAAAAAA

QA 3 587 3 587
DS 



AS 1 3

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CGCAGCTCTCTTCTCTCCTCGGCTTCAATTCCATTCATCCATCCGTTGTGCTCTTCCAAC
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TCACCGGCGTTTGAGAGCCAAATCCACAAACTTTTCTTTTTCTTCTTTGCCACGGAGAGG
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AGACTCTGTTGATGAGATTGTGGGAGTTTGCACTGAGATCTTCGAGACGTTCTTGCGCAG
CGAGTATGGAGGACCTGGAACACTTTTGGTCATACCCTTCATCGACATGGCTGATACACT
CAATGAAAGGGAACTGCCTGGAGGTCCACAAGCCGCACGTGCAGCTATCAAATGGGCTCA
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CCTCAAATCATCAAAATATAATTCAGTACTCATGTATCAGAGGATAGATTGTCTTTGTAA
AACTCTGAATTTTGCAGATTTCGGTATTCTGTTAGCTCTGTTGTTATACAATCGCATGGT
CTCATCAGCTTTTTTCCTAGTTGATTCATGTATGGTTCAGTAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EG79TF U 1
AF RR4CK12TF U 43
AF RR4EG79JQ C 395
BS 1 631 RR4EG79TF
BS 632 675 RR4CK12TF
BS 676 676 RR4EG79JQ
BS 677 766 RR4CK12TF

RD RR4EG79TF 631 0 0
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CGCAGCTCTCTTCTCTCCTCGGCTTCAATTCCATTCATCCATCCGTTGTGCTCTTCCAAC
AATCTTCAATCTCTCTTCACAAGCCGGGAGTTCGTGCGCAATCAAACCGACCCAGTTTCT
TCACCGGCGTTTGAGAGCCAAATCCACAAACTTTTCTTTTTCTTCTTTGCCACGGAGAGG
GTTCGTATGCAGAGCTGCGGAGTACAAGTTCCCGGATCCAATTCCCGAATTCGCCGAAGC
TGAGACTAAGAAATTCAAGGACCATATGACAAAGAAACTATCAAAGAGGGATCTTTTTGA
AGACTCTGTTGATGAGATTGTGGGAGTTTGCACTGAGATCTTCGAGACGTTCTTGCGCAG
CGAGTATGGAGGACCTGGAACACTTTTGGTCATACCCTTCATCGACATGGCTGATACACT
CAATGAAAGGGAACTGCCTGGAGGTCCACAAGCCGCACGTGCAGCTATCAAATGGGCTCA
GGATCATATAGACAAGGATTGGAAAGAATGGACTGGCACTGATTAGTAACACCACCAGAA
CCTCAAATCATCAAAATATAATTCAGTACTC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4CK12TF 724 0 0
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CCGTTGTGCTCTTCCAACAATCTTCAATCTCTCTTCACAAGCCGGGAGTTCGTGCGCAAT
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TTCTTTGCCACGGAGAGGGTTCGTATGCAGAGCTGCGGAGTACAAGTTCCCGGATCCAAT
TCCCGAATTCGCCGAAGCTGAGACTAAGAAATTCAAGGACCATATGACAAAGAAACTATC
AAAGAGGGATCTTTTTGAAGACTCTGTTGATGAGATTGTGGGAGTTTGCACTGAGATCTT
CGAGACGTTCTTGCGCAGCGAGTATGGAGGACCTGGAACACTCTTGGTCATACCTTTCAT
CGACATGGCTGATAC*CTCAATGAAAGGGAACTGCCTGGAGGTCCACAAGCCGCGCGTGC
AGCTATCAAATGGGCTCAGGATCATGTAGACAAGGATTGGAAAGAATGGACTGGCACTGA
TTAGTAACACCACCAGAACCACGAATCATCAAAATATAGTTCAGTACTCATGTATCAGAG
GATAGATTGTCTTTGTAAAACTCTGAATTTTGCGGATTTCGGTATTCTGTTAGCTCTGTT
GTTATACAATCGCATGGTCTCATCAGCTTTTTTCCTAGTTGATTCATGTATGGTTCAGTA
GATT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4EG79JQ 345 0 0
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CCCTTCATCGACATGGCTGATACACTCAATGAAAGGGAACTGCCTGGAGGTCCACAAGCC
GCACGTGCAGCTATCAAATGGGCTCAGGATCATATAGACAAGGATTGGAAAGAATGGACT
GGCACTGATTAGTAACACCACCAGAACCTCAAATCATCAAAATATAATTCAGTACTCATG
TATCAGAGGATAGATTGTCTTTGTAAAACTCTGAATTTTGCAGATTTCGGTATTCTGTTA
GCTCTGTTGTTATACAATCGCATGGTCTCATCAGCTTTTTTCC
GC

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 3

CO CL3888Contig1 867 3 8 U
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CTCCCTTGTGCTCCTTAACCCTGTGTGTGGCCCCTGTGTTTTGCTCCCCTGTGTTTTGCT
TTAACAGCTTACACAATTACTGTCTTACAATATACGAATGACAACACAGCAGTAATCTGC
AACATTATTTAATGCAACTCTGAATAAAAGGAAACCCATTGTAGTGTCTGTGCTCGAGTT
CTCAAGGAGTTAAAAGGGGAAAGATAATTGTTTGTTCCTCATATATACTGGAACCAAAAC
AAAAGCAATTCCGTGGCGATGGTCAAACTACATATGGGGCTCTATCTTGAACAGCAGCAT
CCTGAATTCGACTTAGCAGATTCTCCACAGATTGTCGAATCGAAGTACTGGCTTCTGTGT
CATGCTGGATTTTTTTTAAAAAATATGACAAGTCTTCCCCATCTGCAAGATCAGGAGCAG
TAAGAAGATACTCAAACACCATAGGCAGTTCTTCCTTGAATACTACAGAGGCTCCTTCAT
TGAAATAATTCTCAATAGCTTGAAGAAGGAAACACTGGGACGCCGGTTCCATGACAGCAA
TTAAGTAGATTTTCTTCTCCTCAAGAACTTTGGCAAAGCCTTTCTCCACCCCACTAAAAA
TAGCCTCCAACAAAGCTTTATATTTATCTCCCACAAACACAAAATACGAATCAAGTAGAT
CCTTCATTGCGCTCACAGAAATCCCAGCCTTCATTTTCTCCTTTATGACCTCGTTGCTAT
TATTATCATTGCCTGCACGAATCCACAGCTGGACTTGATCTTGAATATCCCGCTCTACCT
CTGTTCTGGCCATCTCCTGGATGCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CF85JQ U 1
AF RR4CF85TF C 223
AF RR4F886JQ U 179
BS 1 369 RR4CF85JQ
BS 370 370 RR4F886JQ
BS 371 374 RR4CF85JQ
BS 375 384 RR4F886JQ
BS 385 385 RR4CF85TF
BS 386 521 RR4F886JQ
BS 522 522 RR4CF85TF
BS 523 867 RR4F886JQ

RD RR4CF85JQ 374 0 0
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CTCCCTTGTGCTCCTTAACCCTGTGTGTGGCCCCTGTGTTTTGCTCCCCTGTGTTTTGCT
TTAACAGCTTACACAATTACTGTCTTACAATATACGAATGACAACACAGCAGTAATCTGC
AACATTATTTAATGCAACTCTGAATAAAAGGAAACCCATTGTAGTGTCTGTGCTCGAGTT
CTCAAGGAGTTAAAAGGGGAAAGATAATTGTTTGTTCCTCATATATACTGGAACCAAAAC
AAAAGCAATTCCGTGGCGATGGTCAAACTACATATGGGGCTCTATCTTGAACAGCAGCAT
CCTGAATTCCACTT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4CF85TF 532 0 0
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ATATACTGGAACCAAAACAAAAGCAATTCCGTGGCGATGGTCAAACTACATATGGGGCTC
TATCTTGAACAGCAGCATCCTGAATTCGACTTAGCAGATTCTCCACAGATTGTCGAATCG
AAGTACTGGCTTCTGTGTCATGCTGGATTTTTTTTAAAAAATATGACAAGTCTTCCCCAT
CTGCAAGATCAGGAGCAGTAAGAAGATACTCAAACACCATAGGCAGTTCTTCCTTGAATA
CTACAGAGGCTCCTTCATTGAAATAATTCTCAATAGCTTGAAGAAGGAAACACTGGGACG
CCGGTTCCATGACAGCAATTAAGTAGATTTTCTTCTCCTCAAGAACTTTGGCAAAGCCTT
TCTCCACCCCACTAAAAATAGCCTCCAACAAAGCTTTATATTTATCTCCCACAAACACAA
AATACGAATCAAGTAGATCCTTCATTGCGCTCACAGAAATCCCAGCCTTC
CC

QA 1 530 1 530
DS 

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GCAACATTATTTAATGCAACTCTGAATAAGAGGAAACCCATTGTAGTGTCTGTGCTCGAG
TTCTCAAGGAGTTAAAAGGGGAAAGATAATTGTTTGTTCCTCATATATACTGGAACCAAA
ACAAAAACAATTCCGTGGCGATGGTCAAACTACATATGGGGCTCTATCTTGAACAGCAGC
ATCCTGAATTCGACTTAGCAGATTCTTCACAGATTGTCGAATCGAAGTACTGGCTTCTGT
GTCATGCTGGATTTTTTTTAAAAAATATGACAAGTCTTCCCCATCTGCAAGATCAGGAGC
AGTAAGAAGATACTCAAACACCATAGGCAGTTCTTCCTTGAATGCTACAGAGGCTCCTTC
ATTGAAATAATTCTCAATAGCTTGAAGAAGGAAACACTGGGACGCCGGTTCCATGACAGC
AATTAAGTAGATTTTCTTCTCCTCAAGAACTTTGGCAAAGCCTTTCTCCACCCCACTAAA
AATAGCCTCCAACAAAGCTTTATATTTATCTCCCACAAACACAAAATACGAATCAAGTAG
ATCCTTCATTGCGCTCACAGAAATCCCAGCCTTCATTTTCTCCTTTATGACCTCGTTGCT
ATTATTATCATTGCCTGCACGAATCCACAGCTGGACTTGATCTTGAATATCCCGCTCTAC
CTCTGTTCTGGCCATCTCCTGGATGCCCA

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL3889Contig1 1194 3 6 U
GGATTTCATATTTGGGGGAAAACACAACGGGCTGGTTCGTCGTGGTTCGCCCTGAATCCA
ATTTGGGTGTATGGGTAGTGCAAGTGCTAGTCTCCTCCAACCAATGGATACAGATTCTGC
AATTCCTAGAGATAGAGACTTTGGCATCTCCCAATTCGGGTGTGAACACTACAAGAGAAG
GTGCAAAATAAGAGCGCCTTGCTGCAATCTCATCTTCCCATGCCGCCACTGCCACAACGA
CGCCGCGAACTCTTTACCTGATCCTAAAGAACGACATGATTTGGTCCGACAAAACGTCAA
ACAGGTTATCTGTTCAGTATGTGAAACAGAACAAGAGGTAGCTCAAGTCTGTTCGAATTG
TGGTGTATGTATGGGCGAATACTTTTGCAACATATGCAATTTCTTTGACGACGAGACCTC
AAAAGAACAATTTCATTGTGACGACTGTGGAATTTGTAGAGTTGGTGGGCGTGACAATTT
CTATCACTGCCAAAGCTGTGGAGCTTGCTATTCAATGGGACTGCGCGATAATCACGCATG
CATTGAGAACGCCACTAAGAATTCTTGTCCTGTCTGTTATGAGTTTTTATTTGACTCCGT
AAAAGCTGCACATGTCATGAGATGTGGCCATACTATGCATATGGCTTGCTTCAAACAAAT
GATCAATGAACAACAGTACCGATGCCCAATTTGCTACAAGTCAATGATGGATATGTCTTC
CTCGTGGCAATTATTAGATGCCGATATAAGGGCAGCAGAGATGCCTACTGAATATAACTA
TGAGGTTGAAATTCTTTGCAATGACTGCAATAAGAGCAGCAAAGCTATGTTCCACATTTT
CGGACACAAGTGCGCGCATTGTGGCTCTTACAACACTCGCAGGATTTCAGCTCCACAAGA
CACCCCCGCTAGGTGAAACAGAGTGACAAGTTTTTGAACCTTAGAGAATAGCAAACTCTT
CAATATTGGTTCAACCATAAGAGAAATACTGCTCTATGTTTTGCTTGTTTACATAAAGTG
ATCCGGCAAGCGCCATTGGGTTTGCAATGCAGGGTTTAGTCGCCTTGTAATTGGTATCCC
AGTTGCTTTCACCAACTACGGTTTTCTTATAAATTGTGAAACAGGAGGGACTATTTTATT
TTAAAGTAATTGAACATGGCATTTTGCACCAAAATGTCTGAACTATTTTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C673TF U 22
AF RR4AD18TF U 1
AF RR4AD18JQ C 311
BS 1 235 RR4AD18TF
BS 236 236 RR4C673TF
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RD RR4C673TF 630 0 0
CACTC
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CTAGTCTCCTCCAACCAATGGATACAGATTCTGCAATTCCTAGAGATAGAGACTTTGGCA
TCTCCCAATTCGGGTGTGAACACTACAAGAGAAGGTGCAAAATAAGAGCGCCTTGCTGCA
ATCTCATCTTCCCATGCCGTCACTGCCACAACGACGCCGCGAACTCTTTACCTGATCCTA
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CAGAACAAGAGGTAGCTCAAGTCTGTTCGAATTGTGGTGTATGTATGGGCGAATACTTTT
GCAACATATGCAATTTCTTTGACGACGAGACCTCAAAAGAACAATTTCATTGTGACGACT
GTGGAATTTGTAGAGTTGGTGGGCGTGACAATTTCTATCACTGCCAAAGCTGTGGAGCTT
GCTATTCAATGGGACTGCGCGATAATCACGCATGCATTGAGAACGCCACTAAGAATTCTT
GTCCTGTCTGTTATGAGTTTTTATTTGACTCCGTAAAAGCTGTACATTTCATGAGATGCG
GCCATACTATGCATATGGCTTGCTT

QA 6 630 6 630
DS 

RD RR4AD18TF 787 0 0
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ATTTGGGTGTATGGGTAGTGCAAGTGCTAGTCTCCTCCAACCAATGGATACAGATTCTGC
AATTCCTAGAGATAGAGACTTTGGCATCTCCCAATTCGGGTGTGAACACTACAAGAGAAG
GTGCAAAATAAGAGCGCCTTGCTGCAATCTCATCTTCCCATGCCGCCACTGCCACGACGA
CGCTGCGAACTCTTTACCTGATCCTAAAGAACGACATGATTTGGTCCGACAAAACGTCAA
ACAGGTTATCTGTTCAGTATGTGAAACAGAACAAGAGGTAGCTCAAGTCTGTTCGAATTG
TGGTGTATGTATGGGCGAATACTTTTGCAACATATGCAATTTCTTTGACGACGAGACCTC
AAAAGAACAATTTCATTGTGACGACTGTGGAATTTGTAGAGTTGGTGGGCGTGACAATTT
CTATCACTGCCAAAGCTGTGGAGCTTGCTATTCAATGGGACTGCGCGATAATCACGCATG
CATTGAGAACGCCACTAAGAATTCTTGTCCTGTCTGTTATGAGTTTTTATTTGACTCCGT
AAAAGCTGCACATGTCATGAGATGTGGCCATACTATGCATATGGCTTGCTTCAAACAAAT
GATCAATGAACAACAGTACCGATGCCCAATTTGCTACAAGTCAATGATGGATATGTCTTC
CTCGTGGCAATTATTAGATGCCGATATAAGGGCAGCAGAGATGCCTACTGAATATAACTA
TGAG
TTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AD18JQ 884 0 0
TGTTCAGTATGTGAAACAGAACAAGAGGTAGCTCAAGTCTGTTCGAATTGTGGTGTATGT
ATGGGCGAATACTTTTGCAACATATGCAATTTCTTTGACGACGAGACCTCAAAAGAACAA
TTTCATTGTGACGACTGTGGAATTTGTAGAGTTGGTGGGCGTGACAATTTCTATCACTGC
CAAAGCTGTGGAGCTTGCTATTCAATGGGACTGCGCGATAATCACGCATGCATTGAGAAC
GCCACTAAGAATTCTTGTCCTGTCTGTTATGAGTTTTTATTTGACTCCGTAAAAGCTGCA
CATGTCATGAGATGTGGCCATACTATGCATATGGCTTGCTTCAAACAAATGATCAATGAA
CAACAGTACCGATGCCCAATTTGCTACAAGTCAATGATGGATATGTCTTCCTCGTGGCAA
TTATTAGATGCCGATATAAGGGCAGCAGAGATGCCTACTGAATATAACTATGAGGTTGAA
ATTCTTTGCAATGACTGCAATAAGAGCAGCAAAGCTATGTTCCACATTTTCGGACACAAG
TGCGCGCATTGTGGCTCTTACAACACTCGCAGGATTTCAGCTCCACAAGACACCCCCGCT
AGGTGAAACAGAGTGACAAGTTTTTGAACCTTAGAGAATAGCAAACTCTTCAATATTGGT
TCAACCATAAGAGAAATACTGCTCTATGTTTTGCTTGTTTACATAAAGTGATCCGGCAAG
CGCCATTGGGTTTGCAATGCAGGGTTTAGTCGCCTTGTAATTGGTATCCCAGTTGCTTTC
ACCAACTACGGTTTTCTTATAAATTGTGAAACAGGAGGGACTATTTTATTTTAAAGTAAT
TGAACATGGCATTTTGCACCAAAATGTCTGAACTATTTTGTTAT

QA 1 884 1 884
DS 



AS 1 3

CO CL3890Contig1 545 3 3 U
GGGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGA
TCGGAGTTTTTTTTATAAACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAA
TAATTAACAATAATATGGGGATGTCTAAAACTATTAAAGTTGTTTTCTCTCTGGCTCTTG
TGGTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCC
TTCATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACATCCTCAATTCTGCAAGAAGC
AAGAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGA
AAAAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCATTTTTTGATTTATTTTTAAAATGGCATCCCC
ATATTAATATCAAAGGATTAATTTCATTCTTTTTTT*ATTTTAAACTCTGTTATTGGTTA
TATAATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTT
CTTCT


BQ
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25 25 25 10 

AF RR4EU10TF U 1
AF RR4DT72JQ C 263
AF RR4DT72TF U 263
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BS 457 457 RR4DT72TF
BS 458 545 RR4EU10TF

RD RR4EU10TF 545 0 0
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TCGGAGTTTTTTTTATAAACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAA
TAATTAACAATAATATGGGGATGTCTAAAACTATTAAAGTTGTTTTCTCTCTGGCTCTTG
TGGTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCC
TTCATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACATCCTCAATTCTGCAAGAAGC
AAGAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGA
AAAAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCATTTTTTGATTTATTTTTAAAATGGCATCCCC
ATATTAATATCAAAGGATTAATTTCATTCTTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTA
TATAATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTT
CTTCT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4DT72JQ 282 0 0
G
GGTTGTAGTAAACTACATCCTCAATTCTGCAAGAAGCAAGAAGCCAATCCATATGCGAGA
GGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAAAAGTGAATCAACCAAGTTAGA
GCACCATTTTTTGATTTATTTTTAAAATGGCATCCCCATATTAATATCAAAGGATTAATT
TCATTCTTTTTTT*ATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATATAATTGATTGTTACCATATTA
GTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTC

QA 2 282 2 282
DS 

RD RR4DT72TF 282 0 0
G
GGTTGTAGTAAACTACATCCTCAATTCTGCAAGAAGCAAGAAGCCAATCCATATGCGAGA
GGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAAAAGTGAATCAACCAAGTTAGA
GCACCATTTTTTGATTTATTTTTAAAATGGCATCCCCATATTAATATCAAAGGATTAATT
TCATTCTTTTTTT*ATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATATAATTGATTGTTACCATATTA
GTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTC

QA 2 282 2 282
DS 



AS 1 3

CO CL3891Contig1 494 3 2 U
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TTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGATGC
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ACAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACTCAAACGCCGTCTTTA
ATTTTCCAGAAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGAACTTCTATTATT
CTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCTTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTCTGCTAAA
AAACTTATATATTTCTTCGAATTGTTCAATTTTTTTTCTTTGGTTTATGTCTTACTTTCT
GCAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGTTTCAAAAGAATAAAATCATAATTAA
GTGTTTATTAAATG


BQ
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AF RR4H569JQB C 1
AF RR4H569TF U 1
AF RR4FF55TF U 10
BS 1 389 RR4H569TF
BS 390 494 RR4FF55TF

RD RR4H569JQB 391 0 0
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TTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGATGC
GCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTGATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCAAA
ACAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACTCAAACGCCGTCTTTA
ATTTTCCAGAAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGAACTTCTATTATT
CTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCTTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTCTGCTAAA
AAACTTATATATTTCTTCGAATTGTTCAA
GT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4H569TF 391 0 0
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TTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGATGC
GCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTGATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCAAA
ACAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACTCAAACGCCGTCTTTA
ATTTTCCAGAAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGAACTTCTATTATT
CTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCTTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTCTGCTAAA
AAACTTATATATTTCTTCGAATTGTTCAA
GT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4FF55TF 485 0 0
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CCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGATGCGCGGGGACC
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AAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACTCAAACGCCGTCTTTAATTTTCCAG
AAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGAACTTCTATTATTCTAATTAAG
TAATAAATAGCAAATCTTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTCTGCTAAAAAACTTATA
TATTTCTTCGAATTGTTCAATTTTTTTTCTTTGGTTTATGTCTTACTTTCTGCAAGTGTA
TTTAATAAATCTATATATGTTTTAGTTTCAAAAGAATAAAATCATAATTAAGTGTTTATT
AAATG

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL3892Contig1 1174 2 2 U
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TGGCTGAGAACAAACTAGTAGGGATTCTCACTTCGAAGGACATCTTAATACGGGTGATAG
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CTGCAACAGTTGATATGGCAATTGTTGACGCCTTGCATATCATGCATAATGGAAGATTTC
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TAACTCATGCTGCTGTTACCACGGCTGGAAGTACGGCTGGAATAAATAATGAGACAGCAA
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ATGAAACAACGAGGAGTGAAGACGAATCATCAATTAAACTACCTTCGGAGATTGAAGGAA
CAAAATCATTCTCATATCCCAACACATTTGCTTTCAAACTACAGGATAAAAAGGGAAGAA
TGCATAGATTTATGTGTGAGACACATAGTTTGGCAACTCTGATAACTGCAATACTACAAC
GGATGGGGGATGACATTGATCCTGACAACTTGCCTCAGATAATGGTTTGTATTTATTTGA
AAGCTTTTGAATTAAGAAGAGGAAAACTATGATTTTCTTGAAATGTTTTTTGTGCTATGT
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CGTGGGCAGTCGCTTACAAGACAGTTGCGGCCGGGGCTGCTCTTGCCGCTGGACTTGGGG
TTTTGGTATACCTTAAGCGCCATTCAAATTAACTGATTCATTTTTGGCAAGGTGCAAAGG
TACTGAACGTTTTTGTCATGCTTACGCATATTATTGGTGAAAGTATTATCTCTTCTCATT
TATTCGTGCTTTTTTTTAAACCTTGTTACTCAATTCTTTTGTTTTTTTAACCTTACTCAT
TTTTTGTACATAAATAAGTAAAACATTTATCTAT


BQ
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BS 747 1174 RR4FN72JQ

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TGGCTGAGAACAAACTAGTAGGGATTCTCACTTCGAAGGACATCTTAATACGGGTGATAG
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CTGCAACAGTTGATATGGCAATTGTTGACGCCTTGCATATCATGCATAATGGAAGATTTC
TTCATCTTCCTGTATTAGATAAAGATGGAGATGTTGTCGCTGTGATTGATGTAATCCACA
TAACTCATGCTGCTGTTACCACGGCTGGAAGTACGGCTGGAATAAATAATGAGACAGCAA
ACTCAATGATGCAAAACTTTTGGGATGCCGCTATGGCCTTGAGTCCTAATGAAGATGGAG
ATGAAACAACGAGGAGTGAAGACGAATCATCAATTAAACTACCTTCGGAGATTGAAGGAA
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TGCATAGATTTATGTGTGAGACACATAGTTTGGCAACTCTGATAACTGCAATACTACAAC
GGATGGGGGATGACATTGATCCTGACAACTTGCCTCAGATAATGGTTTGTATTTATTTGA
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AGTATGAAGATGAAGACAATGACAAA

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DS 

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AGATTGAAGGAACAAAATCATTCTCATATCCCAACACATTTGCTTTCAAACTACAGGATA
AAAAGGGAAGAATGCATAGATTTATGTGTGAGACACATAGTTTGGCAACTCTGATAACTG
CAATACTACAACGGATGGGGGATGACATTGATCCTGACAACTTGCCTCAGATAATGGTTT
GTATTTATTTGAAAGCTTTTGAATTAAGAAGAGGAAAACTATGATTTTCTTGAAATGTTT
TTTGTGCTATGTAGTATGAAGATGAAGACAATGACAAAGTCATTTTGGCATCCGATGGTG
ATCTTGTAGCTGCCGTAGAGCATGCAAAATCAATAGATTGGAAGGGTTTGAAATTGCACT
TGGACTACGTGGAAGCGAGAGGGCGTAGGAGAGGTTTAAGCACAGAGGATATGGAGTACG
ATAAATCAAAGTCGTGGGCAGTCGCTTACAAGACAGTTGCGGCCGGGGCTGCTCTTGCCG
CTGGACTTGGGGTTTTGGTATACCTTAAGCGCCATTCAAATTAACTGATTCATTTTTGGC
AAGGTGCAAAGGTACTGAACGTTTTTGTCATGCTTACGCATATTATTGGTGAAAGTATTA
TCTCTTCTCATTTATTCGTGCTTTTTTTTAAACCTTGTTACTCAATTCTTTTGTTTTTTT
AACCTTACTCATTTTTTGTACATAAATAAGTAAAACATTTATCTAT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 3

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GGAGAAGGGGTGATGATTCCTCTACCCTGAGTTGTTTCTCTTCGGGAGAAAACGCGGTGG
ATGGAGGAGAAGTGCGACGAACGGTGACTAGTGGGCTCACAGGAGTTTGTCTCTCGGTAA
GCCCTTTGAAATCCCGGATGGAGTTTTTCTATTACCACAAACCGCTTTCACTTCGGATTA
GTATCCGGTTCGACCACAACGGGAGGCAAAGAATGACGGAGGCTGAACCACACCGATGTT
GCGCCACCTTGGTGAGGATTGATGGACAAGAATCCGACTCATATTATTTGGTTCCATCAG
ATGGAACTGGTCAAAAGAAAAGGATGTGCCTTTAGCTTGCTGGATTTTTCTCATTCGGAC
GGGTGGTCCACTAGCGGCTTAAGCTTGTGGCAAGAAACAACAATAACCCTATGATTCTTC
TGGTCAAGCGTCTTAGTGTGTTGTTGCTGTTGGGACAGGGAAATCTTGCATTGATGGGAA
AGCTGTAACTAACAAGGCTAGAGCAAATGAAAGAAATAGGCGCAAGGACCGTCCACCACC
ACCGAACTATGGAGGAGCAGCACCACCGCAGAACAACATGGGAGGAGGTCCACCAAATGC
AAGATGGTCAGGTAACAACAACAACTACCAGCAGCAGAGTGGTGGAATGCAGCAGCCACA
GTACCAGAACAACTATCCACCTAACCGGGATGGCAGCGGGAACCCGTACCAGGAAACTTC
GGGACATGATCAAGAGCAAGAGAATTCGTTAGCGAGATATTTGTTGGGAGATGAGGAGCT
AGCAGCATTTAAGCAGTTTCAAAACTCGCACGAGGAACCACCACCACCAAACATGGGAGG
ACAAAGGCTTCAGCCAAACTATGGAGAAGCACCAGGAGCGCCAGCGAAAAACAACAGGGG
AGAAGGTCCACCAAATGCAGGATGTTCAGGAAACAACAACAACGACCAGGAGCAGGGTGG
TGGAACGCAGCAGCCACAGCAGCAGAACAACTATCCACCTAAACGTGATGGCAGCGGGAA
CCCATTCCAAGGTTAATCATGCATTCTGGACATGTATATAGATAATCTGATGAAGTGATT
GAGAGTACAGTAGCAAGACTTAAACGCCTTTTTGTTTTCAGTGTTTTGTCTGGTTTTGGG
TGTAGAGCAGGAATGTAGCATTTCC


BQ
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AF RR4AK32TF U 1
AF RR4AF17TF U 1
AF RR4AF17JQ C 545
BS 1 789 RR4AF17TF
BS 790 1225 RR4AF17JQ

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AGCTGTAACTAACAAGGCTAGAGCAAATGAAA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4AF17TF 789 0 0
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GGAGAAGGGGTGATGATTCCTCTACCCTGAGTTGTTTCTCTTCGGGAGAAAACGCGGTGG
ATGGAGGAGAAGTGCGACGAACGGTGACTAGTGGGCTCACAGGAGTTTGTCTCTCGGTAA
GCCCTTTGAAATCCCGGATGGAGTTTTTCTATTACCACAAACCGCTTTCACTTCGGATTA
GTATCCGGTTCGACCACAACGGGAGGCAAAGAATGACGGAGGCTGAACCACACCGATGTT
GCGCCACCTTGGTGAGGATTGATGGACAAGAATCCGACTCATATTATTTGGTTCCATCAG
ATGGAACTGGTCAAAAGAAAAGGATGTGCCTTTAGCTTGCTGGATTTTTCTCATTCGGAC
GGGTGGTCCACTAGCGGCTTAAGCTTGTGGCAAGAAACAACAATAACCCTATGATTCTTC
TGGTCAAGCGTCTTAGTGTGTTGTTGCTGTTGGGACAGGGAAATCTTGCATTGATGGGAA
AGCTGTAACTAACAAGGCTAGAGCAAATGAAAGAAATAGGCGCAAGGACCGTCCACCACC
ACCGAACTATGGAGGAGCAGCACCACCGCAGAACAACATGGGAGGAGGTCCACCAAATGC
AAGATGGTCAGGTAACAACAACAACTACCAGCAGCAGAGTGGTGGAATGCAGCAGCCACA
GTACCAGAACAACTATCCACCTAACCGGGATGGCAGCGGGAACCCGTACCAGGAAACTTC
GGGACATGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4AF17JQ 681 0 0
GTAACTAACAAGGCTAGAGCAAATGAAAGAAATAGGCGCAAGGACCGTCCACCACCACCG
AACTATGGAGGAGCAGCACCACCGCAGAACAACATGGGAGGAGGTCCACCAAATGCAAGA
TGGTCAGGTAACAACAACAACTACCAGCAGCAGAGTGGTGGAATGCAGCAGCCACAGTAC
CAGAACAACTATCCACCTAACCGGGATGGCAGCGGGAACCCGTACCAGGAAACTTCGGGA
CATGATCAAGAGCAAGAGAATTCGTTAGCGAGATATTTGTTGGGAGATGAGGAGCTAGCA
GCATTTAAGCAGTTTCAAAACTCGCACGAGGAACCACCACCACCAAACATGGGAGGACAA
AGGCTTCAGCCAAACTATGGAGAAGCACCAGGAGCGCCAGCGAAAAACAACAGGGGAGAA
GGTCCACCAAATGCAGGATGTTCAGGAAACAACAACAACGACCAGGAGCAGGGTGGTGGA
ACGCAGCAGCCACAGCAGCAGAACAACTATCCACCTAAACGTGATGGCAGCGGGAACCCA
TTCCAAGGTTAATCATGCATTCTGGACATGTATATAGATAATCTGATGAAGTGATTGAGA
GTACAGTAGCAAGACTTAAACGCCTTTTTGTTTTCAGTGTTTTGTCTGGTTTTGGGTGTA
GAGCAGGAATGTAGCATTTCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL3894Contig1 1035 3 14 U
GCTTCATTTCCAAGCTCGAGAATATGCCTCCGAAAGCGAAAGCAAAAGATGCAGGTCCCG
TGGAGAGGCCTATTCTCGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCAAGATCGGAATCGTTGGGCTGC
CAAACGTGGGAAAATCTACACTTTTCAACACACTCACGAAGCTTTCGATTCCAGCTGAGA
ACTTCCCTTTCTGTACCATCGAGCCTAACGAGGCGCGCGTGAATATCCCCGACGAGAGGT
TCGATTGGCTTTGCCAATTATACAAGCCTAAGAGTGAGATTCCAGCTTTCTTGGAAATAC
ATGACATTGCTGGGCTTGTTAGAGGCGCTCATGAAGGCCAGGGTCTTGGGAACAACTTCT
TGTCCCATATCCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTTTGCGTGCGTTTGAAGATCCTG
ATATCATTCATGTCGATGATATCGTTGATCCTGTTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAG
AATTGCGGCTTAAGGATATTGAGTTCATTAAAAAGAAGGTTGAAGATGTGGAGAAGAGCA
TGAAGAGGAGCAATGACAAGGCCCTCAAAGTTGAACTTGACCTCTTGCTTAAGGTTAAAG
CTTGGCTGGAAGAAGGAAAAGATGTCCGTTTTGGGGACTGGAAAGCAGCTGATATCGAGA
TTTTGAACACTTTCCAATTGCTTTCCGCTAAGCCTGTTGTTTACTTGATTAACATGAATG
AGAGAGACTACCAGAGGAAGAAAAACAAGTTCTTGCCTAAGATTCATGCTTGGGTTCAGG
AACATGGTGCTGATATTATGATTCCTTTCAGTGGTGTTTTTGAAAGGAGTCTCGCTGATA
TGCTCCCAGACGAAGCAGCTAAGTATTGTGAGGAGAACAAACTGCAAAGTGCCCTTCCGA
GGATCATCAAAACTGGATTTTCAGCCATTAACCTCATATATTTCTTTACAGCAGGCCTGA
TGAGGTAAAGTGCTGGCAAATAAGACGTCAGTCGAAGCTCCTCAAGCTGCTGGCGCTATT
CATACTGATTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EY52TF U 1
AF RR4EY52JQ C 285
AF RR4D146TF U 302
BS 1 738 RR4EY52TF
BS 739 741 RR4D146TF
BS 742 763 RR4EY52TF
BS 764 764 RR4D146TF
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BS 777 779 RR4EY52TF
BS 780 780 RR4D146TF
BS 781 796 RR4EY52TF
BS 797 797 RR4D146TF
BS 798 802 RR4EY52TF
BS 803 803 RR4D146TF
BS 804 819 RR4EY52TF
BS 820 1035 RR4D146TF

RD RR4EY52TF 819 0 0
GCTTCATTTCCAAGCTCGAGAATATGCCTCCGAAAGCGAAAGCAAAAGATGCAGGTCCCG
TGGAGAGGCCTATTCTCGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCAAGATCGGAATCGTTGGGCTGC
CAAACGTGGGAAAATCTACACTTTTCAACACACTCACGAAGCTTTCGATTCCAGCTGAGA
ACTTCCCTTTCTGTACCATCGAGCCTAACGAGGCGCGCGTGAATATCCCCGACGAGAGGT
TCGATTGGCTTTGCCAATTATACAAGCCTAAGAGTGAGATTCCAGCTTTCTTGGAAATAC
ATGACATTGCTGGGCTTGTTAGAGGCGCTCATGAAGGCCAGGGTCTTGGGAACAACTTCT
TGTCCCATATCCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTTTGCGTGCGTTTGAAGATCCTG
ATATCATTCATGTCGATGATATCGTTGATCCTGTTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAG
AATTGCGGCTTAAGGATATTGAGTTCATTAAAAAGAAGGTTGAAGATGTGGAGAAGAGCA
TGAAGAGGAGCAATGACAAGGCCCTCAAAGTTGAACTTGACCTCTTGCTTAAGGTTAAAG
CTTGGCTGGAAGAAGGAAAAGATGTCCGTTTTGGGGACTGGAAAGCAGCTGATATCGAGA
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AGAGAGACTACCAGAGGAG**AAAACAAGTTCTTGCCTAAGAT*CATGCTTGGGT*CAG*
AACATGGTGCTGATAT*ATGAT*CCTTTCAGTGGTGTTT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4EY52JQ 563 0 0
GCTTTCTTGGAAATACATGACATTGCTGGGCTTGTTAGAGGCGCTCATGAAGGCCAGGGT
CTTGGGAACAACTTCTTGTCCCATATCCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTTTGCGT
GCGTTTGAAGATCCTGATATCATTCATGTCGATGATATCGTTGATCCTGTTAGAGATTTG
GAGACCATTACTGAAGAATTGCGGCTTAAGGATATTGAGTTCATTAAAAAGAAGGTTGAA
GATGTGGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGACAAGGCCCTCAAAGTTGAACTTGACCTC
TTGCTTAAGGTTAAAGCTTGGCTGGAAGAAGGAAAAGATGTCCGTTTTGGGGACTGGAAA
GCAGCTGATATCGAGATTTTGAACACTTTCCAATTGCTTTCCGCTAAGCCTGTTGTTTAC
TTGATTAACATGAATGAGAGAGACTACCAGAGGAAGAAAAACAAGTTCTTGCCTAAGATT
CATGCTTGGGTTCAGGAACATGGTGCTGATATTATGATTCCTTTCAGTGGTGTTTTTGAA
AGGAGTCTCGCTGATATGCTCCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4D146TF 734 0 0
G
GACATTGCTGGGCTTGTTAGAGGCGCTCATGAAGGCCAGGGTCTTGGGAACAACTTCTTG
TCCCATATCCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTTTGCGTGCATTTGAAGATCCTGAT
ATCATTCATGTCGATGATATCGTTGATCCCGTTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAGAA
TTGCGACTTAAGGATATTGAGTTCATTAAAAAGAAGGTTGAGGATGTGGAGAAGAGCATG
AAGAGGAGCAATGACAAGGCCCTCAAAGTTGAACTTTACCTCTTGCTTAAGGTTAAAGCT
TGGCTGGAAGAAGGAAAAGATGTCCGTTTTGGGGACTGGAAAGCAGCTGATATCGAGATT
TTGAACACTTTCCAATTGCTTTCCGCTAAGCCAGTTGTTTACTTGATTAACATGAATGAG
AGAGACTACCAGAGGAAGAAAAACAAGTTCTTGCCCAAGATTCATGCTTGGGTTCAGGAA
CATGGTGCTGATATTATGATTCCTTTCAGTGGTGTTTTTGAAAGGAGTCTCGCTGATATG
CTCCCAGACGAAGCAGCTAAGTATTGTGAGGAGAACAAACTGCAAAGTGCCCTTCCGAGG
ATCATCAAAACTGGATTTTCAGCCATTAACCTCATATATTTCTTTACAGCAGGCCTGATG
AGGTAAAGTGCTGGCAAATAAGACGTCAGTCGAAGCTCCTCAAGCTGCTGGCGCTATTCA
TACTGATTTTGAG

QA 2 734 2 734
DS 



AS 1 3

CO CL3895Contig1 576 3 11 U
GATCCAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCT
TCTTCAAAAATAAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGC
ATTGAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTT
TCCCAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGG
TGACTTGGAAGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAA
GGATTACATGGCATGTTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCT
GTCAATAAAATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGG
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TGATATGAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCA
ATCCATGGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATT


BQ
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AF RR4B974JQ C 5
AF RR4B974TF U 5
AF RR4DE74TF U 1
BS 1 14 RR4DE74TF
BS 15 15 RR4B974TF
BS 16 20 RR4DE74TF
BS 21 21 RR4B974TF
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BS 25 25 RR4B974TF
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BS 77 77 RR4B974TF
BS 78 425 RR4DE74TF
BS 426 426 RR4B974TF
BS 427 576 RR4DE74TF

RD RR4B974JQ 517 0 0
GGATC
CAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCTTCAAAA
ATAAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATTGAGCAC
TGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCCCAAAGT
AGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGGTGACTTGGA
AGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAAGGATTACAT
GGCATGTTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTCAATAAA
ATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAACATCAGA
GGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGTTGATATGAA
GAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAAC

QA 6 517 6 517
DS 

RD RR4B974TF 517 0 0
GGATC
CAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCTTCAAAA
ATAAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATTGAGCAC
TGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCCCAAAGT
AGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGGTGACTTGGA
AGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAAGGATTACAT
GGCATGTTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTCAATAAA
ATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAACATCAGA
GGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGTTGATATGAA
GAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAAC

QA 6 517 6 517
DS 

RD RR4DE74TF 576 0 0
GATCCAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCT
TCTTCAAAAATAAAAA*TGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGC
ATTGAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTT
TCCCAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGG
TGACTTGGAAGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAA
GGATTACATGGCATGTTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCT
GTCAATAAAATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGG
AACATTAGAGGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGT
TGATATGAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCA
ATCCATGGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 3

CO CL3896Contig1 713 3 2 U
AAAAGATAAATAGTTTATTTTTAATTACCGCATTTTACATTTTTTTTATATCAAATTACA
CTTTTTGTATATATAAGAAAATAAACAACAGAGATGGTCATGACAGTTAA*TAACTATCT
CTGAGATAAGTTATCATCATATTTAGAATATGACGTCAGGGACGATCCCGAGCTCCTTGA
AAGCGGCGGGGCATTCAGCTGACGGTGTAGGAACCATGAAACCGAGAGGGTTAACGATAC
GTGTCTCGTGAGAGACGATACCGTCATTGGCCGTCAGGCTAACCTTAGCGGCGTTACGTA
GGTAAGCATCTTGGCTGACGTCGCTGCAACCACTGTCTGGTGACTGGAGGAGAACAAGCT
CACAGACTTCCTCCTCGTGGTCACCGGTCACTTCCATTTTGTAGCTGCCTGATTTGTCAG
TCACGGCTTCTTTTGTCAACGTCACGGTTCCGTTGGTTCTGCTCCTGCACTCTAGCTTCA
CTTTGGCTCCTTCAAGGAATTTGCTGAGACGGGTAACGAATTGGACACGGCAAGTGTCGC
AGTAAACGGATCCCTGAATTTGGAAACTGTCCAAGTCATCGGCGTCAGCGACGGCCTTGC
CGGTGAGAGAGGATAGGCACACGGCGGAGACAAAGAAGAAGAAGAATATGGCTTTGGACG
CCATTTTATCTGAAAATGTTAAAAGATTCTCGTCTTATTTTTTTACACTTCCC


BQ
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DS 

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DS 

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CACAGACTTCCTCCTCGTGGTCACCGGTCACTTCCATTTTGTAGCTGCCTGATTTGTCAG
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DS 



AS 1 3

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TGTGTAACACG


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AF RR4FD09TF U 1
AF RR4H343TF U 454
AF RR4H343JQ C 591
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BS 467 467 RR4H343TF
BS 468 643 RR4FD09TF
BS 644 1121 RR4H343TF
BS 1122 1122 RR4H343JQ
BS 1123 1167 RR4H343TF
BS 1168 1391 RR4H343JQ

RD RR4FD09TF 643 0 0
GCTACTCTTAAAAGCTCTTCTGTTCTTTGATTCTTCTCTCTCTCCCTCGTCTTTTGTGAT
CGTTTTGGTTTCTTTTTCTTTCCCCTTTTTGCTGTCACCGTCGTTCTCGTTTCAGCTTTT
CCGATCTCCGATCGAACGTTGAGTCTAACCGACGGTTTACAGCCACTTGGGTTACGACCT
CTTCCCCGGTGAAAAGCTCTGTTCCACAGAGAAATTTGAAAATCTTTAGAATTTGTTAAG
GTGATTTTTTTTTTTATTTTTTTGATGATGGTGATGACACAAAGTATTGAGGTGTGAAGA
GTAGTATGGAAGTGAAAGAACATCAATAATAAAAGAATGACTTTTTACATTCGCCGCGAA
GCTTCTAAGCTATGGAAGAGAGCTTGTTCGGAAATAACGACAGAGATTGGTCTCCTCGCC
GACAACTGGAAATACCTTCTCGCTGGTCTTCTCTGCCAGTACATTCGTGGCTTAGCTGCT
AGGGGAGTTCATTATATTCATAGGCCGGGACCGACACTTCAAGATCTTGGATACACTGTT
CTTCCGGAGCTTGGTCAAGATAAAAGCTATATAAGTGAAACTGTCTTCACTTGTGTTTTT
CTTTCCTTTGTCCTGTGGACTTTCCATCCTTTCATCATAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4H343TF 714 0 0
GGGCAA
TACATTCATGGCTTAGCTGCTAGGGGAGTTCATTATATTCATAGGCCGGGACCGACACTT
CAAGATCTTGGATACACTGTTCTTCCGGAGCTTGGTCAAGATAAAAGCTATATAAGTGAA
ACTGTCTTCACTTGTGTTTTTCTTTCCTTTGTCCTGTGGACTTTCCATCCTTTCATCATA
AAAAGCAAGAAGATATACACTGTGTTGATATGGTGCAGGGTTCTCGCCTTCTTAGTTGCT
TGTCAGTTTCTCCGAGTCATAACTTTCTATTCCACTCAGCTTCCTGGTCCTAACTATCAC
TGTCGAGAGGTTGCCACGGCCACATAGCGTTCTTGAGGTTCTCTTGCTCAACTTTCCTCG
TGGGGTGATATACGGATGTGGAGATTTGATTTTCTCGTCTCATATGATATTCACACTAGT
CTTTGTCCTCACTTACCAGAAGTACGGTTCTAAAAGGTTCATAAAGCTGTTAGGTTGGGT
CATAGCTATATTGCAAAGCCTCTTGATTATCGCGTCACGCAAACATTACACAGTCGATGT
TGTGGTTGCTTGGTATACAGTTAACTTGGTTGTGTTCTTCCTCGACAAGAAACTACCAGA
GCTGCCTGATCGGACAACGGTGTTGCTTCCGGTGAGCTCAAAAGACAGAACCAAAGAAGA
GA*TCACAAACTCTTGAACGGGAACGGTGTTGATCCTGCAGATAGGAG

QA 7 714 7 714
DS 

RD RR4H343JQ 801 0 0
ACTTGTGTTTTCTTT
CTTTGTCCTGTGGACTTTCCATCCTTTCATCATAAAAAGCAAGAAGATATACACTGTGTT
GATATGGTGCAGGGTTCTCGCCTTCTTAGTTGCTTGTCAGTTTCTCCGAGTCATAACTTT
CTATTCCACTCAGCTTCCTGGTCCTAACTATCACTGTCGAGAGGTTGCCACGGCCACATA
GCGTTCTTGAGGTTCTCTTGCTCAACTTTCCTCGTGGGGTGATATACGGATGTGGAGATT
TGATTTTCTCGTCTCATATGATATTCACACTAGTCTTTGTCCTCACTTACCAGAAGTACG
GTTCTAAAAGGTTCATAAAGCTGTTAGGTTGGGTCATAGCTATATTGCAAAGCCTCTTGA
TTATCGCGTCACGCAAACATTACACAGTCGATGTTGTGGTTGCTTGGTATACAGTTAACT
TGGTTGTGTTCTTCCTCGACAAGAAACTACCAGAGCTGCCTGATCGGACAACGGTGTTGC
TTCCGGTGAGCTCAAAAGACAGAACCAAAGAAGAGAATCACAAACTCTTGAACGGGAACG
GTGTTGATCCTGCAGATAGGAGACCTAGGGCTCAAGTTAATGGTAAAGACAGCAATGGAG
GTCACAGTGATAACGCTAACAATAGCGCATGAGAACGCAAGTTTAGTTTTCAGATCGTTA
TGTTTTTGATCAATTTGAATATATAGGATTATAAATCCAGAAAGGATCACGAACAAAAAA
GACAGAGTCAGCTTGTACATTTCACAGTTTCTTGCTTCTCAAGTATGTCGATGTTTGTGT
AACACG

QA 16 801 16 801
DS 



AS 1 2

CO CL3898Contig1 811 2 4 U
TTTTTACTTGAAAGGAAAGCTCTTTGAAACGCCGCTCCGTCGTCTTCGTTGTTCTGTGCT
TCCCATCTCTTCTTCTCTCTTTACCCTCTAACCATTTAATCGAGATATGGGTCTAACGGA
AGAAGAAATCAAAAGACTTTACAGGATCCAGAAGACGTTGATGCAGATGCTCAAGGACCG
TGGTTACTTCATCGCCGACTCTGAGATCACCATGAGCTTATCGCAGTTCGTTAGAAAGTA
TGGAGACAACATGAAAAGAGAGGATCTTGTTACTCTCAAAGCTAAGCGAAACGACAGCAG
TGACCAGCTCTATATCTTCTTCCCTGATGAGGCCAAAGTTGGGGTTAAGACGATGAAGGT
GTACACAAACAGGATGAAGTCAGAGAATGTTTACAGAGCAATCTTGGTGGTGCAACAGAA
CTTGACTCCTTTTGCTCGAACTTGCATTAGTGAGATCTCTTCTAAGTTTCATTTGGAAGT
CTTCCAGGAGGCGGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTTCTTGTTCCGGAGCACCA
AGTTCTCACCACTGAGGAGAAGAAAACTCTTCTGGAGAGATACACTGTCAAGGAGACACA
GCTTCCAAGGATCCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGGCTAAAACGTGGACA
AGTCGTGAAGATCATACGTCCGAGTGAAACTGCTGGTCGTTATGTTACCTACCGCTATGT
TGTATAAGCAAAAAGCTTTTGTTATGCGAGTGGAAACGCCTAGAGTTGTTGTGTGCCAGA
TTGTTGACAATGTTTGTTAAATGTACCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK71TF U 1
AF RR4GK71JQ C 315
BS 1 733 RR4GK71TF
BS 734 734 RR4GK71JQ
BS 735 749 RR4GK71TF
BS 750 811 RR4GK71JQ

RD RR4GK71TF 752 0 0
TTTTTACTTGAAAGGAAAGCTCTTTGAAACGCCGCTCCGTCGTCTTCGTTGTTCTGTGCT
TCCCATCTCTTCTTCTCTCTTTACCCTCTAACCATTTAATCGAGATATGGGTCTAACGGA
AGAAGAAATCAAAAGACTTTACAGGATCCAGAAGACGTTGATGCAGATGCTCAAGGACCG
TGGTTACTTCATCGCCGACTCTGAGATCACCATGAGCTTATCGCAGTTCGTTAGAAAGTA
TGGAGACAACATGAAAAGAGAGGATCTTGTTACTCTCAAAGCTAAGCGAAACGACAGCAG
TGACCAGCTCTATATCTTCTTCCCTGATGAGGCCAAAGTTGGGGTTAAGACGATGAAGGT
GTACACAAACAGGATGAAGTCAGAGAATGTTTACAGAGCAATCTTGGTGGTGCAACAGAA
CTTGACTCCTTTTGCTCGAACTTGCATTAGTGAGATCTCTTCTAAGTTTCATTTGGAAGT
CTTCCAGGAGGCGGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTTCTTGTTCCGGAGCACCA
AGTTCTCACCACTGAGGAGAAGAAAACTCTTCTGGAGAGATACACTGTCAAGGAGACACA
GCTTCCAAGGATCCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGGCTAAAACGTGGACA
AGTCGTGAAGATCATACGTCCGAGTGAAACTGCTGGTCGTTATGTTACCTACCGCTATGT
TGTATAAGCAAAA*GCTTTTGTTATGCGA
GTG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GK71JQ 497 0 0
TTTTT
TTCCCTGATGAGGCCAAAGTTGGGGTTAAGACGATGAAGGTGTACACAAACAGGATGAAG
TCAGAGAATGTTTACAGAGCAATCTTGGTGGTGCAACAGAACTTGACTCCTTTTGCTCGA
ACTTGCATTAGTGAGATCTCTTTTAAGTTTCATTTGGAAGTCTTCCAGGAGGCGGAAATG
CTAGTGAACATTAAAGAACATGTTCTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTCACCACTGAGGAG
AAGAAAACTCTTCTGGAGAGATACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATCCAAGTG
ACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGGCTAAAACGTGGACAAGTCGTGAAGATCATACGT
CCGAGTGAAACTGCTGGTCGTTATGTTACCTACCGCTATGTTGTATAAGCAAAAAGCTTT
TGTTATGCGAGTGGAAACGCCTAGAGTTGTTGTGTGCCAGATTGTTGACAATGTTTGTTA
AATGTACCAATT

QA 6 497 6 497
DS 



AS 1 3

CO CL3899Contig1 1017 3 2 U
GGAAATTTATTTCTCTTATTACGATCGTTTGTGGTACTAACTTTTTTTATAGAGAAATGG
GTAGATTTCCTGGATTTGGTGTTTGGATGAATCAGAACACTCAACAGCCTCTTAAGACCG
GGTCCGAGAGATCTGAGGATGATAACTCTAAGTCCGTGTCACCGAAAGAGAATAATAATT
GGGAACTATATCACGATTCAGAGGAGGAAGATAAGCAAATAAAACTATGGAACGTTGCAG
AGAGGAAGCATCCATGGTATGATCCTCCTCCTAGGGTGAAGGTGACAACGAAAAATGGAA
TTTGTCATATGAATATAGAATTCACATCGGGAGTGACCCCTTTAGCAGCCTTCGAACATT
TGAGTAAACCAATTTCCTTGTCAATAGACATGTCCGCCCGCCAACTTCTGAAAAATCAAT
CAAGAAAGGTTTTGAAGAAGGATGGTCCAAGAGAGATTTTAGAGACAGAGAACACTGTGG
CCTTCGACTTCCTGCGGTGGTCTGGAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCGATGAAAACA
TTAAAGATCTTACGGCAAAATATAAAAAGGAGAAAATGATGTTCATGAAAGTGTTTGAGG
GTAGCTACAAAGTAGAACCAATATTCGTAGATTCAGAACGATTGTGCAAGCATAGGTTGC
CGAAAACCAGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAACTTGCATCGAGAG
TGATAATGGACCAATACTTTCAACCCTCTCCTCCGTTTAATCTGCCACCGTTTTCTTGGT
ATATTCATGGGATCACCATCAGGACCACAAAAATTCTGCTCCAGATGATTCAACTTTCGA
CTGCGACCTTACGAGAGTTGTCTTGAGTTCTCAAGATAATGACGTGGTAAAGACATCAAG
CGACAAACATATATACTAAGCCTAAATGACCATTCAGAAATATGTGTTGTAAGTTGTATG
TAAGACAACCTATATATTTATAACTCATAGAGATAATTATATCTTTTAGAAGGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS19TF U 518
AF RR4AO02TF U 1
AF RR4AO02JQ C 488
BS 1 787 RR4AO02TF
BS 788 1017 RR4AO02JQ

RD RR4GS19TF 137 0 0
AAAGCTTATTGTCGATGAAAACATTAAAGATCTTACGGCAAAATATAAAAAAGAGAAAAT
GATGTTCATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTACAAAGTAGAACCAATATTCGTAGATTCAGA
GCGCTTGTGCAAGCATA

QA 1 137 1 137
DS 

RD RR4AO02TF 787 0 0
GGAAATTTATTTCTCTTATTACGATCGTTTGTGGTACTAACTTTTTTTATAGAGAAATGG
GTAGATTTCCTGGATTTGGTGTTTGGATGAATCAGAACACTCAACAGCCTCTTAAGACCG
GGTCCGAGAGATCTGAGGATGATAACTCTAAGTCCGTGTCACCGAAAGAGAATAATAATT
GGGAACTATATCACGATTCAGAGGAGGAAGATAAGCAAATAAAACTATGGAACGTTGCAG
AGAGGAAGCATCCATGGTATGATCCTCCTCCTAGGGTGAAGGTGACAACGAAAAATGGAA
TTTGTCATATGAATATAGAATTCACATCGGGAGTGACCCCTTTAGCAGCCTTCGAACATT
TGAGTAAACCAATTTCCTTGTCAATAGACATGTCCGCCCGCCAACTTCTGAAAAATCAAT
CAAGAAAGGTTTTGAAGAAGGATGGTCCAAGAGAGATTTTAGAGACAGAGAACACTGTGG
CCTTCGACTTCCTGCGGTGGTCTGGAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCGATGAAAACA
TTAAAGATCTTACGGCAAAATATAAAAAGGAGAAAATGATGTTCATGAAAGTGTTTGAGG
GTAGCTACAAAGTAGAACCAATATTCGTAGATTCAGAACGATTGTGCAAGCATAGGTTGC
CGAAAACCAGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAACTTGCATCGAGAG
TGATAATGGACCAATACTTTCAACCCTCTCCTCCGTTTAATCTGCCACCGTTTTCTTGGT
ATATTCA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4AO02JQ 530 0 0
CTTCCTGCGGTGGTCTGGAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCGATGAAAACATTAAAGA
TCTTACGGCAAAATATAAAAAGGAGAAAATGATGTTCATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTA
CAAAGTAGAACCAATATTCGTAGATTCAGAACGATTGTGCAAGCATAGGTTGCCGAAAAC
CAGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAACTTGCATCGAGAGTGATAAT
GGACCAATACTTTCAACCCTTTCCTCCGTTTAATCTGCCACCGTTTTCTTGGTATATTCA
TGGGATCACCATCAGGACCACAAAAATTCTGCTCCAGATGATTCAACTTTCGACTGCGAC
CTTACGAGAGTTGTCTTGAGTTCTCAAGATAATGACGTGGTAAAGACATCAAGCGACAAA
CATATATACTAAGCCTAAATGACCATTCAGAAATATGTGTTGTAAGTTGTATGTAAGACA
ACCTATATATTTATAACTCATAGAGATAATTATATCTTTTAGAAGGAACC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 3

CO CL3900Contig1 689 3 5 U
GCAGGGTTCACGATTGCCGGCGAGCCGGATTACTTGGCGGTCAAGGAAACTAGCAAAGCC
TATTTAGGAAGGCCTTGGAAAGAGTATTCAAGAACTATTATTATGAACAGTTTTATTCCT
GATTTTATTCAGCCGCAAGGATGGCAACCGTGGCTTGGAAACTTCGGTCTCGACACATTG
TTCTACTCTGAGGTTCAGAACACAGGACCCGGAGCAGCTCTTGCAGGCAGGGTTACTTGG
CCTGGAATCAAGATACTGAGCGACGAAGAGATTCTCAGTTTCACACCAGGTATGTACATC
CAAGGTGATGTTTGGATTCCAGGGAAAGGTGTACCGTACACTCCTGGTCTCTTGGCTGCT
GACCCGAATGCTGCAACCACCACCACCCCTAGCGGCTCAGATGCTCCAAAATTCTCTTCG
TTCTCTGACACAAGTGGTGCTGGTTCAGTTTCTCCAGCAGCTGCACCAGAAGGCTCTAAC
AAAAGTGCTTCACCCAAAAGTGCCGTTACGATGGTTTTAAAAGACTAAAAGATTTGATTA
AGATGCCATATATTGTGTTTTTCTTTCTTATTCTAATTCAAGGAAATCTGGAAACAAATA
AATGGTTAATGTTTAGCTTTGTAAACTCATGTTTCATGTTGCAGTACTCAGTACATTACA
AGATGTTTATAAATTAAGTACTAACACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO95TF U 1
AF RR4H739TF U 131
AF RR4EO95JQ C 24
BS 1 264 RR4EO95TF
BS 265 287 RR4H739TF
BS 288 288 RR4EO95JQ
BS 289 464 RR4H739TF
BS 465 689 RR4EO95JQ

RD RR4EO95TF 264 0 0
GCAGGGTTCACGATTGCCGGCGAGCCGGATTACTTGGCGGTCAAGGAAACTAGCAAAGCC
TATTTAGGAAGGCCTTGGAAAGAGTATTCAAGAACTATTATTATGAACAGTTTTATTCCT
GATTTTATTCAGCCGCAAGGATGGCAACCGTGGCTTGGAAACTTCGGTCTCGACACATTG
TTCTACTCTGAGGTTCAGAACACAGGACCCGGAGCAGCTCTTGCAGGCAGGGTTACTTGG
CCTGGAATCAAGATACTGAGCGAC

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR4H739TF 334 0 0
G
GCCGCAAGGATGGCAACCGTGGCTTGGAAACTTCGGTCTCGACACGTTGTTCTACTCTGA
GGTTCAGAATATAGGACCCGGAGCAGCTCTTGCAGGCAGGGTTACTTGGCCTGGGATCAA
GATACTGAGCGACGAAGAGATTCTCAGTTTCACACCGGGTATGTACATCCAAGGTGATGT
TTGGATTCCAGGGAAAGGTGTACCGTACACTCCTGGTCTCTTGGCTGCTGACCCGAATGC
TGCAACCACCACCACCCCTAGCGGCTCAGATGCTCCAAAATTCTCTTCGTTCTCTGACAC
AAGTGGTGCTGGTTCAGTTTCTCCAGCAGCTGC

QA 2 334 2 334
DS 

RD RR4EO95JQ 666 0 0
GCCGGATTACTTGGCGGTCAAGGAAACTAGCAAAGCCTATTTAGGAAGGCCTTGGAAAGA
GTATTCAAGAACTATTATTATGAACAGTTTTATTCCTGATTTTATTCAGCCGCAAGGATG
GCAACCGTGGCTTGGAAACTTCGGTCTCGACACATTGTTCTACTCTGAGGTTCAGAACAC
AGGACCCGGAGCAGCTCTTGCAGGCAGGGTTACTTGGCCTGGAATCAAGATACTGAGCGA
CGAAGAGATTCTCAGTTTCACACCAGGTATGTACATCCAAGGTGATGTTTGGATTCCAGG
GAAAGGTGTACCGTACACTCCTGGTCTCTTGGCTGCTGACCCGAATGCTGCAACCACCAC
CACCCCTAGCGGCTCAGATGCTCCAAAATTCTCTTCGTTTTTTGACACAAGTGGTGCTGG
TTTGGTTTCTCCAGCAGCTGCACCAGAAGGCTCTAACAAAAGTGCTTCACCCAAAAGTGC
CGTTACGATGGTTTTAAAAGACTAAAAGATTTGATTAAGATGCCATATATTGTGTTTTTC
TTTCTTATTCTAATTCAAGGAAATCTGGAAACAAATAAATGGTTAATGTTTAGCTTTGTA
AACTCATGTTTCATGTTGCAGTACTCAGTACATTACAAGATGTTTATAAATTAAGTACTA
ACACCG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 3

CO CL3901Contig1 718 3 1 U
AGAACAAAAGACTAGTTTTATTGACATGTAGAAAATCACACCAATACATATCACAAGAAA
TGAAGAACACGTAGGAAAACCAATCCAATATGTCAACGAAGAAGGAAAAAGACGAAATTA
AAAGAACATGCACTCTCGTGTGAAGCTTTGGGAGAGCAAGAGATTCAAAAGGTTTCTTGA
AACCATTTTTAAGAAAACAAGAATTGTTCAGTTCAAATTTTCAAAAAACATTTGTTTGCA
GATCTTCCAGCTCAGGGTCCACGACGTTCTCTCCGTTTTCAGCTTCGCCAGGAAATATCG
GTGTTTCGAGCTCCGGAGGAGTCGTGCATCGAATCAGAGCCCAATTAATGCCTTTGAAGA
AAGAATGGTTCTTGACTTCGTTTGCCCCTTCAAGACAGCCTAGTCTCTTCTTCGGGTCTC
GTTGTAACAGCCTAAAAATCAGCTGTTTCACTTGAAGACTTGCAGGAATGCTAGCTGGAA
CTTCAGATCTTTCTGAAGAACATTGGCGAAAGTCTTCTGTCTGGTTTTTCCTCTAAATGG
AGTGTATCCGTATAGCATTTCGTACATAAGGATACCAAGAGCCCACCAGTCTACTGCACT
CGTATGGCCCGCCCCAGTTATAATTTCCGGAGCAATATACTCTTCAGTGCCAACAAATGA
GTTTGATGCACGCATAGGTTCAGCCATGAAGACTGGACTTTGTTGACTCTTTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BA82JQ U 107
AF RR4BV48JQ U 1
AF RR4BV48TF C 80
BS 1 718 RR4BV48JQ

RD RR4BA82JQ 223 0 0
AAAAGACGAAATTAAAAGAACATGCACTCTCGTGTGAAGCTTTGGGAGAGCAAGAAATTC
AAAAGGTTTCTTGAAACCATTTTTAAAAAAACAAAAATTGTTCAATTCAAATTTTCAAAA
AACATTTGTTTGCAGATCTCCCAGCTCAGGGTCCACGACGTTCTCTCCGTTTTCAGCTTC
CCCAGGAAATATCGGTGTTTCCAGCTCCGGAGGAGTCGTGCAT

QA 1 223 1 223
DS 

RD RR4BV48JQ 718 0 0
AGAACAAAAGACTAGTTTTATTGACATGTAGAAAATCACACCAATACATATCACAAGAAA
TGAAGAACACGTAGGAAAACCAATCCAATATGTCAACGAAGAAGGAAAAAGACGAAATTA
AAAGAACATGCACTCTCGTGTGAAGCTTTGGGAGAGCAAGAGATTCAAAAGGTTTCTTGA
AACCATTTTTAAGAAAACAAGAATTGTTCAGTTCAAATTTTCAAAAAACATTTGTTTGCA
GATCTTCCAGCTCAGGGTCCACGACGTTCTCTCCGTTTTCAGCTTCGCCAGGAAATATCG
GTGTTTCGAGCTCCGGAGGAGTCGTGCATCGAATCAGAGCCCAATTAATGCCTTTGAAGA
AAGAATGGTTCTTGACTTCGTTTGCCCCTTCAAGACAGCCTAGTCTCTTCTTCGGGTCTC
GTTGTAACAGCCTAAAAATCAGCTGTTTCACTTGAAGACTTGCAGGAATGCTAGCTGGAA
CTTCAGATCTTTCTGAAGAACATTGGCGAAAGTCTTCTGTCTGGTTTTTCCTCTAAATGG
AGTGTATCCGTATAGCATTTCGTACATAAGGATACCAAGAGCCCACCAGTCTACTGCACT
CGTATGGCCCGCCCCAGTTATAATTTCCGGAGCAATATACTCTTCAGTGCCAACAAATGA
GTTTGATGCACGCATAGGTTCAGCCATGAAGACTGGACTTTGTTGACTCTTTTGTTGC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4BV48TF 639 0 0
CCAATCCAATATGTCAACGAAGAAGGAAAAAGACGAAATTAAAAGAACATGCACTCTCGT
GTGAAGCTTTGGGAGAGCAAGAGATTCAAAAGGTTTCTTGAAACCATTTTTAAGAAAACA
AGAATTGTTCAGTTCAAATTTTCAAAAAACATTTGTTTGCAGATCTTCCAGCTCAGGGTC
CACGACGTTCTCTCCGTTTTCAGCTTCGCCAGGAAATATCGGTGTTTCGAGCTCCGGAGG
AGTCGTGCATCGAATCAGAGCCCAATTAATGCCTTTGAAGAAAGAATGGTTCTTGACTTC
GTTTGCCCCTTCAAGACAGCCTAGTCTCTTCTTCGGGTCTCGTTGTAACAGCCTAAAAAT
CAGCTGTTTCACTTGAAGACTTGCAGGAATGCTAGCTGGAACTTCAGATCTTTCTGAAGA
ACATTGGCGAAAGTCTTCTGTCTGGTTTTTCCTCTAAATGGAGTGTATCCGTATAGCATT
TCGTACATAAGGATACCAAGAGCCCACCAGTCTACTGCACTCGTATGGCCCGCCCCAGTT
ATAATTTCCGGAGCAATATACTCTTCAGTGCCAACAAATGAGTTTGATGCACGCATAGGT
TCAGCCATGAAGACTGGACTTTGTTGACTCTTTTGTTGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL3902Contig1 781 2 10 U
GGACACAAACTCAACTATCTCACCCATTCTCTCTATCTCTCTCACAAGAAACAACAATGG
CAAAACTATATCAAACTCTCTTTCTAATCATCTCAATCTCCTACTTCTTCTCGCTGGAGC
TCACCGCAGCCTCACCGGCCGGAGCTTCCCAAAAAGCCGTAAACTTCATCCAATCCTCTT
GCAAAACGACCACATACCCAACCGTGTGCTTCCGTTCCTTATCCGCCTACGCAAACGCCA
TCCAAACAAGCCCTCAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTAAGCCGAGTCC
AATCCACGAAGCTCTTTGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGACCCTTAAAAAGCGCGAGG
TTGAAGCCGTCAAGGACTGCGTCGAGGAGATCAACGATACCGTCGAACGTTTGACCAAGT
CGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGTAGTGCCAAGAATCAAGAACAGTTTGCGTTCCACA
TGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGCGCTGCTTTGACTGATGAGAACACTTGCTCCGATG
GGTTCTCGGGTCGATTTATGGATGGACGGATCAAGAACTCGGTTCGGGCTAGAATCGTTA
ACGTGGGCCAGGAAACCAGCAACGCATTGTCCTTGATTAATGCATATGGTAAAAAGTACT
AATTTTCAAATTAGTAGTTAAGGAATGTTTTATTTCATGTACCATCTCAAATATATATAA
ATAGTAATGTATGGCTAAGAGTTTAATGTGATATATATATTATATATGTCGATTTTGTTA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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10 

AF RR4D994TF U 1
AF RR4D994JQ C 120
BS 1 682 RR4D994TF
BS 683 683 RR4D994JQ
BS 684 710 RR4D994TF
BS 711 711 RR4D994JQ
BS 712 726 RR4D994TF
BS 727 727 RR4D994JQ
BS 728 760 RR4D994TF
BS 761 761 RR4D994JQ
BS 762 775 RR4D994TF
BS 776 781 RR4D994JQ

RD RR4D994TF 775 0 0
GGACACAAACTCAACTATCTCACCCATTCTCTCTATCTCTCTCACAAGAAACAACAATGG
CAAAACTATATCAAACTCTCTTTCTAATCATCTCAATCTCCTACTTCTTCTCGCTGGAGC
TCACCGCAGCCTCACCGGCCGGAGCTTCCCAAAAAGCCGTAAACTTCATCCAATCCTCTT
GCAAAACGACCACATACCCAACCGTGTGCTTCCGTTCCTTATCCGCCTACGCAAACGCCA
TCCAAACAAGCCCTCAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTAAGCCGAGTCC
AATCCACGAAGCTCTTTGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGACCCTTAAAAAGCGCGAGG
TTGAAGCCGTCAAGGACTGCGTCGAGGAGATCAACGATACCGTCGAACGTTTGACCAAGT
CGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGTAGTGCCAAGAATCAAGAACAGTTTGCGTTCCACA
TGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGCGCTGCTTTGACTGATGAGAACACTTGCTCCGATG
GGTTCTCGGGTCGATTTATGGATGGACGGATCAAGAACTCGGTTCGGGCTAGAATCGTTA
ACGTGGGCCAGGAAACCAGCAACGCATTGTCCTTGATTAATGCATATGGTAAAAAGTACT
AATTTTCAAATTAGTAGTTAAG*AATGTTTTATTTCATGTACCATCTCAA*TATATATAA
ATAGTA*TGTATGGCTAAGAGTTTAATGTGATATATATAT*ATATATGTCGATTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4D994JQ 662 0 0
CTCACCGCAGCCTCACCGGCCGGAGCTTCCCAAAAAGCCGTAAACTTCATCCAATCCTCT
TGCAAAACGACCACATACCCAACCGTGTGCTTCCGTTCCTTATCCGCCTACGCAAACGCC
ATCCAAACAAGCCCTCAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTAAGCCGAGTC
CAATCCACGAAGCTCTTTGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGACCCTTAAAAAGCGCGAG
GTTGAAGCCGTCAAGGACTGCGTCGAGGAGATCAACGATACCGTCGAACGTTTGACCAAG
TCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGTAGTGCCAAGAATCAAGAACAGTTTGCGTTCCAC
ATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGCGCTGCTTTGACTGATGAGAACACTTGCTCCGAT
GGGTTCTCGGGTCGATTTATGGATGGACGGATCAAGAACTCGGTTCGGGCTAGAATCGTT
AACGTGGGCCAGGAAACCAGCAACGCATTGTCCTTGATTAATGCATATGGTAAAAAGTAC
TAATTTTCAAATTAGTAGTTAAGGAATGTTTTATTTCATGTACCATCTCAAATATATATA
AATAGTAATGTATGGCTAAGAGTTTAATGTGATATATATATTATATATGTCGATTTTGTT
AG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL3903Contig1 1132 2 2 U
GGGTTTTCCAAATCGGTTGTAGATATGGCATTCATTCAATCATGAGTTCCCACTATGTCT
ACTTCATTGCTTATCAAACAACGTTTTCATCGTTGCTCTTGGACTATATATGGACAATCC
ATCTTTCCCTTCTAAGTCAGAAAACCCTTAATCGTTTTGTCTTATCAACGACAATGGCAA
ATCAACGGCCCCACTTCTGTGAGCTCAAGGTTGGCCGCTGCTGTCAGAGTATTATCACGA
GGCTTCTTTTTTTTTGGGAAGCTCGAAACTTTAAGAAAGATGGAGAGTTGCAGACATTGA
TCTGGTCAATGAGAAGTCCGCTGTATGTTCATTCGCTAACCGGAATCCGAAAGACGCCGC
GGTAATGACGACGGGGATGGAGAGAGTAGGTAAATCGAGCGCCGCGCTGGAGCAGCTGGA
CATCGAGCGAGGCGTTTGCATCCCTTTCCGAAAGTACTCTCCAGAGACTGTGAGGAGTAA
AGTGCTAGAATCAAGAGGATCAGTGGTCTCTCTTGCTTCACGAGGTGTTGAGATTGTTTG
GAACCTGGGGTTGTATTGGTCTACTTTAGTGTATGATTTTTTGGTTGGAAGGGATGAGGA
AGTCGTCCCGTTTCGTGCTAGGCAGCTTAGGAACCTCTTGTGTAACTTGGGGCCTTCTTT
TATCAAATCTGGACAGATATATTTGTTGGATGCATTTTTTTTATTTCTAGGGTATAACGG
CATTAACCGGATTCTCTAATGTCTATTACGTCGCAGGTTCTTGCAAATAGACCTGATATT
ATTCGTGAAGACTACATGAACGAGCTCTGTATACTTCAAGATGACGTTCCACCGTTCCCC
AATAAGGTTGCTTTCAAGATTATTGAGGAAGAGTTAGGCCAACCTCTTGAGGCCCTGTTT
AGCAAAATTACCTCGGAAACAATAGCGGCTGCAAGCTTGTGACGAGTTTATCGAGCTACT
CTACGTGCCACTGGAGAGAATGTTGCTATCAAGGTTTAATACAGTCAGAAATCAAAGCTA
CATGATTGGATGGGGGAAATAAAAGGCATAGCTCTCAAGGATCTAAGATAAGATTTGTCA
GTTGTCTAACTAAGGAGAATGTATCCTCAATTAAATTATGGCTACCTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FZ65TF U 1
AF RR4FZ65JQ C 349
BS 1 706 RR4FZ65TF
BS 707 1132 RR4FZ65JQ

RD RR4FZ65TF 706 0 0
GGGTTTTCCAAATCGGTTGTAGATATGGCATTCATTCAATCATGAGTTCCCACTATGTCT
ACTTCATTGCTTATCAAACAACGTTTTCATCGTTGCTCTTGGACTATATATGGACAATCC
ATCTTTCCCTTCTAAGTCAGAAAACCCTTAATCGTTTTGTCTTATCAACGACAATGGCAA
ATCAACGGCCCCACTTCTGTGAGCTCAAGGTTGGCCGCTGCTGTCAGAGTATTATCACGA
GGCTTCTTTTTTTTTGGGAAGCTCGAAACTTTAAGAAAGATGGAGAGTTGCAGACATTGA
TCTGGTCAATGAGAAGTCCGCTGTATGTTCATTCGCTAACCGGAATCCGAAAGACGCCGC
GGTAATGACGACGGGGATGGAGAGAGTAGGTAAATCGAGCGCCGCGCTGGAGCAGCTGGA
CATCGAGCGAGGCGTTTGCATCCCTTTCCGAAAGTACTCTCCAGAGACTGTGAGGAGTAA
AGTGCTAGAATCAAGAGGATCAGTGGTCTCTCTTGCTTCACGAGGTGTTGAGATTGTTTG
GAACCTGGGGTTGTATTGGTCTACTTTAGTGTATGATTTTTTGGTTGGAAGGGATGAGGA
AGTCGTCCCGTTTCGTGCTAGGCAGCTTAGGAACCTCTTGTGTAACTTGGGGCCTTCTTT
TATCAAATCTGGACAGATATATTTGTTGGATGCATTTTTTTTATTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FZ65JQ 784 0 0
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GGAGCAGCTGGACATCGAGCGAGGCGTTTGCATCCCTTTCCGAAAGTACTCTCCAGAGAC
TGTGAGGAGTAAAGTGCTAGAATCAAGAGGATCAGTGGTCTCTCTTGCTTCACGAGGTGT
TGAGATTGTTTGGAACCTGGGGTTGTATTGGTCTACTTTAGTGTATGATTTTTTGGTTGG
AAGGGATGAGGAAGTCGTCCCGTTTCGTGCTAGGCAGCTTAGGAACCTCTTGTGTAACTT
GGGGCCTTCTTTTATCAAATCTGGACAGATATATTTGTTGGATGCATTTTTTTTATTTCT
AGGGTATAACGGCATTAACCGGATTCTCTAATGTCTATTACGTCGCAGGTTCTTGCAAAT
AGACCTGATATTATTCGTGAAGACTACATGAACGAGCTCTGTATACTTCAAGATGACGTT
CCACCGTTCCCCAATAAGGTTGCTTTCAAGATTATTGAGGAAGAGTTAGGCCAACCTCTT
GAGGCCCTGTTTAGCAAAATTACCTCGGAAACAATAGCGGCTGCAAGCTTGTGACGAGTT
TATCGAGCTACTCTACGTGCCACTGGAGAGAATGTTGCTATCAAGGTTTAATACAGTCAG
AAATCAAAGCTACATGATTGGATGGGGGAAATAAAAGGCATAGCTCTCAAGGATCTAAGA
TAAGATTTGTCAGTTGTCTAACTAAGGAGAATGTATCCTCAATTAAATTATGGCTACCTC
ATTT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL3904Contig1 855 2 8 U
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TTTGAACATTTTGCAAAAGAATGCATTGATTCTCCTCATTTCATTCGCTTTTTAAAATAC
TTTATTATTAGTTTTATACTTTATTTATGGTAGAAGCAAAGCATCCATAAGTCTAGATGA
ATATATCATCTGATCAGCTTCGCATCTGGATCTGTAGTTCCCTTCGTCATCATCGCCACA
AACTCCTCGTAGTTTATTCTCCCATCGTTGTCTGTATCGACATCATTGATGACTTCATCT
ATGGTAGCATCATCACCCATTCCATACTGAGTCATCGAATGTTTTAGCTCGTCCCTTGTG
ATGTATCCGCTTCTGTCTTTGTCAAAGTATTTGAATGCTTCTAACAAATGCTCCTCTTTC
TCCAATCTATGCCGATGCATTGTAGCTGTTATGAACTCAATGTAATCAATCGTCCCGCTT
TTGTCCACATCAGCAGCTTCCATGAGTTGTTTGATTTCAGATTCAGTAAGTTTAGATCCA
AGACGATGTAAACCGGTTCTTAGTTCATCAAAAGTGATGGTACCACTTCCATCTGTATCA
ATGTTCTTAAACATCTGCTTTAGTCCCTTAATCTCTTCTTCTGATAAGTTTTCAGCTATG
ACCTTCAAGACAAGTTTCTTGAGCTTGTTCATTGCGCGGAACTGCTTCATCCTAATAAGG
ACTGCACTATCTATTGGTTTATCTGAAACTTCGCTATCTGTCAACCATGGATGCTCAAGT
GCTTCAGCTGCTGTAATCCGTGTTTTAGGGTCTCTTGCCAACATCTTCCTTATCAAGTCT
TTGCGCTTTCCGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED54JQ U 1
AF RR4CK48JQ U 48
BS 1 107 RR4ED54JQ
BS 108 108 RR4CK48JQ
BS 109 113 RR4ED54JQ
BS 114 114 RR4CK48JQ
BS 115 134 RR4ED54JQ
BS 135 135 RR4CK48JQ
BS 136 515 RR4ED54JQ
BS 516 855 RR4CK48JQ

RD RR4ED54JQ 515 0 0
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TTTGAACATTTTGCAAAAGAATGCATTGATTCTCCTCATTTCATTCGTTTTTTTAAATAC
TTTATTATTAGTTT*ATACTTTATTTATGGTAGAAGCAAAGCATCCATAAGTCTAGATGA
ATATATCATCTGATCAGCTTCGCATCTGGATCTGTAGTTCCCTTCGTCATCATCGCCACA
AACTCCTCGTAGTTTATTCTCCCATCGTTGTCTGTATCGACATCATTGATGACTTCATCT
ATGGTAGCATCATCACCCATTCCATACTGAGTCATCGAATGTTTTAGCTCGTCCCTTGTG
ATGTATCCGCTTCTGTCTTTGTCAAAGTATTTGAATGCTTCTAACAAATGCTCCTCTTTC
TCCAATCTATGCCGATGCATTGTAGCTGTTATGAACTCAATGTAATCAATCGTCCCGCTT
TTGTCCACATCAGCAGCTTCCATGAGTTGTTTGAT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4CK48JQ 808 0 0
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CTTTTTAAAATACTTTATTATTAGTTTTATACTTTATTTATGGTAGAAGCAAAGCATCCA
TATGTCTAGATGAATATATCATCTGATCAGCTTCGCATCTGGATCTGTGGTTCCCTTCGT
CATCATCGCCACAAACTCCTCGTAGTTTATTCTCCCATCGTTGTCTGTATCGACATCATT
GATGACTTCATCTATGGTAGCATCATCACCCATTCCATACTGAGTCATCGAATGTTTTAG
CTCGTCCCTTGTGATGTATCCGCTTCTGTCTTTGTCAAAGTATTTGAATGCTTCTAGCAA
ATGCTCCTCTTTCTCCAATCTATGCCGATGCATTGTAGCTGTTATGAACTCAATGTAATC
AATCGTCCCGCTTTTGTCCACATCAGCAGCTTCCATGAGTTGTTTGATTTCAGATTCAGT
AAGTTTAGATCCAAGACGATGTAAACCGGTTCTTAGTTCATCAAAAGTGATGGTACCACT
TCCATCTGTATCAATGTTCTTAAACATCTGCTTTAGTCCCTTAATCTCTTCTTCTGATAA
GTTTTCAGCTATGACCTTCAAGACAAGTTTCTTGAGCTTGTTCATTGCGCGGAACTGCTT
CATCCTAATAAGGACTGCACTATCTATTGGTTTATCTGAAACTTCGCTATCTGTCAACCA
TGGATGCTCAAGTGCTTCAGCTGCTGTAATCCGTGTTTTAGGGTCTCTTGCCAACATCTT
CCTTATCAAGTCTTTGCGCTTTCCGATA

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 3

CO CL3905Contig1 944 3 12 U
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ATCATCTAGTTAAATAATACAATGAAAATAAATTGAAAAAAAAACCATTACAGCAACACC
AGATTCAGTTTATGTCTTCCCATTGATGTATGATATATAAATCACATGCATCCAAATAGC
TTTTTAGGTGCCGTTCCAGTGGCACGGTACTTGGCAGCTAATTCCTCGGCTTTGAGAACC
TCTTCACCACGTCTAGCTTCGATCATGGCCCTCTTCTCTTCTGCCTGTTTGTGAATTTGA
GCTATTTTGTTCTTCATTTGCTCCACATACTCTGCCTTCTTCTTCTCCAATTGTTCCTCC
AGTTTCTTGAGCTCAGCTTCCACTGCTGCTTTCTTGTTGTTCTCCCATGACTCAATTGAA
GAAAGTTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCCACTTTGCACTTCTCAGCCTCTTCCCAAGCTTTG
ATAAGTGACATCCTCTTCTCTGTCTCAACTCTAGCCAGGACCGCATCTCGATTAACCGAA
CCTTCTTTCTTTCCTTCCCCTGCTTCATTTGCGACGATGGGAACAATAGCCTTGGAGTCC
TCTAGCTTCTCCTCTGCAGGCGCCGGAGATGGAAGAACTGGTGGTGGAGCCACAGGCTTC
TCCTGTGGAGCAACATCGACCGCAGCAAGAGGTTTCTCCTCCGGAGGTGGCGCTGATGGA
GTTGGTTCAGACACGGTAGGAACGTTCTCCGTCACCTTCTTCTGTTCCTCTTCGGCCATG
TCGTATATGACGTCAGGTATAACAACTAAAGATTACAAGAGAACAAAAATATCTGAAGAG
AATCAAGAATGATCCAGAAGTCTGGCTATTTAAGAGAGAGAATGAGAGGAGAGAGAAGAA
ACTGAGCTGGAATTGTTTGGTAGTGATGTTCTGTTCCTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C071JQ U 19
AF RR4EL09JQ U 1
AF RR4C071TF C 360
BS 1 103 RR4EL09JQ
BS 104 104 RR4C071JQ
BS 105 552 RR4EL09JQ
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BS 554 566 RR4EL09JQ
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BS 568 619 RR4EL09JQ
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BS 656 656 RR4C071TF
BS 657 674 RR4EL09JQ
BS 675 944 RR4C071TF

RD RR4C071JQ 179 0 0
TT
TTTATTTAGATACAACATATTTAAAAAAAAGTTCACGGTTATCATCTAGTTAAATAATAC
AATGAAAATAAATTGAAAAAAAAACCATTACAGCAACACCAGATTCAGTTTATGTCTTCC
CATTGATGTATGATATATAAATCACATGCATCCAAATAGCTTTTTAGGTGCCGTTCC

QA 3 179 3 179
DS 

RD RR4EL09JQ 674 0 0
GCCAACAAAAAAATGTATTATTTATTTAGATACAACATATTTAAAAAAAAGTTCACGGTT
ATCATCTAGTTAAATAATACAATGAAAATAAATTGAAAAAAAA*CCATTACAGCAACACC
AGATTCAGTTTATGTCTTCCCATTGATGTATGATATATAAATCACATGCATCCAAATAGC
TTTTTAGGTGCCGTTCCAGTGGCACGGTACTTGGCAGCTAATTCCTCGGCTTTGAGAACC
TCTTCACCACGTCTAGCTTCGATCATGGCCCTCTTCTCTTCTGCCTGTTTGTGAATTTGA
GCTATTTTGTTCTTCATTTGCTCCACATACTCTGCCTTCTTCTTCTCCAATTGTTCCTCC
AGTTTCTTGAGCTCAGCTTCCACTGCTGCTTTCTTGTTGTTCTCCCATGACTCAATTGAA
GAAAGTTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCCACTTTGCACTTCTCAGCCTCTTCCCAAGCTTTG
ATAAGTGACATCCTCTTCTCTGTCTCAACTCTAGCCAGGACCGCATCTCGATTAACCGAA
CCTTCTTTCTTTTCTTCCCCTGCTTCCTTTGCGACGATGGGAACAATAGCCTTGGAGTCC
TCTAGCTTCTCCTCTGCAG*CGCCGGAGATGGAAGAACTGGTGGTGGAGCCACAG*CTTC
TCCTGTGGAGCAAC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4C071TF 585 0 0
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AGAAAGTTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCCACTTTGCACTTCTCAGCCTCTTCCCAAGCTTT
GATAAGTGACATCCTCTTCTCTGTCTCAACTCTAGCCAGGACCGCATCTCGATTAACCGG
ACCTTCTTTCTTTCCTTCCCCTGCTTCATT*GCGACGATGGGAACAATAGCCTTGGAGTC
CTCTAGCTTCTCCTCTGCAGGCGCCGGAGATGGAAGAACTGGTGGTGGAGCCACAGGCTT
CTCCTGTGGAGCAACATCGACCGCAGCAAGAGGTTTCTCCTCCGGAGGTGGCGCTGATGG
AGTTGGTTCAGACACGGTAGGAACGTTCTCCGTCACCTTCTTCTGTTCCTCTTCGGCCAT
GTCGTATATGACGTCAGGTATAACAACTAAAGATTACAAGAGAACAAAAATATCTGAAGA
GAATCAAGAATGATCCAGAAGTCTGGCTATTTAAGAGAGAGAATGAGAGGAGAGAGAAGA
AACTGAGCTGGAATTGTTTGGTAGTGATGTTCTGTTCCTCGTTCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 3

CO CL3906Contig1 1028 3 12 U
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ATTTTATTATGAGATGATTAATGTCAAAAGGATAAACTGAAATCATATGTTCGGTAAACA
ATATTACAACAGGTTCGTGATGGCATTTCCAATCACGCTATATAAAACTACAAAAAAGGC
TGTTTCTCCTGCAACATTGTTGAGTGTTGTTCCAAGTATTCTTTGCTGTTCATCTCTGTT
AACCTGCTAATGGTCCTGTCTTTAGCAAAACCAAGCTCGTTGTCCACGCATAAATCGATA
TCATCACTCTTCCTAAATCTTGAAAAGGTTCTTGGTGCTATTTGCTGCGCATCAGCTATT
GTCACTATACTCTCCAGCAGTTCTAGAGGGCTACCCTCTGCTGTGCATAGGAGCCTGGCT
TTGGTTTCATACATCACATCAACCAGCGTTACAAAACGGTAAGCTGCAGTCCTGTTGTGG
AGCCCGAACATGGGTACACCTTCCAAAGCCAATGTATGAAATTTCTTGAATAATCCGAGA
TAATCTGCTGCACCTAGGGGTCTGTCACACAGCTCTTCAAAAAGAAAGTAGGCACACCCA
TTGGCAGCCAGTGGAACCTGCAACTTCCTTCCCATTACTACTTCAACCACTAGAGGACCG
GCCGGTTCATCGCCAACCAATTGCTGAAACTTCTGTTTAAGAAGGCCAGAAATATTCCTT
CCAATGAAGTAGAATCCCTCTTCAGCAGAGGTCAGCTTCCGATAGTCTACCGATGAACCA
ATTTCACGAACCACACATCTTTCCTTTAGTGCGGCGATAAACGGAAGGAATAGATCCCTC
TGTAAACCCCTTTCATAGAGATTATCTGGCGCACGGTTGGATGTAGCAACAAGAACAATG
CCATTGTTAAACAAGTGTCTAAAGAGACGGTTTAGTATCAGAGCATCAGCTACATCATTG
ACCATGAACTCATCTAAGCATAGTAATATAGCCTCATCAGCTATTTCCAAGCCAACGACT
TCAAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H550JQB U 1
AF RR4E995JQ U 46
AF RR4E995TF C 400
BS 1 100 RR4H550JQB
BS 101 101 RR4E995JQ
BS 102 174 RR4H550JQB
BS 175 175 RR4E995JQ
BS 176 207 RR4H550JQB
BS 208 209 RR4E995JQ
BS 210 292 RR4H550JQB
BS 293 293 RR4E995JQ
BS 294 315 RR4H550JQB
BS 316 316 RR4E995JQ
BS 317 648 RR4H550JQB
BS 649 1028 RR4E995TF

RD RR4H550JQB 648 0 0
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TGTTTCTCCTGCAACATTGTTGAGTGT**TTCCAAGTATTCTTTGCTGTTCATCTCTGTT
AACCTGCTAATGGTCCTGTCTTTAGCAAAACCAAGCTCGTTGTCCACGCATAGATCGATA
TCATCACTCTTCCTAGATCTTGAAAAGGTTCTTGGTGCTATTTGCTGCGCATCAGCTATT
GTCACTATACTCTCCAGCAGTTCTAGAGGGCTACCCTCTGCTGTGCATAGGAGCCTGGCT
TTGGTTTCATACATCACATCAACCAGCGTTACAAAACGGTAAGCTGCAGTCCTGTTGTGG
AGCCCGAACATGGGTACACCTTCCAAAGCCAATGTATGAAATTTCTTGAATAATCCGAGA
TAATCTGCTGCACCTAGGGGTCTGTCACACAGCTCTTCAAAAAGAAAGTAGGCACACCCA
TTGGCAGCCAGTGGAACCTGCAACTTCCTTCCCATTACTACTTCAACC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4E995JQ 603 0 0
C
CTGTGCTACAACACATTTTATTATGAGATGATTAATGTCAAAAGGATAAACTGAAATCAT
ATGTTCGGTAAACAATATTACAACAGGTTCGTGATGGCATTTCCAATCACGCTATATAAA
ACTACAAAAAAGGCTGTTTCTCCTGCAACATTGTTGAGTGTTGTTCCAAGTATTCTTTGC
TGTTCATCTCTGTTAACCTGCTAATGGTCCTGTCTTTAGCAAAACCAAGCTCGTTGTCCA
CGCATAAATCGATATCGTCACTCTTCCTAAATCTTGAAAAGGTTCTTGGTGCTATTTGCT
GCGCATCAGCTATTGTCACTATACTCTCCAGCAGTTCTAGAGGGCTACCCTCTGCTGTGC
ATAGGAGCCTGGCTTTGGTTTCATACATCACATCAACCAGCGTTACAAAACGGTAAGCTG
CAGTCCTGTTGTGGAGCCCGAACATGGGTACACCTTCCAAAGCCAATGTATGAAATTTCT
TGAATAATCCGAGATAATCTGCTGCACCTAGGGGTCTGTCACACAGCTCTTCAAAAAGAA
AGTAGGCACACCCATTGGCAGCCAGTGGAACCTGCAACTTCCTTCCCATTACTACTTCAA
CC

QA 2 603 2 603
DS 

RD RR4E995TF 629 0 0
GCTGTGCATAGGAGCCTGGCTTTGGTTTCATACATCACATCAACCAGCGTTACAAAACGG
TAAGCTGCAGTCCTGTTGTGGAGCCCGAACATGGGTACACCTTCCAGAGCCAATGTATGA
AATTTCTTGAATAATCCGAGATAATCTGCTGCACCTAGGGGTCTGTCACACAGCTCTTCA
AAAAGAAAGTAGGCACACCCATTGGCAGCCAGTGGAACCTGCAACTTCCTTCCCATTACT
ACTTCAACCACTAGAGGACCGGCCGGTTCATCGCCAACCAATTGCTGAAACTTCTGTTTA
AGAAGGCCAGAAATATTCCTTCCAATGAAGTAGAATCCCTCTTCAGCAGAGGTCAGCTTC
CGATAGTCTACCGATGAACCAATTTCACGAACCACACATCTTTCCTTTAGTGCGGCGATA
AACGGAAGGAATAGATCCCTCTGTAAACCCCTTTCATAGAGATTATCTGGCGCACGGTTG
GATGTAGCAACAAGAACAATGCCATTGTTAAACAAGTGTCTAAAGAGACGGTTTAGTATC
AGAGCATCAGCTACATCATTGACCATGAACTCATCTAAGCATAGTAATATAGCCTCATCA
GCTATTTCCAAGCCAACGACTTCAAGTGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3907Contig1 1016 3 2 U
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CTTATCATCTCAAGAATCAAGACTCATAAAAGCTCATCTCATACTCATCATAACCTAAAA
CCAAAATCTCAAAGAGTTAAAAAAAATATTGAAGTATATATCAGATCTTGATATCATGGA
TCCTGTTTACGGCTTTATAGGCACATCAAACATCCCACACAACACAAACCTTATGATCGC
TGCCGCAGCAGCCACCACCACCACTACCACCTCCTCCTCCTCGTCTTCCTCCGGCGGCTC
AGCGACGAACCAGCTGAGTAGGTACGAGAATCAGAAGAGAAGAGATTGGAACACTTTCGG
ACAATATCTACGCAACCATCGTCCGCCACTTTCCCTCTCCCGTTGCAGTGGTGCTCATGT
ACTTGAGTTCCTCAGGTACCTCGACCAATTTGGCAAGACCAAGGTTCACATGCAACTATG
TCCGTTCTTTGGACATCCAAACCCACCAGCACCATGTACCTGTCCACTCAGACAAGCGTG
GGGCAGCCTCGACGCACTCATTGGCCGGCTTCGAGCCGCTTTTGAAGAGAACGGTGGCTC
ACCAGAGACTAACCCTTTTGGTGCACGAGCCGTTCGACTCTACCTAAGGGAAGTGCGAGA
CTCGCAGGCTAAAGCGCGTGGGATCAGCTACGAAAAGAAGAAGAGGAAGCGACCTCCGCA
GGCGCCGCTCCCGCTACCACCACCTCAGCCGATGATTTCGAGTAGCCCTAATTTGCAATA
AGTCATATCAGTAAGATATGTTTCAGTCAACTACGTTTCCTTACAGCTTTATATAGTATT
TGTCAATGACGATCGAACATGCACTAGTTATCTAAAAGCTGCACGTCTTTCTTCGTACTC
TTTTTATTTGGCAAGCTAAAGAATTTTATGTTGTATTGAAATAATGATTTTTCGTTCGGC
CTCGCATAAAATATGTTTTAGTATTTATTATATTCAATACATACACCATTATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO46TF U 278
AF RR4GA35TF U 1
AF RR4GA35JQ C 371
BS 1 643 RR4GA35TF
BS 644 1016 RR4GA35JQ

RD RR4AO46TF 293 0 0
TCCTCGTCTTCCTCCGGCGGCTCAGCGACGAACCAGCTGAGTAGGTACGAGAATCAGAAG
AGAAGAGATTGGAACACTTTCGGACAATATCTACGCAACCATCGTCCGCCACTTTCCCTC
TCCCGTTGCAGTGGTGCTCATGTACTTGAGTTCCTCAGGTACCTCGACCAATTTGGCAAT
ACCAAGGTTCACATGCAACTATGTCCGTTCTTTGGACATCCAAACCCACCAGCACCATGT
ACCTGTCCACTCAGACAAGCGTGGGGCAGCCTCGACGCACTCATTGGCCGGCT

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR4GA35TF 643 0 0
GGACTGCAATGACTATGGTACCCCCTCTTCTCCTTCCTTTTTTCTCTCCACCATCTCTTC
CTTATCATCTCAAGAATCAAGACTCATAAAAGCTCATCTCATACTCATCATAACCTAAAA
CCAAAATCTCAAAGAGTTAAAAAAAATATTGAAGTATATATCAGATCTTGATATCATGGA
TCCTGTTTACGGCTTTATAGGCACATCAAACATCCCACACAACACAAACCTTATGATCGC
TGCCGCAGCAGCCACCACCACCACTACCACCTCCTCCTCCTCGTCTTCCTCCGGCGGCTC
AGCGACGAACCAGCTGAGTAGGTACGAGAATCAGAAGAGAAGAGATTGGAACACTTTCGG
ACAATATCTACGCAACCATCGTCCGCCACTTTCCCTCTCCCGTTGCAGTGGTGCTCATGT
ACTTGAGTTCCTCAGGTACCTCGACCAATTTGGCAAGACCAAGGTTCACATGCAACTATG
TCCGTTCTTTGGACATCCAAACCCACCAGCACCATGTACCTGTCCACTCAGACAAGCGTG
GGGCAGCCTCGACGCACTCATTGGCCGGCTTCGAGCCGCTTTTGAAGAGAACGGTGGCTC
ACCAGAGACTAACCCTTTTGGTGCACGAGCCGTTCGACTCTAC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4GA35JQ 646 0 0
CGCAACCATCGTCCGCCACTTTCCCTCTCCCGTTGCAGTGGTGCTCATGTACTTGAGTTC
CTCAGGTACCTCGACCAATTTGGCAAGACCAAGGTTCACATGCAACTATGTCCGTTCTTT
GGACATCCAAACCCACCAGCACCATGTACCTGTCCACTCAGACAAGCGTGGGGCAGCCTC
GACGCACTCATTGGCCGGCTTCGAGCCGCTTTTGAAGAGAACGGTGGCTCACCAGAGACT
AACCCTTTTGGTGCACGAGCCGTTCGACTCTACCTAAGGGAAGTGCGAGACTCGCAGGCT
AAAGCGCGTGGGATCAGCTACGAAAAGAAGAAGAGGAAGCGACCTCCGCAGGCGCCGCTC
CCGCTACCACCACCTCAGCCGATGATTTCGAGTAGCCCTAATTTGCAATAAGTCATATCA
GTAAGATATGTTTCAGTCAACTACGTTTCCTTACAGCTTTATATAGTATTTGTCAATGAC
GATCGAACATGCACTAGTTATCTAAAAGCTGCACGTCTTTCTTCGTACTCTTTTTATTTG
GCAAGCTAAAGAATTTTATGTTGTATTGAAATAATGATTTTTCGTTCGGCCTCGCATAAA
ATATGTTTTAGTATTTATTATATTCAATACATACACCATTATTTCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 3

CO CL3908Contig1 638 3 13 U
GGGTCTCACATATCATAAGAAAGATAAAATGGCCGTTCATATTCATAACCCTAACTTTTT
GCACACTCATCAACTCCGATCATCTCATACATGGGCATCTGCATCACCTGCTTCATATCA
CACCACAAGATTTTCTCCTGCAAAACATCCCGGATTCATCTGCAAGTCCAATAACAAAGA
TGACTATCTTATTGATGCTCCTGTGTCTGCTGGAGATGGATTCTCTTTCAGTGGAGGGAA
GTATTCGGATCAACCAAGTCCATCAGATGAATGGTTAAAGCGAGGCAAATGGGTCAAAGC
ACACAGAGTTGGTGGATCTGGTGCAGAAGCCAAAGATCCCATTTTCGGACTAACAATGGG
ATCTAGCTCTCAAGCTTCAAAAGATGTTTTCAGGTGGTTTTGTGTAGAATCTGGGAATGT
AGACAGTCCTCCCGTTATACTCATCCATGGATTCCCATCCCAGGCTTACTCTTACCGGAA
AGCTCTTCCCGTCCTTTCAAAGAACTACCGCGCCATTGCTTTCGATTGGCTAGGATTTGG
ATTTTCTGACAAGCCTCAGGCTGGATATGGATTCAACTACACATTAGACGAGTATGTTTC
GTCGCTTGAATCATTCATTAATGAAGTTACAACTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4F581TF U 11
AF RR4CB28TF U 1
AF RR4GG95TF U 10
BS 1 255 RR4CB28TF
BS 256 256 RR4GG95TF
BS 257 294 RR4CB28TF
BS 295 295 RR4GG95TF
BS 296 300 RR4CB28TF
BS 301 301 RR4GG95TF
BS 302 369 RR4CB28TF
BS 370 370 RR4GG95TF
BS 371 525 RR4CB28TF
BS 526 526 RR4GG95TF
BS 527 619 RR4CB28TF
BS 620 620 RR4GG95TF
BS 621 638 RR4CB28TF

RD RR4F581TF 545 0 0
G
ATCATTAGAAAGATAAAATGGCCGTTCATATTCATAACCCTAACTTTTTGCACACTCATC
AACTCCGATCATCTCATACATGGGCATCTGCATCACCTGCTTCATATCACACCACAAGAT
TTTCTCCTGCAAAACATCCCGGATTCATCTGCAAGTCCAATAACAAAGATGACTATCTTA
TTGATGCTCCTGTGTCTGCTGGAGATGGATTCTCTTTCAGTGGAGGGAAGTATTCGGATC
AACCAAGTCCATCAGATGAATGGTTAAAGCGAGGCAAATGGGTCAAAGCACACAGAGTTG
GTGGATCTGGTGCAGAAGCCAAAGATCCCATTTTCGGACTAACAATGGGATCTAGCTCTC
AAGCTTCAAAAGATGTTTTCAGGTGGTTTTGTGTAGAATCTGGGAATGTAGACAGTCCTC
CCGTTATACTCATCCATGGATTCCCATCCCAGGCTTACTCTTACCGGAAAGCTCTTCCCG
TCCTTTCAAAGAACTACCGCGCCATTGCTTTCGATTGGCTAGGATTTGGATTTTCTGACA
AGCC

QA 2 545 2 545
DS 

RD RR4CB28TF 638 0 0
GGGTCTCACATATCATAAGAAAGATAAAATGGCCGTTCATATTCATAACCCTAACTTTTT
GCACACTCATCAACTCCGATCATCTCATACATGGGCATCTGCATCACCTGCTTCATATCA
CACCACAAGATTTTCTCCTGCAAAACATCCCGGATTCATCTGCAAGTCCAATAACAAAGA
TGACTATCTTATTGATGCTCCTGTGTCTGCTGGAGATGGATTCTCTTTCAGTGGAGGGAA
GTATTCGGATCAACCGAGTCCATCAGATGAATGGTTAAAGCGAGGCAAATGGGTTAAAGC
TCACAGAGTTGGTGGATCTGGTGCAGAAGCCAAAGATCCCATTTTCGGACTAACAATGGG
ATCTAGCTCCCAAGCTTCAAAAGATGTTTTCAGGTGGTTTTGTGTAGAATCTGGGAATGT
AGACAGTCCTCCCGTTATACTCATCCATGGATTCCCATCCCAGGCTTACTCTTACCGGAA
AGCTCTTCCCGTCCTTTCAAAGAACTACCGCGCCATTGCTTTCGACTGGCTAGGATTTGG
ATTTTCTGACAAGCCTCAGGCTGGATATGGATTCAACTACACATTAGACGAGTATGTTTC
GTCGCTTGAATCATTCATTGATGAAGTTACAACTACTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4GG95TF 628 0 0
GG
ATCATAAGAAAGATAAAATGGCCGTTCATATTCATAACCCTAACTTTTTGCACACTCATC
AACTCCGATCATCTCATACATGGGCATCTGCATCACCTGCTTCATATCACACCACAAGAT
TTTCTCCTGCAAAACATCCCGGATTCATCTGCAAGTCCAATAACAAAGATGACTATCTTA
TTGATGCTCCTGTGTCTGCTGGAGATGGATTCTCTTTCAGTGGAGGGAAGTATTCGGATC
AACCAAGTCCATCAGATGAATGGTTAAAGCGAGGCAAATGGGTCAAAGCACACAGAGTTG
GTGGATCTGGTGCAGAAGCCAAAGATCCCATTTTCGGACTAACAATGGGATCTAGCTCTC
AAGCTTCAAAAGATGTTTTCAGGTGGTTTTGTGTAGAATCTGGGAATGTAGACAGTCCTC
CCGTTATACTCATCCATGGATTCCCATCCCAGGCTTACTCTTACCGGAAAGCTCCTCCCG
TCCTTTCAAAGAACTACCGCGCCATTGCTTTCGATTGGCTAGGATTTGGATTTTCTGACA
AGCCTCAGGCTGGATATGGATTCAACTACACATTAGACGAGTATGTTTCGTCGCTTGAAT
CATTCATTAATGAAGTTACAACTACT

QA 3 628 3 628
DS 



AS 1 3

CO CL3909Contig1 1426 3 13 U
GGATACAATAATATAAGTAAAATATTTGGTGTTGAGTTTTTGACACGAATTCGACATGTA
TAAGAAAACTATTCATTATTTTTGACACTTCAGTTTATATTTAAGAGAACTACATATCGC
TCTTACCACAAAGACAATCTACGGGGAGAGGAGAATGATGAAACTCGTTTTGGTGGTTGC
GATATCACTTGCCTTTCTCTTAAGCCTCTTCGATTCTTCCCGCGAGAGTCTAAAACATGG
AGAATCAATGTTGACTGTTCATTTCCCTGAGTTCCATTTGATTCCTACCACCGGAGCTTC
TGGACCTGAGAGTTTCGTCTTCGATATCTCCGGAGATGGTCCTTACACCGGTTTATCCGA
CGGTCGAATTGTTAAGTGGATAGCTAATGAGAGCCGTTGGATAGATTTCGCCGTCACCAC
CCCAGCAAGAGAAGGTTGTGAGGGCCCGCACGACCACCAACGAACGGAACACGAGTGTGG
TCGACCATTGGGCCTGGCCTTTGAAAAATCCACTGGTGATCTGTATATTGCTGATGCTTA
CATGGGCCTTCTTAAAGTTGGTCGAGAAGGTGGTTTAGCCAATCAAGTATTAACAGATCA
GCTGGATAAGCCCCTTACGTTTACCAACAGTGTTGAGATAGATCCACAGACCGGAGTTAT
CTACTTTACCGATAGTAGTACTGTTTATCAACGGAGGAATTATATAGGCGTGATTATGAG
TGGGGACAGAACCGGTAGATTGATGAAATATGATCCAAGTACAAAACAAGTGACAACGCT
TCTAAGCAACCTTGCGTTCGCAAACGGGATCGTACTAAGCCAAAACGGCGATTACCTTCT
CGTAGCTGAGACTGCCACGTCCCGAATCCTACGTTACTGGTTCAACGACACTTCGGTTTC
TAAGTCTCACGAGAACTATGAGGTTTTCGCGGAGCAGCTCCCTGGGTTCCCCGACAATAT
AAAGAGGAGTCCACGTGGTGGATTTTGGGTAGGCTTGAATACAAAACACTCAAAGCTGAC
TGAGTTCGCCATGTCGAACGCGTGGCTAGGACGCGCCGCCTTGGGTTTGCCGGTGGACTG
GATGAAAGTCCACTCGTATTGGGCCAAGTACAAAGGGAACGGGATGGCCGTGAGGTTGAG
CGAAGATAGTGGCGTAATATCGGAGGTTTTCGAGGGTACAAATGGAAATAAATGGATCTC
CATAAGTGAGGTGGAGGAGCGTGACGGAACTCTATGGGTTGGATCGGTGAATACTCCTTT
CGCTGGAGTGTATAAAATCTAAAAACAAATCATTCGTACATTAACGATAAAAATAATCTA
AATTAGCGATTTAAATTTATTTTATATGTCAAGTCTTCATAATGAATGTTTAGGATCATA
AAAATCTAAAATCTTCGTAATACGATATTATAAATGTGGTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D337TF U 1
AF RR4CB57TF U 128
AF RR4CB57JQ C 726
BS 1 243 RR4D337TF
BS 244 244 RR4CB57TF
BS 245 412 RR4D337TF
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BS 455 696 RR4D337TF
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BS 698 707 RR4D337TF
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BS 741 803 RR4CB57TF
BS 804 1426 RR4CB57JQ

RD RR4D337TF 742 0 0
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TAAGAAAACTATTCATTATTTTTGACACTTCAGTTTATATTTAAGAGAACTACATATCGC
TCTTACCACAAAGACAATCTACGGGGAGAGGAGAATGATGAAACTCGTTTTGGTGGTTGC
GATATCACTTGCCTTTCTCTTAAGCCTCTTCGATTCTTCCCGCGAGAGTCTAAAACATGG
AGAGTCAATGTTGACTGTTCATTTCCCTGAGTTCCATTTGATTCCTACCACCGGAGCTTC
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CGGTCGAATTGTTAAGTGGATAGCTAATGAGAGCCGTTGGATAGATTTCGCCTTCACCAC
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TCGACCATTGGGCCTGGCCTTTGAAAAATCCACTGGTGATCTGTATATTGCTGATGCTTA
CATGGGCCTTCTTAAAGTTGGTCGAGAAGGTGGTTTAGCCAATCAAGTATTAACAGATCA
GCTGGATAAGCCCCTTACGTTTACCAACAGTGTTGAGATAGATCCACAGACCGGAGTTAT
CTACTTTACCGATAGTAGTACTGTTTATCAACGGAG*AATTATATAG*CGTGATTATGAG
TGGGGACAGAACCGGTAGAT
GA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4CB57TF 681 0 0
GG
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TGCCTTTCTCTTAAGCCTCTTCGATTCTTCCCGCGAGAGTCTAAAACATGGAGAATCAAT
GTTGACTGTTCATTTCCCTGAGTTCCATTTGATTCCTACCACCGGAGCTTCTGGACCTGA
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TGTTAAGTGGATAGCTAATGAGAGCCGTTGGATAGATTTCGCCGTCACCACCCCAGCAAG
AGATGGTTGTGAGGGCCCGCACGACCACCAACGAACGGAACACGAGTGTGGTCGACCATT
GGGCCTGGCCTTTGAAAAGTCCACTGGTGATCTTTTTATTGCTGATGCTTACATGGGCCT
TCTTAAAGTTGGTCGGGAAGGTGGTTTAGCCAATCAAGTATTAACAGATCAGCTGGATAA
GCCCCTTACGTTTACCAACAGTGTTGAGATAGATCCACAGACCGGAGTTATCTACTTTAC
CGATAGTAGTACTGTTTATCAACGGAGGAATTATATAGGCGTGATTATGAGTGGGGACAG
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CCTTGCGTTCGCAA
CGGGA

QA 3 676 3 676
DS 

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GCAACCTTGCGTTCGCAAACGGGATCGTACTAAGCCAAAACGGCGATTACCTTCTCGTAG
CTGAGACTGCCACGTCCCGAATCCTACGTTACTGGTTCAACGACACTTCGGTTTCTAAGT
CTCACGAGAACTATGAGGTTTTCGCGGAGCAGCTCCCTGGGTTCCCCGACAATATAAAGA
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TCGCCATGTCGAACGCGTGGCTAGGACGCGCCGCCTTGGGTTTGCCGGTGGACTGGATGA
AAGTCCACTCGTATTGGGCCAAGTACAAAGGGAACGGGATGGCCGTGAGGTTGAGCGAAG
ATAGTGGCGTAATATCGGAGGTTTTCGAGGGTACAAATGGAAATAAATGGATCTCCATAA
GTGAGGTGGAGGAGCGTGACGGAACTCTATGGGTTGGATCGGTGAATACTCCTTTCGCTG
GAGTGTATAAAATCTAAAAACAAATCATTCGTACATTAACGATAAAAATAATCTAAATTA
GCGATTTAAATTTATTTTATATGTCAAGTCTTCATAATGAATGTTTAGGATCATAAAAAT
CTAAAATCTTCGTAATACGATATTATAAATGTGGTTTTCAT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

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TCCAAGAAGATCCAATTTAAAGCATGAGAGTGCAAAGAGATACCGAGACTGCTGCGTTTT
TGAACCTTTGAGGATATAGTATGCACTATAAGGTTGACTGTTACTTAAGTAACACCTTGC
TAACAGTTGCAAGTTCACCTCATTAGGGAAATCAGCGAGAAGACGTTCGCAGAAGAAGAT
CGCATTGGAGAACATGAACTGGGTAAGGTTTTTCTCCACACTATTCACCAGTAAACTCTC
CATATCTGACACCGACGACGAAACTGAACGGAGAGAAGAGAAGAGATGGGGCACCGGAAA
AGAAAAGATCGATGACGACTATCGGTCTTCGATTCC


BQ
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AF RR4FO94JQ U 1
AF RR4G876JQ U 1
AF RR4G876TF C 1
BS 1 516 RR4FO94JQ

RD RR4FO94JQ 516 0 0
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CATTAAAGCATGTGAGAGTCATACAGAAACTTGCCTATAGATAAGACCAAGAAGATAATG
CCCAGCTGCACCACCAGGAATTTGTTGGTCAACAGTGGACAACAATGCGCCTTGAGCCTC
TCCAAGAAGATCCAATTTAAAGCATGAGAGTGCAAAGAGATACCGAGACTGCTGCGTTTT
TGAACCTTTGAGGATATAGTATGCACTATAAGGTTGACTGTTACTTAAGTAACACCTTGC
TAACAGTTGCAAGTTCACCTCATTAGGGAAATCAGCGAGAAGACGTTCGCAGAAGAAGAT
CGCATTGGAGAACATGAACTGGGTAAGGTTTTTCTCCACACTATTCACCAGTAAACTCTC
CATATCTGACACCGACGACGAAACTGAACGGAGAGAAGAGAAGAGATGGGGCACCGGAAA
AGAAAAGATCGATGACGACTATCGGTCTTCGATTCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4G876JQ 516 0 0
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CCCAGCTGCACCACCAGGAATTTGTTGGTCAACAGTGGACAACAATGCGCCTTGAGCCTC
TCCAAGAAGATCCAATTTAAAGCATGAGAGTGCAAAGAGATACCGAGACTGCTGCGTTTT
TGAACCTTTGAGGATATAGTATGCACTATAAGGTTGACTGTTACTTAAGTAACACCTTGC
TAACAGTTGCAAGTTCACCTCATTAGGGAAATCAGCGAGAAGACGTTCGCAGAAGAAGAT
CGCATTGGAGAACATGAACTGGGTAAGGTTTTTCTCCACACTATTCACCAGTAAACTCTC
CATATCTGACACCGACGACGAAACTGAACGGAGAGAAGAAAAGAGATGGGGCACCGGAAA
AGAAAAGATCGATGACGACTATCGGTCTTCGATTCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4G876TF 516 0 0
GAGGCAGCAAATGAATAAGCTTTCTACAGCATCAGTATACAAAGATAGTGAAGTAGTAAA
CATTAAAGCATGTGAGAGTCATACAGAAACTTGCCTATAGATAAGACCAAGAAGATAATG
CCCAGCTGCACCACCAGGAATTTGTTGGTCAACAGTGGACAACAATGCGCCTTGAGCCTC
TCCAAGAAGATCCAATTTAAAGCATGAGAGTGCAAAGAGATACCGAGACTGCTGCGTTTT
TGAACCTTTGAGGATATAGTATGCACTATAAGGTTGACTGTTACTTAAGTAACACCTTGC
TAACAGTTGCAAGTTCACCTCATTAGGGAAATCAGCGAGAAGACGTTCGCAGAAGAAGAT
CGCATTGGAGAACATGAACTGGGTAAGGTTTTTCTCCACACTATTCACCAGTAAACTCTC
CATATCTGACACCGACGACGAAACTGAACGGAGAGAAGAGAAGAGATGGGGCACCGGAAA
AGAAAAGATCGATGACGACTATCGGTCTTCGATTCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 3

CO CL3911Contig1 1203 3 13 U
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AAAAATCAGGTGGAGGATTCTATTATCCAAGAATCATTGCTTACTTGCATTGATCTCGGA
AACTCTGATGTTCACCAATCAGCTCTTTTGCTTAAGAAGGCATGTCTGGATAGTGGATTT
TTTTATGTTATAAACCACGGAATAACCAAAAAAGTCATGGAGAAGGCTTTCGAGCAGAGC
CAAAAATTCTTCGCTCTTCCTTTGGAAGAGAAGATGAAAGTGTTGAAAAACGAAAAGCAT
CGTGGCTATACACCTTTGTATGATCAAATCCCTGATCCTGAGAATCAGATCCAAGGGGAT
CACAAAGAAGGTTACTACATTGGGTCAGAAGTTCCCAGAGATGATCCTCAGTGGGATCGG
CCATTCTATGGCCCCAACACGTGGCCTAATCCTGATGTTTTGCCTGGGTGGCGAGAGACA
ATGGAGGAATACCATCAAGAAGCACTGAGGGTTTGTAAG*GCTATTGCAAAACTATTGGC
ATTGTCGCTTAACTTGGATGCAGATTACTTTGATAGCCCTGAGATGCTTGGAAAGCCTAT
TTCAACTTTACGCTTGCTTCACTATGAAGGAAAATCGGATCCCTCAAAAGGAATATATGG
AACTGGAGCACATTCTGATTATGGGATGATTACACTCTTAGCAACAGATGGTGTAATGGG
ACTACAGATATGCAAGGATAGGAACGCTAAGATTCAAAAGTGGGAATATGTACCGTCGAT
TAAAGGAGCAATTGTTGTGAATCTTGGTGATATGATGGAGCGTTGGAGCAATGGTCTTTT
CAGATCCACATTGCACCGGGTTATTTTAAATGGACAGACTCGATATTCCATTCCATTTTT
CGTGGAACCGAATCACGACTGCATAATAGAGTGTCTTCCAACTTGCCAGTCCGAAAACAA
TCTTCCCAAATATCCCGCAATCAAATGTTCGGCGTATCTCACCCAACGTTACGAAGAATC
GCATTTGAAGTTCAGCAGCTACAAAAAACAAACTTGAGTGAAGTTTGTTGTCCACCCCCT
TTCCACTATCCTTGGTTTTCAAGTTGCGTTGATTTTCTTTCCATATTATTAGAGTCGCTT
TCGGTTTGGCTTGTTCTGTTGTTCACCATGGTTATCTATTCTATTAATTCTCCACCAATT
GAT


BQ
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10 10 

AF RR4D305TF U 1
AF RR4E789TF U 1
AF RR4E789JQ C 508
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BS 408 550 RR4D305TF
BS 551 551 RR4E789TF
BS 552 675 RR4D305TF
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BS 689 736 RR4E789TF
BS 737 1203 RR4E789JQ

RD RR4D305TF 688 0 0
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AACTGGAGCACATTCCGATTATGGGATG

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AAAAATCAGGTGGAGGATTCTATTATCCAAGAATCATTGCTTACTTGCATTGATCTCGGA
AACTCTGATGTTCACCAATCAGCTCTTTTGCTTAAGAAGGCATGTCTGGATAGTGGATTT
TTTTATGTTATAAACCACGGAATCAGCAAAAAAGTCATGGAGAAGGCTTTCGAGCAGAGC
CAAAAATTCTTCGCTCTTCCTTTGGAAGAGAAGATGAAAGTGTTGAAAAACGAAAAGCAT
CGTGGCTATACACCTTTGTATGATCAAATCCCTGATCCTGAGAATCAGATTCAAGGGGAT
CACAAAGGAGGTTACTACATTGGGTCAGAAGTTCCCAGAGATGATCCTCAGTGGGATCGG
CCATTCTATGGCCCCAACACGTGGCCTAATCCTGATGTTTTGCCTGGGTGGCGAGAGACA
ATGGAGGAATACCATCAAGAAGCACTGAGGGTTTGTAAGAGCTATTGCAAAACTATTGGC
ATTGTCGCTTAACTTGGATGCAGATTACTTTGATAGCCCTGAGATGCTTGGAAAGCCTAT
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DS 

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AAATGGACAGACTCGATATTCCATTCCATTTTTCGTGGAACCGAATCACGACTGCATAAT
AGAGTGTCTTCCAACTTGCCAGTCCGAAAACAATCTTCCCAAATATCCCGCAATCAAATG
TTCGGCGTATCTCACCCAACGTTACGAAGAATCGCATTTGAAGTTCAGCAGCTACAAAAA
ACAAACTTGAGTGAAGTTTGTTGTCCACCCCCTTTCCACTATCCTTGGTTTTCAAGTTGC
GTTGATTTTCTTTCCATATTATTAGAGTCGCTTTCGGTTTGGCTTGTTCTGTTGTTCACC
ATGGTTATCTATTCTATTAATTCTCCACCAATTGAT

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DS 



AS 1 3

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AACTCCACGGTGCAGTGCTTAAAATCTGTCCCAGAGTTGAAATCTGCATTATCCAATTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A393TF U 292
AF RR4A393TFB U 1
AF RR4CH41TF U 61
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RD RR4A393TF 125 0 0
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CTGCAGATGAGATAGTGAAAGCTCCTGAAAAGGCTATTGTTTTTTACTGAGGATCTACCT
GAAGA

QA 1 125 1 125
DS 

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GGACGCTGACATATGCTCTCTCTCTATTTCATTTCAAGACCACCACCACCATCGAACTCC
GTAGAAGAACAAAGTTGTCTCCTTTTGCCGTCTCTCCAAGCAATCAAAGCAAAGAAGCCT
CCCTCCCTGCAAAGATGCTTACAGTAAGCGTAAAGTGGCAGAAGAAGGTGTTTGAAGGGA
TCGAGATTGATGTGACTCTGCCTCCTTGTGTCTTCAAGGCTCAGCTGTATGATTTGACTG
GTGTCCCACCCGAGAGGCAAAAGATCATGGTCAAAGGTGGCCTCTTGAAGGATGATGCTG
ATTGGTCAGCCATTGGAGTGAAAGATGGTCAAAAACTGATGATGATGGGAACTGCAGATG
AGATAGTGAAAGCTCCTGAAAAGGCTATTGTTTTT*ACTGAGGATCTACCTGAAGAAGAG
CAAGCCACCAATCTGGGTTACAGTGCAGGCCTTGTCAATCTGGGAAACACCTGTTACATG
AACTCCACGGTGCAGTGCTTAAAATCTGTCCCAGAGTTGAAATCTGCATTATCCAATTAT
TCACTTGCTGGACGAAGCAATGATGTGGACCAGACTTCTCACATGCTCACAGTTGCCACA
CGTGAGCTGTTTGGTGATCTTGATAGAAGTGTCAATGCTGTTTCCCCTACCCAGTTCTGG
ATGACACTACGAAAGAAATTTCCTCAGTTTAGTCAGTTGCAGAATGGAATGCACAT
ACA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4CH41TF 709 0 0
GG
AGAAGAATAAAGTTGTCTCCTTTTACCGTCTCTCCAAGCAATCAAAGCAAAGAAGCCTCC
CT****GCAAAGATGCTTACAGTAAGCGTGAAGTGGCAGAAGAAGGTGTTTGAAGGGATC
GAGATTGATGTGACTCTGCCTCCTTATGTCTTCAAGGCTCAGCTGTATGATTTGACTGGA
GTCCCACCCGAGAGGCAAAAGATCATGGTCAAAGGTGGCCTCTTGAAGGATGATGCTGAT
TGGTCAGCCATTGGAGTGAAAGATGGTCAAAAACTGATGATGATGGGAACTGCTGATGAG
ATAGTGAAAGCTCCTAAAAAGGCTATTGTTTTT*GCTGAGGATCTACCTGAAGAAGAGCA
AGCCACCAATCTGGGTTACAGTGCGGGCCTTGTCAATCTAGGCAACACGTGTTACATGAA
CTCCACGGTGCAGTGCTTAAAATCTGTCCCAGAGTTGAAATCTGCATTATCCAATTACTC
ACTTGCTGGACGAAGCAATGATGTGGACCAGACTTCTCACATGCTCACAGTTGCCACACG
TGAGCTATTTGGTGATCTTGATCGAAGTGTCAATGCTGTTTCCCCTACCCAGTTCTGGAT
GACACTACGAAAGAA*TTCCCTCAGTTTAGTCAGTTGCAGAATGGAATGCACATGCAGCA
GATGCTGAGAATGTTGGACGCAACTGTTATACACTCTTTCTCAGTCC

QA 3 709 3 709
DS 



AS 1 3

CO CL3913Contig1 1327 3 17 U
GGACAACTCTCTTGTTTTATCTTTTAAGCCATGGAAGCTCGGATTTTGCAGTCTTCTTCT
TCTTCTCGCTCCTTCTCCCCTGGTTGTTCCATCAACCGACACCGTTTCTCCTCCATTTCA
CAATCTCGGAACCCTCTGGCTCTCTCCGTGAGATTTCCACAAAAGACGACAAGAACAACA
AGGGTTTTATCCATGTCCAAGAAAGATGACGACACCGAGAGCCTCAGTTACAAAGGCTCG
GGTGTTGACATCGATGCCGGGACTGAGCTCGTTAGAAGAATCGCTAAGATGGCTCCTGGA
ATCGGCGGCTTCGGTGGTCTCTTCCCATTAGGAGATTCTTATCTCGTAGCTGGTACGGAT
GGTGTAGGGACAAAGCTTAAGCTTGCCTTTGAGACTGGAATCCATCACACCATTGGAATC
GACTTGGTTGCTATGAGTGTGAATGATATTGTTACTTCCGGTGCTAAGCCTCTCTTCTTC
CTTGATTACTTTGCTACTAGCCGTCTCCATGTCGACCTTGCAGAGAAAGTCATTAAAGGG
ATTGTTGATGGTTGTGGGCAATCAGACTGTGCTCTCTTAGGAGGAGAGACTGCGGAGATG
CCTGACTTTTACGCAGAGGGAGAGTATGATCTCAGTGGGTTTGCAGTTGGGATTGTGAAG
AAAGACTCTGTTATAAACGGGAAGAACATCGTTGCTGGAGATGTCCTTATTGGCCTCCCA
TCTAGTGGTGTTCACTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAAAAGTCGCGGCTCGAAGCGGT
CTTTCGTTGAATGATGAGCTTCCAGGTGGATCAACAACCCTTGGTGAAGCTTTAATGGCA
CCCACTACCATTTATGTCAAGCAGGTACTTGACATAATCAGCAGAGGAGGAGTGAAAGGC
ATAGCTCATATAACAGGAGGAGGTTTCACAGACAACATCCCTCGACCTTCCCTGACGGTT
TAGGTGCTGTTATCCACACTGATGCTTGGGAACTTCCACCGTTGTTCAAATGGATCCAAC
AGCCTGGGAGAATAGAAGACAGTGAGATGAGAAGGACGTTTAACCTGGGAATAGGGATGG
TTTTGGTGGTTAGTCCTGAGGCGGCTTCGAGGATACTTGGAGAAGCCAAGAATGGAGACT
ATGCTGCTTATCGCATTGGAGAGGTTGTAGATCGTGAAGGTGTAACATATCATTAGATCC
ATGTTTGTGTTTTTTTTTACCAACCATCATTGTGTTTTGAATAGGACCGCGCGAACTGTG
TTTCAAGTTTTGTGTCAGAGAAGACGTGACCACTCTGTTTCACAAGTTTTAATCCATTTT
TGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H519TF U 1
AF RR4G503TF U 483
AF RR4H519JQB C 612
BS 1 512 RR4H519TF
BS 513 513 RR4G503TF
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BS 763 764 RR4G503TF
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BS 766 815 RR4G503TF
BS 816 816 RR4H519JQB
BS 817 857 RR4G503TF
BS 858 858 RR4H519JQB
BS 859 899 RR4G503TF
BS 900 900 RR4H519JQB
BS 901 943 RR4G503TF
BS 944 1327 RR4H519JQB

RD RR4H519TF 558 0 0
GGACAACTCTCTTGTTTTATCTTTTAAGCCATGGAAGCTCGGATTTTGCAGTCTTCTTCT
TCTTCTCGCTCCTTCTCCCCTGGTTGTTCCATCAACCGACACCGTTTCTCCTCCATTTCA
CAATCTCGGAACCCTCTGGCTCTCTCCGTGAGATTTCCACAAAAGACGACAAGAACAACA
AGGGTTTTATCCATGTCCAAGAAAGATGACGACACCGAGAGCCTCAGTTACAAAGGCTCG
GGTGTTGACATCGATGCCGGGACTGAGCTCGTTAGAAGAATCGCTAAGATGGCTCCTGGA
ATCGGCGGCTTCGGTGGTCTCTTCCCATTAGGAGATTCTTATCTCGTAGCTGGTACGGAT
GGTGTAGGGACAAAGCTTAAGCTTGCCTTTGAGACTGGAATCCATCACACCATTGGAATC
GACTTGGTTGCTATGAGTGTGAATGATATTGTTACTTCCGGTGCTAAGCCTCTCTTCTTC
CTTGATTACTTTGCTACTAGCCGTCTCCATGTTGACCTTGCAGAGAAAGTCATTAAAGGG
ATTGTTGATGGTTGTGGG

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4G503TF 474 0 0
G
GATTACTTTGCTACTAGCCGTCTCCATGTCGACCTTGCAGAGAAGGTCATTAAAGGGATT
GTTGATGGTTGTGGGCAATCAGACTGTGCTCTCTTAGGAGGAGAGACTGCGGAGATGCCT
GACTTTTACGCAGAGGGAGAGTATGATCTCAGTGGGTTTGCAGTTGGGATTGTGAAGAAA
GACTCTGTTATTAACGGGAAGAACATCGTTGCTGGAGATGTCCTTATTGGCCTCCCATCT
AGTGGTGTTCACTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAAAGGTGGCGGCTCGAAGCGGTCTT
TCGTTGAATGATGAGCTTCCAGGTGGATCAACTACCCTTGGTGAAGCTTTAATGGCACCC
ACTACCATTTATGTGAAGCAGGTACTTGACATAATCAGCAGAGGAGGAGTGAAAGGTATA
GCTCATATAACAGGAGGAGGTTTCACAGACAACATCCCTC
ATGTTTTCCCTGA

QA 2 461 2 461
DS 

RD RR4H519JQB 716 0 0
CGCAGGGGGAGAGTATGATCTCAGTGGGTTTGCAGTTGGGATTGTGAAGAAAGACTCTGT
TATAAACGGGAAGAACATCGTTGCTGGAGATGTCCTTATTGGCCTCCCATCTAGTGGTGT
TCACTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAAAAGTCGTGGCTCGAAGTGGTCTTTCGTTGAA
TGATGAGCTTCCAGGTGGATCAACAACGCTTGGTGAAGCTTTAATGGCACCCACTACCAT
TTATGTCAAGCAGGTACTTGACATAATCAGCAGAGGAGGAGTGAAAGGCATAGCTCATAT
AACAGGAGGAGGTTTCACAGACAACATCCCTCGACCTTCCCTGACGGTTTAGGTGCTGTT
ATCCACACTGATGCTTGGGAACTTCCACCGTTGTTCAAATGGATCCAACAGCCTGGGAGA
ATAGAAGACAGTGAGATGAGAAGGACGTTTAACCTGGGAATAGGGATGGTTTTGGTGGTT
AGTCCTGAGGCGGCTTCGAGGATACTTGGAGAAGCCAAGAATGGAGACTATGCTGCTTAT
CGCATTGGAGAGGTTGTAGATCGTGAAGGTGTAACATATCATTAGATCCATGTTTGTGTT
TTTTTTTACCAACCATCATTGTGTTTTGAATAGGACCGCGCGAACTGTGTTTCAAGTTTT
GTGTCAGAGAAGACGTGACCACTCTGTTTCACAAGTTTTAATCCATTTTTGTTACG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

CO CL3914Contig1 1032 3 4 U
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AGAAGATTCGCGTTACGACGCCGTTTACTCGCTTTCTCTCAACGGGGGACGACAAGCAGC
AGCAGGACCCACCAGAGCCTTTACCCAACAGACCTTTGCGAGGGGAGAGATCTCCTTCCA
ACTCCGCTAAGCCTTCTCAAACCCCTAAACTTGAAAACACACTATCCGACCATGGCTTCC
TCGAACAGTTCAAGCTTGGTGTATCCCATCAGGAAGAGGAGCAAAAGCCCCAGGGGGAGG
AAACAAGCCAGCCGTTACCGGATCCTCAAGACTCGGACGAGATCTTCAAGGCGATGAAGG
AAGGAGGTCTGATTCCCAACGCTGTGGCCATGCTTGATGGGCTTTGCAAAGATGGGCTTG
TACAGGAAGCGATGAAGCTGTTCGGGACGATGCGTGACAAGGGTACAATCCCTGAGGTGG
TTATCTACACTGCTGTTGTGGAGGGCTTTTGCAAGGCTCATAAAATCGAAGACGCTAAGA
GGATTTTCAGGAAGATGCAGACCGTTGGGATTTCTCCGAATGCCTTCAGCTATGGTGTCT
TGGTTCAGGGGTTGTACACTTGCAACATGCTTGACGATGCTGTTGATTTCTGCGTTGAGA
TGCTAGAGTCTGGTCACTCTCCCAACATCCCCACTTTCGTTGGATTGGTTGATGCCTTGT
GCAGAGAAAAGGGCGTCGAGCAAGCCCGGTCGGCTATTGACACGTTCAACCAGAAAGGAT
TTGCGGTTAATTTAAAGACCGTCAAGGAGTTTATGGAGAGGACGGCGCCGTTTCCTTTTC
TGGCTTGGGAAGCCATTTTCAAGAAGAAATCAGTCGAGAAACCTTTTTGATTGTTGCAGT
CTCCATAAGTTTGTACGTGGCTTGTAGTAGGTAGCAACCCAGGGACAAAAAAGTATAATA
AAGACCTGAGGTTTCGGATTATCCAGTTCTGTTTCTTTGGCCTGTGATAGATATTATATC
AAATGGGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV41TF U 72
AF RR4BO26TF U 1
AF RR4BV41JQ C 280
BS 1 732 RR4BO26TF
BS 733 733 RR4BV41JQ
BS 734 765 RR4BO26TF
BS 766 1032 RR4BV41JQ

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CCTTCTCAAACCCCTAAACTTGAAAACACACTATCCGACCATGGCTTCCTCGAACAGTTC
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CCGTTACCGGATCCTCAAGACTCGGA

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DS 

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AGAAGATTCGCGTTACGACGCCGTTTACTCGCTTTCTCTCAACGGGGGACGACAAGCAGC
AGCAGGACCCACCAGAGCCTTTACCCAACAGACCTTTGCGAGGGGAGAGATCTCCTTCCA
ACTCCGCTAAGCCTTCTCAAACCCCTAAACTTGAAAACACACTATCCGACCATGGCTTCC
TCGAACAGTTCAAGCTTGGTGTATCCCATCAGGAAGAGGAGCAAAAGCCCCAGGGGGAGG
AAACAAGCCAGCCGTTACCGGATCCTCAAGACTCGGACGAGATCTTCAAGGCGATGAAGG
AAGGAGGTCTGATTCCCAACGCTGTGGCCATGCTTGATGGGCTTTGCAAAGATGGGCTTG
TACAGGAAGCGATGAAGCTGTTCGGGACGATGCGTGACAAGGGTACAATCCCTGAGGTGG
TTATCTACACTGCTGTTGTGGAGGGCTTTTGCAAGGCTCATAAAATCGAAGACGCTAAGA
GGATTTTCAGGAAGATGCAGACCGTTGGGATTTCTCCGAATGCCTTCAGCTATGGTGTCT
TGGTTCAGGGGTTGTACACTTGCAACATGCTTGACGATGCTGTTGATTTCTGCGTTGAGA
TGCTAGAGTCTGGTCACTCTCCCAACATCCCCACTTTCGTTGGATTGGTTGATGCCTTGT
GCAGAGAAAAGG*CGTCGAGCAAGCCCGGTCGGCTATTGACACGT
CAC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4BV41JQ 753 0 0
AGCAAAAGCCCCAGGGGGAGGAAACAAGCCAGCCGTTACCGGATCCTCAAGACTCGGACG
AGATCTTCAAGGCGATGAAGGAAGGAGGTCTGATTCCCAACGCTGTGGCCATGCTTGATG
GGCTTTGCAAAGATGGGCTTGTACAGGAAGCGATGAAGCTGTTCGGGACGATGCGTGACA
AGGGTACAATCCCTGAGGTGGTTATTTACACTGCTGTTGTGGAGGGCTTTTGCAAGGCTC
ATAAAATCGAAGACGCTAAGAGGATTTTCAGGAAGATGCAGACCGTTGGGATTTCTCCGA
ATGCCTTCAGCTATGGTGTCTTGGTTCAGGGGTTGTACACTTGCAACATGCTTGACGATG
CTGTTGATTTTTGCGTTGAGATGCTAGAGTCTGGTCACTCTCCCAACATCCCCACTTTCG
TTGGATTGGTTGATGCCTTGTGCAGAGAAAAGGGCGTCGAGCAAGCCCGGTCGGCTATTG
ACACGTTCAACCAGAAAGGATTTGCGGTTAATTTAAAGACCGTCAAGGAGTTTATGGAGA
GGACGGCGCCGTTTCCTTTTCTGGCTTGGGAAGCCATTTTCAAGAAGAAATCAGTCGAGA
AACCTTTTTGATTGTTGCAGTCTCCATAAGTTTGTACGTGGCTTGTAGTAGGTAGCAACC
CAGGGACAAAAAAGTATAATAAAGACCTGAGGTTTCGGATTATCCAGTTCTGTTTCTTTG
GCCTGTGATAGATATTATATCAAATGGGTTACG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3915Contig1 1213 3 6 U
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ACCTCAATCACACTTTAAATTTACAAAAGACAGAACAAAAAAACACCATAATTCTATCAA
GATGGAAGTTCAGAGAAATCAAGATGATCAAAAGGGCAACAAACAGACAAAACATATAAG
ATTACCAAAAATATCTGGACTTTTTATTAGAATGAAGAGGAGGATGAGTGAAAGTAGTAG
TAATTTGTGGGACAGTGAAGCCACCATCATCATACCATCTCTTGTTCTGTCCTTGTTGTT
TCATGTTTTGTATTGGAGCATAAGTCTTCACTTCTGGTAATGTTTCTCTGTTGTACTTCC
CAAACTGAATATTGTTGTTTTTGTTTTCCTGAAAAAAGTACTGATTTGTGTATGAAGAAG
GAAGAGTTTGTGGAATCTGAGGGACCCAAATCCCCAAATTCCCAGATGGAAATGACACTG
TATTGGGGTTGTTTCTCTTAGTGCTGTCATCGTCTGCTTCTATATATGGTAACACTCCAT
CATTATCGCCACTCTTAGAGAAACCAAAAGGAGGAAGCGAGGAATCAAGGAAGTCCTCAA
CGTGCCAACCAGGTAACGTATCGATCAAGTACTCTGAAATCGTGCTTGTGGATCCCCACT
GACTCACCTCTGAGTCGCCACCGATCTTTGAAGAAGGTTGGATCTTGGAGTTGTTGCTCT
GAGGAGCTGAGAGAGGTTTCTTGGAAGGGACAGAGCAGTCTTGACTACTAGAAGAAGAAG
ATTCTGAAGTTGGTCTGTAAACAGCAGAGGAAGCAGAGAGCTTAACCCCTGTGAGAAGAA
ACCTATCATGTTTCTTCTTATGCTCGTTGGCAGAGTGTATCGATGCATCACAGTCGTTGC
ATAAGATAGCCCTATCTTGTTGACAAAACAGCAAAGCTTTTTTTCTCCTGACAGATGTCG
CAGATAGGAGAGTCGTTGTTAGAGGAAGAAGGGTATAGGAGAGAGAAACGGAGATGTTTG
GAGGCAAGCTTGTTAGCGTGGTGAACTTGCTGGTAGCAGCCGCTACACAAAGACGCTTCG
TCGGCGGTGCAAAACACCGACGCTTCTTCTTTATCGCAGACGTCGCACCTGATCTTCATC
AAACGATCGAGTAAGAGAGATAAAAGAGAGAGGTTCTTGAAAAGGATAGGAAAGAAGATG
TGAGATTTTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE48JQ U 45
AF RR4EX57JQ U 1
AF RR4GE48TF C 501
BS 1 347 RR4EX57JQ
BS 348 348 RR4GE48JQ
BS 349 547 RR4EX57JQ
BS 548 548 RR4GE48JQ
BS 549 741 RR4EX57JQ
BS 742 1213 RR4GE48TF

RD RR4GE48JQ 637 0 0
CAAAGATTAAACCGCAACCTCAATCACACTTTAAATTTACAAAAGACAGAACAAAAAAAC
ACCATAATTCTATCAAGATGGAAGTTCAGAGAAATCAAGATGATCAAAAGGGCAACAAAC
AGACAAAACATATAAGATTACCAAAAATATCTGGACTTTTTATTAGAATGAAGAGGAGGA
TGAGTGAAAGTAGTAGTAATTTGTGGGACAGTGAAGCCACCATCATCATACCATCTCTTG
TTCTGTCCTTGTTGTTTCATGTTTTGTATTGGAGCATAAGTCTTCACTTCTGGTAATGTT
TCTCTGTTGTACTTCCCAAACTGAATATTGTTGTTTTTGTTTTCCTGAGAAAAGTACTGA
TTTGTGTATGAAGAAGGAAGAGTTTGTGGAATCTGAGGGACCCAAATCCCCAAATTCGCA
GATGGAAATGACACTGTATTGTGGTTGTTTCTCTTAGTGCTGTCATCGTCTGCTTCTATA
TATGGTAACACTCCATCATTATCGCCACTCTTAGAGAAACCAAAAGGAGGAAGCGAGGAA
TCAAGGAAGTCCTCAACGTGCCAACCAGGTAACGTATCGATCAAGTACTCTGAAATCGTG
CTTGTGGATCCCCACTGACTCACCTCTGAGTCGCCAC

QA 1 637 1 637
DS 

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ACCTCAATCACACTTTAAATTTACAAAAGACAGAACAAAAAAACACCATAATTCTATCAA
GATGGAAGTTCAGAGAAATCAAGATGATCAAAAGGGCAACAAACAGACAAAACATATAAG
ATTACCAAAAATATCTGGACTTTTTATTAGAATGAAGAGGAGGATGAGTGAAAGTAGTAG
TAATTTGTGGGACAGTGAAGCCACCATCATCATACCATCTCTTGTTCTGTCCTTGTTGTT
TCATGTTTTGTATTGGAGCATAAGTCTTCACTTCTGGTAATGTTTCTTTGTTGTACTTCC
CAAACTGAATATTGTTGTTTTTGTTTTCCTGAAAAAAGTACTGATTTGTGTATGAAGAAG
GAAGAGTTTGTGGAATCTGAGGGACCCAAATCCCCAAATTCCCAGATGGAAATGACACTG
TATTGGGGTTGTTTCTCTTAGTGCTGTCATCGTCTGCTTCTATATATGGTAACACTCCAT
CATTATCACCACTCTTAGAGAAACCAAAAGGAGGAAGCGAGGAATCAAGGAAGTCCTCAA
CGTGCCAACCAGGTAACGTATCGATCAAGTACTCTGAAATCGTGCTTGTGGATCCCCACT
GACTCACCTCTGAGTCGCCACCGATCTTTGAAGAAGGTTGGATCTTGGAGTTGTTGCTCT
GAGGAGCTGAGAGAGGTTTCT

QA 1 741 1 741
DS 

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AAACCAAAAGGAGGAAGCGAGGAATCAAGGAAGTCCTCAACGTGCCAACCAGGTAACGTA
TCGATCAAGTACTCTGAAATCGTGCTTGTGGATCCCCACTGACTCACCTCTGAGTCGCCA
CCGATCTTTGAAGAAGGTTGGATCTTGGAGTTGTTGCTCTGAGGAGCTGAGAGAGGTTTC
TTGGAAGGGACAGAGCAGTCTTGACTACTAGAAGAAGAAGATTCTGAAGTTGGTCTGTAA
ACAGCAGAGGAAGCAGAGAGCTTAACCCCTGTGAGAAGAAACCTATCATGTTTCTTCTTA
TGCTCGTTGGCAGAGTGTATCGATGCATCACAGTCGTTGCATAAGATAGCCCTATCTTGT
TGACAAAACAGCAAAGCTTTTTTTCTCCTGACAGATGTCGCAGATAGGAGAGTCGTTGTT
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TAAAAGAGAGAGGTTCTTGAAAAGGATAGGAAAGAAGATGTGAGATTTTGTCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

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TTTTAGGTTTCTTCAAAGCAAAGCGAGGATCCAGATTTGGCTCTTTGAGCAGAAAGATTT
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AGAAACACTCTCGTGGATGGTGTCTTTTCGATTATCCCCCAAGCATTTGCTTAATTGAGA
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AAAAAGGTTTGAGAAATTATGGAGTTTCGTGGAATCTAAAGGATGTTATTGCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4BB55TF U 1
AF RR4BC80JQ C 1
AF RR4BC80TF U 1
BS 1 534 RR4BB55TF

RD RR4BB55TF 534 0 0
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AGAAACACTCTCGTGGATGGTGTCTTTTCGATTATCCCCCAAGCATTTGCTTAATTGAGA
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QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4BC80JQ 534 0 0
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TTTTAGGTTTCTTCAAAGCAAAGCGAGGATCCAGATTTGGCTCTTTGAGCAGAAAGATTT
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QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4BC80TF 534 0 0
GGGTCTTTGGTGTTGATTTAGGGTTTAAAGAGTTGGGAAGATTGAGAGAGAATTGAGAGA
GTCGGGAGCAATGGCGAGCACCAAAGTTCAAAGGATTATGACCCAACCTATCAACTTGAT
TTTTAGGTTTCTTCAAAGCAAAGCGAGGATCCAGATTTGGCTCTTTGAGCAGAAAGATTT
GAGGATTGAAGGAAGAATCACTGGGTTCGACGAATACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGC
TGAAGAAGTGAGCATCAAGAAGAACACCAGAAAGCAACTTGGAAGGATTCTACTTAAAGG
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AGAAACACTCTCGTGGATGGTGTCTTTTCGATTATCCCCCAAGCATTTGCTTAATTGAGA
CTCTTCTTCTGTAACCGACAATGGTTTCTTCTCTTCTTTATCGTGTAATTGCAATGTAGT
AAAAAGGTTTGAGAAATTATGGAGTTTCGTGGAATCTAAAGGATGTTATTGCCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 3

CO CL3917Contig1 873 3 8 U
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ATCTTCCCGGACAGCAACAAGAGCTCGTGACACAAGTGGCTAAAGCAGCGAAAGGACCTG
TTTTTCTAGTTGTCATGTCCGGTGGAGGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G407TF U 1
AF RR4G623TF U 90
AF RR4EV43TF U 221
BS 1 455 RR4G407TF
BS 456 456 RR4G623TF
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RD RR4G407TF 777 0 0
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ACGGGAAACCGACATGTGCTGATCCAGATCTCCTCTCTGGTGTTATCCGCGGCGAATGGA
AGTTAAACGGGTACATTGTTTCGGACTGTGACTCGGTTGATGTGTTGTACAAGAACCAGC
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ACTGTGGTTACTTCTTGGGTGACCATACAGAGGCAGCGGTTAAAGCCGGTTTGGTAAACG
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TCGACGGAGATCCAAAGAAACAGATCTACGGAGGGCTTGGTCCTAAAGACGTTTGCACGC
CCGCTAATCAAGAGCTAGCCGCAGAAGCAGCGAGATAAGGCATTGTCTTACTGAAAAACA
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CGAACGTCACAAAGACTATGATAGGTAACTACGAAGGCACGCCGTGTAAGTACACAACAC
CGCTTCAGGGATTAGCCGGGACGGTACACACAACGTATCTACCGGGCTGCTCTAATGTAG
CATGCGCGGTGGCGGATGTAGATGGAGCCACGAAGCTAGCAGCAGCTTCTGACGCGACGG
TTCTCGTTATAG*TGCAGATCAATCTATCGAGGCAGAGAGCCGTGACAGAGTCGATC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4G623TF 638 0 0
G
TCCTCTCTGGTGTTATCCGCGGCGAATGGAAGTTAAACGGGTACATTGTTTCGTACTGTG
ACTCGGTTGATGTGTTGTACAAGAACCAGCACTATACCAAGACTCCAGAGGAAGCTGCAG
CTATATCTATCAACGCAGGTTTGGACTTGAACTGTGGTTACTTCTTGGGTGACCATACAG
AGGCAGCGGTTAAAGCCGGTTTGGTAAACGAAGCAGCTATCGACAAAGCCATTACAAACA
ACTTCTTAACCCTTATGCGATTAGGATTTTTCGACGGAGATCCAAAGAAACAGATCTACG
GAGGGCTTGGTCCTAAAGACGTTTGCACGCCCGCTAATCAAGAGCTAGCCGCAGAAGCAG
CGAGACAAGGCATTGTCTTACTAAAAAACACTGGCGCCTTACCGCTTTCTCCTAAAGCGA
TCAAAACGTTAGCAGTGATCGGACCAAACGCGAACGTCACAAAGACAATGATAGGTAACT
ACGAAGGCACGCCGTGTAAGTACACAACACCGCTTCAGGGATTAGCCGGGACGGTACACA
CAACGTATCTACCGGGCTGCTCTAATGTAGCATGCGCGGTGGCGGATGTAGATGGAGCCA
CGAAGCTAGCAGCAGCTTCTGACGCGACGGTTCTCGT

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR4EV43TF 653 0 0
G
AACGCAGGTTTGGACTTGAACTGTGGTTACTTCTTGGGTGACCATACAGAGGCAGCGGTT
AAAGCCGGTTTGGTAAACGAAGCAACTATCGACAAAGCCATTACAAACAACTTCTTAACC
CTTATGCGATTAGGATTTTTCGACGGAGATCCAAAGAAACAGATCTACGGAGGGCTTGGT
CCTAAAGACGTTTGCACGCCCGCTAATCAAGAGCTAGCCGCAGAAGCAGCGAGACAAGGC
ATTGTCTTACTGAAAAACACTGGCGCCTTACCGCTTTCTCCTAAAGCGATCAAAACGCTA
GCAGTGATCGGACCAAACGCGAACGTCACAAAGACAATGATAGGTAACTACGAAGGCACG
CCGTGTAAGTACACAACACCGCTTCAGGGATTAGCCGGGACGGTACACACAACGTATCTA
CCGGGCTGCTCTAATGTAGCATGCGCGGTGGCGGATGTAGATGGAGCCACGAAGCTAGCA
GCAGCTTCTGACGCGACGGTTCTCGTTATAGGTGCAGATCAATCTATCGAGGCAGAGAGC
CGTGATAGAGTCGATCAGAATCTTCCCGGACAGCAACAAGAGCTCGTGACACAAGTGGCT
AAAGCAGCGAAAGGACCTGTTTTTCTAGTTGTCATGTCCGGTGGAGGTTTTG

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 3

CO CL3918Contig1 426 3 2 U
GGAAGAAACACAAACATTGTTTATGCTCTCTCTTATCAAATATTGAACCATGAAGTCTCA
TGCTTTATTTATTGTCTTTTGTGTTGTTTTATTGCTCATTTTGAGTTATTCTAAAGAAGC
AGAAGCTGCTCCCAACAGGTGCCCGGCTAAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGAAATGA
TGGAATACAAAGTTGTCTAAGGGATTTCAAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCACATTATTGA
TCAGTGTAGTAAATGTCAGGACGCTAAATCCCCAAATGGCGTAGTTAGACGTGATTGTCA
CTGCAGTTACCCTTCTACTGTACCTTGCTTATAAATTCATTGCTGGAGTCAATTATGATA
TCTGATATAAAAATATATTTTAATTTTGTTTCATTAATAATAATAGAGAAATAAATTTTA
TAATTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD45JQ C 1
AF RR4CD45TF U 1
AF RR4DQ21TF U 1
BS 1 420 RR4CD45TF
BS 421 426 RR4DQ21TF

RD RR4CD45JQ 330 0 0
GGAAGAAACACAAACATTGTTTATGCTCTCTCTTATCAAATATTGAACCATGAAGTCTCA
TGCTTTATTTATTGTCTTTTGTGTTGTTTTATTGCTCATTTTGAGTTATTCTAAAGAAGC
AGAAGCTGCTCCCAACAGGTGCCCGGCTAAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGAAATGA
TGGAATACAAAGTTGTCTAAGGGATTTCAAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCACATTATTGA
TCAGTGTAGTAAATGTCAGGACGCTAATTCCCCAAATGGCGTAGTTAGACGTGATTGTCA
CTGCAGTTACCCTTCTACTGTACCTTGCTT

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4CD45TF 421 0 0
GGAAGAAACACAAACATTGTTTATGCTCTCTCTTATCAAATATTGAACCATGAAGTCTCA
TGCTTTATTTATTGTCTTTTGTGTTGTTTTATTGCTCATTTTGAGTTATTCTAAAGAAGC
AGAAGCTGCTCCCAACAGGTGCCCGGCTAAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGAAATGA
TGGAATACAAAGTTGTCTAAGGGATTTCAAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCACATTATTGA
TCAGTGTAGTAAATGTCAGGACGCTAAATCCCCAAATGGCGTAGTTAGACGTGATTGTCA
CTGCAGTTACCCTTCTACTGTACCTTGCTTATAAATTCATTGCTGGAGTCAATTATGATA
TCTGATATAAAAATATATTTTAATTTTGTTTCATTAATAATAATAGAGAAATAAATTTTA
C

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4DQ21TF 426 0 0
GGAAGAAACACAAACATTGTTTATGCTCTCTCTTATCAGATATTGAACCATGAAGTCTCA
TGCTTTATTTATTGTCTTTTGTGTTGTTTTATTGCTCATTTTGAGTTATTCTAAAGAAGC
AGAAGCTGCTCCCAACAGGTGCCCGGCTAAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGAAATGA
TGGAATACAAAGTTGTCTAAGGGATTTCAAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCACATTATTGA
TCAGTGTAGTAAATGTCAGGACGCTAAATCCCCAAATGGCGTAGTTAGACGTGATTGTCA
CTGCAGTTACCCTTCTACTGTACCTTGCTTATAAATTCATTGCTGGAGTCAATTATGATA
TCTGATATAAAAATATATTTTAATTTTGTTTCATTAATAATAATAGAGAAATAAATTTTA
TAATTT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL3919Contig1 755 2 2 U
AGGTTCGATGATTCGTCTAATTACGGAGGCTACGCTACTTTCAACCTCGCGGGTTACAGC
TCGAGCCAGCTCAGGGAGCTGAAGAAGCGCTTTACCTCGGAGCTCGAGCAGATTCGGATC
CTCAGGGAGCGGATCGAGTCGGGGACCTTCGAGACTCGGCAAACGGAGGTATCCGCCGTT
CGTTCGGCTCCGGCCGGTGAGACGAGCGACCTCGTGCTGAAGAAGCAGAAACCGAAGAAG
CGATGCAATCCATTCCCTGCCGAAGATACTCACCCGAAGCGGGTTTCGAACCCGGAGTCG
GAGAAAGCGCTTGCCGCTATGCTTAATACTTGCGGACAGATGTTGGTTAAGCTGATGAAG
CACAAGTGGGCCTGGGTGTTCAATACCCCTGTCGATGTGGTCGGTTTAGGGCTTCATGAT
TACCATCTCATCGTGAAGAAGCCTATGGATCTCGGCACGGTCAAGTTGAATCTCGAGAAG
GGGTTTTACGTCTCTCCGCCCGATTTCGCGACCGATGTGAGACTGACGTTTAGGAACGCG
ATGGCGTATAACCCCAAGGGGCAAGATGTGTACTTTATGGCGGAGAAGCTTCTTGATCAG
TTTGATGTAATGTTCAATCCTGCTTTCAGAAATTCGAAGCTCAGCGGGTGAAACTCGCTG
GCTCTCGTCGTCTCGTTTGAGCATGAGTGAAGCAAAGACAGTGGAGTCAGACTACTCCCG
TGGAGGCTATGTGGGGAGAGGACTGAACAGATCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H449TF U 1
AF RR4H462TF U 1
BS 1 590 RR4H449TF
BS 591 755 RR4H462TF

RD RR4H449TF 590 0 0
AGGTTCGATGATTCGTCTAATTACGGAGGCTACGCTACTTTCAACCTCGCGGGTTACAGC
TCGAGCCAGCTCAGGGAGCTGAAGAAGCGCTTTACCTCGGAGCTCGAGCAGATTCGGATC
CTCAGGGAGCGGATCGAGTCGGGGACCTTCGAGACTCGGCAAACGGAGGTATCCGCCGTT
CGTTCGGCTCCGGCCGGTGAGACGAGCGACCTCGTGCTGAAGAAGCAGAAACCGAAGAAG
CGATGCAATCCATTCCCTGCCGAAGATACTCACCCGAAGCGGGTTTCGAACCCGGAGTCG
GAGAAAGCGCTTGCCGCTATGCTTAATACTTGCGGACAGATGTTGGTTAAGCTGATGAAG
CACAAGTGGGCCTGGGTGTTCAATACCCCTGTCGATGTGGTCGGTTTAGGGCTTCATGAT
TACCATCTCATCGTGAAGAAGCCTATGGATCTCGGCACGGTCAAGTTGAATCTCGAGAAG
GGGTTTTACGTCTCTCCGCCCGATTTCGCGACCGATGTGAGACTGACGTTTAGGAACGCG
ATGGCGTATAACCCCAAGGGGCAAGATGTGTACTTTATGGCGGAGAAGCT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4H462TF 755 0 0
AGGTTCGATGATTCGTCTAATTACGGAGGCTACGCTACTTTCAACCTCGCGGGTTACAGC
TCGAGCCAGCTCAGGGAGCTGAAGAAGCGCTTTACCTCGGAGCTCGAGCAGATTCGGATC
CTCAGGGAGCGGATCGAGTCGGGGACCTTCGAGACTCGGCAAACGGAGGTATCCGCCGTT
CGTTCGGCTCCGGCCGGTGAGACGAGCGACCTCGTGCTGAAGAAGCAGAAACCGAAGAAG
CGATGCAATCCATTCCCTGCCGAAGATACTCACCCGAAGCGGGTTTCGAACCCGGAGTCG
GAGAAAGCGCTTGCCGCTATGCTTAATACTTGCGGACAGATGTTGGTTAAGCTGATGAAG
CACAAGTGGGCCTGGGTGTTCAATACCCCTGTCGATGTGGTCGGTTTAGGGCTTCATGAT
TACCATCTCATCGTGAAGAAGCCTATGGATCTCGGCACGGTCAAGTTGAATCTCGAGAAG
GGGTTTTACGTCTCTCCGCCCGATTTCGCGACCGATGTGAGACTGACGTTTAGGAACGCG
ATGGCGTATAACCCCAAGGGGCAAGATGTGTACTTTATGGCGGAGAAGCTTCTTGATCAG
TTTGATGTAATGTTCAATCCTGCTTTCAGAAATTCGAAGCTCAGCGGGTGAAACTCGCTG
GCTCTCGTCGTCTCGTTTGAGCATGAGTGAAGCAAAGACAGTGGAGTCAGACTACTCCCG
TGGAGGCTATGTGGGGAGAGGACTGAACAGATCTC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL3920Contig1 1004 3 7 U
GTTGGGTTTCTCCGTTGGAAGCTTTGAGATTGACGTGGTTGGAGGGTGGAGATACATGTA
TGGATTCGGTACCCCTGTTGCTTTGCTGATGGGACTAGGCATGTGGAGCCTCCCTCCGTC
TCCTCGCTGGTTGCTTCTCAGAGCTGTTCAAGGTAAAGGCCCTTTACAGGAATACAAAGA
GAGAGCCATGCTTGCCCTCAGCAAGCTACGCGGCAGACCTCCCGGTGATAAACTGTCGGA
GAAGCTGGTGGATGATGCCTTGTTGTCTGTGGAAACGGCTTACGAAGATGAGAAGTCTGG
TGGGAACTTCTTGGAAGTGTTCCAAGGGCCTAACTTGAAAGCTTTGACTATTGGTGGAGG
TTTAGTCCTTTTTCAGCAGATAACTGGACAGCCAAGTGTTCTTTACTACGCGGGTTCGAT
TCTTCAGACTGCTGGATTCTCTGCTGCTGCTGATGCAACTAGGGTCTCTGTTATTATCGG
TGTCTTCAAGTTACTGATGACGTGGGTGGCTGTTGCCAAAGTTGATGATCTTGGAAGACG
TCCCTTACTGATTGGAGGCGTCAGCGGCATTGCGTTGTCTTTGTTTCTACTGTCAGCATA
CTACAAGTTTCTCGGAAGTTTTCCTCTTGTCGCAGTTGGTGCACTGCTTCTCTATGTTGG
TTGCTACCAGATCTCATTCGGACCAATCAGCTGGCTAATGGTGTCGGAGATTTTCCCGCT
TCGCACAAGACGGAGAGGGATCAGTCTTGCAGTTCTTACAAACTTCGGCTCCAATGCCAT
TGTGACCTTTGCGTTTTCACCCTTAAAGGAATATCTTGGAGCAGAGAATCTCTTCCTTCT
CTTTGGAGCTATAGCATTGGTATCACTCTTGTTTGTAGTTCTAGTAGTTCCTGAGACCAA
GGGTCTCAGCTTAGAAGAGATTGAGTCTAAAATCTTGAAGTGAAATGTTGAGAAAAACAC
ATGTATGTTATGTAAACTCACAACAAATCACAATACAATCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E766TF U 1
AF RR4E871TF U 166
AF RR4GO96JQ C 369
BS 1 178 RR4E766TF
BS 179 179 RR4E871TF
BS 180 539 RR4E766TF
BS 540 540 RR4E871TF
BS 541 605 RR4E766TF
BS 606 903 RR4E871TF
BS 904 1004 RR4GO96JQ

RD RR4E766TF 605 0 0
GTTGGGTTTCTCCGTTGGAAGCTTTGAGATTGACGTGGTTGGAGGGTGGAGATACATGTA
TGGATTCGGTACCCCTGTTGCTTTGCTGATGGGACTAGGCATGTGGAGCCTCCCTCCGTC
TCCTCGCTGGTTGCTTCTCAGAGCTGTTCAAGGTAAAGGCCCTTTACAGGAATACAAATA
GAGAGCCATGCTTGCCCTCAGCAAGCTACGCGGCAGACCTCCCGGTGATAAACTGTCGGA
GAAGCTGGTGGATGATGCCTTGTTGTCTGTGGAAACGGCTTACGAAGATGAGAAGTCTGG
TGGGAACTTCTTGGAAGTGTTCCAAGGGCCTAACTTGAAAGCTTTGACTATTGGTGGAGG
TTTAGTCCTTTTTCAGCAGATAACTGGACAGCCAAGTGTTCTTTACTACGCGGGTTCGAT
TCTTCAGACTGCTGGATTCTCTGCTGCTGCTGATGCAACTAGGGTCTCTGTTATTATCGG
TGTCTTCAAGTTACTGATGACGTGGGTGGCTGTTGCCAAAGTTGATGATCTTGGAAGACC
TCCCTTACTGATTGGAGGCGTCAGCGGCATTGCGTTGTCTTTGTTTCTACTGTCAGCATA
CTACA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4E871TF 745 0 0
G
CAGGAGTACAAAGAGAGAGCCATGCTTGCTCTCAGCAAGCTACGCGGCAGACCTCCCGGT
GATAAACTGTCGGAGAAGCTGGTGGATGATGCCTTGTTGTCTGTGGAAACGGCTTACGAA
GATGAGAAGTCTGGTGGGAACTTCTTGGAAGTGTTCCAAGGGCCTAACTTGAAAGCTTTG
ACTATTGGTGGAGGTTTAGTCCTTTTTCAGCAGATAACTGGACAGCCAAGTGTTCTTTAC
TACGCGGGTTCGATTCTTCAGACTGCTGGATTCTCTGCTGCTGCTGATGCAACCAGAGTC
TCTGTTATCATTGGTGTCTTCAAGTTACTGATGACATGGGTGGCTGTTGCCAAAGTTGAT
GATCTTGGAAGACGTCCCTTACTGATTGGAGGCGTCAGTGGCATTGCGTTGTCTTTGTTT
CTACTGTCAGCATACTACAAGTTTCTCGGAAGTTTTCCTCTTGTCGCAGTTGGTGCACTG
CTTCTCTATGTTGGTTGCTACCAGATCTCATTCGGACCAATCAGCTGGCTAATGGTGTCG
GAGATTTTCCCGCTTCGCACAAGACGGAGAGGGATCAGTCTTGCAGTTCTTACAAACTTC
GGCTCCAATGCCATTGTGACCTTTGCGTTTTCACCCTTAAAGGAATATCTTGGAGCAGAG
AATCTCTTCCTTCTCTTTGGAGCTATAGCATTGGTATCACTCTTGTTTGTAGTTCTAGTA
GTTCCTGAGACCAAGGG
CTCAGCT

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR4GO96JQ 636 0 0
TTTTTCAGCAGATAACTGGACAGCCAAGTGTTCTTTACTACGCGGGTTCGATTCTTCAGA
CTGCTGGATTCTCTGCTGCTGCTGATGCAACTAGGGTCTCTGTTATTATCGGTGTCTTCA
AGTTACTGATGACGTGGGTGGCTGTTGCCAAAGTTGATGATCTTGGAAGACGTCCCTTAC
TGATTGGAGGCGTCAGCGGCATTGCGTTGTCTTTGTTTCTACTGTCAGCATACTACAAGT
TTCTCGGAAGTTTTCCTCTTGTCGCAGTTGGTGCACTGCTTCTCTATGTTGGTTGCTACC
AGATCTCATTCGGACCAATCAGCTGGCTAATGGTGTCGGAGATTTTCCCGCTTCGCACAA
GAGGGAGAGGGATCAGTCTTGCAGTTCTTACAAACTTTGGCTCCAATGCCATTGTGACCT
TTGCGTTTTCACCCTTAAAGGAATATCTTGGAGCAGAGAATCTCTTCCTTCTCTTTGGAG
CTATATCCTTGGTATCACTCTTGTTTGTAGTTCTAGTAGTTCCTGAGACCAAGGGTCTCA
GCTTAGAAGAGATTGAGTCTAAAATCTTGAAGTGAAATGTTGAGAAAAACACATGTATGT
TATGTAAACTCACAACAAATCACAATACAATCATTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 3

CO CL3921Contig1 767 3 2 U
AATTAGTTCAACCTGTAACATGCCAGGCCGTACTTCCTTGTTATTATTATCATTTCAACA
ACAACAACACAACACAAAAGTCGCTGATCAAATTTTCACCACAAGAATACTTTATTTTAA
TTATTCGAAACTAAAAGAAGAAGAAAAAAACACAAAATGTCATCATAAGAATTATTTAAA
CCGAAATAGACCGCAATCACAAGCAGAAAAGTCTTCAAATCATAAAACCAAACCGGAGAA
AACCAAACATTACTAAATGTGTTGATTTTAACCGAGGATGGTGGTTTCAGCAATCATGGA
CGTAACGACATAAGGATCCATGTTAGAAGCCGGCCTTCTGTCCTCGAAGTAACCTTTGCC
TTCTTTCTCAGTGTCACGTCCCACTCTCACCGAAGCTCCGCGGTTCGCCACTCCCCAAGA
GAACGTGTTGATGTCAGCGGTCTCGTGCTTCCCCGTGAGACGACGCTCGTTGCCTTCACC
GTAAGCAGCGATGTGCTCCTTGTGTTTCACCTGAAGCTTCTCTATTGCTTTCTTGATCAC
CGCTAATCCTCCGTCGTTCCTCATCGACTTCGTACTGTAGTTGCAGTGAGCTCCAGCTCC
GTTCCAGTCACCCGGGACTGGTTTTGGGTCGAAGCTGACATTTACACCAGAGATCTCAGT
GATCCTCTCGAGAAGGAATCTAGCGACCCAGACTTGATCACCAGCGCTAATACCTTCAAC
TGGACCGACTTGGAATTCCCACTGGCCAGGCATGACTCTCCATTGAC


BQ
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AF RR4DL55JQ U 1
AF RR4DL55TF C 1
AF RR4FY48JQ U 99
BS 1 279 RR4DL55JQ
BS 280 767 RR4FY48JQ

RD RR4DL55JQ 280 0 0
AATTAGTTCAACCTGTAACATGCCAGGCCGTACTTCCTTGTTATTATTATCATTTCAACA
ACAACAACACAACACAAAAGTCGCTGATCAAATTTTCACCACAAGAATACTTTATTTTAA
TTATTCGAAACTAAAAGAAGAAGAAAAAAACACAAAATGTCATCATAAGAATTATTTAAA
CCGAAATAGACCGCAATCACAAGCAGAAAAGTCTTCAAATCATAAAACCAAACCGGAGAA
AACCAAACATTACTAAATGTGTTGATTTTAACCGAGGAT
C

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR4DL55TF 280 0 0
AATTAGTTCAACCTGTAACATGCCAGGCCGTACTTCCTTGTTATTATTATCATTTCAACA
ACAACAACACAACACAAAAGTCGCTGATCAAATTTTCACCACAAGAATACTTTATTTTAA
TTATTCGAAACTAAAAGAAGAAGAAAAAAACACAAAATGTCATCATAAGAATTATTTAAA
CCGAAATAGACCGCAATCACAAGCAGAAAAGTCTTCAAATCATAAAACCAAACCGGAGAA
AACCAAACATTACTAAATGTGTTGATTTTAACCGAGGAT
C

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR4FY48JQ 669 0 0
CCACAAGAATACTTTATTTTAATTATTCGAAACTAAAAGAAGAAGAAAAAAACACAAAAT
GTCATCATAAGAATTATTTAAACCGAAATAGACCGCAATCACAAGCAGAAAAGTCTTCAA
ATCATAAAACCAAACCGGAGAAAACCAAACATTACTAAATGTGTTGATTTTAACCGAGGA
TGGTGGTTTCAGCAATCATGGACGTAACGACATAAGGATCCATGTTAGAAGCCGGCCTTC
TGTCCTCGAAGTAACCTTTGCCTTCTTTCTCAGTGTCACGTCCCACTCTCACCGAAGCTC
CGCGGTTCGCCACTCCCCAAGAGAACGTGTTGATGTCAGCGGTCTCGTGCTTCCCCGTGA
GACGACGCTCGTTGCCTTCACCGTAAGCAGCGATGTGCTCCTTGTGTTTCACCTGAAGCT
TCTCTATTGCTTTCTTGATCACCGCTAATCCTCCGTCGTTCCTCATCGACTTCGTACTGT
AGTTGCAGTGAGCTCCAGCTCCGTTCCAGTCACCCGGGACTGGTTTTGGGTCGAAGCTGA
CATTTACACCAGAGATCTCAGTGATCCTCTCGAGAAGGAATCTAGCGACCCAGACTTGAT
CACCAGCGCTAATACCTTCAACTGGACCGACTTGGAATTCCCACTGGCCAGGCATGACTC
TCCATTGAC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL3922Contig1 1142 3 8 U
GCTAGATGCGTCTATGATGCTTTTGCTGATTACCAGCTGCCAGAACTCCTGAGGACTCCG
TTACAGTCTCTATGTCTACAAATCAAAAGCTTAGGGCTTGGAAGCATTTCAGAGTTCCTT
TCTAGAGCATTGCAACCTCCTGAAGCTTTATCAGTCCAGAATGCTGTTGAGTATCTAAAG
CTTATTGGTGCTCTTGATGACAACGAAAATTTAACAGCTTTAGGAAAAAAATTGTCAATG
CTTCCTGTGGAGCCTAAACTTGGAAAGATGCTTATTTTAGGGGCTATCTTCAACTGTCTA
GATCCAATAATGACAGTTGTTGCTGGTCTTAGTGTCAGAGACCCATTCCTGATGCCATCT
GACAAAAAGGATCTAGCAGAGTCGGCTAGGTCCAAGTTCGCTGGCCGTGATTGTAGTGAT
CATTTGACATTGATTCGAGCATACAGTGGTTGGAAAGATGCTGAAAGAACACGTTCTGGT
AACGAGTATTGCTGGCAGAACTTTCTCTCTGCGCAAACTCTCAAGGCAATGGACTCTATG
CGGAAACAATTCTTCTTTCTCCTCAAGGAGGCTTCTCTTATTGATAACGTTGAAGGTTGC
AGTAAACTGAGTTACGATGATCATCTTGTCCGCGCCATCATCTGTGCTGGTCTGTTCCCT
GGAGTTTCTTCTGTTGTTAATAAGGAAAAGTCAATTACGTTCAAGACAATGGAGGATGGG
CAAGTGCTTCTGTACCAAAGTTCTGTGAATGGCAATGTACAAAGGATTCCTTTCCCTTGG
CTAGTCTTCAACGAAAAAATCAAAGTCAATTCTGTGTTTCTTAAAGACTCCACTGCTGTT
TCTGACTCAGTGCTTCTTTTGTTTGGAGATAAAGTATCTTCCGGTGGATTTGATGGTCAT
CTCAAAATGCTGGGAGGCTATCTAGAGTTTTTCATGAAACCCTCTTTAGCATATACATAC
ATATCGTTAAAAAGAGAGCTCGATGAACTTATTCAGAATAAGCTTGTGAATCCAAAACTT
GATATTCAACTATACGACAAACTTATGACTGCCATTAGATTACTTGTGTCTGAGGACCAG
TGTGAGGGCAAATTCGTCTTCGGCCGGAAAGCTCTGAGCCCCACAACGAAGTTAAAAGTA
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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10 10 

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AF RR4GR86JQ C 145
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GCTAGGTCCAAGTTCGCTGGCCGTGATTGTAGTGATCATTTGACATTGATTCGAGCATAC
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G
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AATTCGTCTTCGGCCGGAAAGCTCTGAGCCCCACAACGAAGTTAAAAGTAGT

QA 2 653 2 653
DS 



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CCTGTTACCCCAGTAACTGAGTCAAAGAAAGCTACTATCTCTCAGATTGATCTCTCAAAT
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TTAACTTTCTAAATGAATTCTATTTATATAAATTTTCTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV33TF U 1
AF RR4DM33TF U 1
AF RR4DV33JQ C 522
BS 1 56 RR4DM33TF
BS 57 59 RR4DV33TF
BS 60 259 RR4DM33TF
BS 260 260 RR4DV33TF
BS 261 379 RR4DM33TF
BS 380 380 RR4DV33TF
BS 381 470 RR4DM33TF
BS 471 471 RR4DV33TF
BS 472 711 RR4DM33TF
BS 712 712 RR4DV33JQ
BS 713 748 RR4DM33TF
BS 749 1301 RR4DV33JQ

RD RR4DV33TF 512 0 0
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CTCGTCCCCCCCAACGCTCATCGATCCATCTCCATCATCACCAACCTCTCTCGATGCATT
AGCACTCTGATTCTAGCGGAACATGAGAGCGGTTCCATCAAACTTCAGACAGTGAGTACA
GTAGTTGCAGCGAACCAATTGGGTGAGAGCTCTTCAGTTTCTTTGTTATTAGCTGGTTCT
GGCTCTTCTCTTCAAGAAGCTGCTTCTCAAGCTGCCTCTTGTCATCCTTCTGTTTCCGAG
GTACTTGTTGCTGATTCAGATAGATTTGAGTACCCTTTAGCTGAACCTTGGGCAAAATTA
GTTGACTTTGTTCGGCAACAAAGAGGAGATTACTCTCACATCCTTGCTTCCTCTAGCTCA
TTTGGCAAGAACATACTACCCCGCGTTGCGGCTCTTTTAGATGTCTCTCCCGTTACTGAT
GTTGTCAAAATCTTAG*ACCCAACGAGTTTAT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4DM33TF 748 0 0
GGAGAAGCGAAAACAATGACGAGAGCCCTTCTCCTCAGAGCTCTGACGAAGAAGAA***G
CTCGTCCCCCCCAACGCTCATCGATCCATCTCCATCATCACCAACCTCTCTCGATGCATT
AGCACTCTGATTCTAGCGGAACATGAGAGCGGTTCCATCAAACCTCAGACAGTGAGTACA
GTAGTTGCAGCGAACCAATTGGGTGAGAGCTCTTCAGCTTCTTTGCTATTAGCTGGTTCT
GGCTCTTCTCTTCAAGAAGTTGCTTCTCAAGCTGCCTCTTGTCATCCTTCTGTTTCCGAG
GTACTTGTTGCTGATTCAGATAGATTTGAGTACCCTTTAGCTGAACCTTGGGCAAAATTA
GTTGACTTTGTTCGGCAACGAAGAGGAGATTACTCTCACATCCTTGCTTCCTCTAGCTCA
TTTGGCAAGAACATACTACCCCGCGTTGCGGCTCTTTTAGATGTCTCTCCTGTTACTGAT
GTTGTCAAAATCTTAGGACCCAACGAGTTTATCAGGCCTATATATGCGGGAAACGCCTTG
TGTAGAGTTCGTTATACTGGTACTGGTCCTTGTGTTTTGACTATTAGAACTACATCTTTT
CCTGTTACCCCAGTAACTGAGTCAAAGAAAGCTACTATCTCTCAGATTGATCTCTCAAAT
TTCAAAGAAGAATTTGTGAGTAGATCCAGATACGTGGGGCAATCAACTCAG*ATACAGAA
CGGCCTGATCTTGGAAGTGCACGTGTTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DV33JQ 780 0 0
ATATGCGGGAAACGC*TTGTGTAGAGTTCGTTATACTGGTACTGGTCCTTGTGTTTTGAC
TATTAGAACTACATCTTTTCCTGTTACCCCAGTAACTGAGTCAAAGAAAGCTACTATCTC
TCAGATTGATCTCTCAAATTTCAAAGAAGAATTTGTGAGTAGATCCAGATACGTGGGGCA
ATCAACTCAGGATACAGAACGGCCTGATCTTGGAAGTGCACGTGTTGTGGTTACAGGTGG
AAGGGCGTTAAAGAGCGTTGAGAACTTTAAATTGATCGAAAATCTTGCAGAGAAACTTGG
CGGAGCAGTTGGTGCGACTCGTGCTGCGGTTGATGCTGGATATGTTCCTAATGATCTTCA
GGTGGGGCAAACGGGGAAAATAGTAGCACCAGAGTTATACATGGCGTTTGGTGTTTCAGG
AGCTATTCAACACTTAGCTGGAATTAAGGATTCTAAGGTGATTGTGGCAGTTAATAAAGA
CGCAGATGCACCTATTTTTCAGGTAGCTGATTATGGACTTGTTGGAGATCTTTTTGAGGT
GATACCAGAGTTGCTGGAGAAGCTTCCGGAAAAGAAATGAGAAACTCTTAAGCTCTCAGG
TTGCAGACCATAGTAAAGTAGTGTACATAGCAAAATTGTAATAAAAAACTGTCTGAATAA
TCATTGTCATAATCTCTATTTCACTTTTGATTCTCTGCAACGAATATGATACAAAAAAAT
AAAACCATTTGAAAAGTGTTTAACTTTCTAAATGAATTCTATTTATATAAATTTTCTTGC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL3925Contig1 1094 2 2 U
GGCTTATCATTAAGCGAAGTAACCTTGGAGGTTCCTCAAAATCATGTCTTCGCAGATTTG
CAGGAAGTGAGGAGATATGGATAGTGAGAGAAGAGTGCATCCGGACTGTATAAACGCCTC
TAATCCTTACCACGAGTGTGTTGAGTATTGCTTTAAGAAAATTGCTCAAGCAAAGGCCAA
CTTAGAGAAGCAAGGATTAGTTGAAGCTGTCAGTGGGCAGTCAAGGGAGACACCTGCTGA
TAAAATTGTAGAGGAAGAGAGTTCTGAGGAAGAAGATGAAGAAGAAGATAACCAAGAACC
TGAAGTTGACGTCAGCCAACTTACAGGGAGGAAGAAGAAGTTGTATGAGCTGAGACTTAA
GATGAATGAAGCAAGAAAGTTCAATCAGACAGATGTCGGGTCTGAAAAGAAGAAAATGGA
AGCACCAACTGAGCCAAAAGGAATCTCCAAACAGAAATGGGTGGAGGCGAGGCAGAAAAA
GATTGGGAAGATTCTCGATGCTAATGGTTTAGATCTGTCAAAGGCGTACATGCTCGATAC
TCAAGAAACAGCAGAAACCAAATACAAGAAATGGGAAAAGGAACCCACACCTTCTGGTTG
GGATGTCTTCAACCAGAAGACGTTATACAACGCATACAAGAAACGGACAAAGAACATTCA
GGTTGACATTGAGGAGTACAACCGAATGAGAGCAGCTGATCCAGAGTTTTACCGTGAGGC
CTCAAGCTTGCAATACGGCAAGGCTCCAAAAATTTCAAAAGATAAGATAGATAAGATGGC
AAAGGAGCTCCATGACAGAGAAGAGAAGCGACAGGAGTTTAGCAGGAGAAGAAAGTTCAG
GGAAGAAAAGGATATCGATTCGATCAACGACAGAAACGAGCATTTCAACAAGAAGATCGA
GCGTGCGTTCGGGAAGTACACGCTGGAGATCAAAAACAACTTGGAGCGAGGAACTGCATT
ACCTGACTAAGTTAATTGAGATCACATGTTGGAAACATGACAATGTATTATCTTGTCGAA
TTATAATGCTTTTGTCTGCTTATCGTCTTTAATATCTTGTAGAATGTACCACCAAATTCT
CTCGTTAGAGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT92TF U 1
AF RR4FT92JQ C 379
BS 1 607 RR4FT92TF
BS 608 1094 RR4FT92JQ

RD RR4FT92TF 607 0 0
GGCTTATCATTAAGCGAAGTAACCTTGGAGGTTCCTCAAAATCATGTCTTCGCAGATTTG
CAGGAAGTGAGGAGATATGGATAGTGAGAGAAGAGTGCATCCGGACTGTATAAACGCCTC
TAATCCTTACCACGAGTGTGTTGAGTATTGCTTTAAGAAAATTGCTCAAGCAAAGGCCAA
CTTAGAGAAGCAAGGATTAGTTGAAGCTGTCAGTGGGCAGTCAAGGGAGACACCTGCTGA
TAAAATTGTAGAGGAAGAGAGTTCTGAGGAAGAAGATGAAGAAGAAGATAACCAAGAACC
TGAAGTTGACGTCAGCCAACTTACAGGGAGGAAGAAGAAGTTGTATGAGCTGAGACTTAA
GATGAATGAAGCAAGAAAGTTCAATCAGACAGATGTCGGGTCTGAAAAGAAGAAAATGGA
AGCACCAACTGAGCCAAAAGGAATCTCCAAACAGAAATGGGTGGAGGCGAGGCAGAAAAA
GATTGGGAAGATTCTCGATGCTAATGGTTTAGATCTGTCAAAGGCGTACATGCTCGATAC
TCAAGAAACAGCAGAAACCAAATACAAGAAATGGGAAAAGGAACCCACACCTTCTGGTTG
GGATGTC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FT92JQ 716 0 0
GTTCAATCAGACAGATGTCGGGTCTGAAAAGAAGAAAATGGAAGCACCAACTGAGCCAAA
AGGAATCTCCAAACAGAAATGGGTGGAGGCGAGGCAGAAAAAGATTGGGAAGATTCTCGA
TGCTAATGGTTTAGATCTGTCAAAGGCGTACATGCTCGATACTCAAGAAACAGCAGAAAC
CAAATACAAGAAATGGGAAAAGGAACCCACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAA
GACGTTATACAACGCATACAAGAAACGGACAAAGAACATTCAGGTTGACATTGAGGAGTA
CAACCGAATGAGAGCAGCTGATCCAGAGTTTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCAATACGG
CAAGGCTCCAAAAATTTCAAAAGATAAGATAGATAAGATGGCAAAGGAGCTCCATGACAG
AGAAGAGAAGCGACAGGAGTTTAGCAGGAGAAGAAAGTTCAGGGAAGAAAAGGATATCGA
TTCGATCAACGACAGAAACGAGCATTTCAACAAGAAGATCGAGCGTGCGTTCGGGAAGTA
CACGCTGGAGATCAAAAACAACTTGGAGCGAGGAACTGCATTACCTGACTAAGTTAATTG
AGATCACATGTTGGAAACATGACAATGTATTATCTTGTCGAATTATAATGCTTTTGTCTG
CTTATCGTCTTTAATATCTTGTAGAATGTACCACCAAATTCTCTCGTTAGAGAGAA

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

CO CL3926Contig1 834 3 5 U
GGGTTTTGAGAAAGAATTTCAGAATTGAAGATAAAGATATCATTACTAAGTGGAATGGCA
ACGACATACACGTGGTCATGGACGCTTCTCGCCTTCATTCTGACATGGATGGTTTTTCAT
CTCATCCAAAGAAAGAAGGTTGGAACAGAGGAGATAGAGGTTGAAGCAGAAGAGACGAGA
GATGGTGAGGCTGATGTCATCATTGTTGGAGCGGGTGTGGCTGGCGCGGCTCTTGCTTAT
GCTCTTGCTAAGGATGGGCGGCGAGTACATGTGATAGAGAGAGACTTGAAAGAACCTCAA
AGATTTATGGGAGAGCTGATGCAACCGGGTGGACGCCTCATGTTAGCTCAACTTGGCCTT
GAAGATTGTTTGGAGGAGATAGACGCTCAAGAAATAAAGTCATTGGCAATCTACAAGGAC
GGGAAAAATGACACCTTGTATTTTCCGGATAACAAAAAGTTTCCTTACGAACCTGCCGGT
AGACTCTTACGTAATGGCCGTCTGGTGCAACGTTTACGCAAAAAGGCAGCTTCTCATGTC
AATGTGCAATTAGAAGAAGGAACAGTGAAGTCTTTGATAGAAGAAAAACGAGTGGTTAAG
GGAGTTATATACAAGAATAGCGCAGGCGAAAACATAACTGCCTTCGCACCTCTCACTGTG
GTATGACGGTTGCTACTCGAACCTTCGCCGGTCAGCCGTCGATAATAAAGAGGAAGTGCT
CTCTTACTTTGTGGGTTACGTCACGAAGAATACCCGACTTGAGATCCACATAGTATGCAT
CTGATTTTTTCTAAACCTTTGCCATGTGTTGTATATCATATACAGCATGAGTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX11TF U 1
AF RR4EB47TF U 1
AF RR4AX70TF U 28
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BS 408 621 RR4EB47TF
BS 622 834 RR4AX70TF

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ACGACATACACGTGGTCATGGACGCTTCTCGCCTTCATTCTGACATGGATGGTTTTTCAT
CTCATCCAAAGAAAGAAGGTTGGAACAGAGGAGATAGAGGTTGAAGCAGAAGAGACGAGA
GATGGTGAGGCTGATGTCATCATTGTTGGAGCGGGTGTGGCTGGCGCGGCTCTTGCTTAT
GCTCTTGCTAAGGATGGGCGGCGAGTACATGTGATAGAGAGAGACTTGAAAGAACCTCAA
AGATTTATGGGAGAGCTGATGCAACCGGGTGGACGCCTCATGTTAGCTCAACTTGGCCTT
GAAGATTGTTTGGAGGAGATAGACGCTCAAGAAATAAAGTCATTGGCAATCTACAAGGAC
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DS 

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CTCGCCTTCATTCTGACATGGATGGTTTTTCATCTCATCAAAAGAAAGAAGGTTGGAACA
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GGAGCGGGTGTGGCTGGCGCGGCTCTTGCTTATGCTCTTGCTAAGGATGGGCGGCGAGTA
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CAACGTTTACGCAAAAAGGCAGCTTCTCATGTCAATGTGCAATTAGAAGAAGGAACAGTG
AAGTCTTTGATAGAAGAAAAACGAGTGGTTAAGGGAGTTATATACAAGAATAGCGCAGGC
GAAAACATAACTGCCTTCGCACCTCTCACTGTGGTATGACGGTTGCTACTCGAACCTTCG
CCGGTCAGCCGTCGATAATAAAGAGGAAGTGCTCTCTTACTTTGTGGGTTACGTCACGAA
GAATACCCGACTTGAGATCCACATAGTATGCATCTGATTTTTTCTAAACCTTTGCCATGT
GTTGTATATCATATACAGCATGAGTTC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 3

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GCCCTACCGTGTTTGTCCTCTCTCTGGTCCCTTGCTTACGATCCTTTTATCAATTCGCCC
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TGCTTTTTGAATCGGAATGGACTGCAAGAAGTTCATGCAGATAGTGGAGGAGAAGAAAAG
GCAAATTCTTGAGAAGAAAGAAGCTCCTTTGAAATGGGAGCAGAAGCTTGAGGCGGCTGC
CAAGGCTGTTGAAACCAAAGAAAAGAGGGCAAAGAAGGGGAGAAGACAAAGGGGTGAGTC
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GAAATCCAGAAGGCATAAGAGGAGGTCCTCAAGTTCAAGGGATGAGTACGAAAGCGGGTC
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CTTGTGATACTCTCTTAATTGTTTATTTTTTACATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G886TF U 21
AF RR4A452TF U 1
AF RR4G886JQ C 374
BS 1 282 RR4A452TF
BS 283 283 RR4G886TF
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RD RR4G886TF 488 0 0
GG
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TCTGGTCCTTTGCTTACGATCCTTTTATCAATTCGCCCTTGTAGCTTCAGGAGCCTTGCT
TGCTTGCTTAGCTTCTCCTCTTTTGGTCTAATCTTAGAACTCTTACTCGCATCAGATGCA
CTTTTTGTTATATTCATACCAAAATGCAGATTTTCAGCTGCTTTTTGAATCGGAATGGAC
TGCAAGAAGTTCATGCAGATAGTGGAGGAGAAGAAAAGGCAAATTCTTGAGAAGAAAGAA
GCTCCTTTGAAATGGGAGCAGAAGCTTGAGGCGGCTGCCAAGGCTGTTGAAACCAAAGAA
AAGAGGGCAAAGAAGGGGAGAAGACAAAGGGGTGAGTCTGAATCTAGCTCTGAAAGTGAT
AGTAGCTATGAGGTGAGAAGAAAGTCGAGAAGAACTCACAGTAGGCACCGAAGGCATTCA
CACTCT

QA 3 488 3 488
DS 

RD RR4A452TF 803 0 0
GAGACAAAACCTGTCGAAGAACGTTCCCGAAAAAGAGTAAAGAGAGAGACGAAAAGCGAA
GCCCTACCGTGTTTGTCCTCTCTCTGGTCCCTTGCTTACGATCCTTTTATCAATTCGCCC
TCGTAGCTTCAGGAGCCTTGCTTGCTTGCTTAGCTTCTCCTCTTTTGGTCTAATCTTAGA
ACTCTTACTCGCATCAGATGCACTTTTTGTTATATCCATACCAAAATGCAGATTTTCAGC
TGCTTTTTGAATCGGAATGGACTGCAAGAAGTTCATGCAGATGGTGGAGGAGAAGAAAAG
GCAAATTCTTGAGAAGAAAGAAGCTCCTTTGAAATGGGAGCAGAAGCTTGAGGCGGCTGC
CAAGGCTGTTGAAACCAAAGAAAAGAGGGCAAAGAAGGGGAGAAGACAAAGGGGTGAGTC
TGAATCTAGCTCTGAAAGTGATAGTAGCTATGAGGTGAGAAGAAAGTCGAGAAGAACTCA
CAGTAGGCACCGAAGGCATTCACACTCTGATTCAGATGACAGTAATAAGAGGAAAGGTAA
GAAATCCAGAAGGCATAAGAGGAGGTCCTCAAGTTCAAGGGATGAGTACGAAAGCGGGTC
AGAGGACGAGCTCAGGGTGAAGAAGATAAGGCACCGCCGGAGGCGCAAGTCGCATAGCTC
AAGACAGACTTCTGATGATGACAGGTATGGTGAGGTGGTTACTTCAAGTGATAGCGAGGA
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CAGCGACTCAGACTCAGAGGTTA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4G886JQ 745 0 0
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GAAAGTGATAGTAGCTATGAGGTGAGAAGAAAGTCGAGAAGAACTCACAGTAGGCACCGA
AGGCATTCACACTCTGATTCAGATGACAGTAATAAGAGGAAAGGTAAGAAATCCAGAAGG
CATAAGAGGAGGTCCTCAAGTTCAAGGGATGAGTACGAAAGCGGGTCAGAGGACGAGCTC
AGGGTGAAGAAGATAAGGCACCGCCGGAGGCGCAAGTCGCATAGCTCAAGACAGACTTCT
GATGCTGACAGGTATGGTGAGGTGGTTACTTCAAGTGATAGCGAGGAAGAGAGAGAAAGA
AGAAGACATGGGAGATATCACAGGCACAACAGAGGTTCAGCTGCCTCCAGCGACTCAGAC
TCAGAGGTTAGACGGAAGAATAGAAAGAGAAGGGAACATAAAAGGTATCGTTGGGCAGAG
TCTTCAAGTGAGGATGATGGAGCAACGCGAAGGAGAAGGCATAATCATAAACATGACAGA
GAGTCAGCATCCGAAACTGATGGAAGGGTGTCAGATGAGAACAAATAGGACCAACATAGA
CAAGTGAAAAATGTGGACGGGCATTAAAAAGTGAAAGTTGTTTAATTCTTACAATCGTCA
GAACTGAATGTTGTGTGCATCCCAGTCAAAACTATTGTGTTGAACTACTTGTGATACTCT
CTTAATTGTTTATTTTTTACATCAG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL3928Contig1 1034 2 2 U
GGTCGTTGTGCGCCGCCTCGAGCTCTGTCTGTCTCGCTCATTTTCACAGAAGAGGATTTC
TCAGGAAAAACAATGGCGGGTTGGCAGAGGAATCTACAGTTAATTCGTCAAGTTGCGAGA
AGAGTGACGAACAGTAACGTCTCCACAGCCAATTACTCTTCAGCTCGTAGTTTGGAGTCC
CCTTTCTCAAAAGGTTACTTGCAGGGTCTCTTGAGACCAACCTACACCTCAGCACCACTG
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CCTGTTTCATCACCTTTGTCATCTCCAGCTCTGTTGGGCACTGGAAAAGAAGAAGAAGAA
GAGCACAAGATTATCCCTAAGCGTAAGAAAGTGCAGGCTGTACTCAAGGCCATTAAGCAG
AGTCCTAAGAAGGTCAACCTAGTTGCAGCGCTAGTACGTGGTATGCGCGTTGAAGATGCT
CTGATGCAACTGCAATTCACTGTTAAACGGGCTTCCCATACCGTGTACCGGGTTATCCAC
GCCGCCCGAGCTAATGCTTCTCATAACCATGGACTAGATCCTGACCGTCTCATCATTGCG
GAAGCGTTTGTTGGGAAGGGACTGTTCAAGAAACGGATATCTATCCATGGAAAAGGAAAA
TCCGGGGTGATGATAAGACCCGAGTGTCGTCTAACTGTCGTAGTTAGAGAGACGACTCCA
GAGGAAGAAGCTGAGATTGCCAAGCTCAAGGTTCACAACTGCAAGAAGAAGCTAAGCAAG
CGGGAGAGGAGGCTTGTCCCCTTCAAGCTCATTGAGACAACTTCAATCTGGAACCGTAGA
GGCACTAAAGCCAATCATCGTTCCTCAGAGTTGGTACCATCTCAATCTCGCTAGTGTCTT
CCTTCCCCGATGGTTTACAAGAACGGTTCACTAGTACACCTTATTGTTTGTTTTTGGTTT
GACATTGTACCGGTACTTAATTGGATCGGTTTATTATTTGCATTAAATAAAATGTTGCAA
GAACGGATTAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC57TF U 1
AF RR4AC57JQ C 202
BS 1 739 RR4AC57TF
BS 740 1034 RR4AC57JQ

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AGAGTGACGAACAGTAACGTCTCCACAGCCAATTACTCTTCAGCTCGTAGTTTGGAGTCC
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CCTGTTTCATCACCTTTGTCATCTCCAGCTCTGTTGGGCACTGGAAAAGAAGAAGAAGAA
GAGCACAAGATTATCCCTAAGCGTAAGAAAGTGCAGGCTGTACTCAAGGCCATTAAGCAG
AGTCCTAAGAAGGTCAACCTAGTTGCAGCGCTAGTACGTGGTATGCGCGTTGAAGATGCT
CTGATGCAACTGCAATTCACTGTTAAACGGGCTTCCCATACCGTGTACCGGGTTATCCAC
GCCGCCCGAGCTAATGCTTCTCATAACCATGGACTAGATCCTGACCGTCTCATCATTGCG
GAAGCGTTTGTTGGGAAGGGACTGTTCAAGAAACGGATATCTATCCATGGAAAAGGAAAA
TCCGGGGTGATGATAAGACCCGAGTGTCGTCTAACTGTCGTAGTTAGAGAGACGACTCCA
GAGGAAGAAGCTGAGATTG
CCAAG

QA 1 739 1 739
DS 

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GTTGCAGCGCTAGTACGTGGTATGCGCGTTGAAGATGCTCTGATGCAACTGCAATTCACT
GTTAAACGGGCTTCCCATACCGTGTACCGGGTTATCCACGCCGCCCGAGCTAATGCTTCT
CATAACCATGGACTAGATCCTGACCGTCTCATCATTGCGGAAGCGTTTGTTGGGAAGGGA
CTGTTCAAGAAACGGATATCTATCCATGGAAAAGGAAAATCCGGGGTGATGATAAGACCC
GAGTGTCGTCTAACTGTCGTAGTTAGAGAGACGACTCCAGAGGAAGAAGCTGAGATTGCC
AAGCTCAAGGTTCACAACTGCAAGAAGAAGCTAAGCAAGCGGGAGAGGAGGCTTGTCCCC
TTCAAGCTCATTGAGACAACTTCAATCTGGAACCGTAGAGGCACTAAAGCCAATCATCGT
TCCTCAGAGTTGGTACCATCTCAATCTCGCTAGTGTCTTCCTTCCCCGATGGTTTACAAG
AACGGTTCACTAGTACACCTTATTGTTTGTTTTTGGTTTGACATTGTACCGGTACTTAAT
TGGATCGGTTTATTATTTGCATTAAATAAAATGTTGCAAGAACGGATTAAGGT

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL3929Contig1 531 2 3 U
GAGTGAATATTGTAAAAGACATGAATATAAAAGTTACAATAAAGATCAGGAACGTTGATC
ATCTCATCAGTAAATTCCACAAAACAAAAACAAACGAAACTCACACACACACAATTAAAA
CTGAATTAGGAAAACCAATTCAATCAAAATCATCAAAATGGTCGCAGCTTATCCAATGAG
TGCAAGTAGCAAAAATGCCCCTTCCCATGTTTTAACCTTTTGGTTTTAGCTTTCCCTATG
ATCGAATGGGTTCCATCTGACAAGGTTTTCAAGATTCAGTTACCTTCTTCTCATCTCCTT
CCGCAGCTGCTTCGTTTGAACAATGGTTCTTGACAACTGTCGATATGTCAGTTTCAGAAG
CACCAGCAAGTTTGAATCTTTCAACTGCTGAGTCAAGATTCTTCTCCCAACCGCTTACAC
TGATTTTGCATTCCACTTGTGATCTTTCAAACAGCATATTTCCCCAGAACAGATGGATCT
GTGATCTCATAGCAATCGCTTGCTCTGCTGCTTCTGCTGCTGTAACAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AT75JQ U 15
AF RR4AT75TF C 1
BS 1 14 RR4AT75TF
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BS 357 531 RR4AT75TF

RD RR4AT75JQ 345 0 0
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TTCCACAAAACAAAAACAAACGAAACTCACACACACACAATTAAAACTGAATTAGGAAAA
CCAATTCAATCAAAATCATCAAAATGGTCGCAGCTTATCCAATGAGTGCAAGTAGCAAAA
ATGCCCCTTCCCATGTTTTAACCTTTTGGTTTTAGCTTTCCCTATGATCGAATGGGTTCC
ATCTGACAAGGTTTTCAAGATTCAGTTACCTTCTTCTCATCTCCTTCCGCAGCTGCTTCG
TTTGAACAATGGTTCTTGACAACTGTCGATATGTCAGTTTCA
AAA

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR4AT75TF 531 0 0
GAGTGAATATTGTAAAAGACATGAATATAAAAGTTACAATAAAGATCAGGAACGTTGATC
ATCTCATCAGTAAATTCCACAAAACAAAAACAAACGAAACTCACACACACACAATTAAAA
CTGAATTAGGAAAACCAATTCAATCAAAATCATCAAAATGGTCGCAGCTTATCCAATGAG
TGCAAGTAGCAGAAATGCCCCTTCCCATGTTTTAGCCTTTTGGTTTTAGCTTTCCCTATG
ATCGAATGGGTTCCATCTGACAAGGTTTTCAAGATTCAGTTACCTTCTTCTCATCTCCTT
CCGCAGCTGCTTCGTTTGAACAATGGTTCTTGACAACTGTCGATATGTCAGTTTCAGAAG
CACCAGCAAGTTTGAATCTTTCAACTGCTGAGTCAAGATTCTTCTCCCAACCGCTTACAC
TGATTTTGCATTCCACTTGTGATCTTTCAAACAGCATATTTCCCCAGAACAGATGGATCT
GTGATCTCATAGCAATCGCTTGCTCTGCTGCTTCTGCTGCTGTAACAGCTC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 3

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GGATGAGTTGTAAGTTTTATTTTTTCCCATTAAATCACTTGACACCATTTAAGGTTTTAA
CGTAAACCTCTCAATAGACATATAGGTCCAACACAAAGTAACAACAACGTTAAGGAACCA
CGAACTGAACTATTATTGAAGCTAAGGTCGAAAAATCAAGCCTTCTTCTTTTTGGATTTG
AGCATGACCATGCCGATGAACACGGAAAGAAGAGAGAGGAGAGTCACGCCCGCAAAGACA
GGTACGAGAATGGCATAGTCTTGGGGCAAGAAGTACTTGTGGATGAAGTGATCACTATCT
ACAAATGGGAGGATGATGACCCAGAAAGTATAGTAGGTGAATATGGATAAGCTGATTGAA
GATAACAGAAGCCCCACTGCTCGATCCGCTAACTCCATTTAGCCACGTTCAATACGTTTT
TCGGAGGCGAGGGAGATGCGAATTGCGAAATCACGATTGATATGAGTTTAGGGGGAGATC
CGGGTCAATGGAGGAGCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F653JQ U 1
AF RR4H693JQB U 5
AF RR4F653TF C 1
BS 1 498 RR4F653JQ

RD RR4F653JQ 498 0 0
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CGTAAACCTCTCAATAGACATATAGGTCCAACACAAAGTAACAACAACGTTAAGGAACCA
CGAACTGAACTATTATTGAAGCTAAGGTCGAAAAATCAAGCCTTCTTCTTTTTGGATTTG
AGCATGACCATGCCGATGAACACGGAAAGAAGAGAGAGGAGAGTCACGCCCGCAAAGACA
GGTACGAGAATGGCATAGTCTTGGGGCAAGAAGTACTTGTGGATGAAGTGATCACTATCT
ACAAATGGGAGGATGATGACCCAGAAAGTATAGTAGGTGAATATGGATAAGCTGATTGAA
GATAACAGAAGCCCCACTGCTCGATCCGCTAACTCCATTTAGCCACGTTCAATACGTTTT
TCGGAGGCGAGGGAGATGCGAATTGCGAAATCACGATTGATATGAGTTTAGGGGGAGATC
CGGGTCAATGGAGGAGCC

QA 1 498 1 498
DS 

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GG
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GAACTATTATTGAAGCTAAGGTCGAAAAATCAAGCCTTCTTCTTTTTGGATTTGAGCATG
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AAAATGGCATAGTCTTGGGGCAAGAAGTACTTGTGGATGAAGTGATCACTATCTACAAAT
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GCGAGGGAGATGCGAATTGCGAAATCACGATTGATATGAGTTTAGGGGGAGATCCGGGTC
CC

QA 3 482 3 482
DS 

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GAACTATTATTGAAGCTAAGGTCGAAAAATCAAGCCTTCTTCTTTTTGGATTTGAGCATG
ACCATGCCGATGAACACGGAAAGAAGAGAGAGGAGAGTCACGCCCGCAAAGACAGGTACG
AGAATGGCATAGTCTTGGGGCAAGAAGTACTTGTGGATGAAGTGATCACTATCTACAAAT
GGGAGGATGATGACCCAGAAAGTATAGTAGGTGAATATGGATAAGCTGATTGAAGATAAC
AGAAGCCCCACTGCTCGATCCGCTAACTCCATTTAGCCACGTTCAATACGTTTTTCGGAG
GCGAGGGAGATGCGAATTGCGAAATCACGATTGATATGAGTTTAGGGGGAGATCCGGGTC
AATGGAGGAGCC

QA 7 498 7 498
DS 



AS 1 3

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AH10TF U 1
AF RR4AH22TF U 1
AF RR4AH94TF U 1
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CTCACTACCTTTTATCATCTATCTATAAAGCAGAGGTTTATT

QA 1 282 1 282
DS 

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CTCACTACCTTTTATCATCTATCTATAAAGCAGAGGTTTATT

QA 1 282 1 282
DS 



AS 1 3

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TAACATGGGCGTTAAAGAATCCAAGCAAGGTTGAGAAAATCGCCATCCTTAATACTCCGT
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AATTCACGTGCCAAAATGCTATATTGGCAGAGCGGTTCATTGAAGGAGGTAGCCCATACT
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CTTTGCGAGTCAAATGAGTGGTTGCAAAAATGATTCGTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C841TF U 1
AF RR4C841JQ C 274
AF RR4DM16TF U 398
BS 1 614 RR4C841TF
BS 615 666 RR4DM16TF
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RD RR4C841TF 614 0 0
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TTCATTGCTATGCACCTGATTGGATAGGGTTCGGATTCAGTGACAAACCTCAGCCAGGAT
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TCTTGAAGAACGAGAAAGCTGATGTATATCGTCTACCATATTTGTCAAGCGGAGGGCCTG
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CAAATGGGTTTTCA

QA 1 614 1 614
DS 

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AACAAGGTCAAAGGTATTGGTGTCAGAGCCTTACCTCTTTGATGGATGTGTGCAAGGCTT
CACATTGCTCTTTGGAGAGGCTAGAAGCAGTCTGCAACGGGTGGATTCTTGCCTGTGAAA
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*TTTCCAAAGAAAAGAGAACACTTTGCGAGTCAAATGAGTGGTTGCAAAAATGATTCGTT
TGACC

QA 7 791 7 791
DS 

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ATATTTGTCAAGCGGAGGGCCTGGCTTTGCCTTGCTAGAGACTGCTAAAAAGATCAACTT
CGGAGACACCTTGGGTCAAATTGCAAATGGGTTTTCATCAGGCAGCTGGGACAAACCCAC
GCTTCTGGCTTGGGGTATAGCTGATAAGT*CCTGTCTCAGTCTATAGCAGAGGAGTTCGA
GAAACAGAACCCTCAAAATGTTAAGCTTCGACTCATCGAAGGTGCTGGCCATTTGCCTCA
GGAAGACTGGCCAGAGAAAGTAGTTGCTGCACTCCGATCATTTTTCTAACTTCCAAAGTT
AAAACAAGGTCAAAGGTATTGGTGTCAGAGCCTTACCTCTTTGATGGATGTGTGCAAGGC
TTCACATTGCTCTTTGGAGAGGCTAGAAGCAGTCTGCAACGGGTGGATTCTTGCCTGTGA
AAGAGGAAGACAAGTAGAGCATTAATCCTACAACATGTAAATTGAGTCGTAAAATGTACA
AAATTTCCAAAGAAAAGAGAACACTTTGCGA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL3933Contig1 514 2 2 U
CGGATAAAAACTGCATCACTGATTCGAAGGTCAGTGCAAAGTTGAAAAGGGTAAACAAAA
CTTGAAATAATCTGATAAAAAGTGGGGTTGCAAAATGATTGTTCAATCCTCTTCATCGAT
GACTTTAGTGCCAAGACCGGAGAGACCTTCGGCGGGGATTTCAGCGACAGTGACAAGGGA
GAAGAACTCTTCCTTTGCATCTTCGTCATCATTTCTCTTACGAGCAACTCGGACTCTGAT
CCTTCTAGGAGGACCTCTGATACCTTTGCTCCAAATCTGCTTGTTCAGCTTCACATCCAC
TCTCACATCCTTTGTCCCCATTGCCTTCTCTGCAAACTTCCTTATTTCCTTGATTGCCTT
CGGAGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTATGAAGGCGTCTGTGAAGGTTGATGGTGTACTC
TCTGGTCACCACCTCCTCTTTCCTTCCCTTCTTTTCCGACATTTTTTTTATGTGTCTTTC
TCTGTTCCTTTGCTTCTCCAAGAACGCCGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4CI11TF C 1
AF RR4CI11JQ U 39
BS 1 38 RR4CI11TF
BS 39 514 RR4CI11JQ

RD RR4CI11TF 514 0 0
CGGATAAAAACTGCATCACTGATTCGAAGGTCAGTGCAAAGTTGAAAAGGGTAAACAAAA
CTTGAAATAATCTGATAAAAAGTGGGGTTGCAAAATGATTGTTCAATCCTCTTCATCGAT
GACTTTAGTGCCAAGACCGGAGAGACCTTCGGCGGGGATTTCAGCGACAGTGACAAGGGA
GAAGAACTCTTCCTTTGCATCTTCGTCATCATTTCTCTTACGAGCAACTCGGACTCTGAT
CCTTCTAGGAGGACCTCTGATACCTTTGCTCCAAATCTGCTTGTTCAGCTTCACATCCAC
TCTCACATCCTTTGTCCCCATTGCCTTCTCTGCAAACTTCCTTATTTCCTTGATTGCCTT
CGGAGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTATGAAGGCGTCTGTGAAGGTTGATGGTGTACTC
TCTGGTCACCACCTCCTCTTTCCTTCCCTTCTTTTCCGACATTTTTTTTATGTGTCTTTC
TCTGTTCCTTTGCTTCTCCAAGAACGCCGAGT
CC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4CI11JQ 476 0 0
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TTGTTCAATCCTCTTCATCGATGACTTTAGTGCCAAGACCGGAGAGACCTTCGGCGGGGA
TTTCAGCGACAGTGACAAGGGAGAAGAACTCTTCCTTTGCATCTTCGTCATCATTTCTCT
TACGAGCAACTCGGACTCTGATCCTTCTAGGAGGACCTCTGATACCTTTGCTCCAAATCT
GCTTGTTCAGCTTCACATCCACTCTCACATCCTTTGTCCCCATTGCCTTCTCTGCAAACT
TCCTTATTTCCTTGATTGCCTTCGGAGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTATGAAGGCGTC
TGTGAAGGTTGATGGTGTACTCTCTGGTCACCACCTCCTCTTTCCTTCCCTTCTTTTCCG
ACATTTTTTTTATGTGTCTTTCTCTGTTCCTTTGCTTCTCCAAGAACGCCGAGTCC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 3

CO CL3934Contig1 858 3 7 U
AACTGAAGATTCATATAATAGCAAACTGTAACACTACGTCAATATAAGACTCACAACAGA
ACTATATAACTATATATAGAATAAAGTTTCACTCTAGATATTATTTTTAAAAAGAATAAC
AATTGAGACCTCGAGCTGAGATCGTTTACAAACTGAATCAGCTGGTTTAATTGACCATCT
CCTTAGCTCTAAAACGGTCTGGTGCTACGACCGCTAGCTCTACCACATAGAAGAGCGTTC
TTGGGGATTGGGAATTCATCTCTCAGAGAAGTGGAAGTTGTGTAGACACGTAAATAAAAC
TGTTGTCCTAAGTACTGCCTTGCCCAAAACTCGGATCTTAGGTTCCACATCCCTACGTTG
TCTAGTGCTATGTATATAGCCGTCCATGAACTCGGATAAACCTGAACGGTGCAGCGAGCT
AATGCATCGCGTAGATTGTACTCGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTTACCACCGTCCATT
CCAACAACCCAAAAAGAGTAACCATCTAGATGCCAGCTCTGGACAATATTCTCAGGGTTC
TCGAAAACAATCTCTACAAAGGTTCTGTAGTCTGCTTGCATAACAGATGTGTCGAGGTAA
ATTCCACCACCAGTGGGTTGGCTCTGTATGCTTCCAACTCTGTAGACACCATCGATCTTG
AAGAAGTAAGCGAGTTTCAGAGGAGTGTCTGCTGGCTTAAAGGATACGCTGTTCACGGCG
TATCTTTGCTCCCCGTTGACCTGACCGGCAGCGCTAGCAAGTCTGATGGTTCTTGTGGTG
TTTATCATACCGTAGTGGTATGATCCTTGTGGATTAGGCCTTGGTCCACTCGCTGTAAGG
TTAGTTCTGATGGCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC09JQ U 1
AF RR4BX67JQ U 47
AF RR4EC09TF C 235
BS 1 267 RR4EC09JQ
BS 268 268 RR4BX67JQ
BS 269 532 RR4EC09JQ
BS 533 667 RR4BX67JQ
BS 668 668 RR4EC09TF
BS 669 678 RR4BX67JQ
BS 679 858 RR4EC09TF

RD RR4EC09JQ 532 0 0
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ACTATATAACTATATATAGAATAAAGTTTCACTCTAGATATTATTTTTAAAAAGAATAAC
AATTGAGACCTCGAGCTGAGATCGTTTACAAACTGAATCAGCTGGTTTAATTGACCATCT
CCTTAGCTCTAAAACGGTCTGGTGCTACGACCGCTAGCTCTACCACATAGAAGAGCGTTC
TTGGGGATTGGGAATTCATCTCTCAGAAAAGTGGAAGTTGTGTAGACACGTAAATAAAAC
TGTTGTCCTAAGTACTGCCTTGCCCAAAACTCGGATCTTAGGTTCCACATCCCTACGTTG
TCTAGTGCTATGTATATAGCCGTCCATGAACTCGGATAAACCTGAACGGTGCAGCGAGCT
AATGCATCGCGTAGATTGTACTCGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTTACCACCGTCCATT
CCAACAACCCAAAAAGAGTAACCATCTAGATGCCAGCTCTGGACAATATTCT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4BX67JQ 632 0 0
G
GACTCACAACAGAACTATATAACTATATATAGAATAAAGTTTCACTCTAGATATTATTTT
TAAAAAGAATAACAATTGAGACCTCGAGCTGAGATCGTTTACAAACTGAATCAGCTGGTT
TAATTGACCATCTCCTTAGCTCTAAAACGGTCTGGTGCTACGACCGCTAGCTCTACCACA
TAGAAGAGCGTTCTTGGGGATTGGGAATTCATCTCTCAGAGAAGTGGAAGTTGTGTAGAC
ACGTAAATAAAACTGTTGTCCTAAGTACTGCCTTGCCCAAAACTCGGATCTTAGGTTCCA
CATCCCTACGTTGTCTAGTGCTATGTATATAGCCGTCCATGAACTCGGATAAACCTGAAC
GGTGCAGCGAGCTAATGCATCGCGTAAATTGTACTCGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTT
ACCACCGTCCATTCCAACAACCCAAAAAGAGTAACCATCTAGATGCCAGCTCTGGACAAT
ATTCTCAGGGTTCTCGAAAACAATCTCTACAAAGGTTCTGTAGTCTGCTTGCATAACAGA
TGTGTCGAGGTAAATTCCACCACCAGTGGGTTGGCTCTGTATGCTTCCAACTCTGTAGAC
ACCATCGATCTTGAAGAAGTCAGCGAGTTTC

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR4EC09TF 624 0 0
GCGTTCTTGGGGATTGGGAATTCATCTCTCAGAGAAGTGGAAGTTGTGTAGACACGTAAA
TAAAACTGTTGTCCTAAGTACTGCCTTGCCCAAAACTCGGATCTTAGGTTCCACATCCCT
ACGTTGTCTAGTGCTATGTATATAGCCGTCCATGAACTCGGATAAACCTGAACGGTGCAG
CGAGCTAATGCATCGCGTAGATTGTACTCGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTTACCACCG
TCCATTCCAACAACCCAAAAAGAGTAACCATCTAGATGCCAGCTCTGGACAATATTCTCA
GGGTTCTCGAAAACAATCTCTACAAAGGTTCTGTAGTCTGCTTGCATAACAGATGTGTCG
AGGTAAATTCCACCACCAGTGGGTTGGCTCTGTATGCTTCCAACTCTGTAGACACCATCG
ATCTTGAAGAAGTAAGCGAGTTTCAGAGGAGTGTCTGCTGGCTTAAAGGATACGCTGTTC
ACGGCGTATCTTTGCTCCCCGTTGACCTGACCGGCAGCGCTAGCAAGTCTGATGGTTCTT
GTGGTGTTTATCATACCGTAGTGGTATGATCCTTGTGGATTAGGCCTTGGTCCACTCGCT
GTAAGGTTAGTTCTGATGGCTCGC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

CO CL3935Contig1 1171 3 8 U
GGGGGAGTTAACCAATATAATAACTAAAAAAACAAAGAAGATTGTAAGATAAAGCTGATG
AAGTTCACATTGCAAGAAGAGAATCTGCTTATAACAAAAGAAAGAGAGATATAAGAGAAG
ACCTTGCTAAGTCTTTGGTTTCTTCTTGATAACACAACTACTACTATGTACAGATTCAGC
AACACAGTGATTGGAGTCTTAAACCTCCTCAGCTTACTAGCTTCGATACCAATCATAGGA
GCCACTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACGACTTGCGAGAACTTCCTCCAAACTCCTCTA
CTCGTTATAGGTTTCATCATACTCTTAGTATCCCTCGCCGGGTTCATAGGAGCATGTTTC
AACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTTTACTTAGTGGTCATGATTTTCCTCATCGCGACTCTT
ATGGGTCTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACGAGCCAAGGAGGTGGTGTGGAAGTACCA
GGGAGGGTTTACAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGCTGAGAGAAAGAGTT
AGAGATCCTCAGTATTGGATCTCTATAAGAAGCTGTATCTTGAGTTCCAAGACTTGTGCT
AAGATTGAATCTTGGACTACACTTGATTACTTCCAAAGAGACATGACCTCTGTTCAGTCG
GGATGTTGTAAGCCACCGACGGCGTGCACGTACGAGACCGGAGTAATAGTAGGAGGAGAT
GATTGCTATAGATGGAATAATGGTATTGAAACGTTATGCTACGAGTGTGATGCTTGTAAA
GCTGGTGTTCTTGAGGAGATCCGTCTTGACTGGAGAAAGTTGTCGGTGGTTAACATTTTG
GTCCTTGTCCTCCTCATCGCTGTCTATGCTGCGGGTTGCTGCGCCTTCCACAACACTCGC
CACGCAGTACATCCTTATCATCCTTCTGATGATAATCGCATGACTAAAGTCCGTCCTCGT
TGGGACTACTACTGGTGGAGATGGTGGCATGAGAAGAAAGAGCAGCTTTACTGAGAGAGC
AGCCACATCGCTTGTGTTTTCATATTTTCATCATTATCTGTTTACCAAACCAGCTTGAGA
TTAAGAAAACACAAATCTAAGAAACGTTGATGTACTTCTGTTTTCTATAGTTCATCAAGA
GATGTAGTAAAAGTTGTTCTGATCTCAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D635TF U 76
AF RR4DJ17TF U 1
AF RR4DJ17JQ C 347
BS 1 194 RR4DJ17TF
BS 195 195 RR4D635TF
BS 196 243 RR4DJ17TF
BS 244 244 RR4D635TF
BS 245 712 RR4DJ17TF
BS 713 713 RR4DJ17JQ
BS 714 732 RR4DJ17TF
BS 733 1171 RR4DJ17JQ

RD RR4D635TF 628 0 0
GG
AGAGAATCTGCTTATAACAAAAGAAAGAGAGATATAAGAGAAGACCTTGCTAAGTCTTTG
GTTTCTTCTTGATAACACAACTACTACTATGTACAGATTCAGCAACACAGTGATTGGAGT
CTTAAACCTCCTCAGCTTACTAGCTTCGATACCAATCATAGGAGCCACTCTATGGAAGGC
AAGAAGCAGCACGACTTGCGAGAACTTCCTCCAAACTCCTCTACTCGTTATAGGTTTCAT
CATACTCTTAGTATCCCTCGCCGGGTTCATAGGAGCATGTTTCAACGTGGCATGGGCTCT
TTGGGTTTACTTAGTGGTCATGATTTTCCTCATCGCTACTCTTATGGGTCTAACTCTGTT
TGGTCTGGTGGTGACGAGCCAAGGAGGTGGTGTGGAAGTACCAGGGAGGGTTTACAAAGA
GTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGCTGAGAGAAAGAGTTAGAGATCCTCAGTATTG
GATCTCTATAAGAAGCTGTATCTTGAGTTCCAAGACTTGTGCTAAGATTGAATCCTGGAC
TACACTTGATTACTTCCAAAGAGACATGACCTCTGTTCAGTCGGGATGTTGTAAGCCACC
GACGGCGTGCACGTACGAGACCGGAG

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR4DJ17TF 732 0 0
GGGGGAGTTAACCAATATAATAACTAAAAAAACAAAGAAGATTGTAAGATAAAGCTGATG
AAGTTCACATTGCAAGAAGAGAATCTGCTTATAACAAAAGAAAGAGAGATATAAGAGAAG
ACCTTGCTAAGTCTTTGGTTTCTTCTTGATAACACAACTACTACTATGTACAGATTCAGC
AACACAGTGATTGGGGTCTTAAACCTCCTCAGCTTACTAGCTTCGATACCAATCATAGGA
GCCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACGACTTGCGAGAACTTCCTCCAAACTCCTCTA
CTCGTTATAGGTTTCATCATACTCTTAGTATCCCTCGCCGGGTTCATAGGAGCATGTTTC
AACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTTTACTTAGTGGTCATGATTTTCCTCATCGCGACTCTT
ATGGGTCTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACGAGCCAAGGAGGTGGTGTGGAAGTACCA
GGGAGGGTTTACAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGCTGAGAGAAAGAGTT
AGAGATCCTCAGTATTGGATCTCTATAAGAAGCTGTATCTTGAGTTCCAAGACTTGTGCT
AAGATTGAATCTTGGACTACACTTGATTACTTCCAAAGAGACATGACCTCTGTTCAGTCG
GGATGTTGTAAGCCACCGACGGCGTGCACGTACGAGACCGGAGTAATAGTAG*AGGAGAT
GATTGCTATAGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4DJ17JQ 825 0 0
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TCATCGCGACTCTTATGGGTCTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACGAGCCAAGGAGGTG
GTGTGGAAGTACCAGGGAGGGTTTACAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGC
TGAGAGAAAGAGTTAGAGATCCTCAGTATTGGATCTCTATAAGAAGCTGTATCTTGAGTT
CCAAGACTTGTGCTAAGATTGAATCTTGGACTACACTTGATTACTTCCAAAGAGACATGA
CCTCTGTTCAGTCGGGATGTTGTAAGCCACCGACGGCGTGCACGTACGAGACCGGAGTAA
TAGTAGGAGGAGATGATTGCTATAGATGGAATAATGGTATTGAAACGTTATGCTACGAGT
GTGATGCTTGTAAAGCTGGTGTTCTTGAGGAGATCCGTCTTGACTGGAGAAAGTTGTCGG
TGGTTAACATTTTGGTCCTTGTCCTCCTCATCGCTGTCTATGCTGCGGGTTGCTGCGCCT
TCCACAACACTCGCCACGCAGTACATCCTTATCATCCTTCTGATGATAATCGCATGACTA
AAGTCCGTCCTCGTTGGGACTACTACTGGTGGAGATGGTGGCATGAGAAGAAAGAGCAGC
TTTACTGAGAGAGCAGCCACATCGCTTGTGTTTTCATATTTTCATCATTATCTGTTTACC
AAACCAGCTTGAGATTAAGAAAACACAAATCTAAGAAACGTTGATGTACTTCTGTTTTCT
ATAGTTCATCAAGAGATGTAGTAAAAGTTGTTCTGATCTCAGAGG

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 3

CO CL3936Contig1 652 3 4 U
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TTTCCCTAAAGATGGGAATCTGTGATGTTACTAAACATAGCAAAGTATCCTTCAACTTCA
AACCAAAGTCTTTAGATAAGTTTCTTCTTGTGGAAATATCGCTTCAGGTACCATATCTGT
ACACCCGCAACGGAAAGGCAAACCCCAAGTGACATTATACTGAACCAAGCCACTCTTGCG
TTGGTTGCTTCACTCACTTCTCGCATCTCCCCTTCCCTGTTCTTTATATAATTAATGTTC
TCACGGATCGCCTGCACTAACCCC*TCAAGTCTTGCTAACTGAAGGTCAACACCCTCGAT
CTTTTCCTTTTTAGCAACAGAGTCCCAATCTTTGGTGGCGATACCAGTCTTCCAATCAAT
CCCAAGTGTCAACGGATTAGGTAGCGGATGACTTGAATCAACCGAGAAACAAGCCAAGTA
GTTTCCCGTTTCTTGCGTCGTGAACGCAAACTGACCATGCGTTACGTTCTCTTGGTGATG
AAGATTGTTCCCATATGGAGATGTTACCTTAGCAGAAACAGCAGGTGTGCTTCCAGGGTT
CTGCTCATCGACGACGTAGTAATCAGCCAAGACGACGACGTTGCTCTGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES57JQ U 59
AF RR4CQ56JQ U 1
AF RR4CQ56TF C 140
BS 1 124 RR4CQ56JQ
BS 125 125 RR4ES57JQ
BS 126 630 RR4CQ56JQ
BS 631 652 RR4CQ56TF

RD RR4ES57JQ 497 0 0
TTTTTCCCTAAAGATGGGAATCTGTGATGTTACTAAACATAGCAAAGTATCCTTCAACTT
CAAACCAAAGTCTTTAGATAAGTTTCTTCTTGTGGAAATATCGCTTCAGGTACCATATCT
GTACACCCGCAACGGAAAGGCAAACCCCAAGTGACATTATACTGAACCAAGCCACTCTTG
CGTTGATTGCTTCACTCACTTCTCGCATCTCCCCTTCCCTGTTCTTTATATAATTAATGT
TCTCACGGATCGCCTGCACTAACCCC*TCAAGTCTTGTTAACTGAAGGTCAACACCCTCG
ATCTTTTCCTTTTTAGCAACAGAGTCCCAATCTTTGGTGGCGATACCAGTCTTCCAATCA
ATCCCAAGTGTCAACGGATTAGGTAGCGGATGACTTGAATCAACTGAGAAACAAGCCAAG
TAGTTTCCCGTTTCTTGCGTCGTGAACGCAAACTGACCATGCGTTACGTTCTCTTGGTGA
TGAAGATCGTTCCCATA

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4CQ56JQ 630 0 0
CTGAAAGAAAATAAAAAATGAAAATGTAATTGTAACCAGTTAACTCTACAATTTTGAGTT
TTTCCCTAAAGATGGGAATCTGTGATGTTACTAAACATAGCAAAGTATCCTTCAACTTCA
AACCGAAGTCTTTAGATAAGTTTCTTCTTGTGGAAATATCGCTTCAGGTACCATATCTGT
ACACCCGCAACGGAAAGGCAAACCCCAAGTGACATTATACTGAACCAAGCCACTCTTGCG
TTGGTTGCTTCACTCACTTCTCGCATCTCCCCTTCCCTGTTCTTTATATAATTAATGTTC
TCACGGATCGCCTGCACTAACCCC*TCAAGTCTTGCTAACTGAAGGTCAACACCCTCGAT
CTTTTCCTTTTTAGCAACAGAGTCCCAATCTTTGGTGGCGATACCAGTCTTCCAATCAAT
CCCAAGTGTCAACGGATTAGGTAGCGGATGACTTGAATCAACCGAGAAACAAGCCAAGTA
GTTTCCCGTTTCTTGCGTCGTGAACGCAAACTGACCATGCGTTACGTTCTCTTGGTGATG
AAGATTGTTCCCATATGGAGATGTTACCTTAGCAGAAACAGCAGGTGTGCTTCCAGGGTT
CTGCTCATCGACGACGTAGTAATCAGCCAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4CQ56TF 513 0 0
TAGTTC
TCTTGTGGAAATATCGCTTCAGGTACCATATCTGTACACCCGCAACGGAAAGGCAAACCC
CAAGTGACAT*ATACTGAACCAAGCCACTCTTGCGTTGGTTGCTTCACTCACTTCTCGCA
TCTCCCCTTCCCTGTTCTTTATATAATTAATGTTCTCACGGATCGCCTGCACTAACCCCC
TCAAGTCTTGCTAACTGAAGGTCAACACCCTCGATCTTTTCCTTTTTAGCAACAGAGTCC
CAATCTTTGGTGGCGATACCAGTCTTCCAATCAATCCCAAGTGTCAACGGATTAGGTAGC
GGATGACTTGAATCAACCGAGAAACAAGCCAAGTAGTTTCCCGTTTCTTGCGTCGTGAAC
GCAAACTGACCATGCGTTACGTTCTCTTGGTGATGAAGATTGTTCCCATATGGAGATGTT
ACCTTAGCAGAAACAGCAGGTGTGCTTCCAGGGTTCTGCTCATCGACGACGTAGTAATCA
GCCAAGACGACGACGTTGCTCTGTATC

QA 7 513 7 513
DS 



AS 1 3

CO CL3937Contig1 724 3 2 U
GGGTATAAACCTCTGTGGCTGCCGGTCATTTATCTCTCTCTCTCTCCCTTCCTCTAAGCT
AAAGCCAAAACATAACAAGAATAAAAGCTATGGCTGGTATGCTTCCAGGAGTTGAGTGCG
AGAGGAGGCGGCGCTTCCACGGCGGTGCTCCACCGATTGACTTATCCAACACGGCTTCTG
TGGCTGCAGCAACGGGACACGTATGGACTCGCCGACCATCCTTCTCTCTCTACACTACCA
ATCACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCCTTCTCGGAGAGAAATATTAGGAACAAATCTT
ACGGTGTTGATAACCATGAGAAGCTTGTAGGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGG
ACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGTTCAGGCAAAATGACAAAGATAAAGTGAATAA
ATTGGAGCAAGGGAAAGGTAAATCTCTCAAGGATTTACCGACAGAGGTGGTTGGGTTAAA
GAAGAGCCGGAGAAGGCTTGTCAAATGGTTCGGGTGGCGAGTAAAGGAGCAACAAGAGTG
TGCTATATGTCTAGACCAGTTCAAGACGGGTGAGACATTGGTCCATCTACCATGCACCCA
TAAGTTTCACTCCATATGTTTATTGCCTTGGCTAGATACCAACGTGTATTGCCCTTATTG
TAGAATGGACATTTGGAATTAATTGTAATAATTTAATGTCATATCATTAGGTCTTGTTTA
CGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4H027TF U 1
AF RR4G202TF U 39
AF RR4H027JQ C 270
BS 1 710 RR4H027TF
BS 711 724 RR4H027JQ

RD RR4H027TF 717 0 0
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AAAGCCAAAACATAACAAGAATAAAAGCTATGGCTGGTATGCTTCCAGGAGTTGAGTGCG
AGAGGAGGCGGCGCTTCCACGGCGGTGCTCCACCGATTGACTTATCCAACACGGCTTCTG
TGGCTGCAGCAACGGGACACGTATGGACTCGCCGACCATCCTTCTCTCTCTACACTACCA
ATCACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCCTTCTCGGAGAGAAATATTAGGAACAAATCTT
ACGGTGTTGATAACCATGAGAAGCTTGTAGGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGG
ACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGTTCAGGCAAAATGACAAAGATAAAGTGAATAA
ATTGGAGCAAGGGAAAGGTAAATCTCTCAAGGATTTACCGACAGAGGTGGTTGGGTTAAA
GAAGAGCCGGAGAAGGCTTGTCAAATGGTTCGGGTGGCGAGTAAAGGAGCAACAAGAGTG
TGCTATATGTCTAGACCAGTTCAAGACGGGTGAGACATTGGTCCATCTACCATGCACCCA
TAAGTTTCACTCCATATGTTTATTGCCTTGGCTAGATACCAACGTGTATTGCCCTTATTG
TAGAATGGACATTTGGAATTAATTGTAATAATTTAATGTCATATCATTAG
TCTTGTT

QA 1 710 1 710
DS 

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G
CTCTCTCCCTTCCTCTAAGCTAAAGCCAAAACATAACAAGAATAAAAGCTATGGCTGGTA
TGCTTCCAGGAGTTGAGTGCGCGAGGAGGCGGCGCTTCCACGGCGGTGCTCCACCGATTG
ACTTATCCAACACGGCTTCTGTGGCTGCAGCAACGGGACACGTATGGACTCGCCGACCAT
CCTTCTCTCTCTACACTACCAATCACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCCTTCTCGGAGA
GAAATATTAGGAACAAATCTTACGGTGTTGATAACCATGAGAAGCTTGTAGGAGCAGCCA
AAGAGGCGAAAGATAGATTGGACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAG*****GCAAAA
TGACAAAGACAAAGTGAATAAATTGGAGCAAGGGAAAGGTAAATCTCTTAAGGATTTACC
GACAGAGGTGGTTGGGTTAAAGAAGAGCCGGAGAAGGCTTGTCAAATGGTTCGGGTGGCG
AGTAAAGGAGCAACAAGTGTGTGCTATATGTCT*GACCAGTTCAAGACGGGTGAGACATT
GGTCCACCTACCATGCACCCATAAGTTTCACTCCATATGTTTATTGCCTTGGCTAGATAC
CAACGTGTATTGCCCTTATTGTAGAATGGACATTTGTAATTAATTGTAATAATTTAATGT
CATATCA

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR4H027JQ 455 0 0
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GGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGGACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGT
TCAGGCAAAATGACAAAGATAAAGTGAATAAATTGGAGCAAGGGAAAGGTAAATCTCTCA
AGGATTTACCGACAGAGGTGGTTGGGTTAAAGAAGAGCCGGAGAAGGCTTGTCAAATGGT
TCGGGTGGCGAGTAAAGGAGCAACAAGAGTGTGCTATATGTCTAGACCAGTTCAAGACGG
GTGAGACATTGGTCCATTTACCATGCACCCATAAGTTTCACTCCATATGTTTATTGCCTT
GGCTAGATACCAACGTGTATTGCCCTTATTGTAGAATGGACATTTGGAATTAATTGTAAT
AATTTAATGTCATATCATTAGGTCTTGTTTACGGC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 3

CO CL3938Contig1 521 3 7 U
GGATCTCTAACAAAACCATACTCAGAACAAGTAAAAGAAACTAAAAGGGTTTATACTTTG
AAGAAAACATGGTGCTTGAAAACTCCTCTAATCACAAATCTCATCATCACCGCAACTCGA
TGAAAGAGTTCCGAGTTTCCTATGCAGCTGAAGAACCAAAACAGGTCTTGGGGTGTGTGG
ATATGAGGAGGACAAAGAGCGAGAAGGTGAGTAGGAGAAAGTCTATAAAAGAAGAGAATG
TTGACAAGGAAGCAGAAGCATTCATCAGGTTTGAGCATAGCAAGTGGTTGACTGAGAGCA
GCTAGCTAGTCCATTAACTATGAGTAAGAAACAATAAGGACATACCATATCATATATAGA
TTGTATTAAATGATCTTTGTATATTTTGCACGTGTGTTTTTCTTCTTGGTGTGCAACCAT
CTTCTCGTTTTCATTTTGGTTATTTATTGTAACAAAAATGGATGTCGTTTCCCTTAAGCT
AAAAGGGTGCATGGAATAAACCATTACAAACTATTAATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FD12JQ C 104
AF RR4ET02TF U 1
AF RR4FD12TF U 104
BS 1 221 RR4ET02TF
BS 222 222 RR4FD12TF
BS 223 419 RR4ET02TF
BS 420 420 RR4FD12TF
BS 421 465 RR4ET02TF
BS 466 466 RR4FD12TF
BS 467 521 RR4ET02TF

RD RR4FD12JQ 355 0 0
G
CATCACCGCAACTCGATGAAAGAGTTCCGAGTTTCCTATGCAGCTGAAGAACCAAAACAG
GTCTTGGGGTGTGTGGATATGAGGAGGACAAAGAGCGAGAAGGTGAGTAGGAGAAAGTCT
ATAAAAGAAGAGAATGTTGACAAGGAAGCAGAAGCATTCATCAGGTTTGAGCATAGCAAG
TGGTTGACTGAGAGCAGCTAGCTAGTCCATTAACTATGAGTAAGAAACAATAAGGACATA
CCATATCATATATAGATTGTATTAAATGATCTTTGTATATTTTGCACGTGTGTTTTTCTT
CTTGGTGTGCAACCATCTTCTCGTTTTCATTTTGGTTATTTATTGTAACAAAAA

QA 2 355 2 355
DS 

RD RR4ET02TF 521 0 0
GGATCTCTAACAAAACCATACTCAGAACAAGTAAAAGAAACTAAAAGGGTTTATACTTTG
AAGAAAACATGGTGCTTGAAAACTCCTCTAATCACAAATCTCATCATCACCGCAACTCGA
TGAAAGAGTTCCGAGTTTCCTATGCAGCTGAAGAACCAAAACAGGTCTTGGGGTGTGTGG
ATATGAGGAGGACAAAGAGCGAGAAGGTGAGTAGGAGAAAGGCTATAAAAGAAGAGAATG
TTGACAAGGAAGCAGAAGCATTCATCAGGTTTGAGCATAGCAAGTGGTTGACTGAGAGCA
GCTAGCTAGTCCATTAACTATGAGTAAGAAACAATAAGGACATACCATATCATATATAGA
TTGTATTAAATGATCTTTGTATATTTTGCACGTGTGTTTTTCTTCTTGGTGTGCAACCAC
CTTCTCGTTTTCATTTTGGTTATTTATTGTAACAAAAATGGATGTTGTTTCCCTTAAGCT
AAAAGGGTGCATGGAATAAACCATTACAAACTATTAATTGG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4FD12TF 409 0 0
G
CATCACCGCAACTCGATGAAAGAGTTCCGAGTTTCCTATGCAGCTGAAGAACCAAAACAG
GTCTTGGGGTGTGTGGATATGAGGAGGACAAAGAGCGAGAAGGTGAGTAGGAGAAAGTCT
ATAAAAGAAGAGAATGTTGACAAGGAAGCAGAAGCATTCATCAGGTTTGAGCATAGCAAG
TGGTTGACTGAGAGCAGCTAGCTAGTCCATTAACTATGAGTAAGAAACAATAAGGACATA
CCATATCATATATAGATTGTATTAAATGATCTTTGTATATTTTGCACGTGTGTTTTTCTT
CTTGGTGTGCAACCATCTTCTCGTTTTCATTTTGGTTATTTATTGTAACAAAAATGGATG
TCGTTTCCCTTAAGCTAAAAGGGTGCATGGAATAAACCATTACAAAC
C

QA 2 408 2 408
DS 



AS 1 2

CO CL3939Contig1 1048 2 2 U
GGGTGGACGAGAAATGTCTCTGAAACTTTACTTCTCTCTTCACTCATCATCACTCAAAAT
TGCCAAACCCTCCAACGTTTCCATCGCTCAACAATCCTCCGGTGACCGGAAAACCTCCCC
AGCCGAGGAGTTTTCTCCCCTTGCTGAGAAATTCAACCGGCGGCTTCTTCTTGGTGTAGG
CTCGTCCTCTGTGCTCGCCATCGGTGCGAACTTCGGAGGAGTCACGAGTTTTGTACTCGG
TTTATCGCCGGAGTTTGGTCGGAACCTGAAACTCGACGTCGTATATCCGATCAGAGGTTA
TAGCAGATGTATCGACACGGTTGAAGGGTTCGAGTTTATATATCCGGCTACGTGGGTTGG
AGACCAGACACTCTTGTATAGAGCGGCGGAGAAGTCAGAGCGGGAGATTTCTCTAGACCT
TCCTCCCGCAAGAAACAGTCGCCGGAAAAATGTCAATGAACCGGTTGTTGCATTTGGACC
ACCCGGTTCGACCGGAGAGCTTAACGTCAGTGTTATTGTCTCCCCTGTCTCACCCACTTT
CTCAATTGAAGCATTTGGAGGGCCAAAAGAAGTAGGAGAGGCCATAGTAAAAACAGTGAC
AAGATCTAGTCAAAGAACAGATTTAAAAGGAACTTTGCTGGAAGCAAACCTCAGACAAGA
TTCAGAGAGGAACTTGAAGTACTATGAGTTGGACTTCAAAGTCGAATCACCGTCTTTCAG
GCGGCATAACGTGGCCGTTTGTTGCGTTAACGGTGGCAGGCTTTATACTCTGAATGCTCA
GGCTCCAGAGTCAGCTTGGTCAGAGTTAAAACATGAGTTTCACACTGTTGCTAAATCATT
CAATATCATTTCTTGAATGTGAAAGAAAACAAGACACTACAAAGAAAGGCTTGTTTTGTT
TGTTCATTATCATCGTTGGGAACTTATGGTTTCTGACTTTAGACACATGTTTAAAAGAGC
TAACCTAGTGCTATTTCTATTTTAAAATTTTATGTTTTAGAATTTTTCACATATACTATT
ATGATTATTAATACATTATTTTGTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E212TF U 1
AF RR4E212JQ C 270
BS 1 625 RR4E212TF
BS 626 1048 RR4E212JQ

RD RR4E212TF 625 0 0
GGGTGGACGAGAAATGTCTCTGAAACTTTACTTCTCTCTTCACTCATCATCACTCAAAAT
TGCCAAACCCTCCAACGTTTCCATCGCTCAACAATCCTCCGGTGACCGGAAAACCTCCCC
AGCCGAGGAGTTTTCTCCCCTTGCTGAGAAATTCAACCGGCGGCTTCTTCTTGGTGTAGG
CTCGTCCTCTGTGCTCGCCATCGGTGCGAACTTCGGAGGAGTCACGAGTTTTGTACTCGG
TTTATCGCCGGAGTTTGGTCGGAACCTGAAACTCGACGTCGTATATCCGATCAGAGGTTA
TAGCAGATGTATCGACACGGTTGAAGGGTTCGAGTTTATATATCCGGCTACGTGGGTTGG
AGACCAGACACTCTTGTATAGAGCGGCGGAGAAGTCAGAGCGGGAGATTTCTCTAGACCT
TCCTCCCGCAAGAAACAGTCGCCGGAAAAATGTCAATGAACCGGTTGTTGCATTTGGACC
ACCCGGTTCGACCGGAGAGCTTAACGTCAGTGTTATTGTCTCCCCTGTCTCACCCACTTT
CTCAATTGAAGCATTTGGAGGGCCAAAAGAAGTAGGAGAGGCCATAGTAAAAACAGTGAC
AAGATCTAGTCAAAGAACAGATTTA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4E212JQ 779 0 0
AACTCGACGTCGTATATCCGATCAGAGGTTATAGCAGATGTATCGACACGGTTGAAGGGT
TCGAGTTTATATATCCGGCTACGTGGGTTGGAGACCAGACACTCTTGTATAGAGCGGCGG
AGAAGTCAGAGCGGGAGATTTCTCTAGACCTTCCTCCCGCAAGAAACAGTCGCCGGAAAA
ATGTCAATGAACCGGTTGTTGCATTTGGACCACCCGGTTCGACCGGAGAGCTTAACGTCA
GTGTTATTGTCTCCCCTGTCTCACCCACTTTCTCAATTGAAGCATTTGGAGGGCCAAAAG
AAGTAGGAGAGGCCATAGTAAAAACAGTGACAAGATCTAGTCAAAGAACAGATTTAAAAG
GAACTTTGCTGGAAGCAAACCTCAGACAAGATTCAGAGAGGAACTTGAAGTACTATGAGT
TGGACTTCAAAGTCGAATCACCGTCTTTCAGGCGGCATAACGTGGCCGTTTGTTGCGTTA
ACGGTGGCAGGCTTTATACTCTGAATGCTCAGGCTCCAGAGTCAGCTTGGTCAGAGTTAA
AACATGAGTTTCACACTGTTGCTAAATCATTCAATATCATTTCTTGAATGTGAAAGAAAA
CAAGACACTACAAAGAAAGGCTTGTTTTGTTTGTTCATTATCATCGTTGGGAACTTATGG
TTTCTGACTTTAGACACATGTTTAAAAGAGCTAACCTAGTGCTATTTCTATTTTAAAATT
TTATGTTTTAGAATTTTTCACATATACTATTATGATTATTAATACATTATTTTGTAATT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 3

CO CL3940Contig1 783 3 3 U
GAGAACATACATTTGGTGTTATTACTTATAAAACCAATACTGAGTTTATTGCAAACTTTC
TAATCTTTTATGCCAAACTACTTAAAAACTATTGAAATCATTTGGTCGGGACGAAGTTGT
GTGAGAGCCGTTCTATCTGCGACCGTAGGATCTCACCTAGTGAGAAACGGTGAGTTTGCG
GTTGCTGTTGCGGCGCAACCAAGGCT*AGCTGTTCATGAGCCGCGACAGTTCTGTCTTCT
GCACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATAGGTCTCATCTCTTTCTTCACTGACTCA
ACAAACTCCATATCAATCTTGTTCCCGGAGATGTCCCTGACGTAAAAAGCGTTGAGAGAC
TTCTGTCCCTGTGTCTCCACGTCCGCACGAACAACAGTCAAGCCGTTCTCACGGAGAACA
CGAGATATATCAGAAAGTAAGCCTACTCTGTTCTCTGCGCATAGCTCCAACTTCACCCCC
TCGCAAACACGACGTTCTATAGCAGCTTCCAAGCATTTAATCACACGTTCTTTCTCTCCT
TCAGTGTTCAGCGCACGTCCATCTACGTGTCTTATGAAGTACTCCTGAAAAGCATCAGCT
CCATCAGACCGGAGAGCAGCGTGGAAGATAACGTACTGCATATCAATCAAAGTGCAAATC
GTATCGAACATGAGTCTCCTCCGATCTTTAGACTTCACCGTCACTATAGAATACCCTCTG
TCCTCGCAGTTCCCAATAGAAACACTCGTCGTCGTCTTCCTCTCGCAATACTCCAACTTG
GAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RR4GZ44JQ U 1
AF RR4H218JQ U 1
AF RR4H218TF C 162
BS 1 611 RR4GZ44JQ
BS 612 770 RR4H218JQ
BS 771 783 RR4H218TF

RD RR4GZ44JQ 611 0 0
GAGAACATACATTTGGTGTTATTACTTATAAAACCAATACTGAGTTTATTGCAAACTTTC
TAATCTTTTATGCCAAACTACTTAAAAACTATTGAAATCATTTGGTCGGGACGAAGTTGT
GTGAGAGCCGTTCTATCTGCGACCGTAGGATCTCACCTAGTGAGAAACGGTGAGTTTGCG
GTTGCTGTTGCGGCGCAACCAAGGCT*AGCTGTTCATGAGCCGCGACAGTTCTGTCTTCT
GCACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATAGGTCTCATCTCTTTCTTCACTGACTCA
ACAAACTCCATATCAATCTTGTTCCCGGAGATGTCCCTGACGTAAAAAGCGTTGAGAGAC
TTCTGTCCCTGTGTCTCCACGTCCGCACGAACAACAGTCAAGCCGTTCTCACGGAGAACA
CGAGATATATCAGAAAGTAAGCCTACTCTGTTCTCTGCGCATAGCTCCAACTTCACCCCC
TCGCAAACACGACGTTCTATAGCAGCTTCCAAGCATTTAATCACACGTTCTTTCTCTCCT
TCAGTGTTCAGCGCACGTCCATCTACGTGTCTTATGAAGTACTCCTGAAAAGCATCAGCT
CCATCAGACCG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4H218JQ 770 0 0
GAGAACATACATTTGGTGTTATTACTTATAAAACCAATACTGAGTTTATTGCAAACTTTC
TAATCTTTTATGCCAAACTACTTAAAAACTATTGAAATCATTTGGTCGGGACGAAGTTGT
GTGAGAGCCGTTCTATCTGCGACCGTAGGATCTCACCTAGTGAGAAACGGTGAGTTTGCG
GTTGCTGTTGCGGCGCAACCAAGGCT*AGCTGTTCATGAGCCGCGACAGTTCTGTCTTCT
GCACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATAGGTCTCATCTCTTTCTTCACTGACTCA
ACAAACTCCATATCAATCTTGTTCCCGGAGATGTCCCTGACGTAAAAAGCGTTGAGAGAC
TTCTGTCCCTGTGTCTCCACGTCCGCACGAACAACAGTCAAGCCGTTCTCACGGAGAACA
CGAGATATATCAGAAAGTAAGCCTACTCTGTTCTCTGCGCATAGCTCCAACTTCACCCCC
TCGCAAACACGACGTTCTATAGCAGCTTCCAAGCATTTAATCACACGTTCTTTCTCTCCT
TCAGTGTTCAGCGCACGTCCATCTACGTGTCTTATGAAGTACTCCTGAAAAGCATCAGCT
CCATCAGACCGGAGAGCAGCGTGGAAGATAACGTACTGCATATCAATCAAAGTGCAAATC
GTATCGAACATGAGTCTCCTCCGATCTTTAGACTTCACCGTCACTATAGAATACCCTCTG
TCCTCGCAGTTCCCAATAGAAACACTCGTCGTCGTCTTCCTCTCGCAATA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4H218TF 622 0 0
TGAG
AACGGTGAGTTTGCGGTTGCTGTTGCGGCGCAACCAAGGCTTAGCTGTTCATGAGCCGCG
ACAGTTCTGTCTTCTGCACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATAGGTCTCATCTCT
TTCTTCACTGACTCAACAAACTCCATATCAATCTTGTTCCCGGAGATGTCCCTGACGTAA
AAAGCGTTGAGAGACTTCTGTCCCTGTGTCTCCACGTCCGCACGAACAACAGTCAAGCCG
TTCTCACGGAGAACACGAGATATATCAGAGAGTAAGCCTACTCTGTTCTCTGCGCATAGC
TCCAACTTCACCCCCTCGCAAACACGACGTTCTATAGCAGCTTCCAAGCATTTAATCACA
CGTTCTTTCTCTCCTTCAGTGTTCAGCGCACGTCCATCTACGTGTCTTATGAAGTACTCC
TGAAAAGCATCAGCTCCATCAGACCGGAGAGCAGCGTGGAAGATAACGTACTGCATATCA
ATCAAAGTGCAAATCGTATCGAACATGAGTCTCCTCCGATCTTTAGACTTCACCGTCACT
ATAGAATACCCTCTGTCCTCGCAGTTCCCAATAGAAACACTCGTCGTCGTCTTCCTCTCG
CAATACTCCAACTTGGAC

QA 5 622 5 622
DS 



AS 1 3

CO CL3941Contig1 893 3 2 U
ATCTTGCTAAGATACTTTATTAACACAGCAAAACATTTCAGTGTTAAAAAAAAAAACACA
GCAAGTACAAGAAATGTCTATCTACAGACTTATTCTGATACTTGTACTCGCACCATTTCA
AAGATTCACTCTTAGGTATGATAGGTCGCAGTAACCGTCACTCTATTTACATCTTCCCGC
ATTCTATACAACCCTCTCCTTCATCTAAACATATCTCTACTATTCCCCACGTGGTTCATA
CCTTACTCGGTTTCCCAACCAAGTTCATCATAATCTTGACCGGAGGACACGTTTCTTGAA
ACCAATATTCGAGGTTTTACGGGAAGTAAAAGTGGCATACGGTTGCCCGTTGAGAGAACC
ACCAAATCTGAATCCCAGCCTTCGATGTTTTTTGGAACACATGAGTCAAATAGGAACTGC
CCGAGCACACTGTGAGCGTTGCTCGTTGGTTGGGGTGGGCGGAAGGAAAATCTTTCTCTC
TGTTCTTCTTGTGAAGACGAAGATGCATCGCTTGTGTTGTTGCTTTGATACGGTGCTGAG
CTTGGTAAGAAAAAGTGATCACTTGGCCCAGTTGCTACTCTTCTTAGGCTTTGGTTAGAG
TTCACAGCTACTTTCTGAAGGTCGCATATTAACTCAGAGATCTCATCATTCGTGTGAGCT
CTTTCTCCAAGCTGTCGGATTTTCTGTAAGTGCACTGATACGGCCTTCTCTAGAAAGTTG
GAGATAACAGCTCGGTATTGTATAGGGTTATGCCTATAGTGTCCTGCATGAGGAGAATTT
TTCCACTTGACAACTTTAACTTCTCCTCCCAGTTCCTGCAACTGATGGGCGAAGCTTGAA
ATAACTTGGTGAGGAGCAAGTTCGTCATCATCGGAGCATAAAATTAGATATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A367JQD U 1
AF RR4A367JQ U 2
AF RR4A367TFB C 47
BS 1 495 RR4A367JQD
BS 496 893 RR4A367TFB

RD RR4A367JQD 497 0 0
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AAGATTCACTCTTAGGTATGATAGGTCGCAGTAACCGTCACTCTATTTACATCTTCCCGC
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CCTTACTCGGTTTCCCAACCAAGTTCATCATAATCTTGACCGGAGGACACGTTTCTTGAA
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ACCAAATCTGAATCCCAGCCTTCGATGTTTTTTGGAACACATGAGTCAAATAGGAACTGC
CCGAGCACACTGTGAGCGTTGCTCGTTGGTTGGGGTGGGCGGAAGGAAAATCTTTCTCTC
TGTTCTTCTTGTGAA
GA

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4A367JQ 494 0 0
TCTTGCTAAGATACTTTATTAACACAGCAAAACATTTCAGTGTTAAAAAAAAAAACACAG
CAAGTACAAAAAATGTCTATCTACAGACTTATTCTGATACTTGTACTCCCACCATTTCAA
AGATTCACTCTTAGGTATGATAGGTCGCAGTAACCGTCACTCTATTTACATCTTCCCGCA
TTCTATACAACCCTCTCCTTCATCTAAACATATCTCTACTATTCCCCACGTGGTTCATAC
CTTACTCGGTTTCCCAACCAAGTTCATCATAATCTTGACCGGAGGACACGTTTCTTGAAA
CCAATATTCGAGGTTTTACGGGAAGTAAAAGTGGCATACGGTTGCCCGTTGAAAAAACCA
CCAAATCTGAATCCCAGCCTTCGATGTTTTTTGGAACACATGAGTCAAATAGGAACTGCC
CGAGCACACTGTGAGCGTTGCTCGTTGGTTGGGGTGGGCGGAAGGAAAATCTTTCTCTCT
GTTCTTCTTGTGAA

QA 1 494 1 494
DS 

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AAAAAAAAAACACAGCAAGTACAAGAAATGTCTATCTACAGACTTATTCTGATACTTGTA
CTCGCACCATTTCAAAGATTCACTCTTAGGTATGATAGGTCGCAGTAACCGTCACTCTAT
TTACATCTTCCCGCATTCTATACAACCCTCTCCTTCATCTAAACATATCTCTACTATTCC
CCACGTGGTTCATACCTTACTCGGTTTCCCAACCAAGTTCATCATAATCTTGACCGGAGG
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CCGTTGAGAGAACCACCAAATCTGAATCCCAGCCTTCGATGTTTTTTGGAACACATGAGT
CAAATAGGAACTGCCCGAGCACACTGTGAGCGTTGCTCGTTGGTTGGGGTGGGCGGAAGG
AAGATCTTTCTCTCTGTTCTTCTTGTGAAGACGAAGATGCATCGCTTGTGTTGTTGCTTT
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GGCTTTGGTTAGAGTTCACAGCTACTTTCTGAAGGTCGCATATTAACTCAGAGATCTCAT
CATTCGTGTGAGCTCTTTCTCCAAGCTGTCGGATTTTCTGTAAGTGCACTGATACGGCCT
TCTCTAGAAAGTTGGAGATAACAGCTCGGTATTGTATAGGGTTATGCCTATAGTGTCCTG
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GGGCGAAGCTTGAAATAACTTGGTGAGGAGCAAGTTCGTCATCATCGGAGCATAAAATTA
GATATGC

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 3

CO CL3942Contig1 887 3 8 U
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GCACTACATCAGAAGAGCGGATACAAACAAAGAACCACGCTCAATCATAATCATACAAAG
ATTCTAGATTAGATCAAGTGGTGGCAACAAACAGCAGCAGCAGCAACAAACAAAAACAAC
ATGAAGCAAACCATTATTTTTAGCAAAAGGAGACACTGCGAACCGAGATTTTATGTACAC
TTCACACACTGATCACCGCACTCTGCATGCTGTAGGTCCACTCGGAGAACAACTTTGGCT
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ATAATCAGGCACCCCTCCCATTGCAAACGCAGCTCCACCAGGGATTAGGGAATCACCTGT
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CTGACTCAAACAATAATACGCTAGGCTGCATGCCTTCTGAGCTGCCTTGACTGAGTATTG
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AGCCCAATCAACCAGGTTCTGCTCTTTTCTAGGTCTTGTCTTGTCCACTGACTTTCTTCC
CGTCAACATCTCCAGAAGAACAACTCCAAAGCTGTACACATCACTTCTCGCCGTCAGGTG
TCCAGTCATCACATATTCTGGAGCAGCATAGCCGTAAGTACCCATCACTCGAGTTGACAC
ATGGGTTTCATCACCTTGAGGGCCAGCTTTAGCCAAGCCAAATCTGAAAGCTTGGCTGTG
TAGTCCGAGTCAAGCAGTATATTGGAAGTCTTGAATCACGATAAAAA


BQ
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AF RR4DD33JQ U 1
AF RR4DD33TF C 1
AF RR4CT85JQ U 6
BS 1 49 RR4DD33JQ
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RD RR4DD33JQ 485 0 0
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GCACTACATCAGAAGAGCGGATACAAACAAAGAACCACGCTCAATCATAATCATACAAAG
ATTCTAGATTAAATCAAGTGGTGGCAACAAACAGCAGCAGCAGCAACAAACAAAAACAAC
ATGAAGCAAACCATTATTTTTAGCAAAAGGAGACACTGCGAACCGAGATTTTATGTACAC
TTCACACACTGATCACCGCACTCTGCATGCTGTAGGTCCACTCGGAAAACAACTTTGGCT
AGGTGATGACCTGCAAATGGCACCAGGCCCAACATTCTTTGCAAACCTCCTGTGCATTCT
ATAATCAGGCACCCCTCCCATTGCAAACGCAGCTCCACCAGGGATTAGGGAATCACCTGT
GCACTGCAAAGGCTCCAAAGTCTCAACCACATCACTCATCAATGGCCTAGCTTTCGGGTT
CTGAC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4DD33TF 515 0 0
GGTTA
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ATGACCTGCAAATGGCACCAGGCCCAACATTCTTTGCAAACCTCCTGTGCATTCTATAAT
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TCAGACAATAATACGCTAGGCTGCATGCC
C

QA 6 514 6 514
DS 

RD RR4CT85JQ 882 0 0
CACACAAAAAAATTCACATTGGAGTGATTAGAGAAATTGTAAGAGACTAATACAAGCACT
ACATCAGAAGAGCGGATACAAACAAAGAACCACGCTCAATCATAATCATACAAAGATTCT
AGATTAGATCAAGTGGTGGCAACAAACAGCAGCAGCA***ACAAACAAAAACAACATGAA
GCAAACCATTATTTTTAGCAAAAGGAGACACTGCGAACCGAGATTTTATGTACACTTCAC
ACACTGATCACCGCACTCTGCATGCTGTAGGTCCACTCGGAGAACAACTTTGGCTAGGTG
ATGACCTGCAAATGGCACCAGGCCCAACATTCTTTGCAAACCTCCTGTGCATTCTATAAT
CAGGTACCCCTCCCATTGCAAACGCAGCTCCACCAGGGATTAGGGAATCACCTGTGCACT
GCAAAGGCTCCAAAGTCTCAACCACATCACTCATCAATGGCCTAGCTTTCGGGTTCTGAC
TCAAACAATAATACGCTAGGCTGCATGCCTTCTGAGCTGCCTTGACTGAGTATTGGTTCT
CCAGCCTCGGGTCGATTATTTGCAGCAGTTTTCTTTTATCATTCAGCTTCGGCCGAGCCC
AATCAACCAGGTTCTGCTCTTTTCTAGGTCTTGTCTTGTCCACTGACTTTCTTCCCGTCA
ACATCTCCAGAAGAACAACTCCAAAGCTGTACACATCACTTCTCGCCGTCAGGTGTCCAG
TCATCACATATTCTGGAGCAGCATAGCCGTAAGTACCCATCACTCGAGTTGACACATGGG
TTTCATCACCTTGAGGGCCAGCTTTAGCCAAGCCAAATCTGAAAGCTTGGCTGTGTAGTC
CGAGTCAAGCAGTATATTGGAAGTCTTGAATCACGATAAAAA

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 2

CO CL3943Contig1 731 2 2 U
GGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAATTGACACTGACCTCTCGTATCAGAAACACCA
GCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACATTTGCTTATCACACCTATTTCTCTGTCTCGG
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TTGTTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCTGTGGTGTGGAATCCTTGGGATAAGAGGTCAA
AGACGATATCAGACTTGGGAGATGAAGACTATAAGCATATGCTTTGTGTTGAAGCTGCAG
CTATCGAAAGGCCAATCACATTGAAACCAGGTGAAGAATGGAAAGGAAGACTCGAGCTCT
CTGCGGTTCCTTCTAGTTACTCCAGTGGACAGCTTGACCCCAAGAAAGTCCTCGAGTGAT
ACTCATCCCTTTCCCTTACAGTACTATGAAGAAATGAGTGAAGGGAGGTGTGAAAATGTT
TTATCGGATTATTATACTATAGAAAGAAACTGAGTTCGAATAAAAAAAATGTCGATTTGT
GGATCAAAGACAAGATACTTGCACTCGTTAAAATTGTGGTTTCATTATATGTTATGGTAC
ATTTGACCACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ30TF U 1
AF RR4FQ30JQ C 108
BS 1 580 RR4FQ30TF
BS 581 731 RR4FQ30JQ

RD RR4FQ30TF 580 0 0
GGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAATTGACACTGACCTCTCGTATCAGAAACACCA
GCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACATTTGCTTATCACACCTATTTCTCTGTCTCGG
ACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAAGGATTGGAGACGCTTGATTATCTAGACAACTTAAAGA
ACAGAGAACGTTTTACCGAACAAGGCGATGCTATAACTTTTGAATCCGAAACTGACAAGA
TTTACCTGAGCACTCCTACGAAGACTGCTATTTTGGACCATGAGAAGAAGAGGACTTTCG
TTGTTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCTGTGGTGTGGAATCCTTGGGATAAGAGGTCAA
AGACGATATCAGACTTGGGAGATGAAGACTATAAGCATATGCTTTGTGTTGAAGCTGCAG
CTATCGAAAGGCCAATCACATTGAAACCAGGTGAAGAATGGAAAGGAAGACTCGAGCTCT
CTGCGGTTCCTTCTAGTTACTCCAGTGGACAGCTTGACCCCAAGAAAGTCCTCGAGTGAT
ACTCATCCCTTTCCCTTACAGTACTATGAAGAAATGAGTG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4FQ30JQ 624 0 0
TTC
TCTGTCTCGGACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAAGGATTGGAGACGCTTGATTATCTAGAC
AACTTAAAGAACAGAGAACGTTTTACCGAACAAGGCGATGCTATAACTTTTGAATCCGAA
ACTGACAAGATTTACCTGAGCACTCCTACGAAGACTGCTATTTTGGACCATGAGAAGAAG
AGGACTTTCGTTGTTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCTGTGGTGTGGAATCCTTGGGAT
AAGAGGTCAAAGACGATATCAGACTTGGGAGATGAAGACTATAAGCATATGCTTTGTGTT
GAAGCTGCAGCTATCGAAAGGCCAATCACATTGAAACCAGGTGAAGAATGGAAAGGAAGA
CTCGAGCTTTCTGCGGTTCCTTCTAGTTACTCCAGTGGACAGCTTGACCCCAAGAAAGTC
CTCGAGTGATACTCATCCCTTTCCCTTACAGTACTATGAAGAAATGAGTGAAGGGAGGTG
TGAAAATGTTTTATCGGATTATTATACTATAGAAAGAAACTGAGTTCGAATAAAAAAAAT
GTCGATTTGTGGATCAAAGACAAGATACTTGCACTCGTTAAAATTGTGGTTTCATTATAT
GTTATGGTACATTTGACCACC

QA 4 624 4 624
DS 



AS 1 3

CO CL3944Contig1 752 3 9 U
GGACTTACACACTTTCCTTTTCTTATCCGTCTCATTCTCTCTCTTTCTCATGACGAGTAG
TAGTGGAAGCCTCAAACTAGAGATCCACACCGACGACAAGACGCCAGGAAAGTGGAGCGT
ACCGCTCAGCGAGGAAGTTTTCTGGAGGTTCTTAAGCGGCGGAGGAGGCTCGGAGAAAGC
TGTGTTCAGCGAGGGGTCTATTTTCAGCCCGTTCTTGTTCGGGAAGTACTTTGATCCGTC
TGATGCGTTTCCATTGTAGGAATTCGAGGCAGATGTTTTGCTAGCAAGCCTCAGGAGCGT
AGGACAGTCTAGAGTCGATTGGTTGCAAACCGACCAAGCTTATGTCCTTAAATCTGACCT
CGCCGTGGTGGGGAAAAATAACGTGCATGTGTACGTCGACGTTAAAGGAAAAGTGATGGA
GATTAGTGGCCAATGGAACATTAATAAGAAAACGGCGGCCAACGGCGACTGGAGAAGCGG
CCAGTGGTGGGAATACGGTTATGTCCGCCGTCTCGAGCTACCCGGCGATGCCGACCCCCA
AAACTCCGATGCTTTCCTTTCCAACAAAGACAAGTACTCTTTCTTAGAGATCATAATCCC
CAAGATTAATTCTAAGAACAAATTATAATTTGATGTGTCATTAATCATTATTGGCGTTTT
ATGAGCATGAAGTTTTAGTTTTTTTTTCTTCTTAATATAGAATGATATGTAATACTTTTC
TGTTGTGGACAATGAATGATATAAACATGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
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AF RR4HB89TF U 1
AF RR4GN12TF U 5
AF RR4GN12JQ C 202
BS 1 26 RR4HB89TF
BS 27 27 RR4GN12TF
BS 28 75 RR4HB89TF
BS 76 76 RR4GN12TF
BS 77 98 RR4HB89TF
BS 99 99 RR4GN12TF
BS 100 119 RR4HB89TF
BS 120 675 RR4GN12TF
BS 676 752 RR4GN12JQ

RD RR4HB89TF 123 0 0
GGACTTACACACTTTCCTTTTCTTATTCGTCTCATTCTCTCTCTTTCTCATGACGAGTAG
TAGTGGAAGCCTCAA*CTAGAGATCCACACCGACGACA*GACGCCAGGAAAGTGGAGCG
ACCG

QA 1 119 1 119
DS 

RD RR4GN12TF 671 0 0
GG
ACACACTTTCCTTTTCTTATCCGTCTCATTCTCTCTCTTTCTCATGACGAGTAGTAGTGG
AAGCCTCAAACTAGAGATCCACACCGACGACAAGACGCCAGGAAAGTGGAGCGTACCGCT
CAGCGAGGAAGTTTTCTGGAGGTTCTTAAGCGGCGGAGGAGGCTCGGAGAAAGCTGTGTT
CAGCGAGGGGTCTATTTTCAGCCCGTTCTTGTTCGGGAAGTACTTTGATCCGTCTGATGC
GTTTCCATTGTAGGAATTCGAGGCAGATGTTTTGCTAGCAAGCCTCAGGAGCGTAGGACA
GTCTAGAGTCGATTGGTTGCAAACCGACCAAGCTTATGTCCTTAAATCTGACCTCGCCGT
GGTGGGGAAAAATAACGTGCATGTGTACGTCGACGTTAAAGGAAAAGTGATGGAGATTAG
TGGCCAATGGAACATTAATAAGAAAACGGCGGCCAACGGCGACTGGAGAAGCGGCCAGTG
GTGGGAATACGGTTATGTCCGCCGTCTCGAGCTACCCGGCGATGCCGACCCCCAAAACTC
CGATGCTTTCCTTTCCAACAAAGACAAGTACTCTTTCTTAGAGATCATAATCCCCAAGAT
TAATTCTAAGAACAAATTATAATTTGATGTGTCATTAATCATTATTGGCGTTTTATGAGC
ATGAAGTTT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR4GN12JQ 551 0 0
TTTCAGCCCGTTCTTGTTCGGGAAGTACTTTGATCCGTCTGATGCGTTTCCATTGTAGGA
ATTCGAGGCAGATGTTTTGCTAGCAAGCCTCAGGAGCGTAGGACAGTCTAGAGTCGATTG
GTTGCAAACCGACCAAGCTTATGTCCTTAAATCTGACCTCGCCGTGGTGGGGAAAAATAA
CGTGCATGTGTACGTCGACGTTAAAGGAAAAGTGATGGAGATTAGTGGCCAATGGAACAT
TAATAAGAAAACGGCGGCCAACGGCGACTGGAGAAGCGGCCAGTGGTGGGAATACGGTTA
TGTCCGCCGTCTCGAGCTACCCGGCGATGCCGACCCCCAAAACTCCGATGCTTTCCTTTC
CAACAAAGACAAGTACTCTTTCTTAGAGATCATAATCCCCAAGATTAATTCTAAGAACAA
ATTATAATTTGATGTGTCATTAATCATTATTGGCGTTTTATGAGCATGAAGTTTTAGTTT
TTTTTTCTTCTTAATATAGAATGATATGTAATACTTTTCTGTTGTGGACAATGAATGATA
TAAACATGCGT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 3

CO CL3945Contig1 497 3 1 U
GAGCCGTTAGCGGATGTCAAGTTCATGGAGATTGGCTCTTCCGTCGACGTGACGCAAGAC
GTAATCGCTTGCTTGAGAGAGAACGCGCCAGAGCTTCTTAACGTGTTGGCTTGCAGCGAA
GTGTTTGACAGCAGCGGAGGCGGTGCGGAGAGGATGTGCAGGGAAATGGGAGTGCCGTTT
CTTGGGAAAGTTCCTTTGGATCCACAGCTTTGCAAAGCAGCTGAACAAGGTAAGTCGTGC
TTTGAGGGGAACAACAAGTGTTCTGTCAGCGCGCCTGCGCTCAAGAGCATCATACAGAAG
GTTCTTGCTTCGATGACCGAGTGAAGAATTCCACTAAATAGATCCGTTGGTTGGATCTGT
GCTACTATGAAAGGTGTGTAGGCTTTTTGTGCAAGCTATAGGCATTGTCTTCGCATGTGT
AATAAGATTTGTTTTTATGAGATTGGACCACTAAATCTTGTCGACTATAATTACTATCGT
TGAAATTCATTTTGAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DL27JQ C 142
AF RR4DL27TF U 1
AF RR4DL71TF U 1
BS 1 497 RR4DL27TF

RD RR4DL27JQ 161 0 0
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CCACAGCTTTGCAAAGCAGCTGAACAAGGTAAGTCGTGCTTTGAGGGGAACAACAAGTGT
TTTGTCAGCGCCCCTGCGCTCAAGAGCATCATACAGAAGGT

QA 1 161 1 161
DS 

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CTTGGGAAAGTTCCTTTGGATCCACAGCTTTGCAAAGCAGCTGAACAAGGTAAGTCGTGC
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GTTCTTGCTTCGATGACCGAGTGAAGAATTCCACTAAATAGATCCGTTGGTTGGATCTGT
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QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4DL71TF 497 0 0
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GTAATCGCTTGCTTGAGAGAGAACGCGCCAGAGCTTCTTAACGTGTTGGCTTGCAGCGAA
GTGTTTGACAGCAGCGGAGGCGGTGCGGAGAGGATGTGCAGGGAAATGGGAGTGCCGTTT
CTTGGGAAAGTTCCTTTGGATCCACAGCTTTGCAAAGCAGCTGAACAAGGTAAGTCGTGC
TTTGAGGGGAACAACAAGTGTTCTGTCAGCGCGCCTGCGCTCAAGAGCATCATACAGAAG
GTTCTTGCTTCGATGACCGAGTGAAGAATTCCACTAAATAGATCCGTTGGTTGGATCTGT
GCTACTATGAAAGGTGTGTAGGCTTTTTGTGCAAGCTATAGGCATTGTCTTCGCATGTGT
AATAAGATTTGTTTTTATGAGATTGGACCACTAAATCTTGTCGACTATAATTACTATCGT
TGAAATTCATTTTGAGT

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 3

CO CL3946Contig1 1112 3 11 U
GGACATCCCTGGATCAAAGAAAAGTCTCGCTCCCGGCTTGAATACCCTTTTACTCCGGCG
AATATCCATCGTTAAAATTTTCAGATCGGGCCTAGCTCAATGAAGAACAGATTGAAGAGC
TACAAGAGGAAGAAGCTAGGGTTAGCCACAGTCATCGTCTTCTGTTCCCTCTGTTTCCTC
ATCGGCTTCTACGCTTCAGCTCTACTCTCTCAGAATGTGCCTGGAGTACGACCCAGGTTG
AGAATGGTGGAGATGGTGGAGAACGGTGAAGGAGAAGGTTCCTCGATGCCTCATGGTGTT
AGTGGAGATGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTGGAAACCGAGGGCT
TTATATTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTATTGAGAGAGCAAAG
GTTAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGCTGAGAGCACTCAG
GGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGATGAGAGTTCTGGTGCTTTG
GAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACGATGATCCCAAGGACTCATGGAGAGGCA
TTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGG*CAAAAGTATGATTCCCACTATGATGTTTTCAA
CCCTACAGAATACGGACCACAAAAAAGCCAAAGGATTGCTTCCTTCCTGCTCTACTTATC
TGATGTAGAAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAACGGTGCTAATATGGGTGC
TGGATATGATTACAAGCAATGTACTGGGCTAAAAGTAAAACCTCGGAAAGGAGATGGTCT
TCTTTTTTATTCAGTGTTTCCTAATGGCACAATTGATCAGACTTCGCTTCACGGGAGTTG
CCCGGTGACCAAAGGAGAAAAATGGGTAGCGACCAAATGGATCAGAGACCAAGACCAAGA
AGACTAAAATGATTTCATCTTTTACATATGTATCTCTCACAGCTTCTATCTTTTGCCTGA
AAAAGGATTCTTGATCTGTTATGTACAGTTTATTCAACAAGACGGTGTAACTATTGGGGT
TATTTATATACAATGTGACGCAGTCCTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AV62TF U 1
AF RR4AD04TF U 402
AF RR4AD04JQ C 402
BS 1 473 RR4AV62TF
BS 474 474 RR4AD04TF
BS 475 521 RR4AV62TF
BS 522 522 RR4AD04TF
BS 523 627 RR4AV62TF
BS 628 628 RR4AD04TF
BS 629 803 RR4AV62TF
BS 804 804 RR4AD04TF
BS 805 813 RR4AV62TF
BS 814 1019 RR4AD04TF
BS 1020 1112 RR4AD04JQ

RD RR4AV62TF 822 0 0
GGACATCCCTGGATCAAAGAAAAGTCTCGCTCCCGGCTTGAATACCCTTTTACTCCGGCG
AATATCCATCGTTAAAATTTTCAGATCGGGCCTAGCTCAATGAAGAACAGATTGAAGAGC
TACAAGAGGAAGAAGCTAGGGTTAGCCACAGTCATCGTCTTCTGTTCCCTCTGTTTCCTC
ATCGGCTTCTACGCTTCAGCTCTACTCTCTCAGAATGTGCCTGGAGTACGACCCAGGTTG
AGAATGGTGGAGATGGTGGAGAACGGTGAAGGAGAAGGTTCCTCGATGCCTCATGGTGTT
AGTGGAGATGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTGGAAACCGAGGGCT
TTATATTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTATTGAGAGAGCAAAG
GTTAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGCTGAGAGTACTCAG
GGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAAGAGAGTTCTGGTGCTTTG
GAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACGATGATCCCAAGGACTCATGGAGAGGCA
TTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGGGCAAAAGTATGATTCCCACTATGATGTTTTCAA
CCCTACAGAATACGGACCACAAAAAAGCCAAAGGATTGCTTCCTTCCTGCTCTACTTATC
TGATGTAGAAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAACGGTGCTAATATGGGTGC
TGGATATGATTACAAGCAATGTATTGGGCTAAA
GTAAACCTC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4AD04TF 618 0 0
G
ATTATTGAGAGAGCAAAGGTTAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAG
ACTGCTGAGAGCACTCAGGGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAT
GAGAGTTCTGGTGCTTTGGAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACGATGATCCCA
AGGACTCATGGAGAGGCATTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGG*CAAAAGTATGATTC
CCACTATGATGTTTTCAACCCTACAGAATACGGACCACAAAAAAGCCAAAGGATTGCTTC
CTTCCTGCTCTACTTATCTGATGTAGAAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAA
CGGTGCTAATATGGGTGCTGGATATGATTACAAGCAATGTACTGGGCTAAAAGTAAAACC
TCGGAAAGGAGATGGTCTTCTTTTTTATTCAGTGTTTCCTAATGGCACAATTGATCAGAC
TTCGCTTCACGGGAGTTGCCCGGTGACCAAAGGAGAAAAATGGGTAGCGACCAAATGGAT
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CTTCTATCTTTTGCCTG

QA 2 618 2 618
DS 

RD RR4AD04JQ 711 0 0
G
ATTATTGAGAGAGCAAAGGTTAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAG
ACTGCTGAGAGCACTCAGGGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAT
GAGAGTTCTGGTGCTTTGGAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACGATGATCCCA
AGGACTCATGGAGAGGCATTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGG*CAAAAGTATGATTC
CCACTATGATGTTTTCAACCCTACAGAATACGGACCACAAAAAAGCCAAAGGATTGCTTC
CTTCCTGCTCTACTTATCTGATGTAGAAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAA
CGGTGCTAATATGGGTGCTGGATATGATTACAAGCAATGTACTGGGCTAAAAGTAAAACC
TCGGAAAGGAGATGGTCTTCTTTTTTATTCAGTGTTTCCTAATGGCACAATTGATCAGAC
TTCGCTTCACGGGAGTTGCCCGGTGACCAAAGGAGAAAAATGGGTAGCGACCAAATGGAT
CAGAGACCAAGACCAAGAAGACTAAAATGATTTCATCTTTTACATATGTATCTCTCACAG
CTTCTATCTTTTGCCTGAAAAAGGATTCTTGATCTGTTATGTACAGTTTATTCAACAAGA
CGGTGTAACTATTGGGGTTATTTATATACAATGTGACGCAGTCCTATATC

QA 2 711 2 711
DS 



AS 1 3

CO CL3947Contig1 890 3 2 U
GGTGATCCGATGGAACCAAGACCTACGGTGGATATTCGGAGTCCATTGTGGTCGACCAAC
GGTTTGTTTTACAGTTTCCCGAGGGATTACCTAGCGATTCTGGTGCGCCTTTGCTGTGTG
CTGGAATCACTGTGTATAGTCCAATGAAGTACTATGGTATGACCGAGCCAGGGAAGCATT
TGGGTGTGGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTG
GTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTC
TTGGTGCTGATCCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAA
CAATGGACTGCATTATCGATACCGTTTCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTT
TACTCAAAGTCAATGGAAAGCTAGTCACTTTAGGCTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTAC
CAATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGA
AGGAGACACAGGAGATGCTTGAGTTCTGCGCTAAGCATAACATAACGGCAGATATTGAGC
TGATCAAGATGGATGAGATTAACACTGCAATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGATGTTAGGT
ACAGGTTCGTGATCGACGTGGCTAACTCCTTGAGCCCTCCATGACTTAGCCGAATCTAAG
AGTTGACCCTGGAGGAGTTTGTATCTTGTGCTTCTGTTGTCTTCGTGTTATCTTCGTTTT
CTACTATTATGTTTTTAGTGAACTGGTTTCTTCTGAAACAAGTCACTTTAAGTTGTCAGA
GAACGTCTCTCTGTGTTTCCTTTTCACGATATAATAAGTATTTCTGATTA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EP45TF U 1
AF RR4EP45JQ C 113
AF RR4EO24TF U 199
BS 1 547 RR4EP45TF
BS 548 890 RR4EO24TF

RD RR4EP45TF 547 0 0
GGTGATCCGATGGAACCAAGACCTACGGTGGATATTCGGAGTCCATTGTGGTCGACCAAC
GGTTTGTTTTACAGTTTCCCGAGGGATTACCTAGCGATTCTGGTGCGCCTTTGCTGTGTG
CTGGAATCACTGTGTATAGTCCAATGAAGTACTATGGTATGACCGAGCCAGGGAAGCATT
TGGGTGTGGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTG
GTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTC
TTGGTGCTGATCCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAA
CAATGGACTGCATTATCGATACCGTTTCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTT
TACTCAAAGTCAATGGAAAGCTAGTCACTTTAGGCTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTAC
CAATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGA
AGGAGAC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4EP45JQ 777 0 0
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GAAGCATTTGGGTGTGGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAA
AGCTTTTGGTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCAT
TAATCGTCTTGGTGCTGATCCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGC
AATAGGAACAATGGACTGCATTATCGATACCGTTTCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATT
ACTTGGTTTACTCAAAGTCAATGGAAAGCTAGTCACTTTAGGCTTACCTGAGAAGCCTCT
TGAGCTACCAATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGG
AGGAATGAAGGAGACACAGGAGATGCTTGAGTTCTGCGCTAAGCATAACATAACGGCAGA
TATTGAGCTGATCAAGATGGATGAGATTAACACTGCAATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGA
TGTTAGGTACAGGTTCGTGATCGACGTGGCTAACTCCTTGAGCCCTCCATGACTTAGCCG
AATCTAAGAGTTGACCCTGGAGGAGTTTGTATCTTGTGCTTCTGTTGTCTTCGTGTTATC
TTCGTTTTCTACTATTATGTTTTTAGTGAACTGGTTTCTTCTGAAACAAGTCACTTTAAG
TTGTCAGAGAACGTCTCTCTGTGTTTCCTTTTCATGATATAATAAGTATTTCTGATT

QA 1 777 1 777
DS 

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GG
GGGCTTGGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGAAAGTTACTGTGATT
AGTTCTTCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTCTTGGTGCTGATTCGTTTCTT
GTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAACAATGGACTACATTATCGAT
ACCGTTTCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTTTACTCAAAGTCAATGGAAAG
CTAGTCACTTTAGGCTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTACCAATCTTCCCTCTTGTTCTC
GGAAGGAAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGAAGGAGACACAGGAGATGCTT
GAGTTCTGCGCTAAGCATAACATAACGGCAGATATTGAGCTGATCAAGATGGATGAGATT
AACACTGCAATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGATGTTAGGTACAGGTTCGTGATCGACGTG
GCTAACTCCTTGAGCCCTCCATGACTTAGCCGAATCTAAGAGTTGACCCTGGAGGAGTTT
GTATCTTGTGCTTCTGTTGTCTTCGTGTTATCTTCGTTTTCTACTATTATGTTTTTAGTG
AACTGGTTTCTTCTGAAACAAGTCACTTTAAGTTGTCAGAGAACGTCTCTCTGTGTTTCC
TTTTCACGATATAATAAGTATTTCTGATTA

QA 3 692 3 692
DS 



AS 1 3

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AGAGGCGGAGCAAGGAGGAGGAGATCCGGCGATGTGGGAGGATCTTGATCGTAATTTCAG
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AAACATCTCTAAGGTTGTTTCAATGTACTCTGACCTCAACACCAATTTCTCATCGGCGTT
TCACGGTGGGAAGAACGGACGCGACGGTGGTGGAACTGCCGGAACCAGAGCTAATTAATC
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CTGTTTAACATAAGATCTAAACCTGTTATATAAGTTAATGTTATGTTATTGCAATGATTG
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TCTTTTTCAATGTGTCTCTGCTGCAATTTCTCTAATAAT


BQ
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AF RR4BU14TF U 148
AF RR4BU14JQ C 1
AF RR4FF78TF U 2
BS 1 3 RR4BU14JQ
BS 4 59 RR4FF78TF
BS 60 60 RR4BU14JQ
BS 61 106 RR4FF78TF
BS 107 107 RR4BU14JQ
BS 108 147 RR4FF78TF
BS 148 435 RR4BU14TF
BS 436 639 RR4FF78TF

RD RR4BU14TF 288 0 0
GGCGATGTGGGAGGATCTTGATCGTAATTTCAGACAAGTGCAGTCGGTTTTGGACAGAAA
CAGATCACTTATCCAGCAAGTCAACGAAAATCACCAGTCAAGAATGGCTGATAACATGTC
CAAGAACGTTGCTTTGATCCAAGAACTCAACGGAAACATCTCTAAGGTTGTTTCAATGTA
CTCTGACCTCAACACCAATTTCTCATCGGCGTTTCACGGTGGGAAGAACGGACGCGACGG
TGGTGGAACTGCCGGAACCAGAGCTAATTAATCAACCCGGATCAAATT

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR4BU14JQ 639 0 0
GGAAAAATAAATCATACAAAGCACACATACAAAACATATAGAAGAAGAAAATCTTCGGTA
GATAAAAACTATTTAAATGAAAGGGAACGGTGAAACCAAGCGGCGGAGGAACGTGGCGGA
AGAGGCGGAGCAAGGAGGAGGAGATCCGGCGATGTGGGAGGATCTTGATCGTAATTTCAG
ACAAGTGCAGTCGGTTTTGGACAGAAACAGATCACTTATCCAGCAAGTCAACGAAAATCA
CCAGTCAAGAATGGCTGATAACATGTCCAAGAACGTTGCTTTGATCCAAGAACTCAACGG
AAACATCTCTAAGGTTGTTTCAATGTACTCTGACCTCAACACCAATTTCTCATCGGCGTT
TCACGGTGGGAAGAACGGACGCGACGGTGGTGGAACTGCCGGAACCAGAGCTAATTAATC
AACCCGGATCAAATTGATCTCTCTTAGTTGGACCGGCCGGTTTGAACATTTCGAATAAGT
CTGTTTAACATAAGATCTAAACCTGTTATATAAGTTAATGTTATGTTATTGCAATGATTG
TCGTTAGAATAATCCGTGGGAGAAAACCCATTATATGGGTTATTTTAATTATGGTTCGAG
TCTTTTTCAATGTGTCTCTGCTGCAATTTCTCTAATAAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4FF78TF 638 0 0
GG
AAAATAAATCATACAAAACACACATACAAAACATATAGAAGAAGAAAATCTTCGGTTGAT
AAAAACTATTTAAATGAAAAGGAACGGTGAAACCAAGCGGCGGGGGAACGTGGCGGAAGA
GGCGGAGCAAGGAGGAGGAGATCCGGCGATGTGGGAGGATCTTGATCGTAATTTCAGACA
AGTGCAATCGGTTTTGGACAGAAACAGATCACTTATCCAGCAAGTCAACGAAAATCACCA
GTCAAGAATGGCTGATAACATGTCCAAGAACGTTGCTTTGATCCAAGAACTCAACGGAAA
CATCTCTAAGGTTGTTTCAATGTACTCTGACCTCAACACCAATTTCTCATCGGCGTTTCA
CGGTGGGAAGAACGGACGCGACGGTGGTGGAACTGCCGGAACCAGAGCTAATTAATCAAC
CCGGATCAAATTGATCTCTCTTAGTTGGACCGGCCGGTTTGAACATTTCGAATAAGTCTG
TTTAACATAAGATCTAAACCTGTTATATAAGTTAATGTTATGTTATTGCAATGATTGTCG
TTAGAATAATCCGTGGGAGAAAACCCATTATATGGGTTATTTTAATTATGGTTCGAGTCT
TTTTCAATGTGTCTCTGCTGCAATTTCTCTAATAAT

QA 3 638 3 638
DS 



AS 1 3

CO CL3949Contig1 783 3 5 U
GACAATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATAC
CAAAAAACTCAAGCACAAAAGTAATAATATAACTCATTATACAAAGAAAAAAATACAATG
GGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCT
GTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCCTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGAC
GACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAGCTTGCTAGAGGA
CGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGC
CGATCTTACTATGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGT
GCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTT
GATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTC
TTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTT
TCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTCCG
TTGTTGTTGTTGTCCTTGTGTTTCGTTTCGTTCATATATTTAAGTTCCGTTTGTCTATTA
TATACATCATATGATGTTCTTAGTACAATTAAGCATTTGTTTTTAAATGAGGGCCCAAGT
TGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4C571JQ C 1
AF RR4C571TF U 121
AF RR4EJ45TF U 196
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TTGTTGTTGTTGTCCTTGTGTTTCGTTTCGTTCATATATTTAAGTTCCGTTTGTCT

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DS 

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GTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCCTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGAC
GACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAGCTTGCTAGAGGA
CGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGC
CGATCTTACTATGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGT
GCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTT
GATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTC
TTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTT
TCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTCCG
TTGTTGTTGTTGTCCTTGTGTTTCGTTTCGT*CATATATTTAAGTTCCGTTTGTCT

QA 1 596 1 596
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G
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CTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAGCTTGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGAT
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GCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCT
ATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTTGATTCAACACGGTTCG
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TATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTTTATTTCATCATG
ATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTCCTTTGTTGTTGTTGTCCT
TGTGTTTCGTTTCGTTCATATATTTAAGTTCCGTTTGTCTATTATATACATCATATGATG
TTCTTAGTACAATTAAGCATTTGTTTTTAAATGAGGGCCCAAGTTGG

QA 2 588 2 588
DS 



AS 1 2

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CATACTCTGCTTGTTCATGGCTTCGTCCGACAATCTAACCGACAAGAACATTGTATTCAG
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TGCTCTACCTGAATCTCCCGTTGCTGCTGCGGAAGCAACTAACGGGGTCTCTTCTTTTTC
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TGCAAGGAAACTTACTACTAAGGCAACGGCTAATCTTTATGACCAGAAACCTGAAGAGGT
TGCACCGGTTATTCCTCCTCCTCCTGCTTCTTCGATTAATAACGGTGGAAGCAAATCAAC
AGCTGGTTCATCATCATATGCCTCTCGGTTTGAGTACAATGACGACTTTCAAACCGGAGG
ACAAAGCGTTGGTGGTGGTGGTACACAAGTGCTTAGCCATGTTGCTCCACCAAACTCGTC
CAGCTTCTTTTCGGATTTTGGAATGGACAGTTCTTACCCCAAGAAACCAAGCTCCAACTC
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AAAGTCCATCTCTTCTGCTCAGTACTTTGGTGATCAGAACAAAAACGCTGATCTCGAATC
AAAAGCTACTCTTCAGAAGTTTTCAGGCTCAGCCTCTATATCAAGCACTGATTTTTTCGG
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AAACTTCCAATGAAAGTAGACACGTCTCTCTGTTGTTGTCATCAGCTTATATGGATACTA
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TAATTGTTATGATAAAGATACAACCCTGTTTTGAATGTTCGATCCTCAAAATAATTGTAA
GATTATATGGTTTTGCC


BQ
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AF RR4BA40TF U 1
AF RR4BA40JQ C 770
BS 1 818 RR4BA40TF
BS 819 819 RR4BA40JQ
BS 820 839 RR4BA40TF
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BS 841 867 RR4BA40TF
BS 868 1577 RR4BA40JQ

RD RR4BA40TF 870 0 0
GGTCCTTGATTTCAAAAAAATCTTGTCTTAATTCGTCGAGAGGGTGATCTGATCTGCTGT
CATACTCTGCTTGTTCATGGCTTCGTCCGACAATCTAACCGACAAGAACATTGTATTCAG
AAAACTAAAGTCAAAATCTGAGAACAAGGTATGCTTCGATTGCAGTGCGAAGAATCCAAC
ATGGGCATCAGTCACGTACGGTGTCTTCCTCTGCATAGATTGCTCAGCTACTCATCGCAG
TCTCGGTGTTCACATCAGCTTCGTCAGATCTACGAATTTGGATTCGTGGAGCCCCGAGCA
GCTCAGGACTATGATGTTTGGTGGCAACAACCGGGCACAGGTCTTCTTTAAGCAGCATGG
TTGGACCGACGGTGGCAAAATCGAGGCTAAGTACACTTCACGTGCTGCTGATTTGTATAG
GCAGATTCTTGCTAAAGAAGTTGCTAAAGCCATTTCACTACAAGATACTACTACTAACAC
TGCTCTACCTGAATCTCCCGTTGCTGCTGCGGAAGCAACTAACGGGGTCTCTTCTTTTTC
TGTCAAGGAAGACTTACCTCCTAAAGAAACCTCTTCGCCTAAAGCTTCTAATACAGTTGT
GCCTAGTACGTTTAAGAAACCCATTGGTGCTAAAAGGACGGGTAAAACTGGTGGTCTTGG
TGCAAGGAAACTTACTACTAAGGCAACGGCTAATCTTTATGACCAGAAACCTGAAGAGGT
TGCACCGGTTATTCCTCCTCCTCCTGCTTCTTCGATTAATAACGGTGGAAGCAAATCAAC
AGCTGGTTCATCATCATATGCCTCTCGGTTTGAGTACA*TGACGACTTTCAAACCGGAG*
ACAAAGCGTTGGTGGTGGTGGTACACA
GTG

QA 1 867 1 867
DS 

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CCAAACTCGTCCAGCTTCTTTTCGGATTTTGGAATGGACAGTTCTTACCCCAAGAAACCA
AGCTCCAACTCTTCAAAAGCTCAAGTAAAGGTTGAAGAGTCAGATGAAGCAAGAAAGAAG
TTTACAAATGCAAAGTCCATCTCTTCTGCTCAGTACTTTGGTGATCAGAACAAAAACGCT
GATCTCGAATCAAAAGCTACTCTTCAGAAGTTTTCAGGCTCAGCCTCTATATCAAGCACT
GATTTTTTCGGTCACGGGGAAGATGATTCCAATGTTGATATAACTGCTAGTGATCTCATT
AACCGGCTTTCTTTCCAGGCGCAACAAGATATCTCGTCTGTAATGAACATAGCAGGCGAA
ACAAAGAAGAAGCTTGGAACTTTGGCTTCTGGCATCTTCAGTGACCTTCAGGATAGAATG
CTGTAAGAAGAAAACTAGGTCTCTCATGGTTTTAATATTTTTACAGAGAAGAAGAAAGAA
GTGTTTCCGGGAAACTTCCAATGAAAGTAGACACGTCTCTCTGTTGTTGTCATCAGCTTA
TATGGATACTATTGGATATGTCATAAATATTACTTTTATCAATCTTTTGTTTGTTTGCAG
AAAAAAAGATTTAATTGTTATGATAAAGATACAACCCTGTTTTGAATGTTCGATCCTCAA
AATAATTGTAAGATTATATGGTTTTGCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 3

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GTTCGAGTTTTGAAGTCGAGGTTGTATCTGAGCAATTCGAAGGGAAGAGATTGCTAGAGA
GGCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTA
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AAGCCAAAGATGCTTGAAACTCTGTTTTTTTTAAAGGCCTTGTGAGAAAAGAACAAGAGA
ATGACTATGTTTGATACTTTCGTCATTACTTGCAAATCTACAAGACTATTTTTATGCTTT
CTTATTGTAAAACGGTTTCAGTTGGGCTCGGATGAGTTTAACAGCACTATTGGGC


BQ
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E002TF U 1
AF RR4AN33JQ C 1
AF RR4AN33TF U 1
BS 1 4 RR4E002TF
BS 5 5 RR4AN33TF
BS 6 331 RR4E002TF
BS 332 332 RR4AN33TF
BS 333 406 RR4E002TF
BS 407 407 RR4AN33TF
BS 408 416 RR4E002TF
BS 417 475 RR4AN33TF

RD RR4E002TF 416 0 0
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QA 1 416 1 416
DS 

RD RR4AN33JQ 475 0 0
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GGCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTA
TTAAGAAAGCTCAGACTCCACAACAGTGGAAGCCGTCACAAGACTCTTCTTCTACTACTC
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QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4AN33TF 475 0 0
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GGCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTA
TTAAGAAAGCTCAGACTCCACAACAGTGGAAGCCGTCACAAGACTCTTCTTCTACTACTC
AAGCCAAAGATGCTTGAAACTCTGTTTTTTTTAAAGGCCTTGTGAGAAAAGAACAAGAGA
ATGACTATGTTTGATACTTTCGTCATTACTTGCAAATCTACAAGACTATTTTTATGCTTT
CTTATTGTAAAACGGTTTCAGTTGGGCTCGGATGAGTTTAACAGCACTATTGGGC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 3

CO CL3952Contig1 831 3 12 U
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ATCTTGTCTTTAGGGTCGACAACTACATGAACTCTCCTAAAGATAACATAGTCCTTATGG
ATGCTTCGGGCCTACCCCTCCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAGTCTCGGAGATTGCT
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AGAAAACAGCGGAGATCAAGAGGAAAGAGGCAATGGTTGGAGGAGTCGCCTTTGGCAAAG
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TCATCCTCGACCAAATGTTTAGATATTGACTTTTCATTTTCAAGCTTTTAACGTATATAT
GGCCTCTCTTTTTGTCATGTAATTTGTGCATGTGTCCTAATAGGGACGAAAACGAATCGG
ATATCTATGTTTTTGAAGATATTCATTATCTCTATCGTTTTGTATTGATCATAACTTTTA
TGATTGGTATTTCCCCATTATTAATGTTTAACATATGGTAAAATTTGTACC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP92JQ C 1
AF RR4D294TF U 1
AF RR4AP92TF U 1
BS 1 62 RR4D294TF
BS 63 63 RR4AP92TF
BS 64 568 RR4D294TF
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BS 775 784 RR4D294TF
BS 785 831 RR4AP92JQ

RD RR4AP92JQ 831 0 0
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ATGCTTCGGGCCTACCCCTCCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAGTCTCGGAGATTGCT
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TGATTGGTATTTCCCCATTATTAATGTTTAACATATGGTAAAATTTGTACC

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4D294TF 791 0 0
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TGTGGAAGAAGTCCCTTCTCTTCAACTGTGATGGCTTCACAGTGTACAACTCCAATGGAG
ATCTTGTCTTTAGGGTCGACAACTACATGAACTCTCCTAAAGATAACATAGTCCTTATGG
ATGCTTCGGGCCTACCCCTCCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAGTCTCGGAGATTGCT
GGATGGTATACGATGGAGAAACACAAAGAGATCCAATATTTACGGCAAAGAAAAACATTG
GTATAGTGACAAACAGGAGGAGCTTGGTGTCAGTTAGCTCGAAGAAGACGGTACTATACG
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AGAAAACAGCGGAGATCAAGAGGAAAGAGGCAATGGTTGGAGGAGTCGCCTTTGGCAAAG
ATGTGTTTAAACTTATAGTTGAACCGGATATGGAGCCTCGTGTGGCCATGGCATTGACCA
TCATCCTCGACCAAATGTTTAGATATTGACTTTTCATTTTCAAGCTTTTAACGTATATAT
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TGAT
GGTATTT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AP92TF 795 0 0
TATTCTCCAACAAAAATCATCAATACCACAAAGAAAAGATAATGACAAAAGTTCACCCGA
AGTTCCAAAACACTTGCCAGGAAAGCTTGTATGATAGTAAAGAAGCTATCGTTTTAACGG
TGTGGAAGAAGTCCCTTCTCTTCAACTGTGATGGCTTCACAGTGTACAACTCCAATGGAG
ATCTTGTCTTTAGGGTCGACAACTACATGAACTCTCCTAAAGATAACATAGTCCTTATGG
ATGCTTCGGGCCTACCCCTCCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAGTCTCGGAGATTGCT
GGATGGTATACGATGGAGAAACACAAAGAGATCCAATATTTACGGCAAAGAAAAACATTG
GTATAGTGACAAACAGGAGGAGCTTGGTGTCAGTTAGCTCGAAGAAGACGGTACTATACG
AGATAGAAGGATCATACAGCCAAAGAAGCTGCAAAATATTGGACGAGAAGAGGAACAAGA
AGAAAACAGCGGAGATCAAGAGGAAAGAGGCAATGGTTGGAGGAGTCGCCTTTGGCAAAG
ATGTGTTTAAACTTATAGTTGAACCGGAGATGGAGCCTCGTGTGGCCATGGCATTGACCA
TCATCCTCGACCAAATGTTTAGATATTGACTTTTCATTTTCAAGCTTTTAACGTATATAT
GGCCTCTCTTTTTGTCATGTAATTTGTGCATGTGTCCTAATAGGGACGAAAACGAATCGG
ATATCTATGTTTTTGAAGATATTCATTATCTCTATCGTTTTGTATTGATCATAACTTTTA
TGAT
TGGTATTTCCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 3

CO CL3953Contig1 748 3 4 U
CGGTGAATCAAAACTTCTACTCATAACAAAAATATACAAGTCTATATGAACTATAAGAAG
CTACAAATCGGTTGCATGATGTTATAAAATATAATAATGTTTGGAAGATACGCTTATGAA
CAAGAAGCATCTAAAATCTTATGGACTATGGGACGAGCTCTACATATAGCTTTCAACGGT
GTAGCTTTGCGCATGATAATTCCCTTCTCAGCTTCTGTCATGTCCACATATTTTTCTCCA
TCTCTCTCCCAATCGAAACATTGTACCAACGAACCCAGAGCCAATGTCACAAGCCGCTGA
GCTAGCCCTGACCCAGGACAAGCTCGCCGTCCCATCCCAAAAGACAACATCTTTTTGTCC
TCACCTTCCTTCTCAAACCTCTCCGGCTTGAACTTCTCCGCCTCTTCCCACATCTTTGGG
TCTCTATGAATGGCCCACGCGTTCACCAATACCATAGTGCCACGAGGGACATCGTACCCT
GCCACCTTGCAGTCTTCTGACGCCATGTGAGGGAGAAGCATTGGTACCACAGGATATAGC
CGTAATGTCTCTGACATAATGTTCTGTAGATAAGGAAGCTTCGCAATATCTTGTTCCTCT
ATCAACCTGTCTGAACCGATCTGCTCGTCGATCTCGGTTCTTGCCCTTTTTAACACTTCT
GGATGGTTCAACAAGTTGGCCATCGCCCATTCTAACGTTCCTCCTGATGTATCAGTCCCG
GCAATTATCATAACTACTATGATTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A908JQ U 1
AF RR4A908TF C 1
AF RR4G911JQ U 5
BS 1 106 RR4A908JQ
BS 107 107 RR4G911JQ
BS 108 584 RR4A908JQ
BS 585 748 RR4G911JQ

RD RR4A908JQ 585 0 0
CGGTGAATCAAAACTTCTACTCATAACAAAAATATACAAGTCTATATGAACTATAAGAAG
CTACAAATCGGTTGCATGATGTTATAAAATATAATAATGTTTGGAAAATACGCTTATGAA
CAAGAAGCATCTAAAATCTTATGGACTATGGGACGAGCTCTACATATAGCTTTCAACGGT
GTAGCTTTGCGCATGATAATTCCCTTCTCAGCTTCTGTCATGTCCACATATTTTTCTCCA
TCTCTCTCCCAATCGAAACATTGTACCAACGAACCCAGAGCCAATGTCACAAGCCGCTGA
GCTAGCCCTGACCCAGGACAAGCTCGCCGTCCCATCCCAAAAGACAACATCTTTTTGTCC
TCACCTTCCTTCTCAAACCTCTCCGGCTTGAACTTCTCCGCCTCTTCCCACATCTTTGGG
TCTCTATGAATGGCCCACGCGTTCACCAATACCATAGTGCCACGAGGGACATCGTACCCT
GCCACCTTGCAGTCTTCTGACGCCATGTGAGGGAGAAGCATTGGTACCACAGGATATAGC
CGTAATGTCTCTGACATAATGTTCTGTAGATAAGGAAGCTTCGC
C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4A908TF 585 0 0
CGGTGA
ATCAAAACTTCTACTCATAACAAAAATATACAAGTCTATATGAACTATAAGAAGCTACAA
ATCGGTTGCATGATGTTATAAAATATAATAATGTTTGGAAGATACGCTTATGAACAAGAA
GCATCTAAAATCTTATGGACTATGGGACGAGCTCTACATATAGCTTTCAACGGTGTAGCT
TTGCGCATGATAATTCCCTTCTCAGCTTCTGTCATGTCCACATATTTTTCTCCATCTCTC
TCCCAATCGAAACATTGTACCAACGAACCCAGAGCCAATGTCACAAGCCGCTGAGCTAGC
CCTGACCCAGGACAAGCTCGCCGTCCCATCCCAAAAGACAACATCTTTTTGTCCTCACCT
TCCTTCTCAAACCTCTCCGGCTTGAACTTCTCCGCCTCTTCCCACATCTTTGGGTCTCTA
TGAATGGCCCACGCGTTCACCAATACCATAGTGCCACGAGGGACATCGTACCCTGCCACC
TTGCAGTCTTCTGACGCCATGTGAGGGAGAAGCATTGGTACCACAGGATATAGCCGTAAT
GTCTCTGACATAATGTTCTGTAGATAAGGAAGCTTCGC
C

QA 7 584 7 584
DS 

RD RR4G911JQ 744 0 0
GG
ATCAAAACTTCTACTCATAACAAAAATATACAAGTCTATATGAACTATAAGAAGCTACAA
ATCGGTTGCATGATGTTATAAAATATAATAATGTTTGGAAGATACGCTTATGAACAAGAA
GCATCTAAAATCTTATGGACTATGGGACGAGCTCTACATATAGCTTTCAACGGTGTAGCT
TTGCGCATGATAGTTCCCTTCTCAGCTTCTGTCATGTCCACATATTTTTCTCCATCTCTC
TCCCAATCGAAACATTGTACCAACGAACCCAGAGCCAATGTCACAAGCCGCTGAGCTAGC
CCTGACCCAGGACAAGCTCGCCGTCCCATCCCAAAAGACAACATCTTTTTGTCCTCACCT
TCCTTCTCAAACCTCTCCGGCTTGAACTTCTCCGCCTCTTCCCACATCTTTGGGTCTCTA
TGAATGGCCCACGCGTTCACCAATACCATAGTGCCACGAGGGACATCGTACCCTGCCACC
TTGCAGTCTTCTGACGCCATGTGAGGGAGAAGCATTGGTACCACAGGATATAGCCGTAAT
GTCTCTGACATAATGTTCTGTAGATAAGGAAGCTTCGCAATATCTTGTTCCTCTATCAAC
CTGTCTGAACCGATCTGCTCGTCGATCTCGGTTCTTGCCCTTTTTAACACTTCTGGATGG
TTCAACAAGTTGGCCATCGCCCATTCTAACGTTCCTCCTGATGTATCAGTCCCGGCAATT
ATCATAACTACTATGATTCCTT

QA 3 744 3 744
DS 



AS 1 3

CO CL3954Contig1 807 3 3 U
GGACAAACAACAACTTTTCTTCTTCTTTCTCTCTCCTCTCTCCACTCTCTCTCTCTCATT
GCGAAGATGATAGATTCTACCTTGGAGTTCGTCAACAAAACCACTTCCAATTCTTTATTC
ATGTTTCTCTTCTGCAACGTGATCATCATCTTAATCCTCATGGGGAAACTCTAAACCGGG
TTCAGAAGACAAGCTCGGTTCGAAGGAACCCATGCTGGTATCTGAATCGGTTCTCTCTTC
CAAGTCCATGTTGTTATCTGAGTCGAGGACCCTCAACTCAAAGGCCGATTTTAAGAAACC
CGTGCTGATACCTGAATCGGTTCTGTCCTCCAAACCCGTGCTAGTGTCTGAATCGGTTCT
CTCTTCCAAACCCGGTTTGGAGAAACCAGAGTTAATATCTGATTCTACTCTCCCGTTAAA
TCCCGGTTTACAAGAACCGGGAACGATATCAAAGTCGGTTCGCTCCTCCAAACCTGTGGG
TTCTGATCAATCGTTGACTTCTAAATCCGGTTTGAATGTAATATCTTCGGGGTTGAAACT
CGGTTCAGACTGTTTAGAGAAGGATGACGAGAGAGGGAGAATGAGAAAGAAAGAGAGCTT
GGAAGTAGAGAATGAGAGCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAGAAGACGAGCTGAAGAATT
TATCCGTAAAGTTAATACTCAATGGAAATTAGAGAATACTTGTCTCCGATACTAATCAGA
GTTTTGTTTGTAATTATCGAAATGCTCTTTTTCAAAAACAAAATGTTTTTATGGAAATAC
TTTTTTAAAAACAACTAAATTTAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D563TF U 1
AF RR4B210TF U 282
AF RR4D563JQ C 411
BS 1 751 RR4D563TF
BS 752 774 RR4B210TF
BS 775 807 RR4D563JQ

RD RR4D563TF 754 0 0
GGACAAACAACAACTTTTCTTCTTCTTTCTCTCTCCTCTCTCCACTCTCTCTCTCTCATT
GCGAAGATGATAGATTCTACCTTGGAGTTCGTCAACAAAACCACTTCCAATTCTTTATTC
ATGTTTCTCTTCTGCAACGTGATCATCATCTTAATCCTCATGGGGAAACTCTAAACCGGG
TTCAGAAGACAAGCTCGGTTCGAAGGAACCCATGCTGGTATCTGAATCGGTTCTCTCTTC
CAAGTCCATGTTGTTATCTGAGTCGAGGACCCTCAACTCAAAGGCCGATTTTAAGAAACC
CGTGCTGATACCTGAATCGGTTCTGTCCTCCAAACCCGTGCTAGTGTCTGAATCGGTTCT
CTCTTCCAAACCCGGTTTGGAGAAACCAGAGTTAATATCTGATTCTACTCTCCCGTTAAA
TCCCGGTTTACAAGAACCGGGAACGATATCAAAGTCGGTTCGCTCCTCCAAACCTGTGGG
TTCTGATCAATCGTTGACTTCTAAATCCGGTTTGAATGTAATATCTTCGGGGTTGAAACT
CGGTTCAGACTGTTTAGAGAAGGATGACGAGAGAGGGAGAATGAGAAAGAAAGAGAGCTT
GGAAGTAGAGAATGAGAGCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAGAAGACGAGCTGAAGAATT
TATCCGTAAAGTTAATACTCAATGGAAATTAGAGAATACTTGTCTCCGATACTAATCAGA
GTTTTGTTTGTAATTATCGAAATGCTCTTTT
CAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4B210TF 493 0 0
G
GGCCGATTTTAAGAAACCCGTGCTGATACCTGAATCGGTTCTGTCCTCCAAACCCGTGCT
AGTGTCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAACCCGGTTTGGAGAAACCAGAGTTAATATCTGA
TTCTACTCTCCCGTTAAATCCCGGTTTACAAGAACCGGGAACGATATCAAAGTCGGTTCG
CTCCTCCAAACCTGTGGGTTCTGATCAATCGTTGACTTCTAAATCCGGTTTGAATGTAAT
ATCTTCGGGGTTGAAACTCGGTTCAGACTGTTTAGAGAAGGATGACGAGAGAGGGAGAAT
GAGAAAGAAAGAGAGCTTGGAAGTAGAGAATGAGAGCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAG
AAGACGAGCTGAAGAATTTATCCGTAAAGTTAATACTCAATGGAAATTAGAGACTACTTG
TCTCCGATACTAATCAGAGTTTTGTTTGTAATTATCGAAATGCTCTTTTTCAAAAACAAA
ATGTTTTTATGG

QA 2 493 2 493
DS 

RD RR4D563JQ 397 0 0
TCCCGTTAAATCCCGGTTTACAAGAACCGGGAACGATATCAAAGTCGGTTCGCTCCTCCA
AACCTGTGGGTTCTGATCAATCGTTGACTTCTAAATCCGGTTTGAATGTAATATCTTCGG
GGTTGAAACTCGGTTCAGACTGTTTAGAGAAGGATGACGAGAGAGGGAGAATGAGAAAGA
AAGAGAGCTTGGAAGTAGAGAATGAGAGCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAGAAGACGAG
CTGAAGAATTTATCCGTAAAGTTAATACTCAATGGAAATTAGAGAATACTTGTCTCCGAT
ACTAATCAGAGTTTTGTTTGTAATTATCGAAATGCTCTTTTTCAAAAACAAAATGTTTTT
ATGGAAATACTTTTTTAAAAACAACTAAATTTAGATG

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 3

CO CL3955Contig1 1053 3 4 U
CTGTATTAAGCTGCATATGATCTTCATTTAACATTAGAGAACGACACATTAGCAAATACT
AATGCAAACTTAATTAAAGTGCTAATGAGTGTCTAACATCCTTGTTGAATAAGAGCCGCT
AGAGAATATACAGAAACAAAACAACTACTAAATTAAAGTACTAATGAGTCTCTCTCTCTA
ACTTCAATGTCACTTCAGATGTAGAGGATCAACTCTTCTACCTTGTTCCTAAACTTTCCA
GATGCCTCTACAGATACTTTTTACTCTCTTTCTTTGTTCAGTTGTAGCAGAAACCCTGTA
CAAGTCTCCAAACGGGATTCTATCATTCATGTGCCTCGTCTACTGTGTTTTGACTCTATT
CCTGAAGCGCACGGACCGCCTCTGACATTTCCATTATCTGCTGCTCCGCTTTGGCTTTCC
AACTCACCAACTCTTTCAATGTTTCCTGAGAAAGAAGACTTGGGTCGTCAATATCTGATC
TTGGACCTGCAGTCACTGAAGAACCTGGAGTCAACTCCGCTTTGTCCTGATTACAGATTC
TGGAATCACCTCTGGTCATGCAGCTCTCCGTCCTTTGCATTTCGGAGTTGAGCACTGACT
GTTCCTCAAACCACATATGATCTTGAAATGAGCTTTTGCGAGCATTTGGTGGGAGCGAGT
AGTCAGCCTCAGGTAGAACATCGGTAAGGTCAGCTTCAACATCCCATGGCTCGAAACCAT
TCACTGTAAAATCATCCAAGGTAGCGCTATGCAATAGATTTTCCCAATTATTAGGAGGAG
ATCTGCTCCCATTTGCCTGCATATTGTTCTGCGAGTTCGAAATTCCCACCAGCTGATGTT
CTACTTTATCTTTCCAGGAAGCTAGCTCGTTAACCATGCACTGTGTTGAAGTCAAAGAAG
TCGAGATCTCTGCCATTTTCTTATCAGTCTCTACCTTCCACCTCATGCATTCCTTGAATT
TTCTCGTTTGCATCAGCATGATCTGGTGACTTTGGCTTGGATACAAGCTTCTTGATATCA
CTCTTCATCTTATCTATTTCTTCCCTAAGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ57JQ U 8
AF RR4E347JQ U 1
AF RR4BQ57TF C 376
BS 1 536 RR4E347JQ
BS 537 537 RR4BQ57JQ
BS 538 668 RR4E347JQ
BS 669 1053 RR4BQ57TF

RD RR4BQ57JQ 642 0 0
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ATACAGAAACAAAAC***TACTAAATTAAAGTACTAATGAGTCTCTCTCTCTAACTTCAA
TGTCACTTCAGATGTAGAGGATCAACTCTTCTACCTTGTTCCTAAACTTTCCAGATGCCT
CTACCGATACTTTTTACTCTCTTTCTTTGTTCAGTTGTAGCAGAAACCCTGTACAAGTCT
CCAAACGGGATTCTATCATTCATGTGCCTCGTCTACTGTGTTTTGACTCTATTCCTGAAG
CGCACGGACCGCCTCTGACATTTCCATTATCTGCTGCTCCGCTTTGGCTTTCCAACTCAC
CAACTCTTTCAATGTTTCCTGAGAAAGAAGACTTGGGTCGTCAATATCTGATCTTGGACC
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AAACCACATATGATCTTGAAATGAGCTTTTGCGAGCATTTGG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4E347JQ 668 0 0
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AATGCAAACTTAATTAAAGTGCTAATGAGTGTCTAACATCCTTGTTGAATAAGAGCCGCT
AGAGAATATACAGAAACAAAACAACTACTAAATTAAAGTACTAATGAGTCTCTCTCTCTA
ACTTCAATGTCACTTCAGATGTAGAGGATCAACTCTTCTACCTTGTTCCTAAACTTTCCA
GATGCCTCTACAGATACTTTTTACTCTCTTTCTTTGTTCAGTTGTAGCAGAAACCCTGTA
CAAGTCTCCAAACGGGATTCTATCATTCATGTGCCTCGTCTACTGTGTTTTGACTCTATT
CCTGAAGCGCACGGACCGCCTCTGACATTTCCATTATCTGCTGCTCCGCTTTGGCTTTCC
AACTCACCAACTCTTTCAATGTTTCCTGAGAAAGAAGACTTGGGTCGTCAATATCTGATC
TTGGACCTGCAGTCACTGAAGAACCTGGAGTCAACTCCGCTTTGTCCTGATTACAGCTTC
TGGAATCACCTCTGGTCATGCAGCTCTCCGTCCTTTGCATTTCGGAGTTGAGCACTGACT
GTTCCTCAAACCACATATGATCTTGAAATGAGCTTTTGCGAGCATTTGGTGGGAGCGAGT
AGTCAGCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4BQ57TF 678 0 0
ACCG
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TGTTTCCTGAGAAAGAAGACTTGGGTCGTCAATATCTGATCTTGGAC*TGCAGTCACTGA
AGAACCTGGAGTCAACTCCGCTTTGTCCTGATTACAGATTCTGGAATCACCTCTGGTCAT
GCAGCTCTCCGTCCTTTGCATTTCGGAGTTGAGCACTGACTGTTCCTCAAACCACATATG
ATCTTGAAATGAGCTTTTGCGAGCATTTGGTGGGAGCGAGTAGTCAGCCTCAGGTAGAAC
ATCGGTAAGGTCAGCTTCAACATCCCATGGCTCGAAACCATTCACTGTAAAATCATCCAA
GGTAGCGCTATGCAATAGATTTTCCCAATTATTAGGAGGAGATCTGCTCCCATTTGCCTG
CATATTGTTCTGCGAGTTCGAAATTCCCACCAGCTGATGTTCTACTTTATCTTTCCAGGA
AGCTAGCTCGTTAACCATGCACTGTGTTGAAGTCAAAGAAGTCGAGATCTCTGCCATTTT
CTTATCAGTCTCTACCTTCCACCTCATGCATTCCTTGAATTTTCTCGTTTGCATCAGCAT
GATCTGGTGACTTTGGCTTGGATACAAGCTTCTTGATATCACTCTTCATCTTATCTATTT
CTTCCCTAAGCTTC

QA 5 678 5 678
DS 



AS 1 3

CO CL3956Contig1 826 3 4 U
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ATGGCGCTACACCTATGGCAAACACTGAGAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTCTCTCC
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TGGTTTGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCA
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AAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATGGCCATCAAACATCAGATC
TATGATGTTACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCA
GGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGG
GATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTC
AAGAGCAAGTATGCTACCGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAGAAACC
CCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTCATGTAACCAAGCAAGAA
TCGGCCGTAGTGTCTAAGAATGATGAGCCTCCTACTGAGCGTGATGTGAAGAACGAGTAG
ATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGGGGAAGTCTCAATGTAGAATTTCTGAT
GTTTTTGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGTTTCATTATCTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EC58TF U 37
AF RR4EC12TF U 1
AF RR4EC58JQ C 278
BS 1 331 RR4EC12TF
BS 332 332 RR4EC58TF
BS 333 648 RR4EC12TF
BS 649 826 RR4EC58JQ

RD RR4EC58TF 559 0 0
GG
ATTCTTCTCTCCAAGCGAAACCATGGCGCTACACCTATGGCAAACACTGAGAGAAGCGAT
ACATGCTTACACAGGTCTCTCCCCGGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGC
CATTTACCAAGTCGT*TCAGGCTGGTTTGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCA
GAGGGCTAGATCGTCAGCTGCAGAGGAAGAACCACCGATTCCTCAGCCTGTTCAGGTCGG
CGAGATCACAGAGGATGAGCTTAAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCT
TATGGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTTACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGG
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TGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCT
TCAGGACTGGGAGTACAAGTTCAAGAGCAAGTATGCTACCGTTGGCACCGTCAAAGTGAC
CGGTTCAGAAGCCGAAG

QA 3 559 3 559
DS 

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ATGGCGCTACACCTATGGCAAACACTGAGAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTCTCTCC
CCGGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGCCATTTACCAAGTCGTCTCAGGC
TGGTTTGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCA
GAGGAAGAACCACCGATTCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACAGAGGATGAGCTT
AAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCTCCTTCTTATGGCCATCAAACATCAGATC
TATGATGTTACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCA
GGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGG
GATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTC
AAGAGCAAGTATGCTACCGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAGAAACC
CCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTCATGTA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EC58JQ 549 0 0
GCGAGATCACAGAGGATGAGCTTAAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTC
TTATGGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTTACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAG
GAGGACCGTATGCTTTGTTTGCAGGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTT
TTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTC
TTCAGGACTGGGAGTACAAGTTCAAGAGCAAGTATGCTACCGTTGGCACCGTCAAAGTGA
CCGGTTCAGAAGCCGAAGAAACCCCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAG
ACGCTCATGTAACCAAGCAAGAATCGGCCGTAGTGTCTAAGAATGATGAGCCTCCTACTG
AGCGTGATGTGAAGAACGAGTAGATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGGGGA
AGTCTCAATGTAGAATTTCTGATGTTTTTGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGTTTCATTA
TCTCAAAAA

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL3957Contig1 951 2 10 U
GAGACAAAGATAATTCCAAGCTAAAGTAATTGGTTTACAGCCAGGTGGGTTCTCCATAAT
CCTTTGTTATTCAACCAACGCCTCAGTGACAAACACAAACCATTTTTCCAAAGTACTCTC
TACGCAGAATATGGTGTCTTCACTCCCATTCTCAGACACAACCAAGGCCGGTCCTGATTT
GGATCCACAAAACTATGATGCAGAAAGTGTCCAGCTTCTTCATCCATCAGTTCTCTCGAC
CATGTAACACGTCCTGACGAGCAGCTACCCGGACCAAAGCACCTGTACTCATAAAAGCAA
GCACTTCTCTCATTCTCTGCGTTACCCCAGTTATGCCAACCAACATTTCTAACACATGCA
TCCATGTAAGTGTATGCAAGGACCACTCTCCCAAATGGTCCCCATGGCCTTCCTAGATAC
ATATACCCACTCTGACCATTCCCCGCGATCACACATCTTAGGAAAACGTAACCAGTAGAT
TCCTGAAAGGTTTTGCGGCTCTGTGCTGTAATGAAACCCTGAGATTTGCAGTGGATATGG
CAGTGTTCCAAAAGCGCAGTGCTGTTTCCAAATATGAAATCCACGCTTCCTTCCACGTAG
CAGTCTTTCAAGTATTGCTTTCCATGATGCAAATACAATGTATCCTGCCAGCCGAGAAAG
CGACAGTTATAAAAGGCACAACGGTCTGCAGTGACTCTTATCGCCACAGCTTGCCCTGAT
CCCTCAGGAGAAGAGTTTTCAAAAGTAACGTTCTCAGCAATAAAGTCTTCACCTTCAACA
ATAACACTCCCGCACCCAAACGTTCCCGTCCCTATGACTCTAGACGCCTGGTGATGCTCA
ATCTTGGAAGCGGTGTTGTTCCAAGTGAGAAGGGTGATTTCCGGGGAGATTCCGGCGAAA
GTGATGAAGTCTTTCCTCTTGGGCACGTACACCGGCTGCCTGTAGATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU32JQ U 1
AF RR4C648TF C 274
BS 1 323 RR4CU32JQ
BS 324 324 RR4C648TF
BS 325 464 RR4CU32JQ
BS 465 465 RR4C648TF
BS 466 509 RR4CU32JQ
BS 510 510 RR4C648TF
BS 511 777 RR4CU32JQ
BS 778 778 RR4C648TF
BS 779 791 RR4CU32JQ
BS 792 951 RR4C648TF

RD RR4CU32JQ 791 0 0
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CCTTTGTTATTCAACCAACGCCTCAGTGACAAACACAAACCATTTTTCCAAAGTACTCTC
TACGCAGAATATGGTGTCTTCACTCCCATTCTCAGACACAACCAAGGCCGGTCCTGATTT
GGATCCACAAAACTATGATGCAGAAAGTGTCCAGCTTCTTCATCCATCAGTTCTCTCGAC
CATGTAACACGTCCTGACGAGCAGCTACCCGGACCAAAGCACCTGTACTCATAAAAGCAA
GCACTTCTCTCATTCTCTGCGTTTCCCCAGTTATGCCAACCAACATTTCTAACACATGCA
TCCATGTAAGTGTATGCAAGGACCACTCTCCCAAATGGTCCCCATGGCCTTCCTAGATAC
ATATACCCACTCTGACCATTCCCCGCGATCACACATCTTAGGAATACGTAACCAGTAGAT
TCCTGAAAGGTTTTGCGGCTCTGTGCTGTTATGAAACCCTGAGATTTGCAGTGGATATGG
CAGTGTTCCAAAAGCGCAGTGCTGTTTCCAAATATGAAATCCACGCTTCCTTCCACGTAG
CAGTCTTTCAAGTATTGCTTTCCATGATGCAAATACAATGTATCCTGCCAGCCGAGAAAG
CGACAGTTATAAAAGGCACAACGGTCTGCAGTGACTCTTATCGCCACAGCTTGCCCTGAT
CCCTCAGGAGAAGAGTTTTCAAAAGTAACGTTCTCAGCAATAAAGTCTTCACCTTCA*CA
ATAACACTCCC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4C648TF 678 0 0
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TGCCAACCAACATTTCTAACACATGCATCCATGTAAGTGTATGCAAGGACCACTCTCCCA
AATGGTCCCCATGGCCTTCCTAGATACATATACCCACTCTGACCATTCCCCGTGATCACA
CATCTTAGGAAAACGTAACCAGTAGATTCCTGAGAGGTTTTGCGGCTCTGTGCTGTAATG
AAACCCTGAGATTTGCAGTGGATATGGCAGTGTTCCAAGAGCGCAGTGCTGTTTCCAAAT
ATGAAATCCACGCTTCCTTCCACGTAGCAGTCTTTCAAGTATTGCTTTCCATGATGCAAA
TACAATGTATCCTGCCAGCCGAGAAAGCGACAGTTATAAAAGGCACAACGGTCTGCAGTG
ACTCTTATCGCCACAGCTTGCCCTGATCCCTCAGGAGAAGAGTTTTCAAAAGTAAGGTTC
TCAGCAATAAAGTCTTCACCTTCAACAATAACACTCCCGCACCCAAACGTTCCCGTCCCT
ATGACTCTAGACGCCTGGTGATGCTCAATCTTGGAAGCGGTGTTGTTCCAAGTGAGAAGG
GTGATTTCCGGGGAGATTCCGGCGAAAGTGATGAAGTCTTTCCTCTTGGGCACGTACACC
GGCTGCCTGTAGATCCCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

CO CL3958Contig1 947 3 3 U
GGGTAGCTTTTAAGAAATAAAGGAAGGGGAACAAGAGCAGAAGCTTCTCTCTCAGAATAA
ATCACAAAGAACAAGATTCTTTAATTTCTTTAAAGCCCTTAAAGGTTGTTCCTTGCTTTC
CTCGGTTAAAAAGAGGAAAGATGTTGTGTAGAATGGTGGTGGTGACCGGCGGCCGGAAGA
AGAAAGCCGGTTCGGTTCCGGTTTATCTGAATGTATACGACCTCACACCCATCAATGGCT
ACGCTTACTGGTTAGGACTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGAAGTTCACGGGGTTGAGT
ACGGTTTCGGAGCTCACGAGCATTCGACAACAGGGATCTTCGAGGTGGAACCGAAGCAGT
GTCCAGGTTTCACATTCAGGAAGTCTATTTTGATTGGGAGAACAGATTTGGATCCTGAGA
AAGTCCGTGCCTTTATGGAGAAGCTTGCTGAAGAGTACAGCGGAAACACTTACCATCTCA
TTACAAAGAACTGTAATCACTTTTGTAACGACGTTTGTGTTCAGCTGACTCGAAGATCTA
TCCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGCTCGTTTCGGTTTGTTCTGCAACTGTGTTCTGCCTG
CAGAGCTGAACGAGACGAAGGTGAGGCAGGTTAGGTCAAAAGAGGAGAAGGTTCCGGAAG
CAGAAGAGAAGAAACTTAGGAGCAGGTCAAGTAGATATCCACCTGGACCTTCGCTTTCTT
CGTCGGAGTCTTTAAACCGAAGCAGAAGAAGAGGAGGAGCAGGAGGAGGAGAGAGGAGAA
GACAATGTCTTCCTCCATCACCACCTGTGAGTGCTTAGGTTTTAGATTCTCCTAGTAAAA
TCTTTTTTTGTTTCGTTATTTGATTCGGTTTGTAATGGTTTCAAGAAGTTGTGTTTATGT
GAACCAAACATTTTTATTGATGGCTAATGGTATAAGATCTTTACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CZ60TF U 1
AF RR4CJ85TF U 105
AF RR4CJ85JQ C 182
BS 1 283 RR4CZ60TF
BS 284 648 RR4CJ85TF
BS 649 947 RR4CJ85JQ

RD RR4CZ60TF 283 0 0
GGGTAGCTTTTAAGAAATAAAGGAAGGGGAACAAGAGCAGAAGCTTCTCTCTCAGAATAA
ATCACAAAGAACAAGATTCTTTAATTTCTTTAAAGCCCTTAAAGGTTGTTCCTTGCTTTC
CTCGGTTAAAAAGAGGAAAGATGTTGTGTAGAATGGTGGTGGTGACCGGCGGCCGGAAGA
AGAAAGCCGGTTCGGTTCCGGTTTATCTGAATGTATACGACCTCACACCCATCAATGGCT
ACGCTTACTGGTTAGGACTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGA

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4CJ85TF 544 0 0
GTTGTTCCTTGCTTTCCTCGGTTAAAAAGAGGAAAGATGTTGTGTAGAATGGTGGTGGTG
ACCGGCGGCCGGAAGAAGAAAGCCGGTTCGGTTCCGGTTTATCTGAATGTATACGACCTC
ACACCCATCAATGGCTACGCTTACTGGTTAGGACTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGAA
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AACACTTACCATCTCATTACAAAGAACTGTAATCACTTTTGTAACGACGTTTGTGTTCAG
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AACTGTGTTCTGCCTGCAGAGCTGAACGAGACGAAGGTGAGGCAGGTTAGGTCAAAAGAG
GAGA

QA 1 544 1 544
DS 

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CGCTTACTGGTTAGGACTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGAAGTTCACGGGGTTGAGTA
CGGTTTCGGAGCTCACGAGCATTCGACAACAGGGATCTTCGAGGTGGAACCGAAGCAGTG
TCCAGGTTTCACATTCAGGAAGTCTATTTTGATTGGGAGAACAGATTTGGATCCTGAGAA
AGTCCGTGCCTTTATGGAGAAGCTTGCTGAAGAGTACAGCGGAAACACTTACCATCTCAT
TACAAAGAACTGTAATCACTTTTGTAACGACGTTTGTGTTCAGCTGACTCGAAGATCTAT
CCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGCTCGTTTCGGTTTGTTCTGCAACTGTGTTCTGCCTGC
AGAGCTGAACGAGACGAAGGTGAGGCAGGTTAGGTCAAAAGAGGAGAAGGTTCCGGAAGC
AGAAGAGAAGAAACTTAGGAGCAGGTCAAGTAGATATCCACCTGGACCTTCGCTTTCTTC
GTCGGAGTCTTTAAACCGAAGCAGAAGAAGAGGAGGAGCAGGAGGAGGAGAGAGGAGAAG
ACAATGTCTTCCTCCATCACCACCTGTGAGTGCTTAGGTTTTAGATTCTCCTAGTAAAAT
CTTTTTTTGTTTCGTTATTTGATTCGGTTTGTAATGGTTTCAAGAAGTTGTGTTTATGTG
AACCAAACATTTTTATTGATGGCTAATGGTATAAGATCTTTACATC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 3

CO CL3959Contig1 1020 3 9 U
GGGTAGGAATAAAATTTGAAATTCAAACGCTCCTTTTCTCTCAAACCTACTTCAACTTCC
CCCTCTCTCTCTCTCTCTTCCACGATAAACCCTAAAAAATCATTAGTGTTTCTTCACGAT
GACTCTTGTACCATCCATAGGTCGCGAGCTCTCGAATCCACCGTCCGATGGAATCTCTAA
TCTCAGGTTCTCCAATAGCAGCGACCATCTACTAGTCTCTTCATGGGATAAGAGTGTGAG
ATTGTATGATGCGAGCGCCGATTCGATGAGAGGAGAGTTCAAGCATGGAGGAGCGGTGCT
CGATTGCTGCTTCCATGACGAGTCTTCTGGGTTCAGTGCCTGCGCCGATCATAAAGTCAG
ACGAATTGACTTCAATGCTGGCAAAGAGGACATTTTGGGAATGCATGATGAACCGGTTCG
TTGTGTTGAGTATTCTTATGCTGCAGGGCAAGTGATCACTGGAAGCTGGGATAGAACGAT
TAAATGTTGGGACCCAAGAGCTGCGAGTGGGCCGGAGCGCTCACAGATTGGAACATATAA
GCAACCTGAGCGTGTTAACTCTCTTTCTCTCGTTGGAAATCATTTGGTTGTGGCGACAGC
AGTAAGACATGTCAATATTTATGACCTGAGGAATATGGCCCAGCCTGAGCAGAGAAGGGA
GTCCTCACTTAAGTACCAGACCAGATGTGTGCGTTGTTATCCCAATGGAACAGGGTATGC
ACTTAGCTCTGTTGAAGGGAGGGTTTCAATGGAGTTTTTCGATCTATCAGAGGCTGCTCA
AGCTAAAAAATATGCTTTCAAATGTCACCGGAAATCCGAGGATGGAAGGGACATTGTCTA
CCCTGTAAATGCGATTGCCTTCCTGGAGTTTTAAAAACATATTTTGGCTGTAAAGTGAAG
TGTGAACAATGCAATGGCTTTAGAATCTGATGTTGTGTTCTTTTGGTTTTGAGTAAAGTC
CATTTACTCTCTGGTGGTAAGAAACGATATTAATACAATGAGCTTGTGTTTCTGTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GN29TF U 1
AF RR4G010TF U 273
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RD RR4GN29TF 654 0 0
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AGGGAGGCATGTCAACATTTATGACCTGAGGAATATGGCCCAGCCTGAGCAGAG

QA 1 654 1 654
DS 

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CGGAGCGCTCACAGATTGGAACATATAAGCAACCTGAGCGTGTTAACTCTCTTTCTCTCG
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AATCCGAGGATGGAAGGGACATTGTCTACCCTGTAAATGCGATTGCCTTCCTGGAGTTTT
AAAAACATATTTTGGCTGTAAAGTGAAGTGTGAACAATGCAATGGCTTTAGAATCTGATG
TTGTGTTCTTTTGGTTTTGAGTAAAGTCCATTTACTCTCTGGTGGT

QA 1 706 1 706
DS 

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TCACTTAAGTACCAGACCAGATGTGTGCGTTGTTATCCCAATGGAACAGGGTATGCACTT
AGCTCTGTTGAAGGGAGGGTTTCAATGGAGTTTTTCGATCTATCAGAGGCTGCTCAAGCT
AAAAAATATGCTTTCAAATGTCACCGGAAATCCGAGGATGGAAGGGACATTGTCTACCCT
GTAAATGCGATTGCCTTCCTGGAGTTTTAAAAACATATTTTGGCTGTAAAGTGAAGTGTG
AACAATGCAATGGCTTTAGAATCTGATGTTGTGTTCTTTTGGTTTTGAGTAAAGTCCATT
TACTCTCTGGTGGTAAGAAACGATATTAATACAATGAGCTTGTGTTTCTGTGGTTT

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 3

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AACTTCATCCCCCCGCATATTTATCCTACCGAAAGTGAACGTTGTATTTTTCCCCTTTTA
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CATTAGCTTCTTGAATCCAGTCAACGGGAGCCAACCAGTTAGCGACAGTGTACTGATTAA
CCTCAGATGCAGACTTGGCGATCTTAACCCAGTCAACTCTTTTGTTAGTTTTAGCTCCTG
GTCCACGGTTGTTGAACTCAATGTACTTACATGTCTTGTGGAAACTTTCCCCATCCCAAA
CTTTCCATCCTTCAGGTGTAATCACATCACCGATCTCGCTGTTGATGACCGCGGTGGTGG
AGTACTTCTTCCACGGCCTTCCCAAGTATGACAGAACGGTTAACCTCTCTGCCTGTAGTT
TCTTGTCTGGAACGATTTTGCAGTTCTGGAGGACGATACCGATTTTCATGGATAATCCCT
TCTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGAATTGGTTCTTGTTTCCTTTACGGACAACAA
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CGACGATGTTTCTGTAGAACTGACGACCATTGTTAGCGTATAGAGTGTCTTGGTAACCAT
CGAATCTACAGTTGAAGAGGACTGCACGGTCTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD84JQ U 1
AF RR4F041JQ U 1
AF RR4DD84TF C 160
BS 1 559 RR4DD84JQ
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BS 650 650 RR4DD84TF
BS 651 660 RR4F041JQ
BS 661 754 RR4DD84TF

RD RR4DD84JQ 559 0 0
AAACAATATATTTTTTTTCCTCATATTTCATACGTGAGACAAACAAAAAGTGAATCTTAC
AACTTCATCCCCCCGCATATTTATCCTACCGAAAGTGAACGTTGTATTTTTCCCCTTTTA
CATGAACACGTACTAGTCTTTTTCAATTTTATATGATTTATAGTCCAAGGTTGACGGGAA
CATTAGCTTCTTGAATCCAGTCAACGGGAGCCAACCAGTTAGCGACAGTGTACTGATTAA
CCTCAGATGCAGACTTGGCGATCTTAACCCAGTCAACTCTTTTGTTAGTTTTAGCTCCTG
GTCCACGGTTGTTGAACTCAATGTACTTACATGTCTTGTGGAAACTTTCCCCATCCCAAA
CTTTCCATCCTTCAGGTGTAATCACATCACCGATCTCGCTGTTGATGACCGCGGTGGTGG
AGTACTTCTTCCACGGCCTTCCCAAGTATGACAGAACGGTTAACCTCTCTGCCTGTAGTT
TCTTGTCTGGAACGATTTTGCAGTTCTGGAGGACGATACCGATTTTCATGGATAATCCCT
TCTCGTTTCCGTCGGCTGT

QA 1 559 1 559
DS 

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GG
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CTTCATCCCCCCGCATATTTATCCTACCGAAAGTGAACGTTGTATTTTTCCCCTTTTACA
TGAACACGTGCTAGTCTTTTTCAATTTTATATGATTTATAGTCCAAGGTTGACGGGAACA
TTAGCTTCTTGAATCCAGTCAACGGGAGCCAACCAGTTAGCGACAGTGTACTGATTAACC
TCAGATGCAGACTTGGCGATCTTAACCCAGTCAACTCTTTTGTTAGTTTTAGCTCCTGGT
CCACGGTTGTTGAACTCAATGTACTTACATGTCTTGTGGAAACTTTCCCCATCCCAAACT
TTCCATCCTTCAGGTGTAATCACATCACCGATCTCGCTGTTGATGACCGCGGTGGTGGAG
TACTTCTTCCACGGCCTTCCCAAGTATGACAGAACGGTTAACCTCTCTGCCTGTAGTTTC
TTG*CTGGAACGATTTTGCAGTTCTGGAGGACGATACCGATTTTCATGGATAATCCCTTC
TCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGAATTGGTTCTTGTTTCCTTTACGGACAACAATC
ATTGAGTTTTGGATGACGGTTGCTCCTTTTCCGAAGATGAAATCGATTGTTCCTGAGA

QA 3 660 3 660
DS 

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TAGCGACAGTGTACTGATTAACCTCAGATGCAGACTTGGCGATCTTAACCCAGTCAACTC
TTTTGTTAGTTTTAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGAACTCAATGTACTTACATGTCTTGT
GGAAACTTTCCCCATCCCAAACTTTCCATCCTTCAGGTGTAATCACATCACCGATCTCGC
TGTTGATGACCGCGGTGGTGGAGTACTTCTTCCACGGCCTTCCCAAGTATGACAGAACGG
TTAACCTCTCTGCCTGTAGTTTCTTGTCTGGAACGATTTTGCAGTTCTGGAGGACGATAC
CGATTTTCATGGATAATCCCTTCTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGAATTGGTTCT
TGTTTCCTTTACGGACAACAATCATTGAGTTTTGGATGACGGTTGCTCCTTTTCCGAAGA
TGAAATCGATCGTTCCTGAGACGACGATGTTTCTGTAGAACTGACGACCATTGTTAGCGT
ATAGAGTGTCTTGGTAACCATCGAATCTACAGTTGAAGAGGACTGCACGGTCTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 3

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TGGCGTCTCTTAGCATCATCACCACAGCTTTATCTACAATCTTTCATCTTCTCCACAGCC
TCCACTACAAAGTCTCCAGCCTTGCGTCAAAGTCGGCATCTTCAGACAGGTGTTTCTCCA
GTCGTCACTTCAAGCTACTTGCCCACTTCCTACATCACTCAGAAGCAGATTGAAACCCCT
ACCTCCCCGGAAAAGCAAGGGCCATCAGTGCAGGAGAGTTTGGGTGCTTTTCAAAAACTC
CCCATGGTGATGCCATCTATTGATTTGTACTCTTCTGCTCTCAGGAAGTCCAGAAGAGTC
CAACCAACTAAAGGTATAGCTAATATAGCAAAGCGAGAAAGAAATAGAGGTGCTAAACAG
CTTGATGCGTTCATGAAAGAACTGGCTTTACCTTTAAAAGGATACATGGAGAGTTTTCCG
AGGAGGAGACTCTTGCATCCTTATGAGCGCTCTCTTATTGAGTTGACACTTGGTGATGGA
AAGTACGAGGAGGTGTTGGGAAAAGTTGATGCTCTTAGGAAGAAGGTGTTGTCTGTTGGA
AAGGAACATGCTTCTCTCTGTGCTAAGGCATTATCAAAGCGAGAAGCAGAGGATCGGTTG
AACGAAGGTGTGGAGAAGCTTGAATTGGTTTTCCAGCAAGAAGAGAGCTGTTGATGATTT
GTTAAGCATAGCAAAGTTTTGAGGGCTATGCCAGTTGTTGACTTGGAAATGCCAACCCTT
TGCCTTGTCGAGCCCAAACGTTGGAAATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C223TF U 1
AF RR4DE53TF U 13
AF RR4DG77TF U 13
BS 1 21 RR4C223TF
BS 22 22 RR4DE53TF
BS 23 30 RR4C223TF
BS 31 31 RR4DE53TF
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BS 629 647 RR4C223TF
BS 648 810 RR4DG77TF

RD RR4C223TF 647 0 0
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GTCGTCACTTCAAGCTACTTGCCCACTTCCTACATCACTCAGAAGCAGATTGAAACCCCT
ACCTCCCCGGAAAAGCAAGGGCCATCAGTGCAGGAGAGTTTGGGTGCTTTTCAAAAACTC
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CAACCAACTAAAGGTATAGCTAATATAGCAAAGCGAGAAAGAAATAGAGGTGCTAAACAG
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AAGTACGAGGAGGTGTTGGGAAAAGTTGATGCTCTTAGGAAGAAGGTGTTGTCTGTTGGA
AAGGAACATGCTTCTCTCTGTGCTAAG*CATTATCAAAGCGAGAAGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4DE53TF 609 0 0
GG
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CTACTTGCCCACTTCCTACATCACTCAGAAGCAGATTGAAACCCCTACCTCCCCGGAAAA
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ATCTATTGATTTGTACTCTTCTGCTCTCAGGAAGTCCAGAAGAGTCCAACCAACTAAAGG
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GCATCCTTATGAGCGCTCTCTTATTGAGTTGACACTTGGTGATGGAAAGTACGAGGAGGT
GTTGGGAAAAGTTGATGCTCTTAGGAAGAAGGTGTTGTCTGTTGGAAAGGAACATGCTTC
TCTCTGT

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR4DG77TF 798 0 0
GG
ATCAGAGAAGACGATGGAATTGGCGTCGAGCTTGTTTCCTAATCAATGGCGTCTCTTAGC
ATCATCACCACAGCTTTATCTACAATCTTTCATCTTCTCCACAGCCTCCACTACAAAGTC
TCCAGCCTTGCGTCAAAGTCGGCATCTTCAGACAGGTGTTTCTCCAGTCGTCACTTCAAG
CTACTTGCCCACTTCCTACATCACTCAGAAGCAGATTGAAACCCCTACCTCCCCGGAAAA
GCAAGGGCCATCAGTGCAGGAGAGTTTGGGTGCTTTTCAAAAACTCCCCATGGTGATGCC
ATCTATTGATTTGTACTCTTCTGCTCTCAGGAAGTCCAGAAGAGTCCAACCAACTAAAGG
TATAGCTAATATAGCAAAGCGAGAAAGAAATAGAGGTGCTAAACAGCTTGATGCGTTCAT
GAAAGAACTGGCTTTACCTTTAAAAGGATACATGGAGAGTTTTCCGAGGAGGAGACTCTT
GCATCCTTATGAGCGCTCTCTTATTGAGTTGACACTTGGTGATGGAAAGTACGAGGAGGT
GTTGGGAAAAGTTGATGCTCTTAGGAAGAAGGTGTTGTCTGTTGGAAAGGAACATGCTTC
TCTCTGTGCTAAGGCATTATCAAAGCGAGAAGCAGAGGATCGGTTGAACGAAGGTGTGGA
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AGTTTTGAGGGCTATGCCAGTTGTTGACTTGGAAATGCCAACCCTTTGCCTTGTCGAGCC
CAAACGTTGGAAATCA

QA 3 798 3 798
DS 



AS 1 3

CO CL3962Contig1 561 3 1 U
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GATATGAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCAT
GTTTGGTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGTCTCTCGGATACATTTTGCAT
GAATGAAAGACTTGTTAGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4AV71JQ C 1
AF RR4AV71TF U 1
AF RR4AZ96TF U 21
BS 1 561 RR4AV71TF

RD RR4AV71JQ 561 0 0
GGAGGGCTCTCTTCTTCCTGTAAATCCGGCGAGCAGCGACACTTGACGGCGTGAGAAGAA
GATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATCAACAGCAGATTAGCTCT
TGTGATGAAGAGTGGAAAGTACGCCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAG
CTCCAAAGGCAAGTTTATTTTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAAATCAGAGAT
CGAATATTACGCTATGCTTGCTAAAGTGGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGA
TTTGGGAACTGCTTGCGGGAAGTACTTCCGTGTGTCTTGCCTCAGCATCGTTGATCCAGG
TGACTCCGACATCATCAAGTCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGGGTCGATTT
GATATGAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCAT
GTTTGGTTTTTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGTCTTTCGGATACATTTTGCAT
GAATGAAAGACTTGTTAGGTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4AV71TF 561 0 0
GGAGGGCTCTCTTCTTCCTGTAAATCCGGCGAGCAGCGACACTTGACGGCGTGAGAAGAA
GATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATCAACAGCAGATTAGCTCT
TGTGATGAAGAGTGGAAAGTACGCCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAG
CTCCAAAGGCAAGTTTATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAAATCAGAGAT
CGAATATTACGCTATGCTTGCTAAAGTGGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGA
TTTGGGAACTGCTTGCGGGAAGTACTTCCGTGTGTCTTGCCTCAGCATCGTTGATCCAGG
TGACTCCGACATCATCAAGTCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGGGTCGATTT
GATATGAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCAT
GTTTGGTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGTCTCTCGGATACATTTTGCAT
GAATGAAAGACTTGTTAGGTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4AZ96TF 541 0 0
TAAATCCGGCGAGCAGCGACACTTGACGGCGTGAGAAGAAGATGGTAGCGGCGAAGAAGA
CGAAGAAGTCCCATGAGGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGT
ACGCCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGGCAAGTTTATTC
TTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAAATCAGAGATCGAATATTACGCTATGCTTG
CTAAAGTGGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAACTGCTTGCGGGA
AGTACTTCCGTGTGTCTTGCCTCAGCATCGTTGATCCAGGTGACTCCGACATCATCAAGT
CGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGGGTCGATTTGATATGAGTTTGCCATGTTT
TGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAACTCCTT
ATGCTTAATTACACTTTCGTCTCTCGGATACATTTTGCATGAATGAAAGACTTGTTAGGT
T

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 3

CO CL3963Contig1 1242 3 7 U
GGATCTATAGACAAGACCGTTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
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BQ
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TCCAAGGATCCAGTAATAGGTGGAAGCTTACTATTGACGTATACAACAGGATACGTTGCT
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DS 



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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT83JQ U 1
AF RR4GX38JQ U 41
AF RR4GX38TF C 262
BS 1 458 RR4BT83JQ
BS 459 459 RR4GX38JQ
BS 460 630 RR4BT83JQ
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BS 632 632 RR4BT83JQ
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BS 663 672 RR4BT83JQ
BS 673 715 RR4GX38JQ
BS 716 946 RR4GX38TF

RD RR4BT83JQ 672 0 0
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GATCCTTAAAAATACTAAAATCATCCATACACAACAATGTAACACCAAAGGGAAACGACT
AGTAGGAGAGGAGGGATTAAAGAGCTGCTGCCACTAGTTAACACCATAAAAAAAAACGAG
TTACAGTCACATTCACCATCAACCTTAGTGAAAGTAAGCAGGAGGAGGAGCCTGGTACTG
ATAGCAGTTTCCATAAAAGTTCCCATGAGCAGCAGCAGCTGGACTGAAAGTGTAAGTCTG
AGGAGGAGGAGGTTGTGCTGCCATGATTGGACCGCTAAGGAACGATATGTTGTCATACAC
ATACTGCGGATACCTCTCAGGTATCACTCTACCATATCCTGTCTTACTGTTATTGTTGTT
GTTGTTGTCAGTGGCTCGGGGTTGAGGACCACGTGGTCCCTTTGTCTGAGGCTTCGTGGG
CTCCGTTGCTCTCTTTTTCTCAGCTTTGGCCTTCTCCAGCTGGAGAATCCTTTTGTGAAG
TGGCTCAACTGGGTACTGCTCTTCCAGGTTATGCTCTTCCACACACTTTATCACAGCCTT
AAGACTCGTCAGCTCCCTCTCACTGAACTCGTACTGAACAGCAGGAGATGCATCGCCAGG
TCCGCCTTGGGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4GX38JQ 675 0 0
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ACACCATAGAAGAGAACGAGTTACAGTCACATTCACCATCAACCTTAGTGAAAGTAAGCA
GGAGGAGGAGCCTGGTACTGATAGCAGTTTCCATAGAAGTTCCCATGAGCAGCAGCAGCT
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GTCTTACTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTCAGTGGCTCGGGGTTGAGGACCACGTGGTCGC
TTTGTCTGAGGCTTCGTGGGCTCCGTTGCTCTCTTTTTCTCAGCTTTGGCCTTCTCCAGC
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ACACACTTTATCACAGCCTTAAGACTCGTCAGCTCCCTCTCACTGAACTCATCCTGAACA
GCAGGAGATGCATCGCCAGGTACGCCTTGGGAGGTAGATCTACTTGCCTCAGTCAAGTAA
CATTTAAGCAACTCA

QA 1 675 1 675
DS 

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TATCACTCTACCATATCCTGTCTTACTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTCAGTGGCTCGGGG
TTGAGGACCACGTGGTCGCTTTGTCTGAGGCTTCGTGGGCTCCGTTGCTCTCTTTTTCTC
AGCTTTGGCCTTCTCCAGCTGGAGAATCCTTTTGTGAAGTGGCTCAACTGGGTACTGCTC
TTCCAGGTTATGCTCTTCCACACACTTTATCACAGCCTTAAGACTCGTCAGCTCCCTCTC
ACTGAACTCATCCTGAACAGCAGGAGATGCATCGCCAGGTACGCCTTGGGAGGTAGATCT
ACTTGCCTCAGTCAAGTAACATTTAAGCAACTCAACAGGTGGGAACTGTTCTGTGAGTCC
AAACGCAAATGCCAAGTTCACAGCATCAATCTGTTTACCACTGTTCACTAGAACTTCAAT
CACACCAGGCATTTTTCCAGACAATCCAAGAGAACGGCAAAGCTCAGCCGCCTGGCGGCG
ACGCGAGACCATAGGAATCAGCTTCAAGATCTCATCCTCTTCAAAATCGGAAACAACACC
AAAAGTGGCAAGCAGTTGCAAAAAA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 3

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GTTTTGAATCCCAAATTATTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4BR52TF U 1
AF RR4FB34TF U 1
AF RR4EH94TF U 1
BS 1 87 RR4BR52TF
BS 88 88 RR4FB34TF
BS 89 102 RR4BR52TF
BS 103 103 RR4FB34TF
BS 104 238 RR4BR52TF
BS 239 239 RR4FB34TF
BS 240 573 RR4BR52TF
BS 574 574 RR4FB34TF
BS 575 579 RR4BR52TF
BS 580 580 RR4FB34TF
BS 581 623 RR4BR52TF

RD RR4BR52TF 623 0 0
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ACGCAGTGAACGTAGGGATCGCTGTTCAAGCGGATTGGGAGAATCGTGAGTTCATCTCAC
ACATCTCTCTCAATGTCCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAA
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TCGAGGTACAAGTGAGTACCGCCACGGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACAT
ATAGTCAGAGTCTGAGCCTTTGGCACTAATCAGAAGAAGAAGAAGCATCTTTTCGTTTTG
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GAATCCACGCATGAACTGTGTAATCTTTGTCTACCCCAGCGTTGATGTAACTTGTAAGAT
GTTTTGAATCCCAAATTATTTCG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4FB34TF 622 0 0
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GATTGCGTCTTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCAGGAGGGATCACGA
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GAATCCACGCATGAACTGTGTAATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGAT
GTTTTGAATCCCAAATTATTT
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4EH94TF 621 0 0
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TCGAGGTACAAGTGAGTACCGCCACGGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACAT
ATAGTCAGAGTCTGAGCCTTTGGCACTAATCAGAAGAAGAAGAAGCATCTTTTCGTTTTG
AATGTGTACCGTTGAATCATTCTTTCTTTTTTTTCCATAGCTGTAGTAAACTATAAATAT
GAATCCACGCATGAACTGTGTAATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGAT
GTTTTGAATCCCAAATTATTT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL3966Contig1 624 2 5 U
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ACGGAGAAACATCTTGCTGATGAAGCGATCTCTGTTAACAGGAAGAGCTTTCTTCTTTCC
TTTCCCAGTTTTAGGTAACTCGGTCCACATTTCTCTGACGTTTTCCAGGACCATGTTGCA
GTGCCTGTCAAAAGCTCTAACACGACCAAGGAGTTTCCCGTTGTTGCGGCAATTGATGAG
CACCTGAGTGTTGTTCTTGACACTCATCATCAGAACAGAAAGGGGTCCCGTGTTGAACTC
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CAGCTCAACAAATTCTCCGAAGATTAGTCTTAAACCTGCAAAGGATTCGAGTGGGAAGAC
GATGAATCAAGAAACTATCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP13JQ U 100
AF RR4D441TF C 1
BS 1 99 RR4D441TF
BS 100 398 RR4AP13JQ
BS 399 399 RR4D441TF
BS 400 561 RR4AP13JQ
BS 562 624 RR4D441TF

RD RR4AP13JQ 462 0 0
GCAAGACTAGATTTAAGACTGATACTCAAAGATTATCTCCGTTGATGCAACAATTAGAAT
TTGACGAGAAGAAACAAGTACAAACAGCGACATATCTCTCTCTCACTTGGGGTTCCTGAG
GACGATAATGACAGAGTCACCACGGAGAAACATCTTGCTGATGAAGCGATCTCTGTTAAC
AGGAAGAGCTTTCTTCTTTCCTTTCCCAGTTTTAGGTAACTCGGTCCACATTTCTCTGAC
GTTTTCCAGGACCATGTTGCAGTGCCTGTCAAAAGCTCTAACACGACCAAGGAGTTTCCT
GTTGTTGCGGCAATTGATGAGCACCTGAGTGTTGTTCTTGACACTCATCATCAGAACAGA
AAGGGGTCCCGTGTTGAACTCCTCCTCCTCCGTCTTTCCCTGGTTGGTATCCTCTTCCAT
TGGCCTACTCATATTCGCTTGCAGCTCAACAAATTCTCCGAA

QA 1 462 1 462
DS 

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CATAAGAGATAGGGGAAAACACAAGTGAAAAATACAAGGGCAAGACTAGATTTAAGACTG
ATACTCAAAGATTATCTCCGTTGATGCAACAATTAGAATTTGACGAGAAGAAACAAGTAC
AAACAGCGACATATCTCTCTCTCACTTGGGGTTCCTGAGGACGATAATGACAGAGTCACC
ACGGAGAAACATCTTGCTGATGAAGCGATCTCTGTTAACAGGAAGAGCTTTCTTCTTTCC
TTTCCCAGTTTTAGGTACCTCGGTCCACATTTCTCTGACGTTTTCCAGGACCATGTTGCA
GTGCCTGTCAAAAGCTCTAACACGACCAAGGAGTTTCCCGTTGTTGCGGCAATTGATGAG
CTCCTGAGTGTTGTTCTTGACACTCATCATCAGAACAGAAAGGGGTCCCGTGTTGAACTC
CTCCTCCTCCGTCTTTCC***GTTGGTATCCTCTTCCATTGGCCTACTCATATTCGCTTG
CAGCTCAACAAATTCTCCGAAGATTAGTCTTAAACCTGCAAAGGATTCGAGTGGGAAGAC
GATGAATCAAGAAACTATCAATCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

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GACCAACACTAGTGCTGCTACTTCACTAGGAACGTACTTCTTATCCCAAATTTCCTTGAT
ATTTTTGGATATGCTGAATGTCTACAGAATGTACAGTGAGCTTGTGTCAACCAGCATTAC
TAGTGGGGGACCATATGCTTCCAAGACATCTTTTGTAAAACTCTTAAGATCTGTCAAGAG
GGAAACCCTTAAGCTGATTGAAACCTTTTTAGACAAAGCTGAAGACCAACCACACATAGG
GAAACAGTTTGTGCCTCCAATGATGGAATCTGTACTTTGTGACTACGCGAGGAATGTGCC
TGATGCTAGGGAATCAGAAGTTCTCTCACTTTTTGCAACGATTATAAACAAGTACAAGGC
GACAATGTTAGATGACGTGCCAAACATATTTGAAGCTGTTTTCCAGTGTACATTGGAGAT
GATAACTAAGAACTTCGAAGATTATCCGGAACACCGCCTCAAGTTTTTCTCATTACTCCG
TGCTATTGCAACATTTTGCTTCCCTGCCTTGATAAAGTTGTCAAGTCAGCAACTGAAGCT
AGTGATGGATTCAATCATCTGGGTATTTAGACATACCGAGAGAAATATTGCTGAAACTGG
GCTTAATCTCTTGCTTGAGATGCTGAAGAACTTTCAGCAATCTGCGTTTTGTAATCAATT
CTTCCGGTCGTACTTCATACAAATCGAGCAAGAAATATTTGCTGTTTTGACTGATACCTT
CCATAAGCCTGGCTTCAAGCTGCATGTGTTGGTGCTGCAGCATCTGTTTTGCCTGGTTGA
GAGCGGTGCTTTGACGGAACCTTTGTGGGATTCTGCAACCGTACCTTACCCGTATCCCAA
CAACGCTGCTTTTGTTCGTGAATACACAATCAAGCTGTTGAGCACTTCATTCCCCAACAT
GACTGCAGCAGAGGTCACACAGTTTGTGAATGGACTTTACGAGTCAAGAAATGACCCGTC
TGAATTTAAGAAAAACATCCGTGACTTCCTTGTACAGTCTAAAGAATTCTCCGCTCAGGA
TAACAAAGACCTCTACGCCGAGGAAGCAGCTGCGCAGAGAGAGCAAGAGCGCCAAAGAAT
GCTTTCGATTCCTGGTCTTGTTGCTCCTAATGAGATTCAAGACGAGATGGTGGACTCCTA
AATCAAAACAAGAAGAAGAAAGGTTTCCCGATTTCATAGGGTTTTTTTGAACACAGTGAA
GAGTTGAGGAAAAGACATTAGTTACTTTCCCCTGACTGTATGTATTTCTGCTTCTTAATT
CGACTTTGAGAATTGGAATAGCCAAGAAAACAAAGATCTTTGACGGGTAACATGGTTTGA
CCTTTTTCGAGTGTTTTTTTTGTTTAAAGCGATTCGTGTTTTAGGTGCACAAGACATTGT
TTTGACTCTGCTATTGTTACCAGTAATACAAAATGTGTTTTTTTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW02TF U 1
AF RR4BH72TF U 659
AF RR4GW02JQ C 798
BS 1 713 RR4GW02TF
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RD RR4GW02TF 721 0 0
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GACCAACACTAGTGCTGCTACTTCACTAGGAACGTACTTCTTATCCCAAATTTCCTTGAT
ATTTTTGGATATGCTGAATGTCTACAGAATGTACAGTGAGCTTGTGTCAACCAGCATTAC
TAGTGGGGGACCATATGCTTCCAAGACATCTTTTGTAAAACTCTTAAGATCTGTCAAGAG
GGAAACCCTTAAGCTGATTGAAACCTTTTTAGACAAAGCTGAAGACCAACCACACATAGG
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TGATGCTAGGGAATCAGAAGTTCTCTCACTTTTTGCAACGATTATAAACAAGTACAAGGC
GACAATGTTAGATGACGTGCCAAACATATTTGAAGCTGTTTTCCAGTGTACATTGGAGAT
GATAACTAAGAACTTCGAAGATTATCCGGAACACCGCCTCAAGTTTTTCTCATTACTCCG
TGCTATTGCAACATTTTGCTTCCCTGCCTTGATAAAGTTGTCAAGTCAGCAACTGAAGCT
AGTGATGGATTCAATCATCTGGGTATTTAGACATACCGAGAGAAATATTGCTGAAACTGG
GCTTAATCTCTTGCTTGAGATGCTGAAGAACTTTCAGCAATCTGCGTTTTGTA
TCAATTCT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4BH72TF 790 0 0
GGGCTTAATCTCTTGCTTGAGATGCTGAAGAACTTTCAGCAATCTGCGTTTTGTAATCAA
TTCTTCCGGTCGTACTTCATACAAATCGAGCAAGAAATATTTGCTGTTTTGACTGATACC
TTCCATAAGCCTGGCTTCAAGCTGCATGTGTTGGTGCTGCAGCATCTGTTTTGCCTGGTT
GAGAGCGGTGCTTTGACGGAACCTTTGTGGGATTCTGCAACCGTACCTTACCCGTATCCC
AACAACGCTGCTTTTGTTCGTGAATACACAATCAAGCTGTTGAGCACTTCATTCCCCAAC
ATGACTGCAGCAGAGGTCACACAGTTTGTGAATGGACTTTACGAGTCAAGAAATGACCCG
TCTGAATTTAAGAAAAACATCCGTGACTTCCTTGTACAGTCTAAAGAATTCTCCGCTCAG
GATAACAAAGACCTCTACGCCGAGGAAGCAGCTGCGCAGAGAGAGCAAGAGCGCCAAAGA
ATGCTTTCGATTCCTGGTCTTGTTGCTCCTAATGAGATTCAAGACGAGATGGTGGACTCC
TAAATCAAAACAAGAAGAAGAAAGGTTTCCCGATTTCATAGGGTTTTTTTGAACACAGTG
AAGAGTTGAGGAAAAGACATTAGTTACTTTCCCCTGACTGTATGTATTTCTGCTTCTTAA
TTCGACTTTGAGAATTGGAATAGCCAAGAAAACAAAGATCTTTGACGGGTAACATGGTTT
GACCTTTTTCGAGTGTTTTTTT*GTTTAAAGCGATTCGTGTTTTAG*TGCACAAGACATT
GTTTTGACTC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4GW02JQ 689 0 0
AGCTGCATGTGTTGGTGCTGCAGCATCTGTTTTGCCTGGTTGAGAGCGGTGCTTTGACGG
AACCTTTGTGGGATT**GCAACCGTACCTTACCCGTATCCCAACAACGCTGCTTTTGTTC
GTGAATACACAATCAAGCTGTTGAGCACTTCATTCCCCAACATGACTGCAGCAGAGGTCA
CACAGTTTGTGAATGGACTTTACGAGTCAAGAAATGACCCGTCTGAATTTAAGAAAAACA
TCCGTGACTTCCTTGTACAGTCTAAGGAATTCTCCGCTCAGGATAACAAAGACCTCTACG
CCGAGGAAGCAGCTGCGCAGAGAGAGCAAGAGCGTCAAAGAATGCTTTCGATTCCTGGTC
TTGTTGCTCCTAATGAGATTCAAGACGAGATGGTGGACTCCTAAATCAAAACAAGAAGAA
GAAAGGTTTCCCGATTTCATAGGGTTTTTTTGAACACAGTGAAGAGTTGAGGAAAAGACA
TTAGTTACTTTCCCCTGACTGTATGTATTTCTGCTTCTTAATTCGACTTTGAGAATTGGA
ATAGCCAAGAAAACAAAGATCTTTGAGGGGTAACATGGTTTGACCTTTTTCGAGTGTTTT
TTTTGTTTAAAGCGATTCGTGTTTTAGGTGCACAAGACATTGTTTTGACTCTGCTATTGT
TACCAGTAATACAAAATGTGTTTTTTTTT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL3968Contig1 864 3 3 U
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TCACACACCTGTTGAGTCTTAAATAAACATCAGTCCCAACGAATCATCTAGAAAAAATCC
TCTTTGAGAAAAATAAATCAGAACAATGTACTCTTCATCATCTGTATCAAAACGTCTCAT
TTTGATTCATGTCTTAGCCATACAACATCTCTTTATAAGCAGCAAATTGCCCCAAATGCC
GCGACTGCTTTGCCACCTCCATGGCTGTGCTTCGTAAGAGATGTCCGTGGTATAAGGGGA
GAATAGTATGGTATGACCAATGTCTTCTGTCGTTTTCGTCCACATATGCTACTGGAAAGA
TCGATTACGACAATATCTTTTGTATGTCCAACGCAAAGAAGTTGGGAGATAAACTCGGGT
TT*GCAAGTGTTT*GGAATACTC*TCATGGACAATCTGACGACGTTAGCCC*TCAGTCAA
GTTAACTACACTCAGCC*AACAGCATTATACTCTGTGGGGGAGACTCGGTTCAAGGGTGA
TACAATTTATGGAATGG*TGCAGTGTACCAAAGACATATCACCACAAGCTTGTGAA*GAG
TGTTT*GGTTTTCAATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCTTGAATGATAAACGAGGAGCGAG
ATTTGTGGGTACAAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTATCCTTTTATTAACAAGCCGGT
CGAGTATTTAAAAAGTTAAATAAATAATTAACTTTTTGTTTGTTTTTTCAATCAAAAGCT
TATGTAACATCAAGTACTACTTTTTTAAAGAATGTTTAAAGAATAAAACAAAAGAATAAT
AATTGGATAAGATATTGCTCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA56TF U 1
AF RR4B464TF U 404
AF RR4B464JQ C 195
BS 1 683 RR4BA56TF
BS 684 803 RR4B464TF
BS 804 864 RR4B464JQ

RD RR4BA56TF 683 0 0
GGGACCTTTCAAACAAATTGCGAACTGGGTAACCAGAAAAATATATTATATATATAAACA
TCACACACCTGTTGAGTCTTAAATAAACATCAGTCCCAACGAATCATCTAGAAAAAATCC
TCTTTGAGAAAAATAAATCAGAACAATGTACTCTTCATCATCTGTATCAAAACGTCTCAT
TTTGATTCATGTCTTAGCCATACAACATCTCTTTATAAGCAGCAAATTGCCCCAAATGCC
GCGACTGCTTTGCCACCTCCATGGCTGTGCTTCGTAAGAGATGTCCGTGGTATAAGGGGA
GAATAGTATGGTATGACCAATGTCTTCTGTCGTTTTCGTCCACATATGCTACTGGAAAGA
TCGATTACGACAATATCTTTTGTATGTCCAACGCAAAGAAGTTGGGAGATAAACTCGGGT
TT*GCAAGTGTTT*GGAATACTC*TCATGGACAATCTGACGACGTTAGCCC*TCAGTCAA
GTTAACTACACTCAGCC*AACAGCATTATACTCTGTGGGGGAGACTCGGTTCAAGGGTGA
TACAATTTATGGAATGG*TGCAGTGTACCAAAGACATATCACCACAAGCTTGTGAA*GAG
TGTTT*GGTTTTCAATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCTTGAATGATAAACGAGGAGCGAG
ATTTGTGGGTACAAGCTGTACTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4B464TF 400 0 0
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GTTAGCCCCTCAGTCAAGTTAACTACACTCAGCCCAACAGCATTATACTCTGTGGGGGAG
ACTCGGTTCAAGGGTGATACAATTTATGGAATGGGTGCAGTGTACCAAAGACATATCACC
ACAAGCTTGTGAAAGAGTGTTTTGGTTTTCAATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCTTGAAT
GATAAACGAGGAGCGAGATTTGTGGGTACAAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTATCCT
TTTATTAACAAGCCGGTCGAGTATTTAAAAAGTTAAATAAATAATTAACTTTTTGTTTGT
TTTTTCAATCAAAAGCTTATGTAACATCAAGTACTACTTT

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR4B464JQ 670 0 0
TAGCCATACAACATCTCTTTATAAGCAGCAAATTGCCCCAAATGCCGCGACTGCTTTGCC
ACCTCCATGGCTGTGCTTCGTAAGAGATGTCCGTGGTATAAGGGGAGAATAGTATGGTAT
GACCAATGTTTTCTGTCGTTTTCGTCCACATATGCTACTGGAAAGATCGATTACGACAAT
ATTTTTTGTATGTCCAACGCAAAGAAGTTGGGAGATAAACTCGGGTTT*GCAAGTGTTT*
GGAATACTT*TCATGGACAATCTGACGACGTTAGCCC*TCAGTCAAGTTAACTACACTCA
GCC*AACAGCATTATACTCTGTGGGGGAGACTCGGTTCAAGGGTGATACAATTTATGGAA
TGG*TGCAGTGTACCAAAGACATATCACCCCAAGCTTGTGAA*GAGTGTTT*GGTTTTCA
ATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCTTGAATGATAAACGAGGAGCGAGATTTGTGGGTACAA
GCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTATCCTTTTATTAACAAGCCGGTCGAGTATTTAAAAA
GTTAAATAAATAATTAACTTTTTGTTTGTTTTTTCAATCAAAAGCTTATGTAACATCAAG
TACTACTTTTTTAAAGAATGTTTAAAGAATAAAACAAAAGAATAATAATTGGATAAGATA
TTGCTCTCCT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL3969Contig1 648 3 4 U
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GCCCGATCCGCCGCCTCTTCTCTCCGCCAGCGCGCCGGGATGGGTCTCCCCGTCGGCAAA
CACATCGTCCCCGATAAGCCACTTTCGGTTAACGACGAGCTGATGTGGGACAACGGGACT
GCGTTTCCAGAGCCTTGCATAGATCGGATTGCTGACACCGTCGGGAAGTATGAAGCATTG
GGATGGTTGTGTGGCGGTTTAGGGTTCTTTGCGACTCTTGGTTTGCTCGCTGTTGTGAAC
GATAAGGCTTCCAAGGTTCCTTTTACACCACGAGTGTATCCTTATGATAACCTGAGAGTG
GAGCTTGGAGGAGAGCCGTAGAAGAGACCTACGAGTGATCTACTCAATCAAAACTCCAGC
AGTGTTTTCTTCACTGTTTCGTTCTTCAAAAGTGTTTTAATTTCCTCTTCAAAACGTGAA
GACAAACGAATAAAAGAGAATTGCCTTTTTCATTTACATGTGCTGTCCCTGTTATTAACA
GTGCCCATGTGAGTGATTCATAAGACTGATAAGACATCTGTTTTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
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AF RR4AK43JQ C 1
AF RR4AK43TF U 155
AF RR4CP37TF U 4
BS 1 5 RR4AK43JQ
BS 6 154 RR4CP37TF
BS 155 646 RR4AK43TF
BS 647 648 RR4AK43JQ

RD RR4AK43JQ 648 0 0
GGGCTGAGAACGAAAGAGAAACCTGAAACAACGAAAGCTTCGGCAAATAGGAAAAAAAA*
GGAATGGCAGGAAGATTGAGCGGTGTGTCCTCACGAATCATGGGTGGAAACGGCATCGTT
GCCCGATCCGCCGCCTCTTCTCTCCGCCAGCGTGCCGGGATGGGTCTCCCCGTCGGCAAA
CACATCGTCCCCGATAAGCCACTTTCGGTTAACGACGAGCTGATGTGGGACAACGGGACT
GCGTTTCCAGAGCCTTGCATAGATCGGATTGCTGACACCGTCGGGAAGTATGAAGCATTG
GGATGGTTGTGTGGCGGTTTAGGGTTCTTTGCGACTCTTGGTTTGCTCGCTGTTGTGAAC
GATAAGGCTTCCAAGGTTCCTTTTACACCACGAGTGTATCCTTATGATAACCTGAGAGTG
GAGCTTGGAGGAGAGCCGTAGAAGAGACCTACGAGTGATCTACTCAATCAAAACTCCAGC
AGTGTTTTTTTCACTGTTTCGTTCTTCAAAAGTGTTTTAATTTCCTCTTCAAAACGTGAA
GACAAACGAATAAAAGAGAATTGCCTTTTTCATTTACATGTGCTGTCCCTGTTATTAACA
GTGCCCATGTGAGTGATTCATAAGACTGATAAGACATCTGTTTTCAAT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4AK43TF 494 0 0
CCGGGATGGGTCTCCCCGTCGGCAAACACATCGTCCCCGATAAGCCACTTTCGGTTAACG
ACGAGCTGATGTGGGACAACGGGACTGCGTTTCCAGAGCCTTGCATAGATCGGATTGCTG
ACACCGTCGGGAAGTATGAAGCATTGGGATGGTTGTGTGGCGGTTTAGGGTTCTTTGCGA
CTCTTGGTTTGCTCGCTGTTGTGAACGATAAGGCTTCCAAGGTTCCTTTTACACCACGAG
TGTATCCTTATGATAACCTGAGAGTGGAGCTTGGAGGAGAGCCGTAGAAGAGACCTACGA
GTGATCTACTCAATCAAAACTCCAGCAGTGTTTTCTTCACTGTTTCGTTCTTCAAAAGTG
TTTTAATTTCCTCTTCAAAACGTGAAGACAAACGAATAAAAGAGAATTGCCTTTTTCATT
TACATGTGCTGTCCCTGTTATTAACAGTGCCCATGTGAGTGATTCATAAGACTGATAAGA
CATCTGTTTTCA
AT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4CP37TF 643 0 0
GG
GAGAACGAAAGAGAAACCTGAAACAACGAAAGCTTCGGCAAATAGGAAAAAAAAAGGAAT
GGCAGGAAGATTGAGCGGTGTGGCCTCACGAATCATGGGTGGAAACGGCATCGTTGCCCG
ATCCGCCGCCTCTTCTCTCCGCCAGCGCGCCGGGATGGGTCTCCCCGTCGGCAAACACAT
CGTCCCCGATAAGCCACTTTCGGTTAACGACGAGCTGATGTGGGACAACGGGACTGCGTT
TCCAGAGCCTTGCATAGATCGGATTGCTGACACCGTCGGGAAGTATGAAGCATTGGGATG
GTTGTGTGGCGGTTTAGGGTTCTTTGCGACTCTTGGTTTGCTCGCTGTTGTGAACGATAA
GGCTTCCAAGGTTCCTTTTACACCACGAGTGTATCCTTATGATAACCTGAGAGTGGAGCT
TGGAGGAGAGCCGTAGAAGAGACCTACGAGTGATCTACTCAATCAAAACTCCAGCAGTGT
TTTCTTCACTGTTTCGTTCTTCAAAAGTGTTTTAATTTCCTCTTCAGAACGTGAAGACAA
ACGAATAAAAGAGAATTGCCTTTTTCATTTACATGTGCTGTCCCTGTTATTAACAGTGCC
CATGTGAGTGATTCATAAGACTGATAAGACATCTGTTTTCA

QA 3 643 3 643
DS 



AS 1 3

CO CL3970Contig1 872 3 8 U
GATTTTCGTATTTAATCATAATAAGAGGATAAAAAAAGAAGATGATTCGGTGCTTCCCGC
GTGCACCGTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCACCACCCATCACCATCTCCGCAT
CTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGAGAAATAGCTCTATCCATTATCG
CCGTCGCGTCTTCTTCCATCATCTCCTCCTCCTGTTACTTCTCGTCTCCGGCGCTCGCTG
AGTTCTCCGAAATCCCTGACTCCGGCGGAGTAAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGAAG
GTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGA
AGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGATCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTC
CTTTTACTTTCGTCCTTGGTTCTACTAATGTTATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGT
CGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATA
CATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTCGACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCT
TTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGTTCTACTCTTGGAACTCTCGTTTTCGATA
TCGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATACAGCCAGCCGTTCATACTC
TTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATGCCATAAAATAAACAATTACAATTACACAAAA
TCTTTAGTAAGCATTTGCATATGGTTAGTTGAATCTCGATGTGCACCTCACCCCCAATCT
ATGATTATAGTATGATCCACTATTCCACTTGG


BQ
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AF RR4F696TF U 1
AF RR4DC85TF U 1
AF RR4F696JQ C 152
BS 1 271 RR4DC85TF
BS 272 272 RR4F696TF
BS 273 433 RR4DC85TF
BS 434 434 RR4F696TF
BS 435 571 RR4DC85TF
BS 572 572 RR4F696JQ
BS 573 627 RR4DC85TF
BS 628 872 RR4F696JQ

RD RR4F696TF 455 0 0
GGA
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CACCGTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCACCACCCATCACCATCTCCGCATCTC
ATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGAGAAATAGCTCTATCCATTATCGCCG
TCGCGTCTTCTTCCATCATCTCCTCCTCCTGTTACTTCTCGTCTCCGGCGCTCGCTGAGT
TCTCCGAAATCCCTGACTCCGGCGGAGTAAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGAAGGTG
AAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGAAGC
AAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGATCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTCCTT
TTACTTTCGTCCTTGGTTCTACTAATGTTATT

QA 4 455 4 455
DS 

RD RR4DC85TF 627 0 0
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GTGCACCGTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCACCACCCATCACCATCTCCGCAT
CTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGAGAAATAGCTCTATCCATTATCG
CCGTCGCGTCTTCTTCCATCATCTCCTCCTCCTGTTACTTCTCGTCTCCGGCGCTCGCTG
AGTTCTCCGAAATCCCTGACTCCGGCGGAGTTAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGAAG
GTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGA
AGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGATCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTC
CTTTTACTTTCGTTCTTGGTTCTACTAATGTTATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGT
CGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATA
CATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCT
TTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4F696JQ 721 0 0
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CTGTTACTTCTCGTCTCCGGCGCTCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCTGACTCCGGCGGAGT
AAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGAAGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGC
AATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGA
TCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTCCTTTTACTTTCGTCCTTGGTTCTACTAATGT
TATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGT
TATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTT
CGACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGG
TTCTACTCTTGGAACTCTCGTTTTCGATATCGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCG
ATGATTCATACAGCCAGCCGTTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATGCC
ATAAAATAAACAATTACAATTACACAAAATCTTTAGTAAGCATTTGCATATGGTTAGTTG
AATCTCGATGTGCACCTCACCCCCAATCTATGATTATAGTATGATCCACTATTCCACTTG
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL3971Contig1 569 3 3 U
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TCTAATCAAATGAGACACGCGCTTCCTGGTCTCGGCATCGGCGTTGGTGCCTTCTGCGTT
TACCTTGTCGGCGAGCAGATCTATACCAAACTCATGGCTCCTTCTCAATCATCTCACCAG
AAACAACCAGCTCCCTCTTCTCACTGAGACTGATTGTTTTCGATCATGATGAAACTTGCC
GCAGATTAAGAGGTGTGGGATACAGAATTCGCTATTTTTCTTGGTTTATCTCAATAAGAT
GTTGATGAAAGACAAAAGACTTGTATGACATTCTGCTATGTGGTCTTGCTATGTATTGTC
GTTTTGGATAATAACAGTTCTAAAATGACATTGAAGAATAAAGATTGACTCTTAGACATC
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GAGTTTTCTCTGAAAATGGGCCTATTGAC


BQ
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AF RR4G930JQ C 19
AF RR4G930TF U 19
AF RR4AZ18TF U 1
BS 1 329 RR4AZ18TF
BS 330 330 RR4G930TF
BS 331 569 RR4AZ18TF

RD RR4G930JQ 464 0 0
GG
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TTTCAGGAGAAGGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCTAATCAAATGAGACACGC
GCTTCCTGGTCTCGGCATCGGCGTTGGTGCCTTCTGCGTTTACCTTGTCGGCGAGCAGAT
CTATACCAAACTCATGGCTCCTTCTCAATCATCTCACCAGAAACAACCAGCTCCCTCTTC
TCACTGAGACTGATTGTTTTCGATCATGATGAAACTTGCCGCAGATTAAGAGGTGTGGGA
TACAGAATTCGCTATTTTTCTTGGTTTATCTCAATAAGATGTTGATGAAAGACAAAAGAC
TTGTATGACATTCTGCTATGTGGTCTTGCTATGTATTGTCGTTTTGGATAATAACAGTTC
TAAAATGACATTGAAGAATAAAGATTGACTCTTAGACATCC
G

QA 3 463 3 463
DS 

RD RR4G930TF 464 0 0
GG
GATCCGAGGAAGAAGAAGAAGGGAGAAAATGGCGAAACCGTTGGGAACTACGGGAGAGTT
TTTCAGGAGAAGGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCTAATCAAATGAGACACGC
GCTTCCTGGTCTCGGCATCGGCGTTGGTGCCTTCTGCGTTTACCTTGTCGGCGAGCAGAT
CTATACCAAACTCATGGCTCCTTCTCAATCATCTCACCAGAAACAACCAGCTCCCTCTTC
TCACTGAGACTGATTGTTTTCGATCATGATGAAACTTGCCGCAGATTAAGAGGTGTGGGA
TACAGAATTCGCTATTTTTCTTGGTTTATCTCAATAAGATGTTGATGAAAGACAAAAGAC
TTGTATGACATTCTGCTATGTGGTCTTGCTATGTATTGTCGTTTTGGATAATAACAGTTC
TAAAATGACATTGAAGAATAAAGATTGACTCTTAGACATCC
G

QA 3 463 3 463
DS 

RD RR4AZ18TF 569 0 0
GGTTGGTGGTGGAGGAGATCGATCCGAGGAAGAAGAAGAAGGGAGAAAATGGCGAAACCG
TTGGGAACTACGGGAGAGTTTTTCAGGAGAAGGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTT
TCTAATCAAATGAGACACGCGCTTCCTGGTCTCGGCATCGGCGTTGGTGCCTTCTGCGTT
TACCTTGTCGGCGAGCAGATCTATACCAAACTCATGGCTCCTTCTCAATCATCTCACCAG
AAACAACCAGCTCCCTCTTCTCACTGAGACTGATTGTTTTCGATCATGATGAAACTTGCC
GCAGATTAAGAGGTGTGGGATACAGAATTTGCTATTTTTCTTGGTTTATCTCAATAAGAT
GTTGATGAAAGACAAAAGACTTGTATGACATTCTGCTATGTGGTCTTGCTATGTATTGTC
GTTTTGGATAATAACAGTTCTAAAATGACATTGAAGAATAAAGATTGACTCTTAGACATC
CAAGGACAGGTCTGTATTCATCTAAAGTCTAAACAAACTACGTCGATTAGATCGAATATG
GAGTTTTCTCTGAAAATGGGCCTATTGAC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 3

CO CL3972Contig1 882 3 9 U
GGCTCAAGACTGCCATTGAAAAGGCTGGCTACACTGGCAAGGTCGTCATTGGAATGGATG
TCGCCGCTTCTGAGTTCTACTCAGCAGACAAGACCTATGACTTGAACTTCAAGGAAGAGA
ACAACAATGGTTCTCAGAAGATTTCTGGAGATGCACTCAAGGACCTATACAAGTCCTTTG
TTGCTGAGTACCCAATTGTGTCCATTGAGGACCCATTTGACCAAGATGACTGGGAGCACT
ATGCCAAGATGACCGCAGAGTGTGGAGACAATGTTCAGATTGTTGGTGATGATTTGTTGG
TCACCAACCCCAATAGGGTTGCTAAGGCAATCGCAGAAAAGTCTTGCAATGCTCTTCTCT
TGAAGGTTAACCAAATCGGGTCACTGACAGAGAGTATTGAGGCAGTGAGGATGTCGAAGA
AAGCAGGATGGGGAGTGATGACCAGCCACAGAAGTGGTGAAACCGAGGACACCTTCATTG
CTGACCTAGCTGTTGGCTTGTCTACTGGACAAATCAAGACTGGTGCTCCTTGCAGGTCCG
AGCGTCTTGCCAAGTACAACCAGCTTTTGCGTATTGAGGAGGAGTTGGGATCAGAGGCAG
TTTACGCTGGAGCTAACTTCCGCAAACCTGTTGAGCCTTACTAGACAAGTGCCAGCTTTT
CAGAATCGAAGTGCTCTTCTTTGTGATGAGAAGATCAGAGTTGTGTTTGATCATTTTGCT
TTAATAAAAACACTACGTTTGCTCTTTTTTTTTTGGTTTATTTTGCGAACTCCCCTTGTT
TGGGAGTCTAGTTGCTTTTTTTTGTAAGAAAAAAAACTGAGATAGCTCTGCCTTTCAAGG
ACAGTAGCTGTTCTTTTATAATCTAATTTCGGCTTTACTCTT


BQ
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC49TF U 1
AF RR4AC49JQ C 111
AF RR4E475TF U 201
BS 1 725 RR4AC49TF
BS 726 753 RR4E475TF
BS 754 754 RR4AC49JQ
BS 755 815 RR4E475TF
BS 816 816 RR4AC49JQ
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BS 840 840 RR4AC49JQ
BS 841 852 RR4E475TF
BS 853 882 RR4AC49JQ

RD RR4AC49TF 725 0 0
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TTAAT

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DS 

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AAGTCCTTTGTTGCTGAGTACCCAATTGTGTCCATTGAGGACCCATTTGACCAAGATGAC
TGGGAGCACTATGCCAAGATGACCGCAGAGTGTGGAGACAATGTTCAGATTGTTGGTGAT
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GCTCTTCTCTTGAAGGTTAACCAAATCGGGTCACTGACAGAGAGTATTGAGGCAGTGAGG
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ACCTTCATTGCTGACCTAGCTGTTGGCTTGTTTACTGGACAAATCAAGACTGGTGCTCCT
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GCCAGCTTTTCAGAATCGAAGTGCTTTTCTTTGTGATGAGAAGATCAGAGTTGTGTTTGA
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QA 1 772 1 772
DS 

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ACCAGCCACAGAAGTGGTGAAACCGAGGACACCTTCATTGCTGACCTAGCTGTTGGCTTG
TCTACTGGACAAATCAAGACTGGTGCTCCTTGCAGGTCCGAGCGTCTTGCCAAGTACAAC
CAGCTTTTGCGTATTGAGGAGGAGTTGGGATCAGAGGCAGTTTACGCTGGAGCTAACTTC
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TTTGTAAGAAAAAAA*CTGAGATAGCTCTGCCTTTCAAG*ACAGTAGCTGTT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 3

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ACATGGGGGTTCAACATCTTTGTTCGAGCTTACTTCGCCTTCCTTGACAACTACTCTTCC
TTCACATCCGATCAAATCCATCGTACCCGCGCGAATCTACGATCGGATAAAGTCGGTTCG
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GTCCTCGAGAGCATCAATATCTACGGTCGATCATGCAGTGGAATCATCAAAATCCTCCCC
ACCGCCGGCAAAACAGACGCCGCCACGACTTTAAAGATCGTCAAGAAGGCGACGTCTCAG
GGAGAAGATCTCGCTTTGTACTTTGAATTCTGCAGAGGCTTTGGCGTTCCGAACGCACGG
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AAGAAGAGCGTCGAAAAGGATGAACAAGAGCAAGAAGAAGAAGTAGTGAAGGAGGAAGAG
AAAGCTATTGTACTGTTGGAGAAACCGAGATTGCAGACGATCATAACAGACGAATGGGAG
ATTTTCGAAGACGATGAACATTGTTTTAATGAAAAGGTCATTCAAGAATATCATCAAGAT
CCTCTGCCTCTTGTAGTATGGAACCAACCAGTTGTTTACACAATGCCAGATTTGATTACG
TTCTAGAGAACGTTCAGCAGATTTGGATGAGATTTGATTCTTTTTTTCACCTGGTTCTGG
TTCTGTGCATAATACAATTTTTTTTTACCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AO68TF U 1
AF RR4GT35TF U 7
AF RR4GT35JQ C 481
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GTCCTCGAGAGCATCAATATCTACGGTCG
GATATGCAGCGGAATCAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4GT35TF 721 0 0
GG
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AAAAGACCAGAAAAGCTTACTAGCCGTTGGATTCTCCCGGCGAACTTCATACCGGAACAC
GGATCTCGAAGCAGCCATCATCAAAGCAACCTCCCACGACGACTCCTCCGTCGACTATTC
GAACGCTCAGCGCGTCTACAAATGGATCAAAGCTTCTCCTCTCAACCTCAAAACTCTAAT
CCACTCATTATCCACCCGCGTCAACCATACCCGAAGCTGGATCGTCGCTCTCAAATCCCT
GATGCTTCTCCACGGTGTGCTCTTGTGCAAAGTCTCTTCCGTCGTCGGAGAGATTCGACG
TCTTCCTTTCGATCTCTCCGATTTTTCGGACGGACATTCGGCTCTCAGCAAAACATGGGG
GTTCAACATCTTTGTTCGAGCTTACTTTGCTTTCCTTGACAACTACTCTTCCTTCACATC
CGATCAAATCCATCGTACCCGCGCGAATCTACGATCGGATAAAGTCGGTTCGGTGAAGCA
GCAGCTCGATAGGATCCAGAGACTTCAGTCTCTTCTCGATTTGATTCTTCAGATACTTCC
CATTGCTGATAACATGAAGAGAGCGTTGATCCTAGAAGCCATGGACTGCATTGTCCTCGA
GAGCATCAATATCTACG*TCGATCATGCAGTGGAATCATCAAAATCCTCCCCACCGC
GG

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR4GT35JQ 752 0 0
TTCACATCCGATCAAATCCATCGTACCCGCGCGAATCTACGATCGGATAAAGTCGGTTCG
GTGAAGCAGCAGCTCGATAGGATCCAGAGACTTCAGTCTCTTCTCGATTTGATTCTTCAG
ATACTTCCCATTGCTGATAACATGAAGAGAGCGTTGATCCTAGAAGCCATGGACTGCATT
GTCCTCGAGAGCATCAATATCTACGGTCGATCATGCAGTGGAATCATCAAAATCCTCCCC
ACCGCCGGCAAAACAGACGCCGCCACGACTTTAAAGATCGTCAAGAAGGCGACGTCTCAG
GGAGAAGATCTCGCTTTGTACTTTGAATTCTGCAGAGGCTTTGGCGTTCCGAACGCACGG
GATACGCCTCAGTTCGTTAGTATACCAACGGCTGAAGTAGAAGCGATGGAGAAAATGGTC
AAGAAGAGCGTCGAAAAGGATGAACAAGAGCAAGAAGAAGAAGTAGTGAAGGAGGAAGAG
AAAGCTATTGTACTGTTGGAGAAACCGAGATTGCAGACGATCATAACAGACGAATGGGAG
ATTTTCGAAGACGATGAACATTGTTTTAATGAAAAGGTCATTCAAGAATATCATCAAGAT
CCTCTGCCTCTTGTAGTATGGAACCAACCAGTTGTTTACACAATGCCAGATTTGATTACG
TTCTAGAGAACGTTCAGCAGATTTGGATGAGATTTGATTCTTTTTTTCACCTGGTTCTGG
TTCTGTGCATAATACAATTTTTTTTTACCAGT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL3974Contig1 578 3 7 U
GGACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGGAGAAGAAGAAGACACGCACCATCCATCCG
TCTCCAAGAGGGAGTTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCCTGATA
ACAAGCCTAATTTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGCTTC
GCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGTCTGC
TGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAACCCTCTGATTGTCCCAATC
CTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGCGCAAAAGTGA
GTAGTAATACCGGGACGCTTACCTTCCTCTGTTTTCCATTCTTGTGTATCTTCAATCTTT
TAAATGGGTTTGTATTTCTGTTTCCTAGTGTGTGTGAACAAATCCATAAACTTTTTTGCC
TCTGTATTATTGGAAATTTCCATGTATTCTATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAAC
AATGTATCATTGTTGATGAAATAATGTCTTTTGACAGT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB82TF U 1
AF RR4BS19TF U 43
AF RR4F827TF U 4
BS 1 170 RR4FB82TF
BS 171 171 RR4BS19TF
BS 172 174 RR4FB82TF
BS 175 175 RR4BS19TF
BS 176 343 RR4FB82TF
BS 344 348 RR4BS19TF
BS 349 578 RR4FB82TF

RD RR4FB82TF 578 0 0
GGACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGGAGAAGAAGAAGACACGCACCATCCATCCG
TCTCCAAGAGGGAGTTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCCTGATA
ACAAGCCTAATTTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGGATCCGCTTC
GCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGTCTGC
TGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAACCCTCTGATTGTCCCAATC
CTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAG*****GCGCAAAAGTGA
GTAGTAATACCGGGACGCTTACCTTCCTCTGTTTTCCATTCTTGTGTATCTTCAATCTTT
TAAATGGGTTTGTATTTCTGTTTCCTAGTGTGTGTGAACAAATCCATAAACTTTTTTGCC
TCTGTATTATTGGAAATTTCCATGTATTCTATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAAC
AATGTATCATTGTTGATGAAATAATGTCTTTTGACAGT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4BS19TF 530 0 0
ACACGCACCATCCATCCGTCTCCAAGAGGGAGTTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAA
AAGATGGGTTTCCTGATAACAAGCCTAATTTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTG
TGCGTTCGAATCTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTC
ATTACTGCCACGGTCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAAC
CCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCA
GGCTATGCGCAAAAGTGAGTAGTAATACCGGGACGCTTACCTTCCTCTGTTTTCCATTCT
TGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGGTTTGTATTTCTGTTTCCTAGTGTGTGTGAACAAA
TCCATAAACTTTTTTGCCTCTGTATTATTGGAAATTTCCATGTATTCTATTCCCAAAACA
AGCTGAGATGCTCAAAACAATGTATCATTGTTGATGAAATAATGTCTTTT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4F827TF 569 0 0
G
GGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGGAGAAGAAGAAGACACGCACCATCCATCCGTCTC
CAAGAGGTAGTTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCCTGATAACAA
GCCTAATTTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGCTTCGCTA
GAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGTCTGCTGCT
GGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAACCCTCTGATTGTCCCAATCCTAA
GCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGCGCAAAAGTGAGTAG
TAATACCGGGACGCTTACCTTCCTCTGTTTTCCATTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAA
TGGGTTTGTATTTCTGTTTCCTAGTGTGTGTGAACAAATCCATAAACTTTTTTGCCTCTG
TATTATTGGAAATTTCCATGTATTCTATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAACAATG
TATCATTGTTGATGAAATAATGTCTTTT

QA 2 569 2 569
DS 



AS 1 2

CO CL3975Contig1 952 2 2 U
GAACTCAGAAGAAAAGTTTGCATCTCTGTTAGAGAAGTTAGAAACAGCCAGACCTGAAGG
CGGTGAGCTAGACAACATATGTGATCAGATCCATCAAGTGATGAAGTCACTGCAAGTGCC
TAAAGAAACAATCAACACCATAAGCAAAGCCTTTCCCCAAGACGACGCTCGTCTCATCGT
TCGTTCAAGCGCCAACGTCGAGGACTTAGCAGGAATGTCAGCAGCAGGGCTCTACGAATC
AATCCCCAACGTGAGCCCCTCGGATTCTTCGGTGTTTTCAGATTCCGTCTGCCAAGTTTG
GGCTTCTCTCTACACGAGAAGAGCTGTTCTGAGCCGTAGAGCCGCTGGTGTCTCTCAGAG
AGAAGCTACAATGGCGGTTCTTGTTCAAGAGATGCTGTCTCCTGACTTATCTTTCGTTCT
TCACACGGTGAGTCCAGCTGATCCAGACAGTAACCTTGTCGAGGCCGAGATAGCTCCTGG
TTTAGGTGAGACTTTAGCTTCGGGGACGAGAGGAACACCGTGGAGACTTGCTTCGGGTAA
GCTCGATGGGGTTGTGGAGACCTTAGCGTTTGCAAACTTCAGTGAAGAGCTTCTTGTGTC
AGGAAAAGGTCCTGCTGATGGAAAATACGTTCGGTTGACCGTTGACTATAGCAAGAAACG
GTTAACGGTTGACTCGGTGTTTAGACAGAAGCTCGGTCAGAGACTCGGTTCGGTTGGTTT
CTTCTTGGAAAGGAACTTTGGATGTGCACAAGACGTTGAAGGTTGTTTGGTTGGTGAGGA
TGTCTACATCGTTCAGTCAAGGCCACAACCTCTGTAGAATCTTTTTTTTTTATGTTCTAT
AAAGCGAATAATAACAAAAATGTTAAAATAAAATCTGCAGTTATGTCATTATCATATGTG
ATGTATGTTTAATAATGATACACATATATCTTAATTACTATATTTTAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ26TF U 1
AF RR4EJ26JQ C 200
BS 1 598 RR4EJ26TF
BS 599 952 RR4EJ26JQ

RD RR4EJ26TF 600 0 0
GAACTCAGAAGAAAAGTTTGCATCTCTGTTAGAGAAGTTAGAAACAGCCAGACCTGAAGG
CGGTGAGCTAGACAACATATGTGATCAGATCCATCAAGTGATGAAGTCACTGCAAGTGCC
TAAAGAAACAATCAACACCATAAGCAAAGCCTTTCCCCAAGACGACGCTCGTCTCATCGT
TCGTTCAAGCGCCAACGTCGAGGACTTAGCAGGAATGTCAGCAGCAGGGCTCTACGAATC
AATCCCCAACGTGAGCCCCTCGGATTCTTCGGTGTTTTCAGATTCCGTCTGCCAAGTTTG
GGCTTCTCTCTACACGAGAAGAGCTGTTCTGAGCCGTAGAGCCGCTGGTGTCTCTCAGAG
AGAAGCTACAATGGCGGTTCTTGTTCAAGAGATGCTGTCTCCTGACTTATCTTTCGTTCT
TCACACGGTGAGTCCAGCTGATCCAGACAGTAACCTTGTCGAGGCCGAGATAGCTCCTGG
TTTAGGTGAGACTTTAGCTTCGGGGACGAGAGGAACACCGTGGAGACTTGCTTCGGGTAA
GCTCGATGGGGTTGTGGAGACCTTAGCGTTTGCAAACTTCAGTGAAGAGCTTCTTGTG
TC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4EJ26JQ 753 0 0
GAGGACTTAGCAGGAATGTCAGCAGCAGGGCTCTACGAATCAATCCCCAACGTGAGCCCC
TCGGATTCTTCGGTGTTTTCAGATTCCGTCTGCCAAGTTTGGGCTTCTCTCTACACGAGA
AGAGCTGTTCTGAGCCGTAGAGCCGCTGGTGTCTCTCAGAGAGAAGCTACAATGGCGGTT
CTTGTTCAAGAGATGCTGTCTCCTGACTTATCTTTCGTTCTTCACACGGTGAGTCCAGCT
GATCCAGACAGTAACCTTGTCGAGGCCGAGATAGCTCCTGGTTTAGGTGAGACTTTAGCT
TCGGGGACGAGAGGAACACCGTGGAGACTTGCTTCGGGTAAGCTCGATGGGGTTGTGGAG
ACCTTAGCGTTTGCAAACTTCAGTGAAGAGCTTCTTGTGTCAGGAAAAGGTCCTGCTGAT
GGAAAATACGTTCGGTTGACCGTTGACTATAGCAAGAAACGGTTAACGGTTGACTCGGTG
TTTAGACAGAAGCTCGGTCAGAGACTCGGTTCGGTTGGTTTCTTCTTGGAAAGGAACTTT
GGATGTGCACAAGACGTTGAAGGTTGTTTGGTTGGTGAGGATGTCTACATCGTTCAGTCA
AGGCCACAACCTCTGTAGAATCTTTTTTTTTTATGTTCTATAAAGCGAATAATAACAAAA
ATGTTAAAATAAAATCTGCAGTTATGTCATTATCATATGTGATGTATGTTTAATAATGAT
ACACATATATCTTAATTACTATATTTTAAAGCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3976Contig1 1658 3 3 U
GGGCATCATTCATCTTATCTTTTGATAGTAGCTCTTCAGGAGTTGGTAGTTGGTCAGGTC
AACTCTGTTCCTATTTACGTCTATTTTCGGTTTAGCTATGATATTTACTTGGAATTACCC
GAATAGTGTATCTCGGGTTTATGATTTTTCTTTTCCACTGTAGGTCAGTTTATTATGCAG
CCTCGGATGTAGTTATACTCAGATTTATGGTTGAGGTGTGTTGGGCTCCTATGTTGGCTG
CTTTCAGTGTTCCACTTGACCAGAGTGATGATGCAGTCATTACGTCATTATGTCTGGAGG
GTTTCCACCATGCTATCCATGTCACTTCTGTAATGTCCTTAAAGACGCACAGAGATGCCT
TTGTGACATCACTAGCAAAATTTACGTCTCTCCACTCTCCTGCTGATATCAAGCAGAAAA
ATATTGAGGCCATAAAGGTTTGTATCTTTTCTCTCTCAATTTTTTTCCTTATTTTCAGGG
TAAAAGAAGAGTTAGGGAAATCTCATTCAGTTTTAAGTTTTATTCTATATTGGATTAGCA
TTCACATTGTGTTTGAAAATCTTGGGAAAAACATGCGTTGTTTCTTTTTAAGCTTTTCTA
GTTTATAGGTGATGGTGATTCGCCTAGCTTTTTCCTTCTGTTTTGTTTGTGGATTGAGTT
GGATACTTTGGATGATATGAAGCGAATTCTATGGATTTATTGTTTTTTTTTGTTCACTGA
CAGGCAATAGTCAAATTGGCAGAGGAAGAAGGCAACTATCTGCAAGATGCTTGGGAGCAT
ATATTGACATGTGTTTCTCGGTTTGAACATCTTCATCTCTTGGGGGAAGGGGCACCTCCC
GATGCTACCTTCTTTGCATTTTCTCAAACCGAGTCGGGAAACTCTCCCATGGCTAAGTCA
AATTCAGTACCTGCAAGTAAAGAAAGAGCATCTGGAAAACTTCAACATGCCGCTTCTGCT
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BQ
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AF RR4FX16JQ U 1
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AF RR4BW74TF U 908
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GGATACTTTGGATGATATGAAGCGAATTCTATGGATTTATTGTTTTTTTTTGTTCACTG

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TGTGACATCACTAGCAAAATTTACGTCTCTCCACTCTCCTGCTGATATCAAGCAGAAAAA
TATTGAGGCCATAAAGGTTTGTATCTTTTCTCTCTCAATTTTTTTCCTTATTTTCAGGGT
AAAAGAAGAGTTAGGGAAATCTCATTCAGTTTTAAGTTTTATTCTATATTGGATTAGCAT
TCACATTGTGTTTGAAAATCTTGGGAAAAACATGCGTTGTTTCTTTTTAAGCTTTTCTAG
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TATTGACATGTGTTTCTCGGTTTGAACATCTTCATCTCTTGGGGGAAGGGGCACCTCCCG
ATGCTACCTTCTTTGCATTTTCTCAAACCGAGTCGGGAAACTCTCCCATGGCTAAGTCAA
ATTCAGTACCTGCAAGTAAAGAAAGAGCATCTGGAAAACTTCAATATGCCGCTTCTGCTA
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C

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DS 

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G
ACCTGCAAGTAAAGAAAGAGCATCTGGAAAACTTCAACATGCCGCTTCTGCTATGATAAG
GGGTTCCTACGATGGTTCTGGTGTTGCTGGCAAGGCCTCTAATGCGGTGACATCTGAGCA
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ATTTACGCGTAGTCAAAGATTGAACAGTGAAGCGATAATAGACTTCGTTAAAGCACTCTG
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QA 2 751 2 751
DS 



AS 1 3

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GAGAGAAACCAAAACTAGAACATGAGAATGATCCAGCAACCTTATATTTAAAACGAGAAA
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CTTCTTTCATCAAATCCACTTGATCGTTTCTAGCAGTAAAGATAATGATGCCAGTCTCAT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4ES79JQ U 1
AF RR4CS10JQ U 9
AF RR4ES79TF C 259
BS 1 229 RR4ES79JQ
BS 230 233 RR4CS10JQ
BS 234 581 RR4ES79JQ
BS 582 582 RR4CS10JQ
BS 583 644 RR4ES79JQ
BS 645 743 RR4CS10JQ
BS 744 746 RR4ES79TF
BS 747 775 RR4CS10JQ
BS 776 776 RR4ES79TF
BS 777 797 RR4CS10JQ

RD RR4ES79JQ 644 0 0
GTTCTCGTCGTTACATATATCGTCTTTATACGTTTATTTATAGCATCCAAAGACAACACA
GAGAGAAACCAAAACTAGAACATGAGAATGATCCAGCAACCTTATATTTAAAACGAGAAA
GGGTAAATCAGAGGCAAGCCAGATAATACATAAAAGACTCAAACCAGCAACAAACCCCAC
CTGCAAATTCTGATAAGCAAAAACTCAAAGCAGAGTAGAGAGAGAGAGA****TGCTATT
GCTTCTACAACTAGAGAACATAAGTCTTATGAGTCACTCTGCTTTCTTTCGTTGGCTAAC
TAAATCAAGCTTCAACGTTCACAAGCTCATACTCGATGAGGGAAAGATTGTTATCTTCCT
TGACGGTGATGTCTGTGGCATCCTCCTCAGCGACTTCAACGCGTCCCCATCTATCAACTG
CAAGCCTCATAGATCCCTTGTACATGTCGATCTTGGCGTTGCGCAGGGTCACAACCTTCC
CTTCTTTCATCAAATCCACTTGATCGTTTCTAGCAGTAAAGATAATGATGCCAGTCTCAT
CACCAACAAGACACTCAGCAATCCGCATCTGACGAGCCGGAAGACCACTGGGACGACCTC
CTCCACCACCTCTCTGCATCACCATCTTCGTGCTGATAACTTTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4CS10JQ 789 0 0
CGTTACATATATCGTCTTTATACGTTTATTTATAGCATCCAAAGACAACACAGAGAGAAA
CCAAAACTAGAACATGAGAATGATCCAGCAACCTTATATTTAAAACGAGAAAGGGTAAAT
CAGAGGCAAGCCAGATAATACATAAAAGACTCAAACCAGCAACAAACCCCACCTGCAAAT
TCTGATAAGCAAAAACTCAAAGCAGAGTAGAGAGAGAGAGAGAGATGCTATTGCTTCTAC
AACTAGAGAACATAAGTCTTGTGAGTCACTCTGCTTTCTTTCGTTGGCTAACTAAATCAA
GCTTCAACGTTCACAAGCTCATACTCGATGAGGGAAAGATTGTTATCTTCCTTGACGGTG
ATGTCTGTGGCATCCTCCTCAGCGACTTCAACGCGTCCCCATCTATCAACTGCAAGCCTC
ATAGATCCCTTGTACATGTCGATCTTGGCGTTGCGCAGGGTCACAACCTTCCCTTCTTTC
ATCAAATCCACTTGATCGTTTCTAGCAGTAAAGATAATGATGCCAGTCTCATCACCAACA
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CCTCTCTGCATCACCATCTTCGTGCTGATAACTTTCACGTTCAGTGAGTGACCATTGGTT
CCTGGTCTCAGCTCATTAACCTTGGTGAACACAGGCTTCCTCAAAGCTGTTGTTACCTCA
GCCATTGTTTTTTTT***TGGTATCGAGAGAGAAAAGACGACGACTC*GGGCGATCAGAT
CTGTTTGAT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4ES79TF 535 0 0
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CATCCTCCTCAGCGACTTCAACGCGTCCCCATCTATCAACTGCAAGCCTCATAGATCCCT
TGTACATGTCGATCTTGGCGTTGCGCAGGGTCACAACCTTCCCTTCTTTCATCAAATCCA
CTTGATCGTTTCTAGCAGTAAAGATAATGATGCCAGTCTCATCACCAACAAGACACTCAG
CAATCCGCATCTGACGAGCCGGAGGACCACTGGGACGACCTCCTCCACCACCTCTCTGCA
TCACCATCTTCGTGCTGATAACTTTCACGTTCAGTGAGTGACCATTGGTTCCTGGTCTCA
GCTCATTAACCTTGGTGAACACAGGCTTCCTCAAAGCTGTTGTTGCCTCAGCCATTGTTT
TTTTTTTTTGGTATCGAGAGAGAAAAGACGACGACTCAGGGCGATCAGATCTGTT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 3

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TTAGTAAAGAAATGGAAGAAATAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCG
AAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATA
ATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCG
CAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTG
TGGAATCAGTCATGGTTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATA
TAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCGAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACC
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AGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTGTGTATGTTTG
AGAGCAATTGATGCAATAGTTGAATCAATATTCGC


BQ
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AF RR4A353TFB U 1
AF RR4AV26JQ C 46
AF RR4AV26TF U 46
BS 1 414 RR4A353TFB
BS 415 415 RR4AV26TF
BS 416 617 RR4A353TFB
BS 618 618 RR4AV26TF
BS 619 629 RR4A353TFB
BS 630 635 RR4AV26JQ

RD RR4A353TFB 629 0 0
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TTAGTAAAGAAATGGAAGAAATAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCG
AAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATA
ATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCG
CAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTG
TGGAATCAGTCATGGTTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATA
TAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCGAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTC*GAACC
TTAAGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGC
TAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGA
AGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTGTGTATGTTTG
AGAGCAATTGATGCAATCGTTGAATCAAT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4AV26JQ 590 0 0
GT
AAACAAAAGAATTTTAGTAAAGAAATGGAAGAAATAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCA
GTGGACGAGAGCGAAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCA
TATGGTTCCAATAATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCT
TCCATTGATGCCGCAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATAC
GAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGTTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAG
TCCGATTTTAATATAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCGAAGGAAGTAATATGTAAC
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ATTATTGTGAAGAAGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGA
TTGTGTATGTTTGAGAGCAATTGATGCAATAGTTGAATCAATATTCGC

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR4AV26TF 590 0 0
GT
AAACAAAAGAATTTTAGTAAAGAAATGGAAGAAATAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCA
GTGGACGAGAGCGAAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCA
TATGGTTCCAATAATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCT
TCCATTGATGCCGCAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATAC
GAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGTTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAG
TCCGATTTTAATATAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCGAAGGAAGTAATATGTAAC
GCAGTTCAGAACCTTAAGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTC
AAAAGGGCTTTGCTAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTG
ATTATTGTGAAGAAGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGA
TTGTGTATGTTTGAGAGCAATTGATGCAATAGTTGAATCAAT
ATTCGC

QA 3 584 3 584
DS 



AS 1 2

CO CL3979Contig1 988 2 2 U
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GTGGCTTTATAGAGCCACCGACAATGATCATTATATGAGTTATGTTGTTGACATGGCTCA
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CGTTCAACTCCTCGCTTCCATGTTGATAAAAGAAGAAAAGCACAAGGAACACTCCAAAAT
CATACAACAATACAAATCAAAGGCGGATCATTATCTATGCTCAATTTTAAACAAGAACAT
CAATGGCACAAACGTCCAACGAACTCCGGCCGGTTTACTCTACGTCCGGCAATGGAACAA
CATGCAATACGTTTCCACCGCATCATTCCTCCTAACCGTATATTCCGATCATCTCCGCAA
ATCAAACTCTGATCTCGAGTGTCATGAAGGAACCGTTACTCCTGATGAGATGCTTGTGTT
TGCGAAATCCTAAATAGACTATATTTTAGGATCAAACCCAATGAAAACAAGTTATCTAGT
CGGATACGGTCCGAAATATCCGACTAGGGTTCATCATAGAGGTGCATCGATCGCTTCATA
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CGAGCCAAATCCAAGTGTTTTAGTCGGGGCTTTGGTTGGAGGACCGGATCACCGAGATGA
GTTTGTTGACCGGAGGGATAACTACGTTCAAACCGAGGCTTGTACGTATAATACTCCCCC
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GAGTTTGGTTGCAACTTATAAGAGATAGGTTTTACAATACAAAAGAAAATAAGAGAAAAT
GAGTTTGGTTGCAACTCAGCAATTTTTTTATCGAGTGAAAAGTGTGTATAAATATGAATT
ATGAATATAGAATGTTTTGTTATTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DB33TF U 1
AF RR4DB33JQ C 179
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BS 654 988 RR4DB33JQ

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CAATGGCACAAACGTCCAACGAACTCCGGCCGGTTTACTCTACGTCCGGCAATGGAACAA
CATGCAATACGTTTCCACCGCATCATTCCTCCTAACCGTATATTCCGATCATCTCCGCAA
ATCAAACTCTGATCTCGAGTGTCATGAAGGAACCGTTACTCCTGATGAGATGCTTGTGTT
TGCGAAATCCTAAATAGACTATATTTTAGGATCAAACCCAATGAAAACAAGTTATCTAGT
CGGATACGGTCCGAAATATCCGACTAGGGTTCATCATAGAGGTGCATCGATCGCTTCATA
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QA 1 653 1 653
DS 

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CTGCG
TCAACTCCTCGCTTCCATGTTGATAAAAGAAGAAAAGCACAAGGAACACTCCAAAATCAT
ACAACAATACAAATCAAAGGCGGATCATTATCTATGCTCAATTTTAAACAAGAACATCAA
TGGCACAAACGTCCAACGAACTCCGGCCGGTTTACTCTACGTCCGGCAATGGAACAACAT
GCAATACGTTTCCACCGCATCATTCCTCCTAACCGTATATTCCGATCATCTCCGCAAATC
AAACTCTGATCTCGAGTGTCATGAAGGAACCGTTACTCCTGATGAGATGCTTGTGTTTGC
GAAATCCTAAATAGACTATATTTTAGGATCAAACCCAATGAAAACAAGTTATCTAGTCGG
ATACGGTCCGAAATATCCGACTAGGGTTCATCATAGAGGTGCATCGATCGCTTCATATAA
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TGTTGACCGGAGGGATAACTACGTTCAAACCGAGGCTTGTACGTATAATACTCCCCCTTT
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TTTGGTTGCAACTTATAAGAGATAGGTTTTACAATACAAAAGAAAATAAGAGAAAATGAG
TTTGGTTGCAACTCAGCAATTTTTTTATCGAGTGAAAAGTGTGTATAAATATGAATTATG
AATATAGAATGTTTTGTTATTGCTT

QA 6 810 6 810
DS 



AS 1 3

CO CL3980Contig1 1204 3 9 U
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AAGCTATAAATTGCTTGGATGGGTTAGAAGTTGAGGTAAGGCTTGGAGAGTTTATAAAAG
CATATGGAGATAGAAGAAACCAAGAGACAGGTCTTAGTCTATCGTGGAAGTTAAAAGACT
GGCCGAGCCCAAGTGCTTCAGAGGAGTTCATATTCAACCAGAGACCTGAGTTTATCAGAA
GATTTCCGTTTCTTGAGTACATACATCCCCGGTTAGGCCTTCTGAACGTTGCAGCCAAGA
TGCCTCATTACTCGCTCCAAAACGATACAGGTCCAAAGGTTGTAGTGTCTTGTGGGACGT
TCAAAGAAACTGATGCTGGCGATTCATTGAATAGTATTCACTACAGCATGCGTGACATGG
TATACCTCTTGGTGCACACATCTGAAGGAACAAAACTCGATAGTGTGAGAGAGACAAATC
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AGTTACATGAATCTGAGATGATGTCTAGTGTGAATCCAGAGAGTCACAACATGGAATCTT
CTTGCACGTCTTCATGTGCAGGAGGAGCCAAATGGGATGTCTTCAGGCGCCAAGACGTCC
CAAAGCTGGCCGAGTATTTGCAGAGAACATTCCTGAAGCCTGATGATAGTGTTAAGTGTG
ATGTTGCGTCACGTCCGTTGTTTGAAGGATTGTTCTTAAATGAACACCACAAGACGCAAC
TAAAAGATGAGTTAGGAATTGAGCCATGGACGTTTGAGCAACTTCGTGGTGAGGCTATCT
TCATTCCAGCTGGATGTCCGTTCCAATTCAGAAACCTCAGATTCTAGAGATAGGGAAGAT
ATCGTTATACGCAGCTAGCTCAGCCATCAAAGAGGTTCAGAAACTGATCTTGAATCCAGA
ATTTGGAGCAGAGCTTGGTTTTGAGGACCCTAACCTAACCAAAGCAGTCTCCAACAACTT
GGATAAGGTAATCAAGCGGCCACAGCAAATCAGCTGTACTTGATCAGAAGAAGATTTGTA
CAGTAGTATTACCTATTGTTGTGACATTAGTCTAAAACTACTAATACTACGATTCAGGAT
TTGTATGTATCTTAGTGTATATGCTTTACAAATTATATGCATGAGCATCACTATTCCACT
TCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 10 10 

AF RR4GN36TF U 1
AF RR4F747TF U 440
AF RR4F747JQ C 605
BS 1 447 RR4GN36TF
BS 448 448 RR4F747TF
BS 449 487 RR4GN36TF
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RD RR4GN36TF 528 0 0
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AAGCTATAAATTGCTTGGATGGGTTAGAAGTTGAGGTAAGGCTTGGAGAGTTTATAAAAG
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GGCCGAGCCCAAGTGCTTCAGAGGAGTTCATATTCAACCAGAGACCTGAGTTTATCAGAA
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TCAAAGAAACTGATGCTGGCGATTCATTGAATAGTATTCACTACAGCATGCGTGACATGG
TATACCTCTTGGTGCACACATCTGAAGTAACAAAACTCGATAGTGTGAGAGAGACAAATC
ACGGTCCGAGAGAACCTGATGAGAAGATGGGAGAAAATGAGGAAAAAA

QA 1 528 1 528
DS 

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G
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ATGTCTAGTGTGAATCCAGAGAGTCACAACATGGAATCTTCTTGCACGTCTTCATGTGCA
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TTCCAATTCAGAAACCTCAGATTCTAGAGATAGGGAAGATATCGTTATACGCAGCTAGCT
CAGCCATCAAAGAGGTTCAGAAACTGATCTTGAATCCAGAATTTGGAGCAGAGCTTGGTT
TTGAGGACCCTAACCTAACCAAAGCAGTCTCCAACAACTTGGATAAGGTAATCAAGCGGC
CACAGCAAATCAGCTGTACTTGATCAGAAGAAGATTTGTACAGTAGTATTACCTATTGTT
GTGACATTAGTCTAAAACTACTAATACTACGATTCAG*ATTTGTATGTATCTTAGTGTAT
ATGCTTTACAAATTATATGCATGAGCATCACTATTCCACTTC

QA 2 763 2 763
DS 

RD RR4F747JQ 600 0 0
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TGCGTCACGTCCGTTGTTTGAAGGATTGTTCTTAAATGAACACCACAAGACGCAACTAAA
AGATGAGTTAGGAATTGAGCCATGGACGTTTGAGCAACTTCGTGGTGAGGCTATCTTCAT
TCCAGCTGGATGTCCGTTCCAATTCAGAAACCTCAGATTCTAGAGATAGGGAAGATATCG
TTATACGCAGCTAGCTCAGCCATCAAAGAGGTTCAGAAACTGATCTTGAATCCAGAATTT
GGAGCAGAGCTTGGTTTTGAGGACCCTAACCTAACCAAAGCAGTTTCCAACAACTTGGAT
AAGGTAATCAAGCGGCCACAGCAAATCAGCTGTACTTGATCAGAAGAAGATTTGTACAGT
AGTATTACCTATTGTTGTGACATTAGTCTAAAACTACTAATACTACGATTCAGGATTTGT
ATGTATCTTAGTGTATATGCTTTACAAATTATATGCATGAGCATCACTATTCCACTTCAG

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL3981Contig1 993 3 2 U
GGGGCTGTTATTCAACGGCCATTTTCCATCTTACACACCCAACTCGTGTTCCTCTGTTTT
GTATTACCAAACCCGTTTCGTCTTTCCTTCTTCAGATTCTTACCATCGATCCACCAACTG
TTTCTTGATTTCTCGAATTGCTTTTCCCTATATCCTCGGGGGAAAACGGAACAGAACCTC
TTGTTTAAAAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGTTGATGGATCCCCC
AAGCGGTCCATGTTTATGTATTGATGCTAATACAAGAAGCTCTCCGAACAAGAAGAAGAT
CCTTGGCAGTGCAATAAAGCTAGAGTTAGGAAGCTCTTTTACCGGTTCAATCATTGTTTT
CAGGCTTTCTTCTACCAAACGCGTACCGAGAATTGCGAGTCGAAGGAGCAAGAAGAAGCT
CGTGATTGTGAACGAGGACGTTGCTGGGAATTACGAGGATACCTTCGGAGATGTCAAGAC
GCAACTTATAAACTACTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTACATCAGTTATACGA
AATGAATCCTCCTCGATACACTTGGTTCTATAATTATGTCGTATCAAACAGACCAACCGA
AGGCAAACGATTCCTTCGCAAACTCGGCAAGGAGAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTTAT
GATCACACGCCTCCACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGTGACCATGGGAAGATATA
CCAAGATATATCAGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTGATGGAGACCGTGAT
ATGGCCTTCTGACGACTCAAACTCTGAGGTTATTGGCTGAAGAAGTATATGTCACAAAAC
CCACAGCATCTCCTTTGTGAATTCGCTTCTCAGTTTTTTTAGGACCTTGAGCTTCTCTTA
GTTTATAATATAGTTCATTGAGCAGTATATACGAGTCTTTTCTTGGCATGTACTGTTTAT
GATATATAGCAAAACTATATCTTCTTCTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN71TF U 1
AF RR4DH07TF U 8
AF RR4DN71JQ C 220
BS 1 636 RR4DN71TF
BS 637 993 RR4DN71JQ

RD RR4DN71TF 636 0 0
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TTGTTTAAAAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGTTGATGGATCCCCC
AAGCGGTCCATGTTTATGTATTGATGCTAATACAAGAAGCTCTCCGAACAAGAAGAAGAT
CCTTGGCAGTGCAATAAAGCTAGAGTTAGGAAGCTCTTTTACCGGTTCAATCATTGTTTT
CAGGCTTTCTTCTACCAAACGCGTACCGAGAATTGCGAGTCGAAGGAGCAAGAAGAAGCT
CGTGATTGTGAACGAGGACGTTGCTGGGAATTACGAGGATACCTTCGGAGATGTCAAGAC
GCAACTTATAAACTACTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTACATCAGTTATACGA
AATGAATCCTCCTCGATACACTTGGTTCTATAATTATGTCGTATCAAACAGACCAACCGA
AGGCAAACGATTCCTTCGCAAACTCGGCAAGGAGAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4DH07TF 630 0 0
GG
ATTCAACGGCCATTTTCCATCTTACACACCCAACTCGTGTTCCTCTGTTTTGTATTACCA
AACCCGTTTCGTCTTTCCTTCTTCAGATTCTTACCATCGATCCACCAACTGTTTCTTGAT
TTCTCGAATTGCTTTTCCCTATATCCTCGGGGGAAAGCGGAACAGAACCTCTTGTTTAAA
AGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGTTGATGGATCCCCCAAGCGGTCC
ATGTTTATGTATTGATGCTAATACAAGAAGCTCTCCGAACAAGAAGAAGATCCTTGGCAG
TGCAATAAAGCTAGAGTTAGGAAGCTCTTTTACCGGTTCAAGCATTGTTTTCAGGCTTTC
TTCTACCAAACGCGTACCGAGAATTGCGAGTCGAAGGAGCAAGAAGAAGCTCGTGATTGT
GAACGAGGACGTTGCTGGGAATTACGAGGATACCTTCGGAGATGTCAAGACGCAACTTAT
AAACTACTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTACATCAGTTATACGAAATGAATCC
TCCTCGATACACTTGGTTCTATAATTATGTCGTATCAAACAGACCAACCGAAGGCAAACG
ATTCCTTCGCAAACTCGGCAAGGAGAA
T

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR4DN71JQ 774 0 0
CTCATCGTTGATGGATCCCCCAAGCGGTCCATGTTTATGTATTGATGCTAATACAAGAAG
CTCTCCGAACAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTGCAATAAAGCTAGAGTTAGGAAGCTCTTT
TACCGGTTCAATCATTGTTTTCAGGCTTTCTTCTACCAAACGCGTACCGAGAATTGCGAG
TCGAAGGAGCAAGAAGAAGCTCGTGATTGTGAACGAGGACGTTGCTGGGAATTACGAGGA
TACCTTCGGAGATGTCAAGACGCAACTTATAAACTACTTCACATACAAAGCTGTGAGGAC
GGTTCTACATCAGTTATACGAAATGAATCCTCCTCGATACACTTGGTTCTATAATTATGT
CGTATCAAACAGACCAACCGAAGGCAAACGATTCCTTCGCAAACTCGGCAAGGAGAATCA
GGAGCTTGCAGAAAGAGTTATGATCACACGCCTCCACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAA
ATGTGACCATGGGAAGATATACCAAGATATATCAGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGA
ACGCCTGATGGAGACCGTGATATGGCCTTCTGACGACTCAAACTCTGAGGTTATTGGCTG
AAGAAGTATATGTCACAAAACCCACAGCATCTCCTTTGTGAATTCGCTTCTCAGTTTTTT
TAGGACCTTGAGCTTCTCTTAGTTTATAATATAGTTCATTGAGCAGTATATACGAGTCTT
TTCTTGGCATGTACTGTTTATGATATATAGCAAAACTATATCTTCTTCTCAATT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL3982Contig1 1236 2 2 U
GGCCCATTCCCCAGTTTGTTATTTTCATCACTCCTCCTCCTTCGTCCTCAACTTGTCGCG
CCGTTCTTCATCGTTCTCGTTAACCGTCGTTACTTTTACAGATTGTGTCTGGTTCAGAGT
TTGACAATGAAGGGAGATAGTAAGTTTGAACCGAGCTCGAGTAAGATTGTGTTTGACGAC
AGTGAAGACGATGATGAAGATCAATCCTTATCGTCTCTGTCTTCTTCAGATGAGGTCTGT
CGGAATATCTTACAATGTTGCTTTGTTTGTTGATTTTTATAAATTTTGAAGAGTTTCTTT
TTCTTTTAAATTGGTAATTAGGAAGAAGAAGAAGAGAAAGGGAAAGAGTTAACATTGGAG
GAAATACATATATTGCGTGCTGATGAGTCTCGTCCTGCTGCTCCCTTAAAGCCATCGTTT
TCTCAAGTGAAGAAGAACACTGGTCGTGCTGCAGACAAGAACATTACCTTCTCTGAAGCG
AAGAAACCTGCTCGTGCAAACAAGAATAGACCGGTAGAGTTAAGTTCCAGAAGACCCGTG
AGTCGTTATAGAGAGGTTATTCAAGCTCCAAAGAAGGTGGTTCGGGATCCTCGTTTTGAC
TCATTGGCTGGAAACGCTGATCCTGAGGGGTTTAGGAAGCGATACAGTTTCTTTTTCGAG
GAGAAACTTCCTGTAGAAAGAGAGGAACTGAAAAAGAAGCTAAAGAAAACAAAGAATCCA
GAAGAGGTCGACGAACTCAAGGACCCGTTAACTTATGTTGAGAAGTTGTTGAAGTATGAT
CCGTCAACAAATAGCAAAGGAAAGTCAATACTAACAGAACACAAAAAGAGAGAAAGAGAA
GCCGCTAAGATGGGCAAAAAGCCTTACTATCTCAAACAATCTGAGATCCGTAAACAAGAA
CTCATCGAAAAGTACAACAGTCTCAAGGAATCTGGTAAGCTTTCATCGTTTCTTGACAAA
CGGAGGAAGAAGAATGCAACGAAGGATCATAGGTACATGCCCTATCGTCGAGCCGGTGCT
TCAGAGCAATAGAGAGAGACAGTATTGCTTTCTGACTTATTGTTTACGTTGGTTCGTTAA
GGGCTTTGTGATGAGAATTGAAATCCAAATGTTACTTGTTTTTTTGTGTGCTTGATTGAG
CCATATCAAGTACTGATGTTGCTTAGACTTTGTTTTGGTTCTCTCCAGACACACGAAAGA
ACCACATAGAGTAATCAATATAGTTTTGTTGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DX23TF U 1
AF RR4DX23JQ C 554
BS 1 631 RR4DX23TF
BS 632 1236 RR4DX23JQ

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CCGTTCTTCATCGTTCTCGTTAACCGTCGTTACTTTTACAGATTGTGTCTGGTTCAGAGT
TTGACAATGAAGGGAGATAGTAAGTTTGAACCGAGCTCGAGTAAGATTGTGTTTGACGAC
AGTGAAGACGATGATGAAGATCAATCCTTATCGTCTCTGTCTTCTTCAGATGAGGTCTGT
CGGAATATCTTACAATGTTGCTTTGTTTGTTGATTTTTATAAATTTTGAAGAGTTTCTTT
TTCTTTTAAATTGGTAATTAGGAAGAAGAAGAAGAGAAAGGGAAAGAGTTAACATTGGAG
GAAATACATATATTGCGTGCTGATGAGTCTCGTCCTGCTGCTCCCTTAAAGCCATCGTTT
TCTCAAGTGAAGAAGAACACTGGTCGTGCTGCAGACAAGAACATTACCTTCTCTGAAGCG
AAGAAACCTGCTCGTGCAAACAAGAATAGACCGGTAGAGTTAAGTTCCAGAAGACCCGTG
AGTCGTTATAGAGAGGTTATTCAAGCTCCAAAGAAGGTGGTTCGGGATCCTCGTTTTGAC
TCATTGGCTGGAAACGCTGATCCTGAGGGGT

QA 1 631 1 631
DS 

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AACTCAAGGACCCGTTAACTTATGTTGAGAAGTTGTTGAAGTATGATCCGTCAACAAATA
GCAAAGGAAAGTCAATACTAACAGAACACAAAAAGAGAGAAAGAGAAGCCGCTAAGATGG
GCAAAAAGCCTTACTATCTCAAACAATCTGAGATCCGTAAACAAGAACTCATCGAAAAGT
ACAACAGTCTCAAGGAATCTGGTAAGCTTTCATCGTTTCTTGACAAACGGAGGAAGAAGA
ATGCAACGAAGGATCATAGGTACATGCCCTATCGTCGAGCCGGTGCTTCAGAGCAATAGA
GAGAGACAGTATTGCTTTCTGACTTATTGTTTACGTTGGTTCGTTAAGGGCTTTGTGATG
AGAATTGAAATCCAAATGTTACTTGTTTTTTTGTGTGCTTGATTGAGCCATATCAAGTAC
TGATGTTGCTTAGACTTTGTTTTGGTTCTCTCCAGACACACGAAAGAACCACATAGAGTA
ATCAATATAGTTTTGTTGGACCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

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GGACCTTACCACAATTCTCCCAGCTTCAACCTAACGCCAAGAGCCGCCTTGGGATTGATA
ATCAACCGAAGCAATCGAAATCGATCAGATCATTGCAGAGCGCAGCCTTTCTCAGACCAA
ACTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGATTTGATTTGGTTAAGAAGATATCATGGCGC
AGTGCATAGACGGTTTCAAGCATTTGTGCACCTCTGTTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATT
TGTATAAACAACCTGGTGGCCTTGGAGACCCTGAGTTGCTTGCAAGAGACACTGTTTTTA
GTGTGAGTGAAATAGAAGCTCTTTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCCGTCATTG
ACGATGGACTAATCAACAAGGAAGAGTTTCAGTTGGCTTTGTTTAAGACAAATAAAAAAG
AGAGCTTGTTTGCTGACCGGGTTTTTGATTTGTTTGATACAAAACACAATGGAATACTTG
GTTTTGAAGAGTTCGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACA
AAATCCATTTTTCATTTCAGCTATATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATTGAACGGCAAG
AGGTGAAACAAATGGTTGTCGCCACGCTTGCTGAATCTGGAATGAACTTGAAGGATACTG
TCATTGAAGATATAATCGACAAGACGTTTGAGGAAGCAGACACAAAACATGATGGAAAGA
TTGATAAGGAAGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTTAGACATCCTAGCCTTCTCAAGAACATGA
CTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCAAGTTTTGTGTTCCATTCACAGG
TTGAAGATACCTGAAGATTAAAAAAAAAAGGCAAGCAACAAGACTTGGTGGTTTGTTTTG
TTCATTTGTTTCATTGAGCTCTTTTTTTGTGAAGCAATATACATAATTCATTTTATTTCT
CTCAACTCCTATGTTTTTATTTAGGTCTTTTTTTTGCTTGTGAAGCAAACTTCATATCGA
TTTCGCATCTTTGGTCAGGCCTATTTTGTAGATATAACGTTTGCTTCTTGATATGATATA
TAAAGTTTTAATTTGC


BQ
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AF RR4GF96TF U 1
AF RR4FK17TF U 392
AF RR4FK17JQ C 639
BS 1 576 RR4GF96TF
BS 577 1038 RR4FK17TF
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ATCAACCGAAGCAATCGAAATCGATCAGATCATTGCAGAGCGCAGCCTTTCTCAGACCAA
ACTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGATTTGATTTGGTTAAGAAGATATCATGGCGC
AGTGCATAGACGGTTTCAAGCATTTGTGCACCTCTGTTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATT
TGTATAAACAACCTGGTGGCCTTGGAGACCCTGAGTTGCTTGCAAGAGACACTGTTTTTA
GTGTGAGTGAAATAGAAGCTCTTTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCCGTCATTG
ACGATGGACTAATCAACAAGGAAGAGTTTCAGTTGGCTTTGTTTAAGACAAATAAAAAAG
AGAGCTTGTTTGCTGACCGGGTTTTTGATTTGTTTGATACAAAACACAATGGAATACTTG
GTTTTGAAGAGTTCGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACA
AAATCCATTTTTCATTTCAGCTATATGATCTTAAAC

QA 1 576 1 576
DS 

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TTTTTA
TTTGTTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCTGACCGGGTTTTTGATTTGTTTGA
TACAAAACACAATGGAATACTTGGTTTTGAAGAGTTCGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCA
CCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCATTTTTCATTTCAGCTATATGATCTTAAACA
GCAAGGGTTCATTGAACGGCAAGAGGTGAAACAAATGGTTGTCGCCACGCTTGCTGAATC
TGGAATGAACTTGAAGGATACTGTCATTGAAGATATAATCGACAAGACGTTTGAGGAAGC
AGACACAAAACATGATGGAAAGATTGATAAGGAAGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTTAGACA
TCCTAGCCTTCTCAAGAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCC
AAGTTTTGTGTTCCATTCACAGGTTGAAGATACCTGAAGATTAAAAAAAAAAGGCAAGCA
ACAAGACTTGGTGGTTTGTTTTGTTCATTTGTTTCATTGAGCTCTTTTTTTGTGAAGCAA
TATACATAATTCATTTTATTTCTCTCAACTCCTATGTTTTTATTTAGGTCTTTTTTTTGC
TTGTGAAGCAAACTTCATATCGATTTCGCATCTTTGGTCAG
CCTATTT

QA 7 647 7 647
DS 

RD RR4FK17JQ 458 0 0
GGAATGAACTTGAAGGATACTGTCATTGAAGATATAATCGACAAGACGTTTGAGGAAGCA
GACACAAAACATGATGGAAAGATTGATAAGGAAGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTTAGACAT
CCTAGCCTTCTCAAGAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCA
AGTTTTGTGTTCCATTCACAGGTTGAAGATACCTGAAGATTAAAAAAAAAAGGCAAGCAA
CAAGACTTGGTGGTTTGTTTTGTTCATTTGTTTCATTGAGCTCTTTTTTTGTGAAGCAAT
ATACATAATTCATTTTATTTCTCTCAACTCCTATGTTTTTATTTAGGTCTTTTTTTTGCT
TGTGAAGCAAACTTCATATCGATTTCGCATCTTTGGTCAGGCCTATTTTGTAGATATAAC
GTTTGCTTCTTGATATGATATATAAAGTTTTAATTTGC

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 3

CO CL3984Contig1 623 3 2 U
TTTTTTTTGGGCCAACTCATTTCTTTGAAGATGCCATTATTACAAACACACAAAGCCTAC
ATATTATTACAGCATTATGAAACAGTGCGATGGATCTCTCTCAACATAATTGCTTTTAAG
CTGTCTGCTTGTTGTTGTTGTAGAATCTGAGAAAGAAAGCAACGCCGAGAATCAAGAGAG
GAACCAAGTATACAAGCATCTTGTTTCCAGATTCTTCTTTTGTGGTTTCAGCCGTAGATT
CTTTCTCCCACGGCGGAATATATTTCGCCGTCACCGGGACAGTTGACTTGTCAACGTCAC
CAATATAATACTTCTTCATTGTGTCTTTCGCATCACTGCTGTGGTTCACATCGTCAAAGT
CAGTGGACGCGTCCTTTCCGGTGACGGCGAGTAGAACATTGTCACCGCCGGGATGTTCGT
CCATGAAACTGCTGATGTCATAAACCTTTCCATGGATAAGAATCCAACAATCGTTCTTGC
ACTTATGTTTAGCCACATCATGAAACGAGATAAGCTTGGCCATTGATTACTTTCTTATGC
TCTTGCCGGCTAGAAATGAACACGATTATGAACCAATATAAAACAGAGCGCAAACTTCTC
GAGACCACACGCGTTCTGTTTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E705TF C 1
AF RR4DS27JQ U 9
AF RR4E705JQ U 55
BS 1 8 RR4E705TF
BS 9 623 RR4DS27JQ

RD RR4E705TF 570 0 0
TTTTTTTTGGGCCAACTCATTTCTTTGAAGATGCCATTATTACAAACACACAAAGCCTAC
ATATTATTACAGCATTATGAAACAGTGCGATGGATCTCTCTCAACATAATTGCTTTTAAG
CTGTCTGCTTGTTGTTGTTGTAGAATCTGAGAAAGAAAGCAACGCCGAGAATCAAGAGAG
GAACCAAGTATACAAGCATCTTGTTTCCAGATTCTTCTTTTGTGGTTTCAGCCGTAGATT
CTTTCTCCCACGGCGGAATATATTTCGCCGTCACCGGGACAGTTGACTTGTCAACGTCAC
CAATATAATACTTCTTCATTGTGTCTTTCGCATCACTGCTGTGGTTCACATCGTCAAAGT
CAGTGGACGCGTCCTTTCCGGTGACGGCGAGTAGAACATTGTCACCGCCGGGATGTTCGT
CCATGAAACTGCTGATGTCATAAACCTTTCCATGGATAAGAATCCAACAATCGTTCTTGC
ACTTATGTTTAGCCACATCATGAAACGAGATAAGCTTGGCCATTGATTACTTTCTTATGC
TCTTGCCGGCTAGAAATGAACACGATTATG

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DS 

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ACAGCATTATGAAACAGTGCGATGGATCTCTCTCAACATAATTGCTTTTAAGCTGTCTGC
TTGTTGTTGTTGTAGAATCTGAGAAAGAAAGCAACGCCGAGAATCAAGAGAGGAACCAAG
TATACAAGCATCTTGTTTCCAGATTCTTCTTTTGTGGTTTCAGCCGTAGATTCTTTCTCC
CACGGCGGAATATATTTCGCCGTCACCGGGACAGTTGACTTGTCAACGTCACCAATATAA
TACTTCTTCATTGTGTCTTTCGCATCACTGCTGTGGTTCACATCGTCAAAGTCAGTGGAC
GCGTCCTTTCCGGTGACGGCGAGTAGAACATTGTCACCGCCGGGATGTTCGTCCATGAAA
CTGCTGATGTCATAAACCTTTCCATGGATAAGAATCCAACAATCGTTCTTGCACTTATGT
TTAGCCACATCATGAAACGAGATAAGCTTGGCCATTGATTACTTTCTTATGCTCTTGCCG
GCTAGAAATGAACACGATTATGAACCAATATAAAACAGAGCGCAAACTTCTCGAGACCAC
ACGCGTTCTGTTTCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4E705JQ 569 0 0
GCCTACATATTATTACAGCATTATGAAACAGTGCGATGGATCTCTCTCAACATAATTGCT
TTTAAGCTGTCTGCTTGTTGTTGTTGTAGAATCTGAGAAAGAAAGCAACGCCGAGAATCA
AGAGAGGAACCAAGTATACAAGCATCTTGTTTCCAGATTCTTCTTTTGTGGTTTCAGCCG
TAGATTCTTTCTCCCACGGCGGAATATATTTCGCCGTCACCGGGACAGTTGACTTGTCAA
CGTCACCAATATAATACTTCTTCATTGTGTCTTTCGCATCACTGCTGTGGTTCACATCGT
CAAAGTCAGTGGACGCGTCCTTTCCGGTGACGGCGAGTAGAACATTGTCACCGCCGGGAT
GTTCGTCCATGAAACTGCTGATGTCATAAACCTTTCCATGGATAAGAATCCAACAATCGT
TCTTGCACTTATGTTTAGCCACATCATGAAACGAGATAAGCTTGGCCATTGATTACTTTC
TTATGCTCTTGCCGGCTAGAAATGAACACGATTATGAACCAATATAAAACAGAGCGCAAA
CTTCTCGAGACCACACGCGTTCTGTTTCC

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DS 



AS 1 3

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GTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGTTATTGCCGCGCTGTCTCCGCCATTG
TGTATGTAGTTGATGCTGCAGATCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAGCGAACTCCATG
ATCTGTTGAGCAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGGAACAAGATCG
ACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCTTCAGTCGCTTA
CAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGATCAGG
TCATTGATTGGCTGGTGAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAACTTCACCAAGAAAAGAA
CACACATTCTCTCTTCTTAAGTCTTCTTCCTGTATTGTGTGCCTTGATGATGATGGTTGA
AGACTATTTTTAAACTCGTGTGAAAACAAGAGTTTGTCTCTATATTCTCCAGTCTTGTCT
CTGTATATTAGATGTGGGATGGTATTCTATTCTAAAGCATTTGCAATTTTTGGAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EN73TF U 1
AF RR4BW39TF U 19
AF RR4BW39JQ C 61
BS 1 379 RR4EN73TF
BS 380 380 RR4BW39TF
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BS 657 839 RR4BW39JQ

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AAGTTCTTCAGTGAATCAGCTGTTCAATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTC
GTAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAACTTTCTTTGATAGGGCTTCAGAATGCAGGAA
AGACATCTCTTGTCAATGTTGTTGCAACTGGTGGTTATAGCGAGGACATGATTCCTACGG
TGGGTTTTAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAATGTTACTATCAAGCTATGGGATCTTG
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ATCTGTTGAGCAAGACTTCGCTTAGCGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGGAACAAGATCG
ACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCTTCAGTCGCTTA
CAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGATCAGG
TCATTGATTGGCTGGTGAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAACTTCACCAAGA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BW39TF 655 0 0
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GCTGTTCAATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTCGTAGCCTCTTCTTCAAGC
AAGAAATGGAACTTTCTTTGATAGGGCTTCAGAATGCAGGAAAGACATCTCTTGTCAATG
TTGTTGCAACTGGTGGTTATAGCGAGGACATGATTCCTACGGTGGGTTTTAACATGAGGA
AAGTGACAAAAGGAAATGTTACTATCAAGCTATGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCC
GCAGCATGTGGGAACGTTATTGCCGCGCTGTCTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTG
CAGATCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAGCGAACTCCATGATCTGTTGAGCAAGACTT
CGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGGAACAAGATCGACAAACCTGGAGCTCTCT
CTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCTTCAGTCGCTTACAGATAGAGAAGTTTGCT
GTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTAC*AACATTGATCAGGTCATTGATTGGCTGGTGA
AGCATTCAAA*TCAAAGAACTAAAACTTCACCAAGAAA
GACACACATTCTCTCTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4BW39JQ 779 0 0
GAAG
TCTTCAGTGAATCAGCTGTTCAATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTCGTAG
CCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAACTTTCTTTGATAGGGCTTCAGAATGCAGGAAAGAC
ATCTCTTGTCAATGTTGTTGCAACTGGTGGTTATAGCGAGGACATGATTCCTACGGTGGG
TTTTAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAATGTTACTATCAAGCTATGGGATCTTGGTGG
TCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGTTATTGCCGCGCTGTCTCCGCCATTGTGTA
TGTAGTTGATGCTGCAGACCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAGCGAACTCCATGATCT
GTTGAGCAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGGAACAAGATCGACAA
ACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCTTCAGTCGCTTACAGA
TAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGATCAGGTCAT
TGATTGGCTGGTGAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAACTTCACCAAGAAAAGAACACA
CATTCTCTCTTCTTAAGTCTTCTTCCTGTATTGTGTGCCTTGATGATGATGGTTGAAGAC
TATTTTTAAACTCGTGTGAAAACAAGAGTTTGTCTCTATATTCTCCAGTCTTGTCTCTGT
ATATTAGATGTGGGATGGTATTCTATTCTAAAGCATTTGCAATTTTTGGAAACTC

QA 5 779 5 779
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GGGCGCAACCGGTGAAAAGAGAGAGAGAAGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACGCTTCT
GCAATCGCTCATCGATCCAAAGAAGAACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCCGTATC
AACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACATGACCAGTATGAAAATCT
GGACATTAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCG
TCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGC
GGTGCAGACCCCATTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAG
AAGGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACA
CCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGA
GGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTGTTT*ACTTCCTCAA
AAGCCCAAGTCTTTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTT
T*CACTTTCTGCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAATGATT
CTCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY42JQ C 26
AF RR4DY42TF U 26
AF RR4CZ28TF U 1
BS 1 420 RR4CZ28TF
BS 421 421 RR4DY42TF
BS 422 521 RR4CZ28TF
BS 522 523 RR4DY42TF
BS 524 525 RR4CZ28TF
BS 526 526 RR4DY42TF
BS 527 668 RR4CZ28TF

RD RR4DY42JQ 632 0 0
G
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ACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCCGTATCAACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCA
GGTACGATGATCTACATGACCAGTATGAAAATCTGGACATTAAGGAAGCTCTGAACAGAT
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TGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTGCAGACCCCATTCCGTGGCTATC
TTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAGGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTC
TACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACACCCTTTTTCCCTATCTTTTGATAAAC
TCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGAGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAAT
CACATTCCTGAACAGAGCTGTTT*ACTTCCTCAAAAGCCCAAGTCTTTTGTGATTCTTTT
CCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTTT*CACTTTCTGCTGGCATGAATAAAA
TCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAATG

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR4DY42TF 632 0 0
G
GAAGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACGCTTCTGCAATCGCTCATCGATCCAAAGAAGA
ACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCCGTATCAACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCA
GGTACGATGATCTACATGACCAGTATGAAAATCTGGACATTAAGGAAGCTCTGAACAGAT
TGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCA
TGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTGCAGACCCCATTCCGTGGCTATC
TTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAGGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTC
TACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACACCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAAC
TCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGAGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAAT
CACATTCCTGAACAGAGCTGTTTTACTTCCTCAAAAGCCCAAGTCTTTTGTGATTCTTTT
CCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTTTTCACTTTCTGCTGGCATGAATAAAA
TCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAATG

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR4CZ28TF 668 0 0
GGGCGCAACCGGTGAAAAGAGAGAGAGAAGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACGCTTCT
GCAATCGCTCATCGATCCAAAGAAGAACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCCGTATC
AACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACATGACCAGTATGAAAATCT
GGACATTAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCG
TCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGC
GGTGCAGACCCCATTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAG
AAGGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACA
TCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGA
GGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAG**CTATTT*ACTTCCTCAA
AAGCCCAAGTCTTTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTT
T*CACTTTCTGCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAATGATT
CTCATTTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 3

CO CL3988Contig1 845 3 4 U
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AGAAGATACTACAACAAAGAGTGTCTACCAATTAAGTCTGTAAATAAAAGAGCGATAAAA
AAAAGTATGTTCAAAGACTAACATTGATAGTAGACAAAATATAGAGGTCAGGGTCCACAG
TGAAGACATGATCAGTGCACTGGATGTTCCCCCAAATGTGGTGCAGCCGCCTCTCAAGTG
AAATCTCAGCACACCAAACCTGCAACTTATCCCCGACGAGCACGGACCAGAAGATGACAA
TGTTGCCAGCGGATTTGCTGATTTTGAAGCCCGGAACTATGCCTAGGAGGCCGTTTGTGT
AACCACGCTTGAGCATATGGCAATTCCACACATCGGCACACTCCC*ATCGAAAATGATTG
AATTTATGTTGGAAGTGTCAAACTTGAGGAACCCTTGAAGATCATCCAGACCATTCACCG
TGTACCACTCCATGCTCCCTTTCCTCACCCCACTCCAAGGGTCACACCACTTGATTCTCC
CGTCAAAATCACAACTGAATAACAACCTGTCTTCTTCACTCCGAAACTTGAACGAAATAT
TATTATTATCCGGCCCAACAACCCTGCAAGCCTCCTTGCTCATCACCGGATCAGGTATAC
ACACACTGCTCCAAGTTTGCGTCATTGGATCGAAAACCTCTGGATTGTCGCGGGAGAATG
GATCATCGCAGCCTCCCATGACGTATATCTTTCCGTCTAAACCCCTGCGTTGGCTTCACA
GCGAGCAACCTCATGGAGGGGAGCTCGCTCACGTGTGAGTCCGACATCCAGGAAGAGACA
CGCGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4E781JQ U 1
AF RR4E781TF C 1
AF RR4GE67JQ U 5
BS 1 289 RR4E781JQ
BS 290 290 RR4GE67JQ
BS 291 505 RR4E781JQ
BS 506 845 RR4GE67JQ

RD RR4E781JQ 512 0 0
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AGAAGATACTACAACAAAGAGTGTCTACCAATTAAGTCTGTAAATAAAAGAGCGATAAAA
AAAAGTATGTTCAAAGACTAACATTGATAGTAGACAAAATATAGAGGTCAGGGTCCACAG
TGAAGACATGATCAGTGCACTGGATGTTCCCCCAAATGTGGTGCAGCCGCCTCTCAAGTG
AAATCTCAGCACACCAAACCTGCAACTTATCCCCGACGAGCACGGACCAAAAGATGACAA
TGTTGCCAGCGGATTTGCTGATTTTGAAGCCCGGAACTATGCCTAGGAGGCCGTTTGTGT
AACCACGCTTGAGCATATGGCAATTCCACACATCGGCACACTCCC*ATCGAAAATGATTG
AATTTATGTTGGAAGTGTCAAACTTGAGGAACCCTTGAAGATCATCCAGACCATTCACCG
TGTACCACTCCATGCTCCCTTTCCT
CACCCCC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR4E781TF 505 0 0
ATAA
CCCAAAATTGACCATCATTCACAATATATAATTCATGAAATAGAAGTAGAAGAAGAAGAA
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GTATGTTCAAAGACTAACATTGATAGTAGACAAAATATAGAGGTCAGGGTCCACAGTGAA
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CTCAGCACACCAAACCTGCAACTTATCCCCGACGAGCACGGACCAGAAGATGACAATGTT
GCCAGCGGATTTGCTGATTTTGAAGCCCGGAACTATGCCTAGGAGGCCGTTTGTGTAACC
ACGCTTGAGCATATGGCAATTCCACACATCGGCACACTCCC*ATCGAAAATGATTGAATT
TATGTTGGAAGTGTCAAACTTGAGGAACCCTTGAAGATCATCCAGACCATTCACCGTGTA
CCACTCCATGCTCCCTTTCCT

QA 5 505 5 505
DS 

RD RR4GE67JQ 841 0 0
CCCAAAATTGACCATCATTCACAATATATAATTCATGAAATAGAAGTAGAAGAAGAAGAA
GATACTACAACAAAGAGTGTCTACCAATTAAGTCTGTAAATAAAAGAGCGATAAAAAAAA
GTATGTTCAAAGACTAACATTGATAGTAGACAAAATATAGAGGTCAGGGTCCACAGTGAA
GACATGATCAGTACACTGGATGTTCCCCCAAATGTGGTGCAGCCGCCTCTCAAGTGAAAT
CTCAGCACACCAAACCTGCAACTTATCCCCGACGAGCACGGACCAGAAGATGACAATGTT
GCCAGCGGATTTGCTGATTTTGAAGCCCGGAACTATGCCTAGGAGGCCGTTTGTGTAACC
ACGCTTGAGCATATGGCAATTCCACACATCGGCACACTCCCCATCGAAAATGATTGAATT
TATGTTGGAAGTGTCAAACTTGAGGAACCCTTGAAGATCATCCAGACCATTCACCGTGTA
CCACTCCATGCTCCCTTTCCTCACCCCACTCCAAGGGTCACACCACTTGATTCTCCCGTC
AAAATCACAACTGAATAACAACCTGTCTTCTTCACTCCGAAACTTGAACGAAATATTATT
ATTATCCGGCCCAACAACCCTGCAAGCCTCCTTGCTCATCACCGGATCAGGTATACACAC
ACTGCTCCAAGTTTGCGTCATTGGATCGAAAACCTCTGGATTGTCGCGGGAGAATGGATC
ATCGCAGCCTCCCATGACGTATATCTTTCCGTCTAAACCCCTGCGTTGGCTTCACAGCGA
GCAACCTCATGGAGGGGAGCTCGCTCACGTGTGAGTCCGACATCCAGGAAGAGACACGCG
A

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 3

CO CL3989Contig1 809 3 6 U
GAAACAAAAAAAACTATTTGGAACAATATCAATTAGTACACAATGCTTAAACACTCCAAC
AAAAAAAATCAAATAAACAACAAATCAGCTAGGTTTTTTACATAGCATTCCCACTTTTCC
CTCCCACCCCATAATGAAAAAAATCAAATACATCAAAGCAAATTCATCACAACTTAAAAA
AAATGTGATTGGATTAAATAAAATTGGCTTCTTGATAAATTAATTTCTCGACGCAAAGAG
GTTTTAAGTCAAGAATCCTTACGCCAAATAAAATCTTAATCAGTGAAACCGCTTTAGGCA
TTCAGCTGTTCTTTCTCAACGGACGGTTTGATATCAGCCTGAAATTGGTCGGAAACATTA
TTCTCCATCTTCTTGAGGCTCTGTTGATGATAAACTTGTCGAAGTCTCTCTATTTCTCTC
TTCAATGCTTCTTGGTGAGCGTCTTTGAAAA*TCTTGTCTTGCGCTAAAGCGGCTATTCG
TTGCTTGATAGCACTATTGTCGACGTTCAGAAGCAATCGCTGGTGATCCAAAAACGCAAC
TCTTGGTGATAACACTGACACTTCCGTCTGCAATGAAGTAACGCTCCGTTCGAGCTCTGA
AATGTATTGAAGTTTTCTCACCCTTGATCTCTGTGCTGATTGCCTATTTGCTAAAATTCT
TTTAACTCTTTTGGGATCGTTAATCCGATTGCCTGAGCTTCCGCCGGAGTTTTGATTCGC
CGATGACGGAGCGCCGTCTTGTGGCTCCGTCTTGCATTGGCTTTGAACCTCATCTGATTC
ATTGTAATTGTTACCGGCGACGTTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK89JQ U 346
AF RR4H846JQB U 1
AF RR4CK89TF C 373
BS 1 462 RR4H846JQB
BS 463 463 RR4CK89JQ
BS 464 509 RR4H846JQB
BS 510 510 RR4CK89JQ
BS 511 788 RR4H846JQB
BS 789 809 RR4CK89TF

RD RR4CK89JQ 353 0 0
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CTCTCTATTTCTCTCTTCAATGCTTCTTGGTGAGCGTCTTTGAAAA*TCTTGTCTTGCGC
TAAAGCGGCTATTCGTTGCTTGATAGCACTATTGTCGACGTTCAGAAGCAATCGCTGGTG
ATCCAAAAACGCAACTCTTGGTGATAACACTGACACTTCCGTCTGCAATGAAGTAACGCT
CCGTTCGAGCTCTGAAATGTATTGAAGTTTTCTCACCCTTGATCTCTGTGCTGATTGCCT
ATTTGCTAAAATTCTTTTAACTCTTTTGGGATCGTTAATCCGATTGCCTGAGC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4H846JQB 788 0 0
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AAAAAAAATCAAATAAACAACAAATCAGCTAGGTTTTTTACATAGCATTCCCACTTTTCC
CTCCCACCCCATAATGAAAAAAATCAAATACATCAAAGCAAATTCATCACAACTTAAAAA
AAATGTGATTGGATTAAATAAAATTGGCTTCTTGATAAATTAATTTCTCGACGCAAAGAG
GTTTTAAGTCAAGAATCCTTACGCCAAATAAAATCTTAATCAGTGAAACCGCTTTAGGCA
TTCAGCTGTTCTTTCTCAACGGACGGTTTGATATCAGCCTGAAATTGGTCGGAAACATTA
TTCTCCATCTTCTTGAGGCTCTGTTGATGATAAACTTGTCGAAGTCTCTCTATTTCTCTC
TTCAATGCTTCTTGGTGAGCGTCTTTGAAAA*TCTTGTCTTGTGCTAAAGCGGCTATTCG
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TCTTGGTGATAACACTGACACTTCCGTCTGCAATGAAGTAACGCTCCGTTCGAGCTCTGA
AATGTATTGAAGTTTTCTCACCCTTGATCTCTGTGCTGATTGCCTATTTGCTAAAATTCT
TTTAACTCTTTTGGGATCGTTAATCCGATTGCCTGAGCTTCCGCCGGAGTTTTGATTCGC
CGATGACGGAGCGCCGTCTTGTGGCTCCGTCTTGCATTGGCTTTGAACCTCATCTGATTC
ATTGTAAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4CK89TF 437 0 0
TTGAGGCTCTGTTGATGATAAACTTGTCGAAGTCTCTCTATTTCTCTCTTCAATGCTTCT
TGGTGAGCGTCTTTGAAAAATCTTGTCTTGCGCTAAAGCGGCTATTCGTTGCTTGATAGC
ACTATTGTCGACGTTCAGAAGCAATCGCTGGTGATCCAAAAACGCAACTCTTGGTGATAA
CACTGACACTTCCGTCTGCAATGAAGTAACGCTCCGTTCGAGCTCTGAAATGTATTGAAG
TTTTCTCACCCTTGATCTCTGTGCTGATTGCCTATTTGCTAAAATTCTTTTAACTCTTTT
GGGATCGTTAATCCGATTGCCTGAGCTTCCGCCGGAGTTTTGATTCGCCGATGACGGAGC
GCCGTCTTGTGGCTCCGTCTTGCATTGGCTTTGAACCTCATCTGATTCATTGTAATTGTT
ACCGGCGACGTTGTTAT

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 3

CO CL3990Contig1 754 3 26 U
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CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCAGCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGAGT
TAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGACTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACCTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTGTGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCAGGC
TCCAGTCTATCGTTTTCAAAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTAATTTGATAACTTGAGACT
GTGTTTTTATTGTATGTAGACTTTTGGGAATCTTTCAAGAAATCAAATGTTCATCAAGGA
GGCCATTTTCATCTTTTATCAAAAACTTTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E471TF U 14
AF RR4CD52TF U 1
AF RR4E471JQ C 73
BS 1 86 RR4CD52TF
BS 87 87 RR4E471TF
BS 88 174 RR4CD52TF
BS 175 175 RR4E471TF
BS 176 209 RR4CD52TF
BS 210 210 RR4E471TF
BS 211 273 RR4CD52TF
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BS 335 459 RR4CD52TF
BS 460 460 RR4E471TF
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BS 699 715 RR4CD52TF
BS 716 754 RR4E471JQ

RD RR4E471TF 474 0 0
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GGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTACGACCTTGAATGG
AACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTGCCGCACCGTTCAT
TTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACCTATTTGGGTCAACGA
AATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTGTGGGAGAAGGTTGACTTCTTATGGTAC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4CD52TF 715 0 0
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CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGAGT
TAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCAGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAAT*TGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGACTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATCCAGAAGCAGCTTGGAAAAGTGACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTATTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACCTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCAGGC
TCCAGTCTATCGTTTTCACAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTA*TTTGATAACTTGGGACT
GTGTTTTTATTGTATGTAGACTTTTGGGAATCTTTCA*GAAATCAAATGTTCATC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4E471JQ 682 0 0
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CGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCAGTTCCACGCGTT
GATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTACGACTGGATCAA
TGGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTACGACCTTGAATG
GAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTGCCGCACCGTTCA
TTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACCTATTTGGGTCAACG
AAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTGTGGGAGAAGGTTGACTTCTTATGGTACTACGA
GGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAGAGAAGCTCATGT
GATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCAGGCTCCAGTCTATTG
TTTTCAAAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTAATTTGATAACTTGAGACTGTGTTTTTATTG
TATGTAGACTTTTGGGAATCTTTCAAGAAATCAAATGTTCATCAAGGAGGCCATTTTCAT
CTTTTATCAAAAACTTTGAGTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 3

CO CL3991Contig1 1016 3 6 U
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CCCACCGCCGCCGCTGCTTCGTCCATCATGGGTACTCGCGTGGTTCCCGATATCCACTCC
GGTTCGGGTAGAATCACAGCCAGGTTTGGGTTCGGGAAGAAGAAGGCGGCTCCCAAAAAG
ACCAAGACTACAGTGACTACCGACAGGCCTCTCTGGTACCCAGGCGCCAAATCTCCCGAG
TGGCTTGACGGTTCCCTTGTTGGAGATTACGTTTTTGATCCTTTCGGTTTAGGTAAACCG
GCCGAGTATCTCCAGTTCGACATAGATTCGCTAGACCAGAATCTGGCTAAGAACTTAGCC
GGAGACGTGATCGGAACACGCACGGAAGAGGCTGCCCCCAAATCGACTCCGTTTCAGCCG
TACAGTGAGGTGTTCGGAATCCAGAGGTTCAGAGAATGCGAGCTGATTCACGGACGGTTG
GCGATGCTCGCCACTCTCGGCGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGCGTCACTTGGCAA
GACGCCGGAAAGGTGGAGCTAGTGGACGGATCGTCCTACTTGGGGCAGCCACTGCCCTTC
TCCATCTCGACGTTGATATGGATCGAGGTGTTGGTGATCGGCTACATTGAGTTCCAGCGC
AACGCCGAGCTTGACTCAGAGAAGCGTTTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCGCTT
GGTTTAGCGTCTGACCCTGAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCACGCA
CGTCTTGCCATGGTCGCCTTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCAGCTGCGACTGGTAAAGGT
CCACTCAACAATTGGGCTACTCACCTCAGTGATCCGCTTCACACCACCATCATCGATACC
TTCTCCTCTTAGAAATCATTCTCTCCTTTCTCATCATCATCTCTATCGTGTAATGTAACT
TTGTTCTAGTAGTATAAAACAGAGCTGCTATGAGACTGAATCGCGTTTTGCCGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G692TF U 1
AF RR4G692JQ C 219
AF RR4DA31TF U 846
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DS 

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GCTCACCGGCGTCACTTGGCAAGACGCCGGAAAGGTGGAGCTAGTGGACGGATCGTCCTA
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CGGCTACATTGAGTTCCAGCGCAACGCCGAGCTTGACTCAGAGAAGCGTTTGTACCCTGG
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TCACACCACCATCATCGATACCTTCTCCTCTTAGAAATCATTCTCTCCTTTCTCATCATC
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G
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AT

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AS 0 0

AS 1 3

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CTGTTCTTTTGAACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E313TF U 1
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AF RR4E313JQ C 194
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AAGATCCTCGATACTACTCCTGAGAAACTAGATGAGATAAGTGAGGCAGCAGCAAAG*CA
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DS 

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GG
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GGAAATGGTGTTGATGTTGATGGAATTCTCGAGTTTATCCAGGCAAAGTATCAAAGGACT
TTTTCGCCAAATTATAGGAAGAACTTGGAAGGAGGGCTGAAAAGACGTGTTTCTCAATGC
ATACTAGAGAAGGTAGAAACCCACTACAAGATCCTCGATACTACTCCTGAGAAACTAGAT
GAGATAAGTGAGGCAGCAGCAAAGGCACTTGCAGTGTCTGATCAGAAAGATTTAGAAGCG
AAAGGGGCATCCGAAGCTGCAGATAGGGCCAAAAA

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR4E313JQ 722 0 0
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CTTCTTCAGATGCCTCTACTTCCTCTGGGAATACGCCTCTTTATGACCCTGTTATTGAGG
CTATATCAACAATCAATGATGGAAATGGTGTTGATGTTGATGGAATTCTCGAGTTTATCC
AGGCAAAGTATCAAAGGACTTTTTCGCCAAATTATAGGAAGAACTTGGAAGGAGGGCTGA
AAAGACGTGTTTCTCAATGCATACTAGAGAAGGTAGAAACCCACTACAAGATCCTCGATA
CTACTCCTGAGAAACTAGATGAGATAAGTGAGGCAGCAGCAAAGGCACTTGCAGTGTCTG
ATCAGAAAGATTTAGAAGCGAAAGAGGCATCCGAAGCTGCAGATAGGGCCAAAAAGGTGT
TAGAAGAAAACCAACTTGTTTTGCAGGTTGTCAAAGAAACACTTGGCCGATATACCAGAG
GCGAATAGGTTTCCCTGCCCTAAAAGCTCTACCTTCTGGTCTGGTTCTTTGATAGTTTGG
GTTTTGTGATATGTGATTTCATTGACTAAAACTTTGTCACTTTATGTTTTAGCTTTTGAG
GTCAAACGTTTCTGGTTGTACGTACATAAATAACGTTTCTAGTACTACTGTTCTTTTGAA
CG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GGTGTCAGCAAGTCTTTCTCTCAACAAGTCTAGAGTGTGCGTTGATTCTTTAAAGATTCA
ATTCCAGAATCGTTGGAGCTTCATCGGAGGATCACGCCTCGCTTTTCTCCCCAGTGTTTC
ATCGAATTCATCCTCCTTTGTTTACAAGAAACCCTCCTGCGTACGAGCTTCATGGTTAGC
TACTTCTCAGATCGCAAGCAGTGTATTTGCTGTCGGAACAACCGCGGTTCTTCCTTTTTA
CACTCTGATGGTTGTAGCTCCTAAAGCTGAAATTACCAAGAAGTGTATGGAGAGTAGCAT
ACCGTATGTCGTCTTAGGCCTATTATACGCGTATTTGTTATACCTTTCTTGGACACCTGA
TACGCTCAAATACATGTTTTCCAGTAAATACTTGTTGCCAGAGTTGTCCGGAATAGCGAA
AATGTTCTCAAGTGAAATGACGCTTGCTTCTGCTTGGATTCATCTTCTTGTTATTGATCT
TTTTGCTGCTAGACAAGTTTTTAACGATGGCTTGGAGAATAAGATCGAGACTAGGCACTC
TGTTTCACTTTGCCTTCTCTTCTGTCCGGTTGGAATCGTTTCGCATGTGGTTACCAAAGC
CTTAACCAACAGTTCAACATCCAATACCAATAACCAGTGCAAGTGAACTGATCATCTTGG
TTGGTTTCTCATCATTGTCTTTCTTAACTGCTTATAAATATTTTTGGTTTGAGAGTTCAT
TTTGCTTTAGCTTCGGTTAAGTCAGCAGAACGAGTTTGTTGTGGATTTAGTTCCTGAAAA
AAACAAATAAGACCAAACAACTTGAGACAGTGTTTCTTTTACTATTTGGTAGACACAATT
TTGGTTTCCCAGATCAGTCACAGAGATTCCCTATCTAAACACTAAACAAAAGTAAATTGT
ACTGGCCTTGAACATAAGCGATTGAAAGAAGTTTTCTTACTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW55TF U 1
AF RR4FD28TF U 188
AF RR4FD28JQ C 325
BS 1 634 RR4DW55TF
BS 635 635 RR4FD28TF
BS 636 668 RR4DW55TF
BS 669 669 RR4FD28TF
BS 670 676 RR4DW55TF
BS 677 677 RR4FD28TF
BS 678 689 RR4DW55TF
BS 690 690 RR4FD28TF
BS 691 701 RR4DW55TF
BS 702 702 RR4FD28TF
BS 703 704 RR4DW55TF
BS 705 705 RR4FD28TF
BS 706 732 RR4DW55TF
BS 733 842 RR4FD28TF
BS 843 843 RR4FD28JQ
BS 844 930 RR4FD28TF
BS 931 931 RR4FD28JQ
BS 932 946 RR4FD28TF
BS 947 1003 RR4FD28JQ

RD RR4DW55TF 732 0 0
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TACTTCTCAGATCGCAAGCAGTGTATTTGCTGTCGGAACAACCGCGGTTCTTCCTTTTTA
CACTCTGATGGTTGTAGCTCCTAAAGCTGAAATTACCAAGAAGTGTATGGAGAGTAGCAT
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AATGTTCTCAAGTGAAATGACGCTTGCTTCTGCTTGGATTCATCTTCTTGTTATTGATCT
TTTTGCTGCTAGACAAGTTTTTAACGATGGCTTGGAGAATAAGATCGAGACTAGGCACTC
TGTTTCACTTTGCCTTCTCTTCTGTCCGGTTGGA*TCGTTTCGCATGTGGTTACCAAAGC
CTTAACCAGCAGTTCA*CATCCAATACCACTAACCAGTGCA*GTAAACTGATCATCTTGG
TTGGTTTCTCAT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4FD28TF 762 0 0
G
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AGATCGCAAGCAGTGTATTTGCTGTCGGAACAACCGCGGTTCTTCCTTTTTACACTCTGA
TGGTTGTAGCTCCTAAAGCTGAAATTACCAAGAAGTGTATGGAGAGTAGCATACCGTATG
TCGTCTTAGGCCTATTATACGCGTATTTGTTATACCTTTCTTGGACACCTGATACGCTCA
AATACATGTTTTCCAGTAAATACTTGTTGCCAGAGTTGTCCGGAATAGCGAAAATGTTCT
CAAGTGAAATGACGCTTGCTTCTGCTTGGATTCATCTTCTTGTTATTGATCTTTTTGCTG
CTAGACAAGTTTTTAACGATGGCTTGGAGAATAAGATCGAGACTAGGCACTCTGTTTCAC
TTTGCCTTCTCTTCTGTCCGGTTGGAATCGTTTCGCATGTGGTTACCAAAGCCTTAACCA
ACAGTTCAACATCCAATACCAATAACCAGTGCAAGTGAACTGATCATCTTGGTTGGTTTC
TCATCATTGTCTTTCTTAACTGCTTATAAATATTTTTGGTTTGAGAGTTCATTTTGCTTT
AGCTTCGGTTAAGTCAGCAGAACGAGTTTGTTGTGGATTTAGTTCCTGAAAAAA*CAAAT
AAGACCAAACAACTTGAGACAGTGTTTCTTTTACTATTTGGTAGACACAATTTTGGTTTC
CCAGATCAGTCACAGAGATTCC*TATCTAAACACTAAA
AAA

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR4FD28JQ 679 0 0
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TAAATACTTGTTGCCAGAGTTGTCCGGAATAGCGAAAATGTTCTCAAGTGAAATGACGCT
TGCTTCTGCTTGGATTCATCTTCTTGTTATTGATCTTTTTGCTGCTAGACAAGTTTTTAA
CGATGGCTTGGAGAATAAGATCGAGACTAGGCACTCTGTTTCACTTTGCCTTCTCTTCTG
TCCGGTTGGAATCGTTTCGCATGTGGTTACCAAAGCCTTAACCAACAGTTCAACATCCAA
TACCAATAACCAGTGCAAGTGAACTGATCATCTTGGTTGGTTTCTCATCATTGTCTTTCT
TAACTGCTTATAAATATTTTTGGTTTGAGAGTTCATTTTGCTTTAGCTTCGGTTAAGTCA
GCAGAACGAGTTTGTTGTGGATTTAGTTCCTGAAAAAAACAAATAAGACCAAACAACTTG
AGACAGTGTTTCTTTTACTATTTGGTAGACACAATTTTGGTTTCCCAGATCAGTCACAGA
GATTCCCTATCTAAACACTAAACAAAAGTAAATTGTACTGGCCTTGAACATAAGCGATTG
AAAGAAGTTTTCTTACTAT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL3996Contig1 644 3 3 U
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AGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCA
AAGCTGGTGCACTCGGTGATTCCGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCA
CTTCCGATGGTCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGA
AGCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACG
AGTTGAGGTACTTCAACATTGCCGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTATT
ACATCTGTTTCCGTTTTTTTGTTTTGTGTTCGTTGTTGCTCAATACAATTTATCATCGAC
CTTGTGTTCTTCTTTATCGACACCTTATTTTAGGTTTGTTGAAGTTACCCCTTGGTTCAG
ACTATTGTTTAAGAAAATATTTTGGTAATGATTCAAGAATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB46JQ C 1
AF RR4EB46TF U 1
AF RR4DJ44TF U 7
BS 1 8 RR4EB46JQ
BS 9 614 RR4EB46TF
BS 615 644 RR4DJ44TF

RD RR4EB46JQ 614 0 0
GGGGCTTTCGTCTCCCTCGACTAAAAAAAAAA*GAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTG
TTCCACTTTCCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTG
CAAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTTTCCTTCTCCATTGATTGCTCCAAGCCTGTCGATGACA
AGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCA
AAGCTGGTGCACTCGGTGATTCCGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCA
CTTCCGATGGTCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGA
AGCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACG
AGTTGAGGTACTTCAACATTGCCGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTATT
ACATCTGTTTCCGTTTTTTTGTTTTGTGTTCGTTGTTGCTCAATACAATTTATCATCGAC
CTTGTGTTCTTCTTTATCGACACCTTATTTTAGGTTTGTTGAAGTTACCCCTTGGTTCAG
ACTATTGTTTAAGA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4EB46TF 614 0 0
GGGGCTTT
CGTCTCCCTCGACTAAAAAAAAAA*GAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTT
TCCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCAAAGGGA
AAGAAGAAGGGAGTTTCCTTCTCCATTGATTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATG
GAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGT
GCACTCGGTGATTCCGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGAT
GGTCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAAC
GTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGG
TACTTCAACATTGCCGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTATTACATCTGT
TTCCGTTTTTTTGTTTTGTGTTCGTTGTTGCTCAATACAATTTATCATCGACCTTGTGTT
CTTCTTTATCGACACCTTATTTTAGGTTTGTTGAAGTTACCCCTTGGTTCAGACTATTGT
TTAAGA

QA 9 614 9 614
DS 

RD RR4DJ44TF 638 0 0
GG
CGTCTCCCTCGACTAAAAAAAAAAAGAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCT*TT
TCCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGA
AAGAAGAAGGGAGTTTCCTTCTCTATCGATTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATG
GAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGT
GCACTCGGTGATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGAT
GGTCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAAC
GTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGG
TACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACATCTGT
TTCCGGTTTTT*GTTTTGTGTTCGTTGTTGCTCAATACTATTTATCATCGACCTTGTGTT
CTTCTTTATCGACACCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGT
TTAAGAAAATATTTTGGTAATGATTCAAGAATCTTT

QA 3 638 3 638
DS 



AS 1 2

CO CL3997Contig1 589 2 3 U
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ACAGAATCGATTCTTCCGAAGTCATTCACATTGTAAAACCCATTAGAAAAAAAACCAGAA
AAACCTGCCGACAGCTGAGACAAAAACATATCTTCACCATCCAACGGCTCAAAGTACTCA
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AGGGGAGGAGAAGGGCTGAGGTCGGAGACGGTGGAGGGGGAGAACACGAGCTCCGGTTGA
TCGACGGCGTCTTGGCCAGTGAGCTCTTGTACGAGCTCTCTAAACTTGGAAGCACAGGTT
TTGACTTTCATGGGGTTTGATATGTAACGCACTTTGATGGCTTTGTTTGCTGAAGCCGTC
TTCTTCTTTTGCTTTGATGGCTTTCTCGAAACAGGAGATGGGTTTCCCTGGTCTAAGCTT
GCGGCGGCGAGAAAAGTGGATGAATCCATGTTGTGTTTCCGGTGAGAGAATCTAGATGAG
TTTGTGTCTTTCTTTGGACAAACAGATGAGTTTGTGTCTTTTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN67JQ U 25
AF RR4FN67TF C 1
BS 1 24 RR4FN67TF
BS 25 504 RR4FN67JQ
BS 505 589 RR4FN67TF

RD RR4FN67JQ 480 0 0
CTTTGATGAAAACCCTAAAACTCTGAAGATCTTCACACAGAATCGATTCTTCCGAAGTCA
TTCACATTGTAAAACCCATTAGAAAAAAAACCAGAAAAACCTGCCGACAGCTGAGACAAA
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TCCTGCAGAAGAACACGTGGCGCAAGATTCTCCGACAGGGGAGGAGAAGGGCTGAGGTCG
GAGACGGTGGAGGGGGAGAACACGAGCTCCGGTTGATCGACGGCGTCTTGGCCAGTGAGC
TCTTGTACGAGCTCTCTAAACTTGGAAGCACAGGTTTTGACTTTCATGGGGTTTGATATG
TAACGCACTTTGATGGCTTTGTTTGCTGAAGCCGTCTTCTTCTTTTGCTTTGATGGCTTT
CTCGAAACAGGAGATGGGTTTCCCTGGTCTAAGCTTGCGGCGGCGAGAAAAGTGGATGAA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4FN67TF 589 0 0
GGATTTCATAATTTTTTATATATACTTTGATGAAAACCCTAAAACTCTGAAGATCTTCAC
ACAGAATCGATTCTTCCGAAGTCATTCACATTGTAAAACCCATTAGAAAAAAAACCAGAA
AAACCTGCCGACAGCTGAGACAAAAACATATCTTCACCATCCAACGGCTCAAAGTACTCA
TGACCCACCCGATCATCGAATGGCTCCTGCAGAAGAACACGTGGCGCAAGATTCTCCGAC
AGGGGAGGAGAAGGGCTGAGGTCGGAGACGGTGGAGGGGGAGAACACGAGCTCCGGTTGA
TCGACGGCGTCTTGGCCAGTGAGCTCTTGTACGAGCTCTCTAAACTTGGAAGCACAGGTT
TTGACTTTCATGGGGTTTGATATGTAACGCACTTTGATGGCTTTGTTTGCTGAAGCCGTC
TTCTTCTTTTGCTTTGATGGCTTTCTCGAAACAGGAGATGGGTTTCCCTGGTCTAAGCTT
GCGGCGGCGAGAAAAGTGGATGAATCCATGTTGTGTTTCCGGTGAGAGAATCTAGATGAG
TTTGTGTCTTTCTTTGGACAAACAGATGAGTTTGTGTCTTTTGTTTTCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL3998Contig1 801 2 18 U
TTGAAGATTTATTGTTACTTACCATCAAGCGACTAAGTTTGAGGCTTGAAGCACACATGC
AAATGATACACTTTGAATTAAATATGATCTGAAAAGAATGTCTTAAGGTTACATTACATG
TTTTCTTTTGGTGGCTGTAGTTCTTGGAGTTGAAGGAGCAACCCCAGGAAGGCTGTTCCT
CTTTGGTGGTAGTTTTGCTTCACCAAAGTTGCTTCTTGAAGTTGAAGGAGCAGTCCCAAG
AAGGCTGTTGTTCCTCTTAGGAGGTAGATTCCCTTCACCACTTCTCGAAGTTGAAGGAGC
AGTCCCAAGAAAGCTGTTGATCCTCTTTGGAGGTAGATTCCCTTCACCACTTCTTGAAGT
TGAAGGAGCAGTCCCAGGAAGGCTGTCGATCCTCCTAGGGGCAGAAATACTGAAAACTCT
TCTGGATTGTGTTCCTTTTAACCGCAGTGAGATTCTTCTCTAGTTCGCCATAAGAGTTGT
TTCTTGAAGTTGAGGGCAGGTTTGCAGATAAGCCGGTTCTCTTTGAAGGAGAACTACTGA
AACCCTTCTGAATACTGTTCCTCTTAATTGCAGTGAGATTCTTCACTTCTTGACTTTTTA
AAACATCTAGCTTAGCCTTCTTCATGATGTTGCTTTTGACATTCGAAAGATTGTAACTAG
GTCCACTATTACCCCAGAAGGATTTTTTGATTGGAGGAGCTTTTGCGCAGAGCTTAGTTT
GACGACTTTGTTTCCTTGCATCTTCATTCTTGTAACGTTGCTTCAATCGATCAACAGCTT
CCTTCTCATCTTCTTCCACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B765JQ U 1
AF RR4EJ13JQ U 52
BS 1 105 RR4B765JQ
BS 106 106 RR4EJ13JQ
BS 107 386 RR4B765JQ
BS 387 387 RR4EJ13JQ
BS 388 415 RR4B765JQ
BS 416 416 RR4EJ13JQ
BS 417 442 RR4B765JQ
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BS 471 513 RR4B765JQ
BS 514 514 RR4EJ13JQ
BS 515 535 RR4B765JQ
BS 536 538 RR4EJ13JQ
BS 539 714 RR4B765JQ
BS 715 801 RR4EJ13JQ

RD RR4B765JQ 714 0 0
TTGAAGATTTATTGTTACTTACCATCAAGCGACTAAGTTTGAGGCTTGAAGCACACATGC
AAATGATACACTTTGAATTAAATATGATCTGAAAAGAATGTCTTA*GGTTACATTACATG
TTTTCTTTTGGTGGCTGTAGTTCTTGGAGTTGAAGGAGCAACCCCAGGAAGGCTGTTCCT
CTTTGGTGGTAGTTTTGCTTCACCAAAGTTGCTTCTTGAAGTTGAAGGAGCAGTCCCAAG
AAGGCTGTTGTTCCTCTTAGGAGGTAGATTCCCTTCACCACTTCTCGAAGTTGAAGGAGC
AGTCCCAAGAAAGCTGTTGATCCTCTTTGGAGGTAGATTCCCTTCACCACTTCTTGAAGT
TGAAGGAGCAGTCCCAGGAAGGCTGTTGATCCTCCTAGGGGCAGAAATACTGAAA*CTCT
TCTGGATTGTGTTCCTTTTAACTGCAGTGAGATTCTTCTCTTGTTCGCCGTAAGAGTTGT
TTCTTGAAGTTGAGGGCAGGTTTGCAGATAAGCTGGTTCTCTTTGAAGGAGAACT***GA
AACCCTTCTGAATACTGTTCCTCTTAATTGCAGTGAGATTCTTCACTTCTTGACTTTTTA
AAACATCTAGCTTAGCCTTCTTCATGATGTTGCTTTTGACATTCGAAAGATTGTAACTAG
GTCCACTATTACCCCAGAAGGATTTTTTGATTGGAGGAGCTTTTGCGCAGAGCT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4EJ13JQ 750 0 0
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CATTACATGTTTT**TTTGGTGGCTGTATTTCTTGGAGTTGAAGGAGCAACCCCAGGAAG
GCTGTTCCTCTTTGGTGGTAGTTTTGCTTCACCAAAGTTGCTTCTTGAAGTTGAAGGAGC
AGTCCCAAGAAGGCTGTTGTTCCTCTTAGGAGGTAGATTCCCTTCACCACTTCTCGAAGT
TGAAGGAGCAGTCCCAAGAAGGCTGTTGATCCTCTTTGGAGGTAGATTCCCTTCACCACT
TCTTGAAGTTGAAGGAGCAGTCCCAGGAAGGCTGTCGATCCTCCTAGGGGCAGAAATACT
GAAAACTCTTCTGGATTGTGTTCCTTTTAACCGCAGTGAGATTCTTCTCTAGTTCGCCAT
AAGAGTTGTTTCTTGAAGTTG**GGCAGGTTTGCAGATAAGCCGGTTCTCTTTGAAGGAG
AACTACTGAAACCCTTCTGAATACTGTTCCTCTTAATTGCAGTGAGATTCTTCACTTCTT
GACTTTTTAAAACATCTAGCTTAGCCTTCTTCATGATGTTGCTTTTGACATTCGAAAGAT
TGTAACTAGGTCCACTATTACCCCAGAAGGATTTTTTGATTGGAGGAGCTTTTGCGCAGA
GCTTAGTTTGACGACTTTGTTTCCTTGCATCTTCATTCTTGTAACGTTGCTTCAATCGAT
CAACAGCTTCCTTCTCATCTTCTTCCACAA

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL3999Contig1 794 3 2 U
GACAATTTTGAATAAATAATCAACAGTTAAATCATGCATTGGATAGAAGAAGAGAGCACA
CATCTAAAATTAACATCCCTACCCTCCGTACAATGATTGTGGTTTTTAGTCCCATCATCC
TACTCTAAGATGGAAGATGGCCAGAGACGTGTCCACATAGCAATCTCTTCTTTACAACTT
AGCTTTTTGATTCCTCCATAGAACCCCTCTTCCTCGTTACCTTCCTCTCTATGATCTCTC
TTGTTTATCATCGTTCTTCTCCACCTCGATCCCACTGTGTACTGGTTGAATTCCAACACC
ACCATCTCATTAAGATGGCAGTGACAATGGTTGAGATTCCCATCACAGGATTCTAAGTGG
CCAACGACACCATACCACCATCCATAAGGGAACGCTTTGTTTCTTCTCCACTGAATCTCA
ATGTGATCTCCAGGTTTCAACTCGTTTAGAGAATCTGACACATGAAGGTGATGAGGAGAT
ATATCGATGGGAGCTGCTCTTAGCCTTTCCCATGTCACACCTTTTTCAACCGCAACTGCC
TTTCTACCATGTGGTGCATACCTGGCTTGAAACGTATCAGTGTGAGTATCATAGCTGAGC
TCCGCATCATAGCATGACAACACGAACCCTACATGCCCATTCTCACGGTTGTAAACTTGA
GCTGGGAACCAAAAACGACCAGTTTTAAGGGAGAGGTAGAAACTCATGGTGGAATCAAGT
GGCAGAGAAGACGCAGCATATCTCTTCCTCTTTTCATCACCAGAGGAAATAGATCGGATC
AGAGAGATGATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM94JQ U 1
AF RR4BM94TF C 1
AF RR4GG41JQ U 38
BS 1 494 RR4BM94JQ
BS 495 794 RR4GG41JQ

RD RR4BM94JQ 494 0 0
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AGCTTTTTGATTCCTCCATAGAACCCCTCTTCCTCGTTACCTTCCTCTCTATGATCTCTC
TTGTTTATCATCGTTCTTCTCCACCTCGATCCCACTGTGTACTGGTTGAATTCCAACACC
ACCATCTCATTAAGATGGCAGTGACAATGGTTGAGATTCCCATCACAGGATTCTAAGTGG
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ATATCGATGGGAGC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4BM94TF 494 0 0
GACAATTTTGAATAAATAATCAACAGTTAAATCATGCATTGGATAGAAGAAGAGAGCACA
CATCTAAAATTAACATCCCTACCCTCCGTACAATGATTGTGGTTTTTAGTCCCATCATCC
TACTCTAAGATGGAAGATGGCCAGAGACGTGTCCACATAGCAATCTCTTCTTTACAACTT
AGCTTTTTGATTCCTCCATAGAACCCCTCTTCCTCGTTACCTTCCTCTCTATGATCTCTC
TTGTTTATCATCGTTCTTCTCCACCTCGATCCCACTGTGTACTGGTTGAATTCCAACACC
ACCATCTCATTAAGATGGCAGTGACAATGGTTGAGATTCCCATCACAGGATTCTAAGTGG
CCAACGACACCATACCACCATCCATAAGGGAACGCTTTGTTTCTTCTCCACTGAATCTCA
ATGTGATCTCCAGGTTTCAACTCGTTTAGAGAATCTGACACATGAAGGTGATGAGGAGAT
ATATCGATGGGAGC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4GG41JQ 757 0 0
TTTC
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GTTTTTAGTCCCATCATCCTACTCTAAGATGGAAGATGGCCAGAGACGTGTCCACATAGC
AATCTCTTCTTTACAACTTAGCTTTCTGATTCCTCCATAGAACCCCTCTTCCTCGTTACC
TTCCTCTCTATGATCTCTCTTGTTTATCATCGTTCTTCTCCACCTCGATCCCACTGTGTA
CTGGTTGAATTCCAACACCACCATCTCATTAAGATGGCAGTGACAATGGTTGAGATTCCC
ATCACAGGATTCTAAGTGGCCAACGACACCATACCACCATCCATAAGGGAACGCTTTGTT
TCTTCTCCACTGAATCTCAATGTGATCTCCAGGTTTCAACTCGTTTAGAGAATCTGACAC
ATGAAGATGATGAGGAGATATATCGATGGGAGCTGCTCTTAGCCTTTCCCATGTCACACC
TTTTTCAACCGCAACTGCCTTTCTACCATGTGGTGCATACCTGGCTTGAAACGTATCAGT
GTGAGTATCATAGCTGAGCTCCGCATCATAGCATGACAACACGAACCCTACATGCCCATT
CTCACGGTTGTAAACTTGAGCTGGGAACCAAAAACGACCAGTTTTAAGGGAGAGGTAGAA
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AGAGGAAATAGATCGGATCAGAGAGATGATTTT

QA 5 757 5 757
DS 



AS 1 3

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AGCAAGCATTTGAGGCGCATAGAGAAAATATCATACATCAACGTGGCACCGTTTTGCCAA
CCAAAAAA*TACCAGTGAGTTCACATAGTCTTGGATCTAGTGGGGGTCCTGTTTTGTCAG
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AGACGAAACTCGGGAGGAGTATCAAGATCTATGTTGGAGGGATCAAGAACGAGTTTCTGA
CAATCCTCCAGATCCCTTTTGAAGGCTTCTGATCCTCCCAAGTGTGCGTAATCACCAAAA
CATGGCTGCTTGTTCCTTGAGCCTCCTCCATTGTTTGTGTCCTGTGATCCCACCTGCAGG
AGATCATCGCAAAGAGACAAGTGTTCCACAAGCTGTTGCGAGTCCAATATAAACTGAGAT
CCACCACTGTCGAACCAATTCGGATCTTGGTCGTTTCCATCTTCCTCAGCAGCAGCTTGA
TTTTCATTTTCATCTCTCTCTCTGTCTTCTTGCTCGTTTCCATCTTACTTACCATTCTCT
TTCTCTTCTTCATCATACACCATTATTTCATTATCTCGGTTTTCAATCCAGGTCTCAGGT
CCAGGCTCATCCTCGGAGCTTGTTCTTTCATGGTTACGTTGAACTCCCTGAACCTCATCT
TCCATATACACTGCCTCTGATATCTCAGCAAGAGAAACCCCAGGGCTGCTACATAGCCAT
GAGGAGTAGCATAATCATCCGCGAGTGAG


BQ
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AF RR4B103JQ U 37
AF RR4B103TF C 37
AF RR4C856JQ U 1
BS 1 60 RR4C856JQ
BS 61 62 RR4B103JQ
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RD RR4B103JQ 543 0 0
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CC
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4B103TF 543 0 0
CAAAAGCACCAATTTACATAAGGA**CATTGATAAACGTTCCAAAGTAGTTGTTCTAAAT
CCGAGAAA*AAAAAACAGTTTGAAAGCAAGCATTTGAGGCGCATAGAGAAAATATCATAC
ATCAACGTGGCACCGTTTTGCCAACCAAAAAA*TACCAGTGAGTTCACATAGTCTTGGAT
CTAGTGGGGGTCCTGTTTTGTCAGTCAGTCTTTCCAGTGCCCCAAGCGAGAAAGCTCTCC
TGTGATCCAAATTCCAGCTGGCTCAGACGAAACTCGGGAGGAGTATCAAGATCTATGTTG
GAGGGATCAAGAACGAGTTTCTGACAATCCTCCAGATCCCTTTTGAAGGCTTCTGATCCT
CCCAAGTGTGCGTAATCACCAAAACATGGCTGCTTGTTCCTTGAGCCTCCTCCATTGTTT
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TGCGAGTCCAATATAAACTGAGATCCACCACTGTCGAACCAATTCGGATCTTGGTCGTTT
CC
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4C856JQ 869 0 0
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CCAAAAAAATATCAGTGAGTTCACATAGTCTTGGATCTCGTGGGAGTCCTGTTTTGTCAG
TCAGTCTTTACAGTGCCCCAAGCGAGAAAGCTCTCCTGTGATCCAAATTCCAGCTGGCTC
AGACGAAACTCGGGTGGAGTATCAAGATCTATGTTGGAGGGATCAAGAACGAGTTTCTGA
CAATCCTCCAGATCCCTTTTGAAGGCTTCTGATCCTCCCAAGTGTGCGTAATCACCAAAA
CATGGCTGCTTGTTCCTTGAGCCTCCTCCATTGTTTGTGTCCTGTGATCCCACCTGCAGG
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CCACCACTGTCGAACCAATTCGGATCTTGGTCGTTTCCATCTTCCTCAGCAGCAGCTTGA
TTTTCATTTTCATCTCTCTCTCTGTCTTCTTGCTCGTTTCCATCTTACTTACCATTCTCT
TTCTCTTCTTCATCATACACCATTATTTCATTATCTCGGTTTTCAATCCAGGTCTCAGGT
CCAGGCTCATCCTCGGAGCTTGTTCTTTCATGGTTACGTTGAACTCCCTGAACCTCATCT
TCCATATACACTGCCTCTGATATCTCAGCAAGAGAAACCCCAGGGCTGCTACATAGCCAT
GAGGAGTAGCATAATCATCCGCGAGTGAG

QA 1 869 1 869
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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CAAGTTAAACTACTACCCTCCTAAACCGGTCTTTGTTAAGCTTAAACCAACAATAACGAC
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CCAGCCCTCTCAACCAGATAAAAAAAAAATAAGAGACCTTCCTTATTTTATTGAATTGAC
CCAACAAGTCTAAGCTTCAACCGAATTTTCCGGTTAGACTGCAAACCGAAATAGCAAACA
CAACCGCAACCACCCCCGCTTTCAAAAGCCCTCTGTATGAACCTCACCGGTAGTGAGTCA
AGCGATAACACTTCCATAAGTCTTGAATTGATTCACCAGGTGCCGAGACTTTGAGGAGTT
CGAGTTCAAAAGGAAGTGTATCAAAGATCCGATTCAAAAGGTGTCGAGAAGGAAAGAGAA
ACAGATTCCAGAATTTTTG


BQ
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AF RR4GS78JQ U 1
AF RR4GT33JQ U 1
AF RR4GT33TF C 1
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DS 

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CCAACAAGTCTAAGCTTCAACCGAATTTTCCGGTTAGACTGCAAACCGAAATAGCAAACA
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ACAGATTCCAGAATTTTTG

QA 1 499 1 499
DS 

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CCAACAAGTCTAAGCTTCAACCGAATTTTCCGGTTAGACTGCAAACCGAAATAGCAAACA
CAACCGCAACCACCCCCGCTTTCAAAAGCCCTCTGTATGAACCTCACCGGTAGTGAGTCA
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ACAGATTCCAGAATTTTTG

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 3

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ACTTATTAC


BQ
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AF RR4A107JQ U 1
AF RR4A107JQD U 1
AF RR4A107TFB C 1
BS 1 39 RR4A107JQ
BS 40 40 RR4A107JQD
BS 41 489 RR4A107JQ

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QA 1 489 1 489
DS 

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CTCATCTCAAGTAGATAGCGTGTTGGCTTACTTGGTTGTATCTTGATTTCTCTGAATCGA
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ACTTATTAC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 2

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TAGCAGAGTACACAGTGACTGCTCTCGCG


BQ
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AF RR4AP24TF U 1
AF RR4CX17TF U 1
BS 1 101 RR4AP24TF
BS 102 102 RR4CX17TF
BS 103 183 RR4AP24TF
BS 184 184 RR4CX17TF
BS 185 514 RR4AP24TF
BS 515 809 RR4CX17TF

RD RR4AP24TF 514 0 0
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TGTCTGCTTTTGTCGGCAAATACGCAGATGAGCTGATCAAGGCTGCCAAGTACATTGCAA
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CCATCATCAATGTTGAGAACATTGAGTCCAACCGCCAAGCTCTCCGTGAGCTCCTCTTCA
CTTCCCCAGGCGCTCTCCCTTGCCTCTCCGGCGTTATCCTCTTCGAGGAAACCCTCTACC
AGAAAACTTCTGATGGCAAGCCCTTTGTCGAGTTCCTCCAGGAGAACGGAGTTATCCCCG
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CCAAATGGCGTGCAGTCCTCAAGATTGGGGCCAC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4CX17TF 809 0 0
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CTTCCCCAGGCGCTCTCCCTTGCCTCTCCGGCGTTATCCTCTTCGAGGAAACCCTCTACC
AGAAAACTTCTGATGGCAAGCCCTTTGTCGAGTTCCTCCAGGAGAACGGAGTTATCCCCG
GAATCAAAGTGGACAAGGGTGTTGTTGATCTAGCAGGGACCAATGGTGAGACCACTACTC
AGGGTCTAGACTCGCTTGGTGCACGTTGCCAGGAGTATTACAAGGCAGGAGCTCGATTTG
CCAAATGGCGTGCAGTCCTCAAGATTGGGGCCACCGAGCCGAGCGAGCTCTCGATCCAAG
AGAACGCCAAAGGGCTAGCTCGCTATGCCATCATCTGCCAGGAGAACGGACTGGTTCCAA
TCGTCGAGCCAGAGGTTCTAACTGACGGGAGCCACGACATCAAGAAATGTGCGGCTGTGA
CTGAGACAGTTCTTTCTGCCGTGTACAAGCCTTGAACGACCACCACGTCCTCCTCGAAGC
ACTCTGCTGAAACTAACATGGTCACTCCCGGCTCAGACAGCGCCAGTTGCACCGGAGTGA
TAGCAGAGTACACAGTGACTGCTCTCGCG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

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ACGGCGAAGCTGGCCAAGTACGTGGCCAGCTTCACCTGTCGGATGGCGTTCGGGCTGAGT
TTCGTCGGGAGCGGGATGGACAACGAGAGGTTTCTCGAGATCTTCACGGAGGCGAACAGG
GTGATCGGGAAGTTCGCGGCGGAGGATATTTTTCCGGTGTTTGGGTGGGTCGTTGATCGG
GTCTCGGGGCTTGAGGGTAGCAGGAGGAAGAGCTTTCGAGCTCTGGACACGTTTTACCAG
AAAGCTATTGAGGATCATCGAGAGAAGAAGAGGACTGGGGGAGATGAGCGTGAAGATCTT
ATTGACGTGTTGCTCAAGCTACAGAGTCAAGAAACCAAACTCGGGTCTACGCGGATCACT
GATAAACACATCAGAGCCATTCTTATGGATTTATTTGTAGCAGGCATAGACACATCTGCA
ATAACAATGGATTGGACAATGGCTGAGATTGCAAGACACCCAAGGGTGATGAAGAAAGTA
CAAACCGAGATACGTGAGCGTGTAGGAGACAAGGGAAAAGTGACATACGAGGATCTCGAA
GGCCTAGAGTACATGAAAATGGTGATCAAGGAGACTTGGAGGTTACATGCACCGAGTCCG
ATTCTTATTCCAAGAGAGGCAATGTCGAGATTCAAGATCAAGGGCTATGACATATACCCC
GGAACACGGATTCATGTTAACACATGGGCTATTGGACGTAGCCCTGATGTGTGGAAGGAT
CCTGATGAGTTTATTCCGGAGAGATTTGTGGATAGCAATGTTGAAACTAAAGGGACGAGT
TATGAGTTGTTGCCGTTTGGGAGTGGACGGAGAGGTTGTCCGGCGATGTATATGGGATTG
AGTACGGTGGAGTTCACTTTGGCCAATCTTTTGTACCATTTTGATTGGAAAGTGATGGAG
GAAGTGAGTGTTGATGAAGCGCCTGGTCTCACTAGCCACAGGAAACATCCTCTTCATCTT
GTTCCTGTTAATGTTATTAACCGCGTGTCTTAAGAGTTTGGGAAACAAGCAGTTTGCTTT
GCAAAGAATAATGGCCAATCAAGTTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D066TF U 1
AF RR4D066JQ C 426
BS 1 719 RR4D066TF
BS 720 721 RR4D066JQ
BS 722 722 RR4D066TF
BS 723 723 RR4D066JQ
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BS 753 753 RR4D066JQ
BS 754 773 RR4D066TF
BS 774 1111 RR4D066JQ

RD RR4D066TF 784 0 0
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GTCTCGGGGCTTGAGGGTAGCAGGAGGAAGAGCTTTCGAGCTCTGGACACGTTTTACCAG
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ATTGACGTGTTGCTCAAGCTACAGAGTCAAGAAACCAAACTCGGGTCTACGCGGATCACT
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ATAACAATGGATTGGACAATGGCTGAGATTGCAAGACACCCAAGGGTGATGAAGAAAGTA
CAAACCGAGATACGTGAGCGTGTAGGAGACAAGGGAAAAGTGACATACGAGGATCTCGAA
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ATTCTTATTCCAAGAGAGGCAATGTCGAGATTCAAGATCAAGGGCTATGACATATACCC*
*GGACACGGAT*CATGT*AACACATGGGCTAT*GGACGTAGCCCTGATGTGTG
AAGATCTGATG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4D066JQ 686 0 0
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AATGGATTGGACAATGGCTGAGATTGCAAGACACCCAAGGGTGATGAAGAAAGTACAAAC
CGAGATACGTGAGCGTGTAGGAGACAAGGGAAAAGTGACATACGAGGATCTCGAAGGCCT
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TATTCCAAGAGAGGCAATGTCGAGATTCAAGATCAAGGGCTATGACATATACCCCGGAAC
ACGGATTCATGTTAACACATGGGCTATTGGACGTAGCCCTGATGTGTGGAAGGATCCTGA
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GTTGTTGCCGTTTGGGAGTGGACGGAGAGGTTGTCCGGCGATGTATATGGGATTGAGTAC
GGTGGAGTTCACTTTGGCCAATCTTTTGTACCATTTTGATTGGAAAGTGATGGAGGAAGT
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TGTTAATGTTATTAACCGCGTGTCTTAAGAGTTTGGGAAACAAGCAGTTTGCTTTGCAAA
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QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

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TCTATTTCCCATAGAATCATATATCATATTACACAAATCGCTTAAAAGTCGACAACAACA
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CCAAGACTACTCCTTTCCTTAAGATTATGGCACTGCTTCAAAGATCTTTGGCCATACGAA
AGAATCACATTTCTACAAACTTGAGATAAAGATGAAAAGAAAGAAAAAAAACTATATATA
TATAGTGAGCTCTCAAGCTTCTTTTAAGATAATTTACAGGTAATTAAGGGAAACCGAATG
ACTTCACAAGTCACCCAAAAGGCTCTTGCTTCATATGGAAACCGCCATTTTGCATTGTGT
TGAAAGGCAGCGCCAAAGTTGAATAACTCAATAAGGTAGCTGAAAGATCATCATCTATTG
CAACCGGCAATGGTGGCATCTGGCTCATCAAGCCAGGCATATTATTCATGTCGTTTTGGA
TGGAGATAAGGTTGTTCCTTGCCTGATAGAAGAGATCTATGTTATCATGTGCCTTGTATG
AGGAGAGATTAGCTCTAATTTGACTAAATGCTCTTACATTCTGGTCTAAGAGACTGATCG
CATTGCCGCTTAAATCTGAGGTTGTAGAGGGCATTAAGAAAGGGTAGGAAGCCATGCTAG
AAGGCGAAACAGAAGGTATGCTCGAAGTCAATTCCACCTGCTTGCCCTTGCTATAACTTA
TCCTTTTTCCACAGTTTATTTCTTCTGCTTTCCTTCTCTTTCTCGTCATCCATCTACACC
TTAAAGCAACATCTCGAACAGTTTTGTCAGGTAAAGTGGCTGCAATTTTGATATACTTCA
TGATACTTGGCTTATCCTTATAATTCTCAAGGCCAACCACATACTCCGACAAAAACAAAC
CCCAAAAACTACCTCTAAACCCTCACCATCCCTCCCCTTACAAATCAACTAAAAAGGAAC
AAACTTTAGCACTTTAAGAATCGAAATCAAACTTTCCCTTGGATTCTCGGAGATCCAACT
CCAAACTCGAAGCCCTTTTGATTAGATATGAAAAAGACAGACCTTGAGAAAGTGAATCAT
GTTAAGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C515JQ U 1
AF RR4F926JQ U 43
AF RR4F926TF C 402
BS 1 46 RR4C515JQ
BS 47 47 RR4F926JQ
BS 48 172 RR4C515JQ
BS 173 173 RR4F926JQ
BS 174 195 RR4C515JQ
BS 196 198 RR4F926JQ
BS 199 566 RR4C515JQ
BS 567 864 RR4F926JQ
BS 865 1150 RR4F926TF

RD RR4C515JQ 566 0 0
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TCTATTTCCCATAGAATCATATATCATATTACACAAATCGCTTAAAAGTCGACAACAACA
TTTAACTAAGGTGATCAATCTATAGACCTTGTCAAGTGGGTTTTGGGTCTGGGGCCAGGA
CCAAGACTACTCCTT***TTAAGATTATGGCACTGCTTCAAAGATCTTTGGCCATACGAA
AGAATCACATTTCTACAAACTTGAGATAAAGATGAAAAGAAAGAAAAAAAACTATATATA
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TGGAGATAAGGTTGTTCCTTGCCTGA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4F926JQ 822 0 0
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TA***GTCGACAACAACATTTAACTAAGGTGATCAATCTATAGACCTTGTCAAGTGGGTT
TTGGGTCTGGAGCCAGGACCAAGACTACTCCTTTCCTTAAGATTATGGCACTGCTTCAAA
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GAAAAAAAACTATATATATATAGTGAGCTCTCAAGCTTCTTTTAAGATAATTTACAGGTA
ATTAAGGGAAACCGAATGACTTCACAAGTCACCCAAAAGGCTCTTGCTTCATATGGAAAC
CGCCATTTTGCATTGTGTTGAAAGGCAGCGCCAAAGTTGAATAACTCAATAAGGTAGCTG
AAAGATCATCATCTATTGCAACCGGCAATGGTGGCATCTGGCTCATCAAGCCAGGCATAT
TATTCATGTCGTTTTGGATGGAGATAAGGTTGTTCCTTGCCTGATAGAAGAGATCTATGT
TATCATGTGCCTTGTATGAGGAGAGATTAGCTCTAATTTGACTAAATGCTCTTACATTCT
GGTCTAAGAGACTGATCGCATTGCCGCTTAAATCTGAGGTTGTAGAGGGCATTAAGAAAG
GGTAGGAAGCCATGCTAGAAGGCGAAACAGAAGGTATGCTCGAAGTCAATTCCACCTGCT
TGCCCTTGCTATAACTTATCCTTTTTCCACAGTTTATTTCTTCTGCTTTCCTTCTCTTTC
TCGTCATCCATCTACACCTTAAAGCAACATCTCGAACAGTTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4F926TF 749 0 0
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TTATTCATGTCGTTTTGGATGGAGATAAGGTTGTTCCTTGCCTGATAGAAGAGATCTATG
TTATCATGTGCCTTGTATGAGGAGAGATTAGCTCTAATTTGACTAAATGCTCTTACATTC
TGGTCTAAGAGACTGATCGCATTGCCGCTTAAATCTGAGGTTGTAGAGGGCATTAAGAAA
GGGTAGGAAGCCATGCTAGAAGGCGAAACAGAAGGTATGCTCGAAGTCAATTCCACCTGC
TTGCCCTTGCTATAACTTATCCTTTTTCCACAGTTTATTTCTTCTGCTTTCCTTCTCTTT
CTCGTCATCCATCTACACCTTAAAGCAACATCTCGAACAGTTTTGTCAGGTAAAGTGGCT
GCAATTTTGATATACTTCATGATACTTGGCTTATCCTTATAATTCTCAAGGCCAACCACA
TACTCCGACAAAAACAAACCCCAAAAACTACCTCTAAACCCTCACCATCCCTCCCCTTAC
AAATCAACTAAAAAGGAACAAACTTTAGCACTTTAAGAATCGAAATCAAACTTTCCCTTG
GATTCTCGGAGATCCAACTCCAAACTCGAAGCCCTTTTGATTAGATATGAAAAAGACAGA
CCTTGAGAAAGTGAATCATGTTAAGCCCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

CO CL4007Contig1 1099 3 4 U
GGGATGGAAGTGGAAACTTTAAGACGATTTCTGAAGCGGTTAACGCTTGCCCGGAGAAAA
ACCCTGGACGTTGCATTATCCATATCAAGGCTGGTGTCTACAAGGAAATGGTCAGAATCC
CTAAGAAGAAGAACAACATTTTCATGTTTGGAGATGGTGCTACAAAAACCATCATTACTA
ATGACAAAAGTGTTGCCCTTAGCAAAACCACTACTTCACTCAGTGCCACCGTTCAGGTTG
AATCTGAGGGATTCATGGCGAAATGGATCGGATTCCAGAACACTGCTGGTCCATTGGGAC
ACCAAGCGGTCGCATTCCGTGTGAACGGAGACCGTGCGGTCATATTCAACTGTAGATTTG
ACGCTTTCCAAGACACACTCTACGTCAACAACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTG
TATCCGGTACAGTCGATTTCATCTTCGGAAAATCTGCTACCGTGATCCAAAACTCTCTAA
TCCTCATCAGAAAGGGTAGCCAGGGACAGGCCCACTACGTAACAGCCGACGGTAACATGA
AAGGTGAAGCGGTCAAGATCGGTATCGTTCTTCAGAACTGCCGTATCATGGCAGACAAAG
ATCTCGAAGCTGAGAAACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTT
CCACCACCGTTATTATTGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAAGCCAGAAGGATGGTCAG
AATGGAAAGGAGAAGCTAACCACAAAACAGCTAAATACATTGAGTTCAATAACCGTGGAC
CAGGAGCTAACACTGCTGCTAGGGTTCCTTGGGCTAAGATCGCTAAGTCTGCGGCTGAGG
TTGAAAAGTACACCGTCGCTAAATGGTTGACTCCGGTTAACTGGATTCAAGAAGCCAACG
TGCCTGTCCAGCTTGGATTGTAAGAAAAACAAACAAACTAAAATTTACTAATAAAACAGT
ATGTGATTATGTAAAGAGGTATATACGACCTCGTCTCTGGGGACCAGGGCTCTTTTTGAT
ATTATTATACAATATAGGGGGTTCTAGACATTATGGGATGAAGTTTGTATAAGATTGCTT
TTGTTTCACGTGCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF37TF U 1
AF RR4DF37JQ C 607
AF RR4GT21TF U 430
BS 1 511 RR4DF37TF
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RD RR4DF37TF 698 0 0
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ACGCTTTCCAAGACACACTCTACGTCAACAACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTG
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ATCTCGAAGCTGAGAAACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTT
CCACCACCGTTATTATTGGAACTGAGATTAGTGATGTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4DF37JQ 388 0 0
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QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4GT21TF 670 0 0
CG
GTCGATTTCATCTTCGGAAAATCTGCTACCGTGATCCAAAACTCTCTAATCCTCATCAGA
AAGGGTAGCCAGGGACAGGCCCACTACGTAACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTGAAGCG
GTCAAGATCGGTATCGTTCTTCAGAACTGCCGTATCATGGCAGACAAAGATCTCGAAGCT
GAGAAACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTTCCACCACCGTT
ATTATTGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAAGCCAGAAGGATGGTCAGAATGGAAAGGA
GAAGCTAACCACAAAACAGCTAAATACATTGAGTTCAATAACCGTGGACCAGGAGCTAAC
ACTGCTGCTAGGGTTCCTTGGGCTAAGATCGCTAAGTCTGCGGCTGAGGTTGAAAAGTAC
ACCGTCGCTAAATGGTTGACTCCGGTTAACTGGATTCAAGAAGCCAACGTGCCTGTCCAG
CTTGGATTGTAAGAAAAACAAACAAACTAAAATTTACTAATAAAACAGTATGTGATTATG
TAAAGAGGTATATACGACCTCGTCTCTGGGGACCAGGGCTCTTTTTGATATTATTATACA
ATATAGGGGGTTCTAGACATTATGGGATGAAGTTTGTATAAGATTGCTTTTGTTTCACGT
GCAAAAAA

QA 3 670 3 670
DS 



AS 1 3

CO CL4008Contig1 931 3 10 U
CGTGCCAAGAAGGAAGTGTTTCAAAAGGAAGAGAAAGAGCTCACTGAGGTTATCAAAGGT
CCCGATCGAGCATTTGGAGACTTGATAGCAAAGTCTGGTATAACAGATGAAATGCTAGAT
AGTCTGATAGCCTTGAAGGATTTCCAAGGGGTCCAAGGGTTACCTCCTCTGACTGAGATT
GAGAACCTGCGGCGTGAGAAGAGTTCTAAGAAGTCGTCAAGAGCTGAGATTGAACTCCAG
ATGCGAGAGGAGATTGCCAAGTCGAGGGTCAGACAAGTGGATGAGACTGGGAGAGCATAC
GGAACCGGGAGAAGAAAATGCAGCATCGCCCGTGTTTGGATTGTCCCTGGCAAAGGAAAG
TTCCTTGTTAACGACAAAGAGTTCGATGTCTATTTCCCTATGCTTGATCACCGTGCCGCT
CTTCTGCGCCCGCTTGCTGAAACCAAAACCTTAGGTAGTTGGGATATTAACTGCACTGTT
AA*TGGCGGTGGAACTACAGGTCAAGTTGGAGCTATTCAATTGGGTATCAGCAGGGCATT
GCAAAACTGGGAACCAGATATGCGGACAGCACTTCGAGCTGCTGGTTTTTTGACAAGAGA
CTCGAGAGTTGTGGAAAGGAAGAAACCTGGAAAAGCCAAGGCAAGAAAGAGTTTCCAGTG
GGTCAAACGTTAAATCCATTCGATATCTTTCTCTTTCTCTATGTCTTCATTTTCATTGGT
TCATCTTTACTTATACCGGGTTTGGAAGAATCACCGGATGATAACTTGTTCTTTTGGTCC
GGTTTCTTAGTCTTTCTTGCACCAACACATTACTCTACTACGACTCTTGAGTCTTGGAAA
CTTGAGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCACGACACATAATTTGTATGTTTTTGTTCCTGTTT
CTTCAAAAGGTGCATTGATAATGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H190TF U 1
AF RR4G438TF U 279
AF RR4G438JQ C 422
BS 1 344 RR4H190TF
BS 345 345 RR4G438TF
BS 346 482 RR4H190TF
BS 483 483 RR4G438TF
BS 484 535 RR4H190TF
BS 536 536 RR4G438TF
BS 537 582 RR4H190TF
BS 583 909 RR4G438TF
BS 910 910 RR4G438JQ
BS 911 931 RR4G438TF

RD RR4H190TF 582 0 0
CGTGCCAAGAAGGAAGTGTTTCAAAAGGAAGAGAAAGAGCTCACTGAGGTTATCAAAGGT
CCCGATCGAGCATTTGGAGACTTGATAGCAAAGTCTGGTATAACAGATGAAATGCTAGAT
AGTCTGATAGCCTTGAAGGATTTCCAAGGGGTCCAAGGGTTACCTCCTCTGACTGAGATT
GAGAACCTGCGGCGTGAGAAGAGTTCTAAGAAGTCGTCAAGAGCTGAGATTGAACTCCAG
ATGCGAGAGGAGATTGCCAAGTCGAGGGTCAGACAAGTGGATGAGACTGGGAGAGCATAC
GGAACCGGGAGAAGAAAATGCAGCATCGCCCGTGTTTGGATTGTTCCTGGCAAAGGAAAG
TTCCTTGTTAACGACAAAGAGTTCGATGTCTATTTCCCTATGCTTGATCACCGTGCCGCT
CTTCTGCGCCCGCTTGCTGAAACCAAAACCTTAGGTAGTTGGGATATTAACTGCACTGTT
AAATGGCGGTGGAACTACAGGTCAAGTTGGAGCTATTCAATTGGGTATCAGCAGG*CATT
GCAAAACTGGGAACCAGATATGCGGACAGCACTTCGAGCTGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4G438TF 653 0 0
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GATTGTCCCTGGCAAAGGAAAGTTCCTTGTTAACGACAAAGAGTTCTATGTCTATTTCCC
TATGCTTGATCACCGTGCCGCTCTTCTGCGCCCGCTTGCTGAAACCAAAACCTTAGGTAG
TTGGGATATTAACTGCACTGTTAA*TGGCGGTGGAACTACAGGTCAAGTTGGAGCTATTC
AATTGGGTATCAGCAGGGCATTGCAAAACTGGGAACCAGATATGCGGACAGCACTTCGAG
CTGCTGGTTTTTTGACAAGAGACTCGAGAGTTGTGGAAAGGAAGAAACCTGGAAAAGCCA
AGGCAAGAAAGAGTTTCCAGTGGGTCAAACGTTAAATCCATTCGATATCTTTCTCTTTCT
CTATGTCTTCATTTTCATTGGTTCATCTTTACTTATACCGGGTTTGGAAGAATCACCGGA
TGATAACTTGTTCTTTTGGTCCGGTTTCTTAGTCTTTCTTGCACCAACACATTACTCTAC
TACGACTCTTGAGTCTTGGAAACTTGAGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCACGACACATAAT
TTGTATGTTTTTGTTCCTGTTTCTTCAAAAG*TGCATTGATAATGAAAAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4G438JQ 502 0 0
TTT
TGCGCCCGCTTGCTGAAACCAAAACCTTAGGTAGTTGGGATATTAACTGCACTGTTAA*T
GGCGGTGGAACTACAGGTCAAGTTGGAGCTATTCAATTGGGTATCAGCAGGGCATTGCAA
AACTGGGAACCAGATATGCGGACAGCACTTCGAGCTGCTGGTTTTTTGACAAGAGACTCG
AGAGTTGTGGAAAGGAAGAAACCTGGAAAAGCCAAGGCAAGAAAGAGTTTCCAGTGGGTC
AAACGTTAAATCCATTCGATATCTTTCTCTTTCTCTATGTCTTCATTTTCATTGGTTCAT
CTTTACTTATACCGGGTTTGGAAGAATCACCGGATGATAACTTGTTCTTTTGGTCCGGTT
TCTTAGTCTTTCTTGCACCAACACATTACTCTACTACGACTCTTGAGTCTTGGAAACTTG
AGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCAGGACACATAATTTGTATGTTTTTGTTCCTGTTTCTTC
AAAAGGTGCATTGATAATG

QA 4 502 4 502
DS 



AS 1 3

CO CL4009Contig1 759 3 16 U
AGATATATTTTATTCAATTGTAATCCTCAACGGAAAACAACAAATAGAGGTTTTTATTAT
AAGTCAAAGTAAACATCGAGTCTTGTCCTCCCACGCAAGTCTCACATAGTCTTGGACGAA
GTTTCAGTAACTTTAGCTTTCTTGAACATAACCAAAAACGGCTTCGAGGTTAAAGCCAAA
CGCCTGATGCCTTTTTCATCCACAAATATACCGACATTCCTGCATCTAGGACGGCCAGTC
TCAAGAGCGGGAGGACAGAACACAAACTTGTAAGCATCATCTCCAAATTTCTCGATCTGG
AAAAAACTCTTCAGTGAATCTTGTGGACCACCCCGCACGAAGTACTGCTTCCTCTCCTCG
TCAAACTCACCGACTTGCCAATACGTTGACTGGATGCAAATCGTGGCTGCAATGTCTGTC
TCGATGTTAAGGTTCTGTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTGATCCTCCAGTTTGAGAAT
TTTACGGGAATACCCTCATCGACCTCGGATGATTTTTGCACGATGTCGAGAGGACATATC
TCAACACCGCGGCCTCGTAGAGTCAGGCCTCCGCCTTGGCCACGGATGACGGGGAGAACA
TAGTAACTGCCGCGGAAGATGGTGTCACCGTCGATGTCAAGAACCTGGCCATATGTGTTT
GTGGCCAAAACTGCGGTTAAGGCAAGAAAGAAGTAAAACGTACGATTCATGATATTGTAT
TTTTGAGTTTTTTTTTGTTGTGATTTCATTGGGTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C966JQ U 14
AF RR4GS06JQ U 1
AF RR4GS06TF C 426
BS 1 25 RR4GS06JQ
BS 26 26 RR4C966JQ
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BS 43 43 RR4C966JQ
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BS 157 285 RR4GS06JQ
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BS 400 728 RR4GS06JQ
BS 729 759 RR4GS06TF

RD RR4C966JQ 521 0 0
TCAATTGTAATCCTCAACGGAAAACAACAAATAGAGGTTTTTATTATAAGTCAAAGTAAA
CATCGAGTCTTGTCCTCCCACGCAAGTCTCACATAGTCTTGGACGAAGTTTCAGTAACTT
TAGCTTTCTTGAACATAACCAAAAACGGCTTCGAGGTTAAAGCCAAACGCCTGATGCCTT
TTTCATCCACAAATATACCGACATTCCTGCATCTAGGACGGCCAGTCTCAAGAGCGGGAG
GACAGAACACAAACTTGTAAGCATCATCTCCAAATTTCTCGATCTGGAAAAAACTCTTCA
GTGAATCTTGTGGACCACCCCGCACGAAGTACTGCTTCCTCTCCTCGTCAAACTCACCGA
CTTGCCAATACGTTGACTGGATGCAAATCGTGGCTGCAATGTCTGTCTCGATGTTAAGGT
TCTGTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTGATCCTCCAGTTTGAAAATTTTACGGGAATAC
CCTCATCGACCTCGGATGATTTTTGCACGATGTCGAGAGGA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4GS06JQ 728 0 0
AGATATATTTTATTCAATTGTAATCTTCAACGGAAAACAACAGATAGAGGTTTTTATTAT
AAGTCAAAGTAAACATCGAGTCTTGTCCTCCCACGCAAGTCTCACATAGTCTTGGACGAA
GTTTCAGTAACTTTAGCTTTCTTGAACATAACCAAGAACGGCTTCGAGGTTAAAGCCAAA
CGCCTGATGCCTTTTTCATCCACAAATATACCGACATTCCTGCATCTAGGACGGCCAGTC
TCAAGAGCGGGAGGACAGAACACAAACTTGTAAGCATCATCTCCAGATTTCTCGATCTGG
AAGAAACTCTTCAGTGAATCTTGTGGACCAGCCCGCACGAAGTACTGCTTCCTCTCCTCG
TCAAACTCACCGACTTGCCAATACGTTGACTGGATGCAGATCGTGGCTGCAATGTCTGTC
TCGATGTTAAGGTTCTGTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTGATCCTCCAGTTTGAGAAT
TTTACGGGAATACCCTCATCGACCTCGGATGATTTTTGCACGATGTCGAGAGGACATATC
TCAACACCGCGGCCTCGTAGAGTCAGGCCTCCGCCTTGGCCACGGATGACGGGGAGAACA
TAGTAACTGCCGCGGAAGATGGTGTCACCGTCGATGTCAAGAACCTGGCCATATGTGTTT
GTGGCCAAAACTGCGGTTAAGGCAAGAAAGAAGTAAAACGTACGATTCATGATATTGTAT
TTTTGAGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4GS06TF 334 0 0
GTTAAGGTTCTGTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTGATCCTCCAGTTTGAGAATTTTAC
GGGAATACCCTCATCGACCTCGGATGATTTTTGCACGATGTCGAGAGGACATATCTCAAC
ACCGCGGCCTCGTAGAGTCAGGCCTCCGCCTTGGCCACGGATGACGGGGAGAACATAGTA
ACTGCCGCGGAAGATGGTGTCACCGTCGATGTCAAGAACCTGGCCATATGTGTTTGTGGC
CAAAACTGCGGTTAAGGCAAGAAAGAAGTAAAACGTACGATTCATGATATTGTATTTTTG
AGTTTTTTTTTGTTGTGATTTCATTGGGTGTTTG

QA 1 334 1 334
DS 



AS 1 3

CO CL4010Contig1 928 3 10 U
GGACGACCAATCTCCGCACGGTTCCTGTCGTAACGCTCTTTCCTTTTGTTTCCTAGCTTC
CTAAGATAACAAGTTGTATCAGTCATTTGGTTGTGAGATAAAAAAAAAGGAGGTGCAATG
GCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGCTAAATCAAAGCAAGAAGAAGAAGGGTCCTAGTCGG
ATAAGTATTTCTACAATTGTCGTGTGTAATCTTGTAGTTGCTGTAGTTGTACTCTCCTTG
GTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCAT
AGTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCC
GATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAA
ACCGTGGACAAGTTTCTAGATCTATGTAAAAAAGACCACTTCAAGGGAATGCCGTTTCAA
CGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAA
GAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCTTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCA
TTCATGTTGGGGACACCCAAGAACAAAGGGAACAATAACAACAACAAGGACTTCGAGCTT
CTGATCACAACGGCGCCAATCCCGGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGCTCGGAAGAGTC
CTTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAGCATTTCCAG
CCGAAATCGCAGATAGGGATCATTAGCATTGTATTGAAACGAGACTTATGAAATGAAAAA
TCTCTCTTGTTTAGTACCTGACGCCAAATCTTTTCTTCATACTCACCTGTGTCTAAAACC
CTTTTTTTATATCTTTATTTTACTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ88TF U 1
AF RR4C883TF U 164
AF RR4FQ88JQ C 444
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BS 728 728 RR4C883TF
BS 729 744 RR4FQ88TF
BS 745 745 RR4C883TF
BS 746 753 RR4FQ88TF
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BS 755 785 RR4FQ88TF
BS 786 839 RR4C883TF
BS 840 840 RR4FQ88JQ
BS 841 928 RR4C883TF

RD RR4FQ88TF 791 0 0
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GCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGCTAAATCAAAGCAAGAAGAAGAAGGGTCCTAGTCGG
ATAAGTATTTCTACAATTGTCGTGTGTAATCTTGTAGTTGCTGTAGTTGTACTCTCCTTG
GTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCAT
AGTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCC
GATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAA
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CGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAA
GAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCTTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCA
TTCATGTTGGGGACACCCAAGAACAAAGGGAACAATAACAACAACAAGGACTTCGAGCTT
CTGATCACAACGGCGCCAATCCCGGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGCTCGGAAGAGTC
CTTAAGG*AGAGGATGTAGTACAG*AGATTGAG*AAGTGGATACAGATGAGCATTTCCAG
CCGAA
TCGCAG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4C883TF 765 0 0
G
GAAGGGTCCTAGTCGGATAAGTATTTCTACAATTGTCGTGTGTAATCTTGTAGTTGCTGT
AGTTGTACTCTCCTTGGTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACT
TGAAACCCAGAGTCATAGTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGA
TCGTCCTGGCTATGCCGATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAA
AGATGCTTCCCCTGAAACCGTGGACAAGTTTCTAGATCTATGTAAAAAAGACCATTTCAA
GGGAATGCCGTTTCAACGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAGCTGGTCACTCCTCGAG
CTCTATACCTGTAGAAGAATGGACTGCTGAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCTTTGACACAAG
CCCAAAACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCCAAGAACAAAGGGAACAATAACAACAA
CAAGGACTTCGAGCTTCTGATCACAACGGCGCCAATCCCGGATCTGAATGATCAGCTTAT
AGTGTTCGGAAGAGTCCTTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAGTGGGTAC
AGATGAGCATTTCCAGCCGAAATCGCAGATAGGGATCATTAGCATTGTATTGAAACGAGA
CTTATGAAATGAAAA*TCTCTCTTGTTTAGTACCTGACGCCAAATCTTTTCTTCATACTC
ACCTGTGTCTAAAACCCTTTTTTTATATCTTTATTTTACTGATT

QA 2 765 2 765
DS 

RD RR4FQ88JQ 459 0 0
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GCAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAAGAATGGACTGCTAAAGGAAAGCT
CCGTGGTCGCTTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCCAAGAA
CAAAGGGAACAATAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTGATCACAACGGCGCCAATCCC
GGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGCTCGGAAGAGTCCTTAAGGGAGAGGATGTAGTACA
GGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAGCATTTCCAGCCGAAATCGCAGATAGGGATCAT
TAGCATTGTATTGAAACGAGACTTATGAAATGAAAAATCTCTCTTGTTTAGTACCTGACG
CCAAATCTTTTCTTCATACTCACCTGTGTCTAAAACCC
C

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 3

CO CL4011Contig1 1133 3 14 U
GGACCGGTTGCTGATGGTCTTGGGAGAGTGAACCGGGTTGAGCCTGTGAGCTTGGAAGAG
CTTGGAAGGCCGAGGATTGATGTCGTTGTTAACTGCTCAGGGGTCTTCCGTGATCTGTTT
ATTAATCAGATGAATCTTCTTGACAGGGCAATCAAGATGGTAGCTGAGCTAGACGAGCCA
GTTGAGATGAACTACGTGAGGAAACACGCCATGGAGCAAGCAGCAACGCTCGGCGTTGAT
ATCATAGAGGCAGCTACAAGAGTTTTCTCAAACGCTTCGGGGTCATACTCGGCAAACATC
AGTCTCGCTGTTGAGAACTCTTCATGGAACGATGAGCAACAGCTTCAGGACATGTACTTG
AGCCGCAAATCGCTTGCGTTTGACAGCGATGCTCCTGGAGCAGGGATGGCTGAGAAGAAG
GAGGTCTTTTCAGATGGCTCTTATGACTGCAGAAGTCACGTTCCAGAACCTCGATTCTTC
CGAGATTTCGTTGACCGACGTGAGCCATTACTTTGACTCTGACCCGACAAACTTGGTTCA
GAGTTTGAGGAAAGACAAGAAGAAGCCTAGCGCTTACATTGCTGATACAACAACCGCAAA
CGCACAGGTGAGGTCACTATCTGAGACAGTGAGGCTGGACGCAAGAACAAAGCTGCTGAA
CCCAAAGTGGTACGAAGGAATGATGTCAAGCG*ATACGAAGGTGTTCGTGAGATAGAGAA
GAGACTGACCAACACTGTGGGATGGAGTGCAACCTCAGGTCAAGTAGACAACTGGGTCTA
CGAAGAGGCCAACACCACTTTCATCAAAGACGAGGAGATGCTCAACCGTCTCATGAACAC
TAATCCAAACTCCTTCAGGAAGATGATCCAGACGTTCTTGGAAGCCAATGGCCGTGGCTA
CTGGGAGACTTCGGAAGACAACATCGAGAAGCTCAAGGACTTGTACTCTCAGGTCGAAGA
CAAGATTGAAGGGATCGATCGATAGATAAACAATGTGAAGCATATTTTTTTAAAGTAAAT
GGAAACAAACTGCATTGATGTTTTATTTTTCAAACAATGACATCATCTCTATGTGAATAA
GAGAATGCTTTTGCTGACGTTTTCTGACTTTATATGAATGTTGTGGAGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A995TF U 1
AF RR4A995JQ C 384
AF RR4F422TF U 662
BS 1 716 RR4A995TF
BS 717 789 RR4F422TF
BS 790 790 RR4A995JQ
BS 791 795 RR4F422TF
BS 796 796 RR4A995JQ
BS 797 822 RR4F422TF
BS 823 823 RR4A995JQ
BS 824 891 RR4F422TF
BS 892 892 RR4A995JQ
BS 893 915 RR4F422TF
BS 916 916 RR4A995JQ
BS 917 1068 RR4F422TF
BS 1069 1069 RR4A995JQ
BS 1070 1133 RR4F422TF

RD RR4A995TF 716 0 0
GGACCGGTTGCTGATGGTCTTGGGAGAGTGAACCGGGTTGAGCCTGTGAGCTTGGAAGAG
CTTGGAAGGCCGAGGATTGATGTCGTTGTTAACTGCTCAGGGGTCTTCCGTGATCTGTTT
ATTAATCAGATGAATCTTCTTGACAGGGCAATCAAGATGGTAGCTGAGCTAGACGAGCCA
GTTGAGATGAACTACGTGAGGAAACACGCCATGGAGCAAGCAGCAACGCTCGGCGTTGAT
ATCATAGAGGCAGCTACAAGAGTTTTCTCAAACGCTTCGGGGTCATACTCGGCAAACATC
AGTCTCGCTGTTGAGAACTCTTCATGGAACGATGAGCAACAGCTTCAGGACATGTACTTG
AGCCGCAAATCGCTTGCGTTTGACAGCGATGCTCCTGGAGCAGGGATGGCTGAGAAGAAG
GAGGTCTTTTCAGATGGCTCTTATGACTGCAGAAGTCACGTTCCAGAACCTCGATTCTTC
CGAGATTTCGTTGACCGACGTGAGCCATTACTTTGACTCTGACCCGACAAACTTGGTTCA
GAGTTTGAGGAAAGACAAGAAGAAGCCTAGCGCTTACATTGCTGATACAACAACCGCAAA
CGCACAGGTGAGGTCACTATCTGAGACAGTGAGGCTGGACGCAAGAACAAAGCTGCTGAA
CCCAAAGTGGTACGAAGGAATGATGTCAAGCG*ATACGAAGGTGTTCGTGAGATAG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4A995JQ 712 0 0
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TGACTGCAGAAGTCACGTTCCAGAACCTCGATTCTTCCGAGATTTCGTTGACCGACGTGA
GCCATTACTTTGACTCTGACCCGACAAACTTGGTTCAGAGTTTGAGGAAAGACAAGAAGA
AGCCTAGCGCTTACATTGCTGATACAACAACCGCAAACGCACAGGTGAGGTCACTATCTG
AGACAGTGAGGCTGGACGCAAGAACAAAGCTGCTGAACCCAAAGTGGTACGAAGGAATGA
TGTCAAGCG*ATACGAAGGTGTTCGTGAGATAGAGAAGAGACTGACCAACACTGTTGGAT
GGAGTGCAACCTCAGGTCAAGTAGACAACTGGGTCTACGAAGAGGCCAACACCACTTTCA
TCAAAGACGAGGAGATGCTCAACCGTCTCATGAACACTAATCCAAACTCCTTCAGGAAGA
TGATCCAGACGTTCTTGGAAGCCAATGGCCGTGGCTACTGGGAGACTTCGGAAGATAACA
TCGAGAAGCTCAAGGACTTGTACTCTCAGGTCGAAGACAAGATTGAAGGGATCGATCGAT
AGATAAACAATGTGAAGCATATTTTTT*AAAGTAAATGGAAACAAACTGCATTGATGTTT
TATTTTTCAAACAATGACATCATCTCTATGTGAATAGGAGAATGTTTTTGC
C

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4F422TF 472 0 0
G
CAAAGTGGTACGAAGGAATGATGTCAAGCGGATACGAAGGTGTTCGTGAGATAGAGAAGA
GACTGACCAACACTGTGGGATGGAGTGCAACCTCAGGTCAAGTAGACAACTGGGTCTACG
AAGAGGC*AACACGACTTTCATCAAAGACGAGGAGATGCTTAACCGTCTCATGAACACTA
ATCCAAACTCCTTCAGGAAGATGATCCAGACGTTCTTGGAAGCCAATGGTCGTGGCTACT
GGGAGACTTCGGAGGACAACATCGAGAAGCTCAAGGACTTGTACTCTCAGGTCGAAGACA
AGATTGAAGGGATCGATCGATAGATAAACAATGTGAAGCATATTTTTTTAAAGTAAATGG
AAACAAACTGCATTGATGTTTTATTTTTCAAACAATGACATCATCT*TATGTGAATAAGA
GAATGCTTTTGCTGACGTTTTCTGACTTTATATGAATGTTGTGGAGCTTTT

QA 2 472 2 472
DS 



AS 1 2

CO CL4012Contig1 651 2 19 U
TTTTTGTTTCAGAGACAGAGAGCTTAGGTCGTGTCCGTGTTTGATCAGAAGGTCGAAACT
TGAAGTATTTTTTTAGCTACTGCTCACTGCTATATCATCAAGCGTTTTTCCAGATGCCTC
GGAGACCATCGGGAGGAGGAAGAAGATTCATAAAGCATCAACCTTTAGCATTTTCACCGT
TTATGCGGTCACTTGCTTTAGCTTCAAGGCGTAGTAAACAAGAGGACTCTCAACGCTCTG
AAGAGCTGATGTCTTTTGATGAAAGGCTCCCAACTTCATCTAAAAAGGAGAAAAAGGAAG
AGCTTTCAGACTCCTCTGATGACGAAGACTCTCAGGGAGATGTACAAGCAGACTTTGAGT
TCTTTGATCCTAAGACAACAGACTTCAACGGAGTCAAGATTCTTCTCAAAAACTATCTAG
ATGACAAGGAGTGGGACTTGAGCAGCTTTGTTGATTTGGTATTGGAACAGACGACAGTAG
GAACCGTCGTGAAAGTAGCAGACGATGAGGACGAGTCTGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTC
TCAACTTGGGAAGATACAAAGAGCACAAGTGCTTTAGAGAGGTGAAAGAGTTTCTTCTCC
AAGTCTGTTCGGAGAAGAGTGCCGCTAGTGATCTCAAACTGTTGCTGGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ58TF U 10
AF RR4FO69TF U 1
BS 1 43 RR4FO69TF
BS 44 44 RR4CJ58TF
BS 45 73 RR4FO69TF
BS 74 74 RR4CJ58TF
BS 75 76 RR4FO69TF
BS 77 77 RR4CJ58TF
BS 78 194 RR4FO69TF
BS 195 195 RR4CJ58TF
BS 196 436 RR4FO69TF
BS 437 437 RR4CJ58TF
BS 438 472 RR4FO69TF
BS 473 473 RR4CJ58TF
BS 474 502 RR4FO69TF
BS 503 503 RR4CJ58TF
BS 504 526 RR4FO69TF
BS 527 527 RR4CJ58TF
BS 528 559 RR4FO69TF
BS 560 560 RR4CJ58TF
BS 561 651 RR4FO69TF

RD RR4CJ58TF 570 0 0
CAGAGACAGAGAGCTTAGGTCGTGTCCGTGTTTGATCAGAAGGTCGAAACTTGAAGTATT
TTTTTAGCTACTGCTCACTGCTATATCATCAAGCGTTTTTCCAGATGCCTCGGAGACCAT
CGGGAGGAGGAAGAAGATTCATAAAGCATCAACCTTTAGCATTTTCACCGTTTATGCGGT
CGCTTGCTTTAGCTTCAAGGCGTAGTAAACAAGAGGACTCTCAACGCTCTGAAGAGCTGA
TGTCTTTTGATGAAAGGCTCCCAACTTCATCTAAAAAGGAGAAAAAGGAAGAGCTTTCAG
ACTCCTCTGATGATGAAGACTCTCAGGGAGATGTACAAGCAGACTTTGAGTTCTTTGATC
CTAAGCCAACAGACTTCAACGGAGTCAAGATTCTTCTCAAAAACTATCTAGATGACAAGG
AGTGGGACTTGAGCAGCTTTGTTGATTTGGTATTGGAACAGACGACGGTAGGAACCGTCG
TGAAAGTAGCAGACGATGAGGACGAGTCTGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTCTCAACTTGG
GAAGATACAAAGAGCACAAGTGCTTTA
AAG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4FO69TF 651 0 0
TTTTTGTTTCAGAGACAGAGAGCTTAGGTCGTGTCCGTGTTTGGTCAGAAGGTCGAAACT
TGAAGTATTTTTT*AGTTACTGCTCACTGCTATATCATCAAGCGTTTTTCCAGATGCCTC
GGAGACCATCGGGAGGAGGAAGAAGATTCATAAAGCATCAACCTTTAGCATTTTCACCGT
TTATGCGGTCACTTTCTTTAGCTTCAAGGCGTAGTAAACAAGAGGACTCTCAACGCTCTG
AAGAGCTGATGTCTTTTGATGAAAGGCTCCCAACTTCATCTAAAAAGGAGAAAAAGGAAG
AGCTTTCAGACTCCTCTGATGACGAAGACTCTCAGGGAGATGTACAAGCAGACTTTGAGT
TCTTTGATCCTAAGACAACAGACTTCAACGGAGTCAAGATTCTTCTCAAAAACTATCTAG
ATGACAAGGAGTGGGATTTGAGCAGCTTTGTTGATTTGGTATTGGAACAGACTACAGTAG
GAACCGTCGTGAAAGTAGCAGATGATGAGGACGAGTCTGTGTTTGCTGTCGTCTCTGCTC
TCAACTTGGGAAGATACAAGGAGCACAAGTGCTTTAGAGAGGTGAAAGAGTTTCTTCTCC
AAGTCTGTTCGGAGAAGAGTGCCGCTAGTGATCTCAAACTGTTGCTGGAGA

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL4013Contig1 677 2 5 U
TGGAATCAGTTTTGTTCTCATTTAACAATCAATCATACAAGTGTTACAAATGGAGTATGT
GAGTGGCAACAAAAAATAGTTTTATGAGTGGATGTTTTCCCAACTCCCAATGATTAATTG
AATCCCTTTTTTTCTTTGTTCTTGGTCGATTTGATGGCATTGTTAAATTCTTCTTCTAAT
CGTAAAGGCCTTCGTCATACCATATATCGACCAGAAAGTCCACCATCTCGGGTAAAGGAA
TCGACTCAGAGAAAGGTTCATGAGTTGAGAGAAGATCTTCATATGTAGTAGACCAACTTA
TAATCTGATCCTTTGTAGTTTTTTTTCTTTGTCGAGATTGATCTCCCACCCATTTTTCTC
TGTTCTCTTGCCACACCTTTACACCATGATTCACCGGTGTAATGGTGCTTTCAGTGTTCT
TTTTAACCGAGCTTTTATCTTCTATGACCAGTTTTGAAAGCTCAAGAGGTTTGTTTTCCG
TGGACGGACAGTTTGCAGTAAAAAGCTCCATTGATATGATTCAGTCGAATGATCATTCCT
TTACGAAATAAATTCGATCATACCAACATTCAACAAAGAATATCAAAGGTTTCCACACAA
GCTCATTGACATATTCATCAATCAGCTTGTGGGAAAACCTAAATGAGGGAGTACAAGCAG
AAAGTTTGGTGGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN19JQ U 22
AF RR4AN19TF C 1
BS 1 29 RR4AN19TF
BS 30 78 RR4AN19JQ
BS 79 79 RR4AN19TF
BS 80 192 RR4AN19JQ
BS 193 677 RR4AN19TF

RD RR4AN19JQ 171 0 0
TTAACAAT
CAATCATACAAGTGTTACAAATGGAGTATGTGAGTGGCAACAAAAAATATTTTTATGAGT
GGATGTTTTCCCAACTCCCAATGATTAATTGAATCCCTTTTTTTCTTTGTTCTTGGTCGA
TTTGATGGCATTGTTAAATTCTTCTTCTAATCGTAAAGGCCTT

QA 9 171 9 171
DS 

RD RR4AN19TF 677 0 0
TGGAATCAGTTTTGTTCTCATTTAACAATCAATCATACAAGTGTTACAAATGGAGTATGT
GAGTGGCAACAAAAAATAGTTTTATGAGTGGATGTTTTCGCAACTCCTAATGATTAATTG
AATCGCTTTTTTTCTTTGTTCTTGGTCGATTTGATGGCATTGTTAGATTCTTCTTCTAAT
CGTAAAGGCCTTCGTCATACCATATATCGACCAGAAAGTCCACCATCTCGGGTAAAGGAA
TCGACTCAGAGAAAGGTTCATGAGTTGAGAGAAGATCTTCATATGTAGTAGACCAACTTA
TAATCTGATCCTTTGTAGTTTTTTTTCTTTGTCGAGATTGATCTCCCACCCATTTTTCTC
TGTTCTCTTGCCACACCTTTACACCATGATTCACCGGTGTAATGGTGCTTTCAGTGTTCT
TTTTAACCGAGCTTTTATCTTCTATGACCAGTTTTGAAAGCTCAAGAGGTTTGTTTTCCG
TGGACGGACAGTTTGCAGTAAAAAGCTCCATTGATATGATTCAGTCGAATGATCATTCCT
TTACGAAATAAATTCGATCATACCAACATTCAACAAAGAATATCAAAGGTTTCCACACAA
GCTCATTGACATATTCATCAATCAGCTTGTGGGAAAACCTAAATGAGGGAGTACAAGCAG
AAAGTTTGGTGGGAGCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL4014Contig1 837 3 7 U
GGGGTTGTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCA
AAACGAAAACAAAATGGCTGAGGCAGCACCTGCATTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGT
TAGTGAGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGAA
GATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGATGCG
TATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACGA
TCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCAAAGATCGACAT
GTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGCGTGTTGAAGTCGCTGAGGA
TTCCACAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGT
GAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTC
TAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTGC
AGGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTCATGTATGCACCGTTC
TCATTTTGAAAATCAGGTTGCCTGTTTTCTTTGTTTTTTTTAATGTAGATTGATTCTCTT
ATCATGGGATCATTTTCTTGTTTTAGTTTTCGTTTCCTTCTGGACGTTAAAGCAAAAGAG
AAAACATATACAAGTGTCTTATGTTTGGAGTATAATGAAAGTTCGATATGGCTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H711TF U 1
AF RR4FK87TF U 58
AF RR4H711JQB C 128
BS 1 554 RR4H711TF
BS 555 626 RR4FK87TF
BS 627 627 RR4H711JQB
BS 628 652 RR4FK87TF
BS 653 653 RR4H711JQB
BS 654 696 RR4FK87TF
BS 697 837 RR4H711JQB

RD RR4H711TF 554 0 0
GGGGTTGTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCA
AAACGAAAACAAAATGGCTGAGGCAGCACCTGCATTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGT
TAGTGAGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGAA
GATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGATGCG
TATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACGA
TCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCAAAGATCGACAT
GTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGCGTGTTGAAGTCGCTGAGGA
TTCCACAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGT
GAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTC
TAGTTGAAGAAGCA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4FK87TF 639 0 0
GG
AAAACGAAAACAAAATGGCTGAGGCAGCACCTGCATTGAGGAAGCCTGTGTTCACTAAGG
TTAGTGAGTTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGA
AGATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTTGTCCTCAGGCTCGTCATATGC
GTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACG
ATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCGACA
TGTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGCGTGTTGAAGTCGCTGAGG
ATTCCACAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTG
TGAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCT
CTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTG
CAGGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAGTCTTTATGCTTGCCTCTCATGTATGTACCGTT
CTCATTTTGAAAATCAGGTTGCCTGTTTTCTTTGTTT

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR4H711JQB 710 0 0
C
TGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGAAGATGGTGA
TGCAGAGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGATGCGTATTGCTG
AATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACGATCAAGTGG
ATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCAAAGATCGACATGTACAAGG
GCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGCGTGTTGAAGTCGCTGAGGATTCCACAG
ACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGAGCGTTG
AAGCTTAATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCTAGTTGAA
GAAGCATTAGGCCTCTCTCTTTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTTGGT
TTTTTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTCATGTATGCACCGTTCTCATTTTG
AAAATCAGGTTTCCTGTTTTCTTTGTTTTTTTTAATGTAGATTGATTCTCTTATCATGGG
ATCATTTTCTTGTTTTAGTTTTCGTTTCCTTCTGGACGTTAAAGCAAAAGAGAAAACATA
TACAAGTGTCTTATGTTTGGAGTATAATGAAAGTTCGATATGGCTCTGT

QA 2 710 2 710
DS 



AS 1 2

CO CL4015Contig1 1000 2 2 U
GACCGAAGCTGATGTCGTCTTCGTGCCATTCTTCTCCTCATTGAGCTACAACAGATTCTC
TAAGGTTAACCAAAAGCAGAAGCAGAGCCGAGACAGAGAACTACAGGACAAGGTGGTGAA
GTTCGTGACGGCACAGAAGGAGTGGAAGCACTCAGGAGGGAAAGATCATGTGATAATGGC
GCACCATCCTAACAGCATGTCCACGGCGAGGCATAAGCTATATCCAGCTATGTTTGTGGT
CGCTGACTTCGGTAGATACTCGCCACGTGTAGCTAATGTTGATAAAGACATCGTAGCTCC
GTACAAACACCTTGTACCATCTTACGTTAATGACACATCAGGCTTTGATTCACGTCCCGT
CTTGCTCTACTTCCAAGGAGCCATCTACCGTAAAGCTGGTGGATTCGTGAGACAAGAGCT
ATACTACCTTCTGAAAGAAGAAAAAGACGTTCACTTCTCCTTCGGAAGTGTGCAAAACCA
CGGCATAAGCAAAGCGGGAGAAGTAATGAGATCGTCTAAGTTCTGTCTCAACATCGCTGG
AGATACTCCCTCTTCGAACCGTCTCTTTGACGCTATAGCTAGCCATTGTATTCCCGTGAT
CATCAGCGATGACATTGAGTTGCCTTACGAGGATGTTCTCAACTACAACGAGTTCTGCAT
CTTCGTCCGAGCATCAGATGCTTTGAAGAAAGGGTTTCTGTTGGGTCTTGTGAGGAGTAT
TGGGAGAGAAGAGTGGAACAAGATGTGGAGGAGGTTGAAGGAGGTTGAGAGGTACTTTGA
TTTCCGTTTTCCGGGGAAGGATGATGATGGAGACTATGGAGTTCAGATGATTTGGAAAGC
TGTGGCGAGGAAAGCTCCTTTGGTGAAGATGAAGGTTCATAGGTTTCAGAGGTTTACAAG
GCCTTTTTTGATTTAGTGTAGAAGTATAATTAAATATAGTCTCAGTTCAATTGTGGAATG
TGTTAACCTAGCACCAGTGGTACACTCTTTTTATCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD63TF U 1
AF RR4AD63JQ C 145
BS 1 756 RR4AD63TF
BS 757 1000 RR4AD63JQ

RD RR4AD63TF 756 0 0
GACCGAAGCTGATGTCGTCTTCGTGCCATTCTTCTCCTCATTGAGCTACAACAGATTCTC
TAAGGTTAACCAAAAGCAGAAGCAGAGCCGAGACAGAGAACTACAGGACAAGGTGGTGAA
GTTCGTGACGGCACAGAAGGAGTGGAAGCACTCAGGAGGGAAAGATCATGTGATAATGGC
GCACCATCCTAACAGCATGTCCACGGCGAGGCATAAGCTATATCCAGCTATGTTTGTGGT
CGCTGACTTCGGTAGATACTCGCCACGTGTAGCTAATGTTGATAAAGACATCGTAGCTCC
GTACAAACACCTTGTACCATCTTACGTTAATGACACATCAGGCTTTGATTCACGTCCCGT
CTTGCTCTACTTCCAAGGAGCCATCTACCGTAAAGCTGGTGGATTCGTGAGACAAGAGCT
ATACTACCTTCTGAAAGAAGAAAAAGACGTTCACTTCTCCTTCGGAAGTGTGCAAAACCA
CGGCATAAGCAAAGCGGGAGAAGTAATGAGATCGTCTAAGTTCTGTCTCAACATCGCTGG
AGATACTCCCTCTTCGAACCGTCTCTTTGACGCTATAGCTAGCCATTGTATTCCCGTGAT
CATCAGCGATGACATTGAGTTGCCTTACGAGGATGTTCTCAACTACAACGAGTTCTGCAT
CTTCGTCCGAGCATCAGATGCTTTGAAGAAAGGGTTTCTGTTGGGTCTTGTGAGGAGTAT
TGGGAGAGAAGAGTGGAACAAGATGTGGAGGAGGTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4AD63JQ 856 0 0
GAAGCA
CTCAGGAGGGAAAGATCATGTGATAATGGCGCACCATCCTAACAGCATGTCCACGGCGAG
GCATAAGCTATATCCAGCTATGTTTGTGGTCGCTGACTTCGGTAGATACTCGCCACGTGT
AGCTAATGTTGATAAAGACATCGTAGCTCCGTACAAACACCTTGTACCATCTTACGTTAA
TGACACATCAGGCTTTGATTCACGTCCCGTCTTGCTCTACTTCCAAGGAGCCATCTACCG
TAAAGCTGGTGGATTCGTGAGACAAGAGCTATACTACCTTCTGAAAGAAGAAAAAGACGT
TCACTTCTCCTTCGGAAGTGTGCAAAACCACGGCATAAGCAAAGCGGGAGAAGTAATGAG
ATCGTCTAAGTTCTGTCTCAACATCGCTGGAGATACTCCCTCTTCGAACCGTCTCTTTGA
CGCTATAGCTAGCCATTGTATTCCCGTGATCATCAGCGATGACATTGAGTTGCCTTACGA
GGATGTTCTCAACTACAACGAGTTCTGCATCTTCGTCCGAGCATCAGATGCTTTGAAGAA
AGGGTTTCTGTTGGGTCTTGTGAGGAGTATTGGGAGAGAAGAGTGGAACAAGATGTGGAG
GAGGTTGAAGGAGGTTGAGAGGTACTTTGATTTCCGTTTTCCGGGGAAGGATGATGATGG
AGACTATGGAGTTCAGATGATTTGGAAAGCTGTGGCGAGGAAAGCTCCTTTGGTGAAGAT
GAAGGTTCATAGGTTTCAGAGGTTTACAAGGCCTTTTTTGATTTAGTGTAGAAGTATAAT
TAAATATAGTCTCAGTTCAATTGTGGAATGTGTTAACCTAGCACCAGTGGTACACTCTTT
TTATCATTCC

QA 7 856 7 856
DS 



AS 1 3

CO CL4016Contig1 642 3 10 U
CTGAACAAACAAAATGGCGGCCATGAACTCGACTGTTCTCACATGCAGCTACGCAATCTC
TGGTGGTAGCTCAGCAGAGCTGAACCAGAAAGTGGGTTTAGTGAATTCATCGGTTGGGTT
TGGTCAAAAGAAACAAACGCTTCCTGTGATCAAAGCAGCTCAACGACGAGTCGGTGGTGA
TGATGTTAATGGAAGAAGATCCGCAATGGTGTTCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGC
TGCTGTCTCTGCTTCTGCTAATGCTGGCGTCATCGATGAGTACCTCGAGAAGAGCAAAGC
CAACAAAGAACTGAATGATAAGAAGAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGC
GTTTACTGTTCAGTTCGGAAGCTGTAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCT
TGCCAAACAAAAGAAAGTACCATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAA
AGATAAGTTCAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTTTGTTGTCTT
TTTTAAATCCATTCTTTGTATAAACTCAACAGTGTATCTCTCTCTCTCTTTATTCATCAA
AGTTCTCATACTCATTTGAATCTATAAAGTGAATATTGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO39TF U 1
AF RR4BO39JQ C 1
AF RR4BA17TF U 4
BS 1 6 RR4BO39JQ
BS 7 398 RR4BO39TF
BS 399 399 RR4BA17TF
BS 400 409 RR4BO39TF
BS 410 410 RR4BA17TF
BS 411 437 RR4BO39TF
BS 438 438 RR4BA17TF
BS 439 451 RR4BO39TF
BS 452 609 RR4BA17TF
BS 610 642 RR4BO39JQ

RD RR4BO39TF 454 0 0
CTGAAC
AAACAAAATGGCGGCCATGAACTCGACTGTTCTCACATGCAGCTACGCAATCTCTGGTGG
TAGCTCAGCAGAGCTGAACCAGAAAGTGGGTTTAGTGAATTCATCGGTTGGGTTTGGTCA
AAAGAAACAAACGCTTCCTGTGATCAAAGCAGCTCAACGACGAGTCGGTGGTGATGATGT
TAATGGAAGAAGATCCGCAATGGTGTTCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGT
CTCTGCTTCTGCTAATGCTGGCGTCATCGATGAGTACCTCGAGAAGAGCAAAGCCAACAA
AGAACTGAATGATAAGAAGAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCGTTTAC
TGTTCAGTTCGGAAGCTGTAAGTTCCCTGAGA*TTTCACTGGT*GCCAAGATCTTGCCAA
ACAAAAGAAAG*ACCATTCATCTCA
AAG

QA 7 451 7 451
DS 

RD RR4BO39JQ 642 0 0
CTGAACAAACAAAATGGCGGCCATGAACTCGACTGTTCTCACATGCAGCTACGCAATCTC
TGGTGGTAGCTCAGCAGAGCTGAACCAGAAAGTGGGTTTAGTGAATTCATCGGTTGGGTT
TGGTCAAAAGAAACAAACGCTTCCTGTGATCAAAGCAGCTCAACGACGAGTCGGTGGTGA
TGATGTTAATGGAAGAAGATCCGCAATGGTGTTCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGC
TGCTGTCTCTGCTTCTGCTAATGCTGGCGTCATCGATGAGTACCTCGAGAAGAGCAAAGC
CAACAAAGAACTGAATGATAAGAAGAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGC
GTTTACTGTTCAGTTCGGAAGCTGTAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCT
TGCCAAACAAAAGAAAGTACCATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAA
AGATAAGTTCAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTTTGTTGTCTT
TTTTAAATCCATTCTTTGTATAAACTCAACAGTGTATCTCTCTCTCTCTTTATTCATCAA
AGTTCTCATACTCATTTGAATCTATAAAGTGAATATTGAGAG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4BA17TF 606 0 0
GGA
AAACAAAATGGCGGCCATGAACTCGACTGTTCTCACATGCAGCTACGCAATCTCTGGTCC
*AGCTCAGCAGAGCTGAACCAGAAAGTGGGTTTAGTGAATTCATCGGTTGGGTTTGGTCA
AAAGAAACAAACGCTTCCTGTGATCAAAGCAGCTCAACGACGAGTCGGTGGTGATGATGT
TAATGGAAGAAGATCCGCAATGGTGTTCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGT
CTCTGCTTCTGCTAATGCCGGCGTCATCGATGAGTACCTCGAGAAGAGCAAAGCCAACAA
AGAACTGAATGATAAGAAGAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCGTTTAC
TGTTCAGTTCGGAAGCTGTAAGTTCCCTAAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTTGCCAA
ACAAAAGAAAGTACCATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGATAA
GTTCAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTTTGTTGTCTTTTTTAA
ATCCATTCTTTGTATAAACTCAACAGTGTATCTCTCTCTCTCTTTATTCATCAAAGTTCT
CAT

QA 4 606 4 606
DS 



AS 1 3

CO CL4017Contig1 946 3 10 U
CAGTCATCACATATTATCATTAGTAGCTGAAAATACACAATCACCGATATAGTGCAGTTT
CTTGATTTTTGACTTTATTTTGTCCTCAGTATTATACCATTTCAACATGCAATACTCTTA
CACACATACACATACGAAACAAACTCATTCGAGTGAACTTATAACTAGAAAAAAAGTAAA
CACATAACCATAAAGCAAAACAGGAACAAGTAAACTCTGCTTAGCGACTCATCCGCCTGC
ATTGTCCGCCGCCTTAACCGGAGATTTGTGTCCCGCTCCCTCCGGTACGGTGACACGTTG
CTCGAAGACTCACCAAATAGTCTCCTATACACCATTTCGCATACCACACCCATCACTGGA
TCAGGCATTCTATACATGTACCGTTGACTACTCGTACCTTCGTCTGAACGTTGACCGACT
CCTCTTATGTCATAAACCGGACCGGATGGTCTGCTCGGTAAGGTTAAACCGGACCGAGAA
GTTTTCTGTCCCCGGCCGTAGATAGGGACAAGCGTGGCGTCGGAGACATTGGATTTGCAG
ACCGGACATTTTGTAGGTTCCTTCTTATCATACTGATCGACTTGTTGCCTTGATGTGCTG
GTGGAGTAAGTCCACTTGTAAATGCAAGGCCAACAAAACAAGTGGCCGCATAAAGTCACG
ACCGGGTCTCGAACCTGATCGAAACATATGTTGCAGTCGAAGTCTCCTCCAGAATCACCC
GACGTTGCTGGGTTGTCTTCTTGGTTCTCTATCTCCATTTTACTGAAACGTAAAACAGGA
CAACCCAATTCATTGTTTATAAGTAGACCACTTCAAACTTTACAGAGTCATCTATACACC
AATCATGATCTTGCTTAACTTTTTTGAAAATTTAAAGAAAGAAAACGGGTGAAACAAAGG
GGAGCTTGAAGGTAAACGAGAGAAGAGCTTAATGTTATGTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK68JQ U 93
AF RR4FD74JQ U 1
AF RR4FD74TF C 250
BS 1 137 RR4FD74JQ
BS 138 138 RR4CK68JQ
BS 139 172 RR4FD74JQ
BS 173 173 RR4CK68JQ
BS 174 178 RR4FD74JQ
BS 179 179 RR4CK68JQ
BS 180 212 RR4FD74JQ
BS 213 213 RR4CK68JQ
BS 214 850 RR4FD74JQ
BS 851 946 RR4FD74TF

RD RR4CK68JQ 127 0 0
TATACCATTTCAACATGCAATACTCTTACACACATACACATACGAAACAAACTCATTCGA
GTGAACTTATAACTAGAAAAAAAGTAAACACATAACCATAAAGCAAAACAGGAACAAGTA
AACTCTG

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR4FD74JQ 850 0 0
CAGTCATCACATATTATCATTAGTAGCTGAAAATACACAATCACCGATATAGTGCAGTTT
CTTGATTTTTGACTTTATTTTGTCCTCAGTATTATACCATTTCAACATGCAATACTCTTA
CACACATACACATACGATACAAACTCATTCGAGTGAACTTATAACTAGAAAAGAAGTAGA
CACATAACCATAAAGCAAAACAGGAACAAGTAGACTCTGCTTAGCGACTCATCCGCCTGC
ATTGTCCGCCGCCTTAACCGGAGATTTGTGTCCCGCTCCCTCCGGTACGGTGACACGTTG
CTCGAAGACTCACCAAATAGTCTCCTATACACCATTTCGCATACCACACCCATCACTGGA
TCAGGCATTCTATACATGTACCGTTGACTACTCGTACCTTCGTCTGAACGTTGACCGACT
CCTCTTATGTCATAAACCGGACCGGATGGTCTGCTCGGTAAGGTTAAACCGGACCGAGAA
GTTTTCTGTCCCCGGCCGTAGATAGGGACAAGCGTGGCGTCGGAGACATTGGATTTGCAG
ACCGGACATTTTGTAGGTTCCTTCTTATCATACTGATCGACTTGTTGCCTTGATGTGCTG
GTGGAGTAAGTCCACTTGTAAATGCAAGGCCAACAAAACAAGTGGCCGCATAAAGTCACG
ACCGGGTCTCGAACCTGATCGAAACATATGTTGCAGTCGAAGTCTCCTCCAGAATCACCC
GACGTTGCTGGGTTGTCTTCTTGGTTCTCTATCTCCATTTTACTGAAACGTAAAACAGGA
CAACCCAATTCATTGTTTATAAGTAGACCACTTCAAACTTTACAGAGTCATCTATACACC
AATCATGATC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4FD74TF 697 0 0
GCCGCTTAA
CGGAGATTTGTGTCCCGCTCCCTCCGGTACGGTGACACGTTGCTCGAAGACTCACCAAAT
AGTCTCCTATACACCATTTCGCATACCACACCCATCACTGGATCAGGCATTCTATACATG
TACCGTTGACTACTCGTACCTTCGTCTGAACGTTGACCGACTCCTCTTATGTCATAAACC
GGACCGGATGGTCTGCTCGGTAAGGTTAAACCGGACCGAGAAGTTTTCTGTCCCCGGCCG
TAGATAGGGACAAGCGTGGCGTCGGAGACATTGGATTTGCAGACCGGACATTTTGTAGGT
TCCTTCTTATCATACTGATCGACTTGTTGCCTTGATGTGCTGGTGGAGTAAGTCCACTTG
TAAATGCAAGGCCAACAAAACAAGTGGCCGCATAAAGTCACGACCGGGTCTCGAACCTGA
TCGAAACATATGTTGCAGTCGAAGTCTCCTCCAGAATCACCCGACGTTGCTGGGTTGTCT
TCTTGGTTCTCTATCTCCATTTTACTGAAACGTAAAACAGGACAACCCAATTCATTGTTT
ATAAGTAGACCACTTCAAACTTTACAGAGTCATCTATACACCAATCATGATCTTGCTTAA
CTTTTTTGAAAATTTAAAGAAAGAAAACGGGTGAAACAAAGGGGAGCTTGAAGGTAAACG
AGAGAAGAGCTTAATGTTATGTGAAAAA

QA 10 697 10 697
DS 



AS 1 3

CO CL4018Contig1 1104 3 7 U
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GATTGTTTTCCTCATTATTTGATTGCCGCGAACTTATTGTGCTCTGGAAAAGTGATCGTA
TTTCAAAACAGCATTTTGCTATTGTAAAATCCTTGTTTTAATTTCCAAAAATCCTTGTTT
TAGCATCTTCTTAATTTTTTTTCATTTTCTATATATTTCCGATACTAGCTAGCATTTGTT
TTCTTCATTTTCTTACGTAAATAAATAGAAAACACCCGACTTCAAGATCTATGCAACTTA
CAATGGCAAGCTCAAGTATGAAAAGCCTATTGAAAGGCCTCCGATACATTTCTCAAGTAT
TTGAAAGCGGAAAAGAAGAAGAAGAGATAGAGATAGGGAATCCAACGGACGTAAAGCATG
TTGCCCATATTGGTTGGGATGGACCATCTGCTACTCCTGCCTCTGCGCCAAGCTGGATGA
ACGAGTTCAAAAGTAGTGATGGATTCGAATCTGGCCAAGGAGGCGGAGAAGATGATTCAT
CTGCGAGATGTATGTCTGAATGTGGCGGTCAGACCAGAGATTTACCAAAACTACCAAAAT
CTACGAGGAAAGCGGCCTCCGAAAAAGGTTCTCCGACAAGGGAAATATCATCGGACAAAA
CTAAACGCAGGTCTTCGAAAAAAGGAACAACATCATCGTCAAGAAGACAAAAGGAAGTGT
CTGAACTAAAAGAGTTTTCTTCGTGGTCTAGTCCAAGTACAGGAACATTACCGGAAGTTC
CTAAGAAATCAAGGAGGAAGAAGAAAGCGAAAGAAACTGGAGGAGGAGGATCAACTAGAT
CAATTAGAAGATCTGATGTGGATAACATGTCTGAGACTGGTTCTGTGAGATCTATGCCTC
AATTCGACAACAGAGATGACTTTTGAAAATAAGAGACAGAAGAAGAGTTTTTCATGCTTG
GACATGTATGGCTAATCAATCCTCACTGAACATACCAATATTAGAATATCTTCTTTAGCC
TCCAGTCTTTGTACTATTACCATTCACTTTAATTACAACAATACTCTTTTTTTTTTCTAT
ATATAACCGGAGAACTTGAACCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4BJ84TF U 79
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CT

QA 1 659 1 659
DS 

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GG
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T*CATTTTCTAT****TTCCGATACTAGCTAGCATTTGTTTTCTTCATTTTCTTATGTAA
ATAAATAGAAAACACCCGACTTCAAGATCTATGCAACTTACAATGGCAAGCTCTAGTATG
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QA 3 719 3 719
DS 

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AGGAACATTACCGGAAGTTCCTAAGAAATCAAGGAGGAAGAAGAAAGCGAAAGAAACTGG
AGGAGGAGGATCAACTAGATCAATTAGAAGATCTGATGTGGATAACATGTCTGAGACTGG
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AGAAGAGTTTTTCATGCTTGGACATGTATGGCTAATCAATCCTCACTGAACATACCAATA
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ATACTCTTTTTTTTTTCTATATATAACCGGAGAACTTGAACCTT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FL51TF U 1
AF RR4FL51JQ C 201
AF RR4EU26TF U 74
BS 1 617 RR4FL51TF
BS 618 618 RR4EU26TF
BS 619 651 RR4FL51TF

RD RR4FL51TF 651 0 0
GGTCACAAAAAATATCTTCATGCATGTTTTGTTCCTTCTCGTTATAAAACCATCATAGTT
CTCTTCCAAGTTCTTGGATCTGTCCCCAAAGCAATTGGAGATCTACAAAGAAGAAGAAGA
CGGATCCTCAAAACAGAAGACAAAAATGTGTACTGCTACTCATCATGATCATCAATCACA
ACAACAAAACCTCCCTTGTCTCCACTGCGACCCACACTCATACATTCGCATGGTTCAACA
TATGATAGAGAGGTGTATCATACTCCGTATGAGTCGTGACGGATGCGTTGAGTCGTTAGA
CCACCACGCAAGCATTCTACCACTCGTTACGCTCACCGTTTGGAGAGGACTTGAGAGGGA
AAATAAGGATTTCTTTAAAACGTACGAGCAGTCCTTCTCCCCTGAGCCGTTCTCAAGCGG
GGATACATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTGGCGAGAAGGATACAACAATGAAGACTTTGCT
TTAGGCTTCTAGATTCATATGAGAAAAAAAAAAACTTCAAGTTTATACATGTAGACGATG
GACATAGGCTATCATTACATATCTGCTAAGATGAAACATGATCATGCTATACCATATGTA
CACCCCCCCTTTTTTTT*ATGTTAAAGCGTTTCTCTAATTAGATTAAGTAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4FL51JQ 449 0 0
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TACTCCGTATGAGTCGTGACGGATGCGTTGAGTCGTTAGACCACCACGCAAGCATTTTAC
CACTCGTTACGCTCACCGTTTGGAGAGGACTTGAGAGGGAAAATAAGGATTTCTTTAAAA
CGTACGAGCAGTCCTTTTCCCCTGAGCCGTTTTCAAGCGGGGATACATGTTCGGAGATCG
CCGAGGTTGGCGAGAAGGATACAACAATGAAGACTTTGCTTTAGGCTTCTAGATTCATAT
GAGAAAAAAAAAAACTTCAAGTTTATACATGTAGACGATGGACATAGGCTATCATTACAT
ATCTGCTAAGATGAAACATGATCATGCTATACCATATGTACACCCCCCCTTTTTTTTTAT
GTTAAAGCGTTTCTCTAATTAGATTAAGT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR4EU26TF 561 0 0
GG
GGATCTGTCCCCAAAGCAATTGGAGATCTACAAAGAAGAAGAAGACGGATCCTCAAAACA
GAAGACAAAAATGTGTACTGCTACTCATCATGATCATCAATCACAACAACAAAACCTCCC
TTGTCTCCACTGCGACCCACACTCATACATTCGCATGGTTCAACATATGATAGAGAGGTG
TATCATACTCCGTATGAGTCGTGACGGATGCGTTGAGGCGTTAGACCACCACGCAAGCAT
TCTACCACTCGTTACGCTCACCGTTTGGAGAGGACTTGAGAGGGAAAATAAGGATTTCTT
TAAAACGTACGAGCAGTCCTTCTCCCCTGAGCCGTTCTCAAGCGGGGATACATGTTCGGA
GATCGCCGAGGTTGGCGAGAAGGATACAACAATGAAGACTTTGCTTTAGGCTTCTAGATT
CATATGAGAAAAAAAAA**CTTCAAGTTTATACATGTAGACGATAGACATAGGCTATCAT
TACATATCTGCTAAGATGAAACATGATCATGCTATACCATATGTACACCCCCCCTTTTTT
TTTATGTTAAAGCGTTTCT

QA 3 561 3 561
DS 



AS 1 2

CO CL4020Contig1 916 2 2 U
CGAAACTCATTCCTTTTGTTACAATAAGGAAGAAACACTGATGCTCTTACTTCCACTAAC
ACTCACAAACCCTTCTCTCTCCCTTTTTCTTAGTTTTACAAAACTCCCAAACTGGACTTC
AAATCCTAATTTTATATATAACATATCTTTTTGATTACCCTTTTTCCACATATTTACAAA
TTTTCGACAAAAAACCCACATAATCCCATTATCATCAACTCCTAAACCTTTCGAATGGTT
TTTTAGCCTTCTCTGTTTTATATATGCATGTTATTGGGACTCTTATGCAAGAGTAGGAAC
ACTGTTGCGTCTGTCCATGTCAAGGCAATTAAATCCCACGACACGAACCGCAGGATTGTT
CCCGAAGTTAGTCGTCGCCCTAACGCAACCGCCACCGTTCATTGGAGATGACGGTGGTGG
TGGCTTGGTTGCTCGTGGAATCGACGGACGAGTAGGAACCACCACGAGAAGCTCCTCCCG
AAAGAGTGAATCTTTGGTTAAAGGGTTAGAAACTCTACTCGGCGGTGACCCTGTGAAGAA
TAGCTCCGGCGTCGGATCTTGTTCAAAACCACCACCCTTTGCGAGTATGAAATCCAAAAT
ATCGCTTCTTGAATTCGATTCACATAGCTCCATCTGGTGACTGACTTGCCAACGGAGAGA
TCGAGTAAGGTGGTGGTGGTTTAGGACACTGACACGACGTGGTTTAGGGCAAACGACGGC
GTCTCTGCTCCTCATCACCTCGAAAGCGTTTTGTTGAACTCCACAGCTGTTCATCTGAAG
CTCGAAAAGCACAGATCGTTCTTTTGGAAGAGAAGCAGCTTTAAGCCAAGAAGAAGAAAG
AGAAAGAGAGATCTGAAGAAAAGTCTAATGGCTCTTAGGTTAACAACAAAGGCAGGTAGA
AATATAGAACCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E058JQ U 1
AF RR4B488JQ U 134
BS 1 667 RR4E058JQ
BS 668 916 RR4B488JQ

RD RR4E058JQ 667 0 0
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AAATCCTAATTTTATATATAACATATCTTTTTGATTACCCTTTTTCCACATATTTACAAA
TTTTCGACAAAAAACCCACATAATCCCATTATCATCAACTCCTAAACCTTTCGAATGGTT
TTTTAGCCTTCTCTGTTTTATATATGCATGTTATTGGGACTCTTATGCAAGAGTAGGAAC
ACTGTTGCGTCTGTCCATGTCAAGGCAATTAAATCCCACGACACGAACCGCAGGATTGTT
CCCGAAGTTAGTCGTCGCCCTAACGCAACCGCCACCGTTCATTGGAGATGACGGTGGTGG
TGGCTTGGTTGCTCGTGGAATCGACGGACGAGTAGGAACCACCACGAGAAGCTCCTCCCG
AAAGAGTGAATCTTTGGTTAAAGGGTTAGAAACTCTACTCGGCGGTGACCCTGTGAAGAA
TAGCTCCGGCGTCGGATCTTGTTCAAAACCACCACCCTTTGCGAGTATGAAATCCAAAAT
ATCGCTTCTTGAATTCGATTCACATAGCTCCATCTGGTGACTGACTTGCCAACGGAGAGA
TCGAGTA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4B488JQ 783 0 0
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ACCCACATAATCCCATTATCATCAACTCCTAAACCTTTCGAATGGTTTTTTAGCCTTCTC
TGTTTTATATATGCATGTTATTGGGACTCTTATGCAAGAGTAGGAACACTGTTGCGTCTG
TCCATGTCAAGGCAATTAAATCCCACGACACGAACCGCAGGATTGTTCCCGAAGTTAGTC
GTCGCCCTAACGCAACCGCCACCGTTCATTGGAGATGACGGTGGTGGTGGCTTGGTTGCT
CGTGGAATCGACGGACGAGTAGGAACCACCACGAGAAGCTCCTCCCGAAAGAGTGAATCT
TTGGTTAAAGGGTTAGAAACTCTACTCGGTGGTGACCCTGTGAAGAATAGCTCCGGCGTC
GGATCTTGTTCAAAACCACCACCCTTTGCGAGTATGAAATCCAAAATATCGCTTCTTGAA
TTCGATTCACATAGCTCCATCTGGTGACTGACTTGCCAACGGAGAGATCGAGTAAGGTGG
TGGTGGTTTAGGACACTGACACGACGTGGTTTAGGGCAAACGACGGCGTCTCTGCTCCTC
ATCACCTCGAAAGCGTTTTGTTGAACTCCACAGCTGTTCATCTGAAGCTCGAAAAGCACA
GATCGTTCTTTTGGAAGAGAAGCAGCTTTAAGCCAAGAAGAAGAAAGAGAAAGAGAGATC
TGAAGAAAAGTCTAATGGCTCTTAGGTTAACAACAAAGGCAGGTAGAAATATAGAACCTA
CCC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4021Contig1 1279 2 2 U
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TTCTCCAACTCCGAAAGTGAAACGATACGTGGAGGAGGTTAGATTGGCGAAATCAAATCC
TCCTCCTCCACGGCGGCGATGTTTCGGTGTCAGCGAATAGTAGAAAGCACAGAGATGGTG
GGGGTCCTTGGCGGCGGAGGAAGCTGCTATGGTTTACGATCGAGCCTAATTTTCGAACTC
CGCCTCCTTCGCCGGAGAACCAGAGCCTCTGTAACTGTTCTCCGACTTCTGTTCTTCGAT
TCAACGTCGAGGAGGAAACAGTGTATCGAACGGAACCAATCGGCGGAGGTGAAGCCGAGC
CTCGCAAGTTTTTTCCCGGATCCGTATTCGTTGCCGGAGTTGGTTTAGGTCTGTAATATT
AGAATTTAAACTCCATGAAAGCTTGAGCTCTCTCTCTCGCCGGATCTCTCTTTCTCGCCG
GATCTCTCTCTCTCGCCGGATTCTCTCTCTCGTCGGATCTCATTCTCACCGCATCTCACT
CTCTCTCTCTCTCGGGATGGGCTTATGTCGACTCCAGGTGATAGGATTCTCGTTCTTGCA
GCAACAAATAGGCCGTTTTATCTTGATGAAGCCATCATTAGGAGGTTTGAGCGAAGGTAA
GTGGACCTTGTATTACTTGAAATCCTGAGCTTGAGTTGTACTAACTCCAGCTTTTGTTGT
GAGGGAGAATCATGGTTGGTCTCCCATCAGTTGAGAGCAGAGAGAAGATCTTGAGAACTT
TACTGTCAAAAAGAGAAACAGAGAATCTTGATTTCCATGAGCTAGCACAGATGACAGATA
GCTATATAGTGGAAGTGATATCAAGAACTTTTGCACAACAGCTGCATATAGACCTGTGAG
GGAGCTGATAAAGCATGAGTGCTTGAAAGACCAGGAGAGGAAAAAGAGAGAGGAAGCAGA
GAAGAGGAATATGAAGCAAAAGAAGAAGCATCTGAGGAGAGAGTGACAACGCTGAGAGCT
TTGAGCATGGAAGACATGAGAGTAGCTAAAAACCAGGTTTCTGCTAGTATTGCAGCAGAA
GGAGCAGGAATGAATGAACTGAAGCAGTGGAACGATTTGTATGGAGAAGGAGGGTCCAGG
AAGAAGGAACAGCTCTCTTACTTCCTTTAGTATCATTCAGTAATTGTCTTAAAGCTATGT
TGCGTTTGTGTTGTTGTTGCAGCAAAAGTAACGTTGTATAAAGCTATGTTGTGTGTTTAT
GTGTAATTGTGTTTATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU70TF U 1
AF RR4EU70JQ C 532
BS 1 608 RR4EU70TF
BS 609 1279 RR4EU70JQ

RD RR4EU70TF 608 0 0
GGGTGCCAGTTAAACCATCTAACTGTTCTCCGAGAGTGGTCCTAATAACGTAACGGTGGC
TTCTCCAACTCCGAAAGTGAAACGATACGTGGAGGAGGTTAGATTGGCGAAATCAAATCC
TCCTCCTCCACGGCGGCGATGTTTCGGTGTCAGCGAATAGTAGAAAGCACAGAGATGGTG
GGGGTCCTTGGCGGCGGAGGAAGCTGCTATGGTTTACGATCGAGCCTAATTTTCGAACTC
CGCCTCCTTCGCCGGAGAACCAGAGCCTCTGTAACTGTTCTCCGACTTCTGTTCTTCGAT
TCAACGTCGAGGAGGAAACAGTGTATCGAACGGAACCAATCGGCGGAGGTGAAGCCGAGC
CTCGCAAGTTTTTTCCCGGATCCGTATTCGTTGCCGGAGTTGGTTTAGGTCTGTAATATT
AGAATTTAAACTCCATGAAAGCTTGAGCTCTCTCTCTCGCCGGATCTCTCTTTCTCGCCG
GATCTCTCTCTCTCGCCGGATTCTCTCTCTCGTCGGATCTCATTCTCACCGCATCTCACT
CTCTCTCTCTCTCGGGATGGGCTTATGTCGACTCCAGGTGATAGGATTCTCGTTCTTGCA
GCAACAAA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4EU70JQ 748 0 0
CATCTCAC
TCTCTCTCTCTCTCGGGATGGGCTTATGTCGACTCCAGGTGATAGGATTCTCGTTCTTGC
AGCAACAAATAGGCCGTTTTATCTTGATGAAGCCATCATTAGGAGGTTTGAGCGAAGGTA
AGTGGACCTTGTATTACTTGAAATCCTGAGCTTGAGTTGTACTAACTCCAGCTTTTGTTG
TGAGGGAGAATCATGGTTGGTCTCCCATCAGTTGAGAGCAGAGAGAAGATCTTGAGAACT
TTACTGTCAAAAAGAGAAACAGAGAATCTTGATTTCCATGAGCTAGCACAGATGACAGAT
AGCTATATAGTGGAAGTGATATCAAGAACTTTTGCACAACAGCTGCATATAGACCTGTGA
GGGAGCTGATAAAGCATGAGTGCTTGAAAGACCAGGAGAGGAAAAAGAGAGAGGAAGCAG
AGAAGAGGAATATGAAGCAAAAGAAGAAGCATCTGAGGAGAGAGTGACAACGCTGAGAGC
TTTGAGCATGGAAGACATGAGAGTAGCTAAAAACCAGGTTTCTGCTAGTATTGCAGCAGA
AGGAGCAGGAATGAATGAACTGAAGCAGTGGAACGATTTGTATGGAGAAGGAGGGTCCAG
GAAGAAGGAACAGCTCTCTTACTTCCTTTAGTATCATTCAGTAATTGTCTTAAAGCTATG
TTGCGTTTGTGTTGTTGTTGCAGCAAAAGTAACGTTGTATAAAGCTATGTTGTGTGTTTA
TGTGTAATTGTGTTTATGGC

QA 9 748 9 748
DS 



AS 1 3

CO CL4022Contig1 885 3 21 U
GGGATCATAGCCCCTGATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAGGAGTGAC
GGAATCAAGATCATCAACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGGAC
GGGATGAAAAACCTTCTTGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGGATCAGTATT
GGAAGCCTTGGATTATACGGGCACGAGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGTGAACTGC
ACCCTCAGAAATACTGATAATGGTGTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTGCAGCTTGCTCC
ACGACCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAACCCTATC
CTCATCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGATGCAACAAGAATAAACCATCAACTATC
AAGCTGGTCGACATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTT
AAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTT*CCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATAT
TAAATATACTGGTAAA*GACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATC*CCCGAAG
CTCGTGGGGAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAGGCACCAGGCCAC
TAGAAACTCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTAGT
GTATGTTATTTCCTTTGAATCTTTGTAAAAAAAAAAATCTGTTTTCTTTTTGCCGTTTTG
GCCCCTAAAATTTTGCATTTTTGCTAGCTTTATTGATTGTATAAGATGCATCATTCCTGT
AAAAAAAATTTCTAATATAGCAATGAGAAACTAAGATTTCACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AV04TF U 1
AF RR4ES42JQ C 313
AF RR4E594TF U 387
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BS 356 356 RR4ES42JQ
BS 357 504 RR4AV04TF
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BS 554 556 RR4AV04TF
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BS 757 757 RR4ES42JQ
BS 758 884 RR4E594TF
BS 885 885 RR4ES42JQ

RD RR4AV04TF 746 0 0
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GGAATCAAGATCATCAACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGGAC
GGGATGAAAAACCTTCTTGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGGATCAGTATT
GGAAGCCTTGGATTATACGGGCACGAGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGTGAACTGC
ACCCTCAGAAATACTGATAATGGTGTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTGCAGCTTGCTCC
ACGACCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAACCTTATC
CTCATCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGATGCAACAAGAATAAACCATCAACTATC
AAGCTGGTCGACATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTT
AAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTTTCCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATAT
TAAATATACTGGAAAAAGACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATCTCCCGAAG
CTGGTGGGGAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAG*CACCAG*CCAC
TAGAAACTCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTAGT
GTATGTTATTTCCTTTGAATCTTTGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4ES42JQ 573 0 0
GGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAACCCTATCCTCATCGACCAA
GAGTACTGCCCATGGAACCGATGCAACAAGAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTCGAC
ATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGC
AGCAAGGCATTT*CCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGG
TAAA*GACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATC*CCCGAAGCTCGTGGGGAAA
CAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAGGCACCAGGCCACTAGAAACTCGGA
GTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTAGTGTATGTTATTTC
CTTTGAATCTTTGTAAAAAAAAAAATCTGTTTTCTTTTTGCCGTTTTGGCCCCTAAAATT
TTGCATTTTTGCTAGCTTTATTGATTGTATAAGATGCATCATTCCTGTAAAAAAAATTTC
TAATATAGCAATGAGAAACTAAGATTTCACTGC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4E594TF 498 0 0
GAACCGATGCAACAAGAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTCGACATAAAGTTCAAGAA
TATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTT*C
CGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGGTAAA*GACGGTCCA
GCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATC*CCCGAAGCTCGTGGGGAAACAGTGTCCTAAAGC
ATGTAGCAGCCCACTGACGAAGGCACCAGGCCACTAGAAACTCGGAGTGTATATAATATA
TACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTAGTGTATGTTATTTCCTTTGAATCTTTGT
AAAAAAAAAA*TCTGTTTTCTTTTTGCCGTTTTGGCCCCTAAAATTTTGCATTTTTGCTA
GCTTTATTGATTGTATAAGATGCATCATTCCTGTAAAAAAAATTTCTAATATAGCAATGA
GAAACTAAGATTTCACTG

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 3

CO CL4023Contig1 787 3 4 U
GGGACGCGGACAATTTGGCGCCTCTTCTTCTTATCCATAATCTGGAAAGGAACAAGACGA
CAATGGCTATGGAGATTGCGCAGTTTTTCGTCGGATCATCCATGAGATTAAGCGTGGGAA
ATTCTAGGAACGGCGTTTCCCGTAGTAAGTTATTTTCTATATCGGCCGTTCATCATCGTC
CCAGAAGGATGTTTATGCAGCTCGCTGGGCTGGGTTCGGTGTTGACCCTTGTGAATCTTC
CTGGTTTAGCTGCGCCAGTTCCTGAGATGAAGGAACCTGAAGTTGTCAGGACGTTGAAGC
TCCCAAGTGGCGTCAGGATTCAAGAGATTATTGAAGGGGAAGGACGAGAAGCTCATGAAG
GGGACCTGGTCGAACTAAACTATGTATGTCGACGTGCAAATGGATACTTCGTTCATAGCA
CAGTGGACCAATTCAGTGGGGAAGCCGCTCCTGTCAAACTTTTTCTTGACGGCAATGACG
TTATCGAGGGCTTGAAGGAAGTATTGGTGGGCATGAAAGCCGGAGGGAAGCGTAGAGCAC
TGATACCTCCATCAGCAGGGTACATAAATAGACACTGAAGCCAATCCCTGGAGTTTGGAC
CAAGACGCAGCCTTCTATCGCACGCGAATGAGCCTCTGGTCTTTGAAGTCCAGCTCTTGA
AAATATTATGATCTTCTTGGACTGGGACAATGGCAATGAAGGATTTGGCTGTGTTTGTGT
TATTTTCTATTCGTAAAAATCTGTAACACAAATTAAATGGAACTATTAAGCTGTCTTTTT
TTCTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU65TF U 31
AF RR4CB09TF U 1
AF RR4CB09JQ C 81
BS 1 79 RR4CB09TF
BS 80 80 RR4EU65TF
BS 81 697 RR4CB09TF
BS 698 787 RR4CB09JQ

RD RR4EU65TF 543 0 0
GG
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CGAGA

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DS 

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CAGTGGACCAATTCAGTGGGGAAGCCGCTCCTGTCAAACTTTTTCTTGACGGCAATGACG
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DS 

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TCAG
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CCGCTCCTGTCAAACTTTTTCTTGACGGCAATGACGTTATCGAGGGCTTGAAGGAAGTAT
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CGAATGAGCCTCTGGTCTTTGAAGTCCAGCTCTTGAAAATATTATGATCTTCTTGGACTG
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AACACAAATTAAATGGAACTATTAAGCTGTCTTTTTTTCTGCG

QA 5 707 5 707
DS 



AS 1 3

CO CL4024Contig1 947 3 13 U
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AGGTTATGCTACCGATGAAAATGGAGATGGCTAACGCTCCTTCCAAGTTTAAATCACCTG
ATCTACTTCATGTTCTCGCCGTCGACGATAGCCACGTTGATCGGAAATTCATAGAGCGCT
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TTATGACGGATTACTCTATGCCCGGAATGACTGGATATGAACTCTTGAAGAAAATCAAAG
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GTATTGATAGATGTCTTGAAGAAGGTGCTGAAGATTTCTTATTGAAGCCTGTAAAACTTT
CGGATGTAAGAAGAATAAGGGATTCTCTGATGAAAGCTGAAGTAGATCTATCTTTCACGA
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TTCTTACAAGAGATTGTAAGCTGGTTTTATGAAAGTTGGCTAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4A719TF U 1
AF RR4A650TF U 26
AF RR4A650JQ C 26
BS 1 184 RR4A719TF
BS 185 185 RR4A650TF
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RD RR4A719TF 729 0 0
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TGGGCTTAA

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GG
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AG

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RD RR4A650JQ 922 0 0
GG
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TTCTCTTCAAAATCCAGTAATATCACATGGCTGAGGTTATGCTACCGATGAAAATGGAGA
TGGCTAACGCTCCTTCCAAGTTTAAATCACCTGATCTACTTCATGTTCTCGCCGTCGACG
ATAGCCACGTTGATCGGAAATTCATAGAGCGCTTGCTCAAAGTCTCTTCCTGTAAAGTTA
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CCGTTGGTGTTAAGGATTTGAAAGTTAATTTGATTATGACGGATTACTCTATGCCCGGAA
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ACAATTTTCCACCCCCTTGCGTCTTCTTTTTTTGCTGAGTAAAACTCTCAGTGTTGACAG
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ATTATTATTCATTAGAGATGTCATGTTTTTTTCTTCTTACAAGAGATTGTAAGCTGGTTT
TATGAAAGTTGGCTAATTAT

QA 3 922 3 922
DS 



AS 1 2

CO CL4025Contig1 720 2 2 U
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AGCCTTCAAAAGGAATTGGCAGAACAAACGCAAAGCTGAGGGTAAACCCTATGACAAACC
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AGCTGAAATGGTAGACGAGAACACAATCTGTGTTGCTGCCATACTTGGTTCCACACTCAA
CGGTGAATTCGAAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAGGTGCTTCACGAGCTTGACACCTTG
CCTTCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTCGGAAATGTGATAGGGAAGAAG
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AAGAAGATGAATGGTGTGTGTTAATCTGAACTGTCTTCTGTTTGTGTTTGAATGTATTAA
ATGTCGTCTAATAAAAGAAGAGGTATGTGTGTGTGTGTGAGAACTTGGAGTTTGATGAAA
GAGTTGTGTGTCTGGTATCTATTTGAGACAATAATTGGTTCCGGATTCTATTGTACGCTT
GAAACTCATCTTGAGCCTTTGATTATTTGTAAAATAGTCTTGAAATGCTATTTCCTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AGCTGAAATGGTAGACGAGAACACAATCTGTGTTGCTGCCATACTTGGTTCCACACTCAA
CGGTGAATTCGAAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAGGTGCTTCACGAGCTTGACACCTTG
CCTTCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTCGGAAATGTGATAGGGAAGAAG
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ATGTCGTCTAAT

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TAAAAGAAGTGAAGCTTAGTGAAGGTTACTACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGAAA
TGGTAGACGAGAACACAATCTGTGTTGCTGCCATACTTGGTTCCACACTCAACGGTGAAT
TCGAAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAGGTGCTTCACGAGCTTGACACCTTGCCTTCCAA
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GAATGGTGTGTGTTAATTTGAACTGTCTTCTGTTTGTGTTTGAATGTATTAAATGTCGTC
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TGTCTGGTATCTATTTGAGACAATAATTGGTTCCGGATTCTATTGTACGCTTGAAACTCA
TCTTGAGCCTTTGATTATTTGTAAAATAGTCTTGAAATGCTATTTCCTTGAG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 3

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GAATTTTGGAAGCAGAAAGAAAAAAAGGTTTTTAAACTTCAAAGCTTTATCGGAACTTGT
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GGAGCTGAGGCTTTCTCGACGACTTTCTTATCGCGTCTCTCCATTGCAACATCCCACTCA
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CCCATAATACAGAGCATCCCTCCGATGATTCCCAGAGGCAGAGCCGCTTCTAGCCACACC
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BQ
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AF RR4A220JQ U 1
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AF RR4A220TFB C 1
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CTCACAAGAAAAATCAAACGGGCATAACAGTATTGGACTCTCCAGCTTCTTGAATAAACT
TTATTTGTGACAACAAGTTGTTCACCTGAAGCCCCAGATCTGATCATGATTCATGAGGAA
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AACGACATCTTCTTCCTCTTCCTTCCTGATTCTCCTTCTCTGTTTCAAAAGATCCCC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4A220TFB 537 0 0
GATGACCCATTTTTTTCAAGATTATTATTCATTCACACAGCAAGAAGTGTTTGTATACCA
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GAATTTTGGAAGCAGAAAGAAAAAAAGGTTTTTAAACTTCAAAGCTTTATCGGAACTTGT
CTCACAAGAAAAATCAAACGGGCATAACAGTATTGGACTCTCCAGCTTCTTGAATAAACT
TTATTTGTGACAACAAGTTGTTCACCTGAAGCCCCAGATCTGATCATGATTCATGAGGAA
GGAGCTGAGGCTTTCTCGACGACTTTCTTATCGCGTCTCTCCATTGCAACATCCCACTCA
TCGTGCCCGATGTGCTTCGGACGGCCATGATAAGCTTTGTGGATGTAGTACTGAGAGCTT
CCCATAATACAGAGCATCCCTCCGATGATTCCCAGAGGCAGAGCCGCTTCTAGCCACACC
AACGACATCTTCTTCCTCTTCCTTCCTGATTCTCCTTCTCTGTTTCAAAAGATCCCC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 3

CO CL4027Contig1 1029 3 7 U
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GGCGGATTCTCTGATGCTCTCTCCATCGCCTCCGATCTCGGTTACGCCGTCGCTCCTCCT
CCCTCGCAGGAAGAATTACAAAGCTTGGCGTCTTCAAATGGTGATGATTTGATAAGGGTG
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CCAACAACACCAGGAAGTAACGAAACGCCACATAGAGACTCGGATTGTGTAACTCCACCT
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TTAACTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A409TF U 1
AF RR4GY45TF U 184
AF RR4GY45JQ C 487
BS 1 482 RR4A409TF
BS 483 483 RR4GY45TF
BS 484 590 RR4A409TF
BS 591 591 RR4GY45TF
BS 592 660 RR4A409TF
BS 661 846 RR4GY45TF
BS 847 1029 RR4GY45JQ

RD RR4A409TF 660 0 0
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GGCGGATTCTCTGATGCTCTCTCCATCGCCTCCGATCTCGGTTACGCCGTCGCTCCTCCT
CCCTCGCAGGAAGAATTACAAAGCTTGGCGTCTTCAAATGGTGATGATTTGATAAGGGTG
TTGCGGGAGTTATCTGCTGTGCAAAGAAAAATTGCTGATTTTCAGGTCGAGCTTCAAGGG
AGGAAGGATGATAAGAATGTGGCACATTTGACTCATGTGAGTGAAATGCAAAAGAAAATC
GAGACTCTTTCAAGGATTACTCAAATCTTGAAAGATGTTATACAAAACAAGGATCGCATC
ATTGCTCGTCTCCAACAACCTTATTCACTGGATTGTATTCCAGTTGAAGCAGAATATCAG
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CTGCGTCCAATACCGGTGGCACTAGCGTCATGCACGAGATTCTTCGAGGCCATGACCGCG
ATGAGAGAATCATTCGCAACTCTTCAAGACCTTAGAGTTGGTAGCTCTGCATCTTCTTTA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4GY45TF 663 0 0
G
GGGAGTTATCTGCTGTGCAAAGAAAAATTGCTGATTTTCAGGTCGAGCTTCAAGGGAGGA
AGGATGATAAGAATGTGGCACATTTGACTCATGTGAGTGAAATGCAAAAGAAAATCGAGA
CTCTTTCAAGGATTACTCAAATCTTGAAAGATGTTATACAAAACAAGGATCGCATCATTG
CTCGTCTCCAACAACCTTATTCACTGGATTGTATTCCAGTTGAAGCAGAATATCAGAAAC
AATTTTCAGAGTTGTTAATGAAAGCCGCCAGTGATTATGGCGCCTTAACAGCATCAGTAT
CTGATTTTCAGTGGAGCCAAAACTTTAAAGAACCTCCTTCAGTCTGGGGGGAAATGCTGC
GTCCAATACCGGTGGCACTAGCGTCATGCACGAGATTCTTCGAGGC*ATGACCGCGATGA
GAGAATCATTCGCAACTCTTCAAGACCTTAGAGTTGGTAGCTCTGCATCTTCTTTACCAA
CAACACCAGGAAGTAACGAAACGCCACATAGAGACTCGGATTGTGTAACTCCACCTCAAG
GGAGAACAGATCCAAGCTTCGACGACTTGGCTGTTCAGACAACAAGGAGACAAATCCATG
ATCAAAATGAAACGGAAGAAGATGAGAATGTTCAACTTGACCGGAGACTATCTTGGCCTC
CT

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4GY45JQ 543 0 0
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CCAATACCGGTGGCACTAGCGTCATGCACGAGATTTTTCGAGGC*ATGACCGCGATGAGA
GAATCATTCGCAACTCTTCAAGACCTTAGAGTTGGTAGCTCTGCATCTTCTTTACCAACA
ACACCAGGAAGTAACGAAACGCCACATAGAGACTCGGATTGTGTAACTCCACCTCAAGGG
AGAACAGATCCAAGCTTCGACGACTTGGCTGTTCAGACAACAAGGAGACAAATCCATGAT
CAAAATGAAACGGAAGAAGATGAGAATGTTCAACTTGACCGGAGACTATCTTGGCCTCCT
TCGGTTAAGAAGAGTGGTGTTTAGAACATATCCAACAAGAACTTCATTTTAAAGGTGACT
GACCCAGTGACCCTCAAAATTAGAGTTTGAGGGTGGGTTACTCCAACAAGTATCCTCAAA
TTTATCTTTAAAGTTTTATGTAATTTGCATTCCATTCCTCAACTCTAATATAAGTTAACT
ACC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 3

CO CL4028Contig1 481 3 1 U
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ATCTGAACACTTAGTGTATCAAACAATGTTTTTCTTTTCTCCACCACCAAAGAAAACAAA
AACAGAGTTCGGTCTCGGAATCACGACCCCTCCAGCCTCGACAAATAATGCAGGAGGTGA
AAATCATTTTATAGTTACTTCTGTTATGAGACCTCAAATGTCCAATCACAACCTTCTTAG
AAGTTTGTGCTCTCCTCTTTTAACAAACCACCCGCTTTTTCATTGATCTTCATCTTCTTC
CTTACTTCTAGCTTTCTTTGACTTCTTACCATCAGTCTTGTCTTTAACAACCAGAACCAC
AACCTACTCCGCTTCAACAGCTGATGTTTTTTTTAAAACAATCACTCTGCATAGATGAAT
CTTTAAAAATTCCTGATGAGCATTATTTTAGATAAAACATTAATTCAAGCTCTTGGTTCA
C


BQ
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10 

AF RR4G003JQ U 163
AF RR4FF62TF C 1
AF RR4FF62JQ U 1
BS 1 481 RR4FF62JQ

RD RR4G003JQ 317 0 0
AAATAATGCAGGAGGTGAAAATCATTTTATAGTTACTTCTGTTATGAGACCTCAAATGTC
CAATCACAACCTTCTTAGAAGTTTGTGCTCTCCTCTTTTAACCAACCACCCGCTTTTTCA
TTGATCTTCATCTTCTTCCTTACTTATAGCTTTCTTTGACTTCTTACCATCACTCTTGTC
TTTAACAACCAGAACCACAACCTACTCCGCTTCAACAGCTGATGTTTTTTTTAAAACAAT
CACTCTGCATAGATGAATCTTTAAAAATTCCTGATGAGCATTATTTTAGATAAAACAATA
ATTCAAGCTCTTGGTTC

QA 1 317 1 317
DS 

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ATCTGAACACTTAGTGTATCAAACAATGTTTTTCTTTTCTCCACCACCAAAGAAAACAAA
AACAGAGTTCGGTCTCGGAATCACGACCCCTCCAGCCTCGACAAATAATGCAGGAGGTGA
AAATCATTTTATAGTTACTTCTGTTATGAGACCTCAAATGTCCAATCACAACCTTCTTAG
AAGTTTGTGCTCTCCTCTTTTAACAAACCACCCGCTTTTTCATTGATCTTCATCTTCTTC
CTTACTTCTAGCTTTCTTTGACTTCTTACCATCAGTCTTGTCTTTAACAACCAGAACCAC
AACCTACTCCGCTTCAACAGCTGATGTTTTTTTTAAAACAATCACTCTGCATAGATGAAT
CTTTAAAAATTCCTGATGAGCATTATTTTAGATAAAACATTAATTCAAGCTCTTGGTTC
AC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4FF62JQ 481 0 0
GAAATTACTTTGTTTTAGAAATTTGATACTAAAATTTACTTTATGTAAGGAGAGTCTAGA
ATCTGAACACTTAGTGTATCAAACAATGTTTTTCTTTTCTCCACCACCAAAGAAAACAAA
AACAGAGTTCGGTCTCGGAATCACGACCCCTCCAGCCTCGACAAATAATGCAGGAGGTGA
AAATCATTTTATAGTTACTTCTGTTATGAGACCTCAAATGTCCAATCACAACCTTCTTAG
AAGTTTGTGCTCTCCTCTTTTAACAAACCACCCGCTTTTTCATTGATCTTCATCTTCTTC
CTTACTTCTAGCTTTCTTTGACTTCTTACCATCAGTCTTGTCTTTAACAACCAGAACCAC
AACCTACTCCGCTTCAACAGCTGATGTTTTTTTTAAAACAATCACTCTGCATAGATGAAT
CTTTAAAAATTCCTGATGAGCATTATTTTAGATAAAACATTAATTCAAGCTCTTGGTTCA
C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 3

CO CL4029Contig1 960 3 10 U
GGAAGTCAAGAGTCGAAAAGACTTTCGATTTCAGCTGCTTTTTTTTCCGTCTCCTAGCTG
CCTAAAGAGAGAGAGAACCCTTCTTTCTTTTCTCTCTCCTCTCTGCTCAAATCGAAATTA
GGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGGTTCATAAAGTGCGTCACCGT
CGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCCTACACAAGCAACACTTTCCC
TACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAATGTGATTGTTGATGGGAA
CACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACTATAATAGACTAAGACC
ATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAG
CTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATTACGCTCCTGGTGTTCC
CATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTACTTTGTTGAGCA
CCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAGCTTGTTGGAGC
TTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAAAGGCTGTCTTTGATGC
TGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGAGAAAGTCTCA
GAAAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAGAAGAAACACACAGTTATAAAGTCATAA
CTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTTTTCTTATTTCCATGAAACAGGAA
TCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAAACTCATTGGTCTTTGTTTGAGG
TTGTATTCTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATATGATGATACCACGTTTGCTTTCGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4FT63TF U 1
AF RR4FT63JQ C 244
AF RR4DG18TF U 367
BS 1 683 RR4FT63TF
BS 684 747 RR4DG18TF
BS 748 748 RR4FT63JQ
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BS 750 750 RR4FT63JQ
BS 751 773 RR4DG18TF
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BS 776 776 RR4FT63JQ
BS 777 960 RR4DG18TF

RD RR4FT63TF 697 0 0
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CCTAAAGAGAGAGAGAACCCTTCTTTCTTTTCTCTCTCCTCTCTGCTCAAATCGAAATTA
GGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGGTTCATAAAGTGCGTCACCGT
CGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCCTACACAAGCAACACTTTCCC
TACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAATGTGATTGTTGATGGGAA
CACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACTATAATAGACTAAGACC
ATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAG
CTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATTACGCTCCTGGTGTTCC
CATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTACTTTGTTGAGCA
CCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAGCTTGTTGGAGC
TTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAAAGGCTGTCTTTGATGC
TGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGC
ACCTAAAACAGAGA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4FT63JQ 714 0 0
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CATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACTATAATAGACTAAGACCATT
GAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTA
TGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATTACGCTCCTGGTGTTCCCAT
CATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTACTTTGTTGAGCACCC
TGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAGCTTGTTGGAGCTTC
TGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAAAGGCTGTCTTTGATGCTGC
TATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGAGAAAGTCTCAGAA
AGGCTGTTCTATTTTGTGATTCCAGAGAAGAAGAAA*ACACAGTTATAATGTCATAACTA
ATC*TTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTTTTCTTATTTCCATGAAACAGGAATCT
GTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAAACTCATTGGTCTTTGTTTGAGGTTG
TATTCTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATATGATGATACCACGTTTGCTTT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DG18TF 594 0 0
G
TATCGTGTTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAA
AATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATTACGCTCCTGGTGTTCCCATCATC
CTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTACTTTGTTGAGCACCCTGGA
GCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCT
TATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAGCAGATTGTAAAAGCTGTCTTTGATGCGGCTATT
AAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGC
TGTTCTATATTGTGATTCCATATAAGAAGAAACACACAGTTATAAATTTATAACTAATCC
TTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTTTTCTTATTTCCATGAAACAGGAATCTGTTG
TTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAAACTCATTGGTCTTTGTTTGAGGTTGTATT
CTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATATGATGATACCACGTTTGCTTTCGG

QA 2 594 2 594
DS 



AS 1 3

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CTCACCATAGGTCTTATAATCGAAGCCCAAACTGGGAAGGGTATCTTAGCTCAGTTGGTT
GGTTATTGGTCTGCGTTTCTGCATCTATTCACTCCATCAACATAGCATCTCCCAACAGTA
CACACAATCAAACCTGAGCCACTTGGTTTACTCTATTTTCTACTGATGTTTGTTCATGTA
AGTTTCTTTTACATTTTATACTCCTCGGCTATGTCTATGTGCAGATCCTAAGAAGAGTAC
ATGAATTATATACGTAAATGAAGTGAAACAATGTTGCAGATATGTTTGGTCATATCTTAT
CTGTGAAGTATAAAAA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES53TF U 1
AF RR4ES53JQ C 1
AF RR4H651TF U 195
BS 1 503 RR4ES53TF
BS 504 616 RR4H651TF

RD RR4ES53TF 503 0 0
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GTAGACCCTCTTGAGGCCAAGAAATTAGCAGCGAAGCAAATGGAAGTGATCAAAGGCAGA
GAGAGGCAACAGAGAAGGCGTGAAATAGAGGCTATTAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGA
CTCACCATAGGTCTTATAATCGAAGCCCAAACTGGGAAGGGTATCTTAGCTCAGTTGGTT
GGTTATTGGTCTGCGTTTCTGCATCTATTCACTCCATCAACATAGCATCTCCCAACAGTA
CACACAATCAAACCTGAGCCACTTGGTTTACTCTATTTTCTACTGATGTTTGTTCATGTA
AGTTTCTTTTACATTTTATACTC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4ES53JQ 584 0 0
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AAAGGGACTAAGAAGACACCAAGATGCAACAAGAGGCAGGGTGGAGCAGTTCGAGTCCTA
GCAAATCCAAATGCATCTCCTTCTCCAGGAAAAGTAAAGCCAAAAAAGGAGGTGATCATG
GTAGACCCTCTTGAGGCCAAGAAATTAGCAGCGAAGCAAATGGAAGTGATCAAAGGCAGA
GAGAGGCAACAGAGAAGGCGTGAAATAGAGGCTATTAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGA
CTCACCATAGGTCTTATAATCGAAGCCCAAACTGGGAAGGGTATTTTAGCTCAGTTGGTT
GGTTATTGGTTTGCGTTTTTGCATCTATTCACTCCATCAACATAGCATCTCCCAACAGTA
CACACAATCAAACCTGAGCCACTTGGTTTACTCTATTTTTTACTGATGTTTGTTCATGTA
AGTTTCTTTTACATTTTATACTCCTCGGCTATGTCTATGTGCAGATCCTAAGAAGAGTAC
ATGAATTATATACGTAAATGAAGTGAAACAATGTTGCAGATATG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4H651TF 422 0 0
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AAGGCGTGAAATAGAGGCTATTAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGACTCACCATAGGTCT
TATAATCGAAGCCCAAACTGGGAAGGGTATCTTAGCTCAGTTGGTTGGTTATTGGTCTGC
GCTTCTGCATCTATTCACTCCATCAACATAGCATCTCCCAACAGTACACACAATCAAACC
TGAACCACTTGGTTTACTCTATTTTCTACTGATGTTTGTTCATGTAAGTTTCTTTTACAT
TTTATACTCCTCGGCTATGTCTATGTGCAGATCCTAAGAAGAGTACATGAATTATATACG
TAAATGAAGTGAAACAATGTTGCAGATATGTTTGGTCATATCTTATCTGTGAAGTATAAA
AA

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 3

CO CL4031Contig1 1891 3 17 U
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TCGTCTCTGTCTTGCAGCTGATGTTCCTCTTGTAGAAAGCGGGACAACAGGCTTCCTAGG
ACAGGTAACTGTGCATGTAAAGGGAAAGACAGAATGCTATGAGTGCCAAACCAAACCTAC
TCCTAAGACATATCCTGTCTGTACAATAACCAGCACTCCAACTAAGTTTGTGCACTGTAT
CGTGTGGGCGAAAGACCTGCTCTTTGCGAAATTGTTTGGCGACAAGAATCAGGATAATGA
TCTTAACGTGCGTGCCAAAAAGGAGGCTAGCTCATCCAAAGAAACAGAAGATGTATTCGA
GCGTGCAGAAGATGAAGATATTGAACAGTATGGTAGAAAGATATATGATCACGTGTTTGG
CTATAACATTGAAGCGGCTTTGTCCAATGAGGAAACACAGAAAAATCGTACAAGGCCAAG
GCCTATATACAGTAAGGAAGTCTTGCCTGAAAGTCGGACTCAGAAAAATGGAAGCACTCA
GAATTGTTCTGCTACTGATGTTGATGATTCGACGGTCTCTGCCATGCCGTTGCTTGGCCT
GAAGAATCCACAGGAGTTGTGGGGTCTAACACAGAATTCTCTAGTGTTCATAGAAGCATT
GAAGTTGTTCTTCGCAAAGAGAAAGAAGGAGATAGGACACCTTACTTTTGACAAAGATGA
TCAGTTAGCTGTAGAATTCGTCACTGCTGCTGCAAATATCCGTGCGGAGTCTTTTGGAAT
ACCTTTGCACAGTCTTTTTGAAGCCAAAGGAATCGCTGGGAACATTGTTCATGCCGTTGC
TACGACTAACGCCATTGTTGCTGGTTTGATTGTTATTGAAGCAATCAAAGTGCTGAAAAA
GGATGAGGACAAATACAGAATGACATATTGCTTAGAACATCCAAGCAGAAAGCTGCTTCT
TATGCCAGTGGAGCCATTTGAACCTAATCCTTCTTGCTATGTCTGCTCCAAGACCCCTTT
AGTACTTGAGATCAATACTCAGAAATCGAAACTAAGGGATCTAGTTGATACGATTGTCAA
AGCCAAGCTTGGAATGAACCTACCATTGATTATGCACGGGGCATCACTTCTTTACGAAGT
TGGTGATGATCTTGATGATATAATGGTTGCAAACTACAATGCTAATCTCGAGAAGTTTTT
ATCAGAACTTCCTTCTCCCGTTATCAATGGAAGCACCCTCACTGTGGAAGATCTTCAACA
AGAGCTATCTTGCAAGATTAATGTCAAGCACAGGGAAGAATTTGATGAGGAGAAAGAACC
TGAAGGAATGGTTCTCTCTGGATGGACACAATCTCCACCTACCAACGGTGAGAGCGCGTC
AACATCAAAGAATGAGAGCGATGTTGATGTCACAGAGAGTTCCTCAGGACCGGAGATTGC
TTCTAAGAAGAGAAGACTCTCCGAGACACAGCCCAAGAATCATAAGAGAGAAACAGAGAA
CGTTGAGGGTGAAGATGATGATTATCTCATGGAGATCGAAGATGATGATCTCACGGAGAT
TGAAAATCCCATGACCGTGAGCAAGAAGAAAAGAGTTGCGTAGACTTTTTTCTGAAAGCA
TCTCTGAATCCTTGCTCTTTTCATATATTTTCTTTCTAACTCTATGAGGTTGTGTCACGA
GAACTACAAGTATGAACTAGGGTTTCTTTCATGCTGGAAGAAACTACTCGGATTGTTAAA
TATTTTGTTTAGGACAGGACAGGATCCTCTCTGCAGGGAGATCAGCAACTCGGAGAGTGT
AACATTTTCACCTTTTTCTGTTTTACTAACTGTAAAAGCTCTCTTGTATTCTCTAATCCT
TGTCACCAAAATGATGTACTTTTTCATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B229TF U 1
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TACGACT

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DS 

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G
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TCTGCTACTGATGTTGATGATTCGACGGTCTCTGCCATGCCGTTGCTTGGCCTGAAGAAT
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CTTGGAATGAACCTACCATTGATTATGCTCGGGGCATCACTTCTTTACGAAGTTGGTGAT
GATCTTGATGATATAATGGTTGCAAACTACAATGCTAATCTCGAGAAGTTTTTATCAGAA
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GATCT

QA 2 822 2 822
DS 

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TGGTTGCAAACTACAATGCTAATCTCGAGAAGTTTTTATCAGAACTTCCTTCTCCCGTTA
TCAATGGAAGCACCCTCACTGTGGAAGATCTTCAACAAGAGCTATCTTGCAAGATTAATG
TCAAGCACAGGGAAGAATTTGATGAGGAGAAAGAACCTGAAGGAATGGTTCTCTCTGGAT
GGACACAATCTCCACCTACCAACGGTGAGAGCGCGTCAACATCAAAGAATGAGAGCGATG
TTGATGTCACAGAGAGTTCCTCAGGACCGGAGATTGCTTCTAAGAAGAGAAGACTCTCCG
AGACACAGCCCAAGAATCATAAGAGAGAAACAGAGAACGTTGAGGGTGAAGATGATGATT
ATCTCATGGAGATCGAAGATGATGATCTCACGGAGATTGAAAATCCCATGACCGTGAGCA
AGAAGAAAAGAGTTGCGTAGACTTTTTTCTGAAAGCATCTCTGAATCCTTGCTCTTTTCA
TATATTTTCTTTCTAACTCTATGAGGTTGTGTCACGAGAACTACAAGTATGAACTAGGGT
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TACTAACTGTAAAAGCTCTCTTGTATTCTCTAATCCTTGTCACCAAAATGATGTACTTTT
TCATTTGG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 3

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AGACTGAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAG
ACAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCG
GAAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGG
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TTTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCCCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTAC
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TAACGACAAGAATCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGT
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CTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTGGAATAAAACTGTTATGCTTCAATAAATACTTGT
GTGTTTGATTGATGATCACTCAACATCTTCTTCACATAACCAGTTTTTTTTTAAAATTAA
CAAATACTATAGTTAAGCAGTTTAGAATGAGCCAAAAATATTTACCTTACATGTATATGT
ATATATAGAAATATGGTGTGTATTTTATAATTTTTAGCTTTTCTTCTTTTTGTTTTTATT
AATTTTAAATAAAAATGCAAAAAGGGAGAAGATATTCTCGTGGATGATTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ51TF U 1
AF RR4F884TF U 95
AF RR4DQ51JQ C 392
BS 1 205 RR4DQ51TF
BS 206 206 RR4F884TF
BS 207 350 RR4DQ51TF
BS 351 355 RR4F884TF
BS 356 737 RR4DQ51TF
BS 738 761 RR4F884TF
BS 762 762 RR4DQ51JQ
BS 763 821 RR4F884TF
BS 822 1070 RR4DQ51JQ

RD RR4DQ51TF 742 0 0
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AGACTGAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAG
ACAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCG
GAAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCCACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGG
CATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGT
TTTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCCCTTGCTTTGCCTGAAGATG*****ATTAC
TGCAATAGATATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGG
TGTTGATCACAAGATCAATTTCATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGT
TAACGACAAGAATCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGT
GAACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAA
CACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGA
ATCAAGAGCGTCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCCTTGGATCCTCGAGTGGAAAT
CTCTCAGATCTCTGTCG
AGATG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4F884TF 727 0 0
GGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGACAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGA
GAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGGAAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATC
GAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGCATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATCATAAAC
GCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTTTTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCCCTT
GCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTG
GGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATCTATTGCGAT
GGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTT
GCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAG
GTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAA
GAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGAATCAAGAGCGGTTGTTATAGAATTTAATAAGAAA
TTGGCTTTGGATCCTCGAGTGGAAATCTCTCAGATCTCTGTCGGAGATGGTCTCACTCTA
TGCAGACTCCTTGTGTGAGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTGGAATAAA
ACTGTTA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4DQ51JQ 679 0 0
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TTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTG
AAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAA
GAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGAATCAAGAGCGTCTGTTATAGAATTTAATAAG
AAATTGGCCTTGGATCCTCGAGTGGAAATCTCTCAGATCTCTGTCGGAGATGGTCTCACT
CTATGCAGACGCCTTGTGTGAGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTGGAAT
AAAACTGTTATGCTTCAATAAATACTTGTGTGTTTGATTGATGATCACTCAACATCTTCT
TCACATAACCAGTTTTTTTTTAAAATTAACAAATACTATAGTTAAGCAGTTTAGAATGAG
CCAAAAATATTTACCTTACATGTATATGTATATATAGAAATATGGTGTGTATTTTATAAT
TTTTAGCTTTTCTTCTTTTTGTTTTTATTAATTTTAAATAAAAATGCAAAAAGGGAGAAG
ATATTCTCGTGGATGATTC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

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GGGGGAGACATGTTGGGAATCGGTGGTGTACTGGCGGGAGAAGAAATGAAGAAACAGCTA
TGGCTTCTCTCTCTCTCTCTTATGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTCTCTGTTG
ATTATGATTTATTTGTTATTGGTGAATGAGGCAAAAGAAGATGATGTTTGTTGGTGAAGA
GGAACCTTGTGGCTGAGCGCCAATCCATTTCTCTCTCTCCCGGATCTCTGGTGATTGTTA
ACCATTACGACCTGCTCTGAATCCGGATAAAGCGAATCACTTTGACCTGAGGACGATGAG
ACATGGTTAAGAGAATCACGTCGTGGAAGCGTGACGTTTGGACTTCTCTCCACAGTCACA
GTGCAGTGGTGGTACTTGCAGTCACGGGGTGGAGGTCGCGGTCGTTACCGTCGCCGTCAC
CTTCATTGGAAGTCCAAGTGAAGAGGCGGCGGAGAAGATGCAAGGAAGATAGTTTATTTT
GTTTATTTTAGGATTAGTTTTTTTCTTTAATTTTGTTTGTTTTTGTAATTTTTTCTTTAA
TTTTGTTTATTTTTGTAAACCAATTTAATTTGTAAACTTGTTTAGTCTGTAAACCAAATC
TAATTTATAAAACAAAAATTTTATTGGTAAATTTTTTTTGTAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EE49TF U 1
AF RR4EE49JQ C 24
AF RR4AU19TF U 80
BS 1 615 RR4EE49TF
BS 616 617 RR4AU19TF
BS 618 646 RR4EE49JQ

RD RR4EE49TF 615 0 0
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TGGCTTCTCTCTCTCTCTCTTATGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTCTCTGTTG
ATTATGATTTATTTGTTATTGGTGAATGAGGCAAAAGAAGATGATGTTTGTTGGTGAAGA
GGAACCTTGTGGCTGAGCGCCAATCCATTTCTCTCTCTCCCGGATCTCTGGTGATTGTTA
ACCATTACGACCTGCTCTGAATCCGGATAAAGCGAATCACTTTGACCTGAGGACGATGAG
ACATGGTTAAGAGAATCACGTCGTGGAAGCGTGACGTTTGGACTTCTCTCCACAGTCACA
GTGCAGTGGTGGTACTTGCAGTCACGGGGTGGAGGTCGCGGTCGTTACCGTCGCCGTCAC
CTTCATTGGAAGTCCAAGTGAAGAGGCGGCGGAGAAGATGCAAGGAAGATAGTTTATTTT
GTTTATTTTAGGATTAGTTTTTTTCTTTAATTTTGTTTGTTTTTGTAATTTTTTCTTTAA
TTTTGTTTATTTTTGTAAACCAATTTAATTTGTAAACTTGTTTAGTCTGTAAACCAAATC
TAATTTATAAAACAA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4EE49JQ 623 0 0
TGGTGTACTGGCGGGAGAAGAAATGAAGAAACAGCTATGGCTTCTCTCTCTCTCTCTTAT
GGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTCTCTGTTGATTATGATTTATTTGTTATTGGT
GAATGAGGCAAAAGAAGATGATGTTTGTTGGTGAAGAGGAACCTTGTGGCTGAGCGCCAA
TCCATTTCTCTCTCTCCCGGATCTCTGGTGATTGTTAACCATTACGACCTGCTCTGAATC
CGGATAAAGCGAATCACTTTGACCTGAGGACGATGAGACATGGTTAAGAGAATCACGTCG
TGGAAGCGTGACGTTTGGACTTCTCTCCACAGTCACAGTGCAGTGGTGGTACTTGCAGTC
ACGGGGTGGAGGTCGCGGTCGTTACCGTCGCCGTCACCTTCATTGGAAGTCCAAGTGAAG
AGGCGGCGGAGAAGATGCAAGGAAGATAGTTTATTTTGTTTATTTTAGGATTAGTTTTTT
TCTTTAATTTTGTTTGTTTTTGTAATTTTTTCTTTAATTTTGTTTATTTTTGTAAACCAA
TTTAATTTGTAAACTTGTTTAGTCTGTAAACCAAATCTAATTTATAAAACAAAAATTTTA
TTGGTAAATTTTTTTTGTAAGCT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4AU19TF 546 0 0
TTATGGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTCTCTGTTGATTATGATTTATTTGTTAT
TGGTGAATGAGGCAAAAGAAGATGATGTTTGTTGGTGAAGAGGAACCTTGTGGCTGAGCG
CCAATCCATTTCCCTCTCTCCCGGATCTCTGGTGATTGTTAACCATTACGACCTGCTCTG
AATCCGGATAAAGCGAATCACTTTGACCTGAGGACGATGAGACATGGTTAAGAGAATCAC
GTCGTGGAAGCGTGACGTTTGGACTTCTCTCCACAGTCACAGTGCAGTGGTGGTACTTGC
AGTCACGGGGTGGAGGTCGCGGTCGTTACCGTCGCCGTCACCTTCATTGGAAGTCCAAGT
GAAGAGGCGGCGGAGAAGATGCAAGGAAGATAGTTTATTCTGTTTATTTTAGGATTAGTT
TTTTTCTTTAATTTTGTTTGTTTTTGTAATTTTTTCTTTAATTTTGTTTATTTTTGTAAA
CCAATTTAATTTGTAAACTTGTTTAGTCTGTAAACCAAATCTAATTTATAAAACAAAA
TTTTATTG

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 3

CO CL4034Contig1 1348 3 13 U
TTTTTCTCTCACTAGCCTTCGTCTCATCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTAAACCATCTCCGT
ACGCAGGCTCTCTCATCTCTTCCTCTCTACCTTTCCCTAAAACATTTTCAGTTCACACAC
ACACACACACGGAAGCGTTTGACACTTAAAAATGGAAACTTTGAGTCGTTTCTTAGTGTT
CATATCTCTGTTCTCCGGTTTAGTTTCTGGTTTTACTCTGCAGAATCTTCCAATCACATC
CTTTGAAGAGAGTTACACGCAACTTTTTGGTGACAAGAACTTGTTTGTTCATAAAGACGG
CAAATCCGTCCGGTTAACGCTCGATGAAAGGACCGGTTCTGGGTTCGTCTCAAATGATCT
TTATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAACTACCTTCTGATTATTCAGCAGGAGT
AGTTGTTGCTTTTTATATGTCAAATGGAGATACGTATGAGAAAAATCATGATGAGATTGA
TTTTGAGTTTCTTGGTAACATTAGAGGAAGAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTATGG
TAATGGAAGCACTCATTTGGGAAGAGAAGAAAGATGTAATCTTTGGTTTGATCCTACTGA
AGATTATCATCAATACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTACGTAGACAA
TGTTCCTATCAGAGAGGTGAAGCGAACATCATCAATGGGCGGTGACTTCCCGTCGAAGCC
CATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGAAAGTA
CGGTGTAAACTACAAATATGCGCCTTACATCGCACGGTTCTCTGACCTAGTCCTGCATGG
CTGCCCTGTGGACCCAATGTCGCAGTTTCCGAAGTGCGACGAAGGAGCCACCGAGTATAT
CCGTGCGGCGCAGGAGATTAACCCGTCACAGAGGGCTAAAATGGAGGTTTTCAGGCGCAA
ACACATGACTTATTCGTATTGCTGTGATCGGACCAGGTACAAGGTTTATTTGCCGGAGTG
CGTTGTGAATCCGGGAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTTATGATCCAGTCACGTTGGGTGG
TACTCCGAGGCGCCGCCGCAGCGGAAAGCACAGGAGCAAGAGAAGCCGTATGGATGGAAC
AGAGACGATATGATTGATTGTGCATTGTCATTAAATTATGGTGTTGGTTTGGATGGGGGA
GGGGTTTCTAAAATAAGTCTTTTTATTGGTATACTTTTGTTACAATGCATTTTTGTTATT
CACAGTTAGAGAGAGAAAGAGGGGGGGGGGGGAGTTTTGTTCATTTGTTGCTTGTATATG
AAATAAAGTGATTTATTTATTTATTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CW38TF U 1
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ACACACACACGGAAGCGTTTGACACTTAAAAATGGAAACTTTGAGTCGTTTCTTAGTGTT
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TTATTTACATGGATTATTCAGTGCTTTAATCAAACTACCTTCTGATTATTCAGCAGGAGT
AGTTGTTGCTTTTTATATGTCAAATGGAGATACGTATGAGAAAAATCATGATGAGATTGA
TTTTGAGTTTCTTGGTAACATTAGAGGAAGAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTATGG
TAATGGAAGCACTCATTTGGGAAGAGAAGAAAGATGTAATCTTTGGTTTGATCCTACTGA
AGATTATCATCAATACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTCTACGTAGACAA
TGTTCCTATCAGAGAG*TGAAGCGA*CATCATCAATGGGCGGAGACTTCCCGTCGAAGCC
CATGTCTCTCTACACA*CAATATGGGACGGT
CTAATG

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DS 

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G
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TCAAACTACCTTCTGATTATTCAGCAGGAGTAGTTGTTGCTTTTTATATGTCAAATGGAG
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GAGAATGGAGGATTCAGACAAATATTTATGGTAATGGAAGCACTCATTTGGGAAGAGAAG
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CTGATTCTCACATCATATTCTACGTAGACAATGTTCCTATCAGAGAGGTGAAGCGAACAT
CATCAATGGGCGGTGACTTCCCGTCGAAGCCCATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACG
GTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGAAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCGCCTTACA
TCGCACGGTTCTCTGACCTAGTCCTGCATGGCTGCCCTGTGGACCCAATGTCGCAGTTTC
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AGAGGGCTAAAATGGAGGTTTT

QA 2 623 2 623
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GCCCATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGAAA
GTACGGTGTAAACTACAAATATGCGCCTTACATCGCACGGTTCTCTGACCTAGTCCTGCA
TGGCTGCCCTGTGGACCCAATGTCGCAGTTTCCGAAGTGCGACGAAGGAGCCACCGAGTA
TATCCGTGCGGCGCAGGAGATTAACCCGTCACAGAGGGCTAAAATGGAGGTTTTCAGGCG
CAAACACATGACTTATTCGTATTGCTGTGATCGGACCAGGTACAAGGTTTATTTGCCGGA
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TGGTACTCCGAGGCGCCGCCGCAGCGGAAAGCACAGGAGCAAGAGAAGCCGTATGGATGG
AACAGAGACGATATGATTGATTGTGCATTGTCATTAAATTATGGTGTTGGTTTGGATGGG
GGAGGGGTTTCTAAAATAAGTCTTTTTATTGGTATACTTTTGTTACAATGCATTTTTGTT
ATTCACAGTTAGAGAGAGAAAGAGGGGGGGGGGGGAGTTTTGTTCATTTGTTGCTTGTAT
ATGAAATAAAGTGATTTATTTATTTATTGGG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 3

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GTACGGAAACAGAAACATAGTTTTCATATAATATAACTAAATAAACTTAACAACATCAAA
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CCGTACTTGCCGTTTCTATTCTTCAGTATCCCAAGCAATGTGATTAGAATACGCGCTCCA
CTGCAGCCTAGAGGATGTCCTAAGGAGACGGCTCCTCCATTTACATTCACCTTCTCCGGA
CTAATCCCAAGTAGCTTTTGATTTGCAAGTGCTACAACTGCAAATGCTTCATTGATCTCA
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GCAAGTACTTGAAGTCCTAGCTGAAGCGCCTTCTCTCCACTCACTAGGACAATAGCAGCT
GCACCATCACTTATGCTAGAGGCATTTCCAGCTGTAACTGTGCCTCCATTCTCCTTGAAA
CTCGGACGGAGTTTCCTCAGTTTTGCAGCATCAAACTTCCCAAGACCTTCATCCTTGTCA
ACAATGGTTGATGGCCTACCCCTTCCTCCAGAAACTTCAACCGGGACGATCTCCCATGTG
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TGCTGCTCCCTGGTTATCTCAAACTTCTCAGCGCATAACTCTGCACAGCTTCCCATCCCA
CAGTCGTTATAGACATCCCACAGTCCATCCTTAAGCATCCCATCTACC


BQ
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AF RR4FI23JQ U 1
AF RR4DE73JQ U 14
AF RR4FI23TF C 332
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BS 561 589 RR4DE73JQ
BS 590 1008 RR4FI23TF

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GTAGAATGATAGTAGATACGCTCTATATAGTTCAACAACCTGGGATTCATATAAATGCAT
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DS 

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AACATAGTTTTCATATAATATAACTAAATAAACTTAACAACATCAAAGATCATCATCACT
CATTTATTGAGAGAGACCAACCAATATCAAACTTGAAGTGCAAGTTGGTAGAATGATAGT
AGATACGCTCTATATAGTTCAACAACCTGGGATTCATATAAATGCATCAAACGACTTCAA
GAACAAGAGCAGAAGCACCTCCTCCTCCGTTGCACACTCCTCCCACACCGTACTTGCCGT
TTCTCTTCTTCAGTATCCCAAGCAATGTGATTAGAATACGCGCTCCACTGCAGCCTAGAG
GATGTCCTAAGGAGACGGCTCCTCCATTTACATTCACCTTCTCCGGACTAATCCCAAGTA
GCTTTTGATTTGCAAGTGCTACAACTGCAAATGCTTCATTGATCTCATAGTAATCAACTT
GAGAAGATTCCAAACCAGCATGTGCAATAGCTTTTGGTATTGCAAGAGCAGGAGCAGTAG
TGAAAAACTCTGGCTCCTGAGCTGCATCACCATAAC

QA 1 576 1 576
DS 

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CTCCTCCATTTACATTCACCTTCTCCGGACTAATCCCAAGTAGCTTT*GATTTGCAAGTG
CTACAACTGCAAATGCTTCATTGATCTCATAGTAATCAACTTGGGAAGATTCCAAACCAG
CATGTGCAATAGCTTTTGGTATTGCAAGAGCAGGAGCAGTAGTGAAAAACTCTGGCTCCT
GAGCTGCATCACCATAACCTTTAACTTTTGCAAGTACTTGAAGTCCTAGCTGAAGCGCCT
TCTCTCCACTCACTAGGACAATAGCAGCTGCACCATCACTTATGCTAGAGGCATTTCCAG
CTGTAACTGTGCCTCCATTCTCCTTGAAACTCGGACGGAGTTTCCTCAGTTTTGCAGCAT
CAAACTTCCCAAGACCTTCATCCTTGTCAACAATGGTTGATGGCCTACCCCTTCCTCCAG
AAACTTCAACCGGGACGATCTCCCATGTGAAGGCGCCAGCTTCCTGAGCAGCAATACCAC
GCTCAAAGCTCTGAACAGCGTAATCATCTTGCTGCTCCCTGGTTATCTCAAACTTCTCAG
CGCATAACTCTGCACAGCTTCCCATCCCACAGTCGTTATAGACATCCCACAGTCCATCCT
TAAGCATCCCATCTACC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

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GCCCCGGCCTCTCCATCCCTTTCCCTCAACAATCTTCCAAAACGATGATGCAGGCAACGA
TGATGCAGGCAACGATGGGACAAAAACAAGGCGTTGAATCTAGAGGAGATATCATCACAA
CGGGGCCGTCGCCGTTTGATTTCTTGCCGGAGGATTGCATCTCCAAAATAATCTCCTTCA
CAAGTCCGCGTGACGCGTGCGTCGCCGCTTCGGTTTCTAAAACCTTTGAATCTGCGGTTA
AGTCAGATACCGTGTGGGAGAAGTTTCTTCCGCCGGAATATTCCTCTTTGATCCCACGAT
CGAGAGCTTTCTCGTCCAAGAAGGAGCTCTATCTCACCCTTTGCGATGATCCTGTTCTTA
TCGAAGATGGTAAAAAGAGCTTCTGGTTAGAGAAATCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGT
TATCTTCCAAAGAAGTGTGGATCACATGGGGAAGTAGTCCACAATATTGGCGATGGATTT
CAATTCCTGAATCTAGGTTTGAGAAAATAGCAGAGCTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGA
TTCGTGCGGGGATGCATACTCGTTACCTATCTCCAGGAACTCGTTATTCGGTTTACATTG
TGTTCAAGACAGAGGACGGATGTCCTGGG*TTGGGTGATATCCCGGTAGAAGCTGGAGTT
GGGTTGGTTGGACAAGAATCTTCTCAAAAGTTGATATACTTTGTTGGGCCTAGTGGTCGA
AGGAGAGAGAGAGAAAGGAGAGATGTGACGAGACCAAAAGAGAGGGAAGATGGGTGGATG
GAAGCCGAGCTTGGTGAGTTGTACAATGGATCATGCTGTGATGATATCTCGGTTAGTGTT
GTTGAGATTAAATCTCCTTATTGGAAACGTGGTTTGATAATTCAAGGATTTGAATTCCGC
CCCTCGAAAACTCAGTAACACTAGCTATATGCAGTTTCTGGTTTATGGTTGTTTGCTTCA
GTTCCATGTCTAAGCAAAGTGAAAGGATTTGTTGTATTGTAATGTTTTCGAAATTTCAAG
TCCTTTTGGATTGAATGTTTGCATGGTTTGATTTTGATCACATGAATAAGTCGATAAAAA
AATTGTGTGTTAAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH75TF U 1
AF RR4AI59TF U 1
AF RR4AI59JQ C 362
BS 1 779 RR4AH75TF
BS 780 782 RR4AI59TF
BS 783 783 RR4AI59JQ
BS 784 818 RR4AI59TF
BS 819 1155 RR4AI59JQ

RD RR4AH75TF 779 0 0
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QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4AI59TF 833 0 0
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GCCCCGGCCTCTCCATCCCTTTCCCTCAACAATCTTCCAAAACGATGATGCAGGCAACGA
TGATGCAGGCAACGATGGGACAAAAACAAGGCGTTGAATCTAGAGGAGATATCATCACAA
CGGGGCCGTCGCCGTTTGATTTCTTGCCGGAGGATTGCATCTCCAAAATAATCTCCTTCA
CAAGTCCGCGTGACGCGTGCGTCGCCGCTTCGGTTTCTAAAACCTTTGAATCTGCGGTTA
AGTCAGATACCGTGTGGGAGAAGTTTCTTCCGCCGGAATATTCCTCTTTGATCCCACGAT
CGAGAGCTTTCTCGTCCAAGAAGGAGCTCTATCTCACCCTTTGCGATGATCCTGTTCTTA
TCGAAGATGGTAAAAAGAGCTTCTGGTTAGAGAAATCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGT
TATCTTCCAAAGAAGTGTGGATCACATGGGGAAGTAGTCCACAATATTGGCGATGGATTT
CAATTCCTGAATCTAGGTTTGAGAAAATAGCAGAGCTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGA
TTCGTGCGGGGATGCATACTCGTTACCTATCTCCAGGAACTCGTTATTCGGTTTACATTG
TGTTCAAGACAGAGGACGGATGTCCTGGGGTTGGGTGATATCCCGGTAGAAGCTGGAGTT
GGGTTGGTTGGACAAGAATCTTCTCAAAAGTTGATATACTTTGTTGGGCCTAGTGGTCGA
AG*AGAGAGAGAGAAAGGAGAGATGTGACGAGACCAAA
GAGAGGGAGATGGGT

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DS 

RD RR4AI59JQ 794 0 0
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CGAAGATGGTAAAAAGAGCTTCTGGTTAGAGAAATCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGTT
ATCTTCCAAAGAAGTGTGGATCACATGGGGAAGTAGTCCACAATATTGGCGATGGATTTC
AATTCCTGAATCTAGGTTTGAGAAAATAGCAGAGCTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGAT
TCGTGCGGGGATGCATACTCGTTACCTATCTCCAGGAACTCGTTATTCGGTTTACATTGT
GTTCAAGACAGAGGACGGATGTCCTGGG*TTGGGTGATATCCCGGTAGAAGCTGGAGTTG
GGTTGGTTGGACAAGAATCTTCTCAAAAGTTGATATACTTTGTTGGGCCTAGTGGTCGAA
GGAGAGAGAGAGAAAGGAGAGATGTGACGAGACCAAAAGAGAGGGAAGATGGGTGGATGG
AAGCCGAGCTTGGTGAGTTGTACAATGGATCATGCTGTGATGATATCTCGGTTAGTGTTG
TTGAGATTAAATCTCCTTATTGGAAACGTGGTTTGATAATTCAAGGATTTGAATTCCGCC
CCTCGAAAACTCAGTAACACTAGCTATATGCAGTTTCTGGTTTATGGTTGTTTGCTTCAG
TTCCATGTCTAAGCAAAGTGAAAGGATTTGTTGTATTGTAATGTTTTCGAAATTTCAAGT
CCTTTTGGATTGAATGTTTGCATGGTTTGATTTTGATCACATGAATAAGTCGATAAAAAA
ATTGTGTGTTAAAG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL4037Contig1 590 2 4 U
GGTTTTCAAGCCGTTAGGTAACAGTACCGGACGGGTCTCTCTATGTGACCGCCAAAGCTC
CTCCATTTGCAACTTCTTGTACTCTAATTGCAGGGCCATTAGTTTAATAAACCTCCAAGA
ATCAACGTGTTGCGTCTACGTACCTCTAGATCTCGGACCATCGTTTGAAATGGACCTACA
GAAACCCCGGTGCTCGTCCTACTCCGGTTTATACAATCTTGGTCCGGCCCAAGAATCTCA
CCCGGAAAATTGGAACTATGGAATCGCACTCAAGTACAAGTTCAACGTCTTCAATGAGTA
CCCTGCTGTGTGTGGTGGCTGCGAGCGTAGTAACGGTGCATGTGGATACAACACTCAGAC
TAGCTCGTTCGTTTGTAATTGTCCCGGTGGGATCAATACGACGTCAGATTGCTTCTTCCT
TTATAACTCGGCTTCTATTCTTCTTCCTTGGTTTTCAAGAGCATGGATGATCTACCCTTT
GTCATGGGTTGTTTTTTTGGACAGTGATCAGTCTTCCTTGAAGGAGTTTTAATGGTTCAT
AGAGAAAGTTTAATGAATGGAATCTTTGCTTCTTTCTACATTCTTTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FV71TF U 1
AF RR4FV71JQ C 182
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QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4FV71JQ 409 0 0
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CCTGCTGTGTGTGGTGGCTGCGAGCGTAGTAACGGTGCATGTGGATACAACACTCAGACT
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TCATGGGTTGTTTTTTTGGACAGTGATCAGTCTTCCTTGAAGGAGTTTTAATGGTTCATA
GAGAAAGTTTAATGAATGGAATCTTTGCTTCTTTCTACATTCTTTGTAA

QA 1 409 1 409
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TACACGAAATTGTGTTTCTAGCCCTTTGTGAGCGTGTAATGCTTGCTTAATGGACTCAAA
TATGGGCCTGATAATCGCAATTAGGGGAATTATACTGCATGCTGGTTTTGA


BQ
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AF RR4H370TF U 1
AF RR4H370JQ C 18
BS 1 617 RR4H370TF
BS 618 771 RR4H370JQ

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TCTATTTCGTGCTTGTTTTTGATGCATCAGAGAATGAGCTTGCTATGCTTGATCTCATCC
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TCAACTACAGCAAGATGCACACAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTTCTTG
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CAAACGCTATCTCACTTGTCCCCAAGTCTGTTTCCGGGTGGCGAGGCCGATAGCTTCGAA
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AAATTACTCTCATCACA
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DS 

RD RR4H370JQ 754 0 0
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TTTGATGCATCAGAGAATGAGCTTGCTATGCTTGATTTCATCCAAGTTCTTGTTGAAACA
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CACACAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTTCTTGAAACTAGTTCCACGGAA
TTCATGAAGGCTGTTGAGGATATATCAAAGTTGGAAGCTGCTTCAAACGCTATCTCACTT
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CAAAGAACAAGTCATATTCCAAAACATGTTTTTTCATGCTTTGAAATTACTCTCATCACA
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CTAGCCCTTTGTGAGCGTGTAATGCTTGCTTAATGGACTCAAATATGGGCCTGATAATCG
CAATTAGGGGAATTATACTGCATGCTGGTTTTGA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 3

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TATTACATTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGT
AGCTTTAAGCTTGGCAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAG
AAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAAC
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ATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTT
CTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGC
TTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTC
TAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAA
TAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTTTCTTCACTTTGT
GTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCTCTTCATTGGCATTATTATTATC
TTATATAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ49TF U 1
AF RR4FC39TF U 1
AF RR4FC39JQ C 133
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BS 55 193 RR4AZ49TF
BS 194 194 RR4FC39TF
BS 195 518 RR4AZ49TF
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RD RR4AZ49TF 627 0 0
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TATTACATTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGT
AGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAG
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ATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTT
CTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGC
TTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGCGCTTCTTCATTCTGAATCCTC
TAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAA
TAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4FC39TF 732 0 0
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CAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTCTCTTAGCTTTCAGTTTGATTTGATCTTCTTATATTCT
TATTACATTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGT
AGCTTTAAGCTTGGCAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAG
AAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAAC
ATTGACAAGAAAAAATACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTG
ATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTT
CTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGC
TTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTC
TAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAA
TAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTT*CTTCACTTTGT
GTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCTCTTCATTGGCATTATTATTATC
TTATATAAAAAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4FC39JQ 595 0 0
CTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGTAGCTTTAAGCTT
GGCAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAAGTACCCTGAT
AGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAGAAA
AAATACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGGAAGAGG
ATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCCTACT
GGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTACATT
ACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGAGAAA
CGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATCGTTC
TCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTTTCTTCACTTTGTGTTCAATAATGT
AAAGTAAGACTAATATGAAATATTCTCTTCATTGGCATTATTATTATCTTATAT
T

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL4041Contig1 1203 2 2 U
GGAACACGTGTCACATTTTCCTTCCCTCCTCTCTCTCTCCCGTACTTCCCGGAGACGACG
CCGGAGAAACTCTGCTTCGACTTCACGTGGCCGCTCCACGAAGACGCTTATCTCTCTCTA
TCTCTCTAGAAAAGTTCCTCTGCCTTCGTCACCACCAATCGAAGGAAGGTGTAATTTGGT
AATGGTGGAGAGCGATTTACGGGGGGAAAGAGAAAAGAGTTAAGCACCTTCTTCGTTGGA
CCCCCCTGACTCTTGTTCCTTTTCTGCAGGTTTTGAAGAATTGTAGAGAGATTGATTTTT
GTTGGATATTCTGTTGCAATGTCTGGCGTTGGCGAGAATCAGCTTATCTCCATTGTACCT
GATGAACTCAAATTTCTTTTTGAACTTGAGAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTGCC
AATAAAACTGAGAACTATGTTGCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTT
GTAAGACCCAATACTGGTGTCATTCAGCCTTGGGACTCCTGCATTATTAGAGTTACCCTA
CAAGCGCAACGGGAGTATCCTCCAGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCCTCCTTCAAAGC
ACCATCGTACCCCCACACACTGATGTTGATGAACTTCCACAAGACACTTTCACTAAGGAT
AGTGGGAAAACGTTAACAGAGTGTAAGCTTAAGGTCTCGTATATCTCACCCTCTACAACC
CAAAGATCCTCTGAGTCTGGAGCAACCAATGGCGATGGAAATGGCTCTGATACCATCTCT
ACTATACAGCGGCTGAAGGAAGAGCGAGATGCAGCCGTTAAGCAAACACAACAGTTGCAA
CATGAACTGGAGATGGTGAAGAGACGGAGAAACCAGAGTAACAGCGGGCTATCCTTGAAG
TTGGCAGCTTTGGTTGGACTAATCGGACTCATCATCGGTTTCATCCTAAAACTCACCTTA
GCTTCTCCCAAATAACAACTATCAGCAGCTTCCCCGCATCATCTACAATCTCAACGTATG
TAACCGCAGGAATCAAAACGGCGTTACACATTTTGGGGTATTATACTCTGTTTTCTCTCT
TTATCTTTCTCTGTGATGATCTCTTCTTTGTTTTTTTTTCCTATCAAATTTGCTTATTTT
TCAGTTATATTGGACGTACATTTTTTGACTCAACAGACCCTTCCTGATACTAATTTTATC
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4B207TF U 1
AF RR4B207JQ C 382
BS 1 653 RR4B207TF
BS 654 1203 RR4B207JQ

RD RR4B207TF 653 0 0
GGAACACGTGTCACATTTTCCTTCCCTCCTCTCTCTCTCCCGTACTTCCCGGAGACGACG
CCGGAGAAACTCTGCTTCGACTTCACGTGGCCGCTCCACGAAGACGCTTATCTCTCTCTA
TCTCTCTAGAAAAGTTCCTCTGCCTTCGTCACCACCAATCGAAGGAAGGTGTAATTTGGT
AATGGTGGAGAGCGATTTACGGGGGGAAAGAGAAAAGAGTTAAGCACCTTCTTCGTTGGA
CCCCCCTGACTCTTGTTCCTTTTCTGCAGGTTTTGAAGAATTGTAGAGAGATTGATTTTT
GTTGGATATTCTGTTGCAATGTCTGGCGTTGGCGAGAATCAGCTTATCTCCATTGTACCT
GATGAACTCAAATTTCTTTTTGAACTTGAGAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTGCC
AATAAAACTGAGAACTATGTTGCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTT
GTAAGACCCAATACTGGTGTCATTCAGCCTTGGGACTCCTGCATTATTAGAGTTACCCTA
CAAGCGCAACGGGAGTATCCTCCAGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCCTCCTTCAAAGC
ACCATCGTACCCCCACACACTGATGTTGATGAACTTCCACAAGACACTTTCAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4B207JQ 822 0 0
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GCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGACCCAATACTGGTGTC
ATTCAGCCTTGGGACTCCTGCATTATTAGAGTTACCCTACAAGCGCAACGGGAGTATCCT
CCAGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCCTCCTTCAAAGCACCATCGTACCCCCACACACT
GATGTTGATGAACTTCCACAAGACACTTTCACTAAGGATAGTGGGAAAACGTTAACAGAG
TGTAAGCTTAAGGTCTCGTATATCTCACCCTCTACAACCCAAAGATCCTCTGAGTCTGGA
GCAACCAATGGCGATGGAAATGGCTCTGATACCATCTCTACTATACAGCGGCTGAAGGAA
GAGCGAGATGCAGCCGTTAAGCAAACACAACAGTTGCAACATGAACTGGAGATGGTGAAG
AGACGGAGAAACCAGAGTAACAGCGGGCTATCCTTGAAGTTGGCAGCTTTGGTTGGACTA
ATCGGACTCATCATCGGTTTCATCCTAAAACTCACCTTAGCTTCTCCCAAATAACAACTA
TCAGCAGCTTCCCCGCATCATCTACAATCTCAACGTATGTAACCGCAGGAATCAAAACGG
CGTTACACATTTTGGGGTATTATACTCTGTTTTCTCTCTTTATCTTTCTCTGTGATGATC
TCTTCTTTGTTTTTTTTTCCTATCAAATTTGCTTATTTTTCAGTTATATTGGACGTACAT
TTTTTGACTCAACAGACCCTTCCTGATACTAATTTTATCCCC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 3

CO CL4042Contig1 874 3 6 U
CACAATTGTCGTTGTTTCATATTATCCGCAAGATCTATCGAATCCTATCGTTTTGGTGAT
TTTCTTCGGTAAATCTCGTCGAACTGGAGAGTTATCTGAATCCCAAAGCTCAATTTCACT
TCCACAAGCATCAGAGCAACTATGGGACAGTGGCCAGTGGTTGAAAGAAGGCCACAGTCT
TTGACAAATACCCCTTTGAGCGGTTTCAGTTCACGCTCATCCTCTCAAGGGTCTGGCCTG
AAGAGCCAGAGCTTCATGGACATGCTAAGATCAGCGAAAGGAACTTCACAGGATGATGAT
TTTGATGATGAAGAAGATTTTGTCATGAAGAAAGAAAGCTCTTCCACTAGCCAGATCCAT
AGAGATTTGAGGGTAAAAGCAGAGGCTAGAGGCGGTGGTAACGATCAAAAGCTGAACACG
CCTAGGTCTAAACATTCTGCTACAGAACAAAGGAGGAGGAGCAAGATCAATGATAGATTT
CAAATGTTGAGACAACTAATACCTAACAGCGACCAAAAGCGGGACAAGGCCTCCTTCTTG
CTCGAGGTTATCGAGTATATTCAATTCTTACAGGAGAAAACAAGTAAGTACGAGACTCCT
TACCAAGGATGGAATCACGATCCTGCGAAGCTATTGAATTGGCAAAGAAACGATGACGAC
GCCAAGCAATGTCGAAAACCAAAACGGCTCAAGACGAACAACACAAGTTAAAAAAAAGCA
TCACAGTCGGGTATAATAACCCCAAAGTTGAAACGTCTGTTTTCATTCTTCTTTATCTCA
AAACAGGGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATAGATATATTCAATCTTAAATTTTTCTTACTT
TGTACATTGGAAACTATAATTTTTATAATGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EX45TF U 1
AF RR4A824JQ C 273
AF RR4A824TF U 273
BS 1 573 RR4EX45TF
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BS 596 874 RR4A824TF

RD RR4EX45TF 595 0 0
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TTTCTTCGGTAAATCTCGTCGAACTGGAGAGTTATCTGAATCCCAAAGCTCAATTTCACT
TCCACAAGCATCAGAGCAACTATGGGACAGTGGCCAGTGGTTGAAAGAAGGCCACAGTCT
TTGACAAATACCCCTTTGAGCGGTTTCAGTTCACGCTCATCCTCTCAAGGGTCTGGCCTG
AAGAGCCAGAGCTTCATGGACATGCTAAGATCAGCGAAAGGAACTTCACAGGATGATGAT
TTTGATGATGAAGAAGATTTTGTCATGAAGAAAGAAAGCTCTTCCACTAGCCAGATCCAT
AGAGATTTGAGGGTAAAAGCAGAGGCTAGAGGCGGTGGTAACGATCAAAAGCTGAACACG
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CAAATGTTGAGACAACTAATACCTAACAGCGACCAAAAGCGGGACAAGGCCTCCTTCTTG
CTCGAGGTTATCGAGTATATTCAATTCTTACAG*AGAAAACAAGCAAGTACGAGA

QA 1 595 1 595
DS 

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G
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CGTCTGTTTTCATTCTTCTTTATCTCAAAACAGGGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATAGAT
ATATTCAATCTTAAATTTTTCTTACTTTGTACATTGGAAACTATAATTTTTATAATGTTT
T

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR4A824TF 602 0 0
G
GCGAAAGGAACTTCACAGGATGATGATTTTGATGATGAAGAAGATTTTGTCATGAAGAAA
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CAAAAGCGGGACAAGGCCTCCTTCTTGCTCGAGGTTATCGAGTATATTCAATTCTTACAG
GAGAAAACAAGTAAGTACGAGACTCCTTACCAAGGATGGAATCACGATCCTGCGAAGCTA
TTGAATTGGCAAAGAAACGATGACGACGCCAAGCAATGTCGAAAACCAAAACGGCTCAAG
ACGAACAACACAAGTTAAAAAAAAGCATCACAGTCGGGTATAATAACCCCAAAGTTGAAA
CGTCTGTTTTCATTCTTCTTTATCTCAAAACAGGGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATAGAT
ATATTCAATCTTAAATTTTTCTTACTTTGTACATTGGAAACTATAATTTTTATAATGTTT
T

QA 2 602 2 602
DS 



AS 1 3

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GCTTTCATGTTAAATCAAAAATAGATAACACAAATTAATCATACTTGAAACAGAACCTTG
TTCATGGCATTGCGCTGGTAAAGCTTAATGTGGATGCGGAAAGAACAAAAGCAAACCTCT
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CAAATCATACATTCCTTATTTTCCTTCAAAAACAAACCAAAAAGGATTGCATGTCCTAGA
GACGGGTCGACCTCTC


BQ
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AF RR4A268JQ U 1
AF RR4A268JQD U 1
AF RR4A268TFB C 1
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TTCATGGCATTGCGCTGGTAAAGCTTAATGTGGATGCGGAAAGAACAAAAGCAAACCTCT
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AATTCATGTTACAAATCCTTCAGTCTCGATGCCCTTCTGCCTCGATGCCATTGAATTTGA
GCAACTGCGTCATGAGACGCTCGTCAGTCTTGTCAGATTCCACCACAGCTTTCATCCATC
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GACGGGTCGACCTCTC

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DS 

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TTCATGGCATTGCGCTGGTAAAGCTTAATGTGGATGCGGAAAGAACAAAAGCAAACCTCT
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GACGGGTCGACCTCTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4A268TFB 496 0 0
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GCTTTCATGTTAAATCAAAAATAGATAACACAAATTAATCATACTTGAAACAGAACCTTG
TTCATGGCATTGCGCTGGTAAAGCTTAATGTGGATGCGGAAAGAACAAAAGCAAACCTCT
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AATTCATGTTACAAATCCTTCAGTCTCGATGCCCTTCTGCCTCGATGCCATTGAATTTGA
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GACGGGTCGACCTCTC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 3

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GCATCGATGGCGGCTACAATGTGATTCGGAGTGATGGTGTTTGCAAAACTGAGCAGAGGA
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GGAGACGGTTGTAGTGTGGTGTCCCTAGGGTCTGAAGCGGAGGCCTCTACCGATGTCTCA
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ATATGGTCACGAGGAGGCGGAACCGTGTCGTCTGTGAGTAGATGAGATTGAGAAAGAGAA
GTGGGATCGGAAGAAGGAGATGGAGGGGGAGGGACGTTGTTGATCTGACCAGTGATAAAG
GCCAGACGATCGGATCCTCTTTCTAAGATCTTCCACCTCCTTGCTTCTCTAGTGTTCGAC
GCCATTGCCGGTTCC


BQ
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AF RR4FP92JQ U 1
AF RR4FO16JQ U 16
AF RR4FP92TF C 248
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BS 447 718 RR4FO16JQ
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GAAACAATAACTTAAGCAAAGATGCTTTGTGTGAACAAAAGACCACATATGAAAATCACA
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TCCAGCGCGTTGCCCACTTGGTCCGCTATGCCTTGTCCCGAGTTTTCTCGTCTTGAGCCT
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AAGAAAAGCAAGAAAACGGGTCTGAAGCTTACTATGCTGCCTAAGGAAGCGAAGCCGAAA
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DS 

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C
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AGCAATGTGTTATACTATAAGTGTATACTGATCACTACTTGGGAGAAACAATAACTTAAG
CAAAGATGCTTTGTGTGAACAAAAGACCACATATGAGAATCACAGCGTATAAGCTAAAAT
CCATAGAGATGGCGTTCATTATCTTCTTAATCATCATGACTGTCTCCAGCGCGTTGCCCA
CTTGGTCCGCTATGCCTTGTCCCGAGTTTTCTCGTCTTGAGCCTGAGGAAGGAGCTCCAC
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CGGGTCTGAAGCTTACTATGCTGCCTAAGGAAGCGAAGCCGAGATGAGAGAGTATGACAA
GGAGTGCGATCACGAGAGATGAGAACATCCGTGCGCATTCTGAGGCATCGATGGCGGCTA
CAATGTGATTCGGAGTGATGGTGTTTGCAAAACTGAGCAGAGGAGTAAATGCTTGAGAAG
CACCCAAATCTACCACTGATGGGGTTTGAGTGGTTGATGTTGCCGGAGACGGTTGTAGTG
TGGTGTCCCTAGGGTCTGAAGCGGAGGCCTCTACCGATGTCTCAGTATACTTCCGAGGCT
GAAGCGGTTCTGCTCTACTGGTATGATCCACATTATCAACCA

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DS 

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GCG
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CTCCACGATGGCTCAGCAGAACACGTCCGAGCACGATTGTGGCGTCGGTCAAGAGAAGCA
AGAAAACGGGTCTGAAGCTTACTATGCTGCCTAAGGAAGCGAAGCCGAGATGAGAGAGTA
TGACAAGGAGTGCGATCACGAGAGATGAGAACATCCGTGCGCATTCTGAGGCATCGATGG
CGGCTACAATGTGATTCGGAGTGATGGTGTTTGCAAAACTGAGCAGAGGAGTAAATGCTT
GAGAAGCACCCAAATCTACCACTGATGGGGTTTGAGTGGTTGATGTTGCCGGAGACGGTT
GTAGTGTGGTGTCCCTAGGGTCTGAAGCGGAGGCCTCTACCGATGTCTCAGTATACTTCC
GAGGCTGAAGCGGTTCTGCTCTACTGGTATGATCCACATTATCAACCATCGAAGCATCGG
ATATGTTTTCTTGATGACTTGTGAAAGCTGTTTCTCGATCAGTAGTACGTATATGGTCAC
GAGGAGGCGGAACCGTGTCGTCTGTGAGTAGATGAGATTGAGAAAGAGAAGTGGGATCGG
AAGAAGGAGATGGAGGGGGAGGGACGTTGTTGATCTGACCAGTGATAAAGGCCAGACGAT
CGGATCCTCTTTCTAAGATCTTCCACCTCCTTGCTTCTCTAGTGTTCGACGCCATTGCCG
GTTCC

QA 4 728 4 728
DS 



AS 1 3

CO CL4045Contig1 1695 3 5 U
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ACGATGTAAACGTTAAGAATCGTGGAAAACAATCAATTCCTTTCTCAATAAGAAGATCTC
GAACTGGCTTCTCTGATTCTTTCTCTTCTCATGATGAAGAACAAATAGCAACATTCTGCA
CCAACAAATCAGAATCAGACGATGATCTACTAAGTATAGAATCTGAAACATTATCATCTT
CCGTGTTGAGCACGTCAGACACATCATCATCAGAAGCTAATCATCATCCCCACAATCGCC
GTCATCATCACTCGCATGTAGGTCCTACCAACGGTCACTGGAGAGGTTTCCACCGTTTAC
TCAAGAAAGGATCATCAGCTATGCCATTCAATACATTCTCACATCTCAAAGGAGTCCCTA
AACTAACCAGACGCAAGAGCAAACGCATAAAAGACAACATGGTCCCTGCTCTACCTGCTG
CTGCTCTTGACACTGATGACTTGTTCCTTTTCAAACCTTCCTGGAAAAATTATTCCCTCC
AAGATATTCAAACCGCGACAAATGGCTATAGCCCTGAGAATCTGATCGGAGAAGGAGGAT
ATGCAGAGGTCTACAAGGGAGAGATGGCAGATGGGCAGATAGTAGCAATAAAGAAACTGA
CTAGAGGGTCTGCGGAAGAGATGACGATGGATTATTTGTCAGAACTAGGGATCATAGTTC
ATGTAGATCATCCAAACATTGCTAAGCTTATTGGATATTGTGTTGAAGGAGGAATGCATC
TTGTTCTTGAGCTTTCTCCTAATGGAAGCCTCGCTTCTTTGCTCTATGAGGCGAAAGATA
AACTGAGTTGGAGCATAAGATACAAAGTGGCGATGGGAACAGCTGAGGGACTGTACTATC
TCCCATGAAAGTTGTCAGAGAAGGATCATTCATAAAGACATCAAAGCATCTAACATCCTT
CTCACTGAGAACTTTGAGGCTCAGATATCTGATTTTGGGCTGGCGAAATGGCTACCAGAC
CAATGGACTCACCATACTGTATCCAAAGTCGAAGGAACATTCGGTTACCTTCCGCCAGAG
TTCTTCATGCACGGGATTGTAGACGAGAAAACAGATGTGTACGCTTTTGGTGTACTGCTT
CTTGAGCTCATTACTGGTAAACAAGCCATCGACAGCTCACAACACAGCGTTGTCATGTGG
GCCAAGCCATTGATCAAAGAGAACAAGATCAAACAACTTGTTGATCCGATTTTGGGAGAT
GACTACGACTTAGAAGAGTTGGACCGTCTTGTCTCCATAGCGTCCTTGTGTATACACCAA
ACTTCCATGAACCGACCTCACATGAGTCAGGTTGTGGAGATTCTGAAGGGAGACAAGTGC
AGCTTAGATAAGTTAAGAGAAGGAGAAAACTCAAAACTGCAGAGAACATACTCGGAAGAA
CTATTGGATAACGAAGAATACAACTCAACAAAATATTTAAACGATATTAATCGACACATG
GAGACTCTTCTCGGAACGTCAAACGACTCTTGAAACATCTTACTGGTTAAGTTTATAGAG
GATGATTCACTTATTGCATATGTATTTGATCGTGATCATGGTGTTGTGTTCTTCCATATT
TGACTTATTGTTTGTTAAATGTTATCCTATTGTTCTGTATGTTTATTACTAAAATATATA
ATATTAAATTCAAAC


BQ
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AF RR4G537TF U 1
AF RR4B384TF U 218
AF RR4B384JQ C 818
BS 1 612 RR4G537TF
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RD RR4G537TF 612 0 0
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GAACTGGCTTCTCTGATTCTTTCTCTTCTCATGATGAAGAACAAATAGCAACATTCTGCA
CCAACAAATCAGAATCAGACGATGATCTACTAAGTATAGAATCTGAAACATTATCATCTT
CCGTGTTGAGCACGTCAGACACATCATCATCAGAAGCTAATCATCATCCCCACAATCGCC
GTCATCATCACTCGCATGTAGGTCCTACCAACGGTCACTGGAGAGGTTTCCACCGTTTAC
TCAAGAAAGGATCATCAGCTATGCCATTCAATACATTCTCACATCTCAAAGGAGTCCCTA
AACTAACCAGACGCAAGAGCAAACGCATAAAAGACAACATGGTCCCTGCTCTACCTGCTG
CTGCTCTTGACACTGATGACTTGTTCCTTTTCAAACCTTCCTGGAAAAATTATTCCCTCC
AAGATATTCAAACCGCGACAAATGGCTATAGCCCTGAGAATCTGATCGGAGAAGGAGGAT
ATGCAGAGGTCT

QA 1 612 1 612
DS 

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G
GAATCTGAAACATTATCATCTTCCGTGTTGAGCACGTCAGACACATCATCATCAGAAGCT
AATCATCATCCCCACAATCGCCGTCATCATCGCTCGCATGTAGGTCCTACCAACGGTCAC
TGGAGAGGTTTCCACCGTTTACTCAAGAAAGGATCATCAGCTATGCCATTCAATACATTC
TCACATCTCAAAGGAGTCCCTAAACTAACCAGACGCAAGAGCAAACGCATAAAAGACAAC
ATGGTCCCTGCTCTACCTGCTGCTGCTCTTGACACTGATGACTTGTTCCTTTTCAAACCT
TCCTGGAAAAATTATTCCCTCCAAGATATTCAAACCGCGACAAATGGCTATAGCCCTGAG
AATCTGATCGGAGAAGGAGGATATGCAGAGGTCTACAAGGGAGAGATGGCAGATGGGCAG
ATAGTAGCAATAAAGAAACTGACTAGAGGGTCTGCGGAAGAGATGACGATGGATTATTTG
TCAGAACTAGGGATCATAGTTCATGTAGATCATCCAAACATTGCTAAGCTTATTGGATAT
TGTGTTGAAGGAGGAATGCATCTTGTTCTTGAGCTTTCTCCTAATGGAAGCCTCGCTTCT
TTGCTCTATGAGGCGAAAGATAAACTGAGTTGGAGCATAAGATACAAAGTGGCGATGGGA
ACAGCTGAGGGACTGTACTATCTCC*ATGAAAGTTGTCAGAGAAGGATCATTCATAAAGA
CATCAAAGCATCTAACATCCTTCTCACTGAGAACTT

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR4B384JQ 878 0 0
TTTGCTCTATGAGGCGAAAGATAAACTGAGTTGGAGCATAAGATACAAAGTGGCGATGGG
AACAGCTGAGGGACTGTACTATCTCCCATGAAGGTTGTCAGAGAAGGATCATTCATAAAG
ACATCAAAGCATCTAACATCCTTCTCACTGAGAACTTTGAGGCTCAGATATCTGATTTTG
GGCTGGCGAAATGGCTACCAGACCAATGGACTCACCATACTGTATCCAAAGTCGAAGGAA
CATTCGGTTACCTTCCGCCAGAGTTCTTCATGCACGGGATTGTAGACGAGAAAACAGATG
TGTACGCTTTTGGTGTACTGCTTCTTGAGCTCATTACTGGTAAACAAGCCATCGACAGCT
CACAACACAGCGTTGTCATGTGGGCCAAGCCATTGATCAAAGAGAACAAGATCAAACAAC
TTGTTGATCCGATTTTGGGAGATGACTACGACTTAGAAGAGTTGGACCGTCTTGTCTCCA
TAGCGTCCTTGTGTATACACCAAACTTCCATGAACCGACCTCACATGAGTCAGGTTGTGG
AGATTCTGAAGGGAGACAAGTGCAGCTTAGATAAGTTAAGAGAAGGAGAAAACTCAAAAC
TGCAGAGAACATACTCGGAAGAACTATTGGATAACGAAGAATACAACTCAACAAAATATT
TAAACGATATTAATCGACACATGGAGACTCTTCTCGGAACGTCAAACGACTCTTGAAACA
TCTTACTGGTTAAGTTTATAGAGGATGATTCACTTATTGCATATGTATTTGATCGTGATC
ATGGTGTTGTGTTCTTCCATATTTGACTTATTGTTTGTTAAATGTTATCCTATTGTTCTG
TATGTTTATTACTAAAATATATAATATTAAATTCAAAC

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 3

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GAGGCGGATCCTTATCGGAGGTATACAGCAGCGCTAAAAAGATCCTACTCAGAGCTCGCG
ACGGGATCGAGAGGCTGGAGAGGTTCGAATCCGCTGCTCTTATGGATTCTTCCGATCTCA
CCTCCTCCGTGAAACGCGACATCACCGAGGTGCAATCTCTCTGCGCCACCATGGATGCTC
TATGGCGCTCAATCTCCGTCAAATCCCAACGCGATCTCTGGCGAAGGAAGACTGAACAAG
TTGGGGAAGAGGCTGAGTATTTGAACAAGAGTCTGGAGAAGTACACGTGGAGGAGTCAGA
GGAAGGTGATGGAAGCTAAAGAGAGGGCGGATTTGTTGAACAGAGGGAGCGGAGAAGGAG
CGCACATCTTGCAGATATTCGATGACGAGGCTCAGGCGATGAGCTCTGTCAAGAACTCAA
AGAGATTGCTGGAAGACTCCTTCTCTAGTGGAGTTGCTATCCTCGCCAAATATGCTGAAC
AAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTTCTGAACACGGTAGGGC
TCTCCAACTCTGTGCTCAGGCTTATTGAGAGGCGCAATCGCGTCGACACCTGGATCAAGT
ACGCCGGTATGATCGCTACGATTGTCATATTGTATCTGTTCATAAAATGGACTCGCTGAA
TCTCTTTAAGGATAATTGGAAACGACTTTAGTTACACTGAATTGTATGTAGAGAGTTATG
GGTAAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACTCTTACAAGACTTCTCCCCCGCATCTTA
TATAGTTGTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H581TF U 1
AF RR4H581JQB C 244
AF RR4AJ61TF U 404
BS 1 595 RR4H581TF
BS 596 596 RR4H581JQB
BS 597 643 RR4AJ61TF
BS 644 644 RR4H581JQB
BS 645 663 RR4AJ61TF
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BS 665 686 RR4AJ61TF
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BS 688 773 RR4AJ61TF
BS 774 775 RR4H581JQB
BS 776 854 RR4AJ61TF

RD RR4H581TF 595 0 0
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GAGGCGGATCCTTATCGGAGGTATACAGCAGCGCTAAAAAGATCCTACTCAGAGCTCGCG
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CCTCCTCCGTGAAACGCGACATCACCGAGGTGCAATCTCTCTGCGCCACCATGGATGCTC
TATGGCGCTCAATCTCCGTCAAATCCCAACGCGATCTCTGGCGAAGGAAGACTGAACAAG
TTGGGGAAGAGGCTGAGTATTTGAACAAGAGTCTGGAGAAGTACACGTGGAGGAGTCAGA
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AGAGATTGCTGGAAGACTCCTTCTCTAGTGGAGTTGCTATCCTCGCCAAATATGCTGAAC
AAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTTCTGAACACGGT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4H581JQB 588 0 0
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GGGAAGAGGCTGAGTATTTGAACAAGAGTCTGGAGAAGTACACGTGGAGGAGTCAGAGGA
AGGTGATGGAAGCTAAAGAGAGGGCGGATTTGTTGAACAGAGGGAGCGGAGAAGGAGCGC
ACATCTTGCAGATATTCGATGACGAGGCTCAGGCGATGAGCTCTGTCAAGAACTCAAAGA
GATTGCTGGAAGACTCCTTCTCTAGTGGAGTTGCTATCCTCGCCAAATATGCTGAACAAA
GGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTTCTGAACACGGTAGGGCTCT
CCAACTCTGTGCTCAGGCTTATTGAGAGGCGCAATCGCGTCGACACCTGGATCAAGTACG
CCGGTATGATCGCTACGATTGTCATATTGTATCTGTTCATAAAATGGACTCGCTGAATCT
CTTTAAGGATAATTGGAAACGACTTTAGTTACACTGAATTGTATGTAGAGAGTTATGGGT
AAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACTCTTACAAGACTTCTCCCC

QA 1 588 1 588
DS 

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G
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TCTGTCAAGAACTCAAAGAGATTGCTGGAAGACTCCTTCTCAAGTGGAGTTGCTATACTC
GCCAAGTATGCTGAACAAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTT
CTGAACACGGTGGGGCTCTCCAACTCTGTGCTCAGGCTTATTGAGAGGCGCAATCGCGTT
GACACCTGGATCAAGTACGGCGGTATGATCGCTACGATTGTCGTATTGTATCTGTTCATA
AAATGGACTCGCTGAATCTCTTTAAGGATAATTGGAAACGACTTTAGTTACACTGAATTG
TATGTAGAG**TTATGGGTAAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACTCTTACAAGACT
TCTCCCCCGCATCTTATATAGTTGTTCATC

QA 2 451 2 451
DS 



AS 1 3

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TCCCTAATATGTCTCTGTATGTGTCTTTGACCTTCTGAAACAGCACCTCCCTATCTGGTT
TGAAGATGATGTTCTTGTAAACGAACCACCCAGTGTAACCAATGCCTACAAGTTCAAAAA
CACCTGGAAACAATGGAAGCTTGTCGATTGCCGAGATGAGGCCGGTAGATCCCCAAAGAG
CCACCAAAGCAGCAAATGCGAGTGAACCAATTGCATATTTGTCCTCCACTTTCTCCCACG
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AAGCTTCAACTTCGGTAGCTCTCGTCAGAACGTTCCTAGCGATCTTCCGACAGTAAGCGG
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AGGCTTGTCGAGTAGGAGAAGCTCTAGAATTAATGATAGTCGAAG


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK28JQ U 1
AF RR4AK28TF C 1
AF RR4FO62JQ U 1
BS 1 595 RR4AK28JQ
BS 596 645 RR4FO62JQ

RD RR4AK28JQ 595 0 0
GCATGAAATAGACATCTCATCATTGCAGTCGAGGAATTTACAACACTTTGACATAAAATG
GATGATATTTTGAGCCACAAGAGCACAAAGAAAGAGAGAGAGAGATGCATGTGTTAGATT
CTTCTTTTGATTTTCCTTCATGAATATCTCTCAAACTTCTTCCTTTGATTTAGCTGTTGC
TCCCTAATATGTCTCTGTATGTGTCTTTGACCTTCTGAAACAGCACCTCCCTATCTGGTT
TGAAGATGATGTTCTTGTAAACGAACCACCCAGTGTAACCAATGCCTACAAGTTCAAAAA
CACCTGGAAACAATGGAAGCTTGTCGATTGCCGAGATGAGGCCGGTAGATCCCCAAAGAG
CCACCAAAGCAGCAAATGCGAGTGAACCAATTGCATATTTGTCCTCCACTTTCTCCCACG
CTTCTTGAGCTGTCTTGACTATTTCTGGCAACTCTGTAGTGTCAGCTTCGGCAGTGACCG
AAGCTTCAACTTCGGTAGCTCTCGTCAGAACGTTCCTAGCGATCTTCCGACAGTAAGCGG
TGGACTGAAGCGGCTTAGGAGGAAGCATCGGAAGGGAAATACACGACGGAGAAGA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4AK28TF 600 0 0
GC
ATGAAATAGACATCTCATCATTGCAGTCGAGGAATTTACAACACTTTGACATAAAATGGA
TGATATTTTGAGCCACAAGAGCACAAAGAAAGAGAGAGAGAGATGCATGTGTTAGATTCT
TCTTTTGATTTTCCTTCATGAATATCTCTCAAACTTCTTCCTTTGATTTAGCTGTTGCTC
CCTAATATGTCTCTGTATGTGTCTTTGACCTTCTGAAACAGCACCTCCCTATCTGGTTTG
AAGATGATGTTCTTGTAAACGAACCACCCAGTGTAACCAATGCCTACAAGTTCAAAAACA
CCTGGAAACAATGGAAGCTTGTCGATTGCCGAGATGAGGCCGGTAGATCCCCAAAGAGCC
ACCAAAGCAGCAAATGCGAGTGAACCAATTGCATATTTGTCCTCCACTTTCTCCCACGCT
TCTTGAGCTGTCTTGACTATTTCTGGCAACTCTGTAGTGTCAGCTTCGGCAGTGACCGAA
GCTTCAACTTCGGTAGCTCTCGTCAGAACGTTCCTAGCGATCTTCCGACAGTAAGCGGTG
GACTGAAGCGGCTTAGGAGGAAGCATCGGAAGGGAAATACACGACGGAGAAGA
GAAGC

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR4FO62JQ 645 0 0
GG
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TGATATTTTGAGCCACAAGAGCACAAAGAAAGAGAGAGAGAGATGCATGTGTTAGATTCT
TCTTTTGATTTTCCTACATGAATATCTCTCACACTTCTTCCTTTGATTTAGCTGTTGCTC
CCTAATATGTCTCTGTATGTGTCTTTGACCTTCTGAAACAGCACCTCCCTATCTGGTTTG
AAGATGATGTTCTTGTAAACGAACCACCCAGTGTAACCAATGCCTACAAGTTCAAAAACA
CCTGGAAACAATGGAAGCTTGTCGATTGCCGAGATGAGGCCGGTAGATCCCCAAAGAGCC
ACCAAAGCAGCAAATGCGAGTGAACCAATTGCATATTTGTCCTCCACTTTCTCCCACGCT
TCTTGAGCCGTCTTGACTATCTCTGGCAACTCTGTAGTGTCAGCTTCGGCAGTGACCGAA
GCTTCAACTTCGGTAGCTCTCGTCAGAACGTTCCTAGCGATCTTCCGACAGTAAGCGGTG
GACTGAAGCGGCTTAGGAGGAAGCATCGGAAGGGAAATACACGACGGAGAAGAGAAGGAG
GCTTGTCGAGTAGGAGAAGCTCTAGAATTAATGATAGTCGAAG

QA 3 645 3 645
DS 



AS 1 2

CO CL4048Contig1 1000 2 2 U
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TATCTCTTTGTCTGAAACATAAAATTCATTGCTATTCTTGTCTGAACTGAGTCTCCACTT
CTCAAGACTACAGTCTGACAAATTGTAATAACATCCATGAATCTTTACTTCACCAGTCTT
TACTCTATCTCTTATCCATGGATATGTTATTAAATTCATCACAGAATCCTTTATAGATTC
CTTTTCACAGTTTCTGCATTGTTCATCAAAACTTAAGTGTGAAGAAGCTTCTTGTGTTCT
TAACTTGGCGGCTTTTCCATTCAAGACCCATCTCTCTACCAAACTAGACGGTTGTTCTAG
ATGGTTTTCATGGTTCATAAGCGCTGCGATTCCTCCACAATTGCTATGACCCATTACTAT
AATGTTCTCAACCTGAAGAGTGGTGACTGCAAATTCAAGAGCCGAGTTGGTTTCTGTTGG
CCCGTTCTGAATCGGTGTGATGAGGTTGGCAACATTTCGGATAGTAAAAGCCTCACCAGG
TTGGAATCCTAGTACATAAGAAGGACACACCCTTGAATCTGCACATCCTATCACCATAAC
CTTTGGTGATTGAGCTATGGCCAAAGCTTGAAACTTTTCTATCTGTGGTAAATACTTTTG
TCTCTTGAATCTAAGAAACCTCTGTCTCATCTCACCCAGATAATCATAACTTGTCTCCGT
ATCTCTGTTTTCTTGCATAAGTTCTTCTCTACTTCCTAATTCTTGAACCATATTCGTCCT
CCTGGGTAATAATCTTATTGCTTTTGCTTGACCAAGCTGAAACCGATCCGATCCGGTTTG
TTGAAGTCTTTGAAGACAACCATTGCTATATACTGATGTTGCAGAGACTAAGTGACGAGC
TCTTCCACCTGAACATGGAAACACAACGATGACGTTTAGGAGATTAGTTCAGCTGATAAA
CTTTGATCAGCTTTTGATCATAAGACTCACATAGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G956JQ U 1
AF RR4C931TF C 212
BS 1 673 RR4G956JQ
BS 674 1000 RR4C931TF

RD RR4G956JQ 673 0 0
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CTCAAGACTACAGTCTGACAAATTGTAATAACATCCATGAATCTTTACTTCACCAGTCTT
TACTCTATCTCTTATCCATGGATATGTTATTAAATTCATCACAGAATCCTTTATAGATTC
CTTTTCACAGTTTCTGCATTGTTCATCAAAACTTAAGTGTGAAGAAGCTTCTTGTGTTCT
TAACTTGGCGGCTTTTCCATTCAAGACCCATCTCTCTACCAAACTAGACGGTTGTTCTAG
ATGGTTTTCATGGTTCATAAGCGCTGCGATTCCTCCACAATTGCTATGACCCATTACTAT
AATGTTCTCAACCTGAAGAGTGGTGACTGCAAATTCAAGAGCCGAGTTGGTTTCTGTTGG
CCCGTTCTGAATCGGTGTGATGAGGTTGGCAACATTTCGGATAGTAAAAGCCTCACCAGG
TTGGAATCCTAGTACATAAGAAGGACACACCCTTGAATCTGCACATCCTATCACCATAAC
CTTTGGTGATTGAGCTATGGCCAAAGCTTGAAACTTTTCTATCTGTGGTAAATACTTTTG
TCTCTTGAATCTA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4C931TF 789 0 0
TAAA
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AGTGTGAAGAAGCTTCTTGTGTTCTTAACTTGGCGGCTTTTCCATTCAAGACCCATCTCT
CTACCAAACTAGACGGTTGTTCTAGATGGTTTTCATGGTTCATAAGCGCTGCGATTCCTC
CACAATTGCTATGACCCATTACTATAATGTTCTCAACCTGAAGAGTGGTGACTGCAAATT
CAAGAGCTGAGTTGGTT*CTGTTGGCCCGTTCTGAATCGGTGTGATGAGGTTGGCAACAT
TTCGGATAGTAAAAGCCTCACCAGGTTGGAATCCTAGTACATAAGAAGGACACACCCTTG
AATCTGCACATCCTATCACCATAACCTTTGGTGATTGAGCTATGGCCAAAGCTTGAAACT
TTTCTATCTGTGGTAAATACTTTTGTCTCTTGAATCTAAGAAACCTCTGTCTCATCTCAC
CCAGATAATCATAACTTGTCTCCGTATCTCTGTTTTCTTGCATAAGTTCTTCTCTACTTC
CTAATTCTTGAACCATATTCGTCCTCCTGGGTAATAATCTTATTGCTTTTGCTTGACCAA
GCTGAAACCGATCCGATCCGGTTTGTTGAAGTCTTTGAAGACAACCATTGCTATATACTG
ATGTTGCAGAGACTAAGTGACGAGCTCTTCCACCTGAACATGGAAACACAACGATGACGT
TTAGGAGATTAGTTCAGCTGATAAACTTTGATCAGCTTTTGATCATAAGACTCACATAGT
GTTCC

QA 5 789 5 789
DS 



AS 1 3

CO CL4049Contig1 697 3 7 U
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GTTACATTTTTAAACTATGGAAATTAAAAATGGAAGTCAAGTCCATTGAGTAAGAATCGG
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ATCTTTTGTATCCATTCCATCTGGAAGCTTCCAATCGAAACGGTAAAGAAGATTGATAAG
GGTTAAGTGCACTAAAGCCATACCCATACCTATACCAGGACACATCCTCCTTCCACTACC
AAATGGCAACAACTCAAAGTCTAGACCTTTATAGTTAATCCCATTGTCCATGAACCTCTC
GGGGATGAAAACTTCTGGATCTTTCCAAACGTTTGGATTCCTATGAACAGCCCATACATT
GACATGGATCCATGTCTTCTTTGGAATGTCGTAACCTCCAATCTTTAAATCTTTTGACGC
TTCTCTTGGAATAAGAATTGGCACAAGTGGGTTTATCCTAAGTGTTTCTTTAATCACCAT
TTTAAGATACTCGAGTCGTTCGATATCTTCTTCTGTGATATTGTCTTTGTTTTTTATCAC
TTCTCTCACCTCAGCTTGCACTTTCTTCAGAACTCTTGGATTTGTAATCAAATGCGTCAT
CACCCATGTTATCGTGTGGCCAGAAGTGTCTATTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV43JQ U 92
AF RR4AV43TF C 92
AF RR4DO45JQ U 1
BS 1 171 RR4DO45JQ
BS 172 172 RR4AV43JQ
BS 173 230 RR4DO45JQ
BS 231 231 RR4AV43JQ
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BS 315 315 RR4AV43JQ
BS 316 697 RR4DO45JQ

RD RR4AV43JQ 403 0 0
GGAAGTCAAGTCCATTGAGTAAGAATCGGGATAAGTTGAAGTGGAACTTTCTTAGGACAG
ACGAGTCCATATGATTCTTCGAGATCAACATCTTTTGTATCCATTCCATCTGGAAGCTTC
CAATCGAAACGGTAAAGAAGATTGATAAGGGTTAAGTGCACTAAAGCCATACCCATACCT
ATACCAGGACACATCCTCCTTCCACTACCAAATGGCAACAACTCAAAGTCTAGACCTTTA
TAGTTAATCCCATTGTCCATGAACCTCTCGGGGATGAAAACTTCTGGATCTTTCCAAACG
TTTGGATTCCTATGAACAGCCCATACATTGACATGGATCCATGTCTTCTTTGGAATGTCG
TAACCTCCAATCTTTAAATCTTTTGACGCTTCTCTTGGAAT
CC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR4AV43TF 403 0 0
GGAAGTCAAGTCCATTGAGTAAGAATCGGGATAAGTTGAAGTGGAACTTTCTTAGGACAG
ACGAGTCCATATGATTCTTCGAGATCAACATCTTTTGTATCCATTCCATCTGGAAGCTTC
CAATCGAAACGGTAAAGAAGATTGATAAGGGTTAAGTGCACTAAAGCCATACCCATACCT
ATACCAGGACACATCCTCCTTCCACTACCAAATGGCAACAACTCAAAGTCTAGACCTTTA
TAGTTAATCCCATTGTCCATGAACCTCTCGGGGATGAAAACTTCTGGATCTTTCCAAACG
TTTGGATTCCTATGAACAGCCCATACATTGACATGGATCCATGTCTTCTTTGGAATGTCG
TAACCTCCAATCTTTAAATCTTTTGACGCTTCTCTTGGAAT
CC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR4DO45JQ 697 0 0
CGTCAAACAGTTTCCTTAATGATAACTGATATTGGTAAGACCTTTAAAACACTTCCAACG
GTTACATTTTTAAACTATGGAAATTAAAAATGGAAGTCAAGTCCATTGAGTAAGAATCGG
GATAAGTTGAAGTGGAACTTTCTTAGGACAGACGAGTCCATATGATTCTTCAAGATCAAC
ATCTTTTGTATCCATTCCATCTGGAAGCTTCCAATCGAAACGGTAAAGAAAATTGATAAG
GGTTAAGTGCACTAAAGCCATACCCATACCTATACCAGGACACATCCTCCTTCCACTACC
AAATGGCAACAACTTAAAGTCTAGACCTTTATAGTTAATCCCATTGTCCATGAACCTCTC
GGGGATGAAAACTTCTGGATCTTTCCAAACGTTTGGATTCCTATGAACAGCCCATACATT
GACATGGATCCATGTCTTCTTTGGAATGTCGTAACCTCCAATCTTTAAATCTTTTGACGC
TTCTCTTGGAATAAGAATTGGCACAAGTGGGTTTATCCTAAGTGTTTCTTTAATCACCAT
TTTAAGATACTCGAGTCGTTCGATATCTTCTTCTGTGATATTGTCTTTGTTTTTTATCAC
TTCTCTCACCTCAGCTTGCACTTTCTTCAGAACTCTTGGATTTGTAATCAAATGCGTCAT
CACCCATGTTATCGTGTGGCCAGAAGTGTCTATTCCA

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 3

CO CL4050Contig1 516 3 3 U
GGACCGTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAATGATGAAGTCTTTGATTTGTC
TCTCGCTCATCCTCCTCCCGCTCATAGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGA
AGATTGAAAACTTATCAGATCCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGC
ATAACAAGCAGTCGAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGCAAG
TGGTTAGCGGGAAAAAGTACGATCTGAAGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACAA
AGAACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTT
TCAAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATCTGATGTCTATATAGGTTTCCTTGGT
TTGAGATTTTGACACTATATGTTGTTGTTTTTTGACATTATATGTTGTTGTTTGGTAATA
AAAAGTCTTCTTGATATTAAATAAAAGATCTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP82TF U 1
AF RR4FO25JQ C 63
AF RR4FO25TF U 4
BS 1 399 RR4EP82TF
BS 400 400 RR4FO25TF
BS 401 516 RR4EP82TF

RD RR4EP82TF 516 0 0
GGACCGTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAATGATGAAGTCTTTGATTTGTC
TCTCGCTCATCCTCCTCCCGCTCATAGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGA
AGATTGAAAACTTATCAGATCCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGC
ATAACAAGCAGTCGAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGCAAG
TGGTTAGCGGGAAAAAGTACGATCTGAAGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACAA
AGAACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTT
TCAAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATCTGATATCTATATAGGTTTCCTTGGT
TTGAGATTTTGACACTATATGTTGTTGTTTTTTGACATTATATGTTGTTGTTTGGTAATA
AAAAGTCTTCTTGATATTAAATAAAAGATCTGTTTT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR4FO25JQ 436 0 0
TCGCTCATCCTCCTCCCGCTCATAGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGAAG
ATTGAAAACTTATCAGATCCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGCAT
AACAAGCAGTCGAAAGGGAATTTGGTGTTCGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGCAAGTG
GTTAGCGGGAAAAAGTACGATTTGAAGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACAAAG
AACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTTTC
AAGGCTGTGTAGATTTGATTTGGAATATTGATTTGATGTCTATATAGGTTTCCTTGGTTT
GAGATTTTGACACTATATGTTGTTGTTTTTTGACATTATATGTTGTTGTTTGGTAATAAA
AAGTTTTCTTGATATT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4FO25TF 495 0 0
GG
GTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAAAA*GAAAAATGATGAAGTCTTTGATTTGTCTCTCG
CTCATCCTCCTCCCGCTCATAGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGAAGATT
GAAAACTTATCAGATCCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGCATAAC
AAGCAGTCGAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGCAAGTGGTT
AGCGGGAAAAAGTACGATCTGAAGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACAAAGAAC
TACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTTTCAAG
GCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATCTGATGTCTATATAGGTTTCCTTGGTTTGAG
ATTTTGACACTATATGTTGTTGTTTTTTGACATTATATGTTGTTGTTTGGTAATAAAAAG
TCTTCTTGATATT

QA 3 495 3 495
DS 



AS 1 2

CO CL4051Contig1 925 2 4 U
GGCACTGTCCAGAATGCGTACCTCTGTGGCTGGCGCTCGCTAATCTTGAAGAGAGAGTGA
CTGGGCTGAACAAAGCTCGGGCTATTCTCACACGGCCAGGAAGAAGAATCCTCATGTGGA
TGAGCTATGGCTAGCTGCTATTCGTGTTGAACTCAGGCATGACAACAAGAAAGAGGCAGA
GCACCTGATGTCAAAGGCTCTCCGAGAGTGTCCTCAGAGTGGTATCCTTTGGGCTGCGGA
TGTCGAGATGGCACCACGTCCTCGCCGGAAAACAAAGAGTATGGATGCTATGAAGAAGTG
TGATCGTGACCCGCATGTCACTGCAGCTGTTGCCAAGCTCTTCTGGCAAGACAAGAAGGT
GGAGAAAGCCGGAGCATGGCTTAAACGGGCTGTGACCCTCGCCCCAGATATTGGTGATTT
CTGGGCGCTGTATTACAAATTTGAACTTCAACATGGCAACGAAGAGAGCCAGAAGGAGGT
CCTTGCTAAATGTGTAGCTTGTGAGCCGAAGCATGGTGAGAAGTGGCAAGCTATCTCAAA
AGCGGTGGAGAATGCACACCAGCCTATCGATGTCATCTTGAAGAAAGTCGTGATTGCATT
GAGCAAGGAACAGAAGGCTGCTTGAGCGTTCAACTTTTAGCTGTTCATGTTTTTCTTCAG
TAACGAGAACTAATAATGATTTGATGGAGTGTTTTCACCAGATACTTAGTTCACTGAATC
ATTCAGTCTTCGTTTGGCGTGTGTGTACTAGTCATGAAATCCAACTTCAAAGCTTCTTTA
GACAGTGTAAGCAACTAATAACCCCTGACATAATTTTTATAGTTATTTATCCACGCTATT
AACAAGACTTATTGTGATTAGTAAAATCCTAGGAGAATAATATTAAACCTCTTCCATGTT
TAAATCAAACAACTAGTTTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD50TF U 1
AF RR4GD50JQ C 189
BS 1 632 RR4GD50TF
BS 633 633 RR4GD50JQ
BS 634 677 RR4GD50TF
BS 678 925 RR4GD50JQ

RD RR4GD50TF 677 0 0
GGCACTGTCCAGAATGCGTACCTCTGTGGCTGGCGCTCGCTAATCTTGAAGAGAGAGTGA
CTGGGCTGAACAAAGCTCGGGCTATTCTCACACGGCCAGGAAGAAGAATCCTCATGTGGA
TGAGCTATGGCTAGCTGCTATTCGTGTTGAACTCAGGCATGACAACAAGAAAGAGGCAGA
GCACCTGATGTCAAAGGCTCTCCGAGAGTGTCCTCAGAGTGGTATCCTTTGGGCTGCGGA
TGTCGAGATGGCACCACGTCCTCGCCGGAAAACAAAGAGTATGGATGCTATGAAGAAGTG
TGATCGTGACCCGCATGTCACTGCAGCTGTTGCCAAGCTCTTCTGGCAAGACAAGAAGGT
GGAGAAAGCCGGAGCATGGCTTAAACGGGCTGTGACCCTCGCCCCAGATATTGGTGATTT
CTGGGCGCTGTATTACAAATTTGAACTTCAACATGGCAACGAAGAGAGCCAGAAGGAGGT
CCTTGCTAAATGTGTAGCTTGTGAGCCGAAGCATGGTGAGAAGTGGCAAGCTATCTCAAA
AGCGGTGGAGAATGCACACCAGCCTATCGATGTCATCTTGAAGAAAGTCGTGATTGCATT
GAGCAAGGAACAGAAGGCTGCTTGAGCGTTCA*CTTTTAGCTGTTCATGTTTTTCTTCAG
TAACGAGAACTAATAAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GD50JQ 737 0 0
TGTCAAAGGCTCTCCGAGAGTGTCCTCAGAGTGGTATCCTTTGGGCTGCGGATGTCGAGA
TGGCACCACGTCCTCGCCGGAAAACAAAGAGTATGGATGCTATGAAGAAGTGTGATCGTG
ACCCGCATGTCACTGCAGCTGTTGCCAAGCTCTTCTGGCAAGACAAGAAGGTGGAGAAAG
CCGGAGCATGGCTTAAACGGGCTGTGACCCTCGCCCCAGATATTGGTGATTTCTGGGCGC
TGTATTACAAATTTGAACTTCAACATGGCAACGAAGAGAGCCAGAAGGAGGTCCTTGCTA
AATGTGTAGCTTGTGAGCCGAAGCATGGTGAGAAGTGGCAAGCTATCTCAAAAGCGGTGG
AGAATGCACACCAGCCTATCGATGTCATCTTGAAGAAAGTCGTGATTGCATTGAGCAAGG
AACAGAAGGCTGCTTGAGCGTTCAACTTTTAGCTGTTCATGTTTTTCTTCAGTAACGAGA
ACTAATAATGATTTGATGGAGTGTTTTCACCAGATACTTAGTTCACTGAATCATTCAGTC
TTCGTTTGGCGTGTGTGTACTAGTCATGAAATCCAACTTCAAAGCTTCTTTAGACAGTGT
AAGCAACTAATAACCCCTGACATAATTTTTATAGTTATTTATCCACGCTATTAACAAGAC
TTATTGTGATTAGTAAAATCCTAGGAGAATAATATTAAACCTCTTCCATGTTTAAATCAA
ACAACTAGTTTCTTGCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

CO CL4052Contig1 759 3 19 U
AAATGTTGAACCAGCACATCTTATTGAAAAAGTAGCAGATTTATATAGTTTTCTCTCTAA
CTCGATTCGAGATACACCTGACCATTTTATATGGTTATAGTCCTACACTTATAATTAGAT
GACCCAATGATCAATAATTTTAGTGTACACGTTCTCTACTCATAACTAAGCATAGAACCT
ATAAGCAGAAGAATCCGCGATGATGTTCCTTAGTCTTCCAATTGTTGACGCCAGCATTAT
GAACACCCCTACAATGATGGAGATCCAATTGACCAACCACGTTATGCTGAATCTCTTTGG
TTTCTTTATGATAAGCCACATTATACTTGGGAGAAAGAAAGAAGTGGGTGCAAAGCCAAA
TCCTCCAAAGAACCCTAGAAGGTCTCCAAAGAAGGGGAAACTCACTCCAATGAACAATGT
AAACGCGACATAAATAGTTCTAGTGAAAAACCTCAGAACAACTCCATGCTTAAAACCGAA
CCTAGTAACCATCATCCTCTCCAAAAGGTCAAAGACAGGCATAGCAAACACTTGGTAGCT
ACCAATGACGTGGACAACAACCATGAGATTAGCAGAAGCAATAAGCCAAGCTGGTCTCTG
TAGATTATTCAGCACATTGTCGTCTACGTCTTGACCAAAGGCCCAATAGCAGATCAGAGC
CACAGGGAAATAGCAAATGGCGTTGACAAAGTAAGCTCCCATCACTCCTTGCCACATGGG
CACCTTTGATGGTCTCTCAGGAGTTGAAGGCATCGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FI52JQ U 1
AF RR4GZ17JQ U 26
AF RR4GZ17TF C 26
BS 1 37 RR4FI52JQ
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BS 457 508 RR4FI52JQ
BS 509 653 RR4GZ17JQ
BS 654 759 RR4GZ17TF

RD RR4FI52JQ 508 0 0
AAATGTTGAACCAGCACATCTTATTGAAAAAGTAGCAAATTTATATAGTTTTCTCTCTAA
CTCGATTCGAGATACACCTGACCATTTTATATGGTTATAGTCCTACACTTATAATTAGAT
GACCCAATGATCAATAATTTTAGTGTACACGTTCTCTACTCATAACTAAGCATAAAACCT
ATAAGCAAAAAAATCCGCGATGATGTTCCTTAGTCCTCCAATTGTTGACGCCAGCATTAT
GAACACCCCTACAATGATGGAGATCCAATTGACCAACCACGTTATGCTGAATCTCTTTGG
TTTCTTTATGATAAGCCACATTATACTTGGGAGAAAGAAAGAAGTGGGTGCAAAGCCAAA
TCCTCCAAAGAACCCTAAAAGGTCTC*AAAGAAGGGGAAACTCACTCCAATGAACAATGT
AAACGCGACATAAATAGTTCTAGTGAAAAACCTCAAAACAACTCCATGCTTAAAACCGAA
CCTAGTAACCATCATCCTCTCCAAAAGG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4GZ17JQ 628 0 0
GAAG
AAGTAGCAGATTTATATAGTTTTCTCTCTAACTCGATTCGAGATACACCTGACCATTTTA
TATGGTTATAGTCCTACACTTATAATTAGATGACCCAATGATCAATAATTTTAGTGTACA
CGTTCTCTACTCATAACTAAGCATAGAACCTATAAGCAGAAGAATCCGCGATGATGTTCC
TTAGTCTTCCAATTGTTGACGCCAGCATTATGAACACCCCTACAATGATGGAGATCCAAT
TGACCAACCACGTTATGCTGAATCTCTTTGGTTTCTTTATGATAAGCCACATTATACTTG
GGAGAAAGAAAGAAGTGGGTGCAAAGCCAAATCCTCCAAAGAACCCTAGAAGGTCTCCAA
AGAAGGGGAAACTCACTCCAATGAACAATGTAAACGCGACATAAATAGTTCTAGTGAAAA
ACCTCAGAACAACTCCATGCTTAAAACCGAACCTAGTAACCATCATCCTCTCCAAAAGGT
CAAAGACAGGCATAGCAAACACTTGGTAGCTACCAATGACGTGGACAACAACCATGAGAT
TAGCAGAAGCAATAAGCCAAGCTGGTCTCTGTAGATTATTCAGCACATTGTCGTCTACGT
CTTGACCAAAGGCCCAATAGCAGA

QA 5 628 5 628
DS 

RD RR4GZ17TF 734 0 0
GAAGAAGTAGCAGATT*ATATAGTTT*CTCTCTAACTCGATTCGAGATACAC*TGACCAT
TTTATATGGTTATAGTCCTACACTTATAATTAGATGACCCAATGATCAATAATTTTAGTG
TACACGTTCTCTACTCATAACTAAGCATAGAACCTATAAGCAGAAGAATCCGCGATGATG
TTCCTTAGTCTTCCAATTGTTGACGCCAGCATTATGAACACCCCTACAATGATGGAGATC
CAATTGACCAACCACGTTATGCTGAATCTCTTTGGTTTCTTTATGATAAGCCACATTATA
CTTGGGAGAAAGAAAGAAGTGGGTGCAAAGCCAAATCCTCCAAAGAACCCTAGAAGGTCT
CCAAAGAAGGGGAAACTCACTCCAATGAACAATGTAAACGCGACATAAATAGTTCTAGTG
AAAAACCTCAGAACAACTCCATGCTTAAAACCGAACCTAGTAACCATCATCCTCTCCAAA
AGGTCAAAGACAGGCATAGCAAACACTTGGTAGCTACCAATGACGTGGACAACAACCATG
AGATTAGCAGAAGCAATAAGCCAAGCTGGTCTCTGTAGATTATTCAGCACATTGTCGTCT
ACGTCTTGACCAAAGGCCCAATAGCAGATCAGAGCCACAGGGAAATAGCAAATGGCGTTG
ACAAAGTAAGCTCCCATCACTCCTTGCCACATGGGCACCTTTGATGGTCTCTCAGGAGTT
GAAGGCATCGTTGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL4053Contig1 1379 3 7 U
GGACCACTTCACTCTCTACCTCGAATACTTGATATCTTGGAGATGGCAGGCAAGTTTAGT
TTTGTGAGTGTCATGGGAGCACTATTGGTGTCAACCATCTTCCATGATCCGATCATCGTC
AACGCCGGCCAAGGTGTTCCGAATGTAGCACTGTTCACTTTTGGGGACTCTTACTACGAC
GTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTACGGC
AAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTCATC
GCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAATTTT
TCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAAAGT
ATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGACGAC
TACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTCATC
AAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTCACGAAC
AAATTAAAGACCGACATCAACTTGTTATACTCCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTTCCA
ACGCTAGCACCATTGGGTTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAACTGGCAACGAC
TGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGATGTTG
AACGAGTTTGCTAAAAAACCCAATGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCTACAAT
GCTGTTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCTTCCGGTTTTATGTTACCAACACATCG
TGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAG
CTGTGTGAGTACCAAAGATTTTACTTTTTTTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCT
CAGGAAGAAATCGCTCATATTTTTTATGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAATGACC
ATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAAC
AACCTATCTACTCGTCGTCGACGGTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTATTAT
TGAAATATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGCCTACGAATATGGTATCCTA
GCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTCGTGCCGTCGAATAAATTGCGTGATATGTATTAGTA
TGTTTTTCTAATCTACGGAAAATATAATAAAAAGGGTACTACAATTCCCTTATTTGTCG


BQ
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AF RR4AC82TF U 1
AF RR4AC82JQ C 665
AF RR4GZ48TF U 1047
BS 1 729 RR4AC82TF
BS 730 1047 RR4AC82JQ
BS 1048 1168 RR4GZ48TF
BS 1169 1169 RR4AC82JQ
BS 1170 1190 RR4GZ48TF
BS 1191 1191 RR4AC82JQ
BS 1192 1379 RR4GZ48TF

RD RR4AC82TF 729 0 0
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TTTGTGAGTGTCATGGGAGCACTATTGGTGTCAACCATCTTCCATGATCCGATCATCGTC
AACGCCGGCCAAGGTGTTCCGAATGTAGCACTGTTCACTTTTGGGGACTCTTACTACGAC
GTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTACGGC
AAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTCATC
GCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAATTTT
TCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAAAGT
ATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGACGAC
TACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTCATC
AAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTCACGAAC
AAATTAAAGACCGACATCAACTTGTTATACTCCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTTCCA
ACGCTAGCACCATTGGGTTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAACTGGCAACGAC
TGTTACGAG

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DS 

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ACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGATGTTGAACG
AGTTTGCTAAAAAACCCAATGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCTACAATGCTG
TTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCTTCCGGTTTTATGTTACCAACACATCGTGCT
GCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAGCTGT
GTGAGTACCAAAGATTTTACTTTTTTTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCTCAGG
AAGAAATCGCTCATATTTTTTATGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATAC
GTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAACAACC
TATCTACTCGTCGTCGACGGTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTATTATTGAA
ATATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGCCTACGAATATGGTATCCTAGCTG
TAATGCTTGGTAACTATGTTCGTGCCGTCGAATAAATTGCGTGATATGTATTAGTATGTT
TTTTTAATTTACGGAAAATATAATAAAAAGGGTACTACAATTCCCTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4GZ48TF 333 0 0
G
GGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCT
AAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAACAACCTATCTACTCGTCGTCGACGGTCA
TTTCGTGATAACCTCGATTTATCGGCTTATTATTGAAATATAATTGTGCTGAATCTTTCG
TTATGTATGTGAGCCTACGAATATGGTATCCTAGCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTCGT
GCCGTCGAATAAATTGCGTGATATGTATTAGTATGTTTTTCTAATCTACGGAAAATATAA
TAAAAAGGGTACTACAATTCCCTTATTTGTCG

QA 2 333 2 333
DS 



AS 1 3

CO CL4054Contig1 856 3 2 U
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AATGACAACAAAAGCAAAACCAATTTACAAAGACAGAATGACAAATCCCATTTTATCACT
CTTCTCTCTACCTGAATGTTCACTTAACTTCTCAGCCAATCACGTAACGCCGTGTCACAA
CCAAATCCAAACCCACGTCAGCGTGAGTCACCAAGACCCTAGCAAGACCAATGTGATGAC
GCTGAAAAGTAAGAAGTGGACCACATGGTACGGGTGCTGAATTAAAGTTGATGAGCCGTT
AGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGGCATGCCGTCACCGCCGAGAGCACATGACCG
TGGCTCGCCGTTTTGGTTGAGCATGACGGCTCGGAGGACTGAAGTGACAGTGGGGAAGTA
AGCCGTACGGTTCTTAGCGAGAAGCCAAGTGAGACCCATGAGAACACAGTCTTTGTTGTG
CATCTTTGTTGTTCTGTTTCTGTCTTCCTTCGATGGGTTTCTTGTCCCTGACGTTTTCTT
CGGGTTTAGCTTATAGAGGCTGTTCAAGCACTTGTTACATCTACCTAGAGGAGTTAATCT
ATCTCCATTGTCGTGGCTTACACTCAAACAATCAGTCTCCAACCGATCAACACTCTCATC
TCCAACAAGCCTCCCTTCTCCGTTCACACTAAACGCCTCGGAACAGCTCAAGTGATGCAA
CCTTATCCCACAGTAGCAGTCAACCAGGCCGCACGTCTCGTTCGGACTCGCCAGCTCAAT
CCCTCTCCTCCTCAGAGATTTCTCCAATCCGTCGACGCAAGTCTCCGAGTCGTCGGGAAG
CAAAGGCATATCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI11JQ U 23
AF RR4BZ71JQ U 1
AF RR4BZ71TF C 185
BS 1 670 RR4BZ71JQ
BS 671 856 RR4BZ71TF

RD RR4GI11JQ 271 0 0
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CTTAACTTCTCAGCCAATCACGTAACGCCGTGTCACAACCAAATCCAAACCCACGTCAGC
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ACATGGTACGGGTGCTGAATTAAAGTTGATG

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR4BZ71JQ 670 0 0
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AATGACAACAAAAGCAAAACCAATTTACAAAGACAGAATGACAAATCCCATTTTATCACT
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CCAAATCCAAACCCACGTCAGCGTGAGTCACCAAGACCCTAGCAAGACCAATGTGATGAC
GCTGAAAAGTAAGAAGTGGACCACATGGTACGGGTGCTGAATTAAAGTTGATGAGCCGTT
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TGGCTCGCCGTTTTGGTTGAGCATGACGGCTCGGAGGACTGAAGTGACAGTGGGGAAGTA
AGCCGTACGGTTCTTAGCGAGAAGCCAAGTGAGACCCATGAGAACACAGTCTTTGTTGTG
CATCTTTGTTGTTCTGTTTCTGTCTTCCTTCGATGGGTTTCTTGTCCCTGACGTTTTCTT
CGGGTTTAGCTTATAGAGGCTGTTCAAGCACTTGTTACATCTACCTAGAGGAGTTAATCT
ATCTCCATTGTCGTGGCTTACACTCAAACAATCAGTCTCCAACCGATCAACACTCTCATC
TCCAACAAGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4BZ71TF 672 0 0
TC
CCAAACCCACGTCAGCGTGAGTCACCAAGACCCTAGCAAGACCAATGTGATGACGCTGAA
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GCCGTTTTGGTTGAGCATGACGGCTCGGAGGACTGAAGTGACAGTGGGGAAGTAAGCCGT
ACGGTTCTTAGCGAGAAGCCAAGTGAGACCCATGAGAACACAGTCTTTGTTGTGCATCTT
TGTTGTTCTGTTTCTGTCTTCCTTCGATGGGTTTCTTGTCCCTGACGTTTTCTTCGGGTT
TAGCTTATAGAGGCTGTTCAAGCACTTGTTACATCTACCTAGAGGAGTTAATCTATCTCC
ATTGTCGTGGCTTACACTCAAACAATCAGTCTCCAACCGATCAACACTCTCATCTCCAAC
AAGCCTCCCTTCTCCGTTCACACTAAACGCCTCGGAACAGCTCAAGTGATGCAACCTTAT
CCCACAGTAGCAGTCAACCAGGCCGCACGTCTCGTTCGGACTCGCCAGCTCAATCCCTCT
CCTCCTCAGAGATTTCTCCAATCCGTCGACGCAAGTCTCCGAGTCGTCGGGAAGCAAAGG
CATATCCTCC

QA 3 672 3 672
DS 



AS 1 3

CO CL4055Contig1 1639 3 15 U
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AACCAAAACGATTTATAGTTTGTGTTCTTGCGAGGTTTGTTCTTTATTCTTCTGTGTCAT
CATCCTCTACTTAATTGAGAATCTAAAAAAAGCATCTTTCCTCTTTCTTTCTAATCCGAT
TGTACAGTTTTCATATTCCAATTCCAGTTTTTTCACTCAACCCTGTCATGTTTAATCAAT
CAAAAAGACTTCAACTTTGGTAACTCTCTATCTATAGTTAGGGTTTTTGTGTTCAGAAAC
ATATAATCTTGTGTCTGGAGAGAAAAGAAATGGGATCTGCAAGTGGGTTTTACTCAAACG
AAGGTTTTTAATTGGATCCTAAATGGCTCGTTGATCCTCGTCATCTCTTTGTTGGTCCCA
AGATCGGCGAAGGTGCTCATGCCAAAGTTTATGAGGGAAAGTATAGAAACCAAACAGTGG
CGATTAAGATAATAAAAAGAGGAGAGTCCCCTGAAGAGATTGCCAAAAGAGGCAGCCGGT
TTGCAAGAGAGATCGCTATGTTGTCTAAAGTCCAGCACAAAAACTTGGTCAAGTTCATTG
GAGCGTGCAAAGAACCAATGATGGTTATAGTCACCGAGCTTCTACTAGGCGGTACGTTGC
GTAAATATCTAGTCAGCTTGCGGCCTAAACGTTTGGATATACGTTTGGCTGTAGCGTTTG
CGCTTGACATTGCTCGTGCGATGGAATGTTTGCATTCCCATGGAATCATTCACCGCGATC
TCAAACCAGAGAATTTGATCTTATCTGAGGATCATAAGACGGTAAAGCTCGCTGATTTCG
GTTTAGCTAGAGAAGAATCATTAACAGAAATGATGACCGCAGAGACTGGTACATACCGTT
GGATGGCCCCTGAGCTTTACAGTACGGTTACGTTAAGACATGGAGAGAAGAAACATTATA
ACCATAAAGTAGATGCTTACAGCTTCGCCATCGTCTTGTGGGAACTCATTCTCAACAAGT
TACCCTTTGAAGGCATGTCCAATCTACAAGCAGCCTATGCTGCTGCCTTCAAGAACTTGA
GGCCTAGTGCGGAGGATCTACCAGGGGAACTAGGGTTGATAGTGACGTCATGCTGGAAAG
AAGATCCTAACGAACGGCCAAACTTCACTGAGATAATACAAATGCTCCTGCGTTACCTAT
CCACTGTTTCTCCTCCGCAGATCGTTCCTCCTCCGGTGAGACGTGTTTTCTCGTCGGAGA
ACGTGGTTTTCTCACCGGATTCTCCTGGTACTTGTTCGCTGATGAACGTGAGAGACAAAG
ATGGTTCGGGACAGAACGTTAACGCTGCTGATCCGTCTGAGAAGGAAACGAAAGGGAGCT
TCTTCTTCTGCTGCTCATAGATGACGATGATGATGGATAGTACTATAAAAAGATAAATCG
GGTTGTAATTGTGTAAAGGAAACGAGAGAGAAGTTGTATTTGTTATATGGAATGATAAAT
AGCAATGAACTCTTAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ81TF U 1
AF RR4EX28TF U 535
AF RR4EX28JQ C 814
BS 1 651 RR4DZ81TF
BS 652 1226 RR4EX28TF
BS 1227 1227 RR4EX28JQ
BS 1228 1261 RR4EX28TF
BS 1262 1262 RR4EX28JQ
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BS 1283 1293 RR4EX28TF
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RD RR4DZ81TF 654 0 0
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AACCAAAACGATTTATAGTTTGTGTTCTTGCGAGGTTTGTTCTTTATTCTTCTGTGTCAT
CATCCTCTACTTAATTGAGAATCTAAAAAAAGCATCTTTCCTCTTTCTTTCTAATCCGAT
TGTACAGTTTTCATATTCCAATTCCAGTTTTTTCACTCAACCCTGTCATGTTTAATCAAT
CAAAAAGACTTCAACTTTGGTAACTCTCTATCTATAGTTAGGGTTTTTGTGTTCAGAAAC
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AAGGTTTTTAATTGGATCCTAAATGGCTCGTTGATCCTCGTCATCTCTTTGTTGGTCCCA
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CGATTAAGATAATAAAAAGAGGAGAGTCCCCTGAAGAGATTGCCAAAAGAG
ACA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4EX28TF 795 0 0
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GCGATCTCAAACCAGAGAATTTGATCTTATCTGAGGATCATAAGACGGTAAAGCTCGCTG
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ATTATAACCATAAAGTAGATGCTTACAGCTTCGCCATCGTCTTGTGGGAACTCATTCTCA
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DS 

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TCTTGTGGGAACTCATTCTCAACAAGTTACCCTTTGAAGGCATGTCCAATCTACAAGCAG
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TTGTATTTGTTATATGGAATGATAAATAGCAATGAACTCTTAGATC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 3

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TAAAGAACATATCATGTGTACTTATCAAAACTGATAAACATTTGGAGTTCTAATCGACCA
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CACCAATCCTTTACCCATTTCACCTACCGCCTTCAACATCTCTACTGGATTAGTTTCCTC
TTCTTCTTCATCTCGTTCTCGTTTCTTTGAATTGTGTTGAGTCCAAGTCAAACCAATCGC
GTCGCCTCCTATATGATCATACCACGTCTTCAAGGTTCCAAACTCTTCCTGCAACCCACT
CATGAAGCACTTGGTCGGCTCGAAGTCCACCAATAACTTCTTCTTAAGCTCCTCAGGGCT
TCTCTTCATATCTCCAGGCAATAAAAACGGGTTAAACGCTTTACTCGCCTTTCCACGAGC
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ACCGAAGTCATTGCTTATGTCAACAATCAACGGATAGAACATCCAGTCATAGC


BQ
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AF RR4DO74JQ U 1
AF RR4BC73JQ U 16
AF RR4BC73TF C 53
BS 1 127 RR4DO74JQ
BS 128 128 RR4BC73JQ
BS 129 167 RR4DO74JQ
BS 168 168 RR4BC73JQ
BS 169 576 RR4DO74JQ
BS 577 872 RR4BC73JQ
BS 873 893 RR4BC73TF

RD RR4DO74JQ 576 0 0
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TCTCTTCATATCTCCAGGCAATAAAAACGGGTTAAACGCTTTACTCGCCTTTCCACGAGC
TACATGTTTCCCTTGGTTAAGTTCCGACGGAAACAAAAGATGATGTGGGTAAGGTAATTT
TTCTCTGTGGAGAAGAACAACTGCGTCATAGTTGTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4BC73JQ 857 0 0
CG
GTTGAGATTAATTTATATGAAAAAGATTGTTTGATTGGTATTGTAAAGAACATATCATGT
GTACTTATCAAAACTGATAAACATTTGGAGTTCTAATCGACCAGAGCTAAGAGATTTGAA
GCTTTTAGACAAAACGTGGAGTCTTGAGCAGGTAGATATCTCTCACCAATCCTTTACCCA
TTTCACCTACCGCCTTCAACATCTCTACTGGATTAGTTTCCTCTTCTTCTTCATCTCGTT
CTCGTTTCTTTGAATTGTGTTGAGTCCAAGTCAAACCAATCGCGTCGCCTCCTATATGAT
CATACCACGTCTTCAAGGTTCCAAACTCTTCCTGCAACCCACTCATGAAGCACTTGGTCG
GCTCGAAGTCCACCAATAACTTCTTCTTAAGCTCCTCAGGGCTTCTCTTCATATCTCCAG
GCAATAAAAACGGGTTAAACGCTTTACTCGCCTTTCCACGAGCTACATGTTTCCCTTGGT
TAAGTTCCGACGGAAACAAAAGATGATGTGGGTAAGGTAATTTTTCTCTGTGGAGAAGAA
CAACTGCGTCATAGTTGTTCAGAGGTGTTCTGAAAAGGCACTCCCATTGAACAGAATCAT
GGTGTTCTTGTAGTACCAGCTTACTTAATACGTTTGCACTGCTTCGAGCATAAGCCACCA
ACCTTTTTAGTTCCGATAAGTTTGGTGAAAGTGATGTCCATGCCTCTGATGCCTTGTCGT
AAGGGGCTGCCAAGAACATGGCTGAACTTATGTTTTGTTTGTCCTCTTCGTAGCCCTTTC
TACTTGACATGAAGTTATCGTTGATCTCTTTCTCGTCATTTCTACCGAAGTCATTGCTTA
TGTCAACAATCAACG

QA 3 857 3 857
DS 

RD RR4BC73TF 841 0 0
TGGTATTGTAAAGAACATATCATGTGTACTTATCAAAACTGATAAACATTTGGAGTTCTA
ATCGACCAGAGCTAAGAGATTTGAAGCTTTTAGACAAAACGTGGAGTCTTGAGCAGGTAG
ATATCTCTCACCAATCCTTTACCCATTTCACCTACCGCCTTCAACATCTCTACTGGATTA
GTTTCCTCTTCTTCTTCATCTCGTTCTCGTTTCTTTGAATTGTGTTGAGTCCAAGTCAAA
CCAATCGCGTCGCCTCCTATATGATCATACCACGTCTTCAAGGTTCCAAACTCTTCCTGC
AACCCACTCATGAAGCACTTGGTCGGCTCGAAGTCCACCAATAACTTCTTCTTAAGCTCC
TCAGGGCTTCTCTTCATATCTCCAGGCAATAAAAACGGGTTAAACGCTTTACTCGCCTTT
CCACGAGCTACATGTTTCCCTTGGTTAAGTTCCGACGGAAACAAAAGATGATGTGGGTAA
GGTAATTTTTCTCTGTGGAGAAGAACAACTGCGTCATAGTTGTTCAGAGGTGTTCTGAAA
AGGCACTCCCATTGAACAGAATCATGGTGTTCTTGTAGTACCAGCTTACTTAATACGTTT
GCACTGCTTCGAGCATAAGCCACCAACCTTTTTAGTTCCGATAAGTTTGGTGAAAGTGAT
GTCCATGCCTCTGATGCCTTGTCGTAAGGGGCTGCCAAGAACATGGCTGAACTTATGTTT
TGTTTGTCCTCTTCGTAGCCCTTTCTACTTGACATGAAGTTATCGTTGATCTCTTTCTCG
TCATTTCTACCGAAGTCATTGCTTATGTCAACAATCAACGGATAGAACATCCAGTCATAG
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 3

CO CL4057Contig1 481 3 12 U
GGAAGTCATCACACACAAAACAACAAATCAAAGCATCAGTTTAAGTTCTAAGCAAACACG
AGAGAGAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCGAGCAGGCCAAGCAACTGG
CCAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTTTGATGGACAGGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCCGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAACAGATGAAGCAGAAGGCATAAGGAGCTGCTGA
CGTGGTCAAGGACAAAACTGGCTTGAACAAAAACACCTAACAACTTTCATTTTACTCTAT
TATATTCCTCTCTTTTAAGTTATTTAATAAATTATGTTTTAATTCTCATTTCTGCTGCTC
CTGACGTTTATGTAACCAGATGATTTCCGGCAATATCGCAAGATGGTTTCATTTGAAAGT
AGATTTATTCATTACATATTATGTAATAATAATATTTATACAAATTTTAAAACATTAGTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4BC91TF U 1
AF RR4EJ27JQ C 7
AF RR4EJ27TF U 7
BS 1 165 RR4BC91TF
BS 166 166 RR4EJ27TF
BS 167 226 RR4BC91TF
BS 227 227 RR4EJ27TF
BS 228 246 RR4BC91TF
BS 247 247 RR4EJ27TF
BS 248 364 RR4BC91TF
BS 365 365 RR4EJ27TF
BS 366 404 RR4BC91TF
BS 405 405 RR4EJ27TF
BS 406 420 RR4BC91TF
BS 421 481 RR4EJ27TF

RD RR4BC91TF 420 0 0
GGAAGTCATCACACACAAAACAACAAATCAAAGCATCAGTTTAAGTTCTAAGCAAACACG
AGAGAGAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCGAGCAGGCCAAGCAACTGG
CCAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTTTGATGGACAGGGCCAAAGACGCTGCTGCTTCCGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAACAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
CGTGGTTAAGGACAAAACTGGCTTGAACAAAAACACCTAACAACTTTCATTTTACTCTAT
TATATTCCTCTCTTTTAAGTTATTTAATAAATTATGTTTTAATTCTCATTTCTGCTGCTC
CTGATGTTTATGTAACCAGATGATTTCCGGCAATATCGCAAGATAGTTTCATTTGAAAGT

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4EJ27JQ 475 0 0
G
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AAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCGAGCAGGCCAAGCAACTGGCCAGACT
AAGGAGAAGGCAAGTGGTTTGATGGACAGGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCCGCTCAAGAC
TCCATGCAACATGCTGGACAACAGATGAAGCAGAAGGCATAAGGAGCTGCTGACGTGGTC
AAGGACAAAACTGGCTTGAACAAAAACACCTAACAACTTTCATTTTACTCTATTATATTC
CTCTCTTTTAAGTTATTTAATAAATTATGTTTTAATTCTCATTTCTGCTGCTCCTGACGT
TTATGTAACCAGATGATTTCCGGCAATATCGCAAGATGGTTTCATTTGAAAGTAGATTTA
TTCATTACATATTATGTAATAATAATATTTATACAAATTTTAAAACATTAGTCC

QA 2 475 2 475
DS 

RD RR4EJ27TF 475 0 0
G
ATCACACACAAAACAACAAATCAAAGCATCAGTTTAAGTTCTAAGCAAACACGAGAGAGA
AAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCGAGCAGGCCAAGCAACTGGCCAGACT
AAGGAGAAGGCAAGTGGTTTGATGGACAGGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCCGCTCAAGAC
TCCATGCAACATGCTGGACAACAGATGAAGCAGAAGGCATAAGGAGCTGCTGACGTGGTC
AAGGACAAAACTGGCTTGAACAAAAACACCTAACAACTTTCATTTTACTCTATTATATTC
CTCTCTTTTAAGTTATTTAATAAATTATGTTTTAATTCTCATTTCTGCTGCTCCTGACGT
TTATGTAACCAGATGATTTCCGGCAATATCGCAAGATGGTTTCATTTGAAAGTAGATTTA
TTCATTACATATTATGTAATAATAATATTTATACAAATTTTAAAACATTAGTCC

QA 2 475 2 475
DS 



AS 1 3

CO CL4058Contig1 821 3 10 U
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CCAACCGTCGAATCGCCATAGGAGCTGCGATTTCTCCTAGATCTTGTATAGAGGTGGACA
ATTCGATATAAGCTTATTGATCTGGAAGGATCCAAAGCACGGTCACTGGTGGCTACAATT
CGGGTCGGGTACATTAGTCGGTTACTGGCCAGCGTTTCTATTCACGCATCTAAAGCAACA
TGGGAGCATGGTCCAATTCGGAGGCAAGATTGTGAACACCCGACCTGGTGGTTCACACAC
TTCGACCCAAATGGGCAGTGGCCATTTCGCCGGTGAAGGTTTTGGTAAAGCATCTTATTT
CCGGAATCTCCAAGTGGTTGATTGGGACAATACTCTTCTTCCCGTTTCGAATCTAAAGAT
CCTCGCTGATCATCCCAATTGTTATGATATAAGAGGTGGGACGAATCGTGTGTGGGGTAA
CTATTTTTATTATGGAGGTCCAGGAAAAAACCCTAGATGTCCATGAAGAATCAAGAAACG
TACGTTACTATTATTATTCTTT*ACATGTGGTGGCTTAATGATTTTTGAGATTAGAAAGG
AATTTACAAGTATCTTTGCGGCTAGGTGTTTTGCAAATATCATGTGGATGAATTTATCAC
CACGAGGGCACTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTACAAATGGTAGTTGTTTTGCAAATAT
CATGTGTCATACTTTTTTGTTTGTTTTATTTTTAGGAAATTGTGATATTCTATGGATTTT
TGTAATTTGTAAATGTAGACAATTCGTAAGACCGAATGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B440TF U 1
AF RR4A689JQ C 335
AF RR4A689TF U 335
BS 1 562 RR4B440TF
BS 563 563 RR4A689TF
BS 564 588 RR4B440TF
BS 589 589 RR4A689TF
BS 590 692 RR4B440TF
BS 693 694 RR4A689TF
BS 695 746 RR4B440TF
BS 747 747 RR4A689TF
BS 748 787 RR4B440TF
BS 788 821 RR4A689TF

RD RR4B440TF 787 0 0
CGTCCGGTGCATACCGATCAACGGGTTGCTACAATTTGTTGTGTTCCGGTTTCGTTCAAA
CCAACCGTCGAATCGCCATAGGAGCTGCGATTTCTCCTAGATCTTGTATAGAGGTGGACA
ATTCGATATAAGCTTATTGATCTGGAAGGATCCAAAGCACGGTCACTGGTGGCTACAATT
CGGGTCGGGTACATTAGTCGGTTACTGGCCAGCGTTTCTATTCACGCATCTAAAGCAACA
TGGGAGCATGGTCCAATTCGGAGGCAAGATTGTGAACACCCGACCTGGTGGTTCACACAC
TTCGACCCAAATGGGCAGTGGCCATTTCGCCGGTGAAGGTTTTGGTAAAGCATCTTATTT
CCGGAATCTCCAAGTGGTTGATTGGGACAATACTCTTCTTCCCGTTTCGAATCTAAAGAT
CCTCGCTGATCATCCCAATTGTTATGATATAAGAGGTGGGACGAATCGTGTGTGGGGTAA
CTATTTTTATTATGGAGGTCCAGGAAAAAACCCTAGATGTCCATGAAGAATCAAGAAACG
TACGTTACTATTATTATTCTTTTACATGTGGTGGCTTAATGATTTTTGGGATTAGAAAGG
AATTTACAAGTATCTTTGCGGCTAGGTGTTTTGCAAATATCATGTGGATGAATTTATCAC
CACGAGGGCACTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTC*ACAAATGGTAGTTGTTTTGCAAATAT
CATGTGTCATACTTTTTTGTTTGTTT*ATTTTTAGGAAATTGTGATATTCTATGGATTTT
TGTAATT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4A689JQ 487 0 0
GAAGGTTTTGGTAAAGCATCTTATTTCCGGAATCTCCAAGTGGTTGATTGGGACAATACT
CTTCTTCCCGTTTCGAATCTAAAGATCCTCGCTGATCATCCCAATTGTTATGATATAAGA
GGTGGGACGAATCGTGTGTGGGGTAACTATTTTTATTATGGAGGTCCAGGAAAAAACCCT
AGATGTCCATGAAGAATCAAGAAACGTACGTTACTATTATTATTCTTT*ACATGTGGTGG
CTTAATGATTTTTGAGATTAGAAAGGAATTTACAAGTATCTTTGCGGCTAGGTGTTTTGC
AAATATCATGTGGATGAATTTATCACCACGAGGGCACTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTT
ACAAATGGTAGTTGTTTTGCAAATATCATGTGTCATACTTTTTTGTTTGTTTTATTTTTA
GGAAATTGTGATATTCTATGGATTTTTGTAATTTGTAAATGTAGACAATTCGTAAGACCG
AATGGCG

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR4A689TF 487 0 0
GAAGGTTTTGGTAAAGCATCTTATTTCCGGAATCTCCAAGTGGTTGATTGGGACAATACT
CTTCTTCCCGTTTCGAATCTAAAGATCCTCGCTGATCATCCCAATTGTTATGATATAAGA
GGTGGGACGAATCGTGTGTGGGGTAACTATTTTTATTATGGAGGTCCAGGAAAAAACCCT
AGATGTCCATGAAGAATCAAGAAACGTACGTTACTATTATTATTCTTT*ACATGTGGTGG
CTTAATGATTTTTGAGATTAGAAAGGAATTTACAAGTATCTTTGCGGCTAGGTGTTTTGC
AAATATCATGTGGATGAATTTATCACCACGAGGGCACTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTT
ACAAATGGTAGTTGTTTTGCAAATATCATGTGTCATACTTTTTTGTTTGTTTTATTTTTA
GGAAATTGTGATATTCTATGGATTTTTGTAATTTGTAAATGTAGACAATTCGTAAGACCG
AATGGCG

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 3

CO CL4059Contig1 838 3 2 U
GACTTGTGATCGCAGACGGAGTCTACAGGAATATAACCTTTGGGGAGACCCCATTCGTGT
CCATGGCCGAGTTTGCAGAGATTGTGCCAGTGATGTTGTTAGGTTCAATATCAAAGAGAT
GGCTCGTCCCTGGCTGGAGGTTTGGCTGGATGGTCACCGTTGACCCTCATAACATCATGA
AAGATTCTGGGCTTGTTCATAGTCTTGTCAACGTCCTCAACATGTCGATAGATCCCGTAA
CTTTTATTCAGGGGGCAATGCCTGATATCCTTGAGAAGACAAAAGAGGAATTCTTCTCGT
CGAAAATGGAAATACTAAGAGAGTGTGCAGAGACTTGTTACGAGGAGATAAAGAAGATCC
CTTGCATGAGTTGCCCTTACAAACCAGAGGCGTCAATGTTCACTATGGTGAAGTTAGAGC
CATCGGTTCTTGAAGATATAAAGGATGATTTGGAATTCTGCTGCAAGTTGGCTAAAGAGG
AATCGTTGATGATCCTACCAGGCCGATCTGTGGGGTTTAAGAATTGGCTACGCATCACCT
TTGCGGTGGAGCCAGCGCTCCTAAAAGATGGGCTTTCCAGGCTAAACAAGTTTGCACAGA
GACACTCCAAGAAGATGCAGCAGCCATGAGAGAATTTCTCTCTCATTCTTCTCACACCTC
AAGCAAATGACATTGTTTTTGAAAAAAAAACATTGTTGGTGTTTGTAATAAAACTTATAT
TTTTAAATATATGTTGTATCAAATGTTGTACTGTTTGTAGTGACTCTTATCACGAGAGCC
CAAGTTGCTGATTCGAATGAAAGGAATATTTTTTTTAAGGAAAATAAATATTGACCCC


BQ
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BW92TF U 127
AF RR4D172TF U 1
AF RR4D172JQ C 297
BS 1 682 RR4D172TF
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RD RR4BW92TF 204 0 0
G
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TGGGCTTGTTCATAGTCTTGTCAACGTCCTCAACATGTCGATAGATCCCGTAACTTTTAT
TCAGGGGGCAATGCCTGATATCCTTGAGAAGACAAAAGAGGA*TTCTTCTCGTCGAAA*T
GGAAATACTAAGAGAGTGTGCAG

QA 2 204 2 204
DS 

RD RR4D172TF 682 0 0
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CCATGGCCGAGTTTGCAGAGATTGTGCCAGTGATGTTGTTAGGTTCAATATCAAAGAGAT
GGCTCGTCCCTGGCTGGAGGTTTGGCTGGATGGTCACCGTTGACCCTCATAACATCATGA
AAGATTCTGGGCTTGTTCATAGTCTTGTCAACGTCCTCAACATGTCGATAGATCCCGTAA
CTTTTATTCAGGGGGCAATGCCTGATATCCTTGAGAAGACAAAAGAGGAATTCTTCTCGT
CGAAAATGGAAATACTAAGAGAGTGTGCAGAGACTTGTTACGAGGAGATAAAGAAGATCC
CTTGCATGAGTTGCCCTTACAAACCAGAGGCGTCAATGTTCACTATGGTGAAGTTAGAGC
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AATCGTTGATGATCCTACCAGGCCGATCTGTGGGGTTTAAGAATTGGCTACGCATCACCT
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AAGCAAATGACATTGTTTTTGA

QA 1 682 1 682
DS 

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GAGGAATCGTTGATGATCCTACCAGGCCGATCTGTGGGGTTTAAGAATTGGCTACGCATC
ACCTTTGCGGTGGAGCCAGCGCTCCTAAAAGATGGGCTTTCCAGGCTAAACAAGTTTGCA
CAGAGACACTCCAAGAAGATGCAGCAGCCATGAGAGAATTTCTCTCTCATTCTTCTCACA
CCTCAAGCAAATGACATTGTTTTTGAAAAAAAAACATTGTTGGTGTTTGTAATAAAACTT
ATATTTTTAAATATATGTTGTATCAAATGTTGTACTGTTTGTAGTGACTCTTATCACGAG
AGCCCAAGTTGCTGATTCGAATGAAAGGAATATTTTTTTTAAGGAAAATAAATATTGACC
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

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CTGGAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTC
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ACCCCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGTAAGCACC
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TTTTTGCTGTACTCGCAACTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTGTTGTTAGTTACCGTTCGATC
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TGGTAAATGATATAGTACTGTATTTT


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AF RR4AO37TF U 1
AF RR4GL62TF U 59
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BS 72 72 RR4GL62TF
BS 73 371 RR4AO37TF
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BS 374 542 RR4AO37TF
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BS 544 566 RR4AO37TF

RD RR4AO37TF 566 0 0
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TAGACATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTC
CTGGAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTC
ATCCAGGAAGCAACATAGCCACCAGAGGATTGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTC
ACCCCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGTAAGCACC
GCTAAAGCGAG**CATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAAATGTGTTTTTTGTTGTTT
TTTTTGCTGTACTCGCAACTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTGTTGTTAGTTACCGTTCGATC
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TGTTAAATGATATAGTACTGTATTTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4GL62TF 508 0 0
G
GCTGGACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCC
ATAGACATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGT
CCTGGAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTT
CATCCAGGAAGCAACATAGCCACCAGAGGATTGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCT
CACCCCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGTAAGCAC
CGCTAGAGCGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAAATGTGTTTTTTGTTGTT
TTTTTTGCTGTACTCGCAACTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTGTTGTTAGTTACCGTTCGAT
CTCTAGTTTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGGCGATGCGTCCTCTTGTAAGTTTGTACTGT
TTGGTAAATGATATAGTACTGTATTTT

QA 2 508 2 508
DS 



AS 1 2

CO CL4061Contig1 895 2 4 U
CAACCCCAAATGTTAACTTTAACTTTAACTTTTTACTACAAAATCGTATGGTCGTGGATT
AAAGGGTTTTAGCATCTTTGGTATTGACCAGCTCCTCCTCAGTATGTTATTTTCTCCCAA
AGAAAAGGAAACAGTAAGTAAAAGGGTTGGTTAATAAAACAAATAATGGTTTAAATATGT
AGTTGTTATTTGCTCGGATCATATTCCCAATATCTTACTCGGATGTAAACGTTTAAATTT
AAGAAACCAAGTACAAACCGAGAGACAAAAATCAACACTGCCACAGCACTTTTTGAAATT
GGTCAATTAAACGCAGAATATCTTTTTGCCAAAATAAACGCAGAATATGAACCATTCAAC
CCTCAGTTCTTCTTGCCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTCTTCACAACGTTC
TTACATGAATCCTTCTTGTCTTGTTGGAATGTGCTTTTGTTCACCGGAATCACACACTCT
GCTTTTCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTGCTTTGAAACAGGAGCATTACAAGTACCA
AGTGTGAAGTTTCCACAGTCACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAACTCAACGGCTGCG
ATCTTCTTATTGCCTGAGCATTTAAGAGTAGCCGTGAGACACACTTTATCAGTGATGGCT
TGGACCTCGTCTTTCTTCCTAATCCAGTGTCCAACACTTGGAGTGTAGTTTTCTCCGACC
AAGAACAAACAGTGTCTCTGTTGACGATGACAAAGTCTATAAGCTCAGGCTTCACATTAG
GCTCTTCCTCGAATATAACGAGAAGATTTTTCTTGGGCTTCAAGAAAGATCTAGGGATGT
GATATTCTATTTGCGTGGATTGGTTTAATGGATTCAAGAAAGACATCCAATATCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY70JQ U 1
AF RR4FP40JQ U 168
BS 1 321 RR4FY70JQ
BS 322 322 RR4FP40JQ
BS 323 717 RR4FY70JQ
BS 718 895 RR4FP40JQ

RD RR4FY70JQ 717 0 0
CAACCCCAAATGTTAACTTTAACTTTAACTTTTTACTACAAAATCGTATGGTCGTGGATT
AAAGGGTTTTAGCATCTTTGGTATTGACCAGCTCCTCCTCAGTATGTTATTTTCTCCCAA
AGAAAAGGAAACAGTAAGTAAAAGGGTTGGTTAATAAAACAAATAATGGTTTAAATATGT
AGTTGTTATTTGCTCGGATCATATTCCCAATATCTTACTCGGATGTAAACGTTTAAATTT
AAGAAACCAAGTACAAACCGAGAGACAAAAATCAACACTGCCACAGCACTTTTTGAAATT
GGTCAATTAAACGCAGAATATTTTTTTGCCAAAATAAACGCAGAATATGAACCATTCAAC
CCTCAGTTCTTCTTGCCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTCTTCACAACGTTC
TTACATGAATCCTTCTTGTCTTGTTGGAATGTGCTTTTGTTCACCGGAATCACACACTCT
GCTTTTCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTGCTTTGAAACAGGAGCATTACAAGTACCA
AGTGTGAAGTTTCCACAGTCACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAACTCAACGGCTGCG
ATCTTCTTATTGCCTGAGCATTTAAGAGTAGCCGTGAGACACACTTTATCAGTGATGGCT
TGGACCTCGTCTTTCTTCCTAATCCAGTGTCCAACACTTGGAGTGTAGTTTTCTCCG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4FP40JQ 728 0 0
GGTTTAAATATGTAGTTGTTATTTGCTCGGATCATATTCCCAATATCTTACTCGGATGTA
AACGTTTAAATTTAAGAAACCAAGTACAAACCGAGAGACAAAAATCAACACTGCCACAGC
ACTTTTTGAAATTGGTCAATTAAACGCAGAATATCTTTTTGCCAAAATAAACGCAGAATA
TGAACCATTCAACCCTCAGTTCTTCTTGCCACGAGCACACTTGACTTGCCCGGCAAGCGT
CTTCACAACGTTCTTACATGAATCCTTCTTGTCTTGTTGGAATGTGCTTTTGTTCACCGG
AATCACACACTCTGCTTTTCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTGCTTTGAAACAGGAGC
ATTACAAGTACCAAGTGTGAAGTTTCCACAGTCACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAA
CTCAACGGCTGCGATCTTCTTATTGCCTGAGCATTTAAGAGTAGCCGTGAGACTCACTTT
ATCTGTGATGGCTTGGACCTCGTCTTTCTTCCTAATCCAGTGTCCAACACTTGGAGTGTA
GTTTTCTCCGACCAAGAACAAACAGTGTCTCTGTTGACGATGACAAAGTCTATAAGCTCA
GGCTTCACATTAGGCTCTTCCTCGAATATAACGAGAAGATTTTTCTTGGGCTTCAAGAAA
GATCTAGGGATGTGATATTCTATTTGCGTGGATTGGTTTAATGGATTCAAGAAAGACATC
CAATATCT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

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GGGAATTGTGGACTAAAGCCAAAAGTTTTGTCGGAAACTGGAGCTCCGGCGCCAGAGGAG
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TTCCTTCAAGAAAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGACGAGAAGATAACACCGGAAAAG
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AAGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATCTGAAGGTTGTGAAG
GAAGAGGCCGTTCATGGCCAGAAAGTGATCGACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAGAAACA
GAGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAAGAGAAGCACAAGCGCAGTGAAATAAGCTCAAAACT
TTTACAAGCTAGTTTCTGCGTTTGCGGTCTTGATCCCAATACGCTTTTCTTTTTGTTTAG
CTTATGTTTGTTCTCGATTCCCAAATGCAAACGCTTGGTTTCATTACATGAAATGCAACG
TCATATCCCATTTACACGATTTCGTCAACAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
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AF RR4FK64TF U 1
AF RR4AN12TF U 2
AF RR4CX87TF U 55
BS 1 49 RR4FK64TF
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BS 144 610 RR4FK64TF
BS 611 629 RR4AN12TF
BS 630 634 RR4CX87TF

RD RR4FK64TF 610 0 0
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TTCCTTCAAGAAAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGACGAGAAGATAACACCGGAAAAG
ATACCGGTTACTGAAGTTCTGAAAACAGCTCTGGCTGAGGCAGAGTCTCCAGTTACAGAA
AAGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATCTGAAGGTTGTGAAG
GAAGAGGCCGTTCATGGCCAGAAAGTGATCGACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAGAAACA
GAGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAAGAGAAGCACAAGCGCAGTGAAATAAGCTCAAAACT
TTTACAAGCTAGTTTCTGCGTTTGCGGTCTTGATCCCAATACGCTTTTCTTTTTGTTTAG
CTTATGTTTGTTCTCGATTCCCAAATGCAAACGCTTGGTTTCATTACATGAAATGCAACG
TCATATCCCA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4AN12TF 628 0 0
GGAACGAGATATAACAAAAAGAATTTAGAATACCTGGCTAGCTAAAGGATAGCAATATGG
GGAATTGTGGACTAAAGCCAAAAGTTTTGTCGGAAACTGGAGCTCCGGCGCCAGAGGAGC
TTGAGATTTCACTTCTTGAAGATCAGAAGATCGACGCTGCAAAATCTCTTATCAACCTGT
TCCTTCAAGAAAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGACGAGAAGATAACACCGGAAAAGA
TACCGGTTACTGAAGTTCTGAAAACAGCTCTGGCTGAGGCAGAGTCTCCAGTTACAGAAA
AGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATCTGAAGGTTGTGAAGG
AAGAGGCCGTTCATGGCCAGAAAGTGATCGACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAGAAACAG
AGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAAGAGAAGCACAAGCGCAGTGAAATAAGCTCAAAACTT
TTACAAGCTAGTTTCTGCGTTTGCGGTCTTGATCCCAATACGCTTTTCTTTTTGTTTAGC
TTATGTTTGTTCTCGATTCCCAAATGCAAACGCTTGGCTTCATTACATGAAATGCAACGT
CATATCCCATTTACACGATTTCGTCAAC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4CX87TF 580 0 0
G
ATATGGGGAATTGTGGACTAAAGCCAAAAGTTTTGTCGGAAACTGGAGCTCCGGCGCCAG
AGGAGCTTGAGATTTCACTTCTTGAAGATCAGAAGATCGACGCTGCAAAATCTCTTATCA
ACCTGTTCCTTCAAGAAAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGACGAGAAGATAACACCGG
AAAAGATACCGGTTACTGAAGTTCTGAAAACAGCTCTGGCTGAGGCAGAGTCTCCAGTTA
CAGAAAAGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATCTGAAGGTTG
TGAAGGAAGAGGCCGTTCATGACCAGAAAGTGATCGACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAG
AAACAGAGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAAGAGAAGCACAAGCGCAGTGAAATAAGCTCA
AAACTTTTACAAGCTAGTTTCTGCGTTTGCGGTCTTGATCCCAATACGCTTTTCTTTTTG
TTTAGCTTATGTTTGTTCTCGATTCCCAAATGCAAACGCTCGGTTTCATTACATGAAATG
CAACGTCATATCCCATTTACACGATTTCGTCAACAAAAA

QA 2 580 2 580
DS 



AS 1 2

CO CL4063Contig1 845 2 6 U
CAACTGGTATTGTATTGGACTCTGGAGATGGTGTGAACCACACTGTACCGATCTACGAGG
GTTATGCTCTCCCACACGCAATCTACGTCTTGATCTAGCGGGGCGTGACCTCACGGACTA
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CGTTAGGGACATGAAAGAAAAACTCTCTTACATTGCTCTAGACCATGAACAAGAGCTAGA
GACTTCCAATACAAGTTCTTCTGTAGAAAAAAGCTTTGAGCTTCCTGATGGACAAGTGAT
AACCATTGGTGCAGAGCGGTTCAGGTGTCCAGAAGTTCTGTTTCAGCCGTCAATGATCGG
GATGGAAAACCCAGGAATCCATGAAACCACATATAACTCTATCATGAAATGTGATGTGGA
TATTAGAAAAGATTTGTATGGCAACATTGTGCTAAGTGGTGGAACCACAATGTTTGGTGG
CATTGGTGATAGAATGAGTAAAGAGATTACAGCTTTGGCTCCAAGTAGTATGAAGATTAA
GGTCGTGGCTCCACCTGAGAGGAAGTACAGTGTTTGGATTGGTGGTTCTATATTGGCTTC
GCTTAGTACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCAGAATATGATGAATCAGGACCATC
AATTGTGCATAGGAAGTGCTTCTAATCACACTTCATAGAAGCACCAAAGGAAGATTGGAG
TAAAAGATAAAAACACATTTGAGCTTCTTTTTTACAGCCTACTACCAATTGCCGATTTTT
TTAATTCACATTTCTTCACCCAAATTGTTCTTTGTAATTTTGATTTGAAGCAACTGAACT
AAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4CI28JQ C 1
AF RR4BR75TF U 210
BS 1 210 RR4CI28JQ
BS 211 705 RR4BR75TF
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BS 753 753 RR4CI28JQ
BS 754 845 RR4BR75TF

RD RR4CI28JQ 840 0 0
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GTTATGCTCTCCCACACGCAATCTACGTCTTGATCTAGCGGGGCGTGACCTCACGGACTA
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CGTTAGGGACATGAAAGAAAAACTCTCTTACATTGCTCTAGACTATGAACAAGAGCTAGA
GACTTCCAATACAAGTTCTTCTGTAGAAAAAAGCTTTGAGCTTCCTGATGGACAAGTGAT
AACCATTGGTGCAGAGCGGTTCAGGTGTCCAGAAGTTCTGTTTC***CGTCAATGATCGG
GATGGAAAACCCAGGAATCCATGAAACCACATATAACTCTATCGTGAAATGTGATGTGGA
TATTAGAAAAGATTTGTATGGCAACATTGTGCTAAGTGGTGGAACCACAATGTTTGGTGG
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GGTCGTGGCTCCACCTGAGAGGAAGTACAGTGTTTGGATTGGTGGTTCTATATTGGCTTC
GCTTAGTACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCAGAATATGATGAATCAGGACCATC
AATTGTGCATAGGAAGTGCTTCTAATCACACTTCATAGAAGCACCAAAGGAAGATTGGAG
TAAAAGATAAAAACACATTTGAGCTTCTTTTTTACAGCCTACTACCAATTGCCGATTTTT
TTAATTCACATTTCTTCACCCAAATTGTTCTTTGTAATTTTGATTTGAAGCAACTGAACT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4BR75TF 636 0 0
G
CATTGCTCTAGACCATGAACAAGAGCTAGAGACTTCCAATACAAGTTCTTCTGTAGAAAA
AAGCTTTGAGCTTCCTGATGGACAAGTGATAACCATTGGTGCAGAGCGGTTCAGGTGTCC
AGAAGTTCTGTTTCAGCCGTCAATGATCGGGATGGAAAACCCAGGAATCCATGAAACCAC
ATATAACTCTATCATGAAATGTGATGTGGATATTAGAAAAGATTTGTATGGCAACATTGT
GCTAAGTGGTGGAACCACAATGTTTGGTGGCATTGGTGATAGAATGAGTAAAGAGATTAC
AGCTTTGGCTCCAAGTAGTATGAAGATTAAGGTCGTGGCTCCACCTGAGAGGAAGTACAG
TGTTTGGATTGGTGGTTCTATATTGGCTTCGCTTAGTACTTTCCAGCAGATGTGGATTGC
AAAGGCAGAATATGATGAATCAGGACCATCAATTGTGCATAGGAAGTGCTTCTAATCACA
CTTCATAGAAGCACCGAAGGAAGATTGGAGTAAAAGATAAAAACACATTTGAGCTTCTTT
TT*ACAGCCTACTACCAATTGCCGATTTTTTTAATTCACATTTCTTCACCCAAATTGTTC
TTTGTAATTTTGATTTGAAGCAACTGAACTAAAAG

QA 2 636 2 636
DS 



AS 1 3

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TTTCGCTTCTTCCTTGACGGCTTCATCTTTTTTGTCTCCTGGTTTTGCAAATTCTTCATC
ATCACTGTCTTCAAACTCTTCCATGCCACCCATACCACCCATGCCTCCCATGCCACCCAT
GCCGCCAAGTCCTTCAAGTCCGGCCACGCCACCAAGTCCACCCATGCCACCCATGCCGCC
AAGTCCTTCCATACCACCCATTCCACCAAAGTTCGAGAAATCCATTCCACCC*ATTCCTC
CCATATCCATATCTCCAGCACCAGCGGTGCCTTCGTCGTCCTCATCAACCCACTTGTCCC
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GCTCTGCTTTCTCTATTATGCAGAAGATGCTTCTTACTCCAATATTGATCTTGCTTTCCT
CTACATTGACTTTACCGTGAAGCTAGGGTTTAAGTTCATAGACGTGGTTCTCGGGACCAG
CTTTTGCAGAGAAATCAAAGACACCTTCAGGGTCTAGATTGACTTTGGTCTCCTTGGAAT
CAGCTAATACTACAGTGAGGAAGATCTTGTCAGTGGTCTCAGCCCACTTCACTTCAGGAT
GACGACTCATGTTTAGTAGATGAAGCTTGGAGAAGAAAAGAACCCTAGAGAAGTGACGCA
AAGATTAAATTTTTTTTTTTTTACTTAGCTTTGATCGACAGAAGAAAGTTAGATGCTCCA
CATAGAGATTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4H841JQB U 1
AF RR4H929JQB U 1
AF RR4H841TF C 259
BS 1 565 RR4H841JQB
BS 566 912 RR4H841TF

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GCTCTGCTTTCTCTATTATGCAGAA

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AAAAAGCTAATAATAATAATAACCCTTAGCTAATAATAAACTTGAAACCAAAACACATTA
ATGAGTTCATCTCTGGAACGAACAGCATCTTCTTCATTTGTCTTCCTTGACATCTACTGG
TTTCGCTTCTTCCTTGACGGCTTCATCTTTTTTGTCTCCTGGTTTTGCAAATTCTTCATC
ATCACTGTCTTCAAACTCTTCCATGCCACCCATACCACCCATGCCTCCCATGCCACCCAT
GCCGCCAAGTCCTTCAAGTCCGGCCACGCCACCAAGTCCACCCATGCCACCCATGCCGCC
AAGTCCTTCCATACCACCCATTCCACCAAAGTTCGAGAAATCCATTCCACCC*ATTCCTC
CCATATCCATATCTCCAGCACCAGCGGTGCCTTCGTCGTCCTCATCAACCCACTTGTCCC
AATCAATCTTGACATAGTGAGGCGCTTTCCCTCCACGGACTAGCTTATTCCACCTTTCGG
GCTCTGCTTTCTCTATTATGCAGAA

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QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 3

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CTACACCGAAGCAGTAAATATCCGATTTAACGGTAAGTTTCCCGCTCATTGCGTACTCGG
GAGCGCAGTAACCGTAAGTTCCCATGACACGTGTGGAGACATGAGTTCTATCTCCTACCG
GACCGAGTTTTGCCAGTCCGAAATCAGAGAGCTTGGGGTTGAACTCTTTGTCTAGCAATA
TGTTTGCGGATTTCAAGTCGCGGTAGATCACGGGCGGGTTTGCAGTGCAGTGAAGATACT
CTATTCCCCGAGCCGCACCTACCGCGATTTTCATGCGTGTGTTCCAGGTTAACGGTTCTT
GATTTGGATC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN54JQ U 17
AF RR4CG96JQ U 1
AF RR4FN54TF C 90
BS 1 33 RR4CG96JQ
BS 34 34 RR4FN54JQ
BS 35 39 RR4CG96JQ
BS 40 40 RR4FN54JQ
BS 41 414 RR4CG96JQ
BS 415 415 RR4FN54JQ
BS 416 613 RR4CG96JQ
BS 614 790 RR4FN54TF

RD RR4FN54JQ 560 0 0
CATCGTAGGAAAAATAAAAATAAAAAACTAAAAACACATTTACCAAATTATTTGTGCGAA
AGACAACATTTTTACAGAACACCAAACTGAAAGTTCTTAAAGAGCTCAAGAGTTTTGCGT
GTGTGTCTAAAAGTCTCGTCCCGGCGTTCTTCTGACCTCAGGTGACGTGGAGGAAACGTT
ACAAGCTTCATGAAACTGACTCTGTGCGGCTAAGTACTCAAGTGCCACCACAATGTCACC
TATAAACGGTCGATAATGAGCTTCCTCGTTCAAACACATTGCGATTATCGCAATTGCATA
GTTTAAACATCGTCGGGGGTATTTTCCTCGTAAAAAAGGATCCACTAAGTGTCCAAACTT
CTTCTGATCCTTAAGGTATGGACGTGACCAAGCGACAAAATTTTGCTCGCCTTGCTTTTG
ACTCATGTCAATGACTTTCCTCCCAGTAACCAGCTCAAGCAAGACTACACCGAAGCAGTA
AATATCCGATTTAACGGTAAGTTTCCCGCTCATTGCGTACTCGGGAGCGCAGTAACCGTA
AGTTCCCATGACACGTGTGG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4CG96JQ 613 0 0
TCTTCAAACTCATATACATCGTAGGAAAAATAAGAATAAGAAACTAAAAACACATTTACC
AAATTATTTGTGCGAAAGACAACATTTTTACAGAACACCAAACTGAAAGTTCTTAAAGAG
CTCAAGAGTTTTGCGTGTGTGTCTAAAAGTCTCGTCGCGGCGTTCTTCTGACCTCAGGTG
ACGTGGAGGAGACGTTACGAGCTTCATGAGACTGACTCTGTGCGGCTAAGTACTCAAGTG
CCACCACAATGTCACCTATAAACGGTCGATAATGAGCTTCCTCGTTCAAACACATTGCGA
TTATCGCAATTGCATAGTTTAAACATCGTCTGGGGTATTTTCCTCGTAGAGAAGGATCCA
CTAAGTGTCCAAACTTCTTCTGATCCTTAAGGTATGGACGTGACCAAGCGACAAGATTTT
GCTCGCCTTGCTTTTGACTCATGTCAATGACTTTCCTCCCAGTAACCAGCTCAAGCAAGA
CTACACCGAAGCAGTAAATATCCGATTTAACGGTAAGTTTCCCGCTCATTGCGTACTCGG
GAGCGCAGTAACCGTAAGTTCCCATGACACGTGTGGAGACATGAGTTCTATCTCCTACCG
GACCGAGTTTTGC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4FN54TF 701 0 0
ACAGAACACCAAACTGAAAGTTCTTAAAGAGCTCAAGAGTTTTGCGTGTGTGTCTAAGAG
TCTCGTCGCGGCGTTCTTCTGACCTCAGGTGACGTGGAGGAGACGTTACGAGCTTCATGA
GACTGACTCTGTGCGGCTAAGTACTCAAGTGCCACCACAATGTCACCTATAAACGGTCGA
TAATGAGCTTCCTCGTTCAAACACATTGCGATTATCGCAATTGCATAGTTTAAACATCGT
CTGGGGTATTTTCCTCGTAGAGAAGGATCCACTAAGTGTCCAAACTTCTTCTGATCCTTA
AGGTATGGACGTGACCAAGCGACAAAATTTTGCTCGCCTTGCTTTTGACTCATGTCAATG
ACTTTCCTCCCAGTAACCAGCTCAAGCAAGACTACACCGAAGCAGTAAATATCCGATTTA
ACGGTAAGTTTCCCGCTCATTGCGTACTCGGGAGCGCAGTAACCGTAAGTTCCCATGACA
CGTGTGGAGACATGAGTTCTATCTCCTACCGGACCGAGTTTTGCCAGTCCGAAATCAGAG
AGCTTGGGGTTGAACTCTTTGTCTAGCAATATGTTTGCGGATTTCAAGTCGCGGTAGATC
ACGGGCGGGTTTGCAGTGCAGTGAAGATACTCTATTCCCCGAGCCGCACCTACCGCGATT
TTCATGCGTGTGTTCCAGGTTAACGGTTCTTGATTTGGATC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL4066Contig1 800 2 2 U
GGAAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATACAATACATGATTTTGTCCTGTTGAACTTTTC
TCCCGGTCCCGGTAAGTCAATTATCTCTTTGGGGGGCTATATTTTCAGGGAGTAAAATGG
GTATATTCCCCGAGTTTGGTGCCTGGATCAGTCAGAACACACAACATCCTACAAAATCTG
AAGAAAATGTTAAATCCAAGCCAATGGCACAGCCAAAAACTCACGAGGAGAGAAATGAGT
TGAAGGAGCAATTAAAACTATGGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAAACTC
CTCCTACCGTGAAGAAGGTGCGTACAGACCATAATTCTGGCATTTCCTATATGAAAATGG
AATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGGCTTTTTAACTAATGAAGACAACA
TAGCATACTCCAGAGAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGGATGTAGGTGATCAAGGGAGTA
TGCTGGACGTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGGCATGGAACTTCCTTTTCTTGTCAGGAACTA
TCCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAATACCCAAACAAACTTGACGTGCACTACATGAAAC
AGCAAAATGGAATAAGGTCAATGGAATCGTTCGAGGGTTGGTATACAGTGGAGCCAGTGT
ATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCGAGCACATGAAGCCAAAGAGTCAAGAGATACAGAAAA
TGTAGTGGTGGAAAAGGATAACTGCGTCCAAGTTAAAGTGTTCAGACTTTAGCCTGCTTC
TCTTGGGATCTGCCACTGCT


BQ
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AF RR4AY05TF U 1
AF RR4EB55TF U 1
BS 1 127 RR4AY05TF
BS 128 800 RR4EB55TF

RD RR4AY05TF 127 0 0
GGAAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATACAATACATGATTTTGTCCTGTTGAACTTTTC
TCCCGGTCCCGGTAAGTCAATTATCTCTTTGGGGGGCTATATTTTCAGGGAGTAAAATGG
GTATATT

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR4EB55TF 800 0 0
GGAAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATACAATACATGATTTTGTCCTGTTGAACTTTTC
TCCCGGTCCCGGTAAGTCAATTATCTCTTTGGGGGGCTATATTTTCAGGGAGTAAAATGG
GTATATTCCCCGAGTTTGGTGCCTGGATCAGTCAGAACACACAACATCCTACAAAATCTG
AAGAAAATGTTAAATCCAAGCCAATGGCACAGCCAAAAACTCACGAGGAGAGAAATGAGT
TGAAGGAGCAATTAAAACTATGGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAAACTC
CTCCTACCGTGAAGAAGGTGCGTACAGACCATAATTCTGGCATTTCCTATATGAAAATGG
AATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGGCTTTTTAACTAATGAAGACAACA
TAGCATACTCCAGAGAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGGATGTAGGTGATCAAGGGAGTA
TGCTGGACGTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGGCATGGAACTTCCTTTTCTTGTCAGGAACTA
TCCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAATACCCAAACAAACTTGACGTGCACTACATGAAAC
AGCAAAATGGAATAAGGTCAATGGAATCGTTCGAGGGTTGGTATACAGTGGAGCCAGTGT
ATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCGAGCACATGAAGCCAAAGAGTCAAGAGATACAGAAAA
TGTAGTGGTGGAAAAGGATAACTGCGTCCAAGTTAAAGTGTTCAGACTTTAGCCTGCTTC
TCTTGGGATCTGCCACTGCT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

CO CL4067Contig1 910 3 4 U
GCACGTATCACAATTTGATTAAAAGAAGAGAGTATGCATTACATATGACACAACAACAAC
AACACAAATGTATGGTATACCTGGGAGATTATCCCATCGGGGGGCAACAATAGGAAACGG
TGAGCGTAAAACCACCAACCCGTGAATAAAAATTCAAAGAATGGCTCTTCTATCCTACAA
CATCCTAACGTGGCTGACGAACCAAAACCAAAACAAAAACAAGAGAGAAAGTAACCACCT
CTCC*AGTCTTCTTCTTCTTCTTCTCATCGTCTCCTCACGCTCGGCGAGTGTGCATACCC
TTCAAAGAAATCAAGAACGATTCTCTCAATATCTTCAACCGAATACTTTAGGTAGTTCTC
AGGGTGTCTCCCACTCTCTATATGACCCCTGAACCTTCCAAGAAACGATCTATAAGCCGG
GATCAGATGCTCGGACAAAGATATCCTCAGCTCCTCTCTAAGCTGAGCATCCGGAACCGA
CCACGTAGACTGAGACCTATGAACCTCTTCGAACATCGCGTTGAACGCTTTAAACCTCTC
TCTCAACGCGCTTCTCGACACACCGGATGAGAAACTCCCACTCACGTGCAACCCTTCGTC
TCTCAAACTATTCAGCACTCTAACCCACGTGGATCTCTGGTAGTTCGTCGCCGCGTGTCT
GAATATCCCCGTGAGTTTCCTCAGATAATGGTCACCGATCATTTCCCTCAGCTCCGGCGA
TCCTTTCACCTTCTGAACTATGTAATGAATGTTGTTCATGATGAATATGTGAGCTAGGGA
CGCGTCTCTGTAGTGATGCGACTTCTCTTCCAAGTTGTAATGCAGCACCATGATCAGCCA
TATCAGATGCAGAGCCAAGG*AGACTTGCCGTCCAGCTCGGTGTAATCCATAACCGGTTT
GTTCGTCTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR4A043JQD U 1
AF RR4A043TFB C 85
AF RR4A043JQ U 98
BS 1 92 RR4A043JQD
BS 93 93 RR4A043TFB
BS 94 908 RR4A043JQD
BS 909 910 RR4A043JQ

RD RR4A043JQD 908 0 0
GCACGTATCACAATTTGATTAAAAGAAGAGAGTATGCATTACATATGACACAACAACAAC
AACACAAATGTATGGTATACCTGGGAGATTATTCCATCGGGGGGCAACAATAGGAAACGG
TGAGCGTAAAACCACCAACCCGTGAATAAAAATTCAAAGAATGGCTCTTCTATCCTACAA
CATCCTAACGTGGCTGACGAACCAAAACCAAAACAAAAACAAGAGAGAAAGTAACCACCT
CTCC*AGTCTTCTTCTTCTTCTTCTCATCGTCTCCTCACGCTCGGCGAGTGTGCATACCC
TTCAAAGAAATCAAGAACGATTCTCTCAATATCTTCAACCGAATACTTTAGGTAGTTCTC
AGGGTGTCTCCCACTCTCTATATGACCCCTGAACCTTCCAAGAAACGATCTATAAGCCGG
GATCAGATGCTCGGACAAAGATATCCTCAGCTCCTCTCTAAGCTGAGCATCCGGAACCGA
CCACGTAGACTGAGACCTATGAACCTCTTCGAACATCGCGTTGAACGCTTTAAACCTCTC
TCTCAACGCGCTTCTCGACACACCGGATGAGAAACTCCCACTCACGTGCAACCCTTCGTC
TCTCAAACTATTCAGCACTCTAACCCACGTGGATCTCTGGTAGTTCGTCGCCGCGTGTCT
GAATATCCCCGTGAGTTTCCTCAGATAATGGTCACCGATCATTTCCCTCAGCTCCGGCGA
TCCTTTCACCTTCTGAACTATGTAATGAATGTTGTTCATGATGAATATGTGAGCTAGGGA
CGCGTCTCTGTAGTGATGCGACTTCTCTTCCAAGTTGTAATGCAGCACCATGATCAGCCA
TATCAGATGCAGAGCCAAGG*AGACTTGCCGTCCAGCTCGGTGTAATCCATAACCGGTTT
GTTCGTCT

QA 1 908 1 908
DS 

RD RR4A043TFB 826 0 0
GAGATTATCCCATCGGGGGGCAACAATAGGAAACGGTGAGCGTAAAACCACCAACCCGTG
AATAAAAATTCAAAGAATGGCTCTTCTATCCTACAACATCCTAACGTGGCTGACGAACCA
AAACCAAAACAAAAACAAGAGAGAAAGTAACCACCTCTCCCAGTCTTCTTCTTCTTCTTC
TCATCGTCTCCTCACGCTCGGCGAGTGTGCATACCCTTCAAAGAAATCAAGAACGATTCT
CTCAATATCTTCAACCGAATACTTTAGGTAGTTCTCAGGGTGTCTCCCACTCTCTATATG
ACCCCTGAACCTTCCAAGAAACGATCTATAAGCCGGGATCAGATGCTCGGACAAAGATAT
CCTCAGCTCCTCTCTAAGCTGAGCATCCGGAACCGACCACGTAGACTGAGACCTATGAAC
CTCTTCGAACATCGCGTTGAACGCTTTAAACCTCTCTCTCAACGCGCTTCTCGACACACC
GGATGAGAAACTCCCACTCACGTGCAACCCTTCGTCTCTCAAACTATTCAGCACTCTAAC
CCACGTGGATCTCTGGTAGTTCGTCGCCGCGTGTCTGAATATCCCCGTGAGTTTCCTCAG
ATAATGGTCACCGATCATTTCCCTCAGCTCCGGCGATCCTTTCACCTTCTGAACTATGTA
ATGAATGTTGTTCATGATGAATATGTGAGCTAGGGACGCGTCTCTGTAGTGATGCGACTT
CTCTTCCAAGTTGTAATGCAGCACCATGATCAGCCATATCAGATGCAGAGCCAAGGGAGA
CTTGCCGTCCAGCTCGGTGTAATCCATAACCGGTTTGTTCGTCT
CC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4A043JQ 813 0 0
CGGGGGGCAACAATAGGAAACGGTGAGCGTAAAACCACCAACCCGTGAATAAAAATTCAA
AGAATGGCTCTTCTATCCTACAACATCCTAACGTGGCTGACGAACCAAAACCAAAACAAA
AACAAGAGAGAAAGTAACCACCTCTCC*AGTCTTCTTCTTCTTCTTCTCATCGTCTCCTC
ACGCTCGGCGAGTGTGCATACCCTTCAAAGAAATCAAGAACGATTCTCTCAATATCTTCA
ACCGAATACTTTAGGTAGTTCTCAGGGTGTCTCCCACTCTCTATATGACCCCTGAACCTT
CCAAGAAACGATCTATAAGCCGGGATCAGATGCTCGGACAAAGATATCCTCAGCTCCTCT
CTAAGCTGAGCATCCGGAACCGACCACGTAGACTGAGACCTATGAACCTCTTCGAACATC
GCGTTGAACGCTTTAAACCTCTCTCTCAACGCGCTTCTCGACACACCGGATGAGAAACTC
CCACTCACGTGCAACCCTTCGTCTCTCAAACTATTCAGCACTCTAACCCACGTGGATCTC
TGGTAGTTCGTCGCCGCGTGTCTGAATATCCCCGTGAGTTTCCTCAGATAATGGTCACCG
ATCATTTCCCTCAGCTCCGGCGATCCTTTCACCTTCTGAACTATGTAATGAATGTTGTTC
ATGATGAATATGTGAGCTAGGGACGCGTCTCTGTAGTGATGCGACTTCTCTTCCAAGTTG
TAATGCAGCACCATGATCAGCCATATCAGATGCAGAGCCAAGG*AGACTTGCCGTCCAGC
TCGGTGTA*TCCATAACCGGTTTGTTCGTCTCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4069Contig1 518 2 2 U
GGGCGATAAACCTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTAGGTCTTTCTTTGAACTTTCTCGAG
AAAAAATGTCTTGCTGCGGATGGAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAACG
GTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCCGGCGAGACAACCACGA
GTGAGACTTTTGTCTCTGGTGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCG
AGAGTAACGTCGAGAACGATGGATGCACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGATC
CTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTT
TTTAGTTAAGTAATAATACTACTGCAATGATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTT
AATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTGTGTCTTTGGTCTGTCTCTGCCAATT
TGTGAGCATTATAGATGATGAGCCACTTTTGATTTACC


BQ
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AF RR4H584TF U 1
AF RR4H584JQB C 209
BS 1 509 RR4H584TF
BS 510 518 RR4H584JQB

RD RR4H584TF 518 0 0
GGGCGATAAACCTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTAGGTCTTTCTTTGAACTTTCTCGAG
AAAAAATGTCTTGCTGCGGATGGAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAACG
GTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCCGGCGAGACAACCACGA
GTGAGACTTTTGTCTCTGGTGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCG
AGAGTAACGTCGAGAACGATGGATGCACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGATC
CTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTT
TTTAGTTAAGTAATAATACTACTGCAATGATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTT
AATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTGTGTCTTTGGTCTGTCTCTGCCAATT
TGTGAGCATTATAGATGATGAGCCACTTT
TGATTTACC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4H584JQB 310 0 0
GGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGAGTAACGTCGAGAACGATGGATGCAC
ATGCAAGTGTGGATTTGACTGCAAGTGTGATCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTT
TTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTTTTTAGTTAAGTAATAATACTACTGCAAT
GATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTTAATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTT
TCGTTTGTGTCTTTGGTCTGTTTCTGCCAATTTGTGAGCATTATAGATGATGAGCCACTT
TTGATTTACC

QA 1 310 1 310
DS 



AS 1 3

CO CL4070Contig1 904 3 3 U
AGTCTAATGATTTATTTTGGTTCGTTCAGTCCACATTTTTATTGTTTCTGATACATGGAG
AAAGAAGAAGAAACAGAGAGTACAATAAAGTACAATTTGCATCAGCAGATTACTAATACG
TTCACACACAACACTAACACAGTGTTAACCCTTCCTAAACGGCTCACAGTAAGGAAGCTT
CAGAATGTGATGACTTGTTTGGGTTGTCTACCTACCTTCCCGAGAGCTTTATCGAGGGCG
ACAGGGAACTCGTCGAAAGGAACCAGTTCCGTTTCGTATTTTAGCTTTCCGTCCCGGGCA
AGCCCGAGAAGATAGTCTATCATCTCCCTGCATTCTTTTACTTTACCCAAACTCAACCAG
TTCTGCAGCCAAAACCCTTTCAACTCCAAATCCTTGAAGATGAAAGATGTTGTTGAAACA
GTGATTGGCTTCTTAGACATCCCACCATATGTTACCATGGTTCCTCCTTCCCTCAGAAAC
TTGAGGACGAGAGAGGCAGCATTGCCACCAACACAGTTGAATCCCAGATCTGGTTCAGGT
AACTCTCCCAAAAGACTTTTCACATTCTTCACACTCAGATGACTCTCCGAAAACACTTGG
TCTGCACATAGAGCTTTCAGATTCTCTTTTGCTTCATCCGACCCGGGCCTATCACGGATG
ATATTGATGGTACTGATGCTCGTATACGATGGCCTTTGACGGTGGCGACATAAGCATAGA
GAAGGATCTCAGAGAACGTGTTCGTGTTTCTCCGCTTTGGTTCAGCCTGAAATTCACCGC
CGACGACAGTTTTAGAGCTCGGACACCGACTGACTTCATCAACGCCGTCATCTCTCTCTC
GCTCTCTTTTCTCTCGCTCTCTTTCCGACGGACTTTATTCTCAGATGCCCCAACCTCTCT
TTCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4G285JQ U 1
AF RR4A704JQ U 19
AF RR4A704TF C 159
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BS 719 904 RR4A704TF

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CAGAATGTGATGACTTGTTTGGGTTGTCTACCTACCTTCCCGAGAGCTTTATCGAGGGCG
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AGCCCGAGAAGATAGTCTATCATCTCCCTGCATTCTTTTACTTTACCCAAACTCAACCAG
TTCTGCAGCCAAAACCCTTTCAACTCCA

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DS 

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AGTACAATAAAGTACAATTTGCATCAGCAGATTACTAATACGTTCACACACAACACTAAC
ACAGTGTTAACCCTTCCTAAACGGCTCACAGTAAGGAAGCTTCAGAATGTGATGACTTGT
TTGGGTTGTCTACCTACCTTCCCGAGAGCTTTATCGAGGGCGACAGGGAACTCGTCGAAA
GGAACCAGTTCCGTTTCGTATTTTAGCTTTCCGTCCCGGGCAAGCCCGAAAAGATAGTCT
ATCATCTCCCTGCATTCTTTTACTTTACCCAAACTCAACCAGTTCTGCAGCCAAAACCCT
TTCAACTCCAAATCCTTGAAGATGAAAGATGTTGTTGAAACAGTGATTGGCTTCTTAGAC
ATCCCACCATATGTTACCATGGTTCCTCCTTCCCTCAGAAACTTGAGGACGAGAGAGGCA
GCATTGCCACCAACACAGTTGAATCCCAGATCTGGTTCAGGTAACTCTCCCAAAAGACTT
TTCACATTCTTCACACTCAGATGACTCTCCGAAAACACTTGGTCTGCACATAGAGCTTTC
AGATTCTCTTTTGCTTCATCCGACCCGGGCCTATCACGGATGATATTGATGGTACTGATG
CTCGTATACGATGGCCTTTGACGGTGGCGACATAAGCATA

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DS 

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ACGGCTCACAGTAAGGAAGCTTCAGAATGTGATGACTTGTTTGGGTTGTCTACCTACCTT
CCCGAGAGCTTTATCGAGGGCGACAGGGAACTCGTCGAAAGGAACCAGTTCCGTTTCGTA
TTTTAGCTTTCCGTCCCGGGCAAGCCCGAGAAGATAGTCTATCATCTCCCTGCATTCTTT
TACTTTACCCAAACTCAACCAGTTCTGCAGCCAAAACCCTTTCAACTCCAAATCCTTGAA
GATGAAAGATGTTGTTGAAACAGTGATTGGCTTCTTAGACATCCCACCATATGTTACCAT
GGTTCCTCCTTCCCTCAGAAACTTGAGGACGAGAGAGGCAGCATTGCCACCAACACAGTT
GAATCCCAGATCTGGTTCAGGTAACTCTCCCAAAAGACTTTTCACATTCTTCACACTCAG
ATGACTCTCCGAAAACACTTGGTCTGCACATAGAGCTTTCAGATTCTCTTTTGCTTCATC
CGACCCGGGCCTATCACGGATGATATTGATGGTACTGATGCTCGTATACGATGGCCTTTG
ACGGTGGCGACATAAGCATAGAGAAGGATCTCAGAGAACGTGTTCGTGTTTCTCCGCTTT
GGTTCAGCCTGAAATTCACCGCCGACGACAGTTTTAGAGCTCGGACACCGACTGACTTCA
TCAACGCCGTCATCTCTCTCTCGCTCTCTTTTCTCTCGCTCTCTTTCCGACGGACTTTAT
TCTCAGATGCCCCAACCTCTCTTTCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 3

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GGATCCTTAAAAAAAAATCCCCAGTCGATTCAGAACCCTAAGCGGTGCCATCCTCAACAC
CACAACAACTATGGCTGAACCCGATTCTCCTCCTCCTCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTT
CGTTGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTCTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGC
CGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGATAAGGAGACTCAGAACTCGACGGTCTCTTT
CCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAAGGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGG
GACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATACACTTGGAGGGTTTCTTGTCCT
GAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAACAAGAAGTCAACGGATGATGA
TGATGATGATCAAGCTCCTCATCCCGAAGATGATTGATTGATGATGAAGGCTTGGTCATA
TTTGCACGACGAAGGCAATGAAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAAAAACA
CCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGCATCTCTACTCAAGACTCTATTGAGTTTCTTC
TACTTCTGTAATGACTAGTAACACGTACGTTTAGGGTGTTGTGGGTGTCGGTTCTCACCC
GGGTCTGAACTGCTAAATTTGCACACACAAATTGGAGATGAGATCCGTGGAGCTCTGAAA
CGAGCTTCAAGGAAGACACAAGAACCTCGCCACGTTCTATAGAGGACGTGAGAAATTGAA
AGATACTATATGTAATAACAATCAATGTTCTGTTATAACGCTATGTATCACATACATACC
TTTACAATATTTTGTTTTTGACTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E214TF U 1
AF RR4FC38TF U 29
AF RR4FC38JQ C 164
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CGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGATAAGGAGACTCAGAACTCGACGGTCTCTTT
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GACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCT
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CGATGATGATCAAGCTCCTCATCCCGAAGATGATTGATTGATGATGAAGGCTTGGTCATA
TTTGCACGACGAAGGCAATGAAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAAAAACA
CCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTCTATTGAGTTTCTTC
TACTTCTGTAATGACTAGTA
CGATTCTCCTCTCT

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DS 

RD RR4FC38TF 767 0 0
G
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CTCCTCCTCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTTGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAAC
CTAAGTCTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAG
ATAAGGAGACTCAGAACTCGACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGC
CACTCAAGGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGC
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GGAACGAGAACAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCATCCCGAAG
ATGATTGATTGATGATGAAGGCTTGGTCATATTTGCACGACGAAGGCAATGAAATCTTTT
ACCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGC
ATCTCTACTCAAGACTCTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTAGTAACACGTACG
TTTAGGGTGTTGTGGGTGTCGGTTCTCACCCGGGTCTGAACTGCTAAATTTGCACACACA
AATTGGAGATGAGATCCGTGGAGCTCTGAAACGAGCTTCAAGGA*GACACAAGAACCTCG
CCACGTTCTATAGAGGACGTGAGAAATTGAAAGATACTATATGTA
T

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR4FC38JQ 705 0 0
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GGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAACAAG
AAGTCAACGGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCATCCCGAAGATGATTGATTGATG
ATGAAGGCTTGGTCATATTTGCACGACGAAGGCAATGAAATCTTTTACCCCCATTTTGGT
TCTGTATAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGCATCTCTACTCAAGA
CTCTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTAGTAACACGTACGTTTAGGGTGTTGTG
GGTGTCGGTTCTCACCCGGGTCTGAACTGCTAAATTTGCACACACAAATTGGAGATGAGA
TCCGTGGAGCTCTGAAACGAGCTTCAAGGAAGACACAAGAACCTCGCCACGTTCTATAGA
GGACGTGAGAAATTGAAAGATACTATATGTAATAACAATCAATGTTCTGTTATAACGCTA
TGTATCACATACATACCTTTACAATATTTTGTTTTTGACTTTGTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

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CTAAAAAAGGACTCTCACATTTATTTGTATGGGTGAAAATGCAATCGTACATAAATCATA
TCTTTTGATCACACAGAGTTTCTTGAAGCTTTTTGGTTGCTTGACGTAAAGTGATTCCAT
CACATTATACAGCAATTTGGTGAAGACTCAAGCATCTCTGGAGATATTTGGCCTAGGCTT
GCGAAATCAAACCCTGGATCCATCTCTTGAACAATATCATTAGGTGGTTGTCCGCACTCT
TGCATCTTCTGCATGATCTCCATAATCTTAGTTGAATTGTTTGGTTCATCCTCGTAAACC
GCATTGAGTTCTTTGATCAGTTTGTACTGTTGCGAATAGCGGTTATAGTCTTCTTTGCTT
ATACTGCCTTCGTTCTCTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGT
TCGTGGAGGATATCCTTCGACAGTAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAG
CCCTGAGATCCAGCGAGACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCCCCA
TCACCAGAAGCTGCCTGCTGCTGCTGCTGCTTGGAAGAGATAGATTCCACAGTTTCCCTA
GTTTGTTCCCTAAGCTTGTCAAGAGCTTCC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG61JQ U 1
AF RR4DO70TF C 4
BS 1 72 RR4GG61JQ
BS 73 73 RR4DO70TF
BS 74 480 RR4GG61JQ
BS 481 481 RR4DO70TF
BS 482 571 RR4GG61JQ
BS 572 630 RR4DO70TF

RD RR4GG61JQ 587 0 0
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TCTTTTGATCACCCAGAGTTTCTTGAAGCTTTTTGGTTGCTTGACGTAAAGTGATTCCAT
CACATTATACAGCAATTTGGTGAAGACTCAAGCATCTCTGGAGATATTTGGCCTAGGCTT
GCGAAATCAAACCCTGGATCCATCTCTTGAACAATATCATTAGGTGGTTGTCCGCACTCT
TGCATCTTCTGCATGATCTCCATAATCTTAGTTGAATTGTTTGGTTCATCCTCGTAAACC
GCATTGAGTTCTTTGATCAGTTTGTACTGTTGCGAATAGCGGTTATAGTCTTCTTTGCTT
ATACTGCCTTCGTTCTCTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGT
TCGTGGAGGATATCCTTCGACAGTAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAG
TCCTGAGATCCAGCGAGACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCCCCA
TCACCAGAAGCTGCCTGCTGCTGCTGCTGCT
GTTGCTTGGAAGAGAT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4DO70TF 627 0 0
AAAAAGGACTCTCACATTTATTTGTATGGGTGAAAATGCAATCGTACATAAATCATATCT
TTTGATCACACAGAGTTTCTTGAAGCTTTTTGGTTGCTTGACGTAAAGTGATTCCATCAC
ATTATACAGCAATTTGGTGAAGACTCAAGCATCTCTGGAGATATTTGGCCTAGGCTTGCG
AAATCAAACCCTGGATCCATCTCTTGAACAATATCATTAGGTGGTTGTCCGCACTCTTGC
ATCTTCTGCATGATCTCCATAATCTTAGTTGAATTGTTTGGTTCATCCTCGTAAACCGCA
TTGAGTTCTTTGATCAGTTTGTACTGTTGCGAATAGCGGTTATAGTCTTCTTTGCTTATA
CTGCCTTCGTTCTCTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGTTCG
TGGAGGATATCCTTCGACAGTAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAGCCC
TGAGATCCAGCGAGACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCCTCATCA
CCAGAAGCTGCCTGCTGCTGCTGCTGCTTGGAAGAGATAGATTCCACAGTTTCCCTAGTT
TGTTCCCTAAGCTTGTCAAGAGCTTCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 3

CO CL4073Contig1 803 3 21 U
TTTTTTTTAGTAGCATGAAGAAATCATACTTTATTTACTATAAACTTATGAGAATTACAA
TACAATCATTACACAATAATAGCAATTTCAGTAACCAAATACTATTGAAACTATGGTTTC
ACAGGAATACTCTGTTCGTTCCTGAAGAAGTTCCCACTGTCAACTCTCGTCTTAATCTTC
ACCAACCTCTCGAAATTGCCGTTGAAATATTTCTTCCCGTAACGTTCACCTTCCACGTAG
CTCCGGACAACTCCGTCGTGAGAATTAATCCCCAAGTCAACATCCCGATAGTTAAAGTAC
GACTGTCTCGGATTCTTGGAAACAAAAGGAGTCATGAACCGGTACAGCTCCCTCGTCAGC
TCCAAATACCGGTTCGTCAGCCTATCTTCTCTCCAGTTCGCACCGTACTGAATCTTCCAG
AGATTCCCTGCTCTGTATGGGAACGGAGTCGCCCTTGACGGAACCCTCCCCATCATGCCG
CCGTATGGATTGAAAGCCATCGTCGGAATCTCAAGCTCGATCATCTTCTTCCAGATAGAT
TCTAAACCGGTTCTCGAAATCGGTTCGCGGACGTAATCGGACTTCCTCTTGAGATAATTC
ACGGTCTGGTTCCTCTGGAGTAGAACTGTCTCCGGCGTACCAACTCGGATATTAGTCCAG
AAAAGAACCGATTGGATCCAGCTCGTCTCGGTACAGTCGGATAAGACCAGTCCCAATTCT
GGTAATCTCCGGTTTAATATAGACAGAAGCGTCGTTGCGTCTCCCAGGAAATGCCTACGA
AAGATGCCCTAACGGTCTTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G208JQ U 16
AF RR4FQ44JQ U 17
AF RR4BU32JQ U 1
BS 1 173 RR4BU32JQ
BS 174 174 RR4G208JQ
BS 175 197 RR4BU32JQ
BS 198 198 RR4G208JQ
BS 199 213 RR4BU32JQ
BS 214 214 RR4G208JQ
BS 215 437 RR4BU32JQ
BS 438 438 RR4G208JQ
BS 439 449 RR4BU32JQ
BS 450 450 RR4G208JQ
BS 451 452 RR4BU32JQ
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BS 455 455 RR4BU32JQ
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BS 457 503 RR4BU32JQ
BS 504 504 RR4G208JQ
BS 505 554 RR4BU32JQ
BS 555 555 RR4G208JQ
BS 556 566 RR4BU32JQ
BS 567 567 RR4G208JQ
BS 568 803 RR4BU32JQ

RD RR4G208JQ 662 0 0
CGA
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AGCCTATCTTCTCTCCAGTACGCACCGTACTGAATCTTCCAGAGATTCCCTGCTCTGTAT
GGGAACGGAGTCGCCCTTGACGGAACCCTCCCCATCATGCCGCCGTATGGATTGAAAGCC
ATCGTCGGAATCTCAAGCTCGATCATCTTCTTCCAGATAGATTCTAAACCGGTTCTCGAA
ATCGGTTCGCGGACGTAATCGGGCTTCCTCTTGAGATAATTCACGGTCTGGTTCCTCTAG
AGTAGAACTGTCTCCGGCGTACCAACTCGGATATTAGTCCAGAAAAGAACCGAT
TGGAT

QA 4 657 4 657
DS 

RD RR4FQ44JQ 656 0 0
GG
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ATAGCAATTTCAGTAACCAAATACTATTGAAACTATGGTTTCACAGGAATACTCTGTTCG
TTCCTGAAGAAGTTCCCACTGTCAACTCTCGTCTTAATCTTCACCAACCTCTCGAAATTG
CCGTTGAAATATTTCTTCCCGTAACGTTCACCTTCCACGTAGCTCCGGACAACTCCGTCG
TGAGAATTAATCCCCAAGTCAACATCCCAATAGTTAAAGTACGACTGTCTCGGATTCTTG
GAAACAAAAGGAGTCATGAACCGGTACAGCTCCCTCGTCAGCTCCAAATACCGGTTCGTC
AGCCTATCTTCTCTCCAGTTCGCACCGTACTGAATCTTCCAGAGATTCCCTGCTCTGTAT
GGGAACGGAGTCGCCCTTGACGGAACCCTCCCCATCATGCCGCCGTATGGATTGAAAGCC
ATCGTCGGAATCTCAAGCTCGATAATCTTCTTCCAGATAGATTCTAAACCGGTTCTCGAA
ATCGGTTCGCGGACGTAATCGGACTTCCTCTTGAGATAATTCACGGTCTGGTTCCTCTGG
AGTAGAACTGTCTCCGGCGTACCAACTCGGATATTAGTCCAGAAAAGAACCGAT

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR4BU32JQ 803 0 0
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TACAATCATTACACAATAATAGCAATTTCAGTAACCAAATACTATTGAAACTATGGTTTC
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ACCAACCTCTCGAAATTCCCGTTGAAATATTTCCTCCCGTAACGTTCACCTTCCACGTAG
CTCCGGACAACTCCGTCGTGAGAATTAATCCCCAAGTCAACATCCCGATAGTTAAAGTAC
GACTGTCTCGGATTCTTGGAAACAAAAGGAGTCATGAACCGGTACAGCTCCCTCGTCAGC
TCCAAATACCGGTTCGTCAGCCTATCTTCTCTCCAGTTCGCACCGTACTGAATCTTCCAG
AGATTCCCTGCTCTGTACGGGAACGGAGTTGCTGTCGACGGAACCCTCCCCATCATGCCG
CCGTATGGATTGAAAGCCATCGTAGGAATCTCAAGCTCGATCATCTTCTTCCAGATAGAT
TCTAAACCGGTTCTTGAAATCGGTTCACGGACGTAATCGGACTTCCTCTTGAGATAATTC
ACGGTCTGGTTCCTCTGGAGTAGAACTGTCTCCGGCGTACCAACTCGGATATTAGTCCAG
AAAAGAACCGATTGGATCCAGCTCGTCTCGGTACAGTCGGATAAGACCAGTCCCAATTCT
GGTAATCTCCGGTTTAATATAGACAGAAGCGTCGTTGCGTCTCCCAGGAAATGCCTACGA
AAGATGCCCTAACGGTCTTTTGA

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL4074Contig1 722 2 30 U
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TAAAACTTCGCATCCAGAGCTCAATGAATAGTACGATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAA
AAAGCTATGGCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCA
GGCTGGAGATGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGAT
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AGCTGCGGTTGGCTACCTCGAAGGAGTGATCGAGAAGCTCAAAGCCACTAAGGAGCCTCG
CATCACTGAACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCCTTGTTCAAGCTTGAGCAAGG
TGATCAGAAGGAGTGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCAAAGACCTCTCTTGATAGCATGAC
TGACATTGACCCTTCGGTGTACGCGAACTTCTACTGGGTCTCTTCTCAGTACCACAAGTT
CCGTCAAGAGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTATCTTGCGTATACCTCTGT
GGAGGCACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCT
ACTTGGAAAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4GX14TF U 1
AF RR4FA11TF U 7
BS 1 13 RR4GX14TF
BS 14 14 RR4FA11TF
BS 15 89 RR4GX14TF
BS 90 90 RR4FA11TF
BS 91 92 RR4GX14TF
BS 93 93 RR4FA11TF
BS 94 315 RR4GX14TF
BS 316 316 RR4FA11TF
BS 317 330 RR4GX14TF
BS 331 331 RR4FA11TF
BS 332 361 RR4GX14TF
BS 362 362 RR4FA11TF
BS 363 399 RR4GX14TF
BS 400 400 RR4FA11TF
BS 401 456 RR4GX14TF
BS 457 457 RR4FA11TF
BS 458 460 RR4GX14TF
BS 461 461 RR4FA11TF
BS 462 546 RR4GX14TF
BS 547 547 RR4FA11TF
BS 548 552 RR4GX14TF
BS 553 553 RR4FA11TF
BS 554 594 RR4GX14TF
BS 595 595 RR4FA11TF
BS 596 639 RR4GX14TF
BS 640 640 RR4FA11TF
BS 641 667 RR4GX14TF
BS 668 668 RR4FA11TF
BS 669 714 RR4GX14TF
BS 715 722 RR4FA11TF

RD RR4GX14TF 720 0 0
GGACTTCTGCGAATCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCT
TAAAACTTCGCATCCAGAGCTCAATGAATGGTGCGATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAA
AAAGCTATGGCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCA
GGCTGGAGATGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGAT
CAACCTCCTCAAGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCGGTACTCTGAGAAAGA
AGCTGCGGTTGGCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAGGAGCCTCG
CGTCACTGAACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGG
TGATCAGAAGGAGTGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAGGCCTCTCTTGATAGCATGAC
TGACATTGACCCTTCGGTGTACGCGAACTTCTACTGGGTCTCTTCTCAGTACCACAAGTT
CCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTATCTTGCGTATACTTCTGT
GGAGGCACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTTGATTTGTCACTTTCAGCTCT
ACTTGGAGAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAA
GTCTCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FA11TF 716 0 0
GG
GCGAAGCAAAACCTATTTTCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTTAAAACTT
CGCATCCAGAGCTCAATGAATAGTACGATTCCCTCTCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTAT
GGCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCAGGCTGGAG
ATGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAATCTCC
TCAAGCTTGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCGGTACTCTGAGAAAGAAGCTGCGG
TTGGCTACCTCGAAGGAGTGATCGAGAAGCTTAAAGCCACTAAGGAGCCTCGCATCACTG
AACCTATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCCTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGA
AGGAGTGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCAAAGACTTCTCTTGATAGCATGACTGACATTG
ACCCTTCGGTGTACGCGAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAAG
AGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTATCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGCAC
TCTCTGAATCGTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAA
AAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCT

QA 3 716 3 716
DS 



AS 1 3

CO CL4075Contig1 694 3 5 U
TTTTTCACCTTGCTGCTTCTGTCATAAAGCCAAACCTTCCCAAACGTAACTATTTTTTCT
TCTTCTTACTACTAACATAGAACGAGAACAAGAAGCCTCCTCCAGTTTCATACTGTAGAT
CCTGCCTCTCTTCTTACTAGTATATATAAGCTCCTCTCAAAACTGGCATGAAGTGCCAAG
TCTCTGTCTCTTGCTCAACGTTGCCGTTTTGCGTTTTGCAAAAGCCGGTCCAAGCAACTC
TTGGAACCTCTCCAAGAACACAACCCACTCGTCCTCTTTCATGTCCGCTACTTTCACAAA
GCTTGCACTCACTTGAAGCTGCTCGTTTGCGCTTTTGTGACCAGACGACGTGTTCTCTGA
TTTGCCTCTTGTTAAAGTCTTTGTGCTGCTTTTCCTTCCTATCTCGCTAAGATGCGTGTT
CTTCATCGATGTAGAAAGCTTTGAAAGAGATGTAGATTTGTCATGAAAAGCAGCACAACT
AAAAAAACTGTCTTTCATTGTCATCATTACAGGGACAGCGTTTTCAGTATTGTCCTCGTC
CTCTTCATCATCATCTTCATCCTCTTCTTCCTTGATGCTTTCTTCAAGCTTTCCTAGCGA
AGAACGTCCGTTCGAAAAAGGATTCTTCGTGAAGTAGTCATCGGTCACTTGCATCTTGGA
GCCGTAGACTGATTCCAACTCATCACAGTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F773JQ U 1
AF RR4BV36JQ U 68
AF RR4BV36TF C 115
BS 1 180 RR4F773JQ
BS 181 181 RR4BV36JQ
BS 182 487 RR4F773JQ
BS 488 619 RR4BV36JQ
BS 620 694 RR4BV36TF

RD RR4F773JQ 487 0 0
TTTTTCACCTTGCTGCTTCTGTCATAAAGCCAAACCTTCCCAAACGTAACTATTTTTTCT
TCTTCTTACTACTAACATAGAACGAGAACAAGAAGCCTCCTCCAGTTTCATACTGTAGAT
CCTGCCTCTCTTCTTACTAGTATATATAAGCTCCTCTCAAAACTGGCATGAAGTGCCAAG
CCTCTGTCTCTTGCTCAACGTTGCCGTTTTGCGTTTTGCAAAAGCCGGTCCAAGCAACTC
TTGGAACCTCTCCAAGAACACAACCCACTCGTCCTCTTTCATGTCCGCTACTTTCACAAA
GCTTGCACTCACTTGAAGCTGCTCGTTTGCGCTTTTGTGACCAGACGACGTGTTCTCTGA
TTTGCCTCTTGTTAAAGTCTTTGTGCTGCTTTTCCTTCCTATCTCGCTAAGATGCGTGTT
CTTCATCGATGTAGAAAGCTTTGAAAGAGATGTAGATTTGTCATGAAAAGCAGCACAACT
AAAAAAA

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR4BV36JQ 552 0 0
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CTCTTCTTACTAGTATATATAAGCTCCTCTCAAAACTGGCATGAAGTGCCAAGTCTCTGT
CTCTTGCTCAACGTTGCCGTTTTGCGTTTTGCAAAAGCCGGTCCAAGCAACTCTTGGAAC
CTCTCCAAGAACACAACCCACTCGTCCTCTTTCATGTCCGCTACTTTCACAAAGCTTGCA
CTCACTTGAAGCTGCTCGTTTGCGCTTTTGTGACCAGACGACGTGTTCTCTGATTTGCCT
CTTGTTAAAGTCTTTGTGCTGCTTTTCCTTCCTATCTCGCTAAGATGCGTGTTCTTCATC
GATGTAGAAAGCTTTGAAAGAGATGTAGATTTGTCATGAAAAGCAGCACAACTAAAAAAA
CTGTCTTTCATTGTCATCATTACAGGGACAGCGTTTTCAGTATTGTCCTCGTCCTCTTCA
TCATCATCTTCATCCTCTTCTTCCTTGATGCTTTCTTCAAGCTTTCCTAGCGAAGAACGT
CCGTTCGAAAAA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4BV36TF 580 0 0
GTAGATCCTGCCTCTCTTCTTACTAGTATATATAAGCTCCTCTCAAAACTGGCATGAAGT
GCCAAGTCTCTGTCTCTTGCTCAACGTTGCCGTTTTGCGTTTTGCAAAAGCCGGTCCAAG
CAACTCTTGGAACCTCTCCAAGAACACAACCCACTCGTCCTCTTTCATGTCCGCTACTTT
CACAAAGCTTGCACTCACTTGAAGCTGCTCGTTTGCGCTTTTGTGACCAGACGACGTGTT
CTCTGATTTGCCTCTTGTTAAAGTCTTTGTGCTGCTTTTCCTTCCTATCTCGCTAAGATG
CGTGTTCTTCATCGATGTAGAAAGCTTTGAAAGAGATGTAGATTTGTCATGAAAAGCAGC
ACAACTAAAAAAACTGTCTTTCATTGTCATCATTACAGGGACAGCGTTTTCAGTATTGTC
CTCGTCCTCTTCATCATCATCTTCATCCTCTTCTTCCTTGATGCTTTCTTCAAGCTTTCC
TAGCGAAGAACGTCCGTTCGAAAAAGGATTCTTCGTGAAGTAGTCATCGGTCACTTGCAT
CTTGGAGCCGTAGACTGATTCCAACTCATCACAGTCAAGC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4077Contig1 876 3 8 U
TTTTTTTCCTCTCCTCTCTAACCTCTCCTCTCAGCTTGTGCTGGATCTCTCCAGCAGAGA
CGAACCAATCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCG
GGCTATCAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGTCCCAAGC
TTTGCATCAACAATTGCGGTTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGT
GTCACAAGACTATCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTCTCTG
GTGGTACATCGTCATCCAGCAGCATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTTGATG
CTGAAACCAAATCCATTGAGCCGGTGGTTGTATCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAAGTTG
CCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCTGCAGCGAAACCAAAGGAAGGACCAAGCC
GATGTACTACATGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACC
TCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCG
CTGCGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAAAA
TCTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCTTCGTCCTGTCTGCGTCTGGTTCAAGGTGTGTCG
CATGTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATATGGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGTTTAT
CTTTAGTTTCTCTCTGCAATATTTGTGGTGTGGAACATTCTATTATCTGTGGTTTGAAGC
AGAGAAGTGTGCTCTTAAAGAATATGCTTTGATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF24TF U 210
AF RR4FT54TF U 1
AF RR4FT54JQ C 79
BS 1 641 RR4FT54TF
BS 642 642 RR4FT54JQ
BS 643 659 RR4FT54TF
BS 660 660 RR4FT54JQ
BS 661 692 RR4FT54TF
BS 693 693 RR4FT54JQ
BS 694 706 RR4FT54TF
BS 707 876 RR4FT54JQ

RD RR4GF24TF 361 0 0
AGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAGACTATCCTCTTTCAACAGGAA
CAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTCTCTGGTGGTACATCGTCATCCAGCAGCATCTTA
AAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTTGATGCTGAAACCAAATCCATTGAGCCGGTGGTT
GTATCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAAGTTGCCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCA
GCTGCAGCGAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATGTACTACATGCAATAAACGGGTTGGT
CTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGAC
A

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4FT54TF 706 0 0
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DS 

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TCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAAGTTGCCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCT
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GTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAAAATCTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCTTCGTC
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TGTC

QA 15 798 15 798
DS 



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AGTAGTAGCAGCAAATGGTCGAGCCAAGCCTCCCAAGCGTGTGGAGTTGACGTAATCATA
TGGCAGATGATTAGAGGCACCAGGGAATATTATTCCAAAAATCCTAATAAACGTCATAAT
CCAATTTTCTTTGTAGTCTCTGCCTTTCCAAAACCGTATTATGAAACTCCTTATGAACTC
CCACGCACCATTTAACAGCTTCGGTATTAGCCACAACAAGCTGAAGTAATTTGCATTTGG
TGCATCTTCCCTTACCTTTCCTTTGTAGAGACTATTGAAGTAATTGCAAGATCCGTAGTG
CTTGAACGCGAATAAAACCTTGTCATCAAAGGGTATCCTAGGCACAATATCGCTGTTATA
AACAAACCTCTCATACTCTATTCCATGCTTTCTCACTACTTCCTTCATAAACTCCCCAAA
CACCTCATCCCCTATGCGTGGCTGTCCAAATGTGTACACTCCCTCTAGTTTATCTAGCAA
CTCATCCTCACCGTGAATCGCCAGTACCGCTGGAAAAAGAGCGGCTAGTGCGCCACCAAG
GCTGTGACCCGTTAGAATAAACTTAAGGTTCCTGTTTTTTGCAAACATGTCCCTAAGCTT
CTGTCTAATTGTGTAGTACGCATATTGGTGTCCTAGAGGTATAATTTCTTTGGGCCATCC
GTTTTTTTGGAGGCCTAGAGCTTTAGAGCATTAATATCTTTTGAACCAAAACGGCTAACA
CAATGATCCATCGACTTGCGAAAGTTCTCCGGACGCTTTTGAGCGTGTCCGGGGGAGAAT
CTATGAATCCTGTGTTGGTCAGGTTGGGGAAAAATAAAAGGAGAAGGAGATCAAGAACAC
TCGCTTTGGTCGGATCGACCAGAAAATAGCTACTACAGAATTTCATATCGGTTTGGTACA
TTATCACTATATGAAAAGAACAGACTTCGCTGAAAAAGAAGAAGAAAGAAGTGATGTTGG
CTGATTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT09JQ U 1
AF RR4BU08JQ U 250
AF RR4BU08TF C 478
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GAG

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ACATTATCACTATATGAAAAGAACAGACTTCGCTGAAAAAGAAGAAGAAAGAAGTGATGT
TGGCTGATTTGTCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

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GGAGTTGGACTATGGATTGACCACAGCTTGTATCTGCTCCAATGTCTTCCCTTTGGTTTC
AGGCACCACGGCAATGACAAAGACAATGGCCAGCGCGTTGATCACCGCATAAATAATGAA
AGTTCCATAAGAGCTCCAAGACATAAGGAAGTTGAAAGTGTAAGAAACGGCCCATGCTCC
AAACCAGTTCACCAGCGTAGCCATGCCTCCTGCTACTCCTTTAATATTTATAGGAAATAT
CTCAGACATGACAACCCACGGCATTGCTCCCATTCCAGCTGAGAACGATGCTATGTACAC
CATTATACCAACAACAGCCAGGACAGGGACTGCTTTCTGTGCCATGTCGTGAACCTTAAG
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CAATGGCTTTCTTCCGGCTTTGTCAACTATAGGTGCATTAAGCGCAGTGATTACAACCTG
AAGAACAGCATATATTATCATCCCAAGTCTTGGTGGGAAACCTGCTTGCTCAAATATAGA
GCTCGTGTAAAAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HB49JQB U 1
AF RR4D671JQ U 30
AF RR4GT46TF C 164
BS 1 41 RR4HB49JQB
BS 42 42 RR4D671JQ
BS 43 72 RR4HB49JQB
BS 73 73 RR4D671JQ
BS 74 179 RR4HB49JQB
BS 180 180 RR4D671JQ
BS 181 323 RR4HB49JQB
BS 324 324 RR4D671JQ
BS 325 336 RR4HB49JQB
BS 337 337 RR4D671JQ
BS 338 378 RR4HB49JQB
BS 379 379 RR4D671JQ
BS 380 384 RR4HB49JQB
BS 385 385 RR4D671JQ
BS 386 439 RR4HB49JQB
BS 440 440 RR4D671JQ
BS 441 484 RR4HB49JQB
BS 485 485 RR4D671JQ
BS 486 597 RR4HB49JQB
BS 598 598 RR4D671JQ
BS 599 604 RR4HB49JQB
BS 605 611 RR4D671JQ
BS 612 612 RR4GT46TF
BS 613 666 RR4D671JQ
BS 667 793 RR4GT46TF

RD RR4HB49JQB 604 0 0
CGGGAAAGAATGCACATAACAGTGATATTAGAGCAATAGAGTTGCCATCACTAATGAGCA
TTGATTTTTTTT*GTTTCCGCCACGGTCCAATGGAACCCGACGCAAAAAACATGAATGCC
CATGTCTAAGTTTGCTGGTGAAACTTGGGCATCCGTTTGAAGTCAGAAGTGTTCATTAAA
ATAAGAGTCTAAAAAGCATTCAAAATTGATACTTAATGTCTCATATGAATGTAATATTTA
GGAGTTGGACTATGGATTGACCACAGCTTGTATCTGCTCCAATGTCTTCCCTTTGGTTTC
AGGCACCACGGCAATGACAAAGAAAATGGCCAGCGCATTGATCACCGCATAAATAATGAA
AGTTCCATAAGAGCTCCAGGACATGAGGAAGTTGAAAGTGTAAGAAACGGCCCATGCTCC
AAACCAGTTCACCAGCGTACCCATGCCTCCTGCTACTCCTTTAATATTTATAGGAAATAT
CTCAAACATGACAACCCACGGCATTGCTCCCATTCCAGCTGAGAACGATGCTATGTACAC
CATTATACCAACAACAGCCAGGACAGGGACTGCTTTCTGTGCCATGTCGTGAACCTTGAG
ATAG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4D671JQ 637 0 0
AGAGCAATAGAGCTGCCATCACTAATGAGCATTGATTTTTTTTTGTTTCCGCCACGGTCC
AATGGAACCCGACGCAAAAAACATGAATGCCCATGTTTAAGTTTGCTGGTGAAACTTGGG
CATCCGTTTGAAGTCAGAAGTGTTCATTAAGATAAGAGTCTTAAAAGCATTCAAAATTGA
TACTTAATGTCTCATATGAATGTAATATTTAGGAGTTGGACTATGGATTGACCACAGCTT
GTATCTGCTCCAATGTCTTCCCTTTGGTTTCAGGCACCACGGCAATGACAAAGACAATGG
CCAGCGCGTTGATCACCGCATAAATAATGAAAGTTCCATAAGAGCTCCAAGACATAAGGA
AGTTGAAAGTGTAAGAAACGGCCCATGCTCCAAACCAGTTCACCAGCGTAGCCGTGCCTC
CTGCTACTCCTTTAATATTTATAGGAAATATCTCAGACATGACAACCCACGGCATTGCTC
CCATTCCAGCTGAGAACGATGCTATGTACACCATTATACCAACAACAGCCAGGACAGGGA
CTGCTTTCTGTGCCATGTCGTGAACCTTAAGATAGAACGAGACCGCTGTGATCAAACAGC
CTATCACTAACCCTGTTGCAGAAACCAGTAGCAATGG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4GT46TF 630 0 0
CAGAAGTGTTCATTAAGATAAGAGTCT*AAAAGCAT*CAAAATTGATACTTAATGTCTCA
TATGAATGTAATATTTAGGAGTTGGACTATGGATTGACCACAGCTTGTGTCTGCTCCAAT
GTCTTCCCTTTGGTTTCAGGCACCACGGCAATGACAAAGACAATGGCCAGCGCGTTGATC
ACCGCATAAATAATGAAAGTTCCATAAGAGCTCCAAGACATAAGGAAGTTGAAAGTGTAA
GAAACGGCCCATGCTCCAAACCAGTTCACCAGCGTAGCCATGCCTCCTGCTACTCCTTTA
ATATTTATAGGAAATATCTCAGACATGACAACCCACGGCATTGCTCCCATTCCAGCTGAG
AACGATGCTATGTACACCATTATACCAACAACAGCCAGGACAGGGACTGCTTTCTGTGCC
ATGTCGTGAACCTTAAGATAGAACGAGAACGCTGTGATCAAACAGCCTATCACTAACCCT
GTTGCAGAAACCAGTAGCAATGGCTTTCTTCCGGCTTTGTCAACTATAGGTGCATTAAGC
GCAGTGATTACAACCTGAAGAACAGCATATATTATCATCCCAAGTCTTGGTGGGAAACCT
GCTTGCTCAAATATAGAGCTCGTGTAAAAA

QA 1 630 1 630
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4081Contig1 801 2 6 U
GGTCTCTTAAGCCCATTTGCAAGTTGTCTAAAAATGGAGTGTACGTGTCGCTGGTCAAAG
ATGTTAGGGATGCCTTCGAACTGAGTCACTTGGTGAAAGTTGATTGCCCTGGACTTGAAC
CAAGTGATTATAAGAAAATAGGCGCTAAGCTTAAGGAGTTAGTTCCTTGTGTGCTTCTAT
CTTTTGACGATGAGCAAATTCTCATGTGGAGAGGACGAGACTGGAAATCCCGGTTTGTAA
ACAATCCTTTAACTGCAATCCTCACTGAGACCAACATAGCAGATGATGCAGACAAAACCA
CTGAAGAACAAACAGTGTCTGATCAGAGTACAGTGATCTCAAGCCCCAAAATGATCTCAC
TCTGGAAACGAGCCGTGGAATCGTCTAAAGCAGTAATCCTGGAAGAGCTTGATCTCGCTC
CAGACGCTCTGTTGGAGAAGGTGGAAGAGTTCGAAGGCACTTCGCAGGCCGCAGAACACA
CTTTCACAGCCTTAGTCTTGCCGGGAGACGAGGGTGCTGCTGAGGATTACGTAGATGACG
AGGACCGTCCAGAAGTGTATAGTGACATAGACGATGACTTTGACGACGAGTGTTCCGATG
ATGATGAGTCGTTAGAACCGGTGGGTCCAGAGGGATCTTTGGCCGTTGACAAGATAGTTA
GGAAGCTGAGGGAAAAACTTAAATAGAGAGCCATAAGTGTTTTAACTGTAATTTCATATT
TTGTTAAATTTGTTTCGTGTAAACTGTCGATATTTAAAACATACTAAAACAGCACCATAC
GAAAGTGGTTACATATTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN46TF U 1
AF RR4CC13TF U 256
BS 1 471 RR4FN46TF
BS 472 472 RR4CC13TF
BS 473 676 RR4FN46TF
BS 677 677 RR4CC13TF
BS 678 778 RR4FN46TF
BS 779 801 RR4CC13TF

RD RR4FN46TF 778 0 0
GGTCTCTTAAGCCCATTTGCAAGTTGTCTAAAAATGGAGTGTACGTGTCGCTGGTCAAAG
ATGTTAGGGATGCCTTCGAACTGAGTCACTTGGTGAAAGTTGATTGCCCTGGACTTGAAC
CAAGTGATTATAAGAAAATAGGCGCTAAGCTTAAGGAGTTAGTTCCTTGTGTGCTTCTAT
CTTTTGACGATGAGCAAATTCTCATGTGGAGAGGACGAGACTGGAAATCCCGGTTTGTAA
ACAATCCTTTAACTGCAATCCTCACTGAGACCAACATAGCAGATGATGCAGACAAAACCA
CTGAAGAACAAACAGTGTCTGATCAGAGTACAGTGATCTCAAGCCCCAAAATGATCTCAC
TCTGGAAACGAGCCGTGGAATCGTCTAAAGCAGTAATCCTGGAAGAGCTTGATCTCGCTC
CAGACGCTCTGTTGGAGAAGGTGGAAGAGTTCGAAGGCACTTCGCAGGCCGTAGAACACA
CTTTCACAGCCTTAGTCTTGCCGGGAGACGAGGGTGCTGCTGAGGATTACGTAGATGACG
AGGACCGTCCAGAAGTGTATAGTGACATAGACGATGACTTTGACGACGAGTGTTCCGATG
ATGATGAGTCGTTAGAACCGGTGGGTCCAGAGGGATCTTTGGCCGTTGACAAGATAGTTA
GGAAGCTGAGGGAAAA*CTTAAATAGAGAGCCATAAGTGTTTTAACTGTAATTTCATATT
TTGTTAAATTTGTTTCGTGTAAACTGTCGATATTTAAAACATACTAAAACAGCACCAT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4CC13TF 546 0 0
G
AATCCTTACTGAGACCAACATAGCAGATGATGCAGACAGAACCACTGAAGAACAAACAGT
GTCTGATCAGAGTACAGTGATCTCAAGCCCCAAAATGATCTCACTCTGGAAACGAGCCGT
GGAATCGTCTAAAGCAGTAATCCTGGAAGAGCTTGATCTCGCTCCAGACGCTCTGTTGGA
GAAGGTGGAAGAGTTCGAAGGCACTTCGCAGGCCGCAGAACACACTTTCACAGCCTTAGT
CTTGCCGGGAGACGAGGGTGCTGCTGAGGATTACGTAGATGACGAGGACCGTCCAGAAGT
GTATAGTGACATAGACGATGACTTTGACGACGAGTGTTCCGATGATGATGAGTCGTTAGA
ACCGGTGGGTCCAGAGGGATCTTTGGCCGTTGACAAGATAGTTAGGAAGCTGAGGGAAAA
ACTTAAATAGAGAGCCATAAGTGTTTTAACTGTAATTTCATATTTTGTTAAATTTGTTTC
GTGTAAACTGTCGATATTTAAAACATACTAAAACAGCACCATACGAAAGTGGTTACATAT
TGTCT

QA 2 546 2 546
DS 



AS 1 3

CO CL4082Contig1 947 3 5 U
GTAAATATTTCCCTTCGCTAAAATGATAAAAGTGAATTCACCACAATTTTACCCTTTGAA
AGAAAAAACGTAGGCCATAGAAGAAACTAATACATAAAAGTGAGTCGAATCTTTTTTCTT
GTTCCTTGATTAAATTGGTAAGTTCACGTTACAACATGGACAAATATAATATCATATCGA
ACATGAAAGCTATAACAATAACCGAGAAAGATAACCGGTTAGTTAAACCGGTGCCAGACA
TTTCATCGGTGTAGTCATTATAAGAATCTAAACCGCCACTACCTTCGGATCCAGTAGTAG
TCCACATCCCCAAATTGTTATTCCTGCCACCAACGCCAAGAACGCCGCAATGAAATGTGA
TTTGGTCGATGAACGAGGCAGATTTAGGGCCGACGCTGTACGCCTTCTCGTACCTCATCT
CCGCACCTTCTCCAGATGCCACGAAGAAAGCTCCGTTAACCAAAATGTCTCCCTCCGATC
TCCAGTTCCACCCTTTCCAATCACCATCTGGCGTTTCTACTCTTTTAGTCACCTCTTTGG
CAAACGGGTTGGTTGGGGCGGTATAGCGGTTACCCTGACTATTAATGGTTGGGTTACCGC
TACCGCCAATCGCATACATTTCCCATTGAGTAAAATCATTGTTAACCACATGGATGTAAC
CACGTCTACATCTAGGCATCCTTTGTACCAACTTCTCTCCGAAGTGATTAAACGCAATGG
TTACCTGCATGCCACTGTCTGGCTCGTAGTGATCGCTGTGACCAAGAAGCATGACTTCAT
TGTGGTGTGAGAAGAAGTTGTTCGATATTGTAATCCCTGTGGACCCGTCACAGCATCTAT
CAAACCATCTCTACATCTTGATAGAGAACAATGGTCGATCCATATGTCCTTTGATCCGAA
GATGGAGATACCATCACCGTCCGATTCCGTTCTTAATCCGTAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FW64JQ U 1
AF RR4H090JQ U 102
AF RR4FW64TF C 429
BS 1 389 RR4FW64JQ
BS 390 390 RR4H090JQ
BS 391 544 RR4FW64JQ
BS 545 775 RR4H090JQ
BS 776 947 RR4FW64TF

RD RR4FW64JQ 544 0 0
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GTTCCTTGATTAAATTGGTAAGTTCACGTTACAACATGGACAAATATAATATCATATCGA
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TTTCATCGGTGTAGTCATTATAAGAATCTAAACCGCCACTACCTTCGGATCCAGTAGTAG
TCCACATCCCCAAATTGTTATTCCTGCCACCAACGCCAAGAACGCCGCAATGAAATGTGA
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CCGCACCTTCTCCAGATGCCACGAAGAAAGCTCCGTTAACCAAAATGTCTCCCTCCGATC
TCCAGTTCCACCCTTTCCAATCACCATCTGGCGTTTCTACTCTTTTAGTCACCTCTTTGG
CAAA

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DS 

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GG
GTCGAATCTTTTTTCTTGTTCCTTGATTAAATTGGTAAGTTCACGTTACAACATGGACAA
ATATAATATCATATCGAACATGAAAGCTATAACAATAACCGAGAAAGATAACCGGTTAGT
TAAACCGGTGCCAGACATTTCATCGGTGTAGTCATTATAAGAATCTAAACCGCCACTACC
TTCGGATCCAGTAGTAGTCCACATCCCCAAATTGTTATTCCTGTCACCAACGCCAAGAAC
GCCGCAATGAAATGTGATTTGGTCGATGAACGAGGCAGATTTAGGGCCGACGCTGTACGC
CTTCTCGTACCTCATCTCCGCACCTTCTCCAGATGCCACGAAGAACGCTCCGTTAACCAA
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TTTAGTCACCTCTTTGGCAAACGGGTTGGTTGGGGCGGTATAGCGGTTACCCTGACTATT
AATGGTTGGGTTACCGCTACCGCCAATCGCATACATTTCCCATTGAGTAAAATCATTGTT
AACCACATGGATGTAACCACGTCTACATCTAGGCATCCTTTGTACCAACTTCTCTCCGAA
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AAGAAGCATGAC

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DS 

RD RR4FW64TF 519 0 0
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TACCATCACCGTCCGATTCCGTTCTTAATCCGTAGTGCC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 3

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TGGTTTATCTATCAATACAACCAGAAATTCCATGTCCCGGTTAGTCAAATATGCCAAACC
CCAAACCATTGGCAAACGCAACCTGCAAAAGGTGAGAAGACAATAATATAGAAATAACCA
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TAATCTGACAATACTTTTTGAGAGAAACAGAGAACACATGAAAACAGAGAGTAAAATAAA
GTATATGTACACAATGCACTTCCGCATCTTTCTTCACCCAACAACAAAAAAAACATATGA
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CCGTAGATCTCTCATTACCCGCCAATTCAACTTCTTTCCGACCAGATCTGTCCCCCTAGT
GATTCCTGCTGTGTTTTCTTTTTCTTCTTTAATAAAGAGAAGAGCAAACCTAAAATCTGA
AACCAGATCAGATCAGATCAATCACACTCGGCTCTCGACATAACCGAAAGCCTACTAGGA
CGAGGCTGAAACGTAAAAGAAACCTTGAAAGCTAGAACAGAGATATAAAGTTTCAATCTT
TATTCATTTTCCCTTTTCC


BQ
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AF RR4A303JQD U 1
AF RR4A303JQ U 1
AF RR4A303TFB C 301
BS 1 876 RR4A303JQ
BS 877 979 RR4A303TFB

RD RR4A303JQD 788 0 0
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GATTCCTG

QA 1 788 1 788
DS 

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CCAAACCATTGGCAAACGCAACCTGCAAAAGGTGAGAAGACAATAATATAGAAATAACCA
CACACTGTTGATCAAAAAAAAAAGAAATAACCACACAAAAATAAAATACCGAGAAAACGA
AAAACCAAATAAAAGAAAAAAACATACTTAAAAAGAAAAAAATGAAAGAACAATACCTGA
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QA 1 876 1 876
DS 

RD RR4A303TFB 679 0 0
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AACAACGCGAACGTTGACTTCACGAAACACGAACAAACAGGAATCAGACAAATGCTGCAG
ACACACACCACACACACAAAGGATGTGAGATTAGAGATCTAAAAATCTCACTTGTAAACT
GGATTACAGAACTTTGATTCAGATCTAATATTATTCTGAATTTTTTTTTAATTTTAGATG
TAATCTGACAATACTTTTTGAGAGAAACAGAGAACACATGAAAACAGAGAGTAAAATAAA
GTATATGTACACAATGCACTTCCGCATCTTTCTTCACCCAACAACAAAAAAAACATATGA
TGGTGTGTTCGTTTTACAAAACTCCGATCTCAAGGGTTGAGATTTCTCCTCCCACAATCG
CCGTAGATCTCTCATTACCCGCCAATTCAACTTCTTTCCGACCAGATCTGTCCCCCTAGT
GATTCCTGCTGTGTTTTCTTTTTCTTCTTTAATAAAGAGAAGAGCAAACCTAAAATCTGA
AACCAGATCAGATCAGATCAATCACACTCGGCTCTCGACATAACCGAAAGCCTACTAGGA
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TATTCATTTTCCCTTTTCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL4084Contig1 914 3 4 U
GGAAAAGAATAGAATGAGCAAATTGTGGGAAAGAACGTGTTGAATAGTTTGGGGGAGGAT
AACATTAAACACTTTCTTTCTTCTAATCAATTAATCATCATCATCATCCCCAAGTCTTTT
TTCTTTTTCCAATCATTCATCGTTATCTCGAAAGCTTCGTTGATTATCTCCAATCTTCTC
AAAAAGTCCAATGGATCAAAGGCCTCTGGGATTGCTAACGATCCACGTCAAAAAAGGTAT
TAATCTCGCCATTCGCGACCACAGAAGCAGCGATCCTTATGTTGTTATCACCGTCGCCGA
CCAGACATTGAAGACGCGTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGAT
GACCGTTGCTATCAAAGATCCCAATGTCCCTATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAA
GTTTACTGGAGATGACAAAATGGGAGATGCAAACTTAGACATTCAACCCTACTTAGAATC
TCTCAAAATGGGAATGGAGCTTTTGAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAACGGGTTCA
GCCCTCCAGGCACAACTGTTTATCTGATGAAAGCAGCATCGTGTGGAACAATGGTAAGAT
CACGCAAGACATGATCCTTAGGCTCAACAACGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCT
TGAATGGCATGAAGGTGCTGGTTGCAGAGGTACTACTTCCAAAGGAGTAGGTGAGGGCTC
TTCTTACTCTACCTAAAAAAAAAGAATATGCTTGTTCTTCTTGTTGAATGAATGAATGAA
TGATCGATTGTTGTTTCCATATGTATTAGATAAATCGTGTATTTCTTTGATGACCATACT
AACCGAGAAACAATCTCGAAACTTTTTTTTTGTATCTCTTCTTCCATTTGAATGTCTTTT
GATTGTGTATTGCA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E483TF U 1
AF RR4E483JQ C 138
AF RR4DF45TF U 422
BS 1 663 RR4E483TF
BS 664 664 RR4DF45TF
BS 665 687 RR4E483TF
BS 688 914 RR4DF45TF

RD RR4E483TF 687 0 0
GGAAAAGAATAGAATGAGCAAATTGTGGGAAAGAACGTGTTGAATAGTTTGGGGGAGGAT
AACATTAAACACTTTCTTTCTTCTAATCAATTAATCATCATCATCATCCCCAAGTCTTTT
TTCTTTTTCCAATCATTCATCGTTATCTCGAAAGCTTCGTTGATTATCTCCAATCTTCTC
AAAAAGTCCAATGGATCAAAGGCCTCTGGGATTGCTAACGATCCACGTCAAAAAAGGTAT
TAATCTCGCCATTCGCGACCACAGAAGCAGCGATCCTTATGTTGTTATCACCGTCGCCGA
CCAGACATTGAAGACGCGTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGAT
GACCGTTGCTATCAAAGATCCCAATGTCCCTATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAA
GTTTACTGGAGATGACAAAATGGGAGATGCAAACTTAGACATTCAACCCTACTTAGAATC
TCTCAAAATGGGAATGGAGCTTTTGAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAACGGGTTCA
GCCCTCCAGGCACAACTGTTTATCTGATGAAAGCAGCATCGTGTGGAACAATGGTAAGAT
CACGCAAGACATGATCCTTAGGCTCAACAACGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCT
TGA*TGGCATGAAGGTGCTGGTTGCAG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4E483JQ 683 0 0
CATCGTTATCTCGAAAGCTTCGTTGATTATCTCCAATCTTCTCAAAAAGTCCAATGGATC
AAAGGCCTCTGGGATTGCTAACGATCCACGTCAAAAAAGGTATTAATCTCGCCATTCGCG
ACCACAGAAGCAGCGATCCTTATGTTGTTATCACCGTCGCCGACCAGACATTGAAGACGC
GTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGATGACCGTTGCTATCAAAG
ATCCCAATGTCCCTATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAAGTTTACTGGAGATGACA
AAATGGGAGATGCAAACTTAGACATTCAACCCTACTTAGAATCTCTCAAAATGGGAATGG
AGCTTTTGAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAACGGGTTCAGCCCTCCAGGCACAACT
GTTTATCTGATGAAAGCAGCATCGTGTGGAACAATGGTAAGATCACGCAAGACATGATCC
TTAGGCTCAACAACGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCTTGAATGGCATGAAGGTG
CTGGTTGCAGAGGTATTACTTCCAAAGGAGTAGGTGAGGGCTCTTCTTACTCTACCTAAA
AAAAAAGAATATGCTTGTTCTTCTTGTTGAATGAATGAATGAATGATCGATTGTTGTTTC
CATATGTATTAGATAAATCGTGT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4DF45TF 493 0 0
G
TTACTGGAGATGACAAAATGGGAGATGCAAACTTAGACATTCAACCCTACTTAGAATCTC
TCAAAATGGGAATGGAGCTTT*GAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAACGGGTTCAGC
CCTCCAGGCACAACTGTTTATCTGATGAAAGCAGCATCGTGTGGAACAATGGTAAGATCA
TGCAAGACATGATCCTTAGGCTCAACAACGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCTTG
AATGGCATGAAGGTGCTGGTTGCAGAGGTACTACTTCCAAAGGAGTAGGTGAGGGCTCTT
CTTACTCTACCTAAAAAAAAAGAATATGCTTGTTCTTCTTGTTGAATGAATGAATGAATG
ATCGATTGTTGTTTCCATATGTATTAGATAAATCGTGTATTTCTTTGATGACCATACTAA
CCGAGAAACAATCTCGAAACTTTTTTTTTGTATCTCTTCTTCCATTTGAATGTCTTTTGA
TTGTGTATTGCA

QA 2 493 2 493
DS 



AS 1 2

CO CL4085Contig1 772 2 2 U
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GAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCAT
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TGTGGTGGAGCTTAATGGAAGACTGAGCAAATGTGGGGTCATCAGCCCTCGTTTCGACGT
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CATTGTTCTTACCACCTCCGCTGGTATCGTGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGT
TGGTGGCAAGGTTCTTGGATTCTTTTACTGAAAAAGCCATATCTTTGTCCTGGTTATACT
TTGCTTCTTCTCCTTTTGGCGAGATCAGGAATTCGAATGAGCCCAGAGTCTAGAGAGGGT
AGTAAGAGTTTTTGCTGCGTTTGTTTTCTTAGATAATCATTTTGTTTGTTTTGCGCAAAT
GTAGACAGTAATGTGCTTATTTTGAGTCATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACACTTGTACC
CTCTTGTTTTGATGGTTAAAGCATCATAATCAATTTTCTAAATCAATAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CI29TF U 1
AF RR4CI29JQ C 251
BS 1 565 RR4CI29TF
BS 566 772 RR4CI29JQ

RD RR4CI29TF 565 0 0
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AGCTGGAGAAGTTTGAGCGTCTGCTACTTGGATTTCGAGTCTTTTGAGCATTTGAAGAAT
GGTGAGAATCAGTGTGCTTAACGATGCTCTCAAGAGTATGTTCAACGCGGAGAAGAGAGG
GAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCAT
GCAGAAACACGGTTACATTGGTGAGTTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCTGGCAAGAT
TGTGGTGGAGCTTAATGGAAGACTGAGCAAATGTGGGGTCATCAGCCCTCGTTTCGACGT
TGGTGTTAAGGAGATTGAAAGCTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTA
CATTGTTCTTACCACCTCCGCTGGTATCGTGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGT
TGGTGGCAAGGTTCTTGGATTCTTTTACTGAAAAAGCCATATCTTTGTCCTGGTTATACT
TTGCTTCTTCTCCTTTTGGCGAGAT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4CI29JQ 522 0 0
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CTTAATGGAAGACTGAGCAAATGTGGGGTCATCAGCCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAG
GAGATTGAAAGCTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTT
ACCACCTCCGCTGGTATCGTGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAG
GTTCTTGGATTCTTTTACTGAAAAAGCCATATCTTTGTCCTGGTTATACTTTGCTTCTTC
TCCTTTTGGCGAGATCAGGAATTCGAATGAGCCCAGAGTCTAGAGAGGGTAGTAAGAGTT
TTTGCTGCGTTTGTTTTCTTAGATAATCATTTTGTTTGTTTTGCGCAAATGTAGACAGTA
ATGTGCTTATTTTGAGTCATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTT
GATGGTTAAAGCATCATAATCAATTTTCTAAATCAATAAACC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 3

CO CL4086Contig1 845 3 5 U
CTGTCAGAAACTCAAGCTTAGTCCAAGAAAACTTAGGAAAAGTCAAAACAAGACACCAAC
TAATGTCAAAACGATAAAGAAACTCAGCAAAGAATCTTACTGAGTATCATCACTGTGTAA
AGATTTGAAGCAAAAACTAATGTATTTCAGATCAAAGTTAAACTCCCTTTTGTTTATTCA
ATCTTCATCTGATCCTGACTCTTCAGAACTCGATTCCTTCTTGTTTACTTTCTTCTTTGA
TCCTCTCTTCTTATCTTCCTCGTCCTTACTGTACTCACTTTCATAATCCTCCTCTTCAAT
CTCATCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCATACCCTCTCCTGCAGCCTCACCATCCACATC
ACGGGTTCTTTTCAAAACCTCCACTTTCAGTGACGTCTTTTGGTCACAACCAATCCAAGC
ATCGCTTAGGCAGAGGCAAGTCAAGTTATAAGTACCTTCCCGAGGTGCCAAGACTCTCCC
CATCACCAATCTTGATCCAATTTTAACCTTCTCAACAGCTTCTTCAACTGCATTGTTCTT
TGCCTCAACGCTTGCTCCTGAACTCTCCATCGTCTCACTAATAGCAATCGAAGCAGTGCT
TATAGCTTCAGCTTCATCCATGAAACTAACCTTCTGAAAGAACCAGACATTGTTTGAATC
CGCTAGAAGAACCCAAAAGTTCTCCTCCTTGTGGAAAGGGAAGCAAGGCGAGTGAGGAAC
AGCGCCTACAAGTCCATTGGGACGTTTCAGAGTGATCCAAGCTTGAACTGTCGTCACGTC
ACCTTCTTGAATACCTTCTTCGCCTTCTGTTTGCAAGTGACTTCTATTTCAGAGAAGTAT
CATTT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4BI54JQ U 3
AF RR4BI54TF C 3
AF RR4ES26JQ U 1
BS 1 266 RR4ES26JQ
BS 267 267 RR4BI54JQ
BS 268 355 RR4ES26JQ
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CATCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCATACCCTCTCCTGCAGCCTCACCATCCACATCAC
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C

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4BI54TF 557 0 0
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ATGTCAAAACGATAAAGAAACTCAGCAAAGAATCTTACTGAGTATCATCACTGTGTAAAG
ATTTGAAGCAAAAACTAATGTATTTCAGATCAAAGTTAAACTCCCTTTTGTTTATTCAAT
CTTCATCTGATCCTGACTCTTCAGAACTCGATTCCTTCTTGTTTACTTTCTTCTTTGATC
CTCTCTTCTTATCTTCCTCGTCCTTACTGTACTCACTTTCATAATCCTCCTCTTCAATCT
CATCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCATACCCTCTCCTGCAGCCTCACCATCCACATCAC
GGGTTCTTTTCAAAACCTCCACTTTCAGTGACGTCTTTTGGTCACAACCAATCCAAGCAT
CGCTTAGGCAGAGGCAAGTCAAGTTATAAGTACCTTCCCGAGGTGCCAAGACTCTCCCCA
TCACCAATCTTGATCCAATTTTAACCTTCTCAACAGCTTCTTCAACTGCATTGTTCTTTG
CCTCAACGCTTGCTCC
C

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4ES26JQ 845 0 0
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TAATGTCAAAACGATAAAGAAACTCAGCAAAGAATCTTACTGAGTATCATCACTGTGTAA
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CTCATCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCATACCCTCTCCTGCAGCCTCACCATCCGCATC
ACGGGTTCTTTTCAAAACCTCCACTTTCAGTGACGTCTTTTGGTCACAACCAATCCAAGC
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CATCACCAATCTTGATCCAATTTTAACCTTCTCAACAGCTTCTTCAACTGCATTGTTCTT
TGCCTCAACGCTTGCTCCTGAACTCTCCATCGTCTCACTAATAGCAATCGAAGCAGTGCT
TATAGCTTCAGCTTCATCCATGAAACTAACCTTCTGAAAGAACCAGACATTGTTTGAATC
CGCTAGAAGAACCCAAAAGTTCTCCTCCTTGTGGAAAGGGAAGCAAGGCGAGTGAGGAAC
AGCGCCTACAAGTCCATTGGGACGTTTCAGAGTGATCCAAGCTTGAACTGTCGTCACGTC
ACCTTCTTGAATACCTTCTTCGCCTTCTGTTTGCAAGTGACTTCTATTTCAGAGAAGTAT
CATTT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 3

CO CL4087Contig1 1290 3 22 U
GAACGCTTAAAATTATACATTGTTTTATATTATGTACAAACGAAATTTTAGTTGAATAAT
TTGATACCAAACTAATTTTAGCAACAGAAGAAAAATTAATGCTAAAAGGAGACAGTTTTC
TAGCAAATTAACATCTCGGTTTGCTACTTATTCATCCCATCAAGCTTTTCTTGGTTTACA
ATACATTGTAACTTTGAAACATCAATAGTATTAAAATGTTTTTTAACACTTTGTTACTAC
CCAAAAAAGAATCTGCTGCTCCACTTCTTCCCAATTATGAACTCTAGTAACCAAAGGATG
TCTGTCCACAGACTCAGTTTTAAACCAAGGGTACGAGTTTTCATAGCCAAAGAGGAAAAC
CTTCATTCCTATGTTAGCGCATTCCTCTGCATATCTGGGGTTATCGTCAATCAATATCTC
TGCTCCAAAAGATCTGCAAATTTCAAACTTGGGTTTAGACTCTCCATGAAAAGCAAAACG
GTTCCCGAAATGAATCTGTTTAAACAGTCCTGGAAAATGCATGTCGATCCACCCAAGTGT
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CTTGTTAAGGGCCGAGACAAAGTTTCCCAAAACCTCATCAATGTCAACAGCCACAACGAT
CTTATCATTCCCTTGGAACCTCGCCGTGTTACCAACTCCACGTCCATCCGCTAAGTCCGC
GGTTCCGCCGCCGAGACGTTCTTCCCTCGAGCCATGGAGGAGGAGGCGGCGATGATGATG
ATGCAGAGATAAAGCTCGAGCCTTCTTGTGATGAGGAGGAGGAGGAGAATCATCAAAACA
GCTTCTTAAGGTTAACCACCTATTGGGCTTTCCGCCTCCTTTAAACAAGGCGTTAGAAAT
GGGATTGAGTCTATGAACGAAACCACCACCTCCATCACATAATCTGTTCACGATGGATCG
AGTGTGGAGCGATCGCGAGGGATCGGTGTAAGCGGCAGCGGCAGACATTGTTAGGGTTGG
TGAATCGAATCGTGAGATTCTGTTGAGAATGGCGTGCGACTGTCTCTTTAACATAACGAG
ATCTCTCTCTTTCTCTCTCACATTACATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH80JQ U 120
AF RR4GD25JQ U 1
AF RR4GD25TF C 527
BS 1 244 RR4GD25JQ
BS 245 245 RR4GH80JQ
BS 246 246 RR4GD25JQ
BS 247 247 RR4GH80JQ
BS 248 322 RR4GD25JQ
BS 323 323 RR4GH80JQ
BS 324 346 RR4GD25JQ
BS 347 347 RR4GH80JQ
BS 348 356 RR4GD25JQ
BS 357 357 RR4GH80JQ
BS 358 429 RR4GD25JQ
BS 430 430 RR4GH80JQ
BS 431 438 RR4GD25JQ
BS 439 439 RR4GH80JQ
BS 440 445 RR4GD25JQ
BS 446 446 RR4GH80JQ
BS 447 470 RR4GD25JQ
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BS 472 478 RR4GD25JQ
BS 479 479 RR4GH80JQ
BS 480 779 RR4GD25JQ
BS 780 1290 RR4GD25TF

RD RR4GH80JQ 578 0 0
CTAGCAAATTACCATCTCGGTTTGCTACTTATTCATCCCATCAAGCTTTTCTTGGTTTAC
AATACATTGTAACTTTGAAACATCAATAGTATTAAA*TGTTTTTTAACACTTTGTTACTA
CCCAAAAAAGAATCTGCTGCTCCACTTCTTCCCAATTATGAACTCTAGTAACCAAAGGAT
GTCTGTCCACAGACTCAGTTTTAAACCAAGGGTACGAGTTTTCATAGCCAAAGAGGAAAA
CCTTCATTCCTATGTTAGCGCATTCCTCTGCATATCTGGGGTTATCGTCAATCAATATCT
CTGCTCCAAAAGATCTGCAAATTTCAAACTTGGGTTTAGACTCTCCATGAAAAGCAAAAC
GGTTCCCGAAATGAATCTGTTTAAACAGTCCTGGGAAATGCATGTCGATCCACCCAAGTG
TGTGATCTTTTATCGCATTCTGCCGGGACGTCACAACTGAAAGCTCGCAGTATCTTGATA
GCTTGTGAAGAGTCTTATGGGTACCTGGAAAAGGATGGATCCCTTTCTTGAAATATGATG
TCTTAAAGAATTCATGAACACGTAGGTCAGCTTCATTC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4GD25JQ 779 0 0
GAACGCTTAAAATTATACATTGTTTTATATTATGTACAAACGAAATTTTAGTTGAATAAT
TTGATACCAAACTAATTTTAGCAACAGAAGAAAAATTAATGCTAAAAGGAGACAGTTTTC
TAGCAAATTAACATCTCGGTTTGCTACTTATTCATCCCATCAAGCTTTTCTTGGTTTACA
ATACATTGTAACTTTGAAACATCAATAGTATTAAAATGTTTTTTAACACTTTGTTACTAC
CCAAGAGAGAATCTGCTGCTCCACTTCTTCCCAATTATGAACTCTAGTAACCAAAGGATG
TCTGTCCACAGACTCAGTTTTAGACCAAGGGTACGAGTTTTCATAGTCAAAGAGGAGAAC
CTTCATTCCTATGTTAGCGCATTCCTCTGCATATCTGGGGTTATCGTCAATCAATATCTC
TGCTCCAAACGATCTGCAGATTTCAGACTTGGGTTTAGACTCTCCATGAAGAGCAAAATG
GTTCCCGAAATGAATCTGTTTAAACAGTCCTGGAAAATGCATGTCGATCCACCCAAGTGT
GTGATCCTTTATCGCATTCTGCCGGGACGTAACAACTGAGAGCTCGCAGTATCTTGATAG
CTTGTGAAGAGTCTTATGGGCACCTGGAAGAGGATGGATCCCTTTCTTGAAATATGATGT
CTTAAAGAATTCATGAACACGTAGGTCAGCTTCATTCCGGGAGCAATTCCATATCCTGAA
GAACTCGTAGACATGGTATTCTGAGACAGAATGGTTTGACAAATAGCGGTCGGCAATGA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4GD25TF 764 0 0
ATCCACCCAAGTGTGTGATCCTTTATCGCATTCTGCCGGGACGTAACAACTGAGAGCTCG
CAGTATCTTGATAGCTTGTGAAGAGTCTTATGGGCACCTGGAAGAGGATGGATCCCTTTC
TTGAAATATGATGTCTTAAAGAATTCATGAACACGTAGGTCAGCTTCATTCCGGGAGCAA
TTCCATATCCTGAAGAACTCGTAGACATGGTATTCTGAGACAGAATGGTTTGACAAATAG
CGGTCGGCAATGAACTTGTTAAGGGCCGAGACAAAGTTTCCCAAAACCTCATCAATGTCA
ACAGCCACAACGATCTTATCATTCCCTTGGAACCTCGCCGTGTTACCAACTCCACGTCCA
TCCGCTAAGTCCGCGGTTCCGCCGCCGAGACGTTCTTCCCTCGAGCCATGGAGGAGGAGG
CGGCGATGATGATGATGCAGAGATAAAGCTCGAGCCTTCTTGTGATGAGGAGGAGGAGGA
GAATCATCAAAACAGCTTCTTAAGGTTAACCACCTATTGGGCTTTCCGCCTCCTTTAAAC
AAGGCGTTAGAAATGGGATTGAGTCTATGAACGAAACCACCACCTCCATCACATAATCTG
TTCACGATGGATCGAGTGTGGAGCGATCGCGAGGGATCGGTGTAAGCGGCAGCGGCAGAC
ATTGTTAGGGTTGGTGAATCGAATCGTGAGATTCTGTTGAGAATGGCGTGCGACTGTCTC
TTTAACATAACGAGATCTCTCTCTTTCTCTCTCACATTACATCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 3

CO CL4088Contig1 784 3 6 U
GAAATCTTATTTTATTTGAAAATCTGAAAAAAAACATTATTTATTTTAGTGTGTCTATCT
CCAATCTCTCTCCCCTGATATAACCAACCCACACAGTCTGACACAAAACATCAACACAAA
ATACAAAACAAGAACAAACAAGACCTCCACATTGTCTCTAAACACAACCAAGAATCTCAA
CTGTTCTCTAAAGAGAACTAAGAAACTTAACCCATATGATCTGTGCACTCTCCATTGCCT
CTCTCGCAAACTCCTCAGCCGCTTGCTCCTCTTTCGCCTTCCTCACAGCTCCATGATACT
CCTCATAAGCCTCTGAAGCATCAACAAGAAAATGAGAAAGACCTTTCACAACCTTCTTAA
ACTCCACATCGACAGCTTCTCTCTCTGTCTCAAGCTTCTTCAACAGTTTCTTGATCGCAA
AGATTCTAACGTACAGCGCGTCTCCTCTCTGCGCAAGCCTTTTAGCCTCCTCGAAGTTAG
CGTCCACGAAGGTCTGCTTCTCGGTGGCCGTCTCTTTGAGCATCGTAGCCCGTGCCTTTG
CGATGTGGACTCTCTCGGAAGCCTCGAGTCCTTGTGTTATTACGTTTCTGTACTTAGCTA
ACCTTGAAATGTAACTGATGGGAGCTGAGCTTAGCTCTTCGAAAGCTGCAGCCATGACGA
GAATCTTATCAAAGTCTTGACGTGTCACGAGCTGACGAGCGGTTAAGCCACGAAACTCTT
TCAGTTTAGCCCTAAGGCTCTCTACAGTCTCTGACGTGGCTGCTGATTCACTTGTGGATG
GTGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4F825JQ U 1
AF RR4F825TF C 1
AF RR4CN94JQ U 24
BS 1 171 RR4F825JQ
BS 172 172 RR4CN94JQ
BS 173 527 RR4F825JQ
BS 528 528 RR4CN94JQ
BS 529 593 RR4F825JQ
BS 594 784 RR4CN94JQ

RD RR4F825JQ 593 0 0
GAAATCTTATTTTATTTGAAAATCTGAAAAAAAACATTATTTATTTTAGTGTGTCTATCT
CCAATCTCTCTCCCCTGATATAACCAACCCACACAGTCTGACACAAAACATCAACACAAA
ATACAAAACAAGAACAAACAAGACCTCCACATTGTCTCTAAACACAACCAAAAATCTCAA
CTGTTCTCTAAAGAGAACTAAGAAACTTAACCCATATGATCTGTGCACTCTCCATTGCCT
CTCTCGCAAACTCCTCAGCCGCTTGCTCCTCTTTCGCCTTCCTCACAGCTCCATGATACT
CCTCATAAGCCTCTGAAGCATCAACAAGAAAATGAGAAAGACCTTTCACAACCTTCTTAA
ACTCCACATCGACAGCTTCTCTCTCTGTCTCAAGCTTCTTCAACAGTTTCTTGATCGCAA
AGATTCTAACGTACAGCGCGTCTCCTCTCTGCGCAAGCCTTTTAGCCTCCTCGAAGTTAG
CGTCCACGAAGGTCTGCTTCTCGGTGGCCGTCTCTTTGAGCATCGTAACCCGTGCCTTTG
CGATGTGGACTCTCTCGGAAGCCTCGAGTCCTTGTGTTATTACGTTTCTGTAC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4F825TF 618 0 0
GAAATCTTATTTTATTTGAAAATCTGAAAAAAAACATTATTTATTTTAGTGTGTCTATCT
CCAATCTCTCTCCCCTGATATAACCAACCCACACAGTCTGACACAAAACATCAACACAAA
ATACAAAACAAGAACAAACAAGACCTCCACATTGTCTCTAAACACAACCAAGAATCTCAA
CTGTTCTCTAAAGAGAACTAAGAAACTTAACCCATATGATCTGTGCACTCTCCATTGCCT
CTCTCGCAAACTCCTCAGCCGCTTGCTCCTCTTTCGCCTTCCTCACAGCTCCATGATACT
CCTCATAAGCCTCTGAAGCATCAACAAGAAAATGAGAAAGACCTTTCACAACCTTCTTAA
ACTCCACATCGACAGCTTCTCTCTCTGTCTCAAGCTTCTTCAACAGTTTCTTGATCGCAA
AGATTCTAACGTACAGCGCGTCTCCTCTCTGCGCAAGCCTTTTAGCCTCCTCGAAGTTAG
CGTCCACGAAGGTCTGCTTCTCGGTGGCCGTCTCTTTGAGCATCGTAGCCCGTGCCTTTG
CGATGTGGACTCTCTCGGAAGCCTCGAGTCCTTGTGTTATTACGTTTCTGTACTTAGCTA
ACCTTGAAATGTAACTG
C

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4CN94JQ 761 0 0
G
TGAAAAAAAACATTATTTATTTTAGTGTGTCTATCTCCAATCTCTATCCCCTGATATAAC
CAACCCACACAGTCTGACACAAAACATCAACACAAAATACAAAACAAGAACAAACAAGAC
CTCCACATTGTCTCTAAACACAACCAAGAATCTCAACTGTTCTCTAAAGAGAACTAAGAA
ACTTAACCCATATGATCTGTGCACTCTCCATTGCCTCTCTCGCAAACTCCTCAGCCGCTT
GCTCCTCTCTCGCCTTCCTCACAGCTCCATGATACTCCTCATAAGCCTCTGAAGCATCAA
CAAGAAAATGAGAAAGACCTTTCACAACCTTCTTAAACTCCACATCGACAGCTTCTCTCT
CTGTCTCAAGCTTCTTCAACAGTTTCTTGATCGCAAAGATTCTAACGTACAGCGCGTCTC
CTCTCTGCGCAAGCCTTTTAGCCTCCTCGAAGTTAGCGTCCACGAAGGTCTGCTTCTCGG
TGGCCGTCTCTTTGAGCATCGTAGCCCGTGCCTTTGCGATGTGGACTCTCTCGGAAGCCT
CGAGTCCTTGTGTTATTACGTTTCTGTACTTAGCTAACCTTGAAATGTAACTGATGGGAG
CTGAGCTTAGCTCTTCGAAAGCTGCAGCCATGACGAGAATCTTATCAAAGTCTTGACGTG
TCACGAGCTGACGAGCGGTTAAGCCACGAAACTCTTTCAGTTTAGCCCTAAGGCTCTCTA
CAGTCTCTGACGTGGCTGCTGATTCACTTGTGGATGGTGA

QA 2 761 2 761
DS 



AS 1 3

CO CL4089Contig1 1065 3 8 U
GGGGAAAGTCCCTTCTTGGGTTGGTATCCCAACTTCAGTTGCTCTGCCTTTTGGTGTTTT
TGAGAAGGTTCTCTCTGAAAAGGCGAATCAGGCTGTGAGCGAGAAAGTGCAAGTATTGAA
GAAAAGTCTTGATGAGGGAGACCAAGATGCTCTCGGAGAAATCCGTAAGACAGTGTTGGG
ACTAGTTGCACCCGCAGAACTGGTTGAAGAACTAAAAAGCACTATGAAAAAATCCGACAT
GCCATGGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATGGGAACAAGCATGGGCAGCCATTAAAAA
GGTCTGGGCGTCGAAATGGAACGAGAGAGCCTACTTCAGCACGAAGAAAGTAAAACTGGA
TCATGACTACCTCTGCATGGCTGTTCTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCGGACTATGCGTT
CGTCATTCACACAACCAACCCTTCTTCTGGAGACTCATCAGAGATTTACGCCGAGGTTGT
CAAAGGCCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCATATCCTGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCAC
CAAGAAAAACAACCTCGACTCTCCACTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGGGCT
ATTCATAAGACGTTCGATCATCTTCAGGTCTGATTCTAACGGAGAGGATCTCGAAGGTTA
TGCAGGTGCAGGTCTCTACGACAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTCGTTCTCGA
TTACACAACAGATCCTCTGATCACGGACGAGGGCTTCCAGAGAAAGATCCTCTCAGACAT
TGCACGTGCCGGAGATGCCATTGAGAAGCTGTATGGAACTGCACAAGACATTCAAGGGGT
GATCAGAGACGGGAAACTCTATGTTGTCCAGACACGACCACAAGTGTGATCAGTGTATAT
ATGACGTTCTTTGTCCAGTGAACTTATTATTTGCTCTATAAGCAAAGAGTAAAAAGCATG
AACATATAGATCAATGTGTAGTACAAAATAACATCATATCGCATTACCACCAAAATGTAA
GCAAACACTTTGTATTGGAGTTGAAAGCTTCTTCAGCTTTTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E668TF U 1
AF RR4BT16TF U 431
AF RR4E668JQ C 336
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BS 549 549 RR4E668JQ
BS 550 832 RR4BT16TF
BS 833 833 RR4E668JQ
BS 834 961 RR4BT16TF
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BS 963 1008 RR4BT16TF
BS 1009 1065 RR4E668JQ

RD RR4E668TF 549 0 0
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GAAAAGTCTTGATGAGGGAGACCAAGATGCTCTCGGAGAAATCCGTAAGACAGTGTTGGG
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GCCATGGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATGGGAACAAGCATGGGCAGCCATTAAAAA
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CAAGAAAA
A

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4BT16TF 578 0 0
GG
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TGAAACTCTTGTAGGAGCATATCCTGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCACCAAGAAAA*CAA
CCTCGACTCTCCACTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGGGCTATTCATAAGACG
TTCGATCATCTTCAGGTCTGATTCTAACGGAGAGGATCTCGAAGGTTATGCAGGTGCAGG
TCTCTACGACAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTCGTTCTCGATTACACAACAGA
TCCTCTGATCACGGACGAGGGCTTCCAGAGAAAGATCCTCTCAGACATTGCACGTGCCGG
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GAAACTCTATGTTGTCCAGACACGACCACAAGTGTGATCAGTGTATATATGACGTTCTTT
GTCCAGTGAACTTATTATTTGCTCTATAAGCAAAGAGTAAAAAGCATGAGCATATAGATC
AATGTGTAGTACAAAATAACATCATATCGCATTACC

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR4E668JQ 730 0 0
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AAGTCATCAATGCGGACTATGCGTTCGTCATTCACACAACCAACCCTTCTTCTGGAGACT
CATCAGAGATTTACGCCGAGGTTGTCAAAGGCCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCATATC
CTGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCACCAAGAAAAACAACCTCGACTCTCCACTGGTGTTGG
GTTACCCAAGCAAACCGATTGGGCTATTCATAAGACGTTCGATCATCTTCAGGTCTGATT
CTAACGGAGAGGATCTCGAAGGTTATGCAGGTGCAGGTCTTTACGACAGTGTACCGATGG
ACGAGGAAGACAAAGTCGTTCTCGATTACACAACAGATCCTCTGATCACGGACGAGGGCT
TCCAGAGAAAGATCCTTTCAGACATTGCACGTGCCGGAGATGCCATTGAGAAGCTGTATG
GAACTGCACAAGACATTCAAGGGGTGATCAGAGACGGGAAACTCTATGTTGTCCAGACAC
GACCACAAGTGTGATCAGTGTATATATGACGTTCTTTGTCCAGTGAACTTATTATTTGCT
CTATAAGCAAAGAGTAAAAAGCATGAACATATAGATCAATGTGTAGTACAAAATAACATC
ATATCGCATTACCACCAAAATGTAAGCAAACACTTTGTATTGGAGTTGAAAGCTTCTTCA
GCTTTTGCCT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL4090Contig1 1011 3 5 U
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AATGTCGACATCTGGGTTTAGTTTGTTCCTCGGTCTTCTACAACTCGTTGTTCTCTTACT
TCCGTTGAGAACATCTGCAATTAGGAAGGACATCGGATTCTTAGAAGAGAGGATTTGCAG
AACAACTGTACAAGGAAGGTACCTGATCTCCGATGATGAAGGCAATGTGTGCGATGCTCT
GTCTTTGGATTCTCGAACCCGGTGCTGCCCATTGAAAGGAGAAAGATTCTCTTGCCAGGG
ATGCAACATCCTTTCACAATGCTGCAGCTCTTATGAATTTTGCGTTTCTTGTTGCTTGAA
TCCAACTCGGACGCTTCTCGAGAAGGTGGTTAAGGTAAAAGTTGCCAAGCCGGCTACAGC
AGGGACATACAAGACTGTATTTGATTTTTGTGCCGGGAGATGTCGCCATAGTTCTGAGAG
TGTAGTTCATGAAAATGCATACCACAGCAAGTTTCACCATTGCTTTTCTCTGACGTCAAA
TGCTTCAGGGGCTAATCTTACACAAGTTGAAACAAGACTTCTTGGCATTGACGTTATTGT
CGGAAGGCAAGGAGATTCATGCGATGCTGTTTGCAAGGCACGTGGACAATTGTGTGTGAT
GAATAAACTCTCACTTCTAAACCAATGTGACGTTATGCAAAGATACATGACCTGCAAAGG
CTCTTGTTTAGCAAGTGTTGGGCCTGACCAACCTGCTGAAGTTGCTGATGATGCACCCAG
AGATTTGTATCCCGGCGCGTGCTTGTATAGCCGGACACAATCAATGCTTTCTTGTGACGG
TTTACACCAATACACCCGACGACTCTGCCCATGTGCCTAAAAAAAACTAGTCAGAAACTT
TTGCCAATAACTTTTTCCCTGCTTATATACACATGTTCATATATAACCACAACAGATAGC
AATGGAATTATAGATTTTAGATGTTTTGTTAGTCTGAAGAACTCACAAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G748TF U 1
AF RR4F261TF U 11
AF RR4G748JQ C 485
BS 1 231 RR4G748TF
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RD RR4G748TF 575 0 0
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GTCTTTGGATTCTCGAACCCGGTGCTGCCCATTGAAAGGAGAAAGATTCTCTTGCCAGGG
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TCCAACTCGGACGCTTCTCGAGAAGGTGGTTAAGGTAAAAGTTGCCAAGCCGGCTACAGC
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TGTAGTTCATGAAAATGCATACCACAGCAAGTTTCACCATTGCTTTTCTCTGACGTCAAA
TGCTTCAGGGGCTAATCTTACACAAGTTGAAACAA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4F261TF 734 0 0
GG
AGAGTCGGAACTTGATCTGGTCGAAAGGGTTGTTCTTTCTCCGACAAGAATGTCGACATC
TGGGTTTAGTTTGTTCCTCGGTCTTCTACAACTCGTTGTTCTCTTACTTCCGTTGAGAAC
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AGGAAGGTACCTGATCTCCGATGATGAAGGCAATGTGTGCGATGCTCTGTCTTTGGATTC
TCGAACCCGGTGCTGCCCATTGAAAGGAGAAAGATTCTCTTGCCAGGGATGCAACATCCT
TTCACAATGCTGCAGCTCTTATGAATTTTGCGTTTCTTGTTGCTTGAATCCAACTCGGAC
GCTTCTCGAGAAGGTGGTTAAGGTAAAAGTTGCCAAGCCGGCTACAGCAGGGACATACAA
GACTGTATTTGATTTTTGTGCCGGGAGATGTCGCCATAGTTCTGAGAGTGTGGTTCATGA
AAATGCATACCACAGCAAGTTTCACCATTGCTTTTCTCTGACGTCAAATGCTTCAGGGGC
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AGATTCATGCGATGCTGTTTGCAAGGCACGTGGACAATTGTGTGTGATGAATAAACTCTC
ACTTCTAAACCAATGTGACGTTATGCAAAGATACATGACCTGCAAAGGCTCTTGTTTAGC
AAGTGTTGGGCC

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR4G748JQ 527 0 0
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AGGCAAGGAGATTCATGCGATGCTGTTTGCAAGGCACGTGGACAATTGTGTGTGATGAAT
AAACTCTCACTTCTAAACCAATGTGACGTTATGCAAAGATACATGACCTGCAAAGGCTCT
TGTTTAGCAAGTGTTGGGCCTGACCAACCTGCTGAAGTTGCTGATGATGCACCCAGAGAT
TTGTATCCCGGCGCGTGCTTGTATAGCCGGACACAATCAATGCTTTCTTGTGACGGTTTA
CACCAATACACCCGACGACTCTGCCCATGTGCCTAAAAAAAACTAGTCAGAAACTTTTGC
CAATAACTTTTTCCCTGCTTATATACACATGTTCATATATAACCACAACAGATAGCAATG
GAATTATAGATTTTAGATGTTTTGTTAGTCTGAAGAACTCACAAGCA

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

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CGTACGGCGATTCCTCCAACGTACCAAGGCCACAAAGAAGACAACATCTGGTCTCCGTTC
GTTTACGGAACCGCTGTTCCCATAGCTCCTTACAACTCCGTCGCGTTGGGGGATGAGCAA
GGACGTGGGTTCGTCGGGTTGATGATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGGTGGAAAGTAGGG
ACGTTGATCACCGGGAAATACCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCCTACATCAATCTTGGA
AACAAAGCTGCTGGTGTTATTGTCGGTGACAACGCCGTTAAGTATACGTTGGTTACTAAA
TGCAGTGTCAATGTTTAGAACATTGACGGCGTTAAGTTGCTTTTCCCCTTTTTTAATTTA
TTCATAATCAATCATTTTCTTTTTAAGAACAAATTTGCCAAACTTCTTCTTCCACCAGCA
AGATAAGGTTTCTGTTTCACTACTTTTGGTTGTTAAGATTAGTGTTGATTATTATTATAG
AACAATTACAGTCACGATGGTGTGTGGTTGGATTTAACTATATATCCACTTAAGGTGAAA
AAGATGGATTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT91TF U 40
AF RR4EY23JQ C 1
BS 1 40 RR4EY23JQ
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G
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CGGCCTACATCAATCTTGGAAACAAAGCTGCTGGTGTTATTGTCGGTGACAACGCCGTTA
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TTTTCCCCTTTTTTAATTTATTCATAATCAATCATTTTCTTTTTTAGAACAAATTTGCCA
AACTTCTTCTTCCACCAGCAAGATAAGGTTTCTGTTTCACT

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR4EY23JQ 613 0 0
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CGTACGGCGATTCCTCCAACGTACCAAGGCCACAAAGAAGACAACATCTGGTCTCCGTTC
GTTTACGGAACCGCTGTTCCCATAGCTCCTTACAACTCCGTCGCGTTGGGGGATGAGCAA
GGACGTGGGTTCGTCGGGTTGATGATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGGTGGAAAGTAGGG
ACGTTGATCACCGGGAAATACCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCCTACATCAATCTTGGA
AACAAAGCTGCTGGTGTTATTGTCGGTGACAACGCCGTTAAGTATACGTTGGTTACTAAA
TGCAGTGTCAATGTTTAGAACATTGACGGCGTTAAGTTGCTTTTCCCCTTTTTTAATTTA
TTCATAATCAATGATTTTCTTTTTAAGAACAAATTTGCCAAACTTCTTCTTCCACCAGCA
AGATAAGGTTTCTGTTTCACTACTTTTGGTTGTTAAGATTAGTGTTGATTATTATTATAG
AACAATTACAGTCACGATGGTGTGTGGTTGGATTTAACTATATATCCACTTAAGGTGAAA
AAGATGGATTGGG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL4092Contig1 749 2 8 U
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AAAAGAGATATAGAAAGAGAATGGCATCAGCAGAGCAAAAGGAGGTAGAAGAAAATGGGT
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CGGGTTCGTTGGTTGGCAACAAGACAACGGTTTTAGACGTACCAGTTAAGGTGGCTTATA
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ACATTGGACTAACTTTCGACATTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTCTCTACTC
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TAATTATAATCTAATTTTCAATAACATACGATCCACAAACATAGGCGATCGGAGATTATC
AATTCTGCATTTATTTTAAATCCTTTTTCTTTTAATTTTAGTTAAGGACATTTGTTGGTT
GTTTATGTTTGCATGGTGTTGTTTATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FE13TF U 1
AF RR4FW11TF U 37
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BS 296 296 RR4FW11TF
BS 297 308 RR4FE13TF
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BS 658 749 RR4FW11TF

RD RR4FE13TF 657 0 0
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AAAAGAGATATAGAAAGAGAATGGCATCAGCAGAGCAAAAGGAGGTAGAAGAAAATGGGT
CGATGATTTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTTGCGGAGAAGCTAGCTAGTG
TTCCGACACCGGAAGCCGCCGTGGACAACGTAGACTTTAAGGGAGTGACACGTCAAGGTG
TAGACTACCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAGACGATTCCTATTTGCC
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CGGGTTCGTTGGTTGGCAACAAGACAACGGTTTTAGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATA
GCATAGCGGTTAGTCTGATGAAGGACATTGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTG
ACATTGGACTAACTTTCGACATTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTCTCTACTC
AGGGCGAGATCAAGCTCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTAGACTATGGTATGTCT
TAATTATAATCTAATTTTCAATAACATACGATCCACAAACATAGGCGATCGGAGATT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4FW11TF 713 0 0
GG
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AAGGGAGTGACACGTCAAGGTGTAGACTACCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTAC
TCTCAGACGATTCCTATCTGCCAGATCTCTTACGTCCTCAAGAGTGCCACGAGGC***TA
GCGTCGGGGACAATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGTAACAAGACAACGGTTTTAGAC
GTACCAGTTAAGGTGGCTTATAGCATAGCGGTTAGTCTGATGAAGGACATTGGCTCGGAC
TGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGACTAACTTTCGACATTCCTGTTGTTGGTGAC
ATTACCATTCCTGTCTCTACTCAGGGCGAGGTCAAGCTCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTT
TAATTTAGACTATGGTATGTCTTAATTATAATCTAATTTTCAATAACATACGATCCACAA
ACATAGGCGATCGGAGATTATCAATTCTGCATTTATTTTAAATCCTTTTTCTTTTAATTT
TAGTTAAGGACATTTGTTGGTTGTTTATGTTTGCATGGTGTTGTTTATGGT

QA 3 713 3 713
DS 



AS 1 3

CO CL4093Contig1 661 3 2 U
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AAGTGTCAGTAAAAGCTTACAGAAAACATAAAAGAAACACCATGAAACAATACACAAGAT
ATATAGGCTGCTAAAACAACCTTCACCGTAAAAATTTATCAGCTAAAAGTTTTTTTTTCC
CTTTTCTTCCATCTTCCTCTGCTTTCTTTCGTTGACAAATGGCTTTAAATAAAAACAAAA
GAAACAACAACACAGATCTCATGTTACATGAGTCTGAGTTCGTACTCACCAGCCATGGTT
ATATATCTCACCCACGGAAGAGCTTGGTACCCACTCTTCTCTATCACCTTCAGGTAACGA
ACCTGTATCCCTGAAACAGTGAAATATGGGATCTCGAATTTGACTCGGATAGGAGCTTTT
CGCTCAGGCGTGGCTTCCTCTGCGGTTATACTTGGGAGATGGAACTCTGCTCTCAACATA
TACTCCTTGTTCCCAGGGAAAGATTTGATTTTCCAAACCAATGCATCTTTTTCAGGAGCA
TATGCGGCAGACCCGAGAGATGTTCTTACGGTGGGGTTGGATGCATCGGTTGGTACAGGC
AACTCGATCTCAACATTCGTTGCAGTGCTTCTTTCCTTGAACTGGCTTCTAGCTTTTACA
A


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EU48JQ U 1
AF RR4DM77JQ U 18
AF RR4EU48TF C 1
BS 1 548 RR4EU48JQ
BS 549 661 RR4EU48TF

RD RR4EU48JQ 554 0 0
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AAGTGTCAGTAAAAGCTTACAGAAAACATAAAAGAAACACCATGAAACAATACACAAGAT
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CTTTTCTTCCATCTTCCTCTGCTTTCTTTCGTTGACAAATGGCTTTAAATAAAAACAAAA
GAAACAACAACACAGATCTCATGTTACATGAGTCTGAGTTCGTACTCACCAGCCATGGTT
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TACTCCTTGTTCCCAGGGAAAGATTTGATTTTCCAAACCAATGCATCTTTTTCAGGAGCA
TATGCGGC
AGACCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4DM77JQ 531 0 0
GCA
AAAAAATGCTCGTTGTTTAACAATTTTTGACAAAGATTAAAAGTGTCAGTAAAAGCTTAC
AGAAAACATAAAAGAAACACCATGAAACAATACACAAGATATATAGGCTGCTAAAACAAC
CTTCACCGTAAAAATTTATCAGCTAAAAGTTTTTTTTTCCCTTTTCTTCCATCTTCCTCT
GCTTTCTTTCGTTGACAAATGGCTTTAAATAAAAACAAAAGAAACAACAACACAGATCTC
ATGTTACATGAGTCTGAGTTCGTACTCACCAGCCATGGTTATATATCTCACCCACGGAAG
AGCTTGGTACCCACTCTTCTCTATCACCTTCAGGTAACGAACCTGTATCCCTGAAACAGT
GAAATATGGGATCTCGAATTTGACTCGGATAGGAGCTTTTCGCTCAGGCGTGGCTTCCTC
TGCGGTTATACTTGGGAGATGGAACTCTGCTCTCAACATATACTCCTTGTTCCCAGGGAA
AGATTTGATTTTCCAAACCAATGCATCTTTTTCAGGAGCATATGCGGC

QA 4 531 4 531
DS 

RD RR4EU48TF 661 0 0
GCCAGACAAAGTGGCCATACAAAAAATGCTCGTTGTTTAGCAATTTTTGACAAAGATTAA
AAGTGTCAGTAAAAGCTTACAGAAAACATAAAAGAAACACCATGAAACAATACACAAGAT
ATATAGGCTGCTAAAACAACCTTCACCGTAAAAATTTATCAGCTAAAAGTTTTTTTTTCC
CTTTTCTTCCATCTTCCTCTGCTTTCTTTCGTTGACAAATGGCTTTAAATAAAAACAAAA
GAAACAACAACACAGATCTCATGTTACATGAGTCTGAGTTCGTACTCACCAGCCATGGTT
ATATATCTCACCCACGGAAGAGCTTGGTACCCACTCTTCTCTATCACCTTCAGGTAACGA
ACCTGTATCCCTGAAACAGTGAAATATGGGATCTCGAATTTGACTCGGATAGGAGCTTTT
CGCTCAGGCGTGGCTTCCTCTGCGGTTATACTTGGGAGATGGAACTCTGCTCTCAACATA
TACTCCTTGTTCCCAGGGAAAGATTTGATTTTCCAAACCAATGCATCTTTTTCAGGAGCA
TATGCGGCAGACCCGAGAGATGTTCTTACGGTGGGGTTGGATGCATCGGTTGGTACAGGC
AACTCGATCTCAACATTCGTTGCAGTGCTTCTTTCCTTGAACTGGCTTCTAGCTTTTACA
A

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 3

CO CL4094Contig1 864 3 10 U
GTGAATTTGAAATTATTTTATGATGAAAAATCATCTATTGAACACCATAGAAGCTTATTG
GAGAACAAACAAGGCATTGTCTGGAGTTTCAAACCAAGAGAAAACATCTTCAAAAAACTA
TTCCAGATTTGATTAGGAACAAATGGAAAAATCTTGAATCCAAGTTCTACGATGTAGCAA
GTAGATTAACATCTTCGGTCGCCTTGCCTTCAGTTTGCATTTCTTTAACTGCTCTTATCA
GCCCCTGAGTAATAGCATTGAGGTGCAAGCCCTTCTGCTTCATCTCCTCAAACAGCATCT
CTGCTTTCTCCCAGTCCAAGGCTTTTAGGCAGAACGACTGTATCAGCTTACTATACTCAT
CCTCACTAGGCTTCACACCGAAACTCTCCATCTCGTTCAAAAGCTTAAGAGCTTCGTCAT
ACTCTTCAATCTTGCAGTAGCCTCGGATGAGCGAGTGATACGTCACGGGACTAAGCCTCT
CATGTTTCTTTTTCGCTTCCGCTAGTATCTCCTGAGCTTCGTTCATCATCCCTCCTTTAG
CATAACCGCTGATGATGACTGTGTAAGTGTACACGTCCGGTTTCAAACCTCTGCTCTCCA
TCAACTTCAAAACCTCTTTGGCTTCGTCGAGATCTCCACTTCTCGAAGCGGCATGGACGA
TCAGATTAAAAACCGCGTTCCCAGGAGCAGGTCCTTTAGAGATCATATCAAGAACCAAAC
CTTTAGCGTCTTTAACATTCTTCATCCTGCACAAACTCTGGATCACATCAGAAAACGGTT
TGATCCCCTGTCGCCTAGCTTCACCAGACAAATCACTCAACAACTCCTGAGCAAACCCAA
CAGTCCCATCATTCTCGCTCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EW96JQ U 1
AF RR4B768JQ U 22
AF RR4BG02JQ U 22
BS 1 79 RR4EW96JQ
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BS 81 166 RR4EW96JQ
BS 167 167 RR4B768JQ
BS 168 199 RR4EW96JQ
BS 200 200 RR4B768JQ
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BS 224 631 RR4EW96JQ
BS 632 864 RR4B768JQ

RD RR4EW96JQ 631 0 0
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TTCCAGATTTGATTAGGAACAAATGGAAAAATCTTGAATCCAAGTTTTACGATGTAGCAA
GTAGATTAACATCTTCGGTTGCCTTGCCTTCAGTTTGCATTTATTTAACTGCTCTTATCA
GCCCCTGAGTAATAGCATTGAGGTGCAAGCCCTTCTGCTTCATCTCCTCAAACAGCATCT
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CATAACCGCTGATGATGACTGTGTAAGTGTACACGTCCGGTTTCAAACCTCTGCTCTCCA
TCAACTTCAAAACCTCTTTGGCTTCGTCGAG

QA 1 631 1 631
DS 

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GG
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TTTAGGCAGAACGACTGTATCAGCTTACTATACTCATCCTCACTAGGCTTCACACCGAAA
CTCTCCATCTCGTTCAAAAGCTTAAGAGCTTCGTCATACTCTTCAATCTTGCAGTAGCCT
CGGATGAGCGAGTGATACGTCACGGGACTAAGCCTCTCATGTTTCTTTTTCGCTTCCGCT
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TAAGTGTACACGTCCGGTTTCAAACCTCTGCTCTCCATCAACTTCAAAACCTCTTTGGCT
TCGTCGAGATCTCCACTTCTCGAAGCGGCATGGACGATCAGATTAAAAACCGCGTTCCCA
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ATCCTGCACAAACTCTGGATCACATCAGAAAACGGTTTGATCCCCTGTCGCCTAGCTTCA
CCAGACAAATCACTCAACAACTCCTGAGCAAACCCAACAGTCCCATCATTCTCGCTCAGA
G

QA 3 843 3 843
DS 

RD RR4BG02JQ 833 0 0
GG
TGAAAAATCATCTATTGAACACCATAGAAGCTTATTGGAGAACAAACAAGGCATTGTCTG
GAGTTTCAAACCAAGAGAAAACATCTTCAAAAAACTATTCCAGATTTGATTAGGAACAAA
TGGAAAAATCTTGAATCCAAGTTCTACGATGTAGCAAGTAGATTAACATCTTCGGTCGCC
TTGCCTTCAGTTTGCATTTCTTTAACTGCTCTTATCAGCCCCTGAGTAATAGCATTGAGG
TGCAAGCCCTTCTGCTTCATCTCCTCAAACAGCATCTCTGCTTTCTCCCAGTCCAAGGCT
TTTAGGCAGAACGACTGTATCAGCTTACTATACTCATCCTCACTAGGCTTCACACCGAAA
CTCTCCATCTCGTTCAAAAGCTTAAGAGCTTCGTCATACTCTTCAATCTTGCAGTAGCCT
CGGATGAGCGAGTGATACGTCACGGGACTAAGCCTCTCATGTTTCTTTTTCGCTTCCGCT
AGTATCTCCTGAGCTTCGTTCATCATCCCTCCTTTAGCATAACCGCTGATGATGACTGTG
TAAGTGTACACGTCCGGTTTCAAACCTCTGCTCTCCATCAACTTCAAAACCTCTTTGGCT
TCGTCGAGATCTCCACTTCTCGAAGCGGCATGGACGATCAGATTAAAAACCGCGTTCCCA
GGAGCAGGTCCTTTAGAGATCATATCAAGAACCAAACCTTTAGCGTCTTTAACATTCTTC
ATCCTGCACAAACTCTGGATCACATCAGAAAACGGTTTGATCCCCTGTCGCCTAGCTTCA
CCAGACAAATCACTCAACAACTCCTGAGCAAACCCAACAGTCCCATCATTC

QA 3 833 3 833
DS 



AS 1 3

CO CL4095Contig1 1255 3 6 U
AAAATACATTCTCTTTATTTTCCCGAAAAATAAAAACAACACAAAGAAAAGCCAATGGAT
ATTAAGATTTTTGTACCTTCTACACAAACCCAACAGAGTTTTTTTTTCCTTTTTTAAGAG
TATCTGTATCATCTAGGAGGGTCTGAGTTCTGGTTAGCTTCCCTATCTCTACGTCTCCTA
TTAACTGATCTTCCCAGGAAAACCCTTCTCTGGCTCCTCATCCGGTTCGCGAACGACCTA
GCCCCATCCTCCTCATCTCCAGGATTCCACATCGCTCTGATTGATCGTCAAGTCATCTGC
ATCGGATGCTAAACCATGAGATGTGTCAAATGCGTTTCCTGATCCCCCAAAAGCCTGCAA
CAAAAGGAAAACGTTCACTAGGTTCCTACCAATCCCAGCACCGATCCTCCCCACTTCCTC
CCTATCATCCTCATCCGAATCTGAACCGTACGCACCTCTCTCTATCACGTAATCCCCAAA
CACCGTTGCACCAGGCATCGTCGACCTGATCGTGCTGATCACATCGTTACGGTCCTGCTC
AACCTCGAACCTTCTCCACTCCTGCTCCACATCGGGATCCACTTCACGCGGCTGCGCACA
AGGGTGGTCTTTCTTCATGTGTTTCCTCAGCTCCTTGAAACATCCAGCAAAGGAACAATC
CTCCTGCATACAGCTCCTCTTCTTCAGATTCAGATCGTCTCTCGCAGGCTTCACGATAGT
CCAACCTTTCACCTGTCCCCTACAAAGCGGACACTTGAGATTCTCCGCAACCTCGCACTC
ACTACCAACCACTTGCTGCTGATGCGGCGACGGCATTAGCTTAGCAGACGCCTTCTTGTA
CTGATCCGAGCAGTTTGAGTAACGGAAGCTGGTCCCACACATGTAAGGACGGCAACCCTT
GTCGTGAGAGGAACAGAGGAGAAGCACAGCGTTGTGAGGACACTCCATACAGACGGAACA
CACAGCATCCGCCCAATCGTTCTTCTCCATCATCGCCTTGGGACAAGTGTTTGCAAACAC
GCTCCTCCTCCCCACAAGTCGCTTCGAAGATGCGAACTTGTATGGTCTTGCTCTGATCCG
TCGAGTAGAAACCCTGCGCCTGGCTCTTCTAGCTTTCACCATCTTCTTATGTACCTGAAC
AAGAACAAGCAAACACCGGATGAATGTAATCCACGCGGCTGAGATTATGGAGCGGAGACC
GGCGACGTGAAATGACGCCGGGAAGGTGTAGAGAGAGACAGAGAAGGAAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A143JQD U 1
AF RR4A143JQ U 116
AF RR4A143TFB C 566
BS 1 138 RR4A143JQD
BS 139 139 RR4A143JQ
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BS 163 641 RR4A143JQD
BS 642 1255 RR4A143TFB

RD RR4A143JQD 641 0 0
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ATTAAGATTTTTGTACCTTCTACACAAACCCAACAGAGTTTTTTTTTCCTTTTTTAAGAG
TATCTGTATCATCTAGGATGGTCTGAGTTCTGGTTAGCTTCTCTATCTCTACGTCTCCTA
TTAACTGATCTTCCCAGGAAAACCCTTCTCTGGCTCCTCATCCGGTTCGCGAACGACCTA
GCCCCATCCTCCTCATCTCCAGGATTCCACATCGCTCTGATTGATCGTCAAGTCATCTGC
ATCGGATGCTAAACCATGAGATGTGTCAAATGCGTTTCCTGATCCCCCAAAAGCCTGCAA
CAAAAGGAAAACGTTCACTAGGTTCCTACCAATCCCAGCACCGATCCTCCCCACTTCCTC
CCTATCATCCTCATCCGAATCTGAACCGTACGCACCTCTCTCTATCACGTAATCCCCAAA
CACCGTTGCACCAGGCATCGTCGACCTGATCGTGCTGATCACATCGTTACGGTCCTGCTC
AACCTCGAACCTTCTCCACTCCTGCTCCACATCGGGATCCACTTCACGCGGCTGCGCACA
AGGGTGGTCTTTCTTCATGTGTTTCCTCAGCTCCTTGAAAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4A143JQ 513 0 0
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TCCTATTAACTGATCTTCCCAGGAAAACCCTTCTCTGGCTCCTCATCCGGTTCGCGAACG
ACCTAGCCCCATCCTCCTCATCTCCAGGATTCCACATCGCTCTGATTGATCGTCAAGTCA
TCTGCATCGGATGCTAAACCATGAGATGTGTCAAATGCGTTTCCTGATCCCCCAAAAGCC
TGCAACAAAAGGAAAACGTTCACTAGGTTCCTACCAATCCCAGCACCGATCCTCCCCACT
TCCTCCCTATCATCCTCATCCGAATCTGAACCGTACGCACCTCTCTCTATCACGTAATCC
CCAAACACCGTTGCACCAGGCATCGTCGACCTGATCGTGCTGATCACATCGTTACGGTCC
TGCTCAACCTCGAACCTTCTCCACTCCTGCTCCACATCGGGATCCACTTCACGCGGCTGC
GCACAAGGGTGGTCTTTCTTCATGTGTTTCCTC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR4A143TFB 690 0 0
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CTCAGCTCCTTGAAACATCCAGCAAAGGAACAATCCTCCTGCATACAGCTCCTCTTCTTC
AGATTCAGATCGTCTCTCGCAGGCTTCACGATAGTCCAACCTTTCACCTGTCCCCTACAA
AGCGGACACTTGAGATTCTCCGCAACCTCGCACTCACTACCAACCACTTGCTGCTGATGC
GGCGACGGCATTAGCTTAGCAGACGCCTTCTTGTACTGATCCGAGCAGTTTGAGTAACGG
AAGCTGGTCCCACACATGTAAGGACGGCAACCCTTGTCGTGAGAGGAACAGAGGAGAAGC
ACAGCGTTGTGAGGACACTCCATACAGACGGAACACACAGCATCCGCCCAATCGTTCTTC
TCCATCATCGCCTTGGGACAAGTGTTTGCAAACACGCTCCTCCTCCCCACAAGTCGCTTC
GAAGATGCGAACTTGTATGGTCTTGCTCTGATCCGTCGAGTAGAAACCCTGCGCCTGGCT
CTTCTAGCTTTCACCATCTTCTTATGTACCTGAACAAGAACAAGCAAACACCGGATGAAT
GTAATCCACGCGGCTGAGATTATGGAGCGGAGACCGGCGACGTGAAATGACGCCGGGAAG
GTGTAGAGAGAGACAGAGAAGGAAGATTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

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TACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCT
CGGGCTTGATCTCGACCTGGTTGAAAGTCTTCCCATTGTAGACACCAATGATGCTTCCGA
TCATCTCAGGGACGATGATCATGTTCCTCAAATGGGTTCTCACTGGCTCAGGCTTCTCAC
CTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGCAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGG
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TCTTCTTCGGGACTCCTGCAGCAGCAGCAACCTCTGGCTCAACATCCGCCATGTTTCTTT
AGATCTCAGTGAAAGGATACGGTTACAAGACGATGGTCTGCGTTAAGTCTTTTTGGAGGC
GATAAACAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE51JQ U 1
AF RR4FC22JQ U 16
AF RR4EE51TF C 40
BS 1 536 RR4EE51JQ
BS 537 567 RR4FC22JQ
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BS 705 731 RR4EE51TF

RD RR4EE51JQ 536 0 0
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ATAGACGAGAGATGGTATCTAAGAAGTTTTTCATCATAAAGCAACAA*AAAAAAAGGTCT
AACAAACGAACGTTGTAAAATCAAAGGCAAGAGACCATGTAAAGACATTCCCGCAAGTAC
AACAAGATCTTCACTTGAGAGGAATGAATCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCC
TACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCT
CGGGCTTGATCTCGACCTGGTTGAAAGTCTTCCCATTGTAGACACCAATGATGCTTCCGA
TCATCTCAGGGACGATGATCATGTTCCTCAAATGGGTTCTCACTGGCTCAGGCTTCTCAC
CTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGCAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGG
TCAAACCTCTCGAGAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4FC22JQ 689 0 0
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TATCTAAGAAGTTTTTCATCATAAAGCAACAGCAAAAAAAGGTCTAACAAACGAACGTTG
TAAAATCAAGGGCAAGAGACCATGTAAAGACATTCCCGCAAGTACAACAAGATCTTCACT
TGAGAGGAATGAATCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCG
GCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCTCGGGCTTGATCTCGA
CCTGGTTGAAAGTCTTCCCATTGTAGACACCAATGATGCTTCCGATCATCTCAGGGACGA
TGATCATGTTCCTCAAATGGGTTCTCACTGGCTCAGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCC
TTTTCGCCTTACGCAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTCGAGA
ACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCATCAGTAGACATGTCAAGAA
GAGCATCGAGATTGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTCGGGACTC
CTGCAGCAGCAGCAACCTCTGGCTCAACATCCGCCATGTT*CTTTAGATCTCAGTGAAAG
GATACGGTTACAAGACGATGGTCTGCGTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4EE51TF 692 0 0
TTTTAAGATCCTGGTCACATAATAGACGAGAGATGGTATCTAAGAAGTTTTTCATCATAA
AGCAACAA*AAAAAAAGGTCTAACAAACGAACGTTGTAAAATCAAAGGCAAGAGACCATG
TAAAGACATTCCCGCAAGTACAACAAGATCTTCACTTGAGAGGAATGAATCTGGAGGAGT
GGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAG
CCAGGTAGTGACCAATCATCTCGGGCTTGATCTCGACCTGGTTGAAAGTCTTCCCATTGT
AGACACCAATGATGCTTCCGATCATCTCAGGGACGATGATCATGTTCCTCAAATGGGTTC
TCACTGGCTCAGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGCAGCTTCTTAA
TCAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTCGAGAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGA
AGAGCTTGACGAGATCATCAGTAGACATGTCAAGAAGAGCATCGAGATCGACTCCTTTGA
AGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTCGGGACTCCTGCAGCAGCA***ACCTCTGGCT
CAACATCCGCCATGTTTCTTTAGATCTCAGTGAAAGGATACGGTTACAAGACGATGGTCT
GCGTTAAGTCTTTTTGGAGGCGATAAACAGCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 3

CO CL4097Contig1 781 3 23 U
GGGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATTCCAACGAAGATCCATGGCCATC
TCCTTAGCGAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTCATCTCCACTTCGTTC
GCGACCTCTGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAA
TCCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCG
TATGATGTGTCTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGA
AACACTTCAAGATCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCATTCGAA
CTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAATCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATC
CCCACAAAGACTGCTCTACAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTC
GCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCCAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGA
TCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCA
AAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTCAGTGAAATGAAGCTA
AGAATGGTTGTCACGATGCTTTTTTTTTTTGTGTTTAGCTGTTAAAACACAGTTTGAAAA
CTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGCGTTTGCAGAGGACTATGTTAAAGAG
C


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4F142TF U 1
AF RR4FY84TF U 10
AF RR4C717JQ C 208
BS 1 68 RR4F142TF
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BS 381 437 RR4F142TF
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BS 615 680 RR4FY84TF
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RD RR4F142TF 614 0 0
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GCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCCAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGA
TCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTTATATACTTGGTAGCAACGCCTTCA
AAGTCCAATTTAGC

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DS 

RD RR4FY84TF 671 0 0
GG
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GCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTCATCTCCACTTCGTTCGCGACCTCTGA
AATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCGGCGCCGA
GCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGTC
TCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAG
ATCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCATTCGAACTTGAGGCTAA
GGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAATCCTGCTGCCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGAC
TGCTCTACAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCC
TCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCCAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTC
AGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTT
AGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTCAGTGAAATGAAGCTAAGAATGGTTGT
CACGATGCT

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DS 

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TGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAGATCATGGGAGAGACTT
GATGCAGGAGGTATTCTGTTTCATTCATTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTT
TATGGTAATCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTTTACAGCAAGCC
TTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTT
GCCGTGGCCAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTG
GTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGC
AAGAAGAAGCGCTAAGTCAGTGAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTCACGATGCTTTTTTTT
TTTGTGTTTAGCTGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTC
ACTTTGGCGTTTGCAGAGGACTATGTTAAAGAGC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

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TGGCTTCTCATGGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAGAAATAAGATCCAACGTTAATCAAG
CTTCCATTGGGAGCTCTCCACAGGCATAGATTCTGCAAGGTTTCTTGGGAACATCCATGG
CACGCGTCTCCTGAGACTCAAGTCTCCTCACAATGTTCATACCTTCAATGACTTGTCCAA
ACACAATATGCATACCATCTAACCATGAAGTCTTGGCGGTGCAAATGAAAAACTGGCTTC
CATTAGTATTAGGACCAGCGTTAGCCATGCTCAAGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAGGG
TGAAGTTTTCATCTTCAAACTTGGCACCGTAAATACTAATACCTCCAGTACCATTTCCCT
CAGTGAAATCACCTCCTTGGATCATGAAGTCCTTAATGATACGGTGAAAGGAAGAACCTT
TGTACCCATACTTCTTCTCACCAGTACACAAGGCACGGAAGTTGTCGACGGTTCTAGGGA
CAACATCACCAAACAGACCCATCACAATCCTTCCAGCGACTTCACCACCAATCTCAATAT
CAAAGTAAACCTTTTTCGTCACTTTAGCCTGAGGAGGTACTAGCACTTCTTCCTCCTCCT
CAGCGGCCATTGATTTGACACAAGCTGTTCGCTTAAGAGGGAAGCTTGTTGCGTAGTGTA
GTCTTGAAGAAAGTGAGAAACCAGAGGAACGAGCTCCGAAGCAAAGTGATTGAGGTGTTC
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CCATTTGCAATGGAGACGAAGAAGCCATTGATTGATTGATACTGTAAGAGTCAAAGTTAA
GAAGACGATGACGACTATCCTGTGTTGATTGTCTTTGCTTCAGACAAGAGTGTCTACTTC
CAGATAAGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F150JQ U 1
AF RR4BP50TF C 232
BS 1 654 RR4F150JQ
BS 655 976 RR4BP50TF

RD RR4F150JQ 654 0 0
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TGGCTTCTCATGGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAGAAATAAGATCCAACGTTAATCAAG
CTTCCATTGGGAGCTCTCCACAGGCATAGATTCTGCAAGGTTTCTTGGGAACATCCATGG
CACGCGTCTCCTGAGACTCAAGTCTCCTCACAATGTTCATACCTTCAATGACTTGTCCAA
ACACAATATGCATACCATCTAACCATGAAGTCTTGGCGGTGCAAATGAAAAACTGGCTTC
CATTAGTATTAGGACCAGCGTTAGCCATGCTCAAGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAGGG
TGAAGTTTTCATCTTCAAACTTGGCACCGTAAATACTAATACCTCCAGTACCATTTCCCT
CAGTGAAATCACCTCCTTGGATCATGAAGTCCTTAATGATACGGTGAAAGGAAGAACCTT
TGTACCCATACTTCTTCTCACCAGTACACAAGGCACGGAAGTTGTCGACGGTTCTAGGGA
CAACATCACCAAACAGACCCATCACAATCCTTCCAGCGACTTCACCACCAATCTCAATAT
CAAAGTAAACCTTTTTCGTCACTTTAGCCTGAGGAGGTACTAGCACTTCTTCCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BP50TF 745 0 0
TGACTGTCCAACACAAC
TGCATCCCATCTAACCATGA*GTCT*GGCGGTGCAAATGAAAA*CTG*CTTCCATTAGTA
TTAGGACCAGCGTTAGCCATGCTCAAGATTCCAGGTCCAGTATGCTTCAGGGTGAAGTTT
TCATCTTCAAACTTGGCACCGTAGATACTAATACCTCCAGTACCATTTCCCTCAGTGAAA
TCACCTCCTTGGATCATGAAGTCCTTAATGATACGGTGAAAGGAAGAACCTTTGTACCCA
TACTTCTTCTCACCAGTACACAAGGCACGGAAGTTGTCGACGGTTCTAGGGACTACATCA
CCAAACAGACCCATCACAATCCTTCCAGCGACTTCACCACCAATCTCAATATCAAAGTAA
ACCTTTTTCGTCACTTTAGCCTGAGGAGGTACTAGCACTTCTTCCTCCTCCTCAGCGGCC
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GAAAGTGAGAAACCAGAGGAACGAGCTCCGAAGCAAAGTGATTGAGGTGTTCGATGTGCG
GAGACTAGCTGCGACTTCACACCAATCTGAGAGATGGTGCGAGAAGTGTGAACCATTTGC
AATGGAGACGAAGAAGCCATTGATTGATTGATACTGTAAGAGTCAAAGTTAAGAAGACGA
TGACGACTATCCTGTGTTGATTGTCTTTGCTTCAGACAAGAGTGTCTACTTCCAGATAAG
AAAAAAAA

QA 18 745 18 745
DS 



AS 1 3

CO CL4099Contig1 766 3 4 U
GGAAGCAAAGTCTTCGAAGAGCAGCCACAACAAACTCTCATCTCTCTCTCTACATCTCTC
CTCTCTGTTTTTAGGGTTTTCTTAAAAACGGAGAAAGATGTTCAGAAGAGGACCTTCGAG
TAAGAGCGACAACACCAAGTTCTACGAGATCCTCGGCGTCCCCAAGACCGCCTCACCTGA
AGATCTCAAAAAGGCTTACAAGAAAGCCGCCATCAAAAACCATCCCGACAAGGGTGGAGA
TCCCGAGAAGTTCAAGGAGCTAGCTCAGGCTTATGAAGTTCTAAGCGATCCAGAGAAGCG
TGAGATCTACGATCAGTATGGTGAGGACGCGCTCAAGGAAGGAATGGGCGGAGGAGGCGG
TGGTCACGACCCCTTTGATATCTTCTCCTCCTTCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGACACCC
TTTCGGAGGTGGTAGTAGCCGTGGAAGGAGGCAGAGGCGTGGTGAGGATGTTGTTCACCC
TCTGAAGGTTTCTCTAGAGGATCTTTATCTCGGAACAACGAAGAAGCTTTCGCTTTCTAG
GAAGGCTTTGTGCTCAAAGTGTAACGGAAAGGGTTCGAAGTCTGGAGCTTCGATGACGTG
CGGTGGATGCCAGGGATCGGGAATGAAGGTGTCGATCAGGCAGATTGGACCTGGGATGAT
TCAGCAGATGCAGCATCCTTGCCATGACTGCAAGGGAACTGGTGAGACCATCAACGATCG
TGATAGGTGTCCTCAGTGCAAAGGAGAGAAGGTTGTCTCCGAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D428TF U 1
AF RR4GX42TF U 24
AF RR4C350TF U 325
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BS 180 636 RR4D428TF
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TGAGATCTACGATCAGTATGGTGAGGACGCGCTCAAGGAAGGAATGGGCGGAGGAGGCGG
TGGTCACGACCCCTTTGATATCTTCTCCTCCTTCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGACACCC
TTTCGGAGGTGGTAGTAGCCGTGGAAGGAGGCAGAGGCGTGGTGAGGATGTTGTTCACCC
TCTGAAGGTTTCTCTAGAGGATCTTTATCTCGGAACAACGAAGAAGCTTTCGCTTTCTAG
GAAGGCTTTGTGCTCAAAGTGTAACGGAAAGGGTTCGAAGTCTGGAGCTTCGATGACGTG
CGGTGGATGCCAGGGATCGGGAATGAAGGTGTCGAT

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CCCAAGACCGCCTCACCTGAAGATCTCAAAAAGGCTTACAAGAAAGCCGCCATCAAAAAC
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CTAAGCGATCCAGAGAAGCGTGAGATCTACGATCAGTATGGTGAGGACGCGCTCAAGGAA
GGAATGGGCGGTGGAGGCGGTGGTCACGACCCCTTTGATATCTTCTCTTCCTTCTTTGGT
GGTGGTGGTGGTGGACACCCTTTCGGAGGTGGTAGTAGCCGTGGAAGGAGGCAGAGGTGT
GGCGAAGATGTTGTTCACCCTCTGAAGGTTTCTCTAGAGGGTCTTTATCTCGGAACAACG
AAGAAGCTTTCACTCTCTAGGAAGGCCTTGTGCTCAAAGTGTAACGGAAAGGGTTCGAAG
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CTCCTCCTTCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGACACCCTTTCGGAGGTGGTAGTAGCCGTGG
AAGGAGGCAGAGGCGTGGTGAGGATGTTGTTCACCCTCTGAAGGTTTCTCTAGAGGATCT
TTATCTCGGAACAACGAAGAAGCTTTCGCTTTCTAGGAAGGCTTTGTGCTCAAAGTGTAA
CGGAAAGGGTTCGAAGTCTGGAGCTTCGATGACGTGCGGTGGATGCCAGGGATCGGGAAT
GAAGGTGTCGATCAGGCAGATTGGACCTGGGATGATTCAGCAGATGCAGCATCCTTGCCA
TGACTGCAAGGGAACTGGTGAGACCATCAACGATCGTGATAGGTGTCCTCAGTGCAAAGG
AGAGAAGGTTGTCTCCGAGAAG

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 3

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CTACTTTCTCTGTGGCCAAACCTTCTCTTCAGGGTTTCTCTGAGTTCTCAGGACTTCGAC
ACTCCTCTGCTCTTCCCTTCGCCAAGAAATCTTCTTCCGATGAGTTCGTTTCCTTTGTCA
GTTTCCAAACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGTGGATACAGGAAAGGAGTGACCGAGGCCA
AGCTAAAGGTAGCCATCAATGGGTTCGGTAGGATTGGTAGGAACTTCTTGAGGTGTTGGC
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AAGCAACCCATCTCCTCAAATACGACTCTACTCTTGGAATCTTTGACGCTGACGTCAAAC
CCTCTGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGATCGTA
ACCCATCTAATCTCCCCTGGGGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAAGGAACCGGAG
TGTTTGTGGACAGAGAAGGTGCTGGAAAGCACATTCAAGCTGGAGCCGTGGCTCTCGTGC
TCCCTAACCTCAAAGGAAAGCTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACGTCT
CAGTGGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAGGACTTTTGCTGAGGAAGTAAACGCTG
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TCGTCTCTGTTGACTTCAGGTGCTCTGATGTTTCCTCAACCATTGATTCTTCTCTCACAA
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CTCAGAGAGTTGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAAGACTCA
ACTTTTGATGTCTTGCTCCATTTTTTCTTTAATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTC
CCGAGTTTATGTATTTGTGATCTACAATTTTATAGTAATAAACTTTATTCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DC56TF U 1
AF RR4DC56JQ C 378
AF RR4GN94TF U 612
BS 1 761 RR4DC56TF
BS 762 781 RR4GN94TF
BS 782 782 RR4DC56JQ
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BS 948 1069 RR4GN94TF
BS 1070 1075 RR4DC56JQ

RD RR4DC56TF 761 0 0
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CTACTTTCTCTGTGGCCAAACCTTCTCTTCAGGGTTTCTCTGAGTTCTCAGGACTTCGAC
ACTCCTCTGCTCTTCCCTTCGCCAAGAAATCTTCTTCCGATGAGTTCGTTTCCTTTGTCA
GTTTCCAAACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGTGGATACAGGAAAGGAGTGACCGAGGCCA
AGCTAAAGGTAGCCATCAATGGGTTCGGTAGGATTGGTAGGAACTTCTTGAGGTGTTGGC
ATGGTCGCAAAGACTCTCCTCTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGTGGTGTCAAAC
AAGCAACCCATCTCCTCAAATACGACTCTACTCTTGGAATCTTTGACGCTGACGTCAAAC
CCTCTGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGATCGTA
ACCCATCTAATCTCCCCTGGGGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAAGGAACCGGAG
TGTTTGTGGACAGAGAAGGTGCTGGAAAGCACATTCAAGCTGGAGCCGTGGCTCTCGTGC
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CAGTGGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAGGACTTTTGCTGAGGAAGTAAACGCTG
CTTTCAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTC

QA 1 761 1 761
DS 

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CTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGATCGTAACCCATCTAATCTCCCC
TGGGGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAAGGAACCGGAGTGTTTGTGGACAGAGAA
GGTGCTGGAAAGCACATTCAAGCTGGAGCCGTGGCTCTCGTGCTCCCTAACCTCAAAGGA
AAGCTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTC
GTGCAGGTCTCCAAGAGGACTTTTGCTGAGGAAGTAAACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCT
GAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTCGTCTCTGTTGACTTC
AGGTGCTCTGATGTTTCCTCAACCATTGATTCTTCTCTCACAATGGTTATGGGAGATGAT
ATGGTTAAAGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCTCAGAGAGTTGTTGAT
TTGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAAGACTCAACTTTTGATGTCTTGCT
CCATTTTTTCTTTAATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTCCCGAGTTTATGTATTTG
TGATCTACAATTTTATAGTAATAAACTTTATTCAAACT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4GN94TF 458 0 0
G
AAGGAAAGCTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACATCTCAGCGGTTGACT
TGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAAGACTTTTGCTGAGGAAGTCAACGCTGCTTTCAGGGATG
CAGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTTG
ACTTCAGGTGCTCTGATGTTTCCTCAACCATTGATTCTTCTCTCACAATGGTTATGGGAG
ATGATATGGTTAAAGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCTCAGAGAGTTG
TTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAATTGAACAAGACTCAACTTTTGATGTC
TTGCTCCATTTTTTCTTTAATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTCCCGAGTTTATGT
ATTTGTGATCTACAATTTTATAGTAATAAACTTTATT

QA 2 458 2 458
DS 



AS 1 2

CO CL4101Contig1 743 2 6 U
CGGCGATGAATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGT
CCATCTACTGTACAAAGACTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAAATGCAACCGTGGATTA
ATAAAATCTCTGGGCTCACTCCTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGA
GTTTCATCGGTGAGTCCCAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGAGGAACACTT
CTTAGAACCGCTCCATCCATCTGAAAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGA
GATATCCTTCTCTCTTCTATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATC
TCTATTCGAATCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCC
ACATACCTGAGAGGCGGCTCTTTTAAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCC
ATAAGCGAAAAGCGCGAGAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTT
GAATTCCTTTAACGAGATACGCATGTCCCGGAGATGTAGGTGTTCGCTCAGATCCTCCAC
TCGATCAAGCAGTTTGCCCAAATGGCTTGCATCAGCCGCAGCCACCATAGACAATGCAAA
ATCTTTGGCCGATATAGTTTCTCTTCGTTTATAGTCATAATGTGCAAACTCCAGCCTCAG
CATTTCTTCAGTTAGATCTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D119JQ U 1
AF RR4BO51JQ U 17
BS 1 197 RR4D119JQ
BS 198 198 RR4BO51JQ
BS 199 247 RR4D119JQ
BS 248 248 RR4BO51JQ
BS 249 527 RR4D119JQ
BS 528 743 RR4BO51JQ

RD RR4D119JQ 527 0 0
CGGCGATGAATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGT
CCATCTACTGTACAAAGACTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAAATGCAACCGTGGATTA
ATAAAATCTCTGGGCTCACTCCTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGA
GTTTCATCGGTGAGTCCTAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGAGGAACACTT
CTTAGAATCGCTCCATCCATCTGAAAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGA
GATATCCTTCTCTCTTCTATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATC
TCTATTCGAATCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCC
ACATACCTGAGAGGCGGCTCTTTTAAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCC
ATAAGCGAAAAGCGCGAGAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4BO51JQ 727 0 0
G
CTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGTCCATCTACTGTACAAAG
ATTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAAATGCAACCGTGGATTAATAAAATCTCTGGGCTC
ACTCCTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGAGTTTCATCGGTGAGTCC
CAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGGGGAACACTTCTTAGAACCGCTCCATC
CATCTGAGAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGAGATATCCTTCTCTCTTC
TATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATCTCTATTCGAATCAAACA
CATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCCACATACCTGAGAGGCGG
CTCTTTTGAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCCATAAGCGAAAAGCGCGA
GAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTTGAATTCCTTTAACGAGA
TACGCATGTCCCGGAGATGTAGGTGTTCGCTCAGATCCTCCACTCGATCAAGCAGTTTGC
CCAAATGGCTTGCATCAGCCGCAGCCACCATAGACAATGCAAAATCTTTGGCCGATATAG
TTTCTCTTCGTTTATAGTCATAATGTGCAAACTCCAGCCTCAGCATTTCTTCAGTTAGAT
CTTTCA

QA 2 727 2 727
DS 



AS 1 3

CO CL4102Contig1 819 3 2 U
GGGTGTCGGTATTCAGATACTCCAGCAGTTTTCGGGTATCAATGGTGTTCTCTACTACAC
TCCTCAGATTCTTGAACGCGCTGGTGTGGACATTCTTCTCTCAAGCTTTGGACTTAGCTC
CATCTCCGCGTCGTTCCTCATCAGCGGGTTAACTACTTTACTCATGCTTCCATCTATTGT
CGTCGCCATGAGACTCATGGATGTCTCCGGAAGAAGGGCATTACTTCTCTGGACCATCCC
TGTTCTCATCCTCTCGCTCATCGTCCTCTTCAACAGCGAGCTTGTCCACATCAGCAAAGT
CGTAAACGCAGCCCTCTCCACGGCCTGTGTGATACTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGG
CTACGGTCCCATTCCGAACATCCTCTGTTCCGAAATCTTCCCGACGAGAGTCCGTGGTCT
CTGCATTGCTATCTGCGCTATGGTGTTCTGGATTGGAGACATTATTGTCACGTACTCGCT
TCCCGTTCTCCTAAGCTCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCATTTACGGTGCGGTTTG
CGTTATCTCGTGGATCTTTGTTTACATGAAGGTCCCGGAGACTAAAGGTATGCCCTTGGA
GGTTATCACAGACTACTTTGCCTTTGGAGCTCAGGCTCAAGCTTCTGCTCCTTCCAAGGA
TACATAGTTTGTAACCTTTTATTCTCTTCTTCATTTGCTCTCTGTACTTAAAAGATTTCT
TCTGGTTCTGAGATACCTTCATTTCGTTTTCTTTTTGTCTCTCTTTCTCTGTTTTTGTTA
TCGAAATTAATCTAATAATTACTCAATTTTCTCACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E256TF U 1
AF RR4E256JQ C 225
AF RR4E482TF U 373
BS 1 631 RR4E256TF
BS 632 819 RR4E482TF

RD RR4E256TF 631 0 0
GGGTGTCGGTATTCAGATACTCCAGCAGTTTTCGGGTATCAATGGTGTTCTCTACTACAC
TCCTCAGATTCTTGAACGCGCTGGTGTGGACATTCTTCTCTCAAGCTTTGGACTTAGCTC
CATCTCCGCGTCGTTCCTCATCAGCGGGTTAACTACTTTACTCATGCTTCCATCTATTGT
CGTCGCCATGAGACTCATGGATGTCTCCGGAAGAAGGGCATTACTTCTCTGGACCATCCC
TGTTCTCATCCTCTCGCTCATCGTCCTCTTCAACAGCGAGCTTGTCCACATCAGCAAAGT
CGTAAACGCAGCCCTCTCCACGGCCTGTGTGATACTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGG
CTACGGTCCCATTCCGAACATCCTCTGTTCCGAAATCTTCCCGACGAGAGTCCGTGGTCT
CTGCATTGCTATCTGCGCTATGGTGTTCTGGATTGGAGACATTATTGTCACGTACTCGCT
TCCCGTTCTCCTAAGCTCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCATTTACGGTGCGGTTTG
CGTTATCTCGTGGATCTTTGTTTACATGAAGGTCCCGGAGACTAAAGGTATGCCCTTGGA
GGTTATCACAGACTACTTTGCCTTTGGAGCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4E256JQ 589 0 0
TTCTCTGGACCATCCCTGTTCTCATCCTCTCGCTCATCGTCCTCTTCAACAGCGAGCTTG
TCCACATCAGCAAAGTCGTAAACGCAGCCCTCTCCACGGCCTGTGTGATACTCTACTTCT
GCTTCTTCGTGATGGGCTACGGTCCCATTCCGAACATCCTCTGTTCCGAAATCTTCCCGA
CGAGAGTCCGTGGTCTCTGCATTGCTATCTGCGCTATGGTGTTCTGGATTGGAGACATTA
TTGTCACGTACTCGCTTCCCGTTCTCCTAAGCTCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCA
TTTACGGTGCGGTTTGCGTTATCTCGTGGATCTTTGTTTACATGAAGGTCCCGGAGACTA
AAGGTATGCCCTTGGAGGTTATCACAGACTACTTTGCCTTTGGAGCTCAGGCTCAAGCTT
CTGCTCCTTCCAAGGATACATAGTTTGTAACCTTTTATTCTCTTCTTCATTTGCTCTCTG
TACTTAAAAGATTTCTTCTGGTTCTGAGATACCTTCATTTCGTTTTCTTTTTGTCTCTCT
TTCTCTGTTTTTGTTATCGAAATTAATCTAATAATTACTCAATTTTC
AC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4E482TF 447 0 0
TCCGAACATCCTCTGTTCCGAAATCTTCCCGACGAGAGTCCGTGGTCTCTGCATTGCTAT
CTGCGCTATGGTGTTCTGGATTGGAGGCATTATTGTCACGTACTCGCTTCCCGTTCTCCT
AAGCTCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCATTTACGGTGCGGTTTGCGTTATCTCGTG
GATCTTTGTTTACATGAAGGTCCCGGAGACTAAAGGTATGCCCTTGGAGGTTATCACAGA
CTACTTTGCCTTTGGAGCTCAGGCTCAAGCTTCTGCTCCTTCCAAGGATACATAGTTTGT
AACCTTTTATTCTCTTCTTCATTTGCTCTCTGTACTTAAAAGATTTCTTCTGGTTCTGAG
ATACCTTCATTTCGTTTTCTTTTTGTCTCTCTTTCTCTGTTTTTGTTATCGAAATTAATC
TAATAATTACTCAATTTTCTCACTTCC

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 3

CO CL4103Contig1 474 3 6 U
GGCAGGCTTCCAACTCTCATAAATAAGAGAGACAAGGAGGTACTACATACTAATGGCTAA
GATGCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCGT
AATCTCCCAGGCTCGAACCCTTTCTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCGGCTCCGTC
TTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCAACCCACCTTATTGTCGTCCATG
AGAGTTTTAATTTGGTCACATGAACAATTTTCAAATAAAATAAGGTGATGTATTATGTAT
ATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATAATATGATTTGCTGGGGAATAAAATGCTTGTG
AAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGATATTTATGTTT
ATTTTGTTTGGTCATTCATGATGATGTCTCTGTTTAATGAACAAAAGTTACCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EU52JQ C 243
AF RR4EF77TF U 1
AF RR4EU52TF U 1
BS 1 241 RR4EF77TF
BS 242 242 RR4EU52TF
BS 243 297 RR4EF77TF
BS 298 298 RR4EU52TF
BS 299 433 RR4EF77TF
BS 434 474 RR4EU52TF

RD RR4EU52JQ 109 0 0
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GGGTTATGGGTATTTTCATATATTATAATATGATTTGGTGGGGAA
AAAA

QA 1 105 1 105
DS 

RD RR4EF77TF 433 0 0
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GATGCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCGT
AATCTCCCAGGCTCGAACCCTTTCTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCGGCTCCGTC
TTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCAACCCACCTTATTGTCGTCCATG
ATAGTTTTAATTTGGTCACATGAACAATTTTCAAATAAAATAAGGTGATGTATTATGCAT
ATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATAATATGATTTGCTGGGGAATAAAATGCTTGTG
AAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGATATTTATGTTT
ATTTTGTTTGGTC

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4EU52TF 474 0 0
GGCAGGCTTCCAACTCTCATAAATAAGAGGGACAAGGAGGTACTACATACTAATGGCTAA
GATGCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCGT
AATCTCCCAGGCTCGAACCCTTTCTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCGGCTCCGTC
TTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCAACCCACCTTATTGTCGTCCATG
AGAGTTTTAATTTGGTCACATGAACAATTTTCAAATAAAATAAGGTGATGTATTATGTAT
ATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATAATATGATTTGCTGGGGAATAAAATGCTTGTG
AAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGATATTTATGTTT
ATTTTGTTTGGTCATTCATGATGATGTCTCTGTTTAATGAACAAAAGTTACCAT

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL4104Contig1 1067 2 4 U
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GAGTATCCATAATAAATATTACTAGAAGCTATAGGACACTTAAAAACTCTAATGAGCGCA
CACACTGCATAGGATAATTAATCAAGATTGTTTTAATGCAAACCAACAAACGACTGTGAT
AAATGAGAAACTCTCTTGTTTCTAGTTTCTAGGCTTTAGACGACCTTCATTAGCAAGCTT
GAAGGTATGTGCCTGCTTTGTTGCTGCCTTGGTTGAGGAAAGTCCTGCCACAAAGTGGTC
TCTGACTTGAGGGGTTGTTAAAGGGAACTTGTTGTTGACCATGGAGTTTAACCAAGACGC
TGTGCCTTCACGGTAGAGAGCTCCAATAGCATCGGTGCGGGTATTGGAAAGTGCCTGAAG
AAGGTTCATGTGAGGATCAAAGCCTGGAATGCTACTGGAAGTACTGACTGTACCAAACGC
TCAACCAACGGTTCCCCACCAGCCAAGAAGACCCCATATGAGTGTAGGGTGGTTTCTCCA
GTAATCGCATGTTCCAGTGATTGGTGGAAAAGGAGCAGGAACGAAAGGAGTTCCAGGAGT
GCCAGGGTCAATAATAGGAGTTGGTGGGCTTCCTACAACAATGGGTGTTGGTGGAGTCAC
AACGACTGGAGTACTTGGTGGAGAGTAATATCCACCCGAAGGAGGCGTTGAAGGGTGTGA
AGGCGTCGAAGGATGTGATGGTGTAGAAGGGTGAGGAGGTGTGGAAGGGTCGTGAGGTGG
AGTACCACAGTTACAAGGAGGCGTGTGGTGAGTTGGTGTGTGTGGGGTTGGAGTGTGAGA
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CTCATCTTCGAACCTTGTGGAAGTAACGGAAGCAAACAGCTGCTGTGAGAGTAAAGCAGC
AAAGGGAGCCCAAATAGTTAGACTCTTCATCCCTCTCATTTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D110JQ U 1
AF RR4BK02TF C 420
BS 1 525 RR4D110JQ
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RD RR4D110JQ 658 0 0
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AAATGAGAAACTCTCTTGTTTCTAGTTTCTAGGCTTTAGACGACCTTCATTAGCAAGCTT
GAAGGTATGTGCCTGCTTTGTTGCTGCCTTGGTTGAGGAAAGTCCTGCCACAAAGTGGTC
TCTGACTTGAGGGGTTGTTAAAGGGAACTTGTTGTTGACCATGGAGTTTAACCAAGACGC
TGTGCCTTCACGGTAGAGAGCTCCAATAGCATCGGTGCGGGTATTGGAAAGTGCCTGAAG
AAGGTTCATGTGAGGATCAAAGCCTGGAATGCTACTGGAAGTACTGACTGTACCAAACGC
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GTAATCGCATGTTCCAGTGATTGGTGGAAAAGGAGCAGGAACGAAAGGAGTTCCAGGAGT
GCCAGGGTCAATAATAGGAGTTGGTGGGCTTCCTACAACAATGGGTGTTGGTGGAGTC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4BK02TF 648 0 0
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CTCCACCAACGGTTCCCCACCAGCCAAGAAGACCCCATATGAGTGTAGGGTGGTTTCTCC
AGTAATCGCATGTTCCAGTGATTGGTGGAAA*GGAGCAGGAACGAAAGGAGTTCCAGGAG
TGCCAGGGTCAATAATAGGAGTTGGTGGGCTTCCTACAACAATGGGTGTTGGTGGAGTCA
CAACGACTGGAGTACTTGGTGGAGAGTAATATCCACCCGAAGGAGGCGTTGAAGGGTGTG
AAGGCGTCGAAGGATGTGATGGTGTAGAAGGGTGAGGAGGTGTGGAAGGGTCGTGAGGTG
GAGTACCACAGTTACAAGGAGGCGTGTGGTGAGTTGGTGTGTGTGGGGTTGGAGTGTGAG
ATGGAGTCGAAGGAGTTGGAGTGTGAGATGGAGTTGAAGGAGTTGGGTCGTAAGGTGGAC
TTCCACAGTTAGGAGTGGGAGTGTAACCGCCGTGTCCAGAGGGAGGAGAGTAGTATGTCT
TCTCATCTTCGAACCTTGTGGAAGTAACGGAAGCAAACAGCTGCTGTGAGAGTAAAGCAG
CAAAGGGAGCCCAAATAGTTAGACTCTTCATCCCTCTCATTTTAAAAA

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4105Contig1 603 2 2 U
GGATTCCAATACATACACACCAAAGTCTCTTTTAAAGCAAAAAGAGAAATTTAACAATGG
GTTCAAGAACCACAGGCTCTTTAGCCATTTTCTTGATTCTCAACATCCTCTTCTTCACAA
CAATCTCCGCCTGCGGTAACTGCGGTTGCCCTTCTCCCAAGCCAAAACCTAACCCTAAAC
CCAAACCAACCCCAAACCCTAGCCCTGCCACAGCCAAATGCCCTAGAGATGCCCTTAAGC
TTGGAGTCTGCACCAACGTGCTCAACGGTCTACTCAACATTACCCTTGGCCAACCACCGG
TCGAGCCATGTTGCACGCTTATAAAAGGACTCGCTGATCTTGAGGCTGCTGCTTGTCTCT
GCACCGCGCTCAAGGCTAATATCCTCGGGAACAACTTGAACATCCCGATCTCTCTCAGTC
TGCTTCTCAATGTTTGTAGCAAAAAGGTTCCCCCTGGCTTCCAATGCTGATTAAGATTCT
AATCATATACAACCATCACAGTTCTACATATCGTCTTTGTATCTCGTGTTTTGTAATGTG
TGTAATTATGTATATGTGTATGTGATTCCTACAACTCTAAACTTCACAGTTATTTTTATT
TCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 

AF RR4GI27TF U 1
AF RR4GI27JQ C 324
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TGCTTCTCAATGTTTGTAGCAAAAAGGTTCCCCCTGGCTTCCAATGCTGATTAAGATTCT
AATCATATACAACCATCACAGTTCTACATATCGTCTTTGTATCTCGTGTTTTGTAATGTG
TGTAATTATGTATATGTGTATGTGATTCCTACAACTCTAAACTTCACAGTTATTTTTATT
T
CG

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DS 

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AAGGTTCCCCCTGGCTTCCAATGCTGATTAAGATTCTAATCATATACAACCATCACAGTT
CTACATATCGTCTTTGTATCTCGTGTTTTGTAATGTGTGTAATTATGTATATGTGTATGT
GATTCCTACAACTCTAAACTTCACAGTTATTTTTATTTCG

QA 1 280 1 280
DS 



AS 1 2

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GCCAACTGAGGAACAGTAGTAGTAACAATCTTTTTTGATTGAACTGCTAAGTTTCTAGGG
GGTTTCGTCCATATGTTTCCTTAAGACGTCGTTCGCTTTCTTGCCAATTAGCTTTATCTC
CAAAAGCTTTTTTATTCATTCATCATATTTCCGGCGAGTCGAACCACATCAAATCATCTT
TTATATCTTTGCTTGATTTTCTTTTCTTTGTTTCTTTTTGTTCTGTCTTTTTTTCTTTTT
GACTTGGGGTTATCCATTTCAATGTCTGCTATAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 0 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DX26JQ C 1
AF RR4GH26TF U 45
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BS 669 696 RR4GH26TF

RD RR4DX26JQ 696 0 0
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TTATATCTTTGCTTGATTTTCTTTTCTTTGTTTCTTTTTGTTCTGTCTTTTT**CTTTTT
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DS 

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GTCTTTTTTTCTTTTTGGTTTTGTGTTATCCATTTCAATGTCTGCTATAAAC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 3

CO CL4107Contig1 818 3 2 U
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BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F672JQ U 4
AF RR4BC04JQ U 1
AF RR4BC04TF C 174
BS 1 736 RR4BC04JQ
BS 737 818 RR4BC04TF

RD RR4F672JQ 619 0 0
GATCAATGAAGACAAATTCAAACTGAGGAAATATCAGGACAATGGAGATTAGTTTCACAG
AGTAAACTAAACGGAACAAGTTTCTTTTGTCTTTAATCTTATTATTATAAAGCCAGACAG
CACAAAGAAGTCGACACATTTATCTAGGCCCATCTTTAACAGCCACCTGTGATCGGTTCC
ATTTTAATAGCAGGGTGTGGCAAGCGTTGAAGAGCTGTAATGGTGGTTCTCAGCAGATCA
TCATCTCCAACAATCATCCTCAGCTTCTTCGAAAATCCCTCTCGAGATAGCTTCTTCTCC
CTAAGTTGTTGGTAATAAGCAGTGATCAAGTCCATGGCTTTCGGAGCAATTTTGCTTGAG
ATTGCATTGAAGAGCAGAGGGTAAGGCATCAAACTAGAGCTGGGCTTCCTAGTGCTGGAA
CCGGCACTGTTGTTTCCTCCGCTTCCTAGCCC***GTTGGAGGGAGATCCTTTGGTTCCT
TCCAAGGTGAGCCCTGAAGTCTCATGCTTACTCTGAGTAGCAGAAAGTAAATTCCCTTCA
GTATTGGGGATAGACAACAGCTTGAAGCTAACTACAAATTCTGGACAAACATGAGTGTTC
ATATTCATGTTCCAGACAA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BC04JQ 736 0 0
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CAGAGTAAACTAAACGGAACAAGTTTCTTTTGTCTTTAATCTTATTATTATAAAGCCAGA
CAGCACAAAGAAGTCGACACATTTATCTAGGCCCATCTTTAACAGCCACCTGTGATCGGT
TCCATTTTAATAGCAGGGTGTGGCAAGCGTTGAA*AGCTGTAATGGTGGTTCTCAGCAGA
TCATCATCTCCAACAATCATCCGCAGCTTCTTCGAAAATCCCTCTCGA*ATAGCTTCTTC
TCCCTAAGTTGTTGGTAATAAGCAGTGATCAAGTCCATGGCTTTCGGAGAAATTTTGCTT
GAGATTGCATTGAAGAGCAGAGGGTAAGGCATCAAACTAGAGCTGGGCTTCCTAGTGCTG
GAACCGGCACTGTTGTTTCCTCCGCTTCCTAGCCCCTGGTTGGAGGGAGATCCTTTGGTT
CCTTCCAAGGTGAGCCCTGAAGTCTCATGCTTACTCTGAGTAGCAGAAAGTAAATTCCCT
TCAGCATTGGGGATAGACAACAGCTTGAAGCTAACTACAAATTCTGGACAAACATGAGTG
TTCATATTCATGTTCCAGACAACATAATGCTTCGGACTCGACACATTATCTACTCCATTA
TCATACTCTTCTCCACCAGTAAAGAACTGAGCTCTATCACCACCAAGTGGCTCCATATTC
CCCATTATCACACGGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4BC04TF 645 0 0
GATCGGTTCCATTTTAATAGCAGGGTGTGGCAAGCGTTGAA*AGCTGTAATGGTGGTTCT
CAGCAGATCATCATCTCCAACAATCATCCGCAGCTTCTTCGAAAATCCCTCTCGA*ATAG
CTTCTTCTCCCTAAGTTGTTGGTAATAAGCAGTGATCAAGTCCATGGCTTTCGGAGAAAT
TTTGCTTGAGATTGCATTGAAGAGCAGAGGGTAAGGCATCAAACTAGAGCTGGGCTTCCT
AGTGCTGGAACCGGCACTGTTGTTTCCTCCGCTTCCTAGCCCCTGGTTGGAGGGAGATCC
TTTGGTTCCTTCCAAGGTGAGCCCTGAAGTCTCATGCTTACTCTGAGTAGCAGAAAGTAA
ATTCCCTTCAGCATTGGGGATAGACAACAGCTTGAAGCTAACTACAAATTCTGGACAAAC
ATGAGTGTTCATATTCATGTTCCAGACAACATAATGCTTCGGACTCGACACATTATCTAC
TCCATTATCATACTCTTCTCCACCAGTAAAGAACTGAGCTCTATCACCACCAAGTGGCTC
CATATTCCCCATTATCACACGGCACAAAACCATGTGACGCACACCGTTTTCATCAACATC
ACAATGTGTCGCACTGAAGTAAGGGCAGTTTGCAGCAGCCAAGTG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

CO CL4108Contig1 549 3 5 U
GGAAAATTTAAACAAATCTGGAACCTGTAAACTTTTAGAGACGTCGCCACGAATTTCGTT
TGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTGCATCAGCTGAGGAAAGGGAGAGATAA
TGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTG
TTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGATTTGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAA
TAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGAGAGTCGCTCAGCATATGGAAG
AACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCG
GGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGGGGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAA
AGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTT
TCTCTTATTTTAAAAAAAAATTCACTTGACAAGGAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTT
GTGAAGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EB71TF U 35
AF RR4DQ37JQ C 1
AF RR4DQ37TF U 1
BS 1 36 RR4DQ37TF
BS 37 222 RR4EB71TF
BS 223 223 RR4DQ37TF
BS 224 529 RR4EB71TF
BS 530 549 RR4DQ37TF

RD RR4EB71TF 503 0 0
GG
AGAGACGTCGCCACGAATTTCGTTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTGCA
TCAGCTGAGGAAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCT
CATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGAT
TTGCTGCGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGG
AGAGAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGT
GAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGGGG
ATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACA
CAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTTTAAAAAAAAATTCACTTGACAAGGAG
TGACTTTGGCTAA
CAAAAAAA

QA 3 495 3 495
DS 

RD RR4DQ37JQ 549 0 0
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TGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTGCATCAGCTGAGGAAAGGGAGAGATAA
TGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTG
TTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGATTTGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAA
TAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGAGAGTCGCTCAGCATATGGAAG
AACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCG
GGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGGGGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAA
AGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTT
TCTCTTATTTTAAAAAAAAATTCACTTGACAAGGAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTT
GTGAAGTCG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4DQ37TF 549 0 0
GGAAAATTTAAACAAATCTGGAACCTGTAAACTTTTAGAGACGTCGCCACGAATTTCGTT
TGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTGCATCAGCTGAGGAAAGGGAGAGATAA
TGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTG
TTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGATTTGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAA
TAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGAGAGTCGCTCAGCATATGGAAG
AACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCG
GGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGGGGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAA
AGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTT
TCTCTTATTTTAAAAAAAAATTCACTTGACAAGGAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTT
GTGAAGTCG

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 3

CO CL4109Contig1 1183 3 8 U
GTAAGTAAGGGTTTCATTCTGCATCACTCTCCCCGTCGTTCTCGACCTCGCAAGGTTTTT
GAAGCGGCCTAAGCGGGAAGTGACAATACCGCTTTTCTTCAGCACATTTTGGATGATTTG
AGCGAAAACGGAGTACAAAGTTCAGCCTTTAAGGAGGCTATGAATCAAATAGGGCAGGTG
GCGCAGTCCCCACTTGACCAATTTGAGATTGTCCCATTGATTCCTATGAATATCGGAAAC
TTCTATTTCTCATTCACAAATTCATCTTTGTTCATGCTGCTAACTCTGAGTTTTTTCCTA
CTTCTGATTCATTTTATTACTAAAAAGGGAGGAGGAAACTTAGTCCCAAATGCTTGGCAA
TCCTTGGTATAGCTTCTTTATGATTTCGTGCTGAACCTGGTAAAGGAACAAATAGGTGGT
CTTTCCGGAAATGTGAAACAAATGTTTTTCCCTTGCATCTTGGTCACTTTTCTTTTTTTG
TTATTTTGTAATCTTCAGGGTATGATACCTTATAGCTTCACAGTGACAAGTCATTTTCTC
ATTACTTTGGCTCTCTCATTTTCTATGTTTATTGGCATTACTATAGTGGGATTTCAAAGA
CATGGGCTTCATTTTTTCAGCTTTTTATCACCCGCAGGAGTCCCACTGCCGTTAGCACCT
TTTTTAGTACTCCTTGAGCTAATTTCTTATTGTTTTCGCGCATTAAGCTTAGGAATACGT
TTATTTGCTAATATGATGGCCGGTCATAGTTTAGTAAAGATTTTAAGTGGGTTCGCTTGG
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GTTCTTGCATTAACCGGTCTGGAATTAGGTGTAGCTATATTACAAGCTTATGTTTTTACG
ATCTTAATCTGTATTTACTTGAATGATGCTATAAATCTCCATTAAAGTTCTTCTTTCTTT
TATTTAGATTTATAATTGAACAAAAGCGAGGGATGAGAGTAGTGTTATAAAGAGCAGTTA
CACAGCCCCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAA
CAAGAAATGCTCGAGTTACTAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGATAAGAAAAAACG
AAAAATCTTAAATTTATGAAAATCTGGTTCGATGGCTGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AV11TF U 1
AF RR4FX31TF U 798
AF RR4DG70TF U 445
BS 1 661 RR4AV11TF
BS 662 924 RR4DG70TF
BS 925 925 RR4FX31TF
BS 926 982 RR4DG70TF
BS 983 983 RR4FX31TF
BS 984 1116 RR4DG70TF
BS 1117 1117 RR4FX31TF
BS 1118 1183 RR4DG70TF

RD RR4AV11TF 661 0 0
GTAAGTAAGGGTTTCATTCTGCATCACTCTCCCCGTCGTTCTCGACCTCGCAAGGTTTTT
GAAGCGGCCTAAGCGGGAAGTGACAATACCGCTTTTCTTCAGCACATTTTGGATGATTTG
AGCGAAAACGGAGTACAAAGTTCAGCCTTTAAGGAGGCTATGAATCAAATAGGGCAGGTG
GCGCAGTCCCCACTTGACCAATTTGAGATTGTCCCATTGATTCCTATGAATATCGGAAAC
TTCTATTTCTCATTCACAAATTCATCTTTGTTCATGCTGCTAACTCTGAGTTTTTTCCTA
CTTCTGATTCATTTTATTACTAAAAAGGGAGGAGGAAACTTAGTCCCAAATGCTTGGCAA
TCCTTGGTATAGCTTCTTTATGATTTCGTGCTGAACCTGGTAAAGGAACAAATAGGTGGT
CTTTCCGGAAATGTGAAACAAATGTTTTTCCCTTGCATCTTGGTCACTTTTCTTTTTTTG
TTATTTTGTAATCTTCAGGGTATGATACCTTATAGCTTCACAGTGACAAGTCATTTTCTC
ATTACTTTGGCTCTCTCATTTTCTATGTTTATTGGCATTACTATAGTGGGATTTCAAAGA
CATGGGCTTCATTTTTTCAGCTTTTTATCACCCGCAGGAGTCCCACTGCCGTTAGCACCT
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4FX31TF 336 0 0
G
GAGATTTTCTATTTTATAGGGGCTCTTGGTCCTTTATTTATAGTTCTTGCATTAACCGGT
CTGGAATTAGGTGTAGCTATATTACAAGCTTATGTTTTTACGATTTTAATCTGTATTTAC
TTGAATGATGCTATAAATCTCCATTAAAGTTCTTCTTTCTTTTATTTAGATTTATAATTG
AACAAAAGCGAGGGATGAGAGTAGTGTTATAAAGAGCAGTTACACAGCCCCTCTCCTTGC
AGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTA
CTAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGATAAG
G

QA 2 335 2 335
DS 

RD RR4DG70TF 739 0 0
TTTTTCCCTTGCATCTTGGTCACTTTTCTTTTTTTGTTATTTTGTAATCTTCAGGGTATG
ATACCTTATAGCTTCACAGTGACAAGTCATTTTCTCATTACTTTGGCTCTCTCATTTTCT
ATTTTTATTGGCATTACTATAGTGGGATTTCAAAGACATGGGCTTCATTTTTTCAGCTTT
TTATTACCCGCAGGAGTCCCACTGCCGTTAGCACCTTTTTTAGTACTCCTTGAGCTAATT
TCTTATTGTTTTCGCGCATTAAGCTTAGGAATACGTTTATTTGCTAATATGATGGCCGGT
CATAGTTTAGTAAAGATTTTAAGTGGGTTCGCTTGGACTATGCTATGTATGAATGAGATT
TTCTATTTTATAGGGGCTCTTGGTCCTTTATTTATAGTTCTTGCATTAACCGGTCTGGAA
TTAGGTGTAGCTATATTACAAGCTTATGTTTTTACGATCTTAATCTGTATTTACTTGAAT
TATGCTATAAATCTCCATTAAAGTTCTTCTTTCTTTTATTTAGATTTATAATTGAACAGA
AGCGAGGGATGAGAGTAGTGTTATAAAGAGCAGTTACACAGCCCCTCTCCTTGCAGTCGA
GTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTACTAAAC
ACCCCCTAGGGG*CCCCTCTCTGATAAGAAAAAACGAAAAATCTTAAATTTATGAAAATC
TGGTTCGATGGCTGTCTCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL4110Contig1 1051 3 6 U
GGGAGTGAGAGAGAGAGATGAACCACATGCACACCACCAAATGTCTGCTTCTTCTTTATT
TATTAATTTCCCATTGATTCGCCTCAGATCTCTCTCCCATCTCCCTCTGTCATCGCTCCG
ATCCGTTTCTCAGAGAAAGTTACCGACTTTTCGAGCTTTCTCCGGTACTACCACAATGAC
AGATGCTGGAATGGATGCTGTTCAGAGACGCCTCATGTTCGAAGACGAATGCATTCTTGT
TGACGAAACTGATCGTGTTGTGGGGCATGACAGCAAATATAATTGTCATCTGATGGAAAA
TATTGAAGCTAAGAATCTGCTTCACAGGGCTTTTAGTGTATTTTTATTCGACTCCAACTA
TGACTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAAGCAAAGGTGACCTTCCCTCTAGTGTGGACAAA
CACTTGTTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCTGAGCTTATCGAGGAAAATACTCTCGG
TGTGAGGAATGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGTATTGTAGCTGAAGATGT
ACCAGTCGATGAGTTCACTCCTCTGGGACGTATGCTTTACAAGGCTCCTTGATGGCAAAT
GGGGAGAGCACGAACTTGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGGGATGTTAAGGTCCAACCAA
ATCCGGACGAAGTAGCGGATATCAAGTATGTGAGCAGGGAAGAGCTGAAGGAGCTGGTGA
AGAGAGCTGATGCAGGGGAGGAAGGTTTGAAACTATCTCCATGGTTCAGATTGGTGGTGG
ATAACTTCCTGATGAAGTGGTGGGATCATGTTGAGAAAGGCACTTTGAGTGAAGCTGTAG
ACATGAAAACCATTCACAAGCTTTGAACTCTTCTTCCCTATGTTTTTTTTTTTTCTGGAT
AACCTCTCTGTTTTTTTATCTCTGTTTTTTATATTTTTGTTGCGAGACTTTTAGATATTC
CAAGCAAGTCACGCACTGAAGTTTCTTTTTTTTTTTCAAATTTGGATTTATGAATTATCT
TTCAATAATCGAAGTTTGAATTTTACATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH50TF U 20
AF RR4CH33TF U 1
AF RR4CH33JQ C 223
BS 1 62 RR4CH33TF
BS 63 65 RR4EH50TF
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BS 125 646 RR4CH33TF
BS 647 1051 RR4CH33JQ

RD RR4EH50TF 336 0 0
TGGGG
ACATGCACACCACCAAATGTCTGCTTCTTCTTTATTTATTAATTTCCCATTGATTCGCCT
CAGATCTCTCTCCCATCTCCCTCTGTCATCGCTCCGATCCGTTTCTCAGAGAAAGTTACC
GACTTTTCGAGCTTTCTCCGGTACTACCACAATGACAGATGCTGGAATGGATGCTGTTCA
GAGACGCCTCATGTTCGAAGACGAATGCATTCTTGTTGACGAAACTGATCGTGTTGTGGG
GCATGACAGCAAATATAACTGTCATCTGATGGAAAATATTGAAGCTAAGAATCTGCTTCA
CAGGGCTTTTAGTGTATTTTTATTCAACTCC

QA 6 336 6 336
DS 

RD RR4CH33TF 646 0 0
GGGAGTGAGAGAGAGAGATGAACCACATGCACACCACCAAATGTCTGCTTCTTCTTTATT
TA***ATTTCCCATTGATTCGCCTCAGATCTCTCTCCCATCTCCCTCTGTCATCGCTCCG
ATCTGTTTCTCAGAGAAAGTTACCGACTTTTCGAGCTTTCTCCGGTACTACCACAATGAC
AGATGCTGGAATGGATGCTGTTCAGAGACGCCTCATGTTCGAAGACGAATGCATTCTTGT
TGACGAAACTGATCGTGTTGTGGGGCATGACAGCAAATATAATTGTCATCTGATGGAAAA
TATTGAAGCTAAGAATCTGCTTCACAGGGCTTTTAGTGTATTTTTATTCGACTCCAACTA
TGACTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAAGCAAAGGTGACCTTCCCTCTAGTGTGGACAAA
CACTTGTTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCTGAGCTTATCGAGGAAAATACTCTCGG
TGTGAGGAATGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGTATTGTAGCTGAAGATGT
ACCAGTCGATGAGTTCACTCCTCTGGGACGTATGCTTTACAAGGCTCCTTGATGGCAAAT
GGGGAGAGCACGAACTTGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGGGATGT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4CH33JQ 829 0 0
CGAAGACGAATGCATCTG
TGACGAAACTGATCGTGTTGTGGGGCATGACAGCAAATATAATTGTCATCTGATGGAAAA
TATTGAAGCTAAGAATCTGCTTCACAGGGCTTTTAGTGTATTTTTATTCGACTCCAACTA
TGACTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAAGCAAAGGTGACCTTCCCTCTAGTGTGGACAAA
CACTTGTTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCTGAGCTTATCGAGGAAAATACTCTCGG
TGTGAGGAATGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGTATTGTAGCTGAAGATGT
ACCAGTCGATGAGTTCACTCCTTTGGGACGTATGCTTTACAAGGCTCCTTGATGGCAAAT
GGGGAGAGCACGAACTTGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGGGATGTTAAGGTCCAACCAA
ATCCGGACGAAGTAGCGGATATCAAGTATGTGAGCAGGGAAGAGCTGAAGGAGCTGGTGA
AGAGAGCTGATGCAGGGGAGGAAGGTTTGAAACTATCTCCATGGTTCAGATTGGTGGTGG
ATAACTTCCTGATGAAGTGGTGGGATCATGTTGAGAAAGGCACTTTGAGTGAAGCTGTAG
ACATGAAAACCATTCACAAGCTTTGAACTCTTCTTCCCTATGTTTTTTTTTTTTCTGGAT
AACCTCTCTGTTTTTTTATCTCTGTTTTTTATATTTTTGTTGCGAGACTTTTAGATATTC
CAAGCAAGTCACGCACTGAAGTTTCTTTTTTTTTTTCAAATTTGGATTTATGAATTATCT
TTCAATAATCGAAGTTTGAATTTTACATTGT

QA 19 829 19 829
DS 



AS 1 3

CO CL4111Contig1 779 3 10 U
GGATCCAACTTTCGAAACAGAACACAAAATTCAGGAACGTAGAGAGAAAAAAATGGACCG
AACAAAGACTGCAAAGGTATCTCTGTTTGCTGTTTGGACAATCCTCCTTGTCTTAAATGT
GAACGGCCAATCAGGTTGTGATACCCACAGCTTCGCCAATAACATCGCTTTCACCTCTTG
CTCTCCCCTCCCGGCCCTTGGCTCATTCCTTCACTGGAACTTCAACGAACAAAACAGCAC
CGTTTCAATCGCTTTCCGCCACCCAGGAACTTCCTCTTCTTCATGGGTTGCTTGGGGGCT
TAACCCAAGTGGGCCTCAGATGTCCGGGACACAAGCTCTTGTCGCCTTCACCAATTCTAG
TGGACAGTTCCAAGCCTACACCTCTTCGGTCGATGGGTACGGCACCCAGCTAACACGTGG
AGACCTTAGTTTTGGGGTCAGCCTCGTTTCCGCGACTCTCGTCAACGGAGAGGCTACCAT
CTTTGCGACTCTTGAGTTACCGGCCAATTTGGTCATGACCAACCAGGTTTGGCAAGAAGG
TCCGGTCGCTAATGGTATTCCTCAGGTTCATCAAAGAACAGGAGATAATATGAGATCGAT
AGGTAGGATCGATTTCAGGACAGGTCAATCATCGGCTAGTGGAGGAGGTTCTGGTAGCAG
GCTGAGAAGGAGAAATGTAAGTTCAACTTTCTTTTCTGTTTGGCTTCACTTTTCAAGTTT
GCTTATTAAGAAATAACAACGAACCAAAATAACATTTGGTTAGTTTATCTGAGTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR60TF U 89
AF RR4GG92TF U 1
AF RR4GG92JQ C 54
BS 1 618 RR4GG92TF
BS 619 619 RR4AR60TF
BS 620 647 RR4GG92TF
BS 648 648 RR4AR60TF
BS 649 660 RR4GG92TF
BS 661 661 RR4GG92JQ
BS 662 667 RR4GG92TF
BS 668 669 RR4GG92JQ
BS 670 705 RR4GG92TF
BS 706 779 RR4GG92JQ

RD RR4AR60TF 572 0 0
GG
TGTTTGGACAATCCTCCTTGTCTTAAATGTGAACGGCCAATCAGGTTGTGATACCCACAG
CTTCGCCAATAACATCGCTTTCACCTCTTGCTCTCCCCTCCCGGCCCTTGGCTCATTCCT
TCACTGGAACTTCAACGAACAAAACAGCACCGTTTCAATCGCTTTCCGCCACCCAGGAAC
TTCCTCTTCTTCATGGATTGCTTGGGGGCTTAACCCAAGTGGGCCTCAGATGTCCGGGAC
ACAAGCTCTTGTCGCCTTCACCAATTCTAGTGGACAGTTCCAAGCCTACACCTCTTCGGT
CGATGGGTACGGCACCCAGCTAACACGTGGAGACCTTAGTTTTGGGGTCAGCCTCGTTTC
CGCGACTCTCGTCAACGGAGAGGCTACCATCTTTGCGACTCTTGAGTTACCGGCCAATTT
GGTCATGACCAACCAGGTTTGGCAAGAAGGTCCGGTCGCTAATGGTATTCCTCAGGTTCA
TCAAAGAACAGGAGATAATATGAGATCGATAGGTAGGATCGATTTCAGGACAGGTCAATC
ATCGGCTAGTGGAGGAGGTTCTGGTAGCAG

QA 3 572 3 572
DS 

RD RR4GG92TF 708 0 0
GGATCCAACTTTCGAAACAGAACACAAAATTCAGGAACGTAGAGAGAAAAAAATGGACCG
AACAAAGACTGCAAAGGTATCTCTGTTTGCTGTTTGGACAATCCTCCTTGTCTTAAATGT
GAACGGCCAATCAGGTTGTGATACCCACAGCTTCGCCAATAACATCGCTTTCACCTCTTG
CTCTCCCCTCCCGGCCCTTGGCTCATTCCTTCACTGGAACTTCAACGAACAAAACAGCAC
CGTTTCAATCGCTTTCCGCCACCCAGGAACTTCCTCTTCTTCATGGGTTGCTTGGGGGCT
TAACCCAAGTGGGCCTCAGATGTCCGGGACACAAGCTCTTGTCGCCTTCACCAATTCTAG
TGGACAGTTCCAAGCCTACACCTCTTCGGTCGATGGGTACGGCACCCAGCTAACACGTGG
AGACCTTAGTTTTGGGGTCAGCCTCGTTTCCGCGACTCTCGTCAACGGAGAGGCTACCAT
CTTTGCGACTCTTGAGTTACCGGCCAATTTGGTCATGACCAACCAGGTTTGGCAAGAAGG
TCCGGTCGCTAATGGTATTCCTCAGGTTCATCAAAGAACAGGAGATAATATGAGATCGAT
AGGTAGGATCGATTTCAG*ACAGGTCAATCATCGGCTAGTGGAGGAG*TTCTGGTAGCAG
*CTGAGA**GAGAAATGTAAGTTCAACTTTCTTTTCTGTTTGGCT
CAC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GG92JQ 726 0 0
TGGACCGAACAAAGACTGCAAAGGTATCTCTGTTTGCTGTTTGGACAATCCTCCTTGTCT
TAAATGTGAACGGCCAATCAGGTTGTGATACCCACAGCTTCGCCAATAACATCGCTTTCA
CCTCTTGCTCTCCCCTCCCGGCCCTTGGCTCATTCCTTCACTGGAACTTCAACGAACAAA
ACAGCACCGTTTCAATCGCTTTCCGCCACCCAGGAACTTCCTCTTCTTCATGGGTTGCTT
GGGGGCTTAACCCAAGTGGGCCTCAGATGTCCGGGACACAAGCTCTTGTCGCCTTCACCA
ATTCTAGTGGACAGTTCCAAGCCTACACCTCTTCGGTCGATGGGTACGGCACCCAGCTAA
CACGTGGAGACCTTAGTTTTGGGGTCAGCCTCGTTTCCGCGACTCTCGTCAACGGAGAGG
CTACCATCTTTGCGACTCTTGAGTTACCGGCCAATTTGGTCATGACCAACCAGGTTTGGC
AAGAAGGTCCGGTCGCTAATGGTATTCCTCAGGTTCATCAAAGAACAGGAGATAATATGA
GATCGATAGGTAGGATCGATTTCAGGACAGGTCAATCATCGGCTAGTGGAGGAGGTTCTG
GTAGCAGGCTGAGGAGGAGAAATGTAAGTTCAACTTTCTTTTCTGTTTGGCTTCACTTTT
CAAGTTTGCTTATTAAGAAATAACAACGAACCAAAATAACATTTGGTTAGTTTATCTGAG
TATACC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL4112Contig1 697 3 18 U
GGAAACCAAAACCTCAACAGTTATATTTGGGGATCATCAGGGCTTCTTCTTCACCATGGA
TCCTTACAAGTATCGTCCTTCGAGCGCCTACAACGCTCCGTTCTACACCACAAACGGTGG
TGCTCCAGTCTCGAACAACATCTCCTCCCTCACCATCGGAGAAAGAGGTCCGGTTCTTCT
TGAGGACTACCATCTGATCGAGAAGGTAGCCAACTTCACCAGAGAGAGAATCCCTGAGAG
AGTGGTTCATGCCAGAGGAATCAGTGCTAAGGGTTTCTTCGAGGTCACGCATGACATTTC
CAACCTCACTTGTGCTGATTTCCTCAGGGCCCCCGGTGTTCAAACTCCGGTCATCGTCCG
TTTCTCCACCGTCGTTCACGAGCGTGCCAGCCCTGAAACCATGAGGGATATTCGTGGCTT
CGCCGTCAAGTTTTACACCAGAGAGGGGAACTTTGATCTAGTTGGTAACAACACTCCAGT
GTTCTTCATCCGTGACGGGATCCAGTTCCCGGATGTTGTCCATGCCCTGAAACCGAACCC
GAAGACAAACATCCAGGAGTACTGGAGGATACTGGACTACATGTCCCACTTACCAGAGAG
TTTGCTCACATGGTGCTGGATGTTTGATGACGTTGGTATCCCACAAGACTACAGACACAT
GGAAGGATCCGGTGTCCACACCTACACTCTAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ92TF U 1
AF RR4DX21TF U 15
AF RR4G009TF U 15
BS 1 132 RR4FZ92TF
BS 133 133 RR4DX21TF
BS 134 258 RR4FZ92TF
BS 259 259 RR4DX21TF
BS 260 288 RR4FZ92TF
BS 289 289 RR4DX21TF
BS 290 382 RR4FZ92TF
BS 383 383 RR4DX21TF
BS 384 459 RR4FZ92TF
BS 460 460 RR4DX21TF
BS 461 531 RR4FZ92TF
BS 532 532 RR4DX21TF
BS 533 585 RR4FZ92TF
BS 586 586 RR4DX21TF
BS 587 609 RR4FZ92TF
BS 610 610 RR4DX21TF
BS 611 691 RR4FZ92TF
BS 692 697 RR4G009TF

RD RR4FZ92TF 695 0 0
GGAAACCAAAACCTCAACAGTTATATTTGGGGATCATCAGGGCTTCTTCTTCACCATGGA
TCCTTACAAGTATCGTCCTTCGAGCGCCTACAACGCTCCGTTCTACACCACAAACGGTGG
TGCTCCAGTCTCCAACAACATCTCCTCCCTCACCATCGGAGAAAGAGGTCCGGTTCTTCT
TGAGGACTACCATCTGATCGAGAAGGTAGCCAACTTCACCAGAGAGAGAATCCCTGAGAG
AGTGGTTCATGCCAGAGGGATCAGTGCTAAGGGTTTCTTCGAGGTCACCCATGACATTTC
CAACCTCACTTGTGCTGATTTCCTCAGGGCCCCCGGTGTTCAAACTCCGGTCATCGTCCG
TTTCTCCACCGTCGTTCACGAGTGTGCCAGCCCTGAAACCATGAGGGATATTCGTGGCTT
CGCCGTCAAGTTTTACACCAGAGAGGGGAACTTTGATCTTGTTGGTAACAACACTCCAGT
GTTCTTCATCCGTGACGGGATCCAGTTCCCGGATGTTGTCCATGCCCTGAAGCCGAACCC
GAAGACAAACATCCAGGAGTACTGGAGGATACTGGACTACATGTCTCACTTACCAGAGAG
TTTGCTCACCTGGTGCTGGATGTTTGATGACGTTGGTATCCCACAAGACTACAGACACAT
GGAAGGATCCGGTGTCCACACCTACACTCTA
TTTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4DX21TF 654 0 0
CAACAGTTATATTTGGGGATCATCAGGGCTTCTTCTTCACCATGGATCCTTACAAGTATC
GTCCTTCGAGCGCCTACAACGCTCCGTTCTACACCACAAACGGTGGTGCTCCAGTCTCGA
ACAACATCTCCTCCCTCACCATCGGAGAAAGAGGTCCGGTTCTTCTTGATGACTACCATC
TGATCGAGAAGGTAGCCAACTTCACCAGAGAGAGAATCCCTGAGAGAGTGGTTCATGCCA
GAGGAATCAGTGCTGAGGGTTTCTTCGAGGTCACGCATGGCATTTCCAACCTCACTTGTG
CTGATTTCCTCAGGGCCCCCGGTGTTCAAACTCCGGTCATCGTCCGTTTCTCCACCGTCG
TTCACGAGCGTGCCAGCCCTGAAACCATGAGGGATATTCGTGGCTTCGCCGTCAAGTTTC
ACACCAGAGAGGGGAACTTTGATCTAGTTGGTAACAACACTCCAGTGTTCTTCATCCGTG
ACGGGATCCAGTTCCCGGATGTTGTCCATGCCCTGAAACCGAACCCGAAGACAAACATCC
ATGAGTACTGGAGGATACTGGACTACATGTCCCACTTACCAGAGAGTTTGCTCACATGGT
GCTGGATGTTTGATGACGTTGGTACCCCACAAGACTACAGACACATGGAA
AGGG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4G009TF 683 0 0
CAACAGTTATATTTGGGGATCATCAGGGCTTCTTCTTCACCATGGATCCTTACAAGTATC
GTCCTTCGAGCGCCTACAACGCTCCGTTCTACACCACAAACGGTGGTGCTCCAGTCTCGA
ACAACATCTCCTCCCTCACCATCGGAGAAAGAGGTCCGGTTCTTCTTGAGGACTACCATC
TGATCGAGAAGGTAGCCAACTTCACCAGAGAGAGAATCCCTGAGAGAGTGGTTCATGCCA
GAGGAATCAGTGCTAAGGGTTTCTTCGAGGTCACGCATGACATTTCCAACCTCACTTGTG
CTGATTTCCTCAGGGCCCCCGGTGTTCAAACTCCGGTCATCGTCCGTTTCTCTACCGTCG
TTCACGAGCGTGCCAGCCCTGAAACCATGAGGGATATTCGTGGCTTCGCCGTCAAGTTTT
ACACCAGAGAGGGGAACTTTGATCTAGTTGGTAACAACACTCCAGTGTTCTTCATCCGTG
ACGGGATCCAGTTCCCGGATGTTGTCCATGCCCTGAAACCGAACCCGAAGACAAACATCC
AGGAGTACTGGAGGATACTGGACTACATGTCCCACTTACCAGAGAGTTTGCTCACATGGT
GCTGGATGTTTGATGACGTTGGTATCCCACAAGACTACAGACACATGGAATGGTTCGGTG
TCCACACCTACACTCTAGTTTCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL4113Contig1 855 3 22 U
GAATAAAGAGGCATATATCAATTCGATCACTCAGGGCTACAAAACAATGGACTAAAACGC
AAAGTTTTCTTCAAACGCAGACGTAATGTAAAACCCAGAGAGTTTGTCACACAAATAAAC
GAAATCAAAGGGAAATGAAACAAACAAATGGAGAAAGCAAATATAAAAGAAAAAATCATA
AAACCCATCTTTTAGCCTTCTCCTTGATACAGCTTAAAAGCATTTTCTGTGGACAATCCC
TGGACCTGCCTCATCATACTCAGCCTTGGAGATCCACATCTGCTGGAATGTGCTGAGGGA
AGCAAGAATGGAACCACCGATCCAGACACTGTACTTCCTCTCCGGAGGTGCAACGACCTT
AATCTTCATGCTGCTTGGTGCAAGTGCTGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCTGCAATACC
CGAGAACATAGTAGTTCCACCACTGAGCACAATGTTACCATACAAGTCCTTCCTGATATC
CACGTCACACTTCATGATCGAGTCGTAGGTCGTCTCGTGGATTCCAGCAGCTTCCATTCC
CACGAACGAAGGCTGGAACAGAACCTCTGGGCATCTGAATCTCTCGGCACCGATGGTGAT
CACTTGCCCGTCTGGTAACTCGTAGTTTTTCTCGATGGAGGAGTTGGTTGTAGAAAGTGT
GATGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGCTCACAACACCATGCTCAATAGGGTATT
TCAAGGTGAGAATACCTCTCTTGGACTGTGCTTCGTCACCAACGTAGGCATCCTTCTGGT
CCATCCCAACCATGACACCGTGATGTCTTGGCCTACCAACAACACTCGGGAATACAGCCC
TGGGAGCATCATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH81JQ U 85
AF RR4DH81TF C 1
AF RR4C264JQ U 69
BS 1 70 RR4DH81TF
BS 71 74 RR4C264JQ
BS 75 75 RR4DH81TF
BS 76 84 RR4C264JQ
BS 85 97 RR4DH81JQ
BS 98 98 RR4C264JQ
BS 99 99 RR4DH81JQ
BS 100 100 RR4C264JQ
BS 101 120 RR4DH81JQ
BS 121 121 RR4C264JQ
BS 122 152 RR4DH81JQ
BS 153 153 RR4C264JQ
BS 154 168 RR4DH81JQ
BS 169 169 RR4C264JQ
BS 170 270 RR4DH81JQ
BS 271 271 RR4C264JQ
BS 272 315 RR4DH81JQ
BS 316 316 RR4C264JQ
BS 317 320 RR4DH81JQ
BS 321 414 RR4C264JQ
BS 415 415 RR4DH81TF
BS 416 855 RR4C264JQ

RD RR4DH81JQ 236 0 0
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CAAATGGAAAAAGCAAATATAAAAAAAAAAATCATAAAACCCATCTTTTAGCCTTCTCCT
TGATACAGCTTAAAAGCATTTTCTGTGGACAATCCCTGGACCTGCCTCATCATACTCAGC
CTTGGAAATCCACATCTGCTGGAATGTGCTGAGGGAAGCAAGAATGGAACCCCCGA

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR4DH81TF 529 0 0
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AAAGTTTTCTTCAAACGCAGACGTAATGTAAAACCCAGAGAGTTTGTCACACAAATAAAC
GAAATCAAAGGGAAATGAAACAAACAAATGGAGAAAGCAAATATAAAAGAAAAAATCATA
AAACCCATCTTTTAGCCTTCTCCTTGATACAGCTTAGAAGCATTTTCTGTGGACAATCCC
TGGACCTGCCTCATCATACTCAGCCTTGGAGATCCACATCTGCTGGAATGTGCTGAGGGA
AGCAAGAATGGAACCACCGATCCAGACACTGTACTTCCTCTCCGGAGGTGCAACGACCTT
AATCTTCATGCTGCTTGGTGCAAGTGCTGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCTGCAATACC
CGAGAACATAGTGGTTCCACCACTGAGCACAATGTTACCGTACAAGTCCTTCCTGATGTC
CACGTCACACTTCATGATCGAGTTGTAGGTCGTCTCGTGGATTCCAGC
C

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4C264JQ 787 0 0
CC
TCAAGCGCAGACGTAATGTAAAACCCAGAGAGTTTGCCACACAAATAAACGAAATCAAAG
GGAAATGAAACAAACAAATGGAGAAAGCAAATATAAAAGAAAAAATCATAAAACCCATCT
TTTAGCCTTCTCCTTGATACAGCTTAAAAGCATTTTCTGTGGACAATCCCTGGACCTGCC
TCGTCATACTCAGCCTTGGAGATCCACATCTGCTGGAATGTGCTGAGGGAAGCAAGAATG
GAACCACCGATCCAGACACTGTACTTCCTCTCCGGAGGTGCAACGACCTTAATCTTCATG
CTGCTTGGTGCAAGTGCTGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCTGCGATACCCGAGAACATA
GTAGTTCCACCACTGAGCACAATGTTACCATACAAGTCCTTCCTGATATCCACGTCACAC
TTCATGATCGAGTCGTAGGTCGTCTCGTGGATTCCAGCAGCTTCCATTCCCACGAACGAA
GGCTGGAACAGAACCTCTGGGCATCTGAATCTCTCGGCACCGATGGTGATCACTTGCCCG
TCTGGTAACTCGTAGTTTTTCTCGATGGAGGAGTTGGTTGTAGAAAGTGTGATGCCAGAT
CTTCTCCATGTCATCCCAGTTGCTCACAACACCATGCTCAATAGGGTATTTCAAGGTGAG
AATACCTCTCTTGGACTGTGCTTCGTCACCAACGTAGGCATCCTTCTGGTCCATCCCAAC
CATGACACCGTGATGTCTTGGCCTACCAACAACACTCGGGAATACAGCCCTGGGAGCATC
ATCAC

QA 3 787 3 787
DS 



AS 1 3

CO CL4114Contig1 1157 3 6 U
CTCTTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATGCCGAATTGTTGGCGTAGT
TGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACGAATCGGCGTCGTATACAC
ATGGATCTAGTAACTCCATTTTGATTCATGATCCAGAAGACGGATCTTAGCTGCTGAGAT
CTCAGACGATCGGTTGAAGAGCTGATCTGATCAAGCATCATGATCTCTCGGCAAAAGCTA
GGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTCCTAGAGGAGCAATTGAAGA
AGATGGAAGAGGATTGGGATATGGGAATTGATGAATGAGATTGAAGGATGTATGAGATGT
TTGTTAAGGACGATGAGTTCTGATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGT
GCGCTTGCATGGCAGGTCACACAAAATTATAATAAAAATAATCGTTTTGTGTTTGGTGAG
GGGGGAGTTCGCACGGGAGATTTTTTTAAAGCCCGGGTTCTCCCTCTCACCTTTGTGTCT
TGCACTCTCGCTTTCGCTCTCTCTCTCTCTGATTCCATTCGACTGCGCCATAATATCTCT
CCGTACACATACATTTTTGAATTATTTAACTCGAGAAGATCTGAAGTCAAAACGCGGCCA
TATCTAAACTCCAACATACTCCACAGAGGCAAAAGGTACTTTGAATTTGAGTCTTTATTC
GTATTACAATCTCAACATCGGTTTTAATTTGCTCCTGGAGAAATGATTCTAGTCATCTTT
GGCATAGTAATGTTTATGTTCCAATTTTTATTCTCGTTAAAGAAACGTCCAACAGCTTAA
CAAACAGCCTTAACTTTCATTTGGTCTAGTGAGTTGTTATTTTGGTGAGATCTATGTTAA
AATGGTATTTAATACAAAGAACGATCATTTAGAGTCTTGATCAATTTTCACTGTATTGCA
AGTATATTGTACTGTGTTTTTCATATAGCTAGAGTTTTGCAAAGTCTTTGGAGTCTGAAG
ACCTTGGCGGTGTTATCAGCTCTTGCAGGATTATTTTCATGTTGATGCAATGAGGTATCT
ATAGAACAAGTAACTTGTATGACTTTATTGTGTATGATTTGTCAAGAGTTCGAGCCTACA
GCTCTGTTTCTTTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU69TF U 1
AF RR4EG23TF U 1
AF RR4EU69JQ C 504
BS 1 484 RR4EG23TF
BS 485 485 RR4EU69TF
BS 486 648 RR4EG23TF
BS 649 649 RR4EU69JQ
BS 650 666 RR4EG23TF
BS 667 1157 RR4EU69JQ

RD RR4EU69TF 549 0 0
CTCTTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATGCCGAATTGTTGGCGTAGT
TGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACGAATCGGCGTCGTATACAC
ATGGATCTAGTAACTCCATTTTGATTCATGATCCAGAAGACGGATCTTAGCTGCTGAGAT
CTCAGACGATCGGTTGAAGAGCTGATCTGATCAAGCATCATGATCTCTCGGCAAAAGCTA
GGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTCCTAGAGGAGCAATTGAAGA
AGATGGAAGAGGATTGGGATATGGGAATTGATGAATGAGATTGAAGGATGTATGAGATGT
TTGTTAAGGACGATGAGTTCTGATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGT
GCGCTTGCATGGCAGGTCACACAAAATTATAATAAAAATAATCGTTTTGTGTTTGGTGAG
GGGGGAGTTCGCACGGGAGATTTTTTTAAAGCCCGGGTTCTCCCTCTCACCTTTGTGTCT
TGCACTCTC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4EG23TF 666 0 0
CTCTTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATGCCGAATTGTTGGCGTAGT
TGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACGAATCGGCGTCGTATACAC
ATGGATCTAGTAACTCCATTTTGATTCATGATCCAGAAGACGGATCTTAGCTGCTGAGAT
CTCAGACGATCGGTTGAAGAGCTGATCTGATCAAGCATCATGATCTCTCGGCAAAAGCTA
GGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTCCTAGAGGAGCAATTGAAGA
AGATGGAAGAGGATTGGGATATGGGAATTGATGAATGAGATTGAAGGATGTATGAGATGT
TTGTTAAGGACGATGAGTTCTGATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGT
GCGCTTGCATGGCAGGTCACACAAAATTATAATAAAAATAATCGTTTTGTGTTTGGTGAG
GGGG*AGTTCGCACGGGAGATTTTTTTAAAGCCCGGGTTCTCCCTCTCACCTTTGTGTCT
TGCACTCTCGCTTTCGCTCTCTCTCTCTCTGATTCCATTCGACTGCGCCATAATATCTCT
CCGTACACATACATTTTTGAATTATTTAACTCGAGAAGATCTGAAGTCGAAACGCGGCCA
TATCTA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4EU69JQ 654 0 0
TTTTAAAGCCCGGGTTCTCCCTCTCACCTTTGTGTCTTGCACTCTCGCTTTCGCTCTCTC
TCTCTCTGATTCCATTCGACTGCGCCATAATATCTCTCCGTACACATACATTTTTGAATT
ATTTAACTCGAGAAGATCTGAAGTCAAAACGCGGCCATATCTAAACTCCAACATACTCCA
CAGAGGCAAAAGGTACTTTGAATTTGAGTCTTTATTCGTATTACAATCTCAACATCGGTT
TTAATTTGCTCCTGGAGAAATGATTCTAGTCATCTTTGGCATAGTAATGTTTATGTTCCA
ATTTTTATTCTCGTTAAAGAAACGTCCAACAGCTTAACAAACAGCCTTAACTTTCATTTG
GTCTAGTGAGTTGTTATTTTGGTGAGATCTATGTTAAAATGGTATTTAATACAAAGAACG
ATCATTTAGAGTCTTGATCAATTTTCACTGTATTGCAAGTATATTGTACTGTGTTTTTCA
TATAGCTAGAGTTTTGCAAAGTCTTTGGAGTCTGAAGACCTTGGCGGTGTTATCAGCTCT
TGCAGGATTATTTTCATGTTGATGCAATGAGGTATCTATAGAACAAGTAACTTGTATGAC
TTTATTGTGTATGATTTGTCAAGAGTTCGAGCCTACAGCTCTGTTTCTTTGTCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 3

CO CL4115Contig1 558 3 1 U
GGAACCTTTGTTGCTCATAGAAGCAGCCTCCATCAAATATTTTATGAAATCAAACGTTTC
CTTTAGTTCTTGAAGACAAACACAAAGCTTCTCCTTTTCTATTTTCTGCACTTAAATAAA
GCTTTAATAAGCTATTTATATTTCAATAAAACTCTGTTTTATATTTAATCACACTACTTA
CTAGAAAGTTCAATTGCAATTCAAAATAATGTCGATAAAATTCTGTTTGCATTTTGTTTG
AATTGGTTCATTTTATTTATCAGTTTTTTTTTTCAAAATAATGGAGCGGTCTAGCCAGTT
GGATTCCAAGATCTACAAGTGTTGAACACGTTGTTTCAAGTCCAAACAGCAAAGCATCTG
CTCGGTATTTGGTTTCTGCTGGATGGTCGGGTATAATATAAAAGAAGGTTTGCTGAGAAT
TACGACAGACCATCTGACATATATACAATTAAGTTTGTCAGGACACCAGATTATCCAAAG
CACTTTTGGTCTTTTATTTTTTTGTCGCTGTCACTGGTTCTGCGACTATGAAAAGAAACC
AGAACATTGCATTGAGCG


BQ
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AF RR4A202JQD C 1
AF RR4A202TF U 1
AF RR4A202TFB U 1
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CACTTTTGGTCTTTTATTTTTTTGTCGCTGTCACTGGTTCTGCGACTATGAAAAGAAACC
AGAACATTGCATTGAGCG

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DS 



AS 1 2

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ATATCGATGCTGCTGCTGAAAGCCTGGAGAAAGCTCTTCAGTTCGAACCTAACGATGCTG
GCCTCAAGAAAGAATATGCTGCTGTAATGAAAAAGATTGCCATTAGAGACAATAAAGAGA
AAAAGCAGTACCGCAAAATGTTTGGATAGAATGGGTTTGATACATTTTAGGGGTTTGGTT
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ATTCAAGACTTTGGGCACTGTCTCTGGTTCCCTCATTTTGGTAAACAATGTTTACTTCTG
CAATTCCAGCAAAGATATGCATAATCTTTTACCCACGACAGACTATGAGATGACGATTAT
TGCAATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG13TF U 1
AF RR4BG13JQ C 442
BS 1 862 RR4BG13TF
BS 863 1330 RR4BG13JQ

RD RR4BG13TF 862 0 0
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TTCCTGAGGGTGAAGATGATGGGATATGTAACTTTTTCAAGGACGGTGATGTGTTCCCTG
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AAGAGACGAGCACTGCCTTGCGTAAGACAAAGTCGCAGATCTTCACTAACAGTGCTGCCT
GTAAACTGAAATTTGGAGATGC

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4BG13JQ 889 0 0
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CTCCTTCTCTGGATGTTGTGATTCATGACTGTGGGGTCATTCCTGAGGGTGAAGATGATG
GGATATGTAACTTTTTCAAGGACGGTGATGTGTTCCCTGACTGGCCTATTGATCTTAATG
ATAGCCCTGCCGAGTTGTCTTGGTGGATGGAGACTGTTGATTCTGTCAAGGCTAGTGGTA
ACGACCACTTTAAGAAACAAGACTACAAGATGGCTCTTAGAAAGTACCGCAAGGCTTTGC
GTTATCTGGATATTTGCTGGGAGAAAGATGGCATTGACCAAGAGACGAGCACTGCCTTGC
GTAAGACAAAGTCGCAGATCTTCACTAACAGTGCTGCCTGTAAACTGAAATTTGGAGATG
CAAAGGGAGCATTGTTGGACACTGAATTTGCTATGCGTGATGAAGATAACAATGTCAAAG
CATTGTTTCGACAGGGACAGGCACACATGGCTCTCAATAATATCGATGCTGCTGCTGAAA
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CTGTAATGAAAAAGATTGCCATTAGAGACAATAAAGAGAAAAAGCAGTACCGCAAAATGT
TTGGATAGAATGGGTTTGATACATTTTAGGGGTTTGGTTGGATAGTGGAGAAGGGACTAA
CAAAGAAAAGATGAAAAGAGCATATAAAAGAAAAGAAATATTCAAGACTTTGGGCACTGT
CTCTGGTTCCCTCATTTTGGTAAACAATGTTTACTTCTGCAATTCCAGCAAAGATATGCA
TAATCTTTTACCCACGACAGACTATGAGATGACGATTATTGCAATTTTG

QA 1 889 1 889
DS 



AS 1 2

CO CL4117Contig1 745 2 2 U
GGAGTAATAGACGATATCATCAGAAGATTGCTAGAAGGTAGAGGAGGCAAACAGGTTCAG
CTATCAGAGTGCGAGATTCGTCAACTCTGCTCCAACTCCCGTCAAATCTTCCTCTCTCAA
CCCAATCTCCTCGAACTCCACGCCCCAATCCGCATCTGCGGTGATATCCATGGTCAGTAT
CAAGATCTTCTTCGGTTATTCGAATACGGAGGCTACCCTCCTTCAGCGAACTATCTCTTC
CTCGGAGACTACGTTGACAGAGGCAAACAAAGTCTCGAGACCATTTGTCTCCTCCTCGCT
TACAAGATTCGTTACCCGTCCAAGATATATCTCCTGAGAGGCAACCACGAGGACGCTAAG
ATCAACAGAATCTACGGCTTCTACGACGAGTGCAAGCGTAGATTCAACGTGCGTCTTTGG
AAGATCTTCACCGATTGCTTCAACTCTTTACCCGTGGCAGCGCTCATCGACGACAAGATC
TTGTGTATGCACGGAGTGTTGTCGCCGTAGCTGGAGAATTTGAACCAGATTCGAGAGATT
GAGAGGCCTACGGAGATTCCGGACAACGGTCTTCTTTGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCT
GACCCGAAGAAGGAAGGATGGTCTGATAGTGATAGAGGGTATTTCGTGCACGTTTGGAGC
TGATAAAGTCGATGAGTTTTGGATAAGAATGATCTTGACCTCATTTGCCGTGGCCATCAG
TAGTGGAAGATGGGTATGAGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E962TF U 1
AF RR4E456TF U 103
BS 1 604 RR4E962TF
BS 605 745 RR4E456TF

RD RR4E962TF 608 0 0
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CTATCAGAGTGCGAGATTCGTCAACTCTGCTCCAACTCCCGTCAAATCTTCCTCTCTCAA
CCCAATCTCCTCGAACTCCACGCCCCAATCCGCATCTGCGGTGATATCCATGGTCAGTAT
CAAGATCTTCTTCGGTTATTCGAATACGGAGGCTACCCTCCTTCAGCGAACTATCTCTTC
CTCGGAGACTACGTTGACAGAGGCAAACAAAGTCTCGAGACCATTTGTCTCCTCCTCGCT
TACAAGATTCGTTACCCGTCCAAGATATATCTCCTGAGAGGCAACCACGAGGACGCTAAG
ATCAACAGAATCTACGGCTTCTACGACGAGTGCAAGCGTAGATTCAACGTGCGTCTTTGG
AAGATCTTCACCGATTGCTTCAACTCTTTACCCGTGGCAGCGCTCATCGACGACAAGATC
TTGTGTATGCACGGAGTGTTGTCGCCGTAGCTGGAGAATTTGAACCAGATTCGAGAGATT
GAGAGGCCTACGGAGATTCCGGACAACGGTCTTCTTTGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCT
GACC
CGAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4E456TF 643 0 0
CAAATCTTCCTCTCTCAACCCAATCTCCTCGAACTCCACGCCCCAATCCGCATCTGCGGT
GATATCCATGGTCAGTATCAAGATCTTCTTCGGTTATTCGAATACGGAGGCTACCCTCCT
TCAGCGAACTATCTCTTCCTCGGAGACTACGTTGACAGAGGCAAACAAAGTCTCGAGACC
ATTTGTCTCCTCCTCGCTTACAAGATTCGTTACCCGTCCAAGATATATCTCCTGAGAGGC
AACCACGAGGACGCTAAGATCAACAGAATCTACGGCTTCTACGACGAGTGCAAGCGTAGA
TTCAACGTGCGTCTTTGGAAGATCTTCACCGATTGCTTCAACTCTTTACCCGTGGCAGCG
CTCATCGACGACAAGATCTTGTGTATGCACGGAGTGTTGTCGCCGTAGCTGGAGAATTTG
AACCAGATTCGAGAGATTGAGAGGCCTACGGAGATTCCGGACAACGGTCTTCTTTGTGAT
CTGCTTTGGTCTGATCCTGACCCGAAGAAGGAAGGATGGTCTGATAGTGATAGAGGGTAT
TTCGTGCACGTTTGGAGCTGATAAAGTCGATGAGTTTTGGATAAGAATGATCTTGACCTC
ATTTGCCGTGGCCATCAGTAGTGGAAGATGGGTATGAGTTCTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4119Contig1 1650 3 17 U
GGGAAGCAATCTGTAACAAAATCACGGCGGCGAAGATGGCGGAGGCTGCGATCCTAGGGT
TCCTGCAGAACAACGAATCAATCCCAGATTCCGGTAATTTCGCCGCGGAGCACAACCTCG
ACCACGAAGAATTCAAAAACGTAATCAAGAGCTTACAAGCTTTTCGCTACATCGAAGCTA
AGGAGCTTAAACGGGAAACACTGGTGTTGACTGATGAAGGGAAGAAGTACGCGGCGGAAG
GGTCGCCGGAGTTTCACTTTTTCTCGGCTGTTCCCGAGGAAGGTACCATATCCAAGGATG
ATCTAGAGAAAAAGCTAGATGCTTCTGTGTTCAAAATTGGAAGTACACAAGCTGCTAAAA
AGAAGTGGGTTGCAATGGGAAAGCAAGTCTCTAGGAAGGTTCAACATGTCGAAGATAAAG
TAAAGGAGTCTCTTTTACAGATACATCAAGGACTGGAACTTGACAAAGAAAGTCTCAACT
CTCTCAAAACCAGGAAACTCATTGCATCACAGGGATGGACGGGATATTCTGATATTATGA
AAGGTCCCAGCTATGCTCCCAAAAGGAAGACTTTCGCTACTGACTTGACTCGAGAGAATC
TGCAGAACTGGAAAGAGTTGGAATTCAAGGAGTATAACTTCAACGCTATGGGACAACCTC
TTGATGCAGGGCATCTCCATCCCCTTCTCAAGGTGCGGAAGCAGTTCAAAGACATATTTT
GTCAGATGGGATTTGAAGAGATGCCAACAAACAACTTTGTGGAGAGCAGCTTCTGGAATT
TCGATGCACTGTTCCAGCCTCAGCAGCACCCTGCTCGTGACTCTCATGACACCTTCTTTT
TAAAAGCTCCTTCGACAACGAGGGAATTACCAGAAGACTATGTTGAGAGGGTGAAACAAG
TTCACGAGTCTGGTGGATATGGATCTCGAGGGTATAACTATGACTGGAAAAGAGAGGAAG
CAAACAAGAATCTTCTCCGTACACACACAACAGCAGTCTCGTCTAGGATGCTTTATGCAC
TCGCAAAGGGACCTTTCACTCCCAAGAAGTACTTTTCAATAGACCGTGTCTTCAGAAACG
AGGCTGTTGACAAAGCACATCTGGCGGAATTCCATCAGATTGAAGGTTTGATCTGTGACC
TTGGTCTGACATTGGGTGATCTCATTGGTGTATTGGAAGCGTTCTTCGCTCGATTAGGGA
TGCCCAAACTGCGTTTCAAGCCGGCATACAACCCATACACTGAACCAAGCATGGAGATTT
TCAGCTATCATCCAGGACTAGAGAAATGGGTAGAGATTGGAAACTCTGGCATGTTCAGAC
CCGAAATGCTGCAGCCAACGGGTCTGCCAGAGGATGTCCGAGTCATTGCATGGGGTCTTC
CTCTTGAAAGACCAACAATGATCTTATATGGCGTTGACAACATCCGTGATCTGTTCGGAC
ACAAGGTGGATCTCAAACTCATCGAACGGAATCCCATCTGTCGCGTTGGAATCTAGTCGG
CTTGATTTGGATTATGAATTTGCTACAGTTTCTTTGATGCAGTTATGCTAAATGCTATAC
ACAATCTATGATCCTTCCAATTTTACTTTTTGACTTGTTTTATCATCATCAGTTTAAAGA
TTATATATCAACTTTTTTTAATAAGACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU05TF U 1
AF RR4FL78TF U 291
AF RR4FU05JQ C 854
BS 1 418 RR4FU05TF
BS 419 419 RR4FL78TF
BS 420 435 RR4FU05TF
BS 436 436 RR4FL78TF
BS 437 550 RR4FU05TF
BS 551 551 RR4FL78TF
BS 552 636 RR4FU05TF
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BS 741 1032 RR4FL78TF
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BS 1034 1094 RR4FL78TF
BS 1095 1650 RR4FU05JQ

RD RR4FU05TF 740 0 0
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TCCTGCAGAACAACGAATCAATCCCAGATTCCGGTAATTTCGCCGCGGAGCACAACCTCG
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TAAAGGAGTCTCTTT*ACAGATACATCAAGGACTGGAACTTGACAAAGAAAGTCTCAACT
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AAGGTCCCAGTTATGCTCCCAAAAGGAAGACTTTCGCTACTGACTTGACTCGAGAGAATC
TGCAGAACTGGAAAGAGTTGGAATTCAAGGAGTATAGCTTCAATGCTATGGGACAACCTC
TTGATGCAGGGCATCTCCATCCCCTTCTCAAG*TGCGGAAGCAGTTCAAAGACATATTTT
GTCAGATGGGATTTGAAGAG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4FL78TF 804 0 0
G
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AAGATAAAGTAAAGGAGTCTCTTTTACAGATACATCAAGGACTGGAACTTGACAAAGAAA
GTCTCAACTCTCTCAAAACCAGGAAACTCATTGCATCACAGGGATGGACGGGATATTCTG
ATATTATGAAAGGTCCCAGCTATGCTCCCAAAAGGAAGACTTTCGCTACTGACTTGACTC
GAGAGAATCTGCAGAACTGGAAGGAGTTGGAATTCAAGGAGTATAACTTCAACGCTATGG
GACAACCTCTTGATGCAGGGCATCTCCATCCCCTTCTCAAGGTGCGGAAGCAGTTCAAAG
ACATATTTTGTCAGATGGGATTTGAAGAGATGCCAACAAACAACTTTGTGGAGAGCAGCT
TCTGGAATTTCGATGCACTGTTCCAGCCTCAGCAGCACCCTGCTCGTGACTCTCATGACA
CCTTCTTTTTAAAAGCTCCTTCGACAACGAGGGAATTACCAGAAGACTATGTTGAGAGGG
TGAAACAAGTTCACGAGTCTGGTGGATATGGATCTCGAGGGTATAACTATGACTGGAAAA
GAGAGGAAGCAAACAAGAATCTTCTCCGTACACACACAACAGCAGTCTCGTCTAGGATGC
TTTATGCACTCGCAAAGGGAC*TTTCACTCCCAAGAAGTACTTTTCAATAGACCGTGTCT
TCAGAAACGAGGCTGTTGACAAA

QA 2 804 2 804
DS 

RD RR4FU05JQ 797 0 0
GACAACGAGGGAATTACCAGAAGACTATGTTGAGAGGGTGAAACAAGTTCACGAGTCTGG
TGGATATGGATCTCGAGGGTATAACTATGACTGGAAAAGAGAGGAAGCAAACAAGAATCT
TCTCCGTACACACACAACAGCAGTCTCGTCTAGGATGCTTTATGCACTCGCAAAGGGACC
TTTCACTCCCAAGAAGTACTTTTCAATAGACCGTGTCTTCAGAAACGAGGCTGTTGACAA
AGCACATCTGGCGGAATTCCATCAGATTGAAGGTTTGATCTGTGACCTTGGTCTGACATT
GGGTGATCTCATTGGTGTATTGGAAGCGTTCTTCGCTCGATTAGGGATGCCCAAACTGCG
TTTCAAGCCGGCATACAACCCATACACTGAACCAAGCATGGAGATTTTCAGCTATCATCC
AGGACTAGAGAAATGGGTAGAGATTGGAAACTCTGGCATGTTCAGACCCGAAATGCTGCA
GCCAACGGGTCTGCCAGAGGATGTCCGAGTCATTGCATGGGGTCTTCCTCTTGAAAGACC
AACAATGATCTTATATGGCGTTGACAACATCCGTGATCTGTTCGGACACAAGGTGGATCT
CAAACTCATCGAACGGAATCCCATCTGTCGCGTTGGAATCTAGTCGGCTTGATTTGGATT
ATGAATTTGCTACAGTTTCTTTGATGCAGTTATGCTAAATGCTATACACAATCTATGATC
CTTCCAATTTTACTTTTTGACTTGTTTTATCATCATCAGTTTAAAGATTATATATCAACT
TTTTTTAATAAGACATT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 3

CO CL4120Contig1 862 3 10 U
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TTGATGAATATTGGTTACTAAGAACATTCAGTCACACAACACAAGCATATATCTAAAGAG
AATCAGTATATAAAAGTAACTCTTCAGTCTCCAACTCGGACATGCTCCATGCTTCTGATC
TCCTTTCCTTGAATTTTTTATGTTCACGTAGATGCCAATAGCTTCTCTATGTCCTTCTCA
ATCTCAAGAGGTGATGTTGTAGGAGCATATCGATCCACAACATTTCCTTGTTTGTCTACC
AGAAATTTTGCGAAGTTCCACTTGATAGAATCCCCAAACAATCCACCTTTCTGTTCTTTC
AAGAACTTGTATAGAGGCGAAGCATTCTCACCATTCACTTCAATCTTGTCAAAGATGGGA
AACTCTCCTTTGAAGGTTGTGCAAGTGTTATCCTTAATCTCCTTGTTGCTACCTGGCTCT
TGATTTCCAAATTGGTTGCAGGGAAACGCTAAGATCTCAAGCCCCTTAGTTTTGTACTTG
GCATACAAAATGTTCAACTCTTTGTAGTTTCCCTGTGTTAGACCACACTTAGAGGCTACG
TTGACAATAAGAAGCACCTTTCCAGTGAACTTGCTTAAACTCACATCATTCCCATCAATA
TCCTTAACGGAGATGTGGTAGATGGAGCTGTATGATGATTGGTCGACAATAGCTGGAGAA
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CTTCTTGATCTAGGCATCGAGACAGATTCTCTATGAATGACGATGAGGACGAACAAACAA
ATGTGTTCAAGTTCTAACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CN22JQ U 1
AF RR4AM36JQ U 63
AF RR4AM36TF C 78
BS 1 138 RR4CN22JQ
BS 139 139 RR4AM36JQ
BS 140 332 RR4CN22JQ
BS 333 333 RR4AM36JQ
BS 334 444 RR4CN22JQ
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BS 446 480 RR4CN22JQ
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BS 482 749 RR4CN22JQ
BS 750 862 RR4AM36JQ

RD RR4CN22JQ 749 0 0
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TCCTTTCCTTGAATTTTTTATGTTCACGTAGATGCCAATAGCTTCTCTATGTCCTTCTCA
ATCTCAAGAGGTGATGTTGTAGGAGCATATCGATCCACAACATTTCCTTGTTTGTCTACC
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AAGAACTTGTATAGAGGCGAAGCATTCTCACCATTCACTTCAATCTTGTCAAAGATGGGA
AACTCTCCTTTGAAGGTTGTGCAAATGTTATCCTTAATCTCCTTGTTGCTACCTGGCTCT
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GGCAGGTACCTGTACAGGTAGAACACAAA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AM36JQ 800 0 0
GG
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TTCCTTGAATTTTTTATGTTCACGTAGATGCCAATAGCTTCTCTATGTCCTTCTCAATCT
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ATTTTGCGAAGTTCCACTTGATAGAATCCCCAAACAATCCACCTTTCTGTTCTTTCAAGA
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TTCCAAATTGGTTGCAGGGAAACGCTAAGATCTCAAGCCCCTTAGTTTTGTACTTGGCAT
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GTTCAAGTTCTAACACCC

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR4AM36TF 785 0 0
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CCACTTGATAGAATCCCCAAACAATCCACCTTTCTGTTCTTTCAAGAACTTGTATAGAGG
CGAAGCATTCTCACCATTCACTTCAATCTTGTCAAAGATGGGAAACTCTCCTTTGAAGGT
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CTCTTTGTAGTTTCCCTGTGTTAGACCACACTTAGAGGCTACGTTGACAATAAGAAGCAC
CTTTCCAGTGAACTTGCTTAAACTCACATCATTCCCATCAATATCCTTAACGGAGATGTG
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GTAGAACACAAAGGCTAGAGGCAATAACAGAATCAGGACACGACTTCTTGATCTAGGCAT
CGAGACAGATTCTCTATGAATGACGATGAGGACGAACAAACAAATGTGTTCAAGTTCTAA
CACCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL4121Contig1 829 3 3 U
TTTTTTTTTGGGAGACATAGAACAACAAATCAAAAGTAGAAATAATCACACAACACCTCA
AAGTAGATTGAAAAAGAAACCGAACAAGTGAAAGTACACAAGTTCCAAATACAGCACTAA
TAAACCTATACAGCCCAGGCAAACTACTTCTGTAGGATAGAAAAATGTTATACCAAAATG
TCAAACATCTCTCCTCCCTCATCGCTAAGTAGTGCAAAGCTGATCTAAGTCAGAAAGCAT
ACTCATCTCTCCTTTTGGTGGTTGGTACCATAGATATATAGCATTCTCATGGGTTCTATG
GTAATACAATAAATCACAAGAGGATGTAAAGAGAGCAAGTGAAATAAGAAGATACAAGGT
TAAAAAAAGAGCTTCAAAAGCATTTTACTTTTTTTCTTAAACTGATAAGCCCACGAGAAC
CAATCATTTCACTCATCTCACTGTGTGCTCCTAGTTAACCCACTTCGTCCAGCAGCTCTT
CCAGCAAGAATCTGAGCAGTGTTGGATGAGTTCTTGGTGTTTGAAGATCTTTTAGCTCTG
TTATCCTGATCTTTATCCACACGCATAGCAGCAACCTCTTTCTCCATTGCAGCTACTTCC
CTTCTCATCTTCTTTGCTTCAACCTCCATTGCTTTTGTTAATGTTTCAACCTTTTTTGCT
AACATGTCTATGGCATCATCCATGTCTTTGAGGCTTTGATCCTTTTCATGTGAAGATTTT
CTCAAGGCAACTACTTCCTTCTGAAGTAAATCATACAAAACCCCTGGGACATTGTCTTCA
GTTGTTGGCGGAGGGAGTTCACTCGGTGGCTTCTCCTCTGAATCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GT92TF C 1
AF RR4GT92JQ U 10
AF RR4CK32JQ U 46
BS 1 9 RR4GT92TF
BS 10 637 RR4GT92JQ
BS 638 829 RR4CK32JQ

RD RR4GT92TF 638 0 0
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AAGTAGATTGAAAAAGAAACCGAACAAGTGAAAGTACACAAGTTCCAAATACAGCACTAA
TAAACCTATACAGCCCAGGCAAACTACTTCTGTAGGATAGAAAAATGTTATACCAAAATG
TCAAACATCTCTCCTCCCTCATCGCTAAGTAGTGCAAAGCTGATCTAAGTCAGAAAGCAT
ACTCATCTCTCCTTTTGGTGGTTGGTACCATAGATATATAGCATTCTCATGGGTTCTATG
GTAATACAATAAATCACAAGAGGATGTAAAGAGAGCAAGTGAAATAAGAAGATACAAGGT
TAAAAAAAGAGCTTCAAAAGCATTTTACTTTTTTTCTTAAACTGATAAGCCCACGAGAAC
CAATCATTTCACTCATCTCACTGTGTGCTCCTAGTTAACCCACTTCGTCCAGCAGCTCTT
CCAGCAAGAATCTGAGCAGTGTTGGATGAGTTCTTGGTGTTTGAAGATCTTTTAGCTCTG
TTATCCTGATCTTTATCCACACGCATAGCAGCAACCTCTTTCTCCATTGCAGCTACTTCC
CTTCTCATCTTCTTTGCTTCAACCTCCATTGCTTTTG
C

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4GT92JQ 629 0 0
GGGAGACATAGAACAACAAATCAAAAGTAGAAATAATCACACAACACCTCAAAGTAGATT
GAAAAAGAAACCGAACAAGTGAAAGTACACAAGTTCCAAATACAGCACTAATAAACCTAT
ACAGCCCAGGCAAACTACTTCTGTAGGATAGAAAAATGTTATACCAAAATGTCAAACATC
TCTCCTCCCTCATCGCTAAGTAGTGCAAAGCTGATCTAAGTCAGAAAGCATACTCATCTC
TCCTTTTGGTGGTTGGTACCATAGATATATAGCATTCTCATGGGTTCTATGGTAATACAA
TAAATCACAAGAGGATGTAAAGAGAGCAAGTGAAATAAGAAGATACAAGGTTAAAAAAAG
AGCTTCAAAAGCATTTTACTTTTTTTCTTAAACTGATAAGCCCACGAGAACCAATCATTT
CACTCATCTCACTGTGTGCTCCTAGTTAACCCACTTCGTCCAGCAGCTCTTCCAGCAAGA
ATCTGAGCAGTGTTGGATGAGTTCTTGGTGTTTGAAGATCTTTTAGCTCTGTTATCCTGA
TCTTTATCCACACGCATAGCAGCAACCTCTTTCTCCATTGCAGCTACTTCCCTTCTCATC
TTCTTTGCTTCAACCTCCATTGCTTTTG
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4CK32JQ 784 0 0
G
CACACAACACCTCAAAGTAGATTGAAAAAGAAACCGAACAAGTGAAAGTACACAAGTTCC
AAATACAGCACTAATAAACCTATACAGCCCAGGCAAACTACTTCTGTAGGATAGAAAAAT
GTTATACCAAAATGTCAAACATCTCTCCTCCCTCATCGCTAAGTAGTGCAAAGCTGATCT
AAGTCAGAAAGCATACTCATCTCTCCTTTTGGTGGTTGGTACCATAGATATATAACATTC
TCATGGGTTCTATGGTAATACAATAAATCACAAGAGGATGTAAAGAGAGCAAGTGAAATA
AGAAGATACAAGGTTAAAAAAAGAGCTTCAAAAGCATTTTACTTTTTTTCTTAAACTGAT
AAGCCCACGAGAACCAATCATTTCACTCATCTCACTGTGTGCTCCTAGTTAACCCACTTC
GTCCAGCAGCTCTTCCAGCAAGAATCTGAGCAGTGTTGGATGAGTTCTTGGTGTTTGAAG
ATCTTTTAGCTCTGTTATCCTGATCTTTATCCACACGCATAGCAGCAACCTCTTTCTCCA
TTGCAGCTACTTCCCTTCTCATCTTCTTTGCTTCAACCTCCATTGCTTTTGTTAATGTTT
CAACCTTTTTTGCTAACATGTCTATGGCATCATCCATGTCTTTGAGGCTTTGATCCTTTT
CATGTGAAGATTTTCTCAAGGCAACTACTTCCTTCTGAAGTAAATCATACAAAACCCCTG
GGACATTGTCTTCAGTTGTTGGCGGAGGGAGTTCACTCGGTGGCTTCTCCTCTGAATCTT
CTT

QA 2 784 2 784
DS 



AS 1 2

CO CL4122Contig1 828 2 10 U
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TCTTGGTTCTTCTTGCCGGACTTCTCGAGAATCCGGAACTTGCTCTTGATTCTCTCTCTG
TTTGCTTGGCGATTGCTGGTTGGGCGTTCATGATATCTGTTGGGTTCAACGCAGCGATTA
GTGTAAGAGTCAGTAATGAACTGGGAGCTGGAAATCCTAAATCAGCAGCATTTTCTGTAA
TCATCGTCAACATATATTCGTTAATCACAAGTGTGATCTTAGCCATTATAGTTTGGCTGT
TCCGTGACATTCTGAGCTACGCATTCACCGAAGGTGAAAAAGTCTCAGCTGCGGTTTCTG
ATCTTTGCCCGTTTTTAGCTGTAACTCTTGTTCTCAATGGAACCCAACCTGTACTGTCTG
GTGTGGCGGTTGGGTGCGGTTGGCAAACGTTTGTGGCAAAAGTTAACGTTGGATGCTACT
ACATTATCGGAATTCCCATTGGGGCTCTCTTTGGGTTTTATTTCAAATACGATGCCAAGG
GTATATGGACGGGAATGATTGGTGGTACGCTTATACAAACGGTTGTTTTGGTCTGGGTCA
TATTTAAAACAGACTGGACAAAAGAAGTTGAAGAAGCTTCCAAACGGCTAGATAAATGGA
GCAACAAGAAACCATAAATAATTTCTGAATGATGTAATTAAGCTGGCCTGGTATTCAATA
AACCCAAAATATTATTTTTGTCCGAACATATTACATGTATGCATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B226TF U 1
AF RR4B226JQ C 374
BS 1 730 RR4B226TF
BS 731 731 RR4B226JQ
BS 732 777 RR4B226TF
BS 778 780 RR4B226JQ
BS 781 788 RR4B226TF
BS 789 789 RR4B226JQ
BS 790 805 RR4B226TF
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BS 807 819 RR4B226TF
BS 820 828 RR4B226JQ

RD RR4B226TF 819 0 0
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TCTTCAAACTGTCCGCCGCCTCCGCCGTGATGCTTTGCCTTGAGACTTGGTATTTTCAGA
TCTTGGTTCTTCTTGCCGGACTTCTCGAGAATCCGGAACTTGCTCTTGATTCTCTCTCTG
TTTGCTTGGCGATTGCTGGTTGGGCGTTCATGATATCTGTTGGGTTCAACGCAGCGATTA
GTGTAAGAGTCAGTAATGAACTGGGAGCTGGAAATCCTAAATCAGCAGCATTTTCTGTAA
TCATCGTCAACATATATTCGTTAATCACAAGTGTGATCTTAGCCATTATAGTTTGGCTGT
TCCGTGACATTCTGAGCTACGCATTCACCGAAGGTGAAAAAGTCTCAGCTGCGGTTTCTG
ATCTTTGCCCGTTTTTAGCTGTAACTCTTGTTCTCAATGGAACCCAACCTGTACTGTCTG
GTGTGGCGGTTGGGTGCGGTTGGCAAACGTTTGTGGCAAAAGTTAACGTTGGATGCTACT
ACATTATCGGAATTCCCATTGGGGCTCTCTTTGGGTTTTATTTCAAATACGATGCCAAGG
GTATATGGACGGGAATGATTGGTGGTACGCTTATACAAACGGTTGTTTTGGTCTGGGTCA
TATTTAAAACAGACTGGACAAAAGAAGTTGAAGAAGCTTCCAAACGGCTAGATAAATGGA
GCAACAAGAA*CCATAAATAATTTCTGAATGATGTAATTAAGCTGGCCTGGTATTCAT**
AACCCAAA*TATTATTTTTGTCCGA*CATATTACATGTA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4B226JQ 455 0 0
GAGCTACGCATTCACCGAAGGTGAAAAAGTTTCAGCTGCGGTTTCTGATCTTTGCCCGTT
TTTAGCTGTAACTCTTGTTCTCAATGGAACCCAACCTGTACTGTCTGGTGTGGCGGTTGG
GTGCGGTTGGCAAACGTTTGTGGCAAAAGTTAACGTTGGATGCTACTACATTATCGGAAT
TCCCATTGGGGCTCTCTTTGGGTTTTATTTCAAATACGATGCCAAGGGTATATGGACGGG
AATGATTGGTGGTACGCTTATACAAACGGTTGTTTTGGTTTGGGTCATATTTAAAACAGA
CTGGACAAAAGAAGTTGAAGAAGCTTCCAAACGGCTAGATAAATGGAGCAACAAGAAACC
ATAAATAATTTCTGAATGATGTAATTAAGCTGGCCTGGTATTCAATAAACCCAAAATATT
ATTTTTGTCCGAACATATTACATGTATGCATTATT

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 3

CO CL4123Contig1 962 3 4 U
GCAAGATTGCTTCTTTGCAAACTGAAGTCTCATCACTACAAGGTTCATCTGATTCTGCAA
AAGAGTTGGGGAAGGTTCAAGAACGTGTTGTTGAATTAGAGAAGCAGATAGAGGTACTCA
GAAACTTCCTGGAGCAAAAAAACAAGGAGAAAGCTTCCACAGAAGCTCGGACAAAGGAAG
CTGAGAAAAAACTAAGTGAACTAAACTCAAGCCTAGATAAACTTCAAGAAATTGTAGACC
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CGAAACCACATGTTGATAAAATTAAGGTTGCCGTGAAACCTTACACAACCAAGGTGGTCA
TCGTTTACACAGAGTTCCTTGGATCCGCCACGACTTATCATAATCAGGTCCAAGCCCATG
TTGAACAAAAACTAAAGAGCCATGAGCTGACGGAGGCTTTTGCTACCAGTGAATTTGTTT
GGTTTGCGGCTTCTGCGTTGTTGGCGTTACCCATCTTCTTTGCATACAGAGTGCTCGTTT
CCCTCTTCTGCACAAAGACGAAGACACCTGTTAAACACCCTCATCACCATGGTCGTCGTA
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TAGTTGAGGTAAGAGGTTAAAGCGCCTTTGTCGCAGACATCTTCTAAGATGATGTGGTCA
CCGTTGCTCTTTGTGCAAAATGTGTAACCTCTTCCCTTTATTATTTTGTGTTGTCTTGGT
CAAATATTCAGTCTTTTTTTTTTACACGTAATATTAGACATTACTAGCAAAGCTTGTGTA
ATTTTAGTGTATTTTTCAATTTCACTATATTGAGATTTTTTACACTTTATTTTCTTCTGT
TCAAGTGATCTTTTTAGCTTTCTCTCTTTTGAATCAAAACTGTTTACTCTGATATATTCG
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4DZ33TF U 1
AF RR4DZ33JQ C 143
AF RR4CD40TF U 564
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BS 775 775 RR4DZ33JQ
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TAGTTGAGGTA

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GACACCTGTTAAACACCCTCATCACCATGGTCGTCGTAAGACCAAAAAGGGTCACAGTCA
CACTGACAAGTGAGATTCATTGTTCCACGCGCTCAGAATAGTTGAGGTAAGAGGTTAAAG
CGCCTTTGTCGCAGACATCTTCTAAGATGATGTGGTCACCGTTGCTCTTTGTGCAAAATG
TGTAACCTCTTCCCTTTATTATTTTGTGTTGTCTTGGTCAAATATTCAGTCTTTTTTT**
TACACGTAATATTAGACATTACTAGCAAAGCTTGTGTAATTTTAGTGTATTTTTCAATTT
CACTATATTGAGATTTTTTACACTTTATTTTCTTCTGTTCAAGTGATCTTTTTAGCTTTC
TCTCTTTTGAATCAAAACTGTTTACTC
C

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DS 

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GG
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TGACAAGTGAGATTCATTGTTCCACGCGCTCAGAATAGTTGAGGTAAGAGGTTAAAGCGC
CTTTGTCGCAGACATCTTCTAAGATGATGTGGTCACCGTTGCTCTTTGTGCAAAATGTGT
AACCTCTTCCCTTTATTATTTTGTGTTGTTTTGGTCAAATATTCAGTCTTTTTTTTTTAC
ACGTAATATTAGACATTACTAGCAAAGCTTGTGTAATTTTAGTGTATTTTTCAATTTCAC
TATATTGAGATTTTTTACACTTTATTTTCTTCTGTTCAAGTGATCTTTTTAGCTTTCTCT
CTTTTGAATCAAAACTGTTTACTCTGATATATTCGTT

QA 3 399 3 399
DS 



AS 1 3

CO CL4124Contig1 884 3 16 U
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TTCCCATGGAGTTTAGCGCAACCAGCTCGAATTGCAAGCGGATACTATGCACCGCAGACA
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ACTCGAGGTTTTTCAAACAGAGATGTCCTGACGCCTACAGCTATCCACAAGACGACCCGA
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BQ
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AF RR4AT16TF U 1
AF RR4AC55TF U 6
AF RR4AT16JQ C 127
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RD RR4AT16TF 842 0 0
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CTTTGAACCAATTCAACAACTTAGACTTCTACGACATTTCACTTGTCGATGGATTTAACA
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ACTCGAGGTTTTTCAAACAGAGATGTCCTGACGCCTACAGCTATCCACAAGACGACCCGA
CCAGCACTTTTACTTGCACTAACACCAACTACAGGGTCGTGTTTTGTCCAAGGGCTGGGC
TCGATGCTACTGGGACCGACCTGCTCCCCATCA*GATGGTCACTGAG*AGACT*AATAAA
GAGACGAGTCTC*ATTGTATGTGTGTGTGCGTGAGA*TGTACTGGTGACTCACGCTTA
TGAT

QA 1 838 1 838
DS 

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G
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TCATATTCTCCATCCTTTTCTTCATCTCCACGGCGACCGCCGCCACATTCGAGATCCTGA
ACCAATGCGGTTACACCGTATGGGCTGCTGCAAGTCCTGGAGGGGGCAGGCGTCTAAACT
CAGGCCAATCGTGGACATTAAATGTTCCAGCTCGAACGTCTATGGCACGAATTTGGGGTC
GGACAAACTGTAACTTTGACTCTTCGGGGCGTGGCCGATGTGAAACAGGTGACTGTACCG
GTGGACTTCAATGTACCGGTTGGGGCCAGCCACCAAACACGTTGGCTGAGTATGCTTTGA
ACCAATTCAACAACTTAGACTTCTACGACATTTCACTTGTCGATGGATTTAACATTCCCA
TGGAGTTTAGCGCAACCAGCTCGAATTGCAAGCGGATACTATGCACCGCAGACATAAACG
GACAGTGTCCAAACGTGTTGAGGGCGCCGGGCGGTTGCAACAACCCGTGCACGGTTTTTA
AGACGAACGAGTACTGTTGTACAAACGGACAGGGATCATGTACCGACACAAACTACTCGA
GGTTTTTCAAACAGAGATGTCCTGACGCCTACAGCTATCCACAAGACGACCCGACCAGCA
CTTTTACTTGCACTAACACCAACTACAGGGTCGTGTTTTGTCCAAGGGCTGGGCTCGATG
CTACTGGGACCGACCTGCTCCCCATCAAGATGGTCACTGAGGAGAATTAATAAAGAGACG
AGTCTCCATTGTATGTGTGTGTGC

QA 2 805 2 805
DS 

RD RR4AT16JQ 758 0 0
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CAGGCCAATCGTGGACATTAAATGTTCCAGCTCGAACGTCTATGGCACGAATTTGGGGTC
GGACAAACTGTAACTTTGACTCTTCGGGGCGTGGCCGATGTGAAACAGGTGACTGTACCG
GTGGACTTCAATGTACCGGTTGGGGCCAGCCACCAAACACGTTGGCTGAGTATGCTTTGA
ACCAATTCAACAACTTAGACTTTTACGACATTTCACTTGTCGATGGATTTAACATTCCCA
TGGAGTTTAGCGCAACCAGCTCGAATTGCAAGCGGATACTATGCACCGCAGACATAAACG
GACAGTGTCCAAACGTGTTGAGGGCGCCGGGCGGTTGCAACAACCCGTGCACGGTTTTTA
AGACGAACGAGTACTGTTGTACAAACGGACAGGGATCATGTACCGACACAAACTACTCGA
GGTTTTTCAAACAGAGATGTCCTGACGCCTACAGCTATCCACAAGACGACCCGACCAGCA
CTTTTACTTGCACTAACACCAACTACAGGGTCGTGTTTTGTCCAAGGGCTGGGCTCGATG
CTACTGGGACCGACCTGCTCCCCATCAAGATGGTCACTGAGGAGAACTAATAAAGAGACG
AGTCTCCATTGTATGTGTGTGTGCGTGAGAATGTACTGGTGACTCACGCTTAATGAATAA
AAAATAGAGGCAATAATAGTTACGTTGGTCGACCAGTG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL4125Contig1 624 3 2 U
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AAATTTGGATGTGCTGTCGTTTTGATGGAACATATTCTTAGAAAAATCTCAGCGCCTTTG
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TCGTTCGCACCAGAGATGGCGTTTGTGTCTACATTGTCATCTTCCTCAAATCTCTGCGAC
GGAGGAAATGGGTTGGTGAGGATTCCGATTGATTTTCCGGGAGAGATATTGTGCGTGCCG
TCCGAAACTGTTAAGCGATCACCTTTCGACCTTTTCGTGCCGACGATATTCGCAGGAGTT
ATGGTTGTTGCATCAGTCTCTTTAATCCGATCGTGTTTTGGGATCGAAAACGACTTATAG
ATACTACGTTACTCTTTTCAAAGCTCGTTTAAATTATTGCGTTTCTAGATTGATCCAGTG
TAGAAACTACAGTTTTATTTTTGCTAAATACTAGACAATGTATAAATTTGTGTTTTGGAA
TCGAAATACGGTCTTGTACTACTCACATTATATGTTGAGAAAAAAAAAACCCCTACTCAC
ATTATCAATAATAATGATTCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C048TF U 1
AF RR4C072TF U 1
AF RR4C059TF U 1
BS 1 579 RR4C048TF
BS 580 624 RR4C059TF

RD RR4C048TF 579 0 0
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TCGTTCGCACCAGAGATGGCGTTTGTGTCTACATTGTCATCTTCCTCAAATCTCTGCGAC
GGAGGAAATGGGTTGGTGAGGATTCCGATTGATTTTCCGGGAGAGATATTGTGCGTGCCG
TCCGAAACTGTTAAGCGATCACCTTTCGACCTTTTCGTGCCGACGATATTCGCAGGAGTT
ATGGTTGTTGCATCAGTCTCTTTAATCCGATCGTGTTTTGGGATCGAAAACGACTTATAG
ATACTACGTTACTCTTTTCAAAGCTCGTTTAAATTATTGCGTTTCTAGATTGATCCAGTG
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TCGAAATACGGTCTTGTACTACTCACATTATATGTTGAG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4C072TF 582 0 0
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AAATTTGGATGTGCTGTCGTTTTGATGGAACATATTCTTAGAAAAATCTCAGCGCCTTTG
CCGGTTCTTGTACAAGCCGCCACGTGGACATTGCTCCTAATGCTGACGGTGGGTTTTGCG
TCGTTCGCACCAGAGATGGCGTTTGTGTCTACATTGTCATCTTCCTCAAATCTCTGCGAC
GGAGGAAATGGGTTGGTGAGGATTCCGATTGATTTTCCGGGAGAGATATTGTGCGTGCCG
TCCGAAACTGTTAAGCGATCACCTTTCGACCTTTTCGTGCCGACGATATTCGCAGGAGTT
ATGGTTGTTGCATCAGTCTCTTTAATCCGATCGTGTTTTGGGATCGAAAACGACTTATAG
ATACTACGTTACTCTTTTCAAAGCTCGTTTAAATTATTGCGTTTCTAGATTGATCCAGTG
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AAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4C059TF 624 0 0
TTTTTTTTGTATCACAAGGAAACTGAGCATCTAATTTGGTTAGTTTCTGTTTCTCGTCAA
AAATTTGGATGTGCTGTCGTTTTGATGGAACATATTCTTAGAAAAATCTCAGCGCCTTTG
CCGGTTCTTGTACAAGCCGCCACGTGGACATTGCTCCTAATGCTGACGGTGGGTTTTGCG
TCGTTCGCACCAGAGATGGCGTTTGTGTCTACATTGTCATCTTCCTCAAATCTCTGCGAC
GGAGGAAATGGGTTGGTGAGGATTCCGATTGATTTTCCGGGAGAGATATTGTGCGTGCCG
TCCGAAACTGTTAAGCGATCACCTTTCGACCTTTTCGTGCCGACGATATTCGCAGGAGTT
ATGGTTGTTGCATCAGTCTCTTTAATCCGATCGTGTTTTGGGATCGAAAACGACTTATAG
ATACTACGTTACTCTTTTCAAAGCTCGTTTAAATTATTGCGTTTCTAGATTGATCCAGTG
TAGAAACTACAGTTTTATTTTTGCTAAATACTAGACAATGTATAAATTTGTGTTTTGGAA
TCGAAATACGGTCTTGTACTACTCACATTATATGTTGAGAAAAAAAAAACCCCTACTCAC
ATTATCAATAATAATGATTCTTTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL4126Contig1 642 2 1 U
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ATAACAATGGCAATAATGTTTCTTGGTGTGAGATCAGATTTGAACCAGGACATAAAAGGG
TGTCAAGATTCCATGTCTGATCTCTACTCTTGTCTTCCTTTCGTCACTAACAAAGCTAAA
GCTCCAGACTCAACATGTTGCACAACACTCAAAGAAAAACTAGACAAAGGGCAGACCAAG
AGATGTCTCTGCACTCTTGTCAAAGACAGGGATGATCCTGGTTTAGGGTTCAAAGTTGAT
GCCAACCGTGCAATGAGCCTCCCTTCCACTTGTCATGTCCCTGCAAATATTTCACAATGC
CCAGATCTTCTACATTTGCCTCCAGATTCAGTAGCCGCTAAGATTTTTAAGCAATTCACT
GAATCCTCCTCTCAGAATGTTGCACCTAAAGCTGTATCCACTGGTTCAAGCGTTAAAGGA
AGAGATAAGAAGCAATATGGTCTAGTGATGGCTGGAGCTTTCTCAGTATGGTACTTAATG
TAAACATTTGTTATGAAAGTTAATAAATATAACTAAGACCGCTATGTGATTCATATCTAT
CAGCTGTGTATGTATCATTGGTTGTTAATAAAACATATTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4FL14TF U 1
AF RR4CO25TF U 224
BS 1 642 RR4FL14TF

RD RR4FL14TF 642 0 0
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ATAACAATGGCAATAATGTTTCTTGGTGTGAGATCAGATTTGAACCAGGACATAAAAGGG
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GCTCCAGACTCAACATGTTGCACAACACTCAAAGAAAAACTAGACAAAGGGCAGACCAAG
AGATGTCTCTGCACTCTTGTCAAAGACAGGGATGATCCTGGTTTAGGGTTCAAAGTTGAT
GCCAACCGTGCAATGAGCCTCCCTTCCACTTGTCATGTCCCTGCAAATATTTCACAATGC
CCAGATCTTCTACATTTGCCTCCAGATTCAGTAGCCGCTAAGATTTTTAAGCAATTCACT
GAATCCTCCTCTCAGAATGTTGCACCTAAAGCTGTATCCACTGGTTCAAGCGTTAAAGGA
AGAGATAAGAAGCAATATGGTCTAGTGATGGCTGGAGCTTTCTCAGTATGGTACTTAATG
TAAACATTTGTTATGAAAGTTAATAAATATAACTAAGACCGCTATGTGATTCATATCTAT
CAGCTGTGTATGTATCATTGGTTGTTAATAAAACATATTATA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4CO25TF 418 0 0
G
CAAAGGGCAGACCAAGAGATGTCTCTGCACTCTTGTCAAAGACAGGGATGATCCTGGTTT
AGGGTTCAAAGTTGATGCCAACCGTGCAATGAGCCTCCCTTCCACTTGTCATGTCCCTGC
AAATATTTCACAATGCCCAGATCTTCTACATTTGCCTCCAGATTCAGTAGCCGCTAAGAT
TTTTAAGCAATTCACTGAATCCTCCTCTCAGAATGTTGCACCTAAAGCTGTATCCACTGG
TTCAAGCGTTAAAGGAAGAGATAAGAAGCAATATGGTCTAGTGATGGCTGGAGCTTTCTC
AGTATGGTACTTAATGTAAACATTTGTTATGAAAGTTAATAAATATAACTAAGACCGCTA
TGTGATTCATATCTATCAGCTGTGTATGTATCATTGGTTGTTAATAAAACATATTAT

QA 2 418 2 418
DS 



AS 1 3

CO CL4127Contig1 799 3 2 U
TTTTTCTCTCACTGAAGACATTGGGTGTTTCATATCAGATTCTACCAAATTAGGAAGACT
GTTTCTACTTTCAACGTTTCTTATTCTCAAAGCAGTGCATAAGCCTTGATTCTTGGGAAT
TGAGAATCTTGAGGAGAGGCGATGACAGGGGACTGCTCTGAGCAACAGTTTCACTGGAAC
GGTGACGAATGGAGATGGGAAGTTAGGGGGTTTCAAGGTGTCGTCTCTGTTATTAGGAGA
GTTAACGGCACTTCCTCCTGATAACACTACTTGACACTTCTGTAATTGACCATCAACATT
AGGCAAACTTGTATTCCCAATTTTAAATAAAGTTTGTATCATAATAAAAACAAAGAGTTG
TTAGCACGATGAAATGCTTGAATTGTGATAAGATTACACAAGCTCATGAGTTTCCAATTT
GATTATCAATCTCTACCCCCCCCTATACGGCTATAACTAGTTCCATTTGCCAATGATCTT
AAACACAAACTATCAAAAGTAAAAGATGGATCTTACATTAACCACCAACATAACCTCTAT
CGAGACTCTTCGACTGCTACGTTGGAGTAAGTACACTCGAAGCTCTCTTCCTCTGATCCT
TTCCCTCTACTCCTCTTCCATGATATCTTCCATGTCTTATACAAGCTAATCCTCTCAGTT
TGAACATTTCTTTTGGCGAGCATGAGGGTAAGGAAGACAGGGACCATAGCAGCACACAAA
TGCTTTATAGAATGGCCACTAAGAATATGATGCGTCCAGCTATATATCGGCTTATCTGCA
GCCTCTTCCACTTTCGCTA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG89JQ C 1
AF RR4FG89TF U 1
AF RR4FH41JQ U 376
BS 1 427 RR4FG89TF
BS 428 799 RR4FH41JQ

RD RR4FG89JQ 427 0 0
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GTTTCTACTTTCAACGTTTCTTATTCTCAAAGCAGTGCATAAGCCTTGATTCTTGGGAAT
TGAGAATCTTGAGGAGAGGCGATGACAGGGGACTGCTCTGAGCAACAGTTTCACTGGAAC
GGTGACGAATGGAGATGGGAAGTTAGGGGGTTTCAAGGTGTCGTCTCTGTTATTAGGAGA
GTTAACGGCACTTCCTCCTGATAACACTACTTGACACTTCTGTAATTGACCATCAACATT
AGGCAAACTTGTATTCCCAATTTTAAATAAAGTTTGTATCATAATAAAAACAAAGAGTTG
TTAGCACGATGAAATGCTTGAATTGTGATAAGATTACACAAGCTCATGAGTTTCCAATTT
GATTATC

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4FG89TF 427 0 0
TTTTTCTCTCACTGAAGACATTGGGTGTTTCATATCAGATTCTACCAAATTAGGAAGACT
GTTTCTACTTTCAACGTTTCTTATTCTCAAAGCAGTGCATAAGCCTTGATTCTTGGGAAT
TGAGAATCTTGAGGAGAGGCGATGACAGGGGACTGCTCTGAGCAACAGTTTCACTGGAAC
GGTGACGAATGGAGATGGGAAGTTAGGGGGTTTCAAGGTGTCGTCTCTGTTATTAGGAGA
GTTAACGGCACTTCCTCCTGATAACACTACTTGACACTTCTGTAATTGACCATCAACATT
AGGCAAACTTGTATTCCCAATTTTAAATAAAGTTTGTATCATAATAAAAACAAAGAGTTG
TTAGCACGATGAAATGCTTGAATTGTGATAAGATTACACAAGCTCATGAGTTTCCAATTT
GATTATC

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4FH41JQ 424 0 0
GCTTGAATTGTGATAAGATTACACAAGCTCATGAGTTTCCAATTTGATTATCAATCTCTA
CCCCCCCCTATACGGCTATAACTAGTTCCATTTGCCAATGATCTTAAACACAAACTATCA
AAAGTAAAAGATGGATCTTACATTAACCACCAACATAACCTCTATCGAGACTCTTCGACT
GCTACGTTGGAGTAAGTACACTCGAAGCTCTCTTCCTCTGATCCTTTCCCTCTACTCCTC
TTCCATGATATCTTCCATGTCTTATACAAGCTAATCCTCTCAGTTTGAACATTTCTTTTG
GCGAGCATGAGGGTAAGGAAGACAGGGACCATAGCAGCACACAAATGCTTTATAGAATGG
CCACTAAGAATATGATGCGTCCAGCTATATATCGGCTTATCTGCAGCCTCTTCCACTTTC
GCTA

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 3

CO CL4128Contig1 583 3 5 U
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CGGTGACGGCGATGGATGTTGTCTACGCGTTGAAGAGGCAGGGACGGACTTTGTATGGAT
TCGGCGGTTGAGGGGATGATGAGATTGGCGTTTGTAAATCGCGTTTGGTCTTTAGGGTTT
GTTTGATTTCTATTAAGCTGCTTTTAGGGTTTCGTTTTAGAATGTTTCACCGGTTTGAAT
TAAATGAAACGCTTCTTTTTATCTATTTGCTTCTCTGCAAAATTGTCGGTATTAAAGCTG
AATCTTCGTGTTAACTAAGAACAAATTAAACAACTTCGTACCT


BQ
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AF RR4EP20JQ C 13
AF RR4EP20TF U 13
AF RR4DT25TF U 1
BS 1 42 RR4DT25TF
BS 43 43 RR4EP20TF
BS 44 337 RR4DT25TF
BS 338 338 RR4EP20TF
BS 339 583 RR4DT25TF

RD RR4EP20JQ 492 0 0
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AGCGTATCAGCGGCTTGATCTACGAGGAGACTCGCGGTGTTCTCAAGATCTTTCTCGAGA
ATGTGATTCGCGACGCTGTTACTTACACTGAGCACGCTCGTAGGAAGACGGTGACGGCGA
TGGATGTTGTCTACGCGTTGAAGAGGCAGGGACGGACTTTGTATGGATTCGGCGGTTGAG
GGGATGATGAGATTGGCGTTTGTAAATCGCGTTTGGTCTTTAGGGTTTGTTTGATTTCTA
TTAAGCTGCTTTTAGGGTTTCGTTTTAGAATGTTTCACCGGTTTGAATTAAATGAAACGC
TTCTTTTTATC
C

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR4EP20TF 492 0 0
CACACCAAAGCGAATCTCAATTTTAAAAACCTTCCGAGAAAAGGAAAATGTCTGGGCGAG
GAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGAAAGGGAGGAGCCAAGAGGCACAGGAAGGTTCTCCGTG
ACAACATCCAGGGCATCACGAAGCCGGCGATTCGCCGTTTAGCGAGAAGAGGCGGCGTCA
AGCGTATCAGCGGCTTGATCTACGAGGAGACTCGCGGTGTTCTCAAGATCTTTCTCGAGA
ATGTGATTCGCGACGCTGTTACTTACACTGAGCACGCTCGTAGGAAGACGGTGACGGCGA
TGGATGTTGTCTACGCGTTGAAGAGGCAGGGACGGACTTTGTATGGATTCGGCGGTTGAG
GGGATGATGAGATTGGCGTTTGTAAATCGCGTTTGGTCTTTAGGGTTTGTTTGATTTCTA
TTAAGCTGCTTTTAGGGTTTCGTTTTAGAATGTTTCACCGGTTTGAATTAAATGAAACGC
TTCTTTTTATC
C

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR4DT25TF 583 0 0
GGACATCGAAAACACACCAAAGCGAATCTCAATTTTAAAAACTTTCCGAGAAAAGGAAAA
TGTCTGGGCGAGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGAAAGGGAGGAGCCAAGAGGCACAGGA
AGGTTCTCCGTGACAACATCCAGGGCATCACGAAGCCGGCGATTCGCCGTTTAGCGAGAA
GAGGCGGCGTCAAGCGTATCAGCGGCTTGATCTACGAGGAGACTCGCGGTGTTCTCAAGA
TCTTTCTCGAGAATGTGATTCGCGACGCTGTTACTTACACTGAGCACGCTCGTAGGAAGA
CGGTGACGGCGATGGATGTTGTCTACGCGTTGAAGAGACAGGGACGGACTTTGTATGGAT
TCGGCGGTTGAGGGGATGATGAGATTGGCGTTTGTAAATCGCGTTTGGTCTTTAGGGTTT
GTTTGATTTCTATTAAGCTGCTTTTAGGGTTTCGTTTTAGAATGTTTCACCGGTTTGAAT
TAAATGAAACGCTTCTTTTTATCTATTTGCTTCTCTGCAAAATTGTCGGTATTAAAGCTG
AATCTTCGTGTTAACTAAGAACAAATTAAACAACTTCGTACCT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 3

CO CL4129Contig1 1595 3 13 U
GGAGATCCGAAGTCGGCTCTGGCTCTGCAGAAATTGGTGCAAGCTGCAGTATGGTTCCTT
GGAGAAAATGCAAACTACGCCGCTTCAGAATATGCATGGGAATCTGCAACTCCACCAGGC
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ACTCTAGCTGGTGCATTAACTCGCCTCCAGAGGTGTGCGTTTAGTGGTAGCTGGGAGGTA
CGAATTGTTGCAGTGCAAGCTCTTACTACAATAGCCATCAGATCTGGTGAACCTTTCAGG
CTGCAGATATACGAGTTTTTGCACACCTTGGCGGAGGGTGGTGTACAGTCTCAACTTTCT
GAAATGCACCTGAGTAATGGAGAGGACCAAGGAGTTAGTGGTACAGGACTTGGAGTTTTA
ATAACTCCGATGTTAAAAGTTCTGGATGAAATGTATGTAGGACAAGACGAATTAATCAAG
GATATACGCAATCACGATAATGCAAACAAAGAATGGAAGGACGAGGAGCTGAAAAAACTC
TACGAAACTCATGAGAGACTGCTAGATTTTGTTTCCTTGTTTTGCGACATTCCAAGAGCC
AAGTATTTACCCCTGGGTCCGATAAGTGCAAAGCTCATTGACACATACCGCACAAAGCAC
AATATCACGGCATCTTCTGGGTCAACCGATCCAACTGTTGTTGCTACTGGTATTTCGGAC
TTAATTTATGAGTCCACTCAGCCTGCCCCTGCTGCCTCAAACTCCAGTGGTCTAGATGAT
GATCTGGTGAATGCTTGGGCTGCAAACCTTGGTGATGATGGCCTTCTTGGAACAGATGCA
CCAGATGTTGATGAGGAGAATGTCTTCTCCAGACCTTCGGTTGGCTATGATGACATGTGG
GCTAAGACTCTTTTAGAAACTAACGAACTGGAGGAAGATGATGCGAGATCAGGTTCATCT
TCTCCAGACTCTACTGGATCAGTGGAAAGCTCTATATCTTCTCACTTTGGTGGAATGAAT
TATCCATCCTTATTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATCAGGTGGAAGC
AAATACCAGTCCACATATGAAGGCTATGGTTCCCCGATTCGAGAAGAACCTCCTCCGCCT
TACTCATTTTCTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTATGGCAGGGTCAGGT
TCTGGAAGTTACGAATCAGATGATGAAGAGCCTAGGAAATCTACTGGTACAAGGTTCGGA
ACAGCGCTCTATGACTTCACTGCCGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGACGGCAGAAGAG
GAATTGGAGATAGAATATGAAGTTGATGGCTGGTTTTACGTAAAGAAGAAGCGGCCTGGC
AGAGACGGGAAGATGGCTGGACTTGTACCCGTTCTTTACGTCAACCAATCTTAATTTTCT
TTGTTGAAGCCGAGGTTATGTACGTCTTAAGGAGACGGTTTAAGATGCCCAAAAAATTCT
GGTCCATGATCTTCTCGAGAGGCAATGTAGAATCAGTGTACATGAATGAATGTTATTTGT
TGGAGTTTGATATATGTGTATGGGGAAAATCGCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D483TF U 1
AF RR4GP92TF U 664
AF RR4GP92JQ C 905
BS 1 684 RR4D483TF
BS 685 685 RR4GP92TF
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BS 792 800 RR4D483TF
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BS 1313 1348 RR4GP92TF
BS 1349 1595 RR4GP92JQ

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GGAGAAAATGCAAACTACGCCGCTTCAGAATATGCATGGGAATCTGCAACTCCACCAGGC
ACTGCACTTATGATGTTGGATGCAGATAAAATGGTTGCTGCTGCTAGTTCTCGCAATCCT
ACTCTAGCTGGTGCATTAACTCGCCTCCAGAGGTGTGCGTTTAGTGGTAGCTGGGAGGTA
CGAATTGTTGCAGTGCAAGCTCTTACTACAATAGCCATCAGATCTGGTGAACCTTTCAGG
CTGCAGATATACGAGTTTTTGCACACCTTGGCGGAGGGTGGTGTACAGTCTCAACTTTCT
GAAATGCACCTGAGTAATGGAGAGGACCAAGGAGTTAGTGGTACAGGACTTGGAGTTTTA
ATAACTCCGATGTTAAAAGTTCTGGATGAAATGTATGTAGGACAAGACGAATTAATCAAG
GATATACGCAATCACGATAATGCAAACAAAGAATGGAAGGACGAGGAGCTGAAAAAACTC
TACGAAACTCATGAGAGACTGCTAGATTTTGTTTCCTTGTTTTGCGACATTCCAAGAGCC
AAGTATTTACCCCTGGGTCCGATAAGTGCAAAGCTCATTGACACATACCGCACAAAGCAC
AATATCACGGCATCTTCTGGGTCA*CCGATCCAACTGTTGTTGCTACTGGTATTTCGGAC
TTAATTTATGAGTCCACTCAGCCTGCCC*TGCTGCCTCAAACTC*AGTGGTCTAGATGAT
GATCTGGTGA*TGCTTGGGC

QA 1 800 1 800
DS 

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G
TCACGGCATCTTCTGGGTCAACCGATCCAACTGTTGTTGCTACTGGTATTTCGGACTTAA
TTTATGAGTCCACTCAGCCTGCCCCTGCTGCCTCAAACTCCAGTGGTCTAGATGATGATC
TGGTGAATGCTTGGGCTGCAAACCTTGGTGATGATGGCCTTCTTGGAACAGATGCACCAG
ATGTTGATGAGGAGAATGTCTTCTCCAGACCTTCGGTTGGCTATGATGACATGTGGGCTA
AGACTCTTTTAGAAACTAACGAACTGGAGGAAGATGATGCGAGATCAGGTTCATCTTCTC
CAGACTCTACTGGATCAGTGGAAAGCTCTATATCTTCTCACTTTGGTGGAATGAATTATC
CATCCTTATTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATCAGGTGGAAGCAAAT
ACCAGTCCACATATGAAGGCTATGGTTCCCCGATTCGAGAAGAACCTCCTCCGCCTTACT
CATTTTCTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTATGGCAGGGTCAGGTTCTG
GAAGTTACGAATCAGATGATGAAGAGCCTAGGAAATCTACTGGTACAAGGTTCGGAACAG
CGCTCTATGACTTCACTGCCGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGACG*CAGAAGAGGAAT
TGGAGATAGAATATGAAGTTGATG

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR4GP92JQ 691 0 0
AGACTCTTTTAGAAACTAACGAACTGGAGGAAGATGATGCGAGATCAGGTTCATCTTCTC
CAGACTCTACTGGATCAGTGGAAAGCTCTATATCTTCTCACTTTGGTGGAATGAATTATC
CATCCTTATTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATCAGGTGGAAGCAAAT
ACCAGTCCACATATGAAGGTTATGGTTCCCCGATTCGAGAAGAACCTCCTCCGCCTTACT
CATTTTTTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTATGGCAGGGTCAGGTTCTG
GAAGTTACGAATCAGATGATGAAGAGCCTAGGAAATCTATTGGTACAAGGTTCGGAACAG
CGCTCTATGACTTCACTGCCGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGACGGCAGAAGAGGAAT
TGGAGATAGAATATGAAGTTGATGGCTGGTTTTACGTAAAGAAGAAGCGGCCTGGCAGAG
ACGGGAAGATGGCTGGACTTGTACCCGTTCTTTACGTCAACCAATCTTAATTTTCTTTGT
TGAAGCCGAGGTTATGTACGTCTTAAGGAGACGGTTTAAGATGCCCAAAAAATTCTGGTC
CATGATCTTCTCGAGAGGCAATGTAGAATCAGTGTACATGAATGAATGTTATTTGTTGGA
GTTTGATATATGTGTATGGGGAAAATCGCAT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 3

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GATACTATCCGTTTCAAGTACAACAAAGACTCGGTGTTAGTTGTATCAGAAGACGAGTAC
AAAAAATGCAAAGCTACTAAACCGCAGTTTTATTCGAACAACGACGACACGGTTTTTAAA
CTAGACCGTCCCGGTTTGTTTTACTTCATCAGCGGTATATCGGGCCACTGCGAAAAGGGT
CAGAAGATGATCATCAAAGTTATGGAGACTGAGTCTACGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCG
TCCACTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCCCCCGGCGTCGACTCACAAAAAGAGCAAT
GCCTTGAAAACAACAGTCCAGTTCATTGGTTCCTGTTTTGTCGTCTTTGCGATCATGGCT
ATTTCTGTTTTTGGTTTGGTTTAGTTAAAGCAGATTTTTGACCGGTTTAGCGTTTTGTTC
TCTTTAGGTTCTTCATTTTTAGGCACTCACTCTTCCGAATAAACACATTGATTTATGTTT
CAATCAAAATATGTTTTCCCATTTTCTTGTAGCCTCATTATTTATATGGATCTTTACGGT
TTCCTTATGTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F850TF U 1
AF RR4FK58TF U 5
AF RR4AX77TF U 239
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BS 459 459 RR4FK58TF
BS 460 594 RR4F850TF
BS 595 614 RR4AX77TF

RD RR4F850TF 594 0 0
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GATACTATCCGTTTCAAGTACAACAAAGACTCGGTGTTAGTTGTATCAGAAGACGAGTAC
AAAAAATGCAAAGCTACTAAACCGCAGTTTTATTCGAACAACGACGACACGGTTTTTAAA
CTAGACCGTCCCGGTTTGTTTTACTTCATCAGCGGTATATCGGGCCACTGCGAAAAGGGT
CAGAAGATGATCATCAAAGTTATGGAGACTGAGTCTACGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCG
TCCACTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCCCCCGGCGTCGACTCACAAAAAGAGCAAT
GCCTTGAAAACAACAGTCCAGTTCATTGGTTCCTGTTTTGTCGTCTTTGCGATCATGGCT
ATTTCTGTTTTTGGTTTGGTTTAGTTAAAGCAGATTTTCGACCGGTTTAGCGTTTTGTTC
TCTTTAGGTTCTTCATTTTTAGGCACTCACTCTTCCGAATAAACACATTGATTTATGTTT
CAATCAAAATATGTTTTCCCATTTTCTTGTAGCCTCATTATTTATATGGATCTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4FK58TF 539 0 0
G
GACTCATGGTGATGTGTTTAACCAATGGGCTTCACACAATCGCTTTAAAGTTGACGATAC
TATCCGTTTCAAGTACAACAAAGACTCGGTGTTAGTTGTATCAGAAGACGAGTACAAAAA
ATGCAAAGCTACTAAACCGCAGTTTTATTCGAACAACGACGACACGGTTTTTAAACTAGA
CCGTCCCGGTTTGTTTTACTTCATCAGCGGTATATCGGGCCACTGCGAAAAGGGTCAGAA
GATGATCATCAAAGTTATGGAGACTGAGTCTACGCCAGATTCTCCTCCTCCTTCGTCCAC
TCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCCCCCGGCGTCGACTCACAAAAAGAGCAATGCCTT
GAAAACAACAGTCCAGTTCATTGGTTCCTGTTTTGTCGTCTTTGCGATCATGGCTATTTC
TGTTTTTGGTTTGGTTTAGTTAAAGCAGATTTTTGACCGGTTTAGCGTTTTGTTCTCTTT
AGGTTCTTCATTTTTAGGCACTCACTCTTCCGAATAAACACATTGATTTATGTTTCAA

QA 2 539 2 539
DS 

RD RR4AX77TF 376 0 0
GTCAGAAGATGATCATCAAAGTTATGGAGACTGAGTCTACGCCAGATTCTCCTCCTCCTT
CGTCCACTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCCCCCGGCGTCGACTCACAAAAAGAGCA
ATGCCTTGAAAACAACAGTCCAGTTCATTGGTTCCTGTTTTGTCGTCTTTGCGATCATGG
CTATTTCTGTTTTTGGTTTGGTTTAGTTAAAGCAGATTTTTGACCGGTTTAGCGTTTTGT
TCTCTTTAGGTTCTTCATTTTTAGGCACTCGGTCTTCCGAATAAACACATTGATTTATGT
TTCAATCAAAATATGTTTTCCCATTTTCTTGTAGCCTCATTATTTATATGGATCTTTACG
GTTTCCTTATGTGCCT

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 3

CO CL4131Contig1 828 3 12 U
GGGTAAAAAGGGAAAGGAAGGAATCAGATGTTGGTGCGCTTACCAGTAGCAGCTGCAGGC
TCCGTCGTTGTCTATCTTCATCGGCGAATCACCACCGCTTGTCTGCTATCCACGAAGAGC
TCGATGACTTCGGGTTCCTCTGGTGCCGCCTTCACGACCATCAAAGAAACCGTATCCTTA
GAGAAAGAGATTAAGAAGAGCAAATTCATCTCAATCGCCGGTCCTATCTCCTCCGAGCAG
TCGGCACAACTGTTCCTCTCCGAGGTCCGAGATCCTCGCGCTTCGCACAACTGCTGGGCT
TATAAGGTTGGTGATCAACATCGATCTAGTGATGATGGTGAGCCATCGGGCACAGCAGGA
AAGCCGATGCTGTCTGCTATTTGTTCCTCTGGATTAGACAGAGTTATGGTTGTTGTCATT
AGGTATTTTGGGGGCATCAAACTCGGAACCGGAGGTCTTGTTAGAGCATATAGTGGGGTT
ACCTCTGATTGCTTGAAAACTGCTTCAACTCGCCTTTTCAAGTCTAAAGTTCAAATGGGA
GTCGAGGTGACATTTGATCTTCTAGGTGTTGTTTACAATCAGCTGCAGTCATGCCAGGCC
GAAGACATCAAGGAAGACTATGATACTGGTAAAGATGGTACCACCATGGTTTCCTTCAAG
GTTGATTTTGACCAGGTTGATAAACTAGAGGATGCTATCAAATCAAACTGCAAACGAGAC
CTTGTCTTTTTCAAAAACCTAGCGAATGGTAGCCAACTCGGCAAAAACATTATCCAGTAA
TTGTTACAGAATACTGCCAAAAAGTAAAGCTATTTTTTGTTCTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ71TF U 201
AF RR4D517TF U 1
AF RR4CJ71JQ C 201
BS 1 210 RR4D517TF
BS 211 211 RR4CJ71TF
BS 212 377 RR4D517TF
BS 378 378 RR4CJ71TF
BS 379 471 RR4D517TF
BS 472 472 RR4CJ71TF
BS 473 491 RR4D517TF
BS 492 492 RR4CJ71JQ
BS 493 599 RR4D517TF
BS 600 600 RR4CJ71JQ
BS 601 656 RR4D517TF
BS 657 828 RR4CJ71JQ

RD RR4CJ71TF 280 0 0
G
AAATTCATCTCAATCGCCGGTCCTATCTCCTCCGAGCAGTCGGCACAACTGTTCCTCTCC
GAGGTCCGAGATCCTCGCGCTTCGCACAACTGCTGGGCTTATAAGGTTGGTGATCAACAT
CGATCTAGTGATGATGGTGAGCCATCGGGCACAGCAGGAAAGCCGATGCTGTCTGCTATT
TGTTCCTCTGGATTAGACAGAGTTATGGTTGTTGTCATTAGGTATTTTGGGGGCATCAAA
CTCGGAACCGGAGGTCTTGTTAGAGCATATAGTGGGGTT

QA 2 280 2 280
DS 

RD RR4D517TF 656 0 0
GGGTAAAAAGGGAAAGGAAGGAATCAGATGTTGGTGCGCTTACCAGTAGCAGCTGCAGGC
TCCGTCGTTGTCTATCTTCATCGGCGAATCACCACCGCTTGTCTGCTATCCACGAAGAGC
TCGATGACTTCGGGTTCCTCTGGTGCCGCCTTCACGACCATCAAAGAAACCGTATCCTTA
GAGAAAGAGATTAAGAAGAGCAAATTCATCGCAATCGCCGGTCCTATCTCCTCCGAGCAG
TCGGCACAACTGTTCCTCTCCGAGGTCCGAGATCCTCGCGCTTCGCACAACTGCTGGGCT
TATAAGGTTGGTGATCAACATCGATCTAGTGATGATGGTGAGCCATCGGGCACAGCAGGA
AAGCCGATGCTGTCTGCAATTTGTTCCTCTGGATTAGACAGAGTTATGGTTGTTGTCATT
AGGTATTTTGGGGGCATCAAACTCGGAACCGGAGGTCTTGTTAGAGCATATGGTGGGGTT
ACCTCTGATTGTTTGAAAACTGCTTCAACTCGCCTTTTCAAGTCTAAAGTTCAAATGGGA
GTCGAGGTGACATTTGATCTTCTAGGTGTTGTTTACAATCAGCTGCAGTCATGCCAGGCT
GAAGACATCAAGGAAGACTATGATACTGGTAAAGATGGTACCACCATGGTTTCCTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CJ71JQ 628 0 0
G
AAATTCATCTCAATCGCCGGTCCTATCTCCTCCGAGCAGTCGGCACAACTGTTCCTCTCC
GAGGTCCGAGATCCTCGCGCTTCGCACAACTGCTGGGCTTATAAGGTTGGTGATCAACAT
CGATCTAGTGATGATGGTGAGCCATCGGGCACAGCAGGAAAGCCGATGCTGTCTGCTATT
TGTTCCTCTGGATTAGACAGAGTTATGGTTGTTGTCATTAGGTATTTTGGGGGCATCAAA
CTCGGAACCGGAGGTCTTGTTAGAGCATATAGTGGGGTTACCTCTGATTGCTTGAAAACT
GCTTCAACTTGCCTTTTCAAGTCTAAAGTTCAAATGGGAGTCGAGGTGACATTTGATCTT
TTAGGTGTTGTTTACAATCAGCTGCAGTCATGCCAGGCCGAAGACATCAAGGAAGACTAT
GATACTGGTAAAGATGGTACCACCATGGTTTCCTTCAAGGTTGATTTTGACCAGGTTGAT
AAACTAGAGGATGCTATCAAATCAAACTGCAAACGAGACCTTGTCTTTTTCAAAAACCTA
GCGAATGGTAGCCAACTCGGCAAAAACATTATCCAGTAATTGTTACAGAATACTGCCAAA
AAGTAAAGCTATTTTTTGTTCTTAGCT

QA 2 628 2 628
DS 



AS 1 3

CO CL4132Contig1 745 3 14 U
GGGTTCACTCTCATTCAACAGATTCCATCTTCTCTGATCATCTCTCTCTGTTTCTTCTGT
CTTACGGAGAAATGGCAGTAATCAACAGCCTCCGAAGGTTGGCTCGTTCCTCTCAGGTTA
CTTTGCAGAGCAAGTATGCTGCTTCACAATATACGTCTGGTTCGAGGATCTTTACTACAG
AGGCTTCACCCCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCTAAGGGGCATGATATGCTGGCACCTT
TTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCCTTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAA
GTTATGTGTATGATGACCATGGCAAAAAGTATCTTGATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTA
CTGCCTTGGGAGGAAATGAGCCACGGCTTGTTTCTGCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACCT
TGCCCTTTTATCACTCCTTCTGGAACCGTACTACTAAGCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGG
ATCTTCTAGACATGTTCACGGCCAATAAAATGGCTAAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGAT
CAGAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTGGTTTGGTACTACAATAACGCACTTGGAAGGC
CTGAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAGAAAGAAATCGTACCATGGCTCCACTCTAATATCAG
CAAGTCTGTCCCGCCTTCCAGCACTGCACCAAAACTTTGATTTACCAGCACCATTTGTGC
TACACACAGATTGCCCTCACTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H649TF U 201
AF RR4GI12TF U 1
AF RR4DN56TF U 26
BS 1 313 RR4GI12TF
BS 314 314 RR4H649TF
BS 315 334 RR4GI12TF
BS 335 335 RR4H649TF
BS 336 388 RR4GI12TF
BS 389 389 RR4H649TF
BS 390 541 RR4GI12TF
BS 542 542 RR4DN56TF
BS 543 678 RR4GI12TF
BS 679 679 RR4DN56TF
BS 680 711 RR4GI12TF
BS 712 712 RR4DN56TF
BS 713 730 RR4GI12TF
BS 731 745 RR4DN56TF

RD RR4H649TF 303 0 0
ACCATAGTTGGGTCTAAGGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAGT
GCTGATTTACATCCCTTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCAT
GGCAAAAAGTATCTTGATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTGGGAGGAAATGAG
CCACGGCTTGTTTCTGCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACCTTGCCCTTTTATCACTCCTTC
TGGAACCGTACGACTAAGTCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGATCATCTAGACATGTTCAC
TGCT

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4GI12TF 733 0 0
GGGTTCACTCTCATTCAACAGATTCCATCTTCTCTGATCATCTCTCTCTGTTTCTTCTGT
CTTACGGAGAAATGGCAGTAATCAACAGCCTCCGAAGGTTGGCTCGTTCCTCTCAGGTTA
CTTTGCAGAGCAAGTATGCTGCTTCACAATATACGTCTGGTTCGAGGATCTTTACTACAG
AGGCTTCACCCCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCTAAGGGGCATGATATGCTGGCACCTT
TTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCCTTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAA
GTTATGTGTATGACGACCATGGCAAAAAGTATCTCGATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTA
CTGCCTTGGGAGGAAATGAGCCACGGCTAGTTTCTGCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACCT
TGCCCTTTTATCACTCCTTCTGGAACCGTACTACTAAGCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGG
ATCTTCTAGACATGTTCACGGCCAATAAAATGGCTAAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGAT
CTGAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTGGTTTGGTACTACAATAACGCACTTGGAAGGC
CTGAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAGAAAGAAATCGTACCATGGCTCCACTCTAATATCAG
CAAGTCTGTCCCGCCTTCTAGCACTGCACCAAAACTTTGATTTACCAGCACTATTTGTGC
TACACACAGA
CTG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4DN56TF 720 0 0
CATCTTCTCTGATCATCTCTCTCTGTTTCTTCTGTCTTACGGAGAAATGGCAGTAATCAA
CAGCCTCCGAAGGTTGGCTCGTTCCTCTCAGGTTACTTTGCAGAGCAAGTATGCTGCTTC
ACAATATACGTCTGGTTCTAGGATCTTTACTACAGAGGCTTCACCCCAGAAGCAGACCAT
AGTTGGGTCTAAGGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGA
TTTACGTCCCTTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCATGGCAA
AAAGTATCTTGATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTAGGAGGAAATTAGCCACG
GCTTGTTTCTGCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACTTTGCCCTTTTATCACTCCTTCTGGAA
CCGTACTACTAAGCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGATCTTCTAGACATGTTCACGGCTAA
TAAAATGGCTAAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCAGAGGCCAATGATACCCAGGTCAA
GCTTGTTTGGTACTACAATAACGCACTTGGGAGGCCTGAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAG
AAAGAAATCGTACCATGGCTCCACTCTAATATCAGCAAGTTTGTCCGGCCTTCCAGCTCT
GCAC*AAAACTTTGATTTACCAGCACCATTTGTGCTACACACAGATTGCCCTCACTATTG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 3

CO CL4133Contig1 698 3 3 U
GGAAGGATAAACCATAGCCTAACATTTTACCACCCACCAAAAAACAGAGAGAGAGAGATG
AGAGGGCGTGAGCCACGGTCAAGCTCCTCTTGTGCAGCTTGCAAGCTCTTGAAGAGAAGA
TGCACACCCACTTGCATCTTCGCTCCTCATTTCCGCTCGACCGACCAGATGACTTTCGCC
AAAGTCCATAAAGTCTTTGGAGCCAGCAACGTCAGTAAGCTTCTCAGCGAGGTTCCCGAA
GAACAGAGACAAGAAACCGTCAACTCCTTGGCTTACGAAGCTGACGTCCGTCTCAAGGAT
CCTGTTTACGGTTGTATTGGAGCCATAGCTTCTCTGCAGAAGAAGATGCTTGAGCTTCAA
CATGATATAGCCGTTGCTCGCAGTCGACTACTTAGTGCCCATAATAATGCTGGTGGTGGT
GGTGTCAACAACAACAACAACAGCAACCACGTGTCGTCGTCCCCTTTGGTAGATGATTCT
TCTACTCAGCTTGCTGCTTTTCTTGATCTTGTACCTTCTTATAGTGACTTGATGTTGCTT
GATGGGTCTGGTCTTGATGCTTACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTTTGTATAGGCC
TCGCTTTATCTCTTTTATCCACTGTATTTGCACTTGCTAATAAGTCATCTTCACTAATGT
ATTATTAATCCTAATATGCAAAATCATTTGCTTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EZ83TF U 1
AF RR4AG68JQ C 110
AF RR4AG68TF U 110
BS 1 438 RR4EZ83TF
BS 439 441 RR4AG68TF
BS 442 698 RR4EZ83TF

RD RR4EZ83TF 698 0 0
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AGAGGGCGTGAGCCACGGTCAAGCTCCTCTTGTGCAGCTTGCAAGCTCTTGAAGAGAAGA
TGCACACCCACTTGCATCTTCGCTCCTCATTTCCGCTCGACCGACCAGATGACTTTCGCC
AAAGTCCATAAAGTCTTTGGAGCCAGCAACGTCAGTAAGCTTCTCAGCGAGGTTCCCGAA
GAACAGAGACAAGAAACCGTCAACTCCTTGGCTTACGAAGCTGACGTCCGTCTCAAGGAT
CCTGTTTACGGTTGTATTGGAGCCATAGCTTCTCTGCAGAAGAAGATGCTTGAGCTTCAA
CATGATATAGCCGTTGCTCGCAGTCGACTACTTAGTGCCCATAATAATGCTGGTGGTGGT
GGTGTCAACAACAACAAC***AGCAACCACGTGTCGTCGTCCCCTTTGGTAGATGATTCT
TCTACTCAGCTTGCTGCTTTTCTTGATCTTGTACCTTCTTATAGTGACTTGATGTTGCTT
GATGGGTCTGGTCTTGATGCTTACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTTTGTATAGGCC
TCGCTTTATCTCTTTTATCCACTGTATTTGCACTTGCTAATAAGTCATCTTCACTAATGT
ATTATTAATCCTAATATGCAAAATCATTTGCTTACTTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AG68JQ 584 0 0
G
GAAGAGAAGATGCACACCCACTTGCATCTTCGCTCCTCATTTCCGCTCGACCGACCAGAT
GACTTTCGCCAAAGTCCATAAAGTCTTTGGAGCCAGCAACGTCAGTAAGCTTCTCAGCGA
GGTTCCCGAAGAACAGAGACAAGAAACCGTCAACTCCTTGGCTTACGAAGCTGACGTCCG
TCTCAAGGATCCTGTTTACGGTTGTATTGGAGCCATAGCTTCTCTGCAGAAGAAGATGCT
TGAGCTTCAACATGATATAGCCGTTGCTCGCAGTCGACTACTTAGTGCCCATAATAATGC
TGGTGGTGGTGGTGTCAACAACAACAACAACAGCAACCACGTGTCGTCGTCCCCTTTGGT
AGATGATTCTTCTACTCAGCTTGCTGCTTTTCTTGATCTTGTACCTTCTTATAGTGACTT
GATGTTGCTTGATGGGTCTGGTCTTGATGCTTACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTT
TGTATAGGCCTCGCTTTATCTCTTTTATCCACTGTATTTGCACTTGCTAATAAGTCATCT
TCACTAATGTATTATTAATCCTAATATGCAAAATCATTTGCTT

QA 2 584 2 584
DS 

RD RR4AG68TF 584 0 0
G
GAAGAGAAGATGCACACCCACTTGCATCTTCGCTCCTCATTTCCGCTCGACCGACCAGAT
GACTTTCGCCAAAGTCCATAAAGTCTTTGGAGCCAGCAACGTCAGTAAGCTTCTCAGCGA
GGTTCCCGAAGAACAGAGACAAGAAACCGTCAACTCCTTGGCTTACGAAGCTGACGTCCG
TCTCAAGGATCCTGTTTACGGTTGTATTGGAGCCATAGCTTCTCTGCAGAAGAAGATGCT
TGAGCTTCAACATGATATAGCCGTTGCTCGCAGTCGACTACTTAGTGCCCATAATAATGC
TGGTGGTGGTGGTGTCAACAACAACAACAACAGCAACCACGTGTCGTCGTCCCCTTTGGT
AGATGATTCTTCTACTCAGCTTGCTGCTTTTCTTGATCTTGTACCTTCTTATAGTGACTT
GATGTTGCTTGATGGGTCTGGTCTTGATGCTTACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTT
TGTATAGGCCTCGCTTTATCTCTTTTATCCACTGTATTTGCACTTGCTAATAAGTCATCT
TCACTAATGTATTATTAATCCTAATATGCAAAATCATTTGCTT

QA 2 584 2 584
DS 



AS 1 2

CO CL4134Contig1 1131 2 4 U
GGGCAACGAGAGTGTTGTTGTAAAAGGGATGGCAGGTCGGTACGATCGGAACCCCTTCGC
CGAAGGAGACGAAGTCAATCCTTTTGCTAATCCTGGAAGTGCACCCGCTGCTTCGAGTTC
CGGACTATCGCCTCTGCCTCCGGAGCCTGCTGGTTTCGGTTATGGTCGCACCGTTGACGT
TCCTCTTGACAGACCTGCTGGGTCTGGTGCAAAGGATCTGAAGAAGAAAGAGAAGGAGCT
TCAAGCCAAAGAAGCTGAGCTTAAACGACGCGAGCAGGATATCAAACGGAAAGAGGATGC
TGCTGCACGAGCCGGAATTGTAATCGAAGTGAAAAACTGGCCGCCCTTGTTCCCTCTTAT
CCACCATGACATTGCAAATGAAATTCCCATTCCTCTCCAAAGGCTTCAGTATATTGCTTT
TTCTACTTATTTGGGGTTGGTTCTTGCACTTTTCTGGAACATCATCGCCGTTACTACAGC
TTGGATCAAAGGAGAAGGAGTAACGATTTGGCTTCTTGCTCTTATTTACTTCATCTCCGG
TGTCCCCGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGTCCTCTCTACCGTGCCTTCAGAAATGAGAG
CGTATTGAGCTTTGGATGGTTTTTCTTGTTCTACATGCTCCACATAGCTTTCTGCGTCTT
TGCTGCAGTTGCTCCTCCTATTTTCTTCAAAGGAAACTCACTTGCGGGAATATTACCTGC
GTTAGATATGTTGAGCAGTCAGGCATTGGTCGGAATCTTCTACTTCATCGGGTTTGCATT
TTTTCTGCCTTGAATCAGTGGTCAGCATCTGGGTTATTCAGGTCTCTTTCCTTGTCTTTA
GAAACCGAAAAGATATAGTCTCTGCATCGGTATCGTTTTCCGAGGTAAGGGACTCTTTTA
ACACTTGAAATGGCCAATTTTACGTGTGCAGCAAGTATACATGTACTTCCGAGGGAGCGG
GAAAGCAGATGAGATGAAAAGGGATGCTGCAAGAGGAGCCATGAGAGCTGCCATATGATG
CACAGATGATTTGAACTCATGATCTCTCCTGAAGCCATGGGTTGTGATGTGTAACTTTTT
TACATTCTTCACTCTTTCACCTTTTTTGTTTTGTTTTTACAGCAGCAAACT


BQ
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AF RR4AT83TF U 1
AF RR4CB16TF U 456
BS 1 593 RR4AT83TF
BS 594 594 RR4CB16TF
BS 595 738 RR4AT83TF
BS 739 1131 RR4CB16TF

RD RR4AT83TF 738 0 0
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CGAAGGAGACGAAGTCAATCCTTTTGCTAATCCTGGAAGTGCACCCGCTGCTTCGAGTTC
CGGACTATCGCCTCTGCCTCCGGAGCCTGCTGGTTTCGGTTATGGTCGCACCGTTGACGT
TCCTCTTGACAGACCTGCTGGGTCTGGTGCAAAGGATCTGAAGAAGAAAGAGAAGGAGCT
TCAAGCCAAAGAAGCTGAGCTTAAACGACGCGAGCAGGATATCAAACGGAAAGAGGATGC
TGCTGCACGAGCCGGAATTGTAATCGAAGTGAAAAACTGGCCGCCCTTGTTCCCTCTTAT
CCACCATGACATTGCAAATGAAATTCCCATTCCTCTCCAAAGGCTTCAGTATATTGCTTT
TTCTACTTATTTGGGGTTGGTTCTTGCACTTTTCTGGAACATCATCGCCGTTACTACAGC
TTGGATCAAAGGAGAAGGAGTAACGATTTGGCTTCTTGCTCTTATTTACTTCATCTCCGG
TGTCCCCGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGTCCTCTCTACCGTGCCTTCAGAA*TGAGAG
CGTATTGAGCTTTGGATGGTTTTTCTTGTTCTACATGCTCCACATAGCTTTCTGCGTCTT
TGCTGCAGTTGCTCCTCCTATTTTCTTCAAAGGAAACTCACTTGCGGGAATATTACCTGC
GTTAGATATGTTGAGCAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4CB16TF 676 0 0
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TTGCTCTTATTTACTTCATCTCCGGTGTCCCCGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGTCCTC
TCTACCGTGCCTTCAGAAATGAGAGCGTATTGAGCTTTGGATGGTTTTTCTTGTTCTACA
TGCTCCACATAGCTTTCTGCGTCTTTGCTGCAGTTGCTCCTCCTATTTTCTTCAAAGGAA
ACTCACTTGCGGGAATATTACCTGCGTTAGATATGTTGAGCAGTCAGGCATTGGTCGGAA
TCTTCTACTTCATCGGGTTTGCATTTTTTCTGCCTTGAATCAGTGGTCAGCATCTGGGTT
ATTCAGGTCTCTTTCCTTGTCTTTAGAAACCGAAAAGATATAGTCTCTGCATCGGTATCG
TTTTCCGAGGTAAGGGACTCTTTTAACACTTGAAATGGCCAATTTTACGTGTGCAGCAAG
TATACATGTACTTCCGAGGGAGCGGGAAAGCAGATGAGATGAAAAGGGATGCTGCAAGAG
GAGCCATGAGAGCTGCCATATGATGCACAGATGATTTGAACTCATGATCTCTCCTGAAGC
CATGGGTTGTGATGTGTAACTTTTTTACATTCTTCACTCTTTCACCTTTTTTGTTTTGTT
TTTACAGCAGCAAACT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 3

CO CL4135Contig1 1046 3 5 U
GATCTCCACGAATCCCTAAAACTGAAAAAAATCTCGAAAACCTAGCTGTCTTGTGTACTA
TCTTAGGGAATGGATAGTGATTTGGATGCTATGAGAGATCGAAGAAGCCGGAGCGTTAGG
ATTTTAGTTAAGGGATATGACACTTCCCTTCATGTGGATGTTGTCAAGAGCCAGTTAACT
AAACACTTCTCTTCATGTGGAGAGGTTGTGTGTGTTTCTATCCCCTATTTCGCTATAGAC
GGTGCTCCCAACAGATCTGGCTATATATATATTTTGGGAGACGGCGCAGAAGAGAAGGCA
CTGCAACTTAGTGGAAGTGAGATGGAAGGACGCAAAATAGTTGCTACTTCAACTCACGAG
GTGTTCCTTAAACTCACTCCTGAAATGACTGCTAGGTTGGCCGAGGCAGAACGAGTTTGT
GATGGCAAAATGATTATCGTTAGAGGATATGACACTTCGCTTCCTGCTGCTGATATCAAG
ACCTTCTTGACCAACCGTTTCTCTTCATGCGGAGAGATTGTTGATTTTCAGTTATTCCCC
*GTAGAACATCATCCCAGTCAAGATCACCAAGCCATCATTTCTATTCTGGGAGAAAGTGC
AGAAGAGAAGGCCCTGGAACTTAATGGGAGTGACATGGGAGGAGGATTCAAACTAGTTGT
TGTGCCTGCTTTAAAACCCGTGGGAAACAGCCCCATTCCTGTCGATGATGCTTTCCCACG
TGGCTTCATGATCCCAGCTCGGGTTGCCAACCCCAAGAAGACGAGCCGTTACAAGATGAA
GAAGAAGAAGGCCAACCGTAAGAAGGCTTGGAAGTAGAAAGCCTATTCTCAACTGGTGAT
GCACTGCAATCCTACTTTTGTCTCTCTTTATGCGATATATCGTCCGGCACCTTTAACATT
ATCACACTTGTCTTGTCTTATATGTTTGTCCCGATGTTAAAACTCAGTACTCATGACCTG
TTCCTGTTTCATTGAGTCGTTTGTCCGATTTGCGGCTAACTCGAATAATGTTGTGATGGA
AAAAAAGGATTTTATTTTTGCCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DF63TF U 1
AF RR4EY82TF U 73
AF RR4EY82JQ C 231
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BS 612 641 RR4EY82TF
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GGATATGACACTTCCCTTCATGTGGATGTTGTCAAGAGCCAGTTAACTAAACACTTCTCT
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CCTGGAACTTAATGGGAGTGACATGGGAG
AGG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4EY82JQ 816 0 0
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CTTTCCCACGTGGCTTCATGATCCCAGCTCGGGTTGCCAACCCCAAGAAGACGAGCCGTT
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AACTGGTGATGCACTGCAATCCTACTTTTGTCTCTCTTTATGCGATATATCGTCCGGCAC
CTTTAACATTATCACACTTGTCTTGTCTTATATGTTTGTCCCGATGTTAAAACTCAGTAC
TCATGACCTGTTCCTGTTTCATTGAGTCGTTTGTCCGATTTGCGGCTAACTCGAATAATG
TTGTGATGGAAAAAAAGGATTTTATTTTTGCCTTAT

QA 1 816 1 816
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4137Contig1 1516 3 7 U
CCCCTCAACTCTATTAGCTTTTTTTTATTGCAAAAAAAAAAAAAAAATGTTTTACATAAT
AAAAAAAAAAATTAGTTTTCTGTATACATCAACATTTGAGAGCAGGGTTCACAATAAAGC
TTTATGATCAAACCCAGTACATGAAAAGTTCCCTATATATATGTATGTATATATGAGTTC
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CCTCAGCCAACTGTCTGCGGCTTGGAAAAGGGAGTTCACTAGCTGGTTCCCAAAGCCCTT
GATGCTTGTCCATACTGAACCTCTCAACTTGTATGAGGCAAGGCCAAAGATAGGCAGCGT
TGTCTTCTCCCTTGGCTGCACCTCCTCACACATAGACTGTGTTGTAACGCCTACACCTTG
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TCCTGTGGGTATTTTGTAAATAGGGTACCAAGCCACAGAAAACCAGCTTGAGGGTAGTAA
ATCACAGCTTCTCAGCGTCTTCAGCTCGGGAAATCTAGAAGCGAGGTCAGACATCTTGTC
GGCAAAGGGTTCACGGATGTAAGGAAGATCACGTTCGAGATACTCGAATATCAAACGGCT
TTGAGAGCTTCTTAAAGGCTCGTCGCCATCATCATCACTGGAGGACGAGTCTTCCGGATG
CTCCTTTTGGTCCATACTAGCTGTAGAGATCATCTGATCTTTTGGATCTCTTTCTGATTC
GCTGCTGCTGCTTCCTTCGCTGCTAGAATCCTTGAAATCGCTGCTGTCGCTCTCCTCACC
TACCCGCCTTGGTTGAAGAAAAGAGCTTAAGGTATGAGAAGGAAGAGCGTAGATTTGGAT
AGCGGAGAGAGAAGGAACGTAGTATTGGATGACACGATCCTTGTAGTTATTCAAAGAGAG
AGGAACTCCAGTGCCGTAAGCACTCCACTCTGCAAACGATCCCCATACATCTCCAAGAAC
AAAGTAAGGAGGAGGAGGCTGCAACAACTCAACCACATCACTCCCTCTCTTTTCACTTCG
ATTAAGCTTGGAGTTGGAGAGATAGTGGTGGTGAGCAGGCACAGATGGTGTGACCGACTC
CAAAAACCGTTCTACATTACTTGTTACTGTCGAATCCTCCAATGCAGACCCGTTGTTGTC
GCGTTCTTGGCTGTGAATCGATCTGACGACGCTCTGAGCTTTATTATGCAGCTTAGTCAA
CTGATACCCACCAGCTCCCAACATCTCTTCTTCTTCACTCACACACACACCACAGAACAG
ACGATGCAAGCAACACTCGTCCCACTGGTCGTACGAAGGGGATTTAAAATTGAGAGGATT
TTTTTCACGAGTTTTAAACACGATTGAAGCAAATGAGGAGAAAGAGAGATTTTTGGATTC
GGACAAAATTAAGTCC


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AF RR4CG21JQ U 1
AF RR4DM18JQ U 65
AF RR4DM18TF C 736
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BS 290 290 RR4DM18JQ
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AAAAAAAAAAATTAGTTTTCTGTATACATCAACATTTGAGAGCAGGGTTCACAATAAAGC
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CTCAGGACAGTAATTATAAAGAGTTCCTACATCTTTTCTCGTCATAATAATCACACCTAT
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CCTCAGCCAACTGTCTGCGGCTTGGAAAAGGGAGTTCACTAGCTGGTTCCCAAAGCCCTT
GATGCTTGTCCATACTGAACCTCTCAACTTGTATGAGGCAAGGCCAAAGATAGGCAGCGT
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DS 

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AAG
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TCAAACCCAGTACATGAGAAGTTCCCTATATATATGTATGTATATATGAGTTCCTCAGGA
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GTCCATACTGAACCTCTCAACTTGTATGAGGCAAGGCCAAAGATAGGCAGCGTTGTCTTC
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CTTCTCAGCGTCTTCAGCTCGGGAAATCTAGAAGCGAGGTCAGACATCTTGTCGGCAAAG
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CTTCTTAAAGGCTCGTCGCCATCATCATCACTGGAGGACGAGTCTTCCGGATGCTCCTTT
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TCACTACCCG

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DS 

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AATCGATCTGACGACGCTCTGAGCTTTATTATGCAGCTTAGTCAACTGATACCCACCAGC
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CTCGTCCCACTGGTCGTACGAAGGGGATTTAAAATTGAGAGGATTTTTTTCACGAGTTTT
AAACACGATTGAAGCAAATGAGGAGAAAGAGAGATTTTTGGATTCGGACAAAATTAAGTC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

CO CL4138Contig1 1461 3 9 U
GGAATCTTTGCACTTCGCGTCTATCTCCAAAACCCTTCTCTCTCTTTACTCCGTTTTCTC
TCTCTTCCTCTCTCTTCCCTCGTGTGTGAAACCTAAGAAGAAAACCATGACTAAGAATAA
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ACGCTTTGAAGATGCTGATGAAATCGAAGTCGCAGAAGGCTCCGGTCTGGAAGCCGGACA
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CAGCGCCGATTACTACTTCGATTCCTACTCTCACTTCGGAATTCATGAAGAGATGTTGAA
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GGACAAAATTGTTCTTGATGTTGGAGCTGGGACAGGAATCTTGCCTCTCTTCTGTGCCAA
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GATTGTTAAAGCCAATGGCTTTTCTGATGTGATAACGGTTTTGAAAGGAAAGATTGAGGA
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GTTGTTTGAAAATATGTTGGACAGTGTCCTCTACGCTCGTAATAAATGGCTTGTTGATGG
CGGGATTATGCTGCCAGACAAAGCCTCTCTGTTTCTTACAGCAATTGAGGATTCAGAGTA
TAAAGAAGACAAAATTGAATTTTGGAACAGTGTGTATGGTTTTGACATGTCATGCATCAA
GAAAAAAGCTATGATGGAACCACTTGTTGACACAGTCGACCAAAACCAGATTGTCACCGA
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AGCTCCCTTTAAACTCGTTGCACAACGCAATGACTACATCCACGCCCTTGTAGCCTACTT
TGATGTATCATTCACCATGTGCCACAAGCTCCTTGGTTTCTCAACAGGACCGAGATCCCG
GGCTACGCACTGGAAACAAACAGTCATGTACCTTGAAGATGTGTTAACTATATGTGAGGG
TGAGACGATCACTGGAAGCATGTCTGTTTCGTATAACAAGAAGAATCCTAGAGACGTTGA
CATAAAGCTAAGCTATTCTTTGAATGGCCAGCACTCCAAAGTCTCAAGGACCCAACACTA
CAAAATGCGTTGAAGTTCTTTCAGAAGAACTTTAAATTTGCAGCTGAAACTGAGAAGATG
CCATTCTCAAATTGTGATGTGATATTAGTTTTTGTATTTTTCCTTTTCCAGTTTTGCAAC
ATTGCCTTTGCTTCACACTGCAACACTTTTTTTCCGAGTTGAATTTATGATTTTGCTATA
AGCTAATTTCTTGTGTTACAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH50TF U 1
AF RR4A991TF U 387
AF RR4A991JQ C 665
BS 1 463 RR4CH50TF
BS 464 464 RR4A991TF
BS 465 576 RR4CH50TF
BS 577 577 RR4A991TF
BS 578 671 RR4CH50TF
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BS 674 696 RR4CH50TF
BS 697 1226 RR4A991TF
BS 1227 1461 RR4A991JQ

RD RR4CH50TF 700 0 0
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TCTCTTCCTCTCTCTTCCCTCGTGTGTGAAACCTAAGAAGAAAACCATGACTAAGAATAA
CAACAACAACAACAAGGAAGAGGAGTTTATCAGCTTCGGACACAACCTGAACACGAAGAT
ACGCTTTGAAGATGCTGATGAAATCGAAGTCGCAGAAGGCTCCGGTCTGGAAGCCGGACA
AGATGAATCCATGTGCGACGCAGGAGAGAGCAACGATGCTGAAGTCACTGATGATACCAC
CAGCGCCGATTACTACTTCGATTCCTACTCTCACTTCGGAATTCATGAAGAGATGTTGAA
GGATGTAGTGAGAACAAAGACTTATCAGAATGTAATTTACCAAAACAAGTTTCTCATCAA
GGACAAAATTGTTCTTGATGTTGGAGCTGGGACAGGAATCTTGTCTCTCTTCTGTGCCAA
GGCTGGAGCTAAACATGTCTATGCTGTTGAGTGTTCTCAAATGGCTGACATGGCAAAGGA
GATTGTTAAAGCCAATGGCTTTTCTGATGTGATAACTGTTTTGAAAGGAAAGATTGAGGA
GATAGAGCTTCCCACTCCTAAAGTGGATGTGATTATATCTGAATGGATGGGCTACTTTTT
GTTGTTTGAAAC*ATGTTGGACAGTGTCCTCTACGC
CGTA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4A991TF 840 0 0
G
GAATGTAATTTACCAAAACAAGTTTCTCATCAAGGACAAAATTGTTCTTGATGTTGGAGC
TGGGACAGGGATCTTGCCTCTCTTCTGTGCCAAGGCTGGAGCTAAACATGTCTATGCTGT
TGAGTGTTCTCAAATGGCTGACATGGCAAAGGAGATTGTTAAAGCCAATGGCTTTTCTGA
TGTGATAACGGTTTTGAAAGGGAAGATTGAGGAGATAGAGCTTCCCACTCCTAAAGTGGA
TGTGATTATATCTGAATGGATGGGCTACTTTTTGTTGTTTGAAAATATGTTGGACAGTGT
CCTCTACGCTCGTAATAAATGGCTTGTTGATGGCGGGATTATGCTGCCAGACAAAGCCTC
TCTGTTTCTTACAGCAATTGAGGATTCAGAGTATAAAGAAGACAAAATTGAATTTTGGAA
CAGTGTGTATGGTTTTGACATGTCATGCATCAAGAAAAAAGCTATGATGGAACCACTTGT
TGACACAGTCGACCAAAACCAGATTGTCACCGATAGTAAGCTACTTAAGACAATGGATAT
CTCGAAGATGTCTTCTGGTGATGCTTCCTTCACAGCTCCCTTTAAACTCGTTGCACAACG
CAATGACTACATCCACGCCCTTGTAGCCTACTTTGATGTATCATTCACCATGTGCCACAA
GCTCCTTGGTTTCTCAACAGGACCGAGATCCCGGGCTACGCACTGGAAACAAACAGTCAT
GTACCTTGAAGATGTGTTAACTATATGTGAGGGTGAGACGATCACTGGAAGCATGTCTGT
TTCGTATAACAAGAAGAATCCTAGAGACGTTGACATAAAGCTAAGCTATTCTTTGAATG

QA 2 840 2 840
DS 

RD RR4A991JQ 797 0 0
TTTGAAAATATGTTGGACAGTGTCCTCTACGCTCGTAATAAATGGCTTGTTGATGGCGGG
ATTATGCTGCCAGACAAAGCCTCTCTGTTTCTTACAGCAATTGAGGATTCAGAGTATAAA
GAAGACAAAATTGAATTTTGGAACAGTGTGTATGGTTTTGACATGTCATGCATCAAGAAA
AAAGCTATGATGGAACCACTTGTTGACACAGTCGACCAAAACCAGATTGTCACCGATAGT
AAGCTACTTAAGACAATGGATATCTCGAAGATGTCTTCTGGTGATGCTTCCTTCACAGCT
CCCTTTAAACTCGTTGCACAACGCAATGACTACATCCACGCCCTTGTAGCCTACTTTGAT
GTATCATTCACCATGTGCCACAAGCTCCTTGGTTTCTCAACAGGACCGAGATCCCGGGCT
ACGCACTGGAAACAAACAGTCATGTACCTTGAAGATGTGTTAACTATATGTGAGGGTGAG
ACGATCACTGGAAGCATGTCTGTTTCGTATAACAAGAAGAATCCTAGAGACGTTGACATA
AAGTTAAGCTATTCTTTGAATGGCCAGCACTCCAAAGTCTCAAGGACCCAACACTACAAA
ATGCGTTGAAGTTCTTTCAGAAGAACTTTAAATTTGCAGCTGAAACTGAGAAGATGCCAT
TCTCAAATTGTGATGTGATATTAGTTTTTGTATTTTTCCTTTTCCAGTTTTGCAACATTG
CCTTTGCTTCACACTGCAACACTTTTTTTCCGAGTTGAATTTATGATTTTGCTATAAGCT
AATTTCTTGTGTTACAG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4140Contig1 1024 3 12 U
TTCGTATAAAGGAAGCCCTAGTCGAGTCTCTGTTTCTAGCTTAGGTTTGGTTTCAGAGGA
AGGAAGGAAGGAACGAAGATCAAATCGAAGAGGGGTTTCATTAGGAGGAAGGAAGGATGT
ATCGTGACAAAAAGGGAGAAGCCTTTGTCTCTGATCGCCGAAGTAAATTGTATGAGATGG
TGGATGATCCTTCAACAGATTCAATAGTTTCGTGGAGCGAGAGCGGAAAGAGTTTCATCG
TTTGGGATGACGTGGAGTTTAGAAAAGCTCTTCTTCTTCCCGGAGGGTGCCTTGGATACT
TGGGCTCTTCACAATCTCAATCTCATGAGCATTGCGAATACGCATGCCCTTATTTTATGA
GAGGCCAGCCTGACCTTAAACCGTCACAAGACAACCTCATTAGAAAGATTGAGACCGACA
ACAACAAGGGATTGGACAGTAGCAATGATGATGGACTTATTCGCTTTAGCAGCCTTTCTT
*GCTACCAAGAGATGGCTAGGCTTGCCAAGAAGGAGCGTCCCCCTTCCTCATCAATTCGA
TGCCCTCCCCCCC*TTTTCATCAGAGACGTGTACGATATGTTGGATGATCCTACAGTTGA
TTCAGTTGTCTCGTGGAGTGAGAGCGGCAAGAGTTTCGTCGTTTGGAATGAATCTAAGTT
CCTCGGAGATGTTCTTCCTAGTCGCTTACCCTTCAATTACAAAGATATGACATCCCTCAC
CACCCAGTTTCATGCCATTGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGAGCATTGGGAATACGC
ATCCGATTATTTGGTGAGAGGTCAGCCTCCCCCCCCTAAGGATAAATCCCCATGCACTCC
TGGGGGTCTTATGATTACTCCAGAACTTGCCAGACTCATCGAGAGATCCTTTGCTTGCTC
GCAAACAATAAGCTAGTTGCTCTACTCTCGTGGTTGTTGTTGTTGTCGTTTTCTTAATCG
TATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACTATTATGGTTTGTAAGATACAAAGATGGTTGATGTT
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4F472TF U 81
AF RR4AU28TF U 1
AF RR4AU28JQ C 198
BS 1 111 RR4AU28TF
BS 112 115 RR4F472TF
BS 116 155 RR4AU28TF
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BS 822 840 RR4AU28TF
BS 841 1024 RR4AU28JQ

RD RR4F472TF 557 0 0
G
AAATCGAAGAGGGGTTTCATTAGGAGGAAGGAAGGATGTATCGTGACAAAAAGGGAGAAG
CCTTTGTCTCTGATCGCCGAAGTAAATTGTATGAGATGGTGGATGATCCTTCAACAGATT
CAATAGTTTCGTGGAGCGAGAGCGGGAAGAGTTTCATCGTTTGGGATGACGTGGAGTTTA
GAAAAGCTCTTCTTCTTCCTGGAGGGTGCCTTGGATACTTGGGATTTTCACAATCTCAAT
CTCATGAGCAATGCGAATACGCATGCCCTTATTTTATGAGAGGCCAGCCTGACCTTAAAC
CGTCACAAGACGACCTCATTAGAAAGATTGAGACCGACAACAACAAGGGCTTGGACAGTA
GCAATGATGATGGACTTATTCGCTTTAGCAGCCTTTCTT*GCTACCAAGAGATGGCTAGG
CTTGCCAAGAAGGAGCGTCCCCCTTCCTCATCAATTCGATGCCCTCCCCCCC*TTTTCAT
CAGAGACGTGTACGATATGTTGGATGATCCTACAGTTGATTCCGTTGTCTCGTGGAGTGA
GAGCGGCAAGAGTTTC

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR4AU28TF 840 0 0
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AGGAAGGAAGGAACGAAGATCAAATCGAAGAGGGGTTTCATTAGGAGGAAG****GATGT
ATCGTGACAAAAAGGGAGAAGCCTTTGTCTCTGATTGCCGAAGTAAATTGTATGAGATGG
TGGATGATCCTTCAACAGATTCAATAGTTTCGTGGAGCGAGAGCGGAAAGAGTTTCATCG
TTTGGGATGACGTGGAGTTTAGAAAAGCTCTTCTTCTTCCCGGAGGGTGCCTTGGATACT
TGGGCTCTTCACAATCTCAATCTCATGAGCATTGCGAATACGCATGCCCTTATTTTATGA
GAGGCCAGCCTGACCTTAAACCGTCACAAGACAACCTCATTAGAAAGATTGAGACCGACA
ACAACAAGGGATTGGACAGTAGCAATGATGATGGACTTATTCGCTTTAGCAGCCTTTCTT
TGCTACCAAGAGATGGCTAGGCTTGCCAAGAAGGAGCGTCCCCCTTCCTCATCAATTCGA
TGCCCTCCCCCCCCTTTTCATCAGAGACGTGTACGATATGTTGGATGATCCTACAGTTGA
TTCAGTTGTCTCGTGGAGTGAGAGCGGCAAGAGTTTCGTCGTTTGGAATGAATCTAAGTT
CCTCGGAGATGTTCTTCCTAGTCGCTTACCCTTCAATTACAAAGATATGACATCCCTCAC
CACCCAGTTTCATGCCATTGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGAGCATTGGGAATACGC
ATCCGATTATTTGGTGAGAGGTCAGCCTCCCCCCCCTAAG*ATAAATCCCCATGCACTCC

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR4AU28JQ 827 0 0
GATTCAATAGTTTCGTGGAGCGAGAGCGGAAAGAGTTTCATCGTTTGGGATGACGTGGAG
TTTAGAAAAGCTCTTCTTCTTCCCGGAGGGTGCCTTGGATACTTGGGCTCTTCACAATCT
CAATCTCATGAGCATTGCGAATACGCATGCCCTTATTTTATGAGAGGCCAGCCTGACCTT
AAACCGTCACAAGACAACCTCATTAGAAAGATTGAGACCGACAACAACAAGGGATTGGAC
AGTAGCAATGATGATGGACTTATTCGCTTTAGCAGCCTTTCTT*GCTACCAAGAGATGGC
TAGGCTTGCCAAGAAGGAGCGTCCCCCTTCCTCATCAATTCGATGCCCTCCCCCCC*TTT
TCATCAGAGACGTGTACGATATGTTGGATGATCCTACAGTTGATTCAGTTGTCTCGTGGA
GTGAGAGCGGCAAGAGTTTCGTCGTTTGGAATGAATCTAAGTTCCTCGGAGATGTTCTTC
CTAGTCGCTTACCCTTCAATTACAAAGATATGACATCCCTCACCACCCAGTTTCATGCCA
TTGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGAGCATTGGGAATACGCATCCGATTATTTGGTGA
GAGGTCAGCCTCCCCCCCCTAAGGATAAATCCCCATGCACTCCTGGGGGTCTTATGATTA
CTCCAGAACTTGCCAGACTCATCGAGAGATCCTTTGCTTGCTCGCAAACAATAAGCTAGT
TGCTCTACTCTCGTGGTTGTTGTTGTTGTCGTTTTCTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTT
TGAAAACTATTATGGTTTGTAAGATACAAAGATGGTTGATGTTTTTT

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 3

CO CL4141Contig1 1015 3 5 U
GCGAAAATTTACGGTTCCATTAGAAATTTTGATTAGTATGAAAGTTTCTCGGTTCTCACA
ATGAACGAGATCATTTTTGAGTTTAATCAAATTAAATAATATCTGAGCACGAATAATAAT
TTTTCATCGAACTATTGACGATAAACATTAATTTATGATAAAAAGAGAAGTGCTTGTTGA
TTATATAATAGTAACCTTTGGGAAGATACGTAGAATCATTTCTTGAGAAATTTAGAGATT
TGGAGAAGACAACGAAGAGATTTTCCATCGCGAAGCAGCTGAAACGCATCGTTTATCTTC
TCAAATGGAAGCTCATTGGTAATAAAAGGTTCTAATTTCACAACCCCTTTCATGCATTGT
TGAGCAAAATTTGGAAGCTGAGATTTGGGCTTGAAACCACCGAATATAGAACCGGTGATT
GTGCGGCCGTCAAAAAGCTCCATTGGATGAAGGGGCAATGTTTTTGGTGTCGGATATATT
CCTACAAGCACCGTCGATCCCCAACCTGCTTGAGTGGATAAAAAGGCTTCGCGAAGAACA
TCGACGTTTCCTGTACATTCAAAGCTATAATCCACGCCTCCACTCATTAGCTCTCGAATC
CTCTCATGTACTGGCTTTGTTAAGTCTTTAGGGTTTACGAAGTCTGTTACACCCATCAGT
TTACCTTTCTCAAATTTGAAAGCATTAGCGTAAATACCAATGATCCTAGAAGCACCTCTT
GCTCTTGCACCTTCAGCAACCGCGAGTCCAACAGAACCCAATCCAAAGACAGCAGTGGTT
GTTCCTTCCTTCACATTGGCAGTGTTCCAAGCTGCTCCCACACCAGTGGAGACACCACAG
CTCAAGAGGCTCATTTGCTTGAGAGGAGCATTAGGATCGATCTTGACGACGCAAGCTGAG
TCCAAGACGGTGTATTCAGTGAACGTGGATGTGTTAAGGAAGTGATAAACGTGTTGCTTC
TGGCTCGAACCACCTTCCTTGTTTGTGGTGGTTGAGAATCTCGTCCCTCCATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4FI44JQ U 1
AF RR4GO22JQ U 125
AF RR4FI44TF C 351
BS 1 381 RR4FI44JQ
BS 382 382 RR4GO22JQ
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BS 634 850 RR4GO22JQ
BS 851 1015 RR4FI44TF

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ATGAACGAGATCATTTTTGAGTTTAATCAAATTAAATAATATCTGAGCACGAATAATAAT
TTTTCATCGAACTATTGACGATAAACATTAATTTATGATAAAAAGAGAAGTGCTTGTTGA
TTATATAATAGTAACCTTTGGGAAGATACGTAGAATCATTTCTTGAGAAATTTAGAGATT
TGGAGAAGACAACGAAGAGATTTTCCATCGCGAAGCAGCTGAAACGCATCGTTTATCTTC
TCAAATGGAAGCTCATTGGTAATAAAAGGTTCTAATTTCACAACCCCTTTCATGCATTGT
TGAGCAAAATTTGGAAGCTGAAATTTGGGCTTGAAACCACCGAATATAGAACCGGTGATT
GTGCGGCCGTCAAAAAGCTCCATTGGATGAAGGGGCAATGTTTTTGGTGTCGGATATATT
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TCGACGTTTCCTGTACATTCAAAGCTATAATCCACGCCTCCACTCATTAGCTCTCGAATC
CTCTCATGTACTGGCTTTGTTAAGTCTTTAGGG

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DS 

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ATAATAGTAACCTTTGGGAAGATACGTAGAATCATTTCTTGAGAAATTTAGAGATTTGGA
GAAGACAACGAAGAGATTTTCCATCGCGAAGCAGCTGAAACGCATCGTTTATCTTCTCAA
ATGGAAGCTCATTGGTAATAAAAGGTTCTAATTTCACAACCCCTTTCATGCATTGTTGAG
CAAAATTTGGAAGCTGAGATTTGGGCTTGAAACCACCGAATATAGAACCGGTGATTGTGC
GGCCGTCAAAA*GCTCCATTGGATGAAGGGGCAATGTTTTTGGTGTCGGATATATTCCTA
CAAGCACCGTCGATCCCCAACCTGCTTGAGTGGATAAAAAGGCTTCGCGAAGAACATCGA
CGTTTCCTGTACATTCAAAGCTATAATCCACGCCTCCACTCATTAGCTCTCGAATCCTCT
CATGTACTGGCTTTGCTAAGTCTTTAGGGTTTACGAAGTCTGTTACACCCATCAGTTTAC
CTTTCTCAAATTTGAAAGCATTAGCGTAAATACCAATGATCCTAGAAGCACCTCTTGCTC
TTGCACCTTCAGCAACCGCGAGTCCAACAGAACCCAATCCAAAGACAGCAGTGGTTGTTC
CTTCCTTCACATTGGCAGTGTTCCAAGCTGCTCCCACACCAGTGGAGACACCACAGCTCA
AGAGGC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4FI44TF 665 0 0
CATGCATTGTTGAGCAAAATTTGGAAGCTGAGATTTGGGCTTGAAACCACCGAATATAGA
ACCGGTGATTGTGCGGCCGTCAAAAAGCTCCATTGGATGAAGGGGCAATGTTTTTGGTGT
CGGATATATTCCTACAAGCACCGTCGATCCCCAACCTGCTTGAGTGGATAAAAAGGCTTC
GCGAAGAACATCGACGTTTCCTGTACATTCAAAGCTATAATCCACGCCTCCACTCATTAG
CTCTCGAATCCTCTCATGTACTGGCTTTGTTAAGTCTTTAGGGTTTACGAAGTCTGTTAC
ACCCATCAGTTTACCTTTCTCAAATTTGGAAGCATTAGCGTCAATACCAATGATCCTAGA
AGCACCTCTTGCTCTTGCACCTTCAGCAACCGCGAGTCCAACAGAACCCAATCCAAAGAC
AGCAGTGGTTGTTCCTTCCTTCACATTGGCAGTGTTCCAAGCTGCTCCCACACCAGTGGA
GACACCACAGCTCAAGAGGCTCATTTGCTTGAGAGGAGCATTAGGATCGATCTTGACGAC
GCAAGCTGAGTCCAAGACGGTGTATTCAGTGAACGTGGATGTGTTAAGGAAGTGATAAAC
GTGTTGCTTCTGGCTCGAACCACCTTCCTTGTTTGTGGTGGTTGAGAATCTCGTCCCTCC
ATCGC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL4142Contig1 1406 3 19 U
GGAAGTGAATACGTTTCAGATAGATTGATGAAGCAATATAGACCGGTTCGGTTTCTTATC
TTCCTCTTAACAATTTGTATATGCTTCGTCACAATCCATTCTCAATGCCCACCAACACTA
CCTGTGCCTCAACCAATGCCGGCACCACCACCACCACCACCTGGCCCATCTTCAAAGCCA
TGTCCACCACACGGAACATATAAATTCCCACCTGCGCCTCAACCGGTGCCATCATTAGCA
CCTTGCACATGTCCGTGTCCATCTGACCCATCTCCAAGACAAGAGCCACCAAAGAACGTT
ACCGTACCGGCATTGTTTGTGTTTGGGGATTCGCTCGTAGACACAGGAAATAACAATAAC
GTAAGCACACCTCTCAGGTGTAATTTTCGACCATATGGTATCGATTTCTTACAAGGTGTT
CCCACTGGTCGGTACTCCGATGGCAAAGTCCCTTCTGACTTTTTAGCGGAGTATTTGGGG
ATAAAATCGCTCGTACCGGCATATATGGATCCAAAATTGCAACCAGATGATTTACTCACC
GGTGTATGCTTTGCTTCGGGTGGTAGTGGTTACATTCCTTTGACACCCACATATTTGAAC
GTGATACCGATGTTGCACCAATTGGCATGTTTCCAACAATACATAGCGAGAGTGAAGAAG
TTAGTAGGACAAGAAAAGGGTGATCATATAATAGCCAATGGCTTAGCCATTGTGATCGCG
GGTAGCAACGATATGGGCATTACTTATTATGGTCCAGGTGGTCAGTGGGTCAAAGATGAT
ATTTACTCGTTTACCTCTAATATGGTTGATTCTGCCACTAGTTTTGCCATGCAATTGTAT
GGATATGGAGCAAGACATATAGGAGTGGCGGGAATGACACCACTGGGATGTATTCCAGCA
CAAAGAACTCTAAAAGGAGGTCCTCATCGAAAATGTGCTGAAGATGTTAACTATGCTGCT
CAGCTTTTCAATGCCAAACTCTCCACTGCTTTAGGTCACCTGGCTAAAACTCTACCAGAT
TCTAAATTGGTTTTCATGGACATCTATTCTCCATTCAGTCAGATTCTACAAAACCCCGCC
GATTACGGATTTGAAGTGATAAATAGAGGGTGTTGTGGAACCGGACTAGTAGAAACAGGT
CCACTTTGCAACCAAGAGACATCAACTGTGTGTAGAAATATATCTGCTTATCTGTTTTGG
GATAGTTTCCATCCATCGCAAAGATTATATGAAATCTTAACCAAAATACTTGTTAAAAAG
TACATGCCTCTGTTATTTTGAGTAGTAGATTTTTACTTGAGACTTCTTAAAAATAATTCT
GAGAGGATATAATATTTTGTATATGTATTAATCATGTTGTGCTTACGAAATGGTTGTTGT
TTATGATAGTTACCGATTGATATCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE88TF U 1
AF RR4CI47TF U 325
AF RR4CI47JQ C 622
BS 1 622 RR4GE88TF
BS 623 623 RR4CI47TF
BS 624 628 RR4GE88TF
BS 629 629 RR4CI47TF
BS 630 641 RR4GE88TF
BS 642 642 RR4CI47TF
BS 643 647 RR4GE88TF
BS 648 648 RR4CI47TF
BS 649 663 RR4GE88TF
BS 664 994 RR4CI47TF
BS 995 995 RR4CI47JQ
BS 996 1008 RR4CI47TF
BS 1009 1009 RR4CI47JQ
BS 1010 1033 RR4CI47TF
BS 1034 1034 RR4CI47JQ
BS 1035 1051 RR4CI47TF
BS 1052 1052 RR4CI47JQ
BS 1053 1064 RR4CI47TF
BS 1065 1406 RR4CI47JQ

RD RR4GE88TF 663 0 0
GGAAGTGAATACGTTTCAGATAGATTGATGAAGCAATATAGACCGGTTCGGTTTCTTATC
TTCCTCTTAACAATTTGTATATGCTTCGTCACAATCCATTCTCAATGCCCACCAACACTA
CCTGTGCCTCAACCAATGCCGGCACCACCACCACCACCACCTGGCCCATCTTCAAAGCCA
TGTCCACCACACGGAACATATAAATTCCCACCTGCGCCTCAACCGGTGCCATCATTAGCA
CCTTGCACATGTCCGTGTCCATCTGACCCATCTCCAAGACAAGAGCCACCAAAGAACGTT
ACCGTACCGGCATTGTTTGTGTTTGGGGATTCGCTCGTAGACACAGGAAATAACAATAAC
GTAAGCACACCTCTCAGGTGTAATTTTCGACCATATGGTATCGATTTCTTACAAGGTGTT
CCCACTGGTCGGTACTCCGATGGCAAAGTCCCTTCTGACTTTTTAGCGGAGTATTTGGGG
ATAAAATCGCTCGTACCGGCATATATGGATCCAAAATTGCAACCAGATGATTTACTCACC
GGTGTATGCTTTGCTTCGGGTGGTAGTGGTTACATTCCTTTGACACCCACATATTTGAAC
GTGATACCGATGTTGCACCAATCGGCATATTTCCAACAATATATAGCAAGAGTGAAGAAG
TTA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CI47TF 745 0 0
GGGGATTCGCTCGTAGACACAGGAAATAACAATAACGTAAGCACACCTCTCAGGTGTAAT
TTTCGACCATATGGTATCGATTTCTTACAGGGTGTTCCCACTGGTCGGTACTCCGATGGC
AAAGTCCCTTCTGACTTTTTAGCGGGGTATTTGGGGATAAAATCGCTCGTACCGGCATAT
ATGGATCCAAAATTGCAACCAGATGATTTACTCACCGGTGTATGCTTTGCTTCGGGTGGT
AGTGGTTACATTCCTTTGACACCCACATATTTGAACGTGATACCGATGTTGCACCAATTG
GCATGTTTCCAACAATACATAGCGAGAGTGAAGAAGTTAGTAGGACAAGAAAAGGGTGAT
CATATAATAGCCAATGGCTTAGCCATTGTGATCGCGGGTAGCAACGATATGGGCATTACT
TATTATGGTCCAGGTGGTCAGTGGGTCAAAGATGATATTTACTCGTTTACCTCTAATATG
GTTGATTCTGCCACTAGTTTTGCCATGCAATTGTATGGATATGGAGCAAGACATATAGGA
GTGGCGGGAATGACACCACTGGGATGTATTCCAGCACAAAGAACTCTAAAAGGAGGTCCT
CATCGAAAATGTGCTGAAGATGTTAACTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCCAAACTCTCC
ACTGCTTTAG*TCACCTGGCTAAA*CTCTACCAGATTCTAAATTGGTTT*CATGGACATC
TATTCTC*ATTCAGTCAGAT
CTACA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4CI47JQ 785 0 0
A
TGGCATGTTTCCAACAATACATAGCGAGAGTGAAGAAGTTAGTAGGACAAGAAAAGGGTG
ATCATATAATAGCCAATGGCTTAGCCATTGTGATCGCGGGTAGCAACGATATGGGCATTA
CTTATTATGGTCCAGGTGGTCAGTGGGTCAAAGATGATATTTACTCGTTTACCTCTAATA
TGGTTGATTCTGCCACTAGTTTTGCCATGCAATTGTATGGATATGGAGCAAGACATATAG
GAGTGGCGGGAATGACACCACTGGGATGTATTCCAGCACAAAGAACTCTAAAAGGAGGTC
CTCATCGAAAATGTGCTGAAGATGTTAACTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCCAAACTCT
CCACTGCTTTAGGTCACCTGGCTAAAACTCTACCAGATTCTAAATTGGTTTTCATGGACA
TCTATTCTCCATTCAGTCAGATTCTACAAAACCCCGCCGATTACGGATTTGAAGTGATAA
ATAGAGGGTGTTGTGGAACCGGACTAGTAGAAACAGGTCCACTTTGCAACCAAGAGACAT
CAACTGTGTGTAGAAATATATCTGCTTATCTGTTTTGGGATAGTTTCCATCCATCGCAAA
GATTATATGAAATCTTAACCAAAATACTTGTTAAAAAGTACATGCCTCTGTTATTTTGAG
TAGTAGATTTTTACTTGAGACTTCTTAAAAATAATTCTGAGAGGATATAATATTTTGTAT
ATGTATTAATCATGTTGTGCTTACGAAATGGTTGTTGTTTATGATAGTTACCGATTGATA
TCAT

QA 2 785 2 785
DS 



AS 1 2

CO CL4143Contig1 964 2 4 U
GGGTCGCTTTTCGTCTCTCTCTCTCTGTCTCCTCGTGTTCTCTTTCTCTGTCGCTGCTAA
ACATTCAGATCGCTAGCTAGCTCTGGTCGTGTGCATCTAATTTACTTCTATATTCGTTCT
TCTTCCCAGAATCGAGCTTAACAAAAAATGAACAAGTGTCCACGCATCGATATCCCTTCC
TCGTCTTCTCCATCAGCTTCAGCTTCTGCAGATGGTGAGCTCAACGAAGACGACATCTTC
TCAATCGACATAACTCACCCTCCTCCTCCTTCGTTCTCTTCTGGTCAACACACACCTGCT
CGCCAGCTTCAGAGAAGCAAAAGCGGTTTGAAAAACGTGGAAGCTTCTGGTATCCTCGCT
GCTCTTCCCGAGCCTTCTGGGAAGAGTTACCTCAACCACGTCTTTCACCATAAGCCTGCA
TCTCTTCTCTCCACTTCACCTTCTTCATCTTCATCTTCGGCGGCTCGTGCCATTCCCTCA
GCTCCCAAACCGCCTCAAGAGAGGCTTCCGTACACTGCTTCTTTTACAGGTGGAGGGAAG
TATCCTCAGTCTGCTCCGGTTCAAGTGCCGGTAGCATCTTTGGCCATGATGAATCGTCAT
AAGAAGGAGTTCAAGCTGACTGATGTGGTGGATGAGGATGATGAGGAAGAAGAAGGCGAA
ATGCTTCCTCCGCATGAGATTGTAGCCCGGTCTTTGGCGCAGTCTTCTTACCTGTCATGC
TCCGTGCTTGAAGGAGCAGGAAGAACACTTAAAGGGAGAGATTTCCGACAGGTGAGGAAT
GCTGTTTTCAGAAGAACCGGTTTCATTGATTGAGCTCTGTTTTTCACCGGAAGGACATTC
TTTGATTTGTTACTTTGGCCACAGAAACTTTCCAATTGTACGTGTTCATATTATGTTGTG
TCTACTTCATATCAAAGACGTTGATGTGATAACACATGTTGTGTTTATATAATTGTTTCA
TGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4EI06TF U 1
AF RR4EI06JQ C 284
BS 1 655 RR4EI06TF
BS 656 656 RR4EI06JQ
BS 657 728 RR4EI06TF
BS 729 964 RR4EI06JQ

RD RR4EI06TF 728 0 0
GGGTCGCTTTTCGTCTCTCTCTCTCTGTCTCCTCGTGTTCTCTTTCTCTGTCGCTGCTAA
ACATTCAGATCGCTAGCTAGCTCTGGTCGTGTGCATCTAATTTACTTCTATATTCGTTCT
TCTTCCCAGAATCGAGCTTAACAAAAAATGAACAAGTGTCCACGCATCGATATCCCTTCC
TCGTCTTCTCCATCAGCTTCAGCTTCTGCAGATGGTGAGCTCAACGAAGACGACATCTTC
TCAATCGACATAACTCACCCTCCTCCTCCTTCGTTCTCTTCTGGTCAACACACACCTGCT
CGCCAGCTTCAGAGAAGCAAAAGCGGTTTGAAAAACGTGGAAGCTTCTGGTATCCTCGCT
GCTCTTCCCGAGCCTTCTGGGAAGAGTTACCTCAACCACGTCTTTCACCATAAGCCTGCA
TCTCTTCTCTCCACTTCACCTTCTTCATCTTCATCTTCGGCGGCTCGTGCCATTCCCTCA
GCTCCCAAACCGCCTCAAGAGAGGCTTCCGTACACTGCTTCTTTTACAGGTGGAGGGAAG
TATCCTCAGTCTGCTCCGGTTCAAGTGCCGGTAGCATCTTTGGCCATGATGAATCGTCAT
AAGAAGGAGTTCAAGCTGACTGATGTGGTGGATGAGGATGATGAGGAAGAAGAAG*CGAA
ATGCTTCCTCCGCATGAGATTGTAGCCCGGTCTTTGGCGCAGTCTTCTTACCTGTCATGC
TCCGTGCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4EI06JQ 681 0 0
GTCAACACACACCTGCTCGCCAGCTTCAGAGAAGCAAAAGCGGTTTGAAAAACGTGGAAG
CTTCTGGTATCCTCGCTGCTCTTCCCGAGCCTTCTGGGAAGAGTTACCTCAACCACGTCT
TTCACCATAAGCCTGCATCTCTTCTCTCCACTTCACCTTCTTCATCTTCATCTTCGGCGG
CTCGTGCCATTCCCTCAGCTCCCAAACCGCCTCAAGAGAGGCTTCCGTACACTGCTTCTT
TTACAGGTGGAGGGAAGTATCCTCAGTCTGCTCCGGTTCAAGTGCCGGTAGCATCTTTGG
CCATGATGAATCGTCATAAGAAGGAGTTCAAGCTGACTGATGTGGTGGATGAGGATGATG
AGGAAGAAGAAGGCGAAATGCTTCCTCCGCATGAGATTGTAGCCCGGTCTTTGGCGCAGT
CTTCTTACCTGTCATGCTCCGTGCTTGAAGGAGCAGGAAGAACACTTAAAGGGAGAGATT
TCCGACAGGTGAGGAATGCTGTTTTCAGAAGAACCGGTTTCATTGATTGAGCTCTGTTTT
TCACCGGAAGGACATTCTTTGATTTGTTACTTTGGCCACAGAAACTTTCCAATTGTACGT
GTTCATATTATGTTGTGTCTACTTCATATCAAAGACGTTGATGTGATAACACATGTTGTG
TTTATATAATTGTTTCATGCT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL4144Contig1 1141 3 18 U
GGATCTAATAAGACTCTTATTAATAAGATATACAGAGAGAGCGATGGCGATTAACGGCGA
AGATCGCATCTCCGGTGACCGCCCGATCATAATGATCAACAATGACGACGGAATAGACGC
GCCTGGTCTCCGCTCTCTCGTTAGCGTCCTCGTCTCCACCAACCTCTACCAAGTCCGCGT
CTGCGCTCCCGATTCGGAGAAGTCTGCTGTAAGTCACAGTATCATATGGAGCAGACCTCT
CACTGCAAAACGAGTTGACATTGAAGGAGCCGAGGCCTATGCCGTTTCTGGAACCCCTGC
GGATTGCACTGGTTTGGGCATATCGGAAGCACTCTTCCCTTCTCCTCCCGACCTGGTTCT
TAGTGGTATAAACGTGGGAAGCAACTGTGGATATAACATCGTCTACTCTGGAACTGTTCC
TGGTGCTCGTGAAGCCTTCATTTATGATGTCCCTTCTGCCTCCATTTCTTATGATTGGAA
GCGTGGAGACATCAATACTAATGATTTTGTCCTCGCTGCCCAAGCTTGTTTGCCTATTAT
CAACGGCATGCTCACTGCCATCAAGAACAAAACTCACCCAACTAACTGCTTTCTGAATAT
CGATTTGCCTACTGACATTGCTAACCATAAGGGATACAAGCTAACTAGACAAGGAAAAAG
CTTGGGTAAGATGGGATGGAGACAAGTGGAGGAGGAAGCACAAGGTGGGAAGATGTTGTC
AACAATGTCAATGGAAACAGATTCAGGAGTAGTTTCAGACAACAACAACGACACATTTGC
TCATCATTCAAAAGATGATAGCCGTTTGTTCAAGAGAGAGGTAAGGACTGCGGTGGTTTG
AAAGGCACTGATTTTCACTTCCTACGAGAAGGATATATTACAGTGACGCCGATAGGAGCT
CTCTTTCAGGTTGATGTGGATTGCCAAAACTACTACAAAGAATGGCTTCCCAAGATTTTT
TCATCCTTGTGATGCCACCAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTTTTAATAATT
TAACCTTTGTGGACCACAGTTTGTGGTAGACCTATTTATCCATACTCTTTTTAAGTTATT
TATGTTGTGAGCAGCTAAATCTCTGGAACCAGTTTTATGCAGTAGCTTTTACCTGAACTC
T


BQ
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10 

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CGATTTGCCTACTGATATTGCTAACCATAAGGGATACAAGCTAACTAGACAAGGAAAA
A

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DS 

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TATTAATGATTTTGTCCTCTCTGCGCAAGCTTGTTTGCCTATTATCAACGGCATGCTCAC
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ATGGAGACAAGTG

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AATTTAACCTTTGTGGACCACAGTTTGTGGTAGACCTATTTATCCATACTCTTTTTAAGT
TATTTATGTTGTGAGCAGCTAAATCTCTGGAACCAGTTTTATGCAGTAGCTTTTACCTGA
ACTCT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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CGGTGTCTCTCACCGCCGCCGGGAGCGGGCCCGTTTCGTCTATTATTTAGCTTCTACGGC
TTTTAATCACGGCATTTTGAACGATTTTGAGGAGTACAGCTTCGGATCCGGGTTGAGAAA
TGGAGAGGATGCGACGACTCTTGCGTCTGATCCTTGAGCGTCTCTACTTGGATGGAGAAT
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TGGTAAGAGATTGTGGAGCTTTAGCTCAATCGCGTTCAGTCTTTGAGTAGTTGTCTGCCA
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ACTCTAACCTCAAATAATTTGACCTTCAACGCCTTCCCGCTTATTCTAGCTTCGATCATC
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BQ
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AF RR4AZ13TF U 1
AF RR4AZ13JQ C 430
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RD RR4AZ13TF 879 0 0
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CGATCTGTACCGGTAGCTTCGGACTCTGAGCAGTGCTCGTGAGCTTGGCTGTCGGGTTAC
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QA 1 867 1 867
DS 

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CTAAACCGGCTCTGATGTGGGTTGCTACTTCTTCCAACGAATTTGGTGAAGCTAATCTCA
GATGGGTCAACAATGGTTCTTCGTATCTGGCCTTCTTCTCAATGCCCTGTCGTCTATGTT
AAGGGTTTCTTAAGCTATGTCTTGTCTTGAGTGATTTCTTTGAGATACTGGAGTACCTAG
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CGCTAATGCCTCGACCTGTGCTTTTAATGTTGAATGGTTCAGTGTGGAGTTGCGATGTTG
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ATTGAGTGCCGGTTGCTCGTGGTTCCCGGATGGAACTTGTTTTGGAGCTTTACTCTAACC
TCAAATAATTTGACCTTCAACGCCTTCCCGCTTATTCTAGCTTCGATCATCGTCTTGCTT
CACATTCTTATTGGTTGTTTGTGTGCTCCAAATATCTCAGGGATCATTTGTTTCCTTTGT
TTTTATTTATGTTTTGTAATCTTTCCTGTTGTTTTAAACCTGGCTCCGAGTGGTATTGTT
TACCTCGTCGGCTTATGCTTTTGAAAGGGTGTTTCACCTTTGTCGACTCTGTGTACTTCA
AAGTTTAAGTGAATGAAAATCCAACAGATGAC

QA 1 932 1 932
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FC27TF U 1
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ACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTAGGAACTGTGATGCGTTCTCTTGAACCTCATGGCT
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TTCTTAAATTTTTATTCATGGGGACTCGGTTCTGTTTTCTGGTTGTTTTAAGACCAAATG
CTATCCCTTTTATGCTTTGTGTCTGAAGTCTTTTCTTGTCTTTTGTTTTGTAAGTTGTGT
AACTCTGTCTAGTTTCGTGGTTTCTTGTTAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FC27JQ 479 0 0
TG
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GATGCTTTTGGTTTTGGTTTGCCTCTCTTACCAAAACTCTTTTTATGTAATTTTTATATT
TACTTATGTATGTTCTTAAATTTTTATTCATGGG*ACTCGGTTCTGTTTTCTGGTTGTTT
TAAGACCAAATGCTATCCCTTTTATGCTTTGTGTTTGAAGTCTTTTCTTGTCTTTTGTTT
TGTAAGTTGTGTAACTCTGTCTAGTTTCGTGGTTTCTTGTTAATTCTAGTAAAGTAT

QA 3 479 3 479
DS 



AS 1 2

CO CL4147Contig1 454 2 2 U
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BQ
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AF RR4E017JQ C 1
AF RR4E017TF U 1
BS 1 449 RR4E017TF
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GAGGAAGTGAAGGAAGTTGGACAGCAGTGGGAAGATGATTGGGACGATGATGATGTCAAT
GACGACTTCTCGCTTCAGTTAAGGAAGGAGCTTGAGACTAGTTCCGCTGATAAGAAATGA
ATGAGCAGCAGCTCTCAAGATTAAAAGATTGTATTTGAATTTGCATCCTCTGTTTTTTTT
ACTATTGTTGCTTCTACTTTTACCCTTTTGCACATTTTACTCTTGGATGCAATATTCCCC
ATCTATCAAATCTTAACCGCTTAATAGATTTATC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4E017TF 454 0 0
GGGAGAAAAAAAAATTCGTCTCCGTTAATCTAAACCTCTACAGAGAGAGTCTCAGGCTTG
ATACGATCTGTAACTATGGCGGCAGAGCAGAAGGCGACTACTGAAGAAGTGAAGATGGAT
CTGTTCGAGGACGACGATGAGTTCGAGGAGTTTGAAATTAACGAAGATTGGGTTGAGAAA
GAGGAAGTGAAGGAAGTTGGACAGCAGTGGGAAGATGATTGGGACGATGATGATGTCAAT
GACGACTTCTCGCTTCAGTTAAGGAAGGAGCTTGAGACTAGTTCCGCTGATAAGAAATGA
ATGAGCAGCAGCTCTCAAGATTAAAAGATTGTATTTGAATTTGCATCCTCTGTTTTTTTT
ACTATTGTTGCTTCTACTTTTACCCTTTTGCACATTTTACTCTTGGATGCAATATTCCCC
ATCTATCAAATCTTAACCGCTTAATAGAT
TTATC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 3

CO CL4148Contig1 607 3 1 U
GGTAGCAAAAGAGTACTTCTTTGAACAAAAAAGAAACAAAAACAAAAGGTTATTTGAACA
TTCCCCCTTGTTGTGTCGGTACTCGGTAGAGAGGGATAGAAGCAAAGTTGTTGGCAACTA
AGTGACTAACAAAATCAAAACTAACAAGCAATAATTGCAAGTAATAAAAACATCGAGGAT
CCTTTTTTGATCAAATTGCAAATAATAAAAACATTTGATCAAAAACATTGAGGATCAAAA
GTTGTGGTTGTTTTGTGAGCCATTTGAAAGCACGCGTGCGTACCTTTCCAATCAGGTTGT
TTTGTGAGCCATTTGAACATTTCCTTCCCGGCGGCGTCTCTTTCAACAACGCTACACCGC
CGCCGATTCCGCCGGTAATCAATACCAGCGTAGTAAGGTATGTAAAAAGCAGAAGCCAAC
GACGAGTTTCTCGTCAAGCACTCGTATCTCTTCATCTTATCATGGAAAATCACTTCAAGC
ATGAACTGATTAGTCGCGTACCAGCTCGGAGGGTCCCGAGAATGAAAATCGATGGAGACA
TCATCACCAATCAGTGGTCCGTAGCCCGAGTTTTCGAGGTACTTACACATGCTGATCTTG
TCCTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4H725JQB U 1
AF RR4H725TF C 115
AF RR4H878JQB U 1
BS 1 607 RR4H725JQB

RD RR4H725JQB 607 0 0
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TTCCCCCTTGTTGTGTCGGTACTCGGTAGAGAGGGATAGAAGCAAAGTTGTTGGCAACTA
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CCTTTTTTGATCAAATTGCAAATAATAAAAACATTTGATCAAAAACATTGAGGATCAAAA
GTTGTGGTTGTTTTGTGAGCCATTTGAAAGCACGCGTGCGTACCTTTCCAATCAGGTTGT
TTTGTGAGCCATTTGAACATTTCCTTCCCGGCGGCGTCTCTTTCAACAACGCTACACCGC
CGCCGATTCCGCCGGTAATCAATACCAGCGTAGTAAGGTATGTAAAAAGCAGAAGCCAAC
GACGAGTTTCTCGTCAAGCACTCGTATCTCTTCATCTTATCATGGAAAATCACTTCAAGC
ATGAACTGATTAGTCGCGTACCAGCTCGGAGGGTCCCGAGAATGAAAATCGATGGAGACA
TCATCACCAATCAGTGGTCCGTAGCCCGAGTTTTCGAGGTACTTACACATGCTGATCTTG
TCCTTTC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4H725TF 493 0 0
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GAGGATCCTTTTTTGATCAAATTGCAAATAATAAAAACATTTGATCAAAAACATTGAGGA
TCAAAAGTTGTGGTTGTTTTGTGAGCCATTTGAAAGCACGCGTGCGTACCTTTCCAATCA
GGTTGTTTTGTGAGCCATTTGAACATTTCCTTCCCGGCGGCGTCTCTTTCAACAACGCTA
CACCGCCGCCGATTCCGCCGGTAATCAATACCAGCGTAGTAAGGTATGTAAAAAGCAGAA
GCCAACGACGAGTTTCTCGTCAAGCACTCGTATCTCTTCATCTTATCATGGAAAATCACT
TCAAGCATGAACTGATTAGTCGCGTACCAGCTCGGAGGGTCCCGAGAATGAAAATCGATG
GAGACATCATCACCAATCAGTGGTCCGTAGCCCGAGTTTTCGAGGTACTTACACATGCTG
ATCTTGTCCTTTC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4H878JQB 607 0 0
GGTAGCAAAAGAGTACTTCTTTGAACAAAAAAGAAACAAAAACAAAAGGTTATTTGAACA
TTCCCCCTTGTTGTGTCGGTACTCGGTAGAGAGGGATAGAAGCAAAGTTGTTGGCAACTA
AGTGACTAACAAAATCAAAACTAACAAGCAATAATTGCAAGTAATAAAAACATCGAGGAT
CCTTTTTTGATCAAATTGCAAATAATAAAAACATTTGATCAAAAACATTGAGGATCAAAA
GTTGTGGTTGTTTTGTGAGCCATTTGAAAGCACGCGTGCGTACCTTTCCAATCAGGTTGT
TTTGTGAGCCATTTGAACATTTCCTTCCCGGCGGCGTCTCTTTCAACAACGCTACACCGC
CGCCGATTCCGCCGGTAATCAATACCAGCGTAGTAAGGTATGTAAAAAGCAGAAGCCAAC
GACGAGTTTCTCGTCAAGCACTCGTATCTCTTCATCTTATCATGGAAAATCACTTCAAGC
ATGAACTGATTAGTCGCGTACCAGCTCGGAGGGTCCCGAGAATGAAAATCGATGGAGACA
TCATCACCAATCAGTGGTCCGTAGCCCGAGTTTTCGAGGTACTTACACATGCTGATCTTG
TCCTTTC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

CO CL4149Contig1 770 3 22 U
ATAAAATCTACACACTGTAAATTAGCAGTAGTAAGGAACTTCATAGTTATTACAGAAATC
TTCTGAAGGGATATCAATACACCCAATTTTCCAATAACAGTAAATATTATTCTGCATAAG
TTCCTACTCATATTATGTTCACACAAACCCGACATTAAAACCAGAACCACAACATCTTAC
AATAGCAATGTTGAACCGGCCAGAATAAAGCCAAGCAGTATGAGCACAATCCTTCGGAGA
CCAATGGGTAGGACATTAGAACCCGAGGCGCTGTTGCAGTAGTTGAAACCGTACCATATA
CTCTCAGGGACGTTCGTGTTATACGGGAAGGTGACAGCTCTGGAGCCATGGCTGTATATC
TTGACACTCTCTGGAATCCAACTGCCGGGACCAGACCTGTAGAGATACACATAGCATATT
TGGTATGTGCATGGTCCGTTAATCTCAAATGTGTCTGATGAGCACTGCTCAAAGGTCTTA
ATAGACGGGTCGTCAAGCCTTGGTGCGTATATCTGATTCCCGTATGCATCTCCAAAAGCG
ACGCTAATTTGATCGCGAGTGTACCTCGATGACGAACAGCTCGTAGAGATGATCACTGTG
TAAGAACAACTAGCCCCAAATTTCTGGATGAGGCTGACATTGAAAGACTCAGCGGCTTGA
GGCTCCAAGAGTTTGGATTCGGAAACAGCGAGTAAGGTTGAGAAGAGGAAGAAGAAGCAG
AGGAGAGTAAAGAGACGACGTGTTGACATCATTTTTTCAGTGCTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH88JQ U 257
AF RR4C603JQ U 1
AF RR4EH88TF C 238
BS 1 329 RR4C603JQ
BS 330 330 RR4EH88JQ
BS 331 374 RR4C603JQ
BS 375 375 RR4EH88JQ
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BS 451 461 RR4C603JQ
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RD RR4EH88JQ 255 0 0
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TGTTATACGGGAAGGGGACAGCTCTGGAGCCATGGCTGTATATCTTGACACTCTCTGGAA
TCCAACTGCCGGGACCAGACCTGTAAAGATACACATAGCATATTTGGTATGTGCATGGTC
CGTTAATCTCAAATGTGTCTGATGAGCACTGCTCAAAGGTCTTAATAAACGGGTCGTCAA
GCCTTGGTGCGTATA

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR4C603JQ 746 0 0
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TTCTGAAGGGATATCAATACACCCAATTTTCCAATAACAGTAAATATTATTCTGCATAAG
TTCCTACTCATATTATGTTCACACAAACCCGACATTAAAACCAGAACCACAACATCTTAC
AATAGCAATGTTGAACCGGCCAGAATAAAGCCAAGCAGTATGAGCACAATCCTTCGGAGA
CCAATGGGTAGGACATTAGAACCCGAGGCGCTGTTGCAGTAGTTGAAACCGTACCATATA
CTCTCAGGGACGTTCGTGTTATACGGGAACGTGACAGCTCTGGAGCCATGGCTGTATATC
TTGACACTCTCTGGGATCCAACCGTCGGGACCAGACCTGTAGAGATACACGTAGCATATT
TGGTATGTGCATGGTCCGTTAATCTCAAACGTGTCTGATGAACACTGCTCAAAGGTCTTT
ATAGACGGGTCGTCAAGCCTTGGTGCGTATATCTGATTCCCGTATGCATCTCCAAAAGCG
ACGCTAATTTGGTCGCGAGTGTACCTCGATGAGGAACAGCTCGTAGAGATGATCACTGTG
TAAGAACAACTAGCCCCAAATTTCTGGATGAGGCTGACATTGAAAGACTCAGCGGCTTGA
GGCTCCAAGAGTTTGGATTCGGAAACAGCGAGTAAGGTTGAGAAGAGGAAGAAGAAGCAG
AGGAGAGTAAAGAGACG
TGTTGTTGA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4EH88TF 533 0 0
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ATACTCTCAGGGACGTTCGTGTTATACGGGAAGGTGACAGCTCTGGAGCCATGGCTGTAT
ATCTTGACACTCTCTGGAATCCAACTGCCGGGACCAGACCTGTAGAGATACACATAGCAT
ATTTGGTATGTGCATGGTCCGTTAATCTCAAATGTGTCTGATGAGCACTGCTCAAAGGTC
TTAATAGACGGGTCGTCAAGCCTTGGTGCGTATATCTGATTTCCGTATGCATCTCCAAAA
GCGACGCTAATTTGATCGCGAGTGTACCTCGATGACGAACAGCTCGTAGAGATGATCACT
GTGTAAGAACAACTAGCCCCAAATTTCTGGATGAGGCTGACATTGAAAGACTCAGCGGCT
TGAGGCTCCAAGAGTTTGGATTCGGAAAGAGCGAGTAAGGTTGAGAAGAGGAAGAAGAAG
CAGAGGAGAGTAAAGAGACGACGTGTTGACATCATTTTTTCAGTGCTTCTCCC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 3

CO CL4150Contig1 1169 3 2 U
GGACCCACATAGTTACACTATATTCGGCTGCCTCCCTCAACGAGTTGCCAATCCTCAATT
GATCTCTCCTCTTCGCTTCTTCCCCGGAGAGAATCATACCTTTCCCTTATTCAACGCGGC
TGTATAGCGGATCGTCTCCGTAAACAAGTATGGATCCTCGTCAATTCGAACACATCGTTG
TGAAGGATGATGAGATTCAGAGCATTGTAATGTCTTATCTTCTCCACAACTGCTTCGATG
AAACTGCTGACTCTCTTGCTTCCACTACTGGAATACACCAACCCGCAATTGATCGCGATA
ACATGGAGAGAAGAAAACAAATAATGCGTTTTGTACTGGAGAAGAAGGCGCTCAAGGCTG
TTGAGCTAACTGAACAACAATTAGGACAAGAGTTGCTTGAGAAAAACAAGGATTTGCACT
TTGATCTTCTTTGCCTTCACTTTGTTGAGCTTATCTGTGATGCCAAAGGCGAAGAAGCTC
TTGAATTTGCTAAGACAAGTCTGGCTCCTTTTGGGAATTCCCAAAAATATGTGGGGAAGC
TTGAAGACGTGATAGCTTTGCTGGCTTATGAAGACCCTGAGAAATCACCAATGTTCTATC
TTCTGAGCTCTGAGTACCGTCAACAGGTTGCTGATGATCTCAACCGCACCATTCTTGAGC
ACGCAGACCATCCAAGCTACACACCGATGGAAAGGCTCTTGCAACGGGTGACAGTTGCGA
GACAATACTTGACTGAGGAGAACGGCAAAGATGCGTTTCCTCCATTCTCCTTGAAAGATT
ATTTTAAAGGCTAAAGATCGCAGGAGGACTCACTTTGCAAGGAGAAGGAAATGCTAAACA
TTTTCATGTATATACAGAAAATGGCTTTGCTTTTCAGTTTCATCTCCATTGTTTTAAACC
TGTCTTCAACTTCTGCAAACATGGATAAAAGGTTAGTCTAGTCACCCATGGCCACAGATG
GTTAAAATTTGCTGTTGCCGGAGATGAATATTGTTAAAGACCGGTTCTGTTTCAGTTCAG
TTCTGCTCTCCTCCACTTGAAGGTGTTTGCCTTTACCTTTTGCGAGTTTAATCGATGAAT
CTTGTAATCCATGATCTTGGAAAACTCATTTTATCTTTGTAATTATCGTTTATGTTTTTA
TATTGAGGAATCTGTGGAGACTTCACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E930TF U 49
AF RR4A630TF U 1
AF RR4A630JQ C 290
BS 1 801 RR4A630TF
BS 802 1169 RR4A630JQ

RD RR4E930TF 693 0 0
GG
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ACAGTTGCGAGACAATACTTGACTGAG
AGAA

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ACATGGAGAGAAGAAAACAAATAATGCGTTTTGTACTGGAGAAGAAGGCGCTCAAGGCTG
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TTGATCTTCTTTGCCTTCACTTTGTTGAGCTTATCTGTGATGCCAAAGGCGAAGAAGCTC
TTGAATTTGCTAAGACAAGTCTGGCTCCTTTTGGGAATTCCCAAAAATATGTGGGGAAGC
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TGTGGGGAAGCTTGAAGACGTGATAGCTTTGCTGGCTTATGAAGACCCTGAGAAATCACC
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TTTCAGTTCAGTTCTGCTCTCCTCCACTTGAAGGTGTTTGCCTTTACCTTTTGCGAGTTT
AATCGATGAATCTTGTAATCCATGATCTTGGAAAACTCATTTTATCTTTGTAATTATCGT
TTATGTTTTTATATTGAGGAATCTGTGGAGACTTCACATG

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4EU03TF U 1
AF RR4EU03JQ C 162
AF RR4H727TF U 624
BS 1 676 RR4EU03TF
BS 677 818 RR4H727TF

RD RR4EU03TF 676 0 0
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TTCTTGGTGGGGGTGGTGATGCTTTATTTGTTGGTGTAAACGAGAGATAAACTCAGATGA
GATAATTCGTGTGAGATTAACTCAGATGAGATCATGTGAGTGAAGAGGAGCATGACAGAG
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TCTTTTTGCCGGAGAATGACTTTAAAAACAATAACTTGTTGCAAGTTATCAAAGCTGTTG
AAGCAGCTGAAACCACCACCATCAAGCAGCAGGTCAAGAATAGCAAAAGCAGAGTACCAT
TAAACCAGGGACTGAAGTGAAGCTTTTTTTGCTTGTGTCTATTTTTTGTATTTGTATGTA
TCATGAGAATGGAAGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4EU03JQ 657 0 0
AAATAAGATTGGTGGAGGTTTTGAGTTCTAGGGTGGTGGTGGAGGGGAAAGAAGAAGATT
GGTGGAGGTTTTGGTTGGGTTCTTGGTGGGGGTGGTGATGCTTTATTTGTTGGTGTAAAC
GAGAGATAAACTCAGATGAGATAATTCGTGTGAGATTAACTCAGATGAGATCATGTGAGT
GAAGAGGAGCATGACAGAGAGAGGAAAGTAGAGTCCTTTGGTCAAGTTTGATTGGAGATT
TAGTCAGGTTCGAGTAAAAGGGGGAATGAGGATGGAGAACGGTCATGAGAACGATTCTTC
TCAAGTGGGTGATGAAGATTCTTTTTGCCGGAGAATGACTTTAAAAACAATAACTTGTTG
CAAGTTATCAAAGCTGTTGAAGCAGCTGAAACCACCACCATCAAGCAGCAGGTCAAGAAT
AGCAAAAGCAGAGTACCATTAAACCAGGGACTGAAGTGAAGCTTTTTTTGCTTGTGTCTA
TTTTTTGTATTTGTATGTATCATGAGAATGGAAGAATTAGGAACTGAAGTTAAGCAACTA
CCATTAAACCATTACTAGACCATGACCCGTCCGGTTAATTTTTTAATTTTTGATTTACAC
TAAATGATGTATTTGTTAATAGTTACTTGTGATACATTGAGTTCTTTTTGAATTTTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4H727TF 195 0 0
TTTTTTTGCTTGTGTCTATTTTTTGTATTTGTATGTATCATGAGAATGGAAGAATTAGGA
ACTGAAGTTAAGCAACTACCATTAAACCATTACTAGACCATGACCCGTCCGGTTAATTTT
TTAATTTTTGATTTACACTAAATGATGTATTTGTTAATAGTTACTTGTGATACATTGAGT
TCTTTTTGAATTTTT

QA 1 195 1 195
DS 



AS 1 3

CO CL4152Contig1 1011 3 3 U
CGTTATAAAATGAATTGAATCACTAACAAACAGTTAGAAAGATGATTAAAATATAGTTGT
AAATCACCAAAACATTACAATACAATACAAACTATACATAGTAGCATTACAATAATCAAA
ACAAAAACAGAAAAAATTGGCCAAAAAACTAGTTTTGATTGAAGAACTCTCGCCCTCAAA
AAACAAAAGAGTATAAAATAAAGTGATGTTTTTACTTGTTAGACCACTGGAATTCAATTT
CAAGGTTTCTGGGGCCACTTTTGCTCTCTGGTAACAAACTGTATTCACCTGCAACTGCTC
CCAGCATTACCACTCGATCGATTTGGATTGTTACTTTCCCAAATGAACTCTTTCCCATTT
TGCTCTTGTTCTTGCATGAAATGTGGAGTTTTTGACCTTTGGGAGGGCTCTCAAATGACC
ATGAGAAACTCTCGTCCCACTCTGGATTTGGACCAGTCGATATAACCTTGGTTTGTCTTG
GAGGAGTGTTACCGAGTGTTATCTTACAAAACACGCTCGGGTTACCAACGGATTGTTTCA
TGTTGTTACCGCGTTTGATCGTGACCACTAGAGTACCTGGCAAACACTGCAAGAGGAATT
CAGCTTTCTCCTGGAACCGTGGAGGACCTGATTGGATTAGGTACTGAAGTAAAGGGATGG
CGTCTGCAGCAGCAACCGATTGGGCCCTAGAAACTTCGGCTGGACACGCTGACCAAGCTT
GTCTGAGAAGAAACAGGGCATCCAAGGCAGCTTCTTGAGTTGCCTCTGACCCTGTCTTGA
GGGATGTAACTAGATGCGGTATACTTAGTGTTGCAGGCTCAGTGGCTCCTAGACGCGGGA
AGTTGTTAAACAAAGAGTTTAAAGCTTTTAGATACTCGTCATTCACGGTTCCGGAGGCCC
ATAAGTCCTTCTCAATAGCAGCAGTTATTGCTCTGACGGTCTCGCTAGATGCGTACTCTT
GCACAGTGTGATTAGAGAATAGTAGTTTTACGAACATTGCAGCCTGAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C016JQ U 1
AF RR4GR22JQ U 31
AF RR4GR22TF C 278
BS 1 183 RR4C016JQ
BS 184 837 RR4GR22JQ
BS 838 1011 RR4GR22TF

RD RR4C016JQ 183 0 0
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AAATCACCAAAACATTACAATACAATACAAACTATACATAGTAGCATTACAATAATCAAA
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AAA

QA 1 183 1 183
DS 

RD RR4GR22JQ 807 0 0
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ACTATACATAGTAGCATTACAATAATCAAAACAAAAACAGAAAAAATTGGCCAAAAAACT
AGTTTTGATTGAAGAACTCTCGCCCTCAAAAAACAAAAGAGTATAAAATAAAGTGATGTT
TTTACTTGTTAGACCACTGGAATTCAATTTCAAGGTTTCTGGGGCCACTTTTGCTCTCTG
GTAACAAACTGTATTCACCTGCAACTGCTCCCAGCATTACCACTCGATCGATTTGGATTG
TTACTTTCCCAAATGAACTCTTTCCCATTTTGCTCTTGTTCTTGCATGAAATGTGGAGTT
TTTGACCTTTGGGAGGGCTCTCAAATGACCATGAGAAACTCTCGTCCCACTCTGGATTTG
GACCAGTCGATATAACCTTGGTTTGTCTTGGAGGAGTGTTACCGAGTGTTATCTTACAAA
ACACGCTCGGGTTACCAACGGATTGTTTCATGTTGTTACCGCGTTTGATCGTGACCACTA
GAGTACCTGGCAAACACTGCAAGAGGAATTCAGCTTTCTCCTGGAACCGTGGAGGACCTG
ATTGGATTAGGTACTGAAGTAAAGGGATGGCGTCTGCAGCAGCAACCGATTGGGCCCTAG
AAACTTCGGCTGGACACGCTGACCAAGCTTGTCTGAGAAGAAACAGGGCATCCAAGGCAG
CTTCTTGAGTTGCCTCTGACCCTGTCTTGAGGGATGTAACTAGATGCGGTATACTTAGTG
TTGCAGGCTCAGTGGCTCCTAGACGCG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4GR22TF 734 0 0
ACTGTATTCAC*TGCAACTGCTCCCAGCATTACCACTCGATCGATT*GGATTGTTACTTT
CCCAAATGAACTCTTTCCCATTTTGCTCTTGTTCTTGCATGAAATGTGGAGTTTTTGACC
TTTGGGAGGGCTCTCAAATGACCATGAGAAACTCTCGTCCCACTCTGGATTTGGACCAGT
CGATATAACCTTGGTTTGTCTTGGAGGAGTGTTACCGAGTGTTATCTTACAAAACACGCT
CGGGTTACCAACGGATTGTTTCATGTTGTTACCGCGTTTGATCGTGACCACTAGAGTACC
TGGCAAACACTGCAAGAGGAATTCAGCTTTCTCCTGGAACCGTGGAGGACCTGATTGGAT
TAGGTACTGAAGTAAAGGGATGGCGTCTGCAGCAGCAACCGATTGGGCCCTAGAAACTTC
GGCTGGACACGCTGACCAAGCTTGTCTGAGAAGAAACAGGGCATCCAAGGCAGCTTCTTG
AGTTGCCTCTGACCCTGTCTTGAGGGATGTAACTAGATGCGGTATACTTAGTGTTGCAGG
CTCAGTGGCTCCTAGACGCGGGAAGTTGTTAAACAAAGAGTTTAAAGCTTTTAGATACTC
GTCATTCACGGTTCCGGAGGCCCATAAGTCCTTCTCAATAGCAGCAGTTATTGCTCTGAC
GGTCTCGCTAGATGCGTACTCTTGCACAGTGTGATTAGAGAATAGTAGTTTTACGAACAT
TGCAGCCTGAACGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL4153Contig1 1103 3 6 U
GGCTAACCATCCAAATTCCAAAGAAACATGTAGACATGTTCTTCTTTTTTCACATTTGTC
TAAAGATCAATCTGTGAAAACCTGAGTACCGTTAACAAGAGGTTGTTGTTCCGGGTAACC
GATACTACTCTCATCACTCAAAATGCTATAATCAAAATCGTCAAATTCATACTCATCATC
GTCTTCTTCTTCTTCCTTAAACTCTGTTTCTTCTTCTTTTAGACTCACCACGTTAGACCC
ATCTTTCCTTCTTTCAATTGTCTGCTTAATGGCATCATCGTAAGACATATCATACCACAC
ATTGCCTTTTCCAACGATGGATTTGTTGTGTGCATCCTTCATTCTCTCTTGCTTGCTAAT
CTCAGTTCTTTGGCTCTCCCCCAGTAGTCATACTGGTATAATGCGCTTGTTGGATCGTAT
TGGTCTTTCCCAAAGAAGCTTCCTGGCTTATACCTCCCTGGTTCCTCCAATGGTAAACCC
AGTGCTTGACGAGAGCTGATATCTCTGAGCAATGCTTCTCTTTCCTCTAAAGACCTGCGC
CAGTGTAAAGAATCATACTCGTCCATCTCAATATTTCTTCTTAGCTTCTCGATTTTGTAT
CCTTCTCCTCTTGCTTTAGCTTCCATCATCAGTTTATTATGGTACTTGCGCTCTATCAAG
GCAGCCTCTAAGTCAAGTTCCTTGACACTGGTTTTCAGAATCACTTTTGGCAATTTGGTT
TTCTTATAATACGCTTCTCCATGCTCGATTTCCTTTTGTTCATCAAAGCCTTTGTCGTCA
GATAGTTCTGATAGTTTTTTGCCTTTGTACTTTTCAGGGTTAGCTTCGTAATCATCCAAA
ATCATTTGCTCAGCTACATGTAACTGCCACAACTTGTCAACATATGGGTGATCAGAGAGC
AGCCCTTCCTCCTCTGGCTTTGATCCTGGATCTTTTCTAGGCTCAGGTCTTCCACAATCT
CGCCGTATCTCATCTGGATTAATATCCCCATCGCGATGGAATATTGGTGGAAGGTCAAAC
TTATTAAAGATCATGTGATCTATATTAGGATGGACGAAGCGCAACTCTAAGGGAAACCTA
AACCTGTATGGGTCTCTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BZ88JQ U 45
AF RR4FC10JQ U 1
AF RR4FC10TF C 352
BS 1 199 RR4FC10JQ
BS 200 200 RR4BZ88JQ
BS 201 381 RR4FC10JQ
BS 382 382 RR4FC10TF
BS 383 694 RR4FC10JQ
BS 695 1103 RR4FC10TF

RD RR4BZ88JQ 174 0 0
TTTTTTCACATTTGTCTAAAGATCAATCTGTGAAAACCTGAGTACCGTTAACAAGAGGTT
GTTGTTCCGGGTAACCGATACTACTCTCATCACTCAAAATGCTATAATCAAAATCGTCAA
ATTCATACTCATCATCGTCTTCTTCTTCTTCCTTAAACTCTGTTTCTTCTTCTT

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR4FC10JQ 694 0 0
GGCTAACCATCCAAATTCCAAAGAAACATGTAGACATGTTCTTCTTTTTTCACATTTGTC
TAAAGATCAATCTGTGAAAACCTGAGTACCGTTAACAAGAGGTTGTTGTTCCGGGTAACC
GATACTACTCTCATCACTCAAAATGCTATAATCAAAATCGTCAAATTCATACTCATCATC
GTCTTCTTCTTCTTCCTTAGACTCTGTTTCTTCTTCTTTTAGACTCACCACGTTAGACCC
ATCTTTCCTTCTTTCAATTGTCTGCTTAATGGCATCATCGTAAGACATATCATACCACAC
ATTGCCTTTTCCAACGATGGATTTGTTGTGTGCATCCTTCATTCTCTCTTGCTTGCTAAT
CTCAGTTCTTTGGCTCTCCCC*AGTAGTCATACTGGTATAATGCGCTTGTTGGATCGTAT
TGGTCTTTCCCAAAGAAGCTTCCTGGCTTATACCTCCCTGGTTCCTCCAATGGTAAACCC
AGTGCTTGACGAGAGCTGATATCTCTGAGCAATGCTTCTCTTTCCTCTAAAGACCTGCGC
CAGTGTAAAGAATCATACTCGTCCATCTCAATATTTCTTCTTAGCTTCTCGATTTTGTAT
CCTTCTCCTCTTGCTTTAGCTTCCATCATCAGTTTATTATGGTACTTGCGCTCTATCAAG
GCAGCCTCTAAGTCAAGTTCCTTGACACTGGTTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4FC10TF 752 0 0
CTTGCTAATCTCAGTTCTTTGGCTCTCCCCCAGTAGTCATACTGGTATAATGCGCTTGTT
GGATCGTATTGGTCTTTCCCAAAGAAGCTTCCTGGCTTATACCTCCCTGGTTC*TCCAAT
GGTAAACCCAGTGCTTGACGAGAGCTGATATCTCTGAGCAATGCTTCTCTTTCCTCTAAA
GACCTGCGCCAGTGTAAAGAATCATACTCGTCCATCTCAATATTTCTTCTTAGCTTCTCG
ATTTTGTATCCTTCTCCTCTTGCTTTAGCTTCCATCATCAGTTTATTATGGTACTTGCGC
TCTATCAAGGCAGCCTCTAAGTCAAGTTCCTTGACACTGGTTTTCAGAATCACTTTTGGC
AATTTGGTTTTCTTATAATACGCTTCTCCATGCTCGATTTCCTTTTGTTCATCAAAGCCT
TTGTCGTCAGATAGTTCTGATAGTTTTTTGCCTTTGTACTTTTCAGGGTTAGCTTCGTAA
TCATCCAAAATCATTTGCTCAGCTACATGTAACTGCCACAACTTGTCAACATATGGGTGA
TCAGAGAGCAGCCCTTCCTCCTCTGGCTTTGATCCTGGATCTTTTCTAGGCTCAGGTCTT
CCACAATCTCGCCGTATCTCATCTGGATTAATATCCCCATCGCGATGGAATATTGGTGGA
AGGTCAAACTTATTAAAGATCATGTGATCTATATTAGGATGGACGAAGCGCAACTCTAAG
GGAAACCTAAACCTGTATGGGTCTCTTTTTGC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL4154Contig1 740 2 7 U
TTTTTTTGTTTCTGTGTAGTAGATCTGACTAACTCGACTCTGTTCACACTAATCTACTTG
ATGAAGCAATGTATCGTTTAGGGTTCATGTTAAAGTCTTCCCCTTTTGATCATTCTCTTG
TTGTAAAGCTAAAGGGTTACTGTTAACGCTTTTGCAACAAGTGATGATTGAGAATTCAAC
AAAAAGTTTACATCTTTCCTTCGAAATTGAGAAGAAAAATCAAAACTTTAGGGTTTATGA
TCTTAGATTCGATGCGTAGGAAAAGGTGGGAAGGCTGTTTTGAAGTGTTCTCTTGTTTCA
AGTCACAGAAAGGAGGAAAAAGAATAGTACCCGCCTCTCGCACTCCTGAAGGCGGCAATG
CCTCAGCCTCACAACCTAATGGTGTATTAAGTAACCAAACTACAGGAGTAGGAGTTAACT
TATCTCTTTTTGGCTCCACCATCCTCTCCTGCTTCCTTCACCAACTCTGCTCTTCCTTCA
ACAGCTCATTCACCAAACCGCTACTTGTCCCTAGCTGCAAACTCACCAGGAGGTCCTTCT
TCCAGCATGTACGCCACTGGACCGTACGCTCACGAAACCCAACTCGTCTCGCCACCTCCT
GTTTTCTCAACGCTCACCACTGAGCCATCCACTGCTCCTTTCACTCCCCCTCCAGAGCTT
GCACACCTCACCACCCCTTCTTCGCCTGATGTCCCTTACGCTCGGTTCTTGACTTCCTCC
ATTGGTCCAAGAACTCTGGC


BQ
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AF RR4CS19TF U 212
AF RR4FH69TF U 1
BS 1 342 RR4FH69TF
BS 343 343 RR4CS19TF
BS 344 430 RR4FH69TF
BS 431 431 RR4CS19TF
BS 432 612 RR4FH69TF
BS 613 613 RR4CS19TF
BS 614 740 RR4FH69TF

RD RR4CS19TF 426 0 0
AAGAAAAATCAAAACTTTAGGGTTTATGATCTTAGATTCGATGCGTAGGAAAAGGTGGGA
AGGCTGTTTTGAAGTGTTCTCTTGTTTCAAGTCACAGAAAGGAGGAAAAAGAATAGTACC
CGCCTCTCGCACTCCTGAAGGCGGCAATGCCTCAGCCTCACAACCTAATGGTGTATTAAG
TAACCAAACTACAGGAGTAGGAGTTAACTTATCTCTTTTTGGCTCCACCATCCTCTCCTG
CTTCCTTCACCAACTCTGCTCTTCCTTCAACAGCTCATTCACCAAACCGCTACTTGTCCC
TAGCTGCAAACTCACCAGGAGGTCCTTCTTCCAGCATGTACGCCACTGGACCGTACGCTC
ACGAAACCCAACTCGTCTCGCCACCTCCTGTTTTCTCA*CGCTCACCACTGAGCCATCCA
CTGCTC

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4FH69TF 740 0 0
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ATGAAGCAATGTATCGTTTAGGGTTCATGTTAAAGTCTTCCCCTTTTGATCATTCTCTTG
TTGTAAAGCTAAAGGGTTACTGTTAACGCTTTTGCAACAAGTGATGATTGAGAATTCAAC
AAAAAGTTTACATCTTTCCTTCGAAATTGAGAAGAAAAATCAAAACTTTAGGGTTTATGA
TCTTAGATTCGATGCGTAGGAAAAGGTGGGAAGGCTGTTTTGAAGTGTTCTCTTGTTTCA
AGTCACAGAAAGGAGGAAAAAGAATAGTACCCGCCTCTCGCATTCCTGAAGGCGGCAATG
CCTCAGCCTCACAACCTAATGGTGTATTAAGTAACCAAACTACAGGAGTAGGAGTTAACT
TATCTCTTTT*GGCTCCACCATCCTCTCCTGCTTCCTTCACCAACTCTGCTCTTCCTTCA
ACAGCTCATTCACCAAACCGCTACTTGTCCCTAGCTGCAAACTCACCAGGAGGTCCTTCT
TCCAGCATGTACGCCACTGGACCGTACGCTCACGAAACCCAACTCGTCTCGCCACCTCCT
GTTTTCTCAACGTTCACCACTGAGCCATCCACTGCTCCTTTCACTCCCCCTCCAGAGCTT
GCACACCTCACCACCCCTTCTTCGCCTGATGTCCCTTACGCTCGGTTCTTGACTTCCTCC
ATTGGTCCAAGAACTCTGGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL4155Contig1 771 3 4 U
GGAAGGGAGATTCTCCTCTCTGCATCCTCCGTCGTCTCTTACAACTCTCCTCTCTGCCGA
GTAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTAAGGAGGA
GACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTTTGCCCTTCTACGATATATCCTGGACATGGT
ATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCAAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAG
AACTTCAAAATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCA
CACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACTTTTGAGTTT*GAGAAGAAGAGAAACAGACC
CGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAA
GATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCACATCAGCAAGAGGTT*GAAGCCAAACAAACAGA
AGGCATTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGCACCAG
GTTCGCAGCAACAAGACTCAGAGAAGGTGAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGCCTGTTC
AAAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTATGTGGTAACATTTGAGGATCCATTTAGAAGATGT
ATTCACTATACTCCAAAGCTGGTGTTGTCTTTTTAAAAAAGGAGTTTTAAGATTGTTTTG
TTTTTGCAATGTATTAAATTACCTGATACAACGAAAACAAATTTAAGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H988TF U 155
AF RR4C125TF U 1
AF RR4C125JQ C 223
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BS 644 693 RR4C125TF
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GGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGA
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AGTTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCCGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACT
CTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCACATCAGT
AAGAGGTTTGAAGCCAAACAAACAGAAGGCATTCAAGAG

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR4C125TF 694 0 0
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GTAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTAAGGAGGA
GACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTTTGCCCTTCTACGATATATCCTGGACATGGT
ATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCAAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAG
AACTTCAAAATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCA
CACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACTTTTGAGTTT*GAGAAGAAGAGAAACAGACC
CGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAA
GATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCACATCAGCAAGAGGTT*GAAGCCAAACAAACAGA
AGGCATTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGCACCAG
GTTCGCAGCAACAAGACTCAGAGAAGGTGAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGCCTGTTC
AAAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTATGTGGTAACATTTGAG*ATCCATTTAGAAGATGT
ATTCACTATACTCCAAAGCTGGTGTTGTCTTTT
A

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4C125JQ 549 0 0
AGGTCTAAGTGCCACAAGAACTTCAAAATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACT
AAAGCCTACAGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACTTTTGAGTTT*GA
GAAGAAGAGAAACAGACCCGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTTTCAAGGC
CATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCACATCAGCAAGAGGTT
*GAAGCCAAACAAACAGAAGGCATTCAAGAGTGATTTCAAGGAGATAGACCAGCACATTA
ATTTGATCAAGGCACCAGGTTCGCAGCAACAAGACTCAGAGAAGGTGAAAGTTTTGGTCT
CCAGCAACAAGCCTGTTCAAAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTATGTGGTAACATTTGAG
GATCCATTTAGAAGATGTATTCACTATACTCCAAAGCTGGTGTTGTCTTTTTAAAAAAGG
AGTTTTAAGATTGTTTTGTTTTTGCAATGTATTAAATTACCTGATACAACGAAAACAAAT
TTAAGTAGT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 3

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TCGGTGCTGTGAAAAGGTCTTTAGTCTAGTTCTCTGTTCTGTTTAGGCTGAGATGAGGCT
TTCTAGTGTCAGAGAAGTCTTGGACTGGGAATTGATTTCGATTTCATCATATGTTTTGCC
TGGGTTTTTTCTCTAGATCCGTAGCTTTTTCTGGTGCGCGGTGCAGGTTATGCCGGCTCT
GATGTGGGTGGGTACTTCTTCCATCGGATCAGGTGAGGGAGAACTCAGGTTCTTCGGGTG
GTCGTTCGTTCTTCCTCTGTTCATTATCTTCGTTTTGCTGCTCTGAAGGTTCTCAGTCTC
TCTTAGTTGTTAGCTGTTGTTGTCTTAATCAAGCTCTATGTCCTAAGCCTCTCGATATAA
GTTCGGTTCTGCGTTAAGGTCGTCGTTTAAAGGCTCTCTTGTGGGCTTCAGAATGAGGTT
TCTTCGTGGAGGCAACTTGAGAGAGTGTTGCGGTGTTAGAGTGAGAGGTTCTTTTCGTTT
TTCTGGGAAGGAGGTTCAGTTGTTATCGGAGTTGTGGAGTTTGTTTGGTCTAATGGTTCT
GTTGGGAGATATCATTCTCTATATTCCAGGCCTCGCTGTTAGTCCTCGGGTCGTTATTTT
GCTCTCTTTAGTTGGTGAAGTTCCCGGGCGGGGAAGTTGTGCTGTTCCTTGGTTGGTAAC
CAACGGGGTTCTCCGGATTATTTGGTAAGGAGCTGTGGAGCTTTAGCTCAATTGCGTGCA
GTCTTTGAGTAGTTAATTGCCAACCGTCGTCTTCTTTGGCTGCTCGGGTTGAAGATCGTA
TCTCCTGTGGCTTCT


BQ
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AF RR4BE19TF U 1
AF RR4BC30TF U 271
AF RR4BE19JQ C 694
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BS 750 915 RR4BE19JQ

RD RR4BE19TF 749 0 0
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TTCTAGTGTCAGAGAAGTCTTGGACTGGGAATTGATTTCGATTTCATCATATGTTTTGCC
TGGGTTTTTTCTCTAGATCCGTAGCTTTTTCTGGTGCGCGGTGCAGGTTATGCCGGCTCT
GATGTGGGTGGGTACTTCTTCCATCGGATCAGGTGAGGGAGAACTCAGGTTCTTCGGGTG
GTCGTTCGTTCTTCCTCTGTTCATTATCTTCGTTTTGCTGCTCTGAAGGTTCTCAGTCTC
TCTTAGTTGTTAGCTGTTGTTGTCTTAATCAAGCTCTATGTCCTAAGCCTCTCGATATAA
GTTCGGTTCTGCGTTAAGGTCGTCGTTTAAAGGCTCTCTTGTGGGCTTCAGAATGAGGTT
TCTTCGTGGAGGCAACTTGAGAGAGTGTTGCGGTGTTAGAGTGAGAGGTTCTTTTCGTTT
TTCTGGGAAGGAGGTTCAGTTGTTATCGGAGTTGTGGAGTTTGTTTGGTCTAATGGTTCT
GTTGGGAGATATCATTCTCTATATTCCAGGCCTCGCTGTTAGTCCTCGGGTCGTTATTTT
GCTCTCTTTAGTTGGTGAAGTTCCCGGGC

QA 1 749 1 749
DS 

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CGTTTTGCTGCTCTGAAGGTTCTCAGTCTCTCTTAGTTGTTAGCTGTTGTTGTCTTAATC
AAGCTCTATGTCCTAAGCCTCTCGATATAAGTTCGGTTCTGCGTTAAGGTCGTCGTTTAA
AGGCTCTCTTGTGGGCTTCAGAATGAGGTTTCTTCGTGGAGGCAACTTGAGAGAGTGTTG
CGGTGTTAGAGTGAGAGGTTCTTTTCGTTTTTCTGGGAAGGAGGTTCAGTTGTTATCGGA
GTTGTGGAGTTTGTTTGGTCTAATGGTTCTGTTGGGAGATATCATTCTCTATATTCCAGG
CCTCGCTGTTAGTCCTCGGGTCGTTATTTTGCTCTCTTTAGTTGGTGAAGT

QA 1 471 1 471
DS 

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AAGTTGTGCTGTTCCTTGGTTGGTAACCAACGGGGTTCTCCGGATTATTTGGTAAGGAGC
TGTGGAGCTTTAGCTCAATTGCGTGCAGTCTTTGAGTAGTTAATTGCCAACCGTCGTCTT
CTTTGGCTGCTCGGGTTGAAGATCGTATCTCCTGTGGCTTCT

QA 1 222 1 222
DS 



AS 1 3

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CGACAGTGAAGACGATATGGGAACTAGTTCAGTCGATGGACAACGAAAAAATATGCTACG
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TTTTCATGGATTATGGATACAAAATTGGAGGCGAACTTGAATTTTCAAAGAACAAATCAA
AAGTTAAATGGTTTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCATGACGGTCACGGTCTAACCA
ACGGCCCTTTGCCACGAATCGTTATAGCTGAGGTTCTTCTTGACCAACTTAGCCTTGAAT
CACAGGGGATAATAAGAAAGTACTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCGGTTCTGTCAA
GCACTTTGGGGTCCTTAATATGGGAGAAGCCTACATGGACCGACTTCAAGCAACTTGCAA
AAGAAAACGAATTTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCTACACAATGAATCATCTTGCAT
TTTCGGTTCATCGATTCAAACATCAGCTCAGTGACATTAAGTTCATCAAACAGTATCTTG
AAGAAAAAGAATTCGAACTTAACACTGACGGGGGAGTTATCAAAGTGAGTCAAGATGGTC
TACTGTTACAAGTATCGTCCATCGCGGACAAACTTGCGGTTGAATTTGCTGACGGAGTAA
CTGAAACAATCCCGGCTTCTTACATTGAGTTTACTCAACGTCTAGTTCTTCCACGGTTCA
AAGATGTGCCGTTTGATGAGATTAAAGAGTTCCACAGACGTGAAGGCTTTGAGCTTGATA
ACGCCAGCAACATAATGGAAAGTACCCGTTTCACAGCACCAGTGTAAAACAAGACTTGTC
TTGTTCGGCTCAGTATGCCAAATGTGTGCATGGATTCGTGTTTTATTTATGTGTGACCTT
GATTCCTATCGGTAACAATGTAATAATCGTGGAATGGCAGAAAAATATAATTAAGTTATG
AAATAATTTAAAATCTACAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ78TF U 1
AF RR4FQ86TF U 50
AF RR4FJ78JQ C 430
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BS 107 107 RR4FQ86TF
BS 108 229 RR4FJ78TF
BS 230 230 RR4FQ86TF
BS 231 289 RR4FJ78TF
BS 290 290 RR4FQ86TF
BS 291 305 RR4FJ78TF
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BS 307 323 RR4FJ78TF
BS 324 324 RR4FQ86TF
BS 325 346 RR4FJ78TF
BS 347 347 RR4FQ86TF
BS 348 407 RR4FJ78TF
BS 408 408 RR4FQ86TF
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BS 417 719 RR4FJ78TF
BS 720 1160 RR4FJ78JQ

RD RR4FJ78TF 719 0 0
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CGACAGTGAAGACGATATGGGAACTAGTTCAGTCGATGGACAACGAAAAGATATGCTACG
ATCACTTCACTTTCAGGACATTTAAGGTAGATGGTTATGGAATAGATTCTTTGTCGAGTT
TTTTCTTGGATTATGGATACAAAGTTGGAGGCGAACTTGAATTTTCGAAGAACAAATCAA
AAGTTAAATGGTTTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCATGACGGTGACGGTCTGACCA
ACGGCCCTTTGCCACGAATCGTTATAGCTGAGGTTCTTCTTGACCAACTTAGCCTTGAAT
CACAGGGGATAATAAGAAAGTACTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCGGTTCTGTCAA
GCACTTTGGGGTCCTTAATATGGGAGAAGCCTACATGGACCGACTTCAAGCAACTTGCAA
AAGAAAACGAATTTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCTACACAATGAATCATCTTGCAT
TTTCGGTTCATCGATTCAAACATCAGCTCAGTGACATTAAGTTCATCAAACAGTATCTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FQ86TF 641 0 0
GG
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AGGGAGGAAGTGAAACGTTTCTCCGGAATGTTCTTGAAAGTATACTGAAAACGTATTTGA
TGAAGAATCCGACAGTGAAGACGATATGGGAACTAGTTCAGTCGATGGACAACGAAAAAA
TATGCTACGATCACTTCACTTTCAGGACATTTAAGGTAGATGGTTATGGAATAGATTCCT
TGTCGAGTTTTTTCATGGATTATGGATACAAAATTGGAGGCGAACTTGAATTTTCAAAGA
ACAAATCAAAAGTTAAATGGTTTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCATGACGGTCACG
GTCTAACCAACGGCCCTTTGCCACGAATCGTTATAGCTGAGGTTCTTCTGGACCAACTAA
GCCCTGAATCACAGGGGGTAATAAGAAAGTACTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCGG
TTCTGTCAAGTACTTTGGGATCCTTAATATGGGAGAAGCCTACATGGAACGACTTCAAGC
AACTCGCAAAAGAAAACGAATTTGCGGCATGGACGTTTATCCACGGCTACACAATGAACC
ATCTTGCATTTTCGGTTCATCGATTCAAACA
CCAGTTCA

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR4FJ78JQ 731 0 0
TGCCACGAATCGTTATAGCTGAGGTTCTTCTTGACCAACTTAGCCTTGAATCACAGGGGA
TAATAAGAAAGTACTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCGGTTCTGTCAAGCACTTTGG
GGTCCTTAATATGGGAGAAGCCTACATGGACCGACTTCAAGCAACTTGCAAAAGAAAACG
AATTTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCTACACAATGAATCATCTTGCATTTTCGGTTC
ATCGATTCAAACATCAGCTCAGTGACATTAAGTTCATCAAACAGTATCTTGAAGAAAAAG
AATTCGAACTTAACACTGACGGGGGAGTTATCAAAGTGAGTCAAGATGGTCTACTGTTAC
AAGTATCGTCCATCGCGGACAAACTTGCGGTTGAATTTGCTGACGGAGTAACTGAAACAA
TCCCGGCTTCTTACATTGAGTTTACTCAACGTCTAGTTCTTCCACGGTTCAAAGATGTGC
CGTTTGATGAGATTAAAGAGTTCCACAGACGTGAAGGCTTTGAGCTTGATAACGCCAGCA
ACATAATGGAAAGTACCCGTTTCACAGCACCAGTGTAAAACAAGACTTGTCTTGTTCGGC
TCAGTATGCCAAATGTGTGCATGGATTCGTGTTTTATTTATGTGTGACCTTGATTCCTAT
CGGTAACAATGTAATAATCGTGGAATGGCAGAAAAATATAATTAAGTTATGAAATAATTT
AAAATCTACAT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL4158Contig1 1109 2 2 U
GGGATCATCTTCAGCTTGGGAAGGATCTTGATCTCATTGATTTTGACTCTGCTTCAGAGG
TAAGTGGTTCAAAGTTTTTCTATTTGAAGAATGAAGCAGTGTTATTGGAGATGGCCCTCC
TTAACTGGACCTTATCAGAAGTCATGAAGAAGGGTTTTACTCCCCTAACAACCCCTGAGA
TAGTGAGATCTTCGATTGTTGAGAAATGCGGTTTCCAACCTCGTGGAGATAACACTCAGG
TTTATTCTATAGATGGAACTGACCAATGTCTCATTGGCACCGCTGAAATTCCCGTAGGAG
GAATCCACATGGATTCTATTCTTCTTGAATCAGCACTACCTTTGAAATACATAGCATTCT
CTCATTGTTTCCGAACTGAAGCTGGTGCAGCTGGTGCCGCTACAAAAGGTCTTTACCGAG
TTCATCAGTTCAGCAAAGCAGAAATGTTTGTCCTGTGCCGACCTGAAGATAGTGAAACCT
TCCACAACGAACTTATTCAGATCGAAGAAGATCTGTTTACTTCTTTAGGATTACACTTCA
AAACATTGGACATGGCCACAGCAGATTTAGGCGCTCCAGCTTACCGCAAGTTTGACATTG
AAGCATGGATGCCCGGTTTAGGAAGATATGGCGAGATATCAAGCGCATCTAACTGCACGG
ATTACCAAAGCCGGAGACTGGGAATACGTTACCGCCCATCTGAACCGCTTCAGACGGGTC
CTAAGAAAGGCAAAGCCAGTCTTCCGGCTACTAAGTTTGTGCACACTCTAAACGCTACAG
CGTGTGCTGTCCCAAGGATGATGGTGTGTTTGCTGGAGAATTACCAGCAAGAAGATGGGT
CCGTCGTCATCCCTGAGCCTCTTAGGCCTTTCATGGGAGGCATTGAGCTTATTAAACCCA
AGCTTAGATAAGTTTTAAAGGCTAGCTCTAAGCTGAGTCTTGTTGTAACTCATGATCTGA
GGTTTGCGGGCATACATTATACAGTTCACATGCGTTGAGTTTTGTTGTGTTTTTTTCTTC
AATTGTATAATAGAAATGGAATTTACCTTTCCTTTTCACTTATTTGTATATACCAAACTT
TATTCCATAATATCTGAGGATATTGCTGC


BQ
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AF RR4GH49TF U 1
AF RR4GH49JQ C 483
BS 1 733 RR4GH49TF
BS 734 1109 RR4GH49JQ

RD RR4GH49TF 737 0 0
GGGATCATCTTCAGCTTGGGAAGGATCTTGATCTCATTGATTTTGACTCTGCTTCAGAGG
TAAGTGGTTCAAAGTTTTTCTATTTGAAGAATGAAGCAGTGTTATTGGAGATGGCCCTCC
TTAACTGGACCTTATCAGAAGTCATGAAGAAGGGTTTTACTCCCCTAACAACCCCTGAGA
TAGTGAGATCTTCGATTGTTGAGAAATGCGGTTTCCAACCTCGTGGAGATAACACTCAGG
TTTATTCTATAGATGGAACTGACCAATGTCTCATTGGCACCGCTGAAATTCCCGTAGGAG
GAATCCACATGGATTCTATTCTTCTTGAATCAGCACTACCTTTGAAATACATAGCATTCT
CTCATTGTTTCCGAACTGAAGCTGGTGCAGCTGGTGCCGCTACAAAAGGTCTTTACCGAG
TTCATCAGTTCAGCAAAGCAGAAATGTTTGTCCTGTGCCGACCTGAAGATAGTGAAACCT
TCCACAACGAACTTATTCAGATCGAAGAAGATCTGTTTACTTCTTTAGGATTACACTTCA
AAACATTGGACATGGCCACAGCAGATTTAGGCGCTCCAGCTTACCGCAAGTTTGACATTG
AAGCATGGATGCCCGGTTTAGGAAGATATGGCGAGATATCAAGCGCATCTAACTGCACGG
ATTACCAAAGCCGGAGACTGGGAATACGTTACCGCCCATCTGAACCGCTTCAGACGGGTC
CTAAGAAAGGCAA
GCCA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4GH49JQ 627 0 0
CACAACGAACTTATTCAGATCGAAGAAGATCTGTTTACTTCTTTAGGATTACACTTCAAA
ACATTGGACATGGCCACAGCAGATTTAGGCGCTCCAGCTTACCGCAAGTTTGACATTGAA
GCATGGATGCCCGGTTTAGGAAGATATGGCGAGATATCAAGCGCATCTAACTGCACGGAT
TACCAAAGCCGGAGACTGGGAATACGTTACCGCCCATCTGAACCGCTTCAGACGGGTCCT
AAGAAAGGCAAAGCCAGTCTTCCGGCTACTAAGTTTGTGCACACTCTAAACGCTACAGCG
TGTGCTGTCCCAAGGATGATGGTGTGTTTGCTGGAGAATTACCAGCAAGAAGATGGGTCC
GTCGTCATCCCTGAGCCTCTTAGGCCTTTCATGGGAGGCATTGAGCTTATTAAACCCAAG
CTTAGATAAGTTTTAAAGGCTAGCTCTAAGCTGAGTCTTGTTGTAACTCATGATCTGAGG
TTTGCGGGCATACATTATACAGTTCACATGCGTTGAGTTTTGTTGTGTTTTTTTCTTCAA
TTGTATAATAGAAATGGAATTTACCTTTCCTTTTCACTTATTTGTATATACCAAACTTTA
TTCCATAATATCTGAGGATATTGCTGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 3

CO CL4159Contig1 876 3 6 U
GGAACGGAGACCAAAGTAAATGGGAAGCAACGACGACTGACTGACTCGTCTCTCTCCTCC
TCCTCCACCTCTTTCTAGCTCTGAGATTGATCGGAACTAAAGCTATTGAGATTCCGATTT
TGATTTATTTCGATCATCAGCCTTCTCATAGTTTTATCAAGTAACCGAAGTCAAGGGATT
CGTGCTTGTGAAGCTCTAGGTGAATATTGGAGTGAAAGACTTCAAGATTGGAAAGGATGC
TTGAGGGACCACCAAGGTTCGATGTGCTCGCTGCTGGGCATCACAACAACGACCACAATT
ACTACCCTTTCACCCAAGACTTCTATAAAAAGCTCGGTGAAGATGGTACAAACATGTCCA
CGGACAGTATGCAGACAAGTAACGCCGGAGGCTCTGTCTCCATGTCTGTGGACAACAGTA
GCGTTGGTTCAAGCGATGCTCTCATCGGCCATCCCGGTTTGAAACCTATGCGCCATCCCT
ACTCTCTCTCCGTTGGACAAAGCGTGTTTCGTCCCGGAAGAGTTACGCATGCGCTTAACG
ATGATGCCTTAGCACAAGCGTTGATGGACGGTAGCTACCCAACCCAGGGACTCGCAAACT
ATGAAGAGTGGACGATAGATCTTAGGAAGCTTCACATGGGACCCGCTTTTGCTCAAGGGG
CGTTTGGTAAGCTGTACAGAGGGACTTACAAAGGAGAAGATGTAGCCATCAAGCTACTCG
AGAGGCCAGAGAATAGTCCC*GAAAAGGCACAAGCCCTGGAACAGCAGTTTCAGCAGGAG
GTTTCTATGCTCTCGTTTTTGAAACACCCCAACATAGTTAGGTTTATCGGCGCCTGCATT
AAACCGATGGTGTTGTGCATCGTGACTGAATATGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F895TF U 1
AF RR4FU02TF U 245
AF RR4BM02TF U 303
BS 1 283 RR4F895TF
BS 284 284 RR4FU02TF
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BS 660 660 RR4FU02TF
BS 661 771 RR4F895TF
BS 772 876 RR4FU02TF

RD RR4F895TF 771 0 0
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TCCTCCACCTCTTTCTAGCTCTGAGATTGATCGGAACTAAAGCTATTGAGATTCCGATTT
TGATTTATTTCGATCATCAGCCTTCTCATAGTTTTATCAAGTAACCGAAGTCAAGGGATT
CGTGCTTGTGAAGCTCTAGGTGAATATTGGAGTGAAAGACTTCAAGATTGGAAAGGATGC
TTGAGGGACCACCAAGGTTCGATGTGCTCGCTGCTGGGCATCA*AACAACGACCACAATT
ACTACCCTTTCACCCAAGACTTCTATAAAAAGCTCGGTGAAGATGGTACAAACATGTCCA
CGGACAGTATGCAGACAAGTAACGCCGGAGGCTCTGTCTCCATGTCTGTGGACAACAGTA
GCGTTGGTTCAAGCGATGCTCTCATCGGCCATCCCGGTTTGAAACCTATGCGCCATCCCT
ACTCTCTCTCCGTTGGACAAAGCGTGTTTCGTCCCGGAAGAGTTACGCATGCGCTTAACG
ATGATGCCTTAGCACAAGCGTTGATGGACGGTAGCTACCCAACCCAGGGACTCGCAAACT
ATGAAGAGTGGACGATAGATCTTAGGAAGCTTCACATGGGACCCGCTTTTGCTCAAGGG*
CGTTTGGTAAGCTGTACAGAGGGACTTACAAAGGAGAAGATGTAGCCATCAAGCTACTCG
AGAGGCCAGAGAATAGTCCC*GAAAAGGCACAAGCCCTGGAACAGCAGTTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4FU02TF 632 0 0
GGGACCACCAAGGTTCGATGTGCTCGCTGCTGGGCATCACAACAACGACCACAATTACTA
CCCTTTCAGCCAAGACTTCTATAAAAAGCTCGGTGAAGATGGTACAAACATGTCCACGGA
CAGTATGCAGACAAGTAACGCCGGAGGCTCTGTCTCCATGTCTGTGGACAACAGTAGCGT
TGGTTCAAGCGATGCTCTCATCGGCCATCCCGGTTTGAAACCTATGCGCCATCCCTACTC
TCTCTCCGTTGGACAAAGCGTGTTTCGTCCCGGAAGAGTTACGCATGCGCTTAACGATGA
TGCCTTAGCACAAGCGTTGATGGACGGTAGCTACCCAACCCAGGGACTCGCAAACTATGA
AGAGTGGACGATAGATCTTAGGAAGCTTCACATGGGACCCGCTTTTGCTCAAGGGGCGTT
TGGTAAGCTGTACAGAGGGACTTACAAAGGAGAAGATGTAGCCATCAAGCTACTCGAGAG
GCCAGAGAATAGTCCC*GAAAAGGCACAAGCCCTGGAACAGCAGTTTCAGCAGGAGGTTT
CTATGCTCTCGTTTTTGAAACACCCCAACATAGTTAGGTTTATCGGCGCCTGCATTAAAC
CGATGGTGTTGTGCATCGTGACTGAATATGCA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4BM02TF 554 0 0
TACCCTTTCACCCAAGACTTCTATAAAAAGCTCGGTGAAGATGGTACAAACATGTCCACG
GACAGTATGCAGACAAGTAACGCCGGAGGCTCTGTCTCCATGTCTGTGGACAACAGTAGC
GTTGGTTCAAGCGATGCTCTCATCGGCCGTCCCGGTTTGAAACCTATGCGCCATCCCTAC
TCTCTCTCCGTTGGACAAAGCGTGTTTCGTCCCGGAAGAGTTACGCAAGCGCTTAACGAT
GATGCCTTAGCACAAGCGTTGATGGACGGTAGCTACCCAACCCAGGGACTCGCAAACTAT
GAAGAGTGGACGATAGAACTTAGGAAGCTTCACATGGGACCCGCTTTTGCTCAAGGGGCG
TTTGGTAAGCTGTACAGAGGGACTTACAAAGGAGAAGATGTAGCCATCAAGCTACTCGAG
AGGCCAGAGAATAGTCCCCGAAAAGGCACAAGCCCTGGAACAGCAGTTTCAGCAGGAGGT
TTCTATGCTCTCGTTTTTGAAACACCCCAACATAGTTAGGTTTATCGGCGCCTGCATTAA
ACCGATGGTGTTGT

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL4160Contig1 506 2 4 U
TTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTTTTGTAACAGCACCGGT
TTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACCGCCCCAC
CCACCTCATTTTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCATGCACCA
CCCCATCCACCACCATTTGCTGCCTCTGGACGTGGAGGTGGTGAGAGTTTGGTTGTTGCG
TTTGCTGCGATTTTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTCTAGTTAAGAGTTG
CTTTAATGACTAATAAATATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTGGAGA
TCCTGGAGACCTTGACTAGTTAATGTATCGAGCCATGAAGTACTAGTAATCAATATAAAT
TAATGAAACATGCACCAGTGTGTTTGCATGTGATTTATAATTACCTTCTAGTTGAATCTT
GTATTGTGTAAATATATTACACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GZ37JQ C 1
AF RR4FJ83TF U 273
BS 1 272 RR4GZ37JQ
BS 273 330 RR4FJ83TF
BS 331 331 RR4GZ37JQ
BS 332 506 RR4FJ83TF

RD RR4GZ37JQ 462 0 0
TTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTTTTGTAACAGCACCGGT
TTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACCGCCCCAC
CCACCTCATTTTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCATGCACCA
CCCCATCCACCACCATTTGCTGCCTCTGGACGTGGAGGTGGTGAGAGTTTGGTTGTTGCG
TTTGCTGCGATTTTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTTTAGTTAAGAGTTG
CTTTAATGACTAATAAATATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTGGAGA
TCCTGGAGACCTTGACTAGTTAATGTATCGAGCCATGAAGTACTAGTAATCAATATAAAT
TAATGAAACATGCACCAGTGTGTTTGCATGTGATTTATA
ATT

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR4FJ83TF 234 0 0
GGTGGTTTGAGTTTCTAGTTAAGAGTTGCTTTAATGACTAATAAATATGGTGTAGTGATT
TTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTGGAGATCCTGGAGACCTTGACTAGTTAATGTATCGAG
CCATGAAGTACTAGTAATCAATATAAATTAATGAAACATGCACCAGTGTGTTTGCATGTG
ATTTATAATTACCTTCTAGTTGAATCTTGTATTGTGTAAATATATTACACAACT

QA 1 234 1 234
DS 



AS 1 3

CO CL4161Contig1 623 3 1 U
GCAAGTTGAAAGCTTAAAACTTTATTAAAATCAAGTAAGATTTCAATGGTAGTAGAATCA
AAAGAAGTTATTTGATTTCCTTACCGAACAATGCAAAACAGTAATGTTCGAGATTAGTAC
CAAACTTTATAGCGACGACATCTATATATCAAATATCTCCTAGAGAATTTGGAAAAAAGA
TATATTAGGAAAAACCAATATTCATGGAATCTAAACAATGTTTCTTTCTTTGGTTGGGTT
TCATTAAACATCATCCATAAGTAGACAAGCAGACACATTTTAAACGGGAGAAAAAACGAA
CAGATCGTGAGAAACCTTTGCAGAGCGGAGCTCAAACATCTACAAAACCCTATCGACAGA
ACTCAAATTCTCTTCCTTTTTAATTTCTAATTAAGAAACCCACAAGATAAAACTAAGCAG
CGGGCTCAATGCAGGTACGCGGATGCATAAAGTTTAGATCTTTTTATAAGAAAATTAAGT
GGAAAAGGATTGAGATTTGGACCTGCGGAAGCTCCAGAGAGAAAACCCTTGAGGAAAAGA
AGGAGCTTGGAGGGTGGGGAAGGGGGCAGATCGAGATGCTGAATCCGCTCCGCCCTTGGG
GAAAGAGAGTGTCTTTGGTGGTC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4B489JQ U 1
AF RR4BG18JQ U 1
AF RR4BG18TF C 1
BS 1 623 RR4B489JQ

RD RR4B489JQ 623 0 0
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QA 1 623 1 623
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GGAAAAGGATTGAGATTTGGACCTGCGGAAGCTCCAGAGAGAAAACCCTTGAGGAAAAGA
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GAAAGAGAGTGTCTTTGGTGGTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4BG18TF 623 0 0
GCAAGTTGAAAGCTTAAAACTTTATTAAAATCAAGTAAGATTTCAATGGTAGTAGAATCA
AAAGAAGTTATTTGATTTCCTTACCGAACAATGCAAAACAGTAATGTTCGAGATTAGTAC
CAAACTTTATAGCGACGACATCTATATATCAAATATCTCCTAGAGAATTTGGAAAAAAGA
TATATTAGGAAAAACCAATATTCATGGAATCTAAACAATGTTTCTTTCTTTGGTTGGGTT
TCATTAAACATCATCCATAAGTAGACAAGCAGACACATTTTAAACGGGAGAAAAAACGAA
CAGATCGTGAGAAACCTTTGCAGAGCGGAGCTCAAACATCTACAAAACCCTATCGACAGA
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GGAAAAGGATTGAGATTTGGACCTGCGGAAGCTCCAGAGAGAAAACCCTTGAGGAAAAGA
AGGAGCTTGGAGGGTGGGGAAGGGGGCAGATCGAGATGCTGAATCCGCTCCGCCCTTGGG
GAAAGAGAGTGTCTTTGGTGGTC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

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CGGGATGCAGCACCATAGTGATTACGGGATGAAGCAGCACGGGATGCAGCACCACGGTGA
GTACGGGATGAAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGATGTCACCACATCATGTCTA
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CTGGCCAGTCAGCAACAGCGGTGGCGGCCATTACAAGGCGGGGTGGGGGGAGTAAGGGAC
TCTAGCTGCAACCAACTACTCTGCCAGTTCAAAATAAAAGTAATGATTATGTATACTGAA
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ATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGTTGCTGCTTATGTTGAATAAAAATGATACAAGTATTA
TCAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP57TF U 1
AF RR4GP57JQ C 202
AF RR4F804TF U 524
BS 1 687 RR4GP57TF
BS 688 688 RR4F804TF
BS 689 716 RR4GP57TF
BS 717 717 RR4F804TF
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BS 771 771 RR4GP57JQ
BS 772 787 RR4F804TF

RD RR4GP57TF 727 0 0
GGTGAGGCTTCCGGCAAACCACGGCCGTCCACCCATGGCTCACATGCCTCTCTTTGATGA
AGACGATTCAGATGTAGAGGAATTCTATAAGAGCAGCCGAAGCCACCACACTACTGTGTT
ACCGCACCACGGCAAAAACCACCACCAGCAGCCACCTCATATGAACTTCATGCCCCCACC
TCCGATGTCTCAACCTCACCATAGTGGAAAGATGGGTAATGGATGGCAGGGGAAGTATGA
AGATGCATACCATGGCGGGCACGGGATGCAGCACCACGGTGAGTACGGGATGAATCAGCA
CGGGATGCAGCACCATAGTGATTACGGGATGAAGCAGCACGGGATGCAGCACCACGGTGA
GTACGGGATGAAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGATGTCACCACATCATGTCTA
CATGAACCCAAACCATGGCACTGGCAGTGGCCATGCTGTAGTGGTCAATGCTTCGGAAAA
CTGGCCAGTCAGCAACAGCGGTGGCGGCCATTACAAGGCGGGGTGGGGGGAGTAAGGGAC
TCTAGCTGCAACCAACTACTCTGCCAGTTCAAAATAAAAGTAATGATTATGTATACTGAA
TAATAATATTATTAACTAAGACGTGTGTGATGAACATGTTTCAGTACCGTACTACGACCA
AACATGGGACTTTTAAGAACAAAAAAA**TAGAAAGAAAGTGTTCTTGCTTGATGA*CTT
ATGATTA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4GP57JQ 581 0 0
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CGGGATGCAGCACCACGGTGAGTACGGGATGAATCAGCACGGGATGCAGCACCATAGTGA
TTACGGGATGAAGCAGCACGGGATGCAGCACCACGGTGAGTACGGGATGAAGCACCAGGA
CAGGCTTATGGCTCCTCAGATGTCACCACATCATGTCTACATGAACCCAAACCATGGCAC
TGGCAGTGGCCATGCTGTAGTGGTCAATGCTTCGGAAAACTGGCCAGTCAGCAACAGCGG
TGGCGGCCATTACAAGGCGGGGTGGGGG*AGTAAGGGACTCTAGCTGCAACCAACTATTC
TGCCAGTTCAAAATAAAAGTAATGATTATGTATACTGAATAATAATATTATTAACTAAGA
CGTGTGTGATGAACATGTTTCAGTACCGTATTACGACCAAACATGGGACTTTTAAGAACA
AAAAAAA*TAGAAAGAAAGTGTTCTTGCTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGT
TGTTGCTGCTTATGTTGAATAAAAATGATACAAGTATTA
CC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4F804TF 264 0 0
GT
GGGGGAGTAAGGGACTCTAGCTGCAACCAACTACTCTGCCAGTTCAAAATAAAAGTAATG
ATTATGTATACTGAATAATAATATTATTAACTAAGACGTGTGTGATGAACATGTTTCAGT
ACCGTACTACGACCAAACATGGGACTTTTAAGAACAAAAAAAAATAGAAAGAAAGTGTTC
TTGCTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGTTGCTGCTTATGTTGAATAAAA
ATGATGCAAGTATTATCAATTG

QA 3 264 3 264
DS 



AS 1 3

CO CL4163Contig1 639 3 1 U
GCGTTTCGAGACGCAATTACACTTGCGATCCCGCCAAAACGTACTCCATCGCCGATCTAA
ACTATCCGTCTTTCGCTGTTAATGTTGATGGATCCGGAGCGTACAAGTACACACGCACTG
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TCAAGATTTCGGTTGTACCGGCTGTTTTGAATTTCAAAGAAGTTAACGAGAAGAAATCGT
ATACAGTGACGTTTACCGTAGACTCGTCTAAGGCGTCTGGATCTAACAGCTTCGGGAGCA
TTGAATGGTCAGATGGGAAGCACGTGGTGGCCAGTCCCGTGGCGATCAGCTGGTCGTAGT
GGTTTGGTTTAGTTATGACAAAATTAATGGGCTTTTATGGGAAGAAGAAAGTCCAGATAT
TGTAATGCCGTTTCTATAAGAGTTCTGTTTAGCGGAAACGGCATGCAGTCTTGGCTTATC
TAGTTTGTTTTTGGAACTCTTGTCGTTGTGTTTTCTCTTTGCTATTTGAAGAAAAGAAAT
ATTCTCCGGCCACAAGGATAGCTGGATTGTGCCTTTAGCTGTTTTATCATGTGACTTGAA
TATTTAAATGAAAAGTAAAATGATTGGACTTTTTAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD58JQ C 95
AF RR4CD58TF U 1
AF RR4BQ21TF U 378
BS 1 639 RR4CD58TF

RD RR4CD58JQ 455 0 0
CGGAGCGTACAAGTACACACGCACTGTCACGAGCGTTGGAGGAGCTGGGTCCTACTCGGT
TAAAGTCACTTCCGATACCACAGCAGTCAAGATTTCGGTTGTACCGGCTGTTTTGAATTT
CAAAGAAGTTAACGAGAAGAAATCGTATACAGTGACGTTTACCGTAGACTCGTTTAAGGC
GTCTGGATCTAACAGCTTCGGGAGCATTGAATGGTCAGATGGGAAGCACGTGGTGGCCAG
TCCCGTGGCGATCAGCTGGTCGTAGTGGTTTGGTTTAGTTATGACAAAATTAATGGGCTT
TTATGGGAAGAAGAAAGTCCAGATATTGTAATGCCGTTTCTATAAGAGTTCTGTTTAGCG
GAAACGGCATGCAGTCTTGGCTTATCTAGTTTGTTTTTGGAACTCTTGTCGTTGTGTTTT
CTCTTTGCTATTTGAAGAAAAGAAATATTCTCCGG

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4CD58TF 639 0 0
GCGTTTCGAGACGCAATTACACTTGCGATCCCGCCAAAACGTACTCCATCGCCGATCTAA
ACTATCCGTCTTTCGCTGTTAATGTTGATGGATCCGGAGCGTACAAGTACACACGCACTG
TCACGAGCGTTGGAGGAGCTGGGTCCTACTCGGTTAAAGTCACTTCCGATACCACAGCAG
TCAAGATTTCGGTTGTACCGGCTGTTTTGAATTTCAAAGAAGTTAACGAGAAGAAATCGT
ATACAGTGACGTTTACCGTAGACTCGTCTAAGGCGTCTGGATCTAACAGCTTCGGGAGCA
TTGAATGGTCAGATGGGAAGCACGTGGTGGCCAGTCCCGTGGCGATCAGCTGGTCGTAGT
GGTTTGGTTTAGTTATGACAAAATTAATGGGCTTTTATGGGAAGAAGAAAGTCCAGATAT
TGTAATGCCGTTTCTATAAGAGTTCTGTTTAGCGGAAACGGCATGCAGTCTTGGCTTATC
TAGTTTGTTTTTGGAACTCTTGTCGTTGTGTTTTCTCTTTGCTATTTGAAGAAAAGAAAT
ATTCTCCGGCCACAAGGATAGCTGGATTGTGCCTTTAGCTGTTTTATCATGTGACTTGAA
TATTTAAATGAAAAGTAAAATGATTGGACTTTTTAGCTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4BQ21TF 254 0 0
G
CAAAATTAATGGGCTTTTATGGGAAGAAGAAAGTCCAGATATTGTAATGCCGTTTCTATA
AGAGTTCTGTTTAGCGGAAACGGCATGCAGTCTTGGCTTATCTAGTTTGTTTTTGGAACT
CTTGTCGTTGTGTTTTCTCTTTGCTATTTGAAGAAAAGAAATATTCTCCGGCCACAAGGA
TAGCTGGATTGTGCCTTTAGCTGTTTTATCATGTGACTTGAATATTTAAATGAAAAGTAA
AATGATTGGACTT

QA 2 254 2 254
DS 



AS 1 3

CO CL4164Contig1 579 3 2 U
GGAATAATTCATTTTGTCCTTGTGTTAGGGTTCGTCATCCGTGTCTCGATCTAATCTCCT
TCCCGATCAGTTTACAGCTTCCGATTTGACTTTCCGACATGGCAGATGATGAAGTTGTTG
ATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCTAAATGTGTGAAGCCACTACTCGAAT
ATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGC
AGTACTTCGACTACTGGCATTGCATTGACAAATGTGTTGCACCAAAGCTGTTTGCAAAAC
TAAAATGATTAGGAAGCAGAGGTGGAGACGATGTTGTCTTGCTTGAGTGTGCTTCATTTG
GTTTAAAAGGGATGTATAAAACGCTGTGGACGTTGAACTTTCTTTCATAACTACAAACCT
GAATATGGCCAAATGGCTATGCTCCTCGTTTTGTTTCTATGTTACTATACCACAAAAATT
GTTATTGTGCTCTCTCTCTCATGCCATCAACTACAAGAATTTTCCCTTCTTTGAACAAAT
TATTAGGCTTTTAGTTTCAATAAAGAGTTTTTCACGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F350TF U 23
AF RR4FG43TF U 1
AF RR4FG43JQ C 185
BS 1 519 RR4FG43TF
BS 520 579 RR4FG43JQ

RD RR4F350TF 456 0 0
G
GTTAGGGTTCGTCATCCGTGTCTCGATCTAATCTCCTTCCCGATCAGTTTACAGCTTCCG
ATTTGACTTTCCGACATGGCAGATGATGAAGTTGTTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAA
TCTTGCAAACCTAAATGTGTGAAGCCACTACTCGAATATCTGGCGTGTGTGAAGAGAATC
CAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGCAGTACTTCGACTACTGGCATTGC
ATTGACAAATGTGTTGCACCAAAGCTGTTTGCAAAACTAAAATGATTAGGAAGCAGAGGT
GGAGACGATGTTGTCTTGCTTGAGTGTGCTTCATTTGGTTTAAAAGGGATGTATAAAACG
CTGTGGACGTTGAACTTTCTTTCATAACTACAAACCTGAATATGGCCAAATGGCTATGCT
CCTCGTTTTGTTTCTATGTTACTATACCACAAAAA

QA 2 456 2 456
DS 

RD RR4FG43TF 519 0 0
GGAATAATTCATTTTGTCCTTGTGTTAGGGTTCGTCATCCGTGTCTCGATCTAATCTCCT
TCCCGATCAGTTTACAGCTTCCGATTTGACTTTCCGACATGGCAGATGATGAAGTTGTTG
ATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCTAAATGTGTGAAGCCACTACTCGAAT
ATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGC
AGTACTTCGACTACTGGCATTGCATTGACAAATGTGTTGCACCAAAGCTGTTTGCAAAAC
TAAAATGATTAGGAAGCAGAGGTGGAGACGATGTTGTCTTGCTTGAGTGTGCTTCATTTG
GTTTAAAAGGGATGTATAAAACGCTGTGGACGTTGAACTTTCTTTCATAACTACAAACCT
GAATATGGCCAAATGGCTATGCTCCTCGTTTTGTTTCTATGTTACTATACCACAAAAATT
GTTATTGTGCTCTCTCTCTCATGCCATCAACTACAAGAA

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4FG43JQ 395 0 0
GGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGCAGTA
CTTCGACTACTGGCATTGCATTGACAAATGTGTTGCACCAAAGCTGTTTGCAAAACTAAA
ATGATTAGGAAGCAGAGGTGGAGACGATGTTGTCTTGCTTGAGTGTGCTTCATTTGGTTT
AAAAGGGATGTATAAAACGCTGTGGACGTTGAACTTTCTTTCATAACTACAAACCTGAAT
ATGGCCAAATGGCTATGCTCCTCGTTTTGTTTTTATGTTACTATACCACAAAAATTGTTA
TTGTGCTCTCTCTCTCATGCCATCAACTACAAGAATTTTCCCTTCTTTGAACAAATTATT
AGGCTTTTAGTTTCAATAAAGAGTTTTTCACGATT

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 3

CO CL4165Contig1 1213 3 5 U
GGAATCCATATGTGAAGAAAACTGGTTGGATCGCTGCAAGAAAAAGAGAAGAAAGAGATG
GCGACTGCCACAGTTCTCAGCCGCTTGTCACTGACACCGAACCTATCTTCCAAACCAAAA
TCGTTTTCAAACAGAAGAACAACACCTACGACTGTTTCCGTCAGAGCGCAAGCTTCTTTC
TCCGACCCATTCGTACTTCAGCTAGCAGAATCTCTCGAAGACTCTCTCTCCCCTTCTCCT
TCTCCTTCTTTACCTCTCCTAGGGTTTTTGTCTTGGTAGAGGAAGGAGGTGAGATTGGTA
TAGTTGAAGAGTTTGTGGGTAAAGACGAACAAGGGTTTTATTGGACCAATCCTGTTTTGG
AAGTTGTTGTCTTAAAGAATGCCAAGGTTAAGCATTCTTACTTGCAGCAAGAGTCTACGG
CTGCTGCTCATATCAAATGGACTTTCGTCCGACAGGAGGCAGAGAGTGAGTACGAGCTTG
TAGAAGTGAGTACCGGCGGGAGATTAGGGAGGCACAATGTTCATGTGCAGCAACTCGGGC
CCGATACGCTCACGGGAGCTAACAACGTTTCATATGTGCGTCAACGACCAGACTCTTGAT
CTCCATAGCAGAATTGTCTTAGACCATCCTCGAGGCTCTTCCCGTCAGCTCCACAAGTGT
ATTGTTGCTCACTCCTCTGGTCAAGCTGTGTTCGATGGCAATGTCCGAGTTAACAAGTAT
GCTCAACAGACGGACGCGGGACAACTGACAAGAAGCCTTCTTTTGAAACCTCGAGCCACC
GTGAACATAAAACCCAACCTTCAGATCATTGCAGATGATGTCAAGTGCTCACACGGAGCT
GCTATCAGTGATCTTGAAGAAGACCAGCTCTTCTATTTCCAAGCTCGTGGGATCGACTTG
GAGACTGCAAGAAGAGCTCTCATTTCCTCTTTTGGTTCAGAGGTGATCGAGAAGTTTCCA
AATCGGGAAATACGCGACCAAGCTAGGAATCACGTCAAGTCCTTACTCTGATCTTTACAA
GACAACGATCATCTCAAACCTATCGCGTGGTATTCACGCGTCGCTCCTGCGATTCATCTG
TGTATTATTACTATGTGAGGCCCATCGATTTTGGTTTAGGCCCGTTTAAGAGAAAACAAC
AAACGGTTGGCTTCTATGTGAATTTTAACAGCGTGCAGTTTTTTCTTCATTAAACGTTAC
AATTTACAACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE24TF U 1
AF RR4D572TF U 412
AF RR4D572JQ C 620
BS 1 445 RR4EE24TF
BS 446 446 RR4D572TF
BS 447 593 RR4EE24TF
BS 594 1070 RR4D572TF
BS 1071 1213 RR4D572JQ

RD RR4EE24TF 593 0 0
GGAATCCATATGTGAAGAAAACTGGTTGGATCGCTGCAAGAAAAAGAGAAGAAAGAGATG
GCGACTGCCACAGTTCTCAGCCGCTTGTCACTGACACCGAACCTATCTTCCAAACCAAAA
TCGTTTTCAAACAGAAGAACAACACCTACGACTGTTTCCGTCAGAGCGCAAGCTTCTTTC
TCCGACCCATTCGTACTTCAGCTAGCAGAATCTCTCGAAGACTCTCTCTCCCCTTCTCCT
TCTCCTTCTTTACCTCTCCTAGGGTTTTTGTCTTGGTAGAGGAAGGAGGTGAGATTGGTA
TAGTTGAAGAGTTTGTGGGTAAAGACGAACAAGGGTTTTATTGGACCAATCCTGTTTTGG
AAGTTGTTGTCTTAAAGAATGCCAAGGTTAAGCATTCTTACTTGCAGCAAGAGTCTACGG
CTGCTGCTCATATCAAATGGACTTTTGTCCGACAGGAGGCAGAGAGTGAGTACGAGCTTG
TAGAAGTGAGTACCGGCGGGAGATTAGGGAGGCACAATGTTCATGTGCAGCAACTCGGGC
CCGATACGCTCACGGGAGCTAACAACGTTTCATATGTGCGTCAACGACCAGAC

QA 1 593 1 593
DS 

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G
GTCTACGGCTGCTGCTCATATCAAATGGACTTTCGTCCGACAGGAGGCAGAGAGTGAGTA
CGAGCTTGTAGAAGTGAGTACCGGCGGGAGATTAGGGAGGCACAATGTTCATGTGCAGCA
ACTCGGGCCCGATACGCTCACGG*AGCTAACAACGTTTCATATGTGCGTCAACGACCAGA
CTCTTGATCTCCATAGCAGAATTGTCTTAGACCATCCTCGAGGCTCTTCCCGTCAGCTCC
ACAAGTGTATTGTTGCTCACTCCTCTGGTCAAGCTGTGTTCGATGGCAATGTCCGAGTTA
ACAAGTATGCTCAACAGACGGACGCGGGACAACTGACAAGAAGCCTTCTTTTGAAACCTC
GAGCCACCGTGAACATAAAACCCAACCTTCAGATCATTGCAGATGATGTCAAGTGCTCAC
ACGGAGCTGCTATCAGTGATCTTGAAGAAGACCAGCTCTTCTATTTCCAAGCTCGTGGGA
TCGACTTGGAGACTGCAAGAAGAGCTCTCATTTCCTCTTTTGGTTCAGAGGTGATCGAGA
AGTTTCCAAATCGGGAAATACGCGACCAAGCTAGGAATCACGTCAAGTCCTTACTCTGAT
CTTTACAAGACAACGATCATCTCAAACCTATCGCGTGGTATTCACGCGTCGCTCCTGC

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR4D572JQ 594 0 0
TAGACCATCCTCGAGGCTCTTCCCGTCAGCTCCACAAGTGTATTGTTGCTCACTCCTCTG
GTCAAGCTGTGTTCGATGGCAATGTCCGAGTTAACAAGTATGCTCAACAGACGGACGCGG
GACAACTGACAAGAAGCCTTCTTTTGAAACCTCGAGCCACCGTGAACATAAAACCCAACC
TTCAGATCATTGCAGATGATGTCAAGTGCTCACACGGAGCTGCTATCAGTGATCTTGAAG
AAGACCAGCTCTTCTATTTCCAAGCTCGTGGGATCGACTTGGAGACTGCAAGAAGAGCTC
TCATTTCCTCTTTTGGTTCAGAGGTGATCGAGAAGTTTCCAAATCGGGAAATACGCGACC
AAGCTAGGAATCACGTCAAGTCCTTACTCTGATCTTTACAAGACAACGATCATCTCAAAC
CTATCGCGTGGTATTCACGCGTCGCTCCTGCGATTCATCTGTGTATTATTACTATGTGAG
GCCCATCGATTTTGGTTTAGGCCCGTTTAAGAGAAAACAACAAACGGTTGGCTTCTATGT
GAATTTTAACAGCGTGCAGTTTTTTCTTCATTAAACGTTACAATTTACAACCCT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 3

CO CL4166Contig1 852 3 2 U
CAACTTTGTGTCTCAGCTGATGGTGTTCATTTGGGTTTTATACGTTCTTATTACGTCGGA
ATCAGGCGGTGTGACTGAGCAAGTCATGAACATGCTTCCCATCAACGCGGCTGCTAGAGT
CAGATGCGTTGAAGTTTTAGACTTGGCTATCTCTGGCGTGCTTTTAGCTACCGCGGAGAT
CGCGTTCTTCCAAGGATGTCTCACTCGGCTCTTGTTTAGACTTTACAATATACATTTCCT
TTACATGTCGACTGTTCTGGCTTTTATCAGCGCTCTGTTACCGATCTTCCCTTACTGGTT
CGCCACGATCCCTGCGGCGTTGCAGCTTGTGCTGGAAGGAAGATACATTGTTGCGGTGAC
TCTGTCTGTGACTCATCTTGTGTTGATGGAGTATGGTGCTTCGGAGATTCAAGATGACAT
TCCGGGGTCTAATGCTTACCTTACTGGACTAAGTATTATTGGTGGAGTGACTCTGTTTCC
TTCTGCTCTCGAGGGAGCTATAATGGGACCGTTGATAACGACGGTGGTGATTGCATTGAA
GGATCTGTATGCAGAGTTTGTCTTGAATGATCCGAATAAGATTGATTAGCTGGTATTGGT
TTCTGTAATAGGGAACTTCAAGTGCTTCTGCCATGGCTGCTTTGTATTTGAGAGAAGAAT
CATGTAGATTAGTAGAGAGAAAGAGGGAGAGAAAGAAGTCTTTATTGTTGATTGTTTGAG
ATTTGTTTGCTTTGGGATGTAATTTATAATGTGTAAGTAGTATGCCGTTGTTGTCTCTGT
TGTATTCTATGAGGTCTGATTCTTTGGGGAAACCGTGTAAAAGTTTTTGGCTAATACTAT
TTGTGTTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB76TF U 1
AF RR4BB76JQ C 700
AF RR4F642TF U 402
BS 1 789 RR4BB76TF
BS 790 852 RR4F642TF

RD RR4BB76TF 789 0 0
CAACTTTGTGTCTCAGCTGATGGTGTTCATTTGGGTTTTATACGTTCTTATTACGTCGGA
ATCAGGCGGTGTGACTGAGCAAGTCATGAACATGCTTCCCATCAACGCGGCTGCTAGAGT
CAGATGCGTTGAAGTTTTAGACTTGGCTATCTCTGGCGTGCTTTTAGCTACCGCGGAGAT
CGCGTTCTTCCAAGGATGTCTCACTCGGCTCTTGTTTAGACTTTACAATATACATTTCCT
TTACATGTCGACTGTTCTGGCTTTTATCAGCGCTCTGTTACCGATCTTCCCTTACTGGTT
CGCCACGATCCCTGCGGCGTTGCAGCTTGTGCTGGAAGGAAGATACATTGTTGCGGTGAC
TCTGTCTGTGACTCATCTTGTGTTGATGGAGTATGGTGCTTCGGAGATTCAAGATGACAT
TCCGGGGTCTAATGCTTACCTTACTGGACTAAGTATTATTGGTGGAGTGACTCTGTTTCC
TTCTGCTCTCGAGGGAGCTATAATGGGACCGTTGATAACGACGGTGGTGATTGCATTGAA
GGATCTGTATGCAGAGTTTGTCTTGAATGATCCGAATAAGATTGATTAGCTGGTATTGGT
TTCTGTAATAGGGAACTTCAAGTGCTTCTGCCATGGCTGCTTTGTATTTGAGAGAAGAAT
CATGTAGATTAGTAGAGAGAAAGAGGGAGAGAAAGAAGTCTTTATTGTTGATTGTTTGAG
ATTTGTTTGCTTTGGGATGTAATTTATAATGTGTAAGTAGTATGCCGTTGTTGTCTCTGT
TGTATTCTA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4BB76JQ 107 0 0
CTTTATTGTTGATTGTTTGAGATTTGTTTGCTTTGGGATGTAATTTATAATGTGTAAGTA
GTATGCCGTTGTTGTCTCTGTTGTATTCTATGAGGTCTGATTCTTTG

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR4F642TF 451 0 0
G
GGAGATTCAAGATGACATTCCGGGGTCTAATGCTTACCTTACTGGACTAAGTATTATTGG
TGGAGTGACTCTGTTTCCTTCTGCTCTCGAGGGAGCTATAATGGGACCGTT*ATAACGAC
GGTGGTGATTGCATTGAAGGATCTGTATGCAGAGTTTGTCTTGAATGATCCGAATAAGAT
TGATTAGCTGGTATTGGTTTCTGTAATGGGGAACTTCAAGTGCTTCTGCCATGGCTGCTT
TGTATTTGAGAGAAGAATCATGTAGATTAGTAGAGAGAAAGAGGGAGAGAAAGAAGTCTT
TATTGTTGATTGTTTGAGATTTGTTTGCTTTGGGATGTAATTTATAATGTGTAAGTAGTA
TGCTGTTGTTGTCTCTGTTGTATTCTATGAGGTCTGATTCTTTGGGGAAACCGTGTAAAA
GTTTTTGGCTAATACTATTTGTGTTCTCTT

QA 2 451 2 451
DS 



AS 1 2

CO CL4167Contig1 943 2 2 U
GGGGGAGGAGACGAATCAAATCAAAGGGGAAGGATAATCTATAAATATTGGTCGGAATCC
TTTGCAATCATTTCGTTTGCGCGTGCGAGGGGTCTATCGAAATCTCTCTCAAGGCTCTGT
GTTTGATAAGAATCTCGAAGAAAAGCTAGGGTTAAGGGTTTGTTCGGCGAGTAAAAGAAG
ATGCTGCAGTCTCCGCAAATGTTTCCGACGATGGTTCCTTCGATTGCGTCATCGAACATC
ACCACAGAGCAGATCCAAAACCACCTTGATGAGAACAAAAAGCTGATAATGGCAATCATG
GAGAACCAGAATCTGGGGAAACTTGCAGAATGTGCACAGTACCAAGCTCTTCTCCAGAAG
AACTTAATGTACCTCGCTGCTATTGCTGATGCTCAGCCTCCTCCACCTACAACAGGACCT
GCACCAGCACCAGCTATGGCTTCTCAGATGACGGCAGCACCACATCCTTCGATACAACCG
CCGAGCTACTTTATGCAACAACACCCACAAGCTTCAGGGATGGTGGCTCAACAACAAGCA
TTTCCCGCCGGCGGTATTTTCCCTCCAAGAGGTCCTTTGCAGTTTGGTAGCCCTCACCAG
CTTCATGGGTGGGATTAGACCCATTCCAATGGGTATCAACAACAACATTGGGATGCAGCA
TCAGATGCAACAACTGCCAGAAACCTCTCTTGGAGGAAGTGCTGCAAACGTGGGGCTTAG
AGGTGGCAAGCAAGATGGAGCAGATGGACAAGGGAAAGATGATGGCAAATGAAAAGAGGA
TCCAAAGAAGCTTTGTTTCGTTTATATATATATATTTTAGGACTTGTGCTTTCGGCTTTT
GCATCAATTTTCTTTAGCAGAAGATGATATAGAAGTGGAGTTTGGTTCCACAAACGGTGT
TGTGACATTATTTAGTACAAGTTCGGTTTGGTTTAGAAACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM35TF U 1
AF RR4DM35JQ C 229
BS 1 692 RR4DM35TF
BS 693 943 RR4DM35JQ

RD RR4DM35TF 692 0 0
GGGGGAGGAGACGAATCAAATCAAAGGGGAAGGATAATCTATAAATATTGGTCGGAATCC
TTTGCAATCATTTCGTTTGCGCGTGCGAGGGGTCTATCGAAATCTCTCTCAAGGCTCTGT
GTTTGATAAGAATCTCGAAGAAAAGCTAGGGTTAAGGGTTTGTTCGGCGAGTAAAAGAAG
ATGCTGCAGTCTCCGCAAATGTTTCCGACGATGGTTCCTTCGATTGCGTCATCGAACATC
ACCACAGAGCAGATCCAAAACCACCTTGATGAGAACAAAAAGCTGATAATGGCAATCATG
GAGAACCAGAATCTGGGGAAACTTGCAGAATGTGCACAGTACCAAGCTCTTCTCCAGAAG
AACTTAATGTACCTCGCTGCTATTGCTGATGCTCAGCCTCCTCCACCTACAACAGGACCT
GCACCAGCACCAGCTATGGCTTCTCAGATGACGGCAGCACCACATCCTTCGATACAACCG
CCGAGCTACTTTATGCAACAACACCCACAAGCTTCAGGGATGGTGGCTCAACAACAAGCA
TTTCCCGCCGGCGGTATTTTCCCTCCAAGAGGTCCTTTGCAGTTTGGTAGCCCTCACCAG
CTTCATGGGTGGGATTAGACCCATTCCAATGGGTATCAACAACAACATTGGGATGCAGCA
TCAGATGCAACAACTGCCAGAAACCTCTCTTG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4DM35JQ 715 0 0
TCATCGAACATCACCACAGAGCAGATCCAAAACCACCTTGATGAGAACAAAAAGCTGATA
ATGGCAATCATGGAGAACCAGAATCTGGGGAAACTTGCAGAATGTGCACAGTACCAAGCT
CTTCTCCAGAAGAACTTAATGTACCTCGCTGCTATTGCTGATGCTCAGCCTCCTCCACCT
ACAACAGGACCTGCACCAGCACCAGCTATGGCTTCTCAGATGACGGCAGCACCACATCCT
TCGATACAACCGCCGAGCTACTTTATGCAACAACACCCACAAGCTTCAGGGATGGTGGCT
CAACAACAAGCATTTCCCGCCGGCGGTATTTTCCCTCCAAGAGGTCCTTTGCAGTTTGGT
AGCCCTCACCAGCTTCATGGGTGGGATTAGACCCATTCCAATGGGTATCAACAACAACAT
TGGGATGCAGCATCAGATGCAACAACTGCCAGAAACCTTTCTTGGAGGAAGTGCTGCAAA
CGTGGGGCTTAGAGGTGGCAAGCAAGATGGAGCAGATGGACAAGGGAAAGATGATGGCAA
ATGAAAAGAGGATCCAAAGAAGCTTTGTTTCGTTTATATATATATATTTTAGGACTTGTG
CTTTCGGCTTTTGCATCAATTTTCTTTAGCAGAAGATGATATAGAAGTGGAGTTTGGTTC
CACAAACGGTGTTGTGACATTATTTAGTACAAGTTCGGTTTGGTTTAGAAACATC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL4168Contig1 549 2 1 U
GGGACCTTTGGTTACCATGCGCCAGAGTATGCCATGACTGGTTCACTAACACAGAAGAGT
GATGTTTATAGTTTTGGTGTAGTGCTTTTGGAGCTCTTGACTGGTGAAAGCCTGTTGATC
ATACTATGCCACGTGGTCAACAAAGTCTTGTCACTTGGGCCGCTCCAAGGCTGAGTGAAG
ACAAAGTGAAGCAATGCGTTGATCCAAAACTCAATGGAGATTATCCTCCTAAAGCAGTTG
CAAAGCTGGCGGCTGTTGCAGCGTTGTGTGTGCAATACGAATCAGAGTTTAGGCCGAACA
TGAGCATTGTGGTAAAAGCTCTACAACCATTGTTGAAGTCATCAAGGTCATCAACAGCAG
CAGCTACTCCATCCCAGGAAACTTGATTCTTATTATATGCGATAATGGGAGATTAGTTTC
CGTTTCATGTGTTGCCATATCATATACAAATACTGTTATTCAGTGTGTCTCTTTGTTGAG
GTTTATATCTTCTTATATGTTTATGTGCGTCTTGACAACTGTTTTGTTTGGTACTTGCAA
AAGTATTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AI12JQ C 1
AF RR4AI12TF U 1
BS 1 549 RR4AI12TF

RD RR4AI12JQ 549 0 0
GGGACCTTTGGTTACCATGCGCCAGAGTATGCCATGACTGGTTCACTAACACAGAAGAGT
GATGTTTATAGTTTTGGTGTAGTGCTTTTGGAGCTCTTGACTGGTGAAAGCCTGTTGATC
ATACTATGCCACGTGGTCAACAAAGTCTTGTCACTTGGGCCGCTCCAAGGCTGAGTGAAG
ACAAAGTGAAGCAATGCGTTGATCCAAAACTCAATGGAGATTATCCTCCTAAAGCAGTTG
CAAAGCTGGCGGCTGTTGCAGCGTTGTGTGTGCAATACGAATCAGAGTTTAGGCCGAACA
TGAGCATTGTGGTAAAAGCTCTACAACCATTGTTGAAGTCATCAAGGTCATCAACAGCAG
CAGCTACTCCATCCCAGGAAACTTGATTCTTATTATATGCGATAATGGGAGATTAGTTTC
CGTTTCATGTGTTGCCATATCATATACAAATACTGTTATTCAGTGTGTCTCTTTGTTGAG
GTTTATATCTTCTTATATGTTTATGTGCGTCTTGACAACTGTTTTGTTTGGTACTTGCAA
AAGTATTTC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4AI12TF 549 0 0
GGGACCTTTGGTTACCATGCGCCAGAGTATGCCATGACTGGTTCACTAACACAGAAGAGT
GATGTTTATAGTTTTGGTGTAGTGCTTTTGGAGCTCTTGACTGGTGAAAGCCTGTTGATC
ATACTATGCCACGTGGTCAACAAAGTCTTGTCACTTGGGCCGCTCCAAGGCTGAGTGAAG
ACAAAGTGAAGCAATGCGTTGATCCAAAACTCAATGGAGATTATCCTCCTAAAGCAGTTG
CAAAGCTGGCGGCTGTTGCAGCGTTGTGTGTGCAATACGAATCAGAGTTTAGGCCGAACA
TGAGCATTGTGGTAAAAGCTCTACAACCATTGTTGAAGTCATCAAGGTCATCAACAGCAG
CAGCTACTCCATCCCAGGAAACTTGATTCTTATTATATGCGATAATGGGAGATTAGTTTC
CGTTTCATGTGTTGCCATATCATATACAAATACTGTTATTCAGTGTGTCTCTTTGTTGAG
GTTTATATCTTCTTATATGTTTATGTGCGTCTTGACAACTGTTTTGTTTGGTACTTGCAA
AAGTATTTC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 3

CO CL4169Contig1 643 3 4 U
CAAAAAATCTGCAATTCGTAATTATTTTGAACTAATCCATACAACAAAACATATAAAAAT
CCATGGAGCGTAACTACGAAGTTTGCAAATTACTGAAGTGTTCCGGTACGTTCTCAAAAA
AAGCAATAATAGCAGTCTAAAAAATTATCTGGAACAGCATGTTATAACAACGCAATCATG
CTTATCACCGCCTGGGGGGATTTAACAATTCTCATCCTCTAAAATCTTCCCTTTCCTATC
AACTCCATCACCAGTTAAAAGCATCGTATGAAGATCTAAATCACGTCCATTATCCTTTTC
AAAGACTAACTTTTCATCCACAGTGGGCTCGAAAATAACATCTTTCCTCACGGACTCGTA
GGAAGGGAACATGAAAACAGAGCAAGTAAGTGGTCCCACTTCAAGCGCGTTCAAAACTTT
CATTGTCATATCTTCTCCTTCAGCATCTGTACCTGTTGTCAAGACCCTCATTTGAGGTAC
TTTCAGGTCCAGCTTTGTCATTCTAGGATTTTTCATCGATTTGGGACCATCATCAGAGTC
ATTCGAATCTCCGGATTCTGAATCATCTCCCTCAGCGGAATGGGTGATGTCGCAATGAGG
GTCACTACAGCAGGTAGAGAGGCCAATAGAATCTTCATCTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF57JQ U 1
AF RR4GO06JQ U 68
AF RR4AA11JQ U 65
BS 1 373 RR4DF57JQ
BS 374 374 RR4AA11JQ
BS 375 523 RR4DF57JQ
BS 524 643 RR4AA11JQ

RD RR4DF57JQ 523 0 0
CAAAAAATCTGCAATTCGTAATTATTTTGAACTAATCCATACAACAAAACATATAAAAAT
CCATGGAGCGTAACTACGAAGTTTGCAAATTACTGAAGTGTTCCGGTACGTTCTCAAAAA
AAGCAATAATAGCAGTCTAAAAAATTATCTGGAACAGCATGTTATAACAACGCAATCATG
CTTATCACCGCCTGGGGGGATTTAACAATTCTCATCCTCTAAAATCTTCCCTTTCCTATC
AACTCCATCACCAGTTAAAAGCATCGTATGAAGATCTAAATCACGTCCATTATCCTTTTC
AAAGACTAACTTTTCATCCACAGTGGGCTCGAAAATAACATCTTTCCTCACGGACTCGTA
GGAAGGGAACATGGAAACAGAGCAAGTAAGTGGTCCCACTTCAAGCGCGTTCAAAACTTT
CATTGTCATATCTTCTCCTTCAGCATCTGTACCTGTTGTCAAGACCCTCATTTGAGGTAC
TTTCAGGTCCAGCTTTGTCATTCTAGGATTTTTCATCGATTTG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4GO06JQ 504 0 0
GT
GTAACTACCAAGTTTGCAAATTACTGAAGTGTTCCGGTACGTTCTCAAAAAAAGCAATAA
TAGCAGTCTAAAAAATTATCTGGAACAGCATGTTATAACAACCCAATCATGCTTATCCCC
CCCTGGGGGGATTTAACAATTCTCATCCTCTAAAATCTTCCCTTTCCTATCAACTCCATC
ACCAGTTAAAAGCATCGTACAAAAATCTAAATCACGTCCATTATCCTTTTCAAAAACTAA
CTTTTCATCCACAGTGGGCTCGAAAATAACATCTTTCCTCACGGACTCGTAGGAAGGGAA
CATGAAAACAAAGCAAGTAAGTGGTCCCACTTCAAGCGCGTTCAAAACTTTCATTGTCAT
ATCTTCTCCTTCAGCATCTGTACCTGTTGTCAAGACCCTCATTTGAGGTACTTTCAGGTC
CAGCTTTGTCATTCTAGGATTTTTCATCGATTTGGGACCATCATCAGAGTCATTCGAATC
TCCGGATTCTGAATCATCTCCC

QA 3 504 3 504
DS 

RD RR4AA11JQ 579 0 0
GGA
GTGTAACTACGAAGTTTGCAGATTACTGAAGTGTTCCGGTACGTTCTCAGAAAAAGCAAT
AATAGCAGTCTAAAAAATTATCTGGAACAGCATGTTATAACAACGCAATCATGCTTATCA
CCGCCTGGGGGGATTTAACAATTCTCATCCTCTAAAATCTTCCCTTTCCTATCAACTCCA
TCACCAGTTAAAAGCATCGTATGAAGATCTAAATCACGTCCATTATCCTTTTCAAAGACT
AACTTTTCATCCACAGTGGGCTCGAAAATAACATCTTTCCTCACGGACTCGTAGGAAGGG
AACATGAAAACAGAGCAAGTAAGTGGTCCCACTTCAAGCGCGTTCAAAACTTTCATTGTC
ATATCTTCTCCTTCAGCATCTGTACCTGTTGTCAAGACCCTCATTTGAGGTACTTTCAGG
TCCAGCTTTGTCATTCTAGGATTTTTCATCGATTTGGGACCATCATCAGAGTCATTCGAA
TCTCCGGATTCTGAATCATCTCCCTCAGCGGAATGGGTGATGTCGCAATGAGGGTCACTA
CAGCAGGTAGAGAGGCCAATAGAATCTTCATCTGAA

QA 4 579 4 579
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4171Contig1 1265 3 19 U
GGAAAGCAGAACAGAGAGAGAAGAAGCAGCACAAAAATGGCGACTCCTTCATCCTCTCTA
CTATCTTCTCCTCCTCCTCTATGCAAACTCAGATTCTCGCCAGTATCGGGAATTGATTTC
ATCTCTTTCTCGCCTCGAACAACTCTCTCCCCGGCGATGATTCTCTCTCTCCCTGTCAAA
CATAGAAACTCGCTCCAAGTGAAATCAGTAGCTAGTCCAACGGAGACGGTGTCGGAGTTC
GAGGAGATGGTCTCCGGCACGAAACGGAAGTACTACATGCTGGGAGGGAAAGGAGGAGTT
GGCAAGACCAGCTGCGCTGCTTCTTTAGCTGTGAGATTCGCCAACAACGGACACCCGACT
CTCGTTGTGTCCACAGATCCAGCACACTCCCTTAGCGATTCTTTTGCTCAGGACTTGACT
GGAGGAATGCTTGTGCCTGTTGAAGGACCTGACTCTCCTTTGTTTGCTCTTGAAATAAAC
CCTGAGAAGGCTAGAGAAGAGTTTCGTAGTGCCTCCCAGATGAATGAAGGAACTGATGTC
AAAGACTTTATGGATGGTATGGGACTTGGGATGCTTGTAGAGCAGTTGGGGGAACTTAAA
CTTGGAGAGTTACTAGATACACCGCCTCCTGGATTGGATGAAGCCATTGCCATCTCTAAG
GTCATTCAATTCTTGGAATCACCCGAGTATAACATGTTCACTAGAATCGTGTTTGATACT
GCACCAACCGGTCATACACTGAGACTACTCTCCTTACCAGACTTCTTAGACGCGTCCATA
GGTAAAATCCTGAAGCTTAGGCAGAAAATAACCTCGGCTACTTCAGCAATCAAATCAGTG
TTTGGGAAAGAAGATAACCAGCCTGATGCTGCTGATAAATTGGAAAGACTAAGAGAAAGG
ATGGTTAAAGTACGCGAGCTTTTTCGTGACACAGAGTCAACAGTTTCGTCATTGTCACTA
TCCCAACGGTAATGGCTGTGAACGAGTCTTCTAGATTAAGTGCTTCCTTGAAGAAAGAAA
GTGTCCCCGTCAAAAGACTTGTTGTTAATCAGATTCTCCCTCCCTCCTCCTCGGATTGCA
AATTTTGTTCCATTAAGAGGAAGGACCAGATGCGCGCTCTAGATATGATACGAGAGGATT
CAGAACTTTCTGCTTTGACATTAATGGAGGCTCCCCTGGTCGATATGGAGATCAGAGGTG
TCCCTGCTCTGCGCTTCTTGGGCGATATCATTTGGAAATGAGATTCTCACACATTATATT
TATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 

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G

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G
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GTGAGATTCGCCAACAACGGACACCCGACTCTCGTTGTGTCCACAGATCCAGCACACTCC
CTTAGCGATTCTTTTGCTCAGGACTTGACTGGAGGAATGCTTGTGCCTGTTGAAGGACCT
GACTCTCCTTTGTTTGCTCTTGAAATAAACCCTGAGAAGGCTAGAGAAGAGTTTCGTAGT
GCCTCCCAGATGAATGAAGGAACTGATGTCAAAGACTTTATGGATGGTATGGGACTTGGG
ATGCTTGTAGAGCAGTTGGGGGAACTTAAACTTGGAGAGTTACTAGATACACCGCCTCCT
GGATTGGATGAAGCCATTGCCATCTCTAAGGTCATTCAATTCTTGGAATCACCCGAGTAT
AACATGTTCACTAGAATCGTGTTTGATACTGCACCAACCGGTCATACACTGAGACTACTC
TCCTTACCAGACTTCTTAGACGCGTCCATAGGTAAAATCCTGAAGC

QA 2 647 2 647
DS 

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TGATACTGCACCAACCGGTCATACACTGAGACTACTCTCCTTACCAGACTTTTTAGACGC
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ATCAGTGTTTGGGAAAGAAGATAACCAGCCTGATGCTGCTGATAAATTGGAAAGACTAAG
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GTCACTATCCCAACGGTAATGGCTGTGAACGAGTCTTCTAGATTAAGTGCTTCCTTGAAG
AAAGAAAGTGTCCCCGTCAAAAGACTTGTTGTTAATCAGATTCTCCCTCCCTCCTCCTCG
GATTGCAAATTTTGTTCCATTAAGAGGAAGGACCAGATGCGCGCTCTAGATATGATACGA
GAGGATTCAGAACTTTCTGCTTTGACATTAATGGAGGCTCCCCTGGTCGATATGGAGATC
AGAGGTGTCCCTGCTCTGCGCTTCTTGGGCGATATCATTTGGAAATGAGATTCTCACACA
TTATATTTATGC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

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AAGAGATGACAGTCAGAGACGCTCTAAACTCTGCAATTGATGAGGAGATGTCTGCAGATC
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AAGGCCTTTTGGAGAAGTATGGTCCTGAGAGAGTTTACGATACCCCTATTACCGAGGCTG
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ATTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTACCCATTGTCTTTAGAGGACCCAATGGTGCTG
CTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAGTGCTATGCAGCATGGTACGCATCAGTTCCTG
GTTTGAAAGTTCTCGCTCCATATTCAGCTGAAGATGCTCGTGGTCTTCTTAAAGCTGCTA
TCAGAGACCCTGACCCGGTTGTCTTCCTTGAAAACGAGTTACTATATGGTGAATCATTTC
CAATTTCAGAAGAAGCACTTGATTCAAGTTTCTGTCTTCCCATAGGCAAAGCCAAGATTG
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CAGTTGAAGAAGGTTTCCCTCAGCATGGAGTCTGTGCAGAAATCTGTGCTTCGGTAGTAG
AGGAGAGCTTTTCATACTTTGGATGCACCGGTGGAGAGGATAGCAGGAGCTGATGTTCCG
ATGTCCTTACGCAGCTAACCTAGAGAGATTGGCTCTTCCTCAGGTAGAGGATATCGTTCG
AGCAGCAAAGAGAGCTTGTTACAGATCCAAATAAAGAATATGATCATCTTCAGAAACCCC
ACCCCCAACACAAATAAGAAAAAAAGAGGAGAAAATGACGTCTCTTTTTGCTACAAACAA
CCGTTCCTTGTGATTTTATTTGATCTCTTTTGATATTGTTAATCCTCTGCCCTGCGGTTT
TCATTTTTCCCTTTTGTCTTGCGAATTGAAAATTATACATCTTTTG


BQ
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH90TF U 1
AF RR4A155TFB U 432
AF RR4A155TF U 747
BS 1 645 RR4FH90TF
BS 646 646 RR4A155TFB
BS 647 671 RR4FH90TF
BS 672 919 RR4A155TFB
BS 920 920 RR4A155TF
BS 921 963 RR4A155TFB
BS 964 964 RR4A155TF
BS 965 1210 RR4A155TFB
BS 1211 1211 RR4A155TF
BS 1212 1246 RR4A155TFB

RD RR4FH90TF 671 0 0
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AAGAGATGACAGTCAGAGACGCTCTAAACTCTGCAATTGATGAGGAGATGTCTGCAGATC
CTAAAGTATTTGTCATGGGTGAAGAGGTTGGACAATATCAGGGTGCATACAAGATCACTA
AAGGCCTTTTGGAGAAGTATGGTCCTGAGAGAGTTTACGATACCCCTATTACCGAGGCTG
GATTTACTGGAATTGGAGTTGGTGCCGCCTATGCCGGCTTAAAGCCCGTTGTAGAATTTA
TGACGTTCAACTTTTCTATGCAGGCAATTGATCATATCATAAATTCTGCGGCAAAGTCAA
ATTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTACCCATTGTCTTTAGAGGACCCAATGGTGCTG
CTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAGTGCTATGCAGCATGGTACGCATCAGTTCCTG
GTTTGAAAGTTCTCGCTCCATATTCAGCTGAAGATGCTCGTGGTCTTCTTAAAGCTGCTA
TCAGAGACCCTGACCCGGTTGTCTTCCTTGAAAACGAGTTACTATATGGTGAATCATTTC
CAATTTCAGAAGAAGCACTTGATTCAAGTTTCTGTCTTCCCATAG*CAAAGCCAAGATTG
AACGAGAAGGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4A155TFB 815 0 0
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CTCTCTCCATATTCAGCTGAAGATGCTCGTGGTCTTCTTAAAGCTGCTATCAGAGACCCT
GACCCTGTTGTCTTCCTTGAAAACGAGTTACTATATGGTGAATCATTTCCAATTTCAGAA
GAAGCACTTGATTCAAGTTTCTGTCTTCCCATAGGCAAAGCCAAGATTGAACGAGAAGGA
AAGGATGTAACCATAACAACTTTCTCCAAGATGGTCGGTTTTGCCCTCAAGGCAGCTGAG
AAGCTCGCAGAAGAGGGAATAAGTGCTGAGGTAATAGATCTGCGGTCAATCCGTCCGCTA
GACAGAGCAACCATCAATGCTTCAGTGAGAAAGACAAGTAGATTGGTAACAGTTGAAGAA
GGTTTCCCTCAGCATGGAGTCTGTGCAGAAATCTGTGCTTCGGTAGTAGAGGAGAGCTTT
TCATACTT*GGATGCACCGGTGGAGAGGATAGCAGGAGCTGATGTTCCGATG*CCTTACG
CAGCTAACCTAGAGAGATTGGCTCTTCCTCAGGTAGAGGATATCGTTCGAGCAGCAAAGA
GAGCTTGTTACAGATCCAAATAAAGAATATGATCATCTTCAGAAACCCCACCCCCAACAC
AAATAAGAAAAAAAGAGGAGAAAATGACGTCTCTTTTTGCTACAAACAACCGTTCCTTGT
GATTTTATTTGATCTCTTTTGATATTGTTAATCCTCTGCCCTGCGGTTTTCATTTTTCCT
TTTTGTCTTGCGAATTGAAAATTATACATCTTTTG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4A155TF 492 0 0
GGAATAAGTGCTGAGGTAATAGATCTGCGGTCAATCCGTCCGCTAGACAGAGCAACCATC
AATGCTTCAGTGAGAAAGACAAGTAGATTGGTAACAGTTGAAGAAGGTTTCCCTCAGCAT
GGAGTCTGTGCAGAAATCTGTGCTTCGGTAGTAGAGGAGAGCTTTTCATACTTTGGATGC
ACCGGTGGAGAGGATAGCAGGAGCTGATGTTCCGATGTCCTTACGCAGCTAACCTAGAGA
GATTGGCTCTTCCTCAGGTAGAGGATATCGTTCGAGCAGCAAAGAGAGCTTGTTACAGAT
CCAAATAAAGAATATGATCATCTTCAGAAACCCCACCCCCAACACAAATAAGAAAAAA*G
AGGAGAAAATGACGTCTCTTTTTGCTACAAACAACCGTTCCTTGTGATTTTATTTGATCT
CTTTTGATATTGTTAATCCTCTGCCCTGCGGTTT*CATTTTTCCCTTTTGTCT*GCGAAT
TGAAAAT
ATACA

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 3

CO CL4173Contig1 1379 3 5 U
GGGTTATTATGTCCATTTGAGTGGTTTCTTTTGCATCTGCAGAAGAACTTCATATTTTCT
AAATCTTTTATTTTTGTTTTCATTAGAGTCTGATTTTTACAGTTACTATCTTTATTTGCA
GTACACTCCAGCTATAGACATATGGAGCATCGGCTGCATCTTTGCAGAGGTGCTAACAGG
GAAGCCATTGTTCCGGGGAAAAGCATTATTCATCAGCTGGAGTTGATTACTGATCTTCTC
GGCACACCAAAACCTGAGACTATTTCTGGAGTTAGAAATGATAAAGCTAGAAAATACTTG
AGTGAGATGAGGAAGAAAGATCCGGTCATCTTCTCTAAAAAATTCTCAAAAGCAGATCCT
TTAGCAATCAGACTTCTGCAGAGGCTGCTGGCCTTCGATCCAAAGGATAGACCAACCGCT
GCAGAGGCGTTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGTCTTTCTAAGGTTGAGAGAGAGCCTTCG
TGTCAGCCAATCTCGAAGATGGAGTTTGAATTTGAGAGAAGAAGGTTGACAAAGGATGAC
ATTAGGGAACTTATTTACAGGGAAATACTTGAGTACCATCCTCAGTTGCTCAAGGACTAT
ATGAGTGGTTCTGAGGGATCAAGTTTTGTATATCCTAGCGCTATAGGACATCTTAGAAAG
CAGTTCAATTACTTAGAGGAGAATAGCAGTAGAAACGGGCCGGTCATACCTCTTGAGAGG
AAGCACGTTTCACTTCCCCGGTCTTCAGTTCACTCAAGTGTAGTGCACTCCACAAGTCAA
CCCAACTTGTTCGAGCCCTCAAGAAGTGGTGTAGTTTCTGGAGGAACTAGAGCTTTAGGA
CCTCCACCAAGAGTACCACCATCAGGTAGAGCAGGACGTGTTGTGGAATCATCATCTGTT
AGTTATGAGAATGGTAGGAACCTCAAAGAAGCTTATTTCAGAAGCGCCGTATCATCTCCT
CACTGCTACTTCAAAGCAAACACCATGATTAACCGCAAAGTAGAAGCTTCTTTTCAGCCA
AACCCGCAAGAATTCGTCACTGTGACTAACCAAACAAACGTGGAGATTGTAAACAGCCCA
AACCCTTATTACCACCAATCACAGCTCCCTAATATAGAACAGTCAACCAACAACATTGCC
ATCGATGTTAAGCTGTTGCAAGCACAGACACAGTTCGGTCCAGCAGTTGGAGTAGCATCA
CACCAGAACATAGGCACAGTTGGGTACGGCACAGCAACTTAGGCTCAACAACATTTCAGA
CAGATATTTTAACAGCCAAGGTCTTACCTTTTTTGTGTAAAGTCTTATTGTTATTTCAAC
CAGGCTCTGATTTGAACAACTTTGCAATGATATATAAAATATAGACTTTCTGATGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F285TF U 1
AF RR4GW15TF U 198
AF RR4GW15JQ C 711
BS 1 339 RR4F285TF
BS 340 340 RR4GW15TF
BS 341 734 RR4F285TF
BS 735 834 RR4GW15TF
BS 835 1379 RR4GW15JQ

RD RR4F285TF 734 0 0
GGGTTATTATGTCCATTTGAGTGGTTTCTTTTGCATCTGCAGAAGAACTTCATATTTTCT
AAATCTTTTATTTTTGTTTTCATTAGAGTCTGATTTTTACAGTTACTATCTTTATTTGCA
GTACACTCCAGCTATAGACATATGGAGCATCGGCTGCATCTTTGCAGAGGTGCTAACAGG
GAAGCCATTGTTCCGGGGAAAAGCATTATTCATCAGCTGGAGTTGATTACTGATCTTCTC
GGCACACCAAAACCTGAGACTATTTCTGGAGTTAGAAATGATAAAGCTAGAAAATACTTG
AGTGAGATGAGGAAGAAAGATCCGGTCATCTTCTCTAAAGAATTCTCAAAAGCAGATCCT
TTAGCAATCAGACTTCTGCAGAGGCTGCTGGCCTTCGATCCAAAGGATAGACCAACCGCT
GCAGAGGCGTTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGTCTTTCTAAGGTTGAGAGAGAGCCTTCG
TGTCAGCCAATCTCGAAGATGGAGTTTGAATTTGAGAGAAGAAGGTTGACAAAGGATGAC
ATTAGGGAACTTATTTACAGGGAAATACTTGAGTACCATCCTCAGTTGCTCAAGGACTAT
ATGAGTGGTTCTGAGGGATCAAGTTTTGTATATCCTAGCGCTATAGGACATCTTAGAAAG
CAGTTCAATTACTTAGAGGAGAATAGCAGTAGAAACGGGCCGGTCATACCTCTTGAGAGG
AAGCACGTTTCACT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GW15TF 637 0 0
GAAAAGCATTATTCATCAGCTGGAGTTGATTACTGATCTTCTTGGCACACCAAAACCTGA
GACTATTTCTGGAGTTAGAAATGATAAAGCTAGAAAATACTTGAGTGAGATGAGGAAGAA
AGATCCGGTCATCTTCTCTAAAAAATTCTCAAAAGCAGATCCTTTAGCAATCAGACTTCT
GCAGAGGCTGCTGGCTTTCGATCCAAAGGATAGACCAACCGCTGCAGAGGCGTTGGCTGA
TCCTTACTTTAAGGGTCTTTCTAAGGTTGAGAGAGAGCCTTCGTGTCAGCCAATCTCGAA
GATGGAGTTTGAATTTGAGAGAAGAAGGTTGACAAAGGATGACATTAGGGAACTTATTTA
CAGGGAAATACTTGAGTACCATCCTCAGTTGCTCAAGGACTATATGAGTGGTTCTGAGGG
ATCAAGTTTTGTATATCCTAGCGCTATAGGACATCTTAGAAAGCAGTTCAATTACTTAGA
GGAGAATAGCAGTAGAAACGGGCCGGTCATACCTCTTGAGAGGAAGCACGTTTCACTTCC
CCGGTCTTCAGTTCACTCAAGTGTAGTGCACTCCACAAGTCAACCCAACTTGTTCGAGCC
CTCAAGAAGTGGTGTAGTTTCTGGAGGAACTAGAGCT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4GW15JQ 669 0 0
TCTTGAGAGGAAGCACGTTTCACTTCCCCGGTCTTCAGTTCACTCAAGTGTAGTGCACTC
CACAAGTCAACCCAACTTGTTCGAGCCCTCAAGAAGTGGTGTAGTTTCTGGAGGAACTAG
AGCTTTAGGACCTCCACCAAGAGTACCACCATCAGGTAGAGCAGGACGTGTTGTGGAATC
ATCATCTGTTAGTTATGAGAATGGTAGGAACCTCAAAGAAGCTTATTTCAGAAGCGCCGT
ATCATCTCCTCACTGCTACTTCAAAGCAAACACCATGATTAACCGCAAAGTAGAAGCTTC
TTTTCAGCCAAACCCGCAAGAATTCGTCACTGTGACTAACCAAACAAACGTGGAGATTGT
AAACAGCCCAAACCCTTATTACCACCAATCACAGCTCCCTAATATAGAACAGTCAACCAA
CAACATTGCCATCGATGTTAAGCTGTTGCAAGCACAGACACAGTTCGGTCCAGCAGTTGG
AGTAGCATCACACCAGAACATAGGCACAGTTGGGTACGGCACAGCAACTTAGGCTCAACA
ACATTTCAGACAGATATTTTAACAGCCAAGGTCTTACCTTTTTTGTGTAAAGTCTTATTG
TTATTTCAACCAGGCTCTGATTTGAACAACTTTGCAATGATATATAAAATATAGACTTTC
TGATGTTAC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL4174Contig1 775 3 10 U
GCACGTAAATTTTCATATATATATTTATATCATACAAAATGACACCATTCACATTACAAC
CACTCAGTGGTAAAACATTTGATTCAAACATATAAAATTAGACAAAGCAAAAACAGAACA
AAAACAGAGGAATGCTGTCTTAGCATATAGGAATCGGAGCTCCGTTCCATTCCTCGAGGC
AATCCATCAATGGATCAATAATCTCACCTTCACACATTGCAGTGAACACCTTATCAAACT
CCTCCCCCGGAGACACAACCTTCTCTCCTGTCAGCAACTTCGTTCCGAGCTCTTCCCTCA
CGAACTTATACAACGGGTAAGACCGACACTCCTTAATCCTGTTCGGAATCGCCGCGTTTC
CATTACCATAAGCCTCTCTAGCCGCATCCACTTCTTTAGGAAGAACCATCTTGAGCTCTT
CCTCGAAA*GCTCCGATCTTTTGAAAGATCGACGTCACCGCGTTCTTCTCAGTCTCGCCG
TTAGACAAA*GCGTGGTCAACAA*TAACCTGTCTCAGCTTCTGCATCAACGGGTACGTGG
CGCTACAA*GGATCATCCACGTACGTGAACACCTGCTCACGGTCAACGACCTTAAGCAAG
TCCTTCTCGCAGAAGCGCGAAGGATGCAGCTCACCGTTGACTCCAGTAGTCAACACTTTC
TTCGCCACTTGAGAGACCGTGGTCTTCACCGTCTGTCTCAGATTCTCCTCGAGATGTCTC
AGACCAACAGCCTGGCATATCGCGACGAGGAACGTCGTCGACATAAGCTTGAGAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI42TF C 255
AF RR4AI42JQ U 1
AF RR4CU41JQ U 2
BS 1 123 RR4AI42JQ
BS 124 124 RR4CU41JQ
BS 125 199 RR4AI42JQ
BS 200 200 RR4CU41JQ
BS 201 204 RR4AI42JQ
BS 205 205 RR4CU41JQ
BS 206 244 RR4AI42JQ
BS 245 245 RR4CU41JQ
BS 246 687 RR4AI42JQ
BS 688 775 RR4CU41JQ

RD RR4AI42TF 319 0 0
CACAA
CTTCTCTCCTGTCAGCAACTTCGTTCCGAGCTCTTCCCTCACGAACTTATACAACGGGTA
AGACCGACACTCCTTAATCCTGTTCGGAATCGCCGCGTTTCCATTACCATAAGCCTCTCT
AGCCGCATCCACTTCTTTAGGAAGAACCATCTTGAGCTCTTCCTCGAAAAGCTCCGATCT
TTTGAAAGATCGACGTCACCGCGTTCTTCTCAGTCTCGCCGTTAGACAAAAGCGTGGTCA
ACAAATAACCTGTCTCAGCTTCTGCATCAACGGGTACGTGGCGCTACAAAGGATCATCCA
CGTACGTGAACACC

QA 6 319 6 319
DS 

RD RR4AI42JQ 687 0 0
GCACGTAAATTTTCATATATATATTTATATCATACAAAATGACACCATTCACATTACAAC
CACTCAGTGGTAAAACATTTGATTCAAACATATAAAATTAGACAAAGCAAAAACAGAACA
AAA*CAGAGGAATGCTGTCTTAGCATATAGGAATCGGAGCTCCGTTCCATTCCTCGAGGC
AATCCATCAATGGATCAATGATCTTACCTTCACACATTGCAGTGAACACCTTATCAAACT
CCTCTCCCGGAGACACAACCTTCTCTCCTGTCAGCAACTTCGTTCCGAGCTCTTCCCTCA
CGAACTTATACAACGGGTAAGACCGACACTCCTTAATCCTGTTCGGAATCGCCGCGTTTC
CATTACCATAAGCCTCTCTAGCCGCATCCACTTCTTTAGGAAGAACCATCTTGAGCTCTT
CCTCGAAA*GCTCCGATCTTTTGAAAGATCGACGTCACCGCGTTCTTCTCAGTCTCGCCG
TTAGACAAA*GCGTGGTCAACAA*TAACCTGTCTCAGCTTCTGCATCAACGGGTACGTGG
CGCTACAA*GGATCATCCACGTACGTGAACACCTGCTCACGGTCAACGACCTTAAGCAAG
TCCTTCTCGCAGAAGCGCGAAGGATGCAGCTCACCGTTGACTCCAGTAGTCAACACTTTC
TTCGCCACTTGAGAGACCGTGGTCTTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CU41JQ 774 0 0
CACGTAAATTTTCATATATATATTTATATCATACAAAATGACACCATTCACATTACAATC
ACTCAGTGGTAAAACATTTGATTCAAACATATAAAATTAGACAAAGCAAAAACAGAACAA
AAACAGAGGAATGCTGTCTTAGCATATCGGAATCGGAGCTCCGTTCCATTCCTTGAGGCA
ATCCATCAGTGGATCAATAATCTCACCTTCACACATTGCAGTGAACACCTTATCAAACTC
CTCCCCCGGAGACACAACCTTCTCTCCTGTCAACAACTTTGTTCCGAGCTCTTCCCTCAC
AAACTTATACAACGGGTAAGACCGACATTCCTTAATCCTGTTCGGAATCGCCGCGTTTCC
GTTACCATAAGCCTCTCTAGCCGCATCCACTTCTTTAGGAAGAACCATCTTCAGCTCTTC
CTCGAAC*GCTCCGATCTTTTGAAAGATCGACGTCACCGCGTTCTTCTCAGTCTCACCGT
TAGACAAA*GCGTGGTCAACAA*TAACCTGTCTCAGCTTCTGCATCAACGGGTACGTGGC
GCTACAA*GGATCATCCACGTACGTGAACACCTGCTCACGGTCAACGACCTTAAGCAAGT
CCTTCTCGCAGAAGCGCGAAGGATGCAGCTCGCCGTTGACTCCAGTAGTCAACACTTTCT
TCGCCACTTGAGAGACCGTGTTCTTCACCGTCTGTCTCAGATTCTCCTCGAGATGTCTCA
GACCAACAGCCTGGCATATCGCGACGAGGAACGTCGTCGACATAAGCTTGAGAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL4175Contig1 756 2 2 U
GCGATGTGCCAGGAACTTCGATATTTGTGTCAAATCTGCCAATGGATGCAATGCCGCCTC
AAGTCCATGAACTGTTCAAGGAGTTTGGTCCTATCAAAGAACATGGTGTTCAAGTCAGAA
GCTCCAATGCTCGTGGAACTTGCTTCGGTTTTGTTGCCTTTGAATCTGTTACCTCTGTCC
AGATCGTGCTTGAGGCTGCCAAGAACAATCCCTTCAAGCTTGGAGACCGTAAGCTTCGTG
TAAAGGAGAAGCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACCGTCTGGTGGGAGAAAGACTGAGA
ATGGCTCTGCAGATGGAAGCAAGCCTTCTGGTGTGAAAAGCGGTGGAGGAGGAAGCAAGA
GTGAGAATGGCTCTGCCTCTGCAGTAGATGGAAGCAAGACAGAGAATGGGTCTGCTGCAG
ATGCGGAAGATGACTTCAAGCCTATTAGAAGCCGTAGGAACAGAAGCGAGAAAAAGGGAA
ACGTTAACGAGAAAAACAATGTGCAAACAACACCAAAACCAAAGGCTTGATTGATGCTCT
CCCCTCTGCCAGTTCCAACAACAACAACACCAAAAAGAGTCGACTTGAGATTATTTTTCT
ATATTACAGATTCATCATCTCTTTACTTCTTTAGGTCTTTTCTTGCATCTTATTGGGAGC
CAACATGATTTTTTTTCTGTTTTGTTTTCGTATTTTTTTCAACAGACAACTTCTACCGTT
TTTGTTTTTTCTTCTATTCGAAATTTATTTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE46TF U 1
AF RR4DE46JQ C 62
BS 1 549 RR4DE46TF
BS 550 756 RR4DE46JQ

RD RR4DE46TF 549 0 0
GCGATGTGCCAGGAACTTCGATATTTGTGTCAAATCTGCCAATGGATGCAATGCCGCCTC
AAGTCCATGAACTGTTCAAGGAGTTTGGTCCTATCAAAGAACATGGTGTTCAAGTCAGAA
GCTCCAATGCTCGTGGAACTTGCTTCGGTTTTGTTGCCTTTGAATCTGTTACCTCTGTCC
AGATCGTGCTTGAGGCTGCCAAGAACAATCCCTTCAAGCTTGGAGACCGTAAGCTTCGTG
TAAAGGAGAAGCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACCGTCTGGTGGGAGAAAGACTGAGA
ATGGCTCTGCAGATGGAAGCAAGCCTTCTGGTGTGAAAAGCGGTGGAGGAGGAAGCAAGA
GTGAGAATGGCTCTGCCTCTGCAGTAGATGGAAGCAAGACAGAGAATGGGTCTGCTGCAG
ATGCGGAAGATGACTTCAAGCCTATTAGAAGCCGTAGGAACAGAAGCGAGAAAAAGGGAA
ACGTTAACGAGAAAAACAATGTGCAAACAACACCAAAACCAAAGGCTTGATTGATGCTCT
CCCCTCTGC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4DE46JQ 695 0 0
AGTCCATGAACTGTTCAAGGAGTTTGGTCCTATCAAAGAACATGGTGTTCAAGTCAGAAG
CTCCAATGCTCGTGGAACTTGCTTCGGTTTTGTTGCCTTTGAATCTGTTACCTCTGTCCA
GATCGTGCTTGAGGCTGCCAAGAACAATCCCTTCAAGCTTGGAGACCGTAAGCTTCGTGT
AAAGGAGAAGCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACCGTCTGGTGGGAGAAAGACTGAGAA
TGGCTCTGCAGATGGAAGCAAGCCTTCTGGTGTGAAAAGCGGTGGAGGAGGAAGCAAGAG
TGAGAATGGCTCTGCCTCTGCAGTAGATGGAAGCAAGACAGAGAATGGGTCTGCTGCAGA
TGCGGAAGATGACTTCAAGCCTATTAGAAGCCGTAGGAACAGAAGCGAGAAAAAGGGAAA
CGTTAACGAGAAAAACAATGTGCAAACAACACCAAAACCAAAGGCTTGATTGATGCTCTC
CCCTCTGCCAGTTCCAACAACAACAACACCAAAAAGAGTCGACTTGAGATTATTTTTCTA
TATTACAGATTCATCATCTCTTTACTTCTTTAGGTCTTTTCTTGCATCTTATTGGGAGCC
AACATGATTTTTTTTCTGTTTTGTTTTCGTATTTTTTTCAACAGACAACTTCTACCGTTT
TTGTTTTTTCTTCTATTCGAAATTTATTTTTCATC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

CO CL4176Contig1 939 3 4 U
GGGGATGATGAGGATGTCTACTTTGATGATGAATCTGCAGAAGTGGTCATATCTTCCTTG
CGCCTTGGAGATGATGAGGAGAGCGGTTCCCTCTTCACAAATTCAAACTGGTTTGCTTTC
GATGATGAAAAATCTGCGAATGAACGCTCAGTGAACTCAATCGCTTCCCCTTCACCCGAT
GGTGATGAGGATGATGTCGTCATAGGTGAAGCCGATGAATTCAGCGACGCCGCAGCTTCT
TCCGAGGCTGTTGATATGGAAACAGAAGACTCTACATCGAAGAATCCTACTGAAAACCCG
AGTGAACAAGAAGCTGAAAAATCACCTGCTTGGGTTGAATGGAGAGAGACCTCCGAGTCT
ACTGCGCCTTCTTCAAACCCAGACGAAGCCACCATATTGCCCAATGGTGTGGTTCAAACA
GAGAAAGAGGATGCTGGTGATGATACCGAAAAGAAAAGTGCAGATGAGAATCCACCACCA
GATGCATGTGGCGATGAAACCACAGAGAAGTCACCAGATGCAGCAAGTTGCGAGGCTGAA
ATAGATGAGAAGTTGAAAGAATCGAGTTGTGATGCATCAGAAGAAGCTGTTGAATCGCAT
GAGAAGAATGCTCAAAGCTCCGAACCTGCAATCCCGCAGGAGACAGAGAAAAGCCAGGAA
GCGGATGTAGATGCCAAAGAAACTAAAGAAGCTGCTTTAGAGGAGCCAAAGATGTGAGCT
TTACTTCAAACTGGGGTTCACTTCTTAACTAGTAAATCAAATTTCTACTTTGGTTTTATA
TAGTTTGCTTTTATATAGTTTGGTTTTTATCTGGTACGGATACGAGTTAATTACTATTCT
TTTTTTTGTTCTCGTTTCCATTGTATCATCCCCAAATCCAGTCCCAACATTATTGTCGAC
CAAGAGTTACAGTTGGCTTATCATTTTTTCTAGTTGAAG


BQ
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G
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TCACTCTCCCCGTTGGCACAATGTCCAGGTCGACAGAGATGACACGCGGTCGTTTTACCC
AAAGATACGCAGCGGCCAACGTGGGTGCCAACGTGGGTGTATTCTGGGACATCAATGATT
TCCCCATTCCCGATTATCTTGATTCATGTGCCTTTTATGAAGATGTGAAAACAAGTCTTC
AGGAGAAGGGTTTTACTGGTAGCTTTTCATTACATCTATACGCAGATGGCGATCCCTACA
TGCCTGCCAGATTGGTAAACCGATTTCGGTGTCTCGAACTTGGAGTCAGTTACATACCTT
CAGGTGGTGAATTTCAAAGAAGAAGCGGCAGTCAATATTTCCTACCTGGGTATTAGTCAC
GACCTCTTCTTAGCGTATGATCTTCGTACCGAAAGCCCTGAATGGCTTTGCTCTTTCTCT
ATTAGACCTCTCTCCATGAGACCTCGAAGTGCACATCTGACGAAGACTAAGATCGAATTC
GAGTCTTTTCTCTCCCTTTTCAGGAAATTTGACACCTCTTTCCGTTTTTTTCCCAAGGCC
ATACAGACTTCACACAAAGGTCGTCGTGCACAAGTCTTCTGGGATGTCTCGGATTCCTCA
AAACTTGAAGTTTTGGATCCCCAAGGGGTTGCTGCCCATATCAGTGGAGCGCTTGTTGGT
AATGGTTACTCTCTTCCTCTTTGTAGTACTCTCGTCTACATTGACGAGAACACTGTCTCA
CCTGATATCTTATCAAGATATGCCCATGCTAATCTACT

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AD38JQ 801 0 0
AGGTGGT
GAATTTCAAAGAAGAAGCGGCAGTCAATATTTCCTACCTGGGTATTAGTCACGACCTCTT
CTTAGCGTATGATCTTCGTACCGAAAGCCCTGAATGGCTTTGCTCTTTCTCTATTAGACC
TCTCTCCATGAGACCTCGAAGTGCACATCTGACGAAGACTAAGATCGAATTCGAGTCTTT
TCTCTCCCTTTTCAGGAAATTTGACACCTCTTTCCGTTTTTTTCCCAAGGCCATACAGAC
TTCACACAAAGGTCGTCGTGCACAAGTCTTCTGGGATGTCTCGGATTCCTCAAAACTTGA
AGTTTTGGATCCCCAAGGGGTTGCTGCCCATATCAGTGGAGCGCTTGTTGGTAATGGTTA
CTCTCTTCCTCTTTGTAGTACTCTCGTCTACATTGACGAGAACACTGTCTCACCTGATAT
CTTATCAAGATATGCCCATGCTAATCTACTTTTGCATCCAGTCCCCAAAGGAAACAAGTT
TGCTAGAATGCATAGTATTGCACTCGACTTGCTTTTCCATGCAAGGATTTGTAGTAAACC
ATCAACTCTTCTCTTACTCTCAGAAGACATCGATGAGGATCCTCTGTTCTCAACAGTTCT
TGATTTCCTTCAAAGGAAAGGTTTCAATATTGTTGTTCAAAATCCTAACCCAATAGTAGA
ACTTCCTTTTGATCCAAATGATTATGTATTTGATGACATTAGCCCGAAATTCTGAATTAA
TTATGTATTGTGCTTTTTTTTATTGTTAAGGAGAACAATTATTATTATAATAAATAATGT
CTCTTTTTTGAACC

QA 8 801 8 801
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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ACACGCGACGAGTCTCATCCTCTCTTCCTCCTCCAGGTTCTCTCGTCTCGGCTACGCACC
AGATTTCTCCTTCTGTAAAGAAACGTGTGGTCTCTGGAGTCCAGCCTACAGGTTCAATCC
ACCTCGTGAAACTATCTCGGCGCTATCAAAAACTGGGTCACTCTTCAGGATACATACGAA
ACACTCTTTTTTATCGTTGACCTTCATGCGATAACACTACCGTATGACGTGCAAGAACTA
AGAAAGGCAACTAGGGATACCGCAGCGCTCTATCTAGCATGTGGTGTAGACATTTCTAAG
GCTTCGGTGTTTGTGCAATCTCACGTCCGCGCTCATGTAGAGTTAATGTGGCTTTTGAGT
TCATCCACACCTATCGGTTGGCTACAGAAAATGACCCAGTTCAAAGAGAAATCACGCAAG
GAGGGGGGTGAGAATGCTTCTGTGTCTTTGTTAACTTATCCAGTTCTGATGGCTGCTGAC
ATCCTCTTGTATAAGTCAGATTTTGTGCCTGTGGGTGAGGACCAGAAGCAGCACCTAGAA
CTTGCACGCGACCTGGCACAGCGTGTGAATAATTTATATGGTGGAAGGAAGTGGAAGAAG
CTTGGAGGGCGTGGTGGTTCTATCTTTAAGATACCAGAACCACTCATACCACAAGTTGGA
GCCAGTCCCGGATCAATCTCCTTGACTCTAAAGATTTGATTGCGGATAAGATCAAACGGT
CCAAGACAGATTCATTTGCAGGCCTTGAGTTTGACAATGCCGAGAGACCTGAATGCAACA
ATCACCTCTCCGTATATCAGATTGTTTCAGGCAATACAAAAGAGGAAGTGATGGAGGAAT
GCAAAAATATGAGCTGGGGCACATTTAAGCCTCTCCTTGCTGATGCTGTCATCGAGCATC
TCAGTCCAATCCAGGTCCGTTATGAGGAGATAACAGCAGAGTCAGCTTATTTGGACAAAG
TATTGTCAGAAGGTGCGGACAGAGCCACGGAGATAGCCGAATCCACTATTCACAATTTGA
AACAAGCGATGGGTTTCTATATATGAGAGAGGATCAGTGCCTACAAGCTTCTTTTTTTTT
TTGGTGGAGAGTGAGAGTTAAGAGTTAAAATTTGTAAAACGATTTTTGATTCTTGTATTA
GTGCAGTCAAATGCTGCTCAATATTCTTTGCTGTAACTGTGATGTATCGATATTCTTTGC
GGTAAGTTATTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E764TF U 1
AF RR4EH82TF U 203
AF RR4EH82JQ C 527
BS 1 441 RR4E764TF
BS 442 442 RR4EH82TF
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BS 619 636 RR4E764TF
BS 637 797 RR4EH82TF
BS 798 1275 RR4EH82JQ

RD RR4E764TF 636 0 0
TTTTTTTTCGGTGGTGCGGCGTGACTGACCATCAGAGAGAAGACAAAGAATGGCAGCAGC
ACACGCGACGAGTCTCATCCTCTCTTCCTCCTCCAGGTTCTCTCGTCTCGGCTACGCACC
AGATTTCTCCTTCTGTAAAGAAACGTGTGGTCTCTGGAGTCCAGCCTACAGGTTCAATCC
ACCTCGTGAAACTATCTCGGCGCTATCAAAAACTGGGTCACTCTTCAGGATACATACGAA
ACACTCTTTTTTATCGTTGACCTTCATGCGATAACACTACCGTATGACGTGCAAGAACTA
AGAAAGGCAACTAGGGATACCGCAGCGCTCTATCTAGCATGTGGTGTAGACATTTCTAAG
GCTTCGGTGTTTGTGCAATCTCACGTCCGCGCTCATGTAGAGTTAATGTGGCTTTTGAGT
TCATCCACACCTATCGGTTGGTTGCAGAAAATGACCCAGTTCAAAGAGAAATCACGCAAG
GAGGGGGGTGAGAATGCTTCTGTGTCTTTGTTAACTTATCCAGTTCTGATGGCTGCTGAC
ATCCTCTTGTATAAGTCAGATTTTGTGCCTGTGGGTGAGGACCAGAAGCAGCACCTAGAA
CTTGCCCGCGACCTGGCGCAGCGTGTGAATAATTTA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4EH82TF 595 0 0
G
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TCATGCGATAACACTACCGTATGACGTGCAAGAACTAATAAAGGCAACTAGGGATACCGC
AGCGCTCTATCTAGCATGTGGTGTAGACATTTCTAAGGCTTCGGTGTTTGTGCAATCTCA
CGTCCGTGCTCATGTGGAGTTAATGTGGCTTTTGAGTTCATCCACACCTATTGGTTGGCT
ACAGAAAATGACTCAGTTCAAAGAGAAATCACGCAAGGAGGGGGGTGAGAATGCTTCTGT
GTCTTTGTTAACTTATCCAGTTCTGATGGCTGCTGACATCCTCTTGTATAAGTCAGATTT
TGTGCCTGTGGGTGAGGACCAGAAGCAGCACCTAGAACTTGCACGCGACCTGGCACAGCG
TGTGAATAATTTATATGGTGGAAGGAAGTGGAAGAAGCTTGGAGGGCGTGGTGGTTCTAT
CTTTAAGATACCAGAACCACTCATACCACAAGTTGGAGCCAGTCCCGGATCAATCTCCTT
GACTCTAAAGATTTGATTGCGGATAAGATCAAACGGTCCAAGACAGATTCATTT

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR4EH82JQ 749 0 0
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AGCAGCACCTAGAACTTGCACGCGACCTGGCACAGCGTGTGAATAATTTATATGGTGGAA
GGAAGTGGAAGAAGCTTGGAGGGCGTGGTGGTTCTATCTTTAAGATACCAGAACCACTCA
TACCACAAGTTGGAGCCAGTCCCGGATCAATCTCCTTGACTCTAAAGATTTGATTGCGGA
TAAGATCAAACGGTCCAAGACAGATTCATTTGCAGGCCTTGAGTTTGACAATGCCGAGAG
ACCTGAATGCAACAATCACCTCTCCGTATATCAGATTGTTTCAGGCAATACAAAAGAGGA
AGTGATGGAGGAATGCAAAAATATGAGCTGGGGCACATTTAAGCCTCTCCTTGCTGATGC
TGTCATCGAGCATCTCAGTCCAATCCAGGTCCGTTATGAGGAGATAACAGCAGAGTCAGC
TTATTTGGACAAAGTATTGTCAGAAGGTGCGGACAGAGCCACGGAGATAGCCGAATCCAC
TATTCACAATTTGAAACAAGCGATGGGTTTCTATATATGAGAGAGGATCAGTGCCTACAA
GCTTCTTTTTTTTTTTGGTGGAGAGTGAGAGTTAAGAGTTAAAATTTGTAAAACGATTTT
TGATTCTTGTATTAGTGCAGTCAAATGCTGCTCAATATTCTTTGCTGTAACTGTGATGTA
TCGATATTCTTTGCGGTAAGTTATTTTAA

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

CO CL4180Contig1 1052 3 11 U
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TCATTGAAAAAATATCTGAAGTTCCTCTCACTGTTCATCTTCCCCCTTCTCTCTAAAAAC
CTAGATCCAGTTTTCTTTGCTCGCCGGCTTCGGTGGCTTCTCTAGCACGGAGCTGTGCTC
CCCCTCTGTTTATATTTGTTCCTTTTCGCATCTGTTCTGTTCTCGTGCTTTCTTTTGGCG
GATTAAACAACGGTTCCTCCGAGTTAGATCCTATTTTGTCTCGGTGGTCCGGCTTCTATC
CGTTTAATCTATGGATGGTTTTCGATGGCTTTCAGTTCTTTTCTTTGAGACTGGTTGAGC
TGTTTGCAGGTGGCTTGTAGCGGTAGGGTCTTACTTTTATTTCAGATCTGACGGTCTCTC
TGTCATGTTATCCCCTCTAGCCTCTCTCTGCTTGATGGCTCTTGGATGTGCTGGTGAAGG
GTTTGTGTCCTTTGGATCCGTTTACCTTGCTCGTGGAAGCACTATCTTGAATCGGCTGTG
CTGTTCTGAGGAGAGATCTCTCAGTTTCCTCCCCTTTGCCGTCGGTGTCTTATGTGGTTG
GCGTTTTGAGCTTGTTAAATCGGTTTTCTGCTGTGATTATCCCCCAAAGTTTGTGCTTCT
TGTTGTTTGGATGGTTTTTTCAGAAATTGTTGGTCACCGGAACTATTATTGCGGCCTCAC
TGGTAAAAGATCTCTGGGAAGAGGGATAAGCAAATGTTCTGGTCCGTAGCCATGTTCTTA
ATTTCTGTTTGATCCATTCTTATTGTTTGGTTCTCTGGTCATAGCCATCCAGTTGATCTT
GTTTCAGTCTCTTTGGATAGTGTCTGTAGCCATGTTTGAACTGTCTCTAGGTTTATCTAT
TTTCTTAAGTTTTCCAGTTGGGCTGTAGTTTCAGGAGATAGTATGTTATCTGCCTACTTA
GTTTCTCCTATTTTTTTGGATCTCTTGTTTTCTGCTAGTGTCCTGTTGTAAAGTTTCAGG
CTGAAGATCGAATGAAAATATTGGTCAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DV47TF U 1
AF RR4FW10TF U 78
AF RR4DV47JQ C 275
BS 1 584 RR4DV47TF
BS 585 585 RR4FW10TF
BS 586 615 RR4DV47TF
BS 616 727 RR4FW10TF
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BS 729 800 RR4FW10TF
BS 801 801 RR4DV47JQ
BS 802 809 RR4FW10TF
BS 810 811 RR4DV47JQ
BS 812 833 RR4FW10TF
BS 834 1052 RR4DV47JQ

RD RR4DV47TF 615 0 0
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TCATTGAAAAAATATCTGAAGTTCCTCTCACTGTTCATCTTCCCCCTTCTCTCTAAAAAC
CTAGATCCAGTTTTCTTTGCTCGCCGGCTTCGGTGGCTTCTCTAGCACGGAGCTGTGCTC
CCCCTCTGTTTATATTTGTTCCTTTTCGCATCTGTTCTGTTCTCGTGCTTTCTTTTGGCG
GATTAAACAACGGTTCCTCCGAGTTAGATCCTATTTTGTCTCGGTGGTCCGGCTTCTATC
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TGTCATGTTATCCCCTCTAGCCTCTCTCTGCTTGATGGCTCTTGGATGTGCTGGTGAAGG
GTTTGTGTCCTTTGGATCCGTTTACCTTGCTCGTGGAAGCACTATCTTGAATCGGCTGTG
CTGTTCTGAGGAGAGATCTCTCAGTTTCCTCCCCTTTGCCGTCG*TGTCTTATGTGGTTG
GCGTTTTGAGCTTGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4FW10TF 760 0 0
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TGCTCGCCGGCTTCGGTGGCTTCTCTAGCACGGAGCTGTGCTCCCCCTCTGTTTATATTT
GTTCCTTTTCGCATCTGTTCTGTTCTCGTGCTTTCTTTTGGCGGATTAAACAACGGTTCC
TCCGAGTTAGATCCTATTTTGTCTCGGTGGTCCGGCTTCTATCCGTTTAATCTATGGATG
GTTTTCGATGGCTTTCAGTTCTTTTCTTTGAGACTGGTTGAGCTGTTTGCAGGTGGCTTG
TAGCGGTAGGGTCTTACTTTTATTTCAGATCTGACGGTCTCTCTGTCATGTTATCTCCTC
TAGCCTCTCTCTGCTTGATGGCTCTTGGATGTGCTGGTGAAGGGTTTGTGTCCTTTGGAT
CCGTTTACCTTGCTCGTGGAAGCACTATCTTGAATCGGCTGTGCTGTTCTGAGGAGAGAT
CTCTCAGTTTCCTCCCCTTTGCCGTCGGTGTCTTATGTG*TTGGCGTTTTGAGCTTGTTA
AATCGGTTTTCTGCTGTGATTATCCCCCAAAGTTTGTGCTTCTTGTTGTTTGGATGGTTT
TTTCAGAAATTGTTGGTCACCGGAACTATTATTGCGGCCTCACTGGTAAA*GATCTCTGG
GAAGAGGGATAAGCAAATGTTCTGGTCCGTAGCCATGTTCTTAATTTCTGTTTGATCCAT
TCT*ATTGTTTG**TCTCTGGTCATAGCCATCCAGT
GATC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4DV47JQ 778 0 0
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GTTCTTTTCTTTGAGACTGGTTGAGCTGTTTGCAGGTGGCTTGTAGCGGTAGGGTCTTAC
TTTTATTTCAGATCTGACGGTCTCTCTGTCATGTTATCCCCTCTAGCCTCTCTCTGCTTG
ATGGCTCTTGGATGTGCTGGTGAAGGGTTTGTGTCCTTTGGATCCGTTTACCTTGCTCGT
GGAAGCACTATCTTGAATCGGCTGTGCTGTTCTGAGGAGAGATCTCTCAGTTTCCTCCCC
TTTGCCGTCGGTGTCTTATGTGGTTGGCGTTTTGAGCTTGTTAAATCGGTTTTCTGCTGT
GATTATCCCCCAAAGTTTGTGCTTCTTGTTGTTTGGATGGTTTTTTCAGAAATTGTTGGT
CACCGGAACTATTATTGCGGCCTCACTGGTAAAAGATCTCTGGGAAGAGGGATAAGCAAA
TGTTCTGGTCCGTAGCCATGTTCTTAATTTCTGTTTGATCCATTCTTATTGTTTTGTTCT
CTGGTCATAGCCATCCAGTTGATCTTGTTTCAGTCTCTTTGGATAGTGTCTGTAGCCATG
TTTGAACTGTCTCTAGGTTTATCTATTTTCTTAAGTTTTCCAGTTGGGCTGTAGTTTCAG
GAGATAGTATGTTATCTGCCTACTTAGTTTCTCCTATTTTTTTGGATCTCTTGTTTTCTG
CTAGTGTCCTGTTGTAAAGTTTCAGGCTGAAGATCGAATGAAAATATTGGTCAGTTGC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

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TCACAATGCAATTGTCACATTTGATGGGAAAAAGACCCTATCAATCTCACTAATGGCACT
AATATGCGTACTTGGTAACAACAATCGTAACAAAGGTACTGCCGAAGTTGAGACCTTGAA
CTTAGGTTTGATCTTGTCCACTGCTGCTTTGATGATCGATGGAGACGGTACGCTGAACCA
TTTTAAATACCATGAGAGAAGGATTACATCTTTCTGCATCTCAGAGTTATGAACAGCATG
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AATCTCTTCGCACCGTTTCCCCAATGATGCTAAGAAGATTGATTGAACAAAGCCACCTGA
AGAGGCCAATCTTCCACTAGTTACCGCCTCGTTGTAAGCAAGAGAAACCTTGAGGCC


BQ
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AF RR4G509JQ U 1
AF RR4FA82JQ U 5
AF RR4FA82TF C 5
BS 1 334 RR4G509JQ
BS 335 537 RR4FA82JQ

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AAATATTAATCTGTGCTAATTGAATAGCCATCAAAATTAGAAGAACCAAAATCATGTTTT
TCACAATGCAATTGTCACATTTGATGGGAAAAAGACCCTATCAATCTCACTAATGGCACT
AATATGCGTACTTGGTAACAACAATCGTAACAAAGGTACTGCCGAAGTTGAGACCTTGAA
CTTAGGTTTGATCTTGTCCACTGCTGCTTTGATGATCGATGGAGACGGTACGCTGAACCA
TTTTAAATACCATGAGAGAAGGATTACATCTTTC

QA 1 334 1 334
DS 

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G
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TTAATCTGTGCTAATTGAATAGCCATCAAAATTAGAAGAACCAAAATCATGTTTTTCACA
ATGCAATTGTCACATTTGATGGGAAAAAGACCCTATCAATCTCACTAATGGCACTAATAT
GCGTACTTGGTAACAACAATCGTAACAAAGGTACTGCCGAAGTTGAGACCTTGAACTTAG
GTTTGATCTTGTCCACTGCTGCTTTGATGATCGATGGAGACGGTACGCTGAACCATTTTA
AATACCATGAGAGAAGGATTACATCTTTCTGCATCTCAGAGTTATGAACAGCATGCCAAG
TCTCCGAGATCAGATAGTTCCTCAAATGAATCTTCAGCTCGGTTGAGCAATTCAGAATCT
CTTCGCACCGTTTCCCCAATGATGCTAAGAAGATTGATTGAACAAAGCCACCTGAAGAGG
CCAATCTTCCACTAGTTACCGCCTCGTTGTAAGCAAGAGAAACCTTGAGGCC

QA 2 533 2 533
DS 

RD RR4FA82TF 533 0 0
G
GTCCATCGAATTCATAATCATATTCACTAGGTCTGGGTAATCCTACAGAGAGAGTAAATA
TTAATCTGTGCTAATTGAATAGCCATCAAAATTAGAAGAACCAAAATCATGTTTTTCACA
ATGCAATTGTCACATTTGATGGGAAAAAGACCCTATCAATCTCACTAATGGCACTAATAT
GCGTACTTGGTAACAACAATCGTAACAAAGGTACTGCCGAAGTTGAGACCTTGAACTTAG
GTTTGATCTTGTCCACTGCTGCTTTGATGATCGATGGAGACGGTACGCTGAACCATTTTA
AATACCATGAGAGAAGGATTACATCTTTCTGCATCTCAGAGTTATGAACAGCATGCCAAG
TCTCCGAGATCAGATAGTTCCTCAAATGAATCTTCAGCTCGGTTGAGCAATTCAGAATCT
CTTCGCACCGTTTCCCCAATGATGCTAAGAAGATTGATTGAACAAAGCCACCTGAAGAGG
CCAATCTTCCACTAGTTACCGCCTCGTTGTAAGCAAGAGAAACCTTGAGGCC

QA 2 533 2 533
DS 



AS 1 3

CO CL4182Contig1 673 3 8 U
GGGAGGAAGCTTTGATTTGATCGTAAATTCGTAATCGATAGATTGTTGTTGGCGATTGCT
AAGATTGATTAAGAGAGTTGAGTTTTTTTTTTTTATTGTGCGATCGGAGATAATGGATTG
GGGAAATGTGACGGTTGAGGATCTGGTGGATGCTCTACGAGAGGTTGACTGGTCGTCGCC
GCCGCGTCCGCTATCGGAGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAATCTTTCGCTAAATG
GGATAGCCGCCTCAAGTGCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACTTCATCATGATCGT
CTTTATACTTGGATTGGGATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCTCTGCCCTTTTGAC
AGCACTAACTGTGGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTGAGAAGGCCAC
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TGTCATCCGTGGACGTCCATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTGGCCAACCCCGTTG
GGCCTTTGTCTTGGTATCCTCACTTGTGAGTTTTGCCCTTTGGTATATCTCATGTGGTTT
GTTCACTGTCTCTTTGGCACTACTCATTGGGCTTCTTGCTACGATTCTTCATGCAACCTT
GAGAACACCCAAC


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV45JQ C 183
AF RR4C809TF U 1
AF RR4GV45TF U 86
BS 1 100 RR4C809TF
BS 101 101 RR4GV45TF
BS 102 182 RR4C809TF
BS 183 183 RR4GV45TF
BS 184 255 RR4C809TF
BS 256 256 RR4GV45TF
BS 257 560 RR4C809TF
BS 561 673 RR4GV45TF

RD RR4GV45JQ 257 0 0
C
GCGTCCGCTATCGGAGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAATCTTTCGCTAAATGGGA
TAGCCGCCTCAAGTGCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACTTCATCATGATCGTCTT
TATACTTGGATTGGGATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCTCTGCCCTTTTGACAGC
ACTAACTGTGGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTGAGAAGGCCACACG
AACCATCAGAAGATTC

QA 2 257 2 257
DS 

RD RR4C809TF 560 0 0
GGGAGGAAGCTTTGATTTGATCGTAAATTCGTAATCGATAGATTGTTGTTGGCGATTGCT
AAGATTGATTAAGAGAGTTGAGTTTTTTTTTTTTATTGTGTGATCGGAGATAATGGATTG
GGGAAATGTGACGGTTGAGGATCTGGTGGATGCTCTACGAGAGGTTGACTGGTCGTCGCC
GCTGCGTCCGCTATCGGAGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAATCTTTCGCTAAATG
GGATAGCCGCCTCAATTGCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACTTCATCATGATCGT
CTTTATACTTGGATTGGGATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCTCTGCCCTTTTGAC
AGCACTAACTGTGGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTGAGAAGGCCAC
ACGAACCATCAGAAGATTCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGACCTCCATTGGCGCC
TGTCATCCGTGGACGTCCATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTGGCCAACCCCGTTG
GGCCTTTGTCTTGGTATCCT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4GV45TF 588 0 0
TTTTTTTTTATTGTGCGATCGGAGATAATGGATTGGGGAAATGTGACGGTTGAGGATCTG
GTGGATGCTCTACGAGAGGTTGACTGGTCGTCGCCGCCGCGTCCGCTATCGGAGTTCTTC
TCAAGGTTCACCGTTCCTAAATCTTTCGCTAAATGGGATAGCCGCCTCAAGTGCAATCTC
TACTACTACCGAACGAACTACTTCATCATGATCGTCTTTATACTTGGATTGGGATTTCTT
ACAAGGCCTCTCGCCATTCTCTCTGCCCTTTTGACAGCACTAACTGTGGCATTCCTAAAT
GACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTGAGAAGGCCACACGAACCATCAGAAGATTCTCCCCA
CCTTTAGCTGCTAAAATGAGACCTCCATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGTCCATCAGCT
AAGAGAGCAATCTATATCTGTGGCCAACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGGTATCCTCACTT
GTGAGTTTTGCCCTTTGGTATATCTCATGTGGTTTGTTCACTGTCTCTTTGGCACTACTC
ATTGGGCTTCTTGCTACGATTCTTCATGCAACCTTGAGAACACCCAAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 3

CO CL4183Contig1 509 3 3 U
GATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAACAATATTATTTC
AGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCTGGGAAGC
TGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTCTACACTT
TTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTCTGGGTAT
GCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTT
GATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCTCTGGTAC
TTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCATTTCACAT
GTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCCATTTAGTGCTATGCATGGTTCTTTGGT
AACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4ET82TF U 1
AF RR4G483JQ C 52
AF RR4G483TF U 52
BS 1 452 RR4ET82TF
BS 453 453 RR4G483TF
BS 454 509 RR4ET82TF

RD RR4ET82TF 509 0 0
GATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAACAATATTATTTC
AGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCTGGGAAGC
TGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTCTACACTT
TTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTCTGGGTAT
GCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTT
GATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCTCTGGTAC
TTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCATTTCACAT
GTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCATGGTTCTTTGGT
AACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAG

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4G483JQ 458 0 0
G
ATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATC
TGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTT
CTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGT
CTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCT
GTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATC
TCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCA
TTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCCATTTAGTGCTATGCATGGT
TCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAG

QA 2 458 2 458
DS 

RD RR4G483TF 458 0 0
G
ATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATC
TGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTT
CTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGT
CTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCT
GTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATC
TCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCA
TTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCCATTTAGTGCTATGCATGGT
TCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAG

QA 2 458 2 458
DS 



AS 1 3

CO CL4184Contig1 1141 3 11 U
GGAAGCCATATAGAGTCAAGATTTAAATAAGTAAACTCGGCCCCTAACCGTCGTCGAAGT
TCTTCATCTCTTTATCTCACCGGCGACCAAAACCTACAAACGTTACGGAATCAGTCTGAA
TTGAAGCGTCATCTCTAAAGCACTCTCATTAACAATATCTCCCCACCCCTACCACGATTT
CCTCCCTCCCGATCTTCAACTATAAAAAAGTATGACTATCCCATGAAATTCATCAGTTTA
TTGTGATCACATACGTCCTTCCATGTTTTCCTATTCTACTCATCCGGAAAGAACTTTGGA
GTGGAGATTTGACAAGGGAATTGAGTGGCAACACGACAGAGAGTCAAGATACAGATGTTA
ACTAAACTGATTGTGATTTTTATGTTCATACTTTTTTGAATTTAGTATACGTTCGTTTAA
TGTTTTCTTCTGATTTAGATTCTTAGGCTGAAAAAATGGATCTGAGACTGAGAGCGAGTG
GATCCACATGGAGATCAAAATCCAAATCATAAGCCAAGGAATCTTGCGAACAAAGATAAG
CAGAGATGCGAGAGACGTGACCAACAGATTCTCCAACAAAAGTCAAAGAGATCAGATAGT
TACGCAGAAGAGGACATGTCCATGAAGCTATACTAGAGAAGATATGTGGAAAAATATCAA
GGAAATCAGAATTAAAAGAAGCGAAACTAAAGGCTGGCTAGTAGAGGAAATCTATGCACT
ATCTAAACAGGTTAAAACAAAAGAAAACATCAAGGTTAGAGTTTTCACCAAGAGCATCTG
AATAATGCAGAGGTAGAGCTATTGCAGACGGAGAGCTCAAACTTTTGATTGAAGCAGCAG
ATGGAGGAAAGAGAACGGAAGGCTTTGCAGTTTTGAAATAATTGACCGATCCTCAAAATG
ATTTTAGAGATGCAGTGGTTGAGATGATCATGGAGAATGGTGTCAACCACCCAGAAGAAC
TCAAACATGTTCACAGTTGTTATATCAGTCCAAGAGAAACAAGATCCAGCGAAAGTTTAT
TATTATCAAAAGAACATTTTAGGATAATCATCAGCTTACGCTCAAATCATGGATATTGGT
TAAAATGGTGTAAAGCTTATATGATTTTTTCTAACATCAGTAAAATTAATTAAATAACTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4FK90TF U 1
AF RR4AU54TF U 54
AF RR4FK90JQ C 482
BS 1 134 RR4FK90TF
BS 135 135 RR4AU54TF
BS 136 653 RR4FK90TF
BS 654 654 RR4AU54TF
BS 655 672 RR4FK90TF
BS 673 792 RR4AU54TF
BS 793 793 RR4FK90JQ
BS 794 810 RR4AU54TF
BS 811 811 RR4FK90JQ
BS 812 853 RR4AU54TF
BS 854 1141 RR4FK90JQ

RD RR4FK90TF 672 0 0
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TCTTCATCTCTTTATCTCACCGGCGACCAAAACCTACAAACGTTACGGAATCAGTCTGAA
TTGAAGCGTCATCTTTAAAGCACTCTCATTAACAATATCTCCCCACCCCTACCACGATTT
CCTCCCTCCCGATCTTCAACTATAAAAAAGTATGACTATCCCATGAAATTCATCAGTTTA
TTGTGATCACATACGTCCTTCCATGTTTTCCTATTCTACTCATCCGGAAAGAACTTTGGA
GTGGAGATTTGACAAGGGAATTGAGTGGCAACACGACAGAGAGTCAAGATACAGATGTTA
ACTAAACTGATTGTGATTTTTATGTTCATACTTTTTTGAATTTAGTATACGTTCGTTTAA
TGTTTTCTTCTGATTTAGATTCTTAGGCTGAAAAAATGGATCTGAGACTGAGAGCGAGTG
GATCCACATGGAGATCAAAATCCAAATCATAAGCCAAGGAATCTTGCGAACAAAGATAAG
CAGAGATGCGAGAGACGTGACCAACAGATTCTCCAACAAAAGTCAAAGAGATCAGATAGT
TACGCAGAAGAGGACATGTCCATGAAGCTATACTAGAGAAGATATGTGGAAAA*TATCAA
GGAAATCAGAAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4AU54TF 800 0 0
GG
GAAGTTCTTCATCTCTTTATCTCACCGGCGACCAAAACCTACAAACGTTACGGAATCAGT
CTGAATTGAAGTGTCATCTCTAAAGCACTCTCATTAACAATATCTCCCCACCCCTACCAC
GATTTCCTCCCTCCCGATCTTCAACTATAAAAAAGTATGACTATCCCATGAAATTCATCA
GTTTATTGTGATCACATACGTCCTTCCATGTTTTCCTATTCTACTCATCCGGAAAGAACT
TTGGAGTGGAGATTTGACAAGGGAATTGAGTGGCAACACGACAGAGAGTCAAGATACAGA
TGTTAACTAAACTGATTGTGATTTTTATGTTCATACTTTTTTGAATTTAGTATACGTTCG
TTTAATGTTTTCTTCTGATTTAGATTCTTAGGCTGAAAAAATGGATTTTAGACTGAGAGC
GAGTGGATCCACATGGAGATCAAAATCCAAATCAGAAGCCAAGGAATCTTGCGAACAAAG
ATAAGCAGAGATGCGAGAGACGTGACCAACAGATTCTCCAACAAAAGTCAAAGAGATTAG
ATAGTTACGCAGAAGAGGACATGTCCATGAAGCTATACTAGAGAAGATATGTGGAAAAAT
ATCAAGGAAATCAGAATTAAAAGAAGCGAAACTAAAGGCTGGCTAGTAGAGGAAATCTAT
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ATCTGAATAATGCAGAGTTAGAGCTATTGCAGACG*AGAGCTCAAACTTTTGATTGAAGC
AGCAGATGGAGGAAAGAG

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR4FK90JQ 660 0 0
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AGAGATGCGAGAGACGTGACCAACAGATTCTCCAACAAAAGTCAAAGAGATCAGATAGTT
ACGCAGAAGAGGACATGTCCATGAAGCTATACTAGAGAAGATATGTGGAAAAATATCAAG
GAAATCAGAATTAAAAGAAGCGAAACTAAAGGCTGGCTAGTAGAGGAAATCTATGCACTA
TCTAAACGGGTTAAAACAAAAGAAAACATCAAGGTTAGAGTTTTCACCAAGAGCATTTGA
ATAATGCAGAGGTAGAGCTATTGCAGACGGAGAGCTCAAACTTTTGATTGAAGCAGCAGA
TGGAGGAAAGAGAACGGAAGGCTTTGCAGTTTTGAAATAATTGACCGATCCTCAAAATGA
TTTTAGAGATGCAGTGGTTGAGATGATCATGGAGAATGGTGTCAACCACCCAGAAGAACT
CAAACATGTTCACAGTTGTTATATCAGTCCAAGAGAAACAAGATCCAGCGAAAGTTTATT
ATTATCAAAAGAACATTTTAGGATAATCATCAGCTTACGCTCAAATCATGGATATTGGTT
AAAATGGTGTAAAGCTTATATGATTTTTTCTAACATCAGTAAAATTAATTAAATAACTTG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4185Contig1 803 2 9 U
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AAAGGAAAAAATGCTATCCTCGACAACTAATCCCATAAGAAGGGAAACTAAAACCCATAA
AAAGGGAAACTATAGCTCATCATCCACAGAGCACATAAGCAACATAACCAAGTTGACTTC
AAAACTTAAATCCCCAAGAGGCTGAAAGTTCAAGAGAAAGGAAGGAGAAAACAGTAACCA
TGAAACTTAAACCACCGGAAGCTTACACGGAAACAGCCAGACGAAACGAGGATGGGCCTC
CAATGAGGATAGACACCGACACTTGAAATGCTTGGCAACCAATCCTAAAAACAGAAACAA
ACCCAACCGCCAGACCACACAGCAAAACAAGGACTTACACACCTCAAATTAGACTTTTTC
ACCGGAGAGAAACCAATAGCAAACCAAGGATCCTCGGGACGCTTCACCGTTTGCAGAAAA
AAACCCACAGAGACATACAACTCCACACCAAACCAGAACCAATTAAGAAAAGCCACAAAC
TTGAATGCACCAACTGAAGAACCAACACTGGAGAAATGGATCCAATCTTTGGACATAGGT
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ACATATGGCGCCAGACTCGTCAT


BQ
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AF RR4D506JQ U 1
AF RR4C663JQ U 1
BS 1 43 RR4C663JQ
BS 44 44 RR4D506JQ
BS 45 141 RR4C663JQ
BS 142 144 RR4D506JQ
BS 145 191 RR4C663JQ
BS 192 192 RR4D506JQ
BS 193 238 RR4C663JQ
BS 239 239 RR4D506JQ
BS 240 803 RR4C663JQ

RD RR4D506JQ 452 0 0
CTGTT
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AAAAGATGCTATCCTCGACAACTAATCCCATAAGAAGGGAAACTAAAACCCATAAAAAGG
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CTTAAACCACCGGAAGCTTACACGGAAACAGCCAGACGAAACGAGGATGGGCCTCCAATG
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ACCGCCAGACCACACAGCAGAACGAGGACTTACACACCTCAAATTAGACTTTTTCACCGG
AGAGAAACCAATAGCAAACCAAGGATC

QA 6 452 6 452
DS 

RD RR4C663JQ 803 0 0
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AAAGGAAAAAATGCTATCCTCGACAACTAATCCCATAAGAAGGGAAACTAAAACCCATAA
AAAGGGAAACTATAGCTCATC***CACAGAGCACATAAGCAACATAACCAAGTTGACTTC
AAAACTTAAATTCCCAAGAGGCTGAAAGTTCAAGAGAAAGGAAGGAGAAAACAGTAACTA
TGAAACTTAAACCACCGGAAGCTTACACGGAAACAGCCAGACGAAACGAGGATGGGCCTC
CAATGAGGATAGACACCGACACTTGAAATGCTTGGCAACCAATCCTAAAAACAGAAACAA
ACCCAACCGCCAGACCACACAGCAAAACAAGGACTTACACACCTCAAATTAGACTTTTTC
ACCGGAGAGAAACCAATAGCAAACCAAGGATCCTCGGGACGCTTCACCGTTTGCAGAAAA
AAACCCACAGAGACATACAACTCCACACCAAACCAGAACCAATTAAGAAAAGCCACAAAC
TTGAATGCACCAACTGAAGAACCAACACTGGAGAAATGGATCCAATCTTTGGACATAGGT
ACCTGAAGGCGCACACAGAAAAACTCAGTCGACAAAACAACTCACCGAGAAATAAACTCC
CTGCAGAAACGATGAGCAGCAAAAGGAACAAGAGTTGAAGAAAGCCCAAAAACGACGTCA
GCGAAAGCACCTGCACTGCTCCCAGCAGCTACACCGCACCGTCAACAGGTCCTCGACCTG
ACATATGGCGCCAGACTCGTCAT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 3

CO CL4186Contig1 808 3 6 U
AAAAGCAGATATCAATTCATTATGCCATCTCCAATCCATATCCAAAAGGTAATTTGCATC
CCAAGGAAAAAAGGCACGACACAAGTTAAAAAAAGAAAAAAAAAATTCAAAACAAAGCCA
TAAATAGTTTTTCAGGGTAGCAAATGTGATTCTCATAATAACAAGCAGAAACCATAACAT
AATAGCAGATTCTTCCATTCATTAAGCCCAGCCACCTCACATCGTTGTTTTTTCCTTCCC
GCTTCTAAGCCAAGTACCTAAACATGTTAGGGTTCTCCTTGTCCCTCTCCAAATAATCCC
TCGTTATCAAATCCTCCATGCGCTTCTTGATCGCTTTGATATCAGGCTTGAACATCCGGC
TAAGCTGCTCGACGCACTCGGAAACAAGCTGTTGATGTCCCAATACTTTCCTGCTCATCA
TGATCCTGACTATGGCAGCATCAATCGCATAGCGTCTGTCTTTGTCCACGTCTTCCACAA
CTTTCTTCCTTTCATCAACAGGTGG*AGAGGGATCTTTATTCTCCGCATTCTATCGGTGA
ATTTAGAGTTGAATTCAAAAGTATCAGCCTGGGTAACAGTCTTTGTGTTTGGCTCCTTGA
GAAGAATCTTGTATCTAGCACATGACAATGAATGAAGCAACCTCACTAAATCTTCGTGGC
TTAGGTTCAGCTGGGTTAGGATGTCAGTGTAGCTCAATTTGTCTGTTGTGTTGAACAGCA
GAAGCACAGCAGCCTGGTACGTAGACACAACTAATTCAATGGGCTTAATGTCGAACTTTC
CGTTGAGGTGACAAGTTCCTAGCGATAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EW41JQ U 1
AF RR4EW41TF C 1
AF RR4E746JQ U 40
BS 1 94 RR4EW41JQ
BS 95 95 RR4E746JQ
BS 96 167 RR4EW41JQ
BS 168 168 RR4E746JQ
BS 169 633 RR4EW41JQ
BS 634 808 RR4E746JQ

RD RR4EW41JQ 634 0 0
AAAAGCAGATATCAATTCATTATGCCATCTCCAATCCATATCCAAAAGGTAATTTGCATC
CCAAGGAAAAAAGGCACGACACAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCAAAACAAAGCCA
TAAATAGTTTTTCAGGGTAGCAAATGTGATTCTCATAATAACAAGCAAAAACCATAACAT
AATAGCAGATTCTTCCATTCATTAAGCCCAGCCACCTCACATCGTTGTTTTTTCCTTCCC
GCTTCTAAGCCAAGTACCTAAACATGTTAGGGTTCTCCTTGTCCCTCTCCAAATAATCCC
TCGTTATCAAATCCTCCATGCGCTTCTTGATCGCTTTGATATCAGGCTTGAACATCCGGC
TAAGCTGCTCGACGCACTCGGAAACAAGCTGTTGATGTCCCAATACTTTCCTGCTCATCA
TGATCCTGACTATGGCAGCATCAATCGCATAGCGTCTGTCTTTGTCCACGTCTTCCACAA
CTTTCTTCCTTTCATCAACAGGTGG*AGAGGGATCTTTATTCTCCGCATTCTATCGGTGA
ATTTAGAGTTGAATTCAAAAGTATCAGCCTGGGTAACAGTCTTTGTGTTTGGCTCCTTGA
GAAGAATCTTGTATCTAGCACATGACAATGAAT
C

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EW41TF 634 0 0
AAAAGCAGATATCAATTCATTATGCCATCTCCAATCCATATCCAAAAGGTAATTTGCATC
CCAAGGAAAAAAGGCACGACACAAGTTAAAAAAAGAAAAAAAAAATTCAAAACAAAGCCA
TAAATAGTTTTTCAGGGTAGCAAATGTGATTCTCATAATAACAAGCAGAAACCATAACAT
AATAGCAGATTCTTCCATTCATTAAGCCCAGCCACCTCACATCGTTGTTTTTTCCTTCCC
GCTTCTAAGCCAAGTACCTAAACATGTTAGGGTTCTCCTTGTCCCTCTCCAAATAATCCC
TCGTTATCAAATCCTCCATGCGCTTCTTGATCGCTTTGATATCAGGCTTGAACATCCGGC
TAAGCTGCTCGACGCACTCGGAAACAAGCTGTTGATGTCCCAATACTTTCCTGCTCATCA
TGATCCTGACTATGGCAGCATCAATCGCATAGCGTCTGTCTTTGTCCACGTCTTCCACAA
CTTTCTTCCTTTCATCAACAGGTGG*AGAGGGATCTTTATTCTCCGCATTCTATCGGTGA
ATTTAGAGTTGAATTCAAAAGTATCAGCCTGGGTAACAGTCTTTGTGTTTGGCTCCTTGA
GAAGAATCTTGTATCTAGCACATGACAATGAAT
C

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4E746JQ 769 0 0
G
TCCAAAAGGTAATTTGCATCCCAAGGAAAAAAGGCACGACACAAGTTAAAAAAAGAAAAA
AAAA*TTCAAAACAAAGCCATAAATAGTTTTTCAGGGTAGCAAATGTGATTCTCATAATA
ACAAGCAGAAACCATAACATAATAGCAGATTCTTCCATTCATTAAGCCCAGCCACCTCAC
ATCGTTGTTTTTTCCTTCCCGCTTCTAAGCCAAGTACCTAAACATGTTAGGGTTCTCCTT
GTCCCTCTCCAAATAATCCCTCGTTATCAAATCCTCCATGCGCTTCTTGATCGCTTTGAT
ATCAGGCTTGAACATCCGGCTAAGCTGCTCGACGCACTCGGAAACAAGCTGTTGATGTCC
CAATACTTCCCTGCTCTTCATGATCCTGACTATGGCAACATCAATCGCATAGCGTCTGTC
TTTGTCCAAGTCTTCCACAACTTTCTTCCTTTCATCAACAGGTGGGAGAGGGATCTTTAT
TCTCCGCATTCTATCGGTGAATTTAGAGTTGAATTCAAAAGTATCAGCCTGGGTAACAGT
CTTTGTGTTTGGCTCCTTGAGAAGAATCTTGTATCTAGCACATGACAATGAATGAAGCAA
CCTCACTAAATCTTCGTGGCTTAGGTTCAGCTGGGTTAGGATGTCAGTGTAGCTCAATTT
GTCTGTTGTGTTGAACAGCAGAAGCACAGCAGCCTGGTACGTAGACACAACTAATTCAAT
GGGCTTAATGTCGAACTTTCCGTTGAGGTGACAAGTTCCTAGCGATAG

QA 2 769 2 769
DS 



AS 1 3

CO CL4187Contig1 487 3 5 U
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGA
GGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AACCACTTGGAAGGATTCTGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCC
AAAGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTC
TCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGT
GGTTGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU16JQ C 1
AF RR4GF83TF U 6
AF RR4AU16TF U 19
BS 1 7 RR4AU16JQ
BS 8 218 RR4GF83TF
BS 219 219 RR4AU16TF
BS 220 463 RR4GF83TF
BS 464 487 RR4AU16TF

RD RR4AU16JQ 433 0 0
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGA
GGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AACCACTTGGAAGGATTCTGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCC
AAAGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTC
TCTTCATGATCGT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4GF83TF 458 0 0
GG
GTTGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGAGGATTAT
GACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCCAGATTTG
GCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACGAGTACAT
GAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTTGCATCAAGAAGAACACCAGGAAACCACT
TGGAAGGATTCTGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAAAGTAATG
TCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCCAAAGCTT
TTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTCTCTTCAT
GATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAG

QA 3 458 3 458
DS 

RD RR4AU16TF 469 0 0
GAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGAGGATTATGACCCAACCTA
TCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCCAGATTTGGCTTTTTGAGC
AGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACGAGTACATGAACCTAGTGT
TGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGAAACCACTTGGAAGGATTC
TGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAAAGTAATGTCTGTTCTCAA
CACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCCAAAGCTTTTGCTAAATAT
ATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTCTCTTCATGATCGTGTAAT
ATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGTGGTTGAA

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 3

CO CL4188Contig1 952 3 12 U
GTAAGAATCTGATGGGGAAGAAGCTGTTTGAGGTTATGATGGAGAAAAAAACTAATCTTT
GCTCAGCTGCTGATGTTGGTACTGCTGCTGAGTTGCTTGACATTGCTGACAAGGTGGGAC
CAGAGATATGTATGTTGAAGACACATGTTGATATCCTGCCTGATTTCACCTCTGATTTTG
GCTCTAAACTCCGCGCGATTGCAGACAAGCACAACTTTGTCATATTTGAGGATCGTAAGT
TTGCAGACATTGGTAACACGGTCACGATGCAGTATGAAGGAGGTGTCTTTAAGATATTAG
AGTGGGCTGATATCATAAACGCTCACATCATATCAGGGCCAGGGATCGTTGACGGCCTCA
AGTTGAAGGGTTTGCCACGTGGTAAGGGTCTGCTTTTGTTAGCTGAGATGAGCTCTGCTG
GTAACCTAGCCACAGGAGACTACACTGCAGCAGCGGTGAAAATCGCAGAGGCTCATTCAG
ATTTCGTGATGGGGTTCATCTCGGTTAATCCAGCGTCATGGAAATACGGAAATGTGAGTC
CGTCTATGATCCATGCGACGCCTGGTGTTCAAATGGTGAAAGGTGGTGATGCACTTGGTC
AACAGTACAACACTCCACACTCCGTGATCACTGAGAGGGGAAGTGACATTATAATCGTGG
GAAGGGGGATCATAAAGGCGGAGAACCCTGCAGTGACGGCTCGTGAGTATCGAGATGAAG
GCTGGAAAGCATACGTGGAGAAATGCTCTCAGTAGTTTCGATTCTGTGAGGTGGTTGAGT
TTGTGTTCTGATGCTATTTGTGGGAGTTCTGTGTGATTCATGTGAGGTTTTAAGACTCGT
CTCTCGTTGATTTGTAATTTGATCTCAAATCTCAAATAAGTGAAAGCGTGGAAAGCTATT
ATCACATGGTTATGTACTTGCTTTCAGAATGTCTCTTTAATAAAGAAACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F126TF U 1
AF RR4C472TF U 201
AF RR4F126JQ C 293
BS 1 257 RR4F126TF
BS 258 258 RR4C472TF
BS 259 720 RR4F126TF
BS 721 721 RR4C472TF
BS 722 746 RR4F126TF
BS 747 868 RR4C472TF
BS 869 869 RR4F126JQ
BS 870 875 RR4C472TF
BS 876 876 RR4F126JQ
BS 877 884 RR4C472TF
BS 885 885 RR4F126JQ
BS 886 952 RR4C472TF

RD RR4F126TF 746 0 0
GTAAGAATCTGATGGGGAAGAAGCTGTTTGAGGTTATGATGGAGAAAAAAACTAATCTTT
GCTCAGCTGCTGATGTTGGTACTGCTGCTGAGTTGCTTGACATTGCTGACAAGGTGGGAC
CAGAGATATGTATGTTGAAGACACATGTTGATATCCTGCCTGATTTCACCTCTGATTTTG
GCTCTAAACTCCGCGCGATTGCAGACAAGCACAACTTTGTCATATTTGAGGATCGTAAGT
TTGCAGACATTGGTAACGCGGTCACGATGCAGTATGAAGGAGGTGTCTTTAAGATATTAG
AGTGGGCTGATATCATAAACGCTCACATCATATCAGGGCCAGGGATCGTTGACGGCCTCA
AGTTGAAGGGTTTGCCACGTGGTAAGGGTCTGCTTTTGTTAGCTGAGATGAGCTCTGCTG
GTAACCTAGCCACAGGAGACTACACTGCAGCAGCGGTGAAAATCGCAGAGGCTCATTCAG
ATTTCGTGATGGGGTTCATCTCGGTTAATCCAGCGTCATGGAAATACGGAAATGTGAGTC
CGTCTATGATCCATGCGACGCCTGGTGTTCAAATGGTGAAAGGTGGTGATGCACTTGGTC
AACAGTACAACACTCCACACTCCGTGATCACTGAGAGGGGAAGTGACATTATAATCGTGG
GAAGGGGGATCATAAAGGCGGAGAACCCTGCAGTGACGGCTCGTGAGTATCGAGATGAAG
*CTGGAAAGCATACGTGGAGAAATGC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4C472TF 752 0 0
GCAGACAAGCACAACTTTGTCATATTTGAGGATCGTAAGTTTGCAGACATTGGTAACACG
GTCACGATGCAGTATGAAGGAGGTGTCTTTAAGATATTAGAGTGGGCTGATATCATAAAC
GCTCACATCATATCAGGGCCAGGGATCGTTGACGGCCTCAAGTTGAAGGGTTTGCCACGT
GGTAAGGGTCTGCTTTTGTTAGCTGAGATGAGCTCTGCTGGTAACCTAGCCACAGGAGAC
TACACTGCAGCAGCGGTGAAAATCGCAGAGGCTCATTCAGATTTCGTGATGGGGTTCATC
TCGGTTAATCCAGCGTCATGGAAATACGGAAATGTGAGTCCGTCTATGATCCATGCGACG
CCTGGTGTTCAAATGGTGAAAGGTGGTGATGCACTTGGTCAACAGTACAACACTCCACAC
TCCGTGATCACTGAGAGGGGAAGTGACATTATAATCGTGGGAAGGGGGATCATAAAGGCG
GAGAACCCTGCAGTGACGGCTCGTGAGTATCGAGATGAAGGCTGGAAAGCATACGTGGAG
AAATGCTCTCAGTAGTTTCGATTCTGTGAGGTGGTTGAGTTTGTGTTCTGATGCTATTTG
TGGGAGTTCTGTGTGATTCATGTGAGGTTTTAAGACTCGTCTCTCGTTGATTTGTAATTT
GATCTCAA*TCTCAA*TAAGTGAA*GCGTGGAAAGCTATTATCACATGGTTATGTACTTG
CTTTCAGAATGTCTCTTTAATAAAGAAACGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4F126JQ 623 0 0
GATATTAGAGTGGGCTGATATCATAAACGCTCACATCATATCAGGGCCAGGGATCGTTGA
CGGCCTCAAGTTGAAGGGTTTGCCACGTGGTAAGGGTCTGCTTTTGTTAGCTGAGATGAG
CTCTGCTGGTAACCTAGCCACAGGAGACTACACTGCAGCAGCGGTGAAAATCGCAGAGGC
TCATTCAGATTTCGTGATGGGGTTCATCTCGGTTAATCCAGCGTCATGGAAATACGGAAA
TGTGAGTCCGTCTATGATCCATGCGACGCCTGGTGTTCAAATGGTGAAAGGTGGTGATGC
ACTTGGTCAACAGTACAACACTCCACACTCCGTGATCACTGAGAGGGGAAGTGACATTAT
AATCGTGGGAAGGGGGATCATAAAGGCGGAGAACCCTGCAGTGACGGCTCGTGAGTATCG
AGATGAAGGCTGGAAAGCATACGTGGAGAAATGCTCTCAGTAGTTTCGATTCTGTGAGGT
GGTTGAGTTTGTGTTCTGATGCTATTTGTGGGAGTTCTGTGTGATTCATGTGAGGTTTTA
AGACTCGTCTCTCGTTGATTTGTAATTTGATCTCAAATCTCAAATAAGTGAAAGCGTGGA
AAGCTATTATCACATGGTTATGT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL4189Contig1 552 2 2 U
GGGCAAATTCAAAACCCTCGGAGAAAGTTTGAGAGATCAGAATGTCCGTCGAGGAAGACG
CCACCGTTAGGGAGCCACTGGATCTGATTCGATTGAGCATCGAAGAGAGAATCTACGTCA
AGCTCCGATCCGACCGCGAACTCCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATA
TGATTCTGGGTGATGTTGAAGAGGTTATCACGACTGTAGAAATCGACGAGGAGACTTACG
AAGAGATTGTTCGTACATCGAAACGAAAGATTCCGTTTCTATTTGTGAGAGGAGATGGAG
TGATCTTGGTGTCCCCGCCTTTGAGGACTACTTAGACTTCAGATACAGTGTTCTTGTGTT
ATTGGCTGAGATCTGATGAGTTCACAAATCTGGAGCTACCTTTTTTTTTTTTAAATATTT
CCTTAGCTTCTGATTTGTATTTGTGCGTTTTGTTTTTTTTTTAGACATTTTAACTGAATG
TAGCTTTTGAGATATCGTATTCGAAACCCTTGTTAACTTTGTGCTTCATTATAATAGAAG
TGGTGTTTGCCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF35JQ C 1
AF RR4BF35TF U 1
BS 1 546 RR4BF35TF
BS 547 552 RR4BF35JQ

RD RR4BF35JQ 552 0 0
GGGCAAATTCAAAACCCTCGGAGAAAGTTTGAGAGATCAGAATGTCCGTCGAGGAAGACG
CCACCGTTAGGGAGCCACTGGATCTGATTCGATTGAGCATCGAAGAGAGAATCTACGTCA
AGCTCCGATCCGACCGCGAACTCCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATA
TGATTCTGGGTGATGTTGAAGAGGTTATCACGACTGTAGAAATCGACGAGGAGACTTACG
AAGAGATTGTTCGTACATCGAAACGAAAGATTCCGTTTCTATTTGTGAGAGGAGATGGAG
TGATCTTGGTGTCCCCGCCTTTGAGGACTACTTAGACTTCAGATACAGTGTTCTTGTGTT
ATTGGCTGAGATCTGATGAGTTCACAAATCTGGAGCTACCTTTTTTTTTTTTAAATATTT
CCTTAGCTTCTGATTTGTATTTGTGCGTTTTGTTTTTTTTTTAGACATTTTAACTGAATG
TAGCTTTTGAGATATCGTATTCGAAACCCTTGTTAACTTTGTGCTTCATTATAATAGAAG
TGGTGTTTGCCT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4BF35TF 552 0 0
GGGCAAATTCAAAACCCTCGGAGAAAGTTTGAGAGATCAGAATGTCCGTCGAGGAAGACG
CCACCGTTAGGGAGCCACTGGATCTGATTCGATTGAGCATCGAAGAGAGAATCTACGTCA
AGCTCCGATCCGACCGCGAACTCCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAATA
TGATTCTGGGTGATGTTGAAGAGGTTATCACGACTGTAGAAATCGACGAGGAGACTTACG
AAGAGATTGTTCGTACATCGAAACGAAAGATTCCGTTTCTATTTGTGAGAGGAGATGGAG
TGATCTTGGTGTCCCCGCCTTTGAGGACTACTTAGACTTCAGATACAGTGTTCTTGTGTT
ATTGGCTGAGATCTGATGAGTTCACAAATCTGGAGCTACCTTTTTTTTTTTTAAATATTT
CCTTAGCTTCTGATTTGTATTTGTGCGTTTTGTTTTTTTTTTAGACATTTTAACTGAATG
TAGCTTTTGAGATATCGTATTCGAAACCCTTGTTAACTTTGTGCTTCATTATAATAGAAG
TGGTGT
TTGCCT

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 3

CO CL4190Contig1 607 3 4 U
GGATTGCATCTCCTCTCATAGAGACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAA
AACAATGGAGTCCAGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGC
CAAGGAAGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCA
GAGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGA
GACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGT
GGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAG
TTTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGT
TGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTT
CAAAATAAGTGTCGTTTTATGATTTCAATGCAAAATTTATTGACTTTTTAATCTAATCTA
TTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 

AF RR4D874TF U 1
AF RR4CH83TF U 6
AF RR4D874JQ C 17
BS 1 421 RR4D874TF
BS 422 422 RR4CH83TF
BS 423 606 RR4D874TF
BS 607 607 RR4CH83TF

RD RR4D874TF 607 0 0
GGATTGCATCTCCTCTCATAGAGACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAA
AACAATGGAGTCCAGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGC
CAAGGAAGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCA
GAGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGA
GACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGT
GGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAG
TCTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGT
TGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTT
CAAAATAAGTGTCGTTTTATGATTTCAATGCAAAATTTATTGACTTTTTAATCTAATCTA
TTTTTC
C

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4CH83TF 602 0 0
GG
ATCTCCTCTCATAGAAACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAAAACAATG
GAGTCCAGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCT
CAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGCCAAGGAA
GAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCAGAGGAAA
CTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGAT
GCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGTGGATATG
CTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAGTTTCTGC
TCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGTTGCTATG
AGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAACATTTTCGTTTCAAAATA
AGTGTCGTTTTATGATTTCAATGCAAAATTTATTGACTTTTTAATCTAATCTATTTTTCT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RR4D874JQ 591 0 0
CATAGAGACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAAAACAATGGAGTCCAGC
AGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCTCAACACATT
GTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGCCAAGGAAGAGGCTGAG
AAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAAGAG
ACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGATGCCAAAATC
GAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGTGGATATGCTCCTCAAA
CATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAGTTTCTGCTCTCTGTTT
CTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGTTGCTATGAGTTACTTC
CTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTTCAAAATAAGTGTCGTT
TTATGATTTCAATGCAAAATTTATTGACTTTTTAATCTAATCTATTTTTC
C

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

CO CL4191Contig1 555 3 7 U
GATTCAAAGTCAAGAAATTATGATAATAAATTACAATGTAATCAATATCGGTTTGTTTCT
ACATACTAGATGATTTACATCTCCTCTTTACTCGCCCAGCATTCATATAAGCATAATCAT
CTTATTCCCCCATTATTCATGTTTGAAACATTCACTCACACACATAGAAAACTAATCCAG
GTACTAATAATCTTAATAGTAAAGTTTGTTCATAGCATCCATCTCTCGCTTGAAGTCAAC
CATTGCAACTCTTGGCAACGTCATGATCACTTTAACTCCACCTTCCATTGATGGATCAAG
TTGTGAAGGTCTCAAGATCATCCCTATATGCAGTGCAGTCTTCTGCTCGGTCAACGGCCG
CAGATTCACTGGCTCATTCCAACCAAAATCCATTGATCCAAACCAACCAATATTCCTCCA
GTCAGTGAGGAACAATAGTCCATCACTCACCCCTTCAAATTTTGCATTATCCCTCATTAA
TCTCTCCGTATTCTTTAACTCTTCTTGCAGTTCTCTTACGGTTAACTCGATATAGACATC
TATGTAGGCGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV17TF C 17
AF RR4HA06JQB U 11
AF RR4H057JQ U 1
BS 1 147 RR4H057JQ
BS 148 148 RR4HA06JQB
BS 149 313 RR4H057JQ
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BS 457 457 RR4HA06JQB
BS 458 555 RR4H057JQ

RD RR4GV17TF 431 0 0
ATTATGATAATAAATTACAATGTAATCAATATCGGTTTGTTTCTACATACTAGATGATTT
ACATCTCCTCTTTACTCGCCCAGCATTCATATAAGCATAATCATCTTATTCGCCCATTAT
TCATGTTTGAAACATTCACTCACACACATAGAAAACTAATCCAGGTACTAATAATCTTAA
TAGTAAAGTTTGTTCATAGCATCCATCTCTCGCTTGAAGTCAACCATTGCAACTCTTGGC
AACGTCATGATCACTTTAACTCCATCTTCCATTGATGGATCAAGTTGTGAAGGTCTCAAG
ATCATCCCTATATGCAGTGCAGTCTTCTGCTCGGTCAACGGCCGCAGATTCACTGGCTCA
TTCCAACCAAAATCCATTGATCCAAACCAACCAATATTCCTCCAGTCAGTGAGGAACAAT
AGTCCATCACT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR4HA06JQB 494 0 0
CAAAAA
ATTATGATAATAAATAACAATGTAATCAATATCGGTTTGTTTCTACATACTAAATGATTT
ACATCTCCTCTTTACTCCCCCAGCATTCATATAAGCATAATCATCTTATTCCCCCATTAT
TCATGTTTGAAACATTCACTCCCACACATAAAAAACTAATCCAGGTACTAATAATCTTAA
TAGTAAAGTTTGTTCATAGCATCCATCTCTCGCTTGAAGTCAACCATTGCAACTCTTGGC
AACGTCATGATCACTTTAACTCCCCCTTCCATTGATGGATCAAGTTGTGAAGGTCTCAAA
ATCATCCCTATATGCAGTGCAGTCTTCTGCTCGGTCAACGGCCGCAAATTCACTGGCTCA
TTCCAACCAAAATCCATTGATCCAAACCAACCAATATTCCTCCAGTCAGTGAGGAACAAT
AGTCCATCACTCACCCCTTCAAATTTTGCATTATCCCTCATTAATCTCTCTGTATTCTTT
AACTCTTC

QA 7 494 7 494
DS 

RD RR4H057JQ 555 0 0
GATTCAAAGTCAAGAAATTATGATAATAAATTACAATGTAATCAATATCGGTTTGTTTCT
ACATACTAGATGATTTACATCTCCTCTTTACTCGCCCAGCATTCATATAAGCATAATCAT
CTTATTCCCCCATTATTCATGTTTGAAGCATTCACTCACACACATAGAAAACTAATCCAG
GTACTAATAATCTTAATAGTAAAGTTTGTTCATAGCATCCATCTCTCGCTTGAAGTCAAC
CATTGCAACTCTTGGCAACGTCATGATCACTTTAACTCCACCTTCCATTGATGGATCAAG
TTGTGAAGGTCTCGAGATCATCCCTATATGCAGTGCAGTCTTCTGCTCGGTCAACGGCCG
CAGATTCACTGGCTCATTCCAACCAAAATCCATTGATCCAAACCAACCAATATTCCTCCA
GTCAGTGAGGAACAATAGTCCATCACTCACCCCTTCGAATTTTGCATTATCCCTCATTAA
TCTCTCCGTATTCTTTAACTCTTCTTGCAGTTCTCTTACGGTTAACTCGATATAGACATC
TATGTAGGCGTTACC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 3

CO CL4192Contig1 817 3 28 U
GGAATCGCCATTGTTAGCTAGCTACACATCCACTCTGTTACCCACTCGATCGAAAGCTTT
CGTGTTCCACGCAGCGAGAGATCGATGGCGCGTCGTTCCGGAGACTGTATGAAATGCCTG
GTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTC
AACAAAGGTTTCGTTGGATCTACGAGTAGAAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGAT
TGCCCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACA
GATTGTGGAGGAGATGATCCAGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTT
CTGACCGAGGAACTGAAGCTGCAAGAAGCTGTTGCAGATGAGCATAGCCGTCATATGAAT
GTCACCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGC
AACGCCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAG
GAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCTATCAGGCTGGGAAGGTGAG
TAAACTGATTGCATTTCTCATGTCAGAGAAACCAAACTTTCACAACTTAGCTCAAGAAAA
GGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAATCCTATCTTCCATGTTTCCTCCATATATTGT
AGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCAGAATGTAGCTAAAGACATGGCTTTGTATCGACTTT
CTTTTTATACATAATTATGATTGTCCATTTCACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY70TF U 18
AF RR4F049TF U 1
AF RR4GY70JQ C 165
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BS 75 75 RR4GY70TF
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BS 99 99 RR4GY70TF
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GG
AGCTACACATCCACTCTGTTTCCCACTCGATCGAAAGCTTTCGTGTTCCACGCAGCGA**
**TCGATGGCGCGTCGTTCCGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTTGTAT
CTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAACAAAGGTTTCGTTGGAT
CTACGAGTAGAAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGATTGCCCACCTCCTGTCTCTC
TCCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGATTGTGGAGGAGATGATC
CAGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGC
TGCAAGAAGCTGTTGCAGATGAGCATAGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGGAGAAGCTA
AAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACCGAGATTT
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TGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCTAT

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR4F049TF 649 0 0
GGAATCGCCATTGTTAGCTAGCTACACATCCACTCTGTTACCCACTCGATCGAAAGCTTT
CGTGTTCCACGCAGGGAGAGATCGATGGCGCGTCGTTCGGGAGTCTGTATGAAATGCCTG
GTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTC
GACAAGGGTTTCGTTGGATCTACTAGTAGAAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGAT
TGCCCACCTCCTGTGTCTCTTCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACA
GATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTT
CTGACCGAGGAGCTGAAGCTTCAAGAAGCTGTTGCGGATGAGCATAGCCGTCATATGAAT
GTCACCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGC
AACGCCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAG
GAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCTATCAGGCTGGGAAGGTGAG
TAAACTGATTGCATTTCTCATGTCAGAGAAACCAAACTTTCGCAACTTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4GY70JQ 653 0 0
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TCCTTGCTCCTGTGATTGCCCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGC
AAATCTCTCTGTTACAGATTGTGGAGGAGATGATCCAGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAA
GCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTGCAAGAAGCTGTTGCAGATGAGCA
TAGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAA
GGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGA
AGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCTATC
AGGCTGGGAAGGTGAGTAAACTGATTGCATTTCTCATGTCAGAGAAACCAAACTTTCACA
ACTTAGCTCAAGAAAAGGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAATCCTATCTTCCATGT
TTCCTCCATATATTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCAGAATGTAGCTAAAGACATG
GCTTTGTATCGACTTTCTTTTTATACATAATTATGATTGTCCATTTCACTGCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 3

CO CL4193Contig1 554 3 5 U
GGAAACCAGATCAAAAACAATCACCAATTCTTTATAGTTCAAAGATTTTCTGAGCCCTCA
TCAATGGCGCCATCAGCTGCAATGCTCATACTTTCGCATCCTCTGATTAGCCACAAAACG
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TTGCCGTGGAAGTCATCGGACAGTGAGGAGGTCGGTCTAGGCCGGCTAGTCTTTGGCGAT
CCCGCTACACTGGAGAAGCGTTTTCAAGAAGCTCTTGAACTTAGCTGCTGGTAATTTTTC
ACAATGTCTAGTGATATCGTTTCACTGGCTGCATCTTCGTAATTATTAAGCGTTTTATTA
ATATTTTTTTTTTTGACAAAGATTTTTCTATTAAAAAGAAAAAATTCAAAATTTAAAATT
CACTAGTGACGATGATGGTTTCTCACATAACCTGTTTTATTAATATTGTCTTGTCGATGG
AAATAATGTAAAAGTAATGGTTTTACAAAAAAAAAAAAGAAGAAATGTAAAAGTAATGGT
TGGTTTTATAAATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4F165JQ C 375
AF RR4F165TF U 1
AF RR4F554TF U 1
BS 1 143 RR4F165TF
BS 144 144 RR4F554TF
BS 145 317 RR4F165TF
BS 318 318 RR4F554TF
BS 319 554 RR4F165TF

RD RR4F165JQ 140 0 0
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TAATGGTTTTACAAAAAAAA

QA 1 140 1 140
DS 

RD RR4F165TF 554 0 0
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TTGCCGTGGAAGTCATCGGACAGTGAGGAGGTCGGTCTAGGCCGGCTAGTCTTTGGCGAT
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ATATTTTTTTTTTTGACAAAGATTTTTCTATTAAAAAGAAAAAATTCAAAATTTAAAATT
CACTAGTGACGATGATGGTTTCTCACATAACCTGTTTTATTAATATTGTCTTGTCGATGG
AAATAATGTAAAAGTAATGGTTTTACAAAAAAAAAAAAGAAGAAATGTAAAAGTAATGGT
TGGTTTTATAAATT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4F554TF 551 0 0
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TCAATGGCGCCATCAGCTGCAATGCTCATACTTTCGCATCCTCTGATTAGCCACAAAACG
ACAAATCAGTCTCCATCAACGCCAGCCTCCTCTAAGTCGAGACGTATGTTCGATCTTCTT
TTGCCGTGGAAGTCATCGGACAGTGAGGAGGTCGGTCTAGGCCGGCTAGTCTTTGGCGAT
CCCGCTACACTGGAGAAGCGTTTTCAAGGAGCTCTTGAACTTAGCTGCTGGTAATTTTTC
ACAATGTCTAGTGATATCGTTTCACTGGCTGCATCTTCGTAATTATTAAGCGTTTTATTA
ATATTTTTTTTT**GACAAAGATTTTTCTATTAAAA*GAAAAAATTCAAAATTTAAAATT
CACTAGTGACGATGATGGTTTCTCACATAACCTGTTTTATTAATATTGTCTTGTCGATGG
AAATAATGTAAAAGTAATGGTTTTACCAAAAAAAAA**GAAGAA*TGTAAAAGTAATGGT
TGGTTTTATAA

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 3

CO CL4194Contig1 1191 3 7 U
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GATGCTGGAAAATGAGACGAATTGCTTCCTCAAAGATGGAAGCATGTCCCATCAGCAACT
CATTGCCGACAGTAACGACATATCAATTGTCCAAATGTTGTCTTCCAATCAAATCTCTGA
GGCCACGAGTCACTTCGATCCCAAGTGTTACCTCGGAAAAGAAGAAGAAACTTTAAGATC
TAAGCTAATGGAATTCTGGAGGAAGAAGAAGATGAAGGGCAAGGCCGGAAAGTGCTTCCT
CAGGAATGGAAGTGTGTTTCTCAAGGAACTCATAGCCGACTGCAACGGCATATCAATCCC
TATCCGAATGTTTTCTTCCGATCAAATCTCCAAGGCCACGATTAACTTCGATCTCGAGCC
TCTCGTTCAAAAATCAGACTTCACCTGTTTGACTGGCATCATTGAAGGCAGATCTTACAC
GATCAAGATATATATAGGAGAGGAAGAGATGTCTTACGACGATGTTGTCTTATCTGCTCG
AGTAAGTAATCACAGTGGATTCCTCAAACTCATGGGTTGTTGTCTGGAATATCCTCGTCC
GTGTCTGGTGTTTGAAGACCTAGACTATACAGTATTGAACGAGAGAGGAACTGTTGGCTG
CGAGGACGGGCCATTGTTACCGTGGAATGTACGTTTAAAAATTGCGAAGGAGGTTGCGAC
TGCTATAACTTATCTTCACACTGCTTTCCCTAGAATTATTATACACAGAAATATAGTGCC
GTGGAACGTTTGCTTGGACAAGAATGGGAGGGCTAAGCTAAATGATTTCTCGTTTGCCGT
AACACTCCCTGAGGGTAAGTCTTGGATTGAAGATGAGGTGTTTGGAACTGTGGGACACAT
GGATCCTGTTTATGCCATGCGGGGCTTGGTGAGAGAATATACAGATGTGTTCAGTTTTTG
GAGTCCTTTATGTTGGTTCTTCTGATTGGAAGACCAGCAATTTTGGTTGGGATCAGATGG
CGATTGGGATCCTTCCAGTGATATTAGTTATTATGTGAAGGATCTGCATGAGAGAGGAGA
AACTGTCGTATTCGGGGGTGATTCTAACGACATGAAGCCTGGTCAGATGAAGATGTTTCT
CGAGCTGGCACTCAGATGCTGCGACTGGGAGGAGTGTAGACAAGCCAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CS81JQ C 1
AF RR4AS58TF U 334
AF RR4AU52TF U 334
BS 1 334 RR4CS81JQ
BS 335 968 RR4AS58TF
BS 969 969 RR4AU52TF
BS 970 1130 RR4AS58TF
BS 1131 1131 RR4AU52TF
BS 1132 1169 RR4AS58TF
BS 1170 1191 RR4AU52TF

RD RR4CS81JQ 766 0 0
GGATGATCACGGTGGCAAAAAGATTAAGCTAATAGAACAAGGATCATTTGATTGTTCTGA
GATGCTGGAAAATGAGACGAATTGCTTCCTCAAAGATGGAAGCATGTCCCATCAGCAACT
CATTGCCGACAGTAACGACATATCAATTGTCCAAATGTTGTCTTCCAATCAAATCTCTGA
GGCCACGAGTCACTTCGATCCCAAGTGTTACCTCGGAAAAGAAGAAGAAACTTTAAGATC
TAAGCTAATGGAATTCTGGAGGAAGAAGAAGATGAAGGGCAAGGCCGGAAAGTGCTTCCT
CAGGAATGGAAGTGTGTTTCTCAAGGAACTCATAGCCGACTGCAACGGCATATCAATCCC
TATCCGAATGTTTTCTTCCGATCAAATCTCCAAGGCCACGATTAACTTCGATCTCGAGCC
TCTCGTCCAAAAATCTGACTTCACCTGTTTGACTGGCATCATTGAAGGCAGATCTTACAC
GATCAAGATATATATAGGAGAGGAAGAGATGTCTTACGACGATGTTGTCTTATCTGCTCG
AGTAAGTAATCACAGTGGATTCCTCAAACTCATGGGTTGTTGTCTGGAATATCCTCGTCC
GTGGCTGGTGTTTGAAGACCTAGACTATACAGTATTGAACGAGAGAGGAACTGTTGGCTG
CGAGGACGGGCCATTGTTACCGTGGAATGTACGTTTAAAAATTGCGAAGGAGGTTGCGAC
TGCTATAACTTATCTTCACACTGCTTTCTCTAGAATCATTATACAC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4AS58TF 836 0 0
G
GCCGACTGCAACGGCATATCAATCCCTATCCGAATGTTTTCTTCCGATCAAATCTCCAAG
GCCACGATTAACTTCGATCTCGAGCCTCTCGTTCAAAAATCAGACTTCACCTGTTTGACT
GGCATCATTGAAGGCAGATCTTACACGATCAAGATATATATAGGAGAGGAAGAGATGTCT
TACGACGATGTTGTCTTATCTGCTCGAGTAAGTAATCACAGTGGATTCCTCAAACTCATG
GGTTGTTGTCTGGAATATCCTCGTCCGTGTCTGGTGTTTGAAGACCTAGACTATACAGTA
TTGAACGAGAGAGGAACTGTTGGCTGCGAGGACGGGCCATTGTTACCGTGGAATGTACGT
TTAAAAATTGCGAAGGAGGTTGCGACTGCTATAACTTATCTTCACACTGCTTTCCCTAGA
ATTATTATACACAGAAATATAGTGCCGTGGAACGTTTGCTTGGACAAGAATGGGAGGGCT
AAGCTAAATGATTTCTCGTTTGCCGTAACACTCCCTGAGGGTAAGTCTTGGATTGAAGAT
GAGGTGTTTGGAACTGTGGGACACATGGATCCTGTTTATGCCATGCGGGGCTTGGTGAGA
GAATATACAGATGTGTTCAGTTTTTGGAGTCCTT*ATGTTGGTTCTTCTGATTGGAAGAC
CAGCAATTTTGGTTGGGATCAGATGGCGATTGGGATCCTTCCAGTGATATTAGTTATTAT
GTGAAGGATCTGCATGAGAGAGGAGAAACTGTCGTATTCGGGGGTGATTCTAACGACATG
AAGCCTGGTCAGATGA*GATGTTTCTCGAGCTGGCACTCAGATGCTGCGACTGGG

QA 2 836 2 836
DS 

RD RR4AU52TF 858 0 0
G
GCCGACTGCAACGGCATATCAATCCCTATCCGAATGTTTTCTTCCGATCAAATCTCCAAG
GCCACGATTAACTTCGATCTCGAGCCTCTCGTTCAAAAATCAGACTTCACCTGTTTGACT
GGCATCATTGAAGGCAGATCTTACACGATCAAGATATATATAGGAGAGGAAGAGATGTCT
TACGACGATGTTGTCTTATCTGCTCGAGTAAGTAATCACAGTGGATTCCTCAAACTCATG
GGTTGTTGTCTGGAATATCCTCGTCCGTGTCTGGTGTTTGAAGACCTAGACTATACAGTA
TTGAACGAGAGAGGAACTGTTGGCTGCGAGGACGGGCCATTGTTACCGTGGAATGTACGT
TTAAAAATTGCGAAGGAGGTTGCGACTGCTATAACTTATCTTCACACTGCTTTCCCTAGA
ATTATTATACACAGAAATATAGTGCCGTGGAACGTTTGCTTGGACAAGAATGGGAGGGCT
AAGCTAAATGATTTCTCGTTTGCCGTAACACTCCCTGAGGGTAAGTCTTGGATTGAAGAT
GAGGTGTTTGGAACTGTGGGACACATGGATCCTGTTTATGCCATGCGGGGCTTGGTGAGA
GAATATACAGATGTGTTCAGTTTTTGGAGTCCTTTATGTTGGTTCTTCTGATTGGAAGAC
CAGCAATTTTGGTTGGGATCAGATGGCGATTGGGATCCTTCCAGTGATATTAGTTATTAT
GTGAAGGATCTGCATGAGAGAGGAGAAACTGTCGTATTCGGGGGTGATTCTAACGACATG
AAGCCTGGTCAGATGAAGATGTTTCTCGAGCTGGCACTCAGATGCTGCGACTGGGAGGAG
TGTAGACAAGCCAAAGA

QA 2 858 2 858
DS 



AS 1 3

CO CL4195Contig1 649 3 4 U
CAGACATGAATGACAATATTTATTTAAACAATACTGAATCCACTCACGCAACAAACGAAA
TTATTTACATTGAAAAAAAAAACTCAATGAACTTAACCAATGTCACCACCATGAGGGGGG
TTTTTAGCAATTCAAAAATTACAGGGAGAAACCTGCAAAAAATCTCATCATCTAGAGGAG
CAAAACAAACAAACAAATAAATTAGATAACAGACTCTCAGCACTCCTCTCCTCCGTTTCT
TTCCTTCATCTGCTGCTCTGTATGTATCTTTCAATAATACAAGACGAGACGACGATTACA
GGAGGAACAAGAGTACTTGCGTTTGACCTTGAAACAGAGTGGTAAGAAACAGAACAACCA
CTTCGTCTCAGTATCTACCGCCGCCACTTTTCCGCCGCAGTATGGACACACACCCGGTGC
TTGTTGGCGACCAAGCTCTGTCTTCTCCTCGTGATACACAAACTCCAAACACATTTTTGC
TTCTTTGTTTTTTTTACTCAAAAATCCCTTTTTGTGTCGATATATATCTTCTGGACTTGT
CTCTGCTTCTGGAAGTGTGAAGAACAAGAAATGAGAAAATATTACCAGAAAAGGGAAAAA
TATTATAAAGTGTGAAGATGTTTTCTTTTGCTCACAAGGACTCTGCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H453JQB U 1
AF RR4HA82JQB U 1
AF RR4H453TF C 157
BS 1 134 RR4H453JQB
BS 135 135 RR4HA82JQB
BS 136 560 RR4H453JQB
BS 561 649 RR4HA82JQB

RD RR4H453JQB 560 0 0
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TTATTTACATTGAAAAAAAAAACTCAATGAACTTAACCAATGTCACCACCATGAGGGGGG
TTTTTAGCAATTCAGAAATTACAGGGAGAAACCTGCAAAAAATCTCATCATCTAGAGGAG
CAAAACAAACAAACAAATAAATTAGATAACAGACTCTCAGCACTCCTCTCCTCCGTTTCT
TTCCTTCATCTGCTGCTCTGTATGTATCTTTCAATAATACAAGACGAGACGACGATTACA
GGAGGAACAAGAGTACTTGCGTTTGACCTTGAAACAGAGTGGTAAGAAACAGAACAACCA
CTTCGTCTCAGTATCTACCGCCGCCACTTTTCCGCCGCAGTATGGACACACACCCGGTGC
TTGTTGGCGACCAAGCTCTGTCTTCTCCTCGTGATACACAAACTCCAAACACATTTTTGC
TTCTTTGTTTTTTTTACTCAAAAATCCCTTTTTGTGTCGATATATATCTTCTGGACTTGT
CTCTGCTTCTGGAAGTGTGA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4HA82JQB 649 0 0
CAGACATGAATGACAATATTTATTTAAACAATACTGAATCCACTCACGCAACAAACGAAA
TTATTTACATTGAAAAAAAAAACTCAATGAACTTAACCAATGTCACCACCATGAGGGGTG
TTTTTAGCAATTCAAAAATTACAGGGAGAAACCTGCAAAAAATCTCATCATCTAGAGGAG
CAAAACAAACAAACAAATAAATTAGATAACAGACTCTCAGCACTCCTCTCCTCCGTTTCT
TTCCTTCATCTGCTGCTCTGTATGTATCTTTCAATAATACAAGACGAGACGACGATTACA
GGAGGAACAAGAGTACTTGCGTTTGACCTTGAAACAGAGTGGTAAGAAACAGAACAACCA
CTTCGTCTCAGTATCTACCGCCGCCACTTTTCCGCCGCAGTATGGACACACACCCGGTGC
TTGTTGGCGACCAAGCTCTGTCTTCTCCTCGTGATACACAAACTCCAAACACATTTTTGC
TTCTTTGTTTTTTTTACTCAAAAATCCCTTTTTGTGTCGATATATATCTTCTGGACTTGT
CTCTGCTTCTGGAAGTGTGAAGAACAAGAAATGAGAAAATATTACCAGAAAAGGGAAAAA
TATTATAAAGTGTGAAGATGTTTTCTTTTGCTCACAAGGACTCTGCTCC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4H453TF 493 0 0
AAAAAATCTCATCATCTAGAGGAGCAAAACAAACAAACAAATAAATTAGATAACAGACTC
TCAGCACTCCTCTCCTCCGTTTCTTTCCTTCATCTGCTGCTCTGTATGTATCTTTCAATA
ATACAAGACGAGACGACGATTACAGGAGGAACAAGAGTACTTGCGTTTGACCTTGAAACA
GAGTGGTAAGAAACAGAACAACCACTTCGTCTCAGTATCTACCGCCGCCACTTTTCCGCC
GCAGTATGGACACACACCCGGTGCTTGTTGGCGACCAAGCTCTGTCTTCTCCTCGTGATA
CACAAACTCCAAACACATTTTTGCTTCTTTGTTTTTTTTACTCAGAGATCCCTTTTTGTG
TCGATATATATCTTCTGGACTTGTCTCTGCTTCTGGAAGTGTGAAGAACAAGAAATGAGA
AAATATTACCAGAAAAGGGAAAAATATTATAAAGTGTGAAGATGTTTTCTTTTGCTCACA
AGGACTCTGCTCC

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL4196Contig1 622 2 5 U
GGGCACTGAAACTCTCAGAAGAAGATAATATGGCGACGACAAGCGCATCTGCTTTGCTCT
CACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCTCAGAAAACCCCAAACTCCATCTCATTCC
ACGGCCTCCGTCCTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCA
CCTCCGGAAGGAGATCTTCCTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTCG
TCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAACTTCC
AGAGAGAAAACGTGGCTAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAGCCG
GAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTTAGCCTCTTGAAGCCGAACGATCCAGTTGGATTCA
ACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCTTAG
CCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTCTGTC
TCGTTATATGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTGTCTA
TTGGCTTCTCTCTTTCGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D107TF U 1
AF RR4C565TF U 57
BS 1 129 RR4D107TF
BS 130 130 RR4C565TF
BS 131 398 RR4D107TF
BS 399 399 RR4C565TF
BS 400 622 RR4D107TF

RD RR4D107TF 622 0 0
GGGCACTGAAACTCTCAGAAGAAGATAATATGGCGACGACAAGCGCATCTGCTTTGCTCT
CACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCTCAGAAAACCCCAAACTCCATCTCATTCC
ACGGCCTCCTTCCTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCA
CCTCCGGAAGGAGATCTTCCTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTCG
TCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAACTTCC
AGAGAGAAAACGTGGCTAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAGCCG
GAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTTAGCCTCTTGAAGTCGAACGATCCAGTTGGATTCA
ACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCTTAG
CCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTCTGTC
TCGTTATATGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTGTCTA
TTGGCTTCTCTCTTTCGTTTAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4C565TF 554 0 0
CTCTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCTCAGAAAACCCCAAACTCCATCTCA
TTCCACGGCCTCCGTCCTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCC
ACCACCTCCGGAAGGAGATCTTCCTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCC
GTCGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAAC
TTCCAGAGAGAAAACGTGGCTAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAA
GCCGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTTAGCCTCTTGAAGCCGAACGATCCAGTTGGA
TTCAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTC
TTAGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTC
TGTCTCGTTATATGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTG
TCTATTGGCTTCT
C

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 3

CO CL4197Contig1 824 3 8 U
ACTGGACGTAAACATTGGATTTTCACACTTCAGGACATAAAATAAAAAGCTCTCAAGTAA
GAAACAAAACAACACAGGTGAATTGTCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTT
TTCTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAGCAAAATAAA
TGGCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCG
ATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTTTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATG
AACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCG
AGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGACCTTTCCACACCTGGGGGTAAGATATACTACTCTTT
GATGTCACTAGGCAAGCGGCTTTGGAAAAGGACTCTTCTGCGTATTGCCTCAAATATGTG
AAGCAGTTACTGTGTGTGTGTGGTGACTCAAAAGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCG
TACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCTTTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTA
GATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAGAACATC
TCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAGA
TGCTTGGCCATGTTGACATTTGACCTCAAGTTCTCGAGTTCTTGAGCTCTCTGTTTCTCC
TTCTGCAGCTGACCGAGCCTCTTGACCTTCCTTGAAACTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GJ50JQ U 1
AF RR4BE09TF C 30
AF RR4BE09JQ U 33
BS 1 182 RR4GJ50JQ
BS 183 183 RR4BE09JQ
BS 184 437 RR4GJ50JQ
BS 438 438 RR4BE09JQ
BS 439 740 RR4GJ50JQ
BS 741 741 RR4BE09JQ
BS 742 775 RR4GJ50JQ
BS 776 824 RR4BE09JQ

RD RR4GJ50JQ 775 0 0
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GAAACAAAACAACACAGGTGAATTGTCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTT
TTCTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAGCAAAATAAA
TGCCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCG
ATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTTTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATG
AACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCG
AGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGACCTTTCCACACCTGGGGGTAAGATATACTACTCTTT
GATGTCACTAGGCAAGCAGCTTTGGAAAAGGACTCTTCTGCGTATTGCCTCAAATATGTG
AAGCAGTTACTGTGTGTGTGTGGTGACTCAAAAGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCG
TACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCTTTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTA
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TCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAGA
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QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4BE09TF 795 0 0
TTTC
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TTGAGAATCAAACAGCAGCAAAATAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAG
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TGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAAC
TGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGACCTTTCCAC
ACCTGGGGGTAAGATATACTACTCTTTGATGTCACTAGGCAAGCGGCTTTGGAAAAGGAC
TCTTCTGCGTATTGCCTCAGATATGTGAAGCAGTTACTGTGTGTGTGTGGTGACTCAAAA
GCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCTTTGTCAAGA
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GAAACTTCTGC

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DS 

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C
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GCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTTTTCTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAG
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ATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTT
TGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAAC
TGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGACCTTTCCAC
ACCTGGGGGTAAGATATACTACTCTTTGATGTCACTAGGCAAGCGGCTTTGGAAAAGGAC
TCTTCTGCGTATTGCCTCAAATATGTGAAGCAGTTACTGTGTGTGTGTGGTGACTCAAAA
GCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCTTTGTCAAGA
AGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCC
ATGGTCTCAACAAGAAAAGAGAACATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCA
GACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAGATGCTTGGCCATGTTGACATTTGACCTCAAGTTC
TCGAGTTCTTGAGCTCTCTGTTTCTCCTTCTGCAGCTGACCGAGCCTCTTGACCTTCCTT
GAAACTTCTGC

QA 2 792 2 792
DS 



AS 1 3

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ATGATCGTCTTCACTGTTGCTCATAAATACAAAAAAAAAACAAGTCCTTGTAGAACCTAA
ATGTTCTAAGCAACAAAGATTCTCCTGACTTCAAGCTGTGTCTGCTTCCCTCTTCAACGA
CTCATCCTTAATACAGACGTAGATGTAATGAACATCAGGGCTTCTGCCAATTACTGATTC
CACTGAACTTCCCTCAGCATCTAGAGGAATGGGTTTCGTCAGTTCCCATTTCGACGTTTC
TAATGGTTGGTGATCTGTTAAACTTTTGTCTATCACATGGAGTTTCGTCGTCCAAGAGCG
TGAGTCTTTAAACAACCTAAGTCGGTAATCCGGAGCTCCATATGTAATCAGGATGTAGAC
TCCTTTATCCTTGAGGACCCTCCAAACTTCCTCAAGCATCTGCGTTGAGTGTTGTCTCGA
ATTGCTCCCACACAAAATAGAGTCTAAGGTTCCTTTATCAATGACAGCATCAAAAGAACC
ATCTCCAAACGCCTTCATATCACGCACATCCATCTTCAAATATTTGAGACGAGGACGGTC
GGAGTATTTCTTAACCATAGCATCGATCACCACAGAGGAGATATCGATGCTGACCACGTC
TTCGTACCCGTCGTCAACCATTCCTTCGCTGAACGCTGAGTTTCCGCAGCCGATGGCGAG
GACGGGGTGGGGACGGTTAGGGGCGTAGAGATTGATGAGAGGAGCCAATGAAGTGTAGCT
CTGGTACCAATCGAAAGGGATCGGATTCGTTCGTGTAGCGTTCGTCCCAGTACCATTGCT
CGCTGTATGATTGCGTTGGCGTCGTCTCTGTCTCCATCGTCTTCTCCGTCGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A315JQ U 1
AF RR4A315JQD U 1
AF RR4A315TFB C 226
BS 1 417 RR4A315JQ
BS 418 418 RR4A315JQD
BS 419 499 RR4A315JQ
BS 500 500 RR4A315JQD
BS 501 805 RR4A315JQ
BS 806 894 RR4A315TFB

RD RR4A315JQ 805 0 0
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CACTGAACTTCCCTCAGCATCTAGAGGAATGGGTTTCGTCAGTTCCCATTTCGACGTTTC
TAATGGTTGGTGATCTGTTAAACTTTTGTCTATCACATGGAGTTTCGTCGTCCAAGAGCG
TGAGTCTTTAAACAACCTAAGTCGGTAATCCGGAGCTCCATATGTAATCAGGATGTAAAC
TCCTTTATCCTTGAGGACCCTCCAAACTTCCTCAAGCATCTGCGTTGAGTGTTGTCTCGA
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ATCTCCAAACGCCTTCATATCACGCACATCCATCTTCAAATATTTGAGACGAGGACGGTC
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CTGGTACCAATCGAAAGGGATCGGA

QA 1 805 1 805
DS 

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GCTAAAAAAATATAACTGTTGTTCCTCCTGTAATTAGAAAGTATAGCATGAATCCAAGAT
ATGATCGTCTTCACTGTTGCTCATAAATACAAAAAAAAAACAAGTCCTTGTAGAACCTAA
ATGTTCTAAGCAACAAAGATTCTCCTGACTTCAAGCTGTGTCTGCTTCCCTCTTCAACGA
CTCATCCTTAATACAGACGTAGATGTAATGAACATCAGGGCTTCTGCCAATTACTGATTC
CACTGAACTTCCCTCAGCATCTAGAGGAATGGGTTTCGTCAGTTCCCATTTCGACGTTTC
TAATGGTTGGTGATCTGTTAAACTTTTGTCTATCACATGGAGTTTCGTCGTCCAAGAGCG
TGAGTCTTTAAACAACCTAAGTCGGTAATCCGGAGCTCCATATGTAATCAGGATGTAGAC
TCCTTTATCCTTGAGGACCCTCCAAACTTCCTCAAGCATCTGCGTTGAGTGTTGTCTCGA
ATTGCTCCCACACAAAATAGAGTCTAAGGTTCCTTTATCAATGACAGCATCAAAAGAACC
ATCTCCAAACGCCTTCATATCACGCACATCCATCTTCAAATATTTGAGACGAGGACGGTC
GGAGTATTTCTTAACCATAGCATCGATCACCACAGAGGAGATATCGATGCTGACCACGTC
TTCGTACCCGTCGTCAACCATTCCTTCGCTGAACGCTGAGTTTCCGCAGCCGATGGCGAG
GACGGGGTGGGGACGGTTAGGGGCGTAGAGATTGATGAGAGGAGCCAATGAAGTGTAGCT
CTGGT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4A315TFB 669 0 0
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CCATTTCGACGTTTCTAATGGTTGGTGATCTGTTAAACTTTTGTCTATCACATGGAGTTT
CGTCGTCCAAGAGCGTGAGTCTTTAAACAACCTAAGTCGGTAATCCGGAGCTCCATATGT
AATCAGGATGTAGACTCCTTTATCCTTGAGGACCCTCCAAACTTCCTCAAGCATCTGCGT
TGAGTGTTGTCTCGAATTGCTCCCACACAAAATAGAGTCTAAGGTTCCTTTATCAATGAC
AGCATCAAAAGAACCATCTCCAAACGCCTTCATATCACGCACATCCATCTTCAAATATTT
GAGACGAGGACGGTCGGAGTATTTCTTAACCATAGCATCGATCACCACAGAGGAGATATC
GATGCTGACCACGTCTTCGTACCCGTCGTCAACCATTCCTTCGCTGAACGCTGAGTTTCC
GCAGCCGATGGCGAGGACGGGGTGGGGACGGTTAGGGGCGTAGAGATTGATGAGAGGAGC
CAATGAAGTGTAGCTCTGGTACCAATCGAA*GGGATCGGATTCGTTCGTGTAGCGTTCGT
CCCAGTACCATTGCTCGCTGTATGATTGCGTTGGCGTCGTCTCTGTCTCCATCGTCTTCT
CCGTCGTCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL4199Contig1 496 3 9 U
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TATAATTTGATTTAGACAAAGTGTCTGATCCATGGCTGCATCCAGAGAATTTATCATATG
TTGCCTCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGA
CATCAGAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGT
AGAGAAGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAA
GATGAGGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCAGTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTA
ATCTTATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTACTGGCGTCGATTTTTCTG
TATTTGTGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCCGATTAATGAGAGAAATTGTGATCT
GAAGGTCAGTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B909TF U 4
AF RR4B909JQ C 4
AF RR4BB06TF U 1
BS 1 168 RR4BB06TF
BS 169 169 RR4B909TF
BS 170 170 RR4BB06TF
BS 171 171 RR4B909TF
BS 172 397 RR4BB06TF
BS 398 398 RR4B909TF
BS 399 405 RR4BB06TF
BS 406 406 RR4B909TF
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GG
AAAATAAGAAAGTAAAGAAAGAACCAAAGCTTTTTAAGCAGTTCTGTTAATCTATTATAA
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TCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGACATCA
GAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGTAGAGA
AGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAAGATGA
GGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCAGTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTAATCTT
ATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTACTGGCGTCGATTTTTCTGTATTT
GTGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCC

QA 3 453 3 453
DS 

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GG
AAAATAAGAAAGTAAAGAAAGAACCAAAGCTTTTTAAGCAGTTCTGTTAATCTATTATAA
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TCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGACATCA
GAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGTAGAGA
AGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAAGATGA
GGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCAGTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTAATCTT
ATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTACTGGCGTCGATTTTTCTGTATTT
GTGTTAATTTAATTTTATCTT

QA 3 443 3 443
DS 

RD RR4BB06TF 496 0 0
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CATCAGAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGT
AGAGAAGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAA
GATGAGGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCAGTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTA
ATCTTATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTT*GTTACTG*CGTCGATTTTTCTG
TATTTGTGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCCGATTAATGAGAGAAATTGTGATCT
GAAGGTCAGTTCTGTT

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 3

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GATGACTTACATAACGTATTCGAACATTTGTGCGAATCTGGTGAGGAATTGTCTGAAGGA
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TATCTCAATAATCAAAGGACAATACTTTATGTTTATCCTTTTGTTTTGCCTCCAAAACTC
TTTGCATTTTTTGAAAATAAAAATCCTACTCTTCTTCCCAAGCAAATCGTTTCTCAGTTA
AAATACAATGGTTCATTTTAGATG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4E336JQ C 1
AF RR4E336TF U 1
AF RR4E949TF U 1
BS 1 504 RR4E336TF

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QA 1 504 1 504
DS 

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GATGACTTACATAACGTATTCGAACATTTGTGCGAATCTGGTGAGGAATTGTCTGAAGGA
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ACGTTTAAGGTTAATAACGGTGCGGGAGCAAGAAACTGTTGTGTTACCTCTGCAGCGAAG
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TATCTCAATAATCAAAGGACAATACTTTATGTTTATCCTTTTGTTTTGCCTCCAAAACTC
TTTGCATTTTTTGAAAATAAAAATCCTACTCTTCTTCCCAAGCAAATCGTTTCTCAGTTA
AAATACAATGGTTCATTTTAGATG

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4E949TF 504 0 0
GGAAGGAAGATCGGAGGAGATGGCGTCGAGCGCGGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGG
GATGACTTACATAACGTATTCGAACATTTGTGCGAATCTGGTGAGGAATTGTCTGAAGGA
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TGGTGGAAAGCCTGAGAAACCAATTTTGCGTTCAGACACACCTGGAGTTTGATGTTTTTG
ACGTTTAAGGTTAATAACGGTGCGGGAGCAAGAAACTGTTGTGTTACCTCTGCAGCGAAG
ATGATTTTTTTCTATCTACTTTGAGATAGTTAGCAATGAAGGTTGAGTGAGACTCATTCC
TATCTCAATAATCAAAGGACAATACTTTATGTTTATCCTTTTGTTTTGCCTCCAAAACTC
TTTGCATTTTTTGAAAATAAAAATCCTACTCTTCTTCCCAAGCAAATCGTTTCTCAGTTA
AAATACAATGGTTCATTTTAGATG

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 3

CO CL4201Contig1 1095 3 9 U
TTTTTTTCTTGCTACATTTCACTTCATTTTCTTCCTCTTTCATCGGTATCTCCTTGTTCT
TTCTCATTTTCATATTCTCTGTGTTTTACTTTTAAGTGTTCTTACATCATATTTCTTACT
TATACTAAGACACTTCTCATACGCATCATCAGTTTTTCATCTAATGTTCTCTTAGTCGAT
TTTCAGTTTGCAGGGTTAATTAAGTTCTTTCTTTTTTCTCTAAACCGGAAAATACAAGAA
ATGGGTTTGCCTTCTTATCTGAAGTCATACCTTATTTATCTCCTCTTCTGCCTTCTCAAT
GTTACCTCCATAAATTCAACGAAGCCATTAAAAAAAGAGGCCGTGCTTCTTGGCGGGAAT
TTTCCAGCTTTATATGTTATTGGAGATTCATTGGTTGATCCAGGAAACAATAATTATCTT
CTGACACTAGTCAGAGCGAATTTTAAACCTTATGGTTCTAACTTCAAAGGAGGCAAAGCT
ACCGGGCGTTTTAGTGATGGCAAAACAATTGCTGATTATATTGCTATTTATTATGGACTT
CCTTTGGCTCCTGCATACATGGGATTATCTAGAAAGGAAAAAAACAACCTCTCAACGGGT
ATTAACTATGCTTCTGCTAGCTGTGGGATTTTTCCTGACACAGGAAAGCAATTTGGAAGA
TGTCTCTCCATGAGTGTCCAAATCGATCTACTCAATAAAACCATTGAGAAGAATCTTAAG
AAAAAGTTCAAGACACAGTCAGAGCTTAGTAACCACTTGGGTAAATCGTTGTTTATGACC
GCGATTGGGGTCAATGATTACGCTTTCACCTATGAAAAGAACGCAACCGATGCAAATGAG
TTTGCAAGCATGCTTCTTAGTGAGTTCTTGAAACAGCTCGAGGTACAAAAATGTTAGGGG
TTTCAAAAAAAATGGCCACTACGTTATTTAGTTTCAATTAGGAATGTCTACTTTAAGACG
AAATGAGTACTTCCTGGAAAATCTTATGTTTAGAACAATTTCATTAAGGATATCTTTACT
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CAATTTTTTTGAGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU43TF U 1
AF RR4AI73TF U 8
AF RR4FU43JQ C 365
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TTCTCATTTTCATATTCTCTGTGTTTTACTTTTAAGTGTTCTTACATCATATTTCTTACT
TATACTAAGATACTTCTCATACGCATCATCAGTTTTTCATCTAATGTTCTCTTAGTCGAT
TTTCAGTTTGCAGGGTTAATTAAGTTCTTTCTTTTTTCTCTAAACCGGAAAATACAAGAA
ATGGGTTTGCCTTCTTATCTGAAGTCATACCTTATTTATCTCCTCTTCTGCCTTCTCAAT
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TTTCCAGCTTTATATGTTATTGGAGATTCATTGGTTGATCCAGGAAACAATAATTATCTT
CTGACACTAGTCAGAGCGAATTTTAAACCTTATGGTTCTAACTTCAAAGGAGGCAAAGCT
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CCTTTGGCTCCTGCATACATGGGATTATCTAG

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TTTCATATTCTCTGTGTTTTACTTTTAAGTGTTCTTACATCATATTTCTTACTTATACTA
AGACACTTCTCATACGCATCATCAGTTTTTCATCTAATGTTCTCTTAGTCGATTTTCAGT
TTGCAGGGTTAATTAAGTTCTTTCTTTTTTCTCTAAACCGGAAAATACAAGAAATGGGTT
TGCCTTCTTATCTGAAGTCATACCTTATTTATCTCCTCTTCTGCCTTCTCAATGTTACCT
CCATAAATTCAACGAAGCCATTAAAAAAAGAGGCCGTGCTTCTTGGCGGGAATTTTCCAG
CTTTATATGTTATTGGAGATTCATTGGTTGATCCAGGAAACAATAATTATCTTCTGACAC
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GTTTTAGTGATGGCAAAACAATTGCTGATTATATTGCTATTTATTATGGACTTCCTTTGG
CTCCTGCATACATGGGATTATCTAGAAAGGAAAAAAACAACCTCTCAACGGGTATTAACT
ATGCTTCTGCTAGCTGTGGGATTTTTCCTGACACAGGAAAGCAATTTGGAAGATGTCTCT
CCATGAGTGTCCAAATCGATCTACTCAATAAAACCATTGAGAAGAATCTTAAGAAAAAGT
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GCATGC

QA 1 846 1 846
DS 

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CACTAGTCAGAGCGAATTTTAAACCTTATGGTTCTAACTTCAAAGGAGGCAAAGCTACCG
GGCGTTTTAGTGATGGCAAAACAATTGCTGATTATATTGCTATTTATTATGGACTTCCTT
TGGCTCCTGCATACATGGGATTATCTAGAAAGGAAAAAAACAACCTCTCAACGGGTATTA
ACTATGCTTCTGCTAGCTGTGGGATTTTTCCTGACACAGGAAAGCAATTTGGAAGATGTC
TCTCCATGAGTGTCCAAATCGATCTACTCAATAAAACCATTGAGAAGAATCTTAAGAAAA
AGTTCAAGACACAGTCAGAGCTTAGTAACCACTTGGGTAAATCGTTGTTTATGACCGCGA
TTGGGGTCAATGATTACGCTTTCACCTATGAAAAGAACGCAACCGATGCAAATGAGTTTG
CAAGCATGCTTCTTAGTGAGTTCTTGAAACAGCTCGAGGTACAAAAATGTTAGGGGTTTC
AAAAAAAATGGCCACTACGTTATTTAGTTTCAATTAGGAATGTCTACTTTAAGACGAAAT
GAGTACTTCCTGGAAAATCTTATGTTTAGAACAATTTCATTAAGGATATCTTTACTAATA
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TTTTTTGAGAG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

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TTTGAAATGAAGAAAACGGATTTCCACAATCAATCTCAAATCTCCTATTCATCAACACAC
ATATAACTTTAACAACCAAAGTTCATATCCGAAGAAAGTAAGATACAAGGGGATGTATAA
CCCATTGTCATCATCCTTTTAGGATAAACCTAAAAGGACTTTGAATGTGTCCACTAGATT
GCTGTTGACAAGTGTCTTTAACAGTCCAAGCTTTCGTCTAGAGTATGGTGGATACCTGAT
GGCTGAATCACCTAAAAAGCTTTTGAAGAGAACAGATTTCTTGTGACTGAATGCATCAAA
TGAGAATTTACCATGGTAAGAACCAATTCCACTTTCACCGACTCCTCCAAATGGCAATGT
GGGAAGTGTAAAATGAACAGCTGTGTCGTTGACTACAATGCCTACAGCAGAAACTGTCTT
GGTAAATTTCTTTTTCAGCTTGTGGTTTTTGGTAAACAAATACGCAGCAGGTGGCTTGGG
TCGAGAATTAATCACGCCAAAACACTCCTCCAGGTTGTTGAGCGTGATGATTGGCAGGAG
AGGGCCAAATATTTCTTCACTCATGATCAAAGAATCTAATGGCACGTCAAGCAAGACTGT
TGGAGAAATTTTCAGGTTCTCTCTGTTCTTTTGACCTCCATAGACGATTTTATCAGAAAC
TTCCTTCTCCTCTAACATCTTAGACAGGCGATCAAAGTGATTCAAGTTTACAATACGTGA
CGTATCTTTGGACCCCATAGAGTTATTCCCATAAAATGCCTCCAATTCTTTCTTCAGGGC
TTCAATCTTGGGAAGAGAAAAGAGAGCGTCAAAATACAGAAGTGCATCAAGGATGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D205JQ U 84
AF RR4C492JQ U 1
AF RR4D205TF C 189
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TGAAGAGAACAGATTTCTTGTGACTGAATGCATCAAATGAGAATTTACCATGGTAAGAAC
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TGTCGTTGACTACAATGCCTACAGCAGAAACTGTCTTGGTAAATTTCTTTTTCAGCTTGT
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TGTTCTTTTGACCTC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4C492JQ 791 0 0
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TTTGAAATGAAGAAAACGGATTTCCACAATCAATCTCAAATCTCTTATTCATCAACACGC
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CCCATTGTCATCATCCTTTTAGGATAAACCTAAAAGGACTTTGAATGTGTCCACTAAATT
GCTGTTGACAAGTGTCTTTAACAGTCCAAGCTTTCGTCTAGAGTATGGTGGATACCTGAT
GGCTGAATCACCTAAAAAGCTTTTGAAGAAAACAGATTTCTTGTGACTGAATGCATCAAA
TGAGAATTTACCATGGTAAGAACCAATTCCACTTTCACCGACTCCTCCAAATGGCAATGT
GGGAAGTGTAAAATGAACAGCTGTGTCGTTGACTACTATGCCTCCAGCAAAAACTGTCTT
GGTAAATTTCTTTTTCAGCTTGTGGTTTT*GGTAAACAAATACCCAGCAAGTGGCTTGGG
TCGAGAATGAATCACGTCAAAACACTCCTCCAGGTTGTTGAGAGTGAGGATTGGCAGGAG
AGGGCCAAATATTTCTTCACTCATGATCAAAGAATCTAATGGCACGTCAAGCAAGACTGT
TGGAGAAATGTTCAGGTTTTCTCTGTTCCTTTGACCTCCATAGACGATTTTATCAGAAAC
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CGTATCTTTGG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4D205TF 712 0 0
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CTTTAACAGTCCAAGCTTTCGTCTAGAGTATGGTGGATACCTGATGGCTGAATCACCTAA
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GTAAGAACCAATTCCACTTTCACCGACTCCTCCAAATGGCAATGTGGGAAGTGTAAAATG
AACAGCTGTGTCGTTGACTACAATGCCTACAGCAGAAACTGTCTTGGTAAATTTCTTTTT
CAGCTTGTGGTTTTTGGTAAACAAATACGCAGCAGGTGGCTTGGGTCGAGAATTAATCAC
GCCAAAACACTCCTCCAGGTTGTTGAGCGTGATGATTGGCAGGAGAGGGCCAAATATTTC
TTCACTCATGATCAAAGAATCTAATGGCACGTCAAGCAAGACTGTTGGAGAAATTTTCAG
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CATAGAGTTATTCCCATAAAATGCCTCCAATTCTTTCTTCAGGGCTTCAATCTTGGGAAG
AGAAAAGAGAGCGTCAAAATACAGAAGTGCATCAAGGATGTATCC

QA 8 712 8 712
DS 



AS 1 3

CO CL4203Contig1 1009 3 15 U
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GGGTTTAAAAAAAAAGATGAAGCTTGATACAAGTGGGTTCGAGACCTCCATGCCTACGAT
TGGATTCGGCTCCAGCGACGATACGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCCTCCTTTGATAT
TCCCCGCACTACTGATTTCGATGGGTTTCAGAAAGAGGCTGTACAGATGGTGAAGCCAGC
GAAAGGAACAACCACACTCGCTTTTATCTTCAAGGAAGGTGTCATGGTCGCTGCTGATTC
TCGTGCTAGCATGGGTGGATATATCTCGTCACAATCTGTGAAGAAGATTATTGAGATCAA
TCCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGTCAATTCTGGCACCGAAA
CCTTGGTATTAAGTGCCGTCTACATGAGCTGGCGAACAAGAGGAGAATCTCTGTTTCCGG
AGCTTCAAAGCTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGG
CACGATGATTGCTGGATGGGATGAAACCGGCCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGG
AGGAAGACTCAAGGGAGACAGGTTTTCAGTCGGTTCCG*TTCACCATACGCTTATGGTGT
ACTTGACAGCGGGTACAAATTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCGTCTGAGTTAGCAAGGAG
ATCAATCTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCTAGTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCA
CGTGGGACCAAATGGGTGGACGAAACTGTCACGAGATGATGTTGGGGAGCTGCATTATCA
CTACTACCCCGTGCCGCCAGCCACTGCGGAACAGGTCATGGAGGAAGCAGCCGCCGAGTA
ATGAGCCCCCTTTTAGTTCACAAGTCATTCACTCTCTAGCTTGATAAACTTTGGTTTTTA
ACTATAAGATTCTCCTTTTTATCTGCAAATGCATACTCTTTGTTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DI91TF U 1
AF RR4DA35TF U 222
AF RR4DI91JQ C 475
BS 1 788 RR4DI91TF
BS 789 823 RR4DA35TF
BS 824 824 RR4DI91JQ
BS 825 874 RR4DA35TF
BS 875 875 RR4DI91JQ
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BS 972 974 RR4DA35TF
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BS 976 988 RR4DA35TF
BS 989 989 RR4DI91JQ
BS 990 1001 RR4DA35TF
BS 1002 1009 RR4DI91JQ

RD RR4DI91TF 788 0 0
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GGGTTTAAAAAAAAAGATGAAGCTTGATACAAGTGGGTTCGAGACCTCCATGCCTACGAT
TGGATTCGGCTCCAGCGACGATACGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCCTCCTTTGATAT
TCCCCGCACTACTGATTTCGATGGGTTTCAGAAAGAGGCTGTACAGATGGTGAAGCCAGC
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TCCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGTCAATTCTGGCACCGAAA
CCTTGGTATTAAGTGCCGTCTACATGAGCTGGCGAACAAGAGGAGAATCTCTGTTTCCGG
AGCTTCAAAGCTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGG
CACGATGATTGCTGGATGGGATGAAACCGGCCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGG
AGGAAGACTCAAGGGAGACAGGTTTTCAGTCGGTTCCG*TTCACCATACGCTTATGGTGT
ACTTGACAGCGGGTACAAATTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCGTCTGAGTTAGCAAGGAG
ATCAATCTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCTAGTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCA
CGTGGGAC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4DA35TF 780 0 0
G
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CGTGGTCGCTGCTGATTCTCGTGCTAGCATGGGTGGATATATCTCGTCACAATCTGTGAA
GAAGATTATTGAGATCAATCCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTG
TCAATTCTGGCACCGAAACCTTGGTATTAAGTGCCGTCTACATGAGCTGGCGAACAAGAG
GAGAATCTCTGTTTCCGGAGCTTCAAAGCTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGG
AATGGGACTTTCCGTCGGCACGATGATTGCTGGATGGGATGAAACCGGCCCTGGACTATA
CTATGTGGACAACGAATGAGGAAGACTCAAGGGAGACAGGTTTTCAGTCGGTTCGG*TTC
ACCATACGCTTATGGTGTACTTGACAGCGGGTACAAATTCGATATGTCAGTTGAAGAAGC
GTCTGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCTAGTGGTGG
AGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGACCAAATGGGTGGACGAAACTGTCACGAGATGATGT
TTGGGAGCTGCATTATCACTACTACCCCGTGCCGCCAGCCACTGCGGAACAG*TCATGGA
GGAAGCAGCCGCCGAGTAATGAGCCCCCTTTTAGTTCACAAGTCATTCACTCTCTAGCTT
GATAAACTTTGGTTTT*AACTATAAGAT*CTC*TTTTTATCTGCAA*TGCATACTCTTT

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR4DI91JQ 535 0 0
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CGTCGGCACGATGATTGCTGGATGGGATGAAACCGGCCCTGGACTATACTATGTGGACAA
CGAAGGAGGAAGACTCAAGGGAGACAGGTTTTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTA
TGGTGTACTTGACAGCGGGTACAAATTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCGTTTGAGTTAGC
AAGGAGATCAATTTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCTAGTGGTGGAGTTGCTAGCGT
GTACCACGTGGGACCAAATGGGTGGACGAAACTGTCAGGAGATGATGTTGGGGAGCTGCA
TTATCACTACTACCCCGTGCCGCCAGCCACTGCGGAACAGGTCATGGAGGAAGCAGCCGC
CGAGTAATGAGCCCCCTTTTAGTTCACAAGTCATTCACTCTCTAGCTTGATAAACTTTGG
TTTTTAACTATAAGATTCTCCTTTTTATCTGCAAATGCATACTCTTTGTTTGTCG

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 3

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ATTCAACGACTGGGAACAAGAAAAAGAAAAACAACAGGGGGATTAATATGTCATGAACTC
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ACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCAGCTTTGCTTTTCACG
GGTTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAACCCCGA
GATGTTGGACGTAAACCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGACACCTGAAGTACAAGG
GCTCCATTACGAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTATGTTAATA
CCAGCTCGAAGGACTTTGCTGAACTGGATTAGTTGAGGAACAATCTTCAATACAGTTGAT
GACGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAAATGTTCCTGTCTGTGTGTATATGGCTGTGTTG
ATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAATCGAGC


BQ
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AF RR4EB49JQ U 209
AF RR4GY81JQ U 1
AF RR4H513JQB U 1
BS 1 565 RR4GY81JQ
BS 566 570 RR4H513JQB

RD RR4EB49JQ 176 0 0
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CTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAACCCCGAGATGTTGGACGTAAACCTGCTTTTGCAG
CCAGACTATCTCCAGGCACCTGAAGTACAAGAGCTCCATTACGAACATTGAGTTGA

QA 1 176 1 176
DS 

RD RR4GY81JQ 565 0 0
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ACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCAGCTTTGCTTTTCACG
GGTTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAACCCCGA
GATGTTGGACGTAAACCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGACACCTGAAGTACAAGG
GCTCCATTACGAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTATGTTAATA
CCAGCTCGAAGGACTTTGCTGAACTGGATTAGTTGAGGAACAATCTTCAATACAGTTGAT
GACGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAAATGTTCCTGTCTGTGTGTATATGGCTGTGTTG
ATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAAT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4H513JQB 570 0 0
AGTAAAAGGAACATGCTTCGAGAGGTGGACATGTTTCTTCTATTGACATTACATATATGT
ATTCAACGACTGGGAACAAGAAAAAGAAAAACAACAGGGGGATTAATATGTCATGAACTC
TTCTCTTCCAGTGAGATCTGTAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCTTTATCGCTAGTTTC
ACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCAGCTTTGCTTTTCACG
GGTTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAACCCCGA
GATGTTGGACGTAAACCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAAACACCTGAAGTACAAGG
GCTCCATTACAAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTATGTTAATA
CCAGCTCGAAGGACTTTGCTGAACTGGATTAGTTGAGGAACAATCTTCAATACAGTTGAT
GACGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAGATGTTCCTGTCTGTGTGTATATGGCTGTGTTG
ATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAATCGAGC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 3

CO CL4205Contig1 1399 3 3 U
GCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAA
GTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTGTT
TGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACC
CCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTTGC
TCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCATTC
AAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGT
GACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAG
GAAGGTAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAA
CAATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAG
GATCCATTGGAGTGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTA
TATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGCCCGGTCC
GCCTTCGGCGAGCACCGGTCGGCTTGTCTCTTCTGTTGGCGATACGCTCCTGGTCTTAAC
TGGCCGGGTCGTGCCTCCTTCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCCCAAAGCAAGCC
TACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGC
CTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAG
AGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGCCCTGC
AAGACCCGTCAGTGCTAAGAAACCTGTGGGGGCTCGAGCTAACAACGGAACACCAAACCG
GCGTTTATCTTTGAATGCAAACCAGAATGGAAGCAGGTCTGTTGCAAAAGAAGTAGAGAG
AAGGGGGAGTCTCAACAGGCCGGCTGCTCCTACAAACTACGTTGCCATTTCGAAAGAGGA
AGCTGCTTCCTCTCCTGGTTCTGGTGCTGCAGATCATGTTCAAGCTTCACCGTGAAGATG
AGAAAGGAAAAGATCTCTATTTTTCTTTCTGTTTGTGAGTTGTTTTAGGGAGAGAGAGTT
ATATGAAACACCGAGAGAAGACAGAAAAAGACGTTTGAGAGTAGAATGGTGTAGTAGAAA
GTGTATGTGTATGTTTTGTTAATGTGTTTTGTGAATGTTGTTTGCCGTGGAATATCAGAA
AGTATCTTGTTGTGCCTGT


BQ
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AF RR4FF49TF U 1
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AF RR4EL45TF U 875
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G
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QA 2 525 2 525
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H426JQB U 1
AF RR4AS06TF C 239
BS 1 255 RR4H426JQB
BS 256 256 RR4AS06TF
BS 257 533 RR4H426JQB
BS 534 534 RR4AS06TF
BS 535 698 RR4H426JQB
BS 699 970 RR4AS06TF

RD RR4H426JQB 698 0 0
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CACTCAAGCCATCCTTCGGGTCTCACAACGCTGCTCATATTATTCCTCATGAAAATTGTC
CTTGAATATTCCTTCCATGGCCTCCCTAGATACGTGCTTGTCGTGTTTAGGTATGGAACT
AAGTCTGCGTCCGCCGAAATGTTGCTGAATTGGATAGAGAATCCTGAGGGTTGGTTGGGA
TCTTTCCGGCCTTGTGCAGTGATGGTATTCTTTTGGTTAGGGAGTCCTCTCCTGGCCAAA
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ATGGTGCACTCGCGGTAGAACTGACGCATGGTGTGTGTGTAGAGCGTATCTTGAAAACCT
CTCATGGCACATCTGTAGAACACAGAGAGGTCAGAGTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AS06TF 732 0 0
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GATCTTTCCGGCCTTGTGCAGTGATGGTATTCTTTTGGTTAGGGAGTCCTCTCCTAGCCA
AAATGTGACAGTTTTGAAACACAACGGTTCCATCCCCAAATATAAAATCTACAGTTCCAG
TGATGGTGCACTCGCGGTAGAACTGACGCATGGTGTGTGTGTAGAGCGTATCTTGAAAAC
CTCTCATGGCACATCTGTAGAGCACAGAGAGGTCAGAGTCCGACCTTAGGGCTACGGCTT
GATGCTTCTCTGGCCCCGCTGTGTTCTGAAAGGTTATATCTCTTGCTAAGAATCCCTTTC
CGCTTACAGCGAATGTAGCGGACCGGAAAGTGGTCCAACCGTCAATGAAGTTGCGATTAC
CGGAAATAACGGTCACATCAATGCCATCACCTATCATAACGAGGTTCCATTTCTTCTTCT
TGATCTCAACATTTTCCAAGTATAAACCCTTTTTAATGTATATGACGAAACGTTGCGAGC
TGTACTCAGGAG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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CCCCAAGCTATAAGTTACTGAGATTTATCGATGATTACCTCTTTGTGTCTACCTCAAGAG
AACAGGCCACTAGATTTTATCAGAGGTTGAAGCAAGGGTTCCCAAATTACAACTGCTTTA
TGAACGACAAGAAATTCTGCATAAACTTTGGAGATGAAGAAGATTCTAACAGGATGTATT
TGGGTGATAATGAAGTTTCTTTTATAAGATGGACGGGTTTGCTTATTAATTCCCATACAT
TCGAAGTTCAAGTTGACTACACAAGGTACGTGAGTGGCCATATAAGCTCAACCTTTTCGG
TAGACTGGCAGAACAAACCAGTTGGAAATCTTCGGCATAAATTGTGTTACTTCTTGGTCC
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ACATCTATCAGATCTTTCTGTTAGCTGCGATGAAGTGACATTGTTATGTCTGCGAACTGG
TCTGGTTTTGGAAGCTTCGTCCTCAAACTTTGTCCAAATTCATTACAAGATCTATCAGGT
ACATGTTCAAACTCATCAATCGAAAGATGCACAGAATCAACACTGGTTCTAGTTTCAGAC
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TACTGAAGAAGAAACACTCCAGATATCGATCACTCTTGAACTATTTGGGATCTGCACTTT
CGAAACTCGATATTCCTTTGAATCTATCGCCGGATCTGGAGTATGCAACGAACCGATCCA
ACTCATCTATCCTGTGGAAACTGAGTTACTGATCCTCTATGATTAAAGCTGGTATAAGCG
AGTTAATTTGATTTCTGTCTTCTTTACAGTTATTTCTGTGTAACTGTTTAATATGACAAC
GTCACTTTCGGCTCTATAATATGTTTTGATTCTGTTTGGGACTACTGCATCAGCCCACCT
AATGTTGCAGAATAAAGCGCACCTAATGAAATTACTCT


BQ
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AF RR4H204TF U 1
AF RR4H204JQ C 474
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BS 711 1238 RR4H204JQ

RD RR4H204TF 710 0 0
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CTTCGTTATGCTGTTTGTACTACGGGCATCTCGAGAGGACTTTGATCTACCCGTTCCTCG
AAGAAGCCTCTGGAGACGTGTCTGCTAAAGAATGCAATGGAGAGAAAGAGCTAATCAATC
CCCCAAGCTATAAGTTACTGAGATTTATCGATGATTACCTCTTTGTGTCTACCTCAAGAG
AACAGGCCACTAGATTTTATCAGAGGTTGAAGCAAGGGTTCCCAAATTACAACTGCTTTA
TGAACGACAAGAAATTCTGCATAAACTTTGGAGATGAAGAAGATTCTAACAGGATGTATT
TGGGTGATAATGAAGTTTCTTTTATAAGATGGACGGGTTTGCTTATTAATTCCCATACAT
TCGAAGTTCAAGTTGACTACACAAGGTACGTGAGTGGCCATATAAGCTCAACCTTTTCGG
TAGACTGGCAGAACAAACCAGTTGGAAATCTTCGGCATAAATTGTGTTACTTCTTGGTCC
CTAAATGTCATCCCATTCTCTTTGACTCCAACATCAACTCTGGAGCAGTTGTGAGGTTAA
ACATCTATCAGATCTTTCTGTTAGCTGCGATGAAGTGACATTGTTATGTC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4H204JQ 765 0 0
CA
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TTCGGTAGACTGGCAGAACAAACCAGTTGGAAATCTTCGGCATAAATTGTGTTACTTCTT
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GTTAAACATCTATCAGATCTTTCTGTTAGCTGCGATGAAGTGACATTGTTATGTCTGCGA
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CAGGTACATGTTCAAACTCATCAATCGAAAGATGCACAGAATCAACACTGGTTCTAGTTT
CAGACCAGTTTTTAAACTGTGCAAAGAAGAAGTGATATGGCTTGGCTTACACGCTTACAT
TCAAGTACTGAAGAAGAAACACTCCAGATATCGATCACTCTTGAACTATTTGGGATCTGC
ACTTTCGAAACTCGATATTCCTTTGAATCTATCGCCGGATCTGGAGTATGCAACGAACCG
ATCCAACTCATCTATCCTGTGGAAACTGAGTTACTGATCCTCTATGATTAAAGCTGGTAT
AAGCGAGTTAATTTGATTTCTGTCTTCTTTACAGTTATTTCTGTGTAACTGTTTAATATG
ACAACGTCACTTTCGGCTCTATAATATGTTTTGATTCTGTTTGGGACTACTGCATCAGCC
CACCTAATGTTGCAGAATAAAGCGCACCTAATGAAATTACTCT

QA 3 765 3 765
DS 



AS 1 3

CO CL4208Contig1 840 3 8 U
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TCTTCACCGTTGCTCTCAAGCTTCCCGTCGAAGCCGATTTCCAAACCTCCTCTTCCTTCC
TCAAGCGTTTTTCACCTCTTCCTCAAGGTTTGTTACAGTCTCTGCTCCAACACTTGAATC
TGATATCGCTTGGACTCATCTTTCTAGAATCGATAGGTCATTGAGAAATTAAACCTATAG
TTTTTGCTTCTCCGCTGATTTGCTTTCTTAGGATTTCGGATCTTAGTGAATCTGCCTCAT
ATAGATCTCGTTTGTGTTTTTGGGTCGTAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGAC
ACTTAACCCTCGTTAGAACTGAGGTCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGAT
TTGGCTTTTGGAGTTTAGTAGTTGTCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGATCAG
GAGAACGGTGTGTCTTTCTAGTTGGATTAGTTTTATCAGTTCTATTTGATTATGTTCGTT
TTTTCAAGATATGGTCTACAACCTCAAGCTATTTATTAGTCGAACAGAGAAGCCGATGAG
ACACATACGACATGTTTGGTTTGTTCTTTTTCAAGTGATAGGACACTGTTGTGTTTCTTT
TACAGTCTAGATGTGTACTCTTTTTCTCTTCGGAAATTTATCTATTACCCCCCCGTATTG
GTGTGCGTGAACTTTTTTAAGTTTTTTTTTTTTAACTTGAACTGTTTAAGTTTCTTTTGT
ATCCATCAATACCTTTATGATAAATGATATTGTATCGTCGAATGACTATATGGAATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EU72TF U 6
AF RR4DP31TF U 1
AF RR4EU72JQ C 145
BS 1 106 RR4DP31TF
BS 107 107 RR4EU72TF
BS 108 641 RR4DP31TF
BS 642 642 RR4EU72JQ
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BS 694 705 RR4DP31TF
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RD RR4EU72TF 471 0 0
GG
AAATCAGACATTTTGTTTTGGCCGTCAAATTCAGGAGAACTCGATTCTCACCTTCTTCAC
CGTTGCTCTCAAGCTTCCCGTCGAAGCCGATTTCCAAACCTCCTCTTCCTTCCTCAAGCG
TTTTTCACCTCTTCCTCAAGGTTTGTTACAGTCTCTGCTCCAACACTTGAATCTGATATC
GCTTGGACTCATCTTTCTAGAATCGATAGGTCATTGAGAAATTAAACCTATAGTTTTTGC
TTCTCCGCTGATTTGCTTTCTTAGGATTTCGGATCTTAGTGAATCTGCCTCATATAGATC
TCGTTTGTGTTTTTGGGTCGTAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGACACTTAAC
CCTCGTTAGAACTGAGGTCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGATTTGGCTT
TTGGAGTTTAGTAGTTGTCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGA

QA 3 471 3 471
DS 

RD RR4DP31TF 705 0 0
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TCTTCACCGTTGCTCTCAAGCTTCCCGTCGAAGCCGATTTCCAAACTTCCTCTTCCTTCC
TCAAGCGTTTTTCACCTCTTCCTCAAGGTTTGTTACAGTCTCTGCTCCAACACTTGAATC
TGATATCGCTTGGACTCATCTTTCTAGAATCGATAGGTCATTGAGAAATTAAACCTATAG
TTTTTGCTTCTCCGCTGATTTGCTTTCTTAGGATTTCGGATCTTAGTGAATCTGCCTCAT
ATAGATCTCGTTTGTGTTTTTGGGTCGTAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGAC
ACTTAACCCTCGTTAGAACTGAGGTCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGAT
TTGGCTTTTGGAGTTTAGTAGTTGTCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGATCAG
GAGAACGGTGTGTCTTTCTAGTTGGATTAGTTTTATCAGTTCTATTTGATTATGTTCGTT
TTTTCAAGATATGGTCTACAACCTCAAGCTATTTATTAGTCGAACAGAGAAGCCGATGAG
ACACATACGACATGTTTGGTTTGTTCTTTTTCAAGTGATAG*ACACTGTTGTGTTTCTTT
TACAGTCTAGATGTGTACTCTTTTTCTCTTCG*AAATTTATCTAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4EU72JQ 696 0 0
AAGGTTTGTTACAGTCTCTGCTCCAACACTTGAATCTGATATCGCTTGGACTCATCTTTC
TAGAATCGATAGGTCATTGAGAAATTAAACCTATAGTTTTTGCTTCTCCGCTGATTTGCT
TTCTTAGGATTTCGGATCTTAGTGAATCTGCCTCATATAGATCTCGTTTGTGTTTTTGGG
TCGTAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGACACTTAACCCTCGTTAGAACTGAGG
TCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGATTTGGCTTTTGGAGTTTAGTAGTTG
TCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGATCAGGAGAACGGTGTGTCTTTCTAGTTG
GATTAGTTTTATCAGTTCTATTTGATTATGTTCGTTTTTTCAAGATATGGTCTACAACCT
CAAGCTATTTATTAGTCGAACAGAGAAGCCGATGAGACACATACGACATGTTTGGTTTGT
TCTTTTTCAAGTGATAGGACACTGTTGTGTTTCTTTTACAGTCTAGATGTGTACTCTTTT
TCTCTTCGGAAATTTATCTATTACCCCCCCGTATTGGTGTGCGTGAACTTTTTTAAGTTT
TTTTTTTTTAACTTGAACTGTTTAAGTTTCTTTTGTATCCATCAATACCTTTATGATAAA
TGATATTGTATCGTCGAATGACTATATGGAATAAAA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

CO CL4209Contig1 907 3 6 U
GGGCCGAACCAACTAACCCTCAGGGGACTCTTAGAAAAAAGAAAAAAAAAGCCTCAAAAT
CCTCTCTAGTCTTCTTCTAGAAACACCTTCTCTCTCATTTAGAGTCTTTTCAAAAAAAAA
AAAAATGGCGGTTACATCTTCTAGAACCAGATCAACCGGTACTGCGCTACGCTCTTCTTC
AGGCTTCGCTTCCTCCACAACCTCAACCTTCTCGTCCCGTTCTTCAGCTTTCTTCAGCAA
CCAACAACAACAACAACAACAACCTCACCACAGATCCGCGTCCCCGACGCGCGTGAACCT
CTTCGCATCATCACCGTTAAAACAATCGTTCCGTTACTCGATCGATTCCAGATCTATATC
CGACGAACAGTTTGAATATGAGAAGATCGGCGATGACGAATTCGCTGGTGAGGATCGGTG
GAGTTGAAGGTGAGTGGGTGAGGAGAGCGTTGACGACGTTGATAAGGCCGTCCTCGCATC
AGCAGAAGAGAAGGTCCGCGTATCAGCCTAGGCCTAGTAGGCTATCGACTATGTCGAAAG
CAGGAGAAGGTGTTTGATCAGGTTTTAGGGCTTTGTGTCACTGAATCGGCCTCAGGAGAT
ATCGTTTCTGGTAGAGCTGTGGGAGATAGATCCGGCGAAGGGG*GCTGAGACTCGGGTCG
GGTCTGCGCGTACGGGTTGAATCAGGGAGTTATGTAAACGGTTCCGGAAACGACGCCGTC
TTAATTTTGTGTTTTGTTTTGTTGGGTGAAGATGAATTGTACATAGTAGTACTTCATTTG
CTATTGAAGCGCACTGAATTTCCATAAGCTCGAAAAGTATCTAAGAACACTTAGTAGTAG
AATTGGTTGTTAAAAATCAAATGGAACAAAGGGACATGGTTTTATATATTCTGATTCCAG
TTTCTAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4AL82TF U 1
AF RR4FN96JQ C 441
AF RR4FN96TF U 441
BS 1 639 RR4AL82TF
BS 640 640 RR4FN96TF
BS 641 643 RR4AL82TF
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BS 645 798 RR4AL82TF
BS 799 907 RR4FN96TF

RD RR4AL82TF 798 0 0
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CCTCTCTAGTCTTCTTCTAGAAACACCTTCTCTCTCATTTAGAGTCTTTTCAAAAAAAAA
AAAAATGGCGGTTACATCTTCTAGAACCAGATCAACCGGTACTGCGCTACGCTCTTCTTC
AGGCTTCGCTTCCTCCACAACCTCAACCTTCTCGTCCCGTTCTTCAGCTTTCTTCAGCAA
CCAACAACAACAACAACAACAACCTCACCACAGATCCGCGTCCCCGACGCGCGTGAACCT
CTTCGCATCATCACCGTTAAAACAATCGTTCCGTTACTCGATCGATTCCAGATCTATATC
CGACGAACAGTTTGAATATGAGAAGATCGGCGATGACGAATTCGCTGGTGAGGATCGGTG
GAGTTGAAGGTGAGTGGGTGAGGAGAGCGTTGACGACGTTGATAAGGCCGTCCTCGCATC
AGCAGAAGAGAAGGTCCGCGTATCAGCCTAGGCCTAGTAGGCTATCGACTATGTCGAAAG
CAGGAGAAGGTGTTTGATCAGGTTTTAGGGCTTTGTGTCACTGAATCGGCCTCAGGAGAT
ATCGTTTCTGGTAGAGCTGTGGGAGATAGATCCGGCGAAAGGGAGCTGAGACTCGGGTCG
GGTCTGCGCGTACGGGTTGAATCAGGGAGTTATGTAAACGGTTCCGGAAACGACGCCGTC
TTAATTTTGTGTTTTGTTTTGTTGGGTGAAGATGAATTGTACATAGTAGTACTTCATTTG
CTATTGAAGCGCACTGAA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4FN96JQ 467 0 0
G
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GTTTTAGGGCTTTGTGTCACTGAATCGGCCTCAGGAGATATCGTTTCTGGTAGAGCTGTG
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TTGGGTGAAGATGAATTGTACATAGTAGTACTTCATTTGCTATTGAAGCGCACTGAATTT
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TGGAACAAAGGGACATGGTTTTATATATTCTGATTCCAGTTTCTAC

QA 2 467 2 467
DS 

RD RR4FN96TF 467 0 0
G
GGAGAGCGTTGACGACGTTGATAAGGCCGTCCTCGCATCAGCAGAAGAGAAGGTCCGCGT
ATCAGCCTAGGCCTAGTAGGCTATCGACTATGTCGAAAGCAGGAGAAGGTGTTTGATCAG
GTTTTAGGGCTTTGTGTCACTGAATCGGCCTCAGGAGATATCGTTTCTGGTAGAGCTGTG
GGAGATAGATCCGGCGAAGGGG*GCTGAGACTCGGGTCGGGTCTGCGCGTACGGGTTGAA
TCAGGGAGTTATGTAAACGGTTCCGGAAACGACGCCGTCTTAATTTTGTGTTTTGTTTTG
TTGGGTGAAGATGAATTGTACATAGTAGTACTTCATTTGCTATTGAAGCGCACTGAATTT
CCATAAGCTCGAAAAGTATCTAAGAACACTTAGTAGTAGAATTGGTTGTTAAAAATCAAA
TGGAACAAAGGGACATGGTTTTATATATTCTGATTCCAGTTTCTAC

QA 2 467 2 467
DS 



AS 1 3

CO CL4210Contig1 1049 3 13 U
AGAAGGACAAGATCGGGAAAAATGGCGTCATGGATTAAACCGGTGCTAATCTCTACAGGA
GTCGTAGCTGTAGCTATGCAACTAAAAATCATTGTCCCTGTTGTGGCACTAGATTTCTCT
CGAGCTCCCGTCCTTTTCGGTTCCTTTCTCTCATGGCTGAAACCACCATACCTCTACGTC
ATCACCAACGTCATCATCGCCATGATCGGGTTCTCATCCATATATCACCGGATCATCACA
AACCCCGAGGTCAAAGACCACGGGGGCTCATACGGCGGCGACCATAAGTTTCAGAACGAG
CAGAACGTCCACCGAGCTCAACCGCAGCGATCTGAAGATTTCAGTTTTATCGCCGCAGCT
CCGCCGTCAAAGACCATCGTTAAGGAGAAGGAGAGAGAAGAGATGGTTACGGAGAAGCTA
GCATAAGCTGCCACAAAAGTAGAGGAGGAGAAGAAGTGTTTAGTGGTGGTGGTGGCCGAA
CCGGAAAATCAGACTCCGGTTGAGAAGCCTCTTGTTTCGGCTAGGATCGGCCAACGGAAA
CTGGTCAAGACCACCACGGCAGAACGAAAATCTTTGAAAGCGTTGAGAGTGGCGAAGCCA
AACGGCAAGAGACTCTTGAGAATAGTGGAAGATGATAACGGAAGGGAAGCCGTTGACTAG
CTATTACCGGAGACCAGACACGTTCGGACTTGGCGTAGAAGATTCTTCCAACAAGACAAA
ACAGTCCGGTTTGAAGAAAGCCGAGACGTTTAGCGATCGAACCAAGTATTACCTCTCACC
GGCCGTGTCGCGGAGTCGAAACGAGCTGAATGTAAGAGCAGAAGCGTTTATAAAAAAGTG
CAACGACGAAAGGTTCGAGTCGATGAGACAGGACACAGAAATGACTCGTCGTGGTCTTCC
GTTTTAGTTTTAGTTATGGTTTTTTTGCTTTTGTTTTGTCTATTTTATTAGTTTCGATTG
CATTTTCTAGAAGCTGTTAAGTAATAACAAAAGGAAATGACAAATGTGGGAAGTCATGGA
TAAACAAAGCACCCCTTATTGGCCTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F993TF U 1
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G
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DS 



AS 0 0

AS 1 3

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AAATGATTCTCGTTAACAGAGCCGTTTCTACAGCAAGCCTTGACAACGTCGCTTGGTTTT
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BQ
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AF RR4FN83TF U 1
AF RR4GR33TF U 489
AF RR4GR33JQ C 701
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BS 526 526 RR4GR33TF
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AAATGATTCTCGTTAACAGAGCCGTTTCTACAGCAAGCCTTGACAACGTCGCTTGGTTTT
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CCAAGAGGTCAACGGAAACTAACATCACTGTGGCTTCAACCAAAACAGCAGGGAGCCAGT
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DS 

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GCTGGTAGCTTCCTACCTCCTACGGAAAGAAGATTTGCTGTCTTGTTAGGATCACTTCTT
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GTAGATACACATGTCCATCGCATTTGCAATCGACTTGGTTGGGTTTCTCGACCAGGAACC
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GTGGTTTTGCTAGAAAACTTCGACTCCAGAGGAAACAAGAGTAGCTCTGCAACAATGGCT
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CAA
GAG

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DS 

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AAACAAGAGTAGCTTTGCAACAATGGCTTCCAAAGGAAGAATGGGTTGCCATTAACCCGC
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AGAAATTTAAGCGAAGCAAAGAACTATAATCCGAAGTCAGGGGAACATATGAAGCTAGTT
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CTTTTTTTTAAACAACCAACTGGTTTTCTTTTGTTATTAAGTAGTAATTACTAAATTTTA
ATCCGTACAACTATT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

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TCTGCTCCACCTGCTGATCGAAGAGCTCTCAAGATAGCTCGGTTCAAACGTCAAAAGGCT
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GCTGCTGCCTTGTCTACTCCGGTTGAATCTGGAGAAGATGACATCCCAGATGATGACAGC
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CACAAGCATCAACCACTTATCTTCGGTCCAGCAAGCATCGTGAATGGAGGTCTTTCTACG
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AAGCCATTGAAGAAGCAACCACCTCATGGCACAATGACAACCTCTGAGAAGAAGGAGAGG
ATGAAGAAGATGATGATGAAGACGAAGATGCTGTGATGAAAGCTAGA


BQ
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AF RR4AV72TF U 1
AF RR4G087TF U 392
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QA 1 819 1 819
DS 

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G
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GAAGGGGCGACGCGGACGTTCAAAAAGGGCTGCTGCCTTGTCTACTCCGGTTGAATCTGG
AGAAGATGACATCCCTGATGATGACAGCGAAGAAGAAAGAGATGCGTGGCTCGCCACAAT
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GCTCTCTGCAATCAAGGAGAAACAATTGAAGGATGGAGAGGATGTGTTTTCTCGGGATGC
TCTAGATGATCGCACAAAGAAAGCTGAAACATGGCACAGAGATGCTGCTGCGAGGGTACA
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AAGCATCGTGAATGGAGGTCTTTCTACGGAGAGAGAAAGAATGATAGCTCAGGTTTTCCA
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AATGAATGATTGGCAAGAGCAGACGAAAAAGCCATTGAAGAAGCAACCACCTCATGGCAC
AATGACAACCTCTGAGAAGAAGGAGAGGATGAAGAAGATGATGATGAAGACGAAGATGCT
GTGATGAAAGCTAGA

QA 2 796 2 796
DS 



AS 1 3

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CTCAATCCCCCGTTCGGCGGCGTATTCTGGTACAAGCTTTGACAGCAGAGGAAGTAATGA
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TCGGAAGTGCTATCGGTTTATACATGGTTGCTGTTGAGAGACAAACCCAGAACAGGGCAC
GTGCTTTGGCTGAAGGTATGAGAGCTGCTGAATCACAAGGTGGTGGTGGTTGTGATGGTG
ATGGTAGTATCTGAATCTACCCAAGTGCCATCAGTTGAGTTTTTTTTTTGTTTTTTTAGA
TGTATGGTAACATCTTGCTTGTTCCAAAGATTGTGCTTGTTGCAGTTTCTTGTTGGCAAA
TATAATCTCAATAAGGTTTTGATACTTGAAGTTGCTAAACATACAAGTTTGTGTTATC


BQ
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AF RR4E795JQ C 1
AF RR4E795TF U 1
AF RR4E982TF U 1
BS 1 478 RR4E795TF

RD RR4E795JQ 478 0 0
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ATGGTAGTATCTGAATCTACCCAAGTGCCATCAGTTGAGTTTTTTTTTTGTTTTTTTAGA
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QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4E795TF 478 0 0
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TCGGAAGTGCTATCGGTTTATACATGGTTGCTGTTGAGAGACAAACCCAGAACAGGGCAC
GTGCTTTGGCTGAAGGTATGAGAGCTGCTGAATCACAAGGTGGTGGTGGTTGTGATGGTG
ATGGTAGTATCTGAATCTACCCAAGTGCCATCAGTTGAGTTTTTTTTTTGTTTTTTTAGA
TGTATGGTAACATCTTGCTTGTTCCAAAGATTGTGCTTGTTGCAGTTTCTTGTTGGCAAA
TATAATCTCAATAAGGTTTTGATACTTGAAGTTGCTAAACATACAAGTTTGTGTTATC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4E982TF 478 0 0
GGGATTTCATTTTCCGTCTTCTTCTTCTTCTTCCCACTGTCAACTATTGTCTTGTCGGTT
CTCAATCCCCCGTTCGGCGGCGTATTCTGGTACAAGCTTTGACAGCAGAGGAAGTAATGA
TGGGTTCGAGAGGAGTTATCAGTGATAAGTGGTCGATGAGGATTCTATGGGGCTGTGCAC
TCGGAAGTGCTATCGGTTTATACATGGTTGCTGTTGAGAGACAAACCCAGAACAGGGCAC
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ATGGTAGTATCTGAATCTACCCAAGTGCCATCAGTTGAGTTTTTTTTTTGTTTTTTTAGA
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QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 3

CO CL4215Contig1 1014 3 4 U
GGAGAGAAAATCAGATAGTAAATAAATAAGAAACAGAGCATACAAACTTTGTTCCTAGAT
CAAAAGTAAACAACAAACTTCATAATAAACGTTTAAAATATTGGAAAGTAACATAAAGAG
TGATGAGCAGAGACCATCTTTAAGTGATTGATGCTTCTTTTGCCTTTGAAGACTCAGTGG
CCATTGGCTATGGATCCATCGTCTCCTTTCTTGCCATAAAATCTCCGGTACAATGAATCA
ACCTCTTTCAGATAATAAGTTCCCGGAGCCAAAAGGTCTATGATGACTTCTTTGCTCGTC
ACAAACTCCTTTGCTCCGTACCTATGTTCCATCAGCTTCATTGTCTCCACAAACTTCTCA
GGTGCATACTCATGTCTAGCCTTCAGTTTACCGCCTACGTCCATGACAGATGCAATGTTT
GAGAGGCTGAAAGGAGACTGGTTTTCGCAGAAACGCAATGAAAACATTGTTGCGGTTGAA
CCACTTCCATATGAGAACATAACCACCCTCTTTCCCGCCAAGTCGCTGTGTTTGTTGTGG
ATGAGAGAAGCAAAAGCTGCGTAGAGAGAAGCAGTGTACATGTTACCCACTTGTTTTGGT
ACTAAAGTCGTTGGTTGCACTTTAGCATCATAAAAACTTTTGGCAACTTGTTGTGACACC
TTTTCAAGATCACGGCTTTGGTAACTCTCGTCGAGTGACAAAGACGAGTAAGGAGTGGAC
TTCTCTTTGGCAGCCTCGTCAATGGAGCTTGCGTTTCTCAAGAAGTCGTTGTACAAGAGA
CGAGCAAAGCTTTTCTGTACAAGTTTGTTGTATGGAGAATGGAACACAAAGTAGTCAGCA
TCATTGATGGAGAACTCTTTGCCTTCGAGTTTCTCAAACTTGTTGCATAAATGTTTATAG
CAGGAGTCAAGTGCCATAAGGTAGCAAGTCTGTGAAAGCTTACCATCAACAACAGGGTAC
TCGCTAGCAAGATTTGGCTTGTAAAAGTCATAGACATGAGCCATGTGGCTTCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FK68JQ U 1
AF RR4BM12JQ U 1
AF RR4FK68TF C 330
BS 1 285 RR4BM12JQ
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RD RR4FK68JQ 445 0 0
A
GAGAGAAAATCAGATAGTAAATAAATAAGAAACAGAGCATACAAACTTTGTTCCTAGATC
AAAAGTAAACAACAAACTTCATAATAAACGTTTAAAATATTGGAAAGTAACATAAAGAGT
GATGAGCAGAGACCATCTTTAAGTGATTGATGCTTCTTTTGCCTTTGAAGACTCAGTGGC
CATTGGCTATGGATCCATCGTCTCCTTTCTTGCCATAGAATCTCCGGTACAATGAATCAA
CCTCTTTCAGATAATAAGTTCCCGGAGCCAAAAGGTCTATGATGACTTCTTTGCTCGTCA
CAAACTCCTTTGCTCCGTACCTATGTTCCATCAGCTTCATTGTCTCCACAAACTTCTCAG
GTGCATACTCATGTCTAGCCTTCAGTTTACCGCCTACGTCCATGACAGATGCAATGTTTG
AGAGGCTGAAAGGAGACTGGTTTT

QA 2 445 2 445
DS 

RD RR4BM12JQ 691 0 0
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CAAAAGTAAACAACAAACTTCATAATAAACGTTTAAAATATTGGAAAGTAACATAAAGAG
TGATGAGCAGAGACCATCTTTAAGTGATTGATGCTTCTTTTGCCTTTGAAGACTCAGTGG
CCATTGGCTATGGATCCATCGTCTCCTTTCTTGCCATAAAATCTCCGGTACAATGAATCA
ACCTCTTTCAGATAATAAGTTCCCGGAGCCAAAAGGTCTATGATGCCTTCTTTGCTCGTC
ACAAACTCCTTTGCTCCGTACCTATGTTCCATCAGCTTCATTGTCTCCACAAACTTCTCA
GGTGCATACTCATGTCTAGCCTTCAGTTTACCGCCTACGTCCATGACAGATGCAATGTTT
GAGAGGCTGAAAGGAGACTGGTTTTCGCAGAAACGCAATGAAAACATTGTTGCGGTTGAA
CCACTTCCATATGAGAACATAACCACCCTCTTTCCCGCCAAGTCGCTGTGTTTGTTGTGG
ATGAGAGAAGCAAAAGCTGCGTAGAGAGAAGCAGTGTACATGTTACCCACTTGTTTTGGT
ACTAAAGTCGTTGGTTGCACTTTAGCATCATAAAAACTTTTGGCAACTTGTTGTGACACC
TTTTCAAGATCACGGCTTTGGTAACTCTCGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FK68TF 685 0 0
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GAGACGCAATGAAAACATTGTTGCGGTTGAACCACTTCCATATGAGAACATAACCACCCT
CTTTCCCGCCAAGTCGCTGTGTTTGTTGTGGATGAGAGAAGCAAAAGCTGCGTAGAGAGA
AGCAGTGTACATGTTACCCACTTGTTTTGGTACTAAAGTCGTTGGTTGCACTTTAGCATC
ATAAAAACTTTTGGCAACTTGTTGTGACACCTTTTCAAGATCACGGCTTTGGTAACTCTC
GTCGAGTGACAAAGACGAGTAAGGAGTGGACTTCTCTTTGGCAGCCTCGTCAATGGAGCT
TGCGTTTCTCAAGAAGTCGTTGTACAAGAGACGAGCAAAGCTTTTCTGTACAAGTTTGTT
GTATGGAGAATGGAACACAAAGTAGTCAGCATCATTGATGGAGAACTCTTTGCCTTCGAG
TTTCTCAAACTTGTTGCATAAATGTTTATAGCAGGAGTCAAGTGCCATAAGGTAGCAAGT
CTGTGAAAGCTTACCATCAACAACAGGGTACTCGCTAGCAAGATTTGGCTTGTAAAAGTC
ATAGACATGAGCCATGTGGCTTCCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 3

CO CL4216Contig1 747 3 4 U
GGCTTCTGGAACTGCTGTTCACAACACGGTCGACATGCAATCACTGTTTCTTCTAACCGG
ACCTAACGGTGGTGGTAAATCGAGTTTGCTCAGATCGATATGCGCAGTTGCTTTGCTTGG
AATCTGTGGTTTTATGGTTCCAGCTGAATCAGCTTATATCCCTCACTTTGATTCCATCAT
GCTTCATATGAAATCTTATGACAGTCCTGTAGATGGGAAGAGTTCGTTTCAGGTAGAAAT
GTCGGAGATAAGATCTATTGTAAGCCAGGCTACTTCAAGAAGCCTAGTGCTCATAGATGA
GATATGCAGAGGGACAGAGATAGCTAAAGGCACTTGCATTGCGGGTAGCGTGATCGAGAG
TCTTGACGCAAGTGGTTGCTTGGGTATTGTATCTACACATCTCCATGGAATTTTTGATTT
GCCTCTTACGGCTAAAAACGTCACCTATAAAGCAATGGGAGCCCAGAATGTGGAAGGGCA
GACAAAGCCAACTTGGAAATTGACAGACGGGGTTTGCAGAGAGAGTCTTGCGTTTGAAAC
AGCTAAGAGAGAAGGTGTCCCGGAGACAGTTATCCAAAGAGCCGAAGCTCTTTACCTCTC
GGTTTATGCAAAAGAGGCGTCGTCTGGAGTTGTTAGACGAAACAACACCGAGACTTCATC
GGACAATAGCCTTAAAATCAGCAAACCAGTCAGGTCTGAGAGAAGCTTAGAGAAGGACTT
AGCAAAAGCTATCCTTAAAATCTGTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI12TF U 154
AF RR4GC11TF U 1
AF RR4GC11JQ C 107
BS 1 691 RR4GC11TF
BS 692 692 RR4GC11JQ
BS 693 707 RR4GC11TF
BS 708 747 RR4GC11JQ

RD RR4CI12TF 363 0 0
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TGGGAAGAGTTCGTTTCAGGTAGAAATGTCGGAGATAAGATCTATTGTAAGCCAGGCTAC
TTCAAGAAGCCTAGTGCTCATAGATGAGATATGCAGAGGGACAGAGACGGCTAAAGGCAC
TTGTATTGCGGGTAGCGTGATCGAGAGTCTTGACGCAAGTGGTTGCTTGGGTATTGTATC
TACACATCTCCATGGAATTTTTGATTTGCCTCTTACGGCTAAAAACGTCACCTATAAAGC
AATGGGAGCACAGAATGTGGAAGGGCAGACAAAGCCAGCTTGGAAATTGACAGACGGGGT
TTG

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR4GC11TF 707 0 0
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AATCTGTGGTTTTATGGTTCCAGCTGAATCAGCTTATATCCCTCACTTTGATTCCATCAT
GCTTCATATGAAATCTTATGACAGTCCTGTAGATGGGAAGAGTTCGTTTCAGGTAGAAAT
GTCGGAGATAAGATCTATTGTAAGCCAGGCTACTTCAAGAAGCCTAGTGCTCATAGATGA
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GCCTCTTACGGCTAAAAACGTCACCTATAAAGCAATGGGAGCCCAGAATGTGGAAGGGCA
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GGACAATAGCCTTAAAATCAGCAAACCAGTC*GGTCTGAGAGAAGCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4GC11JQ 641 0 0
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TTTGATTCCATCATGCTTCATATGAAATCTTATGACAGTCCTGTAGATGGGAAGAGTTCG
TTTCAGGTAGAAATGTCGGAGATAAGATCTATTGTAAGCCAGGCTACTTCAAGAAGCCTA
GTGCTCATAGATGAGATATGCAGAGGGACAGAGATAGCTAAAGGCACTTGCATTGCGGGT
AGCGTGATCGAGAGTCTTGACGCAAGTGGTTGCTTGGGTATTGTATCTACACATCTCCAT
GGAATTTTTGATTTGCCTCTTACGGCTAAAAACGTCACCTATAAAGCAATGGGAGCCCAG
AATGTGGAAGGGCAGACAAAGCCAACTTGGAAATTGACAGACGGGGTTTGCAGAGAGAGT
CTTGCGTTTGAAACAGCTAAGAGAGAAGGTGTCCCGGAGACAGTTATCCAAAGAGCCGAA
GCTCTTTACCTCTCGGTTTATGCAAAAGAGGCGTCGTCTGGAGTTGTTAGACGAAACAAC
ACCGAGACTTCATCGGACAATAGCCTTAAAATCAGCAAACCAGTCAGGTCTGAGAGAAGC
TTAGAGAAGGACTTAGCAAAAGCTATCCTTAAAATCTGTGG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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ACCAGAGTGACATTGGAATCATATGCGTATTTCCGGGAGAAAACAATAGCTGCATTACGT
TCTTGTTCTGACTCGAAAGTTAGTAAGAAACTTAGACCCTTTCTTGGTTGCCAGAACAAT
GCTTTTGCTGGAGCATTAGCATTGCCTCTCACTCCACATAACTGCATGGAGTTTGAATAT
ATCTCTCTAGCCTTTGTGATCCATCCTCGAGACAGCTTCACTCTCGCCTTTCCAACAGTA
AACACGTGGGAACGCGATGAATGATCTTGCCCATTCATCTGTGATATAACCACGGTGAAT
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BQ
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AF RR4FQ27JQ U 1
AF RR4AG93JQ U 50
BS 1 513 RR4FQ27JQ
BS 514 768 RR4AG93JQ

RD RR4FQ27JQ 513 0 0
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TTCTGTTACTACATACAAACAAATCTTCACACCCAAAAATAAAAACCCTAAGCAACAATG
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AATGCCAACCACCTCACACTAGTGATCATGCCAAAAACACACACACACAAAATGTGCTTC
CTGCCTAAAAAAAACTATGCAGCAAACACACAAACTATGCAGTAAAGAATCATCCAACCT
CAACTACATACAAAGACATAACACTCAAAATCGCCAATCTTAAAAAAAACTTTCAGGACA
CTTGATAGAAAAGATTGGTTACACCTTTCATTATTATTAGGTCCTCAATCGTCAGGCCCA
ACCAGAGTGACATTGGAATCATATGCGTATTTCCGGGAGAAAACAATAGCTGCATTACGT
TCTTGTTCTGACTCGAAAGTTAGTAAGAAACTT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR4AG93JQ 719 0 0
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CAAAATAAGAAAATGCCAACCACCTCACACTAGTGATCATGCCAAAAACACACACACACA
AAATGTGCTTCCTGCCTAAAAAAAACTATGCAGCAAACACACAAACTATGCAGTAGAGAA
TCATCCAACCTCAACTACATACAAAGACATAACACTCCAAATCGCCAATCTTAGAAAAAA
CTTTCAGGACACTTGATAGAAAAGATTGGTTACACCTTTCATTATTAT*AGGTCCTCAAT
CGTCAGGCCCAACCAGAGTGACATTGGAATCATATGCGTATTTCCGGGAGAGAACAATAG
CTGCATTACGTTCTTGTTCTGACTCGAAAGTTAGTAAGAAACTTAGACCCTTTCTTGGTT
GCCAGAACAATGCTTTTGCTGGAGCATTAGCATTGCCTCTCACTCCACATAACTGCATGG
AGTTTGAATATATCTCTCTAGCCTTTGTGATCCATCCTCGAGACAGCTTCACTCTCGCCT
TTCCAACAGTAAACACGTGGGAACGCGATGAATGATCTTGCCCATTCATCTGTGATATAA
CCACGGTGAATTCACTGTTAGATTTGCGCAGGAGTGATTCAACACGTGATTGCAAGCCG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4218Contig1 733 2 16 U
GGTTTCGAGAACTTACCTGGGAACAATCGGCGGAACAACCGCTAGAGTGCTCGCCTGGAG
TGATCTCGAATTTTCGTGATTTTTCAACCTGCAAAGTCAGTTCCTAGAAAGATAAAGACA
AAGAGAAAACAATATTTACACTCACCAGTGGGTTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTG
TCACTAGCTTGACTTCAATGAGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGCTCAAGGGTATCTCT
ACACCTTCAGCGATTGTTGTGTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACA
AATTCTCCTCCTCTTGTGTCCAGCAACACAACAGCTCCATAAGGGCGAACCTCCTTAATG
GTGAAAGGTCCAGACCATCTAGATTTGAGCTTTCCAGGGAACAGCTTAACCCGTGAATTG
AAGAGTAAAACCTGATCGTTCGAAGCAAAGCTTCTGCTGATGATCCGCTTGTCGTGGAAC
GCCTTGGTCTTTTCCTTGTAGATCTTAAAACTCTCATAGGCCAGATGCCTGATCTCCTCC
AACTCGTGGATCTGAATGGTTCGCCTCTCCTTGGCAGGTTTGATATCGAAGTTGAGTAGT
TTGACAGCCCAAGCCGCCTTGTACTCTAGCTCAACAGGTAGGTGGCACGCCTTGCCATAG
ACCAGGTGATAGGGAGTGGTCCCTAGAGGGGTCTTGTAGGCTGTTCTGTATGCCCAGAGA
GCATCGTCAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP37JQ U 1
AF RR4G955JQ U 6
BS 1 43 RR4AP37JQ
BS 44 44 RR4G955JQ
BS 45 52 RR4AP37JQ
BS 53 53 RR4G955JQ
BS 54 75 RR4AP37JQ
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BS 77 94 RR4AP37JQ
BS 95 95 RR4G955JQ
BS 96 97 RR4AP37JQ
BS 98 98 RR4G955JQ
BS 99 442 RR4AP37JQ
BS 443 443 RR4G955JQ
BS 444 572 RR4AP37JQ
BS 573 573 RR4G955JQ
BS 574 594 RR4AP37JQ
BS 595 733 RR4G955JQ

RD RR4AP37JQ 594 0 0
GGTTTCGAGAACTTACCTGGGAACAATCGGCGGAACAACCGCTGGAGTGCTCTCCTGGAG
TGATCTCGAATTTTCTTGATTTTTCAACCTGCAA*GTTAGTTCCTAGAAAGATAAAGACA
AAGAGAAAACAATATTTACACTCACCAGTGGGTTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTG
TCACTAGCTTGACTTCAATGAGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGCTCAAGGGTATCTCT
ACACCTTCAGCGATTGTTGTGTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACA
AATTCTCCTCCTCTTGTGTCCAGCAACACAACAGCTCCATAAGGGCGAACCTCCTTAATG
GTGAAAGGTCCAGACCATCTAGATTTGAGCTTTCCAGGGAACAGCTTAACCCGTGAATTG
AAGAGTAAAACCTGATCGTTCGGAGCAAAGCTTCTGCTGATGATCCGCTTGTCGTGGAAC
GCCTTGGTCTTTTCCTTGTAGATCTTAAAACTCTCATAGGCCAGATGCCTGATCTCCTCC
AACTCGTGGATCTGAATGGTTCGCCTCTCCTTTGCAGGTTTGATATCGAAGTTG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4G955JQ 728 0 0
CGAGAACTTACCTGGGAACAATCGGCGGAACAACCGCTAGAGTGCTCGCCTGGAGTGGTC
TCGAATTTTCGTGATTTTTCGACCTGCAAAGTCAGTTCCTAGAAAGATAAAGACAAAGAG
AAAACAATATTTACACTCACCAGTGGGTTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTGTCACT
AGCTTGACTTCAATGAGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGCTCAAGGGTATCTCTACACC
TTCAGCGATTGTTGTGTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACAAATTC
TCCTCCTCTTGTGTCCAGCAACACAACAGCTCCATAAGGGCGAACCTCCTTAATGGTGAA
AGGTCCAGACCATCTAGATTTGAGCTTTCCAGGGAACAGCTTAACCCGTGAATTGAAGAG
TAAAACCTGATCGTTCGAAGCAAAGCTTCTGCTGATGATCCGCTTGTCGTGGAACGCCTT
GGTCTTTTCCTTGTAGATCTTAAAACTCTCATAGGCCAGATGCCTGATCTCCTCCAACTC
GTGGATCTGAATGGTTCGCCTCTCCTTGGCAGGTTTGATATCGAAGTTGAGTAGTTTGAC
AGCCCAAGCCGCCTTGTACTCTAGCTCAACAGGTAGGTGGCACGCCTTGCCATAGACCAG
GTGATAGGGAGTGGTCCCTAGAGGGGTCTTGTAGGCTGTTCTGTATGCCCAGAGAGCATC
GTCAAGCT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL4219Contig1 987 3 2 U
ACTCATGAAACACATCCTTTATTTAGTATATTATGACGATATTATTATTACACTGTTCGT
TGTAAAACAAAGTGATAAAACTGATTTTATATTCGTATCTGCTTCAGCAAGATTTAGGTA
TGTTTAATTTGACCACGCGCATATTTGTAGGTTGAACCGGCCTTGCGTTTGTATTTGATT
GATCGTGAACAGCCACTCGGAGTAGTTTCACTTGGTTTCTCGCCACAGTCTTTACCTTTT
TAACGACGGTCCAAATAACATTTTGGGTACAAGGAGGAATGGTAAGTGATCCAATATATC
GATAATATTTTCTGCACCCAAACTTAATTCCCCTGGGATCAATCATTCCTATATTTTTCT
CTTCGTTGGGGTCTGTCATTGTCGACAATTTATTTTCCAACAGGCTGAGAAAAGAGTCTG
GTCTTCCGATTTTGTAAAGTACTGTGATTACAGCCAAACTTCCGTTTAAGCTTTCGTGAA
CCATATGCAGTTCCAGAGCAAACTTTCTCCCATTGATCGTATGTTCAGAGGGAGAATGCC
AATGAAGCTGATGGAGTTGATATTCAATATTATTGATCTTAATACTACTTGACCCTTCTT
CAAATCTCACCATCATGTCATGGCCTCTATTTCTGAGAGAGGCATTGGAAGGTTTGTAGT
TTCTAGTAAGCCTTCCCAGATGTGAAACAATTCTAACCCTTTTGTGCATAAGATCAATTG
GAGATTGCATCTCTCCTTTTCCGCACATTTTCCATTCCGGCTTCAGTTTCCCCCATTTCT
CTGGCCCGTTCTCTTGATTCCGATCGTAGGTAAATTCACTTTCATCCTCAACTTCTCTCT
GTGCATTCGAACATGAAATTATGGTGGCGATGATGGTAAGAAGTATGAATAAGAAGCATT
GGATTGATGATTTATCCATCTTTGTTTTCCAAAGAGAGAAAGCGGAGATAGATGTCCGCG
AGAGATGAGTTGGATCAGTTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FM85JQ U 109
AF RR4FM86JQ U 1
AF RR4FM86TF C 271
BS 1 755 RR4FM86JQ
BS 756 987 RR4FM86TF

RD RR4FM85JQ 247 0 0
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TTGTATTTGATTGATCGTGAACAGCCACTCGGAGTAGTTTCACTTGGTTTCTCGCCACAG
TCTTTACCTTTTTAACGACGGTCCAAATAACATTTTGGGTACAAGGAGGAATGGTAAGTG
ATCCAATATATCGATAATATTTTCTGCACCCAAACTTAATTCCCCTGGGATCAATCATTC
CTATATT

QA 1 247 1 247
DS 

RD RR4FM86JQ 755 0 0
ACTCATGAAACACATCCTTTATTTAGTATATTATGACGATATTATTATTACACTGTTCGT
TGTAAAACAAAGTGATAAAACTGATTTTATATTCGTATCTGCTTCAGCAAGATTTAGGTA
TGTTTAATTTGACCACGCGCATATTTGTAGGTTGAACCGGCCTTGCGTTTGTATTTGATT
GATCGTGAACAGCCACTCGGAGTAGTTTCACTTGGTTTCTCGCCACAGTCTTTACCTTTT
TAACGACGGTCCAAATAACATTTTGGGTACAAGGAGGAATGGTAAGTGATCCAATATATC
GATAATATTTTCTGCACCCAAACTTAATTCCCCTGGGATCAATCATTCCTATATTTTTCT
CTTCGTTGGGGTCTGTCATTGTCGACAATTTATTTTCCAACAGGCTGAGAAAAGAGTCTG
GTCTTCCGATTTTGTAAAGTACTGTGATTACAGCCAAACTTCCGTTTAAGCTTTCGTGAA
CCATATGCAGTTCCAGAGCAAACTTTCTCCCATTGATCGTATGTTCAGAGGGAGAATGCC
AATGAAGCTGATGGAGTTGATATTCAATATTATTGATCTTAATACTACTTGACCCTTCTT
CAAATCTCACCATCATGTCATGGCCTCTATTTCTGAGAGAGGCATTGGAAGGTTTGTAGT
TTCTAGTAAGCCTTCCCAGATGTGAAACAATTCTAACCCTTTTGTGCATAAGATCAATTG
GAGATTGCATCTCTCCTTTTCCGCACATTTTCCAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4FM86TF 717 0 0
AAGGAGGAATGGTAAGTGATCCAATATATCGATAATATTTTCTGCACCCAAACTTAATTC
CCCTGGGATCAATCATTCCTATATTTTTCTCTTCGTTGGGGTCTGTCATTGTCGACAATT
TATTTTCCAACAGGCTGAGAAAAGAGTCTGGTCTTCCGATTTTGTAAAGTACTGTGATTA
CAGCCAAACTTCCGTTTAAGCTTTCGTGAACCATATGCAGTTCCAGAGCAAACTTTCTCC
CATTGATCGTATGTTCAGAGGGAGAATGCCAATGAAGCTGATGGAGTTGATATTCAATAT
TATTGATCTTAATACTACTTGACCCTTCTTCAAATCTCACCATCATGTCATGGCCTCTAT
TTCTGAGAGAGGCATTGGAAGGTTTGTAGTTTCTAGTAAGCCTTCCCAGATGTGAAACAA
TTCTAACCCTTTTGTGCATAAGATCAATTGGAGATTGCATCTCTCCTTTTCCGCACATTT
TCCATTCCGGCTTCAGTTTCCCCCATTTCTCTGGCCCGTTCTCTTGATTCCGATCGTAGG
TAAATTCACTTTCATCCTCAACTTCTCTCTGTGCATTCGAACATGAAATTATGGTGGCGA
TGATGGTAAGAAGTATGAATAAGAAGCATTGGATTGATGATTTATCCATCTTTGTTTTCC
AAAGAGAGAAAGCGGAGATAGATGTCCGCGAGAGATGAGTTGGATCAGTTGTTTTCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4221Contig1 1004 3 8 U
TTTTTGGGGTTTTAGTTGGTATCGTCGGAAGAGAGATAAAAATGTTGGGAATTTTCAGCG
GAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAACCGAACCCCATCGCCGA
AGACAACCGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTGGAGAAAAATCCCTCCGCCGTGTCCG
TACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCGTACAGCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGC
CAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGATCACTTGACAACC
TAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCA
TCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCATGTCGTGTCTC
ACCTAAGGGGCGACTTCGCCTTCGTGGTTTTCGACAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAG
CCTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGGTATGTGG
CATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGCAAATCTCTTGCTTCGTTCC
CTCAAGGCTGTTTTTACTCGACTGCGTTAGGTGGGCTAAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGA
ACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGG
AAGGAGCAGCTGTTCTTGCACATGGAGATTGAGAAAAGAAAAAAAAAATCAAGCTCCATC
TCTCTTAATATCGAAACTCCAAAATAATGATGTAGAGAAAACAATAAGCTGTTCTATGAG
TTTTTCTTTAAGCTATCAAATGGTTGGGGATGTGTAGTGTTGTGATCTCTGTTTTGTCTT
TTGTTTCTCTGTACAGCTTGTGTTTGTCTCTTCTGGTGTTTCTAGTGTGTTCGTCCCAAT
AAGTTATGTCTCATAGACTCTAAATCTACCTTCTCTTGATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EV62TF U 97
AF RR4EC28TF U 1
AF RR4EC28JQ C 338
BS 1 130 RR4EC28TF
BS 131 131 RR4EV62TF
BS 132 154 RR4EC28TF
BS 155 155 RR4EV62TF
BS 156 606 RR4EC28TF
BS 607 607 RR4EC28JQ
BS 608 630 RR4EC28TF
BS 631 1004 RR4EC28JQ

RD RR4EV62TF 501 0 0
GG
GGGAACCGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTGAACAAGTTCGTGGAG
AAAAATCCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCGTACAGCCAC
CACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTG
TTCCAAGGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAAC
GCAAACGAGGTTCTCTCGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTAC
CCAGCCAACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTTGTGGTCTTCGACAAA
TCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCAGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGG
ATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTAAAAGGTGCTTGT
GGCAAATCTCTTGCTTCGT

QA 3 501 3 501
DS 

RD RR4EC28TF 631 0 0
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GAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAACCGAACCCCATCGCCGA
AGACAACCGGCTCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTTGAGAAAAATCCCTCCGCCGTGTCCG
TACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCGTACAGCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGC
CAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGATCACTTGACAACC
TAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCA
TCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCATGTCGTGTCTC
ACCTAAGGGGCGACTTCGCCTTCGTGGTTTTCGACAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAG
CCTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGGTATGTGG
CATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGCAAATCTCTTGCTTCGTTCC
CTCAAG*CTGTTTTTACTCGACTGCGTTAG
T

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4EC28JQ 667 0 0
CGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTA
CCCGGCCAACCATGTCGTGTCTCACCTAAGGGGCGACTTCGCCTTCGTGGTTTTCGACAA
ATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGG
GATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTAAAAGGTGCTTG
TGGCAAATCTCTTGCTTCGTTCCCTCAAGGCTGTTTTTACTCGACTGCGTTAGGTGGGCT
AAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAAT
TTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAGCTGTTCTTGCACATGGAGATTGAGAAAA
GAAAAAAAAAATCAAGCTCCATCTCTCTTAATATCGAAACTCCAAAATAATGATGTAGAG
AAAACAATAAGCTGTTCTATGAGTTTTTCTTTAAGCTATCAAATGGTTGGGGATGTGTAG
TGTTGTGATCTCTGTTTTGTCTTTTGTTTCTCTGTACAGCTTGTGTTTGTCTCTTCTGGT
GTTTCTAGTGTGTTCGTCCCAATAAGTTATGTCTCATAGACTCTAAATCTACCTTCTCTT
GATCCCT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

CO CL4222Contig1 708 3 4 U
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TTCCATCTGTTAAGAGAAATTAAAATCAATGCGATGAAGGGTCTGGCGCATTCACAAAGT
TGCAGCATCTGAACCTCTAACCGAAAACCATTCCTCCCGATATGACGACGACGACGGGCG
TGAAAGGATTTTTTAAAGGCCTTCGCCACATCACTCAGATTTTCGAGGAAGGTAAAGAGC
GTGATATTCAGATTGGGTTTCCCACCGATGTAAAACATGTCGCCCACATTGGATCCGATG
GTCCCGCATCAAATGCACCAAGCTGGATGAGTGACTTCAACTCTCAAGGAAATGAGAATG
CTCAAGTAGTTTCTCGACGAGATGCCAACAACAATCCAACAGGAGAAGGAGTTGGATTAC
AAGAGTTGCTGCC*TCCTCCC*GAGAAACAAAAGCTCAAGAAGACAAGGCGTAATTCC*G
AGTCACATCACGGTTCTCCTCCTAGGCGAAACAGCAACGTGTTACCATCTGAACTGGTAC
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CATCCCTCAGGAGGAGGCGTGTTATTATCTCGGCTAACGACGAGGAAGGTTCTAATCATC
TTTCAGACAGCTCTTCTGCTTCTCATAGAAAGTCTTCGTCGTCGCGTC


BQ
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AF RR4BJ36TF U 1
AF RR4B634TF U 54
AF RR4BJ36JQ C 303
BS 1 608 RR4BJ36TF
BS 609 610 RR4B634TF
BS 611 611 RR4BJ36JQ
BS 612 708 RR4B634TF

RD RR4BJ36TF 608 0 0
CAACCAAGAACTTGTCTGAAACCTAATCTTGTGTCTCTCTAGATCTCTTCCTCTTTCCAA
TTCCATCTGTTAAGAGAAATTAAAATCAATGCGATGAAGGGTCTGGCGCATTCACAAAGT
TGCAGCATCTGAACCTCTAACCGAAAACCATTCCTCCCGATATGACGACGACGACGGGCG
TGAAAGGATTTTTTAAAGGCCTTCGCCACATCACTCAGATTTTCGAGGAAGGTAAAGAGC
GTGATATTCAGATTGGGTTTCCCACCGATGTAAAACATGTCGCCCACATTGGATCCGATG
GTCCCGCATCAAATGCACCAAGCTGGATGAGTGACTTCAACTCTCAAGGAAATGAGAATG
CTCAAGTAGTTTCTCGACGAGATGCCAACAACAATCCAACAGGAGAAGGAGTTGGATTAC
AAGAGTTGCTGCC*TCCTCCC*GAGAAACAAAAGCTCAAGAAGACAAGGCGTAATTCC*G
AGTCACATCACGGTTCTCCTCCTAGGCGAAACAGCAACGTGTTACCATCTGAACTGGTAC
CAAGACCCTCGAGACGTCACCACAGGAGCAGGCACGCGTCGTTAGATTCATCTAATGATC
CATCCCTC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4B634TF 655 0 0
TTTCCAATTCCATCTGTTAAGAGAAATTAAAATCAATGCGATGAAGGGTCTGGCGCATTC
ACAAAGTTGCAGCATCTGAACCTCTAACCGAAAACCATTCCTCCCGATATGACGACGACG
ACGGGCGTGAAAGGATTTTTTAAAGGCCTTCGCCACATCACTCAGATTTTCGAGGAAGGT
AAAGAGCGTGATATTCAGATTGGGTTTCCCACCGATGTAAAACATGTCGCCCACATTGGA
TCCGATGGTCCCGCATCAAATGCACCAAGCTGGATGAGTGACTTCAACTCTCAAGGAAAT
GAGAATGCTCAAGTAGTTTCTCGACGAGATGCCAACAACAATCCAACAGGAGAAGGAGTT
GGATTACAAGAGTTGCTGCCCTCCTCCCCGAGAAACAAAAGCTCAAGAAGACAAGGCGTA
ATTCCCGAGTCACATCACGGTTCTCCTCCTAGGCGAAACAGCAACGTGTTACCATCTGAA
CTGGTACCAAGACCCTCGAGACGTCACCACAGGAGCAGGCACGCGTCGTTAGATTCATCT
AATGATCCATCCCTCAG*AGGAGGCGTGTTATTATCTCGGCTAACGACGAGGAAGGTTCT
AATCATCTTTCAGACAGCTCTTCTGCTTCTCATAGAAAGTCTTCGTCGTCGCGTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4BJ36JQ 367 0 0
CCCGCATCAAATGCACCAAGCTGGATGAGTGACTTCAACTCTCAAGGAAATGAGAATGCT
CAAGTAGTTTCTCGACGAGATGCCAACAACAATCCAACAGGAGAAGGAGTTGGATTACAA
GAGTTGCTGCC*TCCTCCC*GAGAAACAAAAGCTCAAGAAGACAAGGCGTAATTCC*GAG
TCACATCACGGTTCTCCTCCTAGGCGAAACAGCAACGTGTTACCATCTGAACTGGTACCA
AGACCCTCGAGACGTCACCACAGGAGCAGGCACGCGTCGTTAGATTCATCTAATGATCCA
TCCCTCAGGAGGAGGCGTGTTATTATCTCGGCTAACGACGAGGAAGGTTCTAATCATCTT
TCAGACA

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 2

CO CL4223Contig1 1017 2 6 U
GGTAAACAAAATAAACCAAATACACAAATATATATTAAAGATAAGGCACAATCACACACA
CAAACAACTACTTTTGTACAAGAAACAACACCTAAAGTTAGGACCTCAAATCTATATATC
ACATGGTATATATAGTGCTACAATAATAACACATCAATATTATTATGATTACGTAAAACT
AATAAATAAAGCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTTTTGCCTATAGACCAGCTTTGG
CCTTACACTCGAGATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGTCGTTGGTCAAACCGGGCGGCT
TGCATTAACGAATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGACGAACCATGTCT
TTGCTTATGGTTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCTTTTGGCAAGATGTGTATTCT
GTGGTAACCGGTTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATTTGTTGAATGATCCAAAATCT
CTTTTAACCTTGAGAATTTGTTTAGAGTTGTCAACAATTGCAAGGACTTGGCTAAGGCCA
ATTCCATAGTCGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGCTGAACTCTGCGACAAGCTCT
GCCTCGGAACCAGAGAAAGCCTCTCTAAAAGTGTTTCTTCTCTTCAAAACCGAAGTCCAG
TCGGATCCTACTTGAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCAAACAGTAGGTTGTCATCATGA
ACAGGAACTCCCCATTCTTCATCATGGTAAGCCACATAGATTGGATCTGAACTTGTAGTG
ATGAAACTGCATCTCTTCTTCTTCTCATGTTCAACATTTAAGTTATTTTCGTTTGATTTT
ACAGATTTTACTCTACCATAATGAGAGATTTTCTTCTTTCTTTCTTCTTGTTTCATAGCA
ACCTCTTGTCTTCGTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCTTCTGAACAGTCATCAAGGAC
TTAACCTCTCTGCAGCCACCATCAGTGCTCTCTTGTAATTTCACCGGTTTAGCAGCC


BQ
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GB05JQ U 1
AF RR4AW46TF C 166
BS 1 294 RR4GB05JQ
BS 295 295 RR4AW46TF
BS 296 579 RR4GB05JQ
BS 580 580 RR4AW46TF
BS 581 602 RR4GB05JQ
BS 603 1017 RR4AW46TF

RD RR4GB05JQ 611 0 0
GGTAAACAAAATAAACCAAATACACAAATATATATTAAAGATAAGGCACAATCACACACA
CAAACAACTACTTTTGTACAAGAAACAACACCTAAAGTTAGGACCTCAAATCTATATATC
ACATGGTATATATAGTGCTACAATAATAACACATCAATATTATTATGATTACGTAAAACT
AATAAATAAAGCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTTTTGCCTATAGACCAGCTTTGG
CCTTACACTCGAGATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGTCGTTGGTCAAACCGG*CGGCT
TGCATTAACGAATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGACGAACCATGTCT
TTGCTTATGGTTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCTTTTGGCAAGATGTGTATTCT
GTGGTAACCGGTTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATTTGTTGAATGATCCAAAATCT
CTTTTAACCTTGAGAATTTGTTTAGAGTTGTCAACAATTGCAAGGACTTGGCTAAGGCCA
ATTCCATAGTCGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGTTGAACTCTGCGACAAGCTCT
GC
TTCGAAACC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4AW46TF 852 0 0
ATGA
TACGTAAAACTAATAAATAAAGCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTTTTGC*TATAG
ACCAGCTTTGGC*TTACACTCGAGATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGTCGTTGGTCAA
ACCGGGCGGCTTGCATTAACGAATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGAC
GAACCATGTCTTTGCTTATGGTTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCTTTTGGCAAG
ATGTGTATTCTGTGGTAACCGGTTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATTTGTTGAATG
ATCCACAATCTCTTTTAACCTTGAGAATTTGTTTAGAGTTGTCAACAATTGCAAGGACTT
GGCTAAGGCCAATTCCGTAGTCGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGCTGAACTCTG
CGACAAGCTCTGCCTCGGAACCAGAGAAAGCCTCTCTAAAAGTGTTTCTTCTCTTCAAAA
CCGAAGTCCAGTCGGATCCTACTTGAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCAAACAGTAGGT
TGTCATCATGAACAGGAACTCCCCATTCTTCATCATGGTAAGCCACATAGATTGGATCTG
AACTTGTAGTGATGAAACTGCATCTCTTCTTCTTCTCATGTTCAACATTTAAGTTATTTT
CGTTTGATTTTACAGATTTTACTCTACCATAATGAGAGATTTTCTTCTTTCTTTCTTCTT
GTTTCATAGCAACCTCTTGTCTTCGTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCTTCTGAACAG
TCATCAAGGACTTAACCTCTCTGCAGCCACCATCAGTGCTCTCTTGTAATTTCACCGGTT
TAGCAGCC

QA 5 852 5 852
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4225Contig1 940 3 4 U
GACATTTGACATCATCATTCAAATTAAATTGAAACCTCAAGCCAACCTCCAAATTGTTTT
CGTAACTTTCATGCCGTAGTGAACAAATCCACGAAGCTCACATCTGTTGCCACCCTCTCG
TGACAATACTAAACATTTCAGATCATCCGATCATAAATAAAATATATAAAAAAAAAGTTG
AGCCGTTGGATTTTGATATTCGCTCTAGAACGGCCTAGTGTGGCGGCCTCTAGCTCGTCC
GCACAGAAGAGCGTTCTTTGGTGGAGGATACTCGTCTCGATACGAAGTAGAGGACGTGTA
AACTCTGAGATAGAATTGTTGCCCTAAGTATTGTCGTGCCCAATCCTCCGACCGTATGTT
CCACATCCCAACATTATCTAAAGCGATGTAGATAGCTGTCCATGCCCTCGGGTAAACCTG
AACGGTGGATCGTGAAACTGCGTCACGGAGGTTGTACTTTGATCGGCTCCCCTGTGTCCA
TTGGCCTCCGTCCATTCCGACGACGAAGAAAGAGTAACCGGAGATGTGCCAAGACTGGAC
TGAGTTTTCCCAGTTTTGAAAAACAATCTCGATGAACTCTCTGAAGTTAGCACCCATAAC
AGAGGATGTAAGGTAAGCTCCGTTCCCACCAGGGGGATTTGTTGGGATGATTCCTAGGTT
AAAAACGCCAGGGATCTTGAAGTAATCGGCGAGCTTCAACGGCGTATCAGGCGCAATAAA
AGAGGCACCGTTAACGGCGTATCTTTGCTTGCCATTAATCCAAGGAGCTGAGTTGGCGAG
CATGATCGTACGGGCTGGTTTGATCAAACCGTAATGGTATGAGCCTTGCGGGTTTGGCCT
CGGACCACTCGCGGTTAGATTCCTCTTGATAGTTCGAGCTTGGAAGAGCGAAGAGGCAAT
GTTCAAAGTGGGGCCAAATGGAGCAGGACCAGAGACGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FQ75JQ U 8
AF RR4FW38JQ U 1
AF RR4FW38TF C 232
BS 1 202 RR4FW38JQ
BS 203 203 RR4FQ75JQ
BS 204 788 RR4FW38JQ
BS 789 940 RR4FW38TF

RD RR4FQ75JQ 493 0 0
GACATCATCATTCAAATTAAATTGAAACCTCAAGCCAACCTCCAAATTGTTTTCGTAACT
TTCATGCCGTAGTGAACAAATCCACGAAGCTCACATCTGTTGCCACCCTCTCGTGACAAT
ACTAAACATTTCAGATCATCCGATCATAAATAAAATATATAAAAAAAAAGTTGAGCCGTT
GGATTTTGATATTCGCTCTAGAACGGCCTAGTGTGGCGGCCTCTAGCTCGTCCGCACAGA
AAAGCGTTCTTTGGTGGAGGATACTCGTCTCGGTACGAAGTAGAGGACGTGTAAACTCGG
AGATAGAATTGTTGCCCTAAGTATTGTCTTGCCCAATTCTCCGACCGTATGTTCCACATC
CCAACATTATCTAAAGCTATGTAGATAGCTGTCCATGCCCTCGGGTAAACCTGAACGGTG
GATCGTGAAACTGCGTCCCGGAGGTTGTACTTTGATCGGCTCCCCTGTGTCCATTGGCCT
CCGTCCATTCCGA

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4FW38JQ 788 0 0
GACATTTGACATCATCATTCAAATTAAATTGAAACCTCAAGCCAACCTCCAAATTGTTTT
CGTAACTTTCATGCCGTAGTGAACAAATCCACGAAGCTCACATCTGTTGCCACCCTCTCG
TGACAATACTAAACATTTCAGATCATCCGATCATAAATAAAATATATAAAAAAAAAGTTG
AGCCGTTGGATTTTGATATTCGTTCTAGAACGGCCTAGTGTGGCGGCCTCTAGCTCGTCC
GCACAGAAGAGCGTTCTTTGGTGGAGGATACTCGTCTCGATACGAAGTAGAGGACGTGTA
AACTCTGAGATAGAATTGTTGCCCTAAGTATTGTCGTGCCCAATCCTCCGACCGTATGTT
CCACATCCCAACATTATCTAAAGCGATGTAGATAGCTGTCCATGCCCTCGGGTAAACCTG
AACGGTGGATCGTGAAACTGCGTCACGGAGGTTGTACTTTGATCGGCTCCCCTGTGTCCA
TTGGCCTCCGTCCATTCCGACGACGAAGAAAGAGTAACCGGAGATGTGCCAAGACTGGAC
TGAGTTTTCCCAGTTTTGAAAAACAATCTCGATGAACTCTCTGAAGTTAGCACCCATAAC
AGAGGATGTAAGGTAAGCTCCGTTCCCACCAGGGGGATTTGTTGGGATGATTCCTAGGTT
AAAAACGCCAGGGATCTTGAAGTAATCGGCGAGCTTCAACGGCGTATCAGGCGCAATAAA
AGAGGCACCGTTAACGGCGTATCTTTGCTTGCCATTAATCCAAGGAGCTGAGTTGGCGAG
CATGATCG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4FW38TF 709 0 0
AGCTCGTCCGCACAGAAGAGCGTTCTTTGGTGGAGGATACTCGTCTCGATACGAAGTAGA
GGACGTGTAAACTCTGAGATAGAATTGTTGCCCTAAGTATTGTCGTGCCCAATCCTCCGA
CCGTATGTTCCACATCCCAACATTATCTAAAGCGATGTAGATAGCTGTCCATGCCCTCGG
GTAAACCTGAACGGTGGATCGTGAAACTGCGTCACGGAGGTTGTACTTTGATCGGCTCCC
CTGTGTCCATTGGCCTCCGTCCATTCCGACGACGAAGAAAGAGTAACCGGAGATGTGCCA
AGACTGGACTGAGTTTTCCCAGTTTTGAAAAACAATCTCGATGAACTCTCTGAAGTTAGC
ACCCATAACAGAGGATGTAAGGTAAGCTCCGTTCCCACCAGGGGGATTTGTTGGGATGAT
TCCTAGGTTAAAAACGCCAGGGATCTTGAAGTAATCGGCGAGCTTCAACGGCGTATCAGG
CGCAATAAAAGAGGCACCGTTAACGGCGTATCTTTGCTTGCCATTAATCCAAGGAGCTGA
GTTGGCGAGCATGATCGTACGGGCTGGTTTGATCAAACCGTAATGGTATGAGCCTTGCGG
GTTTGGCCTCGGACCACTCGCGGTTAGATTCCTCTTGATAGTTCGAGCTTGGAAGAGCGA
AGAGGCAATGTTCAAAGTGGGGCCAAATGGAGCAGGACCAGAGACGCCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL4226Contig1 911 2 6 U
GGATACTAAATTGGCATATGCAGAGCATCCCACCGCACGAGCTCTTTGGTGTTCTATCAT
CTCTCCACACTTTGCTTCGATTTCTCTGCAATATTAAAACACTTTTTTTTTGTTGGTTTC
ATCTCAAGCTTCCAACTTGGGCCGTTATTTAATTGAGTTTCTCGTGTTCTGATTTTGAAC
TTGAAAAAAGAGTTTAATTTTGGGAGAAAGGAGAAGATGATGAAAGGTCTCTGAGTGTGT
GTGTGTGAGCTAGGGTTAAGTGTGATTCTAAGTTGTGTAAAGAAAGAAGGGGGGAGTTTT
GATGGCGGCGGAGCTTGAATGTTGCGAGGCGAACTTCTTCATACACATAGCGGTGATAGC
GTTTCTGGTCTTGTTCGCTGGACTCATGTCTGGTTTGACATTGGGTCTTATGTCCTTGAG
TCTCGTTGATCTCGAGGTTCTCGCTAAATCCGGTACTCCCCAGCATCGCCAATACGCTGA
AAAGATATTGCCAGTGGTGAAGAATCAGCATCTGTTGCTTGTCACTTTACTTGTATGCAA
TGCAGCTGCTATGGAGACGCTTCCTATATTTCTTGATTCTCTTGTCACGGCTTGGGGTGC
CATTTTGATCTCAGTTACATTGATTCTTCTCTTTGGTGAGATTATACCTCAGTCAATTTG
TTCACGTTATGGTTTGGCCATTGGTGCAACAGTGGCTCCCTTTGTCCGTGTCCTAGTCTT
TGTCTGCTTACCAGTTGCATGGCCGATTAGCAAGCTGCTGGACTTTCTATTGGGTCACCG
TCGTGCAGCGCTGTTTCGAAGAGCTGAGCTGAAAACACTTGTAGACTTTCATGGAATGAG
CTAGAAAGGGCGGAGAGTTGACTCATGACGAACGACATCATTGCAGAGCTCTTGAACTCT
CTGATAAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B843TF U 1
AF RR4AW01TF U 112
BS 1 567 RR4B843TF
BS 568 568 RR4AW01TF
BS 569 799 RR4B843TF
BS 800 800 RR4AW01TF
BS 801 814 RR4B843TF
BS 815 911 RR4AW01TF

RD RR4B843TF 818 0 0
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TTGAAAAAAGAGTTTAATTTTGGGAGAAAGGAGAAGATGATGAAAGGTCTCTGAGTGTGT
GTGTGTGAGCTAGGGTTAAGTGTGATTCTAAGTTGTGTAAAGAAAGAAGGGGGGAGTTTT
GATGGCGGCGGAGCTTGAATGTTGCGAGGCGAACTTCTTCATACACATAGCGGTGATAGC
GTTTCTGGTCTTGTTCGCTGGACTCATGTCTGGTTTGACATTGGGTCTTATGTCCTTGAG
TCTCGTTGATCTCGAGGTTCTCGCTAAATCCGGTACTCCCCAGCATCGCCAATACGCTGA
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TGCAGCTGCTATGGAGACGCTTCCTATTTTTCTTGATTCTCTTGTCACGGCTTGGGGTGC
CATTTTGATCTCAGTTACATTGATTCTTCTCTTTGGTGAGATTATACCTCAGTCAATTTG
TTCACGTTATGGTTTGGCCATTGGTGCAACAGTGGCTCCCTTTGTCCGTGTCCTAGTCTT
TGTCTGCTTACCAGTTGCATGGCCGATTAGCAAGCTGCTGGACTTTCTATTGGGTCACCG
TCGTGCAGCGCTGTTTCGA*GAGCTGAGCTGAAA
CACT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4AW01TF 800 0 0
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ATTTTGAACTTGAAAAAAGAGTTTAATTTTGGGAGAAAGGAGAAGATGATGAAAGGTCTC
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GGGAGTTTTGATGGCGGCGGAGCTTGAATGTTGCGAGGCGAACTTCTTCATACACATAGC
GGTGATAGCGTTTCTGGTCTTGTTCGCTGGACTCATGTCTGGTTTGACATTGGGTCTTAT
GTCCTTGAGTCTCGTTGATCTCGAGGTTCTCGCTAAATCCGGTACTCCCCAGCATCGCCA
ATACGCTGAAAAGATATTGCCAGTGGTGAAGAATCAGCATCTGTTGCTTGTCACTTTACT
TGTATGCAATGCAGCTGCTATGGAGACGCTTCCTATATTTCTTGATTCTCTTGTCACGGC
TTGGGGTGCCATTTTGATCTCAGTTACATTGATTCTTCTCTTTGGTGAGATTATACCTCA
GTCAATTTGTTCACGTTATGGTTTGGCCATTGGTGCAACAGTGGCTTCCTTTGTCCGTGT
CCTAGTCTTTGTCTGCTTACCAGTTGCATGGCCGATTAGCAAGCTGCTGGACTTTCTATT
GGGTCACCGTCGTGCAGCGCTGTTTCGAAGAGCTGAGCTGAAAACACTTGTAGACTTTCA
TGGAATGAGCTAGAAAGGGCGGAGAGTTGACTCATGACGAACGACATCATTGCAGAGCTC
TTGAACTCTCTGATAAATGG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

CO CL4227Contig1 775 3 5 U
GGACACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACCATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCC
TTAAGTCCCTCTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGT
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TCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAG
GATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGGCA
AGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAA
TGGATTTCAACGCCTGGTTTTGTTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGA
CATTGAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAGGAGATCTATCGGTCGTCG
GTGGGACCGGTGATTTCGTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTC
AAGGGGCTAACTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGA
TTATATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATG
TGTTACTGAGAATAAATCATGTTTCTTTTGTTTTTTTTAAATAGTTTTCGTGTCTGTTTG
TTTGTGATTTTAAATATTATAATCTATATATAATAGCAAACCATTTTTTGGTGAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF93TF U 1
AF RR4G012TF U 3
AF RR4DF93JQ C 171
BS 1 674 RR4DF93TF
BS 675 698 RR4G012TF
BS 699 699 RR4DF93JQ
BS 700 724 RR4G012TF
BS 725 775 RR4DF93JQ

RD RR4DF93TF 674 0 0
GGACACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACCATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCC
TTAAGTCCCTCTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGT
CCCGCAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACA
TCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAG
GATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGGCA
AGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAA
TGGATTTCAACGCCTGGTTTTGTTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGA
CATTGAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAGGAGATCTATCGGTCGTCG
GTGGGACCGGTGATTTCGTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTC
AAGGGGCTAACTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGA
TTATATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATG
TGTTACTGAGAATA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4G012TF 722 0 0
GG
ACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACCATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCCTTAA
GTCCCTCTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGTCCCG
CAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACATCCT
CTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAGGATT
AGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACAAGAA
CTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAATGGA
TTTCAACGCCTGGTTTTGTTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGACATT
GAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTCGGTGG
GACCGGTGATTTCGTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTCAAGG
GGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTCAGTAACTGATTAT
ATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATGTGTT
ACTGAGAATAAATCATGTTTCTTTTGTTTTTTTTTAATAGTTTTCGTGTCTGTTTGTTTG

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR4DF93JQ 605 0 0
TTTCATGACATCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTG
AGCCCTCCAGGATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATA
ACAATGGGCAAGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTAT
GACATGAAAATGGATTTCAACGCCTGGTTTTGTTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAA
CACAAAGGGACATTGAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAGGAGATCTA
TCGGTCGTCGGTGGGACCGGTGATTTCGTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACA
GATATATTTCAAGGGGCTAACTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGT
TAGTAACTGATTATATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAG
AGATAAAATGTGTTACTGAGAATAAATCATGTTTCTTTTGTTTTTTTTAAATAGTTTTCG
TGTCTGTTTGTTTGTGATTTTAAATATTATAATCTATATATAATAGCAAACCATTTTTTG
GTGAT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 3

CO CL4228Contig1 758 3 12 U
GGATTTCATCAGATATCTCTTCCTTCGAAAAGATTAAAAAAAAAACACACAAAAGAATGG
CAGCTCTAGCATCAAACCCTCAGATGTTAACGAGACAAGGTCACAGTAATTACAAAAAGG
AACAATTCTGGAGGAAAGAGAGTTTGAATACGGAGAAGAAGTGTGGGTTTTTCTGTGTGA
AGGTTTACAATCATGAAAAGCTTGGGAGGTCACAAGTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAG
CTTTTTGGTCAAACGTATCACAGCCTGAGACTGTGGAGATGGTACCCATCAATGACGTTG
ATGAGCCTAAAGCTGTTCTCTCTGACGCACGCAACCTCTCTCAGCCTATCATCATCGAAT
GGATGGCTTCTTGGTGTCGGAAATGTATTTACTTGAAGCCTAAGTTGGAGAAACTGGCAG
CGGAATATAATAACCGAACGAAGTTCTACTACGTGGATGTGAACAAAGTCCCTCAAACTT
TGGTGAAGCGTGGCAACATCTCGAAAATGCCCACCATTCAGTTGTGGAAGGAAGGGGAGA
TGCAAGAGGAAGTGATAGGAGGTCACAAAGGATGGCTTGTTATTGAAGAAGTCAGAGAAT
TGATCAATAAATATGTCTGATTCTCTTTTTTTTT***CTTCTCTTCCTCATCTTTTCTGT
TAATTTGTACAGTAGCTTTTAAATTTTGCATTTTTTGATATTTGAGACATAGAGAATGGA
GAAAGAGAACTAAATATGATAAGCTGTGTTTTTAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GN90TF U 1
AF RR4AL09TF U 12
AF RR4AL09JQ C 27
BS 1 306 RR4GN90TF
BS 307 307 RR4AL09TF
BS 308 308 RR4GN90TF
BS 309 309 RR4AL09TF
BS 310 365 RR4GN90TF
BS 366 366 RR4AL09TF
BS 367 556 RR4GN90TF
BS 557 557 RR4AL09TF
BS 558 634 RR4GN90TF
BS 635 637 RR4AL09TF
BS 638 728 RR4GN90TF
BS 729 758 RR4AL09TF

RD RR4GN90TF 730 0 0
GGATTTCATCAGATATCTCTTCCTTCGAAAAGATTAAAAAAAAAACACACAAAAGAATGG
CAGCTCTAGCATCAAACCCTCAGATGTTAACGAGACAAGGTCACAGTAATTACAAAAAGG
AACAATTCTGGAGGAAAGAGAGTTTGAATACGGAGAAGAAGTGTGGGTTTTTCTGTGTGA
AGGTTTACAATCATGAAAAGCTTGGGAGGTCACAAGTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAG
CTTTTTGGTCAAACGTATCACAGCCTGAGACTGTGGAGATGGTACCCATCAATGACGTTG
ATGAGCTTGAAGCTGTTCTCTCTGACGCACGCAACCTCTCTCAGCCTATCATCATCGAAT
GGATGACTTCTTGGTGTCGGAAATGTATTTACTTGAAGCCTAAGTTGGAGAAACTGGCAG
CGGAATATAATAACCGAACGAAGTTCTACTACGTGGATGTGAACAAAGTCCCTCAAACTT
TGGTGAAGCGTGGCAACATCTCGAAAATGCCCACCATTCAGTTGTGGAAGGAAGGGGAGA
TGCAAGAGGAAGTGATGGGAGGTCACAAAGGATGGCTTGTTATTGAAGAAGTCAGAGAAT
TGATCAATAAATATGTCTGATTCTCTTTTTTTTTTTTCTTCTCTTCCTCATCTTTTCTGT
TAATTTGTACAGTAGCTTTTAAATTTTGCATTTTTTGATATTTGAGACATAGAGAATGGA
GAAAGAGA
CT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4AL09TF 747 0 0
GATATCTCTTCCTTCGAAAAGATTAAAAAAAAAACACACAAAAGAATGGCAGCTCTAGCA
TCAAACCCTCAGATGTTAACGAGACAAGGTCACAGTAATTACAAAAAGGAACAATTCTGG
AGGAAAGAGAGTTTGAATACGGAGAAGAAGTGTGGGTTTTTCTGTGTGAAGGTTTACAAT
CATGAAAAGCTTGGGAGGTCACAAGTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAGCTTTTTGGTCA
AACGTATCACAGCCTGAGACTGTGGAGATGGTACCCATCAATGACGTTGATGAGCCTAAA
GCTGTTCTCTCTGACGCACGCAACCTCTCTCAGCCTATCATCATCGAATGGATGGCTTCT
TGGTGTCGGAAATGTATTTACTTGAAGCCTAAGTTGGAGAAACTGGCAGCGGAATATAAT
AACCGAACGAAGTTCTACTACGTGGATGTGAACAAAGTCCCTCAAACTTTGGTGAAGCGT
GGCAACATCTCGAAAATGCCCACCATTCAGTTGTGGAAGGAAGGGGAGATGCAAGAGGAA
GTGATAGGAGGTCACAAAGGATGGCTTGTTATTGAAGAAGTCAGAGAATTGATCAATAAA
TATGTCTGATTCTCTTTTTTTTT***CTTCTCTTCCTCATCTTTTCTGTTAATTTGTACA
GTAGCTTTTAAATTTTGCATTTTTTGATATTTGAGACATAGAGAATGGAGAAAGAGAACT
AAATATGATAAGCTGTGTTTTTAGTTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4AL09JQ 732 0 0
AAAAGATTA
AAAAAAAAAACACACAAAAGAATGGCAGCTCTAGCATCAAACCCTCAGATGTTAACGAGA
CAAGGTCACAGTAATTACAAAAAGGAACAATTCTGGAGGAAAGAGAGTTTGAATACGGAG
AAGAAGTGTGGGTTTTTCTGTGTGAAGGTTTACAATCATGAAAAGCTTGGGAGGTCACAA
GTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAGCTTTTTGGTCAAACGTATCACAGCCTGAGACTGTG
GAGATGGTACCCATCAATGACGTTGATGAGCCTAAAGCTGTTCTTTTTGACGCACGCAAC
CTCTCTCAGCCTATCATCATCGAATGGATGGCTTCTTGGTGTCGGAAATGTATTTACTTG
AAGCCTAAGTTGGAGAAACTGGCAGCGGAATATAATAACCGAACGAAGTTTTACTACGTG
GATGTGAACAAAGTCCCTCAAACTTTGGTGAAGCGTGGCAACATCTCGAAAATGCCCACC
ATTCAGTTGTGGAAGGAAGGGGAGATGCAAGAGGAAGTGATAGGAGGTCACAAAGGATGG
CTTGTTATTGAAGAAGTCAGAGAATTGATCAATAAATATGTCTGATTCTCTTTTTTTTT*
**CTTCTCTTCCTCATCTTTTCTGTTAATTTGTACAGTAGCTTTTAAATTTTGCATTTTT
TGATATTTGAGACATAGAGAATGGAGAAAGAGAACTAAATATGATAAGCTGTGTTTTTAG
TTG

QA 10 732 10 732
DS 



AS 1 3

CO CL4229Contig1 888 3 5 U
GTCGTTCCCACCAGCAGCAACGGAGGCGGAGGAGATAGATTCGAGAAGCGAGGGAGCTTC
GAGTCTTTGTCTAGGAACCGCGATTCGCAGTTCGGATCTGATTCGGATACATGGGGGAGG
AGGAGAGAGGAGACTGCGCCAACTCCGATCGGCGGCGGTGGTGGTGGCTCACGGCCGAGA
TTGGTGTTACAGCCGCGAACGCTTCCTGTGGCTGTTGTTGAAGTGAAGCCGGAGAGCCCG
GTGGCTGTTGCTGTTGTTGAGAGACCTGTGATTGTGGAGAGACCTAAAGGGGCGAATCCT
TTCGGGAACGCGAGGCCTAGGGAGGAGGTTTTGGCTGAGAAGGGACAGGACTGGAAGGAG
ATTTGATGAGAAGCTCGAGGCTGTCAAGTTGAAGGAGGTTTGCTGCTGCAGTTGAGAAGC
CTGATGAGAGGTCTCCTGGGAAGATGGGGTTTTGGTCTTTGGCAACGGCCGTAAGGACGA
TCGTACTGACGGAAGTTGGAGGAAAAGCTCTGAGGAAGCTCAGCAAGAGGAAGCAGCTGT
AGCTCAGCAAGAGGATGCAGCTGTAGAAGAGGCTAACAAGGAAGAACCTGCCAAGGAAGA
GGCTGGCAAGCTAGAGGCGGAGGACACAAACTAAATGTTCTTTTTGGGATTCTGAGGAGA
AGAGTTTGAGTCCATGAGGGTTTTTAGCTTCTGAGAATTTGTGTTGTTTTAAGTCGTCTG
TTTAACTCTATAGAAAATTTTTGGTAGGGACTCCATATAATTTATGTCTTTTTGTTTGCA
TACAGTCTTGCTGCAATTTCTAGGGATTGTGGGTGTCTTTCTATTAATTTTGCACAATTT
GTTATTCGTATTACTGTCTCTTTTTCGATTTGAGAGCTGCTTCTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B592TF U 1
AF RR4B592JQ C 18
AF RR4H125TF U 647
BS 1 703 RR4B592TF
BS 704 715 RR4H125TF
BS 716 716 RR4B592JQ
BS 717 872 RR4H125TF
BS 873 888 RR4B592JQ

RD RR4B592TF 703 0 0
GTCGTTCCCACCAGCAGCAACGGAGGCGGAGGAGATAGATTCGAGAAGCGAGGGAGCTTC
GAGTCTTTGTCTAGGAACCGCGATTCGCAGTTCGGATCTGATTCGGATACATGGGGGAGG
AGGAGAGAGGAGACTGCGCCAACTCCGATCGGCGGCGGTGGTGGTGGCTCACGGCCGAGA
TTGGTGTTACAGCCGCGAACGCTTCCTGTGGCTGTTGTTGAAGTGAAGCCGGAGAGCCCG
GTGGCTGTTGCTGTTGTTGAGAGACCTGTGATTGTGGAGAGACCTAAAGGGGCGAATCCT
TTCGGGAACGCGAGGCCTAGGGAGGAGGTTTTGGCTGAGAAGGGACAGGACTGGAAGGAG
ATTTGATGAGAAGCTCGAGGCTGTCAAGTTGAAGGAGGTTTGCTGCTGCAGTTGAGAAGC
CTGATGAGAGGTCTCCTGGGAAGATGGGGTTTTGGTCTTTGGCAACGGCCGTAAGGACGA
TCGTACTGACGGAAGTTGGAGGAAAAGCTCTGAGGAAGCTCAGCAAGAGGAAGCAGCTGT
AGCTCAGCAAGAGGATGCAGCTGTAGAAGAGGCTAACAAGGAAGAACCTGCCAAGGAAGA
GGCTGGCAAGCTAGAGGCGGAGGACACAAACTAAATGTTCTTTTTGGGATTCTGAGGAGA
AGAGTTTGAGTCCATGAGGGTTTTTAGCTTCTGAGAATTTGTG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4B592JQ 871 0 0
CAACGGAGGCGGAGGAGATAGATTCGAGAAGCGAGGGAGCTTCGAGTCTTTGTCTAGGAA
CCGCGATTCGCAGTTCGGATCTGATTCGGATACATGGGGGAGGAGGAGAGAGGAGACTGC
GCCAACTCCGATCGGCGGCGGTGGTGGTGGCTCACGGCCGAGATTGGTGTTACAGCCGCG
AACGCTTCCTGTGGCTGTTGTTGAAGTGAAGCCGGAGAGCCCGGTGGCTGTTGCTGTTGT
TGAGAGACCTGTGATTGTGGAGAGACCTAAAGGGGCGAATCCTTTCGGGAACGCGAGGCC
TAGGGAGGAGGTTTTGGCTGAGAAGGGACAGGACTGGAAGGAGATT*GATGAGAAGCTCG
AGGCTGTCAAGTTGAAGGAGGTT*GCTGCTGCAGTTGAGAAGCCTGATGAGAGGTCTCCT
GGGAAGATGGGGTTT*GGTCTT*GGCAACGGCCGTAAGGACGATCGTACTGACGGAAGTT
GGAGGAAAAGCTCTGAGGAAGCTCAGCAAGAGGAAGCAGCTGTAGCTCAGCAAGAGGATG
CAGCTGTAGAAGAGGCTAACAAGGAAGAACCTGCCAAGGAAGAGGCTGGCAAGCTAGAGG
CGGAGGACACAAACTAAATGTTCTTTTTGGGATTCTGAGGAGAAGAGTTTGAGTCCATGA
GGGTTTTTAGCTTCTGAGAATTTGTGTTGTTTTAAGTTGTCTGTTTAACTCTATAGAAAA
TTTTTGGTAGGGACTCCATATAATTTATGTCTTTTTGTTTGCATACAGTCTTGCTGCAAT
TTCTAGGGATTGTGGGTGTCTTTCTATTAATTTTGCACAATTTGTTATTCGTATTACTGT
CTCTTTTTCGATTTGAGAGCTGCTTCTTTGG

QA 1 871 1 871
DS 

RD RR4H125TF 226 0 0
GGATTCTGAGGAGAAGAGTTTGAGTCCATGAGGGTTTTTAGCTTCTGAGAATTTGTGTTG
TTTTAAGTCTTCTGTTTAACTCTATAGAAAATTTTTGGTAGGGACTCCATATAATTTATG
TCTTTTTGTTTGCATACAGTCTTGCTGCAATTTCTAGGGATTGTGGGTGTCTTTCTATTA
ATTTTGCACAATTTGTTATTCGTATTACTGTCTCTTTTTCGATTTG

QA 1 226 1 226
DS 



AS 1 3

CO CL4230Contig1 812 3 11 U
GGTGCCAAAATGCAAATTTATTGCTGATTGAACCTTTATTATTGGCGTTGAAATGTAAAA
GGAGATAGTTCAAGGTACAATTCACTCCTTATAGTAGACAACAAACTGACCAAACCGACC
CATAAACTCTTCAAATGATCAATTCCAAACCTTACAAACTAAATGCATTCATGGACACAT
TTGATATCATTTCTTGTTTCGTTTAAGAAGTTGCCTAAACCATTGTGCAGATATCTTGGG
GTACCGCTTCAAGGTCTTGTAATCAACATAGACGATCCCAAACCTTGAGGTATATCCTGA
CAACCATTCGAAATTATCAAGCAATGACCACGCGAAATATCCCTTCACATTGGCTCCATC
ATCCACAGCTTTCTTAAGTTGAGTTAAGTAATCTTTATAGTACTTGATTCTCGTTGTGTC
GTGTAGTCCTTGAGCTAGGGTAACGTTACCTGGATCATCCATACCATTTTCAGAGAGAAT
CATAGTTGGGTTGCCATAACGTTCCTTCATGTACATCAACGCTTTGTACATTCCCCATGG
TACGTTGTATAACCAATACGAGTACGCCCTTGGACCGATCGGCTTCCCCAACTTTGCAAA
CCCGAAAGTAGCATTCCAATCTTGTTGATAACCCAATTCCTTAGGTATGGTTGAGTTATG
AGTATCTGACATGAAATAAGTTGTGTATTGGTTTATTCCCACGAAATCTATGGAACCTTT
CACCATTTTCACTTCTTCCTCTGTAAATTTTGGAAGCCTCTCTTTCACAATGTTCTGCAT
TGTATTTGGATACTCTCCGTATACTATTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C759JQ U 1
AF RR4GO16TF C 121
AF RR4GO16JQ U 23
BS 1 56 RR4C759JQ
BS 57 57 RR4GO16JQ
BS 58 231 RR4C759JQ
BS 232 232 RR4GO16JQ
BS 233 428 RR4C759JQ
BS 429 429 RR4GO16JQ
BS 430 447 RR4C759JQ
BS 448 448 RR4GO16JQ
BS 449 783 RR4C759JQ
BS 784 784 RR4GO16TF
BS 785 812 RR4C759JQ

RD RR4C759JQ 812 0 0
GGTGCCAAAATGCAAATTTATTGCTGATTGAACCTTTATTATTGGCGTTGAAATGTCAAA
GGAGATAGTTCAAGGTACAATTCACTCCTTATAGTAGACAACAAACTGACCAAACCGACC
CATAAACTCTTCAAATGATCAATTCCAAACCTTACAAACTAAATGCATTCATGGACACAT
TTGATATCATTTCTTGTTTCGTTTAAGAAGTTGCCTAAACCATTGTGCAGACATCTTGGG
GTACCGCTTCAAGGTCTTGTAATCAACATAGACGATCCCAAACCTTGAGGTATATCCTGA
CAACCATTCGAAATTATCAAGCAATGACCACGCGAAATATCCCTTCACATTGGCTCCATC
ATCCACAGCTTTCTTAAGTTGAGTTAAGTAATCTTTATAGTACTTGATTCTCGTTGTGTC
GTGTAGTCATTGAGCTAGGGTAACGTTGCCTGGATCATCCATACCATTTTCAGAGAGAAT
CATAGTTGGGTTGCCATAACGTTCCTTCATGTACATCAACGCTTTGTACATTCCCCATGG
TACGTTGTATAACCAATACGAGTACGCCCTTGGACCGATCGGCTTCCCCAACTTTGCAAA
CCCGAAAGTAGCATTCCAATCTTGTTGATAACCCAATTCCTTAGGTATGGTTGAGTTATG
AGTATCTGACATGAAATAAGTTGTGTATTGGTTTATTCCCACGAAATCTATGGAACCTTT
CACCATTTTCACTTCTTCCTCTGTAAATTTTGGAAGCCTCTCTTTCACAATGTTCTGCAT
TGTCTTTGGATACTCTCCGTATACTATTGGGT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4GO16TF 672 0 0
CATAAACTCTTCAAATGATCAATTCCAAACCT*ACAAACTAAATGCATTCATGGACACAT
TTGATATCATTTCTTGTTTCGTTTAAGAAGTTGCCTAAACCATTGTGCAGATATCTTGGG
GTACCGCTTCAAGGTCTTGTAATCAACATAGACGATCCCAAACCTTGAGGTATATCCTGA
CAACCATTCGAAATTATCAAGCAATGACCACGCGAAATATCCCTTCACATTGGCTCCATC
ATCCACAGCTTTCTTAAGTTGAGTTAAGTAATCTTTATAGTACTTGATTCTCGTTGTGTC
GTGTAGTCCTTGAGCTAGGGTAACGTTACCTGGATCATCCATACCATTTTCAGAGAGAAT
CATAGTTGGGTTGCCATAACGTTCCTTCATGTACATCAACGCTTTGTACATTCCCCATGG
TACGTTGTATAACCAATACGAGTACGCCCTTGGACCGATCGGCTTCCCCAACTTTGCAAA
CCCGAAAGTAGCATTCCAATCTTGTTGATAACCCAATTCCTTAGGTATGGTTGAGTTATG
AGTATCTGACATGAAATAAGTTGTGTATTGGTTTATTCCCACGAAATCTATGGAACCTTT
CACCATTTTCACTTCTTCCTCTGTAAATTTTGGAAGCCTCTCTTTCACAATGTTCTGCAT
TGTATTTGGAT
C

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4GO16JQ 759 0 0
GCTGATTGAACCTTTATTATTGGCGTTGAAATGTAAAAGGAGATAGTTCAAGGTACAATT
CACTCCTTATAGTAGACAACAAACTGACCAAACCGACCCATAAACTCTTCAAATGATCAA
TTCCAAACCTTACAAACTAAATGCATTCATGGACACATTTGATATCATTTCTTGTTTCGT
TTAAGAAGTTGCCTAAACCATTGTGCAGATATCTTGGGGTACCGCTTCAAGGTCTTGTAA
TCAACATAGACGATCCCAAACCTTGAGGTATATCCTGACAACCATTCGAAATTATCAAGC
AATGACCACGCGAAATATCCCTTCACATTGGCTCCATCATCCACAGCTTTCTTAAGTTGA
GTTAAGTAATCTTTATAGTACTTGATTCTCGTTGTGTCGTGTAGTCCTTGAGCTAGGGTA
ACGTTACCTGGATCATCCATACCATTTTCAGAGAGAATCATAGTTGGGTTGCCATAACGT
TCCTTCATGTACATCAACGCTTTGTACATTCCCCATGGTACGTTGTATAACCAATACGAG
TACGCCCTTGGACCGATCGGCTTCCCCAACTTTGCAAACCCGAAAGTAGCATTCCAATCT
TGTTGATAACCCAATTCCTTAGGTATGGTTGAGTTATGAGTATCTGACATGAAATAAGTT
GTGTATTGGTTTATTCCCACGAAATCTATGGAACCTTTCACCATTTTCACTTCTTCCTCT
GTAAATTTTGGAAGCCTCTCTTTCACAATGTTCTGCATT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL4231Contig1 1421 2 4 U
GAACGACTAAAAGTAGAAAGATAGTCTCTGGTGCGACTCTCACTTCTTCCTCTTCTTCTT
CGAGCTCGAACCAATCTCTGCTTCATTCCGATTCGATCAGACGAGCGAATACTGGAAAAA
TTATACAGATATCAAATTTTTGTGGAATCTTGATCGTTGAAATGGATGCGAATACATTCG
TTTTGCTTCTGTGTATAGCTTTGCTTTTGGGGACTAAGGTTGAGGGAGAGGCACAAATTG
TATCCAATTTGACAGATACAAGTGTGCCTCAGATTGTTACTGATTCTTCTAAGAGTAGTG
ATCATTCTACTAACACCACCACAACCAATCAATTGGGTGCTAGTAGTGATGGATCTGAGA
CCAAGCCTATTGTTGATGATAGTACGAGTCAAAAGAATATAGGAGGAGGAGGAGGAAGCG
ATGAAAGTGAAAGCAGCGCTACTACGAGCAGCAACTCCTCCTCTTCAAGGAAGAAGAAAG
AAGGTGAAGACTGTGATCCATCTTATATGTGTTCTGATGACCAACATCTCTTTCTCGCCT
GTCTCCGTGTCCCTGGTGATGATGATGATGCGCCTCATCTCTCTCTCCTCATAAAGAACA
AAGCCAAAACTGCTTTGCTTCTTACCATAACTGCTCCCAGTTTTGTCCGCTTAGAGACCA
ATCAAGTTCAGCTTCCTGAAAGCCAAGACACAAAGGTGAAAGTCTCTATTAAGAAGGGAG
GCTCCAACGATAGCGCAATCACACTCACTTCCAGTAACGGCGGCCATTGCAGCCTTGAAT
TAAAAGATTTGGCCGGTGCATCATCACATGAAACAGGAAAGGACAGCACAGTGGCTGTTT
CTCGCCCTTCGATCCTCAACATCAGCTCGCGAACACTCATCGTGATCGCCATGATATCCT
TCCTCGTTCTCTCCCTCGTCATCATCCCGGTGATCTACCACGTTTACAGAAGCAAGTCGC
AGGCGAAAAGCAAGTACCAGAGGCTCGACAACATGGAACTGCCAGTCTCTAGCACCGCCG
CCGCCGCGGCGTTGGTGTCGAAATCGGATCAAGAAAGTGGTGATGACGGATGGAACAATA
ACTGGGGAGATGATTGGGGCGATGGAGATGAAGAACAGCCGAATACTCCGGTGTTACCAC
TCACACCGAGTGTTTCTTCTAGAGGACTTGCTCCTAGACGACTCAGCAAAGAAGGTTGGA
AAGATTAGCTTTACTCTGTTTCTCTCTTTTGTTTCCTTTGGAAGTCTATACATTAGTACA
AGATGCCCGGAGGATTTGACTCCAATTGGTAAGAAAATTTGTGGAATGTTTTTTTTCATC
GTGTATAACTGCAAAACCAAAACACTGCTCTCTTTATACTTTTGGGCCTTTATCGTAGAG
TATGATGAGCTTCTTGTTTATAGGCTTAATAAGCCTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH70TF U 1
AF RR4BH70JQ C 680
BS 1 795 RR4BH70TF
BS 796 796 RR4BH70JQ
BS 797 814 RR4BH70TF
BS 815 1421 RR4BH70JQ

RD RR4BH70TF 814 0 0
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CGAGCTCGAACCAATCTCTGCTTCATTCCGATTCGATCAGACGAGCGAATACTGGAAAAA
TTATACAGATATCAAATTTTTGTGGAATCTTGATCGTTGAAATGGATGCGAATACATTCG
TTTTGCTTCTGTGTATAGCTTTGCTTTTGGGGACTAAGGTTGAGGGAGAGGCACAAATTG
TATCCAATTTGACAGATACAAGTGTGCCTCAGATTGTTACTGATTCTTCTAAGAGTAGTG
ATCATTCTACTAACACCACCACAACCAATCAATTGGGTGCTAGTAGTGATGGATCTGAGA
CCAAGCCTATTGTTGATGATAGTACGAGTCAAAAGAATATAGGAGGAGGAGGAGGAAGCG
ATGAAAGTGAAAGCAGCGCTACTACGAGCAGCAACTCCTCCTCTTCAAGGAAGAAGAAAG
AAGGTGAAGACTGTGATCCATCTTATATGTGTTCTGATGACCAACATCTCTTTCTCGCCT
GTCTCCGTGTCCCTGGTGATGATGATGATGCGCCTCATCTCTCTCTCCTCATAAAGAACA
AAGCCAAAACTGCTTTGCTTCTTACCATAACTGCTCCCAGTTTTGTCCGCTTAGAGACCA
ATCAAGTTCAGCTTCCTGAAAGCCAAGACACAAAGGTGAAAGTCTCTATTAAGAAGGGAG
GCTCCAACGATAGCGCAATCACACTCACTTCCAGTAACGGCGGCCATTGCAGCCTTGAAT
TAAAAGATTTGGCCG*TGCATCATCACATGAAAC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4BH70JQ 742 0 0
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GTAACGGCGGCCATTGCAGCCTTGAATTAAAAGATTTGGCCGGTGCATCATCACATGAAA
CAGGAAAGGACAGCACAGTGGCTGTTTCTCGCCCTTCGATCCTCAACATCAGCTCGCGAA
CACTCATCGTGATCGCCATGATATCCTTCCTCGTTCTCTCCCTCGTCATCATCCCGGTGA
TCTACCACGTTTACAGAAGCAAGTCGCAGGCGAAAAGCAAGTACCAGAGGCTCGACAACA
TGGAACTGCCAGTCTCTAGCACCGCCGCCGCCGCGGCGTTGGTGTCGAAATCGGATCAAG
AAAGTGGTGATGACGGATGGAACAATAACTGGGGAGATGATTGGGGCGATGGAGATGAAG
AACAGCCGAATACTCCGGTGTTACCACTCACACCGAGTGTTTCTTCTAGAGGACTTGCTC
CTAGACGACTCAGCAAAGAAGGTTGGAAAGATTAGCTTTACTCTGTTTCTCTCTTTTGTT
TCCTTTGGAAGTCTATACATTAGTACAAGATGCCCGGAGGATTTGACTCCAATTGGTAAG
AAAATTTGTGGAATGTTTTTTTTCATCGTGTATAACTGCAAAACCAAAACACTGCTCTCT
TTATACTTTTGGGCCTTTATCGTAGAGTATGATGAGCTTCTTGTTTATAGGCTTAATAAG
CCTTTTAC

QA 15 742 15 742
DS 



AS 1 3

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AAACTATATAGAAACATACTACAATCCCTTAATACTACAAACATATTTCCTATACGATAT
AAACAAAGGAAACAGCGATGTATATGATTTTCTTTATATTATCTATTTCTACGGCTTTAA
AAGAAAAACAATACTAACCATTTACAATACTATGACCTATGACCACGGGAAACCTTTCTA
TATGGTTAGTTACGTGTTGGTTAAGTTCAGAACGGAGCACGGTGTGGTACGCCCTTCCGT
CTGCTTGAGTTCCGGTGATTATATATAGTTGGTGTCCCCGGAGAAAGATTAAAACCACTT
TCATCACCGGAGCTTGAAGACCACTGATCTCCTGAAAAGTAATCTGATTTAACGGTGGAG
ATGGAGAGACCATTCATCAGACGGTTGAAAGCACATGTCTTGCGCATCTTAGTTGGTGTG
GTCGCCTCATCAGATTCCGCTTCACCTCGATATTCTCTCCCATGCTTCCCTTTTAAAGAG
AAGGAAAGACTTTGATTTCCTCTCTTCATCCCTCCAAGTTTGCAACCGAGAGAGCAGAAA
CGGAAAGAATCAAGGAGGCTCCTGCAACATATTTCACAAGTATTGGTAACGCCTTTGCCG
ATTCTTGGCTGAGGACGTTCGTTCAAGAACACGATCCTTGCGCTGTTAATTATATATGTC
TGAACACAAGAGATGTCTATGTACTTCTGAATCTCGTTCACCCTTACAACGTTGTGGTAT
GATGATCTTCGTATCTGAAGAACACGATGGTTTTTATGATTGCTCAAACAGTAAGAGCAA
AAGGAACTAGAACTGAGTCAAGACAGAACATGTTGCATTCACTTTTGTTGGAATCAGCGT
GGATCGAACATGGGACAAAGTAGTTTGCTCTTAGCAATGGTATTAGCCATGATGGACTTT
CTTCTTCTACTCTCATCATTGGTCCCTGGAGAGTTTTAAGACCAATTCAAACGGTAGCCC
C


BQ
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10 

AF RR4DG58JQ U 1
AF RR4BL46JQ U 66
AF RR4DG58TF C 349
BS 1 80 RR4DG58JQ
BS 81 81 RR4BL46JQ
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BS 800 827 RR4DG58JQ
BS 828 1021 RR4DG58TF

RD RR4DG58JQ 837 0 0
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AAACTATATAGAAACATACTTCAATCCCTTAATACTACAAACATATTTCCTATACGATAT
AAACAAAGGAAACAGCGATGTATATGATTTTTTTTATATTATCTATTTCTACGGCTTTAA
AAGAAAAACAATACTAACCATTTACAATACTATGACCTATGACCACGGGAAACCTTTCTA
TATGGTTAGTTACGTGTTGGTTAAGTTCAGAACGGAGCACGGTGTGGTACGCCCTTCCGT
CTGCTTGAGTTCCGGTGATTATATATAGTTGGTGTCCCCGGAGAAAGATTAAAACCACTT
TCATCACCGGAGCTTGAAGACCACTGATCTCCTGAAAAGTAATCTGATTTAACGGTGGAG
ATGGAGAGACCATTCATCAGACGGTTGAAAGCACATGTCTTGCGCATCTTAGTTGGTGTG
GTCGCCTCATCAGATTCCGCTTCACCTCGATATTCTCTCCCATGCTTCCCTTTTAAAGAG
AAGGAAAGACTTTGATTTCCTCTCTTCATCCCTCCAAGTTTGCAACCGAGAGAGCAGAAA
CGGAAAGAATCAAGGAGGCTCCTGCAACATATTTCACAAGTATTGGTAACGCCTTTGCCG
ATTCTTGGCTGAGGACGTTCGTTCAAGAACACGATCCTTGCGCTGTTAATTATATATGTC
TGAACACAAGAGATGTCTATGTACTTCTGAATCTCGTTCACCCTTACAACGTTGTGGTAT
GATGATCTTCGTATCTGA*GAACACGATGGTTTTTATGATTGCTCAA
CAGTAGAGCA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4BL46JQ 743 0 0
G
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AGGAAACAGCGATGTATATGATTTTCTTTATATTATCTATTTCTACGGCTTTAAAAGAAA
AACAATACTAACCATTTACAATACTATGACCTATGACCACGGGAAACCTTTCTATATGGT
TAGTTACGTGTTGGTTAAGTTCAGAACGGAGCACGGTGTGGTACGCCCTTCCGTCTGCTT
GAGTTCCGGTGATTATATATAGTTGGTGTCCCCGGAGAAAGATTAAAACCACTTTCATCA
CCGGAGCTTGAAGACCACTGATCTCCTGAAAAGTAATCTGATTTAACGGTGGAGATGGAG
AGACCATTCATCAGACGGTTGAAAGCACATGTCTTGCGTATCTTAGTTGGTGTGGTCGCC
TCATCAGATTCCGCTTCACCTCGATATTCTCTCCCATGCTTCCCTTTTAAAGAGAAGGAA
AGACTTTGATTTCCTCTCTTCATCCCTCCAAGTTTGCAACCGAGAGAGCAGAAACGGAAA
GAATCAAGGAGGCTCCTGCAACATATTTCACAAGTATCGGTAACGCCTTTGCCGATTCTT
GGCTGAGGACGTTCGTTCAAGAACACGATCCTTGCGCTGTTAATTATATATGTCTGAACA
CAAGAGATGTCTATGTACTTCTGAATCTCGTTCACCCTTACAACGTTGTGGTATGATGAT
CTTCGTATCTGA
AGAACGCGAT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4DG58TF 673 0 0
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TTAACGGTGGAGATGGAGAGACCATTCATCAGACGGTTGAAAGCACATGTCTTGCGCATC
TTAGTTGGTGTGGTCGCCTCATCAGATTCCGCTTCACCTCGATATTCTCTCCCATGCTTC
CCTTTTAAAGAGAAGGAAAGACTTTGATTTCCTCTCTTCATCCCTCCAAGTTTGCAACCG
AGAGAGCAGAAACGGAAAGAATCAAGGAGGCTCCTGCAACATATTTCACAAGTATTGGTA
ACGCCTTTGCCGATTCTTGGCTGAGGACGTTCGTTCAAGAACACGATCCTTGCGCTGTTA
ATTATATATGTCTGAACACAAGAGATGTCTATGTACTTCTGAATCTCGTTCACCCTTACA
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CAGTAAGAGCAAAAGGAACTAGAACTGAGTCAAGACAGAACATGTTGCATTCACTTTTGT
TGGAATCAGCGTGGATCGAACATGGGACAAAGTAGTTTGCTCTTAGCAATGGTATTAGCC
ATGATGGACTTTCTTCTTCTACTCTCATCATTGGTCCCTGGAGAGTTTTAAGACCAATTC
AAACGGTAGCCCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 3

CO CL4233Contig1 752 3 11 U
GGACAGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAAGAATCCCCCTCTCTCCGACGACAAACCAGAC
CTGCGACCCCTTTCGAGAGAAAAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTCCTAGGAAGAGTT
CTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGATTCCGGATCTGAC
GGTGGTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAAGCACACCTCTCT
TCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTT
GCTCTGAAAGGGCTCAGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTT
TTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCC
GAGGACCGCCAATTCTCGCTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTTCTCGGG
GCCTTGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCCTCAAAGAGCAGC
AACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGATCTGTTCTATTCTCTTCCAC
ACACGTTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTCCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTC
TTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAATTCTAGACTTGGCCACGATTCTTTTCTATTTCT
CTTCTAGTTTTTATTTATTTTTGAGATCTAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH56TF U 1
AF RR4EA38TF U 1
AF RR4EH56JQ C 306
BS 1 169 RR4EA38TF
BS 170 171 RR4EH56TF
BS 172 256 RR4EA38TF
BS 257 257 RR4EH56TF
BS 258 315 RR4EA38TF
BS 316 316 RR4EH56TF
BS 317 470 RR4EA38TF
BS 471 471 RR4EH56TF
BS 472 637 RR4EA38TF
BS 638 638 RR4EH56TF
BS 639 752 RR4EA38TF

RD RR4EH56TF 663 0 0
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ACACGTTTATCAG*CTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTCCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTC
TTC

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DS 

RD RR4EA38TF 752 0 0
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CTGCGACCCCTTTCGAGAGAAAAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTCCTAGGAAGAGTT
CTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGATTTTGGATCTGAC
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TTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCC
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AACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGATCTGTTCTATTCTCTTCCAC
ACACGTTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTC
TTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAATTCTAGACTTGGCCACGATTCTTTTCTATTTCT
CTTCTAGTTTTTATTTATTTTTGAGATCTAAG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4EH56JQ 441 0 0
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GCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGATTACGACCTCCTCAAAGAGCAGCAACCT
GAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGATCTGTTCTATTTTCTTCCACACACG
TTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTCCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTCTTCCT
GACAACTTTTTTTACTGTAGAATTCTAGACTTGGCCACGATTCTTTTCTATTTCTCTTCT
AGTTTTTATTTATTTTTGAGA

QA 1 441 1 441
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4DI64JQ U 1
AF RR4H750JQB U 181
AF RR4H750TF C 181
BS 1 519 RR4DI64JQ
BS 520 520 RR4H750JQB
BS 521 625 RR4DI64JQ
BS 626 626 RR4H750JQB
BS 627 814 RR4DI64JQ
BS 815 834 RR4H750JQB

RD RR4DI64JQ 814 0 0
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TCATCAGCCGACAATAGTCCAACTCGACAATGGTTTGTCCACGTCATCTCATCACCATTT
TAAAAGTTGATTAGTTGGTTCTGGTGTGAGTCGAGAGATTCACATAAAAGCAAGAAAGAG
GAAGAGTAACGAACACGTTTTGTACAAAACCCTAACTTTAGTTCCAAAGAAACATGTCTC
CTATACAAAAAGAAACTTCAAGCTCAAGTCACTGTGTCAGTAATCAGTATCATAACTTCC
AACTTGTGCAGATCAGGATATGTCTTTAATATTCTCTAACTCGTTTCTTAGTAGCCCCAG
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GTTCCTCAATTTGTAACTGCAGTGTTCTTTGGACCTCAAGTTGCTCGTGGAGTTTTTTCT
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TCAGCCCTGGGCTATTGATGAGCTTCAGTACAGC

QA 1 814 1 814
DS 

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GG
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QA 3 654 3 654
DS 

RD RR4H750TF 654 0 0
GG
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ATACAAAAAGAAACTTCAAGCTCAAGTCACTGTGTCAGTAATCAGTATCATAACTTCCAA
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AAAGATCCGCTCTGATCCAGTGTGCTAGAACCACTCTGCAGTTTCTGCGAAAGGTTTGTT
GATGGAGCTGAAGTGTTGTCGGCTTCTGGCATTGATGATGAGCCAGAAGAAGAGCCAATT
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TCCTCAATTTGTAACTGCAGTGTTCTTTGGACCTCAAGTTGCTCGTGGAGTTTTTTCTGA
ACTTCCATCTGTAACCGTAGAGCCTCAGTGATTTCAATGCTCGTCTTCAAGTCAATAGAT
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AGCCCTGGGCTATTGATGAGCTTCAGTACAGCCTTAGGTGTGGCTCGTTCGC

QA 3 654 3 654
DS 



AS 1 3

CO CL4235Contig1 457 3 1 U
GGAGCCAAAGCAATTCTCTGTGGCCGTGCACTCGAGCGTTGGAGCGAACGCGTACAAGCC
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AGAAGAGAGTGGGACGGTGATGTATCAGACGTTTGAGAAGTTTGGCAAGTACTGTGGATC
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TGTGTTTCGTACTTTATAAGTTTGGGTTTTATTATATTAAAGACTATTATGTTTGCTATT
ATGGTTTACACTTTCGTACAAGTACTCTGTCTTTTCG


BQ
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AF RR4BX94TF U 102
AF RR4F844JQ C 1
AF RR4F844TF U 1
BS 1 457 RR4F844TF

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ATGGTTTACACTTTCGTACAAGTACTCTGTCTTTTCG

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AGAAGAGAGTGGGACGGTGATGTATCAGACGTTTGAGAAGTTTGGCAAGTACTGTGGATC
GCCTAGATCTACCTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAATAGCTGCAGCAGCGAGGACGA
GAAGGACGAGGGAATCTAGCAGAACTATTTATGAGCCTTCTGTTTTATGCATCTTTTCTT
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TGTGTTTCGTACTTTATAAGTTTGGGTTTTATTATATTAAAGACTATTATGTTTGCTATT
ATGGTTTACACTTTCGTACAAGTACTCTGTCTTTTCG

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 3

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TTCGACACAACCATCTCTGAAAGATGCTTCTCCGCCTCCTCAATACTTAGGCATAGAAGC
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BQ
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AF RR4C069JQ U 1
AF RR4EA25JQ U 26
AF RR4C069TF C 379
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AAA

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QA 10 327 10 327
DS 



AS 1 3

CO CL4237Contig1 806 3 1 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A287TFB C 433
AF RR4A287JQD U 1
AF RR4A287JQ U 1
BS 1 806 RR4A287JQ

RD RR4A287TFB 281 0 0
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GACATCAAAGAGAGCTTTTTATGACCAAAAAGTATCCATCAACAGATGAGATCAAGATTT
TGTGAACACATTGTGTTATGTACATTCTCTCAACATTCAA
A

QA 1 280 1 280
DS 

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TTTCACTGATTGAAATTGTGTTTTTGGTTTGCTGTTTTCTCAAAAGTTATGAATAAAAAT
GTCAAAATTGTTTGGATACTCATGAGAAATCATTTAGTTATTAACATAATAAATTCTCTA
ACGTTGCAGCTACATTTGCATGAAATTTAGTTAACATCGAGGTGAAAATCCTATAACAAT
GGTTATGTGAATATGGTGACTAAAAGAACTATACTATCAAAAGAAGTTTATGTGAATATA
TAAGTAGTTGGAGAAGCAACAATTTACAAAACATTTTCTGTATTATGGAATCAGATTGAG
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TACTTGAAAACTAGTT

QA 1 736 1 736
DS 

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GAATGAAAGTTTCTTTCATTTACTGGTAGAATTATCATTTACGGTTTTCTTGTAACTGAA
GCCGTGAATCTTTAACTCTCAAGACTAAGCTATTTGGTATATATGCAGGATGTGGCTGGA
ACATACAGAGCAAATACACTTCCAGCTTTTGTTTTTGTGAAGAGAGGAGAAGAGATTGAT
AGGGTTGTTGGAGCCAAACCTGATGAACTTGTGTACAAGATTGAAACGCATAGGGTTTAA
GTTTTGTTTATTTTTAATTTGAAGAACGAAAGATTATACATTTGAGTGTTTGTGTGTGTG
TTTCACTGATTGAAATTGTGTTTTTGGTTTGCTGTTTTCTCAAAAGTTATGAATAAAAAT
GTCAAAATTGTTTGGATACTCATGAGAAATCATTTAGTTATTAACATAATAAATTCTCTA
ACGTTGCAGCTACATTTGCATGAAATTTAGTTAACATCGAGGTGAAAATCCTATAACAAT
GGTTATGTGAATATGGTGACTAAAAGAACTATACTATCAAAAGAAGTTTATGTGAATATA
TAAGTAGTTGGAGAAGCAACAATTTACAAAACATTTTCTGTATTATGGAATCAGATTGAG
AATACGTATCATGACATCAAAGAGAGCTTTTTATGACCAAAAAGTATCCATCAACAGATG
AGATCAAGATTTTGTGAACACATTGTGTTATGTACATTCTCTCAACATTCAAGAACCTTT
TACTTGAAAACTAGTTGCAGAACATTCAACTCCATTTCCACCAAGAACTCTCTTAAGATC
TGTCTTCTGTTCCGATGTTAGCCTCG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 3

CO CL4238Contig1 887 3 8 U
AGCAGTTGAAATGTCCTTGATTAACTATTTAACTCTCAACAAGAGAACTATCTATCTCCA
ACAGTTCACTTCATTAGAAACAAAGAGCGGCAAAGATACAACTAGGAAAGTCAACAGCAA
CTACATAACTATTTGTTTTTAACCAAAAAAAGTAGTATTATAAAAGGGTCTACATCTTTG
AGGAGTCTATAAAA*TGAACTTGTCTATGAGATTTCTACTTCTTGGCGATATTGAGATCA
ATGTGTACATACGCAAGAGAAGCCACAAAGACGAAGAAGAATGCCGATACAAGCATGAAC
GGTTCCGCAAGCATGTATATTGGTTTGAACGTATAGTACACCTGGAAGGGTACGTTGTGA
GTGGGAACTACATTATCCTTTTGCAACACAACCACGGTTCTTCCCACGATGTCAAGGTAT
GAGTATTTGACCTGTAAGTCTTGATTGACTGTGAAGGGCAAAACAGCAGAAGGGTCCTTT
GATCCTTCAGGAAGCACGACTTTGATAGTCAACTTGTTAACTATAGTTTCAACGAGGGGG
CAGCCAAAGGTAAAGTTCAAGTAACGTCTGCCATCAGGTGATTCAAAGAGATAGTCCTCC
AATGGAACTCGATAGCCGATGATAAATGTTGCTCTCCACCCTCCAAATAACGGGTATTGC
GGTTCAAATTCAAGTTCTGACTTCTTAAAGCCAGTACGCAAATGCGAAGTTGAGATGTTT
CCAATGTCATCCCTGTAGTAAACAGAGTTAACTCTGGGAGGAAGCACTGCAAGGAGCGCA
TTGAAAGAGGATGAACCACTGATGGAACGTCTAGACTGATAATCAACCCTAGAGAAGACG
CCCTTATGACGAGCTCCCCCATGAGTCAACCTATAATTCTCCGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E048TF C 168
AF RR4EY04JQ U 1
AF RR4B139JQ U 54
BS 1 278 RR4EY04JQ
BS 279 279 RR4B139JQ
BS 280 468 RR4EY04JQ
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BS 481 785 RR4EY04JQ
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RD RR4E048TF 567 0 0
TA
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TATTGAGATCGATGTGTACATAAGCAAGAGAAGCCACAAAGACGAAGAAGAATGCCGATA
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AAGGGTCCTTTGATCCTTCAGGAAGCACGACTTTGATAGTCAACTTGTTAACTATAGTTT
CAACGAGGGGGCAGCCAAAGGTAAAGTTCAAGTAACGTCTGCCATCAGGTGATTCAAAGA
GATAGTCCTCCAAAGGAACTCGATAGCCGATGATAAATGTTGCTCTCCACCCTCCAAATA
ACGGGTATCTCGGTTCAAATTCAAGTTCTGACTTCTTAAAGCCAGTACGCAAATGCGAAG
TTGAGATGTTTCCAATGTCATCCC
C

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR4EY04JQ 785 0 0
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CTACATAACTATTTGTTTTTAACCAAAAAAAGTAGTATTATAAAAGGGTCTACATCTTTG
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ATGTGTACATACGCAAGAGAAGCCACAAAGACGAAGAAAAATGCCGATACAAGCATGAAC
GGTTCCGCAAGCATGTATATTGGTTTGAACGTATAGTACACCTGGAAGGGTACGTTGTGA
GTGGGAACTACATTATCCTTTTGCAACACAACCACGGTTCTTCCCACGATGTCAAGGTAT
GAGTATTTGACCTGTAAGTCTTGATTGACTGTGAAGGGCAAAACAGCAAAAGGGTCCTT*
GATCCTTCAGGAAGCACGACTTTGATAGTCAACTTGTTAACTATAGTTTCAACGAGGGGG
CAGCCAAAGGTAAAGTTCAAGTAACGTCTGCCATCAGGTGATTCAAAGAGATAGTCCTCC
AATGGAACTCGATAGCCGATGATAAATGTTGCTCTCCACCCTCCAAATAACGGGTATTGC
GGTTCAAATTCAAGTTCTGACTTCTTAAAGCCAGTACGCAAATGCGAAGTTGAGATGTTT
CCAATGTCATCCCTGTAGTAAACAGAGTTAACTCTGGGAGGAAGCACTGCAAGGAGCGCA
TTGAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4B139JQ 834 0 0
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ACAGCAACTACATAATTATTTGTTTTTAACCAAAAAAAGTAGTATTATAAAAGGGTCTAC
ATCTTTGAGGAGTCTATAAAA*TGAACTTGTCTATGAGATTTCTACTTCTTGGCGATATT
GAGATCAATGTGTACATACGCAAGAGAAGCCACAAAGACGAAGAAGAATGCCGATACAAG
CATGAACGGTTCCGCAAGCATGTATATTGGTTTGAACGTATAGTACACCTGGAAGGGTAC
GTTGTGAGTGGGAACTACATTATCCTTTTGCAACACAACCACGGTTCTTCCCAAGATGTC
AAGGTATGAGTATTTGACCTGTAAGTCTTGATTGACTGTGAAGGGCAAAACAGCAGAAGG
GTCCTTTGATCCTTCAGGAAGCACGACTTTGATAGTCAACTTGTTAACTATAGTTTCAAC
GAGGGGGCAGCCAAAGGTAAAGTTCAAGTAACGTCTGCCATCAGGTGATTCAAAGAGATA
GTCCTCCAATGGAACTCGATAGCCGATGATAAATGTTGCTCTCCACCCTCCAAATAACGG
GTATTGCGGTTCAAATTCAAGTTCTGACTTCTTAAAGCCAGTACGCAAATGCGAAGTTGA
GATGTTTCCAATGTCATCCCTGTAGTAAACAGAGTTAACTCTGGGAGGAAGCACTGCAAG
GAGCGCATTGAAAGAGGATGAACCACTGATGGAACGTCTAGACTGATAATCAACCCTAGA
GAAGACGCCCTTATGACGAGCTCCCCCATGAGTCAACCTATAATTCTCCGTTAT

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 3

CO CL4239Contig1 1032 3 3 U
GATACAAATAAGAATTTATTAAGAATTTATTCAAAGACCAAACCGGGATCTTAACCCGGA
ACCCGGTTTGTTACAACATGAAATTAGCAGGGACAAAACAAAAACAACAAAAGAAACAAC
AGAACAATACAATAGAAACAAAGAAAACAACAATGAGAAGCACTTCATCTCTGGATCTAA
AATCACACAGAGTCCAGAGATTATTATTCATACGAACAAACAAAGCTTGATGAGGAATAA
CAACAACAGATTCTTTTACAGACTCAGCAGCATACCCTTTTCACTCCTTCAGTAGATTCC
TCGAGAAAATCCTCTTGCAGTAAGGATTATTACGCAGAATCGAATGTGGCCTTATCACTT
CCACTAGTGACGCATGGAGTGGACCCTTTGTGGCGGCAAGAGCGGCTTGGACGACAAAGT
TGGCGTAAGGGTCTTGAAGAAGGTGATCAAAGTGAGGAACGGAGACAAGCTCACGTACTA
TCTGTGGACGACTCTCTGGACAATGCATGAGACATCTTTCCACCATGTGGCTACTGAACT
TCTGCATGGATAACTGAACGTAATGCCCTTTTAACTGAGCTAGCATCATCGCTACCGCTG
AAGGTATCCTCAGTTCTATAACGAACTGCACTGCATAGTTCCCAAAGGGGTCTTGAGCAA
GAAGGAGACTGTTTCTAGAGATTTCAGCGATCAGCTTCTCTCGTTGTTGCCTCATTGAAT
AAGCAATGCATTTTTGTAGCACACAGCATCCATGTCGATGTGTTGCAATCTCAGTACAGA
ACTTTGTCGCTGCGTCAAAGATAAACTTGTTATCTTCAGTGCCAAGGCACTGCAAGCAAC
GTTGGATCACATGGTTCCCATTCAAATCCTTGATCAAATCAAGAAAACCAGGTCTCAACG
CTGACTTCACCATAGAAACCTGCTTCCCTGTTCTGATTGTTTCCACTAATCTCTGAACAA
CTCGAGTACCGTAGGCATTGAGAGATATCCTGATAAGTTGACCAGGCTCAGCAGTTGCAA
CGAGCACGATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D604JQ U 1
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AF RR4D812TF C 312
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DS 

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AATCACACAGAGTCCAGAGATTATTATTCATACGAACAAACAAAGCTTGATGAGGAATAA
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TCGAGAAAATCCTCTTGCAGTAAGGATTATTACGCAGAATCGAATGTGGCCTTATCACTT
CCACTAGTGACGCATGGAGTGGACCCTTTGTGGCGGCAAGAGCGGCTTGGACGACAAAGT
TGGCGTAAGGGTCTTGAAGAAGGTGATCAAAGTGAGGAACGGAGACAAGCTCACGTACTA
TCTGTGGACGACTCTCTGGACAATGCATGAGACATCTTTCCACCATGTGGCTACTGAACT
TCTGCATGGATAACTGAACGTAATGCCCTTTTAACTGAGCTAGCATCATCGCTACCGCTG
AAGGTATCCTCAGTTCTATAACGAACTGCACTGCATAGTTCCCAAAGGGGTCTTGAGCAA
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QA 1 813 1 813
DS 

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CATTGAGAGATATCCTGATAAGTTGACCAGGCTCAGCAGTTGCAACGAGCACGATCC

QA 5 721 5 721
DS 



AS 1 3

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CTGTGTTTTTGTTCACATTTTAGTCACAAACACAATAACAGTTCGTCTCTTTCTTTGTTT
TGTTATGTTACGATACATGGTGTGGTTGTTGACCAACTCTTTATAATACACAGTCTGTTC
AATCT


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4FD21TF U 1
AF RR4ET37TF U 1
AF RR4FD21JQ C 629
BS 1 653 RR4ET37TF
BS 654 654 RR4FD21TF
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BS 795 795 RR4FD21JQ
BS 796 799 RR4ET37TF
BS 800 800 RR4FD21JQ
BS 801 818 RR4ET37TF
BS 819 1385 RR4FD21JQ

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TCGAGAGTATCGGGAGCGGTTGTTG

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DS 

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AGTATATCCTCTAGATGGTGAGTTTGCAAAACCGTTATGGGTTTTCGGTACAAACTCCTA
CGAAATAATCGAGTGCTCTGAAGAGAAGAACCTAATTGCATGTAGCTACAGGCAGAAAGG
AAAGTCATATCTTGGCATTTTGGATGATTCGAAGGGTTCATGTTCTCTGCTTGATATTCC
TTTAACTGATTATGATAACATTACATTGGGTAATCAATGCCTTTATGTTGAGGGATCGTC
AGCAGTTCTTCCACCATCAGTTGCCAAGGTAACACTGGATCAGCATAAGATGAAAGCACT
CAGTTCTGAGATTGTTTGGTCTTCTTCCCCCGATGTTTTAAAGTACAAGTCTTTCCTCAG
CGTGCCATATTTGATTGAATTTCCAACAGAGGTTCCTGGTCAAAACGCTTATGCTTACTT
TTATCCTCCAACCAATCCGCTCTACAATGCTAGCATAGAGGAGAAACCTCCATTACTAGT
GAAGAGTCACGGAGGCCCTACTGCTGAATCACGTGGATCCTTAAACCTGAGTATCCAGTA
CTGGACAAGTCGAGGGTGGGCATTTGTTGATGTCAATTATGGTGGAAGCACAGTT*ATGG
TCGAGAGTATCGGGAGCGGTTGTTGCGTAG*TGGGGGATTGTTGACGTGGATGACTGTTG
TGGATGTGCTAA*TACTTGGTATCTTCTGGAAAG*CAGATGTTAAGCG*CTCTGTATATC
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GGC

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DS 

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GGAAAGGCAGATGTTAAGCGGCTCTGTATATCTGGAGGTTCTGCAGGAGGTTACACAGCT
CTTACAGCATTGGCATTAAGAGATGTCTTCAAGGCTGGAGCGTCTTTATACGGGGTGGCT
GACTTAAAAATGCTGAAAGAAGAAGGTCATAAGTTTGAATCCCGCTATATCGACAATCTT
GTTGGAGAAGAAAAGGATTTCTATGAGAGATCACCAATCAACTTCGTCGATAGGTTCTCT
TGCCCCATCATCCTTTTCCAAGGATTGGAAGACAAGATTGTAAACCCGGATCAAACTCGT
AAAATCTATCGGGCACTGAAGGAAAAAGGTGTGCCTGTTGCCCTTGTCGAGTACGAAGGA
GAAGAACACGGTTTTCGTAAGGCAGAGAACATCAAATACACACTGGAGCAACAAATGGTG
TTCTTTGCCCGAGTCGTGGGAGGATTCCAAGTTGCAGATGACATCACTCCTCTGAAAATT
GACAACTTCGACACTTCCAGTGATGTTTAGGTCTGTGTTTTTGTTCACATTTTAGTCACA
AACACAATAACAGTTCGTCTCTTTCTTTGTTTTGTTATGTTACGATACATGGTGTGGTTG
TTGACCAACTCTTTATAATACACAGTCTGTTCAATCT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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TGCGATTGAATCTTCGGTGACAGGCGTGTGGTGCCTCCTTTAGCACCACCGCCGGTCTAG
TTTGCTTTCTTTAGCTTTCTAGTGTGTATTTTATGTTTTTTAAGCTTTGGATGTGGATCA
GGCAGATGGGAGGACTCAGATCTAACATTTCATCTATGGTCATACTTGTCGGGATGGTCA
TGGGCTGTCTGGTTGGTGTCCGTCATCGGTGAATCGCGGTGGTATCTACTGGTTTCGTGC
TGCTGATTTTCCTTCGTTCGATTTGGGTGGTAAAAGTGAAGGATTCATACTTCGTGGTGG
CTTTGCGTTGGTCTTGGACTAAATGGTTGGGTCCGGGGCCGGTGAAGTGCGCCGATCTCC
TCTCCCCATGAGTTTCTCCTGTTTGCGGTCCCTTCCTCGTAGCTAGTTTATCATGATGTA
GTTGATGGTTTGGGCCCTTTCTATCTTTGATTAGAGTAGAGATGGTTATCTCTAGTCTCT
GTTCAGCAACGGTACAGCAGTGGCGTGATGATGCGTTTGTGAGCAGAACAGAGCTAGCAA
TTGGTTGACAAGTTTTGTTTTGTTACCTCTCCATTTCCAGTTGTGAAGGAGTCCTCTCTG
CATCTTTCAATAAGATTCCTTCATGCTCCTGGTGTGTTTGCTGATCTCATTAGTCTTCGG
TGGCTTCTTCTTGGTTATTAGAAGCAATATAATGAGGTTGAGGTTTTGGTTCAATCGGAT
GAAGATGCAGTTGTGTTGGAGGGTTTAGCCCAGGTGCTTCTGTTCTTTGTGGTTCTTGTT
AGTGTGGTCAGTGTTGTGGGTGTTGTGCTATTATGCGTGTTCTGGCTCTTCATCGTGGAC
GGGAGGGTCCAGGTGAGTTTCTGTTTGGATTTTACATCTTGCTGCTTGCTCGCTTGGCTG
GTGCCTGGTGGTGTAACATAGCAAGACATCCGGCTGATTTAGACGGAGGACTATCTATCT
TTGGTTGATCGTATGTGGGTTTTAGCTGTAGAAATCAACTTTCGTTTTAGTTAGGTCTCA
AATTATGTTTCGATCTGCTTGTATGCTACCTTGTTTGGGTTGTAGCTTCCCTCCGATGGG
CTCTGTTTCCAGGGATTTCAATGTGTTCCGCCGGCTTATATATGTCATTATGTATTTTAT
TTAGTGTTTAATATAATTCAGTTGACGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX67TF U 1
AF RR4DX67JQ C 460
BS 1 648 RR4DX67TF
BS 649 649 RR4DX67JQ
BS 650 666 RR4DX67TF
BS 667 1229 RR4DX67JQ

RD RR4DX67TF 666 0 0
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TGCGATTGAATCTTCGGTGACAGGCGTGTGGTGCCTCCTTTAGCACCACCGCCGGTCTAG
TTTGCTTTCTTTAGCTTTCTAGTGTGTATTTTATGTTTTTTAAGCTTTGGATGTGGATCA
GGCAGATGGGAGGACTCAGATCTAACATTTCATCTATGGTCATACTTGTCGGGATGGTCA
TGGGCTGTCTGGTTGGTGTCCGTCATCGGTGAATCGCGGTGGTATCTACTGGTTTCGTGC
TGCTGATTTTCCTTCGTTCGATTTGGGTGGTAAAAGTGAAGGATTCATACTTCGTGGTGG
CTTTGCGTTGGTCTTGGACTAAATGGTTGGGTCCGGGGCCGGTGAAGTGCGCCGATCTCC
TCTCCCCATGAGTTTCTCCTGTTTGCGGTCCCTTCCTCGTAGCTAGTTTATCATGATGTA
GTTGATGGTTTGGGCCCTTTCTATCTTTGATTAGAGTAGAGATGGTTATCTCTAGTCTCT
GTTCAGCAACGGTACAGCAGTGGCGTGATGATGCGTTTGTGAGCAGAACAGAGCTAGCAA
TTGGTTGACAAGTTTTGTTTTGTTACCTCTCCATTTCCAGTTGTGAAG*AGTCCTCTCTG
CATCTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4DX67JQ 770 0 0
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AGATGGTTATCTCTAGTCTCTGTTCAGCAACGGTACAGCAGTGGCGTGATGATGCGTTTG
TGAGCAGAACAGAGCTAGCAATTGGTTGACAAGTTTTGTTTTGTTACCTCTCCATTTCCA
GTTGTGAAGGAGTCCTCTCTGCATCTTTCAATAAGATTCCTTCATGCTCCTGGTGTGTTT
GCTGATCTCATTAGTCTTCGGTGGCTTCTTCTTGGTTATTAGAAGCAATATAATGAGGTT
GAGGTTTTGGTTCAATCGGATGAAGATGCAGTTGTGTTGGAGGGTTTAGCCCAGGTGCTT
CTGTTCTTTGTGGTTCTTGTTAGTGTGGTCAGTGTTGTGGGTGTTGTGCTATTATGCGTG
TTCTGGCTCTTCATCGTGGACGGGAGGGTCCAGGTGAGTTTCTGTTTGGATTTTACATCT
TGCTGCTTGCTCGCTTGGCTGGTGCCTGGTGGTGTAACATAGCAAGACATCCGGCTGATT
TAGACGGAGGACTATCTATCTTTGGTTGATCGTATGTGGGTTTTAGCTGTAGAAATCAAC
TTTCGTTTTAGTTAGGTCTCAAATTATGTTTCGATCTGCTTGTATGCTACCTTGTTTGGG
TTGTAGCTTCCCTCCGATGGGCTCTGTTTCCAGGGATTTCAATGTGTTCCGCCGGCTTAT
ATATGTCATTATGTATTTTATTTAGTGTTTAATATAATTCAGTTGACGGG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL4242Contig1 833 2 9 U
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CCAGGTTTCTCAGAACCATGTGCAGCAGCAGCAGCAGCGACAACTCCAGACCCACTAAGA
TCCAAGAACTCAACGTGTACGAGTTCAACGAAGGCGACCGAAACAGCCCCGCGGTTCTAA
AACTCGGCAAGAACCCACAACAGCTCTGCATCGGCGACCTCGTCCCTTTCACGAACAAAC
TCTACACCGGAGACCTCAAGAAACGCGTCGGGATCACCGCGGGACTCTGCGTTTTGATCC
AGCACGTTCCCGAGAAGAAAGGCGACCGCTTCGAAGCTTCTTACAGCTTCTACTTCGGAG
AGTACGGTCACATTTCCGTTCAGGGACCTTACCTGACTTACGAGGACACGTACCTCGCCA
TCACCGGTGGCTCCGGAGTCTTCGAAGGTGCCTACGGACAGGTCAGGCTTCGTCAGCTTG
TGTATCCGACCAAGCTGTTCTACACTTTTTACTTGAAAGGTGTTGCCTCTGATTTGCCTG
TGGAGCTCACCGGAAAACATGTTGAGCCGTCGAAGGATGTGAAGCCGGCGGCGGAAGCTC
AGGCGGCTCAGCACGGCGCCACTATCCTAAACTTTACCGAGTAAAAAAATCATTTGCGTC
GTTGAGCTTTCTCTGTTTGTTTTCTCTTGGATCTTAATGGGTCTGTTTAATGGGCCTAAA
TAATGGGCTTTTAAATAATGAGCCGCTTTTCGTAAATCTATCGTGTGTCAAGCAATAGCT
GGTTATGGCCTGTGAACCCTTTGCTAAATAATTTCAAGACATTGGCATATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GG
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AGGCGACCGCTTCGAAGCTTCTTACAGCTTCTACTTCGGAGAGTACGGTCACTTTTCCGT
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CTACACTTTTTACTTGAAAGGTGTTGCCTCTGATTTGCCTGTGGAGCTCACCGGAAAACA
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TTTTCTCTTGGATCTTAATGGGTCTGTTTAATGGGCCTAAATAATGGGCTTTTA

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DS 

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AACTCGGCAAGAACCCACAACAGCTCTGCATCGGCGACCTCGTCCCTTTCACGAACAAAC
TCTACACCGGAGACCTCAAGAAACGCGTCGGGATCACCGCGGGACTCTGCGTTTTGATCC
AGCACGTTCCCGAGAAGAAAGGCGACCGCTTCGAAGCTTCTTACAGCTTCTACTTCGGAG
AGTACGGTCACATTTCCGTTCAGGGACCTTACCTGACTTACGAGGACACGTACCTCGCCA
TCACCGGTGGCTCCGGAGTCTTCGAAGGTGCCTACGGACAGGTCAGGCTTCGTCAGCTTG
TGTATCCGACCAAGCTGTTCTACACTTTTTACTTGAAAGGTGTTGCCTCTGATTTGCCTG
TGGAGCTCACCGGAAAACATGTTGAGCCGTCGAAGGATGTGAAGCCGGCGGCGGAAGCTC
AGGCGGCTCAGCACGGCGCCACTATCCTAAACTTTACCGAGTAAAAAAATCATTTGCGTC
GTTGAGCTTTCTCTGTTTGTTTTCTCTTGGATCTTAATGGGTCTGTTTAATGGGCCTAAA
TAATGGGCTTTTAAATAATGAGCCGCTTTTCGTAAATCTATCGTGTGTCAAGCAATAGCT
GGTTATGGCCTGTGAACCCTTTGCTAAATAATTTCAAGACATTGGCATATACC

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DS 



AS 1 3

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GTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGGACACAGTCGCAAATCTTTGGACCTGTTTTCATATCT
TGTCCATTTTGACCTGTGTTGATTATTACTCTTTTAACTCTTGTTGCTGTTTAAGCCATG
GAAGCTCAAATTTTGCAATCTTCTTCTCGCTGCTTCATCAATCGATACCGTTTCTCCTCC
GTTTCATCATCTCCGAAGCCTCTCTCCGTCAACTTTCCTCATAAAACGAGAACAACAACA
ACAAGTGTTTTATCCTTGTCCAAGAAAGATGACAACACCGAGAGTCTCAGTTACAAGGGT
TCAGGTGTTGATATCGATGCCGGGACTGAGCTCGTTAGAAGAATCGCGAAGATGGCTCCT
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ATCGACTTGGTTGCTATGAGTGTGAATGATATTGTTACTTCCGGTGCAAAGCCTCTGTTT
TTCCTTGATTACTTTGCTACTAGCCGTCTTGATGTAGACCTTGCAGAGAAAGTTATTAAA
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AGAAAGATTCTGTTATAAACGGGAAAAACATTGTCGCTGGAGATGTACTTATTGGCCTCC
CATCTAGCGGTGTTCATTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAAAGGTCGTGGCTCGAAGCG
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CACCCACTGTCATTTATGTGAAGCAGGTACTTGACATAATTAGCAGAGGAGGAGTGAAAG
GGATAGCTCATATAACAGGTGGAGGTTTCACAGACAACATTCCCCGTGTCTTCCCTGATG
GTTTGGGTGCTGTTATCCACACTGATGCTTGGGAACTTCCACCTTTGTTCAAATGGATCC
AACAGTCTGGGAGAATAGAAGACAGTGAGATGCGAAGGACGTTTAACCTGGGAATAGGGA
TGGTGATGGTGGTTAGTCCAGAGGCTGCCTTGAGAATACTTGGAGAAGCCAAGAATGGAG
ACTATGTTGCATATCGCATTGGAGAGGTTATCAATGGTGAAGGCGTTACCTATCAATAAG
ACCGTGTTTGTGTTTTCTACCAATCACTATTTTGTTCTCAATAAGACCATGCGAATTGTG
TTTTCAGAGTTTGTGTCGGAGATGGGACAGAGGACCTCTTTGTTTCCCATGTTTCAAATC
CATTTTTGTTATCCTTTCGGTTTTGCATCAATGTGGGTTTATAATGAGATTGATAATTAT
GAAGTGTCGTGAATAATAC


BQ
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TCTCTCGGGACACAGTCGCAAATCTTTGGACCTGTTTTCATATCTTGTCCATTTTGACCT
GTGTTGATTATTACTCTTTTAACTCTTGTTGCTGTTTAAGCCATGGAAGCTCAAATTTTG
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AAGCCTCTCTCCGTCAACTTTCCTCATAAAACGAGAACAACAACAACAAGTGTTTTATCC
TTGTCCAAGAAAGATGACAACACCGAGAGTCTCAGTTACAAGGGTTCAGGTGTTGATATC
GATGCCGGGACTGAGCTCGTTAGAAGAATCGCGAAGATGGCTCCTGGAATCGGTGGATTC
GGTGGTCTCTTTCCGTTAGGTGATTCTTATCTCGTAGCTGGTACAGATGGTGTAGGGACT
AAACTTAAGTTGGCCTTTGAGTCTGGAATCCATCACACCATTGGAATCGACTTGGTTGCT
ATGAGTGTGAATGATATTGTTACTTCCGGTGCAAAGCCTCTGTTTTTCCTTGATTACTTT
GCTACTAGCCGTCTTGATGTAGACCTTGCAGAGCA*GTTATTAAAGG*ATTGTTGATGGT
TGTGGTCAATCAGACTGTGCTCTCTTAGTGGAGAGACTGCAGAGATGC*AGACTTT*ACG
CAGAGGGG*AGTACGATCTCAGTGGGTT

QA 1 748 1 748
DS 

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GTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGGACACAGTCGCAAATCTTTGGACCTGTTTTCATATCT
TGTCCATTT*GACCTGTGTTGATTATTACTCTTTTAACTCTTGTTGCTGTTTAAGCCATG
GAAGCTCAAATTTTGCAATCTTCTTCTCGCTGCTTCATCAATCGATACCGTTTCTCCTCC
GTTTCATCATCTCCGAAGCCTCTCTCCGTCAACTTTCCTCATAAAACGAGAACAACAACA
ACAAGTGTTTTATCCTTGTCCAAGAAAGATGACAACACCGAGAGTCTCAGTTACAAGGGT
TCAGGTGTTGATATCGATGCCGGGACTGAGCTCGTTAGAAGAATCGCGAAGATGGCTCCT
GGAATCGGTGGATTCGGTGGTCTCTTTCCGTTAGGTGATTCTTATCTCGTAGCTGGTACA
GATGGTGTAGGGACTAAACTTAAGTTGGCCTTTGAGTCTGGAATCCATCACACCATTGGC
ATCGACTTGGTTGCTATGAGTGTGAATGATATTGTTACTTCCGGTGCAAAGCCTCTGTTT
TTCCTTGATTACTTTGCTACTAGCCGTCTTGATGTAGACCTTGCAGAGAAAGTTATTAAA
GGGATTGTTGATGGTTGTGGTCAATCAGACTGTGCTCTCTTAGTGGAGAGACTGCAGAGA
TGCCAGACTTTTACGCAGAGGGGGAGTACGATCTCAGTGGGTT*GCAGTTGGGATAGTGA
AGAAAGATTCTGT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4EM91JQ 822 0 0
TCTAG
GTGGAGAGACTGCAGAGATGCCAGACTTT*ACGCAGAGGGG*AGTACGATCTCAGTGGGT
TTGCAGTTGGGATAGTGAAGAAAGATTCTGTTATAAACGGGAAAAACATTGTCGCTGGAG
ATGTACTTATTGGCCTCCCATCTAGCGGTGTTCATTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAA
AGGTCGTGGCTCGAAGCGGTCTTTCGCTGAAAGATGAACTTCCAGGTGGATCAACTACTC
TGGGAGAAGCTTTAATGGCACCCACTGTCATTTATGTGAAGCAGGTACTTGACATAATTA
GCAGAGGAGGAGTGAAAGGGATAGCTCATATAACAGGTGGAGGTTTCACAGACAACATTC
CCCGTGTCTTCCCTGATGGTTTGGGTGCTGTTATCCACACTGATGCTTGGGAACTTCCAC
CTTTGTTCAAATGGATCCAACAGTCTGGGAGAATAGAAGACAGTGAGATGCGAAGGACGT
TTAACCTGGGAATAGGGATGGTGATGGTGGTTAGTCCAGAGGCTGCCTTGAGAATACTTG
GAGAAGCCAAGAATGGAGACTATGTTGCATATCGCATTGGAGAGGTTATCAATGGTGAAG
GCGTTACCTATCAATAAGACCGTGTTTGTGTTTTCTACCAATCACTATTTTGTTCTCAAT
AAGACCATGCGAATTGTGTTTTCAGAGTTTGTGTCGGAGATGGGACAGAGGACCTCTTTG
TTTCCCATGTTTCAAATCCATTTTTGTTATCCTTTCGGTTTTGCATCAATGTGGGTTTAT
AATGAGATTGATAATTATGAAGTGTCGTGAATAATAC

QA 6 822 6 822
DS 



AS 1 2

CO CL4244Contig1 1428 2 2 U
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AAAGGATGGTGAAGATCTGTTGTATTGGAGCTGGATACGTTGGTGGTCCAACGATGGCAG
TGATTGCACTCAAATGTCCACACGTTGAAGTAGCAGTCGTTGACATCTCTGTCCCACGTA
TCAACGCATGGAACAGTGACCAGCTTCCCATCTACGAGCCTGGCCTTGAAGACATCGTCA
AGCAGTGCAGAGGCAAGAACCTCTTCTTCAGCACCGACGTTGAGAAGCACGTCAGAGAAG
CTGACATCGTGTTCGTCTCCGTCAACACGCCCACGAAGACCACTGGTCTTGGAGCTGGGA
AAGCCGCGGATCTCACCTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTATGATTGCTGATGTGTCGGTTT
CCGACAAGATTGTGGTTGAGAAATCGACTGTGCCGGTGAAAACAGCTGAAGCCATTGAGA
AGATCTTGATGCATAACAGCAAAGGGATCAAGTTTCAGATCCTTTCGAACCCTGAGTTTC
TCGCGGAAGGGACTGCGATCGCTGATCTTTTCAACCCTGACCGTGTTCTCATCGGAGGGC
GGGAGACACCTGAAGGTTTCAAAGCTGTTCAGACGCTCAAGGAAGTGTATGCAAACTGGG
TTCCTGAGGGCCAGATCATCACGACCAACCTCTGGTCCGCCGAGCTTTCCAAGCTAGCTG
CAAACGCTTTCTTGGCTCAGAGGATCTCATCAGTCAACGCCATGTCGGCTCTGTGTGAAT
CCACAGGCGCTGATGTCACTCAAGTGGCTTACGCCGTTGGTACTGATTCAAGAATCGGTC
CCAAGTTCTTGAACGCTAGCGTTGGATTCGGAGGGTCTTGTTTCCAGAAGGACATTCTGA
ATCTGGTCTACATCTGTCAGTGCAACGGACTTCCAGAAGTTGCTGAGTACTGGAAACAAG
TGATCAAGATCAACGATTACCAGAAGAACCGGTTCGTGAACAGGATCGTCTCCTCTATGT
TCAACACCGTCTCCAACAAGAAGGTGGCGATCCTCGGATTCGCGTTCAAGAAAGACACGG
GTGACACGGGGGAGACACCAGCCATTGACGTGTGCAAAGGTTTGTTGGGAGACAAAGCGC
AGGGAGAGACCTTTCGATGAAAAAGTTCGACTGGGACCATCCACTACGCTTGCAGCCGAT
GAGCCCCACCACGGTGAAACAAGTGAGTGTGAAATGGGACGCGTATGAAGCTACTAAAGA
CGCGCATGCGGTTTGCGTTTTGACTGAGTGGGATGAGTTCAAGTCTTTGGACTACCAGAA
GATCTTTGACACATGCAGAAACCAGCTTTTATCTTCGATGGAAGAACGTTCTGATGTGGA
CAGTTGAGAGAGATCGGTTCATCGTTACTCCATTGGTAGCACTTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AY63TF U 1
AF RR4FR28TF U 656
BS 1 833 RR4AY63TF
BS 834 1428 RR4FR28TF

RD RR4AY63TF 833 0 0
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AAAGGATGGTGAAGATCTGTTGTATTGGAGCTGGATACGTTGGTGGTCCAACGATGGCAG
TGATTGCACTCAAATGTCCACACGTTGAAGTAGCAGTCGTTGACATCTCTGTCCCACGTA
TCAACGCATGGAACAGTGACCAGCTTCCCATCTACGAGCCTGGCCTTGAAGACATCGTCA
AGCAGTGCAGAGGCAAGAACCTCTTCTTCAGCACCGACGTTGAGAAGCACGTCAGAGAAG
CTGACATCGTGTTCGTCTCCGTCAACACGCCCACGAAGACCACTGGTCTTGGAGCTGGGA
AAGCCGCGGATCTCACCTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTATGATTGCTGATGTGTCGGTTT
CCGACAAGATTGTGGTTGAGAAATCGACTGTGCCGGTGAAAACAGCTGAAGCCATTGAGA
AGATCTTGATGCATAACAGCAAAGGGATCAAGTTTCAGATCCTTTCGAACCCTGAGTTTC
TCGCGGAAGGGACTGCGATCGCTGATCTTTTCAACCCTGACCGTGTTCTCATCGGAGGGC
GGGAGACACCTGAAGGTTTCAAAGCTGTTCAGACGCTCAAGGAAGTGTATGCAAACTGGG
TTCCTGAGGGCCAGATCATCACGACCAACCTCTGGTCCGCCGAGCTTTCCAAGCTAGCTG
CAAACGCTTTCTTGGCTCAGAGGATCTCATCAGTCAACGCCATGTCGGCTCTGTGTGAAT
CCACAGGCGCTGATGTCACTCAAGTGGCTTACGCCGTTGGTACTGATTCAAGA

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4FR28TF 773 0 0
GG
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CTGCAAACGCTTTCTTGGCTCAGAGGATCTCATCAGTCAACGCCATGTCGGCTCTGTGTG
AATCCACAGGCGCTGATGTCACTCAAGTGGCTTACGCCGTTGGTACTGATTCAAGAATCG
GTCCCAAGTTCTTGAACGCTAGCGTTGGATTCGGAGGGTCTTGTTTCCAGAAGGACATTC
TGAATCTGGTCTACATCTGTCAGTGCAACGGACTTCCAGAAGTTGCTGAGTACTGGAAAC
AAGTGATCAAGATCAACGATTACCAGAAGAACCGGTTCGTGAACAGGATCGTCTCCTCTA
TGTTCAACACCGTCTCCAACAAGAAGGTGGCGATCCTCGGATTCGCGTTCAAGAAAGACA
CGGGTGACACGGGGGAGACACCAGCCATTGACGTGTGCAAAGGTTTGTTGGGAGACAAAG
CGCAGGGAGAGACCTTTCGATGAAAAAGTTCGACTGGGACCATCCACTACGCTTGCAGCC
GATGAGCCCCACCACGGTGAAACAAGTGAGTGTGAAATGGGACGCGTATGAAGCTACTAA
AGACGCGCATGCGGTTTGCGTTTTGACTGAGTGGGATGAGTTCAAGTCTTTGGACTACCA
GAAGATCTTTGACACATGCAGAAACCAGCTTTTATCTTCGATGGAAGAACGTTCTGATGT
GGACAGTTGAGAGAGATCGGTTCATCGTTACTCCATTGGTAGCACTTGATG

QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 3

CO CL4245Contig1 776 3 4 U
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TTATCACCTTATGAATTAAATAAAGGTGTAAAGTAGCAACACAACAATAAGTAGATAAAA
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TCCTCCGGCAAGAAGTGTCTGTTCTTCACCCAAAGAGAGTCGGCGATAACCGGCTCATTG
TCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAGCGCATGAGTCATGTTCTTTATTTCTAGAAGAGCA
TGTCCAAAACTAGCCTCTCTATACGCTGAGTAACTCGGTTGAGGGTACGTGTAATCGTTA
GCGATTCCTTCTATGTTGCCACCATCACCAATGGTGATGTAAATTGGAGCAGATTGATCT
TTCACAGGAGAACCCAAACCATCAGTGATATTGTACTTAATGTTGGAGACACGTTCTGAT
CGCTCGTAGGCATGAACATGACCAGCAAAGACAATATCAACTTTGTTTTGGACAAACCAT
GGCTCAAACGTGACTCTCATACTTTCACCTTCCATGTAGTGATAACCGTTGCTGTTGTAC
CACGGCGAGTGAACCAGAACAATAAGCCATGGAGTCTGCTCTCTGTTTACTTTCTTCAGT
TCACTCTCGAGCCACGAGTTTTGAGGTGTGTACTTGTCAAAAGCTGAGTAAGAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CY10JQ U 25
AF RR4FQ92JQ U 1
AF RR4FQ92TF C 149
BS 1 83 RR4FQ92JQ
BS 84 84 RR4CY10JQ
BS 85 672 RR4FQ92JQ
BS 673 776 RR4FQ92TF

RD RR4CY10JQ 521 0 0
GG
AAAGAAAAAGATAACTACCGAGATGTTGGAACTCTTATCACCTTATGAATTAAATAAAGG
TGTAAAGTAGCAACACAACAATAAGTAGATAAAACGTAAAAATTAAATTAGATTAAACCT
AACAAAAGAACACGAAATACTAATCTTATTATTAAAAAGAGATGAGTAAAAAGAAAAGCT
GAAACATTCTTGAGTCGTTGAAACTTTCTATTCCTCCTCCGGCAAGAAGTGTCTGTTCTT
CCCCCAAAGAGAGTCGGCGATAACCGGCTCATTGTCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAG
CGCATGAGTCATGTTCTTTATTTCTAGAAGAGCATGTCCAAAACTAGCCTCTCTATACGC
TGAGTAACTCGGTTGAGGGTACGTGTAATCGTTAGCGATTTCTTCTATGTTGCCACCATC
ACCAATGGTGATGTAAATTGGAGCAGATTGATCTTTCACAGGAAAACCCAAACCATCAGT
GATATTGTACTTAATGTTGGAGACACGTTCTGATCGCTC

QA 3 521 3 521
DS 

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TTATCACCTTATGAATTAAATAAGGGTGTAAAGTAGCAACACAACAATAAGTAGATAAAA
CGTAAAAATTAAATTAAATTAAACCTAACAAAAGAACACGAAATACTAATCCTATTATTA
GAAAGAGATGAGTAAAAAGAAAAACTGAAACATTCTTGAGTCGTTGAAACTTTCTATTCC
TCCTCCGGCAAGAAGTGTCTGTTCTTCACCCAAAGAGAGTCGGCGATAACCGGCTCATTG
TCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAGCGCATGAGTCATGTTCTTTATTTCTAGAAGAGCA
TGTCCAAAACTAGCCTCTCTATACGCTGAGTAACTCGGTTGAGGGTACGTGTAATCGTTA
GCGATTCCTTCTATGTTGCCACCATCACCAATGGTGATGTAAATTGGAGCAGATTGATCT
TTCACAGGAGAACCCAAACCATCAGTGATATTGTACTTAATGTTGGAGACACGTTCTGAT
CGCTCGTAGGCATGAACATGACCAGCAAAGACAATATCAACTTTGTTTTGGACAAACCAT
GGCTCAAACGTGACTCTCATACTTTCACCTTCCATGTAGTGATAACCGTTGCTGTTGTAC
CACGGCGAGTGA

QA 1 672 1 672
DS 

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CAAAAGAACACGAAATACTAATCCTATTATTAGAAAGAGATGAGTAAAAAGAAAAACTGA
AACATTCTTGAGTCGTTGAAACTTTCTATTCCTCCTCCGGCAAGAAGTGTCTGTTCTTCA
CCCAAAGAGAGTCGGCGATAACCGGCTCATTGTCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAGCG
CATGAGTCATGTTCTTTATTTCTAGAAGAGCATGTCCAAAACTAGCCTCTCTATACGCTG
AGTAACTCGGTTGAGGGTACGTGTAATCGTTAGCGATTCCTTCTATGTTGCCACCATCAC
CAATGGTGATGTAAATTGGAGCAGATTGATCTTTCACAGGAGAACCCAAACCATCAGTGA
TATTGTACTTAATGTTGGAGACACGTTCTGATCGCTCGTAGGCATGAACATGACCAGCAA
AGACAATATCAACTTTGTTTTGGACAAACCATGGCTCAAACGTGACTCTCATACTTTCAC
CTTCCATGTAGTGATAACCGTTGCTGTTGTACCACGGCGAGTGAACCAGAACAATAAGCC
ATGGAGTCTGCTCTCTGTTTACTTTCTTCAGTTCACTCTCGAGCCACGAGTTTTGAGGTG
TGTACTTGTCAAAAGCTGAGTAAGAGGC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

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GAATCTTGTTATTTTGTTAATAATATAGGTTGCTGTGGCACACACAATTGGTCACGTGGC
TGCAACGGTGAGCATGTCAAAGGTTGCGGTTTCCTTCACACACATCATCAAGAGTGGTGA
ACCAGCGTTTAGCGTTCTTGTCTCCAGATTCCTTTTGGGTGAAACTTTTCCTGCTTCCGT
TTACCTCTCACTTATTCCCATCATCGGTGGTTGTGCTCTCTCTGCTCTTACCGAGCTTAA
CTTCAACATGATTGGTTTCATGGGAGCGATGATCTCGAACTTGGCATTCGTGTTCCGTAA
CATCTTCTCAAAGAAGGGAATGAAGGGAAGGTCTGTGAGCGGAATGAACTACTACGCTTG
TCTCTCAATGTTATCTCTCTTGATCCTTACGCCCTTTGCAATTGCGGTTGAAGGACCTCA
GATGTGGATCGATGGCTGGCAAAAGGCTCTCTCCGACATCGGACCTCAGTTTGTCTGGTG
GGTGGCTGCGCAGAGTGTGTTCTATCACCTCTACAACCAGGTGTCTTACATGTCTTTAGA
CCAAATCTCTCCCTTGACGTTTAGTGTGGGTAACACCATGAAGCGTATCTCAGTCATCGT
CTCCTCCATCATTATCTTCCGCACTCCTGTCCGGCCCGTTAACGCTCTCGGAGCTGCCAT
TGCTATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4F658TF U 1
AF RR4FD38TF U 32
BS 1 693 RR4F658TF
BS 694 694 RR4FD38TF
BS 695 729 RR4F658TF

RD RR4F658TF 729 0 0
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GAATCTTGTTATTTTGTTAATAATATAGGTTGCTGTGGCACACACAATTGGTCACGTGGC
TGCAACGGTGAGCATGTCAAAGGTTGCGGTTTCCTTCACACACATCATCAAGAGTGGTGA
ACCAGCGTTTAGCGTTCTTGTCTCCAGATTCCTTTTGGGTGAAACTTTTCCTGCTTCCGT
TTACCTCTCACTTATTCCCATCATCGGTGGTTGTGCTCTCTCTGCTCTTACCGAGCTTAA
CTTCAACATGATTGGTTTCATGGGAGCGATGATCTCGAACTTGGCATTCGTGTTCCGTAA
CATCTTCTCAAAGAAGGGAATGAAGGGAAGGTCTGTGAGCGGAATGAACTACTACGCTTG
TCTCTCAATGTTATCTCTCTTGATCCTTACGCCCTTTGCAATTGCGGTTGAAGGACCTCA
GATGTGGATCGATGGCTGGCAAAAGGCTCTCTCCGACATCGGACCTCAGTTTGTCTGGTG
GGTGGCTGCGCAGAGTGTGTTCTATCACCTCTACAACCAGGTGTCTTACATGTCTTTAGA
CCAAATCTCTCCCTTGACGTTTAGTGTGGGTAACACCATGAAGCGTATCTCAGTCATCGT
CTCCTCCATCATTATCTTCCGCACTCCTGTCCG*CCCGTTAACGCTCTCGGAGCTGCCAT
TGCTATCCT

QA 1 729 1 729
DS 

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GCTGTGGCACACACAATTGGTCACGTGGCTGCAACGGTGAGCATGTCAAAGGTTGCGGTT
TCCTTCACACACATCATCAAGAGTGGTGAACCAGCGTTTAGCGTTCTTGTCTCCAGATTC
CTTTTGGGTGAAACTTTTCCTGCTTCCGTTTACCTCTCACTTATTCCCATCATCGGTGGT
TGTGCTCTCTCTGCTCTTACCGAGCTTAACTTCAACATGATTGGTTTCATGGGAGCGATG
ATCTCGAACTTGGCATTCGTGTTCCGTAACATCTTCTCAAAGAAGGGAATGAAGGGAAGG
TCTGTGAGCGGAATGAACTACTACGCTTGTCTCTCAATGTTATCTCTCTTGATCCTTACG
CCCTTTGCAATTGCGGTTGAAGGACCTCAGATGTGGATCGATGGCTGGCAAAAGGCTCTC
TCCGACATCGGACCTCAGTTTGTCTGGTGGGTGGCTGCGCAGAGTGTGTTCTATCACCTC
TACAACCAGGTGTCTTACATGTCTTTAGACCAAATCTCTCCCTTGACGTTTAGTGTGGGT
AACACCATGAAGCGTATCTCAGTCATCGTCTCCTCCATCATTATCTTCCGCACTCCTGTC
CGGCCCGTTAACGCTCTCGGAGCTGCCATTGCTATC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL4247Contig1 853 2 3 U
GCAACATCTCCGTCCTCCACATCAGCCAAGTCCTGACCTCCCCGGAAGCTGAGGCTCCCA
CCGCGAGCCCCAGCGACCTCGTCCTCACCTCGATCCTCGAGAAGCAAGGGTGCAAGGCCT
TCTCCGACATGCTGAAATCCACCGGAGCAGACAAGACGTTTCAAGACACCGTCGACGGAG
GCCTGACGGTGTTCTGTCCTTCCGACGCCGCCGTCGGAAAGTTCGCGCCGAAGTTCAAAG
CCCTCTCCGCGGCGAACAAGACGGCGCTGGTGCTGTACCACGGCATGCCGGTTTACCAGT
CGCTGCAGATGCTTAGATCGGGTAACGGCGCCGTTAACACGCTGGCGACCGAAGGCAACA
ACAAGTATGGCTTCACGGTTCAGAACGACGGAGAGGACGTGACGCTCGAGACGGACGTCG
TGACGGCGAAGATCATGGGGACGTTGAAGGATCAAGAGCCGTTGATCGTTTACAAGGTGG
ACACAGTTTTGTTGCCGAGAGAGATCTACAAGGCTGTCAAGAAGGCGGCCGCTCCAGCTC
CCAAGTCGAGTAAGCACAAGCCTAAGAACGCGGTGGCTGATGGACCGAGCGCTGATGCTC
CGGGGGCAGACGATGACGGTGAGGTTGCTGATGATAAAAACGGTGCCGTTCATTTGATGA
TTAAAGGAAGCAGTGTTCTTGTGTCGGCGATTGTTTGGCTCTGTTTTGGAATTTAGCTCA
TTTGATGTTTTGTTAATATTGTTTCCCTTGTGTATGATCTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTT
TTGATCTTTTTTTTCTTTTCTTGTGGGGCTCTGTTTGTGAATTGTGAGTTTGGAGTTCAC
GTCACTTTCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD54TF U 648
AF RR4BD54JQ C 1
BS 1 654 RR4BD54JQ
BS 655 759 RR4BD54TF
BS 760 853 RR4BD54JQ

RD RR4BD54TF 113 0 0
GTTCATT
TGATGATTAAAGGAAGCAGTGTTCTTGTGTCGGCGATTGTTTGGCTCTGTTTTGGAATTT
AGCTCATTTGATGTTTTGTTAATATTGTTTCCCTTGTGTATGATC
T

QA 8 112 8 112
DS 

RD RR4BD54JQ 853 0 0
GCAACATCTCCGTCCTCCACATCAGCCAAGTCCTGACCTCCCCGGAAGCTGAGGCTCCCA
CCGCGAGCCCCAGCGACCTCGTCCTCACCTCGATCCTCGAGAAGCAAGGGTGCAAGGCCT
TCTCCGACATGCTGAAATCCACCGGAGCAGACAAGACGTTTCAAGACACCGTCGACGGAG
GCCTGACGGTGTTCTGTCCTTCCGACGCCGCCGTCGGAAAGTTCGCGCCGAAGTTCAAAG
CCCTCTCCGCGGCGAACAAGACGGCGCTGGTGCTGTACCACGGCATGCCGGTTTACCAGT
CGCTGCAGATGCTTAGATCGGGTAACGGCGCCGTTAACACGCTGGCGACCGAAGGCAACA
ACAAGTATGGCTTCACGGTTCAGAACGACGGAGAGGACGTGACGCTCGAGACGGACGTCG
TGACGGCGAAGATCATGGGGACGTTGAAGGATCAAGAGCCGTTGATCGTTTACAAGGTGG
ACACAGTTTTGTTGCCGAGAGAGATCTACAAGGCTGTCAAGAAGGCGGCCGCTCCAGCTC
CCAAGTCGAGTAAGCACAAGCCTAAGAACGCGGTGGCTGATGGACCGAGCGCTGATGCTC
CGGGGGCAGACGATGACGGTGAGGTTGCTGATGATAAAAACGGTGCCGTTCATTTGATGA
TTAAAGGAAGCAGTGTTCTTGTGTCGGCGATTGTTTGGCTCTGTTTTGGAATTTAGCTCA
TTTGATGTTTTGTTAATATTGTTTCCCTTGTGTATGATCTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTT
TTGATCTTTTTTTTCTTTTCTTGTGGGGCTCTGTTTGTGAATTGTGAGTTTGGAGTTCAC
GTCACTTTCTTCT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 3

CO CL4248Contig1 974 3 3 U
GATGGATCTAGATATCTTACCTCAAGGTGCTGGAAAGGGACAAGCGCTCGCTTATCTCCT
CAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTCTCAACACTCTCGCTTGTGGTGACTCCGG
GAACGATGCTGAACTCTTTAGCATCCCTGACGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATGCTCA
GGAAGAGCTGTTGAAGTGGCACGCTGAGAATGCGAAAGACAATCCCAAGGTGATCCACGC
GAAGGAGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTGAGTTCAAGCTTGGTCCAAA
CCTTTCTCCGAGGGATGTCTCTGACTTCTTGGAGTGCAGGGCTGAGAATGTCAACCCTGG
TCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTTTATGAGAGGTGGAGACGTGGTGAGGTTGAGAA
CAGCGAGGCGTACATAGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGGTGTGTTTGTTCA
TCCATCTGGTGCTGAGAAATCTCTGGTAGATACCATTGATGAGCTGCGTCAGTACCATGG
AGACGAACAAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTTGATCAAGTCTTGGCAACAGAGACCAC
TCATGGGATATGGATTGTAAAGTTTGACAAATGGGAACAGAGTGGGGATGAACGCATAGG
CTGCACAACGACTGTCAAGTTCACAGCAAAGGAAGGTGAAGGGTTGGTGTGGGAACGTGT
AGAGCAAACTTGGTCTGAGGAATCAAAGTTGAAGAAGGATGATAGCAGCTGGATCATCTG
AATCACACAATCTCTTTCTTCTCTACAGATGAAGACTTCTTTCTCTTTCTTTTCTTACGA
ATTTCTGCCATAAAATCATTAAAGCTTTGTCTTGATCACACGAGATCCAATAAAACAGTA
CCTTGGTAAACACATGGATCTCAAAACTCATGTACATCTCCAAGTTGACTACGTTTTCTT
TAACCCTTCGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G701TF U 1
AF RR4H579TF U 159
AF RR4H579JQB C 420
BS 1 626 RR4G701TF
BS 627 687 RR4H579TF
BS 688 974 RR4H579JQB

RD RR4G701TF 626 0 0
GATGGATCTAGATATCTTACCTCAAGGTGCTGGAAAGGGACAAGCGCTCGCTTATCTCCT
CAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTCTCAACACTCTCGCTTGTGGTGACTCCGG
GAACGATGCTGAACTCTTTAGCATCCCTGACGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATGCTCA
GGAAGAGCTGTTGAAGTGGCACGCTGAGAATGCGAAAGACAATCCCAAGGTGATCCACGC
GAAGGAGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTGAGTTCAAGCTTGGTCCAAA
CCTTTCTCCGAGGGATGTCTCTGACTTCTTGGAGTGCAGGGCTGAGAATGTCAACCCTGG
TCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTTTATGAGAGGTGGAGACGTGGTGAGGTTGAGAA
CAGCGAGGCGTACATAGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGGTGTGTTTGTTCA
TCCATCTGGTGCTGAGAAATCTCTGGTAGATACCATTGATGAGCTGCGTCAGTACCATGG
AGACGAACAAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTTGATCAAGTCTTGGCAACAGAGACCAC
TCATGGGATATGGATTGTAAAGTTTG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4H579TF 529 0 0
GCGTCATGGTAAGCAATGCTCAGGAAGAGCTGTTGAAGTGGCACGCTGAGAATGCGAAAG
ACAATCCCAAGGTGATCCACGCGAAGGAGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTG
GTGAGTTCAAGCTTGGTCCAAACCTTTCTCCGAGGGATGTCTCTGACTTCTTGGAGTGCA
GGGCTGAGAATGTCAACCCTGGTCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTTTATGAGAGGT
GGAGACGTGGTGAGGTTGAGAACAGCGAGGCGTACATAGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTC
ACCCTGGTGGTGTGTTTGTTCATCCATCTGGTGCTGAGAAATCTCTGGTAGATACCATTG
ATGAGCTGCGTCAGTACCATGGAGACGAACAAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTTGATC
AAGTCTTGGCAACAGAGACCACTCATGGGATATGGATTGTAAAGTTTGACAAATGGGAAC
AGAGTGGGGATGAACGCATAGGCTGCACAACGACTGTCAAGTTCACAGC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4H579JQB 555 0 0
ACAGCGAGGCGTACATAGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGGTGTGTTTGTTC
ATCCATCTGGTGTTGAGAAATTTCTGGTAGATACCATTGATGAGCTGCGTCAGTACCATG
GAGACGAACAAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTTGATCAAGTCTTGGCAACAGAGACCA
CTCATGGGATATGGATTGTAAAGTTTGACAAATGGGAACAGAGTGGGGATGAACGCATAG
GCTGCACAACGACTGTCAAGTTCACAGCAAAGGAAGGTGAAGGGTTGGTGTGGGAACGTG
TAGAGCAAACTTGGTCTGAGGAATCAAAGTTGAAGAAGGATGATAGCAGCTGGATCATCT
GAATCACACAATCTCTTTCTTCTCTACAGATGAAGACTTCTTTCTCTTTCTTTTCTTACG
AATTTCTGCCATAAAATCATTAAAGCTTTGTCTTGATCACACGAGATCCAATAAAACAGT
ACCTTGGTAAACACATGGATCTCAAAACTCATGTACATCTCCAAGTTGACTACGTTTTCT
TTAACCCTTCGAACC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 3

CO CL4249Contig1 767 3 6 U
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATG
GCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGCTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTAC
AGGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAAT
GTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACA
TGCGATGGGAAGCAAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATC
TTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGTAAAGTTACTA***TATGGGAG
AAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTT
GCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCA
TCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATA
TCATCTCCATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTG
AAGTTTCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCTCGACCGGTTTGA
TATGTCATGCTTTGATATATTCCAGTGTTATTAAGTTTGTCAAAGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DD40TF U 1
AF RR4AK27TF U 1
AF RR4AK27JQ C 106
BS 1 52 RR4AK27TF
BS 53 53 RR4DD40TF
BS 54 108 RR4AK27TF
BS 109 109 RR4DD40TF
BS 110 762 RR4AK27TF
BS 763 767 RR4AK27JQ

RD RR4DD40TF 437 0 0
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GCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGCTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTAC
AGGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAAT
GTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACA
TGCGATGGGAAGCAAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATC
TTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAG
AAGCGCAACGATGAGTT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4AK27TF 762 0 0
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGATAGAAATG
GCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGCTAAAAGGGACGGTGTAGAAACATTAC
AGGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAAT
GTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACA
TGCGATGGGAAGCAAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATC
TTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGTAAAGTTACTA***TATGGGAG
AAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTT
GCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCA
TCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATA
TCATCTCCATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTG
AAGTTTCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCTCGACCGGTTTGA
TATGTCATGCTTTGATATATTCCAGTGTTATTAAGTTTGTCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4AK27JQ 662 0 0
GTGT
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ACATCCAAAATGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTT
GGAACTACACATGCGATGGGAAGCAAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATG
AGAAGAAAACGGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGT
ATGACGTCATCTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGTAAAGTTACTA
***TATGGGAGAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCA
AGAGCATGGTTGCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCAC
CAGCATCACCATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCAC
CATGATCAATATCATCTCCATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAAT
GTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCTC
GACCGGTTTGATATGTCATGCTTTGATATATTCCAGTGTTATTAAGTTTGTCAAAGGT

QA 5 662 5 662
DS 



AS 1 3

CO CL4250Contig1 765 3 8 U
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CACCGTACAATCAAGCTTCGTCTCAGCACAAAAAAGGCTCGTCTCCATCTCAAAACAATC
TCTCTCTGGATTCGCCTGTCCTTCTCTTACAAAACCTAGAAACTTGAATCTCTCTGTTCT
TCGTTGTTGTTCCATGGGTTCCTTTAACTCTTCTCAGAAATCAGACAACGTCCAAGAAGC
TGCGAAGAGTGATTTTGCTTCTATAAGTGAACGTGAGTGGAAGAAACGGCTTACACCAGA
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CACAAAGACCCCAGGAGTATACAAATGTATCTGTTGCGAGACGCCACTGTTTGACTCATC
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TTGTAACGCCCATCTTGGTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCAACTGGAAAAAGATA
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TCTGGTACAAAGTATTGTTCATATATTATACAATATAGTTTCATCCTTGTATTGAAAACA
TTGTAATCACATGTAATAATACACAGAAGAAGAGTTGATTCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4AD89TF U 1
AF RR4FM09TF U 28
AF RR4FM09JQ C 47
BS 1 252 RR4AD89TF
BS 253 253 RR4FM09TF
BS 254 271 RR4AD89TF
BS 272 272 RR4FM09TF
BS 273 666 RR4AD89TF
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BS 668 738 RR4AD89TF
BS 739 765 RR4FM09JQ

RD RR4AD89TF 742 0 0
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CACCGTACAATCAAGCTTCGTCTCAGCACAAAAAAGGCTCGTCTCCATCTCAAAACAATC
TCTCTCTGGATTCGCCTGTCCTTCTCTTACAAAACCTAGAAACTTGAATCTCTCTGTTCT
TCGTTGTTGTTCCATGGGTTCCTTTAACTCTTCTCAGAAATCAGACAACGTCCAAGAAGC
TGCGAAGAGTGACTTTGCTTCTATAAGTGAAGGTGAGTGGAAGAAACGGCTTACACCAGA
ACAGTATTACATCACTAGACAGAAGGGAACAGAGAGAGCTTTCACTGGGGAGTATTGGAA
CACAAAGACCCCAGGAGTATACAAATGTATCTGTTGCGAGACGCCACTGTTTGACTCATC
AACAAAGTTTGATAGTGGAACCGGGTGGCCATCGTATTACCAACCTATTGGAAACAATGT
GAAGTCAAAGCTAGACCTCTCTATCATCTTCATGCCAAGACAAGAAGTTATCTGTGCTGT
TTGTAACGCCCATCTTGGTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCAACTGGAAAAAGATA
TTGCCTCAACAGTGCTGCTCTGAAACTTGAGGCATTGGAGAGAACAAGAGACTGAGAGTT
TCTGGTTCAAAGTATTGTTCATATATTATACAATATAGTTTCATCCTTGTATTGAAAACA
TTGTAATCACATGTAATA
TACA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FM09TF 720 0 0
G
ATTCAAAGCAAGATGGCTTCTTCTAGTTGTTTCACCGTACAATCAAGCTTCGTCTCAGCA
CAAAAAAGGCTCGTCTCCATCTCAAAACAATCTCTCTCTGGATTCGCCTGTCCTTCTCTT
ACAAAACCTAGAAACTTGAATCTCTCTGTTCTTCGTTGTTGTTCCATGGGTTCCTTTAAC
TCTTCTCAGAAATCAGACAACGTCCAAGAAGCTGCGAAGAGTGATTTTGCTTCTATAAGT
GAACGTGAGTGGAAGAAACGGCTTACACCAGAACAGTATTACATCACTAGACAGAAGGGA
ACAGAGAGAGCTTTCACTGGGGAGTATTGGAACACAAAGACCCCAGGAGTATACAAATGT
ATCTGTTGCGAGACGCCACTGTTTGACTCATCAACAAAGTTTGATAGTGGAACCGGGTGG
CCATCGTATTACCAACCTATTGGAAACAATGTGAAGTCAAAGCTAGACCTCTCTATCATC
TTCATGCCAAGACAAGAAGTTATCTGTGCTGTTTGTAACGCCCATCTTGGTCATGTCTTT
GATGACGGTCCACGACCAACTGGAAAAAGATATTGCCTCAACAGTGCTGCTCTGAAACTT
GAGGCATTGGAGAGAACAAGAGACTGAGAGTTTCTGGTACAAAGTATTGTTCATATATTA
TACAATATAGTTTCATCCTTGTATTGAAAACATTGTAATCACATGTAATA
ATACACAGA

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR4FM09JQ 719 0 0
TCTTCTAGTTGTTTCACCGTACAATCAAGCTTCGTCTCAGCACAAAAAAGGCTCGTCTCC
ATCTCAAAACAATCTCTCTCTGGATTCGCCTGTCCTTCTCTTACAAAACCTAGAAACTTG
AATCTCTCTGTTCTTCGTTGTTGTTCCATGGGTTCCTTTAACTCTTCTCAGAAATCAGAC
AACGTCCAAGAAGCTGCGAAGAGTGATTTTGCTTCTATAAGTGAACGTGAGTGGAAGAAA
CGGCTTACACCAGAACAGTATTACATCACTAGACAGAAGGGAACAGAGAGAGCTTTCACT
GGGGAGTATTGGAACACAAAGACCCCAGGAGTATACAAATGTATCTGTTGCGAGACGCCA
CTGTTTGACTCATCAACAAAGTTTGATAGTGGAACCGGGTGGCCATCGTATTACCAACCT
ATTGGAAACAATGTGAAGTCAAAGCTAGACCTCTCTATCATCTTCATGCCAAGACAAGAA
GTTATCTGTGCTGTTTGTAACGCCCATCTTGGTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCA
ACTGGAAAAAGATATTGCCTCAACAGTGCTGCTCTGAAACTTGAGGCATTGGAGAGAACA
AGAGACTGAGAGTTTCTGGTACAAAGTATTGTTCATATATTATACAATATAGTTTCATCC
TTGTATTGAAAACATTGTAATCACATGTAATAATACACAGAAGAAGAGTTGATTCCACT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL4251Contig1 895 3 24 U
AGTTGTATTAGTTACTTATATATAGTTCAATAAGATAATGTTATAATGAAACAAACAACA
ATTATACCAATAATTGTTGCGAGAGAGAGTATTTTAAAACCATAACTGAAATAACAAACA
CCCATTAAAACAGAAAAAAGTCACAAAAGCAGAAAATCTCTCAATCCTCCCCTTCGGTCT
CGGACTCAGCGCTCTGGAGCCACACCACAAAAGGCTTAACATTCTTCCAGACAGACGAGC
TTTTGTCAACTCCCTTCAGACCCTTCTGGTACCATTCCAACACAAACTCTTCCTCAACGA
TGTCTTCATCGTACAGTTCTTTAAGAACCAGCGCCACCTCCTTACCCACCTCTTCGTTTC
CTTTCTTTCCAAAGAAAGATCCGATTGAGTTGAGCAGAAGATGCATCTGTGAACCATCCT
CTTGCGTTGCGGCCGCCAAGTACTTCTTCTTCTTCGTCACTTCTTCAGCGTACCCTCTGC
TCACACCATCAAAGAGAGCGTTGACGAGTGCGTCCATGACATCTTGAGGAGGATCAGAGA
GAGAGGAGACGAAAGTTTTGAGCTCGCTTATCAATGAATCTTTCATCAGATACTCTCTCA
TCACCTTCACGAGATTCTTAGGCTCCTCTTCTTCAACAGAGAGCATCACCATTTCCGCAG
TTACAGCACTCAACTGTTCCTTCATTCTTTTCTCAGCAGCTTCTCTAGAAGTATCGGTTT
GCCACTGGATACCATCGTCTTCATCATCATCATCATCCACCTCATCATGCTTTGGACTGA
TATCATCCTCATCAGACGCATGATTCTTGGACATACTAGAAGAAGCCTCCTTCCCATTCC
CATTCCCATTACAAGGCGCTTTCTTCTTGAGCTTCTTCTGCGCCTCATCAGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
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AF RR4G158JQ U 1
AF RR4CB81JQ U 27
AF RR4CB81TF C 176
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GA

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CAG
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QA 4 778 4 778
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QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 3

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TTTCTGTTATGAATCTTTGTTTCTTCC


BQ
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AF RR4ET90TF U 1
AF RR4F710TF U 1
AF RR4F710JQ C 456
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QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4F710TF 736 0 0
GGGGCAGAAAAGAAAGAAGGAAAAAAAAAACCCTAAAAACTAAATCTCACCTGCCGCTGT
CTCTTTTCTTTTTTTCTTTCTTTTCTTTCCTTTGGTTTCACTGCTTGTTCTGTCTCGATG
GATCCATCTCTTTCCAGTGATCCTCACCGTCCTCAATACTCTCCTTTCCCTCAATTCCCA
ACCTCCAACAGCCCTTTCGTCTCCGCTCCTAATCTCCCCTTTTACGGTGCTCAGCCCGTT
AACCAAACGCCGTTCAATGTCTCCCTAAGCGCGGACGTGGACGTCCCGTTGGTAGACCAA
GAAAGAACCCATGGCCCGTCACCGGAGCTACTAGTGGTGCACTAGAATCTGCCGCCTATG
GAGAACTCAAGGCAAAGCTTGATCTCTGTAATGAGAAAGCAAAAGAAATCCTGAATGTGT
TGAACGCTGGTATTGCAAACAACGACAATCAAGCAGCGGTAGAAGCTGCAGAAAAGCTGA
GAGGATTAATAACATTGTTGACGGTTGAGCAGCCACAAGCCGTGGTGGAAGAAGTGCAGC
CAGAGGAGGCAGCACCACAGACTGATGAAGCTGAAGAACCACAAGGAGAGGCAGAGGGAG
AGGGACATGAACAAGAAAGAGAAGGAGAAG*AGGAGAAGAAGAACAAGCCCCGACAGGCC
AGACCCAGGTTCAGACAGATGCAGAGGC*ATGCAAGAAGCTTGTTCTGAG**ATAATATG
ATCTCACAAAAAAAAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4F710JQ 532 0 0
GCGGTAGAAGCTGCAGAAAAGCTGAGAGGATTAATAACATTGTTGACGGTTGAGCAGCCA
CAAGCCGTGGTGGAAGAAGTGCAGCCAGAGGAGGCAGCACCACAGATTGATGAAGCTGAA
GAACCACAAGGAGAGGCAGAGGGAGAGGGACATGAACAAGAAAGAGAAGGAGAAGGAGGA
GAAGAAGAACAAGCCCCGACAGGCCAGACCCAGGTTCAGACAGATGCAGAGGCCATGCAA
GAAGCTTGTTTTGAAGAATAATATGATTTCACAAAAAAAAAACAGCCTAGACATTTAAGT
CTTGGTGTTTGTGGTGGTTAGGAGGAGTGTTCTTTTTAGTATTTAGGTGTTGGATCCTAT
CTTTAATTAAAAAAAACCTATAAGGAATTTTAGTTTGTGGAAGAAGAAAAACAAAGACTC
TTTTGATGGGTGTTGTGTCAGTGTCACTAACTAAAACATTAAGAGGTTGATGTAAATTAG
GGGATATTTCCAGTGCTGGATGTTTTTTCTGTTATGAATCTTTGTTTCTTCC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 3

CO CL4253Contig1 650 3 1 U
GAACAATGTAACCGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGGACACGGCCTAAGTGTTGGTAG
TCTCGGTAAGTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCATTCACTTTAGGAACTGCACAAT
GAGAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCACCAAGCAAGGC
TATTGACATTCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACGTCAAGAACCCAATCATCATTGA
CCAAAACTATGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAGCGATGTGTTGTTCAA
GAACGTGAGAGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCATGTGCAGCAAATCGGT
ACCGTGTAAAGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTCGTAGGCCACGTAGGAGG
ACACCAGTCGTCGTCAGGTGGTTTGATCGGATCTCTTTGTAATAACGTCAATCTTATCTT
TGGTGGAAAGGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAAATAATATTTTTGGTCTAAATAATATAA
TAAAGGAAGAAAAAAAATCGAAAGTTCCCACAAACATTTGTTTTGTTTGTGGATTAGTTT
GGAAAATTTATCAACATGACAATTGGAATATTTGACTTTTGATAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H174TF U 13
AF RR4DJ58JQ C 1
AF RR4DJ58TF U 1
BS 1 650 RR4DJ58TF

RD RR4H174TF 545 0 0
CGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGGACACGGCCTAAGTGTTGGTAGTCTCGGTAATTA
CCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCATTCACTTTAGGAACTGCACAATGAGAAATACCGA
CAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCACCAAGCAAGGCTATTGACATTCA
TTTCGAAGATATTATCATGAAAAACGTCAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTATGG
TTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAGCGATGTGTTGTTCAAGAACGTGAGAGG
AACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCATGTGCAGCAAATCGGTACCGTGTAAAGG
AGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTCGTAGGCCACGTAGGAGGACACCAGTCGTC
GTCAGGTGGTTTGATCGGATCTCTTTGTAATAACGTCAATCTTATCTTTGGTGGAAAGGT
TAACTTCCCTCTGTGTCCAAAATAATATTTTTGGTCTAAATAATATAATAAAGGAAGAAA
AAAAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4DJ58JQ 643 0 0
GAACAATGTAACCGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGGACACGGCCTAAGTGTTGGTAG
TCTCGGTAAGTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCATTCACTTTAGGAACTGCACAAT
GAGAAATACCGACAATGGTTTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTTGTCACCAAGCAAGGC
TATTGACATTCATTTTGAAGATATTATCATGGAAAACGTCAAGAACCCAATCATCATTGA
CCAAAACTATGGTTCAAGAGGGGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAGCGATGTGTTGTTCAA
GAACGTGAGAGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCATGTGCAGCAAATCGGT
ACCGTGTAAAGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTTGTAGGCCACGTAGGAGG
ACACCAGTCGTCGTCAGGTGGTTTGATCGGATCTTTTTGTAATAACGTCAATTTTATCTT
TGGTGGAAAGGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAAATAATATTTTTGGTTTAAATAATATAA
TAAAGGAAGAAAAAAAATCGAAAGTTCCCACAAACATTTGTTTTGTTTGTGGATTAGTTT
GGAAAATTTATCAACATGACAATTGGAATATTTGACTTTTGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4DJ58TF 650 0 0
GAACAATGTAACCGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGGACACGGCCTAAGTGTTGGTAG
TCTCGGTAAGTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCATTCACTTTAGGAACTGCACAAT
GAGAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCACCAAGCAAGGC
TATTGACATTCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACGTCAAGAACCCAATCATCATTGA
CCAAAACTATGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAGCGATGTGTTGTTCAA
GAACGTGAGAGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCATGTGCAGCAAATCGGT
ACCGTGTAAAGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTCGTAGGCCACGTAGGAGG
ACACCAGTCGTCGTCAGGTGGTTTGATCGGATCTCTTTGTAATAACGTCAATCTTATCTT
TGGTGGAAAGGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAAATAATATTTTTGGTCTAAATAATATAA
TAAAGGAAGAAAAAAAATCGAAAGTTCCCACAAACATTTGTTTTGTTTGTGGATTAGTTT
GGAAAATTTATCAACATGACAATTGGAATATTTGACTTTTGATAAAAAAA

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 3

CO CL4254Contig1 783 3 2 U
GGCTTGCAATTAGTTTACTCTCTGCTGATAAGTTTCGGAATAAGATACAGTATAAAGCGT
TGGTGAAACGTTGGAGAATCATCTTACATATAACATTGGCCACTGCAAAAAGATATTGAG
ATTTTCAAAATACCAATGCATAGGCCATCAAGCTGCGTAGTCAGGCATTGCTTTCTTGAG
GAATGTTATCGGCTGCGACTCCTCTGGGGCTAATCGGTCAAAAGGAATGTAGTTCTCCTC
TTTGTCATAGACATGGCACACAGTCATTATTGTCTTCATCAAGCGCCAGTTCCATGTAGC
CAAGTTTGTGTACTTTCCCCAGTTCTCTTGAATAGACTCATGAGCCGCACGGAGATTGTA
GCTGGGTATCCTTGGGCTAATGTGATGCGGGATGTGTACATTGATATCATGGCACAAAAT
CTCAATCCAACTAGGATAATCACAATGAACAGTTCCGTTAAGCTGTGCTTGAGCTGCATT
CCACTCATCCGCAGGCTTGAAAGGAATGTGTGGAGCTGTATGATGAACCATCGTGAACGT
GCTCATCCAAAAGTGATAGCCCAACCACGGCATCAACCAGAACTTAACCCATCCCAATAT
GCCAACTTTGTATATGATCAGTGGCCACCCAACAGCCATGAAGGCGAAAACACAAGCCAA
ACTTATCTTCACCCTATTCACTTCGCTTGGTCTGAACTTTCTCAGATTGAAGTGCCAGTT
CACCCAGTGAGCTATGGACAACCAAGGCCGAATTGGACCATATCCAAAATGATTGCTTTT
CGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FV14JQ U 12
AF RR4GQ22JQ U 1
AF RR4BN58JQ U 28
BS 1 767 RR4GQ22JQ
BS 768 783 RR4BN58JQ

RD RR4FV14JQ 644 0 0
G
GTTTACTCTCTGCTGATAAGTTTCGGAATAAGATACAGTATAAAGCGTTGGTGAAACGTT
GGAAAATCATCTTACATATAACATTGGCCACTGCAAAAAGATATTGAGATTTTCAAAATA
CCAATGCATAGGCCATCAAGCTGCGTAGTCAGGCATTGCTTTCTTGAGGAATGTTATCGG
CTGCGACTCCTCTGGGGCTAATCGGTCAAAAGGAATGTAGTTCTCCTCTTTGTCATAAAC
ATGGCACACAGTCATTATTGTCTTCATCAAGCGCCAGTTCCATGTAGCCAAGTTTGTGTA
CTTTCCCCAGTTCTCTTGAATAAACTCATGAGCCGCACGGAAATTGTAGCTGGGTATCCT
TGGGCTAATGTGATGCGGGATGTGTACATTGATATCATGGCACAAAATCTCAATCCAACT
AGGATAATCACAATGAACAGCTCCGTTAAGCTGTGCTTGAGCTGCATTCCACTCATCCCC
AGGCTTGAAAGGAATGTGTGGAGCTGTATGATGAACCATCGTGAACGTGCTCATCCAAAA
GTGATAGCCCAACCACGGCATCAACCAGAACTTAACCCATCCCAATATGCCAACTTTGTA
TATGATCAGTGGCCACCCAACAGCCATGAAGGCGAAAACACAA

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR4GQ22JQ 770 0 0
GGCTTGCAATTAGTTTACTCTCTGCTGATAAGTTTCGGAATAAGATACAGTATAAAGCGT
TGGTGAAACGTTGGAGAATCATCTTACATATAACATTGGCCACTGCAAAAAGATATTGAG
ATTTTCAAAATACCAATGCATAGGCCATCAAGCTGCGTAGTCAGGCATTGCTTTCTTGAG
GAATGTTATCGGCTGCGACTCCTCTGGGGCTAATCGGTCAAAAGGAATGTAGTTCTCCTC
TTTGTCATAGACATGGCACACAGTCATTATTGTCTTCATCAAGCGCCAGTTCCATGTAGC
CAAGTTTGTGTACTTTCCCCAGTTCTCTTGAATAGACTCATGAGCCGCACGGAGATTGTA
GCTGGGTATCCTTGGGCTAATGTGATGCGGGATGTGTACATTGATATCATGGCACAAAAT
CTCAATCCAACTAGGATAATCACAATGAACAGTTCCGTTAAGCTGTGCTTGAGCTGCATT
CCACTCATCCGCAGGCTTGAAAGGAATGTGTGGAGCTGTATGATGAACCATCGTGAACGT
GCTCATCCAAAAGTGATAGCCCAACCACGGCATCAACCAGAACTTAACCCATCCCAATAT
GCCAACTTTGTATATGATCAGTGGCCACCCAACAGCCATGAAGGCGAAAACACAAGCCAA
ACTTATCTTCACCCTATTCACTTCGCTTGGTCTGAACTTTCTCAGATTGAAGTGCCAGTT
CACCCAGTGAGCTATGGACAACCAAGGCCGAATTGGACCATATCCAA
GAA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BN58JQ 756 0 0
ATAAGTTTCGGAATAAGATACAGTATAAAGCGTTGGTGAAACGTTGGAGAATCATCTTAC
ATATAACATTGGCCACTGCAAAAAGATATTGAGATTTTCAAAATACCAATGCATAGGCCA
TCAAGCTGCGTAGTCAGGCATTGCTTTCTTGAGGAATGTTATCGGCTGCGACTCCTCTGG
GGCTAATCGGTCAAAAGGAATGTAGTTCTCCTCTTTGTCATAGACATGGCACACAGTCAT
TATTGTCTTCATCAAGCGCCAGTTCCATGTAGCCAAGTTTGTGTACTTTCCCCAGTTCTC
TTGAATAGACTCATGAGCCGCACGGAGATTGTAGCTGGGTATCCTTGGGCTAATGTGATG
CGGGATGTGTACATTGATATCATGGCACAAAATCTCAATCCAACTAGGATAATCACAATG
AACAGTTCCGTTAAGCTGTGCTTGAGCTGCATTCCACTCATCCGCAGGCTTGAAAGGAAT
GTGTGGAGCTGTATGATGAACCATCGTGAACGTGCTCATCCAAAAGTGATAGCCCAACCA
CGGCATCAACCAGAACTTAACCCATCCCAATATGCCAACTTTGTATATGATCAGTGGCCA
CCCAACAGCCATGAAGGCGAAAACACAAGCCAAACTTATCTTCACCCTATTCACTTCGCT
TGGTCTGAACTTTCTCAGATTGAAGTGCCAGTTCACCCAGTGAGCTATGGACAACCAAGG
CCGAATTGGACCGTATCCAAAATGATTGCTTTTCGT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

CO CL4255Contig1 770 3 15 U
GGAATTCCAAATCTACGAAAAAAATGGCTCTCCGATCTGTCAAAACACCGTTTGTAACTC
CCACCGCCGTCGTCTCCTCCTCAATTGTCAACAAACCACAGTCTTTCAGATTCGCCTCTA
AACCGAGGGCATCACTCGCCGTCCACAACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGAT
CGAATCTTATACCCAAACTCAAACCATCATCTCCCGCCGCGAAATTCAGGTGCTCGGCGT
CGTCGTCGGCGCTCACGCCGCAGCTTAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGA
AAGTCGTGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCGATGTGCGGATTCTCGAACACGG
TGGTGCAGATCCTCAAGAATCTGAACGTCCCCTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACG
AGATGCTGAGGCAAGGGCTGAAAGAGTACTCGAACTAGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACA
TCGACGGCGAGTTCTTCGGGGGATGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGT
TGCAGGAAGTTGTTGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTTGATATGCTTGTCTTTGGGG
*TTTTGTAACAATGCTATTTGATCGTATTGTGTGATGGATATAGTTATAGAAATAGTACT
ACTATGTGCTTGAATCCATACATTATAAAACTCTTCTTGATGTCTCAGAGTTTATGGTTG
GTGGTAACACTACAAGAGACATATTGTATAATGGAACTAGCTATGTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G466TF U 27
AF RR4G466JQ C 247
AF RR4AM51TF U 1
BS 1 133 RR4AM51TF
BS 134 134 RR4G466TF
BS 135 143 RR4AM51TF
BS 144 145 RR4G466TF
BS 146 265 RR4AM51TF
BS 266 266 RR4G466TF
BS 267 337 RR4AM51TF
BS 338 338 RR4G466TF
BS 339 376 RR4AM51TF
BS 377 377 RR4G466TF
BS 378 456 RR4AM51TF
BS 457 457 RR4G466TF
BS 458 600 RR4AM51TF
BS 601 601 RR4G466TF
BS 602 770 RR4AM51TF

RD RR4G466TF 680 0 0
GCTCTCCGATCTGTCAAAACACCGTTTGTAACTCCCACCGCCGTCGTCTCCTCCTCAATT
GTCAACAAACCACAGTCTTTCAGGTTCGCCTCTAAACCGAGGGCATCACTCGCCGTCCAC
AACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGATCGAATCTTATACCCAAACTCAAACCA
TCATCTCCCGCCGCGAAATTCAGGTGCTCGGCGTCGTCGTCGGCGCTCACGCCGCAGCTT
AGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGAAAGTCGTGTTATTCATGAAAGGCACG
AGGGATTTCCCGATGTGCGGATTCTCGAACACGGTGGTGCAGATCCTCAAGAATCTGAAC
GTCCCCTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACGAGATGCTGAGGCAAGGGCTGAAAGAG
TACTCGAACTAGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACATCGACGGCGAGTTCTTCGGGGGATGT
GACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGTTGCAGGAAGTTGTTGAAAGAGCTATT
TGTTCTTGATGCTTTGATATGCTTGTCTTTGGGG*TTTTGTAACAATGCTATTTGATCGT
ATTGTGTGATGGATATAGTTATAGAAATAGTACTACTATGTGCTTGAATCCATACATTAT
AGAACTCTTCTTGATG
CCGC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4G466JQ 418 0 0
CGGCGCTCACGCCGCAGCTTAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGAAAGTCG
TGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCGATGTGCGGATTCTCGAACACGGTGGTGC
AGATCCTCAAGAATCTGAACGTCCCCTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACGAGATGC
TGAGGCAAGGGCTGAAAGAGTACTCGAACTAGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACATCGACG
GCGAGTTCTTCGGGGGATGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGTTGCAGG
AAGTTGTTGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTTGATATGCTTGTCTTTGGGG*TTTTG
TAACAATGCTATTTGATCGTATTGTGTGATGGATATAGTTATAGAAATAGTACTACTA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4AM51TF 770 0 0
GGAATTCCAAATCTACGAAAAAAATGGCTCTCCGATCTGTCAAAACACCGTTTGTAACTC
CCACCGCCGTCGTCTCCTCCTCAATTGTCAACAAACCACAGTCTTTCAGATTCGCCTCTA
AACCGAGGGCATCGCTCGCCGTCTGCAACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGAT
CGAATCTTATACCCAAACTCAAACCATCATCTCCCGCCGCGAAATTCAGGTGCTCGGCGT
CGTCGTCGGCGCTCACGCCGCAGCTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGA
AAGTCGTGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGATTCTCGAACACGG
TGGTGCAGATCCTCAATAATCTGAACGTCCCCTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACG
AGATGCTGAGGCAAGGGCTGAAAGAGTACTCGAACTGGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACA
TCGACGGCGAGTTCTTCGGGGGATGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGT
TGCAGGAAGTTGTTGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTTGATATGCTTGTCTTTGGGG
GTTTTGTAACAATGCTATTTGATCGTATTGTGTGATGGATATAGTTATAGAAATAGTACT
ACTATGTGCTTGAATCCATACATTATAAAACTCTTCTTGATGTCTCAGAGTTTATGGTTG
GTGGTAACACTACAAGAGACATATTGTATAATGGAACTAGCTATGTACAT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 3

CO CL4256Contig1 877 3 5 U
CCTCTCTAGGTTCCTTGTTGAAGACGTTACGGAAGATCACTTTACAATTTTCCCTTCTCT
TTATAATACACACACACGGACACACCAAGTCATTCCTTATAATTATTCATCATTGAATAT
GTAACATTTTCTAAATTTTCCAACGACCAGGAACAATCAAACTGTAACCTTGGTACAGAC
ATATATTTTTAAGACGCCACTCATTCAACCGGCAAATTTTCTGCTTCAAACCTAACAGAA
TCGAACAGTTTAGTCGATAGATAACGTTCTCCTCCACTGGGAAAAACCACCACAATGAGT
TTCCCTGCATTTTCTGGCCGCTTTGCAACCCTTAACGCAGCCGCTGCTGCGGCTCCAGAT
GATATTCCCACCAACAATCCCTCTTTGAGAGCAAGAAGCTTGGCTGTTTCAATAGCTTCC
TCACCTTTCACTTGAATGATCTCATCAACAATGCTTAACTCCAAATTGGTTGGGATGATA
CCAGAACCAATTCCCTGGATTAAATGTGGACTTGGTTCTCCTCCACTGAGTACAGGACTT
TCTAAAGGTTCAACCGCATAAACCTTAATGTCTTTATTCATCTCCTTGAGGAACTTCCCT
ACTCCACTAACCGTTCCACCAGTCCCAACACCAGCAACCAGTATATCTACTTTCCCTGCT
GAATCTCTCCATATCTCCGGACCGGTGGTTCGGTAATGAATCTCAGGGTTTGCAGGATTT
TCAAACTGTTGTGGAACAAAACCACCAGGTGTTTTGCTTAATATCTCTTCAGTTTTTTCC
AGCATTCCTTTAATGCCTATCTTCACATCTGTGAGATGAAGCTCTGCACCTAATGCTTTT
AGAATGATTCTCCTCTCCAAGCTCATCGTTGAGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM81JQ U 1
AF RR4DU40JQ U 99
AF RR4DU40TF C 212
BS 1 781 RR4AM81JQ
BS 782 782 RR4DU40JQ
BS 783 811 RR4AM81JQ
BS 812 852 RR4DU40JQ
BS 853 877 RR4DU40TF

RD RR4AM81JQ 811 0 0
CCTCTCTAGGTTCCTTGTTGAAGACGTTACGGAAGATCACTTTACAATTTTCCCTTCTCT
TTATAATACACACACACGGACACACCAAGTCATTCCTTATAATTATTCATCATTGAATAT
GTAACATTTTCTAAATTTTCCAACGACCAGGAACAATCAAACTGTAACCTTGGTACAGAC
ATATATTTTTAAGACGCCACTCATTCAACCGGCAAATTTTCTGCTTCAAACCTAACAGAA
TCGAACAGTTTAGTCGATAGATAACGTTCTCCTCCACTGGGAAAAACCACCACAATGAGT
TTCCCTGCATTTTCTGGCCGCTTTGCAACCCTTAACGCAGCCGCTGCTGCGGCTCCAGAT
GATATTCCCACCAACAATCCCTCTTTGAGAGCAAGAAGCTTGGCTGTTTCAATAGCTTCC
TCACCTTTCACTTGAATGATCTCATCAACAATGCTTAACTCCAAATTGGTTGGGATGATA
CCAGAACCAATTCCCTGGATTAAATGTGGACTTGGTTCTCCTCCACTGAGTACAGGACTT
TCTAAAGGTTCAACCGCATAAACCTTAATGTCTTTATTCATCTCCTTGAGGAACTTCCCT
ACTCCACTAACCGTTCCACCAGTCCCAACACCAGCAACCAGTATATCTACTTTCCCTGCT
GAATCTCTCCATATCTCCGGACCGGTGGTTCGGTAATGAATCTCAGGGTTTGCAGGATTT
TCAAACTGTTGTGGAACAAAACCACCAGGTGTTTTGCTTAATATCTCTTCAGTTTTTTCC
AACATTCCTTTAATGCCTATCTTCACATCTG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4DU40JQ 769 0 0
ATAATTATTCATCATTGAATATGTAACATTTTCTAAATTTTCCAACGACCAGGAACAATC
AAACTGTAACCTTGGTACAGACATATATTTTTAAGACGCCACTCATTCAACCGGCAAATT
TTCTGCTTCAAACCTAACAGAATCGAACAGTTTAGTCGATAGATAACGTTCTCCTCCACT
GGGAAAAACCACCACAATGAGTTTCCCTGCATTTTCTGGCCGCTTTGCAACCCTTAACGC
AGCCGCTGCTGCGGCTCCAGATGATATTCCCACCAACAATCCCTCTTTGAGAGCAAGAAG
CTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCTCACCTTTCACTTGAATGATCTCATCAACAATGCTTAA
CTCCAAATTGGTTGGGATGATACCAGAACCAATTCCCTGGATTAAATGTGGACTTGGTTC
TCCTCCACTGAGTACAGGACTTTCTAAAGGTTCAACCGCATAAACCTTAATGTCTTTATT
CATCTCCTTGAGGAACTTCCCTACTCCACTAACCGTTCCACCAGTCCCAACACCAGCAAC
CAGTATATCTACTTTCCCTGCTGAATCTCTCCATATCTCCGGACCGGTGGTTCGGTAATG
AATCTCAGGGTTTGCAGGATTTTCAAACTGTTGTGGAACAAAACCACCAGGTGTTTTGCT
TAATATCTCTTCAGTTTTTTCCAGCATTCCTTTAATGCCTATCTTCACATCTGTGAGATG
AAGCTCTGCACCTAATGCTTTTAGAATGATTCTC
TCTCAAGCTCATCGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4DU40TF 666 0 0
GCAAATTTTCTGCTTCAAAC*TAACAGAATCGAACAGTTTAGTCGATAGATAACGTTCTC
CTCCACTGGGAAAAACCACCACAATGAGTTTCCCTGCATTTTCTGGCCGCTTTGCAACCC
TTAACGCAGCCGCTGCTGCGGCTCCAGATGATATTCCCACCAACAATCCCTCTTTGAGAG
CAAGAAGCTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCTCACCTTTCACTTGAATGATCTCATCAACAA
TGCTTAACTCCAAATTGGTTGGGATGATACCAGAACCAATTCCCTGGATTAAATGTGGAC
TTGGTTCTCCTCCACTGAGTACAGGACTTTCTAAAGGTTCAACCGCATAAACCTTAATGT
CTTTATTCATCTCCTTGAGGAACTTCCCTACTCCACTAACCGTTCCACCAGTCCCAACAC
CAGCAACCAGTATATCTACTTTCCCTGCTGAATCTCTCCATATCTCCGGACCGGTGGTTC
GGTAATGAATCTCAGGGTTTGCAGGATTTTCAAACTGTTGTGGAACAAAACCACCAGGTG
TTTTGCTTAATATCTCTTCAGTTTTTTCCAGCATTCCTTTAATGCCTATCTTCACATCTG
TGAGATGAAGCTCTGCACCTAATGCTTTTAGAATGATTCTCCTCTCCAAGCTCATCGTTG
AGGGCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL4257Contig1 830 2 2 U
TTCTCTAATGCATGGACTCTGGACTTACATGTTCAGCAAAACTGAGTTCCATGTCCTCAT
TCTTGGTATCGACAAAGCTGGCAAAACGACGTTTTTGGAGAAACTGAAGACGATTTACTC
AATCTCCGAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCCTACTGTTGGCCTTAACATCGGTCG
TATTGAAGTCGCCAATGCTAAAATCGTCTTCTGGGACCTTGGTGGTCAGCCTGGTTTGCG
TTCGATTTGGGAGAAGTATTATGAAGAAGCCCACGCATTGATATATTTGATCGACGCAGC
ATGCCCATCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCTAGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGA
TTTGCAAGGAGCGCCTCTTTTGATATTGGCAAACAAGCAAGATCTCCCAAATGCTGTCTC
GGCTGAGGAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAAACTAGACGAAAGGGTGTACATGTT
TGAAGCAGCTTCTGGATATGATGGGCGAGGAATCAAAGAGAGCATAGAATGGCTGGTGGG
AGTGATGGAGAGAAGCAAAAGAACCGAAACATTAAGAGCCCGTGCACGATACGTTCCTGT
CCCAACTTCCTAGACTTGAAAGAAGTGTTCACAAACTCAATTCTCAAACCAACTGTTTTC
TGTCAGAAACATTTGTAGATAAAAAAAAAATCGTGCATTGTTTTGTGTTAGCACATGATA
AGTAGGGCTAGTAATAATCCTTATTATATTTGCCTTTACATCATTTCTAATGCTATGATT
CAGATTGAGACTTGAGGTTACTGAAAACAATAACGTAATCAAGTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A888TF U 1
AF RR4A888JQ C 7
BS 1 680 RR4A888TF
BS 681 830 RR4A888JQ

RD RR4A888TF 680 0 0
TTCTCTAATGCATGGACTCTGGACTTACATGTTCAGCAAAACTGAGTTCCATGTCCTCAT
TCTTGGTATCGACAAAGCTGGCAAAACGACGTTTTTGGAGAAACTGAAGACGATTTACTC
AATCTCCGAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCCTACTGTTGGCCTTAACATCGGTCG
TATTGAAGTCGCCAATGCTAAAATCGTCTTCTGGGACCTTGGTGGTCAGCCTGGTTTGCG
TTCGATTTGGGAGAAGTATTATGAAGAAGCCCACGCATTGATATATTTGATCGACGCAGC
ATGCCCATCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCTAGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGA
TTTGCAAGGAGCGCCTCTTTTGATATTGGCAAACAAGCAAGATCTCCCAAATGCTGTCTC
GGCTGAGGAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAAACTAGACGAAAGGGTGTACATGTT
TGAAGCAGCTTCTGGATATGATGGGCGAGGAATCAAAGAGAGCATAGAATGGCTGGTGGG
AGTGATGGAGAGAAGCAAAAGAACCGAAACATTAAGAGCCCGTGCACGATACGTTCCTGT
CCCAACTTCCTAGACTTGAAAGAAGTGTTCACAAACTCAATTCTCAAACCAACTGTTTTC
TGTCAGAAACATTTGTAGAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4A888JQ 824 0 0
AATGCATGGACTCTGGACTTACATGTTCAGCAAAACTGAGTTCCATGTCCTCATTCTTGG
TATCGACAAAGCTGGCAAAACGACGTTTTTGGAGAAACTGAAGACGATTTACTCAATCTC
CGAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCCTACTGTTGGCCTTAACATCGGTCGTATTGA
AGTCGCCAATGCTAAAATCGTCTTCTGGGACCTTGGTGGTCAGCCTGGTTTGCGTTCGAT
TTGGGAGAAGTATTATGAAGAAGCCCACGCATTGATATATTTGATCGACGCAGCATGCCC
ATCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCTAGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGATTTGCA
AGGAGCGCCTCTTTTGATATTGGCAAACAAGCAAGATCTCCCAAATGCTGTCTCGGCTGA
GGAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAAACTAGACGAAAGGGTGTACATGTTTGAAGC
AGCTTCTGGATATGATGGGCGAGGAATCAAAGAGAGCATAGAATGGCTGGTGGGAGTGAT
GGAGAGAAGCAAAAGAACCGAAACATTAAGAGCCCGTGCAGGATACGTTCCTGTCCCAAC
TTCCTAGACTTGAAAGAAGTGTTCACAAACTCAATTCTCAAACCAACTGTTTTCTGTCAG
AAACATTTGTAGATAAAAAAAAAATCGTGCATTGTTTTGTGTTAGCACATGATAAGTAGG
GCTAGTAATAATCCTTATTATATTTGCCTTTACATCATTTCTAATGCTATGATTCAGATT
GAGACTTGAGGTTACTGAAAACAATAACGTAATCAAGTTTCTTG

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 3

CO CL4258Contig1 843 3 5 U
GGGAGTTATTAGGTCTTGAGAGCATCCGATTTTCAATCATGTGGATCTCTCGTGTAGGGT
TTGATGTGTGGGAAGGGTCTGATGAGCTGTCCGGGTGTTTCTGTGACGGTGGGCAGAGAT
GATGGCGGTTAATTTCGTCTACGTGCTTGAATCAGTGGTATCCTTCGATGCCTTGCAGTC
GGGTCTCATTCCGTTGACGTCTAAAGACTTATGGTGTCCCTTTAAAAAAATGGTGGTGTT
TCTTAAGGGTTTGTGAGATTTGACTTATCAGGTTTAGTTCGTAGGGAGTAGTTGCAGTGG
TAGCTTGTGGTTTCGGTTTTATTCTGTGTTATGGCAGGATTATTTCGATTGGCAAGGCTT
CGTGTTTGTGAAGGTTGTGTGGACTTCAATTTAGGAGTTAGCGATCTCTGAAGGCGTCGC
ATCCCTATCCGAAGATTGTGTGGACTGTGTGGAGTTCCCTCTGTCGGATTTTGAAGTTGT
AGGGTCTTGGTTTCTTGGGTGTTATCGTTTGGCGGGCGTGAAGCAGCAGCGGTAAGCCAT
GGGTATGATGAAGGAAGTGGAAGATCTCGTGTGGCGGGCTATAGGCAGCAACGACGATTC
CCGTTCACGGACTGTCCTAAGTTCTAAAATTTGTTAAGTCAATTTGCTCGCTTTTCCTCT
TTTAAGTTTGTGATAGTTGTTTATCTAGCTTTAGTTCCAGTTTTAATCTATCGCTGCCCC
GGTGTGGGTTTAAGTTGCCGCCTTCATGTGGGCTCTAGTGTCTGGGGATTGTTCTTCATC
CGCCAATTGTTGTATCAAAAGTGTTCTTTCTTTGGAATGAAATTTACCAGATGGGAAAAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4B495TF U 1
AF RR4B495JQ C 81
AF RR4DB58TF U 129
BS 1 816 RR4B495TF
BS 817 817 RR4B495JQ
BS 818 821 RR4DB58TF
BS 822 822 RR4B495JQ
BS 823 843 RR4DB58TF

RD RR4B495TF 829 0 0
GGGAGTTATTAGGTCTTGAGAGCATCCGATTTTCAATCATGTGGATCTCTCGTGTAGGGT
TTGATGTGTGGGAAGGGTCTGATGAGCTGTCCGGGTGTTTCTGTGACGGTGGGCAGAGAT
GATGGCGGTTAATTTCGTCTACGTGCTTGAATCAGTGGTATCCTTCGATGCCTTGCAGTC
GGGTCTCATTCCGTTGACGTCTAAAGACTTATGGTGTCCCTTTAAAAAAATGGTGGTGTT
TCTTAAGGGTTTGTGAGATTTGACTTATCAGGTTTAGTTCGTAGGGAGTAGTTGCAGTGG
TAGCTTGTGGTTTCGGTTTTATTCTGTGTTATGGCAGGATTATTTCGATTGGCAAGGCTT
CGTGTTTGTGAAGGTTGTGTGGACTTCAATTTAGGAGTTAGCGATCTCTGAAGGCGTCGC
ATCCCTATCCGAAGATTGTGTGGACTGTGTGGAGTTCCCTCTGTCGGATTTTGAAGTTGT
AGGGTCTTGGTTTCTTGGGTGTTATCGTTTGGCGGGCGTGAAGCAGCAGCGGTAAGCCAT
GGGTATGATGAAGGAAGTGGAAGATCTCGTGTGGCGGGCTATAGGCAGCAACGACGATTC
CCGTTCACGGACTGTCCTAAGTTCTAAAATTTGTTAAGTCAATTTGCTCGCTTTTCCTCT
TTTAAGTTTGTGATAGTTGTTTATCTAGCTTTAGTTCCAGTTTTAATCTATCGCTGCCCC
GGTGTGGGTTTAAGTTGCCGCCTTCATGTGGGCTCTAGTGTCTGGGGATTGTTCTTCATC
CGCCAATTGTTGTATCAAAAGTGTTCTTTCTTTGGA
ATGAAATTTACCA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4B495JQ 755 0 0
GATGAGCTGTCCGGGTGTTTCTGTGACGGTGGGCAGAGATGATGGCGGTTAATTTCGTCT
ACGTGCTTGAATCAGTGGTATCCTTCGATGCCTTGCAGTCGGGTCTCATTCCGTTGACGT
CTAAAGACTTATGGTGTCCCTTTAAAAAAATGGTGGTGTTTCTTAAGGGTTTGTGAGATT
TGACTTATCAGGTTTAGTTCGTAGGGAGTAGTTGCAGTGGTAGCTTGTGGTTTCGGTTTT
ATTCTGTGTTATGGCAGGATTATTTCGATTGGCAAGGCTTCGTGTTTGTGAAGGTTGTGT
GGACTTCAATTTAGGAGTTAGCGATCTCTGAAGGCGTCGCATCCCTATCCGAAGATTGTG
TGGACTGTGTGGAGTTCCCTCTGTCGGATTTTGAAGTTGTAGGGTCTTGGTTTCTTGGGT
GTTATCGTTTGGCGGGCGTGAAGCAGCAGCGGTAAGCCATGGGTATGATGAAGGAAGTGG
AAGATCTCGTGTGGCGGGCTATAGGCAGCAACGACGATTCCCGTTCACGGACTGTCCTAA
GTTCTAAAATTTGTTAAGTCAATTTGCTCGCTTTTCCTCTTTTAAGTTTGTGATAGTTGT
TTATCTAGCTTTAGTTCCAGTTTTAATCTATCGCTGCCCCGGTGTGGGTTTAAGTTGCCG
CCTTCATGTGGGCTCTAGTGTCTGGGGATTGTTCTTCATCCGCCAATTGTTGTATCAAAA
GTGTTCTTTCTTTGGAATGAAATTTACCA
GATGGG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4DB58TF 715 0 0
G
TAATTTCGTCTACGTGCTTGAATCAGTGGTATCCTTCGATGCCTTGCAGTCGGGTCTCAT
TCCGTTGACGTCTAAAGACTTATGGTGTCCCTTTAAAAAAATGGTGGTGTTTCTTAAGGG
TTTGTGAGATTTGACTTATCATGTTTAGTTCGTAGGGAGTAGTTGCAGTGGTAGCTTGTG
GTTTCGGTTTTATTCTGTGTTATGGCAGGATTATTTCGATTGGCAAGGCTTCGTGTTTGT
GAAGGTTGTGTGGACTTCAATTTAGGAGTTAGCGATCTCTGAAGGCGTCGCATCCCTATC
CGAAGATTGTGTGGACTGTGTGGAGTTCCCTCTGTCGGATTTTGAAGTTGTAGGGTCTTG
GTTTCTTGGGTGTTATCGTTTGGCGGGCGTGAAGCAGCAGCGGTAAGCCATGGGTATGAT
GAAGGAAGTGGAAGATCTTGTGTGGCGGGCTATAGGCAGCAACGACGATTCCCGTTCACG
GACTGTCCTAAGTTCTAAAATTTGTTAAGTCAATTTGCTCGCTTTTCCTCTTTTAAGTTT
GTGATAGTTGTTTATCTAGCTTTAGTTCCAGTTTTAATCTATCGCTGCCCCGGTGTGGGT
TTAAGTTGCCGCCTTCATGTGGGCTCTAGTGTCTGGGGATTGTTCTTCATCCGCCAATTG
TTGTATCAAAAGTGTTCTTTCTTTGGA*TGAA*TTTACCAGATGGGAAAAAAAA

QA 2 715 2 715
DS 



AS 1 3

CO CL4259Contig1 1140 3 3 U
GGATCCTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGTTTCGTTTCTCTTCTAGGAAAGAAGAGT
CTCCAAGTTCCAAGTTAACGCAAGAAGTAAACATGGGTCCTGTTGGATTTTTAGTCATGG
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ATAACGGACTTAGCTGCGGTTCTTGCTTTGAGATAAGATGTGAAAACGATGGTAAATGGT
GTCTCCCTGGCTCAATTGTTGTAACCGCTACAAACTTTTGCCCACCAAACAACGCCTTAC
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GAACAGGTTGGCAAGCCATGTCAAGAAACTGGGGGCAAAACTGGCAAAGCAACTCTTACC
TCAACGGTCAAGCGCTTTCTTTCAAAGTCACCACTAGTGACGGCCGTACCGTTGTCTCCT
ACAACGCAGCTCCTTCTGGCTGGTCCTTCGGCCAGACATTCACCGGTGGACAGTTCCGCT
AAAAGGAGCAGTTTGGTCATTCTATACTATTTTTATATCTAAAAAGTAAACTTGTTTGTG
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TGGTTTTGCAGAAGGCCTTGATGACATTTACCTTTTTGAACCTCTTTATTTATTTTTTTT
CTTGAAATGTAGTTTTATACTAAGGGGGGGGAAAAGAAACACATAGTAGTAGTTATTGTA
TTACTGATGCAGAGATGGAGTTAAACTACCCCCCGCTAGTAGTAACGAGTATCCCCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DY72TF U 1
AF RR4EV59TF U 367
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GG
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CA

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DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4B431JQ C 1
AF RR4BC83TF U 5
AF RR4B431TF U 1
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TCTGTTATTAGTCTCTGCGACTCTGTGTATGTTCTCTCTTCGATACATTTGTAAAAGTG

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU89JQ U 14
AF RR4C846JQ U 1
AF RR4C846TF C 655
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RD RR4CU89JQ 714 0 0
G
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ATATACAGTTGACGTAGAGAGAGAGGAAGTCTATTGGGAGAAAACAACCTGGAAACAAG*
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GCGACCTGGATTGCAGCTGCAGCAGCAGCTCCAGAAGATATACCAACCAACAAGCCTTCT
TGGAGAGCTAGTTGCTTTGCAGTTTCAATAGCTTCATCACTGGAAATCGCTATGTATTCA
TCTACAATAGTCTGATCCAAATTCTTAGGAATAAATCCAGCTCCAATCCCTTGAATCTTG
TGAGGTCCTGGTTTTCCTCCAGCAAGTATGGCGCTTTCCGTGGGTTCAACACCAATAACC
TTGAGTTCAGGTTTTCTTTCTTTAATGTATCGACCAACACCAGTAATGGTTCCACCAGTT
CCAATTCCAGCAACCAATATATCCACCTTCCCTCTTGTATCTTCCCAAATCTCAGGACCA
GTTGTCTCGTAATGAATCTTGGGATTGGCAGGGTTGTCAAACTGTTGGAGCAT

QA 2 714 2 714
DS 

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GGAAATTTCAAATCTCAGGCTGCATTTTCTCGCACTCTTCACGGATCGACTGGAAGAGCA
TTGTCGAGAGGTAACGTTCCCCGAAGCTCGGGAACACAACAGCTATGAGTTTCCCGGCAT
TTTCAGGTCTCCTTGCGACCTGGATTGCAGCTGCAGCAGCAGCTCCAGAAGATATACCAA
CCAACAAGCCTTCTTGGAGAGCTAGTTGCTTTGCGGTTTCAATAGCTTCATCACTGGAAA
TCGCTATGTATTCATCTACAATAGTCTGATCCAAATTCTTAGGAATAAATCCAGCTCAAA
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TGGTTCCACCAGTTCCAATTCCAGCAACCAATATATCCACCTTCCCTCTTGTATCTTCCC
AAATCTCAGGACCAGTTGTCTCGTAATGAATCTTGGGATTGGCAGGGTTGTCAAACTGTT
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DS 

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TC
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GCGATATTGAGCCCTTCAACACCAGCTTCGACCTTTGCAGACACAGCCTTGCACACGACA
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ATGGTTTGGATCTTTCGTCCTTCC

QA 3 746 3 746
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GTTCTCCTTCCTCTTTGCTAACAGCTCTCTTGTGAGCAAGATCGCATTTGTTCCCAATCA
GCATAATACTCATGTTGGGATTAGCATGTTGCCGAGCATCCTCTAACCAGCTCGCCAGAT
GGTTAAACGTCTCTCTCCTGGTGATGTCGTAGACAAGTAAAGCTCCAGCTGCTCCTCTGT
AGTACGACCTAGTGATGGATCTAAATGACTCTTGTCCAGCGGTGTCCCAAATTTGGAGTT
TGATGGGACGACCATCGACGGTGACCATACGAGCACCGAACTCGACACCAATGGTGAGAT
CGTGGACTGGTTGGAACCTCTTGTCAGTAAATTGCAGAAGCAAGCAAGATTTCCCCACAC
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TTGGGAGCAAGGTGGATGGATGATCGCTTGGGAGGAAGAAGAAGAGATGGAGGAGAGTTA
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BQ
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DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4CE84JQ C 207
AF RR4CE84TF U 207
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GAGCTGACTGTGGACCCATTCACCAGAACGGACCTTGTTTCAACCCAAACACCGTCAAGT
CTCACTGCTCCTACGCCGTCAACAGCTTCTTCCAGAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTT
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TTCCTGCAAGTGCCAGTGGAAGTGGGACAATGACACCAGTGACGACAACACCATCGACAA
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TGGGGATTCCAGCTGGTGGTTTCAACCCAGACTACACAGATCCATCCTATTCCTTTGGAT
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*GATCTAGTAGTAGACA
CAACAA

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ATTGTGC

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DS 

RD RR4CE84TF 673 0 0
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CGACAACACCATCGACAAGAGTCCCTAC***AACAAATACAAGACCCTACACAGTCACAC
CTCCAACAGGAGGAGGTTTGGGGATTCCAGCTGGTGGTTTCAACCCAGACTACACAGATC
CATCCTATTCCTTTGGATCCAAACTCCAGAACCCAAGAGCTCTACCACTTTATTTTTTAT
CTGGATTCTTCTACTTGTTGATCTAGTAGTAGACAACAACAACTAAGTTGGACTGTGGAT
CATGTGAATGTGGGTCTCTCTCTCTCTCACTAATGGAATCTTTTGAGAGATAGACTTGTT
TTGTTCAACCTTGTCTGTTATTTTCCCTAGCTGTTATCCACTTGGCTTTGAAAAAAA

QA 17 673 17 673
DS 



AS 1 3

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AACGATCCTGTTCTTGCTGACACACTCTGGCAATCCGGGCTTTCTAATTTGTTTACTGAT
ATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTAT
AGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCTTGAAGATGGGAAG
CGGACCTATTACACATTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCAAAATCCAAATCC
AAGAGCAGTTCTTCAAGCAAGACGAATGATTCTCCTTTAGCTGAGCCTTTAGTAGGTGGA
GAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGTGGAAGGT
ATGGCTCTGTTTCATATTCATGGAGACAAGTGTATGTTTCACGAAG*AAGAAATGTCTCC
AAGGGAGTCAAGTATGTGTTCCGTTCTGATGTTGTTTTTGCATAACGAAACATTATTCAC
ATTCTATGTGTTTTGTGTTTCACAAATTTATTACTTTCATTCAACATTTCGAACCAGTAA
TTAACTTTATGTTCACTGAAGCAGAACAACGTTACATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM25TF U 1
AF RR4DS89TF U 59
AF RR4DS89JQ C 60
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BS 741 758 RR4GM25TF
BS 759 879 RR4DS89JQ

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DS 

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GG
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ATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTAT
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DS 

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G
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CTCACTAGTGATGAGTCAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTAGGTTTCACTCAC
CAAGGAAGCCGAGGCCCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAATCTCTGTG
AACGATCCTGTTCTTGCTGACACACTCTGGCAATCCGGGCTTTCTAATTTGTTTACTGAT
ATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTAT
AGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCTTGAAGATGGGAAG
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AAGAGCAGTTCTTCAAGCAAGACGAATGATTCTCCTTTAGCTGAGCCTTTAGTAGGTGGA
GAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGTGGAAGGT
ATGGCTCTGTTTCATATTCATGGAGACAAGTGTATGTTTCACGAAGGAAGAAATGTCTCC
AAGGGAGTCAAGTATGTGTTCCGTTCTGATGTTGTTTTTGCATAACGAAACATTATTCAC
ATTCTATGTGTTTTGTGTTTCACAAATTTATTACTTTCATTCAACATTTCGAACCAGTAA
TTAACTTTATGTTCACTGAAGCAGAACAACGTTACATAG

QA 2 820 2 820
DS 



AS 1 3

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ACATTGACGCTTGGAGATTTGAGAGGATGTCTTTCCATGGTGTGCTATTGCAAAGGAGCA
AATGCAGATGTTTGGGTGATGAAGGAGTTTGGAGAAAGAGATTCTTGGTCTAAACTCTTG
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TCTCCGAGTGACCTTTAAGAGTTGGGCTCTAACCAGATCTATAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CF20TF U 1
AF RR4H824TF U 2
AF RR4CF20JQ C 459
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BS 661 779 RR4CF20TF
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CCATATGGAGTTGTTCTTGCTAACAAATCAAGATCCGGTATCTACATCAATGGAACACTA
AACTGGGCAGCCACTCATTCCTCATCATCATCATCAGTTTCTACCATCATATCATACGA

QA 1 779 1 779
DS 

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GCTTCTTCTCTCTCCCTAATCTTCCTCCTGAAATGATGGAAGAGATTCTCTTGAGACTAC
CTGTAAAGTCATTGAAGAGATTCAAACGCGTTTGCCTCTCGTGGAGATCTTTGATCTCAG
AGTCTCTGTTTACTCTGAAACACGCTTTGATGTTGGAGGCCTCCAAGGCAACCACTTATA
AGAAGAGTCCATACGGAGTCATCACAACGTCTCGGTACCATCTCAAGTCTTGCTGCGTCC
ACTCTCTGTATAATGAGCCAATGGCCAACGTCTTTGAGCACGATGGTGAGCTTTTAGGCA
GGGATTACTACCAAGTCGTTGGGACCTGCAATGGGTTGGTCTGTTTCCATGTAGATTACA
ACAAAAGCTTCTATTTGTGGAACCCGACCATCAAGGTTCAACAAAGATTGATTGGTTCAG
ATCTTGAAGCGGGGGATGAGGTTGTTGTAAACTATGGATTTGGTTATGATGAATCTGAAG
ATGACTATAAGATAGTTGCATTGTTGCAACAAAGACACGAACTGAAGACAGAGGCAATGA
TCTACTCAACGAGACAAAAGCTATGGAGAAGAAGAAGAAGCAGCAGCAGCACTTGTTTTC
CATATGGAGTTGTTCTTGCTAACAAGTCAAGATCCGGCATCTACATCAATGGAACACTAA
ACT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CF20JQ 728 0 0
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ATTTGGTTATGATGAATCTGAAGATGACTATAAGATAGTTGCATTGTTGCAACAAAGACA
CGAACTGAAGAC*GAGGCAATGATCTACTCAACGAGACAAAAGCTATGGAGAAGAAGAAG
CAGCAGCAGTAGCACTTGTTTTCCATATGGAGTTGTTCTTGCTAACAAATCAAGATCCGG
TATCTACATCAATGGAACACTAAACTGGGCAGCCACTCATTCCTCATCATCATCATCAGT
TTCTACCATCATATCATACGATATGGCACGAGATGTGTTCAATGAGCTTCTTGGACCAGG
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GGTGTGCTATTGCAAAGGAGCAAATGCAGATGTTTGGGTGATGAAGGAGTTTGGAGAAAG
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GATCTCAAGAGGTTTGGTGGTTTTGTTGGAGTTTAGATCCGGTTTAGCTCTCTACAACTG
TTCCACTGGAAAGTTTCAGTACCCAGTTTCAGACAGCTTGAGTGGTTGTCGGGACGCTAA
AGTCTATGTCAAGACATTGGTTTCTCCGAGTGACCTTTAAGAGTTGGGCTCTAACCAGAT
CTATAAAA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL4267Contig1 1073 3 3 U
GCATGCAAGAAAATTTAGTTTATTTGTCTATAAAATCCCATCTCAAAAGTAAATATATCA
ATACCAGCCAATATAAAAGGGCAACACAAAAGCTGGATAAGAAAGAAGACGAACACTAAA
CTCAATGCTCTCACATCTTAATAAATGTCGGCGAAAAAGAAGAAACGACATGGGTCGCTT
TTTCTTATTATTATTACTCAAGAGACTAATCACGTCTTAGAAAGATAATCCCCTCAGTTG
CGGAACTCATCCATGAAGCTCTTGTGGAACTCAGTAAGACGGTTCACGATTGCCGGTATC
TTATCTTCTTGCGGAAGTATCGTCAACCTGAAATGCCATGTTCCCGGTACCTGTCTAAAT
CCAGAACCAGGGACAACGACTATTCCCGTAGCGTTTAGAAGGCGTTTGCAGTAGAAAGTG
TCCGGTGAAGTCTTTGCAGCTTCTGCAGCTGCAATCGCCTTTTGTGGAAGTTTAATGCGA
GGGAACAGATACATAGCTCCCTCTGCTCTATTGCATGTTATACCCTCCAACTTCTTCAGA
CCTTCTTCAAGTGTCTTCGCACGTCTTGCCATAGACGAGAGAATCCCCTCTTTCTCTGCT
ATGTATGACTCGTATGACTCATCACCAGGCTTGGGTGGGCTCATGACGAGGCTGGCAAGA
ATCTGACCAGAGATGTTGGAGCAAAGATTCA*AGAAGCCACTTTGTATATCTGTTCTCTT
ACATCAGAAGTGAAACCAGTGACCTCCATGTAACCTCCTCTCTTCCCACACTCTCCATAG
TATCCTTTGGAGATAGATTGGAACGAGACCAAGGAGATATCCTTCTCACCGTAGCCCACA
GACCGGGCCACTTTCTTGAAAGAGTGGAACTTTTTGTCAGGGACGTAAACGTTTTCCTGA
TAAACTTCATCGGCTAAAAGAACCAAGCCCTCTTTCTTGCAGAAGTCAACAATGTCACGC
TGGTTTTCTTCTGAAAGAACCTGTCCTGTTGGGTTTCCCGGGTTAATAACCGCCAAGGCT
CTCACAGTGATGCCCTTTGACTTAGCATCCTCCAGTTGCTTCTTCAGCTCAGC


BQ
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AF RR4D878JQ U 1
AF RR4BG76JQ U 43
AF RR4D878TF C 267
BS 1 715 RR4D878JQ
BS 716 876 RR4BG76JQ
BS 877 1073 RR4D878TF

RD RR4D878JQ 715 0 0
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ATCTGACCAGAGATGTTGGAGCAAAGATTCA*AGAAGCCACTTTGTATATCTGTT

QA 1 715 1 715
DS 

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AAACGACATGGGTCGCTTTTTCTTATTATTATTACTCAAGAGACTAATCACGTCTTAGAA
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CGTTTGCAGTAGAAAGTGTCCGGTGAAGTCTTTGCAGCTTCTGCAGCTGCAATCGCCTTT
TGTGGAAGTTTAATGCAAGGGAACAGATACATAGCTCCCTCTGCTCTATTGCATGTTATA
CCCTCCAACTTCTTCAGACCTTCTTCAAGTGTCTTCGCACGTCTTGCCATAGACGAGAGA
ATCCCCTCTTTCTCTGCTATGTATGACTCGTATGACTCATCACCAGGCTTGGGTGGGCTC
ATGACGAGGCTGACAAGAATCTGACCAGAGATGTTGGAGCAAAGATTCACAGAAGCCACT
TTGTATATCTGTTCTCTTACATCAGAAGTGAAACCAGTGACCTCCATGTAACCTCCTCTC
TTCCCACACTCTCCATAGTATCCTTTGGAGATAGATTGGAACGAGACCAAGGAGATATCC
TTCTCACCGTAGCCCACAGACCGGGCCACTTTCTTGAAAGAGTGGAACTTTTTG

QA 1 834 1 834
DS 

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TG
ACTCAGTAAGACGGT*CACGAT*GCCGGTATCT*ATCTTCT*GCGGAAGTATCGTCAAC*
TGAAATGCCATGTTCCCGGTAC*TGTCTAAATCCAGAACCAGGGACAACGACTATTCCCG
TAGCGTT*AGAAGGCGTTTGCAGTAGAAAGTGTCCGGTGAAGTCTTTGCAGCTTCTGCAG
CTGCAATCGCCTTTTGTGGAAGTTTAATGCGAGAGAACAGATACATAGCTCCCTCTGCTC
TATTGCATGTTATACCCTCCAACTTCTTCAGACCTTCTTCAAGTGTCTTCGCACGTCTTG
CCATAGACGAGAGAATCCCCTCTTTCTCTGCTATGTATGACTCGTATGACTCATCACCAG
GCTTGGGTGGGCTCATGACGAGGCTGGCAAGAATCTGACCAGAGATGTTGGAGCAAAGAT
TCA*AGAAGCCACTTTGTATATCTGTTCTCTTACATCAGAAGTGAAACCAGTGACCTCCA
TGTAACCTCCTCTCTTCCCACACTCTCCATAGTATCCTTTGGAGATAGATTGGAACGAGA
CCAAGGAGATATCCTTCTCACCGTAGCCCATAGACCGGGCCACTTTCTTGAAAGAGTGGA
ACTTTTTGTCAGGGACGTAAACGTTTTCCTGATAAACTTCATCGGCTAAAAGAACCAAGC
CCTCTTTCTTGCAGAAGTCAACAATGTCACGCTGGTTTTCTTCTGAAAGAACCTGTCCTG
TTGGGTTTCCCGGGTTAATAACCGCCAAGGCTCTCACAGTGATGCCCTTTGACTTAGCAT
CCTCCAGTTGCTTCTTCAGCTCAGC

QA 3 807 3 807
DS 



AS 1 2

CO CL4268Contig1 898 2 2 U
GGGTCGCGCAACTCTCATCTCCGATGACAATTCAGATTTCGACACCATAACGCTCTAAGT
AAAAATTCTGTATTGAATCCCTTCAGTCACTCATCCACTACGTGGTCTTCAATTCTCTTA
TTTGATCTTAGGACGGTGGTGTCACAGTATAAATAGGTGTGCGATTTCTTCTTTCCAACT
CATCCTCTCATCGATTCTCACTCATTCATGGCGGCGAGTGAATGAGTGACGAGGGTTCAT
CGGAGACGACGGCGGATGGCAGATGGCGGCGAGGGTTCATCGGAGATGACGAAAGCGGAG
CTCCCAGAGAAATTGGCGAAAAGCGTTGTGATATTGACGTGCGAGTCCACAAGGGAAAGC
GGGTCTTGGCGGATCTTGTGATGTGTGTTTGATCGGGACTGCTCATGCTTCAAAGGAATC
ATGTCGAGAAGTTCAAGCAGTAATCAGCATCTTGAAACCAGAGGCTGTCTTCGTGGAGTT
GTGTTCAAGCCGTTTGTCTATTCTCAAACCTCAGACTTTGAAGTGGTCCTTATGATGAAG
GGAAATTGAAATTGGAGCTTGATGTTTGAATGATAAGTGTCTGCATTGAGCTTGGTTTTT
AGGAACAATCAGACACTCTCACACTTCTGTGCAAGGTCTTCATCAAGATATCAGTAGGAG
ATGAATCACAAAGGAGGCCAACGAATCTGAGGTTTGGCAGTATAATCTAGGATTCTGCAA
AGGATCTTTCTGTTGCTGTTCTGTTTATTTTCACTTAACATGTTAGTCGGATAGTTTTGT
GTCTATGATGGAGTATAGTATGATGATAAGTACTAACATTTACTTGGGAAAGCGATTTTT
TCCCTTAGCCGCTTTAAACTTTTTGTAAGACATTCAGTTCTACCAAGTGTAGAATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ87TF U 1
AF RR4EQ87JQ C 28
BS 1 692 RR4EQ87TF
BS 693 898 RR4EQ87JQ

RD RR4EQ87TF 695 0 0
GGGTCGCGCAACTCTCATCTCCGATGACAATTCAGATTTCGACACCATAACGCTCTAAGT
AAAAATTCTGTATTGAATCCCTTCAGTCACTCATCCACTACGTGGTCTTCAATTCTCTTA
TTTGATCTTAGGACGGTGGTGTCACAGTATAAATAGGTGTGCGATTTCTTCTTTCCAACT
CATCCTCTCATCGATTCTCACTCATTCATGGCGGCGAGTGAATGAGTGACGAGGGTTCAT
CGGAGACGACGGCGGATGGCAGATGGCGGCGAGGGTTCATCGGAGATGACGAAAGCGGAG
CTCCCAGAGAAATTGGCGAAAAGCGTTGTGATATTGACGTGCGAGTCCACAAGGGAAAGC
GGGTCTTGGCGGATCTTGTGATGTGTGTTTGATCGGGACTGCTCATGCTTCAAAGGAATC
ATGTCGAGAAGTTCAAGCAGTAATCAGCATCTTGAAACCAGAGGCTGTCTTCGTGGAGTT
GTGTTCAAGCCGTTTGTCTATTCTCAAACCTCAGACTTTGAAGTGGTCCTTATGATGAAG
GGAAATTGAAATTGGAGCTTGATGTTTGAATGATAAGTGTCTGCATTGAGCTTGGTTTTT
AGGAACAATCAGACACTCTCACACTTCTGTGCAAGGTCTTCATCAAGATATCAGTAGGAG
ATGAATCACAAAGGAGGCCAACGAATCTGAGG
TTG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4EQ87JQ 871 0 0
CAATTCAGATT*CGACACCATAACGCTCTAAGTAAAA*TTCTGTATTGAT**CCTTCAGT
CACTCATCCACTACGTGGTCTTCAATTCTCTTATTTGATCTTAGGACGGTGGTGTCACAG
TATAAATAGGTGTGCGATTTCTTCTTTCCAACTCATCCTCTCATCGATTCTCACTCATTC
ATGGCGGCGAGTGAATGAGTGACGAGGGTTCATCGGAGACGACGGCGGATGGCAGATGGC
GGCGAGGGTTCATCGGAGATGACGAAAGCGGAGCTCCCAGAGAAATTGGCGAAAAGCGTT
GTGATATTGACGTGCGAGTCCACAAGGGAAAGCGGGTCTTGGCGGATCTTGTGATGTGTG
TTTGATCGGGACTGCTCATGCTTCAAAGGAATCATGTCGAGAAGTTCAAGCAGTAATCAG
CATCTTGAAACCAGAGGCTGTCTTCGTGGAGTTGTGTTCAAGCCGTTTGTCTATTCTCAA
ACCTCAGACTTTGAAGTGGTCCTTATGATGAAGGGAAATTGAAATTGGAGCTTGATGTTT
GAATGATAAGTGTCTGCATTGAGCTTGGTTTTTAGGAACAATCAGACACTCTCACACTTC
TGTGCAAGGTCTTCATCAAGATATCAGTAGGAGATGAATCACAAAGGAGGCCAACGAATC
TGAGGTTTGGCAGTATAATCTAGGATTCTGCAAAGGATCTTTCTGTTGCTGTTCTGTTTA
TTTTCACTTAACATGTTAGTCGGATAGTTTTGTGTCTATGATGGAGTATAGTATGATGAT
AAGTACTAACATTTACTTGGGAAAGCGATTTTTTCCCTTAGCCGCTTTAAACTTTTTGTA
AGACATTCAGTTCTACCAAGTGTAGAATTTG

QA 1 871 1 871
DS 



AS 1 2

CO CL4269Contig1 1145 2 10 U
CTCTCTCTCCGCCACTCTACAATGGCCGGTCTACTCAAAACGCCGTCTTTACACCTCACG
CCGTCTCTCACTCATGCACCCTCTGCGCCCTTCAAGCCCTTCTGTGTCTCCTTCGCCGGA
GGAAGGAGAACTAGCTTCTCACTCTCTCGCCGAGCTTCTCTGCGTTCCGTCTCTGGTGGC
TGTCCTCTCCGTTTACTTAACTTCGTACCCTTTGCTTCTGGAGAAGCCGTAACGACTGAG
ACTGAGGTGGAATCGAGCGAACCCGAAGTCCAGGAGACGGATGGTGCTGAGGGTGAAAAC
GCTGGCGGTGAGGAAGAAGAAGCGGCGGTTACCATAGCATTGCTGAGTTCATACAAAGAA
GCTTTAGCAGAGAACAACGAGGAGAAGATTGCTGAGATAGAAGCGTCACTGAAGTCCATC
GAAGATGAAAAGTTTCAACTCCAGGAGAAAGCCGCCTCTTTATCTAATGAGTTAACTGTA
GAGAGGGATCGGCTGATAAGGATCAGTGCGGACTTCGACAACTTCAGGAAGAGGAACGAG
AGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAAATGCTCAAGGGGAGGTTGTTGAGAATCTGTTGGCG
GTTTTGGATAATTTCGAGAGAGCTAAGTCCCAGATCAAGGTGGAGACCGAGGGAGAAGAG
AAAGTCACAAACAGCTACCAGAGCATATACAAACAGTTTGTTGAGATTCTAGGTTCGCTT
GGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCGGCAAGCAGTTTGATCCGATGCTACACGAGGCAATA
ATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACGAAGAGGGTATAGTACTTGAAGAATACAGGAAAGGT
TTCTTGCTAGGGGAAAGACTTTTACGTCCTTCAATGGTGAAAGTATCAGCTGGACCCGGA
CCAGAAAAGCCAGGTGAAACTGAAGGAGAAGTAGCCGTTGCACAAGGAAGCGCAGAAGGA
GCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCATCTTGAATGAACAGACAATCAAGACTAAGCAGTTTT
GTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAAGGGTCTGGTTAAGATTTAATTATTGG
CATTGTTGTTGTTGTTACACTAAATTATTTCTACAGAGTTTAGCGAAAATAGAATGAGAT
TTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4BT79TF U 1
AF RR4BA91JQ C 506
BS 1 665 RR4BT79TF
BS 666 666 RR4BA91JQ
BS 667 707 RR4BT79TF
BS 708 708 RR4BA91JQ
BS 709 712 RR4BT79TF
BS 713 713 RR4BA91JQ
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BS 746 746 RR4BA91JQ
BS 747 774 RR4BT79TF
BS 775 1145 RR4BA91JQ

RD RR4BT79TF 780 0 0
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CCGTCTCTCACTCATGCACCCTCTGCGCCCTTCAAGCCCTTCTGTGTCTCCTTCGCCGGA
GGAAGGAGAACTAGCTTCTCACTCTCTCGCCGAGCTTCTCTGCGTTCCGTCTCTGGTGGC
TGTCCTCTCCGTTTACTTAACTTCGTACCCTTTGCTTCTGGAGAAGCCGTAACGACTGAG
ACTGAGGTGGAATCGAGCGAACCCGAAGTCCAGGAGACGGATGGTGCTGAGGGTGAAAAC
GCTGGCGGTGAGGAAGAAGAAGCGGCGGTTACCATAGCATTGCTGAGTTCATACAAAGAA
GCTTTAGCAGAGAACAACGAGGAGAAGATTGCTGAGATAGAAGCGTCACTGAAGTCCATC
GAAGATGAAAAGTTTCAACTCCAGGAGAAAGCCGCCTCTTTATCTAATGAGTTAACTGTA
GAGAGGGATCGGCTGATAAGGATCAGTGCGGACTTCGACAACTTCAGGAAGAGGAACGAG
AGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAAATGCTCAAGGGGAGGTTGTTGAGAATCTGTTGGCG
GTTTTGGATAATTTCGAGAGAGCTAAGTCCCAGATCAAGGTGGAGACCGAGGGAGAAGAG
AAAGTTACAAACAGCTACCAGAGCATATACAAACAGTTTGTTGAGAT*CTAG*TTCGCTT
GGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCG*CAAGCAGTTTGATCCGATGCTACACGAG
CAATAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4BA91JQ 640 0 0
GTGCAGAT
TTCGACAACTTCAGGAAGAGGAACGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAAATGCTCAA
GGGGAGGTTGTTGAGAATCTGTTGGCGGTTTTGGATAATTTCGAGAGAGCTATGTCCCAG
ATCAAGGTGGAGACCGAGGGAGAAGAGAAAGTCACAAACAGCTACCAGAGCATATACAAA
CAGTTTGTTGAGATTCTAGGTTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCGGCAAGCAG
TTTGATCCGATGCTACACGAGGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACGAAGAGGGT
ATAGTACTTGAAGAATACAGGAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGACTTTTACGTCCTTCA
ATGGTGAAAGTATCAGCTGGACCCGGACCAGAAAAGCCAGGTGAAACTGAAGGAGAAGTA
GCCGTTGCACAAGGAAGCGCAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCATCTTGAATG
AACAGACAATCAAGACTAAGCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGA
AGGGTCTGGTTAAGATTTAATTATTGGCATTGTTGTTGTTGTTACACTAAATTATTTCTA
CAGAGTTTAGCGAAAATAGAATGAGATTTTCC

QA 9 640 9 640
DS 



AS 1 2

CO CL4270Contig1 888 2 7 U
GGTAGGCAGTCCATTTTATATCAACTTTTTTCGTTTCACCTTTTCTCTCTTTAAAGAATT
AAAGAAAACAAAAACTGTGTAGAGATCCGAAGGGTAAGAAGAAAAGAAAAGTTATGCAGA
GATAAGACCTACGTAAGTTGCTGAAAGAGAGAGCAAAGAAGATATAACATACGCCATTGT
AACTATCATTGGCTCCTTCAAACCACTTAGCCTTAGGTGACGATGAAACGGCACCGTTCT
GAAAACCCGACGCCCTCATCCCTTTAAACGTTTAGTCGCTGAGTAAAACGCTACCTGAAT
AATGACAGAAGCAGCTTCCAAGATGGAAACACCAGAGGATATGAACAATGGCAAGAACAT
TCCAGAGCAAGCAGCCATTGCCGCCAAAGCTCCACCGATGGCCAATGATCCTGTACCTCC
CATAGACACAGATGCTCTGTATCGATTGTGAAGTAGGAAACCAAAGCAAGCACCAGCCAT
CGAAGCTCCGAATATAGAAAGATCAGAGCAAATAGGAAGAACTGCGATTGCCATTGCAAC
GAAAGCCAAGGCAGCAATACCTCCAGCCAATCCATCGAGACCGTCGGTTGCTTTGACTAA
GTTCCCCATGGAAACGAAGTAGAACGATGTCAACAATAGGTAAAGTTTTCCCAAGCAAAT
GAGACCTCCTAATGGTGAAGGCAAAGGAACCAACATTTTCCCTCATATTAGTTATAAGAT
GCTATACACGCCATAGGGAGATGATATGCTTGCACCCTCCAACCAAAACGCAAAGCACGT
CCCGACCGCTCCCTCCAAAAGAGTTGTATCTTTGCAGATAAACCGTTGTTATTATCACTG
CAGAGGCTTAACGAGTCATCAACTAAACAATCGCTGCAAACAGCACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CY50JQ U 36
AF RR4FG81JQ U 1
BS 1 220 RR4FG81JQ
BS 221 221 RR4CY50JQ
BS 222 363 RR4FG81JQ
BS 364 364 RR4CY50JQ
BS 365 728 RR4FG81JQ
BS 729 729 RR4CY50JQ
BS 730 888 RR4FG81JQ

RD RR4CY50JQ 766 0 0
TCACCTTTTCTCTCTTTAAAGAATTAAAGAAAACAAAAACTGTGTAGAGATCCGAAGGGT
AAGAAGAAAAGAAAAGTTATGCAGAGATAAGACCTACGTAAGTTGCTGAAAGAGAGAGCA
AAGAAGATATAACATACGCCATTGTAACTATCATTGGCTCCTTCAAACCACTTAGCCTTA
GGTGACGATGAAACGGCACCGTTCTGAAAACCCGACGCCCTCTTCCCTTTAAACGTTTAG
TCGCTGAGTAAAACGCTACCTGAATAATGACAGAAGCAGCTTCCAAGATGGAAACACCAG
AGGATATGAACAATGGCAAGAACATTCCAGAGCAAGCAGCCATTGCCGCCAAAGCTCCAC
CGATGGCCAATGATCCTGTACCTCCCATAGACACAGATGCTCTGTATCGATTGTGAAGTA
GGAAACCAAAGCAAGCACCAGCCATCGAAGCTCCGAATATAGAAAGATCAGAGCAAATAG
GAAGAACTGCGATTGCCATTGCAACGAAAGCCAAGGCAGCAATACCTCCAGCCAATCCAT
CGAGACCGTCGGTTGCTTTGACTAAGTTCCCCATGGAAACGAAGTAGAACGATGTCAACA
ATAGGTAAAGTTTTCCCAAGCAAATGAGACCTCCTAATGGTGAAGGCAAAGGAACCAACA
TTTTCCCTCATATTAGTTATAAGATGCTATACACGCCATAGGGAGATGATATGCTTGCAC
CCTCCAACCAAAACGCAAAGCACGTCCCGACCGCTCCCTCCAAAA
A

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4FG81JQ 888 0 0
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AAAGAAAACAAAAACTGTGTAGAGATCCGAAGGGTAAGAAGAAAAGAAAAGTTATGCAGA
GATAAGACCTACGTAAGTTGCTGAAAGAGAGAGCAAAGAAGATATAACATACGCCATTGT
AACTATCATTGGCTCCTTCAAACCACTTAGCCTTAGGTGATGATGAAACGGCACCGTTCT
GAAAACCCGACGCCCTCATCCCTTTAAACGTTTAGTCGCTGAGTAAAACGCTACCTGAAT
AATGACAGAAGCAGCTTCCAAGATGGAAACACCAGAGGATATGAACAATGGCAAGAACAT
TCCGGAGCAAGCAGCCATTGCCGCCAAAGCTCCACCGATGGCCAATGATCCTGTACCTCC
CATAGACACAGATGCTCTGTATCGATTGTGAAGTAGGAAACCAAAGCAAGCACCAGCCAT
CGAAGCTCCGAATATAGAAAGATCAGAGCAAATAGGAAGAACTGCGATTGCCATTGCAAC
GAAAGCCAAGGCAGCAATACCTCCAGCCAATCCATCGAGACCGTCGGTTGCTTTGACTAA
GTTCCCCATGGAAACGAAGTAGAACGATGTCAACAATAGGTAAAGTTTTCCCAAGCAAAT
GAGACCTCCTAATGGTGAAGGCAAAGGAACCAACATTTTCCCTCATATTAGTTATAAGAT
GCTATACATGCCATAGGGAGATGATATGCTTGCACCCTCCAACCAAAACGCAAAGCACGT
CCCGACCGCTCCCTCCAAAAGAGTTGTATCTTTGCAGATAAACCGTTGTTATTATCACTG
CAGAGGCTTAACGAGTCATCAACTAAACAATCGCTGCAAACAGCACGG

QA 1 888 1 888
DS 



AS 1 3

CO CL4271Contig1 1425 3 19 U
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ACAAAGACTTTAAAATTCACCGGTCGATATCAAGCACTCCGAAAACCCTAGCCAATCTCA
AGAACAAGAAACATAGGTAAATAGCCAGTAATCCGCCACCGACAAGCCGATCAAGCCTCA
TCTTCTTCTTTGGCATTATCACAAGTGCCCAAAGCAAGCCTACCATTAAGAACCCTAGTG
TCTCAAGCAACGAATTGTCACTTGGAATGATATAAACCGCAGGATATTCAACCAAAGAAG
TCATAACAAGTGGCACGCCTAGTCCAATCACCGTGTTGAATAGTGGACCTGCATAGCACC
CCGAAAGTGCTATCTGCGCACCATCGCTGCCTCCGTGAACCGCCACGGTCACGTTGGCTA
TTAAATCGCCTAGAGAATTACCCCAAGCTAGTACGGTTAGTCCTAACACGGAAGGACTAA
TACCAAAGATATTCCCTAGGGATATTAACAATGAGACTAGCTCCTGTGCTATAATGTATG
TCCATGTCACACTCATTGTGAAGCCGCCTAGAAGCCAAACCAGTGAGAATTTTTTTGGTG
GCCGAGACTTTTCCGTCGTCAAGTAGGCTAAGACACCAAAGAATAAACCGATTATTCCAG
AGATTACGTATAGTGTTAGGTTTCTTTTGGACCCGCTGTAATGAGAACAATAAAGTTCGG
TTAGTAGAACAGGCGCGATGGCTGTGGAAACAACCGCGCAAGGCCTTGACCACTTTTCTT
CACTGACCACGGGGATTGTGAGCCGGCGTGGGAGATATAGAGGCAGTCCTACGATGCTCA
CTAGCACCGAGAAGCAAGACGGCTGCTTTGGTGGCAATTCAAGAATCACAATCTTGAATT
CTTGTTCTTGATTTCTTGATTCTTGAGCAACTTTTTGCGGCGGTAAGGGCTTCTCCTCAA
CGATATAGCCGAGGAATGGAACGCCCATCTCGGCTAAATCCTCTTTAGTACGAAGAATCT
GATTGGAAATAGGTTTCTTCCGATCCAAGAAATGCGAGGCCGATAAGAACCCTACATAGA
GGAGATAAATGGAGAGGTAACAAAGCGCGACCCAAATGGTTACTCTGCCGACGAAAACGA
TCAAGCCGAGACAGCAAAGAGCGACCAGTAGAAAAACCACATCGCGGATAAAGCTGTACT
TGTCGATAGAGACATCTCTAGACCCAATCAACAGACAAATCGTCCCGACAACGAAGCTAG
AGACGAAGAACGCACCGCCTAAAACAGAGTTGAGTCCAAAGTCGCCATTATTCGACCTCG
TGAAAGAGACAACGCTCGAGAACAAATCCGGCGCACCGTTTCCGAGAGAGAGAAGCGTAA
CTCCAGCCATGGTGGGAGACAGCTTCAAGACCTTAGACAAGCTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FW85JQ U 1
AF RR4AO07JQ U 22
AF RR4AO07TF C 653
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TCTCAAGCAACGAATTGTCACTTGGAATGATATAAACCGCAGGATATTCAGCCAAAGAAG
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TTAGTAGA

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DS 

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CTGTGGAAACAACCGCGCAAGGCCTTGACCACTTTTCTTCACTGACCACGGGGATTGTGA
GCCGGCGTGGG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4AO07TF 773 0 0
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CTTTTCTTCACTGACCACGGGGATTGTGAGCCGGCGTGGGAGATATAGAGGCAGTCCTAC
GATGCTCACTAGCACCGAGAAGCAAGACGGCTGCTTTGGTGGCAATTCAAGAATCACAAT
CTTGAATTCTTGTTCTTGATTTCTTGATTCTTGAGCAACTTTTTGCGGCGGTAAGGGCTT
CTCCTCAACGATATAGCCGAGGAATGGAACGCCCATCTCGGCTAAATCCTCTTTAGTACG
AAGAATCTGATTGGAAATAGGTTTCTTCCGATCCAAGAAATGCGAGGCCGATAAGAACCC
TACATAGAGGAGATAAATGGAGAGGTAACAAAGCGCGACCCAAATGGTTACTCTGCCGAC
GAAAACGATCAAGCCGAGACAGCAAAGAGCGACCAGTAGAAAAACCACATCGCGGATAAA
GCTGTACTTGTCGATAGAGACATCTCTAGACCCAATCAACAGACAAATCGTCCCGACAAC
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CGACCTCGTGAAAGAGACAACGCTCGAGAACAAATCCGGCGCACCGTTTCCGAGAGAGAG
AAGCGTAACTCCAGCCATGGTGGGAGACAGCTTCAAGACCTTAGACAAGCTGC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

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TCCACAGTCCAATTCAGAGAGAAGCTTCCTTGGTTCCTTAGCGCACTTCCTTCTGCTGAT
TGTGCTAAAGGTGGCCATGGTGCTTATTACTAGTGTTGATTTGCAAGGAGATAAAAATGG
TATCATCCAAGCTTCATCGTTCCGCACTTATCACACACCTCTTAACAAGCAGGCTGACTT
TGTTAATTCAATGAGAGCGGCTCAAGAGTTTAGTTCCAAAGTTTCTCGTTCTTTAAAGAT
GGAGATATATCCATACTCAGTGTTCTATATGTTCTTTGAGCAATATCTCGACATATGGAA
AACTGCATTAATCAACCTCTCCATAGCCATCGCTGCCGTCTTTGCGGTGTGTTTAATCAT
CACATGCAGTTTTTGGAGCTCTGCTATTATCCTGCTGGTGATTGCAATGCTCATCATTGA
TCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAACGCACTATCTGTTGTAAATCT
AATCATGTCAGTGGGCATAGCGGTTGAGTTCTGTGTACACATAACACATGCTTTCTCGAC
AAGCTCTGGGAACAGGAACCAAAGGATGAAAGAGGCGCTTGGTGGGATGGG*AGC**CAG
TTTTCAGTGGAATTACATTGACAAAGCTAGTTGGAGTGATTGTGCTTGGCTTCTCAAAAT
CGGAAGTGTTTGTGGTCTACTACTTCAAGATGTATTTGGCACTAGTCCTCCTCGGTTTCT
TGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGCCCAGCTCCAAGACATG
TAGCAGGGGATAATAAGCAAGATCCTCAACCTTCGGCTTCATCGCTGCCGTAGAGGCTCA
ATTAGGGGTTTTTGATTCTTTATTTACAAAGGTTTTGTTTTGGATACATCTTCTATTTGT
AAATGGTTAAAGATTTGTTTCACCCT


BQ
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AF RR4AL87TF U 1
AF RR4G005TF U 178
AF RR4AL87JQ C 177
BS 1 651 RR4AL87TF
BS 652 652 RR4G005TF
BS 653 833 RR4AL87TF
BS 834 986 RR4AL87JQ

RD RR4AL87TF 841 0 0
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TCCACAGTCCAATTCAGAGAGAAGCTTCCTTGGTTCCTTAGCGCACTTCCTTCTGCTGAT
TGTGCTAAAGGTGGCCATGGTGCTTATTACTAGTGTTGATTTGCAAGGAGATAAAAATGG
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GGAGATATATCCATACTCAGTGTTCTATATGTTCTTTGAGCAATATCTCGACATATGGAA
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TCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAACGCACTATCTGTTGTAAATCT
AATCATGTCAGTGGGCATAGCGGTTGAGTTCTGTGTACACATAACACATGCTTTCTCGAC
AAGCTCTGGGAACAGGAACCAAAGGATGAAAGAGGCGCTTGGTGGGATGGGGAGC**CAG
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CGGAAGTGTTTGTGGTCTACTACTTCAAGATGTATTTGGCACTAGTCCTCCTCGGTTTCT
TGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGCCCAGCTCCA
GACATGTA

QA 1 833 1 833
DS 

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G
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TTTGTTAATTCAATGAGAGCGGCTCAAGAGTTTAGTTCCAAAGTTTCTCGTTCTTTAAAG
ATGGAGATATATCCATACTCAGTGTTTTATATGTTCTTTGAGCAATATCTCGACATATGG
AAAACTGCATTAATCAACCTCTCCATAGCCATCGCTGCCGTCTTTGCGGTGTGTTTAATC
ATCACATGCAGTTTTTGGAGCTCTGCTATTATCCTGCTGGTGATTGCAATGCTCATCATT
GATCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAACGCACTATCTGTTGTAAAT
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ATCGGAAGTGTTTGTGGTCTACTACTTCAAGATGTATTTGGCACTAGTCCTCCTCGGTTT
CTTGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTTCTTGAGCA

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR4AL87JQ 810 0 0
AT
GGTATCATCCAAGCTTCATCGTTCCGCACTTATCACACACCTCTTAACAAGCAGGCTGAC
TTTGTTAATTCAATGAGAGCGGCTCAAGAGTTTAGTTCCAAAGTTTCTCGTTCTTTAAAG
ATGGAGATATATCCATACTCAGTGTTCTATATGTTCTTTGAGCAATATCTCGACATATGG
AAAACTGCATTAATCAACCTCTCCATAGCCATCGCTGCCGTCTTTGCGGTGTGTTTAATC
ATCACATGCAGTTTTTGGAGCTCTGCTATTATCCTGCTGGTGATTGCAATGCTCATCATT
GATCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAACGCACTATCTGTTGTAAAT
CTAATCATGTCAGTGGGCATAGCGGTTGAGTTCTGTGTACACATAACACATGCTTTCTCG
ACAAGCTCTGGGAACAGGAACCAAAGGATGAAAGAGGCGCTTGGTGGGATGGG*AGC**C
AGTTTTCAGTGGAATTACATTGACAAAGCTAGTTGGAGTGATTGTGCTTGGCTTCTCAAA
ATCGGAAGTGTTTGTGGTCTACTACTTCAAGATGTATTTGGCACTAGTCCTCCTCGGTTT
CTTGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGCCCAGCTCCAAGACA
TGTAGCAGGGGATAATAAGCAAGATCCTCAACCTTCGGCTTCATCGCTGCCGTAGAGGCT
CAATTAGGGGTTTTTGATTCTTTATTTACAAAGGTTTTGTTTTGGATACATCTTCTATTT
GTAAATGGTTAAAGATTTGTTTCACCCT

QA 3 810 3 810
DS 



AS 1 3

CO CL4273Contig1 1395 3 2 U
GGAGAGCCAGAATCTCCAGTGGGCTCAGGGGAAAGCCGGGGAGGATCGTGTACACGTGGT
AGTATCGGAAGAGCACGGGTGGCTCTTCGTCGGAATCTACGATGGATTCAACGGTCCAGA
TGCGCCGGATTATCTTCTCTCTCATCTGTATCCAGCTGTTCATCGTGAGCTCAAGGGGTT
GTTATGGGACGATCCCAAACTCGAATCGAGTCTTTCCTCCGATGTCGTTGATTATCAGGA
AAGTAACGGTCCTTGTCCGAGCGAAAACTGTGATCCGAGTTCGGAGAAAAAGTCAAAGAG
CGATTGTCGGAAGTCAAAGAGATGCGAGGAAAGTCAACGGCGGTGGAGATGCGAGTGGGA
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GTCGGATCCGGATCCGAACTCTTCGGACGTTTTGAAGGCCTTGTCGGAAGCTCTGAGGAA
GACGGAAGAGGCGTATCTAGAGAATGCGGATATGATACTCCACGAGAATCCTGAGCTGGC
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TGTGGGAGATAGTAGAGCAGTGCTGGGTCAGAAAGCCGAGACTGAGTACTGGATGGGGAA
GATAAGACGAGACTTGGAACGAATCAACGAAGAAACTATGATTGATTTTAATGGCACTTG
GGAAGGAGAACGAGCTAGTTTGGTGCCGAATCTATCTGCGTTTCAGCTTACCGTTGATCA
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TGCGGTGTCGAATGAACGTGTTAAAGGTTCGTTGAAGGTCACAAGAGCTTTTGGTGCAGG
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GGTTTCAGAGGTGGAACTCTTTATTACGTTACAACCTGAAGGTGACCCGGCTCAACACTT
GGTTCAAGAACTTCTTTTCCGTGCTGCCAAGAAAGCTGGTATGGATTTTCATGAACTGCT
TGAGATACCACAAGGGGAACGGAGACGGTACCACGATGATGTTTCTATTGTAGTGATCTC
TTTAGAAGGAAGAATGTGGAAGTCTTGTGTATAAAAAGTATAATCAAAAACCATATCATA
AATAGAGAGAAACTCGGAGAAGACGTGCAAATATGTATTATGTTAATAATAATCATTAAG
AAAAAAGTTTTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO02TF U 116
AF RR4AT22TF U 1
AF RR4AT22JQ C 647
BS 1 720 RR4AT22TF
BS 721 1395 RR4AT22JQ

RD RR4GO02TF 491 0 0
G
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GGTTGTTATGGGACGATCCCAAACTCGAATCGAGTCTTTCCTCCGATGTCGTTGATTATC
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AGAGCGATTGTCGGAAGTCAAAGAGATGCGAGGAAAGTCAACGGCGGTGGAGATGCGAGT
GGGATCGAGAAAGACTTGATCTCGACCGTTTATTAAAGGA*AAAATCAACAAGAGGACGA
ACGGGTCGGATCCGGATCCGAACTCTTCGGACGTTTTGAAGGCCTTGTCGGAAGCTCTGA
GGAAGACGGAAGAGGCGTATCTAGAGAATGCGGATATGATACTCCACGAGAATCCTGAGC
TGGCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTTGTGATGTTGATGAAAGGTGAAGATGTTTATTTGA
TGAATGTGGG

QA 2 491 2 491
DS 

RD RR4AT22TF 720 0 0
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AGTATCGGAAGAGCACGGGTGGCTCTTCGTCGGAATCTACGATGGATTCAACGGTCCAGA
TGCGCCGGATTATCTTCTCTCTCATCTGTATCCAGCTGTTCATCGTGAGCTCAAGGGGTT
GTTATGGGACGATCCCAAACTCGAATCGAGTCTTTCCTCCGATGTCGTTGATTATCAGGA
AAGTAACGGTCCTTGTCCGAGCGAAAACTGTGATCCGAGTTCGGAGAAAAAGTCAAAGAG
CGATTGTCGGAAGTCAAAGAGATGCGAGGAAAGTCAACGGCGGTGGAGATGCGAGTGGGA
TCGAGAAAGACTTGATCTCGACCGTTTATTAAAGGAGAAAATCAACAAGAGGACGAACGG
GTCGGATCCGGATCCGAACTCTTCGGACGTTTTGAAGGCCTTGTCGGAAGCTCTGAGGAA
GACGGAAGAGGCGTATCTAGAGAATGCGGATATGATACTCCACGAGAATCCTGAGCTGGC
TTTGATGGGTTCTTGTCTTCTTGTGATGTTGATGAAAGGTGAAGATGTTTATTTGATGAA
TGTGGGAGATAGTAGAGCAGTGCTGGGTCAGAAAGCCGAGACTGAGTACTGGATGGGGAA
GATAAGACGAGACTTGGAACGAATCAACGAAGAAACTATGATTGATTTTAATGGCACTTG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AT22JQ 749 0 0
TACTGGATGGGGAAGATAAGACGAGACTTGGAACGAATCAACGAAGAAACTATGATTGAT
TTTAATGGCACTTGGGAAGGAGAACGAGCTAGTTTGGTGCCGAATCTATCTGCGTTTCAG
CTTACCGTTGATCATAGCACAAATGTAGAAGAGGAAGTTGATAGAATAAGAAAGGAGCAT
CCAGATGATGCTAGTGCGGTGTCGAATGAACGTGTTAAAGGTTCGTTGAAGGTCACAAGA
GCTTTTGGTGCAGGTTTCCTCGAGCAGCCAAAATGGAACAATGCGCTCCTCGAAATGTTC
CAAATCGATTACATAGGGACGTCACCTTACATCAATTGCTTGCCAGCACTTTACCACCAT
AGATTAGGCTCTAAAGACCAGTTTCTGATACTATCATCAGATGGTCTCTACCAATACTTC
ACTAATGAAGAAGCGGTTTCAGAGGTGGAACTCTTTATTACGTTACAACCTGAAGGTGAC
CCGGCTCAACACTTGGTTCAAGAACTTCTTTTCCGTGCTGCCAAGAAAGCTGGTATGGAT
TTTCATGAACTGCTTGAGATACCACAAGGGGAACGGAGACGGTACCACGATGATGTTTCT
ATTGTAGTGATCTCTTTAGAAGGAAGAATGTGGAAGTCTTGTGTATAAAAAGTATAATCA
AAAACCATATCATAAATAGAGAGAAACTCGGAGAAGACGTGCAAATATGTATTATGTTAA
TAATAATCATTAAGAAAAAAGTTTTGCAT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

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GTGAGCAAATTGAAAAAGAAAATAACTTAAGTATATACGTGTTCTCTACTCTCCCACATA
TGAGAGTTCCTCATTTTCCAAAACAGCAGTGAACACTCTAGAGATCATCTGGTTCGAACA
CAAGGTGACATGACTTCGACGCTCTGACGACACTAGCCAACTCCTTGAGCATCTCTCGCC
TCTTTTCCAACTTTTCCAGCTCTTTCGGGTTGACGTATGCTGGGTAGAAAGTTATTTTCT
TCAACTGTCTAGCGTTCTTAAGGATGTATGTGGCCACTTGTTTCTCATATTCTCGTTGCC
ATCCGTAGCTTCTCAACACCAGTGTCTCCAGATGGAGCAACAGACATTCTGGTACAAATT
TCGGCTGATTCCATTCCCATCCCACTGGACAATCTTCCCGCCATGAGCTGTTGAGTTTGA
GGGATTGCAATTTAGGAGAGCTGTCGAACATGAAGGAAAGTAGATTCCACCCGCTTATGT
CATCTATACGTAGCTCCAAAGATACCAGCTGATAGAAGATGCTACCAGTAGGATACTTAA
TCTCTAAGGGTAAGTGGAAGGTAAGAGAAA*GACTCTTGGCTGAAGTGAGAGATGCAAGA
ATGTTTTCATTGGCTATATCAGAAACATCTTCCACCTTTGCTTCCACAAGCTCTGGCGCA
TACTCAATCAGACAGAAATCAATAAAATAGAGGCCGTTGATGCTCAAGTATTTCAAAGCT
GGTGCGTTTATCACGTAGCCTCCACCACCTACATCTGTGCTACTATAATCCTCTTTTATG
GTTAGCCTCTGTAGTGATGGCACCGTAATAGTGTAAGTCTCCACATCGAAATTGCTATGT
CGTTCCACAACCAAATCTTGAAGCCTAGGGCAGCCAGATAAAAAGTTGCAAACAGATGCT
TCATCTTTGAATTCCACGTAGTAAAGATGCAGCTCTCTAAGGGCGTCGAA


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL15JQ U 1
AF RR4CT82JQ U 1
AF RR4CT82TF C 366
BS 1 741 RR4BL15JQ
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BS 783 803 RR4CT82JQ
BS 804 804 RR4CT82TF
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BS 843 843 RR4CT82TF
BS 844 855 RR4CT82JQ
BS 856 1010 RR4CT82TF

RD RR4BL15JQ 777 0 0
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QA 1 777 1 777
DS 

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CAAGGTGACATGACTTCGACGCTCTGACGACACTAGCCAACTCCTTGAGCATCTCTCGCC
TCTTTTCCAACTTTTCCAGCTCTTTCGGGTTGACGTATGCTGGGTAGAAAGTTATTTTCT
TCAACTGTCTAGCGTTCTTAAGGATGTATGTGGCCACTTGTTTCTCATATTCTCGTTGCC
ATCCGTAGCTTCTCAACACCAGTGTCTCCAGATGGAGCAACAGACATTCTGGTACAAATT
TCGGCTGATTCCATTCCCATCCCACTGGACAATCTTCCCGCCATGAGCTGTTGAGTTTGA
GGGATTGCAATTTAGGAGAGCTGTCGAACATGAAGGAAAGTAGATTCCACCCGCTTATGT
CATCTATACGTAGCTCCAAAGATACCAGCTGATAGAAGATGCTACCAGTAGGATACTTAA
TCTCTAAGGGTAAGTGGAAGGTAAGAGAAA*GACTCTTGGCTGAAGTGAGAGATGCAAGA
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GT*AGCCTCTGTAGT

QA 1 855 1 855
DS 

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QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4G351TF U 1
AF RR4AG08JQ C 28
AF RR4AG08TF U 28
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TCTGAGAATAAATAAGCCTTTGTTGCAGACCAGTGTGTGTTAAGACGAAACCTGAAGTTA
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QA 1 572 1 572
DS 

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QA 3 562 3 562
DS 

RD RR4AG08TF 562 0 0
GG
AATCGTCAAGAGAGAGACCGAGGAGACCATAACATCAAAGATGGAATCAAAAGCTTTCGG
TTCTGTTACGTTCTTGATCATCACCCTTCTTCTCTGTGGAACAATTCGATTAGGGTTTTG
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GAGTCTCGCTCGGTTTGCTATACGAGAACATAACAACAAAGAGAACAAGGTTCTTGAGTT
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TGAAGCAAACGAAGGTGGCCAGACTAAGAATTTCGAAGCCAAAGTTTGGGTGAAGCCATG
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CCAGTGTGTGTTAAGACGAAACCTGAAGTTAATGTAATCAAGAAACTTGTTTTCTGTTCT
CCTGAAATTTGCTTTTATGC

QA 3 562 3 562
DS 



AS 1 3

CO CL4276Contig1 932 3 8 U
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AATCATAATATATTTTTGTCAATGTTGCAGAGACAAGAAGAGTTAACAAGAGATTGAATA
CATAATTTTCTTTTTAAGAAAGAGATTGAATACATACAATGGAAAACACAAGAGCGATAG
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TTGAGGACGAGGTTCGTCGGGATCGTGAGCGACATGGCTCTTAGGATTTCGAAAGTTCTT
AGGGTGGGAGGATAGAGAGATGATGAGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN39JQ U 116
AF RR4H991JQB U 1
AF RR4AN39TF C 141
BS 1 159 RR4H991JQB
BS 160 160 RR4AN39JQ
BS 161 402 RR4H991JQB
BS 403 403 RR4AN39JQ
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BS 768 768 RR4AN39TF
BS 769 811 RR4H991JQB
BS 812 932 RR4AN39TF

RD RR4AN39JQ 373 0 0
GC
ATACATAATTTTCTTTTTAAGAAAGAGATTGAATACATACAATGGAAAACACAAGAGCGA
TAGAGAAAGAAGCAAACAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTAGACATCCTTGGCGATG
AGATCACCATTGAGTAACGCTCTGTAAGCAGCAATGGGCCAAATGAAACCACGGAAGATG
AGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATGGCTGGTTTCTTCTCATCA
CTGATCGCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTAGAGGAAG
AAAAGTCCTGGTGTTATGAACTCTCCCCAATGCCGCTGGGCTCCGTTGACTATCAAGTGT
GGTAGCCCGTC

QA 3 373 3 373
DS 

RD RR4H991JQB 811 0 0
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AATCATAATATATTTTTGTCAATGTTGCAGAGACAAGAAGAGTTAACAAGAGATTGAATA
CATAATTTTCTTTTTAAGAAAGAGATTGAATACATACAACGGAAAACACAAGAGCGATAG
AGAAAGAAGCAAACAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTAGACATCCTTGGCGATGAGA
TCACCATTGAGTAACGCTCTGTAAGCAGCAATGGGCCAAATGAAACCACGGAAGATGAGA
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ATCGCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAACAATGTAGAGGAAGAGA
AGTCCTGGTGTTATGAACTCTCCCCAATGCCGCTGGCCTCCGTTGACTATCAAGTGTGGT
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TTCTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTCTCAGGAGCGTAGAGCTTAAGA
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CAAGGGGTTAAGCCCGAGATATCGGCGACGGCTGGCATCGGAGCTGAGAGGAGGATGGAA
GAGAGAGCTACGGCCGCGGAGAAAGCCTTCATGGACTGCTGTTGCTGCGGCGTTGCGGAT
TTGTCATCGGAGCAGACGAATCTCGCGGTGG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4AN39TF 792 0 0
AGAGATTGAATACATACAATGGAAAACACAAGAGCGATAGAGAAAGAAGCAAACAAAAGA
TGAAAAGCAGATATGTTTCTAGACATCCTTGGCGATGAGATCACCATTGAGTAACGCTCT
GTAAGCAGCAATGGGCCAAATGAAACCACGGAAGATGAGACGACTAGCCAATGGAACATC
GATAATGATCTCTTTCATGGCTGGTTTCTTCTCATCACTGATCGCTATCAAGTAGCTTCT
TCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGTGTTATGAACTC
TCCCCAATGCCGCTGGTCTCCGTTGACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAG
GAGCCCGTACTTGCCGTAGTTGTCAAACCTGCGCTTGGTCTTCTCGATCTGAGCGTTAAG
AGCAAGAGCAGGGGCGCTCTCAGGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTCGAGCTTCTTGAT
CTGTTGCTTCTCCCTCTTGGCGAACTGTTTCGACTCCTTGCAAGGGGTTAAGCCCGAGAT
ATCGGCGACGGCTGGCATCGGAGCTGAGAGGAGGATGGAAGAGAGAGCTACGGCCGCGGA
GAAAGCCTTCATGGACTGCTGTTGCTGAGGCGTTGCGGATTTGTCATCGGAGCAGACGAA
TCTCGCGGTGGATTTAGGTACGGATTGGGTGAGTGACTTGTTGAGGACGAGGTTCGTCGG
GATCGTGAGCGACATGGCTCTTAGGATTTCGAAAGTTCTTAGGGTGGGAGGATAGAGAGA
TGATGAGCTTCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GGGTAGTCTCCGCCTCCACCTACCGTCCCTGTCTCTCCCTGTGCATCAAATAAAATGGCA
ACCGTTCAAGTTTCTACCACTAGCATGACCACCACAACCAAGGCGGTTCTTAGAAGCCAG
CCAACCAACAACAAGCTCACCACTAACAGAGTCTCCGTTGGATCAGTCAATAAAGTCTCG
AGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAGCCAGCTCTGGTGGTGCCACCATGTCAGCAGTATAC
AAGGTCAAGCTCATCGGACCCGATGGCCAAGAAAACGAGTTTGATGTCCCTGACGACCAA
TACATATTGGATGCTGCTGAAGAAGCTGGAGTTGACTTGCCTTACTCTTGTAGAGCCGGT
GCCTGTTCCACCTGCGCCGGTAAGATCGAGAAAGGTCAAGTTGACCAGTCTGATGGTTCG
TTTCTTGAGGATCATCACTTTGAGAAAGGTTATGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAG
TCTGACCTTGTGATCCATACCCACAAAGAAGAGGAACTCTTCTAAGCATGGTCTCTCTGT
TTGGTGGTAATGATGCAAATTGTTATTTTCGAGTTATTATTATCAGTTTCAAAAGGGGTA
TATGCTTTTGTATGAAAACGTCTCCCGATATGCCTTTTTTAGTGTTCATCAATCGTCACT
GTGTTGCAACTGGTTAATAAAAGAGTTTATGGTTTCTCGTCTCAAAGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CQ82JQ C 1
AF RR4AT86TF U 10
AF RR4CQ82TF U 1
BS 1 11 RR4CQ82TF
BS 12 27 RR4AT86TF
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BS 627 679 RR4AT86TF
BS 680 708 RR4CQ82TF

RD RR4CQ82JQ 703 0 0
GGGTAGTCTCCGCCTCCACCTACCGTCCCTGTCTCTCCCTGTGCATCAAATAAAATGGCA
ACCGTTCAAGTTTCTACCACTAGCATGACCACCACAACCAAGGCGGTTCTTAGAAGCCAG
CCAACCAACAACAAGCTCACCACTAACAGAGTCTCCGTTGGATCAGTCAATAAAGTCTCG
AGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAGCCAGCTCTGGTGGTGCCACCATGTCAGCAGTATAC
AAGGTCAAGCTCATCGGACCCGATGGCCAAGAAAACGAGTTTGATGTCCCTGACGACCAA
TACATATTGGATGCTGCTGAAGAAGCTGGAGTTGACTTGCCTTACTCTTGTAGAGCCGGT
GCCTGTTCCACCTGCGCCGGTAAGATCGAGAAAGGTCAAGTTGACCAGTCTGATGGTTCG
TTTCTTGAGGATCATCACTTTGAGAAAGGTTATGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAG
TCTGACCTTGTGATCCATACCCACAAAGAAGAGGAACTCTTCTAAGCATGGTCTCTCTGT
TTGGTGGTAATGATGCAAATTGTTATTTTCGAGTTATTATTATCAGTTTCAAAAGGGGTA
TATGCTTTTGTATGAAAACGTCTCCCGATATGCCTTTTTTAGTGTTCATCAATCGTCACT
GTGTTGCAACTGGTTAATAAAAGAGTTTATGGTTTCTCGTCTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4AT86TF 670 0 0
GG
GCCTCCACCTACCGTCTCTGTCTCTCCCTGTGCATCAAATAAAATGGCAACCGTTCAAGT
TTCTACCACTAGCATGACCACCACAACCAAGGCGGTTCTTAGAAGCCAGCCAACCAACAA
CAAGCTCACCACTAACAGAGTCTCCGTTGGATCAGTCAATAAAGTCTCGAGATCCTTTGG
CTTGAAATGCTCAGCCAGCTCTGGTGGTGCCACCATGTCAGCAGTATACAAGGTCAAGCT
CATCGGACCCGATGGCCAAGAAAACGAGTTTGATGTCCCTGACGACCAATACATATTGGA
TGCTGCTGAAGAAGCTGGAGTTGACTTGCCTTACTCTTGTAGAGCCGGTGCCTGTTCCAC
CTGCGCCGGTAAGATCGAGAAAGGTCAAGTTGACCAGTCTGATGGTTCGTTTCTTGAGGA
TCATCACTTTGAGAAAGGTTATGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCTGACCTTGT
GATCCATACCCACAAAGAAGAGGAACCCTTCTAAGCATGGTCTCTCTGTTTGGTGGTAAT
GATGCAAATTGTTATTTTCGAGTTATTATTATCAGTTTCAAAAGGGGTATATGCTTTTGT
ATGAAAACGTCTCCTGATATGCCTTTTTTAGTGTTCATCAATCGTCACTGTGTTGCAACT
GGTTAATA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR4CQ82TF 708 0 0
GGGTAGTCTCCGCCTCCACCTACCGTCCCTGTCTCTCCCTGTGCATCAAATAAAATGGCA
ACCGTTCAAGTTTCTACCACTAGCATGACCACCACAACCAAGGCGGTTCTTAGAAGCCAG
CCAACCAACAACAAGCTCACCACTAACAGAGTCTCCGTTGGATCAGTCAATAAAGTCTCG
AGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAGCCAGCTCTGGTGGTGCCACCATGTCAGCAGTATAC
AAGGTCAAGCTCATCGGACCCGATGGCCAAGAAAACGAGTTTGATGTCCCTGACGACCAA
TACATATTGGATGCTGCTGAAGAAGCTGGAGTTGACTTGCCTTACTCTTGTAGAGCCGGT
GCCTGTTCCACCTGCGCCGGTAAGATCGAGAAAGGTCAAGTTGACCAGTCTGATGGTTCG
TTTCTTGAGGATCATCACTTTGAGAAAGGTTATGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAG
TCTGACCTTGTGATCCATACCCACAAAGAAGAGGAACTCTTCTAAGCATGGTCTCTCTGT
TTGGTGGTAATGATGCAAATTGTTATTTTCGAGTTATTATTATCAGTTTCAAAAGGGGTA
TATGCTTTTGTATGAAAACGTCTCCCGATATGCCTTTTTTAGTGTTCATCAATCGTCACT
GTGTTGCAACTGGTTAATAAAAGAGTTTATGGTTTCTCGTCTCAAAGA

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL4279Contig1 815 3 6 U
GTATAACCAAGAATACAAATATTATTATATCAAAAATACATATATCACTTAACCAAGTTT
GCTCAATCTATCTGAAGACAATACAAGCTATAGACACTCAAAGGTTCCTCAACGAAGTTA
AAACAGACTCTTGAGAGTAGTACTAAGAGTTGGTCTCATCAAAGTTTGCTTCCCTGGATC
ATGCTAGTATGCCACCCATTTCTAGAATATTCTCGGCCAAAAAGAATCTCCGGAACCAAA
AGTCTTTCAATAAACTTTTTCATCTGGGAAGAAGAGGCGTTCTGTCGTCTGTGACACCGC
GGTGAGTAGCCTCTTCATTTGCTCCTGCGGCCATGTTGATGAATGAGTCATTAGCCCTGT
GGGTATCCTGGGCATTGCCTAATTCTAAGCTCCCGTTCTGCTGTTGCTCGTCTTCCACTT
TGGCAAGGGGTGAAAAGAACTGGTGCATTGAAATGAAAACTATAGAAATTCCAAGAAGGA
AGTTCATGGTTATAACATGTCCAAAGAGTGCTGCAGATGCTATGCCAGTAAATATTGTGG
CAACTGTGGATGAATATTTCTTCAAAATTGTATCTGCATACTTGAAGAAAAAGGAGGAAA
GAATCCCTTGAGCTGCGTTGTTCATTATTAGAAAAGGGTTGCCCTAGAATGTCCTTGTAG
GATGTCAAAGCTTTCGGGACCTTTGTATATAACAGTTGCTAGTATTCCAAGAAAGTTGAA
TATCGCACCATATCCATAAAGAAATAAGTTCTGAAGATAAATGCTTGTGTCATACTGACT
CTTCAGTGCATACTCGTTGAAGACAGATGCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G210JQ U 1
AF RR4EH58JQ U 52
AF RR4G210TF C 111
BS 1 100 RR4G210JQ
BS 101 101 RR4EH58JQ
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BS 109 592 RR4G210JQ
BS 593 815 RR4G210TF

RD RR4G210JQ 592 0 0
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GCTCAATCTATCTGAAGACAATACAAGCTATAGACACTCAGAGGTTCTTCAACGAAGTTA
AAACAGACTCTTGAGAGTAGTACTAAGAGTTGGTCTCATCAAAGTTTGCTTCCCTGGATC
ATGCTAGTATGCCACCCATTTCTAGAATATTCTCGGCCAAAAAGAATCTCCGGAACCAAA
AGTCTTTCAATAAACTTTTTCATCTGGGAAGAAGAGGCGTTCTGTCGTCTGTGACACCGC
GGTGAGTAGCCTCTTCATTTGCTCCTGCGGCCATGTTGATGAATGAGTCATTAGCCCTGT
GGGTATCCTGGGCATTGCCTAATTCTAAGCTCCCGTTCTGCTGTTGCTCGTCTTCCACTT
TGGCAAGGGGTGAAAAGAACTGGTGCATTGAAATGAAAACTATAGAAATTCCAAGAAGGA
AGTTCATGGTTATAACATGTCCAAAGAGTGCTGCAGATGCTATGCCAGTAAATATTGTGG
CAACTGTGGATGAATATTTCTTCAAAATTGTATCTGCATACTTGAAGAAAAA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4EH58JQ 541 0 0
ACCAAGTTTGCTCAAT**ATCTGAAGACAATACAAGCTATAGACACTCAAAGGTTCCTCA
ACGAAGTTAAAACAAACTCTTGAGAGTAGTACTAAAAGTTGGTCTCATCAAAGTTTGCTT
CCCTGGATCATGCTAGTATGCCACCCATTTCTAGAATATTCTCGGCCAAAAAAAATCTCC
GGAACCAAAAGTCTTTCAATAAACTTTTTCATCTGGGAAGAAGAGGCGTTCTGCCGTCTG
TGACACCGCGGTGAGTAGCCTCTTCATTTGCTCCTGCGGCCATGTTGATGAATGAGTCAT
TAGCCCTGTGGGTATCCTGGGCATTGCCTAATTCTAAGCTCCCGTTCTGCTGTTGCTCGT
CTTTCACTTTGGCAAGGGGTGAAAAGAACTGGTGCATTGAAATGAAAACTATAAAAATTC
CAAGAAGGAAGTTCATGGTTATAACATGTCCAAAGAGTGCTGCAAATGCTATGCCAGTAA
ATATTGTGGCAACTGTGGATGAATATTTCTTCAAAATTGTATCTGCATACTTGAAGAAAA
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4G210TF 705 0 0
AACGAAGTTAAAACAGACTCTTGAGAGTAGTACTAAGAGTTGGTCTCATCAAAGTTTGCT
TCCCTGGATCATGCTAGTATGCCACCCATTTCTAGAATATTCTCGGCCAAAAAGAATCTC
CGGAACCAAAAGTCTTTCAATAAACTTTTTCATCTGGGAAGAAGAGGCGTTCTGTCGTCT
GTGACACCGCGGTGAGTAGCCTCTTCATTTGCTCCTGCGGCCATGTTGATGAATGAGTCA
TTAGCCCTGTGGGTATCCTGGGCATTGCCTAATTCTAAGCTCCCGTTCTGCTGTTGCTCG
TCTTCCACTTTGGCAAGGGGTGAAAAGAACTGGTGCATTGAAATGAAAACTATAGAAATT
CCAAGAAGGAAGTTCATGGTTATAACATGTCCAAAGAGTGCTGCAGATGCTATGCCAGTA
AATATTGTGGCAACTGTGGATGAATATTTCTTCAAAATTGTATCTGCATACTTGAAGAAA
AAGGAGGAAAGAATCCCTTGAGCTGCGTTGTTCATTATTAGAAAAGGGTTGCCCTAGAAT
GTCCTTGTAGGATGTCAAAGCTTTCGGGACCTTTGTATATAACAGTTGCTAGTATTCCAA
GAAAGTTGAATATCGCACCATATCCATAAAGAAATAAGTTCTGAAGATAAATGCTTGTGT
CATACTGACTCTTCAGTGCATACTCGTTGAAGACAGATGCCATCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 3

CO CL4280Contig1 800 3 4 U
GGGTTGCTTTTCATCGCCTTTGTTGGAACCATGGCGGAGAGATGGACGAACACGGCTCTA
CTCGTTATCGATATGCAGAATGATTTCTTAGAGGAAGATTCTGTGATGCAAGTGAAAGGT
GGAAAAGCCATAGTTCCTAACGTTATCAGAGTGGTCGAACTCGCGAGGCAGCGTGGCGTT
CTCGTGGTTTGGGTTGTTAGAGAACACGATCCTCAGGGAAGAGATGTTGAAATATTCAGG
CGTCATCACTACAGTTCTGAGAAAGTTGGACCGACTGTTAAAGGAACAGAAGGTGCAAAG
CTAGTCGATGGACTGAACATCAGAGAAGAAGAAGATTATAAGATAGTGAAAACTCGTTTC
AGCGCCTTCTTCGGCACACATCTTCATTCGTTCCTCCAAACTTCAGGGGTTACCAAGTTA
GTCATCGCTGGGGTGCAAACGCCAAATTGTATCAGGCAAACGGTGTTTGATGCAGTGGAG
CTGGATTATCCAGATGTAACTGTTATCGTAGATGCCACAGCTGCTGCGACACCGGAGATT
CATACCGCGAATATTCTGGACATGAAAAATATCGGCGTCAAGACTCCTACGTTACACGAA
TGGTCTGAAGAATTTGCATGATGGTTTGTG*ATGACAATATATCAACCCTTCTTTTTTTT
CTTTGTCAATAAACCCTTCTTCTTCTATCTTCTTCCACCACTTTTTTCTTGTCTTTTTAT
ATATTTGTAATTGAAGATTTGAATGAAAAATAAAGTAAAACATCTTGCACTTATTATGGC
ATGTCGTTTCTATAATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FP83TF U 1
AF RR4A708JQ C 20
AF RR4A708TF U 20
BS 1 630 RR4FP83TF
BS 631 631 RR4A708TF
BS 632 658 RR4FP83TF
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RD RR4FP83TF 658 0 0
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CTCGTTATCGATATGCAGAATGATTTCTTAGAGGAAGATTCTGTGATGCAAGTGAAAGGT
GGAAAAGCCATAGTTCCTAACGTTATCAGAGTGGTCGAACTCGCGAGGCAGCGTGGCGTT
CTCGTGGTTTGGGTTGTTAGAGAACACGATCCTCAGGGAAGAGATGTTGAAATATTCAGG
CGTCATCACTACAGTTCTGAGAAAGTTGGACCGACTGTTAAAGGAACAGAAGGTGCAAAG
CTAGTCGATGGACTGAACATCAGAGAAGAAGAAGATTATAAGATAGTGAAAACTCGTTTC
AGCGCCTTCTTCGGCACACATCTTCATTCGTTCCTCCAAACTTCAGGGGTTACCAAGTTA
GTCATCGCTGGGGTGCAAACGCCAAATTGTATCAGGCAAACGGTGTTTGATGCAGTGGAG
CTGGATTATCCAGATGTAACTGTTATCGTAGATGCCACAGCTGCTGCGACACCGGAGATT
CATACCGCGAATATTCTGGACATGAAAAATATCGGCGTCAAGACTCCTACGTTACACGAA
TGGTCTGAAGAATTTGCATGATGGTTTGTGGATGACAATATATCAACCCTTCTTTTTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4A708JQ 781 0 0
GG
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AAAGTTGGACCGACTGTTAAAGGAACAGAAGGTGCAAAGCTAGTCGATGGACTGAACATC
AGAGAAGAAGAAGATTATAAGATAGTGAAAACTCGTTTCAGCGCCTTTTTCGGCACACAT
CTTCATTCGTTCCTCCAAACTTCAGGGGTTACCAAGTTAGTCATCGCTGGGGTGCAAACG
CCAAATTGTATCAGGCAAACGGTGTTTGATGCAGTGGAGCTGGATTATCCAGATGTAACT
GTTATCGTAGATGCCACAGCTGCTGCGACACCGGAGATTCATACCGCGAATATTCTGGAC
ATGAAAAATATCGGCGTCAAGACTCCTACGTTACACGAATGGTCTGAAGAATTTGCATGA
TGGTTTGTG*ATGACAATATATCAACCCTTCTTTTTTTTCTTTGTCAATAAACCCTTCTT
TTTCTATCTTCTTCCACCACTTTTTTCTTGTCTTTTTATATATTTGTAATTGAAGATTTG
AATGAAAAATAAAGTAAAACATCTTGCACTTATTATGGCATGTCGTTTCTATAATAATT

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR4A708TF 781 0 0
GG
GTTGGAACCATGGCGGAGAGATGGACGAACACGGCTCTACTCGTTATCGATATGCAGAAT
GATTTCTTAGAGGAAGATTCTGTGATGCAAGTGAAAGGTGGAAAAGCCATAGTTCCTAAC
GTTATCAGAGTGGTCGAACTCGCGAGGCAGCGTGGCGTTCTCGTGGTTTGGGTTGTTAGA
GAACACGATCCTCAGGGAAGAGATGTTGAAATATTCAGGCGTCATCACTACAGTTCTGAG
AAAGTTGGACCGACTGTTAAAGGAACAGAAGGTGCAAAGCTAGTCGATGGACTGAACATC
AGAGAAGAAGAAGATTATAAGATAGTGAAAACTCGTTTCAGCGCCTTCTTCGGCACACAT
CTTCATTCGTTCCTCCAAACTTCAGGGGTTACCAAGTTAGTCATCGCTGGGGTGCAAACG
CCAAATTGTATCAGGCAAACGGTGTTTGATGCAGTGGAGCTGGATTATCCAGATGTAACT
GTTATCGTAGATGCCACAGCTGCTGCGACACCGGAGATTCATACCGCGAATATTCTGGAC
ATGAAAAATATCGGCGTCAAGACTCCTACGTTACACGAATGGTCTGAAGAATTTGCATGA
TGGTTTGTG*ATGACAATATATCAACCCTTCTTTTTTTTCTTTGTCAATAAACCCTTCTT
CTTCTATCTTCTTCCACCACTTTTTTCTTGTCTTTTTATATATTTGTAATTGAAGATTTG
AATGAAAAATAAAGTAAAACATCTTGCACTTATTATGGCATGTCGTTTCTATAATAATT

QA 3 781 3 781
DS 



AS 1 2

CO CL4281Contig1 752 2 6 U
GGGATAAAATTTTCTTTTCTAGGAAAACCCTCAAACTTCCCCTGATAATTACTCTATTCA
ACCACTCTTTCGTCTCTCGCCGATCTCTCGTTGGGTCATTCTGCTGTTTAGATCTCTTTT
CCAAGTAATCAATCTGAGAAATGGACAAGGAGAAATCTCCTAGTGGAGGTCTACCTCCAC
CATCAGGCCGTTACTCATCCTTTCCTCATTTGACTCCTCCAAGTGGGAGCACCACCACCC
CAGACGCTAACCGTTTCTGCCACGATATAAGCCGAATGCCGGACAACCCGCCTAAGAACA
ATCTAGGCCATCGCCGAGCTCACTCGGAGATCCTCACTCTTCCCGATGACTTGAGCTTCG
ACAGTGATCTCGGTGTGGTTGGTGGTGATGGACCTTCTTTCTCCGACGACACTGATGAGG
ACTTGATGTCTATGTATCTCGACATGGATAAGTTTAATTCCTCGGCGAGTTCTTCCTGTG
AGCCGTCGGAACTCGTTTGGAGGAATGAGCTAGGCGGCGGCGGCTCGGCGGGTTCTAATC
TTCAGAGTACGCCTCCTGGTGGTAGTGAAAGACCGAGGATTAGGCACCAGCATAGCCAGT
CGATGGATGGTTCGACGAGTATAAAGCCTGAGTTGCTTATGTCTGGGAATGAAGGAGTTG
ACTCTAAGAAAGCTATCTCTGCTGCTAAACTCTCCGAGCTTGCTCTCATTGATCCAAAAC
GTGCCAGGATATGGGCAAACAGGCAGTCTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GD31TF U 1
AF RR4FG01TF U 303
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BS 690 709 RR4GD31TF
BS 710 752 RR4FG01TF

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CCAAGTAATCAATCTGAGAAATGGACAAGGAGAAATCTCCTAGTGGAGGTCTACCTCCAC
CATCAGGCCGTTACTCATCCTTTCCTCATTTGACTCCTCCAAGTGGGAGCACCACCACCC
CAGACGCTAACCGTTTCTGCCACGATATAAGCCGAATGCCGGACAACCCGCCTAAGAACA
ATCTAGGCCATCGCCGAGCTCACTCGGAGATCCTCACTCTTCCCGATGACTTGAGCTTCG
ACAGTGATCTCGGTGTGGTTGGTGGTGATGGACCTTCTTTCTCCGACGACACTGATGAGG
ACTTGATGTCTATGTATCTCGACATGGATAAGTTTAATTCCTCGGCGAGTTCTTCCTGTG
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TTCAGAGTACGCCTCCTGGTGGTAGTGAAAGACCGAGGATTAGGCACCAGCATAGCCAGT
CGATGGATGGTTCGACGAGTATAAAGCCTGAGTTGCTTATGTCTGGGAATGAAG*AGTTG
ACTCTAAGAAAGCTATCTCTGCTGCTAA*CTCTCCGAGCTTGCTCTCAT
TGATCCAAAACGTGCCAA

QA 1 709 1 709
DS 

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TTGATGTCTATGTATCTCGACATGGATAAGTTTAATTCCTCGGCGAGTTCTTCCTGTGAG
CCGTCTGAACTCGTTTGGAGGAATGAGCTAGGCGGCGGCGGCTCGGCGGGTTCTAATCTT
CAGAGTACGCCTCCTGGTGGTAGTGAAAGACCGAGGATTAGGCACCAGCATAGCCAGTCG
ATGGATGGTTCGACGAGTATAAAGCCTGAGTTGCTTATGTCTGGGAATGAAGGAGTTGAT
TCTAAGAAAGCTATCTCTGCTGCTAAACTCTCCGAGCTTGCTCTCATTGATCCAAAACGT
GCCAGGATATGGGCAAACAGGCAGTCTGCT

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 3

CO CL4282Contig1 647 3 1 U
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AAAGAACACCAAAATTCAGAAAAACTAGATAAAAAAAAATATTAGTGAAAAGCCCACTCG
TTCTCCTTGCGAACCTCTGCTTCTTCCTCAGGCGTGAAATCATTCTCGATGTTAAAAATC
TCGCGAACCTCCTCTGGTTGCTTGTCTTTGATGCTATCTGCAACCTTCTGGCAAGCAATG
TCAATAAGGCCTTTGACGTTGAGATAGTTAGCTGCGAGGATGAGTACAAAGAGCGTTTCC
CTCTCCTCATCAACAACTTTTTTGTCGAACTCCTCGAGCGCCTTCTTAGCGTCCTCGTTT
CCTTCGACATTACCAACTTCGACGTGTTTCTTGCAATACGTGATCACTTTGGAGAGGATC
TTACCGTCGACGGTTGCGATCGGGATATTGCTACCAGTGCAGCCATCTTCGAGCATGTGC
GCTACGATCTCGAACTCACGCGCCACCGCTTCTTCCACCTCGAAAGACTCGCCGTCGGAG
CTTACTAACGTAATATTGTCTGGCTTAGACATTGTTTGTTTTGATTATTAGGTTGAAAGC
GGCGAAGAGTTCTAGGGTTTTGTTTTGCAGAATGGACTTGAGGATCC


BQ
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AF RR4A079JQD U 172
AF RR4A746JQ U 1
AF RR4A746TF C 1
BS 1 647 RR4A746JQ

RD RR4A079JQD 192 0 0
TTAAAAATCTCGCGAACCTCCTCTGGTTGCTTGTCTTTGATGCTATCTGCAACCTTCTGG
CAAGCAATGTCAATAAGGCCTTTGACGTTGAGATAGTTAGCTGCGAGGATGAGTACAAAG
AGCGTTTCCCTCTCCTCATCAACAACTTTTTTGTCGAACTCCTCGAGCGCCTTCTTAGCG
TCCTCGTTTCCT

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR4A746JQ 647 0 0
CTTAAAAAAGTTCCTTCACGAATGTAAAAGAAAAGGGACAAACCAAGTCATTAAAAAAAC
AAAGAACACCAAAATTCAGAAAAACTAGATAAAAAAAAATATTAGTGAAAAGCCCACTCG
TTCTCCTTGCGAACCTCTGCTTCTTCCTCAGGCGTGAAATCATTCTCGATGTTAAAAATC
TCGCGAACCTCCTCTGGTTGCTTGTCTTTGATGCTATCTGCAACCTTCTGGCAAGCAATG
TCAATAAGGCCTTTGACGTTGAGATAGTTAGCTGCGAGGATGAGTACAAAGAGCGTTTCC
CTCTCCTCATCAACAACTTTTTTGTCGAACTCCTCGAGCGCCTTCTTAGCGTCCTCGTTT
CCTTCGACATTACCAACTTCGACGTGTTTCTTGCAATACGTGATCACTTTGGAGAGGATC
TTACCGTCGACGGTTGCGATCGGGATATTGCTACCAGTGCAGCCATCTTCGAGCATGTGC
GCTACGATCTCGAACTCACGCGCCACCGCTTCTTCCACCTCGAAAGACTCGCCGTCGGAG
CTTACTAACGTAATATTGTCTGGCTTAGACATTGTTTGTTTTGATTATTAGGTTGAAAGC
GGCGAAGAGTTCTAGGGTTTTGTTTTGCAGAATGGACTTGAGGATCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4A746TF 647 0 0
CTTAAAAAAGTTCCTTCACGAATGTAAAAGAAAAGGGACAAACCAAGTCATTAAAAAAAC
AAAGAACACCAAAATTCAGAAAAACTAGATAAAAAAAAATATTAGTGAAAAGCCCACTCG
TTCTCCTTGCGAACCTCTGCTTCTTCCTCAGGCGTGAAATCATTCTCGATGTTAAAAATC
TCGCGAACCTCCTCTGGTTGCTTGTCTTTGATGCTATCTGCAACCTTCTGGCAAGCAATG
TCAATAAGGCCTTTGACGTTGAGATAGTTAGCTGCGAGGATGAGTACAAAGAGCGTTTCC
CTCTCCTCATCAACAACTTTTTTGTCGAACTCCTCGAGCGCCTTCTTAGCGTCCTCGTTT
CCTTCGACATTACCAACTTCGACGTGTTTCTTGCAATACGTGATCACTTTGGAGAGGATC
TTACCGTCGACGGTTGCGATCGGGATATTGCTACCAGTGCAGCCATCTTCGAGCATGTGC
GCTACGATCTCGAACTCACGCGCCACCGCTTCTTCCACCTCGAAAGACTCGCCGTCGGAG
CTTACTAACGTAATATTGTCTGGCTTAGACATTGTTTGTTTTGATTATTAGGTTGAAAGC
GGCGAAGAGTTCTAGGGTTTTGTTTTGCAGAATGGACTTGAGGATCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL4283Contig1 702 2 3 U
TCAGGCATTTTCATAGCTAAAACGCTTCTTTCCCAAAGGGGTATCCTGAGAACACAAATG
ATAACAAACTATGGCCAAGGGAGTTGCAGTCTTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGAC
TATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACGGTGCGACCACTGTGACTGGTACAATTTCTGTACT
TAAACCTGGTCTACATGGTTTTCATGTCCATGCTCTTGGTGACACCACTAACGGCTGCAT
GTCCACCGGTCCACATTTCAACCCTGAAGGTAAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGCTAA
TCGACATGCTGGCGATCTAGGAAACATCACTGTTGGAGATGATGGAACTGCCACCTTCAC
AATCACTGACAGCCAGATTCCTCTTGATGGACCAAACTCTATTGTGGTAAGGGCTGTTGT
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ATCGAGGAAGAGAGTGATGTAATAAGGAGGTCATATACCTCCAGACCTGGCTAGTTTGTG
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AGAAATTCCAGACTATTTTATGATACAGAGCAGATGTGACTT


BQ
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AF RR4CY85TF U 140
AF RR4CY86TF U 1
BS 1 169 RR4CY86TF
BS 170 170 RR4CY85TF
BS 171 702 RR4CY86TF

RD RR4CY85TF 174 0 0
GGAAACGGTGCGACCACTGTGACTGGTACAATTTCTGTACTTAAACCTGGTCTACATGGT
TTTCATGTCCATGCTCTTGGTGACACCACTAACGGCTGCATGTCCACCGGTCCACATTTC
AACCCTGAAGGTAAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGCTAATCGACATGCTGGC

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR4CY86TF 702 0 0
TCAGGCATTTTCATAGCTAAAACGCTTCTTTCCCAAAGGGGTATCCTGAGAACACAAATG
ATAACAAACTATGGCCAAGGGAGTTGCAGTCTTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGAC
TATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACGGTGCGACCACTGTGACTGGTACAGTTTCTGTACT
TAAACCTGGTCTACATGGTTTTCATGTCCATGCTCTTGGTGACACCACTAACGGCTGCAT
GTCCACCGGTCCACATTTCAACCCTGAAGGTAAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGCTAA
TCGACATGCTGGCGATCTAGGAAACATCACTGTTGGAGATGATGGAACTGCCACCTTCAC
AATCACTGACAGCCAGATTCCTCTTGATGGACCAAACTCTATTGTGGTAAGGGCTGTTGT
TGTCCACGCTGACCCTGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCATGAACTCAGCTTGGCTACCGG
AAATGCAGGCGGCCGTGTTGCTTGTGGTATTATTGGTCTTCAGGGCTAAGCTGTCACTTT
ATCGAGGAAGAGAGTGATGTAATAAGGAGGTCATATACCTCCAGACCTGGCTAGTTTGTG
TGTGCGTGTGTGTGGCTCCTTTGTGGATCAAATGCATTTTATTTAAGACCCAAAAAACAG
AGAAATTCCAGACTATTTTATGATACAGAGCAGATGTGACTT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL4284Contig1 671 3 12 U
GTGGGATACCGGTGGTTATCAAGTATATTAGTGAGCCTCATATGCACTCCATGCCTGCCA
TTTCTGTTCACCCGAATGGGAAGTGGCTTGCGGCGCAGAGCTTGGACAACCAGATTCTGA
TCTACGGTACCAGGGAGAGGTTTCAGCTGAATAAGAAGAAGAGGTTTGCAGGGCACATTG
TCGCCGGTTATGCATGCCAGGTTAATTTCTCGCCGGATGGACGGTTTGTGATGTCGGGAG
ATGGTGAGGGTAAGTGCTGGTTTTGGGACTGGAAGAGCTGCAGAGTATTCAAGACTCTTA
AATGTCACAACGGAGTATGCATTGGAGCCGAGTGGCATCCTCTGGAACAGAGCAAAGTTG
CAACTTGTGGCTGGGACGGCTTGATTAAGTACTGGGACTAAGACAAGAGTCTTGTCACGA
GACAGAGGCATCACGGAGAAAGAAGTAGTAATGACGGACGGTCTAGCCTCGGATATACAG
AATGCTCTGCATCTTTGAGATACAAAGTCCCTTTTTTTTTTTAGTTTCGCTTTCCTCTGT
TTTTTAGATTCTTCAGTGTTGTAACGCTCTCTGTTTAATGGATGGTGTAGTCTGTAGAGG
GACGACCAAAACAAATTTCAAATGCTTTGACTGTATCTTATAAAGATAGCATCTCAGACT
TGAATATTCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW22TF U 1
AF RR4CW22JQ C 1
AF RR4B472TF U 17
BS 1 67 RR4CW22TF
BS 68 68 RR4B472TF
BS 69 166 RR4CW22TF
BS 167 167 RR4B472TF
BS 168 243 RR4CW22TF
BS 244 290 RR4B472TF
BS 291 291 RR4CW22JQ
BS 292 521 RR4B472TF
BS 522 522 RR4CW22JQ
BS 523 609 RR4B472TF
BS 610 611 RR4CW22JQ
BS 612 671 RR4B472TF

RD RR4CW22TF 247 0 0
GTGGGATACCGGTGGTTATCAAGTATATTAGTGAGCCTCATATGCACTCCATGCCTGCCA
TTTCTGT*CACCCGAATGGGAAGTGGCTTGCGGCGCAGAGCTTGGACAACCAGATTCTGA
TCTACGGTACCAGGGAGAGGTTTCAGCTGAATAAGAAGAAGAGGTT*GCAGGGCACATTG
TCGCCGGTTATGCATGCCAGGTTAATTTCTCGCCGGATGGACGGTTTGTGATGTCGGGAG
ATG
TGAG

QA 1 243 1 243
DS 

RD RR4CW22JQ 662 0 0
GTGGGATACCGGTGGTTATCAAGTATATTAGTGAGCCTCATATGCACTCCATGCCTGCCA
TTTCTGTTCACCCGAATGGGAAGTGGCTTGCGGCGCAGAGCTTGGACAACCAGATTCTGA
TCTACGGTACCAGGGAGAGGTTTCAGCTGAATAAGAAGAAGAGGTTTGCAGGGCACATTG
TCGCCGGTTATGCATGCCAGGTTAATTTCTCGCCGGATGGACGGTTTGTGATGTCGGGAG
ATGGTGAGGGTAAGTGCTGGTTTTGGGACTGGAAGAGCTGCAGAGTATTCAAGACTCTTA
AATGTCACAACGGAGTATGCATTGGAGCCGAGTGGCATCCTCTGTAACAGAGCAAAGTTG
CAACTTGTGGCTGGGACGGCTTGATTAAGTACTGGGACTAAGACAAGAGTCTTGTCACGA
GACAGAGGCATCACGGAGAAAGAAGTAGTAATGACGGACGGTCTAGCCTCGGATATACAG
AATGCTCTGCATCTTTGAGATACAAAGTCCCTTTTTTTTTTTAGTTTCGCTTTCCTCTGT
TTTTTAGATTCTTCAGTGTTGTAACGCTCTCTGTTTAATGGATGGTGTAGTCTGTAGAGG
GACGACCAAAACAAATTTCAAATGCTTTGACTGTATCTTATAAAGATAGCATCTCAGACT
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4B472TF 655 0 0
TATCAAGTATATTAGTGAGCCTCATATGCACTCCATGCCTGCCATTTCTGTTCACCCGAA
TGGGAAGTGGCTTGCGGCGCAGAGCTTGGACAACCAGATTCTGATCTACGGTACCAGGGA
GAGGTTTCAGCTGAATAAGAAGAAGAGGTTTACAGGGCACATTGTCGCCGGTTATGCATG
CCAGGTTAATTTCTCGCCGGATGGACGGTTTGTGATGTCGGGAGATGGTGAGGGTAAGTG
CTGGTTTTGGGACTGGAAGAGCTGCAGAGTATTCGAGACTCTTAAATGTCACAACGGAGT
ATGCATTGGAGCCGAGTGGCATCCTCTGGAACAGAGCAAAGTTGCAACTTGTGGCTGGGA
CGGCTTGATTAAGTACTGGGACTAAGACAAGAGTCTTGTCACGAGACAGAGGCATCACGG
AGAAAGAAGTAGTAATGACGGACGGTCTAGCCTCGGATATACAGAATGCTCTGCATCTTT
GAGATACAAAGTCCCTTTTTTTTTT*AGTTTCGCTTTCCTCTGTTTTTTAGATTCTTCAG
TGTTGTAACGCTCTCTGTTTAATGGATGGTGTAGTCTGTAGAGGGACGACCAA**CAAAT
TTCAAATGCTTTGACTGTATCTTATAAAGATAGCATCTCAGACTTGAATATTCGC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 3

CO CL4285Contig1 927 3 11 U
GGGACGGAGAAACGATGGCGGTAGAAGACAGTCTGAAGCCTGTTGTTGTTGTTGCTACGG
AAGAAGAGAAACCAAATTCTCTAGAGCACCCGATTGATCGATACGATGAGGAAGGTGCGG
AAGGAGGAGAGATCGCAGACGACGAATCATCGGGAAAATCCGAGGTTCCTGAATCGCATC
GGTTGGAGAATTCGTGGACGTTCTGGTTCGATAATCCTTCCGTGAAACTAAAACAGAGGG
CTTGGGGAAGCTCCTTACGATCCGTCTTCACCTTCTCCACCGCCGAGGAGTTCTGGAGTT
TGTACAATAACATGCGGCATCCGAGCAAGCTAGCTAACGGAGCTGACTTGTACTGTTTCA
AGCACAATATCGAGCCTAAGTGGGAGGATCCTATCTGTGCCAATGGAGGCAAATGGACTA
TGAATTTCTCTAGGGAGAAGTCTGATAAGCCCTTCCTTTACACCTTGCTTGCATTGATTG
GAGAACAGTTTGACCATGGAGATGAAATCTGTGGAGCTGTTGTTAACATTAGAGCTAAGC
AGGAAAGAATATCCATTTGGACTAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCAGGTGAGCATTG
GGAGACAATGGAAGGAGTTCCTTGATTACAATAGCAGCATTGGTTTCATCATCCATGAGG
ATGCGAAGAAGCTGGACAGGAACGTTAAGAGCTCTTACACTGCCTGAAACGCCGCCCCCA
ACAACCTCTCCGATCTTTACACCGTTTCAATCACAGTTTCGTATGTGAGAGATCTCTATT
TAACTTGAGATGACGTCTTTGTTCTTGAGTGTTTGATTTGTTCACAAGTCTTAACATTTC
ATTTACTATTAGTATATGTTAGTATGATATTCTTAAATTGATGGTGTATGAAATCAAACT
TTTACCTTATAGTTTTCAACTCTGGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB45TF U 1
AF RR4EE01TF U 6
AF RR4CB45JQ C 77
BS 1 18 RR4CB45TF
BS 19 19 RR4EE01TF
BS 20 590 RR4CB45TF
BS 591 591 RR4EE01TF
BS 592 607 RR4CB45TF
BS 608 718 RR4EE01TF
BS 719 719 RR4CB45JQ
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BS 750 750 RR4CB45JQ
BS 751 761 RR4EE01TF
BS 762 927 RR4CB45JQ

RD RR4CB45TF 611 0 0
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AAGGAGGAGAGATCGCAGACGACGAATCATCGGGAAAATCCGAGGTTCCTGAATCGCATC
GGTTGGAGAATTCGTGGACGTTCTGGTTCGATAATCCTTCCGTGAAACTAAAACAGAGGG
CTTGGGGAAGCTCCTTACGATCCGTCTTCACCTTCTCCACCGCCGAGGAGTTCTGGAGTT
TGTACAATAACATGCGGCATCCGAGCAAGCTAGCTAACGGAGCTGACTTGTACTGTTTCA
AGCACAATATCGAGCCTAAGTGGGAGGATCCTATCTGTGCCAATGGAGGCAAATGGACTA
TGAATTTCTCTAGGGAGAAGTCTGATAAGCCCTTCCTTTACACCTTGCTTGCATTGATTG
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GGAGACA
TGGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4EE01TF 756 0 0
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GGAGAGATCGCAGACGACGAATCATCGGGAAAATCCGAGGTTCCTGAATCGCATCGGTTG
GAGAATTCGTGGACGTTCTGGTTCGATAATCCTTCCGTGAAACTAAAACAGAGGGCTTGG
GGAAGCTCCTTACGATCCGTCTTCACCTTCTCCACCGCCGAGGAGTTCTGGAGTTTGTAC
AATAACATGCGGCATCCGAGTAAGCTAGCTAACGGAGCTGACTTGTACCGTTTCAAGCAC
AATATCGAGCCTAAGTGGGAG*ATCCTATCTGTGCCAATGGAGGCAAATGGACTATGAAT
TTCTCTAGGGAGAAGTCTGATAAGCCCTTCCTTTACACCTTGCTTGCATTGATTGGAGAA
CAGTTTGACCATGGAGATGAAATCTGTGGAGCTGTCGTTAGCATTAGAGCTAAGCAGGAA
AGAATATCCATTTGGACTAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCAGGTGAGCATTGGGAGA
CAATGGAAGGAGTTCCTTGATTACAATAGCAGCATTGGTTTCATCATCCATGAGGATGCG
AAGAAGCTGGACAGGAACGTTAAGAGCTCTTACACTGCCTGAAACGCCGCCCC*AACAAC
CTCTCCGATCTTTACACCGTTTCA*TCACAGTTTCG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4CB45JQ 851 0 0
TTCTCTAGAGCACCCGAT*GATCGATACGATGAGGAAGGTGCGGAAGGAGGAGAGATCGC
AGACGACGAATCATCGGGAAAATCCGAGGTTCCTGAATCGCATCGGTTGGAGAATTCGTG
GACGTTCTGGTTCGATAATCCTTCCGTGAAACTAAAACAGAGGGCTTGGGGAAGCTCCTT
ACGATCCGTCTTCACCTTCTCCACCGCCGAGGAGTTCTGGAGTTTGTACAATAACATGCG
GCATCCGAGCAAGCTAGCTAACGGAGCTGACTTGTACTGTTTCAAGCACAATATCGAGCC
TAAGTGGGAGGATCCTATCTGTGCCAATGGAGGCAAATGGACTATGAATTTCTCTAGGGA
GAAGTCTGATAAGCCCTTCCTTTACACCTTGCTTGCATTGATTGGAGAACAGTTTGACCA
TGGAGATGAAATCTGTGGAGCTGTTGTTAACATTAGAGCTAAGCAGGAAAGAATATCCAT
TTGGACTAAAAACGCTTCCAACGAAGCTGCTCAGGTGAGCATTGGGAGACAATGGAAGGA
GTTCCTTGATTACAATAGCAGCATTGGTTTCATCATCCATGAGGATGCGAAGAAGCTGGA
CAGGAACGTTAAGAGCTCTTACACTGCCTGAAACGCCGCCCCCAACAACCTCTCCGATCT
TTACACCGTTTCAATCACAGTTTCGTATGTGAGAGATCTCTATTTAACTTGAGATGACGT
CTTTGTTCTTGAGTGTTTGATTTGTTCACAAGTCTTAACATTTCATTTACTATTAGTATA
TGTTAGTATGATATTCTTAAATTGATGGTGTATGAAATCAAACTTTTACCTTATAGTTTT
CAACTCTGGAC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 3

CO CL4286Contig1 952 3 7 U
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CAAAACAATACACAGGCTTACAAAAAAAACAAAGCAAAAAATGTAGGAGTATTGTTTTGC
CATCTTCGTGGCACATTCAAAGGTTTTATTTTCTCTGGTCTCATCTCCTCTGTTCTTGGA
AGATTTATTTAGCCAAGAAGGGGTCACCACCATACATCGAGTTAAAACTCGCTTTTAGTC
TCGTGAACGTACAAACCAGAGGAAAGACAACAAGCAGCTACTCTTTTTATCCCTTATGCT
GCTTAGGCTCCTGTTGCTATTGCTACTACCGCTCCTCTTTGTGCTCTCACTACCCCTCGA
CTCAGACAACCTATTCCACCACTCTCTATCCTCTGTTTTCACAGACTCATCAGAGATCGA
AGGTCTCGGCGAAACCTGAGAATCTTTAACAGAATCCTTCCCCTTTCTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTTTTCGCCGTATCTTTCTTTGATCCAAAGCTAAACGGAAACATCATTTTCAG
AAGAAACCCACCGTTGTTTACACTCGGATCAGCCCGTTTACCACTCTTAGTCTTCCTCAC
AACCTTACCTGTTCTCTGAGTCAACTCATCGAAGATCTTCCTGTCGTTATTCTCTTCGTT
TCCCCTCGCTTCTACAAGATCCCTCAAGGAAAGCTCGTAGCACGACTCTGGCATCTTACT
AACCATCTCCATAAGCTCCCGTTGTCCACGAGCGATAGCCTGAGCCTTCGATCCGGAGAA
AGGCTGGAGTAGTGTTCCGGCCGGTGAAGAGGACCCCTCGGTGGGCTTGTGCTCCACAGA
GTAGGAGAACAGACGCCGGAATCTGAGTGATCATTGGGAACAGTTGGGAAACTCAAGTGG
TGACTGTAGGTTTCAGCTGAAGGATCAAACATATCAATCTTGCAAGAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EB07JQ U 1
AF RR4HB44JQB U 9
AF RR4EB07TF C 175
BS 1 134 RR4EB07JQ
BS 135 135 RR4HB44JQB
BS 136 364 RR4EB07JQ
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BS 366 721 RR4EB07JQ
BS 722 763 RR4HB44JQB
BS 764 952 RR4EB07TF

RD RR4EB07JQ 721 0 0
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CATCTTCGTGGCACGTTCAAAGGTTTTATTTTCTCTGGTCTCATCTCCTCTGTTCTTGGA
AGATTTATTTAGCCAAGAAGGGGTCACCACCATACATCGAGTTAAAACTCGCTTTTAGTC
TCGTGAACGTACAAACCAGAGGAAAGACAACAAGCAGCTACTCTTTTTATCCCTTATGCT
GCTTAGGCTCCTGTTGCTATTGCTACTACCGCTCCTCTTTGTGCTCTCACTACCCCTCGA
CTCAAACAACCTATTCCACCACTCTCTATCCTCTGTTTTCACAGACTCATCAGAGATCGA
AGGTCTCGGCGAAACCTGAGAATCTTTAACAGAATCCTTCCCCTTTCTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTTTTCGCCGTATCTTTCTTTGATCCAAAGCTAAACGGAAACATCATTTTCAG
AAGAAACCCACCGTTGTTTACACTCGGATCAGCCCGTTTACCACTCTTAGTCTTCCTCAC
AACCTTACCTGTTCTCTGAGTCAACTCATCGAAGATCTTCCTGTCGTTATTCTCTTCGTT
TCCCCTCGCTTCTACAAGATCCCTCAAGGAAAGCTCGTAGCACGACTCTGGCATCTTACT
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4HB44JQB 755 0 0
GAGAGACTAATCAGTGCACATTAGACTCTAATTACACAAATAAAACTGTATCCAAAACAA
TACACAGGCTTACAAAAAAA*CAAAGCAAAAAATGTAGGAGTATTGTTTTGTCATCTTCG
TGGCACATTCAAAGGTTTTATTTTCTCTGGTCTCATCTCCTCTGTTCTTGGAAGATTTAT
TTAGCCAAGAAGGGGTCACCACCATACATCGAGTTAAAACTCGCTTTTAGTCTCGTGAAC
GTACAAACCAGAGGAAAGACAACAAGCAGCTACTCTTTTTATCCCTTATGCTGCTTAGGC
TCCTGTTGCTATTGCTACTACCGCTCCTCTTTGTGCTCTCACTACCCCTCGACTCAGACA
ACCTATTCCACCACTCTCTATCCTCTGTTTTCACAGACTCATCAGAGATCGAAGGTCTCG
GCGAAACCTGAGAATCTTTAACAGAATCCTTCCCCTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TTTTCGCCGTATCTTTCTTTGATCCAAAGCTAAACGGAAACATCATTTTCAGAAGAAACC
CACCGTTGTTTACACTCGGATCAGCCCGTTTACCACTCTTAGTCTTCCTCACAACCTTAC
CTGTTCTCTGAGTCAACTCATCGGAGATCTTCCTGTCGTTATTCTCTTCGTTTCCCCTCG
CTTCTACAAGATCCCTCAAGGAAAGCTCGTAGCACGACTCTGGCATCTTACTAACCATCT
CCATAAGCTCCCGTTGTCCACGAGCGATAGCCTGA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4EB07TF 778 0 0
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TTAGTCTCGTGAACGTACAAACCAGAGGAAAGACAACAAGCAGCTACTCTTTTTATCCCT
TATGCTGCTTAGGCTCCTGTTGCTATTGCTACTACCGCTCCTCTTTGTGCTCTCACTACC
CCTCGACTCAGACAACCTATTCCACCACTCTCTATCCTCTGTTTTCACAGACTCATCAGA
GATCGAAGGTCTCGGCGAAACCTGAGAATCTTTAACAGAATCCTTCCCCTTTCTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTTTTCGCCGTATCTTTCTTTGATCCAAAGCTAAACGGAAACATCAT
TTTCAGAAGAAACCCACCGTTGTTTACACTCGGATCAGCCCGTTTACCACTCTTAGTCTT
CCTCACAACCTTACCTGTTCTCTGAGTCAACTCATCGAAGATCTTCCTGTCGTTATTCTC
TTCGTTTCCCCTCGCTTCTACAAGATCCCTCAAGGAAAGCTCGTAGCACGACTCTGGCAT
CTTACTAACCATCTCCATAAGCTCCCGTTGTCCACGAGCGATAGCCTGAGCCTTCGATCC
GGAGAAAGGCTGGAGTAGTGTTCCGGCCGGTGAAGAGGACCCCTCGGTGGGCTTGTGCTC
CACAGAGTAGGAGAACAGACGCCGGAATCTGAGTGATCATTGGGAACAGTTGGGAAACTC
AAGTGGTGACTGTAGGTTTCAGCTGAAGGATCAAACATATCAATCTTGCAAGAACCCC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

CO CL4287Contig1 1108 3 6 U
ACTCAGGTTCTACATTTTCACATCACAAATACTCAGAAAATTAATTGTACACCAGAAATC
ATATACTGTTCTTGTACATTTACTACACAAGTCTTTGGGTGATACCACTTTGAAGAATGA
AACAAAACAGCGCAATCATTCATTCTTTCCTCAAATATTATCTCATTCTACTCTGTTGGT
GCAAGACATGATTGTAGTTTTCATCTCTTCTTTGCTCAATGATGCTTCCACAATTAGCTC
TTGCACTCTGTTTCCAGCTCGGGCAAGTAGTTTGTATTGGTTCTCAAACATTGGCGCCAT
GTAAACCTGAAACGTTGGAGCAAGACCAGGGCTCAAGAAGAAACGACCTTTTGAAACAGA
TTGGATTCCTTCAACCATCTCCATCTCTTTGATTAGAGATTCCACATCAGGCCACTCAGC
GTCAAGCTCTGCAGCTTGTAACTTTCCCAACTGATCATTATCACCAACTACAGATTCCAA
GGCTTCTGTTAGAGGATCAGGCGTGATTTCTTTTAGTGACAAGAAGATACGTTCAAGAGC
AAAATCTAGCTGGTGCACTTTCGCCTCCACCATCTGACCGATTTTGAAATATGAAGCAGG
GTCTAAAGTTGCATCCCATGAAACTTCTGATTGGTGAATCAATGCAGGGACCCCTTCTAG
CTCGCAGAAAATACCAAAATAGGTGATCTTCTTGATGCAGCATTTCACAACATCCCCAAC
GCGAAGCTTAGCCATCAGATTTCGTTTTTTCTCAACTTCCTCTTCATTTTCTCCTGGCCT
CATCGGGAATATAAGCTTCCTTGAGTTTCTATTAGCCATAACCACATTCACTTTGATTTT
CTGGCCAACAAAAGATGATAGGAACTTCTGCTTCTCTCTGTCATACACCATAAGAAGATC
TTCAAGCTTCATATCAGAAGAAACTTCTCCATTAACAACTTCAGAAGCCACTAAGCTTGA
AGAGTCTGGAGATGGAGCTTTGCTCGTGATATCTTGACCTCCAATCACTCCAAGGTTTTG
TCGATACAATGATGGATCTACACCTTTTCTTCTCAACCATGATTCAAACGCCAGGAATTT
CCATTTTGCTGGTAGGTTCCGGTAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO36JQ U 40
AF RR4H882JQB U 1
AF RR4AO36TF C 373
BS 1 243 RR4H882JQB
BS 244 244 RR4AO36JQ
BS 245 533 RR4H882JQB
BS 534 534 RR4AO36JQ
BS 535 734 RR4H882JQB
BS 735 1108 RR4AO36TF

RD RR4AO36JQ 659 0 0
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TGATACCACTTTGAAGAATGAAACAAAACAGCGCAATCATTCATTCTTTCCTCAAATATT
ATCTCATTCTACTCTGTTGGTGCAAGACATGATTGTAGTTTTCATCTCTTCTTTGCTCAA
TGATGCTTCCACAATTAGCTCTTGCACTCTGTTTCCAGCTCGGGCAAGTAGTTTGTATTG
GTTCTCAAACATTGGCGCCATGTAAACCTGAAACGTTGGAGCAAGACCAGGGCTCAAGAA
GAAACGACCTTTTGAAACAGATTGGATTCCTTCAACCATCTCCATCTCTTTGATTAGAGA
TTCCACATCAGGCCACTCAGCGTCAAGCTCTGCAGCTTGTAACTTTCCCAACTGATCATT
ATCACCAACTACAGATTCCAAGGCTTCTGTTAGAGGATCAGGCGTGATTTCTTTTAGTGA
CAAGAAGATACGTTCAAGAGCAAAATCTAGCTGGTGCACTTTCGCCTCCACCATCTGACC
GATTTTGAAATATGAAGCAGGGTCTAAAGTTGCATCCCATGAAACTTCTGATTGGTGAAT
CAATGCAGGGACCCCTTCTAGCTCGCAGAAAATACCAAAATAGGTGATCTTCTTGATGC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4H882JQB 734 0 0
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ATATACTGTTCTTGTACATTTACTACACAAGTCTTTGGGTGATACCACTTTGAAGAATGA
AACAAAACAGCGCAATCATTCATTCTTTCCTCAAATATTATCTCATTCTACTCTGTTGGT
GCAAGACATGATTGTAGTTTTCATCTCTTCTTTGCTCAATGATGCTTCCACAATTAGCTC
TTGTACTCTGTTTCCAGCTCGGGCAAGTAGTTTGTATTGGTTCTCAAACATTGGCGCCAT
GTAAACCTGAAACGTTGGAGCAAGACCAGGGCTCAAGAAGAAACGACCTTTTGAAACAGA
TTGGATTCCTTCAACCATCTCCATCTCTTTGATTAGAGATTCCACATCAGGCCACTCAGC
GTCAAGCTCTGCAGCTTGTAACTTTCCCAACTGATCATTATCACCAACTACAGATTCCAA
GGCTTCTGTTAGAGGATCAGGCGTGATTTCTTTTAGTGACAAGAAGATACGTTAAAGAGC
AAAATCTAGCTGGTGCACTTTCGCCTCCACCATCTGACCGATTTTGAAATATGAAGCAGG
GTCTAAAGTTGCATCCCATGAAACTTCTGATTGGTGAATCAATGCAGGGACCCCTTCTAG
CTCGCAGAAAATACCAAAATAGGTGATCTTCTTGATGCAGCATTTCACAACATCCCCAAC
GCGAAGCTTAGCCA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4AO36TF 736 0 0
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AGCTTGTAACTTTCCCAACTGATCATTATCACCAACTACAGATTCCAAGGCTTCTGTTAG
AGGATCAGGCGTGATTTCTTTTAGTGACAAGAAGATACGTTCAAGAGCAAAATCTAGCTG
GTGCACTTTCGCCTCCACCATCTGACCGATTTTGAAATATGAAGCAGGGTCTAAAGTTGC
ATCCCATGAAACTTCTGATTGGTGAATCAATGCAGGGACCCCTTCTAGCTCGCAGAAAAT
ACCAAAATAGGTGATCTTCTTGATGCAGCATTTCACAACATCCCCAACGCGAAGCTTAGC
CATCAGATTTCGTTTTTTCTCAACTTCCTCTTCATTTTCTCCTGGCCTCATCGGGAATAT
AAGCTTCCTTGAGTTTCTATTAGCCATAACCACATTCACTTTGATTTTCTGGCCAACAAA
AGATGATAGGAACTTCTGCTTCTCTCTGTCATACACCATAAGAAGATCTTCAAGCTTCAT
ATCAGAAGAAACTTCTCCATTAACAACTTCAGAAGCCACTAAGCTTGAAGAGTCTGGAGA
TGGAGCTTTGCTCGTGATATCTTGACCTCCAATCACTCCAAGGTTTTGTCGATACAATGA
TGGATCTACACCTTTTCTTCTCAACCATGATTCAAACGCCAGGAATTTCCATTTTGCTGG
TAGGTTCCGGTAAGGT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL4288Contig1 763 3 9 U
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TGGTTGTACAGCTTGATCTCAAAATCAGACTCCTTAAACAAAGTTACATTACAACTAATC
TTTGCAAACATTGTCTTTACCATCTCAGCCAAATGACTTGCTTCTTGTATATGTTTTATA
CTCTCAATACAGAGCTTCCCTTGGTGCTCCGATTAAGTTAAGCGCAGTTGCTGCTATATG
AGACGGCATGAGTCCAGCTTCAGCCATTTGATCAGCTGGTGAACCGTGGTCAATGTACCT
ATCAGGCAATACCATTGGTCTCCACTTGAGCTTCCCATCGAGAAGACCGTCCAATGCAAG
AAACTGAACCACATGCGATCCAAACCCTCCAATAGAACCTTCTTCAACCGTGATCAGCAC
CTCGTGAGACTTAGCTAAGAATCGAATGAGAGCACGGTCCAACGGCTTACAGAACCGTGC
ATCTGCTACGGTTACGTTCAATCCACGTTCTTGGAGCATCACAGCCGCTCCTAAACAGCT
CTGAACCGCTGAGCCATACCCCAGCAAAGCAACCCTCTCTCCTTCTTTTAAGATCCTACC
TTTCCCAACCTCAATAGGAACACCTTTGTTTCCTGGAGGTAACGCAACGCCAATACCGTT
ACCTCTAGGGTAACGGAAACAAGAAGGACGGTCATCGATAGCAGCAGCGGTTGCAACAAT
GTTGAAGAGCTCTGCTTCATCTGATGGAGCCATCACTATCATG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4A721JQ U 3
AF RR4A721TF C 3
AF RR4GL09JQ U 1
BS 1 308 RR4GL09JQ
BS 309 310 RR4A721JQ
BS 311 348 RR4GL09JQ
BS 349 349 RR4A721JQ
BS 350 439 RR4GL09JQ
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BS 446 763 RR4GL09JQ

RD RR4A721JQ 711 0 0
GT
AACATCATCTATTAAAAAAGGGAGAGAATATTTGATTTTTACAAAGATGTTAGATATGGT
TGTACAGCTTGATCTCAAAATCAGACTCCTTAAACAAAGTTACATTACAACTAATCTTTG
CAAACATTGTCTTTACCATCTCAGCCAAATGACTTGCTTCTTGTATATGTTTTATACTCT
CAATACAGAGCTTCCCTTGGTGCTCCGATTAAGTTAAGCGCAGTTGCTGCTATATGAGAC
GGCATGAGTCCAGCTTCAGCCATTTGATCAGCTGGTGAACCGTGGTCAATGTACCTATCA
GGCAATACCATTGGTCTCCACTTGAGCTTCCCATCGAGAAGACCGTCCAATGCAAGAAAC
TGAACCACATGCGATCCAAACCCTCCAATAGAACCTTCTTCAACCGTGATCAGCACCTCG
TGAGACTTAGCTAAGAATCGAATGAGAGCACGGTCCAACGGCTTACAGAACCGTGCATCT
GCTACGGTTACGTTCAATCCACGTTCTTGGAGCATCACAGCCGCTCCTAAACAGCTCTGA
ACCGCTGAGCCATACCCCAGCAAAGCAACCCTCTCTCCTTCTTTTAAGATCCTACCTTTC
CCAACCTCAATAGGAACACCTTTGTTTCCTGGAGGTAACGCAACGCCAATACCGTTACCT
CTAGGGTAACGGAAACAAGAAGGACGGTCATCGATAGCAGCAGCGGTT
C

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR4A721TF 711 0 0
GT
AACATCATCTATTAAAAAAGGGAGAGAATATTTGATTTTTACAAAGATGTTAGATATGGT
TGTACAGCTTGATCTCAAAATCAGACTCCTTAAACAAAGTTACATTACAACTAATCTTTG
CAAACATTGTCTTTACCATCTCAGCCAAATGACTTGCTTCTTGTATATGTTTTATACTCT
CAATACAGAGCTTCCCTTGGTGCTCCGATTAAGTTAAGCGCAGTTGCTGCTATATGAGAC
GGCATGAGTCCAGCTTCAGCCATTTGATCAGCTGGTGAACCGTGGTCAATGTACCTATCA
GGCAATACCATTGGTCTCCACTTGAGCTTCCCATCGAGAAGACCGTCCAATGCAAGAAAC
TGAACCACATGCGATCCAAACCCTCCAATAGAACCTTCTTCAACCGTGATCAGCACCTCG
TGAGACTTAGCTAAGAATCGAATGAGAGCACGGTCCAACGGCTTACAGAACCGTGCATCT
GCTACGGTTACGTTCAATCCACGTTCTTGGAGCATCACAGCCGCTCCTAAACAGCTCTGA
ACCGCTGAGCCATACCCCAGCAAAGCAACCCTCTCTCCTTCTTTTAAGATCCTACCTTTC
CCAACCTCAATAGGAACACCTTTGTTTCCTGGAGGTAACGCAACGCCAATACCGTTACCT
CTAGGGTAACGGAAACAAGAAGGACGGTCATCGATAGCAGCAGCGGTT
C

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR4GL09JQ 763 0 0
CTGCAACATCATCTATTAAAAAAGGGAGAGAATATTTGATTTTTACAAAGATGTTAGATA
TGGTTGTACAGCTTGATCTCAAAATCAGACTCCTTAAACAAAGTTACATTACAACTAATC
TTTGCAAACATTGTCTTTACCATCTCAGCCAAATGACTTGCTTCTTGTATATGTTTTATA
CTCTCAATACAGAGCTTCCCTTGGTGCTCCGATTAAGTTAAGCGCAGTTGCTGCTATATG
AGACGGCATGAGTCCAGCTTCAGCCATTTGATCAGCTGGTGAACCGTGGTCAATGTACCT
ATCAGGCA**ACCATTGGTCTCCACTTGAGCTTCCCATCGAGAAGACCATCCAATGCAAG
AAACTGAACCACATGCGATCCAAACCCTCCAATAGAACCTTCTTCAACCGTGATCAGCAC
CTCGTGAGACTTAGCTAAGCTTCGGATGAGAGCACGGTCCAACGGCTTACAGAACCGTGC
ATCTGCTACGGTTACGTTCAATCCACGTTCTTGGAGCATCACAGCCGCTCCTAAACAGCT
CTGAACCGCTGAGCCATACCCCAGCAAAGCAACCCTCTCTCCTTCTTTTAAGATCCTACC
TTTCCCAACCTCAATAGGAACACCTTTGTTTCCTGGAGGTAACGCAACGCCAATACCGTT
ACCTCTAGGGTAACGGAAACAAGAAGGACGGTCATCGATAGCAGCAGCGGTTGCAACAAT
GTTGAAGAGCTCTGCTTCATCTGATGGAGCCATCACTATCATG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 3

CO CL4289Contig1 763 3 6 U
AACACAAACCTTGAATACATTAAGAACAAACCAGAATACATGACAAACTTATCTTATGTA
ATAGACGACACAAGACTACAACAACCCCAGACAAACAAGATAATATAAAGATGAGACAAA
CACACCAATGACTCTAGTTGCAACAAAACTCGAACCAACAAGACAAATGAGTAAACCGAC
CAAGACACGTTTTCCAAAATCCTCAGAACTCGAACATATCAGCAGAAGCCCTAATCGGCT
GCATCGGACAAGAAACCTGCCAAGGGTTAATCTCGGGAATATCCAAAGCCTGACCACTAA
TCTCTTCAACCATCTCGAGCACAGAGTTCAACGACCTCAACCTCTCCGTCAACTCCGAGG
CCCGCGCTCTCAGAACGTCGTTCTTGGACTCCATTTCGGCGTACTTCCTCGTGGCCGCAT
CAACCTGATCGGAGATCTTGGCGTTATCGCTCTTGAGAACAGTGACCTCGTTGATGAGAT
CGCCGAGTTGCTTCTGTTTCCCCATCCCCGATCTCCGTGCGGATTCTCTGTTGGAGATCA
TTCTCTTCCTCTTCCTCTCATCCGTCACCGAAGCGTACCTCGGATCATTGTCGGAATCAG
GACTTGTCTGTCTTTGCAACGACCCCATTGACTTTTTTTTTTGTTCACCAAAATTTAAAC
AATATAATAATAATATATTTCTTCTAGATTCCTCTAATCTATCAAAGAATCAGTTATATC
CAACGAAAATTTATTCGAGAAGAGCTAAAGCAAAATCAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G805JQ U 50
AF RR4GB88JQ U 1
AF RR4G805TF C 16
BS 1 210 RR4GB88JQ
BS 211 211 RR4G805JQ
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BS 363 363 RR4G805TF
BS 364 743 RR4GB88JQ
BS 744 763 RR4G805TF

RD RR4G805JQ 257 0 0
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CTGACCACTAATCTCTT

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR4GB88JQ 743 0 0
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ATAGACGACACAAGACTACAACAACCCCAGACAAACAAGATAATATAAAGATGAGACAAA
CACACCAATGACTCTAGTTGCAACAAAACTCGAACCAACAAGACAAATGAGTAAACCGAC
CAAGACACGTTTTCCAAAATCCTCAGAACTAGAACATATCAGCAGAAGCCCTAATCGGCT
GCATCGGACAAGAAACCTGCCAAGGGTTAATCTCGGGAATATCCAAAGCCTGACCACTAA
TCTCTTCAACCATCTCGAGCACAGAGTTCAACGACCTCAACCTCTCCGTCAACTCCGAGG
CCTGCGCTCTCAGAACGTCGTTCTTGGACTCCATTTCGGCGTACTTCCTCGTGGCCGCAT
CAACCTGATCGGAGATCTTGGCGTTATCGCTCTTGAGAACAGTGACCTCGTTGATGAGAT
CGCCGAGTTGCTTCTGTTTCCCCATCCCCGATCTCCGTGCGGATTCTCTGTTGGAGATCA
TTCTCTTCCTCTTCCTCTCATCCGTCACCGAAGCGTACCTCGGATCATTGTCGGAATCAG
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AATATAATAATAATATATTTCTTCTAGATTCCTCTAATCTATCAAAGAATCAGTTATATC
CAACGAAAATTTATTCGAGAAGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4G805TF 748 0 0
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CTACAACAACCCCAGACAAACAAGATAATATAAAGATGAGACAAACACACCAATGACTCT
AGTTGCAACAAAACTCGAACCAACAAGACAAATGAGTAAACCGACCAAGACACGTTTTCC
AAAATCCTCAGAACTCGAACATATCAGCAGAAGCCCTAATCGGCTGCATCGGACAAGAAA
CCTGCCAAGGGTTAATCTCGGGAATATCCAAAGCCTGACCACTAATCTCTTCAACCATCT
CGAGCACAGAGTTCAACGACCTCAACCTCTCCGTCAACTCCGAGGCCCGCGCTCTCAGAA
CGTCGTTCTTGGGCTCCATTTCGGCGTACTTCCTCGTGGCCGCATCAACCTGATCGGAGA
TCTTGGCGTTATCGCTCTTGAGAACAGTGACCTCGTTGATGAGATCGCCGAGTTGCTTCT
GTTTCCTCATCCTCGATCTCCGTGCGGATTCTCTGTTGGAGATCATTCTCTTCCTCTTCC
TCTCATCCGTCACCGAAGCGTACCTCGGATCATTGTCGGAATCAGGACTTGTCTGTCTTT
GCAACGACCCCATTGACTTTTTTTTT*GTTCACCAAAATTTAAACAATATAATAATAATA
TATTTCTTCTAGATTCCTCTAATCTATCAAAGAATCAGTTATATCCAACGAAAATTTATT
CGAGAAGAGCTAAAGCAAAATCAGATCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4290Contig1 817 2 15 U
GGAAAAGAAGGAAGGGAAAAACAAAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTTTA
CCTCATCCCCATCCGCTTACCAACGTTCTCCTCATCCTCATGGCTACAGATCGTCTAGAG
TTTTCATGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCTACAGAGGTCACCAATGGAAGGAAACCGC
ATCTCCCTCCACGTGAGGTCCATCTTCAAGTGAAATATTCAATGCCACCACAAAAGCTGG
AGATCTTCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCCAACGACAACCTGCTGCCTTACCTAAAACCCG
TTGAGAAATCATGGCAGCCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTATG
ACCAAGCCAAGGAGTTGAGAGAAAGGTGTAAAGAGCTTTCTGATGACTACCTTGTAGTGC
TTGTTGGGGATATGATCACAGAGGAAGCACTCCCAACTTATCAGACAATGATTAATACAT
TGGATGGGGTTAGAGATGAGACGGGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACAAGGG
CATGGACTGCTGAAGAGAATAGGCATGGTGATCTTCTCAACAAGTATCTTTACCTCTCTG
GAAGAGTGGACATGAGGCAGATTGAAAAGACCATTCAATATCTGATTGGTTCTGGAATGG
ATCCAAAGACTGAGAATAACCCTTTACTTGGGTTTCATCTACACTTCTTTTCAAGAGAGA
GCCACCTTCATCTCTCATGGAAACACTGCTGGACTCGCAAAAAGCTTGGGGACTCGAAGC
TAGCGCAGATCTGCGACACCATCGCTGCTGATGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AL96TF U 5
AF RR4CA17TF U 1
BS 1 21 RR4CA17TF
BS 22 23 RR4AL96TF
BS 24 72 RR4CA17TF
BS 73 73 RR4AL96TF
BS 74 79 RR4CA17TF
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BS 321 655 RR4CA17TF
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BS 723 723 RR4AL96TF
BS 724 817 RR4CA17TF

RD RR4AL96TF 757 0 0
GG
GAAGGAAGGGAAAAACAAAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTTTACCTCAT
CCCCATCCGTTTACCAACGTTCTCCTCATCCTCATGGCTACAGATCGTCTAGAGTTTTCA
TGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCTACAGAGGTCACTAATGGAAGGAAACCGCATCTCC
CTCCACGTGAGGTCCATCTTCAAGTGAAATATTCAATGCCACCACAAAAGCTGGAGATCT
TCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCCAACGACAACCTGCTGCCTTACCTAAAACCCGTTGAGA
AATCATGGCAGCCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTATGACCAAG
CCAAGGAGTTGAGA*AAAGGTGTAAAGAGCTTTCTGATGACTACTTTGTAGTGCTTGTTG
GGGATATGATCACAGAGGAAGCACTCCCAACTTATCAGACAATGATTAATACATTGGATG
GGGTTAGAGATGAGACGTGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACAAGGGCATGGA
CTGCTGAAGAGAATAGGCATGGTGATCTTCTCAACAAGTATCTTTACCTCTCTGGAAGAG
TGGACATGAGGCAGATTGAAAAGACCATTCAATATCTGATTGGTTCTGGAATGGATCCAA
AGACTGAGAATAACCCTT*ACTTGGGTTTCATCTACACTTCTTTTCAAGAGAGAGCCACC
TTCATCTCTCATGGAAACACTGCTGGACTTGCAAA

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR4CA17TF 817 0 0
GGAAAAGAAGGAAGGGAAAAA**AAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTTTA
CCTCATCCCCATTCGCTTATCAACGTTCTTCTCATCCTCATGGCTACAGATCGTCTAGAG
TTTTCATGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCTACAGAGGTCACCAATGGAAGGAAACCGC
ATCTCCCTCCACGTGAGGTCCATCTTCAAGTGAAATATTCAATGCCACCACAAAAGCTGG
AGATCTTCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCCAACGACAACCTGCTGCCTTACCTAAAACCCG
TTGAGAAATCATGGCAGCCGACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTATG
ACCAAGCCAAGGAGTTGAGAGAAAGGTGTAAAGAGCTTTCTGATGACTACCTTGTAGTGC
TTGTTGGGGATATGATCACAGAGGAAGCACTCCCAACTTATCAGACAATGATTAATACAT
TGGATGGGGTTAGAGATGAGACGGGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACAAGGG
CATGGACTGCTGAAGAGAATAGGCATGGTGATCTTCTCAACAAGTATCTTTACCTCTCTG
GAAGAGTGGACATGAGGCAGATTGAAAAGACCATTCAATATCTGATTGGTTCTGGGATGG
ATCCAAAGACTGAGAATAACCCTTTACTTGGGTTTCATCTACACTTCTTTTCAAGAGAGA
GCTACCTTCATCTCTCATGGAAACACTGCTGGACTCGCAAAAAGCTTGGGGACTCGAAGC
TAGCGCAGATCTGCGACACCATCGCTGCTGATGAGAA

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL4291Contig1 928 2 6 U
GTGGGAGATTTAGTTGCGAAGAAGAACGAGCTTAAGATTTTGATTCAGGTGGAGATTTAA
TCATACAGTGATTATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAGCAAATCAACAGGTCTTCC
ACGTAAGCGATTCTACAGAGCAAGAGCTCATAGCAACCCACTCAGCGACTCTCACTTCCC
CATTCCCATCTCCCCATCTCACGTCGTCTTTTCGCTTCACTTCCCCAAGTTCGTTGGAGC
CAACAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAGGTTGAGTTCGCTGATATCGGATGCGGCTTCGG
CGGTCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTCCCTGATACACTGATGATCGGCATGGAGCT
GAGGGATAAATTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCTTGAGGAAGACGAGCTC
GGGGGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGACTAACTCGATGAAGTACATTCCGAA
TTACTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTTTCCTCTTTCCGGATCCGCATTTCAA
GGAGAAGAATCGCTGGAGGAGGGTGATTAGTATTGATTTGCTGGATGAGTATGCGTACGT
TCTTAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTGACGTTGAGGAGCTTGGTGAGTGGAT
GAGGTCTTGCTTGGAGAAACATCCCATGTTTGAGTCTTTGACACAGGAAGAGCTTGATTC
TGATCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTACTGAGGAAGGACAGAAAGTTGCCAGGAA
TGGAGGTCAGACTTTCAGAGCCGTTTTCAGACGCATTGCATATGTTTCTTGAATTCAATC
TCTTTCTTTTTTGTAGTGAACACCTTATTGTTGTTGTAACACCAGATTCTTTCTTCACTT
CAAATTTATTGGGATAGTATTTTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CA27TF U 1
AF RR4DO48TF U 561
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BS 759 768 RR4CA27TF
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TCATACAGTGATTATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAGCAAATCAACAGGTCTTCC
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CATTCCCATCTCCCCATCTCACGTCGTCTTTTCGCTTCACTTCCCCAAGTTCGTTGGAGC
CAACAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAGGTTGAGTTCGCTGATATCGGATGCGGCTTCGG
CGGTCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTCCCTGATACACTGATGATCGGCATGGAGCT
GAGGGATAAATTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCTTGAGGAAGACGAGCTC
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GGAGAAGAATCGCTGGAGGAGGGTGATTAGTATTGATTTGCTGGATGAGTATGCGTACGT
TCTTAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTGACGTTGAGGAGCTTGGTGAGTGGAT
GAGGTCTTGCTTGGAGAAACATCCCATGTTTGAGTCTTTGACACAGGAAGAGCTTGAT*C
TGATCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTACTGAG*AAGGACAGAA
GTGCAAGGAATGGAGTCA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4DO48TF 368 0 0
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TATACACGATCACTGACGTTGAGGAGCTTGGTGAGTGGATGAGGTCTTGCTTGGAGAAAC
ATCCCATGTTTGAGTCTTTGACACAGGAAGAGCTTGATTCTGATCCTGTCGTTGAGCTTC
TGTGCAGTGCTACTGAGGAAGGACAGAAAGTTGCCAGGAATGGAGGTCAGACTTTCAGAG
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CACCTTATTGTTGTTGTAACACCAGATTCTTTCTTCACTTCAAATTTATTGGGATAGTAT
TTTTACAG

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 3

CO CL4292Contig1 782 3 8 U
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ATATTTATAAGTTTCCATTTTAATTCAAAAATAAAAATTAGAATCTGTTGGAATCAGATC
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AT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RR4G623JQ U 1
AF RR4EV43JQ U 12
AF RR4G407JQ U 3
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RD RR4G623JQ 731 0 0
CTACAATTACGTTTTTATTCATTTTCTTTTCTTGAACTTGCATAAGCTTAATAAATAAGC
ATATTTATAAGTTTCCATTTTAATTCAAAAATAAAAATTAGAATCTGTTGGAATCAGATC
CTAATGCTCAAAGAATGCTTCACGTCACCCACGTGAAGAAGATGCTGACCCAAACCAATC
TTCCTCTTCCCGACTTCATCCACAACGCTCAGATCTTTACAGACGTCAACCTTAAACTTC
ACCACCGCTTCTTCCATCTTCCCCAAGCGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTC
GGCGACCCGTGAACCGCCGGCGGCGTCGTGAATAGAAACACCGTATGGATTCCTTCTCTG
TCTCCGCCGTTCTGTACCTTAATATGAACCTCAAACGCCTTTCCACCCGTACCTGAGACA
GCGTTATCACAATGCGGTCCGATCGCGTTCAGCGATTGACATTCGGATGATCGGCAAACG
TGATTCTCTTCAAGACTGAGAGAAACTAGCCGTGGAGCTTTTACTAAGCTGTGGCTGAAC
TTGGTGTAGCTGAGTCCATCACCGAAGGCGTAAACCGTCTCTCCGGTGTAGAACCGGTAA
GTACGACCCGGATACCCGTTTGATTTGTCGGGTCTCATGTTCATGTTCGTCATCGGAACT
TTCTCCACGTAGGACTGTGGATACCACGTCATCGGTAACCTTCCACTTGGATTATAACGG
CCAAAGATGAC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4EV43JQ 741 0 0
TTTTTATTCATTTTCTTTTCTTGAACTTGCATAAGCTTAATAAATAAGCATATTTATAAG
TTTCCATTTTAATTCAAAAATAAAAATTAAAATCTGTTGGAATCAGATCCTAATGCTCAA
AGAATGCTTCACGTCACCCACGTGAAGAAGATGCTGACCCAAACCAATCTTCCTCTTCCC
GACTTCATCCACAACGCTCAGATCTTTACAGACATCAACCTTAAACTTCACCACCGCTTC
TTCCATCTTCCCCAAGCGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTCGGCGACCCGTG
AACCGCCGGCGGTGTCGTGAATAGAAACACCGTGTGGATTCCTTCTCTGTCTCCGCCGTT
CTGTACCTTAATATGAACCTCAAACGCCTTTCCACCCGTACCTGAGACAGCGTTATCACA
ATGCGGTCCGATCGCGTTCAGCGATTGACATTCGGATGATCGGCAAACGTGATTCTCTTC
AAGACTGAAAGAAACTAGCCGTGGAGCTTTTACTAAGCTGTGGCTGAACTTGGTGTAGCT
GAGTCCATCACCGAAGGCGTAAACCGTCTCTCCGGTGTAGAACCGGTAAGTACGACCCGG
ATACCCGTTTGATTTGTCGGGTCTCATGTTCATGTTCGTCATCGGAACTTTCTCCACGTA
GGACTGTGGATACCACGTCATCGGTAACCTTCCACTTGGATTATAACGGCCAAAGATGAC
GCCGGCGATTGCGATACCACC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4G407JQ 780 0 0
C
CAATTACGTTTTTATTCATTTTCTTTTCTTGAACTTGCATAAGCTTAATAAATAAGCATA
TTTATAAGTTTCCATTTTAATTCAAAAATAAAAATTAGAATCTGTTGGAATCAGATCCTA
ATGCTCAAAGAATGCTTCACGTCACCCACGTGAAGAAGATGCTGACCCAAACCAATCTTC
CTCTTCCCGACTTCATCCACAACGCTCAGATCTTTACAGACATCAACCTTAAACTTCACC
ACCGCTTCTTCCATCTTCCCCAAGCGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTCGGC
GACCCGTGAACCGCCGGCGGCGTCGTGAATAGAAACACCGTGTGGATTCCTTCTCTGTCT
CCGCCGTTCTGTACCTTAATATGAACCTCAAACGCCTTTCCACCCGTACCTGAGACAGCG
TTATCACAATGCGGTCCGATCGCGTTCAGCGATTGACATTCGGATGATCGGCAAACGTGA
TTCTCTTCAAGACTGAGAGAAACTAGCCGTGGAGCTTTTACTAAGCTGTGGCTGAACTTG
GTGTAGCTGAGTCCATCACCGAAGGCGTAAACCGTCTCTCCGGTGTAGAACCGGTAAGTA
CGACCCGGATACCCGTTTGATTTGTCGGGTCTCATGTTCATGTTCGTCATCGGAACTTTC
TCCACGTAGGACTGTGGATACCACGTCATCGGTAACCTTCCACTTGGATTATAACGGCCA
AAGATGACGTCGGCGATTGCGATACCACCAGCTTCCCCGGGATAACCAACCCATAAGAT

QA 2 780 2 780
DS 



AS 1 3

CO CL4293Contig1 1031 3 8 U
GGGAACCACCACCACCGAGAAACCCTACGACTGCTCTGCCCCCAATGGATATAGCTCTCT
TCTCGCCTTCCTCTCTCTTCGCCGCCGACGATGACTCCTCGGATGGAGAGACGACGGAGA
CGAGTCAGAGCTTCGTTGATAGGAATCACCAGTTTCCTGGAATGGAATTGAATATCCGGG
AGTTCGGTTTCCACCAGCTGAATGCAAACTTGCTCTGGCCTGGTTCATTCGCCTTCGCTG
ATTGGTTAGTTCAACATCCCCACCTCATCCGTAACCGCCGTTGTCTCGAGATTGGAAGCG
GAACGGGTGCTCTAGCTATTTTTCTTAAGAAGGAGTTTAATCTAGACATAACTACTTCAG
ACTACGATGACCAGGAGATTCAAGACAACATTGCTCATAACTGTACTGCAAACAACATCA
CCCCTTCTCTCCCCCATATCAAGCATACATGGGGAGATGAATTTCCAACCTCAGTACCAG
ATTGGGATTTGATCATTGCCAGTGATATCCTTCTATATGTGAAACAGTACCCAAACTTGA
TAAAGTCACTCTCTTTTCTTCTCAACTCCTACAAACCTAAAGACACAACCAATGCCGTTC
CTCCAGCAGAGCGCAAGCTAAATGGAGCAGAGTCTGATATGCTACCGTGGCCGGTGTTCT
TGATGAGCTGGAGACGAAGGATTGGGAAAGAAGACGAGTCTTTATTCTTTACTGGTTGCC
AAGAAGCTGGCTTCGAGGTGAAGCATCTTGGAAACCGAGTTTATTGCATCAGCCTTAGAG
AAACCAACCTCTGAAGAATAAGTTACATACTCCTCGTGAGTCGGGTCTCCTTCCGCAGAT
TGTTCGCCTCTGAAATTAGTGTGTTACCTTGCAGCTTATTTGGATTTGCGTCTCTTTTCT
TTTTTTTGGGTCAAAGTTAAAGGTGAAATGAGATACTGTTGTAGTAGGGGTCATTTCATC
CGTTTGCGTCGCTTCCCGTGTAGATTGAACTTTTAACAAACGTTTCTATTATGATCACTG
CTCCTTTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EP60TF U 1
AF RR4B326JQ C 473
AF RR4B326TF U 473
BS 1 653 RR4EP60TF
BS 654 654 RR4B326TF
BS 655 678 RR4EP60TF
BS 679 679 RR4B326TF
BS 680 691 RR4EP60TF
BS 692 692 RR4B326TF
BS 693 711 RR4EP60TF
BS 712 1031 RR4B326TF

RD RR4EP60TF 711 0 0
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AGTTCGGTTTCCACCAGCTGAATGCAAACTTGCTCTGGCCTGGTTCATTCGCCTTCGCTG
ATTGGTTAGTTCAACATCCCCACCTCATCCGTAACCGCCGTTGTCTCGAGATTGGAAGCG
GAACGGGTGCTCTAGCTATTTTTCTTAAGAAGGAGTTTAATCTAGACATAACTACTTCAG
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CCCCTTCTCTCCCCCATATCAAGCATACATGGGGAGATGAATTTCCAACCTCAGTACCAG
ATTGGGATTTGATCATTGCCAGTGATATCCTTCTATATGTGAAACAGTACCCAAACTTGA
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DS 

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G
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DS 

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G
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CTTAGAGAAACCAACCTCTGAAGAATAAGTTACATACTCCTCGTGAGTCGGGTCTCCTTC
CGCAGATTGTTCGCCTCTGAAATTAGTGTGTTACCTTGCAGCTTATTTGGATTTGCGTCT
CTTTTCTTTTTTTTGGGTCAAAGTTAAAGGTGAAATGAGATACTGTTGTAGTAGGGGTCA
TTTCATCCGTTTGCGTCGCTTCCCGTGTAGATTGAACTTTTAACAAACGTTTCTATTATG
ATCACTGCTCCTTTCTGG

QA 2 559 2 559
DS 



AS 1 3

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TTGTTCGCGACTTTCATGCCCTCCATCTTCCTCTCAATATCCTCATCTCTTGAAGAGTAG
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TGATTCGATTTCCTTTTCGTATGTACCACGTTTGAGGAATGGGATGGCTGATTCGGTGGC
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GAATGAATGTGTGTTTGATCAAAAAAA


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI05TF U 4
AF RR4D188JQ C 1
AF RR4D188TF U 1
BS 1 3 RR4D188JQ
BS 4 33 RR4CI05TF
BS 34 34 RR4D188TF
BS 35 37 RR4CI05TF
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BS 97 97 RR4D188TF
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BS 220 284 RR4CI05TF
BS 285 687 RR4D188TF

RD RR4CI05TF 281 0 0
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QA 1 281 1 281
DS 

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GAATGAATGTGTGTTTGATC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4D188TF 687 0 0
AGG
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ATTCTTGAGAGACATATCCGTGGACCTCAAAAA*TAAAGAGGATCTAGTAAAAATGGGGT
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GAGGAATAGGAATGGAGACAGCAAGAGTAATGGCACAGAGAGGTGCTCATGTGGTGATTG
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TGAATGTGTGTTTGATCAAAAAAA

QA 4 687 4 687
DS 



AS 1 2

CO CL4295Contig1 1291 2 6 U
TTTTTGGTCTGGTTTCCATGATCTGATACATATCTGTCTCTGCTCGTAGAGAATCATCCT
TCTTCTCTCTTTTTTTGGTTTTTGTTTCCCCTTATCAAAATCTCTGAGATCTCTGTTCAG
GATTCGAAATTAGAGAAGTAGGGCTTCTCCGTTGGGTAATAGGGTTACAGAAGAGCATAA
AGATATAATGCCTTGGGTGCCCTCAAAGCTTCTCCTTTTGGCTCCTTCCTTGACTCCTTA
TCATTCTGGTTTGTCTTCCCATCGTCTTAAACCTCTTCAAAAGTCTGATTGGCGTGGTAA
TCTTAGTTAACATCTCCTCCTTCTCCTTCCTCCTCTTCTTCTCTCCTCCTCCTCTGATCC
CTCTGAGATTCTCCTTTAGCTCCATCATCGAAAAGACGCAAACTTTACTTGATCTTTGGT
GTGTTTGATTTGCATCCCCAACGAAAGTTACTACTACTAAGTTTGATCTGCTATTAGTTG
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CAATGCTCTGATGGCTCCAAGCATTATTCGCATCCTGGATCTGAAGAATCTCTTGAACCT
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AATAATGAGCTAGAATCAGCTGCCACTGAGGATCTCGGCAAATCCATTTTAGCTTCTTTA
CCTTCCAAGTCTTCAGATGATGAAGACAAGAATGAGAACGTTACTACTACACCAGTTGTT
CTCATCCCCGCCATAAAAGGCAGCCGGGAGAAGCATGGCTTGTCACTGAGGAAGACCAGT
GTTTCATGGGCGGATGACGTGTATGATCCTCCTCCCTCCATTGCCTCGCACACAAGAAAC
AAGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAATCAAAGAGCAAAGACAGCCACAGGAAGAACGGA
AAGAAAGGACAGAAGGGCAAAGACAGCTCTAATTCCTCTCGTAGTGGCAAGGACAAGAAG
CAAGCTTCTCGCAAACACAGCCGCGACAAGTTTGATTGGGTTACTCAGATGCCTATCGTT
GCTGCATCTTCTTGAATGCGCATTGGCTTGCTAATAACCAAAGGCACATCTTCACACATC
AATGAGATGTGCTCCCACTCTTTGTTTAATAAATAATCAAAATCACTTTGTGTGTGTGTT
TTCTTTCTTATGTGTAATGTAATGAATGGTTGATCCTAAGTACTATTGTGGAGATTTTTG
TGCTTTTTATTTTGAGATAAAGTTTCACTGT


BQ
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AF RR4G777TF U 1
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AGATATAATGCCTTGGGTGCCCTCAAAGCTTCTCCTTTTGGCTCCTTCCTTGACTCCTTA
TCATTCTGGTTTGTCTTCCCATCGTCTTAAACCTCTTCAAAAGTCTGATTGGCGTGGTAA
TCTTAGTTAACATCTCCTCCTTCTCCTTCCTCCTCTTCTTCTCTCCTCCTCCTCTGATCC
CTCTGAGATTCTCCTTTAGCTCCATCATCGAAAAGACGCAAACTTTACTTGATCTTTGGT
GTGTTTGATTTGCATCCCCAACGAAAGTTACTACTACTAAGTTTGATCTGCTATTAGTTG
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DS 

RD RR4G777JQ 755 0 0
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TTTACCTTCCAAGTCTTCAGATGATGAAGACAAGAATGAGAACGTTACTACTACACCAGT
TGTTCTCATCCCCGCCATAAAAGGCAGCCGGGAGAAGCATGGCTTGTCACTGAGGAAGAC
CAGTGTTTCATGGGCGGATGACGTGTATGATCCTCCTCCCTCCATTGCCTCGCACACAAG
AAACAAGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAATCAAAGAGCAAAGACAGCCACAGGAAGAA
CGGAAAGAAAGGACAGAAGGGCAAAGACAGCTCTAATTCCTCTCGTAGTGGCAAGGACAA
GAAGCAAGCTTCTCGCAAACACAGCCGCGACAAGTTTGATTGGGTTACTCAGATGCCTAT
CGTTGCTGCATCTTCTTGAATGCGCATTGGCTTGCTAATAACCAAAGGCACATCTTCACA
CATCAATGAGATGTGCTCCCACTCTTTGTTTAATAAATAATCAAAATCACTTTGTGTGTG
TGTTTTCTTTCTTATGTGTAATGTAATGAATGGTTGATCCTAAGTACTATTGTGGAGATT
TTTGTGCTTTTTATTTTGAGATAAAGTTTCACTGT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL4296Contig1 812 3 11 U
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AGAAGAAGAAAGAAGAAGATGGCTTCGCCTAGCAAACGCCTAGAGATGGACATGATGAAA
TTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACGACGATTTGCATATGTTCTATGTC
ACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTACGAAGGAGGCGTATGGAAGATCAAAGTCGAA
CTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCGTTAACAAGATTTATCAC
CCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAGATGTAATAAACCAGACATGGAGT
CCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCCTTCCCCAACTGCTTCTATATCCA
AACCCATCTGATCCTTTCAATGGTGAAGCTGCCTCTCTCTTGATGCGAGACCGCCCTGCC
TATGAGCTCAAAGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATGCTAAACCAGAGGATATAGGAGCA
CCTGAGGAGATCTCAAGTGATGACGATGATGATGATGATAGCATGAGCGAACGTGGTTCA
GACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGCTGATCCTTGATGACTTCGTCACGAA
TCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCCATTTCAAAAAATATAAACCATTGATG
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TCTTTAGGATTATTGAAACTTTCATTTGCTCC


BQ
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AF RR4F487TF U 1
AF RR4FZ38TF U 97
AF RR4F487JQ C 38
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GT

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DS 

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TGTAAAGACTTGTGTTA
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DS 

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GCCTAGAGATGGACATGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACG
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TCTTGATGCGAGACCGCCCTGCCTATGAGCTCAAAGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATG
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TCAAAAAATATAAACCATTGATGTTCATTGCATGGGAGGAGATAAAAACTTTCCTCTGTA
AATGTGTAAAGACTTGTGTTAATTCTTTAGGATTATTGAAACTTTCATTTGCTCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 3

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ATGCAGAACGTTACGGGTTTGTCTCTTGCTGTTCTTGGACACTACGGAGCAGGGGTTACT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B559TF U 1
AF RR4AQ88TF U 283
AF RR4B559JQ C 617
BS 1 449 RR4B559TF
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BS 451 542 RR4B559TF
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BS 892 1404 RR4B559JQ

RD RR4B559TF 804 0 0
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CGAGGAGTTGCTTTCCTCTTGGCTCAAGCTGGTTCTTACTTGACTAAAGTGAAGCTCCAG
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GATCTTGTGCTATGGGCTTCAAGGAGTGAATGAGAAAGGCTTCTGGGTCATGGGGAATGC
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TGGGCTTGAAGCTGTTGGAAGTGGTTGTACCGATCTGAAGCATGTCTCTCTGAGCAAATG
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CTTGGAATCACATCTGAGTTCAACCAGCTGCAGCTCTATACGGTCTTTAACAGTCCGTTG
CTGTCCTGGTTTTGGAGATGCGAGTCTCTCTTTCTTAGGGAAGGTCTGCCATCAGCTTCA
GGACGTTGAGCTTTGTGGATTGAATGGAGTGACTGACGCTGTTGTCCACTCTTTGCTTCA
GAGCTGCAACAGTGTTGGTCTAGTGAAGGTGAACTTAAGCGGATGTGTCAATGTCACAGA
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QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AQ88TF 609 0 0
GG
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TCTCTCTGAGCAAATGCTTGCTTGTTTCCGGCAAAGGGCTTGTCTCTTTGGCGAAATCTG
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CTTTAACAGTCCGTTGCTGTCCTGGTTTTGGAGATGCGAGTCTCTCTTTCTTAGGGAAGG
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AGAACTG

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR4B559JQ 788 0 0
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TCTAGTTAGGGTTTAAGCTTTGGAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTATATCTATGTTCTTTG
TGGGAGTC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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TTCTGCCACCAATGGCACCAAACCATATCGTGAATCCAATCATATACACTTCACCCACAA
TCCCCCGGCGTTTCGCGGCGATCTCGCCACTTAAAACCCTAAACCCCCAATTTTCCCGCT
ACACACCTCACGCCCACGCAATCTCTCGCAGACTCTTTCTTCCTTCTGTTTCCTCGATCT
GGGACGCCATAACCGGAGGCGGAGATTCGAACCCTCGTGAAGCCATCGCAGCGATTCGAA
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CTATTGTGTTGGATTCCCGACAAAAGGCATATCTTTGGCAACGTGGGCTTTCTCTTTACT
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ATGACACTGAGGAATCGATTTGGTGCTTTCTCTGTGAAGCTCGGCTCCACGGTGTTGATG
TTGCACGAAAACAGTTTCTTGAGGTTGGTAGAGATTCTAGGCCCGTGATGAGGGAAGCTT
ATAACCTATTCAAGAACGGTGGTGATCCTGAAAAGTTAGTTAGTGACTTCTCGAGTGGTC
AAGCAAGTGAAGTCTTCTACGCTTCACTGTATGCAGGACTCTACTATGAAGCTGAGGTAA
ATCAGAAAAGCAAAGTTTCACATACCGCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK71TF U 40
AF RR4GY46TF U 1
BS 1 420 RR4GY46TF
BS 421 421 RR4FK71TF
BS 422 583 RR4GY46TF
BS 584 584 RR4FK71TF
BS 585 696 RR4GY46TF
BS 697 697 RR4FK71TF
BS 698 752 RR4GY46TF

RD RR4FK71TF 674 0 0
GG
GCCGTAAAAATTCTTTAGCTTCTGCCACCAATGGCACCAAACCATATCGTGAATCCAATC
ATATACACTTCACCCACAATCCCCCGGCGTTTCGCGGTGATCTCGCCACTTAAAACCCTA
AACCCCCAATTTTCCCGCTACACACCTCACGCCCACGCAATCTCTCGCAGACTCTTTCTT
CCTTCTGTTTCCTCGATTTGGGACGCCATAACCGGAGGCGGAGATTCGAACCCTCGTGAA
GCCATCGCAGCGATTCGAAACGGAATGCAACTCTTCAGACAGGGTGATGTTTCTGGATCT
GTGACAGAGTTCGATAAAGCTATTGTGTTGGATTCCCGACAAAAGGCATATCTTTGGCAA
CGTGGGCTTTCTCTTTACTATATGTATAGGTTTGAAGAAGGTGCAGAACAGTTCAGGTTA
GATGTTGCTCAAAACCCAAATGACACTGAGGAATCGATTTGGTGCTTTCTCTGTGAAGCT
CGGCTCCACGGTGTTGATGTTGCACGAAAACAGTTTCTTGAGGTTGGTAGAGATTCTAGG
CCCGTGATGAGGGAAGCTTATAACCTATTCAAGAACGGTGGTGATCCTGAAAAGTTAGTT
AGTGACTTCTCGAGTGGTCAAGCAAGTGAAGTCTTCTACGCTTCACTGTATGCAGGACTC
TACTATGAAGCT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR4GY46TF 752 0 0
GGAATCCCTTAACTGAAACCTTTAGAGAGATCGTAACCATCGCCGTAAAAATTCTTTAGC
TTCTGCCACCAATGGCACCAAACCATATCGTGAATCCAATCATATACACTTCACCCACAA
TCCCCCGGCGTTTCGCGGCGATCTCGCCACTTAAAACCCTAAACCCCCAATTTTCCCGCT
ACACACCTCACGCCCACGCAATCTCTCGCAGACTCTTTCTTCCTTCTGTTTCCTCGATCT
GGGACGCCATAACCGGAGGCGGAGATTCGAACCCTCGTGAAGCCATCGCAGCGATTCGAA
ACGGAATGCAACTCTTCAGACAGGGTGATGTTTCTGGATCTGTGACAGAGTTCGATAAAG
CTATTGTGTTGGATTCCCGACAAAAGGCATATCTTTGGCAACGTGGGCTTTCTCTTTACT
GTATGGATAGGTTCGAAGAAGGTGCAGAACAGTTCAGGTTAGATGTTGCTCAAAACCCAA
ATGACACTGAGGAATCGATTTGGTGCTTTCTCTGTGAAGCTCGGCTCCACGGTGTTGATG
TTGCACGAAAACAGTTTCTTGAGGTTGGTAGAGATTCTAGGCCTGTGATGAGGGAAGCTT
ATAACCTATTCAAGAACGGTGGTGATCCTGAAAAGTTAGTTAGTGACTTCTCGAGTGGTC
AAGCAAGTGAAGTCTTCTACGCTTCACTGTATGCAG*ACTCTACTATGAAGCTGAGGTAA
ATCAGAAAAGCAAAGTTTCACATACCGCAGCT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL4299Contig1 851 3 1 U
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TGTTCTATAATATATATATTCGATACATATTACTCGAAAGACAGACAAAAGACTCTAATT
AATCTATTAGGTGGGCTAAGGCAAAAGACCCCTAACTTACGTGTGTAACACGGTGGTGTC
ATTTTGCCCGCTCCTTACCTTCACAAACCCTAGAAAAATTACAGCTTGGAATAATAACTC
TGCCTCACTATCTACCTTGAACACAAATTTTGCGTTCTACACACGAATTGTTCCTAGTTA
CTTGCTAACAGTTTACTCCACAAACGGGTAAACCATGGCGATCTGATCTCGGCAGATCCC
GTACATTCAGCATCGCCTTCTTCCGATGTGCTGAAAAGTGTTTGATCCGAGCAGTCTAAG
GAAGCCCCACACGCCACATTATAGGACTGACATGCTGAATGGCATACCCGTAATCTATCG
TCTCCATCAATATCACACTTCTGGATCGATATCCAACATGCTAGTCTTTTCGCTGCCTCA
TCACAATAGCTGTTACCAAAAATGCTAAATAATTTCCGAGCCCCGCCTGGAAAAAGCCTA
TTGTAGTTGGGCATGACCACAACTTCCTCAAGCTGCTGAAGTATGCTAGGTTCTCGTGGA
GCACAATGTTGCCCCAACATGTCTCTCTCCAACACATTTTTGCATACCAGTAAACCTGTT
ACTAGTTTAGAGCTGTTCTGACATGTGTAGCCAGCATAATCAGAGCAACGGAACTCGCAA
ACACCATTGTCACACACTCCTCCATGTAGGATGCATTGTTCGTCGCACACAGCAGTGGAA
CAATCAATTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A034TFB C 1
AF RR4A034JQD U 1
AF RR4A034JQ U 345
BS 1 851 RR4A034JQD

RD RR4A034TFB 775 0 0
AGACGATGAGATATTTCACTTTTCTTT*CACTTGATAGGC*TTCGGCCTATAAATTCATT
*GTTCTATAATATATATATTCGATACATATTACTCGAAAGACAGACAAAAGACTCTAATT
AATCTATTAGGTGGGCTAAGGCAAAAGACCCCTAACTTACGTGTGTAACACGGTGGTGTC
ATTTTGCCCGCTCCTTACCTTCACAAACCCTAGAAAAATTACAGCTTGGAATAATAACTC
TGCCTCACTATCTACCTTGAACACAAATTTTGCGTTCTACACACGAATTGTTCCTAGTTA
CTTGCTAACAGTTTACTCCACAAACGGGTAAACCATGGCGATCTGATCTCGGCAGATCCC
GTACATTCAGCATCGCCTTCTTCCGATGTGCTGAAAAGTGTTTGATCCGAGCAGTCTAAG
GAAGCCCCACACGCCACATTATAGGACTGACATGCTGAATGGCATACCCGTAATCTATCG
TCTCCATCAATATCACACTTCTGGATCGATATCCAACATGCTAGTCTTTTCGCTGCCTCA
TCACAATAGCTGTTACCAAAAATGCTAAATAATTTCCGAGCCCCGCCTGGAAAAAGCCTA
TTGTAGTTGGGCATGACCACAACTTCCTCAAGCTGCTGAAGTATGCTAGGTTCTCGTGGA
GCACAATGTTGCCCCAACATGTCTCTCTCCAACACATTTTTGCATACCAGTAAACCTGTT
ACTAGTTTAGAGCTGTTCTGACATGTGTAGCCAGCATAATCAGAGCAACGGAACT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4A034JQD 851 0 0
AGACGATGAGATATTTCACTTTTCTTTTCACTTGATAGGCCTTCGGCCTATAAATTCATT
TGTTCTATAATATATATATTCGATACATATTACTCGAAAGACAGACAAAAGACTCTAATT
AATCTATTAGGTGGGCTAAGGCAAAAGACCCCTAACTTACGTGTGTAACACGGTGGTGTC
ATTTTGCCCGCTCCTTACCTTCACAAACCCTAGAAAAATTACAGCTTGGAATAATAACTC
TGCCTCACTATCTACCTTGAACACAAATTTTGCGTTCTACACACGAATTGTTCCTAGTTA
CTTGCTAACAGTTTACTCCACAAACGGGTAAACCATGGCGATCTGATCTCGGCAGATCCC
GTACATTCAGCATCGCCTTCTTCCGATGTGCTGAAAAGTGTTTGATCCGAGCAGTCTAAG
GAAGCCCCACACGCCACATTATAGGACTGACATGCTGAATGGCATACCCGTAATCTATCG
TCTCCATCAATATCACACTTCTGGATCGATATCCAACATGCTAGTCTTTTCGCTGCCTCA
TCACAATAGCTGTTACCAAAAATGCTAAATAATTTCCGAGCCCCGCCTGGAAAAAGCCTA
TTGTAGTTGGGCATGACCACAACTTCCTCAAGCTGCTGAAGTATGCTAGGTTCTCGTGGA
GCACAATGTTGCCCCAACATGTCTCTCTCCAACACATTTTTGCATACCAGTAAACCTGTT
ACTAGTTTAGAGCTGTTCTGACATGTGTAGCCAGCATAATCAGAGCAACGGAACTCGCAA
ACACCATTGTCACACACTCCTCCATGTAGGATGCATTGTTCGTCGCACACAGCAGTGGAA
CAATCAATTCC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4A034JQ 507 0 0
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ATCCGAGCAGTCTAAGGAAGCCCCACACGCCACATTATAGGACTGACATGCTGAATGGCA
TACCCGTAATCTATCGTCTCCATCAATATCACACTTCTGGATCGATATCCAACATGCTAG
TCTTTTCGCTGCCTCATCACAATAGCTGTTACCAAAAATGCTAAATAATTTCCGAGCCCC
GCCTGGAAAAAGCCTATTGTAGTTGGGCATGACCACAACTTCCTCAAGCTGCTGAAGTAT
GCTAGGTTCTCGTGGAGCACAATGTTGCCCCAACATGTCTCTCTCCAACACATTTTTGCA
TACCAGTAAACCTGTTACTAGTTTAGAGCTGTTCTGACATGTGTAGCCAGCATAATCAGA
GCAACGGAACTCGCAAACACCATTGTCACACACTCCTCCATGTAGGATGCATTGTTCGTC
GCACACAGCAGTGGAACAATCAATTCC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 3

CO CL4300Contig1 943 3 9 U
GGAACCAAGATTATTTCAGATCTATCCATATTCTTTCTCTCTCCCCCCTCTTCCATTCAC
TTCTCTCTCCCTCCTTTTCTATTCACTTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATGGCCA
TTATCAAGCTTCCTAACCTCCCACCAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTATGAAAGTG
AGCCTCCTCGACTATTCCCTTCATCGATCGCTTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCCCTAA
TTGATACTCTAAAGGACTCCTCCACTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGACAAAATCGAACA
GGCAGAATTTTCAATATGCAAAAGCTCCAAACAACGCTCCACAGGCTTTGCTTGTTTTGT
GGTCAAATCGACCAAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTTTTCC
TTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGTT
GTCAGCTTGCAGAGGCTCTGCTCCTCTCTGAAACCTATTCACCGTCGAGTTGTTTAACAG
CTAGAGAGCGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACGACGAAGAAGATGACCGGAGGA
GGCAGATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCGT
CAAGGCAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAGGCTAAAG
CTGCTTGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTTTCTCGTGGGAAGCTACGGGAAC
AATCAAAGTAGAGAGAGCAAACTGTTAAAAGGTCCTTCTCAGATACAGAGCAACACATTG
GCTGCTTTGGAAGCCATTGATGTTCCCGTTGCTGAAGAAGTTATGGACGCTGGCTGTATC
ATCGGTGATCGGATAACGGTCTTGTCGACGTGTCTCTGGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 5 5 
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GG
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AS 1 3

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BQ
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AF RR4DY25JQ U 1
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DS 

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ATTAGAGTTGGGACTCTCTCTGCAACTGTGGTTACAATATTACTCCCGTTAAAAGGTATT
GTGAGTTCTGAGTTATCCCACGGAGTTTCTGCATACGGCGATTCCCCAACAGCAACAATT
GCATAAGAGAAGCTTTCACTCGAGGCTAAGGATTCCTCCGAAGGATTTTTCTCATATATT
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TCTGCATGTGTTCCAGTGACTAAAATTCGTTTGGCATTGCGATCTAGTGGTAGAAACGGT
TTATCAATATCTTTGCCGTTCTTCAGCAGAACTAAAGACTTTCTAACGGCTTCACGGCCC
AATTCTCTATGTTCCTTGCAGCCAATAGTACCCAGTAAAGATCGGTCTGTGAGAGGATGT
TCGAAAAGACCAGCTACAAA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 3

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ACCACAACAAGATCTCCAGAAACCAAACCCAAAAGAGGGAGACTAAAGCTCAAAAGACTA
GACATGAGCACTTAAACAGAACAATAGCCAAGATACTACACTCCTCCAACTAACTAAATG
AATCCAGAAACAACCCAATAGGAGATAGTAGAAAAAGAACTTAATTGACTATGACCAACC
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AGCAACTTTCATCTGAACCACCCGTCCACGATGACACAGCAAGAACCACACGAACCATTT
TGACGAAACCAAGACAGAAACCAAACAGAAGCAACAACCGGTAAAAACCCCTTCTCAACA
GAACCTTCATCTGGACGCTTCAAAGCCACAACCTCATTCTATTGCTCCAACTTCAAGAAG
CCACCGAGGATAATAGAGACCAGAGACAGACCAGGAAAACACACTTATTCAAGGAACGGG
AGAAGGGCTCCTAAGAGACAGAGAGATGAAGAGTTGCCCTGAAACCAGCTTCTTCTCGAC
ACTAACCTACACCTGCTCAACACACACCACTACGAAGCCTGCTACACCGTTGCAGAATCA
AAGACCAACTAAGCAAACTCTACACTCCATCAAAGATTAATCGGATACAATCCAGCAGAG
AAGACAAAATCCACAACTTAACGAAACCCTAAGAAAAGCTAGCAAGGATCCAGGATCCAC
TACAAGGAAGATAAAGTCCAAACAAGAAGGCACCAAGAGCACAAACTACTGGAGGAGGGG
CGAGTAGATCTAGGGATTCAAAAGAGTACCAAACTCTCTGATACCGGCGAAAAGACATCG
CACACGTCTTCCACATCTAGATAAGATCAACCCCTAACCGTTGGACACCGAAATCGCTCT
CCACGCGCCGTCACGGTCCTTCACGCCGGAATCTCCACAACCCACAAGCCAGACAGATCC
TCACCACACCTTCAAAGAGCAAGCAGAATAAAGAAAACAACCTGAGAATAAGACCACGAA
ACCCGACTCCGGTGCTGTGTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN04JQ U 1
AF RR4BV32JQ U 22
AF RR4BV32TF C 458
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AGCAACTTTCATCTGAACCACCCGTCCACGATGACACAGCAAGAACCACACGAACCATTT
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AAGACAAAATCCACAACTTAACGAAACCCTAAGAAA*GCTAGCAAGGAT

QA 1 769 1 769
DS 

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QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BV32TF 647 0 0
TTCTA
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TACACCGTTGCAGAATCAAAGACCAACTAAGCAAACTCTACACTCCATCAAAGATTAATC
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CAAGGATCCAGGATCCACTACAAGGAAGATAAAGTCCAAACAAGAAGGCACCAAGAGCAC
AAACTACTGGAGGAGGGGCGAGTAGATCTAGGGATTCAAAAGAGTACCAAACTCTCTGAT
ACCGGCGAAAAGACATCGCACACGTCTTCCACATCTAGATAAGATCAACCCCTAACCGTT
GGACACCGAAATCGCTCTCCACGCGCCGTCACGGTCCTTCACGCCGGAATCTCCACAACC
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TGAGAATAAGACCACGAAACCCGACTCCGGTGCTGTGTGAGC

QA 6 647 6 647
DS 



AS 1 3

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CATAAAAAATAAACAATGTCGACAGACTTGACGGAGGAGGAGTCGTTGTCCGGCATGATC
TTCATCCTTGTCTACTGCACTGCCGGCATCTCTGGTGGGCACATTAACCCTGCAGTGACG
TTTGGACTATTCTTGGCTAGCAAGGTGTCGTTGGTGAGAGCTATATCCTACATAGTGGCC
CAGTGTCTCGGAGCCACTTGCGGAGTTGGTTTGGTGAAAGTCTTCCAGAAAACTTATTAC
AACCGATATGGCGGTGGAGCCAACGTCCTCGCCGACGGATACAACGTTGGTGTTGGTGTT
GGTGCTGAGATTATCGGCACATTTGTCCTTGTCTACACGGTCTTCTCCGCTACAGACCCT
AAGCGTAATGCCCGTGACTCTCACATTCCTGTATTGGCACCATTGCCAATTGGATTTTCG
GTGTTCATGGTTCATTTAGCCACAATCCCAATCACTGGAACTGGAATTAACCCGGCTAGG
AGTTTTGGAGCTGCAGTCATCTACAACAATCAAAAGGCTTGGGATGATCAATGGATCTTC
TGGGTCGGTCCATTTGTGGGAGCAGCAATTGCAGCTTTGTACCACCAGTTTGTGTTGAGA
GCTGGTGCTATGAGGGCTTATGGGTCAGTCAGGAGCCAGCTTCACGAGCTTCACGCTTAG
AATTTGATTTTTTCAAAACTATCTAAGAGGTGGAGATTTCTTTGGGCCAGGAGGAAGGGA
AAAAAAATATCAAAATAATAATTAAAAAGAATTTATTGGTGAGTAACATTTAGTGTATTA
TTTGTTGCTTTGAGGGGGAGGTTTGAGAGTGACTTTATACACCAGTTTGCTGTATCCAAG
CTTGTAGAATGTATGTTTCTATTTGATGTATTTGTTATATATATTCTGTACTTGTCAACC
CTTCTATTTGTTGAATGATGTTTCATAATTATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4B880TF U 1
AF RR4DO20TF U 316
AF RR4E915TF U 316
BS 1 340 RR4B880TF
BS 341 341 RR4DO20TF
BS 342 567 RR4B880TF
BS 568 568 RR4DO20TF
BS 569 692 RR4B880TF
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BS 733 735 RR4DO20TF
BS 736 766 RR4B880TF
BS 767 993 RR4DO20TF
BS 994 994 RR4E915TF

RD RR4B880TF 766 0 0
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CATAAAAAATAAACAATGTCGACAGACTTGACGGAGGAGGAGTCGTTGTCCGGCATGATC
TTCATCCTTGTCTACTGCACTGCCGGCATCTCTGGTGGGCACATTAACCCTGCAGTGACG
TTTGGACTATTCTTGGCTAGCAAGGTGTCGTTGGTGAGAGCTATATCCTACATAGTGGCC
CAGTGTCTCGGAGCCACTTGCGGAGTTGGTTTGGTGAAAGTCTTCCAGAAAACTTATTAC
AACCGATATGGCGGTGGAGCCAACGTCCTCGCCGACGGATGCAACGTTGGTGTTGGTGTT
GGTGCTGAGATTATCGGCACATTTGTCCTTGTCTACACGGTCTTCTCCGCTACAGACCCT
AAGCGTAATGCCCGTGACTCTCACATTCCTGTATTGGCACCATTGCCAATTGGATTTTCG
GTGTTCATGGTTCATTTAGCCACAATCCCAATCACTGGAACTGGAATTAACCCGGCTAGG
AGTTTTGGAGCTGCAGTCATCTACAACGATCAAAAGGCTTGGGATGATCAATGGATCTTC
TGGGTCGGTCCATTTGTGGGAGCAGCAATTGCAGCTTTGTACCACCAGTTTGTGTTGAGA
GCTGGTGCTATGAGGGCTTATGGGTCAGTCAG*AGCCAGCTTCACGAGCTTCTCGCTTAG
AATTTGATTTTTC**AAACTATCTAAGAGGTGGAGATTTCTTTGGG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4DO20TF 678 0 0
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GGCACATTTGTCCTTGTCTACACGGTCTTCTCCGCTACAGACCCTAAGCGTAATGCCCGT
GACTCTCACATTCCTGTATTGGCACCATTGCCAATTGGATTTTCGGTGTTCATGGTTCAT
TTAGCCACAATCCCAATCACTGGAACTGGAATTAACCCGGCTAGGAGTTTTGGAGCTGCA
GTCATCTACAACAATCAAAAGGCTTGGGATGATCAATGGATCTTCTGGGTCGGTCCATTT
GTGGGAGCAGCAATTGCAGCTTTGTACCACCAGTTTGTGTTGAGAGCTGGTGCTATGAGG
GCTTATGGGTCAGTCAGGAGCCAGCTTCACGAGCTTCACGCTTAGAATTTGATTTTTTCA
AAACTATCTAAGAGGTGGAGATTTCTTTGGGCCAGGAGGAAGGGAAAAAAAATATCAAAA
TAATAATTAAAAAGAATTTATTGGTGAGTAACATTTAGTGTATTATTTGTTGCTTTGAGG
GGGAGGTTTGAGAGTGACTTTATACACCAGTTTGCTGTATCCAAGCTTGTAGAATGTATG
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TGATGTTTCATAATTATA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4E915TF 679 0 0
GGAGCCAACGTCCTCGCCGACGGATACAACGTTGGTGTTGGTGTTGGTGCTGAGATTATC
GGCACATTTGTCCTTGTCTACACGGTCTTCTCCGCTACAGACCCTAAGCGTAATGCCCGT
GACTCTCACATTCCTGTATTGGCACCATTGCCAATTGGATTTTCGGTGTTCATGGTTCAT
TTAGCCACAATCCCAATCACTGGAACTGGAATTAACCCGGCTAGGAGTTTTGGAGCTGCA
GTCATCTACAACAATCAAAAGGCTTGGGATGATCAATGGATCTTCTGGGTCGGTCCATTT
GTGGGAGCAGCAATTGCAGCTTTGTACCACCAGTTTGTGTTGAGAGCTGGTGCTATGAGG
GCTTATGGGTCAGTCAGGAGCCAGCTTCACGAGCTTCACGCTTAGAATTTGATTTTTTCA
AAACTATCTAAGAGGTGGAGATTTCTTTGGGCCAGGAGGAAGGGAAAAAAAATATCAAAA
TAATAATTAAAAAGAATTTATTGGTGAGTAACATTTAGTGTATTATTTGTTGCTTTGAGG
GGGAGGTTTGAGAGTGACTTTATACACCAGTTTGCTGTATCCAAGCTTGTAGAATGTATG
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TGATGTTTCATAATTATAA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL4304Contig1 836 2 4 U
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TTATTAGCCCTAATCATCCAAGGATCCGACAATTTCTCCATAGGAGGACGCATCAAGTAT
TTGATATGGCACTTAGGGTCCACAGGAACATACAACAGAGAGACATGGAGATTGGTCGGA
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GGCCAAAACAAATAGAGCCAACAAGCACAGCCAAGGCTGCGAAGAAGCTATTAGATTCAA
CACGTCTCAAACCGCATGCCAACACGAAGACTCCTCAGAGTAGTGAAGTGGGTAGGCACT
TGTTCTTGTCCTTGAGGAACCTCAGGCCCAAGTTTTCACCGACAATCTCGATGATGATGA
AGATCAAGCCGCCAAGAGCCGTTGGAAGTACCACTCAGTACAGGCCTTTCAGTGAATCCA
GTCTTGTGAAACCATTCTATGCTAGAGGCGGGTTCGATGGTGTTGTCAGGAAGGATATTT
TGCAATGGATGGGGCAGAGATGAAGATCGCCACAATTCACCAAAGCTGGTTCTCATGTTA
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AATAAGTGGTCTAATCTCTTGGAGAATACATGACTTGTGTCTAGTTTTACGTGACCACGC
AACCAGAAATGTCATGTTAAAGATTCTAACAAATGCAAGTTCAGTTTCTAGGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY68TF U 1
AF RR4BY68JQ C 120
BS 1 686 RR4BY68TF
BS 687 687 RR4BY68JQ
BS 688 775 RR4BY68TF
BS 776 836 RR4BY68JQ

RD RR4BY68TF 780 0 0
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TTATTAGCCCTAATCATCCAAGGATCCGACAATTTCTCCATAGGAGGACGCATCAAGTAT
TTGATATGGCACTTAGGGTCCACAGGAACATACAACAGAGAGACATGGAGATTGGTCGGA
ACCTTGGAAACTGGATTCTTCGAGGGCTCGACCGGATGAAGCCATCAGCTCAGGTGCTAC
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CACGTCTCAAACCGCATGCCAACACGAAGACTCCTCAGAGTAGTGAAGTGGGTAGGCACT
TGTTCTTGTCCTTGAGGAACCTCAGGCCCAAGTTTTCACCGACAATCTCGATGATGATGA
AGATCAAGCCGCCAAGAGCCGTTGGAAGTACCACTCAGTACAGGCCTTTCAGTGAATCCA
GTCTTGTGAAACCATTCTATGCTAGAGGCGGGTTCGATGGTGTTGTCAGGAAGGATATTT
TGCAATGGATGGGGCAGAGATGAAGATCGCCACAATTCACCAAAGCTGGTTCTCATGTTA
CAAGTAGCTGGCGAATACCACGAGCA*TAAAAGAGAACTGTTCTTCATATATAGTCTTTT
AATAAGTGGTCTAATCTCTTGGAGAATACATGACTTGTGTCTAGTTTTACGTGAC
ACGCA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4BY68JQ 717 0 0
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TTTGATATGGCACTTAGGGTCCACAGGAACATACAACAGAGAGACATGGAGATTGGTCGG
AACCTTGGAAACTGGATTCTTCGAGGGCTCGACCGGATGAAGCCATCAGCTCAGGTGCTA
CGGCCAAAACAAATAGAGCCAACAAGCACAGCCAAGGCTGCGAAGAAGCTATTAGATTCA
ACACGTCTCAAACCGCATGCCAACACGAAGACTCCTCAGAGTAGTGAAGTGGGTAGGCAC
TTGTTCTTGTCCTTGAGGAACCTCAGGCCCAAGTTTTCACCGACAATCTCGATGATGATG
AAGATCAAGCCGCCAAGAGCCGTTGGAAGTACCACTCAGTACAGGCCTTTCAGTGAATCC
AGTCTTGTGAAACCATTCTATGCTAGAGGCGGGTTCGATGGTGTTGTCAGGAAGGATATT
TTGCAATGGATGGGGCAGAGATGAAGATCGCCACAATTCACCAAAGCTGGTTCTCATGTT
ACAAGTAGCTGGCGAATACCACGAGCAATAAAAGAGAACTGTTCTTCATATATAGTCTTT
TAATAAGTGGTCTAATCTCTTGGAGAATACATGACTTGTGTCTAGTTTTACGTGACCACG
CAACCAGAAATGTCATGTTAAAGATTCTAACAAATGCAAGTTCAGTTTCTAGGGATC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 3

CO CL4305Contig1 1019 3 5 U
GGAGTCTAGATCGTCGGTTAATCACCATCGTTGAATCTTTTGGAGACAATCCCAAGTCAC
TGAGTTGAAAATGGTGTTGATCGAAAGCGAAAGCGACGATGAAATCTCCATTAAAGAAGA
ACCAAATCCATCGCGATCTTCCTCGTCGCCGCCCAAAACAGCGGATGCGAAAATAGTCGG
CGGAGATGATTCCGACGGGTTCGAAACTGCCAGCGAACGTGGAGTTAGCGATAACGAAGA
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ACCAGAGAAGAAGGAAGATCAGGTGGAGGCCATTGCCGATGTTGAATCAAATCAGGAGAA
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TTACGAAGATGCATTGTCAAAGTATGAGCTTGCTTTACAGTTTGCTCAGGAGTTCCCTGA
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CAAATATGCAGAAGCAGTCAAGGAAAGCACAAAAGCGATAGAGCTGAATCCCAGCTATAC
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CACTGACTTGAAGAAGATATTAGAACTGGACCCTTCAAATGATCAGGCTAGAAAAGGAAT
TCGGCGTTTGGAACCATTGGCGGCTGCGAAGCAAGAAAAGATGAAAGAAGAAGCCATAGC
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CCAACAATACACTTACTCATGGTATACTTGCATCAACCATTTTGTGTTCATCGTCTGTGA
GATCAGTACGTTTGTTGTCGATGAATTTGTACTGGAAAGTAGAAGACTCGTTTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR21TF U 1
AF RR4A767TF U 41
AF RR4GR21JQ C 220
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T

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A255JQD U 1
AF RR4A255JQ U 1
AF RR4A255TFB C 95
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CTTCGAGATTTCT

QA 1 673 1 673
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AGCTTATTTCTTCCTCATTGTTTTTATTTTAATCTTTTACTGTGGAGAATCTTCCACTCT
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CGTTCTCCTTTTTCACGGGAGATATCTGTTGATTGTCGCCGTTGAATTTCATTCCGCAAA
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TGCAGTGATTCAAACCTGAACTTAACGATTTAAAGCTCTTGGAGTAAAGTTTAAGGCAAT
CTTCCAACAGCTTCTTACTAAGATTACTCTTATATTTCTTCTCTTTTATAATATTCTCCA
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QA 1 832 1 832
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CTTCTTTGCTGTCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

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ATCGTTGGATGCTTTCCTGTCACTGTGGTCACTGATGACACTATTAGAACCAGCTAAGAG
TGTGGAACATTTGATTTACATTGGATTCCCAGGTGATCCATCTTCTGCCGTTCGTCTTAC
TAGGAGAAGACGTTTAGATCGCAAAAAGCAACAATGCGAAAGAAAAGTTTTCCAGTGCTT
TGTGTTTGGTCCCAATAACGCCGGAAAATCTGCACTACTGAACTGCTTTCTTGGAAGGTC
ATATGATGGCCAGGGATCAACGACTGATGAGCGCTATGCAGTAAATATGGTGGATGACTC
TGGGAATGCAAAGAAAACTCTTGTGATGAGGGAAATTCCAGATGATGGGGCTAAAGAGCT
ATTTTCATCCAAGGAGTCGTTGGCTGCATGTGACATAGCTGTCTTCGTATATGACAGCTC
GGACGAGTCCTCATGGAAGAGAGCCACTGAGTTGCTTGTCGAAGTTGCAACTCACGGCGA
GGCCACTGGATATGAGGTCCCTTGCCTCATGGTTTCGGCCAAGGACGATCTTGATTCATT
CCCAATTTGCATTCAGGAATCCACCAGGGTGACACAAGATATGGGAATAGAGCCTCCGGT
ATCCATCAGCTCGAAACTGGGGGATTTTAACAACTTATTCCGCAAAATCATTACTGCAGC
GCAGCATCCTCACCTGAGTATTCCAGAAACCGAAGCAGGAAAAAGCCGCAAGCATTACAA
CAGGCTAATCAACCGCTCTCTTATGGCTGTTTCAATTGGAGCTGCTGCTGTGGTCGTTGG
ACTGGCTGCATACCGTGTGTATGCCGCAAGAAAGAGCGCTTCTACCTGAGAAAATTGAGA
ATGAAGAAGCTTAGTGACTCAAGGGTAGCAAATCTTGTTCTGAGTTTGTTTATCATTCCC
AAGTTTAAAACCAGAGTACTGTTTTCTTAGAAGATGAATGGAAAAATGGGGTTTTTGAAA
GATCTGTAGGAACACAAAAGAAAAGAAGAGAACATATAGTAGCTACAAATAGACATTGTG
TTTGAGTTTCATCAATAACAAAAAGACCTTTCGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC58TF U 1
AF RR4AC58JQ C 318
BS 1 754 RR4AC58TF
BS 755 1117 RR4AC58JQ

RD RR4AC58TF 754 0 0
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ATCGTTGGATGCTTTCCTGTCACTGTGGTCACTGATGACACTATTAGAACCAGCTAAGAG
TGTGGAACATTTGATTTACATTGGATTCCCAGGTGATCCATCTTCTGCCGTTCGTCTTAC
TAGGAGAAGACGTTTAGATCGCAAAAAGCAACAATGCGAAAGAAAAGTTTTCCAGTGCTT
TGTGTTTGGTCCCAATAACGCCGGAAAATCTGCACTACTGAACTGCTTTCTTGGAAGGTC
ATATGATGGCCAGGGATCAACGACTGATGAGCGCTATGCAGTAAATATGGTGGATGACTC
TGGGAATGCAAAGAAAACTCTTGTGATGAGGGAAATTCCAGATGATGGGGCTAAAGAGCT
ATTTTCATCCAAGGAGTCGTTGGCTGCATGTGACATAGCTGTCTTCGTATATGACAGCTC
GGACGAGTCCTCATGGAAGAGAGCCACTGAGTTGCTTGTCGAAGTTGCAACTCACGGCGA
GGCCACTGGATATGAGGTCCCTTGCCTCATGGTTTCGGCCAAGGACGATCTTGATTCATT
CCCAATTTGCATTCAGGAATCCACCAGGGTGACACAAGATATGGGAATAGAGCCTCCGGT
ATCCATCAGCTCGAAACTGGGGGATTTTAACAACTTATTCCGCAAAATCATTACTGCAGC
GCAGCATCCTCACCTGAGTATTCCAGAAACCGAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AC58JQ 800 0 0
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CTCTTGTGATGAGGGAAATTCCAGATGATGGGGCTAAAGAGCTATTTTCATCCAAGGAGT
CGTTGGCTGCATGTGACATAGCTGTCTTCGTATATGACAGCTCGGACGAGTCCTCATGGA
AGAGAGCCACTGAGTTGCTTGTCGAAGTTGCAACTCACGGCGAGGCCACTGGATATGAGG
TCCCTTGCCTCATGGTTTCGGCCAAGGACGATCTTGATTCATTCCCAATTTGCATTCAGG
AATCCACCAGGGTGACACAAGATATGGGAATAGAGCCTCCGGTATCCATCAGCTCGAAAC
TGGGGGATTTTAACAACTTATTCCGCAAAATCATTACTGCAGCGCAGCATCCTCACCTGA
GTATTCCAGAAACCGAAGCAGGAAAAAGCCGCAAGCATTACAACAGGCTAATCAACCGCT
CTCTTATGGCTGTTTCAATTGGAGCTGCTGCTGTGGTCGTTGGACTGGCTGCATACCGTG
TGTATGCCGCAAGAAAGAGCGCTTCTACCTGAGAAAATTGAGAATGAAGAAGCTTAGTGA
CTCAAGGGTAGCAAATCTTGTTCTGAGTTTGTTTATCATTCCCAAGTTTAAAACCAGAGT
ACTGTTTTCTTAGAAGATGAATGGAAAAATGGGGTTTTTGAAAGATCTGTAGGAACACAA
AAGAAAAGAAGAGAACATATAGTAGCTACAAATAGACATTGTGTTTGAGTTTCATCAATA
ACAAAAAGACCTTTCGTTTG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL4308Contig1 613 2 4 U
GGTCCCCAGATCATCAGATCTCCACGTCAGCAAATCTCCGTCGCAAACCAGCCGGAGAAA
CCGAGAAACTTTACCATCATGATTCCTTACGTAACGGTTGAGGAAGCTTCCTTCGCGCTC
GGAAGAAACCTCACGTGGTTGGAGACAGTTTGGTTCGATTACTCCGCCACAAAGTCCGAC
TACTATCTCTACTGCCACAACATTCTCTTCCTATTCCTCGTCCTTTCTCTAGCTCCTCTC
CCTCTGGTTCTCGTCGAGCTGGCTCGATCCGCTTCTGGGTGGTTCGACCGGTACAAGATC
CAACCCAAAGTAAACTACTCCTTGTCCGACATGTTCGGATGTTACAAAGACGTCATGAAG
ATGTTCATCCTCGTCGTTGGTCCATTACAACTCGTTTCTTATCCTTCCATTCAGATGATT
GGGATACGATCTGGTTTACCATTACCAACATTTTCAGAAATACTGCCACAGTTGTTCGTC
TACTTCTTGATAGAAGACTACACAAACTATTGGGTACATAGATTTTTCCACAGTAAGTGG
GGGATACGAGAACATTCATCGCGTTCATCACGAGTACACAGCTCCTATTGGATACGCTGC
ACCTTATGCACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV78TF U 1
AF RR4BM96TF U 14
BS 1 542 RR4DV78TF
BS 543 543 RR4BM96TF
BS 544 590 RR4DV78TF
BS 591 613 RR4BM96TF

RD RR4DV78TF 590 0 0
GGTCCCCAGATCATCAGATCTCCACGTCAGCAAATCTCCGTCGCAAACCAGCCGGAGAAA
CCGAGAAACTTTACCATCATGATTCCTTACGTAACGGTTGAGGAAGCTTCCTTCGCGCTC
GGAAGAAACCTCACGTGGTTGGAGACAGTTTGGTTCGATTACTCCGCCACAAAGTCCGAC
TACTATCTCTACTGCCACAACATTCTCTTCCTATTCCTCGTCCTTTCTCTAGCTCCTCTC
CCTCTGGTTCTCGTCGAGCTGGCTCGATCCGCTTCTGGGTGGTTCGACCGGTACAAGATC
CAACCCAAAGTAAACTACTCCTTGTCCGACATGTTCGGATGTTACAAAGACGTCATGAAG
ATGTTCATCCTCGTCGTTGGTCCATTACAACTCGTTTCTTATCCTTCCATTCAGATGATT
GGGATACGATCTGGTTTACCATTACCAACATTTTCAGAAATACTGCCACAGTTGTTCGTC
TACTTCTTGATAGAAGACTACACAAACTATTGGGTACATAGATTTTTCCACAGTAAGTGG
GG*ATACGAGAACATTCATCGCGTTCATCACGAGTACACAGCTCCTATTG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4BM96TF 600 0 0
TCAGATCTCCACGTCAGCAAATCTCCGTCGCAAACCAGCCGGAGAAACCGAGAAACTTTA
CCATCATGATTCCTTACGTAACGGTTGAGGAAGCTTCCTTCGCGCTCGGAAGAAACCTCA
CGTGGTTGGAGACAGTTTGGTTCGATTACTCCGCCACAAAGTCCGACTACTATCTCTACT
GCCACAACATTCTCTTCCTATTCCTCGTCTTTTCTCTAGCTCCTCTCCCTCTGGTTCTCG
TCGAGCTGGCTCGATCCGCTTCTGGGTGGTTCGACCGGTACAAGATCCAACCCAAAGTAA
ACTACTCCTTGTCCGACATGTTCGGATGTTACAAAGACGTCATGAAGATGTTCATCCTCG
TCGTTGGTCCATTACAACTCGTTTCTTATCCTTCCATTCAGATGATTGGGATACGATCTG
GTTTACCATTACCAACATTTTCAGAAATGCTGCCACAGTTGTTCGTCTACTTCTTGATAG
AAGACTACACAAACTATTGGGTACATAGATTTTTCCACAGTAAGTGGGGGATACGAGAAC
ATTCATCGCGTTCATCACGAGTACACAGCTCCTATTGGATACGCTGCACCTTATGCACAC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL4309Contig1 600 3 2 U
TTTTTTTTTCACAAATCGAAAGGCCTTTATTATTATTCATATTGCTTACATCACAAACAA
ACACTACATAAGCAACAACGAAGACGAAGAACACTTTAAAAAGAACCATTTAAATCATCG
TTCATCAAGAAGCCTTCTTCTCGAGCTTCGAAGCTTCCAGATCCGCCGCCTTCTTCAGCA
AATTATCATCATTGTCATCCAACGCCATCGTAATCGGACACGATCCGAGCCCATCGGCAA
TCGCTAGCACGATCTTCTTCATCTCCGATCTAAACTCCTCCAGATCCACGGAACCGCTCT
GATCCGTGTCGAACTTGTCGAATATCGAGTCGTAAAGACTCGTCAGCTCCTCCTGAGGTG
TCACCACGTCGACGCCGAAGTGCGATTCCAAAAGCCTCATCGATTCGAACGTCTTTCGTA
GCTCGGATCGAGATAAAACGCCGTCGTTGTTTGGATCCAGAGCCGCGAACCTCTCGTCTA
TGGTCTTTTTGAACTGCTCCTCGTCCTCCACGAACGACCGCACCGTTGATCCGTCGATCA
CTACCACTCCCATTTTCTTACGGTTATAGCTTTTTTTCTCGTTTATTATCGCAACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DP95JQ U 52
AF RR4CY28TF C 1
AF RR4CY28JQ U 10
BS 1 9 RR4CY28TF
BS 10 600 RR4CY28JQ

RD RR4DP95JQ 479 0 0
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TCTCGTCTATGGTCTTTTTGAACTGCTCCTCGTCCTCCACGAACGACCGCACCGTTGAT

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DS 

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AATTATCATCATTGTCATCCAACGCCATCGTAATCGGACACGATCCGAGCCCATCGGCAA
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TCACCACGTCGACGCCGAAGTGCGATTCCAAAAGCCTCATCGATTCGAACGTCTTTCGTA
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DS 

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AAGCCTTCTTCTCGAGCTTCGAAGCTTCCAGATCCGCCGCCTTCTTCAGCAAATTATCAT
CATTGTCATCCAACGCCATCGTAATCGGACACGATCCGAGCCCATCGGCAATCGCTAGCA
CGATCTTCTTCATCTCCGATCTAAACTCCTCCAGATCCACGGAACCGCTCTGATCCGTGT
CGAACTTGTCGAATATCGAGTCGTAAAGACTCGTCAGCTCCTCCTGAGGTGTCACCACGT
CGACGCCGAAGTGCGATTCCAAAAGCCTCATCGATTCGAACGTCTTTCGTAGCTCGGATC
GAGATAAAACGCCGTCGTTGTTTGGATCCAGAGCCGCGAACCTCTCGTCTATGGTCTTTT
TGAACTGCTCCTCGTCCTCCACGAACGACCGCACCGTTGATCCGTCGATCACTACCACTC
CCATTTTCTTACGGTTATAGCTTTTTTTCTCGTTTATTATCGCAACGATCC

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DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A818TF U 1
AF RR4BJ68TF U 27
AF RR4BJ68JQ C 101
BS 1 191 RR4A818TF
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TTTTGTTGATCAGTGACTCTTCTGTTGGAAAATCATGCCTTCTTCTCCGATTCGCTGACG
ATGCTTACATTGACAGTTACATCAGTACCATCGGTGTTGACTTCAAAATTAGGACTATTG
AGCTGGATGGGAAGACCGTTAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGGCAAGAACGTTTCA
GGACCATCACTAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGAATCATCATTGTGTACGACTGTA
CTGAAATGGAAAGCTTTAACAACGTGAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGACAGGTATGCTA
ATGACAGTGTTTGCAAGCTTCTTATCGGTAACAAGAATGATATGGTTGAGAGTAAAGTTG
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AAAGAATGGGAAGCCAGACTACT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4BJ68TF 669 0 0
GG
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ACGTTTTCCTGGGAAAAAAATAATCAAATCGGATAAACGTACTTAACCGCTTGAGGAAAT
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CATCGGTGTTGACTTCAAAATTAGGACTATTGAGCTGGATGGGAAGACCGTTAAGCTGCA
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CAA
AGCC

QA 3 665 3 665
DS 

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AATTCCATTTCTTGAGACCAGTGCTAAGGATTCTATCAATGTCGAACAAGCATTTTTAAC
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TTGCCTGAATTATCTATGGTGTTAGTTGATAATG

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 3

CO CL4311Contig1 963 3 2 U
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AAGATCAAACCAAGATCACAAAATCCCAGGAGATCAGATCTTGCTGTCTCAGCATCATCA
GGAGCGAATTTCTTAAAGGAATCTAATACTATTAAGACTATCAAAGCCTTTTGATGGACG
ATTGTCGGGAGAAGAGAAGACGTTGTACAAAACTTAGAGTAAGTACTGATAATAACGACA
TGGAGAAGATGATGCATAGAGAAATCGAGAGACAGAGAAGACAAGAAATGGCTTCTCTTT
ATGCTTCTCTTCGTTCTCTTCTCCCTCTTAATTTCATTCAGGGCAAACGTTCGACGTCAG
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GATTAACCAGAATGAAGTAAATGGTTTTTCTGTTTGTTAAACGATATCCTAAGTGATGTA
AATGGTTGTTGCATTGGTTTCTCTTATCATGTCAAGCAGCGACTAATATAAGCACGTGGT
TAGTTTATTTGTACTTGTATTGTTATGTTGTGTTCAATTTGCATCTATTTGTATGTTTAT
CTTCTTTTTTCCTTTTTCGCTGAAGTGTAAATATTATTTCTGAAATGAAGTCGAGATTTT
ACA


BQ
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10 10 10 

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AAGATCAAACCAAGATCACAAAATCCCAGGAGATCAGATCTTGCTGTCTCAGCATCATCA
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AATGAAGTCGAGATTTTACA

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DS 



AS 1 2

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TGAACTAAATCGGGACCATGCCAGTAGAGAACTAAAGTACAAAACCAATAAAAATATCCT
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TCAACTTCCCTTAGAAGAATAACCTCAGGAAGCATCCGATACCAAGCCGTCGCTACTGGT
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BQ
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GGCTTTGAGTTGAAATCTCCTGATTCTTTAACCAACTCACTCCCATT

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DS 

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TCCTCACGCATTGCCTACACAGCGTGCAATCACGTGGCCGTGCTACCGCTGCCCTCTTCC
TACCATTGCCCATGTCTTCAATGTCAAAAACCTTCTGCGGGCAGGCCTTTACGAGTCGTT
CAGCATCTTCATCCTCAACTTCCCTTAGTAGAATAACCTCAGGAAGCATCCGATACCAAG
CCGTCGCTACTGGTGACCACTTTGCATGTGTTTTACCAATCCCCTTTACCGCATGAGCCT
CCAGCTCAATCTCATGACCAGGGCCGAGTTTTGCGATCAATATGTCAGGATAGCTCGGAG
AGATATTACTATCCTTAGCAGCAAATTCAGGGAAGGAATCTTTTTGGCTTCGGCTGAAGG
AAGTATAAGTTTTTGGCTTTGAGTTGGAATCTCCTGATTCTTTAACCAACTCACTCCCAT
TTGGTAACCAAATCAGTTCCTTTGTTAAAACTTTCTTACGTCCTTCACCCTTTGCACATT
TCGCATGGAGTTTGAAAACGATGGTGTTCTTTTCATTTGGCTGGTCGTTTTCAGATAAAT
AGTCGAAGAGCTTGGAGTCTGCAGCAATAGGAACAAGACCCATCCTCTGAGCAAGAACTT
CATCTTGAACAATGGATGTGTTGTTTGCTATAAACACTTTTTCAAAAGCCATT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4313Contig1 970 2 2 U
GGGAAGACTACTGTTATATCTGCTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTGGTCTTCGGCTTCTAAC
AGGGGCGAGCAGAACCATTACGTCGCTTTGGGAATCGCTCGCAACGCCACGCAGGCTTAC
GTCAAGAGAGCTTATCGGTTGCTCGCTCGAAAGTTTCATCCTGATGTAAACAAGGATTGT
AAAGCAGGAGAGCTATTCAAGAGCATTCGTTGTTCCTACGAGGTTCTATCTAATGAAGCA
ACAAGGACTCAGTACGACCGATCACTTATACATCAGGAAAACTCAAGGTTCTCTAGAGTG
AAAAGGCACTACTACAGCACCCCTGACTCTGAGGTTGAAGATGCCATGAAGTATTGCTAC
AACTGGTCCGAGAAAAGACGCGGATCCAGATACCAGAGAGCCTACGGACACTACTCCACA
TATCCAAACTCGCATTTCTACAGCGAGCCGCCACACAAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAG
ACGGCTCAAGAACAGAGAGACACTTTCTCCAAAGTTCTCAAAACCGCTTTCCTCTCCATG
TTTCTCCTATACACGCTCGGATACCTCGCATCCCTCACGTTCACCACGTTCGCGGCTTTG
CTAGACAAGGAGCTAGACATGGGTTACAAATCCCGGGTTTATGATAGCTTGGATACTCGG
CGGGAAAGGCGGTATCCTTCTCACCCTCTGCCTGACGTTTGCAAGCTGGCTATGCGGGAA
AGCGAGCAGCAGCGTGGTGGTTGTGATGGGAGTGGCGATGTGGGTTGGATCGAATTTAGC
AAGACATGCTCCTCTTCCGCAAGGAGCTCTCCTCACACTCCTCTACATGTCAATCAAGCT
TCAAGTCGACTCAAGTTGAATCTTTTTTAATCTGAGTTCACTTGCATCGGTTTAATCTCA
AAGTTAGATTGTAAATAATTTAGACGCAATTGTATAACTTGTCTATTGCAATGTCTCTCC
TATGATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM85TF U 1
AF RR4GM85JQ C 381
BS 1 728 RR4GM85TF
BS 729 970 RR4GM85JQ

RD RR4GM85TF 728 0 0
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AGGGGCGAGCAGAACCATTACGTCGCTTTGGGAATCGCTCGCAACGCCACGCAGGCTTAC
GTCAAGAGAGCTTATCGGTTGCTCGCTCGAAAGTTTCATCCTGATGTAAACAAGGATTGT
AAAGCAGGAGAGCTATTCAAGAGCATTCGTTGTTCCTACGAGGTTCTATCTAATGAAGCA
ACAAGGACTCAGTACGACCGATCACTTATACATCAGGAAAACTCAAGGTTCTCTAGAGTG
AAAAGGCACTACTACAGCACCCCTGACTCTGAGGTTGAAGATGCCATGAAGTATTGCTAC
AACTGGTCCGAGAAAAGACGCGGATCCAGATACCAGAGAGCCTACGGACACTACTCCACA
TATCCAAACTCGCATTTCTACAGCGAGCCGCCACACAAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAG
ACGGCTCAAGAACAGAGAGACACTTTCTCCAAAGTTCTCAAAACCGCTTTCCTCTCCATG
TTTCTCCTATACACGCTCGGATACCTCGCATCCCTCACGTTCACCACGTTCGCGGCTTTG
CTAGACAAGGAGCTAGACATGGGTTACAAATCCCGGGTTTATGATAGCTTGGATACTCGG
CGGGAAAGGCGGTATCCTTCTCACCCTCTGCCTGACGTTTGCAAGCTGGCTATGCGGGAA
AGCGAGCA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4GM85JQ 590 0 0
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CAGCGAGCCGCCACACAAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAGACGGCTCAAGAACAGAGAGA
CACTTTCTCCAAAGTTCTCAAAACCGCTTTCCTCTCCATGTTTCTCCTATACACGCTCGG
ATACCTCGCATCCCTCACGTTCACCACGTTCGCGGCTTTGCTAGACAAGGAGCTAGACAT
GGGTTACAAATCC*GGGTTTATGATAGCTTGGATACTCGGCGGGAAAGGCGGTATCCTTC
TCACCCTCTGCCTGACGTTTGCAAGCTGGCTATGCGGGAAAGCGAGCAGCAGCGTGGTGG
TTGTGATGGGAGTGGCGATGTGGGTTGGATCGAATTTAGCAAGACATGCTCCTCTTCCGC
AAGGAGCTCTCCTCACACTCCTCTACATGTCAATCAAGCTTCAAGTCGACTCAAGTTGAA
TCTTTTTTAATCTGAGTTCACTTGCATCGGTTTAATCTCAAAGTTAGATTGTAAATAATT
TAGACGCAATTGTATAACTTGTCTATTGCAATGTCTCTCCTATGATACTT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

CO CL4314Contig1 894 3 15 U
GGAAGACCTCTTCACCATTATATCGAGTCTCATCAGCTTCTTGAGTTGAAAGATACCTTT
GATCCGTGTTTCGATTTTCTTAACTTTCATAAACCGACCAAAACTTGTCTAAACAATTAT
GGCGGAGGAAACCAAGAACGTTCATGAGCATGAAGTGCCAAAGGTAGCAACGGAGGAATC
ATCTGCGGCGACTGGGGAGGTAACAGATCGTGGTATGTTCGACTTCTTGAAAAAGAAGAA
GGAGGAAACAAAACCAGAAGAGACGACCCACTCGGAGTTCGAGCAGAAGGTTCAGGTTTC
TGAGCCGGTCCCTGAGGTTAAACACGAAGAAGAGGAGAAGAAACCAAGTCTCCTTGAGAA
GCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGA
GAAGAGAAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGATTGCTACTGAAGGAGAGGGGCAAACAGA
GGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAAGAGAAGCTTCCAGGACATGGAAAGAA
GCCTGAAGACGACTCAGCTGCAGCGGCTGCACCGGCTGTTGCTCTTCCGGTGGAGGAAGC
GCATCCGGCGGAGAAGAAGGGAATTTTGGAGAAGATTAAAGAGAAGCTTCCGGGATACCA
CTCAAAGACCGTTGAGGAGGAGAAGAAAGATGATCACTGATGAAAACATGAATATTAATG
ATGATAAGAGACATGTTGTGTTGTTTGTGATGGATGATGGTCATCTTTTTGGTTTGTGCT
GTTGAAGTTTGTTGGCTTCGTTGTGTCTTATTTTTCAGTTTCTATGTTCTTCTTTTTGTT
GTGTTTTAGGGTATTGTTTCGTGGTATTTTAAAGGTATGAAAAATTTAATTCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC13TF U 1
AF RR4F368TF U 1
AF RR4F368JQ C 184
BS 1 56 RR4DC13TF
BS 57 57 RR4F368TF
BS 58 215 RR4DC13TF
BS 216 216 RR4F368TF
BS 217 316 RR4DC13TF
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BS 318 435 RR4DC13TF
BS 436 438 RR4F368TF
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BS 681 681 RR4F368TF
BS 682 755 RR4DC13TF
BS 756 769 RR4F368TF
BS 770 771 RR4F368JQ
BS 772 794 RR4F368TF
BS 795 894 RR4F368JQ

RD RR4DC13TF 755 0 0
GGAAGACCTCTTCACCATTATATCGAGTCTCATCAGCTTCTTGAGTTGAAAGATACTTTT
GATCCGTGTTTCGATTTTCTTAACTTTCATAAACCGACCAAAACTTGTCTAAACAATTAT
GGCGGAGGAAACCAAGAACGTTCATGAGCATGAAGTGCCAAAGGTAGCAACGGAGGAATC
ATCTGCGGCGACTGGGGAGGTAACAGATCGTGGTACGTTCGACTTCTTGAAAAAGAAGAA
GGAGGAAACAAAACCAGAAGAGACGACCCACTCGGAGTTCGAGCAGAAGGTTCAGGTTTC
TGAGCCGGTCCCTGAGTTTAAACACGAAGAAGAGGAGAAGAAACCAAGTCTCCTTGAGAA
GCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGA
GAAGAGAAAGAAGAA***GGACAAGAAGAAGATTGCTACTGAAGGAGAGGGGCAAACAGA
GGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAAGAGAAGCTTCCAGGACATGGAAAGAA
GCCTGAAGACGACTCAGCTGCAGCGGCTGCACCGGCTGTTGCTCTTCCGGTGGAGGAAGC
GCATCCGGCGGAGAAGAAGGGAATTTTGGAGAAGATTAAAGAGAAGCTTCCGGGATACCA
CTCAAAGACCGTTGAGGAGGGGAAGAAAGATGATCACTGATGAAAACATGAATATTAATG
ATGATAAGAGACATGTTGTGTTGTTTGTGATGGAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4F368TF 794 0 0
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TATCCGTGTTTCGATTTTCTTAACTTTCATAAACCGACCAAAACTTGTCTAAACAATTAT
GGCGGAGGAAACCAAGAACGTTCATGAGCATGAAGTGCCAAAGGTAGCAACGGAGGAATC
ATCTGCGGCGACTGGGGAGGTAACAGATCGTGGTATGTTCGACTTCTTGAAAAAGAAGAA
GGAGGAAACAAAACCAGAAGAGACGACCCACTCGGAGTTCGAGCAGAAGGTTCAGGTTTC
TGAGCCGGTCCCTGAGGTTAAACACGAAGAAGAGGAGAAGAAACCAAGTCTCCTTGAGAA
GCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGA
GAAGAGAAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGATTGCTACTGAAGGAGAGGGGCAAACAGA
GGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAAGAGAAGCTTCCAGGACATGGAAAGAA
GCCTGAAGACGACTCAGCTGCAGCGGCTGCACCGGCTGTTGCTCTTCCGGTGGAGGAAGC
GCATCCGGCGGAGAAGAAGGGAATTTTGGAGAAGATTAAAGAGAAGCTTCCGGGATACCA
CTCAAAGACCGTTGAGGAGGAGAAGAAAGATGATCACTGATGAAAACATGAATATTAATG
ATGATAAGAGACATGTTGTGTTGTTTGTGATGGATGATGGTCATCTTTT**GTTTGTGCT
GTTGAAGTTTGTTG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4F368JQ 711 0 0
TGCGGCGACTGGGGAGGTAACAGATCGTGGTATGTTCGACTTCTTGAAAAAGAAGAAGGA
GGAAACAAAACCAGAAGAGACGACCCACTCGGAGTTCGAGCAGAAGGTTCAGGTTTCTGA
GCCGGTCCCTGAGGTTAAACACGAAGAAGAGGAGAAGAAACCAAGTCTCCTTGAGAAGCT
TCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGAGAA
GAGAAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGATTGCTACTGAAGGAGAGGGGCAAACAGAGGA
GGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAAGAGAAGCTTCCAGGACATGGAAAGAAGCC
TGAAGACGACTCAGCTGCAGCGGCTGCACCGGCTGTTGCTCTTCCGGTGGAGGAAGCGCA
TCCGGCGGAGAAGAAGGGAATTTTGGAGAAGATTAAAGAGAAGCTTCCGGGATACCACTC
AAAGACCGTTGAGGAGGAGAAGAAAGATGATCACTGATGAAAACATGAATATTAATGATG
ATAAGAGACATGTTGTGTTGTTTGTGATGGATGATGGTCATCTTTTTGTTTTGTGCTGTT
GAAGTTTGTTGGCTTCGTTGTGTCTTATTTTTCAGTTTCTATGTTCTTCTTTTTGTTGTG
TTTTAGGGTATTGTTTCGTGGTATTTTAAAGGTATGAAAAATTTAATTCCT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL4315Contig1 778 2 14 U
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CAAACTCTTAACTCTAAGTTACACAGAATATAATATCATAATAGAAAAACCAAAAACAAA
AATAAATTTTAGAAAAAAAACGAAGCTATCTCCTCTCAACATTGTAGCTGCAAGCAACGC
CTTTGTCTTTTTGGATATAAACCTTTAAACAACCGCAATGACTGCTACTTGCATATGCGT
TTGCTCAAGCTGAGGTAGTTGTAGCCATGGAGGAGCCTTCCTTCTGGTCACCAAATACAC
GTTGACGGAAGTCTTTGACCATGAGAGGGAGCCCCTGACGAAAAGACACCTTTGGTTCCC
AACCAAGAAGCTCCTTGGCCTTTGTGATGTCAGGCTTTCTCTTGTGAGGGTCATCTTCTG
TGTTTGGTCTGAACTCTATGTTTGCATTTGGATCAATAGTCTCTTGCACCACCTTAGCGA
GCTCGAGCATGGTGAATTCACCAGGATTACCGAGGTTAAATGGCCCGACATGTTCTCCTC
CCATCAACCTCATCAAACCTTCGACCAGGTCAGAAACAAACTGGAAACTTCGTGTCTGCT
TCCCATCACCATAAACAGTCAAAGGTTCTTTCCTTAGTGCCTGCGCAACGAAGTTGCTGA
CAACACGTCCATCATCAATACACATTCTTGGACCATAGGTGTTGAAGATCCTAGCAATCC
TGACCTCAACGTTGGCTCCACGGTGATAGTCCATGGCAAGCGTCTCCGCCGTACGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4FX67JQ U 1
AF RR4CR68JQ U 56
BS 1 70 RR4FX67JQ
BS 71 71 RR4CR68JQ
BS 72 147 RR4FX67JQ
BS 148 148 RR4CR68JQ
BS 149 215 RR4FX67JQ
BS 216 216 RR4CR68JQ
BS 217 220 RR4FX67JQ
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BS 446 446 RR4CR68JQ
BS 447 505 RR4FX67JQ
BS 506 506 RR4CR68JQ
BS 507 773 RR4FX67JQ
BS 774 778 RR4CR68JQ

RD RR4FX67JQ 773 0 0
CGAAAGACAAAAGTGTTTTCTTAAACTGTAGTGAGGTCCATGAATAAGTAGTGATGGTAC
CAAACTCTTA*CTCTAAGTTACACAGAATATAATATCATAATAGAAAAACCAAAAACAAA
AATAAATTTTAGAAAAAAAACGAAGCTCTCTCCTCTCAACATTGTAGCTGCAAGCAACGC
CTTTGTCTTTTTGGATATAAACCTTTAAACAACCGGAATGGCTGCTACTTGCATATGCGT
TTGCTCAAGCTGAGGTAGTTGTAGCCATGGAGGAGCCTTCCTTCTGGTCACCAAATACAC
GTTGACGGAAGTCTTTGACCATGAGAGGGAGCCCCTGACGAAAAGACACCTTTGGTTCCC
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TGTTTGGTCTGAACTCTATGTTTGCGTTTGGATCAATAGTCTCTTGCACCACCTTAGCGA
GCTCGAGCATGGTGAATTCACCAGGGTTACCGAGGTTAAATGGCCCGACATGTTCTCCTC
CCATCAACCTCATCAAACCTTCGACCAGGTCAGAAACAAACTGGAAACTTCGTGTCTGCT
TCCCATCACCATAAACAGTCAAAGGTTCTTTCCTTAGTGCCTGCGCAACGAAGTTGCTGA
CAACACGTCCATCATCAATACACATTCTTGGACCATAGGTGTTGAAGATCCTAGCAATCC
TGACCTCAACGTTGGCTCCACGGTGATAGTCCATGGCAAGCGTCTCCGCCGTA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4CR68JQ 723 0 0
GGTACCAAACTCTTAACTCTAAGTTACACAGAATATAATATCATAATAGAAAAACCAAAA
ACAAAA*TAAATTTTAGAAAA****CGAAGCTATCTCCTCTCAACATTGTAGCTGCAAGC
AACGCCTTTGTCTTTTTGGATATAAACCTTTAAACAACCGCAATGACTGCTACTTGCATC
TGCGTTTGCTCAAGCTGAGGTTGTTGTAGCCATGGAGGAGCCTTCCTTCTGGTCACCAAA
TACACGTTGACGGAAGTCTTTGACCATGAGAGGGAGTCCCTGACGAAGAGACACCTTTGG
TTCCCAACCAAGAAGCTCCTTGGCCTTTGTGATGTCAGGCTTTCTCTTGTGAGGGTCATC
TTCTGTGTTTGGTCTGAACTCTATGTTTGCATTTGGATCAATAGTCTCTTGCACCACCTT
AGCGAGCTCGAGCATGGTGAATTCACCAGGATTACCGAGGTTAAATGGCCCGACATGTTC
TCCTTCCATCAACCTCATCAGACCTTCGACCAGGTCAGAAACAAACTGGAAACTTCGTGT
CTGCTTCCCATCACCATAAACAGTCAAAGGTTCTTTCCTTAGTGCCTGCGCAACGAAGTT
GCTGACAACACGTCCATCATCAATACACATTCTTGGACCATAGGTGTTGAAGATCCTAGC
AATCCTGACCTCAACGTTGGCTCCACGGTGATAGTCCATGGCAAGCGTCTCTGCCGTACG
CTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 3

CO CL4316Contig1 776 3 2 U
GACCAAAAATTGAGATTGTTTTTAGGACGACACCAAATAAAGAAGAAAAGAATAATGTAT
GAAGTTTTTCGGTAAAAGCGATTTAAAGTTCATTTTTAAAGTGATTAAGAATACAATGTG
TTGATGACGTGTGGCTTTCAAACCATACTTCATCCGCAATAACTGAGAAGTTGTCGTTGT
TTCTATGCCACGACCAATGTGCTCGTTTCTTGTCTATAACTCTCAATCTCCCATGTCCAA
AACTCGATTCACGGAATGCCGACAAAGGTGAACGAGGGTTATGAAATTTATAAGCCAGCC
CTTCTCGATTTCCACCGTCACCGATGGTTATGTACATTGGTCCACATGGGTCGGCCTTGT
GGTTGTATACCGGCCTGAAACGTTCGTAGGTATGAATGTGGCCGGCAAAAACAATGTCGA
CTTCAGCCCGATAAAGCAAACCCTCCATGGCCTTTCTCATTTTCTCCCCTTCACCTTCAT
GCGCCTCGTTTGTGCTATACCATGGAGTGTGCATCACCACCACCAACCACGGCGTTCTTT
TACGGTCAATCTCCCTCACGCAAAAATAATAATCTAATTTTAAGAACTTTCTTAAATCTT
CACGGAGCCACCGGTACTGATCAGAGTGGGAGTCATAGTGGGTGTAAGAACCAATCATAA
CAATGTGGACACCGGCTGCATCAAAAGAGTAGTAAAGATTGGAGTGAGAGAGGCTTTCAG
CGTGCGGCATAAGCCATCGGGCATTGTATGCTTTAAAGCTTATGTGTTCTTCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC48JQ U 72
AF RR4A596JQ U 1
AF RR4A596TF C 24
BS 1 688 RR4A596JQ
BS 689 776 RR4A596TF

RD RR4GC48JQ 474 0 0
GTAAAAGCGATTTAAAGTTCATTTTTAAAGTGATTAAAAATACAATGTGTTGATGACGTG
TGGCTTTCAAACCATACTTCATCCGCAATAACTGAAAAGTTGTCGTTGTTTCTATGCCAC
GACCAATGTGCTCGTTTCTTGTCTATAACTCTCAATCTCCCATGTCCAAAACTCGATTCA
CGGAATGCCGACAAAGGTGAACGAGGGTTATGAAATTTATAAGCCAGCCCTTCTCGATTT
CCACCGTCACCGATGGTTATGTACATTGGTCCACATGGGTCGGCCTTGTGGTTGTATACC
GGCCTGAAACGTTCGTAGGTATGAATGTGGCCGGCAAAAACAATGTCGACTTCAGCCCGA
TAAAGCAAACCCTCCATGGCCTTTCTCATTTTCTCCCCTTCACCTTCATGCGCCTCGTTT
GTGCTATACCATGGAGTGTGCATCACCACCACCAACCACGGCGTTCTTTTACGG

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4A596JQ 688 0 0
GACCAAAAATTGAGATTGTTTTTAGGACGACACCAAATAAAGAAGAAAAGAATAATGTAT
GAAGTTTTTCGGTAAAAGCGATTTAAAGTTCATTTTTAAAGTGATTAAGAATACAATGTG
TTGATGACGTGTGGCTTTCAAACCATACTTCATCCGCAATAACTGAGAAGTTGTCGTTGT
TTCTATGCCACGACCAATGTGCTCGTTTCTTGTCTATAACTCTCAATCTCCCATGTCCAA
AACTCGATTCACGGAATGCCGACAAAGGTGAACGAGGGTTATGAAATTTATAAGCCAGCC
CTTCTCGATTTCCACCGTCACCGATGGTTATGTACATTGGTCCACATGGGTCGGCCTTGT
GGTTGTATACCGGCCTGAAACGTTCGTAGGTATGAATGTGGCCGGCAAAAACAATGTCGA
CTTCAGCCCGATAAAGCAAACCCTCCATGGCCTTTCTCATTTTCTCCCCTTCACCTTCAT
GCGCCTCGTTTGTGCTATACCATGGAGTGTGCATCACCACCACCAACCACGGCGTTCTTT
TACGGTCAATCTCCCTCACGCAAAAATAATAATCTAATTTTAAGAACTTTCTTAAATCTT
CACGGAGCCACCGGTACTGATCAGAGTGGGAGTCATAGTGGGTGTAAGAACCAATCATAA
CAATGTGGACACCGGCTGCATCAAAAGA

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DS 

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TAGAGTTCATTTTTAAAGTGATTAAGAATACAATGTGTTGATGACGTGTGGCTTTCAAAC
CATACTTCATCCGCAATAACTGAGAAGTTGTCGTTGTTTCTATGCCACGACCAATGTGCT
CGTTTCTTGTCTATAACTCTCAATCTCCCATGTCCAAAACTCGATTCACGGAATGCCGAC
AAAGGTGAACGAGGGTTATGAAATTTATAAGCCAGCCCTTCTCGATTTCCACCGTCACCG
ATGGTTATGTACATTGGTCCACATGGGTCGGCCTTGTGGTTGTATACCGGCCTGAAACGT
TCGTAGGTATGAATGTGGCCGGCAAAAACAATGTCGACTTCAGCCCGATAAAGCAAACCC
TCCATGGCCTTTCTCATTTTCTCCCCTTCACCTTCATGCGCCTCGTTTGTGCTATACCAT
GGAGTGTGCATCACCACCACCAACCACGGCGTTCTTTTACGGTCAATCTCCCTCACGCAA
AAATAATAATCTAATTTTAAGAACTTTCTTAAATCTTCACGGAGCCACCGGTACTGATCA
GAGTGGGAGTCATAGTGGGTGTAAGAACCAATCATAACAATGTGGACACCGGCTGCATCA
AAAGAGTAGTAAAGATTGGAGTGAGAGAGGCTTTCAGCGTGCGGCATAAGCCATCGGGCA
TTGTATGCTTTAAAGCTTATGTGTTCTTCAATC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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TACACAAGTAGACCACCATATCTGTACACATTTCTCAGTAGCATCTCCTATCATTTGGAT
TCTGCAACTTTAAACAACTCTCGCCATTTCTGTGGATCACTTCCTGGACCATCTCCCTTG
ACTGAATTGATCTCATAAGCTTTCACTTGTGTGAACTCAATATCAAGTGCCTGTATGCAA
GCTTCAGCCACCACAAGTCTGCTTACCTCTCCAACAAGCTTGTCTCCTTGACCAATAACA
ACAGCACGCCGTTCACCGGCTGTAGCTTTGAGCAAAGTATTGAGATCATAGGATGTGTAT
GGTCCATCAGTCAATCTACCCGGTCTGATAATGGTGAATGGAAGACCAGATTCCCTAAGA
AAATCTTCCCCCATCTTCTTGTACTTAAGAACCCCAAATAAGTTCATGATGCTCCAAGGA
AGCTCATCAGGCTTGGTGACACCTACTGATGAAACCAGAACAACTCTCTCCACCGATGAG
GGCAGTGCTGAAATGAGATTCCTCACACCTTCCCAATCTACTTTATCAGGTGTGTTCTCT
CCACTCCACCTCTGTGAAGGAAAAGCTGTAGTTCCCGTGCAGCAAATCACATGTGTCACA
CCCTCAAACATGGATGGATCAAGATCCTCTGCATTCCTAGTATCCCCTTTGACTACCTGT
AATGAATCTTCATCTTGTTTACCGAACAACTTGGTAGCTTTCTCAAGATCACGTAGCAAT
AGCCTTGACTTAATGTTCCTCTTGAGCAATGAAGCTACCACTAGTTGCCCGACACCACCA
GGGCCACCAACGACAAGGACAAGCTTTGATGAAGAGGATAGAGTAGAAGAATCGACGGCT
TCTTCTGCAAGAGCTTGAATTGGAGAGGATGATGGAGATAAAGATGATTCATTTCTAACT
AGGAAGGAAGAAGTAAGGCCAGAAGAAGAAGATGATGAGAGTGGCAGAGACGTAAAAAGA
GGGATTCTTAGAGAGGGTTTTGGGTATGTTGTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET42JQ U 1
AF RR4CK10TF C 321
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BS 480 480 RR4CK10TF
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BS 779 1055 RR4CK10TF

RD RR4ET42JQ 778 0 0
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GGTCCATCAGTCAATCTACCCGGTCTGATAATGGTGAATGGAAGACCAGATTCCCTAAGA
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QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4CK10TF 735 0 0
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AAAAGCTGTAGTTCCCGTGCAGCAAATCACGTGTGTCACACCCTCAAACATGGATGGATC
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ACCGAACAACTTGGTAGCTTTCTCAAGATCACGTAGCAATAGCCTTGACTTAATGTTCCT
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AGAAGAAGAAGATGATGAGAGTGGCAGAGACGTAAAAAGAGGGATTCTTAGAGAGGGTTT
TGGGTATGTTGTAGA

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 3

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AAAACCACTTCACAAGGGGAGGGTTTCGATAACAATAGCGATAGGATATGATATTGGCAG
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ACAAAGAGAAAAAGTCTTGGAAGTTTAGATGGGAATGTCTTGATGGGTGTAAGCAATCCC
ATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCATTTCCTCTCATTATCCATCTTGTTGTAAGTAATCC
TTCAACTCCGACTGGACCACGGGCATGGATCCTGCCCGTGCTTATTCCCACCTCAGCACC
AAGTCCAAATCTAAAACCATCAGAAAATCTTGTGCTTGCGTTGTGAAACACAGCAGCACT
GTCCACTTGGCGAAGGAATAGCTCTGCAACTTCAGGATCCTCTGTCACAATGCAGTCTGT
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AAGCTCATTGAGCACAGCATTCTGCTCTAGATCCTTATGCACAAGAAGCGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C594JQ U 111
AF RR4DJ80JQ U 1
AF RR4C594TF C 106
BS 1 241 RR4DJ80JQ
BS 242 242 RR4C594JQ
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BS 649 649 RR4C594TF
BS 650 833 RR4DJ80JQ

RD RR4C594JQ 325 0 0
AAAA
ACATTCATCGTCTTACTTATGAGCAAACGGAAACTTATTTTTGGTGCAAACTCTAAACCC
TAAATCAAAACCACTTCACAAGGGGAGGGTTTCGATAACAATAGCGATAGGATATGATAT
TGGCAGAGAGGAAACAAAAAGCTCATCCTCTCCTCTCCTCACTTCCAAGTCTCAACACAA
ACAGACACAAAGAGAAAAAGTCTTGGAAGTTTAGATGGGAATGTCTTGATGGGTGTAAGC
AATCCCATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCATTTCCTCTCATTATCCATCTTGTTGTAAG
TAATCCTTCAACTCCGACTGG

QA 5 325 5 325
DS 

RD RR4DJ80JQ 833 0 0
GCAGATTCAAACTCAAAAGATAAATTGATAAATCAGAAAGGTGTAGGGTAGGTAGCCTTA
CAACGAGTTTTTTTTTTCTTTTTGTTGGACAAAGAAGAACCAAGCTAATAAAAGACATTC
ATCGTCTTACTTATGAGCAAACGGAAACTTATTTTTGGTGCAAACTCTAAACCCTAAATC
AAAACCACTTCACAAGGGGAGGGTTTCGATAACAATAGCGATAGGATATGATATTGGCAG
AAAGGAAACAAAAAGCTCATCCTCTCCTCTCCTCACTTCCAAGTCTCAACACAAACAGAC
ACAAAGAGAAAAAGTCTTGGAAGTTTAAATGGGAATGTCTTGATGGGTGTAAGCAATCCC
ATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCATTTCCTCTCATTATCCATCTTGTTGTAAGTAATCC
TTCAACTCCGACTGGACCACGGGCATGGATCCTGCCCGTGCTTATTCCCACCTCAGCACC
AAGTCCAAATCTAAAACCATCAGAAAATCTTGTGCTTGCGTTGTGGAACACAGCAGCACT
GTCCACTTGGCGAAGGAATAGCTCTGCAACTTCAGGATCCTCTGTCACAATGCAGTCTGT
GTGTGCACTCCCATGTCGGTGAATGTGATCAATAGCAGCATAAACGTCTTCAACAACTTC
AACGGTGCAAGCCTTGGAACAGTACTCATGATTGAACGACCGTGCTTCTGGTATGTTCAG
TATTGTACTTGCCTTTGGTCCACCATACAAAGTGACTCCATTGTTCTGTAGAACAAATAT
AAGCTCATTGAGCACAGCATTCTGCTCTAGATCCTTATGCACAAGAAGCGTTT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4C594TF 680 0 0
TTTTAGAAA
ACATTCATCGTCTTACTTATGAGCAAACGGAAACTTATTTT*GGTGCAAACTCTAAACCC
TAAATCAAAACCACTTCACAAGGGGAGGGTTTCGATAACAATAGCGATAGGATATGATAT
TGGCAGAGAGGAAACAAAAAGCTCATCCTCTCCTCTCCTCACTTCCAAGTCTCAACACAA
ACAGACACAAAGAGAAAAAGTCTTGGAAGTTTAGATGGGAATGTCTTGATGGGTGTAAGC
AATCCCATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCATTTCCTCTCATTATCCATCTTGTTGTAAG
TAATCCTTCAACTCCGACTGGACCACGGGCATGGATCCTGCCTGTGCTTATTCCCACCTC
AGCACCAAGTCCAAATCTAAAACCATCAGAGAATCTTGTGCTTGCGTTGTGAAACACAGC
AGCACTGTCCACTTGGCGAAGGAATAGCTCTGCAACTTCAGGATCCTCTGTCACAATGCA
GTCTGTGTGTGCACTCCCATGTCGGTGAATGTGATCAATAGCAGCATAAACGTCGTCAAC
AACTTCAACGGTGCAAGCCTTGGAACAGTACTCATGATTGAACGACCGTGCTTCTGGTAT
GTTCAGTATTGTACTTGCCTTTGGTCCACCATACAAAGTGACTCCATTGTTCTGTAGAAC
AAATATAAGCT

QA 10 680 10 680
DS 



AS 1 3

CO CL4319Contig1 730 3 7 U
GGGGAGGATTGTGAATATCAATTCTCACGGCGGAATTCAAAAGAAGAAACGATTGCTTTC
TCTCTGGCGAGAGGCGATCTGAGATCCTCCGAAAACCTAAATCGCTTGTTCATCAGTCTC
CCAGGATCGTTCAAGGAGATAACGATGTCTGAAGATGAGAAGCCTAAGTTGAAATGCCGG
ATGTACGAGGCTCGTCTTCCTGTTGAAGGTTCCATCGTGATGGGGAAGGTTACTGATATC
GTTGGAAACGAAGCTGCTGTCTACCTGGTGGAGTACAGAAAGAAGTCTAAACTCATCTTG
TCTGCAGTGGTACCTCCCATCCGAGTTCTTACACCTAAGCGTCTGGAGGCTTTTAGGGTT
CTGCAAGTGAACATCGAAGCTGGTGAAATCTTACTAGATGAGAATCCACTTCCTTTAAGT
GACATCTGGGCGTTTGAAACAAGATACAATGAAGCCAAATTCGTGCAGTCAGTCATGTAC
AGCGTTGCAGATGATTTGAACATGGATTTAAAGGAGGCCTACAAGCTTGCAGGATGGCCT
GACCTGAAGAGGCTGAAGAATTTGTACAAGGACGAGGATTTCACTGCTTGTGAGAATACA
GCCTTCAGGACGCTACTGATTGACAGGGCTGCTTTAATGAGGCACACCTCCTGGCGCATT
AAAGATCCTAGTCGCCTTCAGACATGCTCTCTCAACCAATTGTATGACATTTGTTATGCA
ATTGCTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4DF57TF U 63
AF RR4AA11TF U 1
AF RR4GO06TF U 43
BS 1 168 RR4AA11TF
BS 169 169 RR4GO06TF
BS 170 262 RR4AA11TF
BS 263 266 RR4GO06TF
BS 267 566 RR4AA11TF
BS 567 567 RR4GO06TF
BS 568 730 RR4AA11TF

RD RR4DF57TF 543 0 0
GGG
GGCGAGAGGCGATCTGAGATCCTCCGAAAACCTAAATCGCTTGTTCATCAGTCTCCCAGG
ATCGTTCAAGGAGATAACGATGTCTGAAGATGAGAAGCCTAAGTTGAAATGCCGGATGTA
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AAACGAAGCTGCTGTCTACCTGGTGGAGTACAGAAAGAAGTCTAAACTCATCTTGTCTGC
AGTGGTACCTCCCATCCGAGTTCTTACACCTAAGCGTCTGGAGGCTTTTAGGGTTCTGCA
AGTGAACATCGAAGCTGGTGAAATCTTACTAGATTAGAATCCACTTCCTTTAAGTGACAT
CTGGGCGTTTGAAACAAGATACAATGAAGCCAAATTCGTGCAGTCAGTCATGTACAGCGT
TGCAGATGATTTGAACATGGATTTAAAGGAGGCCTACAAGCTTGCAGGATGGCCTGACCT
GAAGAGGCTGAAGAATTTATACAAGGACGAGGATTTCACTGCTTGTGAGAATACAGCCTT

QA 4 543 4 543
DS 

RD RR4AA11TF 730 0 0
GGGGAGGATTGTGAATATCAATTCTCACGGCGGAATTCAAAAGAAGAAACGATTGCTTTC
TCTCTGGCGAGAGGCGATCTGAGATCCTCCGAAAACCTAAATCGCTTGTTCATCAGTCTC
CCAGGATCGTTCAAGGAGATAACGATGTCTGAAGATGAGAAGCCTAAGCTGAAATGCCGG
ATGTACGAGGCTCGTCTTCCTGTTGAAGGTTCCATCGTGATGGGGAAGGTTACTGATATC
GTTGGAAACGAAGCTGCTGTCT****GGTGGAGTACAGAAAGAAGTCTAAACTCATCTTG
TCTGCAGTGGTACCTCCCATCCGAGTTCTTACACCTAAGCGTCTGGAGGCTTTTAGGGTT
CTGCAAGTGAACATCGAAGCTGGTGAAATCTTACTAGATGAGAATCCACTTCCTTTAAGT
GACATCTGGGCGTTTGAAACAAGATACAATGAAGCCAAATTCGTGCAGTCAGTCATGTAC
AGCGTTGCAGATGATTTGAACATGGATTTAAAGGAGGCCTACAAGCTTGCAGGATGGCCT
GACCTGAAGAGGCTGAAGAATTTGTATAAGGACGAGGATTTCACTGCTTGTGAGAATACA
GCCTTCAGGACGCTACTGATTGACAGGGCTGCTTTAATGAGGCACACCTCCTGGCGCATT
AAAGATCCTAGTCGCCTTCAGACATGCTCTCTCAACCAATTGTATGACATTTGTTATGCA
ATTGCTTTGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4GO06TF 688 0 0
GG
AGAAACGATTGCTTTCTCTCTGGCGAGAGGCGATCTGAGATCCTCCGAAAACCTAAATCG
CTTGTTCATCAGTCTCCCAGGATCGTTCAAGGAGATAACGATGTCTGAAGATGAGAAGCC
TAAGTTGAAATGCCGGATGTACGAGGCTCGTCTTCCTGTTGGAGGTTCCATCGTGATGGG
GAAGGTTACTGATATCGTTGGAAACGAAGCTGCTGTCTACCTGGTGGAGTACAGAAAGAA
GTCTAAACTCATCTTGTCTGCAGTGGTACCTCCCATCCGAGTTCTTACACCTAAGCGTCT
GGAGGCTTTTAGGGTTCTGCAAGTGAACATCGAAGCTGGTGAAATCTTACTAGATGAGAA
TCCACTTCCTTTAAGTGACATCTGGGCGTTTGAAACAAGATACAATGAAGCCAAATTCGT
GCAGTCAGTCATGTACAGCGTTGCAGATGATTTGAACATGGATTTAAAGGAGGCCTACAA
GCTTGCAGGATGGCCTGACCTGAAGAGGCTGAAGAATTTGTACAAGGACGAGGATTTCAC
TGCTTGTGAGAATACAGCCTTCAGGACTCTACTGATTGACAGGGCTGCTTTAATGAGGCA
CACCTCCTGGCGCATTAAAGATCCTAGTCGCCTTCAGACATGCTCTCTCAACCAATTGTA
TGACATTTGTTATGCAATTGCTTTGA

QA 3 688 3 688
DS 



AS 1 3

CO CL4320Contig1 874 3 27 U
CGTGATAAATATCTATATTTACATATACGTAGCTCACAAAACGTGCAAAACTTTTAACAC
TGCTTAAAAAGCTAACAATCACCAAAAATCATCAACAACAAAATTTAAGATGAGAACACA
GTGATATCTATAATTATACATTATATATTCATAAAGATCTTTCTTAGCCACTAGTGAGCA
GCAGCAATTGAAGATCTCTTCACGAACCTTCCTTTCATTCGAGGCCTTTTCTCAGCATTC
AATTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCCTGGAGAACAACCTTGTCCTCCTTTTCTCTCGG
TATCTTGAAACCCTAGCTTCTCTTCCTCCATCCCCAGCCTCTCTCATGTGTAATCCTAGG
CCGCGGAAGTGGTTATGATGATGAGCCTCTCCTCCACTTTCACCCATGGTATTGGTTGGG
CAACAAAGCATGTCCAGGTCTATTTCAGGTGGCTCGAGGGCGGTCCATGGAGTTCCTTGG
CTACCCCAAGTGGAAATCACGGTTTCGTAGTCCAATCTAAGCATAAGAACCTTCTCCTTC
TTCTCTTCTTTAATCCTTCCACTCATCTCATTCACTCCCACGTCCACTAGATTCTTCATC
ACGTCTTCTTTCTCGTCATCTTCTTCGAGTGCCGTCTTGTGTGAGGACTCGTAATCGAAG
CTTATTTCAAATGGAGAAGTCTCATTAGCGGCATCTAGATCACACACTTCTCTTGTTGCG
ATTTCTTCCTCTTCCTTCACCTCTTCTTTTTCAATCTTTAGGATCTCACTTAACCCTAGC
TCTTCCATGGCATGGAATTCTCGATCTGTACCTCCACCGAGGAGAGTCTCCACATCAGCT
GAGAACTGGGCCAGTTCCATTTCGGTCGGGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI57JQ U 1
AF RR4BK16JQ U 44
AF RR4BK16TF C 215
BS 1 168 RR4DI57JQ
BS 169 169 RR4BK16JQ
BS 170 267 RR4DI57JQ
BS 268 268 RR4BK16JQ
BS 269 277 RR4DI57JQ
BS 278 278 RR4BK16JQ
BS 279 374 RR4DI57JQ
BS 375 375 RR4BK16JQ
BS 376 584 RR4DI57JQ
BS 585 585 RR4BK16JQ
BS 586 596 RR4DI57JQ
BS 597 597 RR4BK16JQ
BS 598 620 RR4DI57JQ
BS 621 621 RR4BK16JQ
BS 622 628 RR4DI57JQ
BS 629 629 RR4BK16JQ
BS 630 632 RR4DI57JQ
BS 633 634 RR4BK16JQ
BS 635 650 RR4DI57JQ
BS 651 651 RR4BK16JQ
BS 652 655 RR4DI57JQ
BS 656 656 RR4BK16JQ
BS 657 660 RR4DI57JQ
BS 661 661 RR4BK16JQ
BS 662 791 RR4DI57JQ
BS 792 849 RR4BK16JQ
BS 850 874 RR4BK16TF

RD RR4DI57JQ 791 0 0
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TGCTTAAAAAGCTAACAATCACCAAAAATCATCAACAACAAAATTTAAGATGAGAACACA
GTGATATCTATAATTATACATTATATATTCATAAAGATCTTTCTTAGCTACTAGTGAGCA
GCAGCAATTGAAGATCTCTTCACGAACCTTCCTTTCATTCGAGGCCTTTTCTCAGCATTC
AATTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCTTGGAGAACAGCCTTGTCCTCCTTTTCTCTCGG
TATCTTGAAACCCTAGCTTCTCTTCCTCCATCCCCAGCCTCTCTCATGTGTAATCCTAGG
CCGCGGAAGTGGTTGTGATGATGAGCCTCTCCTCCACTTTCACCCATGGTATTGGTTGGG
CAACAAAGCATGTCCAGGTCTATTTCAGGTGGCTCGAGGGCGGTCCATGGAGTTCCTTGG
CTACCCCAAGTGGAAATCACGGTTTCGTAGTCCAATCTAAGCATAAGAACCTTCTCCTTC
TTCTCTTCTTTAATCCTTCCACTCATCTCATTCACTCCCACGTCTACTAGATTCTTTATC
ACGTCTTCTTTCTCGTCATCGTCTTCGAATGCACTCTTGTGTGAGGACTCATAATTGAAG
TTTATTTCAAATGGAGAAGTCTCATTAGCGGCATCTAGATCACACACTTCTCTTGTTGCG
ATTTCTTCCTCTTCCTTCACCTCTTCTTTTTCAATCTTTAGGATCTCACTTAACCCTAGC
TCTTCCATGGC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4BK16JQ 806 0 0
CAAAACTT
TTTTAACATTGCTTAAAAAGCTAACAATCACCAAAAGTCATCAACAACAAAATTTAAGAT
GAGAACACAGTGATATCTATAATTATACATTATATATTCATAAAGATCTTTCTTAGCCAC
TAGTGAGCAGCAGCAATTGAAGATCTCTTCACGAACCTTCCTTTCATTCGAGGCCTTTTC
TCAGCATTCAATTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCCTGGAGAACAACCTTGTCCTCCTT
TTCTCTCGGTATCTTGAAACCCTAGCTTCTCTTCCTCCATCCCCAGCCTCTCTCATGTGT
AATCCTAGGCCGCGGAAGTGGTTATGATGATGAGCCTCTCCTCCACTTTCACCCATGGTA
TTGGTTGGGCAACAAAGCATGTCCAGGTCTATTTCAGGTGGCTCGAGGGCGGTCCATGGA
GTTCCTTGGCTACCCCAAGTGGAAATCACGGTTTCGTAGTCCAATCTAAGCATAAGAACC
TTCTCCTTCTTCTCTTCTTTAATCCTTCCACTCATCTCATTCACTCCCACGTCCACTAGA
TTCTTCATCACGTCTTCTTTCTCGTCATCTTCTTCGAGTGCCGTCTTGTGTGAGGACTCG
TAATCGAAGCTTATTTCAAATGGAGAAGTCTCATTAGCGGCATCTAGATCACACACTTCT
CTTGTTGCGATTTCTTCCTCTTCCTTCACCTCTTCTTTTTCAATCTTTAGGATCTCACTT
AACCCTAGCTCTTCCATGGCATGGAATTCTCGATCTGTACCTCCACCGAGGAGAGTCTCC
ACATCAGCTGAGAACTGG

QA 9 806 9 806
DS 

RD RR4BK16TF 660 0 0
TCATTCGAGGCCTTTTCTCAGCATTCAATTTACGTACCTCGTACCTTATCTTCCTGGAGA
ACAACCTTGTCCTCCTTTTCTCTCGGTATCTTGAAACCCTAGCTTCTCTTCCTCCATCCC
CAGCCTCTCTCATGTGTAATCCTAGGCCGCGGAAGTGGTTATGATGATGAGCCTCTCCTC
CACTTTCACCCATGGTATTGGTTGGGCAACAAAGCATGTCCAGGTCTATTTCAGGTGGCT
CGAGGGCGGTCCATGGAGTTCCTTGGCTACCCCAAGTGGAAATCACGGTTTCGTAGTCCA
ATCTAAGCATAAGAACCTTCTCCTTCTTCTCTTCTTTAATCCTTCCACTCATCTCATTCA
CTCCCACGTCCACTAGATTCTTCATCACGTCTTCTTTCTCGTCATCTTCTTCGAGTGCCG
TCTTGTGTGAGGACTCGTAATCGAAGCTTATTTCAAATGGAGAAGTCTCATTAGCGGCAT
CTAGATCACACACTTCTCTTGTTGCGATTTCTTCCTCTTCCTTCACCTCTTCTTTTTCAA
TCTTTAGGATCTCACTTAACCCTAGCTCTTCCATGGCATGGAATTCTCGATCTGTACCTC
CACCGAGGAGAGTCTCCACATCAGCTGAGAACTGGGCCAGTTCCATTTCGGTCGGGAATC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4321Contig1 843 2 4 U
GGAATACTACTTGCCATACAAATTAATCGCCTTGAAACATGTCTACTGAGTTGTGTCCGG
AGCGGCCATTGTTTGGCGGCGCAATCTCCAGCGCCTTCCCTCAAAGATTCCAGGATGCTA
GTAATATCCGACAAGTTCCAGATCATCAGGAAGTGTTTGTTGATCCTTCAAGGGATGAGA
GTTTGATTTTTGAGCTTTTGGATTTCAAGTCTGACGTTGGGGACATTGGCAGTGCTTCTT
GGTTCCTTCATGATCTTGCTCGTGAGCAAGATGCCGAAGGTTTCAAGTTGATTGAGCAGT
CACATGTCATTGATGTGCCTGGATTGTCTTATAGAAACATCCCTTCCGTTGCCACAACTT
CTATTGGAGAGATGGCTATATCCAAAGGAAGACAAGGAAGAGAAGCACAAAACCTATTGA
GGGTTTATGTGGCTAATATTCGTCTTAAGGGAGTTGAAACAGATGTCTTAGTGACTGCTT
ATGAACCTATTCTCATCAACCCTCTGAGTGAAAGTGCGAACGCGGTAGGATCTGGTTTAG
CTGTACCGGCTTCACAGTCTGGGATAATGCCAATATGTGATGTCATTAAACAGTCACTCT
CTACTTTCAAAGTCAATGACTGGGGTCTTTTTGGTTCCTCTGCTTGAATCTTGATATGCT
TCCTTCATCAGCAAAACAGAGAAAATGCAGAGCTGCCTTTTGGTGTTATTTGGTTCCGTT
TTTATTTTTTTTTTATTTTGGAGTTCAAGTTGTTTGAGTCTATCCAAACTGGTCGGCTTG
AGAGACATAGTTTAAACATTGTTCTTTAGCTTCTGAGTGATGAGTTTATTATCACACCCC
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4AB24TF U 1
AF RR4BA81TF U 20
BS 1 695 RR4AB24TF
BS 696 696 RR4BA81TF
BS 697 789 RR4AB24TF
BS 790 843 RR4BA81TF

RD RR4AB24TF 789 0 0
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AGCGGCCATTGTTTGGCGGCGCAATCTCCAGCGCCTTCCCTCAAAGATTCCAGGATGCTA
GTAATATCCGACAAGTTCCAGATCATCAGGAAGTGTTTGTTGATCCTTCAAGGGATGAGA
GTTTGATTTTTGAGCTTTTGGATTTCAAGTCTGACGTTGGGGACATTGGCAGTGCTTCTT
GGTTCCTTCATGATCTTGCTCGTGAGCAAGATGCCGAAGGTTTCAAGTTGATTGAGCAGT
CACATGTCATTGATGTGCCTGGATTGTCTTATAGAAACATCCCTTCCGTTGCCACAACTT
CTATTGGAGAGATGGCTATATCCAAAGGAAGACAAGGAAGAGAAGCACAAAACCTATTGA
GGGTTTATGTGGCTAATATTCGTCTTAAGGGAGTTGAAACAGATGTCTTAGTGACTGCTT
ATGAACCTATTCTCATCAACCCTCTGAGTGAAAGTGCGAACGCGGTAGGATCTGGTTTAG
CTGTACCGGCTTCACAGTCTGGGATAATGCCAATATGTGATGTCATTAAACAGTCACTCT
CTACTTTCAAAGTCAATGACTGGGGTCTTTTTGGTTCCTCTGCTTGAATCTTGATATGCT
TCCTTCATCAGCAAAACAGAGAAAATGCAGAGCTGTCTTTTGGTGTTATTTGGTTCCGTT
TTTATTTTTTTTTTATTTTGGAGTTCAAGTTGTTTGAGTCTATCCAAACTGGTCGGCTTG
AGAGACATA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4BA81TF 824 0 0
GGGAATGTA
GCCTTGAAACATGTCTACTGAGTTGTGTCCGGAGCGGCCATTGTTTGGCGGCGCAATCTC
CAGCGCCTTCCCTCAAAGATTCCAGGATGCTAGTAATATCCGACAAGTTCCAGATCATCA
GGAAGTGTTTGTTGATCCTTCAAGGGATGAGAGTTTGATTTTTGAGCTTTTGGATTTCAA
GTCTGACGTTGGGGACATTGGCAGTGCTTCTTGGTTCCTTCATGATCTTGCTCGTGAGCA
AGATGCCGAAGGTTTCAAGTTGATTGAGCAGTCACATGTCATTGATGTGCCTGGATTGTC
TTATAGAAACATCCCTTCTGTTGCCACAACTTCTATTGGAGAGATGGCTATATCCAAAGG
AAGACAAGGAAGAGAAGCACAAAACCTATTGAGGGTTTATGTGGCTAATATTCGTCTTAA
GGGAGTTGAAACAGATGTCTTAGTGACTGCTTATGAACCTATTCTCATCAACCCTCTGAG
TGAAAGTGCGAACGCGGTAGGATCTGGTTTAGCTGTACCGGCTTCACAGTCTGGGATAAT
GCCAATGTGTGATGTCATTAAACAGTCACTCTCTACTT*CAAAGTCAATGACTGGGGTCT
TTTTGGTTCCTCTGCTTGAATCTTGATATGCTTCCTTCATCAGCAAAACAGAGAAAATGC
AGAGCTGCCTTTTGGTGTTATTTGGTTCCGTTTTTATTTTTTTT**ATTTTGGAGTTCAA
GTTGTTTGAGTCTATCCAAACTGGTCGGCTTGAGAGACATAGTTTAAACATTGTTCTTTA
GCTTCTGAGTGATGAGTTTATTATCACACCCCTTG

QA 10 824 10 824
DS 



AS 1 3

CO CL4322Contig1 815 3 10 U
ACAAACAAAAGCTTTGTTCTGTAACCAAAACATACAAAGTGACTACAATGTTTTAATTAA
AGACTCAATTTATGGCATAGAAGCAAATTTTCCCTTAAACTAAACATTGAATTATTGCTG
CATAGTCTACAAACAAAAAGCTTTGTTCTGTAACCAAAACATACAACTAAAAGTGACTAC
AATGTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT***CCTCATTTCTTAACTTGGGCGTCAATTAC
CCAAAGAACAAGAGACACTAGTAGCCAACGTAAACGGCGACATTCACAATGTAGCAGTCC
TCGTTTTTATCACCCATTTCTTCAACTAGAACGCCACTTGAGCAGATCAGTCCTCCATCG
ACCACCTCCACGTTTACAATCTTCCCATAGGGGAAGATAGACTTGACCTTGTCGAGATCC
AGTTGGTGGTGAAGAGAACGAGGCACTCCAAGCTTGATCTGTAACTTCATTTCTCCAAAT
GAAACTCCAGGAATCGAACCTCTTCTAAAAGCAGGAATCGAATTGGAAGAAATTGCATTC
TTACAAGCCTTCATCGCCGCAGATGTCACGTCCTGCCCGTGCTGATCGTAACCCACACCC
ATCTCGACGAACAGTAGCTTCATCGTGTTGTTGGGAACACCACCGGAAATTGTCTCTGCC
GTCGTCTCCATGGCGGTGACTTTGATCAGACGTGATGATATCTCGCGGTGACTACTAGAA
GAGAGAGAAAGCGATCGCGATGAAGAGATTGTCAAAGACGAGGGAGATTGACGGAGACGA
AGATCGGGGCAGATAAGAATTGAGCCGGCAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C455JQ U 1
AF RR4GA66JQ U 92
AF RR4GA66TF C 98
BS 1 208 RR4C455JQ
BS 209 211 RR4GA66JQ
BS 212 244 RR4C455JQ
BS 245 245 RR4GA66JQ
BS 246 326 RR4C455JQ
BS 327 327 RR4GA66JQ
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BS 582 582 RR4GA66JQ
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RD RR4C455JQ 673 0 0
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AATGTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCATTTCTTAACTTGGGCGTCAATTAC
CCAA*GAACAAGAGACACTAGTAGCCAACGTAAACGGCGACATTCACAATGTAGCAGTCC
TCGTTTTTATCACCCATTTCTTCAACCAGAACGCCACTTGAGCAGATCAGTCCTCCATCG
ACCACCTCCACGTTTACAATCTTCCCATAGGGGAAGATAGACTTGACCTTGTCGAGATCC
AGTTGGTGGTGAAGAGAACGAGGCACTCCAAGCTTGATCTGTAACTTCATTTCTCCAAAT
GAAACTCCAGGAATCGAACCTCTTCTAAAAGCAGGAATCGAATTGGAAGAAATTGCATTC
TTACAAGCCTTCATCGCCGCAGATGTCACGTCCTGCCCGTGTTGATCGTAACCCACACCC
ATCTCGACGAACAGTAGCTTCATCGTGTTGTTGGGAACACCACCGGAAATTGTCTCTGCC
GTCGTCTC
ATGGC

QA 1 668 1 668
DS 

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CCCTTA
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CGACATTCACAATGTAGCAGTCCTCGTTTTTATCACCCATTTCTTCAACTAGAACGCCAC
TTGAGCAGATCAGTCCTCCATCGACCACCTCCACGTTTACAATCTTCCCATAGGGGAAGA
TAGACTTGACCTTGTCGAGATCCAGTTGGTGGTGAAGAGAACGAGGCACTCCAAGCTTGA
TCTGTAACTTCATTTCTCCAAATGAAACTCCAGGAATCGAACCTCTTCTAAAAGCAGGAA
TCGAATTGGAAGAAATTGCATTCTTACAAGCCTTCATCGCCGCAGATGTCACGTCCTGCC
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QA 7 724 7 724
DS 

RD RR4GA66TF 718 0 0
AACTAAACATTGAATTATTGCTGCATAGTCTACAAACAAAAAGCTTTGTTCTGTAACCAA
AACATACAACTAAAAGTGACTACAATGTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT***CCTCAT
TTCTTAACTTGGGCGTCAATTACCCAAAGAACAAGAGACACTAGTAGCCAACGTAAACGG
CGACATTCACAATGTAGCAGTCCTCGTTTTTATCACCCATTTCTTCAACTAGAACGCCAC
TTGAGCAGATCAGTCCTCCATCGACCACCTCCACGTTTACAATCTTCCCATAGGGGAAGA
TAGACTTGACCTTGTCGAGATCCAGTTGGTGGTGAAGAGAACGAGGCACTCCAAGCTTGA
TCTGTAACTTCATTTCTCCAAATGAAACTCCAGGAATCGAACCTCTTCTAAAAGCAGGAA
TCGAATTGGAAGAAATTGCATTCTTACAAGCCTTCATCGCCGCAGATGTCACGTCCTGCC
CGTGCTGATCGTAACCCACACCCATCTCGACGAACAGTAGCTTCATCGTGTTGTTGGGAA
CACCACCGGAAATTGTCTCTGCCGTCGTCTCCATGGCGGTGACTTTGATCAGACGTGATG
ATATCTCGCGGTGACTACTAGAAGAGAGAGAAAGCGATCGCGATGAAGAGATTGTCAAAG
ACGAGGGAGATTGACGGAGACGAAGATCGGGGCAGATAAGAATTGAGCCGGCAGTCCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL4323Contig1 1358 3 5 U
GGATGTTGGTTACGAGCAATCTCAAGTACCCAGCAACCACAAGAGCTTATTCTCCTCATC
CTCATTTTCTATTGATATCCTCCCATCACAAATTATATCTGCCAAAACGCCATTGATTCG
ATTCAATTCGCTCGCATAAAATTCGACTTCTCAGCTCACCATTTCTTTTTCTGGGATTCT
CGCTGCGGAACGAAGCTTCTGGGTATCAATTAGAATTTCGTTAATGGAGAAAGGGATCTT
TTTGTTGCTGTTGGTTATTCTGTTTTGGAATTTAACCGTCGACGGTGTATCCGTTAGGGT
TCCAGTTTGTGCTATGAGGTCTGTTAAAGATTACACCTTAGAGTTTCGGGATCAGTCTTG
TCCAGTTTATGATGATGATAAATTAGCCGAGCGTCCTCATTTCACCACCGAGGGTGATGA
GCGTTGGTTGCAAATAGCTTTGGATATGATTCATAAGAACAAGTGTGACTATGTGGCTTT
GCTCTTCTATGCATCATGGTGTCCTTTCTCAAGGTCTTTTACACCCACTTTTGATCTCAT
CTCTTCCCTCTACTCTTCCATTCCTCACTTTGCAATTAAGGAATCATCCGTTAAGCCAAG
TACTCTCTCTAAATATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTCTCTTACTTATGAATTCAACTAT
GCGGGCACGATACCGAGGCACCAGAATGCTTGATTCTCTTGTTGCTTTCTACAGAGATGT
TACTGGCATTGAAACGCTGGATCAGGCTTCTCTCGAGAGGAGCTTATTGGTTCCTCATCT
CGGGAAAGAAAACAACACTGAGCCAGAGAACTGCCCTTTCACATGGGCAAGATCGCCTGA
GAATATGCTTCGACAAGAAACCTATCTAACTCTTGCTATCCTATTCGTACTGTTGGGATT
GCTTCATTTCGTTTTCCCTACACTGCTTGTGTTTGCCAAGTTTACTTGGCCACGGATTGC
TCGAAACATGAGATTAGAAAGCCTGCAAGAACATACTGTAGGATTTTTGAGCCGGCTATG
CTTGTATCTTAAAGAGCCTTGCAAGAGGAGTGACCTCCAGGGAGGAGCCATGAACGCTAG
AGCATGGGCCTCCAAGTCGTTGGCAACTGTCACAATTGGGGAGTCCAGCTCATCAAACAG
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GGTTCCTCTGGAGTGGGGTTAATTCATAGCCAAATATTTTGTACCAAAAATCAGTCAGGT
GGCAATATTATATAAAGTCAGTTCCTGATTCTTCTGCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP49TF U 1
AF RR4AU12TF U 3
AF RR4AU12JQ C 669
BS 1 341 RR4AP49TF
BS 342 342 RR4AU12TF
BS 343 711 RR4AP49TF
BS 712 786 RR4AU12TF
BS 787 1358 RR4AU12JQ

RD RR4AP49TF 711 0 0
GGATGTTGGTTACGAGCAATCTCAAGTACCCAGCAACCACAAGAGCTTATTCTCCTCATC
CTCATTTTCTATTGATATCCTCCCATCACAAATTATATCTGCCAAAACGCCATTGATTCG
ATTCAATTCGCTCGCATAAAATTCGACTTCTCAGCTCACCATTTCTTTTTCTGGGATTCT
CGCTGCGGAACGAAGCTTCTGGGTATCAATTAGAATTTCGTTAATGGAGAAAGGGATCTT
TTTGTTGCTGTTGGTTATTCTGTTTTGGAATTTAACCGTCGACGGTGTATCCGTTAGGGT
TCCAGTTTGTGCTATGAGGTCTGTTAAAGATTACACCTTAGGGTTTCGGGATCAGTCTTG
TCCAGTTTATGATGATGATAAATTAGCCGAGCGTCCTCATTTCACCACCGAGGGTGATGA
GCGTTGGTTGCAAATAGCTTTGGATATGATTCATAAGAACAAGTGTGACTATGTGGCTTT
GCTCTTCTATGCATCATGGTGTCCTTTCTCAAGGTCTTTTACACCCACTTTTGATCTCAT
CTCTTCCCTCTACTCTTCCATTCCTCACTTTGCAATTAAGGAATCATCCGTTAAGCCAAG
TACTCTCTCTAAATATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTCTCTTACTTATGAATTCAACTAT
GCGGGCACGATACCGAGGCACCAGAATGCTTGATTCTCTTGTTGCTTTCTA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4AU12TF 784 0 0
ATGTTGGTTACGAGCAATCTCAAGTACCCAGCAACCACAAGAGCTTATTCTCCTCATCCT
CATTTTCTATTGATATCCTCCCATCACAAATTATATCTGCCAAAACGCCATTGATTCGAT
TCAATTCGCTCGCATAAAATTCGACTTCTCAGCTCACCATTTCTTTTTCTGGGATTCTCG
CTGCGGAACGAAGCTTCTGGGTATCAATTAGAATTTCGTTAATGGAGAAAGGGATCTTTT
TGTTGCTGTTGGTTATTCTGTTTTGGAATTTAACCGTCGACGGTGTATCCGTTAGGGTTC
CAGTTTGTGCTATGAGGTCTGTTAAAGATTACACCTTAGAGTTTCGGGATCAGTCTTGTC
CAGTTTATGATGATGATAAATTAGCCGAGCGTCCTCATTTCACCACCGAGGGTGATGAGC
GTTGGTTGCAAATAGCTTTGGATATGATTCATAAGAACAGGTGTGACTATGTGGCTTTGC
TCTTCTATGCATCATGGTGTCCTTTCTCAAGGTCTTTTACACCCACTTTTGATCTCATCT
CTTCCCTCTACTCTTCCATTCCTCACTTTGCAATTAAGGAATCATCCGTTAAGCCAAGTA
CTCTCTCTAAATATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTCTCTTACTTATGAATTCAACTATGC
GGGCACGATACCGAGGCACCAGAATGCTTGATTCTCTTGTTGCTTTCTACAGAGATGTTA
CTGGCATTGAAACGCTGGATCAGGCTTCTCTCGAGAGGAGCTTATTGGTTCCTCATCTCG
GGAA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AU12JQ 690 0 0
GATACCGAGGCACCAGAATGCTTGATTCTCTTGTTGCTTTCTACAGAGATGTTACTGGCA
TTGAAACGCTGGATCAGGCTTCTCTCGAGAGGAGCTTATTGGTTCCTCATCTCGGGAAAG
AAAACAACACTGAGCCAGAGAACTGCCCTTTCACATGGGCAAGATCGCCTGAGAATATGC
TTCGACAAGAAACCTATCTAACTCTTGCTATCCTATTCGTACTGTTGGGATTGCTTCATT
TCGTTTTCCCTACACTGCTTGTGTTTGCCAAGTTTACTTGGCCACGGATTGCTCGAAACA
TGAGATTAGAAAGCCTGCAAGAACATACTGTAGGATTTTTGAGCCGGCTATGCTTGTATC
TTAAAGAGCCTTGCAAGAGGAGTGACCTCCAGGGAGGAGCCATGAACGCTAGAGCATGGG
CCTCCAAGTCGTTGGCAACTGTCACAATTGGGGAGTCCAGCTCATCAAACAGAGCAAGTT
CAGCTTCTCAATGACTTGAAACTGCTTTAGGGTAGCAAATTTAATCAGCTAAAATGTTTG
GCTGTATCAGGCACTTTTCAAGATAAAGTTGTCTCTTTCCTGTATAATCAGCGGTTCCTC
TGGAGTGGGGTTAATTCATAGCCAAATATTTTGTACCAAAAATCAGTCAGGTGGCAATAT
TATATAAAGTCAGTTCCTGATTCTTCTGCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL4324Contig1 862 3 2 U
AATAAAATCAAAGTTCTTTAGGTAAAAAGATTACAGAGTGAAACACCTCTTATGTAATAT
TCAAAGAGAACAGAAATATTTAATTAAAGAATAATTTGAAAACAAATCTTTGTTTCTCAC
GACCAAAGAACAAAACGAATACTAGACCACAGCTTCTTTCTTTCTTCTTCT***TCATCT
ATATCTACAACACATTTTTGCAAAAAGTAACAAATGTAAACCCTTTTTTCTTTTCTTGTA
ATTATGTAATGAACACAGTGAAGGAGTCTTAAGAGGAGGTATATAATCCATCTCTTGATC
CGTGGGAACCAAACCTTTTTCACCAACCGATCTCACAAGCAGTCCAAACCGCAGATCTCA
AGAACAGGACCACCTTTCGCCACAAACGGATTAACTCTAACCCAAAGAAGTGTAAGAATA
GAAGCAATGAGGATGGACCAGACGATGATAATGGTCGGCATTCTATCTTGTTTCCCAAGC
AAACCTTTAAGGAAAGGGTAAAGATGAATGACCACCCAAAGTGCAAAGAACAATCTTCCG
AAAAGCGGTCCCCATGAGTCGTATCCATTGCTTATAGCATCAGAGATTCCGACCACGATT
CCAATCATGTTTATGATTAGGAGAGTCGTCGGAGGGACGAGAAGTGAAGTCCATTTGAAG
AGGTAAAGGTCTGAGAACTCTCCGTCATCAGCTGCTTTTGACGTGACCGTGAAGTTAGTG
TCCACACCAGCAAGAACCTTGAGAAGACCTTGGAAGAGAGAAAAGAGATGCGCAGAGACA
CCTCCTATGACCCAAAACTGTTCATTTCTCCACCAATCATCGATCCCAACTTTGCCCCAT
TGCATCTCCAGGATACCGTTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM60JQ U 1
AF RR4AM60TF C 1
AF RR4ET40JQ U 67
BS 1 695 RR4AM60JQ
BS 696 862 RR4ET40JQ

RD RR4AM60JQ 695 0 0
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ATATCTACAACACATTTTTGCAAAAAGTAACAAATGTAAACCCTTTTTTCTTTTCTTGTA
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AAAAGCGGTCCCCATGAGTCGTATCCATTGCTTATAGCATCAGAGATTCCGACCACGATT
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QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4AM60TF 695 0 0
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TCAAAGAGAACAGAAATATTTAATTAAAGAATAATTTGAAAACAAATCTTTGTTTCTCAC
GACCAAAGAACAAAACGAATACTAGACCACAGCTTCTTTCTTTCTTCTTCT***TCATCT
ATATCTACAACACATTTTTGCAAAAAGTAACAAATGTAAACCCTTTTTTCTTTTCTTGTA
ATTATGTAATGAACACAGTGAAGGAGTCTTAAGAGGAGGTATATAATCCATCTCTTGATC
CGTGGGAACCAAACCTTTTTCACCAACCGATCTCACAAGCAGTCCAAACCGCAGATCTCA
AGAACAGGACCACCTTTCGCCACAAACGGATTAACTCTAACCCAAAGAAGTGTAAGAATA
GAAGCAATGAGGATGGACCAGACGATGATAATGGTCGGCATTCTATCTTGTTTCCCAAGC
AAACCTTTAAGGAAAGGGTAAAGATGAATGACCACCCAAAGTGCAAAGAACAATCTTCCG
AAAAGCGGTCCCCATGAGTCGTATCCATTGCTTATAGCATCAGAGATTCCGACCACGATT
CCAATCATGTTTATGATTAGGAGAGTCGTCGGAGGGACGAGAAGTGAAGTCCATTTGAAG
AGGTAAAGGTCTGAGAACTCTCCGTCATCAGCTGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4ET40JQ 796 0 0
AGAACAGAAATATTTAATTAAAGAATAATTTGAAAACAAATCTTTGTTTCTCACGACCAA
AGAACAAAACAAATACTAGACCACAGCTTCTTTCTTTCTTCTTCTTCTTCATCTATATCT
ACAACACATTCTTGCAAAAAGTAACAAATGTAAACCCTTTTTTCTTTTCTTGTCATTATG
TAATGAACACAGTGAAGGAGTCTTAAGAGGAGGTATATAAACCATCTCTTGATCCGTGGG
AACCAAACCTTTTTCACCAACCGATCTCACAAGCAGTCCAAACCGCAGATCTCAAGAACA
GGACCACCTTTCGCCACAAACGGATTAACTCTAACCCAAAGAAGTGTAAGAATCGAAGCA
ATGAGGATGGACTAGACGATGATAATGGTCGGCATTCTATCTTGTTTCCCAAGCAAACCT
TTAAGGAAAGGGTAAAGATGAATGACCACCCAAAGTGCAAAGAACAATCTTCCGAAAAGC
GGTCCCCATGAGTCGTATCCATTGCTTATAGCATCAGAGATTCCGACCACGATTCCAATC
ATGTTTATGATGAGGAGAGTCGTTGGAGGGATGAGAAGTGAAGTCCATTTGAAGAGGTAA
AGGTCTGAGAACTCTCCGTCATCAGCTGCTTTTGACGTGACCGTGAAGTTAGTGTCCACA
CCAGCAAGAACCTTGAGAAGACCTTGGAAGAGAGAAAAGAGATGCGCAGAGACACCTCCT
ATGACCCAAAACTGTTCATTTCTCCACCAATCATCGATCCCAACTTTGCCCCATTGCATC
TCCAGGATACCGTTAT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 3

CO CL4325Contig1 759 3 8 U
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GATCATGGGCCGAGTCACATTACATGGACTTGATTATTAGAATGGGATCATCCTTAGACC
TAACTTCTCAACACGAGAAGTAGCAGCTTTAACTTTGACGAATTTGACGAATATGAACTG
AGCCACATCATTGGTGAGATGTAAAACTAGCTATGGTGTTGGGATGGCTCCAACGGTTCC
GGCAGAAGTAGTCAACTTGTAAATGTTTGTGCCATCTTCTTCTCCGACTTTCTCTATCTT
AAAGTGGCTATTTGGTTCCTCAGGTCTACCCCCGATGAAAATTGGATCATAAATAAATTC
ATAGACTTGCCAGAACTTGGATATCTCCTTACAGTCGTCGTTGTACTTGAACTCGATGGT
TATATTGAAATTTGTTTTGACAACTTCTAATGGCGTGAGGAACCCCGGTGGATATGCTAT
GCTAACTGGCACGCCCGGTTCGCCCGTAAATGTTTCGCTAATGTCACGTAGTTGACAAAC
GGGACTTATTACACGTGGAGCAAGACTGCCGCCGTTAATCCCGTTACTGATCGGTTGGAT
GTAGTATTGTTCTTTGAGTCGAACTTCGTTCCCGTTGCTGTCCTTTACCGATTCTTCCCC
GTGGGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAGGAGAGTGATGAGAAAAGAGGCAAATGATGTCAT
GATTGCCATTGTTTTTTGTTTGTTTGAGTTGAGTTATCC


BQ
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AF RR4DO22JQ U 1
AF RR4C459TF C 342
AF RR4C459JQ U 3
BS 1 203 RR4DO22JQ
BS 204 204 RR4C459JQ
BS 205 212 RR4DO22JQ
BS 213 213 RR4C459JQ
BS 214 338 RR4DO22JQ
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BS 340 664 RR4DO22JQ
BS 665 759 RR4C459JQ

RD RR4DO22JQ 664 0 0
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GATCATGGGCCGAGTCACATTACATGGACTTGATTATTAGAATGGGATCATCCTTAGACC
TAACTTCTCAACACGAGAAGTAGCAGCTTTAACTTTGACGAATTTGACGAATATGAACTG
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GGCAGAAGTAGTCAACTTGTAAATGTTTGTGCCATCTTCTTCTCCGACTTTCTCTATCTT
AAAGTGGCTATTTGGTTCCTCAGGTCTACCCCCGATGAGAATTGGATCATAAATAAATTC
ATAGACTTGCCAGAACTTGGATATCTCCTTACAGTCGTCGTTGTACTTGAACTCGATGGT
TATATTGAAATTTGTTTTGACAACTTCTAATGGCGTGAGGAACCCCGGTGGATATGCTAT
GCTAACTGGCACGCCCGGTTCGCCCGTAAATGTTTCGCTAATGTCACGTAGTTGACAAAC
GGGACTTATTACACGTGGAGCAAGACTGCCGCCGTTAATCCCGTTACTGATCGGTTGGAT
GTAGTATTGTTCTTTGAGTCGAACTTCGTTCCCGTTGCTGTCCTTTACCGATTCTTCCCC
GTGG

QA 1 664 1 664
DS 

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QA 1 356 1 356
DS 

RD RR4C459JQ 757 0 0
AAAACATGATTTTTTATTTTATTTATCTTGACGGGTATTATTACAACCCCTTATATTTGA
TCATGGGCCGAGTCACATTACATGGACTTGATTATTAGAATGGGATCATCCTTAGACCTA
ACTTCTCAACACGAGAAGTAGCAGCTTTAACTTTGACGAATTTGACGAATATGAACTGAG
CCACATCATTGGTGAGATGTAAAACTAGCTATGGTGTTGGGATGGCTCCAACGGTTCCGG
CAGAAGTAGTCAACTTGTAAATGTTTGTGCCATCTTCTTCTCCGACTTTCTCTATCTTAA
AGTGGCTATTTGGTTCCTCAGGTCTGCCCCCGATGAAAATTGGATCATAAATAAATTCAT
AGACTTGCCAAAACTTGGATATCTCCTTACAGTCGTCGTTGTACTTGAACTCGATGGTTA
TATTGAAATTTGTTTTGACAACTTCTAATGGCGTGAGGAACCCCGGTGGATATGCTATGC
TAACTGGCACGCCCGGTTCGCCCGTAAATGTTTCGCTAATGTCACGTAGTTGACAAACGG
GACTTATTACACGTGGAGCAAGACTGCCGCCGTTAATCCCGTTACTGATCGGTTGGATGT
AGTATTGTTCTTTGAGTCGAACTTCGTTCCCGTTGCTGTCCTTTACCGATTCTTCCCCGT
GGGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAGGAGAGTGATGAGAAAAGAGGCAAATGATGTCATGA
TTGCCATTGTTTTTTGTTTGTTTGAGTTGAGTTATCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 3

CO CL4326Contig1 761 3 2 U
GGAATTATTCTCTCTCTCTCTTTCTTGATCTTGATCTCGATCTCCTGTGAGTAGTGTGTT
TAAGTGGAGACAGAATCAGATTCAGAGCCAAATCAAACTTGAGAAAATGGGATCTGGAGC
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CAAACAATGGCTCACTTATTGGGTCCTTTACTCCTTACTTACACTCTTCGAGCTCACATT
CGCCAAACTCATCGAATGGGTACCGATATGGTCGTATGCAAAGCTGATTTTGACTTGCTG
GCTTGTGATTCCCTACTTCAGCGGCGCTGCTTATGTCTACGAACATTTTGTGAGACCTGT
GTTTGTCGACCCACAGAGCATTAACATTTGGTATGTGCCAAAGAAAATGGATATCTTCAA
AAAGCCAGACGATGTGTTAACAGCTGCTGAGAAGTACATTGCAGAGAATGGAACTGATGC
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GTATGGGGAAGAGTATCAGTACTAAGGGAACTACAAAAGCTTTTAGTTTTAGACTTGTGG
GGCAAGTTTCATGTCTTTGATGTTGTTGCTTTTGCTTCTTTGTGTGTGGATCTCTGCTGT
GTAGAAAAAGTTATAAGAAACTTTATTGAAACTTGTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EP53TF U 1
AF RR4EP53JQ C 49
AF RR4DB64TF U 88
BS 1 728 RR4EP53TF
BS 729 761 RR4DB64TF

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GTA

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DS 

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CGAGCTCACATTCGCCAAACTCATCGAATGGGTACCGATATGGTCGTATGCAAAGCTGAT
TTTGACTTGCTGGCTTGTGATTCCCTACTTCAGCGGCGCTGCTTATGTCTACGAACATTT
TGTGAGACCTGTGTTTGTCGACCCACAGAGCATTAACATTTGGTATGTGCCAAAGAAAAT
GGATATCTTCAAAAAGCCAGACGATGTGTTAACAGCTGCTGAGAAGTACATTGCAGAGAA
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GG
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CTTATGTCTACGAACATTTTGTGAGACCTGTGTTTGTCAACCCACAGAGCATTAACATTT
GGTATGTGCCAAAGAAAATGGATATCTTCAAAAAGCCAGACGATGTGTTAACAGCTGCTG
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TTTAGCTTCTTTGTGTGTGGATCTCTGCTGTGTAGAAAAAGTTATAAGAAACTTTATTGA
AACTTGTTCAGT

QA 3 674 3 674
DS 



AS 1 3

CO CL4327Contig1 1009 3 9 U
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F418JQ U 1
AF RR4G408JQ U 1
AF RR4G408TF C 240
BS 1 195 RR4F418JQ
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BS 197 307 RR4F418JQ
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BS 754 804 RR4G408JQ
BS 805 1009 RR4G408TF

RD RR4F418JQ 753 0 0
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ACAGCCAACTCCTCGGCCACCCACTTCCTCCCA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4G408JQ 804 0 0
CA
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CATCTTAACTTTTGGCATTGACTTCTTCATCTGGCGTGCACGTTCCTTTGCCTCTTTCTT
CCTCAGAGCCTCACCGCTAAGCTTTGCCTCCGCCTCCTCCAGTAACCTCTTCTTCTCGGC
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AATTAAGTCAATGTAATACGGAATTAGCGCTATCAAGCGGACCATATCATCCATGTGCTT
AGCATCAGGTAAGGCGAACTTGAAAAGCAGCATCTTCCTGTGTTTGCCAGGATGTTGGTC
CGAAAAATGCATTGAAATGAAATACTTGCCAAACTTCTCGAACGATTTGTCACCAAAAAC
CTGATCAAGAACAACATCAGTGATCATATCCCCAGCGACCTCCTTAGACTCAGACACAAC
AGCCAACTCCTCGGCCACCCACTTCCTCCCACCGGGAGCAGCCACCATCCCACCAAACCT
CTGAAGATCCCTCATCTCCTTA

QA 3 804 3 804
DS 

RD RR4G408TF 770 0 0
CGACTCATCTTAC
TTTGGCATTGACTTCTTCATCTG*CGTGCACGTTC*TTTGCCTCTTTCTTCCTCAGAGCC
TCACCGCTAAGCTTTGCCTCCGCCTCCTCCAGTAAC*TCTTCTTCTCGGCTTTCTTTCTC
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CCGTGGCAGTACCTACGCCCGCTCGCGTAGAACTTGC

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DS 



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CCTCCAATCCCATTCTCTTCACTAGCAAATTGTTCAGAGTACCCTGACCACTCAGGGACT
ATGCCTCCGTCCCTCTATCTTCTTCTGCTGCTGGAAGATTCTGCCGTCGAGTCTTCAGTG
CTTTCTGCAACAATTCTAATATTGAATTCTGGAATCATAGCAGTGACTTGGTTCGAAACC
GGATCTGCTCTTGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGAGCTTGGTTGGTGTTGACCATGTTT
CTCGGAACATCTGCTCTGCTATCTCCAACTGAATTTCTTACATTCAGAGACGACTCTTCA
TCTTCTTCAGGTCTGATCAAAGAAGTAGTAATGCTTGGAACCATTTGATCCTCATATCTC
CTGACTGGATTGAGTCTGGTTGGTTCAGTCTCTTCCATCGTGATGTCTCTAGGGAACTCG
ATAGGAGCTTCCTCAAACTCAGTAGAATCTCCAAGCCCTTCCTCCGATCCGTTCTCTATC
GCAGCTCTTGCGGCAGCTTCTAGTTGCCACATCTGCGAAAGCGCTTCGTGAAGCCGTGCT
TTCGCTTCATCTAATCCAACAATTGGTAGAGGATAGTTTGATCCGAGCTCAATACCAGCA
GCTTGAAGCACGGACTCAGGTGCGTTCCACGGATGATGTACCCACTCTGTGGGGAGTCTC
GAAAGTTCAGGGAGCCATCTCCTTACGTATTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F954JQ U 1
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DS 

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A
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GATGTTGTACTTACTCCTCCAATCCCATTCTCTTCACTAGCAAATTGTTCAGAGTACCCT
GACCACTCAGGGACTATGCCTCCGTCCCTCTATCTTCTTCTGCTGCTGGAAGATTCTGCC
GTCGAGTCTTCAGTGCTTTCTGCAACAATTCTAATATTGAATTCTGGAATCATAGCAGTG
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TGATCCTCATATCTCCTGACTGGATTGAGTCTGG

QA 2 695 2 695
DS 

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GTTGACCATGTTTCTCGGAACATCTGCTCTGCTATCTCCAACTGAATTTCTTACATTCAG
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ATCCTCATATCTCCTGACTGGATTGAGTCTGGTTGGTTCAGTCTCTTCCATCGTGATGTC
TCTAGGGAACTCGATAGGAGCTTCCTCAAACTCAGTAGAATCTCCAAGCCCTTCCTCCGA
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TGTGGGGAGTCTCGAAAGTTCAGGGAGCCATCTCCTTACGTATTCACCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 3

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TGAAAATCAATCTGGTACAATACCCAAACAAGGCCTAGTGAAGACACAAACACTGGTAAC
GGCCCAAACATCCATAGCAATAGCGGTACAGAAACGCACATAACTCTGTTCCCAATCATA
GCCATAAAAAACCCTCTCTCCAACACTAATCTTGTATACTCCCTAAACGATCCAGTCCCC
GTCAATTCATAATCGCAATCGCAGTCTCCTTCATGCATTTTAGCAATGGCGTTTATGAGA
AAATTGGCATCCATCAAGTAACTCACAGCAAGTGAGCTGAAGAAAAAGCTTACTGCCAGA
AGCAGAGAGGTAGATGCATACTTGAGGACGAAGATTGTAGGGTTTTTGGAGCCTAAAACA
ATGTCGTCCGCGGTTGTGAAGAGGTGGCTTGCTTTAAACGCGTTGTTAGTAACCGCAGCT
AGAGAAAGCAAGATAAGGATGGAGACTGTAGCAGTGAGAATTGTAACCATTTTTTTGTTC
CTCAGGCTTTGCACTGCCAACATGCCAGTCTTATCGTCACCCTCTTTGATGTCACGGAAC
CAAGATTTGCGTTTGG*GGAATCGATGCCAAGAGAAGTACGAGAAGGATTGTGCTTGAAG
GTGTTCCAGAGGAAGACATGATATCCCACTGCTATGAACACACTCAAGGGCACTAAAACA
CTGTCTGTGTCCACTTTCATTCTTGTTTCTCCTTATTTTGTTCAGTACGAACTTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A263JQ U 1
AF RR4A263JQD U 1
AF RR4F483TF C 17
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CTGTCTGTGTCCACTTTCATTCTT
CC

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AATCAACCGGTTTGATTTTTTTTATTTTATCGTTTACAAACGGAAATTGTGGCGACTGCC
TGAAAATCAATCTGGTACAATACCCAAACAAGGCCTAGTGAAGACACAAACACTGGTAAC
GGCCCAAACATCCATAGCAATAGCGGTACAGAAACGCACATAACTCTGTTCCCAATCATA
GCCATAAAAAACCCTCTCTCCAACACTAATCTTGTATACTCCCTAAACGATCCAGTCCCC
GTCAATTCATAATCGCAATCGCAGTCTCCTTCATGCATTTTAGCAATGGCGTTTATGAGA
AAATTGGCATCCATCAAGTAACTCACAGCAAGTGAGCTGAAGAAAAAGCTTACTGCCAGA
AGCAGAGAGGTAGATGCATACTTGAGGACGAAGATTGTAGGGTTTTTGGAGCCTAAAACA
ATGTCGTCCGCGGTTGTGAAGAGGTGGCTTGCTTTAAACGCGTTGTTAGTAACCGCAGCT
AGAGAAAGCAAGATAAGGATGGAGACTGTAGCAGTGAGAATTGTAACCATTTTTTTGTTC
CTCAGGCTTTGCACTGCCAACATGCCAGTCTTATCGTCACCCTCTTTGATGTCACGGAAC
CAAGATTTGCGTTTGG*GGAATCGATGCCAAGAGAAGTACGAGAAGGATTGTGCTTGAAG
GTGTTCCAGAGGAAGACATGATATCCCACTGCTATGAACACACTCAAGGGCACTAAAACA
CTGTCTGTGTCCACTTTCATTCTT
CC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4F483TF 760 0 0
TTTTTTTATTTTATCGTTTACAAACGGAAATTGTGGCGACTGC*TGAAAATCGATCTGGT
ACAATACCCAAACAAGGCCTAGTGAAGACACAAACACTGGTAACGGCCCAAACATCCATA
GCAATAGCGGTACAGAAACGCACATAACTCTGTTCCCAATCATAGCCATAAAAAACCCTC
TCTCCAACACTAATCTTGTATACTCCCTAAACGATCCAGTCCCCGTCAATTCATAATCGC
AATCGCAGTCTCCTTCATGCATTTTAGCAATGGCGTTTATGAGAAAATTGGCATCCATCA
AGTAACTCACAGAAAGTGAGCTGAAGAAAAAGCTTACTGCAAGAAGCAGAGAGGTAGATG
CATACTTGAGGACGAAGATTGAAGGGTTTTTGGAGCCTAAAACAATGTCGTCCGCGGTTG
TGAAGAGGTGGCTTGCTTTAAACGCGTTGTTAGTAACCGCAGCTAGAGAAAGCAAGATAA
GGATGGAGACTGTAGCAGTGAGAATTGTAACCATTTTTTTGTTCCTCAGGCTTTGCACTG
CCAACATGCCAGTCTTATCGTCACCCTCTTTGATGTCACGGAACCAAGATTTGCGTTTGG
AGGAATCGATGCCAAGAGAAGTACGAGAAGGATTGTGCTTGAAGGTGTTCCAGAGGAAGA
CATGATATCCCACTGCTATGAACACACTCGAGGGCACTAAAACACTGTCTGTGTCCACTT
TCATTCTTGTTTCTCCTTATTTTGTTCAGTACGAACTTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

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ACCAAATAATAATTTATAGATTTTTTTACTATACAGAAATTGGCAAACTTTGGTAGTATT
TTTGCTAAGTGCTAATAAAGAGCATTTCTAAAATTCCTAAAAATAATTTGCAAACGAATC
TGTAGATGAATCCCTAATTTATTATTTTAAGAAAAAGGAAAACAATTTAAATATCATTCG
ACAACTTCATTGCGGCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATGAGCTTTGTTCCT
CCTCTTTCGAAATACCAATCTCCCACAGCTGTTGCAATCCTCTTGTTCTTAACAGCAGGA
GAATTTTTGGTATACCATGTGTTATGATTCTCTGTTTGGCATTGAACAAAGCACGAGTTA
ATAAACATTCCGTTCTTACTTGGCTTTCCAAAACCACTGATTAGATTCACCATACGAGTC
CTGAAACCGTGCAAAAACTTGATCTGAGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATCTACAG
TCAGACCAACTTCCACTTGGATCGGCAGATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCAC
GAATCATATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGATTCTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGT
GCGAAAAAACACGAAGTTGAATTTAGACGTCTTAAACAGTCATTAGGGAGCTGTGTTGCA
ATATTCTGTAATTTTACTACATCTGCGTATAAACGGCTAAGAGGCTGGCCTCCAGAGACA
TCAGTGCTTCAATTATACAAATTACAAAACAAGTTAATATGTATATATACGAAAGTTTTG
TTAATGAAGGTAGCTAGAAAATTACGCACGCATCAAGGAAAAGGCCAGCATCACTCAGAC
ATTTTACTCTGGTGGAAGGATCAGACATATTCGTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D587JQ U 107
AF RR4DH58JQ U 1
AF RR4DH58TF C 97
BS 1 815 RR4DH58JQ
BS 816 879 RR4DH58TF

RD RR4D587JQ 585 0 0
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TTAAATATCATTCGACAACTTCATTGCGGCAAGTCTTGCCACAAGGATAAGCACAGTCTA
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TCTTAACAGCAGGAGAATTTTTGGTATACCATGTGTTATGATTCTCTGTTTGGCATTGAA
CAAAGCACGAGTTAATAAACATTCCGTTCTTACTTGGCTTTCCAAAACCACTGATTAGAT
TCACCATACGAGTCCTGAAACCGTGCAAAAACTTGATCTGAGATGCATTGCACTTGGCGA
TGTTAAATCTCCAGTCAGACCAACTTCCACTTGGATCGGCAGATTTAGGAGTTAAACTCT
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TTATTAGGTTTTGTGCGAAAAAACACGAAGTTGAATTTAGACGTCTTAAACAGTCATTAG
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QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4DH58JQ 815 0 0
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TTTGCTAAGTGCTAATAAAGAGCATTTCTAAAATTCCTAAAAATAATTTGCAAACGAATC
TGTAGATGAATCCCTAATTTATTATTTTAAGAAAAAGGAAAACAATTTAAATATCATTCG
ACAACTTCATTGCGGCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATGAGCTTTGTTCCT
CCTCTTTCGAAATACCAATCTCCCACAGCTGTTGCAATCCTCTTGTTCTTAACAGCAGGA
GAATTTTTGGTATACCATGTGTTATGATTCTCTGTTTGGCATTGAACAAAGCACGAGTTA
ATAAACATTCCGTTCTTACTTGGCTTTCCAAAACCACTGATTAGATTCACCATACGAGTC
CTGAAACCGTGCAAAAACTTGATCTGAGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATCTACAG
TCAGACCAACTTCCACTTGGATCGGCAGATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCAC
GAATCATATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGATTCTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGT
GCGAAAAAACACGAAGTTGAATTTAGACGTCTTAAACAGTCATTAGGGAGCTGTGTTGCA
ATATTCTGTAATTTTACTACATCTGCGTATAAACGGCTAAGAGGCTGGCCTCCAGAGACA
TCAGTGCTTCAATTATACAAATTACAAAACAAGTTAATATGTATATATACGAAAGTTTTG
TTAATGAAGGTAGCTAGAAAATTACGCACGCATCA

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4DH58TF 783 0 0
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TGGCATTGAACAAAGCACGAGTTAATAAACATTCCGTTCTTACTTGGCTTTCCAAAACCA
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GTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGAATCATATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGATTC
TTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGTGCGAAAAAACACGAAGTTGAATTTAGACGTCTTAAA
CAGTCATTAGGGAGCTGTGTTGCAATATTCTGTAATTTTACTACATCTGCGTATAAACGG
CTAAGAGGCTGGCCTCCAGAGACATCAGTGCTTCAATTATACAAATTACAAAACAAGTTA
ATATGTATATATACGAAAGTTTTGTTAATGAAGGTAGCTAGAAAATTACGCACGCATCAA
GGAAAAGGCCAGCATCACTCAGACATTTTACTCTGGTGGAAGGATCAGACATATTCGTAA
ACC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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GACACAGAAGCAAAAAAATAAAAAAAAATCAAAGAGGTTCCTCTTTCGCTTGTTTACCCT
TTTTCTGGTTTTGCAGTCTGGGTAATATAATCAAAATCAAATCCTCTGTTTATCGTTAAC
TACCGCCGTCTCCATTGTCCTCATCCTTTCTCTAGGCTCCTCCCTTGTGTTTGCCCTGAA
ACAACAGAAGCATGGATGATGATGGCCTTCATGGAAACATGCACAATGGCGGAGATGAAC
ATCCACTGCATGTGCAGTATGAGCATCACGGCATGATGGATGCTGACCACGCTGAAGATG
ATGATGGGAATGGGATGAATGGGGGACTTGAGACTGACATTCCTTCTCACCTCGGTAACC
CATCTGATCATCGCGGCGAAGTTGTTGACCGTGGCGGCGGCGGTGATAACGAGGATCAGC
TGACGTTGTCCTATCAGGGACAAGTTTATGTTTTTGACCATGTCTTGCCTGACAAGGTTC
AATCTGTGCTTTTGTTACTTGGTGGACGGGAAGTACCACAGACGCTTCCGACATCCCTAG
GAACACCTCAACAGAACAATAGGGGTCTATCTGGTACTCCTCAAAGGTTAAGTGCCCCGC
AGCGGCAAGCCTCGTTGCTCAGATTTAGGGAGAAAAGAAAAAGGAGGAATTTTGGTCCGA
CCATTCGCTACACTGTCAGGAAGAAGGTAGCATTGAGGATGCAGCGTAAGAAAGTCAGTT
CACATCTGCAAGTCAGCATTGAGATCTTCATCACAGATCTGATTGGGGATCAGCCAGAGC
TGGCCTTAGAAGGTGTGAACTCATAAGCAGAGCTTTATGTCGCACTGTGGAACGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB12TF U 1
AF RR4E126TF U 29
BS 1 55 RR4FB12TF
BS 56 56 RR4E126TF
BS 57 77 RR4FB12TF
BS 78 78 RR4E126TF
BS 79 411 RR4FB12TF
BS 412 412 RR4E126TF
BS 413 683 RR4FB12TF
BS 684 684 RR4E126TF
BS 685 711 RR4FB12TF
BS 712 838 RR4E126TF

RD RR4FB12TF 711 0 0
GACACAGAAGCAAAAAAATAAAAAAAAATCAAAGAGGTTCCTCTTTCGCTTGTTTGCCCT
TTTTCTGGTTTTGCAGTTTGGGTAATATAATCAAAATCAAATCCTCTGTTTATCGTTAAC
TACCGCCGTCTCCATTGTCCTCATCCTTTCTCTAGGCTCCTCCCTTGTGTTTGCCCTGAA
ACAACAGAAGCATGGATGATGATGGCCTTCATGGAAACATGCACAATGGCGGAGATGAAC
ATCCACTGCATGTGCAGTATGAGCATCACGGCATGATGGATGCTGACCACGCTGAAGATG
ATGATGGGAATGGGATGAATGGGGGACTTGAGACTGACATTCCTTCTCACCTCGGTAACC
CATCTGATCATCGCGGCGAAGTTGTTGACCGTGGCGGCGGCGGTGATAACGGGGATCAGC
TGACGTTGTCCTATCAGGGACAAGTTTATGTTTTTGACCATGTCTTGCCTGACAAGGTTC
AATCTGTGCTTTTGTTACTTGGTGGACGGGAAGTACCACAGACGCTTCCGACATCCCTAG
GAACACCTCAACAGAACAATAGGGGTCTATCTGGTACTCCTCAAAGGTTAAGTGCCCCGC
AGCGGCAAGCCTCGTTGCTCAGATTTAGGGAGAAAAGAAAAAGGAGGAATTTTGGTCCGA
CCATTCGCTACACTGTCAGGAAGGAGGTAGCATTGAGGATGCAGCGTAAGA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4E126TF 810 0 0
GG
AAAGAGGTTCCTCTTTCGCTTGTTTACCCTTTTTCTGGTTTTGCAGTCTGGGTAATATAA
TCAAAATCAAATCCTCTGTTTATCGTTAACTACCGCCGTCTCCATTGTCCTCATCCTTTC
TCTAGGCTCCTCCCTTGTGTTTGCCCTGAAACAACAGAAGCATGGATGATGATGGCCTTC
ATGGAAACATGCACAATGGCGGAGATGAACATCCACTGCATGTGCAGTATGAGCATCACG
GCATGATGGATGCTGACCACGCTGAAGATGATGATGGGAATGGGATGAATGGGGGACTTG
AGACTGACATTCCTTCTCACCTCGGTAACCCATCTGATCATCGCGGCGAAGTTGTTGACC
GTGGCGGCGGCGGTGATAACGAGGATCAGCTGACGTTGTCCTATCAGGGACAAGTTTATG
TTTTTGACCATGTCTTGCCTGACAAGGTTCAATCTGTGCTTTTGTTACTTGGTGGACGGG
AAGTACCACAGACGCTTCCGACATCCCTAGGAACACCTCAACAGAACAATAGGGGTCTAT
CTGGTACTCCTCAAAGGTTAAGTGCCCCGCAGCGGCAAGCCTCGTTGCTCAGATTTAGGG
AGAAAAGAAAAGGGAGGAATTTTGGTCCGACCATTCGCTACACTGTCAG*AAGA**GTAG
CATTGAGGATGCAGCGTAAGAAAGTCAGTTCACATCTGCAAGTCAGCATTGAGATCTTCA
TCACAGATCTGATTGGGGATCAGCCAGAGCTGGCCTTAGAAGGTGTGAACTCATAAGCAG
AGCTTTATGTCGCACTGTGGAACGAGTG

QA 3 810 3 810
DS 



AS 1 2

CO CL4332Contig1 767 2 3 U
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AAAGAAAAATCATAGCTCGTTTATTTTTGCTTATTGGAGCTATCTGATACTAAGTTCAAT
AGTACACAATTTTGACAAACACACCCAAAAAAACTGTGTCCCTTTCTCTCAGAAATAAGT
CGTTTATCCTTTTGATTTTGTGTAGTAGTCTTCTTAGCTTTGATTTTCATTACCAAAACC
TTCGTAAGAACGATTCGAAGGAACAAAGGCAGAAGGCTGTTTAGTAACAGCAGCTAAGAT
CTCTCCATAGCCCACTACTCCAACAAGAATATCATCATCTGAATCAGCCTCTGTAACCCA
AACATGTGTGGCTCTATGAGACAGCATCTGAGCCATAACCGCAGCCAATGAGCTCGACGT
TTTGCAAGTTAACGGCGCACTTCTTCCCCTGTACATGCTCCTACCGATGCTCAGTCTTGT
CGGGCTTGTCGGATTGAAACCGATGCTCCTGCTACTGAATTTCTTGGCCTTTGTCGTAGC
CGTTCCGTTCTGGTCTCCTCCTCCTCCTCCGACAAATGAAGTTTGGAGGAAGTCGCTGAA
TGATCTTGATGACATGTTGTCCTCAACTCCCATCACAAACTGCCCTGCATATAGATTAGC
TAGAGCCCAAGCTGCAGCGAGATAATCACATTTCCAGAGCTTCGAAGCTGAGATTTCTCC
TATTATCTTGAACTGTTTGTCGTTTTCGGTTTGTTCCAACACGGCGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FY50TF C 1
AF RR4FY50JQ U 5
BS 1 4 RR4FY50TF
BS 5 750 RR4FY50JQ
BS 751 767 RR4FY50TF

RD RR4FY50TF 767 0 0
GTTTATACATATGCTGTAAACACTAAAACACCAACAACAGTTCACATAGTAATGTATAAG
AAAGAAAAATCATAGCTCGTTTATTTT*GCTTATTGGAGCTATCTGATACTAAGTTCAAT
AGTACACAATTTTGACAAACACACCCAAAAAAACTGTGTCCCTTTCTCTCAGAAATAAGT
CGTTTATCCTTTTGATTTTGTGTAGTAGTCTTCTTAGCTTTGATTTTCATTACCAAAACC
TTCGTAAGAACGATTCGAAGGAACAAAGGCAGAAGGCTGTTTAGTAACAGCAGCTAAGAT
CTCTCCATAGCCCACTACTCCAACAAGAATATCATCATCTGAATCAGCCTCTGTAACCCA
AACATGTGTGGCTCTATGAGACAGCATCTGAGCCATAACCGCAGCCAATGAGCTCGACGT
TTTGCAAGTTAACGGCGCACTTCTTCCCCTGTACATGCTCCTACCGATGCTCAGTCTTGT
CGGGCTTGTCGGATTGAAACCGATGCTCCTGCTACTGAATTTCTTGGCCTTTGTCGTAGC
CGTTCCGTTCTGGTCTCCTCCTCCTCCTCCGACAAATGAAGTTTGGAGGAAGTCGCTGAA
TGATCTTGATGACATGTTGTCCTCAACTCCCATCACAAACTGCCCTGCATATAGATTAGC
TAGAGCCCAAGCTGCAGCGAGATAATCACATTTCCAGAGCTTCGAAGCTGAGATTTCTCC
TATTATCTTGAACTGTTTGTCGTTTTCGGTTTGTTCCAACACGGCGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4FY50JQ 746 0 0
ATACATATGCTGTAAACACTAAAACACCAACAACAGTTCACATAGTAATGTATAAGAAAG
AAAAATCATAGCTCGTTTATTTTTGCTTATTGGAGCTATCTGATACTAAGTTCAATAGTA
CACAATTTTGACAAACACACCCAAAAAAACTGTGTCCCTTTCTCTCAGAAATAAGTCGTT
TATCCTTTTGATTTTGTGTAGTAGTCTTCTTAGCTTTGATTTTCATTACCAAAACCTTCG
TAAGAACGATTCGAAGGAACAAAGGCAGAAGGCTGTTTAGTAACAGCAGCTAAGATCTCT
CCATAGCCCACTACTCCAACAAGAATATCATCATCTGAATCAGCCTCTGTAACCCAAACA
TGTGTGGCTCTATGAGACAGCATCTGAGCCATAACCGCAGCCAATGAGCTCGACGTTTTG
CAAGTTAACGGCGCACTTCTTCCCCTGTACATGCTCCTACCGATGCTCAGTCTTGTCGGG
CTTGTCGGATTGAAACCGATGCTCCTGCTACTGAATTTCTTGGCCTTTGTCGTAGCCGTT
CCGTTCTGGTCTCCTCCTCCTCCTCCGACAAATGAAGTTTGGAGGAAGTCGCTGAATGAT
CTTGATGACATGTTGTCCTCAACTCCCATCACAAACTGCCCTGCATATAGATTAGCTAGA
GCCCAAGCTGCAGCGAGATAATCACATTTCCAGAGCTTCGAAGCTGAGATTTCTCCTATT
ATCTTGAACTGTTTGTCGTTTTCGGT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4333Contig1 734 2 5 U
GCTTTGCTCAAGGAAGTGGCTCTTGCTGGTGCACCAGGAAGCAAGGCCATGAAACAAGTC
ACACAACATATATTCACTTTTGCTCTGAGATTAGCTGGAGAAGGGAACCCTGTCCTAGCC
AAGGAGGCTACAGCGATCGCTATATGGGCCGTGACTGAAAACGTGGACTGCTGCAAGCAC
TGGGACAATCTCTACAAGGAGAATCTAGAAGCTAGTGTTTCTGTTCTCAAAAGGCTTGTA
GATGAATGGAAGGACCGTTCTCTCAAGCTATCATCATCACCTGGTGATACCGCCACTCTC
AACCGAACTATGAAGAGCTTCAGGCTAAAGAACGAGGAAGCCATCACTGAAGGAAGGGCC
AATGGTTCTCTCTACAAGGAAGCTGACAAGTCATGCAAAGTGATATCAGGGAGACTCTCC
CGTGGAAGTGGCTGCCTCAAAGGAACAGCCATCACTGTTATGGTTCTAGCTGCAGCAGCT
GCTGTTCTATCTTCCAACCCTGAGGTTACAACTGAGCTGAAGAACCTGGTGGACTCATTG
GAGCTGCACCAGTACTATAATCCAATCATCACAGCTTTGAAGAACTAAGAGAGAAGAGAG
ACAAAACAAGCTGAGGACGATAAGTTAATCGTCGGTGTGAGAATTTACTTAAAAAGTTAA
AATCCTTTTACTTTTAAGATACAAAATTTTGAAAAAAATTTGACAATGAGAATAAAGTTA
TTTCTGTTTATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU09TF U 8
AF RR4BU09JQ C 1
BS 1 7 RR4BU09JQ
BS 8 642 RR4BU09TF
BS 643 643 RR4BU09JQ
BS 644 653 RR4BU09TF
BS 654 734 RR4BU09JQ

RD RR4BU09TF 650 0 0
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ATATATTCACTTTTGCTCTGAGATTAGCTGGAGAAGGGAACCCTGTCCTAGCCAAGGAGG
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ATCTCTACAAGGAGAATCTAGAAGCTAGTGTTTCTGTTCTCAAAAGGCTTGTAGATGAAT
GGAAGGACCGTTCTCTCAAGCTATCATCATCACCTGGTGATACCGCCACTCTCAACCGAA
CTATGAAGAGCTTCAGGCTAAAGAACGAGGAAGCCATCACTGAAGGAAGGGCCAATGGTT
CTCTCTACAAGGAAGCTGACAAGTCATGCAAAGTGATATCAGGGAGACTCTCCCGTGGAA
GTGGCTGCCTCAAAGGAACAGCCATCACTGTTATGGTTCTAGCTGCAGCAGCTGCTGTTC
TATCTTCCAACCCTGAGGTTACAACTGAGCTGAAGAACCTGGTGGACTCATTGGAGCTGC
ACCAGTACTATAATCCAATCATCACAGCTTTGAAGAACTAAGAGAGAAGAGAGACAAAAC
AAGCTGAGGACGATAAGTTAATCGTCGGTGTGAGA*TTTACTTAAA
AGTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4BU09JQ 734 0 0
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ACACAACATATATTCACTTTTGCTCTGAGATTAGCTGGAGAAGGGAACCCTGTCCTAGCC
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TGGGACAATCTCTACAAGGAGAATCTAGAAGCTAGTGTTTCTGTTCTCAAAAGGCTTGTA
GATGAATGGAAGGACCGTTCTCTCAAGCTATCATCATCACCTGGTGATACCGCCACTCTC
AACCGAACTATGAAGAGCTTCAGGCTAAAGAACGAGGAAGCCATCACTGAAGGAAGGGCC
AATGGTTCTCTCTACAAGGAAGCTGACAAGTCATGCAAAGTGATATCAGGGAGACTCTCC
CGTGGAAGTGGCTGCCTCAAAGGAACAGCCATCACTGTTATGGTTCTAGCTGCAGCAGCT
GCTGTTCTATCTTCCAACCCTGAGGTTACAACTGAGCTGAAGAACCTGGTGGACTCATTG
GAGCTGCACCAGTACTATAATCCAATCATCACAGCTTTGAAGAACTAAGAGAGAAGAGAG
ACAAAACAAGCTGAGGACGATAAGTTAATCGTCGGTGTGAGAATTTACTTAAAAAGTTAA
AATCCTTTTACTTTTAAGATACAAAATTTTGAAAAAAATTTGACAATGAGAATAAAGTTA
TTTCTGTTTATTAT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4334Contig1 790 2 8 U
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GAGAGGTTCTTGGCACTATCAAAGACTCCCTTTCTAACTGTCTCTCGGATACAAATTTGT
TAGAGACTGTACCTGGTTCTTATCACAACTGATCGGTTGAGTGCCTTTGACAGAAACCTT
GCTTCGATTCCCTTCAAAGGCCAGGTTCTTAACGAGACCAGTTTGTGGTGGTTCAATAAC
ACACAGCACATAACTCCAAATGCAATCGTTTCATCTCCTGATAGAAATGTTGTTATTGCA
AAGAAATGCTCCGTTTTCCCAATTGAGTTTGTGGTTAGAGGATATGTGACTGGAAGTACC
GACACCTCTTTATGGACGGTATACAAGAAAGGTGTTAGGAACTATTGTGGAAATGAGCTC
TCAGATGGATTGGTGAAAAACCAGAAGCTTCCAGCTAATATACTGACACCAACAACTAAG
GCTGAGGATCATGATGTGCCCATCTCTCCAACTGAGATAGTTGAAGGTGGATTCATGACT
CAAGCTGAATTTGACGAAGCAAGCATGAAGGCTTTGAGCTTGTTTGAGTTTGGTCAGCGT
GTGGCAAAGGAGCATGGACTGATACTGGTGGACACAAAATATGAGTTTGGAAAAGTAGTG
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GGTCTATGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO31TF U 1
AF RR4CT14TF U 1
BS 1 630 RR4BO31TF
BS 631 631 RR4CT14TF
BS 632 669 RR4BO31TF
BS 670 670 RR4CT14TF
BS 671 727 RR4BO31TF
BS 728 728 RR4CT14TF
BS 729 748 RR4BO31TF
BS 749 790 RR4CT14TF

RD RR4BO31TF 751 0 0
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TAGAGACTGTACCTGGTTCTTATCACAACTGATCGGTTGAGTGCCTTTGACAGAAACCTT
GCTTCGATTCCCTTCAAAGGCCAGGTTCTTAACGAGACCAGTTTGTGGTGGTTCAATAAC
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AAGAAATGCTCCGTTTTCCCAATTGAGTTTGTGGTTAGAGGATATGTGACTGGAAGTACC
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GTGGCAAAG*AGCATGGACTGATACTGGTGGACACAAAATATGAGTTTGGAAAAGTAGTG
ATGGCTC*ATCTTGTTGATTGATGAGAT
CAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4CT14TF 790 0 0
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GAAAGGCTCAAAGCCAGCAGCAGCTGTCTCTTGACGATCTGGTCACGAGTAACCGTAAAG
GAGAGGTTCTTGGCACTATCAAAGACTCCCTTTCTAACTGTCTCTCGGATACAAATTTGT
TAGAGACTGTACCTGGTTCTTATCACAACTGATCGGTTGAGTGCCTTTGACAGAAACCTT
GCTTCGATTCCCTTCAAAGGCCAGGTTCTTAACGAGACCAGTTTGTGGTGGTTCAATAAC
ACACAGCACATAACTCCAAATGCAATCGTTTCATCTCCTGATAGAAATGTTGTTATTGCA
AAGAAATGCTCCGTTTTCCCAATTGAGTTTGTGGTTAGAGGATATGTGACTGGAAGTACC
GACACCTCTTTATGGACGGTATACAAGAAAGGTGTTAGGAACTATTGTGGAAATGAGCTC
TCAGATGGATTGGTGAAAAACCAGAAGCTTCCAGCTAATATACTGACACCAACAACTAAG
GCTGAGGATCATGATGTGCCCATCTCTCCAACTGAGATAGTTGAAGGTGGATTCATGACT
CAAGCTGAATTTGACGAAGCAAGCATGAAGGCTTTGAGCTTGTTTGAGTTTGGTCAGCGT
GTGGCAAAGGAGCATGGACTGATACTGGTGGACACAAA*TATGAGTTTGGAAAAGTAGTG
ATGGCTCCATCTTGTTGATTGATGAGATCATACGCCGGATCAAGCAGATACTGGCTTGCT
GGTCTATGAG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 3

CO CL4335Contig1 682 3 3 U
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GGATCATCATCTCTATCCTCCCGAAGACGGAATAATCAAACTCCGGTATGGCGGCGAGGA
GAAACGTACGGTACGCTCAGCTTCCAGGAGACGAAGACGATGAGGATTACGGAAACGGTG
GCGGGAGGAGGAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACACCGAAGGCGTTTGATAGAG
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CTACTTTAGACTGTTATGTTTTATTGATCTAGCTTGTGAATCTTATTGAACCTCGATTTT
TATCAAGATGTCGTATGCGTCT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT89TF U 1
AF RR4GJ25TF U 1
AF RR4DT89JQ C 4
BS 1 634 RR4DT89TF
BS 635 662 RR4GJ25TF
BS 663 682 RR4DT89JQ

RD RR4DT89TF 652 0 0
GGACTCTCAAAACGCGACGACGAAGAACAAATGCAAATCATCTCGTCAAAGTAGAGATCC
GGATCATCATCTCTATCCTCCCGAAGACGGAATAATCAAACTCCGGTATGGCGGCGAGGA
GAAACGTACGGTACGCTCAGCTTCCAGGAGACGAAGACGATGAGGATTACGGAAACGGTG
GCGGGAGGAGGAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACACCGAAGGCGTTTGATAGAG
TTCCGTGGAAATCGATAGCGTTAGCTTTGTTTCTTCTGTTTCTTGGTTGCTTGCTTCTTC
TTTTGGCGGTTTTTATTTTCACTGGTCACATGGAAGGAGATAGCTCTCAGGGTTACGCGC
TTCTTGTTCTTGGCATCCTTACTTTCCTCCCTGGGTTCTATGAGACTCGGATTGCTTACT
ATTCGTGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTCTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGAATTCAAA
TTAGCTGGAGATGGTTACACGACTCTATCTGTGCATAAACTTATTGGAGAAATGTAATAA
TAGACTTGAGGTGTTTCATGAATCACTCACTCCAAAAGGCTAGGATCCTAGATAGAGATA
CTACTTTAGACTGTTATGTTTTATTGATCTAGCT
GTGATCTATGACTCGTTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GJ25TF 662 0 0
GGA
CTCTCAAAACGCGACGACGAAGAACAAATGCAAATCATCTCGTCAAAGTAGAGATCCGGA
TCATCATCTCTATCCTCCCGAAGACGGAATAATCAAACTCCGGTATGGCGGCGAGGAGAA
ACGTACGGTACGCTCAGCTTCCAGGAGACGAAGACGATGAGGATTACGGAAACGGTGGCG
GGAGGAGGAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACACCGAAGGCGTTTGATAGAGTTC
CGTGGAAATCGATAGCGTTAGCTTTGTTTCTTCTGTTTCTTGGTTGCTTGCTTCTTCTTT
TGGCGGTTTTTATTTTCACTGGTCACATGGAAGGAGATAGCTCTCAGGGTTACGCGCTTC
TTGTTCTTGGCATCCTTACTTTCCTCCCTGGGTTCTATGAGACTCGGATTGCTTACTATT
CGTGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTTTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGAATTCAAATTA
GCTGGAGATGGTTACACGACTCTATCTGTGCATAAACTTATTGGAGAAATGTAATAATAG
ACTTGAGGTGTTTCATGAATCACTCACTCCAAAAGGCTAGGATCCTAGATAGAGATACTA
CTTTAGACTGTCATGTTTTATTGATCTAGCTTGTGAATCTTATTGAACCTCGATTTTTA

QA 4 662 4 662
DS 

RD RR4DT89JQ 679 0 0
CTCTCAAAACGCGACGACGAAGAACAAATGCAAATCATCTCGTCAAAGTAGAGATCCGGA
TCATCATCTCTATCCTCCCGAAGACGGAATAATCAAACTCCGGTATGGCGGCGAGGAGAA
ACGTACGGTACGCTCAGCTTCCAGGAGACGAAGACGATGAGGATTACGGAAACGGTGGCG
GGAGGAGGAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACACCGAAGGCGTTTGATAGAGTTC
CGTGGAAATCGATAGCGTTAGCTTTGTTTCTTCTGTTTCTTGGTTGCTTGCTTCTTCTTT
TGGCGGTTTTTATTTTCACTGGTCACATGGAAGGAGATAGCTCTCAGGGTTACGCGCTTC
TTGTTCTTGGCATCCTTACTTTCCTCCCTGGGTTCTATGAGACTCGGATTGCTTACTATT
CGTGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTCTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGAATTCAAATTA
GCTGGAGATGGTTACACGACTCTATCTGTGCATAAACTTATTGGAGAAATGTAATAATAG
ACTTGAGGTGTTTCATGAATCACTCACTCCAAAAGGCTAGGATCCTAGATAGAGATACTA
CTTTAGACTGTTATGTTTTATTGATCTAGCTTGTGAATCTTATTGAACCTCGATTTTTAT
CAAGATGTCGTATGCGTCT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL4336Contig1 921 3 2 U
CAAAATCATTATCTGGTTATTATTGTTATATAACAACACATTTGCAAACATATCATCAGT
AAGCCTCAAAAGAACAGCAAAGAGGCTACTAAAGACCAATCCTTTTACACATATCCACCA
TTAACAGGAATGATCTGACCGTTGATCCATTCACCACCATCGCCAGCCAAGAACCCAACA
AGAGGCACCACATCTTTAACTTCGCCGACTCTCCCAAAAGGATTCCCTGCGGCTATATTC
TCCACCAACTCTGAGCTCTTTCCTTCAAAGAACATCTCAGTGGCGATGGGTCCCGGAGCT
ACACAGTTTGCAGTGATTCCTGTTCCTTTGAGCTCTTTCGCTAGAATCTTAACCATAGTT
TCCGCAGCTGCCTTTGACGCTGCATATGCACCGAATCCGGGCTTCAAACCTCGGGTCATG
GAAGATGTGAGGAGTATGATCCGACCACCGCCTCCCTTTTTGAGCCTATTGGCAGCTTCT
TTGCTGCAAAGAAACGCCCCTTTTGTATTGACACTGAAAGTGCGATCAAAATCTTCGACT
GATGTGTTTGCGATGGAAGGGTACTTGGGATCGAGTACTCCCGCCGAGTTAACCAGAATA
TGAACCGGCGACTCGAAGGCGCTCTCCGCCGCATCGAAAAGCGATTTCACCTGGCTTGCC
TCTGAGACGTTGGCCTGAACCACGATCGCTCTCGGTCCATCATTTCCGGGGGATGGAAGG
CCGTTGATCTCCGCCGCGACAATCTCGGCGTCTGCCGATTTAGTTGTGTAATTGACAACG
ATCCTCGCACCGAGTTCGGCGAGGTGGATCGCTATGGCTCTTCCGATACCACGAGAAGAG
CCGGTGACTATGGCTACTCTGCCGGCGAGAGGAAGCGATAGCGACTGTGCAGCCATAATA
ACGATTTCTACGAAGAAGCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E959JQ U 1
AF RR4DR43JQ U 1
AF RR4E959TF C 231
BS 1 680 RR4DR43JQ
BS 681 921 RR4E959TF

RD RR4E959JQ 654 0 0
CAG
AATCATTATCTGGTTATTATTGTTATATAACAACACATTTGCAAACATATCATCAGTAAG
CCTCAAAAGAACAGCAAAGAGGCTACTAAAGACCAATCCTTTTACACATATCCACCATTA
ACAGGAATGATCTGACCGTTGATCCATTCACCACCATCGCCAGCCAAGAACCCAACAAGA
GGCACCACATCTTTAACTTCGCCGACTCTCCCAAAAGGATTCCCTGCGGCTATATTCTCC
ACCAACTCTGAGCTCTTTCCTTCAAAGAACATCTCAGTGGCGATGGGTCCCGGAGCTACA
CAGTTTGCAGTGATTCCTGTTCCTTTGAGCTCTTTCGCTAGAATCTTAACCATAGTTTCC
GCAGCTGCCTTTGACGCTGCATATGCACCGAATCCGGGCTTCAAACCTCGGGTCATGGAA
GATGTGAGGAGTATGATCCGACCACCGCCTCCCTTTTTGAGCCTATTGGCAGCTTCTTTG
CTGCAAAGAAACGCCCCTTTTGTATTGACACTGAAAGTGCGATCAAAATCTTCGACTGAT
GTGTTTGCGATGGAAGGGTACTTGGGATCGAGTACTCCCGCCGAGTTAACCAGAATATGA
ACCGGCGACTCGAAGGCGCTCTCCGCCGCATCGAAAAGCGATTTCACCTGG

QA 4 654 4 654
DS 

RD RR4DR43JQ 680 0 0
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AAGCCTCAAAAGAACAGCAAAGAGGCTACTAAAGACCAATCCTTTTACACATATCCACCA
TTAACAGGAATGATCTGACCGTTGATCCATTCACCACCATCGCCAGCCAAGAACCCAACA
AGAGGCACCACATCTTTAACTTCGCCGACTCTCCCAAAAGGATTCCCTGCGGCTATATTC
TCCACCAACTCTGAGCTCTTTCCTTCAAAGAACATCTCAGTGGCGATGGGTCCCGGAGCT
ACACAGTTTGCAGTGATTCCTGTTCCTTTGAGCTCTTTCGCTAGAATCTTAACCATAGTT
TCCGCAGCTGCCTTTGACGCTGCATATGCACCGAATCCGGGCTTCAAACCTCGGGTCATG
GAAGATGTGAGGAGTATGATCCGACCACCGCCTCCCTTTTTGAGCCTATTGGCAGCTTCT
TTGCTGCAAAGAAACGCCCCTTTTGTATTGACACTGAAAGTGCGATCAAAATCTTCGACT
GATGTGTTTGCGATGGAAGGGTACTTGGGATCGAGTACTCCCGCCGAGTTAACCAGAATA
TGAACCGGCGACTCGAAGGCGCTCTCCGCCGCATCGAAAAGCGATTTCACCTGGCTTGCC
TCTGAGACGTTGGCCTGAAC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4E959TF 691 0 0
GGCTATATTCTCCACCAACTCTGAGCTCTTTCCTTCAAAGAACATCTCAGTGGCGATGGG
TCCCGGAGCTACACAGTTTGCAGTGATTCCTGTTCCTTTGAGCTCTTTCGCTAGAATCTT
AACCATAGTTTCCGCAGCTGCCTTTGACGCTGCATATGCACCGAATCCGGGCTTCAAACC
TCGGGTCATGGAAGATGTGAGGAGTATGATCCGACCACCGCCTCCCTTTTTGAGCCTATT
GGCAGCTTCTTTGCTGCAAAGAAACGCCCCTTTTGTATTGACACTGAAAGTGCGATCAAA
ATCTTCGACTGATGTGTTTGCGATGGAAGGGTACTTGGGATCGAGTACTCCCGCCGAGTT
AACCAGAATATGAACCGGCGACTCGAAGGCGCTCTCCGCCGCATCGAAAAGCGATTTCAC
CTGGCTTGCCTCTGAGACGTTGGCCTGAACCACGATCGCTCTCGGTCCATCATTTCCGGG
GGATGGAAGGCCGTTGATCTCCGCCGCGACAATCTCGGCGTCTGCCGATTTAGTTGTGTA
ATTGACAACGATCCTCGCACCGAGTTCGGCGAGGTGGATCGCTATGGCTCTTCCGATACC
ACGAGAAGAGCCGGTGACTATGGCTACTCTGCCGGCGAGAGGAAGCGATAGCGACTGTGC
AGCCATAATAACGATTTCTACGAAGAAGCCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL4337Contig1 800 2 31 U
AGTGAGGAGGACTATATACTAAAATGTTACATACAACAAATATTCCAACGTTTTCCACTA
GATGAGAAAAATAAAAGAGGAGATTACAAGTTAATTGCAAAAGCACAGCTACATAGAAAC
AGAGAAATCAATCAAAGCTACAGAGACTTGATCAAGACCCAACATCAGTTCCAACACTGT
CGAGACGGAAGTCATGAGACCGAGCCAGGTCAACAGCGTCCTGAACCCTAAGCCTGGTTC
CTTGTTGACCAACCACAGTGGCTGCAATCGTGGCAGCCAGCTCTCCCCATCCCATTCAAG
TCAGTGACACCTCTCAAGATACCGTATAAGATCCCTGAAGCGTAAGCGTCTCCAGCACCA
CACGTGTCAACCGGCACGCAAGGTGATGGAGGAATGTATACGGCCTCTCCTTTGGCTCCA
ATGTACGACCCGTTAATTCCATCGGTCACCGAAACAAACGGGACAAAGTGGCTCAAGTAC
CTTGTCGCTGAAATAGGGCTTTCATCTGCCGAAAAGTGACAAAACGCTCTTGCTTCATCA
CTGTTGGCAAATATAATGTCTGCATAGTTGCCCACAATGTCCCAGAAATCATCATAATGC
CTCTCAATGCAAGACACATCTGATGCAGTAACAGCAACAAGCGCTCCATTTCTATGAGCT
TCTTCGCAGGCCTTTGTTATGGTCTTTATAGTATCAGGAAGCTCAAACAAGTAGCCTTCC
ACAACAAAGACATTTGTCTTGGATATCAAACTAGCCAAACAAGAATCATAATTAACCACA
GAAGATGTTCCCTGATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 0 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ63JQ U 16
AF RR4BD06TF C 1
BS 1 17 RR4BD06TF
BS 18 126 RR4CQ63JQ
BS 127 127 RR4BD06TF
BS 128 180 RR4CQ63JQ
BS 181 181 RR4BD06TF
BS 182 287 RR4CQ63JQ
BS 288 288 RR4BD06TF
BS 289 293 RR4CQ63JQ
BS 294 294 RR4BD06TF
BS 295 344 RR4CQ63JQ
BS 345 345 RR4BD06TF
BS 346 392 RR4CQ63JQ
BS 393 393 RR4BD06TF
BS 394 400 RR4CQ63JQ
BS 401 401 RR4BD06TF
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BS 416 416 RR4BD06TF
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BS 504 504 RR4BD06TF
BS 505 509 RR4CQ63JQ
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BS 582 582 RR4BD06TF
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BS 742 753 RR4CQ63JQ
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RD RR4CQ63JQ 738 0 0
AC
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AGGAGATTACAAGTTAATTGCAAAAGCACAGCTACATAGAAACAGAGAA*TCAATCAAAG
CTACAGAGACTTGATCAAGACCCAACATCAGTTCCAACACTGTTGAGACGGAAGTCATGA
GACCGAGCCAGGTCAACAGCGTCCTGAACCCTAAGCCTGGTTCCTTGTTGACCAACCACA
GTGGCTGCAATCGTGGCAGCCAGCTCTCCC*ATCCCTTTCAAGTCAGTGACACCTCTCAA
GATACCGTATAAGATCCCTGAAGCGTAGGCGTCTCCAGCACCACACGTGTCAACCGGCAC
GCAAGGTGATGGAGGGATGTATATGGCCTCTCCTTTGGTTCCAATGTACGACCCGTTAAT
TCCATCGGTCACCGAAACAAACGGGACAAAGTGGCTCAAGTACCTTGTCGCTGAAATAGG
GCTTTCCTCTGCTGAAAAGTGACAAAACGCTCTTGCTTCATCACTGTTGGCAAATATAAT
GTCTGCATAGTTGCCCACAATGTCTCAGAAATCATCATAATGCCTCTCAATGCAAGACAC
ATCTGATGCAGTAACAGCAACAAGGGCTCCATTTCTATGAGCTTCTTCGCAGGCTTTTGT
TATGGTCTTTATAGTATCAGGAAGCTCAAACAAGTAGCCTTCCACAACAAAGACATTTGT
CTTTGATATCAAACTA

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR4BD06TF 800 0 0
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GATGAGAAAAATAAAAGAGGAGATTACAAGTTAATTGCAAAAGCACAGCTACATAGAAAC
AGAGAAATCAATCAAAGCTACAGAGACTTGATCAAGACCCAACATCAGTTCCAACACTGT
CGAGACGGAAGTCATGAGACCGAGCCAGGTCAACAGCGTCCTGAACCCTAAGCCTGGTTC
CTTGTTGACCAACCACAGTGGCTGCAATCGTGGCAGCCAGCTCTCCCCATTGCATTCAAG
TCAGTGACACCTCTCAAGATACCGTATAAGATCCCTGAAGCGTAAGCGTCTCCAGCACCA
CACGTGTCAACCGGCACGCAAGGTGATGGAGGAATGTATACGGCCTCTCCTTTGGCTCCA
ATGTATGACCCGTTGATTCCATCGGTCACCGAAACGAATGGGACAAAGTGGCTCAAGTAC
CTTGTCGCTGAAATAGGGCTTTCATCTGCCGAAAAGTGACAAAACGCTCTTGCTTCATCG
CTGTTGGCAAATATAATGTCTGCATAGTTGCCCACAATGTCCCAGAAATCATCATAATGC
CTCTCAATGCAAGACACATCTGATGCAGTAACAGCGACAAGCGCTCCATTTCTATGCGCT
TCTTCGCAGGCCTTTGTTATGGTCTTTATAGTATCAGGAAGCTCAAACAAGTAGCCTTCC
ACAACAAAGACATTTGTCTTGGATATCAAACTAGCCAAACAAGAATCATAATTAACCACA
GAAGATGTTCCCTGATATGC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

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TCAGACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAAAAGGCAACCGGAAGTGAAATGAGCATAGATTA
TTATACGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGA
TGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGT
TAGGGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATC
CGAACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTC
CGTGCTCACGGTGGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGT
TGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAG
ATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTC
CCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAG
CGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCA
CAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTAC
TTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 

AF RR4FZ42JQ U 1
AF RR4FZ42TF C 10
AF RR4FO95JQ U 68
BS 1 665 RR4FZ42JQ
BS 666 722 RR4FO95JQ
BS 723 726 RR4FZ42TF

RD RR4FZ42JQ 665 0 0
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TCAGACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAAAAGGCAACCGGAAGTGAAATGAGCATAGATTA
TTATACGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGA
TGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGT
TAGGGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATC
CGAACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTC
CGTGCTCACGGTGGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGT
TGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAG
ATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTC
CCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAG
CGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCA
CAGCG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4FZ42TF 717 0 0
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AATCCAAAGAGGATAAAAAA*GGCAACCGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATACGAG
TGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGA
TGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACT
CCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGG
GAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCAC
GGTGGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAA
GGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCT
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TTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACT
TCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGG
AGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTACTTCCCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4FO95JQ 655 0 0
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AGTGTTTTAAAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACT
GATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTA
CTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAA
GGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTC
ACGGTGGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAG
AAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGT
CTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTT
GCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGA
CTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGC
GGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTACTT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 3

CO CL4339Contig1 962 3 7 U
GCGTCGTACACCGCTAAGTCACTCTCGGTCTGCAGAGAAGCTTGTGGAGGACATGGTTAT
GCAGCTGTTAACAGGTTTGGAAGCTTGAGAAACGATCATGACATTTTCCAAACATTTGAA
GGAGACAACACTGTGCTTCTGCAACAGGTGGCAGCTGATTTGCTGAAGCGATACAAAGAG
AAGTTCCAAGGTGGGACATTGACAGCTACGTGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCT
TACTTGTCTCAGCCAAATCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAGGTGAAGATCATCTAAGAGAT
CCTAAATTCCAACTAGATGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGCGTTGCA
ATGAGATTGACGAAACACACCAAGACCCTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTG
AATCATCTCTTGACACTTGCGGAGTTTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATT
GAAGCTGTTCGAAAGTGTCCGGACCGAAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGCATGTGAT
CTTTACGCATTGGAGCGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAACGTGGATTATGTG
GCGCCTAACAAAGCCAAGGCGATTCATAAGTTGACCGAGTATT*GAGTTTTCAAGTAAGG
AATGTGGCCAAGGAACTAGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCGAGCGCCA
ATTGCTAGGCAGTCTGATGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTGAAAAAGG
TGAAAGGAAGAAAAAAAGAAATATCAGATTGAAATAATTAAATCTCCTTCGAGTCTTTTT
GATACGAAGTGAAAATAACAATTTATAGTACGTGTTGTCCCCTTTTTGTTATGTGTTTTG
TGTATTCGTTGCTATTTGTTTTCCACATGGGAATAAAATTCAAGTAAGAAACATTGAACT
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4AD41TF U 1
AF RR4FF64TF U 113
AF RR4FF64JQ C 421
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BS 446 446 RR4FF64TF
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CTTTACGCATTGGAGCGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAACGTGGATTATGTG
GCGCCTAACAAAGCCAAGGCGATTCATAAGTTGACCGAGTATTTGAGTTTTCAAGTAAGG
AATGTGGC

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RD RR4FF64TF 663 0 0
G
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AAGAGATCCTAAATTCCAACTAGATGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAG
CGTTGCAATGAGATTGACGAAACACACCAAGACCCTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAG
ATGCTTGAATCATCTCTTGACACTTGCGGAGTTTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAA
GTTCATTGAAGCTGTTCGAAAGTGTCCGGACCGAAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGC
ATGTGATCTTTACGCATTGGAGCGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAACGTGGA
TTATGTGGCGCCTAACAAAGCCAAGGCGATTCATAAGTTGACCGAGTATT*GAGTTTTCA
AGTAAGGAATGTGGCCAAGGAACTAGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCG
AGCGCCAATTGCTAGGCAGTCTGATGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTG
AA

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4FF64JQ 542 0 0
AATCATCTCTTGACACTTGCGGAGTTTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATT
GAAGCTGTTCGAAAGTGTCCGGACCGAAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGCATGTGAT
CTTTACGCATTGGAGCGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAACGTGGATTATGTG
GCGCCTAACAAAGCCAAGGCGATTCATAAGTTGACCGAGTATT*GAGTTTTCAAGTAAGG
AATGTGGCCAAGGAACTAGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCGAGCGCCA
ATTGCTAGGCAGTCTGATGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTGAAAAAGG
TGAAAGGAAGAAAAAAAGAAATATCAGATTGAAATAATTAAATCTCCTTCGAGTCTTTTT
GATACGAAGTGAAAATAACAATTTATAGTACGTGTTGTCCCCTTTTTGTTATGTGTTTTG
TGTATTCGTTGCTATTTGTTTTCCACATGGGAATAAAATTCAAGTAAGAAACATTGAACT
TC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 3

CO CL4340Contig1 958 3 2 U
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AATCAAAACGATAGAAGAGTACATTAGGTAAAAAAGGGGGAAACAAATGAAGGCAAGTGT
GCAGCACGTGTCAAATGGAGAAGCATCAAAGGGAACACGTAACCAACACGCGTTCTTCAC
AGAAGGAACGGCTACACGACCGCCGGTAAAGCTTCACCACCGTACTCCGTAAGATTTCGC
CTCCACTTCTTTTCTTCTCTCCGTCATTGATCCAATAGCTTAGTACTGATTGCACTGATA
CCTTCCACCTTAAGCCGCGCGCCGAGACCAGACATGACTTCCTTCGCCGTCGATTTTAAA
CTGGGGAAGCTTTAGTCAGATTGAAAACAGACCATTCGTCGGACCGTTTAGAACGCCAAC
TTCTTCTTGATATATTCCAGAATGACTGCAGCAATCCTTTAAACCCAATCACTTTTTCTA
TGAGATGCTTCTTTTACACCATATGTGGCTAATCAATAAAGAAGACTGATTCTCTTGAAA
AGCAATTGAAGTGATACGGTAGAAGAAGATGCTTGATCAGACACCACATAATTAGATTTA
GATCGAGTGGAAAGCAGTTGATACATGAGACAAAACCCGAATAGAATTCGGGTCTTTATT
AGATTTCAAACCCAACCAAAGAAACAGAGTATACATGAAAATCTTGACCTGGTTTTGGGT
TGAAAAACACAACAAAAATTCGCCGAGCGAATTACAAAGTCGCTTATGTGAAGTCTAGAT
CCGCAAACGGAAAAACAAAATCGATCCAAGGATCGAATATATTACATCAAAACAGAGGAG
CTAACCTCGAAACCTTTCCTCTAAAAGATATTATATTAGAGCGGGGAAAGGTCGAGAGAG
AATTCTCTCTCTAGAACAAGAGAGAGAGAAAGCTCCATCAAGTTTTGAGTGTCCGTCC


BQ
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AF RR4A808JQ U 1
AF RR4GT62JQ U 140
AF RR4A808TF C 91
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GCAGCACGTGTCAAATGGAGAAGCATCAAAGGGAACACGTAACCAACACGCGTTCTTCAC
AGAAGGAACGGCTACACGACCGCCGGTAAAGCTTCACCACCGTACTCCGTAAGATTTCGC
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CCTTCCACCTTAAGCCGCGCGCCGAGACCAGACATGACTTCCTTCGCCGTCGATTTTAAA
CTGGGGAAGCTTTAGTCAGATTGAAAACAGACCATTCGTCGGACCGTTTAGAACGCCAAC
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AGCAATTGAAGTGATACGGTAGAAGAAGATGCTTGATCAGACACCACATAATTAGATTTA
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AGATTTCAAACCCAACCAAAGAAACAGAGTATACATGAAAATCTTGACCTGGTTTTGGGT
TGAAAAACACAACAAAAATTCGCCGAGCGAATTACAAAGTCGCTTATGTGAAGTCTAGAT
CCGCAAACGG

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DS 

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CCGCCGGTAAAGCTTCACCACCGTACTCCGTAAGATTTCGCCTCCACTTCTTTTCTTCTC
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CGCCGAGACCAGACATGACTTCCTTCGCCGTCGATTTTAAACTGGGGAAGCTTTAGTCAG
ATTGAAAACAGACCATTCGTCGGACCGTTTAGAACGCCAACTTCTTCTTGATCTATTCCA
GAATGACTGCAGCAATCCTTTAAACCCAATCACTTTTTCTATGAGATGCTTCTTTTACAC
CATATGTGGCTAATCAATAAAGAAGACTGATTCTCTTGAAAAGCAATTGAAGTGATACGG
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TCGCCGAGCGAATTACAAAGTCGCTTATGTGAAGTCTAGATCCGCAAACGG
AAAA

QA 1 651 1 651
DS 

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GGGAACACGTAACCAACACGCGTTCTTCACAGAAGGAACGGCTACACGACCGCCGGTAAA
GCTTCACCACCGTACTCCGTAAGATTTCGCCTCCACTTCTTTTCTTCTCTCCGTCATTGA
TCCAATAGCTTAGTACTGATTGCACTGATACCTTCCACCTTAAGCCGCGCGCCGAGACCA
GACATGACTTCCTTCGCCGTCGATTTTAAACTGGGGAAGCTTTAGTCAGATTGAAAACAG
ACCATTCGTCGGACCGTTTAGAACGCCAACTTCTTCTTGATATATTCCAGAATGACTGCA
GCAATCCTTTAAACCCAATCACTTTTTCTATGAGATGCTTCTTTTACACCATATGTGGCT
AATCAATAAAGAAGACTGATTCTCTTGAAAAGCAATTGAAGTGATACGGTAGAAGAAGAT
GCTTGATCAGACACCACATAATTAGATTTAGATCGAGTGGAAAGCAGTTGATACATGAGA
CAAAACCCGAATAGAATTCGGGTCTTTATTAGATTTCAAACCCAACCAAAGAAACAGAGT
ATACATGAAAATCTTGACCTGGTTTTGGGTTGAAAAACACAACAAAAATTCGCCGAGCGA
ATTACAAAGTCGCTTATGTGAAGTCTAGATCCGCAAACGGAAAAACAAAATCGATCCAAG
GATCGAATATATTACATCAAAACAGAGGAGCTAACCTCGAAACCTTTCCTCTAAAAGATA
TTATATTAGAGCGGGGAAAGGTCGAGAGAGAATTCTCTCTCTAGAACAAGAGAGAGAGAA
AGCTCCATCAAGTTTTGAGTGTCCGTCC

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 2

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GGATCTCCGCCTCACTCATTAGCTCCCTCCCACGGAAACACGCACACCTGATCCGATTAT
CAGAAGCACCAAAGCTAGCTGGTATATATATCTCCGAGTCTGAGCAATGGCTTTGGTGAT
GTACTCGTACAAGGGAAACAAAAACTCTGACAAGGCATTCATTGCCGCAGAGTTCACTGG
TGTCAAGATCGATATGCCTTCTGGCTTTGAGATGGGCGTCACCAACAAAACCCCCGAGTT
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TGAGAGCAATGCCATTGCCCGTTATGTAAGCAGATTGAACGGTGACAACTCCTTGAACGG
CTCCTCCCTCATCGAATCTGCACATGTTGATCAATGGATCGATTTCTCCACAATGGAGAT
TTATGGAAACATCTTCAACTGGTTCGTCCCAAGAATGGGCTTTATGCCATACAGTGTTCC
TAGTGAGGAAGCTGCTATCGCTGCTTTGAAAAGAGGACTCGACGCTTTGAACACTCATCT
CACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTGTTACCCTCGCTGATATCATCACCGTCTG
CAACTTGAACCTGGGATTTTCCACTGTCATGACCAAGAGCTTCACCTCTGCGTCCCCTCA
CGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATCAACCAGCCAAACTTCAAGAAGGT


BQ
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AF RR4D518TF U 1
AF RR4EW72TF U 1
BS 1 563 RR4D518TF
BS 564 564 RR4EW72TF
BS 565 653 RR4D518TF
BS 654 654 RR4EW72TF
BS 655 656 RR4D518TF
BS 657 657 RR4EW72TF
BS 658 659 RR4D518TF
BS 660 660 RR4EW72TF
BS 661 701 RR4D518TF
BS 702 711 RR4EW72TF

RD RR4D518TF 701 0 0
GGATCTCCGCCTCACTCATTAGCTCCCTCCCACGGAAACACGCACACCTGATCCGATTAT
CAGAAGCACCAAAGCTAGCTGGTATATATATCTCCGAGTCTGAGCAATGGCTTTGGTGAT
GTACTCGTACAAGGGAAACAAAAACTCTGACAAGGCATTCATTGCCGCAGAGTTCACTGG
TGTCAAGATCGATATGCCTTCTGGCTTTGAGATGGGCGTCACCAACAAAACCCCCGAGTT
CCTCAAGATGAACCCTTTGGGAAAGATTCCTGTACTTGAGACTCCTGAGGGTCCTATCTT
TGAGAGCAATGCCATTGCCCGTTATGTAAGCAGATTGAACGGTGACAACTCCTTGAACGG
CTCCTCCCTCATCGAATCTGCACATGTTGATCAATGGATCGATTTCTCCACAATGGAGAT
TTATGGAAACATCTTCAACTGGTTCGTCCCAAGAATGGGCTTTATGCCATACAGTGTTCC
TAGTGAGGAAGCTGCTATCGCTGCTTTGAAAAGAGGACTCGACGCTTTGAACACTCATCT
CACTTCCAACACTTACCTTGTTGTACACTCTGTTACCCTCGCTGATATCATCACCGTCTG
CAACTTGAACCTGGGATTTTCCACTGTCATGACCAAGAGCTTCACCTCTGCGTTCC*TCG
CGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATCAACCAGCCAAACT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4EW72TF 711 0 0
GGATCTCCGCCTCACTCATTAGCTCCCTCCCACGGAAACACGCACACCTGATCCGATTAT
CAGAAGCACCAAAGCTAGCTGGTATATATATCTCCGAGTCTGAGCAATGGCTTTGGTGAT
GTATTCGTACAAGGGAAACAAAAACTCTGACAAGGCATTCATTGCCGCAGAGTTCACTGG
TGTCAAGATCGATATGCCTTCTGGCTTTGAGATGGGCGTCACCAACAAAACCCCCGAGTT
CCTCAAGATGAACCCTTTGGGAAAGATTCCTGTACTTGAGACTCCTGAGGGTCCTATCTT
TGAGAGCAATGCCATTGCCCGTTATGTAAGCAGATTGAACGGTGACAACTCCTTGAACGG
CTCCTCCCTCATCGAATCTGCACATGTTGATCAATGGATCGATTTCTCCACAATGGAGAT
TTATGGAAACATCTTCAACTGGTTCGTCCCAAGAATGGGCTTTATGCCATACAGTGTTCC
TAGTGAGGAAGCTGCTATCGCTGCTTTGAAAAGAGGACTCGACGCTTTGAACACTCATCT
CACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTGTTACCCTCGCTGATATCATCACCGTCTG
CAACTTGAACCTGGGATTTTCCACTGTCATGACCAAGAGCTTCACCTCTGCGTCCCCTCA
CGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATCAACCAGCCAAACTTCAAGAAGGT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL4342Contig1 1040 2 2 U
GGATCTACGTTCTTGGCAATGATTTGCGGCTTCAACTTGTAAAGCTACGGAGCATAGAAT
GGTGAAGCGGCGGAGATAGAGATCTGTATTGTTCTCTTTACATCTCCGTAGCTTCTTCAT
TCGTTCCTTCATTCTCTCGTTGAACAAATTCGGCTAATCGAGTTAAAAAAAATGGAGAAT
CTCGCAAGTGATGATGATCCTGGATTGATTGATTCGGGTGTGTATCTGAGGCTAGGGCTT
CTTATTTCAGAGAAGGGCAACAAGCGTCTGCAGAAGCAGCAGCCACCCGCACTTCTCTCA
CGTCTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATGTCCTCGTCTCCCCCAGAGTCTGCTGCTGTG
ACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCCGAGATCACCATTTCAGACTACTTGAATCGC
ATTTTCAACTACTCTCGCTGCAGCCCTTCTTGCTTCGTCGTCGCCTACATCTACATTCAT
CAGTTTCTCCACCTCACCCGGTCTCACCTCACCCCTCTTAATGTCCACCGCCTTCTCGTT
ACTAGTGTCATGTTAGCTGCCAAAGTCTTCGATGACAGGTATTACAACAATGCTTACTAC
GCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAGCTCAACAGATTGGAGATGAAGCTCTTGTTC
GCCCTTGATTTCAAGCTTCAGGTTGATCCTCACACCTTTCACTCCCACTGTTGTCATTTA
GAGGAACCAACAGCAGGGACGACGACGGCTTCCACATCGAGTGGCCTATAAAAGAAGCAT
GCCGACTCAACAAAGAGTCTTGGCGTAAGGCCACACCAGAGTCTGTCTGCTCTCAAACCA
CTGCACGCTGATCAGCGAGGATTTCATTCGTGTGGCAACTGTAAGAATAGGGTTTTTTGG
TAGTGTGATCGATCATTTTTTTGCACAATTTGATTCTTGTGAGCAGGCAAAATTCACAAT
AGTACGTTTTAAGAGGTTTGTTTATTTTGTAGCTTCCAATCGATGCTTAAAACTAATATA
AATTTCCCATTTTTAACATC


BQ
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AF RR4GX68TF U 1
AF RR4FX79JQ C 574
BS 1 679 RR4GX68TF
BS 680 1040 RR4FX79JQ

RD RR4GX68TF 679 0 0
GGATCTACGTTCTTGGCAATGATTTGCGGCTTCAACTTGTAAAGCTACGGAGCATAGAAT
GGTGAAGCGGCGGAGATAGAGATCTGTATTGTTCTCTTTACATCTCCGTAGCTTCTTCAT
TCGTTCCTTCATTCTCTCGTTGAACAAATTCGGCTAATCGAGTTAAAAAAAATGGAGAAT
CTCGCAAGTGATGATGATCCTGGATTGATTGATTCGGGTGTGTATCTGAGGCTAGGGCTT
CTTATTTCAGAGAAGGGCAACAAGCGTCTGCAGAAGCAGCAGCCACCCGCACTTCTCTCA
CGTCTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATGTCCTCGTCTCCCCCAGAGTCTGCTGCTGTG
ACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCCGAGATCACCATTTCAGACTACTTGAATCGC
ATTTTCAACTACTCTCGCTGCAGCCCTTCTTGCTTCGTCGTCGCCTACATCTACATTCAT
CAGTTTCTCCACCTCACCCGGTCTCACCTCACCCCTCTTAATGTCCACCGCCTTCTCGTT
ACTAGTGTCATGTTAGCTGCCAAAGTCTTCGATGACAGGTATTACAACAATGCTTACTAC
GCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAGCTCAACAGATTGGAGATGAAGCTCTTGTTC
GCCCTTGATTTCAAGCTTC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4FX79JQ 467 0 0
GACAGGTATTACAACAATGCTTACTACGCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAGCTC
AACAGATTGGAGATGAAGCTCTTGTTCGCCCTTGATTTCAAGCTTCAGGTTGATCCTCAC
ACCTTTCACTCCCACTGTTGTCATTTAGAGGAACCAACAGCAGGGACGACGACGGCTTCC
ACATCGAGTGGCCTATAAAAGAAGCATGCCGACTCAACAAAGAGTCTTGGCGTAAGGCCA
CACCAGAGTCTGTCTGCTCTCAAACCACTGCACGCTGATCAGCGAGGATTTCATTCGTGT
GGCAACTGTAAGAATAGGGTTTTTTGGTAGTGTGATCGATCATTTTTTTGCACAATTTGA
TTCTTGTGAGCAGGCAAAATTCACAATAGTACGTTTTAAGAGGTTTGTTTATTTTGTAGC
TTCCAATCGATGCTTAAAACTAATATAAATTTCCCATTTTTAACATC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL4343Contig1 1465 2 2 U
AGGGAGCTGAGTGCGGAGGAAGAGGAAGACGATACACTTGTTTCCCGCCACTTCTCCATT
GCCTTCTCCAATCTCCTCCGGTGGTGGGAAACATGTTGTGGGTCGACAAGTACAGGCCGA
AATCGCTCGATAAGGTCATCGTTCACGAAGAGATCGCTCAAAATCTCAAGAAATTGGTAA
TGGAGCAAGATTGTCCACATTTGCTATTCTATGGACCGTCAGGTTCGGGTAAGAAAACCC
TAATCATGGCGCTTCTCAAGCAGATATATGGTCCCAGTGCTGACAAGGTGAAAGTGGAGA
ACAGGGCATGGAAGGTCGATGCTGGGAGTAGAACTATTGATCTGGAGCTCACTACATTAT
CAAGCACCAATCATGTGGAACTGACCCCAAGTGATGCAGGCTTTCAGGACAGATACATCG
TTCAGGAGATCATTAAAGAAATGGCCAAGAACATACCTATTGACACCAAAGGAAAGAAGG
GATACAAGGTGTTGGTACTAAATGAAGTTGACAAGCTGTCACGAGAAGCTCAACACTCTC
TGCGGAGAACAATGGAGAAATATAGCTCATCATGCCGTCTCATCTTATGCTGTAACAGTT
CTTCAAAGGTTACAGAAGCCATCAAATCTCGTTGTCTCAATGTCCGGATTAATGCACCTT
CCCAGGAAGAGATAGTGAAAGTGTTGGAGTTCGTTGCGAAGAAAGAAACTCTGCAACTGC
CACACGGTTTTGCTGCTCGTATTGCTGAAAAATCAAACCGCAGTCTTAGAAGAGCTGTTT
TGTCACTTGAGACCTGTCGTGTCCAAAACTATCCTTTCGCAGATAACCAAGTGATATCTC
CAATGGATTGGGAAGAGTATGTTGCTGAAATATCAACTGACATGTTGAAGGAACAGAGCC
CTAAAAGTTTGTTTCAGGTGCGTGGGAAGGTATATGAGTTGCTAGTTAATTGTATTCCAC
CTGAAGTCATACTGAAGAGACTTCTTCATGAGCTGCTGAAGAAACTGGACTCAGAGCTGA
AGCTTGAAGTCTGCCACTGGGCCGCATATTATGAACGTCGGATGAGATTAGGACAGAAAG
CCATATTTCACATTGAAGCATTTGTGGCCAAGTTTATGAGCATATACAAAAGCTTCCTCA
TTTCAACATTTGGGTAGACAAGGAAGGAAGGAATGCTCCAAATCCAGGCAAAGAGGACAG
TCTTTGATGTTTATACTGTGTTCTGTCTCCTTCTGTTTGCTGTGTTTCCCTTAACATTCC
AATCACTCTCCTCGTCTAGCTAGAAAAGTAGAATCCTTTATCAACTCAACTCGTGTGCAA
GCCTTTTCCTTTCTTTTCTATCCCTTTTTGATAAAAAGAAGGACAAACCCAAGTTTTACT
GTCTTTGTTAAAGAGTTGTGATGTTAAACACCAAAAGCCAGTAATGTATTTTTTTAATCT
GAAAAAAAAACGACGCACAATTGAC


BQ
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AF RR4A833TF U 1
AF RR4A833JQ C 661
BS 1 863 RR4A833TF
BS 864 1465 RR4A833JQ

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TGCGGAGAACAATGGAGAAATATAGCTCATCATGCCGTCTCATCTTATGCTGTAACAGTT
CTTCAAAGGTTACAGAAGCCATCAAATCTCGTTGTCTCAATGTCCGGATTAATGCACCTT
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CACACGGTTTTGCTGCTCGTATTGCTGAAAAATCAAACCGCAGTCTTAGAAGAGCTGTTT
TGTCACTTGAGACCTGTCGTGTCCAAAACTATCCTTTCGCAGATAACCAAGTGATATCTC
CAATGGATTGGGAAGAGTATGTT

QA 1 863 1 863
DS 

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CCCAGG
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ATTGGGAAGAGTATGTTGCTGAAATATCAACTGACATGTTGAAGGAACAGAGCCCTAAAA
GTTTGTTTCAGGTGCGTGGGAAGGTATATGAGTTGCTAGTTAATTGTATTCCACCTGAAG
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AAGTCTGCCACTGGGCCGCATATTATGAACGTCGGATGAGATTAGGACAGAAAGCCATAT
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CATTTGGGTAGACAAGGAAGGAAGGAATGCTCCAAATCCAGGCAAAGAGGACAGTCTTTG
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GTTAAAGAGTTGTGATGTTAAACACCAAAAGCCAGTAATGTATTTTTTTAATCTGAAAAA
AAAACGACGCACAATTGAC

QA 7 805 7 805
DS 



AS 1 2

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GATCTGCAAGTAAGCAAAGTTCAAAG


BQ
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GAACAGACTGTTCCTGATAGAATTGGTAAACCATGTATCATCCTTTTGAAAGACTATGTA
ATGAATATTATCAGCAAAGCTG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4A712JQ 764 0 0
ATTCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACTTCGTTCATATTACCCTCTTTCGTCAGTCCTACCT
CGTCTACCAGACAGAAAGTCTCTCTGCTTCCATCTTCTTCTTCGTCTACTCATGGCGGCA
TTGGCTCCTGCGTCTTAGCAAACCCTCCATCTCGTTTACGAAGAAGGTCTTGGCAGCTCC
CGAGACCCTAACTCCAGAAACCCTCGAAGAACCCGCCTCTGATGACTTCTCCGAGGTTCC
GAGCTCTTCCTCAATAAGTGTAGACGCAGATAAGATGGCGCCAAAGCAAAAGATTAGGAT
AAAGCTTAGATCATACTGGGTGCCTCTCATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACTCGACGC
TGCCAGGAACACCAATGCCAAGACGATGGGTCCTGTTCCCTTGCCAACCAAGAAGCGTAT
CTACTGTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTCCACAAGGATGCAAGGTTCCATTTTGAGATCAG
GACCCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCGACTGCTCAGACCATCGACTCCTTGAT
GCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTGGAAGAAGCTCTGAAACTTCAATGAGGCGA
CGGGCCCTTGCATTGCATGAACAGACTGTTCCTGATAGAATTGGTAAACCATGTATCATC
CTTTTGAAAGACTATGTAATGAATATTATCAGCAAAGCTGGACTCTTTTAGACAATCTTT
GTTCTTAGTTAATGGACAGATCTGCAAGTAAGCAAAGTTCAAAG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4345Contig1 961 2 2 U
GGGCTTCACCGTTCGCTCCTCACTGCTCCTTCGTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCATTTCC
TCTCGAATTCTCGTCTCCGTTAAGGTTTCCACAAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCACTA
AGTATTGGGGGAAAGAGATGAGCTTTACTCAGGCCAATTGTTTTAGACCATCCTACCACT
CTCCTGTGACGACGAGGATACCTAAAGCTAACGGTGTTTCCACCAGTGTACCTGTTAGAG
CAACTGCTTCGGTGTCTACTCTGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACCGGCGTAGTGGGAAAT
GGAAGCAGAGTTCTGCTGTTTGCTTGTTTGGTGGAAAAGATAAGTCTAATGGTGGTGGTG
ACGAGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCGGTTGAAGATA
TGTTGCGGGAGCAGATTCAAAAGAAAGACTTTTATGATACTGACAGCAGCGGAAACGTTC
CTCCACGTGGAGGAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGATCAGGAGGAG
AAGAAGACGGTGGTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCT
TAGGCTTCATCTTTTTGTACACTTACATTATTAATGGGGGAGGAGTTGATCAATCTTGCA
AGAGATTACTTTAGGTTTCTCTCGGGGAAACCTAAGACCGTTCGGTTGACACGAGCCTTG
GATGGTTGGAATAGATTCATGGCGACGATGTCGAAGCCCAAAGAGTATGATGAGTACTGG
CTAGAGAAAGCGATCATCAACACACCTACCTGGTACGACAGTCCAGAGAAGTACAAACAA
GTGCTCAAGGCTTATGTCGACTCAAAGACTGATGAACAGTTCGATTAAACCCTTTGCAGT
TTCACTTTTGTTACTCAGTGCTTGAAGAGATTCTTATATTCATCTTAAGGCTTTTTTAAT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4B571TF U 1
AF RR4B571JQ C 177
BS 1 845 RR4B571TF
BS 846 961 RR4B571JQ

RD RR4B571TF 845 0 0
GGGCTTCACCGTTCGCTCCTCACTGCTCCTTCGTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCATTTCC
TCTCGAATTCTCGTCTCCGTTAAGGTTTCCACAAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCACTA
AGTATTGGGGGAAAGAGATGAGCTTTACTCAGGCCAATTGTTTTAGACCATCCTACCACT
CTCCTGTGACGACGAGGATACCTAAAGCTAACGGTGTTTCCACCAGTGTACCTGTTAGAG
CAACTGCTTCGGTGTCTACTCTGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACCGGCGTAGTGGGAAAT
GGAAGCAGAGTTCTGCTGTTTGCTTGTTTGGTGGAAAAGATAAGTCTAATGGTGGTGGTG
ACGAGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCGGTTGAAGATA
TGTTGCGGGAGCAGATTCAAAAGAAAGACTTTTATGATACTGACAGCAGCGGAAACGTTC
CTCCACGTGGAGGAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGATCAGGAGGAG
AAGAAGACGGTGGTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCT
TAGGCTTCATCTTTTTGTACACTTACATTATTAATGGGGGAGGAGTTGATCAATCTTGCA
AGAGATTACTTTAGGTTTCTCTCGGGGAAACCTAAGACCGTTCGGTTGACACGAGCCTTG
GATGGTTGGAATAGATTCATGGCGACGATGTCGAAGCCCAAAGAGTATGATGAGTACTGG
CTAGAGAAAGCGATCATCAACACACCTACCTGGTACGACAGTCCAGAGAAGTACAAACAA
GTGCT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4B571JQ 785 0 0
CACTCTCCTGTGACGACGAGGATACCTAAAGCTAACGGTGTTTCCACCAGTGTACCTGTT
AGAGCAACTGCTTCGGTGTCTACTCTGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACCGGCGTAGTGGG
AAATGGAAGCAGAGTTCTGCTGTTTGCTTGTTTGGTGGAAAAGATAAGTCTAATGGTGGT
GGTGACGAGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCGGTTGAA
GATATGTTGCGGGAGCAGATTCAAAAGAAAGACTTTTATGATACTGACAGCAGCGGAAAC
GTTCCTCCACGTGGAGGAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGATCAGGA
GGAGAAGAAGACGGTGGTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCC
ACCTTAGGCTTCATCTTTTTGTACACTTACATTATTAATGGGG*AGGAGTTGATCAATCT
TGCAAGAGATTACTTTAGGTTTCTCTCGGGGAAACCTAAGACCGTTCGGTTGACACGAGC
CTTGGATGGTTGGAATAGATTCATGGCGACGATGTCGAAGCCCAAAGAGTATGATGAGTA
CTGGCTAGAGAAGGCGATCATCAACACACCTACCTGGTACGACAGTCCAGAGAAGTACAA
ACAAGTGCTCAAGGCTTATGTCGACTCAAAGACTGATGAACAGTTCGATTAAACCCTTTG
CAGTTTCACTTTTGTTACTCAGTGCTTGAAGAGATTCTTATATTCATCTTAAGGCTTTTT
TAATG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL4346Contig1 934 3 7 U
GCATAGACTCAGATACCAATCTGAAAATTACTGTCAAGCGGATAATTGCAGGCAAATGGG
GTTGCAACAATGGACAGTCATGTATTTCTCCAGACTACATCCTGACGACAAAAGAATTTT
CTCCAAAAGTGGTTGATGCAATGAAGCAAGAACTGGAGGCATTTTATGGGAAGAACCCTA
TGGAGTCTAAAGATATGTCACGAATTGTAAACTCGAATCACTTTGATCGCCTGTCTAAGA
TGTTAGAGGAGAATGAAGTTTCTGACAAAATCGTCTATGGGGGTCAAAAGAACAGAGACA
AGCTGAAAATTGCTCCAACAATCTTGGTCGACGTGCCATTAGATTCTCAGATCATGAGTG
AAGAAATATTTGGCCCTCTCCTTCCAATCATCACGCTCAACAACATGGAAGAGATTTTTG
ACGTGATCCGTTCTCGACCTAAGCCGCTTGCTGCATATTTGTTTACCCAAAACCAGAAGC
TGAAAGAGAGATTTGCCATGACAGTTTCTGCTGGAGGCATAGTGTTCAACGACATAGCTG
TTCATCTTGCAGTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAGTTGGTGAAAGTGGAATGGGTTCTT
ACCATGGTAAGTTCTCATTTGATGCTTTTAGTCACAAGAAGGCTGTTCTCTACAAAAGCT
TTATAGGTGATGCAGCAATCAGGTATCCACCCTACTCCACAGGAAAGCTTAGACTGTTAA
AGGCTCTTGTCAATAGCAATATAGTGGAAATATTCAGAGTCCTTTTAGGTTTGTCTTAAA
AGGTTAAAGATTAAAGGACTACTACTGCACACACACACATTCCCCTTTGTATCTTACTTT
CTTGGTTTTCCTGATATGGAATTTGGTTTGTTACATATGTTTTTGGTGTTGATGAATATT
GAAAGTCTATAAATAAAAGTGGTTTCTTCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AS48TF U 1
AF RR4AS48JQ C 130
AF RR4BQ43TF U 371
BS 1 768 RR4AS48TF
BS 769 769 RR4BQ43TF
BS 770 784 RR4AS48TF
BS 785 785 RR4BQ43TF
BS 786 842 RR4AS48TF
BS 843 932 RR4BQ43TF
BS 933 934 RR4AS48JQ

RD RR4AS48TF 842 0 0
GCATAGACTCAGATACCAATCTGAAAATTACTGTCAAGCGGATAATTGCAGGCAAATGGG
GTTGCAACAATGGACAGTCATGTATTTCTCCAGACTACATCCTGACGACAAAAGAATTTT
CTCCAAAAGTGGTTGATGCAATGAAGCAAGAACTGGAGGCATTTTATGGGAAGAACCCTA
TGGAGTCTAAAGATATGTCACGAATTGTAAACTCGAATCACTTTGATCGCCTGTCTAAGA
TGTTAGAGGAGAATGAAGTTTCTGACAAAATCGTCTATGGGGGTCAAAAGAACAGAGACA
AGCTGAAAATTGCTCCAACAATCTTGGTCGACGTGCCATTAGATTCTCAGATCATGAGTG
AAGAAATATTTGGCCCTCTCCTTCCAATCATCACGCTCAACAACATGGAAGAGATTTTTG
ACGTGATCCGTTCTCGACCTAAGCCGCTTGCTGCATATTTGTTTACCCAAAACCAGAAGC
TGAAAGAGAGATTTGCCATGACAGTTTCTGCTGGAGGCATAGTGTTCAACGACATAGCTG
TTCATCTTGCAGTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAGTTGGTGAAAGTGGAATGGGTTCTT
ACCATGGTAAGTTCTCATTTGATGCTTTTAGTCACAAGAAGGCTGTTCTCTACAAAAGCT
TTATAGGTGATGCAGCAATCAGGTATCCACCCTACTCCACAGGAAAGCTTAGACTGTTAA
AGGCTCTTGTCAATAGCAATATAGTGGAAATATTCAGAGTCCTTTTAG*TTTGTCTTAAA
AGGT*AAAGATTAAAGGACTACTACTGCACACACACACATTCCCCTTTGTATCTTACTTT
CT

QA 1 842 1 842
DS 

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TGGTTGATGCAATGAAGCAAGAACTGGAGGCATTTTATGGGAAGAACCCTATGGAGTCTA
AAGATATGTCACGAATTGTAAACTCGAATCACTTTGATCGCCTGTCTAAGATGTTAGAGG
AGAATGAAGTTTCTGACAAAATCGTCTATGGGGGTCAAAAGAACAGAGACAAGCTGAAAA
TTGCTCCAACAATCTTGGTCGACGTGCCATTAGATTCTCAGATCATGAGTGAAGAAATAT
TTGGCCCTCTCCTTCCAATCATCACGCTCAACAACATGGAAGAGATTTTTGACGTGATCC
GTTCTCGACCTAAGCCGCTTGCTGCATATTTGTTTACCCAAAACCAGAAGCTGAAAGAGA
GATTTGCCATGACAGTTTCTGCTGGAGGCATAGTGTTCAACGACATAGCTGTTCATCTTG
CAGTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAGTTGGTGAAAGTGGAATGGGTTCTTACCATGGTA
AGTTCTCATTTGATGCTTTTAGTCACAAGAAGGCTGTTCTCTACAAAAGCTTTATAGGTG
ATGCAGCAATCAGGTATCCACCCTACTCCACAGGAAAGCTTAGACTGTTAAAGGCTCTTG
TCAATAGCAATATAGTGGAAATATTCAGAGTCCTTTTAGGTTTGTCTTAAAAGGTTAAAG
ATTAAAGGACTACTACTGCACACACACACATTCCCCTTTGTATCTTACTTTCTTGGTTTT
CCTGATATGGAATTTGGTTTGTTATATATGTTTTTGGTGTTGATGAATATTGAAAGTCTA
TAAATAAAAGTGGTTTCTTCGTTTC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4BQ43TF 562 0 0
G
GGCCCTCTCCTTCCAATCATCACGCTCAACAACATGGAAGAGATTTTTGACGTGATTCGT
TCTCGACCTAAGCCACTTGCTGCATATTTGTTTACCCAAAACCAGAAGCTGAAAGAGAGA
TTTGCCATGACAGTTTCTGCTGGAGGCATAGTGTTCAACGACATAGCTGTTCATCTTGCA
GTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAGTTGGTGAAAGTGGAATGGGTTCTTACCATGGTAAG
TTCTCATTTGATGCTTTTAGTCACAAGAAGGCTGTTCTCTACAAAAGCTTTATAGGTGAT
GCAGCAATCAGGTATCCACCCTACTCCACAGGAAAGCTTAGACTGTTAAAGGCCCTTGTC
GATAGCAATATAGTGGAAATATTCAGAGTCCTTTTAGGTTTGTCTTAAAAGGTTGAAGAT
TAAAGGACTACTACTGCACACACACA**TTCCCCTTTGTATCTTACTTTCTTGGTTTTCC
TGATATGGAATTTGGTTTGTTACATATGTTTTTGGTGTTGATGAATATTGAAAGTCTATA
AATAAAAGTGGTTTCTTCGTT

QA 2 562 2 562
DS 



AS 1 3

CO CL4347Contig1 889 3 6 U
GGAAAACAGGCTACATCGTGTCCGATTCTGAAAGAACTCGCTCCTTTCTCTCCACACCGT
CTTCTTCTCCGATCAATCTCTCATCGACCAGATCGAATTTCCACCCGTCTATCTATCACT
CCTCCTCGTCGTCTGATTTTGCAAGATGAGCATGAAGGCTACGATCCTAATATTAGGGCT
CGTATGGAGCTTCCAGGCAGCGTTAGGGATTAGATTCGTCATAGACAGAGAAGAATGTTT
CTCCCACAAGGCTGAGTACGAAGGCGATACCCTTCATGTCTCGTTCGTCGTCATCAAGTC
TGATTCTCAATGGCATTTTAACGAGGATGGTGTAGATCTTGTGATACACGGGCCAACAGG
GGAACAGATTCATGACTTCAGGGAGCAGATAAGTGCCAAGCACGACTTTGTTGTCCAAAA
GAAAGGGGTTTACCGTTTCTGTTTCACTAACAAGTCTCCTTATCATGAAACCATTGACTT
CGATGTACAGCTTGGTCACTTTGCATACTACGACCAGCACGCAAAGGACGAGCATTTCAC
TCCCTTGATGGAGCAAATATCAAAGTTAGAGGAGGCTCTTTACAACATCCAGTTCGAGCA
ACACTGGTTAGAGGCTCAGACCGATCGTCAAGCTATCGTGAACGAGAACATGAGCAAAAG
AGCAGTACACAAAGCGTTGTTCGAGTCGTTTGCATTGATCGGTGCAAGTGTCCTCCAAGT
TTACCTTCTGCGTCGCTTGTTTGAACGCAAACTCGGCATGTCTCGTGTCTAAATTAGTAT
TTTCCTCCTAAGTTACCATATAATATTTACTTACCTTTCTTTACATGTAGTTCATTGGAT
GATTTTGCGTTTTTTCATGTTCAAGAAATTATCCACTCGTGTTTGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ20TF U 1
AF RR4FU54TF U 38
AF RR4DQ20JQ C 305
BS 1 658 RR4DQ20TF
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BS 660 744 RR4DQ20TF
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BS 746 771 RR4DQ20TF
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RD RR4DQ20TF 771 0 0
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CTTCTTCTCCGATCAATCTCTCATCGACCAGATCGAATTTCCACCCGTCTATCTATCACT
CCTCCTCGTCGTCTGATTTTGCAAGATGAGCATGAAGGCTACGATCCTAATATTAGGGCT
CGTATGGAGCTTCCAGGCAGCGTTAGGGATTAGATTCGTCATAGACAGAGAAGAATGTTT
CTCCCACAAGGCTGAGTACGAAGGCGATACCCTTCATGTCTCGTTCGTCGTCATCAAGTC
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GGAACAGATTCATGACTTCAGGGAGCAGATAAGTGCCAAGCACGACTTTGTTGTCCAAAA
GAAAGGGGTTTACCGTTTCTGTTTCACTAACAAGTCTCCTTATCATGAAACCATTGACTT
CGATGTACAGCTTGGTCACTTTGCATACTACGACCAGCACGCAAAGGACGAGCATTTCAC
TCCCTTGATGGAGCAAATATCAAAGTTAGAGGAGGCTCTTTACAACATCCAGTTCGAGCA
ACACTGGTTAGAGGCTCAGACCGATCGTCAAGCTATCGTGAACGAGAACATGAGCAAA*G
AGCAGTACACAAAGCGTTGTTCGAGTCGTTTGCATTGATCGGTGCAAGTGTCCTCCAAGT
TTACCTTCTGCGTCGCTTGTTTGA*CGCAAACTCGGCATGTCTCGTGTCTA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4FU54TF 713 0 0
GG
GCTCCTTTCTCTCCACACCGTCTTCTTCTCCGATCGATCTCTCATCGACCAGATCGAATT
TCCACCCGTCTATCTATCACTCCTCCTCGTCGTCTGATTTTGCAAGATGAGCATGAAGGC
TACGATCCTAATATTAGGGCTCGTATGGAGCTTCCAGGCAGCGTTAGGGATTAGATTCGT
CATAGACAGAGAAGAATGTTTCTCCCACAAGGCTGAGTACGAAGGCGATACCCTTCATGT
CTCGTTCGTCGTCATCAAGTCTGATTCTCAATGGCATTTTAACGAGGATGGTGTAGACCT
TGTGATACACGGGCCAACAGGGGAACAGATTCATGACTTCAGGGAGCAGATAAGTGCCAA
GCACGACTTTGTTGTCCAAAAGAAAGGGGTTTACCGTTTCTGTTTCACTAACAAGTCTCC
TTATCATGAAACCATTGACTTCGATGTACAGCTTGGTCACTTTGCATACTACGACCAGCA
CGCAAAGGACGAGCATTTCACTCCCTTGATGGAGCAAATATCAAAGTTAGAGGAGGCTCT
TTACAACATCCAGTTCGAGCAACACTGGTTTGAGGCTCAGACCGATCGTCAAGCTATCGT
GAACGAGAACATGAGCAAAAGAGCAGTACACAAAGCGTTGTTCGAGTCGTTTGCATTGAT
CGGTGCAAGTGTCCTCCAAGTT*ACCTTCTGCGTCGCTTGTTTGA
CGCAAA

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR4DQ20JQ 585 0 0
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CAGATTCATGACTTCAGGGAGCAGATAAGTGCCAAGCACGACTTTGTTGTCCAAAAGAAA
GGGGTTTACCGTTTCTGTTTCACTAACAAGTCTCCTTATCATGAAACCATTGACTTCGAT
GTACAGCTTGGTCACTTTGCATACTACGACCAGCACGCAAAGGACGAGCATTTCACTCCC
TTGATGGAGCAAATATCAAAGTTAGAGGAGGCTCTTTACAACATCCAGTTCGAGCAACAC
TGGTTAGAGGCTCAGACCGATCGTCAAGCTATCGTGAACGAGAACATGAGCAAAAGAGCA
GTACACAAAGCGTTGTTCGAGTCGTTTGCATTGATCGGTGCAAGTGTCCTCCAAGTTTAC
CTTCTGCGTCGCTTGTTTGAACGCAAACTCGGCATGTCTCGTGTCTAAATTAGTATTTTC
CTCCTAAGTTACCATATAATATTTACTTACCTTTCTTTACATGTAGTTCATTGGATGATT
TTGCGTTTTTTCATGTTCAAGAAATTATCCACTCGTGTTTGTGAC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL4348Contig1 742 2 2 U
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TAGAAGCTCTTGAGAGCCTCACAGGACAAGTTAGTAACCGGAGATCTAGGAGATGGTTAA
ATGATCGTATTCTGATGGAGCTTGTTCCTCGTTTAGATGCCCAGGAAATCAGAGGCTTGT
TTGCCCCACCTCCATGGGGTGATGATGTTCCTCCCTCTGCCTTTTCTTTGACTAATGTTG
GGGAATGGGACAGATTCAGAAACATTGACATGGACAAGGAGGCCAATATCATGGACTCCT
TGAACCAGTCATCCGTAAGGCAGAAAGGTCATGTGGATGCTGATAAAACTGCTGTTTTAA
CCGCTTGGCGAAGAATAGAGTGTAGAACTAGAGAGGCTCTTCGGCGCAGCTTTTTACCTG
ACCTCATCGAGGGCTATGAGAACTGTATAAGTCATTTCATTGAGGAAGGCGGTGAAGGAG
CTTGGTAACATCATCACATAGACAAACACACTCCTTTGTAGCTGTAACTCTTATGAATAA
GAAAAAGAGCTGCATTGGCCTCCTCTCTATATGCAGCAAGAGGATTTCTTTGCTTCTTCT
CCCTCTTATGTGGTCTTGTGACCTTTGTATTGTATTCTCATTACGTACCTTTCAAGTGAT
AGGTTAAGTAGACAACCAGTTTTGGAAGATAAAACAATACACAAATGTATTAATTTACTT
TATTTCATGGAACATTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR70TF U 1
AF RR4CR70JQ C 13
BS 1 594 RR4CR70TF
BS 595 742 RR4CR70JQ

RD RR4CR70TF 594 0 0
TTTATCCCCGTAGAGGAGGAGATACGTCTGCTTCTCGTGGCCTATCTCTCGAGAAGAAAA
TAGAAGCTCTTGAGAGCCTCACAGGACAAGTTAGTAACCGGAGATCTAGGAGATGGTTAA
ATGATCGTATTCTGATGGAGCTTGTTCCTCGTTTAGATGCCCAGGAAATCAGAGGCTTGT
TTGCCCCACCTCCATGGGGTGATGATGTTCCTCCCTCTGCCTTTTCTTTGACTAATGTTG
GGGAATGGGACAGATTCAGAAACATTGACATGGACAAGGAGGCCAATATCATGGACTCCT
TGAACCAGTCATCCGTAAGGCAGAAAGGTCATGTGGATGCTGATAAAACTGCTGTTTTAA
CCGCTTGGCGAAGAATAGAGTGTAGAACTAGAGAGGCTCTTCGGCGCAGCTTTTTACCTG
ACCTCATCGAGGGCTATGAGAACTGTATAAGTCATTTCATTGAGGAAGGCGGTGAAGGAG
CTTGGTAACATCATCACATAGACAAACACACTCCTTTGTAGCTGTAACTCTTATGAATAA
GAAAAAGAGCTGCATTGGCCTCCTCTCTATATGCAGCAAGAGGATTTCTTTGCT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4CR70JQ 730 0 0
GAGGAGGAGATACGTCTGCTTCTCGTGGCCTATCTCTCGAGAAGAAAATAGAAGCTCTTG
AGAGCCTCACAGGACAAGTTAGTAACCGGAGATCTAGGAGATGGTTAAATGATCGTATTC
TGATGGAGCTTGTTCCTCGTTTAGATGCCCAGGAAATCAGAGGCTTGTTTGCCCCACCTC
CATGGGGTGATGATGTTCCTCCCTCTGCCTTTTCTTTGACTAATGTTGGGGAATGGGACA
GATTCAGAAACATTGACATGGACAAGGAGGCCAATATCATGGACTCCTTGAACCAGTCAT
CCGTAAGGCAGAAAGGTCATGTGGATGCTGATAAAACTGCTGTTTTAACCGCTTGGCGAA
GAATAGAGTGTAGAACTAGAGAGGCTTTTCGGCGCAGCTTTTTACCTGACCTCATCGAGG
GCTATGAGAACTGTATAAGTCATTTCATTGAGGAAGGCGGTGAAGGAGCTTGGTAACATC
ATCACATAGACAAACACACTCCTTTGTAGCTGTAACTCTTATGAATAAGAAAAAGAGCTG
CATTGGCCTCCTCTCTATATGCAGCAAGAGGATTTCTTTGCTTCTTCTCCCTCTTATGTG
GTCTTGTGACCTTTGTATTGTATTCTCATTACGTACCTTTCAAGTGATAGGTTAAGTAGA
CAACCAGTTTTGGAAGATAAAACAATACACAAATGTATTAATTTACTTTATTTCATGGAA
CATTTTATTT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL4349Contig1 501 3 1 U
GGGAGAAACCAACCCTAGCCGAGCAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTACTCAGAGATGGC
CAAGTCGAAGAATCACACGGCGCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCAAGGAAGCATAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTA
AGCTTTTTGATTCTCTCTGAGAGGTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAAT
CAATTTAATACATTTCGCTTTATGTTTGGTTTGATTATGTTTAATCAATGCGGTTGGGAT
ACTCTTTTATCCTTTGGCCTTAATTTTAATATCATGGATTTCCATTTCTTATTGTGTTGA
GTTTCTTTATTTGATTGGTTCTGCATATGTTATCTGAAAAATTAAAGCTTGTAACCATCA
TATGTAACATTTATCTGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EO51TF U 9
AF RR4FC45TF U 1
AF RR4FC45JQ C 100
BS 1 501 RR4FC45TF

RD RR4EO51TF 398 0 0
GG
AACCCTAGCCGAGCAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAG
AATCACACGGCGCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGG
AGGCACCGTCACACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTAC
GCAAGGAAGCATAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTAAGCTTTTTGA
TTCTCTCTGAGAGGTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAATCAATTTAATA
CATTTCGCTT*ATGTTTGGTTTGATTATGTTTAATCAATGCGGTTGGGATACTCTTTTAT
CCTTTGGCCTTAATTTTAATATCATGGATTTCCATT

QA 3 398 3 398
DS 

RD RR4FC45TF 501 0 0
GGGAGAAACCAACCCTAGCCGAGCAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTACTCAGAGATGGC
CAAGTCGAAGAATCACACGGCGCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCAAGGAAGCATAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTA
AGCTTTTTGATTCTCTCTGAGAGGTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAAT
CAATTTAATACATTTCGCTTTATGTTTGGTTTGATTATGTTTAATCAATGCGGTTGGGAT
ACTCTTTTATCCTTTGGCCTTAATTTTAATATCATGGATTTCCATTTCTTATTGTGTTGA
GTTTCTTTATTTGATTGGTTCTGCATATGTTATCTGAAAAATTAAAGCTTGTAACCATCA
TATGTAACATTTATCTGAGAC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4FC45JQ 402 0 0
GGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCACCAGAGGGAT
GGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCATAACGTCAAGAACGGCGA
GAATGCCACCGCCGAAGATTAAGCTTTTTGATTCTCTCTGAGAGGTTTTTATGAAATTAA
GTTTGTTTTAGACAAGAGAATCAATTTAATACATTTCGCTTTATGTTTGGTTTGATTATG
TTTAATCAATGCGGTTGGGATACTCTTTTATCCTTTGGCCTTAATTTTAATATCATGGAT
TTCCATTTCTTATTGTGTTGAGTTTCTTTATTTGATTGGTTCTGCATATGTTATCTGAAA
AATTAAAGCTTGTAACCATCATATGTAACATTTATCTGAGAC

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 3

CO CL4350Contig1 1335 3 6 U
TCCCTCGCCGCCACCTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACTCGCGACATCCTTTAGAAC
AAACTGAATTGTTCCCAAAGAAAGGATGGTGACTGAAGAAGACAAGATATTCGCCAAGAA
CTTCTACATCGACGACCTCCCCGACGTTCCTGCCGGACTCCCTCCGCATCTGAAACTCAA
GCAAAACCGTGCCGTCGTCTCTAAAAAAGATGCTTCCGTTGATACTACAGATGTCATTTA
CTCGGGTAGCTATGTCTCTTCGGGAGTGGACAACACTGTGAAGCTAGGAAACTTCTATGA
GGATTTCAAAGTTGATGTGATTAGTTGCACGGAGACAGACATGGAGTTTGATATGATCGG
TATCGATGCTGCATTCGCCAATGCTTTCAGAAGGATCCTTATAGCTGAGGTTCCTTCAAT
GGCTATTGAAAAAGTGCTTATAGCATACAACACGTCGCTTATTGTTGACGAAGTTCTTGC
TCACAGGATTGGTCTTATTCCCATTGCCGCAGATCCAAGGCTCTTTGAGTATTTAACCGA
AACCGACCAGCCAAACGAGAAGAACACCATCGTTTTCAAACTCCATGTGAAATGTCCGAA
AGGTCAATCACGTCTTCATGTTTTAACGAACGAGTTGCAATGGTTACCAAATGGAAGTGA
GTTTATCAAAGAAACCGGAGATTCAACTTCAACCTCGAAGCCAAAAACTTACACTTCATT
CAGCTGTAGTCAAGATTCTCTCCCTGAATTTGCTGATAGCCCTATCACTCCGAGCCACCT
TGATATCTTGATATCAAAACTCAGCCCTGGTCAGGAAATTGAACTTGAAGCTCATGCGAT
TAAGGGCATTGGTAAAACACATGCAAAATGGTCTCCAGTAGGGACAGCTTGGTATCGAAT
GCTTCCTGAGGTGGTTTTACTAGGGGAAGTTGAGGATGAGAAAGCTGAACGACTGGTAAA
AACCTGCCCAATGAATGTTTTTGACATTGAAGACATGGGCAATGGTAGGAAAAGGGCAAC
GGTAGCACAGCCTCGCAATTGCACCTTGTGTAAGGAGTGCATAAGAGACCATGACTTGGT
TGACCTGGTGGATCTGCGCAGTGTCAAGGACCATTTTATATTTAAAGTTGAGTCCACAGG
ATCACTGCCTCCGGATGTTCTCTTTACTGAAGCTGTGAAGATATTGGAAGATAAATGTGA
GCGTGTTATCGCTGATCTCTCCTGAAAAGAGATTGTTTTGGTTTACTCTCTACTACCTAC
ACTTTCCGGTTTAGTTCAATTTTGGTGTTTGTATCAAATATTCTCCTTATTATTAATACG
AAGAACCTTGAAATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G470TF U 1
AF RR4AK72TF U 1
AF RR4AK72JQ C 548
BS 1 39 RR4AK72TF
BS 40 40 RR4G470TF
BS 41 125 RR4AK72TF
BS 126 126 RR4G470TF
BS 127 809 RR4AK72TF
BS 810 1335 RR4AK72JQ

RD RR4G470TF 763 0 0
TCCCTCGCCGCCACCTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACTCGCGACATCCTTTAGAAC
AAACTGAATTGTTCCCAAAGAAAGGATGGTGACTGAAGAAGGCAAGATATTCGCCAAGAA
CTTCTACATCGACGACCTCCCCGACGTTCCTGCCGGACTCCCTCCGCATCTGAAACTCAA
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GGATTTCAAAGTTGATGTGATTAGTTGCACGGAGACAGACATGGAGTTTGATATGATCGG
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GGCTATTGAAAAAGTGCTTATAGCATACAACACGTC**TTATTGTTGACGAAGTTCTTGC
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QA 1 763 1 763
DS 

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AAACTGAATTGTTCCCAAAGAAAGGATGGTGACTGAAGAAGACAAGATATTCGCCAAGAA
CTTCTGCATCGACGACCTCCCCGACGTTCCTGCCGGACTCCCTCCGCATCTGAAACTCAA
GCAAAACCGTGCCGTCGTCTCTAAAAAAGATGCTTCCGTTGATACTACAGATGTCATTTA
CTCGGGTAGCTATGTCTCTTCGGGAGTGGACAACACTGTGAAGCTAGGAAACTTCTATGA
GGATTTCAAAGTTGATGTGATTAGTTGCACGGAGACAGACATGGAGTTTGATATGATCGG
TATCGATGCTGCATTCGCCAATGCTTTCAGAAGGATCCTTATAGCTGAGGTTCCTTCAAT
GGCTATTGAAAAAGTGCTTATAGCATACAACACGTCGCTTATTGTTGACGAAGTTCTTGC
TCACAGGATTGGTCTTATTCCCATTGCCGCAGATCCAAGGCTCTTTGAGTATTTAACCGA
AACCGACCAGCCAAACGAGAAGAACACCATCGTTTTCAAACTCCATGTGAAATGTCCGAA
AGGTCAATCACGTCTTCATGTTTTAACGAACGAGTTGCAATGGTTACCAAATGGAAGTGA
GTTTATCAAAGAAACCGGAGATTCAACTTCAACCTCGAAGCCAAAAACTTACACTTCATT
CAGCTGTAGTCAAGATTCTCTCCCTGAATTTGCTGATAGCCCTATCACTCCGAGCCACCT
TGATATCTTGATATCAAAACTCAGCCCTG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4AK72JQ 788 0 0
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TCACGTCTTCATGTTTTAACGAACGAGTTGCAATGGTTACCAAATGGAAGTGAGTTTATC
AAAGAAACCGGAGATTCAACTTCAACCTCGAAGCCAAAAACTTACACTTCATTCAGCTGT
AGTCAAGATTCTCTCCCTGAATTTGCTGATAGCCCTATCACTCCGAGCCACCTTGATATC
TTGATATCAAAACTCAGCCCTGGTCAGGAAATTGAACTTGAAGCTCATGCGATTAAGGGC
ATTGGTAAAACACATGCAAAATGGTCTCCAGTAGGGACAGCTTGGTATCGAATGCTTCCT
GAGGTGGTTTTACTAGGGGAAGTTGAGGATGAGAAAGCTGAACGACTGGTAAAAACCTGC
CCAATGAATGTTTTTGACATTGAAGACATGGGCAATGGTAGGAAAAGGGCAACGGTAGCA
CAGCCTCGCAATTGCACCTTGTGTAAGGAGTGCATAAGAGACCATGACTTGGTTGACCTG
GTGGATCTGCGCAGTGTCAAGGACCATTTTATATTTAAAGTTGAGTCCACAGGATCACTG
CCTCCGGATGTTCTCTTTACTGAAGCTGTGAAGATATTGGAAGATAAATGTGAGCGTGTT
ATCGCTGATCTCTCCTGAAAAGAGATTGTTTTGGTTTACTCTCTACTACCTACACTTTCC
GGTTTAGTTCAATTTTGGTGTTTGTATCAAATATTCTCCTTATTATTAATACGAAGAACC
TTGAAATT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 3

CO CL4351Contig1 1324 3 6 U
GCTAAACTTTGTGTAAATATGTTTGTAATAAAGATTTCTGGATAAATATTACAGTAGTTA
CTACTCATAACATATGAAGACCGTGATATTGACATGAACACACCTCCATAGACATACAAT
CAAACTACTCAACACAAACCATAAAACACACATAGATACATACATCCAATAATATAGCAT
CCCCCAAATGAGTAACAAAGCTGTAAGATATGGGAACTTAGCCTCTCTTGGTGAAATCCA
TGAAGCTCGATGGCTGCCCATTTGTGCTCATCTGCTAGTTCTTGTTGTTGTTCCCCACCA
GCTGAAATGAAAATTGCGCGCGGTTGTTGTTGAATGAGTTCCCGTTCCCTTGAGGAATTT
CTCCAGCGGCTATCTTGAGTCGGTTCAGTTCTCCCCGCAGTGCTTCATTCAAAGCGTCCC
TAAGTTCAGCTTGTTGTTCTAATGCTTGCAACCGCATTTTGAGGTGTTTGTTTTCAGTGG
TCAGGTCCGATGTTCCTCTCTGCAACATAGTGACTTGAGCAGAGAGTGTAGTAGCTTCGT
TCTGAAGTGTCTGAACTTTCCTCTCGAGCTCACCAGTATACTTAATCTTCCTCTCTTTTG
ACCTAGCCGCCGATTGTCTATTCGCTAGAATCCGTTTAGCTCGTTTGGGATCAAGCAACG
CAAGCTCGGCGAGTCTGTCACTAGCCATACCCATGTTCTTCTTAGCACCGGCGGCTAGAA
TCGAGTCCATGTTAAAGGAGCCCGAGCTTGTAGCTCCATCCATAGAATTACTCCGATGAT
GGTGACCACCTCTTCTCCCTCCAGAGCGGGCCAATTGAGTATCCTCAGCGACGAGATCGT
CGAAGAAATTGGATTCGGAATCGACTGAGAAGCTCCGGACGTGACGGCCGGCAGGGAGAG
GAATGGGCGGCGGAGGAGCACCGTTGGATGAGGTTTCCTCCGGAGGGGAATCGACGGACA
TCGGCTGCGGCTGAGGTGTTGGTGGAGCGTTGAGGAAATCGAGAGAAGAGAAATCGACAT
CGGAAGGATCGAAGATGAGGAGATCGTCGATTGATTCGCCGGCGGAGAAGAAAGTGTCCG
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CGCTTAGGATCAATGATGACTGGTTTGGTCTTTGGGAAGGCTCCATCGATTTAGGCGGCG
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TCTTCAAAGACAAAATGACGGACACGAGTGAGTTTTGTCAATATGGGCAAGTGATTTGGT
CTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4EG77JQ U 11
AF RR4GR16JQ U 1
AF RR4GR16TF C 638
BS 1 131 RR4GR16JQ
BS 132 132 RR4EG77JQ
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BS 306 306 RR4EG77JQ
BS 307 796 RR4GR16JQ
BS 797 1324 RR4GR16TF

RD RR4EG77JQ 691 0 0
C
TGTAAATATGTTTGTAATAAAGATTTCTGGATAAATATTACAGTAGTTACTACTCATAAC
ATATGAAGACCGTGATATTGACATGAACACACCTCCATAGACATACAATCAAACTACTCA
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GTAACAAAGCTGTAAGATATGGGAACTTAGCCTCTCTTGGTGAAATCCATGAAGCTCGAT
GGCTGCCCATTTGTGCTCATCTGCTGGTTCTTGTTGTT***CCCCACCAGCTGAAATGAA
AATTGCGCGCGGTTGTTGTTGAATGAGTTCCCGTTCCCTTGAGGAATTTCTCCAGCGGCT
ATCTTGAGTCGGTTCAGTTCTCCCCGCAGTGCTTCATTCAAAGCGTCCCTAAGTTCAGCT
TGTTGTTCTAATGCTTGCAACCGCATTTTGAGGTGTTTGTTTTCAGTGGTCAGGTCTGAT
GTTCCTCTCTGCAACATAGTGACTTGAGCAGAGAGTGTAGTAGCTTCGTTCTGAAGTGTC
TGAACTTTCCTCTCGAGCTCACCAGTATACTTAATCTTCCTCTCTTTTGACCTAGCCGCC
GATTGTCTATTCGCTAGAATCCGTTTAGCTCGTTTGGGATCAAGCAACGCAAGCTCGGCG
AGTCTGTCACTAGCCATACCCATGTTCTTC

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR4GR16JQ 796 0 0
GCTAAACTTTGTGTAAATATGTTTGTAATAAAGATTTCTGGATAAATATTACAGTAGTTA
CTACTCATAACATATGAAGACCGTGATATTGACATGAACACACCTCCATAGACATACAAT
CAAACTACTCAGCACAAACCATAAAACACACATAGATACATACATCCAATAATATAGCAT
CCCCCAAATGAGTAACAAAGCTGTAAGATATGGGAACTTAGCCTCTCTTGGTGAAATCCA
TGAAGCTCGATGGCTGCCCATTTGTGCTCATCTGCTAGTTCTTGTTGTTGTTCCCCACCA
GCTGAGATGAAAATTGCGCGCGGTTGTTGTTGAATGAGTTCCCGTTCCCTTGAGGAATTT
CTCCAGCGGCTATCTTGAGTCGGTTCAGTTCTCCCCGCAGTGCTTCATTCAAAGCGTCCC
TAAGTTCAGCTTGTTGTTCTAATGCTTGCAACCGCATTTTGAGGTGTTTGTTTTCAGTGG
TCAGGTCCGATGTTCCTCTCTGCAACATAGTGACTTGAGCAGAGAGTGTAGTAGCTTCGT
TCTGAAGTGTCTGAACTTTCCTCTCGAGCTCACCAGTATACTTAATCTTCCTCTCTTTTG
ACCTAGCCGCCGATTGTCTATTCGCTAGAATCCGTTTAGCTCGTTTGGGATCAAGCAACG
CAAGCTCGGCGAGTCTGTCACTAGCCATACCCATGTTCTTCTTAGCACCGGCGGCTAGAA
TCGAGTCCATGTTAAAGGAGCCCGAGCTTGTAGCTCCATCCATAGAATTACTCCGATGAT
GGTGACCACCTCTTCT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4GR16TF 687 0 0
AGCTCGTTTGGGATCAAGCAACGCAAGCTCGGCGAGTCTGTCACTAGCCATACCCATGTT
CTTCTTAGCACCGGCGGCTAGAATCGAGTCCATGTTAAAGGAGCCCGAGCTTGTAGCTCC
ATCCATAGAATTACTCCGATGATGGTGACCACCTCTTCTCCCTCCAGAGCGGGCCAATTG
AGTATCCTCAGCGACGAGATCGTCGAAGAAATTGGATTCGGAATCGACTGAGAAGCTCCG
GACGTGACGGCCGGCAGGGAGAGGAATGGGCGGCGGAGGAGCACCGTTGGATGAGGTTTC
CTCCGGAGGGGAATCGACGGACATCGGCTGCGGCTGAGGTGTTGGTGGAGCGTTGAGGAA
ATCGAGAGAAGAGAAATCGACATCGGAAGGATCGAAGATGAGGAGATCGTCGATTGATTC
GCCGGCGGAGAAGAAAGTGTCCGAGCGAACTCGACGGTGGTGAGAGATGCGCTGACGTGG
AGCTTCTGGCATGCGTTTGATTTCGCTTAGGATCAATGATGACTGGTTTGGTCTTTGGGA
AGGCTCCATCGATTTAGGCGGCGAGGTTTGGGTTGGGGTTACTCCCGTTTTACTTGTTTA
TACCTAACCCAAGTAGAAGAAAGTCTTCAAAGACAAAATGACGGACACGAGTGAGTTTTG
TCAATATGGGCAAGTGATTTGGTCTCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL4352Contig1 831 3 2 U
GGAGAAAATGCATTTTTATTTACAATACAAACTTCATCATCCTTTTTAAAAAGCAGAGAG
AAATAGGTAGCCAATCAAAGAGTCCTCGCTCACACAAATCACCAGCGTTAGTTAATTTAT
TAAAACAAGAGCTCGCTGGTTTAACTAATGGGCGGCGGGTGAGACGGTGGCTGTAACGGT
GGAGACAAGACTGTCAACGCCACAAACGTTACGGCCTCTACAGATTTTGTAAAAACCATT
CTCACCCCAAGTCTCTCCCCACGAGTTCTTAATAATCCAGTAAGGCTTCTCCTTGAACCT
AGCGGGAGCGTAACCAGCCGATCCATAACCCACCAACAAGACACCGTGGTTGAGCCTCCT
CATGCACACGTAAGGGCACGAGACTCCTCCGATGTAAGTCTGCATATATGCGGCGTTGAT
GGCTACCGCGAGAGGTCCGTTCTTGACAAGATTCGCAGCGATCTGGTCTTCGTCGATGGA
AATGACGCTGAAGTTGGAGACGGACGCAACGATCTTGGACTT*TCTAGTTTGCAGGTAGG
GCCGTCCTTTCCGGTGTAAGGATAGTCTTCTTCTCTCATGAGCCCTCCGGTTTTGAGTGT
GTATTCGAATGCGCTGTTCATTAGGCCGCCGTTGCAACCAGAGTCACATGAACCTGCCTG
TTCTGGGTCACACTCGTGATCACAGTCGACGAGCTGTTGCTCGCTAAGGCTGACGAGCTT
GCCGGTAGAGAGGAAGTTAGCACCTTCCAGAGCTCCGGTTGCACTGAAACTCCAACAAGA
ACCGCAAGATCCCTGGTTTTTGACGGGGGTAACAGCACCACGATCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK45JQ U 27
AF RR4DY88JQ U 1
AF RR4DY88TF C 15
BS 1 770 RR4DY88JQ
BS 771 831 RR4DY88TF

RD RR4CK45JQ 564 0 0
ACAAACTTCATCATCCTTTTTAAAAAGCAAAGAGAAATAGGTAGCCAATCAAAGAGTCCT
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AATGGGCGGCGGGTGAGACGGTGGCTGTAACGGTGGAGACAAGACTGTCAACGCCACAAA
CGTTACGGCCTCTACAGATTTTGTAAAAACCATTCTCACCCCAAGTCTCTCCCCACGAGT
TCTTAATAATCCAGTAAGGCTTCTCCTTGAACCTAGCGGGAGCGTAACCAGCCGATCCAT
AACCCACCAACAAGACACCGTGGTTGAGGCTCCTCATGCACACGTAAGGGCACGAGACTC
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CAACGATCTTGGACTTGTCTAGCTTGCAGGTAGGGCCGTCCTTTCCGGTGTAAGGATAGT
CTTCTTCTCTCATGAGCCCTCCG
C

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DS 

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AAATAGGTAGCCAATCAAAGAGTCCTCGCTCACACAAATCACCAGCGTTAGTTAATTTAT
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GGAGACAAGACTGTCAACGCCACAAACGTTACGGCCTCTACAGATTTTGTAAAAACCATT
CTCACCCCAAGTCTCTCCCCACGAGTTCTTAATAATCCAGTAAGGCTTCTCCTTGAACCT
AGCGGGAGCGTAACCAGCCGATCCATAACCCACCAACAAGACACCGTGGTTGAGCCTCCT
CATGCACACGTAAGGGCACGAGACTCCTCCGATGTAAGTCTGCATATATGCGGCGTTGAT
GGCTACCGCGAGAGGTCCGTTCTTGACAAGATTCGCAGCGATCTGGTCTTCGTCGATGGA
AATGACGCTGAAGTTGGAGACGGACGCAACGATCTTGGACTT*TCTAGTTTGCAGGTAGG
GCCGTCCTTTCCGGTGTAAGGATAGTCTTCTTCTCTCATGAGCCCTCCGGTTTTGAGTGT
GTATTCGAATGCGCTGTTCATTAGGCCGCCGTTGCAACCAGAGTCACATGAACCTGCCTG
TTCTGGGTCACACTCGTGATCACAGTCGACGAGCTGTTGCTCGCTAAGGCTGACGAGCTT
GCCGGTAGAGAGGAAGTTAGCACCTTCCAGAGCTCCGGTTGCACTGAAAC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4DY88TF 817 0 0
TTTTA
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CCACAAACGTTACGGCCTCTACAGATTTTGTAAAAACCATTCTCACCCCAAGTCTCTCCC
CACGAGTTCTTAATAATCCAGTAAGGCTTCTCCTTGAACCTAGCGGGAGCGTAACCAGCC
GATCCATAACCCACCAACAAGACACCGTGGTTGAGCCTCCTCATGCACACGTAAGGGCAC
GAGACTCCTCCGATGTAAGTCTGCATATATGCGGCGTTGATGGCTACCGCGAGAGGTCCG
TTCTTGACAAGATTCGCAGCGATCTGGTCTTCGTCGATGGAAATGACGCTGAAGTTGGAG
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TCACAGTCGACGAGCTGTTGCTCGCTAAGGCTGACGAGCTTGCCGGTAGAGAGGAAGTTA
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TTGACGGGGGTAACAGCACCACGATCTCTCCC

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DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4FF31JQ C 1
AF RR4FF31TF U 1
AF RR4FF43TF U 1
BS 1 560 RR4FF31TF
BS 561 599 RR4FF43TF

RD RR4FF31JQ 560 0 0
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AGACAAGATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACGAGAGAGTACACCAT
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TGTTGTTTTCATTTCAAAGGGAGTTTTTGTCTTTCTTGGTAGTGTTGACGATGCAGTTTA
TTGGAAAGACTCATTTTCTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4FF31TF 560 0 0
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CAACCTCCACAGACGCCTTCACAGCTGTACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATAAA
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GGATTGAAGATCCTTGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGGTTTTTATTTTTGTATTTCT
TGTTGTTTTCATTTCAAAGGGAGTTTTTGTCTTTCTTGGTAGTGTTGACGATGCAGTTTA
TTGGAAAGACTCATTTTCTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4FF43TF 599 0 0
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AGACAAGATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACGAGAGAGTACACCAT
CAACCTCCACAGACGCCTTCACAGCTGTACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGC*ATAAA
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GGATTGAAGATCCTTGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGGTTTTTATTTTTGTATTTCT
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TTGGAAAGACTCATTTTCTTCTGCAAGACCTAAAGATGAATCTGCTTTATGTTCTTATC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 3

CO CL4354Contig1 713 3 10 U
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TCTAAGCCTGCCGATGAAGATTAGGAGATCCCAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATG
CCAGAGTGGACACGTAGTAGAGGACGCTTACACAACAGCTGTGTGGTATTAGTAGTAGTT
GCATATGATATTTTGTTTCTGTGTGTGAATATATGAAGAACACTACACTCCTCTGCTTTA
GGTGTTACTGTAATATTCCACTTTGTTGACTTATTGCAATGGCTTTGTTCAGC


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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G
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DS 



AS 1 3

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TGTTTGTGTGTTTGTATAATCATATTTTCGTATGATATGCATTTAATAGAATATATAATT
TTGTAAGTATATTAAATAAATCAATTTTCATAAGCC


BQ
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AF RR4GV59TF U 1
AF RR4BG87TF U 1
AF RR4GV59JQ C 696
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ATATCATGGAGGGGTAACTCCGGCGTTAACGATGGCTCCCTAGCCAATGTGGATTTAACT
GGTGGGTACTACACCGAAGGAGACAACGTCAAATACAATTTCCCAATGGCGTTTACCACC
ACAATGCTTTCATGGAGCACACTTGAGTACGGCGGCCAGATGGGTCCTGAGCTCCAAAAC
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GAAGATATGGACACACCTCGTACAGTCTATTCTGTATCCGCTTCTAACCCCGGTTCTGAC
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ACTTGAATTA

QA 1 790 1 790
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AA
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TGGAGAACAGACTGACATCTTCAACTGGAACAACAAATATTCTGGCGCTTATGTTCTTCT
TTCACAGCGAGCATTAGTTAACAACGACAGCAACTTTGAACAATACAAGCAAGAAGCTGA
GAGTTTCATATGCAAGATCCTCCCCAGATGAGAAGGATGAGTATCTAGATAAGAGAGACG
ATTACATTCACTCGGAACCTGCTACGTACATTAACGCCCCCTTCGTCGGAACTTTGGCGT
ACTTCGCCTCCGGTGGATCGGCTTGAAACCGTCTGGCCGAAGCCGGATGTGACAATATGA
AATTTATCAAGTAACTAGAGATTGACCCGCCCTCAAGAAGGTGGGTATATGTTTCGTTTT
TAATTTTTTTATCTCATATAATATGTTTGTGTGTTTGTATAATCATATTTTCGTATGATA
TGCATTTAATAGAATATATAATTTTGTAAGTATATTAAATAAATCAATTTTCATAAGCC

QA 3 601 3 601
DS 



AS 1 2

CO CL4356Contig1 808 2 2 U
CAGAGTAAGCGTACTTGCGGTATTAATCTCAACCCCTTATATTTGGCCATTGACCGAGTC
TTTGGCTTTTACATTACAAGGTTTCACGTTTAACAAAATGGGACCATCCTTAGTCATTAC
TTTTCAACACGAGAAGTAGAAGTAACAACGGTACTAACATCTCTGATGAATTTGACGAAT
ATGGTCTTATCCACATCATTGGTGAGAACTAGTTGTGGACTGTCCAAGGACCCTGAGATG
GTTACAACGGTTCCGGCAGAAGTGGTAAATTTGTAAATGTTTGTTTGTGCTTCTTTTCCG
GCCCTCTCGATTCTAAACCAGCTATTTTGTCTCCCGGTTACCACCGATGAGAATCTCGGG
CTGGTTGGGATTCTGTGCGAATTCATCTACTTCCCAAAACTTGGAGATGCGATTGCAGAT
GTTGGACTGGAACTCGATGGTCATGTCGGTATTTGTACGGACAATGGTGAGTGGCAGTAT
GGGAGGGATCAACCACGGTGGAAATGCGATCCTAACCAGCACACCCGATTCCCCCGGAAA
TGCTTCGGTGATGCCAAGTGGACAAGAGGGAAGTATAGCAGCAACTGGGATAAGACCACC
TCCGTTAATCCCGGTATTGACTGGTTGGATGATGTATCGTTCATTGACACGAACGATGTT
TCCGTCCGTGTCCGTCACCGGTGGCGGTAGTACTTGTCCGTGGGTGCAGACAGCTGCAGC
CAACAAGAGAGCGATGACAAAGGAGAGCAATAGGGATGATGACATGATTGTGATGTTTTT
TCTTTTGTTTTGTTTTGGAGCGAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H205JQ U 1
AF RR4B012TF C 40
BS 1 201 RR4H205JQ
BS 202 808 RR4B012TF

RD RR4H205JQ 201 0 0
CAGAGTAAGCGTACTTGCGGTATTAATCTCAACCCCTTATATTTGGCCATTGACCGAGTC
TTTGGCTTTTACATTACAAGGTTTCACGTTTAACAAAATGGGACCATCCTTAGTCATTAC
TTTTCAACACGAGAAGTAGAAGTAACAACGGTACTAACATCTCTGATGAATTTGACGAAT
ATGGTCTTATCCACATCATTG

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR4B012TF 769 0 0
TATTTGGCCATTGACCGAGTCTTTGGCTTTTACATTACAAGGTTTCACGTTTAACAAAAT
GGGACCATCTTTAGTCATTACTTTTCAACACGAGAAGTAGAAGTAACAACGGTACTAACA
TCTCTGATGAATTTGACGAATATGGTCTTATCCACATCATTGGTGAGAACTAGTTGTGGA
CTGTCCAAGGACCCTGAGATGGTTACAACGGTTCCGGCAGAAGTGGTAAATTTGTAAATG
TTTGTTTGTGCTTCTTTTCCGGCCCTCTCGATTCTAAACCAGCTATTTTGTCTCCCGGTT
ACCACCGATGAGAATCTCGGGCTGGTTGGGATTCTGTGCGAATTCATCTACTTCCCAAAA
CTTGGAGATGCGATTGCAGATGTTGGACTGGAACTCGATGGTCATGTCGGTATTTGTACG
GACAATGGTGAGTGGCAGTATGGGAGGGATCAACCACGGTGGAAATGCGATCCTAACCAG
CACACCCGATTCCCCCGGAAATGCTTCGGTGATGCCAAGTGGACAAGAGGGAAGTATAGC
AGCAACTGGGATAAGACCACCTCCGTTAATCCCGGTATTGACTGGTTGGATGATGTATCG
TTCATTGACACGAACGATGTTTCCGTCCGTGTCCGTCACCGGTGGCGGTAGTACTTGTCC
GTGGGTGCAGACAGCTGCAGCCAACAAGAGAGCGATGACAAAGGAGAGCAATAGGGATGA
TGACATGATTGTGATGTTTTTTCTTTTGTTTTGTTTTGGAGCGAGTTCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 3

CO CL4357Contig1 786 3 5 U
TTCAGCAATAAGCCGAGCAGATCAATACGACAAAACCATTAAGAAAGGGTTTGTGAAAAG
AAGAAGTCAAATTGATAAGTAACTTTTTGTTCTTTTCTTTTACTTCTAAGTAGAGACTCT
GAAACCCCAAACATACAAATAAAGAAGTACCTCAAAGTTCCAAAAAAATCTTTAAAAGAA
AACAAAAGAGACAGACATATCCTTCTCATTCTTGAGCATTGCTGCTTGTTTCCATTGGCT
CAGCTTCCGTTGAGGTCTCCCCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTC
CACCACCCTTCTTCTTCTTGATAGCCAAGGCTAACCACTCTTTGATCTCAGGCTGGTCAT
CAATGGTCTTCGTAGGTTGAAGCTCCTGAAGTGTATGTGAAGTGATCCTATCCGATCCAT
TAGGCATCAGCAACACTGTGAATTTGATTTGAGCAACAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAA
GTACAGGATACGGTAGCAAATGGCCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAGACGTGCCC
TTTTCTCCTCCAGTGACCTTGCAGTGAATGGCATGTGGGGAAAGTTTTCTTTAATCTCGC
TGAATATGAATCTGGAGGCTTTCATCTTCAACTGATATTTAACATCCGCATCCTTCTTGT
AAACAGTTGTGCTCTCGTCTAAAAGATTCGGCTTGCCATCACCAGTGCTTGCCACAATAT
CTACGGAATAGACTTCATTCTCTTCAAACTCAGCATCATCAACCCTTGTTTCTGGAGTGG
ATACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4C209JQ U 40
AF RR4C209TF C 1
AF RR4CW89JQ U 55
BS 1 39 RR4C209TF
BS 40 301 RR4C209JQ
BS 302 302 RR4CW89JQ
BS 303 331 RR4C209JQ
BS 332 786 RR4CW89JQ

RD RR4C209JQ 292 0 0
TAAGAAAGGGTTTGTGAAAAGAAGAAGTCAAATTGATAAGTAACTTTTTGTTCTTTTCTT
TTACTTCTAAGTAGAGACTCTGAAACCCCAAACATACAAATAAAGAAGTACCTCAAAGTT
CCAAAAAAATCTTTAAAAGAAAACAAAAGAGACAGACATATCCTTCTCATTCTTGAGCAT
TGCTGCTTGTTTCCATTGGCTCAGCTTCCGTTGAGGTCTCCCCTCCTTTCTCTCCAGCCT
TCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCC*CCACCCTTCTTCTTCTTGATAGCCAAGGC

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR4C209TF 527 0 0
TTCAGCAATAAGCCGAGCAGATCAATACGACAAAACCATTAAGAAAGGGTTTGTGAAAAG
AAGAAGTCAAATTGATAAGTAACTTTTTGTTCTTTTTTTTTACTTCTAAGTAGAGACTCT
GAAACCCCAAACATACAAATAAAGAAGTACCTCAAAGTTCCAAAAAAATCTTTAAAAGAA
AACAAAAGAGACAGACATATCCTTCTCATTCTTGAGCATTGCTGCTTGTTTCCATTGGCT
CAGCTTCCGTTGAGGTCTCCCCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTC
CACCACCCTTCTTCTTCTTGATAGCCAAGGCTAACCACTCTTTGATCTCAGGCTGGTCAT
CAATGGTCTTCGTAGGTTGAAGCTCCTGAAGTGTATGTGAAGTGATCCTATCCGATCCAT
TAGGCATCAGCAACACTGTGAATTTGATTTGAGCAACAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAA
GTACAGGATACGGTAGCAAATGGCCATGGTTCACACACTCCAC
CCCT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4CW89JQ 732 0 0
GG
AAAGAAGAAGTCAAATTGATAAGTAACTTTTTGTTCTTTTCTTTTACTTCTAAGTAGAGA
CTCTGAAACCCCAAACATACAAATAAAGAAGTACCTCAAAGTTCCAAAAAAATCTTTAAA
AGAAAACAAAAGAGACAGACATATCCTTCTCATTCTTGAGCATTGCTGCTTGTTTCCATT
GGCTCAGCTTCCGTTGAGGTCTCCCCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTC
TTTCCACCACCCTTCTTCTTCTTGATAGCCAAGGCTAACCACTCTTTGATCTCAGGCTGG
TCATCAATGGTCTTCGTAGGTTGAAGCTCCTGAAGTGTATGTGAAGTGATCCTATCCGAT
CCATTAGGCATCAGCAACACTGTGAATTTGATTTGAGCAACAAAATCCCCAGGCTTCTCG
TAAAGTACAGGATACGGTAGCAAATGGCCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAGACGT
GCCCTTTTCTCCTCCAGTGACCTTGCAGTGAATGGCATGTGGGGAAAGTTTTCTTTAATC
TCGCTGAATATGAATCTGGAGGCTTTCATCTTCAACTGATATTTAACATCCGCATCCTTC
TTGTAAACAGTTGTGCTCTCGTCTAAAAGATTCGGCTTGCCATCACCAGTGCTTGCCACA
ATATCTACGGAATAGACTTCATTCTCTTCAAACTCAGCATCATCAACCCTTGTTTCTGGA
GTGGATACAC

QA 3 732 3 732
DS 



AS 1 3

CO CL4358Contig1 726 3 6 U
GGGATCAATGGCGAACACTCTAATGGCGACAACTCGTCCACTCGCTCTCCTCTCCTCCAC
AAGATCTACCCTTCATCTCCTTTTCAAATCCCCGAAGAGACCCTTCTCTTCGTTTCTGTC
ATCTCCAGCCGCGAGAAGCTCTAGTTCGAGACGCGTAAGCGCCGTTTTGTCTCGTGGAGA
GACGACCACGCCGTCGTCGTCGATTTACCGCAGCGGAGTTTTCAGGGCTTCTGGGTTTGG
TGTTGCTAATATTCGCAGCCGTGATTTCAGTACAAGATCCTCTCAGATCAACGATGCTGG
TTCGATTGATCAAACTCTTATGCAATCCATGGAGCAAAAGATCAAAGAACAATTGAATGC
AGAGTCGGTTTCTGTCAAGGATATGTCTGGAGATGGTCGCCACGTTTGCATCAATGTCGT
ATCATCCGCTTTTGAGGGACAATCTGCAGTTAACAGACAGAGGATGGTCTACAAGGCCAT
TTGGGAGGAGCTTCAGAACGTAGTTCATGCCGTTGATCAGATGACGACAAAGACTCCTTC
CGAAGTTTGAAGCCTCTTAAATTTTTTTTTTTATGATACGAAGCCAAATCTATTATTTGA
ACAGCGGACAAAGCTGTTTTGTTTTATCAAAAACAAATTTGGATGTTTCTTTTTGTTGTT
GATGTCGGTTTATGACATCCTTTGCTCTGTTTAGTAAAATTCAGTGATAAAAGGTATGTT
TCAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC63JQ C 315
AF RR4EC63TF U 1
AF RR4A929TF U 115
BS 1 247 RR4EC63TF
BS 248 248 RR4A929TF
BS 249 570 RR4EC63TF
BS 571 572 RR4A929TF
BS 573 619 RR4EC63TF
BS 620 726 RR4A929TF

RD RR4EC63JQ 238 0 0
TTT
TTATGCAATCCATGGAGCAAAAGATCAAAGAACAATTGAATGCAGAGTCGGTTTCTGTCA
AGGATATGTCTGGAGATGGTCGCCACGTTTGCATCAATGTCGTATCATCCGCTTTTGAGG
GACAATTTGCAGTTAACAGACAGAGGATGGTTTACAAGGCCATTTGGGAGGAGCTTCAGA
ACGTAGTTCATGCCGTTGATCAGATGACGACAAAGACTCCTTCCGAAGTTTGAAG

QA 4 238 4 238
DS 

RD RR4EC63TF 619 0 0
GGGATCAATGGCGAACACTCTAATGGCGACAACTCGTCCACTCGCTCTCCTCTCCTCCAC
AAGATCTACCCTTCATCTCCTTTTCAAATCCCCGAAGAGACCCTTCTCTTCGTTTCTGTC
ATCTCCAGCCGCGAGAAGCTCTAGTTCGAGACGCGTAAGCGCCGTTTTGTCTCGTGGAGA
GACGACCACGCCGTCGTCGTCGATTTACCGCAGCGGAGTTTTCAGGGCTTCTGGGTTTGG
TGTTGCTGATATTCGCAGCCGTGATTTCAGTACAAGATCCTCTCAGATCAACGATGCTGG
TTCGATTGATCAAACTCTTATGCAATCCATGGAGCAAAAGATCAAAGAACAATTGAATGC
AGAGTCGGTTTCTGTCAAGGATATGTCTGGAGATGGTCGCCACGTTTGCATCAATGTCGT
ATCATCCGCTTTTGAGGGACAATCTGCAGTTAACAGACAGAGGATGGTCTACAAGGCCAT
TTGGGAGGAGCTTCAGAACGTAGTTCATGCCGTTGATCAGATGACGACAAAGACTCCTTC
CGAAGTTTGAAGCCTCTTAAATTTTTTTTT**ATGATACGAAGCCAAATCTATTATTTGA
ACAGCGGACAAAGCTGTTT

QA 1 619 1 619
DS 

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G
CTGTCATCTCCAGCCGCGAGAAGCTCTAGTTCGAGACGCGTAAGCGCCGTTTTGTCTCGT
GGAGAGACGACCACGCCGTCGTCGTCGATTTACCGCAGCGGAGTTTTCAGGGCTTCTGGG
TTTGGTGTTGCTAATATTCGCAGCCGTGATTTCAGTACAAGATCCTCTCAGATCAACGAT
GCTGGTTCGATTGATCAAACTCTTATGCAATCCATGGAGCAAAAGATCAAAGAACAATTG
AATGCAGAGTCGGTTTCTGTCAAGGATATGTCTGGAGATGGTCGCCACGTTTGCATCAAT
GTCGTATCATCCGCTTTTGAGGGACAATCTGCAGTTAACAGACAGAGGATGGTCTACAAG
GCCATTTGGGAGGAGCTTCAGAACGTAGTTCATGCCGTTGATCAGAT**CGACAAAGACT
CCTTCCGAAGTTTGAAGCCTCTTAAATTTTTTTTTTTATGATACGAAGCCAAATCTATTA
TTTGAACAGCGGACAAAGCTGTTTTGTTTTATCAAAAACAAATTTGGATGTTTCTTTTTG
TTGTTGATGTCGGTTTATGACATCCTTTGCTCTGTTTAGTAAAATTCAGTGATAAAAGGT
ATGTTTCAAAT

QA 2 612 2 612
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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GTCGTTCACATCGCTCATTGACAACATGGCCGTCACAGAAGGACAACAAGTCATGGCTCT
CATCAGCAAGCGTCTCCGCGCTCACCGCAAGAAGTACAACCGTATTACCGAGATGGAAGA
CTCGGTTTCTCAGGGCAAAACCCTAAACAAGGAGCAAAAAGAAGCCATCCGCTCGAAGCC
AATCGTCATCGCCCTTATCGAAGAACTCGAAAAGCTCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCTCC
TTCCGCGGCCGGTTCAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGA
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GATCTCTGATGGTCTTGATGCTGTTGAGTTTACGAAGGATGATGTTTCTCCGTGTAGCGT
AAGCTCACAAGATGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAA
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TTTT**TATTCTTCCGCTCGTTCACA*AGAGCTTTTTTTTT*CCGTTTGAGCTTTCTTTC
TTTCTACTATTTT*GGTATTGTTTGGTCACCTTGAGTTTTTTGATTCCTATGAAAGTCGA
TTAATATTTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FP14TF U 10
AF RR4E106TF U 1
AF RR4E106JQ C 75
BS 1 761 RR4E106TF
BS 762 762 RR4E106JQ
BS 763 793 RR4E106TF

RD RR4FP14TF 751 0 0
TTCATATCCCTAAACCTATAACCAACCTCTATATCTTTTTTCTCCTCAGCCGTCGTTCAC
ATCGCTCATTGACAACATGGCCGTCACAGAAGGACAACAAGTCATGGCTCTCATCAGCAA
GCGTCTCCGCGCTCACCGCAAGAAGTACAACCGTATTACCGAGATGGAAGACTCGGTTTC
TCAGGGCAAAACCCTAAACAAGGAGCAAAAAGAAGCCATCCGCTCGAAGCCAATCGTCAT
CGCCCTTATCGAAGAACTCGAAAAGCTCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCTCCTTCCGCGGC
CGGTTCAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGAACGTAAGGA
GGTAGCCGAGGAGAAAGACGTGACCCTCAAGGAGGATATCGAGGAGTGCAAGATCTCTGA
TGGTCTTGATGCTGTTGAGTTTACGAAGGATGATGTTTCTCCGTGTAGCGTAAGCTCACA
AGATGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAAACGGAAGGC
GAAGAAACCTCTGACTTCGAACTGATCGTGTCTCCAACTGTTGTACGAAGCGGAAGTCAG
TGCAATTATAAGTGCCATGAATTGCTTTGGTCACAATCCTTGGCAGTTTCCTTTTAGTAT
TCTTCCGCTCGTTCACAGAGCTTTTTTTTTTT*CCGTTTGAGCTTTCTTTCTTTCTACTA
TTTT*GGTAT*GTTTGGTCACCT
GAGTTTTT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4E106TF 793 0 0
GGATCCTATTTCATATCCCTAAACCTATAACCAACCTCTATATCTTTTTTCTCCTCAGCC
GTCGTTCACATCGCTCATTGACAACATGGCCGTCACAGAAGGACAACAAGTCATGGCTCT
CATCAGCAAGCGTCTCCGCGCTCACCGCAAGAAGTACAACCGTATTACCGAGATGGAAGA
CTCGGTTTCTCAGGGCAAAACCCTAAACAAGGAGCAAAAAGAAGCCATCCGCTCGAAGCC
AATCGTCATCGCCCTTATCGAAGAACTCGAAAAGCTCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCTCC
TTCCGCGGCCGGTTCAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGA
ACGTAAGGAGGTAGCCGAGGAGAAAGACGTGACCCTCAAGGAGGATATCGAGGAGTGCAA
GATCTCTGATGGTCTTGATGCTGTTGAGTTTACGAAGGATGATGTTTCTCCGTGTAGCGT
AAGCTCACAAGATGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAA
ACGGAAGGCGAAGAAACCTCTGACTTCGAACTGATCGTGTCTCCAACTGTTGTACGAAGC
GGAAGTCAGTGCAATTATAAGTGCCATGAATTGCTTTGGTCACAATCCTTGGCAGTTTCC
TTTT**TATTCTTCCGCTCGTTCACA*AGAGCTTTTTTTTT*CCGTTTGAGCTTTCTTTC
TTTCTACTATTTT*GGTATTGTTTGGTCACCTTGAGTTTTT*GATTCCTATGAAAGTCGA
TTAATATTTTGCG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4E106JQ 719 0 0
TCATTGACAACATGGCCGTCACAGAAGGACAACAAGTCATGGCTCTCATCAGCAAGCGTC
TCCGCGCTCACCGCAAGAAGTACAACCGTATTACCGAGATGGAAGACTCGGTTTCTCAGG
GCAAAACCCTAAACAAGGAGCAAAAAGAAGCCATCCGCTCGAAGCCAATCGTCATCGCCC
TTATCGAAGAACTCGAAAAGCTCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCTCCTTCCGCGGCCGGTT
CAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGAACGTAAGGAGGTAG
CCGAGGAGAAAGACGTGACCCTCAAGGAGGATATCGAGGAGTGCAAGATCTTTGATGGTC
TTGATGCTGTTGAGTTTACGAAGGATGATGTTTCTCCGTGTAGCGTAAGCTCACAAGATG
GGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAAACGGAAGGGGAAGA
AACCTCTGACTTCGAACTGATCGTGTCTCCAACTGTTGTACGAAGCGGAAGTCAGTGCAA
TTATAAGTGCCATGAATTGCTTTGGTCACAATCCTTGGCAGTTTCCTTTT**TATTTTTC
CGCTCGTTCACA*AGAGCTTTTTTTTTTCCGTTTGAGCTTTCTTTCTTTCTACTATTTTT
GGTATTGTTTGGTCACCTTGAGTTTTTTGATTCCTATGAAAGTCGATTAATATTTTGCG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL4361Contig1 939 3 11 U
GGTTTGTAGTTTGGTTGAAAGTAGCATAATCTTAATGCAAAACTAGTTTGCAATTAAGAC
AAAAACAAAAGATTGAAAAAGAGATTAAATGATCCATGGTTACTCCGTCAGGAAAAGGAA
AAAGATATTACATTTAGATATTGCCTAAAAATGCAAGAAGCAAAAGCACATGAAGACCTC
AAACAGTGAGGGCTGAGAGAGTTTCTCCATTCATATCTATATGAACTTTATCTTCATTCA
AGCTTGACTCTTACGACGCTGCCTCAATCTTCCACCAATACTGTCCGGGTTTGGCTCAAC
AGACATTTTCCTCTTGCCTCCTCTTGTTTTCCCATTCTCTTTGTCTCCAGAATAAGCCTT
AACATCAATCATCAACAAAGGAGTTGCTGGATCCATCTCGTTCACTGAAGTTTGATTGTC
CTCGGCAGACGAGAAGAAACTCAATGACTTTCTAGCTGAATCCTGATTCTTGTCTGTGCC
TTCATTATCATCGTCAATGTGATTCTCCTGAACCGCAAGCCCATCGGTGATCTGGAGGAG
ATTGAGATCATCATCATCTTCTTCTGAAGACACCTTAGCTTCTTTGAAAGAAAGTGACCT
CTTTGCAGAAGCTTGGGAAGGAGTGTCGTCTGTCTCATCATCATCCTCATCTGTTTCTGA
CTGCTTGTTGTTTTGAATCAGGTAATGTGCAACAGACTTGTACCCTAGCTTACATACCTT
CTTGTAAGCTGTACCAGTGGGCAACCACCCTTTACGTTTACGACAGAGACTGCAGTTGCA
GATTCCGCGACAGCCAGGACAAATCCACTCCGGATTCTCCAGTGTCTCAAGCACATGTTC
TCCATACCTCATGTACAAACAATCTCCACAGAATTGACCTGTGACAGATGGGTGACACTT
GCTGCATTGTGTTCGATAACCAAGCGTCTTCTGCCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D693JQ U 1
AF RR4D625JQ U 57
AF RR4D625TF C 108
BS 1 87 RR4D693JQ
BS 88 88 RR4D625JQ
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BS 421 421 RR4D625JQ
BS 422 594 RR4D693JQ
BS 595 595 RR4D625JQ
BS 596 627 RR4D693JQ
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BS 651 793 RR4D625JQ
BS 794 939 RR4D625TF

RD RR4D693JQ 650 0 0
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AAAAACAAAAGATTGAAAAAGAGATTACATGATCCATGGTTACTCCGTCAGGAAAAGGAA
AAAGATATTACATTTAGATATTGCCTAAAAATGCAAGAAGCAAAAGCACATGAAGACCTC
AAACAGTGAGGGCTGAGAGAGTTTCTCCATTCATATCTATATGAACTTTATCTTCATTCA
AGCTTGACTCTTACGACGCTGCCTCAATCTTCCACCAATACTGTCCGGGTTTGGCTCAAC
AGACATTTTCCTCTTGCCTCCTCTTGTTTTCCCATTCTCTTTGTCTCCAGAATAAGCCTT
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TTCGGCAGACGAGAAGAAACTCAATGACTTTCTAGCTGAATCCTGATTCTTGTCTGTGCC
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ATTGAGATCATCATCATCTTCTTCTGAAGACACCTTAGCTTCTTTGAAAGAAAGCGACCT
CTTTGCAGAAGCTTGGGAAGGAGTGTCATCTGTCTCATCATCATCCTCAT

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DS 

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G
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GAAAAAGATATTACATTTAGATATTGCCTAAAAATGCAAGAAGCAAAAGCACATGAAGAC
CTCAAACAGTGAGGGCTGAGAGAGTTTCTCCATTCATATCTATATGAACTTTATCTTCAT
TCAAGCTTGACTCTTACGACGCTGCCTCAATCTTCCACCAATACTGTCCGGGTTTGGCTC
AACAGACATTTTCCTCTTGCCTCCTCTTGTTTTCCCATTCTCTTTGTCTCCAGAATAAGC
CTTAACATCAATCATCAACAAAGGAGTTGCTGGATCCATCTCGTTCACTGAAGTTTGATT
GTCCTCGGCAGACGAGAAGAAACTCAATGACTTTCTAGCTGAATCCTGATTCTTGTCTGT
GCCTTCATTATCATCGTCAATGTGATTCTCCTGAACCGCAAGCCCATCGGTGATCTGGAG
GAGATTGAGATCATCATCATCTTCTTCTGAAGACACCTTAGCTTCTTTGAAAGAAAGTGA
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CTTCTTGTAAGCTGTACCAGTGGGCAACCACCCTTTACGTTTACGACAGAGACTGCAGTT
GCAGATTCCGCGACAG

QA 2 737 2 737
DS 

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GTCAGG
AAAGGAAAAAGATATTACATTTAGATATTGCT**AAAATGCA*GAAGCAAA*GCACATGA
AGAC*TCAAACAGTGAGGGCTGAGAGAGTTTCTCCATTCATATCTATATGAACTTTATCT
TCATTCAAGCTTGACTCTTACGACGCTGCCTCAATCTTCCACCAATACTGTCCGGGTTTG
GCTCAACAGACATTTTCCTCTTGCCTCCTCTTGTTTTCCCATTCTCTTTGTCTCCAGAAT
AAGCCTTAACATCAATCATCAACAAAGGAGTTGCTGGATCCATCTCGTTCACTGAAGTTT
GATTGTCCTCGGCAGACGAGAAGAAACTCAATGACTTTCTAGCTGAATCCTGATTCTTGT
CTGTGCCTTCATTATCATCGTCAATGTGATTCTCCTGAACCGCAAGCCCATCGGTGATCT
GGAGGAGATTGAGATCATCATCATCTTCTTCTGAAGACACCTTAGCTTCTTTGAAAGAAA
GTGACCTCTTTGCAGAAGCTTGGGAAGGAGTGTCGTCTGTCTCATCATCATCCTCATCTG
TTTCTGACTGCTTGTTGTTTTGAATCAGGTAATGTGCAACAGACTTGTACCCTAGCTTAC
ATACCTTCTTGTAAGCTGTACCAGTGGGCAACCACCCTTTACGTTTACGACAGAGACTGC
AGTTGCAGATTCCGCGACAGCCAGGACAAATCCACTCCGGATTCTCCAGTGTCTCAAGCA
CATGTTCTCCATACCTCATGTACAAACAATCTCCACAGAATTGACCTGTGACAGATGGGT
GACACTTGCTGCATTGTGTTCGATAACCAAGCGTCTTCTGCCTGCC

QA 7 832 7 832
DS 



AS 1 3

CO CL4362Contig1 953 3 4 U
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AAGCTGAAAGCTTTGGACAGTGAAGCTCAGAAGAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAATGGG
CTTCAAAGTTTGCATCTTTCTCCTTGGGTTGGAGAGTCCGGTGGAGCTTACAATAGTGGT
GGCCAACATGTCTCTGATACATTCATAGACAGCCTCTGGTATCTAGACCAGCTTGGAATG
TCGTCCAAACACAACACTAAAGTGTACTGCAGACAGACTTTGGTCGGAGGGTTTCACGGT
CTGCTCGAAAAGGGAACTTTTGTTCCAAATCCTGATTACTATAGTGCACTGCTTTGGCAT
CGGTTAATGGGTAAAGGTGTCCTTGCGGTTCAGACAGATGGACCACCTCAGCTACGTGTT
TACGCTCATTGTTCAAAAGGAAGAGAGGGTGTAACGTTGCTTCTGATCAATCTAAGCAAC
CAATCAGACTTTACGGTTAGTGTCAGCAACGGTGTGAACGTGGCTTTGAACGTAGAGTCA
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AAAGCTTCGGATGGTTATCTGAACAGAGAAGAGTATCATCTAACACCAGAGAAGGGTGAG
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ATCCCGAACCTTGAACCGGTCATCCGTGGAGTGAACTCTCCGGTTTCTGTCTCGTCATTG
TCCATGTCGTTCGTTGTGTTGCCTAATTTTGATGCTTCTGCCTGTTCTTGATGTTAATGT
TGGGTTGTGTCATAAAAAAAAAAGATGTAATTCTTCTGGTAAATTGTATCTAAATGCTGG
TGATAAAGAGTTGTAATTCCATATATCTAAATAAACTTGATGCAGTTTTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FT87TF U 1
AF RR4FT87JQ C 297
AF RR4F006TF U 386
BS 1 483 RR4FT87TF
BS 484 805 RR4F006TF
BS 806 806 RR4FT87JQ
BS 807 953 RR4F006TF

RD RR4FT87TF 483 0 0
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AAGCTGAAAGCTTTGGACAGTGAAGCTCAGAAGAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAATGGG
CTTCAAAGTTTGCATCTTTCTCCTTGGGTTGGAGAGTCCGGTGGAGCTTACAATAGTGGT
GGCCAACATGTCTCTGATACATTCATAGACAGCCTCTGGTATCTAGACCAGCTTGGAATG
TCGTCCAAACACAACACTAAAGTGTACTGCAGACAGACTTTGGTCGGAGGGTTTCACGGT
CTGCTCGAAAAGGGAACTTTTGTTCCAAATCCTGATTACTATAGTGCACTGCTTTGGCAT
CGGTTAATGGGTAAAGGTGTCCTTGCGGTTCAGACAGATGGACCACCTCAGCTACGTGTT
TACGCTCATTGTTCAAAAGGAAGAGAGGGTGTAACGTTGCTTCTGATCAATCTAAGCAAC
CAA

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4FT87JQ 557 0 0
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AGATATCCCGAACCTTGAACCGGTCATCCGTGGAGTGAACTCTCCGGTTTCTGTCTCGTC
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ATGTTGGGTTGTGTCAT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4F006TF 568 0 0
G
GGTTCAGACAGATGGACCACCTCAGCTACGTGTTTACGCTCATTGTTCAAAAGGAAGAGA
GGGTGTAACGTTGCTTCTGATCAATCTAAGCAACCAATCAGACTTTACGGTTAGTGTCAG
CAACGGTGTGAACGTGGCTTTGAACGTAGAGTCAAAGCCGAAGAAGAAGTCGTTGTTGGA
TACTTTGAAGAAACCTTTTGCGTGGATTGGAAACAAAGCTTCGGATGGTTATCTGAACAG
AGAAGAGTATCATCTAACACCAGAGAAGGGTGAGTTGCGTAGCAAGACAATGGTCTTGAA
TGGTAAACCGTTGAAACCGACAGAAACCGGAGATATCCCGAACCTTGAACCGGTCATCCG
TGGAGTGAACTCTCCGGTTTCTGTCTCGTCATTGTCCATGTCGTTCGTTGTGTTGCCTAG
TTTTGATGCTTCTGCCTGTTCTTGATGTTAATGTTGGGTTGTGTCATAAAAAAAAAAGAT
GTAATTCTTCTGGTAAATTGTATCTAAATGCTGGTGATAAAGAGTTGTAATTCCATATAT
CTAAATAAACTTGATGCAGTTTTCTGG

QA 2 568 2 568
DS 



AS 1 3

CO CL4363Contig1 1130 3 7 U
GGACAGATTCCTCCAAATCCACTTCGATGGCGGATCCATCTTCTCAAGGCCCTACCCTTT
CCACTTCACCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTGCCCTTCAATCACAAACCTCTGAACCACCAC
CTTGCTCAGTCTTTCCTTTTCTCAAGAGTGTGAACAGACCGAAACTCCGCTTCACATCTG
AATTCGACAGCGATAGTCTCCTCTTCTTCAACAAAGTGTCTTGTAAGATCTTTGATAACC
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TCTCTTTCACTTCCAAATACGTCTCTGTTCTCTACGATGTCCAGGAGAAGAACACTTTTG
TTAAGAGCAGTGTTGATGTTTCTCCGCGTCTTCAGCTGAGAGCTCTTCATAATGTCAAGG
CGCAACAAGGAGAGGTTGCCATGGAGGCAAATCTAGCTGAACAGGCTACTCCCTGGAGCT
TTCATCACCTGTTCCTATTGGCTATCCAAGAGCAACACTTAAATTCCCACTTGGAGAAGT
TTCAGTACAAGAGAAAGAAGTGGAGGAGGAGGAGAAGAGCAAGCGAATAATATCTGTTAA
CGGGTTCCTCAAACGTCGAGCTATGGATGGTGTTTGTTCTGCTCTCTACACTGATGAAGA
GTTGAGGCTGAGATATGCTTATAAGGATGAAGCATTGTCTTTCATTCCAACCATCTCCCT
TCCTTCAAATGCTGTTTCATTTGCGTTCAAGCGCCGGTTTAGCCCTTCTTATAAGTTGAG
CTACTGGTACAAGTTTGATTCAAACATGTGGAGTGCAGTGTACAAACGCACATATGGTAA
AGACTACAAGTTCAAAGCTGGCTATGATTCTGATGTACGCCTTGGCTGGGCATCTCTCTG
GGTAGGGGAAGAAGATGGAAAAGTAAAAGCGACGCCAATGAAGATGAGAGTGCAGTTCAT
GCTCCAAGTTCCACAAGATGACATCAAAACCTCAGTCTTGATGTTCCGAGTTAAGAAAAG
ATGGGACCTTTGATTGTAAAAATCTTTTCAAAATCACATACATGTTTGTTTCTTCTCTCT
GTAAGAAAACGGATCTATAAGTTGACTTGTCTGATAATAGTATCTTTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG44TF U 1
AF RR4EV01TF U 1
AF RR4EG44JQ C 421
BS 1 299 RR4EG44TF
BS 300 300 RR4EV01TF
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TCTCTTTCACTTC*AAATACGTCTCTGTTCTCTACGATGTCCAGGA
AAGA

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR4EV01TF 663 0 0
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CTTGCTCAGTCTTTCCTTTTCTCAAGAGTGTGAACAGACCGAAACTCCGCTTCACATCTG
AATTCGACAGCGATAGTCTCCTCTTCTTCAACAAAGTGTCTTGTAAGATCTTTGATAACC
TCGCCAAGCTCAAGCTATCGTTTCAGAACAACGCTCAGCGGGAGGTTTCTCAGCCTCAGG
TCTCTTTCACTTCCAAATACGTCTCTGTTCTCTACGATGTCCAGGAGAAGAACACTTTTG
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TTCAGTACAAGAGAAAGAAGTGGAGGAGGAGGAGAAGAGCAAGCGAATAATATCTGTTAA
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GTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4EG44JQ 710 0 0
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TTCAGTACAAGAGAAAGAAGTGGAGGAGGAGGAGAAGAGCAAGCGAATAATATCTGTTAA
CGGGTTCCTCAAACGTCGAGCTATGGATGGTGTTTGTTCTGCTCTCTACACTGATGAAGA
GTTGAGGCTGAGATATGCTTATAAGGATGAAGCATTGTCTTTCATTCCAACCATCTCCCT
TCCTTCAAATGCTGTTTCATTTGCGTTCAAGCGCCGGTTTAGCCCTTCTTATAAGTTGAG
CTACTGGTACAAGTTTGATTCAAACATGTGGAGTGCAGTGTACAAACGCACATATGGTAA
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GTAAGAAAACGGATCTATAAGTTGACTTGTCTGATAATAGTATCTTTTAC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 3

CO CL4364Contig1 619 3 13 U
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AACTCGAATCTGTAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV68JQ U 1
AF RR4B324JQ U 18
AF RR4B324TF C 18
BS 1 89 RR4CV68JQ
BS 90 90 RR4B324JQ
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BS 525 526 RR4B324JQ
BS 527 619 RR4CV68JQ

RD RR4CV68JQ 619 0 0
GCTTAACTCAACTTGCAGTAATTGATAATATATGTTTTAACAACGTCTTCTCAAGCTGTT
TTAAAATCTTCAGGACCCCATTACAAATTTTCGAACAACTGATAAACACAGACACAGAGT
TTTATCAGTTATTTGAACTATATTTCAGCCTTAGAGTTCAGCTCTGGTGTTTCCGGAAAC
GCCAAGAAGCTTGGCCAGTTCCCCGCTCTCATGCGCGTCTACGGCATCATCTGATCCTCC
GACGTGCTTTCCGTCAATGAAAACCTGTGGCACTGTTCGCCTTCCGACAATCTCTCCAAG
TGCACTCTGGATACTGCCCCCATCTTCTCTTTCGTCAAGCT*AACGACATGAGGAACCTG
ATTCAGCTCACTGAACACAGACTTCGCTCTCCTGCAATACGGGCAGTAGGATTTGGAGAA
GATGACAATCTTGTGGGAAGAGATGGTCTTCTTAACAAACTCTGTTTCAGGAGATGCTGA
AGCGGATGAAACCATGGAGATGGATGCAACTAGTGCCACGAGGAGTGCTGCCATCGAGAT
GGATCTGATCATTGTCATGCCTTCTTCTTCTCACTCAGATCTGCTCTGCTATAGGATCGA
AACTCGAATCTGTAGTTCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4B324JQ 595 0 0
GTAATTGATAATATATGTTTTAACAACGTCTTCTCAAGCTGTTTTAAAATCTTCAGGACC
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CTATATTTCAGCCTTAGAGTTCAGCTCTGGTGTTTCCGGAAACGCCAAGAAGCTTGGCCA
GTTCCCCGCTCTCATGCGCGTCTACGGTATCATCTGATCCTCCGACGTGCTTTCCGTCAA
TGAAAACCTGTGGCACTGTTCGCCTTCCGACAATCTCTCCAAGTGCACTCTGGATACTGC
CCCCATCTTCTCTTTCGTCAAGCTCAACGACATGAGGAACCTGATTCAGCTCACTGAACA
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AAGAGATGGTCTTCTTAACAAACTCTGTTTCAGGAGATGCTGAAGCGGATGAAACCATGG
AGATGGATGCAACTAGTGCCACGAGGAACGCTGCCATCGAGATGGATCTGATCATTGTCA
TGCCTTCTTCTTCTCACTCAGATCTGCTCTGCTATAGGATCGAAACTCGAATC
CC

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DS 

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CCATTACAAATTCTCGAACAACTGATAAACACAGACACAGAGTTTTATCAGTTATTTGAA
CTATATTTCAGCCTTAGAGTTCAGCTCTGGTGTTTCCGGAAACGCCAAGAAGCTTGGCCA
GTTCCCCGCTCTCATGCGCGTCTACGGTATCATCTGATCCTCCGACGTGCTTTCCGTCAA
TGAAAACCTGTGGCACTGTTCGCCTTCCGACAATCTCTCCAAGTGCACTCTGGATACTGC
CCCCATCTTCTCTTTCGTCAAGCTCAACGACATGAGGAACCTGATTCAGCTCACTGAACA
CAGACTTTGCTCTCCTGCAATACGGGCAGTAGGATTTGGAGAAGATGACGATCTTGTGGG
AAGAGATGGTCTTCTTAACAAACTCTGTTTCAGGAGATGCTGAAGCGGATGAAACCATGG
AGATGGATGCAACTAGTGCCACGAGGAACGCTGCCATCGAGATGGATCTGATCATTGTCA
TGCCTTCTTCTTCTCACTCAGATCTGCTCTGCTATAGGATCGAAACTCGAATC
CC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL4365Contig1 1270 2 4 U
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CCTTTCGCGCTCATCCTCCTCGCGTCCCCCGCCGCTTCTTGGCTTTTCCTCTACGTGTTC
CGTCCCTCGGATCAGCCGTTGGTCATCGGAGGACGCACGTTCTCTGACCTGGAGACGCTG
GGGATGCTCTGTCTTTGCACCGTGGTGGTGATGTTCATGACGAGCGTCGGTTCGCTCTTG
ATGTCTACACTGGCTCTTGGGACGATGGCTGTGGCCGTGCACGGCGCGTTCCGTGCGCCT
GAAGATCTGTTTCTTGAGGAGCAAGAAACCATTGGATCTGGTCTTTTTACATTCTTTAAC
CAAAATGCTTCGAACGCGGCAGCTGCTGCTATTGCTACATCCGCTATGTCACGAGTTCGA
GCCTGATAAGCTTAATAAACATTACCATTTTCCAACAGATATACGTTTATACTATTGAAT
TTATTCACTCCTTTCGTTTTTATTACTCATAATATTTCAATTTTTGTTAATGTATTCCTC
GACAATTTTTGTTGATGTAATAAAATTTTCTAAACGTGTTTAAGGAGTATTTAACTATCT
TTGTTTATGTTGCTCTTTTACACCAAAGTGAAACTGTGTAAAGCCCAAAACCATATGAGT
AAAAGAATAAGAAGAAGAAAATTACAGGTTGATCTCTTGTTTAAGAGCTCTCTCTATTGT
ATTGACTAGTCTCCTCTGCAGCCTTTGCCCACACATTGGCCATCTTCTCTGCATATCCAA
CCTGGCTAACAACAAACCCCTCCATCATACCCAGGAAGTCTGCACGCCGTTCTCTGTCCA
GCCTTTCACCCTCGGTCCGATTATTTTCCTTGATCCACTCATACTCCCTGATGGCTACGT
TTTTGGCGTCTTCAGTGGCCTTGATGGTTTCTTTTAACTCTTCTATCTTCTTAATCCTTG
ATTTGTCCCCGCCAAACACCTTTGAAGATGCAGCTTCTAGCTTCTCTGCTCTTCCTTCAA
GTGAAGAAACCTCAGATAGAAGCGTCTGCACTGTAAGTAAAGCACTTGATCTATCTGCAA
ATGCGCCCTGGACCGCCATCATTACTCCTAGGTAATCGTGGGGTGCGTCCAAATGCTTGA
CCGTTTGTGAGTTCAGCTCTCTGTAAAACCTGCTAGCTTTCACAGCTGCCGTGGCTAAAT
TCTTCATATCATTGGCACGAGCTCGTTGAGAATTGAAGATAGCTTCTTCGTTCTCGAACT
TAGTCAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D818JQ C 1
AF RR4BR72JQ U 570
BS 1 569 RR4D818JQ
BS 570 612 RR4BR72JQ
BS 613 613 RR4D818JQ
BS 614 1270 RR4BR72JQ

RD RR4D818JQ 689 0 0
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CCTTTCGCGCTCATCCTCCTCGCGTCCCCCGCCGCTTCTTGGCTTTTCCTCTACGTGTTC
CGTCCCTCGGATCAGCCGTTGGTCATCGGAGGACGCACGTTCTCTGACCTGGAGACGCTG
GGGATGCTCTGTCTTTGCACCGTGGTGGTGATGTTCATGACGAGCGTCGGTTCGCTCTTG
ATGTCTACACTGGCTCTTGGGACGATGGCTGTGGCCGTGCACGGCGCGTTCCGTGCGCCT
GAAGATCTGTTTCTTGAGGAGCAAGAAACCATTGGATCTGGTCTTTTTACATTCTTTAAC
CAAAATGCTTCGAACGCGGCAGCTGCTGCTATTGCTACATCCGCTATGTCACGAGTTCGA
GCCTGATAAGCTTAATAAACATTACCATTTTCCAACAGATATACGTTTATACTATTGAAT
TTATTCACTCCTTTCGTTTTTATTACTCATAATATTTCAATTTTTGTTAATGTATTCCTC
GACAATTTTTGTTGATGTAATAAAATTTTCTAAACGTGTTTAAGGAGTATTTAACTATCT
TTGTTTATGTTGCTCTTTTACACCAAAGTGAAACTGTGTAAAGCCCAAAACCATATGAGT
AAAAGAATAAGAAGAAGAAAATTACAGG
C

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4BR72JQ 701 0 0
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CACACATTGGCCATCTTCTCTGCATATCCAACCTGGCTAACAACAAACCCCTCCATCATA
CCCAGGAAGTCTGCACGCCGTTCTCTGTCCAGCCTTTCACCCTCGGTCCGATTATTTTCC
TTGATCCACTCATACTCCCTGATGGCTACGTTTTTGGCGTCTTCAGTGGCCTTGATGGTT
TCTTTTAACTCTTCTATCTTCTTAATCCTTGATTTGTCCCCGCCAAACACCTTTGAAGAT
GCAGCTTCTAGCTTCTCTGCTCTTCCTTCAAGTGAAGAAACCTCAGATAGAAGCGTCTGC
ACTGTAAGTAAAGCACTTGATCTATCTGCAAATGCGCCCTGGACCGCCATCATTACTCCT
AGGTAATCGTGGGGTGCGTCCAAATGCTTGACCGTTTGTGAGTTCAGCTCTCTGTAAAAC
CTGCTAGCTTTCACAGCTGCCGTGGCTAAATTCTTCATATCATTGGCACGAGCTCGTTGA
GAATTGAAGATAGCTTCTTCGTTCTCGAACTTAGTCAGCTT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

CO CL4366Contig1 454 3 6 U
GGAGAACAAGCAACACAAAACACACACAAGACCTGAAACAACTTCAGTTAAGAAAAGAAA
AAAGAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGT
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AAGCCATGTTCATGGGCGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTA
CCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAACCAAAATGTAATATGAATAAATGTTG
ATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTC**TTTTTTTTTTTTGTTCACTAAGCTCA
TATCTTTCTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCT
CTTATAATCTAATATATCATATTATCTACATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H675TF U 1
AF RR4CO36JQ C 6
AF RR4CO36TF U 6
BS 1 195 RR4H675TF
BS 196 196 RR4CO36TF
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BS 335 442 RR4H675TF
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RD RR4H675TF 442 0 0
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AAAGAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGT
GCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACATTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTACAAGG
AAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTA
CCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAACCAAAATGTAATATGAATAAATGTTG
ATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGTTCACTAAGCTCA
TATCTTTCTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCT
CTTATAATCTAATATATCATAT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR4CO36JQ 449 0 0
GG
AAGCAACACAAAACACACACAAGACCTGAAACAACTTCAGTTAAGAAAAGAAAAAAGAAA
ACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAA
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GTTCATGGGCGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTACCTGCAG
TTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAACCAAAATGTAATATGAATAAATGTTGATGTGAG
CTCATTTAGTAAGCTCATATCTTT***TTTTTTTTTTTTGTTCACTAAGCTCATATCTTT
TTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCTCTTATAA
TTTAATATATCATATTATCTACATGTG

QA 3 449 3 449
DS 

RD RR4CO36TF 449 0 0
GG
AAGCAACACAAAACACACACAAGACCTGAAACAACTTCAGTTAAGAAAAGAAAAAAGAAA
ACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAA
GAAGGGAACCAGCTACACATTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCAT
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CTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCTCTTATAA
TCTAATATATCATATTATCTACATGTG

QA 3 449 3 449
DS 



AS 1 3

CO CL4367Contig1 1221 3 4 U
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ATGGGTTCTGGGAATTTTTTCAAGGCAATAATTGGATCGAAGAAAGGGAAACAAACAAAG
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CTAGTTGTTCGTAGCGAGGACTGGGCTGCAACTCGAATTCAGTCTGCTTTTAGAGCCTAT
AAGGCTAGAAAAATGCTACGGCGTCTAAAAGGGATTGCAAGAGCAAAGATGTTAGCTGAA
AAGCATCCGGTGAAGAAGCAAGCGGGAGTGACATTGAAGTATCTGCACTCATGGAGTAAT
ATACAGTCTCAAATAAAGGCTCGCCGAGTTGGCATGGTCGTGGAAAGCAGACTGATGCAT
AAAAGGTTAGAGAATCAGCAGAAGCTTGAGGCTAAGCTTCACGATATTGAGGTTGAATGG
*AATGGTGGGGCAGAGACAAAAGATGAAATCTTAGGGAGGATACATCAAAGGGAAGAAGC
AACGATCAAGCGGGAAAGAGCCTTGGCTTATGCCTTCTCTCATCAGTGGAAAGCAGATGG
TAAGACTCAGTGGCTGGGGGGTTATGAGCTGGGGAATACTAATTGGGGTTGGAGCTGGAA
AGAGCGTTGGATTGCTGTTCGGCCTTGGGAAGTAAGATATTCTTTGGCTCCTAAGAAACC
AAAGAGCTCAAAGACAGTTTGTTGCAAGGGTGAAGCTAAATCAAACTCACCTGCAAAGAG
AGTATCATCAGTTTCAGCCAAAGCTCCGTCTTCTGGAGCTAGAAACGCGGTGAAACCACG
GAGATTGTCATTTCCAGGGGCCTGAACTTAAGTGAGGGCTCAACTTAAGTTAACGTGTGT
CTGCGTATACGAGTATACTACACAAAATCTTGATAAGAGGATTGAGACTGCAAGATATGA
AGGGGTATATTCATTTGGTGTCTGTGTGTTATGTTCTGTCTCTGCTGTGATGTGATGTAA
ATACATGTATTTGATATGCAGGCAATGATGGTGATTCTTGGTTTGATTTTGTAATGCATA
CAATAGTTTGTCTTCGTCGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E136TF U 1
AF RR4E822TF U 1
AF RR4E822JQ C 539
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RD RR4E136TF 718 0 0
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QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4E822TF 669 0 0
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ATCTTCACGAGAAGCTTCTATAGCATTTGAGTTGTCTTTCTTTCCCCTAAAGAGTCTGAG
ATGGGTTCTGGGAATTTTTTCAAGGCAATAATTGGATCGAAGAAAGGGAAACAAACAAAG
GGGCTTTCTCCTGCTGCGAAATCAAAAGCTTCCAAGAAGAAGGGTACTCATGCTTCTTCA
CTAGTTGTTCGTAGCGAGGACTGGGCTGCAACTCGAATTCAGTCTGCTTTTAGAGCCTAT
AAGGCTAGAAAAATGCTACGGCGTCTAAAAGGGATTGCAAGAGCAAAGATGTTAGCTGAA
AAGCATCCGGTGAAGAAGCAAGCGGGAGTGACATTGAAGTATCTGCACTCATGGAGTAAT
ATACAGTCTCAAATAAAGGCTCGCCGAGTTGGCATGGTCGTGGAAAGCAGACTGATGCAT
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*AATGGTGGGGCAGAGACAAAAGATGAAATCTTAGGGAGGATACATCAAAGGGAAGAAGC
AACGATCAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4E822JQ 683 0 0
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GG*AATGGTGGGGCAGAGACAAAAGATGAAATCTTAGGGAGGATACATCAAAGGGAAGAA
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CGGAGATTGTCATTTCCAGGGGCCTGAACTTAAGTGAGGGCTCAACTTAAGTTAACGTGT
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AAATACATGTATTTGATATGCAGGCAATGATGGTGATTCTTGGTTTGATTTTGTAATGCA
TACAATAGTTTGTCTTCGTCGCT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

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ACGTAGTAGTAAAGATATAATGCATATGCTAAACATAGAGCTGGCATCATAAAATAGAAT
AAAAGACACTATAATAATTAATTATAGGGGTATTTTAGGTTTGAGAAAACTGGGGATTCA
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AAAATCCTCTTCCTCCTTGTTCTCTTGGCATCTTTTTAGCAGCTGAAGTTGGCGTCGAAG
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CAGTTTGGGTTGATGGCACCAGCAGATCAACATTTTGTTCGCTCCCGTCACGCACCACAA
CTCCAGTCACAACGGTGCCTGCTGCCTCGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D651JQ U 1
AF RR4AK71TF C 1
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BS 3 113 RR4D651JQ
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BS 333 500 RR4D651JQ
BS 501 570 RR4AK71TF

RD RR4D651JQ 500 0 0
GG
TCTCAAGTTTTATACATCCTCCAATGTAATAGTTTGTGACACAGAATGAGGTTTATTAAC
GTAGTAGTAAAGATATAATGCATATGCTAAACATAGAGCTGGCATCATAAA*TAGAATAA
AAGACACTCTAATAATTAATTATAGGG*TATTTTAGGTTTGAGAAA*CTGGG*ATTCAAA
TGGTGAAGAAGGGAGAAACTTTAGATTCGGGTAGCTGAATCAAAA*GGCAGGTGCAGCGA
AATCCTCTTCCTCTTTGTTCTCTTGGCATCTTTTTAGCAGCTGAAGTTGGCGTCGAAGAT
GCAA*TACCTCTTCTTGAAGCATAGTTGG*AGGGAAGCCATGGAAATGAGCTGCTTCATT
TCTTGCATAAGAGCTTGGTCTTTGACCCCTGACCATGTCTGTGGAGGTAATGCCAACAGA
AGTACAGTGAACACATCGTTTCCTGCAGGATAATTTGCCTCTGGACCACATTCACAGTCA
GTTTGGGTTGATGGCACC

QA 3 500 3 500
DS 

RD RR4AK71TF 570 0 0
GATCTCAAGTTTTATACATCCTCCAATGTAATAGTTTGTGACACAGAATGAGGTTTATTA
ACGTAGTAGTAAAGATATAATGCATATGCTAAACATAGAGCTGGCATCATAAAATAGAAT
AAAAGACACTATAATAATTAATTATAGGGGTATTTTAGGTTTGAGAAAACTGGGGATTCA
AATGGTGAAGAAGAGAGAAACTTTAGATTTGGGTAGCTGAATCAAAAAGGCAGGTGCAGC
AAAATCCTCTTCCTCCTTGTTCTCTTGGCATCTTTTTAGCAGCTGAAGTTGGCGTCTAAG
ATGCAAATACCTCTTCTTGAAGCATAGTTGGGAGGGAAGCCATGGAAATGAGCTGCTTCA
TTTCTTGCATAAGAGCTTGGTCTTTGACCCCTGACCATGTCTGTGGAGGTAATGCCAACA
GAAGTACAGTGAACACATCGTTTCCTGCAGGATAATTTGCCTCTGGACCACATTCACAGT
CAGTTTGGGTTGATGGCACCAGCAGATCAACATTTTGTTCGCTCCCGTCACGCACCACAA
CTCCAGTCACAACGGTGCCTGCTGCCTCGC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 3

CO CL4369Contig1 831 3 5 U
GGATCTCCGATCCTTCCGTGATCCTCGTAATGGCTACGTATACAGCTGACGACGATTACG
ACTTCCTCTACAAAGTGGTACTAATCGGAGACTCCGGCGTCGGCAAATCCAACCTCCTCT
CTCGATTCACACGCAACGAGTTCAGCCTCGAGTCCAAATCCACCATCGGCGTCGAATTCG
CCACCAGAACCATTCACGTCGACGACAAAATCGTCAAAGCTCAGATTTGGGACACCGCCG
GTCAAGAAAGATACCGAGCGATCACTAGCGCATACTATCGAGGAGCTCTAGGAGCATTAC
TTGTCTACGACGTTACACGGCACGTGACTTTCGAGAACGTCGAGAGATGGCTCAAGGAGC
TTAGAGACCACACCGACGCCAACATTGTTATTATGCTCGTTGGGAACAAGGCTGATCTGC
GTCACCTTAGGGCTGTTTCCACGGAAGATGCTACGGCGTTTGCTGAGAGGAAAAGACGTT
CTTTATGGAGACGTCCGCATTGGAAGCTTT*GAACGTTGAGGATGCTTTCACTCAGCTGC
TTTCTCAGATATACTGTGTGGCTAGCAAAAGAGCTTTGGATGTTGGTGATGGTGATGGTG
ATGATCGGTCTGCTCTCCCTAAAGGACAGAGTGTTGATGTCGGGCCTAA*GGGAGATGTG
TCTGAGGTCAAGAAGATCGGTTGCTGCTCGAGTTGATCGCAGTTGTTAGAGGAACTATGT
GGTTTTGAGTAAATCTATGGAACGGATGATGATTCTCCCTTGTCTTGTTACTTTTGGTGT
AAGCTAGTTTCTCGGATCCTTATAAATGTTTTATCTATGTGTTACATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI01TF U 1
AF RR4AI01JQ C 61
AF RR4B734TF U 478
BS 1 731 RR4AI01TF
BS 732 765 RR4B734TF
BS 766 766 RR4AI01JQ
BS 767 802 RR4B734TF
BS 803 831 RR4AI01JQ

RD RR4AI01TF 731 0 0
GGATCTCCGATCCTTCCGTGATCCTCGTAATGGCTACGTATACAGCTGACGACGATTACG
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CTCGATTCACACGCAACGAGTTCAGCCTCGAGTCCAAATCCACCATCGGCGTCGAATTCG
CCACCAGAACCATTCACGTCGACGACAAAATCGTCAAAGCTCAGATTTGGGACACCGCCG
GTCAAGAAAGATACCGAGCGATCACTAGCGCATACTATCGAGGAGCTCTAGGAGCATTAC
TTGTCTACGACGTTACACGGCACGTGACTTTCGAGAACGTCGAGAGATGGCTCAAGGAGC
TTAGAGACCACACCGACGCCAACATTGTTATTATGCTCGTTGGGAACAAGGCTGATCTGC
GTCACCTTAGGGCTGTTTCCACGGAAGATGCTACGGCGTTTGCTGAGAGGAAAAGACGTT
CTTTATGGAGACGTCCGCATTGGAAGCTTT*GAACGTTGAGGATGCTTTCACTCAGCTGC
TTTCTCAGATATACTGTGTGGCTAGCAAAAGAGCTTTGGATGTTGGTGATGGTGATGGTG
ATGATCGGTCTGCTCTCCCTAAAGGACAGAGTGTTGATGTCGGGCCTAA*GGGAGATGTG
TCTGAGGTCAAGAAGATCGGTTGCTGCTCGAGTTGATCGCAGTTGTTAGAGGAACTATGT
GGTTTTGAGTA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4AI01JQ 771 0 0
ACTTCCTCTACAAAGTGGTACTAATCGGAGACTCCGGCGTCGGCAAATCCAACCTCCTCT
CTCGATTCACACGCAACGAGTTCAGCCTCGAGTCCAAATCCACCATCGGCGTCGAATTCG
CCACCAGAACCATTCACGTCGACGACAAAATCGTCAAAGCTCAGATTTGGGACACCGCCG
GTCAAGAAAGATACCGAGCGATCACTAGCGCATACTATCGAGGAGCTCTAGGAGCATTAC
TTGTCTACGACGTTACACGGCACGTGACTTTCGAGAACGTCGAGAGATGGCTCAAGGAGC
TTAGAGACCACACCGACGCCAACATTGTTATTATGCTCGTTGGGAACAAGGCTGATCTGC
GTCACCTTAGGGCTGTTTCCACGGAAGATGCTACGGCGTTTGCTGAGAGGAAAAGACGTT
CTTTATGGAGACGTCCGCATTGGAAGCTTT*GAACGTTGAGGATGCTTTCACTCAGCTGC
TTTCTCAGATATACTGTGTGGCTAGCAAAAGAGCTTTGGATGTTGGTGATGGTGATGGTG
ATGATCGGTCTGCTCTCCCTAAAGGACAGAGTGTTGATGTCGGGCCTAA*GGGAGATGTG
TCTGAGGTCAAGAAGATCGGTTGCTGCTCGAGTTGATCGCAGTTGTTAGAGGAACTATGT
GGTTTTGAGTAAATCTATGGAACGGATGATGATTCTCCCTTGTCTTGTTACTTTTGGTGT
AAGCTAGTTTCTCGGATCCTTATAAATGTTTTATCTATGTGTTACATGATC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4B734TF 325 0 0
GTTCTTTATGGAGACGTCCGCATTGGAAGCTTTTGAACGTTTAGGATGCTTTCACTCAGC
TGCTTTCTCAGATATACCGTGTGGCTAGCAAAAGAGCTTTGGATGTTGGTGATGGTGATG
GTGATGATCGGTCTGCTCTCCCTAAAGGACAGAGTGTTGATGTCGGGTCTAAAGGGAGAT
GTGTCTGAG*TCAAGAAGATCGGTTGCTACTCGAGT*GATCGCAGTTGTTAGAGGAACTA
TGTGGTTTTGAGTAAATCTATGGAACGGATGATGATTCTCCCTTGTCT*GTTACTTTTGG
TGTAAGCTAGTTTCTCGGATCCTTA

QA 1 325 1 325
DS 



AS 1 3

CO CL4370Contig1 484 3 3 U
GGATCGTCAACGCGAATCAGTCACCACCAGAGAGCGAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTT
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CAAGAACTCCAAGTTTGTCCAACAACACAGGCGCTAGGTGAACATGTAGAAGCTGAGAAA
GGGAAAGTCCTTATGAAAAAACTATTTTGAGTGCTTCGGCTTTCAAAACTATTCTAATAA
CATAGAAGAGAGGATTATTGATACTGTTCGTCTCTCTTTTCTTTTTTCATAACTCTTGAA
CAGTGCAAGTTCTACTTTTGTTGATTCAATCTTTTTCTCCCCCGTATGTTTGACTTAGAA
GTGGATTTTGATTCCTCCCTTTCTTTTGGTGTTCCCGTACACTTAAATAAATCTTACAGT
CCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4G303TF U 7
AF RR4DS24JQ C 1
AF RR4DS24TF U 1
BS 1 8 RR4DS24JQ
BS 9 438 RR4G303TF
BS 439 484 RR4DS24TF

RD RR4G303TF 432 0 0
GG
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GGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGCTGTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCG
TTACCGGCGTCCTTATCACCAAGCTCACGGCTGGATTCACCGAGGAAGACGCCAAGAACT
CCAAGTTTGTCCAACAACACAGGCGCTAGGTGAACATGTAGAAGCTGAGAAAGGGAAAGT
CCTTATGAAAAAACTATTTTGAGTGCTTCGGCTTTCAAAACTATTCTAATAACATAGAAG
AGAGGATTATTGATACTGTTCGTCTCTCTTTTCTTTTTTCATAACTCTTGAACAGTGCAA
GTTCTACTTTTGTTGATTCAATCTTTTTCTCCCCCGTATGTTTGACTTAGAAGTGGATTT
TGATTCCTCC

QA 3 432 3 432
DS 

RD RR4DS24JQ 484 0 0
GGATCGTCAACGCGAATCAGTCACCACCAGAGAGCGAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTT
CGATCCATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGCTGTTGGCCGTTTCTCACCGG
ATTCGCCGTTACCGGCGTCCTTATCACCAAGCTCACGGCTGGATTCACCGAGGAAGACGC
CAAGAACTCCAAGTTTGTCCAACAACACAGGCGCTAGGTGAACATGTAGAAGCTGAGAAA
GGGAAAGTCCTTATGAAAAAACTATTTTGAGTGCTTCGGCTTTCAAAACTATTCTAATAA
CATAGAAGAGAGGATTATTGATACTGTTCGTCTCTCTTTTCTTTTTTCATAACTCTTGAA
CAGTGCAAGTTCTACTTTTGTTGATTCAATCTTTTTCTCCCCCGTATGTTTGACTTAGAA
GTGGATTTTGATTCCTCCCTTTCTTTTGGTGTTCCCGTACACTTAAATAAATCTTACAGT
CCTG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4DS24TF 484 0 0
GGATCGTC
AACGCGAATCAGTCACCACCAGAGAGCGAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCAT
GGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGCTGTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCG
TTACCGGCGTCCTTATCACCAAGCTCACGGCTGGATTCACCGAGGAAGACGCCAAGAACT
CCAAGTTTGTCCAACAACACAGGCGCTAGGTGAACATGTAGAAGCTGAGAAAGGGAAAGT
CCTTATGAAAAAACTATTTTGAGTGCTTCGGCTTTCAAAACTATTCTAATAACATAGAAG
AGAGGATTATTGATACTGTTCGTCTCTCTTTTCTTTTTTCATAACTCTTGAACAGTGCAA
GTTCTACTTTTGTTGATTCAATCTTTTTCTCCCCCGTATGTTTGACTTAGAAGTGGATTT
TGATTCCTCCCTTTCTTTTGGTGTTCCCGTACACTTAAATAAATCTTACAGTCCTG

QA 9 484 9 484
DS 



AS 1 2

CO CL4371Contig1 707 2 2 U
GTCTACGCAGGAATAGTGGCGTCTGGAATCGCGTTTGCTGTTCAGATCTGGTGCATTGAC
AGAGGGGGTCCAGTGTTCGTTGCTGTTTACCAACCTGTTCAAACTTTGGTCGTTGCCATA
ATGGCTTCGATTGCTTTAGGCGAAGAGTTTTACTTGGGCGGAATTATTGGAGCTGTGCTG
ATTATAGCGGGACTTTACTTTGTGTTGTACGGTAAGAGCGAAGAGAGGAAGTTCGCAGCT
CTTGAGAAGGCGACGTTCCAGTCCTCCGCGGAGCATGGTATCGAGCGTGCACCCGTTTCT
CGCGGCTCCATCACAGCTCCACTGCTCCACCAGTCAACAAACAACGTTTGACTAATCGAA
TCTTACTCAATAATTACATACAAATGCCATTGCCCGTTACCCAATTAAAAGGGAACAAGG
GTGTACCACATTGTGTTTTATGACTTTTGTGTCTGCTTTTTCTCGTTATTTTTTTCTTAA
TATTTGATTACCTACGAAAGTTTTTTGAGGGGGAAAATGGTGGATGAGACATCATTGTTC
GTGAGGATGGTGGTGATGATGATGATGATAGTGATGATAAAGACTATATGGGAACTTTGA
ATTGGGACTTTTCCAATATTATTATATTTGGCTGATATTATTTATGCCTTTATTACATTT
CTTGTGTGTTTTTGGCTTTTCTATCATCAATAGAATGTTACAATTTG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FB63JQ C 1
AF RR4FB63TF U 1
BS 1 1 RR4FB63JQ
BS 2 707 RR4FB63TF

RD RR4FB63JQ 707 0 0
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ATTATAGCGGGACTTTACTTTGTGTTGTACGGTAAGAGCGAAGAGAGGAAGTTCGCAGCT
CTTGAGAAGGCGACGTTCCAGTCCTCCGCGGAGCATGGTATCGAGCGTGCACCCGTTTCT
CGCGGCTCCATCACAGCTCCACTGCTCCACCAGTCAACAAACAACGTTTGACTAATCGAA
TCTTACTCAATAATTACATACAAATGCCATTGCCCGTTACCCAATTAAAAGGGAACAAGG
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TATTTGATTACCTACGAAAGTTTTTTGAGGGGGAAAATGGTGGATGAGACATCATTGTTC
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ATTGGGACTTTTCCAATATTATTATATTTGGCTGATATTATTTATGCCTTTATTACATTT
CTTGTGTGTTTTTGGCTTTTCTATCATCAATAGAATGTTACAATTTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4FB63TF 707 0 0
G
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TTATAGCGGGACTTTACTTTGTGTTGTACGGTAAGAGCGAAGAGAGGAAGTTCGCAGCTC
TTGAGAAGGCGACGTTCCAGTCCTCCGCGGAGCATGGTATCGAGCGTGCACCCGTTTCTC
GCGGCTCCATCACAGCTCCACTGCTCCACCAGTCAACAAACAACGTTTGACTAATCGAAT
CTTACTCAATAATTACATACAAATGCCATTGCCCGTTACCCAATTAAAAGGGAACAAGGG
TGTACCACATTGTGTTTTATGACTTTTGTGTCTGCTTTTTCTCGTTATTTTTTTCTTAAT
ATTTGATTACCTACGAAAGTTTTTTGAGGGGGAAAATGGTGGATGAGACATCATTGTTCG
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TTGGGACTTTTCCAATATTATTATATTTGGCTGATATTATTTATGCCTTTATTACATTTC
TTGTGTGTTTTTGGCTTTTCTATCATCAATAGAATGTTACAATTTG

QA 2 707 2 707
DS 



AS 1 3

CO CL4372Contig1 940 3 6 U
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TGATGAAGCCCCTGACGAGTAAGCGTATGAGCTATCTCTAGTCCCGGTGCTAGACGAGGC
ATTATCTGAAGAAAGATTCGTGTAGTTGTTGACTCTGTTGTTCACTTCCTCTGTCTTTTT
CTCGACCGGTCCTTTCACTTTCAAGTCCATGAAATCAGAAATCAAACCCGGCCTGGTTAT
GCTCCTGTTCTCTACATCCTTCTCCCCTGTTAACAGCTTCACCACTGTGGACATACTTGG
CCTTAGCTTAGGATCGTCTTGCGTGCACAGAAGACCGATCTTTAGGTACCTGCAAGCTTC
CTCCGCGTCAAAGACTCCGTTTAACCCTGTGTCAACAAGATCCACGAGCTGACTCCGCTC
ATAAAGATCCCAAGCTCTTTCTAGAAGATATTGATAACCCTGGGGTAACCGTGAGTTTTT
GTTGCTTCTTGCACTGACTATCTCCATCAGAAGGACTCCATAGCTGTAAATGTCAGCTTT
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ATGCGGACGTACTTCTTCGTGAAGAAAGGCAAGACCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EO36JQ U 36
AF RR4G834JQ U 1
AF RR4EO36TF C 306
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TGTTGTTCACTTCCTCTGTCTTTTTCTCGACCGGTCCTTTCACTTTCAAGTCCATGAAAT
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CGATCTTTAGGTACCTGCAAGCTTCCTCCGCGTCAAAGACTCCGTTTAACCCTGTGTCAA
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AACCCTGGGGTAACCG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4G834JQ 806 0 0
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ACAACACTGAGACAGAAAAACCGCCATTTTTTTGCGGTTCCTACCGATTCAAAATCTTAA
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TAATTTTTTTTTTTTACTTTTCTAAATGGTACTGCTGAGTGTAGAAACCGCAGTAGTAGA
TGATGAAGCCCCTGACGAGTAAGCGTATGAGCTATCTCTAGTCCCGGTGCTAGACGAGGC
ATTATCTGAAGAAAGATTCGTGTAGTTGTTGACTCTGTTGTTCACTTCCTCTGTCTTTTT
CTCGACCGGTCCTTTCACTTTCAAGTCCATGAAATCAGAAATCAAACCCGGCCTGGTTAT
GCTCCTGTTCTCTACATCCTTCTCCCCTGCTAACAGCTTCACCACTGTGGACATACTTGG
CCTTAGCTTAGGATCGTCTTGCGTGCACAGAAGACCGATCTTTAGGTACCTGCAAGCTTC
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ATAAAGATCCCAAGCTCTTTCTAGAAGATATTGATAACCCTGGGGTAACCGTGAGTTTTT
GTTGCTTCTTGCACTGACTATCTCCATCAGAAGGACTCCATAGCTGTAAATGTCAGCTTT
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ACGAGTGCTGACATGAGTCATGTTGG

QA 1 806 1 806
DS 

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GCTTAGGATCGTCTTGCGTGCACAGAAGACCGATCTTTAGGTACCTGCAAGCTTCCTCCG
CGTCAAAGACTCCGTTTAACCCTGTGTCAACAAGATCCACGAGCTGACTCCGCTCATAAA
GATCCCAAGCTCTTTCTAGAAGATATTGATAACCCTGGGGTAACCGTGAGTTTTTGTTGC
TTCTTGCACTGACTATCTCCATCAGAAGGACTCCATAGCTGTAAATGTCAGCTTTGCGCG
TCACCAGCCCTCTGACCGCATACTCTGGCGCTAGATAACCAATTGTACCGGCGACACGAG
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GGGATAAGTCTCTGTCAAGTAGAATGTTGCTCGCCTTGATATCTCTATGAATGATATGCG
GACGTACTTCTTCGTGAAGAAAGGCAAGACCTCCT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 3

CO CL4373Contig1 834 3 4 U
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ATGAACTAGTATTGTTTCTTCTTGTCTCAGTACAAACTTTGTTCCCAAACTTCCAACAAG
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ATACTTCCATAATCCATCCTTCCACGAGACGTCGAAGGAACATTCGGGACATGATGATTG
TTAGTCCTACGTCCTCCCCAAGGGACACCATTGGTATATGAGCTACTTCTGGGTGAGCGT
TGACCCCCATAATTGTTATTGGACGGAGGAAGCTGTGCATTGATGTGATTCCGATCCATC
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TCATCTGCGCTATCTTCTTGTAGAAGCAATTCATCACTGTAATTTGGGTCCCAGTCTCCT
GGATCAGGCACTGATAAGGCATTATCCGGATTTTCGGGATGGGGTCCAGTACTGGAAGGG
TTATACATATTGGACCGAAGGGATGAGCTTGAAATGTTTTGTGTAGAGTACCCC


BQ
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AF RR4EM05JQ U 1
AF RR4CX05JQ U 1
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BS 1 779 RR4CX05JQ
BS 780 780 RR4CX05TF
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BS 797 834 RR4CX05TF

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DS 

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GAGATTGCACACCAAGAGAAAGAACAAAATAAATGAGAGTTAAGACCGAGAACTTAGGCA
ATACTTCCATAATCCATCCTTCCACGAGACGTCGAAGGAACATTCGGGACATGATGATTG
TTAGTCCTACGTCCTCCCCAAGGGACACCATTGGTATATGAGCTACTTCTGGGTGAGCGT
TGACCCCCATAATTGTTATTGGACGGAGGAAGCTGTGCATTGATGTGATTCCGATCCATC
GCCCTTCCAGCATTTGGCCTCCCGTGATTGACCCGCTGCTGCCCTAAGCGACTTGGAGAG
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QA 1 796 1 796
DS 

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TCTC
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ATGAGCTTGAAATGTTTTGTGTAGAGTACCCC

QA 5 756 5 756
DS 



AS 1 3

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ATTCATAATAACTAAAAAAAAGTTAAAAGCGAGAAGAGAGGAAAGAAGAGCAGATTCATC
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TCATTCGTCTTCTTAATCTTTCTCGATCTGAGATTTCTACGTTTTCAATCGCTCTCTGCT
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CGGAGGTACAAGAACCGTGAGCTTCAGACCATGAGGCTGCTTGACCACCCCAACGCTGTC
TCTCTCAAACACTGCTTCTTCTCCACCACCGAGAAAGACGAGCTTTACCTCAACCTGGTT
CTTGAGTACGTCCCCGAAACTGTTCACCGTGTTATCAAACATTACAACAAACTCAACCAG
CGGATGCCTATCATATACGTCAAACTCTACACCTATCAGATCTTTAGGGCTTTATCTTAC
ATTCACCGTTGTATTGGGGTGTGTCATCGTGACATCAAACCTCAAAACTTGTTGGTAAAT
CCACACACTCATCAAGTGAAGCTATGTGATTTCGGAAGTGCTAAAGTATTGGTAAAAGGG
GAACCAAACATCTCCTACATTTGCTCGAGGTATTACAGAGCACCTGAACTTATCTTTGGA
GCCACCGAGTATACAACAGCCATTGATGTCTGGTCTGCTGGATGTGTTCTTGCTGAGCTC
TTGCTTGGACAGCCATTGTTCCCTGGTGAGAGCGGTGTTGATCAACTTGTTGAGATTATT
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GCATAATATGCCTCTATCTATCTCTGTGTGTATCCACAATCTGAGATGTACCCTCTGTTT
GTTGTATGAGTAGTAGAAAAAAAAAGAAATTATGACTGGTTGGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF87TF U 1
AF RR4HA25TF U 644
AF RR4HA25JQB C 817
BS 1 737 RR4AF87TF
BS 738 738 RR4HA25TF
BS 739 794 RR4AF87TF
BS 795 1282 RR4HA25TF
BS 1283 1666 RR4HA25JQB

RD RR4AF87TF 794 0 0
GGATATCATACGTTTCACTTCACGAGACGAGAAGAGAGAAGAAACAACACAATAAAATAA
ATTCATAATAACTAAAAAAAAGTTAAAAGCGAGAAGAGAGGAAAGAAGAGCAGATTCATC
ATCATCAAAACCCACAATCTCTTCTTATTAAATCGTACGGATCTATCTACCTCCTAAAGA
TCATTCGTCTTCTTAATCTTTCTCGATCTGAGATTTCTACGTTTTCAATCGCTCTCTGCT
TGAAGGGATTGAAAGAAGATAACTTTGTTTTGTAGCCCCTGAAAAATAATGGCATCCGTG
AGCATACCACCACCTCCTCCTCCTATTGACTCTACTGGTGGTGTTGATAAATTGCCTGAA
GAATTGAACGACATGAAGATTCGTGACGATAAAGAGATGGAAGCCACAGTGGTTGATGGT
AACAGCACAGAGACTGGCCACATCATAGTCACTACCATCGGTGGTAGAAACGGCCAACCT
AAACAGACGATCAGCTACATGGCCGAACGTGTCGTTGGCCACGGTTCTTTCGGCGTTGTC
TTCCAGGCGAAATGCCTCGAGACAGGAGAAACCGTTGCGATTACGAAAGTTTTGCAAGAC
CGGAGGTACAAGAACCGTGAGCTTCAGACCATGAGGCTGCTTGACCACCCCAACGCTGTC
TCTCTCAAACACTGCTTCTTCTCCACCACCGAGAAAGACGAGCTTTACCTCAACCTGGTT
CTTGAGTACGTCCCCGAGACTGTTCACCGTGTTATCAAACATTACAACAAACTCAACCAG
CGGATGCCTATCAT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4HA25TF 639 0 0
G
CCACCCCAACGCTGTCTCTCTCAAACACTGCTTCTTCTCCACCACCGAGAAAGACGAGCT
TTACCTCAACCTGGTTCTTGAGTACGTCCCTGAAACTGTTCACCGTGTTATCAAACATTA
CAACAAACTCAACCAGCGGATGCCTATCATATACGTCAAACTCTACACCTATCAGATCTT
TAGGGCTTTATCTTACATTCACCGTTGTATTGGGGTGTGTCATCGTGACATCAAACCTCA
AAACTTGTTGGTAAATCCACACACTCATCAAGTGAAGCTATGTGATTTCGGAAGTGCTAA
AGTATTGGTAAAAGGGGAACCAAACATCTCCTACATTTGCTCGAGGTATTACAGAGCACC
TGAACTTATCTTTGGAGCCACCGAGTATACAACAGCCATTGATGTCTGGTCTGCTGGATG
TGTTCTTGCTGAGCTCTTGCTTGGACAGCCATTGTTCCCTGGTGAGAGCGGTGTTGATCA
ACTTGTTGAGATTATTAAGGTTTTGGGAACGCCTACTAGGGAGGAAATCAAGTGCATGAA
TCCAAACTACACGGAGTTCAAGTTCCTTCAGATTAAAGCTCATCCATGGCACAAGATTTT
TCACAAACGTATGCCTCCAGAGGCTGTTGATTTGGTAT

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR4HA25JQB 850 0 0
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AAACCTCAAAACTTGTTGGTAAATCCACACACTCATCAAGTGAAGCTATGTGATTTCGGA
AGTGCTAAAGTATTGGTAAAAGGGGAACCAAACATCTCCTACATTTGCTCGAGGTATTAC
AGAGCACCTGAACTTATCTTTGGAGCCACCGAGTATACAACAGCCATTGATGTCTGGTCT
GCTGGATGTGTTCTTGCTGAGCTCTTGCTTGGACAGCCATTGTTCCCTGGTGAGAGCGGT
GTTGATCAACTTGTTGAGATTATTAAGGTTTTGGGAACGCCTACTAGGGAGGAAATCAAG
TGCATGAATCCAAACTACACGGAGTTCAAGTTCCTTCAGATTAAAGCTCATCCATGGCAC
AAGATTTTTCACAAACGTATGCCTCCAGAGGCTGTTGATTTGGTATCAAGGCTTCTTCAA
TACTCTCCCAATCTACGATCTGCCGCTCTTGACACATTGGTCCACCCATTCTTTGATGAG
CTAAGAGATCCAAATGCGCGTCTGCCTAATGGACGTTTCCTTCCACCACTGTTCAACTTC
AAGCCTCACGAGCTGAAAGGTGTGGCAGTGGAGACTGTAGCTAAGTTAGTACCTGAGCAT
GCGAGGAAGCAGTGTCCTTGGCTCGGTTTGTAATTTCCTTTAAATAAAAAAACCTTAAAT
GTAGTAGCACAAAGCACTAAACTTGCATAATATGCCTCTATCTATCTCTGTGTGTATCCA
CAATCTGAGATGTACCCTCTGTTTGTTGTATGAGTAGTAGAAAAAAAAAGAAATTATGAC
TGGTTGGTTT

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 3

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AGCTATTGAAGGAGATGTGTTGGAGCAGTACAAGAGCTATAAGATAACACTCGACGTTGT
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ATCAGTTTCTACT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 

AF RR4FQ78TF U 54
AF RR4BW51JQ C 1
AF RR4BW51TF U 1
BS 1 673 RR4BW51TF

RD RR4FQ78TF 528 0 0
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AATTTTTCAACACTTTCAAGAAGAAAGAAGGAAATTTCACAGACAAGACAGCGGCAGTTT
CTGTTCATCGTGACGATCCCAAATCCAACTCCTCGATTCAGATCTGGAACTTCATCGTAG
ATGGAAAGATGGAGCATATTAAGGAGAAGATAGATGTTGATGAGGAGAACAAGTCGGTTT
CTTTCTTAGCTATTGAAGGAGATGTGTTGGAGCAGTACAAGAGCTATAAGATAACACTCG
ACGTTGTTCCTAGAGATGCTGGAGTTTGTATTGCCAAGTGGAAATGGGAGTACGAGAAGC
TCAACGACGACGTTCCACCCCCTACCAAATACATTGCTTTCGTTGCAGATTACACGCGTG
ACCTCGAGACTAGGTTGTTGTCTGAATCATAAATTAACAACTCATCAACGTGGTCTTTGA
GTTTCCTTCTTAAAATAAATCAAATCTTATAGTCGCCTGTTTTGGTT
C

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4BW51JQ 673 0 0
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TCCTAGAGATGCTGGAGTTTGTACTGCCAAGTGGAAATGGGAGTACGAGAAGCTCAACGA
CGACGTTCCACCCCCTACCAAATACATTGCTTTCGTTGCAGATTACACGCGTGACCTCGA
GACTAGGTTGTTGTTTGAATCATAAATTAACAACTCATCAACGTGGTCTTTGAGTTTCCT
TCTTAAAATAAATCAAATCTTATAGTCGCCTGTTTTGGTTTTTCTTTGGACTTGTTTACA
GTCTATTTGTAGTTAGAACCTGTTAAAGCAATCTATACATGCACGACCCCAAATCAAGAC
ATCAGTTTTTACT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4BW51TF 673 0 0
GGCGATGGTAAAATATTAAGACAAGACAAGACAACACGAGATCTCAAATTGTAGAGCCAT
GGCGGGCGTTCAGACTCTCGACCTGGAGATCCAAGTGAACATGACGGCCGATAAATTTTT
CAACACTTTCAAGAAGAAAGAAGGAAATTTCACAGACAAGACAGCGGCAGTTTCTGTTCA
TCGTGACGATCCCAAATCCAACTCCTCGATTCAGATCTGGAACTTCATCGTAGATGGAAA
GATGGAGCATATTAAGGAGAAGATAGATGTTGATGAGGAGAACAAGTCGGTTTCTTTCTT
AGCTATTGAAGGAGATGTGTTGGAGCAGTACAAGAGCTATAAGATAACACTCGACGTTGT
TCCTAGAGATGCTGGAGTTTGTACTGCCAAGTGGAAATGGGAGTACGAGAAGCTCAACGA
CGACGTTCCACCCCCTACCAAATACATTGCTTTCGTTGCAGATTACACGCGTGACCTCGA
GACTAGGTTGTTGTCTGAATCATAAATTAACAACTCATCAACGTGGTCTTTGAGTTTCCT
TCTTAAAATAAATCAAATCTTATAGTCGCCTGTTTTGGTTCTTCTTTGGACTTGTTTACA
GTCTATTTGTAGTTAGAACCTGTTAAAGCAATCTATACATGCACGACCCCAAATCAAGAC
ATCAGTTTCTACT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL4376Contig1 706 2 4 U
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TATTTTTTTGTTGATCTTGGCATGTTTCTAAGTTCTTCTCGATGCTAAGGCCATAACCTC
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ATCATCATCCGTTGTGGTCCTAATGTCACCTAACTCATCGTCGTTGACATGAAACCGTTC
ATTATCACTAACGTTCTTGTCATCACCATGTTCAGCCATCGCCCAAACACCTTTCCTCCC
CATCTCAATCTCATCGTTACCTCTCCCCATGTTTGGACTCATAAAACCGCCAACAGCTGA
TCTCGACGGCATTGGAGCTGCTTACCTAGGTACCATAGCTCTGAAACTGTTCTTGGAAGG
AGGTACCGCAGAACAAAAGATCTCTTTAAAGTTATCAACCACTCCTCTGTTGTGTGGGTT
GGTACGCCGGTCATAATTATATCTGAAATTCTCATATGTAGTCTGATTTGTGCTGATGAG
ATAGAGATGGAAACCAGTTAAGCCTCCAACGAACCACATACAAATG


BQ
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AF RR4D054JQ U 1
AF RR4H410JQB U 1
BS 1 545 RR4D054JQ
BS 546 546 RR4H410JQB
BS 547 685 RR4D054JQ
BS 686 706 RR4H410JQB

RD RR4D054JQ 685 0 0
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TCATAACTTCTGAAAAATCAAACCAATTCACAATTGATTTATCTGAACAACACAAAATAC
AATCAGTAAACAAAAAAAAAGCTGAAAATCATACAAAACACATTTTGAAAACACCTCAGT
TATTTTTTTGTTGATCTTGGCATGTTTCTAAGTTCTTCTCGATGCTAAGGCCATAACCTC
TGGTGACATTTCCCAGCTTGAGTGCCTTGGGTGAATGTTTGGCCTACCACTCTGTTGTTC
ATCATCATCCGTTGTGGTCCTAATGTCACCTAACTCATCGTCGTTGACATGAAACCGTTC
ATTATCACTAACGTTCTTGTCATCACCATGTTCAGCCATCGCCCAAACACCTTTCCTCCC
CATCTCAATCTCATCGTTACCTCTCCCCATGTTTGGACTCATAAAACCGCCAACAGCTGA
TCTCGACGGCATTGGAGCTGCTTACCTAGGTACCATAGCTCTGAAACTGTTCTTGGAAGG
AGGTATCGCAGAACAAAAGATCTCTTTAAAGTTATCAACCACTCCTCTGTTGTGTGGGTT
GGTACGCCGGTCATAATTATATCTGAAATTCTCATATGTAGTCTGATTTGTGCTGATGAG
ATAGAGATGGAAACCAGTTAAGCCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4H410JQB 706 0 0
A
CAATAAAACACAATGATTAGAGTTTTTAACTGTCTGAACACAACAACTAATAAAAACACT
CATAACTTCTGAAAAATCAAACCAATTCACAATTGATTTATCTGAACAACACAAAATACA
ATCAGTAAACAAAAAAAAAGCTGAAAATCATACAAAACACATTTTGAAAACGCCTCAGTT
ATTTTTTTGTTGATCTTGGCATGTTTCTAAGTTCTTCTCGATGCTAAGGCCATAACCTCT
GGTGACATTTCCCAGCTTGAGTGCCTTGGGTGAATGTTTGGCCTACCACTCTGTTGTTCA
TCATCATCCGTTGTGGTCCTAATGTCGCCTAACTCATCGTCGTTGACATGAAACCGTTCA
TTATCACTAACGTTCTTGTCATCACCATGTTCAGCCATCGCCCAAACACCTTTCCTCCCC
ATCTCAATCTCATCGTTACCTCTCCCCATGTTTGGACTCATAAAACCGCCAACAGCTGAT
CTCGACGGCATTGGAGCTGCTTCCCTAGGTACCATAGCTCTGAAACTGTTCTTGGAAGGA
GGTACCGCAGAACAAAGGATCTCTTTAAAGTTATCAACCACTCCTCTGTTGTGTGGGTTG
GTACGCCGGTCATAATTATATCTGAAATTCTCATATGTAGTCTGATTTGTGCTGATGAGA
TAGAGATGGAAACCAGTTAAGCCTCCAACGAACCACATACAAATG

QA 2 706 2 706
DS 



AS 1 2

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AACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCTCCCACAGGCAAGTACATTATTCTTGCTGGGTTGA
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CTGAACACTTCATGGCCACTGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACAG
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CATTCTTGTCTCCGGAGAAGGAAGAAGAGATCGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGA
AGTACGAGTTGGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGGGAGAAGA
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AGGATGAAGCCAAAGAAGTCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATGTTATTGACGTCACTGAAG
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TATCGTCTTCTGTTCGTTGAAGTTTTAGAATTTTCAATTTTGTTTCCTTGGATATTATTA
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BQ
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AF RR4BF96TF U 1
AF RR4B574JQ C 8
BS 1 228 RR4BF96TF
BS 229 229 RR4B574JQ
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BS 736 886 RR4B574JQ

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AACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCTCCCACAGGCAAGTACATTATTCTTGCTGGGTTGA
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CAGTGACGTCAGTCCATGAGATGGAGAATGGGTTCACCATCTGGTCGTTCAATGGAAAAT
TGCTTTACCGGAATCTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCATGGCGCCCAAGACCTCCAT
CATTCTTGTCTCCGGAGAAGGAAGAAGAGATCGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGA
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AGGAGAAACTTGCGAGGCAAAACCTCAAGGATGGAGAAATCAGTGATGAGGAAGAAGAAG
AGGATGAAGCCAAAGAAGTCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATGTTATTGACGTCACTGAAG
AAGTCGTCCAAGAATGAATGCAAGTTTCCTCCCCACTTCAATAAGTGTCATTCTCCTTTC
CTTTTCCTGTCCTTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4B574JQ 879 0 0
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GTCAGTCCATGAGATGGAGAATGGGTTCACCATCTGGTCGTTCAATGGAAAATTGCTTTA
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GTCTCCGGAGAAGGAAGAAGAGATCGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTACGA
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GTTGAAGGAAGAGTGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCGCTGCAGGAAGAGGAGAA
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AGCCAAAGAAGTCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATGTTATTGACGTCACTGAAGAAGTCGT
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TGTCCTTTGGATCACTCTTTAGACATCTATCAAACTGTTTCTTTCTTTTTTGTTATCGTC
TTCTGTTCGTTGAAGTTTTAGAATTTTCAATTTTGTTTCCTTGGATATTATTATGTTCTT
AATCCAGTTTCGGATTATATGTTGGAGCACTTTAATAAG

QA 1 879 1 879
DS 



AS 1 3

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CTGACCCCATCCAATCAAACGCCACA*CTTTTCCACACGTCGGCTCAGTGCCACTTTCTC
TCCTTTGCTGGTGCAAACCGGGGCGGTGAGTTGCAACTTGGCCAGATCGTTCTTAACTCC
AACAACTTTGGCACCAGTCGACATGGAACCGATGTTGAGCATCAGAATCTCTCCCTTTGT
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AATGCGAGAGTAGATTGGAGTGCATTTTGGGTTGCCACGCTCGTCTTTCACAACAATTCC
AGGTCGGATCTCGATTAACTGGTTGACTTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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TAG

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BQ
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AF RR4A684JQ C 1
AF RR4CI52TF U 53
AF RR4A684TF U 1
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QA 1 438 1 438
DS 



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BQ
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AF RR4CD18JQ U 1
AF RR4CV75JQ U 26
AF RR4CD18TF C 1
BS 1 748 RR4CD18JQ

RD RR4CD18JQ 748 0 0
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QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4CV75JQ 714 0 0
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CC

QA 1 712 1 712
DS 

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AGGCCGAGCCTTGAATGAAAGCTCTCTTGCCACCGTTCCACGTCTCGTTCAAGACATGCA
CCGTGCCGTCAGGGTTGAGGGTGTAGGTGGCGCGAGTGTCAACACCGTTCTTGGGCTGAA
AAATGGAAGGGAAAGAAGCAATCTCATACCAGCGGCCCACGTATCTCTCCAAGTCGAGAT
TTTTCACCACTTCCATCACTTTCTTCTCCGTTGTCATCTTTTCTTCTTCTCTACGTTTCA
GATATTTTATTTGCTTTGAGGTGTAGTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

CO CL4381Contig1 756 3 11 U
GGGATGAAAACCTAAACTATTCCAGTCAAATCTTGATAGACAGATGGGGCTAACGGAAGA
AGAAATCAGAAGACTACACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGG
CTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGG
TGACAACATGAAAAGAGATGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAGAAACGATAGCAGTGA
TCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTA
CACAAACCGGATGAAGTCAGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCT
CACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTT
CCAGGAGGCGGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGT
TCTCACCACAGAAGATAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCT
TCCAAGGATTCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGT
CATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAGCCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGT
ATAATAAGCCAACATTGCTTGATTAGAGAATAATTGTTTTTGTTCCAAACTCTTGACAAT
GTTCTTTCTTAAAAGTAAGAATTGAAAACCTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4FS11TF U 1
AF RR4H211TF U 17
AF RR4H211JQ C 255
BS 1 311 RR4FS11TF
BS 312 312 RR4H211TF
BS 313 487 RR4FS11TF
BS 488 489 RR4H211TF
BS 490 495 RR4FS11TF
BS 496 496 RR4H211TF
BS 497 625 RR4FS11TF
BS 626 626 RR4H211TF
BS 627 701 RR4FS11TF
BS 702 754 RR4H211TF
BS 755 756 RR4H211JQ

RD RR4FS11TF 701 0 0
GGGATGAAAACCTAAACTATTCCAGTCAAATCTTGATAGACAGATGGGGCTAACGGAAGA
AGAAATCAGAAGACTACACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGG
CTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGG
TGACAACATGAAAAGAGATGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAGAAACGATAGCAGTGA
TCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTA
CACAAACCGGACGAAGTCAGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCT
CACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTT
CCAGGAGGCGGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGT
TCTCACC**AGAAGAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCT
TCCAAGGATTCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGT
CATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGT
ATAATAAGCCAACATTGCTTGATTAGAGAATAATTGTTTTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4H211TF 738 0 0
GG
ATTCCAGTCAAATCTTGATAGACAGATGGGGCTAACGGAAGAAGAAATCAGAAGACTACA
CAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTC
CGAGATCACGATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGAGA
TGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTT
CCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTC
AGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAA
TTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCGGAAATGCT
AGTGAACATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTCACCACAGAAGATAA
GAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGAC
TGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCC
CAGTGAAGCCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAGCCAACATTGC
TTGATTAGAGAATAATTGTTTTTGTTCCAAACTCTTGACAATGTTCTTTCTTAAAAGTAA
GAATTGAAAACCTTGA

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR4H211JQ 502 0 0
TCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGA
AGTCAGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTC
GTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCGGAAA
TGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTCACCACAGAAG
ATAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAG
TGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATAC
GTCCCAGTGAAGCCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAGCCAACA
TTGCTTGATTAGAGAATAATTGTTTTTGTTCCAAACTCTTGACAATGTTCTTTCTTAAAA
GTAAGAATTGAAAACCTTGACG

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 3

CO CL4382Contig1 500 3 7 U
GGGAAAGTGCTGCTGCTCATTGTTCCTCTCAGATCGAAGCGAAGAAGCTAAGCTAAGCAA
AGCGACACAATGGCGGCGACTCCGATTACGAGTCCGATTCCGGTGGCGATGTACCCGACT
CTGTCGGTGTTCACTCTTGCGATCGGCCTCATCATCACCGCTATCTTCTTCATCTATGAA
GCTACATCATCCAGGAAAAACCGTAGCCTCGCCAAGGAGCTCGCGACTGCAGCAGTAGCA
TCTGTTTTCTTGGGTTTTGGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGA
TCATCCCTCTTACTCAAATACTATCATCCCCTCTAGTTTCAGTGAACAAAAGAACATCTT
TTTTTCTTTCTGTCCAACATATCAGAGTTATGAATGTTAAGACTTCAACTATATCTTTTA
ATGTAAACGGAATTTGAATGTGGCCACTATTAGAACAGCGTTTGCGTCAGTCAAGTTTAT
CAACTTATATATATTCTACC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DC03TF U 2
AF RR4AL16JQ C 1
AF RR4AL16TF U 1
BS 1 1 RR4AL16JQ
BS 2 20 RR4DC03TF
BS 21 21 RR4AL16TF
BS 22 372 RR4DC03TF
BS 373 373 RR4AL16TF
BS 374 448 RR4DC03TF
BS 449 500 RR4AL16TF

RD RR4DC03TF 447 0 0
GGAAAGTGCTGCTGCTCATCGTTCCTCTCAGATCGAAGCGAAGAAGCTAAGCTAAGCAAA
GCGACACAATGGCGGCGACTCCGATTACGAGTCCGATTCCGGTGGCGATGTACCCGACTC
TGTCGGTGTTCACTCTTGCGATCGGCCTCATCATCACCGCTATCTTCTTCATCTATGAAG
CTACATCATCCAGGAAAAACCGTAGCCTCGCCAAGGAGCTCGCGACTGCAGCAGTAGCAT
CTGTTTTCTTGGGTTTTGGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGAT
CATCCCTCTTACTCAAATACTATCATCCCCTCTAGTTTCAGTGAACAAAAGAACATCTTT
TTTTCTTTCTGCCCAACATATCAGAGTTATGAATGTTAAGACTTCAACTATATCTTTTAA
TGTAAACGGAATTTGAATGTGGCCACT

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4AL16JQ 500 0 0
GGGAAAGTGCTGCTGCTCATTGTTCCTCTCAGATCGAAGCGAAGAAGCTAAGCTAAGCAA
AGCGACACAATGGCGGCGACTCCGATTACGAGTCCGATTCCGGTGGCGATGTACCCGACT
CTGTCGGTGTTCACTCTTGCGATCGGCCTCATCATCACCGCTATCTTCTTCATCTATGAA
GCTACATCATCCAGGAAAAACCGTAGCCTCGCCAAGGAGCTCGCGACTGCAGCAGTAGCA
TCTGTTTTCTTGGGTTTTGGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGA
TCATCCCTCTTACTCAAATACTATCATCCCCTCTAGTTTCAGTGAACAAAAGAACATCTT
TTTTTCTTTCTGTCCAACATATCAGAGTTATGAATGTTAAGACTTCAACTATATCTTTTA
ATGTAAACGGAATTTGAATGTGGCCACTATTAGAACAGCGTTTGCGTCAGTCAAGTTTAT
CAACTTATATATATTCTACC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4AL16TF 500 0 0
G
GGAAAGTGCTGCTGCTCATTGTTCCTCTCAGATCGAAGCGAAGAAGCTAAGCTAAGCAAA
GCGACACAATGGCGGCGACTCCGATTACGAGTCCGATTCCGGTGGCGATGTACCCGACTC
TGTCGGTGTTCACTCTTGCGATCGGCCTCATCATCACCGCTATCTTCTTCATCTATGAAG
CTACATCATCCAGGAAAAACCGTAGCCTCGCCAAGGAGCTCGCGACTGCAGCAGTAGCAT
CTGTTTTCTTGGGTTTTGGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGAT
CATCCCTCTTACTCAAATACTATCATCCCCTCTAGTTTCAGTGAACAAAAGAACATCTTT
TTTTCTTTCTGTCCAACATATCAGAGTTATGAATGTTAAGACTTCAACTATATCTTTTAA
TGTAAACGGAATTTGAATGTGGCCACTATTAGAACAGCGTTTGCGTCAGTCAAGTTTATC
AACTTATATATATTCTACC

QA 2 500 2 500
DS 



AS 1 3

CO CL4383Contig1 732 3 3 U
GGGAATCTGAAGGAGCTCTATCGCAGAAATGGAAAGAACGCTTCTTGTGACCTTGTCTGT
GTTACTCTTTTCTTCTGTTG***CGGCAGATGATTACGTCCGACCAAAACCTCGTCAAGC
TTTACAGTTTCCATGGAAACAAAAGTCCACTTCTCAACCCGAGCAGGTGCATATCTCATT
GGCTGGAGAAAAACATATGCGAGTGGGTTGGGTCACCAACGACAAATCTTCGCCTTCCTT
TGTTGAATACGGAACATCTCCAGGGAAATACTCCTTTCTTGGTCAAGGAGAGAGCACCTC
TTACAGCTACATATTCTACAGATCAGGGAAGATACACCACGCCGTCATCGGCCCATTGGA
ACCGAACACGGTTTACTATTACCGTTGCGGTGGAGGAGGACCTGAGTTTCATCTGAAAAC
ACCACCGGCTCAGTTCCCGATCACTTTCGCAGTGGCTGGTGATCTTGGTCAAACCGGTTG
GACCAAGTCGACGCTAGATCACATCGATCAGTGCAGATACGAAGTGCATCTGCTCCCCGG
TGATCTTTCTTATGCTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGAGAGCTTGTTCA
GCCTCTGGCGAGTGTGAGCCCTGGATGGTGACTCAAGGAAACCATGAGAAAGAGATATTC
CGTTTGTGGTGGATGAGTTTGTGTCGTATAACTCGAGTGGATATGCCTTACGCGGAGAGG
GATCAATTCGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR38TF U 50
AF RR4E167TF U 1
AF RR4DT67TF U 1
BS 1 640 RR4DT67TF
BS 641 641 RR4E167TF
BS 642 732 RR4DT67TF

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TCCCCTTCCTTTGTTGAATACGGAACATCTCCAGGGAAATACACCTTTCTTGGCCAAGGA
GAGAGCACTTCATACAGCTACATATTCTACAGATCAGGGAAGATACACCACGCCGTCATC
GGTCCATTAGAACCGAACACGGTTTACTATTACCGTTGCGGTGGAGGAGGACCTGAGTTT
CATCTTAAAACACCACCAGCTCAGTTCCCAATCACTTTCGCAGTGGCTGGTGATCTTGGT
CAAACCGGTTGGACCAAGTCGACGCTAGATCACATCGATCAGTGCAGGTACGAAGTGCAT
CTGCTCCCCGGTGATCTTTCTTATGCTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGA
GAGCTTGTTCAGCCTCTGGCGAGTGTGAGCCCTGGATGGTGACTCAAG
AAACCA

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DS 

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DS 

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TTTACAGTTTCCATGGAAACAAAAGTCCACTTCTCAACCCGAGCAGGTGCATATCTCATT
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ACCACCGGCTCAGTTCCCGATCACTTTCGCAGTGGCTGGTGATCTTGGTCAAACCGGTTG
GACCAAGTCGACGCTAGATCACATCGATCAGTGCAGATACGAAGTGCATCTGCTCCCCGG
TGATCTTTCTTATGCTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGAGAGCTTGTTCA
GCCTCTGGCGAGTGTGAGCCCTGGATGGTGACTCAAGGAA*CCATGAGAAAGAGATATTC
CGTTTGTGGTGGATGAGTTTGTGTCGTATAACTCGAGTGGATATGCCTTACGCGGAGAGG
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QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL4384Contig1 885 3 14 U
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CCAGCTTTTGTTCCAATATGGAGTCAACGACACCAAAGGAACTCTCTCAGACAAACATGT
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CGATGTTATAGGCGTTACATACCGAAGACTTGATGGCAGTACTCAAGTCACAGATAGACA
AACTATAGTCGACACATTCAACAACGATAAGTCGATATTTGCTTGTCTGTTGTCAACTCG
AGCAGGCGGACAAGGTCTGAATTTAACGGGAGCAGATACAGTGATTATTCACGATATGGA
TTTTAATCCACAGATTGATCGGCAAGCTGAAGATCAATGCCATCGTATCGGTCAAACCAA
ACCAGTCACTATCTTCAGACTGGTGACGAAGTCAACGGTGGATGAGAACATCTACGAGAT
AGCAAAGAGGAAACTTGTACTTGATGCGGCGGTTTTAGAGTCGGGAGTTCACGTAGATGA
CAACGGAGACACGCCGGAGAAAACCATGGGAGAGATTCTCGCTTCTCTTCTCATGGGATA
ACAGTTCTTTTCTCTGTTGTCTTTGAGGTAAATTGAGAAACGAAATTTATGTGTTATCGG
AGAGAAACATGTGTAACACTAGTAGTAGCTTACCAGATATATCTCTATAGTTTTTTTTGG
GGTCAAGTGATATATCTATAGTTACATTTCTCTTACGCATGTAAACTGAAAACCAAACAT
TCTCGGTCTAATGAACGTTGGATGAACATTTCATGTTTGGAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G749TF U 93
AF RR4AL51TF U 1
AF RR4G749JQ C 169
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G
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CAGATATATCTCTATAGTTTT

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR4AL51TF 847 0 0
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TATGCTCTCAGCAAAATGTCGGATATTAGCGGAGCTTCTTCCTTCAATGAAGAAATCAGG
CAATCGTGTTCTAATATTCAGTCAGTGGACATCGATGCTCGATATCTTAGAGTGGACACT
CGATGTTATAGGCGTTACATACCGAAGACTTGATGGCAGTACTCAAGTCACAGATAGACA
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DS 

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TCACGATATGGATTTTAATCCACAGATTGATCGGCAAGCTGAAGATCAATGCCATCGTAT
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CATCTACGAGATAGCAAAGAGGAAACTTGTACTTGATGCGGCGGTTTTAGAGTCGGGAGT
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TCTCATGGGATAACAGTTCTTTTCTCTGTTGTCTTTGAGGTAAATTGAGAAACGAAATTT
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AGTTTTTTT*GGGGTCAAGTGATATATCTATAGTTACATTTCTCTTACGCATGTAAACTG
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QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAAGGCGAAGTCAAAGATGTCAAAAGCAGAGAAAGAAGCGAGGAAGAAGCAGAAGATGC
AGGCGTTTCAACAGGCTAAACAGAAGTCAAAGGCCAGCAAGAATTCAAAGAGATGGAACT
GAGTACTGAAAGGAGTCTTAGAGATTTATAAAAAGTCTTCTTAGAGTTGCAACGTCTTTA
TTGTGGAATCAGTTTGTATAGATATACTTTTTCAGTTAAAGGTACTATTAGG


BQ
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AF RR4D968TF U 1
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BS 1 690 RR4D968TF
BS 691 691 RR4D968JQ
BS 692 737 RR4D968TF
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BS 753 763 RR4D968TF
BS 764 1012 RR4D968JQ

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DS 

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AGGTCTGTTAGGACGGTGCAACTTCAAAGCAGACATGCTTGATCGTAAGGTCTCTCTTTT
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GCTTGTTTTGGCGAACCGACCAATCACTTGGACATTCCTTCGAAAGAGATGCTTGAGGAA
GCGATAAACGAGTACCAAGGTACAGTCATTGCAGTCTCACACGACCGATACTTCATCAAA
CAGATTGTTAACAGAGTCATAGAAGTTGAAGATGGTTGTTTGGAAGATTACGCAGGAGAC
TACAATTATTATTTGGAGAAGAACCTGGAAGCTAGAGCAAAGGCGGTAGAGAGAGAAGCA
GAGCTAGAAGAGAAAGCACCAAAAGTGAAGGCGAAGTCAAAGATGTCAAAAGCAGAGAAA
GAAGCGAGGAAGAAGCAGAAGATGCAGGCGTTTCAACAGGCTAAACAGAAGTCAAAGGCC
AGCAAGAATTCAAAGAGATGGAACTGAGTACTGAAAGGAGTCTTAGAGATTTATAAAAAG
TCTTCTTAGAGTTGCAACGTCTTTATTGTGGAATCAGTTTGTATAGATATACTTTTTCAG
TTAAAGGTACTATTAGG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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AACTGTGATCATATTCAAGTACAACACCAATAGGAAACAAAACATAGAGGAATCTCTAGA
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GTCTAATCGATATAATCGCCTCCAGACCTGCGGCTTTTGCAGCAGTAGCTTCTTGGTAAA
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TGTAACTCCTGCTTTCTTTCTTGTTTCCGATTGTAGCGTCGAAAAAGCCAGATAAATACT
TCCTCAGATCTCCATAGCTTGTGTTCCCAAAGAGAAGCCTTTGAGCTAATCTAATACCAC
TAGAATATATGTAAACCTTAGTTCCTGACGTGTGCCATTTCTCTAAAGCGTCTGCTACAT
CTTCGAAAACGACAGACTTCAGTTCATTACACTGGAAACCTGTTCGCCATATGTGACCTT
GCAATTCCTTTAAAGCAGTGATCTTTCTATCAGCTTTTATCATTGCCTCTACATTAGAGA
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TTTCTGCTGTCTCGTACGTCAAATTCAAATGCTTCCCAACGTTCTCACGAGCATAGGGAA
AGAGAACATCGGTGACGAATGTTATGGGGGTTGTTGTCCCTTCAATGTCCAGGACAATGC
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ATTCTGTGAGTGTGTGGCTCTTTGGATAGGCCCATGTTCTGGAGTAGCAGCATCCAGACC
CAGTTGATGAAGCTTGATGGCAGCATCGAACAGATAATGGTAACATTCAGACCGAGTCTT
AGCATGGATCCAGGAATCACCCCAAATGTAAACTCCGTGATTGCGTACCAACACTGCCGT
TGCTTTTGGATAGGCTTCCATAGCTTTAGTGAGAGAATCAGTGAGCTCATTCTCATAAGC
AGTGTTCTCTATGATTGGGACAACGAGCTCGTCATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ21JQ U 1
AF RR4A878JQ U 37
AF RR4FZ21TF C 494
BS 1 100 RR4FZ21JQ
BS 101 101 RR4A878JQ
BS 102 336 RR4FZ21JQ
BS 337 337 RR4A878JQ
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RD RR4FZ21JQ 715 0 0
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AACTGTGATCATATTCAAGTACAACACCAATAGGAAACAACACATAGAGGAATCTCTAGA
TTTGTGAGAATGATGTGACAGTCTTGAACCCGTGATTCTCTGGTAGGGAAGCGTTTCCAG
GTCTAATCGATATAATCGCCTCCAGACCTGCGGCTTTTGCAGCAGTAGCTTCTTGGTAAA
CATCAGTCACAAAAAGAATATCAGAAGGATCATCCACTCCCAATGTTTCTGTAATCTCCT
TGTAACTCCTGCTTTCTTTCTTGTTTCCGATTGTAGTGTCGAAAAAGCCAGATAAATACT
TCCTCAGATCTCCATAGCTTGTGTTCCCAAAGAGAAGCCTTTGAGCTAATCTAATACCAC
TAGAATATATGTAAACCTTAGTTCCTGACGTGTGCCATTTCTCTAAAGCGTCTGCTACAT
CTTCGAAACCGACAGACTTCAGTTCATTACACTGGAAACCTGTTCGCCATATGTGACCTT
GCAATTCCTTTAAAGCAGTGATCTTTCTATCAGCTTTTATCATTGCCTCTACATTAGAGA
CCATAGCTGCAATGACCTCGTCTTTTCCTTCATCAGCATGAGGTACAGGAACAGCACCGG
GTACACCTTGTCTCAAGTCTTCCTCCACCTGAGACCGCAACAACTTAATATCCT
C

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4A878JQ 769 0 0
ATTATCAAAGTCCATTTATTTGGTAACTGTGATCATATTCAAGTACAACACCAATAGGAA
ACAAAACATAGAGGAATCTCTAGATTTGTGAGAATGATGTGACAGTCTTGAACCCGTGAT
TCTCTGGTAGGGAAGCGTTTCCAGGTCTAATCGATATAATCGCCTCCAGACCTGCGGCTT
TTGCAGCAGTAGCTTCTTGGTAAACATCAGTCACAAAAAGAATATCAGAAGGATCATCCA
CTCCCAATGTTTCTGTAATCTCCTTGTAACTCCTGCTTTCTTTCTTGTTTCCGATTGTAG
CGTCGAAAAAGCCAGATAAATACTTCCTCAGATCTCCATAGCTTGTGTTCCCAAAGAGAA
GCCTTTGAGCTAATCTACTACCACTAGAATATATGTAAACCTTAGTTCCTGACGTGTGCC
ATTTCTCTAAAGCGTCTGCTACATCTTCGAAAACGACAGACTTCAGTTCATTACACTGGA
AACCTGTTCGCCATATGTGACCTTGCAATTCCTTTAAAGCAGTGATCTTTCTATCAGCTT
TTATCATTGCCTCTACATTAGAGACCATAGCTGCAATGACCTCGTCTTTTCCTTCATCAG
CATGAGGTACAGGAACAGCACCGGGTACACCTTGTCTCAAGTCTTCCTCCACCTGAGACC
GCAACAACTTAATATCCTATTGGGTTTCTGCTGTCTCGTACGTCAAATTCAAATGCTTCC
CAACGTTCTCACGAGCATAGGGAAAGAGAACATCGGTGACGAATGTTAT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4FZ21TF 683 0 0
AGACTTCAGTTCAT*ACACTGGAAAC*TGTTCGCCATATGTGAC*TTGCAATTCCTTTAA
AGCAGTGATCTTTCTATCAGCTTTTATCATTGCCTCTACATTAGAGACCATAGCTGCAAT
GACCTCGTCTTTTCCTTCATCAGCATGAGGTACAGGAACAGCACCGGGTACACCTTGTCT
CAAGTCTTCCTCCACCTGAGACCGCAACAACTTAATATCCTCTTGGGTTTCTGCTGTCTC
GTACGTCAAATTCAAATGCTTCCCAACGTTCTCACGAGCATAGGGAAAGAGAACATCGGT
GACGAATGTTATGGGGGTTGTTGTCCCTTCAATGTCCAGGACAATGCATCGCCAAGGATA
TTTGTTTGGTTTTGTGAATCCTTGACTCCGGATTTCACAGATAATTGATTCTGTGAGTGT
GTGGCTCTTTGGATAGGCCCATGTTCTGGAGTAGCAGCATCCAGACCCAGTTGATGAAGC
TTGATGGCAGCATCGAACAGATAATGGTAACATTCAGACCGAGTCTTAGCATGGATCCAG
GAATCACCCCAAATGTAAACTCCGTGATTGCGTACCAACACTGCCGTTGCTTTTGGATAG
GCTTCCATAGCTTTAGTGAGAGAATCAGTGAGCTCATTCTCATAAGCAGTGTTCTCTATG
ATTGGGACAACGAGCTCGTCATA

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL4389Contig1 764 3 7 U
GGGAGAAAGATAGAGGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCAGCGA
ACCTCGCGAGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGT
CCATGTTAGGCGGAATCAAAAGCTCCCTCGCATTAAGGACATGTC**AAGCCCACACCTC
TCCGATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGT
CATCATCGTCTCCATCTCCCTCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAAAACGACAGTAGCAG
AAAACCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCTTGGTGCTCATACTCGTCCGAAGTGAAGTCGT
TGTTCAATGGGCTTCAAGTTAAGCCTCTCGTTATTGAACTTGATCAACTTGGTGCAGAGG
GGTCGCAGCTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACCGGACAATACACTGTTCCTAATGTTT
TCATCGGAGGCAAGCATATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGGG
AGCTGGAGCCAATGTTAGCTGAGGCAAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATGAAAAC
TGGTTGGAGATTTGTTTACGTGTCCGTTTCTGTTTAATCAGAACCTCTGAATTAAAATTC
TTCAAGTTGAGATGATGTGCTGTCTACGTAGAGATTTCATAAGAACCCTATTATGCGTCT
TTCCATGGAAGTAAAATAAATAAACAGGCAGACTGGTTTCTCTT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F272TF U 4
AF RR4F891TF U 1
AF RR4F891JQ C 3
BS 1 704 RR4F891TF
BS 705 705 RR4F891JQ
BS 706 735 RR4F891TF
BS 736 736 RR4F891JQ
BS 737 743 RR4F891TF
BS 744 744 RR4F891JQ
BS 745 764 RR4F891TF

RD RR4F272TF 630 0 0
G
GAAAGATAGAGGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCATCGAACCT
CGCGAGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGCTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGTCCAT
GTTAGGCGGAATCAAAAGCTCCCTCGCATTAAGGACATGTCTAAAGCCCACACCTCTCCT
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ATCGTCTCCATCTCCCTCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAAAACGACAGTAGCAGAAAA
CCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCTTGGTGCTCATACTCGTCTGAAGTGAGGTCGTTGTT
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CGGAGGCAAGCATATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGGGAGCT
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TGGAGATTTGTTTACGTGTCCGTTTCTGT

QA 2 630 2 630
DS 

RD RR4F891TF 764 0 0
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ACCTCGCGAGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGT
CCATGTTAGGCGGAATCAAAAGCTCCCTCGCATTAAGGACATGTC**AAGCCCACACCTC
TCCGATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGT
CATCATCGTCTCCATCTCCCTCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAAAACGACAGTAGCAG
AAAACCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCTTGGTGCTCATACTCGTCCGAAGTGAAGTCGT
TGTTCAATGGGCTTCAAGTTAAGCCTCTCGTTATTGAACTTGATCAACTTGGTGCAGAGG
GGTCGCAGCTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACCGGACAATACACTGTTCCTAATGTTT
TCATCGGAGGCAAGCATATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGGG
AGCTGGAGCCAATGTTAGCTGAGGCAAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATGAAAAC
TGGTTGGAGATTTGTTTACGTGTCCGTTTCTGTTTAATCAGAACCTCTGAATTAAAATTC
TTCAAGTTGAGATGATGTGCTGTCTACGTAGAGATTTCATAAGA*CCCTATTATGCGTCT
TTCCATGGAAGTAAA*TAAATAA*CAGGCAGACTGGTTTCTCTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4F891JQ 762 0 0
GA
GAAAGATAGAGGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCAGCGAACCT
CGCGAGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGTCCAT
GTTAGGCGGAATCAAAAGCTCCCTCGCATTAAGGACATGTC**AAGCCCACACCTCTCCG
ATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGTCATC
ATCGTCTCCATCTCCCTCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAAAACGACAGTAGCAGAAAA
CCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCTTGGTGCTCATACTCGTCCGAAGTGAAGTCGTTGTT
CAATGGGCTTCAAGTTAAGCCTCTCGTTATTGAACTTGATCAACTTGGTGCAGAGGGGTC
GCAGCTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACCGGACAATACACTGTTCCTAATGTTTTCAT
CGGAGGCAAGCATATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGGGAGCT
GGAGCCAATGTTAGCTGAGGCAAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATGAAAACTGGT
TGGAGATTTGTTTACGTGTCCGTTTCTGTTTAATCAGAACCTCTGAATTAAAATTCTTCA
AGTTGAGATGATGTGCTGTCTACGTAGAGATTTCATAAGAACCCTATTATGCGTCTTTCC
ATGGAAGTAAAATAAATAAACAGGCAGACTGGTTTCTCTT

QA 3 762 3 762
DS 



AS 1 3

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GGATTCATTTTATTCACCAAAGAAAAAACTAATAGAAACTTAACTAGACGACAAGAAATA
CATTTCTTGATTTCTTGGTAAATGGCGTCTTCAAATACTCTGGCGATATCTCCGAGGAAG
CTCCGTTCAGACCTTTATTCATACTCTTACCAAGACGGTTCTAGCACACCACTCGTGATC
TCTGTTCTCTCGTCTCTGATTGAACGGACGTTGGCTCGGAACGAGAGGATCAGCCGGAGC
TATGGTGGTTTTGGAAAGACACGTGTCTTCGACTGCCTAGAGATTCCTGACATGACGATC
CAATCGTATTTAGAGAGGATTTTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTATGTCGTG
GCTTATGTCTACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAATCAGTCTCACT
AATGTACATCGTCTCCTCATCACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATG
AACTACAGAAACTCGTACTTTGCGAAAGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGATTTAAACAAC
TTGGAACTGGAGTTCTTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGCGTGTTC
GAGAGTTACTGTTGTCATCTTGAGAGAGAAGTAAGTATAGGAGGAGGTTATCAGATCGAG
AAAGCATTGCGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCCAGACAAATTGTTCAAGATCCAAAACAC
CATAATCAATTTCCAAGAATCTTGTTGTAGTCAAAAACTCTGTTTTGTTTTGTCGGTTTG
CTTTTGAGGGTGTTTGACTTTTTGATTACCTTGTGTCCTTGTCGGTTGGGTTTTTCTTGA
AATGTAAATAGAGAGAAAATATAGAGACCGGTGTTGTATGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB96TF U 1
AF RR4GL42TF U 14
AF RR4BB96JQ C 70
BS 1 55 RR4BB96TF
BS 56 56 RR4GL42TF
BS 57 726 RR4BB96TF
BS 727 733 RR4GL42TF
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BS 752 883 RR4BB96JQ

RD RR4BB96TF 726 0 0
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CATTTCTTGATTTCTTGGTAAATGGCGTCTTCAAATACTCTGGCGATATCTCCGAGGAAG
CTCCGTTCAGACCTTTATTCATACTCTTACCAAGACGGTTCTAGCACACCACTCGTGATC
TCTGTTCTCTCGTCTCTGATTGAACGGACGTTGGCTCGGAACGAGAGGATCAGCCGGAGC
TATGGTGGTTTTGGAAAGACACGTGTCTTCGACTGCCTAGAGATTCCTGACATGACGATC
CAATCGTATTTAGAGAGGATTTTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTATGTCGTG
GCTTATGTCTACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAATCAGTCTCACT
AATGTACATCGTCTCCTCATCACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATG
AACTACAGAAACTCGTACTTTGCGAAAGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGATTTAAACAAC
TTGGAACTGGAGTTCTTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGCGTGTTC
GAGAGTTACTGTTGTCATCTTGAGAGAGAAGTAAGTATAGGAGGAGGTTATCAGATCGAG
AAAGCATTGCGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCCAGACAAATTGTTCAAGATCCAAAACAC
CATAAT

QA 1 726 1 726
DS 

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GG
ACCAAAGAAAAAACTAATAGAAACTTAACTAGACGACAAGAAATACATTTCTTGATTTCT
TGGTAAATGGCGTCTTCAAATACTCTGGCGATATCTCCGAGGAAGCTCCGTTCAGACCTT
TATCCATACTCTTACCAAGACGGTTCTAGCACACCACTCGTGATCTCTGTTCTCTCGTCT
CTGATTGAACGGACGTTGGCTCGGAACGAGAGGATCAGCCGGAGCTATGGTGGTTTTGGA
AAGACACGTGTCTTCGACTGCCTAGAGATTCCTGACATGACGATCCAATCGTATTTAGAA
AGGATTTTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTATGTCGTGGCTTATGTCTACATT
GACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAATCAGTCTCACTAATGTACATCGTCTC
CTCATCACAACAATCATGGTTGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGAACTATAGAAACTCG
TACTTTGCAAAAGTAGGAGGATTAGAGACGGAAGATTTAAACAACTTGGAACTGGAGTTC
TTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGCGTGTTCGAGAGTTACTGTTGT
CATCTTGAGAGAGAAGTAAGTATAGGAGGAGGTTATCAGATCGAGAG*GCATTGCGTTGC
GCTGAGGAAATCAAATCCAGACAA*TTGTTCAAGATCCTAAACACCATAATCAATTTC**
AGAATCTTGTTGTAGT

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR4BB96JQ 814 0 0
ATTTCTTGGTAAATGGCGTCTTCAAATACTCTGGCGATATCTCCGAGGAAGCTCCGTTCA
GACCTTTATTCATACTCTTACCAAGACGGTTCTAGCACACCACTCGTGATCTCTGTTCTC
TCGTCTCTGATTGAACGGACGTTGGCTCGGAACGAGAGGATCAGCCGGAGCTATGGTGGT
TTTGGAAAGACACGTGTCTTCGACTGCCTAGAGATTCCTGACATGACGATCCAATCGTAT
TTAGAGAGGATTTTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTATGTCGTGGCTTATGTC
TACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAATCAGTCTCACTAATGTACAT
CGTCTCCTCATCACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGAACTACAGA
AACTCGTACTTTGCGAAAGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGATTTAAACAACTTGGAACTG
GAGTTCTTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGCGTGTTCGAGAGTTAC
TGTTGTCATCTTGAGAGAGAAGTAAGTATAGGAGGAGGTTATCAGATCGAGAAGGCATTG
CGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCCAGACAAATTGTTCAAGATCCAAAACACCATAATCAA
TTTTCAAGAATCTTGTTGTAGTCAAAAACTCTGTTTTGTTTTGTCGGTTTGCTTTTGAGG
GTGTTTGACTTTTTGATTACCTTGTGTCCTTGTCGGTTGGGTTTTTCTTGAAATGTAAAT
AGAGAGAAAATATAGAGACCGGTGTTGTATGTAG

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 3

CO CL4391Contig1 904 3 37 U
GGGGAGAGAGAGTTAAAGATCTACGAAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGGAGAGCAGA
CAAGCGAAGAGGATCTCAAAGATCAATGTCTTTGTATTCGTCGGTCTGATACTATTGAAT
TCAATCAATCAAATCTCCTCGCTCTCCGTTACAGTCGAGGAAGATGAATGCGTCCAAGAG
TACGTCCTCTACGAAGGAGACACCGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATGTC
TTCTGGGGACCGGATCATACCGGTATTGATTTCACGGTGACGTCACCTTCTGGGAACATT
GTACAGACGTTGAAAGGGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCACCGAGGAGTGGG
ATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACTCTGCTCCTGAGACTGTCTCCTTCTACATT
CACGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGACGAACATTTGGACCCGGTG
AATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGTCTTTGGAATCTGTTGTTGCTGAGCAGAAGTAT
CTTAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATA
TTCTACACAGTAGGAGAGTACATTTTCCTTGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGATTCTCTAC
ATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCATACAACAGAGTTTGAACATAATTGAAACCC
CCACGACATCGTTTTGTCTCTTTTTTTTAATGTTTTGAATCGGTAACACACCATCTTTTG
AAAATGTTAGTTAATTAAGACCTTAACATCGAAAGACCCTTTTTGTTTTTGTTTTCGGTA
TCTACATTTTTCATTAACTTCAGTTTTGTTTATGTTTTAACAATGGAGGACTTGATATGC
TTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4F609TF U 1
AF RR4BF51TF U 50
AF RR4BF51JQ C 228
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BS 78 78 RR4BF51TF
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RD RR4F609TF 828 0 0
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CAAGCGAAGAGGATCTCGAAGATCAATGTCTTTGTATTCGTCGGTCTGATACTATTGAAT
TCAATCAATCAAATCTCCTCGCTCTCCGTTACAGTCGAGGAAGATGAATGCGTCCAAGAG
TACGTCCTCTACGAAGGAGACACCGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATGTC
TTCTGGGGACCGGATCATACCGGCATTGATTTCTCGGTGACGTCACCTGCTGGGAACATT
GTACAGACGTTGAAGGGGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTTAAGGCGCCGAGAAGTGGG
ATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACTCTGCTCCTGAGACTGTCTCTTTCTACATT
CACGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGACGAACATTTGGACCCGGTG
AATGTTAAGATAGCTGAGTTGAGAGAGTCTTTGGAATCTGTTGTTGCTGAGCAGAAGTAT
CTTAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATA
TTCTACACAGTAGGAGAGTACATTTTCCTTGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGATTCTCTAC
ATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCATACAACAGAGTTTGAACATAATTGAAACCC
C*ACGACATCGTTTTGTCTCTTTTTTTTAATGTTTTGA*TTGGTA*CACACCATCTTT**
GAAATGTTAGTTAATTAAGAC*TTAACATCGAAAGACC*TTTTTGTTT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4BF51TF 791 0 0
G
GGAGAGCAGACAAGCGGCGAGGATCTCAAAGATCAATGTCTTTGTATTGGTCGGTCTGAT
ACTATTGAATTCAATCAATCCAATCTCCTCGCTCTCCGTTACAGTCGAGGAAGATGAATG
CGTCCAAGAGTACGTCCTCTACGAAGGAGACACCGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGA
CCATGATGTCTTCTGGGGACCGGATCATACCGGTATTGATTTCACGGTGACGTCACCTTC
TGGGAACATTGTACAGACGTTGAAAGGGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCACC
GAGGAGTGGGATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACTCTGCTCCTGAGACTGTCTC
CTTCTACATTCACGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGACGAACATTT
GGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGTCTTTGGAATCTGTTGTTGCTGA
GCAGAAGTATCTTAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAGAAA
GCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATTTTCCTTGCAGCAGCAAGTGGTCTTCA
GATTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCATACAACAGAGTTTGAACATA
ATTGAAACCCCCACGACATCGTTTTGTCTCTTTTTTTTAATGTTTTGAATCGGTAACACA
CCATCTTTTGAAAATGTTAGTTAATTAAGACCTTAACATCGAAAGACCCTTTTTGTTTTT
GTTTTCGGTA

QA 2 791 2 791
DS 

RD RR4BF51JQ 677 0 0
CGACCATGATGTCTTCTGGGGACCGGATCATACCGGTATTGATTTCACGGTGACGTCACC
TTCTGGGAACATTGTACAGACGTTGAAAGGGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGC
ACCGAGGAGTGGGATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACTCTGCTCCTGAGACTGT
CTCCTTCTACATTCACGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGACGAACA
TTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGTCTTTGGAATCTGTTGTTGC
TGAGCAGAAGTATCTTAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAG
AAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATTTTCCTTGCAGCAGCAAGTGGTCT
TCAGATTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCATACAACAGAGTTTGAAC
ATAATTGAAACCCCCACGACATCGTTTTGTCTCTTTTTTTTAATGTTTTGAATCGGTAAC
ACACCATCTTTTGAAAATGTTAGTTAATTAAGACCTTAACATCGAAAGACCCTTTTTGTT
TTTGTTTTCGGTATCTACATTTTTCATTAACTTCAGTTTTGTTTATGTTTTAACAATGGA
GGACTTGATATGCTTAC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL4392Contig1 687 2 5 U
GGAGAAAATCTAACGCAATCTTATTAAATCTGATGAAAAAAGAAATCGAAACAGAAAATC
AAAGAAAACAAATAAAATCCTAAATCAAATAACAAAAAACAAGAACTTAAACATTCAAAC
TACTCATCGGTCTGTAAATTGTATCGGTTATACAACATGACAGAATCAGCTGCGACGGGC
TCATTGTCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAGCGCGTGGGTCTTGTTCTTAATCTCCAAG
AGAGCGTGACCGAAACTAGCCTCTCTATATGCTGAGTAGCTTGGTTGTGGGTCAGTGTAG
CTGTTTGCGATTCCTTCAATGTTTCCTCCATCTCCAATAGTGATGTACATTGGAGCAGTA
AGATCTTTCACAGGGGTACTCAAGCCATTGGTGATGTTGTACTTAATATTGGAGAAACGT
TCGGATCTCTCATAGGCATGGACGTGACCAGCCAAGACCAAGTCAACTTTGCTGTTAACA
AGCCACGACTCAAACATAATCCTCATGCTCTCACCTTCCATGTAATGGTAGTTGTTGCTG
TTGTACCACGGCGAATGAACCATGACTATCAACCAGGGAGTCTCCTCTCTGTTCACGTTC
TTTAGCTCTTGCTCCAGCCACAAGTATTGTGGCGTGTATTTGCCGTAGGCAGAGTAAGAG
GAAAGGACGATGATGTGAGCAGGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FD02TF C 1
AF RR4GU32JQ U 295
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BS 295 632 RR4GU32JQ
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AAAGAAAACAAATAAAATCCTAAATCAAATAACAAAAAACAAGAACTTAAACATTCAAAC
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TCATTGTCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAGCGCGTGGGTCTTGTTCTTAATCTCCAAG
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AGATCTTTCACAGGGGTACTCAAGCCATTGGTGATGTTGTACTTAATATTGGAGAAACGT
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QA 1 371 1 371
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGCTCTGTGGGTTTATCCTGTCAAGTCCCCATATCCTTATGGTGCCATCATCGCTTGCTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DA26JQ U 1
AF RR4BU16TF C 70
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QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4BU16TF 747 0 0
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TGCGTCCTCTGACCTTTCCAGCATTCCATCTCTCTACCGTCTAAGTCCCACATGCCGATG
CTCCGGTCTGTCATCC

QA 12 747 12 747
DS 



AS 1 3

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GAACAGAACTAGCTGGCTTTGCTGTTCTTGATCAGGCTATCTCCTGCGTCTGTTCTCTCT
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TCTGTAAGCTTCCAACTCCTCCATGTCTTGCTTGGGACTTCTCGTCTGCCTATTCTGGCT
AGTGTACACATCTGAATCCTTGGACACGCTTAACCTTCCACCGTTTTGAGGAACA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CH20JQ U 1
AF RR4CS19JQ U 1
AF RR4FH69JQ U 74
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BS 762 775 RR4FH69JQ

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QA 1 761 1 761
DS 

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GCCATGACAAACTAAAATAACCATTCACTTTTCTCACACTTGCTTGCTAATATATCACAT
CACATCATTTTACTACAACCATTTGTATTTATATATCTACATACTTAAAAACTAGATTCT
ATCTCAAGAGTTAGCATCACCAGATCATATCAAACACTTTTCAACTTTCAAAGACCTTAA
GAACAGAACTAGCTGGCTTTGCTGTTCTTGATCAGGCTATCTCCTGCGTCTGTTCTCTCT
GCCTTCTCTTAAGCTTCTTCCTCTCCTGTATTCAATCTCTGCATCAGAGCTTGAGAAAGC
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CGCATGAATACCATTTCTTGGTTTGTGATCTTTGCAGCCATTTGATGATGACTTTGGTGG
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TAGCTTCTGTCCATCGCTCGGAGAGTAAGCAGAAGTGAACAAAGAATCATCCATCACATT
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AGTGTACACATCTGAATCCTTGGACACGCTT

QA 1 751 1 751
DS 

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G
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CATCACCAGATCATATCAAACACTTTTCAACTTTCAAAGACCTTAAGAACTGAACTAGCT
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AATCCTTGGACACGCTTAACCTTCCACCGTTTTGAGGAACA

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DS 



AS 1 3

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TGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGG
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CCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTACACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCT
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BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H672TF U 1
AF RR4H672JQB C 1
AF RR4BG36TF U 6
BS 1 5 RR4H672JQB
BS 6 423 RR4H672TF
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TTTTT
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QA 6 423 6 423
DS 

RD RR4H672JQB 681 0 0
TTTTTAGGGCTTTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTC
TCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCCCACTAGAGCCACCCGAAGTACCAATT
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TGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGG
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TGAATCTTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCGTTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAG
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TTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATGTGTCGTATTGAATAAAATATC
AATGATTGTTTTTTT
TAGTCG

QA 1 675 1 675
DS 

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AACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTG
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AAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCA
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TGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGA
TTGTTTTTTTAGTCAACACGGTTTTTCCGTTATTTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

CO CL4397Contig1 883 3 5 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX19JQ U 1
AF RR4G064JQ U 47
AF RR4GX19TF C 108
BS 1 263 RR4GX19JQ
BS 264 264 RR4G064JQ
BS 265 721 RR4GX19JQ
BS 722 781 RR4G064JQ
BS 782 883 RR4GX19TF

RD RR4GX19JQ 721 0 0
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CAAACCACTAGTTTAACACATGAGATACATTGGTAAACCGAAGATTGAAAAGTGTGTTCC
AAAGTGAAGATTTTGGTTGTTCTTGCGATGTCTTATAACACACACATAAAGTGAAATGAA
AACAGTAGCAAGAGAACTAGTAATAGTAGCCAAGGATGACTTCCCCTTTTGGTGGGAAAC
ATGAAAACAGCACCAAAGTCTCAAATATGGACAGACAAATGGTGCAAGTCCCCACCTCCA
TGCATGTCATTGGATTGATGACCATTAACAAGCATGGCTCGGTTAGTCTGAGTTGTTTGG
AAACCTGAAAACTGGAATCCGGTGTGTCCAAAGATATCAACACCGTCGGAAGCAGATGTG
ATGTCTGATCCAGATGTCGTTGAGCTACGGTCTTTGTTATGTTGCAGCACATGAGCTTCA
AATCTAGACATGTTTGCCTTTTTGCTTTCTTCTTGTTCTTTAGCAGTACCCTGTTGTGAT
TCTTGAAGAAGTTTCTTGGTGTTTAGGAATCTTCCACCGGATCCTCTTGGTCTTTTAAGA
GCATGAACATGTCGAGACTCATGAAGATACGGCTTCCTGGCTTTGATTAACTTGTTCTGA
GCCTCAAGCTTGGCACGTTGCTGCCTTCTCCTCATGATTGCGTGATACTGCTTCGCATTG
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4G064JQ 735 0 0
GCTTATAATAAAACCAAACCACTAGTTTAACACATGAGATACATTGGTAAACCGAAGATT
GAAAAGTGTGTTCCAAAGTGAAGATTTTGGTTGTTCTTGCGATGTCTTATAACACACACA
TAAAGTGAAATGAAAACAGTAGCAAGAGAACTAGTAATAGTAGCCAAGGATGACTTCCCC
TTTTGGTGGGAAACATGAAAACAGCACCAAAGTCTCAGATATGGACAGAGAAATGGTGCA
AGTCCCCACCTCCATGCATGTCATTGGATTGATGACCATTAACAAGCATAGCTCGGTTAG
TCTGAGTTGTTTGGAAACCTGAAAACTGGAATCCGGTGTGTCCAAAGATATCAACACCGT
CGGAAGCAGATGTGATGTCTGATCCAGATGTCGTTGAGCTACGGTCTTTGTTATGTTGCA
GCACATGAGCTTCAAATCTAGACATGTTTGCCTTTTTGCTTTCTTCTTGTTCTTTAGCAG
TACCCTGTTGTGATTCTTGAAGAAGTTTCTTGGTGTTTAGGAATCTTCCACCGGATCCTC
TTGGTCTTTTAAGAGCATGAACATGTCGAGACTCATGAAGATACGGCTTCCTGGCTTTGA
TTAACTTGTTCTGAGCCTCAAGCTTGGCACGTTGCTGCCTTCTCCTCATGATTGCGTGAT
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GACCAGGAACCATAC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GX19TF 776 0 0
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AAAGTGAAATGAAAACAGTAGCAAGAGAACTAGTAATAGTAGCCAAGGATGACTTCCC*T
TTTGGTGGGAAACATGAAAACAGCACCAAAGTCTCAGATATGGACAGACAAATGGTGCAA
GTCCCCACCTCCATGCATGTCATTGGATTGATGACCATTAACAAGCATGGCTCGGTTAGT
CTGAGTTGTTTGGAAACCTGAAAACTGGAATCCGGTGTGTCCAAAGATATCAACACCGTC
GGAAGCAGATGTGATGTCTGATCCAGATGTCGTTGAGCTACGGTCTTTGTTATGTTGCAG
CACATGAGCTTCAAATCTAGACATGTTTGCCTTTTTGCTTTCTTCTTGTTCTTTAGCAGT
ACCCTGTTGTGATTCTTGAAGAAGTTTCTTGGTGTTTAGGAATCTTCCACCGGATCCTCT
TGGTCTTTTAAGAGCATGAACATGTCGAGACTCATGAAGATACGGCTTCCTGGCTTTGAT
TAACTTGTTCTGAGCCTCAAGCTTGGCACGTTGCTGCCTTCTCCTCATGATTGCGTGATA
CTGCTTCGCATTGACAAAGACTGGCTC*GTTTCAGTGATCTCAACTGGTAGAGGAACTCG
ACCAGGAACCATACCCACCATTTGGGGGTTGCATGTCTGTGGTATATAAGTTGCAGCTAA
CATACCACCGCCAAAATGTGGATCAGCATAGTGAAAAGAGAAATTAGCATGCGTCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 3

CO CL4398Contig1 936 3 9 U
GGACCTCGGACTGAGCACAAGAGCCAGACAATGCGTGCGTGCTGCATTCGAGGCAGAGAA
GCAACGAGTTGATAATCAGACCAAGATATACAACAAACTTCCTAAAATAGTAGAGAAGCT
GACGCGGATAGAGGACGAATACAAGCCGAGGTGTAAAACTCATAAAAACGGGTACTATGA
CTCCTTCAAGTATTCTAATGAAGAGAAAGACTTCAGAGCCAACGTCAATAGAGCTGAGCT
AGCTGGTCTATTCGACGAGGTGCTCGGTTTAGTGAAGAAAGGTCTGCTTCCAGATGGATT
CGAGGGTCACAGAGAGTGGATCGAGCTATCAACTCGCTACCGCAGATTAATCGAACCGCT
TGATATTTCAAACTACCACAGACATTTAAAGAACGAAGACACGGGGCCTTATATGCTAAA
AGGAAGACCGAACCGATACAAACACGCTCAGAGAGGGTACGAGCATGAGCTGTTGAAGGC
GGGAAAGAGTGCAGAGGAGATAAAGGAATCTCGTTGCGGATCTTGCTTTTGGGCTGACGT
TGAAGAACTCAAGGGGAAAGCATATGAAAGTGTTGAGGTTAAGAGATTTGAAAAGTTAGT
TGAAGGATGGATCAGAGAGAGGGAGATAGATGATGAGCAAATATTTCTGGAGGGTTCAAC
ATTCAGAAAGTGGTGGCATTCGCTTCCTGAGGAACACAAACGCTCTTCTCTGCTGCGAGA
GCGTATGGGTGAAACAATATCCACTTGAGCCTGAAAAATCCCACAGATTGTTTAAGCTAT
TGTAACTTTCCTTGTTTACATTGATGCAGTTTTCTCTATTCTAATGTTTTAGAGTTTGGT
TTCTACGTCAGGATGGTCTTAAAAATAAGAAACATGTCCTAAGATCATCATGAGGTGATG
TAATATCTCTCTGTTCTAATGTTAAATTTGCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H259TF U 1
AF RR4AA89TF U 12
AF RR4AA89JQ C 150
BS 1 658 RR4H259TF
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BS 759 841 RR4AA89TF
BS 842 936 RR4AA89JQ

RD RR4H259TF 703 0 0
GGACCTCGGACTGAGCACAAGAGCCAGACAATGCGTGCGTGCTGCATTCGAGGCAGAGAA
GCAACGAGTTGATAATCAGACCAAGATATACAACAAACTTCCTAAAATAGTAGAGAAGCT
GACGCGGATAGAGGACGAATACAAGCCGAGGTGTAAAACTCATAAAAACGGGTACTATGA
CTCCTTCAAGTATTCTAATGAAGAGAAAGACTTCAGAGCCAACGTCAATAGAGCTGAGCT
AGCTGGTCTATTCGACGAGGTGCTCGGTTTAGTGAAGAAAGGTCTGCTTCCAGATGGATT
CGAGGGTCACAGAGAGTGGATCGAGCTATCAACTCGCTACCGCAGATTAATCGAACCGCT
TGATATTTCAAACTACCACAGACATTTAAAGAACGAAGACACGGGGCCTTATATGCTAAA
AGGAAGACCGAACCGATACAAACACGCTCAGAGAGGGTACGAGCATGAGCTGTTGAAGGC
GGGAAAGAGTGCAGAGGAGATAAAGGAATCTCGTTGCGGATCTTGCTTTTGGGCTGACGT
TGAAGAACTCAAGGGGAAAGCATATGAAAGTGTTGAGGTTAAGAGATTTGAAAAGTTAGT
TGAAGGATGGATCAGAGAGAGGGAGATAGATGATGAGCAAATATTTCTGGAGGGTTCA*C
ATTTAGAAAGTGGTGGCATTCGCTTCCTGAGGAACACAAACGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4AA89TF 830 0 0
G
GAGCACAAGAGCCAGACAATGCGTGCGTGCTGCATTCGAGGCAGAGAAGCGACGAGTTGA
TAATCAGACCAAGATATACAACAAACTTCCTAAAATAGTAGAGAAGCTGACGTGGATAGA
GGACGAATACAAGCCGAGGTGTAAAACTCATAAAAACGGGTACTATGACTCCTTCAAGTA
TTCTAATGAAGAGAAAGACTTCAGAGCCAACGTCAATAGAGCTGAGCTAGCTGGTCTATT
CGACGAGGTGCTCGGTTTAGTGAAGAAAGGTCTGCTTCCAGATGGATTCGAGGGTCACAG
AGAGTGGATCGAGCTATCAACTCGCTACCGCAGATTAATCGAACCGCTTGATATTTCAAA
CTACCACAGACATTTAAAGAACGAAGACACGGGGCCTTATATGCTAAAAGGAAGACCGAA
CCGATACAAACACGCTCAGAGAGGGTACGAGCATGAGCTGTTGAAGGCGGGAAAGAGTGC
AGAGGAGATAAAGGAATCTCGTTGCGGATCTTGCTTTTGGGCTGACGTTGAAGAACTCAA
GGGGAAAGCATATGAAAGTGTTGAGGTTAAGAGATTTGAAAAGTTAGTTGAAGGATGGAT
CAGAGAGAGGGAGATAGATGATGAGCAAATATTTCTGGAGGGTTCAACATTCAGAAAGTG
GTGGCATTCGCTTCCTGAGGAACACAAACGCTCTTCTCTGCTGCGAGAGCGTATGGGTGA
AACAATATCCACTTGAGCCTGAAAA*TCCCACAGATTGTTTAAGCTATTGTAACTTTCCT
TGTTTACATTGATGCAGTTTTCTCTATTCTAATGTTTTAGAGTTTGGTT

QA 2 830 2 830
DS 

RD RR4AA89JQ 787 0 0
GGTGTAAAACTCATAAAAACGGGTACTATGACTCCTTCAAGTATTCTAATGAAGAGAAAG
ACTTCAGAGCCAACGTCAATAGAGCTGAGCTAGCTGGTCTATTCGACGAGGTGCTCGGTT
TAGTGAAGAAAGGTCTGCTTCCAGATGGATTCGAGGGTCACAGAGAGTGGATCGAGCTAT
CAACTCGCTACCGCAGATTAATCGAACCGCTTGATATTTCAAACTACCACAGACATTTAA
AGAACGAAGACACGGGGCCTTATATGCTAAAAGGAAGACCGAACCGATACAAACACGCTC
AGAGAGGGTACGAGCATGAGCTGTTGAAGGCGGGAAAGAGTGCAGAGGAGATAAAGGAAT
CTCGTTGCGGATCTTGCTTTTGGGCTGACGTTGAAGAACTCAAGGGGAAAGCATATGAAA
GTGTTGAGGTTAAGAGATTTGAAAAGTTAGTTGAAGGATGGATCAGAGAGAGGGAGATAG
ATGATGAGCAAATATTTCTGGAGGGTTCAACATTCAGAAAGTGGTGGCATTCGCTTCCTG
AGGAACACAAACGCTCTTTTCTGCTGCGAGAGCGTATGGGTGAAACAATATCCACTTGAG
CCTGAAAAATCCCACAGATTGTTTAAGCTATTGTAACTTTCCTTGTTTACATTGATGCAG
TTTTCTCTATTCTAATGTTTTAGAGTTTGGTTTCTACGTCAGGATGGTCTTAAAAATAAG
AAACATGTCCTAAGATCATCATGAGGTGATGTAATATCTCTCTGTTCTAATGTTAAATTT
GCTTTAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 3

CO CL4399Contig1 786 3 3 U
GGAACACAAACCAAGAAATGGAAGAAGAGAAGAGACTGGAACTTAGGCTGGCTCCTCCTT
GTCACCAACTCACTTCCAACAACATCAATGGACCTAAACAAAGAAGCCTCGCCAAAGAAA
CACCTTTTGTTTCCAGTAACAGTAGGGTGGAGGCAGCTCCTGTGGTGGGATGGCCGCCGG
TAAGATCTTCCCGGCGATACCTAACGGCACAGCTAAAGGAAGAGATAAAGAAGATTGAGA
GTGATGAAGAAAGAGAGTTGTACGTTAAGATCAACATGGAAGGAGTTCCCATCGGAAGAA
AAGTCAACCTCTCGGCTTATAACAACTACCAACAGCTTTCACATGCCGTTGACCAACTCT
TCTCTAAGAAAGATTCGTCGGATCTAAACAGACAATACACTTTGGTCTACGAAGACACTG
AAGGAGATAAAGTTCTGGTCGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTGTATCAACTGTCAAGA
GGCTGCATGTTTTAAAGAGCTCCCACGTTTCCATGCTCTCACCTAGGAAACACGGCAAGG
AATAGAGTGAGGTTCGCCACAATCATCAGTTCGATGATTTGTTTTAAAAATGTAATTTAT
GGAAACCATGGGGCTTGGCTTGATTTACCGAGTTTTTTTTTTGTTCGTTAGAATTTGTTT
TTCAACTTATATTCTAGATTTTTTTTT*GCTTATGGAAGATGATTTTGTGTAAATATGTT
GTTTGCTTAAGTAAGCTGTGTGGCATGGTATCTCTATA*TATTATTTGAGAAGTCAGTTT
CCTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 

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AF RR4C949TF U 1
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GG
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CCTCTCGGCTTATAACAACTACCAACAGCTTTCACATGCCGTTGACCAACTCTTCTCTAA
GAAAGATTCGTCTGATCTAAACAGACAATACACTTTGGTCTACGAAGACACTGAAGGAGA
TAAAGTTCTGGTCGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTGTATCAACTGTCAAGAGTCTGCA
TGTTTTAAAGAGCTCCCACGTTTCCATGCTCTCACCTAGGAAACACGGCAAGGAATAGAG
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ATGGGGCTTGGCTTGATTTACCGAGTTTTTTTTTTGTTCGTTAGAATTTGTTTTTCAACT
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AGTCA

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CCTAAA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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CCTCCTGTAATCAACGCCACTTTTCCACGAAGCTTGTTGGAGGGTTTGTAGTCTGAGCTA
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AAGTTCGATGATAAGACCCTTGACGAAGAGCC


BQ
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AF RR4E544JQ U 1
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BS 778 1172 RR4AZ46TF

RD RR4E544JQ 777 0 0
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AGAATTCATTTTTATTACAGACATGCAAGAACTGCCCCAACGACACCATGACCTTTATAT
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GCTCCTCCGTTAGGGTGAAGAACTTGACCGGTGAAGTAAGATGAACAATGATTACAAGCC
AAGAAAACATAGGAAGGTGCCACCTCAATAGGCTGGCCGGCTCGTTTCATCGGGACCTCA
GACCCAAAATTCTTGATTTTCTCCTCATTAAATGAGGTTGGGATAAGGGGAGTCCATATC
GGACCAGGTGCCACACCATTCACACGGATGCCTTTCTCAGCGAGCTGAAGTGCGAGCCCA
CGAGTAAA*CGCCACAATCGCTCCTTTCGTAGCGGTGTAATCGAGAAGCGATGCGTTTCC
CTTGTAAGCATTCACGG*ATGTTGTATTAATTATGCTGCTTCCTTCCTTCATGTGCTTCA
ACGCATGCCTAGTGAGGAAGAAGTAAGAGAAAATGTTTGTGCGGAAAACACGTTCC*AGT
CTAGCCTCATCAATCTGTTCGATCGAGCTGCTCTCATACTGCTCTGCTGCGTTATTGATC
AAGACATCAATGCGTCCAAACGCATTAACGACATCGTCGACGACCATCTTGCAGTTCTTA
TCGAATCCTAAATCCGTTGGAATAGCTATCGGATCCCTAGCCTCCGATGTTTTTGCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4AZ46TF 844 0 0
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TGCCTTTCTCAGCGAGCTGAAGTGCGAGCCCACGAGTAAAACGCCACAATCGCTCCTTTC
GTAGCGGTGTAATCGAGAAGCGATGCGTTTCCCTTGTAAGCATTCACGGGATGTTGTATT
AATTATGCTGCTTCCTTCCTTCATGTGCTTCAACGCATGCCTAGTGAGGAAGAAGTAAGA
GAAAATGTTTGTGCGGAAAACACGTTCCCAGTCTAGCCTCATCAATCTGTTCGATCGAGC
TGCTCTCATACTGCTCTGCTGCGTTATTGATCAAGACATCAATGCGTCCAAACGCATTAA
CGACATCGTCGACGACCATCTTGCAGTTCTTATCGAATCCCAAATCCGTTGGAATAGCTA
TCGGATCCCTAGCCTCCGATGTTTTTGCATCCTTCAACATTTGAAGCGTCTCCTGCGCGT
CTTTTTCCTCCTTCCCCTTCACATAAGTGAAAGCCACTGTGGCACCTTCCAGTGCAAAAC
AGTAACTCACGGCTCTACCAATCCCAGAGTCTCCTCCTGTAATCAACGCCACTTTTCCAC
GAAGCTTGTTGGAGGGTTTGTAGTCTGAGCTAGAGAATTGTGGAGTTGGGTCCATGACGT
GCTCTTTGCCAGGTTGTACTCCTCCTTGTTTTTGCCTTTCAGACGCCATCGCTCTTACCC
ACACAAGTTGAGATAGTTTTCTATTTGTTTCTACCTTGTGAGGTAGGAAAGATCTATGCG
TTTCGTTCGCAAATTGATAAAAGGAAAATCTGAAGTTCGATGATAAGACCCTTGACGAAG
AGCC

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 3

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TTTTGTCTGGTGTTAGTGATGTTGTTTCGCAAAAACTCTCTGGGATACAGAAGATCCAGC
TGAGAAGGGTTCTTCTCAAAATGATTTTTGCAGGTGGTTTTCTCGGACCAGTAGGGCATT
ACTTTCATACAACTCTAGATAAGATTTTTCAAGGGAAGAAGGACACAAAGACTGTTGCAA
AGAAGGTAATCGTGGAACAGCTGACATTGTCACCATTGAACCATTTGCTTTTCATGATCT
ATTATGGAGTAGTCATTGAAAGAACTCCTTGGATTCTTGTTAGAGACAGGATCAAGAAGA
CTTACCCTACAGTCCAGCTTACAGCATGGACGTTTTTCCCTGTCGTTGGATG**TAAACT
ACAAGTATGTGCCACTGCACTTCCGGGTCATCTTGCACAGCCTCGTCGCATTCTTCTGGG
GAATCTTCCTGACCCTGCGAGCAAGGTCAATGACACTAGCTTTGGCAAAAGCTAGGTGAT
CAGGGAAACACATCAAGCAAGCACTAGCTATGATCTTTTTTTTTCTGTAAGTTAAACAAG
TCTAAAAAGTAAATGATAAAGGGTGAAACCGAATAAGAATATGTATTAAGATGATAATAA
CAATGGTTTCAAGCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EF51TF U 1
AF RR4B021JQ C 1
AF RR4B021TF U 1
BS 1 118 RR4EF51TF
BS 119 119 RR4B021TF
BS 120 151 RR4EF51TF
BS 152 152 RR4B021TF
BS 153 175 RR4EF51TF
BS 176 176 RR4B021TF
BS 177 472 RR4EF51TF
BS 473 474 RR4B021TF
BS 475 594 RR4EF51TF
BS 595 595 RR4B021TF
BS 596 639 RR4EF51TF
BS 640 735 RR4B021TF

RD RR4EF51TF 639 0 0
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CAGGGAAACACATCAAGCAAGCACTAGCTATGATCTTTT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4B021JQ 735 0 0
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ACTTTCATACAACTCTAGATAAGATTTTTCAAGGGAAGAAGGACACAAAGACTGTTGCAA
AGAAGGTAATCGTGGAACAGCTGACATTGTCACCATTGAACCATTTGCTTTTCATGATCT
ATTATGGAGTAGTCATTGAAAGAACTCCTTGGATTCTTGTTAGAGACAGGATCAAGAAGA
CTTACCCTACAGTCCAGCTTACAGCATGGACGTTTTTCCCTGTCGTTGGATG**TAAACT
ACAAGTATGTGCCACTGCACTTCCGGGTCATCTTGCACAGCCTCGTCGCATTCTTCTGGG
GAATCTTCCTGACCCTGCGAGCAAGGTCAATGACACTAGCTTTGGCAAAAGCTAGGTGAT
CAGGGAAACACATCAAGCAAGCACTAGCTATGATCTTTTTTTTTCTGTAAGTTAAACAAG
TCTAAAAAGTAAATGATAAAGGGTGAAACCGAATAAGAATATGTATTAAGATGATAATAA
CAATGGTTTCAAGCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4B021TF 735 0 0
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TTTTGTCTGGTGTTAGTGATGTTGTTTCGCAAAAACTCTCTGGGATACAGAAGATCCAGC
TGAGAAGGGTTCTTCTCAAAATGATTTTTGCAGGTGGTTTTCTCGGACCAGTAGGGCATT
ACTTTCATACAACTCTAGATAAGATTTTTCAAGGGAAGAAGGACACAAAGACTGTTGCAA
AGAAGGTAATCGTGGAACAGCTGACATTGTCACCATTGAACCATTTGCTTTTCATGATCT
ATTATGGAGTAGTCATTGAAAGAACTCCTTGGATTCTTGTTAGAGACAGGATCAAGAAGA
CTTACCCTACAGTCCAGCTTACAGCATGGACGTTTTTCCCTGTCGTTGGATG**TAAACT
ACAAGTATGTGCCACTGCACTTCCGGGTCATCTTGCACAGCCTCGTCGCATTCTTCTGGG
GAATCTTCCTGACCCTGCGAGCAAGGTCAATGACACTAGCTTTGGCAAAAGCTAGGTGAT
CAGGGAAACACATCAAGCAAGCACTAGCTATGATCTTTTTTTTTCTGTAAGTTAAACAAG
TCTAAAAAGTAAATGATAAAGGGTGAAACCGAATAAGAATATGTATTAAGATGATAATAA
CAATGGTTTCAAGCT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

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ATTAGCCACAGCCATTCCTAGACCAAACAACGCAGCAGCGATGCTCGACATGCTTTTGGG
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CGGTCTACCTCGGATCTTGGAAGCTAGTGGGAGGATGGCTCGGTCGTAGAGACACCCATG
AGATAGGCTATGATAGTGACATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY90JQ U 20
AF RR4FT75JQ U 1
BS 1 46 RR4FT75JQ
BS 47 47 RR4FY90JQ
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BS 671 864 RR4FT75JQ

RD RR4FY90JQ 788 0 0
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A*GAATAAAATAAGCACACCTACTAAAATAATCATCTACTTCCTAAATCCAAAATCAATA
AAAATATATAATAAATCTAATTACATACATAA*AAAAGATTATATAACACACACCATGAA
TCATGAACAAAGAAACTAAATAAAAATCTTTAGTTTATTTTAACAACTTCTTCTTGTTCC
TCCTCTCTCACGCCATTAACCTTATCATTCCTCACCTGATCCACCGTCGGACCATACGAC
CAGCTACACACCACGTAATAGATAACATTGACGAAGCTCATGATCGCCAAAACCCAATAG
TAATAATCATAATGACCCTTGTTGATATTATCTTCAATCCAGCTCACTCCACCTTTCTTT
GAGCTGTTCTTGATCACATTGAGTATCACACTAGCCAATATATTAGCCACAGCCATTCCT
AGACCAAACAGCGCGGCAGCTATGCTCGACATGCTTTTGGGAAACTCGGTGTAGAAAAAC
TCTGTCTGTCCTATCCCGGTTAAGGCCTCTGCTAAACCGTGTAGCACGTACTGCGGTACG
AGCCACATCGCTGAGATGTTCACCGTAGAAGTGGCGTTGTCTCTGAGTCCCTGGCTTATC
GCGGTTCTCCTTCTGTAATGCTCAACAGTTGCGGAGACCGCCATCGCTAGGAATGATATG
AATAGTCCTAACCCCATACGGATCTTGACGTTGATCCTAACCGGTCTACCTCGGATCTTG
GAAGCTA
A

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4FT75JQ 864 0 0
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CAATGGCTTTTGAAAGAAGAAGAACAAAATAAGCACACCTACTAAAATAATCATCTACTT
CCTAAATCCAAAATCAATAAAAATATATAATAAATCTAATTACATACAACATAAAAGATT
ATATAACACACACCATGAATCATGAACAAAGAAACTAAATAAAAATCTTTAGTTTATTTT
AACAACTTCTTCTTGTTCCTCCTCTCTCACTCCATTAACCTTATCATTCCTCACCTGATC
CACCGTCGGACCATACGACCAGCTACACACCACGTAGTAGATAACATTGACGAAGCTCAT
GATCGCCAAAACCCAATAGTAATAATCATAATGACCCTTGTTGATATTATCTTCAATCCA
GCTCACTCCACCTTTCTTTGAGCTGTTCTTGATCACATTGAGTATCACACTAGCCAATAT
ATTAGCCACTGCCATTCCTAGACCAAACAACGCAGCCGTGATGCTCGACATGCTTTTGGG
AAACTCGGTGTAGAAAAACTCTGTCTGTCCTATACCGGTTAAGGCCTCTGCTAAACCGTG
TAGCACGTACTGCGGTACGAGCCACATCGCTGAGATGTTCACCGTAGCAGTGGCGTTGTT
TGCGAGTCCTTGGCTTATCGCGGTTCTCCTTCTGTAATGCTCAACAGTTGCGGAGACCGC
CATCGCTAGGAATGATATGAATAGTCCTAACCCCATACGGATCTTGACGTTGATCCTAAC
CGGTCTACCTCGGATCTTGGAAGCTAGTGGGAGGATGGCTCGGTCGTAGAGACACCCATG
AGATAGGCTATGATAGTGACATAC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 3

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TATAAAATGTACCAATTTACCAACTTTCATTTAAGAGAGACCAACCCCATTTGAAAAAAA
AAAAA*GTGAAACCACATGATTAAAAAGATCAGCTAAATTTACCAATTTCCATCTTCTTC
TTGATTGCTTTTTGACCATGATATATAAACGCATCTATTATCCCAGACACCGTGAAAACA
CCTCCGACTATGGCACAGACATTCGTCAAGAAGTGCAAGAACGATATATGTTCCTCTGTG
AATGTTACCTTGATTGGAGAGAGATCATAGAAAAAGAAAACTCCTGGTAAGGATTGCAGT
TGGCCTGCTTCTGAGCTCTTAACATGTTCGGTCACTGAGAACTGATTTGACTGAATTGTG
TGTCCACTGATATCTGTGTATACTGTTGGTACAACCTTGATAAAATATTGGTACATAGCA
TTGGGTGTGTCTTGACTCCACTGGACTTTGTCCAGAGGGTTCACGACGCCAGGAAAGTAG
TCCCCAAAAGTCAGTCGATTGATCTTGTGACTTATGTTAAAACTGTCTTTCTGAAAAGCA
AGAAGATCATGGACGTGAACGCCCGCCTGATGAAAGCTTTTCCCGGGAGCAAAGTGGAAG
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TCCTTTACTCTTTG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E480JQ U 1
AF RR4BL72JQ U 3
AF RR4FJ93JQ U 1
BS 1 332 RR4E480JQ
BS 333 333 RR4FJ93JQ
BS 334 708 RR4E480JQ
BS 709 734 RR4FJ93JQ

RD RR4E480JQ 708 0 0
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TATAAAATGTACCAATTTACCAACTTTCATTTAAGAGAGACCAACCCCATTTGAAAAAAA
AAAAA*GTGAAACCACATGATTAAAAAGATCAGCTAAATTTACCAATTTCCATCTTCTTC
TTGATTGCTTTTTGACCATGATATATAAACGCATCTATTATCCCAGACACCGTGAAAACA
CCTCCGACTATGGCACAGACATTCGTCAAGAAGTGCAAGAACGATATATGTTCCTCTGTG
AATGTTACCTTGATTGGAGAGAGATCATAGAAGAAGAAAACTCCTGGTAAGGATTGCAGT
TGGCCTGCTTCTGAGCTCTTAACATGTTCGGTCACTGAGAACTGATTTGACTGAATTGTG
TGTCCACTGATATCTGTGTATACTGTTGGTACAACCTTGATAAAATATTGGTACATAGCA
TTGGGTGTGTCTTGACTCCACTGGACTTTGTCCAGAGGGTTCACGACGCCAGGAAAGTAG
TCCCCAAAAGTCAGTCGATTGATCTTGTGACTTATGTTAAAACTGTCTTTCTGAAAAGCA
AGAAGATCATGGACGTGAACGCCCGCCTGATGAAAGCTTTTCCCGGGAGCAAAGTGGAAG
TTTCCCGCCACTTTATTCACCTCCAAGAACCCATAGATATTACACCCT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BL72JQ 712 0 0
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TAAAATGTACCAATTTACCAACTTTCATTTAAGAGAGACCAACCCCATTTGAAAAAAAA*
****GTGAAACCACATGATTAAAAAGATCAGCTAAATTTACCAATTTCCATCTTCTTCTT
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TCCGACTATGGCACAGACATTCGTCAAGAAGTGCAAGAACGATATATGTTCCTCTGTGAA
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GGGTGTGTCTTGACTCCACTGGACTTTGTCCAGAGGGTTCACGACGCCAGGAAAGTAGTC
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AAGATCATGGACGTGAACGCCCGCCTGATGAAAGCTTTTCCCGGGAGCAAAGTGGAAGTT
TCCCGCCACTTTATTCACCTCCAAGAACCCATAGATATTACACCCT
TCACCT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FJ93JQ 734 0 0
AT
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TAAAATGTACCAACTTACCAACTTTCATTTAAGAGAGACCAACCCCATTTGAAAAAAAAA
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GATTGCTTTTTGACCATGATATATAAACGCATCTATTATCCCAGACACCGTGAAAACACC
TCCGACTATGGCACAGACATTCGTCAAGAAGTGCAAGAACGATATATGTTCCTCTGTGAA
TGTTACCTTGATTGGAGAGAGATCATAGAAAAAGAAAACTCCTGGTAAGGATTGCAGTTG
GCCTGCTTCTGAGCTCTTAACATGTTCGGTCACTGAGAACTGATTTGACTGAATTGTGTG
TCCACTGATATCTGTGTATACTGTTGGTACAACCTTGATAAAATATTGGTACGTAGCATT
GGGTGTGTCTTGACTCCACTGGACTTTGTCCAGAGGGTTCACGACGCCAGGAAAGTAGTC
CCCAAAAGTCGGTCGATTGATCTTGTGACTTATGTTAAAACTGTCTTTCTGAAAAGCAAG
AAGATCATGGACGTGAACGCCCGCCTGATGAAAGCTTTTCCCGGGAGCAAAGTGGAAGTT
TCCCGCCACTTTATTCACCTCCAAGAACCCATAGATATTACACCCTTCACCTTCTTCATC
CTTTACTCTTTG

QA 3 734 3 734
DS 



AS 1 3

CO CL4404Contig1 1007 3 3 U
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AAGAAGAAGACGCTCTGTTCTTGAATCTTGAATCAAGCAAAGCTGCTAAGGGAGGTGGCT
GAACAAAACCCTTATCCTAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATAGTGAGACTTC
TCTTACCAGGGATCAGAGTGTTGATTAGAAGGTCGTTACTTTGGTTGCTGTAGATGCATA
TCCCTTCTTGGATCTACCAGTTACTTGGTTGCATGGG*****AGGTTGTTTTGGATGCTG
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CATCACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTTAACAATGGATTGAG
CCTCTGGTTGCAAACTAGACAACAGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGC
TAAAGTTCGAGAACCTACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAGAGCTTGTTGGGTATGAA
CAAGCGGTTCTCTCGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTG
GGAGCAAGAGGGCTTGTATGATTGATTTATTTGCAACTCAAGAATATACTTAATCTCTTC
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GTATTTAAAATCTCAAGGAACTAAGATATTTTTACCTTCAAAAAGGAAATACTTATTCAT
ATATGTCTTTTTGTTTGTGTGTTTGGTATGTGTTAAACAGTTGATTATTGTAATAAACTC
AGAATTGTATTATATTTTATTTTATAACCAAGTAAAAGTTTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ92TF U 1
AF RR4B147TF U 75
AF RR4AZ92JQ C 257
BS 1 815 RR4AZ92TF
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TCCCTTCTTGGATCTACCAGTTACTTGGTTGCATGGG*****AGGTTGTTTTGGATGCTG
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CATCACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTTAACAATGGATTGAG
CCTCTGGTTGCAAACTAGACAACAGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGC
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GGAGCAAGAGGGCTTGTATGATTGATTTATTTGCAACTCAAGAATATACTTAATCTCTTC
TCCTTTTTCTTCTTCTTCTTGTGTGTGTTGTGTGT

QA 1 815 1 815
DS 

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GG
GTTCTTGAATCTTGAATCAAGCAAAGCTGCTAAGGGAGGTGGCTGAACAAAACCCTTATC
CTAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATAGTGAGACTTCTCTTACCAGGGATCAG
AGTGTTGATTAGAAGGTCGTTACTTTGGTTGCTGTAGATGCATATCCCTTCTTGGATCTA
CCAGTTACTTGGTTGCATGGGTACAGAGGTTGTTTTGGATGCTGCAATAAACCACCGCTT
ATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCAAGGTCGTCTAGTGAAGAAG
CCGACGAGCGTGTCAGACGATTTCTGGAGCACAAGCACCTGCGAGATGGATAACAACAGC
ACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTTTCTTCTATCAGCTTCACTAACATCACTGCTGCTTCT
GCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTTAACAATGGATTGAGCCTCTGGTTGCAAACT
AGACAACAGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGCTAAAGTTCGAGAACCT
ACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAGAGCTTGTTGGGTATGAACAAGCGGTTCTCTCGT
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TCTTGTGTGTGTTGTGTGTGTAATCAAACTTGGCTTCCTGAAAAGTATTTAAAATCT

QA 3 779 3 779
DS 

RD RR4AZ92JQ 751 0 0
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ATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCAAGGTCGTCTAGTGAAGAAG
CCGACGAGCGTGTCAGACGATTTCTGGAGCACAAGCACCTGCGAGATGGATAACAACAGC
ACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTTTCTTCTATCAGCTTCACTAACATCACTGCTGCTTCT
GCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTTAACAATGGATTGAGCCTCTGGTTGCAAACT
AGACAACAGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGCTAAAGTTCGAGAACCT
ACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAGAGCTTGTTGGGTATGAACAAGCGGTTCTCTCGT
CCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTGGGAGCAAGAGGGCTTG
TATGATTGATTTATTTGCAACTCAAGAATATACTTAATCTCTTCTCCTTTTTCTTCTTCT
TCTTGTGTGTGTTGTGTGTGTAATCAAACTTGGCTTCCTGAAAAGTATTTAAAATCTCAA
GGAACTAAGATATTTTTACCTTCAAAAAGGAAATACTTATTCATATATGTCTTTTTGTTT
GTGTGTTTGGTATGTGTTAAACAGTTGATTATTGTAATAAACTCAGAATTGTATTATATT
TTATTTTATAACCAAGTAAAAGTTTTTATGC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL4405Contig1 882 2 4 U
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AAAGTTTCTTTGTGCTCTACAAAAGAAAATATTACATTAATACCATTGTATTTCTCTGTT
TCACATACTCTTCTTTCCCTCTGGGCTATGGCCGATAGACTCCAACTGGTTCCTGAGATT
CTGATTATCCTCAAGCAGCCTATCATACTCCATGAGAAACCCATCAGCTGATTTTCTCAG
AGTCTCTGTTTCAGCTTGTGCACTTTTCAGTTCTTTGCCTTTGCTTTCACTTTCAGATTC
TAATTTCTTGATCTTTGCCTTCAACGCTGCGATTTCTTCCCCGAGCGCTTTAACTTCTTC
CCCACTAGTGTTCTTGCCATCCTCGAAACTTCTGTTCTGTTTCTTTGCAGTCTCCATTGT
CTTCCTAAGCAACCGCAACTCCCTTATGTAATGGTGTAGCCGATCAATCATGAGCGAGAG
AAATAGCACAAACCCCATGAGAGAAGCTTCGAGAAGATGCTTGGAGGCGAGGACCTGATC
GGTAGGATTGAGGACGGCACCATCCTCAGATCGGCGTTGGATACTAAGCAAACTGTAGAC
GCTGGACATAAGAACGACGAAGACGGTGGCGCCGATGGTTTTGACGACGACGGGGCCGCG
GCCGCGTTTGATGCGATCGAAGGTGAGGATGATTAGCTTCCGGAGAGGAGTCTTGAAGAG
GAGAAGGAGGATTAAGGCCATTTCGGCGAAGATCACCGAGTAGAGGAGCTGGATCATCGT
TGTCGGTGTGAGCAAACCCTAGATCGGAGAGAAGTCAGGAGAGCGTGTTGTTGAATGAAA
CGAGATGCCAACACGTCCTTTCTTATTAATCTTTCTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CI64JQ U 1
AF RR4CH18TF C 602
BS 1 708 RR4CI64JQ
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BS 710 717 RR4CI64JQ
BS 718 882 RR4CH18TF

RD RR4CI64JQ 717 0 0
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GCCGCGTTTGATGCGATCGAAGGTGAGGATGATTAGCTTCCGGAGAGGCGTCTTGAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4CH18TF 281 0 0
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GAGATGCCAACACGTCCTTTCTTATTAATCTTTCTCGTTCC

QA 1 281 1 281
DS 



AS 1 3

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AAAACACTTCCCAGCTCAACAGTCCTTCATAGTATTCATCTATTAGATTAACCAAGAACT
TCCTGTTCAGCTCAATCGTCTTCTTGAACCCCAAGAACCTGCGATGACCTTCCACGACTT
TGGCCATGTTCCCATAATAAGTAGGAACGAATATATCACTTTCCAGAGAGATGAGGTAAT
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GAGTTTCTTTCCTGACCACATTTGGAAAGACGTCTGCTAAAGCCTTTAACCTCCTTTTAC
CACCGTAAATCTCTCCGGCAGCTATGTAAATCTGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH18TF C 1
AF RR4GH18JQ U 8
AF RR4BH89JQ U 112
BS 1 9 RR4GH18TF
BS 10 443 RR4GH18JQ
BS 444 444 RR4BH89JQ
BS 445 700 RR4GH18JQ
BS 701 876 RR4BH89JQ

RD RR4GH18TF 719 0 0
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TAAAATGAAAACTGCAACTTTTCTTCTACATCAAGGGAGGCTCTCTTCAGATGTCTCTGT
ACACCAAAAGAACCCTACATAACCTCATTAAAAATCACATCCTCAAGATTGATATAATAA
TCCTCATAAACTCCATTACTCACACATTCATGTCCTGCCAAATCTAAATGTAGAACAATG
GTGGTGGCTCTGATCATATGGTTTCATCTAATGAATCGCCATTATCATTCTCATGTAACA
GCTGAAGACATTCATATGGATTCGCATAGAAGTAGTCTTCTTCTTTCGGTTTATTTGGAA
TCACAAGCCGCTTCTTGGGACCTCCCATTCTTGTAGCGTGAAAGGCCTTCACCCTGGTCG
AAAACACTTCCCAGCTCAACAGTCCTTCATAGTATTCATCTATTAGATTAACCAAGAACT
TCCTGTTCAGCTCAATCGTCTTCTTGAACCCCAAGAACCTGCGATGACCTTCCACGACTT
TGGCCATGTTCCCATAATAAGTAGGAACGAATATATCACT
CTCTAGCGAGATAGGGTAG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4GH18JQ 712 0 0
GA
AACTTCATGAAACTTACACATAAACAAAATTATCAATTATCAATTAATATACAGGAGGAT
AATGTGTAACATAATTATGCACTGCATTTTTTTTTTATTTTTCAGCTACAAAACTGCAAG
TCCATGGGTGAGGACGATGGTGATGGTGCCAAATGACAAATCTGCAAACTTTAAAATGAA
AACTGCAACTTTTCTTCTACATCAAGGGAGGCTCTCTTCAGATGTCTCTGTACACCAAAA
GAACCCTACATAACCTCATTAAAAATCACATCCTCAAGATTGATATAATAATCCTCATAA
ACTCCATTACTCACACATTCATGTCCTGCCAAATCTAAATGTAGAACAATGGTGGTGGCT
CTGATCATATGGTTTCATCTAATGAATCGCCATTATCATTCTCATGTAACAGCTGAAGAC
ATTCATATGGATTCCCATAGAAGTAGTCTTCTTCTTTCGGTTTATTTGGAATCACAAGCC
GCTTCTTGGGACCTCCCATTCTTGTAGCGTGAAAGGCCTTCACCCTGGTCGAAAACACTT
CCCAGCTCAACAGTCCTTCATAGTATTCATCTATTAGATTAACCAAGAACTTCCTGTTCA
GCTCAATCGTCTTCTTGAACCCCAAGAACCTGCGATGACCTTCCACGACTTTGGCCATGT
TCCCATAATAAGTAGGAACGAATATATCACT
CTCTAGCGAGATAGGGTAG

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR4BH89JQ 765 0 0
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TGCAAACTTTAAAATGAAAACTGCAACTTTTCTTCTACATCAAGGGAGGCTCTCTTCAGA
TGTCTCTGTACACCAAAAGAACCCTACATAACCTCATTAAAAATCACATCCTCAAGATTG
ATATAATAATCCTCATAAACTCCATTATTCACACATTCATGTCCTGCCAAATCTAAATGT
AGAACAATGGTGGTGGCTCTGATCATATGGTTTCATCTAATGAATCGCCATTATCATTCT
CATGTAACAGCTGAAGACATTCATATGGATTCGCATAGAAGTAGTCTTCTTCTTTCGGTT
TATTTGGAATCACAAGCCGCTTCTTGGGACCTCCCATTCTTGTAGCGTGAAAGGCCTTCA
CCCTGGTCGAAAACACTTCCCAGCTCAACAGTCCTTCATAGTATTCATCTATTAGATTAA
CCAAGAACTTCCTGTTCAGCTCAATCGTCTTCTTGAACCCCAAGAACCTGCGATGACCTT
CCACGACTTTGGCCATGTTCCCATAATAAGTAGGAACGAATATATCACTTTCCAGAGAGA
TGAGGTAATCAAGGGCAGCCATTTGAGAAGAATGGTTCTTACAAAAACTCAAATCAGATG
AATCCAGCAGAGTTTCTTTCCTGACCACATTTGGAAAGACGTCTGCTAAAGCCTTTAACC
TCCTTTTACCACCGTAAATCTCTCCGGCAGCTATGTAAATCTGAA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL4407Contig1 830 3 15 U
GGATTCACCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAAAGAGAGAGAGAGATGCAGTCGCTGC
AGGAGAAGGCATCGGCATGGAGCGGCGTGGATCAGGCTGACTCGTTCGCCATCGACGAGT
CCAATCTCTTCGAAAAGCTCGGTCTTCAGAGCTTCATCAACCTCTCCACCAACTTCTACA
CCAGGGTATATGATGACGAATAAGAATGGTTTCGATCTATGTTTGCTAAATCTACGAAAG
AAGACGCCATCCAGAACCAATATGAGTTCTTCGTCCAGCGTATGGGAGGCCCTCCTCTCT
ATTCTCAAAGGAAAGGTCATCCTGCTCTGATTGGTCGTCACCGTCCATTTCCGGTGACTC
ATGAAGCTGCAGAGAGATGGCTACAGCATATGCAAAATGCCATGGACGAGTCGGTCGACA
TTGACCAGGAGTCGAAAGTCAAAATGATGAATTTCTTCAGGCACACCGCTTTCTTCCTTG
TGGCTGGAAACGAGTTGAAGAACCAGGATCAGAATCAGAACAACCAAGTTACGTGCAAGT
GTAAGCACGCTCACGCTGCCAATAACCCAGCAGAAGAGTGAGTAATCAACATCAACAGAT
TCTTGTTGTATTTTTTTATTGTACTTTTTCATAGTGAAAGAAAGAATCTTTCTTCGAAAT
GCTACGCAAGAGAAATAGGACTGGTCTTAGCTCTCATTGCAATAGCACTCCCTCTTCTTT
AGACGGTCTGATACATTTGAAGATCCGAATAATGCTGTATTACATACAAGTCTTTACTTC
TTCCATGTCACATGTGTAATCCGCAGACATAAAGAATCTCATGTGCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI72JQ C 133
AF RR4CI72TF U 9
AF RR4BB58TF U 1
BS 1 45 RR4BB58TF
BS 46 46 RR4CI72TF
BS 47 93 RR4BB58TF
BS 94 94 RR4CI72TF
BS 95 187 RR4BB58TF
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BS 192 200 RR4BB58TF
BS 201 201 RR4CI72TF
BS 202 275 RR4BB58TF
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BS 323 830 RR4BB58TF

RD RR4CI72JQ 635 0 0
AAAAGCTCGGTCTTCAGAGCTTCATCAACCTCTCCACCAACTTCTACACCAGGGTATATG
ATGACGAATAAGAATGGTTTCGATCTATGTTTGCTAAATCTACGAAAGAAGACGCCATCC
AGAACCAATATGAGTTCTTCGTCCAGCGTATGGGAGGCCCTCCTCTCTATTCTCAAAGGA
AAGGTCATCCTGCTCTGATTGGTCGTCACCGTCCATTTCCGGTGACTCATGAAGCTGCAG
AGAGATGGCTACAGCATATGCAAAATGCCATGGACGAGTCGGTCGACATTGACCAGGAGT
CGAAAGTCAAAATGATGAATTTCTTCAGGCACACCGCTTTTTTCCTTGTGGCTGGAAACG
AGTTGAAGAACCAGGATCAGAATCAGAACAACCAAGTTACGTGCAAGTGTAAGCACGCTC
ACGCTGCCAATAACCCAGCAGAAGAGTGAGTAATCAACATCAACAGATTCTTGTTGTATT
TTTTTATTGTACTTTTTCATAGTGAAAGAAAGAATCTTTTTTCGAAATGCTACGCAAGAG
AAATAGGACTGGTCTTAGCTCTCATTGCAATAGCACTCCCTCTTCTTTAGACGGTCTGAT
ACATTTGAAGATCCGAATAATGCTGTATTACATA
C

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4CI72TF 758 0 0
GGACCT
AGAGAGAGAGAGAGAGAGTAAAGAGAGAGAGAGATGCAGTCGCTGCAGGAGAAGGCATCG
GCATGGAGCGGCGTGGATCAGGCTGACTCGTTCGCCATCGACGAGTCCAATCTCTTCGAA
AAGCTCGGTCTTCAGAGCTTCATCAACCTCTCCACCAACTTCTACACCAGGGTATATGAT
GACGAATAAGAATGGTTTCGATCTATGTTTGCTAAATCTACGAAAGAAGACGCCATCCAG
AACCAATATGAGTTCTTCGTCCAGCGTATGGGAGGCCCTCCTCTCTATTCTCAAAGGAAA
GGTCATCCTGCTCTGATTGGTCGTCACCGTCCATTTCCGGTGACTCATGAAGCTGCAGAG
AGATGGCTACAGCATATGCAAAATGCCATGGACGAGTCGGTCGACATTGACCAGGAGTCG
AAAGTCAAAATGATGAATTTCTTCAGGCACACCGCTTTCTTCCTTGTGGCTGGAAACGAG
TTGAAGAACCAGGATCAGAATCAGAACAACCAAGTTACGTGCAAGTGTAAGCACGCTCAC
GCTGCCAATAACCCAGCAGAAGAGTGAGTAATCAACATCAACAGATTCTTGTTGTATTTT
TTTATTGTACTTTTTCATAGTGAAAGAAAGAATCTTTCTTCGAAATGCTACGCAAGAGAA
ATAGGACTGGTCTTAGCTCTCATTGCAATAGCACTCCCTCTTCTTTAGACGGTCTGATAC
ATTTGAAGATCCGAA*AATGCTGTATTACATA

QA 7 758 7 758
DS 

RD RR4BB58TF 830 0 0
GGATTCACCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAAAGAGAGAGAGGGATGCAGTCGCTGC
AGGAGAAGGCATCGGCATGGAGCGGCGTGGATCTGGCTGACTCGTTCGCCATCGACGAGT
CCAATCTCTTCGAAAAGCTCGGTCTTCAGAGCTTCATCAACCTCTCCACCAACTTCTACA
CCAGGGTGTACGATGACGAAGAAGAATGGTTTCGATCTATGTTTGCTAAATCTACGAAAG
AAGACGCCATCCAGAACCAATATGAGTTCTTCGTCTAGCGTATGGGAGGCCCTCCTCTCT
ATTCTCAAAGGAAAGGTCATCTTGCTCTGATTGGTCGTCACCGTCCATTTCCGGTGACTC
ATGAAGCTGCAGAGAGATGGCTACAGCATATGCAAAATGCCATGGACGAGTCGGTCGACA
TTGACCAGGAGTCGAAAGTCAAAATGATGAATTTCTTCAGGCACACCGCTTTCTTCCTTG
TGGCTGGAAACGAGTTGAAGAACCAGGATCAGAATCAGAACAACCAAGTTACGTGCAAGT
GTAAGCACGCTCACGCTGCCAATAACCCAGCAGAAGAGTGAGTAATCAACATCAACAGAT
TCTTGTTGTATTTTTTTATTGTACTTTTTCATAGTGAAAGAAAGAATCTTTCTTCGAAAT
GCTACGCAAGAGAAATAGGACTGGTCTTAGCTCTCATTGCAATAGCACTCCCTCTTCTTT
AGACGGTCTGATACATTTGAAGATCCGAATAATGCTGTATTACATACAAGTCTTTACTTC
TTCCATGTCACATGTGTAATCCGCAGACATAAAGAATCTCATGTGCACAT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4409Contig1 815 3 6 U
GGATTATTACATCGACACTAAACTAGCGCCGCGCGGAGTCAGAGCGAGAGCGAAAAAAGG
CAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGGATGTTCTTCCACATAGTGTTGGAGCGAAACATGCAATA
CATCCTCGATTCTTTGGTCGCAACCTTCGTGAAAATCTCGTCTCTAAGCTCATGAAAGAT
GTCGAGGGCACTTGCAGTGGCCGACATGGGTTTGTAGTGGCGATAACAGGAATAGAAAGT
GTAGGGAAAGGACTGATCCGAGATGGGACTGCCTTCGTCACCTTCCCCGTTAAGTACCAG
TGCGTTGTTTTCAGACCTTTCAAAGGCGAGATTTTGGAAGCTGTTGTCACTCTCGTCAAT
AAGATGGGTTTCTTCGCTGAAGCTGGCCCTGTTCAGATTTTTGTGTCCAAGCATTTGATT
CCAGATGATATGGAGTTTCAGGCTGGAGACATGCCTAACTACACGACATCTGATGGATCA
GTTAAGATCCAGAAAGAATGTGAAGTAAGGCTAAAGATTATTGGAACAAGAGTCGATGCC
ACTGAAATCTTTTGTGTGGGTACCATCAAAGACGATTTTTTGGGAGTCATCAACGACCCT
GCAGCCGCTGCATAAGCAAAGGTTTCAGGCCGACTTCGCTTTTGGTCCAGAAGATGCCAT
GTGATAAAAA*GATGTAACATACACCATCTACAAGTTGAAGTTTATGGATATGTTTATTC
TGAATAATGTTTAATTTTGAATCGAGTGTAGTAGACTCTGTTCCTCTATATTTTTTCAAG
AGTGTATCTTATTGTGTTAGAAATAAAAGTAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ64TF U 1
AF RR4DJ64JQ C 93
AF RR4GE17TF U 169
BS 1 723 RR4DJ64TF
BS 724 724 RR4GE17TF
BS 725 731 RR4DJ64TF
BS 732 732 RR4GE17TF
BS 733 764 RR4DJ64TF
BS 765 815 RR4GE17TF

RD RR4DJ64TF 764 0 0
GGATTATTACATCGACACTAAACTAGCGCCGCGCGGAGTCAGAGCGAGAGCGAAAAAAGG
CAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGGATGTTCTTCCACATAGTGTTGGAGCGAAACATGCAATA
CATCCTCGATTCTTTGGTCGCAACCTTCGTGAAAATCTCGTCTCTAAGCTCATGAAAGAT
GTCGAGGGCACTTGCAGTGGCCGACATGGGTTTGTAGTGGCGATAACAGGAATAGAAAGT
GTAGGGAAAGGACTGATCCGAGATGGGACTGCCTTCGTCACCTTCCCCGTTAAGTACCAG
TGCGTTGTTTTCAGACCTTTCAAAGGCGAGATTTTGGAAGCTGTTGTCACTCTCGTCAAT
AAGATGGGTTTCTTCGCTGAAGCTGGCCCTGTTCAGATTTTTGTGTCCAAGCATTTGATT
CCAGATGATATGGAGTTTCAGGCTGGAGACATGCCTAACTACACGACATCTGATGGATCA
GTTAAGATCCAGAAAGAATGTGAAGTAAGGCTAAAGATTATTGGAACAAGAGTCGATGCC
ACTGAAATCTTTTGTGTGGGTACCATCAAAGACGATTTTTTGGGAGTCATCAACGACCCT
GCAGCCGCTGCATAAGCAAAGGTTTCAGGCCGACTTCGCTTTTGGTCCAGAAGATGCCAT
GTGATAAAAA*GATGTAACATACACCATCTACAAGTTGAAGTTTATGGATATGTTTATTC
TGA*TAATGTT*AATTTTGAATCGAGTGTAGTAGACTCTGTTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4DJ64JQ 708 0 0
ACATAGTGTTGGAGCGAAACATGCAATACATCCTCGATTCTTTGGTCGCAACCTTCGTGA
AAATCTCGTCTCTAAGCTCATGAAAGATGTCGAGGGCACTTGCAGTGGCCGACATGGGTT
TGTAGTGGCGATAACAGGAATAGAAAGTGTAGGGAAAGGACTGATCCGAGATGGGACTGC
CTTCGTCACCTTCCCCGTTAAGTACCAGTGCGTTGTTTTCAGACCTTTCAAAGGCGAGAT
TTTGGAAGCTGTTGTCACTCTCGTCAATAAGATGGGTTTCTTCGCTGAAGCTGGCCCTGT
TCAGATTTTTGTGTCCAAGCATTTGATTCCAGATGATATGGAGTTTCAGGCTGGAGACAT
GCCTAACTACACGACATTTGATGGATCAGTTAAGATCCAGAAAGAATGTGAAGTAAGGCT
AAAGATTATTGGAACAAGAGTCGATGCCACTGAAATCTTTTGTGTGGGTACCATCAAAGA
CGATTTTTTGGGAGTCATCAACGACCCTGCAGCCGCTGCATAAGCAAAGGTTTCAGGCCG
ACTTCGCTTTTGGTCCAGAAGATGCCATGTGATAAAAA*GATGTAACATACACCATCTAC
AAGTTGAAGTTTATGGATATGTTTATTCTGAATAATGTTTAATTTTGAATCGAGTGTAGT
AGACTCTGTTCCTCTATATTTTTTCAAGAGTGTATCTTATTGTGTTA
T

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4GE17TF 647 0 0
G
TCATGAAAGATGTCGAGGGCACTCGCAGTGGGCGACATGGGTTTGTAGTGGCGATAACAG
GAATAGAAAGCGTAGGGAAAGGATTGATCCGAGATGGGACTGCCTTCGTCACCTTCCCCG
TTAAGTACCAGTGCGTTGTTTTCAGACCTTTCAAAGGCGAGATTTTGGAAGCTGTTGTCA
CTTTGGTCAATAAGATGGGTTTCTTCGCTTAAGCTGGCCCTGTTCAGATTTTTGTGTCCA
AGCATTTGATTCCAGATGATATGGAGTTTCAGGCTGGAGACATGCCTAACTACACGACAT
CTGATGGATCAGTTAAGATCCAGAAAGAATGTGAAGTAAGGCTAAAGATTATTGGAACAA
GAGTCGATGCCACTGAAATCCTTTGTGTGGGTACCATAAAAGACGATTTTTTGGGAGTCA
TCAACGACCCTGCAGCCGCTGCATAAGCAACGGTTCCAGGCTGACTTCGCTTTTGGTCCA
GATGATGGCATGTGATAAAAAAGATGTAACATAGACCATCTACAAGTTGAAGTTTATGGA
TATGTTTATTCTGAATAATGTTTAATTTTGATTCGAGTGTAGTAGACTCTGTTCCTCTAT
ATTTTTTCAAGAGTGTATCTTATTGTGTTAGAAATAAAAGTAATCG

QA 2 647 2 647
DS 



AS 1 3

CO CL4410Contig1 743 3 5 U
GCAAGAACATTCTGTAGTCTTAGTAAGAGGGGGAAGGGTTAAGGATTTACCCGGTGTGAG
ATATCACATTGTTCGAGGAACCCTAGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAACAAGGGCG
TTCTAAATATGGGGTCAAAAAGCCAAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACA
GATTCTTGAACCCCTTTCACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGAAAAAACTGCA
AAATCCGATCCAATTTATCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAA
CACGGAAAAAAATCATTGGCTTATCAAATTATCTATCGAGCCTTGAAAAAGATTCAACAA
AAGACAGAAACAAATCCACTATCTGTTTTACGTCAAGCAATACGTGGAGTAACTCCCGAT
ATAGCAGTAAAAGCAAGACGTGTAGGCGGATCAACTCATCAAGTTCCCATTGAAATAGGA
TCCACGCAAGGAAAAGCGCTTGCCATTCGTTGGTTATTAGGGGCATCCCGAAAACGTCCG
GGTCGAAATATGGCTTTCAAATTAAGTTCCGAATTAGTGGATGCTGCCAAAGGGAGTGGC
GATGCCATACGCAGAAAGGAAGAGACTCATAGAATGGCAGAGGCAAATAGAGCGTTTGCA
CATTTTCGTTAATCCATGAACAGGATCTATATAGACACATAGATCCGTGGATCCATACAT
CTCGATCCGAAAAGAATCAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 

AF RR4F046TF U 51
AF RR4BF87TF U 1
AF RR4F046JQ C 78
BS 1 497 RR4BF87TF
BS 498 498 RR4F046TF
BS 499 613 RR4BF87TF
BS 614 614 RR4F046TF
BS 615 743 RR4BF87TF

RD RR4F046TF 668 0 0
GG
GGTGTGAGATATCACATTGTTCGAGGAACCCTAGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAA
CAAGGGCGTTCTAAATATGGGGTCAAAAAGCCAAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAA
AGAAAACAGATTCTTGAACCCCTTTCACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGAAA
AAACTGCAAAATCCGATCCAATTTATCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTA
TTCTGAAACACGGAAAAAAATCATTGGCTTATCAAATTATCTATCGAGCCTTGAAAAAGA
TTCAACAAAAGACAGAAACAAATCCACTATCTGTTTTACGTCAAGCAATACGTGGAGTAA
CTCCCGATATAGCAGTAAAAGCAAGACGTGTAGGCGGATCAACTCATCAAGTTCCCATTG
AAATAGGATCCACGCAAGGAAAAGCGCTTGCCATTCGTTGGTTATTAGGGGCATCCCGAA
AACGTCCGGGTCGAAATATGGCTTTCAAATTAAGTTCCGAATTAGTGGATGCTGCCAAAG
GGAGTGGCGATGCCATACGCAGAAAGGAAGAGACTCATAGAATGGCAGAGGCAAATAGAG
CGTTTGCACATTTTCGTTAATCCATGAACAGGATCTATATAGACACATAGATCCGTGGAT
CCATAC

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR4BF87TF 743 0 0
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ATATCACATTGTTCGAGGAACCCTAGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAACAAGGGCG
TTCTAAATATGGGGTCAAAAAGCCAAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACA
GATTCTTGAACCCCTTTCACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGAAAAAACTGCA
AAATCCGATCCAATTTATCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAA
CACGGAAAAAAATCATTGGCTTATCAAATTATCTATCGAGCCTTGAAAAAGATTCAACAA
AAGACAGAAACAAATCCACTATCTGTTTTACGTCAAGCAATACGTGGAGTAACTCCCGAT
ATAGCAGTAAAAGCAAGACGTGTAGGCGGATCAACTCATCAAGTTCCCATTGAAATAGGA
TCCACGCAAGGAAAAGCACTTGCCATTCGTTGGTTATTAGGGGCATCCCGAAAACGTCCG
GGTCGAAATATGGCTTTCAAATTAAGTTCCGAATTAGTGGATGCTGCCAAAGGGAGTGGC
GATGCCATACGCAAAAAGGAAGAGACTCATAGAATGGCAGAGGCAAATAGAGCGTTTGCA
CATTTTCGTTAATCCATGAACAGGATCTATATAGACACATAGATCCGTGGATCCATACAT
CTCGATCCGAAAAGAATCAATAG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4F046JQ 666 0 0
GAACCCTAGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAACAAGGGCGTTCTAAATATGGGGTCA
AAAAGCCAAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACAGATTCTTGAACCCCTTT
CACGCTCATGTCACGTCGAGGTACTGCAGAAGAAAAAACTGCAAAATCCGATCCAATTTA
TCGTAATCGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTTTGAAACACGGAAAAAAATCATT
GGCTTATCAAATTATCTATCGAGCCTTGAAAAAGATTCAACAAAAGACAGAAACAAATCC
ACTATTTGTTTTACGTCAAGCAATACGTGGAGTAACTCCCGATATAGCAGTAAAAGCAAG
ACGTGTAGGCGGATCAACTCATCAAGTTCCCATTGAAATAGGATCCACGCAAGGAAAAGC
GCTTGCCATTCGTTGGTTATTAGGGGCATCCCGAAAACGTCCGGGTCGAAATATGGCTTT
CAAATTAAGTTCCGAATTAGTGGATGCTGCCAAAGGGAGTGGCGATGCCATACGCAGAAA
GGAAGAGACTCATAGAATGGCAGAGGCAAATAGAGCGTTTGCACATTTTCGTTAATCCAT
GAACAGGATCTATATAGACACATAGATCCGTGGATCCATACATCTCGATCCGAAAAGAAT
CGATAG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 3

CO CL4411Contig1 837 3 4 U
GGAAATATTTTCATAATAATAAAACTGTACTATAGTTGGGTTTGATCCTTCGACCCCAGA
ATCATCAAAGCATTTCATATTCCCCGGCAATGGAAGCACTAGTTCCGGTTCAAAGTGCTG
GACAGAGACTTCCGGTTAGACTGGTCTCACCGTCTCTCTATCGGTGTATCGGTTCTGTCT
CGATCAGACGTTCGGTTTCAGGTTTTGCCATGGACACAAGGATCAGTTCCAAAGCTCCGT
CGCAGTTCACGATCCGGGCTCAACAGAGCTTAGGTGTTGCTTCTTCATCTTCAGTAGAGA
ATGATCTAAGAATCAAGGAATGGGAAGTAGACATGTATCACAATGAATTAGCTATTAGCC
AAGGTATCAGGATCAGGAGAAAACCACCAAGCAAGGCTCCACTGGGTTATTCTGGACCGT
TTGAGCTGAGATTGCATAATGCTGATTCTCCCAGTAACATCTTGGAGGAGATTACTTGGT
ACAAAGACCAAGAAGTTTCCAGGATGAAGGAAATGAACCCACTTGAGGCGTTAAAGAAAG
CTGTAGAGAATGCTCCTCCCACTAGGGATTTTGTGGGTGCGCTTAGGATGGCTCATCAAA
GGACTGGCTTCCCTGCTTTGATCGCTGAGGTTAAGAAGGCTTCTCCTAGTAGAGGAATCC
TGAAAGATAATTTTGACCCGGTCGAGATTGCTCAAGCTTATGAAAGAGGCGGTGCAGCGT
GTCTCAGTGTTTTGACTGACCAGAAGTACTTCAAGGGAGGCTTTGAAAACTTGGAAGCAA
TAAGAAGCTTGGTTTGGCTGCCCTTGTTGGCATCAATAACCGCAGTCTTGAAACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA12TF U 51
AF RR4F811TF U 1
AF RR4A423TF U 51
BS 1 708 RR4F811TF
BS 709 709 RR4A423TF
BS 710 738 RR4F811TF
BS 739 837 RR4A423TF

RD RR4GA12TF 595 0 0
G
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AAGCTCCGTCGCAGTTCACGATCCGGGCTCAACAGAGCTTAGGTGTTGCTTCTTCATCTT
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CTGGACCGTTTGAGCTGAGATTGCATAATGCTGATTCTCCCAGTAACATCTTGGAGGAGA
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CTCATCAAAGGACTGGCTTCCCTGCTTTGATCGCTGAGGTTAAGAAGGCTTCTC

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DS 

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GACAGAGACTTCCGGTTAGACTGGTCTCACCGTCTCTCTATCGGTGTATCGGTTCTGTCT
CGATCAGACGTTCGGTTTCAGGTTTTGCCATGGACACAAGGATCAGTTCCAAAGCTCCGT
CGCAGTTCACGATCCGGGCTCAACAGAGCTTAGGTGTTGCTTCTTCATCTTCAGTAGAGA
ATGATCTAAGAATCAAGGAATGGGAAGTAGACATGTATCACAATGAATTAGCTATTAGCC
AAGGTATCAGGATCAGGAGAAAACCACCAAGCAAGGCTCCACTGGGTTATTCTGGACCGT
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ACAAAGACCAAGAAGTTTCCAGGATGAAGGAAATGAACCCACTTGAGGCGTTAAAGAAAG
CTGTAGAGAATGCTCCTCCCACTAGGGATTTTGTGGGTGCGCTTAGGATGGCTCATCAAA
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GTCTCAGTGTTTTGACTG

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DS 

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G
GACCCCAGAATCATCAAAGCATTTCATATTCCCCGGCAATGGAAGCACTAGTTCCGGTTC
AAAGTGCTGGACAGAGACTTCCGGTTAT**TGGTCTCACCGTCTCTCTATCGGTGTATCG
GTTCTGTCTCGATCAGACGTTCGGTTTCAGGTTTTGCCATGGACACAAGGATCAGTTCCA
AAGCTCCGTCGCAGTTCACGATCCGGGCTCAATAGAGCTTAGGTGTTGCTTCTTCATCTT
CAGTAGAGAATGATCTAAGAATCAAGGAATGGGAAGTAGACATGTATCACAATGAATTAG
CTATTAGCCAAGGTATCAGGATCAGGAGAAAACCACCAAGCAAGGCTCCACTGGGTTATT
CTGGACCGTTTGAGCTGAGATTGCATAATGCTGATTCTCCCAGTAACATCTTGGAGGAGA
TTACTTGGTACAAAGACCAAGAAGTTTCCAGGATGAAGGAAATGAACCCACTTGAGGCGT
TAAAGAAAGCTGTAGAGAATGCTCCTCCCACTAGGGATTTTGTGGGTGCGCTTAGGATGG
CTCATCAAAGGACTGGCTTCCCTGCTTTGATCGCTGAGGTTAAGAAGGCTTCTCCTAGTA
GAGGAATCCTGAAAGATAATTTTGACCCGGTCGAGATTGCTCAAGCTTATGAAAGAGGCG
GTGCAGCGTGTCTCAGTGTTTTGACTGACCAGAAGTACTTCAAGGGAGGCTTTGAAAACT
TGGAAGCAATAAGAAGCTTGGTTTGGCTGCCCTTGTTGGCATCAATAACCGCAGTCTTGA
AACATT

QA 2 787 2 787
DS 



AS 1 2

CO CL4412Contig1 971 2 4 U
AAATATCAATCTTCTCAAAAAGTAAAGTCCAAACATTCAAGCAAAAAGATAAGCTAAAAC
AAAAACTTTCATGTAAAACATAAAAATTAAATTCATCCAAAAGAAAAAAAAAGTGAATAT
CTTAGGATGATGGTCTAATTCATCCTCTGAGCAGCTTCTTTGGCTAGAACTCTCTCTTTA
GCCTTAGTCTTGGCCTGTGATTTGGATCCCATTATCCCACCTCCCCACTTCTTCCGGTTC
TCTTCATATTTGTCGTTGAAATTTGCCTTAATGGCCTCAAGGACTTTGCTGAACTCCATC
TTGTCCTCGTTCTTCACTGTTGTCAAACACAAGCAAGCTGCTGTTTTTTGGTGGACAATC
TTACCGCTCCCAATCTTGATTTCCCCTTGATAATGCAGTAAGGAACTTCCATTTTCCTGC
AAAGTGCAGGCAGCCAGACAACCAACTCAATCGGGTCCACATCATGAGCAATCACCACAA
GTTGCGCCTTGTTCTGCTCAATGAGGTATGTAACATGGTTAAGACCATACTTCACAACGA
TTGGCTTCTTCGACTCAACAGGCTTTCCCTCGGCCTCAGACTGAGCCTTCTTGAGAAGAC
GTTCCTTCTTGGCTGCCTCGTCCTCAGGCCTATACTTGACAAGAATCTTCAAGAGAGAAG
TTGCTAAGTTCTTGTCAAGGGTCTTTGTAAACTGGTTGAGTGCTGGTGGGACCTTAAGCC
TCTGCTTAAGAATACGCTTCTGCCTCTGGAGGCGGATGGACTTTGGCCATTTGATGTATC
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CAAAAAGTGGGTTTGTTACTTTCTCCGGCTTCTTCTTGGTAACCGCTTTGACTCCTTTCT
TTGGGGCCATTTTCAATTTCCGCAGCAACTGTTTGTTCCTGAGACAGGGAGGGAAGAAAC
TGAAACCGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG28JQ U 1
AF RR4BF53TF C 210
BS 1 618 RR4DG28JQ
BS 619 619 RR4BF53TF
BS 620 787 RR4DG28JQ
BS 788 971 RR4BF53TF

RD RR4DG28JQ 787 0 0
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AAAAACTTTCATGTAAAACATAAAAATTAAATTCATCCAAAAGAAAAAAAAAGTGAATAT
CTTAGGATGATGGTCTAATTCATCCTCTGAGCAGCTTCTTTGGCTAGAACTCTCTCTTTA
GCCTTAGTCTTGGCCTGTGATTTGGATCCCATTATCCCACCTCCCCACTTCTTCCGGTTC
TCTTCATATTTGTCGTTGAAATTTGCCTTAATGGCCTCAAGGACTTTGCTGAACTCCATC
TTGTCCTCGTTCTTCACTGTTGTCAAACACAAGCAAGCTGCTGTTTTTTGGTGGACAATC
TTACCGCTCCCAATCTTGATTTCCCCTTGATAATGCAGTAAGGAACTTCCATTTTCCTGC
AAAGTGCAGGCAGCCAGACAACCAACTCAATCGGGTCCACATCATGAGCAATCACCACAA
GTTGCGCCTTGTTCTGCTCAATGAGGTATGTAACATGGTTAAGACCATACTTCACAACGA
TTGGCTTCTTCGACTCAACAGGCTTTCCCTCGGCCTCAGACTGAGCCTTCTTGAGAAGAC
GTTCCTTCTTGGCTGCCTTGTCCTCAGGCCTATACTTGACAAGAATCTTCAAGAGAGAAG
TTGCTAAGTTCTTGTCAAGGGTCTTTGTAAACTGGTTGAGTGCTGGTGGGACCTTAAGCC
TCTGCTTAAGAATACGCTTCTGCCTCTGGAGGCGGATGGACTTTGGCCATTTGATGTATC
TCGTGAG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4BF53TF 762 0 0
CATTATCCCACCTCCCCACTTCTTCCGGTTCTCTTCATATTTGTCGTTGAAATTTGCCTT
AATGGCCTCAAGGACTTTGCTGAACTCCATCTTGTCCTCGTTCTTCACTGTTGTCAAACA
CAAGCAAGCTGCTGTTTTTTGGTGGACAATC*****GCTCCCAATCTTGATTTCCCCTTG
ATAATGCAGTAAGGAACTTCCATTTTCCTGCAGAGTGCAGGCAGCCAGACAACCAACTCA
ATCGGGTCCACATCATGAGCAATCACCACAAGTTGCGCCTTGTTCTGCTCAATGAGGTAT
GTAACATGGTTAAGACCATACTTCACAACGATTGGCTTCTTCGACTCAACAGGCTTTCCC
TCGGCCTCAGACTGAGCCTTCTTGAGAAGACGTTCCTTCTTGGCTGCCTCGTCCTCAGGC
CTATACTTGACAAGAATCTTCAAGAGAGAAGTTGCTAAGTTCTTGTCAAGGGTCTTTGTA
AACTGGTTGAGTGCTGGTGGGACCTTAAGCCTCTGCTTAAGAATACGCTTCTGCCTCTGG
AGGCGGATGGACTTTGGCCATTTGATGTATCTCGTGAGATCCTTCTTCGGTGGCAATGCT
CCCCCGATTCCAAACTGTTTTGGACGCCTCTCAAAAAGTGGGTTTGTTACTTTCTCCGGC
TTCTTCTTGGTAACCGCTTTGACTCCTTTCTTTGGGGCCATTTTCAATTTCCGCAGCAAC
TGTTTGTTCCTGAGACAGGGAGGGAAGAAACTGAAACCGTCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

CO CL4413Contig1 853 3 9 U
AATTCTCTCTCAATAATTATTCTTTTTTTCAAACAAACAAACAAACGCCATTTGTGTAAC
AAAAAAAA**AGGAGACGTTTTCTGGTTTCCGATGTTAGACTTGCAGCCGTCCGATCGTC
GTCCCGGAGCGCCGAGTTCTAGCGGTGGAGATGAGCTGATCAGAACGTATAAGGGTTGGA
AAGGCAATAACGTGTTCTTCTTAGGAGGAAGGCTCGTGTTTGGACCAGATGCTCGATCTA
TACTCATCACCATCTTCTTGATCACAGCTCCCGTCATTATCTTCTGTGTTTTCGTCGGCC
GTAAATTCATTGATGACTTCCCTCACCACAGAGGAGTATCAGTATTAGCCGTCGCCGTTG
GTCTCAACTTATTAGCTCTAATATTTCTTCTTGTAACCTCGGGGAGAGACCCTGGAATCA
TACCCCGTAACCTCTATCCACCCGAGCCAGAGGGCTTCGAAAGTAG***TGGAGAACCGC
GTCTTACTCATACTCCTACTCAGTCCCGGTTGCCTCGGACAAAAGACATGATCGTTAATG
GAATCACTGTGAAGATCAAATACTGCGACACGTGCATGCTCTACAGACCTCCTCGCGCTT
CCCATTGCTCCATATGCAACAACTGCGTTGACAAATTTGATCACCACTGTCCTTGGCTTG
GTCAATGCATTGGATTGAGAAACTACAGGTTCTACTTCATGTTTATATTATGCTCGGCTC
TTCTCTGCATTTATGTCCATGTGTTTTGCTGGATACACGTCAACGCATCATGGATGGTGA
GAAGATAAGCATCTGGAAGTCGCTTATCAAGACACCTGCTTCCATCGCGCTGAAATCTAT
ACTTTCATCTGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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ATTATCAGA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4A276TFB U 1
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AF RR4A276JQD C 307
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CGTTCAAGCGCCAACGTTGAGGACTTAGCAGGAATGTCAGCAGCAGGACTCTATGAATCA
GTCCCC*AACGTGAGTCCATCAGACCCTTCGGTCTTCTCTGCTTCCGTTTGCCGAGTTTG
GGCCCCTCTCTACACGAGGAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCCGCTGGTGTCTCTCAGAG
AGAAGCTTCC*ATGGCGGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCTCCTGACTTATCTTTCGTCC
TCCACACGGTGAGTCCATCTGATCC*GGGCAGTAACCTCGTGGAAGCTGAGATTGCTCCT
GG*TTTAG*TGAGACTTTAGCTTCGGGGACGAGAGGAACACCGTGGAGACTCGCTTCGGG
TAAGCTTGGATGGGGTTGTGCAGACGTTAGCGTTTGCCA*CTTCAGTGA
GAGCTTCTG

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DS 

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TTGCTGATTCAGATGCATCAACATCTGGTTCAAAAGCTGCTGCATGTGGTCTTCTTGCAT
CTCTAGCAGCAGCTTCTACTAGAGTGCACAGCGAACATGGAGTTCCAGCATCATTCAAGG
TACCAACCGGAGTTGTCATACCTTTTGGTTCCATGGAGTTAGCCTTAAAGCAAAGCAACT
CAGAAGAAAAGTTCACATCTCTGCTAGAAAAGTTAGAAACCGCCACACCTGAAGACGGTG
AGCTAGACATCACATGTGATCAGATCAACGAAGTGATGAAGTCACTGCAAGTTCCCAAAG
AAACAATCAGCACCATTAGCAAAGCCTTCCCCAAAGACGCTCGACTCATCGTTCGTTCAA
GCGCCAACGTTGAGGACTTAGCAGGAATGTCAGCAGCAGGACTCTATGAATCAGTCCCCC
AACGTGAGTCCATCAGACCCTTCGGTCTTCTCTGCTTCCGTTTGCCGAGTTTGGGCCCCT
CTCTACACGAGGAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCCGCTGGTGTCTCTCAGAGAGAAGCT
TCCCATGGCGGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCTCCTGACTTATCTTTCGTCCTCCACAC
GGTGAGTCCATCTGATCCCGGGCAGTAACCTCGTGGAAGCTGAGATTGCTCCTGGGTTTA
GGTGAGACTTTAGCTTCGGGGACGAGAGGAACACCGTGGAGACTCGCTTCGGGT

QA 1 774 1 774
DS 

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GAGCTAGACATCACATGTGATCAGATCAACGAAGTGATGAAGTCACTGCAAGTTCCCAAA
GAAACAATCAGCACCATTAGCAAAGCTTCCCCAAAAGACGCTCGACTCATCGTTCGTTCA
AGCGCCAACGTTGAGGACTTAGCAGGAATGTCAGCAGCAGGACTCTATGAATCAGTCCCC
*AACGTGAGTCCATCAGACCCTTCGGTCTTCTCTGCTTCCGTTTGCCGAGTTTGGGCCCC
TCTCTACACGAGGAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCCGCTGGTGTCTCTCAGAGAGAAGC
TTCC*ATGGCGGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCTCCTGACTTATCTTTCGTCCTCCACA
CGGTGAGTCCATTTGATCC*GGGCAGTAACCTCGTGGAAGCTGAGATTGCTCCTGG*TTT
AGGTGAGACTTTAGCTTCGGGGACGAGAGGAACACCGTGGAGACTCGCTTCGGGTAAGCT
TG*ATGGGGTTGTGCAGACGTTAGCGTTTGCCAACTTCAGTGAAGAGCTTCTTGTGTCAG
GGAAAGGTCCTGCTGATGGCAAATATGTTCGGTTAACCGTTGACTATAGCAAGAAACGGT
TAACGGTTGACTCGGTGTTTAGACAGAAACTTGGTCAGAGACTCGGTTCGGTTGGTTTCT
TCTTGGAAAGGAACTTTGGTTGTGCACAAGACGTTGAAGGTTGTTTGGTTGGTGAAGATG
TTTACATTGTTCAGTCAAGGCCACAACCTCTGTAAAAATCTTCTTTTTTTTTTTTTTACT
TTTATATAAAATATCGAATAATAAAAAATGTCAGAAATCAATTCGGCATTTACGTATGTT
TAAATAATAATGAGATATATATTTACTATACATTTTTGAAATCATCTTTGCGGAATTATC
AGA

QA 1 903 1 903
DS 



AS 1 3

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GGTTGGTGAAAACTTTATCATTTCACCTGTTATGGTGGTTATCGACAGTTGAAATTATTC
ATTTTTAAGAGGATCGGGCAAACAAAAACACCTCAAGAATTGTAAAACCAAAACCAATTT
TTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAAAAACGAAAGAAGTGATTCAGAGCTTTATCCT
GAAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAGGTTTATTATGTGGTAAT
CATCCAAGGTTTCATTTAATCAACAGCTGAATCTTTCTCTCACAGAAGAAGTCTTCGAAC
ATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAACTTGTCCATCGAAGAT
CCGATGATCAGCGGATAGCGTCACATTCATTTTCGTTACAACCGAAGGCTTCTCAGTTCC
ATCTATTCCAAGAACTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAACTGCTAGAATTCCAGC
CTGAGGGGGGTTAATGATTGCGCAGAATTGGTCCACAGGATACATTCCGAGATTTGAAAT
GCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAGATCGTGCCTTTTGTGC
CAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATAGATTTCTGGTCAGCATTTCTGATAAT
TGGAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTGCAACTGCAATTGATATGTCAACATCCTCACACAA
AACAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCATGTCGTACATTCCTCAGTGC
GACTGCCACTGCTTTAATAACTATGTCATTGACCGACACTTTAACACCATGGTTTTCTTG
AAGTTCTTTTCTAAATGCAAGAAGAGGATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO53JQ U 1
AF RR4B607JQ U 5
AF RR4B607TF C 183
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RD RR4CO53JQ 768 0 0
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GCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCACGAGGAGCAAGCATTCCAGATCGTGCCTTTTGTGC
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TGGAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTACAACTGCAATTGATATGTCAACATCCTCACACAA
AACAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCATGTCGTAC

QA 1 768 1 768
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TCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAACTTGTCCATCGAAGATCCGA
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ATTCCAAGAACTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAACTGCTAGAATTCCAGCCTGA
GGGGGGTTAATGATTGCGCAGAATTGGTCCACAGGATACATTCCGAGATTTGAAATGCTG
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ATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCATGTCGTACATTCCTCAGTGCGACT
GCCACTGCTTTAATAACTATGTCATTGACCGACACTTTAACACCATGGTTTTCTTGAAGT
TCTTTT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4B607TF 688 0 0
AGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAGGTTTATTATGTGGTAATCA
TCCAAGGTTTCATTTAATCAACAGCTGAATCTTTCTCTCACAGAAGAAGTCTTCGAACAT
CCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAACTTGTCCATCGAAGATCC
GATGATCAGCGGATAGCGTCACATTCATTTTCGTTACAACCGAAGGCTTCTCAGTTCCAT
CTATTCCAAGAACTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAACTGCTAGAATTCCAGCCT
GAGGGGGGTTAATGATTGCGCAGAATTGGTCCACAGGATACATTCCGAGATTTGAAATGC
TGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAGATCGTGCCTTTTGTGCCA
GCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATAGATTTCTGGTCAGCATTTCTGATAATTG
GAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTGCAACTGCAATTGATATGTCAACATCCTCACACAAAA
CAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCATGTCGTACATTCCTCAGTGCGA
CTGCCACTGCTTTAATAACTATGTCATTGACCGACACTTTAACACCATGGTTTTCTTGAA
GTTCTTTTCTAAATGCAAGAAGAGGATC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 3

CO CL4416Contig1 836 3 8 U
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CATCAGGATACAAAAGTAATATACAGAGTTTTGTTTGTCTTGGTAGTCCAGTCTCTGGTC
CAGATACCAGACCCCAATACTGACACTTACAACCGCCAATTGTAAACTATAACAACGTGG
TTATCCAAGGCGTAGAACTTGATAGACTCAACTGTGACCGAGGCTGTTGAGACGAATCCA
AGTAGGCAACATCGCTGCAAACCGTGATTTCAGAGCTTGAGCAGATGATTTCAGCCTTCT
CAAGTGTGAATCCGTGGATTATGGGCAAAGGGAAGCCTTTTTCTAGATGGTCATTTGCAT
ATGGCACAAACACCGTTTGTATAGCGGTCCACACTATTGGCTGAAGAAGATGCAGATGTA
GATTTCCAATGTTGCTCCACTCCAAAGACATGGAGAAATCTTCTAATCTTACGCTGCCTC
CAAGGTTATTACCCATCACTCTGAGGGCACCCGACCCTCGGATCTCCAAGGAGATGCATG
CTACTGGTATCACTTGGTCTGCTTCTAGAACATTGATTACTAGGTCCGCGTTCACATTAG
CTCCCACATACTGCTCTGATATCTTTACAAGCGGAGGCGATGACAAACTGATGTTCAGAT
TCATATCCTGGTTTGGGTACTTCCTGTATAGTTGTGGAATGATGAACCTCCACCTAGCGG
TGTTCAAAAGCGCCTGGTCTGGTATTTTATCCACTACCCATTGCATAAACTCTGCATTGT
AGTACAAAGCTGCAGCAGAGTTAAAGACAGCCTCATCCAACGAAATTCCGAGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX03TF C 1
AF RR4CX03JQ U 8
AF RR4CK08JQ U 8
BS 1 9 RR4CX03TF
BS 10 65 RR4CK08JQ
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BS 67 383 RR4CK08JQ
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BS 385 594 RR4CK08JQ
BS 595 595 RR4CX03JQ
BS 596 836 RR4CK08JQ

RD RR4CX03TF 739 0 0
TTTTTTTGCAAAGACATTT*TATTTCATATAAAGAAGAATAGCATACACAGTTTGATCAA
CATCAGGATACAAAAGTAATATACAGAGTTTTGTTTGTCTTGGTAGTCCAGTCTCTGGTC
CAGATACCAGACCCCAATACTGACACTTACAACCGCCAATTGTAAACTATAACAACGTGG
TTATCCAAGGCGTAGAACTTGATAGACTCAACTGTGACCGAGGCTGTTGAGACGAATCCA
AGTAGGCAACATCGCTGCAAACCGTGATTTCAGAGCTTGAGCAGATGATTTCAGCCTTCT
CAAGTGTGAATCCGTGGATTATGGGCAAAGGGAAGCCTTTTTCTAGATGGTCATTTGCAT
ATGGCACAAACACCGTTTGTATAGCGGTCCACACTATTGGCTGAAGAAGATGCAGATGTA
GATTTCCAATGTTGCTCCACTCCAAAGACATGGAGAAATCTTCTAATCTTACGCTGCCTC
CAAGGTTATTACCCATCACTCTGAGGGCACCCGACCCTCGGATCTCCAAGGAGATGCATG
CTACTGGTATCACTTGGTCTGCTTCTAGAACATTGATTACTAGGTCCGCGTTCACATTAG
CTCCCACATACTGCTCTGATATCTTTACAAGCGGAGGCGATGACAAACTGATGTTCAGAT
TCATATCCTGGTTTGGGTACTTCCTGTATAGTTGTGGAATGATGAACCTCCACCTAGCGG
TGTTCAAAAGCGCCTGGTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4CX03JQ 732 0 0
GC
AAAGACATTTTTATTTCATATAAAGAAGAATAGCATACACAGTTTGATCAACATCAGGAT
ACAAAAGTAATATACAGAGTTTTGTTTGTCTTGGTAGTCCAGTCTCTGGTCCAGATACCA
GACCCCAATACTGACACTTACAACCGCCAATTGTAAACTATAACAACGTGGTTATCCAAG
GCGTAGAACTTGATAGACTCAACTGTGACCGAGGCTGTTGAGACGAATCCAAGTAGGCAA
CATCGCTGCAAACCGTGATTTCAGAGCTTGAGCAGATGATTTCAGCCTTCTCAAGTGTGA
ATCCGTGGATTATGGGCAAAGGGAAGCCTTTTTCTAGATGGTCATTTGCATATGGCACAA
ACACCGTTTGTATAGCGGTCCACACTATTGGCTGAAGAAGATGCAGATGTAGATTTCCAA
TGTTGCTCCACTCCAAAGACATGGAGAAATCTTCTAATCTTACGCTGCCTCCAAGGTTAT
TACCCATCACTCTGAGGGCACCCGACCCTCGGATCTCCAAGGAGATGCATGCTACTGGTA
TCACTTGGTCTGCTTCTAGAACATTGATTACTAGGTCCGCGTTCACATTAGCTCCCACAT
ACTGCTCTGATATCTTTACAAGCGGAGGCGATGACAAACTGATGTTCAGATTCATATCCT
GGTTTGGGTACTTCCTGTATAGTTGTGGAATGATGAACCTCCACCTAGCGGTGTTCAAAA
GCGCCTGGTC

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR4CK08JQ 829 0 0
GT
AAAGACATTTATATTTCATATAAAGAAGAATAGCATACACAGTTTGATCAACATCAAGAT
ACAAAAGTAATATACAGAGTTTTGTTTGTCTTGGTAGTCCAGTCTCTGGTCCAGATACCA
GACCCCAATACTGACACTTACAACCGCCAATTGTAAACTATAACAACGTGGTTATCCAAG
GCGTAGAACTTGATAGACTCAACTGTGACCGAGGCTGTTGAGACGAATCCAAGTAGGCAA
CATCGCTGCAAACCGTGATTTCAGAGCTTGAGCAGATGATTTCAGCCTTCTCAAGTGTGA
ATCCGTGGATTATGGGCAAAGGGAAGCCTTTTTCTAGATGGTCATTTGCATATGGCACAA
ACACCGTTTGTATAACGGTCCACACTATTGGCTGAAGAAGATGCAGATGTAGATTTCCAA
TGTTGCTCCACTCCAAAGACATGGAGAAATCTTCTAATCTTACGCTGCCTCCAAGGTTAT
TACCCATCACTCTGAGGGCACCCGACCCTCGGATCTCCAAGGAGATGCATGCTACTGGTA
TCACTTGGTCTGCTTCTAGAACATTGATTACTAGGTCCGCGTTCAAATTAGCTCCCACAT
ACTGCTCTGATATCTTTACAAGCGGAGGCGATGACAAACTGATGTTCAGATTCATATCCT
GGTTTGGGTACTTCCTGTATAGTTGTGGAATGATGAACCTCCACCTAGCGGTGTTCAAAA
GCGCCTGGTCTGGTATTTTATCCACTACCCATTGCATAAACTCTGCATTGTAGTACAAAG
CTGCAGCAGAGTTAAAGACAGCCTCATCCAACGAAATTCCGAGCATT

QA 3 829 3 829
DS 



AS 1 2

CO CL4417Contig1 756 2 4 U
AGTAGAATAACCTTCGTTTATTCAATTATTAAAGACATAAAATTCACACTCCATTCAGCC
AAAAGCTCACATTACAAAGCCACTCATCATCATCAACAGCAGAAAGATAATTAAAAAGGC
CCTTTTATTAACGTCCCTCGCAGGCTCCCCACATTCTTCATACTTTAGAATTTACACAAG
TGTTCCCTTGGCGAGCTGAAGCGCTTTCTCTCGCCCATAGAACTTCTCAACGATAGCAAG
TGAAAACTCCATCGCAGTCCCTGGAGCTCTGCTCGTTATCACATTCCCGTCCACAACAAC
TCCGTGCTCAAGGTGACTCTGGTCCGAAAGTTTGTCGCTCACCACTGGGTGGGTAGTTGC
CTTCTTACCCTTGAGTAAACCATGATGCTCAAAGACGTAAACAGGCGATGCGCAGATTCC
TCCATAAAGTTTGTTTGCTTCCGCTTGTTTCTTTAACATATTCACTAGTTTCTCGCAGCT
TGCCAATCTTGGAGCACCCTTAAGACCTCCAGGTAATACAATCAGATCGAACGACTTCTC
TGCAACCTCATCAAGAAGCACATCTGCAACTAACTTACATTTGCGAGATCCTACCACTTC
CAAACTGTTACCAACTGCAGCTATCACGACATTTGCTTTTACCCTCCTCAGGATATCTAC
AAGTGCAATAGCTTCGATCTCCTCAGAGTCCTCTGCAATGGGGACAAGAATCTGTGGAGT
ATCTTCGAACGACCATTTGGTTTGGTTGAGCTCGGT


BQ
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AF RR4E690JQ U 1
AF RR4F752JQ U 5
BS 1 302 RR4E690JQ
BS 303 303 RR4F752JQ
BS 304 744 RR4E690JQ
BS 745 756 RR4F752JQ

RD RR4E690JQ 744 0 0
AGTAGAATAACCTTCGTTTATTCAATTATTAAAGACATAAAATTCACACTCCATTCAGCC
AAAAGCTCACATTACAAAGCCACTCATCATCATCAACAGCAGAAAGATAATTAAAAAGGC
CCTTTTATTAACGTCCCTCGCAGGCTCCCCACATTCTTCATACTTTAGAATTTACACAAG
TGTTCCCTTGGCGAGCTGAAGCGCTTTCTCTCGCCCATAGAACTTCTCAACGATAGCAAG
TGAAAACTCCATCGCAGTCCCTGGAGCTCTGCTCGTTATCACATTCCCGTCCACAACAAC
TCTGTGCTCAAGGTGACTCTGGTCCGAAAGTTTGTCGCTCACCACTGGGTGGGTAGTTGC
CTTCTTACCCTTGAGTAAACCATGATGCTCAAAGACGTAAACAGGCGATGCGCAGATTCC
TCCATAAAGTTTGTTTGCTTCCGCTTGTTTCTTTAACATATTCACTAGTTTCTCGCAGCT
TGCCAATCTTGGAGCACCCTTAAGACCTCCAGGTAATACAATCAGATCGAACGACTTCTC
TGCAACCTCATCAAGAAGCACATCTGCAACTAACTTACATTTGCGAGATCCTACCACTTC
CAAACTGTTACCAACTGCAGCTATCACGACATTTGCTTTTACCCTCCTCAGGATATCTAC
AAGTGCAATAGCTTCGATCTCCTCAGAGTCCTCTGCAATGGGGACAAGAATCTGTGGAGT
ATCTTCGAACGACCATTTGGTTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4F752JQ 752 0 0
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GCTCACATTACAAAGCCACTCATCATCATCAACAGCAGAAAGATAATTAAAAAGGGCCTT
TTATTAACGTCCCTCGCAGGCTCCCCACATTTTTCATACTTTAGAATTTACACAAGTGTT
CCCTTGGTGAGCTGAAGCGCTTTCTCTCGCCCGTAGAACTTCTCAACGATAGCAAGTGAA
AACTCCATCGCAGTCCCTGGAGCTCTGCTCGTTATCACATTCCCGTCCACAACAACTCCG
TGCTCAAGGTGACTCTGGTCCGAAAGTTTGTCGCTCACCACTGGGTGGGTAGTTGCCTTC
TTACCCTTGAGTAAACCATGATGCTCAAAGACGTAAACAGGCGATGCGCAGATTCCTCCA
TAAAGTTTGTTTGCTTCCGCTTGTTTCTTTAACATATTCACTAGTTTCTCGCAGCTTGCC
AATCTTGGAGCACCCTTAAGACCTCCAGGTAATACAATCAGATCGAACGACTTCTCTGCA
ACCTCATCAAGAAGCACATCTGCAACTAACTTACATTTGCGAGATCCTACCACTTCCAAA
CTGTTACCAACTGCAGCTATCACGACATTTGCTTTTACCCTCCTCAGGATATCTACAAGT
GCAATAGCTTCGATCTCCTCAGAGTCCTCTGCAATGGGGACGAGAATCTGTGGAGTATCT
TCGAACGACCATTTGGTTTGGTTGAGCTCGGT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL4418Contig1 1197 3 18 U
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CTCTCTCTTTCTCATCAAATCAAGAATCATGACAAGCGAGGTGAGAGAGAAGAAGATCAA
GACCAACGGGGCTTGGTTAAATGTGGCTGAGAAAGGAGACGACGGAGGCCCCTTAGTTCT
GTTACTCCATGGCTTCCCTGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTC
AAGACACGGCTACCACGTAGTTGCTCCAGATCTTAGAGGCTACGCTGACTCCGATGCTCC
TCCGAGCCACGAGTCTTACACTGTGAGCCATCTCGTAGCTGATGTCATCGGTTTGCTCGA
TCACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGAGCTATCATAGGTTG
GACTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGCCAAAGGTTTCGCAAGTCTCTCTGTTCCATA
CTCTCCAAGAGATCCAAATCTCAAACCTTCCGACTTACTCAAAAGCTTTGGAGATGGGTT
ATACATCACTCAGTTTCAGGAACCTGGAAGAGCTGAGGCTGCATTTGCCAAGCACGATTG
CTTGACAGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCTGGGTGGCTCCTCC
TGATACAGAGATCATCGATGATCTTGAGGTTCCATCGACGCTTCCAGATTGGATAACTGA
AGAAGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAAAAGTCTGGATTCACAGGCCCATTGAA
TTACTACAGAGCCATGGATTTGAACTGGGAGATACCGGCGCCGTGGCAAGGCTACAAGAT
CGTTGTTCCGACAAAGTTTATCGCGGGAGACAAAGATATAGGAAATGAAGGAGCCAATGG
AACGATTAAGTATGTGAAGGGAGAGATGTTCAAGAGTATTGTACCTAATCTTGAGGTTGT
TGTTATTGAGGATGGTCATCATTTTATCCAGCAGGAGAAGCCTGAACGTGTCTCAGAGGA
GATTCTTTCCTACTTTAACAAGTTAAGAAACACAACAGAGTAATATGATCACGCCATTCT
ATGGCCTTATAAAAAAAACTATGTTTCTAGTATAAAGTACACTAATGATGTATGTCTAAG
AATAAAGCCGAGTGAACAATAATGGTTAATAAAGTAAAAGAAAGATCTAATGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CM07TF U 1
AF RR4AM45TF U 349
AF RR4AM45JQ C 446
BS 1 449 RR4CM07TF
BS 450 450 RR4AM45TF
BS 451 461 RR4CM07TF
BS 462 462 RR4AM45TF
BS 463 594 RR4CM07TF
BS 595 595 RR4AM45TF
BS 596 688 RR4CM07TF
BS 689 689 RR4AM45TF
BS 690 733 RR4CM07TF
BS 734 734 RR4AM45TF
BS 735 746 RR4CM07TF
BS 747 994 RR4AM45TF
BS 995 995 RR4AM45JQ
BS 996 1097 RR4AM45TF
BS 1098 1098 RR4AM45JQ
BS 1099 1182 RR4AM45TF
BS 1183 1183 RR4AM45JQ
BS 1184 1197 RR4AM45TF

RD RR4CM07TF 762 0 0
GGGAACAATCAAAATCTCAACTCTGGTAATAAAAGTCTCACTTGGTCGCTGATTTTTCCT
CTCTCTCTTTCTCATCAAATCAAGAATCATGACAAGCGAGGTGAGAGAGAAGAAGATCAA
GACCAACGGGGCTTGGTTAAATGTGGCTGAGAAAGGAGACGACGGAGGCCCCTTAGTTCT
GTTACTCCATGGCTTCCCTGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTC
AAGACACGGCTACCACGTAGTTGCTCCAGATCTTAGAGGCTACGCTGACTCCGATGCTCC
TCCGAGCCACGAGTCTTACACTGTGAGCCATCTCGTAGCTGATGTCATCGGTTTGCTCGA
TCACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGAGCTATCATAGGTTG
GACTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCGTAAGTCTCTCTGTTCCATA
CTCTCCAAGAGATCCAAATCTCAAACCTTCCGACTTACTCAAAAGCTTTGGAGATGGGTT
ATACATCACTCAGTTTCAGGAACCTGGAAGAGCTGAGGCTGCATTTGCCAAGCATGATTG
CTTGACAGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCTGGGTGGCTCCTCC
TGATACAGAGATCATCGATGATCTTGAG*TTCCATCGACGCTTCCAGATTGGATAACTGA
AGAAGAGATTCAG*TTTATGCAGACA
GTTTCAAAGTCTGGAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AM45TF 849 0 0
G
GGTTTGCTCGATCACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGAGCT
ATCATAGGTTGGACTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGCCAAAGGTTTCGCAAGTCTC
TCTGTTCCATACTCTCCAAGAGATCCAAATCTCAAACCTTCCGACTTACTCAAAAGCTTT
GGAGATGGGTTATACATCACTCAGTTTCAGGAACCTGGAAGAGCTGAGGCTGCATTTGCC
AAGCACGATTGCTTGACAGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCTGG
GTGGCTCCTCCTGATACAGAGATCATCGATGATCTTGAGGTTCCATCGACGCTTCCAGAT
TGGATAACTGAAGAAGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAAAAGTCTGGATTCACA
GGCCCATTGAATTACTACAGAGCCATGGATTTGAACTGGGAGATACCGGCGCCGTGGCAA
GGCTACAAGATCGTTGTTCCGACAAAGTTTATCGCGGGAGACAAAGATATAGGAAATGAA
GGAGCCAATGGAACGATTAAGTATGTGAAGGGAGAGATGTTCAAGAGTATTGTACCTAAT
CTTGAGGTTGTTGTTATTGAGGATGGTCATCATTTTATCCAGCAG*AGAAGCCTGAACGT
GTCTCAGAGGAGATTCTTTCCTACTTTAACAAGTTAAGAAACACAACAGAGTAATATGAT
CACGCCATTCTATGGCCTTATAAAAAAA*CTATGTTTCTAGTATAAAGTACACTAATGAT
GTATGTCTAAGAATAAAGCCGAGTGAACAATAATGGTTAATAAAGTAAAAGAA*GATCTA
ATGTTCTT

QA 2 849 2 849
DS 

RD RR4AM45JQ 752 0 0
AGAGCCAAAGGTTTCGCAAGTCTCTCTGTTCCATACTCTCCAAGAGATCCAAATCTCAAA
CCTTCCGACTTACTCAAAAGCTTTGGAGATGGGTTATACATCACTCAGTTTCAGGAACCT
GGAAGAGCTGAGGCTGCATTTGCCAAGCACGATTGCTTGACAGTTATGAAGAAGTTCTTG
CTAACAACGAGAACAGATTTCTGGGTGGCTCCTCCTGATACAGAGATCATCGATGATCTT
GAGGTTCCATCGACGCTTCCAGATTGGATAACTGAAGAAGAGATTCAGGTTTATGCAGAC
AAGTTTCAAAAGTCTGGATTCACAGGCCCATTGAATTACTACAGAGCCATGGATTTGAAC
TGGGAGATACCGGCGCCGTGGCAAGGCTACAAGATCGTTGTTCCGACAAAGTTTATCGCG
GGAGACAAAGATATAGGAAATGAAGGAGCCAATGGAACGATTAAGTATGTGAAGGGAGAG
ATGTTCAAGAGTATTGTACCTAATCTTGAGGTTGTTGTTATTGAGGATGGTCATCATTTT
ATCCAGCAGGAGAAGCCTGAACGTGTCTCAGAGGAGATTCTTTCCTACTTTAACAAGTTA
AGAAACACAACAGAGTAATATGATCACGCCATTCTATGGCCTTATAAAAAAAACTATGTT
TCTAGTATAAAGTACACTAATGATGTATGTCTAAGAATAAAGCCGAGTGAACAATAATGG
TTAATAAAGTAAAAGAAAGATCTAATGTTCTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL4419Contig1 766 3 3 U
GGATCAACTACTGTAAAATCGATCGCTCACTAAAACCTCGTACTCATCGCCCCCCTGTCT
GTATCTTCTTCTCTAGATCTACTCTTAACCATGGCCACTATCACTGTTGTTAAGGCTAGG
CAGATCTTCGACAGCCGTGGCAACCCCACCGTCGAGGTTGATGTACACACATCCACTGGT
GTCAAGGTTACAGCAGCTGTTCCTAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTACGAGGCTCTTGAG
CTTAGGGATGGTGGCTCTGACTACCTTGGAAAGGGTGTTTCTAAGGCTGTTGGCAATGTG
AACAACATCATCGGCCCAGCATTGATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGAC
AACTTCATGGTCCATGAACTTGATGGCACCCAGAACGAGTGGGGTTGGTGCAAACAAAAG
CTTGGAGCCAATGCTATCCTTGCTGTGTCTCTTGCTGTCTGCAAGGCTGGGGCCGTTGTC
AGTGGCATTCCTCTCTACAAGCACATTGCCAATCTCGCTGGTAACCCTAAGATTGTGCTA
CCTGTTCCTGCCTTCAACGTTATCAATGGTGGATCACATGCCGGAAACAAGCTCGCTATG
CAGGAGTTTATGATTCTCCCTATCGGAGCTTCATCTTTCAAAGAAGCCATGAAAATGGGT
GTTGAGGTTTACCACAACTTGAAGTCTGTGATTAAGAAGAAGTACGGCCAGGACGCTACA
AACGTTGGTGATGAAAGGTGGCTTTGCACCAAACATTCAGAGAACA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FW53TF U 4
AF RR4G814TF U 1
AF RR4B941TF U 1
BS 1 382 RR4B941TF
BS 383 383 RR4FW53TF
BS 384 766 RR4B941TF

RD RR4FW53TF 660 0 0
GG
AACTACTGTAAAATCGATCGCTCACTAAAACCTCGTACTCATCGCCCCCCTGTCTGTATC
TTCTTCTCTAGATCTACTCTTAACCATGGCCACTATCACTGTTGTTAAGGCTAGGCAGAT
CTTCGACAGCCGTGGCAACCCCACCGTCGAGGTTGATGTACACACATCCACTGGTGTCAA
GGTTACAGCAGCTGTTCCTAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTATGAGGCTCTTGAGCTTAG
GGATGGTGGCTCTGACTACCTTGGAAAGGGTGTTTCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAA
CATCATCGGCCCAGCATTGATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTT
CATGGTCCATGAACTTGATGGCACCCAGAACGAGTGGGGTTGGTGCAAACAAAAGCTTGG
AGCCAATGCTATCCTTGCTGTGTCTCTTGCTGTCTGCAAGGCTGGGGCCGTTGTCAGTGG
CATTCCTCTCTACAAGCACATTGCCAATCTCGCTGGTAACCCTAAGATTGTGCTACCTGT
TCCTGCCTTCAACGTTATCAATGGTGGATCACATGCCGGAAACAAGCTCGCTATGCAGGA
GTTTATGATTCTCCCTATCGGAGCTTCATCTTTCAAAGAAGCCATGAAAATGGGTGTT

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR4G814TF 700 0 0
GGATC
AACTACTGTAAAATCGATCGCTCACTAAAACCTCGTACTCATCGCCCCCCTGTCTGTATC
TTCTTCTCTAGATCTACTCTTAACCATGGCCACTATCACTGTTGTTAAGGCTAGGCAGAT
CTTCGACAGCCGTGGCAACCCCACCGTCGAGGTTGATGTACACACATCCACTGGTGTCAA
GGTTACAGCAGCTGTTCCTAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTACGAGGCTCTTGAGCTTAG
GGATGGTGGCTCTGACTACCTTGGAAAGGGTGTTTCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAA
TATCATCGGCCCAGCATTGATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTT
CATGGTCCATGAACTTGATGGCACCCAGAACGAGTGGGGTTGGTGCAAACAAAAGCTTGG
AGCCAATGCTATCCTTGCTGTGTCTCTTGCTGTCTGCAAGGCTGGGGCCGTTGTCAGTGG
CATTCCTCTCTACAAGCACATTGCCAATCTCGCTGGTAACCCTAAGGTTGTGCTACCTGT
TCCTGCCTTCAACGTTATCAATGGTGGATCACATGCCGGAAACAAGCTCGCTATGCAGGA
GTTTATGATTCTCCCTATCGGAGCTTCATCTTTCAAAGAAGCCATGAAAATGGGTGTTGA
GGTTTAC*ACAACTTGAAGTCTGTGATTAAGAAGA

QA 6 700 6 700
DS 

RD RR4B941TF 766 0 0
GGATCAACTACTGTAAAATCGATCGCTCACTAAAACCTCGTACTCATCGCCCCCCTGTCT
GTATCTTCTTCTCTAGATCTACTCTTAACCATGGCCACTATCACTGTTGTTAAGGCTAGG
CAGATCTTCGACAGCCGTGGCAACCCCACCGTCGAGGTTGATGTACACACATCCACTGGT
GTCAAGGTTACAGCAGCTGTTCCTAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTACGAGGCTCTTGAG
CTTAGGGATGGTGGCTCTGACTACCTTGGAAAGGGTGTTTCTAAGGCTGTTGGCAATGTG
AACAACATCATCGGCCCAGCATTGATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGAC
AACTTCATGGTCCATGAACTTGGTGGCACCCAGAACGAGTGGGGTTGGTGCAAACAAAAG
CTTGGAGCCAATGCTATCCTTGCTGTGTCTCTTGCTGTCTGCAAGGCTGGGGCCGTTGTC
AGTGGCATTCCTCTCTACAAGCACATTGCCAATCTCGCTGGTAACCCTAAGATTGTGCTA
CCTGTTCCTGCCTTCAACGTTATCAATGGTGGATCACATGCCGGAAACAAGCTCGCTATG
CAGGAGTTTATGATTCTCCCTATCGGAGCTTCATCTTTCAAAGAAGCCATGAAAATGGGT
GTTGAGGTTTACCACAACTTGAAGTCTGTGATTAAGAAGAAGTACGGCCAGGACGCTACA
AACGTTGGTGATGAAAGGTGGCTTTGCACCAAACATTCAGAGAACA

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 3

CO CL4420Contig1 1185 3 19 U
GGGCCATTCGACAATATGTCTGTTTCCGATGATGAAGACGAGTGCTTCGCTCGGTTCCTC
GAATCAGAAGTCTCCTCGGTAGAGGAGGAAGAAAAAACGAAAGAACCTGAACCGAAACGA
CAACGTCTTGACAAGGACAAGACAAAGGCTGTAGACAAGGATGGAGATCAAAAGGAAGAT
GGTAATAACAACAAAGATAGAAATGCTGTAAAGAGAATAGAGAGTGGAGTTTTCAGCAAA
GTTCCTACAGAACTTTTTCGTCATATCTTCAAGTTCTTATCCTCTGAGGATCTTCTATCA
TGCTCTTTAGTGTGTAAATTTCTCAACTTTGCTGCCTCTGATGAATCCTTATGGCGTCGC
CTGTACTGTATTCGTTGGGGTCTAATGCCTTCAACTAGAATGTTACGTGAGTGTGCTTGG
AAGAAGCTTTACATCGATCGTGACGAGAAGGACATGATTGAACTTGTAAGAAGCTGTCCA
ACGGACTTTAAAGAGTATTACATTCAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTT
GCGGCCCATATGGTGGATGACCAGATAGTTCTTGACAAAACTGTACTTGACAAAGTATCT
CTGTGGAAGAAAAGCAAAGGACTTCCCGATAAGGCTGTAGTTGGCCATGTTTGTTTGGGA
ACAAAATGTGATTACCATCAGATCGACGACGTTTTCATATGCCAGGAGACAGGAAATGTT
CATGTATGTGATGGCAACTGCAAGGAAGTAATATTTTGTCGGGAGAGTGGGAACATGGTG
CGTACTATCTCAGGGCTTTGTTCTGAAAGTCTGCTCGTACAAGATGATTCAGACGCAGAT
GAGGAAGAAGCTGAACAAGAAGCTGAAGTGTTAACAGGAAGAGGCCGTTTTGGTCGAGCT
TTTGAATTTGGATACAACTGCGAGAGTGAGCAGGAGTTAGATCGCTCCTTTGGGTTCTGC
TGATCAAAACTCTCAGCCTTTTCGTTCAGTTCCAAAATCTTTACTGTCTCTAATACCAAG
TCTGCATGAGTTTTCACGGTAAAACATCTGTAGAGTGCAATGAATCAAAAGTAGCTTGTT
GTTTTAGTAGTCTTAATGTTTCTTTGTAATTTATGCAGATCTTTGTCTGTAATTTGCTAT
ACAATCCCCCTTACAAAAATGTTTACTTGTAGTAATTAAGCTCCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FB64TF U 1
AF RR4FB64JQ C 394
AF RR4EG75TF U 445
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BS 1173 1185 RR4FB64JQ

RD RR4FB64TF 788 0 0
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TGCTCTTTAGTGTGTAAATTTCTCAACTTTGCTGCCTCTGATGAATCCTTATGGCGTCGC
CTGTACTGTATTCGTTGGGGTCTAATGCCTTCAACTAGAATGTTACGTGAGTGTGCTTGG
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ACGGACTTTAAAGAGTATTACATTCAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTT
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TGTGTACTATC

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DS 

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ATGATTGAACTTGTAAGAAGCTGTCCAACGGACTTTAAAGAGTATTACATTCAAATGCAA
GCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTTGCGGCCCATATGGTGGATGACCAGATAGTTCTT
GACAAAACTGTACTTGACAAAGTATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAAGGACTTCCCGATAAG
GCTGTAGTTGGCCATGTTTGTTTGGGAACAAAATGTGATTACCATCAGATCGACGACGTT
TTCATATGCCAGGAGACAGGAAATGTTCATGTATGTGATGGCAACTGCAAGGAAGTAATA
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CTCGTACAAGATGATTCAGACGCAGATGAGGAAGAAGCTGAACAAGAAGCTGAAGTGTTA
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TGCAGATCTTTGTCTGTAATTTGCTATACAATCGCCCTTACAAAAATGTTTACTTGTAGT
AATTAAGCTCCA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4EG75TF 728 0 0
GAGAAGGACATGATTGAACTTGTAAGAAGCTGTCCAACGGATTTTAAAGAGTATTGCATT
CAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTTGCGGCCCAGATGGTGGATGACCAG
ATAGTTCTTGACAAAACTGTACTTGACAAAGTATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAAGGACTT
CCTGATAAGGCTGTAGTTGGCCATGTTTGTTTGGGAACAAAATGTGATTACCATCAGATC
GACGACGTTTTCATATGCCAAGAGACTGGAAATGTTCATGTATGTGATGACAACTGCAAG
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GAAAGTCTGCTCGTACAAGATGATTCAGACGCAGATGAGGAAGAAGCTGAACAAGAAGCT
GAAGTTTTAACAGGAAGAGGCCGTTTTGGTCGAGCTTTTGAATTTGGATACAACTGCGAG
AGTGAGCAGGAGTTAGATCGCTCCTTTGGGTTCTGCTGATCAAAACTCTCAGCCTTTTCG
TTCAGTTCCAAAATCTTTACTGTCTCTAATACCAAGTCTGCATGAGTTTTCACGGTAAAA
CATCTGTAGGGTGCAATGAATCAAAAGTAGCTTGTTGTTTTAGTAGTCTTAATGTTTCTT
TGTAATTTATGCAGATCTTTGTCTGTAATTTGCTATACAATCCCCCTTACAAAA*TGTTT
ACTTGTAG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL4421Contig1 799 3 20 U
CAGAATAAAACTGTTAATTTATTATCACGAGTTTTCCGGAATGCAAATTTGCAAACTGCA
AGTGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATAAATCTCAAAAGAAACAATTTGAGAATTTGTACA
CGAACAACGTTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAG
CATAAATAGCGTGAGAAGCCTCAGGACGC*GGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCT
TTCTTACAGTGGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGT
CCAAGAGCTCTGTCCCATATTAGCTGAGAGCAGATACCGAGACTCCTCGAGACACCAAAG
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GCATCAACATTTGGCCATGGGTTCTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACA
ACTTCATAAAGCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGATCATCAGGCAAATGCTTCAACGCA
AACTCTCTTTGGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCA
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ATGTTTTCTCCACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAAATTCCTGATTAGCC
AAACCATGGAGTGGCCCAGCTAAACCGTTTAATGCAGCTGCAAATGACAGATACGGATCT
GAAAGTGCACTACCGACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW17JQ U 76
AF RR4CY83JQ U 1
AF RR4AW17TF C 2
BS 1 115 RR4CY83JQ
BS 116 116 RR4AW17JQ
BS 117 209 RR4CY83JQ
BS 210 210 RR4AW17JQ
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BS 224 224 RR4AW17JQ
BS 225 290 RR4CY83JQ
BS 291 291 RR4AW17JQ
BS 292 327 RR4CY83JQ
BS 328 328 RR4AW17JQ
BS 329 515 RR4CY83JQ
BS 516 516 RR4AW17TF
BS 517 524 RR4CY83JQ
BS 525 525 RR4AW17TF
BS 526 584 RR4CY83JQ
BS 585 585 RR4AW17TF
BS 586 706 RR4CY83JQ
BS 707 707 RR4AW17TF
BS 708 771 RR4CY83JQ
BS 772 799 RR4AW17TF

RD RR4AW17JQ 308 0 0
CAGAAAAGTATAAATCTCAAAAGAAACAATTTGAGAATTTGTACACGAACAACGTTTTTC
TTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAAAACGGAGCATAAATAGCGTGAG
AAGCCTCAGGACGC*GGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCTTTCTTACAGTGGGCT
TCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGTCCAAGAGCTCTGTCC
CATATTAGCTGAGAGCAGATACCGAGACTCCTCGAGACACCAAAGAGCACCGTGTAGTAC
CTTGCTTC

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR4CY83JQ 771 0 0
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AGTGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATAAATCTCAAAAGAAACAATTTGAGAATTTCTACA
CGAACAACGTTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAG
CATAAATAGCGTGAGAAGCCTCAGGACGCCGGTAATGTTTAAGAAGATGAAGCTATAGCT
TTCTTACAGTGGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCTAGTGCAAGT
CCAAGAGCTCTGTCCCATATTAGCTGAAAGCAGATACCGAGACTCCTCGAGACACCAAAG
AGCACCGTGTAGTACCTTGCTTCGGTTAGACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGA
GCATCAACATTTGGCCATGGGTTCTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACA
ACTTCATAAAGCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGGTCATCAGGTAAATGCTTCAACGCA
AACTCTCTTTGGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACGCCATGTCCATATCCA
GGAACAACCTTGCCACTGTTTAATGTTTTCCAGACATATTCTTTCAACTGGTCTTTCGAT
ATGTTTTCTCCACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAACTTCCTGATTAGCC
AAACCATGGAGTGGCCCAGCTAAACCGTTTAATGCAGCTGCAAATGACAGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AW17TF 798 0 0
G
GAATAAAACTGTTAATTTATTATCACGAGTTTTCCGGAATGCAAATTTGCAAACTGCAAG
TGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATAAATCTCAAAAGAAACAATTTGAGAATTTGTACACG
AACAACGTTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAGCA
TAAATAGCGTGAGAAGCCTCAGGACGC*GGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCTTT
CTTACAGTGGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGTCC
AAGAGCTCTGTCCCATATTAGCTGAGAGCAGATACCGAGACTCCTCGAGACACCAAAGAG
CACCGTGTAGTACCTTGCTTCGGTTAGACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGAGC
ATCAACATTTGGCCATGGGTTCTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACAAC
TTCATAGAGCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGATCATCAGGCAAATGCTTCAACGCAAA
CTCTCTTTGGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCAGG
AACTACCTTTCCACTGTTTAATGTTTTCCAGACATATTCTTTCAACTGGTCTTTCGATAT
GTTTTCTCCACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAAATTCCTGATTAGCCAA
ACCATGGAGTGGCCCAGCTAAACCGTTTAATGCAGCTGCAAATGACAGATACGGATCTGA
AAGTGCACTACCGACCC

QA 2 798 2 798
DS 



AS 1 3

CO CL4422Contig1 734 3 3 U
TTTGGCAATGTTATTTAGTTATTTTCTTGGTTAGGATAATATGTCTAATATATAGGTACA
TTTTAAGTTCCGACAAAACCAACTCCACATATTATAAATGCAAGAGCCTGCATGAATAGA
TAAATGTATAGCATTGTATTCCCATATGCAAAGTCGTAGCATGCACAACACAGTATGTAT
ATCCCCACCATCATCTCTTTTGAGTTTACTCTTTCGAAAAGCCTATTGCGAGGTTTTTTC
ACTTGTGGAAGTAATTTAGTCTCAAGAGCATCTCCTAATTTCTCGGTGACGACCCATTCG
TTTACTCTCCCTCCTTCAAGTAATCCAATGAAAGTTCCTTTAGTCCGGTGCATAGCCATT
ACATTCTCGAACAAGACCCAGAAAACCACGAGGTAGAATGATCTTGGTGTGGCGATGGCA
TTGAAGAGAGTGATCATAAAAGGAAGGTAGATAGTTGACCAAGTCGGAATGTTAACTTCG
CTGAAGAATACGCTCGTAGGAAGAATGACGCAATAGAAAAAGAAAGTGAAGAAATGGACT
ATGATCTTCCGTACGAAGAAGAAGCTGTAGATCACATACAGTTTCTTCCAGATTTTTACT
CTCTTATTGTGAATAATTTCCATAGTCATTTTCCTGAAGAGATTAGCTGGACCGCATGAC
CATCGATGTTGCTGGAATCTGAAAGCCTTAAACTGGCTTGGTAGCTCACTTTTTACCGTA
ATGTCGTTGACGAA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC26TF C 1
AF RR4FC26JQ U 4
AF RR4GO77JQ U 5
BS 1 4 RR4FC26TF
BS 5 723 RR4FC26JQ
BS 724 734 RR4GO77JQ

RD RR4FC26TF 724 0 0
TTTGGCAATGTTATTTAGTTATTTTCTTGGTTAGGATAATATGTCTAATATATAGGTACA
TTTTAAGTTCCGACAAAACCAACTCCACATATTATAAATGCAAGAGC*TGCATGAATAGA
TAAATGTATAGCATTGTATTCCCATATGCAAAGTCGTAGCATGCACAACACAGTATGTAT
ATCCCCACCATCATCTCTTTTGAGTTTACTCTTTCGAAAAGCCTATTGCGAGGTTTTTTC
ACTTGTGGAAGTAATTTAGTCTCAAGAGCATCTCCTAATTTCTCGGTGACGACCCATTCG
TTTACTCTCCCTCCTTCAAGTAATCCAATGAAAGTTCCTTTAGTCCGGTGCATAGCCATT
ACATTCTCGAACAAGACCCAGAAAACCACGAGGTAGAATGATCTTGGTGTGGCGATGGCA
TTGAAGAGAGTGATCATAAAAGGAAGGTAGATAGTTGACCAAGTCGGAATGTTAACTTCG
CTGAAGAATACGCTCGTAGGAAGAATGACGCAATAGAAAAAGAAAGTGAAGAAATGGACT
ATGATCTTCCGTACGAAGAAGAAGCTGTAGATCACATACAGTTTCTTCCAGATTTTTACT
CTCTTATTGTGAATAATTTCCATAGTCATTTTCCTGAAGAGATTAGCTGGACCGCATGAC
CATCGATGTTGCTGGAATCTGAAAGCCTTAAACTGGCTTGGTAGCTCACTTTTTACCGTA
ATG
C

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4FC26JQ 721 0 0
G
GCAATGTTATTTAGTTATTTTCTTGGTTAGGATAATATGTCTAATATATAGGTACATTTT
AAGTTCCGACAAAACCAACTCCACATATTATAAATGCAAGAGCCTGCATGAATAGATAAA
TGTATAGCATTGTATTCCCATATGCAAAGTCGTAGCATGCACAACACAGTATGTATATCC
CCACCATCATCTCTTTTGAGTTTACTCTTTCGAAAAGCCTATTGCGAGGTTTTTTCACTT
GTGGAAGTAATTTAGTCTCAAGAGCATCTCCTAATTTCTCGGTGACGACCCATTCGTTTA
CTCTCCCTCCTTCAAGTAATCCAATGAAAGTTCCTTTAGTCCGGTGCATAGCCATTACAT
TCTCGAACAAGACCCAGAAAACCACGAGGTAGAATGATCTTGGTGTGGCGATGGCATTGA
AGAGAGTGATCATAAAAGGAAGGTAGATAGTTGACCAAGTCGGAATGTTAACTTCGCTGA
AGAATACGCTCGTAGGAAGAATGACGCAATAGAAAAAGAAAGTGAAGAAATGGACTATGA
TCTTCCGTACGAAGAAGAAGCTGTAGATCACATACAGTTTCTTCCAGATTTTTACTCTCT
TATTGTGAATAATTTCCATAGTCATTTTCCTGAAGAGATTAGCTGGACCGCATGACCATC
GATGTTGCTGGAATCTGAAAGCCTTAAACTGGCTTGGTAGCTCACTTTTTACCGTAATG
C

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR4GO77JQ 730 0 0
GCAATGTTATT*AGTTATTTTCTTGGTTAGGATAATATGTCTAATATATAGGTACATTTT
AAGTTCCGACAAAACCAACTCCACATATTATAAATGCAAGAGCCTGCATGAATAGATAAA
TGTATAGCATTGTATTCCCATATGCAAAGTCGTAGCATGCACAACACAGTATGTATATCC
CCACCATCATCTCTTTTGAGTTTACTCTTTCGAAAAGCCTATTGCGAGGTTTTTTCACTT
GTGGAAGTAATTTAGCCTCAAGAGCATCTCCTAATTTCTCGGTGACGACCCATTCGTTTA
CTCTCCCTCCTTCAAGTAATCCAATGAAAGTTCCTTTAGTCCGGTGCATAGCCATTACAT
TCTCGAACAAGACCCAGAAAACCACGAGGTAGAATGATCTTGGTGTGGCGATGGCATTGA
AGAGAGTGATCATAAAAGGAAGGTAGATAGTTGACCAAGTCGGAATGTTAACTTCGCTGA
AAAATACGCTCGTAGGAAGAATGACGCAATAGAAAAAGAAAGTGAAGAAATGGACTATGA
TCTTCCGTACGAAGAAGAAGCTGTAGATCACATACAGTTTCTTCCAGATTTTTACTCTCT
TATTGTGAATAATTTCCATAGTCATTTTCCTGAAGAGATTAGCTGGACCGCATGACCATC
GATGTTGCTGGAATCTGAAAGCCTTAAACTGGCTTGGTAGCTCACTTTTTACCGTAATGT
CGTTGACGAA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL4423Contig1 819 3 2 U
GGCCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCGAACCAGAACCTAACA
CACACTAACACGATGTTGCTTGGAAAGAGACTACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGT
TTATCCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAG
CAGAGTCCAGGCCAAAATACTGTGGTCGGACCGTC*GGTTCAAGTGGTCAAAACGTGTCA
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TCAGGCGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTA
CTTGTTCCTGGTCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAG
TGCAGAGAACAGCAAATGACACAGGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAGGCCGGCGAAAGAA
TCTGCGGTGCCAGCCAGAGTCAAACCCGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCC
TCCTCCCACCCCGTATTCACATACATTATATAGTTATATACTATGTATTATGTGTGGCTT
GTTCTGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATT
AACCTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTTTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGA
GGGTTTAAATTTTACAAGTTTTGATCTATTTGAAACTATAATTCAAATGCATGTAAGACT
TGTGTTATTTTTAAGTACTTAATGAGAAATTTTAAGATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD41TF U 1
AF RR4AJ50TF U 1
AF RR4AJ50JQ C 61
BS 1 788 RR4AJ50TF
BS 789 819 RR4AJ50JQ

RD RR4GD41TF 716 0 0
GGCCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCGAACCAGAACCTAACA
CACACTAACACGATGTTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGT
TTATCCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAG
CAGAGTCCAGGCCAAAATACTGTGGTCGGACCGTCCGGTTCAAGTGGTCAAAACGTGTCA
GCAGCCGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCCCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACAC
TCAGGCGAGTTTTCCGACGCTGGACGTTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTA
CTTGTTCCTGGTCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAG
TGCAGAGAACAGCAAATGACACAGGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAGGCCGACGAAAGAA
TCTGCGGTGCCAGCCAGAGTCAAACCCGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCC
TCCTCCCACCCCGTATTCACATACATTATATAGTTATATACTATGTATTATGTGTGGCTT
GTTCTGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATT
AACCTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTTTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTT
A

QA 1 715 1 715
DS 

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TTATCCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAG
CAGAGTCCAGGCCAAAATACTGTGGTCGGACCGTC*GGTTCAAGTGGTCAAAACGTGTCA
GCAGCCGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCCCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACAC
TCAGGCGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTA
CTTGTTCCTGGTCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAG
TGCAGAGAACAGCAAATGACACAGGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAGGCCGGCGAAAGAA
TCTGCGGTGCCAGCCAGAGTCAAACCCGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCC
TCCTCCCACCCCGTATTCACATACATTATATAGTTATATACTATGTATTATGTGTGGCTT
GTTCTGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATT
AACCTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTTTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGA
GGGTTTAAATTTTACAAGTTTTGATCTATTTGAAACTATAATTCAAATGCATGTAAGACT
TGTGTTAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AJ50JQ 759 0 0
CACACTAACACGATGTTGCTTGGAAAGAGACTACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGT
TTATCCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAG
CAGAGTCCAGGCCAAAATACTGTGGTCGGACCGTC*GGTTCAAGTGGTCAAAACGTGTCA
GCAGCCGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCCCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACAC
TCAGGCGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTA
CTTGTTCCTGGTCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAG
TGCAGAGAACAGCAAATGACACAGGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAGGCCGGCGAAAGAA
TCTGCGGTGCCAGCCAGAGTCAAACCCGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCC
TCCTCCCACCCCGTATTCACATACATTATATAGTTATATACTATGTATTATGTGTGGCTT
GTTCTGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATT
AACCTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTTTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGA
GGGTTTAAATTTTACAAGTTTTGATCTATTTGAAACTATAATTCAAATGCATGTAAGACT
TGTGTTATTTTTAAGTACTTAATGAGAAATTTTAAGATC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

CO CL4424Contig1 828 3 12 U
GGAACACATTATCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAAAGATGGGAT
TGCTCGATCTGGAAAAGCACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCCAATCAACA
TCGTGATCCACATCATCTTCGTATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCTCCTCTACC
CAGCGTCCCCAGTTTACGACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCGACG
GCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTCGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCT
GTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGT
CCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTC
AGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCACCTG
CGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGA
TTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCA
AGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATAATGAGCTCA
CATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATT
AAAACCCCACGTAATAATAAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGTTTC
AATATAGTTGACAAAAAAAATTGCGTTTCAATTCAATATGTTGAACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS03TF U 1
AF RR4CF35JQ C 151
AF RR4CF35TF U 151
BS 1 191 RR4GS03TF
BS 192 192 RR4CF35TF
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BS 555 653 RR4GS03TF
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BS 655 689 RR4GS03TF
BS 690 828 RR4CF35TF

RD RR4GS03TF 694 0 0
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TGCTCGATCTGGAAAAGCACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCCAATCAACA
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CAGCGTCCCCAATTTACGACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCGACG
GCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTCGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCT
GTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGT
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AGCTGTTATGTCGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGATTGTTCG*GAAACGAGCACCTG
CGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGA
TTCTTCAAATGGTATTCGGGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCA
AGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATAATAAGCTCA
CATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGA
CCTAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4CF35JQ 639 0 0
G
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TCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGG
CCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCT
CATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATA
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AAAGAAGCAGATGAAGAATAATGAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAAC
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QA 2 639 2 639
DS 

RD RR4CF35TF 678 0 0
G
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AGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTCGCCGT
CACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGC
TCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTC
TCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGG
CCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCT
CATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATA
TCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGAGAGA
AAAGAAGCAGATGAAGAATAATGAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAAC
CTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATTAAAACCCCACGTAATAATAAGACCACCATTG
ATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGTTTCAATATAGTTGACAAAAAAAATTGCGTTTCAA
TTCAATATGTTGAACGG

QA 2 678 2 678
DS 



AS 1 3

CO CL4425Contig1 1039 3 7 U
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ATCCACGTTGACGCAGCAAGTGGAGGCTTCATAGCTCCATTTATTTACCCTGACTTGGAA
TGGGACCTTAGGCTTCCTTTGGTGAAGAGTATCAATGTGAGTGGTCATAAGTATGGGCTG
GTCTATGCTGGTATTGGCTGGGTCGTGTGGAGGACACAACAGGATTTGCCTGATGAGCTC
ATCTTTCATATAAACTATCTTGGTGCTGATCAACCCACTTTCACTCTCAATTTCTCCAAG
GGATCGAGCCAAATTATTGCTCAATACTATCAGCTCATTCGTCTTGGCTTCGAGGGCTAC
AAGAACGTGATGGGGAACTGCAGGGAGAGCATGGTGGTTCTGAGAGAAGGGATCGAGAAA
ACAGAGCGTTTCAACATAGTCTCAAAGGAGGTAGGAGTGCCACTGGTAGCCTTCTCTCTC
AAGGACCACAGTTTCCACAACGAGTTCGAGATCTCAGAGATGCTACGCCGTTTTGGCTGG
ATTGTCCCGGCTTACACCATGCCTGCGGATGCGCAACACATCACGGTTCTCCGTGTTGTC
ATAAGGGAAGATTTCTCAAGAACACTTGCGGAGAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAGGTG
CTTCACGAGCTTGACACCTTGCCTTCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTC
GGAAATGTGAAAGGGAAGAAGGTGGAAAGGGACATTCTGATGGAAGTCATTGTTGGATGG
AGGAAGTTTGTGAAGGAGAGGAAGAAGATGAATGGTGTGTGTTAATCTGAACTGTCTTCT
GTTTGTGTTTGAATGTATTAAATGTCGTCTAATAAAAGAAGAGGTATGTGTGTGTGTGAG
AACTTGGAGTTTGATGAAAGAGTTGTGTGTCTGGTATCTATTTGAGACAATAATTGGTTC
CGGATTCTATTGTACGCTTGAAACTCATCTTGAGCCTTTGATTATTTGTAAAATAGTCTT
GAAATGCTATTTCCTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CD94TF U 1
AF RR4C210TF U 422
AF RR4CD94JQ C 235
BS 1 575 RR4CD94TF
BS 576 576 RR4C210TF
BS 577 657 RR4CD94TF
BS 658 658 RR4C210TF
BS 659 688 RR4CD94TF
BS 689 720 RR4C210TF
BS 721 1039 RR4CD94JQ

RD RR4CD94TF 691 0 0
GTCAAGCGCCTTAATGACTTGCTGGTCAAGAAAAACGAAGAGACTGGCTGGAACACTCCA
ATCCACGTTGACGCAGCAAGTGGAGGCTTCATAGCTCCATTTATTTACCCTGACTTGGAA
TGGGACCTTAGGCTTCCTTTGGTGAAGAGTATCAATGTGAGTGGTCATAAGTATGGGCTG
GTCTATGCTGGTATTGGCTGGGTCGTGTGGAGGACACAACAGGATTTGCCTGATGAGCTC
ATCTTTCATATAAACTATCTTGGTGCTGATCAACCCACTTTCACTCTCAATTTCTCCAAG
GGATCGAGCCAAATTATTGCTCAATACTATCAGCTCATTCGTCTTGGCTTCGAGGGCTAC
AAGAACGTGATGGGGAACTGCAGGGAGAGCATGGTGGTTCTGAGAGAAGGGATCGAGAAA
ACAGAGCGTTTCAACATAGTCTCAAAGGAGGTAGGAGTGCCACTGGTAGCCTTCTCTCTC
AAGGACCACAGTTTCCACAACGAGTTCGAGATCTCAGAGATGCTACGCCGTTTTGGCTGG
ATTGTCCCGGCTTACACCATGCCTGCGGATGCGCA*CACATCACGGTTCTCCGTGTTGTC
ATAAGGGAAGATTTCTCAAGAACACTTGCGGAGAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAG*TG
CTTCACGAGCTTGACACCTTGCCTTCCA
GAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4C210TF 299 0 0
G
AGAGCGTTTCAACATAGTCTCAAAGGAGATAGGAGTACCACTCGTTGCCTTCTCTCTCAA
GGACCACAGTTTCCACAACGAGTTCGAGATCTCAGAGATGCTACGCCGCTTTGGCTGGAT
CGTCCCGGCTTACACCATGCCTGCGGATGCGCAACACATCACGGTTCTCCGTGTTGTCAT
AAGGGAAGATTTCTCAAGAACACTTGCGGAGAGACTTGTGGCTGATATCGTGAAGGTGCT
TCACGAGCTTGACACCTTGCCATCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTC

QA 2 299 2 299
DS 

RD RR4CD94JQ 805 0 0
GAGCTCATCTTTCATATAAACTATCTTGGTGCTGATCAACCCACTTTCACTCTCAATTTC
TCCAAGGGATCGAGCCAAATTATTGCTCAATACTATCAGCTCATTCGTCTTGGCTTCGAG
GGCTACAAGAACGTGATGGGGAACTGCAGGGAGAGCATGGTGGTTCTGAGAGAAGGGATC
GAGAAAACAGAGCGTTTCAACATAGTCTCAAAGGAGGTAGGAGTGCCACTGGTAGCCTTC
TCTCTCAAGGACCACAGTTTCCACAACGAGTTCGAGATCTCAGAGATGCTACGCCGTTTT
GGCTGGATTGTCCCGGCTTACACCATGCCTGCGGATGCGCAACACATCACGGTTCTCCGT
GTTGTCATAAGGGAAGATTTCTCAAGAACACTTGCGGAGAGACTTGTGGCTGATATTGTG
AAGGTGCTTCACGAGCTTGACACCTTGCCTTCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAG
GATTTCGGAAATGTGAAAGGGAAGAAGGTGGAAAGGGACATTCTGATGGAAGTCATTGTT
GGATGGAGGAAGTTTGTGAAGGAGAGGAAGAAGATGAATGGTGTGTGTTAATCTGAACTG
TCTTCTGTTTGTGTTTGAATGTATTAAATGTCGTCTAATAAAAGAAGAGGTATGTGTGTG
TGTGAGAACTTGGAGTTTGATGAAAGAGTTGTGTGTCTGGTATCTATTTGAGACAATAAT
TGGTTCCGGATTCTATTGTACGCTTGAAACTCATCTTGAGCCTTTGATTATTTGTAAAAT
AGTCTTGAAATGCTATTTCCTTGAG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 3

CO CL4426Contig1 711 3 1 U
GTATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAA
GAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAATAAGAGTCACCAAGGCAA
TGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAAT
AGGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGAT
CAAGAACGGTAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGA
AGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATAT
TCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAA
GGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTACTACTGCTTCTAATGGATTTTGATAT
TTGAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAATATTCTGTTTGGATTCAGTTGACTCTTTTGAG
TATTCTCGCTTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTACTTTTACCACTCTCAATA
TGTCTCATCTAGTCCTATTGAAACCATGTTTAAATGTTAAATCTTTTAATTTTCACAAAT
CATATATAACTGTAATATTCTCAGTTGGTTGTACATGTTGCTTGAATTTAT


BQ
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AF RR4A942TF U 150
AF RR4H227TF U 1
AF RR4H227JQ C 14
BS 1 711 RR4H227TF

RD RR4A942TF 490 0 0
CTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTG
CCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGTAAAAAGATTGCTGCTTTCG
TCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGT
TCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGG
TCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGA
GACTACTACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAAT
ATTCTGTTTGGATTCAGTTGACTCTTTTGAGTATTCTCGCTTCCTCCACTAGAGCTTCCT
CATTTTCTCTTTACTTTTACCACTCTCAATATGTCTCATCTAATCCTATTGAAACCATGT
TTAAATGTT
T

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4H227TF 711 0 0
GTATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAA
GAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAATAAGAGTCACCAAGGCAA
TGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAAT
AGGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGAT
CAAGAACGGTAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGA
AGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATAT
TCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAA
GGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTACTACTGCTTCTAATGGATTTTGATAT
TTGAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAATATTCTGTTTGGATTCAGTTGACTCTTTTGAG
TATTCTCGCTTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTACTTTTACCACTCTCAATA
TGTCTCATCTAGTCCTATTGAAACCATGTTTAAATGTTAAATCTTTTAATTTTCACAAAT
CATATATAACTGTAATATTCTCAGTTGGTTGTACATGTTGCTTGAATTTAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4H227JQ 698 0 0
GTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAATAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATTGAGGCC
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGTAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGACGAA
GTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGAGACTACTACTGCTTTTAATGGATTTTGATATTTGAAACACTCCT
CTGTTCTACTTAAAATATTCTGTTTGGATTCAGTTGACTCTTTTGAGTATTCTCGCTTCC
TCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTACTTTTACCACTCTCAATATGTCTCATCTAGT
CCTATTGAAACCATGTTTAAATGTTAAATCTTTTAATTTTCACAAATCATATATAACTGT
AATATTCTCAGTTGGTTGTACATGTTGCTTGAATTTAT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL4427Contig1 839 3 3 U
GGGAAAAAAACTTGATCAAATCATACAATTGCTCTGCTCTTGACATTCATTTTCAATGCA
GAAGCAGAGCGTTCTTCACTCGGGGCACCTAAGACTTGGGACCGGATTGGTTAAACCGAT
AGAAACTAGTGCATTTCCTAGATGGATCAGTCGCAGCAATAGAGTCAGATTGTCGTTTCC
AAGAGCTGAAGCTTCTTCATCCATGAGCGCAGTAAACAAAAGTTGCACGTGGAGAGCGAA
TAGCTTAGGACAGGAGATCCAAGCGGACTTGAGTGATGAAGACGAAGAAGATCTATGTCC
GGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCAAGACAGATGAAGAACTTGTTAGAGTCCTGGAGAAAGC
CAAAGAGACTAACACTTTGGTTGTGGTTGATTTCTATCGTCCTTCATGTGGTAGTTGTAA
ATACATAGAGCGGGGCTTCTCGAAGCTCTGCAAGCAATCCGGTGACCAAGAAGCTCCCGT
TGTCTTCCTTAAGCATAATGTGATAGATGAATATGACGAACAATCTGAAGTCGCTGAAAG
GCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTCTCTTCCACTTCTACAAAAATGGAGTTCTGTTAGAAGC
ATTTGCTACTAGAGACAAGGGGAGGATTGACGCTTCTATAGCCAAATATACTTCCTCTGA
ATCTTCAAGCACATTGGACTAAACCGCACTTTTGGTTCTCTCTCTCTTTCAAATCATAGA
TAATGATGTGAACTATATTGAGCTGTTGTAAAGATACCTGAACAGCCATCATTTTGTATC
ATACTGAATAAGACAGATGCAACATTTTTTTTCTAATATTGTAGTTTGATTTGAGGTAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C358TF U 1
AF RR4C358JQ C 93
AF RR4A870TF U 143
BS 1 613 RR4C358TF
BS 614 812 RR4A870TF
BS 813 839 RR4C358JQ

RD RR4C358TF 613 0 0
GGGAAAAAAACTTGATCAAATCATACAATTGCTCTGCTCTTGACATTCATTTTCAATGCA
GAAGCAGAGCGTTCTTCACTCGGGGCACCTAAGACTTGGGACCGGATTGGTTAAACCGAT
AGAAACTAGTGCATTTCCTAGATGGATCAGTCGCAGCAATAGAGTCAGATTGTCGTTTCC
AAGAGCTGAAGCTTCTTCATCCATGAGCGCAGTAAACAAAAGTTGCACGTGGAGAGCGAA
TAGCTTAGGACAGGAGATCCAAGCGGACTTGAGTGATGAAGACGAAGAAGATCTATGTCC
GGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCAAGACAGATGAAGAACTTGTTAGAGTCCTGGAGAAAGC
CAAAGAGACTAACACTTTGGTTGTGGTTGATTTCTATCGTCCTTCATGTGGTAGTTGTAA
ATACATAGAGCGGGGCTTCTCGAAGCTCTGCAAGCAATCCGGTGACCAAGAAGCTCCCGT
TGTCTTCCTTAAGCATAATGTGATAGATGAATATGACGAACAATCTGAAGTCGCTGAAAG
GCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTCTCTTCCACTTCTACAAAAATGGAGTTCTGTTAGAAGC
ATTTGCTACTAGA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4C358JQ 747 0 0
GACTTGGGACCGGATTGGTTAAACCGATAGAAACTAGTGCATTTCCTAGATGGATCAGTC
GCAGCAATAGAGTCAGATTGTCGTTTCCAAGAGCTGAAGCTTCTTCATCCATGAGCGCAG
TAAACAAAAGTTGCACGTGGAGAGCGAATAGCTTAGGACAGGAGATCCAAGCGGACTTGA
GTGATGAAGACGAAGAAGATCTATGTCCGGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCAAGACAGATG
AAGAACTTGTTAGAGTCCTGGAGAAAGCCAAAGAGACTAACACTTTGGTTGTGGTTGATT
TCTATCGTCCTTCATGTGGTAGTTGTAAATACATAGAGCGGGGCTTCTCGAAGCTCTGCA
AGCAATCCGGTGACCAAGAAGCTCCCGTTGTCTTCCTTAAGCATAATGTGATAGATGAAT
ATGACGAACAATCTGAAGTCGCTGAAAGGCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTCTCTTCCACT
TCTACAAAAATGGAGTTCTGTTAGAAGCATTTGCTACTAGAGACAAGGGGAGGATTGACG
CTTCTATAGCCAAATATACTTCCTCTGAATCTTCAAGCACATTGGACTAAACCGCACTTT
TGGTTCTCTCTCTCTTTCAAATCATAGATAATGATGTGAACTATATTGAGCTGTTGTAAA
GATACCTGAACAGCCATCATTTTGTATCATACTGAATAAGACAGATGCAACATTTTTTTT
CTAATATTGTAGTTTGATTTGAGGTAA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4A870TF 670 0 0
G
GGATCAGTCGCGGCAATAGAGTCAGATTTTCGTTTCCAAGAGCTGAAGCTTCTTCATCCA
TGAGCGCAGTAAACAAAAGTTGCACGTGGAGAGCGAATAGCTTAGGACAGGAGATCCAAG
CGGACTTGAGTGATGAAGACGAAGAAGATCTATGTCCGGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCA
AGACAGATGAAGAACTTGTTAGAGTCCTGGAGAAAGCCAAAGAGACTAACACTTTGGTTG
TGGTTGATTTCTATCGTCCTTCATGTGGTAGTTGTAAATACATAGAGCAGGGCTTCTCGA
AGCTCTGCAAGCAATCCGGTGACCAAGAAGCTCCCGTTGTCTTCCTTAAGCATAATGTGA
TAGATGAATATGACGAACAATCTGAAGTCGCTGAAAGGCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTC
TCTTCCACTTCTACAAAAATGGAGTTCTGTTAGAAGCATTTGCTACTAGAGACAAGGGGA
GGATTGACGCTTCTATAGCCAAATATACTTCCTCTGAATCTTCAAGCACATTGGACTAAA
CCGCACTTTTGGTTCTCTCTCTCTTTCAAATCATAGATAATGATGTGAACTATATTGAGC
TGTTGTAAAGATACCTGAACAGCCATCATTTTGTATCATACTGAATAAGACAGATGCAAC
ATTTTTTTT

QA 2 670 2 670
DS 



AS 1 2

CO CL4428Contig1 841 2 16 U
GCTCTGATATTATACTTAAATATGCAATCATTTTTTTTCAGTCTTTCAAAAAGCACATGG
TTTTTAGTGCTTGATTTTCTTACATTAAATCCTAAACAGACATTTTTTTTTTGTCTTGTT
GATTAGCCATCCCCAGGCTAAAACAACATAACAAAATAAGCTGATACATGCATCAGCTTT
GAGTTTTAGCACATGAGTGATTTTGATGCTTGTGCTCCATTAGCAACATCATCACTCTAT
TCTAGAGAGAACCCTTTTATCTCGTGAAGATGCAGTTGCAAAGAAGGTGGGAGATGACAA
TACGACATAACCACCATATGAAATTGGAGATCCCATTGGGAATCCGCAAATAAAAGCCAC
CTCAAATTCCATAAAATGGGGTGGCTTTTAGAGTGAAACAAAAGTGTTGAGAGATAGCCA
GAGAGTATCCAATAAACCATAGATGACTCGTGACTCGATGATGACGACGATTGTGATAGC
TTTGATCGCTATCAAAGGTAAGGAATGAGAGGTGGCTGAAGGGGAAAGCCTGTTACACCT
TGTTGAAGAGAAATGGTGGCAGGAGAGTAATGGTGAGGGTTGTCATAAGCAGAGAAATGG
TGATAAAATGGCTGTGGTTGTGAGAATTGGACCCCACCTTGTCCTCCACCGCACGGATAA
AAAGGAGCGGCTGATGCAGCAGCTGCGGTTAGTCCACCGCCTCCACCGTTTCCGTTTCCA
TACAGTCCGTATTGTCCACCTGAGTTGCATCCGTACACGCCGTATAAGTTCGTAGGGAAT
GGAGAGTAATCTGACGAGTAAGTGAGTACCAAAGAGATGAGAGGAGGTGGGGATAGTGAG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4BB51JQ U 1
AF RR4BK28JQ U 19
BS 1 109 RR4BB51JQ
BS 110 111 RR4BK28JQ
BS 112 133 RR4BB51JQ
BS 134 134 RR4BK28JQ
BS 135 186 RR4BB51JQ
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BS 188 230 RR4BB51JQ
BS 231 233 RR4BK28JQ
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BS 263 263 RR4BK28JQ
BS 264 464 RR4BB51JQ
BS 465 465 RR4BK28JQ
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BS 738 738 RR4BK28JQ
BS 739 810 RR4BB51JQ
BS 811 841 RR4BK28JQ

RD RR4BB51JQ 818 0 0
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TTTTTAGTGCTTGATTTTCTTACATTAAATCCTAAACAGACATTTTTTT**TGTCTTGTT
GATTAGCCATCCCTAGGCTAAAACAACATAACAAAATAAGCTGATACATGCATCAGCTTT
GAGTTT*AGCACATGAGTGATTTTGATGCTTGTGCTCCATTAGCAACATC***ACTCTAT
TCTAGAGAGAACCCTTTTATCTTGTGAAGATGCAGTTGCAAAGAAGGTGGGAGATGACAA
TACGACATAACCACCATATGAAATTGGAGATCCCATTGGGAATCCGCAAATAAAAGCCAC
CTCAAATTCCATAAAATGGGGTGGCTTTTAGAGTGAAACAAAAGTGTTGAGAGATAGCCA
GAGAGTATCCAATAAACCATAGATGACTCGTGACTCGATGATGATGACGATTGTGATAGC
TTTGATCGCTATCAAAGGTAAGGAATGAGAGGTGGCTGAAGGGGAAAGCCTGTTACACCT
TGTTGAAGAGAAATGGTGGCAGGAGAGTAATGGTGAGGGTTGTCATAAGCAGAGAAATGG
TGATAAAATGGCTGTGGTTGTGAGAATTGGACCCCACCTTGTCCTCCACCGCACGGATAA
AAAGGAGCGGCTGATGCAGCAGCTGCGGTTAGTCCACCGCCTCCACCGTTTCCGTTTCCA
TACAGTCCGTATTGTCCCCCTGAGTTGCATCCGTACACGCCGTATAAGTTCGTAGGGAAT
GGAGAGTAATCTGACGAGTAAGTGAGTACC
CAAAGAGA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4BK28JQ 823 0 0
G
ATATGCAATCATTTTTTTTCAGTCTTTCAAAAAGCACATGGTTTTTAGTGCTTGATTTTC
TTACATTAAATCCTAAACAGACATTTTTTTTTTGTCTTGTTGATTAGCCATCCCCAGGCT
AAAACAACATAACAAAATAAGCTGATACATGTATCAGCTTTGAGTTTTAGCACATGAGTG
ATTTTGATGCTTGTGCTCCATTAGCAACATCATCACTCTAT*CTAGAGAGAACCCTTTTC
TCTCGTGAAGATGCAGTTGCAAAGAAGGTGGGAGATGACAATACGACATAACCACCATAT
GAAATTGGAGATCCCATTGGGAATCCGCAAATAAAAGCCACCTCAAGTTCCATAAAATGG
GGTGGCTTTTAGAGTGAAACAAAAGTGTTGAGAGATAGCCAGAGAGTATCCAATAAACCA
TAGATGACTCGTGACTCGATGATGACGACGATTGTGATAGCTTTGATTGCTATCAAAGGT
AAGGAATGAGAGGTGGCTGAAGGGGAAAGCCTGTTACACCTTGTTGAAGAGAAATGGTGG
CAGGAGAGTAATGGTGAGGGTTGTCATAAGCAGAGAAATGGTGATAAAATGGCTGTGGTT
GTGAGAATTGGACCCCACCTTGTCCTCCACCGCACGGATAAAAAGGAGCGGCTGATGCAG
CAGCTGCGGTTAGTCCACCGCCTCCACCGTTTCCGTTTCCATACAGTCCGTATTGTCCAC
CTGAGTTGCATCCGTATACGCCGTATAAGTTCGTAGG*AATGGGGAGTAGTCTGACGAGT
AAGTGAGTACCAAAGAGATGAGAGGAGGTGGGGATAGTGAGT

QA 2 823 2 823
DS 



AS 1 2

CO CL4429Contig1 764 2 4 U
GGCAACGCTTTGAGAAGAGGTTTAGCATCCTTCACATCTCCAACATGATCCTTGCCATCG
GCAGCATGCTCTACCATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACAACAGAGTGATGAGACACCAA
TGGTGTGGGAGATACTTCTCTACATGTACATCCTCTACTCTCCGGACTGGCATTACAGAA
GCACCATGCCCACTTTTCTCTTCCTCTACGGTGCCGCCTTCGCCGCGGTCCACGCTTACC
TCAGGTTCGGCATCGGTTTCAAGGTCCACTACGTGATCCTCTGCCTTCTCTGCATCCCTC
GGATGTACAAGTACTACATCCACACCGAGGACACCGCGGCCAAGAGGATTGCCAAGTGGT
ACGTCGCTACGATCCCTAGTGGGAAGCGTGTGCTGGTTCTGTGACCGTGTGTTCTGCAAG
ACGATATCTCAGTGGTCTGTGAATCCTCAGGGACATGCTCTCTGGCATGTGTTTATGAGT
TTCAACTCTTACTGCGCGAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAACGTGGATGG
AATCCGAAGGTGAAGTACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTATGTCAAGATCGAGAAGCCGAAG
GAACAGTGAGAAAGATTGGGAGGAAGAAAGAGCCCTGAAGAAGACCTTTATTATATTTTT
TTTTGGAAGTGAAACTCTCTAGATACAGAAGTCTAGATCCTTTTTTTCTTGTATTATTTT
TTTTGGGAATGATGATGATCTTAAGAAGAATTGATTTTTAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE09TF U 1
AF RR4GE09JQ C 304
BS 1 600 RR4GE09TF
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RD RR4GE09TF 645 0 0
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GCAGCATGCTCTACCATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACAACAGAGTGATGAGACACCAA
TGGTGTGGGAGATACTTCTCTACATGTACATCCTCTACTCTCCGGACTGGCATTACAGAA
GCACCATGCCCACTTTTCTCTTCCTCTACGGTGCCGCCTTCGCCGCGGTCCACGCTTACC
TCAGGTTCGGCATCGGTTTCAAGGTCCACTACGTGATCCTCTGCCTTCTCTGCATCCCTC
GGATGTACAAGTACTACATCCACACCGAGGACACCGCGGCCAAGAGGATTGCCAAGTGGT
ACGTCGCTACGATCCCTAGTGGGAAGCGTGTGCTGGTTCTGTGACCGTGTGTTCTGCAAG
ACGATATCTCAGTGGTCTGTGAATCCTCAGGGACATGCTCTCTGGCATGTGTTTATGAGT
TTCAACTCTTACTGCGCGAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAACGTGGATGG
AATCCGAAGGTGAAGTACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTATGTCAAGATCGAGAAGCCGAAG
*AACAGTGAGAAAGATTGGGAGGAAGAAAGAGCCCTGAAGAAGAC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4GE09JQ 461 0 0
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TCGCTACGATCC*TAGTGGGAAGCGTGTGCTGGTTCTGTGACCGTGTGTTCTGCAAGACG
ATATCTCAGTGGTCTGTGAATCCTCAGGGACATGCTCTCTGGCATGTGTTTATGAGTTTC
AACTCTTACTGCGCGAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAACGTGGATGGAAT
CCGAAGGTGAAGTACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTATGTCAAGATCGAGAAGCCGAAGGAA
CAGTGAGAAAGATTGGGAGGAAGAAAGAGCCCTGAAGAAGACCTTTATTATATTTTTTTT
TGGAAGTGAAACTCTCTAGATACAGAAGTCTAGATCCTTTTTTTCTTGTATTATTTTTTT
TGGGAATGATGATGATCTTAAGAAGAATTGATTTTTAGCTT

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 3

CO CL4430Contig1 906 3 8 U
GCAGCAATAGTGGTCTCTGCTGTTAGTGGTTTGGTGGACTATGATGAAGCTATCTTCCTA
TGGCGAGTGGACAAGAGGGATTTTACACTTTGGATCATCACTAGCACCACAACTTTGTTC
TTCGGAATAGAGATTGGTGTCCTTGTTGGTGTTGGTTTTTCATTAGCATTCGTTATCCAC
GAGTCTGCAAACCCTCATATTGCTGTCTTGGGGCGTCTTCCAGGGACCACAGTGTACAGA
AACGTAAAGCAGTATCCAGAGGCTTACACGTACAACGGGATTGTGATTGTTAGAATAGAT
GCTCCTATTTACTTTGCCAACATAAGCTACATTAAAGACAGACTGCGAGAATATGAAGTG
GCTGTTGACAAATACACAACCAAGGGACCAGAGGTGGAGAGAATCTCCTTTGTTATCCTA
GAATTGTCACCTGTTACTCACATAGACTCGAGCGCTGTGGAAGCGTTAAAAGAACTGTAT
CAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCGATCTCAAATCCGAACAAAGACGTTCAC
ATGACGATAGCAAGATCAGGAATGGTCGAGCTCGTTGGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGG
GTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTCTTAACTGCGTACAGAGCTCTAGCTTGGGAGACAAG
AAACCAAGTTTCTTGAGAAGGTTTGGGAACAATGGGAGCAGCAACAACGGTTCATCATCA
TACACTGATCTTCAATCCTACAACACTTTGTTGAAGGAGCCATTGTTGCCAGTGGAGAAG
TAAAGTATCATGTAATGTAAGTTACTGTGTATAGTTGTTGCGATTTTGTAAACAACAAAA
TTTACCTGATATATACTGTTATTATTTTCCTCAATACAGTAATAAAATTAGAGGCTAAGA
CCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 

AF RR4CK59TF U 1
AF RR4CK59JQ C 217
AF RR4GE04TF U 434
BS 1 658 RR4CK59TF
BS 659 659 RR4GE04TF
BS 660 683 RR4CK59TF
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BS 690 690 RR4GE04TF
BS 691 702 RR4CK59TF
BS 703 906 RR4GE04TF

RD RR4CK59TF 702 0 0
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TTCGGAATAGAGATTGGTGTCCTTGTTGGTGTTGGTTTTTCATTAGCATTCGTTATCCAC
GAGTCTGCAAACCCTCATATTGCTGTCTTGGGGCGTCTTCCAGGGACCACAGTGTACAGA
AACGTAAAGCAGTATCCAGAGGCTTACACGTACAACGGGATTGTGATTGTTAGAATAGAT
GCTCCTATTTACTTTGCCAACATAAGCTACATTAAAGACAGACTGCGAGAATATGAAGTG
GCTGTTGACAAATACACAACCAAGGGACCAGAGGTGGAGAGAATCTCCTTTGTTATCCTA
GAATTGTCACCTGTTACTCACATAGACTCGAGCGCTGTGGAAGCGTTAAAAGAACTGTAT
CAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCGATCTCAAATCCGAACAAAGACGTTCAC
ATGACGATAGCAAGATCAGGAATGGTCGAGCTCGTTGGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGG
GTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTCTTAACTGCGTACAGAGCTCTAGCTTGGGAGACA*G
AAACCAAGTTTCTTGAGAAGGTT*GGGAA*AATGGGAGCAGC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4CK59JQ 686 0 0
CTTCCAGGGACCACAGTGTACAGAAACGTAAAGCAGTATCCAGAGGCTTACACGTACAAC
GGGATTGTGATTGTTAGAATAGATGCTCCTATTTACTTTGCCAACATAAGCTACATTAAA
GACAGACTGCGAGAATATGAAGTGGCTGTTGACAAATACACAACCAAGGGACCAGAGGTG
GAGAGAATCTCCTTTGTTATCCTAGAATTGTCACCTGTTACTCACATAGACTCGAGCGCT
GTGGAAGCGTTAAAAGAACTGTATCAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCGATT
TCAAATCCGAACAAAGACGTTCACATGACGATAGCAAGATCAGGAATGGTCGAGCTCGTT
GGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGGGTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTTTTAACTGCGTA
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AGCAGCAACAACGGTTCATCATCATACACTGATCTTCAATCCTACAACACTTTGTTGAAG
GAGCCATTGTTGCCAGTGGAGAAGTAAAGTATCATGTAATGTAAGTTACTGTGTATAGTT
GTTGCGATTTTGTAAACAACAAAATTTACCTGATATATACTGTTATTATTTTCCTCAATA
CAGTAATAAAATTAGAGGCTAAGACC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4GE04TF 473 0 0
G
TACTCACATAGACTCGAGCGCTGTGGAAGCGTTAAAAGAACTGTATCAGGAGTACAAAGC
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GAGAAGGTTTGGGAACAATGGGAGCAGCAACAACGGTTCATCATCATACACTGATCTTCA
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ATGTAAGTTACTGTGTATAGTTGTTGCGATTTTGTAAACAACAAAATTTACCTGATATAT
ACTGTTATTATTTTCCTCAATACAGTAATAAAATTAGAGGCTAAGACCATTC

QA 2 473 2 473
DS 



AS 1 3

CO CL4431Contig1 356 3 1 U
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TCTTCTTCGATGTTCTGATACTTCAAGAGCTCAACATCGAAAACCTCGGCAGTCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4B751JQ U 1
AF RR4BG43JQ U 1
AF RR4BG43TF C 1
BS 1 356 RR4B751JQ

RD RR4B751JQ 356 0 0
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QA 1 356 1 356
DS 

RD RR4BG43JQ 356 0 0
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TACTGAGACTGATCACATCTCCTCACATCTTCAATCATTCTCGCAACCTCCTCCATCTTC
GGCCTCGACTCTGGGTTCCTCGCCACACAAGCCAACGCAAGCTGAAGCATCTGAACCATT
TCTTCTTCGATGTTCTGATACTTCAAGAGCTCAACATCGAAAACCTCGGCAGTCCC

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR4BG43TF 356 0 0
CTTAAAAAAAGTCACATTATTTCAAATCAAAGAGAAACAGATTCATAACGACACAATTCA
ATAAGACGCAAGTGCAATTGATCAAAGAGACATATAGTTCTAGAAAACAACAGTCTTTTG
TTTCTGAATCATTCAGAGACATTCGAAGTAGCCTCTGAAGATGTTCTGTTCTGCTGCAAC
TACTGAGACTGATCACATCTCCTCACATCTTCAATCATTCTCGCAACCTCCTCCATCTTC
GGCCTCGACTCTGGGTTCCTCGCCACACAAGCCAACGCAAGCTGAAGCATCTGAACCATT
TCTTCTTCGATGTTCTGATACTTCAAGAGCTCAACATCGAAAACCTCGGCAGTCCC

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 2

CO CL4432Contig1 822 2 2 U
AATCAAAGTGAATTTATTTGTTGTTGCCGTTAAAAAAATTACTCATATCCCCCAACGGAG
AAAGTAAAAAAAAAAAAACATTGTGAGATCATTGGGGTCAACAAATATGACCATATGGTA
AAAAGTGTGTAATTTTCCCATTACACCATGAGACCCTGAGGAGGAGCAGCAGCAGGAGCC
TTAGGTTTCGGTTTGTCAACAACAATGGCCTGAGTTGTCAGTACCATTCCTGCAACCGAT
GCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTGACTTTAGCTGGATCAATCACTCCAGCTTCCAAC
AGATTCTCATAGTTATCAGTCATGGCGTTGTACCCTATCTCCCATTCACTGAACATAATC
TTTTCAACCACAACTTCTCCTTCGATTCCAGCGTTCTGAGCAATAAGTGCAGCTGGTGCC
ACCAAAGCCTTCTGTACTATGTCAGCTCCCAAACGTTCATCAGCATCCTCCAGCTTCTCT
TTAATGGCAGGAATCACAGTTGAGAGATGCACCAAAGTCGCACCACCACCAGGAACTATA
CCTTCTTCGATAGCAGCAAATGTAGCGTTCTTTGCGTCCTCAATGCGAAGCTTACGGTCC
TCAAGCTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACAGCAACACCACCAGAGAGTTTA
GCCATTCTCTCAGCGAGCTTCTCTGAGTCATAGACAGAATCAGTCTCGAATAGCTCTTTC
TTCAGCTGGGAGATACGAGCTTGTAACTCGTCCTTGGAAGCTGCATCTGCAATAAGCGTA
GTCGAATCTTTGCTTATGGTGACTTTACGAGCAATACCCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT77JQ U 1
AF RR4AZ21TF C 520
BS 1 782 RR4GT77JQ
BS 783 822 RR4AZ21TF

RD RR4GT77JQ 782 0 0
AATCAAAGTGAATTTATTTGTTGTTGCCGTTAAAAAAATTACTCATATCCCCCAACGGAG
AAAGTAAAAAAAAAAAAACATTGTGAGATCATTGGGGTCAACAAATATGACCATATGGTA
AAAAGTGTGTAATTTTCCCATTACACCATGAGACCCTGAGGAGGAGCAGCAGCAGGAGCC
TTAGGTTTCGGTTTGTCAACAACAATGGCCTGAGTTGTCAGTACCATTCCTGCAACCGAT
GCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTGACTTTAGCTGGATCAATCACTCCAGCTTCCAAC
AGATTCTCATAGTTATCAGTCATGGCGTTGTACCCTATCTCCCATTCACTGAACATAATC
TTTTCAACCACAACTTCTCCTTCGATTCCAGCGTTCTGAGCAATAAGTGCAGCTGGTGCC
ACCAAAGCCTTCTGTACTATGTCAGCTCCCAAACGTTCATCAGCATCCTCCAGCTTCTCT
TTAATGGCAGGAATCACAGTTGAGAGATGCACCAAAGTCGCACCACCACCAGGAACTATA
CCTTCTTCGATAGCAGCAAATGTAGCGTTCTTTGCGTCCTCAATGCGAAGCTTACGGTCC
TCAAGCTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACAGCAACACCACCAGAGAGTTTA
GCCATTCTCTCAGCGAGCTTCTCTGAGTCATAGACAGAATCAGTCTCGAATAGCTCTTTC
TTCAGCTGGGAGATACGAGCTTGTAACTCGTCCTTGGAAGCTGCATCTGCAATAAGCGTA
GT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AZ21TF 303 0 0
CACCACCAC
CCAGGAACTATACCTTCTTCGATAGCAGCAAATGTAGCGTTCTTTGCGTCCTCAATGCGA
AGCTTACGGTCCTCAAGCTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACAGCAACACCA
CCAGAGAGTTTAGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCTGAGTCGTAGCCAGAATCAGTCTCG
GATAGTTCTTTCTTCAGCTGGGAGATACGAGCTTGTAACTCGTCCTTGGAAGCTGCATCT
GCAATAAGCGTAGTCGAATCTTTGCTTATGGTGACTTTACGAGCAATACCCAAC

QA 10 303 10 303
DS 



AS 1 2

CO CL4433Contig1 898 2 8 U
CGAGCCAGTACAGAAAATCTAACTTCGAGGGCCTCTTGATATTTACTGAGTTGAGCAATT
CGTAGTAACAAGAATACAGTGGTTATCTAACCGAAAAAAAGGAATCTACTTATATATGTT
TTATACAACGGTTGAGCTAGCTTGGACTGGCCGTGTGAGAATATATGTGATGTATCTCCT
GATTTCAGGTATTATTTTCTTGATAAACATGGGAAACCATATTTCAGAGCTGAGCTTAGT
GTAATGCTCAAGAACGAAGAGAGTGCATGCTCTTCTTAAGGCTGAAGCGTTAAATGTATC
AGCTAAGTCATACATTATCGGTATGTTATCCACACAGATGTCCTGTGCGATTGTGTACTC
ACAAAGGCGTTTGAGGCCTTCGATAAGATACTGATCAGCTGCTACAAGCAAATCTTGAGC
CAAATGTTTTGTGATGCTAATTGTTCCTGTGTATATGAATCTCATCATAAGCTCAAACAC
TTCCCAACCTATATTTGGAATCTCCACGTTTTGGGCGTTGCGTTCCTTGTAAAGGCCATC
AAACATTGCACGAAATGTATCAGAGGAAGCTACCAAGCAAATCTTGTGAGCATAGAATTC
TTTCCCATCGATTAAGAATGTGACATCTGACAGAGTAGGGTTGTTCACAAACTCCTCGCC
CAGAAACACTCGTCGGGTGGGTGAGGAAGGAGCTGAGTCCTCTGGCGCAAAGGAAGTAGC
TTTTCTAGCTAATTCAAATAAAGCTCTTGAACTATATTTCTGCTGTTTCATGCCTGACAA
GTATAGAAGCTCCAACAAAAATTCTACTCCATTGTTATCAATGAAAATTAATTTTCCATC
TTTAGGGTCACAAAGATGTGCAAGAGCCAAAGCAATTCGCATTTGTATAGTCTTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN81JQ U 1
AF RR4AA63JQ U 17
BS 1 99 RR4GN81JQ
BS 100 100 RR4AA63JQ
BS 101 220 RR4GN81JQ
BS 221 221 RR4AA63JQ
BS 222 488 RR4GN81JQ
BS 489 489 RR4AA63JQ
BS 490 729 RR4GN81JQ
BS 730 898 RR4AA63JQ

RD RR4GN81JQ 729 0 0
CGAGCCAGTACAGAAAATCTAACTTCGAGGGCCTCTTGATATTTACTGAGTTGAGCAATT
CGTAGTAACAAGAATACAGTGGTTATCTAACCGAAAAAA*GGAATCTACTTATATATGTT
TTATACAACGGTTGAGCTAGCTTGGACTGGCCGTGTGAGAATATATGTGATGTATCTCCT
GATTTCAGGTATTATTTTCTTGATAAACATGGGAAACCATTTTTCAGAGCTGAGCTTAGT
GTAATGCTCAAGAACGAAGAGAGTGCATGCTCTTCTTAAGGCTGAAGCGTTAAATGTATC
AGCTAAGTCATACATTATCGGTATGTTATCCACACAGATGTCCTGTGCGATTGTGTACTC
ACAAAGGCGTTTGAGGCCTTCGATAAGATACTGATCAGCTGCTACAAGCAAATCTTGAGC
CAAATGTTTTGTGATGCTAATTGTTCCTGTGTATATGAATCTCATCATAAGCTCAAACAC
TTCCCAACTTATATTTGGAATCTCCACGTTTTGGGCGTTGCGTTCCTTGTAAAGGCCATC
AAACATTGCACGAAATGTATCAGAGGAAGCTACCAAGCAAATCTTGTGAGCATAGAATTC
TTTCCCATCGATTAAGAATGTGACATCTGACAGAGTAGGGTTGTTCACAAACTCCTCGCC
CAGAAACACTCGTCGGGTGGGTGAGGAAGGAGCTGAGTCCTCTGGCGCAAAGGAAGTAGC
TTTTCTAGC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4AA63JQ 882 0 0
G
TCTAACTTCGGGGGCCTCTTGATATTTACTGAGTTGAGCAATTCGTAGTAACAAGAATAC
AGTGGTTATCTAACCGAAAAAAAGGAATCTACTTATATATGTTTTATACAACGGTTGAGC
TAGCTTGGACTGGCCGTGTGAGAATATCTGTGATGTATCTCCTGATTTCAGGTATTATTT
TCTTGATAAACATGGGAAACCATATTTCAGAGCTGAGCTTAGTGTAATGCTCAAGAACGA
AGAGAGTGCATGCTCTTCTTAAGGCTGAAGCGTTAAATGTATCAGCTAAGTCATACATTA
TCGGTATGTTATCCACGCAGATGTCCTGTGCGATTGTGTACTCACAAAGGCGTTTGAGGC
CTTCGATAAGATACTGATCAGCTGCTACAAGCAAATCTTGAGCCAAATGTTTTGTGATGC
TAATTGTTCCTGTGTATATGAATCTCATCATAAGCTCAAACACTTCCCAACCTATATTTG
GAATCTCCACGTTTTGGGCGTTGCGTTCCTTGTAAAGGCCATCAAACATTGCACGAAATG
TATCAGAGGAAGCTACCAAGCAAATCTTGTGAGCATAGAATTCTTTCCCATCGATTAAGA
ATGTGACATCTGACAGAGTAGGGTTGTTCACAAACTCCTCGCCCAGAAACACTCGTTGGG
TGGGTGAGGAAGGAGCTGAGTCCTCTGGCGCAAAGGAAGTAGCTTTTCTAGCTAATTCAA
ATAAAGCTCTTGAACTATATTTCTGCTGTTTCATGCCTGACAAGTATAGAAGCTCCAACA
AAAATTCTACTCCATTGTTATCAATGAAAATTAATTTTCCATCTTTAGGGTCACAAAGAT
GTGCAAGAGCCAAAGCAATTCGCATTTGTATAGTCTTCTCA

QA 2 882 2 882
DS 



AS 1 3

CO CL4434Contig1 770 3 10 U
GGACGTAAATCAGAAACGAATATAAGAAAACGTAAATCATTTGCGAAAGTGGTGGATGAT
GCATTCGGACGAAAATTTGTGCCACCATTTGATCCTTATGCCAACTCTTACAATTACCTC
ATTGCTTCATATTTGGTCCCTTATGTTGGTCTCACCGGCTACGTTGGCGCAAACCCGAAA
CTGAAATGTCCCGCGTCAAGGAAGTTAGTAGCCGGACTTTTGGGAGTAGAATCAGGCCAG
GACGCGGTGATAAGAACAATGTTATATGCAAAGGCCAAACACATAGTCCATCCTTATGGT
GTCTCTGTTGCAGCTTTTACGGATAGGATCTCGGATCTGAGGAACAAATTGGGGAAAATG
GGTGTGAAAGATGAGGGGTTGGTTGTGCATAAAGCCATGGGTGCTGAGGGACAAGTGGCT
GGAAATGTATTGGCGGGTGACGAGATGTCGCTTGCGTTTGATCGCACTCCGGAGGAAATT
CTACGGATTGTGTATGGAAATGGAGATGAACGTACCCCTGGTGGATTTTACCCTAAAGGA
GCTGAAGGAGAAATTGCTAAATCTTATTTGGATTAACAATGGTGTCGTTGGGGATGAGGT
AGAGTGTTAGCTTGAGTTTAGTTTCCTTTGTAGGTTGTCAGGTTTTTGGGTTTTATAGGG
ACTTAAGTAAAATAATTTTATGTAATAAATGATGTGAGGGATGAACTTTCGCATTGAACA
ATGTAATAAGTAAGAAAACAGTTTGCCTATGAAATCTCCTCTTCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BU55TF U 1
AF RR4B043JQ C 197
AF RR4B043TF U 197
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RD RR4BU55TF 747 0 0
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ATGTAATAAGTAAGAAA
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G
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TACGGATAGGATCTCGGATCTGAGGAACAAATTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGG
GTTGGTTGTGCATAAAGCCATGGGTGCTGAGGGACAAGTGGCTGGAAATGTATTGGCGGG
TGACGAGATGTCGCTTGCGTTTGATCGCACTCCGGAGGAAATTCTACGGATTGTGTATGG
AAATGGAGATGAACGTACCCCTGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTGAAGGAGAAATTGC
TAAATCTTATTTGGATTAACAATGGTGTCGTTGGGGATGAGGTAGAGTGTTAGCTTGAGT
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QA 2 574 2 574
DS 



AS 1 3

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI94JQ U 1
AF RR4BI94TF C 1
AF RR4H583JQB U 1
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BS 270 270 RR4H583JQB
BS 271 708 RR4BI94JQ
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RD RR4BI94JQ 708 0 0
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CCCGATGGTGGATGATACTAGATAGAGTCCAGACCATATATTATCCCC

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DS 

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A
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QA 2 708 2 708
DS 

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G
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TACAGGTCGAAGCTGTGGCTGTTGAAATGGAAAAGGGGATGATTCGTGGATCGCCAGATG
CTATGTGAACGTATCTCTTTGGCAACGGTGGACTGAAGACTGGCCGGTCCGCATACAATA
ACTCCAACATCCACACTTCCCCATTTCCCATTCAATGACCCAAATATCTCTTTAAAATCA
GGTCTCGTGCCATAACGAGTAGTGATAAGACTCTGAATATCTTCTTCTGTGTTAAGGCCT
TTAAGTTCCTCAGATGGATCATGTAGTTCTTCGCCGTTCATAGTCACCTTGTCGTGGCCA
TTTGGTTCCACTTCACCGGATTTTTCACCCCAAATATTCCAGAAAACAACAACAAGACCT
CCAAAAATCAAGACACTTGCAACCATACAAACCACAAAAAGAAGTCCCTTGTACCACCAC
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ACCGACATGGGACACCCGTTGCACCGTGGCTTCACAGAAAG

QA 2 762 2 762
DS 



AS 1 3

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ATGGGAAAAGAGATACAAACGGATATTAAATACCAATACACACACACACAC**AAACTTA
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ACCATCGGTTTAATGCAGCGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU02JQ U 14
AF RR4BM02JQ U 1
AF RR4F895JQ U 1
BS 1 241 RR4BM02JQ
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RD RR4FU02JQ 555 0 0
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TACAAACGGATATTAAATACCAATACACACACACACACACAAACTTACATATATCTAAAG
CCCTTTCTTGCTCTCCCTCTTAGTCGATTGTCATTGGTTGCGTCATGCAACACCTGAAAC
GGGCTTTCCTCACAGTCGTCATTACCTCGGTTTCAGCCCCCTCAAGAAGATTGACAATCT
CTGCAAAACAAGGACGGACTTCAGGGTCAGCATCCCAGCAACGCGTCATGATCTCCCCAA
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CGATCCCAAAGCTATACACGTCTACCTTCTGAGTGTAGGGTCTATGCTGGATCATCTCTG
GCGCCATCCATCTGTAAGTCCCGGTCTCTGGCGTCATCCCTTCGGTTTGAACTTCAATTC
TTGCAACGCCAAAAT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4BM02JQ 725 0 0
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ATGGGAAAAGAGATACAAACGGATATTAAATACCAATACACACACACACAC**AAACTTA
CATATATCTAAAGCCCTTTCTTGCTCTCCCTCTTAGTCGATTGTCATTGGTTGCGTCATG
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AAATTGACAATCTCTGCAAAACAAGGACGGACTTCAGGGTCAGCATCCCAGCAACGCGTC
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ACCACCGCAAATGCAGCTTGTACTGCAGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTATC
AACTCCCACAGCACGATACCAAAGCTATACACGTCTACCTTCTGAGTGTAGGGTCTATGC
TGGATCATCTCTGGCGCCATCCATCTGTAAGTCCCGGTCTCTGGCGTCATCCCTTCGGTT
TGAACTTCAATTCTTGCAACGCCAAAATCAGCAATCTTGATGGAGCGATCAGCTGATATG
AGGAGGTTATCTGACTTCAGATCCCTGTGTATAAAGTTTCGCTCATGGACATAAGCCATA
CCCCTAGCAACATCCAATGCCTGCTTAACAGCCAACTTCAAAGGCACAGCCCTGTTTTGT
CTCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4F895JQ 801 0 0
CG
CAGCACATACCTTTTTTCTATATCAGTAGTCTAAAACGGTTGGGTTACTTCTCCTATCAT
GGGAAAAGAGATACAAACGGATATTAAATACCAATACACACACACACA****AACTTACA
TATATCTAAAGCCCTTTCTTGCTCTCCCTCTTAGTCGATTGTCATTGGTTGCGTCATGCA
ACACCTGAAACGGGCTTTCCTCACAGTCGTCATTACCTCGGTTTCAGCCCCCTCAAGAAG
ATTGACAATCTCTGCAAAACAAGGACGGACTTCAGGGTCAGCATCCCAGCAACGCGTCAT
GATCTCCCCAAGCACAGGGAGACAATCCCCTGGGACCGTTGGACGCACTCCCCGGTTCAC
CACCGCAAATGCAGCTTGTACTGCAGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTATCAA
CTCCCACAGCACGATCCCAAAGCTATACACGTCTACCTTCTGAGTGTAGGGTCTATGCTG
GATCATCTCTGGCGCCATCCATCTGTAAGTCCCGGTCTCTGGCGTCATCCCTTCGGTTTG
AACTTCAATTCTTGCAACGCCAAAATCAGCAATCTTGATGGAGCGATCAGCTGATATGAG
GAGGTTATCTGACTTCAGATCCCTGTGTATAAAGTTTCGCTCATGGACATAAGCCATACC
CCTAGCAACATCCAATGCCTGCTTAACAGCCAACTTCAAAGGCACAGCCCTGTTTTGTCT
CTTAGTCAAAAACTGTCTGACGGAACCTCCTTTTGCATATTCAGTCACGATGCACAACAC
CATCGGTTTAATGCAGCGC

QA 3 801 3 801
DS 



AS 1 3

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GTGTTCCCTATTGTTTTCTACCCGTTGAGGATTAACATCGATGGGCTCTTGTTCCCTTCT
GCTCCATCGTTAACCACCTCAAATGCTAGGTTTGGTTGCCTCAGCGCTGGTCTCATCTCT
GTCATCTTCTTGGGTGCAAACTGCATCCCGAGCATTTGGGATGCGTTCCAGTTCACTGGA
GCCACTGCTGCTGTTTGTCTCGGATTCATATTCCCAGCTTCTATTATACTAAAGGATCGT
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GGAAAACAAAAGTGTTTGTTTTTATTCCATCTTCTTTTTCTTATGCGAGGTTGAATAAGC
GAGAAGACAGGACTTGTCTTCTCTTTGTGTGTTGTACCGTTGTTGTTGAGTGTTGTTTTA
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TATATATCATAGTCTATTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H777TF U 658
AF RR4E850TF U 15
AF RR4B191JQ C 1
BS 1 15 RR4B191JQ
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GGA
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TATAAAGATCAAATGTAATGCAGAATACATACTTTTTGTGTATC

QA 4 107 4 107
DS 

RD RR4E850TF 721 0 0
G
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TCTGCTTGCTTGTGGTTTTGTATCACCATGAGTGTAGAAACTTTGTATAAAGATCAAATG

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR4B191JQ 803 0 0
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GTGTTCCCTATTGTTTTCTACCCGTTGAGGATTAACATCGATGGGCTCTTGTTCCCTTCT
GCTCCATCGTTAACCACCTCAAATGTTAGGTTTGGTTGCCTCAGCGCTGGTCTCATCTCT
GTCATCTTCTTGGGTGCAAACTGCATCCCGAGCATTTGGGATGCGTTCCAGTTCACTGGA
GCCACTGCTGCTGTTTGTCTCGGATTCATATTCCCAGCTTCTATTATACTAAAGGATCGT
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TTGGCCAATGCAATCGCTATTTACAGCGATGCTTATGCGTTGTTCAAGAGGAACGCACCT
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GGAAAACAAAAGTGTTTGTTTTTATTCCATCTTCTTTTTCTTATGCGAGGTTGAATAAGC
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GGGTGTATGTACTTCTCTGCTTGCTTGTGGTTTTGTATCACCATGAGTGTAGAAACTTTG
TATAAAGATCAAATGTAATGCAGAATACATACTTTTTGTGTATCATGTTCTGATCTGTCA
TATATATCATAGTCTATTATACC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 3

CO CL4438Contig1 1168 3 16 U
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CTGGCTTTATCAAAATCCTTGGAGACAACGGATCCAATCAACGAGACTTGTGTGAGTGTT
CCTCAGATTTAGATGCATTCTTGATTCATCTGAGTCTTCAGAGAGCTGAATTGGAAGTTT
TATAGAGAGATGAAGGATTTTCCTTCTTGCTTCGGCGAAAACGGAGTCCAAGTCGCGGAT
TCTTCGTCTTCGAACTCCGGGAAGAACGCTCAGAATCTGGTTACTTCTATCTACCAGTGC
TGTATCCGAGGAAGCACTTGTTTGATCACTGTGACGCGGGCCAAGACTCTGATGGGTCAG
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CCTTGGCTGTTCACCAAACGAAAAGGGTCCAAGAGTTTGGAGGTTTATTCGTGTTGTAGC
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TCAGATGGGGTTAGGATACATGATGTTGTGATTGAATGTGACACGAGCGTCACTGATCCT
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TTTCGCGGGAACGATACGATAGTTGTTAATAGAATGGCTGTGGAAGTTCTGTGGGATGTT
CATAGTTGGCTATTTGGGATGCCTTCTTCTACAGCGGGAAACGCAGTGTTTATGTTCAGG
ACTAGTCAATCTTCTTCGGATAAGAGCTTGTCTTCTTTCTCAGAGGATATCATGGCAGCA
ACAACAACAACAAACTCCAAGTCTCAAAGTTCTGGTTTTTCGTTGATTCTGTATGCTTGG
AAGAACGAGTAGAATGCCTTTTTAAAAGCGTTTGTTGATTCCTTATCGACATTTGTTATT
GATAGCGTGATTTAATGTGTTGATTCAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
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AF RR4GW29TF U 1
AF RR4H635TF U 1
AF RR4H635JQB C 561
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BS 781 1168 RR4H635JQB

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GTCTCGTGTCGTGT

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CTGGCTTTATCAAAATCCTTGGAGACAACGGATCCAATCAACGAGACTTGTGTGAGTGTT
CCTCAGATTTAGATGCATTCTTGATTCATCTGAGTCTTCAGAGAGCTGAATTGGAAGTTT
TATAGAGAGATGAAGGATTTTCCTTCTTGCTTCGGCGAAAACGGAGTCCAAGTCGCGGAT
TCTTCGTCTTCGAACTCCGGGAAGAACGCTCAGAATCTGGTTACTTCTATCTACCAGTGC
TGTATCCGAGGAAGCACTTGTTTGATCACTGTGACGCGGGCCAAGACTCTGATGGGTCAG
AGTGTGACCGTTGGTGTTGATGATTCTTGTAACCAGAGCCTCTGTAAAGTCGAGATCAAG
CCTTGGCTGTTCACCAAACGAAAAGGGTCCAAGAGTTTGGAGGTTTATTCGTGTTGTAGC
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TCAGATGGGGTTAGGATACATGATGTTGT

QA 1 749 1 749
DS 

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TTTTGGTAAGAGAGAGTTCGCAACGAAGGCTCAGCTCTGTTCAGATGGGGTTAGGATACA
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AGTTGTTAATAGAATGGCTGTGGAAGTTCTGTGGGATGTTCATAGTTGGCTATTTGGGAT
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GTCTCAAAGTTCTGGTTTTTCGTTGATTCTGTATGCTTGGAAGAACGAGTAGAATGCCTT
TTTAAAAGCGTTTGTTGATTCCTTATCGACATTTGTTATTGATAGCGTGATTTAATGTGT
TGATTCAC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 3

CO CL4439Contig1 719 3 1 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4HB65TF U 228
AF RR4BD30TF U 1
AF RR4BF34TF U 1
BS 1 719 RR4BD30TF

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QA 1 351 1 351
DS 

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ACACTTCTCTCAAAGTTACAAACTTCACTCTCCCTCGCGCTTGATCGTTTCCACCCTCTA
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GAGTCGATCTGGAGGTTCTTGAACGCGTGGTCGGATCTGCTCCAAGGGTGGTGGGGGGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BF34TF 708 0 0
GGTCGTGCTAAAAAGAATTAAACAATGATCACCAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAA
CTAGTCGTAGAAAAGAAACTGAGCATCACGTAACTAAAACACCTCCATTAATTACAAATC
TTAAACCAGATGGAAGAAGATCTCGTGGTGATCTCAAGGAGCATAGTAATCCCCAGAAAC
GCCAAGAAATCAACTTCCTTAAACAACAAGATTCATCTCCTCCCATGGGATCTCGCTCGT
CTTCGCTTCGGGTACCTTCAGAGAGGCCTCCTTTTCTCCAAACCTTATCCAAAAATCGAC
ACACTTCTCTCAAAGTTACAAACTTCACTCTCCCTCGCGCTTGATCGTTTCCACCCTCTA
GCTGGTCGTCTCGTAAAGGTACACAACAACGACGATACCGACACCGTCTCTTTCCACATC
AACCCCGACGGTTCAGGTGTGGAGTTCGTCCACGCCGCGGCTAGAAACATCGAGGTCCGT
GATATCCTCAGATTATCATCTTCTTCTTCTTTTGTCCCGAGTGCTTTCACCTCCTTCTTC
CCAGCTACTGGGGTCGAGAACTGCGACGGTGTCTCGAGATCTCTGCTTATGGTTCAAGTG
ACCGAGATGAAAGATGGCATCTTTATCGGTTTCGGTTACAACTCTACTGTGGCTGATGGA
GAGTCGATCTGGAGGTTCTTGAACGCGTGGTCGGATCTGCTCCAAGGG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL4440Contig1 954 3 3 U
CGTTCGAAAGAAGCTAAACTCGCTCGTTTAGCCATGGCGCTCTTTTACCATTCGAGAAGT
AACATCTAATTTCACATGAACCACATATGGCGAGTGATAATTAAACATTGTTACCTACAT
AATACGTAGAGACAGTGGAGACACAGAGTCGAGAGAAAATAACTTTAACTTCATTTACAA
GGTAGCCTGTATGTCCTTGTGATTCGAATCTGTGCAAACGCGTAGATTGCTCGTAAGATT
CTAGCGTAGTCAGTTTCAAGCATCTGAATAACCAAATCAGCTAGTAAGGTCCCCCACATC
ATTGGACCGACTAATTGCATCACTGTTCTTAAGCCAAGGTATCTGGATGCAGCTCCTACA
AACCCTTGTTTTGCTGCAAGCAGAGCTGCTCGAGATTCCAAGTTAATGGCAGCTAACTGT
CCACCCTTTTTAAGCATCTCTCTTCTTATCTGGTAGTTGGCAGCTTCAAGGATTACTTTT
CCAGATAGTTTCTTAGCCAACAACTGATAAATCTTGGCAAATGTGATCATCCCACCACCC
TTGAGAATCATAGATTGGACCTCTGAAGCACCTACTTCTAGAGCAGCAAGTAGTTCAACT
TTCCATTTACTGAGCCCGACTTCTAAGCTTCCCTGCACCTCCGATGCTTGAGAACTATCC
CACAAGCCAGGAAATATCCCTGATGCTTCACTAGAGAAATTGTCAACAAGATAAAGAAAG
ATCCCAGCTTCGAGATCCTCCGTTGGCAAGTGGCTGGAGCAGGGAATACTCAACTTATTC
CTCACCGCAAGTAAAACGTTTCTGTACGAAGGCCTCCAACCCCTGAGAGTGGAGCGAGCA
TCAGCAGCGAGAAACAAGAATCTTGATTCAAGAGATTGAATAAAACCATCTCGAACCTCA
ATATCTTCCCCTATCATCAACCTCTCACTCTGCTTCCTGACTGACGAAAACTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR67JQ U 1
AF RR4E675JQ U 1
AF RR4DR67TF C 208
BS 1 688 RR4DR67JQ
BS 689 760 RR4E675JQ
BS 761 954 RR4DR67TF

RD RR4DR67JQ 688 0 0
CGTTCGAAAGAAGCTAAACTCGCTCGTTTAGCCATGGCGCTCTTTTACCATTCGAGAAGT
AACATCTAATTTCACATGAACCACATATGGCGAGTGATAATTAAACATTGTTACCTACAT
AATACGTAGAGACAGTGGAGACACAGAGTCGAGAGAAAATAACTTTAACTTCATTTACAA
GGTAGCCTGTATGTCCTTGTGATTCGAATCTGTGCAAACGCGTAGATTGCTCGTAAGATT
CTAGCGTAGTCAGTTTCAAGCATCTGAATAACCAAATCAGCTAGTAAGGTCCCCCACATC
ATTGGACCGACTAATTGCATCACTGTTCTTAAGCCAAGGTATCTGGATGCAGCTCCTACA
AACCCTTGTTTTGCTGCAAGCAGAGCTGCTCGAGATTCCAAGTTAATGGCAGCTAACTGT
CCACCCTTTTTAAGCATCTCTCTTCTTATCTGGTAGTTGGCAGCTTCAAGGATTACTTTT
CCAGATAGTTTCTTAGCCAACAACTGATAAATCTTGGCAAATGTGATCATCCCACCACCC
TTGAGAATCATAGATTGGACCTCTGAAGCACCTACTTCTAGAGCAGCAAGTAGTTCAACT
TTCCATTTACTGAGCCCGACTTCTAAGCTTCCCTGCACCTCCGATGCTTGAGAACTATCC
CACAAGCCAGGAAATATCCCTGATGCTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4E675JQ 760 0 0
CGTTCGAAAGAAGCTAAACTCGCTCGTTTAGCCATGGCGCTCTTTTACCATTCGAGAAGT
AACATCTAATTTCACATGAACCACATATGGCGAGTGATAATTAAACATTGTTACCTACAT
AATACGTAGAGACAGTGGAGACACAGAGTCGAGAGAAAATAACTTTAACTTCATTTACAA
GGTAGCCTGTATGTCCTTGTGATTCGAATCTGTGCAAACGCGTAGATTGCTCGTAAGATT
CTAGCGTAGTCAGTTTCAAGCATCTGAATAACCAAATCAGCTAGTAAGGTCCCCCACATC
ATTGGACCGACTAATTGCATCACTGTTCTTAAGCCAAGGTATCTGGATGCAGCTCCTACA
AACCCTTGTTTTGCTGCAAGCAGAGCTGCTCGAGATTCCAAGTTAATGGCAGCTAACTGT
CCACCCTTTTTAAGCATCTCTCTTCTTATCTGGTAGTTGGCAGCTTCAAGGATTACTTTT
CCAGATAGTTTCTTAGCCAACAACTGATAAATCTTGGCAAATGTGATCATCCCACCACCC
TTGAGAATCATAGATTGGACCTCTGAAGCACCTACTTCTAGAGCAGCAAGTAGTTCAACT
TTCCATTTACTGAGCCCGACTTCTAAGCTTCCCTGCACCTCCGATGCTTGAGAACTATCC
CACAAGCCAGGAAATATCCCTGATGCTTCACTAGAGAAATTGTCAACAAGATAAAGAAAG
ATCCCAGCTTCGAGATCCTCCGTTGGCAAGTGGCTGGAGC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4DR67TF 747 0 0
ATCTGTGCAAACGCGTAGATTGCTCGTAAGATTCTAGCGTAGTCAGTT*CAAGCATCTGA
ATAACCAAATCAGCTAGTAAGGTCCCCCACATCATTGGAC*GACTAATTGCATCACTGTT
CTTAAGCCAAGGTATCTGGATGCAGCTCCTACAAACCCTTGTTTTGCTGCAAGCAGAGCT
GCTCGAGATTCCAAGTTAATGGCAGCTAACTGTCCACCCTTTTTAAGCATCTCTCTTCTT
ATCTGGTAGTTGGCAGCTTCAAGGATTACTTTTCCAGATAGTTTCTTAGCCAACAACTGA
TAAATCTTGGCAAATGTGATCATCCCACCACCCTTGAGAATCATAGATTGGACCTCTGAA
GCACCTACTTCTAGAGCAGCAAGTAGTTCAACTTTCCATTTACTGAGCCCGACTTCTAAG
CTTCCCTGCACCTCCGATGCTTGAGAACTATCCCACAAGCCAGGAAATATCCCTGATGCT
TCACTAGAGAAATTGTCAACAAGATAAAGAAAGATCCCAGCTTCGAGATCCTCCGTTGGC
AAGTGGCTGGAGCAGGGAATACTCAACTTATTCCTCACCGCAAGTAAAACGTTTCTGTAC
GAAGGCCTCCAACCCCTGAGAGTGGAGCGAGCATCAGCAGCGAGAAACAAGAATCTTGAT
TCAAGAGATTGAATAAAACCATCTCGAACCTCAATATCTTCCCCTATCATCAACCTCTCA
CTCTGCTTCCTGACTGACGAAAACTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL4441Contig1 1290 3 14 U
GAAGTTTACGGGATGAACTAGATATCAAAGGATTCAAACTGAAGAACTGATGCAAACAAG
TGATGAATATGCAAAACACTATATGATATGAAGCAAACGAGTGCTTAAATCTCTTTTTTT
TTTGAAATGAATGAATGAAACAATATGAACTAGAACGAGATGTATAAGTAACTAGATAGA
TACAACCTGATGCTGAAGGAACTTCAGCTCTGATACCAGAAATGATACAAGCCTAGGCTG
ACAAAGGCTGTATGATCCAAGCAAGAGAGTTGGAGCCGATCTAGATCAAGAGGTGGTTCT
TTTGTTTGATCTAATCAACCAAGAGAAACCGTGAGAGATGGAACCAAGGGGGGGGATTGA
AGTGCACCACACGAGAGATGGAAGGCTCGTGATACAACACAAGGAACCTCAAGCCGTGGA
GGAGCTGGTCTCACAAGGCAAGGAGGTGGCGGCTGTTCTTCTTGAGAGAGAGAACTAGGT
TTTCTTTGAAAAGAAAAGTTTTATAAAATATCAAGTGTACCAAGAAAAGGGTTTTGCAAA
ACACATAAATAGACTAAGGAACATGCTCCTTTGCGTCTCACATAAAGATATTAAGCTATA
GTTCAAATAAGGAAATAAAGAAGAGTGGAGTCTTCTTTGATCTTGGACCGAGATGCATAT
AGGTGATGTGATAAACTAGTTGTGGCCTCGTTAAAAACCTTCCTCCGGAAAACCTCATGG
GATAAAACCAAGAGCAAGGAAAAGAGCACACACAAAGAGCTTGCCTAGTTGCTAGCCCCG
TCCAAGAGTCTTCTTAAACATTTGGATCTTCTATGGTAATGATCATCAAATGGTTGTGGC
TATGATCAGGGATGAATGGCCAAAGATCTTCTCTTGATGCTTGAGAACTCCCATTTGGTT
CCTCTATCTTCACGGCATCTCTCTTGATCACATCTTTGATATCTTCCTCAGCTTGTTTAA
CCTGTCCAAGATCAGAAGCAAGTATCATGCTCTCATTAAATTTATGTCGAAGTATCTTAG
CTCTTTGTCTAGTGATAGCTCCCTTAAACACGGTTGGTATGGGCACTTCTTGCTCAGTCT
CTGGATTGGTAATGTTGCTGATCATGTCTTGGATGTCTGGTTCAGTAAGGTCAGGTTCAA
TGTCCTCATCACAATGTCTCCCTGTAGAAGTTGGGTAAAAATGTCTTCCATTGTGATTAT
GCCGATCACTCCTCCATCAACATTTTCGCAAGATAACTGATCATCATATTGAACGTCAGA
TTGTGTCATATGGACAAGAACATTCTCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF63JQ U 1
AF RR4FW13JQ U 491
AF RR4DJ18JQ U 491
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ATTTGGATCTTCTATGGTAATGATCATCAAATGGTTGTGGCTATGATCAGGGATGAATGG
CCAAAGATCTTCTCTTGATGCTTGAGAACTCCCATTTGGTTCCTCTATCTTCACGGCATC
TCTCTTGATCACATCTTTGATATCTTCCTCAGCTTGTTTAACCTGTCCAAGATCAGAAGC
AAGTATCATGCTCTCATTAAATTTATGTTGAAGTATCTTAGCTCTTTGTCTAGTGATAGC
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GATCATGTCTTGGATGTCTGGTTCAGTAAGGTCAGGTTCAATGTCCTCATCACAATGTCT
CCCTGTAGAAGTTGGGTAAAAATGTCTTCCATTGTGATTATGCCGATCACTCCTCCATCA
ACATTTTCGCAAGATAACTGATCATCATATTGAACGTCAGATTGTGTCATATGGACAAGA
ACATTCTCAAG

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AS 1 3

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CTGGGTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 

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DS 

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AAAAAAAAGAATCTTTCTCTTTCCCTTTTCAGAAAAACCAGTCTTTTGCTTTATTCAAAG
ATTTTCTCAAAATTACCCATCAAGGTCCCACTTTTAAAAACCGATCCTTGAAGTTGTGAG
TTGTGTGTGCGTGTTGGCTAGGCCAAGCAGCGAATCATGATCCCGAACCTGAACCGCTCT
TCAGGGATTAGAGCAACGTTAACATCACTGAACAGAACCCCGTCAGAGGAAAATCAGACA
GGCTGTAGTTCTGATTGCACCGACGGTGTCGGAGAATGGAGAGATGGTGAACACTTACAG
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GTTCGACATCCATTATATAATTTTTATAAGTGGAGAAACACCGCC*TCCAAGAGGGAGTT
AAGAGGTTTCTTAAAT*CCGATGAATCAAGACATT*GAATGAGACATCGTGCTTGATTT*
GCGTTGATGGAGTTAAGAGGTTTCTTAATATCTGATGAATCAAGACATCTCGTAACGTCT
TCGAGGGTAAGAACCGAATGGACAATGTCAAAGCTTGACACAGTTTCTTCACAACCTTTT
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CTGGGTTCC

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DS 

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TT*GAATGAGACATCGTGCTTGATTT*GCGTTGATGGAGTTAAGAGGTTTCTTAATATCT
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CTAAGAAGATCGTCTTTCCCAATCAGACTGGGTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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TCTCCGTTTTGGATCATCCAAATGTGACAAAGCTTGTTGGTTACTGTGCTGAGCATGGAC
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CAGAAGAAGAAAGCAAAGCATTGGTGTGGAACTCACGAGTCAAGATCGTTCTTGGAACTG
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AATCAGCTAATATTTTACTTGATTCGGAGATGAACCCTCACTTATCAGATTCAGGTCTCG
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TGATGCTTGAACTTTTAACCGGGAGGAAACCATTCGACAGCACAAGGTCAAGATCTGAGC
AGTCATTGGTTAGATGGGCGACACCACAACTTCATGACATTGATGCTTTAGGCAAAATGG
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TTGCTCTCTGCGTCCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGACCACCAATGTCTGAAGTTGTGCAGT
CACTGGTTGTGTTAGTTCAGAGAGCTAACATGAGCAAGAGAACTGTTGGAGTTGATCCAA
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AAAGAACACTTTGCTCCATATGGATGAAGTCATTGTTTTATTGTAATATGTTTTATAAAC
CTTTTCACAGTATATTATCCATTGTATTTTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET28TF U 1
AF RR4A593TF U 25
AF RR4A593JQ C 110
BS 1 119 RR4ET28TF
BS 120 120 RR4A593TF
BS 121 221 RR4ET28TF
BS 222 222 RR4A593TF
BS 223 228 RR4ET28TF
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BS 230 292 RR4ET28TF
BS 293 293 RR4A593TF
BS 294 510 RR4ET28TF
BS 511 511 RR4A593TF
BS 512 525 RR4ET28TF
BS 526 526 RR4A593TF
BS 527 699 RR4ET28TF
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BS 701 747 RR4ET28TF
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BS 781 805 RR4ET28TF
BS 806 834 RR4A593TF
BS 835 935 RR4A593JQ

RD RR4ET28TF 805 0 0
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TCTCCGTTTTGGATCATCCAAATGTGACAAAGCTTGTTGGTTACTGTGCTGAGCATGGAT
AGCATCTCCTGGTCTATGAGTTCCACAGTAAAGGATCGCTGCATGACTTGTTACACTTAT
CAGAAGAAGAAAGCAAAGCATTGGTGTGGAACTCACGAGTCGAGATCGCTCTTGGAACTG
CACGTGCGCTAGAGTACCTACATGAAGTTTGTTCGCCATCTATAGTTGACAATAACATCA
AATCAGCTAATATTTTACTTGATTCGGAGATGAACCCTCACTTATCAGATTCAGGTCTCG
CAAGCTTCCTCCCCACAGCCAATGAGTTACTAAACCAAACCGATGAAGGGTATAGCGCAC
CTGAAGTATCAATGTCAGGTCAATACTCTTTGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTAG
TGATGCTTGAACTTTTAACCGGGAGGAAAC*ATTCGACAGCACAAAGTCAAGATCTGAGC
AGTCATTGGTTAGATGGGCGACACCACAACTTCATGACATTGATGCTTTAGGCAAAATGG
TTGATCCAGCTCTTGAAGGACTTTATCCAGTTAAATCTCTCTCTAGATTTGCAGATGTTA
TTGCTCTCTGCGTCCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGACCAC*AATGTCTGAAGTTGTGCAGT
CACTGGTTGTGTTAGTTCAGAGAGCTA*CATGAGCAAGAGAACTGTTGGAGT*GATCCA*
CACAGCGGTCTGGTAGTTCTGAGAC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4A593TF 810 0 0
GCATGACCGATAATTTCACCGAAATAGTATCGAAAATCTCCGTTTTGGATCATCCAAATG
TGACAAAGCTTGTTGGTTACTGTGCTGAGCATGGACAGCATCTCCTGGTCTATGAGTTCC
ACAGTAAAGGATCGCTGCATGACTTGTTACACTTATCAGAAGAAGAAAGCAAAGCATTGG
TGTGGAACTCACGAGTCAAGATCGTTCTTGGAACTGCACGTGCGCTAGAGTACCTACATG
AAGTTTGTTCGCCATCTATAGTTGACAAGAACATCAAATCAGCTAATATTTTACTTGATT
CGGAGATGAACCCTCACTTATCAGATTCAGGTCTCGCAAGCTTCCTCCCCACAGCCAATG
AGTTACTAAACCAAACCGATGAAGGGTATAGCGCACCTGAAGTATCAATGTCAGGTCAAT
ACTCTTTGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTAGTGATGCTTGAACTTTTAACCGGGA
GGAAACCATTCGACAGCACAAGGTCAAGATCTGAGCAGTCATTGGTTAGATGGGCGACAC
CACAACTTCATGACATTGATGCTTTAGGCAAAATGGTTGATCCAGCTCTTGAAGGACTTT
ATCCAGTTAAATCTCTCTCTAGATTTGCAGATGTTATTGCTCTCTGCGTCCAGCCGGAGC
CAGAGTTTAGACCACCAATGTCTGAAGTTGTGCAGTCACTGGTTGTGTTAGTTCAGAGAG
CTAACATGAGCAAGAGAACTGTTGGAGTTGATCCAACACAGCGGTCTGGTAGTTCTGAGA
CAACCAAGGATTACATGTAAATCTATAAAG

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4A593JQ 826 0 0
TGAGCATGGACAGCATCTCCTGGTCTATGAGTTCCACAGTAAAGGATCGCTGCATGACTT
GTTACACTTATCAGAAGAAGAAAGCAAAGCATTGGTGTGGAACTCACGAGTCAAGATCGT
TCTTGGAACTGCACGTGCGCTAGAGTACCTACATGAAGTTTGTTCGCCATCTATAGTTGA
CAAGAACATCAAATCAGCTAATATTTTACTTGATTCGGAGATGAACCCTCACTTATCAGA
TTCAGGTCTCGCAAGCTTCCTCCCCACAGCCAATGAGTTACTAAACCAAACCGATGAAGG
GTATAGCGCACCTGAAGTATCAATGTCAGGTCAATACTCTTTGAAGAGTGATGTTTACAG
TTTTGGAGTAGTGATGCTTGAACTTTTAACCGGGAGGAAACCATTCGACAGCACAAGGTC
AAGATTTGAGCAGTCATTGGTTAGATGGGCGACACCACAACTTCATGACATTGATGCTTT
AGGCAAAATGGTTGATCCAGCTCTTGAAGGACTTTATCCAGTTAAATCTCTCTCTAGATT
TGCAGATGTTATTGCTCTTTGCGTCCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGACCACCAATGTCTGA
AGTTGTGCAGTCACTGGTTGTGTTAGTTCAGAGAGCTAACATGAGCAAGAGAACTGTTGG
AGTTGATCCAACACAGCGGTCTGGTAGTTTTGAGACAACCAAGGATTACATGTAAATCTA
TAAAGAAAAAAAAAGAACACTTTGCTCCATATGGATGAAGTCATTGTTTTATTGTAATAT
GTTTTATAAACCTTTTCACAGTATATTATCCATTGTATTTTGTTGT

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 3

CO CL4445Contig1 776 3 9 U
AGGGACTGCTGAACCGCGCCGCGACATATATATCTTTAATCCTCTCTAGCAGGGCTGTTG
TAGTGACAGTTTCTATCGGAGAAGATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCGACTACTGGTTGC
CAGAAGAAGCTTGAGATCGATGACGACCAGAAGCTCCGTGCTTTTTACGACAAGAGGCTC
TCACAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGTGAATTTTCTACCTACTACTCGTTTG
GAGAAGCTAAGGCGATTGGAGAAGTTACAGAGTGTTGTATCAGCCATCTCTTCTCACGGC
TTACTTTCTTCTTCGTCAGCTTCAGATAATGAATCTTCTTCTTCTTCTCGATTCCTTTCG
GAGCTCGTACTTTTCCTGCTACAACCATCCGGCGACCTTGATATTGAATCGAAACTCGTT
TTGATCTCTGATTTCATACCTAAAGTATCTGGAACTTTCCTCGATGAGATATCTAGGTCA
GTTCAGCGAGAGGATGAACCTAAACCACTAATCACCAGTTCAGCAGCAGAGTGTCAAAAG
AGTTGTGTGAAGAGGAGTTTCATGGACAGGAGGGAGTGAACTCCTCATGGTGGTGGTGAT
GATGATGCCAGTTTTTTTGTGTGTGTTGTTTAACAATTGAGCGAGCGAAAGAGACAAGAA
CGTTGAGAAGATTCGGAAGAGTAAGAGAAAACTTGTTTTTTATTGTATTTTTTTTTGTTT
CTTATGTAACCGACTTTTTTTTTCTCTTTTTGTTTTTTCTTTAATATTTTGGATAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV24TF U 1
AF RR4EV64TF U 3
AF RR4DV24JQ C 25
BS 1 671 RR4DV24TF
BS 672 677 RR4EV64TF
BS 678 678 RR4DV24JQ
BS 679 690 RR4EV64TF
BS 691 691 RR4DV24JQ
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BS 701 701 RR4DV24JQ
BS 702 714 RR4EV64TF
BS 715 776 RR4DV24JQ

RD RR4DV24TF 671 0 0
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GAGCTCGTACTTTTCCTGCTACAACCATCCGGCGACCTTGATATTGAATCGAAACTCGTT
TTGATCTCTGATTTCATACCTAAAGTATCTGGAACTTTCCTCGATGAGATATCTAGGTCA
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AGTTGTGTGAAGAGGAGTTTCATGGACAGGAGGGAGTGAACTCCTCATGGTGGTGGTGAT
GATGATGCCAGTTTTTTTGTGTGTGTTGTTTAACAATTGAGCGAGCGAAAGAGACAAGAA
CGTTGAGAAGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4EV64TF 720 0 0
GGACTGCTGAACTGCGCCGCGACATATATATCTTTAATCCTCTCTAGCAGGGCTGTTGTA
GTGACAGTTTCTATCGGAGAAGATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCGACTACTGGTTGCCA
GAAGAAGCTTGAGATCGATGACGACCAGAAGCTCCGTGCTTTTTACGACAAGAGGCTCTC
ACAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGTGAATTTTCTACCTACTACTCGTTTGGA
GAAGCTAAGGCGATTGGAGAAGTTACAGAGTGTTGTATCAGCCATCTCTTCTCACGGCTT
ACTTTCTTCTTCGTCAGCTTCAGATAATGAATCTTCTTCTTCTTCTCGATTCCTTTCGGA
GCTCGTACTTTTCCTGCTACAACCATCCGGCGACCTTGATATTGAATCGAAACTCGTTTT
GATCTCTGATTTCATACCTAAAGTATCTGGAACTTTCCTCGATGAGATATCTAGGTCAGT
TCAGCGAGAGGATGAACCTAAACCACTAATCACCAGTTCAGCAGCAGAGTGTCAAAAGAG
TTGTGTGAAGAGGAGTTTCATGGACAGGAGGGAGTGAACTCCTCATGGTGGTGGTGATGA
TGATGCCAGTTTTTT*GTGTGTGTTGTTTAACGATTGAGCGAGCGAA*GAGACAAGAA*G
TTGAGAAGATTCGGA*GAGTAAGAGAAA*CTTGTTTTT*ATTGTATTTTTTT
GTTTCTAT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4DV24JQ 752 0 0
CATATATATCTTTAATCCTCTCTAGCAGGGCTGTTGTAGTGACAGTTTCTATCGGAGAAG
ATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCGACTACTGGTTGCCAGAAGAAGCTTGAGATCGATGAC
GACCAGAAGCTCCGTGCTTTTTACGACAAGAGGCTCTCACAGGAAGTTAGCGGAGATGCT
TTGGGCGAGGTGAATTTTCTACCTACTACTCGTTTGGAGAAGCTAAGGCGATTGGAGAAG
TTACAGAGTGTTGTATCAGCCATCTCTTCTCACGGCTTACTTTCTTCTTCGTCAGCTTCA
GATAATGAATCTTCTTCTTCTTCTCGATTCCTTTCGGAGCTCGTACTTTTCCTGCTACAA
CCATCCGGCGACCTTGATATTGAATCGAAACTCGTTTTGATCTCTGATTTCATACCTAAA
GTATCTGGAACTTTCCTCGATGAGATATCTAGGTCAGTTCAGCGAGAGGATGAACCTAAA
CCACTAATCACCAGTTCAGCAGCAGAGTGTCAAAAGAGTTGTGTGAAGAGGAGTTTCATG
GACAGGAGGGAGTGAACTCCTCATGGTGGTGGTGATGATGATGCCAGTTTTTTTGTGTGT
GTTGTTTAACAATTGAGCGAGCGAAAGAGACAAGAAGGTTGAGAAGATTCGGAAGAGTAA
GAGAAAACTTGTTTTTTATTGTATTTTTTTTTGTTTCTTATGTAACCGACTTTTTTTTTC
TCTTTTTGTTTTTTCTTTAATATTTTGGATAT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL4446Contig1 808 3 20 U
GGACTCTTGTGTTTGTTGGAAAGCTAAAATCGAGAGATGGCGGGAGATGAAGAGATTGAG
ATTTACGAAGAAGGAGAGGAGGAATCCATTGAAGCGAAAACTGAGGGAGGAGATGATGAG
AAGGTGTTGCAGTTTTTAGATTCGTTGGATGGGTATCTAACGCTTATGGATTCTCTCAAT
TCAAAGCTACGAGAGGGATGGTTTGATCTAGCAAGTGCTCGACACTCTATGGGAACTTTA
CGTATCACCAGCACCCTCTTAGACCTCAAGGATCATTCCGCTGCTTCCACATTGCAAGTC
TCTGACCAAGATGTTGAATCTTTGGGACCAGTACCTCGTTTTGCTTTGTCCAAGTGGGCT
TCTAAGGGGGGCAGTGGGAAAGGCAAAGACTTCTCTACTGATGCAGATTTCGAGATGGGC
TCTCCTCGTTCCCCACAGCTACGGCATCGAGGCGTTTCTGAAGAGAAACCATCACCCAAG
GGTGAGACCACCGTGTTAGCAGCTGATGAAGAGGTTAAGAAAGAACGGGCCAAGTCTCTG
TCGGTATTCGGAGGTCTAGTCTCCCCTAAGCTGCGTGGTGCTCAACTTTCATTTGAGACA
GCTCTTGAAACTCTTGTGGAAATAGCCAACACACGATCATCCATGTTAGCTGCCTTTGAG
CGGATCACGAAGAAGTAAAGACAGAATGTGCCAATGCGTTAGTTCAATTTTTGAGTTTGT
AACTACCACATTCTGTGTAATACACAAGTATCTATTTTGATCAGAATTGCTTGCTTTACA
GCACCAAATAATATACACAACATTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ77TF U 5
AF RR4FO13TF U 1
AF RR4CZ77JQ C 8
BS 1 100 RR4FO13TF
BS 101 101 RR4CZ77TF
BS 102 189 RR4FO13TF
BS 190 190 RR4CZ77TF
BS 191 254 RR4FO13TF
BS 255 255 RR4CZ77TF
BS 256 368 RR4FO13TF
BS 369 369 RR4CZ77TF
BS 370 507 RR4FO13TF
BS 508 508 RR4CZ77TF
BS 509 688 RR4FO13TF
BS 689 689 RR4CZ77TF
BS 690 717 RR4FO13TF
BS 718 718 RR4CZ77JQ
BS 719 721 RR4FO13TF
BS 722 722 RR4CZ77JQ
BS 723 739 RR4FO13TF
BS 740 740 RR4CZ77JQ
BS 741 787 RR4FO13TF
BS 788 808 RR4CZ77JQ

RD RR4CZ77TF 704 0 0
GGGTGTGT
TTGTTGGAA*GCTAAAATCGAGAGATGGCGGGAGATGAAGAGATTGAGATTTACGAAGAA
GGAGAGGAGGAATCCATTGAAGCGAAAACTGAGGGAGGAGATGATGAGAAGGTGTTGCAG
TTTTTAGATTCGTTGGATGGGTATCTAACGCTTATGGATTCTCTCAATTCAAAGCTACGA
GAGGGATGGTTTGATCTAGCAAGTGCTCGACACTCTATGGGAACTTTACGTATCACCAGC
ACCCTCTTAGACCTCAAGGATCATTCCGCTGCTTCCACATTGCAAGTCTCTGACCAAGAT
GTTGAATCTTTGGGACCAGTACCTCGTTTTGCTTTGTCCAAGTGGGCTTCTAAGGGGGGC
AGTGGGAAAGGCAAAGACTTCTCTACTGATGCAGATTTCGAGATGGGCTCTCCTCGTTCC
CCACAGCTACGGCATCGAGGCGTTTCTGAAGAGAAACCATCACCCAAGGGTGAGACCACC
GTGTTAGCAGCTGATGAAGAGGTTAAGAAAGAACGGGCCAAGTCTCTGTCGGTATTCGGA
GGTCTAGTCTCCCCTAAGCTGCGTGGTGCTCAACTTTCATTTGAGACAGCTCTTGAAACT
CTTGTGGAAATAGCCAACACACGATCATCCATGTTAGCTGCCTTTGAGCGGATCACGAAG
AAGTAAAGACAGAATGTGCCAATGCGTTAGTTCAAT

QA 9 704 9 704
DS 

RD RR4FO13TF 788 0 0
GGACTCTTGTGTTTGTTGGAAAGCTAAAATCGAGAGATGGCGGGAGATGAAGAGATTGAG
ATTTACGAAGAAGGAGAGGAGGAATCCATTGAAGCGAAAAATGAGGGAGGAGATGATGAG
AAGGTGTTGCAGTTTTTAGATTCGTTGGATGGGTATCTAACGCTTATGGATTCTCTCAAT
TCAAAGCTAAGAGAGGGATGGTTTGATCTAGCAAGTGCTCGACACTCTATGGGAACTTTA
CGTATCACCAGCACTCTCTTAGACCTCAAGGATCATTCCGCTGCTTCCACATTGCAAGTC
TCTGACCAAGATGTTGAATCTTTGGGACCAGTACCTCGTTTTGCTTTGTCCAAGTGGGCT
TCTAAGGGCGGCAGTGGGAAAGGCAAAGACTTCTCTACTGATGCAGATTTCGAGATGGGC
TCTCCTCGTTCCCCACAGCTACGGCATCGAGGCGTTTCTGAAGAGAAACCATCACCCAAG
GGTGAGACCACCGTGTTAGCAGCTGAT*AAGAGGTTAAGAAAGAACGGGCCAAGTCTCTG
TCGGTATTCGGAGGTCTAGTCTCCCCTAAGCTGCGTGGTGCTCAACTTTCATTTGAGACA
GCTCTTGAAACTCTTGTGGAAATAGCCAACACACGATCATCCATGTTAGCTGCCTTTGAG
CGGATCACGAAGAAGTAAAGACAGAATGCGCCAATGCGTTAGTTCAATTTTTGAGTT*GT
A*CTACCACATTCTGTGTA*TACACAAGTATCTATTTTGATCAGAATTGCTTGCTTTACA
GCACCAA
T

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4CZ77JQ 801 0 0
GGGTGTGTTGTTGGAAGCT
AAATCGAGAGATGGCGGGAGATGAAGAGATTGAGATTTACGAAGAAGGAGAGGAGGAATC
CATTGAAGCGAAAACTGAGGGAGGAGATGATGAGAAGGTGTTGCAGTTTTTAGATTCGTT
GGATGGGTATCTAACGCTTATGGATTCTCTCAATTCAAAGCTACGAGAGGGATGGTTTGA
TCTAGCAAGTGCTCGACACTCTATGGGAACTTTACGTATCACCAGCACCCTCTTAGACCT
CAAGGATCATTCCGCTGCTTCCACATTGCAAGTCTCTGACCAAGATGTTGAATCTTTGGG
ACCAGTACCTCGTTTTGCTTTGTCCAAGTGGGCTTCTAAGGGGGGCAGTGGGAAAGGCAA
AGACTTCTCTACTGATGCAGATTTCGAGATGGGCTCTCCTCGTTCCCCACAGCTACGGCA
TCGAGGCGTTTCTGAAGAGAAACCATCACCCAAGGGTGAGACCACCGTGTTAGCAGCTGA
TGAAGAGGTTAAGAAAGAACGGGCCAAGTCTCTGTCGGTATTCGGAGGTCTAGTCTCCCC
TAAGCTGCGTGGTGCTCAACTTTCATTTGAGACAGCTCTTGAAACTCTTGTGGAAATAGC
CAACACACGATCATCCATGTTAGCTGCCTTTGAGCGGATCACGAAGAAGTAAAGACAGAA
TGTGCCAATGCGTTAGTTCAATTTTTGAGTTTGTAACTACCACATTCTGTGTAATACACA
AGTATCTATTTTGATCAGAATTGCTTGCTTTACAGCACCAAATAATATACACAACATTTT
GG

QA 20 801 20 801
DS 



AS 1 3

CO CL4447Contig1 1045 3 16 U
CGATTATATTTTACAGATTCTTCTAATCTTCCCCTTAATTATACATTAAAAGATCAGCCT
GAGCCAGAGAAAAAAAAAACACCAAAACGAATACATAGATTTGGACTCTTTATATACAAA
AGACTAACCTGAATAATAAGTCAACAAAACACAGGCAAACGGTAACTGATCTTCAACTTC
CTCCTCCCTCTCACTCTCACTCTCTCAGGAAAGGATGATAAAACACTAAAGATATTTAAC
AATATTCCATTTGCTTCAAAATGGTGGTGGTCGTACTAGTAATCAAATCCTTCTCAGTTA
GGCCCCTGGTGGTGAACAAACGACGGAATCTCTCTATATACACACTTGTCCCTCTCGTCT
ACTTTAAGCCATGGCAGGAATGCCCGAGTTTTGGTTCAAGCATTCAAATCCTTCGACTCT
AACCGCAGGTGGTTTGAGCCCAAATTTCATCCTAACGCAGCCACGAGACGATGATGCTGA
CGAGGAAAAAAAAAAAGCTGATGGAGATGGAAACGCGGTTGCTGAATTGGGCTGAAGGAA
AGGAGAGTTTGGTGAGACGGGACTGAGTTTCTCGACGTCGCGAAAGCGAGCATCTTGAGC
TAATGGGTTCGCTGCTCTGCTCGGAGGTGAACCGGGGAAATACGGTGATGAAGATACAGG
TGATGATGATAGTAACTGCCTTATTGGTCCATTATTATTATCCTCCTTTCTACGAATGAT
GTCTAAAAGCTCAGCACCAGCTTTGGAATCACACAAATCAGCTGCAGCTTGACTCATGTG
TAATCTGAGAGGGCGAATGAGGTTGTGGGTGAGTAAGCATCAAACAACACGTCGTGGCTT
GGGACAAACGACGAGATCCTTGCGTTCGAAACCCATCATCTCGTCGCGAGACATGAAGGC
GTTCTGCTGCTGGAAGTTGCAATGATTCATCTTTTTTTCCTTCACTCTTGATCCACACAA
AGAACGCCTGAGCAAAGATCAGCGAGAGAGGAGAGAGCACGCTGAGAGAGAAGATATGAG
AAACAGAGAGAGGAGAAAATCGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 5 10 10 0 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU55JQ U 1
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RD RR4CU55JQ 824 0 0
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GAGCCAGAGAAAAAAAAAACACCAAAACGAATACATAGATTTGGACTCTTTATATACAAA
AGACTAACCTGAATAATAAGTCAACAAAACACAGGCAAACGGTAACTGATCTTCAACTTC
CTCCTCCCTCTCACTCTCACTCTCTCAGGAAAGGATGATAAAACACTAAAGATATTTAAC
AATATTCCATTTGCTTCAAAATGGTGGTGGTCGTACTAGTAATCAAATCCTTCTCAGTTA
GGCCCCTGGTGGTGAACAAACGACGGAATCTCTCTATATACACACTTGTCCCTCTCGTCT
ACTTTAAGCCATGGCAGGAATGCCCGAGTTTTGGTTCAAGCATTCAAATCCTTCGACTCT
AACCGCAGGGGGTTTGAGCCCAAATTTCATCCTAACGCAGCCACGAAACGATGATGCTGA
CGAGGAAAAAAAAAAAGCTGATGGAGATGGAAACGCGGTTGCTGAATTGGGCTGAAGGAA
AGGAGAGTTTGGTGAGACGGGACTGAGTTTCTCGACGTCGCGAAAGCGAGCATCTTGAGC
TAATGGGTTCGCTGCTCTGCTCGGAGGTGAACCGGGGAAATACGGTGATGAAGATACAGG
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GTCTAAAAGCTCAGCACCAGCTTTGGA*TCACACAAATCAGCTGCAGCTTGACTCATGTG
TA*TCTGAGAGG*CGAATGAGGTTGTGGGTGAGTA
GCATCAACA

QA 1 815 1 815
DS 

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TGAACAAACGACGGAATCTCTCTATATACACACTTGTC**TCTCGTCTACTTTAAGCCAT
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TTTGAGCCCAAATTTCATCCTAACGCAGCCACGAGACGATGATGCTGACGAGGAAAGAA*
****GCTGATGGAGATGGAAACGCGGTTGCTGAATTGGGCTGAAGGAAAGGAGAGTTTGG
TGAGACGGGACTGAGTTTCTCGACGTCGCGAAAGCGAGCATCTTGAGCTAATGGGTTCGC
TGCTCTGCTCGGAGGTGAACCGGGGAAATACGGTGATGAAGATACAGGTGATGATGATAG
TAACTGCCTTATTGGTCCATTATTATTATCCTCCTTTCTACGAATGATGTCTAAAAGCTC
AGCACCAGCTTTGGAATCACACAAATCAGCTGCAGCTTGACTCATGTGTAATCTGAGAGG
GCGAATGAGGTTGTTGGTGAGTAAGCATCCAACAACACGTCGTGGCTTGGGACAAACGAC
GAGATCCTTGCGTTCGAAACCCATCATCTCGTCGCGAGACATGAAGGCGTTCTGCTGCTG
GAAGTTGCAATGATTCATCTTTTTTTCCTTCACTCT*GATCCACACAAAGAACGCCTGAG
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GAGAAAATCGTAT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4CU55TF 755 0 0
GTGGTCGTACTAGTA*TCAAATC*TTCTCAGTTAG**CCCTGGTG*TGAACAAACGACGG
AATCTCTCTATATACACACTTGTCCCTCTCGTCTACTTTAAGCCATGGCAGGAATGCCCG
AGTTTTGGTTCAAGCATTCAAATCCTTCGACTCTAACCGCAGGTGGTTTGAGCCCAAATT
TCATCCTAACGCAGCCACGAGACGATGATGCTGACGAGGAAGAAGAAGAAGCTGATGGAG
ATGGAAACGCGGTTGCTGAATTGGGCTGAAGGAAAGGAGAGTTTGGTGAGACGGGACTGA
GTTTCTCGACGTCGCGAAAGCGAGCATCTTGAGCTAATGGGTTCGCTGCTCTGCTCGGAG
GTGAACCGGGGAAATACGGTGATGAAGATACAGGTGATGATGATAGTAACTGCCTTATTG
GTCCATTATTATTATCCTCCTTTCTACGAATGATGTCTAAAAGCTCAGCACCAGCTTTGG
AATCACACAAATCAGCTGCAGCTTGACTCATGTGTAATCTGAGAGGGCGAATGAGGTTGT
GGGTGAGTAAGCATCAAACAACACGTCGTGGCTTGGGACAAACGACGAGATCCTTGCGTT
CGAAACCCATCATCTCGTCGCGAGACATGAAGGCGTTCTGCTGCTGGAAGTTGCAATGAT
TCATCTTTTTTTCCTTCACTCTTGATCCACACAAAGAACGCCTGAGCAAAGATCAGCGAG
AGAGGAGAGAGCACGCTGAGAGAGAAGATATGAGA

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL4448Contig1 996 3 13 U
GGGATTCTCAAATCTGTACCTGAAAAATCTCAAACTCTCAGATCTGCCAATACCTCTCTC
TTATCGTGACGGTGAAGAGAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAAAAAAATGGCG
GCGGTGACACCCTTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAG
ACCAGCATCATCACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGATACCACCTATCAGGCAACGATT
GGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTATCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCTT
TGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCC
TCTGTTGCTGTCATTGTCTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAG
TGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTTCTCGTGGGTAAC
AAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGT
GATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTA
TTCCGGAAGATTTCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGC
GATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTAATGCGGAGCAACAAAGT
GGTGGCTGTTCGTGCTGATTAATCTTTACTAAAAAAATATATACTTTTAACAGCAACAGA
GTATGGAGATTTTTAAAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACTCTGGTGTAAG
GTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTCTAGCATTCTTTAAGATGTTTTGAGTTCAATATGGA
GATGTGTAATAATGATACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCTCTGTTCTGGTTAG
TGATTACTCAGTTTTTTTCCTACAGCATACACTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY01TF U 1
AF RR4EH23TF U 132
AF RR4EH23JQ C 229
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BS 902 996 RR4EH23JQ

RD RR4BY01TF 756 0 0
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TTATCGTGACGGTGAAGAGAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAAAAAAATGGCG
GCGGTGACACCCTTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAG
ACCAGCATCATCACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGATACCACCTATCAGGCAACGATT
GGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTATCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCTT
TGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCC
TCTGTTGCTGTCATTGTCTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAG
TGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTTCTCGTGGGTAAC
AAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGT
GATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTA
TTCCGGAAGATTTCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAG*C
GATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTA*TGCGGAGCAACAA*GT
GGTGGCTGTTCGTGCTGATTAATCTTTACTAAAAAA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4EH23TF 770 0 0
G
TTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAGACCAGCATCATC
ACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGATACCACCTATCAGGCAACGATTGGGATTGATTTC
TTGTCAAAGACAATGTATCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCTTTGGGATACTGCC
GGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCCTCTGTTGCTGTC
ATTGTCTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAGTGGGTTGAGGAT
GTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTTCTCGTGGGTAACAAAACTGATCTC
GTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGTGATTTTGGAGTT
ATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTATTCCGGAAGATT
TCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGCGATATGGTTGAT
GTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTAATGCGGAGCAACAAAGTGGTGGCTGTTCG
TGCTGATTAATCTTTACTAAAAAAATATATACTTTTAACAGCAACAGAGTATGGAGATTT
TTAAAA*TGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACTCTGGTGTAAGGTAAGAGATTTT
TACTTGGAGTCTCTAGCATTCTTTAAGATGTTTTGAGT*CAATATGGAG

QA 2 770 2 770
DS 

RD RR4EH23JQ 768 0 0
CAGGCAACGATTGGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTATCTTGAGGATAGGACTCTT
CGTCTCCAGCTTTGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTAT
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AACACCTCGAAGTGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTT
CTCGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGAT
AACAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAAC
ATCAAGCCACTATTCCGGAAGATTTCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCA
GCGAAACAAGGCGATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTAATGCG
GAGCAACAAAGTGGTGGCTGTTCGTGCTGATTAATCTTTACTAAAAAAATATATACTTTT
AACAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTAAAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAA
CTCTGGTGTAAGGTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTCTAGCATTCTTTAAGATGTTTTGA
GTTCAATATGGAGATGTGTAATAATGATACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCTC
TGTTCTGGTTAGTGATTACTCAGTTTTTTTCCTACAGCATACACTGTC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 3

CO CL4449Contig1 774 3 2 U
CGAGAGATAGAGTTGCATTTTTTTAAAAAAAACTTTTATACAAACTTAATTGGCAATATA
ATTACAAAATCACAAAGACAGACAGACATAATTATTAAATCTGGCAAAAGAAAATATAAA
ACCACAATCACGATAAAAAAAATATGTATATATCATATCATAAATATTTAGTGGGGAGAA
GACTTTTAGAAAGTTGACTCTTGACAAAGCCATTTTAGGGATTGGTGTTGTGGGCCTGAA
GTAATCCGTTTCGAATCTGTGTTGCCACGTCAGCGACGGCGCCGGGACCGTGAGGAATAA
ACACGGACGAAGATTTGGAGTGAGCTCCGATGTCTCTCATCGTGTCAAAGTACTGAGTCA
TCATCACCATGTCCAACACATCCTTAGCTGACGTCCCCGGCACGTTTCCAGCGAAACCGA
GAACACTGTCTCTGAGACCGTCCACGATAGCTTGTCTCTGGCGAGCGATACCGAGACCAG
AAAGGTACTTGGACTCAGCTTCACCTTCTGCTCTCTTTATCTGAATGATTTTCTCCGCCT
CTGCTTTCTCGTTCGCCGCCACTCTCATCCTCGCCGCGGCGTTGATTTCGTTCATGGCGC
GTTTGACCTGTTGATCAGGCTCGATGTCGATGATAAGGGTTTGAAGGATCTCATAACCAT
AAGCAGTCATGGCTTTGTCTAGCTCTTCTTCCACGGATTTGGCTATTTCATTCTTCTGCT
CGAACACGTCGTCCAAGTTCAGCTTCGGTACACATGCTCTGATCACATCAAGAC


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B712JQ U 1
AF RR4B712TF C 1
AF RR4CR56JQ U 25
BS 1 659 RR4B712JQ
BS 660 774 RR4CR56JQ

RD RR4B712JQ 660 0 0
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ATTACAAAATCACAAAGACAGACAGACATAATTATTAAATCTGGCAAAAGAAAATATAAA
ACCACAATCACGATAAAAAAAATATGTATATATCATATCATAAATATTTAGTGGGGAGAA
GACTTTTAGAAAGTTGACTCTTGACAAAGCCATTTTAGGGATTGGTGTTGTGGGCCTGAA
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AAAGGTACTTGGACTCAGCTTCACCTTCTGCTCTCTTTATCTGAATGATTTTCTCCGCCT
CTGCTTTCTCGTTCGCCGCCACTCTCATCCTCGCCGCGGCGTTGATTTCGTTCATGGCGC
GTTTGACCTGTTGATCAGGCTCGATGTCGATGATAAGGGTTTGAAGGATCTCATAACCA
C

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4B712TF 660 0 0
CGAGAGATAGAGTTGCATTTTTTTAAAAAAAACTTTTATACAAACTTAATTGGCAATATA
ATTACAAAATCACAAAGACAGACAGACATAATTATTAAATCTGGCAAAAGAAAATATAAA
ACCACAATCACGATAAAAAAAATATGTATATATCATATCATAAATATTTAGTGGGGAGAA
GACTTTTAGAAAGTTGACTCTTGACAAAGCCATTTTAGGGATTGGTGTTGTGGGCCTGAA
GTAATCCGTTTCGAATCTGTGTTGCCACGTCAGCGACGGCGCCGGGACCGTGAGGAATAA
ACACGGACGAAGATTTGGAGTGAGCTCCGATGTCTCTCATCGTGTCAAAGTACTGAGTCA
TCATCACCATGTCCAACACATCCTTAGCTGACGTCCCCGGCACGTTTCCAGCGAAACCGA
GAACACTGTCTCTGAGACCGTCCACGATAGCTTGTCTCTGGCGAGCGATACCGAGACCAG
AAAGGTACTTGGACTCAGCTTCACCTTCTGCTCTCTTTATCTGAATGATTTTCTCCGCCT
CTGCTTTCTCGTTCGCCGCCACTCTCATCCTCGCCGCGGCGTTGATTTCGTTCATGGCGC
GTTTGACCTGTTGATCAGGCTCGATGTCGATGATAAGGGTTTGAAGGATCTCATAACCA
C

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4CR56JQ 750 0 0
AAAAAAAACTTTTATACAAACTTAATTGGCAATATAATTACAAAATCACAAAGACGGACA
GACATAATTATTAAATCTGGCAAAAGAAAATATAAAACCACAATCACGATAAAAAAAATA
TGTATATATCATATCATAAATATTTAGTGGGGAGAAGACTTTTAGAAAGTTGACTCTTGA
CAAAGCCATTTTAGGGATTGGTGTTGTGGGCCTGAAGTAATCCGTTTCGAATCTGTGTTG
CCACGTCAGCGACGGCGCCGGGACCGTGAGGAATAAACACGGACGAAGATTTGGAGTGAG
CTCCGATGTATCTCATCGTGTCAAAGTACTGAGTCATCATCACCATGTCCAACACATCCT
TAGCTGACGTCCCCGGAACGTTTCCAGCGAAACCGAAAACACTGTCTCTGAAACCGTCCA
CGATAGCTTGTCTCTGGCGAGCGATACCGAGACCAGAAAGGTACTTGGACTCAGCTTCAC
CTTCTGCTCTCTTTATCTGAATGATTTTCTCCGCCTCTGCTTTCTCGTTCGCCGCCACTC
TCATCCTCGCCGCGGCGTTGATTTCGTTCATGGCGCGTTTGACCTGTTGATCAGGCTCGA
TGTCGATGATAAGGGTTTGAAGGATCTCATAACCATAAGCAGTCATGGCTTTGTCTAGCT
CTTCTTCCACGGATTTGGCTATTTCATTCTTCTGCTCGAACACGTCGTCCAAGTTCAGCT
TCGGTACACATGCTCTGATCACATCAAGAC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

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TCATTCAAGGAAGAATTGACGTTGGATGAAAGGCTCGCGGAATCGAGGGAGATCATCGCC
AAGTACCCTACTCGGATTCCTGTAATTGCTGAGAAGTATTCTAAAACCGATCCGCCTGCA
ATCGAGAAAAAGAAGTTTCTAGTTCCACGAGATATGTCGGTTGGACAATTCATCTATATC
TTGAGTGCTAGGTTACACTTGTCTCCTGGCAAAGCCTTGTTCGTCTTCGTCAACAACACT
CTCCCTCAAACTTCTGCTCTGATGGACTCCGTCTACGAGACTTACAAAGACGAAGATGGA
TTCGTTTACATGTGCTACAGCAGTGAGAAAACCTTTGGTTGATTTGATACACCAAACCAT
GCTTGTACATACACTTCTTTCTTCATAAGCTGTTGTTGTTCACTACTTCATAAGAGACTT
GTAAGCTTATGTTGAGTACTGCTTGTTTTTTACCCTTGAGACTTGGTTCATATGTCGCAA
TTACAATATCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FE01JQ C 1
AF RR4FE01TF U 1
BS 1 551 RR4FE01TF

RD RR4FE01JQ 551 0 0
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TCATTCAAGGAAGAATTGACGTTGGATGAAAGGCTCGCGGAATCGAGGGAGATCATCGCC
AAGTACCCTACTCGGATTCCTGTAATTGCTGAGAAGTATTCTAAAACCGATCCGCCTGCA
ATCGAGAAAAAGAAGTTTCTAGTTCCACGAGATATGTCGGTTGGACAATTCATCTATATC
TTGAGTGCTAGGTTACACTTGTCTCCTGGCAAAGCCTTGTTCGTCTTCGTCAACAACACT
CTCCCTCAAACTTCTGCTCTGATGGACTCCGTCTACGAGACTTACAAAGACGAAGATGGA
TTCGTTTACATGTGCTACAGCAGTGAGAAAACCTTTGGTTGATTTGATACACCAAACCAT
GCTTGTACATACACTTCTTTCTTCATAAGCTGTTGTTGTTCACTACTTCATAAGAGACTT
GTAAGCTTATGTTGAGTACTGCTTGTTTTTTACCCTTGAGACTTGGTTCATATGTCGCAA
TTACAATATCC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4FE01TF 551 0 0
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TCATTCAAGGAAGAATTGACGTTGGATGAAAGGCTCGCGGAATCGAGGGAGATCATCGCC
AAGTACCCTACTCGGATTCCTGTAATTGCTGAGAAGTATTCTAAAACCGATCCGCCTGCA
ATCGAGAAAAAGAAGTTTCTAGTTCCACGAGATATGTCGGTTGGACAATTCATCTATATC
TTGAGTGCTAGGTTACACTTGTCTCCTGGCAAAGCCTTGTTCGTCTTCGTCAACAACACT
CTCCCTCAAACTTCTGCTCTGATGGACTCCGTCTACGAGACTTACAAAGACGAAGATGGA
TTCGTTTACATGTGCTACAGCAGTGAGAAAACCTTTGGTTGATTTGATACACCAAACCAT
GCTTGTACATACACTTCTTTCTTCATAAGCTGTTGTTGTTCACTACTTCATAAGAGACTT
GTAAGCTTATGTTGAGTACTGCTTGTTTTTTACCCTTGAGACTTGGTTCATATGTCGCAA
TTACAATATCC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 3

CO CL4451Contig1 374 3 2 U
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CGCCTAGCCCCACCGCGCTTCCGTCGCCCCGTGGTTTCTACGTCGCCCTCTTATCTTCTT
CTCCTCTCCACCAAGCAATCCGTTGGAGATCCGCTGCTACACCGTCCAATAATCCGAATT
CACCCGCGCCGTTTCAGATCAACACCGTTAGCCTCCGTGAAACCGTTATCTAGACAAAAA
AAAACAAAGGTCGTTACTTTTTGTTTACAATGGAGTGCATGATTGATGAACAGACAATTA
AGAAAGGAGCGGCAAAGACCAAGATGGTCTGGACACTTGGACCAGCGTCTTCATCTGTTG
AGATGATAGAGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK38JQ C 1
AF RR4AK38TF U 1
AF RR4ET12TF U 16
BS 1 235 RR4AK38TF
BS 236 374 RR4ET12TF

RD RR4AK38JQ 235 0 0
GGACCTAACTTCCCAACGTAAAAAAAAAACCTAACCGCCGTCAGAGAGAAAAGAAGTCGT
CGCCTAGCCCCACCGCGCTTCCGTCGCCCCGTGGTTTCTACGTCGCCCTCTTATCTTCTT
CTCCTCTCCACCAAGCAATCCGTTGGAGATCCGCTGCTACACCGTCCAATAATCCGAATT
CACCCGCGCCGTTTCAGATCAACACCGTTAGCCTCCGTGAAACCGTTATCTAGAC

QA 1 235 1 235
DS 

RD RR4AK38TF 235 0 0
GGACCTAACTTCCCAACGTAAAAAAAAAACCTAACCGCCGTCAGAGAGAAAAGAAGTCGT
CGCCTAGCCCCACCGCGCTTCCGTCGCCCCGTGGTTTCTACGTCGCCCTCTTATCTTCTT
CTCCTCTCCACCAAGCAATCCGTTGGAGATCCGCTGCTACACCGTCCAATAATCCGAATT
CACCCGCGCCGTTTCAGATCAACACCGTTAGCCTCCGTGAAACCGTTATCTAGAC

QA 1 235 1 235
DS 

RD RR4ET12TF 359 0 0
GG
GTAAAAAAAAAACCTAACCGCCGTCAGAGAGAAAAGAAGTCGTCGCCTAGCCCCACCGCG
CTTCCGTCGCCCCGTGGTTTCTACGTCGCCCTCTTATCTTCTTCTCCTCTCCACCAAGCA
ATCCGTTGGAGATCCGCTGCTACACCGTCCAATAATCCGAATTCACCCGCGCCGTTTCAG
ATCAACACCGTTAGCCTCCGTGAAACCGTTATCTAGACAAAAAAAAACAAAGGTCGTTAC
TTTTTGTTTACAATGGAGTGCATGATTGATGAACAGACAATTAAGAAAGGAGCGGCAAAG
ACCAAGATGGTCTGGACACTTGGACCAGCGTCTTCATCTGTTGAGATGATAGAGAAG

QA 3 359 3 359
DS 



AS 1 3

CO CL4452Contig1 835 3 5 U
GGAGATGAATAGCAAAATATTCTTTAGTTTTACACAACAATACTACAACTTCAACTCACT
TTTATGAGTCTTTTGCATAAACACAGGCACCACATTTATTTGAATACATATCAAGATAGA
GAATTTATAAGCTAAACAAACTCTTACACTCCACAACAGTTGCTAGTGTTTATGTCTTGA
TCTCTCTTTTCTTGTTCTTCCATTGTATCGCAGAGACTGGACCCTTTTGTCTCGGGTAGA
ATCAAAACGAACAACCCAAAACCAGACATGGCAACTCCGAAAACGGCGAAGGATACTGAT
GGTACATCTCTTCCAATGGAAGCAATGAGCGGACAGAAAGCTCCTCCGACAACAAGAGCC
TGTCTAAACATCATTGTTGCGGAACTTCTCACACAAGTCGGAAACATTTCTACCATATAA
ACCGCCATTAGGTTGAATCCTGTTCTTGCACAGAAAAATGTTGCTAGCTCAAACGCAAAC
GCGATTCCTGTTTTTCCTAAAACGCTGAGAACAAAACATAGCACTCCTGATGCTCCACCG
AGTAATGTATTCACTAGAACAGAGATTCTTCTGCTAAACCTCTCAAATATGAACGGAGTG
ATAATGAAAGTAGGCAACTCCACCACTGCGTTTAGGGTTTCGCTCAAGTAGATGTTGACG
TCTATGTCTCTAGCTGCTAATGGAACTCCGTAGTATGATATTCCCAAACCAAACAATATG
ATCATTACAACCACAATCCTCCGAAGAGCCCAATTTCGGAAGAAGAAGTCCTTAATAGAG
TACCTTGGAGTTCTTTAGATGTTTCTTGCTCCAGGGTACTTAGAAACTAGTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET02JQ U 302
AF RR4FX22JQ U 7
AF RR4ET14JQ U 1
BS 1 254 RR4ET14JQ
BS 255 255 RR4FX22JQ
BS 256 564 RR4ET14JQ
BS 565 565 RR4FX22JQ
BS 566 835 RR4ET14JQ

RD RR4ET02JQ 207 0 0
GTACATCTCTTCCAATGGAAGCAATGACCGGACAGAAAGCTCCTCCGACAACAAAAGCCT
GTCTAAACATCATTGTTGCGGAACTTCTCACACAAGTCGGAAACATTTCTACCATATAAA
CCGCCATTAGGTTGAATCCTGTTCTTGCACAGAAAAATGTTGCTAGCTCAAACGCAAACG
CGATTCCTGTTTTTCCTAAAACGCTGA

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4FX22JQ 746 0 0
GAATAGCAAAATATTCTTTAGTTTTACACAACAATACTACAACTTCAACTCACTTTTATG
AGTCTTTTGCATAAACACAGGCACCACATTTATTTGAATACATATCAAGATAGAGAATTT
ATAAGCTAAACAAACTCTTACACTCCACAACAGTTGCTAGTGTTTATGTCTTGATCTCTC
TTTTCTTGTTCTTCCATTGTATCGCAGAGACTGGACCCTTTTGTCTCGGGTAGAATCAAA
ACGAACAACCCAAAACCAGACATGGCAACTCCGAAAACGGCGAAGGATACTGATGGTACA
TCTCTTCCAATGGAAGCAATGAGCGGACAGAAAGCTCCTCCGACAACAAGAGCCTGTCTA
AACATCATTGTTGCGGAACTTCTCACACAAGTAGGAAACATTTCTACCATATAAACCGCC
ATTAGGTTGAATCCTGTTCTTGCACAGAAAAATGTTGCTAGCTCAAACGCAAACGCGATT
CCTGTTTTTCCTAAAACGCTGAGAACAAAACATAGCACTCCTGATGCTCCACCGAGTAAT
GTATTCACTAGAACAGAGATTCTTCTGCTAAACCTCTCCAATATGAACGGAGTGATAATG
AAAGTAGGCAACTCCACCACTGCGTTTAGGGTTTCGCTCAAGTAGATGTTGACGTCTATG
TCTCTAGCTGCTAATGGAACTCCGTAGTATGATATTCCCAAACCAAACAATATGATCATT
ACAACCACAATCCTCCGAAGAGCCCA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4ET14JQ 835 0 0
GGAGATGAATAGCAAAATATTCTTTAGTTTTACACAACAATACTACAACTTCAACTCACT
TTTATGAGTCTTTTGCATAAACACAGGCACCACATTTATTTGAATACATATCAAGATAGA
GAATTTATAAGCTAAACAAACTCTTACACTCCACAACAGTTGCTAGTGTTTATGTCTTGA
TCTCTCTTTTCTTGTTCTTCCATTGTATCGCAGAGACTGGACCCTTTTGTCTCGGGTAGA
ATCAAAACGAACAATCCAAAACCAGACATGGCAACTCCGAAAACGGCGAAGGATACTGAT
GGTACATCTCTTCCAATGGAAGCAATGAGCGGACAGAAAGCTCCTCCGACAACAAGAGCC
TGTCTAAACATCATTGTTGCGGAACTTCTCACACAAGTCGGAAACATTTCTACCATATAA
ACCGCCATTAGGTTGAATCCTGTTCTTGCACAGAAAAATGTTGCTAGCTCAAACGCAAAC
GCGATTCCTGTTTTTCCTAAAACGCTGAGAACAAAACATAGCACTCCTGATGCTCCACCG
AGTAATGTATTCACTAGAACAGAGCTTCTTCTGCTAAACCTCTCAAATATGAACGGAGTG
ATAATGAAAGTAGGCAACTCCACCACTGCGTTTAGGGTTTCGCTCAAGTAGATGTTGACG
TCTATGTCTCTAGCTGCTAATGGAACTCCGTAGTATGATATTCCCAAACCAAACAATATG
ATCATTACAACCACAATCCTCCGAAGAGCCCAATTTCGGAAGAAGAAGTCCTTAATAGAG
TACCTTGGAGTTCTTTAGATGTTTCTTGCTCCAGGGTACTTAGAAACTAGTGATC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 3

CO CL4453Contig1 560 3 4 U
GATCTTTTGATACAGAGAAGGAGAATCAGGAAGGAAGAAGAAGAAGATGTCGTTGGTGTG
GCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTCTGTATTATGGGGAACTC
TCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATG
GGATGTTGCTATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCGTC
ATGATCCGATCCGGTCAGGTAGAGGCGTCAGGTGAACAACTTGTGGTCACAAATAAAGTT
TATTCCAGAAGAAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCTAATACTGTTTTTCCCGTTTGATTTTT
CTTGGAGACAAAGTTCGGATAAAGCTTTTCAAGTTTGAAAACCTTTTTTTTTTCTTTCTG
CTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACCTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTGT
TTGGGAGACATGTTAATTAAGTTGCATGACATTTGGTATACAACACACTTCTTGCTGTGT
GAATGAATAATAATCTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR4BK89JQ C 1
AF RR4BK89TF U 342
AF RR4A465TF U 112
BS 1 111 RR4BK89JQ
BS 112 342 RR4A465TF
BS 343 556 RR4BK89TF
BS 557 560 RR4A465TF

RD RR4BK89JQ 558 0 0
GATCTTTTGATACAGAGAAGGAGAATCAGGAAGGAAGAAGAAGAAGATGTCGTTGGTGTG
GCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTCTGTATTATGGGGAACTC
TCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATG
GGATGTTGCTATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCGTC
ATGATCCGATCCGGTCAGGTAGAGGCGTCAGGTGAACAACTTGTGGTCACAAATAAAGTT
TATTCCAGAAGAAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCTAATACTGTTTTTCCCGTTTGATTTTT
CTTGGAGACAAAGTTCGGATAAAGCTTTTCAAGTTTGAAAACCTTTTTTTTTTCTTTCTG
CTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACCTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTGT
TTGGGAGACATGTTAATTAAGTTGCATGACATTTGGTATACAACACACTTCTTGCTGTGT
GAATGAATAATAATCT
CG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4BK89TF 217 0 0
T
TTTTCCCGTTTGATTTTTCTTGGAGACAAAGTTCGGATAAAGCTTTTCAAGTTTGAAAAC
CTTTTTTTTTTCTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACCTTAATGACATTTGGTTTA
TAACTTGTCTCCATTTGTTTGGGAGACATGTTAATTAAGTTGCATGACATTTGGTATACA
ACACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCT
CG

QA 2 215 2 215
DS 

RD RR4A465TF 449 0 0
GGGGAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCA
CGATGAATGGGATGTTGCTATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGCCTCAGC
TCCTTCGTCATGATCCGATCCGGTCAGGTAGAGGCGTCAGGTGAACAACTTGTGGTCACA
AATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCTAATACTGTTTTTCC*GT
TTGATTTTTCTTGGAGACAAAGTTCGGATAAAGCTTTTCAAGTTTGAAAACCTTTTTTTT
TTCTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACCTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTC
TCCATTTGTTTGGGAGACATGTTAATTAAGTTGCATGACATTTGGTATACAACACACTTC
TTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTGAG

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 3

CO CL4454Contig1 761 3 21 U
GGGAATGTGACGTGAATCAGATCTGTCTCTATCCTGTCTCAACCTTCGAATAATCCAAAG
GGCTCTTCTTATTGAAAAATGGCAGACACGAAACCCGGGTTGAGAAAGCCAGCTTTCACT
AAGGTCGATCAACTGCGTCCTGGGACTAGTGGACACAATGTCACCGTTAAGATCGTTAGC
ACCGAGGTGGTGTTACAAAAAGGTCGTGTAGATGGTCCTCAGGCTCGCCAGATGCGCATT
TCTGAATGCATTGTCGGAGACGAGACTG*AGTTGTGGTCTTCACCGCAAGAAATGACCAA
GTGGACTTAATGAAAGAAGGAACCACTGTAACTCTACGCAATGCAAAAATCGACATGTAT
AAAGGATCAATGAGGCTAGCTGTGGACAAGTGGGGTCGCGTTGAAGTCACTGAGCCTGCG
AGCTTCAAAGTGAAAGAAGACACCAACATGTCACTTGGCGAGTATGAGCTTGTTGATGCT
GTCGAATGAGTGACAAAAATACCAATTTGTTTTCCCTCGAGAGATACTGATGATCAGTAA
TAATAAAGGAAGTAAATCTTAACTGTTGGTGTTGACGTCAAGAAAGAGTTAACCTACGTC
AAGAAAGAGTTAACCTGATATCTCTCTATCTTGCACAAAGCTATGGAAGAGTCAGATGCC
TCTATAAAAGTGAATGCATAGTTTTTTTGGTTTAAGTTGCGTTGATTTGTTGATTATGAC
TTTGTTACAGCCTTTCTTTTGCAAATGTCGACATAATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4A431TF U 1
AF RR4D938JQ C 23
AF RR4D938TF U 23
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TAATAAAGGAAGTAAATCGTAACTGTTGGTGTTGACGTCAAGAAAGAGTTAACCTACGTC
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TG

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QA 4 739 4 739
DS 



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BQ
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AF RR4BU20JQ U 1
AF RR4BZ57JQ U 1
AF RR4BZ57TF C 1
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CACATAGATACCATCAAGGAACTTCCTAATATCCTTCTTCTTCACATGGCATTTCTGATT
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CACATAGATACCATCAAGGAACTTCCTAATATCCTTCTTCTTCACATGGCATTTCTGATT
AATCAGAGCGCAAGAACGCGAGACAAGCTCGATATCATTACCCTCAAGAGTAATCTCATC
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CTTCTCGCCGAGGAAGTTACGGATCTCGATGGACTTGTTGTCGCCGGAGATGGAAGCGTT
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GATGAGATTGCTGACGTGGCTCAGAGCGGTCCTC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 3

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TTATGGTTGTGATTTCATGACTGATTTTAATATAATGTTTTTTTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD49TF U 1
AF RR4EL29TF U 4
AF RR4EL29JQ C 172
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BS 470 497 RR4BD49TF
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BS 754 754 RR4EL29TF
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BS 827 885 RR4EL29JQ

RD RR4BD49TF 799 0 0
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CCGCAAGAAGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCAGGACC
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ACAATATAATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGA
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AGACCAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCCACACCGCCAAAATCAGACGA
GTCACCAACATCGCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACC
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GACCTTTTCTAATTAATTG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4EL29TF 831 0 0
G
ACCTAACAAAAGAAGTAGTATACGCACTTTCAAAAAAACAATATATCAATAATGAAGCAA
TATATATTTCTTTCTGTCTTGGTACTACTATCCTCTTCATTTGCACCCATCCACGCCCAC
AAGAAGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCATGACCATCA
AATTCTGATTGCTCGAGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCACCCCC
GGATCAAATGATACTAGACCTACGAAAGTGTGTTTTGGGGGAATCCTATCTGTTTTACAA
TATAATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGAAATT
AATAATACTAGAGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCCGCAC
TGTGCTATACCGGGCGCGTCAGTACCGGGTGCATCTACTCCTGCAGTTTCGCCATCAGCT
GGAACACCTATGATTTCACCATCTTCAGACAAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGAC
CAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTCA
CCAACATCGCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCGACA
TCTTTACCAGAGTCACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTCGGGCAC*AACCAG
CTCCTAGTTTCA*CACTGACACTCTTTGCCGTTATCGTATCTACAACATACATT*CGAC*
TTTTCTAATTAATTGTTTTTT*CACATTTCATATATTTTTTT
ACTGAGTA

QA 2 823 2 823
DS 

RD RR4EL29JQ 714 0 0
GCCATGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATC
GTACATCACCCCCGGATCAAATGATACTAGACCTACGAAAGTGTGTTTTGGGGGAATCCT
ATCTGTTTTACAATATAATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATAT
GGGGATTGAAATTAATAATACTAGAGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCAT
TGCTGCTCCGCACTGTGCTATACCGGGCGCGTCAGTACCGGGTGCATTTACTCCTGCAGT
TTCGCCATCAGCTGGAACACCTATGATTTCACCATTTTCAGACAAGTCACCAACATCATC
GCCAAAATCAGACCAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCCACATCGCCAAA
ATCAGACGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGA
CGGGTCACCGACATCTTTACCAGAGTCACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTC
GGGCACCAACCAGCTCCTAGTTTCAACACTGACACTTTTTGCCGTTATCGTATTTACAAC
ATACATTTCGACCTTTTTTAATTAATTGTTTTTTTCACATTTCATATATTTTTTTTACTG
AGTTATATTTTATGGTTGTGATTTCATGACTGATTTTAATATAATGTTTTTTTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 3

CO CL4457Contig1 918 3 14 U
GGTGTAATCTCGTCATATGTAGGAATGATTCGAAGAACCTAACCACAATCTTCTTCTTAA
CTGTCTCTCCAAAAATGGTCACACAATCATGTTTAGTTCTTCTGTACTCAAAAAATTTAT
CACAAGGAAGAATCTTATATATATAGACTACTAATGCACAATCTCGTTTGTTATATCCCT
CCCTTCACACCATATGGCTACCTGATCTTGATATCCTTTGTGCTTCTTCCAAGTCCATGA
GAAACCTCTTGGAGTTAAGCACTGCGGTGCCGCCGAGAATAAACCGAATCCCGGAGTTGG
TCGAGTTTTGTAGAGCAACGCAGCGTGATTCCTCGTACGTTGTTCCACCGACCATGAATA
TCACCACCTCTTGTGGCCGTCCCTGTTGAAAGTGATCTCCAACAAAAGGGTAATCCACAT
CTCGTAATCTCCCTCTGGTTATGCTCTCCATTGTTTGAAACAGAAGTGGCTGATGTTGAG
TGTACACATTCTCAACCCTCTTAAGTCCACGAGCCATGTTGCGTGCTATATTCAGAAGAT
CTCTATTCCCAAACAGATCACCAGTTCGCTTCTCTACTTCGGCTTGTTTCAAGAGAAATT
GAACAAGCCCTTGTTTGTACTTGGGAGACCGTGAAGCCAATTTGTTGAACAGTTGCATCA
ACTGAACAGGATTCTCTTTCTCATAGCGCAGAGCATATAGCATCACCAAACGTAGCCGGT
CGATGTCAGACACACTTTCATTGTTTAAGAGATCCGTAACTGCCTCATACGCAGCTCCTT
GGCCACCATTACAAGCCAAGTCCTGCTCTGTCTGTGAAACCAGCATCAGTTTCCTTGCTT
CAACTAGCTTGCTCATTTCAGTAACCAGGGTCACATGATTTGAGACGTTGCCCTGCATCT
TTTTGTACTCAGGGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK74JQ U 1
AF RR4E047JQ U 32
AF RR4E047TF C 222
BS 1 181 RR4AK74JQ
BS 182 182 RR4E047JQ
BS 183 372 RR4AK74JQ
BS 373 373 RR4E047JQ
BS 374 498 RR4AK74JQ
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BS 771 827 RR4AK74JQ
BS 828 918 RR4E047TF

RD RR4AK74JQ 827 0 0
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CTGTCTCTCCAAAAATGGTCACACAATCATGTTTAGTTCTTCTGTACTCAAAAAATTTAT
CACAAGGAAGAATCTTATATATATAGACTACTAATGCACAATCTCGTTTGTTATATCCCT
CTCTTCACACCATATGGCTACCTGATCTTGATATCCTTTGTGCTTCTTCCAAGTCCATGA
GAAACCTCTTGGAGTTAAGCACTGCGGTGCCGCCGAGAATAAACCGAATCCCGGAGTTGG
TCGAGTTTTGTAGAGCAACGCAGCGTGATTCCTCGTACGTTGTTCCACCGACCATGAATA
TCACCACCTCTTATGGCCGTCCCTGTTGAAAGTGATCTCCAACAAAAGGGTAATCCACAT
CTCGTAATCTCCCTCTGGTTATGCTCTCCATTGTTTGAAACAGAAGTGGCTGATGTTGAG
TGTACACATTCTCAACCCCCTTAAGTCCACGAGCCATGTTGCGTGCTATATTCAGAAGAT
CTCTATTCCCAAACAGATCACCAGTTCGCTTCTCTACTCCGGCTTGTTTCAAGAGAAATT
GAACAAGCCCTTGTTTGTACTTGGGAGACCGTGAAGCCAATTTGTTGAACAGTTGCATCA
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GGCCACCATTACAAGCCAAGTCCTGCTCTGTCTGTGAAACCAGCATC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4E047JQ 757 0 0
CC
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TAGTTCTTCTGTACTCAAAAAATTTATCACAAGGAAGAATCTTATATATATAGACTACTA
ATGCACAATCTCGTTTGTTATATCCCTCCCTTCACACCATATGGCTACCTGATCTTGATA
TCCTTTGTGCTTCTTCCAAGTCCATGAGAAACCTCTTGGAGTTAAGCACTGCGGTGCCGC
CGAGAATAAACCGAATCCCGGAGTTGGTCGAGTTTTGTAGAGCAACGCAGCGTGATTCCT
CGTACGTTGTTCCACCGACCATGAATATCACCACCTCTTGTGGCCGTCCCTGTTGAAAGT
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CTACTTCGGCTTGTTTCAAGAGAAATTGAACAAGCCCTTGTTTGTACTTGGGAGACCGTG
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CCGTAACTGCCTCATACGCAGCTCCTTGGCCACCA

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR4E047TF 697 0 0
GTGCTC
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GGGTAATCCACATCTCGTAATCTCCCTCTGGTTATGCTCTCCATTGTTTGAAACAGAAGT
GGCTGATGTTGAGTGTACACATTCTCAACCCTCTTAAGTCCACGAGCCATGTTGCGTGCT
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TTCAAGAGAAATTGAACAAGCCCTTGTTTGTACTTGGGAGACCGTGAAGCCAATTTGTTG
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AAACGTAGCCGGTCGATGTCAGACACACTTTCATTGTTTAAGAGATCCGTAACTGCCTCA
TACGCAGCTCCTTGGCCACCATTACAAGCCAAGTCCTGCTCTGTCTGTGAAACCAGCATC
AGTTTCCTTGCTTCAACTAGCTTGCTCATTTCAGTAACCAGGGTCACATGATTTGAGACG
TTGCCCTGCATCTTTTTGTACTCAGGGTAGC

QA 7 697 7 697
DS 



AS 1 3

CO CL4458Contig1 905 3 2 U
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CGTGGTAGCTTAGAGAATCATCTTTTCAGGAGAGGGTTATATTTCCAACCGTTATCTTGG
AAACTCCGGTTGAAAGTAGCTCTTGGTGCTGCGAAGGGACTTGCCTTTCTTCACAGCTCC
GAGACAAGAGTGATATACAGAGACTTCAAGACTTCTAACATCCTTCTTGATTCGGATTAC
TACGCAAAGCTTTCTGATTTTGGGTTGGCCAAGGATGGGCCAATAGGAGATGAAAGCCAT
GTCTCTACAAGAGTCATGGGTACACATGGATATGCAGCTCCTGAGTACCTCGCAACCGGT
CATCTAACAACAAAGAGTGATGTCTATAGCTTCGGGGTTGTCCTTCTGGAGCTGTTGTCT
GGTCGTAGAGCCGTGGACAGAAACAGACCATCGGTAGAGAGGAACCTTGTGGATTGGGCT
AAACCATACCTTGCAAACAAAAGAAAGATATTCAGAGTGGTCGATAATCGTCTTCAGGAT
CAGTACTCTATGGAAGAAGCATGTAAAGTGGCTACTCTGTCTCTGAGGTGTCTCACTACG
GAGATTAAGCTCAGACCAAACATGAGAGAAGTGGTTTCGCAGCTTGAGCATATTCAGTCT
CTAAATGCGTCTAGAGGAGGAAACGTGGATAGGACGGAGAGAAGAAGAGTGCGTATGAGA
AGTGACAGTGTTGTTACCAAAAAACCTGATGCAGTTTTGTTCGGCAGACCGCTGTGGGCT
GTACAGTTGTTGCTTATCCTCGCCCGTCGCCTCACCGCTGTGTGTCTGAGAATAATAACA
CGTCTGTGTTCTGATAGGACATGTAAGTTCTGATATCATGTCATGTGTATGTGATTCGGA
TGTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4A201TF U 1
AF RR4A201TFB U 1
AF RR4AI06TF U 1
BS 1 713 RR4A201TF
BS 714 905 RR4AI06TF

RD RR4A201TF 713 0 0
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QA 1 713 1 713
DS 

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CGTGGTAGCTTAGAGAATCATCTTTTCAGGAGAGGGTTATATTTCCAACCGTTATCTTGG
AAACTCCGGTTGAAAGTAGCTCTTGGTGCTGCGAAGGGACTTGCCTTTCTTCACAGCTCC
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TACGCAAAGCTTTCTGATTTTGGGTTGGCCAAGGATGGGCCAATAGGAGATGAAAGCCAT
GTCTCTACAAGAGTCATGGGTACACATGGATATGCAGCTCCTGAGTACCTCGCAACCGGT
CATCTAACAACAAAGAGTGATGTCTATAGCTTCGGGGTTGTCCTTCTGGAGCTGTTGTCT
GGTCGTAGAGCCGTGGACAGAAACAGACCATCGGTAGAGAGGAACCTTGTGGATTGGGCT
AAACCATACCTTGCAAACAAAAGAAAGATATTCAGAGTGGTCGATAATCGTCTTCAGGAT
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CTAAATGCGTCTAGAGGAGGAAACGTGGATAGGACGGAGAGAAGAAGAGTGCG
TACGAGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4AI06TF 905 0 0
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AAACCATACCTTGCAAACAAAAGAAAGATATTCAGAGTGGTCGATAATCGTCTTCAGGAT
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AGTGACAGTGTTGTTACCAAAAAACCTGATGCAGTTTTGTTCGGCAGACCGCTGTGGGCT
GTACAGTTGTTGCTTATCCTCGCCCGTCGCCTCACCGCTGTGTGTCTGAGAATAATAACA
CGTCTGTGTTCTGATAGGACATGTAAGTTCTGATATCATGTCATGTGTATGTGATTCGGA
TGTAC

QA 1 905 1 905
DS 



AS 1 3

CO CL4459Contig1 670 3 1 U
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GACAATAACCAAGAGTCTCAAGACATCAATTCAACCACCTTATTACTACTAGCAGTCACA
CTAGTTTCACAGAGCAAAGACGAAACAAAGTGCGAGCCCAGATGGAGGGAGGGACAGAGA
AGTTTCACACATCACAAGTATACATTATTATTATTATCACAAGGTTGCATCCCCCGGTGC
GAACTTGAGGGAGACACTATTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAACCTTC
TCCTTTGAAAACATGTCCAAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCTATTCTTCT
CCCGTCTGGATCCGCGGTTCGGTTAATGGCCCCTGGGATGCCGTCAAAGAAAGCAGGCCA
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GCTATAGATCCCGTCTGCGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGCC
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CTTGTTAACCGATCCGGGGGCTGAAGATGCCATTGCTGTGATACGACGACCACCGCGAAA
ACCTCGACGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FR44JQ U 61
AF RR4FM83JQ U 1
AF RR4FM83TF C 1
BS 1 670 RR4FM83JQ

RD RR4FR44JQ 590 0 0
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CTAGTTTCAAATAGCAAGACAAAAACAAAGTGCGAGCCCAGATGGAGGGAGGGACAGAAA
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GAACTTGAGGGAGACACTGTTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAACCTTC
TCCTTTGAAAACATGTCCAAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCTATTCGTCT
CCCGTCTGGATCCGCGGTTCGGTTAATGGCCCCTGGGATGCCGTCAAAAAAAGCAGGCCA
GCCACAGCCAGAGTCGAACTTGGTGGCGGATTTGTATAGAGGAGTCCCACATCCTGCACA
GCTATAGATCCCGTCTGCGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGCC
TTTCTGCCTGAGGATCCTGAATTGCTCAGGGGAGAGAATCGCACGCCACTCTTCCTCTGG
CTTGTTAACCGATCCGGGAGCTGAAGATGCCATTGCTGTGATACGACGAC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4FM83JQ 670 0 0
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AGTTTCACACATCACAAGTATACATTATTATTATTATCACAAGGTTGCATCCCCCGGTGC
GAACTTGAGGGAGACACTATTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAACCTTC
TCCTTTGAAAACATGTCCAAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCTATTCTTCT
CCCGTCTGGATCCGCGGTTCGGTTAATGGCCCCTGGGATGCCGTCAAAGAAAGCAGGCCA
GCCACAGCCAGAGTCGAACTTGGTGGCGGATTTGTATAGAGGAGTCCCACATCCTGCACA
GCTATAGATCCCGTCTGCGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGCC
TTTCTGCCTGAGGATCCTGAATTGCTCAGGGGAGAGAATCGCACGCCACTCTTCCTCTGG
CTTGTTAACCGATCCGGGGGCTGAAGATGCCATTGCTGTGATACGACGACCACCGCGAAA
ACCTCGACGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4FM83TF 670 0 0
AGTCGAGAAACAAGAGTGATTCGAGTCAT*CCTAAGAAACATTATTCACCAATCTTATAT
GACAATAACCAAGAGTCTCAAGACATCAATTCAACCACCTTATTACTACTAGCAGTCACA
CTAGTTTCACAGAGCAAAGACGAAACAAAGTGCGAGCCCAGATGGAGGGAGGGACAGAGA
AGTTTCACACATCACAAGTATACATTATTATTATTATCACAAGGTTGCATCCCCCGGTGC
GAACTTGAGGGAGACACTATTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAACCTTC
TCCTTTGAAAACATGTCCAAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCTATTCTTCT
CCCGTCTGGATCCGCGGTTCGGTTAATGGCCCCTGGGATGCCGTCAAAGAAAGCAGGCCA
GCCACAGCCAGAGTCGAACTTGGTGGCGGATTTGTATAGAGGAGTCCCACATCCTGCACA
GCTATAGATCCCGTCTGCGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGCC
TTTCTGCCTGAGGATCCTGAATTGCTCAGGGGAGAGAATCGCACGCCACTCTTCCTCTGG
CTTGTTAACCGATCCGGGGGCTGAAGATGCCATTGCTGTGATACGACGACCACCGCGAAA
ACCTCGACGC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL4460Contig1 887 3 12 U
GGACATACACACAATATAAATACTCCTCTCAACGTACCAAAAATATCATCAACTCCCCAT
AACATAAAATCATCACATTTCCTAACCAATTCGAAGATATGTCCATATAGATGGGTTCCG
ATGAAATCAAATCGACGTTGGACACGGAGAAATCAACCGTGCCAGGAGGAAGCTGCACCA
CGTCAAAGAGTTGTTGGATGGTTCAAGTTGTGCTAAGGTTATTTCTGTTTGCAGCCACTT
TGACATCAATTGTGGTGATGGTTACAAGTAAACAGACCAAGACTATTCCTGGAATTCCCA
TTCCTAGGGAAGCAAAGTTCACACACTCACCGGCTTTTATATACTTTGTGGTAGCATTAT
CGGTGGCTTGCTTTTACAGCATTCTATCTACACTTGCCACCGTATCTGCTTTCAAGAAGC
CTTCATCTTGCTCTGCGATTCTCTTGCTTAATCTTGCCATTATGGACGCGGTGATGGTAG
GTATAGTAGCTTCAGCGACCGGAGCATCAGGTGGAGTAGCGTACATTGGTCTGAAGGGCA
TCAAATACGTACAGTGGAGAGAAATCTGTGATTTCTACGACACGTTTTGCCGTCACGTCG
GAGGCGCAGTCGCAGTCTCACTGGTTTCTTCTATCCTTCTCCTCCTCCTCTCCATCATCT
CTGTCCTCTCCCTCTACAAGAGAATCCGCTGATTCATTCTCTCTGTCTTTGAATCTTTCA
TAGTCAACTCATATTGATCTCATTCTTGGTTTTGCTTTGGTGATCTGTCGAAGTTAATCT
TTGTGTTTTTTAATTCTAGTAGTGTTGTCTTGTTTTCTTTGATTTTGTATAATTGTGTGT
TTAGTTTATTTGTAAACCGATTTTTTAGTGAATATTTCCTTCATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G830TF U 43
AF RR4BF60TF U 1
AF RR4G830JQ C 435
BS 1 98 RR4BF60TF
BS 99 99 RR4G830TF
BS 100 424 RR4BF60TF
BS 425 425 RR4G830TF
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BS 628 803 RR4BF60TF
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RD RR4G830TF 711 0 0
GG
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ATATAGATGGGTTCCGATGAAATCAAATCGACGTTGGACACGGAGAAATCAACCGTGCCA
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CTCCTCTCCATCATCTCTGTCCTCTCCCTCTACAAGAGAATCCGCTGATTCATTCTCTCT
GTCTTTGAATCTTTCATAGTCA*CTCATATTGATCTCATTCTTGGTTTT

QA 3 711 3 711
DS 

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CGGTGGCTTGCTTTTACAGCATTCTATCTACACTTGCCACCGTATCTGCTTTCAAGAAGC
CTTCCTCTTGCTCTGCGATTCTCTTGCTTAATCTTGCCGTTATGGATGCGGTGATGGTAG
GTATAGTAGCTTCAGCGACCGGAGCATCAGGTGGAGTAGCGTACATTGGTCTGAAGGGCA
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GAGGCGCAGTCGCAGTCTCACTGGTTGCTTCTATCCTTCTCCTCCTCCTCTCCATCATCT
CTGTCCTCTCCCTCTACAAGAGAATCCGCTGATTCATTCTCTCTGTCTTTGAATCTTTCA
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TTGTGTTTTTTAATTCTAGTAGT

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DS 

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GCGACCGGAGCATCAGGTGGAGTAGCGTACATTGGTCTGAAGGGCATCAAATACGTACAG
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TACAAGAGAATCCGCTGATTCATTCTCTCTGTCTTTGAATCTTTCATAGTCAACTCATAT
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TCTAGTAGTGTTGTCTTGTTTTCTTTGATTTTGTATAATTGTGTGTTTAGTTTATTTGTA
AACCGATTTTTTAGTGAATATTTCCTTCATAGC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 3

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TGTTTAGTAGAGATTTTGAATTTGTGTCATGTAATCTGTTGTAACCTTTCTATTGCACAT
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ACACTTTCATTATCAATGGGATTAAACGTTTTTGTTGTAAGGATTTGTTGGCTCTTCGTT
TTGTGTCTATGTCAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN06TF U 94
AF RR4FC88TF U 1
AF RR4FC88JQ C 29
BS 1 761 RR4FC88TF
BS 762 798 RR4FC88JQ

RD RR4DN06TF 616 0 0
G
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TCTTCCCAGGAGAAAACCAAAGATAAGGAGCCCGAAGCAAAGGAGAAAGAGGAGTCTACG
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CAGTTGTCTTTAGAA

QA 2 616 2 616
DS 

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TGAAACTGAACAAAAGCAACCAGAGGATACTACACAAACAGAGTCAGAGAAAGAGGAAAG
CAACAAGAATGGTGAGACAGAGGTGGTGGTGACTGAGAACGATCAAGAACATTCTGAGAA
TAGTCTTCCTCAAGAAGTAAAAGATGTTCGTACCGATCTTGAAACTCTGCCAGATTCTGG
TAATGGAGGTAACAGTGATAACGTTGCGGCTGAGTAGATCAAATTCTCTCATTCA**TGT
TGTTTAGTAGAGATTTTGAATTTGTGTCATGTAATCTGTTGTAACCTTTCTATTGCACAT
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QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4FC88JQ 770 0 0
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CAGGGAAATGAAAGTACCGAGAGTGAAAAGAAGGAAGGAGTTGAGGAAACCGAGAAGAAG
TCTGACGAAGGCACTAGTGAAACTGGCAGTACTGAAACTGAACAAAAGCAACCAGAGGAT
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CGTACCGATCTTGAAACTCTGCCAGATTCTGGTAATGGAGGTAACAGTGATAACGTTGCG
GCTGAGTAGATCAAATTCTCTCATTCA**TGTTGTTTAGTAGAGATTTTGAATTTGTGTC
ATGTAATCTGTTGTAACCTTTCTATTGCACATATGGGCTGGTGTCACATTTATTTTATTG
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TTTTTGTTGTAAGGATTTGTTGGCTCTTCGTTTTGTGTCTATGTCAGTCG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 3

CO CL4462Contig1 855 3 5 U
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TTTGCATCAGTGATGGCCACACTTGGATTGCAAATCATCTTGGAATCTCTTCGGACAATG
TTATCCAGTCAAAAGGAGTTCAGCCTAACTAGAGAGCAAGAGAGCTGGGTGGTTGGGATC
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GAGATCGTTAAAGCTTATGCTCAAGACCACTTCTTCGACGTCATCACAAACACATTGGAC
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TTCTTGCACTGTACACGATAAGGACGTGGTCGATGACGGTTTTGGAGAACGTGAACTCTC
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ACCATAAAGAGATTAGGCATATCGACACGGTGAGGGCGTACACGTTTGGATCTCATTACT
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GAGAATCGCTGCAAGAGAAGCTGGAGCTGATGCAGGAGATAGAAAGGGCTTTTGTGCATC
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TTTTAAGTCAACTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GX01TF U 1
AF RR4H191TF U 1
AF RR4H191JQ C 280
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QA 1 712 1 712
DS 

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TTATCCAGTCAAAAGGAGTTCAGCCTAACTAGAGAGCAAGAGAGCTGGGTGGTTGGGATC
ATGCTCTCTGTTACATTGGTCAAACTGCTTCTCGTCCTTTACTGCAGATCCTTCAGTAAC
GAGATCGTTAAAGCTTATGCTCAAGACCACTTCTTCGACGTCATCACAAACACATTGGAC
TCATCGCAGTGATCCTCGCCAACTACATCGATAACTGGATGGATCCAGTTGGATCCATCA
TTCTTGCACTGTACACGATAAGGACGTGGTCGATGACGGTTTTGGAGAACGTGAACTCTC
TAGTTGGGAAAACAGCAACGCCAGAGTATCTGCAGAAACTGGCTTACCTGTGTTGGAACC
ACCATAAAGAGATTAGGCATATCGACACGGTGAGGGCGTACACGTTTGGATCTCATTACT
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TCT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4H191JQ 576 0 0
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GCTTAAGAATCTTCAACCATATTGTTTAGTAGACAAAGTACCTTTGTAACTAGTTTTGTT
GTTCTTCTAGTAAAACTATAATTTTAAGTCAACTAC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 3

CO CL4463Contig1 1319 3 7 U
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GCCTACCTCTGATCTTGGCAAGATTTTGGCCTGTATGCACGGACTCGATGTTGGAGGAGA
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AGCTGCTGCTGCTGCTGGGGGTGGTGACTTTGACTTTGGTGTTGATCCAAATATCGATCC
AGAGCTTGCTCTCGCCCTTCGGGTCTCCATGGAGGAGGAGAGAGCAAGGCAAGAGGCTGC
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TGAGGCTACGGGTGCTGGAAACCTCCTAGGAAATCAAGCTTTCATATCATCTGTTCTCTC
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GTGGCTTTAGATAGTCATGAACTAATCGTCGAATCACGTTGGTTTGTTCGGTCTAATCTT
AGAAACAGATATTTTAAAAAGGCCAAATAAGCCAAGTTTAAAGATCTACTTGTCTGCAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS87TF U 1
AF RR4FS87JQ C 501
AF RR4A026TFB U 535
BS 1 609 RR4FS87TF
BS 610 610 RR4A026TFB
BS 611 622 RR4FS87TF
BS 623 1181 RR4A026TFB
BS 1182 1182 RR4FS87JQ
BS 1183 1276 RR4A026TFB
BS 1277 1319 RR4FS87JQ

RD RR4FS87TF 622 0 0
GCCAGAGAACACGGTGGGGATCTTGACCATGGCAGGCAAAGGAGTTAGAGTTTTGACGGC
GCCTACCTCTGATCTTGGCAAGATTTTGGCCTGTATGCACGGACTCGATGTTGGAGGAGA
GACTAACTTAACTGCAGCCATCCAGATTGCTCAGCTTTCTCTCAAGCATCGCCAAAACAA
GAATCAACGCCAACGTACCATTGTTTTCGCTGGAAGCCCAATCAAGTATGAAAAGAAGGC
CTTGGAGGTTGTTGGCAAAAGGCTTAAAAAGAACAGTGTCTCTCTTGACATTGTCAATTT
TGGTGATGATGACGATGTGGACAAGCCTCTCAAACTTGAGGCCCTCCTTTCTGCCGTCAA
TAACAATGACGGTAGCCACATTGTCCATGTTCCTTCCGGTGCCAATGCTCTCTCTGATGT
CCTCCTCAGCACACCTGTATTCACTGGTGATGAGGGTGCAAGTGGGTATGTTTCTGCGGC
AGCTGCTGCTGCTGCTGGGGGTGGTGACTTTGACTTTGGTGTTGATCCAAATATCGATCC
AGAGCTTGCTCTCGCCCTTCGGGTCTCCATGGAGGAGGAGAGAGCAAGGCAAGAGGCTGC
TGCTAAGAAAGCAGCTGATGAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4FS87JQ 819 0 0
GTGGTGACTTTGACTTTGGTGT*GATCCAAATATCGATCCAGAGCTTGCTCTCGCCTTTC
GGGTCTCCATGGAGGAGGAGAGAGCAAGGCAAGAGGCTGCTGCTAAGAAGGCAGCTGATG
ACGCAGGTCAGAAAGACCATGATGGGGCTTCAGCTTCTGCCTCGCAGGAGACGGTTGCTA
GGACAACTGATAAGAACGCTGAACCAATGGATGAGGACAACGCATTGCTAAATCAGGCAA
TTGCTATGTCCGTAGGTGATGTAAACATGTCAGAAGCCGCGAATGAGGACCAGGACTTGG
CTTTAGCTCTGCAAATGTCAATGAGTGGGGAGGAGTCAAGTGAGGCTACGGGTGCTGGAA
ACCTCCTAGGAAATCAAGCTTTCATATCATCTGTTCTCTCATCGCTTCCAGGGGTGGATC
CAAATGATCCAGCGGTTCAAGCGCTGCTAGCGTTTCTGCCAGACGAATCAAAGCGGAACG
AGGAGGAAGAGAGTGGTAACAAAGGTGAGGATGAGAAGAAGTGAAGAAAGAGACGGACGT
GCTCTCAATAAAATTCATGTTTTATCTCTTTGGTTTGGTTTTGATAGAGAGATCATATCG
GGACTGATGAAGAAGAACTCTTGTATTAATCTTTCTGCCTTGTGACCTTGTTTGTTCTCT
CGCTCTTTTGTAACGTTATTAGTTTGTCCAAAAAAAATCGGTGGCTTTAGATAGTCATGA
ACTAATCGTCGAATCACGTTGGTT*GTTCGGTCTAATCTTAGAAACAGATATTTTAAAAA
GGCCAAATAAGCCAAGTTTAAAGATCTACTTGTCTGCAC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4A026TFB 742 0 0
G
GATCCAGAGCTTGCTCTCGCCCTTCGGGTCTCCATGGAGGAGGAGAGAGCAAGGCAAGAG
GCTGCTGCTAAGAAGGCAGCTGATGACGCAGGTCAGAAAGACCATGATGGGGCTTCAGCT
TCTGCCTCGCAGGAGACGGTTGCTAGGACAACTGATAAGAACGCTGAACCAATGGATGAG
GACAACGCATTGCTAAATCAGGCAATTGCTATGTCCGTAGGTGATGTAAACATGTCAGAA
GCCGCGAATGAGGACCAGGACTTGGCTTTAGCTCTGCAAATGTCAATGAGTGGGGAGGAG
TCAAGTGAGGCTACGGGTGCTGGAAACCTCCTAGGAAATCAAGCTTTCATATCATCTGTT
CTCTCATCGCTTCCAGGGGTGGATCCAAATGATCCAGCGGTTCAAGCGCTGCTAGCGTCT
CTGCCAGACGAATCAAAGCGGAACGAGGAGGAAGAGAGTGGTAACAAAGGTGAGGATGAG
AAGAAGTGAAGAAAGAGACGGACGTGCTCTCAATAAAATTCATGTTTTATCTCTTTGGTT
TGGTTTTGATAGAGAGATCATATCGGGACTGATGAAGAAGAACTCTTGTATTAATCTCTC
TGCCTTGTGACCTTGTTTGTTCTCTCGCTCTTTTGTAACGTTATTATTTTGTCCAAAAAA
AATCGGTGGCTTTAGATAGTCATGAACTAATCGTCGAATCACGTTGGTTTGTTCGGTCTA
ATCTTAGAAACAGATATTTTA

QA 2 742 2 742
DS 



AS 1 2

CO CL4464Contig1 832 2 10 U
GGGAGGAGAGGAGGAAGAAGAACCCTTACTTTTGTTCCTCTGACTACTCATTTCATGTCG
GAGACTTCCCAGAAACTAAAGAATCTCTTCAATAGAGACTAAATCTAACTCTCCTTTTTC
TTCGTTTCAGTGTTTTCCCCCTTTGCTTACTTCTGAAGGAAACGAGAGATAGAGAGAGAG
ATAGAGAGAAAGCCATAGAGAAGAGGAGAGATGTATGTAGTGACGCCTCCTCAAAGATCT
GGTTTGGGATCCAACAGCGATTTGCGGGTCTATCAATCATGGAAAGGAAGCAATATATTT
TGTCTTAAGGGAAGGTTTATATTCGGGCCAGACGCAAGATCACTTGGTCTGACCATAAGT
CTCATCGTGGTCCCCGTCATAATCTTCTGCATCTTCGTTGCAAGCAAGCTAATTCAGGAC
TTCTCTGATACTTGGGGACTCTCAATAGTCTCTGTCGCTGTTGTCTTCACCATCTATGAC
ATAATTCTTCTGATGCTTACATCCGGAAGAGATCCAGGGATCATCCCAAGAAACTCTCAT
CCTCCTGAGCCTGAACCTCTCGATGGAAACTCAGGGACAAACCAAACTCCAAGACTGCCT
CGCGTGAAGGAAGTTGAAGTTAACGGGAAGATATTTAAGGTCAAATACTGCGACACTTGC
ATGCTCTACAGACCACCTCGCTGCTCACACTGCTCTATCTGCAACAACTGTGTAGAAAGA
TTTGACCATCACTGTCCTTGGGTTGGTCATGTATTGCCAAAGGAATTATCGGTTCTTCTT
CATGTTTGTCTCTCACACTCTCTCTGTGTATACGTGTGGCCTTTGCTGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H410TF U 1
AF RR4D054TF U 26
BS 1 507 RR4H410TF
BS 508 508 RR4D054TF
BS 509 616 RR4H410TF
BS 617 617 RR4D054TF
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BS 641 667 RR4H410TF
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BS 669 749 RR4H410TF
BS 750 832 RR4D054TF

RD RR4H410TF 756 0 0
GGGAGGAGAGGAGGAAGAAGAACCCTTACTTTTGTTCCTCTGACTACTCATTTCATGTCG
GAGACTTCCCAGAAACTAAAGAATCTCTTCAATAGAGACTAAATCTAACTCTCCTTTTTC
TTCGTTTCAGTGTTTTCCCCCTTTGCTTACTTCTGAAGGAAACGAGAGATAGAGAGAGAG
ATAGAGAGAAAGCCATAGAGAAGAGGAGAGATGTATGTAGTGACGCCTCCTCAAAGATCT
GGTTTGGGATCCAACAGCGATTTGCGGGTCTATCAATCATGGAAAGGAAGCAATATATTT
TGTCTTAAGGGAAGGTTTATATTCGGGCCAGACGCAAGATCACTTGGTCTGACCATAAGT
CTCATCGTGGTCCCCGTCATAATCTTCTGCATCTTCGTTGCAAGCAAGCTAATTCAGGAC
TTCTCTGATACTTGGGGACTCTCAATAGTCTCTGTCGCTGTTGTCTTCACCATCTATGAC
ATAATTCTTCTGATGCTTACATCCGGAGGAGATCCAGGGATCATCCCAAGAAACTCTCAT
CCTCCTGAGCCTGAACCTCTCGATGGAAACTCAGGGACAAACCAAACTCCAAGACTGCCT
CGCGTGAAGGAAGTTGGAGTTAACGGGAAGATATTTAAG*TCAAATACTGCGACACTTGC
ATGCTCTGCAGACCACCTCGCTGCTCACACTGCTCTATCTGCAACAACTGTGTAGAAAGA
TTTGACCATCACTGTCCTTGGGTTGGTCA
ATGTATT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4D054TF 807 0 0
GG
ACTTTTGTTCCTCTGACTACTCATTTCATGTCGGAGACTTCCCAGAAACTAAAGAATCTC
TTCAATAGAGACTAAATCTAACTCTCCTTTTTCTTCGTTTCAGTGTTTTCCCCCTTTGCT
TACTTCTGAAGGAAACGAGAGATAGAGAGAGAGATAGAGAGAAAGCCATAGAGAAGAGGA
GAGATGTATGTAGTGACGCCTCCTCAAAGATCTGGTTTGGGATCCAACAGCGATTTGCGG
GTCTATCAATCATGGAAAGGAAGCAATATATTTTGTCTTAAGGGAAGGTTTATATTCGGG
CCAGACGCAAGATCACTTGGTCTGACCATAAGTCTCATCGTGGTCCCCGTCATAATCTTC
TGCATCTTCGTTGCAAGCAAGCTAATTCAGGACTTCTCTGATACTTGGGGACTCTCAATA
GTCTCTGTCGCTGTTGTCTTCACCATCTATGACATAATTCTTCTGATGCTTACATCCGGA
AGAGATCCAGGGATCATCCCAAGAAACTCTCATCCTCCTGAGCCTGAACCTCTCGATGGA
AACTCAGGGACAAACCAAACTCCAAGACTGCCTCGCGTGAAGGAAGTTGAAGTTAACGGG
AAGATATTTAAGGTCAAATACTGCGACACTTGCATGCTCTACAGACCACCTCGCTGCTCA
CACTGCTCTATCTGCAACAACTGTGTAGAAAGATTTGACCATCACTGTCCTTGGGTTGGT
CATGTATTGCCAAAGGAATTATCGGTTCTTCTTCATGTTTGTCTCTCACACTCTCTCTGT
GTATACGTGTGGCCTTTGCTGTGTC

QA 3 807 3 807
DS 



AS 1 3

CO CL4465Contig1 689 3 6 U
GGAGACTTTCAAAGCCTTTGAAAAATAAGAGAGGCTTCTTTAAACAAAAGCCCATTGTGG
AAGACTTTTTCTTTTCCATTTCTCGCTGCGCAACATCCACTATTCCCATTTGTTGATTCT
CTTCCTAAAGATTTGCAGCCAATCATAGAAGAAGAAGACACTACGAACTAGAAAGAGATC
TCTGTCGATGGGTAAAGCAAGAGGAGTGAACAACGGTGTTAACCAAAGCTCTCTCGATTA
CCTCTTTGGTTCCGGCGAGACTCCTCCGGCCGCTGCGGCGACAATGGGGACCACAACGAC
GACAACCACCACAACTACCACAGATGGAACTGGAGGGAGACCGATAACGACCACGACGAC
CACGGTCACTGAGAATAAGAAGACACCTGCAGGTGTTAGAGGAAGTCCTAATAATTATTT
CAGATCATAAGGCCAGAACTGTGGCAACTTCCTCACGGAGAGGCCGTCTACAAAGGTTCA
TGCTGCCCCTGGTGGAGGATCTTCCCTCGGTTATCTGTTTGGTGGACCAAGTGCTTCTGC
TGATTCTCCAAAGAAATGAAGTTTGCTTTTGTCTGTTGGCTCCTTCCGATTTGTAAATCA
TCAAAAAAAAATGTGTGGCTATTTATCGTCCTCCATCAGTTAAACATTGTGTGATTCATT
GTGATGGAGGGGAATGTTTGAGTTTGATC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV62TF U 1
AF RR4BV62JQ C 1
AF RR4CF50TF U 1
BS 1 3 RR4BV62JQ
BS 4 421 RR4BV62TF
BS 422 610 RR4CF50TF
BS 611 611 RR4BV62JQ
BS 612 665 RR4CF50TF
BS 666 689 RR4BV62JQ

RD RR4BV62TF 421 0 0
GGA
GACTTTCAAAGCCTTTGAAAAATAAGAGAGGCTTCTTTAAACAAAAGCCCATTGTGGAAG
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CCTAAAGATTTGCAGCCAATCATAGAAGAAGAAGACACTACGAACTAGAAAGAGATCTCT
GTCGATGGGTAAAGCAAGAGGAGTGAACAACGGTGTTAACCAAAGCTCTCTCGATTACCT
CTTTGGTTCCGGCGAGACTCCTCCGGCCGCTGCGGCGACAATGGGGACCACAACGACGAC
AACCACCACAACTACCACAGATGGAACTGGAGGGAGACCGATAACGACCACGACGACCAC
GGTCACTGAGAATAAGAAGACACCTGCAGGTGTTAGAGGAAGTCCTAATAATTATTTC

QA 4 421 4 421
DS 

RD RR4BV62JQ 689 0 0
GGAGACTTTCAAAGCCTTTGAAAAATAAGAGAGGCTTCTTTAAACAAAAGCCCATTGTGG
AAGACTTTTTCTTTTCCATTTCTCGCTGCGCAACATCCACTATTCCCATTTGTTGATTCT
CTTCCTAAAGATTTGCAGCCAATCATAGAAGAAGAAGACACTACGAACTAGAAAGAGATC
TCTGTCGATGGGTAAAGCAAGAGGAGTGAACAACGGTGTTAACCAAAGCTCTCTCGATTA
CCTCTTTGGTTCCGGCGAGACTCCTCCGGCCGCTGCGGCGACAATGGGGACCACAACGAC
GACAACCACCACAACTACCACAGATGGAACTGGAGGGAGACCGATAACGACCACGACGAC
CACGGTCACTGAGAATAAGAAGACACCTGCAGGTGTTAGAGGAAGTCCTAATAATTATTT
CAGATCATAAGGCCAGAACTGTGGCAACTTCCTCACGGAGAGGCCGTCTACAAAGGTTCA
TGCTGCCCCTGGTGGAGGATCTTCCCTCGGTTATCTGTTTGGTGGACCAAGTGCTTCTGC
TGATTCTCCAAAGAAATGAAGTTTGCTTTTGTCTGTTGGCTCCTTCCGATTTGTAAATCA
TCAAAAAAAAATGTGTGGCTATTTATCGTCCTCCATCAGTTAAACATTGTGTGATTCATT
GTGATGGAGGGGAATGTTTGAGTTTGATC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4CF50TF 665 0 0
GGT
GACTTTCAAAGCCTTTGAAAAATAAGAGAGGCTTCTTTAAACAAAAGCCCATTGTGGAAG
ACTTTTTCTTTTCCATTTCTCGCTGCGCAACATCCACTATTCCCATTTGTTGATTCTCTT
CCTAAAGATTTGCAGCCAATCATAGAAGAAGAAGACACTACGAACTAGAAAGAGATCTCT
GTCGATGGGTAAAGCAAGAGGAGTGAACAACGGTGTTAACCAAAGCTCTCTCGATTACCT
CTTTGGTTCCGGCGAGACTCCTCCGGCCGCTGCGGCGACAATGGGGACCACAACGACGAC
AACCACCACAACTACCACAGATGGAACTGGAGGGAGACCGATAACGACCACGACGACCAC
GGTCACTGAGAATAAGAAGACACCTGCAGGTGTTAGAGGAAGTCCTAATAATTATTTCAG
ATCATAAGGCCAGAACTGTGGCAACTTCCTCACGGAGAGGCCGTCTACAAAGGTTCATGC
TGCCCCTGGTGGAGGATCTTCCCTCGGTTATCTGTTTGGTGGACCAAGTGCTTCTGCTGA
TTCTCCAAAGAAATGAAGTTTGCTTTTGTCTGTTGGCTCCTTCCGATTTGTAAATCATCA
AAAAAAA*TGTGTGGCTATTTATCGTCCTCCATCAGTTAAACATTGTGTGATTCATTGTG
AT

QA 4 665 4 665
DS 



AS 1 2

CO CL4466Contig1 820 2 8 U
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TCTTTTTTTTACACCACAGAGATCCCACATACAACGAGAAGCAGCAAAACAAACAAACAT
CAAAGAAATGAACTTGCTTTGCTTCACACACACTCTAAAGTTAATAGCTTTTGAAGTTCC
CTTCATACAGATACTCCTCACCATAAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTAT
CAGCTCGGCTCAAGATCTCCTCGAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAG
CAGCTGTCAACACATCATCTGGCTTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAA
TGTTAATGCTCTGAGGGTTAACATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAG
CGCCGCTGAAGTAAGGAATCACAAGCCAGCAAGTCAAGATCAGCCTGGCGTATGACCATA
TCGGTACCCATTCGATGAGTTTGGCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAA
GAACCCAGTAAGTGAGCCATTGTTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCA
CTGAAGCATGTAGTGGATAAACGAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCC
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TAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGCGAATAATTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DB18JQ U 1
AF RR4CG26TF C 185
BS 1 258 RR4DB18JQ
BS 259 259 RR4CG26TF
BS 260 464 RR4DB18JQ
BS 465 465 RR4CG26TF
BS 466 751 RR4DB18JQ
BS 752 752 RR4CG26TF
BS 753 778 RR4DB18JQ
BS 779 820 RR4CG26TF

RD RR4DB18JQ 778 0 0
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CAGCTGTCAACACATCATCTGGCTTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAA
TGTTAATGCTCTGAGGGTTAACATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAG
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GAACCCAGTAAGTGAGCCATTGTTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCA
CTGAAGCATGTAGTGGATAAACGAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCC
TCAAAAGAACTTTGATGAAACTTCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCGAAGTGTTGATTTG
GGCTCTGAATCTGATTCTTCCTCCACTGAAA*CAATACTAGTTCACTGGAGAGAGATT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4CG26TF 636 0 0
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TCGGCTCAAGATCTCCTCGAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGC
TGTCAACAC*TCATCTGGCTTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAATGTT
AATGCTCTGAGGGTTAACATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCC
GCTGAAGTAAGGAATCACAAGCCAGCAAGTCAAGATCAGCCTGGCGTATGACCATATCGG
TACCCATTCGATGAGTTTGGCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAAC
CCAGTAAGTGAGCCATTGTTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCACTGA
AGCATGTAGTGGATAAACGAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCCTCAA
AAGAACTTTGATGAAACTTCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCGAAGTGTTGATTTGGGCT
CTGAATCTGATTCTTCCTCCACTGAAAACAATACTAGTTCACTGGAGAGAGATTGATAGA
GAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGCGAATAATTGTGTCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 3

CO CL4467Contig1 1126 3 5 U
TTATTGTTCTTTATGAAATACATTATTATGGTATCTGACTAAGTGATTCATATGATATCG
TAGAGCATATAGTATATAGATATGATTAAAGAACAGAGCATCTTTGTGAACTCTGCTGCC
TGCGCAATCTAGCGGTTTCTCTCTCAGCGTTGTTGAGTTGATCTCTGAGCCTCCTGATCT
CATCAGCAGATAGATTCTGCAATTCAGTCATCTTTTTCTCGGTTTCTGCTCTCTCTAATT
GTGCCTTAGCTAGTTGCTCCTTCACATCATTCAGTGATTCCTTCAGCTGGTTAGCGATCT
TCTCCTTTATCCCTTCGAGCATTTCGTTATAAGTTTTCTCCATTTCCTTCTTAACTTGTG
ATATCTCTTGTTTCGACTGACCCTTCATTGCTTGAATCTGCTTCTGTTTTCCCTCTAACG
TGGCCTCGTTTTCCCTTAGCTCAAGTGATAAGTCAGCCATAAATGGTTTTCCATTGTTCT
TCTTTGAGATTTGCTCGACGAAGTTGAGAAGATCCTGGACCTGCTTGTCTTTCGTGCTTT
TAGGGATATTACGCCTATTGTCAAACAACACCATGCGGTCATCACATTCTTTGAGAATTT
CCTGAAACTCAGGACACTCCTCTAAATAGTCATCAAGAGTATCTCCATCCTCAAACGCAT
CTCCATTGGTGAAAACCACAATCATGTGGTCAACGATCTGGCTTCCGAAAAGGATCTTTA
ATGTGCGAAGCGTTAATTGCTCCTCTTCTGTTAATTGGTTCCTCACGGAGAAAACCAGAA
TGACTGCATCTATGCCATCTTTAGCCAGACGTAAGCATCTTACGATTTCTCTGATGGTGA
AATCGGGCGTCGAGGAAGCACTGAACAGACCAGGAGTATCGATAACATTGATTCTCTGAC
CACTTGATAACATAGAAGTATGTAGCTTACACTCTTTAGTAATGAATCTTCCTCTTGTTT
TTGACTGGAACTTTGTCTCTCCTAGGATGCTATTTCCAGTTGCACTTTTACCATTCCCCG
TTCGGCCGAGTAGGACTAGAGTTCTTTCAGGTTTCCAATCAACTTCCACATTTACTTTAT
TTGAATACCAAGACATTGTTCAATTTAAAACCGTTATGTATCTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ85JQ U 1
AF RR4H749JQB U 1
AF RR4BZ85TF C 438
BS 1 455 RR4BZ85JQ
BS 456 456 RR4H749JQB
BS 457 582 RR4BZ85JQ
BS 583 646 RR4H749JQB
BS 647 1126 RR4BZ85TF

RD RR4BZ85JQ 582 0 0
TTATTGTTCTTTATGAAATACATTATTATGGTATCTGACTAAGTGATTCATATGATATCG
TAGAGCATATAGTATATAGATATGATTAAAGAACAGAGCATCTTTGTGAACTCTGCTGCC
TGCGCAATCTAGCGGTTTCTCTCTCAGCGTTGTTGAGTTGATCTCTGAGCCTCCTGATCT
CATCAGCAGATAGATTCTGCAATTCAGTCATCTTTTTCTCGGTTTCTGCTCTCTCTAATT
GTGCCTTAGCTAGTTGCTCCTTCACATCATTCAGTGATTCCTTCAGCTGGTTAGCGATCT
TCTCCTTTATCCCTTCGAGCATTTCGTTATAAGTTTTCTCCATTTCCTTCTTAACTTGTG
ATATCTCTTGTTTCGACTGACCCTTCATTGCTTGAATCTGCTTCTGTTTTCCCTCTAACG
TGGCCTCGTTTTCCCTTAGCTCAAGTGATAAGTCAACCATAAATGGTTTTCCATTGTTCT
TCTTTGAGATTTGCTCGACGAAGTTGAGAAGATCCTGGACCTGCTTGTCTTTCGTGCTTT
TAGGGATATTACGCCTATTGTCAAACAACACCATGCGGTCAT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4H749JQB 646 0 0
TTATTGTTCTTTATGAAATACATTATTATGGTATCTGATTAAGTGATTCATATGATATCG
TAGAGCATATAGTATATAGATATGATTAAAGAACAGAGCATCTTTGTGAACTCTGCTGTC
TGCGCAATCTAGCGGTTTCTCTCTCAGCGTTGTTGAGTTGATCTCTGAGCCTCCTGATCT
CATCAGCAGATAGATTCTGCAATTCAGTCATCTTTTTCTCGGTTTCTGCTCTCTCTAATT
GTGCCTTAGCTAGTTGCTCCTTCACATCATTCAGTGATTCCTTCAGCTGGTTAGCGATCT
TCTCCTTTATCCCTTCGAGCATTTCGTTATAAGTTTTCTCCATTTCCTTCTTAACTTGTG
ATATCTCTTGTTTCGACTGACCCTTCATTGCTTGAATCTGCTTCTGTTTTTCCTCTAACG
TGGCCTCGTTTTCCCTTAGCTCAAGTGATAAGTCAGCCATAAATGGTTTTCCATTGTTCT
TCTTTGAGATTTGCTCGACGAAGTTGAGAAGATCCTGGACCTGCTTGTCTTTCGTGCTTT
TAGGGATATTACGCCTATTGTCAAACAACACCATGCGGTCATCACATTCTTTGAGAATTT
CCTGAAACTCAGGACACTCCTCTAAATAGTCATCAAGAGTATCTCC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4BZ85TF 689 0 0
AGCTCAAGTGATAAGTCAGCCATAAATGGTTTTCCATTGTTCTTCTTTGAGATTTGCTCG
ACGAAGTTGAGAAGATCCTGGACCTGCTTGTCTTTCGTGCTTTTAGGGATATTACGCCTA
TTGTCAAACAACACCATGCGGTCATCACATTCTTTGAGAATTTCCTGAAACTCAGGACAC
TCCTCTAAATAGTCATCAAGAGTATCTCCATCCTCAAACGCATCTCCATTGGTGAAAACC
ACAATCATGTGGTCAACGATCTGGCTTCCGAAAAGGATCTTTAATGTGCGAAGCGTTAAT
TGCTCCTCTTCTGTTAATTGGTTCCTCACGGAGAAAACCAGAATGACTGCATCTATGCCA
TCTTTAGCCAGACGTAAGCATCTTACGATTTCTCTGATGGTGAAATCGGGCGTCGAGGAA
GCACTGAACAGACCAGGAGTATCGATAACATTGATTCTCTGACCACTTGATAACATAGAA
GTATGTAGCTTACACTCTTTAGTAATGAATCTTCCTCTTGTTTTTGACTGGAACTTTGTC
TCTCCTAGGATGCTATTTCCAGTTGCACTTTTACCATTCCCCGTTCGGCCGAGTAGGACT
AGAGTTCTTTCAGGTTTCCAATCAACTTCCACATTTACTTTATTTGAATACCAAGACATT
GTTCAATTTAAAACCGTTATGTATCTTCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL4468Contig1 732 3 15 U
GGCTCTTTCACAAATCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCGT
TCATTCCCCACTTTTCTCGGAAAATAAAAAGAATAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATT
TCTGCTTCACAATCCCGTACGGACTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATTA
AGAAAGGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCG
CTGGATATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAATAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTC
TTCAGACAGTCATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGTGTTACTTGCTCACTC
AGAAGATTATGCCTGCTGGTTTGGTTGCTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACG
TATACAAGATCGCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGGT
TATGCAACTCTGTTGGATGAAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAAT
CTCTTGTGTGTCTCTGAGATTAGTTTGCATGGTTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTT
GTGTGTTTCTGAGATTAGTTTCATTTGGTCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAAT
CATGTTTCTGTTAACCACAAACGTTTTGGAGCCACATTAATATGAAGATATCCATGTTTC
TGTTAAAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E396TF U 1
AF RR4D948TF U 10
AF RR4D948JQ C 10
BS 1 58 RR4E396TF
BS 59 59 RR4D948TF
BS 60 76 RR4E396TF
BS 77 77 RR4D948TF
BS 78 178 RR4E396TF
BS 179 179 RR4D948TF
BS 180 204 RR4E396TF
BS 205 205 RR4D948TF
BS 206 271 RR4E396TF
BS 272 272 RR4D948TF
BS 273 344 RR4E396TF
BS 345 345 RR4D948TF
BS 346 478 RR4E396TF
BS 479 677 RR4D948TF
BS 678 732 RR4D948JQ

RD RR4E396TF 478 0 0
GGCTCTTTCACAAATCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCAT
TCATTCCCCACTTTTCCCGGAAAATAAAAAGAATAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATT
TCTGCTTCACAATCCCGTACGGACTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGA
AGAAAGGAAGCATCACATCATTCGTCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCG
CTGGATATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTC
TTCAGACAGTCATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTC
AGAAGATTATGCCTGCTGGTTTGGTTGCTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACG
TATACAAGATCGCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4D948TF 668 0 0
GG
AAATCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCGTTCATTCCCCAC
TTTTCTCGGAAAATAAAAAGAATAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGCTTCACA
ATCCCGTACGGACTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATTAAGAAAGGAAGC
ATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGATATCTC
AGTCTCAATGCTTTCCATAATAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTC
ATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGTGTTACTTGCTCACTCAGAAGATTATG
CCTGCTGGTTTGGTTGCTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATC
GCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGGTTATGCAACTCT
GTTGGATGAAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGTGT
CTCTGAGATTAGTTTGCATGGTTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTG
AGATTAGTTTCATTTGGTCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAATCATGTTTCTGT
TAACCA

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR4D948JQ 723 0 0
GG
AAATCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCGTTCATTCCCCAC
TTTTCTCGGAAAATAAAAAGAATAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGCTTCACA
ATCCCGTACGGACTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATTAAGAAAGGAAGC
ATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGATATCTC
AGTCTCAATGCTTTCCATAATAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTC
ATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGTGTTACTTGCTCACTCAGAAGATTATG
CCTGCTGGTTTGGTTGCTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATC
GCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGGTTATGCAACTCT
GTTGGATGAAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGTGT
CTCTGAGATTAGTTTGCATGGTTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTG
AGATTAGTTTCATTTGGTCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAATCATGTTTCTGT
TAACCACAAACGTTTTGGAGCCACATTAATATGAAGATATCCATGTTTCTGTTAAAAAGG
G

QA 3 723 3 723
DS 



AS 1 3

CO CL4469Contig1 945 3 5 U
AGCAGGGAATAACATTTATTACATCCAACATTTCAACACCTTTATAAGAACAAAGAAACG
AAAGCAAACAAACATAGCCTTCAAAAGCCTAACATCCCCAAAAAAAGGGTTAGATCTTTG
AGAGTTTGACAAAACATATCTCTTCTCTATTATTACTCTTGTTCATCTCAAAGAAACTCT
TACTGGAGACTTTGACAGCATAACAAAACATTCTTCAACAAAAGAGCTTAGTGAAATGAT
TTTTTTTT*AATGGGTGAAGAGGGAGTGAGTACTCTTGAGAGTATGGTAAAGCGCGGCCA
ATGCAGTAACCGAAGTGATGACCGGAAGTTGCTGCTGTACATGGAAAAGAACGTGGTAGA
AACCCGGGTAGGTGAGGCAAATCATACCCATTTTCAGGTAGAGAAGATAGCCGCCAAAAA
AGACTCCTGTCAAGTAAAGCCCCGAGACTCTGTTGGAAATCGATAACATGGAGTTCATCT
GAGGTTGATAAACAGGGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGCTTTGGGTTTTTGGAGAAA
TCTGTTCCTCCTCTGTCATATTAATACCCGCAGAGATTGTAGACAACATGCGTCTTGGTG
CTCCCACACCAAGAGCTCGCAAATGAGCTCCAATTACATTCTCAGTAGCTTTTGAATGCT
CTCTCTCCTCTCTAACGGCATTGCTTGTGTTGGTAGTTCCCAAACCAGTCTCAACATTGT
CATTCACACCAGGTTTCGATCCGAAAGCTCTACAGAAACTTGCATAGTTTTGACCAGCGT
GTGAACTACCCCATGAAGTTTGAGCATTACCAGAAAGAGATTTGTAGACGGAAGAAGGCG
CGGAGACGATTTCACGTCGTCGAATCGATCGAAGAAGAGCCGTGGCAGCCATCGTCTGAA
TCAGATCACTATCTCTACTTCTCTTCCTGCGAAAGCTGGAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E118JQ U 1
AF RR4BL38JQ U 49
AF RR4E118TF C 196
BS 1 248 RR4E118JQ
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BS 250 753 RR4E118JQ
BS 754 826 RR4BL38JQ
BS 827 945 RR4E118TF

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AGAGTTTGACAAAACATATCTCTTCTCTATTATTACTCTTGTTCATCTCAAAGAAACTCT
TACTGGAGACTTTGACAGCATAACAAAACATTCTTCAACAAAAGAGCTTAGTGAAATGAT
TTTTTTTTTAATGGGTGAAGAGGGAGTGAGTACTCTTGAGAGTATGGTAAAGCGCGGCCA
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AACCCGGGTAGGTGAGGCAAATCATACCCATTTTCAGGTAGAGAAGATAGCCGCCAAAAA
AGACTCCTGTCAAGTAAAGCCCCGAGACTCTGTTGGAAATCGATAACATGGAGTTCATCT
GAGGTTGATAAACAGGGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGCTTTGGGTTTTTGGAGAAA
TCTGTTCCTCCTCTGTCATATTAATACCCGCAGAGATTGTAGACAACATGCGTCTTGGTG
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CATTCACACCAGGTTTCGATCCGAAAGCTCTAC

QA 1 753 1 753
DS 

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CG
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AAGAAACTCTTACTGGAGACTTTGACAGCATAACAAAACATTCTTCAACAAAAGAGCTTA
GTGAAATGATTTTTTTTT*AATGGGTGAAGAGGGAGTGAGTACTCTTGAGAGTATGGTAA
AGCGCGGCCAATGCAGTAACCGAAGTGATGACCGGAAGTTGCTGCTGTACATGGAAAAGA
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CCGCCAAAAAAGACTCCTGTCAAGTAAAGCCCCGAGACTCTGTAGGAAATCGATAACATG
GAGTTCATCTGAGGTTGATAAACAGGGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGCTTTGGGTT
TTTGGAGAAATCTGTTCCTCCTCTGTCATCTTAATACCCGCAGAGATTGTAGACAACATG
CGTCTTGGTGCTCCCACACCAAGAGCTCGCAAATGAGCTCCAATTGCATTCTCAGTAGCT
TTTGAATGCTCTCTCTCCTCTCTAACGGCATTGCTTGTGTTGGTAGTTCCCAAACCAGTC
TCAACATTGTCATTCACGCCAGGTTTCGATCCGAAAGCTCTACAGAAACTTGCATAGTTT
TGACCAGCGTGTGAACTACCCCATGAAGTTTGAGCATTACCAGAAAGAGATTTGTA

QA 3 778 3 778
DS 

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TGAAGAGGGAGTGAGTACTCTTGAGAGTATGGTAAAGCGCGGCCAATGCAGTAACCGAAG
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AAAGCCCCGAGACTCTGTTGGAAATCGATAACATGGAGTTCATCTGAGGTTGATAAACAG
GGAGGTGAGGAGATAGAGGGCGAAAGCTTTGGGTTTTTGGAGAAATCTGTTCCTCCTCTG
TCATATTAATACCCGCAGAGATTGTAGACAACATGCGTCTTGGTGCTCCCACACCAAGAG
CTCGCAAATGAGCTCCAATTACATTCTCAGTAGCTTTTGAATGCTCTCTCTCCTCTCTAA
CGGCATTGCTTGTGTTGGTAGTTCCCAAACCAGTCTCAACATTGTCATTCACACCAGGTT
TCGATCCGAAAGCTCTACGGAAACTTGCATAGTTTTGACCAGCGTGTGAACTACCCCATG
AAGTTTGAGCATTACCAGAAAGAGATTTGTAGACGGAAGAAGGCGCGGAGACGATTTCAC
GTCGTCGAATCGATCGAAGAAGAGCCGTGGCAGCCATCGTCTGAATCAGATCACTATCTC
TACTTCTCTTCCTGCGAAAGCTGGAGACCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

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TGGTGTCAACGACGCTCCTGCTTTGAAGAAGGCTGATATTGGTATCGCTGTGGATGATGC
TACCGATGCTGCTCGTGGTGCCTCAGATATCGTTCTCACTGAGCCAGGACTCAGCGTTAT
CATCAGCGCTGTCCTCACCAGCAGAGCTATTTTCCAGAGGATGAAGAACTACACCATCTA
TGCAGTCTCGATCACAATCCGTATCGTTCTTGGTTTCATGCTCATTGCTCTCATATGGGA
GTTTGACTTCTCAGCATTCATGGTTCTGATCATTGCCATTCTTAACGATGGTACCATCAT
GACTATCTCAAAGGACAGAGTCAAGCCATCTCCCACACCTGATAGCTGGAAACTCAGAGA
GATTTTCGCTACTGGAGTTGTGCTTGGAACCTACCAAGCCATCATGAGTGTTATTTTCTT
CTGGCTTGCACACAAAACCGACTTTTTCTCGGACAAGTTTGGTGTGAGGTCCATCAGAGA
CAACAACAATGAGCTAATGGGTGCGGTGTATCTGCAAGTTAGTATCATTAGTCAGGCTCT
CATCTTTGTCACAAGATCAAGGAGTTGGTCCTTTGTTGAACGTCCTGGAGTGTTACTGAT
GGTTGCTTTTGTCGTTGCACAACTGGTTGCTACTTTGATTGCTGTGTACGCCAACTGGGA
GTTTGCAAAGGTTAAGGGTATTGGATGGGGATGGGCTGGAGTGATCTGGATATACAGTAT
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GGCTTGGCTCAACTTGTTTGAGAACAGGGTTGCTTTAACTAACAAGAAAGATTTTGGAAA
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GCAAGCCAAGAAGAGAGCTGAGATCGCTAGGCTTAGGGAGCTGCACACACTCAAGAGACA
TGTTGAATCAGTCGTGAAGCTAAAGGGCTTGGACATTGAAACTCCCGGACACTACACTGT
TTAAGTCGCAAGCAAAGAAAAAGAAATACCAAACATGTGATTTGATCCTTTTTTATCCCA
CCTTGTTTTTGTTTTTCTTATTCTTCACCACAATCTTAAGGTTATTGTTTGCATAGGGAG
AGAGAGATCTTTGTTTATTTCCATAACTCTTCCCCCATTCCTATTGTTAGTGTTCTTGTT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK92TF U 1
AF RR4BQ95TF U 91
AF RR4EK92JQ C 636
BS 1 151 RR4EK92TF
BS 152 152 RR4BQ95TF
BS 153 617 RR4EK92TF
BS 618 728 RR4BQ95TF
BS 729 729 RR4EK92JQ
BS 730 806 RR4BQ95TF
BS 807 1386 RR4EK92JQ

RD RR4EK92TF 617 0 0
GAAGTACGAGATCGTCAAGAAGTTGCAGGAGAGGAAGCATATCGTTGGAATGACTGGTGA
TGGTGTCAACGACGCTCCTGCTTTGAAGAAGGCTGATATTGGTATCGCTGTGGATGATGC
TACCGATGCTGCTCGTGGTGCCTCAGATATCTTTCTCACTGAGCCAGGACTCAGCGTTAT
CATCAGCGCTGTCCTCACCAGCAGAGCTATTTTCCAGAGGATGAAGAACTACACCATCTA
TGCAGTCTCGATCACAATCCGTATCGTTCTTGGTTTCATGCTCATTGCTCTCATATGGGA
GTTTGACTTCTCAGCATTCATGGTTCTGATCATTGCCATTCTTAACGATGGTACCATCAT
GACTATCTCAAAGGACAGAGTCAAGCCATCTCCCACACCTGATAGCTGGAAACTCAGAGA
GATTTTCGCTACTGGAGTTGTGCTTGGAACCTACCAAGCCATCATGAGTGTTATTTTCTT
CTGGCTTGCACACAAAACCGACTTTTTCTCGGACAAGTTTGGTGTGAGGTCCATCAGAGA
CAACAACAATGAGCTAATGGGTGCGGTGTATCTGCAAGTTAGTATCATTAGTCAGGCTCT
CATCTTTGTCACAAGAT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4BQ95TF 716 0 0
GGCTGATATTGGTATCGCTGTGGATGATGCTACCGATGCTGCTCGTGGTGCCTCAGATAT
CGTTCTCACTGAGCCAGGACTCAGCGTTATCATCAGCGCTGTCCTCACCAGCAGAGCTAT
TTTCCAGAGGATGAAGAACTACACCATCTATGCAGTCTCGATCACAATCCGTATCGTTCT
TGGTTTCATGCTCATTGCTCTCATATGGGAGTTTGACTTCTCAGCATTCATGGTTCTGAT
CATTGCCATTCTTAACGATGGTACCATCATGACTATCTCAAAGGACAGAGTCAAGCCATC
TCCCACACCTGATAGCTGGAAACTCAGAGAGATTTTCGCTACTGGAGTTGTGCTTGGAAC
CTACCAAGCCATCATGAGTGTTATTTTCTTCTGGCTTGCACACAAAACCGACTTTTTCTC
GGACAAGTTTGGTGTGAGGTCCATCAGAGACAACAACAATGAGCTAATGGGTGCGGTGTA
TCTGCAAGTTAGTATCATTAGTCAGGCTCTCATCTTTGTCACAAGATCAAGGAGTTGGTC
CTTTGTTGAACGTCCTGGAGTGTTACTGATGGTTGCTTTTGTCGTTGCACAACTGGTTGC
TACTTTGATTGCTGTGTACGCCAACTGGGAGTTTGCAA*GGTTAAGGGTATTGGATGGGG
ATGGGCTGGAGTGATCTGGATATACAGTATTGTAACATACGTCCCACAGGACATTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4EK92JQ 751 0 0
TTGAACGTCCTGGAGTGTTACTGATGGTTGCTTTTGTCGTTGCACAACTGGTTGCTACTT
TGATTGCTGTGTACGCCAACTGGGAGTTTGCAAAGGTTAAGGGTATTGGATGGGGATGGG
CTGGAGTGATCTGGATATACAGTATTGTAACATACGTCCCACAGGACATTTTCAAGTTTG
CCATTAGATACATCTTGAGTGGAAAGGCTTGGCTCAACTTGTTTGAGAACAGGGTTGCTT
TAACTAACAAGAAAGATTTTGGAAAAGAAGAGAGGGAGGCTCAATGGGCAGTTGCTCAGA
GAACACTTCACGGCTTGCAGCCAAAAGAACCTGTTAACATCATTCCTGAGCAAGGAGGTT
ACAGAGAGTTGTCTGAGATTGCAGAGCAAGCCAAGAAGAGAGCTGAGATCGCTAGGCTTA
GGGAGCTGCACACACTCAAGAGACATGTTGAATCAGTCGTGAAGCTAAAGGGCTTGGACA
TTGAAACTCCCGGACACTACACTGTTTAAGTCGCAAGCAAAGAAAAAGAAATACCAAACA
TGTGATTTGATCCTTTTTTATCCCACCTTGTTTTTGTTTTTCTTATTCTTCACCACAATC
TTAAGGTTATTGTTTGCATAGGGAGAGAGAGATCTTTGTTTATTTCCATAACTCTTCCCC
CATTCCTATTGTTAGTGTTCTTGTTTTTCTGATATGTAACCAACCTCCTTTAGAAGAATC
AAGACATGCTTTTATATTTGGCATTTTACCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 3

CO CL4471Contig1 796 3 1 U
GGTTGCCGTCAAGGATCTCAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGT
CAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCTCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGG
TAACGGTTATGCTCCGGTTCTTGATTGCCACACCTCCCACATTGCCGTGAAGTTCTCTGA
GATCCTCACCAAGATCGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTT
GAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTTGAGAC
CTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGC
AGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTGACCAAGGC
TGCCGTCAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTCCAATCATCAAGTCTCTATCATCCGCAGATGA
ATCAAAGTACTATTTTAGTTTTCTTACTCTAGTTTGGTTTTATGTAGCTTGTTTGTGTTA
CAGCTTCCGTTCGTCTCCGTCAGAACTCTCTTGTCCTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTG
GCGGAGCTACTGATCACTCAAGTCTCCTGTTTTTTTGCTTCTCTTGTGCTTTCGGATTAT
GATCCTGTTTTGGATATTTTGTTTTATGATAATGGTGACATTCCTGCGGTTATTATATGT
TTGTGTCGCATGTTTTATTTCTGTCGTCAGTCTCAGTTCACATCTATATAATCTTGACGT
TGCATTATAAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL63JQ C 2
AF RR4BU49TF U 334
AF RR4BL63TF U 1
BS 1 796 RR4BL63TF

RD RR4BL63JQ 760 0 0
GGTTG
CGTCAAGGATCTCAAGCGTGG*TATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGTCAAGGG
TGCTGCCAACTTCACCTCTCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGG
TTATGCTCCGGTTCTTGATTGCCACACCTCCCACATTGCCGTGAAGTTCTCTGAGATCCT
CACCAAGATCGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAA
TGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTTCTC
TGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGG
TGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGCCGT
CAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTCCAATCATCAAGTCTCTATCATCCGCAGATGAATCAAA
GTACTATTTTAGTTTTCTTACTCTAGTTTGGTTTTATGTAGCTTGTTTGTGTTACAGCTT
CCGTTCGTCTCCGTCAGAACTCTCTTGTCCTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTGGCGGAG
CTACTGATCACTCAAGTCTCCTGTTTTTTTGCTTCTCTTGTGCTTTCGGATTATGATCCT
GTTTTGGATATTTTGTTTTATGATAATGGTGACATTCCTGCGGTTATTATATGTTTGTGT
CGCATGTTTTATTTCTGTCGTCAGTCTCAGTTCAC

QA 6 760 6 760
DS 

RD RR4BU49TF 408 0 0
G
GTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGAC
CCAACTGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTCCAATC
ATCAAGTCTCTATCATCCGCAGATGAATCAAAGTACTATTTTAGTTTTCTTACTCTAGTT
TGGTTTTATGTAGCTTGTTTGTGTTGCAGCTTCCGTTCGTCTCCGTCAGAACTCTCTTGT
CCTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTGGCGGAGCTACTGATCACTCAAGTTTCCTGTTTTT
TTGCTTCTCTTGTGCTTTCGGATTATGATCCTGTTTTGGATATTTTGTTTTATGATAATG
GTGACATTCCTGCGGTTATTATATGTTTGTGTCGCATGTTTTATTTC

QA 2 408 2 408
DS 

RD RR4BL63TF 796 0 0
GGTTGCCGTCAAGGATCTCAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGT
CAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCTCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGG
TAACGGTTATGCTCCGGTTCTTGATTGCCACACCTCCCACATTGCCGTGAAGTTCTCTGA
GATCCTCACCAAGATCGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTT
GAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTTGAGAC
CTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGC
AGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTGACCAAGGC
TGCCGTCAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTCCAATCATCAAGTCTCTATCATCCGCAGATGA
ATCAAAGTACTATTTTAGTTTTCTTACTCTAGTTTGGTTTTATGTAGCTTGTTTGTGTTA
CAGCTTCCGTTCGTCTCCGTCAGAACTCTCTTGTCCTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTG
GCGGAGCTACTGATCACTCAAGTCTCCTGTTTTTTTGCTTCTCTTGTGCTTTCGGATTAT
GATCCTGTTTTGGATATTTTGTTTTATGATAATGGTGACATTCCTGCGGTTATTATATGT
TTGTGTCGCATGTTTTATTTCTGTCGTCAGTCTCAGTTCACATCTATATAATCTTGACGT
TGCATTATAAAAAAAA

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL4472Contig1 717 2 1 U
GGCCAAAAGGGAGAGAATTTTATTCAAAGATAATGGGGTCCCAAAGATAATGCATATATT
TGGTGGCGAAGTTTCACTAGCAACAAGAGAAGCAGAAATTGAAATTGTGTGTGTTCTGAA
TTTTAGAAGTAAATCAACAAACAAACAAAAACTTATACAAAACATTTATTTGGAACATGA
GTGAGGAAACTCATGTTTCGGTCTGACCTCTAATAAAGTGTTTTATGCAAATTGTCTTTT
AAATTTTTGGCGGTTCACAGACTCGTCTTAGGTTTGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGTC
ACAGTGCGCATTGTCACGAATTCCTCTGCAGAAGATGGATGTATCCCGACCGTGCTGTCA
AACTGTGCTTTGGTTGCTCCACACTTGAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCT
GCATCTGGACCGCACATGGATGCTCCAATAACCTTATCAGTCTTCTCATCAACTATAAGC
TTCATTAATGTCTTTTCCTGCCGTCCCGAAATGGTGTTCTTCATATGGTTAAAACCTGAG
GTGAAAACCAAAATATCCCCGGTTGCTTTTTCAGCTGCCTCTTCTTCGCTGAGACCCACC
ACAGCTAGTGGTGGTATGCAGAATACGGCACAAGCTACATTGGCGTAGTCTGCTTTTGTA
GGCTTCCCACCAAAGACAGTGTTCGCAAAGCAGGTGGCCTCCATTAACGCAACAGGT


BQ
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C645JQ U 1
AF RR4FL62JQ U 35
BS 1 717 RR4C645JQ

RD RR4C645JQ 717 0 0
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TGGTGGCGAAGTTTCACTAGCAACAAGAGAAGCAGAAATTGAAATTGTGTGTGTTCTGAA
TTTTAGAAGTAAATCAACAAACAAACAAAAACTTATACAAAACATTTATTTGGAACATGA
GTGAGGAAACTCATGTTTCGGTCTGACCTCTAATAAAGTGTTTTATGCAAATTGTCTTTT
AAATTTTTGGCGGTTCACAGACTCGTCTTAGGTTTGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGTC
ACAGTGCGCATTGTCACGAATTCCTCTGCAGAAGATGGATGTATCCCGACCGTGCTGTCA
AACTGTGCTTTGGTTGCTCCACACTTGAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCT
GCATCTGGACCGCACATGGATGCTCCAATAACCTTATCAGTCTTCTCATCAACTATAAGC
TTCATTAATGTCTTTTCCTGCCGTCCCGAAATGGTGTTCTTCATATGGTTAAAACCTGAG
GTGAAAACCAAAATATCCCCGGTTGCTTTTTCAGCTGCCTCTTCTTCGCTGAGACCCACC
ACAGCTAGTGGTGGTATGCAGAATACGGCACAAGCTACATTGGCGTAGTCTGCTTTTGTA
GGCTTCCCACCAAAGACAGTGTTCGCAAAGCAGGTGGCCTCCATTAACGCAACAGGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4FL62JQ 655 0 0
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GAAATTGAAATTGTGTGTGTTCTGAATTTTAGAAGTAAATCAACAAACAAACAAAAACTT
ATGCAAAACATTTATTTGGAACATGAGTGAGGAAACTCATGTTTCGGTCTGACCTCTAAT
AAAGTGTTTTATGCAAATTGTCTTTTAAATTTTTGGCGGTTCACAGACTCGTCTTAGGTT
TGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGTCACAGTGCGCATTGTCACGAATTCCTCTGCAGAAG
ATGGATGTATCCCGACCGTGCTGTCAAACTGTGCTTTGGTTGCTCCACACTTGAGCGCAA
TTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCTGCATCTGGACCGCACATGGATGCTCCAATAACCT
TATCAGTCTTCTCATCAACTATAAGCTTCATTAATGTCTTTTCCTGCCGTCCCGAAATGG
TGTTCTTCATATGGTTAAAACCTGAGGTGAAGACCAAAATATCCCCGGTTGCTTTTTCAG
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CTACATTGGCGTAGTCTGCTTTTGTAGGCTTCCCACCAAAGACAGTGTTCGCAAA

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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TAAAAAGAAGAAAATACTCAGTTGGTTTGGAGAAGAAGCCAGAGATCATTGCCTCACTTG
TGTTTCATCAAGTTACTGGAGCCGATGAACAGTATCTTGCACTCAAAGGCGCTGGAATCA
AAACGGGTGACCATATGCAAGTTTACATCCCTGATGTCAAAGTGGCTGAAGCATCACTGA
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GT


BQ
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10 10 

AF RR4G065TF U 1
AF RR4FU44TF U 1
BS 1 649 RR4FU44TF
BS 650 650 RR4G065TF
BS 651 782 RR4FU44TF

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CCGATAAACAG

QA 1 697 1 697
DS 

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GCAAGATCAGAGTTCTTGCATGTCTAATCTTCGCAAGAGATAGACACAGGCCCGTTGATG
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TTATGACTGCAAAAATAATTGGAGAAGCAGAGGTTCTCAATGGAGAACAGATTCTAGATG
ACATAGAAGTAAATCAGTTAGGAAACCCGCTCCAGGTGGCTGATCCATACATTGGAGTGA
TAAAAAGAAGAAAATACTCAGTTGGTTTGGAGAAGAAGCCAGAGATCATTGCCTCACTTG
TGTTTCATCAAGTTACTGGAGCCGATGAACAGTATCTTGCACTCAAAGGCGCTGGAATCA
AAACGGGTGACCATATGCAAGTTTACATCCCTGATGTCAAAGTGGCTGA*GCATCACTGA
GTGATGTATCTTCGCAGCTTAGAGACATCGTGTCCAACCGATAAACAGCAGTTGTTGGAG
TTTGTTTCGCTGATAGTGGACGTGGTGACTCTTCTTGGTCGTCCAACGCAGAAAGCTCGC
GT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

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TAAAAATAACAAAACGTGGTGGAGCCAATGTTTGATAATTGTCTAATCATTTTTGCTGCA
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CACTTTTTGAGTTTTTCTTTTGTGATAAAAAACACAACAAGACATTACATAAAGTTTTAG
TTACAGTTGTGCACTCACTGTGAGTTTTCTTCGTGTCTCCAAACTCTTAGGTTTAGTAGT
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GCTTGTTGCACACTCCGACATAACAGAGAAACCTGCTGCACTTTCTGTCATTACGCTCCA
CTCTATGCTTACTTCGCTCGGAGCATAATCACTTACTTGCCTCGAAAGAAAAGGTTTTGG
TTTACCTGTGAGATTGTCTATCTCGAACAGATCCGAGCTTGAATCACTCCCTTCACTCTT
TGTGTCTTCTTCTTCCTTTCTTCTTGATTCCCACGGAGGCAATGTGAGTTTCTTCTCGAT
ATTTAAAGGAGATCCAAACACTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A069JQ U 349
AF RR4A069JQD U 1
AF RR4A069TFB C 31
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DS 

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TAAAAATAACAAAACGTGGTGGAGCCAATGTTTGATAATTGTCTAATCATTTTTGCTGCA
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CACTTTTTGAGTTTTTCTTTTGTGATAAAAAACACAACAAGACATTACATAAAGTTTTAG
TTACAGTTGTGCACTCACTGTGAGTTTTCTTCGTGTCTCCAAACTCTTAGGTTTAGTAGT
CTCCATTGGGAACCTCCCAACATGACTTGGGGATGTCTTGTTTTTGTTCATGCTACGTCT
TCTCTCTGAATCACCAGAAACCATAACAGATTTATAACTCTTACAGCTCAACAAGAAACC
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ATGAATCTTGTTATTACTAGGGACCCGAGGAATATGAGAAGAGCGGTTTCTTCTTACAGG
GCTTGTTGCACACTCCGACATAACAGAGAAACCTGCTGCACTTTCTGTCATTACGCTCCA
CTCTATGCTTACTTCGCTCGGAGCATAATCACTTACTTGCCTCGAAAGAAAAGGTTTTGG
TTTACCTGTGAGATTGTCTATCTCGAACAGATCCGAGCTTGAATCACTCCCTTCACTCTT
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ATTTAAAGGAGATCCAAACACTTCC

QA 1 805 1 805
DS 

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TTTGATAATTGTCTAATCATTTTTGCTGCATTCCGGATCTGTGTTTTTTAAACTGATTAG
AATGCTGTTTTTGACTTTCCAACCAAATGACACTTTTTGAGTTTTTCTTTTGTGATAAAA
AACACAACAAGACATTACATAAAGTTTTAGTTACAGTTGTGCACTCACTGTGAGTTTTCT
TCGTGTCTCCAAACTCTTAGGTTTAGTAGTCTCCATTGGGAACCTCCCAACATGACTTGG
GGATGTCTTGTTTTTGTTCATGCTACGTCTTCTCTCTGAATCACCAGAAACCATAACAGA
TTTATAACTCTTACAGCTCAACAAGAAACCACCACTTCTGCCGCTGCTATTCGTTTT*CC
GAATCTGCGGTGCATTTTT*AGACATTTT*ATGAATCTTGTTATTACTAGGGACCCGAGG
AATATGAGAAGAGCGGTTTCTTCTTACAGGGCTTGTTGCACACTCCGACATAACAGAGAA
ACCTGCTGCACTTTCTGTCATTACGCTCCACTCTATGCTTACTTCGCTCGGAGCATAATC
ACTTACTTGCCTCGAAAGAAAAGGTTTTGGTTTACCTGTGAGATTGTCTATCTCGAACAG
ATCCGAGCTTGAATCACTCCCTTCACTCTTTGTGTCTTCTTCTTCCTTTCTTCTTGATTC
CCACGGAGGCAATGTGAGTTTCTTCTCGATATTTAAAGGAGATCCAAA

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 3

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GCAGAAAAGATTGGGTTGCAAAAAAAGCAGTAATTTGGCCTAAAAAGTAAGGTCCTTTGG
GTCCTCAATAATGCTGGCCAATGTTTGCAAGAACTGTGCGAGATCAGCACCATAGATAAC
ACGATGATCTGCAGTCACATTCACCTGCATCTGGTTTTTCATGCCAATGCGGCCGTCTTT
AGTAGCAACCACTGTAGGTTGCGATGCTCCTACAGCCATAATCGCTCCAGTTCCAGGGGG
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ACCACCATCAATAGCGACGGCAACAGCAATGTTGATGCTAGCGTTATACACAAAACTGTT
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TGTTAGTAGTGCCGTCATTGTCACTCCTTTCGACTTAATCTTCTTGTAGAGAGCATCAAG
AGCATCGGTGTTGAAAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG60JQ U 340
AF RR4DY15JQ U 1
AF RR4E092JQ U 1
BS 1 185 RR4DY15JQ
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CT

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DS 

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QA 1 675 1 675
DS 

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ACGATGATCTGCAGTCACATTCACCTGCATCTGGTTTTTCATGCCAATGCGGCCGTCTTT
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TTTTCTAGACAATGAATAAATGTCAACCTTATCGGCGTTCTGAAGCACAGGAGTGATCAA
ACCACCATCAATAGCGACGGCAACAGCAATGTTGATGCTAGCGTTATACACAAAACTGTT
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QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

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TCCTGAAACTCCTCAGTTTCCAATCCAAATCCTCATCTCTAGTCGTCATGATCGCATAGC
TCACTGCAATCACCTCGAAGAAGACAGAGAAAGCGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BN82JQ U 1
AF RR4AK07JQ U 53
AF RR4BN82TF C 541
BS 1 414 RR4BN82JQ
BS 415 415 RR4AK07JQ
BS 416 756 RR4BN82JQ
BS 757 757 RR4AK07JQ
BS 758 773 RR4BN82JQ
BS 774 805 RR4AK07JQ
BS 806 1239 RR4BN82TF

RD RR4BN82JQ 773 0 0
AACACCAAAAAGTAAAATTTTATACGATGAAAGTGATTTGAGTCAAACTAGAAACAAGCT
GTCATACCAAAAGTATAGAGATAAATAAAAATACACGGCGCGATGTGTTTACAGACGAAA
AGTAAGATAAAATAAATAAAAACCTATTCCGATTGTCTTTGTTCAGACTTTTCATTCCAC
AATCAAAACTGCAAGCAGGTATAAGATTTTAGAAGACCAAAAGGATCATCTCAAACTCTC
TTTCTACCACAAACACATAAGAAAGCCTTTTTTTCTTTACCTCACACAAGAACTTTTCTT
AGCTCTCAGTTGTTTCCGAGGCTTCTCCCACAATCTCGGCAGGGAGTGGACTGTCACCAC
GCTCACTAGTAGAGCTACTGCTATTAATCACTTCACTTTCCATTGGATTCAGAGGGGCTG
TATTAGCAGTAGGAGGAACAAGCGATTGCTGCTCTTCTGAATGCTTCGGCTTGTTCAAGG
CCCGGCAATGAGGACAATAGTAAGTAGTGTACTCGAAGTCCTCTTTCCGGCAAAGTCCGT
TATGCATATGGCAGTTTCCGCAGATGAGTGCATACGACTGAGTTGGATCTTCACCAACGA
GGAGAGCCGCTATGCGTGGGATCCAGCTACCGTCATGAGCAGCATACCCCTGAGGGTTAA
AATGCTCGAAAGCCATCTGCTGGTTTTGCTCTGTGGTTCCTTCGCTTGTTCCAGAATGGT
TAGACTCGTTATCTGAATGGTGGGATGAAGTGGACC*AGCAGTGCTTCGTCTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4AK07JQ 756 0 0
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AGACGAAAAGTAAGATAAAATAAATAAAAACCTATTCCGATTGTCTTTGTTCAGACTTTT
CATTCCACAATCAAAACTGCAAGCAGGTATAAGATTTTAGAAGACCAAAAGGATCATCTC
AAACTCTCTTTCTACCACAAACACATAAGAAAGCCTTTTTTTCTTTACCTTACACAAGAA
CTTTTCTTAGCTCTCAGTTGTTTCCGAGGCTTCTCCCACAATCTCGGCAGGGAGTGGACT
GTCACCACGCTCACTAGTAGAGCTACTGCTATTAATCACTTCACTTTCCATTGGATTCAG
AGAGGCTGTATTAGCAGTAGGAGGAACAAGTGATTGCTGCTCTTCTGAATGCTTCGGCTT
GTTCAAGGCCCGGCAATGAGGACAATAGTAAGTAGTGTACTCGAAGTCCTCTTTCCGGCA
AAGTCCGTTATGCATATGGCAGTTTCCGCAGATGAGTGCATACGACTGAGTTGGATCTTC
ACCAACGAGGAGAGCCGCTATGCGTGAGATCCAGCTACCGTCATGAGCAGCATACCCCTG
AGGGTTAAAATGCTCGAAAGCCATCTGCTGGTTTTGCTCTGTGGTTCCTTCGCTTGTTCC
AGAATGGTTAGACTCGTTATCTGAATGGTGGGATGAAGTGGACCCAGCAGTGCTTCGTCT
TGTGTTTGGTTGTTTTCGGTTTCTGAGCCCTTG
CAG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4BN82TF 699 0 0
TATGCATATGGCAGTTTCCGCAGATGAGTGCATACGACTGAGTTGGATCTTCACCAACGA
GGAGAGCCGCTATGCGTGGGATCCAGCTACCGTCATGAGCAGCATACCCCTGAGGGTTAA
AATGCTCGAAAGCCATCTGCTGGTTT*GCTCTGTGGTTCCTTCGCTTGTTCCAGAATGGT
TAGACTCGTTATCTGAATGGTGGGATGAAGTGGACCCAGCAGTGCTTCGTCTTGTGTTTG
GTTGTTTTCGGTTTCTGAGCCCTTGGGAGTGTTCGATCTCCATGTCATTGCTCTTGCCTG
TGGCAGGGTCAAGTTGGGATTCATCTCCTACGTGTACTTTCAAGCCTGAATCAGCACCCA
ACTTGGATGCCAGAATAGTTGCAGCAGCCGCCCTTGCAGCTGGGTCAGGGTCAAACCTAC
GAAGAATATCGAGGGTGGTGAAGTAATTGGTCCTCTCTTTCAACTCATCGATCTTCCCCA
GCATTTCACCTTGAAGCTTCTCCAATGTGTTTTGATCTCTGCGGTCACACATCCTGGTGA
AGCTAACGAGAGAAGAATAAGTAAGGAAAGAAAGAGCAGGCAAAAGAAACATAGGCAAGA
TCCTGAAACTCCTCAGTTTCCAATCCAAATCCTCATCTCTAGTCGTCATGATCGCATAGC
TCACTGCAATCACCTCGAAGAAGACAGAGAAAGCGATGA

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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CCACTCTCTTCCTCAATTCCAAATCTTTTTCGATTAGCAAATGGCTTCGTATTACTCTGC
GTTTTTCGGCAGTGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTCTCTCTTTGCAGTAAACACCTTG
GTCTTAACTCCGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACAGCGTTTTGTAGCATAGAGTGTA
GAGAAGAACAGATTGAATCTGATGAAGCCAAGGAGAGAAGCTGGAAACTTTCTGCTAGAT
CTCTCCGTAAAAAATCTTCTGAAGCTGCAAAAGATTCAGCCGCCGGAAAAACCGTTCGGA
CAGGAACACTCGTGGGTCGCCTAGTATAATATTTTTTATTACATAAGAAAACCAAAGCAT
GTAGCTTTTGTGTATACCCTTTTTGTCTAAAAGCTAATCCCTCTGTTTTTTTAAGATACA
TATTATAGATTTTTCACATA


BQ
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AF RR4AT28TF U 12
AF RR4AT28JQ C 1
BS 1 11 RR4AT28JQ
BS 12 425 RR4AT28TF
BS 426 500 RR4AT28JQ

RD RR4AT28TF 414 0 0
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CTCAATTCCAAATCTTTTTCGATTAGCAAATGGCTTCGTATTACTCTGCGTTTTTCGGCA
GTGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTCTCTCTTTGCAGTAAACACCTTGGTCTTAACTCC
GACATCTTCATGTACAGAGGAGACACAGCGTTTTGTAGCATAGAGTGTAGAGAAGAACAG
ATTGAATCTGATGAAGCCAAGGAGAGAAGCTGGAAACTTTCTGCTAGATCTCTCCGTAAA
AAATCTTCTGAAGCTGCAAAAGATTCAGCCGCCGGAAAAACCGTTCGGACAGGAACACTC
GTGGGTCGCCTAGTATAATATTTTTTATTACATAAGAAAACCAAAGCATGTAGC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4AT28JQ 500 0 0
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CCACTCTCTTCCTCAATTCCAAATCTTTTTCGATTAGCAAATGGCTTCGTATTACTCTGC
GTTTTTCGGCAGTGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTCTCTCTTTGCAGTAAACACCTTG
GTCTTAACTCCGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACAGCGTTTTGTAGCATAGAGTGTA
GAGAAGAACAGATTGAATCTGATGAAGCCAAGGAGAGAAGCTGGAAACTTTCTGCTAGAT
CTCTCCGTAAAAAATCTTCTGAAGCTGCAAAAGATTCAGCCGCCGGAAAAACCGTTCGGA
CAGGAACACTCGTGG*TCGCCTAGTATAATATTTTT*ATTACATAAGAAAACCAAAGCAT
GTAGCTTTTGTGTATACCCTTTTTGTCTAAAAGCTAATCCCTCTGTTTTTTTAAGATACA
TATTATAGATTTTTCACATA

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 3

CO CL4478Contig1 772 3 19 U
GGGTCTTCTTCGATCGCATTGACTTGTCCGTGTAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGG
AGCAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCACGCTCCGTCGTATCATCAT
CGCTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATG
GAAGCATTGGATTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTATAAGTTTCT
CGATGGGATGGCGAAGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGA
CATGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGT
GCAGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATT
TGGAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGG
TGTAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGG
GCAAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATCTTTTAGCAACTTAACTTTGGGAAAATCAG
TCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAAACACACTCACTCTTGGCTTTGC
AAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGCCTTTTACACTGTTTGAATTTAATGGATGTT
GTTGATGTTAAGATTGAAGGTTTTTAGTTATCCTGAGTAAACTCCCTAAGGT


BQ
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU60TF U 1
AF RR4GU60JQ C 1
AF RR4CI23TF U 43
BS 1 42 RR4GU60TF
BS 43 101 RR4CI23TF
BS 102 102 RR4GU60TF
BS 103 177 RR4CI23TF
BS 178 178 RR4GU60TF
BS 179 216 RR4CI23TF
BS 217 217 RR4GU60TF
BS 218 314 RR4CI23TF
BS 315 315 RR4GU60TF
BS 316 638 RR4CI23TF
BS 639 639 RR4GU60TF
BS 640 689 RR4CI23TF
BS 690 690 RR4GU60TF
BS 691 694 RR4CI23TF
BS 695 695 RR4GU60TF
BS 696 706 RR4CI23TF
BS 707 707 RR4GU60JQ
BS 708 728 RR4CI23TF
BS 729 772 RR4GU60JQ

RD RR4GU60TF 712 0 0
GGGTCTTCTTCGATCGCATTGACTTGTCCGTGTAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGG
AGCAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCACGCTCCGTCGTATCATCAT
CGCTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATG
GAAGCATTGGATTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTATAAGTTTCT
CGATGGGATGGCGAAGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGA
CATGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGT
GCAGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATT
TGGAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGG
TGTAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGG
GCAAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATCTTTTAGCAACTTAACTTTGGGAAAATCAG
TCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAAACACACTCACTCTTGGCTTTGC
AAA*TCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGCCTTTTACACTGTTTGA
TTTAAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4GU60JQ 772 0 0
GGGTCTTCTTCGATCGCATTGACTTGTCCGTGTAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGG
AGCAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCACGCTCCGTCGTATCATCAT
CGCTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATG
GAAGCATTGGATTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTATAAGTTTCT
CGATGGGATGGCGAAGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGA
CATGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGT
GCAGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATT
TGGAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGG
TGTAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGG
GCAAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATCTTTTAGCAACTTAACTTTGGGAAAATCAG
TCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAAACACACTCACTCTTGGCTTTGC
AAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGCCTTTTACACTGTTTGAATTTAATGGATGTT
GTTGATGTTAAGATTGAAGGTTTTTAGTTATCCTGAGTAAACTCCCTAAGGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CI23TF 691 0 0
TTTAATGGCGAATCAAGGAGCAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCAA
GCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGATTTT
CTATTCGAGCTTTACGTGGAAGCATTGGATTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGATACGG
TGTTCCTTATAAGTTTCTCGATGGGATGGCGAAGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCT
TATTGATGGTGGGTTTGACATGAGCACTGGTGATATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCT
CTACATCACTTGCTTTGTGCAGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTA
TCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTC
ACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGA
GAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATCTTTTAGCAACT
TAACTTTGGGAAAATCAGTCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAA*CAC
ACTCACTCTTGGCTTTGCAAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGTCTTT*ACACTGT
TTGA*TTTAATGGATGTTGTTGATGT
AAGAT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL4479Contig1 695 3 3 U
GGATCAAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAG
TTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAAAAATGTCGACGGTGGTA
GATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGT
GAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGT
GACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTGGAG
GAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTGACAGGTATCGAGTCAGAT
GTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTAC
AGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATAC
TGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAA
CAAAAAAAAAAATCTATCCGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAA
TAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTAC
TACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH67JQ C 1
AF RR4DH67TF U 1
AF RR4EQ63TF U 3
BS 1 5 RR4DH67JQ
BS 6 521 RR4DH67TF
BS 522 695 RR4EQ63TF

RD RR4DH67JQ 521 0 0
GGATCAAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAG
TTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAAAAATGTCGACGGTGGTA
GATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGT
GAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGT
GACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTGGAG
GAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTGACAGGTATCGAGTCAGAT
GTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTAC
AGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATAC
TGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4DH67TF 521 0 0
GGATC
AAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGTTCGA
CTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAAAAATGTCGACGGTGGTAGATGG
GAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGT
AGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTT
CTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTGGAGGAGCT
AACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTGACAGGTATCGAGTCAGATGTTGG
TAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATC
TAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCG
CCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCAC

QA 6 521 6 521
DS 

RD RR4EQ63TF 693 0 0
GGA
AAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGTTCGA
CTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAAAAATGTCGACGGTGGTAGATGG
G**TGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGT
AGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTT
CTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTGTCAGACATGGAGGACGAGTTGGAGGAGCT
AACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTGACAGGTAACGAGTCAGATGTTGG
TAGGTACCTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATC
TAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCG
CCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAA
AAAAAAATCTATCCGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAA
GCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTACTACTT
TCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCCG

QA 4 693 4 693
DS 



AS 1 3

CO CL4480Contig1 1030 3 5 U
AGATTATAAAGAAGTATATATAATTAAAACTTTTACCCATCTTTTTTACATCTCATTGAT
CAAAAAGGGGAGAAAAAGAAACTCAAAGTGAGCTAATGATAGATTCCAAGTTTTTGAAAC
ATGCATGGGTTCTTTCTGATACCAAAACAAAAAATATATTAAAAATTAAAAGAAATAAAA
ACAGGTCGACCGGTTTCAGTTGTACTGTTGCTGATCAAGCCATGGCC*AAAAACCAGAGT
GGTCATCCATTGCACAGAACATGTTACTGATACTGCTCTCTTCTTTAACCATACTCTGAC
CAGAAGACGGGTTTTGAAAGAATTGCATCGTCGTTGTGGTGGTTGTTGCGGTCGCTGGGG
ACGGTGGAAAGAAGTGTCGACCAATAGTCTGCGGCGCTGGTGGATGGCCGCCTGTTATTG
TGCTGTCTATTGATGGCGGAGCTGTAGAGATGTCCAGCCTGAGATTATCGGAACTGTTGT
CGCTTCTGTTACTGCAAGATCCTTCTGTTTCTTTGTTCAGATTTATTGATTCTGTTTGTT
CTCTGTTCTTTAAACTCATTATCTCAGTTTGGAGTTTCTGGTTGTGAGTTTGAAGAAGAT
CGTTTTCAGCTTTAAGAGAATCAAACTGTCGTTTAAGTGTATCATAATCTTTCTCAAGCT
GCTTTGTTTTCCAGCGAGCTCTTCTGTTCTGAAACCAAATCGCTATCTGTCTTGGCTGTA
ACCCCAAGGCACGAGCCAACTGCATTTTCCTCTCTGGTTCAAGCTTGTTTCCAATCTCGA
AGTTCTTCTCTAATGTCTTCACTTGCTCCATGTTCAATCTCCTCTTCTTTTCTCCCGTTT
GAGACCCATCATCTGAATAATCCTCTTCTCCGTTCATAATATTCCCAGCTTCTAACCCTT
CTATTGGAGATCGCTTACCGAGAAACGAAGCAAACCCATGAAGATATTGAGGTATAGAGC
AAGAAGGAAGGAGAGGTGAAAGAGAATGAGGTAGATCTTCATAAGAGCTTTGGATCATGA
AATTTGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK02JQ U 1
AF RR4BL73JQ U 74
AF RR4AK02TF C 195
BS 1 806 RR4AK02JQ
BS 807 870 RR4BL73JQ
BS 871 871 RR4AK02TF
BS 872 890 RR4BL73JQ
BS 891 1030 RR4AK02TF

RD RR4AK02JQ 806 0 0
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CAAAAAGGGGAGAAAAAGAAACTCAAAGTGAGCTAATGATAGATTCCAAGTTTTTGAAAC
ATGCATGGGTTCTTTCTGATACCAAAACAAAAAATATATTAAAAATTAAAAGAAATAAAA
ACAGGTCGACCGGTTTCAGTTGTACTGTTGCTGATCAAGCCATGGCC*AAAAACCAGAGT
GGTCATCCATTGCACAGAACATGTTACTGATACTGCTCTCTTCTTTAACCATACTCTGAC
CAGAAGACGGGTTTTGAAAGAATTGCATCGTCGTTGTGGTGGTTGTTGCGGTCGCTGGGG
ACGGTGGAAAGAAGTGTCGACCAATAGTCTGCGGCGCTGGTGGATGGCCGCCTGTTATTG
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CTCTGTTCTTTAAACTCATTATCTCAGTTTGGAGTTTCTGGTTGTGAGTTTGAAGAAGAT
CGTTTTCAGCTTTAAGAGAATCAAACTGTCGTTTAAGTGTATCATAATCTTTCTCAAGCT
GCTTTGTTTTCCAGCGAGCTCTTCTGTTCTGAAACCAAATCGCTATCTGTCTTGGCTGTA
ACCCCAAGGCACGAGCCAACTGCATTTTCCTCTCTGGTTCAAGCTTGTTTCCAATCTCGA
AGTTCTTCTCTAATGTCTTCACTTGC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4BL73JQ 817 0 0
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TTCTGATACCAAAACAAAAAATATATTAAAAATTAAAAGAAATAAAAACAGGTCGACCGG
TTTCAGTTGTACTGTTGCTGATCAAGCCATGGCC*AAAAACCAGAGTGGTCATCCATTGC
ACAGAACATGTTACTGATACTGTTCTCTTCTTTAACCATACTCTGACCAGAAGACGGGTT
TTGAAAGAATTGCATCGTCGTTGTGGTGGTTGTTGCGGTCGCTGGGGACGGTGGAAAGAA
GTGTCGACCAATAGTCTGCGGCGCTGGTGGATGGCCGCCTGTTATTGTGCTGTCTATTGA
TGGCGGAGCTGTAGAGATGTCCAGCCTGAGATTATCGGAACTGTTGTCGCTTCTGTTACT
GCAAGATCCTTCTGTTTCTTTGTTCAGATTTATTGATTCTGTTTGTTCTCTGTTCTTTAA
ACTCATTATCTCAGTTTGGAGTTTCTGGTTGTGAGTTTGAAGAAGATCGTTTTCAGCTTT
AAGAGAATCAAACTGTCGTTTAAGTGTATCATAATCTTTCTCAAGCTGCTTTGTTTTCCA
GCGAGCTCTTCTGTTCTGAAACCAAATCGCTATCTGTCTTGGCTGTAAACCCAAGGCACG
AGCCAACTGCATTTTCCTCTCTGGTTCAAGCTTGTTTCCAATCTCGAAGTTCTTCTCTAA
TGTCTTCACTTGCTCCATGTTCAATCTCCTCTTCTTTTCTCCCGTTTGAGACCCATCATC
TGAATAATCCTCTTCTC*GTTCATAATATTCCCAGCT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4AK02TF 836 0 0
GTTCAG
TGTACTGTTGCTGATCAAGCCATGGCCCAAAAACCAGAGTGGTCATCCATTGCACAGAAC
ATGTTACTGATACTGCTCTCTTCTTTAACCATACTCTGACCAGAAGACGGGTTTTGAAAG
AATTGCATCGTCGTTGTGGTGGTTGTTGCGGTCGCTGGGGACGGTGGAAAGAAGTGTCGA
CCAATAGTCTGCGGCGCTGGTGGATGGCCGCCTGTTATTGTGCTGTCTATTGATGGCGGA
GCTGTAGAGATGTCCAGCCTGAGATTATCGGAACTGTTGTCGCTTCTGTTACTGCAAGAT
CCTTCTGTTTCTTTGTTCAGATTTATTGATTCTGTTTGTTCTCTGTTCTTTAAACTCATT
ATCTCAGTTTGGAGTTTCTGGTTGTGAGTTTGAAGAAGATCGTTTTCAGCTTTAAGAGAA
TCAAACTGTCGTTTAAGTGTATCATAATCTTTCTCAAGCTGCTTTGTTTTCCAGCGAGCT
CTTCTGTTCTGAAACCAAATCGCTATCTGTCTTGGCTGTAACCCCAAGGCACGAGCCAAC
TGCATTTTCCTCTCTGGTTCAAGCTTGTTTCCAATCTCGAAGTTCTTCTCTAATGTCTTC
ACTTGCTCCATGTTCAATCTCCTCTTCTTTTCTCCCGTTTGAGACTCATCATCTGAATAA
TCCTCTTCTCCGTTCATAATATTCCCAGCTTCTAACCCTTCTATTGGAGATCGCTTACCG
AGAAACGAAGCAAACCCATGAAGATATTGAGGTATAGAGCAAGAAGGAAGGAGAGGTGAA
AGAGAATGAGGTAGATCTTCATAAGAGCTTTGGATCATGAAATTTGAAGG

QA 7 836 7 836
DS 



AS 1 3

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ATCCTCTGTTCAATGCTTATCCTCTTACGATTCTCATCATCATTATCATCATCAACGCTC
TCAGAGTGATTCGCGTTGGAGATTGGGTTCTAGGGTTTTAGTATCATCGAGTCTGTGTAA
GATTTCTCTGCTTTCTGGAGTTTATTTGAAGCGAAGGAGACATTTGATGTGTGCAGTCAA
GGGAGGAGCTGCAGAAGGAGCGTTTAAGAAGACTGTTGAACTCGATATGATGATAGATGC
TCTTAAAGATGCTAACCCTAGAGAACTTGAGAAGCTTGTTGTTGAAAACATCCTTGCCTT
TGATGAAGTTTTTTGGCTTAGACTAGCTGCCAGGTCGGATACTTGCACATCAGATGATGA
CAAGAAGGACTATGAGGAGTTAGCTGCAACTGTGATGACCATAGTTGACTGCGTTGTTAA
TATGACTCAGGAGAAGATAGAGTCGTCTACTGATGTTCTGAAAGCGATATTAAGACCCGT
TGTGGAAGGAGTTGAAGAAATCTCATGGCCTCCCAGAGATCCTCAAGCCATCAATCAAAT
GGAAAAGGAAATGATACAACGGGAAAAAGAAGGGCAATTAGACGAAGGGTTTCTTTCACA
AGTTAGTGCTCAGCTACGGCAGGCAAAAGAAGATAAAGACAGACCAGGGCTTGCGGCCAT
GCTCCAGAAAGTTCTACAACTCTATGCTGCTACGGTCCTCTCCAAGCGTAGCTACGCAAA
GAAAGGGAACGAAGTTGTAAAGGCGGAGCAGTTTCTGGAAACTCTGATCAAAGCTCCTGA
GGAACAATGGAACAAGCTTTTCTTAGAAGGGTTAACACTCGGGAAAGGTGAAGTAACACC
TGATGAGCTATCTGCTGTTATAAAGAAACGCGTTGAGCGCACGCTGATTCGAACTGAAGG
AGGTTCATACGAGCAGCGAATCTTGATCGAGTATCTCAAAGGGATGGAGTCCAGAGCAAA
TGATGTTATGAAATTACTTCAGGGTTAAATATCAATTCCAAATTTATATTTTATCCTTCC
AAGTTTATATAAAAATCAATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C353TF U 29
AF RR4FI21TF U 1
AF RR4FI21JQ C 322
BS 1 128 RR4FI21TF
BS 129 129 RR4C353TF
BS 130 272 RR4FI21TF
BS 273 273 RR4C353TF
BS 274 628 RR4FI21TF
BS 629 1104 RR4FI21JQ

RD RR4C353TF 283 0 0
GG
GAGCTTTCACTTCACTTCAATGGCGGCAATATCCTCTGTTCAATGCTTATCCTCTTACGA
TTCTCATCATCATTATCATCATCAACGCTCTCAGAGTGATTCGCGTTGGAGATTGGGTTC
TAGGGTTTTAGTATCTTCGAGTCTGTGTAAGATTTCTCTGCTTTCTGGAGTTTATTTGAA
GCGAAGGAGACATTTGATGTGTGCAGTCAAGGGAGGAGCTGCAGAAGGAGCGTTTAAGAA
GACTGTTGAACTCGATATGATGATAGATGCTCTTAAAGATG

QA 3 283 3 283
DS 

RD RR4FI21TF 628 0 0
GGAACCGAGAGTTTGAACGGTCGTGAGAGAGAGCTTTCACTTCACTTCAATGGCGGCAAT
ATCCTCTGTTCAATGCTTATCCTCTTACGATTCTCATCATCATTATCATCATCAACGCTC
TCAGAGTGGTTCGCGTTGGAGATTGGGTTCTAGGGTTTTAGTATCATCGAGTCTGTGTAA
GATTTCTCTGCTTTCTGGAGTTTATTTGAAGCGAAGGAGACATTTGATGTGTGCAGTCAA
GGGAGGAGCTGCAGAAGGAGCGTTTAAGAAGA*TGTTGAACTCGATATGATGATAGATGC
TCTTAAAGATGCTAACCCTAGAGAACTTGAGAAGCTTGTTGTTGAAAACATCCTTGCCTT
TGATGAAGTTTTTTGGCTTAGACTAGCTGCCAGGTCGGATACTTGCACATCAGATGATGA
CAAGAAGGACTATGAGGAGTTAGCTGCAACTGTGATGACCATAGTTGACTGCGTTGTTAA
TATGACTCAGGAGAAGATAGAGTCGTCTACTGATGTTCTGAAAGCGATATTAAGACCCGT
TGTGGAAGGAGTTGAAGAAATCTCATGGCCTCCCAGAGATCCTCAAGCCATCAATCAAAT
GGAAAAGGAAATGATACAACGGGAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4FI21JQ 783 0 0
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AGCTGCAACTGTGATGACCATAGTTGACTGCGTTGTTAATATGACTCAGGAGAAGATAGA
GTCGTCTACTGATGTTCTGAAAGCGATATTAAGACCCGTTGTGGAAGGAGTTGAAGAAAT
CTCATGGCCTCCCAGAGATCCTCAAGCCATCAATCAAATGGAAAAGGAAATGATACAACG
GGAAAAAGAAGGGCAATTAGACGAAGGGTTTCTTTCACAAGTTAGTGCTCAGCTACGGCA
GGCAAAAGAAGATAAAGACAGACCAGGGCTTGCGGCCATGCTCCAGAAAGTTCTACAACT
CTATGCTGCTACGGTCCTCTCCAAGCGTAGCTACGCAAAGAAAGGGAACGAAGTTGTAAA
GGCGGAGCAGTTTCTGGAAACTCTGATCAAAGCTCCTGAGGAACAATGGAACAAGCTTTT
CTTAGAAGGGTTAACACTCGGGAAAGGTGAAGTAACACCTGATGAGCTATCTGCTGTTAT
AAAGAAACGCGTTGAGCGCACGCTGATTCGAACTGAAGGAGGTTCATACGAGCAGCGAAT
CTTGATCGAGTATCTCAAAGGGATGGAGTCCAGAGCAAATGATGTTATGAAATTACTTCA
GGGTTAAATATCAATTCCAAATTTATATTTTATCCTTCCAAGTTTATATAAAAATCAATT
CAT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4482Contig1 1225 2 2 U
GATCGATGATGAAAGAGTTAACCTTGCGTACAAGAGACTACTTGGTCTCGTTTGGAGAGT
GTATGTCCACAAGGCTTTTCTCTGCGTATCTCAACAAAATTGGCCATAAAGCTCGTCAAT
ATGATGCATTTGAGATTGGGTTTATAACCACAGACGATTTCACAAATGCTGATATACTTG
AAGCAATGTACCCTGCTGTCTCCAAAACGCTGCTTAATAACTGGAGCAAGGACAAAGCCG
TCCCTGTAGTTACTGGCTTCCTCGGAAAGGGATGGAGGTCTTGTGCTATAACTACGTTAG
GCCGGGGTGGTAGTGATTTGACGGCAACAACGATTGGGAAAGCGTTAGGACTGAGGGAGA
TTCAGGTTTGGAAAGACGTGGATGGAGTTTTGACTTGTGATCCGAACATATACTCTGGAG
CTCAGTCTGTTCCTTACTTAACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTCGGTGCTC
AGGTGTTGCATCCACTCTCCATGCGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTGAGGGTTA
AGAACTCGTACAACCCCAATGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAGTA
AGGCCGTTCTCACAAGCATTGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATATCAAGCA
CTCGTATGCTCGGCCAGTACGGTTTCCTCGCCAAGGTGTTTACCACATTCGAAGACTTAG
GCATATCGGTGGATGTTGTGGCAACAAGTGAAGTTAGTATATTTCTGACACTTGATCCAG
CAAAGCTCTGGGGTAGAGAGTTAGTTCAGCGAGCAAACGAGCTGGATCATGTGGTGGAGG
AGCTAGAGAAGATTGCTGTTGTGAAGCTGCTTCAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCATAG
GAAACGTTCAGAAATCATCACTCATATTAGAGAAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCAATG
GAGTGAATGTGCAGATGATCTCACAGGGTGCGTCTAAGGTGAACATATCATTGATAGTGA
ATGATGAAGAGGCTGAGCAATGTGCGAGGGCTCTTCACTCCGCCTTCTTTGAGACCTCTT
CTTGATGCACAGACACAGAGCTAAAGAATGTGTCTACTAAGACTTGGAACTACTTCACAC
TCTCCTTCTCTTTCTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGATACGGTTATAATGTGTTTCAAA
CTCTATAATCAATAAAATGTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BZ08TF U 1
AF RR4BZ08JQ C 420
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BS 682 1225 RR4BZ08JQ

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GTATGTCCACAAGGCTTTTCTCTGCGTATCTCAACAAAATTGGCCATAAAGCTCGTCAAT
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TCCCTGTAGTTACTGGCTTCCTCGGAAAGGGATGGAGGTCTTGTGCTATAACTACGTTAG
GCCGGGGTGGTAGTGATTTGACGGCAACAACGATTGGGAAAGCGTTAGGACTGAGGGAGA
TTCAGGTTTGGAAAGACGTGGATGGAGTTTTGACTTGTGATCCGAACATATACTCTGGAG
CTCAGTCTGTTCCTTACTTAACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTCGGTGCTC
AGGTGTTGCATCCACTCTCCATGCGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTGAGGGTTA
AGAACTCGTACAACCCCAATGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAGTA
AGGCCGTTCTCACAAGCATTGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATATCAAGCA
CTCGTATGCTCGGCCAGTACG
TTTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BZ08JQ 806 0 0
GAGCTCAGTCTGTCC
TACTTAACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTCGGTGCTCAGGTGTTGCATCCA
CTCTCCATGCGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTGAGGGTTAAGAACTCGTACAAC
CCCAATGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAGTAAGGCCGTTCTCACA
AGCATTGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATATCAAGCACTCGTATGCTCGGC
CAGTACGGTTTCCTCGCCAAGGTGTTTACCACATTCGAAGACTTAGGCATATCGGTGGAT
GTTGTGGCAACAAGTGAAGTTAGTATATTTCTGACACTTGATCCAGCAAAGCTCTGGGGT
AGAGAGTTAGTTCAGCGAGCAAACGAGCTGGATCATGTGGTGGAGGAGCTAGAGAAGATT
GCTGTTGTGAAGCTGCTTCAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCATAGGAAACGTTCAGAAA
TCATCACTCATATTAGAGAAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCAATGGAGTGAATGTGCAG
ATGATCTCACAGGGTGCGTCTAAGGTGAACATATCATTGATAGTGAATGATGAAGAGGCT
GAGCAATGTGCGAGGGCTCTTCACTCCGCCTTCTTTGAGACCTCTTCTTGATGCACAGAC
ACAGAGCTAAAGAATGTGTCTACTAAGACTTGGAACTACTTCACACTCTCCTTCTCTTTC
TAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGATACGGTTATAATGTGTTTCAAACTCTATAATCAATA
AAATGTCTTTC

QA 16 806 16 806
DS 



AS 1 2

CO CL4483Contig1 1208 2 2 U
GAGGGAGGGTGCATATAGGTCGCTCTCGCTCTGTCCCTGTTAACGATAAGGAAGCAAGCC
TAAAGGGAATGGATTCTTTCTTCAGAGTGATCCCTTCAACTCCTCGTGTAAAGGAAGGAG
ACGTTTTCTCAAATGCATCAGAGGCTGTTAATACTGAAACATGTGAAGCTGATGGAGAAG
ACATACCTGAGGAGGAAGCAGTTTGTAGGATTTGTCTGGTGGATCTCTGTGAAGGAGGAG
AAACTTTAAAAATGGAGTGTAGTTGCAAAGGAGAGCTTGCTCTTGCACACAAAGACTGTG
CTCTTAAATGGTTCACCATAAAAGGTAACAAAACCTGTGAGGTTTGTAAACAAGAAGTTA
AGAACTTACCTGTGACACTCTTACGGATCCAAAGCATTCGAAATTCTGGTGTTCCTCAGA
TAGATGTCACTGGGTACAGGTAAATGATTCATTTACTGAAGTTTCTGCAAGATCGTTAGA
AATTTACAGAAAGTGTTTAAATATTATATCTCTATAGGGTTTGGCAGGAGGTCCCGGTTC
TAGTAATCATCAGTATGCTTGCTTACTTTTGTTTCCTGGAGCAGCTCCTGGTTGAGAAAA
TGGGGACGGGTGCAATTGCTATATCACTGCCGTTTTCTTGTATTCTTGGTCTTCTTGCAT
CCATGACTGCATCAACCATGGTAATGAGAAGATTTGTGTGGATTTACGCATCTGTACAGT
TTGCTTTGGTGGTTCTCTTCGCCCATGTATTTTATTCAGTGGTGGAATTGCAACCGGTTC
TGTCAGTTCTTCTGTCAACATTTGCTGGATTTGGTGTCTGTATATGCGGAAGTTCAGTGA
TGGTTGAGTTTGTGAGATGGAGACGTAGATGGCTAGCCAGAAGGCTGGAGCAGCAGCTGA
ACAATGCTCAGACGCTGCCCCAAACGCTGGATGCAACAACCTCTCAGCATCATCCAAATG
CAGCTTAGAGCCAGGAAAAGTGGAATGATGATTTTACATTTATACAGTTTTTGTTGGTTA
ATGTTATGTGTGATAAAGTGGAATGCTTAAAATGGTTGTTATTTTGTTTGTCTTTGCTTT
GTTTACATACACCATTGTATTGTTTGTAAGTTTGTAACTTTTACTGCTCAATCTCTGCAA
ACTAATTGTTTTGTAGTAGCATTGCTTGTAAAGTTCTCATGTATAATAAAATTGTTATGG
AAATAGCC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A448TF U 1
AF RR4A448JQ C 420
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BS 782 1208 RR4A448JQ

RD RR4A448TF 781 0 0
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TAAAGGGAATGGATTCTTTCTTCAGAGTGATCCCTTCAACTCCTCGTGTAAAGGAAGGAG
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AGAACTTACCTGTGACACTCTTACGGATCCAAAGCATTCGAAATTCTGGTGTTCCTCAGA
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TAGTAATCATCAGTATGCTTGCTTACTTTTGTTTCCTGGAGCAGCTCCTGGTTGAGAAAA
TGGGGACGGGTGCAATTGCTATATCACTGCCGTTTTCTTGTATTCTTGGTCTTCTTGCAT
CCATGACTGCATCAACCATGGTAATGAGAAGATTTGTGTGGATTTACGCATCTGTACAGT
TTGCTTTGGTGGTTCTCTTCGCCCATGTATTTTATTCAGTGGTGGAATTGCAACCGGTTC
T

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DS 

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AAATTTACAGAAAGTGTTTAAATATTATATCTCTATAGGGTTTGGCAGGAGGTCCCGGTT
CTAGTAATCATCAGTATGCTTGCTTACTTTTGTTTCCTGGAGCAGCTCCTGGTTGAGAAA
ATGGGGACGGGTGCAATTGCTATATCACTGCCGTTTTCTTGTATTCTTGGTCTTCTTGCA
TCCATGACTGCATCAACCATGGTAATGAGAAGATTTGTGTGGATTTACGCATCTGTACAG
TTTGCTTTGGTGGTTCTCTTCGCCCATGTATTTTATTCAGTGGTGGAATTGCAACCGGTT
CTGTCAGTTCTTCTGTCAACATTTGCTGGATTTGGTGTCTGTATATGCGGAAGTTCAGTG
ATGGTTGAGTTTGTGAGATGGAGACGTAGATGGCTAGCCAGAAGGCTGGAGCAGCAGCTG
AACAATGCTCAGACGCTGCCCCAAACGCTGGATGCAACAACCTCTCAGCATCATCCAAAT
GCAGCTTAGAGCCAGGAAAAGTGGAATGATGATTTTACATTTATACAGTTTTTGTTGGTT
AATGTTATGTGTGATAAAGTGGAATGCTTAAAATGGTTGTTATTTTGTTTGTCTTTGCTT
TGTTTACATACACCATTGTATTGTTTGTAAGTTTGTAACTTTTACTGCTCAATCTCTGCA
AACTAATTGTTTTGTAGTAGCATTGCTTGTAAAGTTCTCATGTATAATAAAATTGTTATG
GAAATAGCC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 3

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AAATATACAATTTAACTAGTGGTACAACGGATCTCAATGTGAATAACACCATTTCTGGAA
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TCTACATGTCCCAGTTCCTCCTTGGAACGAAAGTGAAAACCGGTTCCTTTACC*ATGACC
TCAACGCGTATACTCTCTTTCAACGGTGGCTCTTCTAGTGTGAACTGAAACTCCTCGTTC
CATCTCGGGTCTCTTGTCTTCCTCAACATCTTTGTTCTCTTCTTTTCTCCTCTGAAGAGA
ACAAGAGCGTAAGGATTTGTATATTTCTTCTTTCCCTCGACATCTTTGGCCGATTGGATT
GAAACCGAGAGTAGACCGGCGTTGCTGAGAAAAACATCATCATCGCCCTCTGATGATTTC
TCATCTCTGCTCTGCTGCTGCTGCTCATCCTCGTTTCTATACTTGAGGCTTTCACCTCTG
AATGGCACATACCTGAGGTCTAACTCTAGTCTTCCTCTCTGTTTCTTCTCTGGTACATCC
ATAACAATACTTGAATTCTTGATCAGATCCAGGTTAAACGCCTTCTTCTCCCCAGGGTTA
ATTCTCTTCAAGGGGATCATCTGCATTCCCAATCTATCATGCCCACCAACCTTGTCCCAG
TCAAAGACTTCTAGCTGAAGGACTTGTGATACTGGGTCCTTGACGATGAGCTTGAAGTGT
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TCTCCGGTCAAGCTAAGCTTGACATAAGGGTCGGATGTTCCAAGCAAGTCTTTCTTTAGG
AGATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FN45JQ U 1
AF RR4EO26JQ U 15
AF RR4EO26TF C 205
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TCTACATGTCCCAGTTCCTCCTTGGAACGAAAGTGAAAACCGGTTCCTTTACCCATGACC
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GAAACCGAAAGTAAACCGGCGCTGCTGAAAAAAACATCATCATCGCCCTCTGATGATTTC
TCATCTCTGCTCTGCTGCTGCTGCTCATCCTCGTTTCTATACTTGAGGCTTTCACCTCTG
AATGGTACATACCTGAGGTCTAACTCTAGTCTTCCTCTCTGTTTCTTCTCTGGTACATCC
ATAACAATACTTGAATTCTTGATCAGATCCAGGTTAAACGCCTTCTTCTCCCCAGGGTTA
ATTCTCTTCAAGGGGATCATCTGCATTCCCAATCTATCATGCCCACCAACCTTGTCCCA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4EO26JQ 690 0 0
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TTTCTGGTTAATCCTTCCATTGACAACTACATCGTCCAGGTTTATGTCTACATGTCCCAG
TTCCTCCTTGGAACGAAAGTGAAAACCGGTTCCTTTACC*ATGACCTCAACGCGTATACT
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TGTCTTCCTCAACATCTTTGTTCTCTTCTTTTCTCCTCTGAAGAGAACAAGAGCGTAAGG
ATTTGTATATTTCTTCTTTCCCTCGACATCTTTGGCCGATTGGATTGAAACCGAGAGTAG
ACCGGCGTTGCTGAGAAAAACATCATCATCGCCCTCTGATGATTTCTCATCTCTGCTCTG
CTGCTGCTGCTCATCCTCGTTTCTATACTTGAGGCTTTCACCTCTGAATGGCACATACCT
GAGGTCTAACTCTAGTCTTCCTCTCTGTTTCTTCTCTGGTACATCCATAACAATACTTGA
ATTCTTGATCAGATCCAGGTTAAACGCCTTCTTCTCCCCAGGGTTAATTCTCTTCAAGGG
GATCATCTGCATTCCCAATCTATCATGCCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4EO26TF 701 0 0
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AACATCTTTGTTCTCTTCTTTTCTCCTCTGAAGAGAACAAGAGCGTAAGGATTTGTATAT
TTCTTCTTTCCCTCGACATCTTTGGCCGATTGGATTGAAACCGAGAGTAGACCGGCGTTG
CTGAGAAAAACATCATCATCGCCCTCTGATGATTTCTCATCTCTGCTCTGCTGCTGCTGC
TCATCCTCGTTTCTATACTTGAGGCTTTCACCTCTGAATGGCACATACCTGAGGTCTAAC
TCTAGTCTTCCTCTCTGTTTCTTCTCTGGTACATCCATAACAATACTTGAATTCTTGATC
AGATCCAGGTTAAACGCCTTCTTCTCCCCAGGGTTAATTCTCTTCAAGGGGATCATCTGC
ATTCCCAATCTATCATGCCCACCAACCTTGTCCCAGTCAAAGACTTCTAGCTGAAGGACT
TGTGATACTGGGTCCTTGACGATGAGCTTGAAGTGTTCGTTCCACTCCGGGTTTAAGTTC
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TAAGGGTCGGATGTTCCAAGCAAGTCTTTCTTTAGGAGATC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

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AGTCTTATGACACTACCAGTAAAAAAACACATAGCATCTCTAGTCTTGAGAAACAAAACA
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ATCTCCGGGTTGTTCAAATCAACTTTGTGAGGGGCAGGAACAGATTTAGCAACCGTGTTT
ATTATTTTCATCCTATCAAGGCCTGTGTTTGCACGTGCTCCATACAACACAGCAAATTTC
CGGGGGTTATCAGTCTCAACGGGAAAATACTGTTCTACAAGAGGCTTGATGGCTCTTGAA
ATTTCTTCCTCCGAAGGGTAACACGCCACTTCAATTGGTAAAATTCTTAGGATGAACCTT
GACATATGTTTTTTTGTTGCAGCAGCAGAAGTCATTGCATTCTGTACAATGTCTTTGGGA
CTTGGATCACCATCTCTCCTTTTCATTTGGATGAAGACAATACCGTTGAAACCAGGATCT
AACTTCATAAACCGTCTCTTGCTCTTGTCACCAAGCTCTTTTAGTTCAGCATCAATAAGC
TTATCAATGGACTTCTCTGCA***TTTCCGTTTACTTTTGCTGATGCTTCTTCCACACAT
GGCTTCTTTTTTGGAGGTTCTTCAACAATATTCTTTTGTTTCTCTTCTTCCTTTTCAGTC
TCAGTTTCTGCTAACTGTTTGACATCACATGAACCTTCTTGGCTTGCTAATTCTTTCTCA
GTCTCAACCACTTGATCATTACCGCCTTCTTTCACGTCTTCCTTATCCCCACCAGCCTCC
TCTTTGTTTTCCTCTTCCTTGTCATCATCATCTTCCTCTTCCTCTTCATCCTCATCCTCG
CTATAGGAAAACGTAACCTTTTTGTTAATTGGGTTCTCGAGCACCCCAGAAGAATTCATT
TTCAAGCCAGTCCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GACATATGTTTTTTTGTTGCAGCAGCAGAAGTCATTGCATGCTGTACAATGTCTTTGGGA
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CCTC

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ49TF U 1
AF RR4AQ49JQ C 559
AF RR4BQ15TF U 551
BS 1 669 RR4AQ49TF
BS 670 1068 RR4BQ15TF
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BS 1233 1233 RR4AQ49JQ
BS 1234 1267 RR4BQ15TF

RD RR4AQ49TF 669 0 0
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GTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTACTTTTGTATTCACACTGTTCTACAACCCTATCATCGT
CGCCGGACAAAATATTCCGGCGGTGGCATTGTTCACATTCGGAGATTCCAACTTTGACGC
AGGAAATAGAAAGTTCATCACAACTTGTACACTTCCTCAAAACTTCTGGCCTTACGGTAA
ATCTCGAGATGACCCCAACGGCAAGTTATCGGATGGCAAAATCGTCCCGGACTTTATTGC
AAAATTCATGGGAATTCACGATTTACCGCCGGCGCTTAAACCTGGCGTTGATGTCTCACG
AGGAGCTAGCTTTGCCGTAGACGCCGCTACTATACTTGGGGCTCCCAAAGACTCTTTGAA
CATGAATCAACAGGTGAGGAAATTCGATCAGATGATATCAAACTGGAACGAGGGTTACAT
TCAGAAATCATTGTTTATGATATCTATTGGTATGGAAGATTACTTAAACTTCACCAAAAG
CAATCCTACAGCCGATGGTTCTGCTCAAGAAGCTTTTATCACTTCAGTCATTAGCAGACT
AAAATACAATATTGAGATGTTGTATTCATTGGGAGCTAGTTAGTTCGTTGTATATATGTT
AGCGCCACT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4AQ49JQ 696 0 0
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GTTGTATTCATTGGGAGCTAGTTAGTTCGTTGTATATATGTTAGCGCCACTAGGTTGCTT
ACCTATCGTGAGACAAGACTTTAACACTGGTAACGAGTGTTACGAGAAATTCAACGATTT
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GGGTTTCCAGTTCACCGTTTTCGATTTCTACAATGTCATTCTTCGCAGGACACAGAGAAA
CATGAATTTCCGTTACTCCGTTACGAGTGTATCGTGTTGCGGTACTGGGACGCACAACGC
GTATGGTTGCGGTTTACCCAACGTGCACTCCAAGCT**GCGAGTATCAAAGGTCTTACCT
CTACTTCGATGGACGTCACAACTCAGAGAAGGCACAAGAATCATTCGCTCATCTTCTATT
CGGAGCCGACCCAAACGTTATCCAACCCATGAACATTCGTGAACTTATTACCTATCCTGT
TAATACAAATATGTCTGAGTTTTGGAAAGAACCAGTGGAGAATGATTTATCGGTAGTCCA
TGAGAATGACGTCTATGCGAGTGCAACTTTGTAGCTCGTCTAGTTTCGAGCATTATAGTT
TCTCTCTAGTTCAGGCACGAGCTTAGCGGCCTGACT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4BQ15TF 717 0 0
AGG
GATGGTTCTGCTCAAGAAGCTTTTATCACTTCAGTCATTAGCAGACTAAAATACAATATT
GAGATGTTGTATTCATTGGGAGCTAGTAAGTTCGTTGTATATATGTTAGCGCCACTAGGT
TGCTTACCTATCGTGAGACAAGACTTTAACACTGGTAACGAGTGTTACGAGAAATTCAAC
GATTTGGCTAAACTACACAACGCTAAAATCGGACCGATGCTTAATGATCTAGCGACATCC
AAATCGGGTTTCCAGTTCACCGTTTTCGATTTCTACAATGTCATTCTTCGCAGGACACAG
AGAAACATGAATTTCCGTTACTCCGTTACGAGTGTATCGTGTTGCGGTACTGGGACGCAC
AACGCGTATGGTTGCGGTTTACCCAACGTGCACTCCAAGCTATGCGAGTATCAAAGGTCT
TACCTCTACTTCGATGGACGTCACAACTCAGAGAAGGCACAAGAATCATTCGCTCATCTT
CTATTCGGAGCCGACCCAAACGTTATCCAACCCATTAACATTCGTGAACTTATTACCTAT
CCTGTTAATACAAATATGTCTGAGTTTTGGAAAGAACCAGTGGAGAATGATTTATCGGTA
GTCCATGAGAATGACGTCTATGCGAGTGCAACTTTGTAGCTCGTCTAGTTTCGAGCATTA
TAGTTTCTCTCTAGTTCAG*CACGAGCTTAGCGGCCTGACTGTGAACTCTAAAT

QA 4 717 4 717
DS 



AS 1 3

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CGTCATCATCATCATCAAACGGTGAAAGCGAGGAAGATGATACTGATAGCTCAAGAAGTG
GGGTTTTGAAGAAGCTTGAGGAAGCTACACAAGGAGTTAAACAGAGCAAACAAGATTTAG
AAACTGCGTTAAACCGTTTAGAGATAGCTAACGTGAAGCAACTCGCAGCTGAAAACGCTT
TCCGCGGGTGGACAAAACACTCACCTGTGAGTCAAACCCGACGCTCTTTCTTCAGACATC
TGAACAAGCAGCATGAGCCAGTTAACAATCTCTCCAAGCCGGTTCTAAAGTCTAATGTCT
CAATGCGTGATGTTCTAAGACGTAAGCAAGTTCCTAAAGAAGATGTTGTTGTCTCCGAGA
GGCTTGAAGGGCAAAGGCGGAATGTGAATTTGAGCCAAATGCTGACGGAGCTGAAGCATG
ATATTAAGTCTTCTTGGGCACGAGGTGAGAAAGAGGAGGTGCATAAAGAGAAACGGTTTG
TCACGCAGAGGAGAAAGTTTGGGTTCATACACATTACGCTTCCCATGCAGAAATAG**TA
AGAAAAA*TCTAGCGTTTA*TAAAACAACACCTTACAACTAGTCAGTCACTACTAGTTTG
TGTGTTTGTTTGTAATTGGATTTTCATTTGGTATGTTGTGTTGTGATTGCATTTCTTGTC
TTTGTATTCATGAGAATAAATATACATCTAGATCTAGTCATAAAATAAAACATAAAGCTA
GAATTTAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G426TF U 1
AF RR4G205TF U 23
AF RR4G426JQ C 93
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BS 769 774 RR4G205TF
BS 775 911 RR4G426JQ

RD RR4G426TF 782 0 0
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TCCGCGGGTGGACAAAACACTCACCTGTGAGTCAAACCCGACGCTCTTTCTTCAGACATC
TGAACAAGCAGCATGAGCCAGTTAACAATCTCTCCAAGCCGGTTCTAAAGTCTAATGTCT
CAATGCGTGATGTTCTAAGACGTAAGCAAGTTCCTAAAGAAGATGTTGTTGTCTCCGAGA
GGCTTGAAGGGCAAAGGCGGAATGTGAATTTGAGCCAAATGCTGACGGAGCTGAAGCATG
ATATTAAGTCTTCTTGGGCACGAGGTGAGAAAGAGGAGGTGCATAAAGAGAAACGGTTTG
TCACGCAGAGGAGAAAGTTTGGGTTCATACACATTACGCTTCC*ATGCAGAAATAG**TA
AGAAAAA*TCTAGCGTTTA**AAAAGCACACCTTACAACTAGTCAGTC
CTACTAGTTTGTGT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4G205TF 767 0 0
G
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ATAGCTAACGTGAAGCAACTCGCAGCTGAAAACGCTTTCCGCGGGTGGACAAAACACTCA
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AAGCAAGTTCCAAAGGAAGATGTTGTTGTCTCCGAGAGGCTTGAAGAACAAAGGCGGAAT
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TTCATACGCATTACGCTTCCCATGCAGAAACAGAGTAAGAAAAA*TCTAGCGTTTA*TAA
AACAACACTTTACAACTAGTCAGTCACTACT
TCTAGTTGGCCCTTT

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR4G426JQ 819 0 0
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CTAGCCATTGCTGAGATAACAATGTTATCGTCATCATCATCATCAAACGGTGAAAGCGAG
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ATTACGCTTCCCATGCAGAAATAG**TAAGAAAAAATCTAGCGTTTAATAAAGCAACACC
TTACAACTAGTCAGTCCCTACTAGTTTGTGTGTTTGTTTGTAATTGGATTTTCATTTGGT
ATGTTGTGTTGTGATTGCATTTCTTGTCTTTGTATTCATGAGAATAAATATACATCTAGA
TCTAGTCATAAAATAAAACATAAAGCTAGAATTTAAGTC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

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TCTCTACCGATGGATCGGTTGCCTCGTCGTCGTGCTGATCTACTTCGTTCGCGTCTACTT
GGTGGAAGGCTTCTACATCATCACCTACGCCATCGGAATCTACCTTCTCAACCTCATCAT
CGCCTTCCTCTCCCCTCAGGAAGACCCCGAGACCTCGCTCGGCGGCGGGACTCTTCCTAC
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ATCGATCATTAGGGCATTCGTCATTTGGTTTTATGATGACGTTCTTCGAAGTCTTTGATG
TACCTGTTTTCTGGCCAATTCTTCTTTTCTACTGGGTGATGCTTTTTATCCTCACCATGA
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AATATGGAAAGAAACCGGCTCCAGTAGAGAGCAGTGAATGATCAAATCAACCGTTCAGGT
CTTTCTTTTCTTTTCTTTTGATTGCCCGAAGCTTTGTTAGGGATTGAGTAAGAAGAAACG
ATCAATCAGATACTCTCATAGCCTGTTTCAGACAAGTTTTTTTTTTGTTGCTCTTTTATC
ATCCTCCTGACTATGGACTGGTTTCACCTGAAAACAATGTATCTTATTAATACAGTTTTT
TGTCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU90TF U 18
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BS 22 445 RR4CU90TF
BS 446 788 RR4CU90JQ

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TCCA
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AGACCCCGAGACCTCGCTCGGCGGCGGGACTCTTCCTACTCGTAGATCCGATGAGTATCG
ACCGTTCGTTCGCCGTCTCCCCGAGTTCAAATTCTGGTTATCGATCATTAGGGCATTCGT
CATTTGGTTTTATGATGACGTTCTTCGAAGTCTTTGATGTACCTGTTTTCTGGCCAATTC
TTCT

QA 5 428 5 428
DS 

RD RR4CU90JQ 788 0 0
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TCTCTACCGATGGATCGGTTGCCTCGTCGTCGTGCTGATCTACTTCGTTCGCGTCTACTT
GGTGGAAGGCTTCTACATCATCACCTACGCCATCGGAATCTACCTTCTCAACCTCATCAT
CGCCTTCCTCTCCCCTCAGGAAGACCCCGAGACCTCGCTCGGCGGCGGGACTCTTCCTAC
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ATCGATCATTAGGGCATTCGTCATT*GGTTTTATGATGACGTTCTTCGAAGTCTTTGATG
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CTTTCTTTTCTTTTCTTTTGATTGCCCGAAGCTTTGTTAGGGATTGAGTAAGAAGAAACG
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ATCCTCCTGACTATGGACTGGTTTCACCTGAAAACAATGTATCTTATTAATACAGTTTTT
TGTCAGCG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 3

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TGATACTCACTTGCAATGGACTTGGCATTAGTCACTCCTTATCACCATGGACACAACAGC
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CAATCTTAACATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CO09TF U 1
AF RR4AT47TF U 23
AF RR4AT47JQ C 103
BS 1 156 RR4CO09TF
BS 157 158 RR4AT47TF
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BS 715 798 RR4AT47TF

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TATTTCACATTTATTGCTGTTTATATTCTTTAATTAGATGATGTGGGAAGAGATTCTTGC
TCTGTTCCTCTTTGCATCAGATGGAAGATAGCAATTCTCCCAAGAAGGATTACTATAAGA
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CTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGTGACACTGTGGCTACTTCAAAGTTTCAGG
AGATCAATGAAGCTTATAACGTGCTAATGGACCCTGCTTTACGTTTTGAGTATGATTTAA
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TGATACTCACTTGCAATGGACTTGGCATTAGTCACTCCTTATCACCATGGACACAACAGC
TGGCGGAAGGGAACAGCACGACAGATGAGCAAGGATACTGTATCAACTGAAGAAGAGACA
GAGCTCAAGTAACATCTGATCTTGAAACTCAAATGGCAAATACTATTCGGTCAC

QA 1 714 1 714
DS 

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ATATTCTTTAATTAGATGATGTGGGAAGAGATTCTTGCTCTGTTCCTCTTTGCATCAGAT
GGAAGATAGCAATTCTCCCAAGAAGGATTACTATAAGATCCTAGAAGTTGATTATGATGC
AACTGAGGAGATGCTCAAACTGAGTTATCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAA
GCACAAAGGTGACACTGTGGCTACTTCAAAGTTTCAGGAGATCAATGAAGCTTATAACGT
GCTAATGGACCCTGCTTTACGTTTTGAGTATGATTTAACCGGAATATACGAGATTCACAA
GTATACTTTGCGGGAGTATCTGGCTAGATTTAAGGGACTGATACTCACTTGCAATGGACT
TGGCATTAGTCACTCCTTATCACCATGGACACAACAGCTGGCGGAAGGGAATAGCACGAC
AGATGAGCAAGGATACTGTATCAACTGAAGAAGAGACAGAGCTCAAGTAACATCTGATCT
TGAAACTCAAATGGCAAATACTATTCGGTCACCCCATTCGACGATATAACAGATTTATCT
GGATGTTGTATTGTATGCTCTATAAATATGATGGTATACAATCTTAACATTTTACC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4AT47JQ 696 0 0
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AGAAAAATCTGCAGTCCTTATTTCACATTTATTGCTGTTTATATTCTTTAATTAGATGAT
GTGGGAAGAGATTCTTGCTCTGTTCCTCTTTGCATCAGATGGAAGATAGCAATTCTCCCA
AGAAGGATTACTATAAGATCCTAGAAGTTGATTATGATGCAACTGAGGAGATGCTCAAAC
TGAGTTATCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGTGACACTGTGG
CTACTTCAAAGTTTCAGGAGATCAATGAAGCTTATAACGTGCTAATGGACCCTGCTTTAC
GTTTTGAGTATGATTTAACCGGAATATACGAGATTCACAAGTATACTTTGCGGGAGTATC
TGGCTAGATTTAAGGGACTGATACTCACTTGCAATGGACTTGGCATTAGTCACTCCTTAT
CACCATGGACACAACAGCTGGCGGAAGGGAATAGCACGACAGATGAGCAAGGATACTGTA
TCAACTGAAGAAGAGACAGAGCTCAAGTAACATCTGATCTTGAAACTCAAATGGCAAATA
CTATTCGGTCACCCCATTCGACGATATAACAGATTTATCTGGATGTTGTATTGTATGCTC
TATAAATATGATGGTATACAATCTTAACATTTTACC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

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TCTTTGCAGGCTTTCCAGATGCAAAGCAGAGAGTGCCTTCAGGGAGTTCTGGCTGTTCAA
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TCTCCACTTCCTCTTCATCACACCAGGGAGCTAAGATAAGTTTCTTTTGGTTGAGAGCAC
TGATAAACTCATCCCAAGTCCTAATTTCTTGCACACATGCTTCCCTCTTTTGCCTCGCCA
CTTCATACATGTTCTGCTGGATCTTCTCAAGCAGTTCCTTAACATGCTCGACTAAGCTAC
CTCTTGGGATATCTTCCTTAACTCCGTTGTCCCGTCTCACAGTTCTGACCTGATCATTTT
CAAGATCTCGGGGTCCAATCTCAATCCTCAATGGGACACCCTTCATTTCCCAGTTTGAGT
ACTTCCATCCAGGAGAGTAGTTGTCCCTTAAATCTTCTTCAGCACGGATACCTGCTTCAC
TCAAGGCAGATACAGTAGCAC


BQ
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DS 



AS 1 3

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TACATGTCGTGTATTTATATCTTTCTCACATCTTCAATAAAATTAAATTTCGCC


BQ
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AF RR4CP51TF U 1
AF RR4H294TF U 10
AF RR4H294JQ C 563
BS 1 50 RR4CP51TF
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CTCTACTA

QA 1 730 1 730
DS 

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GATGTCTCTAAGCTTGAGGGTTTCAGGAAGACGCTTATGATGTCTCTTCAAGACGACGAC
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TTAGTATCTCAGACTGCTACGCCTCGGCTCACTCCTCCTGGTTCTCCACCAGCATTATCA
GCTTCTAGTACCCCTAAAACGACTTCAAGACCTATCTCCCCTCGTCGCCATTCTGTATC

QA 1 719 1 719
DS 

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CTGCTACGCCTCGGCTCACTCCTCCTGGTTCTCCACCAGCATTATCAGCTTCTAGTACCC
CTAAAACGACTTCAAGACCTATCTCCCCTCGTCGCCATTCTGTATCCTTCTTTACTACTA
GAGGCATGTTTGATGATAATAGATCTTCTATCTCAATCTCAGAGCCTGGATCCCACACCG
GACGAACACGGGTTGATGGAAAAGAGTTCTTCCGACAAGTCAGGAGCCGGTTATCTTACG
AGCAGTTTGGTGCATTCCTTGGAAATGTGAAGGATCTTAACGCCCACAAGCAAACAAAAG
ATGAAACGCTTAGGAAAGCTGAAGAGATATTCGGAAGTGACAATAGAGATCTCTATGTCA
TATTCGAGGGCTTGATCACTCGCAACGCTCACTGAGAGTTTTCATTCTTATGTTACACGT
TAAAGTTACATATTCGGAACTCTTCAGACTCAAATTTCTTTTGTTTTGTTGGCTCTCAAG
TAAGACCAAGCGAACCGACAATTTGTTTGTATCTCCTGTACATGTCGTGTATTTATATCT
TTCTCACATCTTCAATAAAATTAAATTTCGCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 3

CO CL4492Contig1 876 3 7 U
GATCTATTCTCCGTTGATTTCAGATCTAGATCTAGGGATTGTTTGGATAGAATTTGGGGA
TTTTGAAAAAGAAGGAATGATTATCGGTTCTCTATGAGCTACTCTGTTCTTCTTCGTCGT
TTCGCATAGTTCACTCTTTCTCCGTCGTTTATCTCTACTACTCTTACGTCTTCTCTTGAA
CTAATCGTCTCCGATCTCATCTCTTTATCTCTCTCGAATAAACATTTCTGAGTTTTTGTT
CGTTCGATCTAACCGATTCTTTAATAGATCAGAATTTGGGGGTAATTTATAGGGATTTAG
AGGAATATTATTATAATTGTTTTATTTTTGGAGTAAAAAGTCAAAAAGTCAACAGAAATG
GGGTCAAAAAGTCCTGATTCCGACAACGATCCGAGGTACGCGGCTGTCACGGACGAGAGG
AAGAGGAAGAGAGTGATCTCCAACAGAGAATCCGCTCGGAGATCAAGGATGAGGAAGCAG
AAGCAGCTCGGAGATCTCATCAACGAGGTCACTGTTCTCAAGAACGACAACTCCAAGATC
GCCGAGCAGGTCGACGCAGCTACGGGGAAGTACGTCGAGATGGAGTCCAAGAACGACGTC
TTGAGAGCGCAAGCCTCGGAGCTGACGGAGAGGTTGAGGTCTTTGAACTCTGTGCTGGAG
ATGGTTGAGGAGATTAGTGGTCAGGCTTTGGATATTCCTGAGATTCCTGATTCTATGCAG
AACCCGTGGCAGGTTCCTTGCCCGATCATGCAAACCAATCATGGCTTCTGCTGAGGGATT
TAACTCATTTGTCTTGTCTCGGTTCTGAGTTTTGTAACAACTAGAGTCATTGGTGTGTGT
CTGTCTTAATAAAACTACAATCCCTTGTTTTTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4GP70TF U 1
AF RR4H065JQ C 160
AF RR4H065TF U 160
BS 1 432 RR4GP70TF
BS 433 433 RR4H065TF
BS 434 481 RR4GP70TF
BS 482 482 RR4H065TF
BS 483 523 RR4GP70TF
BS 524 871 RR4H065TF
BS 872 876 RR4H065JQ

RD RR4GP70TF 531 0 0
GATCTATTCTCCGTTGATTTCAGATCTAGATCTAGGGATTGTTTGGATAGAATTTGGGGA
TTTTGAAAAAGAAGGAATGATTATCGGTTCTCTATGAGCTACTCTGTTCTTCTTCGTCGT
TTCGCATAGTTCACTCTTTCTCCGTCGTTTATCTCTACTACTCTTACGTCTTCTCTTGAA
CTAATCGTCTCCGATCTCATCTCTTTATCTCTCTCGAATAAACATTTCTGAGTTTTTGTT
CGTTCGATCTAACCGATTCTTTAATAGATCAGAATTTGGGGGTAATTTATAGGGATTTAG
AGGAATATTATTATAATTGTTTTATTTTTGGAGTAAAAAGTCAAAAAGTCAACAGAAATG
GGGTCAAAAAGTCCTGATTCCGACAACGATCCGAGGTACGCGGCTGTCACGGACGAGAGG
AAGAGGAAGAGAATGATCTCCAACAGAGAATCCGCTCGGAGATCAAGGATGAGGAAGCAG
A*GCAGCTCGGAGATCTCATCAACGAGGTCACTGTTCTCAAGA
CGACACGC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4H065JQ 717 0 0
G
CTCTTACGTCTTCTCTTGAACTAATCGTCTCCGATCTCATCTCTTTATCTCTCTCGAATA
AACATTTCTGAGTTTTTGTTCGTTCGATCTAACCGATTCTTTAATAGATCAGAATTTGGG
GGTAATTTATAGGGATTTAGAGGAATATTATTATAATTGTTTTATTTTTGGAGTAAAAAG
TCAAAAAGTCAACAGAAATGGGGTCAAAAAGTCCTGATTCCGACAACGATCCGAGGTACG
CGGCTGTCACGGACGAGAGGAAGAGGAAGAGAGTGATCTCCAACAGAGAATCCGCTCGGA
GATCAAGGATGAGGAAGCAGAAGCAGCTCGGAGATCTCATCAACGAGGTCACTGTTCTCA
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TGGAGTCCAAGAACGACGTCTTGAGAGCGCAAGCCTCGGAGCTGACGGAGAGGTTGAGGT
CTTTGAACTCTGTGCTGGAGATGGTTGAGGAGATTAGTGGTCAGGCTTTGGATATTCCTG
AGATTCCTGATTCTATGCAGAACCCGTGGCAGGTTCCTTGCCCGATCATGCAAACCAATC
ATGGCTTCTGCTGAGGGATTTAACTCATTTGTCTTGTCTCGGTTCTGAGTTTTGTAACAA
CTAGAGTCATTGGTGTGTGTCTGTCTTAATAAAACTACAATCCCTTGTTTTTGAGT

QA 2 717 2 717
DS 

RD RR4H065TF 716 0 0
G
CTCTTACGTCTTCTCTTGAACTAATCGTCTCCGATCTCATCTCTTTATCTCTCTCGAATA
AACATTTCTGAGTTTTTGTTCGTTCGATCTAACCGATTCTTTAATAGATCAGAATTTGGG
GGTAATTTATAGGGATTTAGAGGAATATTATTATAATTGTTTTATTTTTGGAGTAAAAAG
TCAAAAAGTCAACAGAAATGGGGTCAAAAAGTCCTGATTCCGACAACGATCCGAGGTACG
CGGCTGTCACGGACGAGAGGAAGAGGAAGAGAGTGATCTCCAACAGAGAATCCGCTCGGA
GATCAAGGATGAGGAAGCAGAAGCAGCTCGGAGATCTCATCAACGAGGTCACTGTTCTCA
AGAACGACAACTCCAAGATCGCCGAGCAGGTCGACGCAGCTACGGGGAAGTACGTCGAGA
TGGAGTCCAAGAACGACGTCTTGAGAGCGCAAGCCTCGGAGCTGACGGAGAGGTTGAGGT
CTTTGAACTCTGTGCTGGAGATGGTTGAGGAGATTAGTGGTCAGGCTTTGGATATTCCTG
AGATTCCTGATTCTATGCAGAACCCGTGGCAGGTTCCTTGCCCGATCATGCAAACCAATC
ATGGCTTCTGCTGAGGGATTTAACTCATTTGTCTTGTCTCGGTTCTGAGTTTTGTAACAA
CTAGAGTCATTGGTGTGTGTCTGTCTTAATAAAACTACAATCCCTTGTTTT
GAGT

QA 2 712 2 712
DS 



AS 1 2

CO CL4493Contig1 789 2 11 U
GGGTGTCAACCAACAAGGCAGCAGCAGTTATTGTCGCTGAGTCATATCAATGGTGTCTTC
TTTGAATGTTTTAATGAGAGTGTAATAATAATCAGAAAAACAAAAGAGAGAGTCAACTAA
CACCAAGACGATGGTTTCGTTTCGCTTCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCTCACTCCCAAA
ACCACCGCGTGCCACTTCTTCATCTTCCAGATTCTCTGTTTCCGCCGTCGCCGTGACACT
CACCGTTGGCGCCGCAGCTGCCGGAGCTGCGGTAGCGGCGTCGCGGAATCCCAGGCATCC
GATTCTGGATTGGGTCTTCTCCTCTCACCCTTCGTCTCTGTTACCATGGGGATCTATGAC
TCTAGCCGATTCTAGCTCCGAATCCATTGCTGAGCCTAAGACCGGTTTCTCGTTCCCGGC
TACAATCGGAGATTCACGGAGATTACTCGGCGTGGGGCTGAGGAAGAAGAGCGTGCTGGG
ATTGAAGAACATTGATGTCTACGCTTTCGGCATATATGCTGACTGTGATGATGTGAAGAA
ACTTGTGGGTGAGAAATACTCCAGTCTTGCAGCTTCTGAGCTCAGGGAAAACAAGGCTTT
CGTCGATCAACTCATGGAAGCCGACATTAAGATGACTATAAAGCTGCAGATTGTTTACGC
AAACTCAGCATCCGTTCCGTTCGCAATGCTTTCCAAGAATCTGTTGGTACAGACTCAAGA
AATTTGGTGCTGGCCTAGACAACATGAGTTGCTCCAAGCTTTACTAGCCTCTTCAAGATG
AGTATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD96TF U 114
AF RR4D425TF U 1
BS 1 177 RR4D425TF
BS 178 178 RR4GD96TF
BS 179 222 RR4D425TF
BS 223 223 RR4GD96TF
BS 224 477 RR4D425TF
BS 478 478 RR4GD96TF
BS 479 507 RR4D425TF
BS 508 508 RR4GD96TF
BS 509 561 RR4D425TF
BS 562 562 RR4GD96TF
BS 563 789 RR4D425TF

RD RR4GD96TF 523 0 0
GGAACACCAAGACGAA
GATGGTTTCGTTTCGCTTCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCTCACTCCCAAAACCACCGCG
TGCCACTTCTTCATCTTCCCGATTCTCTGTTTCCGCTGTCGCCGTGACACTCACCGTTGG
CGCCGCAGCTGCCGGAGCTGCGGTAGCGGCGTCGCGGAATCCCAGGCATCCGATTCTGGA
TTGGGTCTTCTCCTCTCACCGTTCGTCTCTGTTACCATGGGGATCTATGACTCTAGCCGA
TTCTAGTTCCGAATCCATTGCTGAGCCTAAGACCGGTTTCTCGTTCCCGGCTACAATCGG
AGATTCCCGGAGATTACTCGGCGTGGGGCTGAGGAAGAAGAGCGTGCTGGGATTGAAGAA
CATTGATGTCTACGCTTTCGGCATATATGCTGACTGTGATGATGTGAAGAAACTTGTGGG
TGAGAAATACTCCAGTCTTGCCGCTTCTGAGCTCGGGGATAACAAGGCTTTCGTCGATCA
ACTCATGGAAGCCGACATTAAGATGAC

QA 17 523 17 523
DS 

RD RR4D425TF 789 0 0
GGGTGTCAACCAACAAGGCAGCAGCAGTTATTGTCGCTGAGTCATATCAATGGTGTCTTC
TTTGAATGTTTTAATGAGAGTGTAATAATAATCAGAAAAACAAAAGAGAGAGTCAACTAA
CACCAAGACGATGGTTTCGTTTCGCTTCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCTCACTCCCCAA
ACCACCGCGTGCCACTTCTTCATCTTCCAGATTCTCTGTTTCTGCCGTCGCCGTGACACT
CACCGTTGGCGCCGCAGCTGCCGGAGCTGCGGTAGCGGCGTCGCGGAATCCCAGGCATCC
GATTCTGGATTGGGTCTTCTCCTCTCACCCTTCGTCTCTGTTACCATGGGGATCTATGAC
TCTAGCCGATTCTAGCTCCGAATCCATTGCTGAGCCTAAGACCGGTTTCTCGTTCCCGGC
TACAATCGGAGATTCACGGAGATTACTCGGCGTGGGGCTGAGGAAGAAGAGCGTGCTTGG
ATTGAAGAACATTGATGTCTACGCTTTTGGCATATATGCTGACTGTGATGATGTGAAGAA
ACTTGTGGGTGAGAAATACTCGAGTCTTGCAGCTTCTGAGCTCAGGGAAAACAAGGCTTT
CGTCGATCAACTCATGGAAGCCGACATTAAGATGACTATAAAGCTGCAGATTGTTTACGC
AAACTCAGCATCCGTTCCGTTCGCAATGCTTTCCAAGAATCTGTTGGTACAGACTCAAGA
AATTTGGTGCTGGCCTAGACAACATGAGTTGCTCCAAGCTTTACTAGCCTCTTCAAGATG
AGTATAAAT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL4494Contig1 773 2 6 U
GAAAGAAAAAAGAGCTAATCTTCGATTCAACTTACAAAAGAGCAAAAAATCCACAAAAGG
GTTTCAAATCTTTCTGTTTGAAGAGGTTTAATCAAGAAACAGGAACAATTGCTACTCAAG
TAAATACCTTTAAATCCTTTAAAAACACATAAAACCACTCTCTCTCTCTCTCTCATTCAT
TAAAACCCTCAGCATCATTACCAGACTTGAGATGAAAATGCTTCTCTCTCTTTTGGAAAT
CTGTCAACCCTTTACCACTTCCAATCACACCCACTTTCCCAAATGGATCCTCTGGTGATT
TGAATATACTCTCTTTCTTCCTCCCTGTAAAAAAACCCTACCTTTTTAGTTTTGGCTTTA
GTCGTCTGAAACTGTTGCCACGCATTCTGTTTCTTGTTCTGTGCAACCTCCAGTTGCTCC
TGCCTCGCCTTTGACTTGAAAGCATGTATCTTCTTACGCTTTGCAATTTTCACATCCTCG
GGATCGTTAGGGTCGATTTTAAGCTTTGCTGGTAGAGTCTTGGATTGATAATCAAAAGTC
GCAGCTTGCTCAATCTTTCTTTTGAGTACATTCTTTGCAGCTTCAGCTATTCTTTCAGCT
TCCAAGAGGGCATTGGTCTCTATTGCCCTCACATTATCTGGATCAACCTCTTCCTTGTTA
CCCCACTCAGTGTACGAAACATAATAACCGTTTAGAGTATGCGCCTCAATAGTCGCATCA
TACCATTCGCCATCTTCGCTATAGACAGCTTGAACTTTTGTTCCAATGGGGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ81JQ U 1
AF RR4CV58JQ U 1
BS 1 66 RR4CJ81JQ
BS 67 67 RR4CV58JQ
BS 68 216 RR4CJ81JQ
BS 217 217 RR4CV58JQ
BS 218 748 RR4CJ81JQ
BS 749 773 RR4CV58JQ

RD RR4CJ81JQ 748 0 0
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GTTTCAGATCTTTCTGTTTGAAGAGGTTTAATCAAGAAACAGGAACAATTGCTACTCAAG
TAAATACCTTTAAATCCTTTAAAAACACATAAAACCACTCTCTCTCTCTCTCTCATTCAT
TAAAACCCTCAGCATCATTACCAGACTTGAGATGAAGATGCTTCTCTCTCTTTTGGAAAT
CTGTCAACCCTTTACCACTTCCAATCACACCCACTTTCCCAAATGGATCCTCTGGTGATT
TGAATATACTCTCTTTCTTCCTCCCTGTAAAAAAACCCTACCTTTTTAGTTTTGGCTTTA
GTCGTCTGAAACTGTTGCCACGCATTCTGTTTCTTGTTCTGTGCAACCTCCAGTTGCTCC
TGCCTCGCCTTTGACTTGAAAGCATGTATCTTCTTACGCTTTGCAATTTTCACATCCTCG
GGATCGTTAGGGTCGATTTTAAGCTTTGCTGGTAGAGTCTTGGATTGATAATCAAAAGTC
GCAGCTTGCTCAATCTTTCTTTTGAGTACATTCTTTGCAGCTTCAGCTATTCTTTCAGCT
TCCAAGAGGGCATTGGTCTCTATTGCCCTCACATTATCTGGATCAACCTCTTCCTTGTTA
CCCCACTCAGTGTACGAAACATAATAACCGTTTAGAGTATGCGCCTCAATAGTCGCATCA
TACCATTCGCCATCTTCGCTATAGACAG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4CV58JQ 773 0 0
GAAAGAAAAAAGAGCTAATCTTCGATTCAACTTACAAAAGAGCAAAAAATCCACAAAAGG
GTTTCAAATCTTTCTGTTTGAAGAGGTTTAATCAAGAGACAGGAACAATTGCTACTCAAG
TAAATACCTTTAAATCCTTTAGAAACACATAAAACCACTCTCTCTCTCTCTCTCATTCAT
TAAAACCCTCAGCATCATTACCAGACTTGAGATGAAAATGCTTCTCTCTCTTTTGGAAAT
CTGTCAACCCTTTACCACTTCCAATCACACCCACTTTCCCAAATGGATCCTCTGGTGATT
TGAATATACTCTCTTTCTTCCTCCCTGTAAAAAAACCCTACCTTTTTAGTTTTGGCTTTA
GTCGTCTGAAACTGTTGCCACGCATTCTGTTTCTTGTTCTGTGCAACCTCCAGTTGCTCC
TGCCTCGCCTTTGACTTGAAAGCATGTATCTTCTTACGCTTTGCAATTTTCACATCCTCG
GGATCGTTAGGGTCGATTTTAAGCTTTGCTGGTAGAGTCTTGGATTGATAATCAAAAGTC
GCAGCTTGCTCAATCTTTCTTTTGAGTACATTCTTTGCAGCTTCAGCTATTCTTTCAGCT
TCCAAGAGGGCATTGGTCTCTATTGCCCTCACATTATCTGGATCAACCTCTTCCTTGTTA
CCCCACTCAGTGTACGAAACATAATAACCGTTTAGAGTATGCGCCTCAATAGTCGCATCA
TACCATTCGCCATCTTCGCTATAGACAGCTTGAACTTTTGTTCCAATGGGGAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL4495Contig1 782 3 7 U
TTTTTTTTGGTTGTAAAGCACGTGAGCATACTCAAATTGAAATAGCTGTAAATCACAAGG
TATTGCTTACATATAGACATAAACGAAACACAATGTTGAGAAATATAAAAGGATACCAAC
AGATAAACTGAGCGTATATGCATCATGAGCATAAATAAAAGGGAAAATAAACATTAAAGA
TCACTAAGAGAAAAACGGACAATATCAAGAAAAACAAAGTTCAGAATCGTACGTAGAGGA
AACATGTGATCTTTATTTATTTACGCATTCTTTGCACTCTCGCTTCGTTACTCATATTGT
TTGTATGTGCTGATTCAGATTAAGAAGTTAGCCTGTAGCAATGCGTGATGATGCTGCACC
CACGCCTGTAAGGGTTAGCCCTTTTCCTCTTCGTGCAATCGTAGTAAGACCGGCCACGAC
GGCTACATGGCACATTGTTCTTCTTAAGTGCACCGTAACTGATGTACCTGCGCCTTGCGG
CTAGTTGCCGCCTATTGGTCTCAGAATCCATCAAGGACTCAAGCCCATCATCGTCTCCAA
TGCAACCTTGTCCATCGACACAAGATTTGGTCAAAGACCACGTGACATTGGCTGATTCAG
CGACTACTGCCAGGGTCAAGAGGCAAAGGATCAGCAAGAACTTGATACCCATTTAGCTTC
CTTTTGTGTTTGTTTGATGATGAGATTTAAAGGTTTTCTTTTACAGTTATAGAACTGTAA
TGGTGGATTCTTCTACGCCCTTCCTTGTGAAAGGAGGGAACAATAGAAGCGGTATTACAG
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4AB95JQ U 9
AF RR4GP74JQ U 9
AF RR4GP74TF C 1
BS 1 10 RR4GP74TF
BS 11 23 RR4AB95JQ
BS 24 24 RR4GP74JQ
BS 25 345 RR4AB95JQ
BS 346 346 RR4GP74JQ
BS 347 765 RR4AB95JQ
BS 766 782 RR4GP74TF

RD RR4AB95JQ 757 0 0
GA
TTGTAAAGCACGTCAGCATACTCAAATTGAAATAGCTGTAAATCACAAGGTATTGCTTAC
ATATAGACATAAACGAAACACAATGTTGAGAAATATAAAAGGATACCAACAGATAAACTG
AGCGTATATGCATCATGAGCATAAATAAAAGGGAAAATAAACATTAAAGATCACTAAGAG
AAAAACGGACAATATCAAGAAAAACAAAGTTCAGAATCGTACGTAGAGGAAACATGTGAT
CTTTATTTATTTACGCATTCTTTGCACTCTCGCTTCGTTACTCATATTGTTTGTATGTGC
TGATTCAGATTAAGAAGTTAGCCTGTAGCAATGCGCGATGATGCTGCACCCACGCCTGTA
AGGGTTAGCCCTTTTCCTCTTCGTGCAATCGTAGTAAGACCGGCCACGACGGCTACATGG
CACATTGTTCTTCTTAAGTGCACCGTAACTGATGTACCTGCGCCTTGCGGCTAGTTGCCG
CCTATTGGTCTCAGAATCCATCAAGGACTCAAGCCCATCATCGTCTCCAATGCAACCTTG
TCCATCGACACAAGATTTGGTCAAAGACCACGTGACATTGGCTGATTCAGCGACTACTGC
CAGGGTCAAGAGGCAAAGGATCAGCAAGAACTTGATACCCATTTAGCTTCCTTTTGTGTT
TGTTTGATGATGAGATTTAAAGGTTTTCTTTTACAGTTATAGAACTGTAATGGTGGATTC
TTCTACGCCCTTCCTTGTGAAAGGAGGGAACAATA

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR4GP74JQ 742 0 0
GG
TTGTAAAGCACGTGAGCATACTCAAATTGAAATAGCTGTAAATCACAAGGTATTGCTTAC
ATATAGACATAAACGAAACACAATGTTGAGAAATATAAAAGGATACCAACAGATAAACTG
AGCGTATATGCATCATGAGCATAAATAAAAGGGAAAATAAACATTAAAGATCACTAAGAG
AAAAACGGACAATATCAAGAAAAACAAAGTTCAGAATCGTACGTAGAGGAAACATGTGAT
CTTTATTTATTTACGCATTCTTTGCACTCTCGCTTCGTTACTCATATTGTTTGTATGTGC
TGATTCAGATTAAGAAGTTAGCCTGTAGCAATGCGTGATGATGCTGCACCCACGCCTGTA
AGGGTTAGCCCTTTTCCTCTTCGTGCAATCGTAGTAAGACCGGCCACGACGGCTACATGG
CACATTGTTCTTCTTAAGTGCACCGTAACTGATGTACCTGCGCCTTGCGGCTAGTTGCCG
CCTATTGGTCTCAGAATCCATCAAGGACTCAAGCCCATCATCGTCTCCAATGCAACCTTG
TCCATCGACACAAGATTTGGTCAAAGACCACGTGACATTGGCTGATTCAGCGACTACTGC
CAGGGTCAAGAGGCAAAGGATCAGCAAGAACTTGATACCCATTTAGCTTCCTTTTGTGTT
TGTTTGATGATGAGATTTAAAGGTTTTCTTTTACAGTTATAGAACTGTAATGGTGGATTC
TTCTACGCCCTTCCTTGTGA

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR4GP74TF 782 0 0
TTTTTTTTGGTTGTAAAGCACGTGAGCATACTCAAAT*GAAATAGCTGTAAATCACAAGG
TATTGCTTACATATAGACATAAACGAAACACAATGTTGAGAAATATAAAAGGATACCAAC
AGATAAACTGAGCGTATATGCATCATGAGCATAAATAAAAGGGAAAATAAACATTAAAGA
TCACTAAGAGAAAAACGGACAATATCAAGAAAAACAAAGTTCAGAATCGTACGTAGAGGA
AACATGTGATCTTTATTTATTTACGCATTCTTTGCACTCTCGCTTCGTTACTCATATTGT
TTGTATGTGCTGATTCAGATTAAGAAGTTAGCCTGTAGCAATGCGTGATGATGCTGCACC
CACGCCTGTAAGGGTTAGCCCTTTTCCTCTTCGTGCAATCGTAGTAAGACCGGCCACGAC
GGCTACATGGCACATTGTTCTTCTTAAGTGCACCGTAACTGATGTACCTGCGCCTTGCGG
CTAGTTGCCGCCTATTGGTCTCAGAATCCATCAAGGACTCAAGCCCATCATCGTCTCCAA
TGCAACCTTGTCCATCGACACAAGATTTGGTCAAAGACCACGTGACATTGGCTGATTCAG
CGACTACTGCCAGGGTCAAGAGGCAAAGGATCAGCAAGAACTTGATACCCATTTAGCTTC
CTTTTGTGTTTGTTTGATGATGAGATTTAAAGGTTTTCTTTTACAGTTATAGAACTGTAA
TGGTGGATTCTTCTACGCCCTTCCTTGTGAAAGGAGGGAACAATAGAAGCGGTATTACAG
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

CO CL4496Contig1 1006 3 17 U
AATCTTCTAATAGCATCATCATTTCTTGATGGCAAATGTTCACATATAAAACTTAAATGA
TTTGTTCAAAAGAAGTATAGTTTGTACAATAAAATGAAAAATTAGCACCCACAATAATAA
TATATCAATACAATTTATATTTAACGCCCTTATCTAATGGAACCGAGGACCAATCTTTAA
CCTTTCAGTCAAAACCATATCTCAATGTGAGCTAATACTTTGACCACTATTGCATACACA
CACAGCATGCCGTTTATGGGATTGCGTCTGTACACGCAACAATATCCATGCTAGTCCCTT
CCCTCGGCGTCTTCGTCAACTGTTCCACCCTTCAGATTTCGGCTGCGAGTTAGCCAACTC
TTCCACCGATTTCTCTGAAGTGGTCTTAGACATGGGAGGACTTGACAGCCTCATATGTTG
CGGAGGAGTAGTCGCCAGAGCTAGAGCCGGAAACGTCGTTTCGACCAAGATCTCGATGAC
ATCAACATCCCACAAGGACGAGTTCGAACTCTGATGAGAGTTATGAGTGACTGAGTTACG
CCACGGAGGAAGTCCACCATTGGCTCGGAGGAAGCGACCGTGCCTAGTCTTGAGCTTTAC
TTTTGATCCTTCTCTCACCGGCTCCCACTCTACGGACGATTCAAGCCCACTCGGTTTCGA
CAAAACCACTTTACGTCCCGTGGCACCGAGCAAGAACCGCTCGTTCGAAGCGGTGAGGTA
GCTACCGTAGCAACTCTTCAAACGGATCACTTCAAAGGAACCACGAACTGGTTCGACGGT
CCATCGAGCTCTCTTGTCGGAACCATTCCTTTCTTGAGTCACCGTTTCCTCGTCCTCGTC
CGCCATAAGATACTTTTCGTGGGCGTTACGCATCCTAGCGGCTTTAGCGTCATGGAAAAA
CTCCATTTGTTGATAGTACTGTGTTATACTGTTATTATTAATTTCTTCTTGCTGGAACTT
AAGCAAGATTTGTTTCATAAAACGAATTGTGAAGTGAATGCATTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CV18JQ U 1
AF RR4AQ74JQ U 48
AF RR4AQ74TF C 204
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GCTACCGTA

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AG
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TTAGCCAACTCTTCCACCGATTTCTCTGAAGTGGTCTTAGACATGGGAGGACTTGACAGC
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DS 

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GCGTCTGTACACGCAACAATATCCATGCTAGTCCCTTCCCTCGGCGTCTTCGTCAACTGT
TCCACCCTTCAGATTTCGGCTGCGAGTTAGCCAACTCTTCCACCGATTTCTCTGAAGTGG
TCTTAGACATGGGAGGACTTGACAGCCTCATATGTTGCGGAGGAGTAGTCGCCAGAGCTA
GAGCCGGAGACGTCGTTTCGACCAAGATCTCGATGACATCAACATCCCACAAGGACGAGT
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CCCACTCTACGGACGATTCAAGCCCACTCGGTTTCGACAAAACCACTTTACGTCCCGTGG
CACCGAGCAAGAACCGCTCGTTCGAAGCGGTGAGGTAGCTACCGTAGCAACTCTTCAAAC
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CGTTACGCATCCTAGCGGCTTTAGCGTCATGGAAAAACTCCATTTGTTGATAGTACTGTG
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AS 1 3

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TTGGCAATTGGGTTGATAGTTGGAGCTAATATTCTGGTTGGTGGTGCTTTCGACGGTGCG
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CTTTTTCTTGTTTCTTGTTTGGAG


BQ
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AF RR4DC33TF U 1
AF RR4B878TF U 7
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CTATCTTTATGGCTAGCAGTGGAAATGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4B878TF 768 0 0
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GGTTCCGGTATGGCTTACGGAAAGCTAACAGGAGATGGTCCAGCTACACCTTCCGGTTTA
GTGGCCGCGTCTTTGTCTCATGCATTTGCATTGTTCGTGGCGGTTTCAGTCGGTGCAAAC
GTTTCAGGCGGCCATGTAAACCCTGCGGTTACATTCGGAGCTTTCGTGGGTGGAAACATA
ACGTTGTTAAGAGCTATACTTTACTGGATCGCTCAATTACTCGGAGCGGTCGTATCTTGC
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GTTGAGCCGTGGAACGCAGTGGTTTTCGAGATTGTGATGACGTTTGGGTTAGTGTACACC
GTTTACGCTACTGCCGTGGATCCCAAGAAAGGTGATATAGGAATCATTGCTCCATTGGCA
ATTGGGTTGATAGTTGGAGCTAATATTCTGGTTGGTGGTGCTTTCGACGGTGCGTCGATG
AACCCCGGCGGTTTCATTTGGTCCGGCTGTGGTGAGCTGGACTTGGACGAACCATTGGGG
TCTATTGGTTCGGTCCATTTATTGGTGCAGCAATCGCAGCTATTGTTTATGACACTATCT
TTATGGCTAGCAGTGGAAATGAACCACTTCTTTCTAATGACTTCTAAG

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DS 

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TGGGATGGAAACAGCAGCGTTTTCTCTTTCCCATGGAGTTGAGCCGTGGAACGCAGTGGT
TTTCGAGATTGTGATGACGTTTGGGTTAGTGTACACCGTTTACGCTACTGCCGTGGATCC
CAAGAAAGGTGATATAGGAATCATTGCTCCATTGGCAATTGGGTTGATAGTTGGAGCTAA
TATTCTGGTTGGTGGTGCTTTCGACGGTGCGTCGATGAACCC*GGCGGTTTCATTTGGTC
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GGTGCAGCAATCGCAGCTATTGTTTATGACACTATCTTTATGGCTAGCAGTGGAAATGAA
CCACTTCTTTCTAATGACTTCTAAGTTAGGGCTTTTTCTTGTTTCTTGTTTGGAG

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 3

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GTACGTCTCCACGCTCTTCTTGCTCCGTTTCTTCTTCTTGTCCGTCGCGGAGGAGGCGCC
GATGGAGGCTTCCTTCGGTAGCTTCTTACCGGCTTTTGGTTTCTTCTCCGCCGGTGATTT
CTCCGCTACGACGTCCTCCGCTGGCTTCTCCGCCGCGGCGGGTTTCTTCTCTGCGGGTTT
CTTTCCTGCCTTTGGTGCCATTTTCTCGCTGATTGATTTTCTTGGGAATTTGATTTGAGA
TTTAGGTTTTGCGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A120JQD U 1
AF RR4A120TFB C 1
AF RR4A120JQ U 375
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TTTAGGTTTTGCGGTC

QA 1 676 1 676
DS 

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CGCCTTGGTCCCTTCGGAAACAGCGTGCTTAGCGAGCTCACCGGGAAGCACAAGCCTCAC
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GGCCTCCCCGGCGAGCTTCTCGAAGATGTCGTCGATGAAGCTGTTCAAGATCCCCATGGC
CTTGCTCGAGATCCCGATGTCAGGGTGGACCTGCTTCAGCACCTTGAGGATGTAGATCTT
GTACGTCTCCACGCTCTTCTTGCTCCGTTTCTTCTTCTTGTCCGTCGCGGAGGAGGCGCC
GATGGAGGCTTCCTTCGGTAGCTTCTTACCGGCTTTTGGTTTCTTCTCCGCCGGTGATTT
CTCCGCTACGACGTCCTCCGCTGGCTTCTCCGCCGCGGCGGGTTTCTTCTCTGCGGGTTT
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TTTAGGTTTTGCGGTC

QA 1 676 1 676
DS 

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TC

QA 1 302 1 302
DS 



AS 1 3

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BW27JQ U 1
AF RR4BW27TF C 1
AF RR4GU05JQ U 1
BS 1 688 RR4BW27JQ
BS 689 798 RR4GU05JQ

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C

QA 1 688 1 688
DS 

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CAAGCTCAGCCTCACTGGCTCCTTCGACCGGTACGCACCACACTTGACCTTTGTAAGGAA
CATTGTTCGTCGGTTTAGGCAAAGGGTTAAAACCGGTTAAGGGTTTTTGACCGGTGAAAT
CAATGTCGTAGATCGGTGTACCGTCAGGATGCAAGATTCCTCAATTCCTCTGTGTTCCCG
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C

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4GU05JQ 798 0 0
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QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

CO CL4501Contig1 1282 3 4 U
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A129JQD U 1
AF RR4A129JQ U 1
AF RR4A129TFB C 413
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TCTGGTTTCCTCTGTCTCGGATCATCTGGTGTGTTCTCCACCATCTTTATCTCCACGTCC
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TGATCTCAATGATCC

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DS 



AS 1 3

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TTTATGAGGCTCTTAACGTCTGCTTCATGTATCTTAAAGCGGAACGTAACATGGATCTAG
CTTTCCTATCTGGTTTGCAGCCTGACATGATCATCTCCTCGTAAACACCGGGTACCTTTT
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CC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4B171JQ U 1
AF RR4FC14JQ U 33
AF RR4B171TF C 422
BS 1 112 RR4B171JQ
BS 113 113 RR4FC14JQ
BS 114 118 RR4B171JQ
BS 119 119 RR4FC14JQ
BS 120 283 RR4B171JQ
BS 284 284 RR4FC14JQ
BS 285 381 RR4B171JQ
BS 382 382 RR4FC14JQ
BS 383 699 RR4B171JQ
BS 700 1142 RR4B171TF

RD RR4B171JQ 699 0 0
GGTTCAAGATCGATTAATGGAGATTTGGTTTTGAAGTTTCAACATATCCCATCTAATTTA
AGTCTACGTAACAGTTATATATTTATACAGTTTGAATCTTTACATAGACAGAGAATTGTG
AGGATTTGTTCGAAAGACTTTCTCTGGAGATGTGTGGTTTGTGACGTTACATACTGACCT
TAGCTTGTGAGATATCTAACAACAGAAGCTCGATATAATAAGTTTAGCAACTTCTATGTT
TTTATGAGGCTCTTAACGTCTGCTTCATGTATCTTAAAGCGGAGCGTAACATGGATCTAG
CTTTCCTATCTGGTTTGCAGCCTGACATGATCATCTCCTCGTAAACACCGGGTACCTTTT
GGAACTTATCAACACGAATGAGAGCTTTCATGAGTGTTGTGTATGTCACCACGTCTGGAT
TTACGCCGTTTTCTTTCATGTACTGCAAAACGGCAAAGGCTTCGGCGTCTCTTCTATCCT
CTCCAAAGGCATTGATGAGGGAATTGAGAGCCAGTAAACTTGGCTTCAGTCCATCTGATG
TCATCACTCTAAACGCATTAACAGCTTGCTCCGATAAACCCCTCTGTGCATAGGCATTGA
TAAGGGCATTGTACATTGTTGATGATGGTTTCAGCCCAACTGACTTCATCTCCTCCAAGC
AATCTATTGCATCGTTAAACCTACCGGATTTGCCATAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4FC14JQ 670 0 0
GAAGTTTCAACATATCCCATCTAATTTAAGTCTACGTAACAGTTATATATTTATACAGTT
TGAATCTTTACATAGACAGAAAATTGCGAGGATTTGTTCGAAAGACTTTCTCTGGAGATG
TGTGGTTTGTGACGTTACATACTGACCTTAGCTTGTGAGATATCTAACAACAGAAGCTCG
ATATAATAAGTTTAGCAACTTCTATGTTTTTATGAGGCTCTTAACGTCTGCTTCATGTAT
CTTAAAGCGGAACGTAACATGGATCTAGCTTTCCTATCTGGTTTGCAGCCTGACATGATC
ATCTCCTCGTAAACACCGGGTACCTTTTGGAACTTATCAACACGAATGAAAGCTTTCATG
AGTGTTGTGTATGTCACCACGTCTGGATTTACGCCGTTTTCTTTCATGTACTGCAAAACG
GCAAAGGCTTCGGCGTCTCTTCTATCCTCTCCAAAGGCATTGATGAGGGAATTGAGAGCC
AGTAAACTTGGCTTCAGTCCATCTGATGTCATCACTCTAAACGCATTAACAGCTTGCTCC
GATAAACCCCTCTGTGCATAGGCATTGATAAGGGCATTGTACATTGTTGATGATGGTTTC
AGCCCAACTGACTTCATCTCCTCCAAGCAATCTATTGCATCGTTAAACCTACCGGATTTG
TCATAAA
CGT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4B171TF 721 0 0
TACGCCGTTTTCTTTCATGTACTGCAAAACGGCAAAGGCTTCGGCGTCTCTTCTATCCTC
TCCAAAGGCATTGATGAGGGAATTGAGAGCCAGTAAACTTGGCTTCAGTCCATCTGATGT
CATCACTCTAAACGCATTAACAGCTTGCTCCGATAAACCCCTCTGTGCATAGGCATTGAT
AAGGGCATTGTACATTGTTGATGATGGTTTCAGCCCAACTGACTTCATCTCCTCCAAGCA
ATCTATTGCATCGTTAAACCTACCGGATTTGCCATAAACGTCGACGAGTGTTGTGTGTGT
CACGACGTTAGGCAGTACTCCTTGGCTCTTCATCTTCCCCAACAATCTTTTCATATCATC
CCATCTTTCTTGATCTCCATAACTGTTGATCATGATGTTATAGGTTGTGGCGCAAGGCAA
GCACCCTCGCTTCTCCATTGCCTCGAACATCTCTTGTGCTACTATGTGCCGGCCGTGCTT
GCAATGGCAATCGATAAGCGTATTCCAAGTGACCCTATCAGGTTCGATTCCCTCGCTTAA
CATTCTATCAAAAGTCGTCACGGCATGATCAAGACAATTGAACTTCCCAAAGGTATCGAT
CACCACGTTGTAGAATTGTCTATCGGGTTTAACCCCGATGCTCTTCATCTCCTTGAGAAC
TTGAAATGTCTTCTGCCACTCGCCTCTATCGCGATAACCGGCTAAGAGTCTGCTGAAAAC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL4503Contig1 787 3 12 U
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AACAACATCAAAGAACTACAGCCTCGAAACAGATTCAATAACCACAATTCATCACTCCAC
CTCAATCCTATTAAAATACTAATCAAAGACCAAACCAAAGCTACATAGAGCAATCACAAT
CTGTAGTATCTAAGGGCGTTTCAAAGAAAAGGTGTGGTTTTAGTTATCTTTTTTTTCTTC
TTGTAGTTGTATTAATGAAAAAATTATGTAACAATACTTGGTCACAGTAGATTAAGACGA
TGGCTTCAGGTTCCTTATTGCAGCGGCCATAATCCGGGCAGTTCCAGGATCGAACTTTCT
TTCACCAACACTTGTGTTCCTGTCATCTCTCCTTGTGGCTGCACTTCTTTTACTAGATTC
CATACTGTAGTTCACTGTCGATTTTGTGTGATCTTCCACATTGTTGCTGGTTCCGCTGCA
TCCTTCTTCCATATTTGTGGTACGGTCAGAACCACAAACTGGGTTATATAGGGGCTCTGC
GTCGTCTTCAGTAGCTTTGCTCTTGCTTCTAGTTATGTAGTCACAGGTATCACTGGTTCG
GGGGCTTTTTCCCTTCTTCGAAAATTGTGTAGCCGCTGCTCGTGCGCCCGCAATTGCAGC
TGTGAGACTGGTAAGTTGTTCTGTCTTAAGTCTTTTCTTCTCTTGTGTTGTAGAGGAAAC
AGAACCCGGTTTTAAAGAAAAGGTGCATGTTGGGTCTGGAGAGGAAATTTCACCGGAAAA
GAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G192TF C 1
AF RR4GP31JQ U 20
AF RR4FD78JQ U 13
BS 1 21 RR4G192TF
BS 22 149 RR4FD78JQ
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BS 586 742 RR4FD78JQ
BS 743 743 RR4GP31JQ
BS 744 787 RR4FD78JQ

RD RR4G192TF 618 0 0
GACAAAGAAAAAAACAAATAACAGCCAAGATTGGGATAATAAACATTATTTTGAAAATAC
AACAACATCAAAGAACTACAGCCTCGAAACAGATTCAATAACCACAATTCATCACTCCAC
CTCAATCCTATTAAAATACTAATCAAAGACCAAACCAAAGCTACATAGAGCAATCACAAT
CTGTAGTATCTAAGGGCGTTTCAAAGAAAAGGTGTGGTTTTAGTTATCTTTTTTTTCTTC
TTGTAGTTGTATTAATGAAAAAATTATGTAACAATACTTGGTCACAGTAGATTAAGACGA
TGGCTTCAGGTTCCTTATTGCAGCGGCCATAATCCGGGCAGTTCCAGGATCGAACTTTCT
TTCACCAACACTTGTGTTCCTGTCATCTCTCCTTGTGGCTGCACTTCTTTTACTAGATTC
CATACTGTAGTTCACTGTCGATTTTGTGTGATCTTCCACATTGTTGCTGGTTCCGCTGCA
TCCTTCTTCCATATTTGTGGTACGGTCAGAACCACAAACTGGGTTATATAGGGGCTCTGC
GTCGTCTTCAGTAGCTTTGCTCTTGCTTCTAGTTATGTAGTCACAGGTATCACTGGTTCG
GGGGCTTTTTCCCTTCT
C

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4GP31JQ 758 0 0
AG
CAGCCAAGATTGGGATAATAAACATTATTTTGAAAATACAACAACATCAAAGAACTACAG
CCTCGAAACAGATTCAATAACCACAATTCATCACTCCACCTCAATCCTATTAAAATACTA
ATCAAAGACCAAACCAAAGCTACATAGAGCAATCACAATCTGTAGTATCTAAGGGCGTTT
CAAAAAAAAGGTGTGGTTTTAGTTATCTTTTTTTTCTTCTTGTAGTTGTATTAATGAAAA
AATTATGTAACAATACTTGGTCACAGTAAATTAAGACGATGGCTTAAGGTTCCTTATTGC
AGCGGCCATAATCCGGGCAGTTCCAGGATCGAACTTTCTTTCACCAACACTTGTGTTCCT
GTCATCTCTCCTTGTGGCTGCACTTCTTTTACTAAATTCCATACTGTAGTTCACTGTCGA
TTTTGTGTGATCTTCCACATTGTTGCTGGTTCCGCTGCATCCTTCTTCCATATTTGTGGT
ACGGTCAGAACCACAAACTGGGTTATATAGGGGCTCTGCGTCGTCTTCAGTAGCTTTGCT
CTTGCTTCTAGTTATGTAGTCACTGGTATCACTGGTTCGGGGGCTTTTTCCCTTCTTCGA
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TGTCTTAAGTCTTTTCTTCTCTTGTGTTGTAGAGGAAACAGAACCCGGTTTTAAAGAAAA
GGTGCATGTTGGGTCTGGA
AGAGGAATTTCACCGGA

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR4FD78JQ 775 0 0
AACAAATAA
CAGCCAAGATTGGGATAATAAACATTATTTTGAAAATACAACAACATCAAAGAACTACAG
CCTCGAAACAGATTCAATAACCACAATTCATCACTCCACCTCAATCCTATTAAAATACTA
ATCAAAGAGCAAACCAAAGCTACATAGAGCAATCACAATCTGTAGTATCTAAGGGCGTTT
CAAAGAAAAGGTGTGGTTTTAGTTATCTTTTTTTTCTTCTTGTAGTTGTATTAATGAAAA
AATTATGTAACAATACTTGGTCACAGTAGATTAAGACGATGGCTTCAGGTTCCTTATTGC
AGCGGCCATAATCCGGGCAGTTCCAGGATCAAACTTTCTTTCACCAACACTTGTGTTCCT
GTCATCTCTCCTTGTGGCTACACTTCTTTTACTAGATTCCATACTGTAGTTCACTGTCGA
TTTTGTGTGATCTTCCACATTGTTGCTGGTTCCGCTGCATCCTTCTTCCATATTTGTGGT
ACGGTCAGAACCACAAACTGGGTTATATAGGGGCTCTGCGTCGTCTTCAGTAGCTTTGCT
CTTGCTTCTAGTTATGTAGTCACCGGTATCACTGGTTCGGGGGCTTTTTCCCTTCTTCGA
AAATTGTGTAGCCGCTGCTCGTGCGCCCGCAATTGCAGCTGTGAGACTGGTAAGTTGTTC
TGTCTTAAGTCTTTTCTTCTCTTGTGTTGTAGAGGAAACAGAACCCGGTTTTAAAGAAAA
G*TGCATGTTGGGTCTGGAGAGGAAATTTCACCGGAAAAGAGTTTG

QA 10 775 10 775
DS 



AS 1 3

CO CL4504Contig1 685 3 9 U
GGGTTGAGAGTCGATTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGAACCGTAGATCCAGGAG
GTGAAATCTGGAAACGTCTGAGGAACTTTGAAGCCAAATCGAGAATTTGATTGAGCTATG
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GGAATCAGAGCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAGAATGAGCGTGCC
TTGGAAGGATTACAAGACAGAGCCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGCGATATTAACGAA
GAGGTGGATACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATATGGATTCATCAAGG
GGAATTCTCTCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGACCAAATCAAGCAGA
AGAATGCTGACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATTTACTATCTTACC
CGTTGAAATTGGCAAAACCAGAGTACTCTGAAACAATCCATCCATATCATATTTTCATGC
TCTCTGTTGGCTCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTG
TTACAGCGTGATCAAGTGCTTAAGATATAAGTGACAGAAATTCACAATAGCTTATAAAAG
TTTTATGCGATGGATTTTATACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EM04TF U 1
AF RR4B441JQ C 4
AF RR4B441TF U 4
BS 1 139 RR4EM04TF
BS 140 140 RR4B441TF
BS 141 262 RR4EM04TF
BS 263 263 RR4B441TF
BS 264 514 RR4EM04TF
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BS 516 672 RR4EM04TF
BS 673 678 RR4B441TF
BS 679 685 RR4B441JQ

RD RR4EM04TF 673 0 0
GGGTTGAGAGTCGATTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGAACCGTAGATCCAGGAG
GTGAAATCTGGAAACGTCTGAGGAACTTTGAAGCCAAATCGAGAATTTGATTGAGCTATG
AATCCTAGAAGGGAGCCTCATGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGGAATTGAAGAGGGA
GGAATCAGAGCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAGAATGAGCGTGCC
TTGGAAGGATTACAAGACAGAGTCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGCGATATTAACGAA
GAGGTGGATACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATATGGATTCATCAAGG
GGAATTCTCTCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGACCAAATCAAGCAGA
AGAATGCTGACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATTTACTATCTTACC
CGTTGAAATTGGCAAAACCAGAGTACTCTGAAACGATCCATCCATATCATATTTTCATGC
TCTCTGTTGGCTCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTG
TTACAGCGTGATCAAGTGCTTAAGATATAAGTGACAGAAATTCACAATAGCTTATAAAAG
TTTTATGCGATG
C

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4B441JQ 682 0 0
GGGAGT
GTCGATTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGAACCGTAGATCCAGGAGGTGAAATCT
GGAAACGTCTGAGGAACTTTGAAGCCAAATCGAGAATTTGATTGAGCTATGAATCCTAGA
AGGGAGCCTCGTGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGGAATTGAAGAGGGAGGAATCAGA
GCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAGAATGAGCGTGCCTTGGAAGGA
TTACAAGACAGAGCCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGCGATATTAACGAAGAGGTGGAT
ACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATATGGATTCATCAAGGGGAATTCTC
TCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGACCAAATCAAGCAGAAGAATGCTG
ACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATTTACTATCTTACCCGTTGAAAT
TGGCAAAACCAGAGTACTCTGAAACAATCCATCCATATCATATTTTCATGCTCTCTGTTG
GCTCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTGTTACAGCGT
GATCAAGTGCTTAAGATATAAGTGACAGAAATTCACAATAGCTTATAAAAGTTTTATGCG
ATGGATTTTATACACT

QA 7 682 7 682
DS 

RD RR4B441TF 682 0 0
GGGAGT
GTCGATTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGAACCGTAGATCCAGGAGGTGAAATCT
GGAAACGTCTGAGGAACTTTGAAGCCAAATCGAGAATTTGATTGAGCTATGAATCCTAGA
AGGGAGCCTCGTGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGGAATTGAAGAGGGAGGAATCAGA
GCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAGAATGAGCGTGCCTTGGAAGGA
TTACAAGACAGAGCCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGCGATATTAACGAAGAGGTGGAT
ACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATATGGATTCATCAAGGGGAATTCTC
TCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGACCAAATCAAGCAGAAGAATGCTG
ACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATTTACTATCTTACCCGTTGAAAT
TGGCAAAACCAGAGTACTCTGAAACAATCCATCCATATCATATTTTCATGCTCTCTGTTG
GCTCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTGTTACAGCGT
GATCAAGTGCTTAAGATATAAGTGACAGAAATTCACAATAGCTTATAAAAGTTTTATGCG
ATGGATTTT
TATACAC

QA 7 675 7 675
DS 



AS 1 2

CO CL4505Contig1 895 2 7 U
GCTCTTGCAGATACTCCAGTTGTGATTTCAATTTTGGATGGCATTACGTTGAAGCTGATT
TTGGAGGATGAGGATGATTTTGCAATGTTGGCAGAGAATCTCTTCACTGATTTGGATGAA
GAAGATAAAGGAAAGCTTCCCAAGAGCCAGATTCGGAAAGCTCTTTCCCTCATGGGTGTT
GACATGGGCGTCCCTCCACTCTCAGACTTTCCCATCTTAGATGACATCATTAAGAAGCAC
GATGCTGATGGCGACGAAGAGCTAGGACAAGCACAGTTTGCAGAGCTACTACATCCAATT
CTACAAGAAATATCAGAGGTCCTTCATGAGAATCCAATCACCATCGTCCAGAACGTCGAG
ATCTTCAATGGGTCAAGGCTTCGTAAGATTCTTGCAGACGAGAAGACACTTAAATGTCTC
GTAGAGGAAACGGTTCTTGAAGAGTCTACCGGGAAAGACAACCAAGGAAGGGCAGATCTT
ATAAAGAACTTGATGATAGAGAAGGGAAAAGAGTTGGGATTGCCTCCGTTATCTTCAGAG
AGCGAATCAGTGGCTCTTCTCTACGAGACAATACAATCTCAGTTGACTAAGAGAGATAAA
GAACCCTCTGAGGCATCCACAGAAGATGAGTTTATGGATGCTTTAAAAGATATACTGGGA
AATTTTGCGGAGCTGCTCGAATCCACACCGGTATATTCTGCTACCAGTCTCTAGATTCTC
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CTATTTGGTCTGATTGAAATTATTGCTGAACATGGATGATAGATGATTTCAGCAGTTTAG
TGTTGGCTACTTTTGGAATCTCTTTGGATGTATATATTGAAGTTACGTCATAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DK71TF U 8
AF RR4CA07JQ C 1
BS 1 8 RR4CA07JQ
BS 9 659 RR4DK71TF
BS 660 660 RR4CA07JQ
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BS 741 895 RR4CA07JQ

RD RR4DK71TF 733 0 0
G
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TGAGGATGATTTTGCAATGTTGGCAGAGAATCTCTTCACTGATTTGGATGAAGAAGATAA
AGGAAAGCTTCCCAAGAGCCAGATTCGGAAAGCTCTTTCCCTCATGGGTGTTGACATGGG
CGTCCCTCCACTCTCAGACTTTCCCATCTTAGATGACATCATTAAGAAGCACGATGCTGA
TGGCGACGAAGAGCTAGGACAAGCACAGTTTGCAGAGCTACTACATCCAATTCTACAAGA
AATATCAGAGGTCCTTCATGAGAATCCAATCACCATCGTCCAGAACGTCGAGATCTTCAA
TGGGTCAAGGCTTCGTAAGATTCTTGCAGACGAGAAGACACTTAAATGTCTCGTAGAGGA
AACGGTTCTTGAAGAGTCTACCGGGAAAGACAACCAAGGAAGGGCAGATCTTATAAAGAA
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AGTGGCTCTTCTCTACGAGACAATACAATCTCAGTTGACTAAGAGAGATAAAGAACCCTC
TGAGGCATCCACAGAAGATGAGTTTATGGATGCTTTAAAAGATATACTGGGGAATTTTGC
GGAGCTGCTCGAATCCACACCGGTATATTCTGCTACCAGTCTCTAGAT*CTCGTAATATT
GAGTTATATTAT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR4CA07JQ 895 0 0
GCTCTTGCAGATACTCCAGTTGTGATT*CAATTT*GGATGGCAT*ACGT*GAAGCTGATT
T*GGAGGATGAGGATGATTT*GCAATGTTGGCAGAGA*TCTCTTCACTGATTTGGATGAA
GAAGATAAAGGAAAGCTTCCCAAGAGTCAGATTCGGAAAGCTCTTTCCCTCATGGGTGTT
GACATGGGTGTCCCTCCACTCTCAGACTTTCCCATCTTAGATGACATCATTAAGAAGCAC
GATGCTGATGGCGACGAAGAGCTAGGACAAGCACAGTTTGCAGAGCTACTACATCCAATT
CTACAAGAAATATCAGAGGTCCTTCATGAGAATCCAATCACCATCGTCCAGAACGTCGAG
ATCTTCAATGGGTCAAGGCTTCGTAAGATTCTTGCAGACGAGAAGACACTTAAATGTCTC
GTAGAGGAAACGGTTCTTGAAGAGTCTACCGGGAAAGACAACCAAGGAAGGGCAGATCTT
ATAAAGAACTTGATGATAGAGAAGGGAAAAGAGTTGGGATTGCCTCCGTTATCTTCAGAG
AGCGAATCAGTGGCTCTTCTTTACGAGACAATACAATCTCAGTTGACTAAGAGAGATAAA
GAACCCTCTGAGGCATCCACAGAAGATGAGTTTATGGATGCTTTAAAAGATATACTGTGA
AATTT*GCGGAGCTGCTCGAATCCACACCGGTATATTCTGCTACCAGTCTCTAGATTCTC
GTAATATTGAGTTATATTATTGTATATTTGAGAATTTGACTTGCACCCTGGTTGTCCCTG
CTATTTGGTCTGATTGAAATTATTGCTGAACATGGATGATAGATGATTTCAGCAGTTTAG
TGTTGGCTACTTTTGGAATCTCTTTGGATGTATATATTGAAGTTACGTCATAATG

QA 1 895 1 895
DS 



AS 1 3

CO CL4506Contig1 852 3 4 U
GGGCCAGCGAAATGGGGGACACTAAAGAAAGAGTTGGAAGTTGTGTGGAATTGGAAAACT
GCAATCTCCGATTAATCTTACGGACGAAAATGTCAAAGTTACTAGTAAACTTGGATCTCT
CCGAAGCCGGTATTTACCTTCCAATGCCACTATTAAGAACAGAGGACATGATATCATGTT
GGAATTTAAAGGAGGGAATAAAGGTATTGGTATCACTATTCGTGGTATAAAATACAAACT
TCAGCAGCTTCATTGGCATTCTCCTTCCGAACACTCAATCAATGGCAAAAGGTATGCTCT
TGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAAGTGGACGTTTCGCTGTTGTCGCGTTCTTGTA
CAATATTGGGGAACCTGATCCTTTTCTTCTTTCGTTGGAAGAACATTTGAACAAGATAAC
TGATACACACGAGTCCGAGGATTATGTCGGGATGATTGATCCCAAAAAACTCACTTTCGA
ATCAAAACAACACTATAGATATCTTGGATCACTTACAACTCCTCCATGTTCTGAACCTGT
TATTTGGTCTGTTTCCAGAACGATTAGGACCGTAACAAGTCAGCAAGTGGAGCTTCTCCA
TGTGGCTGTACATGATGCTTCTGATACAAATGCTAGGCCGGTTCAGCCAATCAATAAGCG
CGTGGTGCATTTATACATACCACCAACGGAGAACAAATAAGTATGTATTAATTTGATGTC
AACAGAAAACGAGTCTGTCAAATTTAAGCAAAAAAAAAAACAGAAAACGAGTCTGTATTA
ACCTATACGCCATTCGCTGTGTTGCACCAAAAAACTATATTATTTTCTCATATAATGTAA
AACGGGTCTGCC


BQ
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AF RR4B524TF U 1
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G
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TCCTTCCGAACACTCAATCAATGGCAAAAGGTATGCTCTTGAGGAACACATGGTTCATCA
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TTTTCTTCTTTCGTTGGAAGAACATTTGAACAAGATAACTGATACACACGAGTCCGAGGA
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DS 

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TCTGCC

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DS 



AS 1 3

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ATCTCAGACACTCTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAAT
GGGTATATTTCCTGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCTTAAAGAATC
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GTACTATATATACTATATGGTGTAATATACAGTAGTGGAAACAAAGCATTTTGTGTAAAG
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4CN79TF U 1
AF RR4D308TF U 57
AF RR4CN79JQ C 475
BS 1 199 RR4CN79TF
BS 200 201 RR4D308TF
BS 202 267 RR4CN79TF
BS 268 268 RR4D308TF
BS 269 512 RR4CN79TF
BS 513 513 RR4D308TF
BS 514 568 RR4CN79TF
BS 569 569 RR4D308TF
BS 570 655 RR4CN79TF
BS 656 763 RR4D308TF
BS 764 764 RR4CN79JQ
BS 765 792 RR4D308TF
BS 793 1263 RR4CN79JQ

RD RR4CN79TF 655 0 0
GGAAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATAAAATACATGATTTGTCCCGTCTCGTATCTAT
ATCTCAGACACTCTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAAT
GGGTATATTTCCTGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCTTAAAGAATC
TGAAAATGTTAAATCCAAGT*TGTGAGAGAGACAAAAACTCATGATGAGAGAGATGAGAC
GAGGGAGCAATTAAAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTC
TCCTACGGTGAAGGTGCATACAGACCCTAATATTGATAGCTTTTCCAATATGGAAATGGA
ATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGACTTTTTAACTAATCATGACAACAA
AACATACTCTAGAGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTAC
ATCAGAGAGAGGTCTAGGGGAAAGGCCGATCCCTGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATGGA
ACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAAGCCAGAA
GAACTTTCTGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4D308TF 741 0 0
GG
ATATCTCAGACACTCTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAA
ATGGGTATATTTCCTGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCTTAAAGAA
TCTGAAAATGTTAAATCCAAGCCTGTGAGAGAGACAAAAACTCATGATGAGAGAGATGAG
ACGAGGGAGCAATTAAAACTGTGGAGAGACGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCT
TCTCCTACGGTGAAGGTGCATACAGACCCTAATATTGATAGCTTTTCCAATATGGAAATG
GAATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGACTTTTTAACTAATCATGACAAC
AAAACATACTCTAGAGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTT
ACATCAGAGAGAGGTCTAGGGGAAAGGCCGATCC*TGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATG
GAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCC*AATACGTCTATATGTCCTCGAAAAGCCAG
AAGAACTTTCTGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCA
GGGTTGACTACACAGTGGAGCCAATATATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGA
AGCCGAAGAGTATTGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAG*ATTGATTGCGTCCA
AGATTAAAGTGGAC
AGAGT

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR4CN79JQ 789 0 0
AAG
TACATCAGAGAGAGGTCTAGGGGAAAGGCCGATCC*TGGAGGT*GATAAAGAGTTGTCAT
GGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCC*AATACGTCTATATGTCCTCGAAAAGCCA
GAAGAACTTTCTGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTC
AGGGTTGACTACACAGTGGAGC*AATATATGTTGGTGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAG
AAGCCGAAGAGTATTGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCC
AAGATTAAAGTGGACCAGAGTTTTAGGCTTTTTTTTCCTTGGAATCTGCCTTTGCTGTCT
TTGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGCGGAAGATTTTCAAAAG
CGGACTGTTGATATCCGAGGTTTTTGAAATACACAGAACCCCGGTATCCGTCGGTTGTAA
CGTTTTCGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCGTTATCATAAATTCGAAT
AGCAGAATTTTAAAAGTTAAAATCTTGATATTTTCACGAATAAGTACTGGGGAAAATTTG
CACCTTGCCAGGGATGAAAGTGATGAACAAATTTTCCTAGACATGAAATTAATTATGTTT
ATATCGATTATTTGCATCGGTAAAATAAGAAATTTTACAACCCTGAAAAGGCAGAAAATA
GATGTACTATATATACTATATGGTGTAATATACAGTAGTGGAAACAAAGCATTTTGTGTA
AAGTGG

QA 4 789 4 789
DS 



AS 1 2

CO CL4508Contig1 826 2 2 U
AACCGTTTAATTTTGACTTTGCATTATTTGATAGTTTTAGTTTCTCTGCTCCTCTCTCAA
GTGCAAGGAAATACAATAAATGAAAAAACTACACATGGTTTATTACTTAAATCAAAAGAT
TTAACATTTTTATAAATTATTATATTAAACACGAACAAAACACTTAACTCAAAGGCTTTA
CACGCCTGTCAACATCGAACTGAACTTCAGATAGACCAGTGATCCCTGCGGTTATCTTCT
GTCCTATCTTTACAGGTCCAACACCTTCTGGTGTACCAGTCAAGATGACATCTCCTTCGT
AGAGAGTCATTATAGAGCTTATGTAGCTGATGAGGTACGGGACCTTGAAGATCATATCTT
TTGTCAAACCCTTCTGTCTTGTTTCACCATCAACCTTTAGCCAAAGTTCTAGGTTATCGG
GATCATGCACCATCGCCTTTGGCAGAACAGAGCTTATCGGAGTGAAAGTATCCTGTCCTT
TAGCAAGTGTCCAAGGGAGACCAGACGCCTTGGCAGAAGCTTGGAGTTCCCTAGCAGTCA
TATCAAGAGCAACCGCATATCCTCCAATGTAGTCCATGGCGGTAGACTCGGGTACATCTC
TAGCCTTCTCTCCCATCACCACAGCGAGCTCCACCTCATGATGAAGTGATTCTAGAGGAT
GTGGGATCTCAATCGTTCCTCCATTCTCCAAGTACGATGAAGTCGGCTTTAAGAATATAA
CCGGTTCCTTGGGAACGGCGTTGCCTAGTTCTTTGGCGTGAGCGGCGTAGTTACGCCCGA
CGCAGACGATCTTGGTGCCTTGCGTGAACAGCCTCTGTATCACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW76JQ U 1
AF RR4D445TF C 24
BS 1 207 RR4EW76JQ
BS 208 826 RR4D445TF

RD RR4EW76JQ 207 0 0
AACCGTTTAATTTTGACTTTGCATTATTTGATAGTTTTAGTTTCTCTGCTCCTCTCTCAA
GTGCAAGGAAATACAATAAATGAAAAAACTACACATGGTTTATTACTTAAATCAAAAGAT
TTAACATTTTTATAAATTATTATATTAAACACGAACAAAACACTTAACTCAAAGGCTTTA
CACGCCTGTCAACATCGAACTGAACTT

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4D445TF 803 0 0
CATTAATTGATAGTTTAG
TTCTCTGCTCCTCTCTCAAGTGCAAGGAAATACAATAAATGAAGAAACTACACATGGTTT
ATTACTTAAATCAAAAGATTTAACATTTT*ATAAATTATTATATTAAACACGAACAAAAC
ACTTAACTCAAAGGCTTTACACGCCTGTCAACATCGAACTGAACTTCAGATAGACCAGTG
ATCCCTGCGGTTATCTTCTGTCCTATCTTTACAGGTCCAACACCTTCTGGTGTACCAGTC
AAGATGACATCTCCTTCGTAGAGAGTCATTATAGAGCTTATGTAGCTGATGAGGTACGGG
ACCTTGAAGATCATATCTTTTGTCAAACCCTTCTGTCTTGTTTCACCATCAACCTTTAGC
CAAAGTTCTAGGTTATCGGGATCATGCACCATCGCCTTTGGCAGAACAGAGCTTATCGGA
GTGAAAGTATCCTGTCCTTTAGCAAGTGTCCAAGGGAGACCAGACGCCTTGGCAGAAGCT
TGGAGTTCCCTAGCAGTCATATCAAGAGCAACCGCATATCCTCCAATGTAGTCCATGGCG
GTAGACTCGGGTACATCTCTAGCCTTCTCTCCCATCACCACAGCGAGCTCCACCTCATGA
TGAAGTGATTCTAGAGGATGTGGGATCTCAATCGTTCCTCCATTCTCCAAGTACGATGAA
GTCGGCTTTAAGAATATAACCGGTTCCTTGGGAACGGCGTTGCCTAGTTCTTTGGCGTGA
GCGGCGTAGTTACGCCCGACGCAGACGATCTTGGTGCCTTGCGTGAACAGCCTCTGTATC
ACCCT

QA 19 803 19 803
DS 



AS 1 3

CO CL4509Contig1 653 3 11 U
GTAAACAAATTCTACAGTTTTAAGCACTAAAGAAAAAGACACACTCGAATCTGTATCTCA
GAAGAACCCAATGGGAGAACAATCCATACAGTTTTACTCTCTTTATTGACAAGCACAAGT
TTCTTTGTCTAAAACCCGAATATGAAGAAAAGAAAGATAGAAGAAGAATCCAGTCAATCA
CTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCGGACATAAAGGCTATCAACGACCTTCCCCATG
TTAGCAATGGTGTCAAGAGTAGCCGAGTAGATAGCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATG
ATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGTACCTGCGAATTTCTTGTCAAGTATCATCTGA
AACAGCTTCTTCTCCACATGGTCGATAGGCAACCCAATCAGATCAGCAACGTGGGCTATC
TCAACTCGTGAGAAAGGCTCGATCAAACGACAAAGGTTCTGCTCCAGAAGCGTGTCGTAA
AGAGAAGAGAGATGTCTGTGGACAATTGGGTCATCCTCTAGCTGCGCTTTGTAGTCACGG
AGAGCGTTCTCAAACAGTTTCAACGACCTCTTCGAGTGAGCATCGGCGACCGCCTTCATG
GCATCTAGATCAGGGCCAACGTACTGGAGTCCAGCCTTTGAGGGGATTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL75JQ U 33
AF RR4GL75TF C 33
AF RR4FA71JQ U 1
BS 1 45 RR4FA71JQ
BS 46 46 RR4GL75JQ
BS 47 144 RR4FA71JQ
BS 145 145 RR4GL75JQ
BS 146 168 RR4FA71JQ
BS 169 169 RR4GL75JQ
BS 170 172 RR4FA71JQ
BS 173 173 RR4GL75JQ
BS 174 260 RR4FA71JQ
BS 261 261 RR4GL75JQ
BS 262 653 RR4FA71JQ

RD RR4GL75JQ 301 0 0
AAAAAGACACACTCGAATCTGTATCTCAGAAGAACCCAATGGGAGAACAATCCATACAGT
TTTACTCTCTTTATTGACAAGCACAAGTTTCTTTGTCTAAAACCCGAATATGAAGAAAAG
AAAGATAGAAGAAGAATCCAGTCAATCACTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCGGAC
ATAAAGGCTATCAACGACCTTCCCCATGTTAGCAATGGTGTCAAGAGTAGCCGAGTAGAT
AGCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATGATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGTACC
T

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR4GL75TF 301 0 0
AAAAAGACACACTCGAATCTGTATCTCAGAAGAACCCAATGGGAGAACAATCCATACAGT
TTTACTCTCTTTATTGACAAGCACAAGTTTCTTTGTCTAAAACCCGAATATGAAGAAAAG
AAAGATAGAAGAAGAATCCAGTCAATCACTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCGGAC
ATAAAGGCTATCAACGACCTTCCCCATGTTAGCAATGGTGTCAAGAGTAGCCGAGTAGAT
AGCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATGATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGTACC
T

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR4FA71JQ 653 0 0
GTAAACAAATTCTACAGTTTTAAGCACTAAAGAAAAAGACACACTTGAATCTGTATCTCA
GAAGAACCCAATGGGAGAACAATCCATACAGTTTTACTCTCTTTATTGACAAGCACAAGT
TTCTTTGTCTAAAACCCGAATATGGAGAAAAGAAAGATAGAAGAAGAACCCAATCAATCA
CTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCGGACATAAAGGCTATCAACGACCTTCCCCATG
TTAGCAATGGTGTCAAGAGTTGCCGAGTAGATAGCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATG
ATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGTACCTGCGAATTTCTTGTCAAGTATCATCTGA
AACAGCTTCTTCTCCACATGGTCGATAGGCAACCCAATCAGATCAGCAACGTGGGCTATC
TCAACTCGTGAGAAAGGCTCGATCAAACGACAAAGGTTCTGCTCCAGAAGCGTGTCGTAA
AGAGAAGAGAGATGTCTGTGGACAATTGGGTCATCCTCTAGCTGCGCTTTGTAGTCACGG
AGAGCGTTCTCAAACAGTTTCAACGACCTCTTCGAGTGAGCATCGGCGACCGCCTTCATG
GCATCTAGATCAGGGCCAACGTACTGGAGTCCAGCCTTTGAGGGGATTATTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 3

CO CL4510Contig1 888 3 10 U
ATCAAACAATGCGAGAATGAACACCAAGCAAAGCCCATTAAGAAACTGGGCCAGAGAAGC
CCATCAATGTATAGTAAACACCCAACGGTTATCCAAAACATGAAAACCTTTCTGTGAGAA
TGTTATTGTTACCAAGGGAATGAAGGTAAAAAGAAAAAGAAAGGGTGGTCAAATTTAAAA
ATCTGCCAGCGCTGCAGGAAGGATGTAAAAACTGTGGATGGGTGGAGGTGGACAGACGCC
AAGGATAGAACAGACGTCTTTCTTTTCCAGAAAATTTTCGAAATCGGCAAGCATCAGTGG
GCCGTACTCGAACACCATCTTCTTGCACTTGTCCTGGTAATTGTTGAGGGACTTGCATTC
CTTGAGAAGTAAGCGAATTATCTTGAGCTTAGTTTGAGGATCCTTGAGTTTGGTGACAAG
CTGGGAGACAGTATCGTGGCAAGCCTCACAGTTTCCTTGGGAAGCAAGGAGTGGTTGACA
GAGGTTAAGGGTTTTGCAGATGCCGTGGGGGTTGAGAAGAGAGACTCGAGTGAAGAAAAG
TTGGGTATAATGATCTACCATGGAAAGACACTGTTTTTGCAAAGGAGGAATCTGGGAGCA
GGTCATGTGGAGGGCCTCAACGAGTGCATTATGGTTGTCGTCATTTTGGAGGTAATCAAT
GGCGAGGGTGAGATACTTATCACACAACTCACAAACTTGGTTATCCTCAGCAGATGGTTG
GGGAAGAGAAGCATCACAGGTGGTCAGCCCCAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGACTCCAAA
TTTAATAACGCCCATAATTACTGCACGGCGGACGGCCACAGATCTGCTGCTCCTCCTCCT
CCTCTATTGATTGATCGATCGACCTTCGATTCGACTCCTCCTTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E011JQ U 1
AF RR4DA18JQ U 19
AF RR4DA18TF C 324
BS 1 47 RR4E011JQ
BS 48 48 RR4DA18JQ
BS 49 369 RR4E011JQ
BS 370 370 RR4DA18JQ
BS 371 630 RR4E011JQ
BS 631 631 RR4DA18JQ
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BS 706 706 RR4DA18JQ
BS 707 734 RR4E011JQ
BS 735 888 RR4DA18TF

RD RR4E011JQ 735 0 0
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TTGGGTATAATGATCTACCATGGAAAGACACTGTTTTTGCAAAGGAGGAATCTGGGAGCA
GGTCATGTGGAGGGCCTCAACGAGTGCATTCTGGTTGTCGTCATTTTGGAGGTAATCAAT
GGCGAGGGTGAGATACTTATCACACAACTCACAAACTTGGTTATCATCAGCAGATGGTTG
GGGAAGAGAAGCAT
C

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4DA18JQ 716 0 0
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AAGGATGTAGAAACTGTGGATGGGTGGAGGTGGACAGACGCCAAGGATAGAACAGACGTC
TTTCTTTTCCAGAAAATTTTCGAAATCGGCAAGCATCAGTGGGCTGTACTCGAACACCAT
CTTCTTGCACTTGTCCTGGTAATTGTTGAGGGACTTGCATTCCTTGAGAAGTAAGCGAAT
TATCTTGAGCTTAGTTTGAGGATCCTTGAGTTTGGTGACAAGCTGGGAGACAGTATCGTG
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ATCACACAACTCACAAACTTGGTTATCCTCAGCAGATGGTTGGGGAAGAGAAGCAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DA18TF 565 0 0
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TGAGCTTAGTTTGAGGATCCTTGAGTTTGGTGACAAGCTGGGAGACAGTATCGTGGCAAG
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AAAGACACTGTTTTTGCAAAGGAGGAATCTGGGAGCAGGTCATGTGGAGGGCCTCAACGA
GTGCATTATGGTTGTCGTCATTTTGGAGGTAATCAATGGCGAGGGTGAGATACTTATCAC
ACAACTCACAAACTTGGTTATCCTCAGCAGATGGTTGGGGAAGAGAAGCATCACAGGTGG
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CACGGCGGACGGCCACAGATCTGCTGCTCCTCCTCCTCCTCTATTGATTGATCGATCGAC
CTTCGATTCGACTCCTCCTTATTCC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 3

CO CL4511Contig1 680 3 2 U
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CTGCTTCCGGTTCATCTGGTGTCACTACTTCGAAGCTGAAGCTTTTCCTCTTCTCCTGCT
CTTTGGCTCTTAGAGATCGGACAGGCAAAATTTTGGAGGAATAAGCGTGGAGCTCCTTCA
ATCTAAAGAGACGATCGACTTGGATTTCAAGGCATTTCTGGATCTCTCCTCTTTGGAGGA
GATGACTCATCTTCAGATCCATGGCCCCGTCTCTCTCCTCCAGCAATTTCTCAGTCCTCT
CCCGATCTTCTCTCAACCTCTCGAGTTTCTTCTTGAAGGCGTTCAGCTCCTCCGCAAGAG
AAGCGTCCATCGATTCAACAACAGGAACTGGAACTGGAACAAGATTCTCCCCCCTGGCAT
CATCATCTTCATGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTTGGCCTCTTTCAGCTGAAGTTGCGTAT
CTGCTGGTGGGACGTTGAAGATGTTTCTGGGCTGGAGAGCTTTTCGACCTGATGATTTCA
TTTTCTTATTTTTTTTGCCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CP11TF C 1
AF RR4CP11JQ U 4
AF RR4CQ66JQ U 4
BS 1 3 RR4CP11TF
BS 4 680 RR4CP11JQ

RD RR4CP11TF 680 0 0
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AACAAAGCTTTTCTTAAAGACAAGACAAGACAAGATCATAAACGGAAAGTGGGGGTTGTT
GGTCTGTGCCGCCTATTAGTTTGCTTCCTTTAATAAGTCACTTTGCGTTCTCTCTGCTGT
CTGCTTCCGGTTCATCTGGTGTCACTACTTCGAAGCTGAAGCTTTTCCTCTTCTCCTGCT
CTTTGGCTCTTAGAGATCGGACAGGCAAAATTTTGGAGGAATAAGCGTGGAGCTCCTTCA
ATCTAAAGAGACGATCGACTTGGATTTCAAGGCATTTCTGGATCTCTCCTCTTTGGAGGA
GATGACTCATCTTCAGATCCATGGCCCCGTCTCTCTCCTCCAGCAATTTCTCAGTCCTCT
CCCGATCTTCTCTCAACCTCTCGAGTTTCTTCTTGAAGGCGTTCAGCTCCTCCGCAAGAG
AAGCGTCCATCGATTCAACAACAGGAACTGGAACTGGAACAAGATTCTCCCCCCTGGCAT
CATCATCTTCATGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTTGGCCTCTTTCAGCTGAAGTTGCGTAT
CTGCTGGTGGGACGTTGAAGATGTTTCTGGGCTGGAGAGCTTTTCGACCTGATGATTTCA
TTTTCTTATTTTTTTTGCCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4CP11JQ 677 0 0
GAAATGAGAAGGGGCCCAGGATAAAAAGGGCGTAAGTAACGAGACATTAATTACAGAAAC
AAAGCTTTTCTTAAAGACAAGACAAGACAAGATCATAAACGGAAAGTGGGGGTTGTTGGT
CTGTGCCGCCTATTAGTTTGCTTCCTTTAATAAGTCACTTTGCGTTCTCTCTGCTGTCTG
CTTCCGGTTCATCTGGTGTCACTACTTCGAAGCTGAAGCTTTTCCTCTTCTCCTGCTCTT
TGGCTCTTAGAGATCGGACAGGCAAAATTTTGGAGGAATAAGCGTGGAGCTCCTTCAATC
TAAAGAGACGATCGACTTGGATTTCAAGGCATTTCTGGATCTCTCCTCTTTGGAGGAGAT
GACTCATCTTCAGATCCATGGCCCCGTCTCTCTCCTCCAGCAATTTCTCAGTCCTCTCCC
GATCTTCTCTCAACCTCTCGAGTTTCTTCTTGAAGGCGTTCAGCTCCTCCGCAAGAGAAG
CGTCCATCGATTCAACAACAGGAACTGGAACTGGAACAAGATTCTCCCCCCTGGCATCAT
CATCTTCATGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTTGGCCTCTTTCAGCTGAAGTTGCGTATCTG
CTGGTGGGACGTTGAAGATGTTTCTGGGCTGGAGAGCTTTTCGACCTGATGATTTCATTT
TCTTATTTTTTTTGCCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4CQ66JQ 665 0 0
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AAAGCTTTTCTTAAAGACAAGACAAGACAAGATCATAAACGGAAAGTGGGGGTTGTTGGT
CTGTGCCGCCTATTAGTTTGCTTCCTTTAATAAGTCACTTTGCGTTCTCTCTGCTGTCTG
CTTCCGGTTCATCTGGTGTCACTACTTCGAAGCTGAAGCTTTTCCTCTTCTCCTGCTCTT
TGGCTCTTAGAGATCGGACAGGCAAAATTTTGGAGGAATAAGCGTGGAGCTCCTTCAATC
TAAAGAGACGATCGACTTGGATTTCAAGGCATTTCTGGATCTCTCCTCTTTGGAGGAGAT
GACTCATCTTCAGATCCATGGCCCCGTCTCTCTCCTCCAGCAATTTCTCAGTCCTCTCCC
GATCTTCTCTCAACCTCTCGAGTTTCTTCTTGAAGGCGTTCAGCTCCTCCGCAAGAGAAG
CGTCCATCGATTCAACAACAGGAACTGGAACTGGAACAAGATTCTCCCCCCTGGCATCAT
CATCTTCATGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTTGGCCTCTTTCAGCTGAAGTTGCGTATCTG
CTGGTGGGACGTTGAAGATGTTTCTGGGCTGGAGAGCTTTTCGACCTGATGATTTCATTT
TCTTA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL4512Contig1 849 3 7 U
GGGCTTCAAATAATTGATTCAACATCAAAAACTGTAGGAAAATTCACATATCTAGAACAA
CATAATCAAGAAAATCCCATTACATGGATCTTTTTCCTTTTCGAGTAAAACTCAAAAAAG
AAAGAACAAAAACATATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAAACCCTACAATAC
CATATAGAACACATAGGTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAATCCCAAGATGAAATCAT
TCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAATCTCACAAC
TCACCGGAGAAGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCTCTATGCTCTGACGGGTA
CTTAATGGCCCGTGGAGCGCTTTTCGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGAAGCTTCCTAATTG
AAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGGAATTTCGCCACCTTAAT
CCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCCTCCATAGCCTGGCAAAA
CGGACACCAAGGAGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTACGGTTATTACCAAGCTT
CAACAGATTCTCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAACCACATCGCTGCTCTCGAATATATC
ATGCACAATAGCAGGTGCTAAATCCGCGGTGGTGTCGTCTTCCTTCTTAATGTTCCCTTT
GTGGAGGCCACATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCCACCACCACCTTCCTTCTCTCTCGTG
CTGACCGGAAACACTGGCCTAGTACACGGCTCACACCCAATAGAACATATCCTTGAGCAT
GCATGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO38JQ U 36
AF RR4A610JQ U 51
AF RR4DS19JQ U 1
BS 1 88 RR4DS19JQ
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C
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CTTTTCGAGTAAAACTCAAAAAAGAAAGAACAAAAACATATTTAACGACAAGAAGACAGA
AAAAGAGTATAAACCCTACAATACCATATAGAACACATAGGTTTTGCTTATTCTTCTAGA
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CTCTTTACGGTTATTACCAAGCTTCGACAGATTCTCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAAC
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GTCTTCCTTCTTAATGTTCCCTTTGTGGAGGCCACATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCC

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR4A610JQ 680 0 0
C
CTAGAACAACATAATCAAGAAAATCCCATTACATGGATCTTTTTCCTTTTCGAGTAAAAC
TCAAAAAAGAAAGAACAAAAACATATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAAACC
CTACAATACCATATAGAACACATAGGTTTTGCTTATTCTTCTAAATCCACAATCCCAAGA
TGAAATCATTCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAA
TCTCACAACTCACCGGAGAAGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCTCTATGCTC
TGACGGGTACTTAATGGCCCGTGGAGCGCTTTTCGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGAAGCT
TCCTAATTGAAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGGAATTTCGC
CACCTTAATCCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCCTCCATAGC
CTGGCAAAACGGACACCAAGGAGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTACGGTTATT
ACCAAGCTTCAACAGATTCTCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAACCACATCGTTGCTCTC
GAATATATCATGCACAATAGCAGGTGCTAAATCCGCGGTGGTGTCGTCTTCCTTCTTAAT
GTTCCCTTTGTGGAGGCCA

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR4DS19JQ 849 0 0
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CATAATCAAGAAAATCCCATTACATGGACCTTTTTCCTTTTCGAGTAAAACTCAAAAAAG
AAAGAACAAAAACATATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAAACCCTACAATAC
CATATAGAACACATAGGTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAATCCCAAGATGAAATCAT
TCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAATCTCACAAC
TCGCCGGAGAAGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCTCTATGCTCTGACGGGTA
CTTAATGGCCCGTGGAGCGCTTTTCGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGAAGCTTCCTAATTG
AAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGGAATTTCGCCACCTTAAT
CCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCCTCCATAGCCTGGCAAAA
CGGACACCAAGGAGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTACGGTTATTACCAAGCTT
CAACAGATTCTCAATCCCCCCTCTGGTCAATGAAACCACATCGCTGCTCTCGAATATATC
ATGCACAATAGCAGGTGCTAAATCCGCGGTGGTGTCGTCTTCCTTCTTAATGTTCCCTTT
GTGGAGGCCACATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCCACCACCACCTTCCTTCTCTCTCGTG
CTGACCGGAAACACTGGCCTAGTACACGGCTCACACCCAATAGAACATATCCTTGAGCAT
GCATGCATC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

CO CL4513Contig1 1231 2 2 U
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GTACGTCTCAAGATGGAGTGAGGATACGGCGGCTGCAGAAGCAAAGAGAGGCTGAACGCC
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AATTCGGCTCCAGCTCTTGCGAGATTCTTGACACTGCTTTCAAGAAGGAGACAGTGGGTT
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AAGAGAAGGAGAAGTTGCTCAAGCTTCTGCAAGAGGAAGAGGAGCTTCAACAACGTAAGC
GTAGCAAGAAGAGAAAGATTAAGGGAAGCTCCCGTTTATCTCTTGCTGAAGATCTTGACA
ATGGTAGTGATGAAGATGATGGAGATAACAACAAGAGTTCTGGGAACATACGCTACGGAA
AACTTGGCAAGGACCCCTCAGTGGAAACTAACTTCCTGCCTGACAGTGAGCGAGAGGCGG
AGGAACAAGCTGAACGTGAAAGGCTAAAGAAGCAGTGGATTCGTAAACAAGAGCAGATTA
AAAACGATCCTCTTCAAATTACCTACAGTTACTGGGATGGGACCGGCCATAGACGAGTTA
TCCAGGTTCGCAAGGGTGACGCAATTGGGAATTTTCTACGGGCTGTTCAGCAGCAGCTTG
CACCTGACTTCAGGGAGATTAGGACGGCATCAGTTGAGAATTTGCTTTACGTAAAGGAAG
ATCTTATAATCCCACATCAACACAGTTTTTACGAGCTGATCATAAACAAAGCTAGGGGGA
AGAGTGGCCCGCTGTTTCACTTTGATGTGCATGAAGACGTGAGAACAATTGCAGATGCAA
CGATCGAGAAAGACGAGTCACATGCGGGTAAAGTGGTGGAGAGGCATTGGTACGAGAAGA
ACAAGCATATATTTCCTGCTTCCAGATGGGAGATATACGACCCGACAAAGAAGTGGGAAC
GGTACACAGTCCATGGGGATTGATTGATTTTGAAGCAGAACATGTTTTATTGATGGATCA
TCCATCACTTGGTTTACATGTAATCCTGTTTGACATTATTTATCAGATTTTGTGTAGTAG
TAGTAGTGGAACGTTGATGGAATTTGTTTAATGCGTTTTTATTCTTCTTTATTGTCAACC
AGTTCCTCCATAATAACACCCCCCATTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D913TF U 1
AF RR4D913JQ C 552
BS 1 694 RR4D913TF
BS 695 1231 RR4D913JQ

RD RR4D913TF 696 0 0
GGAAAAGTGCATCGTTCAGACGAAACAGAAAGATGTCGGGTATGGGCGACGGATACGTGG
GTACGTCTCAAGATGGAGTGAGGATACGGCGGCTGCAGAAGCAAAGAGAGGCTGAACGCC
GTAAGATCCAGGAGCTGAAGAGCAAGACTGCCTCGGGCCAGGAGCAATCAGGTCTTCTCC
AATTCGGCTCCAGCTCTTGCGAGATTCTTGACACTGCTTTCAAGAAGGAGACAGTGGGTT
TAGTCACCAGAGAGGAGTATGTGGAGAAGAGGGTTAATATTCGTAATAAGTTCGAGGAAG
AAGAGAAGGAGAAGTTGCTCAAGCTTCTGCAAGAGGAAGAGGAGCTTCAACAACGTAAGC
GTAGCAAGAAGAGAAAGATTAAGGGAAGCTCCCGTTTATCTCTTGCTGAAGATCTTGACA
ATGGTAGTGATGAAGATGATGGAGATAACAACAAGAGTTCTGGGAACATACGCTACGGAA
AACTTGGCAAGGACCCCTCAGTGGAAACTAACTTCCTGCCTGACAGTGAGCGAGAGGCGG
AGGAACAAGCTGAACGTGAAAGGCTAAAGAAGCAGTGGATTCGTAAACAAGAGCAGATTA
AAAACGATCCTCTTCAAATTACCTACAGTTACTGGGATGGGACCGGCCATAGACGAGTTA
TCCAGGTTCGCAAGGGTGACGCAATTGGGAATTT
TC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4D913JQ 680 0 0
GAACGTGAAAGGCTAAAGAAGCAGTGGATTCGTAAACAAGAGCAGATTAAAAACGATCCT
CTTCAAATTACCTACAGTTACTGGGATGGGACCGGCCATAGACGAGTTATCCAGGTTCGC
AAGGGTGACGCAATTGGGAATTTTCTACGGGCTGTTCAGCAGCAGCTTGCACCTGACTTC
AGGGAGATTAGGACGGCATCAGTTGAGAATTTGCTTTACGTAAAGGAAGATCTTATAATC
CCACATCAACACAGTTTTTACGAGCTGATCATAAACAAAGCTAGGGGGAAGAGTGGCCCG
CTGTTTCACTTTGATGTGCATGAAGACGTGAGAACAATTGCAGATGCAACGATCGAGAAA
GACGAGTCACATGCGGGTAAAGTGGTGGAGAGGCATTGGTACGAGAAGAACAAGCATATA
TTTCCTGCTTCCAGATGGGAGATATACGACCCGACAAAGAAGTGGGAACGGTACACAGTC
CATGGGGATTGATTGATTTTGAAGCAGAACATGTTTTATTGATGGATCATCCATCACTTG
GTTTACATGTAATCCTGTTTGACATTATTTATCAGATTTTGTGTAGTAGTAGTAGTGGAA
CGTTGATGGAATTTGTTTAATGCGTTTTTATTCTTCTTTATTGTCAACCAGTTCCTCCAT
AATAACACCCCCCATTACCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL4514Contig1 975 2 2 U
CGATGCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTTTGTACAGAGCCGTCATCGCCGAGTTCGTAGC
CACTCTCCTCTTCTTGTATGTCACTGTTTTGACTGTCATCGGCTACAAGATTTCCTCCGA
CACTAAGGCCGGAGGCGACGAGTGCGGAGGTGTCGGAATCCTCGGCATCTCATGGGCTTT
CGGTGGCATGATATTCATCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCAGGTGGTCACATAAA
CCCTGCGGTGACGTTCGGCTTGTTCTTGGCACGGAAGGTATCGTTGGTTAGAGCGGTGCT
ATACATGGTGGCTCAGTGTTTGGGTGCTATTTGTGGAGTTGGTTTCGTCAAAGCTTTCCA
AAGCTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGAGGAGCAAACTCTCTAGCCGATGGATACAGCAC
GGGAACAGGACTCGCTGTAGAGATCATTGGAACATTCGTCCTGGTCTACACTGTTTTCTC
CGCTACAGATCCCAAAAGAAACTCACGAGACTCCCACGTTCCTGTGTTGGTGCCACTCCC
GATTGGATTTGCCGTGTTCATGGTTCACTTGGCCACTATTCCAATCACCGGAACCGGGAT
TAACCCGGCCAGGAGTTTTGGAGCCGCGGTTATCTACAATGAGTCCAAGCCGTGGGATGA
CCACTGGATTTTCTGGGTGGGACCATTCATCGGAGCTGCGATAGCTGCATTTTATCACCA
ATTCGTCCTAAAGGGCCTCTGGTTCCAAGTCCCTCGGCTCCTTCCGAAGTGCAGCTTGAA
TTTAGCCACACAAAACAAAATAGCAATTACAAAATGATTGTTATTATGTATGTACAAAAT
TGGCAACTTTGGTTTTAAAATCTATGCTCTGTTTTATTCCTTGTCTTTCCTAATTTCTGG
TTTCATTGTGTGATATGTGAATGTTTGTGTACTTGGGGAAAACAATCAATGAAATCAAAT
TGTTTTTGCCTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AM42TF U 1
AF RR4AM42JQ C 121
BS 1 832 RR4AM42TF
BS 833 975 RR4AM42JQ

RD RR4AM42TF 832 0 0
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CACTCTCCTCTTCTTGTATGTCACTGTTTTGACTGTCATCGGCTACAAGATTTCCTCCGA
CACTAAGGCCGGAGGCGACGAGTGCGGAGGTGTCGGAATCCTCGGCATCTCATGGGCTTT
CGGTGGCATGATATTCATCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCAGGTGGTCACATAAA
CCCTGCGGTGACGTTCGGCTTGTTCTTGGCACGGAAGGTATCGTTGGTTAGAGCGGTGCT
ATACATGGTGGCTCAGTGTTTGGGTGCTATTTGTGGAGTTGGTTTCGTCAAAGCTTTCCA
AAGCTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGAGGAGCAAACTCTCTAGCCGATGGATACAGCAC
GGGAACAGGACTCGCTGTAGAGATCATTGGAACATTCGTCCTGGTCTACACTGTTTTCTC
CGCTACAGATCCCAAAAGAAACTCACGAGACTCCCACGTTCCTGTGTTGGTGCCACTCCC
GATTGGATTTGCCGTGTTCATGGTTCACTTGGCCACTATTCCAATCACCGGAACCGGGAT
TAACCCGGCCAGGAGTTTTGGAGCCGCGGTTATCTACAATGAGTCCAAGCCGTGGGATGA
CCACTGGATTTTCTGGGTGGGACCATTCATCGGAGCTGCGATAGCTGCATTTTATCACCA
ATTCGTCCTAAAGGGCCTCTGGTTCCAAGTCCCTCGGCTCCTTCCGAAGTGCAGCTTGAA
TTTAGCCACACAAAACAAAATAGCAATTACAAAATGATTGTTATTATGTATG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4AM42JQ 855 0 0
CA
CTAAGGCCGGAGGCGACGAGTGCGGAGGTGTCGGAATCCTCGGCATCTCATGGGCTTTCG
GTGGCATGATATTCATCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCAGGTGGTCACATAAACC
CTGCGGTGACGTTCGGCTTGTTCTTGGCACGGAAGGTATCGTTGGTTAGAGCGGTGCTAT
ACATGGTGGCTCAGTGTTTGGGTGCTATTTGTGGAGTTGGTTTCGTCAAAGCTTTCCAAA
GCTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGAGGAGCAAACTCTCTAGCCGATGGATACAGCACGG
GAACAGGACTCGCTGTAGAGATCATTGGAACATTCGTCCTGGTCTACACTGTTTTTTCCG
CTACAGATCCCAAAAGAAACTCACGAGACTCCCACGTTCCTGTGTTGGTGCCACTCCCGA
TTGGATTTGCCGTGTTCATGGTTCACTTGGCCACTATTCCAATCACCGGAACCGGGATTA
ACCCGGCCAGGAGTTTTGGAGCCGCGGTTATTTACAATGAGTCCAAGCCGTGGGATGACC
ACTGGATTTTCTGGGTGGGACCATTCATCGGAGCTGCGATAGCTGCATTTTATCACCAAT
TCGTCCTAA*GGGCCTCTGGTTCCAAGTCCCTCGGCTCCTTCCGAAGTGCAGCTTGAATT
TAGCCACACAAAACAAAATAGCAATTACAAAATGATTGTTATTATGTATGTACAAAATTG
GCAACTTTGGTTTTAAAATCTATGCTCTGTTTTATTCCTTGTCTTTCCTAATTTCTGGTT
TCATTGTGTGATATGTGAATGTTTGTGTACTTGGGGAAAACAATCAATGAAATCAAATTG
TTTTTGCCTTCGT

QA 3 855 3 855
DS 



AS 1 3

CO CL4515Contig1 1365 3 6 U
GGAATCTCTCACACTTTAGACCTAAACACCTAATTAAAGCCCCCCCAAATCGCTTCATAT
GGCAGAGTGTCTGTCTCTCACACTCAACAACAACACCATGGCTTCCTCTCTTCGAACTCA
AATCTCCGCTTCTCGTCTCCTCCGCTTCTCCTCCTCCTCCTCCGGATCCAAACTCTCTTT
CCCCTCGTCATCTCTCTCCTTCACCAGATCTCTCGTCTCTTCTCCGCTTCTCTCTCAGAA
GAGAAGTCAAGCTACGTTGGTGAATCGGAGGAGCTTCAGCTCGGCTGCAACCACCCAATG
TACGGCAGCTACGGATCCTGAACAGTTGAAGAGTGCTAGAGAAGACATCAAAAAGCTCCT
CAACACCAAGTTTTGCCATCCAATCTTGGTTCGTTTGGGGTGGCATGATGCTGGCACCTA
CAACAAGAACATCTCTGAGTGGCCTCAGAGAGGTGGAGCTAATGGCAGTCTCAGATACGA
GATTGAGCTTAAGCATGCTGCTAATGCTGGTCTTGTAAATGCTTTAAACCTTATTCAGCA
CATCAAAGACATGTACTCTGGGATCTCATACGCTGACCTTTTCCAGCTGGCCAGTGCTAC
TGCTATAGAGGAAGCTGGAGGACCTAAAATACCCATGAAATATGGAAGAGTTGATACCTC
TGGTCCTCATGAATGTCCTGAAGAAGGAAGGCTTCCTGACGCTGGTCCTCCTTCACCTGC
TAATCATCTCAGAGAAGTCTTCTACAGAATGGGTTTAGATGATAAGGACGTAGTTGCATT
ATCTGGTGCACACACCTTAGGAAGATCTAGGCCAGAACGTAGTGGTTGGGGGAAGCCAGA
AACGAAGTACACGAAAGAAGGACCGGGAGCACCAGGAGGACAGTCATGGACACCAGAGTG
GTTGAAGTTTGACAATTCTTACTTCACAGAAATCAGGAAAAGAGAGATGAAGATCTCCTT
GTCCTGCCCACTGATGCTGCCATCTTTGAAGATCCTTCTTTCAAGGTGTATGCTGAGAAG
TATGCTGCAGATCAAGATGCTTTCTTCAAGGATTATGCTGAATCCCATGCGAAACTGAGC
AATCTTGGAGCAAAATTTAACCCTCCTGAGGGTATCATTATCTAGTCGGCATCTAATTAA
CTCTGTCGAGGTACTGGTGTTTTTGAAAAAAATAATGACAAAGAAGAAAGGGAACATTAC
TGGGGAGAACTTTTCTTCTTAGTTTTGCAGATATCTTTTGGACTATGTTTCTGCACAAAG
GAGTTGGTTGAGTTTCTTTTGCCTTAACTATTTGGTCGTTCGTGTCATGGTTGAATTGTC
GTATTGTTTGTTGCAATAACTTGAAAATCGGGACACCTTAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4CX18TF U 1
AF RR4C917JQ C 586
AF RR4C917TF U 586
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RD RR4CX18TF 683 0 0
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QA 1 780 1 780
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CATGCGAAACTGAGCAATCTTGGAGCAAAATTTAACCCTCCTGAGGGTATCATTATCTAG
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CATGGTTGAATTGTCGTATTGTTTGTTGCA*TAACTTGAAA*TCGGGACACCTTAAACTT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 3

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TGAAAGATGATATCATTCAAATAAGACTCAAGAGAGCTTTTAACTTT


BQ
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AF RR4G162JQ C 1
AF RR4GS65TF U 50
AF RR4G162TF U 1
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TTTGGGTTGAAGGATGATATCA

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DS 

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TGAAAGATGATATCATTCAAATAAGACTCAAGAGAGCTTTTAACTTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 3

CO CL4517Contig1 1253 3 3 U
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GAACAACTAGATTTTGTTCTTTGAATTGGCTTCATCTGTAGTCTCTTCCACGTTCTTAGT
TAGCTGTCACCGGATTTATTTGTTAGGCTCAATAGTACCCCAGTGCTGAGAGAAAGCGCC
ACGATACCAAGTGATGCCTCGGTTGATACATGGAAGCCAAAGAAATCGAGGATCATCTTG
CATCCGATGAAGCCAAGAACCACTGCTATTGATGGCTGCAAGTATTCCAGGTCGTCCATT
CCTTCAGAAATCAGGGTATAGAGAGACCTTAGTCCTAGGATTGCAAAGAGATTAGAGGTC
AAGACAATAAAAGGATCCCTTGTGACGCCAAAAACAGCTGGTATCGAGTCAACAGCAAAT
GCTATGTCACTGAGCTCGATCACTGCTACTGTGAGAAGCAACGGTGTCGCTTTCCAAATG
CCTTCATGCTTTGTGAAAAAACGATTCCCATCATAAGTTGATGTGACGGGAATAAATCTC
TGGCATGTCTTCACAATGAAATTGTCGGATAGATCTGAATCATCTTCTTCACTTGAAAAT
AACTTGAAAGATGAATATAAGAGAACTGCTGCTAGTAGTAGGTTGACTGCTTCAAATTTC
TGAAGAGTAGCTGTTCCTATTAATATGAGGGTGAAGCGAAAGATAACTGCACCAGCTACA
CCATAGGAAAGCACCCGGTTCTGATACATGAGGGGCACTTTGAAGTATTTGAAGACGAGA
ACAAAAACAAACAAGTTGTCCACTGACAAGCTTTGTTCCAATAAATAGCCTGCAAAAAAC
TCAGATGCCTTGCCAACACCCTCTTTCAAACCTATTCCGATTCCAAATGCCACCGCAGCG
CTTACACACAAGGCAACAGTCTTGAAGGAAGTTTTGTAAGACTCATCTTGTAGAGTAGTA
TCTCTCAGGTCTTTATCATGTGGTACAAGATCTCTGCTCTCCTTCTCTGAAGAAGAAGAA
GAAGAAAGATCATCTTCCTGATCAGTTCCTCGGGAGCAAGCAATAGGAGAAAGACGACGA
TTTGCAGCTGAAACGAGAGAGAAAGGAGACTCAGTCCATCCACGAACTCGGAAGTTCGGC
GTAATCACCGGAATGCTAACAAAGATTCGATCCTGTTTTGCCGGAGCGAGAACTCCGTGG
TGGTGGATAACTGAAGCTGAGCTCATTGCGTTTTTGCGTCAAAATCCAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ90JQ U 1
AF RR4E252JQ U 1
AF RR4E252TF C 427
BS 1 676 RR4DQ90JQ
BS 677 770 RR4E252JQ
BS 771 1253 RR4E252TF

RD RR4DQ90JQ 676 0 0
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AAGACAATAAAAGGATCCCTTGTGACGCCAAAAACAGCTGGTATCGAGTCAACAGCAAAT
GCTATGTCACTGAGCTCGATCACTGCTACTGTGAGAAGCAACGGTGTCGCTTTCCAAATG
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AACTTGAAAGATGAATATAAGAGAACTGCTGCTAGTAGTAGGTTGACTGCTTCAAATTTC
TGAAGAGTAGCTGTTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4E252JQ 770 0 0
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GAACAACTAGATTTTGTTCTTTGAATTGGCTTCATCTGTAGTCTCTTCCACGTTCTTAGT
TAGCTGTCACCGGATTTATTTGTTAGGCTCAATAGTACCCCAGTGCTGAGAGAAAGCGCC
ACGATACCAAGTGATGCCTCGGTTGATACATGGAAGCCAAAGAAATCGAGGATCATCTTG
CATCCGATGAAGCCAAGAACCACTGCTATTGATGGCTGCAAGTATTCCAGGTCGTCCATT
CCTTCAGAAATCAGGGTATAGAGAGACCTTAGTCCTAGGATTGCAAAGAGATTAGAGGTC
AAGACAATAAAAGGATCCCTTGTGACGCCAAAAACAGCTGGTATCGAGTCAACAGCAAAT
GCTATGTCACTGAGCTCGATCACTGCTACTGTGAGAAGCAACGGTGTCGCTTTCCAAATG
CCTTCATGCTTTGTGAAAAAACGATTCCCATCATAAGTTGATGTGACGGGAATAAATCTC
TGGCATGTCTTCACAATGAAATTGTCGGATAGATCTGAATCATCTTCTTCACTTGAAAAT
AACTTGAAAGATGAATATAAGAGAACTGCTGCTAGTAGTAGGTTGACTGCTTCAAATTTC
TGAAGAGTAGCTGTTCCTATTAATATGAGGGTGAAGCGAAAGATAACTGCACCAGCTACA
CCATAGGAAAGCACCCGGTTCTGATACATGAGGGGCACTTTGAAGTATTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4E252TF 827 0 0
TCACTGAGCTCGATCACTGCTACTGTGAGA*GCAACGGTGTCGCTTTCCAAATGC*TTCA
TGCTTTGTGAAAAA*CGATTCCCATCATAAGTTGATGTGACGGGAATAAATCTCTGGCAT
GTCTTCACAATGAAATTGTCGGATAGATCTGAATCATCTTCTTCACTTGAAAATAACTTG
AAAGATGAATATAAGAGAACTGCTGCTAGTAGTAGGTTGACTGCTTCAAATTTCTGAAGA
GTAGCTGTTCCTATTAATATGAGGGTGAAGCGAAAGATAACTGCACCAGCTACACCATAG
GAAAGCACCCGGTTCTGATACATGAGGGGCACTTTGAAGTATTTGAAGACGAGAACAAAA
ACAAACAAGTTGTCCACTGACAAGCTTTGTTCCAATAAATAGCCTGCAAAAAACTCAGAT
GCCTTGCCAACACCCTCTTTCAAACCTATTCCGATTCCAAATGCCACCGCAGCGCTTACA
CACAAGGCAACAGTCTTGAAGGAAGTTTTGTAAGACTCATCTTGTAGAGTAGTATCTCTC
AGGTCTTTATCATGTGGTACAAGATCTCTGCTCTCCTTCTCTGAAGAAGAAGAAGAAGAA
AGATCATCTTCCTGATCAGTTCCTCGGGAGCAAGCAATAGGAGAAAGACGACGATTTGCA
GCTGAAACGAGAGAGAAAGGAGACTCAGTCCATCCACGAACTCGGAAGTTCGGCGTAATC
ACCGGAATGCTAACAAAGATTCGATCCTGTTTTGCCGGAGCGAGAACTCCGTGGTGGTGG
ATAACTGAAGCTGAGCTCATTGCGTTTTTGCGTCAAAATCCAAAAAA

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL4518Contig1 809 2 2 U
AGTTAATGGGTATCAATCTTTGCACACGGTAGTGATGGACGATGGAACGGTTCCACTTGA
AGTCCAAATACGTACACAAGAGATGCATTTGCAAGCTGAGTATGGGTTTGCAGCTCACTG
GAGGTACAAGGAAGGTGACTGCAAATACTCTTCGTTTGTACTTCAGATGGTTGAATGGGC
TCGATGGGTTGTAACGTGGCACTGCGAAACAATGAGCAAAGACCGAACTTCCATTTGCTC
TTCTGACTCCATCAAACCCCCTTGCAAGTTCCCTTCTCACGCCGAGGAGTGCCCTGCTTC
TTCTTACAAGCCTAACAGTAGCCAGGACGGGCCTGTCTATGTCATTGTAATCGAAAACGA
CAAGATGTCTGTGCAAGAGTTTCCAGCGAGTTCAACAGTCTCGGATCTGCTGAGCGGGGC
GGGGCCAGGGAGCTCGAGGTGGTCCATGTATGGAATACCCGCGAAGGAAGAGCTGAGGCC
AAGGCTGAACCAGAGGCCTGTAAGCGACCTCAAGTGGGAGCTGAAGATGGGTGATGTGGT
GGAGCTGACTCCACCAATTCCTGATGAGTTTCTGCCTGAATACAGAGAAGAGATTCAACG
GATGTATGATCGTGGGCTAGCGTTTTCTCGCCCTGGAACCATGGTTGGATGGGGAAGCTG
ATTATAGTCCTCTCTGATTGTTGATTTAGTCCTCCATGCATATGTAATAATGTATATATA
GTAAATGATTAGTTTTGTTGTACATAACAATGGTTCTGTTGATTCAATTTAAGCTGAAAA
AAAGATTAATGAAAATTCCAAAATTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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CTGAAAAAAAGATTAATGAAAATTCCAAAATTTGCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

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CACCGGAGACTTCCCAGCTTCTGTCTTGAAAGCCAAAGATCTCACGTTTCTTGATCTCAG
GTTCAATACTTTCTCAGGCTGTGTTCCTCCTCAGGTCTTTAATCTTGATCTTGACGTCTT
GTTCATCAACAACAACAATCTTGTTCAGACACTTCCATCCAATCTTGGCTCCATCACTGC
TCTTTATCTCACTTTCGCCAACAACAGGTTCACGGGTAAAATTCCCGCCAGCATAGGCAA
CATCAAGAACCTACAAGAAGTCCTTTTCTTGAATAACACTCTAACCGGGTGCTTACCATA
CCAAATTGGAAAGCTAAACCGAGCCACCGTTTTCGATGTTGGGTTTAACCAGCTAACCGG
TCCAATACCATACTCTTTCGGTTGCTTAGCCAAGATGGAACAACTCAACTTAGCCAGAAA
CAAATTCTATGGAACCATACCAGAGATTGTATGCGAGCTTCCTAGTCTCAAAAACTTTTC
TCTCTCCTATAATTACTTCACTCAGGCCGGTCCAAAATGTAGAGAACTCATCAAGAACCA
TATTCTTGACGTTCGTATGAATTGTATACTTGATCTTCCTAACCAGAAAACTGCACCGGA
ATGTGCTGAGTTCTTCATGCGGAGGCAGACTTGTCCTGATCTCAAGACTATGTTTCAGAT
CCCTTGTGGTAAGAATCCAAACCGTGTTAAACTGGATCAAGAAACTCAAGCTTCTTCTGC
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AGTTATATATATATTGATGTATTTGTGGTTACCAAATACAAATGAATAAATGTGTTTGTT
GTATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH22TF U 1
AF RR4AP40TF U 170
AF RR4EH22JQ C 320
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TCTCTC
TATAATTA

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DS 

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G
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TTGACGTCTTGTTCATCAACAACAACAATCTTGTTCAGACACTTCCATCCAATCTTGGCT
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GCTTACCATACCAAATTGGAAAGCTAAACCGAGCCACCGTTTTCGATGTTGGGTTTAACC
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QA 2 756 2 756
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ACCCCCGACGGGGTTCGGAACCGATAACCTTTTGCTGTATCAGTTATATATATATTGATG
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QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 3

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AAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGATCCGAGAGAGAAACTT
TGATGCAAAAGGTCTCCCCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAACAATGTGG
GTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTAATTTCCATATCG
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CAGGCTATGGAAGTATCGTCTTCATTTCATCTGTTGCTGGGGTTGTATTCTTTGAATCTG
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AATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTC
TGTCTCAACCATATCTCGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCAC
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CAGCGTCTTATATAACTGGCCAAACCATTTGCGTTGATGGAGGCCTCACCATTAACGGTT
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TATAAGGGTGTCTACATTTTCATTGTTGGAATAGAAGATTCAGTTACACACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD71TF U 5
AF RR4AF80TF U 1
AF RR4FD71JQ C 311
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GG
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TTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGATCCGAGAGAGAAACTTTGATGC
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AACCATATCTCGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCACTTGGTC
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CTTATATAACTG

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CAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCTT
CAGGCTATGGAAGTATCGTCTTCATTTCATCTGTTGCTGGGGTTGTATTCTTTGAATCTG
GATCCCTTTATAGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAGAAATTTGGCATGTG
AATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTC
TGTCTCAACCATATCTCGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCGC
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TCTCCTACCAACCACTTGCTTGAGAA

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DS 

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TTC
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ACCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAG
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TCTCGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGATTGTTTGGTAGAACTCCACTTGGTCGCGCTGG
AGAACCAAATGAAGTTGCATCACTGGTGGTATTCTTGTGTCTACCCGCAGCGTCTTATAT
AACTGGCCAAACCATTTGCGTTGATGGAGGCCTCACCATTAACGGTTTCTCCTACCAACC
ACTTGCTTGAGAATGGCCTTGTCGCGTTTTATTTTCTGCCACTGTCTTTGAACTCTTAAA
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ACATTTTCATTGTTGGAATAGAAGATTCAGTTACACACG

QA 4 642 4 642
DS 



AS 1 3

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CGGAAAAGCACCGGAGAAGTCTAGTTTTTCCCGGAGATGTACTTTGCTCAGCCGGTACTT
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TCTCGCCAGAAAATCTGATCTTAGAGGACAACAAAATGAGTTAAAGAAGGCAGACATTTC
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AAACTCCCAGTTGACCATGATCTTCCGCGATAAACTTATGGTTTACGAGTTGCCTGAAGA
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GAACGCTCAGAAACTAAACATGAACGTCAGCCACGAAAGCAAAGTTGTGATTCCTGATCT
GAACGAGCCAACGAGTTCCGGGACCAACAACGACGATCATCAAACAGGACAGCAACATCA
AGTCGTGAAACGCATTGCAACAAGATCCTCTCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGAAAAGA
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GCCACAAAAGGTTGGTCCATCGGTAGAGCCAGGACAACCCTCGCGACAGCCTGAGACTCC
CTCAAAACCAAAGAGAGATAACGATGTGTCGATGGAAGTGGACGGAGAAGAAGGACGGTG
TTCAAAAGATCTCGAACTCAAACTTTAGGACATATAAAATGTTCATGATCGAGTTCACAT
TTGGATTTTGACTTATTTAGGATTTGAAGCTACATAATAAATGTTTAGATTCTTTGAGGT
TGTATTATTACGTAGTCATACTTTTCCATATAACTATATATACTCGTTTCTCAATCTAGT
TTAGATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AD72TF U 1
AF RR4D249TF U 55
AF RR4AD72JQ C 321
BS 1 786 RR4AD72TF
BS 787 790 RR4D249TF
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BS 818 841 RR4D249TF
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RD RR4AD72TF 786 0 0
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GCCACA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4D249TF 787 0 0
GG
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CGACCGGAAAAGCACCGGAGAAGTCTAGTTTTTCCCGGAGATGTACTTTGCTCAGCCGGT
ACTTGAAGGAGAAGGGTAGTTTCGGGAATATTGATATTGGTTTGGCTCATAAACTCGATC
TTGATCTCGCCAGAAAATCTGATCTTAGAGGACAACAAAATGAGTTAAAGAAGGCAGACA
TTTCTGAAACCAGAACCTTCGATGTGAAACAGAAGCTTTCAGTAGGTGAAGCCTCTACTT
CTTCCGGAGGCAAACCCAGCTTTGTCGATCTAAGTGAACCAGCAAGTGTAGTAGCAGAGC
CTGGAAACTCCCAGTTGACCATGATCTTCCGCGATAAACTTATGGTTTACGAGTTGCCTG
AAGACAAAGCAAAGGAGATAATTGAAGCAGCGACCGAAGCACATCGTGTTGCTGTTGCTT
CAAAGAACGCTCAGAAACTAAACATGAATGTCAGCCACGAAAGCAAAGTTGTGATTCCTG
ATCTGAACGAGCCAACGAGTTCCGGGACCAACAACGACGATCATCAAACAGGACAGCAAC
ATCAAGTCGTGAAACGCATTGCAACAAGATCCTCTCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGAA
AAGACAGGGCTGTGGCTAGAGCTCCATATCAAGTGAATCAAAGTGGTGGTCATCTTCCTC
CCAAGCCACAAAAG*TTGGTCCATCGGTAGAGCTAGGACA*CCCTCGCGACAGCCTGAGA
CTCCC

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR4AD72JQ 771 0 0
TGAAACAGAAGCTTTCAGTAGGTGAAGCCTCTACTTCTTCCGGAGGCAAACCCAGCTTTG
TCGATCTAAGTGAACCAGCAAGTGTAGTAGCAGAGCCTGGAAACTCCCAGTTGACCATGA
TCTTCCGCGATAAACTTATGGTTTACGAGTTGCCTGAAGACAAAGCAAAGGAGATAATTG
AAGCAGCGACCGAAGCACATCGTGTTGCTGTTGCTTCAAAGAACGCTCAGAAACTAAACA
TGAACGTCAGCCACGAAAGCAAAGTTGTGATTCCTGATCTGAACGAGCCAACGAGTTCCG
GGACCAACAACGACGATCATCAAACAGGACAGCAACATCAAGTCGTGAAACGCATTGCAA
CAAGATCCTCTCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGAAAAGACAGGGCTGTGGCTAGAGCTC
CATATCAAGTGAATCAAAGTGGTGGTCATCTTCCTCCCAAGCCACAAAAGGTTGGTCCAT
CGGTAGAGCCAGGACAACCCTCGCGACAGCCTGATACTCCCTCAAAACCAAAGAGAGATA
ACGATGTGTCGATGGAAGTGGACGGAGAAGAAGGACGGTGTTCAAAAGATCTCGAACTCA
AACTTTAGGACATATAAAATGTTCATGATCGAGTTCACATTTGGATTTTGACTTATTTAG
GATTTGAAGCTACATAATAAATGTTTAGATTCTTTGAGGTTGTATTATTACGTAGTCATA
CTTTTCCATATAACTATATATACTCGTTTCTCAATCTAGTTTAGATTTTCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL4522Contig1 815 2 3 U
CGTTTATAAATAATTATACGGTAATATTTGTAGAACAGGATGATGTTGACATCTTATTAC
AGGTAAAAACAAGCAGCAACGAGTGGTAGGTAATAGATGACAGTAAGAGCAGTGCGAAAC
ACTCAACTCTCAATGGTCGGTTTAAATTGTTGAAGTACATATCAAAAGATTTTAGTATCC
CTTAACTGTAGAAGCAGTGAGAAGCTTGATTAGGCCTCCTTGACGGCAACAGCCTCCTTG
GCAGGTTCTTCCTTGGCAGCCTCCTTGGTAGGTTCTTCCTTGGCAGCCTCCTCGGTGGCT
TCACTGCTCTTCTCCTTGGCAGGTTCTTCCTTGGCTGGTTCCACTTCATCTGGGACTATG
AAAGCTGAGACAGGGAAAGTCCTGGAAAGCGTGGTTGGTGACATAAAAGTGATCTTCTCT
TTCTCCTCTGTATAGATCTCACTAATAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGACTTGACT
CCAGTGAGCTTCTTGATCTTGCCGGTTTGGACCACGGCAGTGACCTCGGTTCCATATGAG
ACAAGCTTATCGATCGCTTCGAACTTGTGGGTGATGCTCTGCTTCTGCTTCAGCCACACG
ACACCCGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAAAGGTAGTAAGCCATTG
GGCATAGATATTTCCTTGAGGAAAACTTTTATCTTCTCTCGGCACATCTCATCTCCGGTG
TACATCTCTGCCTTAGCTCTCACCTCCTCTGTGACCAGACCCATCTCTGTTTCTTAGCTC
TGTTGTGAGGGGTTTTAGTTGTGTGTTTTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D128JQ U 9
AF RR4B926TF C 1
BS 1 8 RR4B926TF
BS 9 502 RR4D128JQ
BS 503 815 RR4B926TF

RD RR4D128JQ 494 0 0
AATAATTATACGGTAATATTTGTAGAACAGGATGATGTTGACATCTTATTACAGGTAAAA
ACAAGCAGCAACGAGTGGTAGGTAATAGATGACAGTAAGAGCAGTGCGAAACACTCAACT
CTCAATGGTCGGTTTAAATTGTTGAAGTACATATCAAAAGATTTTAGTATCCCTTAACTG
TAGAAGCAGTGAGAAGCTTGATTAGGCCTCCTTGACGGCAACAGCCTCCTTGGCAGGTTC
TTCCTTGGCAGCCTCCTTGGTAGGTTCTTCCTTGGCAGCCTCCTCGGTGGCTTCACTGCT
CTTCTCCTTGGCAGGTTCTTCCTTGGCTGGTTCCACTTCATCTGGGACTATGAAAGCTGA
GACAGGGAAAGTCCTGGAAAGCGTGGTTGGTGACATAAAAGTGATCTTCTCTTTCTCCTC
TGTATAGATCTCACTAATAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGACTTGACTCCAGTGAG
CTTCTTGATCTTGC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4B926TF 815 0 0
CGTTTATAAATAATTATACGGTAATATTTGTAGAACAGGATGATGTTGACATCTTATTAC
AGGTAAAAACAAGCAGCAACGAGTGGTAGGTAATAGATGACAGTAAGAGCAGTGCGAAAC
ACTCAACTCTCAATGGTCGGTTTAAATTGTTGAAGTACATATCAAAAGATTTTAGTATCC
CTTAACTGTAGAAGCAGTGAGAAGCTTGATTAGGCCTCCTTGACGGCAACAGCCTCCTTG
GCAGGTTCTTCCTTGGCAGCCTCCTTGGTAGGTTCTTCCTTGGCAGCCTCCTCGGTGGCT
TCACTGCTCTTCTCCTTGGCAGGTTCTTCCTTGGCTGGTTCCACTTCCTCTGGGACTATG
AAAGCTGAGACAGGGAAAGTCCTGGAAAGCGTGGTTGGTGACATAAAAGTGATCTTCTCT
TTCTCCTCTGTATAGATCTCACTAATAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGACTTGACT
CCAGTGAGCTTCTTGATCTTGCCGGTTTGGACCACGGCAGTGACCTCGGTTCCATATGAG
ACAAGCTTATCGATCGCTTCGAACTTGTGGGTGATGCTCTGCTTCTGCTTCAGCCACACG
ACACCCGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAAAGGTAGTAAGCCATTG
GGCATAGATATTTCCTTGAGGAAAACTTTTATCTTCTCTCGGCACATCTCATCTCCGGTG
TACATCTCTGCCTTAGCTCTCACCTCCTCTGTGACCAGACCCATCTCTGTTTCTTAGCTC
TGTTGTGAGGGGTTTTAGTTGTGTGTTTTGTGTCC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL4523Contig1 917 2 10 U
GTACCGTAGAGACTCTATTGACTCTACTCATTATCCGGTTTTCCATCAGATGGAAGGCTT
TTGTGTCTTTTCTCCTGAGGACTGGAACGAGTCTGGCAAAGATTCCACGTTATATGCAGC
TGAGGATTTGAAGAAATGTCTTGAGGGTTTGGCACGTCACTTGTTTGGTGGTGTGGAGAT
GAGATGGGTTGATACATACTTTCCATTTACAGAACCATCTTTCGAGCTTGAGATATATTT
TAAGGAAGACTGGTTGGAAGTTTTGGGCTGTGGGGTGACAGAGCAACGAATTTTGAAGCA
GAGTGGATTAGAAAACAATGTTGCTTGGGCCTTTGGACTTGGATTGGAACGACTTGCTAT
GGTTTTGTTTGACATCCCTGATATTAGACTTTTCTGGTCCGACGATGAACGGTTTACGTC
CCAGTTTAAAAAAGGAGAGCTTGGAGTCAAGTTCAAGCCATTCTCAAAGTATCCGCCTTG
TTACAAGGACATCAGTTTCTGGATCAGTGAATCATTCACAGAGAATAACTTTTGTGAAGT
TGTGAGAGGAATCGCTGGGGATCTTGTTGAAGAGGTGAAGTTAATAGACAGTTTCACCAA
TAAGAAAGGGATGACGAGTCACTGTTACAGAATTGTCTTCCGTTCCATGGAGCGCTCTCT
TACAGACGAGGAGGTCAATGATCTGCAGGGTAAGGTGCGTGATGAGGTGCAGAGAAAGCT
GAATGTTGAGCTAAGATGATTTTTGTTTAACACTAGAGTTGTTGCAGACAATGGCGAACT
ACATATCAGGTTCTTTTACATTGTAACTCCTACATGAATTTGTTTTCTTCTGCGAAATTT
ACATTACCCTCAAATAAAATATATGTAGATTGTTTAAAATTCTAAAAGGAAAGAAATATA
AGGTTGTGGTTGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H611TF U 1
AF RR4E748TF U 453
BS 1 549 RR4H611TF
BS 550 550 RR4E748TF
BS 551 585 RR4H611TF
BS 586 586 RR4E748TF
BS 587 636 RR4H611TF
BS 637 637 RR4E748TF
BS 638 675 RR4H611TF
BS 676 676 RR4E748TF
BS 677 688 RR4H611TF
BS 689 917 RR4E748TF

RD RR4H611TF 691 0 0
GTACCGTAGAGACTCTATTGACTCTACTCATTATCCGGTTTTCCATCAGATGGAAGGCTT
TTGTGTCTTTTCTCCTGAGGACTGGAACGAGTCTGGCAAAGATTCCACGTTATATGCAGC
TGAGGATTTGAAGAAATGTCTTGAGGGTTTGGCACGTCACTTGTTTGGTGGTGTGGAGAT
GAGATGGGTTGATACATACTTTCCATTTACAGAACCATCTTTCGAGCTTGAGATATATTT
TAAGGAAGACTGGTTGGAAGTTTTGGGCTGTGGGGTGACAGAGCAACGAATTTTGAAGCA
GAGTGGATTAGAAAACAATGTTGCTTGGGCCTTTGGACTTGGATTGGAACGACTTGCTAT
GGTTTTGTTTGACATCCCTGATATTAGACTTTTCTGGTCCGACGATGAACGGTTTACGTC
CCAGTTTAAAAAAGGAGAGCTTGGAGTCAAGTTCAAGCCATTCTCAAAGTATCCGCCTTG
TTACAAGGACATCAGTTTCTGGATCAGTGAATCATTCACAGAGAATAACTTTTGTGAAGT
TGTGAGAGGGATCGCTGGGGATCTTGTTGAAGAGGTGAAGTTAATCGACAGTTTCACCAA
TAAGAAAGGGATGACGAGTCACTGTTACAGAATTGTGTTCCGTTCCATGGAGCGCTCTCT
TACAGACGAGGAGGTTAATGATCTGCAG
AGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4E748TF 465 0 0
GG
AAGCCATTCTCAAAGTATCCTCCTTGTTACAAGGACATCAGTTTCTGGATCAGTGAATCA
TTCACAGAGAATAACTTTTGTGAAGTTGTGAGAGGAATCGCTGGGGATCTTGTTGAAGAG
GTGAAGTTGATAGATAGTTTCACCAATAAGAAAGGGATGACGAGTCACTGTTACAGAATT
GTCTTCCGTTCCATGGAGCGCTCTCTTACTGACGAGGAGGTCAATGATCTGCAGGGTAAG
GTGCGTGATGAGGTGCAGAGAAAGCTGAATGTTGAGCTAAGATGATTTTTGTTTAACACT
AGAGTTGTTGCAGACAATGGCGAACTACATATCAGGTTCTTTTACATTGTAACTCCTACA
TGAATTTGTTTTCTTCTGCGAAATTTACATTACCCTCAAATAAAATATATGTAGATTGTT
TAAAATTCTAAAAGGAAAGAAATATAAGGTTGTGGTTGTGTTT

QA 3 465 3 465
DS 



AS 1 3

CO CL4524Contig1 874 3 17 U
AAAACCTTCTTTGGTCTTGCCGTTTCGTATAAAGGGAGACAAGTGCCTCTCCTCTTTGTC
CAATCCTCTTATTTTTAATAATTCATCAAAATCGCCCGAGAGAAGAGCGACCATCCGTTC
ACCTAGAAGAATCTTTTTAGGGGATGGGTAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTCG
ATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCCTTTCGAACCGCCGCGAACTCGCTGTCTCAGC
TTTACACTCAGTCCATGAACCACCAGAAACTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTC
TGGAAAAACTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACTCCTG
TGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAACTGGAGTGCTGCACAGAGGAACCCCCAATAT
CCCCAAGAGCGCCGCCACCTCAACCAGCAATGCGTTTCACAAATACAGGTCTCATTGCTT
CTTCAGACACGTCTTGCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCCGAGCAATGCGAAAACC
ATGCCAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGTCCAATACGTCGTAGTCTGCAGA
GCTATCAAATTCCGCAGGGAGGCTACATGTCTGGCGGAACCCGAAGCAGTGAACTGAACA
GGGGATCTAACTCTCCAAGTTCTTTTGATTCTTCAATGGACATGCACGCAGACTAAGAAG
CTATAAGATGTAATACCCCCTCTTGTGATAATGTTTGCTCTATACAAAACTGGTTTGGTT
TTTCATAATGTATCAATTGGTTGTCATCTTGAAGGTGGTTTGCTGGTATTTTGGTTAGGA
TATCTGATGGTGATATGTAAATCACTGTGTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR74TF U 1
AF RR4CH65TF U 90
AF RR4CH65JQ C 90
BS 1 382 RR4GR74TF
BS 383 383 RR4CH65TF
BS 384 446 RR4GR74TF
BS 447 447 RR4CH65TF
BS 448 584 RR4GR74TF
BS 585 663 RR4CH65TF
BS 664 664 RR4CH65JQ
BS 665 718 RR4CH65TF
BS 719 719 RR4CH65JQ
BS 720 725 RR4CH65TF
BS 726 726 RR4CH65JQ
BS 727 750 RR4CH65TF
BS 751 751 RR4CH65JQ
BS 752 768 RR4CH65TF
BS 769 769 RR4CH65JQ
BS 770 782 RR4CH65TF
BS 783 874 RR4CH65JQ

RD RR4GR74TF 584 0 0
AAAACCTTCTTTGGTCTTGCCGTTTCGTATAAAGGGAGACAAGTGCCTCTCCTCTTTGTC
CAATCCTCTTATTTTTAATAATTCATCAAAATCGCCCGAGAGAAGAGCGACCATCCGTTC
ACCTAGAAGAATCTTTTTAGGGGATGGGTAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTCG
ATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCCTTTCGAACCGCCGCGAACTCGCTGTCTCAGC
TTTACACTCAGTCCATGAACCACCAGAAACTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTC
TGGAAAAACTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACTCCTG
TGGATATAATCAATTACATTCATAACGAACTGGAGTGCTGCACAGAGGAACCCCCAATAT
CCCCAAGAGCGCCGCCACCTCAACCAACAATGCGTTTCACAAATACAGGTCTCATTGCTT
CTTCAGACACGTCTTGCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCCGAGCAATGCGAAAACC
ATGCCAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGTCCAATA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4CH65TF 701 0 0
AATCGCCCGAGAGAAGAGCGACCATCCGTTCACCTAGAAGAATCTTTTTAGGGGATGGGT
AAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCC
TTTCGAACCGCCGCGAACTCGCTGTCTCAGCTTTACACTCAGTCCATGAACCACCAGAAA
CTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTCTGGAAAAACTGTACCAATGGATATGGAGA
CAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACTCCTGTGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAA
CTGGAGTGCTGCACAGAGGAACCCCCAATATCCCCAAGAGCGCCGCCACCTCAACCAGCA
ATGCGTTTCACAAATACAGGTCTCATTGCTTCTTCAGACACGTCTTGCCCAACAGCTGTT
CCAGTGGTTCGGTCCGAGCAATGCGAAAACCATGCCAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCC
CTTTCAAGTCCAATACGTCGTAGTCTGCAGAGCTATCAAATTCCGCAGGGAGGCTACATG
TCTGGCGGAACCCGAAGCAGTGAACTGAACAGGG*ATCTAACTCTCCAAGTTCTTTTGAT
TCTTCAATGGACATGCACGCAGACTAAGA*GCTATA*GATGTAATACCCCCTCTTGTGAT
A*TGTTTGCTCTATACAAA*CTGGTTTGGTTTT
CATATGTA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4CH65JQ 785 0 0
AATCGCCCGAGAGAAGAGCGACCATCCGTTCACCTAGAAGAATCTTTTTAGGGGATGGGT
AAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCC
TTTCGAACCGCCGCGAACTCGCTGTCTCAGCTTTACACTCAGTCCATGAACCACCAGAAA
CTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTCTGGAAAAACTGTACCAATGGATATGGAGA
CAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACTCCTGTGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAA
CTGGAGTGCTGCACAGAGGAACCCCCAATATCCCCAAGAGCGCCGCCACCTCAACCAGCA
ATGCGTTTCACAAATACAGGTCTCATTGCTTCTTCAGACACGTCTTGCCCAACAGCTGTT
CCAGTGGTTCGGTCCGAGCAATGCGAAAACCATGCCAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCC
CTTTCAAGTCCAATACGTCGTAGTCTGCAGAGCTATCAAATTCCGCAGGGAGGCTACATG
TCTGGCGGAACCCGAAGCAGTGAACTGAACAGGGGATCTAACTCTCCAAGTTCTTTTGAT
TCTTCAATGGACATGCACGCAGACTAAGAAGCTATAAGATGTAATACCCCCTCTTGTGAT
AATGTTTGCTCTATACAAAACTGGTTTGGTTTTTCATAATGTATCAATTGGTTGTCATCT
TGAAGGTGGTTTGCTGGTATTTTGGTTAGGATATCTGATGGTGATATGTAAATCACTGTG
TCTGG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL4525Contig1 1292 3 13 U
GGGAGCTTCCATTACTCCCTTACACTAACTCAGTCACGTTTTCGCGCACAGGCATATGCT
CTTCTTCCTCTTCCTCCTCAACTAGTATTAGAAACTTCCCGGGGAAAAGAATGAGCTTAG
GAATGGGATTCAATAATTCAAGAAGCGTCAAAGCTTCAGCTGGACGGAGCACAGAAGGAG
TGGAGAAGACAGACGGAGGACAGTTCGCGGGTCCTGCCATGGAGGTCACTACACTTGATC
GCGGCCTTGCTAACTCCACGACCGTTGATTTTCCGGTCTGGGACAAAATTGGCGCCGTGG
TTAGACTTACTTACGGGATCGGGGTATATGGAGCAATGGCTGTAGCAGGAAGATTCATAT
GTTCAGTTACTGGTATTGACTCATCTGGTGGCTTTGATCCTTCTCTTGATGCTCTTCTCG
CTGGTCTTGGCTATGCTACACCACCCATCATGGCTCTCCTCTTCATACTCGATGATGAAG
TTGTGAAACTATCACCACATGCTCGAGCCATCAGAGACGTGGAAGATGAGGAACTAAGAA
GCTTTTTCTTCGGAATGTCGCCATGGCAGTTTATACTCATTGTGGCGGCCAGTTCGATAG
GAGAAGAGCTCTTTTACCGTGTTGCTGTACAGGGGGCTCTGTCTGATATATTCTTGAAAG
GAACACAGTTGATGACAGACTCTAGAGGCATGGCCTCTCTGACCGGAGTCTTCCCTCCAT
TTGTTCCGTTTGCTCAAGCATTTGCAGCTGTGATCACCGCTACTCTCACAGGCTCACTCT
ACTTTCTTGCTGCTTCCCCAAAAGACCCAACATACATTGTTGCCCCGGTTCTAAGGTCAC
GCCGCGATGACTTTAAGAAGCTTTTGTCTGCTTGGTACGAGAAGGGACAGATGAAGAAGA
TTTACTCTCCTCTTCTCGAAGGACTCTTAGCTCTCTACCTCGGTATTGAATGGGTTCAGA
CGGACAATATCTTAGCACCGATGATGACGCATGGTATATACTCGACGGTAATATTAGGGC
ATGGGCTGTGGAAAAAACATGATCACCGTAGAAAATTACGTCGGAGGATCGAACTGCTTA
GATCAGAGACCGCTGATGAATGAACAATTTTAAAATCATCTATAGATTGTATGGGGGGGG
GGCGGTTGGATTTGTGTGTATTTTTTTGGGGTATGGGGTCGTATAGTAATAATTAGAGAA
CTTAGATCTCCATAAAATTTAGAACAGCTGCATATATATACATAGCATATAGTTGTATTT
GTTCCTAGTTGTGAGGTTAAAAATAGCAATAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EY86TF U 1
AF RR4BB87TF U 613
AF RR4BB87JQ C 937
BS 1 662 RR4EY86TF
BS 663 663 RR4BB87TF
BS 664 757 RR4EY86TF
BS 758 758 RR4BB87TF
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BS 772 772 RR4BB87TF
BS 773 784 RR4EY86TF
BS 785 1035 RR4BB87TF
BS 1036 1036 RR4BB87JQ
BS 1037 1137 RR4BB87TF
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BS 1139 1278 RR4BB87TF
BS 1279 1292 RR4BB87JQ

RD RR4EY86TF 785 0 0
GGGAGCTTCCATTACTCCCTTACACTAACTCAGTCACGTTTTCGCGCACAGGCATATGCT
CTTCTTCCTCTTCCTCCTCAACTAGTATTAGAAACTTCCCGGGGAAAAGAATGAGCTTAG
GAATGGGATTCAATAATTCAAGAAGCGTCAAAGCTTCAGCTGGACGGAGCACAGAAGGAG
TGGAGAAGACAGACGGAGGACAGTTCGCGGGTCCTGCCATGGAGGTCACTACACTTGATC
GCGGCCTTGCTAACTCCACGACCGTTGATTTTCCGGTCTGGGACAAAATTGGCGCCGTGG
TTAGACTTACTTACGGGATCGGGGTATATGGAGCAATGGCTGTAGCAGGAAGATTCATAT
GTTCAGTTACTGGTATTGACTCATCTGGTGGCTTTGATCCTTCTCTTGATGCTCTTCTCG
CTGGTCTTGGCTATGCTACACCACCCATCATGGCTCTCCTCTTCATACTCGATGATGAAG
TTGTGAAACTATCACCACATGCTCGAGCCATCAGAGACGTGGAAGATGAGGAACTAAGAA
GCTTTTTCTTCGGAATGTCGCCATGGCAGTTTATACTCATTGTGGCGGCCAGTTCGATAG
GAGAAGAGCTCTTTTACCGTGTTGCTGTACAGGGGGCTCTGTCTGATATATTCTTGAAAG
GA*CACAGTTGATGACAGACTCTAGAGGCATGGCCTCTCTGACCGGAGTCTTCCCTCCAT
TTGTTCCGTTTGCTCAAGCATTTGCAGCTGTGATCAC*GCTACTCTCACAG*CTCACTCT
ACTT
C

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4BB87TF 666 0 0
G
TTACCGTGTTGCTGTACAGGGGGCTCTGTCTGATATATTCTTGAAAGGAACACAGTTGAT
GACAGACTCTAGAGGCATGGCCTCTCTGACCGGAGTCTTCCCTCCATTTGTTCCGTTTGC
TCAAGCATTTGCAGCTGTGATCACCGCTACTCTCACAGGCTCACTCTACTTTCTTGCTGC
TTCCCCAAAAGACCCAACATACATTGTTGCCCCGGTTCTAAGGTCACGCCGCGATGACTT
TAAGAAGCTTTTGTCTGCTTGGTACGAGAAGGGACAGATGAAGAAGATTTACTCTCCTCT
TCTCGAAGGACTCTTAGCTCTCTACCTCGGTATTGAATGGGTTCAGACGGACAATATCTT
AGCACCGATGATGACGCATGGTATATACTCGACGGTAATATTAGGGCATGGGCTGTGGAA
AATACATGATCACCGTAGAAAATTACGTCGGAGGATCGAACTGCTTAGATCAGAGACCGC
TGATGAATGAACAATTTTAAAATCATCTATAGATTGTATGGGGGTGGGGCGGTTGGATTT
GTGTGTATTTTTTTGGGGTATGGGGTCGTATAGTAATAATTAGAGAACTTAGATCTCCAT
AAAATTTAGAACAGCTGCATATATATACATAGCATATAGTTGTATTTGTTCCTAGTTGTG
AGGTT

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR4BB87JQ 356 0 0
ACCTCGGTATTGAATGGGTTCAGACGGACAATATTTTAGCACCGATGATGACGCATGGTA
TATACTCGACGGTAATATTAGGGCATGGGCTGTGGAAAAAACATGATCACCGTAGAAAAT
TACGTCGGAGGATCGAACTGCTTAGATCAGAGACCGCTGATGAATGAACAATTTTAAAAT
CATCTATAGATTGTATGGGGGGGGGGCGGTTGGATTTGTGTGTATTTTTTTGGGGTATGG
GGTCGTATAGTAATAATTAGAGAACTTAGATCTCCATAAAATTTAGAACAGCTGCATATA
TATACATAGCATATAGTTGTATTTGTTCCTAGTTGTGAGGTTAAAAATAGCAATAG

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 2

CO CL4526Contig1 834 2 12 U
GGTAAGAAATCTTGTCCATACTTTTTTCAGCTCAAGGACTTGCCTAGTTTGCATCAAAGC
ACACAGAAATGGGATGAAGCAAAAAGAAGACATGGTCTGTTGACTCACAAATACATGACT
ACACGTATACATTCTCAATAGATTTATTGGCAACAGCCTTCAACAGATTTTTATTCATAA
AACGGTTCTTGTCCATTAAAAGGTATATATATGTTTTAAGTGTTCTTCCTCGCAGAGTAG
GCACAGTAAGCCGCCACTCCAGCAAACGCAGCAGCCGTCACTGAAGCAATAACAGCTGAG
TTGTTACTATCCTTCAGTTTTGTAACCACACAGTTTGATTCAAATCTCTTTCTATGACGT
TCTATATCTGCAGCCGAAAGTTTGCCAACGATCATATGAGCTTTGTAGAAAATATCCTTA
ACATCATCATCATCACCCCAAGCATCTTCAAACTGACTGATAAAATCTTCAGTTACAAGC
TCAACACCCCTTTCTTTGGCTTTCATAGCAGGCTGCCAAGATCTCAAGAACCCTATAAAC
CCTTTAAGCGAAAGCTTATGAGGAATGTCAAGCTGTATAGGCTTCCCTTCTGATCCCATC
CCTATGCCTTCAAACGGAAACGGTATCGTTTTGTAGCCGTCAAAAGCAAGATTCATAACG
GGAGTTCTATACGGAAACGTGGAGTCAACAAGACGTTTCATGATGTCATCGACTTCAGGG
GAGATGATCAGGTCGTTGTAGACCCAAACAGCGATTAAACCTCCTTCTTTGCGAAGAACA
CGTTTGGCTATGTTGTAGAATGGTATGAGATCGAAGTAGTGAACGGCTTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C957JQ U 1
AF RR4A701TF C 53
BS 1 560 RR4C957JQ
BS 561 561 RR4A701TF
BS 562 731 RR4C957JQ
BS 732 732 RR4A701TF
BS 733 745 RR4C957JQ
BS 746 746 RR4A701TF
BS 747 777 RR4C957JQ
BS 778 778 RR4A701TF
BS 779 799 RR4C957JQ
BS 800 800 RR4A701TF
BS 801 821 RR4C957JQ
BS 822 834 RR4A701TF

RD RR4C957JQ 821 0 0
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ACACAGAAATGGGATGAAGCAAAAAGAAGACATGGTCTGTTGACTCACAAATACATGACT
ACACGTATACATTCTCAATAGATTTATTGGCAACAGCCTTCAACAGATTTTTATTCATAA
AACGGTTCTTGTCCATTAAAAGGTATATATATGTTTTAAGTGTTCTTCCTCGCAGAGTAG
GCACAGTAAGCCGCCACTCCAGCAAACGCAGCAGCCGTCACTGAAGCAATAACAGCTGAG
TTGTTACTATCCTTCAGTTTTGTAACCACACAGTTTGATTCAAATCTCTTTCTATGACGT
TCTATATCTGCAGCCGAAAGTTTGCCAACGATCATATGAGCTTTGTAGAAAATATCCTTA
ACATCATCATCATCACCCCAAGCATCTTCAAACTGACTGATAAAATCTTCAGTTACAAGC
TCAACACCCCTTTCTTTGGCTTTCATAGCAGGCTGCCAAGATCTCAAGAACCCTATAAAC
CCTTTAAGCGAAAGCTTATGGGGAATGTCAAGCTGTATAGGCTTCCCTTCTGATCCCATC
CCTATGCCTTCAAACGGAAACGGTATCGTTTTGTAGCCGTCAAAAGCAAGATTCATAACG
GGAGTTCTATACGGAAACGTGGAGTCAACAAGACGTTTCATGATGTCATCGACTTCAGGG
GAGATGATCAG*TCGTTGTAGACCCGAACAGCGATTAAACCTCCTTCTTTGCGAAGA*CA
CGTTTGGCTATGTTGTAGA*TGGTATGAGATCGAAGTAGTG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4A701TF 782 0 0
ATCAAAGCACGCAGAAATGGGATGAAGCAAGAAGAAGACATGGTCTGTTGACTCACAAAT
ACATGACTACACGTATACATTCTCAATAGATTTATTGGCAACAGCCTTCAACAGATTTTT
ATTCATAAAACGGTTCTTGTCCATTAAAAGGTATATATATGTTTTAAGTGTTCTTCCTCG
CAGGGTAGGCACAGTAAGCCGCCACTCCAGCAAACGCAGCAGCCGTCACTGAAGCAATAA
CAGCTGAGTTGTTACTATCCTTCAGTTTTGTAACCACACAGTTTGATTCAAATCTCTTTC
TATGACGTTCTATATCTGCAGCCGAAAGTTTGCCAACGATCATATGAGCTTTGTAGAAAA
TATCCTTAACATCATCATCATCACCCCAAGCATCTTCAAACTGACTGATCAAATCTTCAG
TTACAAGCTCAACACCTCTTTCTTTGGCTTTCATAGCAGGCTGCCAAGATCTCAAGAACC
CTATAAACCCTTTAAGCGAAAGCTTATGAGGAATGTCAAGCTGTATAGGCTTCCCTTCTG
ATCCCATCCCTATGCCTTCAGACGGAAACGGTATTGTTTTGTAGCCGTCAAAAGCAAGAT
TCATAACGGGAGTTCTATACGGAAACGTGGAGTCAACAAGACGTTTCATGATGTCATCGA
CTTCAGGGGAGATGATCAGGTCGTTGTAGACCCAAACAGCGATTAAACCTCCTTCTTTGC
GAAGAACACGTTTGGCTATGTTGTAGAATGGTATGAGATCGAAGTAGTGAACGGCTTGTG
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

CO CL4527Contig1 908 3 4 U
GGACATACATTCAACTCAAGAGCTAGTTCCTCTCTCCTCCTCATTATTCTCAAGAAAATG
CCGATTGGTGAGGTTATGATAGGAGCTGCTCTTGGAATTACTCTCCAAGTGCTTTATGAA
GCCATCATAAAAGCAAAAGATAAATCTTTAGCCACAAAATGTTTCTTGGACCGCCTCGGG
GCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGTGGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAGTA
GAATATTCTCAGAGGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTTT
CTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACGGAGAAACCTACACAAGAAGCATAGGTACAAG
ATTAGAATCAAAGAGTTAGAAGCTTCATTAAGATGGATGTTAGATGTGGATGTTCAAGTC
GACCAATGTCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAACTC
GACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATTGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACATCA
CCAGTGATATCACAAACTAGTAATCAAAATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTCAGAGG
AAAATGAAAAAGAAAGCTCAAGGATTGATATCCACCTTCGATGGAGTTCAAGAAAAAAAG
CTAAAGATCGTGAGATCCGATTCGTGGTTAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAAATGAA
TGCTCAAATGTGAAATAGGATTATCTTTTTTTTTTAATGTTGTTGTGAGGAATGGAAATG
GAATCATGTACACAAATAATATGTAAAATGTAGAATTCGTTTTTGTTCTCAAATCTAAAT
GTCAAGTGTATTACAAAATTTACCAATAAGGAATTTTATAAATGAAGGATGTGAGAGGAA
TTATATAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB21TF U 1
AF RR4E333TF U 1
AF RR4E333JQ C 179
BS 1 658 RR4E333TF
BS 659 659 RR4E333JQ
BS 660 715 RR4E333TF
BS 716 908 RR4E333JQ

RD RR4EB21TF 653 0 0
GGACATACATTCAACTCAAGAGCTAGTTCCTCTCTCCTCCTCATTATTCTCAAGAAAATG
CCGATTGGTGAGGTTATGATAGGAGCTGCTCTTGGAATTACTCTCCAAGTGCTTTATGAA
GCCATCATAAAAGCAAAAGATAAATCTTTAGCCACAAAATGTTTCTTGGACCGCCTCGGG
GCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGTGGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAGTA
GAATATTCTCAGAGGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTTT
CTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACGGAGAAACCTACACAAGAAGCATAGGTACAAG
ATTAGAATCAAAGAGTTAGAAGCTTCATTAAGATGGATGTTAGATGTGGATGTTCAAGTC
GACCAATGTCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAACTC
GACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATTGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACATCA
CCAGTGATATCACAAACTAGTAATCAAAATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTCAGAGG
AAAATGAAAAAGAAAGCTCAAGGATTGATATCCACCTTCGATGGAGTTCAAGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4E333TF 723 0 0
GGACATACATTCAACTCAAGAGCTAGTTCCTCTCTCCTCCTCATTATTCTCAAGAAAATG
CCGATTGGTGAGGTTATGATAGGAGCTGCTCTTGGAATTACTCTCCAAGTGCTTTATGAA
GCCATCATAAAAGCAAAAGATAAATCTTTAGCCACAAAATGTTTCTTGGACCGCCTCGGG
GCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGTGGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAGTA
GAATATTCTCAGAGGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTTT
CTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACGGAGAAACCTACACAAGAAGCATAGGTACAAG
ATTAGAATCAAAGAGTTAGAAGCTTCATTAAGATGGATGTTAGATGTGGATGTTCAAGTC
GACCAATGTCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAACTC
GACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATTGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACATCA
CCAGTGATATCACAAACTAGTAATCAAAATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTCAGAGG
AAAATGAAAAAGAAAGCTCAAGGATTGATATCCACCTTCGATGGAGTTCAAGAAAAAA*G
CTAAAGATCGTGAGATCCGATTCGTGGTTAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAA
TGAATGCT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4E333JQ 730 0 0
GGGCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGTGGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAG
TAGAATATTCTCAGAGGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTT
TTCTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACGGAGAAACCTACACAAGAAGCATAGGTACA
AGATTAGAATCAAAGAGTTAGAAGCTTCATTAAGATGGATGTTAGATGTGGATGTTCAAG
TCGACCAATGTCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAAC
TCGACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATTGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACAT
CACCAGTGATATCACAAACTAGTAATCAAAATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTCAGA
GGAAAATGAAAAAGAAAGCTCAAGGATTGATATCCACCTTCGATGGAGTTCAAGAAAAAA
AGCTAAAGATCGTGAGATCCGATTCGTGGTTAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAAATG
AATGCTCAAATGTGAAATAGGATTATCTTTTTTTTTTAATGTTGTTGTGAGGAATGGAAA
TGGAATCATGTACACAAATAATATGTAAAATGTAGAATTCGTTTTTGTTCTCAAATCTAA
ATGTCAAGTGTATTACAAAATTTACCAATAAGGAATTTTATAAATGAAGGATGTGAGAGG
AATTATATAT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL4528Contig1 828 3 16 U
GGAAAGTCTAAAATAAATAAATAAAACAATAGTCAAATAAAATGGAGTTCTCTCTAAAAC
CTTCAACTTTAAAGATGACTCGGACAAGTTTTGTCATAGTAGTAGTTTTAGCAATCAGCA
GTTTTCAGATGATGGAATCATCTCCAGGTCTAGCCAACAAGGTGCAGGCAAATATTCAAT
ATAACGCGATTAATTGTCGAAAACATAGCGCAGTTATAACCGAATTTGGAGCCGTGGGTG
ATGGAAAAACATCAAACACAAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACCAAGCTTGCTCCTAAGG
CGGCCGACGGTGGAGTGCAGCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGGCTTACCGGAAGTTTCA
ACCTGACCAGCCATTTTACTTTGTTCATCCAGAAAGATGCAACTATTCTTGCTTCTCAGG
ATGAAGCTGAATATCCAGTGGTTGCACCATTGCCATCATATGGACAAGGAAGAGATGCAG
CTGGGCCAACATTTGCTAGTTTAATCTCTGGCACAAACCTAACTGATGTTGTTATCACCG
GTAACAACGGAACAATCAACGGACAAGGAAAATACTGGTGGGTGAAGTATAGAAGTGGTG
GATTTAAGAATATCACGAGACCTTACACACTAGAAATCATGTTCTCTAAAGACGTTCAGA
TCTCGAACATCACGATCGTCGATTCGCCTGCATGGAATATTCATCCAGTGTATTGCACTA
ACGTCATCGTTAAAGTGTTACCATTCTGGCTCCTATCGATTCTCCTAACACCGATGGAAT
CAACCCTGATTCTTGCACCAACACGTTGATCGAGACTGTTTCGTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AA65TF U 140
AF RR4CR73TF U 1
AF RR4B742TF U 45
BS 1 435 RR4CR73TF
BS 436 436 RR4B742TF
BS 437 696 RR4CR73TF
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BS 769 778 RR4CR73TF
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BS 792 792 RR4B742TF
BS 793 813 RR4CR73TF
BS 814 828 RR4B742TF

RD RR4AA65TF 443 0 0
ATCTCCAGGTCTAGCCAACAAGGTGCAGGCAAATATTCAATATAACGCGATTAATCGTCG
AAAACATAGCGCAGTTATAGCCGAATTTGGAGCCGTGGGTGATGGAAAAACATCAAACAC
AAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACCAAGCTTGCTCCTAAGGCGGCCGACGGTGGAGTGCA
GCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGGCTTACCGGAAGTTTCAACCTGACCAGCCATTTTAC
TTTGTTCATCCAGAAAGATGCAACTATTCTTGCTTCTCAGGATGAAGCTGAATATCCAGT
GGTTGCACCATTGCCATCATATGGACAAGGAAGAGATGCAGCTGGGCCAACATTTGCTAG
TTTAATCTCTGGCACAAACCTAACTGATGTTGTTATCACCGGTAACAACGGAACAATCAA
CGGACAAGGAAAATACTGGTGGG

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR4CR73TF 816 0 0
GGAAAGTCTAAAATAAATAAATAAAACAATAGTCAAATAAAATGGAGTTCTCTCTAAAAC
CTTCAACTTTAAAGATGACTCGGACAAGTTTTGTCATAGTAGTAGTTTTAGCAATCAGCA
GTTTTCAGATGATGGAATCATCTCCAGGTCTAGCCAACAAGGTGCAGGCAAATATTCAAT
ATAACGCGATTAATTGTCGAAAACATAGCGCAGTTATAACCGAATTTGGAGCCGTGGGTG
ATGGAAAAACATCAAACACAAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACCAAGCTTGCTCCTAAGG
CGGCCGACGGTGGAGTGCAGCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGGCTTACCGGAAGTTTCA
ACCTGACCAGCCATTTTACTTTGTTCATCCAGAAAGATGCAACTATTCTTGCTTCTCAGG
ATGAAGCTGAATATCTAGTGGTTGCACCATTGCCATCATATGGACAAGGAAGAGATGCAG
CTGGGCCAACATTTGCTAGTTTAATCTCTGGCACAAACCTAACTGATGTTGTTATCACCG
GTAACAACGGAACAATCAACGGACAAGGAAAATACTGGTGGGTGAAGTATAGAAGTGGTG
GATTTAAGAATATCACGAGACCTTACACACTAGAAATCATGTTCTCTAAAGACGTTCAGA
TCTCGAACATCACGATCGTCGATTCGCCTGCATGGA*TATTCATCCAGTGTATTGCACTA
ACGTCATCGTTAAAGTGTTAC*ATTCTGGCTCCTATCGAT*CTCCTA*CACCGATGGA*T
CAACCCTGATT*TTGCACCAACACGTTGATCGA
AGA

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4B742TF 784 0 0
GAGTTCTCTCTAAAACCTTCAACTTTAAA*ATGACTCGGACAAGTTTTGTCATAGTAGTA
GTTTTAGCAATCAGCAGTTTTCAGATGATGGAATCATCTCCAGGTCTAGCCAACAAGGTG
CAGGCAAATATTCAATATAACGCGATTAATTGTCGAAAACATAGCGCAGTTATAACCGAA
TTTGGAGCCGTGGGTGATGGAAAAACATCAAACACAAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACC
AAGCTTGCTCCTAAGGCGGCCGACGGTGGAGTGCAGCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGG
CTTACCGGAAGTTTCAACCTGACCAGCCATTTTACTTTGTTCATCCAGAAAGATGCAACT
ATTCTTGCTTCTCAGGATGAAGCTGAATATCCAGTGGTTGTACCATTGCCATCATATGGA
CAAGGAAGAGATGCAGCTGGGCCAACATTTGCTAGTTTAATCTCTGGCACAAACCTAACT
GATGTTGTTATCACCGGTAACAACGGAACAATCAACGGACAAGGAAAATACTGGTGGGTT
AAGTATAGAAGTGGTGGATTTAAGAATATCACGAGACCTTACACACTAGAAATCATGTTC
TCTAAAGACGTTCAGATCTCGAACATCACGATCGTCGATTCGCCTGCATGGAATATTCAT
CCAGTGTATTGCACTAACGTCATCGTTAAAGTGTTACCATTCTGGCTCCTATCGATTCTC
CTAACACCGATGGAATCAACCCTGATTCTTGCACCAACACGTTGATCGAGACTGTTTCGT
AGTC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 3

CO CL4529Contig1 943 3 3 U
GCTTAAAATTTGTTGCATTAAAATATAAAAGTGGCAAAGGAATACAATAGGGGGCCTATT
ACATATCCTTAGTGGATTTTGAATAGAAAATCGGCCTTAAAGCCTAAGTAGCAAAATATA
AAAGGAGGAGTTATTCTGGCCCAGCCCAGGTATTAAGTGAAAATGAAATTGGCCCATGAA
GAAGTTGAGAAGTCCCGTTCGGCAGTTTGAAGAGATGATTCGACGAACGCCGAGAGAATT
AGTGGAGAGAGAACCAGAGCTGCATGCAAGCGCTAGATTCAAGGGGATGAGTCTGGCGCA
TAGCTGAGATGCGGTTCTTGATTATCGAAAAGATGGTGCTGAGGATGGCATCAATAGACT
TGAAGCTCAGACCGATGAAGCCTATTGTTGCGCTCTTTCCAAATTTCATGAATCGCCGCT
TGCCACGCGAGGATGGTCAGATAGCGGAGTTGCTTGCTTCCAGAGAGGCTAATCAGAGCC
TGTAGATATCCCAATCATCTGAAGTAACGATTAGACCGAGTTTTGCCGACAGTTTCCTCC
ATATTCCGGCAGAGAAAGGGCATTGAAAGAAGATGTGGTTCCTTGGAGGTTGCATAAAGA
AAATCCTATTGTTTCTGTTAGGTTCACGGAGAAGATCAGATTTGTTGAGATTGCAGAGAG
CATTAACCCTCTCCCTACCTTGAATCTCTCTTTAAAGTTCAAACATGGTCAACTCTGAGG
ACAAGACAAACAAGAGCAAAAGTACCTTTCTTGGTATGTTCTTTTAGTCTTTTGTCACTT
CTTAAGATTTCTCACACACACATCAGGTATATCATATTTAAGTATTTCGATCTCCTCTGT
TTTACTTGCTGATTTGAAGTCCGGCTATTGCTCTTCCACCATCAAGGTGCGGCTTCTCAG
ATTCTAGAAAGCTAGAAACCTGAAACGCGATGATGGGGGTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G083JQ U 1
AF RR4GJ46JQ U 1
AF RR4G083TF C 197
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BS 652 802 RR4GJ46JQ
BS 803 943 RR4G083TF

RD RR4G083JQ 651 0 0
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QA 1 651 1 651
DS 

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TAGCTGAGATGCGGTTCTTGATTATCGAAAAGATGGTGCTGAGGATGGCATCAATAGACT
TGAAGCTCAGACCGATGAAGCCTATTGTTGCGCTCTTTCCAAATTTCATGAATCGCCGCT
TGCCACGCGAGGATGGTCAGATAGCGGAGTTGCTTGCTTCCAGAGAGGCTAATCAGAGCC
TGTAGATATCCCAATCATCTGAAGTAACGATTAGACCGAGTTTTGCCGACAGTTTCCTCC
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QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4G083TF 747 0 0
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CTTGATTATCGAAAAGATGGTGCTGAGGATGGCATCAATAGACTTGAAGCTCAGACCGAT
GAAGCCTATTGTTGCGCTCTTTCCAAATTTCATGAATCGCCGCTTGCCACGCGAGGATGG
TCAGATAGCGGAGTTGCTTGCTTCCAGAGAGGCTAATCAGAGCCTGTAGATATCCCAATC
ATCTGAAGTAACGATTAGACCGAGTTTTGCCGACAGTTTCCTCCATATTCCGGCAGAGAA
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ACCTTGAATCTCTCTTTAAAGTTCAAACATGGTCAACTCTGAGGACAAGACAAACAAGAG
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AAGTCCGGCTATTGCTCTTCCACCATCAAGGTGCGGCTTCTCAGATTCTAGAAAGCTAGA
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

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ATTGCACGGCCTACAGACATTCAGCCAGTTATGCCATTTTAATATGAAGAAAAAGGTGAT
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CATGACATACACCAAGCTAAATGTGCTTCATTGGCACATTGTGGACACACAGTCATTTCC
CTTGGAGATTCCTTCGTATCCAAAGCTATGGAATGGCGC


BQ
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AF RR4FG47TF U 72
AF RR4A710TF U 1
AF RR4AB72TF U 1
BS 1 677 RR4A710TF
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DS 

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TTTGATCGATACATCCC

QA 1 677 1 677
DS 

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AGCGATTTTGAAAGAAGGATTCGATAGAATGTTTGCAGTTGTGAGGTTGAGCCACGTCGT
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ATTGCACGGCCTACAGACATTCAGCCAGTTATGCCATTTTAATATGAAGAAAAAGGTGAT
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CTTGGAGATTCCTTCGTATCCAAAGCTATGGAATGGCGC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 3

CO CL4531Contig1 1019 3 9 U
GCCATCAAGAGACAATCGGCGGTGAAGAGCCGTTGTTTCTCAGAGACAAAGCGTCGAACA
CCTTCCGTGCAATCCAAACGTGAGTTCTGGGAAGACCCAGACGATGGTAGCGACAGTGAA
GACGAAGGAGAAGACCACGAAGAAGAAGGTATCGGGAATGATTTAGATTTCGAGAGTGAT
TGGGAAGAAGGAGACTCTAGAGCCCAGAAGCAGCTTACTACAGACAACAACTACGAGGAA
CAGCTTGCAAGAGAGGTTGAGCAACTTCTTGAACCTGAAGAAAGAGCGATTCTTCAGCAA
AACGAAAAACCAAACCTTCAAATGATATCAACTAAGAAGTGGAAGCCACTTCAGACACTT
GCTCTGTCAATGCAGATTCAATTAATGGACAACCTCATGGAAAATGGACTAGACATTGAT
GATGTTGACAAGGACGGCCAAACCGCTCTTCACAAGGCAGTCATTGGTAAAAAAGAAGCA
GTGATTAGCCATCTTTTGAGAAGAGGAGCAAATCCACACGTTCAAGATCGGGACGGTGCA
TCTGCCCTTCATTATGCAGTTCGAGTTGGAGCCTTGCAGACTGTGAAACTACTTATCAAG
TACAATGTAGACGTCAATGTTACAGATAATGAAGGATGGACTCCTTTACATATCGCTGTG
CAAAGCAGGAATCAAGACATCACAAAAATCTTGTTGACCAATGGTGCTGATAAGACAAGA
AGAACAAAGGATGGGAAAATAGCATTGGACATGGCTCTGTGCTTTGGAAGAGATTTCAAG
TCATATGATCTGGTCAAGCTGTTGAAGATCATGCCCACTGACGATATATAGAAATAATTG
GTGAGTTTCTGAAGATCAGTTTGACAGTAGTAAACCGGGGTTGCAATTGCCTGGTTTGTT
TGTAATCTGATCCGCTTAAAGTGGTATAAGAAACCTGGTTTAGTTTGTATTAAACTAGAT
TTTTTTTGTTGTATAATCAAAAACCATTGAAGAAAATCAGAAATAAATACATTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK70TF U 1
AF RR4GN41TF U 251
AF RR4GN41JQ C 275
BS 1 562 RR4GK70TF
BS 563 563 RR4GN41TF
BS 564 634 RR4GK70TF
BS 635 635 RR4GN41TF
BS 636 664 RR4GK70TF
BS 665 953 RR4GN41TF
BS 954 954 RR4GN41JQ
BS 955 977 RR4GN41TF
BS 978 1019 RR4GN41JQ

RD RR4GK70TF 664 0 0
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CCTTCCGTGCAATCCAAACGTGAGTTCTGGGAAGACCCAGACGATGGTAGCGACAGTGAA
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TGGGAAGAAGGAGACTCTAGAGCCCAGAAGCAGCTTACTACAGACAACAACTACGAGGAA
CAGCTTGCAAGAGAGGTTGAGCAACTTCTTGAACCTGAAGAAAGAGCGATTCTTCAGCAA
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GCTCTGTCAATGCAGATTCAATTAATGGACAACCTCATGGAAAATGGACTAGACATTGAT
GATGTTGACAAGGACGGCCAAACCGCTCTTCACAAGGCAGTCATTGGTAAAAAAGAAGCA
GTGATTAGCCATCTTTTGAGAAGAGGAGCAAATCCACACGTTCAAGATCGGGACGGTGCA
TCTGCCCTTCATTATGCAGTTCAAGTTGGAGCCTTGCAGACTGTGAAACTACTTATCAAG
TACAATGTAGACGTCAATGTTACAGATAATGAAG*ATGGACTCCTTTACATATCGCTGTG
CAAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4GN41TF 727 0 0
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TGCAGATTCAATTAATGGACAACCTCATGGAAAATGGACTAGACATTGATGATGTTGACA
AGGACGGCCAAACCGCTCTTCACAAGGCAGTCATTGGTAAAAAAGAAGCAGTGATTAGCC
ATCTTTTGAGAAGAGGAGCAAATCCACACGTTCAAGATCGGGACGGTGCATCTGCCCTTC
ATTATGCAGTTCGAGTTGGAGCCTTGCAGACTGTGAAACTACTTATCAAGTACAATGTAG
ACGTCAATGTTACAGATAATGAAGGATGGACTCCTTTACATATCGCTGTGCAAAGCAGGA
ATCAAGACATCACAAAAATCTTGTTGACCAATGGTGCTGATAAGACAAGAAGAACAAAGG
ATGGGAAAATAGCATTGGACATGGCTCTGTGCTTTGGAAGAGATTTCAAGTCATATGATC
TGGTCAAGCTGTTGAAGATCATGCCCACTGACGATATATAGAAATAATTGGTGAGTTTCT
GAAGATCAGTTTGACAGTAGTAAACCGGGGTTGCAATTGCCTGGTTTGTTTGTAATCTGA
TCCGCTTAAAGTGGTATAAGAAACCTGGTTTAGTTTGTATTAA*CTAGATTTTTTTTGTT
GTATAAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4GN41JQ 745 0 0
TGAAGA
AAAGAGCGATTCTTCAGCAAAACGAAAAACCAAACCTTCAAATGATATCAACTAAGAAGT
GGAAGCCACTTCAGACACTTGCTCTGTCAATGCAGATTCAATTAATGGACAACCTCATGG
AAAATGGACTAGACATTGATGATGTTGACAAGGACGGCCAAACCGCTCTTCACAAGGCAG
TCATTGGTAAAAAAGAAGCAGTGATTAGCCATCTTTTGAGAAGAGGAGCAAATCCACACG
TTCAAGATCGGGACGGTGCATCTGCCCTTCATTATGCAGTTCGAGTTGGAGCCTTGCAGA
CTGTGAAACTACTTATCAAGTACAATGTAGACGTCAATGTTACAGATAATGAAGGATGGA
CTCCTTTACATATCGCTGTGCAAAGCAGGAATCAAGACATCACAAAAATCTTGTTGACCA
ATGGTGCTGATAAGACAAGAAGAACAAAGGATGGGAAAATAGCATTGGACATGGCTCTGT
GCTTTGGAAGAGATTTCAAGTCATATGATCTGGTCAAGCTGTTGAAGATCATGCCCACTG
ACGATATATAGAAATAATTGGTGAGTTTCTGAAGATCAGTTTGACAGTAGTAAACCGGGG
TTGCAATTGCCTGGTTTGTTTGTAATCTGATCCGCTTAAAGTGGTATAAGAAACCTGGTT
TAGTTTGTATTAAACTAGATTTTTTTTGTTGTATAATCAAAAACCATTGAAGAAAATCAG
AAATAAATACATTTTCCCC

QA 7 745 7 745
DS 



AS 1 3

CO CL4532Contig1 737 3 2 U
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ATGCTTAATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGG
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TTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTATTCAA
TATGAGAGAGTGACAGTTGGCGTTGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAAA
ACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAA
TGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAG
AAGAATCCTCAAGGAAAAGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCAATGCTCCTTCG
GTTTGAATGAAATCTGTGTTAAAGAGTATTTTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCG
AGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCC
ATATGTTATTTTGTGGATTGTATTATTTTGTGCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTT
TGTATGGTTTGTTTGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR96TF U 1
AF RR4CR96JQ C 1
AF RR4DD11TF U 89
BS 1 646 RR4CR96TF
BS 647 737 RR4DD11TF

RD RR4CR96TF 646 0 0
GGGCAGCAAATAAAGAGAAAAAAAAACCTGAGTAAAAAAAGAAAAATGAGTGGCTCCGGT
GCGCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGTCTGAGGTCGTCAAGGTC
ATGCTTAATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGG
CTCAAAGGACGCTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAG
TTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTATTCAA
TATGAGAGAGTGACAGTTGGCGTTGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAAA
ACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAA
TGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAG
AAGAATCCTCAAGGAAAAGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCAATGCTCCTTCG
GTTTGAATGAAATCTGTGTTAAAGAGTATTTTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCG
AGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4CR96JQ 714 0 0
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GCGCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGTCTGAGGTCGTCAAGGTC
ATGCTTAATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGG
CTCAAAGGACGCTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAG
TTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTATTCAA
TATGAGAGAGTGACAGTTGGCGTTGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAAA
ACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAA
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C

QA 1 713 1 713
DS 

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GG
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GAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAAGAATCCTCAAGGAAAAGGAAGGGACGAG
TTCAACAATGCCCTACGCAATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAAGAGTATT
TTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTAT
TGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATTTTGTGGATTGTATTATTTTG
TGCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTTTGTATGGTTTGTTTGAT

QA 3 649 3 649
DS 



AS 1 3

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ATTTGTCTTTGCCGCCACCAAACATACCCATCATGTCTTTGCCAGAACCCATCCGTTTCA
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TACTCATGTGCTGAGCGTTCATGTTTCTCGAGAGTGCGCTCATGTCTCCATTCTTTGGGA
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CCATCACTTCTCTTACCATCCTCCCTGACCCTCTCGCTATCCTCATCATCCTTGACTCGT
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ACTGGTCGTACATAATTCTCAACGTGAAGTTGCCCTGAGAGAGCTTTTCCAGAAGTTCAG
GCTGTTGATCTTTAGGTACCACATCTTGTAGTTTATCCACGAATCCAGACCAATCACCCA
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CTCCTGTTCCGATGAATATCACAGGACTCTTCGTCGCTGCAACAGCGCTAAGAGCACCAC
CACCCTTGGCATGACCGTCCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F226JQ U 1
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QA 1 776 1 776
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AA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AT34TF 802 0 0
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ACCCTTGGCATGACCGTCCATC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

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GCTATTGATGTGCGCCCATCTTCTCCTTCCTTCCTTGGTGGTTCTTCTTTCATGGGTTTA
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TTGTCTCCGGAGAATGTTGTATTCTGCCGGCTAATGGCTCCGAAGGAAGTTATATCCTGT
CGGCTTAGGTTCTTTAAGTTTGTATCCAACAATGTAGTCCTCCATAGTTATCAATCAATG
AAGTTTTTAGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H418TF U 1
AF RR4D526JQ C 250
BS 1 478 RR4H418TF
BS 479 479 RR4D526JQ
BS 480 686 RR4H418TF
BS 687 914 RR4D526JQ

RD RR4H418TF 686 0 0
GGAGGTACCGCCCAACTAAAGACGCTCTATCTTCTCTCTAACAGCCTTCTTCATCGGTCT
TTGCTTTTCCGGCCGGCGGCGTAGGCTTTCATAGCTACCGTCGGTCGGGCTTCACTTCTT
CTCTCTGTTTTTTTCTGTTGCTTGCCTTTTGTTTATGGTTTCTGATCTTCCAGTTAGATT
TCTAGATCTAGAACTCCAGATCTCGTTTTTAGTGGTTGAATGTTGTCCGTGGAGGCTCGT
TTCGGCTGCATGATGGTCGTGGTTTGTCTTCCTCCGGTGCTATTTTCCTTCCCTAGGGTT
TCACTCGGCTCTCTTTACGAGATCTCGCCGTCGTCTTCCCCTCTCAGATCTGGCCGGTTG
TATGTTGCTGATGCTTGTGTGAGTGCTTCCGTGGATGGATGGTGTGCTGTTCCTTGCTTA
TGCTTGCAACGGGATAGATCCTGATTTGTTCCTATGCAGGCCTTTGTTAAAAGGTTCTTC
GGCTCGTTTCTTAAGGAACAGGAGCCTTGGCTCTTTATGCATCTTGCCAGTGGAGATTGA
TAGGTAAAAGTTATGTCCTTCTTCTCTATGGGTTGCTGTGCGTCGTTCTACCTCATGGTG
GCTCGTTGGTGTGATTCCCGAGCAATATATGGAGGTGCGTCTGCTCCCTAATAATGTCTG
GCTATTGATGTGCGCCCATCTTCTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4D526JQ 665 0 0
ATGATGGTCGTGGTTTGTCTTCCTCCGGTGCTATTTTCCTTCCCTAGGGTTTCACTCGGC
TCTCTTTACGAGATCTCGCCGTCGTCTTCCCCTCTCAGATCTGGCCGGTTGTATGTTGCT
GATGCTTGTGTGAGTGCTTCCGTGGATGGATGGTGTGCTGTTCCTTGCTTATGCTTGCAA
CGGGATAGATCCTGATTTGTTCCTATGCAGGCCTTTGTTAAAAGGTTCTCCGGCTCGTTT
CTTAAGGAACAGGAGCCTTGGCTCTTTATGCATCTTGCCAGTGGAGATTGATAGGTAAAA
GTTATGTCCTTCTTCTCTATGGGTTGCTGTGCGTCGTTCTACCTCATGGTGGCTCGTTGG
TGTGATTCCCGAGCAATATATGGAGGTGCGTCTGCTCCCTAATAATGTCTGGCTATTGAT
GTGCGCCCATCTTCTCCTTCCTTCCTTGGTGGTTCTTCTTTCATGGGTTTAATTGTTTGA
TCTAGATGTTCTTTCTGTTTGATCTGTAAAACCTTGGTTATTTTCTGTCTCTTGTCTCCG
GAGAATGTTGTATTCTGCCGGCTAATGGCTCCGAAGGAAGTTATATCCTGTCGGCTTAGG
TTCTTTAAGTTTGTATCCAACAATGTAGTCCTCCATAGTTATCAATCAATGAAGTTTTTA
GTGTG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL4535Contig1 815 2 16 U
TCCTTGACGCCATAATGAAACTGCAGGATGATACATGGTGTCCGCATCAAAGATGGGAAA
GCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACGTCACGCCTCAAGCAGGAAGAGTTTTTCGGA
GCTGCCAAATTCATGAAGATTGGGGACCTTAAGGGTTTTCTCGGATTGCTCATGGTCTAT
CTGCAACAGCTCAGAACCAAACTTAATGTATTGGACGTCTCTTATGGACATGGAACTGCT
AATACAGCGCTCGTCTATCACCATGGAAAACTTCTAGCACTATCCGAGGCAGATAAGCCA
TATGTCGTCAAAGTCTTGGAAGATGGAGACCTGCAAACTCTTGGCATGATGGATTATGAC
AAGAGATTGACCCACTCCTTCACTGCCCACCCAAAAGTTGACCCAGCTACCGGTGAAATG
TTTACATTTGGCTATTCGCAAACGCCACCTTATCTCACATACAGAGTGATCTCCGAAGAT
GGCATTATGCATGACCCTGTCCCAATTACTATATCAGAGCCAGTCATGATGCACGACTTC
GCTATTACCGAGTCTTACGCAATCTTCATGGATCTTCCTATGCACTTCAGGCCAAAGGAA
ATGGTGAAAGAGAAGAAAATGGTATACTCATTTGATCCAACAAAAAAGGCTCGTTTTGGT
GTTCTTCCACGCTATGCCAAGGATGAACTCTTGATTAGATGGTTTGAGCTTCCCAACTGC
TTTATATTCCATAACGCCAATGCTTGGGAAGAGAGGATGAAGTCGTCCTCACCACTTGTC
GCCTTGAGAATCAGATCTTGACATGGTTAGCGGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EU94TF U 1
AF RR4DG87TF U 34
BS 1 284 RR4EU94TF
BS 285 285 RR4DG87TF
BS 286 473 RR4EU94TF
BS 474 474 RR4DG87TF
BS 475 536 RR4EU94TF
BS 537 537 RR4DG87TF
BS 538 646 RR4EU94TF
BS 647 648 RR4DG87TF
BS 649 677 RR4EU94TF
BS 678 678 RR4DG87TF
BS 679 686 RR4EU94TF
BS 687 687 RR4DG87TF
BS 688 713 RR4EU94TF
BS 714 714 RR4DG87TF
BS 715 723 RR4EU94TF
BS 724 815 RR4DG87TF

RD RR4EU94TF 723 0 0
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GCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACGTCACGCCTCAAGCAGGAAGAGTTTTTCGGA
GCTGCCAAATTCATGAAGATTGGGGACCTTAAGGGTTTTCTCGGATTGCTCATGGTCTAT
CTGCAACAGCTCAGAACCAAACTTAATGTATTGGACGTCTCTTATGGACATGGAACTGCT
AATACAGCGCTCGTCTATCACCATGGAAAACTTCTAGCACTATCGGAGGCAGATAAGCCA
TATGTCGTCAAAGTCTTGGAAGATGGAGACCTGCAAACTCTTGGCATGATGGATTATGAC
AAGAGATTGACCCACTCCTTCACTGCCCACCCAAAAGTTGACCCAGCTACCGGTGAAATG
TTTACATTTGGCTATTCGCAAACGCCACCTTATCTCACATACAGAGTGATCTCGGAAGAT
GGCATTATGCATGACCCTGTCCCAATTACTATATCAGAGCCAGTCATGATGCACGATTTC
GCTATTACCGAGTCTTACGCAATCTTCATGGATCTTCCTATGCACTTCAGGCCAAAGGAA
ATGGTGAAAGAGAAGAAAATGGTATACTCATTTGATCCAACAAAAA**GCTCGTTTTGGT
GTTCTTCCACGCTATGC*AAGGATGA*CTCTTGATTAGATGGTTTGAGCTTCC*AACTGC
TTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4DG87TF 782 0 0
G
ATGGTGTCCGCATCAAAGATGGGAAAGCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACGTCAC
GCCTCAAGCAGGAAGAGTTTTTCGGAGCTGCCAAATTCATGAAGATTGGGGACCTTAAGG
GTTTTCTCGGATTGCTCATGGTCTATCTGCAACAGCTCAGAACCAAACTTAATGTATTGG
ACGTCTCTTATGGCCATGGAACTGCTAATACAGCGCTCGTCTATCACCATGGAAAACTTC
TAGCACTATCCGAGGCAGATAAGCCATATGTCGTCAAAGTCTTGGAAGATGGAGACCTGC
AAACTCTTGGCATGATGGATTATGACAAGAGATTGACCCACTCCTTCACTGCCCACCCAA
AAGTTGACCCAGCTACCGGTGAAATGTTTACATTTGGCTATTCGCAAACGCCACCTTATC
TCACATACAGAGTGATCTCCGAAGATGGCATTATGCATGACCCTGTCCCAATTACTATAT
CAGAGCCAGTCATGATGCACGACTTCGCTATTACCGAGTCTTACGCAATCTTCATGGATC
TTCCTATGCACTTCAGGCTAAAGGAAATGGTGAAAGAGAAGAAAATGGTATACTCATTTG
ATCCAACAAAAAAGGCTCGTTTTGGTGTTCTTCCACGCTATGCCAAGGATGAACTCTTGA
TTAGATGGTTTGAGCTTCCCAACTGCTTTATATTCCATAACGCCAATGCTTGGGAAGAGA
GGATGAAGTCGTCCTCACCACTTGTCGCCTTGAGAATCAGATCTTGACATGGTTAGCGGG
A

QA 2 782 2 782
DS 



AS 1 3

CO CL4536Contig1 957 3 21 U
GGGACTCGAGAGCAAAAGAAAGAATGAAGAGAGGAGGATTAAAGAGAAGAAGACGTTGAG
GAAGAAGAAGAGCTTAAAAAAAAAAAAAGTCGCTTCTCTCCCGCGGCGGGCGGTTATCCT
GTCACCAATTGCAATCGATAAATAATAATGAAGAAGGTATGGAGATGGTACCAGAGATGC
CTGAGCGTTCATTCGTTGAAAACGCAGGTGATAAGCTCCGGCTTTCTTTGGGGATTCGGA
GACGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTCTTCGT
CTCACTGACACAAATAAAGACGCAGAGGCAGATGCAGATTTCAATCTCAACTGGAAGCGA
GTAGCTATCACAAGCATCTTTGGACTTGGTTTTGTCGGTCCTGTTGGCC*CTTCTGGTAC
GAAGGCCTTGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATACGTACCAAAGTCAACACGTTTC
GTGGCAGCCAAAGTTGCAATGGACGGTCTTATCTTTGGCCCCTTTGATCTGCTTGTGTTC
TTCACCTACATGGGGTACGCCACGGGGAAGAACACGTCTCAAGTGAAAGAAGGACTCAAG
CGAGATTTTCTACCGGCTCTAGCTCTTGAAGGCGGAGCATGGCCGCTTCTCCAGATCGCT
AACTTCAGATACGTTCCCGTCCAGTACCAGCTGCTTTACGTCAACGTCTTTTGCCTTATA
GACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGCAGCTTGGAAGCAATGGTTT
TCTACTTCGTTTCTAACGCTTAAAGAACGAGGTGGCACTGGTGGAGTATGAAGATCATTT
TCGCTTTTTTTTTACATGTCATAACAACTTTGAAGGAAAACAGAACAGAGTGTAATAGGC
GATTTTTAATCAAATATTGTTTCGTTTTTAAAGAATTTGTTCTTTTGTGAATGGATT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP59TF U 1
AF RR4GE79TF U 30
AF RR4GE79JQ C 160
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GAAGAAGAAGAGCTTAAAAAAAAAAAAAGTCGCTTCTCTCCCGCGGCGGGCGGTTATCCT
GTCACCAATTGCAATCGATAAATAATAATGAAGAAGGTATGGAGATGGTACCAGAGATGC
CTGAGCGTTCATCCGTTGAAACCGCAGGTGATAAGCTCCGGCTTTCTTTGGGGATTCGGA
GACGTCCCCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTCTTCGT
CTCACTGACACAAATAAAGACGCAGAGGCAGATGCAGATTTCAATCTCAACTGGAAGCGA
GTAGCTATCACAAGCATCTTTGGACTTGGTTTTGTCGGTCCTGTTGGCCACTTCTGGTAC
GAAGGCCTTGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATACGTACCAAAGTCAACCCGTTTC
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TTCACCTACATGGGATACGCCACGGGGAAGAACACGTCTCAAGTGAAAGAAG*ACTCAAG
CGAGATTTTCTACCGGCTCTAGCTCTTGAAGGCGGAGCATGGCCGCTTCTTCAGATCGCT
AACTTCAGATACGTTCCCGTCCAGTACCAGCTGCTTTACGTCAACGTCTTTTACCTTATA
GACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACC
GA

QA 1 748 1 748
DS 

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G
GAGGAGGATTAAAGAGAAGAAGTCGTTGAGGAAGAAGAAGAGCTTAAAAAAAAAAAA*GT
CGCTTCTCTCCCGCGGCGGGCGGTTATCCTGTCACCAATTGCAATCGATAAATAATAATG
AAGAAGGTATGGAGATGGTACCAGAGATGCCTGAGCGTTCATTCGTTGAAAACGCAGGTG
ATAAGCTCCGGCTTTCTTTGGGGATTCGGAGACGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCC
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GATGCAGATTTCAATCTCAACTGGAAGCGAGTAGCTATCACAAGCATCTTTGGACTTGGT
TTTGTCGGTCCTGTTGGCC*CTTCTGGTACGAAGGCCTTGATAAATTCATAAAACTGAAG
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ATCTTTGGCCCCTTTGATCTGCTTGTGTTCTTCACCTACATGGGGTACGCCACGGGGAAG
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GGCGGAGCATGGCCGCTTCTCCAGATCGCTAACTTCAGATACGTTCCCGTCCAGTACCAG
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CAGAAG
ATGCAGCT

QA 2 727 2 727
DS 

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ATGGAGAT
GTACCAGAGATGC*TGAGCGTTCATTCGT*GAAAACGCAGGTGATAAGCTCCGGCTTTCT
TTGGGGATTCGGAGACGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCC
TCCTCTTCTTCGTCTCACTGACACAAATAAAGACGCAGAGGCAGATGCAGATTTCAATCT
CAACTGGAAGCGAGTAGCTATCACAAGCATCTTTGGACTTGGTTTTGTCGGTCCTGTTGG
CC*CTTCTGGTACGAAGGCCTTGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATACGTACCAAA
GTCAACACGTTTCGTGGCAGCCAAAGTTGCAATGGACGGTCTTATCTTTGGCCCCTTTGA
TCTGCTTGTGTTCTTCACCTACATGGGGTACGCCACGGGGAAGAACACGTCTCAAGTGAA
AGAAGGACTCAAGCGAGATTTTCTACCGGCTCTAGCTCTTGAAGGCGGAGCATGGCCGCT
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CTTTTGCCTTATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGCAGCTTG
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TGAATGGATT

QA 9 798 9 798
DS 



AS 1 3

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TACAGAAGAAAACAAACAAATTTGGGGGTTTGAAGAATTCTCGTTCATCAACGTCCATCT
ACGGAAGTGAAAGACTCTGCGAATCCGTAAGGTCTAGAGGGAATACTCATCTGCGTGTTA
CCCAAGCTAGGTAACAGCGAGGAAGTAGATGATTCGAGATCACTTCTTCCTTCATAAGCT
TGCCATTTCTTAAGAGCCTGAGGCAAAGACATGTCGAGATCAATGCCATAAATGTCCTCT
GGATTCTGATCCGCCGGTTTCCATAGCTCGACGAGCGAGGACAGAATGTTGACTGCGTGT
CCCATGTCTGGTCTCTGGTAAGGTTCACGTGCACAGCAATGCCCCGCTAGCTCAGCAACG
GTGTGAACGCTGGCCAGGGTTTCTTCGTCGAGGCCTATTGTCGGGTCGATCGCTTTCTTG
AATGATGATTCCTTGTAGATGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGAATGCTCTCT
TCTGGTTGAGATTCGTCTAGAGATTTCCTTCCTGTTATGAGTTCCATCAAAATCACTCCA
AAGCTGTACACATCGACCTTTGTGGTTACTCTACCCGTAACTGCATATTCGGGTGCCAAG
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ACAAGTCCAAAGTCTGCAACCTTAGCCCTCATATCATCTCCAAGAAGAATGTTCGAAGGC
TTAAGATCTCTGTGAATAAAGCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A291JQ U 1
AF RR4A291JQD U 1
AF RR4A291TFB C 79
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BS 501 760 RR4A291JQ
BS 761 865 RR4A291TFB

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AAGCTGTACACATCGACCTTTGTGGTTACTCTACCCGTAACTGCATATTCGGGTGCCAAG
TAACCAAATGTTCCAGCAATTCTAGTCTCAATAGATCCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4A291JQD 760 0 0
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ACAAGAAACATGAAAGAATTGTTAGGTGAGAATTGAAGACAGAGGACGAACACACAAATA
TACAGAAGAAAACAAACAAATTTGGGGGTTTGAAGAATTCTCGTTCATCAACGTCCATCT
ACGGAAGTGAAAGACTCTGCGAATCCGTAAGGTCTAGAGGGAATACTCATCTGCGTGTTA
CCCAAGCTAGGTAACAGCGAGGAAGTAGATGATTCGAGATCACTTCTTCCTTCATAAGCT
TGCCATTTCTTAAGAGCCTGAGGCAAAGACATGTCGAGATCAATGCCATAAATGTCCTCT
GGATTCTGATCCGCCGGTTTCCATAGCTCGACGAGCGAGGACAGAATGTTGACTGCGTGT
CCCATGTCTGGTCTCTGGTAAGGTTCACGTGCACAGCAATGCCCCGCTAGCTCAGCAACG
GTGTGAACGCTGGCCAGGGTTTCTTCGTCGAGGCCTATTGTCGGGTCGATCGCTTTCTTG
AATGATGATTCCTTGTAGATGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGAATGCTCTCT
TCTGGTTGAGATTCGTCTAGAGATTTCCTTCCTGTTATGAGTTCCATCAAAATCACTCCA
AAGCTGTACACATCGACCTTTGTGGTTACTCTACCCGTAACTGCATATTCGGGTGCCAAG
TAACCAAATGTTCCAGCAATTCTAGTCTCAATAGATCCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4A291TFB 787 0 0
A
TGTTAGGTGAGAATTGAAGACAGAGGACGAACACACAAATATACAGAAGAAAACAAACAA
ATT**GGGGTTTGAAGAATTCTCGTTCATCAACGTCCATCTACGGAAGTGAAAGACTCTG
CGAATCCGTAAGGTCTAGAGGGAATACTCATCTGCGTGTTACCCAAGCTAGGTAACAGCG
AGGAAGTAGATGATTCGAGATCACTTCTTCCTTCATAAGCTTGCCATTTCTTAAGAGCCT
GAGGCAAAGACATGTCGAGATCAATGCCATAAATGTCCTCTGGATTCTGATCCGCCGGTT
TCCATAGCTCGACGAGCGAGGACAGAATGTTGACTGCGTGTCCCATGTCTGGTCTCTGGT
AAGGTTCACGTGCACAGCAATGCCCCGCTAGCTCAGCAACGGTGTGAACGCTGGCCAGGG
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TGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGAATGCTCTCTTCTGGTTGAGATTCGTCTA
GAGATTTCCTTCCTGTTATGAGTTCCATCAAAATCACTCCAAAGCTGTACACATCGACCT
TTGTGGTTACTCTACCCGTAACTGCATATTCGGGTGCCAAGTAACCAAATGTTCCAGCAA
TTCTAGTCTCAATAGATCCTTTCCCTTCAGGTGCAAGACGAACAAGTCCAAAGTCTGCAA
CCTTAGCCCTCATATCATCTCCAAGAAGAATGTTCGAAGGCTTAAGATCTCTGTGAATAA
AGCTCC

QA 2 787 2 787
DS 



AS 1 3

CO CL4538Contig1 457 3 11 U
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TGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCTGGTTCACGCACCTGCCGTGT
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CCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCTT
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AGTTTTTTTAATGCATTTCATTTTTTGTATCGAATAAGTTGGTGGACAAGACATATGTAT
GTTGTCTTAAAAGCTTATGTTTCAATGGAACGATGCTCTATATGACCAAAATATCTATAT
GATTTTTGCAATTGAATGACATAATCTTGGTTGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4G835TF U 1
AF RR4DQ85JQ C 13
AF RR4DQ85TF U 13
BS 1 102 RR4G835TF
BS 103 103 RR4DQ85TF
BS 104 145 RR4G835TF
BS 146 147 RR4DQ85TF
BS 148 295 RR4G835TF
BS 296 296 RR4DQ85TF
BS 297 336 RR4G835TF
BS 337 337 RR4DQ85TF
BS 338 360 RR4G835TF
BS 361 361 RR4DQ85TF
BS 362 457 RR4G835TF

RD RR4G835TF 457 0 0
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TGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCTGGCTCACGCACCTGCCGTGT
GTGTGGAAACTCCCACGGGCTGATC**GAAGTATGGTCTCAACTGCTGCAGACAATGTTT
CCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCTT
GATTGATGCTTATGATACACAAACATGATGGCGTCAATCAATTGGCTCTGAAGCTTTTTT
AGTTTTTTTAATGCATTTCATTTTTTGTATCGAATAGGTTGGTGGACAAGACATATGTAT
TTTGTCTTAAAAGCTTATGTTTCAATGGAACGATGCTCTATATGACCAAAATATCTATAT
GATTTTTGCAATTGAATGACATAATCTTGGTTGTATT

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4DQ85JQ 430 0 0
GG
GACGCCGCTTGTTCTTTCCTCTGTGAGCAACCGACGAAATGGGTCATGACAACGTGTGGA
ACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCTGGTTCACGCACCTGCCGTGTGTGTGGAAACTCCC
ACGGGCTGATCAGGAAGTATGGTCTCAACTGCTGCAGACAATGTTTCCGCAGCAATGCCA
AGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCTTGATTGATGCTTATG
ATACACAAACATGATGGCGTCAATCAATTGGCTCTGAAGCTCTTTTAGTTTTTTTAATGC
ATTTCATTTTTTGTATCGAATAAGTTGGTGGACAAGACATATGTATGTTGTCTTAAAAGC
TTATGTTTCAATGGAACGATGCTCTATATGACCAAAATATCTATATGATTTTTGCAATTG
AATGACAT

QA 3 430 3 430
DS 

RD RR4DQ85TF 430 0 0
GG
GACGCCGCTTGTTCTTTCCTCTGTGAGCAACCGACGAAATGGGTCATGACAACGTGTGGA
ACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCTGGTTCACGCACCTGCCGTGTGTGTGGAAACTCCC
ACGGGCTGATCAGGAAGTATGGTCTCAACTGCTGCAGACAATGTTTCCGCAGCAATGCCA
AGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCTTGATTGATGCTTATG
ATACACAAACATGATGGCGTCAATCAATTGGCTCTGAAGCTCTTTTAGTTTTTTTAATGC
ATTTCATTTTTTGTATCGAATAAGTTGGTGGACAAGACATATGTATGTTGTCTTAAAAGC
TTATGTTTCAATGGAACGATGCTCTATATGACCAAAATATCTATATGATTTTTGCAATTG
AATGACAT

QA 3 430 3 430
DS 



AS 1 2

CO CL4539Contig1 839 2 1 U
GGGTTCTTCCATTATAGACGAATCTCTCTCCTTTAAATTTCCACCAACGCCTCTCTCTCT
CTCTCGATTTCTTTATTGCCGGAGCTCGTAGTTCCACGGCGGGGAGAGATGGCTCCTAAC
GATCCCAAAAACGGCGGTGGTTTCTTCGCGTCTCTTGCTTCCTCGATCTCAAGTTTGGGA
TCGGCCATGACCAAATCAGTTAACGGTTTGGTTGGCTATGAGGGACTCGAAGTTATTAAC
CCTGAAGGAAGTACAGAGGATGCAGCTGAGGAAGCAAACAGAGGAAGGTGGAAGCAAGAG
GAAAGAGATGGCTATTGGAAGATGATGCATAAGTACATTGGATCTGATGTTACATCAATG
GTGACACTTCCTGTTATTATCTTTGAACCGATGACAATGCTCCAGAAAATGGCTGAGTTG
ATGGAGTACTCGCATCTACTAGACATGGCAGACGAAACAGAGGACCCTTATATGCGCATG
GTGTATGCCTCATCTTGGGCTATATCTGTGTATTTTGCTTTCCAACGTACCTGGAAACCG
TTCAATCCGATCCTCGGAGAGACTTATGAGATGGCTAATTACAATGGTGTTAACTTCATA
TCCGAACAGGTCAGCCATCACCCGCCAATGAGCGCAGGTCATGCTGAAAATCAGTATTTC
ACTTACGATTGTACTTCAAAACTGAAAACCAAGTTTCTTGGCAATTCCATTGACGTTTAC
CCAGTAGAAGGACGAGGGTGACACTCAAAGAGATGGAGTGGTTCTTGACTTGGTACCTCC
ACTGACCAAAGTTCACAACCTAATCTTTGGACGAACTTGGGTTGATTCTCCTGGGGAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B067TF U 1
AF RR4AT76TF U 1
BS 1 839 RR4AT76TF

RD RR4B067TF 724 0 0
GGGTTCTTCCATTATAGACGAATCTCTCTCCTTTAAATTTCCACCAACGCCTCTCTCTCT
CTCTCGATTTCTTTATTGCCGGAGCTCGTAGTTCCACGGCGGGGAGAGATGGCTCCTAAC
GATCCCAAAAACGGCGGTGGTTTCTTCGCGTCTCTTGCTTCCTCGATCTCAAGTTTGGGA
TCGGCCATGACCAAATCAGTTAACGGTTTGGTTGGCTATGAGGGACTCGAAGTTATTAAC
CCTGAAGGAAGTACAGAGGATGCAGCTGAGGAAGCAAACAGAGGAAGGTGGAAGCAAGAG
GAAAGAGATGGCTATTGGAAGATGATGCATAAGTACATTGGATCTGATGTTACATCAATG
GTGACACTTCCTGTTATTATCTTTGAACCGATGACAATGCTCCAGAAAATGGCTGAGTTG
ATGGAGTACTCGCATCTACTAGACATGGCAGACGAAACAGAGGACCCTTATATGCGCATG
GTGTATGCCTCATCTTGGGCTATATCTGTGTATTTTGCTTTCCAACGTACCTGGAAACCG
TTCAATCCGATCCTCGGAGAGACTTATGAGATGGCTAATTACAATGGTGTTAACTTCATA
TCCGAACAGGTCAGCCATCACCCGCCAATGAGCGCAGGTCATGCTGAAAATCAGTATTTC
ACTTACGATTGTACTTCAAAACTGAAAACCAAGTTTCTTGGCAATTCCATTGACGTTTAC
CCA
G

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4AT76TF 839 0 0
GGGTTCTTCCATTATAGACGAATCTCTCTCCTTTAAATTTCCACCAACGCCTCTCTCTCT
CTCTCGATTTCTTTATTGCCGGAGCTCGTAGTTCCACGGCGGGGAGAGATGGCTCCTAAC
GATCCCAAAAACGGCGGTGGTTTCTTCGCGTCTCTTGCTTCCTCGATCTCAAGTTTGGGA
TCGGCCATGACCAAATCAGTTAACGGTTTGGTTGGCTATGAGGGACTCGAAGTTATTAAC
CCTGAAGGAAGTACAGAGGATGCAGCTGAGGAAGCAAACAGAGGAAGGTGGAAGCAAGAG
GAAAGAGATGGCTATTGGAAGATGATGCATAAGTACATTGGATCTGATGTTACATCAATG
GTGACACTTCCTGTTATTATCTTTGAACCGATGACAATGCTCCAGAAAATGGCTGAGTTG
ATGGAGTACTCGCATCTACTAGACATGGCAGACGAAACAGAGGACCCTTATATGCGCATG
GTGTATGCCTCATCTTGGGCTATATCTGTGTATTTTGCTTTCCAACGTACCTGGAAACCG
TTCAATCCGATCCTCGGAGAGACTTATGAGATGGCTAATTACAATGGTGTTAACTTCATA
TCCGAACAGGTCAGCCATCACCCGCCAATGAGCGCAGGTCATGCTGAAAATCAGTATTTC
ACTTACGATTGTACTTCAAAACTGAAAACCAAGTTTCTTGGCAATTCCATTGACGTTTAC
CCAGTAGAAGGACGAGGGTGACACTCAAAGAGATGGAGTGGTTCTTGACTTGGTACCTCC
ACTGACCAAAGTTCACAACCTAATCTTTGGACGAACTTGGGTTGATTCTCCTGGGGAAA

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 3

CO CL4540Contig1 1015 3 13 U
TAACCAACCATGGACAAAGGCATAGGTCTTTACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCAC
CTGGTGAGACATGCTCAGGGGATTCATAATGTTGCTGGAGAAAAAGACCATAGTGCTTAC
TCTTCCGAGGACTATTTTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCAT
CTACGGAACCATGTTTTAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCT
CCCTTGCTTAGAACTATACAAACTGCTGTCGGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAGT
GGAGCAGATGCAACACCGCTAATGGTGGCCAACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATT
TCAAGCTTAAACAGCCCACCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACCATGGGTGAT
CATCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCGTTACAGAGTACAGGGCTATGTTTCCTGCAATCGAT
TTTTCAATTATTGAAAGCGACAAGGATGTTTTGTGGAAG*CCTAGTCCAAGAGAGACCCC
AGATGAAGTTGCAGCGAGAGGTGTAGAGTTCATTAACTGGCTATGGACGGGGAAAGAAAA
GGAGATTGCAATTGTATCTCACAGTGGCTTCTTGCACGGTCTACTGAGCTCTTACGGGAA
GGATTGTGTCGACGAGATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTGAGCTTCG
TTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAACCTGGGGACTAATTCTACAGAGACTACAAACTA
TTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGCCTAACCGATGACGAGTAAGAG
ATATAAATAAGAAGGGAACACCTGATGGCTCCATTGGAATATTATTTGGCATTTTCAGCT
TGTATTGTATTTTGATAAACATAATTTAAATTTCAGTACTTATGTCAGCTACTAAATGAA
TTTACTGATTATGGTTTTTATTTGGGGAAAATGAATAAATTTCAGAAGTCTCATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB51TF U 1
AF RR4BD68TF U 1
AF RR4AB51JQ C 78
BS 1 23 RR4AB51TF
BS 24 24 RR4BD68TF
BS 25 707 RR4AB51TF
BS 708 708 RR4BD68TF
BS 709 743 RR4AB51TF
BS 744 744 RR4BD68TF
BS 745 753 RR4AB51TF
BS 754 754 RR4BD68TF
BS 755 790 RR4AB51TF
BS 791 792 RR4BD68TF
BS 793 794 RR4AB51JQ
BS 795 852 RR4BD68TF
BS 853 1015 RR4AB51JQ

RD RR4AB51TF 794 0 0
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CTACGGAACCATGTTTTAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCT
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AGATGAAGTTGCAGCGAGAGGTGTAGAGTTCATTAACTGGCTATGGACGGGGAAAGAAAA
GGAGATTGCAATTGTATCTCACAGTGGCTTCTTGCACGGTCTACTGAGCTCTTACGGGAA
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TTCTGGCAAG
TCCT

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CTGGTGAGACATGCTCAGGGGATTCATAATGTTGCTGGAGAAAAAGACCATAGTGCTTAC
TCTTCCGAGGACTATTTTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCAT
CTACGGAACCATGTTTTAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCT
CCCTTGCTTAGAACTATACAAACTGCTGTCGGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAGT
GGAGCAGATGCAACACCGCTAATGGTGGCCAACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATT
TCAAGCCTAAACAGCCCACCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACCATGGGTGAT
CATCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCGTTACAGAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGAT
TTTTCAATTATTGAAAGCGACAAGGATGTTTTGTGGAAGTCCTAGTCCAAGAGAGACCCC
AGATGAAGTTGCAGCGAGAGGTGTAGAGTTCATTAACTGGCTATGGACGAGGAAAGAAAA
GGAGATTACAATTGTATCTCACAGTGGCTTCTTGCACGGTCTACTGAGCTCTTACGGGAA
GGATTGTGTCGACGAGATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTGAGCTTCG
TTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAACCTGGGGACTAATTCTACAGAGACTACAAACTA
TTCTGGCAAGGT**CTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGCCTAACCGATGACGAGTAAGAG
ATATAAATAAGA
GGG

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4AB51JQ 938 0 0
AGGGGA
TCATAATGTTGCTGGAGAAAAAGACCATAGTGCTTACTCTTCCGAGGACTATTTTGATGC
TCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGAACCATGTTTTAGAAAC
TCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGCTTAGAACTATACAAAC
TGCTGTCGGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAGTGGAGCAGATGCAACACCGCTAAT
GGTGGCCAACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCTTAAACAGCCCACCTTT
CCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACCATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGCGAAGAAG
CGTTACAGAGTACAGGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAAGCGACAA
GGATGTTTTGTGGAAG*CCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGATGAAGTTGCAGCGAGAGGTG
TAGAGTTCATTAACTGGCTATGGACGGGGAAAGAAAAGGAGATTGCAATTGTATCTCACA
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AAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTGAGCTTCGTTCAATGGTTATCGTTGATCAAG
GAAACCTGGGGACTAATTCTACAGAGACTACAAACTATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGAC
TTGATCATCCAAGCGCCTAACCGATGACGAGTAAGAGATATAAATAAGAAGGGAACACCT
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ATTTAAATTTCAGTACTTATGTCAGCTACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTTTTATTT
GGGGAAAATGAATAAATTTCAGAAGTCTCATC

QA 7 938 7 938
DS 



AS 1 3

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ATCGGACACTGATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCACGGTTAAAT
CTGCTCTCTGCCGTAGAACTCATCTCGTTCAATCTTTCTCCGTTGTCTTCCTCTACTGGT
TTTACAACGTTTCATGAATTGTTGAAAACTCCCAAGTCTAATCCTTAATTACAAAAAATA
TATTCATTGCTTTTCAGACAAATCTAAGAAACCATCAAAAACAAATCTGTCCTTTTTTAA
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AGCAGCACATACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGAAACCCATCTGGTCCCGTCGTC
GCCGTCGACGACCGAAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCACGTAGATCG
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GCGGAGAACTCTATCTTGACCGCTCAGATGACAGAGCTGAGCACCAGACTCGAGTCGTTG
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GGCTGTGGATTCGATGGTCGTACGGTTGGGATTAATTGCGACGGATATTACGATGATATG
ATGAGCGGCGTTAATCCTTGGGGTGGTTCTGTTTACTCTAACCAACCAATCATGGCTAAT
GATATGATGAATATGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 5 20 20 5 20 5 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU19TF U 1
AF RR4AS07TF U 7
AF RR4GD72TF U 254
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BS 181 182 RR4AS07TF
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RD RR4BU19TF 750 0 0
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ATCGGACACTGATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCACGGTTAAAT
CTGCTCTCTGCCGTAGAACTCATCTCGTTCAATCTTTCTCCGTTGTCTTCCTCTACTGGT
**TACAACGTTTCATGAATTGTTGAAAACTCCCAAGTCTAATCCTTAATTACAAAAAATA
TATTCATTGCTTTTCAGACAAATCTAAGAAACCATCAAAAACAAATCTGTCCTTTTTTAA
GTTCTTGTAATAATTTTCTTTGTTAAACCTTTTTTTCGGCGGTATAAAATGGCGTCATCT
AGCAGCACATACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGAAACCCATCTGGTCCCGTCGTC
GCCGTCGACGACCGAAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCACGTAGATCG
AGGATGCGTAAACAGAAACACGTGGACGATCTAACGGCTCAGATCAATCAGCTTTCGAAC
GACAACCGTCAGATCTTGACGAGTCTCACCGTCACAACTCAGCTTTACATGAAGATCCAA
GCGGAGAACTCTATCTTGACCGCTCAGATGACAGAGCTGAGCAC*AGACTCGAGTCGTTG
AACGAGATCGTCGATCTCGTGACACACAACAACG**GGGGGTGGTGTCGATCAGATCGAC
G*CTGTGGATTCGATGGTCGTACGGT
GGGA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AS07TF 753 0 0
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CACTGATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCACGGTTAAATCTGCTC
TCTGCCGTAGAACTCATCTCGTTCAATCTTTCTCCGTTGTCTTCCTCTACTGGTTTTACA
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TTGCTTTTCAGACAAATCTAAGAAACCATCAAAAACAAATCTGTCCTTTTT*AAGTTCTT
GTAATAATTTTCTTTGTTAAACCTTTTTTTCGGCGGTATAAAATGGCGTCATCTAGCAGC
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GACGACCGAAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCACGTAGATCGAGGATG
CGTAAACAGAAACACGTGGACGATCTAACGGCTCAGATCAATCAGCTTTCGAACGACAAC
CGTCAGATCTTGACGAGTCTCACCGTCACAACTCAGCTTTACATGAAGATCCAGGCGGAG
AACTCTATCTTGACCGCTCAGATGACAGAGCTGAGCACCAGACTCGAGTCGTTGAACGAG
ATCGTCGATCTCGTGACCACCACCAACAACGGTGGTGGTGTCGATCAGATCGACGGCTGT
GGATTCGATGGTCGTACGGTTGGGATTAATTGC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4GD72TF 604 0 0
G
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TTTCTTTGTTAAACCTTTTTTTCGGCGGTATAAAATGGCGTCATCTAGCAGCACATACCG
GAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGAAACCCATCTGGTCCCGTCGTCGCCGTCGACGACCG
AAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCGCGTAGATCAAGGATGCGTAAACA
GAAACACGTGGACGATCTAACGGCTCAGATCAATCAGCTTTCGAACGACAACCGTCAGAT
CTTGACGAGTGTCAACGTCACAACTCAGCTTTATATGAAGATCCAAGCGGAGAACTCTAT
CTTGACCGCTCAGATGACAGAGCTGAGCACCAGACTCGAGTCGTTGAACGAGATCGTCGA
TCTCGTGACCACCAACACCAACGGTGGTGGTGTCGATCAGATCGACGGCTGTGGATTCGA
TGATCGTACGGTTGGGATTAATTGCGACGGATATTACGATGATATGATGAGCGGCGTTAA
TCCTTGGGGTGGTTCTGTTTACTCTAACCAACCAATCATGGCTAATGATATGATGAATAT
GTA

QA 2 604 2 604
DS 



AS 1 2

CO CL4542Contig1 866 2 9 U
GGAGATTCATATCCGTTACTTTTATCTCAAATCTCTCTTTGTTTCTCTTCAATCCCAGAC
TGATATGTCGATGATGACGATGGGAATTCAAGGCCAGCTTCTCGAGGTCACTGTGGTTGG
GTGCCAGAAATTGAAAGACACGGAATGGTTTTCGAGGCAAGATCCATACGTTGTCCTCGA
GTACAGCGGCGCTAGGCACCAAACCAGAACCTGCACAGATGGTGGGAAAAGCGCAGTGTT
TCAAGAGAAGTTTATGTTCACGTTGTTTGAAGGCATTAAGGATCTTAAGGTTGCTGTCTG
GAATAGCAACACTCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTGCAGAA
GGTTCTTTCTCAGGGATACGACGATTGTACATGGACTCTTCAGACTAAAACTGGCAGATA
TGCGGGAGAAGTAAGACTCATACTGCATTATGCAAGTGCAAAGAACCAACATCACGGATC
TGCGCCATCAGCACCACCTTATGCTCCTCAAGTACCTCACTACTCAGCACCGCCTTCTCC
ATCTCCATATTCGTCACCACCATACTCTGGACCATCTCTGTACCCACAAGTACAATACTC
TCAGCCGCAATCAGCATACCCACCAGCTTCAGCCTATCCTCCTCAGCCATATGGTTACCC
TCCTCCTCCCTCAACCTCCGCATACACTCTCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCACC
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TCCCTATCCAGGACATACCCGCCACCTCCATACTAAACTCCGCGTTGAGATGATGAAAGT
GGTCATCATGTATAGATGATACTAGT


BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FQ18TF U 1
AF RR4B413TF U 1
BS 1 337 RR4B413TF
BS 338 338 RR4FQ18TF
BS 339 424 RR4B413TF
BS 425 425 RR4FQ18TF
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BS 491 491 RR4FQ18TF
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BS 565 565 RR4FQ18TF
BS 566 866 RR4B413TF

RD RR4FQ18TF 768 0 0
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TTCTCACCATCACATATTA

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DS 

RD RR4B413TF 866 0 0
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TCAAGAGAAGTTTATGTTCACGTTGTTTGAAGGCATTAAGGATCTTAAGGTTGCTGTCTG
GAATAGCAACACTCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCGATGCTACGATTCAGTTGCAGAA
GGTTCTTTCTCAGGGATACGACGATTGTACATGGACTCTTCAGACTAAAACTGGCAGATA
TGCGTGAGAAGTAAGACTCATACTGCATTATGCAAGTGCAAAGAACCAACATCACGGATC
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ATCTCCATATTCGTCACCACCATATTCTGGACCATCTCTGTACCCACAAGTACAATACTC
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GGTCATCATGTATAGATGATACTAGT

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RR4D788TF U 1
AF RR4B929JQ C 2
AF RR4B929TF U 2
BS 1 128 RR4D788TF
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RD RR4D788TF 646 0 0
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DS 

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GG
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TAAGAGAATAGCTTTATGTACTTGTGTGACTCTTGCTGCTTGT

QA 3 645 3 645
DS 

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GG
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CCAAACCCTACTTTTCGAATCAGGTCTCAGTTTCTCCGTAGTTTGCCCATCAGATCAACA
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GAATGTTGAGGACTCAGGTGCAGGAACAAAAGAGTACGTCCACATCCGTGTGCAGCAGCG
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ACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGTGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCCTAGT
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TAAGAGAATAGCTTTATGTACTTGTGTGACTCTTGCTGCTTGT

QA 3 645 3 645
DS 



AS 1 3

CO CL4544Contig1 943 3 10 U
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AGATGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATT
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AGAATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATT
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TAAAAAATTGTACGCAATAATATGAACCATCGAGAGACTTGAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX74TF U 2
AF RR4AI45TF U 1
AF RR4BX74JQ C 261
BS 1 60 RR4AI45TF
BS 61 62 RR4BX74TF
BS 63 180 RR4AI45TF
BS 181 181 RR4BX74TF
BS 182 354 RR4AI45TF
BS 355 355 RR4BX74TF
BS 356 709 RR4AI45TF
BS 710 710 RR4BX74TF
BS 711 842 RR4AI45TF
BS 843 943 RR4BX74JQ

RD RR4BX74TF 767 0 0
GATAAAACATAGTGAGTAAAAACAACAAAAAAAGTGGTAAATCAAAAACAAAAAAAAAAA
ATTGTATAAGTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAGGCTCATCATAAGAATAAAGCTGAA
AAGGAACTCAATAAATAGACAAATAGGGAAATCATACAAGAAAATTGAATTAGTCAAGGA
GATGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATTC
CCGAACGTTGCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACAC
AGCTGGCGAACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAGTCCAGC
CGGCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAA
GAATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATTT
TTTAATAGGAGAAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATT
TTCAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAAG
ATATATTATTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGGGTAGAGAGGTTAA
AA*GTTGGCCGACGGTAACAATGGAC*AAACCAGAATAGTCTACAAGCATA*CGCTACAA
AGTTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTA
TGCCTT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4AI45TF 844 0 0
GGATAAAACATAGTGAGTAAAAACAACAAAAAAAGTGGTAAATCAAAAACAAAAAAAAAA
**TTGTATAAGTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAGGCTCATCATAAGAATAAAGCTGA
AAAGGAACTCAATAAATAGACAAATAGGGAAATCATACAAGAAAATTGAATTAGTCAAGG
GGATGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATT
CCCGAACGTTGCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACA
CAGCTGGCGAACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAATCCAG
CCGGCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTA
AGAATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATT
TTTTAATAGGAGAAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCAT
TTTCAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAA
GATATATTATTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGG*TAGAGAGGTTA
AAAAGTTGGCCGACGGTAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAACGCTACA
AAGTTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGAT
CGAAATCTTACCGATGGTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGATGGTA
AA
CC

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4BX74JQ 683 0 0
TCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACACAGCTGGCGAACAAGTGGTT
GTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAGTCCAGCCGGCTTAGTAACTGCAATC
AAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGAATCGTGTGTATTGGGAT
ATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATTTTTTAATAGGAGAAAAGTTC
AAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTTCAAAAACATGGGATACC
TCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAAGATATATTATTCGACGCGGT
GTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGG*TAGAGAGGTTAAAAAGTTGGCCGACGGTAAC
AATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCATAACGCTACAAAGTTCGATTATATGGCTGT
AGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGATCGAAATCTTACCGATGGTAG
TGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGATGGTAAAACCAAAAAATAAATTATT
TAAAGGGCAGGTTGACGATAAGTATCTTTACTGAATCTATTAAAAAATTGTACGCAATAA
TATGAACCATCGAGAGACTTGAC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL4545Contig1 766 3 5 U
GCGTATCTCTAACATATTTAATTGAAAGTAAATTTATAATTACACCTTTCTAATTATTGC
AAAAGCTCTCAATAGTTTATTCAAACAACAAGACTCAAAAGGTGCAACAATCTTCTACAA
GATAAAAGCATAAGCCAGCAAAATTAACTGTAGCATAACTTTGGAACATTAAAAAAAAGG
TAAAAACTCAAAACAAGTCTTTGACATTTTACCATAATCAGGCCTGACCTTCGGGTTTCT
TATCCTCTGCAGTTTCATTAGTCTCTGCTCCTCCTCCTTCAGTGTTGTTCTCCTCAGGTG
GCTGAACCTGTTCATCCTCAGGTAGAGGCTCTTCCACATAATCATTCTCAAAAGCATCAG
CCGGAACCTCGTAAATCCTAACTTGAGGCTTGGACGGATCCTTCACTAGAACATACTTCC
CTTCACTCAGCTTCATACACAGATCAACAATGGACTTGACAATTCCCCACATGTTGGAAG
TGTTCAGATTAATCTGCCCAGCGAAATCCTTCGGCTTATACCCCAGAACCGATAGAATAA
CATGGTTAAAATGATCACGAGGATGAACCCTGGAAACAAAACCAATCTTCATCATATCCG
CATTAGCCAACAGAGCCTGTGCGGTCCACTTAGCTAACTTATTACCATTGTTCTTCAACT
CATTAGCTAAAACCGCACCTCTCTGAGTCTCCAGCTTCTGTCTCCAATCAACACCAGAGT
ACTTAGGATCAAACTCGTTGAGAGCGTTCAAAGTGAGGAACGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV02TF C 51
AF RR4DV02JQ U 59
AF RR4CV15JQ U 1
BS 1 408 RR4CV15JQ
BS 409 409 RR4DV02JQ
BS 410 432 RR4CV15JQ
BS 433 433 RR4DV02JQ
BS 434 766 RR4CV15JQ

RD RR4DV02TF 655 0 0
TTTTTT
TTGCAAAAGCTCTCAATAGTTTATTCAAACAACAAGACTCAAAAGGTGCAACAATCTTCT
ACAAGATAAAAGCATAAGCCAGCAAAATTAACTGTAGCATAACTTTGGAACATTAAAAAA
AAGGTAAAAACTCAAAACAAGTCTTTGACATTTTACCATAATCAGGCCTGACCTTCGGGT
TTCTTATCCTCTGCAGTTTCATTAGTCTCTGCTCCTCCTCCTTCAGTGTTGTTCTCCTCA
GGTGGCTGAACCTGTTCATCCTCAGGTAGAGGCTCTTCCACATAATCATTCTCAAAAGCA
TCAGCCGGAACCTCGTAAATCCTAACTTGAGGCTTGGACGGATCCTTCACTAGAACATAC
TTCCCTTCACTCAGCTTCATACACAGATCAACAATGGACTTGACAATTCCCCACATGTTG
GAAGTGTTCAGATTAATCTGCCCAGCGAAATCCTTCGGCTTATACCCCAGAACCGATAGA
ATAACATGGTTAAAATGATCACGAGGATGAACCCTGGAAACAAAACCAATCTTCATCATA
TCCGCATTAGCCAACAGAGCCTGTGCGGTCCACTTAGCTAACTTATTACCATTGTTCTTC
AACTCATTAGCTAAAACCGCACCTCTCTGAGTCTCCAGCTTCTGTCTCC

QA 7 655 7 655
DS 

RD RR4DV02JQ 647 0 0
GCAAAAGCTCTCAATAGTTTATTCAAACAACAAGACTCAAAAGGTGCAACAATCTTCTAC
AAGATAAAAGCATAAGCCAGCAAAATTAACTGTAGCATAACTTTGGAACATTAAAAAAAA
GGTAAAAACTCAAAACAAGTCTTTGACATTTTACCATAATCAGGCCTGACCTTCGGGTTT
CTTATCCTCTGCAGTTTCATTAGTCTCTGCTCCTCCTCCTTCAGTGTTGTTCTCCTCAGG
TGGCTGAACCTGTTCATCCTCAGGTAGAGGCTCTTCCACATAATCATTCTCAAAAGCATC
AGCCGGAACCTCGTAAATCCTAACTTGAGGCTTGGACGGATCCTTCACTAGAACATACTT
CCCTTCACTCAGCTTCATACACAGATCAACAATGGACTTGACAATTCCCCACATGTTGGA
AGTGTTCAGATTAATCTGCCCAGCGAAATCCTTCGGCTTATACCCCAGAACCGATAGAAT
AACATGGTTAAAATGATCACGAGGATGAACCCTGGAAACAAAACCAATCTTCATCATATC
CGCATTAGCCAACAGAGCCTGTGCGGTCCACTTAGCTAACTTATTACCATTGTTCTTCAA
CTCATTAGCTAAAACCGCACCTCTCTGAGTCTCCAGCTTCTGTCTCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CV15JQ 766 0 0
GCGTATCTCTAACATATTTAATTGAAAGTAAATTTATAATTACACCTTTCTAATTATTGC
AAAAGCTCTCAATAGTTTATTCAAACAACAAGACTCAAAAGGTGCAACAATCTTCTACAA
GATAAAAGCATAAGCCAGCAAAATTAACTGTAGCATAACTTTGGAACATTAAAAAAAAGG
TAAAAACTCAAAACAAGTCTTTGACATTTTACCATAATCAGGCCTGACCTTCGGGTTTCT
TATCCTCTGCAGTTTCATTAGTCTCTGCTCCTCCTCCTTCAGTGTTGTTCTCCTCAGGTG
GCTGAACCTGTTCATCCTCAGGTAGAGGCTCTTCCACATAATCATTCTCAAAAGCATCAG
CCGGAACCTCGTAAATCCTAACTTGAGGCTTGGACGGATCCTTCACTAAAACATACTTCC
CTTCACTCAGCTACATACACAGATCAACAATGGACTTGACAATTCCCCACATGTTGGAAG
TGTTCAGATTAATCTGCCCAGCGAAATCCTTCGGCTTATACCCCAGAACCGATAGAATAA
CATGGTTAAAATGATCACGAGGATGAACCCTGGAAACAAAACCAATCTTCATCATATCCG
CATTAGCCAACAGAGCCTGTGCGGTCCACTTAGCTAACTTATTACCATTGTTCTTCAACT
CATTAGCTAAAACCGCACCTCTCTGAGTCTCCAGCTTCTGTCTCCAATCAACACCAGAGT
ACTTAGGATCAAACTCGTTGAGAGCGTTCAAAGTGAGGAACGATTT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL4546Contig1 1134 2 4 U
GGGATCACATATCATCTCTCTCCTTACTACTCGCCACAACAAACCTGATCTCTCTCTTTG
GAAAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTCTCTCTGTTCTTTGTTCTCA
TCTAGATTCATAAGAATAGAATAAGTCATGATGATGAGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGC
CTAAGCTTAGGACTTTCACAAGATCACACACCTCTTCAGCTGCGTCAGAATCCTAACTCG
TCCATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCATGGAACCAAACATTCGCTTCTTCATCAGAT
CTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAACAACGGTGGATTGCGAGGAGGAGGCAGGA
GTGTCGTCTCCCAACAGTACGATCTCGAGCACCATAAGCGGCGGGAAGAGGAGTGAGAGA
GAAGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCACTCCGGATAGAGGTTACTCGCGTGGAACC
TCCGACGAAGAAGAAGACGGCGATGAAACGTCGAGGAAGAAGCTCCGATTATCTAAAGAT
CAGTCTGCTTTTCTTGAAGACACTTTCAAAGAACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAG
CTAGCTTTGGCCAAGAAGTTGAGCTTGACAGCAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAAC
AGAAGAGCTAGAACCAAATTAAAGCAAACGGAGGTGGATTGTGAATACTTGAAACGATGC
GTAGAGAAACTAACGGAGGAGAATAGGCGACTTCAGAAAGAGGCTATGGAGCTTCGAACG
CTCAAGCTGTCTCCACAGTTCTATGGCCAAATGACTCCACCGACTACACTCATCATGTGT
CCTTCGTGTGAGCGTGTGGCTGGGCCATCACCAAACCATCAACACAATCAGCGACCCGTT
CCAATTAACCCGTGGGTTGCTTGTGCTGGTCAAGTGGCTCATGGGCTGAATTTTGAAGCC
TTGCGTCCACGATCGTGAGAGGAAGGGTGTTTTGTTAATTTTGGTTGCTGTGTTGGTTTG
GTGTTTAAGTTGGCTGTGTGGGGCAATATTGGATGATTGGCCTTGTTAAGTTTAAGTGCT
ATATGTATGATGTAACCCTCATGTAATATAAAATTAGCAAAAATTAGTTACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BQ85TF U 1
AF RR4BQ85JQ C 399
BS 1 658 RR4BQ85TF
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GAAAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTCTCTCTGTTCTTTGTTCTCA
TCTAGATTCATAAGAATAGAATAAGTCATGATGATGAGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGC
CTAAGCTTAGGACTTTCACAAGATCACACACCTCTTCAGCTGCGTCAGAATCCTAACTCG
TCCATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCATGGAACCAAACATTCGCTTCTTCATCAGAT
CTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAACAACGGTGGATTGCGAGGAGGAGGCAGGA
GTGTCGTCTCCCAACAGTACGATCTCGAGCACCATAAGCGGCGGGAAGAGGAGTGAGAGA
GAAGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCACTCCGGATAGAGGTTACTCGCGTGGAACC
TCCGACGAAGAAGAAGACGGCGATGAAACGTCGAGGAAGAAGCTCCGATTATCTAAAGAT
CAGTCTGCTTTTCTTGAAGACACTTTCAAAGAACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAG
CTAGCTTTGGCCAAGAAGTTGAGCTTGACAGCAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGA*C
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TGGATTG

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DS 

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GAAGCTCCGATTATCTAAAGATCAGTCTGCTTTTCTTGAAGACACTTTCAAAGAACACAA
CACTCTCAATCCCAAACAGAAGCTAGCTTTGGCCAAGAAGTTGAGCTTGACAGCAAGACA
AGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACCAAATTAAAGCAAACGGAGGTGGA
TTGTGAATACTTGAAACGATGCGTAGAGAAACTAACGGAGGAGAATAGGCGACTTCAGAA
AGAGGCTATGGAGCTTCGAACGCTCAAGCTGTCTCCACAGTTCTATGGCCAAATGACTCC
ACCGACTACACTCATCATGTGTCCTTCGTGTGAGCGTGTGGCTGGGCCATCACCAAACCA
TCAACACAATCAGCGACCCGTTCCAATTAACCCGTGGGTTGCTTGTGCTGGTCAAGTGGC
TCATGGGCTGAATTTTGAAGCCTTGCGTCCACGATCGTGAGAGGAAGGGTGTTTTGTTAA
TTTTGGTTGCTGTGTTGGTTTGGTGTTTAAGTTGGCTGTGTGGGGCAATATTGGATGATT
GGCCTTGTTAAGTTTAAGTGCTATATGTATGATGTAACCCTCATGTAATATAAAATTAGC
AAAAATTAGTTACAGT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL4547Contig1 1005 3 8 U
GGGCAGATTCTTAGTTTAATCAGAGAGAGATGAGCTTTCAGGATTTGGAAGCGGGGAGGA
AATTAATAAAGGGGAACAAGGATGGAGGAGGAACAGAAGCGGTGGCGTCTGGTATCTTTC
AGATAAACACGGCCGTTTCTAACTTCCAGCGCCTTGTTAATACTCTCGGTACTCCTAAGG
ATACCCCCGAGCTCCGTCACAAGCTGCACAAGACAAGGTTACATATTGGGCAGTTAGTAA
AGGACACTTCGGCCAAACTTAAAGAAGCTAGCGAGACCGATCATCATCGAGATGTTGCTC
AAAGTAAGAAGATTGCGGATGCTAAGCTTGCAAAGGACTTCGAAGCAGTTCTTAAAGAGT
TTCAGAAGGCACAGCGAGTTGCAGCTGAAAGGGAGACTTCCTACACTCCTTTCGATCCAA
AAGGTGACTTTTCTTCAAGTGAAGTAGACATTGGCTATGATAGATCACAAGAGCAGCGTG
TCCTCATGGAATCCAGAAGGCAAGAAGTTGTGTTGCTTGAAAACGAAATATCCTTCAACG
AAGCAGTGATAGAGGAAAGAGAACAGGGGATACTGGAAGTTCAGCAGCAAATCGGTGAAG
TAAACGAGATTTTCAAAGATCTCGCGGTGTTGGTTCACGACCAAAGAGCCATGATAGATG
ATATTGGTAGCCATGTCGAGAATGCACATTCCTCAACAGCTCAGGAAAGGTCTCATCTCG
TGAAAGCCTCCAGGACACAAAGATCAAACTCGTCTCTGATGTGCTTATTAATGGTGATAT
TTGGTATCGTTCTACTCATTGTTGTCATAGTACTCGCAGCTTGAGATCGCCTGAAACACA
CACACAATCTTGGTTAAACATTCGAGAGAAGTCTGGTTTTGGGACAGAGAATTCTTGAGT
GTTTGAACTTGCCTCTGTATATTCCCTCTACTCCCTTGTCTTTCAATCACTTGTAAAACG
AGTCAGTTTGTGTAGCTATAACAATGGTGTTTAATTGTTTTTGCC


BQ
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AF RR4CP40TF U 66
AF RR4F279TF U 1
AF RR4F279JQ C 416
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BS 236 236 RR4CP40TF
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AAGAAGATT
TGC

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DS 

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ATACCCCCGAGCTCCGTCACAAGCTGCACAAGACAAGGTTACATATTGGGCAGTTGGTAA
AGGACACTTCGGCCAAACTTAAAGAAGCTAGCGAGACCGATCATCATCGAGATGTTGCTC
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AAGCAGTGATAGAGGAAAGAGAACAGGGGATACTGGAAGTTCAGCAGCAAATCGGTGAAG
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ATATTGGTAGCCATGTCGAGAATGCACATTCCTCAACAGCTCAGGAA**GTCTCATCTCG
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QA 1 761 1 761
DS 

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GCGTGTCCTCATGGAATCCAGAAGGCAAGAAGTTGTGTTGCTTGAAAACGAAATATCCTT
CAACGAAGCAGTGATAGAGGAAAGAGAACAGGGGATACTGGAAGTTCAGCAGCAAATCGG
TGAAGTAAACGAGATTTTCAAAGATCTCGCGGTGTTGGTTCACGACCAAGGAGCCATGAT
AGATGATATTGGTAGCCATGTCGAGAATGCACATTCCTCAACAGCTCAGGGAAGGTCTCA
TTTCGTGAAAGCCTCCAGGACACAAAGATCAAACTCGTTTCTGATGTGCTTATTAATGGT
GATATTTGGTATCGTTCTACTCATTGTTGTCATAGTACTCGCAGCTTGAGATCGCCTGAA
ACACACACACAATCTTGGTTAAACATTCGAGAGAAGTCTGGTTTTGGGACAGAGAATTCT
TGAGTGTTTGAACTTGCCTCTGTATATTCCCTCTACTCCCTTGTCTTTCAATCACTTGTA
AAACGAGTCAGTTTGTGTAGCTATAACAATGGTGTTTAATTGTTTTTGCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

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GTGGAGTGTGGTGATGGCCGCCCTTTCGGAGCGGTTATTGTTCACAAGATCGAAGTCCTT
GTGAGCTGCCATAATATGGTTTTGAGATACAAAGACCCGACAGCACATGCTGAAACCGTA
GCTATTAGAGAGGCATGTAAGAAACTGAACAGCGCCAAGCTGTCGGAATACGAGATGTAC
GCATCATGCGAGCCTTGTCCGATGTGTTTTGGAGCTATCCACCTTGCAAGACTTAAGAGA
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AATGGTGTGAAAGGCACTGAGCTCTTCCATAAGTCTAATCTAGAGATCGTAAAACTGGAT
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ATAAATAAATGCATTTGTTGTATCAAGTACGCGTTGTATCTCCATTCTGTAAGTGTGTGT
TCGTATGTATGTACCATCTTTTTTAGCGTCTTCTAAGACGCAGAC*AATCTATCAATCTA
TGATCTATCACAGATCGCCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H792TF U 1
AF RR4ET46JQ C 12
AF RR4ET46TF U 12
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BS 74 79 RR4ET46TF
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BS 131 131 RR4ET46TF
BS 132 229 RR4H792TF
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BS 479 630 RR4H792TF
BS 631 631 RR4ET46TF
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BS 707 707 RR4ET46TF
BS 708 729 RR4H792TF
BS 730 747 RR4ET46TF

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TGATCTATC
GC

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DS 

RD RR4ET46JQ 729 0 0
G
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CCTTGTCCGATGTGTTTTGGAGCTATCCACCTTGCAAGACTTAAGAGATTGGTGTATGGG
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GA
ATCGCC

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DS 

RD RR4ET46TF 736 0 0
G
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TCTGTACCTTCCGTTACAGATCCAGGTCATGCCACCGTCGAACTCGCTGCTTCAAATGGT
AGGGATCATAAGTATTTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCATACATTGGAGTGGAGTGTGGT
GATGGCCGCCCTTTCGGAGCGGTTATTGTTCACAAGATCGAAGTCCTTGTGAGCTGCCAT
AATATGGTTTTGAGATACAAAGACCCGACAGCACATGCTGAAACCGTAGCTATTAGAGAG
GCATGTAAGAAACTGAACAGCGCCAAGCTGTCGGAATACGAGATGTACGCATCATGCGAG
CCTTGTCCGATGTGTTTTGGAGCTATCCACCTTGCAAGACTTAAGAGATTGGTGTATGGG
GCGCAAGCAGAAGCAGCTGTAGCCGTCGGGTTCAATAGCTGCGTATCCAATGGTGTGAAA
GGCACTGAGCTCTTCCATAAGTCTAATCTAGAGATCGTAAAACTGGATGTGAGTATCGCT
GAGCAAGTGTTCCAGAATACAAAGGGGAAGTTCAGTTTATAGTAATAAATAAATAAATGC
ATTTGTTGTATCAAGTACGCGTTGTATCTCCATTCTGTAAGTGTGTGTTCGTATGTATGT
ACCATCTTTTTTAGCGTCTTCTA*GACGCAGAC*AATCTATCAATCTATGATCTATCACA
GATCGCCAAAAAAAA

QA 2 736 2 736
DS 



AS 1 3

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GACCTCAGGTCAAATCATGGTCCAACAGCGGATACAGGGTAAAATGTATATTGCCTAATT
GAAACACATGTAACTAGCAAATATAATGGTTCTGTGACAGTGAAGCTTTTCTATTGAATT
AATCGATACATTAAAGTGGATTTAGACATCTGAGGCTCTCTTTCCAGGACAGCAACCACA
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AATCTTCGACCACCAGGTCCAGAAAACCGACGTCCACCATCTTGTCTCTCCTTGGAGCTT
CTTCCTCCACCTGAAGTAGTTTTCTGATTCCCGTCTTTTCCAGTTTCAAATACAGACTTC
TGACGAGCTTCTGCCATTAATTGCCATTTCAAAAACGTGTCATCTCCTCCAACAGCAGCA
CGAGCAGCAACGTTTGCTGCTGTCGTTCTCATTTTGTCGTCGTCCTCTTTATTTCCCTTC
AAGCCCTTTGAACGGTTGTCTTCTTTCTCCTTCTCACTATCCACTCCACCATCACCTTCT
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TTCACCTTCTGGTTCATTTCGTTGATTTGTAGCCGAATATCTGACGTGATAAAGGTCCGG
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TTTAGCCCAACTTTCGCCATAATTTCTGCCAGCTTTTTCTGCAGTGGACTTTTCTGCAAA
ATTAATCTTTCTTCCTCTTCGTGCACAACTCTACGAGATGCTTCAGAAACACGACTATCC
TCCTTGCCACCAGAAAATAATTGTTCTTCCTCTTCCCTAAGATTGACACCACTGACTGCA
GTGACATCATTGAGCTGTTCAATACTTTGATCCACAGAATTCGGTACCACTTTTGCTTCT
TGCTTGGTGGTGGCGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA42JQ U 1
AF RR4FI85JQ U 8
AF RR4FI85TF C 445
BS 1 357 RR4EA42JQ
BS 358 358 RR4FI85JQ
BS 359 408 RR4EA42JQ
BS 409 409 RR4FI85JQ
BS 410 578 RR4EA42JQ
BS 579 633 RR4FI85JQ
BS 634 1098 RR4FI85TF

RD RR4EA42JQ 578 0 0
CGACAAAAAAAATAATAGTAACCAGCACTAGAAAGTTGGTCGATCTTACGGTCTTGACAT
GACCTCAGGTCAAATCATGGTCCAACAGCGGATACAGGGTAAAATGTATATTGCCTAATT
GAAACACATGTAACTAGCAAATATAATGGTTCTGTGACAGTGAAGCTTTTCTATTGAATT
AATCGATACATTAAAGTGGATTTAGACATCTGAGGCTCTCTTTCCAGGACAGCAACCACA
TCCTTCGCCGATATTGTCCTCACCACTTTTGGTTGAAGCGATGGAGCTTGGTTCTTCCCT
AATCTTCGACCACCAGGTCCAGAAAACCGACGTCCACCATCTTGTCTCTCCTTGGAGTTT
CTTCCTCCACCTGAAGTAGTTTTCTGATTCCCGTCTTTTCCAGTTTCAGATACAGACTTC
TGACGAGCTTCTGCCATTAATTGCCATTTCAAAAACGTGTCATCTCCTCCAACAGCAGCA
CGAGCAGCAACGTTTGCTGCTGTCGTTCTCATTTTGTCGTCGTCCTCTTTATTTCCCTTC
AAGCCCTTTGAACGGTTGTCTTCTTTCTCCTTCTCACT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4FI85JQ 626 0 0
AAAAATAATAGTAACCAGCACTAGAAAGTTGGTCGATCTTACGGTCTTGACATGACCTCA
GGTCAAATCATGGTCCAACAGCGGATACAGGGTAAAATGTATATTGCCTAATTGAAACAC
ATGTAACTAGCAAATATAATGGTTCTGTGACAGTGAAGCTTTTCTATTGAATTAATCGAT
ACATTAAAGTGGATTTAGACATCTGAGGCTCTCTTTCCAGGACAGCAACCACATCCTTCG
CCGATATTGTCCTCACCACTTTTGGTTGAAGCGATGGAGCTTGGTTCTTCCCTAATCTTC
GACCACCAGGTCCAGAAAACCGACGTCCACC*TCTTGTCTCTCCTTGGAGCTTCTTCCTC
CACCTGAAGTAGTTTTCTGATTCCCGTCTTTTCCAGTTTCAAATACAGACTTCTGACGAG
CTTCTGCCATTAATTGCCATTTCAAAAACGTGTCATCTCCTCCAACAGCAGCACGAGCAG
CAACGTTTGCTGCTGTCGTTCTCATTTTGTCGTCGTCCTCTTTATTTCCCTTCAAGCCCT
TTGAACGGTTGTCTTCTTTCTCCTTCTCACTATCCACTCCACCATCACCTTCTTCACTCT
CGCTTGGTTTCTTAAGTTTTTCTGCT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4FI85TF 654 0 0
CATTTCAAAAACGTGTCATCTCCTCCAACAGCAGCACGAGCAGCAACGTTTGCTGCTGTC
GTTCTCATTTTGTCGTCGTCCTCTTTATTTCCCTTCAAGCCCTTTGAACGGTTGTCTTCT
TTCTCCTTCTCACTATCCACTCCACCATCACCTTCTTCACTCTCGCTTGGTTTCTTAAGT
TTTTCTGCTTCAGCCTGTTTCTTTTCCCATTCCTCTTTCACCTTCTGGTTCATTTCGTTG
ATTTGTAGCCGAATATCTGACGTGATAAAGGTCCGGTGTCTAGATTTCTCAGTATCAACC
CGCTGCTTTGACAACCGAATGATATGAGATAATAGTCCTCGGATCCTTTCCTCTACACAC
AAAGACAAGCACCGTTCAACATCAACGCCTATCTGCTTTAGCCCAACTTTCGCCATAATT
TCTGCCAGCTTTTTCTGCAGTGGACTTTTCTGCAAAATTAATCTTTCTTCCTCTTCGTGC
ACAACTCTACGAGATGCTTCAGAAACACGACTATCCTCCTTGCCACCAGAAAATAATTGT
TCTTCCTCTTCCCTAAGATTGACACCACTGACTGCAGTGACATCATTGAGCTGTTCAATA
CTTTGATCCACAGAATTCGGTACCACTTTTGCTTCTTGCTTGGTGGTGGCGGTC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 3

CO CL4550Contig1 694 3 8 U
GGTGTTTATTATGTTTCTTTCCAAATCAAATCATACACTTCTTCCAATGAGGCATTGGTA
AAATAGTAAGCTTCTCCATTTGAGGGGGAGGCTTTTTTCTAAGGTTATGTATACAAAGAA
GAATCAAGAAGATATAAATCATCTGAACACCAAGTTGTGGCAGCTCTTGTCACATGGATA
AGGGCAATCAACTAACTTCACTTCTGCTCTATCAAAATACCAATCTCCACGGCTATTGCC
ACCGCCTTTTTCCTGATGACAGGAGAATCATCAGCGAACCAAGTATCTTGCCTCTCGGTT
TGGCAGTGAGCAAAGCAGGAGTTTATGAACAAACCGTTATGCCTAGACATTGAGAAGCCC
CTCACTACTCTCAGCATCTGATCCCTGAATCCTTGCAAGAACCTTATTTGTGAAGGTGTG
CATTTTGCATGGTTTAGTGTACATTCATGCCAAAAGCCACTAGGGTCAGCTGATCTTGGA
GCTATGCTGCTTTGAATCTGCCATGAATCATATGCTGCATTGACAATAAAAAGTGGTGTC
TTAATCTGACTGATGAGATTCTGTGGGAAGAAACACGAGGTTGGATCGAGATGGTTTGTG
CACATACGTGGCAGGTTGTTCTTCACACTCTGAAATTGTACTACACCATTGTATAAGTTC
CTGATTGTGCGGCCACCAGCAACATCAGCTGTGT


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C428JQ U 1
AF RR4FE44JQ U 1
AF RR4FE44TF C 1
BS 1 4 RR4C428JQ
BS 5 5 RR4FE44JQ
BS 6 120 RR4C428JQ
BS 121 121 RR4FE44JQ
BS 122 290 RR4C428JQ
BS 291 291 RR4FE44JQ
BS 292 685 RR4C428JQ
BS 686 694 RR4FE44TF

RD RR4C428JQ 685 0 0
GGTGGTTATTATGTTTCTTTCCAAATCAAATCATACACTTCTTCCAATGAGGCATTGGTA
AAATAGTAAGCTTCTCCATTTGAGGGGGAGGCTTTTTTCTAAGGTTATGTATACAAAGAA
AAATCAAGAAGATATAAATCATCTGAACACCAAGTTGTGGCAGCTCTTGTCACATGGATA
AGGGCAATCAACTAACTTCACTTCTGCTCTATCAAAATACCAATCTCCACGGCTATTGCC
ACCGCCTTTTTCCTGATGACAGGAGAATCATCAGCGAACCAAGTATCTTGACTCTCGGTT
TGGCAGTGAGCAAAGCAGGAGTTTATGAACAAACCGTTATGCCTAGACATTGAGAAGCCC
CTCACTACTCTCAGCATCTGATCCCTGAATCCTTGCAAGAACCTTATTTGTGAAGGTGTG
CATTTTGCATGGTTTAGTGTACATTCATGCCAAAAGCCACTAGGGTCAGCTGATCTTGGA
GCTATGCTGCTTTGAATCTGCCATGAATCATATGCTGCATTGACAATAAAAAGTGGTGTC
TTAATCTGACTGATGAGATTCTGTGGGAAGAAACACGAGGTTGGATCGAGATGGTTTGTG
CACATACGTGGCAGGTTGTTCTTCACACTCTGAAATTGTACTACACCATTGTATAAGTTC
CTGATTGTGCGGCCACCAGCAACAT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FE44JQ 676 0 0
GGTGTTTATTATGTTTCTTTCCAAATCAAATCATACACTTCTTCCAATGAGGCATTGGTA
AAATAGTAAGCTTCTCCATTTGAGGGGGAGGCTTTTTTCTAAGGTTATGTATACAAAGAA
GAATCAAGAAGATATAAATCATCTGAACACCAAGTTGTGGCAGCTCTTGTCACATGGATA
AGGGCAATCAACTAACTTCACTTCTGCTCTATCAAAATACCAATCTCCACGGCTATTGCC
ACCGCCTTTTTCCTGATGACAGGAGAATCATCAGCGAACCAAGTATCTTGCCTCTCGGTT
TGGCAGTGAGCAAAGCAGGAGTTTATGAACAAACCGTTATGCCTAGACATTGAGAAGCCC
CTCACTACTCTCAGCATCTGATCCCTGAATCCTTGCAAGAACCTTATTTGTGAAGGTGTG
CATTTTGCATGGTTTAGTGTACATTCATGCCAAAAGCCACTAGGGTCAGCTGATCTTGGA
GCTATGCTGCTTTGAATCTGCCATGAATCATATGCTGCATTGACAATAAAAAGTGGTGTC
TTAATCTGACTGATGAGATTCTGTGGGAAGAAACACGAGGTTGGATCGAGATGGTTTGTG
CACATACGTGGCAG*TTGTTCTTCACACTCTGAAATTGTACTACACCATTGTATAAGTTC
CTGATTGTGCGGCCAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FE44TF 694 0 0
GGTGTTTATTATGTTTCTTTCCAAATCAAATCATACACTTCTTCCAATGAGGCATTGGTA
AAATAGTAAGCTTCTCCATTTGAGGGGGAGGCTTTTTTCTAAGGTTATGTATACAAAGAA
GAATCAAGAAGATATAAATCATCTGAACACCAAGTTGTGGCAGCTCTTGTCACATGGATA
AGGGCAATCAACTAACTTCACTTCTGCTCTATCAAAATACCAATCTCCACGGCTATTGCC
ACCGCCTTTTTCCTGATGACAGGAGAATCATCAGCGAACCAAGTATCTTGCCTCTCGGTT
TGGCAGTGAGCAAAGCAGGAGTTTATGAACAAACCGTTATGCCTAGACATTGAGAAGCCC
CTCACTACTCTCAGCATCTGATCCCTGAATCCTTGCAAGAACCTTATTTGTGAAGGTGTG
CATTTTGCATGGTTTAGTGTACATTCATGCCAAAAGCCACTAGGGTCAGCTGATCTTGGA
GCTATGCTGCTTTGAATCTGCCATGAATCATATGCTGCATTGACAATAAAAAGTGGTGTC
TTAATCTGACTGATGAGATTCTGTGGGAAGAAACACGAGGTTGGATCGAGATGGTTTGTG
CACATACGTGGCAGGTTGTTCTTCACACTCTGAAATTGTACTACACCATTGTATAAGTTC
CTGATTGTGCGGCCACCAGCAACATCAGCTGTGT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 3

CO CL4551Contig1 815 3 10 U
GGACACTCATCAGCTCTGTTTCTAAATCTTCCTTCACACTAATCGCCATCGTTGCTGCAC
ACTTCCACTCTGATTCGCTCGATTGAGCTTTCTTTTTTGTTGTTATGGCGCGTCGGTCTG
GAGACTGCATGAGATGTCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGCGGAC
CTGCTCTTTATTGGAAATTCAACAAGGGTTTCGTTGGATCCACTCATAAGAGCTCTGTTT
GTCCTCCTTGCGTCTG**ATTGCCCGCCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGC
TTGCGAATCTCACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTTAAACAAGAAATGG
AGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAGCTTAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATG
AGCATAGCCGTCATATGAATGTTACCCTCGCAGAAGCTAAGAGAGTCGCGTCTCAGTACC
AAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAGTCAGCTAGGGAGAGAG
CTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAACTCGGC
AATCAGGGTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCTCAAGTGTTTTTGTCTACGAAACCG
AATTTTCGCAACTTGAAGGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTTTCTCCATATATGTAGTCTT
TTGGTTTTGCCTTTGGATCTGAATGTAGCTAAAAGAATGGCTTATAGCCTTGTATTGACT
TCTATTCAAATATACAATTGTCCATTTCGCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F916TF U 10
AF RR4FH31TF U 1
AF RR4FH31JQ C 186
BS 1 677 RR4FH31TF
BS 678 678 RR4F916TF
BS 679 721 RR4FH31TF
BS 722 723 RR4FH31JQ
BS 724 742 RR4FH31TF
BS 743 743 RR4FH31JQ
BS 744 754 RR4FH31TF
BS 755 755 RR4FH31JQ
BS 756 789 RR4FH31TF
BS 790 815 RR4FH31JQ

RD RR4F916TF 714 0 0
G
CAGCTCTGTTTCTAAATCTTCCTTCACACTAATCGCCATCGTTGCTGCACACTTCCACTC
TGATTCGCTCGATTGAGCTTTCTTTTTTGTTGTTATGGCGCGTCGGTCTGGAGACTGCAT
GAGATGTCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGCGGACCTGCTCTTTA
TTGGAAATTCAACAAGGGTTTCGTTGGATCCACTCATAAGAGCTCTGTTTGTCCTCCTTG
CGTCTGTGATTGCCCGCCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCGAATCT
CACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTTAAACAAGAAATGGAGAAGCAGTT
TGTGGACCTTCTGACCGAGGAGCTTAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATGAGCATAGCCG
TCATATGAATGTTACCCTCGCAGAAACTAAGAGAGTCGCGTCTCAGTACCAAAAGGAAGC
TGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAGTCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTT
GTTGATCAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCAATCAGGGTG
GGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCTCAAGTGTTTTTGTCTACGAAACCGA*TTTTCGCA
ACTTGAAGGAAA*GTCCTTATCTTCCACGTTTCTC*ATATATGTAGTCTTT
GT

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR4FH31TF 789 0 0
GGACACTCATCAGCTCTGTTTCTAAATCTTCCTTCACACTAATCGCCATCGTTGCTGCAC
ACTTCCACTCTGATTCGCTCGATTGAGCTTTCTTTTTTGTTGTTATGGCGCGTCGGTCTG
GAGACTGCATGAGATGTCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGCGGAC
CTGCTCTTTATTGGAAATTCAACAAGGGTTTCGTTGGATCCACTCATAAGAGCTCTGTTT
GTCCTCCTTGCGTCTG**ATTGCCCGCCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGC
TTGCGAATCTCACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTTAAACAAGAAATGG
AGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAGCTTAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATG
AGCATAGCCGTCATATGAATGTTACCCTCGCAGAAGCTAAGAGAGTCGCGTCTCAGTACC
AAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAGTCAGCTAGGGAGAGAG
CTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAACTCGGC
AATCAGGGTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCTCAAGTGTTTTTGTCTACGAAACCG
AATTTTCGCAACTTGAAAGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTTTCTCCATATATGTAGTCTT
T**GTTTTGCCTTTGGATCTGA*TGTAGCTAAAA*AATGGCTTATAGCCTTGTATTGACT
TCTATTCAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4FH31JQ 630 0 0
CTTTATTGGAAATTCAACAAGGGTTTCGTTGGATCCACTCATAAGAGCTCTGTTTGTCCT
CCTTGCGTCTG**ATTGCCCGCCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCG
AATCTCACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTTAAACAAGAAATGGAGAAG
CAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAGCTTAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATGAGCAT
AGCCGTCATATGAATGTTACCCTCGCAGAAGCTAAGAGAGTCGCGTCTCAGTACCAAAAG
GAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAGTCAGCTAGGGAGAGAGCTGAA
GCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAACTCGGCAATCA
GGGTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCTCAAGTGTTTTTGTCTACGAAACCGAATTT
TCGCAACTTGAAGGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTTTCTCCATATATGTAGTCTTTTGTT
TTTGCCTTTGGATCTGAATGTAGCTAAAAGAATGGCTTATAGCCTTGTATTGACTTCTAT
TCAAATATACAATTGTCCATTTCGCTATCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 3

CO CL4552Contig1 678 3 1 U
CTGAAATGGCACTTTGGTTCCATTAGCTCCAAGTGGAGTAGCCCCTTAGCCAGGGATGAT
ATTTAAACGATGCCAAACGTTTCAAAAATGGCATCATCTATGGGAACTGATGCAAAATCT
AATAATGGTAATTCTCACAGACTGATGCCATGCACTTTCTTGTCGTGATTCAGCAGTCTT
GGCCGCCTGATCCGTGCTTAAAACGGGTTGTCCATCTTCTCGACAATGCTTTGTAGTCCC
GACTTGTACGAAGGATGGAGCAATCTGACTTCTAGTCTATCCTTCATATGTTGGTTACTA
ACTCGTTTTTCGCCTCTCAGTGAACTCTGCTCCCGAGACTCATACAGAAATGGTTTCGTT
TCGATCTTCCTTTTCCAACGTTTTTCAATCAACTCCAAGGCGTACTGGAACACCTCTTCT
CTCGGTGCTGGATCATCATCGACGATGTTGTAGATCTCTCTCGATGATGGGTTTTCAATG
GAAGCTAGAAGAGCTTGGCATATATCTTGAACATGGACTCTGGAGGTGAATCTACGGGAC
GCTCTTCTCAGTTGAGTTTCAGACAAATGCTCCCGCTTTAACAAAGTGTCAATCGCACTG
CGACCAGGTCCATAGATACCACCAAGTCGAAGGACTTGAGTAGAAAGACCAAGATCACTC
CCCAAGCTCAACCATCCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR4A041JQD U 1
AF RR4A041TFB C 1
AF RR4A041JQ U 4
BS 1 678 RR4A041JQD

RD RR4A041JQD 678 0 0
CTGAAATGGCACTTTGGTTCCATTAGCTCCAAGTGGAGTAGCCCCTTAGCCAGGGATGAT
ATTTAAACGATGCCAAACGTTTCAAAAATGGCATCATCTATGGGAACTGATGCAAAATCT
AATAATGGTAATTCTCACAGACTGATGCCATGCACTTTCTTGTCGTGATTCAGCAGTCTT
GGCCGCCTGATCCGTGCTTAAAACGGGTTGTCCATCTTCTCGACAATGCTTTGTAGTCCC
GACTTGTACGAAGGATGGAGCAATCTGACTTCTAGTCTATCCTTCATATGTTGGTTACTA
ACTCGTTTTTCGCCTCTCAGTGAACTCTGCTCCCGAGACTCATACAGAAATGGTTTCGTT
TCGATCTTCCTTTTCCAACGTTTTTCAATCAACTCCAAGGCGTACTGGAACACCTCTTCT
CTCGGTGCTGGATCATCATCGACGATGTTGTAGATCTCTCTCGATGATGGGTTTTCAATG
GAAGCTAGAAGAGCTTGGCATATATCTTGAACATGGACTCTGGAGGTGAATCTACGGGAC
GCTCTTCTCAGTTGAGTTTCAGACAAATGCTCCCGCTTTAACAAAGTGTCAATCGCACTG
CGACCAGGTCCATAGATACCACCAAGTCGAAGGACTTGAGTAGAAAGACCAAGATCACTC
CCCAAGCTCAACCATCCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4A041TFB 678 0 0
CTG
AAATGGCACTTTGGTTCCATTAGCTCCAAGTGGAGTAGCCCCTTAGCCAGGGATGATATT
TAAACGATGCCAAACGTTTCAGAAATGGCATCATCTATGGGAACTGATGCAAAATCTAAT
AATGGTAATTCTCACAGACTGATGCCATGCACTTTCTTGTCGTGATTCAGCAGTCTTGGC
CGCCTGATCCGTGCTTAAAACGGGTTGTCCATCTTCTCGACAATGCTTTGTAGTCCCGAC
TTGTACGAAGGATGGAGCAATCTGACTTCTAGTCTATCCTTCATATGTTGGTTACTAACT
CGTTTTTCGCCTCTCAGTGAACTCTGCTCCCGAGACTCATACAGAAATGGTTTCGTTTCG
ATCTTCCTTTTCCAACGTTTTTCAATCAACTCCAAGGCGTACTGGAACACCTCTTCTCTC
GGTGCTGGATCATCATCGACGATGTTGTAGATCTCTCTCGATGATGGGTTTTCAATGGAA
GCTAGAAGAGCTTGGCATATATCTTGAACATGGACTCTGGAGGTGAATCTACGGGACGCT
CTTCTCAGTTGAGTTTCAGACAAATGCTCCCGCTTTAACAAAGTGTCAATCGCACTGCGA
CCAGGTCCATAGATACCACCAAGTCGAAGGACTTGAGTAGAAAGACCAAGATCACTCCCC
AAGCTCAACCATCCC

QA 4 678 4 678
DS 

RD RR4A041JQ 675 0 0
AAATGGCACTTTGGTTCCATTAGCTCCAAGTGGAGTAGCCCCTTAGCCAGGGATGATATT
TAAACGATGCCAAACGTTTCAAAAATGGCATCATCTATGGGAACTGATGCAAAATCTAAT
AATGGTAATTCTCACAGACTGATGCCATGCACTTTCTTGTCGTGATTCAGCAGTCTTGGC
CGCCTGATCCGTGCTTAAAACGGGTTGTCCATCTTCTCGACAATGCTTTGTAGTCCCGAC
TTGTACGAAGGATGGAGCAATCTGACTTCTAGTCTATCCTTCATATGTTGGTTACTAACT
CGTTTTTCGCCTCTCAGTGAACTCTGCTCCCGAGACTCATACAGAAATGGTTTCGTTTCG
ATCTTCCTTTTCCAACGTTTTTCAATCAACTCCAAGGCGTACTGGAACACCTCTTCTCTC
GGTGCTGGATCATCATCGACGATGTTGTAGATCTCTCTCGATGATGGGTTTTCAATGGAA
GCTAGAAGAGCTTGGCATATATCTTGAACATGGACTCTGGAGGTGAATCTACGGGACGCT
CTTCTCAGTTGAGTTTCAGACAAATGCTCCCGCTTTAACAAAGTGTCAATCGCACTGCGA
CCAGGTCCATAGATACCACCAAGTCGAAGGACTTGAGTAGAAAGACCAAGATCACTCCCC
AAGCTCAACCATCCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 3

CO CL4553Contig1 748 3 11 U
GGCGGTTCTTCTCAGCTATTACTTTTATCTCAAGCAAATGGTAATAAATAATGTAAAGGG
TATCATATGAATAATAAGAGGATTCGAATACAATCTTGACATATCACAACTAAAAAACAT
TGGAAAATGAATAGCCACTCGGTTCTATGCTCTGGACGCCTTTGCTTCAGTGTAAAGTTG
ATCAATTATGCCCTTGTAATGTTTGAGGAGCTGTAGCCTTTTCAACTTGAAAGTTGGAGT
TATAAGATCTCTTTCAATATCGAAAAGGTTTGGCTCCAAATGAACCGCTTTTAACATTTC
AAACCCTTTAAGTTGGTGTTGCTTTGCGGTAGAGTTAAGCTCATCCAAGAAGTATTTTTG
AGCTTTGAGATTTTGACATAAAGATTCAAAATCATTGGGAGATGATTGGTTATTAAGTTT
AGCCCAATCTTCAATAGCCTTTCTCTCGGGTACCACCACTGCTACCAGAAAAGACTCGAA
GCTGTTTCCGTAGATCCATACCTGAGCAATGAGAGGGCATCTTGAGTAAGTGTTCTCGAG
GCTTTCGACAGCAACATATTCACCTTGAGACAACTTGAAGATGTCCTTCTTCCTATCTAT
GATTTTCATCGATCCATCTTCTTGCCATTCCCCAATATCTCCTGTGTGGAACCATCCATT
GATCACGACTTGATCAGTTAGGTCTTGTCTTTTGTGGCAACCAGAGAACATTGAATTTCC
TCTAAGACATATCTCTCCTCTAGCCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GS48JQ U 1
AF RR4C351JQ U 41
AF RR4C351TF C 553
BS 1 214 RR4GS48JQ
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BS 216 380 RR4GS48JQ
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BS 698 698 RR4C351JQ
BS 699 748 RR4GS48JQ

RD RR4GS48JQ 748 0 0
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TATCATATGAATAATAAGAGGATTCGAATACAATCTTGACATATCACAACTAAAAAACAT
TGGAAAATGAATAGCCACTCGGTTCTATGCTCTGGACGCCTTTGCTTCAGTGTAAAGTTG
ATCAATTATGCCCTTGTAATGTTTGAGGAGCTGTGGCCTTTTCAACTTGAAAGTTGGAGT
TATAAGATCTCTTTCAATATCGAAAAGGTTTGGCTCCAAATGAACCGCTTTTAACATTTC
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AGCCCAATCTTCAATAGCCTTTCTCTCGGGTACCACCACTGCTACCAGAAAAGACTCGAA
GCTGTTTCCGTAGATCCATACCTGAGCAATGAGAGGGCATCTTGAGTAAGTGTTCTCGAG
GCTTTCGACAGCAACATATTCACCTTGAGACAACTTGAAGATGTTCTTCTTCCTATCTAT
GATCTTCATCGATCCATCTTCTTGCCATTCCCCAATATCTCCTGTGTGGAACCATCCATT
GATCACGACTTGATCAGTTAGGTCTTGTCTTTTGTGGTAACCAGAGAACATTGAATTTCC
TCTAAGACATATCTCTCCTCTAGCCACA

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DS 

RD RR4C351JQ 707 0 0
GTG
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GCTTCAGTGTAAAGTTGATCAATTATGCCCTTGTAATGTTTGAGGAGCTGTAGCCTTTTC
AACTTGAAAGTTGGAGTTATAAGATCTCTTTCAATATCGAAAAGGTTTGGCTCCAAATGA
ACCGCTTTTAACATTTCAAACCCTTTAAGTTGGTGTTGCTTTGCGGTAGAGTTAAGCTCA
TCCAAGAAGTATTTTTGAGCTTTGAGATTTTGACATAAAGATTCAAAATCATTGGGAGAT
GATTGGTTATTAAGTTTAGCCCAATCTTCAATAGCCTTTCTCTCGGGTACCACCACTGCT
ACCAGAAAAGACTCGAAGCTGTTTCCGTAGGTCCATACCTGAGCAATGAGAGGGCATCTT
GAGTAAGTGTTCTCGAGGCTTTCGACAGCAACATATTCACCTTGAGACAACTTGAAGATG
TCCTTCTTCCTATCTATGATTTTCATCGATCCATCTTCTTGCCATTCCCCAATATCTCCT
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GAGAACATTGAATTTCCTCTAAGACATATCTCTCCTCTAGCC
GC

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DS 

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C
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CCATCTTCTTGCCATTCCCCAATATCTCCTGTGTGGAACCATCCATTGATCACGACTTGA
TCAGTTAGGTCTTGTCTTTTGTGGCAACCAGAGAACATTGAATTTCCTCTAAGACATATC
TCTCCTCTAGCC
GC

QA 2 193 2 193
DS 



AS 1 3

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AACGCCACGTGGTATACTACTGTTCCCACCATTCATCAGATCATATTGGACCGTCACGCG
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GAGATACAAGAGCCAAATAACAAGGGAGAGGTTTGTATTAGAGGCCCAAATGTGACAAAG
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CTTATTAACCGTGGAGGTGAGAAAATATCCCCAATTGAAGTGGATTCAGTACTCTTAACT
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CTCCCCAAAACTGCCTCCGGTAAGATTCAGCGCCGTATCGTGGCCCAGCATTTCCTCGAA
AAACCCTAAATAAAACACTGTACACCATCTTGCTGGAATCCTTCGGTGATGAGTCGTAGC
TTGATACGCAAGTGGTTTTGGTCTCTCTATTTGTTTTTTTTCCCTTTCGGGGTTTGTATG
TTACGTGTCATATGTTATCATATGATTAAAAGTGAACATGTAATAATAAAATTGGAAATA
AAGTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H940TF U 1
AF RR4BA49TF U 342
AF RR4H940JQB C 297
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RD RR4H940TF 677 0 0
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AGCCAGCCTGAGCAGGAGTACCCTAAACTTCGGTTCATCAGGAGTTGCAGTGCTTCTTTG
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ATTAACTGTGCGGTGAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4BA49TF 673 0 0
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AGGCCCAAATGTGACAAAGGGTTACAAGAACAACCCGGAGGCCAACAAGGCGGGTTTCGA
GTTTGGGTGGTTCCACACAGGTGATATTGGTTACTTTGATTCTGATGGGTATTTGCATCT
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AGTGTTCATCACTGATAACCTCCCCAAAACTGCCTCCGGTAAGATTCAGCGCCGTATCGT
GGCCCAGCATTTCCTCGAAAAACCCTAAATAAAACACTGTACACCATCTTGCTGGAATCC
TTCGGTGATGAGTCGTAGCTTGATACGCAAGTGGTTTTGGTCTCTCTATTTGTTTTTTTT
CCCTTTCGGGGTTTGTATGTTACGTGTCATATGTTATCATATGATTAAAAGTGAACATGT
AATAATAAA
TTGG

QA 1 669 1 669
DS 

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AAAGGGTTACAAGAACAACCCGGAGGCCAACAAGGCGGGTTTCGAGTTTGGGTGGTTCTA
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AGAGCTTATTAACCGTGGAGGTGAGAAAATATCCCCAATTGAAGTGGATTCAGTACTCTT
AACTCATCCTGATGTTTCTCAAGGAGTTGCGTTCGGGGTTCCTGATGAGAAATATGGAGA
AGAGATTAACTGTGCGGTGATTCCAAGAGAAGGAACAACAGTGACGGAAGAGGACATAAA
AACGTTCTGTAAGAAGAATTTGGCAGCTTTCAAGGTGCCAAAAAGAGTGTTCATCACTGA
TAACCTCCCCAAAACTGCCTCCGGTAAGATTCAGCGCCGTATCGTGGCCCAGCATTTCCT
CGAAAAACCCTAAATAAAACACTGTACACCATCTTGCTGGAATCCTTCGGTGATGAGTCG
TAGCTTGATACGCAAGTGGTTTTGGTCTCTCTATTTGTTTTTTTTCCCTTTCGGGGTTTG
TATGTTACGTGTCATATGTTATCATATGATTAAAAGTGAACATGTAATAATAAAATTGGA
AATAAAGTTGAT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL4555Contig1 987 3 8 U
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GTATAAGCAATATTTAGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAACTCTCTGTGGG
AAAATATTTTGAGAGAGAAGGGTATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACAA
AGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTGTTTCGTCTTGTAA
GAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGGTCTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAA
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TGGGTTTTCGGGGGAAGATGTGTCTTACAAACATAACTGTGAATCTTTTCCTCATCGGTT
AAAATATTCACTTTCTTGTGGTGTTCTTGATTCTGATGATAACAAATGTACCAGAGAGAA
GGCTTAAACGGTGTTAAGCATAATTGTGAGGAAATGTCTAAATTTAAACTCTAGTTGTGT
AGATCTATGTTGTGTGCTATTGAAAGTTCTAAATCCGAACATTGTGTTTGCTCTTTTTCT
TTATGTAACAGAAACAATTTTTGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ74TF U 1
AF RR4EK30TF U 32
AF RR4FZ74JQ C 397
BS 1 733 RR4FZ74TF
BS 734 734 RR4FZ74JQ
BS 735 750 RR4FZ74TF
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BS 764 779 RR4FZ74TF
BS 780 987 RR4FZ74JQ

RD RR4FZ74TF 788 0 0
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AGACTAACCTAGTTAAGAAATGGAAAACGTTGGAGTTTGTGATGAGTTTGTTAACCTAAA
GGCAACAGAGCTGAGACTGGGATTACCAGGAACAGAAGATGGAGGTGAAGAAGAGAAACA
AAAGGTTCCTTGCGGTAGAAGCAACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATATTGA
ATCTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCTCCTCCAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACC
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AATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCCTATCTGAGGAAGATAGATCTAACGGT
GTATAAGCAATATTTAGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAACTCTCTGTGGG
AAAATATTTTGAGAGAGAAGGGTATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACAA
AGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTGTTTCGTCTTGTAA
GAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGGTCTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAA
GAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTTCTGTTTTCTCTGTTTTGTAAGAGCTTTGAAACTGCT
TGGGTTTTCGGGG*AAGATGTGTCTTACAA*CATAACTGTGA*TCTTTTCCTCATCGGT
AAATATTCA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4EK30TF 697 0 0
G
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CCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATATTGAATCTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCTCCTC
CAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACCTGTAAGATCTTACAGGAAGAACAATATTCAGA
CAAAGAAAAATGAATCTGAAGGTCAAGGAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTC
CCTATCTGAGGAAGATAGATCTAACGGTGTATAAGCAATATTCAGAATTGATGAAATCAC
TTGAAAACATGTTTAAATTCTCTGTGGGAAAATATTTTGAGAGAGAAGGGTATAAAGGCT
CAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTC
CTTGGGAGATGTTTGTTTCGTCTTGTAAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTA
AAGGTCTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTTCTGTTTTC
TCTGTTCTGTAAGAGCTTTGAA*CTGCTTGGGTTT
C

QA 2 696 2 696
DS 

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AAACATGTTTAAACTCTCTGTGGGAAAATATTTTGAGAGAGAAGGGTATAAAGGCTCAGA
CTTTGTGCCTACTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTG
GGAGATGTTTGTTTCGTCTTGTAAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGG
TCTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTTCTGTTTTTTTTG
TTTTGTAAGAGCTTTGAAACTGCTTGGGTTTTCGGGGGAAGATGTGTCTTACAAACATAA
CTGTGAATCTTTTCCTCATCGGTTAAAATATTCACTTTCTTGTGGTGTTCTTGATTCTGA
TGATAACAAATGTACCAGAGAGAAGGCTTAAACGGTGTTAAGCATAATTGTGAGGAAATG
TCTAAATTTAAACTCTAGTTGTGTAGATCTATGTTGTGTGCTATTGAAAGTTCTAAATCC
GAACATTGTGTTTGCTCTTTTTCTTTATGTAACAGAAACAATTTTTGTGCT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 3

CO CL4556Contig1 726 3 7 U
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TGGCTCCTATAACTTCTCTAGGTCTCTGGACGAAGGATTTGCACTGTTAGTCATCTCCTT
TCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTTCACAGGAGATCAGAAACAACAATGAGTCAATACAA
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AGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACCCACAGCAGGGATATCCACCACC
GCAGGGTTATCCTCAGCAATCTCCTCCTTATGCACCGCAATATCCACAGCAGCATCAGCA
GCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTCTTGCTGTTCTCTGCTGTTGTTG
TCTCTGTGATTTATGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGCTCGGAGCTGCTTTTTAATTGCA
AGAGAGTGTTTGGCGACACAAGATCATTTGTTGCGTAATGGGCATTAAAATGAATTGCTG
GATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTTTATGTTTTTCGATTCATAAATA
ACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTAGCGGGAATGTAAATT
GGTGTGGTTGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTTCGTATGTCATTGGATTTTTTTT
TGATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ66TF U 48
AF RR4CD86TF U 1
AF RR4CD86JQ C 1
BS 1 49 RR4CD86TF
BS 50 456 RR4BQ66TF
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RD RR4BQ66TF 653 0 0
GG
ACACGTCTCTATGGCTCCTATAACTTCTCTAGGTCTCTGGACGAAGGATTTGCACTGTTA
GTCATCTCCTTTCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTTCACAGGAGATCAGAAACAACAATG
AGTCAATACAATCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCGCCTGAGGGG
TATCCACCGCAAGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACCCACAGCAGGGA
TATCCACCACCGCAGGGTTATCCTCAGCAATCTCCTCCTTATGCACCGCAATATCCACAG
CAGCATCAGCAGCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTCTTGCTGTTCTC
TGCTGTTGTTGTCTCTGTGATTTATGCATCTTCTGATTGGAGTACCTACTCGGAGCTGCT
TTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGGCGACACAAGATCATTTGTTGCGTAATGGGCATTAAA
ATGAATTGCTGGATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTTTATGTTTTTCG
ATTCATAAACAACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTAGCGG
GAATGTAAATTGGTGTGGTTGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTTCG

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR4CD86TF 703 0 0
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TGGCTCCTATAACTTCTCTAGGTCTCTGGACGAAGGATTTGCACTGTTAGTCATCTCCTT
TCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTTCACAGGAGATCAGAAACAACAATGAGTCAATACAA
TCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCGCCTGAGGGGTATCCACCGCA
AGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACCCACAGCAGGGATATCCACCACC
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GCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTCTTGCTGTTCTCTGCTGTTGTTG
TCTCTGTGATTTATGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGCTCGGAGCTGCTTTTTAATTGCA
AGAGAGTGTTTGGCGACACAAGATCATTTGTTGCGTAATGGGCATTAAAATGAATTGCTG
GATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTTTATGTTTTTCGATTCATAAATA
ACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTAGCGGGAATGTAA*TT
GGTGTGGTTGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTTCG
TAT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4CD86JQ 726 0 0
GAAACTTAAAACATTCTCAATGACTTTTCCTTCTCCTTTTCTTTTTTCTACACGTCTCTA
TGGCTCCTATAACTTCTCTAGGTCTCTGGACGAAGGATTTGCACTGTTAGTCATCTCCTT
TCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTTCACAGGAGATCAGAAACAACAATGAGTCAATACAA
TCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCGCCTGAGGGGTATCCACCGCA
AGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACCCACAGCAGGGATATCCACCACC
GCAGGGTTATCCTCAGCAATCTCCTCCTTATGCACCGCAATATCCACAGCAGCATCAGCA
GCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTCTTGCTGTTTTCTGCTGTTGTTG
TCTCTGTGATTTATGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGCTCGGAGCTGCTTTTTAATTGCA
AGAGAGTGTTTGGCGACACAAGATCATTTGTTGCGTAATGGGCATTAAAATGAATTGCTG
GATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTTTATGTTTTTCGATTCATAAATA
ACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTAGCGGGAATGTAAATT
GGTGTGGTTGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTTCGTATGTCATTGGATTTTTTTT
TGATAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL4557Contig1 695 3 1 U
GGATTTCACTGCGCCTCCTCCCACACTCATTCCACACACACGAATCACCAAACCCTAACA
ACAATGCCGCCCAAGTTGGACCCTAGCGCGATCGTCGACGTCTACGTCCGCGTAACCGGA
GGAGAAGTCGGAGCCGCCAGCTCCCTCGCCCCCAAGATCGGTCCCCTCGGTCTCGCCCCC
AAGAAGATCGGAGAGGACATCGCCAAGGAGACCGCCAAAGAGTGGAAAGGCCTCCGCGTC
ACCGTCAAGCTCACGGTCCAGAACCGTTAGGCCAAGGTCACGGTGGTACCTTCCGCCGCG
GCGCTCGTCATCAAGGCCCTGAAGGAGCCAGAGAGGGACCGCAAGAAGGTGAAGAACATC
AAGCACAACGGGAACATTTCGTTTGACGATGTGATCGAGATCGCGAGGATCATGAGGCCG
AGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACCGTGAGGGAGATTCTCGGGACGTGTGTGTCT
GTTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAGGAGGGT
GAGATTGAGATCCCTGAGAACTGAGCATCTCTCTTTGTCTTTTTCTTTTGTTTCGTCTTA
TCGTTTAGATGATGCTGTCTTGTCTTAATTACAGTGACTCGAGTTTTGGATTATTATTAT
TATCTCCGTTGAAATGGTTTATCAGTTCGCTACTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4AW63JQ C 1
AF RR4AW63TF U 1
AF RR4AX54TF U 1
BS 1 695 RR4AW63TF

RD RR4AW63JQ 695 0 0
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GTTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAGGAGGGT
GAGATTGAGATCCCTGAGAACTGAGCATCTCTCTTTGTCTTTTTCTTTTGTTTCGTCTTA
TCGTTTAGATGATGCTGTCTTGTCTTAATTACAGTGACTCGAGTTTTGGATTATTATTAT
TATCTCCGTTGAAATGGTTTATCAGTTCGCTACTC

QA 1 695 1 695
DS 

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ACCGTCAAGCTCACGGTCCAGAACCGTTAGGCCAAGGTCACGGTGGTACCTTCCGCCGCG
GCGCTCGTCATCAAGGCCCTGAAGGAGCCAGAGAGGGACCGCAAGAAGGTGAAGAACATC
AAGCACAACGGGAACATTTCGTTTGACGATGTGATCGAGATCGCGAGGATCATGAGGCCG
AGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACCGTGAGGGAGATTCTCGGGACGTGTGTGTCT
GTTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAGGAGGGT
GAGATTGAGATCCCTGAGAACTGAGCATCTCTCTTTGTCTTTTTCTTTTGTTTCGTCTTA
TCGTTTAGATGATGCTGTCTTGTCTTAATTACAGTGACTCGAGTTTTGGATTATTATTAT
TATCTCCGTTGAAATGGTTTATCAGTTCGCTACTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4AX54TF 695 0 0
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GGAGAAGTCGGAGCCGCCAGCTCCCTCGCCCCCAAGATCGGTCCCCTCGGTCTCGCCCCC
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ACCGTCAAGCTCACGGTCCAGAACCGTTAGGCCAAGGTCACGGTGGTACCTTCCGCCGCG
GCGCTCGTCATCAAGGCCCTGAAGGAGCCAGAGAGGGACCGCAAGAAGGTGAAGAACATC
AAGCACAACGGGAACATTTCGTTTGACGATGTGATCGAGATCGCGAGGATCATGAGGCCG
AGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACCGTGAGGGAGATTCTCGGGACGTGTGTGTCT
GTTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAGGAGGGT
GAGATTGAGATCCCTGAGAACTGAGCATCTCTCTTTGTCTTTTTCTTTTGTTTCGTCTTA
TCGTTTAGATGATGCTGTCTTGTCTTAATTACAGTGACTCGAGTTTTGGATTATTATTAT
TATCTCCGTTGAAATGGTTTATCAGTTCGCTACTC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

CO CL4558Contig1 779 3 8 U
TTTTTTTGCACAATGTATAAAGAACCATTTTATTTCAGAAACGTTACACGCCATGACACG
AAAATAATACAAACAGATAATGAAAAACATTTAACTTATTAACGCCACAAACCCCAAAAC
GCATCCCTTCAAAGACATTAACATTTTTGCTTTGATAGCCATTTAACAAGAAGACAAAGC
TCCTCCACCATTTCTTTGTTTTTCTAAACAGATAATTCGACCTGAGAAACAAGGATACCA
TCAGTATCTGCGTAAAGCCATTCACAATCGCATATCCGAGTGCCAGCTATGTTGAGTGGG
ACTCTCTGTTCACCAAGTCCTTTCTTACTAGCCTTTATGGGATGAGAAGCCAAAGCTCTC
ACTCCAATGTCGCAACCGTTGATCTCATCAACGTCTCTGATGCAACCGTTCACTATGATC
CCCGCCCATCCGTTGTTCTGAGCTTGTACTACCGGGTTCC**CCAAGTATAGCACATCGT
AAACTCCCTCCACCATCCACCACAAGAACTCTTCCATTGCCTTTCTCTTCGAGAAACTGA
CGGATCAAGCCATTGTCTTCAAACACTTTGACAGTAACTACAGGACCTGAGAATATCTGA
CGACGACCGTAAATCTGGAAACAGGACTGCAGAGCTCTGAGCTGGCCACTACGGATCAGA
TCTTGATTCGCGTCACAAACTTCCGCAGTGGTCACAAACGCCATTCTTTTTTCTTCTCAC
CTGAAAGATAAGAAACTCTGTCTTTGTGTGCTCAAGTCTCAGAGATATGAAAGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G029JQ U 8
AF RR4G029TF C 1
AF RR4DL82JQ U 15
BS 1 14 RR4G029TF
BS 15 581 RR4G029JQ
BS 582 625 RR4DL82JQ
BS 626 626 RR4G029TF
BS 627 630 RR4DL82JQ
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BS 632 750 RR4DL82JQ
BS 751 779 RR4G029TF

RD RR4G029JQ 574 0 0
GCACAAT
GTATAAAGAACCATTTTATTTCAGAAACGTTACACGCCATGACACGAAAATAATACAAAC
AGATAATGAAAAACATTTAACTTATTAACGCCACAAACCCCAAAACGCATCCCTTCAAAG
ACATTAACATTTTTGCTTTGATAGCCATTTAACAAGAAGACAAAGCTCCTCCACCATTTC
TTTGTTTTTCTAAACAGATAATTCGACCTGAGAAACAAGGATACCATCAGTATCTGCGTA
AAGCCATTCACAATCGCATATCCGAGTGCCAGCTATGTTGAGTGGGACTCTCTGTTCACC
AAGTCCTTTCTTACTAGCCTTTATGGGATGAGAAGCCAAAGCTCTCACTCCAATGTCGCA
ACCGTTGATCTCATCAACGTCTCTGATGCAACCGTTCACTATGATCCCCGCCCATCCGTT
GTTCTGAGCTTGTACTACCGGGTTCC**CCAAGTATAGCACATCGTAAACTCCCTCCACC
ATCCACCACAAGAACTCTTCCATTGCCTTTCTCTTCGAGAAACTGACGGATCAAGCCATT
GTCTTCAAACACTTTGACAGTAACTAC

QA 8 574 8 574
DS 

RD RR4G029TF 779 0 0
TTTTTTTGCACAATGTATAAAGAACCATTT*ATTTCAGAA*CGT*ACACGCCATGACACG
AAAATAATACAAACAGATAATGAAAAACATTTAACTTATTAACGCCACAAACCCCAAAAC
GCATCCCTTCAAAGACATTAACATTTTTGCTTTGATAGCCATTTAACAAGAAGACAAAGC
TCCTCCACCATTTCTTTGTTTTTCTAAACAGATAATTCGACCTGAGAAACAAGGATACCA
TCAGTATCTGCGTAAAGCCATTCACAATCGCATATCCGAGTGCCAGCTATGTTGAGTGGG
ACTCTCTGTTCACCAAGTCCTTTCTTACTAGCCTTTATGGGATGAGAAGCCAAAGCTCTC
ACTCCAATGTCGCAACCGTTGATCTCATCAACGTCTCTGATGCAACCGTTCACTATGATC
CCCGCCCATCCGTTGTTCTGAGCTTGTACTACCGGGTTCC**CCAAGTATAGCACATCGT
AAACTCCCTCCACCATCCACCACAAGAACTCTTCCATTGCCTTTCTCTTCGAGAAACTGA
CGGATCAAGCCATTGTCTTCAAACACTTTGACAGTAACTACAGGACCTGAGAATATCTGA
CGACGACCGTAAATCTGGAAACAGGACTGCAGAGCTCTGAGCTGGCCACTACGGATCAGA
TCTTGATTCGCGTCACAAACTTCCGCAGTGGTCACAAACGCCATTCTTTTTTCTTCTCAC
CTGAAAGATAAGAAACTCTGTCTTTGTGTGCTCAAGTCTCAGAGATATGAAAGTGATCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4DL82JQ 741 0 0
GTATAAAGAACCATTTTATTTCAGAAACGTTACACGCCATGACACGAAAATAATACAAAC
AGATAATGAAAAACATTTAACTTATTAACGCCACAAACCCCAAAACGCATCCCTTCAAAG
ACATTAACATTTTTGCTTTGATAGCCATTTAACAAGAAGACAAAGCTCCTCCACCATTTC
TTTGTTTTTCTAAACAGATAATTCGACCTGAGAAACAAGGATACCATCAGTATCTGCGTA
AAGCCATTCACCATCGCATATCCGAGTGCCAGCTATGTTGAGTGGGACTCTCTGTTCACC
AAGTCCTTTCTTACTAGCCTTTATGGGTTGAGAAGCCAAAGCTCTCACTCCAATGTCGCA
ACCGTTGATCTCATCAACGTCTCTGATGCAACCGTTCACTATGATCCCCGCCCATCCGTT
GTTCTGAGCTTGTACTACCGGGTTCCCTCCAAGTATAGCACATCGTAAACTCCCTCCACC
ATCCACCACAAGAACTCTTCCATTGCCTTTCTCTTCGAGAAACTGACGGATCAAGCCATT
GTCTTCAAACACTTTGACAGTAACTACAGGACCTGAGAATATCTGACGACGACCGTAAAT
CTGGAAACAGGGCTGCGGAGCTCTGAGCTGGCCACTACGGATCAGATCTTGATTCGCGTC
ACAAACTTCCGCAGTGGTCACAAACGCCATTCTTTTTTCTTCTCACCTGAAAGATAAGAA
ACTCTGTCTTTGTGTG
ATCCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL4559Contig1 901 3 3 U
AGTGAAAAGGAAAATCGAATTGAATCTCTTGATTGTTTTTCATATATTTGGATTGGTATT
TGGTTCTGAAGAATCTTAAATCAAGTTATGGGTTCTTTTTACATATGTTTTGAGGTGGAT
CAAGAAGAAAGTAGCATCTCTAATAAATACAACAAAAAAGGAGGCAGAAAGGAGAGTGTT
AACATCATTGAGTAAGAGGAAGACATTCAAGTTGTATCTCAAGAACACCTCTCTCCACTT
TTTGAAGACTGAGCGATATGTCTTGTTTCACTTTTCCTTCTTCCTGTGAGATTATCCCAC
CACTCACCAATGTGTTCTCTTTGCTCGCCACCCAACTCCCCAGCTGCATCGGTTCTTTTA
TGCTTGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCACTCACCAACGGTTGTATATCTATCTCAGCCT
CCCCCATGAAATCATCTGTCGTGAATGTATCCTTGTCGTACACTAGCACTTTGAGAGGAG
GCATCTGCTCAGGTATCGAAAGCATAAGCGTCTCATTCCACACGGGATTCAAATTGTTCT
TTATCACCTGTGTTTTCACCGATTGTTGTCCAAGAGAAAGGATAACATAAGGATCGCTTG
TCATCACATCTCGAACCGCAAGATTTGCTCCTTTAACAACATTAACCTTAATCAATCCGA
CAAACTCAACCATGTCTGCCATAGAGTTGCTCTTCTTGGGGCATTTGTGATCAGATTCTC
TTCTTCCCCAGCTATTCCTAAATGCATGACCAATGCGGTTTTTTGCAGAACGGTGGCTAC
CACTAGCAGAACATAAAGACCGTGATGTATTATTTATTCTGCTAGGCTCCTGATAAATGC
ACAAAGCACCATCTTTTGGATCCGTAAACTGGTGCAGCTCATATTTCTTTCTAATGAAAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 

AF RR4BZ49JQ U 1
AF RR4GD81JQ U 62
AF RR4BZ49TF C 148
BS 1 759 RR4BZ49JQ
BS 760 783 RR4GD81JQ
BS 784 901 RR4BZ49TF

RD RR4BZ49JQ 759 0 0
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TGGTTCTGAAGAATCTTAAATCAAGTTATGGGTTCTTTTTACATATGTTTTGAGGTGGAT
CAAGAAGAAAGTAGCATCTCTAATAAATACAACAAAAAAGGAGGCAGAAAGGAGAGTGTT
AACATCATTGAGTAAGAGGAAGACATTCAAGTTGTATCTCAAGAACACCTCTCTCCACTT
TTTGAAGACTGAGCGATATGTCTTGTTTCACTTTTCCTTCTTCCTGTGAGATTATCCCAC
CACTCACCAATGTGTTCTCTTTGCTCGCCACCCAACTCCCCAGCTGCATCGGTTCTTTTA
TGCTTGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCACTCACCAACGGTTGTATATCTATCTCAGCCT
CCCCCATGAAATCATCTGTCGTGAATGTATCCTTGTCGTACACTAGCACTTTGAGAGGAG
GCATCTGCTCAGGTATCGAAAGCATAAGCGTCTCATTCCACACGGGATTCAAATTGTTCT
TTATCACCTGTGTTTTCACCGATTGTTGTCCAAGAGAAAGGATAACATAAGGATCGCTTG
TCATCACATCTCGAACCGCAAGATTTGCTCCTTTAACAACATTAACCTTAATCAATCCGA
CAAACTCAACCATGTCTGCCATAGAGTTGCTCTTCTTGGGGCATTTGTGATCAGATTCTC
TTCTTCCCCAGCTATTCCTAAATGCATGACCAATGCGGT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4GD81JQ 722 0 0
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AAGAAGAAAGTAGCATCTCTAATAAATACAACAAAAAAGGAGGCAGAAAGGAGAGTGTTA
ACATCATTGAGTAAGAGGAAGACATTCAAGTTGTATCTCAAGAACACCTCTCTCCACTTT
TTGAAGACTGAGCGATATGTCTTGTTTCACTTTTCCTTCTTCCTGTGAGATTATCCCATC
ACTCACCAATGTGTTCTCTTTGCTCGCCACCCAACTCCC*AGCTGCATCGGTTCTTTTAT
GCTTGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCACTCACCAACGGTTGTATGTCTATCTCAGCCTC
CCCCATGAAATCATCTGTCGTGAATGTATCCTTGTCGTACACTAGCACTTTGAGAGGAGG
CATCTGCTCAGGTATCGAAAGCATAAGCGTCTCATTCCACACGGGATTCAAATTGTTCTT
TATCACCCGTGTTTTCACCGATTGTTGTCCAAGAGAAAGGATAACATAAGGATCGCTTGT
CATCACATCTCGAACCGCAAGATTTGTTCCTTTAACAACATTAACCTTAATCAATCCGAC
AAACTCAACCATGCCTGCCATAGAGTTGCTCTTCTTGGGGCATTTGTGATCAGATTCTCT
TCTTCCCCAGCTATTCCTAAATGCATGACCAATGCGGTTTTTTGCAGAACGGTGGCTACC
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4BZ49TF 754 0 0
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TATCTCAAGAACACCTCTCTCCACTTTT*GAAGACTGAGCGATATGTCTTGTTTCACTTT
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ACTCCCCAGCTGCATCGGTTCTTTTATGCTTGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCACTCAC
CAACGGTTGTATATCTATCTCAGCCTCCCCCATGAAATCATCTGTCGTGAATGTATCCTT
GTCGTACACTAGCACTTTGAGAGGAGGCATCTGCTCAGGTATCGAAAGCATAAGCGTCTC
ATTCCACACGGGATTCAAATTGTTCTTTATCACCTGTGTTTTCACCGATTGTTGTCCAAG
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AACAACATTAACCTTAATCAATCCGACAAACTCAACCATGTCTGCCATAGAGTTGCTCTT
CTTGGGGCATTTGTGATCAGATTCTCTTCTTCCCCAGCTATTCCTAAATGCATGACCAAT
GCGGTTTTTTGCAGAACGGTGGCTACCACTAGCAGAACATAAAGACCGTGATGTATTATT
TATTCTGCTAGGCTCCTGATAAATGCACAAAGCACCATCTTTTGGATCCGTAAACTGGTG
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QA 8 754 8 754
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CA41JQ U 1
AF RR4D692JQ U 5
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BS 77 395 RR4CA41JQ
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RD RR4CA41JQ 736 0 0
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TCGGATCACAGACAATTTAGGTACAACTTAAAATGTAATCCTTTCCAAAACCGGTGTCAA
AATAACCCACTCACTGCACTAATCTTCTTTCCATCATTTCTTTATTATTCACTTCACCCC
AACAACAAGTTACTTAATCATCAGGCAGGAACTGGCCTCGCACCAAAAGAAAGCTGTAGA
TTGGCAGCGTATTCACGCGCCCACAAGTCATAGTGAACAATCTCTTCAAGCGACGGCGAT
GTTACCAACTCGCTTCGATGTTTATCGCATGTTAACTCCACCACCTTGAAGATATCCAAA
TAGCTTATCTCTTCATTAATGAACATTTCAACAGCTTTCTCGTTAGCAGCACTGAGAACA
CCAGTCATAGTACCTCCAGCTCGTCCCGCAGCATAAGCGAGATCCATTGATGGGTATTTC
ACATTGTCTGGTTTCTTGAAAGTCAACGAACCCAGTTTGCAAAGGTCAAGTCTTGGCCAC
GTTACTTCGGAACAAGGAACCCTATCAGGCCATGACATGGTGTAGAGAATAGGTAAACGC
ATATCAGGCCATCCCAGTTGAGCAAGCACAGATGAATCCTGTGTTTCAATCATGGAGTGT
ATGATGCTCTGAGGGTGAATGACAATCTCTATATCGTCATACTCAGCTCCAAACAAATAA
TGAGCTTCAATGACCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4D692JQ 750 0 0
G
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TCACAGACAACTTAGGTACAACTTAAAATGTAATCCTTTCCAAAACCGGTGTCAAAATAA
CCCACTCACTGCACTAATCTTCTTTCCATCATTTCTTTATTATTCACTTCACCCCAACAA
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AGCGTATTCACGCGCCCACAAGTCATAGTGAACAATCTCTTCAAGCGACGGCGATGTTAC
CAACTCGCTTCGATGTTTATCGCATGTTAACTCCACCACCTTGAAGATATCCAAATAGCT
TATCTTTTCATTAATGAACATTTCAACAGCCTTCTCGTTAGCAGCACTGAGAACACCAGT
CATAGTACCTCCAGCTCGTCCCGCAGCATAAGCGAGATCCATTGATGGGTATTTCACATT
GTCTGGTTTCTTGAAAGTCAACGAACCCAGTTTGCAAAGGTCAAGTCTTGGCCACGTTAC
TTCGGAACAAGGAACCCTATCAAGCCATGACATGGTGTAGAGAATAGGTAAACGCATATC
AGGCCATCCCAGTTGAGCAAGCACAGATGAATCCTGTGTTTCAATCATGGAGTGTATGAT
GCTCTGAGGGTGAATGACAATCTCTATATCGTCATACTCAGCTCCAAACAAATAATGAGC
TTCAATGACCTCAAGGCCCTTGTTGAAAA

QA 2 750 2 750
DS 



AS 1 3

CO CL4561Contig1 697 3 2 U
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CGTCGTCATGGGCCGACTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTTTGCCGTA
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CAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTCTCA
CGGAATCCCACAAGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCA
TGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATTTGTATCACCTGATCAAGAAAGCAGTTGCAAT
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GGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCACCCGT
CTGGAAGTATGAGTCTACCACCGCAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAACCATAGAGTAGG
TCAAAGTCCTTCATGAGCGACCATTTCGTTGCAACATTGCAACTCTAGTTCTATGACTAT
GGACTTTGTATCTGTTTTCTCTAGTTTTTTGATTTGTTACAACCTACAATTCGATTTTTA
ATTTAATGAAAACTCTTGTTCTTGTTATCAGAAAAAA


BQ
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AF RR4GS31TF U 1
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QA 1 697 1 697
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AS 1 3

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BQ
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AF RR4BB73JQ U 1
AF RR4BC96JQ U 1
AF RR4BB73TF C 268
BS 1 711 RR4BB73JQ
BS 712 795 RR4BC96JQ
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GTCATCTTCCCGGCGAGCTCATGGATTTTCTCCGCCATTGAAAAAGAGAGAGTTTACGTG
CTTTTGACTCCACAAATCACACAAGCTCACATCTTCTTTTTATTTCCCTTTTTCTAAAAT
GTCTCTTCGTTTTTGGTCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 3

CO CL4563Contig1 701 3 30 U
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ACGGAGCAACAGAAACATGATTCAATTATTAGACAAGAACCTCATCTTCGTCTTCAAAGC
TCAAATTCAAAGTTTGTAACTTAAGGCCAGCTCCTTGTATAGTCTCCACCAAGCTTGACG
CCACTCCTGTTGCTTGAACCGTTGTTTGCTTTGAAAGATCAACAACGGCAACACCTTCAG
AAACTTGAACTTTTAAGTTGGAAACTCCATCTATGTCCTGTAAGGCCTTAGTCACATTAG
GAATAGCTGCTTCGTTCAAAGTTCCATCAGCCTGGAAAAACATGGTGAGCATGTCTGAAG
GAGAGACCGGAACAGAGACTGTCTCTTGCTGTTGTTGTTGCTCTTCATCCGCAATTGCAA
CGCCGTCTTCTCCTCCTCCTTCTCCAAGAGACGAAAGCTTCGCCATCCCAAGGCGAGGAC
TCTGTTTAGTGAACCCATCAAAGCTGCAAACTCTGCTGTTCCCGATGGGTCTGGTTCGAA
AGGTGAGGTTTTTCGATAGAGGAAGAAAATGGGTCGAAGAAAGGTTAGGGCTTTTGGCTG
TTGAGAAGGAGTGAAATGTAGAAGATGCTGCAATCGACGCCATTTTCGCTATTACCCAAT
CTTCGCTCGATAAGAGTCTTTTTGGTTACTCTGTTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C485JQ U 1
AF RR4EL56JQ U 18
AF RR4EL56TF C 18
BS 1 44 RR4C485JQ
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BS 145 145 RR4EL56JQ
BS 146 199 RR4C485JQ
BS 200 200 RR4EL56JQ
BS 201 217 RR4C485JQ
BS 218 218 RR4EL56JQ
BS 219 250 RR4C485JQ
BS 251 251 RR4EL56JQ
BS 252 334 RR4C485JQ
BS 335 335 RR4EL56JQ
BS 336 337 RR4C485JQ
BS 338 338 RR4EL56JQ
BS 339 376 RR4C485JQ
BS 377 377 RR4EL56JQ
BS 378 418 RR4C485JQ
BS 419 419 RR4EL56JQ
BS 420 449 RR4C485JQ
BS 450 450 RR4EL56JQ
BS 451 462 RR4C485JQ
BS 463 463 RR4EL56JQ
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BS 560 560 RR4EL56JQ
BS 561 567 RR4C485JQ
BS 568 701 RR4EL56JQ

RD RR4C485JQ 567 0 0
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CGCCGTCTTCTCCTCCTCCTTCTCCAAGAAACGAAAGCTTCGTCATCCCAAGGCGACGAC
TCTGTTTAGTGATCCCATCAAAGCTGCAAACTCTGCTGTTCCCGATGGGTCTGGTTCGAA
AGGTGAGGTTTTTCGATAGGGGAAGAA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4EL56JQ 684 0 0
CAG
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GTTGTTTGCTTTGAAAGATCAACAACGGCAACACCTTCAAAAACTTGAACTTTTAAGTTG
GAAACTCCATCTATGTCCTGTAAGGCCTTAGTCACATTAGGAATAGCTGCTTCGTTCAAA
GTTCCATCAGCCTGGAAAAACATGGTGAGCATGTCTGAAGGAGAGACCGGAACAGAGACT
GTCTCTTGCTGTTGTTGTTGCTCTTCATCCGCAATTGCAACGCCGTCTTCTCCTCCTCCT
TCTCCAAGAGACGAAAGCTTCGCCATCCCAAGGCGAGGACTCTGTTTAGTGAACCCATCA
AAGCTGCAAACTCTGCTGTTCCCGATGGGTCTGGTTCGAAAGGTGAGGTTTTTCGATAGA
GGAAGAAAATGGGTCGAAGAAAGGTTAGGGCTTTTGGCTGTTGAGAAGGAGTGAAATGTA
GAAGATGCTGCAATCGACGCCATTTTCGCTATTACCCAATCTTCGCTCGATAAGAGTCTT
TTTGGTTACTCTGTTTCTCCC

QA 4 684 4 684
DS 

RD RR4EL56TF 684 0 0
CAG
TAAATATTGAAACATTAATGTGTT*GTCTTTAATCACAAAACGGAGCAACAGAAACATGA
TTCAATTATTAGACAAGAACCTCATCTTCGTCTTCAAAGCTCAGATTCAAAGTTTGTAAC
TTAAGGCCAGCTCCTTGTATAGTCTCCACCAAGCTTGACGCCACTCCTGTTGCTTGAACC
GTTGTTTGCTTTGAAAGATCAACAACGGCAACACCTTCAGAAACTTGAACTTTTAAGTTG
GAAACTCCATCTATGTCCTGTAAGGCCTTAGTCACATTAGGAATAGCTGCTTCGTTCAAA
GTTCCATCAGCCTGGAAAAACATGGTGAGCATGTCTGAAGGAGAGACCGGAACAGAGACT
GTCTCTTGCTGTTGTTGTTGCTCTTCATCCGCAATTGCAACGCCGTCTTCTCCTCCTCCT
TCTCCAAGAGACGAAAGCTTCGCCATCCCAAGGCGAGGACTCTGTTTAGTGAACCCATCA
AAGCTGCAAACTCTGCTGTTCCCGATGGGTCTGGTTCGAAAGGTGAGGTTTTTCGATAGA
GGAAGAAAATGGGTCGAAGAAAGGTTAGGGCTTTTGGCTGTTGAGAAGGAGTGAAATGTA
GAAGATGCTGCAATCGACGCCATTTTCGCTATTACCCAATCTTCGCTCGATAAGAGTCTT
TTTGGTTACTCTGTTTCTCCC

QA 4 684 4 684
DS 



AS 1 3

CO CL4564Contig1 1211 3 6 U
CGTATATAATTAGTTTATTATTGCAAAATAAATTATCAATTAACATGGTAGCTTTCTAAG
TATGGACGTCACTGACGTTTACAAGCGAATGATATTGTCGGAGTGACAATAAATTTACAA
ACACAATTTATATGATCAAAAATGATTCATCAATACTATATGATATCATGATTATACCTC
GTTGTACGTTTTATCTTCTTTCAAACGTTTTAATAAGAAGATAAGAACAAAGATTTGGCT
CAATCTACTAATGAATGGAGTCTCGTTCTTGGACAGCAGCTTTGATGTTTTTTTAGAGAT
TCCTCCCAGTCGTCAAGTAGCCGATGAGTATCGCTTATGACCGTTGGATCTACAGTCAAA
GAAATAGTCATCTTGTTCATGTAACTTTGGAAATGGATCATCAAAGCATGGGGATGGCCA
TAAACACTAGGGGCCATATAAGTGATAGGATGTCCAAAGAAGCTGATTTCTTCAACAGGA
CCAATCAAGTTTGAAAAGGACATCGTTGTGTTGGACAATGCTCTATTTATTACGTTAGCT
GTCACCTTAACGCCAAATAATCTAATCATGAATTTACCGACGATGAATGTAAGCGCAGCT
TCCAGCGAGTTTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAATGGA
TCTTTGCTTAAGCCGATAGAAAACGAAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTA
CACTTTGATCCTTTAGCCATCATATCAGATAGATCCTGGATTCCAGTAGTGGGTCTTAGA
TTTACAAGTATAGCTGATCTTAGCCTTACTCTTTTAGGCATATCATTTGAATTCCTTTGA
TCTTCTCCTAGTTTCTTCTTCTTCTCTCCATATCTTCTCTCCAGGTATTGCGAGAGACCA
GCCTGAGTTACTCCAAGCACTACATCATTTACAGTCATTTTACTGCAGAAACGAGGATGT
CTGATCAAAGTTTGCTTTAATCCTTCGATAATAACATCTGGCTCGATCTTCTTCTTAACA
CCAATCAACGATATGACGTAACAATTAAACTCCGGAGCGTGGAACACGCGCGCCGCGGGA
CTAAGGGGTTGCTCCTCTTCGTCTTTCCTCACGGTTGTCTCTGGTATCTTAATCTCCATG
GCTTGGTGTTCGGTCATAACCCTTCTTTCTCTCTTAACTTAAAAGTATTCTCTCACTTAA
TATAGCCTCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF58JQ U 1
AF RR4EI35JQ U 4
AF RR4GF58TF C 551
BS 1 293 RR4GF58JQ
BS 294 294 RR4EI35JQ
BS 295 475 RR4GF58JQ
BS 476 476 RR4EI35JQ
BS 477 752 RR4GF58JQ
BS 753 1211 RR4GF58TF

RD RR4GF58JQ 752 0 0
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TATGGACGTCACTGACGTTTACAAGCGAATGATATTGTCGGAGTGACAATAAATTTACAA
ACACAATTTATATGATCAAAAATGATTCATCAATACTATATGATATCATGATTATACCTC
GTTGTACGTTTTATCTTCTTTCAAACGTTTTAATAAGAAGATAAGAACAAAGATTTGGCT
CAATCTACTAATGAATGGAGTCTCGTTCTTGGACAGCAGCTTTGATGTTTTTT*AGAGAT
TCCTCCCAGTCGTCAAGTAGCCGATGAGTATCGCTTATGACCGTTGGATCTACAGTCAAA
GAAATAGTCATCTTGTTCATGTAACTTTGGAAATGGATCATCAAAGCATGGGGATGGCCA
TAAACACTAGGGGCCATATAAGTGATAGGATGTCCAAAGAAGCTGATTTCTTCAATAGGA
CCAATCAAGTTTGAAAAGGACATCGTTGTGTTGGACAATGCTCTATTTATTACGTTAGCT
GTCACCTTAACGCCAAATAATCTAATCATGAATTTACCGACGATGAATGTAAGCGCAGCT
TCCAGCGAGTTTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAATGGA
TCTTTGCTTAAGCCGATAGAAAACGAAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTA
CACTTTGATCCTTTAGCCATCATATCAGATAG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4EI35JQ 731 0 0
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GGACGTCACTGACGTTTACAAGCGAATGATATTGTCGGAGTGACAATAAATTTACAAACA
CAATTTATATGATCAAAAATGATTCATCAATACTATATGATATCATGATTATACCTCGTT
GTACGTTTTATCTTCTTTCAAACGTTTTAATAAGAAGATAAGAACAAAGATTTGGCTCAA
TCTACTAATGAATGGAGTCTCGTTCTTGGACAGCAGCTTTGATGTTTTTTTAGAGATTCC
TCCCAGTCGTCAAGTAGCCGATGAGTATCGCTTATGACCGTTGGATCTACGGTCAAAGAA
ATAGTCATCTTGTTCATGTAACTTTGGAAATGGATCGTCAAAGCATGGGGATGGCCATAA
ACACTAGGGGCCATATAAGTGATAGGATGTCCAAAGAAGCTGATTTCTTCAACAGGACCA
ATCAAGTTTGAAAAGGACATTGTTGTGTTGGACAATGCTCTATTTATTACGTTAGCTGTC
ACCTTAACGCCAAATAATCTAATCATGAATTTACCGACGACGAATGTAAGCGCAGCTTCC
AGCGAGTTTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAATGGATCT
TTGTTTAAGCCGATAGAAAACGGAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTACAC
TTTGATCCTTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4GF58TF 661 0 0
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TTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAATGGATCTTTGCTTA
AGCCGATAGAAAACGAAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTACACTTTGATC
CTTTAGCCATCATATCAGATAGATCCTGGATTCCAGTAGTGGGTCTTAGATTTACAAGTA
TAGCTGATCTTAGCCTTACTCTTTTAGGCATATCATTTGAATTCCTTTGATCTTCTCCTA
GTTTCTTCTTCTTCTCTCCATATCTTCTCTCCAGGTATTGCGAGAGACCAGCCTGAGTTA
CTCCAAGCACTACATCATTTACAGTCATTTTACTGCAGAAACGAGGATGTCTGATCAAAG
TTTGCTTTAATCCTTCGATAATAACATCTGGCTCGATCTTCTTCTTAACACCAATCAACG
ATATGACGTAACAATTAAACTCCGGAGCGTGGAACACGCGCGCCGCGGGACTAAGGGGTT
GCTCCTCTTCGTCTTTCCTCACGGTTGTCTCTGGTATCTTAATCTCCATGGCTTGGTGTT
CGGTCATAACCCTTCTTTCTCTCTTAACTTAAAAGTATTCTCTCACTTAATATAGCCTCC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 3

CO CL4565Contig1 675 3 5 U
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TCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCATCCGATCTGACTC
TCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTGAAGCC
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AGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGTCTATTGTTGGTGC
TACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTCCGTGATGCTGCAAG
AGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGGC
AAAGAAGGCTGAGTTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGC
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TCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTATTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATA
TCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTAAGCAACTCTT
ATAATCGCAAGACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY79JQ C 1
AF RR4E769TF U 301
AF RR4EY79TF U 1
BS 1 300 RR4EY79TF
BS 301 432 RR4E769TF
BS 433 433 RR4EY79TF
BS 434 668 RR4E769TF
BS 669 675 RR4EY79JQ

RD RR4EY79JQ 675 0 0
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TCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTGAAGCC
TTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCTCAAGA
AGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGTCTATTGTTGGTGC
TACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTCCGTGATGCTGCAAG
AGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGGC
AAAGAAGGCTGAGTTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGC
TGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAACCCTTGCTTT
TCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTATTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATA
TCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTAAGCAACTCTT
ATAATCGCAAGACTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4E769TF 368 0 0
TACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTCCGTGATGCTGCAAG
AGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGGC
AAAGAAGGCTGATTTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGC
TGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAACCCTTGCTTT
TCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTATTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATA
TCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTAAGCAACTCTT
ATAATCGC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4EY79TF 675 0 0
GGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCAGCCAGCAACCATGGTTCTCAAGACGGAGCTTTG
TCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCATCCGATCTGACTC
TCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTGAAGCC
TTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCTCAAGA
AGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGTCTATTGTTGGTGC
TACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTCCGTGATGCTGCAAG
AGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGGC
AAAGAAGGCTGAGTTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGC
TGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAACCCTTGCTTT
TCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTATTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATA
TCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTAAGCAACTCTT
ATAATCGC
AAGACTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL4566Contig1 695 2 1 U
GAACGTAGATTTCTATCAAGCTATGAATGCTTGTACTACAAATAGCCAGTCTCTTATGTC
GACATTGCCACCACGAGATGATATTCCAATGTCCTTGGCTATGCCTAATGAATCTCTAAA
TGTTGCATCTGTGCCCCCTGCTGTGAAAGTGAAAGGAAGGCCGAGGAAAGAAACCCATCT
CTCTGCACAGAGGAAGCGGACTAGGAAATTAACAGTGAAAGACATGAGCGAACTCTTTGA
GCTGCCTATCGAAAAAGCGGCTCGAAGGTTGAGGATTTGTACAACAGCCGTAAAACTCAT
CTGCAGGAGGGGAGAAGTGTATCGATGGCCTCAACGGAAACTTAGAAGTCTGCGGGAGAA
AGTCGCGGCACTGAAGAATGTAGTACTATCCAATTCAACAGATGCAAAAGTAAGGGCTCG
TGCGGAAGCGAAGATTGAAAATTTTGAGAACCAGATTAATGCTATCTATAGCAAAGCACA
CCAGAACGCTTGAGTGATTTTCATATAATTAAAGACTACTTGTGTTGATGACTCCTATCC
CCTTTGTCATCACAAAGAATTGTCATCGTTACCGGTTGGGTTTGTTTGACGTTGGTACTA
CAGTTTTATGTCTCTTGTCTCGACATGAGATACACTTTTGGTTGTCTTACGTTTATGTCT
CTTTCTCTACATGATATTTATACACTTTTGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM64TF U 1
AF RR4DM70TF U 1
BS 1 695 RR4DM64TF

RD RR4DM64TF 695 0 0
GAACGTAGATTTCTATCAAGCTATGAATGCTTGTACTACAAATAGCCAGTCTCTTATGTC
GACATTGCCACCACGAGATGATATTCCAATGTCCTTGGCTATGCCTAATGAATCTCTAAA
TGTTGCATCTGTGCCCCCTGCTGTGAAAGTGAAAGGAAGGCCGAGGAAAGAAACCCATCT
CTCTGCACAGAGGAAGCGGACTAGGAAATTAACAGTGAAAGACATGAGCGAACTCTTTGA
GCTGCCTATCGAAAAAGCGGCTCGAAGGTTGAGGATTTGTACAACAGCCGTAAAACTCAT
CTGCAGGAGGGGAGAAGTGTATCGATGGCCTCAACGGAAACTTAGAAGTCTGCGGGAGAA
AGTCGCGGCACTGAAGAATGTAGTACTATCCAATTCAACAGATGCAAAAGTAAGGGCTCG
TGCGGAAGCGAAGATTGAAAATTTTGAGAACCAGATTAATGCTATCTATAGCAAAGCACA
CCAGAACGCTTGAGTGATTTTCATATAATTAAAGACTACTTGTGTTGATGACTCCTATCC
CCTTTGTCATCACAAAGAATTGTCATCGTTACCGGTTGGGTTTGTTTGACGTTGGTACTA
CAGTTTTATGTCTCTTGTCTCGACATGAGATACACTTTTGGTTGTCTTACGTTTATGTCT
CTTTCTCTACATGATATTTATACACTTTTGGTTGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4DM70TF 693 0 0
GAACGT
AGATTTCTATCAAGCTATGAATGCTTGTACTACAAATAGCCAGTCTCTTATGTCGACATT
GCCACCACGAGATGATATTCCAATGTCCTTGGCTATGCCTAATGAATCTCTAAATGTTGC
ATCTGTGCCCCCTGCTGTGAAAGTGAAAGGAAGGCCGAGGAAAGAAACCCATCTCTCTGC
ACAGAGGAAGCGGACTAGGAAATTAACAGTGAAAGACATGAGCGAACTCTTTGAGCTGCC
TATCGAAAAAGCGGCTCGAAGGTTGAGGATTTGTACAACAGCCGTAAAACTCATCTGCAG
GAGGGGAGAAGTGTATCGATGGCCTCAACGGAAACTTAGAAGTCTGCGGGAGAAAGTCGC
GGCACTGAAGAATGTAGTACTATCCAATTCAACAGATGCAAAAGTAAGGGCTCGTGCGGA
AGCGAAGATTGAAAATTTTGAGAACCAGATTAATGCTATCTATAGCAAAGCACACCAGAA
CGCTTGAGTGATTTTCATATAATTAAAGACTACTTGTGTTGATGACTCCTATCCCCTTTG
TCATCACAAAGAATTGTCATCGTTACCGGTTGGGTTTGTTTGACGTTGGTACTACAGTTT
TATGTCTCTTGTCTCGACATGAGATACACTTTTGGTTGTCTTACGTTTATGTCTCTTTCT
CTACATGATATTTATACACT
TTTGGTT

QA 7 686 7 686
DS 



AS 1 3

CO CL4567Contig1 839 3 3 U
GATCACAGAAAAAATGTATTTATAATTAAATGAATATTCACCTTCCAAAACAATGTAAAA
CTTTAAAAAAGAATGAAAAAATTAATGAATTGTGAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAG
GCACACCAGTTTGTGGAATCCAAGAGCGACCACCCAGAAATCTCGCAGGAGCAAATCCAA
GAGCCTGAGGACGAGTAATCCTCTGAATACCACGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCG
ACCCAGGCCCACTGTTCTCATACTCAGCGTAGAAAAGCGTTTTGAGCGCAAAGTCACCGT
TCCATGCAGACCATCCCGCTGGATCAATAACATCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGG
TCCTTGCAAACTCTCTCCACGGCCTTCCGAGATACGCTTTGTTTATGTGTTTCACCGGAA
TATACGCCGGTTCTCCAATGATACGGCAGTTGTGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCT
TGTCGCTACGTCCCTGTGCGGTGACCATGCAACCTTGGCCTCCCATGGGTTTTCTCACCA
CGATGATGCAGTTTTGGAAAACGGTGACTGAGTCGCCGAAGATGAAGTCGACGGTTCCTG
AGATGGTGGAGTCACGGTAGAATTGACGATGGGCATGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAAC
CATCGATTTGACAGTTGAAGATAACTACTTGGTCGGCAGAGACTCTTAGGGCTACAGATC
GTCCTCCTTGGGGACCGGCGGTGTTCTCAATCCCGATGTTCTTGGCCAAGAAGTTGTCAC
CCTCGACCGTGAGAGAGGATGTGAGGTATGTCCTGACCTTGCCGATAGCAAAGTTGAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A926JQ U 1
AF RR4AA18JQ U 1
AF RR4AK75TF C 25
BS 1 705 RR4A926JQ
BS 706 827 RR4AA18JQ
BS 828 839 RR4AK75TF

RD RR4A926JQ 705 0 0
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CTTTAAAAAAGAATGAAAAAATTAATGAATTGTGAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAG
GCACACCAGTTTGTGGAATCCAAGAGCGACCACCCAGAAATCTCGCAGGAGCAAATCCAA
GAGCCTGAGGACGAGTAATCCTCTGAATACCACGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCG
ACCCAGGCCCACTGTTCTCATACTCAGCGTAGAAAAGCGTTTTGAGCGCAAAGTCACCGT
TCCATGCAGACCATCCCGCTGGATCAATAACATCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGG
TCCTTGCAAACTCTCTCCACGGCCTTCCGAGATACGCTTTGTTTATGTGTTTCACCGGAA
TATACGCCGGTTCTCCAATGATACGGCAGTTGTGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCT
TGTCGCTACGTCCCTGTGCGGTGACCATGCAACCTTGGCCTCCCATGGGTTTTCTCACCA
CGATGATGCAGTTTTGGAAAACGGTGACTGAGTCGCCGAAGATGAAGTCGACGGTTCCTG
AGATGGTGGAGTCACGGTAGAATTGACGATGGGCATGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAAC
CATCGATTTGACAGTTGAAGATAACTACTTGGTCGGCAGAGACTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4AA18JQ 827 0 0
GATCACAGAAAAAATGTATTTATAATTAAATGAATATTCACCTTCCAAAACAATGTAAAA
CTTTAAAAAAGAATGAAAAAATTAATGAATTGTGAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAG
GCACACCAGTTTGTGGAATCCAAGAGCGACCACCCAGAAATCTCGCAGGAGCAAATCCAA
GAGCCTGAGGACGAGTAATCCTCTGAATACCACGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCG
ACCCAGGCCCACTGTTCTCATACTCAGCGTAGAAAAGCGTTTTGAGCGCAAAGTCACCGT
TCCATGCAGACCATCCCGCTGGATCAATAACATCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGG
TCCTTGCAAACTCTCTCCACGGCCTTCCGAGATACGCTTTGTTTATGTGTTTCACCGGAA
TATACGCCGGTTCTCCAATGATACGGCAGTTGTGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCT
TGTCGCTACGTCCCTGTGCGGTGACCATGCAACCTTGGCCTCCCATGGGTTTTCTCACCA
CGATGATGCAGTTTTGGAAAACGGTGACTGAGTCGCCGAAGATGAAGTCGACGGTTCCTG
AGATGGTGGAGTCACGGTAGAATTGACGATGGGCATGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAAC
CATCGATTTGACAGTTGAAGATAACTACTTGGTCGGCAGAGACTCTTAGGGCTACAGATC
GTCCTCCTTGGGGACCGGCGGTGTTCTCAATCCCGATGTTCTTGGCCAAGAAGTTGTCAC
CCTCGACCGTGAGAGAGGATGTGAGGTATGTCCTGACCTTGCCGATA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4AK75TF 815 0 0
ATTAAATGAATATTCAC*TTCCAAAACAATGTAAAACTTTAAAAAAGAATGAAAAAATTA
ATGAATTGTGAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAGGCACACCAATTTGTGGAATCCACG
AGCGACCACCCAGAAATCTCGCAGGAGCAAATCCAAGAGC*TGAGGACGAGTAATCCTCT
GAATACCAGGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCGACCCAGGCCCACTGTTCTCATACT
CAGCGTAGAAAAGCGTTTTGAGCGCAAAGTCACCGTTCCATGCAGACCATCCCGCTGGAT
CAATAACATCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGGTCCTTGCAAACTCTTTCCACGGCC
TTCCGAGATACGCTTTGTTTATGTGTTTCACCGGAATATACGCCGGTTCTCCAATGATAC
GGCAGTTGTGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCTTGTCGCTACGTCCCTGTGCGGTGA
CCATGCAACCTTGGCCTCCCATGGGTTTTCTCACCACGATGATGCAGTTTTGGAAAACGG
TGACTGAGTCGCCGAAGATGAAGTCGACGGTTCCTGAGATGGCGGAGTCACGGTAGAATT
GACGATGGGCATGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAACCATCGATTTGACAGTTGAAGATAA
CTACTTGGTCGGCAGAGACTCTTAGGGCTACAGCTTGTCCTCCTTGGGGACCGGCGGTGT
TCTCAATCCCGATGTTCTTGGCCAAGAAGTTGTCACCCTCGACCGTGAGAGAGGATGTGA
GGTATGTCCTGACCTTGCCGATAGCAAAGTTGAGA

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 3

CO CL4568Contig1 857 3 4 U
GCGCCGTCTTCTTCCTCCCAGAAGGTGACGCCCGTCCCAGCCCCTCCGTCGCTTCCGCCG
TCGTCGGTTAACTTCAGCAGCTCGGAAGGCTCGAAGACCACGGGATTCGGATCTCCGCCG
AACACGTTGACGGAGCCGGTGTGGGATACGGTGAAGAGGGATCTGTGTCGGATCGTGAGT
AATCTGAAGCTGGTGGTGTTTCCGAATCCGAATAGGGAGGATCCGGGCAAGGCGCTTAGG
GATTGGGATCTGTGGGGTCCCTTTTCTTCATTGTTTTCTTGGGCCTTACGCTTTCCTGGT
CTGCCTCCGTCAAGAAGTCCGAAGTGTTTGCAGTGGCATTTGCACTACTTGCAGCTGGAG
CAGTGATCCTCACACTAAATGTGCTGCTCCTGGGGGGACATATAATCTTCTTCCAAAGTC
TAAGCCTTTTGGGCTACTGTCTGTTCCCACTGGACGTTGGAGCAGTGATCTGCATGTTGA
AGGACAACGTTATACTCAAAATGATAGTAGTCACTGTGACTCTTGCCTGGAGCTCGTGGG
CCGCTTATCCTTTCATGAGCGCAGCCGTGAACCCAAGAAGAAAAGCACTCGCACTTTACC
CGGTCTTCCTCATGTATGTGTCTGTTGGATTCTTGATCATTGCCATTGATTAATTCGATC
TGGAAAAATGAAACATCAGAGATATGTTCTGTGATTCAGCTTCGAAAATCATTTGGTATA
CAGAGTAGAATAGAAGTTTCTCAATCCGTGAACTAATGAGATCATATGTATAATGTGTTC
TTTAACACTTTTTTTTGTTTTGTTAAACTCTGGTTCGACTTCATATGTTTTTGCTCCTTG
TATGAACTTGTGGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ26TF U 1
AF RR4BZ26JQ C 70
AF RR4GA56TF U 281
BS 1 667 RR4BZ26TF
BS 668 668 RR4GA56TF
BS 669 693 RR4BZ26TF
BS 694 857 RR4GA56TF

RD RR4BZ26TF 693 0 0
GCGCCGTCTTCTTCCTCCCAGAAGGTGACGCCCGTCCCAGCCCCTCCGTCGCTTCCGCCG
TCGTCGGTTAACTTCAGCAGCTCGGAAGGCTCGAAGACCACGGGATTCGGATCTCCGCCG
AACACGTTGACGGAGCCGGTGTGGGATACGGTGAAGAGGGATCTGTGTCGGATCGTGAGT
AATCTGAAGCTGGTGGTGTTTCCGAATCCGAATAGGGAGGATCCGGGCAAGGCGCTTAGG
GATTGGGATCTGTGGGGTCCCTTTTCTTCATTGTTTTCTTGGGCCTTACGCTTTCCTGGT
CTGCCTCCGTCAAGAAGTCCGAAGTGTTTGCAGTGGCATTTGCACTACTTGCAGCTGGAG
CAGTGATCCTCACACTAAATGTGCTGCTCCTGGGGGGACATATAATCTTCTTCCAAAGTC
TAAGCCTTTTGGGCTACTGTCTGTTCCCACTGGACGTTGGAGCAGTGATCTGCATGTTGA
AGGACAACGTTATACTCAAAATGATAGTAGTCACTGTGACTCTTGCCTGGAGCTCGTGGG
CCGCTTATCCTTTCATGAGCGCAGCCGTGAACCCAAGAAGAAAAGCACTCGCACTTTACC
CGGTCTTCCTCATGTATGTGTCTGTTGGATTCTTGATCATTGCCATTGATTAATTCGATC
TGGAAAA*TGAAACATCAGAGATATGTTCTGTG

QA 1 693 1 693
DS 

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T
ACTTCAGCAGCTCGGAAGGCTCGAAGACCACGGGATTCGGATCTCCGCCGAACACGTTGA
CGGAGCCGGTGTGGGATACGGTGAAGAGGGATCTGTGTCGGATCGTGAGTAATCTGAAGC
TGGTGGTGTTTCCGAATCCGAATAGGGAGGATCCGGGCAAGGCGCTTAGGGATTGGGATC
TGTGGGGTCCCTTTTCTTCATTGTTTTCTTGGGCCTTACGCTTTCCTGGTCTGCCTCCGT
CAAGAAGTCCGAAGTGTTTGCAGTGGCATTTGCACTACTTGCAGCTGGAGCAGTGATCCT
CACACTAAATGTGCTGCTCCTGGGGGGACATATAATCTTCTTCCAAAGTTTAAGCCTTTT
GGGCTACTGTCTGTTCCCACTGGACGTTGGAGCAGTGATCTGCATGTTGAAGGACAACGT
TATACTCAAAATGATAGTAGTCACTGTGACTCTTGCCTGGAGCTCGTGGGCCGCTTATCC
TTTCATGAGCGCAGCCGTGAACCCAAGAAGAAAAGCACTCGCACTTTACCCGGTCTTCCT
CATGTATGTGTCTGTTGGATTCTTGATCATTGCCATTGATTAATTCGATCTGGAAAAATG
AAACATCAGAGATATGTTCTGTGATTCAGCTTCGAAAATCATTTGGTATACAGAGTAGAA
TAGAAGTTTCTCAATCCGTGAACTAATTAGATCATATGTATAATGTGTTCTTTAACACTT
TTTTTTGTTTTGTTAAACTCTGGTTCGACTTCATATGTTTTTGCTCCTTGTATG

QA 2 775 2 775
DS 

RD RR4GA56TF 577 0 0
GGGCCTTACGCTTTCCTGGTCTGCCTCCGTCAAGAAGTCCGAAGTGTTTGCAGTGGCATT
TGCACTACTTGCAGCTGGAGCAGTGATCCTCACACTAAATGTGCTGCTCCTGGGGGGACA
TATAATCTTCTTCCAAAGTCTAAGCCTTTTGGGCTACTGTCTGTTCCCACTGGACGTTGG
AGCAGTGATCTGCATGTTGAAGGACAACGTTATACTCAAAATGATAGTAGTCACTGTGAC
TCTTGCCTGGAGCTCGTGGGCCGCTTATCCTTTCATGAGCGCAGCCGTGAACCCAAGAAG
AAAAGCACTCGCACTTTACCCGGTCTTCCTCATGTATGTGTCTGTTGGATTCTTGATCAT
TGCCATTGATTAATTCGATCTGGAAAAATGAAACATCAGAGATATGTTCTGTGATTCAGC
TTCGAAAATCATTTGGTATACAGAGTAGAATAGAAGTTTCTCAATCCGTGAACTAATGAG
ATCATATGTATAATGTGTTCTTTAACACTTTTTTTTGTTTTGTTAAACTCTGGTTCGACT
TCATATGTTTTTGCTCCTTGTATGAACTTGTGGTTCT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

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AGAATATGAAAACACATAGAGGTTTAAGTTTCACCAAAGCAACACCAATATCCAAAAGCA
GCATAGAGTTCTAAGTTCCAAATACACGAAACACATAGATTACTTCTCAACATATGGAGA
CTGCTTCATACGAGAAGGCTTTGGTACCCTCTTCGTCTTCTTCGGTGAATCTTCTTCAAC
ATCCTCATCCATTTCATCTGTAGGTTCTTTCTCCGAAGCTTTCTTCTCGGCAACTTCTTT
TTTCGTAGCTTCCTTCTCCGCATCTTCTTTCTCAAACTTCTCTGCAGCTGCTTCCATCAC
TTCAATATCATCTTGCATTGCCTGCTCGGGCTCATTCTCAACGTCTTTAGTGGCTTCCTT
ATCAGCATCATCTTCTGCCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCTTTCTTTGTGGTCTCCTT
ATCAGCATCAACCTGGCCTTCTTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTAGCCTCCTT
ATCAGCCTCATCTTCTACCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCCTTCTTTGTGGTCTCCTT
ATCAGCATCAACCTGGCCTTATTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTAGCCTCCTT
ATCAGCCTCATCTTCTACCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCCTTCTTTGTGGTCTCCTT
ATCAGCATCAACCTGGCCTTCTTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTGGCGTCCTT
ATCAGCCTCATCTTCTGCCATATGTTCGGGTTCATTTTTCTTGGCCTCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN07JQ U 1
AF RR4A249JQD U 62
BS 1 546 RR4GN07JQ
BS 547 547 RR4A249JQD
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BS 561 721 RR4GN07JQ
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RD RR4GN07JQ 721 0 0
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ATCAGCATCAACCTGGCCTTATTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTAGCCTCCTT
ATCAGCCTCATCTTCTACCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCCTTCTTTGTGGTCTCCTT
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4A249JQD 771 0 0
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CATAGAGTTCTAAGTTCCAAATACACGAAACACATAGATTACTTCTCAACATATGGAGAC
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TCCTCATCCATTTCATCTGTAGGTTCTTTCTCCGAAGCTTTCTTCTCGGCAACTTCTTTT
TTCGTAGCTTCCTTCTCCGCATCTTCTTTCTCAAACTTCTCTGCAGCTGCTTCCATCACT
TCAATATCATCTTGCATTGCCTGCTCGGGCTCATTCTCAACGTCTTTAGTGGCTTCCTTA
TCAGCATCATCTTCTGCCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCTTTTTTTGTGGTCTCCTTA
TCAGCATCAACCTGGCCTTCTTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTAGCCTCCTTA
TCAGCCTCATCTTCTACCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCCTTCTTTGTGGTCTCCTTA
TCAGCATCAACCTGGCCTTCTTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTAGCCTCCTTA
TCAGCCTCATCTTCTACCATCTGTTCGGGTTCATTCTCACCCTTCTTTGTGGTCTCCTTA
TCAGCATCAACCTGGCCTTCTTTCTCAGGCTCATTTTCTCCATCCTTCGTGGCGTCCTTA
TCAGCCTCATCTTCTGCCATATGTTCGGGTTCATTTTTCTTGGCCTCCACC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 3

CO CL4570Contig1 890 3 8 U
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TAATTATATAACTTCGTTTAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAGCTTTATACA
ATACAGTAGCAGCTGGGCCATATTCGCTAAGGTATATATATTATATGATGATGAAATTAA
AAAAATATGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACAACAGATTCAA
TAGGAATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCCGGTAACAAGCTAC
ACGGTTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACT
TCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTAATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGAT
CGTTGGTGAACCCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACGGT
AATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCCGAAGCAGGGTGTTGGT
TATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAA
AGATATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTCGGATAGCGGATTGTG
TCTGAAGCAACGTTATGTCTTCCATCCTAACGTCTTTGATTCCACCGGACATTTCACTTC
CGAGTGCTATTCCAGCACTATCGGGAGATATGCATGTGAGCCTTCGGATCGAGAGTTGCT
GAGTTGGCATTCCGACTTTGATACCGAACTGATCCCAACCGCTCTTGACGGCGATGCAAT
CGTCTCCGGAGACTACGAAACAGTCTTCGATCAACGTGTTGGTGCAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B742JQ U 11
AF RR4AA65JQ U 1
AF RR4CR73JQ U 162
BS 1 184 RR4AA65JQ
BS 185 185 RR4B742JQ
BS 186 436 RR4AA65JQ
BS 437 437 RR4B742JQ
BS 438 830 RR4AA65JQ
BS 831 831 RR4CR73JQ
BS 832 859 RR4AA65JQ
BS 860 890 RR4CR73JQ

RD RR4B742JQ 758 0 0
GTTTATAATCATGTATTAATTAATTAAGGAACTTAATAATTCCACAAAGCTAATTATATA
ACTTCGTTTAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAGCTTTATACAATACAGTAGC
AGCTGGGCCATATTCGCTAAGGTATATATATTATATGATGATGAAATTAAAAAAATATGA
TATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACAACAGATTCAATAGGAATCTT
ATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCCGGTAACAAGCTACACGGTTTTGG
CATCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTC
AGCAGCCAAAGCAATGTTAATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAA
CCCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACGGTAATTAATATT
CGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCCGAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACC
ACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTT
AACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTCGGATAGCGGATTGTGTCTGAAGCAA
CGTTATGTCTTCCATCCTAACGTCTTTGATTCCACCGGACATTTCACTTCCGAGTGCTAT
TCCAGCACTATCGGGAGATATGCATGTGAGCCTTCGGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4AA65JQ 859 0 0
GGTCTCAAATGTTTATAATCATGTATTAATTAATTAAGGAACTTAATAATTCCACAAAGC
TAATTATATAACTTCGTTTAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAGCTTTATACA
ATACAGTAGCAGCTGGGCCATATTCGCTAAGGTATATATATTATATGATGATGAAATTAA
AAAA*TATGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACAACAGATTCAA
TAGGAATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCCGGTAACAAGCTAC
ACGGTTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACT
TCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTAATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGAT
CGTTGGTGAACCCATCAAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACGGT
AATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCCGAAGCAGGGTGTTGGT
TATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAA
AGATATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTCGGATAGCGGATTGTG
TCTGAAGCAACGTTATGTCTTCCATCCTAACGTCTTTGATTCCACCGGACATTTCACTTC
CGAGTGCTATTCCAGCACTATCGGGAGATATGCATGTGAGCCTTCGGATCGAGAGTTGCT
GAGTTGGCATTCCGACTTTGATACCGAACTGATCCCAACCGCTCTTGACG*CGATGCAAT
CGTCTCCGGAGACTACGAA

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR4CR73JQ 729 0 0
TATATGATGATGAAATTAAAAAAATATGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTG
TTCAGGACAACAGATTCAATAGGAATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGAT
TTCTCCGGTAACAAGCTACACGGTTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAGATGGCC
GTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTAATATTCGACATA
CATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAACCCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTA
TCCGCGGTCATGTCACGGTAATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAA
CCCGAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTC
ATTGTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTG
ATTCGGATAGCGGATTGTGTCTGAAGCAACGTTATGTCTTCCATCCTAACGTCTTTGATT
CCACCGGACATTTCACTTCCGAGTGCTATTCCAGCACTATCGGGAGATATGCATGTGAGC
CTTCGGATCGAGAGTTGCTGAGTTGGCATTCCGACTTTGATACCGAACTGATCCCAACCG
CTCTTGACGGCGATGCAATCGTCTCCGGAGACTACGAAACAGTCTTCGATCAACGTGTTG
GTGCAAGAA

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

CO CL4571Contig1 685 3 10 U
GGGAAGACATCTCTTCAAGGCTTTCTCATGGAGCAAACAAACACAAAGACTGTTGAAGAT
GTTGAAAGTGTTGATGTCTATACAGCAAAAGGTTTGCTTACTGTTGGCCATCATAGATAT
CTCGATGTTAGGACAAATGAAGAATTCGCAAAGAGCCACTTTGAGGATGCCTTGAACATA
CCTTACATGTTCAAAACAGATGAAGGTAGGATTGTAAATCCGGATTTCCTTCCTCAAGTA
GCATCGGTTTGCAAGAAAGATGACAATCTGATCGTGGCTTGTAACTCTGGAGGAAGAGCA
ACTCGTGCTTGCGTCGATCTTCTCAATGCGGGGTATGAGCATGTGGCTAACATAGAGGGA
GGCTACTCGGCTTGGGTTGACGCTGGTTTCGCTTGCGATAAATCTGCAGCAGAGCTCAAG
ACCGCTTGCAGGTTCCGCCCTACGGACAACTAAACCAGCCCAGTCTTGTTATTCACTAAA
ACATCTCTATTTTTATATATAACCGGTTTAATGCAAAAAAATATATATATGAAATTGAAG
TTGTGATGTTGTATTTGTGATGTTGTATTAAGTTTGTTTCGAGCTCGATGAAGCTGTCTG
CATGGAGTGTTACATTGGGCATGTTCATTTGTGCATCTAGATAGATCATCTGAATGGAAA
TGATAATTAATGTTGGTTTTGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CC72TF U 1
AF RR4B325JQ C 15
AF RR4B325TF U 15
BS 1 92 RR4CC72TF
BS 93 93 RR4B325TF
BS 94 393 RR4CC72TF
BS 394 394 RR4B325TF
BS 395 515 RR4CC72TF
BS 516 516 RR4B325TF
BS 517 520 RR4CC72TF
BS 521 521 RR4B325TF
BS 522 565 RR4CC72TF
BS 566 685 RR4B325TF

RD RR4CC72TF 565 0 0
GGGAAGACATCTCTTCAAGGCTTTCTCATGGAGCAAACAAACACAAAGACTGTTGAAGAT
GTTGAAAGTGTTGATGTCTATACAGCAAAAGGCTTGCTTACTGTTGGCCATCATAGATAT
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CCTTACATGTTCAAAACAGATGAAGGTAGGATTGTAAATCCGGATTTCCTTCCTCAAGTA
GCATCGGTTTGCAAGAAAGATGACAATCTGATCGTGGCTTGTAACTCTGGAGGAAGAGCA
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GGCTACTCGGCTTGGGTTGACGCTGGTTTCGCTGGCGATAAATCTGCAGCAGAGCTCAAG
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QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4B325JQ 671 0 0
GG
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TCTATACAGCAAAAGGTTTGCTTACTGTTGGCCATCATAGATATCTCGATGTTAGGACAA
ATGAAGAATTCGCAAAGAGCCACTTTGAGGATGCCTTGAACATACCTTACATGTTCAAAA
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AAGATGACAATCTGATCGTGGCTTGTAACTCTGGAGGAAGAGCAACTCGTGCTTGCGTCG
ATCTTCTCAATGCGGGGTATGAGCATGTGGCTAACATAGAGGGAGGCTACTCGGCTTGGG
TTGACGCTGGTTTCGCTTGCGATAAATCTGCAGCAGAGCTCAAGACCGCTTGCAGGTTCC
GCCCTACGGACAACTAAACCAGCCCAGTCTTGTTATTCACTAAAACATCTCTATTTTTAT
ATATAACCGGTTTAATGCAAAAAAATATATATATGAAATTGAAGTTGTGATGTTGTATTT
GTGATGTTGTATTAAGTTTGTTTCGAGCTCGATGAAGCTGTCTGCATGGAGTGTTACATT
GGGCATGTTCATTTGTGCATCTAGATAGATCATCTGAATGGAAATGATAATTAATGTTGG
TTTTGTGTC

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR4B325TF 671 0 0
GG
AAGGCTTTCTCATGGAGCAAACAAACACAAAGACTGTTGAAGATGTTGAAAGTGTTGATG
TCTATACAGCAAAAGGTTTGCTTACTGTTGGCCATCATAGATATCTCGATGTTAGGACAA
ATGAAGAATTCGCAAAGAGCCACTTTGAGGATGCCTTGAACATACCTTACATGTTCAAAA
CAGATGAAGGTAGGATTGTAAATCCGGATTTCCTTCCTCAAGTAGCATCGGTTTGCAAGA
AAGATGACAATCTGATCGTGGCTTGTAACTCTGGAGGAAGAGCAACTCGTGCTTGCGTCG
ATCTTCTCAATGCGGGGTATGAGCATGTGGCTAACATAGAGGGAGGCTACTCGGCTTGGG
TTGACGCTGGTTTCGCTTGCGATAAATCTGCAGCAGAGCTCAAGACCGCTTGCAGGTTCC
GCCCTACGGACAACTAAACCAGCCCAGTCTTGTTATTCACTAAAACATCTCTATTTTTAT
ATATAACCGGTTTAATGCAAAAAAATATATATATGAAATTGAAGTTGTGATGTTGTATTT
GTGATGTTGTATTAAGTTTGTTTCGAGCTCGATGAAGCTGTCTGCATGGAGTGTTACATT
GGGCATGTTCATTTGTGCATCTAGATAGATCATCTGAATGGAAATGATAATTAATGTTGG
TTTTGTGTC

QA 3 671 3 671
DS 



AS 1 3

CO CL4572Contig1 652 3 2 U
GGTTACACAGCTGTTATTAAAAAAAATACAATTCAGTTTAACAACGGATGAGTCATTACA
ATTTGGCTTCACGTGATACAAACACACTAGTATTTAAAACAAAAATTCAAAAGAATTAGA
AAATATATATGGGTTAACAACCAACATGGTCACGCCAGTCCAATAACAAAAGAGCAGCTG
CATAGTGGGACAAAGCACCCAACATAACGAACACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCA
CACGATCAAACCATCCAGGCTTAAGCCTCTCAGGTACTCTCCCTACATAAAAACCTGTCC
CAACAAGATAGAACACTGCCATGCCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGT
TTTCCCAGTTGACCACTATAGCATGGACAGCAGGCACGATCCCGAAAAGCCCCATGGAGG
CAAAGAGCAAAGCTCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAAAGTGATGGAGTGAAGAGTG
TGATGATGGTGAAGATTCCCATAGAGGTAATGCCTGCGAGGTAGATGAAGTACCAACGAG
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TGCCGGCGTAGTCTATGCGGAGGAGGAAGACGTTAAGGTCTTTGGAGTGGCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO80JQ U 1
AF RR4BO80TF C 1
AF RR4EE61JQ U 19
BS 1 596 RR4BO80JQ
BS 597 652 RR4EE61JQ

RD RR4BO80JQ 597 0 0
GGTTACACAGCTGTTATTAAAAAAAATACAATTCAGTTTAACAACGGATGAGTCATTACA
ATTTGGCTTCACGTGATACAAACACACTAGTATTTAAAACAAAAATTCAAAAGAATTAGA
AAATATATATGGGTTAACAACCAACATGGTCACGCCAGTCCAATAACAAAAGAGCAGCTG
CATAGTGGGACAAAGCACCCAACATAACGAACACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCA
CACGATCAAACCATCCAGGCTTAAGCCTCTCAGGTACTCTCCCTACATAAAAACCTGTCC
CAACAAGATAGAACACTGCCATGCCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGT
TTTCCCAGTTGACCACTATAGCATGGACAGCAGGCACGATCCCGAAAAGCCCCATGGAGG
CAAAGAGCAAAGCTCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAAAGTGATGGAGTGAAGAGTG
TGATGATGGTGAAGATTCCCATAGAGGTAATGCCTGCGAGGTAGATGAAGTACCAACGAG
GAGTGCACTGGAAGATGTAGTAAATTGGTGGGAAGAAAGAAGTGATGATCATGGCG
C

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4BO80TF 597 0 0
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ATTTGGCTTCACGTGATACAAACACACTAGTATTTAAAACAAAAATTCAAAAGAATTAGA
AAATATATATGGGTTAACAACCAACATGGTCACGCCAGTCCAATAACAAAAGAGCAGCTG
CATAGTGGGACAAAGCACCCAACATAACGAACACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCA
CACGATCAAACCATCCAGGCTTAAGCCTCTCAGGTACTCTCCCTACATAAAAACCTGTCC
CAACAAGATAGAACACTGCCATGCCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGT
TTTCCCAGTTGACCACTATAGCATGGACAGCAGGCACGATCCCGAAAAGCCCCATGGAGG
CAAAGAGCAAAGCTCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAAAGTGATGGAGTGAAGAGTG
TGATGATGGTGAAGATTCCCATAGAGGTAATGCCTGCGAGGTAGATGAAGTACCAACGAG
GAGTGCACTGGAAGATGTAGTAAATTGGTGGGAAGAAAGAAGTGATGATCATGGCG
C

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4EE61JQ 634 0 0
AAAAAAAATACAATTCAGTTTAACAACGGATGAGTCATTACAATTTGGCTTCACGTGATA
CAAACACACTAGTATTTAAAACAAAAATTCAAAAGAATTAGAAAATATATATGGGTTAAC
AACCAACATGGTCACGCCAGTCCAATAACAAAAGAGCAGCTGCATAGTGGGACAAAGCAC
CCAACATAACGAACACATGGAAAATCTGATGACTATGTCCCACACGATCAAACCATCCAG
GCTTAAGCCTCTCAGGTACTCTCCCTACATAAAAACCTGTCCCAACAAGATAGAACACTG
CCATGCCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGTTTTCCCAGTTGACCACTA
TAGCATGGACAAG*GGCACGATCCCGAAAAGCCCCATGGAGGCAAAGAGCAAAGCTCGAA
AACCTCGGTACTTGGGAGAGGAAAGTGATGGAGCGAAGAGTGTGATGATGGTGAAGATTC
CCATAGAGGTAATGCCTGCGAGGTAGATGAAGTACCAACGAGGAGTGCACTGGAAGATGT
AGTAAATTGGTGGGAAGAAAGAAGTGATGATCATGGCGGTGATGCCGGCGTAGTCTATGC
GGAGGAGGAAGACGTTAAGGTCTTTGGAGTGGCA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 3

CO CL4573Contig1 391 3 17 U
GGAAAGATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGTTCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGT
GCTTCTGTTTCTTTGCGTCCTTCCTTGCCTTATCGAATCTGCTATACCTTCTCACCAGCA
ACCACTTCCAGTCACCGGGAGAAGGTTGATGAGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATT
TACAGGACCATCAGGCAGTGGACACGGTGGTGGTCGCACTCCAGCCCCCTAGTCCTACAG
CTAAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTTATTAATGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCA
CAACTCAAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTATGTATATTGTATGTATTGGTGTATTATGT
ATAATGTATGTGTTCTTAAGTTTACGTTCTC


BQ
10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AH70JQ C 1
AF RR4CQ16TF U 2
AF RR4AH70TF U 1
BS 1 1 RR4AH70JQ
BS 2 5 RR4CQ16TF
BS 6 6 RR4AH70TF
BS 7 71 RR4CQ16TF
BS 72 72 RR4AH70TF
BS 73 108 RR4CQ16TF
BS 109 109 RR4AH70TF
BS 110 128 RR4CQ16TF
BS 129 129 RR4AH70TF
BS 130 204 RR4CQ16TF
BS 205 205 RR4AH70TF
BS 206 275 RR4CQ16TF
BS 276 276 RR4AH70TF
BS 277 345 RR4CQ16TF
BS 346 346 RR4AH70TF
BS 347 377 RR4CQ16TF
BS 378 391 RR4AH70TF

RD RR4AH70JQ 391 0 0
GGAAAGATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGTTCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGT
GCTTCTGTTTCTTTGCGTCCTTCCTTGCCTTATCGAATCTGCTATACCTTCTCACCAGCA
ACCACTTCCAGTCACCGGGAGAAGGTTGATGAGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATT
TACAGGACCATCAGGCAGTGGACACGGTGGTGGTCGCACTCCAGCCCCCTAGTCCTACAG
CTAAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTTATTAATGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCA
CAACTCAAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTATGTATATTGTATGTATTGGTGTATTATGT
ATAATGTATGTGTTCTTAAGTTTACGTTCTC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR4CQ16TF 376 0 0
GAAAAATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGTTCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGTG
CTTCTGTTTCATTGCGTCCTTCCTTGCCTTATCGAATCTGCTATACCCTCTCACCAGCAA
CCACTTCTAGTCACCGGGAGAAGGTTGATGAGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATTT
ACAGGACCATCAGGCAGTGGACATGGTGGTGGTCGCACTCCAGCCCCCTAGTCCTACAGC
TAAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTTATTATTGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCAC
AACTCAAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTATGTATATTGTATGTGTTGGTGTATTATGTA
TAATGTATGTGTTCTT

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR4AH70TF 391 0 0
G
GAAAGATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGTTCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGTG
CTTCTGTTTCTTTGCGTCCTTCCTTGCCTTATCGAATCTGCTATACCTTCTCACCAGCAA
CCACTTCCAGTCACCGGGAGAAGGTTGATGAGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATTT
ACAGGACCATCAGGCAGTGGACACGGTGGTGGTCGCACTCCAGCCCCCTAGTCCTACAGC
TAAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTTATTAATGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCAC
AACTCAAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTATGTATATTGTATGTATTGGTGTATTATGTA
TAATGTATGTGTTCTTAAGTTTACGTTCTC

QA 2 391 2 391
DS 



AS 1 3

CO CL4574Contig1 1234 3 4 U
GGGAGTTACACGGCACCCAGAAGGTGGCCATTGAGGTTGAGTACAGTGAAGAAGTCGGAA
CTGGCCTTGGGCCGACGCTGGAGTTCTACACACTTGTCAGTAGAGCATTTCAAAATCCCG
ATCTTGGTATGTGGAGAAGTGATCGTAGTTCCTTGGCTGGAAAACCAATGGAAGACCCGG
GAAGTTTGGTGCCTCCTTCAGGACTCTTTCCACGCCCTTGGTCAGCCGCATCAGCTGCTT
TTCCAGGTGTGCTGCAGATTTGTCCTCTTAGGGACAGTGGTAGCCGAGGCTCTACAAGAT
GGACGAGTGTTAGACATTCCTTTCTCCAAAACCTTCTATAAACTAATTCTCGGACAGGAG
TTGAGTTCATTTGACATCCACTTCGTTGACCCTGAACTTTGTAAAACACTGGTGGAATTG
CAAGCTCTGGCACGTAGGAGAAAGGTTATCTCAGAATCACAAAGTGATGTCCGAGCAGCC
AAGTGTGATTTAAGTTTCCGTGGAACAAGGATTGAGGACCTTTGCCTTGACTTTTCCCTG
CCTGGGTACAGGGACTATGTTCTCGCTCCCCAGTTTGCTAGTGATATGGTAAATTTGGAT
AACCTCGAGGAGTATGTAAAGGCTATTGTCAATGCAACAGTATGTAACGGGATCCAAAAA
CA*GTGGAAGCGTTTCGGTCTGGATTTAACAAAGTTTTCCCTATTGAATATCTTAAGATA
TTCAATGAAGAAGAACTGGAAACTTTATTGTGTGGAGAACGAGATCTCTTTAATATGAAT
GAAGTCTTGGATCACATCAAGTTTGATCATGGTTATACTTCTAGCAGCCCGCCAGTTGAA
AATTTGTTGGAGATTCTGCATGAGTTTGACAAGGAGAAACAGCGAGCTTTTCTGCAATTT
GTAACAGGATGTCCTCGGCTACCCCCTGGCGGTTTGGCGTCTCTCAATCCCAAACTTACA
ATTGTCCGCAAGCACGGTAGCGACTCATCAGAAACCGACCTGCCTAGTGTGATGACATGC
GCCAATTATCTGAAACTTCCACCTTACTCTTCCAAAGAAAAGATGAAGGAGAAGCTAATC
TATGCAATAACTGAAGGACAAGGTTCCTTCCACCTCTCTTGAATTAGCACCATGTAAAAA
ATTAGCAGAAGCGGTAGGAGATGATAGAAGAGTGGATTGTTAGAAGACAACAAAAGGATG
CTCTTCCTTCACATTGCCTTTAATGTCCTCTCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL56TF U 1
AF RR4DN29TF U 1
AF RR4A990TF U 461
BS 1 697 RR4DL56TF
BS 698 698 RR4DN29TF
BS 699 707 RR4DL56TF
BS 708 1234 RR4A990TF

RD RR4DL56TF 722 0 0
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CTGGCCTTGGGCCGACGCTGGAGTTCTACACACTTGTCAGTAGAGCATTTCAAAATCCCG
ATCTTGGTATGTGGAGAAGTGATCGTAGTTCCTTGGCTGGAAAACCAATGGAAGACCCGG
GAAGTTTGGTGCCTCCTTCAGGACTCTTTCCACGCCCTTGGTCAGCCGCATCAGCTGCTT
TTCCAGGTGTGCTGCAGATTTGTCCTCTTAGGGACAGTGGTAGCCGAGGCTCTACAAGAT
GGACGAGTGTTAGACATTCCTTTCTCCAAAACCTTCTATAAACTAATTCTCGGACAGGAG
TTGAGTTCATTTGACATCCACTTCGTTGACCCTGAACTTTGTAAAACACTGGTGGAATTG
CAAGCTCTGGCACGTAGGAGAAAGGTTATCTCAGAATCACAAAGTGATGTCCGAGCAGCC
AAGTGTGATTTAAGTTTCCGTGGAACAAGGATTGAGGACCTTTGCCTTGACTTTTCCCTG
CCTGGGTACAGGGACTATGTTCTCGCTCCCCAGTTTGCTAGTGATATGGTAAATTTGGAT
AACCTCGAGGAGTATGTAAAGGCTATTGTCAATGCAACAGTATGTAACGGGATCCAAAAA
CA*GTGGAAGCGTTTCGGTCTGGATTTAACAAAGTTT*CCCTATTGA
TATCTTAGATATCAT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DN29TF 711 0 0
GGGAGTTACACGGCACCCAGAAGGTGGCCATTGAGGTTGAGTACAGTGAAGAAGTCGGAA
CTGGCCTTGGGCCGACGCTGGAGTTCTACACACTTGTCAGTAGAGCATTTCAAAATCCCG
ATCTTGGTATGTGGAGAAGTGATCGTAGTTCCTTGGCTGGAAAACCAATGGAAGACCCGG
GAAGTTTGGTGCCTCCTTCAGGACTCTTTCCACGCCCTTGGTCAGCCGCATCAGCTGCTT
TTCCAGGTGTGCTGCAGATTTGTCCTCTTAGGGACAGTGGTAGCCGAGGCTCTACAAGAT
GGACGAGTGTTAGACATTCCTTTCTCCAAAACCTTCTATAAACTAATTCTCGGACAGGAG
TTGAGTTCATTTGACATCCACTTCGTTGACCCTGAACTTTGTAAAACACTGGTGGAATTG
CAAGCTCTGGCACGTAGGAGAAAGGTTATCTCAGAATCACAAAGTGATGTCCGAGCAGCC
AAGTGTGATTTAAGTTTCCGTGGAACAAGGATTGAGGACCTTTGCCTTGACTTTTCCCTG
CCTGGGTACAGGGACTATGTTCTCGCTCCCCAGTTTGCTAGTGATATGGTAAATTTGGAT
AACCTCGAGGAGTATGTAAAGGCTATTGTCAATGCAACAGTATGTAACGGGATCCAAAAC
AA*GTGGAAGCGTTTCGGTCTGGATTTAACAAAGTTTTCCCTATTGA
TATC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4A990TF 774 0 0
G
AAGTGATGTCCGAGCAGCCAAGTGTGATTTAAGTTTCCGTGGAACAAAGATTGAGGACCT
TTGCCTTGACTTTTCCCTGCCTGGGTACAGGGACTATGTTCTCGCTCCCCAGTTTGCTAG
TGATATGGTAAATTTGGATAACCTCGAGGAGTATGTAAAGGCTATTGTCAATGCAACAGT
ATGTAACGGGATCCAAAAACAAGTGGAAGCGTTTCGGTCTGGATTTAACAAAGTTTTCCC
TATTGAATATCTTAAGATATTCAATGAAGAAGAACTGGAAACTTTATTGTGTGGAGAACG
AGATCTCTTTAATATGAATGAAGTCTTGGATCACATCAAGTTTGATCATGGTTATACTTC
TAGCAGCCCGCCAGTTGAAAATTTGTTGGAGATTCTGCATGAGTTTGACAAGGAGAAACA
GCGAGCTTTTCTGCAATTTGTAACAGGATGTCCTCGGCTACCCCCTGGCGGTTTGGCGTC
TCTCAATCCCAAACTTACAATTGTCCGCAAGCACGGTAGCGACTCATCAGAAACCGACCT
GCCTAGTGTGATGACATGCGCCAATTATCTGAAACTTCCACCTTACTCTTCCAAAGAAAA
GATGAAGGAGAAGCTAATCTATGCAATAACTGAAGGACAAGGTTCCTTCCACCTCTCTTG
AATTAGCACCATGTAAAAAATTAGCAGAAGCGGTAGGAGATGATAGAAGAGTGGATTGTT
AGAAGACAACAAAAGGATGCTCTTCCTTCACATTGCCTTTAATGTCCTCTCTT

QA 2 774 2 774
DS 



AS 1 3

CO CL4575Contig1 894 3 7 U
TTGTTGTGGTAAAAGTTAAATACAAAAATGTACATACTGGGGCAACAAATGAAAAAAAAA
AACAGGTATAAATCAGTAGCCAAATTTGTAATTTTCAAAACCATCTGATACGAAGCTAAC
GTGGTTCTTAGTTTTGTGATTCATGTGTTGTAAACAGGATGATCTTGAAATCCAACAAGA
GGAGAGAGTAGGGGGAGGCTGATTTGGTTTCCTGCTGGAGCCATCTTGTCTGGTGAAAGA
AACTAATTCAACTTAATTTGAACGAGGAAGGGCCTTTTTCTTCTTCTTCTGCCAAGTAAC
TTGTTTGGAGGATTGGTGGTAATGGTGCCACTACTTTAACAACCTTATGAGTGTCCAACA
GGTTTGGTATCTCAACTTCATGTGCATGAAGATGATATCCGCAATCCCCAGGAACAGCTT
GGTTGGGTCTTCGGTAACCCCCATCTTGAGCAAAAGGAGTAGTAGTAGCATCTACAAGAT
CTGGATCAACACTCTTTGGTTGTCCTCCCGCAACATAAAGTGGGTCCCCTACTAAGGGAT
GTCCAATGAATGCAAGATGAATCCGGATTTGATGTGGTCTTCCAGACTGAATCTCCACCT
TAACCAGCGTGCAATCTCTCTGTCTGTCCCTTTCCAAAACGATTACTTTGCTGAAAGAAG
GTTTACCTTCTGAAGAAGCAACGTATAACCCTTTTGCTACGCCAGGATATCGAGCCACCC
CGATAGGCTGTTTGATAACTACCTCGTCCTCTTCTACTATACCACTCGCTAGTGCTCGAA
ATATCTTTGATATTTTCCTTACGGTTCCACACTCTTGAACCATGTTGCCAGACCCAACAA
GAGATGTCCCCTCAGCAAAATAAGCTGAAAGTTTAGTTTTTGCAAGCTTTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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AF RR4BQ53JQ U 1
AF RR4C661JQ U 1
AF RR4BQ53TF C 475
BS 1 52 RR4BQ53JQ
BS 53 53 RR4C661JQ
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BS 658 697 RR4C661JQ
BS 698 894 RR4BQ53TF

RD RR4BQ53JQ 657 0 0
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TTGTTTGGAGGATTGGTGGTAATGGTGCCACTACTTTAACAACCTTATGAGTGTCCAACA
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GGTTGGGTCTTCGGTAACCCCCATCTTGAGCAAAAGGAGTAGTAGTAGCATCTACAAGAT
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GTCCAATGAATGCAAGATGAATCCGGATTTGATGTGGTCTTCCAGACTGAATCTCCACCT
TAACCAGCGTGCAATCTCTCTGTCTGTCCCTTTCCAAAACGATTACTTTGCTGAAAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4C661JQ 697 0 0
TTGTTGTGGTAAAAGTTAAATACAAAAATGTACATACTGGGGCAACAAATGAAAAAAAAA
AACAGGTATAAATCAGTAGCCAAATTTGTAATTTTCAAAACCATCTGATACGAAGCTAAC
GTGGTTCTTAGTTTTGTGATTCATGTGTTGTAAACAGGATGATCTTGAAATCCAACAAGA
GGAGAGAGTAGGGGGAGGCTGATTTGGTTTCCTGCTGGAGCCATCTTGTCTGGTGAAAGA
AACTAATTCAACTTAATTTGAACGAGGAAGGGCCTTTTTCTTCTTCTTCTGCCAAGTAAC
TTGTTTGGAGGATTGGTGGTAATGGTGCCACTACTTTAACAACCTTATGAGTGTCCAACA
GGTTTGGTATCTCAACTTCATGTGCATGAAGATGATATCCGCAATCCCCAGGAACAGCTT
GGTTGGGTCTTCGGTAACCCCCATCTTGAGCAAAAGGAGTAGTAGTAGCATCTACAAGAT
CTGGATCAACACTCTTTGGTTGTCCTCCCGCAACATAAAGTGGGTCCCCTACTAAGGGAT
GTCCAATGAATGCAAGATGAATCCGGATTTGATGTGGTCTTCCAGACTGAATCTCCACCT
TAACCAGCGTGCAATCTCTCTGTCTGTCCCTTTCCAAAACGATTACTTTGCTGAAAGAAG
GTTTACCTTCTGAAGAAGCAACGTATAACCCTTTTGC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4BQ53TF 420 0 0
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AGGGATGTCCAATGAATGCAAGATGAATCCGGATTTGATGTGGTCTTCCAGACTGAATCT
CCACCTTAACCAGCGTGCAATCTCTCTGTCTGTCCCTTTCCAAAACGATTACTTTGCTGA
AAGAAGGTTTACCTTCTGAAGAAGCAACGTATAACCCTTTTGCTACGCCAGGATATCGAG
CCACCCCGATAGGCTGTTTGATAACTACCTCGTCCTCTTCTACTATACCACTCGCTAGTG
CTCGAAATATCTTTGATATTTTCCTTACGGTTCCACACTCTTGAACCATGTTGCCAGACC
CAACAAGAGATGTCCCCTCAGCAAAATAAGCTGAAAGTTTAGTTTTTGCAAGCTTTGTCC

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 3

CO CL4576Contig1 1069 3 13 U
GGATTCTAATCGTTCATTATTGTTTATATCAATTATTATGCGGAAATTGTGTATTCTGAT
TGCGAATACAAGTGTTGATTAAAGAGTTTACAGGTTCAATCCTATCAAATACACTTTTGG
AACTATAAACGGTTTTCATGCCTTAAAAAGAATATCTGTAACTACACTTTCAATCTAATG
GATTAACCGAATTGAAGCTCTCAAGTCGTCGTGAATGTCTCGATACTGAATTATCATTCA
CTGATCCATCAATCTTTCTCTTCTTGCTTCCTCCCTTGGACACGTCTTCTTTCTCATCCA
TGAGCGACAAGAATCTCTGCAGACGAGTAGAAGAACGCGAGGACGAGGAGTCATGATTCT
CTCTCCCAATGGCATCTTCTTCTCCCTCGCTTGGCTTTCCACTATAGAGCTGACGTATGA
TCTGAACAAAGTAGAGGGAGAGAGCGAGGACACATGCAACTCCACATATGAGAAACAGTC
CCCAGAAGCTTTTCAGATGAAGCCTGTCTGATTCAAGTTCTGCGTTCTCTAGAGTGCATG
CGTTCTTCATCAGCCACTTATCATGGATCCTCTGCAGATCCCCGTTCTCTGCCAACTCCA
*GATCGCTGTTGACAGATCTATTGCTAGAGGAGAGTCTCTAGGAAATGCAAATCCCCAGC
CACTTTTGGTGAACTCCTGACCAACGATCCTATAAGCGCAATTGCTGGAGAGGAAGAGTT
CAACATAAGGACGCTCGTCCACAATTGCAGCAACACCTCCTTTTCTTGGTCCATCTTTTA
AAGCTTTGGCATAAGCTTCAGGTGAACCAAGTGGGACGAGCCTCGACTCTGATATGTTAA
GCTCATCCCTCAGATAACGTTCTGCAAACGAACCCACCTGGTACCCAATCCGATCATTCA
TCTCTATAAGGCTGTCAATTCCCTTGATTGGTGACGAGAGCTGCTGAACCGTCAGTATCG
ATGTGAGACTAGCCGTGTAGCTTGAGTTGATTATTAGTACAACAAATAGCCATATTATCA
GAACCAACCGCCCAAGTGTACTGACTGTATTCTCTCTATGCGCGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FR39JQ U 1
AF RR4DY33JQ U 11
AF RR4FR39TF C 293
BS 1 126 RR4FR39JQ
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BS 128 153 RR4FR39JQ
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BS 333 333 RR4DY33JQ
BS 334 653 RR4FR39JQ
BS 654 721 RR4DY33JQ
BS 722 722 RR4FR39TF
BS 723 768 RR4DY33JQ
BS 769 1069 RR4FR39TF

RD RR4FR39JQ 653 0 0
GGATTCTAATCGTTCATTATTGTTTATATCAATTATTATGCGGAAATTGTGTATTCTGAT
TGCGAATACAAGTGTTGATTAAAGAGTTTACAGGTTCAATCCTATCAAATACACTTTTGG
AACTATGAACGGTTTTCATGCCTTAAAAAGAATCTCTGTAACTACACTTTCAATCTAATG
GATTAACCGAATTGAAGCTCTCAAGTCGTCGTGAATGTCTCGATACTGAATTATCATTCA
CTGATCCATCAATCTTTCTCTTCTTGCTTCCTCCCTTGGACACGTCTTCTTTCTCATCCA
TGAGCGACAAGAATCTCTGCAGACGAGTAAAAAAACGCGAGGACGAGGAGTCATGATTCT
CTCTCCCAATGGCATCTTCTTCTCCCTCGCTTGGCTTTCCACTATAGAGCTGACGTATGA
TCTGAACAAAGTAGAGGGAGAGAGCGAGGACACATGCAACTCCACATATGAGAAACAGTC
CCCAGAAGCTTTTCAGATGAAGCCTGTCTGATTCAAGTTCTGCGTTCTCTAGAGTGCATG
CGTTCTTCATCAGCCACTTATCATGGATCCTCTGCAGATCCCCGTTCTCTGCCAACTCCA
*GATCGCTGTTGACAGATCTATTGCTAGAGGAGAGTCTCTAGGAAATGCAAAT

QA 1 653 1 653
DS 

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GGTTTTCATGCCTTAAAAAGAATATCTGTAACTACACTTTCAATCTAATGGATTAACCGA
ATTGAAGCTCTCAAGTCGTCGTGAATGTCTCGATACTGAATTATCATTCACTGATCCATC
AATCTTTCTCTTCTTGCTTCCTCCCTTGGACACGTCTTCTTTCTCATCCATGAGCGACAA
GAATCTCTGCAGACGAGTAGAAGAACGCAAGGACGAGGAGTCATGATTCTCTCTCCCAAT
GGCATCTTCTTCTCCCTCGCTTGGCTTTCCACTATAGAGCTGACGTATGATCTGAACAAA
GTAGAGGAAGAGAGCGAGGACACATGCAACTCCACATATGAGAAACAGTCCCCAGAAGCT
TTTCAGATGAAGCCTGTCTGATTCAAGTTCTGCGTTCTCTAGAGTGCATGCGTTCTTCAT
CAGCCACTTATCACGGATCCTCTGCAGATCCCCGTTCTCTGCCAACTCCAAGATCGCTGT
TGACAGATCTATTGCTAGAGGAGAGTCTCTAGGAAATGCAAATCCCCAGCCACTTTTGGT
GAACTCCTGACCAACGATCCTATAAGCGCAATTGCTGGAGAGGAAGAGTTCTACATAAGG
ACGCTCGTCCACAATTGCAGCAACACCTCCTTTTCTTG

QA 1 758 1 758
DS 

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ATGATTCTCTCTCCCAATGGCATCT*CTTCTCCCTCGCTTGGCTTTCCACTATAGAGCTG
ACGTATGATCTGAACAAAGTAGAGGGAGAGAGCGAGGACACATGCAACTCCACATATGAG
AAACAGTCCCCAGAAGCTTTTCAGATGAAGCCTGTCTGATTCAAGTTCTGCGTTCTCTAG
AGTGCATGCGTTCTTCATCAGCCACTTATCATGGATCCTCTGCAGATCCCCGTTCTCTGC
CAACTCCA*GATCGCTGTTGACAGATCTATTGCTAGAGGAGAGTCTCTAGGAAATGCAAA
TCCCCAGCCACTTTTGGTGAACTCCTGACCAACGATCCTATAAGCGCAATTGCTGGAGAG
GAAGAGTTCAACATAAGGACGCTCGTCCACAATTGCAGCAACACCTCCTTTTCTTGGTCC
ATCTTTTAAAGCTTTGGCATAAGCTTCAGGTGAACCAAGTGGGACGAGCCTCGACTCTGA
TATGTTAAGCTCATCCCTCAGATAACGTTCTGCAAACGAACCCACCTGGTACCCAATCCG
ATCATTCATCTCTATAAGGCTGTCAATTCCCTTGATTGGTGACGAGAGCTGCTGAACCGT
CAGTATCGATGTGAGACTAGCCGTGTAGCTTGAGTTGATTATTAGTACAACAAATAGCCA
TATTATCAGAACCAACCGCCCAAGTGTACTGACTGTATTCTCTCTATGCGCGAAAAA

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 3

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TCAATATAACATCAAGCAATAAAAAAAGTGGAATCATTTAAATCATCCGATCATGCTACA
TAGTGAAAAGATAGCTCTACTTCAAAGAGTGTCCAAACTTTAGTGAGAAGAAGCAACTTT
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TAGCGTCTTGAACATGAGTTGGTCCGCGTCAAAATCATTGTTGGGTGTTGTCAAAAGCTT
CTCTCCTGTGAAGATGGAGTTTGCACCAGCGAGAAAACACAGGGCTTGCTCTGGCATCGA
GAACCGGACTCTACCAGCAGATAGCCTCACCATTGCTTTTGGCATCACGATTCTTGCTGT
TCCAATCATCCTGATCATCTCACATATCTCAACCGGCTTCTGGTCTTCAAGAGGAGTGCC
TTTAACTGCAAGCAGAGCATTGATGGGAACACTCTCAGGGTGAGAAGGAAGCGTTGCCAA
TGTGTGTAACAAACCTACTCTGTACTCTTCTGCCTCTCCAAGCCCTATTATTCCTCCTGA
ACAGACGTTGATACCAGCTTCACGCACATGGTCAAGAGTTTCAAGACGTTCGTCATAACT
TCTTGTAGTGATGACATTGGGGTAGTACTCTCTCGAAGTATCAAGATTATGGTTGTAAGC
AGTGAGGCCAGCTTTCTTTAGCTCTAACGCTTGCTGCTTCTCAATCATGCCCAAAGTGCA
GCAAACTTCCATCCCCACGCCTCTAATCTCTTTGATGTAGTCAAGTATCTGGTTGAAATT
GGTTTTGCGTACTATTGTATCTCGCCACGCAGCACCCATGCAAAACCTTGTGCTACCAGC
TTCTTTTGCCTTCTTAGCAGCAACGATGACAGCGTCCTTGGACATGAGCCTCTGGGCCTT
GACTCCAGTGTCATACCTGGAGGACTGAGGACAGTAAGAACAGTCCTCACTGCACCCTCC
AGTCTTTATGGAGAGGAGAGTACATTGCTGCACTTCCCTGAAGTTATGAACATGCCTATG
AACCTGTGCTCCATGAAAGAGGAGGTCAAGAACAGGAGAGTCATAGACGGCTTTGATTTC
ATCTTTACTCCAGTCATTTCTTGGACCTTCACGGATCGTTCTTTCAGCTTCAGCTGAAGC
TGCCGATGCATAGGAGTAAGAAGCACACTGACGAACAGAGATAGAATGTAGGAGTTGAGA
TCGAAATACAAATCGAGTAAGCATCATCTTCTCTCACTCTTTTCTTCCTCTTCTATCGAT
TTGAAATATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H208JQ U 1
AF RR4G927JQ U 34
AF RR4G927TF C 662
BS 1 191 RR4H208JQ
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BS 862 1332 RR4G927TF

RD RR4H208JQ 776 0 0
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TAGTGAAAAGATAGCTCTACTTCAAAGAGTGTCCAAACTTTAGTGAGAAGAAGCAACTTT
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TAGCGTCTTGAACATGAGTTGGTCCGCGTCAAAATCATTGTTGGGTGTTGTCAAAAGCTT
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TCCAATCATCCTGATCATCTCACATATCTCAACCGGCTTCTGGTCTTCAAGAGGAGTGCC
TTTAACTGCAAGCAGAGCATTGATGGGAACACTCTCAGGGTGAGAAGGAAGCGTTGCCAA
TGTGTGTAACAAACCTACTCTGTCCTCTTCTGCCTCTCCAAGCCCTATTATTCCTCCTGA
ACAGACGTTGATACCAGCTTCACGCACATGGTCAAGAGTTTCAAGACGTTCGTCATAACT
TCTTGTAGTGATGACATTGGGGTAGTACTCTCTCGAAGTATCAAGATTATGGTTGTAAGC
AGTGAGGCCAGCTTTCTTTAACTCTAACGCTTGCTGCTTCTCAATCATGCCCAA
TG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4G927JQ 828 0 0
GG
CAGAAACCTGAGAGACCAGTTCAATTCAATATAACATCAAGCAATAAAAAAAGTGGAATC
ATTTAAATCATCCGATCATGCTACATAGTGAAAAGATAGCTCTACTTCAAAGAGTGTCCA
AACTTTAGTGAGAAGAAGCAACTTTCTCGCAGCCTTAGGATTCAGAATCATCTTCGGAGA
AACTCGGGGGCTTAGGAGTGAGTCCTAGCGTCTTGAACATGAGTTGGTCCGCGTCAAAAT
CATTGT*GGGTGTTGTCAAAAGCTTCTCTCCTGTGAAGATGGAGTTTGCACCAGCGAGAA
AACACAGGGCTTGCTCTGGTATCGAGAACCGGACTCTACCAGCAGATAGCCTCACCGTTG
CTTTTGGCATCACGATTCTTGCTGTTCCAATCATCCTGATCATCTCCCATATCTCAACCG
GCTTCTGGTCTTCAAGAGGAGTGCCTTTAACTGCAAGCAGAGCATTGATGGGAACACTCT
CAGGGTGAGAAGGAAGTGTTGCCAATGTGTGTAGCAAACCTACTCTGTACTCTTCTGCGT
CTCCAAGCCCTATTATTCCTCCTGAACAGACGTTGATACCAGCTTCACGCACATGGTCAA
GAGTTTCAAGACGTTCGTCATAACTTCTTGTAGTGATGACATTGGGGTAGTACTCTCTCG
AAGTATCAAGATTATGGTTGTAAGCAGTGAGGCCAGCTTTCTTTAGCTCTAACGCTTGCT
GCTTCTCAATCATGCCCAAAGTGCAGCAAACTTCCATCCCCACGCCTCTA*TCTCTTTGA
TGTAGTCAAGTATCTGGTTGAAATTGGTTTTGCGTACTATTGTATC

QA 3 828 3 828
DS 

RD RR4G927TF 671 0 0
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GTTTTGCGTACTATTGTATCTCGCCACGCAGCACCCATGCAAAACCTTGTGCTACCAGCT
TCTTTTGCCTTCTTAGCAGCAACGATGACAGCGTCCTTGGACATGAGCCTCTGGGCCTTG
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GTCTTTATGGAGAGGAGAGTACATTGCTGCACTTCCCTGAAGTTATGAACATGCCTATGA
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TCTTTACTCCAGTCATTTCTTGGACCTTCACGGATCGTTCTTTCAGCTTCAGCTGAAGCT
GCCGATGCATAGGAGTAAGAAGCACACTGACGAACAGAGATAGAATGTAGGAGTTGAGAT
CGAAATACAAATCGAGTAAGCATCATCTTCTCTCACTCTTTTCTTCCTCTTCTATCGATT
TGAAATATTTG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 3

CO CL4578Contig1 844 3 2 U
AAACCATTCTTATTAATAAGTTTAGAATCTTGCCAACATATAAACGATAGAAAGCCAAAC
GTAAACATAACTAGAAGTAAACTGAGAGTCGAATCCAACAAGAGCAGACATAGTAGATAG
AATATTAGATATTAAGTATGGTTTAAATTTTAAGCAATGAATGCAATTTTATCTTCATGA
GTAGTAGTAGATGGTCGAGCCAAGCCTCCCAAGCGCGTGCAGTTGACATAATCAAATGGG
AAATGATTTGACATACCAGGGAGTACTATTCCCACAATCCTAACAGATCTCATCATCCAA
TTCTCTTTGTACTCTTTGGCTTTCCAAAACTGTATTATGAAACTCCTTATGAACTCCCAG
GCACCAGTTAAAATCGTCGGTATTAACCACAACAAGTTGATGTAGTTCGCATGCGGTGCA
TCTTCCCTTACCTTTCCTTTGTAGAGACTGTTGAAGTAATTGCAAGATCCATAGTGCTTG
TATGAGAATAAAATCTTGTCATCGAAGGGGGCTCTAGGAACCATATCATTGTTGTAAACA
AACCTCTCATACTCGATTCCATGCTTTCTTACCACTTCCTTCATATACTCCCCAAATTGC
TCGTCCCCTATACGTGGCTGTCCAAATGTGTAGACTCCCTCTAGCTTATCAAGTAGCACA
TCCTCACCGTGAACCGCAAGAATCGCTGGAAACAGAGCAGCTATTGCGCCACCAAGGCTG
TGACCCGTCAGGATAAATTTAAGGTTTTTGTCAATGGCAAGCATGTCCCTAAGCTTCTGT
CTGATAGTGTAGTAAGCATATTGGTGAATGAGACTTATATTTTCTTTGGGCCATCCGTTT
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4D861JQ U 1
AF RR4D861TF C 70
AF RR4BJ21JQ U 45
BS 1 677 RR4D861JQ
BS 678 844 RR4BJ21JQ

RD RR4D861JQ 677 0 0
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TCTTCCCTTACCTTTCCTTTGTAGAGACTGTTGAAGTAATTGCAAGATCCATAGTGCTTG
TATGAGAATAAAATCTTGTCATCGAAGGGGGCTCTAGGAACCATATCATTGTTGTAAACA
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TCCTCACCGTGAACCGC

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DS 

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GACATACCAGGGAGTACTATTCCCACAATCCTAACAGATCTCATCATCCAATTCTCTTTG
TACTCTTTGGCTTTCCAAAACTGTATTATGAAACTCCTTATGAACTCCCAGGCACCAGTT
AAAATCGTCGGTATTAACCACAACAAGTTGATGTAGTTCGCATGCGGTGCATCTTCCCTT
ACCTTTCCTTTGTAGAGACTGTTGAAGTAATTGCAAGATCCATAGTGCTTGTATGAGAAT
AAAATCTTGTCATCGAAGGGGGCTCTAGGAACCATATCATTGTTGTAAACAAACCTCTCA
TACTCGATTCCATGCTTTCTTACCACTTCCTTCATATACTCCCCAAATTGCTCGTCCCCT
ATACGTGGCTGTCCAAATGTGTAGACTCCCTCTAGCTTATCAAGTAGCACATCCTCACCG
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C

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CAGACATAGTAGATAGAATATTAGATATTAAGTATGGTTTAAATTTTAAGCAATGAATGC
AATTTTATCTTCATGAGTAGTAGTAGATGGTCGAGCCAAGCCTCCCAAGCGCGTGCAGTT
GACATAATCAAATGGGAAATGATTTGACATACCAGGGAGTACTATTCCCACAATCCTAAC
AGATCTCATCATCCAATTCTCTTTGTACTCTTTGCCTTTCCAAAACTGTATTATGAAACT
CCTTATGAACTCCCAGACACCAGTTAAAATCATCGGTATTAACCACAACAAGTTGATGTA
GTTCGCATTCGGTGCATCTTCCCTTACCTTTCCTTTGTAGAGACTGTTGAAGTAATTGCA
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ATCATTGTTGTAAACAAACCTCTCATACTCGATTCCATGCTTTCTTACCACTTCCTTCAT
ATACTCCCCAAATTGCTCGTCCCCTATACGTGGCTGTCCAAACGTGTAGACTCCCTCTAG
CTTATCAAGTAGTACATCCTCACCGTGAACCGCAAGAATCGCTGGAAACAGAGCAGCTAT
TGCGCCACCAAGGCTGTGACCCGTCAGGATAAATTTAAGGTTTTTGTCAATGGCAAGCAT
GTCCCTAAGCTTCTGTCTGATAGTGTAGTAAGCATATTGGTGAATGAGACTTATATTTTC
TTTGGGCCATCCGTTTTTTT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

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TCACACATTTGATGCGCTTTCCATAATCATCATGTCTTACCCATCCTCACCATCCCTAAA
CCAGAACCACTACCCAAATGCTTGTACTCTTTAGCCTCAAGATGATCGTCGTGCTCGGCA
AAACCAGTGCCTCCTTTCTTCAGCCCAACCAAGTTCCTGTCCTTGCAAGGTTTGTCACAC
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TTCGCTGTTATCTTCCGTGAAACGGATAGCAAATAGGTTCTTAAGCTTGAGCTTCTCTTT
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AGCCGATGGAAGCCAGAAGGCTTTCATTGTCCTAAGCGCCTCTTCTTCAAAAGAAGTCGC
CTCCACACTGTTCGCCCCATGGAAACCATTCTTGTCTTGGCTTTGGCTCTTGTCACTGTA
CCGAGGCAAAGCACCATGGTTTTGCTGATCAAATTCGTCGAGCTCTCTAGCCTTTTGTAA
CATGAGTCTCTCTTCTTCCTCGTCCTTATCTTGATTCTTTTGAGAAGCATGGGCAGCAAG
CCTCCTCTGGATGTCTTTCTTCTGGGCGAGGAAGCATTCGAGGATACACTCTCTGCAGAA
GACATGGCCCTTGTGGCAACACATGGGATCGATGAAGGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD49JQ U 339
AF RR4DB44JQ U 1
AF RR4DB44TF C 320
BS 1 673 RR4DB44JQ
BS 674 1002 RR4DB44TF

RD RR4CD49JQ 147 0 0
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QA 1 147 1 147
DS 

RD RR4DB44JQ 673 0 0
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CCGCATGAGCTAAGTGCCACAAGAGACATCGTGTTGGTGAGAGTGACTTT*GCAGCTCGG
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TTCGCTGTTATCTTCCGTGAAACGGATAGCAAATAGGTTCTTAAGCTTGAGCTTCTCTTT
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QA 1 673 1 673
DS 

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CGGGCATAAACTTCTCACCGCACTTCTTGCAGAAAACATGTCCGCATGAGCTAAGTGCCA
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AAACGGATAGCAAATAGGTTCTTAAGCTTGAGCTTCTCTTTGCCCTCTGGACAGACCGTA
TGAGTTTCCGGAGCTTCTACTCTAACTGAAGCTCCAGGTGTAGCCGATGGAAGCCAGAAG
GCTTTCATTGTCCTAAGCGCCTCTTCTTCAAAAGAAGTCGCCTCCACACTGTTCGCCCCA
TGGAAACCATTCTTGTCTTGGCTTTGGCTCTTGTCACTGTACCGAGGCAAAGCACCATGG
TTTTGCTGATCAAATTCGTCGAGCTCTCTAGCCTTTTGTAACATGAGTCTCTCTTCTTCC
TCGTCCTTATCTTGATTCTTTTGAGAAGCATGGGCAGCAAGCCTCCTCTGGATGTCTTTC
TTCTGGGCGAGGAAGCATTCGAGGATACACTCTCTGCAGAAGACATGGCCCTTGTGGCAA
CACATGGGATCGATGAAGGGTTC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL4580Contig1 986 3 14 U
AAACAAGAATCAATCTTTTTTTAGTGGAAACCCAAAGATTAGAGAGCGATGCTTCTACCT
GATCTGGAGGTTGTTTACACACACTTGACACACAAACAAAGTCAGATCATTCATTCATCA
AGATAAATCCCATTACCAACAAATCCAAGATAAATTAAGAAACACCCTTGTTAACTGGAA
ACCATAACTGAAACACCTGTGATGAGACCCACATGCTTCAATCACCCCAAGAAGAATCGT
TGAAGAAACAGAAGTTTCATCGTTTTGTCTGATCCATGGCTTCTTCATCCTAATGCTCCA
TCAAGGCGGCTTCCGTTTCTGACAAAGGAGCTAGCAAGTCTTCGTAGGTATCTGATAATA
AGGACGAGTCCATTAGTAAAGGTGGTGAAAACACTTGATCTTCAACGTCGTAAAACGATT
GTTGCGGATCAGAAGCTACACTGTTTGATCCAGCAACTGAGAGAAACCCATTCCCGTTAT
CGTAATCTTTGAAGGAATCTAGATCATCAAACGTGTCGGGTATGTCGCTGTACTTGCTTG
GCGCGAGGCTGTGGGGAACATTGTGTTCAAGAAAGGAAGGCTCGCTCAGAGAGGTCTGTA
ACCTCGACCCTCTGAGAGGCAAGCTTTTGGTTTCTGATGGAAATCGAGAAAAGCCAGCTC
CTGAAAGAGGTACGAAGTAATGCTCGGAGCCTTCATCGGATTGACTGTCCCGTGATGATC
CTGCTGAAGATGGAATCAATAAAGCCGCTTCTCTAACAGATTTCTTCAGGTTCTGGACAA
AAGAGCTGTTGGTATCAGATGGCAAGTTGTCTGCTCGAGTATTTGACAATGGTTGGTCCG
CAGTGTTCTTCTCAGACAAGCTTTCCATTTTATTGATCTGAGAAGCCATTGGATGTCGCT
TTTGTCCATTTCCACCTTTACCAGAAGTAGGAGTGGAGCTAAATAATTGTGGAAGCTTTA
ACGTAGGGCTAGCTGAGACCTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP26JQ U 1
AF RR4F505JQ U 100
AF RR4F505TF C 450
BS 1 172 RR4AP26JQ
BS 173 173 RR4F505JQ
BS 174 186 RR4AP26JQ
BS 187 187 RR4F505JQ
BS 188 313 RR4AP26JQ
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BS 315 325 RR4AP26JQ
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BS 327 580 RR4AP26JQ
BS 581 581 RR4F505JQ
BS 582 663 RR4AP26JQ
BS 664 664 RR4F505JQ
BS 665 728 RR4AP26JQ
BS 729 986 RR4F505TF

RD RR4AP26JQ 728 0 0
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GATCTGGAGGTTGTTTACACACACTTGACACACAAACAAAGTCAGATCATTCATTCATCA
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TGAAGAAACAGAAGTTTCATCGTTTTGTCTGATCCATGGCTTCTTCATCCTAATGCTCCA
TCAAGGCGGCTTCTGTTTCTGACAA*GGAGCTAGCAAGTCTTCGTAGGTATCTGATAATA
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GTTGCGGATCAGAAGCTACACTGTTTGATCCAGCAACTGAGAGAAACCCATTCCCGTTAT
CGTAATCTTTGAAGGAATCTAGATCATCAAACGTGTCGGGTATGTCGCTGTACTTGCTTG
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ACCTCGACCCTCTGAGAGGCAAGCTTTTGGTTTCTGATGGAAATCGAGAAAAGCCAGCTC
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CTGCTGAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4F505JQ 630 0 0
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AAACACCCTTGTTAACTGGAAACCATAACTGAAACACCTGTGATGAGACCCACATGCTTC
AATCACCCCAAGAAGAATCGTTGAAGAAACAGAAGTTTCATCGTTTTGTCTGATCCATGG
CTTCTTCATCCTAATGCTCCATCAAGGCGGCTTCCGTTTCTGACAAAGGAGCTAGCAAGT
CTTCGTAGGTATCTGATAATAAGGACGAGTCCATTGGTAAAGGTGGTGAAAACACTTGAT
CTTCAACGTCGTAAAACGATTGTTGCGGATCAGAAGCTACACTGTTTGATCCAGCAACTG
AGAGAAACCCATTCCCGTTATCGTAATCTTTGAAGGAATCTAGATCATCAAACGTGTCGG
GTATGTCGCTGTACTTGCTTGGCGCGAGGCTGTGGGGAACATTGTGTTCAAGAAAGGAAG
GCTCGCTCAGAGAGGTCTGTAACCTCGACCCTCTGAGAGGCAAGCTTTTGGTTTCTGATG
GAAATCGAGAAAAGCCAGCTCCTGAAAGAGGTACGAAGTAATGCTCGGAGCCTTCATCGG
ATTGACTGTCCCGTGATGATCCTGCTGAA
G

QA 1 629 1 629
DS 

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AACGTGTCGGGTATGTCGCTGTACTTGCTTGGCGCGAGGCTGTGGGGAACATTGTGTTCA
AGAAAGGAAGGCTCGCTCAGAGAGGTCTGTAACCTCGACCCTCTGAGAGGCAAGCTTTTG
GTTTCTGATGGAAATCGAGAAAAGCCAGCTCCTGAAAGAGGTACGAAGTAATGCTCGGAG
CCTTCATCGGATTGACTGTCCCGTGATGATCCTGCTGAAGATGGAATCAATAAAGCCGCT
TCTCTAACAGATTTCTTCAGGTTCTGGACAAAAGAGCTGTTGGTATCAGATGGCAAGTTG
TCTGCTCGAGTATTTGACAATGGTTGGTCCGCAGTGTTCTTCTCAGACAAGCTTTCCATT
TTATTGATCTGAGAAGCCATTGGATGTCGCTTTTGTCCATTTCCACCTTTACCAGAAGTA
GGAGTGGAGCTAAATAATTGTGGAAGCTTTAACGTAGGGCTAGCTGAGACCTTCTCC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL4581Contig1 590 2 5 U
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TGCTAGTTTCAACATTCACACACACACGCTGTCTCTCTTATTTTTTAGTTTATGAGAGTC
AGATACTTCGTCGCACAGAACATATCCCTAGAAAGAGAGAGAAAGATAAGGATAGCTATT
TGTAGGTATACAGTTTGGATTCATCAAGATGGAATTCAATTCAAGAAATCAGAAAAATCC
CTTGACTCAATAGTTGACCAGCCAACAGCTCGTACACAGCTTCTGTGGGATGAAATCCAT
CCCAAAACACATATCCTGTGGCATTTGAACACGTTCCTAAGGATAGAGAATTGCAGAAGA
ACGATGTCTCTATTGTTCCTGTTCCACAGCATGCCCTTTTTGTTTCAAAGAATCCATTAT
CATATGGGTTGGTGATGATGTCCATGAGAGGTTGGTAGGCGTTAAAGGCGACGAGCTTGA
GGCCTGAGTGACGTTTCATCAATGTCTGGGTTGTGGCTTCAAGTTTGGTGTTGAACATGA
TAGCATCATTGTTCAGCCGTTCGACACAGCTCTTGTTTCCTGCACCGAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FJ66JQ U 1
AF RR4EE11JQ U 1
BS 1 226 RR4EE11JQ
BS 227 227 RR4FJ66JQ
BS 228 357 RR4EE11JQ
BS 358 358 RR4FJ66JQ
BS 359 590 RR4EE11JQ

RD RR4FJ66JQ 468 0 0
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TGCTAGTTTCAACATTCACACACACACGCTGTCTCTCTTATTTTTTAGTTTATGAGAGTC
AGATACTTCGTCGCACAGAACATATCCCTAGAAAGAGAGAGAAAGATAAGGATAGCTATT
TGTAGGTATACAGTTTGGATTCATCAAGATGGAATTCAATTCAAGAAATCAGAAAAATCC
CTTGACTCAATAGTTGACCAGCCAACAGCTCGTACACAGCTTCTGTGGGATGAAATCCAT
CCCAAAACACATATCCTGTGGCATTTGAACACGTTCCTAAGGATAGAGAATTGCAGAAGA
ACGATGTCTCTATTGTTCCTGTTCCACAGCATGCCCTTTTTGTTTCAAAGAATCCATTAT
CATATGGGTTGGTGATGATGTCCATGAGAGGTTGGTAGGCGTTAAAGG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4EE11JQ 590 0 0
CAATGATCGTGATCGTCTTTAACAAAGCTTGTATCTATTGACGCATCACACAAAACCAAT
TGCTAGTTTCAACATTCACACACACACGCTGTCTCTCTTATTTTTTAGTTTATGAGAGTC
AGATACTTCGTCGCACAGAACATATCCCTAGAAAGAGAGAGAAAGATAAGGATAGCTATT
TGTAGGTATACAGTTTGGATTCATCAAGATGGAATTCAATTCAAGAGATCAGAAAAATCC
CTTGACTCAATAGTTGACCAGCCAACAGCTCGTACACAGCTTCTGTGGGATGAAATCCAT
CCCAAAACACATATCCTGTGGCATTTGAACACGTTCCTAAGGATAGAGAATTGCAGAGGA
ACGATGTCTCTATTGTTCCTGTTCCACAGCATGCCCTTTTTGTTTCAAAGAATCCATTAT
CATATGGGTTGGTGATGATGTCCATGAGAGGTTGGTAGGCGTTAAAGGCGACGAGCTTGA
GGCCTGAGTGACGTTTCATCAATGTCTGGGTTGTGGCTTCAAGTTTGGTGTTGAACATGA
TAGCATCATTGTTCAGCCGTTCGACACAGCTCTTGTTTCCTGCACCGAAA

QA 1 590 1 590
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4584Contig1 1099 2 4 U
AGGGGAACGACGACGGACGAGAGTGCCATGGACGATCGGGTTGAGAAGGCGATGGTCAAC
GACGACGAAACGGAGAAGAAATCGTGAATTGACACGTGAGAATGGGGAACTGAAGGAGAA
GGCAGCGAGATTATCGGGAGAGATCGAGGAGATGAAAGGCGTGGAAGCCGAGATGAAACA
GAGCTTCGAAGAGATGGAAGCAGAGATCGAGCAGCTAGAGGAAGAGAAGAAGGGTCTGGA
AACTGTCTCGTCTCTAGCCGTGGAGCTCGAGAGCGAGGTGGGGAAGATTCAGGAAGATCT
CGTGGAAGCGTTGAGAGACGAGACGAGAAGGAGCTGGAGTTGGAGGAGCTGAAGAGAGAG
CTGGTGGAGAAAGGAGAGAGCTTTGAGAGGTGTGAGAAGGAAGCGGGGAGTTTGAGGAAA
GAGAGAGGTGAGATGGAGAAGAAAGGTAGAGACTTGGAGAGGAAGGTAGGGGTTTTGGAA
GTGAGGTTGATGGAGGAGAGGAGCAAGAAAGTTAGGGTAGAGGAGGAGATGAGGGAGAAG
GGTAATCAGAAAGAGGAGGAGATCGAGGAGATGAAGAGGAAAGTCTCTGACTTTAAAATG
GGTTTGGTGAAGGGTATGATGGAGCTGGAGAGATGGGAGGTCGAGAAGAAGCTAATGGAG
GAAGATTTGAGTGAATCGAAAGTAAGGAAAAGAGAGTTGGAGATGAAGAAGGAGGAGTTG
GTGAAGATGGTTGATGAAGCTGAGAAAACGCTGTTTGTGTTGAACGAGAGGATCATGGAG
CCTACTACTAATGGGGTCAGAGACATAAAGGATGGTGGTGGTCAAAAATGTTCCTTGGAA
GGACAATTGCATTGGCCAGTGGTTGGAGCTTTGGGTTTGGTAGCAGCAGCGACAGTGTTT
GTATGCTACTTTAAACGGACTTGATTCAGTAATATTGAGGAGCTGAAGGACCATAACTTT
TTGCAGTTCCGCAGTCATATAGGTGCCCATAACTTTTTTGGTCTCGAGTTTGTGATGTTT
TTGGTTTGTTGGATATGTTTTGTTTGTTTGAGATGATTGATGAATCTTTGGCTTTGTGGC
TATGAATGCATTTGATATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE17TF U 1
AF RR4FE17JQ C 589
BS 1 686 RR4FE17TF
BS 687 687 RR4FE17JQ
BS 688 704 RR4FE17TF
BS 705 1099 RR4FE17JQ

RD RR4FE17TF 704 0 0
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GACGACGAAACGGAGAAGAAATCGTGAATTGACACGTGAGAATGGGGAACTGAAGGAGAA
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GAGCTTCGAAGAGATGGAAGCAGAGATCGAGCAGCTAGAGGAAGAGAAGAAGGGTCTGGA
AACTGTCTCGTCTCTAGCCGTGGAGCTCGAGAGCGAGGTGGGGAAGATTCAGGAAGATCT
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CTGGTGGAGAAAGGAGAGAGCTTTGAGAGGTGTGAGAAGGAAGCGGGGAGTTTGAGGAAA
GAGAGAGGTGAGATGGAGAAGAAAGGTAGAGACTTGGAGAGGAAGGTAGGGGTTTTGGAA
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GGTAATCAGAAAGAGGAGGAGATCGAGGAGATGAAGAGGAAAGTCTCTGACTTTAAAATG
GGTTTGGTGAAGGGTATGATGGAGCTGGAGAGATGGGAGGTCGAGAAGAAGCTAATGGAG
GAAGATTTGAGTGAATCGAAAGTAAG*AAAAGAGAGTTGGAGAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4FE17JQ 511 0 0
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AAGGAGGAGTTGGTGAAGATGGTTGATGAAGCTGAGAAAACGCTGTTTGTGTTGAACGAG
AGGATCATGGAGCCTACTACTAATGGGGTCAGAGACATAAAGGATGGTGGTGGTCAAAAA
TGTTCCTTGGAAGGACAATTGCATTGGCCAGTGGTTGGAGCTTTGGGTTTGGTAGCAGCA
GCGACAGTGTTTGTATGCTACTTTAAACGGACTTGATTCAGTAATATTGAGGAGCTGAAG
GACCATAACTTTTTGCAGTTCCGCAGTCATATAGGTGCCCATAACTTTTTTGGTCTCGAG
TTTGTGATGTTTTTGGTTTGTTGGATATGTTTTGTTTGTTTGAGATGATTGATGAATCTT
TGGCTTTGTGGCTATGAATGCATTTGATATC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL4585Contig1 924 2 2 U
GTCTGTCTGTCTCTAAACTCTGTGAAGAACACATGTCGGGACCTCAGTGCTGCGAAAACC
CGCCGGCTCTTAACCCGGTCTCCGGGTCGGGTCATGTGGAGAAGCTGGGTGGGCTTGATG
CTTACGTCTCTGGCTCTCCCGATTCCTCCAAGTTGTGCGTCATCCTCATCTCTGATGTTT
TTGGGTATGAAGCTCCAAACTTGAGGTCGCTTGCGGATAAGGTTGCAACTTTTGGATTCT
ATGTCGTGGTTCCTGATTACTTCTACGGAGATCCTTTTGATCCTTCTAATCAAGAGAGAC
CCATCTCTCTCTGGCTCAAAGACCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGACACAAAGCCAG
TAATTGAAGCCTTAAAGAGCAAAGGCATAACTGCTATTGGAGCTGCAGGGATGTGTTGGG
GTGCAAAAGTAGTGGTGGAATTGTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCTGTTCTGCTTC
ATCCTTCTTTGGTCACGGTCGACGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATTGCTATACTAG
GGGCTGAGATTGATCAGTTGTCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAGGAGATTCTTG
CTGCCAAACCTGAGGTGAATAGTTATGTGAAGATACACCCGAAAGTAGCACACGGTTGGA
CAGTTAGGTACAAGACGGATGACCCAGAGGCGGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGG
AGATGCTTGATTGGTTTGTGACTTACGTTAAATGAATGATCAAATTGGCTACTACTACTA
GTAGTGTTTATAAATAAAAAATAAAGAGAGAGACTTAAGTATGAAACTCTTTGTTGGTGT
CTTCACTCACATACCTGTTTGGAAGTTGCTATGTTGTGAGTTTGGTCTATGATGCTGAAC
ATCTATAAAAAAACGTATTTTGGC


BQ
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AF RR4AW96TF U 1
AF RR4AW96JQ C 241
BS 1 704 RR4AW96TF
BS 705 924 RR4AW96JQ

RD RR4AW96TF 704 0 0
GTCTGTCTGTCTCTAAACTCTGTGAAGAACACATGTCGGGACCTCAGTGCTGCGAAAACC
CGCCGGCTCTTAACCCGGTCTCCGGGTCGGGTCATGTGGAGAAGCTGGGTGGGCTTGATG
CTTACGTCTCTGGCTCTCCCGATTCCTCCAAGTTGTGCGTCATCCTCATCTCTGATGTTT
TTGGGTATGAAGCTCCAAACTTGAGGTCGCTTGCGGATAAGGTTGCAACTTTTGGATTCT
ATGTCGTGGTTCCTGATTACTTCTACGGAGATCCTTTTGATCCTTCTAATCAAGAGAGAC
CCATCTCTCTCTGGCTCAAAGACCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGACACAAAGCCAG
TAATTGAAGCCTTAAAGAGCAAAGGCATAACTGCTATTGGAGCTGCAGGGATGTGTTGGG
GTGCAAAAGTAGTGGTGGAATTGTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCTGTTCTGCTTC
ATCCTTCTTTGGTCACGGTCGACGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATTGCTATACTAG
GGGCTGAGATTGATCAGTTGTCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAGGAGATTCTTG
CTGCCAAACCTGAGGTGAATAGTTATGTGAAGATACACCCGAAAGTAGCACACGGTTGGA
CAGTTAGGTACAAGACGGATGACCCAGAGGCGGTTAAAGCTGCA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4AW96JQ 684 0 0
ATGTCGTGGTTCCTGATTACTTCTACGGAGATCCTTTTGATCCTTCTAATCAAGAGAGAC
CCATCTCTTTCTGGCTCAAAGACCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGACACAAAGCCAG
TAATTGAAGCCTTAAAGAGCAAAGGCATAACTGCTATTGGAGCTGCAGGGATGTGTTGGG
GTGCAAAAGTAGTGGTGGAATTGTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCTGTTCTGCTTC
ATCCTTCTTTGGTCACGGTCGACGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATTGCTATACTAG
GGGCTGAGATTGATCAGTTGTCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAGGAGATTCTTG
CTGCCAAACCTGAGGTGAATAGTTATGTGAAGATACACCCGAAAGTAGCACACGGTTGGA
CAGTTAGGTACAAGACGGATGACCCAGAGGCGGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGG
AGATGCTTGATTGGTTTGTGACTTACGTTAAATGAATGATCAAATTGGCTACTACTACTA
GTAGTGTTTATAAATAAAAAATAAAGAGAGAGACTTAAGTATGAAACTCTTTGTTGGTGT
CTTCACTCACATACCTGTTTGGAAGTTGCTATGTTGTGAGTTTGGTCTATGATGCTGAAC
ATCTATAAAAAAACGTATTTTGGC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL4586Contig1 460 2 1 U
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TCTAGGCGCGTTTCTCTGCTAAAGCTCACCATCATCATCATGACTCGAGGAAGCCAGAGA
GAGCGAGACCGTGAAAGAGCTCAAGCTCGTGCCGGAGGAAAAGGAAAGACCAAAGACGAT
GGTTTAACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGGGATGCAAAAGCATTGCAAGAGAAGGCGGCG
AAGAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAGGAGGAGGCAAAGGAAAC
AATAATAAGAAATGATTCGTTGTTGTTGTAACTTGTAACTTTCTTTCTTTCTTTTGAGAT
CGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTGCTTTTGAATCTGAAACTTTGATGTTTGTTG
TGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F365JQ C 1
AF RR4F365TF U 1
BS 1 460 RR4F365TF

RD RR4F365JQ 460 0 0
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TCTAGGCGCGTTTCTCTGCTAAAGCTCACCATCATCATCATGACTCGAGGAAGCCAGAGA
GAGCGAGACCGTGAAAGAGCTCAAGCTCGTGCCGGAGGAAAAGGAAAGACCAAAGACGAT
GGTTTAACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGGGATGCAAAAGCATTGCAAGAGAAGGCGGCG
AAGAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAGGAGGAGGCAAAGGAAAC
AATAATAAGAAATGATTCGTTGTTGTTGTAACTTGTAACTTTCTTTCTTTCTTTTGAGAT
CGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTGCTTTTGAATCTGAAACTTTGATGTTTGTTG
TGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCG

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4F365TF 460 0 0
GGATTGTCTCTTGGCCTTTGGCTTCTGTAAGGGAGAGATCTCTCTCCAGATCTCTTGTTG
TCTAGGCGCGTTTCTCTGCTAAAGCTCACCATCATCATCATGACTCGAGGAAGCCAGAGA
GAGCGAGACCGTGAAAGAGCTCAAGCTCGTGCCGGAGGAAAAGGAAAGACCAAAGACGAT
GGTTTAACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGGGATGCAAAAGCATTGCAAGAGAAGGCGGCG
AAGAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAGGAGGAGGCAAAGGAAAC
AATAATAAGAAATGATTCGTTGTTGTTGTAACTTGTAACTTTCTTTCTTTCTTTTGAGAT
CGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTGCTTTTGAATCTGAAACTTTGATGTTTGTTG
TGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCG

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

CO CL4587Contig1 1062 2 10 U
GTCATTGGAGGTAAAGGCAGTCATAGCATTAAGATACTAGAATCTCAAAGCCCTAGCCTC
GAAGAGAATGTGGATCCCATTGAAACATTGAAGAGCCAGTTAGTCGAAGCTGGCGTTTCA
TCAAGCTCTGAAACCGAGAATGATCGTGAGAAATGTAAATCTGAATGGGCGAAGTTGCTA
AAAAGGATATGGGCGCTTGGTCCAAGAGAGAAAGGTCCAAACATACTATTTGCTCCAGAT
GGTAAAAGAATCTGCGAGGATGGGTCCATTCTTGTAAGAGGCTCTCCTCATGTCTCTCAA
AGACTTGGCTTCACAGAAGATTCTACTGAGACACCATCTGACTCAGCATTGTACAGTGAA
GCACTGACTCTCGAGAGCAGCATAGTCTCTGGTTTTCAGCTAGCTACAGCATCAGGACCT
CTATGCGACGATCCAATGTGGGGATTAGCTTTCACCATTGAGTCTCATCTCGCAGAAAAT
TCCGAAACAGAGAAACAACCTGAAAACTTTGGAATATTCACAGGACAAGTCATGACAGCT
GTCAAAGACGCATGTAGAGCCGCCGTGCTTCAGACAAATCCACGGATCGTGGAAGCAATG
TACTTCTGCGAACTAGACACCGCACCGGAGTATCTTGGTGCCATGTACGCGGTTCTGAGC
AGAAGACGAGCTAGAGTTCTCAAGGAAGAAATGCAAGAAGGGTCGTCTCTGTTTACAGTC
CATGCCTACGTGCCCGTTTCAGAAAGTTTTGGTTTTGCAGACGAGCTGAGAAAAGGAACG
TCAGGTGGTGCGAGTGCTCTGATGGTTCTGAGCCACTGGGAAATGCTCGAGGAAGATCCC
TTCTTTGTTCCCAAAACGGAAGAAGAGATCGAAGAGTTTGGTGATGGAGCAAGCGTGCTT
CCCAACACGGCGAGGAAGCTCATCAACGCCGTGAGACGCAGGAAAGGGTTACACGTTGAG
GAGAAAGTGGTTCAACACGCCACTAAACAGAGAACCTTGGCTCGTAAAGTCTGAGTTTTT
ACTGTTTTTTTGTCCGTTTGAAATGGTTTCGGTCCGTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GW16TF U 1
AF RR4GW16JQ C 289
BS 1 641 RR4GW16TF
BS 642 642 RR4GW16JQ
BS 643 677 RR4GW16TF
BS 678 678 RR4GW16JQ
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BS 735 1062 RR4GW16JQ

RD RR4GW16TF 738 0 0
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GAAGAGAATGTGGATCCCATTGAAACATTGAAGAGCCAGTTAGTCGAAGCTGGCGTTTCA
TCAAGCTCTGAAACCGAGAATGATCGTGAGAAATGTAAATCTGAATGGGCGAAGTTGCTA
AAAAGGATATGGGCGCTTGGTCCAAGAGAGAAAGGTCCAAACATACTATTTGCTCCAGAT
GGTAAAAGAATCTGCGAGGATGGGTCCATTCTTGTAAGAGGCTCTCCTCATGTCTCTCAA
AGACTTGGCTTCACAGAAGATTCTACTGAGACACCATCTGACTCAGCATTGTACAGTGAA
GCACTGACTCTCGAGAGCAGCATAGTCTCTGGTTTTCAGCTAGCTACAGCATCAGGACCT
CTATGCGACGATCCAATGTGGGGATTAGCTTTCACCATTGAGTCTCATCTCGCAGAAAAT
TCCGAAACAGAGAAACAACCTGAAAACTTTGGAATATTCACAGGACAAGTCATGACAGCT
GTCAAAGACGCATGTAGAGCCGCCGTGCTTCAGACAAATCCACGGATCGTGGAAGCAATG
TACTTCTGCGAACTAGACACCGCACCGGAGTATCTTGGTGC*ATGTACGCGGTTCTGAGC
AGAAGACGAGCTAGAGT*CTCAAG**AGAA*TGCAAGAAGGGTCGTCTCTGTTTACAGTC
CATGCCTACGTGCC
GTTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4GW16JQ 774 0 0
CATGTCTCTCAAAGACTTGGCTTCACAGAAGATTCTACTGAGACACCATCTGACTCAGCA
TTGTACAGTGAAGCACTGACTCTCGAGAGCAGCATAGTCTCTGGTTTTCAGCTAGCTACA
GCATCAGGACCTCTATGCGACGATCCAATGTGGGGATTAGCTTTCACCATTGAGTCTCAT
CTCGCAGAAAATTCCGAAACAGAGAAACAACCTGAAAACTTTGGAATATTCACAGGACAA
GTCATGACAGCTGTCAAAGACGCATGTAGAGCCGCCGTGCTTCAGACAAATCCACGGATC
GTGGAAGCAATGTACTTCTGCGAACTAGACACCGCACCGGAGTATCTTGGTGCCATGTAC
GCGGTTCTGAGCAGAAGACGAGCTAGAGTTCTCAAGGAAGAAATGCAAGAAGGGTCGTCT
CTGTTTACAGTCCATGCCTACGTGCCCGTTTCAGAAAGTTTTGGTTTTGCAGACGAGCTG
AGAAAAGGAACGTCAGGTGGTGCGAGTGCTCTGATGGTTCTGAGCCACTGGGAAATGCTC
GAGGAAGATCCCTTCTTTGTTCCCAAAACGGAAGAAGAGATCGAAGAGTTTGGTGATGGA
GCAAGCGTGCTTCCCAACACGGCGAGGAAGCTCATCAACGCCGTGAGACGCAGGAAAGGG
TTACACGTTGAGGAGAAAGTGGTTCAACACGCCACTAAACAGAGAACCTTGGCTCGTAAA
GTCTGAGTTTTTACTGTTTTTTTGTCCGTTTGAAATGGTTTCGGTCCGTTGTTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL4588Contig1 847 2 2 U
GGGGATAATGAAAGACATTAAGAGAGTTAATCCCAATTACCAGGTTCTTCTGTTCTCGGC
AACGTTTAACGAAACTGTCAAAGATTTTGTTCAGAGGACAGTCGAGAGCGCTAACCAACT
CTTTGTAAAAAGAGAGGATCTAGCTTTGGACTCAGTAAAACAGTACAAAGTGGTTTGCCC
AAAGGAGCAAGACAAGATTGAAGTCATCAAGGATCAGATCATGGAGCTGGGGGATATTGG
CCAGACCATAATATTTGTGAAAACGAAGGTGTCAGCAAGCAAAGTGCACAAAGCTCTTGC
GGAAATGGGGTATGACGTCACAAGTGTTCATGGTAGCATGACTCAAGAGGAGAGAGATAA
GATAGTGAAGGAGTTCAAAGACTGCCTTACTCAAGTCCTCATTGCAACTGATGTCCTTGC
AAGAGGTTTTGACCAGCAACGGGTGAATTTGGTTGTTAATTATAACATGCCTACTAAATA
TGAAACCGGGGAGCCGGATTATGAGGTCTACCTTCACAGAGTTGGAAGAGCTGGTCGGTT
TGGTCGTAAAGGGGCTGTGTTCAACCTCCTTCTAGAGAATGGGGATGATAAAGAGGTGAT
GGAGAAGATGGAGCGCTACTTTGGAGCGCAAGTTAAGGAGATTAAGTCTTGGAACTCAGA
GGAAGAGTACAAGAGTGCCCTCAAGGAAGCTGGCCTGCTTGATGAGTGAAAAGAATGAAG
ACAGACAGAAGTTATTTAGAAAACGTTTAGGGGGCTTTTGGCTTTTTGTTGTCTAAGATT
TGCTGTTGTAATTTCATTTATCAGATTACATAGAATTCAAACTTTGGTGTAGTTTTGTTT
TTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV37TF U 1
AF RR4FV37JQ C 158
BS 1 617 RR4FV37TF
BS 618 847 RR4FV37JQ

RD RR4FV37TF 617 0 0
GGGGATAATGAAAGACATTAAGAGAGTTAATCCCAATTACCAGGTTCTTCTGTTCTCGGC
AACGTTTAACGAAACTGTCAAAGATTTTGTTCAGAGGACAGTCGAGAGCGCTAACCAACT
CTTTGTAAAAAGAGAGGATCTAGCTTTGGACTCAGTAAAACAGTACAAAGTGGTTTGCCC
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CCAGACCATAATATTTGTGAAAACGAAGGTGTCAGCAAGCAAAGTGCACAAAGCTCTTGC
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AAGAGGTTTTGACCAGCAACGGGTGAATTTGGTTGTTAATTATAACATGCCTACTAAATA
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TGGTCGTAAAGGGGCTGTGTTCAACCTCCTTCTAGAGAATGGGGATGATAAAGAGGTGAT
GGAGAAGATGGAGCGCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4FV37JQ 690 0 0
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ATGACTCAAGAGGAGAGAGATAAGATAGTGAAGGAGTTCAAAGACTGCCTTACTCAAGTC
CTCATTGCAACTGATGTCCTTGCAAGAGGTTTTGACCAGCAACGGGTGAATTTGGTTGTT
AATTATAACATGCCTACTAAATATGAAACCGGGGAGCCGGATTATGAGGTCTACCTTCAC
AGAGTTGGAAGAGCTGGTCGGTTTGGTCGTAAAGGGGCTGTGTTCAACCTCCTTCTAGAG
AATGGGGATGATAAAGAGGTGATGGAGAAGATGGAGCGCTACTTTGGAGCGCAAGTTAAG
GAGATTAAGTCTTGGAACTCAGAGGAAGAGTACAAGAGTGCCCTCAAGGAAGCTGGCCTG
CTTGATGAGTGAAAAGAATGAAGACAGACAGAAGTTATTTAGAAAACGTTTAGGGGGCTT
TTGGCTTTTTGTTGTCTAAGATTTGCTGTTGTAATTTCATTTATCAGATTACATAGAATT
CAAACTTTGGTGTAGTTTTGTTTTTGTCTT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4589Contig1 876 2 6 U
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GCAAAAATATGGAGAAGATGAGACTGAACCAACAGTAAAAGAACCAGCTAGGAAGTCGCT
ATCAGACCTCATCCAAAATGTGAAAGTAACAGACAAGACTGAAGTTACAGCAACAGAACC
TCACATCGAAGAAGAGGCTAAGGCAGAGGGAGAAGATGAGGATGGAGATGAAAATAAAGA
TGATAAAACAAGTCCAGATTCCATTGTGATGGTTGAAGCTAAAGATACAGTTAGCATCAT
CAAAACTCAAAAGAAATCACATGGCATTCTCTCTGGTGTTGGCTCAAAGGTGAAACATTC
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GTTTTCATAATCTTTTTCCATATAAAGTTCAGAACG


BQ
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AF RR4H011TF U 1
AF RR4DX31JQ C 169
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BS 467 467 RR4DX31JQ
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RD RR4H011TF 731 0 0
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TGAAGAGGAAGCAACAAAAGAGATCTATGAAGAGGAGTCTAAGCAAACAAATACTGTAAC
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TATGAAGAACACTGATGATGCTACAGAAAAATCAAAACCCGAGATTCAAGAGATTGACAA
ATTGTCTCCTGCCAGTGAAACACCACAAAAGCAAGGAGATGAAGTTCCAACCCAACAGAA
AAGGGAAATAGCTGATGATGTTCTAAAGATAGAGAATCTAGAGATCGCAGAAAAGGTGCA
GCAAAAATATGGAGAAGATGAGACTGAACCAACAGTAAAAGAACCAGCTAGGAAGTCGCT
ATCAGACCTCATCCAAAATGTGAAAGTAACAGACAAGACTGAAGTTGCAGCAACAGAACC
TCACATCGAAGAAGAGGCTAAGGCAGAGGGAGAAGATGAGGATGGAGATGAAAATAAAGA
TGATAAAACAAGTCCAGATTCCATTGTGATGGTTGAAGCTAAAGATACAGTTAGCATCAT
CAAAACTCAAAAGAAATCACATGGCATTCTCTCTGGTGTTGGCTCAAAGGTGAAACATTC
AATTTCAAAG*TGAAAAAAGCACTCACTGGGAAATCTTCTCACCCAACAAAGCCTTCATC
ACCACAGTGAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4DX31JQ 708 0 0
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AGAGATTGACAAATTGTCTCCTGCCAGTGAAACACCACAAAAGCAAGGAGATGAAGTTCC
AACCCAACAGAAAAGGGAAATAGCTGATGATGTTCTAAAGATAGAGAATCTAGAGATCGC
AGAAAAGGTGCAGCAAAAATATGGAGAAGATGAGACTGAACCAACAGTAAAAGAACCAGC
TAGGAAGTCGCTATCAGACCTCATCCAAAATGTGAAAGTAACAGACAAGACTGAAGTTAC
AGCAACAGAACCTCACATCGAAGAAGAGGCTAAGGCAGAGGGAGAAGATGAGGATGGAGA
TGAAAATAAAGATGATAAAACAAGTCCAGATTCCATTGTGATGGTTGAAGCTAAAGATAC
AGTTAGCATCATCAAAACTCAAAAGAAATCACATGGCATTCTCTCTGGTGTTGGCTCAAA
GGTGAAACATTCAATTTCAAAGGTGAAAAAAGCACTCACTGGGAAATCTTCTCACCCAAC
AAAGCCTTCATCACCACAGTGAGGAGGCCAAAAACAAAACAAACAATATCTATAACGCTT
TCTTTTTATTTTTCGTCTGTTGATTGATTTGGTTGGATTTTGTGAATATTACAGCTTTGT
TTGTGGGTTGTTGTTTTCATAATCTTTTTCCATATAAAGTTCAGAACG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL4590Contig1 1262 2 2 U
GCACCAGAGAAATCTTATGCAGAATCATATCAACTAAAGCAAACAGTAGTATGTATAGAT
AGGTTAAGGACGAACGATAAACTTGGAAGAGTCGGGCCAATAAAGCCTCTGAAACCGCTT
TACGGCGATCTTTCGGCCGTCTTTGAGCCTCCCTCTGTAGACGATGTTAGGAACCTTCTC
GTTGTGCTCCGACACGATGTTCCCGGTGGAGAATCCGTCTGTAGCGACTCTCAGCTGTTC
CAAACTGAACTCTCGAAAACTAGGACATGAGCTTCCGTCATTGTCATCGTTATTCTCTGC
TGAGAATGAAAAAAAAAAGAACAATAAACGTTAGTTTCTCGATCATCATCAACGCATATG
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AAGATTGCAAAGGTTTAAAGCAAATGCAACCCATCGCCGGCAATGTAGACTTAAACTTTT
GAAGTGCGCTTGGTGAAACTCCCGCGCGCCACCGGGAATAATTATATACTTATTTCTTTT
TTCTATAAATACTGTATACAGCACCAATCTTTTTTTTTATAATACTAGTTCTGAAAATAT
CAACGTTGATTTATATTATTTAAGATACGAAAAATGTCAACAGAATCTTGCTATATTATA
AATAATTTAGTTTTCTCATGACTGGCAAAGGACGAACATAGGATATTTGTTGAATTTCGT
CTCCATTTTCAAATGTATCATCACTTAGTCTTAGAATTTAATTATAAACAGAAGAAAATC
TCATTTAAACAATTTATTTTCGTAGGTTTTACCACAGATTTTCGAGATTGGGGAGTGTGA
TATCCATATATCATAATCATCATCCATACTGTAATTTTGTAAACAATTCCCATATCAAAT
CGTTTTAGTATATTTTGCTCATGACTTGCAAAAAGAAAACATATAGAAACTCTTTTTTTT
TTGTCAACCATATAGAAACTCTATATTTCATAATGGGACGCTCGTTTAGGTTAATTATAT
GCTGAAATTAATTGAAATTGAGAAAAATGGCATTTATATACCAAACTTTCACATATTCTC
CAAAAAAATACAAACTTCTCTCGTTAATCCAAATAAATCACAAACTTATATTCACTAAGC
CATATAAGATACATTTTTTAGTCAACTTAAAAATCGCCGTCTAAACCAACGTTTAGCATT
CTTAGTTACTGATATGCAGATTGGCCAATTGAACAAACTTGTGTCGTCTGCATAAGAAGC
CC


BQ
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TGAAATTGAGAAAAATGGCATTTATATACCAAACTTTCACATATTCTCCAAAAAAATACA
AACTTCTCTCGTTAATCCAAATAAATCACAAACTTATATTCACTAAGCCATATAAGATAC
ATTTTTTAGTCAACTTAAAAATCGCCGTCTAAACCAACGTTTAGCATTCTTAGTTACTGA
TATGCAGATTGGCCAATTGAACAAACTTGTGTCGTCTGCATAAGAAGCCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

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ATAAAAA


BQ
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AGACCCCCACCTTTGAAATCCTTTACCGTCCAATACCTCGTGAACTCATGTGGCTTGTCC
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TGAGAAGATAAAGGGAACCATGGAGTACCTTGTGAACAGTGCTGGTCTCAAGGCCAGCGC
CGTTGCTATGCAGCCTTTTGTTTTGGGTCTGAGTTTGGAGAAGAGAATCAAACC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4CC60JQ 773 0 0
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CCTCAACAACCATGGCTTCACCTTCGAACAGATCACCAGAGTCGTCAAATCATTCCCTAC
TATCCTCATAGTCAACCCTGACGAAGTTCAACGAGGTCTTGACCAGAGTACGCAGCTTTG
GTTTCGATCCCAAGAAGATGTATTTTATTCATGCTATGTTGGTTTTCTTTCATGTTAGTG
AGTCCACTGTGGAGCACAAGTTTGAGCTGTACCGACAGTTTGGTTGGTCCAGAGGCGAGT
TCGTGGCAGCGTTCATGAGGTTTCCAAACTGTGTGAAGATATCGGATGAGAAGATAAAGG
GAACCATGGAGTACCTTGTGAACAGTGCTGGTCTCAAGGCCAGCGCCGTTGCTATGCAGC
CTTTTGTTTTGGGTCTGAGTTTGGAGAAGAGAATCAAACCAAGGAACATTGTCATCTCTG
AGCTTTTGTCTAAAGGGTTTGTCAAGAAAGAAGAGTTGAACTACTTCCAGATCCTTAAGG
TTAAAGAATGTGTTTTTGTGGATAAGTTTGTTCTCAAGTTTCAGCAGGTTTCTTCTCTCC
AGCCATCCCTATAGTTTCTTCTCATTTGTTTTCTGTGTGTATTGTGGCATGTACTACTTT
GTTGATCTCTTGTTAAGTTGATTATAATTCTTTTAACACTAGTTTCAGATGACCTTTTAT
AGTATTGTTCATAGAATCATTCATGTGCTAAAGATGTAATCCATAAATAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL4592Contig1 417 2 1 U
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TCTGGTGATCTAGTTAGGTTTTGGTCTTGACCTTTTTTGGAGTTGTTGTCTCTTTATCAT
GTTTAGTGTTCTTGTGGGGGAGATCTTGTTCTCTGGTTTAGGTTTGTGGTAGTGCCTTCA
TCTTTCCTCTTGTAGAGCTTTTGGCAGTGGCGGTGTAACTTCTTAGTTGCCATTTACAAC
TCTCTGGAGTTGTTTTTTTTTGTGTTGTCTTCTGTCAAAAGCTCTGTTTTTTTCCACTTT
TTTTTTTGTTTTAAGGCACTATCTGTACTGCTTGGATCATTGTATAAGCTTCCCTGAACA
TACTACTATCTTTTTGTAATATATAACATGATCCTTGGATCATTTTGTTTTGAATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AC83JQ C 1
AF RR4AC83TF U 1
BS 1 417 RR4AC83TF

RD RR4AC83JQ 417 0 0
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TCTGGTGATCTAGTTAGGTTTTGGTCTTGACCTTTTTTGGAGTTGTTGTCTCTTTATCAT
GTTTAGTGTTCTTGTGGGGGAGATCTTGTTCTCTGGTTTAGGTTTGTGGTAGTGCCTTCA
TCTTTCCTCTTGTAGAGCTTTTGGCAGTGGCGGTGTAACTTCTTAGTTGCCATTTACAAC
TCTCTGGAGTTGTTTTTTTTTGTGTTGTCTTCTGTCAAAAGCTCTGTTTTTTTCCACTTT
TTTTTTTGTTTTAAGGCACTATCTGTACTGCTTGGATCATTGTATAAGCTTCCCTGAACA
TACTACTATCTTTTTGTAATATATAACATGATCCTTGGATCATTTTGTTTTGAATAC

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4AC83TF 417 0 0
AGCAGGTTCCTTGGAGCTTGTTTCTACAGCTGTTGTGTTCCTAAGAACATGTTACTGAGT
TCTGGTGATCTAGTTAGGTTTTGGTCTTGACCTTTTTTGGAGTTGTTGTCTCTTTATCAT
GTTTAGTGTTCTTGTGGGGGAGATCTTGTTCTCTGGTTTAGGTTTGTGGTAGTGCCTTCA
TCTTTCCTCTTGTAGAGCTTTTGGCAGTGGCGGTGTAACTTCTTAGTTGCCATTTACAAC
TCTCTGGAGTTGTTTTTTTTTGTGTTGTCTTCTGTCAAAAGCTCTGTTTTTTTCCACTTT
TTTTTTTGTTTTAAGGCACTATCTGTACTGCTTGGATCATTGTATAAGCTTCCCTGAACA
TACTACTATCTTTTTGTAATATATAACATGATCCTTGGATCATTTTGTTTTGAATAC

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL4593Contig1 701 2 2 U
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TGGTCATGACCGTCCTGATTGGCTCAACAAGAATCTCAATGCCGGAAAGTTGGATTACTT
CTATTATCTGATAGCGGTTTTGGGTGTGTTTAATCTGGTTTATTTTTGGTACTGTGCTCA
AGGATACCGGTACAAGACCGGTCTACAGATGGGAGGTTTTGAGGAGGACAAGAGTTTCTC
TGACGTTGAGATGAGTTCCAAAAAACAGCTGAAATGATTTAAAGCAACAAGAAGATGATC
GATGTTGTTTTAATGATTACTATGAAAATGTATCTATGTATAAGGTATAAGAACTAGATT
ATGTAATAAATTATACCCGTTGTTATAAGAACTGGATCGTATTAGATATTTTATAGTCTA
GTTTAATTTTATGGCTTTGTCATGATGCTATAGATGGTATTCTACAATAGAACTCTAACA
AGTAAATCGCAGTGTAAGCCATAAATGTAATAGATACACTATGATGATATGACCTGAATA
TATATATAAATCATGAATATATATATGGGACTGTTCAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F160TF U 1
AF RR4F160JQ C 179
BS 1 640 RR4F160TF
BS 641 701 RR4F160JQ

RD RR4F160TF 640 0 0
CCCGCAGCTCATTCTGATGGGACTATGTGAAGCATTCAACATCATTGGACAGATTGAGTT
CTTCAACAGTCAGTTTCCTGAACATATGAGAAGCATCGCTAACGCTCTCTTCTCTTTATC
CTTCGCCGGTTCGAACTACCTTAGTAGTTTGATAGTGACGACTGTTCATAGGTTCTCTGG
TGGTCATGACCGTCCTGATTGGCTCAACAAGAATCTCAATGCCGGAAAGTTGGATTACTT
CTATTATCTGATAGCGGTTTTGGGTGTGTTTAATCTGGTTTATTTTTGGTACTGTGCTCA
AGGATACCGGTACAAGACCGGTCTACAGATGGGAGGTTTTGAGGAGGACAAGAGTTTCTC
TGACGTTGAGATGAGTTCCAAAAAACAGCTGAAATGATTTAAAGCAACAAGAAGATGATC
GATGTTGTTTTAATGATTACTATGAAAATGTATCTATGTATAAGGTATAAGAACTAGATT
ATGTAATAAATTATACCCGTTGTTATAAGAACTGGATCGTATTAGATATTTTATAGTCTA
GTTTAATTTTATGGCTTTGTCATGATGCTATAGATGGTATTCTACAATAGAACTCTAACA
AGTAAATCGCAGTGTAAGCCATAAATGTAATAGATACACT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4F160JQ 523 0 0
GGTGGTCATGACCGTCCTGATTGGCTCAACAAGAATCTCAATGCCGGAAAGTTGGATTAC
TTCTATTATCTGATAGCGGTTTTGGGTGTGTTTAATCTGGTTTATTTTTGGTACTGTGCT
CAAGGATACCGGTACAAGACCGGTCTACAGATGGGAGGTTTTGAGGAGGACAAGAGTTTT
TCTGACGTTGAGATGAGTTCCAAAAAACAGCTGAAATGATTTAAAGCAACAAGAAGATGA
TCGATGTTGTTTTAATGATTACTATGAAAATGTATCTATGTATAAGGTATAAGAACTAGA
TTATGTAATAAATTATACCCGTTGTTATAAGAACTGGATCGTATTAGATATTTTATAGTC
TAGTTTAATTTTATGGCTTTGTCATGATGCTATAGATGGTATTCTACAATAGAACTCTAA
CAAGTAAATCGCAGTGTAAGCCATAAATGTAATAGATACACTATGATGATATGACCTGAA
TATATATATAAATCATGAATATATATATGGGACTGTTCAGATT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL4594Contig1 708 2 1 U
TTTTTAGGTTTATCACTTTGTCGCGTCCACTCGAGAGAAAAAATGCCGGCAGGTCATGGA
GTTCGTGCTAGGACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCA
TTTTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGT
GCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTTTGGAAC
GTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGG
AAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAG
CTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACAATA
AGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTG
GAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTT
TCTACTTTCTTCCCCCCAGTGTTTTGCTCAGACTTTTTTGGCTGTTTCTTGTTGGTTATT
TGAGTGTTCTTCATGCGTTTTAGCTACAGTTACATTGTCTTTAAGATGCAATCCAGACAA
CGGAGATTCAGAAATTTGTCTCGTTTATTACTATCTTTTTCTCTCTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DI28JQ C 1
AF RR4DI28TF U 1
BS 1 708 RR4DI28TF

RD RR4DI28JQ 708 0 0
TTTTTAGGTTTATCACTTTGTCGCGTCCACTCGAGAGAAAAAATGCCGGCAGGTCATGGA
GTTCGTGCTAGGACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCA
TTTTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGT
GCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTTTGGAAC
GTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGG
AAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAG
CTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACAATA
AGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTG
GAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTT
TCTACTTTCTTCCCCCCAGTGTTTTGCTCAGACTTTTTTGGCTGTTTCTTGTTGGTTATT
TGAGTGTTCTTCATGCGTTTTAGCTACAGTTACATTGTCTTTAAGATGCAATCCAGACAA
CGGAGATTCAGAAATTTGTCTCGTTTATTACTATCTTTTTCTCTCTTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4DI28TF 708 0 0
TTTTTAGGTTTATCACTTTGTCGCGTCCACTCGAGAGAAAAAATGCCGGCAGGTCATGGA
GTTCGTGCTAGGACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCA
TTTTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGT
GCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTTTGGAAC
GTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGG
AAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAG
CTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACAATA
AGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTG
GAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTT
TCTACTTTCTTCCCCCCAGTGTTTTGCTCAGACTTTTTTGGCTGTTTCTTGTTGGTTATT
TGAGTGTTCTTCATGCGTTTTAGCTACAGTTACATTGTCTTTAAGATGCAATCCAGACAA
CGGAGATTCAGAAATTTGTCTCGTTTATTACTATCTTTTTCTCTCTTT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL4595Contig1 739 2 3 U
CAATTAGGCCTCTCTCGCCATTCAATGGTGAAAACGACGTCGTTGACTGTTTCTCTTCTC
TTCTCTTCTCTTCTCTCTCTCAGCATTTGATCCTTGGTTATCATCTGAGGAAGAGAGAAA
GATCCTCGCTTCAGCGATCAGATGGCGGCACCTTTCACGTTAAGGAAGATCGGCGTACCT
CCGAACTCAGCGAACCTAACGGAAGCTCGCCGCCGTGTATTCGATTACTTCAGAGCTGCC
TGTAGATCCATCCCTACAATCATGGACATTTACAATCTCCAAGACGTCGTCGCGCCTTCT
CAGCTCCGTTTCTCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACTGACCCTAAG
GTGATTGATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCA
AAGCAGCGTCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTCGGTGAAGGGCTCGTCCAGAACACC
GGAAGCAAGGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAATTTCTACACCAGCAACTACTTC
TGAACTCCTCATGTTTCCTTTTCGAGTTTCACCTAAAGCCTTTCATGACTTGAACAAGTC
TTCTTCCCGCAAAATAATTAGACCTTTTTTCATTTGTATGAGTTTGGTCAAACCTCTCTC
TAAGTTTTATCTGTGACAGTGTTTTTGCAGATATTGCTATGATTTAACTCTCAGATATAA
ACTGATATTGGTCTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4AR80TF U 1
AF RR4DA77TF U 98
BS 1 457 RR4AR80TF
BS 458 458 RR4DA77TF
BS 459 739 RR4AR80TF

RD RR4AR80TF 739 0 0
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TTCTCTTCTCTTCTCTCTCTCAGCATTTGATCCTTGGTTATCATCTGAGGAAGAGAGAAA
GATCCTCGCTTCAGCGATCAGATGGCGGCACCTTTCACGTTAAGGAAGATCGGCGTACCT
CCGAACTCAGCGAACCTAACGGAAGCTCGCCGCCGTGTATTCGATTACTTCAGAGCTGCC
TGTAGATCCATCCCTACAATCATGGACATTTACAATCTCCAAGACGTCGTCGCGCCTTCT
CAGCTCCGTTTCTCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACTGACCCTAAG
GTGATTGATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCA
AAGCAGCGTCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTCG*TGAAGGGCTCGTCCAGAACACC
GGAAGCAAGGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAATTTCTACACCAGCAACTACTTC
TGAACTCCTCATGTTTCCTTTTCGAGTTTCACCTAAAGCCTTTCATGACTTGAACAAGTC
TTCTTCCCGCAAAATAATTAGACCTTTTTTCATTTGTATGAGTTTGGTCAAACCTCTCTC
TAAGTTTTATCTGTGACAGTGTTTTTGCAGATATTGCTATGATTTAACTCTCAGATATAA
ACTGATATTGGTCTGTTTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4DA77TF 640 0 0
GG
ATCATCTGAGGAAGAGAGAAAGATCCTCGCTTCAGCGATCAGATGGCGGCACCTTTCACG
TTAAGGAAGATCGGCGTACCTCCGAACTCAGCGAACCTAACGGAAGCTCGCCGCCGTGTA
TTCGATTACTTCAGAGCTGCCTGTAGATCCATCCCTACAATCATGGACATTTACAATCTC
CAAGACGTCGTCGCGCCTTCTCAGCTCCGTTTCTCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAAC
GCTCACGTCACTGACCCTAAGGTGATTGATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTG
ACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTTGGT
GAAGGGCTCGTCCAGAACACCGGAAGCAAGGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAAT
TTCTACACCAGCAACTACTTCTGAACTCCTCATGTTTCCTTTTCGAGTTTCACCTAAAGC
CTTTCATGACTTGAACAAGTCTTCTTCCCGCAAAATAATTAGACCTTTTTTCATTTGTAT
GAGTTTGGTCAAACCTCTCTCTAAGTTTTATCTGTGACAGTGTTTTTGCAGATATTGCTA
TGATTTAACTCTCAGATATAAACTGATATTGGTCTGTT

QA 3 640 3 640
DS 



AS 1 2

CO CL4596Contig1 464 2 1 U
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GTACGTGTTGAGGGTAAGAACGGTGTCTTTCTTCGCCGGAGCTGCGACCGCGTCTTTGAT
CGGCCTATCTGTTCTCTACAAGGATTACAAAGTCGCTCACGAATCCATTTCTCACCAGGC
AAAGGCTTTTCATGACTCTCTGGATACAAGGATCTCTACTCTTGAGAGTTTGAGACAGAG
TGAAGCTTCTCAGCTTCCTCAGACAACAACTGATTAGTATATGTTTCATACATTCTGTCT
TGCTGATCATGTTGTTTATTTGAGGTGCTCTTTTTTCTGCGTTTATGAATAAACCTTGAA
AGTTCCTGTATGACTACTTTATCAAACGATTAAGTTTAGTGTAGTCTACTATGGATTGAA
AATTGCTGTAACACTTGCCAATTATAAAAATTTATGTTTCAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EZ78JQ C 1
AF RR4EZ78TF U 1
BS 1 464 RR4EZ78TF

RD RR4EZ78JQ 464 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGAAGAGGAAGGGATGGG
GTACGTGTTGAGGGTAAGAACGGTGTCTTTTTTCGCCGGAGCTGCGACCGCGTCTTTGAT
CGGCCTATCTGTTCTCTACAAGGATTACAAAGTCGCTCACGAATCCATTTCTCACCAGGC
AAAGGCTTTTCATGACTCTCTGGATACAAGGATCTCTACTCTTGAGAGTTTGAGACAGAG
TGAAGCTTTTCAGCTTCCTCAGACAACAACTGATTAGTATATGTTTCATACATTCTGTCT
TGCTGATCATGTTGTTTATTTGAGGTGCTCTTTTTTCTGCGTTTATGAATAAACCTTGAA
AGTTCCTGTATGACTACTTTATCAAACGATTAAGTTTAGTGTAGTCTACTATGGATTGAA
AATTGCTGTAACACTTGCCAATTATAAAAATTTATGTTTCAGCT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4EZ78TF 464 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGAAGAGGAAGGGATGGG
GTACGTGTTGAGGGTAAGAACGGTGTCTTTCTTCGCCGGAGCTGCGACCGCGTCTTTGAT
CGGCCTATCTGTTCTCTACAAGGATTACAAAGTCGCTCACGAATCCATTTCTCACCAGGC
AAAGGCTTTTCATGACTCTCTGGATACAAGGATCTCTACTCTTGAGAGTTTGAGACAGAG
TGAAGCTTCTCAGCTTCCTCAGACAACAACTGATTAGTATATGTTTCATACATTCTGTCT
TGCTGATCATGTTGTTTATTTGAGGTGCTCTTTTTTCTGCGTTTATGAATAAACCTTGAA
AGTTCCTGTATGACTACTTTATCAAACGATTAAGTTTAGTGTAGTCTACTATGGATTGAA
AATTGCTGTAACACTTGCCAATTATAAAAATTTATGTTTCAGCT

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4597Contig1 748 2 2 U
GGAAGCAACATCTCTAATTTGCACGGATGAGCCGAAGGGGAGAATCGAGAAATCTCCGAG
AAACGCGTGAGAGTTTGAAGTCGTCGTTGTTGCTCCGATAAGGCGGTGTGAATCAAGATC
GTTCCGTTGGACCTGACCACTTCATCTTCTCTGCCCTCGTCGACTTCAAACTTCCTGTGC
AATATGAACTGATGCTCAGACATATCTGGTGAATCCCCTATCTTTCAGATTTTTTTCTCT
GGAGGAGACTCATGCTGCCAAGTGCCATGCCAACAACCGAGTCAAAACTTCATGTATAAT
TTTCTTTTTTCCTCTCCTTTTCTTGTTTTTTTTTTAAATAAACATTCTTTTTAACTTACA
TGAAAACGTTTTTGTAAATAATTTTTTGTGAAAAAAAAACATTTTTAAAAACCTGTTAGT
TTTCCTTTTTCTTTACTAAGACAAAAATATATTTCAAGGTTTTAGGGACTAGATTGATTA
TGAAAACTTATGTGTAAATTTGTGACAAACAAATAGAATATGCATTCTGTTTTTGAGATC
GTTAGAGATGCTATGTTTCATTTGATTTAACACTTACGATCACTAAGTTATTCCTAGTCA
ATCTAGCAATTAAATCTTTTGTTCTGGTTTTTGGTTTAAAACATAACCTTTTCAAGGTTT
TTAGGATTTTTTTATATAATAACTATAATAACCTTTTCATGTGTAAATTTGTGACAAACA
AATGGAAATAATATCCTGACTTTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW82TF U 1
AF RR4EW82JQ C 163
BS 1 631 RR4EW82TF
BS 632 748 RR4EW82JQ

RD RR4EW82TF 631 0 0
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AAACGCGTGAGAGTTTGAAGTCGTCGTTGTTGCTCCGATAAGGCGGTGTGAATCAAGATC
GTTCCGTTGGACCTGACCACTTCATCTTCTCTGCCCTCGTCGACTTCAAACTTCCTGTGC
AATATGAACTGATGCTCAGACATATCTGGTGAATCCCCTATCTTTCAGATTTTTTTCTCT
GGAGGAGACTCATGCTGCCAAGTGCCATGCCAACAACCGAGTCAAAACTTCATGTATAAT
TTTCTTTTTTCCTCTCCTTTTCTTGTTTTTTTTTTAAATAAACATTCTTTTTAACTTACA
TGAAAACGTTTTTGTAAATAATTTTTTGTGAAAAAAAAACATTTTTAAAAACCTGTTAGT
TTTCCTTTTTCTTTACTAAGACAAAAATATATTTCAAGGTTTTAGGGACTAGATTGATTA
TGAAAACTTATGTGTAAATTTGTGACAAACAAATAGAATATGCATTCTGTTTTTGAGATC
GTTAGAGATGCTATGTTTCATTTGATTTAACACTTACGATCACTAAGTTATTCCTAGTCA
ATCTAGCAATTAAATCTTTTGTTCTGGTTTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4EW82JQ 586 0 0
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TTTCAGATTTTTTTTTCTGGAGGAGACTCATGCTGCCAAGTGCCATGCCAACAACCGAGT
CAAAACTTCATGTATAATTTTCTTTTTTCCTCTCCTTTTCTTGTTTTTTTTTTAAATAAA
CATTCTTTTTAACTTACATGAAAACGTTTTTGTAAATAATTTTTTGTGAAAAAAAAACAT
TTTTAAAAACCTGTTAGTTTTCCTTTTTCTTTATTAAGACAAAAATATATTTCAAGGTTT
TAGGGACTAGATTGATTATGAAAACTTATGTGTAAATTTGTGACAAACAAATAGAATATG
CATTCTGTTTTTGAGATCGTTAGAGATGCTATGTTTCATTTGATTTAACACTTACGATCA
CTAAGTTATTCCTAGTCAATCTAGCAATTAAATCTTTTGTTCTGGTTTTTGGTTTAAAAC
ATAACCTTTTCAAGGTTTTTAGGATTTTTTTATATAATAACTATAATAACCTTTTCATGT
GTAAATTTGTGACAAACAAATGGAAATAATATCCTGACTTTGAGTC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL4598Contig1 614 2 12 U
GAAAACGTGTCCTCTCTTTCTTCTTCCCCCATTGCTCTCCAAACCGAGAAAGAAAATGCT
GACTCTACTCTTCTCCTCTCTCGGACTCCTCCTTCTTCTCGGTCTTCTCCTCAAATTCGC
ATTTGCAGACGGGGATTTAACTCTGATCTCGAAGAAGCATGTGAAGCGAGAAGCCATAGA
AGGCAAGGTGGTTTGGATCACAGGGGCTAGCCGTGGAATTGGGGAAGTTCTTGCTAAACA
GTTTGCAACTTTAGGCGCCAAGCTTATTCTCTCTGCCAGGAACGAAGCTGAGTTGTTTCG
TGTAAAGAGTGAGCTCAAAGGTAAGTATGCACCAGAAGATGTCAAGGTTTTGCCTTTAGA
TCTAGCTAGCGGCGAAGAGGGGCTCAAACATGTTGTAGAGCAAGCGGTGTCGCTTTTCCC
TGGGGCTGGTGTTGATTATTTGGTTCACAACGCTGCCTATGAGCGTCCGAAATCAAATGC
AGTGGATGCCACTGAGGAAAATCTTAAGACTACATTCGAGGTTAATGTATTTGGGACCAT
ATCTCTCACAAAGTTGGTAACTCCTCATATGCTGAAACAAGGAGGCGGTCATTTTGTTGT
GATTAGCAGTGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL94TF U 1
AF RR4DD70TF U 5
BS 1 147 RR4GL94TF
BS 148 148 RR4DD70TF
BS 149 255 RR4GL94TF
BS 256 256 RR4DD70TF
BS 257 378 RR4GL94TF
BS 379 379 RR4DD70TF
BS 380 411 RR4GL94TF
BS 412 412 RR4DD70TF
BS 413 423 RR4GL94TF
BS 424 424 RR4DD70TF
BS 425 515 RR4GL94TF
BS 516 614 RR4DD70TF

RD RR4GL94TF 515 0 0
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GACTCTACTCTTCTCCTCTCTCGGACTCCTCCTTCTTCTCGGTCTTCTCCTCAAATTCGC
ATTTGCAGACGGGGATTTAACTCTGATTTCGAAGAAGCATGTGAAGCGAGAAGCCATAGA
AGGCAAGGTGGTTTGGATCACAGGGGCTAGCCGTGGAATTGGGGAAGTTCTTGCTAAACA
GTTTGCAACTTTAGGTGCCAAGCTTATTCTCTCTGCCAGGAACGAAGCTGAGTTGTTTCG
TGTAAAGAGTGAGCTCAAAGGTAAGTATGCACCAGAAGATGTCAAGGTTTTGCCTTTAGA
TCTAGCTAGCGGCGAAGATGGGCTCAAACATGTTGTAGAGCAAGCGGTGTCTCTTTTCCC
TGGTGCTGGTGTTGATTATTTGGTTCACAACGCTGCCTATGAGCGTCCGAAATCAAATGC
AGTGGATGCCACTGAGGAAAATCTTAAGACTACAT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4DD70TF 610 0 0
GG
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ACTCTTCTCCTCTCTCGGACTCCTCCTTCTTCTTGGTCTTCTCCTCAAATTCGCATTTGC
ATACGGGGATTTAACTCTGATCTCGAAGAAGCATGTGAAGCGAGAAGCCATAGAAGGCAA
GGTGGTTTGGATCACAGGGGCTAGCCGTGGAATTGGGGAAGTTCTTGCTAAACAGTTTGC
AAGTTTAGGCGCCAAGCTTATTCTCTCTGCCAGGAACGAAGCTGAGTTGTTTCGTGTTAA
GAGTGAGCTCAAAGGTAAGTGTGCACCAGAAGATGTCAAGGTTTTGCCTTTAGATCTAGC
TAGCGGCGAAGAGGTGCTCAAACATGTTGTAGAGCAAGCGGTGTCGCTTTTCCCTGGGGC
TGGTGTTGATTATTTGGTTCACAACGCTGCCTATGAGCGTCCGAAATCAAATGCAGTGGA
TGCCACTGAGGAAAATCTTAAGACTACATTCGAGGTTAATGTATTTGGGACCATATCTCT
CACAAAGTTGGTAACTCCTCATATGCTGAAACAAGGAGGCGGTCATTTTGTTGTGATTAG
CAGTGCAG

QA 3 610 3 610
DS 



AS 1 2

CO CL4599Contig1 755 2 4 U
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TAGTCAATCGGTGAATACAATGTCATCACTGATGCCACCTGCTTCAGTGGAATCTCTACA
TGAGTCCGGTGGGAATGTGAAGAGAACGGCAGTACATACAAGAAGTGTATCAGAGCCAGA
CTTCGGTAGAACGCCAATACAGGATCTGGCTGACTGTCCAAAAGAAAAGGTTGAAGGGGC
GACAAAGTTGAAATCATCTGGGAGTGTGACAGGTTCGAGGTTTAGTCGATTTGGTTTTGG
CATGCTAAAGGACACGGTAGGGAGGGTCTTACAGTCTCGGTCATCATCGAAAGAGGCAAA
ACTGGGCGCAGAAAATCAATTCTACTATGATGATAAACTAAAGAGATGGGTGGAGAAAGG
TGTGGAACCCCCAGCCGAGGAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACATTAGGCACTTACAA
AAACAACTCACTGAGTTATGAAAACAAATCTGAGATGAATCCACCTAGCGGGAGCTGGAG
TTCCAACGGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTTCAGGAATGCCACCACTCTCACAGAGTTC
GAATCAATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGCGCAAGATACGTTGACACCTTTAA
TCAAGTCGTGGAAACTCTCAGACCATGTTTCAGTCACATCCTGCACAATCTGCTAAACCA
CCAATCCCTGCAAAGCAAAATTCTTTATCCCAGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F234TF U 1
AF RR4F325TF U 1
BS 1 575 RR4F234TF
BS 576 576 RR4F325TF
BS 577 711 RR4F234TF
BS 712 755 RR4F325TF

RD RR4F234TF 711 0 0
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TAGTCAATCGGTGAATACAATGTCATCACTGATGCCACCTGCTTCAGTGGAATCTCTACA
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CTTCGGTAGAACGCCAATACAGGATCTGGCTGACTGTCCAAAAGAAAAGGTTGAAGGGGC
GACAAAGTTGAAATCATCTGGGAGTGTGACAGGTTCGAGGTTTAGTCGATTTGGTTTTGG
CATGCTAAAGGACACGGTAGGGAGGGTCTTACAGTCTCGGTCATCATCGAAAGAGGCAAA
ACTGGGCGCAGAAAATCAATTCTACTATGATGATAAACTAAAGAGATGGGTGGAGAAAGG
TGTGGAACCCCCAGCCGAGGAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACATTAGGCACTTACAA
AAACAACTCACTGAGTTATGAAAACAAATCTGAGATGAATCCACCTAGCGGGAGCTGGAG
TTCCAACGGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTTCAG*AATGCCACCACTCTCACAGAGTTC
GAATCAATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGCGCAAGATACGTTGACACCTTTAA
TCAAGTCGTGGAAACTCTCAGACCATGTTTCAGTCACATCCTGCACAATCT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4F325TF 755 0 0
GGGAAGCCTTCAGTCAAAAGAGTATCATCACCAACAGCAGGAAGCTACTAAGTTACCTTA
TAGTCAATCGGTGAATACAATGTCATCACTGATGCCACCTGCTTCAGTGGAATCTCTACA
TGAGTCCGGTGGGAATGTGAAGAGAACGGCAGTACATACAAGAAGTGTATCAGAGCCAGA
CTTCGGTAGAACGCCAATACAGGATCTGGCTGACTGTCCAAAAGAAAAGGTTGAAGGGGC
GACAAAGTTGAAATCATCTGGGAGTGTGACAGGTTCGAGGTTTAGTCGATTTGGTTTTGG
CATGCTAAAGGACACGGTAGGGAGGGTCTTACAGTCTCGGTCATCATCGAAAGAGGCAAA
ACTGGGCGCAGAAAATCAATTCTACTATGATGATAAACTAAAGAGATGGGTGGAGAAAGG
TGTGGAACCCCCAGCCGAGGAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACATTAGGCACTTACAA
AAACAACTCACTGAGTTATGAAAACAAATCTGAGATGAATCCACCTAGCGGGAGCTGGAG
TTCCAACGGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTTCAGGAATGCCACCACTCTCACAGAGTTC
GAATCAATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGCGCAAGATACGTTGACACCTTTAA
TCAAGTCGTGGAAACTCTCAGACCATGTTTCAGTCACATCCTGCACAATCTGCTAAACCA
CCAATCCCTGCAAAGCAAAATTCTTTATCCCAGCA

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL4600Contig1 739 2 6 U
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AGCAGATAAACATATAAGAAATAGAAAACTTTTTTTTTAACCACTTTACTTTTTCATGTA
TTTGTATTTCATTGTTCAAAAAAATATTTGCAGAAAAAAGATGGATTTTTACCTATTTTG
AATAGAATATTTAGAATATCATTGAATTTAAGTAGGTAAGAAAACGTATGTTTTTTTATT
TATTAATTTTTATTATTAATAAAATAAAAAAGAATGCACAGGTATATATATATGTCTCTT
TTTCTTCTTTTATTGTGGTACAGTTCTATATTGGAACAGCACATGCTGTGCTCTACCAAA
AATGAAATTTTCTTTTCAATGTATTCAATGAAAAATTTCAATACAAAAATTTATTGAGAA
TTACTCCTCAAAAGCATCCCTAGAGAGATAAAATACCCCATTATAGAGCTATACAAGGTA
ACGTATGTTCTGATTCTGGGGTTTACATATACTCATTATTAGTGTTATAATTCAAATGGA
AGAAGATTTCTTTTTAATTGAAAAAACTCAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAAT
GATTTTCTTATATTATTAAAAATAAAAAATGTAAATTTGAATTCAAAAAAGGTCATGAAT
TTACAGTCAATAGTTAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAAT
CTATATTTTTTCGGAGTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D931TF U 1
AF RR4D931JQ C 1
BS 1 651 RR4D931TF
BS 652 652 RR4D931JQ
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BS 709 718 RR4D931TF
BS 719 739 RR4D931JQ

RD RR4D931TF 725 0 0
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TTTGTATTTCATTGTTCAAAAAAATATTTGCAGAAAAAAGATGGATTTTTACCTATTTTG
AATAGAATATTTAGAATATCATTGAATTTAAGTAGGTAAGAAAACGTATGTTTTTTTATT
TATTAATTTTTATTATTAATAAAATAAAAAAGAATGCACAGGTATATATATATGTCTCTT
TTTCTTCTTTTATTGTGGTACAGTTCTATATTGGAACAGCACATGCTGTGCTCTACCAAA
AATGAAATTTTCTTTTCAATGTATTCAATGAAAAATTTCAATACAAAAATTTATTGAGAA
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TTACAGTCAATAGTTAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTATATTT*GTGACTGAAA
TCTATAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4D931JQ 739 0 0
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AGCAGATAAACATATAAGAAATAGAAAACTTTTTTTTTAACCACTTTACTTTTTCATGTA
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AATAGAATATTTAGAATATCATTGAATTTAAGTAGGTAAGAAAACGTATGTTTTTTTATT
TATTAATTTTTATTATTAATAAAATAAAAAAGAATGCACAGGTATATATATATGTCTCTT
TTTCTTCTTTTATTGTGGTACAGTTCTATATTGGAACAGCACATGCTGTGCTCTACCAAA
AATGAAATTTTCTTTTCAATGTATTCAATGAAAAATTTCAATACAAAAATTTATTGAGAA
TTACTCCTCAAAAGCATCCCTAGAGAGATAAAATACCCCATTATAGAGCTATACAAGGTA
ACGTATGTTCTGATTCTGGGGTTTACATATACTCATTATTAGTGTTATAATTCAAATGGA
AGAAGATTTCTTTTTAATTGAAAAAACTCAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAAT
GATTTTCTTATATTATTAAAAATAAAAAATGTAAATTTGAATTCAAAAAAGGTCATGAAT
TTACAGTCAATAGTTAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAAT
CTATATTTTTTCGGAGTTG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL4601Contig1 595 2 1 U
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CCAAAGTTTGTTTCTTTATCTATCAACACAAAGCAATCTGAGATCTTTTACATCATCAAT
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GAAGCTGTCAAAGAAAGACGGATTCAGCGGTGGCATGTTGAAGATCACGCGCTCCTCGTC
CATGTCGTCTTGCCGCGGCAAGAAGACACAGAAACACGGGAGACGCGCTTTCACGAGGAA
GTGCGCGAAATTGGCCAAAGAACAGAGAGCTCGCTTCTACATCATGCGTCGCTGCGTGAT
CATGCTTATTTGCTGGAGAGATAACTACTCTGATTCTTAAAAAAAAACAAACACAAATCT
CTCTTTGCTCTGTTCTGAAACAGAGGTCGATAGATATACATGTACATAAAGTGTTCTGTT
TTCTAATGGTTTCTGCTTCTTTAGATTAGTTTAGGTTATGTAATTTGTATGTCTGAGCCT
TTGATTCTGGAAAGAGGTCATGTGTCTCAAGATCAGTTTCAGTGTGCTGAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DU60TF U 1
AF RR4DU60JQ C 126
BS 1 595 RR4DU60TF

RD RR4DU60TF 595 0 0
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CATGCTTATTTGCTGGAGAGATAACTACTCTGATTCTTAAAAAAAAACAAACACAAATCT
CTCTTTGCTCTGTTCTGAAACAGAGGTCGATAGATATACATGTACATAAAGTGTTCTGTT
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TTGATTCTGGAAAGAGGTCATGTGTCTCAAGATCAGTTTCAGTGTGCTGAAGTTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4DU60JQ 470 0 0
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TGTCAAAGAAAGACGGATTCAGCGGTGGCATGTTGAAGATCACGCGCTCCTCGTCCATGT
CGTCTTGCCGCGGCAAGAAGACACAGAAACACGGGAGACGCGCTTTCACGAGGAAGTGCG
CGAAATTGGCCAAAGAACAGAGAGCTCGCTTTTACATCATGCGTCGCTGCGTGATCATGC
TTATTTGCTGGAGAGATAACTACTTTGATTTTTAAAAAAAAACAAACACAAATCTCTCTT
TGCTCTGTTTTGAAACAGAGGTCGATAGATATACATGTACATAAAGTGTTCTGTTTTCTA
ATGGTTTCTGCTTCTTTAGATTAGTTTAGGTTATGTAATTTGTATGTCTGAGCCTTTGAT
TCTGGAAAGAGGTCATGTGTCTCAAGATCAGTTTCAGTGTGCTGAAGTTT

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL4602Contig1 1066 2 4 U
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GGTACGACAACAAAACTCTGCAAGGAATCCTCAACTTCCAAAGAGGTTTCAAACCACAAG
AAACCGATATAATCATCTCTTCGCTCCCTAAGTCCGGCACGACTTGGCTCAAAGCTCTCA
CAGTAGCTCTCCTAGAGAGATCAAAACACTCTACTAACCATCCACTTCTATCTGACGACC
CTCATGGCTTAGTACCAGTCCTCGAGCTCAGGCTATACATCGAAACCTCGGAACCAGATC
TGACCAGTTTCTCATCAACAACCCCGAGGCTATTCGCGACTCACGTACCGTTCCACACGC
TTCAAGAGGCTCTCAAGAACACTCCCTGTAAGGTCGTGTACGTTTGGAGGAACGTGAAGG
ACGCGTTGGTGTCGCTTTGGTTTTTCGAGTTCGCTAATCATAAGATCAAGATAGATGAAG
AAAGAAGCTTGTTGGAGTCGATGTTCGAGTCGTTTTGTCGTGGAGTTAGCTACTATGGAC
CGTTTTGGGAACATGTGTTGAGTTATTGGAGAGGAAGCTTGGAATACTCCAAGAATGTGC
TATTCTTGAGGTACGAGGAGTTGAAGGTAGAGCCTCGTGGTCAGGTTAAGAGACTTGCCG
AGTTCTTGGGTGTTCCTTTTTCTGTGGAGGAAGAAGAGAGTGGAAGTGTGGAAAAGATCT
TAGACCTTTGCTCGTTGGATAACCTGAAGAGCTTGGAGATAAACAAGAGTGGAAAAACGG
CTAGAGGCGTGGAACACAAGATTTTTTTCCGTAAAGGGGAAGTTGGTGACTCAAAGAACT
ATCTGACTCCTGAAATGGAGAAGAAGATTGACATGATCATCGAGGAGAGATTTCGAGGTG
CGGATTTGAAGTTCTGAAGTAAACTATATGTGTGGTTTTAGATTTACTTTGATGAAAGTA
CTTTCCGTGCATGGTTATACTCCTACTTTTGGTTAATGATTCATGATGTGATGTCTATCA
TTTCATTTTTTTATTACTTGGATGTTTTGTAATTTATGAATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A950TF U 1
AF RR4A950JQ C 196
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TATTCTTGAG*TACGAGGAGTTGA

QA 1 624 1 624
DS 

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QA 1 871 1 871
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4F493JQ C 1
AF RR4F493TF U 1
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DS 

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GGGTCAAGGTGCAGTTGAGTTCCTCTGGTTCTGCAAGAGGGTCCGGATTTCAACCCACCG
ACTGCCACATCCATTTCTGAGATCTATCACTTATTTGTAGGGACATTGGAGTACTATAAT
TAGGCTTAAATAGAATACGTCCTCAGGCATCTACTGGACTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTT
TACAGCAACACAGTACACGATGTGCAATAAAAAAATTGGAATTAAATGATTTTTATTTAG
GTTGGGTCATAAAAGACAATGTTATGTTTTGACGTTTGTTGACAAAAAAAAAGTTATGTT
TTGATGTTCATGTTAAGAAATTAGGGACATTTGAAGCTGCC

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AI22JQ C 1
AF RR4AI22TF U 1
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AATAATAACAATTATCCTTAATCAAATACCTTCTTCATTGCTTAAG

QA 1 466 1 466
DS 

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AATAATAACAATTATCCTTAATCAAATACCTTCTTCATTGCTTAAG

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

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AGCAAACCCAAAAGCCGATTGGTCAATGTCCAAAGTCTGATGAGGTTGGTCGTTGCTGGC
CTCTGCTGGATTACACCGCTGTGATAAGTTCATAAAATCGTCCCCAATGTCTAAATCATC
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GGTGGTGGTGGTGATGACTGTTGGTAGAGTAATAACTCTTGGAGGTTCTTCTTCGACGAA
GGCTCTAAAGTTGTTCCTTGAGGGCTTAACCTTCGTGCAAAACACCTCCATGAAATTGTT
TGCACACCCACGGTTATAGGCCACGGTTCTGCTGTTCGGTCTGTACCGGAAATTCTCATA
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BQ
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BQ
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BS 41 510 RR4D748JQ
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TCCAGCAAAATTCCCCACTGATGATTTCGATTCTC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A078TFB U 1
AF RR4A078TF U 449
BS 1 537 RR4A078TFB
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BS 539 776 RR4A078TFB
BS 777 793 RR4A078TF

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CGTCTGGTCCGTGATGCCAAAACCAACCCTTTGCTTCGTTCCCTCCTTGGTCGGATTCCT
GTTAAACGCCGTTCCTCACGGCCGTTAGTCGAGCTGAATCAGACCATCTTGGTGATGGCA
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TCACATTAGCCTTAGCAGCTTCTGTTTTCATTGGTTCTCGTGAATATTTCGAGCTCGTTA
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TCTGTTATATGCGCTCTTATGCCCATCCTTACACTGTACTTTGGTAACATTGATATATGG
GTGACATGCGCAGCGTTTGTTGTTGCAATGGCTTTGTTAGTACAGAGAGGAAACCCACGT
TTTTCTCAGCTTAGTAGTACAATGTTTGGCTTGTTTTACTGTGGCTATCTCCCTTGTTTT
TGGGTTAAGCTTCGTTGTGGTTTAGCTGCTCCTGCTCTCAACACTGGTATTGCATG

QA 1 776 1 776
DS 

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TCCTCCTCCTAGATATGTATCTCGTTTTTTGCTCTGTTATATGCGCTCTTATGCCCATCC
TTACACTGTACTTTGGTAACATTGATATATGGGTGACATGCGCAGCGTTTGTTGTTGCAA
TGGCTTTGTTAGTACAGAGAGGAAACCCACGTTTTTCTCAGCTTAGTAGTACAATGTTTG
GCTTGTTTTACTGTGGCTATCTCCCTTGTTTTTGGGT*AAGCTTCGTTGTGGTTTAGCTG
CTCCTGCTCTCAACACTGGTATTGCATGGACTTGCCATTTTTTCT

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 2

CO CL4609Contig1 721 2 5 U
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TCTTTTCCCAGATTATCATCATTGTCTTTGTCTCTCTCTAGATTCTGGCTTCTCCTCGTA
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GAGAGTCTTGTTACACCTCCAACAAACAACGAGCCTCAACAGAACAACAACCGTCGTCAT
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CAGTGGTAAGAAAGGAAGCAGATCGGTTCAGCAGAGTAGTTTTCAACAAATGACAACGAC
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TCGTCGAGTTTCTCTTTTCAACTTTGTTTTGGCCACACATTTGGGTGTATTAATTAAATA
TACATTATTGTTCTTGCTGCTTCTTGGTTTGATTTTATAAAATGTTGACAATGTTCTTTA
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4EW67JQ C 1
AF RR4EW67TF U 1
BS 1 701 RR4EW67TF
BS 702 702 RR4EW67JQ
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BS 712 721 RR4EW67TF

RD RR4EW67JQ 721 0 0
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TCTTTTCCCAGATTATCATCATTGTCTTTGTCTCTCTCTAGATTCTGGCTTCTCCTCGTA
TCAGAACCAAGATCCTCTGCTCTAATACCGACAATGGCAACGGGAAACAAAGGAAGACAA
CTGCCAAAATTTGGGGAATGGGACGCCGCGACTAATCCAGGCGCCGCCCAAGGATTCACC
GTCATCTTCAACAACGCTCGCGACGACAAGAAGACCAAGAAAACAGCTGTTGCGGGACCT
GAGAGTCTTGTTACACCTCCAACAAACAACGAGCCTCAACAGAACAACAACCGTCGTCAT
CATCGTCATCAACAGAACAACAACCATCGCAAGAAACGTAATTCGTCGCCACCCCCACGT
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CAGTGGTAAGAAAGGAAGCAGATCGGTTCAGCAGAGTAGTTTTCAACAAATGACAACGAC
AAAAACCTTCTGTTCGTGTTAGATTGTTGTTAACTTCAATTCTTCTTCTTCTTCCTCTTC
TCGTCGAGTTTCTCTTTTCAACTTTGTTTTGGCCACACATTTGGGTGTATTAATTAAATA
TACATTATTGTTCTTGCTGCTTCTTGGTTTGATTTTATAAAATGTTGACAATGTTCTTTA
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4EW67TF 721 0 0
GGAACGACGACGTGATCGTCCTCTCTCCTCCTCCTCATCTATTATTACAATTTCATCTCC
TCTTTTCCCAGATTATCATCATTGTCTTTGTCTCTCTCTAGATTCTGGCTTCTCCTCGTA
TCAGAACCAAGATCCTCTGCTCTAATACCGACAATGGCAACGGGAAACAAAGGAAGACAA
CTGCCAAAATTTGGGGAATGGGACGCCGCGACTAATCCAGGCGCCGCCCAAGGATTCACC
GTCATCTTCAACAACGCTCGCGACGACAAGAAGACCAAGAAAACAGCTGTTGCGGGACCT
GAGAGTCTTGTTACACCTCCAACAAACAACGAGCCTCAACAGAACAACAACCGTCGTCAT
CATCGTCATCAACAGAACAACAACCATCGCAAGAAACGTAATTCGTCGCCACCCCCACGT
GAAAAGAAGAAATGGCTTTGCTTCTATTGAATCTGGTTCGGGCTCTGTTTTCAAAAAACG
CAGTGGTAAGAAAGGAAGCAGATCGGTTCAGCAGAGTAGTTTTCAACAAATGACAACGAC
AAAAACCTTCTGTTCGTGTTAGATTGTTGTTAACTTCAATTCTTCTTCTTCTTCCTCTTC
TCGTCGAGTTTCTCTTTTCAACTTTGTTTTGGCCACACATTTGGGTGTATTAATTAAATA
TACATTATTGTTCTTGCTGCTTCTTGGTTTGATTTTATAAA*TGTTGACA*TGTTCTTTA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4611Contig1 646 2 4 U
GGACCATTAGGGCGAACGCGAAATCTAGGAGGTAACAGAGAGCGATGGCGAGTACAGGAA
CTGCAGGTGCTGCGACGGGAACGACGACGACGGCGGCGAAGAGAAAGCCTGTGTTTGTTA
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AATACGAACTGATTAACGTTACTGATCAGTGATGTCTTTTTTAGTTATCTTTATGCTAGT
GTTTGGTGCTCTAATTCTTCTACCGTCAATGTCTTTTTATTTAGTTGATGAAAGCTTTTG
TATGACTTGGTTCAGAGATCCTTGTTTTGTAGGAATGCTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EY19TF U 1
AF RR4EY19JQ C 178
BS 1 634 RR4EY19TF
BS 635 635 RR4EY19JQ
BS 636 645 RR4EY19TF
BS 646 646 RR4EY19JQ

RD RR4EY19TF 645 0 0
GGACCATTAGGGCGAACGCGAAATCTAGGAGGTAACAGAGAGCGATGGCGAGTACAGGAA
CTGCAGGTGCTGCGACGGGAACGACGACGACGGCGGCGAAGAGAAAGCCTGTGTTTGTTA
AGGTTGAACAGCTCAAGCCTGGCACGACCGGTCACACGTTGACTGTCAAGGTCGTCGACG
CCAATCCAGTGGTTCCGGCTGCGAGGAAGGCTCGTCAAGGGATCTCTATGGGTCGCCCGT
CTCAGCCGAGTCGAATCGCTGAGTGTCTCATCGGAGACGAAACCGGATGTATTCTCTTCA
CTGCTCGTAACGAGCAAGTTGATCTTATGAAGCCTGGACAGACGGTGATACTGCGCAATT
CGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACAATGAGGCTAGGGGTTGATAAATGGGGACGCATCG
AAGCCGCCACCGAACCTGCATCTTTCACAGTCAAAGAGGATAACAACCTGTCTCTTGTTG
AATACGAACTGATTAACGTTACTGATCAGTGATGTCTTTTTTAGTTATCTTTATGCTAGT
GTTTGGTGCTCTAATTCTTCTACCGTCAATGTCTTTTTATTTAGTTGATGAAAGCTTTTG
TATGACTTGGTTCAGAGATCCTTGTTTTGTAGGA*TGCTTTTTAT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4EY19JQ 469 0 0
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CGTTTCAGCCGAGTCGAATCGCTGAGTGTTTCATCGGAGACGAAACCGGATGTATTTTTT
TCACTGCTCGTAACGAGCAAGTTGATTTTATGAAGCCTGGACAGACGGTGATACTGCGCA
ATTCGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACAATGAGGCTAGGGGTTGATAAATGGGGACGCA
TGGAAGCCGCCACCGAACCTGCATCTTTCACAGTCAAAGAGGATAACAACCTGTTTCTTG
TTGAATACGAACTGATTAACGTTACTGATCAGTGATGTCTTTTTTAGTTATCTTTATGCT
AGTGTTTGGTGCTCTAATTTTTCTACCGTCAATGTCTTTTTATTTAGTTGATGAAAGCTT
TTGTATGACTTGGTTCAGAGATCCTTGTTTTGTAGGAATGCTTTTTATT

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL4612Contig1 1008 2 2 U
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CAAGAAAACAAAATCTGTCTCCCTGTGAATCCACGGGAGAAAGATTTTGATTTTCATTGA
TTTCTCGTAAATCTCTCTGATATTTTGATTCTTATTTTTTTGGTAGTATGGAAACAAAAC
CTGAGAAAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAAATAAACAAGAGTCCGACCATGAAGACGA
AAAAGATATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGTCATGTTCATGCTACGTCGTCGCC
GGAGGAGAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCGTGTGGTTGAGTCCGTACGTAAAG
TCCATTCCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTAACTCTACTAACACAATCCTCCTTCCTC
CGGTCCCGGAAACTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGATAATGATGATGTTGTTG
ATGGTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTATTGAGGTTTTCACGGCGTCATCTTCAT
CATCATCCTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGCCATGTCTCTACGTGATTTGGATCATC
ACTATGATGACGATGAGGATGATGATGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAGGAGATG
AAATGATAGATGAGAAAGCTGAGGAATTCATCGTGAGATTTTATGAGCAAATGAAAATGC
AAAATCAGGTTTACACTGAACGTTGCAAAGCCAAAGGGATAATAATTAACTGATGATCAT
CTATCGTTTACGTCGCTATCATGCATGCATGGAGATGAGATTATGGAAATGTCTGGTTAT
TTGATTAATTTGTTCAGACGAAGGAGAATGATCTTCAGGTTTTCTTGGTCGATTCTATTT
TTTTGGTATTGTAACTTTTTATTCTTTAATGAAAATAGGAAAAACGAAATATATGTATGT
CTGTATGTTTTCTTCAATACTCTATATTAATTTATTTGATTTTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX70TF U 1
AF RR4CX70JQ C 180
BS 1 649 RR4CX70TF
BS 650 1008 RR4CX70JQ

RD RR4CX70TF 649 0 0
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TTTCTCGTAAATCTCTCTGATATTTTGATTCTTATTTTTTTGGTAGTATGGAAACAAAAC
CTGAGAAAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAAATAAACAAGAGTCCGACCATGAAGACGA
AAAAGATATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGTCATGTTCATGCTACGTCGTCGCC
GGAGGAGAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCGTGTGGTTGAGTCCGTACGTAAAG
TCCATTCCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTAACTCTACTAACACAATCCTCCTTCCTC
CGGTCCCGGAAACTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGATAATGATGATGTTGTTG
ATGGTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTATTGAGGTTTTCACGGCGTCATCTTCAT
CATCATCCTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGCCATGTCTCTACGTGATTTGGATCATC
ACTATGATGACGATGAGGATGATGATGTTGATTGTTATAGCGATGTTGA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4CX70JQ 829 0 0
CCTGAGAAAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAA*TAAACAAGAGTCCGACCATGAAGACG
AAAAAGATATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGTCATGTTCATGCTACGTCGTCGC
CGGAGGAGAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCGTGTGGTTGAGTCCGTACGTAAA
GTCCATTCCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTAACTCTACTAACACAATCCTCCTTCCT
CCGGTCCCGGAAACTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGATAATGATGATGTTGTT
GATGGTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTATTGAGGTTTTCACGGCGTCATTTTCA
TCATCATCCTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGCCATGTCTCTACGTGATTTGGATCAT
CACTATGATGACGATGAGGATGATGATGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAGGAGAT
GAAATGATAGATGAGAAAGCTGAGGAATTCATCGTGAGATTTTATGAGCAAATGAAAATG
CAAAATCAGGTTTACACTGAACGTTGCAAAGCCAAAGGGATAATAATTAACTGATGATCA
TCTATCGTTTACGTCGCTATCATGCATGCATGGAGATGAGATTATGGAAATGTCTGGTTA
TTTGATTAATTTGTTCAGACGAAGGAGAATGATCTTCAGGTTTTCTTGGTCGATTCTATT
TTTTTGGTATTGTAACTTTTTATTCTTTAATGAAAATAGGAAAAACGAAATATATGTATG
TCTGTATGTTTTCTTCAATACTCTATATTAATTTATTTGATTTTGTGTG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL4613Contig1 686 2 1 U
GTATAAAAAAAACATGGATGGACTAGAAACAAGGAGGGTCAAAAAAATAAAATAAAGATA
CCTCGCCTTGAGGCCTACTATAATCAACAGGGTTTCTTCCAGTGATGATCTCCATGATTA
ATATTCCAAAGCTGTAGATGTCACTCTTCTCGTTTAACATCCCGGTGCACGCATATTCCG
GTGCTACATAACTGAACAAGTACAAGTTATTTCCTAAAGGTTTCTACCGTGATCACAAAG
TGAGAGACATTTTAAAAAAAAGGAGACTTTACCCGAAGGTTCCCATGACACGGGTTGTAA
CATAACTGCTGTCGGAACCCAAGAGCTTAGCAAGTCCAAAATCCGAAACCTTAGCATTCT
ATAGGCGATCAAGTAATATATTGCTCGATTTGATATCCCGATGAACTACTTTTGGTTCAA
GACCCTCGTGTAGATACGCCAATCTACGTATATACCAAAGGTTTACATTGTTTACAAAGA
TAGACTAATAAAATAGTGGAATATATTTTATTTACCCTTTAGCCATCCCGAGTATAATGT
TGATACGGATATCCCAAGTAAGAGGGCTAACATCGCCAACATCACCGTGAATCCATTGCT
CCAAATTGCCATTATCCACAAATTCATACACCAGCATCCTGTAAGATAGAGAGAACTCAC
ACATTATTAGATCACAACATTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B927TF U 1
AF RR4B927JQ C 230
BS 1 686 RR4B927TF

RD RR4B927TF 686 0 0
GTATAAAAAAAACATGGATGGACTAGAAACAAGGAGGGTCAAAAAAATAAAATAAAGATA
CCTCGCCTTGAGGCCTACTATAATCAACAGGGTTTCTTCCAGTGATGATCTCCATGATTA
ATATTCCAAAGCTGTAGATGTCACTCTTCTCGTTTAACATCCCGGTGCACGCATATTCCG
GTGCTACATAACTGAACAAGTACAAGTTATTTCCTAAAGGTTTCTACCGTGATCACAAAG
TGAGAGACATTTTAAAAAAAAGGAGACTTTACCCGAAGGTTCCCATGACACGGGTTGTAA
CATAACTGCTGTCGGAACCCAAGAGCTTAGCAAGTCCAAAATCCGAAACCTTAGCATTCT
ATAGGCGATCAAGTAATATATTGCTCGATTTGATATCCCGATGAACTACTTTTGGTTCAA
GACCCTCGTGTAGATACGCCAATCTACGTATATACCAAAGGTTTACATTGTTTACAAAGA
TAGACTAATAAAATAGTGGAATATATTTTATTTACCCTTTAGCCATCCCGAGTATAATGT
TGATACGGATATCCCAAGTAAGAGGGCTAACATCGCCAACATCACCGTGAATCCATTGCT
CCAAATTGCCATTATCCACAAATTCATACACCAGCATCCTGTAAGATAGAGAGAACTCAC
ACATTATTAGATCACAACATTTTTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4B927JQ 457 0 0
TGATCACAAAGTGAGAGACATTTTAAAAAAAAGGAGACTTTACCCGAAGGTTCCCATGAC
ACGGGTTGTAACATAACTGCTGTCGGAACCCAAGAGCTTAGCAAGTCCAAAATCCGAAAC
CTTAGCATTCTATAGGCGATCAAGTAATATATTGCTCGATTTGATATCCCGATGAACTAC
TTTTGGTTCAAGACCCTCGTGTAGATACGCCAATCTACGTATATACCAAAGGTTTACATT
GTTTACAAAGATAGACTAATAAAATAGTGGAATATATTTTATTTACCCTTTAGCCATCCC
GAGTATAATGTTGATACGGATATCCCAAGTAAGAGGGCTAACATCGCCAACATCACCGTG
AATCCATTGCTCCAAATTGCCATTATCCACAAATTCATACACCAGCATCCTGTAAGATAG
AGAGAACTCACACATTATTAGATCACAACATTTTTCC

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

CO CL4614Contig1 1080 2 2 U
GGATCTTGAGGCTGCAGGAGGAGAAGGCGTCGATAGAGATGGAAGCTAGGCAGTATCAGC
GGATGATAGAAGAGAAGTCAGCTTTTGACGCTGAGGAGATGAGCATTCTCAAAGAGATTT
TGCTGAGGAGGGAGAGGGAGAAACATTTCTTGGAGAAAGAAGTTGACACCTACAGACTAA
TGTTCCTCGAGACTGACCAGCAACCTCTTCCCAACACCGGACGGACTGACTCTTTTGGAT
TTGGTATCTTCACTAATCAGACGGACGAGTCAAGAAGTGAGGGACTTCTGATTGATGTAA
AACCACAAGAGATAGAGGAAGGCATTTCATTTCCAGAACCAGACTCTGAGTCCAAGAAGG
TTGGTGAGGATTGTTGTGTACATGATATCCATGTGGTGAAAGATCAAGACAACGAAGTGC
AACTGAATGTTCCTTCGGACCATATGGTTCGGGATCTTCTCACTCTGGATAGATCACAAA
GTGTTTTAGGTACAACAAGTTATGGACTTCCACCGGCGTTTCCACAAGGACAAAGGATCA
TGTCTCCAAATATGCGCAGAAACTCAATGTCAGCTGTTGACTATGAAAGACTGAAGGTAG
AAGGTGAAGTTAGTTTGCTGAGAGGACGTTTGAGAGCTGTACAGAAGGGAAGAGAGAAGA
TCAGTTTCTCTTCCAAGGAACAGAGCAAATCGCAGACGCAACGTTTTGGAGACAAAACAA
GTCGGTTCTGGGAGGCTAGAGGAACGGGACCTATCGACTCTTCAAGCCCTTCTTCCACAA
TGGTAAAAGCTATGTCTATGTCATTGGACCTGCATAGCGCTTGAAAGTCGAAACTACAAG
GTATGAATTTTTCTCGCATTACGCAGCACAAGCTATGTCTATGCCAAACTCTAATGTGGT
TTTTGCTTGGAGTAGTACGTAATCTGTTGGGAGTTTTTGTTTCAAACATCGTACTACAAA
CGGTATCGTTTCGGAACAAAATAGGGACGCTTTTGTGGTGGTCTTTAATTATAAGAGTTT
CTAATTATAAATGGTGTGAATACTTTCTCTTTTCCATCTTAATGACATTTGCCTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AW24TF U 1
AF RR4AW24JQ C 273
BS 1 730 RR4AW24TF
BS 731 1080 RR4AW24JQ

RD RR4AW24TF 730 0 0
GGATCTTGAGGCTGCAGGAGGAGAAGGCGTCGATAGAGATGGAAGCTAGGCAGTATCAGC
GGATGATAGAAGAGAAGTCAGCTTTTGACGCTGAGGAGATGAGCATTCTCAAAGAGATTT
TGCTGAGGAGGGAGAGGGAGAAACATTTCTTGGAGAAAGAAGTTGACACCTACAGACTAA
TGTTCCTCGAGACTGACCAGCAACCTCTTCCCAACACCGGACGGACTGACTCTTTTGGAT
TTGGTATCTTCACTAATCAGACGGACGAGTCAAGAAGTGAGGGACTTCTGATTGATGTAA
AACCACAAGAGATAGAGGAAGGCATTTCATTTCCAGAACCAGACTCTGAGTCCAAGAAGG
TTGGTGAGGATTGTTGTGTACATGATATCCATGTGGTGAAAGATCAAGACAACGAAGTGC
AACTGAATGTTCCTTCGGACCATATGGTTCGGGATCTTCTCACTCTGGATAGATCACAAA
GTGTTTTAGGTACAACAAGTTATGGACTTCCACCGGCGTTTCCACAAGGACAAAGGATCA
TGTCTCCAAATATGCGCAGAAACTCAATGTCAGCTGTTGACTATGAAAGACTGAAGGTAG
AAGGTGAAGTTAGTTTGCTGAGAGGACGTTTGAGAGCTGTACAGAAGGGAAGAGAGAAGA
TCAGTTTCTCTTCCAAGGAACAGAGCAAATCGCAGACGCAACGTTTTGGAGACAAAACAA
GTCGGTTCTG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4AW24JQ 808 0 0
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CCAGAACCAGACTCTGAGTCCAAGAAGGTTGGTGAGGATTGTTGTGTACATGATATCCAT
GTGGTGAAAGATCAAGACAACGAAGTGCAACTGAATGTTCCTTCGGACCATATGGTTCGG
GATCTTCTCACTCTGGATAGATCACAAAGTGTTTTAGGTACAACAAGTTATGGACTTCCA
CCGGCGTTTCCACAAGGACAAAGGATCATGTCTCCAAATATGCGCAGAAACTCAATGTCA
GCTGTTGACTATGAAAGACTGAAGGTAGAAGGTGAAGTTAGTTTGCTGAGAGGACGTTTG
AGAGCTGTACAGAAGGGAAGAGAGAAGATCAGTTTCTCTTCCAAGGAACAGAGCAAATCG
CAGACGCAACGTTTTGGAGACAAAACAAGTCGGTTCTGGGAGGCTAGAGGAACGGGACCT
ATCGACTCTTCAAGCCCTTCTTCCACAATGGTAAAAGCTATGTCTATGTCATTGGACCTG
CATAGCGCTTGAAAGTCGAAACTACAAGGTATGAATTTTTCTCGCATTACGCAGCACAAG
CTATGTCTATGCCAAACTCTAATGTGGTTTTTGCTTGGAGTAGTACGTAATCTGTTGGGA
GTTTTTGTTTCAAACATCGTACTACAAACGGTATCGTTTCGGAACAAAATAGGGACGCTT
TTGTGGTGGTCTTTAATTATAAGAGTTTCTAATTATAAATGGTGTGAATACTTTCTCTTT
TCCATCTTAATGACATTTGCCTTTTTCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL4615Contig1 915 2 2 U
GAGACCGGGGAGGGTGTACACTAGCTCAGGTCCGACGTTTGCTACAGACAGAACAGAGGT
TGATATCATCTCCATCGACGTTGATGCGGTGGAGAAGTCTTCTTCTGTGAGAAGGCTGAC
GACAAACGGGAAGAACAATGCTTTCCCTTGGCCGTCTCCCGACGGGAAGCTGATCGTGTT
TCGTTCGGGGCGGTCCGGTCACAAAAACCTCTACTTGATGGATGCTGAGAAAGGAGAAAC
CGGTGGTCTTTGGAAGTTAACGGAAGGTGCGTGGACAGACACTATGTGCAGCTGGTCACC
TGATGGAGAATGGATCGCGTTTGCATCGGATAGAGAAAGCCCTGGCTCGGGCAGCTACGA
GCTGTTTTTGATTCACCCGGACGGAACAGGGTTAAGGAAGCTGATACAGAGTGGCACTGG
TGGGATAACGAACCATCCGATCTTTAGTCCCGACAGTAAAAGTATCGTCTTTACATCTGA
TTACGCTGGGATATCAGCTGAACCGATCTCGAACCCGCATCATCACCAACCGTATGGTGA
TATCTTCACGGTGAAACTGGATGGATCTAATCTGAGGAGATTGACGCATAACTCATATGA
AGATGGGACTCCTGCGTGGGCTCCTCGGTTCATCAGCCCAAGTGACGTGGTGTTGCGCAG
GAAGAATGATTTGAGTTGCGCATTCGAAGACTGTCACTGGCTCAATAAGAACCCGACACT
AAAAGGCCAAAAGATCTCATGTTAATATGTATACTATTACGCAACTATTTGAGTATCCTT
GTTCATAGAGCTACTGCTCCACTGTAAGATTATTCCAGCTTGGAACTATTGTTATAGACT
TGTATGAGAGACTGCAGGTGTATATGGATATCGTATTGAATAACACTGTGATATATGCAT
AAGACCATATTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK79TF U 1
AF RR4EK79JQ C 468
BS 1 649 RR4EK79TF
BS 650 915 RR4EK79JQ

RD RR4EK79TF 649 0 0
GAGACCGGGGAGGGTGTACACTAGCTCAGGTCCGACGTTTGCTACAGACAGAACAGAGGT
TGATATCATCTCCATCGACGTTGATGCGGTGGAGAAGTCTTCTTCTGTGAGAAGGCTGAC
GACAAACGGGAAGAACAATGCTTTCCCTTGGCCGTCTCCCGACGGGAAGCTGATCGTGTT
TCGTTCGGGGCGGTCCGGTCACAAAAACCTCTACTTGATGGATGCTGAGAAAGGAGAAAC
CGGTGGTCTTTGGAAGTTAACGGAAGGTGCGTGGACAGACACTATGTGCAGCTGGTCACC
TGATGGAGAATGGATCGCGTTTGCATCGGATAGAGAAAGCCCTGGCTCGGGCAGCTACGA
GCTGTTTTTGATTCACCCGGACGGAACAGGGTTAAGGAAGCTGATACAGAGTGGCACTGG
TGGGATAACGAACCATCCGATCTTTAGTCCCGACAGTAAAAGTATCGTCTTTACATCTGA
TTACGCTGGGATATCAGCTGAACCGATCTCGAACCCGCATCATCACCAACCGTATGGTGA
TATCTTCACGGTGAAACTGGATGGATCTAATCTGAGGAGATTGACGCATAACTCATATGA
AGATGGGACTCCTGCGTGGGCTCCTCGGTTCATCAGCCCAAGTGACGTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4EK79JQ 448 0 0
TCTTTACATCTGATTACGCTGGGATATCAGCTGAACCGATTTCGAACCCGCATCATCACC
AACCGTATGGTGATATTTTCACGGTGAAACTGGATGGATTTAATTTGAGGAGATTGACGC
ATAACTCATATGAAGATGGGACTCCTGCGTGGGCTCCTCGGTTCATCAGCCCAAGTGACG
TGGTGTTGCGCAGGAAGAATGATTTGAGTTGCGCATTCGAAGACTGTCACTGGCTCAATA
AGAACCCGACACTAAAAGGCCAAAAGATCTCATGTTAATATGTATACTATTACGCAACTA
TTTGAGTATCCTTGTTCATAGAGCTACTGCTCCACTGTAAGATTATTCCAGCTTGGAACT
ATTGTTATAGACTTGTATGAGAGACTGCAGGTGTATATGGATATCGTATTGAATAACACT
GTGATATATGCATAAGACCATATTGAGT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

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TAAACTCCCAATTAGCGCAGCAAAGCCTTGCAATGTATTAGAATGTCGAAGAGAGTGTAA
AAAGAAATACCCACCTCTTGGTAGTGGTGTTTGTTCGGAGACTAAGGGATTTTGTGACTG
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TTGTATCAGATCTATGGATTTATTTATAATAAATATTAATATGAATGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E503JQ C 1
AF RR4E503TF U 1
BS 1 469 RR4E503TF

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ATTCATCATTCTTTCACTAGGAACAGATGCGCAAAAAAAGGAAACAAAACTATGTCCTTA
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AAAGAAATACCCACCTCTTGGTAGTGGTGTTTGTTCGGAGACTAAGGGATTTTGTGACTG
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TTGTATCAGATCTATGGATTTATTTATAATAAATATTAATATGAATGTT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR4E503TF 469 0 0
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ATTCATCATTCTTTCACTAGGAACAGATGCGCAAAAAAAGGAAACAAAACTATGTCCTTA
TAAACTCCCAATTAGCGCAGCAAAGCCTTGCAATGTATTAGAATGTCGAAGAGAGTGTAA
AAAGAAATACCCACCTCTTGGTAGTGGTGTTTGTTCGGAGACTAAGGGATTTTGTGACTG
CAATGCTCCTTGTAAGAGTTAAATGTTGCGAATATAATACACAACCCAAATCCTATATTA
CCTTTTTAACAATAATTGTCTAAATATTTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTACTATAATAT
TTGTATCAGATCTATGGATTTATTTATAATAAATATTAATATGAATGTT

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL4617Contig1 1105 2 2 U
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TGAAGAAGTGAAGTGCATTGTGAGAGTGCTTCCTATATGGTTTGCTTCGTCGATCTATTA
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CTTAGGTTCTGGAGGGTTTGTGGTTCCCGCAGCCACCTATGTTGTCTTCTTGATGACGGG
AATGACTGTTTTCATCATAATCTACGACCGCGTCCTCGTGCCTACCTTAAGAAGAATCAC
CGGTCTAGACACGGGGATCACACTCTTGCAGAGGATTGGAACCGGGATCTCCTTCGCCTT
TTTGAGCTTGATAGTCTGGCTTCGTCGAGGAAAGGAGGAGAAACTTCGCGTTGACAAAAC
CAACACTCGGTATGGCGCCACGGAAGGGAGAGATCTCCTCAATGTCAGCAATGTGGCTGA
TACCACAGCTAACACTGGCTGGTATAGCCGAGGCGTTTGGAGCTATTGGACAGATGGAGT
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GAGGAGGAGTTTCCAGTTACCTTGGTAGCTTCTTGATTGCGACGGTTCACAGGACTACGC
AGAACTCGGCTGGTGGTAACTGGTTGGCTGAAGATTTGAACAAAGGAAGATTGGATTTGT
TTTACTTCATGATCGCTGGAATCTTGGCGGTTAACTTTGCTTACTTCTTGGTGATGTCAA
AATGGTATAGGTACAAAGGAAGTGATGATGAAGTGACAACTTATGAAACAAATGGTGATA
TGATCAAACAACAAGACAAGAACAAAGTCTAATGGTCGTCATGTGGTTTCTCATCTTCCT
GAAGCTTTTACACTTAGTTTTTGGTCAGCTTCAATCCCTTTTTTGCACTTTCTTTTGAAT
AAGCTAAGTAAGTAATCTTATACTTGTTGTAGCTCTTTTTTTTTCTTCCCCTGGTTACTA
TTTTACATCACATTTCCTTTTTTCTATCATTGTGGAAAAAAGGGAGATCATAACTTCAGA
TGTAATACAGAATATATGTTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH58TF U 1
AF RR4AH58JQ C 364
BS 1 787 RR4AH58TF
BS 788 1105 RR4AH58JQ

RD RR4AH58TF 787 0 0
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TGAAGAAGTGAAGTGCATTGTGAGAGTGCTTCCTATATGGTTTGCTTCGTCGATCTATTA
CTTGACCATCACGCAACAAATGACTTATCCCGTCTTCCAAGCCCTCCAAAGCGATCGTAG
CTTAGGTTCTGGAGGGTTTGTGGTTCCCGCAGCCACCTATGTTGTCTTCTTGATGACGGG
AATGACTGTTTTCATCATAATCTACGACCGCGTCCTCGTGCCTACCTTAAGAAGAATCAC
CGGTCTAGACACGGGGATCACACTCTTGCAGAGGATTGGAACCGGGATCTCCTTCGCCTT
TTTGAGCTTGATAGTCTGGCTTCGTCGAGGAAAGGAGGAGAAACTTCGCGTTGACAAAAC
CAACACTCGGTATGGCGCCACGGAAGGGAGAGATCTCCTCAATGTCAGCAATGTGGCTGA
TACCACAGCTAACACTGGCTGGTATAGCCGAGGCGTTTGGAGCTATTGGACAGATGGAGT
TTTACTACAAGCAGTTCCCTGAGAACATGAGGAGTTTCGCTGGCTCCATCTTCTATGTTG
GAGGAGGAGTTTCCAGTTACCTTGGTAGCTTCTTGATTGCGACGGTTCACAGGACTACGC
AGAACTCGGCTGGTGGTAACTGGTTGGCTGAAGATTTGAACAAAGGAAGATTGGATTTGT
TTTACTTCATGATCGCTGGAATCTTGGCGGTTAACTTTGCTTACTTCTTGGTGATGTCAA
AATGGTA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4AH58JQ 742 0 0
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CACTCGGTATGGCGCCACGGAAGGGAGAGATCTCCTCAATGTCAGCAATGTGGCTGATAC
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GAGGAGTTTCCAGTTACCTTGGTAGCTTCTTGATTGCGACGGTTCACAGGACTACGCAGA
ACTCGGCTGGTGGTAACTGGTTGGCTGAAGATTTGAACAAAGGAAGATTGGATTTGTTTT
ACTTCATGATCGCTGGAATCTTGGCGGTTAACTTTGCTTACTTCTTGGTGATGTCAAAAT
GGTATAGGTACAAAGGAAGTGATGATGAAGTGACAACTTATGAAACAAATGGTGATATGA
TCAAACAACAAGACAAGAACAAAGTCTAATGGTCGTCATGTGGTTTCTCATCTTCCTGAA
GCTTTTACACTTAGTTTTTGGTCAGCTTCAATCCCTTTTTTGCACTTTCTTTTGAATAAG
CTAAGTAAGTAATCTTATACTTGTTGTAGCTCTTTTTTTTTCTTCCCCTGGTTACTATTT
TACATCACATTTCCTTTTTTCTATCATTGTGGAAAAAAGGGAGATCATAACTTCAGATGT
AATACAGAATATATGTTTTCCG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4618Contig1 1039 2 6 U
TGATCTGATAAGAACGGTTTCTTCATCTACTTTCTCAACCCAACCTTTCAAGTTTTTTAG
ACCCCCCTTGATAACGATAACTGCATCACCCTTCACAAAATGACCTTTCTTTCTGTTTGC
AAATAAAGTTGACATGCCACCAAGATCGGTCTCTCCATTTTCACTTGGTTTGTTGAATTT
TTCAAGTTCATCAAAAGTTGGTGTAACATTCTGAGCAATGATAGACTTCAATGATACTGT
TTGTACATGAAACCATCTTTGAAAAGCATACCACCAATATTTTCAAAGTAATCGCCGGTC
AAGGGATCACGCCGACGCCCAACACGTATGTGCAATTCCCTATACGCATGTAACAAATTT
TAAGAGTGCAGAACTTTAACAAAACTTTCTCAAGTGCAACACACAGATTCTAACAAAAGT
ACCTAGCTTCATCAATGTTCATGAAACGTGGAGGTGGACGAAGGCTTTTTTTCTTCACAA
CTTCTCTTCTGTCCTGCAATTAGTAAGGCAAACTGTGATCAAATAATCTTATGGCTTAAA
CGAATTCAAAAACCTTAGAATGCAGGAAAGTCATAACAATTTCCAACTTCCAAGTCAGCC
TACGTTGAACTATTACTCTATTAGGCATGTTTTATGTTTACTAACGCAAATAGCACCATT
TCCCCCACTTAGTTATGGAGAGAATCCATACCAGCTTAGAAGCTAGAGCCTGTAGATCAA
TTCTCGGAATTAACTTGACTGTGACCCTCTGCCGCACATTATCAACATCAACCACCTGTA
AGGAACTTACATTTTACAAGTCTATAGGAAGTTCTGCCAATGGAATACACATGAAAATGG
ATCATACCTTAGCAAGATCACCTTTATACGTCCCGTTTTTCATTCTAACCCACGTATCTC
GAGATAGATAATTGCTTTGCTTTCAACAGAAAGGACATCGGTCATTTTTCTTATAGGGAC
ATGTAAGATTTTCTGATTAGGATATATATTCCGCATGCCCTTGATTGCCTAGATAAGCAA
AATAAACCAACGCAAATAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV80TF U 1
AF RR4GV80JQ C 275
BS 1 683 RR4GV80TF
BS 684 684 RR4GV80JQ
BS 685 728 RR4GV80TF
BS 729 729 RR4GV80JQ
BS 730 744 RR4GV80TF
BS 745 1039 RR4GV80JQ

RD RR4GV80TF 744 0 0
TGATCTGATAAGAACGGTTTCTTCATCTACTTTCTCAACCCAACCTTTCAAGTTTTTTAG
ACCCCCCTTGATAACGATAACTGCATCACCCTTCACAAAATGACCTTTCTTTCTGTTTGC
AAATAAAGTTGACATGCCACCAAGATCGGTCTCTCCATTTTCACTTGGTTTGTTGAATTT
TTCAAGTTCATCAAAAGTTGGTGTAACATTCTGAGCAATGATAGACTTCAATGATACTGT
TTGTACATGAAACCATCTTTGAAAAGCATACCACCAATATTTTCAAAGTAATCGCCGGTC
AAGGGATCACGCCGACGCCCAACACGTATGTGCAATTCCCTATACGCATGTAACAAATTT
TAAGAGTGCAGAACTTTAACAAAACTTTCTCAAGTGCAACACACAGATTCTAACAAAAGT
ACCTAGCTTCATCAATGTTCATGAAACGTGGAGGTGGACGAAGGCTTTTTTTCTTCACAA
CTTCTCTTCTGTCCTGCAATTAGTAAGGCAAACTGTGATCAAATAATCTTATGGCTTAAA
CGAATTCAAAAACCTTAGAATGCAGGAAAGTCATAACAATTTCCAACTTCCAAGTCAGCC
TACGTTGAACTATTACTCTATTAGGCATGTTTTATGTTTACTAACGCAAATAGCACCATT
TCCCCCACTTAGTTATGGAGAGA*TCCATACCAGCTTAGAAGCTAGAGCCTGTAGATCAA
TTCTCGGA*TTAACTTGACTGTGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4GV80JQ 765 0 0
CAATATTTTCAAAGTAATCGCCGGTCAAGGGATCACGCCGACGCCCAACACGTATGTGCA
ATTCCCTATACGCATGTAACAAATTTTAAGAGTGCAGAACTTTAACAAAACTTTCTCAAG
TGCAACACACAGATTCTAACAAAAGTACCTAGCTTCATCAATGTTCATGAAACGTGGAGG
TGGACGAAGGCTTTTTTTCTTCACAACTTCTCTTCTGTCCTGCAATTAGTAAGGCAAACT
GTGATCAAATAATCTTATGGCTTAAACGAATTCAAAAACCTTAGAATGCAGGAAAGTCAT
AACAATTTCCAACTTCCAAGTCAGCCTACGTTGAACTATTACTCTATTAGGCATGTTTTA
TGTTTACTAACGCAAATAGCACCATTTCCCCCACTTAGTTATGGAGAGAATCCATACCAG
CTTAGAAGCTAGAGCCTGTAGATCAATTCTCGGAATTAACTTGACTGTGACCCTCTGCCG
CACATTATCAACATCAACCACCTGTAAGGAACTTACATTTTACAAGTCTATAGGAAGTTC
TGCCAATGGAATACACATGAAAATGGATCATACCTTAGCAAGATCACCTTTATACGTCCC
GTTTTTCATTCTAACCCACGTATCTCGAGATAGATAATTGCTTTGCTTTCAACAGAAAGG
ACATCGGTCATTTTTCTTATAGGGACATGTAAGATTTTCTGATTAGGATATATATTCCGC
ATGCCCTTGATTGCCTAGATAAGCAAAATAAACCAACGCAAATAA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4619Contig1 1029 2 4 U
GCGCGGGGTGATTGATTTTAAGAGGGAACCGTGGCCAAACATTTCGGAGACTGCTAAGAA
TCTTGTCAGGCAAATGTTAGAGCCTGATCCAAAGCGTCGGCTGACTGCAAAGCAAGTGCT
TGAGCACCCATGGGTTCAAAATGCCAAGAAAGCTCCAAATGTTCCTCTTGGAGATGTTGT
GAAGTCCAGATTAAAGCAGTTTTCAGTGATGAATAGATTCAAGAGAAAAGCTTTGAGGGT
TATTGCCGAATTCTTATCTTCCCAAGAAGTAGAAGACATCAAAGAGATGTTCAACAAGAT
GGATACTGATAAAGATGGTATTGTTACCATCGAGGAGTTGAAAGCTGGGCTTCGAGATTT
TGGTACACAGCTAGCTGAATCAGAAGTTCAGATGCTTATTGAAGCGGTGGATACTAAAGG
GAAAGGAACACTAGACTATGGGGAGTTTGTTGCAGTCTCTCTCCACCTGCAAAAGGTAGC
AAACGATGAGCATCTCCGGAAAGCATTCTCCTACTTTGACAAGGATGGAAATGGGTACAT
TTTGCCCCAAGAGCTTTGTGAAGCCTTAAAGGAAGATGGAGGGGATGACTGTGTGAATGT
CGCCAATGATATATTCCAAGAAGTTGACACAGACAAGGATGGGAGAATAAGCTACGAAGA
GTTTGCGGCAATGATGAAAACAGGAACGGATTGGAGAAAGGCGTCTCGACATTACTCGGG
AGGGAGATTCAATAGCCTAAGCATCAAGCTAATGAAGGACGGATCTTTGAACCTAGGCAA
CGAATAGCAGTAAGCCCGCATTAGATTTTTGTAGAGTTTGTCTCTCACGTCACGGACTCA
GAATTCGATCTTTTGTTTTGTTGTAAATCTTTCGTTTTTAACTTCTTTTTTTTTTCTTTT
CGGGTGATTTATGCTATCTGTGTTCTTTGTTGTATTGTGTTTGTGTTGTTTAGCTTCTTG
TGGTAGAAAGGCCAAAGACATGAGAATCAATGTTTTGATGTGTAGAAGAAAAACAAGGAC
CTTTGTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY39TF U 1
AF RR4FY39JQ C 254
BS 1 646 RR4FY39TF
BS 647 647 RR4FY39JQ
BS 648 678 RR4FY39TF
BS 679 1029 RR4FY39JQ

RD RR4FY39TF 678 0 0
GCGCGGGGTGATTGATTTTAAGAGGGAACCGTGGCCAAACATTTCGGAGACTGCTAAGAA
TCTTGTCAGGCAAATGTTAGAGCCTGATCCAAAGCGTCGGCTGACTGCAAAGCAAGTGCT
TGAGCACCCATGGGTTCAAAATGCCAAGAAAGCTCCAAATGTTCCTCTTGGAGATGTTGT
GAAGTCCAGATTAAAGCAGTTTTCAGTGATGAATAGATTCAAGAGAAAAGCTTTGAGGGT
TATTGCCGAATTCTTATCTTCCCAAGAAGTAGAAGACATCAAAGAGATGTTCAACAAGAT
GGATACTGATAAAGATGGTATTGTTACCATCGAGGAGTTGAAAGCTGGGCTTCGAGATTT
TGGTACACAGCTAGCTGAATCAGAAGTTCAGATGCTTATTGAAGCGGTGGATACTAAAGG
GAAAGGAACACTAGACTATGGGGAGTTTGTTGCAGTCTCTCTCCACCTGCAAAAGGTAGC
AAACGATGAGCATCTCCGGAAAGCATTCTCCTACTTTGACAAGGATGGAAATGGGTACAT
TTTGCCCCAAGAGCTTTGTGAAGCCTTAAAGGAAGATGGAGGGGATGACTGTGTGAATGT
CGCCAATGATATATTCCAAGAAGTTGACACAGACAAGGATGGGAGA*TAAGCTACGAAGA
GTTTGCGGCAATGATGAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FY39JQ 776 0 0
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GATGGTATTGTTACCATCGAGGAGTTGAAAGCTGGGCTTCGAGATTTTGGTACACAGCTA
GCTGAATCAGAAGTTCAGATGCTTATTGAAGCGGTGGATACTAAAGGGAAAGGAACACTA
GACTATGGGGAGTTTGTTGCAGTCTCTCTCCACCTGCAAAAGGTAGCAAACGATGAGCAT
CTCCGGAAAGCATTCTCCTACTTTGACAAGGATGGAAATGGGTACATTTTGCCCCAAGAG
CTTTGTGAAGCCTTAAAGGAAGATGGAGGGGATGACTGTGTGAATGTCGCCAATGATATA
TTCCAAGAAGTTGACACAGACAAGGATGGGAGAATAAGCTACGAAGAGTTTGCGGCAATG
ATGAAAACAGGAACGGATTGGAGAAAGGCGTCTCGACATTACTCGGGAGGGAGATTCAAT
AGCCTAAGCATCAAGCTAATGAAGGACGGATCTTTGAACCTAGGCAACGAATAGCAGTAA
GCCCGCATTAGATTTTTGTAGAGTTTGTCTCTCACGTCACGGACTCAGAATTCGATCTTT
TGTTTTGTTGTAAATCTTTCGTTTTTAACTTCTTTTTTTTTTCTTTTCGGGTGATTTATG
CTATCTGTGTTCTTTGTTGTATTGTGTTTGTGTTGTTTAGCTTCTTGTGGTAGAAAGGCC
AAAGACATGAGAATCAATGTTTTGATGTGTAGAAGAAAAACAAGGACCTTTGTTGT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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TTCCCTCAGTTTTAGGGTTTCTTCCACTATGGTTGACGGTACTTCTACATGAAGGCGGGA
CTCTTCTGGTGTGCCTCAACTCAGTACGTGGTCTGAACGATCCATCGTGGTCGTGGAAAC
AAGACATAGCTCATCTAATCAACAAGTTAAGCTCACGGGAATCCACCAGTAGCAACAACA
ACTCTTTAAGCTCTGTAGAGACTGCACATTAGGTAACTTTGCTTGTCCGTGTGCTCTGTA
TGTCTAATTATGAAACTGTATGCATGATCGCTTAAGAAACCCATCAATCGTATATAAAGA


BQ
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AF RR4FC03JQ C 1
AF RR4FC03TF U 1
BS 1 480 RR4FC03TF

RD RR4FC03JQ 480 0 0
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TTCCCTCAGTTTTAGGGTTTCTTCCACTATGGTTGACGGTACTTTTACATGAAGGCGGGA
CTTTTTTGGTGTGCCTCAACTCAGTACGTGGTTTGAACGATCCATCGTGGTCGTGGAAAC
AAGACATAGCTCATTTAATCAACAAGTTAAGCTCACGGGAATCCACCAGTAGCAACAACA
ACTCTTTAAGCTCTGTAGAGACTGCACATTAGGTAACTTTGCTTGTCCGTGTGCTCTGTA
TGTCTAATTATGAAACTGTATGCATGATCGCTTAAGAAACCCATCAATCGTATATAAAGA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4FC03TF 480 0 0
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TCTTACTGCTTCGAGACAACATCACCGGTGTTCCCTTCTGTGTCGCTAAATCTCGCCAGA
CAACATCATTGGTCAAGCAAAACGTGGCTCTTGCTTTGACGTCAATATTCTTGGCTGCTC
TTCCCTCAGTTTTAGGGTTTCTTCCACTATGGTTGACGGTACTTCTACATGAAGGCGGGA
CTCTTCTGGTGTGCCTCAACTCAGTACGTGGTCTGAACGATCCATCGTGGTCGTGGAAAC
AAGACATAGCTCATCTAATCAACAAGTTAAGCTCACGGGAATCCACCAGTAGCAACAACA
ACTCTTTAAGCTCTGTAGAGACTGCACATTAGGTAACTTTGCTTGTCCGTGTGCTCTGTA
TGTCTAATTATGAAACTGTATGCATGATCGCTTAAGAAACCCATCAATCGTATATAAAGA

QA 1 480 1 480
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4623Contig1 1024 2 12 U
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GGACGACGACAATGTACTCACCAACAGCACTTCGAGGAAGAGGCAACGTTCTCCGACCGA
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CACCATTCCCATCTTCCAGTGTGATAATGGCCATATAGCATGCTCCACTTGCTGCGAAAA
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GCGGGTTATTGAACTACTTACAGTTCGATGCCCCAATGCTGGTTGCTCCGTGGTCGTCTC
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CTTTAGCGGCTGTGACTTTACTTGCTCCTTCAAGGATTTATACAAACACAGCCTCGCTAA
ACACAGCCTTGCCGCACCTTGCGTTGCTAAACTTCACAAGTCCTTCCCCTCGCGCATGTT
TAAATGTGGAACACCCGAGCCTCTGTATTTTGCAACGGATAAGAGGACCATTCTCAAGGA
ACGGACTACTACACAAGGAGAAGGAGAAATTGTGGTTGTGGAGTGGTTCGACATGCCAGA
CGGTCGGGTGCTCTATGCCTGCTGCATTGGACCAGGAACAGACAAGTTCTCCTACCAACT
GAAGCTGACTTCAGTTTACGGTGATGACTTGTTGTTTAACTCAAACCTCAAAAGAGTCAG
TGAAGTGAGCAATGAACCACCACGTGCGCGTTTTATGTTGGCTCCTTCATGTATGTTGCC
TTACCGCGAGTGTTCTATATGCATCAAGCGGGAAACTCAGTAGGATCATCAAGACGCTAC
TACTCTTCATCACTCATCATTAGTCATCAACCACACTGATACTCTTAACTAATATTATGT
TTTGTACTGTAATCGCTATTTAATGTGTGATGTTGATCTAATTTTAATTTAAGTTGTGTG
AATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4CV73TF U 1
AF RR4C781JQ C 281
BS 1 525 RR4CV73TF
BS 526 526 RR4C781JQ
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BS 791 1024 RR4C781JQ

RD RR4CV73TF 790 0 0
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GGACGACGACAATGTACTCACCAACAGCACTTCGAGGAAGAGGCAACGTTCTCCGACCGA
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CACCATTCCCATCTTCCAGTGTGATAATGGCCATATAGCATGCTCCACTTGCTGCGAAAA
GCTGAGCCAGAAGTGTGCAACATGCACCTTACCAACCCTTTCCCGCAACAGAGCGATGGA
GCGGGTTATTGAACTACTTACAGTTCGATGCCCCAATGCTGGTTGCTCCGTGGTCGTCTC
TTGTTCCGAAACATCATCACATGTCAATAATCACTGTCCTTTCACCCAACGTAATTGCCC
CTTTAGCGGCTGTGACTTTACTTGCTCCTTCAAGGATTTATACAAACACAGCCTCGCTAA
ACACAGCCTTGCCGCACCTTGCGTTGCTAAACTTCACAAGTCCTTTCCCTCGCGCATGTT
TAAATGTGGAACACCCGAGCCTCTGTATTTTGCAACGGATAAGAGGACCATTCTCAAGGA
ACGGACTACTACACAAGGAGAAGGAGAAGTTGTGGTTGTGGAGTGGTTCGACATGCCAGA
CGGTCGGGTGCTCTATGCCTGCTGCATTGGACCAGGAACAGACAAGTTCTCCTACCAACT
GAAGCTGACTTCAGTTTACG*TGATGACTTGTTGTTTAACTCAAACCTCAGA*GAGTCAG
TGAAGTGAGC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4C781JQ 744 0 0
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GGTTGCTCCGTGGTCGTCTCTTGTTCCGAAACATCATCACATGTCAATAATCACTGTCCT
TTCACCCAACGTAATTGCCCCTTTAGCGGCTGTGACTTTACTTGCTCCTTCAAGGATTTA
TACAAACACAGCCTCGCTAAACACAGCCTTGCCGCACCTTGCGTTGCTAAACTTCACAAG
TCCTTCCCCTCGCGCATGTTTAAATGTGGAACACCCGAGCCTCTGTATTTTGCAACGGAT
AAGAGGACCATTCTCAAGGAACGGACTAC***ACAAGGAGAAGGAGAAATTGTGGTTGTG
GAGTGGTTCGACATGCCAGACGGTCGGGTGCTCTATGCCTGCTGTATTGGACCAGGAACA
GACAAGTTCTCCTACCAACTGAAGCTGACTTCAGTTTACGGTGATGACTTGTTGTTTAAC
TCAAACCTCAAAAGAGTCTGTGAAGTGAGCAATGAACCACCACGTGCGCGTTTTATGTTG
GCTCCTTCATGTATGTTGCCTTACCGCGAGTGTTCTATATGCATCAAGCGGGAAACTCAG
TAGGATCATCAAGACGCTACTACTCTTCATCACTCATCATTAGTCATCAACCACACTGAT
ACTCTTAACTAATATTATGTTTTGTACTGTAATCGCTATTTAATGTGTGATGTTGATCTA
ATTTTAATTTAAGTTGTGTGAATT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4624Contig1 722 2 2 U
GGCTGTAGAAGAAGCGGTGAAGGAGCCTGAGCTTGATGAAGAGGAGATGAAGAAGTTCAA
GGAGATGATTGAATCTAAGAAGAAAGCTTCTGCAGCAGCTGAAGATGAAGAGGAAGCTGA
GGTGGGACCAATGCCGTTACCTAAAGCCGAAGGACACATCAGTTACGGAGGTGCTTTGAG
ACCCGGTGAAGGAGACGCTATAGCGCAGTACGTGCAGCAAGGGAAGCGTATCCCACGTAG
AGGAGAAGTGGGTCTTAACGCTGATGAGATCCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTATGTGAT
GAGTGGGAGTAGGCATCAGAGGATGAATGCTATTCGTATCAGGAAGGAGAACCAGGTTTA
CAGTGCTGAAGACAAGCGGGCGTTGGCCATGTTTAACTACGAGGAGAAGGCTAAGCGCGG
GGCTAAGGTTATGGCTGATCTTTCGAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGAGAAGAGTTGGG
TCCGAATCATGACCCTTTTGGTGCTGGAAAGACTGATGGAGCTGATGATTGATTTGCTTT
GCTTCCCTTCTACTACTTGTGTGGGTACTTATCTTATGCGTTTGTCTTGTAAACCGTTCC
TTATTACATCGTATTTACTCTTTGTTTACTACTTGCCCGTTAATGGGTTTTAACAGTTTC
AATTTTCTATGCGTGTCACATTATGGCGTTTGTGTGTGTTTAAAGATGAAAGATTCTGAC
GC


BQ
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10 10 

AF RR4BV58TF U 1
AF RR4BV58JQ C 1
BS 1 706 RR4BV58TF
BS 707 722 RR4BV58JQ

RD RR4BV58TF 706 0 0
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QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4BV58JQ 722 0 0
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GGAGATGATTGAATCTAAGAAGAAAGCTTCTGCAGCAGCTGAAGATGAAGAGGAAGCTGA
GGTGGGACCAATGCCGTTACCTAAAGCCGAAGGACACATCAGTTACGGAGGTGCTTTGAG
ACCCGGTGAAGGAGACGCTATAGCGCAGTACGTGCAGCAAGGGAAGCGTATCCCACGTAG
AGGAGAAGTGGGTCTTAACGCTGATGAGATCCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTATGTGAT
GAGTGGGAGTAGGCATCAGAGGATGAATGCTATTCGTATCAGGAAGGAGAACCAGGTTTA
CAGTGCTGAAGACAAGCGGGCGTTGGCCATGTTTAACTACGAGGAGAAGGCTAAGCGCGG
GGCTAAGGTTATGGCTGATCTTTCGAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGAGAAGAGTTGGG
TCCGAATCATGACCCTTTTGGTGCTGGAAAGACTGATGGAGCTGATGATTGATTTGCTTT
GCTTCCCTTCTACTACTTGTGTGGGTACTTATCTTATGCGTTTGTCTTGTAAACCGTTCC
TTATTACATCGTATTTACTCTTTGTTTACTACTTGCCCGTTAATGGGTTTTAACAGTTTC
AATTTTCTATGCGTGTCACATTATGGCGTTTGTGTGTGTTTAAAGATGAAAGATTCTGAC
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL4625Contig1 1001 2 4 U
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AAAAAACGAGATCTGTTTTTCCACGACTGAAGGAGTATGTCGACTCCAGCAAGGAAGAGG
TTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCC
CAGGACAACAATATCATGCTCTGGAATGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACCCCGTGG
GATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTCTCTGAGGATTATCCGAATAAACCACCG
ACAGTTCGCTTTGTGTCACGGATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGC
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AACTCTAATGATTGGGATGCTGTCATGGCTTCTATGAAAGCCTAACATCCTTGTAAAAAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN87TF U 1
AF RR4DN87JQ C 320
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RD RR4DN87TF 751 0 0
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TCGGGTCGTTCGTAGCCAAGTGGCTGCTGAGCTCTGCCTTCGGGCCCTGACGTCGGGGGT
TCGACCCCCACTTACCTCAGTTTGAGGATTAAAGGTCCAAAAGTGACCAGTTGACAAAAA
AAAAAACGAGATCTGTTTTTCCACGACTGAAGGAGTATGTCGACTCCAGCAAGGAAGAGG
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CAGGACAACAATATCATGCTCTGGAATGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACCCCGTGG
GATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTCTCTGAGGATTATCCGAATAAACCACCG
ACAGTTCGCTTTGTGTCACGGATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGC
TCGGACATTCTACAAATCAGTGGAGTCCAATTTATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCA
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QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4DN87JQ 682 0 0
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TGAGTACAACAGAAAAGTGCGTGATGTCGTCGAGCAAAGCTGGACTGCTGACTAAGTATT
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TTCTTATCTTTTCCCATTCATGTCTTTTGTGTGTGTTTCAAAACTCTAATGATTGGGATG
CTGTCATGGCTTCTATGAAAGCCTAACATCCTTGTAAAAACTTTGTACCAAACCTTCTGA
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QA 1 682 1 682
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCTCTGATCATACTTATAACTCCTTCCTTGATTCCAAATCTACTTTAGACTTAATAGGAG
CTTTCTCAAGTAGCTTAGAGAGCCACTTAGCAGATTGTTTCTCGTGCCTTTCCAAGTTGT
GTGCGTAGTCAACATAGTACAGTCCAGACCTCGTCTTGTATCCATCTTCCCACTCTAGTC
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CATGTAATGCCATGAGATGTCTCATATGATAATACTTCCTGTTACTGTCGCTGAGCGCAT
CCGGAAGTACATCTTTCTCTCCAAGTGTCTCCTTGTACCCGTTTCCAGTGACCATGATCT
CCGGATAATTATAGTTCTCTTTGATGTACTTCAAAACCTTTCTTAACCCGTCTGCGCACA
CTGGATACTTAGCGCTAGCCGGCTGAGAACCAATCTTATACCCATCTGGATTTTGCAAAT
GTAACTTGAAGCGAGAATCAGATTCCCAGCTCTGTTTCTCTTGATCAACATCCTCCACAT
GAGCAACAAACGCAGAAGTGAAGTAGTTGACACCAACAAAATCATAAGAACCCTTCAGTT
TCTCCTTCTGCTTGTCTGTA


BQ
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AF RR4FY78JQ U 30
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C
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CA

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DS 

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TCTCCTTCTGCTTGTCTGTA

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AB45TF U 1
AF RR4AB45JQ C 398
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RD RR4AB45TF 843 0 0
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CCATCTGTGTTTGGAGAATCTCCAGGAGATGATGTTGTGAGGTCAGACACTTGAATGTTT
ACGCAGTTATCAAACTTGAGGTGGGTCTGAGGGCTGTTCTGTATGGTTATTCCATTAACC
ATTACACCGTTACTCCCGTAGAATCTCAACGCCTACATACCAGCCAAGGAAGGAGACAGG
TCCAACAAGGAAGGTAGAACCAGATGGAACTAACAGTGTCGATTCTGCCACCTTACAAGC
TTCGTTCCAAGCATCTTCAAAAGCCTGCAACATTAAAAGTTCTCCCGTCACCTTTTGCGC
CATAGTCAAGGACATTGAATGTTCCGGAACTTTCTCCTTCAGCGATAGACCTGCGGTTTC
CTCTCCAGTATACACTGTGTCTAGCGTCGCAAGAGATTAAAAGGAGAAGTTTCAGTGCAA
GACATTTCAAGGTACTTAGCTGGTCTTGGTAAGCTCTTCGGCCTACACAAAACCAGAATC
CGTTTTATCAGGCAAATGGAATAATGGATTTTAAAGAGTCAAGAAAAGTTGCCATACAAT
CACAG*CATGTCACGTAAACCTCATCATA*GATA*TCTTTTTT*ATTTTTGAGTTCCTTA
A
TT

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR4AB45JQ 859 0 0
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GTCGATTCTGCCACCTTACAAGCTTCGTTCCAAGCATCTTCAAAAGCCTGCAACATTAAA
AGTTCTCCCGTCACCTTTTGCGCCATAGTCAAGGACATTGAATGTTCCGGAACTTTCTCC
TTCAGCGATAGACCTGCGGTTTCCTCTCCAGTATACACTGTGTCTAGCGTCGCAAGAGAT
TAAAAGGAGAAGTTTCAGTGCAAGACATTTCAAGGTACTTAGCTGGTCTTGGTAAGCTCT
TCGGCCTACACAAAACCAGAATCCGTTTTATCAGGCAAATGGAATAATGGATTTTAAAGA
GTCAAGAAAAGTTGCCATACAATCACAGGCATGTCACGTAAACCTCATCATAAGATAATC
TTTTTTTATTTTTGAGTTCCTTAAATTAAGCAGCGTAATTTAGGTTAAATCTATGGTGTT
CATTGAATCTTCTCAAATGCTATTTAAAATCTAGTTTATCATTTTTGCTTCGAACTCATG
AACATTCAAAGGTCCATATTAGTTGCATGACAATAGGATGCGCAGTACGGTTTGATTATG
GTATATTAGTAAGATTCAAAGTATGAAATTGAACTCGTGATGCAGATATGCTTTGCATGC
AGCCCCAGGTGGAAGGAAGAATATAGGGCTTTATAGAGTGTAGATTAGCACGTTGCTACA
TGTATGGATCCCATGCGTTGACTTTGACAAAACTTTGTTGAACTATTCTAGTATTTGATA
TCATGATCTTGCTATTGGTCCCCAAATTCACTGAAAATGCTGTTACTATTTTATTAATTT
AATCTTGCTTTGGGAGTTC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

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GGGAGAAGAGGAGAAGAATATACATTGATGTTTTCTTTTCTGTCTCCTTTTTTTTCTGAG
TCTTTTGATTTTACAGCAACCCAACAACACAGCTAAAATGTAATCTATTCTCCAGACCTC
TTAAGTGATGTCCCAATAGCATGCACCAAAAAAGGAGCTTCCCGAGGTAATCCCTGGAAG
CGTCTACTGTTCTACCAGCTCCATCACCACCTTCCGTAGTCCTTATGACTGAACCCTGCA
TCAAAGCTGAAGTATTCTGGTCCTCGGAAATCCTCTCCATCACGTTTTGGACAAGCTGGC
TCACGATTTCTTCAACTTCTGGTGAAAATAGTTGAAATAACTCAGTCACCATCTCAGGAT
CTAAGGAACGCAAATACTCCAACGAGTCATTCTTGCTTCCTTTCTCACATTCTATCTGTA
AAGCCTTCTTCTTAGTGAATCTAGCTCCTCTTTGATGCAAGTTAACTCAGACTGCAACTC
CTGAATATAACTCAAAGCTTCAGGTGACAAGTCTCCAAACACCTGAGGAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B212JQ U 77
AF RR4B212TF C 1
BS 1 76 RR4B212TF
BS 77 527 RR4B212JQ
BS 528 592 RR4B212TF

RD RR4B212JQ 451 0 0
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CTGGTCCTCGGAAATCCTCTCCATCACGTTTTGGACAAGCTGGCTCACGATTTCTTCAAC
TTCTGGTGAAAATAGTTGAAATAACTCAGTCACCATCTCAGGATCTAAGGAACGCAAATA
CTCCAACGAGTCATTCTTGCTTCCTTTCTCACATTCTATCTGTAAAGCCTTCTTCTTAGT
GAATCTAGCTCCTCTTTGATGCAAGTTAACT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4B212TF 592 0 0
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GGGAGAAGAGGAGAAGAATATACATTGATGTTTTCTTTTCTGTCTCCTTTTTTTTCTGAG
TCTTTTGATTTTACAGCAACCCAACAACACAGCTAAGATGTAATCTATTCTCCAGACCTC
TTAAGTGATGTCCCAATAGCATGCACCAGAAAAGGAGCTTCGCGAGGTAATCCCTGGAAG
CGTCTACTGTTCTACCAGCTCCATCACCACCTTCCGTAGTCCTTATGACTGAACCCTGCA
TCAAAGCTGAAGTATTCTGGTCCTCGGAGATCCTCTCCATCACGTTTTGGACAAGCTGGC
TCACGATTTCTTCAACTTCTGGTGAAGATAGTTGAGATAACTCAGTCACCATCTCAGGAT
CTAAGGAACGCAAATACTCCAACGAGTCATTCTTGCTTCCTTTCTCACATTCTATCTGTA
AAGCCTTCTTCTTAGTGAATCTAGCTCCTCTTTGATGCAAGTTAACTCAGACTGCAACTC
CTGAATATAACTCAAAGCTTCAGGTGACAAGTCTCCAAACACCTGAGGAGGC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

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AGATTATGTGCCTTTCGGATGAGAGTTTCAAGTTTTTGTGATGGTTTTGGTTTGATTCTT
TGACAAAATCTCTTCTTTCCTCTTCCCAGAAATTCCAGATCTGATTATGATTCACTTCCT
TTGGGAAGTTTTTCGAGGGATTCACTTGTTAGTGGTTCTTCAGAGGTGGCTTACCTCAAC
CAGTGGATTCTTCTCGGCTATGTCCACTCGCAGATCACCACCTTGCTTCTCAGATCTGTT
CTAGCCGGCACGGATTTCGAGAGGATGGGGTTTTCGTCGTCTATCAAGCCTCCCTTTGCT
GTGGTTACTTCGTCTTTAATTCTTAGCAGAAGATCGTCCGTTTTTCCATGTGAAGCTTGC
CTAATAATGTCTACGGCACTTCAGGTAAATCGGTTGTGGGGTTGTGTTGGAGGGAACTCA
TGGCTTCGACAGCTGAATGACATTGCTGTGGCGAGGGTGAAGTGAGAAGTTCGATTATAA
CCTGGTCTATTATTTCTGTGGTTTCTTGCTAGGCTTTGTTGTTTCGTGTGTTTCCCACAG
TTTGGCCATTTTCTTTGAATCTCTGTTTTATGTTTTTATGTGTTTTAAGATGTCTCCCTT
GTGTGGGTTTATGATTCTGGGGACATCTTTGTAGTCCGCCAGCAAATGTATCTCTCCATC
GCATTCCACACTGTAATCCTTTTCAAGTTATGAAATACATTCGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL75TF U 155
AF RR4BL75JQ C 1
BS 1 154 RR4BL75JQ
BS 155 566 RR4BL75TF
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BS 612 766 RR4BL75JQ

RD RR4BL75TF 473 0 0
CCAGATCTGATTATGATTCACTTCCTTTGGGAAGTTTTTCGAGGGATTCACTTGTTAGTG
GTTCTTCAGAGGTGGCTTACCTCAACCAGTGGATTCTTCTCGGCTATGTCCACTCGCAGA
TCACCACCTTGCTTCTCAGATCTGTTCTAGCCGGCACGGATTTCGAGAGGATGGGGTTTT
CGTCGTCTATCAAGCCTCCCTTTGCTGTGGTTACTTCGTCTTTAATTCTTAGCAGAAGAT
CGTCCGTTTTTCCATGTGAAGCTTGCCTAATAATGTCTACGGCACTTCAGGTAAATCGGT
TGTGGGGTTGTGTTGGAGGGAACTCATGGCTTCGACAGCTGAATGACATTGCTGTGGCGA
GGGTGAAGTGAGAAGTTCGATTATAACCTGGTCTATTATTTCTGTGGTTTCT*GCTAG*C
TTTGTTGTTTCGTGTGTTTCCCACAGTTTGGCCATTT
CTTTGATCTCTGTTTA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4BL75JQ 766 0 0
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AGATTATGTGCCTTTCGGATGAGAGTTTCAAGTTTTTGTGATGGTTTTGGTTTGATTCTT
TGACAAAATCTCTTCTTTCCTCTTCCCAGAAATTCCAGATCTGATTATGATTCACTTCCT
TTGGGAAGTTTTTCGAGGGATTCACTTGTTAGTGGTTCTTCAGAGGTGGCTTACCTCAAC
CAGTGGATTCTTTTCGGCTATGTCCACTCGCAGATCACCACCTTGCTTTTCAGATCTGTT
CTAGCCGGCACGGATTTCGAGAGGATGGGGTTT*CGTCGTCTATCAAGCCTCCCTT*GCT
GTGGTTACTTCGTCTTTAATTCTTAGCAGAAGATCGTCCGTTTTTCCATGTGAAGCTTGC
CTAATAATGTTTACGGCACTTCAGGTAAATCGGTTGTGGG*TTGTGTTGGAGGGAACTCA
TGGCTTCGACAGCTGAATGACATTGCTGTGGCGAGGGTGAAGTGAGAAGTTCGATTATAA
CCTGGTCTATTATTTCTGTGGTTTTTTGCTAGGCTTTGTTGTTTCGTGTGTTTCCCACAG
TTTGGCCATTTTCTTTGAATCTCTGTTTTATGTTTTTATGTGTTTTAAGATGTCTCCCTT
GTGTGGGTTTATGATTCTGGGGACATCTTTGTAGTCCGCCAGCAAATGTATCTCTCCATC
GCATTCCACACTGTAATCCTTTTCAAGTTATGAAATACATTCGAGG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL4631Contig1 717 2 2 U
TGGAGTAATGTATTATACACCTCAAATACTAGAAGAGACAGGTGTGTCTAGTCTTTTGAC
AAACCTTGGAATAAGTGCAGAGTCTGCATCTCTCCTCATAAGCTCTTTAACTACACTCTT
TATGCTTCCATGCATTCTTGTTTCCATGAGATTAATGGATGTATCTGGTAGAAGGTCTCT
GATGCTTTCAACAATCCCCATTCTAATATTGTCACTGCTAACACTGGTGATTGGAAGCTT
GGTGAAGCTTGGAGGTACAGCAAACGCATTGATATCAACAGCTAGCGTTATGGTGTACTT
AAGCTGTTTTGTGATGGGCTTTGGAGCCATACCAAACATCCTGTGTTCAGAGATTTTCCC
TACCTCTGTGCGTGGCCTCTGCATCACCATCTGTGCACTCACTTTCTGGATCTGCGACAT
CATTGTCACTTACACTCTTCCTGTCATGCTCAAATCTCTAGGCCTAGCGGGTGTTTTTGG
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CGATACAGCTTCGTTTTTCTCTGATGATGACTGAAACTTTTCTTTTCTCTGTTGCCTTTC
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EW93JQ C 1
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AAACCTTGGAATAAGTGCAGAGTCTGCATCTCTCCTCATAAGCTCTTTAACTACACTCTT
TATGCTTCCATGCATTCTTGTTTCCATGAGATTAATGGATGTATCTGGTAGAAGGTCTCT
GATGCTTTCAACAATCCCCATTCTAATATTGTCACTGCTAACACTGGTGATTGGAAGCTT
GGTGAAGCTTGGAGGTACAGCAAACGCATTGATATCAACAGCTAGCGTTATGGTGTACTT
AAGCTGTTTTGTGATGGGCTTTGGAGCCATACCAAACATCCTGTGTTCAGAGATTTTCCC
TACCTCTGTGCGTGGCCTCTGCATCACCATCTGTGCACTCACTTTCTGGATCTGCGACAT
CATTGTCACTTACACTCTTCCTGTCATGCTCAAATCTCTAGGCCTAGCGGGTGTTTTTGG
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AAAAGGAATGCCCCTTGAAGTTATCTCTGAGTTCTTTTCTGTTGGTGCAAAACAACAAGA
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QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EW93TF 712 0 0
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TTCCATGCATTCTTGTTTCCATGAGATTAATGGATGTATCTGGTAGAAGGTCTCTGATGC
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CTGTGCGTGGCCTCTGCATCACCATCTGTGCACTCACTTTCTGGATCTGCGACATCATTG
TCACTTACACTCTTCCTGTCATGCTCAAATCTCTAGGCCTAGCGGGTGTTTTTGGGATTT
ATGCATTTGTTTGTGCAGTAGCGTGGGTTTTCGTGTACCTCAAGGTACCGGAAACAAAAG
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GTTTTGCTGCTGTATGTTGAACAAAAGTTAAATAATAAGAAACCATACTTGG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GO56JQ C 1
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AGTAAATAAACAAAC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR4GO56TF 435 0 0
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GTACTTCAGTGTAAATAAATGTTGTGGTTTGATTGGTCATTTTGTTATTTACAATGGAGA
AAGGCAAGGTTTTTGTTAGCGAAGCTGAATCCTTCAGCAAGTTACAACAACGCGAGTGAG
ATGAACACTGGTTCCGATGTAATCTTCACAGACGATGCTAGTCTTGAAGTTTTCTACCAA
CATCTCCAGAAACTAGCAGTGCAATCTTGAAAAAGACCATTACAAAGGTCTTTCTCTCCC
TCTTCATTTTAGATTTGATTGGTATAAACTTGTGTGTGAAAAACAGATAAATGAACTAAT
AGTAAATAAACAAAC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL4633Contig1 503 2 1 U
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BQ
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AF RR4DK05JQ C 1
AF RR4DK05TF U 1
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DS 

RD RR4DK05TF 503 0 0
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GAGTAACTTTTTGTTTTCCTGATTCATTGTTATGAACTTGTAAGTTGTAACTCTGATTCC
GACAAAGGTTCGGTAATTTTACT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

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CCTTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4AI08JQ C 1
AF RR4AI08TF U 1
BS 1 426 RR4AI08TF

RD RR4AI08JQ 426 0 0
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GTTTTAATGGTTACTGCTCAAATCTTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAA
TAAATTTGGATTAATTGATCGTCTGTCTTGGTGATACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTT
CCTTTC

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4AI08TF 426 0 0
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CGATAACTATCATCTCTCAAGAATGGGGAAAGGACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTC
ATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCT
TCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGTTCAATACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCAC
AAGTTCTCCACCAATGTCAACACCATAACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGGTTTGGTT
GTTTTAATGGTTACTGCTCAAATCTTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAA
TAAATTTGGATTAATTGATCGTCTGTCTTGGTGATACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTT
CCTTTC

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL4635Contig1 788 2 6 U
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TTACAACTCGCATTGATTCTACATCATTAAACAAAACTTAACTCTTCCTGCCCACTACAA
CCACGATCTCAAATTCGATGAATCTTATTCAACTTCCAGGCGGTGATTCTCCCTATAAAA
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TGAAGAATCACATGAAAATGAAGATTTTTCTCAATCAAAGAGATAGACACGAGGAGGTTC
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AATGCCAAGTATATGAGCAAGTTTACGAAGTCAACGAAGCACACAACTTTTGTGAGAAGG
ATAAGATGAAGCTGCAGAACCTTTATGCAGAGGATCAAAATACAGAGGATCAGAATAAAC
AACTTTCGCGTAGTTTTATCCTAAAAAAAACCCGAAAAGGCACTCAAGCATGCCGTGGAC
TTTATAATTCACATGTGCATTCACATTTTATCTTTTTTTCATTCTTCCTAAAAGATTAAG
AGCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA76TF U 1
AF RR4HA76JQB C 266
BS 1 689 RR4HA76TF
BS 690 690 RR4HA76JQB
BS 691 699 RR4HA76TF
BS 700 700 RR4HA76JQB
BS 701 740 RR4HA76TF
BS 741 788 RR4HA76JQB

RD RR4HA76TF 742 0 0
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CCACGATCTCAAATTCGATGAATCTTATTCAACTTCCAGGCGGTGATTCTCCCTATAAAA
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TGAAGAATCACATGAAAATGAAGATTTTTCTCAATCAAAGAGATAGACACGAGGAGGTTC
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AATGCCAAGTATATGAGCAAGTTTACGAAGTCAACGAAGCACACAACTTTTGTGAGAAGG
ATAAGATGAAGCTGCAGAACCTTTATGCAGAGGATCAAAATACAGAGGATCAGAATAAAC
AACTTTCGCGTAGTTTTATCCTAAAAAAA*CCCGAAAAG*CACTCAAGCATGCCGTGGAC
TTTATAATTCACATGTGCAT
CA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4HA76JQB 523 0 0
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ATGCTTTCATCAAAAATAAAAATAAGTTCTACAAGAATGCCAAGTATATGAGCAAGTTTA
CGAAGTCAACGAAGCACACAACTTTTGTGAGAAGGATAAGATGAAGCTGCAGAACCTTTA
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AAAAACCCGAAAAGGCACTCAAGCATGCCGTGGACTTTATAATTCACATGTGCATTCACA
TTTTATCTTTTTTTCATTCTTCCTAAAAGATTAAGAGCAAACC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL4636Contig1 588 2 1 U
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TGCAAACTCCAACCGTCTATCTTCTGTAATCAACTGGGCTTCAAGTTCCAATGATATGTG
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TGTTTTTCTTTTCTGCTTTTTAATTTTTAAATATGAATGCCAGTTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BT04JQ C 1
AF RR4BT04TF U 1
BS 1 588 RR4BT04TF

RD RR4BT04JQ 588 0 0
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TCAATTGTGGTTCCGATCATGAACGATGGCGATGACAACGAAGTGAACGACAAAAATTTC
TGCAAACTCCAACCGTCTATCTTCTGTAATCAACTGGGCTTCAAGTTCCAATGATATGTG
TACTTTAATTTAGAGTAATGGGCTGAGCCCAAAACATACTAAAGCCAACTGGGCTTGTAA
TGTTTTTCTTTTCTGCTTTTTAATTTTTAAATATGAATGCCAGTTTAC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4BT04TF 588 0 0
GGGCCTTTAGGGCTACGCGTTTATCGAGTTCACTCACTTTTTAACCAACATCTCCTTTGC
AGCCTTTTTACACCAAACTTTTCTCTGTTATACTCTTCTCTTGTCCAATTCTTCAACTGA
ATCAACACTGGGATACAACTCTGCAGCAACTCCTTCTCTAAAAACAAACAAAGATCATCG
GCGACTCACCCTCATAGCGTTCCAAGCAACAGTTTATTGGATTTGGCATGAAAGGAATGG
TAGACTCCATCTACAAAACTACAAGCTAGCTCAAACCATCATCTCGGACATTGACTTGCA
GATCAGAAACCGGCTCCAAAGCTTTCGATTTACAAACCCTCGAGCTTCTTCCGCCATGTC
TCAATTGTGGTTCCGATCATGAACGATGGCGATGACAACGAAGTGAACGACAAAAATCTC
TGCAAACTCCAACCGTCTATCTTCTGTAATCAACTGGGCTTCAAGTTCCAATGATATGTG
TACTTTAATTTAGAGTAATGGGCTGAGCCCAAAACATACTAAAGCCAACTGGGCTTGTAA
TGTTTTTCTTTTCTGCTTTTTAATTTTTAAATATGAATGCCAGTTTAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL4637Contig1 724 2 2 U
GGAGTCATGGTGTTTACAATGTCTTCTACTTTGTCGTTGGGGTTATACCTTACTGGCTCC
GCTTCCTCCAGTGCATACGCAGATTATGCGAAGAAAAAGACTCAGTACACGGATACAATG
CTCTGAAATACATGCTGACAATCATTGCAGTCATCATAAGAACAGCTTTTGAGCTGAGAA
AGGGAAGAAACTGGATGATTCTGGCTCTTGTAAGCTCGGGCGTTGCGATATGTATGAACA
CATTCTGGGACATTGTTATAGACTGGGGACTCCTCCGTAGGCATTCCAAGAACCCTTACC
TGAGAGACAAACTACTTGTCCCTCACAAAAGCGTCTATTTCGCAGCCATGGTAGTGGATG
TGATTCTAAGAGTGGCATGGATGCAGCTGGTTCTGGAGTTCAACTTGAAGTCCCTTCACA
AAGTCGCCGTATCGACCTTTATCTCATGTTTAGAGATTGTTCGACGTGGAATGTGGAGCT
TCTTCAGGCTGGAGAATGAGCACTTGAACAATGTGGGCAAATACAGAGCATTCAAGTCTG
TTCCACATCCTTTCCATTACTACGACAATGATGAAACTGATGACAAAGACGACTGATCAG
TATAAATACTATCTGATTCACACTGCCATTAGTAGGAAAAGTTTGTATTTTTTTCCAATG
AGCCAATTCAATGTGTAAAGACCGTATGTTTATACATGAATCCAATGGAAAAATAAGTAA
GACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

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CTGGTTCTGGAGTTCAACTTGAAGTCCCTTCACAAAGTCGCCGTATCGACCTTTATCTCA
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AACAATGTGGGCAAATACAGAGCATTCAAGTCTGTTCCACATCCTTTCCATTACTACGAC
AATGATGAAACTGATGACAAAGACGACTGATCAGTATAAATACTATTTGATTCACACTGC
CATTAGTAGGAAAAGTTTGTATTTTTTTCCAATGAGCCAATTCAATGTGTAAAGACCGTA
TGTTTATACATGAATCCAATGGAAAAATAAGTAAGACG

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DS 



AS 1 2

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ATCACCATCCCCACTCCTCCTCCGTTTCCCAGTTTCGGAACTTGAAACTGACGGAGAGCC
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CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RR4FR57TF C 1
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CGAACAGTAGATAACTCATAACTAGGCGGCGGCACCGCCTGAAACCAATTCTCCGGCAGC
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AGAGGAGGAAGAGGAGCGTAAACGGTGGGCTTCCTCTTAATGTCCCAAGGCTGCGTCTTC
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ATCACCATCCCCACTCCTCCTCCGTTTCCCAGTTTCGGAACTTGAAACTGACGGAGAGCC
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CCC

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DS 

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DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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T


BQ
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20 

AF RR4DY91JQ C 1
AF RR4DY91TF U 1
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BS 703 703 RR4DY91JQ
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RD RR4DY91JQ 721 0 0
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TATACACCGACGTGAAGCACTATCTGACATTGATTATGAGTTATCCCAGGCGTTTTATTC
TACACCCATAAAAAGGATCTTCCAACTCTTATGCTAGAAGATACAGCTTTGGATGTTCTC
AAAATTCTAAGATGGCTGCAAGGCAACTTGAGTTTCTGGTGGGGAAGAAATCTGGTGGTC
CAAACACTTGCAGCCTTGAGGATGCTTTAGGAATAGCACAGCACCATGATGGTGACTATG
CCTAAAGACTAGCACTTGGTCCTTCTGAGGAGCAGTGGTGAATTCTGTGCTGGCACACTT
ACCGAACGCACATACAAACCTGGCATATATCATTAACCCAGGTGAGATTGTTATAAACAT
GGTTGTGGGAGGGGAAGTAACTACTCTCAAAAGACAATGGCATTATCATCGCAGAGATGC
CAATCAATATAGTTAGATCTTAAAACAACAACTCAGGGCTCCTATGATCTGAATGATACC
ATCAAAGTTCGGTTGTTGGCACTTATATATGTTACCTATGATCTTCTCCGTAGAAATCAA
TAGTTTGTGTTAAGCTACAGAAGATGTCTCTTTTAGCCATTAAGATGATCACTTTTGGTC
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4DY91TF 721 0 0
GGTGGGATGACCGAGATCGAGATGAAGAATCTCTTTGTTTGTCTCAATTCGCGTCGTTTA
ACCTTCTACTTCACTCAACCGAAACAGTCTGAGTTACAGCCATTATTGCCTTCTTAACTC
TATACACCGACGTGAAGCACTATCTGACATTGATTATGAGTTATCCCAGGCGTTTTATTC
TACACCCATAAAAAGGATCTTCCAACTCTTATGCTAGAAGATACAGCTTTGGATGTTCTC
AAAATTCTAAGATGGCTGCAAGGCAACTTGAGTTTCTGGTGGGGAAGAAATCTGGTGGTC
CAAACACTTGCAGCCTTGAGGATGCTTTAGGAATAGCACAGCACCATGATGGTGACTATG
CCTAAAGACTAGCACTTGGTCCTTCTGAGGAGCAGTGGTGAATTCTGTGCTGGCACACTT
ACCGAACGCACATACAAACCTGGCATATATCATTAACCCAGGTGAGATTGTTATAAACAT
GGTTGTGGGAGGGGAAGTAACTACTCTCAAAAGACAATGGCATTATCATCGCAGAGATGC
CAATCAATATAGTTAGATCTTAAAACAACAACTCACGGCTCCTATGATCTGAATGATACC
ATCAAAGTTCGGTTGTTGGCACTTATATATGTTACCTATGATCTTCTCCGTAGAAATCAA
TAGTTTGTGTTAAGCTACAGAAGATGTCTCTTT*AGCCATTA*GATGATCACTTTTGGTC
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL4642Contig1 766 2 2 U
GGAGTCTTTAGGGACAAAACTATCGGTCAGCGACAGTTGGGAGAAAGTATGTCCTGAGGC
AGCAGCAGCAGCAATGGCTGGTGGAGGTCAAACTCTGGACTGTGATCTTCCTTCAGATGA
TTCCGAGGATGAAGAGTATGATCCAGATGGTTTGAATCATAAAGCAGACGATGAGGATAG
CAGTGATGACAGCGATGAGTCTGAGAACGAAGATGGGAGTTGTGATGAATCAGATTGCAC
ATCTGCATCTGATGAGATGATTGAATCGCTTAAAGAAGCGAAAGATATAATGGACCTTCC
ATCTGATGATTCTGAGGATGATGACTATGATCCTGATGCTCCGGTTCCTGATGAAGATCA
AATGCAAGAATCTTCTGATTCAGATAGTACATCAGACTCTGAGGATCTTGAGACTTCCTT
CAAAGGCGACGAGTCTAATCACCAAGATAAAGTTACACCATGTGGGAAGCCCGGCAGAAA
GAAATCTCAGCTTCCAGATGTTCCCATTTCAGAGTCAGATACTGGGATTGATGATGATGG
TCTCGTAGATGTTCCTGGGAGGAGGAAGGTTGAAAGGCTGGACTACAAAAAGCTCTATGA
TGATGAATATGAGAATGTTCCGACATCTTCAAGTGATGATGAGGATTGGGATAAAACCGC
GGGAAAAGAAGACTTGGAGTCAGCAGAAGAAGGGGACACCGTGCCTCTGAATCAGCACTC
AGAAGCAGAAGAACATACTTCTACCAAGAAACCTAGACAGATATCG


BQ
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AF RR4AH38TF U 1
AF RR4AH38JQ C 1
BS 1 688 RR4AH38TF
BS 689 766 RR4AH38JQ

RD RR4AH38TF 688 0 0
GGAGTCTTTAGGGACAAAACTATCGGTCAGCGACAGTTGGGAGAAAGTATGTCCTGAGGC
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TTCCGAGGATGAAGAGTATGATCCAGATGGTTTGAATCATAAAGCAGACGATGAGGATAG
CAGTGATGACAGCGATGAGTCTGAGAACGAAGATGGGAGTTGTGATGAATCAGATTGCAC
ATCTGCATCTGATGAGATGATTGAATCGCTTAAAGAAGCGAAAGATATAATGGACCTTCC
ATCTGATGATTCTGAGGATGATGACTATGATCCTGATGCTCCGGTTCCTGATGAAGATCA
AATGCAAGAATCTTCTGATTCAGATAGTACATCAGACTCTGAGGATCTTGAGACTTCCTT
CAAAGGCGACGAGTCTAATCACCAAGATAAAGTTACACCATGTGGGAAGCCCGGCAGAAA
GAAATCTCAGCTTCCAGATGTTCCCATTTCAGAGTCAGATACTGGGATTGATGATGATGG
TCTCGTAGATGTTCCTGGGAGGAGGAAGGTTGAAAGGCTGGACTACAAAAAGCTCTATGA
TGATGAATATGAGAATGTTCCGACATCTTCAAGTGATGATGAGGATTGGGATAAAACCGC
GGGAAAAGAAGACTTGGAGTCAGCAGAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4AH38JQ 766 0 0
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TTCCGAGGATGAAGAGTATGATCCAGATGGTTTGAATCATAAAGCAGACGATGAGGATAG
CAGTGATGACAGCGATGAGTCTGAGAACGAAGATGGGAGTTGTGATGAATCAGATTGCAC
ATCTGCATCTGATGAGATGATTGAATCGCTTAAAGAAGCGAAAGATATAATGGACCTTCC
ATCTGATGATTCTGAGGATGATGACTATGATCCTGATGCTCCGGTTCCTGATGAAGATCA
AATGCAAGAATCTTTTGATTCAGATAGTACATCAGACTTTGAGGATCTTGAGACTTCCTT
CAAAGGCGACGAGTCTAATCACCAAGATAAAGTTACACCATGTGGGAAGCCCGGCAGAAA
GAAATCTCAGCTTCCAGATGTTCCCATTTCAGAGTCAGATACTGGGATTGATGATGATGG
TCTCGTAGATGTTCCTGGGAGGAGGAAGGTTGAAAGGCTGGACTACAAAAAGCTCTATGA
TGATGAATATGAGAATGTTCCGACATCTTCAAGTGATGATGAGGATTGGGATAAAACCGC
GGGAAAAGAAGACTTGGAGTCAGCAGAAGAAGGGGACACCGTGCCTCTGAATCAGCACTC
AGAAGCAGAAGAACATACTTCTACCAAGAAACCTAGACAGATATCG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL4643Contig1 1173 2 2 U
GGCAGGTAATCCAATCGACGATTGTTGGCGATGCGACAAAGACTGGGAGAAAAACCGGAA
ACGGTTAGCTGATTGTGGAATCGGTTTTGGAAAAAACGCAATTGGTGGTCGCGATGGTGA
AATTTATGTGGTCACCGATCCAGGAAACGATGATCCAGTAAACCCTAAACCGGGAACACT
AAGATACGCAGTAATTCAAGATGCACCGCTCTGGATCATATTCAACCGAGCATGACGATC
CAACTAAAAGAAGAACTCATAATGAACTCTTTCAAAACTCTAGACGGACGAGGAGCATCA
GTCCACATCTCCGGTGGGCCGTGTATAACCATCCAATACGTGACAAACATCATCATCCAT
GGTTTACACATACATGACTGTAAGCAAGGTGGGAACACTTACGTACGAGATTCTCCAGAG
CACTACGGGTGGCGGACGATATCGGACGGTGACGGTGTTTCCATCTTCGGTGGGAGCCAC
GTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATCCGT
GGATCGACGGCTATAACGATTTCTAATAATTACTTGACGCATCACAATAAGGTTATGTTA
TTGGGACATAGTGATACGTACGAGCAAGACAAGAATATGCAAGTCACTATCGCTTTTAAC
CACTTTGGAGAACGCCTTGTCCAAAGAATGCCAAGGTGTCGACATGGATATTTCCATGTG
GTGAACAATGACTATACACATTGGGAAATGTATGCAATTGGAGGAAGTGCTAATCCTACC
ATCAACTCCCAAGGCAACCGTTTCCTTGCTCCTGATAACTCTTTTAGCAAAGAGGTAACA
AAGCATGAGGATGCGCCAGAAAGCGAATGGAGTCATTGGAATTGGAGATCCGAAGGAGAT
CTAATGCTTAATGGTGCATTCTTTACACTTTCTGGAGCTGGGCCAACTAAATCGTCAAGC
TATTCGAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGACCGTCCTCTAATGTTGGTGAGATAACTATA
TCTTCTGGTGCGCTCAGCTGCAAAAAGGGTTCCCACTGCTGATCATAGCCCCACCAGCGT
GGATGTATTTGTGTGTATATATAATGTAATGAAACCAGCAATTCAAAGCTAGTTGTGTAA
TAATCTCGATGAAAAAGTGACGAGGAGTTGATC


BQ
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AF RR4C912TF U 1
AF RR4C912JQ C 324
BS 1 754 RR4C912TF
BS 755 1173 RR4C912JQ

RD RR4C912TF 754 0 0
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ACGGTTAGCTGATTGTGGAATCGGTTTTGGAAAAAACGCAATTGGTGGTCGCGATGGTGA
AATTTATGTGGTCACCGATCCAGGAAACGATGATCCAGTAAACCCTAAACCGGGAACACT
AAGATACGCAGTAATTCAAGATGCACCGCTCTGGATCATATTCAACCGAGCATGACGATC
CAACTAAAAGAAGAACTCATAATGAACTCTTTCAAAACTCTAGACGGACGAGGAGCATCA
GTCCACATCTCCGGTGGGCCGTGTATAACCATCCAATACGTGACAAACATCATCATCCAT
GGTTTACACATACATGACTGTAAGCAAGGTGGGAACACTTACGTACGAGATTCTCCAGAG
CACTACGGGTGGCGGACGATATCGGACGGTGACGGTGTTTCCATCTTCGGTGGGAGCCAC
GTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATCCGT
GGATCGACGGCTATAACGATTTCTAATAATTACTTGACGCATCACAATAAGGTTATGTTA
TTGGGACATAGTGATACGTACGAGCAAGACAAGAATATGCAAGTCACTATCGCTTTTAAC
CACTTTGGAGAACGCCTTGTCCAAAGAATGCCAAGGTGTCGACATGGATATTTCCATGTG
GTGAACAATGACTATACACATTGGGAAATGTATG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4C912JQ 850 0 0
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GCAAGGTGGGAACACTTACGTACGAGATTCTCCAGAGCACTACGGGTGGCGGACGATATC
GGACGGTGACGGTGTTTCCATCTTCGGTGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCT
CTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATCCGTGGATCGACGGCTATAACGATTTC
TAATAATTACTTGACGCATCACAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGTGATACGTACGA
GCAAGACAAGAATATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCACTTTGGAGAAGGCCTTGTCCA
AAGAATGCCAAGGTGTCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAATGACTATACACATTG
GGAAATGTATGCAATTGGAGGAAGTGCTAATCCTACCATCAACTCCCAAGGCAACCGTTT
CCTTGCTCCTGATAACTCTTTTAGCAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCGCCAGAAAG
CGAATGGAGTCATTGGAATTGGAGATCCGAAGGAGATCTAATGCTTAATGGTGCATTCTT
TACACTTTCTGGAGCTGGGCCAACTAAATCGTCAAGCTATTCGAGAGCCTCAAGCCTAGC
TGCTAGACCGTCCTCTAATGTTGGTGAGATAACTATATCTTCTGGTGCGCTCAGCTGCAA
AAAGGGTTCCCACTGCTGATCATAGCCCCACCAGCGTGGATGTATTTGTGTGTATATATA
ATGTAATGAAACCAGCAATTCAAAGCTAGTTGTGTAATAATCTCGATGAAAAAGTGACGA
GGAGTTGATC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 2

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CTCCTTCTTCAGGACCATCTCCGTCTCAGATGCTAGATCTTCGCTTATCCCTTCGCTGAG
AGATTATGCAACAGCTTCTGCTCAGAAAACCGGCAACGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTGGT
TGGTGAATCTGGCAACTTTGCATCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTT
GGAAAAGATTGAGTCCGATCTCTCTGAGCTGGTTGAGGCTATGAAGACAAGCCCTACTTT
TTCACAGTTCACTAAGGATCCCTCTGTTCCGAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATTGTGGA
TGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCTGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGA
GAATGGGAAGCTGAAGAACTTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACGACGGC
ACATAGGGGAGACGTCAAGGTTTTGGTTACCACAGTCATGCCGCTACCACCTGCTGAGGA
GAAAGAGCTTAAGGAGACACTACAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTTACTGTGGA
ACAAAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTT
GGACATGTCTATCACGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGACTCCTCCGTGAACCTGTTGA
CTTCACCAACCTCTGAAGATTTCCCCTAAGAAACATGCTTTCTGATTTGCTACAAAACCA
GTTGACGAATAAAATATGACCCTCCTCCTGGGGAAACAATCAATACAAGACACAAATTTC
ATTGCATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGAGATATCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F271TF U 1
AF RR4F271JQ C 244
BS 1 706 RR4F271TF
BS 707 895 RR4F271JQ

RD RR4F271TF 706 0 0
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TGGTGAATCTGGCAACTTTGCATCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTT
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QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4F271JQ 652 0 0
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AAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTTGGA
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GACGAATAAAATATGACCCTCCTCCTGGGGAAACAATCAATACAAGACACAAATTTCATT
GCATTTTACAATTGTTGTTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGAGATATCAATC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL4645Contig1 730 2 6 U
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TATTTTGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY25TF U 1
AF RR4FY25JQ C 1
BS 1 56 RR4FY25TF
BS 57 57 RR4FY25JQ
BS 58 652 RR4FY25TF
BS 653 653 RR4FY25JQ
BS 654 719 RR4FY25TF
BS 720 730 RR4FY25JQ

RD RR4FY25TF 728 0 0
GGGATACAAAACTTGAAAAAACCTTGATAATAAAAGCTCTTTTCAAAAAAAAAAAA*TAA
AGAACCTAGATAATAAAAAAACGTGATGCAGTTGAGATCTAGTGGGTTTGATATTTTTCT
CTTATGGCTGCAATTTAATTGGATTTTGTTTTAACTGTTTCATCTAAAAAAGCATATTCT
TTTTAATAACCTAGATCCTATTTAGCAGTTCCTCTCTTCTCTAGTGCTTGAACTTTCTTA
ACAGTTTAATTGTTCTATCTGTTTCTTTTATACGAGCCAAGAGATAGAAGCCAGTCGTGA
AGTGAACCATTATTTTCTTATATGATGATGACCACGAATTTGGTTGGAAATCTGAGAAGA
TTTTACTAAAGAGACGATTATCAATCTTATTTTATATCTCCGGAGCAAGAGACTTGATCG
TATGATTACGTAATTTGTCATTGAGTACCAAAGGCATGAATCATTGAAAGAGGAAACTAG
TTCTAGTCTAGTGATGACGGATTCTCCAATCTTATTAACGTCACTCAAACGATTATATGC
TACTAATGGAGATCGAAGATGAAAAAGAGATGAAGATGACAAAATGTCGATTGAAGAACT
CATGTGGGGAATTCACTTAGCTTCTCTTTGTTCATTTTTTCTGAGATTTTTT*GTAAAGC
TTTTATTTTATTTTTTCCTTTCTCATACCTGTGTGTACAAACAAATTATAAATGGAAAA
TATTTGTCG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FY25JQ 730 0 0
GGGATACAAAACTTGAAAAAACCTTGATAATAAAAGCTCTTTTCAAAAAAAAAAAAATAA
AGAACCTAGATAATAAAAAAACGTGATGCAGTTGAGATCTAGTGGGTTTGATATTTTTCT
CTTATGGCTGCAATTTAATTGGATTTTGTTTTAACTGTTTCATCTAAAAAAGCATATTCT
TTTTAATAACCTAGATCCTATTTAGCAGTTCCTCTCTTCTCTAGTGCTTGAACTTTCTTA
ACAGTTTAATTGTTCTATCTGTTTCTTTTATACGAGCCAAGAGATAGAAGCCAGTCGTGA
AGTGAACCATTATTTTCTTATATGATGATGACCACGAATTTGGTTGGAAATCTGAGAAGA
TTTTACTAAAGAGACGATTATCAATCTTATTTTATATCTCCGGAGCAAGAGACTTGATCG
TATGATTACGTAATTTGTCATTGAGTACCAAAGGCATGAATCATTGAAAGAGGAAACTAG
TTCTAGTCTAGTGATGACGGATTCTCCAATCTTATTAACGTCACTCAAACGATTATATGC
TACTAATGGAGATCGAAGATGAAAAAGAGATGAAGATGACAAAATGTCGATTGAAGAACT
CATGTGGGGAATTCACTTAGCTTCTCTTTGTTCATTTTTTCTGAGATTTTTTTGTAAAGC
TTTTATTTTATTTTTTCCTTTCTCATACCTGTGTGTACAAACAAATTATAAATGGAAAAA
TATTTTGTCG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4646Contig1 933 2 2 U
GGGACAGCTGGATCATCCTAACCTTGTGAAACTAATTGGATACTGCTTGGAGGAAGAGCA
GAGGCTTCTTGTTTACGAGTTCATGCCTCGCGGTAGTCTTGAGAATCACTTATTCAGAAG
AGGAACATTCTTTCAGCCAATTTCATGGAACACACGAGTTCGAATGGCTCTTGGTGCAGC
TAGAGGATTCGCTTTTCTTCACAATGCTCAACCTCAAGTTATATATCGAGACTTCAAAGC
ATCCAACATCTTGCTAGATTCGAACTACAATGCCAAGCTTTCGGATTTCGGTTTGGCTAG
GGATGGTCCAGAGGGTGACAATAGCCATGTCTCTACCAGAGTCGTGGGAACTCAAGGATA
CGCTGCTCCCGAGTATGTAGCTACCGGTCATTTATCGGCAAAGAGCGATGTGTACAGCTT
CGGGGTGGTGTTACTGGAGTTTTTATCAGGAAGACGAGCGATAGACAAGAACCAACCGGT
GGGAGAACACAATCTAGTGGATTGGGCAAGGCCTTACTTGACAAACAAAAGAAGGCTACT
CCGAGTGATGGATCCTCGTCTCCAAGGTCAATACTCGCTAACCAGGGCTTCGAAAATTGC
ACTTGTTGCACTCGATTGCATATCCATAGATTCCAAGGTTAGACCGACCATGAACGATGT
CGTCAAGACACTTGAAGAACTCAATGTCCAGAAGAAACACTAAAAGAGCAGCAGAATGTT
CAACCCAGCAATGAGAGCAATAACAACAAGTCTCCACAAGCTGTGAACTATCCTAGGCCT
TCAATTATGTAACAATCACAAGATGTGTATAGACTCTTTTACCTTCTCTCTGCCTAGGTT
GTTTTATAGTAAAAGGGTCTCTGTTTTGGCAAATGTAAGGGAGAGAAAAACAAAATTATA
GACTATGAACTTAGGTGCTCTTTCTTGGCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL27TF U 1
AF RR4GL27JQ C 177
BS 1 635 RR4GL27TF
BS 636 933 RR4GL27JQ

RD RR4GL27TF 635 0 0
GGGACAGCTGGATCATCCTAACCTTGTGAAACTAATTGGATACTGCTTGGAGGAAGAGCA
GAGGCTTCTTGTTTACGAGTTCATGCCTCGCGGTAGTCTTGAGAATCACTTATTCAGAAG
AGGAACATTCTTTCAGCCAATTTCATGGAACACACGAGTTCGAATGGCTCTTGGTGCAGC
TAGAGGATTCGCTTTTCTTCACAATGCTCAACCTCAAGTTATATATCGAGACTTCAAAGC
ATCCAACATCTTGCTAGATTCGAACTACAATGCCAAGCTTTCGGATTTCGGTTTGGCTAG
GGATGGTCCAGAGGGTGACAATAGCCATGTCTCTACCAGAGTCGTGGGAACTCAAGGATA
CGCTGCTCCCGAGTATGTAGCTACCGGTCATTTATCGGCAAAGAGCGATGTGTACAGCTT
CGGGGTGGTGTTACTGGAGTTTTTATCAGGAAGACGAGCGATAGACAAGAACCAACCGGT
GGGAGAACACAATCTAGTGGATTGGGCAAGGCCTTACTTGACAAACAAAAGAAGGCTACT
CCGAGTGATGGATCCTCGTCTCCAAGGTCAATACTCGCTAACCAGGGCTTCGAAAATTGC
ACTTGTTGCACTCGATTGCATATCCATAGATTCCA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4GL27JQ 757 0 0
CAGCTAGAGGATTCGCTTTTCTTCACAATGCTCAACCTCAAGTTATATATCGAGACTTCA
AAGCATCCAACATCTTGCTAGATTCGAACTACAATGCCAAGCTTTCGGATTTCGGTTTGG
CTAGGGATGGTCCAGAGGGTGACAATAGCCATGTCTCTACCAGAGTCGTGGGAACTCAAG
GATACGCTGCTCCCGAGTATGTAGCTACCGGTCATTTATCGGCAAAGAGCGATGTGTACA
GCTTCGGGGTGGTGTTACTGGAGTTTTTATCAGGAAGACGAGCGATAGACAAGAACCAAC
CGGTGGGAGAACACAATCTAGTGGATTGGGCAAGGCCTTACTTGACAAACAAAAGAAGGC
TACTCCGAGTGATGGATCCTCGTCTCCAAGGTCAATACTCGCTAACCAGGGCTTCGAAAA
TTGCACTTGTTGCACTCGATTGCATATCCATAGATTCCAAGGTTAGACCGACCATGAACG
ATGTCGTCAAGACACTTGAAGAACTCAATGTCCAGAAGAAACACTAAAAGAGCAGCAGAA
TGTTCAACCCAGCAATGAGAGCAATAACAACAAGTCTCCACAAGCTGTGAACTATCCTAG
GCCTTCAATTATGTAACAATCACAAGATGTGTATAGACTCTTTTACCTTCTCTCTGCCTA
GGTTGTTTTATAGTAAAAGGGTCTCTGTTTTGGCAAATGTAAGGGAGAGAAAAACAAAAT
TATAGACTATGAACTTAGGTGCTCTTTCTTGGCATTT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL4647Contig1 671 2 3 U
TTTTCAACTAAACTGTTTATTATATAAATACTTTCAGTCATACATCCATTGATCATTTTG
TTACAAAGTGTAGAGGAACCAAAAGAGTTCTCTATGTTATTAATTGCAGAATCGCACGTA
GCAGACAGACAAACATAGGGTTCACCGCAAAGGATCATTACCCTATTCCCCCAAGACATC
AAAACTAACAACAAATGATTAACAGAAAAAGAGCTTCTTTTCGGTTAATTCATCGCTGCT
TTTTTTTTTTTGCATTACTGCTTGTTGTTCAAGAAAGCTGCTCGTAGCTCTGCTGGGTCA
ATCTCTTTGGAACAGGTTTCCGGGCTGTAATAACCGGTTTTGGGGTATGGAATCCAAGCA
ATCTTTTGGGTCGATTCTTCCACTCTCTTCTTCTTCATCACCGCCGAAACAACGGCTCCA
CCTTTCACACCGGCCGCTTGCGCCGCCGTAGCCGCATAACCGCGTCGGAAGATTGCATTG
GAGAGTTCTTGAGAGACGAAAGCAGATACGATCTTAACGTTAGAGAGAGAACGAGCCATG
TTTTCGAAGTATGTGGTTTCTTGAAAGAGAGAAGGATGGAACAGACAATAAACGTTGAAA
CTTTCTTCTTGTTTTCGTCTGTGTACTCTCTCTCAATACAAGAATGATTTTGAAATGGCT
TTGAAGGATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB27JQ U 5
AF RR4GB27TF C 1
BS 1 4 RR4GB27TF
BS 5 469 RR4GB27JQ
BS 470 671 RR4GB27TF

RD RR4GB27JQ 465 0 0
CAACTAAACTGTTTATTATATAAATACTTTCAGTCATACATCCATTGATCATTTTGTTAC
AAAGTGTAGAGGAACCAAAAGAGTTCTCTATGTTATTAATTGCAGAATCGCACGTAGCAG
ACAGACAAACATAGGGTTCACCGCAAAGGATCATTACCCTATTCCCCCAAGACATCAAAA
CTAACAACAAATGATTAACAGAAAAAGAGCTTCTTTTCGGTTAATTCATCGCTGCTTTTT
TTTTTTTGCATTACTGCTTGTTGTTCAAGAAAGCTGCTCGTAGCTCTGCTGGGTCAATCT
CTTTGGAACAGGTTTCCGGGCTGTAATAACCGGTTTTGGGGTATGGAATCCAAGCAATCT
TTTGGGTCGATTCTTCCACTCTCTTCTTCTTCATCACCGCCGAAACAACGGCTCCACCTT
TCACACCGGCCGCTTGCGCCGCCGTAGCCGCATAACCGCGTCGGA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4GB27TF 671 0 0
TTTTCAACTAAACTGTTTATTATATAAATACTTTCAGTCATACATCCATTGATCATTTTG
TTACAAAGTGTAGAGGAACCAAAAGAGTTCTCTATGTTATTAATTGCAGAATCGCACGTA
GCAGACAGACAAACATAGGGTTCACCGCAAAGGATCATTACCCTATTCCCCCAAGACATC
AAAACTAACAACAAATGATTAACAGAAAAAGAGCTTCTTTTCGGTTAATTCATCGCTGCT
TTTTTTTTTTTGCATTACTGCTTGTTGTTCAAGAGAGCTGCTCGTAGCTCTGCTGGGTCA
ATCTCTTTGGAACAGGTTTCCGGTCTGTAATAACCGGTTTTGGGGTATGGAATCCAAGCA
ATCTTTTGGGTCGATTCTTCCACTCTCTTCTTCTTCATCACCGCCGAAACAACGGCTCCA
CCTTTCACACCGGCCGCTTGCGCCGCCGTAGCCGCATAACCGCGTCGGAAGATTGCATTG
GAGAGTTCTTGAGAGACGAAAGCAGATACGATCTTAACGTTAGAGAGAGAACGAGCCATG
TTTTCGAAGTATGTGGTTTCTTGAAAGAGAGAAGGATGGAACAGACAATAAACGTTGAAA
CTTTCTTCTTGTTTTCGTCTGTGTACTCTCTCTCAATACAAGAATGATTTTGAAATGGCT
TTGAAGGATCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL4648Contig1 760 2 3 U
GGGAATTGAATGCTTCAATCTCTCTCTCTTTTCTGTTAGAGAGAGAAAACTCTCTCAATT
TCCACTTTCTTATCAAATCATATATCTTTTAGAGGATAGAAGATGACATGAGTCCGGTTC
CCGAGTGATCGGGCTCCCTTCCAGAAAAGATGGCTTCTTCAGTATCGTTTGCCGGCTCTT
GACTCTGTCATTGCTCCTTATCCTTTGGTGTAGACGGCTGACTCTTTACTGGTTCATCCG
GCGTTTATATTTTTATTTTTCTTTTGTTTTTTATATTTTCTTCTCCACTCCTAGCCTCCA
TGTTTAACCTCTAGATTCAGTTGGGTTTCGATTTTCATCGGAATGGTCTTTCCGTCCCCA
GTTGTGGGCTGGTTCATCTTTGAACTTATCTGCATCAATAAAGATGATCATTTTGATTAG
GAATTTCTGATGAATCGGATCGATTTCATGCAACTAAATCACCTTCTTCTTTGAAGTGAT
GGTGGTCTTCTTTTTCTGCTTGTTGGCCGCTTTGGCTTCCTGTGAGGACTTTCAAGGCGA
CGTATGGAGTCGATGTATTCCTCTTTCAGAGAGGCGTATCTCTGCTTCATCTCATCAGAA
CATGTGGTGTTGTGGTGTTGAGCTGGATAAGATTATTGGGCTTCCTTCTTGGACTTTTTT
GGCTGGGCCTTTTTTAGTTTTTGTAGTTTTCTTTTGTCTATTTACCTTTCTAATGGGATT
TCTTGTAAATTTTGACTTTGTTTCATAAAATATCAGTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E946TF U 1
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RD RR4E946TF 760 0 0
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DS 

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TATATTTTCTTCTCCACTCCTAGCCTCCATGTTTAACCTCTAGATTCAGTTGGGTTTCGA
TTTTCATCGGAATGGTCTTTCCGTCCCCAGTTGTGGGCTGGTTCATCTTTGAACTTATCT
GCATCAATAAAGATGATCATTTTGATTAGGAATTTTTGATGAATCGGATCGATTTCATGC
AACTAAATCACCTTCTTCTTTGAAGTGATGGTGGTCTTCTTTTTCTGCTTGTTGGCCGCT
TTGGCTTCCTGTGAGGACTTTCAAGGCGACGTATGGAGTCGATGTATTCCTCTTTCAGAG
AGGCGTATTTTTGCTTCATCTCATCAGAACATGTGGTGTTGTGGTGTTGAGCTGGATAAG
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TTTTGTCTATTTACCTTTCTAATGGGATTTCTTGTAAATTTTGACTTTGTTTCATAAAAT
ATCAGTGAG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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CAAGTCCCTGGAAGAGGAAAGAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGAACGATGAGGAC
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TACATATGTGTAGGGAGAAAAGAAAGTGATAGTATCAGAATAGGTTTTCAGTTTTCACCT
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TAAGAAAATAAAAACAAATTTTGATTCCC


BQ
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AF RR4EG52TF U 1
AF RR4EG52JQ C 211
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GAAACACCTAACAGGGTGATGACGCCTATGTAGGTGGATGATGAAAGTGACAACAGTGTA
GGAGTTGAATCAGAGGATGAGGATGAGGGTCAGTTTGTGGTTTACGACCAGAGAAACAAG
TGGGGACTAGATTGGAATAGTAACCCAAATGTAGCAATGGAG*ATGATGAAGAAGTTGTT
GGGGTTGAAAGAGATGTTGCAGAAATGAGTGAGAGCTCTGAG**AGATGATGATGCACCT
GCT

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DS 

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GTAGCAATGGAGGATGATGAAGAAGTTGTTGGGGTTGAAAGAGATGTTGCAGAAATGAGT
GAGAGTTCTGAAGAAGATGATGATGCACCTGCTAATAAGGCAGCAACAAATAATTACGAC
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GAAGAAGATTACATTCTTGAAGACATGTTTTACATATGTGTAGGGAGAAAAGAAAGTGAT
AGTATCAGAATAGGTTTTCAGTTTTCACCTAAGAGAAAATTTTATATGTATACCAGTATT
ATTATGCTTCTGCTATGCATGGACAAAAGTGATTGTTAAATTATTCATACCAAATATAAT
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QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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CCTGACATGCAGTTTCACTCCGGGGTCCTGCTCTTTGACATCATATAAGCTGACCCAAGC
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TCCTGAGAACGGACCGTGGAACTACAACTTTATGGGCGTGAAGCACACGGTGGGCATGAA
ATACAGCGTTAAACTTGGATCCCCAAAGGAGTACTATCACGAGGAACATCGACCCACTCA
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CTTTGCTTGATCATTATGTTTTTACCATGTTATGTACTACGAGTGACTTGAGTTTTACTC
TTGTGTGTGTGGTAGTATTGTAATGTACCCAAGTCTATGACATCTTTTGCCACTAGAGC


BQ
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AF RR4AP51JQ C 1
AF RR4AP51TF U 1
BS 1 719 RR4AP51TF

RD RR4AP51JQ 719 0 0
GCCGGATAATCCCCAGGTGAAGGAAATCCGTTGTGTTGTGATGGTGCCGCAGTGGGGAAG
TCACCAGCATGTGAACCTGCCGTCAGCTCTTCCTGAGCATGATTTCTTGAATGATCTCGA
GCCATTGGGATGGCTGCACACACAGCCTAACGAGCTCCCTCAATTGTCACCACAGGATGT
GACCGCTCATTCCCGCATTCTGGAGAGCAACAAGCAATGGGATGGAGAAAAATGTATCAT
CCTGACATGCAGTTTCACTCCGGGGTCCTGCTCTTTGACATCATATAAGCTGACCCAAGC
TGGATATGAATGGGGACGTCTCAACAAGGACACAGGCAGCAATCCTCATGGCTACCTTCC
CACCCATTATGAGAAGGTTCAGATGCTATTGAGTGACCGCTTCCTCGGGTTTTACATGGT
TCCTGAGAACGGACCGTGGAACTACAACTTTATGGGCGTGAAGCACACGGTGGGCATGAA
ATACAGCGTTAAACTTGGATCCCCAAAGGAGTACTATCACGAGGAACATCGACCCACTCA
TTTCCTCGAGTTCAGCAACATGGAAGACGCTGACATCGTTGAGGGAGATCGTGAAGACAC
CTTTGCTTGATCATTATGTTTTTACCATGTTATGTACTACGAGTGACTTGAGTTTTACTC
TTGTGTGTGTGGTAGTATTGTAATGTACCCAAGTCTATGACATCTTTTGCCACTAGAGC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4AP51TF 719 0 0
GCCGGATAATCCCCAGGTGAAGGAAATCCGTTGTGTTGTGATGGTGCCGCAGTGGGGAAG
TCACCAGCATGTGAACCTGCCGTCAGCTCTTCCTGAGCATGATTTCTTGAATGATCTCGA
GCCATTGGGATGGCTGCACACACAGCCTAACGAGCTCCCTCAATTGTCACCACAGGATGT
GACCGCTCATTCCCGCATTCTGGAGAGCAACAAGCAATGGGATGGAGAAAAATGTATCAT
CCTGACATGCAGTTTCACTCCGGGGTCCTGCTCTTTGACATCATATAAGCTGACCCAAGC
TGGATATGAATGGGGACGTCTCAACAAGGACACAGGCAGCAATCCTCATGGCTACCTTCC
CACCCATTATGAGAAGGTTCAGATGCTATTGAGTGACCGCTTCCTCGGGTTTTACATGGT
TCCTGAGAACGGACCGTGGAACTACAACTTTATGGGCGTGAAGCACACGGTGGGCATGAA
ATACAGCGTTAAACTTGGATCCCCAAAGGAGTACTATCACGAGGAACATCGACCCACTCA
TTTCCTCGAGTTCAGCAACATGGAAGACGCTGACATCGTTGAGGGAGATCGTGAAGACAC
CTTTGCTTGATCATTATGTTTTTACCATGTTATGTACTACGAGTGACTTGAGTTTTACTC
TTGTGTGTGTGGTAGTATTGTAATGTACCCAAGTCTATGACATCTTTTGCCACTAGAGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4651Contig1 800 2 2 U
TTTTTCTAACAGTTAGCTATAAGTTATATACATTTCCATCACAAGCATCTCTAACAATGG
TTCCTCCAAAACCACCGCCTCCACGAACGCAACCCCAACCGCTGCCGGGTAAACGTTTGA
ACCCCGTCCTATGCATCATTGTGGCCCTTGTCCTCTTAGGACTCCTTGTGGGTCTCGCAA
TATTGATCACATACCTCACCCTCAGGCCAAAGCGACTAGTCTATACCGTAGAAGCCGCCT
CGGTCCAAGATTTTGCTATAGCCAAGGATGATCACATTAGCGCCAAATTTAACTATGTGA
TCAAATCATACAACCCGGAGAGACACGTCTCTGTGAGATACCACTCTATGCGCATCTCCA
CGGCTCACCATAACCAGTCCGTAGCTCACAAGGAGATCTCTGCCTTCAAGCAGCGTCCTA
AGAAGGAGACGAGGATTGAGACGCAGCTTGTGTCGCACAACGTGGCACTGTCTAAGTTCA
ATGCGAAGGACTTGAGGGTTGAAACGACGAAAGGGATGATCGAAATGGAAGTGTATATAA
CGGCTAGAGTGAGCTACAAGACGTGGATATTTCGGTCGAGGAGACGTACGTTGAAGGCTG
TGTGCACGCCGGTGATGATCAACGTTACGGAGAACTCGTTGGATGGGTTCCAGAAAGTTT
TATGCCAAACTCGTCTTTAGTTAAATTACTTAACAACTTGAATTGTTTCTATTTGTGTGC
TTATTATTGTGTACTTTGTTCCATTTGTTGATTCTGTGTATGTGCGTGCTTCTTTTATTG
ATTTTCTGATTCTTGTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F320TF U 1
AF RR4F320JQ C 168
BS 1 592 RR4F320TF
BS 593 800 RR4F320JQ

RD RR4F320TF 592 0 0
TTTTTCTAACAGTTAGCTATAAGTTATATACATTTCCATCACAAGCATCTCTAACAATGG
TTCCTCCAAAACCACCGCCTCCACGAACGCAACCCCAACCGCTGCCGGGTAAACGTTTGA
ACCCCGTCCTATGCATCATTGTGGCCCTTGTCCTCTTAGGACTCCTTGTGGGTCTCGCAA
TATTGATCACATACCTCACCCTCAGGCCAAAGCGACTAGTCTATACCGTAGAAGCCGCCT
CGGTCCAAGATTTTGCTATAGCCAAGGATGATCACATTAGCGCCAAATTTAACTATGTGA
TCAAATCATACAACCCGGAGAGACACGTCTCTGTGAGATACCACTCTATGCGCATCTCCA
CGGCTCACCATAACCAGTCCGTAGCTCACAAGGAGATCTCTGCCTTCAAGCAGCGTCCTA
AGAAGGAGACGAGGATTGAGACGCAGCTTGTGTCGCACAACGTGGCACTGTCTAAGTTCA
ATGCGAAGGACTTGAGGGTTGAAACGACGAAAGGGATGATCGAAATGGAAGTGTATATAA
CGGCTAGAGTGAGCTACAAGACGTGGATATTTCGGTCGAGGAGACGTACGTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4F320JQ 633 0 0
GTGGGTCTCGCAATATTGATCACATACCTCACCCTCAGGCCAAAGCGACTAGTCTATACC
GTAGAAGCCGCCTCGGTCCAAGATTTTGCTATAGCCAAGGATGATCACATTAGCGCCAAA
TTTAACTATGTGATCAAATCATACAACCCGGAGAGACACGTCTCTGTGAGATACCACTCT
ATGCGCATCTCCACGGCTCACCATAACCAGTCCGTAGCTCACAAGGAGATCTCTGCCTTC
AAGCAGCGTCCTAAGAAGGAGACGAGGATTGAGACGCAGCTTGTGTCGCACAACGTGGCA
CTGTCTAAGTTCAATGCGAAGGACTTGAGGGTTGAAACGACGAAAGGGATGATCGAAATG
GAAGTGTATATAACGGCTAGAGTGAGCTACAAGACGTGGATATTTCGGTCGAGGAGACGT
ACGTTGAAGGCTGTGTGCACGCCGGTGATGATCAACGTTACGGAGAACTCGTTGGATGGG
TTCCAGAAAGTTTTATGCCAAACTCGTCTTTAGTTAAATTACTTAACAACTTGAATTGTT
TCTATTTGTGTGCTTATTATTGTGTACTTTGTTCCATTTGTTGATTCTGTGTATGTGCGT
GCTTCTTTTATTGATTTTCTGATTCTTGTGTGC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL4652Contig1 944 2 2 U
GGTGTTGATCCTGTGAATATCGATCCAAGTCAGATCCAAGGATCCCTGCGCAAAGGAGAT
GGCGATAAGGACTCAAATTGCTGGAATTCTCCTAGTGGCATGGGGTTTATGATCAGGGGA
AAAACCTACCTCAAAGATAATGCAAAGGTGATGGGTGGGCAGCCCCTTCCGACACTTGTA
TCAGTGGATTGGCTTAAAGTTGATAAAGCTGTAGACAACATCGCTCTGCATCCGAAATGT
CTTGTCCGGTCAGAACCGGGGAAAAAGCTGCCGTTCATCCTAGTCGTAAATCTTCAGGTA
CCAGCAAAACCTAACTATTGTTTGGTCATGTACTATGCTGCGGATCGACCTGTAAGCGAG
TCTTCCTCGCTGGGAAAATTTGTAAATGGGAGTGACAGTTACCGCGACTCAAGATTTAAG
CTGATTCCAAGTATTGTTCAGGGATATTGGATGGTCAAGCGGGCTGTTGGAACAAAAGCC
TGCTTGCTTGGTAAAGCTGTAACCTGCAAGTACCTGAGGAAGGATAACTTTCTGGAGATT
GATGTAGATATTGGATCATCGGCTGTTGCCCGGAGCGTTATTGGTCTGGTACTTGGTTAT
GTCACAAGCCTCATTGTTGATCTAGCCATCTTGATTGAGGGAAAAGAGGAAACAGAGTTG
CCAGAGTATATTCTTGGGACGGTTAGGCTTAACCGAATAGACAAACTTGTGGATTGGATC
AGCAAAATTGAATTCAGGGAATATCAAGCCTTCACTTTGACTCTTTATTAAACCTTCGGA
ATAATACAAACGGGTATTTTGAAAAATACCCTATGTAAGTTTTAGATTTGGAAAATGTCC
TATGTTTATTTTCTTTTAAAAAACCTAGCCCTTTCTTAATTAAAAATACATAAACTTTAC
ATATTACATTTAACAAAACAATAAATAAGTATCGTTGTTTGGAT


BQ
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AF RR4D476TF U 1
AF RR4D476JQ C 172
BS 1 631 RR4D476TF
BS 632 944 RR4D476JQ

RD RR4D476TF 631 0 0
GGTGTTGATCCTGTGAATATCGATCCAAGTCAGATCCAAGGATCCCTGCGCAAAGGAGAT
GGCGATAAGGACTCAAATTGCTGGAATTCTCCTAGTGGCATGGGGTTTATGATCAGGGGA
AAAACCTACCTCAAAGATAATGCAAAGGTGATGGGTGGGCAGCCCCTTCCGACACTTGTA
TCAGTGGATTGGCTTAAAGTTGATAAAGCTGTAGACAACATCGCTCTGCATCCGAAATGT
CTTGTCCGGTCAGAACCGGGGAAAAAGCTGCCGTTCATCCTAGTCGTAAATCTTCAGGTA
CCAGCAAAACCTAACTATTGTTTGGTCATGTACTATGCTGCGGATCGACCTGTAAGCGAG
TCTTCCTCGCTGGGAAAATTTGTAAATGGGAGTGACAGTTACCGCGACTCAAGATTTAAG
CTGATTCCAAGTATTGTTCAGGGATATTGGATGGTCAAGCGGGCTGTTGGAACAAAAGCC
TGCTTGCTTGGTAAAGCTGTAACCTGCAAGTACCTGAGGAAGGATAACTTTCTGGAGATT
GATGTAGATATTGGATCATCGGCTGTTGCCCGGAGCGTTATTGGTCTGGTACTTGGTTAT
GTCACAAGCCTCATTGTTGATCTAGCCATCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4D476JQ 773 0 0
ACACTTGTATCAGTGGATTGGCTTAAAGTTGATAAAGCTGTAGACAACATCGCTCTGCAT
CCGAAATGTCTTGTCCGGTCAGAACCGGGGAAAAAGCTGCCGTTCATCCTAGTCGTAAAT
CTTCAGGTACCAGCAAAACCTAACTATTGTTTGGTCATGTACTATGCTGCGGATCGACCT
GTAAGCGAGTCTTCCTCGCTGGGAAAATTTGTAAATGGGAGTGACAGTTACCGCGACTCA
AGATTTAAGCTGATTCCAAGTATTGTTCAGGGATATTGGATGGTCAAGCGGGCTGTTGGA
ACAAAAGCCTGCTTGCTTGGTAAAGCTGTAACCTGCAAGTACCTGAGGAAGGATAACTTT
CTGGAGATTGATGTAGATATTGGATCATCGGCTGTTGCCCGGAGCGTTATTGGTCTGGTA
CTTGGTTATGTCACAAGCCTCATTGTTGATCTAGCCATCTTGATTGAGGGAAAAGAGGAA
ACAGAGTTGCCAGAGTATATTCTTGGGACGGTTAGGCTTAACCGAATAGACAAACTTGTG
GATTGGATCAGCAAAATTGAATTCAGGGAATATCAAGCCTTCACTTTGACTCTTTATTAA
ACCTTCGGAATAATACAAACGGGTATTTTGAAAAATACCCTATGTAAGTTTTAGATTTGG
AAAATGTCCTATGTTTATTTTCTTTTAAAAAACCTAGCCCTTTCTTAATTAAAAATACAT
AAACTTTACATATTACATTTAACAAAACAATAAATAAGTATCGTTGTTTGGAT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL4653Contig1 977 2 2 U
GGAGTGAAAGAATGGAGACGGCTCTGCTCCGGTTCTGCGTTAGTTTCTCCGGCCATCCCC
ACCACAATAAAATCGCCGCTGCTCATCACAGAGTCAGTTGTGAGATTCCGGGAGGATCAT
CCGAAGACGAGTTGTCTGCTAAGGTTTTGAGTAGAAGATCGGTACTAGCGACGGTTTCTG
GACTCTCATTGGTCTCTTCGACTTCTTTAGCGTTTCCGGGGGAAGGATTAGCTGTCGTGA
AACAAGGTCTTCTCGCCGGGAGAGTTCCTGGTCTATCCGAACCCGATGACGAAGGACAGG
TTGGAGAACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCC
TATTATCCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATTGGAATGAGGTACCTGTGTCGATAGC
TGATCTTGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATTCGCTAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTC
TGTAATTGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATAACCTTGGGGACAACGTGAAGATTGA
AAATATTGGAACACCAGCGAAGGTGATCAACGCCTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAA
CGTTGAAGGGAAGGTGTTAAGTTCTAACGTAGCGGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCA
GTTCGAGCTAGAGCCACCTCATGTACTCATCACTGCGACAGCTGCTGGGAACCGCCTTTA
CTTGTTCAGTGTCACCGGAAACGGGCTTCAATGGAAGAGATACTACAAGGATCTGAAGAA
GATAGCTACTTCTTTCCGCGTTGTTTAGAGACATTTGCAAAAAGTTTTCTTTTTGATTCA
TGCATGGGTTCTTCTACAAGTGAACTCAAATAGTTTATGGATGACCCACCAGTCTCGTAC
GTCATATATATTTGTATAAAGTTGAGAATCCTGTAACTTTACAGTAAACCAAATCCAAGC
AGTACATTAAGTCTGGC


BQ
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AF RR4EW10TF U 1
AF RR4EW10JQ C 276
BS 1 734 RR4EW10TF
BS 735 977 RR4EW10JQ

RD RR4EW10TF 734 0 0
GGAGTGAAAGAATGGAGACGGCTCTGCTCCGGTTCTGCGTTAGTTTCTCCGGCCATCCCC
ACCACAATAAAATCGCCGCTGCTCATCACAGAGTCAGTTGTGAGATTCCGGGAGGATCAT
CCGAAGACGAGTTGTCTGCTAAGGTTTTGAGTAGAAGATCGGTACTAGCGACGGTTTCTG
GACTCTCATTGGTCTCTTCGACTTCTTTAGCGTTTCCGGGGGAAGGATTAGCTGTCGTGA
AACAAGGTCTTCTCGCCGGGAGAGTTCCTGGTCTATCCGAACCCGATGACGAAGGACAGG
TTGGAGAACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCC
TATTATCCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATTGGAATGAGGTACCTGTGTCGATAGC
TGATCTTGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATTCGCTAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTC
TGTAATTGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATAACCTTGGGGACAACGTGAAGATTGA
AAATATTGGAACACCAGCGAAGGTGATCAACGCCTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAA
CGTTGAAGGGAAGGTGTTAAGTTCTAACGTAGCGGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCA
GTTCGAGCTAGAGCCACCTCATGTACTCATCACTGCGACAGCTGCTGGGAACCGCCTTTA
CTTGTTCAGTGTCA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4EW10JQ 702 0 0
TCCGAACCCGATGACGAAGGACAGGTTGGAGAACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTCAG
GAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTATTATCCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATT
GGAATGAGGTACCTGTGTCGATAGCTGATCTTGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATTCG
CTAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTGTAATTGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATA
ACCTTGGGGACAACGTGAAGATTGAAAATATTGGAACACCAGCGAAGGTGATCAACGCCT
TTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAACGTTGAAGGGAAGGTGTTAAGTTCTAACGTAGCGG
AACACGAGGGTAGGCTCTATTACCAGTTCGAGCTAGAGCCACCTCATGTACTCATCACTG
CGACAGCTGCTGGGAACCGCCTTTACTTGTTCAGTGTCACCGGAAACGGGCTTCAATGGA
AGAGATACTACAAGGATCTGAAGAAGATAGCTACTTCTTTCCGCGTTGTTTAGAGACATT
TGCAAAAAGTTTTCTTTTTGATTCATGCATGGGTTCTTCTACAAGTGAACTCAAATAGTT
TATGGATGACCCACCAGTCTCGTACGTCATATATATTTGTATAAAGTTGAGAATCCTGTA
ACTTTACAGTAAACCAAATCCAAGCAGTACATTAAGTCTGGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL4654Contig1 459 2 1 U
GGTAGAGTCAGTAAGCAAACCGCTGATGCCAACAAGCGATAACGTAACAATGGACGAACA
GAACATTCCACCGGGCCAAATGGGAGCAGAGACTCCACACCCACATCCACAGCAAGTGGT
TCTGCCAATGGATGAGAAAGCATTGTCGGGTCTCCAGGCACGAATGGAAAGGCTGAAAGG
TGGTTCACTCGAACATATGTAGTGAAGAAGCTTGGGAGTCATTTTTGTTACTTGTCTCAT
CTATTAATGTTAGTGATAGTAAAGTATCTTTTTTCCATATACATATGTATGTGTAAGAGA
AGAAATATTTATGGGGAAGATGTGGTATTGTATTCGATGGAGTTAGTATAGTGGTGAGAA
ATGATGCACGTGTGGGTAAAGATTCTTTTAAGATGAGGCGATGTATGATTCTTTCTTCTT
ATGTTTACAGATTGTATTTTCATGTGGAGTGATTGTTTT


BQ
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AF RR4ED49JQ C 1
AF RR4ED49TF U 1
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QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B343TF U 1
AF RR4AU09TF U 1
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QA 1 773 1 773
DS 



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BQ
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AF RR4E286JQ U 1
AF RR4DT08JQ U 1
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RD RR4E286JQ 718 0 0
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TATTCTTTTACCTTTTGTTGTTCCATGTACTCTTTATCTGCTTCTGCGACCCGGTTCTGG
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TCTGATTCACCCTGGCTCCCAAGGGAAGGAATCACTTGATGGATAATCCATTGTGAATCT
ACCACACCAATCTTCTCATGAGCAGGCTCAACGCATCGTCTGAGAGCAAAATCAAGACCC
CATCCATGGACAAGATCATTCTGAATCATATGCCAGACACATCGCCATGCTTCTCTAGAA
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CATCCTGGTTTTTCTTGAGTTTCTTTGTGGACATCTCGGTCACCTCTCCTCTTTGTCATT
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CATCCTGGTTTTTCTTGAGTTTCTTTGTGGACATCTCGGTCACCTCTCCTCTTTGTCATT
TCCCATGTAAGTCCGTTGTTTGGCTCTAATCCTGGTTGAGAAATCTCCAAACCATGCTTC
TTAACTAATTCAATGTACCTTTCTGCATTGAAGTGCTCGACTCCAAGATCTTCATCCCAT
ATAAATATATACTCATAAGCCGAGACAACATCAGGATGCAAAAA

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DS 



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TCAGTAAAGCAGCGCAGATGCGTAAATGGTCATGTCTGACTGAACTTGCAAGTTTTAGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AZ02TF U 1
AF RR4AZ02JQ C 397
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QA 1 776 1 776
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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ATACCATCTTTACATATCTTATGCATGTCCATGGGCTTCTAGATGCATCTCATACTACAA
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AGCTGATCCTGACCATCTTAATGGTGCTAAGAGTGTAAGAGAACTCTATGAGATTGCTAG
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CGAATGGATCTACAGTGGGATTAATAACGGTGTCTATAGGTGCGGTTTTGCAAAGAAACA
AGAACCTTACGAGGAGGCAGTGCAGCAAGTGTATGAAGCATTAGATAGATGCGAGGAGAT
TCTTGGAAAGCATCGTTACATCTGCGGTAACACTTTGACTGAAACAGATATCAGATTGTT
TGTGACACTGATAAGATTTGACGAGGTTTATGCGGTTCACTTCAAGTGCAACAAGAAATT
TTTAAGAGAGTATCCGAATCTGTTCAACTACACGAAAGACGTATTTCAAGTCCCTGGTAT
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CAACCCTTTTGGGATCGTCCCTCAGGGGCCAAACATCGATTACTCCTCGCCTCATGATCG
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GTCTGATCATAAATAAACTTTACTTCC


BQ
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AF RR4H850TF U 1
AF RR4H850JQB C 457
BS 1 549 RR4H850TF
BS 550 1107 RR4H850JQB

RD RR4H850TF 549 0 0
AACGTTCCGTAACTTCGTATCAAGAGATCCCAACTCTCAGTTTCCAGCTGAAACTGGTAG
ATACCATCTTTACATATCTTATGCATGTCCATGGGCTTCTAGATGCATCTCATACTACAA
GATCAAAGGACTTGACGATGCAATAAGCTTCTCGTCTGTTAAACCCATTTGGGGAAGGAC
CAAGGAAAGTGATGAGCACATGGGATGGATCTTCCCGGATTCAGACGCTGAGGTTCAAGG
AGCTGATCCTGACCATCTTAATGGTGCTAAGAGTGTAAGAGAACTCTATGAGATTGCTAG
CCCAAACTACACCGGGAAGTATACTGTTCCTGTTCTGTGGGATAAGAAGCTGAAGACTGT
TGTGAACAATGAGAGCGCTGAGATTATCAGGATGTTCAACACCGAGTTCAATCATATTGC
TAGAAACCCTGATCTTGATCTTTACCCTTCTCAACTCCAAGCTAAAATCGATGAAGCTAA
CGAATGGATCTACAGTGGGATTAATAACGGTGTCTATAGGTGCGGTTTTGCAAAGAAACA
AGAACCTTA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4H850JQB 651 0 0
CCAAGCTAAAATCGATGAAGCTAACGAATGGATCTACAGTGGGATTAATAACGGTGTCTA
TAGGTGCGGTTTTGCAAAGAAACAAGAACCTTACGAGGAGGCAGTGCAGCAAGTGTATGA
AGCATTAGATAGATGCGAGGAGATTCTTGGAAAGCATCGTTACATCTGCGGTAACACTTT
GACTGAAACAGATATCAGATTGTTTGTGACACTGATAAGATTTGACGAGGTTTATGCGGT
TCACTTCAAGTGCAACAAGAAATTTTTAAGAGAGTATCCGAATCTGTTCAACTACACGAA
AGACGTATTTCAAGTCCCTGGTATGAGTAGCACCGTGAACATGAATCACATCGAGCAGCA
TTACTATGGAAGCCACCCTTCGATCAACCCTTTTGGGATCGTCCCTCAGGGGCCAAACAT
CGATTACTCCTCGCCTCATGATCGACACAGATTCTCCAAATGATAAATAACCAGTCTTTC
GCACTTGAGTTCTGTCTTCAGAAGTTTCCAAATAAAGTTTGTCTTTGAATAGTGTATACA
TTGAGAAAAATAAAAAGCCTGATGTTTATCATGTTACAGTTTGCAGACTTGCAGTCTCAG
AAGTTGAGACCTGAGACAATGTTGGTCTGATCATAAATAAACTTTACTTCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL4661Contig1 976 2 4 U
GGAGAGTGCGTCTCTAACTCTAGGATTTCAAACGCGATGGTTCATCTTCTTTCTTACAAT
CTGAAGGATATCTGTTATAGATTCATCCTCTTTAAGCCCTCCATCAATCTATCACCCATG
ATCTATCTTTAATGTGAGCTTTAATTCTGCAAGGCTGTGTATCTGCATGTATAAAAAGAC
CGGACGCTCCTCCTCCACCGTTCAAGTGCAGTTGCTCCGGTTCTGGGAGGCCATGGACAT
CATCCTCACAAAAGTTTATTGTATTTCTTCCACCGTCTAAGAGCAGAACCGCCTCTGTTT
TCTCTGGGTCGGCCAAGAGGAAGCATGTCAGCGTATGAGGGAGAGAAGAAAAACAGAGGG
ATGATGAGTGATGCGCGTAAGGGCTACGCCACCGTTGAAGATCTAACGAAAATACCCATA
GCCGGAGCTTCAAACATTAATGGCTGCAGGAGGAAATCACTTGGAGGCGGAGGGGAGAGA
AAATTACTTGGCGGTGGTGGTGGTCGGAGTTGGTATATCTAACAGGCGCCTCCTTCTGTC
AACTTTTCCATGACACCGAGCGGCTTCAGTTTATCAACAGCTTAAGAAAAGACAAGGCAA
TCCTTTACACCAGAGCCAATGCCGTTTACACCAAAACAAATGAACAGAAGTTGTTATGTT
ATTATCCTTTCCAAAAAGTCTGTTTTTGATGGTTAAGGAACTATGTATGATGGGAGAAGG
TTCTCTTACAAGGCTAGGCACCATGTCAAGTATCCTGCTGGGACTGCAGTTGTTGATCTG
AAAGTAGCTTACCTGAATGACAACAACTGTTGATCTGAAAGTAACTTATGGAGGATTTGC
AGGTTTGCTTTTGTTTTATACAGTTGGTCTGGATAATGTTTACGTAAGTGTTTGGTCACC
TTAGATCCAGTTGGTTTTGGTTGGACAAAATTGTTTCAGGTCGTGTGTTTATGTGAATAT
ATATGGTTTGGTTCTC


BQ
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AF RR4DI68TF U 1
AF RR4DI68JQ C 112
BS 1 676 RR4DI68TF
BS 677 677 RR4DI68JQ
BS 678 689 RR4DI68TF
BS 690 976 RR4DI68JQ

RD RR4DI68TF 689 0 0
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CTGAAGGATATCTGTTATAGATTCATCCTCTTTAAGCCCTCCATCAATCTATCACCCATG
ATCTATCTTTAATGTGAGCTTTAATTCTGCAAGGCTGTGTATCTGCATGTATAAAAAGAC
CGGACGCTCCTCCTCCACCGTTCAAGTGCAGTTGCTCCGGTTCTGGGAGGCCATGGACAT
CATCCTCACAAAAGTTTATTGTATTTCTTCCACCGTCTAAGAGCAGAACCGCCTCTGTTT
TCTCTGGGTCGGCCAAGAGGAAGCATGTCAGCGTATGAGGGAGAGAAGAAAAACAGAGGG
ATGATGAGTGATGCGCGTAAGGGCTACGCCACCGTTGAAGATCTAACGAAAATACCCATA
GCCGGAGCTTCAAACATTAATGGCTGCAGGAGGAAATCACTTGGAGGCGGAGGGGAGAGA
AAATTACTTGGCGGTGGTGGTGGTCGGAGTTGGTATATCTAACAGGCGCCTCCTTCTGTC
AACTTTTCCATGACACCGAGCGGCTTCAGTTTATCAACAGCTTAAGAAAAGACAAGGCAA
TCCTTTACACCAGAGCCAATGCCGTTTACACCAAAACAAATGAACAGAAGTTGTTATGTT
ATTATCCTTTCCAAAA*GTCTGTTTTTGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DI68JQ 865 0 0
TCACCCATGATCTATCTT*AATGTGAGCTTTAATTCTGCAAGGCTGTGTATCTGCATGTA
TAAAAAGACCGGACGCTCCTCCTCCACCGTTCAAGTGCAGTTGCTCCGGTTCTGGGAGGC
CATGGACATCATCCTCACAAAAGTTTATTGTATTTCTTCCACCGTCTAAGAGCAGAACCG
CCTCTGTTTTCTCTGGGTCGGCCAAGAGGAAGCATGTCAGCGTATGAGGGAGAGAAGAAA
AACAGAGGGATGATGAGTGATGCGCGTAAGGGCTACGCCACCGTTGAAGATCTAACGAAA
ATACCCATAGCCGGAGCTTCAAACATTAATGGCTGCAGGAGGAAATCACTTGGAGGCGGA
GGGGAGAGAAAATTACTTGGCGGTGGTGGTGGTCGGAGTTGGTATATCTAACAGGCGCCT
CCTTCTGTCAACTTTTCCATGACACCGAGCGGCTTCAGTTTATCAACAGCTTAAGAAAAG
ACAAGGCAATCCTTTACACCAGAGCCAATGCCGTTTACACCAAAACAAATGAACAGAAGT
TGTTATGTTATTATCCTTTCCAAAAAGTCTGTTTTTGATGGTTAAGGAACTATGTATGAT
GGGAGAAGGTTCTCTTACAAGGCTAGGCACCATGTCAAGTATCCTGCTGGGACTGCAGTT
GTTGATCTGAAAGTAGCTTACCTGAATGACAACAACTGTTGATCTGAAAGTAACTTATGG
AGGATTTGCAGGTTTGCTTTTGTTTTATACAGTTGGTCTGGATAATGTTTACGTAAGTGT
TTGGTCACCTTAGATCCAGTTGGTTTTGGTTGGACAAAATTGTTTCAGGTCGTGTGTTTA
TGTGAATATATATGGTTTGGTTCTC

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL4662Contig1 733 2 6 U
GAGCGTTTAATTACAACAACGACTTGGAGGAGAACACGGTGCCAGAAGTACAGAGAACAA
ATCTTGCAAGTGTGGTACTTGCTTTGAAGAGTCTTGGAATTCATGATCTCATAAACTTTG
ATTTTATGGACCCTCCACCTGCTGAAGCACTTGTGAAGGCTTTAGAGCTTCTCTTCGCTC
TAGGTGCTCTAAATAAGCTTGGTGAATTGACCAAAGCTGGTAGAAGGATGGCAGAGTTTC
CCCTTGATCCGATGTTATCGAAGATGATTGTTGTTTCTGACAAGTACAAGTGCTCAGATG
AGGTAATATCAATTGCTGCTATGTTGTCAGTTGGAGGGTCTGTCTTCTACCGTCCCAAGG
ACAAACAGGTTCACGCTGACAATGCAAGAATGAATTTTCACACTGGAAATGTTGGTGACC
GCATTTGCTTTGCTAAAGGTTTACAGCTCATGGAAGGAAACAAACTACTCTACACAATGG
TGCTATGAGAACTACATTCAGGTACGGAGCATGAAAAGAGCCAGAGATATCCGTGACCAG
TTGGAAGGACTGCTTGAGAGAGTGGAAATAGAAATCAGCTCCAACATGAACGAATTGGGA
TTCCGTTAGGAAGTCTATTGTAGCTGGTTTTTTCCCGCACACGGCGAAGCTGCAGAAGAA
TGGATCATATCGAACTGTGAAGCATCCCCAGACCGTGCACATACATCCCAATTCAGATTA
TCTCAGTGTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B126TF U 1
AF RR4AT20TF U 251
BS 1 425 RR4B126TF
BS 426 426 RR4AT20TF
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BS 600 715 RR4B126TF
BS 716 733 RR4AT20TF

RD RR4B126TF 723 0 0
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ATTTTATGGACCCTCCACCTGCTGAAGCACTTGTGAAGGCTTTAGAGCTTCTCTTCGCTC
TAGGTGCTCTAAATAAGCTTGGTGAATTGACCAAAGCTGGTAGAAGGATGGCAGAGTTTC
CCCTTGATCCGATGTTATCGAAGATGATTGTTGTTTCTGACAAGTACAAGTGCTCAGATG
AGGTAATATCAATTGCTGCTATGTTGTCAGTTGGAGGGTCTGTCTTCTACCGTCCCAAGG
ACAAACAGGTTCACGCTGACAATGCAAGAATGAATTTTCACACTGGAAATGTTGGTGACC
GCATT*GCTTTGCTAAAGGTTTACAGCTCATGGAAGGAAACAAACTACTCTACACAATGG
TGCTATGAGAACTACATTCAGGTACGGAGCATGAAAAGAGCCAGAGATATCCGTGACCAG
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TTCCGTTAGGAAGTCTATTGTAGCTGGTTTTTTCCCGCACACGGCGAAGCTGCAGAAGAA
TGGATCATATCGAACTGTGAAGCATCCCCAGACCGTGCACATACATCCCAATTCA
CGATTATC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4AT20TF 483 0 0
GATGTTATCGAAGATGATTGTTGTTTCTGACAAGTACAAGTGCTCAGATGAGGTAATATC
AATTGCTGCTATGTTGTCAGTTGGAGGGTCTGTCTTCTACCGTCCCAAGGACAAACAGGT
TCACGCTGACAATGCAAGAATGAATTTTCACACTGGAAATGTTGGTGACCGCATTTGCTT
TGCTAAAGGTTTACAGCTCATGGAAGGAAACAAACTACTCTACACAATGGTGCTATGAGA
ACTACATTCAGGTACGGAGCATGAAAAGAGCCAGAGATATCCGTGACCAGTTGGAAGGAC
TGCTTGAGAGAGTGGAAATAGAAATCAGCTCCAACATGAACGAATTGGGATTCCGTTAGG
AAGTCTATTGTAGCTGGTTTTTTCCCGCACACGGCGAAGCTGCAGAAGAATGGATCATAT
CGAACTGTGAAGCATCCCCAGACCGTGCACATACATCCCAATTCAGATTATCTCAGTGTT
GCC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

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TCTGTGTTGCTTTTGGAAGCTTGTTTTTGTGCCAATTCCAGTTCTTCCACAAATCCTAAT
AAAGAAGAAGTTCCGAGTTGGTGAAATTTATTGTGTCAAAATCAACGGTTTCGAGCAACA
TATCAGAACAACGGTTTAGAGGTTATCTGATTAGAAGATGGAGAACGGAGGGTCAAGGTT
TCCACCTTTACAGAATTGATGCGTATCAATAGCGAACGGTATACGGTATACGTATTTCTC
ATTTTTTTAACAAAATTTTAATTTTAAATAAGAACTATTTGATCGTTTGCCGAAAAAAAA
TAAAATAAGAACTATTTGATTCCCATTTTCTTTCTTCTCACCACGTGCTTTTTTTAAAAA
CAGTTCTTTTCACAGCGAATATTGCACCGTCCCTAAAACTTTATTTAAAGATTTATATTT
TATGTTTTTAACGTTGTACTCTCTTCTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTCTTCTAAA
TATTCAACATAATAATATTAAATAAAACGAAATATAGCCATTAAATACTGAAAATGACAA
GAACCAGATCAGTTTACAACCAATGAATATCAAACTCGGTTTCGTCACTATTAAAAGCCA
AATTTCCGTCTTTTTAAAAAATTCAGAAACTCCTTTACCTCTATTGAACACGAAAAACAA
TCAAGATGGAAGATTTAATGTACTTTCAAGCTGGAATATCTTGTAACACCCGGTTCATCC
TCACTCGATACCGGCATGTTACCAAACCACAATTGTGTCTCAAAAATCCGATAAAAATCT
TAAAGTCGATTTCCATGG


BQ
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AF RR4GN03TF U 1
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BS 1 526 RR4GN03TF
BS 527 978 RR4GN03JQ

RD RR4GN03TF 526 0 0
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CATCACCTCTGTCTTGTCGTTCTCACTTCTTTGCTTGGATCTGTAAGTCAGCTTTCATTT
TTGTCTCTATAACAAACCCTTCGATTGCTACCTTCTAATATTTGCATCGACCGTTGGGAT
TCTGTGTTGCTTTTGGAAGCTTGTTTTTGTGCCAATTCCAGTTCTTCCACAAATCCTAAT
AAAGAAGAAGTTCCGAGTTGGTGAAATTTATTGTGTCAAAATCAACGGTTTCGAGCAACA
TATCAGAACAACGGTTTAGAGGTTATCTGATTAGAAGATGGAGAACGGAGGGTCAAGGTT
TCCACCTTTACAGAATTGATGCGTATCAATAGCGAACGGTATACGGTATACGTATTTCTC
ATTTTTTTAACAAAATTTTAATTTTAAATAAGAACTATTTGATCGTTTGCCGAAAAAAAA
TAAAATAAGAACTATTTGATTCCCATTTTCTTTCTTCTCACCACGT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4GN03JQ 737 0 0
AAGAAGAAGTTCCGAGTTGGTGAAATTTATTGTGTCAAAATCAACGGTTTCGAGCAACAT
ATCAGAACAACGGTTTAGAGGTTATCTGATTAGAAGATGGAGAACGGAGGGTCAAGGTTT
CCACCTTTACAGAATTGATGCGTATCAATAGCGAACGGTATACGGTATACGTATTTCTCA
TTTTTTTAACAAAATTTTAATTTTAAATAAGAACTATTTGATCGTTTGCCGAAAAAAAAT
AAAATAAGAACTATTTGATTCCCATTTTCTTTCTTCTCACCACGTGCTTTTTTTAAAAAC
AGTTCTTTTCACAGCGAATATTGCACCGTCCCTAAAACTTTATTTAAAGATTTATATTTT
ATGTTTTTAACGTTGTACTCTCTTCTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTCTTCTAAAT
ATTCAACATAATAATATTAAATAAAACGAAATATAGCCATTAAATACTGAAAATGACAAG
AACCAGATCAGTTTACAACCAATGAATATCAAACTCGGTTTCGTCACTATTAAAAGCCAA
ATTTCCGTCTTTTTAAAAAATTCAGAAACTCCTTTACCTCTATTGAACACGAAAAACAAT
CAAGATGGAAGATTTAATGTACTTTCAAGCTGGAATATCTTGTAACACCCGGTTCATCCT
CACTCGATACCGGCATGTTACCAAACCACAATTGTGTCTCAAAAATCCGATAAAAATCTT
AAAGTCGATTTCCATGG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL4664Contig1 468 2 1 U
GGAACCTAAGAAAATCGACTCCTCTGCTTCTTCTCCTTCTTCGTCGTCGAGCAGAGTCAG
CTATCTACAGAAATGGATCGTGACCTCGCAAACAATCCCCAGTTGATTCAATTCCTCAGC
CAAGAAAAAGAAAGGGCGATGGCGAACGAAGTGGTGGCGAAGATAACAAGCTCGTGCTGG
GACAAATGTGTGGACAAACCAGGAAGCAAATTCAGCTCAAGCGAGTCTTCTTGCCTCAGT
AACTGCGCCCTACGCTACATGGACATGACTATGCTCATCATGAAACGCTTTCAGCAGTAG
TGATTTTTGTATCCCATCATGTTACTTCTTCTCTTTTATTTATTAGTATGAAAACCTTCT
TCTTCTTTTTTTCAATTCTCATGGCAACTGGTGTTAAACCCCTGCAATAATGTTCCCTTG
GATGAATTGTTATAGGATTGTTTTATGGTAATGAGATTTGAGATTTTT


BQ
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AF RR4DO26JQ C 1
AF RR4DO26TF U 1
BS 1 468 RR4DO26TF

RD RR4DO26JQ 468 0 0
GGAACCTAAGAAAATCGACTCCTCTGCTTCTTCTCCTTCTTCGTCGTCGAGCAGAGTCAG
CTATCTACAGAAATGGATCGTGACCTCGCAAACAATCCCCAGTTGATTCAATTCCTCAGC
CAAGAAAAAGAAAGGGCGATGGCGAACGAAGTGGTGGCGAAGATAACAAGCTCGTGCTGG
GACAAATGTGTGGACAAACCAGGAAGCAAATTCAGCTCAAGCGAGTCTTCTTGCCTCAGT
AACTGCGCCCTACGCTACATGGACATGACTATGCTCATCATGAAACGCTTTCAGCAGTAG
TGATTTTTGTATCCCATCATGTTACTTCTTCTCTTTTATTTATTAGTATGAAAACCTTCT
TCTTCTTTTTTTCAATTCTCATGGCAACTGGTGTTAAACCCCTGCAATAATGTTCCCTTG
GATGAATTGTTATAGGATTGTTTTATGGTAATGAGATTTGAGATTTTT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4DO26TF 468 0 0
GGAACCTAAGAAAATCGACTCCTCTGCTTCTTCTCCTTCTTCGTCGTCGAGCAGAGTCAG
CTATCTACAGAAATGGATCGTGACCTCGCAAACAATCCCCAGTTGATTCAATTCCTCAGC
CAAGAAAAAGAAAGGGCGATGGCGAACGAAGTGGTGGCGAAGATAACAAGCTCGTGCTGG
GACAAATGTGTGGACAAACCAGGAAGCAAATTCAGCTCAAGCGAGTCTTCTTGCCTCAGT
AACTGCGCCCTACGCTACATGGACATGACTATGCTCATCATGAAACGCTTTCAGCAGTAG
TGATTTTTGTATCCCATCATGTTACTTCTTCTCTTTTATTTATTAGTATGAAAACCTTCT
TCTTCTTTTTTTCAATTCTCATGGCAACTGGTGTTAAACCCCTGCAATAATGTTCCCTTG
GATGAATTGTTATAGGATTGTTTTATGGTAATGAGATTTGAGATTTTT

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

CO CL4665Contig1 472 2 1 U
GCTACACACAAGCTATTGATTTTGACCCTACGGATCATACCTTCTTCTCAAACCGAAGCC
TCTGCTGGTTGCTGTTAGGACAAGGTGAGCATGCCTTGTCGGATGCTAAAGCCTGCAGAG
AACTAAAGCCTGGCTGGCCTAAAGCTTGTTTCAGAGAAGGCGCTGCACTTCGTTTGCTAC
AGCGATTTGATGAGGCAGCCAATGCATTTTACGAGGGAGTGTTGCTAAGCCCTGAAAGCA
AAGAGCTCATTGATGCGTTCAGAGAAGCTGTAGATGCTGGAAGGAAGTTTCACGGCAAGG
ACAAGATTAAGGACAAAGCATAAGATCTTCAAGAGATGGCTCTGTTTAGTATCTGTATGA
AGTTTTGATCTTGCTACTTAACCTGGCCTCTCCCTTTATGCAGTTGCTACCTTATCTTTT
ATTTACTTAAACTTTCTAAAAGCTTCAGGAACAAAGTTTAGTGTGTGGTCCG


BQ
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AF RR4DI36JQ C 1
AF RR4DI36TF U 1
BS 1 472 RR4DI36TF

RD RR4DI36JQ 472 0 0
GCTACACACAAGCTATTGATTTTGACCCTACGGATCATACCTTCTTCTCAAACCGAAGCC
TTTGCTGGTTGCTGTTAGGACAAGGTGAGCATGCCTTGTCGGATGCTAAAGCCTGCAGAG
AACTAAAGCCTGGCTGGCCTAAAGCTTGTTTCAGAGAAGGCGCTGCACTTCGTTTGCTAC
AGCGATTTGATGAGGCAGCCAATGCATTTTACGAGGGAGTGTTGCTAAGCCCTGAAAGCA
AAGAGCTCATTGATGCGTTCAGAGAAGCTGTAGATGCTGGAAGGAAGTTTCACGGCAAGG
ACAAGATTAAGGACAAAGCATAAGATCTTCAAGAGATGGCTCTGTTTAGTATCTGTATGA
AGTTTTGATCTTGCTACTTAACCTGGCCTCTCCCTTTATGCAGTTGCTACCTTATCTTTT
ATTTACTTAAACTTTCTAAAAGCTTCAGGAACAAAGTTTAGTGTGTGGTCCG

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR4DI36TF 472 0 0
GCTACACACAAGCTATTGATTTTGACCCTACGGATCATACCTTCTTCTCAAACCGAAGCC
TCTGCTGGTTGCTGTTAGGACAAGGTGAGCATGCCTTGTCGGATGCTAAAGCCTGCAGAG
AACTAAAGCCTGGCTGGCCTAAAGCTTGTTTCAGAGAAGGCGCTGCACTTCGTTTGCTAC
AGCGATTTGATGAGGCAGCCAATGCATTTTACGAGGGAGTGTTGCTAAGCCCTGAAAGCA
AAGAGCTCATTGATGCGTTCAGAGAAGCTGTAGATGCTGGAAGGAAGTTTCACGGCAAGG
ACAAGATTAAGGACAAAGCATAAGATCTTCAAGAGATGGCTCTGTTTAGTATCTGTATGA
AGTTTTGATCTTGCTACTTAACCTGGCCTCTCCCTTTATGCAGTTGCTACCTTATCTTTT
ATTTACTTAAACTTTCTAAAAGCTTCAGGAACAAAGTTTAGTGTGTGGTCCG

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL4666Contig1 651 2 3 U
TTTTTTTGTCAATGTATTATTCCATCACAGAATATTATACAACCATACACACGAACGTTA
AGGAACCACCATATACTGGTAGATGGTAATCATGATTTGAAAGATAAAAACACACACACA
CGTACGTCCGCTATGGACATGTTTTATTCATCTGCGTACATATATATTCATAATTAGTAA
GGCCAACGGCCCCTAACATTACCAGGAGGATCATAGCTGCAAATGATGAAAGTTCCACCA
CTGTTACACCTGACTTTGGCACATCCAACCCACACCGAGTTTCTCCACACAACTTGAGTA
TAGTGACCACATGCTTTTCCGGAACGACAAGTGTTCGAACTGTAGAAGTAGTCGTTCTTC
TCGTTGACCCACAACCTCACTGCGTCAGCTCCAGACAGATCACCAGTGCTTCCTGCCAAG
TTTTCGCCGTAACGCCCGCCTGAGTGAGTGAGACGACAGTCCCCTCGCCTTTGCAGAGCA
TATTGTCGGGCGTATTCCGCCACATCCGCATGCCATCGTATCGGGCCCACACCAACAGCG
GCACGAGCACGGTTGTGCACATCGAGGTAATCTTGTTGCCTGTCTTGGGCTTTGAGAGGA
ACTGCAAAAGCTAGGACAAGTGCTATAGTCACGAAAACTAGAGTTTGAGAA


BQ
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AF RR4CD81JQ U 9
AF RR4CD81TF C 1
BS 1 8 RR4CD81TF
BS 9 476 RR4CD81JQ
BS 477 651 RR4CD81TF

RD RR4CD81JQ 468 0 0
TCAATGTATTATTCCATCACAGAATATTATACAACCATACACACGAACGTTAAGGAACCA
CCATATACTGGTAGATGGTAATCATGATTTGAAAGATAAAAACACACACACACGTACGTC
CGCTATGGACATGTTTTATTCATCTGCGTACATATATATTCATAATTAGTAAGGCCAACG
GCCCCTAACATTACCAGGAGGATCATAGCTGCAAATGATGAAAGTTCCACCACTGTTACA
CCTGACTTTGGCACATCCAACCCACACCGAGTTTCTCCACACAACTTGAGTATAGTGACC
ACATGCTTTTCCGGAACGACAAGTGTTCGAACTGTAGAAGTAGTCGTTCTTCTCGTTGAC
CCACAACCTCACTGCGTCAGCTCCAGACAGATCACCAGTGCTTCCTGCCAAGTTTTCGCC
GTAACGCCCGCCTGAGTGAGTGAGACGACAGTCCCCTCGCCTTTGCAG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4CD81TF 651 0 0
TTTTTTTGTCAATGTATTATTCCATCACAGAATATTATACAACCATACACACGAACGTTA
AGGAACCACCATATACTGGTAGATGGTAATCATGATTTGAAAGATAAAAACACACACACA
CGTACGTCCGCTATGGACATGTTTTATTCATCTGCGTACATATATATTCATAATTAGTAA
GGCCAACGGCCCCTAACATTACCAGGAGGATCATAGCTGCAAATGATGAAAGTTCCACCA
CTGTTACACCTGACTTTGGCACATCCAACCCACACCGAGTTTCTCCACACAACTTGAGTA
TAGTGACCACATGCTTTTCCGGAACGACAAGTGTTCGAACTGTAGAAGTAGTCGTTCTTC
TCGTTGACCCACAACCTCACTGCGTCAGCTCCAGACAGATCACCAGTGCTTCCTGCCAAG
TTTTCGCCGTAACGCCCGCCTGAGTGAGTGAGACGACAGTCCCCTCGCCTTTGCAGAGCA
TATTGTCGGGCGTATTCCGCCACATCCGCATGCCATCGTATCGGGCCCACACCAACAGCG
GCACGAGCACGGTTGTGCACATCGAGGTAATCTTGTTGCCTGTCTTGGGCTTTGAGAGGA
ACTGCAAAAGCTAGGACAAGTGCTATAGTCACGAAAACTAGAGTTTGAGAA

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL4667Contig1 1173 2 4 U
GTACGTTGTTCACCTGGATCTTGAATCCCCCGTTGATGAGAGACTAGACCTGCTTCTCGG
ATTAATAAGGATCCTATGTATACTAGAACCGGGAATGTCTTTATGACCACCAAGGCTAAT
CTTGTCACGTATAGAGGACCCACCATGGTGGCCAACACACTTCACGCCTGTGCTGTTTTG
CTTAAGAGAAGCGCTAACTGGGATTGGTTTATTAATCTTAGTGCTTCAGATTATCCCCTG
GTGACCCAAGATGATCTGCTTCATACATTTTCGACTCTGTACCGGAACCTCAACTTTATC
GAACACACAAGCGATCTTGGTTGGAAAGAGGAGAAGCGAGCAATGCCAGTAATGATTGAT
CCTGGACTGTACATGTTGAACAAATCAGATATATACTGGGTCACACCTCGTCGAAGTTTG
CCAACTGCGTTTAAACTATTCACCGGATCTGCTTGGATGGCTCTATCACGTCCCTTTGTA
GAGTACTGCATATGGGGATGGGACAACTTACCACGAACCCTCCTAATGTACTACACCAAC
TTCGTCTCATCGCCCGAAGGTTACTTCCAAACCGTGATCTGCAACGTCCCCGAGTTCTCG
AAAACCCCGCTCAACCATGACCTCCACTACATCTCCTGGGACACTCCCCCGCAGCAGCAC
CCTCACGTGCTGTCGCTCAACGACACGTCTCAGATGATATCCAGCGGTGCTGCCTTCGCT
AGGAAGTTCAAAAGAGACGACCAAGTGCTTGACATGATAGATAAGGAGCTGCTGGGAAGG
AGGAACGGTGAAGATGGGTTTACTCCTGGTGGGTGGTGCGGTGGGAAAAAACCGAAATGC
TCCCAGGTCGGTGATGTGGCTAACGTTAAGCCTGGTGCTGGAGCTCAGAGGCTTCAGGGA
CTTGTGGACAGGTTAGTCAACGAGGCTAAAACAGGACTTAATCAGTGTAAATAGATCCGA
GGGGGCTGAGGGAATCGAGAGTGGGACTGTTTCTTACGATATATAATTATATATATACAT
ATAGGGTTCCAGAGAATCTTTAGTTCGGTTTAGAAAAAGACTATTTAGACATTGTTTTTT
GATTGTTGAGTAGATGGATGCCTTGTATACCACGACAACTTACTAGTCTCATATTGGAGA
TTAGTTTTTCCATTGTTTGAAGCCATTTTTCAC


BQ
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AF RR4D176TF U 1
AF RR4D176JQ C 578
BS 1 732 RR4D176TF
BS 733 733 RR4D176JQ
BS 734 761 RR4D176TF
BS 762 1173 RR4D176JQ

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CTTGTCACGTATAGAGGACCCACCATGGTGGCCAACACACTTCACGCCTGTGCTGTTTTG
CTTAAGAGAAGCGCTAACTGGGATTGGTTTATTAATCTTAGTGCTTCAGATTATCCCCTG
GTGACCCAAGATGATCTGCTTCATACATTTTCGACTCTGTACCGGAACCTCAACTTTATC
GAACACACAAGCGATCTTGGTTGGAAAGAGGAGAAGCGAGCAATGCCAGTAATGATTGAT
CCTGGACTGTACATGTTGAACAAATCAGATATATACTGGGTCACACCTCGTCGAAGTTTG
CCAACTGCGTTTAAACTATTCACCGGATCTGCTTGGATGGCTCTATCACGTCCCTTTGTA
GAGTACTGCATATGGGGATGGGACAACTTACCACGAACCCTCCTAATGTACTACACCAAC
TTCGTCTCATCGCCCGAAGGTTACTTCCAAACCGTGATCTGCAACGTCCCCGAGTTCTCG
AAAACCCCGCTCAACCATGACCTCCACTACATCTCCTGGGACACTCCCCCGCAGCAGCAC
CCTCACGTGCTGTCGCTCAACGACACGTCTCAGATGATATCCAGCGGTGCTGCCTTCGCT
AGGAAGTTCAAA*GAGACGACCAAGTGCTTGACATGATAGA
AAGAGCTGCTGGGA

QA 1 761 1 761
DS 

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GGGACACTCCCCCGCAGCAGCACCCTCACGTGCTGTCGCTCAACGACACGTCTCAGATGA
TATCCAGCGGTGCTGCCTTCGCTAGGAAGTTCAAAAGAGACGACCAAGTGCTTGACATGA
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GCGGTGGGAAAAAACCGAAATGCTCCCAGGTCGGTGATGTGGCTAACGTTAAGCCTGGTG
CTGGAGCTCAGAGGCTTCAGGGACTTGTGGACAGGTTAGTCAACGAGGCTAAAACAGGAC
TTAATCAGTGTAAATAGATCCGAGGGGGCTGAGGGAATCGAGAGTGGGACTGTTTCTTAC
GATATATAATTATATATATACATATAGGGTTCCAGAGAATCTTTAGTTCGGTTTAGAAAA
AGACTATTTAGACATTGTTTTTTGATTGTTGAGTAGATGGATGCCTTGTATACCACGACA
ACTTACTAGTCTCATATTGGAGATTAGTTTTTCCATTGTTTGAAGCCATTTTTCAC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL4668Contig1 1050 2 2 U
GAGTGGCAAACGGTCGCGGACAGGCTTGTCGATGAGCTGTTCATCCGAGTGATATTCAAC
GTAGCTGCAAGTAACGGTAGCAAGACTACTACGACGTCGTATAACTCTGTGTTTCTTGGC
GGCAAAGGCATGCTGATGAAAGTTATGAACAAGAGCTTCCCGGAGCTAGGTCTAACGCCG
AAAGATTGTACGGAGATGAGCTGGCTTGAGTCCATTGTTTACATCTCTGGATTCGCGACC
CGCACTCCTACTAAGGTTCTGCTTCAAGGGAAGTCTCCTTTCCCGGAGAACAACTTCAAA
GCCAAATCAGACTTCGTGAAGAAGCCTATTCCAGAGTCGGGGCTTAAAGGGATGTTCAAG
AAGTTGCTTAAAGAAGATAATCCGATGATGATATGGAATCCTTACGGAAGAATGATGGCG
AAGATCCCTGAATCGCAGATACCATTTCCGCATAGAAAGGGAGTCATCTTCAAGATTCAG
TACGTAACGAACTGGCCAGACAGCGACAGGAGAATGAGCAAGCACATCAACTGGATCTGA
GATCTCTACAGTTTCATGACTCCTTATGTCTCTGCGAATCCACGACAAGCGTACGTGAAC
TACCGTGATCTAGACCTGGGACAGAACAGAAAGAACTATGAGTCGAGCATCAACCAAGCT
CGAGGCTGGGGAGCTAGTTACTTCAAAGGAAATTTCGAGAGGTTGGTGAAGATTAAAACA
AAGGTTGATCCTAACAATTTCTTCAGACATGAACAGAGTATCCCACCTATGCTGGTTCGA
AACTGAAGCTCAAGAATATCAAATTAGAATAAAGTAGAAGAGATCAGATGATGGTTCTTC
TATATTTCAGATAAAATGTTTTAGCTAATAATATTAAGGCAAGCATGTAGTGTACTTTGT
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CCCAGTTCCTTGATCAACATTACTACTCTAGAATTGTAATCGAAAGCTTGTTCTCGTTCT
CAAATTGTTAAAGTTTGGTTCTAGTGGACT


BQ
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AF RR4AR39TF U 1
AF RR4AR39JQ C 253
BS 1 719 RR4AR39TF
BS 720 1050 RR4AR39JQ

RD RR4AR39TF 719 0 0
GAGTGGCAAACGGTCGCGGACAGGCTTGTCGATGAGCTGTTCATCCGAGTGATATTCAAC
GTAGCTGCAAGTAACGGTAGCAAGACTACTACGACGTCGTATAACTCTGTGTTTCTTGGC
GGCAAAGGCATGCTGATGAAAGTTATGAACAAGAGCTTCCCGGAGCTAGGTCTAACGCCG
AAAGATTGTACGGAGATGAGCTGGCTTGAGTCCATTGTTTACATCTCTGGATTCGCGACC
CGCACTCCTACTAAGGTTCTGCTTCAAGGGAAGTCTCCTTTCCCGGAGAACAACTTCAAA
GCCAAATCAGACTTCGTGAAGAAGCCTATTCCAGAGTCGGGGCTTAAAGGGATGTTCAAG
AAGTTGCTTAAAGAAGATAATCCGATGATGATATGGAATCCTTACGGAAGAATGATGGCG
AAGATCCCTGAATCGCAGATACCATTTCCGCATAGAAAGGGAGTCATCTTCAAGATTCAG
TACGTAACGAACTGGCCAGACAGCGACAGGAGAATGAGCAAGCACATCAACTGGATCTGA
GATCTCTACAGTTTCATGACTCCTTATGTCTCTGCGAATCCACGACAAGCGTACGTGAAC
TACCGTGATCTAGACCTGGGACAGAACAGAAAGAACTATGAGTCGAGCATCAACCAAGCT
CGAGGCTGGGGAGCTAGTTACTTCAAAGGAAATTTCGAGAGGTTGGTGAAGATTAAAAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4AR39JQ 798 0 0
AAGGTTCTGCTTCAAGGGAAGTCTCCTTTCCCGGAGAACAACTTCAAAGCCAAATCAGAC
TTCGTGAAGAAGCCTATTCCAGAGTCGGGGCTTAAAGGGATGTTCAAGAAGTTGCTTAAA
GAAGATAATCCGATGATGATATGGAATCCTTACGGAAGAATGATGGCGAAGATCCCTGAA
TCGCAGATACCATTTCCGCATAGAAAGGGAGTCATCTTCAAGATTCAGTACGTAACGAAC
TGGCCAGACAGCGACAGGAGAATGAGCAAGCACATCAACTGGATCTGAGATCTCTACAGT
TTCATGACTCCTTATGTCTCTGCGAATCCACGACAAGCGTACGTGAACTACCGTGATCTA
GACCTGGGACAGAACAGAAAGAACTATGAGTCGAGCATCAACCAAGCTCGAGGCTGGGGA
GCTAGTTACTTCAAAGGAAATTTCGAGAGGTTGGTGAAGATTAAAACAAAGGTTGATCCT
AACAATTTCTTCAGACATGAACAGAGTATCCCACCTATGCTGGTTCGAAACTGAAGCTCA
AGAATATCAAATTAGAATAAAGTAGAAGAGATCAGATGATGGTTCTTCTATATTTCAGAT
AAAATGTTTTAGCTAATAATATTAAGGCAAGCATGTAGTGTACTTTGTTTTAACCTAAAA
TTCGAAGCGTTGCTTCTTATGAGTCAGACAAGTTGTTTTTAATTAGTTCCCAGTTCCTTG
ATCAACATTACTACTCTAGAATTGTAATCGAAAGCTTGTTCTCGTTCTCAAATTGTTAAA
GTTTGGTTCTAGTGGACT

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL4669Contig1 917 2 16 U
GACGACAGCTTCCATCTTTTGTTTTCCCAATTGGATACAGAAGGCCGCGGCCTTCTAGGC
ACCAAAATCAACCGGGTGGAAAATCTGGTGAAGATGGTACAGTTTCTAATTCTGTGGTGG
AGAGGCAAGTGAAGAGAAAGAACGATAATGAAATGATGGATGCTCGGCCAGAGAAACCTG
AGAAGCGCGCATCTCTCAGTCCCCACAGTTTAGACATTGTTTCTCCTGACAACAGTGCTA
TCACTACTGGTTGTACTCCTCCTGTATGTGACCTTGGAAGATCTCCTGGTGAGGGAATTG
AGGCTGCAAATTTGAACACTGAGAGTGCTGAACTCGCAAACTTTGCTCGAGATGAGTGTA
ACTCTGGCAGCGAGCAGGCTCTGGAAGTAGATAGTATGGCTCTCGTTCAGGAATGCTCTG
ATCCGGCTGAGGCTTATGGAAAGTGTGTGACACCTGATTCTAGTGATGTGGTAGCAACTG
AAAGTGGTCAGGAGGAAAACTTAGATCGTGATTTGATGTCTGTATCGATCAGTGTTGTCG
ATGAAGCTGAGAGGGAATCAAAGTCTTGTGGTGGTACGCGGATAACTGGGGAAATTGCGG
ATGGTAGCAGATCTTCTGCGCAGAACCGTGATTACGAGGGATTCGAGTTTCCTGCTACAA
AGTCGGATCCTTTTGCGGGAAAGGGAAACTTGTACTCTCAAAGTGGCATACCTGAAGACC
TTCAGTCAAAGTCATTGGTCGGCGGGATGGAGAAGGCAGAAGACGGAGCTAGCAGCAGCA
GGTTGAGCTTAAAGTCCACTGTGTGAACGTCCTTTAGGCTATTGACGTGATGACCAAGAC
TGAAAGATCAACTCAAAATGTTGCGGTGGACAGACGACAGAGCGCATAACCTTTTTGGTA
AGTTAAATTTTTATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GL63TF U 1
AF RR4GL63JQ C 279
BS 1 665 RR4GL63TF
BS 666 666 RR4GL63JQ
BS 667 687 RR4GL63TF
BS 688 688 RR4GL63JQ
BS 689 719 RR4GL63TF
BS 720 720 RR4GL63JQ
BS 721 729 RR4GL63TF
BS 730 730 RR4GL63JQ
BS 731 741 RR4GL63TF
BS 742 742 RR4GL63JQ
BS 743 756 RR4GL63TF
BS 757 757 RR4GL63JQ
BS 758 765 RR4GL63TF
BS 766 766 RR4GL63JQ
BS 767 777 RR4GL63TF
BS 778 917 RR4GL63JQ

RD RR4GL63TF 777 0 0
GACGACAGCTTCCATCTTTTGTTTTCCCAATTGGATACAGAAGGCCGCGGCCTTCTAGGC
ACCAAAATCAACCGGGTGGAAAATCTGGTGAAGATGGTACAGTTTCTAATTCTGTGGTGG
AGAGGCAAGTGAAGAGAAAGAACGATAATGAAATGATGGATGCTCGGCCAGAGAAACCTG
AGAAGCGCGCATCTCTCAGTCCCCACAGTTTAGACATTGTTTCTCCTGACAACAGTGCTA
TCACTACTGGTTGTACTCCTCCTGTATGTGACCTTGGAAGATCTCCTGGTGAGGGAATTG
AGGCTGCAAATTTGAACACTGAGAGTGCTGAACTCGCAAACTTTGCTCGAGATGAGTGTA
ACTCTGGCAGCGAGCAGGCTCTGGAAGTAGATAGTATGGCTCTCGTTCAGGAATGCTCTG
ATCCGGCTGAGGCTTATGGAAAGTGTGTGACACCTGATTCTAGTGATGTGGTAGCAACTG
AAAGTGGTCAGGAGGAAAACTTAGATCGTGATTTGATGTCTGTATCGATCAGTGTTGTCG
ATGAAGCTGAGAGGGAATCAAAGTCTTGTGGTGGTACGCGGATAACTGGGGAAATTGCGG
ATGGTAGCAGATCTTCTGCGCAGAACCGTGATTACGAGGGATTCGAGTTTCCTGCTACAA
AGTCG*ATCCTTTTGCGGGAAAGGGAA*CTTGTACTCTCAAAGTGGCATACCTGAAGAC*
TTCAGTCAA*GTCATTGGTCG*CGGGATGGAGAAGG*AGAAGACG*AGCTAGCAGCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4GL63JQ 639 0 0
AGATCTCCTGGTGAGGGAATTGAGGCTGCAAATTTGAACACTGAGAGTGCTGAACTCGCA
AACTTTGCTCGAGATGAGTGTAACTCTGGCAGCGAGCAGGCTCTGGAAGTAGATAGTATG
GCTCTCGTTCAGGAATGCTCTGATCCGGCTGAGGCTTATGGAAAGTGTGTGACACCTGAT
TCTAGTGATGTGGTAGCAACTGAAAGTGGTCAGGAGGAAAACTTAGATCGTGATTTGATG
TCTGTATCGATCAGTGTTGTCGATGAAGCTGAGAGGGAATCAAAGTCTTGTGGTGGTACG
CGGATAACTGGGGAAATTGCGGATGGTAGCAGATCTTCTGCGCAGAACCGTGATTACGAG
GGATTCGAGTTTCCTGCTACAAAGTCGGATCCTTTTGCGGGAAAGGGAAACTTGTACTCT
CAAAGTGGCATACCTGAAGACCTTCAGTCAAAGTCATTGGTCGGCGGGATGGAGAAGGCA
GAAGACGGAGCTAGCAGCAGCAGGTTGAGCTTAAAGTCCACTGTGTGAACGTCCTTTAGG
CTATTGACGTGATGACCAAGACTGAAAGATCAACTCAAAATGTTGCGGTGGACAGACGAC
AGAGCGCATAACCTTTTTGGTAAGTTAAATTTTTATGAG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL4670Contig1 1278 2 2 U
GGAATCTTCAGACGAGGAAGTTGCTGCTACCAAGAAGCCTGCCGCAGTTGCTAAAAATGG
CTCAGTGAAGGCTAAGGCAGAGAGCTCCTCTGAGGAAGACTCTTCTGATGAATCAGAAGA
TGAATCTGAGGATGAGAAGAAACCTGCTGCTAAGAAGGCAGCTCCTGCTACCAGCAAGGC
TGCTGACGGTTCAGATTCATCCGAGGAAGATTCTGATGAGGAAAGTGAAGATGAATCGGA
GAGTGAAGATGAGAAAGAAACCCCGAAGAAAAAGAACTCTGATGTTGAAATGGGTGATGC
TGAGCAGAAACAGCCTAAGACCCCATCGACTCCTGCTACAGGAGGATCAAAGACACTCTT
TGTTGCCAATCTCTCATTCAACGTTGAGAGAGCAGATGTTGAGAATTTCTTCAAAGATGT
TGGCGAAGTTGTTGATGTTAGATTTGCCACGTCAAGAGATGATGGCAGTTTCAGAGGTTT
TGGCCATGTTGAGTTTACAACTGCTGAACAAGCACAGAAGGCACTGGAGCTTCACGGTAC
ATCCATGCTTGGTCGTGATATCTGTCTTGATGTTGCTCAAGAGAGGGGAGAGAGAACCGC
ATACACTCCACAGAGCGGTGCCGGTGGAAACTTCAAAAGCGGTGGTGGAGGTCAATCTAT
TTTCGTTAAGGGATTTGACTCTTCTCTTCCTGAAGAAGACATCAAGAGCGCATTGACTAA
ACACTTTTCTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTTTCTGTTCCCTGTGACCGTGAAACCGG
ATCTTCCAAAGGAATTGCTTTCCTTGATTTTCAAGAAGGCGCAGACAAGGCGTTGGACCT
TAATGGTAGTGACATGGGAGGATGGAGTCTTGTTGTTGATCAACCGAGGGAGAAGACTAG
TGGTGGATTCAGTGGTGGCGGAAGGAGCGGTGGTAGAGGAAGAGATAGTGGTGGTCGTTT
CGGTGGAAGGAGCGGTGGTGGTAGAGGAAGAGATGGTGGCCGTGGTCGTTTTGGTGGTGG
AAGGGGCGGTGGCAGAGGAAGAGATGGAGGTCGTGGATACAAACCTAGTTTCACTCACTC
ATCAGGTAAGAAGACTACCTTTAACGACGAGTAGAAGCTTTATATGTAGAAGAAAATGCT
CTTCTTATGTCCCTTAACTTATGATACTTCACATCTCCTTTCTATTGTTTCAGTTTTGTT
TCTGTTCTACTTATGTTTTTGTCTGAACCTTCAATTTTTGTCTCAATGTTAAATCAAAGC
TCAATCTTGAGTTCTCTT


BQ
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AF RR4A417TF U 1
AF RR4A417JQ C 683
BS 1 746 RR4A417TF
BS 747 1278 RR4A417JQ

RD RR4A417TF 746 0 0
GGAATCTTCAGACGAGGAAGTTGCTGCTACCAAGAAGCCTGCCGCAGTTGCTAAAAATGG
CTCAGTGAAGGCTAAGGCAGAGAGCTCCTCTGAGGAAGACTCTTCTGATGAATCAGAAGA
TGAATCTGAGGATGAGAAGAAACCTGCTGCTAAGAAGGCAGCTCCTGCTACCAGCAAGGC
TGCTGACGGTTCAGATTCATCCGAGGAAGATTCTGATGAGGAAAGTGAAGATGAATCGGA
GAGTGAAGATGAGAAAGAAACCCCGAAGAAAAAGAACTCTGATGTTGAAATGGGTGATGC
TGAGCAGAAACAGCCTAAGACCCCATCGACTCCTGCTACAGGAGGATCAAAGACACTCTT
TGTTGCCAATCTCTCATTCAACGTTGAGAGAGCAGATGTTGAGAATTTCTTCAAAGATGT
TGGCGAAGTTGTTGATGTTAGATTTGCCACGTCAAGAGATGATGGCAGTTTCAGAGGTTT
TGGCCATGTTGAGTTTACAACTGCTGAACAAGCACAGAAGGCACTGGAGCTTCACGGTAC
ATCCATGCTTGGTCGTGATATCTGTCTTGATGTTGCTCAAGAGAGGGGAGAGAGAACCGC
ATACACTCCACAGAGCGGTGCCGGTGGAAACTTCAAAAGCGGTGGTGGAGGTCAATCTAT
TTTCGTTAAGGGATTTGACTCTTCTCTTCCTGAAGAAGACATCAAGAGCGCATTGACTAA
ACACTTTTCTTCATGTGGAGAGATCA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4A417JQ 596 0 0
TCTCTTCCTGAAGAAGACATCAAGAGCGCATTGACTAAACACTTTTCTTCATGTGGAGAG
ATCACAAGGGTTTCTGTTCCCTGTGACCGTGAAACCGGATCTTCCAAAGGAATTGCTTTC
CTTGATTTTCAAGAAGGCGCAGACAAGGCGTTGGACCTTAATGGTAGTGACATGGGAGGA
TGGAGTCTTGTTGTTGATCAACCGAGGGAGAAGACTAGTGGTGGATTCAGTGGTGGCGGA
AGGAGCGGTGGTAGAGGAAGAGATAGTGGTGGTCGTTTCGGTGGAAGGAGCGGTGGTGGT
AGAGGAAGAGATGGTGGCCGTGGTCGTTTTGGTGGTGGAAGGGGCGGTGGCAGAGGAAGA
GATGGAGGTCGTGGATACAAACCTAGTTTCACTCACTCATCAGGTAAGAAGACTACCTTT
AACGACGAGTAGAAGCTTTATATGTAGAAGAAAATGCTCTTCTTATGTCCCTTAACTTAT
GATACTTCACATCTCCTTTCTATTGTTTCAGTTTTGTTTCTGTTCTACTTATGTTTTTGT
CTGAACCTTCAATTTTTGTCTCAATGTTAAATCAAAGCTCAATCTTGAGTTCTCTT

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL4671Contig1 420 2 1 U
GGAAGAGAGATGGGGAAGCAGCCGGTGAAGTTGAAGGCGGTGGTATACGCGCTTTCGCCG
TTCCAGCAGAAGATAATGACCGGACTCTGGAAGGATCTCCCCGAGAAGATTCACCACAAG
GTCTCCGAGAATTGGATCAGCGCCACTCTTCTCCTCACTCCTGTCCTCGGAACCTACTGG
TATGCTCAGCACTTCCAGGAACAGGAGAAACTCGAGCACAGGTTCTGAAACATGAAGCCT
GCTCCCTCCTCTACTACAACTATTTGAGACTTCGGTCGGAAGCCAAACTCTCTTAATAGA
ATTTTTGATTCAGTTATTTTCTGAAACTGGCTAATTTTCGAAATGTTTTGGTTCATGACA
ATCACTATTGGTTGAAATGTATCTTTCTTGATATAATATCACATGGACAACGTTTGCTCC


BQ
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AF RR4D525JQ C 1
AF RR4D525TF U 1
BS 1 420 RR4D525TF

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TATGCTCAGCACTTCCAGGAACAGGAGAAACTCGAGCACAGGTTCTGAAACATGAAGCCT
GCTCCCTCCTCTACTACAACTATTTGAGACTTCGGTCGGAAGCCAAACTCTCTTAATAGA
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QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4D525TF 420 0 0
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GTCTCCGAGAATTGGATCAGCGCCACTCTTCTCCTCACTCCTGTCCTCGGAACCTACTGG
TATGCTCAGCACTTCCAGGAACAGGAGAAACTCGAGCACAGGTTCTGAAACATGAAGCCT
GCTCCCTCCTCTACTACAACTATTTGAGACTTCGGTCGGAAGCCAAACTCTCTTAATAGA
ATTTTTGATTCAGTTATTTTCTGAAACTGGCTAATTTTCGAAATGTTTTGGTTCATGACA
ATCACTATTGGTTGAAATGTATCTTTCTTGATATAATATCACATGGACAACGTTTGCTCC

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 2

CO CL4672Contig1 582 2 1 U
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TCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGCGAAGCTGGATTTCCAAGTACCGAGTG
AAGCAGAAGTGAAGTCTTACACACTGTACTTCATGTGTGACTCTTACTTGGGTTGTGACC
AAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAGATCCGATGGAAGAGT
GATCTTGTGTTTCAGGCGTGCTGGATCCTGGAGAAGAGCATTCTCACTTTTATGTAATAT
ATGCCGTCTTTGAGTTTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTGTTCCTTTTTTTTTGTTT
TGTCTGGACCAAAATCGAAACAGTAGACGTGCCGTAAACTTGTTTTGAGTTCTGTTACTC
GAAAACGAATAATAATGAAATGCAGCAAGTTTTAGTAAGGAC


BQ
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AF RR4AE80JQ C 1
AF RR4AE80TF U 1
BS 1 582 RR4AE80TF

RD RR4AE80JQ 582 0 0
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CCAAAGAAGAAGGTTGGTGGCTGGTTGTGGGGGACACCAAGACGAACCAGTTGGTGGCCA
TCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGCGAAGCTGGATTTCCAAGTACCGAGTG
AAGCAGAAGTGAAGTCTTACACACTGTACTTCATGTGTGACTCTTACTTGGGTTGTGACC
AAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAGATCCGATGGAAGAGT
GATCTTGTGTTTCAGGCGTGCTGGATCCTGGAGAAGAGCATTCTCACTTTTATGTAATAT
ATGCCGTCTTTGAGTTTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTGTTCCTTTTTTTTTGTTT
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GAAAACGAATAATAATGAAATGCAGCAAGTTTTAGTAAGGAC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4AE80TF 582 0 0
GGGTTGTGGGCAGTGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTGACATTGCAGGTGATGCTTG
AGAGAGACATGGAGGGGAGGACTGAAGTGGGAGCCGTAGATGCACCTAGGTATCCCAAGA
CCAAAGAAGAAGGTTGGTGGCTGGTTGTGGGGGACACCAAGACGAACCAGTTGGTGGCCA
TCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGCGAAGCTGGATTTCCAAGTACCGAGTG
AAGCAGAAGTGAAGTCTTACACACTGTACTTCATGTGTGACTCTTACTTGGGTTGTGACC
AAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAGATCCGATGGAAGAGT
GATCTTGTGTTTCAGGCGTGCTGGATCCTGGAGAAGAGCATTCTCACTTTTATGTAATAT
ATGCCGTCTTTGAGTTTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTGTTCCTTTTTTTTTGTTT
TGTCTGGACCAAAATCGAAACAGTAGACGTGCCGTAAACTTGTTTTGAGTTCTGTTACTC
GAAAACGAATAATAATGAAATGCAGCAAGTTTTAGTAAGGAC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4674Contig1 1136 2 6 U
GCTCGAGAAAAAGGCTCTTGCTTGCTACCAAGGTCCCATTGATGAGAAATATATACAGGG
TAATGAGTTCATAAAAATGCTTGTCCTTGATGGTTGTTTTGTTCTCGAGCTCTTCAAGGG
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GGGATTGATGCATTTGATTCAAAATGACATGTTAATGCTGGAAAATCAACTACCTATGTT
TGTTCTCGATCGATTAGCAGAACTACAGCTTTCTCTACCGAACGACACTATTTCAGTGGG
AAGGATAGCTGTTACTTTCTTTGATCTACTATTGCCATCAAGGGTGGTGTTGACCAAACC
GATCCAGTTAGAACGCACGACCTTGCTAAAAGAATGCGTGTTGAAATTACGAGGCAACAA
GGTCGACTTGCATTGTCTTGATGTTTTCCGTCGAAGTCTCCTTGGGGATAGTCAAACATT
AAATTCGACGTCGACTCAGGATATGAGCTCACGAACTGGCAGTGAACAATATCCGACGTC
CCAGGATTCAGTGAACCTGGTGGACAAGCGAAAACAACATCTTGTGCATTGTGTAACAGA
ATTACGGGAAGCTGGCGTTAAATTTAAGACAAGGGAAACTCATCTGTTTTGGGATATCCG
GTTCGAACAGGGTTGTGTAGAGATACCCAAACTACTAATCCATGACGGTACCAAGTCACT
CTTCTCGAACCTTATAGCTTTCGAACAGTGCCATATTGACTCCACCAACGACATAACGTC
ATACATAATTTTCATGGATAATCTAATAAACTCTTCTGAAGATGTTAGCCACTTGCATTA
TAGTGGTATCATCGAGCATTGGCTAGGGAGTGATGCTGAAGTTGCAGATTTATTCAACCA
GCTATGTCGGGAAGTGATTTTTGATCCCAAAGATAGTTATCTATCTCAACTGTCGGTTGA
GCTTAATAGTTATTATAAACGTAGATGGAATGCTTTGAAAGCTACTTTAAAACACAAGTA
CTTCAATAATCCTTGGGCATATTTTTCCTTTTTGCTGCAGTGGTTCTGCTTATCCTCACA
TTATGCCAAAGTTTTTATGCTGTTTATGCCTATTATAAGCCACCTCCTTAAGTTCC


BQ
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AF RR4F662TF U 1
AF RR4F662JQ C 495
BS 1 728 RR4F662TF
BS 729 729 RR4F662JQ
BS 730 744 RR4F662TF
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BS 746 762 RR4F662TF
BS 763 1136 RR4F662JQ

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TAATGAGTTCATAAAAATGCTTGTCCTTGATGGTTGTTTTGTTCTCGAGCTCTTCAAGGG
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GGGATTGATGCATTTGATTCAAAATGACATGTTAATGCTGGAAAATCAACTACCTATGTT
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AAGGATAGCTGTTACTTTCTTTGATCTACTATTGCCATCAAGGGTGGTGTTGACCAAACC
GATCCAGTTAGAACGCACGACCTTGCTAAAAGAATGCGTGTTGAAATTACGAGGCAACAA
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AAATTCGACGTCGACTCAGGATATGAGCTCACGAACTGGCAGTGAACAATATCCGACGTC
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ACAA

QA 1 762 1 762
DS 

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GCGTTAAATTTAAGACAAGGGAAACTCATCTGTTTTGGGATATCCGGTTCGAACAGGGTT
GTGTAGAGATACCCAAACTACTAATCCATGACGGTACCAAGTCACTCTTCTCGAACCTTA
TAGCTTTCGAACAGTGCCATATTGACTCCACCAACGACATAACGTCATACATAATTTTCA
TGGATAATCTAATAAACTCTTCTGAAGATGTTAGCCACTTGCATTATAGTGGTATCATCG
AGCATTGGCTAGGGAGTGATGCTGAAGTTGCAGATTTATTCAACCAGCTATGTCGGGAAG
TGATTTTTGATCCCAAAGATAGTTATCTATCTCAACTGTCGGTTGAGCTTAATAGTTATT
ATAAACGTAGATGGAATGCTTTGAAAGCTACTTTAAAACACAAGTACTTCAATAATCCTT
GGGCATATTTTTCCTTTTTGCTGCAGTGGTTCTGCTTATCCTCACATTATGCCAAAGTTT
TTATGCTGTTTATGCCTATTATAAGCCACCTCCTTAAGTTCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL4675Contig1 1102 2 2 U
GGCTCCGCTTTTCACAATCTATGAAGCTAAAGATTTCTCTCATCTCTTTATCTCCCCTTT
TGTTCAACGTATTATTCACATTAAACCCAGAAAGATGTGGACCTTTCTGTTTCTTTCATG
TCAGTCTATAACTAGGAGAAGGTTGAGAGCAGGATGGATCTTCATCTCCACTCCGCAAGC
TTTGTGCCCAACCTCTAACCCTCTCTTTCCAACCTCTTCTGGCGTCACGATCCCGTCCCG
GAATCCACTGCTCTGTTTCGGCCGGCGAGACTACGAAACGACTCCGTGGATGATGTCCCT
GACATATCATGGGGCTGCGAGATAGATTCAGTCCAAAACTTCACTCTCCAGTTCAGGCCC
CCTGCCGCAGAAAATGGCTCTCTACAGAGTCGACATCGGAGAGAGAGGACTCGAATAAGA
AGAATAAGCTGAAAAATAAAGAAAAAGAAACTCACCAGTGATTATGGCTGTTGTGGAACG
AGGGTCACAGTTCTACGTTACCTCATCGGCTGGAATCGATTACCTTCGCAGTGCAGTCGA
TGACAATTCTCACGGAGTAACCATGAACAAGAAGCCGTCTTGAATCGGATCATGCTCGAT
GATTTTCAGACAAGTACAAAGATTGAGGCTTTGGTATGTACTCTTAAATATTTATATTTA
CAGCTTATCTACACCCTGTTGCGTTTCTTTTGCATTTTGAGCCTCTTTCTTTGTTTAACG
ATTTTGTGATCGAGTCTGTTTGCAGAGGGAAGAAATAAGGCTCATGGTCGAAAGAGAGGG
GTCTGCAAAAGCAATAGCTTTCAACCAGTTCACATCATTTTTGGATCTGATCAACTACAC
CCTCGGGAAGTGTAGGTTTGGTTGAACCCAACTGGTGGGAAGCATGTCAATGGCAGCTAG
AGATGTTTATAGCAATAAATTCAAGGAAAATCCTAATTGCAAAGTTTTCTTGATGAGTTT
GAAAGCTGGAGGCGCTGCTCTCAGATTAAAAGTCTCTTCTATGTTTTGTGGTCTGATAGT
TTGACAGTTGTTTCCTATGTGACGTTGTACGTAGAATGTTATATGACTGTTTTTATATCC
AATCAGAGAATCTCATATTACT


BQ
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AF RR4E035TF U 1
AF RR4E035JQ C 340
BS 1 742 RR4E035TF
BS 743 1102 RR4E035JQ

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TCAGTCTATAACTAGGAGAAGGTTGAGAGCAGGATGGATCTTCATCTCCACTCCGCAAGC
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GACATATCATGGGGCTGCGAGATAGATTCAGTCCAAAACTTCACTCTCCAGTTCAGGCCC
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AGAATAAGCTGAAAAATAAAGAAAAAGAAACTCACCAGTGATTATGGCTGTTGTGGAACG
AGGGTCACAGTTCTACGTTACCTCATCGGCTGGAATCGATTACCTTCGCAGTGCAGTCGA
TGACAATTCTCACGGAGTAACCATGAACAAGAAGCCGTCTTGAATCGGATCATGCTCGAT
GATTTTCAGACAAGTACAAAGATTGAGGCTTTGGTATGTACTCTTAAATATTTATATTTA
CAGCTTATCTACACCCTGTTGCGTTTCTTTTGCATTTTGAGCCTCTTTCTTTGTTTAACG
ATTTTGTGATCGAGTCTGTTTG

QA 1 742 1 742
DS 

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TTCACTCTCCAGTTCAGGCCCC*TGCCGCAGAAAATGGCTCTCTACAGAGTCGACATCGG
AGAGAGAGGACTCGAATAAGAAGAATAAGCTGAAAAATAAAGAAAAAGAAACTCACCAGT
GATTATGGCTGTTGTGGAACGAGGGTCACAGTTCTACGTTACCTCATCGGCTGGAATCGA
TTACCTTCGCAGTGCAGTCGATGACAATTCTCACGGAGTAACCATGAACAAGAAGCCGTC
TTGAATCGGATCATGCTCGATGATTTTCAGACAAGTACAAAGATTGAGGCTTTGGTATGT
ACTCTTAAATATTTATATTTACAGCTTATCTACACCCTGTTGCGTTTCTTTTGCATTTTG
AGCCTCTTTCTTTGTTTAACGATTTTGTGATCGAGTCTGTTTGCAGAGGGAAGAAATAAG
GCTCATGGTCGAAAGAGAGGGGTCTGCAAAAGCAATAGCTTTCAACCAGTTCACATCATT
TTTGGATCTGATCAACTACACCCTCGGGAAGTGTAGGTTTGGTTGAACCCAACTGGTGGG
AAGCATGTCAATGGCAGCTAGAGATGTTTATAGCAATAAATTCAAGGAAAATCCTAATTG
CAAAGTTTTCTTGATGAGTTTGAAAGCTGGAGGCGCTGCTCTCAGATTAAAAGTCTCTTC
TATGTTTTGTGGTCTGATAGTTTGACAGTTGTTTCCTATGTGACGTTGTACGTAGAATGT
TATATGACTGTTTTTATATCCAATCAGAGAATCTCATATTACT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4676Contig1 855 2 4 U
GGAAAAATAAAAATAGCAAATCTCTAAAACTGAATCGGATTCAGCAGAGCAGAGCAGCAC
ACACTCTCACACATCTTGTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
ATGGGGTTACAAGGTCAACTCTCCGATGTTTCATCAGATTCAATCCCTCTGATGCTCGTC
GCTCTCCTCGCTACTCTTTTCAAACACGTTCGCTCCTTCTTTCTCCGCTTCTCAGCCTCT
AATCCTCATATCACCGACGACGACGACCATGCTACTTCCGTTACTTCAGGACTCGTGAAC
CTCGCCGTGCTAGCCGACCAGCTCAAACTCAACAGACTCTTCTCCTACAGCTACGTTGAC
AACGCCGCGTCAGACTGCATCGTGTGTTTGTCTACGCTAAAGACCGGAGAAGAAGTGAGG
AAGCTGGATTGTAGACACGTGTTCCACAAGCACTGTTTGGAAGGTTGGTTACAACATCTC
AATTTCAGTTGCCCGCTTTGTAGATCTACGTTGCTTGCACATGGACATGGAGAAGGTGAA
CCGATCTCTCTTCACTCAGCAGCCACTGCTTCTCATTGAATTTTCTCTTTATGACACAAA
AAGAAAGGAAAGGAAAGAGAGAAGAAGAGTTTGGGGGTGTGTTTTTGATCTCGTTGCTTT
CTCCTCTTTTCTTTTGGGTAATTATTTCTTCAAAAAGGGGAATTCTCGAAATTCACTTCT
TTATTTTCGTTTCTTTTTTTTTTTTGAGGAAATTTCGGACAGGTGTTGATGTAAATCTTT
AGTATATGAGAAGTGTTTTTTTGTGTTTAGATTTGTGTCTTGTTCAGATTTATAAAAATT
TGAAGCTAATTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED14TF U 1
AF RR4ED14JQ C 232
BS 1 674 RR4ED14TF
BS 675 675 RR4ED14JQ
BS 676 692 RR4ED14TF
BS 693 855 RR4ED14JQ

RD RR4ED14TF 692 0 0
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ATGGGGTTACAAGGTCAACTCTCCGATGTTTCATCAGATTCAATCCCTCTGATGCTCGTC
GCTCTCCTCGCTACTCTTTTCAAACACGTTCGCTCCTTCTTTCTCCGCTTCTCAGCCTCT
AATCCTCATATCACCGACGACGACGACCATGCTACTTCCGTTACTTCAGGACTCGTGAAC
CTCGCCGTGCTAGCCGACCAGCTCAAACTCAACAGACTCTTCTCCTACAGCTACGTTGAC
AACGCCGCGTCAGACTGCATCGTGTGTTTGTCTACGCTAAAGACCGGAGAAGAAGTGAGG
AAGCTGGATTGTAGACACGTGTTCCACAAGCACTGTTTGGAAGGTTGGTTACAACATCTC
AATTTCAGTTGCCCGCTTTGTAGATCTACGTTGCTTGCACATGGACATGGAGAAGGTGAA
CCGATCTCTCTTCACTCAGCAGCCACTGCTTCTCATTGAATTTTCTCTTTATGACACAAA
AAGAAAGGAAAGGAAAGAGAGAAGAAGAGTTTGGGGGTGTGTTTTTGATCTCGTTGCTTT
CTCCTCTTTTCTTT*GGGTAATTATTTCTTCA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4ED14JQ 624 0 0
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CTCGTGAACCTCGCCGTGCTAGCCGACCAGCTCAAACTCAACAGACTTTTCTCCTACAGC
TACGTTGACAACGCCGCGTCAGACTGCATCGTGTGTTTGTTTACGCTAAAGACCGGAGAA
GAAGTGAGGAAGCTGGATTGTAGACACGTGTTCCACAAGCACTGTTTGGAAGGTTGGTTA
CAACATTTCAATTTCAGTTGCCCGCTTTGTAGATTTACGTTGCTTGCACATGGACATGGA
GAAGGTGAACCGATCTCTTTTCACTCAGCAGCCACTGCTTTTCATTGAATTTTTTTTTTA
TGACACAAAAAGAAAGGAAAGGAAAGAGAGAAGAAGAGTTTGGGGGTGTGTTTTTGATCT
CGTTGCTTTCTCCTCTTTTCTTTTGGGTAATTATTTTTTCAAAAAGGGGAATTCTCGAAA
TTCACTTCTTTATTTTCGTTTCTTTTTTTTTTTTGAGGAAATTTCGGACAGGTGTTGATG
TAAATCTTTAGTATATGAGAAGTGTTTTTTTGTGTTTAGATTTGTGTCTTGTTCAGATTT
ATAAAAATTTGAAGCTAATTTGTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL4677Contig1 468 2 1 U
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TTGTGGATGAAGAAAACGACGGGTTCAAAACACCGACCCGTCCGGAAAATAGAATCCCTG
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GAGGTAACACAATGTGGTGCCGTAGACGGTTGGGTTTCTCGCCGGAAAATGCCGTCGGCT
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GTATCTTGTTTTAAGAGTTCGCCTCTCTCAAATATAGGTTTCTGTTTC


BQ
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AF RR4F340JQ C 1
AF RR4F340TF U 1
BS 1 468 RR4F340TF

RD RR4F340JQ 468 0 0
GTAATCATGTGTTGGATATTTGTCGGAAAAGAAAGAGATCAGATGAAGTAGAAGAAGAAC
TTGTGGATGAAGAAAACGACGGGTTCAAAACACCGACCCGTCCGGAAAATAGAATCCCTG
AGGTCAGAGTGTGCCCACCGGCGCCGAGGAAAGGCGAAAAGGAATACTCGGCGATACACA
GAGGTAACACAATGTGGTGCCGTAGACGGTTGGGTTTCTCGCCGGAAAATGCCGTCGGCT
CGTTTATAACGGACTTGCGGTGGAGGACAACGTCAATGTGGATCAAGAAATAATTAATAG
AGAGAGATGTTAAACTTAGTTTTTATATTTTATTATGACCACTTTTAGGTCACGTTCGGA
AAATATCTGAACGTTTTTTTTTCCCGCAGATAGATAACAAAAAAAAACTTGATTAAACTG
GTATCTTGTTTTAAGAGTTCGCCTCTCTCAAATATAGGTTTCTGTTTC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4F340TF 468 0 0
GTAATCATGTGTTGGATATTTGTCGGAAAAGAAAGAGATCAGATGAAGTAGAAGAAGAAC
TTGTGGATGAAGAAAACGACGGGTTCAAAACACCGACCCGTCCGGAAAATAGAATCCCTG
AGGTCAGAGTGTGCCCACCGGCGCCGAGGAAAGGCGAAAAGGAATACTCGGCGATACACA
GAGGTAACACAATGTGGTGCCGTAGACGGTTGGGTTTCTCGCCGGAAAATGCCGTCGGCT
CGTTTATAACGGACTTGCGGTGGAGGACAACGTCAATGTGGATCAAGAAATAATTAATAG
AGAGAGATGTTAAACTTAGTTTTTATATTTTATTATGACCACTTTTAGGTCACGTTCGGA
AAATATCTGAACGTTTTTTTTTCCCGCAGATAGATAACAAAAAAAAACTTGATTAAACTG
GTATCTTGTTTTAAGAGTTCGCCTCTCTCAAATATAGGTTTCTGTTTC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

CO CL4678Contig1 883 2 2 U
GGGGATAGCGAAACCTTAAAATAAGGAAAGTTTTGCGAACTCTCTCTTCCTCTAGAGAGA
GAAGTTTCTCTCAAATCTCCCTTCTTATCAAATACAAATCTTTCAGAAGGGAGAGTTTGA
TTTTGTTTTTGTTGTGTAATACTTTCGATCAATCAGATCGACTTTTACTTTCGCTTGGCG
ACTTGTAAACCTTCGCATGGCGATTTTCTTTTTGTTTTGTTGTGTTTTAAATCAAAAACA
GAGCTGTTCTTAATGGGTTTTTGGAATCTCTGTTTTGGTAATCAGTCTCCTCTTTCGCTA
ATATTCTAAATCCCGTTTTGGTTTGTGTTTGGGCTTTCTTCTTCTTCCGATTATGCTCTT
ATTCTTTGCTTAGGGGTATCAATCTTTACTTGCATGTGTGAGCCAAATAGGCGTATGAGT
AAAGTTTCCTTGATGCAAAGCAATACGTGATTGTTGGATCGATCTCGTTTGGTTCGTTGG
AGGTTTGGTAGAGTCGGCATCTTTACGTTTGAAGATGGTCCGATAAAAAGTCTCCGGTTG
AATCAAAATCGAGTTTTCCCAGTGTAATCAATTGGTGTTGAAGGAATCCCATCTATAAAC
GACGGCTGATACGAAAGTTTGGAGTTATGCGAGATCGGGAAGAAGTAACGGTGAAGCTCC
ATATTTTCTGAAGATCGGAGTTGGTGACCATCGCGGTGAAGGAGCATAGCAGCGTCGGAG
ATGGCATGTTGAACACGTGTACAATACGCGGCGCTGATGTTTCTGAAGTGAAACACGTGT
ATTCGATGTTACCGACTTTAAGTGTTTATTTGGGCCTTATCTATTGTAAACCTGATCCGC
TGTAATATTGCCCTTTGGGCTTTAAAATCAATGAAACAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E112TF U 1
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TTTTGTTTTTGTTGTGTAATACTTTCGATCAATCAGATCGACTTTTACTTTCGCTTGGCG
ACTTGTAAACCTTCGCATGGCGATTTTCTTTTTGTTTTGTTGTGTTTTAAATCAAAAACA
GAGCTGTTCTTAATGGGTTTTTGGAATCTCTGTTTTGGTAATCAGTCTCCTCTTTCGCTA
ATATTCTAAATCCCGTTTTGGTTTGTGTTTGGGCTTTCTTCTTCTTCCGATTATGCTCTT
ATTCTTTGCTTAGGGGTATCAATCTTTACTTGCATGTGTGAGCCAAATAGGCGTATGAGT
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AGGTTTGGTAGAGTCGGCATCTTTACGTTTGAAGATGGTCCGATAAAAAGTCTCCGGTTG
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ATA

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TTGGTTTGTGTTTGGGCTTTCTTCTTCTTCCGATTATGCTCTTATTCTTTGCTTAGGGGT
ATCAATCTTTACTTGCATGTGTGAGCCAAATAGGCGTATGAGTAAAGTTTCCTTGATGCA
AAGCAATACGTGATTGTTGGATCGATCTCGTTTGGTTCGTTGGAGGTTTGGTAGAGTCGG
CATCTTTACGTTTGAAGATGGTCCGATAAAAAGTCTCCGGTTGAATCAAAATCGAGTTTT
CCCAGTGTAATCAATTGGTGTTGAAGGAATCCCATCTATAAACGACGGCTGATACGAAAG
TTTGGAGTTATGCGAGATCGGGAAGAAGTAACGGTGAAGCTCCATATTTTCTGAAGATCG
GAGTTGGTGACCATCGCGGTGAAGGAGCATAGCAGCGTCGGAGATGGCATGTTGAACACG
TGTACAATACGCGGCGCTGATGTTTCTGAAGTGAAACACGTGTATTCGATGTTACCGACT
TTAAGTGTTTATTTGGGCCTTATCTATTGTAAACCTGATCCGCTGTAATATTGCCCTTTG
GGCTTTAAAATCAATGAAACAAGTTG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

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TAGAAAATTAAACTTTATTTTTAATGAATTAAGTTGGTATAACTCTGATAAATTAATTTT
ATTATGTGGTTAATTTTTTTAATAAAAAATTATATACTTTTAATAAAGATTTATAATTTT
CAATGAAAAAATCAATTTTTTTTATGAATGCTTAAATTATATTAAAAAAACATAATAATT
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BQ
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TAGAAAATTAAACTTTATTTTTAATGAATTAAGTTGGTATAACTCTGATAAATTAATTTT
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AAGTGTTTAATTTTTGTTAACTACACAAAATATTAAGAATGGTTGAAAAGAAATTATTTG
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AAAAAA*TATATGTTTAGATTCCTATGAATCTATTTGGATCTAGAAAGTTCCGATTAGAA
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DS 

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CCCTTAATGAAACATATAATGTTAGTAAAGAAAATAGTATTTTTAGTAAAAAACTAATAG
AATCTTGTTTTAATAATATAAGGGATATAGCTTTATCTTTGCGGGTACACAGATTTTAAT
TTTTAAGTTATTTCTATAAACTGTTTAATGAGATTTTAAAAAAAATATATGTTTAGATTC
CTATGAATCTATTTGGATCTAGAAAGTTCCGATTAGAAGTCTGTTCAGAAATTTAGAATA
TCCGAATTGAGTTTAGTTTTAAAACCCAAAAATATCCAATATAAAAAACCCGATGTGTGC
TTGATTATCTATGTCTAACTTATTCTGTAAACAAATAAAAAAATTGTGTTAGTTGATTTG
AATTTTTATCACGAACTGAAGCAATTTTATTCAAAGTTGTCAAAATATTATGGTTAACAC
ATCAAATAAATGATGTGGAGTATTATAGTAAATACAGTTAATAAAGTAACAAGGAAGAGC
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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ATTGACCGTTGATCGTGCCTGATTCATATGTGACGAGGATCTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A139JQD U 1
AF RR4A139JQ U 1
BS 1 885 RR4A139JQ

RD RR4A139JQD 823 0 0
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AGTTAATAACCATCAAAACCCATAAAATTGTACAATAACATTATAGCAATGCAAATGCAT
CCAAAACAAATATATTACAACATATCATATCACCCATTAATATAAATTATTTAAATTAAA
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TGGCTTTGTGAGACTCATCATCATCATAGTACATATACGCAAAGCCACCATGCCGGGTCA
TATCCATGCCAGCCATCTCATCCTCCGCTGATATCCGCAACAGTTTCATTTTCTTGAGGA
TGAAGAAAAGTATTCCCATGGTCGCACTCACCCAACCCGTGATCACAAGTATTTGAATCA
GCTGAGCTCCAAGTAGTTTCCCTCCACCGCCCATGAACAAACCATGCGGCCTTCCGGGCT
TGTCGCCGTATATCTGGTTCAAGTACTTTTCTCTAGCGAAAAGTGCGGTAAATATTAGAC
CCCACGCTCCGCACCCACCGTGTAACTGTGCTGCTTCGAGCGGGTCGTCGTATTTGAGTT
TCTCTGCGAGCTTGTTGCATCCGATGAGGACGAGAGCTGCCACGAAACCGCATATGATTG
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TTAGCGCCGCCGTGCAGCCAGCTAGCGTGGTCGTGACAGCTGT

QA 1 823 1 823
DS 

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AGTTAATAACCATCAAAACCCATAAAATTGTACAATAACATTATAGCAATGCAAATGCAT
CCAAAACAAATATATTACAACATATCATATCACCCATTAATATAAATTATTTAAATTAAA
CAGAGGTCGTAGGAGCACCGGAAGGTGAAGGAGATCTAGGCTCAACTTTCCTTAGCTGGA
TGGCTTTGTGAGACTCATCATCATCATAGTACATATACGCAAAGCCACCATGCCGGGTCA
TATCCATGCCAGCCATCTCATCCTCCGCTGATATCCGCAACAGTTTCATTTTCTTGAGGA
TGAAGAAAAGTATTCCCATGGTCGCACTCACCCAACCCGTGATCACAAGTATTTGAATCA
GCTGAGCTCCAAGTAGTTTCCCTCCACCGCCCATGAACAAACCATGCGGCCTTCCGGGCT
TGTCGCCGTATATCTGGTTCAAGTACTTTTCTCTAGCGAAAAGTGCGGTAAATATTAGAC
CCCACGCTCCGCACCCACCGTGTAACTGTGCTGCTTCGAGCGGGTCGTCGTATTTGAGTT
TCTCTGCGAGCTTGTTGCATCCGATGAGGACGAGAGCTGCCACGAAACCGCATATGATTG
CTGCCCACGGCTCTACGACGGAGCATCCACCAGTTATAGCAGCAAACCCTCCAAGGAGGC
CGTTACATACGTCGCTGACGTTCCAATGGCCTGAGAGAAGACGTTTCCCGAAGAGAGTTG
TTAGCGCCGCCGTGCAGCCAGCTAGCGTGGTCGTGACAGCTGTCCTTCCCACAGCGCTCC
ATTGACCGTTGATCGTGCCTGATTCATATGTGACGAGGATCTTGT

QA 1 885 1 885
DS 



AS 1 2

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ATGGTTTTAGATTTGGAAAATTAAATCTTCTGTTCCAAAATCTATATTAAGTTTGTCAAA
ATAAGTAATAATCTTCTAGATATGGAGTCGCTGGCTTGCTGGTTGCAGCCACTCCTATTC
AGGTGGTCGTGGGAAGTTTCTTAGCTGGAACGAACCAGCAAGATCAGAATACGAGGAAGC
AGAACCACAACTTCATGTCGTCTCCGATGCCAACCACTTCAAATGTAGCTGATTATGGAA
CCATCCGTCAGCCTGATTCATCTGGTGGTACATTGACATACGAGGGCCGGTTTGAGATAT
TATCACTGTCGGGATCATTCATGCCAAGTGACTCGGACGGAACACGGAGCAGAACAGGTG
GAATGACCAAGTCGATAATTTAGGTGAATGGACTCCTTCCTCGGCCGGAGCTAATTTCAC
GCCGCATATAATTACGGTGAACGCAGGCGAGGACGTAACGAAGAAGATAATATCCTTTTC
TCAAAAAGGGTCTCTTGCTATTTGCGTTCTCTGCGCAAACGGTGTCGTTTCAAGTGTTAC
ACTTCGTCTTCTCACCAGATTGGTACATGGACACCGCCTTTAGCTTCTGATCCACGACAC
AAGCCCTCTCATGACATTAACATCACTTTAACTTGATTTCTTCCTCAAAATAAGTGGTGG
ATCTTCCGTATTTCGGTTTAGACTTCTCTCTCAAGATTTTGGTTTTATGTTGGTTTGTAA
CCTAATTAGAGATTGTTTTCCAACTTCTTTTGATTGAGTTTCTTCCTGTATTGGATGTAC
GTAATATTAGAAGTTGAATCTTGTTCACCAATCTCTTGACCAGCTACATTTTCTTGTTTA
CATAAACCGTAGACAATTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GI81TF U 1
AF RR4GI81JQ C 261
BS 1 698 RR4GI81TF
BS 699 699 RR4GI81JQ
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BS 739 925 RR4GI81JQ

RD RR4GI81TF 755 0 0
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ATGGTTTTAGATTTGGAAAATTAAATCTTCTGTTCCAAAATCTATATTAAGTTTGTCAAA
ATAAGTAATAATCTTCTAGATATGGAGTCGCTGGCTTGCTGGTTGCAGCCACTCCTATTC
AGGTGGTCGTGGGAAGTTTCTTAGCTGGAACGAACCAGCAAGATCAGAATACGAGGAAGC
AGAACCACAACTTCATGTCGTCTCCGATGCCAACCACTTCAAATGTAGCTGATTATGGAA
CCATCCGTCAGCCTGATTCATCTGGTGGTACATTGACATACGAGGGCCGGTTTGAGATAT
TATCACTGTCGGGATCATTCATGCCAAGTGACTCGGACGGAACACGGAGCAGAACAGGTG
GAATGACCAAGTCGATAATTTAGGTGAATGGACTCCTTCCTCGGCCGGAGCTAATTTCAC
GCCGCATATAATTACGGTGAACGCAGGCGAGGACGTAACGAAGAAGATAATATCCTTTTC
TCAAAAAGGGTCTCTTGCTATTTGCGTTCTCTGCGCAAACGGTGTCGTTTCAAGTGTTAC
ACTTCGTCTTCTCACCAGATTGGTACATGGACACCGCCTTTAGCTTCTGATCCACGACAC
AAGCCCTCTCATGACATTAACATCACTTTAACTTGATT*CTTC*TCAAA*TAAGTGGTGG
ATCT*CCGTATTTCGGTT
AGACTCTCTCTCAGATT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4GI81JQ 665 0 0
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TCTGGTGGTACATTGACATACGAGGGCCGGTTTGAGATATTATCACTGTCGGGATCATTC
ATGCCAAGTGACTCGGACGGAACACGGAGCAGAACAGGTGGAATGACCAAGTCGATAATT
TAGGTGAATGGACTCCTTCCTCGGCCGGAGCTAATTTCACGCCGCATATAATTACGGTGA
ACGCAGGCGAGGACGTAACGAAGAAGATAATATCCTTTTCTCAAAAAGGGTCTCTTGCTA
TTTGCGTTCTCTGCGCAAACGGTGTCGTTTCAAGTGTTACACTTCGTCTTCTCACCAGAT
TGGTACATGGACACCGCCTTTAGCTTCTGATCCACGACACAAGCCCTCTCATGACATTAA
CATCACTTTAACTTGATTTCTTCCTCAAAATAAGTGGTGGATCTTCCGTATTTCGGTTTA
GACTTCTCTCTCAAGATTTTGGTTTTATGTTGGTTTGTAACCTAATTAGAGATTGTTTTC
CAACTTCTTTTGATTGAGTTTCTTCCTGTATTGGATGTACGTAATATTAGAAGTTGAATC
TTGTTCACCAATCTCTTGACCAGCTACATTTTCTTGTTTACATAAACCGTAGACAATTTG
TTTCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL4682Contig1 590 2 2 U
CGATTAAGATAGAGCAGTCATGCACACTGATAACATACGAGGCATGGTTTTATTTGAAAA
AAGCACGTACGTAACACTTATTTTCATAGAGGTTCTTTCTTGGAATCATATAATGCTAGC
TCCTCCTGAAGTGTCCTTGTGAATGTTTATCTTTGATGATAAGTCCCTCCCCGACTCCGA
GAAGTTATCCATGTAGATTCCAACGTACGATATAAGCGGGTCGGCCCTCGCTTTCTCCAC
CACAAGCTTCAGAGACCGAGACTCGGATCTCGGAAACCTTAAAAGCCTTTTGAAACCAAC
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GAAAGAGGCTACCCTTTGACCCATTTGGATCGGTTCTCGTACTTCCAACACGTTGAAACT
AACCGGATCTCGAAAGTTCAAGTACAGCTCCCATTTATCCTGCCTCTCCTCTGGCGCCCA
GTACTTGTCCAACCCTTCCTCCAAAACATTCTTAGCCTCAAACTGGCTGCCACGGATGCT
GCTAGAGTCAACAGCGGCTTTTCGGGCGAGGTTGTTGGAGAAAATGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT58TF C 1
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GAAGTTATCCATGTAGATTCCAACGTACGATATAAGCGGGTCGGCCCTCGCTTTCTCCAC
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GAAAGAGGCTACCCTTTGACCCATTTGGATCGGTTCTCGTACTTCCAACACGTTGAAACT
AACCGGATCTCGAAAGTTCAAGTACAGCTCCCATTTATCCTGCCTCTCCTCTGGCGCCCA
GTACTT

QA 1 486 1 486
DS 

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TGAAGTGTCCTTGTGAATGTTTATCTTTGATGATAAGTCCCTCCCCGACTCCGAGAAGTT
ATCCATGTAGATTCCAACGTACGATATAAGCGGGTCGGCCCTCGCTTTCTCCACCACAAG
CTTCAGAGACCGAGACTCGGATCTCGGAAACCTTAAAAGCCTTTTGAAACCAACGGTCGT
GCCGCTCACAACTCTCTCCCATCTACCGCTCCTAATGTTCTGCATCTCGAGACGGAAAGA
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ATCTCGAAAGTTCAAGTACAGCTCCCATTTATCCTGCCTCTCCTCTGGCGCCCAGTACTT
GTCCAACCCTTCCTCCAAAACATTCTTAGCCTCAAACTGGCTGCCACGGATGCTGCTAGA
GTCAACAGCGGCTTTTCGGGCGAGGTTGTTGGAGAAAATGGAGC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

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AAAAAAATAATAATACAGAATGGGTGGTGTCAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGAT
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CCGTCGTCAGCTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCTATGATGCTCTCAAAAAGAACAA
TGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAA
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AAATGATAGAGAGAGAGGATGATTTGATTCAACCACGGTCTATCTCTATTCTTCATTCTT
GATCGTTAATGATTTCCTTTCTTAACGTACCCTATGTTATACGTATGATTTCTTATGTCT
TTTTTTTATCTAATCATCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCGTTGATATATCGCCT
ATTTTCCTTTGTTGTTGTCCTTCCATTTCGTTTCGTTCATATATTAAGTTCCGTTTGTCT
ATTATATACATCATGATGTTTTGTATTCTACATTAGCATTTGTTATAACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F207TF U 1
AF RR4DB30TF U 8
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AAAAAAATAATAATACAGAATGGGTGGTGTCAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGAT
CTTAGCTATGGTAGCTAAATCCGTCAAAGCGACCTACCCATTGACTAAATCTTGCATCAA
TGGACAAGGTTGCATCGGAGATGATGATGAACTTGAATCTCTAATGGATTCGGAGACAAA
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TGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAA
TCCTTACAGACGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGTTATAGGTACGCTAAGTGAGAACA
AAATGATAGAGAGAGAGGATGATTTGATTCAACCACGGTCTATCTCTATTCTTCATTCTT
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TTTTTTTATCTAATCATCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCGTTGATATATCGCCT
ATTTTCCTTTGTTGTTGTCCTTCCATTTCGTTTCGTTCATATATTAAGTTCCGTTTGTCT
ATTATATAC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4DB30TF 764 0 0
GG
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ATAATACAGAATGGGTGGTGTCAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTAT
GGTAGCTAAATCCGTCAAAGCGACCTACCCATTGACTAAATCTTGCATCAATGGACAAGG
TTGCATCGGAGATGATGATGAACTTGAATCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCA
GCTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCTATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTG
CAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAG
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AGAGAGAGGATGATTTGATTCAACCACGGTCTATCTCTATTCTTCATTCTTGATCGTTAA
TGATTTCCTTTCTTAACGTACCCTATGTTATACGTATGATTTCTTATGTCTTTTTTTTAT
CTAATCATCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCGTTGATATATCGCCTATTTTCCTT
TGTTGTTGTC*TTCCATTTCGTTTCGTTCATATATTAAGTTCCGTTTGTCTATTATATAC
ATCATGATGTTTTGTATTCTACATTAGCATTTGTTATAACTA

QA 3 764 3 764
DS 



AS 1 2

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TCAAGAGTTGGAAACTTAAACTATGTTTCTCTCCCTCTGTTATTTGATATAGTTGAAATC
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CTTCTGAGAACTTTTCAAGTCATCACTTTTGATACAACACCAGCTCCAACTGTTCTACCT
CCTTCCCTCAGGGCAAATCTTTGACCTATTTCGAGTGGGACAGGCATGATAAGCTCAAAC
ACTGCAGTGACATTGTCACCAGGCATAACCATCTTCACCTCTTCTGGTAACTCTACTCTT
CCAGTGATATCTGCAGTCCTCAAGTAAAACTGAGGCCTGTAGTTTGATAAAAAGGCAGTG
TGACGTCCACCTTCGTCCTTGGTGAGCACGTAAATCTCTGCTTCAAACTTCTTGTACGTC
TTGCATGAACCAGGCTTAGCAATCACCATTCCACGTTGAATGTCTTCTCTCTTGAGCCCA
CGCAGAAGAAGTCCTACGTTACCACCAGCCTGTCCATTATCCAGAATCTTCTTGAACATC
TCGACCCCAATTACAGTTGATTTCATTGGAGGTCCGTCTTTTAAACCCAATATCTCAACT
TCTTCACCAACTTTGATGGCTCCTTGTTCAATACGACCGGTTGCAACAGTTCCACGTCCT
TGGATTGAGAAAACATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR10JQ U 1
AF RR4GI79JQ U 138
BS 1 607 RR4GR10JQ
BS 608 737 RR4GI79JQ

RD RR4GR10JQ 607 0 0
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TCAAGAGTTGGAAACTTAAACTATGTTTCTCTCCCTCTGTTATTTGATATAGTTGAAATC
TCAAAGCAGCGGAGCAAAAGAAAAAAAATAACATCATTGATGGGTTCTTCCTAGAGATGC
CTTCTGAGAACTTTTCAAGTCATCACTTTTGATACAACACCAGCTCCAACTGTTCTACCT
CCTTCCCTCAGGGCAAATCTTTGACCTATTTCGAGTGGGACAGGCATGATAAGCTCAAAC
ACTGCAGTGACATTGTCACCAGGCATAACCATCTTCACCTCTTCTGGTAACTCTACTCTT
CCAGTGATATCTGCAGTCCTCAAGTAAAACTGAGGCCTGTAGTTTGATAAAAAGGCAGTG
TGACGTCCACCTTCGTCCTTGGTGAGCACGTAAATCTCTGCTTCAAACTTCTTGTACGTC
TTGCATGAACCAGGCTTAGCAATCACCATTCCACGTTGAATGTCTTCTCTCTTGAGCCCA
CGCAGAAGAAGTCCTACGTTACCACCAGCCTGTCCATTATCCAGAATCTTCTTGAACATC
TCGACCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4GI79JQ 600 0 0
AAGAAAAAAAATAACATCATTGATGGGTTCTTCCTAGAGATGCCTTCTGAGAACTTTTCA
AGTCATCACTTTTGATACAACACCAGCTCCAACTGTTCTACCTCCTTCCCTCAGGGCAAA
TCTTTGACCTATTTCGAGTGGGACAGGCATGATAAGCTCAAACACTGCAGTGACATTGTC
ACCAGGCATAACCATCTTCACCTCTTCTGGTAACTCTACTCTTCCAGTGATATCTGCAGT
CCTCAAGTAAAACTGAGGCCTGTAGTTTGATAAAAAGGCAGTGTGACGTCCACCTTCGTC
CTTGGTGAGCACGTAAATCTCTGCTTCAAACTTCTTGTACGTCTTGCATGAACCAGGCTT
AGCAATCACCATTCCACGTTGAATGTCTTCTCTCTTGAGCCCACGCAGAAGAAGTCCTAC
GTTATCACCAGCCTGTCCATTATCCAGAATCTTCTTGAACATCTCGACCCCAATTACAGT
TGATTTCATTGGAGGTCCGTCTTTTAAACCCAATATCTCAACTTCTTCACCAACTTTGAT
GGCTCCTTGTTCAATACGACCGGTTGCAACAGTTCCACGTCCTTGGATTGAGAAAACATC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGCACCATTCGGAGACGAC
AACAAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTCCT
CAAACCTCTCTCGCATTCTATACACCCTTCCAATTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAAAA
CGATGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGCGGAACAATAGAGTCAATGTGGTACGT
AGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCACTG
CCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAGACG
ATAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAACAACAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FD25JQ C 1
AF RR4FD25TF U 1
BS 1 466 RR4FD25TF

RD RR4FD25JQ 466 0 0
GGGTACATATATAGATTCACACTAACTAATTACTTTTCAGACTCCAGCTAAGAAAATTAA
TTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGCACCATTCGGAGACGAC
AACAAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTCCT
CAAACCTCTCTCGCATTCTATACACCCTTCCAATTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAAAA
CGATGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGCGGAACAATAGAGTCAATGTGGTACGT
AGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCACTG
CCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAGACG
ATAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAACAACAGC

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4FD25TF 466 0 0
GGGTACATATATAGATTCACACTAACTAATTACTTTTCAGACTCCAGCTAAGAAAATTAA
TTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGCACCATTCGGAGACGAC
AACAAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTCCT
CAAACCTCTCTCGCATTCTATACACCCTTCCAATTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAAAA
CGATGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGCGGAACAATAGAGTCAATGTGGTACGT
AGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCACTG
CCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAGACG
ATAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAACAACAGC

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

CO CL4687Contig1 851 2 2 U
GGGTCGATGGCTCGATTAGTCAGATGTCTGAGGAGAACCGTCTTCTCCAATTCGTCTCCT
TCGATTGCGTACCGGAACCCCAAAATCGGTTTACCCACGAATCAAAATGGAAACTTTTTG
ATCAGCTCTGGGAGATGTCTAAGCTCGGCGGGGAGTTACGTCTCAGAAATGCAGAAATCA
GCTTTCCAAGGAAACATCTGCCGTCTAATCCGTAATGAGATCGATTACGAACTCAATCAC
TCGCCTCCTCTTCAGTCTCCTAGCAGTTATGGTCCATTCACTGTGGAGGAACGACCTGGA
GAGCAGTGGATTAGCTTGAAGAGGAAGTATGGTGAGAAAGAAGACATTAAAGTCGAGGCA
ACCATGTTTGATAGATCAGTTCCGTCCTCAAAATCCACCAGCACTGAACCTGACTTTATT
CTTCACATCACTTTCCTTGTCAACATCTCTAAGGGCGTTCCTGGTGAATCCTTGGAGATC
GTGTGTTCCGCTTGGCCTGATAACATTGAGATATCCAAGCTCTGCATTCGTAAAGGCACC
AACAGCTCGCCGTCTTCCTACGCTGGACCAGAGTTTGAGGAATTAGATGATGAGCTTCAA
GACGCTCTTTATCAGTTTTTAGAGGAGAGGGGTATAAGCGACGAGCTTGCTGTCTTCTTG
CATCGTTATATGAAGAACAAAAGTAAATTCGAGTACGTTAGATGGATGGAAAGCGTTAAA
TCTTATGTCGAGCAGAATTAGACATTAGTCTCTTTGGCTTTCCGCTCCTTGGTTCCTCAT
AAATTCAGTGTGTATGCGAGTACATAACTCTCTTTGATTTGGATATGCTCCAAATAACAA
GTTCAGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ35TF U 1
AF RR4FZ35JQ C 230
BS 1 696 RR4FZ35TF
BS 697 851 RR4FZ35JQ

RD RR4FZ35TF 696 0 0
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TCGATTGCGTACCGGAACCCCAAAATCGGTTTACCCACGAATCAAAATGGAAACTTTTTG
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GCTTTCCAAGGAAACATCTGCCGTCTAATCCGTAATGAGATCGATTACGAACTCAATCAC
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GAGCAGTGGATTAGCTTGAAGAGGAAGTATGGTGAGAAAGAAGACATTAAAGTCGAGGCA
ACCATGTTTGATAGATCAGTTCCGTCCTCAAAATCCACCAGCACTGAACCTGACTTTATT
CTTCACATCACTTTCCTTGTCAACATCTCTAAGGGCGTTCCTGGTGAATCCTTGGAGATC
GTGTGTTCCGCTTGGCCTGATAACATTGAGATATCCAAGCTCTGCATTCGTAAAGGCACC
AACAGCTCGCCGTCTTCCTACGCTGGACCAGAGTTTGAGGAATTAGATGATGAGCTTCAA
GACGCTCTTTATCAGTTTTTAGAGGAGAGGGGTATAAGCGACGAGCTTGCTGTCTTCTTG
CATCGTTATATGAAGAACAAAAGTAAATTCGAGTAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FZ35JQ 622 0 0
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AACGACCTGGAGAGCAGTGGATTAGCTTGAAGAGGAAGTATGGTGAGAAAGAAGACATTA
AAGTCGAGGCAACCATGTTTGATAGATCAGTTCCGTCCTCAAAATCCACCAGCACTGAAC
CTGACTTTATTCTTCACATCACTTTCCTTGTCAACATCTCTAAGGGCGTTCCTGGTGAAT
CCTTGGAGATCGTGTGTTCCGCTTGGCCTGATAACATTGAGATATCCAAGCTCTGCATTC
GTAAAGGCACCAACAGCTCGCCGTCTTCCTACGCTGGACCAGAGTTTGAGGAATTAGATG
ATGAGCTTCAAGACGCTCTTTATCAGTTTTTAGAGGAGAGGGGTATAAGCGACGAGCTTG
CTGTCTTCTTGCATCGTTATATGAAGAACAAAAGTAAATTCGAGTACGTTAGATGGATGG
AAAGCGTTAAATCTTATGTCGAGCAGAATTAGACATTAGTCTCTTTGGCTTTCCGCTCCT
TGGTTCCTCATAAATTCAGTGTGTATGCGAGTACATAACTCTCTTTGATTTGGATATGCT
CCAAATAACAAGTTCAGTTGCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL4688Contig1 904 2 10 U
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ATCTTGATTATCGTAGTCGGCAGTTCCTTTTAGACAATGTATATATTTGCCTGAGAAAAA
AGAAGCTTATTCTATATTATAAATCCAACAATAAGTGAAGTTAAGAACTCTTATGATGAT
GTTGTAACCATACGAGCCTCTCTGATGGTGATTATATTTATGGTGAATCTACCATTTATT
AAATCAAGAAGAGACACAAACAGAGGAGAGTAAATATAGATTATCTTAAGGTGTTCACAA
CATGGAGAAGAAAGTTACAAAGAGTGAAGGAAACATACCAAACTCTAATAAAAAGTTGTC
TCTGATAAGAGCCTTGAGAGGTATAACATGTCTGATGGTGTTGGTGTCAACGGCTTTTAT
GATGTTGATCTTCTGGGGGTTCCTATCAGGCGTAGTGCTGAGGCTTTTCAGCATACGCTA
CAGCCGCAAATGTGTTTCTTTCTTCTTCGGCTCCTGGCTCGCCTTGTGGCCTTTCCTCTT
TGAGAAGATCAACGGAACCAAAGTCGTCTTCTGCGGTGATAAGGTTCCTTGCGAGGAGCA
GCGAGTGTTGCTCATTGCCAATCACAGGACAGAAGTAGATTGGATGTACTTTTGGGATCT
TGCACTGCGTAAAGGACAGATTGGTAATATCAAATATGTGCTTAAGAGTAGTTTGATGAA
GCTGCCTCTGTTTGGTTGGGCGTTTCATCTCTTTGAGTTTATCCCCGTTGAACGGAGATG
GGAAGTGGATGAAGCGAAGTTGAGGCAGATTGTTTCGAGTTTTAAGGATCCTAGAGATGC
TTTGTGGCTTTCTCTTTTCTCTGAAGGCACAGATTACACGGAGGCTAAATGCGAAAGGAG
CAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4DE33TF U 1
AF RR4EO70TF U 331
BS 1 718 RR4DE33TF
BS 719 719 RR4EO70TF
BS 720 765 RR4DE33TF
BS 766 766 RR4EO70TF
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BS 773 805 RR4DE33TF
BS 806 806 RR4EO70TF
BS 807 815 RR4DE33TF
BS 816 904 RR4EO70TF

RD RR4DE33TF 815 0 0
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ATCTTGATTATCGTAGTCGGCAGTTCCTTTTAGACAATGTATATATTTGCCTGAGAAAAA
AGAAGCTTATTCTATATTATAAATCCAACAATAAGTGAAGTTAAGAACTCTTATGATGAT
GTTGTAACCATACGAGCCTCTCTGATGGTGATTATATTTATGGTGAATCTACCATTTATT
AAATCAAGAAGAGACACAAACAGAGGAGAGTAAATATAGATTATCTTAAGGTGTTCACAA
CATGGAGAAGAAAGTTACAAAGAGTGAAGGAAACATACCAAACTCTAATAAAAAGTTGTC
TCTGATAAGAGCCTTGAGAGGTATAACATGTCTGATGGTGTTGGTGTCAACGGCTTTTAT
GATGTTGATCTTCTGGGGGTTCCTATCAGGCGTAGTGCTGAGGCTTTTCAGCATACGCTA
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TGAGAAGATCAACGGAACCAAAGTCGTCTTCTGCGGTGATAAGGTTCCTTGCGAGGAGCA
GCGAGTGTTGCTCATTGCCAATCACAGGACAGAAGTAGATTGGATGTACTTTTGGGATCT
TGCACTGCGTAAAGGACAGATTGGTAATATCAAATATGTGCTTAAGAGTAGTTTGATGGA
GCTGCCTCTGTTTGGTTGGGCGTTTCATCTCTTTGAGTTTATCCC*GTTGAGCGGAGATG
GGAAGTGGATGAAGCGAAGTTGAGG*AGATTGTTT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4EO70TF 574 0 0
G
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CTGATGGTGTTGGTGTCAACGGCTTTTATGATGTTGATCTTCTGGGGGTTCCTATCAGGC
GTAGTGCTGAGGCTTTTCAGCATACGCTACAGCCGCAAATGTGTTTCTTTCTTCTTCGGC
TCCTGGCTCGCCTTGTGGCCTTTCCTCTTTGAGAAGATCAACGGAACCAAAGTCGTCTTC
TGCGGTGATAAGGTTCCTTGCGAGGAGCAGCGAGTGTTGCTCATTGCCAATCACAGGACA
GAAGTAGATTGGATGTACTTTTGGGATCTTGCACTGCGTAAAGGACAGATTGGTAATATC
AAATATGTGCTTAAGAGTAGTTTGATGAAGCTGCCTCTGTTTGGTTGGGCGTTTCATCTC
TTTGAGTTTATCCCCGTTGAACGGAGATGGGAAGTGGATGAAGCGAAGTTGAGGCAGATT
GTTTCGAGTTTTAAGGATCCTAGAGATGCTTTGTGGCTTTCTCTTTTCTCTGAAGGCACA
GATTACACGGAGGCTAAATGCGAAAGGAGCAAG

QA 2 574 2 574
DS 



AS 1 2

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AAGAAGTTGCAAAAGAGCGGTCGTCAAAGAAAGGCAAGAAGAAAGAGAGAGAACCTGCTG
ATAAACCTTCTGTTAAATCCAAGGTTATGAAGAAAAGGGCTCTTGTTTTGCCTCTTGAAG
CCTCCATAGTTGCGCTTCTTCTCCTTATAATGTTGGGTGCTTTCTATGTGATTCATTGTG
TTTGGGCAGCTGCAGAAGCATACTCAGCTCCATCAATAGTTTTGACATCTCAATCGCGTG
ATGGCCTACATGTATTTGATGATTTTAGAGAGTCTTATGCATGGTTAAGCCATAATACTG
ACGTGGATGACAAAGTGGCATCATGGTGGGACTATGGTTATCAGACGACAGCTATGGCTA
ATAGAACTGTTATTGTTGACAACAACACCTGGAATAATACTCACATTGCAACTGTTGGCA
CTGCAATGTCATCTCCAGAAAAGGCGGCGTGGGAAATCTTCAACTCCTTGGATGTGAAAT
ACGTTCTTGTAGTCTTTGGTGGTCTTATTGGTTACCCAAGTGATGATATTAACAAGTTTC
TGTGGATGGTGCGTATTGGAGGCGACGTCTTTCCTCATATAAAGGAAGCTGACTATCTGA
GAGATGGCCAATACCGGATTGATTCTGAGGCCACGCCAACAATGTTGAACTGCCTTATGT
ACAAGCTCTCTTACTACAGGTTTGTAGAGACAGATGGCAAAGCTTATGATCGGGTTAGGC
GGACGGAGATCGGGGAGAAAAATTTCAAGCTCACACATTTCGAAGAGGTTTTCACGAGTC
ACCATTGGATGGTTCGGATATACAAGTTGAAACCTCAAAAGAACAGGATTCGTGGTAGAG
CAAAGAAACTGAAACTGAAAACAAGCTCTGGATTGGACTCAAAACCAGCGAAGAAGAATC
CGTGGATCTAGAAACCCTAGAAATTTTTAATGTTGGATGGTGAGTTATATGTTTAACTCT
TAGGTCACTCTTTATCCTCAGAGGAAGTTGTTGCAGACGCAGTCAAGTTTCTGATGTTAG
GGTTCGTAAACCTTTTTTGGAGACTACTTGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGATATTTA
CAT


BQ
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10 10 10 

AF RR4GA51TF U 1
AF RR4GA51JQ C 329
BS 1 689 RR4GA51TF
BS 690 690 RR4GA51JQ
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BS 741 757 RR4GA51TF
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RD RR4GA51TF 757 0 0
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TTTGGGCAGCTGCAGAAGCATACTCAGCTCCATCAATAGTTTTGACATCTCAATCGCGTG
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CTGCAATGTCATCTCCAGAAAAGGCGGCGTGGGAAATCTTCAACTCCTTGGATGTGAAAT
ACGTTCTTGTAGTCTTTGGTGGTCTTATTGGTTACCCAAGTGATGATATTAACAAGTTTC
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GAGATGGCCAATACCGGATTGATTCTGAG*CCACGCCAACAATGTTGAACTGCCTTATGT
ACAAGCTCTCTTACTACAG*TTTGTAGAGACAGATGG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GA51JQ 815 0 0
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TGGTTACCCAAGTGATGATATTAACAAGTTTCTGTGGATGGTGCGTATTGGAGGCGACGT
CTTTCCTCATATAAAGGAAGCTGACTATCTGAGAGATGGCCAATACCGGATTGATTCTGA
GGCCACGCCAACAATGTTGAACTGCCTTATGTACAAGCTCTCTTACTACAGGTTTGTAGA
GACAGATGGCAAAGCTTATGATCGGGTTAGGCGGACGGAGATCGGGGAGAAAAATTTCAA
GCTCACACATTTCGAAGAGGTTTTCACGAGTCACCATTGGATGGTTCGGATATACAAGTT
GAAACCTCAAAAGAACAGGATTCGTGGTAGAGCAAAGAAACTGAAACTGAAAACAAGCTC
TGGATTGGACTCAAAACCAGCGAAGAAGAATCCGTGGATCTAGAAACCCTAGAAATTTTT
AATGTTGGATGGTGAGTTATATGTTTAACTCTTAGGTCACTCTTTATCCTCAGAGGAAGT
TGTTGCAGACGCAGTCAAGTTTCTGATGTTAGGGTTCGTAAACCTTTTTTGGAGACTACT
TGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGATATTTACAT

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL4690Contig1 835 2 3 U
GCCGCTCTCCATTGCTGTACGGTAGTTATCCATCTTCTCTTCTTCCTGTCGCATGTGCAC
ATCAACCTTCGTATTGGATATGCTTACCGCTTCGAAGCTCCCTACTGCTAAAATCATTTG
TGGATGCAGAGAGCATATTCCCATCAATCGAACCATGCATTTTAGGTTCAGAACCACATG
TGTTTCTCTTTGGTGCAGTCGTTGGATTTATTCCAAAAATATCAAGTCAAGTTCATCATC
AGAGGTCAATTCCGGCAAGAGAAATTATCAAACCAATATCAACATTTAGTCGGAGTCTAT
CAAAACTTGAAGATTGCAGTCCCTTGGCCTTTTTCTTTACAAAAAAGGCTAGCCAAACCT
CCTTATGCCGGGGCCATGAGAGATCATTTTCTACCCTCCTCCTCATCATAGGAGTGAATC
TTTCCACCAGTGCTCCTCCTCATAAGAGGTACTTGTCTCCTGGTCTCAAAGCCAGTGAGC
AGTGTCATTTTCCTAATCATTTGATATCTTGTGTGATGGTTCGTTTGGGACCGGAAGATA
TAACGAGAATCATCCCGATGAGACTCGAGGTTGTGGAATATTCAACGTCACGACATACGG
TGACTATTTCAAAGTCTGAAGATTTCGAAGGACGCAGTATATTCTCTATGAGGTTACTTT
GCGAGTGGCTCTTTTGATATCAACTTGGACACTTTATCAATCATAGCTATGTTTGTGTCT
CTATCTTTAGTTTGCTCTGTTTTTCAATTCCCTAAAAAGATCGCACATCATATGTTTGAT
GTTGCTTGGATCCATGTAAACCTTTAGTTATGAATGAAAAAATATGCGGGGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AL45TF U 1
AF RR4AL45JQ C 120
BS 1 821 RR4AL45TF
BS 822 822 RR4AL45JQ
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RD RR4AL45TF 835 0 0
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ATCAACCTTCGTATTGGATATGCTTACCGCTTCGAAGCTCCCTACTGCTAAAATCATTTG
TGGATGCAGAGAGCATATTCCCATCAATCGAACCATGCATTTTAGGTTCAGAACCACATG
TGTTTCTCTTTGGTGCAGTCGTTGGATTTATTCCAAAAATATCAAGTCAAGTTCATCATC
AGAGGTCAATTCCGGCAAGAGAAATTATCAAACCAATATCAACATTTAGTCGGAGTCTAT
CAAAACTTGAAGATTGCAGTCCCTTGGCCTTTTTCTTTACAAAAAAGGCTAGCCAAACCT
CCTTATGCCGGGGCCATGAGAGATCATTTTCTACCCTCCTCCTCATCATAGGAGTGAATC
TTTCCACCAGTGCTCCTCCTCATAAGAGGTACTTGTCTCCTGGTCTCAAAGCCAGTGAGC
AGTGTCATTTTCCTAATCATTTGATATCTTGTGTGATGGTTCGTTTGGGACCGGAAGATA
TAACGAGAATCATCCCGATGAGACTCGAGGTTGTGGAATATTCAACGTCACGACATACGG
TGACTATTTCAAAGTCTGAAGATTTCGAAGGACGCAGTATATTCTCTATGAGGTTACTTT
GCGAGTGGCTCTTTTGATATCAACTTGGACACTTTATCAATCATAGCTATGTTTGTGTCT
CTATCTTTAGTTTGCTCTGTTTTTCAATTCCCTAAAAAGATCGCACATCATATGTTTGAT
GTTGCTTGGATCCATGTAAACCTTTAGTTATGAATGAAAAA*TATGCGGGGTTAC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4AL45JQ 716 0 0
GTGGATGCAGAGAGCATATTCCCATCAATCGAACCATGCATTTTAGGTTCAGAACCACAT
GTGTTTCTCTTTGGTGCAGTCGTTGGATTTATTCCAAAAATATCAAGTCAAGTTCATCAT
CAGAGGTCAATTCCGGCAAGAGAAATTATCAAACCAATATCAACATTTAGTCGGAGTCTA
TCAAAACTTGAAGATTGCAGTCCCTTGGCCTTTTTCTTTACAAAAAAGGCTAGCCAAACC
TCCTTATGCCGGGGCCATGAGAGATCATTTTCTACCCTCCTCCTCATCATAGGAGTGAAT
CTTTCCACCAGTGCTCCTCCTCATAAGAGGTACTTGTCTCCTGGTCTCAAAGCCAGTGAG
CAGTGTCATTTTCCTAATCATTTGATATCTTGTGTGATGGTTCGTTTGGGACCGGAAGAT
ATAACGAGAATCATCCCGATGAGACTCGAGGTTGTGGAATATTCAACGTCACGACATACG
GTGACTATTTCAAAGTCTGAAGATTTCGAAGGACGCAGTATATTCTCTATGAGGTTACTT
*GCGAGTGGCTCTTTTGATATCAACTTGGACACTTTATCAATCATAGCTATGTTTGTGTC
TCTATCTTTAGTTTGCTCTGTTTTTCAATTCCCTAAAAAGATCGCACATCATATGTTTGA
TGTTGCTTGGATCCATGTAAACCTTTAGTTATGAATGAAAAAATATGCGGGGTTAC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL4691Contig1 999 2 4 U
GGTACCATTAAATGGGCTACAACAGAAAGCATCTCTTCCTACCTATGCCTTTATCTTATT
CATGATTATGAGGATCATGATAAGATGTTCTTCTGTGAAGATAACCAAATGATCATAGGG
AAAGTGCCTTGGCTGGTTGTTAAATCAAATCAGTACTTTGTTCCATCTCTTTGGTTGATC
CCTAGCTTTCAGACCAAACTCATCAAGCTGTTCCCACATAAAGATACTGTCTTCCACCAT
TTGAGTCGGTACCTTCTCCGCCCTACAAACCAAGTCTGGGGTATGGTCACAAGGTCCTAC
ACTGCTTACTTACTAAGAGCAGACGAGATACTTGGGATCCAAGTAAGATTTCTAGGAGAG
GGAACAAGTCCCATCAAGCATGTGATGGATCAGATTGTAGACTGTACGCAAAGAGAGAAA
CTGTTATCAGAAGTAGATACTCAAGGCTCTCAAGTCACCACAACAGAGAAACCCTCTAAA
CTCAAAGCTGTCCAAGTCACTTCTCTGACTTCTGGATGCTCTAAGAATAAAGAGTATGTA
TTGGGAGCATCCGACTTCGACAGGAGAGGTAGTTGTAGTTCACCAGCCAAGCGAAGAAGC
ATATCAGCAGAGTGACAAGAAGCTGCACAACCAAAAGGCCCTTGCTGAGATGTTTCTCTT
GAGTATGACGGATAAAGTTGTGATCAGCGCTTCGTCTACGTTCGGATACGTAGCTCAAGG
TATCGGCGGATTAAAGTCATGGATACTCTACGAACCTGTAAACCACACAGCTCCTGATCC
ACCTTGTGGTCGTGCCATTTCGATGGAGCCGTGTTTCCATGTCCCTCCTGTTTATGGCTG
CAAAGGTAAGACTGGAACCAACTCAGGAAACATCTTCCCATTTGTAAGACTGTGAGGATA
GAATCTTGGGAATTGTAAAGAGGATTTGATATTGTAAACTTGATAACTTGACATTACAAA
GAGCAATTGCTCTGGTTATATACACGTTTGAGATAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ55TF U 1
AF RR4BZ55JQ C 227
BS 1 637 RR4BZ55TF
BS 638 638 RR4BZ55JQ
BS 639 714 RR4BZ55TF
BS 715 999 RR4BZ55JQ

RD RR4BZ55TF 714 0 0
GGTACCATTAAATGGGCTACAACAGAAAGCATCTCTTCCTACCTATGCCTTTATCTTATT
CATGATTATGAGGATCATGATAAGATGTTCTTCTGTGAAGATAACCAAATGATCATAGGG
AAAGTGCCTTGGCTGGTTGTTAAATCAAATCAGTACTTTGTTCCATCTCTTTGGTTGATC
CCTAGCTTTCAGACCAAACTCATCAAGCTGTTCCCACATAAAGATACTGTCTTCCACCAT
TTGAGTCGGTACCTTCTCCGCCCTACAAACCAAGTCTGGGGTATGGTCACAAGGTCCTAC
ACTGCTTACTTACTAAGAGCAGACGAGATACTTGGGATCCAAGTAAGATTTCTAGGAGAG
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TTGGGAGCATCCGACTTCGACAGGAGAGGTAGTTGTAGTTCACCAGCCAAGCGAAGAAGC
ATATCAGCAGAGTGACAAGAAGCTGCACAACCAAAAG*CCCTTGCTGAGATGTTTCTCTT
GAGTATGACGGATAAAGTTGTGATCAGCGCTTCGTCTACGTTCGGATACGTAGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4BZ55JQ 773 0 0
TACTGTCTCCACCA
TTGAGTCGGTAC*TTCTCCGCC*TACAAACCAAGTCTGGGGTATGGTCACAAGGTCCTAC
ACTGCTTACTTACTAAGAGCAGACGAGATACTTGGGATCCAAGTAAGATTTCTAGGAGAG
GGAACAAGTCCCATCAAGCATGTGATGGATCAGATTGTAGACTGTACGCAAAGAGAGAAA
CTGTTATCAGAAGTAGATACTCAAGGCTCTCAAGTCACCACAACAGAGAAACCCTCTAAA
CTCAAAGCTGTCCAAGTCACTTCTCTGACTTCTGGATGCTCTAAGAATAAAGAGTATGTA
TTGGGAGCATCCGACTTCGACAGGAGAGGTAGTTGTAGTTCACCAGCCAAGCGAAGAAGC
ATATCAGCAGAGTGACAAGAAGCTGCACAACCAAAAGGCCCTTGCTGAGATGTTTCTCTT
GAGTATGACGGATAAAGTTGTGATCAGCGCTTCGTCTACGTTCGGATACGTAGCTCAAGG
TATCGGCGGATTAAAGTCATGGATACTCTACGAACCTGTAAACCACACAGCTCCTGATCC
ACCTTGTGGTCGTGCCATTTCGATGGAGCCGTGTTTCCATGTCCCTCCTGTTTATGGCTG
CAAAGGTAAGACTGGAACCAACTCAGGAAACATCTTCCCATTTGTAAGACTGTGAGGATA
GAATCTTGGGAATTGTAAAGAGGATTTGATATTGTAAACTTGATAACTTGACATTACAAA
GAGCAATTGCTCTGGTTATATACACGTTTGAGATAACCC

QA 15 773 15 773
DS 



AS 1 2

CO CL4692Contig1 475 2 1 U
GAAAGCAGCAAACAGATAGATACCTTCATACACATAATAACGTTCTTACCAAAAAATGGG
ATAAGGAAAGCAGCACAAACAGAAGAAGCAACAAGTGCTGTTCTAAGAAGAAGAAAGCAC
CATATGCTCTCTGACATTCTTTCAGAGAGTGGGTTCGAGAAGATTGCAGAGAGAAGAGAG
GTGGCGAACGACGAACAGTTAACGCTGAACTGTCTGAGCAAAGTTTTTTTTTTTAATTTT
TATTACTATTTTTTTGAGGCTTTTTGTGATATGATTGCTTGCTGTCTCTTTGTCTCTGTA
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ATTAGTGAAAGAGTTTAGAGTTGACAAGCAATGTTTTAAGACTTTTTTTTTTTTGGTAAA
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BQ
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CATATGCTCTCTGACATTCTTTCAGAGAGTGGGTTCGAGAAGATTGCAGAGAGAAGAGAG
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TATTACTATTTTTTTGAGGCTTTTTGTGATATGATTGCTTGCTGTCTCTTTGTCTCTGTA
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DS 



AS 1 2

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CGCCTTTT


BQ
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CCTCAAATTCGCCAACATTGACCAGAATTCATCAGTTTCCGCACTTTGACTCATTTATCA
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AGTTTATCTTTGTTCTTCTTTTCTCTGAGTGAGAGAGAGTTTTTTAGCTAGTTCATCGGT
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AF RR4EQ05TF U 1
AF RR4EQ05JQ C 89
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BS 577 578 RR4EQ05JQ

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TTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTTGTTCTGCTTGTGTGTATTGACTCTTGTAACTGTGA
TTCTTCTGCCTTGTCAATGTAAAATAGCTTAAGTTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4EQ05JQ 490 0 0
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GGCGTGTAGTAGCCTGTGGGAGGGGGACACGATTCAGGTTGATACACAGTGGCTTGAAGA
AGCCATCAAGGGCGGTGAGAAGAGACAGAAGGGCTGTGATGGTGATGGTGATGGTGAAGG
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GTACTCTTAATGAAATGATGAGTCGTTTGGTGTTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTTGTT
CTGCTTGTGTGTATTGACTCTTGTAACTGTGATTTTTTTGCCTTGTCAATGTAAAATAGC
TTAAGTTTCG

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

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AAGCCACCTCCACCGGTTCTAGTCCTCCATGGACATTACGGTGGCTGTGTTGGCGATCTT
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GAACTCGGTGCAGCCAGGAACATTCTCGAGCTGGGTGCTGAGATTAGAGTACCTGTGAAG
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AAGGGGAACCCAACAGCAGTCTATAGGAGAGTGGGGCAAGGTTCTTCATACGGTGTAGGT
GTGAAGCTTGGTTTGGTAAGAGCTGAGTATGCTGTAGATCACAACAACGGAACTGGGGCT
CTATTCTTCCGGTTTGGAGAGAGGTATTAATGTAACGAGAGAGGTAACCTTCGGCTTGAC
ATTATTCTCCTCAAGGATTTGTTCAAGGCCCTTTGTATTTTTTCCCCTTTTTCTTTCCTT
TTATGGATTTTAAAATCTTTTTTTAAATAATTGATTAATGTTTCTTAAAGTAACCATAAG
TATTTACTAGATACTATTTATACAATAGTTTGATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DF66TF U 1
AF RR4DF66JQ C 222
BS 1 639 RR4DF66TF

RD RR4DF66TF 639 0 0
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AAGCCACCTCCACCGGTTCTAGTCCTCCATGGACATTACGGTGGCTGTGTTGGCGATCTT
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GAACTCGGTGCAGCCAGGAACATTCTCGAGCTGGGTGCTGAGATTAGAGTACCTGTGAAG
AACACGCATGTGTATGCATTTGCTGAGCATGGGAACGATTTGGGAAGCTCTAAGGATGTG
AAGGGGAACCCAACAGCAGTCTATAGGAGAGTGGGGCAAGGTTCTTCATACGGTGTAGGT
GTGAAGCTTGGTTTGGTAAGAGCTGAGTATGCTGTAGATCACAACAACGGAACTGGGGCT
CTATTCTTCCGGTTTGGAGAGAGGTATTAATGTAACGAGAGAGGTAACCTTCGGCTTGAC
ATTATTCTCCTCAAGGATTTGTTCAAGGCCCTTTGTATTTTTTCCCCTTTTTCTTTCCTT
TTATGGATTTTAAAATCTTTTTTTAAATAATTGATTAATGTTTCTTAAAGTAACCATAAG
TATTTACTAGATACTATTTATACAATAGTTTGATTTACC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4DF66JQ 418 0 0
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CAACAACGGAACTGGGGCTCTATTCTTCCGGTTTGGAGAGAGGTATTAATGTAACGAGAG
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TTCTTAAAGTAACCATAAGTATTTACTAGATACTATTTATACAATAGTTTGATTTACC

QA 1 418 1 418
DS 



AS 1 2

CO CL4696Contig1 960 2 4 U
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CATCACAGTAAACTCGGTACACCCTGGACTTGTCACCACTAATCTCTTTCGTCACTCCGG
TTTGGGGAATGTCGGTCTTCAAGACTATGAGTTTCTTCTTGTGGAAGAACATACCTCAGG
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TTATTTTGTTTAGACGAAAACATTTTTTTTCTTGAAAACCCAGACGAAAGCATAATAAAA


BQ
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AF RR4AV93TF U 1
AF RR4AV93JQ C 386
BS 1 765 RR4AV93TF
BS 766 766 RR4AV93JQ
BS 767 812 RR4AV93TF
BS 813 960 RR4AV93JQ

RD RR4AV93TF 812 0 0
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TTCTTCACCCGCAATATTTTTAGGGTTTAACAGAGAGAAAAATCATGGGAATATATGGAA
TGGTGACTGGAAAAGCGGGAAAGAGTGGATTTGGATCAGCTTCAACAGCTGAAGATGTCA
CTCAGTCCATTGATGCCAATCATCTCACTGCCATCATTACAGGTGGAACAAGTGGGATTG
GATTGGAAGCAGCAAGAGTGTTAGGAATGAGAGGAGCTCATGTGATCATCGCCGCAAGAA
ACACAAAAGCTGCTAGTGAATCTAAAGAGATGATTCTTAAGATGAACCCTAATGCTCGTA
TTGATTATCTTCAACTCGATCTCTCTTCTACCAAATCTGTCAGATCCTTCGTCCAGCAGT
TTCTCGCCCTTAATATCCCTCTCAACATACTCATACTTATACTTATCCCGAAGGTATCGC
GTTCGACAGCATCAACGACCCTGATAAATATTCAGAGAAAAAGGCTTATGGGCAGTCTAA
ACTGGCAAACTTATTGCACTCCAATGCACTCTCTCGTAAACTAGAGGAAGAAGGTGTGAA
CATCACAGTAAACTCGGTACACCCTGGACTTGTCACCACTAATCTCTTTCGTCACTCCGG
TTTGGGGAATGTCGGTCTTCAAGACTATGAGTTTCTTCTTGTGGAAGAACATACCTCAGG
GAGCAGCAACAACATGTTACGTAGCACTTCATCCTAGTCTGAAAG*CGTCACGGGAAAGT
ACTTCGCCGACTGTAACATCACCACTCCGAGC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4AV93JQ 575 0 0
TTCTACCAAATCTGTCAGATCCTTCGTCCAGCAGTTTCTCGCCCTTAATATCCCTCTCAA
CATACTCATACTTATACTTATCCCGAAGGTATCGCGTTCGACAGCATCAACGACCCTGAT
AAATATTCAGAGAAAAAGGCTTATGGGCAGTCTAAACTGGCAAACTTATTGCACTCCAAT
GCACTCTCTCGTAAACTAGAGGAAGAAGGTGTGAACATCACAGTAAACTCGGTACACCCT
GGACTTGTCACCACTAATCTCTTTCGTCACTCCGGTTTGGG*AATGTCGGTCTTCAAGAC
TATGAGTTTCTTCTTGTGGAAGAACATACCTCAGGGAGCAGCAACAACATGTTACGTAGC
ACTTCATCCTAGTCTGAAAGGCGTCACGGGAAAGTACTTCGCCGACTGTAACATCACCAC
TCCGAGCAAATTTGCCACCGATAAGTCTCTGGCCGATAAGCTTTGGGACTTCAGCATCAA
GCTCATCGATTCTCTTCCTAATTAAATATCAAAGCTTATTTTGTTTAGACGAAAACATTT
TTTTTCTTGAAAACCCAGACGAAAGCATAATAAAA

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL4697Contig1 1122 2 6 U
TTGATCTTCTATTGTGTTCTCTCGACTTCCCAGAGAAAGAAAACATGTGGTTCTTCGGAT
CGAAAGGAGCATCTGGATTCTCGGCTCGCTCAACTGCAGAAGAAGTCACACATGGTGTCG
ACGGAACTGGCCTCACTGCCATTGTCACAGGAGCATCGAGTGGTATAGGAGTGGAGACAG
CGCGTGTTCTTGCACTGCGTGGTGTGCACGTGGTTATGGCGGTGAGGAACACTGGCTCTG
GTGCTAAAGTCAAAGAAGATATCGTCAACCGTGTCCCTGGAGCTAAACTAGATGTCATGG
AGTTAGATCTCAGCTCTATGGACTCTGTCAGGAAGTTTGCTTCTGATTACAAATCATCTG
GTCGTCCTCTCAACCTCTTGATCAACAACGCTGGGATAATGGCATGTCCCTTTATGCTCT
CCAAGGACAACATCGAGCTGCAATTCGCGACCAACCATTTAGGTCATTTTCTGTTGACAA
AGCTTCTGCTAGATACAATGAAGAACACATCACGCGAGAGCAAGAGGGAAGGCAGGATTG
TTAATTTATCATCAGAAGCTCATCGGTTCTCCTATCCAGAAGGAGTCCGCTTTGACAAGA
TTAACGACCAGTCAAGTTACAGTAGTATGCGAGCTTATGGACGATCTAAACTCTGCAATG
TATTGCACGCCAACGAGCTTGCAAAGCAATTGAAGGAAGATGGAGTCAATATAACAGCAA
ACTCACTTCATCCAGGAGCCATTATGACAAATCTTGGGCGCTACTTCAACAGCTATTTGG
CTGGAGCTGTTGGTGCAGTGGCTAAATATGTTCTCAAGACTGTTCCGCAGGGGGCGGCGA
CGACTTGCTACGTGGCATTGAATCCTCAGGTTACAGGAGTTACAGGGGAATACTTCTTGG
ATAGCAACATTGCTAAACCGTTATCACTTGCCAAAGATTCAGAGTTGGCCAAGAAGGTTT
GGGAGTTCAGCACTAAGCTTACCGAGTCCCAGTCAGGAGAAAGTAGTTCTTGAAACTAGA
ATGTTCAGTGAATCTTTACGTTGTGATTTCTATTTGAGTCTTTACCAAAGTAAATAAAAT
GTAATAACAAATCTGAATCATTTCAACTCTGCAAATTGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E390TF U 1
AF RR4E390JQ C 379
BS 1 695 RR4E390TF
BS 696 696 RR4E390JQ
BS 697 739 RR4E390TF
BS 740 740 RR4E390JQ
BS 741 805 RR4E390TF
BS 806 1122 RR4E390JQ

RD RR4E390TF 805 0 0
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CGAAAGGAGCATCTGGATTCTCGGCTCGCTCAACTGCAGAAGAAGTCACACATGGTGTCG
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CGCGTGTTCTTGCACTGCGTGGTGTGCACGTGGTTATGGCGGTGAGGAACACTGGCTCTG
GTGCTAAAGTCAAAGAAGATATCGTCAACCGTGTCCCTGGAGCTAAACTAGATGTCATGG
AGTTAGATCTCAGCTCTATGGACTCTGTCAGGAAGTTTGCTTCTGATTACAAATCATCTG
GTCGTCCTCTCAACCTCTTGATCAACAACGCTGGGATAATGGCATGTCCCTTTATGCTCT
CCAAGGACAACATCGAGCTGCAATTCGCGACCAACCATTTAGGTCATTTTCTGTTGACAA
AGCTTCTGCTAGATACAATGAAGAACACATCACGCGAGAGCAAGAGGGAAGGCAGGATTG
TTAATTTATCATCAGAAGCTCATCGGTTCTCCTATCCAGAAGGAGTCCGCTTTGACAAGA
TTAACGACCAGTCAAGTTACAGTAGTATGCGAGCTTATGGACGATCTAAACTCTGCAATG
TATTGCACGCCAACGAGCTTGCAAAGCAATTGAAG*AAGATGGAGTCAATATAACAGCAA
ACTCACTTCATCCAGGAGC*ATTATGACAAATCTTGGGCGCTACTTCAACAGCTATTTGG
CTGGAGCTGTTGGTGCAGTGGCTAA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4E390JQ 744 0 0
TGATCAACAACGCTGGGATAATGGCATGTCCCTTTATGCTCTCCAAGGACAACATCGAGC
TGCAATTCGCGACCAACCATTTAGGTCATTTTCTGTTGACAAAGCTTCTGCTAGATACAA
TGAAGAACACATCACGCGAGAGCAAGAGGGAAGGCAGGATTGTTAATTTATCATCAGAAG
CTCATCGGTTCTCCTATCCAGAAGGAGTCCGCTTTGACAAGATTAACGACCAGTCAAGTT
ACAGTAGTATGCGAGCTTATGGACGATCTAAACTCTGCAATGTATTGCACGCCAACGAGC
TTGCAAAGCAATTGAAGGAAGATGGAGTCAATATAACAGCAAACTCACTTCATCCAGGAG
CCATTATGACAAATCTTGGGCGCTACTTCAACAGCTATTTGGCTGGAGCTGTTGGTGCAG
TGGCTAAATATGTTCTCAAGACTGTTCCGCAGGGGGCGGCGACGACTTGCTACGTGGCAT
TGAATCCTCAGGTTACAGGAGTTACAGGGGAATACTTCTTGGATAGCAACATTGCTAAAC
CGTTATCACTTGCCAAAGATTCAGAGTTGGCCAAGAAGGTTTGGGAGTTCAGCACTAAGC
TTACCGAGTCCCAGTCAGGAGAAAGTAGTTCTTGAAACTAGAATGTTCAGTGAATCTTTA
CGTTGTGATTTCTATTTGAGTCTTTACCAAAGTAAATAAAATGTAATAACAAATCTGAAT
CATTTCAACTCTGCAAATTGTTGG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4698Contig1 941 2 2 U
GGGCTTTTATCTGTTTGCGATTCGAGAGTGAGAGAGAAAGAGATCTGCTTTAGGTTTTCG
TTTCCATCGTACTGAGTGGATTTTCAATAATCATGGAAGTAGACGATGATTACGTGGAGT
ATGTTCCAGTGTCGAAGCGTAGAGCGATGGAAGAGCAGAAGATTCGCCAACGGAAGGGAA
AAGTGTTAGAGCTGGAGGAAGAATCCTCGGAGAAGGAGAAGCTCGCCGAATCCAAACCTA
GCTTGCTCGTCCAAGCAACTCAGCTCAAGCGAGACGTACCCGAAGTCAGCGCCACCGACC
AAATCATCCTACAAGAGAAGGAGATGATGGAGCATCTCTCTGACAAGAAGACCCTCATGT
CTGTTCGTGAGTTAGCCAAAGGTATCACTTACACAGAGCCTCTTTTAACAGGGTGGAAAC
CTCCTTTGCGTATTAGGAAGATGTCGAGGAAGCAGATGGATCTGATCAGGAAGCAGTGGC
ATATCATTGTTAGCGGTGAAGACATTCCTCCTCCCATCAAGAGCTTCGAGGATATGAAGT
TCAAGAAACCTATTCTGCAGACGCTCAGGGAGAAAGGGATAGTTCAGCCGACTCCTATTC
AGGTTCAGGGCCTTCCTGTGATTCTGTCTGGGAGAGATATGATTGGGATTGCGTTCACCG
GTTCTGGGAAGACGATGGTTTTCGTGCTTCCTATGATCATGATTGCTCTTCAGGAGGAGA
AGATGATGCCTATTGGTCCTGGAGAAGGTCCCATTGGCCTTATTGTCTGTCCCTCTAGAG
AGCTTGCTAGGCAGACTTATGATGTTGTTGAACAGTTTGTGGCGCCTTTGGTTCAGGCTG
GATACCCGCCTTTGAGGTCTTTGCTTTGCATTGGAGGTGTTGATATGAGATCACAGTTGG
ATGTTGTCAAGAGAGGTGTTCATATTGTTGTCGCAACCCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DG89TF U 1
AF RR4DG89JQ C 251
BS 1 599 RR4DG89TF
BS 600 941 RR4DG89JQ

RD RR4DG89TF 599 0 0
GGGCTTTTATCTGTTTGCGATTCGAGAGTGAGAGAGAAAGAGATCTGCTTTAGGTTTTCG
TTTCCATCGTACTGAGTGGATTTTCAATAATCATGGAAGTAGACGATGATTACGTGGAGT
ATGTTCCAGTGTCGAAGCGTAGAGCGATGGAAGAGCAGAAGATTCGCCAACGGAAGGGAA
AAGTGTTAGAGCTGGAGGAAGAATCCTCGGAGAAGGAGAAGCTCGCCGAATCCAAACCTA
GCTTGCTCGTCCAAGCAACTCAGCTCAAGCGAGACGTACCCGAAGTCAGCGCCACCGACC
AAATCATCCTACAAGAGAAGGAGATGATGGAGCATCTCTCTGACAAGAAGACCCTCATGT
CTGTTCGTGAGTTAGCCAAAGGTATCACTTACACAGAGCCTCTTTTAACAGGGTGGAAAC
CTCCTTTGCGTATTAGGAAGATGTCGAGGAAGCAGATGGATCTGATCAGGAAGCAGTGGC
ATATCATTGTTAGCGGTGAAGACATTCCTCCTCCCATCAAGAGCTTCGAGGATATGAAGT
TCAAGAAACCTATTCTGCAGACGCTCAGGGAGAAAGGGATAGTTCAGCCGACTCCTATT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4DG89JQ 691 0 0
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GTTAGCCAAAGGTATCACTTACACAGAGCCTCTTTTAACAGGGTGGAAACCTCCTTTGCG
TATTAGGAAGATGTCGAGGAAGCAGATGGATCTGATCAGGAAGCAGTGGCATATCATTGT
TAGCGGTGAAGACATTCCTCCTCCCATCAAGAGCTTCGAGGATATGAAGTTCAAGAAACC
TATTCTGCAGACGCTCAGGGAGAAAGGGATAGTTCAGCCGACTCCTATTCAGGTTCAGGG
CCTTCCTGTGATTCTGTCTGGGAGAGATATGATTGGGATTGCGTTCACCGGTTCTGGGAA
GACGATGGTTTTCGTGCTTCCTATGATCATGATTGCTCTTCAGGAGGAGAAGATGATGCC
TATTGGTCCTGGAGAAGGTCCCATTGGCCTTATTGTCTGTCCCTCTAGAGAGCTTGCTAG
GCAGACTTATGATGTTGTTGAACAGTTTGTGGCGCCTTTGGTTCAGGCTGGATACCCGCC
TTTGAGGTCTTTGCTTTGCATTGGAGGTGTTGATATGAGATCACAGTTGGATGTTGTCAA
GAGAGGTGTTCATATTGTTGTCGCAACCCCT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL4699Contig1 451 2 4 U
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TTCACTAGTTTGTCACTATTCTCGGAATGGATCAGTCAATGATCTTCTCTCCGGTTGAAA
ATAGGTTCCAAACGACAGTCCCGACAAGGTAAAAACCGACCGAAATTGTGAAAACGTCAT
CCCAAAAACCGTGTTGTAGGATGTGACCAGTGGCGGCTGTGCCAAGAACTCCGGCAAGTA
CTCCAGCTGTGTTAAACAAACCAAGTAACACTCCAAAATATCTTGGAGCAATGTCTTGAT
GGTTAGAGTACAGACCAAACTGGGAGAACGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY33JQ U 1
AF RR4GZ93JQ U 1
BS 1 187 RR4GY33JQ
BS 188 188 RR4GZ93JQ
BS 189 430 RR4GY33JQ
BS 431 451 RR4GZ93JQ

RD RR4GY33JQ 430 0 0
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CTAAATTGAAAAGTAAACATGTCCTGAAAAATTTTCCGGCAAAAAAAGGATATTCCGGCA
AGCTCTCAAACTTGTAATATGTGTATATTTAAAGCCTGTCCAGGTCTTGGAGCTGAACTA
TTCACTATTTTGTCACTATTCTCGGAATGGATCAGTCAATGATCTTCTCTCCGGTTGAAA
ATAGGTTCCAAACGACAGTCCCGACAAGGTAAAAACCGACCGAAATTGTGAAAACGTCAT
CCCAAAAACCGTGTTGTAGGATGTGACCAGTGGCGGCTGTGCCAAGAACTCCGGCAAGTA
CTCCAGCTGTGTTAAACAAACCAAGTAACACTCCAAAATATCTTGGAGCAATGTCTTGAT
GGTTAGAGTA

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4GZ93JQ 451 0 0
ACAAAAAAAAATCATCTGTATATCTTTAATCTACATAAGTATTATTCATGTCCGTTTGGC
CTAAATTGAAAAGTAAACATGTCCTGAAAAATTTTCCGGCAAAAAAAGGATATTCCGGCA
AGCTCTCAAACTTGTAATATGTGTATATTTAGAGCCTGTCCAGGTCTTGGAGCTGAACTA
TTCACTAGTTTGTCACTATTCTCGGAATGGATCAGTCAATGATCTTCTCTCCGGTTGAAA
ATAGGTTCCAAACGACAGTCCCGACAAGGTAAAAACCGACCGAAATTGTGAAAACGTCAT
CCCAAAAACCGTGTTGTAGGATGTGACCAGTGGCGGCTGTGCCAAGAACTCCGGCAAGTA
CTCCAGCTGTGTTAAACAAACCAAGTAACACTCCAAAGTATCTTGGAGCAATGTCTTGAT
GGTTAGAGTACAGACCAAACTGGGAGAACGC

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL4700Contig1 732 2 7 U
GGAAAGTATTGTTTCTTCATCGCTTCAGATCATCATCCAACGACTGTCAACGCTCCCATA
TCGTCTCCGGCAGCTCACCCGCGAACACAGTTTCTCTCCAATCCCGTTCTCCCCCGCTTC
CAACGGTCATACTCCGCCGTAAAAGCACCAGCCGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCT
CCTCAGAAGAAGGTGAACAAATATGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGGGCGGGA
CTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTTGAGAAGCGA
AAAGTGCTGAGCAACGTTGAGAAATCTGGTCTTCTCTCGAAAGCAGAGGACTTGGGAGTC
ACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTC
AGTCTCCTTGAAACTTTAGCCGGTACTTCCCCTGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCTCTCCCG
GCTCTCACGGCTGCTATTCTAGCTCTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTG
GTTGCTCAATCGGTTTTGGCCGGTGCTCTTGCCCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGT
TCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGACTGATTCTTTGCTATGTAAAAGTTGTAA
ACCAAACTTAAATAAACCTTTTGTCCAATTGATTTATGTTAGTTTGCTGATATCATTAAT
TTAAGGTTGTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK81TF U 1
AF RR4GC65TF U 1
BS 1 40 RR4EK81TF
BS 41 41 RR4GC65TF
BS 42 412 RR4EK81TF
BS 413 413 RR4GC65TF
BS 414 552 RR4EK81TF
BS 553 553 RR4GC65TF
BS 554 732 RR4EK81TF

RD RR4EK81TF 732 0 0
GGAAAGTATTGTTTCTTCATCGCTTCAGATCATCATCCAATGACTGTCAACGCTCCCATA
TCGTCTCCGGCAGCTCACCCGCGAACACAGTTTCTCTCCAATCCCGTTCTCCCCCGCTTC
CAACGGTCATACTCCGCCGTAAAAGCACCAGCCGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCT
CCTCAGAAGAAGGTGAACAAATATGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGGGCGGGA
CTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTTGAGAAGCGA
AAAGTGCTGAGCAACGTTGAGAAATCTGGTCTTCTCTCGAAAGCAGAGGACTTGGGAGTC
ACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGTTCTTCTC
AGTCTCCTTGAAACTTTAGCCGGTACTTCCCCTGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCTCTCCCG
GCTCTCACGGCTGCTATTCTAGCTCTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTG
GTTGCTCAATCGTTTTTGGCCGGTGCTCTTGCCCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGT
TCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGACTGATTCTTTGCTATGTAAAAGTTGTAA
ACCAAACTTAAATAAACCTTTTGTCCAATTGATTTATGTTAGTTTGCTGATATCATTAAT
TTAAGGTTGTGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4GC65TF 731 0 0
GGAAAGTATTGTTTCTTCATCGCTTCAGATCATCATCCAACGGCTGTCAACGCTCCCATA
TCGTCTCCGGCAGCTCACCCGCGAACACAGTTTCTCTCCAATCCCGTTCTCCCCCGCTTC
CAACGGTCATACTCCGCCGTAAAAGCACCAGCCGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCT
CCTCAGAAGAAGGTGAACAAATATGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGGGCGGGA
CTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTTGAGAAGCGA
AAAGTGCTGAGCAACGTTGAGAAATCTGGTCTTCTCTCGAGAGCAGAGGACTTGGGAGTC
ACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTC
AGTCTCCTTGAAACTTTAGCCGGTACTTCCCCTGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCTCTCCCG
GCTCTCACGGCTGCTATTCTAGCTCTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTG
GTTGCTCAATCGGTTTTGGCCGGTGCTCTTGCCCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGT
TCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGACTGATTCTTTGCTATGTAAAAGTTGTAA
ACCAAACTTAAATAAACCTTTTGTCCAATTGATTTATGTTAGTTTGCTGATATCATTAAT
TTAAG
TTGTGA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4701Contig1 810 2 2 U
AGCATAAAACACACACACAACAGACTTCATTTATAACAACACCACGACAAATTAAAAAAA
TACTGAGCTCCAACCTCACTTTTACACACAAGACAATCACAAAACAAGTACATAAGAAAC
TCAACGAAATCTAAAGGGCAGAGATAAAGAACACATGAGATGGTGATACGGTGGTATTCT
CAGCAGAAGCCTTTTCAGTCTTGATACTCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCATACTCG
CCTTCTTCATCTGCCGTTGCGTCTTGGTATTGCTGATACTCAGACACCAGATCGTCCATG
TTGCTCTCAGCTTCAGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAG
AAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCTGTGAACTGCTCACTCACCCTCCTAAACATCTCTTGG
ATCGATGTCGAATTCCCTATAAAGGTCGACGCCATGGAGAGGCCTCGAGGCGCTATGTCA
CAGACGCTTGACTTCACGTTGTTGGGTATCCATTCCACGAAGTAGGATGAGTTTTTGTTC
TGCACGTTTATCATCTGCTCATCCACTTCTTTTGTGCTCATTTTGCCACGGAACATTGCC
GACGCTGTCAGGTACCGTCCGTGGCGCGGGTCTGCGGCACACATCATGTTCTTTGAATCC
CACATCTGTTGGGTGAGCTCTGGGACGGTGAGTGCGCGGTACTGCTGGGAGCCACGGGAG
GTGAGAGGAGCAAAACCGACCATGAAAAGTGGAGACGAGGGAAAGGGATGAGGTTCACTG
CAAGCTTCCTCAGATCAGAGTTGAGCTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GN91TF C 1
AF RR4CT06JQ U 27
BS 1 27 RR4GN91TF
BS 28 810 RR4CT06JQ

RD RR4GN91TF 309 0 0
AGCATAAAACACACACACAACAGACTTCATTTATAACAACACCACGACAAATTAAAAAAA
TACTGAGCTCCAACCTCACTTTTACACACAAGACAATCACAAAACAAGTACATAAGAAAC
TCAACGAAATCTAAAGGGCAGAGATAAAGAACACATGAGATGGTGATACGGTGGTATTCT
CAGCAGAAGCCTTTTCAGTCTTGATACTCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCATACTCG
CCTTCTTCATCTGCCGTTGCGTCTTGGTATTGCTGATACTCAGACACCAGATCGTTCATG
TTGCTCTC
C

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR4CT06JQ 784 0 0
C
CATTTATAACAACACCACGACAAATTAAAAAAATACTGAGCTCCAACCTCACTTTTACAC
ACAAGACAATCACAAAACAAGTACATAAGAAACTCAACGAAATCTAAAGGGCAGAGATAA
AGAACACATGAGATGGTGATACGGTGGTATTCTCAGCAGAAGCCTTTTCAGTCTTGATAC
TCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCATACTCGCCTTCTTCATCTGCCGTTGCGTCTTGG
TATTGCTGATACTCAGACACCAGATCGTCCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTGAACTCCATC
TCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCTGTG
AACTGCTCACTCACCCTCCTAAACATCTCTTGGATCGATGTCGAATTCCCTATAAAGGTC
GACGCCATGGAGAGGCCTCGAGGCGCTATGTCACAGACGCTTGACTTCACGTTGTTGGGT
ATCCATTCCACGAAGTAGGATGAGTTTTTGTTCTGCACGTTTATCATCTGCTCATCCACT
TCTTTTGTGCTCATTTTGCCACGGAACATTGCCGACGCTGTCAGGTACCGTCCGTGGCGC
GGGTCTGCGGCACACATCATGTTCTTTGAATCCCACATCTGTTGGGTGAGCTCTGGGACG
GTGAGTGCGCGGTACTGCTGGGAGCCACGGGAGGTGAGAGGAGCAAAACCGACCATGAAA
AGTGGAGACGAGGGAAAGGGATGAGGTTCACTGCAAGCTTCCTCAGATCAGAGTTGAGCT
GAC

QA 2 784 2 784
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4703Contig1 858 2 4 U
GGAGCTTTGATCTTTATATCTCCAGTGCCCGGAGGAATAAGACAACCGGATCGAAATTGG
GAGAAGATCTAATAAGTTCCTGAAGAAATCTTGGCGAAGAGATCTGAAGATGGAGTGCGT
GTTCGGTCTCGTTGGTAATGGATTCGTCATCGTGGCGGCGGATACCGGCAGTTCACAGCA
TACTTGTCCACAAGAACAACGAGGACAAGATCATGGTCCTTGACTCACACAAGCTCATCG
CCGCAAGCGGAGAGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGT
CACTGTATCAGTTCCGAAACGGGATCCCTTTGACTACAGCCGCTGCTGCCAACTTCACTC
GTGGAGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAACCCGTACTCAGTAAACATCCTGATGGCTG
GCTACGACAAAGAAGCAGGCGCATCTCTATACTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACA
AGGTTGACAAGGGAGCATTCGGTTACGGCTCCTACTTCTCTCTCTCCACAATGGACAGAC
ACTACCGCAGCGACATGTCTGTTGAAGAAGCCATTGAACTGGTCGACAAATGCATACTCG
AGATCAGGTCAAGGCTGGTCATCGCACCACCCAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGG
ATGGAGCTCGTGTGCACGCTTGGCGTCAGTCTGTGCAAGATGTCACCACTGCTTCTGTTT
AACTCTGTTATGTTACTAAGCTGAAATTTGCTTCTTCTTTTTTTATGTTGAAACTTTAAA
AGCTTCATGGAAAATTAGTTCCCAGATATGATATTATATGACATTGTTGAAATTTGAAAC
GAAAACATGTTTATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ75TF U 1
AF RR4DJ75JQ C 20
BS 1 659 RR4DJ75TF
BS 660 660 RR4DJ75JQ
BS 661 744 RR4DJ75TF
BS 745 858 RR4DJ75JQ

RD RR4DJ75TF 744 0 0
GGAGCTTTGATCTTTATATCTCCAGTGCCCGGAGGAATAAGACAACCGGATCGAAATTGG
GAGAAGATCTAATAAGTTCCTGAAGAAATCTTGGCGAAGAGATCTGAAGATGGAGTGCGT
GTTCGGTCTCGTTGGTAATGGATTCGTCATCGTGGCGGCGGATACCGGCAGTTCACAGCA
TACTTGTCCACAAGAACAACGAGGACAAGATCATGGTCCTTGACTCACACAAGCTCATCG
CCGCAAGCGGAGAGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGT
CACTGTATCAGTTCCGAAACGGGATCCCTTTGACTACAGCCGCTGCTGCCAACTTCACTC
GTGGAGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAACCCGTACTCAGTAAACATCCTGATGGCTG
GCTACGACAAAGAAGCAGGCGCATCTCTATACTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACA
AGGTTGACAAGGGAGCATTCGGTTACGGCTCCTACTTCTCTCTCTCCACAATGGACAGAC
ACTACCGCAGCGACATGTCTGTTGAAGAAGCCATTGAACTGGTCGACAAATGCATACTCG
AGATCAGGTCAAGGCTGGTCATCGCACCACCCAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAG*
ATGGAGCTCGTGTGCACGCTTGGCGTCAGTCTGTGCAAGATGTCACCACTGCTTCTGTTT
AACTCTGTTATGTTACTAAGCTGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DJ75JQ 839 0 0
CTCCAGTGCCCGGAGGAT**AGACAACCGGATCGAAATTGGGAGAAGATCTAATAAGTTC
*TGAAGAAATCTTGGCGAAGAGATCTGAAGATGGAGTGCGTGTTCGGTCTCGTTGGTAAT
GGATTCGTCATCGTGGCGGCGGATACCGGCAGTTCACAGCATACTTGTCCACAAGAACAA
CGAGGACAAGATCATGGTCCTTGACTCACACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGAGAGCCTGG
TGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTCCGAAA
CGGGATCCCTTTGACTACAGCCGCTGCTGCCAACTTCACTCGTGGAGAGCTCGCCACTGC
TTTGAGAAAGAACCCGTACTCAGTAAACATCCTGATGGCTGGCTACGACAAAGAAGCAGG
CGCATCTCTATACTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACAAGGTTGACAAGGGAGCATT
CGGTTACGGCTCCTACTTCTCTCTCTCCACAATGGACAGACACTACCGCAGCGACATGTC
TGTTGAAGAAGCCATTGAACTGGTCGACAAATGCATACTCGAGATCAGGTCAAGGCTGGT
CATCGCACCACCCAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGTGTGCACGC
TTGGCGTCAGTCTGTGCAAGATGTCACCACTGCTTCTGTTTAACTCTGTTATGTTACTAA
GCTGAAATTTGCTTCTTCTTTTTTTATGTTGAAACTTTAAAAGCTTCATGGAAAATTAGT
TCCCAGATATGATATTATATGACATTGTTGAAATTTGAAACGAAAACATGTTTATTATG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL4704Contig1 916 2 2 U
GGATACCACCTAAAACCCATCTCAGATCCCAATACAGATCAATTCGATCGTCTTTCTCAA
AACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCATGTCATCGAACCAAGAAAATGTGAAGAAA
GAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGGAAGTGGATCCAAACGAGAAGGAAGAGAAG
GTTGAGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGTCAGTTGAGAAGGTTAAAATAAAAGACGAAG
TAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATGAGAAGGAAAAAGAAAAGACAAAGGTAAAAG
ATGAAAAAACGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGATATGGAAGTGGAAGAGG
AAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGTGTCAC
AAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAGAAGGTAAGAAGAAGGCGAATAAAGATAAGA
AAACGAAAGAAGATTCCAAGGGTAAGGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAACAGGAAGAGAAGG
ATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGGAAAGAAGAAAAAAGAGAAGAAAGACTCTGATGTAA
AAGATGAAGAAACAGAGAAGGAACGCAAGAAGAAAAAGAAAGGTAAGGAGAAGAAAGATG
AGGATGTATCACAACAAAAAGAGGATTTAGAAGAAGAAGAAAGTAATAAAAAGAAGAAGA
AAGATAAGGATGAATCAGGTGCAGACGGAAAAGACAAGAAGAAACTGAAAGAAGAATCAA
AGGATAAGAAAGAAAAGAAGCTGAAAAAAGAGGAGAAGGATGAGCATGGAGAAGAAGAGG
AAGGGGAGAAGAAAGAAGAAGAGTAAAGATAAGGCGAAGACGAAGGAGACTGATGAGGAT
GAAGGAGAAAAGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC35TF U 1
AF RR4AC35JQ C 164
BS 1 632 RR4AC35TF
BS 633 916 RR4AC35JQ

RD RR4AC35TF 632 0 0
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AACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCATGTCATCGAACCAAGAAAATGTGAAGAAA
GAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGGAAGTGGATCCAAACGAGAAGGAAGAGAAG
GTTGAGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGTCAGTTGAGAAGGTTAAAATAAAAGACGAAG
TAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATGAGAAGGAAAAAGAAAAGACAAAGGTAAAAG
ATGAAAAAACGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGATATGGAAGTGGAAGAGG
AAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGTGTCAC
AAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAGAAGGTAAGAAGAAGGCGAATAAAGATAAGA
AAACGAAAGAAGATTCCAAGGGTAAGGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAACAGGAAGAGAAGG
ATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGGAAAGAAGAAAAAAGAGAAGAAAGACTCTGATGTAA
AAGATGAAGAAACAGAGAAGGAACGCAAGAAG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4AC35JQ 753 0 0
ACGAGAAGGAAGAGAAGGTTGAGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGTCAGTTGAGAAGGT
TAAAATAAAAGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATGAGAAGGAAAAAGA
AAAGACAAAGGTAAAAGATGAAAAAACGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGA
TATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAA
AGATGAGGATGTGTCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAGAAGGTAAGAAGAA
GGCGAATAAAGATAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGGGTAAGGAAGAAAAGAAGAAGAA
GAAACAGGAAGAGAAGGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGGAAAGAAGAAAAAAGAGAA
GAAAGACTCTGATGTAAAAGATGAAGAAACAGAGAAGGAACGCAAGAAGAAAAAGAAAGG
TAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGTATCACAACAAAAAGAGGATTTAGAAGAAGAAGAAAG
TAATAAAAAGAAGAAGAAAGATAAGGATGAATCAGGTGCAGACGGAAAAGACAAGAAGAA
ACTGAAAGAAGAATCAAAGGATAAGAAAGAAAAGAAGCTGAAAAAAGAGGAGAAGGATGA
GCATGGAGAAGAAGAGGAAGGGGAGAAGAAAGAAGAAGAGTAAAGATAAGGCGAAGACGA
AGGAGACTGATGAGGATGAAGGAGAAAAGAAGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL4705Contig1 1017 2 2 U
GGACATCATCCATTAACCGCCGCTCAACAGATATAAGCCATCATGTCTGAGTGGTTCACC
CAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGTAC
TCTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGTCC
CTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCGAA
CCCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTGAG
ATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACAA
CTCGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGAGAGAAGTCTTCGGA
GGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGATCACTCAC
CCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACGAC
GGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTATAAACATAGCTGGAAAAAAGAATGCA
CCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACACGGTTCGAATTG
TCCAGCCACAAGGGTGCCGGATGGGAAGGTTATAACTTTTCCGGTGAGATAAACTCCAAG
GACAAAATCAAGGCTACAACCACAGTCGGTGGTAGAAACATTCCACCGATTGACTTCACA
AGGTTGGCCGGAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAG
ACCCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTTTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCT
AATAGATAGACAATGGATGTTTCCCTTGTTTATTTGGATTTAGCTTTATTATCTTTAATA
GTTTTGTAATATCATTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTCTTGTGGAGGTCTGACCC


BQ
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AF RR4C915TF U 1
AF RR4C915JQ C 214
BS 1 646 RR4C915TF
BS 647 1017 RR4C915JQ

RD RR4C915TF 646 0 0
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CAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGTAC
TCTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGTCC
CTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCGAA
CCCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTGAG
ATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACAA
CTCGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGAGAGAAGTCTTCGGA
GGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGATCACTCAC
CCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACGAC
GGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTATAAACATAGCTGGAAAAAAGAATGCA
CCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4C915JQ 804 0 0
ATGTCATCTC
TGAAAGACAT*GCCGAACCCACCACAGTCGCC*TTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGA
CCGACAAAATGATTGAGATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCC
AGAAGCTGGATAAACAACTCGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCA
AGAGAGAAGTCTTCGGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCA
CTGGTACGATCACTCACCCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTC
CGCACGGATTCCACGACGGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTATAAACATAG
CTGGAAAAAAGAATGCACCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATTTCCGGCACAC
CCACACGGTTCGAATTGTCCAGCCACAAGGGTGCCGGATGGGAAGGTTATAACTTTTCCG
GTGAGATAAACTCCAAGGACAAAATCAAGGCTACAACCACAGTCGGTGGTAGAAACATTC
CACCGATTGACTTCACAAGGTTGGCCGGAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCC
CTTTCAACAGCAGCGAGACCCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTTTTCATTTTC
AGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAATGGATGTTTCCCTTGTTTATTTGGATTTAG
CTTTATTATCTTTAATAGTTTTGTAATATCATTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTCTTG
TGGAGGTCTGACCC

QA 11 804 11 804
DS 



AS 1 2

CO CL4706Contig1 469 2 1 U
AGGGACGAGAACCCATCCACATGCATATGCGAAGATGCAGAGGCCAAGGCAAAGGCGCAG
ATAGAATCTAGAAAGCTTGGAAAGAAAAACAAGTCGACAAATAAAGACGCAACAGCAGTA
ACAGTAGTACCAAACGATGGTCAAACCGAAGAGGATGAGCCAGATTGGTCGGAACCAGAC
TATGAGGAAGAACAGAGTGATCTTCAAGACAGAGGATTGTACAATGGGACTAGTTTAGAC
TACGATGATCCATCATCTACCTCTGATGAGCCAGAGCTTGAAGAAATGCTATCGGATTAG
TTATACATTCATCAATGAGATTGACATAATCATTACAACTGAATCTCTCTCGTCTGCTTG
GACACTTCACAGTGAATTTTTCCAACCTTTGGGGGTTAAAAGCCTTTGTTGTAAGCATTT
CGCATCAAATGTCTCATGTACATAGAACCGCGATAGAGCGTCCTTTGTC


BQ
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AF RR4AP31JQ C 1
AF RR4AP31TF U 1
BS 1 469 RR4AP31TF

RD RR4AP31JQ 469 0 0
AGGGACGAGAACCCATCCACATGCATATGCGAAGATGCAGAGGCCAAGGCAAAGGCGCAG
ATAGAATCTAGAAAGCTTGGAAAGAAAAACAAGTCGACAAATAAAGACGCAACAGCAGTA
ACAGTAGTACCAAACGATGGTCAAACCGAAGAGGATGAGCCAGATTGGTCGGAACCAGAC
TATGAGGAAGAACAGAGTGATCTTCAAGACAGAGGATTGTACAATGGGACTAGTTTAGAC
TACGATGATCCATCATCTACCTCTGATGAGCCAGAGCTTGAAGAAATGCTATCGGATTAG
TTATACATTCATCAATGAGATTGACATAATCATTACAACTGAATCTCTCTCGTCTGCTTG
GACACTTCACAGTGAATTTTTCCAACCTTTGGGGGTTAAAAGCCTTTGTTGTAAGCATTT
CGCATCAAATGTCTCATGTACATAGAACCGCGATAGAGCGTCCTTTGTC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR4AP31TF 469 0 0
AGGGACGAGAACCCATCCACATGCATATGCGAAGATGCAGAGGCCAAGGCAAAGGCGCAG
ATAGAATCTAGAAAGCTTGGAAAGAAAAACAAGTCGACAAATAAAGACGCAACAGCAGTA
ACAGTAGTACCAAACGATGGTCAAACCGAAGAGGATGAGCCAGATTGGTCGGAACCAGAC
TATGAGGAAGAACAGAGTGATCTTCAAGACAGAGGATTGTACAATGGGACTAGTTTAGAC
TACGATGATCCATCATCTACCTCTGATGAGCCAGAGCTTGAAGAAATGCTATCGGATTAG
TTATACATTCATCAATGAGATTGACATAATCATTACAACTGAATCTCTCTCGTCTGCTTG
GACACTTCACAGTGAATTTTTCCAACCTTTGGGGGTTAAAAGCCTTTGTTGTAAGCATTT
CGCATCAAATGTCTCATGTACATAGAACCGCGATAGAGCGTCCTTTGTC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL4707Contig1 751 2 4 U
GAACGAAATCTACAAACACAATAATTTGTTTTATTCTTATTTCATCGTTCAAAATGAAAC
GTTCAAGAACAACGTTGCTAGCTTTGATCTTCTTCATTGTCATCATATGGCAATCAAACT
CATCATTAGCAAACTCCGAGACTTTCACACAATGCCTAACGTCAAACTCCGACCCCCAAC
ATCCCATCTCCTCCGCCGTGATCTTCCCCGGAAACAGCTCCTACTCCTCCGTACTAGAAG
CCTACATCCGTAACCTACGGTTCAACACCTCCACAACCCCAAAACCCTTCCTTATAATCG
CCGCAACACACGAATCACACGTTCAAGCCGCAGTTACTTGTGGCCGACGTCACAACCTCC
AGATGAAAACCAGAAGCGGCGGCCACGACTACGACGGCTTGTCATACGTGACGTACTCTG
GGAAGCCGTTCTTTGTCCTCGATATGTTTAATCTCCGGTCGGTTGATGTTGACCTAGCGA
GTAAAACCGCGTGGGTCCAAAGCGGTGCCATTCTCGGAGAAGTTTATTACTATATATGGG
AGAAAAGCAAAACCCTAGCTTATCCGGCAGGGATCTGTCCGACGGTTGGGTGTTGGTGGC
CATGTTAGCGGCGGAGGGTACGGTAACTTGATGAGGAAGTACGGTCTCACCGTCGATAAC
ACTATCGATGCAAGAATGGTCGACGTCAATGGAAATATTTTGGATAGAAAATGATGGGAG
AGGACTCTACTGGGCATCAATGGAGGAGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G208TF U 1
AF RR4FQ44TF U 6
BS 1 58 RR4G208TF
BS 59 59 RR4FQ44TF
BS 60 744 RR4G208TF
BS 745 751 RR4FQ44TF

RD RR4G208TF 744 0 0
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GTTCAAGAACAACGTTGCTAGCTTTGATCTTCTTCATTGTCATCATATGGCAATCAAACT
CATCATTAGCAAACTCCGAGACTTTCACACAATGCCTAACGTCAAACTCCGACCCCCAAC
ATCCCATCTCCTCCGCCGTGATCTTCCCCGGAAACAGCTCCTACTCCTCCGTACTAGAAG
CCTACATCCGTAACCTACGGTTCAACACCTCCACAACCCCAAAACCCTTCCTTATAATCG
CCGCAACACACGAATCACACGTTCAAGCCGCAGTTACTTGTGGCCGACGTCACAACCTCC
AGATGAAAACCAGAAGCGGCGGCCACGACTACGACGGCTTGTCATACGTGACGTACTCTG
GGAAGCCGTTCTTTGTCCTCGATATGTTTAATCTCCGGTCGGTTGATGTTGACCTAGCGA
GTAAAACCGCGTGGGTCCAAAGCGGTGCCATTCTCGGAGAAGTTTATTACTATATATGGG
AGAAAAGCAAAACCCTAGCTTATCCGGCAGGGATCTGTCCGACGGTTGGGTGTTGGTGGC
CATGTTAGCGGCGGAGGGTACGGTAACTTGATGAGGAAGTACGGTCTCACCGTCGATAAC
ACTATCGATGCAAGAATGGTCGACGTCAATGGAAATATTTTGGATAGAAAATGATGGGAG
AGGACTCTACTGGGCATCAATGGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FQ44TF 746 0 0
GG
ATCTACAAACACAATAATTTGTTTTATTCTTATTTCATCGTTCAAAATGAAACGTTCAAG
AACAACGTTGCTAGCTTTGATCTTCTTCATTGTCATCATATGGCAATCAAACTCATCATT
AGCAAACTCCGAGACTTTCACACAATGCCTAACGTCAAACTCCGACCCCCAACATCCCAT
CTCCTCCGCCGTGATCTTCCCCGGAAACAGCTCCTACTCCTCCGTACTAGAAGCCTACAT
CCGTAACCTACGGTTCAATACCTCCACAACCCCAAAACCCTTCCTTATAATCGCCGCAAC
ACACGAATCACACGTTCAAGCCGCAGTTACTTGTGGCCGACGTCACAACCTCCAGATGAA
AGCTAGAAGCGGCGGCCACGACTACGACGGCTTGTCATACGTGACGTACTCTGGGAAGCC
GTTCTTTGTCCTCGATATGTTTAATCTCCGGTCGGTTGATGTTGACCTAGCGAGTAAAAC
CGCGTGGGTCCAAAGCGGTGCCATTCTCGGAGAAGTTTATTACTATATATGGGAGAAAAG
CAAAACCCTAGCTTATCCGGCAGGGATCTGTCCGACGGTTGG*TGTTGGTGGCCATGTTA
GCGGCGGAGGGTACG*TAACTTGATGAGGAAGTACGGTCTCACCGTCGATAACACTATCG
ATGCAAGAATGGTCGACGTCAATGGAAATATTTTGGATAGAAAATGATGGGAGAGGACTC
TACTGG*CATCAATGGAGGAGGGG

QA 3 746 3 746
DS 



AS 1 2

CO CL4708Contig1 1116 2 2 U
GGCCAAATCTCATCGTTAATATCAAAGACCTTCTCTTCGGTGTTCGACGACTTCTCTCCG
GTGACCAATTCCGACGATATCAAAGACATTCCGGCGACGAGATCGACGATGCTCCGATGA
ACAATTACAAGATCGATGATGCTCCTGCGACTTTCCCGACGAAAAGGAGTGTCTTCTCCC
CTTTCTCTAATCTCCATTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGCCGTTCCTCTGCGATTCTGAAAT
TCCCTTTAAAAGCTTTGATCCTTCCTTTCAGAATCGTAGTAGCGTAATGGCTTTTTGATT
TCCTTTTTTTTTATAATTTGACAGAAAAATTCCCCGCCGCCGGCAGATGGCCAAGTCATC
ACCATCCTCACAATATCCTCCGAACTTGGTGGATTGCTGGTGTTTTCTTCTCGCTAGGGT
CTCAACACCAACATAAAATCAAAGGATCTGATTTTGGTCGGTCTTAATCGATCTCCAATT
TTGACTCGCATTGGGAATCAAATAATTAGAGGATAGATTAGGATAGTGGGGGTTAGGGGA
AGGAAGAAATGGGGAAAATTGTGGAGAAATTGGGAAGATGCTTGAAGACTTGTTTTTCAT
GCTTTACTTGTTTGACCTGCTACACCTTCAACGACCATCTCAGCCGTTACAGCTTCAAGA
GCTCTCTCACCGATATTCCTCTCGTCTCCCTCCTCAGTTCTTTCCTCTTCATCTGTGTGT
ATTCGCTATCTGATGGACCTGCACTCTCTCACGGACCTTACCTCGGAACTGTCTCCTTGA
GAAACATTGTTCAGATTGTGCTTACTTGTCATGACATGGGGCTATTCACAGGGATTTGAA
GCCTGAGAACTTTCTGTTGCTGAACGAAGATGAGAACTCTCCTCTCAAAACCATTGACTT
TGGTCTCTCCGATTTCTACAAGCCAGGAGATGTGTTCAAGGATATAATGGGTGATGCTTA
TTATTACATAGCACTAGAGGCTTTGAAAAGGAAGTATGAATCAGAAGCTGTTATTTGAAG
TTAACCCTTAAATGATTTGTAAAAGGTTTATAAATTCTAAAAATGGTCCATAAACCTTTG
TAAATCATTTATTAAAGATTTATCACTCTTATAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A629TF U 1
AF RR4A629JQ C 412
BS 1 829 RR4A629TF
BS 830 1116 RR4A629JQ

RD RR4A629TF 829 0 0
GGCCAAATCTCATCGTTAATATCAAAGACCTTCTCTTCGGTGTTCGACGACTTCTCTCCG
GTGACCAATTCCGACGATATCAAAGACATTCCGGCGACGAGATCGACGATGCTCCGATGA
ACAATTACAAGATCGATGATGCTCCTGCGACTTTCCCGACGAAAAGGAGTGTCTTCTCCC
CTTTCTCTAATCTCCATTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGCCGTTCCTCTGCGATTCTGAAAT
TCCCTTTAAAAGCTTTGATCCTTCCTTTCAGAATCGTAGTAGCGTAATGGCTTTTTGATT
TCCTTTTTTTTTATAATTTGACAGAAAAATTCCCCGCCGCCGGCAGATGGCCAAGTCATC
ACCATCCTCACAATATCCTCCGAACTTGGTGGATTGCTGGTGTTTTCTTCTCGCTAGGGT
CTCAACACCAACATAAAATCAAAGGATCTGATTTTGGTCGGTCTTAATCGATCTCCAATT
TTGACTCGCATTGGGAATCAAATAATTAGAGGATAGATTAGGATAGTGGGGGTTAGGGGA
AGGAAGAAATGGGGAAAATTGTGGAGAAATTGGGAAGATGCTTGAAGACTTGTTTTTCAT
GCTTTACTTGTTTGACCTGCTACACCTTCAACGACCATCTCAGCCGTTACAGCTTCAAGA
GCTCTCTCACCGATATTCCTCTCGTCTCCCTCCTCAGTTCTTTCCTCTTCATCTGTGTGT
ATTCGCTATCTGATGGACCTGCACTCTCTCACGGACCTTACCTCGGAACTGTCTCCTTGA
GAAACATTGTTCAGATTGTGCTTACTTGTCATGACATGGGGCTATTCAC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4A629JQ 705 0 0
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TCTCCAATTTTGACTCGCATTGGGAATCAAATAATTAGAGGATAGATTAGGATAGTGGGG
GTTAGGGGAAGGAAGAAATGGGGAAAATTGTGGAGAAATTGGGAAGATGCTTGAAGACTT
GTTTTTCATGCTTTACTTGTTTGACCTGCTACACCTTCAACGACCATCTCAGCCGTTACA
GCTTCAAGAGCTCTCTCACCGATATTCCTCTCGTCTCCCTCCTCAGTTCTTTCCTCTTCA
TCTGTGTGTATTCGCTATCTGATGGACCTGCACTCTCTCACGGACCTTACCTCGGAACTG
TCTCCTTGAGAAACATTGTTCAGATTGTGCTTACTTGTCATGACATGGGGCTATTCACAG
GGATTTGAAGCCTGAGAACTTTCTGTTGCTGAACGAAGATGAGAACTCTCCTCTCAAAAC
CATTGACTTTGGTCTCTCCGATTTCTACAAGCCAGGAGATGTGTTCAAGGATATAATGGG
TGATGCTTATTATTACATAGCACTAGAGGCTTTGAAAAGGAAGTATGAATCAGAAGCTGT
TATTTGAAGTTAACCCTTAAATGATTTGTAAAAGGTTTATAAATTCTAAAAATGGTCCAT
AAACCTTTGTAAATCATTTATTAAAGATTTATCACTCTTATAAAC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4709Contig1 894 2 2 U
GGGAAAGGGATTCGTCTTCACCTCTACAATCACTGAGCTCGATGCGGTTTCTGATTACGG
CGAAGCTATTGACGGGAACAAGAGGATGAAATCAGGGTTCTGGGGTTTGTGGGAGTCTGA
TCGACGATGTGTTAGATCGAATAAATGATATTGTTTCCTCCATGGATGTGTTTGATGAAC
CCAAGCCGAGTCCTTTTGTTCTGGAAGGCACCCAAAGTCTCGACTATCCCTTAAAAGTTT
GTGACTTCTCAGGAAAGATTCAACACTTGGTAGACGCAGAAATAAAGCAAAGGCCCATAT
GATATTGGCGTTTGATTTTCCATCCGATTGGGTGTACCTTTTGTTGATTAAAATTTGTTT
CACGGTCATATATCAGAGGATGAACAAGAACTAGACTATTTCTCACCTCAGATTGATTAA
CAAAAAGGCTAAGGGCGAGTCTGTGTATTTGGCGGAGGTTCTCTAAATTTCCCTGATGAG
CGGAAAGTGTAAGAGTCCATCACGGGAATATTGGAAGTACGAGGATATGAGACACATGTG
GAATCACAACAGCCTAGGCTTTTTGTATAATGCTGAACTGGCTGCAGAGACAGCTTGTGG
CTGCAAATGCATCAACAGCAAAGGGATTAGTGTCCACCATAAGTAAGATCGATGGGTCAA
GAGCTTCTTCTAAATCAATCAAGCAATAAGGTTCTGCTTGCATTCTGTAAAGAAGGTTTC
ACTCATTTTTTTACGGAAACCAAATGCCTAATATCATTGTGATGGTTACATGTCTGAGAG
CTCTTTGTATTATATCTACCTTTTCAATCACTTTAAAGAGATCAAGAGCCTTGATTATAC
CAAGGTATATTATTTGTCTGATCTTTTTTTTCTCAATGGACAGGCGTAGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FF16TF U 1
AF RR4FF16JQ C 205
BS 1 685 RR4FF16TF
BS 686 894 RR4FF16JQ

RD RR4FF16TF 685 0 0
GGGAAAGGGATTCGTCTTCACCTCTACAATCACTGAGCTCGATGCGGTTTCTGATTACGG
CGAAGCTATTGACGGGAACAAGAGGATGAAATCAGGGTTCTGGGGTTTGTGGGAGTCTGA
TCGACGATGTGTTAGATCGAATAAATGATATTGTTTCCTCCATGGATGTGTTTGATGAAC
CCAAGCCGAGTCCTTTTGTTCTGGAAGGCACCCAAAGTCTCGACTATCCCTTAAAAGTTT
GTGACTTCTCAGGAAAGATTCAACACTTGGTAGACGCAGAAATAAAGCAAAGGCCCATAT
GATATTGGCGTTTGATTTTCCATCCGATTGGGTGTACCTTTTGTTGATTAAAATTTGTTT
CACGGTCATATATCAGAGGATGAACAAGAACTAGACTATTTCTCACCTCAGATTGATTAA
CAAAAAGGCTAAGGGCGAGTCTGTGTATTTGGCGGAGGTTCTCTAAATTTCCCTGATGAG
CGGAAAGTGTAAGAGTCCATCACGGGAATATTGGAAGTACGAGGATATGAGACACATGTG
GAATCACAACAGCCTAGGCTTTTTGTATAATGCTGAACTGGCTGCAGAGACAGCTTGTGG
CTGCAAATGCATCAACAGCAAAGGGATTAGTGTCCACCATAAGTAAGATCGATGGGTCAA
GAGCTTCTTCTAAATCAATCAAGCA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FF16JQ 690 0 0
AAGGCACCCAAAGTCTCGACTATCCCTTAAAAGTTTGTGACTTCTCAGGAAAGATTCAAC
ACTTGGTAGACGCAGAAATAAAGCAAAGGCCCATATGATATTGGCGTTTGATTTTCCATC
CGATTGGGTGTACCTTTTGTTGATTAAAATTTGTTTCACGGTCATATATCAGAGGATGAA
CAAGAACTAGACTATTTCTCACCTCAGATTGATTAACAAAAAGGCTAAGGGCGAGTCTGT
GTATTTGGCGGAGGTTCTTTAAATTTCCCTGATGAGCGGAAAGTGTAAGAGTCCATCACG
GGAATATTGGAAGTACGAGGATATGAGACACATGTGGAATCACAACAGCCTAGGCTTTTT
GTATAATGCTGAACTGGCTGCAGAGACAGCTTGTGGCTGCAAATGCATCAACAGCAAAGG
GATTAGTGTCCACCATAAGTAAGATCGATGGGTCAAGAGCTTTTTTTAAATCAATCAAGC
AATAAGGTTCTGCTTGCATTCTGTAAAGAAGGTTTCACTCATTTTTTTACGGAAACCAAA
TGCCTAATATCATTGTGATGGTTACATGTCTGAGAGCTCTTTGTATTATATCTACCTTTT
CAATCACTTTAAAGAGATCAAGAGCCTTGATTATACCAAGGTATATTATTTGTCTGATCT
TTTTTTTCTCAATGGACAGGCGTAGAAAGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4710Contig1 841 2 2 U
GACTTTAACATTCATACATCCAACTCTAAGTTCGAGCTTATGTCCGAAGCTTCTTGCTTG
CTGATACCCAAAGAAAACTCTCCAGCTTCATCAGAATCAATGGCAAACAAATCTCTCACA
GGCCTCGAGAGTCTCATAAAGCTTCTCCCAACAGGAACACTCTTCATTTACCTCTTACTC
AACCCGGTCCTCACAAACGACGGCGAATGCTCCACATCTAACAAGGTCATGTCAAGCATT
CTCGTTGCTCTTTGCAGCTTCTCATGCGTTTTTTCATGCTTCACCGATAGTTTCAAAGGC
ACGGATGGGTCAAGAAAGTATGGTATAGTCACCAGAAAGGGTCTTTGGACTTACGCTGAT
CCAGGATCCGTGGATTTGTCTAAGTACAAGCTTAGGATTGCTGATTTCGTTCACGCGGGT
TTCGTGGTGGCTGTGTTTGGAACGCTTGTGTTGCTTGACGCTAATACCGCAAGCTGCTTT
TATCCGCGGTTTAGAGAAACTCAAAAGACTTTGGTCATGGTTTTGCCTGTGGCTGTGGGC
GTTGTCTCGGCAGGTATCTTCGCTATTTTTCCTAGCAAACGGAATGGACTCGGGTATGCT
CCAAGTGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGACCAAGAAAGATTCTGGCTATGCATGAAACGTA
TAGTTACTTTTGTTGTTTGTGGTCTTGTTCAATATTCATTGTAGAATATAAAAGAAAACG
ATTGTATGCTTAATTTTTTTTTAAATGCTTAAAATTTATTAGTTCTTTTGTAAGTTGTGA
CCATAAATGTATATTGTATGGAATCATATAGTATTTCAGAATAAAATACGACGTTACCAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4HB36TF U 1
AF RR4HB36JQB C 214
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GTTGTCTCGGCAGGTATCTTCGCTATTTTTCCTAGCAAACGGAATGGACTCGGGTATGCT
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TAGTTACTTTTGTTGTTTGTGGTCTTGTT

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DS 

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CTTGACGCTAATACCGCAAGCTGCTTTTATCCGCGGTTTAGAGAAACTCAAAAGACTTTG
GTCATGGTTTTGCCTGTGGCTGTGGGCGTTGTCTCGGCAGGTATCTTCGCTATTTTTCCT
AGCAAACGGAATGGACTCGGGTATGCTCCAAGTGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGACCAAG
AAGGATTCTGGCTATGCATGAAACGTATAGTTACTTTTGTTGTTTGTGGTCTTGTTCAAT
ATTCATTGTAGAATATAAAAGAAAACGATTGTATGCTTAATTTTTTTTTAAATGCTTAAA
ATTTATTAGTTCTTTTGTAAGTTGTGACCATAAATGTATATTGTATGGAATCATATAGTA
TTTCAGAATAAAATACGACGTTACCATC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

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GAGATCGGATAGTGGGAAGAGACTGGAAAGAGATGGTTGGTGGCGGAAATCTCGATGAGA
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TTAGTTTTCTTGGTCAGCGACTGTGTGTCTGTTCTATGGCAGAAGACAGTTAAATTATTA
AACCTAATCTAAAAAGTCTTCGGTCC


BQ
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AF RR4CR08TF U 1
AF RR4CR08JQ C 35
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BS 515 626 RR4CR08JQ

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GGAACATGACGTGATTCAAAAGGTGGTGGAGGAGGAGCAGCGTCGTCGTGGCGGCGATCC
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GAGATCGGATAGTGGGAAGAGACTGGAAAGAGATGGTTGGTGGCGGAAATCTCGATGAGA
TACCGCGGAGGAGAGACAGGCATGAGGGATGGTGGTGGAAGAATGAAGCGGTGGTGGAGA
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DS 

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TATGGCAGAAGACAGTTAAATTATTAAACCTAATCTAAAAAGTCTTCGGTCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

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AAACACCTTTCCTGAGGAGAACGTGTCCGAGGTAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTT
TTTTGGAACAAACCAATCAAACAAAAGGGCCATTTTTGGGTTTCCATAAAACTTTTTCAA
CAGACATTTTCTTTTAGGTAAAGAGACTGCAGATAAAGAAAATGTAAAAAATATTGTTTT
TGTTGTTACTGTTTGTAACAGAGTACCCTTACCTTTATATATTGTTATTATTAACAAAGG
ACAGCATCATACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AU25JQ C 1
AF RR4AU25TF U 1
BS 1 673 RR4AU25TF

RD RR4AU25JQ 673 0 0
GCCGACTCAACACCCCGTCACAGCACACCAAGTCATTTACGAACTTCGTGTCTATTCTCT
CCAAAAGGGAAGCTTTGGTTCAGTAATCGTGTCACGGCAAATTAGAGCTGCGCATTGCTT
GACCTCTATCCAGTTCTCTCCCACCTCCGAGCACATACTGCTTGCATATGGACGGCATCA
TGGTTCTCTTTTGAATAGCATCGTTAGTGATGGTGAAGCTACATTACATTTTTTTACAGT
GTTGGAGATATACAGAGTTTCGGATATGGAGCTTGTGAGAGTACTCCCAAGTTCAGAGGA
TGAAGTGAATGTTGCTTGTTTTCATCCTTCTCCCGGAGGTGGCCTTGTTTATGGTACCAA
GGAGGGTTCACTGAGGATCTTCCAGTACAATACAGGTGCAACCTCTAACTTCACTGGACC
AAACACCTTTCCTGAGGAGAACGTGTCCGAGGTAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTT
TTTTGGAACAAACCAATCAAACAAAAGGGCCATTTTTGGGTTTCCATAAAACTTTTTCAA
CAGACATTTTCTTTTAGGTAAAGAGACTGCAGATAAAGAAAATGTAAAAAATATTGTTTT
TGTTGTTACTGTTTGTAACAGAGTACCCTTACCTTTATATATTGTTATTATTAACAAAGG
ACAGCATCATACC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4AU25TF 673 0 0
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CCAAAAGGGAAGCTTTGGTTCAGTAATCGTGTCACGGCAAATTAGAGCTGCGCATTGCTT
GACCTCTATCCAGTTCTCTCCCACCTCCGAGCACATACTGCTTGCATATGGACGGCATCA
TGGTTCTCTTTTGAATAGCATCGTTAGTGATGGTGAAGCTACATTACATTTTTTTACAGT
GTTGGAGATATACAGAGTTTCGGATATGGAGCTTGTGAGAGTACTCCCAAGTTCAGAGGA
TGAAGTGAATGTTGCTTGTTTTCATCCTTCTCCCGGAGGTGGCCTTGTTTATGGTACCAA
GGAGGGTTCACTGAGGATCTTCCAGTACAATACAGGTGCAACCTCTAACTTCACTGGACC
AAACACCTTTCCTGAGGAGAACGTGTCCGAGGTAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTT
TTTTGGAACAAACCAATCAAACAAAAGGGCCATTTTTGGGTTTCCATAAAACTTTTTCAA
CAGACATTTTCTTTTAGGTAAAGAGACTGCAGATAAAGAAAATGTAAAAAATATTGTTTT
TGTTGTTACTGTTTGTAACAGAGTACCCTTACCTTTATATATTGTTATTATTAACAAAGG
ACAGCATCATACC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL4713Contig1 955 2 6 U
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ATAGGGATAGGGACCGTGACCGTGACCGTGATAGACGCCGCGATAGAGACGACCGCTCCC
GTGATCGTGACAGAGATAGAGACCGTGACCGTGACAGAGGGCTAAGGAGCAAGAAATCCC
GATCTCGCACTCCAGACCACCACCACGCTCGTCCTCCTCGCCACGTCCGCTCTCCGGAGA
GGTATCGTTCCCGCTCCCGCTCGATTGACCGCGAACGCGACCGTAATCGGCACCACAGGC
GCAGGACTCCCTCTCCCTCTCGGAAACGGCCTCGCCAGGGCTCAGAGGACGACGAGAAGG
AAAGAAGCCGCAAAAAACCTGCGTCTGACTCCGTCGACGAGATCATCGCTAAACCGCCTG
CTAAGAAAAACGATAAGCAATCGAGCGGCGGCGGAGGCGGAGGCGAAACCGCGGCGGGCG
GAGGAGGAGGAAGGGATGGATGTGAACGAGATGGAGATGATGAAGATGTTAGGGATTCCA
ACGGGATTCGACTCGACGAAAGGGAAGCATGTTGAAGGAGCTGATGTGAGTGGGATTAGG
GCTGTTACCAAGCGGCAGCCGAGGCAGTACATGAACCGTCGCGGTGGCTTTAACCGTCCT
TTACCTGCTGAGCGTAACCGCTAAAGATTTCTCAAGGTTCTTATCATACTGTCTTAGACA
CTAGTCAGATGATGAGAGTTCGAACTTCATTTTCCAAGTTAGTCTACCTTACCCTACCCC
AGGCTTTGTTCTAATGTCCTTTAGAGATCAAACATGTACTCTCAAGAATTTAGAAACATC
TCTTGAGTTCTTTCTTATTTTTGGGGGATTTGGAATTGTCTATGTCATGGATGTAATCTC
CCGGCTGTATCTTTCTCAGACTGTTATTTAGTTGAAATTATGCATGTTCGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G432TF U 1
AF RR4G432JQ C 258
BS 1 689 RR4G432TF
BS 690 690 RR4G432JQ
BS 691 698 RR4G432TF
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BS 700 739 RR4G432TF
BS 740 955 RR4G432JQ

RD RR4G432TF 739 0 0
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ATAGGGATAGGGACCGTGACCGTGACCGTGATAGACGCCGCGATAGAGACGACCGCTCCC
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GATCTCGCACTCCAGACCACCACCACGCTCGTCCTCCTCGCCACGTCCGCTCTCCGGAGA
GGTATCGTTCCCGCTCCCGCTCGATTGACCGCGAACGCGACCGTAATCGGCACCACAGGC
GCAGGACTCCCTCTCCCTCTCGGAAACGGCCTCGCCAGGGCTCAGAGGACGACGAGAAGG
AAAGAAGCCGCAAAAAACCTGCGTCTGACTCCGTCGACGAGATCATCGCTAAACCGCCTG
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GAGGAGGAGGAAGGGATGGATGTGAACGAGATGGAGATGATGAAGATGTTAGGGATTCCA
ACGGGATTCGACTCGACGAAAGGGAAGCATGTTGAAGGAGCTGATGTGAGTGGGATTAGG
GCTGTTACCAAGCGGCAGCCGAGGCAGTACATGAACCGTCGCGGTGGCTTTAACCGTCCT
TTACCTGCTGAGCGTAACCGCTAAAGATT*CTCAAGGT*CTTATCATACTGTCTTAGACA
CTAGTCAGATGATGAGAGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4G432JQ 698 0 0
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CCTGCGTCTGACTCCGTCGACGAGATCATCGCTAAACCGCCTGCTAAGAAAAACGATAAG
CAATCGAGCGGCGGCGGAGGCGGAGGCGAAACCGCGGCGG*CGGAGGAGGAGGAAGGGAT
GGATGTGAACGAGATGGAGATGATGAAGATGTTAGGGATTCCAACGGGATTCGACTCGAC
GAAAGGGAAGCATGTTGAAGGAGCTGATGTGAGTGGGATTAGGGCTGTTACCAAGCGGCA
GCCGAGGCAGTACATGAACCGTCGCGGTGGCTTTAACCGTCCTTTACCTGCTGAGCGTAA
CCGCTAAAGATTTCTCAAGGTTCTTATCATACTGTCTTAGACACTAGTCAGATGATGAGA
GTTCGAACTTCATTTTCCAAGTTAGTCTACCTTACCCTACCCCAGGCTTTGTTCTAATGT
CCTTTAGAGATCAAACATGTACTCTCAAGAATTTAGAAACATCTCTTGAGTTCTTTCTTA
TTTTTGGGGGATTTGGAATTGTCTATGTCATGGATGTAATCTCCCGGCTGTATCTTTCTC
AGACTGTTATTTAGTTGAAATTATGCATGTTCGTTTTT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL4714Contig1 1197 2 2 U
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ACTAGTTTCTCGCCTTCTTCATCACTGGTGAATCGTAGGATTCCAGTTTACTAAAGCTTG
AAGATGAGTTCTACTGTTTGGTGGGAAGGAGTTGAGAAGACACGAGTTCTCATTGCCCCA
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GAAAATGGAACCTGCTACCTTTTTAATAATGGCACGCTTCAAGAGATTCAATGGTTTAAG
CAATCATATGGTTCTTGGTTCCTGGGAGATTACATTTCTCAAGACGGAAGCTTATATATG
GCCACTCCGGTTGATCCTGTTTTCATCTTGTTGCCTGTCTTCGACCAAGCACGAATGAAG
AAAGGTGATGATCCTGGGAAGTTCAGGCAACTGGATGAGATTTTATTTGTGGAAGGGTAT
CCTGACTATCAACATCTGTTGTCACTTTCAGAGAAGTGTATGGAGATCGTTTGTCAAACT
CAAGAGGTGGGATCTATGAAGTTCTATCGCCTTGATAACTCGAAAGTTTTAGCTTGGGTA
ACTTGTAAGGTACGCTGTTTAAAGAAGACTCTACCAGCATTGGACAAGAACTATGCAGCT
CAAGATGAGAAACAAACATTGGTGGATGCAGTTTCAATTGTGGGAGAGTACCTGAAGACA
GAGCCTTGGTTGAAACTTCTGTATGATCATCTCGGACTCGAGTTTGTCGACCCAATAACG
AAAGAAACAACCAATACGGAGACCTTTCCAAATGCAAATGAGAATAAGATGGACTACTCA
AATTCATTACAGGAGAAAGCAAACAAGAAGACAGGCAAGCCTGGGAAACAGACAAAGCAA
GCAAAGGTAGAGACTGGATCAAAGAACATAAGGGATATGTTTTCAAGGGCTTGTAAGAAA
AAGTGCTGAAATAGCTATATATCCAAACTGCTTATGATTTGTTATTTTCAGCTATCAAAT
GATCCTTTGCTTAGCCAGCGACATCTTAAACAAAGACCGAGTCACTTTTTTATTTGGATT
CTAAACTTCTAATTACTGTTGCTTAAGTAGCTGAAATATGTAAAAAATCTGCTTATCAAT
GTAAGAATTCACGGCAAAAATGAAACAGAGAGATGAGAATAAACCATTGTAAACTCG


BQ
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AF RR4BI68TF U 1
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GCCACTCCGGTTGATCCTGTTTTCATCTTGTTGCCTGTCTTCGACCAAGCACGAATGAAG
AAAGGTGATGATCCTGGGAAGTTCAGGCAACTGGATGAGATTTTATTTGTGGAAGGGTAT
CCTGACTATCAACATCTGTTGTCACTTTCAGAGAAGTGTATGGAGATCGTTTGTCAAACT
CAAGAGGTGGGATCTATGAAGTTCTATCGCCTTGATAACTCGAAAGTTTTAGCTTGGGTA
ACTTGTAAGGTACGCTGTTTAAAGAAGACTCTACCAGCATTGGACAAGAACTATGCAGCT
CAAGATGAGAAACAAACATTGGTGGATGCAGTTTCAATTGTGGGAGAGTACCTGAAGACA
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AAAGAAACAACCA

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TCTGTTGTCACTTTCAGAGAAGTGTATGGAGATCGTTTGTCAAACTCAAGAGGTGGGATC
TATGAAGTTCTATCGCCTTGATAACTCGAAAGTTTTAGCTTGGGTAACTTGTAAGGTACG
CTGTTTAAAGAAGACTCTACCAGCATTGGACAAGAACTATGCAGCTCAAGATGAGAAACA
AACATTGGTGGATGCAGTTTCAATTGTGGGAGAGTACCTGAAGACAGAGCCTTGGTTGAA
ACTTCTGTATGATCATCTCGGACTCGAGTTTGTCGACCCAATAACGAAAGAAACAACCAA
TACGGAGACCTTTCCAAATGCAAATGAGAATAAGATGGACTACTCAAATTCATTACAGGA
GAAAGCAAACAAGAAGACAGGCAAGCCTGGGAAACAGACAAAGCAAGCAAAGGTAGAGAC
TGGATCAAAGAACATAAGGGATATGTTTTCAAGGGCTTGTAAGAAAAAGTGCTGAAATAG
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CAAAAATGAAACAGAGAGATGAGAATAAACCATTGTAAACTCG

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTCGGAAAAGCTTTT


BQ
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CAGAGGAGTCAGAAGCCGAACCTGAACCTGAACCTGAGCCAGAGGTTGTGTGCAGAGGGA
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AGTTTCATTACACGGAGATGAGCACAAGCACGGATGTCGTTGCTGTCTGAATAGTTTAGG
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AGCTTTTAAACTAACTTTGTGAATGTAAAAGTTTAACCCTCTCTTTTAGAGCTGTGCTGA
TTTCGGAAAAGCTTTT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

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CATTGGGGGCCCCTTCCTCAAGCTCTGTCCCTCTTTTTCTTCTTCTTCAAAAAATGCCTT
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BQ
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AF RR4BL62JQ U 18
AF RR4BL62TF C 1
BS 1 17 RR4BL62TF
BS 18 79 RR4BL62JQ
BS 80 80 RR4BL62TF
BS 81 240 RR4BL62JQ
BS 241 241 RR4BL62TF
BS 242 480 RR4BL62JQ
BS 481 481 RR4BL62TF
BS 482 546 RR4BL62JQ
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RD RR4BL62JQ 533 0 0
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GTTGCTAACAAAAAATTTAAACAATCATCCAAGTCAAGTGCCTGTAACCAGCCCATTTTG
CAGCAAGCCGAACCCCAATAGCCAAAGCTGCAGCCAACAACGGGATTGGGGGCCCCTTCC
TCAAGCTCTGTCCCTCTTTTTCTTCTTCTTCAAAAAATGCCTTCTTAATTGAATTCTGAT
ACATAGCTAGAGCCAAATACCCTGGGATAGCCACCACTCTCACCCACGGTTCCCCTACTC
CCGCCAGAACAGCCGCAAAAGGTAACGCCGAAGTCACATCATCTCTCTTCTTCACCAACC
TCGAATACCCATACATACACACCAAAACAGTCCAAAAGAACGGGTCGGGGAGGCGGCGTT
CAAAAGCTGCGGGGGAGGAAGTGTAAGCTTGTTATTGACGTTAAAATGA
AAAA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4BL62TF 642 0 0
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AAAAGAAACATAACTAACCAGTGGGTAGAGGTTACAAAGTACAACACAAACTAGTTTAGT
TTGGTCTTTTAATTTTCGTTGCTAACAGAGAATTTAAACAATCATCCAAGTCAAGTGCCT
GTAACCAGCCCATTTTGCAGCAAGCCGAACCCCAATAGCCAAAGCTGCAGCCAACAACGG
CATTGGTGGCCCCTTCCTCAAGCTCTGTCCCTCTTTTTCTTCTTCTTCAGAAGATGCCTT
CTTAATTGAATTCTGATACATAGCTAGAGCCAAATACCCTGTGATAGCCACCACTCTCAC
CCACGGTTCCCCTACTCCCGCCAGAACAGCCGCAGAAGGTAACGCCGAAGTCACATCATC
TCTCTTCTTCACCAACCTCGAATACCCATACATACACACCAAAACAGTCCAGAAGAACGG
CTCGTGGAGGCGGCGTTCAGAAGCTGCGGTGGAGGAAGTGTAAGCTTGTTATTGACGTTA
AGATGAGAAATACGGGAGGCAGAGGAGGAATTGATAGGATTAATGCGATAACTGCGGCAG
AAGGAAGAGGGAGAAAGAGATGAAGAGAGAGCGTAGGACGTC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

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TCGCAGCAATGCATGCTCTAAAGGACAAGGTCTCGCAGAAACTTTCGAATCTCTTCGCCG
ATTCCCCTTCCCAATCCGCATCTCCTCGCTCTGCCCTCACCGATTCTCCAAAGGGTTCAG
GGGGGAAATCGTTTACTTCGTACTTCTCATTCGGTGCTGGAAACGAGGATGAAGATTCTG
AATCATCATCATCATTACCCCCTCCTCCCATTAGAACGGACAGCTACGAGTCTGTTGAGA
ATTGCAAACAAGAAGAAGATTGTAAAAGAACCAACAACAAGCTTCTTCCACTATGATGGG
TGGAGGAGGGGAGGAGATGAAGGAGTTAACAGAGAGCTCTGCTTTTATCTCTCCTCACTT
GTGCGAGTTCTTGCACGCTTGTCTTCCTAACATCGTTAGAGGTTGCAAATGGGGTCTTGG
TTTACAGTACGTTGAAGCATGGCATATCACTTCGTACGCTTCTTCGTAAAAGCGCTGAGC
TTCCTGGTCCTTGTTTACTGGTTGCTGGAGACAAACAAGGTGCAGTTTTTGGTGCTTTGC
TGGAATGTCCATTAACAACTACTCCTAAGAGGAAATATCAGGGTACAAGCCAGACATTCT
TGTTCACTACTATTTATGGTCAACCACGCATATTTAGACCTACAGGTGCCAACCGATATT
ACTACATGTGTATGAACGAGTTTTTGGCTTTTGGGGGTGGAGGAAGCTTTGCGCTATGTT
TAGACGAAGATTTGTTGAAAGCAACGAGTGGACCTTTTGAAACATTTGGCAACGAATGCT
TAGCTATCAGCACAGAGTTTGAGTTGAAGAATGTCGAGCTCTGGGGATTTGCGCATGCGT
CTCAGTACCTCTCCTCCTGATTCTTGGAAGAGAATTGATTACTACATCAAAAGGAAGCTT
ACCCCATCTTTTTTGAATCCACTAATTGTTTCACAAGTTATGGTTGTTAGGCTATAAGAC
AGTTTTGAGGGTTTTACATGATTGTATCTGTGTTACTAATTCAGGTGTGACCTTTCTCCG
AGAACAATTGTGATGTTTTGTCATATACATATATATAAAAGATTCATCTTGTTCCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CV82TF U 1
AF RR4CV82JQ C 345
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BS 643 1137 RR4CV82JQ

RD RR4CV82TF 644 0 0
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GGGGGAAATCGTTTACTTCGTACTTCTCATTCGGTGCTGGAAACGAGGATGAAGATTCTG
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TGGAGGAGGGGAGGAGATGAAGGAGTTAACAGAGAGCTCTGCTTTTATCTCTCCTCACTT
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TGGAATGTCCATTAACAACTACTCCTAAGAGGAAATATCAGG
TA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4CV82JQ 793 0 0
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T*ATCTCTCCTCACTTGTGCGAGTTCTTGCACGCTTGTCTTCCTAACATCGTTAGAGGTT
GCAAATGGG*TCTTGGTTTACAGTACGTTGAAGCATGGCATATCACTTCGTACGCTTCTT
CGTAAAAGCGCTGAGCTTCCTGGTCCTTGTTTACTGGTTGCTGGAGACAAACAAGGTGCA
GTTTTTGGTGCTTTGCTGGAATGTCCATTAACAACTACTCCTAAGAGGAAATATCAGGGT
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GGTGCCAACCGATATTACTACATGTGTATGAACGAGTTTTTGGCTTTTGGGGGTGGAGGA
AGCTTTGCGCTATGTTTAGACGAAGATTTGTTGAAAGCAACGAGTGGACCTTTTGAAACA
TTTGGCAACGAATGCTTAGCTATCAGCACAGAGTTTGAGTTGAAGAATGTCGAGCTCTGG
GGATTTGCGCATGCGTCTCAGTACCTCTCCTCCTGATTCTTGGAAGAGAATTGATTACTA
CATCAAAAGGAAGCTTACCCCATCTTTTTTGAATCCACTAATTGTTTCACAAGTTATGGT
TGTTAGGCTATAAGACAGTTTTGAGGGTTTTACATGATTGTATCTGTGTTACTAATTCAG
GTGTGACCTTTCTCCGAGAACAATTGTGATGTTTTGTCATATACATATATATAAAAGATT
CATCTTGTTCCAG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL4719Contig1 721 2 1 U
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ACCATCCCTCCGCAGAACCAAGAACGACATCTTTTTCGATGTGGCTGGTGAAGACGACAG
GAAAATCTCATTCGGACAGCTAAAAAGATTCTCGTTGCGTGAAGTCCAGCTAGCAACAGA
CAGTTTCAACGAGAGCAATTTGATCGGACAAGGAGGGTTTGGAAAAGTGTACAGAGGTAT
GCTTCCGGACAAAACAAAAGTTGCAGTGAAACGTCTTGCGGATTACTTCAGTCCTGGAGG
TGAAGCGCTTTCCAAAGAGAGATTCAGCTCATAAGCGTCGCTGTTCATAAGAATCTCTTA
CGTCTTATTGGCTTCTGCACAACTTCATCTGAGAGAATCCTCGTGTATCCATACATGGAG
AATCTTAGCGTTGCATATCGACTAAGAGATTTGAAGGCGGGAGAGGAAGGGTTAGACTGG
CCAACAAGGAAACGTGTGGCTTACGGTTCAGCTCACGGTTTAGAGTATCTACACGAGCAT
TGTAACCCTAAGATCATACACCGTGATCTCAAGGCTGCAAACATACTTCTAGACAACAAC
TTTGAGCCTGTTCTTGGAGACTTTGGTTTAGCTAAGCTTGTGGACACATCGTTGACTCAT
GTCACAACTCAAGTCCGTGGCACAATGGGACACATTGCGCCAGAGTATCTCTGCACAGAA
A


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DN42TF U 1
AF RR4DK14TF U 1
BS 1 721 RR4DK14TF

RD RR4DN42TF 712 0 0
GAACCGCAAGCTGCGTTGCTTCTGTAATCTTATTCCTCGGAGCTATGGTTATGTATCACC
ACCATCCCTCCGCAGAACCAAGAACGACATCTTTTTCGATGTGGCTGGTGAAGACGACAG
GAAAATCTCATTCGGACAGCTAAAAAGATTCTCGTTGCGTGAAGTCCAGCTAGCAACAGA
CAGTTTCAACGAGAGCAATTTGATCGGACAAGGAGGGTTTGGAAAAGTGTACAGAGGTAT
GCTTCCGGACAAAACAAAAGTTGCAGTGAAACGTCTTGCGGATTACTTCAGTCCTGGAGG
TGAAGCGCTTTCCAAAGAGAGATTCAGCTCATAAGCGTCGCTGTTCATAAGAATCTCTTA
CGTCTTATTGGCTTCTGCACAACTTCATCTGAGAGAATCCTCGTGTATCCATACATGGAG
AATCTTAGCGTTGCATATCGACTAAGAGATTTGAAGGCGGGAGAGGAAGGGTTAGACTGG
CCAACAAGGAAACGTGTGGCTTACGGTTCAGCTCACGGTTTAGAGTATCTACACGAGCAT
TGTAACCCTAAGATCATACACCGTGATCTCAAGGCTGCAAACATACTTCTAGACAACAAC
TTTGAGCCTGTTCTTGGAGACTTTGGTTTAGCTAAGCTTGTGGACACATCGTTGACTCAT
GTCACAACTCAAGTCCGTGGCACAATGGGACACATTGCGC*AGAGTATCTCT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4DK14TF 721 0 0
GAACCGCAAGCTGCGTTGCTTCTGTAATCTTATTCCTCGGAGCTATGGTTATGTATCACC
ACCATCCCTCCGCAGAACCAAGAACGACATCTTTTTCGATGTGGCTGGTGAAGACGACAG
GAAAATCTCATTCGGACAGCTAAAAAGATTCTCGTTGCGTGAAGTCCAGCTAGCAACAGA
CAGTTTCAACGAGAGCAATTTGATCGGACAAGGAGGGTTTGGAAAAGTGTACAGAGGTAT
GCTTCCGGACAAAACAAAAGTTGCAGTGAAACGTCTTGCGGATTACTTCAGTCCTGGAGG
TGAAGCGCTTTCCAAAGAGAGATTCAGCTCATAAGCGTCGCTGTTCATAAGAATCTCTTA
CGTCTTATTGGCTTCTGCACAACTTCATCTGAGAGAATCCTCGTGTATCCATACATGGAG
AATCTTAGCGTTGCATATCGACTAAGAGATTTGAAGGCGGGAGAGGAAGGGTTAGACTGG
CCAACAAGGAAACGTGTGGCTTACGGTTCAGCTCACGGTTTAGAGTATCTACACGAGCAT
TGTAACCCTAAGATCATACACCGTGATCTCAAGGCTGCAAACATACTTCTAGACAACAAC
TTTGAGCCTGTTCTTGGAGACTTTGGTTTAGCTAAGCTTGTGGACACATCGTTGACTCAT
GTCACAACTCAAGTCCGTGGCACAATGGGACACATTGCGCCAGAGTATCTCTGCACAGAA
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL4720Contig1 732 2 1 U
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CAAAATCTCCTCTTCTTCGATGGCGACGGGGAAAAGCTACTACGCACGGCCAAGCCACCG
TTTCCTCGGCGGAACCGATCAGTCATACTACGCCGCCAATGACTCCGGATTCGAGTTCGA
CGAATCCGATCTCTACTCATCAGCCTCAGCCGCTTCCGATTCCCCCGATTTCCGCCGGAA
AATCTCTAAACCGGTCAGATCCGTGAAGAAACCGTCTAACCGTCCATCCGCGTGCGCCGC
TTCCTCCGCCGTAGCGGCGTCGTCTCTCCCGGTGAACGTGCCGGACCGGTCTAAGATTCT
CCGGGAGGAGCGTCGCGATAACCGCCGGAGAAGCGTCGTGGATGACGAGGAAGACGGAGG
CGACTGGTTGGACGCCAGCGGCGGGAGGTTGCCTCCGCATGAGTTTCTGGCGAAGACGAG
GATGGCGTCGTTCTCGGTTCACGAAGGAGTTGGGAGGACTTTGAAAGGAAGAGATCTGAG
TAGGGTTAGAAATGCAATTTTTGAGAAAATTGGGTTCCAGGATTAATATTTTCAAATTTG
AGGTCCTTTAATAAGTAACTGTCAGAGAGAGAGAGAGCATTTGATATTTTCTTGAAATGC
CCTCGACTTATCGTCTATTCCGAAAATTTTCCCCATGTAATTTTTTGAGATATTATTACA
TTTTGCGTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A794JQ C 1
AF RR4A794TF U 1
BS 1 732 RR4A794TF

RD RR4A794JQ 732 0 0
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CAAAATCTCCTCTTCTTCGATGGCGACGGGGAAAAGCTACTACGCACGGCCAAGCCACCG
TTTCCTCGGCGGAACCGATCAGTCATACTACGCCGCCAATGACTCCGGATTCGAGTTCGA
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TTCCTCCGCCGTAGCGGCGTCGTCTCTCCCGGTGAACGTGCCGGACCGGTCTAAGATTCT
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CGACTGGTTGGACGCCAGCGGCGGGAGGTTGCCTCCGCATGAGTTTCTGGCGAAGACGAG
GATGGCGTCGTTCTCGGTTCACGAAGGAGTTGGGAGGACTTTGAAAGGAAGAGATCTGAG
TAGGGTTAGAAATGCAATTTTTGAGAAAATTGGGTTCCAGGATTAATATTTTCAAATTTG
AGGTCCTTTAATAAGTAACTGTCAGAGAGAGAGAGAGCATTTGATATTTTCTTGAAATGC
CCTCGACTTATCGTCTATTCCGAAAATTTTCCCCATGTAATTTTTTGAGATATTATTACA
TTTTGCGTCTCG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4A794TF 732 0 0
GACAGCAGAACAAAACTTCAAAATAACAATTTTAAAAAATTAATATAAATTCTAAATTCT
CAAAATCTCCTCTTCTTCGATGGCGACGGGGAAAAGCTACTACGCACGGCCAAGCCACCG
TTTCCTCGGCGGAACCGATCAGTCATACTACGCCGCCAATGACTCCGGATTCGAGTTCGA
CGAATCCGATCTCTACTCATCAGCCTCAGCCGCTTCCGATTCCCCCGATTTCCGCCGGAA
AATCTCTAAACCGGTCAGATCCGTGAAGAAACCGTCTAACCGTCCATCCGCGTGCGCCGC
TTCCTCCGCCGTAGCGGCGTCGTCTCTCCCGGTGAACGTGCCGGACCGGTCTAAGATTCT
CCGGGAGGAGCGTCGCGATAACCGCCGGAGAAGCGTCGTGGATGACGAGGAAGACGGAGG
CGACTGGTTGGACGCCAGCGGCGGGAGGTTGCCTCCGCATGAGTTTCTGGCGAAGACGAG
GATGGCGTCGTTCTCGGTTCACGAAGGAGTTGGGAGGACTTTGAAAGGAAGAGATCTGAG
TAGGGTTAGAAATGCAATTTTTGAGAAAATTGGGTTCCAGGATTAATATTTTCAAATTTG
AGGTCCTTTAATAAGTAACTGTCAGAGAGAGAGAGAGCATTTGATATTTTCTTGAAATGC
CCTCGACTTATCGTCTATTCCGAAAATTTTCCCCATGTAATTTTTTGAGATATTATTACA
TTTTGCGTCTCG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL4721Contig1 430 2 1 U
GAGAAGCGAAGAGCAAAAAGGGATCTCTCTCCAATGTCGTCGTCGTCGTCGTCAAGCGAT
CCGTCGAGAACAACAGGGATGGAGAGGAAGAAGAAAGGAGCTCCGATCAAATTCTTGGTG
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CTCAGAGACCGTCTCTTCGGTCTTGTCCTCGCCGGTGCTTTCGCTCATGGCTTCTACCTC
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ATCTAGAGCTCGGCATTTCTCAGATGTCTTTCTGATTTAATAAACAAAACTGCTTTTGTT
TTTTTTTTAAATTAATTTTGTTACGAGATTACATTTTGCTCGTGAATCTGAAGTTGGTTT
TGGTTTTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EO72JQ C 1
AF RR4EO72TF U 1
BS 1 430 RR4EO72TF

RD RR4EO72JQ 430 0 0
GAGAAGCGAAGAGCAAAAAGGGATCTCTCTCCAATGTCGTCGTCGTCGTCGTCAAGCGAT
CCGTCGAGAACAACAGGGATGGAGAGGAAGAAGAAAGGAGCTCCGATCAAATTCTTGGTG
CCTCTCATATACGCGCCTGCTCTCCCTCTCATTCGCTTGACCTTGAGGCATCAGCCTGTT
CTCAGAGACCGTCTTTTCGGTCTTGTCCTCGCCGGTGCTTTCGCTCATGGCTTCTACCTC
GTAACGGACGTATATGATGCAGAGAGCAAATGAAAAAAAAGAAGGGAGTTGCAGCCATTC
ATCTAGAGCTCGGCATTTTTCAGATGTCTTTTTGATTTAATAAACAAAACTGCTTTTGTT
TTTTTTTTAAATTAATTTTGTTACGAGATTACATTTTGCTCGTGAATCTGAAGTTGGTTT
TGGTTTTGCG

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR4EO72TF 430 0 0
GAGAAGCGAAGAGCAAAAAGGGATCTCTCTCCAATGTCGTCGTCGTCGTCGTCAAGCGAT
CCGTCGAGAACAACAGGGATGGAGAGGAAGAAGAAAGGAGCTCCGATCAAATTCTTGGTG
CCTCTCATATACGCGCCTGCTCTCCCTCTCATTCGCTTGACCTTGAGGCATCAGCCTGTT
CTCAGAGACCGTCTCTTCGGTCTTGTCCTCGCCGGTGCTTTCGCTCATGGCTTCTACCTC
GTAACGGACGTATATGATGCAGAGAGCAAATGAAAAAAAAGAAGGGAGTTGCAGCCATTC
ATCTAGAGCTCGGCATTTCTCAGATGTCTTTCTGATTTAATAAACAAAACTGCTTTTGTT
TTTTTTTTAAATTAATTTTGTTACGAGATTACATTTTGCTCGTGAATCTGAAGTTGGTTT
TGGTTTTGCG

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

CO CL4722Contig1 452 2 1 U
GGATTCAAAACAAAACCATTGATTGGATTTAGTTGATAGAGCGAAAAATTTGAGTGAGAA
AGAAAAAAAAAACACTCAAAAGTTCATATCTATTATAAACAGTTAAAAATGAAGTCGACC
ATCGTGATCCTCTTCACGTACCTTCTCCTCGCTGCGCCTTGCTCCGCTTTAGGATCGGAG
AACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGGACCGGAGACTCATAACTCTAGA
CCTCCGCCGGAGTCTCTGCACAGCAAGCGACCGTTCATCCACCATAAAACCTCTGCGGCT
GGATCCGCCGGCGCTCATGTCGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTTCAAGGAAGAGG
AGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATGAGTTTGTATAAGATGCAAGT
ACATAATTATTTATACAGATACATATTTAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EV17JQ C 1
AF RR4EV17TF U 1
BS 1 452 RR4EV17TF

RD RR4EV17JQ 452 0 0
GGATTCAAAACAAAACCATTGATTGGATTTAGTTGATAGAGCGAAAAATTTGAGTGAGAA
AGAAAAAAAAAACACTCAAAAGTTCATATCTATTATAAACAGTTAAAAATGAAGTCGACC
ATCGTGATCCTCTTCACGTACCTTCTCCTCGCTGCGCCTTGTTCCGCTTTAGGATCGGAG
AACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGGACCGGAGACTCATAACTCTAGA
CCTCCGCCGGAGTCTCTGCACAGCAAGCGACCGTTCATCCACCATAAAACCTCTGCGGCT
GGATCCGCCGGCGCTCATGTCGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTTCAAGGAAGAGG
AGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATGAGTTTGTATAAGATGCAAGT
ACATAATTATTTATACAGATACATATTTAACC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4EV17TF 452 0 0
GGATTCAAAACAAAACCATTGATTGGATTTAGTTGATAGAGCGAAAAATTTGAGTGAGAA
AGAAAAAAAAAACACTCAAAAGTTCATATCTATTATAAACAGTTAAAAATGAAGTCGACC
ATCGTGATCCTCTTCACGTACCTTCTCCTCGCTGCGCCTTGCTCCGCTTTAGGATCGGAG
AACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGGACCGGAGACTCATAACTCTAGA
CCTCCGCCGGAGTCTCTGCACAGCAAGCGACCGTTCATCCACCATAAAACCTCTGCGGCT
GGATCCGCCGGCGCTCATGTCGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTTCAAGGAAGAGG
AGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATGAGTTTGTATAAGATGCAAGT
ACATAATTATTTATACAGATACATATTTAACC

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL4723Contig1 489 2 1 U
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CATCCACAAGTACTTCTTGCCTCAAGACTATGCGATTCTCGTACCTGTCTTCGCTGGCGT
AACTCTCCTCTCTCTTCTTTGCGTATTCATTGGGATGGTCATGCTCAAATCCAAAAAGAA
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GGAGACACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E162JQ C 1
AF RR4E162TF U 1
BS 1 489 RR4E162TF

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CATATTCACCTACTATACTTTCTGGGTCATCATCCTGCCATTTGTAGATAGTGATCACTT
CATCCACAAGTACTTCTTGCCTCAAGACTATGCGATTTTCGTACCTGTTTTCGCTGGCGT
AACTCTCCTCTTTTTTCTTTGCGTATTCATTGGGATGGTCATGCTCAAATCCAAAAAGAA
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GGAGACACC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4E162TF 489 0 0
GGGCGCCGCGCCGCTTCCTCTCGTCGTGCTTTCCGTCTCTGCTCTAAACGTTTTGAACGT
GAGACAAATGGAGCTAGCGGATCGAGCAGTCGGGCTTCTATTATCTTCAATCAGCTTATC
CATATTCACCTACTATACTTTCTGGGTCATCATCCTGCCATTTGTAGATAGTGATCACTT
CATCCACAAGTACTTCTTGCCTCAAGACTATGCGATTCTCGTACCTGTCTTCGCTGGCGT
AACTCTCCTCTCTCTTCTTTGCGTATTCATTGGGATGGTCATGCTCAAATCCAAAAAGAA
GAAGGCTTGATTTGGTTTTTGATTCCTTCAGCTGTTGTGCACACTTTGTTTTGGACATTT
TTGTCTTTTGAGAGGTTTTGTCTGCCTGAACTTTAATTGGTGTAGTTGAACCGTACGAGA
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GGAGACACC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 2

CO CL4724Contig1 856 2 2 U
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CTCTCTCTCTAGAACAATGGCTCAGGAAGACGTCGCTGCTGCCGCTGCTACTAACGGTGC
TACTACCGTGGTGGAGAAGGAGAAGTCCGTTACCTTCACGGCGTACAAGCCTCAGCTGAT
CGTGGAAGCACAGAAGGTTGGCGACGCCGTTGCTTTCTACAAGGCGGTGTTTGACGCTGT
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TGCGGTTGCGAAGGCCGTTGCCGCCGGAGCTGTCAAGGTGGAGGAAGAGGAGGTTGGAGT
CAAGGGGAAGGTGACGGATCCGTTCGGTTTAACGTGGATCTTTGTTTCTCCGACGAAAGA
GAGTGAGAAGGAAGATAACAAAGAGGTGGTCTAACTGTCAACCGTCGGATCTGATCTCAT
TCGTCGGTTTCTGAAAAAACTTTTTTAATATTATCCTATGCTTTTTATTTAGTTTGTCTT
TTGTTGGAATCTCCGGTATGGGTAAACCGGATTGATTAGGCTAATGACTTTTGTTGTGTT
TAATTTCACCCCTTTTGACGTAAACTTGGTGAAAGAAATAACGAAAAATCTCGGATGTTA
ATGTTTTGTTTATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH35TF U 1
AF RR4GH35JQ C 186
BS 1 603 RR4GH35TF
BS 604 856 RR4GH35JQ

RD RR4GH35TF 603 0 0
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TACTACCGTGGTGGAGAAGGAGAAGTCCGTTACCTTCACGGCGTACAAGCCTCAGCTGAT
CGTGGAAGCACAGAAGGTTGGCGACGCCGTTGCTTTCTACAAGGCGGTGTTTGACGCTGT
GGAGACTGGACGCTCTCTCTACCCTAAGCGTAAGGCTGACCAAGAGCTCCCTCACCTCGT
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TGCGGTTGCGAAGGCCGTTGCCGCCGGAGCTGTCAAGGTGGAGGAAGAGGAGGTTGGAGT
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GAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4GH35JQ 671 0 0
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TTGCGAAGGCCGTTGCCGCCGGAGCTGTCAAGGTGGAGGAAGAGGAGGTTGGAGTCAAGG
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AGAAGGAAGATAACAAAGAGGTGGTCTAACTGTCAACCGTCGGATCTGATCTCATTCGTC
GGTTTCTGAAAAAACTTTTTTAATATTATCCTATGCTTTTTATTTAGTTTGTCTTTTGTT
GGAATCTCCGGTATGGGTAAACCGGATTGATTAGGCTAATGACTTTTGTTGTGTTTAATT
TCACCCCTTTTGACGTAAACTTGGTGAAAGAAATAACGAAAAATCTCGGATGTTAATGTT
TTGTTTATTAC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL4725Contig1 420 2 1 U
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AAATAATAATGTGTATTTTATGTTTTAGTATTAATTAATAAAAATTATCTGTTTGTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FK22JQ C 1
AF RR4FK22TF U 1
BS 1 420 RR4FK22TF

RD RR4FK22JQ 420 0 0
GGAATGTTCTTCTTCCAATCTATCTCTTTCTCCGTAACAATCAACTCATTTCTCCATCTC
CTCACCGGTTTCACCTCCTCACCATCACCACGGATCTGAGAACGAGCAGACGGTGGAAAA
GACCCGACCCTTCCCTTCTCTCTACTCCCTCCGCGAGTTATTCAAGAGGGAAGGAGAAGT
GGTGTTTGGGAAGATGATGGAACGAGAGAAACAAATGGTGTGACGGTGCGACGCCTCAGG
TGAAGCGTAGTGCGGCGGTGGCAGATGGTGGTGCGGCGGTGGCACGTGGTGGTGCGGCGG
TGGCAGTTGGTGGTGTGGCGGTGGTGTATTTCTATGTATATACGTATTTATGTATAGTAT
AAATAATAATGTGTATTTTATGTTTTAGTATTAATTAATAAAAATTATCTGTTTGTTTTC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4FK22TF 420 0 0
GGAATGTTCTTCTTCCAATCTATCTCTTTCTCCGTAACAATCAACTCATTTCTCCATCTC
CTCACCGGTTTCACCTCCTCACCATCACCACGGATCTGAGAACGAGCAGACGGTGGAAAA
GACCCGACCCTTCCCTTCTCTCTACTCCCTCCGCGAGTTATTCAAGAGGGAAGGAGAAGT
GGTGTTTGGGAAGATGATGGAACGAGAGAAACAAATGGTGTGACGGTGCGACGCCTCAGG
TGAAGCGTAGTGCGGCGGTGGCAGATGGTGGTGCGGCGGTGGCACGTGGTGGTGCGGCGG
TGGCAGTTGGTGGTGTGGCGGTGGTGTATTTCTATGTATATACGTATTTATGTATAGTAT
AAATAATAATGTGTATTTTATGTTTTAGTATTAATTAATAAAAATTATCTGTTTGTTTTC

QA 1 420 1 420
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4727Contig1 726 2 3 U
GAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCCATTGTGGTCGCAGGAG
GCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACACCTTAAAACTGACGTCG
ACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGAT
TTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCGCTTGGTTGTACACCATCACAAA
GGGTTAAAAACAAAAAATATGTGATGAAGAGATAAATTATGCTGCTCAGCTTTTTAATTC
CAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACCCTACGAAATTCGACAATGATTTA
CATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACTATGGATTTGA
GGAGGTAAAGGAACCGTGCTGCAAAATCGGATTAACGGGAGGAGGTGTATTCTGCAAAAA
GAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGGGATGGTGCCCACCC
TACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAATACCTCCGTTATAT
CTGATTAATAACTGTCTTTATTACATTATTAATCTCACCAAAAGTACAACTTTTGCAACG
TATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTGCGACTAATAATCCAAACAACATTTGAGAAT
TTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4FJ62TF U 1
AF RR4FJ62JQ C 196
BS 1 708 RR4FJ62TF
BS 709 709 RR4FJ62JQ
BS 710 726 RR4FJ62TF

RD RR4FJ62TF 726 0 0
GAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCCATTGTGGTCGCAGGAG
GCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACACCTTAAAACTGACGTCG
ACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGAT
TTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCGCTTGGTTGTACACCATCACAAA
GGGTTAAAAACAAAAAATATGTGATGAAGAGATAAATTATGCTGCTCAGCTTTTTAATTC
CAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACCCTACGAAATTCGACAATGATTTA
CATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACTATGGATTTGA
GGAGGTAAAGGAACCGTGCTGCAAAATCGGATTAACGGGAGGAGGTGTATTCTGCAAAAA
GAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGGGATGGTGCCCACCC
TACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAATACCTCCGTTATAT
CTGATTAATAACTGTCTTTATTACATTATTAATCTCACCAAAAGTACAACTTTTGCAACG
TATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTGCGACTAATAATCCAAACA*CATTTGAGAAT
TTAGAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4FJ62JQ 531 0 0
TAGGAGTGATAGGAACACCCCCGCTTGGTTGTACACCATCACAAAGGGTTAAAAACAAAA
AATATGTGATGAAGAGATAAATTATGCTGTTCAGCTTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAAT
TTTGGGTCAGTTGTTGGAAACCCTACGAAATTTGACAATGATTTACATGGACATTTACTT
TATTTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAGGTAAAGGAACC
GTGCTGCAAAATTGGATTAACGGGAGGAGGTGTATTTTGCAAAAAGAAGACATCAAAAAT
ATGTCCCAATACATCGTTTTATTTGTTTTGGGATGGTGCCCCCCCTACTGAGAGAGCTTA
TGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAATACCTCCGTTATATTTGATTAATAACTGT
TTTTATTACATTATTAATTTCACCAAAAGTACAACTTTTGCAACGTATTAATAATGTAGG
CATGAGCGGTTTTTGGGACTAATAATCCAAACAACATTTGAGAATTTAGAT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL4728Contig1 925 2 6 U
GGATCATCATCACTCGCTTTGAACACAAAAGAGTTGTGCATTTTCAAAAAAGACCGGAAC
TTGAGTGCCGCGTCTCTCAGAGAGGAAGATGGAAGAGGTGGAGGAGGAGCGCACTACAAC
AACCCGCGAACCGTGGAAGAAGTCTTCCGAGATTTCAAGGGCCGTCGAGCTGCCATCCTC
CGAGCTCTCACCACCGATGTGCAAGAGTTTTTCCAGCAATGCGACCCTGAGAAGGACAAT
CTTTGCTTGTATGGATTCCGAAATCAAGTATGGGAAGTGAACTTACCAGCTGAAGAAGTA
CCTCCAGAGCTCCCCGAACCTGCACTCGGCATCAACTTTGCCAGAGATGGAATGCACGAA
AAAGACTGGCTTTCTCTCGTTGCTGTCCACAGTGATGCGTGGTTACTTTCTGTCTCCTTT
TTCTTCGGTTCGAAATTTGGTTTTGATAAAACTGACAGGAAGCGCTTGTTCAACATGGTA
AATGAGGTTCCTACTATATTTGAAGTTGTAACTGGAACTGCGAAAACACAAACAAAGGAG
AAACCCTCTTCAGCAAATCAAAATGGCAACACATCCAAGTCAAATTCAAATGTGAGAGAT
TTAGATGGCGAAACCTCAAAGACAATACAACCCATGGACGAAGAAGAAGAAGAGGATGAA
GAAGAGGAAGAGGGTGAAACACAGTGTGGAGCATGTGGAGAGAAGTATGCTTCAGATGAA
TTCTGGATATGCTGTGACATGTGCGAGAAATGGTTCCATGGGACATGTGTGAAGATCACT
CCAGCTAGAGCTGAGCATATCAAGCATTACAAGTGCCCTTCTTGCGCCAACAAAAGAGCT
CGACCCTACTAGTTTTAGTTATCTATCACCCATAATTGTAAAATGATGTCAGTATTTGAA
TCCTCAATCCAACTTTGTTTAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL66TF U 1
AF RR4FL66JQ C 328
BS 1 749 RR4FL66TF
BS 750 750 RR4FL66JQ
BS 751 772 RR4FL66TF
BS 773 773 RR4FL66JQ
BS 774 802 RR4FL66TF
BS 803 925 RR4FL66JQ

RD RR4FL66TF 802 0 0
GGATCATCATCACTCGCTTTGAACACAAAAGAGTTGTGCATTTTCAAAAAAGACCGGAAC
TTGAGTGCCGCGTCTCTCAGAGAGGAAGATGGAAGAGGTGGAGGAGGAGCGCACTACAAC
AACCCGCGAACCGTGGAAGAAGTCTTCCGAGATTTCAAGGGCCGTCGAGCTGCCATCCTC
CGAGCTCTCACCACCGATGTGCAAGAGTTTTTCCAGCAATGCGACCCTGAGAAGGACAAT
CTTTGCTTGTATGGATTCCGAAATCAAGTATGGGAAGTGAACTTACCAGCTGAAGAAGTA
CCTCCAGAGCTCCCCGAACCTGCACTCGGCATCAACTTTGCCAGAGATGGAATGCACGAA
AAAGACTGGCTTTCTCTCGTTGCTGTCCACAGTGATGCGTGGTTACTTTCTGTCTCCTTT
TTCTTCGGTTCGAAATTTGGTTTTGATAAAACTGACAGGAAGCGCTTGTTCAACATGGTA
AATGAGGTTCCTACTATATTTGAAGTTGTAACTGGAACTGCGAAAACACAAACAAAGGAG
AAACCCTCTTCAGCAAATCAAAATGGCAACACATCCAAGTCAAATTCAAATGTGAGAGAT
TTAGATGGCGAAACCTCAAAGACAATACAACCCATGGACGAAGAAGAAGAAGAGGATGAA
GAAGAGGAAGAGGGTGAAACACAGTGTGGAGCATGTGGAGAGAAGTATGCTTCAGATGAA
TTCTGGATATGCTGTGACATGTGCGAGAA*TGGTTCCATGGGACATGTGTGA*GATCACT
CCAGCTAGAGCTGAGCATATCA

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4FL66JQ 598 0 0
GGCATCAACTTTGCCAGAGATGGAATGCACGAAAAAGACTGGCTTTCTCTCGTTGCTGTC
CACAGTGATGCGTGGTTACTTTCTGTCTCCTTTTTCTTCGGTTCGAAATTTGGTTTTGAT
AAAACTGACAGGAAGCGCTTGTTCAACATGGTAAATGAGGTTCCTACTATATTTGAAGTT
GTAACTGGAACTGCGAAAACACAAACAAAGGAGAAACCCTTTTCAGCAAATCAAAATGGC
AACACATCCAAGTCAAATTCAAATGTGAGAGATTTAGATGGCGAAACCTCAAAGACAATA
CAACCCATGGACGAAGAAGAAGAAGAGGATGAAGAAGAGGAAGAGGGTGAAACACAGTGT
GGAGCATGTGGAGAGAAGTATGCTTCAGATGAATTCTGGATATGCTGTGACATGTGCGAG
AAATGGTTCCATGGGACATGTGTGAAGATCACTCCAGCTAGAGCTGAGCATATCAAGCAT
TACAAGTGCCCTTCTTGCGCCAACAAAAGAGCTCGACCCTACTAGTTTTAGTTATCTATC
ACCCATAATTGTAAAATGATGTCAGTATTTGAATCCTCAATCCAACTTTGTTTAACTC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL4729Contig1 755 2 2 U
GGAGATCTATTTCAAAATAAGTTGAGGGAAAAGAATAATAAAACATGGCCAAGATCTCCT
TTGTGCTTCTCCTTCTCCTTCTCGCTCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCAAC
GTTCGACAGATAAAGACGAAAAAGTAACTGAAAACGACATAGGCAAAGAAACAGATAAAG
ATGAAAAAATACTTGAAAACGACCAAGACAAAGAAAGAGATAAAGGTGAAAAAGTAGTTG
AAGACGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAAAGTACTTGAAG
AGGACCTTGATGAAGCCAAAAGCCTGATCGCAGAGGATTTGAAAGAAAAGAAAGCCAACC
TTAAGAACTTGGAAACCGAGGTGAATGTGTTAACCAAATCTGAGACGGCGTTGGATGAGC
TCGGAGAAGCTCACAAAAAGGGTGAGAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAAGCTTAAGAAAT
TCAACAGAAAGCTTAAGCGGACACCAAAGAAAAAGAGATGGCATAATTCAGAGCATTTTG
AAAGATTTGGGATTAAACAGAGGGAGATACTGAAACATGAACTAGGGTTTCATGAACGTT
ATAAAGAGGTTTCATATTGGGCCCATGAAGTTTGGCTTTGCAAATGAGAGGAGCTAATAG
TTTACCCATTGTATGTATATATTTTAATTGCACATAAATTTAATATTAAATCTGATAGAA
CTGTAATATATAAACTACGGAAAATTGAATATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E196TF U 1
AF RR4E196JQ C 206
BS 1 556 RR4E196TF
BS 557 755 RR4E196JQ

RD RR4E196TF 556 0 0
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TTGTGCTTCTCCTTCTCCTTCTCGCTCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCAAC
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AAGACGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAAAGTACTTGAAG
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TCAACAGAAAGCTTAAGCGGACACCAAAGAAAAAGAGATGGCATAATTCAGAGCATTTTG
AAAGATTTGGGATTAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4E196JQ 550 0 0
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CAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAAAGTACTTGAAGAGGACCTTGATGAAGCCAAAAGCCT
GATCGCAGAGGATTTGAAAGAAAAGAAAGCCAACCTTAAGAACTTGGAAACCGAGGTGAA
TGTGTTAACCAAATCTGAGACGGCGTTGGATGAGCTCGGAGAAGCTCACAAAAAGGGTGA
GAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAAGCTTAAGAAATTCAACAGAAAGCTTAAGCGGACACC
AAAGAAAAAGAGATGGCATAATTCAGAGCATTTTGAAGGATTTGGGATTAAACAGAGGGA
GATACTGAAACATGAACTAGGGTTTCATGAACGTTATAAAGAGGTTTCATATTGGGCCCA
TGAAGTTTGGCTTTGCAAATGAGAGGAGCTAATAGTTTACCCATTGTATGTATATATTTT
AATTGCACATAAATTTAATATTAAATCTGATAGAACTGTAATATATAAACTACGGAAAAT
TGAATATTGT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL4730Contig1 423 2 1 U
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CTTTCTGTGTAGTTTGTTTATTTGATCTTTTTTTTTGGTGCACTTGTTTATTTGATCATA
ATC


BQ
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20 20 20 

AF RR4FF72JQ C 1
AF RR4FF72TF U 1
BS 1 423 RR4FF72TF

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GCCGGGCATCATCTACGCACTCTATGCAATCGTTTACGTTGATCGTGATCAGTTTTTCGA
CGAGTACCGTCGCCCACTCTTCTACGCCCAATCACCTTAATTTAATTTATGCGTTCTCTA
TTGTCTGTTTTTTTTAACAATGTTTTGGTTGTTAATTTTATCTATTCCATCGACTACATT
TTCATCTTTCTTTCAATAATTTCAAGATTTTAACACTTGTTTTTGTGACATGCTCAATTT
CTTTCTGTGTAGTTTGTTTATTTGATCTTTTTTTTTGGTGCACTTGTTTATTTGATCATA
ATC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR4FF72TF 423 0 0
GGAGATTTGCTGTGAAATAATGATCGCCATACTCCTTCCTCCACTCGGGGTTTGTTTAAG
GCATGGATGTTGCACTACGGAGTTCATGATATGTCTGATCCTAACGATTCTGGGATACAT
GCCGGGCATCATCTACGCACTCTATGCAATCGTTTACGTTGATCGTGATCAGTTCTTCGA
CGAGTACCGTCGCCCACTCTTCTACGCCCAATCACCTTAATTTAATTTATGCGTTCTCTA
TTGTCTGTTTTTTTTAACAATGTTTTGGTTGTTAATTTTATCTATTCCATCGACTACATT
TTCATCTTTCTTTCAATAATTTCAAGATTTTAACACTTGTTTTTGTGACATGCTCAATTT
CTTTCTGTGTAGTTTGTTTATTTGATCTTTTTTTTTGGTGCACTTGTTTATTTGATCATA
ATC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

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AAGATCCCGATGACTCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGTTCTGAGA
CGTGACGGTCCTCCGCGTAGGGTATTTAATTAAGGGTTTGTTAGATTAAAATCTGTGCGT
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CATTTGGATGCGTACTATAACATTAACCACTCAGTATTCGAAATTACAAAGATTGGTTTA
AATGAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4ES38JQ C 1
AF RR4ES38TF U 1
BS 1 426 RR4ES38TF

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GAGCGAAACAGGCGACTGTTGTGGTTGCAGCTTTGGCTTTTGGATGGTTAGCGATAGAAA
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AAGATCCCGATGACTCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGTTTTGAGA
CGTGACGGTCCTCCGCGTAGGGTATTTAATTAAGGGTTTGTTAGATTAAAATCTGTGCGT
TCAGCTTTGAACTATAACTTAAACAGTTTGTTATGTTTGCATAATTATATGTTTTCTACT
CATTTGGATGCGTACTATAACATTAACCACTCAGTATTCGAAATTACAAAGATTGGTTTA
AATGAT

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4ES38TF 426 0 0
GGGATACACTCCACCGACAAGCGAAAGAGACGACGACACAAGCGATGGGAAAAGCTTCGG
GAGCGAAACAGGCGACTGTTGTGGTTGCAGCTTTGGCTTTTGGATGGTTAGCGATAGAAA
TCGCCTTCAAGCCTTTCCTCGACAAACTCCGCTCCTCAATCGACAAATCCGATCCGGCCA
AAGATCCCGATGACTCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGTTCTGAGA
CGTGACGGTCCTCCGCGTAGGGTATTTAATTAAGGGTTTGTTAGATTAAAATCTGTGCGT
TCAGCTTTGAACTATAACTTAAACAGTTTGTTATGTTTGCATAATTATATGTTTTCTACT
CATTTGGATGCGTACTATAACATTAACCACTCAGTATTCGAAATTACAAAGATTGGTTTA
AATGAT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL4732Contig1 658 2 1 U
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ATGTCCATTTGGGTCAAGCCACCACTACTAGTACTAATCTCCAAGGATAGAGCAATTCTT
GGGTGTAAAAACTATCAAGTACGGCGACTAATCATTTTACAACTATCAAGTACAAATGGA
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ATGTATTCCCCTAAACGAACAGGGGTGACAGATAGCAGGTAATTCAACATATTGAAGGGC
AGAAGGGGAACAACACGTAGCAGCAACACTATCTGTACAGGAAGAAAATATTAACATGTA
ATTAGCAGTCAATCAGTTACATTTAGCCAGAAACTTAAGACACTTTGCCATACTGTTGGT
CCCAGGTATAGCTTGTATGAATAAAAACGAACTAGTATCAACTAACTAAGAGAAAGCTGC
TTCATACCTTGAAGCCAGATCTTTGAATTGCAACGGAAACAGCTTGAAACTTTGGGTAAT
GCTTTATTTTTGAGGTGACATAAGATTTACCTATCTGAATGATAACAGAAAGACAAAAAA
AACATTAGCAACAATGAGACACTAAGATAGGAAAGATGCTACACTTAGTTTGATACGC


BQ
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AF RR4G311TF U 1
AF RR4G311JQ C 237
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DS 

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AAAAAACATTAGCAACAATGAGACACTAAGATAGGAAAGATGCTACACTTAGTTTGATAC
GC

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 2

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AGCTCCGGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B170JQ U 116
AF RR4B170TF C 1
BS 1 115 RR4B170TF
BS 116 549 RR4B170JQ
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QA 1 434 1 434
DS 

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CTTGGCTTCTTCCTTTGATGGCCACAAAGGCTCCCTGAGGTTTGGGTCGTAGGAAAGCAA
AGCTCCGGCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL4734Contig1 537 2 14 U
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BQ
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AF RR4DW69TF U 1
AF RR4FX08TF U 1
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BS 46 46 RR4FX08TF
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BS 162 227 RR4DW69TF
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BS 229 420 RR4DW69TF
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BS 461 462 RR4FX08TF
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RD RR4DW69TF 518 0 0
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QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4FX08TF 537 0 0
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TAAATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGCATGAAAAAGCTTTTCTGCAAATCATTAC
CAAGCAATCATGCTGGAGCATGCGGAAAAAA*TGGAATTAATTTATGCGTAGAGGACATG
AAAAAGATGAGTGTAACAAATACTGGAAAACCTGTGCCAAAAGGATGGGGAGTACAATGT
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CGATATGATTGCTAAATTTTAAAATACATATATGCATAATCTCTTTACTAATAAAGACAT
AAAATCAATGTAATAGAGATCTTTTTGCGTAGATCTAGCAGGAAAAACAGCTCATGTCTT
ATTAATAATTTTCCAAGTTAGATTGGTTATGGTTCAAAATAAATATAAAGTTTATCT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL4735Contig1 1206 2 2 U
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CAACCCGCTTAGGAACCAAAATGGACCGGGGAGGCCACAGACCACGGGTAATCTTGACCT
TGACTACTACCAATCCACGTGTCCACAAGTGGACACCATTGTCCGCCGTGTCGTATTTCA
ATACGTCTCTCGCAGGCCAACTCTTGCTCCTGCGCTTCTAAGGATGCATTTTCGCGACTG
CTTTGTTAGAGGATGTGATGGTTCCATTCTTCTGAAGTCACCAAACAATGATGCGGAAAG
AGACGCTGTCCCTAACTTGTCATTGAGAGGCTTCGAAGTGGTCGATGCTGCCAAATCAGC
TCTCGAGAGGACTAGGGGTTGTCGTAGTATTGTCTCTTGCGCTGATATTATTGCCTTGGT
CGCTAGAGACGCTGTTTCAGTGATCGGGGGACCATGGTGGCCTGTTCCACTGGGGAGGAG
GGACGGAAGCATCTCGAAGGTTTCCGAGGTTAATTTACCATCTCCTTTTTCTAACGTAAC
GACACTGAAGAAGAACTTCCTTGACAAGGGTCTTAACACTAAAGACCTAGTCGTCCTCTC
AGGGGCTCACACCATAGGTGTGTCTTCTTGCGCTATCATCAACAACCGTATCCATAACTT
CACGGGCAAAGGCGACTTTGACCCAGCGATGAACCCTAGCTACGTTAGGGCGTTGAAGAA
AAGGTGCAATCCAACTGATTTCAAGACCCCTTTGGATATGGACCCAGGCAGTGCCAAAAA
ATTTGACTCTCACTACTTCAACATTGTGGCTCAGAAGAAGGGCTTGTTCACATCTGATGC
AACACTTCTCGATGACCTTGACACCAACCTCCACATTCAGGCGCAGGTCTTGACTAGTGG
GGCTTCCTTCAACAGAGATTTCCCCGAATCAATGGTTAAACTTGGTTTCGTCGAGATTCT
TACCGGAAAGCAAGGTGTGGTCAGGAGGAGATGCGCTTTTGTTAACTAACTTCGGACTCA
TGATGATTGAAGTCTAAAATATTTTCTGCTTATTATGTTCTTTTATTTAAGTCCTTTTTC
CACGGATGTTCTTTGTGTTTGAATTTCAAAAATGTGTAATAATGTATTTCTTCTTTTCTC
GAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4H623TF U 1
AF RR4H623JQB C 376
BS 1 536 RR4H623TF
BS 537 1206 RR4H623JQB

RD RR4H623TF 536 0 0
GATCCCTAAACTTGGCTTAATACTCAAACAAAGAAGAGAGACAACAATGGCCCTCAAGAA
CTTACTTGCCCTTGTGGTTCTTCTTGCCTTTGTTGGAGTTTCCGTTGCAAAGCCATATGA
CAACCCGCTTAGGAACCAAAATGGACCGGGGAGGCCACAGACCACGGGTAATCTTGACCT
TGACTACTACCAATCCACGTGTCCACAAGTGGACACCATTGTCCGCCGTGTCGTATTTCA
ATACGTCTCTCGCAGGCCAACTCTTGCTCCTGCGCTTCTAAGGATGCATTTTCGCGACTG
CTTTGTTAGAGGATGTGATGGTTCCATTCTTCTGAAGTCACCAAACAATGATGCGGAAAG
AGACGCTGTCCCTAACTTGTCATTGAGAGGCTTCGAAGTGGTCGATGCTGCCAAATCAGC
TCTCGAGAGGACTAGGGGTTGTCGTAGTATTGTCTCTTGCGCTGATATTATTGCCTTGGT
CGCTAGAGACGCTGTTTCAGTGATCGGGGGACCATGGTGGCCTGTTCCACTGGGGA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4H623JQB 831 0 0
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GGGTTGTCGTAGTATTGTCTCTTGCGCTGATATTATTGCCTTGGTCGCTAGAGACGCTGT
TTCAGTGATCGGGGGACCATGGTGGCCTGTTCCACTGGGGAGGAGGGACGGAAGCATCTC
GAAGGTTTCCGAGGTTAATTTACCATCTCCTTTTTCTAACGTAACGACACTGAAGAAGAA
CTTCCTTGACAAGGGTCTTAACACTAAAGACCTAGTCGTCCTCTCAGGGGCTCACACCAT
AGGTGTGTCTTCTTGCGCTATCATCAACAACCGTATCCATAACTTCACGGGCAAAGGCGA
CTTTGACCCAGCGATGAACCCTAGCTACGTTAGGGCGTTGAAGAAAAGGTGCAATCCAAC
TGATTTCAAGACCCCTTTGGATATGGACCCAGGCAGTGCCAAAAAATTTGACTCTCACTA
CTTCAACATTGTGGCTCAGAAGAAGGGCTTGTTCACATCTGATGCAACACTTCTCGATGA
CCTTGACACCAACCTCCACATTCAGGCGCAGGTCTTGACTAGTGGGGCTTCCTTCAACAG
AGATTTCCCCGAATCAATGGTTAAACTTGGTTTCGTCGAGATTCTTACCGGAAAGCAAGG
TGTGGTCAGGAGGAGATGCGCTTTTGTTAACTAACTTCGGACTCATGATGATTGAAGTCT
AAAATATTTTCTGCTTATTATGTTCTTTTATTTAAGTCCTTTTTCCACGGATGTTCTTTG
TGTTTGAATTTCAAAAATGTGTAATAATGTATTTCTTCTTTTCTCGAATGT

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL4736Contig1 531 2 2 U
GCCGAGTTCCTTAGAGAGAGTTGTCTCGCGCCCCTAGGTATTCTCTACCTACCCACCTGT
GTCGGTTTCGGGTACAGGTACCCTTTTGTTGAAGGTCGTTCGAGCTTTTCCTGGGAGTAT
AGCATGGGTTACTTCAGTGCCGTAGCGCCTGGTACTCGAACATTGGCTCGGGGCATTTTC
TCTACCCCTTCTTACCCTGAAAAAACAGGGACACCTTGCGTTCTTGAACCGATAACCATC
TTTCGGCTAACCTAGCCTCCTCCGTCCCTCGGGACCAACAAGGGGTAGTACAGGAATATT
CACCTGTTGTCCATCGACTACGCCTTTCGGCCTGATCTTAGGCCCTGACTCACCCTCCGT
GGACGAACCTTGCGGAGGAACCCTTGGGTTTTCGGGGCATTGGATTCTCACCAATGTTTG
CGTTACTCAAGCCGACATTCTCGCTTCCGCTTCGTCCACCGCCGCTCGCGCGGTTGCTTC
CCCCTAAGGCGGAACGCTCCCCTACCGATGCATTTTGACATCCCACAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GV70TF C 1
AF RR4GV70JQ U 62
BS 1 61 RR4GV70TF
BS 62 531 RR4GV70JQ

RD RR4GV70TF 527 0 0
GCCGAGTTCCTTAGAGAGAGTTGTCTCGCGCCCCTAGGTATTCTCTACCTACCCACCTGT
GTCGGTTTCGGGTACAGGTACCCTTTTGTTGAAGGTCGTTCGAGCTTTTCCTGGGAGTAT
AGCATGGGTTACTTCAGTGCCGTAGCGCCTGGTACTCGAACATTGGCTCGGGGCATTTTC
TCTACCCCTTCTTACCCTGAAAAAACAGGGACACCTTGCGTTCTTGAACCGATAACCATC
TTTCGGCTAACCTAGCCTCCTCCGTCCCTCGGGACCAACAAGGGGTAGTACAGGAATATT
CACCTGTTGTCCATCGACTACGCCTTTCGGCCTGATCTTAGGCCCTGACTCACCCTCCGT
GGACGAACCTTGCGGAGGAACCCTTGGGTTTTCGGGGCATTGGATTCTCACCAATGTTTG
CGTTACTCAAGCCGACATTCTCGCTTCCGCTTCGTCCACCGCCGCTCGCGCGGTTGCTTC
CCCCTAAGGCGGAACGCTCCCCTACCGATGCATTTTGAC
TCCCACAG

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4GV70JQ 470 0 0
TCGGTTTCGGGTACAGGTACCCTTTTGTTGAAGGTCGTTCGAGCTTTTCCTGGGAGTATA
GCATGGGTTACTTCAGTGCCGTAGCGCCTGGTACTCGAACATTGGCTCGGGGCATTTTCT
CTACCCCTTCTTACCCTGAAAAAACAGGGACACCTTGCGTTCTTGAACCGATAACCATCT
TTCGGCTAACCTAGCCTCCTCCGTCCCTCGGGACCAACAAGGGGTAGTACAGGAATATTC
ACCTGTTGTCCATCGACTACGCCTTTCGGCCTGATCTTAGGCCCTGACTCACCCTCCGTG
GACGAACCTTGCGGAGGAACCCTTGGGTTTTCGGGGCATTGGATTCTCACCAATGTTTGC
GTTACTCAAGCCGACATTCTCGCTTCCGCTTCGTCCACCGCCGCTCGCGCGGTTGCTTCC
CCCTAAGGCGGAACGCTCCCCTACCGATGCATTTTGACATCCCACAGCTC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL4737Contig1 1020 2 2 U
GGGCGTTTTACACAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCAGGCTA
CGAAGATCAATATCCATGGCGATAAGATCAGTCAAAGTTAGCAATCTCTCATCAGGAGCA
ACAGAACATGGTATCAAAGAGTTCTTCTCTTTTTCCGGTGATGTTGAAAGCATTGACATC
CAAAGCAATGAGCATAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGACCGCT
GTGCTCTTATCAGGTGCAAGTATTGCCGATCAATCAGTCATCATTGAGATGGCTCCTAAC
TACACTCCACCTACTGCCCCTCATGCTGAAACACAGAGCGGTGGCGGAGGCGTCGCAGAA
TCAGTTGTCCAGAAGGCAGAAGATGTTGTGAGCAGCATGTTAGCGAAGGGTTTCATCCTC
GGTAAAGACGCTGTCGGCAAAGCAAAAGCTTTTGATGAGAAACTCGGTTTCACTTCAACG
GCAACCGCAGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAAATCGGCCTAACCCAAAAAATCACTGCT
GGTACAAGCTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGAGTGGACCAAAGCTTCCAGGTCACAGAG
AGAACCAAGTCTGCCTTTGCAACTGCGGAACAGACGGTGAGCAGCGCGGGAACGGCCGTG
ATGAAGAACCGTTTTGTATTAACAGGTGTGAGCTGGGCGGCAGGAGCGTTCAACAGAGTT
GCTAAAGCGGCTGGAGAGGTTAGTCAGAAAACAAAAGAAAAGGTTGAAGCTGAGCAACCA
CCACAACCGTCGCAGACAGAGCATCAACCACCAGAAGGGTATTCTCCGATTCATTCGTCT
GAATCGAAGCACTAAATCTCATTACAGTGAAAAAGGTTGCGTTTTCTTTTTCTTGTTGGT
TTCTTTGTTATGAAAAATGTGGGATTTTTTTTTGTCTTTTGGATTGTAACATAAAAGCTA
TGTTTGGATCTTCTACATTCCTAGTTCGTGTTTCTTATAAGATATCATATAGTATTCACT


BQ
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TTATAAGATATCATATAGTATTCACT

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AF RR4EH73TF U 1
AF RR4EH73JQ C 287
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AAGAAGGCGTTCCTCCCACCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTTGCTCGCG
ATCCCCACATCGTCAGATTGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCAAGACTG
TGCTCTACCTCGTGTTCGAGTACGTTGACACTGATCTCAAGAAGTTCATCAGGAGCTTCA
AGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCAGATCACTGTCAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCA
AAGGCATGGCTTTCTGCCATGGCCATGGAGTGTTACACAGGGATCTTAAGCCTCACAATC
TCTTGATGGACCGTCAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCT
TCACTCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAGCTCCAG
AAGTCCTTCTCGGTGCAGCCCATTACTCAACCGCTGTTGATATGTGGTCTGTTGGCTGCA
TTTTTGCTGAACTTGTGAACAAGCAAGCAATCTTTGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGC
TCCTCAGTATTTTCAG*TTGCTAGGA*CACCAAACGA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4EH73JQ 837 0 0
AGAAGGCAAGACTGTGCTCTACCTCGTGTTCGAGTACGTTGACACTGATCTCAAGAAGTT
CATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCAGATCACTGTCAAGTGTTTGAT
GTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCATGGCCATGGAGTGTTACACAGGGATCT
TAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGTCAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGG
ATTAGCCAGAGCCTTCACTCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATG
GTATAGAGCTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAGCCCATTACTCAACCGCTGTTGATATGTG
GTCTGTTGGCTGCATTTTTGCTGAACTTGTGAACAAGCAAGCAATCTTTGCTGGAGACTC
TGAGCTCCAACAGCTCCTCAGTATTTTCAGGTTGCTAGGAACACCAAACGAACAAGTGTG
GCCTGGAGTGAGCAAACTCAAGACTGGCATGAATACCCACAGTGGAAACCTTTGAGCCTC
TCAACAGCTGTTCCAAACCTCGATGAGTCCGGACTTGATCTCTTATCAAAAATGCTGGAG
TATGAGCCAGTGAAACGAATCTCAGCTAAGAAGGCTATGGAGCATCCTTACTTCGATGAT
CTACCTGACAAATCCCTTCTCTGAAGATCTCTTTATGAACGAACTCTCTCTCTGTAGTCT
TGTTTGTTCCAACTTTGTCATTGCTTGTCTCAAGCACCTTATCTTGCTCTCTTAGTAGGA
TGATCAACCTTTTCAAATGGGGTCTATGTTCCCAGTCGTATAAACCTCAACTTCGTT

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL4740Contig1 425 2 1 U
GCAGGAGATCAACATCTTCCACCACCAGGATATCCAGCTCCAGAAGAGGTCTCTGGACAA
CCAGGACAGGACAAGAATAAGAAGAAGCCCTTCGAGACAAAGCAGAAAGGAGACAGAGGC
TTCATTGAAGGATGTCTCTTTGCACTATGCTGCTGCTGGATCTGTGACATGTGTTTCTAA
GACATAGAAGGATGAACGTAACGTATCTATAACTATTAGTGGCTTTTAATATAATTATTA
CTACCGAGAGCGTTTGAAGGACTATATAGTAGCTCAATCTGAACTTTCTTATACTATCCG
TGTGGTGTTTGTATATATTAAACGGAGATTATTATTATACTCAATAATGTAAAGGTCATC
ACCATATTTTCTGAGCTGATATAGGATCGGTTAGAGAATTGAACAAACCAGATTGATACT
GGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR4H493JQB C 1
AF RR4H493TF U 1
BS 1 425 RR4H493TF

RD RR4H493JQB 425 0 0
GCAGGAGATCAACATCTTCCACCACCAGGATATCCAGCTCCAGAAGAGGTCTCTGGACAA
CCAGGACAGGACAAGAATAAGAAGAAGCCCTTCGAGACAAAGCAGAAAGGAGACAGAGGC
TTCATTGAAGGATGTCTCTTTGCACTATGCTGCTGCTGGATCTGTGACATGTGTTTTTAA
GACATAGAAGGATGAACGTAACGTATCTATAACTATTAGTGGCTTTTAATATAATTATTA
CTACCGAGAGCGTTTGAAGGACTATATAGTAGCTCAATCTGAACTTTCTTATACTATCCG
TGTGGTGTTTGTATATATTAAACGGAGATTATTATTATACTCAATAATGTAAAGGTCATC
ACCATATTTTCTGAGCTGATATAGGATCGGTTAGAGAATTGAACAAACCAGATTGATACT
GGATC

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4H493TF 425 0 0
GCAGGAGATCAACATCTTCCACCACCAGGATATCCAGCTCCAGAAGAGGTCTCTGGACAA
CCAGGACAGGACAAGAATAAGAAGAAGCCCTTCGAGACAAAGCAGAAAGGAGACAGAGGC
TTCATTGAAGGATGTCTCTTTGCACTATGCTGCTGCTGGATCTGTGACATGTGTTTCTAA
GACATAGAAGGATGAACGTAACGTATCTATAACTATTAGTGGCTTTTAATATAATTATTA
CTACCGAGAGCGTTTGAAGGACTATATAGTAGCTCAATCTGAACTTTCTTATACTATCCG
TGTGGTGTTTGTATATATTAAACGGAGATTATTATTATACTCAATAATGTAAAGGTCATC
ACCATATTTTCTGAGCTGATATAGGATCGGTTAGAGAATTGAACAAACCAGATTGATACT
GGATC

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 2

CO CL4741Contig1 731 2 5 U
TTTTTTTGATAGGGAGAGAGAAGAGTGAGGCGATCGATTAGGGTTTGTGTTCGTCGGAAT
TTTCTATATTGATCGGAAGGTATGAGCACGGTGGAAGCTGTGATAAAGTCAATCCAGGGA
CTATCAGCGAGCTCCAGGGACTTATCCGCACTTCACGATGTTTTGAAAGGAGCTAACGAG
TCGCTCCGAGCCGACTCGGATCTTCAGCTTTCTACACTTGACCAGCTCGACCCCTCGAAG
CATTCTCTCGGCTACCTCTATCTCCTCGACGTTCTTACGTGTGGTCCAGTGCCCAATGAT
GTGGTTCTGTTGATTGCTCGGTTCATCAACGCTTGCGATGCTGTGCAGATTCGTCTAGCG
AGCGAAAAATTTGTTTCTCTTTGTAAGAGATTCAAAGACAAAGTTTTGGAGCTCAGAGAT
CCTTTACGAGGGGTGGGGCCACTGTTGAAAGCTGTTCATAAGGTTCAGGTCTCCACCAAA
CGTTTGACTGCATTGCATCCGGATCGTCTTCAGCTGTGTTTGCTGGCGAAGTGCTATAAA
GCTGGTTTCTCCGTTCTTAGTGATGATATCTTGGAGGTTGACCAGCCTAGAGATTTTTAT
CTCTATTGCCATTATGGGGGAATGATATGCATTGGGTTGAAGAGATTCCAGAAAGCATTG
GAGCTTCTTTATAATGTTGTCACTGCTCCAATGCATATTGTCAACGCCATAGCTCTTGAG
CGTATAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4DN19TF U 1
AF RR4EL20TF U 1
BS 1 196 RR4DN19TF
BS 197 197 RR4EL20TF
BS 198 504 RR4DN19TF
BS 505 505 RR4EL20TF
BS 506 731 RR4DN19TF

RD RR4DN19TF 731 0 0
TTTTTTTGATAGGGAGAGAGAAGAGTGAGGCGATCGATTAGGGTTTGTGTTCGTCGGAAT
TTTCTATATTGATCGGAAGGTATGAGCACGGTGGAAGCTGTGATAAAGTCAATCCAGGGA
CTATCAGCGAGCTCCAGGGACTTATCCGCACTTCACGATGTTTTGAAAGGAGCTAACGAG
TCGCTCCGAGCCGACTTGGATCTTCAGCTTTCTACACTTGACCAGCTCGACCCCTCGAAG
CATTCTCTCGGCTACCTCTATCTCCTCGACGTTCTTACGTGTGGTCCAGTGCCCAATGAT
GTGGTTCTGTTGATTGCTCGGTTCATCAACGCTTGCGATGCTGTGCAGATTCGTCTAGCG
AGCGAAAAATTTGTTTCTCTTTGTAAGAGATTCAAAGACAAAGTTTTGGAGCTCAGAGAT
CCTTTACGAGGGGTGGGGCCACTGTTGAAAGCTGTTCATAAGGTTCAGGTCTCCACCAAA
CGTTTGACTGCATTGCATCCGGATTGTCTTCAGCTGTGTTTGCTGGCGAAGTGCTATAAA
GCTGGTTTCTCCGTTCTTAGTGATGATATCTTGGAGGTTGACCAGCCTAGAGATTTTTAT
CTCTATTGCCATTATGGGGGAATGATATGCATTGGGTTGAAGAGATTCCAGAAAGCATTG
GAGCTTCTTTATAATGTTGTCACTGCTCCAATGCATATTGTCAACGCCATAGCTCTTGAG
CGTATAAAAAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4EL20TF 730 0 0
TTTTTTTGATAGGGAGAGAGAAGAGTGAGGCGATCGATTAGGGTTTGTGTTCGTCGGAAT
TTTCTATATTGATCGGAAGGTATGAGCACGGTGGAAGCTGTGATAAAGTCAATCCAGGGA
CTATCAGCGAGCTCCAGGGACTTATCCGCACTTCACGATGTTTTGAAAGGAGCTAACGAG
TCGCTCCGAGCCGACTCGGATCTTCAGCTTTCTACACTTGACCAGCTCGACCCCTCGAAG
CATTCTCTCGGCTACCTCTATCTCCTCGACGTTCTTACGTGTGGTCCAGTGCCCAATGAT
GTGGTTCTGTTGATTGCTCGGTTCATCAACGCTTGCGATGCTGTGCAGATTCGTCTAGCG
AGCGAAAAATTTGTTTCTCTTTGTAAGAGATTCAAAGACAAAGTTTTGGAGCTCAGAGAT
CCTTTACGAGGGGTGGGGCCACTGTTGAAAGCTGTTCATAAGGTTCAGGTCTCCACCAAA
CGTTTGACTGCATTGCATCCGGATCGTCTTCAGCTGTGTTTGCTGGCGAAGTGCTATAAA
GCTGGTTTCTCCGTTCTTAGTGATGATATCTTGGAGGTTGACCAGCCTAGAGATTTTTAT
CTCTATTGCTATTATGGGGGAATGATATGCATTGGGTTGAAGAGATTCCAGAAAGCATTG
GAGCTTCTTTATAATGTTGTCACTGCTCCAATGCATATTGTCAACGCCATAGCTCTTGAG
CGTATAAAAA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4742Contig1 1018 2 8 U
GGCTGTGTAGAAATTTTTCGCATTGATTTCTGATGCCAGTTGTATGCAACTTATGACAAA
CACAATAATAATATCTGTTACAGAAAGATCTCTTGCTTATCTTGGTATAAACCCAAGTAT
TATATCTTTCAAGGAAACATTAAGAAGTATAGTGTTTTTGACTCAAAGCTTGGAAGGAGG
TTTGTACCATCCCCATGGTTCATTAGAGATATACTGTGTCACCTGCTTCACACTCAAGTA
GTTCTCAAGTCCCCATTCTCCTAGTTCACGGCCAAAACCACTGCGTTTGGTTCCACCCCA
TGGAGCCTGACAGAAACATGGCTGAAAGCAGTTGACCCACACAATACCCGCCTCGAATGC
CTTACTAACGCGATCACACCTCTCCAGATCATTTGATAATACAGCGCCTGCTAATCCATA
TTGGGAGTCATTTGCCAGCTGTATTGCCTCATCCTCAGTGGAGAATGTTTTAACACAGAG
AACAGGACCAAAAACTTCGTCTCTCCAGATTTCCATTGAAGTAGTCACATTTGATATTAT
AGCAGGTTCAACAAAATACCCCTTCTTCAGATGCTCAGGACGAGCTCCTCCGCAGAGGAC
AGTTGCACCTTCCTTCCTAGCGTTTGATACAAACTTCACTACTCTCTCGTACTGTCCTTT
GCTGACAACAGGACCAAGCCTACAGCCTTCTTCAAAAGGATCTGAAATCTTAATGTTCTT
TGTCCACTTTACCAACTTGCCCAAAAATTCGTCAGCAATCTTTTCATGCACAAGAAGTCG
AGATGTCGCACTGCAAATCTGACCATTAGTCCAGAAACAACCAAACATAGTCCACTCCAC
AGCTTTGTCAATGTCAACATCCTCAAAGACAATGATAGGGCTTTTACCCCCAAGCTCCAA
GGAAACAGGTTTGACCAGTTTTGCAGCAGAAGTAATAATGTTGCTTCCAGTTGCCGTGCT
TCCAGTGAACACAATCTTGTCAACGTTTGGATGCGCTGCCAATGGAGCACCTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EY42JQ U 1
AF RR4DM65TF C 302
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BS 472 472 RR4DM65TF
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RD RR4EY42JQ 793 0 0
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CACAATAATAATATCTGTTACAGAAAGATCTCTTGCTTATCTTGGTATAAACCCAAGTAT
TATATCTTTCAAGGAAACATTAAGAAGTATAGTGTTTTTGACTCAAAGCTTGGAAGGAGG
TTTGTACCATCCCCATGGTTCATTAGAGATATACTGTGTCACCTGCTTCACACTCAAGTA
GTTCTCAAGTCCCCATTCTCCTAGTTCACGGCCAAAACCACTGCGTTTGGTTCCACCCCA
TGGAGCCTGACAGAAACATGGCTGAAAGCAGTTGACCCACACAATACCCGCCTCGAATGC
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TTGGGAGTCATTTGCCAGCTGTATTGCCTCATCCTCAGTGGAGAATGTTTTGACACAGAG
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GCTGACAACAGGACCAAGCCTACAGCCTTCTTCAAAAGGATCTGAAATCTTAATGTTCTT
TGTCCACTTTACCAACTTGTCCAAAAATTCGTCAGCAATCTTTTCATGCACAAGAAGTCG
AGATGTCGCACTG

QA 1 793 1 793
DS 

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TGGAG
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ACCAAA**CTTCGTCTCTCCAGATTTCCATTGAAGTAGTCACATTTGATATTATAGCAGG
TTCAACAAAATACCCCTTCTTCAGATGCTCAGGACGAGCTCCTCCGCAGAGGACAGTTGC
ACCTTCCTTCCTAGCGTTTGATACAAACTTCACTACTCTCTCGTACTGTCCTTTGCTGAC
AACAGGACCAAGCCTACAGCCTTCTTCAAAAGGATCTGAAATCTTAATGTTCTTTGTCCA
CTTTACCAACTTGCGCAAAAATTCGTCAGCAATCTTTTCATGCACAAGAAGTCGAGATGT
CGCACTGCAAATCTGACCATTAGTCCAGAAACAACCAAACATAGTCCACTCCACAGCTTT
GTCAATGTCAACATCCTCAAAGACAATGATAGGGCTTTTACCCCCAAGCTCCAAGGAAAC
AGGTTTGACCAGTTTTGCAGCAGAAGTAATAATGTTGCTTCCAGTTGCCGTGCTTCCAGT
GAACACAATCTTGTCAACGTTTGGATGCGCTGCCAATGGAGCACCTGCTTCC

QA 6 717 6 717
DS 



AS 1 2

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TCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAATTGATTTCTC
TACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACGGAAGAGCT
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TGTGTTCTTCTATTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DH20TF U 1
AF RR4ES37TF U 1
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TCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAATTGATTTCTC
TACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACGGAAGAGCT
AATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAGAATAAATAAAA
TGTGTTCTTCT

QA 1 431 1 431
DS 

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GCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGCC
GCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGTG
TCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAATTTATTTCTC
TACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACGGAAGAGCT
AATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAAAA
TGTGTTCTTCTATTC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL4744Contig1 853 2 2 U
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CGAGTTGCTTTTATCCGATTCCACAAGCGGCGGAGTGTATTGCTAGGATGGTGGAAAGAT
CCAACGGTGCAGTAATCTATCTTTCAACAGATGCTGCGGAAAGTGAAACAAGTCTGCTTC
AGTCACTTGTTGTGGTCGATGGAAAAATTGTGCCACTTGTTAAACGTCCACCGCGTAATT
CAGCTGAGAAATGGGATGCATTGTTATATCGACATGGTATAGAGGATGACTCTCAGGTGG
ATGCAATGCTGGATAAAACGATATGTGCCATGTCCAGCGTCTTCATTGGAGCCTCTGGAT
CGACTTTCGCGGAGGATATCTTGAGGCTAAGGAAAGATTGGGGGACATCTTCTACGTGCG
ACGAGTACTTATGTCGAGGGGAAGAACCAAACTTCATAGTAGAAGATGAATAGGTAAAGC
ACGCAATTTTTTTTCTTACCAACTTGTTTTATTCCCACATTCCATTGTTCTCTTATTCTA
GTTGAATCGTAGTTAGTTATAGAAATCCGATTTTGGATACCTTTTTCCACTTTTATTTTT
TCCATTTTTATTTTTTCCGTGATGGTGTGGAGATAACAGTGTGAATCGATAGAAGAAAGA
GCCTCGGTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A432TF U 1
AF RR4A432JQ C 322
BS 1 777 RR4A432TF
BS 778 853 RR4A432JQ

RD RR4A432TF 777 0 0
GTTTCAAGTCTGATGATGATGACGTGATCGCGATTGGGGATGTTTTCTATGCTGATATGG
AGCAAGAATGGGTGATGCAGCCTGGTGGACCTATTAACCACAAGTGCAAGACCTTGATTG
AACCCAGTAAGCTTATTCTGTTGACAGCTCAGCGGTTCATACAGACCTTCTTGGGGAACA
ATTTCGTCGCGGTTCATTTCCGTCGACATGGGTTCCTCAAATTTTGCAATGCGAAAGCGC
CGAGTTGCTTTTATCCGATTCCACAAGCGGCGGAGTGTATTGCTAGGATGGTGGAAAGAT
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AGTCACTTGTTGTGGTCGATGGAAAAATTGTGCCACTTGTTAAACGTCCACCGCGTAATT
CAGCTGAGAAATGGGATGCATTGTTATATCGACATGGTATAGAGGATGACTCTCAGGTGG
ATGCAATGCTGGATAAAACGATATGTGCCATGTCCAGCGTCTTCATTGGAGCCTCTGGAT
CGACTTTCGCGGAGGATATCTTGAGGCTAAGGAAAGATTGGGGGACATCTTCTACGTGCG
ACGAGTACTTATGTCGAGGGGAAGAACCAAACTTCATAGTAGAAGATGAATAGGTAAAGC
ACGCAATTTTTTTTCTTACCAACTTGTTTTATTCCCACATTCCATTGTTCTCTTATTCTA
GTTGAATCGTAGTTAGTTATAGAAATCCGATTTTGGATACCTTTTTCCACTTTTATT

QA 1 777 1 777
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GAAAAATTGTGCCACTTGTTAAACGTCCACCGCGTAATTCAGCTGAGAAATGGGATGCAT
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TGAGGCTAAGGAAAGATTGGGGGACATTTTTTACGTGCGACGAGTACTTATGTCGAGGGG
AAGAACCAAACTTCATAGTAGAAGATGAATAGGTAAAGCACGCAATTTTTTTTTTTACCA
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GAAATCCGATTTTGGATACCTTTTTCCACTTTTATTTTTTCCATTTTTATTTTTTCCGTG
ATGGTGTGGAGATAACAGTGTGAATCGATAGAAGAAAGAGCCTCGGTTTTTT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

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CTTCAATCCTTCTGGCAATTTCGATATCTCTGCCTTGGACTCTCACGACGATTCAGATAA
AGTGGAACCTCCGATGCCTCCAACGAGCGGCCGATACGAAGTAGTCATAGATAACGACTC
TATTCAGCGCCTTGACTTATCTCCTTTTCAGACTGCCACCGGCATCACCTCACCTTCCTC
AGCTGATCCAAGAGAGTATATGGATCGGAGCATCGGATTCACGATCAATTACAAGAGAGA
AGACCCAGGGGACCCCCGTGAGCTTTCCGAGTATCCGGACATAAGGCTTTGGTTCGTCAG
ACTCGATGCCATGTACCCTTGGCTTCCTCTCCTCCTTGACTGGAGAGCCGGTGAGCTTGC
TCGTTACGCCGCCATGCTTGTCCCTCACCAGATGAGCTTGAGAATGGGTGTTGTTTTCAA
TCCTGAGGCTTTGGAGCTCTTCGTCATGACCAAAGTCTTTGTGGTTTATCCTTGGCTCAA
ACGTCACGGTGTCCCCAAGCCTAGGCTCAAGACCTCTGACATGGCTAGGATGCTCGGCTT
CGGTATCGGCGACCAGCTCTTCGACTTGATCGATCATCATACCGATTCTCTTTAGGTCTC
TTCTTTCCTCCAGTTTCCTTGGTCTGATTCTCAATAATGTAAGAACCATTCCCATGAATA
CTTATTATTGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM81TF U 1
AF RR4EG64JQ C 177
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BS 673 854 RR4EG64JQ

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AGACCCAGGGGACCCCCGTGAGCTTTCCGAGTATCCGGACATAAGGCTTTGGTTCGTCAG
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ACGTCACGGTGT

QA 1 672 1 672
DS 

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**AAAGTGGAACCTCCGATGCCTCCAACGAGCGGCCGATACGAAGTAGTCATAGATAACG
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CCTCAGCTGATCCAAGAGAGTATATGGATCGGAGCATCGGATTCACGATCAATTACAAGG
GAGAAGACCCAGGGGATCCCCGTGAGCTTTCCGAGTATCCGGACATAAGGCTTTGGTTCG
TCAGACTCGATGCCATGTACCCTTGGCTTCCTCTCCTCCTTGACTGGAGAGCCGGTGAGC
TTGCTCGTTACGCCGCCATGCTTGTCCCTCACCAGATGAGCTTGAGAATGGGTGTTGTTT
TCAATCCTGAGGCTTTGGAGCTCTTCGTCATGACCAAAGTCTTTGTGGTTTATCCTTGGC
TCAAACGTCACGGTGTCCCCAAGCCTAGGCTCAAGACCTCTGACATGGCTAGGATGCTCG
GCTTCGGTATCGGCGACCAGCTCTTCGACTTGATCGATCATCATACCGATTCTCTTTAGG
TCTCTTCTTTCCTCCAGTTTCCTTGGTCTGATTCTCAATAATGTAAGAACCATTCCCATG
AATACTTATTATTGATAG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

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CTTTCACCTCCAAAACTGAATGGCTCAAATGCGAAAACGCGATCCTTTGGGGTATCTGGC
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ATAGTTAGCGTGGATGGAGCCACGGCAGTTGCAGGAAGTTGAGAATTAGAATTTCGAGTT
TAACGGGTGACTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI66JQ U 210
AF RR4AI66TF C 1
BS 1 209 RR4AI66TF
BS 210 636 RR4AI66JQ
BS 637 734 RR4AI66TF

RD RR4AI66JQ 427 0 0
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ACCCTTGCGCTTTTGTTCCTTCTTGATTGGTCTTTCACCTCCAAAACTGAATGGCTCAAA
TGCGAAAACGCGATCCTTTGGGGTATCTGGCATTGCGGCATATGTCCCTTCACGGTGCGA
TGAACCTTCTGATTCTTTATACTGTAGCTGCTTCTGAAGATTCAGTAGTGTTAGGATTTC
TTTTCGTAATTCGAGATGCCCATCGCATACAGTTTTTGTAGGAACCTTTGGCTTTAAATT
AACCCCGAGATCTTGTAGAGTCTGCTCAACACGCTTGATCGTTCGAAGACCAACAGCAGA
GCTTGCAGCTTGGACCATTTGTTCAAGTCCATAGGTTCTTAAGTACACATGAAGCATGCG
CAGAGAA

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4AI66TF 734 0 0
GACCCAAACGACTAATGAATACATCATCACTGTACTGTTGGTTGTGCTTTTGACCGGTCT
ACACACTGACTCAAAAAAAGAGACTTTTGACATCAATTTTTTGAGTCATTGGGACAATTC
AACAACTGATAGATATTGCAGTGTCTGACTGAAAATTACATACACATGAAAAATGGGAAT
CAGTATTTCTATTGGACTTAGAGATCAGATGCTTTCAATTTTCTGGGCCGCTTATGAGCT
GGTGAAGGAGTATCTGATTGTCTTCCAGGACCCTTGCGCTTTTGTTCCTTCTTGATTGGT
CTTTCACCTCCAAAACTGAATGGCTCAGATGCGAAAACGCGATCCTTTGGGGTATCTGGC
ATTGCGGCATATGTCCCTTCACGGTGCGATGAACCTTCTGATTCTTTATACTGTAGCTGC
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GTTTTTGTAGGAACCTTTGGCTTTAAATTAACCCCGAGATCTTGTAGAGTCTGCTCAACA
CGCTTGATCGTTCGAAGACCAACAGCAGAGCTTGCAGCTTGGACCATTTGTTCAAGTCCA
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ATAGTTAGCGTGGATGGAGCCACGGCAGTTGCAGGAAGTTGAGAATTAGAATTTCGAGTT
TAACGGGTGACTAT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4747Contig1 933 2 2 U
GGATATTTCTAGGGTTTGTTTGATTCTCCCGGCAGCGATGGAACTGAGGATGTGAAAGCG
AAACGAGATTCGACGGAGATGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAACTGAAGATCGAA
GATGAAGACGACGACACAAGCATGGAAGGAGACGAAGAAGAAAGCGATAGCGACAGTACC
GATAGCGGACGCGCATGGAGTGTCGAGGCAAAAGACGATGAGGAAGTCGTGAAACCTCCT
AACTATTTAAACATGCGAGATCCGGATCCGCAGTGGGATAAGGACAGCTACGACGGTTAC
GAATTGGTATTCGATGCTGACGGCCGTGAAGGCTTCCCCAACGACGAGAAGTACGAAGAG
TTCTGCGAGTATAAAACCATGTGCTTTAAGAATAAGGGGTTTTTAGAAGATCCATTCGGA
TCCATCTACGCTATTGTAGATCTGGAAGAGATTTGGTCAGACAGGATAAACGTGTCTAGG
AGGCAATACTTGACAAATATTGCTTCCCTGTGTGTTAAGAAATTCAACGAGGAAAAGCGT
TTGTCTGTGGAAGTTTTAAGCATTGTGAGAGCCAATCTAAAAGCAGGAGGTGGGTATAAG
CTTTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGCATCCGGATGGTCCTCCCGTCGAGTATCAAGCC
AAGGCCATGGATTTTGCAGGAGGTAGAAAACCTCCCTTTCCCATTCTCTGCAGGCCAGCC
TGTAGCATGCCCTAGTCTATCACTTACATAAGATTGGGTATGATCTTCTTCTAGGGGAAG
ATGAAGATCAAAATAAGGCTTTCCATTCATAAGTAACATGCGTCCATGTGGTTTTTTTTT
TTGGGGCGTTCAAACTTATGGCCCTACTACCTTTTTAGTTGTTTCGTATGATTATGGATT
TTAATAATGGTTGCTATATTATGTTTAATGTTT


BQ
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AF RR4GY09TF U 1
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BS 663 933 RR4GY09JQ

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AA

QA 1 662 1 662
DS 

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CGAATTGGTATTCGATGCTGACGGCCGTGAAGGCTTCCCCAACGACGAGAAGTACGAAGA
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TTTGTCTGTGGAAGTTTTAAGCATTGTGAGAGCCAATCTAAAAGCAGGAGGTGGGTATAA
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GATGAAGATCAAAATAAGGCTTTCCATTCATAAGTAACATGCGTCCATGTGGTTTTTTTT
TTTGGGGCGTTCAAACTTATGGCCCTACTACCTTTTTAGTTGTTTCGTATGATTATGGAT
TTTAATAATGGTTGCTATATTATGTTTAATGTTT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4748Contig1 884 2 2 U
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TCCCACACTGTGCAACATCTCCCGAGGATGCCTTTCCCCATGTCTGATATAGTCGCTGAC
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BQ
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AF RR4A563TF U 1
AF RR4A563JQ C 4
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TACGCTGGCAAACTGGTTTTGTTTTCCCATAGATATGAAATCAATGGGGAGATTTGTTGT
GCGGAGATTTTGCTGGAAAGACGCAATGGGGGGTCAGATTTGGGGTAAAGTTGATCAGTG
GTGTGATCATGTTCTGATTGCTGGTGATTTTAGCATTACGAAATCTCTAGATGTTGTGCT
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TCCTTACTGATACGTAACTGA

QA 1 861 1 861
DS 

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ATGTTGGTGTTCAATACAGAAACACAAATGTGGGAGGATGGGATGACAAAGCCAGGTGAC
GTGTACGCGTATAGAAGCTTGGTAGTGGTGGCTGGTAAGATGTACATGAGGGAGTTTCAT
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GACAAGGAATTGAGAGGGTATGATCCAGAGCACGAGTGTTGGGTAGTGGTGAACGGTTTG
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AATTGATTCAGCAACGCTCTCTCTCTTCCTTATAAACTTGTTTTGATTTGGGGGATTTGT
TTTTGAGAGTTGAGAGTCTCTCTCATTTGTATATCTCTTTTTTTTCTTATGCTGTGTTCC
TTACTGATACGTAACTGAATGGAAACATGTTCCAAGTTTAC

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 2

CO CL4749Contig1 708 2 1 U
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CTCAAGTTCCCAAAGATCGACGAGGGTCTAAGAAACTGCAAAGCCATTTTCCAAGAGTTC
GATGAGGATTCGAACGGGTCCATAGATCACTCGGAGCTAAAGAACTGTTTCAGGAAGCTA
GAGATCATGTTTGAAGAAGAAGAGATAAATGATATGTTCCAGGCCTGTGATATCAACGAG
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ATGAAGAGATTTGAGGAAATGGACTGGGACAGGAATGGAATGGTGAACTTTAAAGAGTTT
CTGTTCGCATTAACTCAGTGGGTTGGGATTGATGAGAATGAAGATGATGATGATGACGGC
AGCAATGACAAGGCTTGATGTTGTGAGGAGTTTCTAAGATAATGTGCTTGCATAATGTAC
TAGTAACAAACTATATTAGTTTAATGCAAACAGAATAATTCATTACCG


BQ
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AF RR4D570JQ C 1
AF RR4D570TF U 1
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DS 

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QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4H781TF U 1
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BS 1 608 RR4H781TF
BS 609 833 RR4H781JQB

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GATGAGGGCACTGCTGGTTCCATGAAAGAGATGACAAGAACATCAGTGAATGAGCCTGAT
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QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

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AF RR4GH34JQ U 1
AF RR4BM25JQ U 16
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BS 211 211 RR4BM25JQ
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BS 749 771 RR4GH34JQ
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RD RR4GH34JQ 771 0 0
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TGCAAAACTACATCCATGTTCTGATTTTTTATCTTGCAATGTATCACTCCCCAGGAGTTT
CTTGTAATCTCTCTGGTGGGTGTTGTCTCAGAAGGTAGATTCATGATTTAGGGTTTGACA
GATTCTTCTTCCTTCCTTGATCTTTTTCTCTTCTCTCGGTTTCTCACTTGTGTATGCTTC
TGGTACTCGGTTTCTTGGTGAATGATTCTATCAAACGGAACATCCAACGATCTAGCATTC
CTGTCAAAGCAAAGGTACCCCCTAATACAGCGCAAAGCCGAGTGATCAAGTGGAGAAAAC
TACGGCGTTCTTCCTTTATGGTCACAGTGATGGGTGAAAGATCATACAAGAAGTAGACGG
CTGGCCATGTCCGGTCAAATTCGTTCATAGGTGTGTAATATTCCGTTACAGAGTACTGAT
TCGCTGTCAGTATGTCTTTTGAAAGATATCTATATTCTGTCGGAACAATCTTAATGTAGT
ACTTGAATGTTCCACTAGTGTCATGCAGCATTCGGTTTGTGTCATCGAGTGGGTTGTGAA
TTCCAGGGTACTTGGGCCCAAACGATAGATCATGAATCATATGGCTCACGTTTACGTTTT
TGGACCCTCCAAATATCATTTGAGCAACGTAGATGTTCAGTCCGTGAACTG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4BM25JQ 761 0 0
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CAGAGAATACATAAGAGATAAAAATACTCAAAAAGACTGACAACATGCAAAACTACATCC
ATGTTCTGATTTTTTATCTTGCAATGTATCACTCCCCAGGAGTTTCTTGTAATCTCTCTG
GTGGGTGTTGTCTCAAAAGGTAGATTCATGATTTAGGGTTTGACAGATTCTTCTTCCTTC
CTTGATCTTTTTCTCTTCTCTCGGTTTCTCACTTGTGTATGCTTCTGGTACTCGGTTTCT
TGGTGAATGATTCTATCAAACGGAACATCCAACGATCTAGCATTCCTGTCAAAGCAAAGG
TACCCCCTAATACAGCGCAAAGCCGAGTGATCAAGTGGAGAAAACTACGGCGTTCTTCCT
TTATGGTCACAGTGATGGGTGAAAGATCATACAAGAAGTAGACGGCTGGCCATGTCCGGT
CAAATTCGTTCATAGGTGTGTAATATTCCGTTACAGAGTACTGATTCGTTGTCAGTATGT
CTTTTGAAAGATATCTATATTCTGTCGGAACAATCTTAATGTAGTA**TGAATGTTCCAC
TAGTGTCATGCAGCATTCGGTTTGTGTCATCAGGTGGGTTGTGAATTCCAGGGTACTTGG
GCCCAAACGATAGATCATGAATCATATGGCTCACGTTTACGTTTTTGGACCCTCCAAATA
TCATTTGAGAAAAGTAGATGTTCAGTCCGTGAACTGAAACG

QA 1 761 1 761
DS 



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GTTTCTGTGAATGGATTTGGAGCTGCTGGAACTGTTGTGCAGCTTGCATAGTGTGGATCG
ACTGATTATTGGGATAGAATTGCTGATTCGATCCAAAAGAACCATAGTTCATTACTGATG
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GCGCTGAGAGAGTAGTAGCTTCAGTTTGTAAAGTCTGTACTTTCCTCTCTAGCTCAGCTA
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BQ
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AF RR4FG01JQ U 12
AF RR4GD31JQ U 1
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TGGTTTTCAACACTCAGTCCATTTGTATCTCTCTGTAAGAGAGTCAACTGCGCTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4GD31JQ 849 0 0
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AAGACTACAGACAAAGGCTTCACTAACAGCTTCTAGGGGTGTCTTGTTTTCCACCAAACT
GGACACTAACAGCAGTCAACAACAATCTTCAGTCTTTTGTTGAGGGAGACTCAAGATCAG
GCAATGTCGCACTCTCTTTCTGACCACCCGAAGAAGAAGACATCGGCCTTCTCGGCTCCG
CCAC*ACACCGCTTTGTTGTTCCTGCTGTTGAATCCGCTGCTGCTGAAGCTGGAGCTGAA
GCTGATACAGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATACTGAAACTGCTGTTGTTGTTGTTGCT
GTTTCTGTGAATGGATTTGGAGCTGCTGGAACTGTTGTGCAGCTTGCATAGTGTGGATCG
ACTGATTATTGGGATAGAATTGCTGATTCGATCCAAAAGAACCATAGTTCATTACTGATG
ATGCACCACCGTTAGAACCACCTTGCCCCGTTAATACCTTAAGATGTTGGACTTCTTCCT
TCAGTGCGTCGTTTAATGCATCCTGCAGGTGAACTTGTTGCTCCACTGTTTGTACTCGGA
GTTTCAGCTCATGGTTTTCAACACTCAGTCCATTTGTATCTCTCTGTAAGAGAGTCAACT
GCGCTGAGAGAGTAGTAGCTTCAGTTTGTAAAGTCTGTACTTTCCTCTCTAGCTCAGCTA
TGTATCTCATCTTCCTTTCTTTGACCTCGCAGCAGACTGCCTGTTTGCCATATCCTCTTG
GCACGTTTT

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

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TATCCGTCCAGACGACTTCTATGGAAGTCTTCTGGTCAATGCAGAAGTTAGTTTTGCAAT
TGATTTTTAAATGTGTTTTTAGAGACGACTTACATGGAATTCATCCATCTTTGTTTGTTA
AAAAAAATCCGAGACAACTTCCATGTAAATTGTCTAAGGTAAACATGTTAGTTTTGCATT
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BQ
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AF RR4AT29JQ C 1
AF RR4AT29TF U 1
BS 1 462 RR4AT29TF

RD RR4AT29JQ 462 0 0
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TTACGATTCTTGGTAGATGTAACTTTTGTTTGAGATTTAGGTGCTTGAAGAAGACTTCTG
TGTGTTAAATAAGTTAATTCACTAATTGAAATTATGAAATCAGTTTTTTTTTTCCAGATC
TATCCGTCCAGACGACTTCTATGGAAGTCTTCTGGTCAATGCAGAAGTTAGTTTTGCAAT
TGATTTTTAAATGTGTTTTTAGAGACGACTTACATGGAATTCATCCATCTTTGTTTGTTA
AAAAAAATCCGAGACAACTTCCATGTAAATTGTCTAAGGTAAACATGTTAGTTTTGCATT
TGACCGAATTGTGTCAAAAAGTCGTCAAGTAGAGAACTAAAT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4AT29TF 462 0 0
GTCATTCTTTCTCAATTCTTATGAAGTAAAAACAACATCTCTTTAACTTTCTTTCTAAAT
TCATCCAAAAAAACTCAAGATTTTGATTCTATTTTTTATGGATCATAGAGCCATTGAAGT
TTACGATTCTTGGTAGATGTAACTTTTGTTTGAGATTTAGGTGCTTGAAGAAGACTTCTG
TGTGTTAAATAAGTTAATTCACTAATTGAAATTATGAAATCAGTTTTTTTTTTCCAGATC
TATCCGTCCAGACGACTTCTATGGAAGTCTTCTGGTCAATGCAGAAGTTAGTTTTGCAAT
TGATTTTTAAATGTGTTTTTAGAGACGACTTACATGGAATTCATCCATCTTTGTTTGTTA
AAAAAAATCCGAGACAACTTCCATGTAAATTGTCTAAGGTAAACATGTTAGTTTTGCATT
TGACCGAATTGTGTCAAAAAGTCGTCAAGTAGAGAACTAAAT

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

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CAAAGTTACAACCACCCATGAACATATATTTGTTCATTATGTAAATAAAAAATATTATAT
ACGGGAAAGTATCATAATAGTAACATAACCGGAGTTACTATCAACCGCAAGCTGAAAAAA
AAACTTTAGCTGTAGTTTTAGTTAAACGCTAACAACGCTAAAAACCCAAACATGACCGCC
TTCACTGTTCTTCTTCCTGCTTTGCTCTCAAAATCCAGCTTCCCACGGTTCACAAACGCA
AACCCCAACCCAACCGTTGGGGTAGTAGTTAAACCCCCCACTTTAAAACTCACTACAAGG
AGCTTCTAAAAACGAAAATCTCGGGCTTTTCACCTTATTTCACCCGTTTGTTAGTGAAAG
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BQ
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AF RR4A072JQ U 1
AF RR4A072JQD U 1
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BS 196 478 RR4A072JQ

RD RR4A072JQ 478 0 0
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QA 1 478 1 478
DS 

RD RR4A072JQD 478 0 0
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QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

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AGCTTCAACGAGGGTGATTATAAAGCCGCACTTAAGGAGCTTAAAGCATTTGACTCTCAG
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AAAGCTCGTGGTCTCCCTTTAGTGCAAATGCTCGAGACCATGAGGAGACAAACAATGGTT
AGAATTGAGGTGAGGAAGAAGAAGTTGCTGAAGTACAGGAAGAAATATAGTGAGAAAGTT
GCAAACACTATCGCTGAAGAGGAAGAAAGACGCAAATGGTGTAAGAAAAGGACACCTGGT
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GATGCTCCGGGTTCTAAGGTTGAACCACCGCCAAGACCTAAGGAGAAAGGTCGGAAGAAG
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ACACAAACCTCCAACTAACTTGAGGTTCTTTTGGTGATGTATTTTGAAGAACGAGGCAGC
CAAAAATCAGATGCTAGTTTTTTGTATTTTAGGTGTGCTTTAGGTGTGTTCTTAATTCGG
CTATGTCTTATAATATCTCTCTTTTTGTAAAACTTATTATGTTATTTTCTGTTTTAAAAC
TTATTATGTAATGAAAATCTTCTGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG45TF U 1
AF RR4AG45JQ C 665
BS 1 743 RR4AG45TF
BS 744 1528 RR4AG45JQ

RD RR4AG45TF 743 0 0
GAGATCTTCGACAAGTTTTATGTGTGTTTTAAAGCTCTAAAGACAATATGGAGAGCTTAT
TGTCGACCCATTTTTGGGATTGATGGGTTCTTTATGAAATCCACTTCAAAAGGACAACTC
CTTGCAGCTGTGGGACGAGACGCAAACAACCAAATATATCCCGTTGCGTGGGGCATTGTT
CAAGTTGAGGACACCGACAATTGGAAGTGGTTCATTCAACGGGTGAAGCATGATTTAAAT
CTCCAAAGTGGCCAAGGGTTCACACTTATCTCTGACAAACAAAAGGGTCTTATAAAGGCT
GTTGAGGACGAGCTTCCTCACATAGAGCATCGTATGTGCGCTAGACACGTCTACGGAAAC
GTTAAGAAGCTACATCCCAACAAGCCTAAGTTTAAAAATCTGTATTGGGCAGTGGTAAAT
AGCTTCAACGAGGGTGATTATAAAGCCGCACTTAAGGAGCTTAAAGCATTTGACTCTCAG
ATATATGATGACTTGATGGTGAGAGATCCTACAACGTGTACTCGTGCATTCTTCAACACT
ACTTCTTCTTGCGAAGATGGACTCAACAATTTCTCAGAGTCTTACAACAGCGGTCTGAAG
AAAGCTCGTGGTCTCCCTTTAGTGCAAATGCTCGAGACCATGAGGAGACAAACAATGGTT
AGAATTGAGGTGAGGAAGAAGAAGTTGCTGAAGTACAGGAAGAAATATAGTGAGAAAGTT
GCAAACACTATCGCTGAAGAGGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4AG45JQ 864 0 0
TTGAGGTGAGGAAGAAGAAGTTGCTGAAGTACAGGAAGAAATATAGTGAGAAGGTTGCAA
ACACTATCGCTGAAGAGGAAGAAAGACGCAAATGGTGTAAGAAAAGGACACCTGGTCCTA
ATGGTGTTTCAGAAGTAGAGGAGATAGGCATTTCTTACACTGTCAATATGGAGAAGCGAA
CATGTAGCTGCAGAAGATGGGACCTCACTGGGATTCCGTGTCGCCATGCTCTAAAGGTGA
TTAAAGATAAAAAGCTTCGTTCTGAGGATTTTGTGGCAGATTGTTACTTGACCAGTTTGT
GGAAGAAGCAATACAGTGATTCAATCACTCCAGTTGAAGGAATGAAGTTCTGGAAGGATG
CTCCGGGTTCTAAGGTTGAACCACCGCCAAGACCTAAGGAGAAAGGTCGGAAGAAGAACC
CGCAGAAGAGGAAGAAGTCAATTTACGAGTCTCCTACAAAAGGAAAAAAGGTCTCAGGTC
ACAAGAGGAAGATGCATTGTTATCGCTGTGGTAGGGAAGGGCACACCTCACCATTTTGTA
CTATTGATGGAGTCCCTAACAAGCCGAGAAAGGTTTATCCAAGGAAGAAGAAACAGACTT
CAGAAAGTGAGACAATGTCAGTTGATCATGGTGAAGCTCCGGGACCAAGTCAACCGACAC
AAACCTCCAACTAACTTGAGGTTCTTTTGGTGATGTATTTTGAAGAACGAGGCAGCCAAA
AATCAGATGCTAGTTTTTTGTATTTTAGGTGTGCTTTAGGTGTGTTCTTAATTCGGCTAT
GTCTTATAATATCTCTCTTTTTGTAAAACTTATTATGTTATTTTCTGTTTTAAAACTTAT
TATGTAATGAAAATCTTCTGTTCC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL4756Contig1 491 2 1 U
GGGACATCGGAAAATATATTTGAATCCGTGAGTCTTCTTCTGCTGAAGATCTGGGAAAGT
AAAGACAAAGGGGGAAAGATGAAGCAGGCGAGATTTCTGGATTGGTATGTGAAGATTGCA
ATTGGATCTGCTATCATCGGCGGAGGAATGGAGTTCTTCATGATCAAGACCGGTTTCTAC
GACAAGGTTACTGTACTAGAAGCTGAGAAACGAGCCTATGAAAATTCCCCTGAAGCTCAA
GCCATGCGGGAAGCTCTTAATCCCTGGAGAAACAAGGACGCTGCAGCTACAAAAACTCCT
TAGAAAGGTTCAGTCATGAAGTTACTTTTACTCACTCTCAAACTTTGCAAATGCTGCTTC
AGCCTCTGCTATTTTGAGATATTAAGTTTTTCATTTGCTAAATGTAACAGCTTTGAACAC
ATTTACATGTTATGAATGAAGAAGATAAAAGATGCTGAAATAAAAAACAAAGATATGGGT
TTTGAAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F451TF U 1
AF RR4F451JQ C 25
BS 1 491 RR4F451TF

RD RR4F451TF 491 0 0
GGGACATCGGAAAATATATTTGAATCCGTGAGTCTTCTTCTGCTGAAGATCTGGGAAAGT
AAAGACAAAGGGGGAAAGATGAAGCAGGCGAGATTTCTGGATTGGTATGTGAAGATTGCA
ATTGGATCTGCTATCATCGGCGGAGGAATGGAGTTCTTCATGATCAAGACCGGTTTCTAC
GACAAGGTTACTGTACTAGAAGCTGAGAAACGAGCCTATGAAAATTCCCCTGAAGCTCAA
GCCATGCGGGAAGCTCTTAATCCCTGGAGAAACAAGGACGCTGCAGCTACAAAAACTCCT
TAGAAAGGTTCAGTCATGAAGTTACTTTTACTCACTCTCAAACTTTGCAAATGCTGCTTC
AGCCTCTGCTATTTTGAGATATTAAGTTTTTCATTTGCTAAATGTAACAGCTTTGAACAC
ATTTACATGTTATGAATGAAGAAGATAAAAGATGCTGAAATAAAAAACAAAGATATGGGT
TTTGAAGGTCC

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR4F451JQ 467 0 0
TCCGTGAGTCTTCTTCTGCTGAAGATCTGGGAAAGTAAAGACAAAGGGGGAAAGATGAAG
CAGGCGAGATTTCTGGATTGGTATGTGAAGATTGCAATTGGATCTGCTATCATCGGCGGA
GGAATGGAGTTCTTCATGATCAAGACCGGTTTTTACGACAAGGTTACTGTACTAGAAGCT
GAGAAACGAGCCTATGAAAATTCCCCTGAAGCTCAAGCCATGCGGGAAGCTCTTAATCCC
TGGAGAAACAAGGACGCTGCAGCTACAAAAACTCCTTAGAAAGGTTCAGTCATGAAGTTA
CTTTTACTCACTCTCAAACTTTGCAAATGCTGCTTCAGCCTCTGCTATTTTGAGATATTA
AGTTTTTCATTTGCTAAATGTAACAGCTTTGAACACATTTACATGTTATGAATGAAGAAG
ATAAAAGATGCTGAAATAAAAAACAAAGATATGGGTTTTGAAGGTCC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL4757Contig1 499 2 4 U
GGTGATTCCACCGGCAGTTAGACCACCACGCCTCTTCGACTACCTCAAACCTTACGTCCT
GAAAATGCACTTCACGAACAAGTTTGTCCACGCCCAAGTCATCCACTCGCCGACAGCCAC
AGTGGCTTGCTCAGCTAGCTCACAGGAGAAAGCATTGAGGGAAACGATGGGCGTCACACG
CGACGTGGCTGCTGCTTCGAAGATTGGTAGGATCCTTGGGGAAAGGCTCTTGTCGAAAGA
TATCCCAGCTGTTGCTATCCACATGAAGAAAGAGCAGAGGTATCATGGTAAAGTCAAGAG
CCGTGATCGATTCCGTCAGAGGAAGCGGGCGTCAAGTTACTTTGAGTATTACAATCCAAA
AAAATCAAATTCCAATGCTGTTGATTTCAAACATTGTTGCCTCTTCTTCATTTCTCCATA
ACCTGTTCCAAAAGAGAATGAATGTTATAAGCTTTGACTATTGAAATAATAGGACTATAT
AATATCAAATTTCATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E071JQ C 1
AF RR4E071TF U 6
BS 1 5 RR4E071JQ
BS 6 326 RR4E071TF
BS 327 327 RR4E071JQ
BS 328 499 RR4E071TF

RD RR4E071JQ 499 0 0
GGTGATTCCACCGGCAGTTAGACCACCACGCCTTTTCGACTACCTCAAACCTTACGTCCT
GAAAATGCACTTCACGAACAAGTTTGTCCACGCCCAAGTCATCCACTCGCCGACAGCCAC
AGTGGCTTGTTCAGCTAGCTCACAGGAGAAAGCATTGAGGGAAACGATGGGCGTCACACG
CGACGTGGCTGCTGCTTCGAAGATTGGTAGGATCCTTGGGGAAAGGCTCTTGTCGAAAGA
TATCCCAGCTGTTGCTATCCACATGAAGAAAGAGCAGAGGTATCATGGTAAAGTCAAG*G
CCGTGATCGATTCCGTCAG*GGAAGCGGGCGTCAAGTTACTTTGAGTATTACAATCCAAA
AAAATCAAATTCCAATGCTGTTGATTTCAAACATTGTTGCCTTTTTTTCATTTCTCCATA
ACCTGTTCCAAAAGAGAATGAATGTTATAAGCTTTGACTATTGAAATAATAGGACTATAT
AATATCAAATTTCATTTCC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4E071TF 494 0 0
TTCCACCGGCAGTTAGACCACCACGCCTCTTCGACTACCTCAAACCTTACGTCCTGAAAA
TGCACTTCACGAACAAGTTTGTCCACGCCCAAGTCATCCACTCGCCGACAGCCACAGTGG
CTTGCTCAGCTAGCTCACAGGAGAAAGCATTGAGGGAAACGATGGGCGTCACACGCGACG
TGGCTGCTGCTTCGAAGATTGGTAGGATCCTTGGGGAAAGGCTCTTGTCGAAAGATATCC
CAGCTGTTGCTATCCACATGAAGAAAGAGCAGAGGTATCATGGTAAAGTCAAGAGCCGTG
ATCGATTCCGTCAGAGGAAGCTGGCGTCAAGTTACTTTGAGTATTACAATCCAAAAAAAT
CAAATTCCAATGCTGTTGATTTCAAACATTGTTGCCTCTTCTTCATTTCTCCATAACCTG
TTCCAAAAGAGAATGAATGTTATAAGCTTTGACTATTGAAATAATAGGACTATATAATAT
CAAATTTCATTTCC

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

CO CL4758Contig1 250 2 1 U
GTCGAGTTTTAGGTCAAAAGAGGTTCTTTGTGTTATCTCCGACGGCGTCAGGAACAATGT
GCGACATCATTGACGAGAAGAAGAGGAAGAAGGAAGAAAAGGTATGCCCAAAGACATGAG
ATGCATACAAGATAATTATGTTTCTAAAAAAAAAAAAACAGTGGCACAGACTCAAAGCAT
GATTATCCCAAAGACACATTTGGGGATTCTTATTTTTTTTAATACATTTAAAGAGTAAAA
GTGATTTACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A933JQ C 1
AF RR4A933TF U 1
BS 1 250 RR4A933TF

RD RR4A933JQ 250 0 0
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GCGACATCATTGACGAGAAGAAGAGGAAGAAGGAAGAAAAGGTATGCCCAAAGACATGAG
ATGCATACAAGATAATTATGTTTTTAAAAAAAAAAAAACAGTGGCACAGACTCAAAGCAT
GATTATCCCAAAGACACATTTGGGGATTCTTATTTTTTTTAATACATTTAAAGAGTAAAA
GTGATTTACG

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR4A933TF 250 0 0
GTCGAGTTTTAGGTCAAAAGAGGTTCTTTGTGTTATCTCCGACGGCGTCAGGAACAATGT
GCGACATCATTGACGAGAAGAAGAGGAAGAAGGAAGAAAAGGTATGCCCAAAGACATGAG
ATGCATACAAGATAATTATGTTTCTAAAAAAAAAAAAACAGTGGCACAGACTCAAAGCAT
GATTATCCCAAAGACACATTTGGGGATTCTTATTTTTTTTAATACATTTAAAGAGTAAAA
GTGATTTACG

QA 1 250 1 250
DS 



AS 1 2

CO CL4759Contig1 465 2 1 U
GGAAGGAGGTTATCCAAGATACTATAAATGAAATGACTGATGATGATGAAGAAGACGAAA
TATCTGAGGCTGGAAGTGGCAAAGAGAAGGAAGAAGAAGAGGAAAAAGCTGAGGCGGAAA
GTAACAAAGAGAAGGAAGAAGAAGACGAAAAAGCTGAGGCTGAAAGTAACACAGAGATGG
AAGAAGAGGAGGAAAAAGCTGAGGCTGAAAGTAACAAAGAGAAGGAAGAAGAAGAGTAAA
AGCTAAAACTGATCAACCTTGTGCACGTGATAGTTAGAGTCTAGAGAGTGCTGGATCTGT
ACTATGTAATCTCTATAGTTTCATCTTATGTACTACTATGTAGTTTCAGTGACTTCTTCT
TGTGTAGCTGTTGTTTGTTAAGTTTTCTAATCCTTGTTCTATTTACTACCTGTTGTGAAA
GTGTGTTTTATTATTGAATCAAAGTGTTCCTTATATAGGAAATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BD02JQ C 1
AF RR4BD02TF U 1
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QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D565JQ U 9
AF RR4D565TF C 1
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QA 1 430 1 430
DS 

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TTAACATCGATCCTTTGGATACTCGTTGTTTTCCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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ATTCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GC53JQ C 1
AF RR4GC53TF U 1
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DS 

RD RR4GC53TF 547 0 0
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CTACCTTGGACCGATCTCTGAAGAATGATCTGTCTGGTTTTTTCCATATGATGGTGGTTT
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ATTCAGC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL4762Contig1 805 2 2 U
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GAGGTGGAGATTATCGGGTGGCGAGCTATGGGCAGCAGCGACAATTCCCGTTCACTGGCC
TCTACAAAGGTTTAAAATCTGCTAATTATCTTCTCTTTCGCTTTATGGTTTTATGCCTTG
TCTAGTTTTTACTGTCATTTTAGTTTCTTGGTACTATATGCTACCCCTGTGTGGGTACTT
TTGTTTCTTAGACTATATGCTACCCTGGTGTGGGTTTAAGTGGCCGCATTTATTTGGGCT
TTTGTGTATGGAGATTGCTCACTCGTCTCCTAGTTTATGTTTTAAGTCATCCCGGTGTGG
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BQ
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TTGTTAAC


BQ
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AF RR4AN42TF U 1
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CCTCCATCAATCTCACCGTGCTTTCTCTCTTCTGTCAACTTCTTCTGGTCCCCTGGTTCA
CCCACATGCACAGCCACTGTCTTTACTTTTTTCATTTGATGGTTTACCAAAATAGGTGAG
TAAGTAATGTGATGTCTGTAAAATCAGTTAGCTTCAGTTAGTGGATACTAATCCAAACCT
ATCAGCACAGCTGCCTCCTTCATTTGTATGCCGACTTTGGCTGCTTTGTTATCTTTATCC
TTGTTTTGTTACTAACTAGTAAACAATGTTAATTGTTAAC

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 2

CO CL4764Contig1 967 2 2 U
GACTCTCGCTCTGGTTAATTCTACAAATAACAATGCTACCAGCAAGAGCATCAGCACAAT
TGATTCACTTGCTTCAAGCACTTGGGAGCAGGTTGCACTAGAAAAGACGTTGATCACACC
CGTACAGTGTAAATCACTGTGGAGACAATTCAAAAACGAAACAGAATATACCGTTACACA
GGCTATTTCTGCACAGGAAGCTAACCGACGGAATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGC
AATCCTTGCATTGGTCGTTCTTGGATTTAATGAATTTATGACTCTATTAAGAGATCCTCT
ATGGCTCGGTGTTCTTTTCGTCGCATACCTTGTATCCAAAGCCTTGTGGGTGCAGTTAAA
TATCTCAGGAGAGTTCAGCCATGGAGCGCTACCTGGACTTCTTTCTTTGTCAACCAAGTT
CCTTCCAACGGTCATGAACCTCCTTAAGAAACTCGCTGAAGAAGGACAAGCTCCATCCAC
AAATACCAACCAGAGTTCTATGAACTCCTCAGCTCAATCGGAAGTTACAACTAATGGAGA
AAGCAGCAGCAGCAGCTCTGGTTCGTCTCCAGCGAAACGCGTTCCCATTGATACAAGTTC
ATAGAACAAAGAACTAGATAAGCTTAAGCTGTTGTTTGTCCGAGAGCCCACGATACCTAG
AAACTTTTAAATTTCCTTACCCTTGCAAAAGGGTAGCTTTCAGTTTTGGTGTTTGATCAG
AGGGATTCACCGAGAGCCATACTTTTATGTCTCCGAAGGCATTGAGTTCCCTCTTGCAGG
TGCCAAAGCCGTCGTCTTGTATGTTCCTAGACAAAGATTCGGATGCAGACAGAAACATAG
TCATGCTTTGTTTGCGAGTTATGTATTAATGTGGTTTATTGTATCTGAAGAAAGAATGTG
AAAACTTAAGATTGGTTTGTTGATTGAAGAGAGTTTCAGTTCTCAATGCAAATTGTTTCA
CTTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC62TF U 1
AF RR4CC62JQ C 249
BS 1 676 RR4CC62TF
BS 677 967 RR4CC62JQ

RD RR4CC62TF 676 0 0
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TGATTCACTTGCTTCAAGCACTTGGGAGCAGGTTGCACTAGAAAAGACGTTGATCACACC
CGTACAGTGTAAATCACTGTGGAGACAATTCAAAAACGAAACAGAATATACCGTTACACA
GGCTATTTCTGCACAGGAAGCTAACCGACGGAATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGC
AATCCTTGCATTGGTCGTTCTTGGATTTAATGAATTTATGACTCTATTAAGAGATCCTCT
ATGGCTCGGTGTTCTTTTCGTCGCATACCTTGTATCCAAAGCCTTGTGGGTGCAGTTAAA
TATCTCAGGAGAGTTCAGCCATGGAGCGCTACCTGGACTTCTTTCTTTGTCAACCAAGTT
CCTTCCAACGGTCATGAACCTCCTTAAGAAACTCGCTGAAGAAGGACAAGCTCCATCCAC
AAATACCAACCAGAGTTCTATGAACTCCTCAGCTCAATCGGAAGTTACAACTAATGGAGA
AAGCAGCAGCAGCAGCTCTGGTTCGTCTCCAGCGAAACGCGTTCCCATTGATACAAGTTC
ATAGAACAAAGAACTAGATAAGCTTAAGCTGTTGTTTGTCCGAGAGCCCACGATACCTAG
AAACTTTTAAATTTCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4CC62JQ 719 0 0
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GTGTTCTTTTCGTCGCATACCTTGTATCCAAAGCCTTGTGGGTGCAGTTAAATATCTCAG
GAGAGTTCAGCCATGGAGCGCTACCTGGACTTCTTTCTTTGTCAACCAAGTTCCTTCCAA
CGGTCATGAACCTCCTTAAGAAACTCGCTGAAGAAGGACAAGCTCCATCCACAAATACCA
ACCAGAGTTCTATGAACTCCTCAGCTCAATCGGAAGTTACAACTAATGGAGAAAGCAGCA
GCAGCAGCTTTGGTTCGTTTCCAGCGAAACGCGTTCCCATTGATACAAGTTCATAGAACA
AAGAACTAGATAAGCTTAAGCTGTTGTTTGTCCGAGAGCCCACGATACCTAGAAACTTTT
AAATTTCCTTACCCTTGCAAAAGGGTAGCTTTCAGTTTTGGTGTTTGATCAGAGGGATTC
ACCGAGAGCCATACTTTTATGTCTCCGAAGGCATTGAGTTCCCTCTTGCAGGTGCCAAAG
CCGTCGTCTTGTATGTTCCTAGACAAAGATTCGGATGCAGACAGAAACATAGTCATGCTT
TGTTTGCGAGTTATGTATTAATGTGGTTTATTGTATCTGAAGAAAGAATGTGAAAACTTA
AGATTGGTTTGTTGATTGAAGAGAGTTTCAGTTCTCAATGCAAATTGTTTCACTTGGCG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4765Contig1 686 2 2 U
GATCAGTTCTTTGGGGGTACTTCGCCTTCATGGCCATCGAGAGCTTACCAGGAAACCAGT
TCTGGGAAAGAATCTTACTTCTCTTCACTGCACCAAGTCGAAGATTCAAGGTTCTTGAAG
ACAACCATGCTACATTTGTGGAAACTGTTCCATTCAAAACGATTGCAATGTTCACAATCT
TCCAAACAACTTACCTTCTAATCTGCTTTGGCCTCACATGGATCCCAATAGCTGGAGTTA
TGTTCCCACTAATGATCATGTTTCTAATACCAGTAAGGCAATATTTACTCCCAAGATTCT
TCAAAGGTGCTCATCTTCAGGACTTAGACGCGGCAGAGTATGAAGAAGCACCCGCTTTAC
CATTCAATCTCGCAGTAGGGGAAGATGAAATGGGATCAACAGCTTCTTATCCATGCGACT
CTGAGATTCTTGATGAGGTTATTACAAGAAGTAGAGGAGAGTTTAGACACACTTGCAGTC
CTAAAGTTACTAGTTCGACTTCAACGCCGGTTTATCATAGGAACCTGTCCTAAGTGTTTA
GTCCTCGAGTTAATGAACTAAGGGGTGGCATGGTGAGTCCTGGTCTCGCCGGAAAAGGGC
AAAATAGTCCAAAGCCAAGTCCTTTGAACCAATCTTCCTCGTCACAGTCGAAGTGAGAAT
AATTCTTCATGGAGGCTTAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU01TF U 1
AF RR4FU01JQ C 200
BS 1 664 RR4FU01TF
BS 665 686 RR4FU01JQ

RD RR4FU01TF 664 0 0
GATCAGTTCTTTGGGGGTACTTCGCCTTCATGGCCATCGAGAGCTTACCAGGAAACCAGT
TCTGGGAAAGAATCTTACTTCTCTTCACTGCACCAAGTCGAAGATTCAAGGTTCTTGAAG
ACAACCATGCTACATTTGTGGAAACTGTTCCATTCAAAACGATTGCAATGTTCACAATCT
TCCAAACAACTTACCTTCTAATCTGCTTTGGCCTCACATGGATCCCAATAGCTGGAGTTA
TGTTCCCACTAATGATCATGTTTCTAATACCAGTAAGGCAATATTTACTCCCAAGATTCT
TCAAAGGTGCTCATCTTCAGGACTTAGACGCGGCAGAGTATGAAGAAGCACCCGCTTTAC
CATTCAATCTCGCAGTAGGGGAAGATGAAATGGGATCAACAGCTTCTTATCCATGCGACT
CTGAGATTCTTGATGAGGTTATTACAAGAAGTAGAGGAGAGTTTAGACACACTTGCAGTC
CTAAAGTTACTAGTTCGACTTCAACGCCGGTTTATCATAGGAACCTGTCCTAAGTGTTTA
GTCCTCGAGTTAATGAACTAAGGGGTGGCATGGTGAGTCCTGGTCTCGCCGGAAAAGGGC
AAAATAGTCCAAAGCCAAGTCCTTTGAACCAATCTTCCTCGTCACAGTCGAAGTGAGAAT
AATT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4FU01JQ 487 0 0
AATCTGCTTTGGCCTCACATGGATCCCAATAGCTGGAGTTATGTTCCCACTAATGATCAT
GTTTCTAATACCAGTAAGGCAATATTTACTCCCAAGATTCTTCAAAGGTGCTCATCTTCA
GGACTTAGACGCGGCAGAGTATGAAGAAGCACCCGCTTTACCATTCAATCTCGCAGTAGG
GGAAGATGAAATGGGATCAACAGCTTCTTATCCATGCGACTCTGAGATTCTTGATGAGGT
TATTACAAGAAGTAGAGGAGAGTTTAGACACACTTGCAGTCCTAAAGTTACTAGTTCGAC
TTCAACGCCGGTTTATCATAGGAACCTGTCCTAAGTGTTTAGTCCTCGAGTTAATGAACT
AAGGGGTGGCATGGTGAGTCCTGGTCTCGCCGGAAAAGGGCAAAATAGTCCAAAGCCAAG
TCCTTTGAACCAATCTTCCTCGTCACAGTCGAAGTGAGAATAATTCTTCATGGAGGCTTA
ATAAAAA

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL4766Contig1 897 2 6 U
GGCTCTCTCGCTCTCTCGCTCTCACCTAACTCACTAAAGCAGCAGCTAGCTACAATGGCG
GTTACCTTTTCAGATCTACACACAGAGCTGGGTCTCAAATCCGTTGAGGAGCACCTCGTC
GGAAAAACCTACATCTCCGGAGATAAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCC
GTTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGCCTGTGTTGCC
TCCCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGCT
GCTGCTCCTGCCCAAGCTGAGGCACCTGCAGTAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATG
GATCTGTTTGGTGACGAGACCTAGGAGGAAAAGAAGGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCT
AAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGAGTGGAAAGTCCTCTGTGCTCATGGAAGTGAAA
CCATGGGATGACGAGACTGACATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATG
CCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTGGGTTACGGGATCAAGAAGCTC
ACGATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTAC
CTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCGTTCAACAAG
ATTTAGAGACTCTAAAACTTCTCTCCCTACCAAACGATACATTTTGATTTCCTTCCGAGT
TTTGTCTGCTTGAGATGTTTGTTTTCTAGTTGCAACTTGCACGACCCCTTTCATGTTTGC
AAGAAACATAAACTATGGATGCTTAATATTCCTTTGCTAAAAACTGAAGTGTTGTGC


BQ
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AF RR4E507TF U 1
AF RR4E507JQ C 311
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BS 737 737 RR4E507JQ
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BS 766 775 RR4E507TF
BS 776 897 RR4E507JQ

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GATCTGTTTGGTGACGAGACCTAGGAGGAAAAGAAGGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCT
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CTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCGTTCAACAAG
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GAGTTTGTCTGCTTGA

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DS 

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ACGAGACTGACATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTC
TATGGGGAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTGGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGC
TCACAATCGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTACCTCACCTCTG
AACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCGTTCAACAAGATTTAGAGAC
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TGAGATGTTTGTTTTCTAGTTGCAACTTGCACGACCCCTTTCATGTTTGCAAGAAACATA
AACTATGGATGCTTAATATTCCTTTGCTAAAAACTGAAGTGTTGTGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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GTTTCTGCTTCCATGTCCTAATAAAATAATAACACTCTAATTCTC


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AF RR4BE47JQ C 1
AF RR4BE47TF U 1
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DS 

RD RR4BE47TF 465 0 0
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CTCGTATTCCATCGACCCCAAGAGGTACTGAACTCGTCAACCTATCTATATAGACAATCA
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TGCGACCGATTTGCCCGGCTTGTGTGTGTTGCGAGCCAGCGCCACGAGGAAGGTGCTGCA
GATGTTGTGCATCACCTATCGTCTCTCAGACTCATCACCACTCTCGAACTCCATGAAAGA
CATAAACAAAAAGCCCGACTAATAAAGAATCATAAAGAAATTAAGTCCTTTGTAGTCCAT
GTTTCTGCTTCCATGTCCTAATAAAATAATAACACTCTAATTCTC

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL4768Contig1 1078 2 4 U
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TCAAGTTGAGCAACAGAGATTACACAGAAGGATATTCTTGGAGAATGTGAATCCAGAGAA
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GCCATTTGGAGAATCAGTGTACGGTCCTGGAGGTGTTGCTTCTAGGCGTCCGTTGATGCT
AATCGAACCCTCATACAAAATCAACGGAGAAGACAAATCTAAATCTCAAAACCGTGCATC
AAAACCAACCGCGGAGGCGGAGCAAGAAAACAAGGTTCCTTCCAGTCCAAAGTCCAAGGA
AACGCCTTCTCCAGACCCAAAGGCAAACATGAAAGTTGGAGAGTCTGATGCCAACAAAAC
ATTTGACGAAAAGCCAGGAACCCAACCGGTCTCCAAACCAGCTACCATCGCAAAGGATAC
AACAGAAGCTTCAGCAGCTGAGAAACCAAAGGCCAAGAGAAGTGGTGGTACCACACCAAA
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CCTGGAAGAGAATATAGTGTTGGGTGTCGCACTAGAGGGATCAAAGATGACACTACCAAT
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TGCTCGGAGATCTGGAAATGGGACATTGGTGGCTGCAAAGGAGCAGAAAGATGGGCAGTC
TCAAACAAGCTCAAGTGCTGCTGCTTTTAGTGAAAACAATGAGATTGAAAGAAAATGATG
TTTAGTGTAATACACACTCTGTTGTAATGTAATGCTATTGATTGATTTACCCTCCACAAT
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AF RR4AL61TF U 1
AF RR4AL61JQ C 329
BS 1 676 RR4AL61TF
BS 677 677 RR4AL61JQ
BS 678 753 RR4AL61TF
BS 754 1078 RR4AL61JQ

RD RR4AL61TF 753 0 0
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TCAAGTTGAGCAACAGAGATTACACAGAAGGATATTCTTGGAGAATGTGAATCCAGAGAA
CCAGGCCCTAGTGATACTAATCTCTTGTTTTGTGAAGACGTCCCATTTCGAAGAATATTT
ATGTGTAAAAGAAGCTATATTGTTGGACCTTCTTAGAGTCATAAGCCATCACCGAGCACG
TCTAGCTACACCAATTCGTACAATCCGAAAGATGTACACAGACGCAGACATGGAAAACGC
GCCATTTGGAGAATCAGTGTACGGTCCTGGAGGTGTTGCTTCTAGGCGTCCGTTGATGCT
AATCGAACCCTCATACAAAATCAACGGAGAAGACAAATCTAAATCTCAAAACCGTGCATC
AAAACCAACCGCGGAGGCGGAGCAAGAAAACAAGGTTCCTTCCAGTCCAAAGTCCAAGGA
AACGCCTTCTCCAGACCCAAAGGCAAACATGAAAGTTGGAGAGTCTGATGCCAACAAAAC
ATTTGACGAAAAGCCAGGAACCCAACCGGTCTCCAAACCAGCTACCATCGCAAAGGATAC
AACAGAAGCTTCAGCAGCTGAGAAACCAAAGGCCAAGAGAAGTGGTGGTACCACACCAAA
GAACGATACTCAGAAG*AAACAGATGGTTCAACTTCACCAGCGTCGTCTAGATCAGCAGC
CCTGGAAGAGAATATAGTGTTGGGTGTCGCACT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4AL61JQ 750 0 0
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GAAGACAAATCTAAATCTCAAAACCGTGCATCAAAACCAACCGCGGAGGCGGAGCAAGAA
AACAAGGTTCCTTCCAGTCCAAAGTCCAAGGAAACGCCTTCTCCAGACCCAAAGGCAAAC
ATGAAAGTTGGAGAGTCTGATGCCAACAAAACATTTGACGAAAAGCCAGGAACCCAACCG
GTCTCCAAACCAGCTACCATCGCAAAGGATACAACAGAAGCTTCAGCAGCTGAGAAACCA
AAGGCCAAGAGAAGTGGTGGTACCACACCAAAGAACGATACTCAGAAGGAAACAGATGGT
TCAACTTCACCAGCGTCGTCTAGATCAGCAGCCCTGGAAGAGAATATAGTGTTGGGTGTC
GCACTAGAGGGATCAAAGATGACACTACCAATAGAGGAAGATATGCCTTTTTCTTCTCCC
ACGGAAACAGATGGTAAAGAGCTCACCGGTGCTGCTCGGAGATCTGGAAATGGGACATTG
GTGGCTGCAAAGGAGCAGAAAGATGGGCAGTCTCAAACAAGCTCAAGTGCTGCTGCTTTT
AGTGAAAACAATGAGATTGAAAGAAAATGATGTTTAGTGTAATACACACTCTGTTGTAAT
GTAATGCTATTGATTGATTTACCCTCCACAATTCTAGAAGCTGGGGGTGATAAATTAATA
TATTTAATATAAGGGTGGTTTTCAGATAAC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4769Contig1 852 2 4 U
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TCCGAGATTCATCAAGTGCCAATGACTCAAGTTATGTCAGAAGGAGCTTACATGTTGTTC
TACATGAGATCGTACCCGCGTCCTCAAAGAGGAGAACACAACGTGAAACCTCAGGCTCGG
CATTCGCTGCAACCAAGAAACGAGACTAAGGAGCAGCAGAGGAAACCGGTAAACCGATTC
AAACCGAGAGCGGACTACTACAACAAGAACTTAGCAGAGCCATCATCATCATCAAGCGAA
TGGTCTCTCTTTACGAGCTCAGACGAAGCAGCTTCGTTCACCACGGAATCAACCAGAGAC
TCTTTCAGCACAGTTGACTACGCAGACGGCTGCCACGTACTAGACTCTCCTTTCTCCATC
TTCAACAACTTATACCACAACAACAACAACAACGTGGAGCCGTCGCCGCACAACACCGTC
GCCTGCAGAATGTTCTCGGGTACCAAACCCGAGACCCGGTATTTCGTGGAGGAGGAAGAA
ACAAATCACAACAACAACACGGTGGTGATGGAGGACACATCATCATCCCACGGCTATTAC
CAGCAGCAACAGAGTATGTATGTAGTAGATTATGAGACTAACCACTATCAGGATCATCAA
ACTTACGGTTATGAACAAAACTGGTAGTTTAGAATAAGAGATTGATTCTGTCTTTTAATC
TCTCTCTTTTTGGGGATACTTAACTCGAGTTCCCTAACCGAAAACATTTTGTTCTTTTCA
TGATATAATCAACAACCTCTTGTCTGATTATTATTTATTACATATTAAAAAGAAAAAAGA
GTTCACTTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO76TF U 1
AF RR4FO76JQ C 196
BS 1 651 RR4FO76TF
BS 652 652 RR4FO76JQ
BS 653 665 RR4FO76TF
BS 666 852 RR4FO76JQ

RD RR4FO76TF 665 0 0
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TCCGAGATTCATCAAGTGCCAATGACTCAAGTTATGTCAGAAGGAGCTTACATGTTGTTC
TACATGAGATCGTACCCGCGTCCTCAAAGAGGAGAACACAACGTGAAACCTCAGGCTCGG
CATTCGCTGCAACCAAGAAACGAGACTAAGGAGCAGCAGAGGAAACCGGTAAACCGATTC
AAACCGAGAGCGGACTACTACAACAAGAACTTAGCAGAGCCATCATCATCATCAAGCGAA
TGGTCTCTCTTTACGAGCTCAGACGAAGCAGCTTCGTTCACCACGGAATCAACCAGAGAC
TCTTTCAGCACAGTTGACTACGCAGACGGCTGCCACGTACTAGACTCTCCTTTCTCCATC
TTCAACAACTTATACCACAACAACAACAACAACGTGGAGCCGTCGCCGCACAACACCGTC
GCCTGCAGAATGTTCTCGGGTACCAAACCCGAGACCCGGTATTTCGTGGAGGAGGAAGAA
ACAAATCACAACAACAACACGGTGGTGATGGAGGACACATCATCATCCCACGGCTATTAC
CAGCAGCAACAGAGTATGTATGTAGTAGATTATGAGACTAACCACTATCAG*ATCATCAA
ACTTA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4FO76JQ 657 0 0
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TACTACAACAAGAACTTAGCAGAGCCATCATCATCATCAAGCGAATGGTCTCTCTTTACG
AGCTCAGACGAAGCAGCTTCGTTCACCACGGAATCAACCAGAGACTCTTTCAGCACAGTT
GACTACGCAGACGGCTGCCACGTACTAGACTCTCCTTTCTCCATCTTCAACAACTTATAC
CACAACAACAACAACAACGTGGAGCCGTCGCCGCACAACACCGTCGCCTGCAGAATGTTC
TCGGGTACCAAACCCGAGACCCGGTATTTCGTGGAGGAGGAAGAAACAAATCACAACAAC
AACACGGTGGTGATGGAGGACACATCATCATCCCACGGCTATTACCAGCAGCAACAGAGT
ATGTATGTAGTAGATTATGAGACTAACCACTATCAGGATCATCAAACTTACGGTTATGAA
CAAAACTGGTAGTTTAGAATAAGAGATTGATTCTGTCTTTTAATCTCTCTCTTTTTGGGG
ATACTTAACTCGAGTTCCCTAACCGAAAACATTTTGTTCTTTTCATGATATAATCAACAA
CCTCTTGTCTGATTATTATTTATTACATATTAAAAAGAAAAAAGAGTTCACTTTTTC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL4770Contig1 1010 2 2 U
GGGCCTTTTGGTTGTCTCCAGGAAACATTCTCTTTCTCCGGTGTGAGAAAGACTTTCCGG
AGATAAAAAAAAGCAGTAGAGCTTGGTTTTAAGTTTCTGTTAGAAAAAGAGAATAAGTAA
GTGATTTACCAACTATCATCTTCTCCGATGGCTGTTGCGCCGGCAAGAGCTCGTTCAGAC
TATGATTACCTCATCAAGCTCCTCCTCATCGGCGATAGCGGTGTGGGAAAAAGTTGCTTG
CTACTGCGTTTCTCTGATGATACTTTCACCACAAGTTTCATTACCACCATTGGAATCGAT
TTCAAGATAAGAACAGTCGAACTTGATGGAAAGCGTATCAACCTACAGATATGGGACACT
GCTGGACAAGAACGTTTCCGAACTATAACCACAGCATATTACAGAGGAGCAATGGGCATA
TTACTTGTCTACGATGTAACAGACGAGTCATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGATGAAG
AATATTGAGCAACATGCTTCAGGTAGCGTCAATAGAATATTGGTTGGTAACAAAGCTGAT
ATGGACGAAAGCAAAAGGGCTATCCCAACATCAAAGGGACAAGCTTTGGCTGATGAGTAC
GGAATCAAATTCTTCGAGACGAGTGCAAAAACAAACCTGAATGTCGAGCAGGTTTTCATG
TCTATCGCTAAAGACATCAAACAAAGACTCACAGAAACTGATACAAAAGCTGAGCCCCAA
GGGCTCAAGATCACAAAACAAGATGCTAACAAAGCCTCATCGTCTTCTACAACTGAGAAA
TCAGCTTGCTGCAGTTATGTTTAGAAGTTCCATGGACCCGGTTTCTAGTCTCTTGTCGTG
TTCATTAATCTTCTCTGAAGTCATTCAGAGATGCTTATGTTAGAGCAAGTAGGAGAGAAG
CTTCATTGATGGGTTGTGAATCTTATGTTTATGTTGCTATCTCCATTGCCTAACACAGGA
CAATGTTTTTAAGTGTTCAAAGACCTCGAATTAATGCAATCAGGTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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CCTTCAACAACATTAGGAACTGGATGAAGAATATTGAGCAACATGCTTCAGGTAGCGTCA
ATAGAATATTGGTTGGTAACAAAGCTGATATGGACGAAAGCAAAAGGGCTATCCCAACAT
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CAAACCTGAATGTCGAGCAGGTTTTCATGTCTATCGCTAAAGACATCAAACAAAGACTCA
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AAGCCTCATCGTCTTCTACAACTGAGAAATCAGCTTGCTGCAGTTATGTTTAGAAGTTCC
ATGGACCCGGTTTCTAGTCTCTTGTCGTGTTCATTAATCTTCTCTGAAGTCATTCAGAGA
TGCTTATGTTAGAGCAAGTAGGAGAGAAGCTTCATTGATGGGTTGTGAATCTTATGTTTA
TGTTGCTATCTCCATTGCCTAACACAGGACAATGTTTTTAAGTGTTCAAAGACCTCGAAT
TAATGCAATCAGGTGTTGT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GG13TF U 1
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DS 

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TGTTTTAAAGTGGCTTATGTTGTTGTTTAAGATTAAACTGCACTTTGCC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

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GAAGAAAAAGAAGGAACAAGAAGCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAGGCTTCAATGG
TCATGGGTATGATGAACATCATGGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAG
TTCCCCTGGTTCCCAAGGAAACGGAGAAGTTTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTT
ATCTGGTCTGAGGAAGGACACTTTTAAAGAGAAAACAGAGGGACAAGAAGCTAAAGGTGA
AGACGTTGTTGCTGCTGCTGCACTTGGAAGAGGAACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGT
GAACGGAAAAGCTTTGGAAATTGCACCTGCTGATGATGTTTCTGTCAAGCCTGTGGACTC
TTCTGTTTCAGAGATCGTGATTACTAACAAAAATGGGCACCCTGAAAGCTCGACAGACTC
GGGTTCTGTCCAACATAAAGCTAATGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAGGCAAA
GGAGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGA
AAAGAGTCATCTCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGCTG
CGGTTTGTTTGATGTGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGAACATGAGGAGGAAATCA
TTCAGCAAACAGTGGACATCAAAAGCTACATGGTCCGTAGATCATTTTATGTACATTCAA
CCATTAATGTCTTTTCTTGATAATAATGCGAGTGTTTTTGAAAAAAAAAATATACAAACA
AGAACAAAAGTTATTTTCTATTCATGTAAGGAGTTTTGAAAAAA


BQ
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AF RR4DY85TF U 1
AF RR4DY85JQ C 251
BS 1 679 RR4DY85TF
BS 680 884 RR4DY85JQ

RD RR4DY85TF 679 0 0
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GAAGAAAAAGAAGGAACAAGAAGCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAGGCTTCAATGG
TCATGGGTATGATGAACATCATGGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAG
TTCCCCTGGTTCCCAAGGAAACGGAGAAGTTTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTT
ATCTGGTCTGAGGAAGGACACTTTTAAAGAGAAAACAGAGGGACAAGAAGCTAAAGGTGA
AGACGTTGTTGCTGCTGCTGCACTTGGAAGAGGAACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGT
GAACGGAAAAGCTTTGGAAATTGCACCTGCTGATGATGTTTCTGTCAAGCCTGTGGACTC
TTCTGTTTCAGAGATCGTGATTACTAACAAAAATGGGCACCCTGAAAGCTCGACAGACTC
GGGTTCTGTCCAACATAAAGCTAATGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAGGCAAA
GGAGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGA
AAAGAGTCATCTCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGCTG
CGGTTTGTTTGATGTGATG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DY85JQ 634 0 0
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GCTGCTGCTGCACTTGGAAGAGGAACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAA
GCTTTGGAAATTGCACCTGCTGATGATGTTTCTGTCAAGCCTGTGGACTCTTCTGTTTCA
GAGATCGTGATTACTAACAAAAATGGGCACCCTGAAAGCTCGACAGACTCGGGTTCTGTC
CAACATAAAGCTAATGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAGGCAAAGGAGGGTAAC
ATCACAGGATCTGCTGCAGAGACATCTCAAGTGCCAGAATGTTTTGAAGAAAAGAGTCAT
CTCCCTTTTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGCTGCGGTTTGTTT
GATGTGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGAACATGAGGAGGAAATCATTCAGCAAAC
AGTGGACATCAAAAGCTACATGGTCCGTAGATCATTTTATGTACATTCAACCATTAATGT
CTTTTCTTGATAATAATGCGAGTGTTTTTGAAAAAAAAAATATACAAACAAGAACAAAAG
TTATTTTCTATTCATGTAAGGAGTTTTGAAAAAA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL4773Contig1 711 2 1 U
GCTCAGAAGAACGTTGGTCCTTCCGGTGTGACGATCGTGATCATCAGGAAAGATCTGATC
GGTGACGCTCAGGAGATCACTCCCGTGATGCTTGACTACAAGATCCACGACGAGAATAAG
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CTGTTGGAGCAAGGTGGGATGAAGGAAGTGGAGAGGAAGAACGTGAGGAAAGCTGGTTTG
CTTTATAATGCGATTGAAGGGAGCGGGGGGTTTTACAGGTGTCCTGTTGAGAAGTCGGTG
AGGTCGTTGATGAATGTGCCTTTCACGTTGGAGAGATCTGAGCTGGAAGGTGAGTTTATC
AAGGAAGCTGCTAAGGAGGGGATGGTGCATCTTAAAGGGCATAGGTCGGTGGGTGGTATG
AGGGCTTCTATTTATAATGCTATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAAGCTTGTCGCTTTCATG
AAAGATTTTCAGGCAAAACATGCCTAAGTTTATTTGTGTTTCTTTCTTTTTGTTTTGCAT
TTTGGTTATGTTTGTTGGGTGATGATAAGCGGATGCTTATGATTTGGTTTTACTTTTTTT
TTTTTTTGAAACACAATTTGGTTTTACTTCTTTCCGGAATTTTCTAGTAATAATGTATCA
AAAATCTTGGTCGAGTTTGTTAACAACAGAGATCTGATAATCTCCTTTAAG


BQ
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AF RR4BG29JQ C 1
AF RR4BG29TF U 1
BS 1 711 RR4BG29TF

RD RR4BG29JQ 711 0 0
GCTCAGAAGAACGTTGGTCCTTCCGGTGTGACGATCGTGATCATCAGGAAAGATCTGATC
GGTGACGCTCAGGAGATCACTCCCGTGATGCTTGACTACAAGATCCACGACGAGAATAAG
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AAGGAAGCTGCTAAGGAGGGGATGGTGCATCTTAAAGGGCATAGGTCGGTGGGTGGTATG
AGGGCTTCTATTTATAATGCTATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAAGCTTGTCGCTTTCATG
AAAGATTTTCAGGCAAAACATGCCTAAGTTTATTTGTGTTTCTTTCTTTTTGTTTTGCAT
TTTGGTTATGTTTGTTGGGTGATGATAAGCGGATGCTTATGATTTGGTTTTACTTTTTTT
TTTTTTTGAAACACAATTTGGTTTTACTTCTTTCCGGAATTTTCTAGTAATAATGTATCA
AAAATCTTGGTCGAGTTTGTTAACAACAGAGATCTGATAATCTCCTTTAAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BG29TF 711 0 0
GCTCAGAAGAACGTTGGTCCTTCCGGTGTGACGATCGTGATCATCAGGAAAGATCTGATC
GGTGACGCTCAGGAGATCACTCCCGTGATGCTTGACTACAAGATCCACGACGAGAATAAG
TCGTTGTACAACACGCCTCCTTGCTTGGGGATCTACATGTGCGGTCTCGTGTTCGAGGAT
CTGTTGGAGCAAGGTGGGATGAAGGAAGTGGAGAGGAAGAACGTGAGGAAAGCTGGTTTG
CTTTATAATGCGATTGAAGGGAGCGGGGGGTTTTACAGGTGTCCTGTTGAGAAGTCGGTG
AGGTCGTTGATGAATGTGCCTTTCACGTTGGAGAGATCTGAGCTGGAAGGTGAGTTTATC
AAGGAAGCTGCTAAGGAGGGGATGGTGCATCTTAAAGGGCATAGGTCGGTGGGTGGTATG
AGGGCTTCTATTTATAATGCTATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAAGCTTGTCGCTTTCATG
AAAGATTTTCAGGCAAAACATGCCTAAGTTTATTTGTGTTTCTTTCTTTTTGTTTTGCAT
TTTGGTTATGTTTGTTGGGTGATGATAAGCGGATGCTTATGATTTGGTTTTACTTTTTTT
TTTTTTTGAAACACAATTTGGTTTTACTTCTTTCCGGAATTTTCTAGTAATAATGTATCA
AAAATCTTGGTCGAGTTTGTTAACAACAGAGATCTGATAATCTCCTTTAAG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL4774Contig1 464 2 1 U
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CTATGTCTATTTCATGTTCGAGTAACGCAGGCGACACCATTCCATTTCCGTGACGAAGTT
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ACTAGATTATATCCTGAGCCACGCGCGGGTATTATCTTTATGTATTAATAATAACAATTT
GAGTATGTAAAATTTGCCATCTATTTATATAAAATAGAGTTTCC


BQ
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AF RR4GR46JQ C 1
AF RR4GR46TF U 1
BS 1 464 RR4GR46TF

RD RR4GR46JQ 464 0 0
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CTATGTCTATTTCATGTTCGAGTAACGCAGGCGACACCATTCCATTTCCGTGACGAAGTT
CTCATTCCTCCCATCTGGAGATCCGTTCACCGCTCCCGGAATTGTGGAGGCCCTATTGGA
AGCGTCGATATCAGTGGAGAAAAGGGACCTTGTAGACGTCCACGACCTCCCAATGCCGCG
GCTTTAGAATAAGCGACCGAAGCGGTTTCTTAATACAACCTTATTTACCAATACTTTTTG
TTACTCTTCGTTGGAAGATTACGTATATCTTCTTTTTTGACTTTCCACTTTAATATATCT
ACTAGATTATATCCTGAGCCACGCGCGGGTATTATCTTTATGTATTAATAATAACAATTT
GAGTATGTAAAATTTGCCATCTATTTATATAAAATAGAGTTTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4GR46TF 464 0 0
GGATGATATAGAAGAGGAGCAGTGGCGATGAAGAATCTACAAACATGTCTACTTATACTT
CTATGTCTATTTCATGTTCGAGTAACGCAGGCGACACCATTCCATTTCCGTGACGAAGTT
CTCATTCCTCCCATCTGGAGATCCGTTCACCGCTCCCGGAATTGTGGAGGCCCTATTGGA
AGCGTCGATATCAGTGGAGAAAAGGGACCTTGTAGACGTCCACGACCTCCCAATGCCGCG
GCTTTAGAATAAGCGACCGAAGCGGTTTCTTAATACAACCTTATTTACCAATACTTTTTG
TTACTCTTCGTTGGAAGATTACGTATATCTTCTTTTTTGACTTTCCACTTTAATATATCT
ACTAGATTATATCCTGAGCCACGCGCGGGTATTATCTTTATGTATTAATAATAACAATTT
GAGTATGTAAAATTTGCCATCTATTTATATAAAATAGAGTTTCC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4775Contig1 1033 2 12 U
TTTTTGTAGAAAAAAACTTCTCTTTTTCTTGCATTGAGATGAAGAGATTAGATGGTCCAA
GAAAATCCCGTAGATGGAAACTCTCTATGAAATCTCTCCTTTGTTCAATCTGCAATGTGA
TGGTGGTGAGATCAAGAAAAAACCTGAAATGGGAAAACATGGATAGAGATATTCTGATCA
AGATTTTCGAGAAGCTCAACGTCATAGATGTTACCATGGGAGCATCACGTGTTTGCATCT
CTTGGTTCCTTGCCTCTCACGAAAAGTCTCTTTGGAAAACCATCAACCTCGCAGATCTCC
AACGTGTGGACTTCAGCCTTCGTCGATTATCAAACTCCCGGGTGGAAGATGAAAAGGTAC
ACGAACATGTGTACCGTTGTAATACGATTTTGTTTGAAAGCACCAAATTCAGCAGCACTG
TCCCCATCAACTTATTCTTCAACTTCGATACCTACTTAACTGATGAGGATCTCATCATCG
CTGCGCAAAGGCAATGGAAGAATCTCCAAACGTTAATCATTGATCAACGCCAAGCATCAT
TAACCTGGAGACACGAGATTCGAGCTAGCGGAGAGAACTGTAAAAACCTCACTAACTTGA
AAATTATGGGGTGCCTTAACGAAGCTGAAGCTGGGGATATCGTTCGTTGGTTTCCAAACC
TCAAGAAGCTGAGTTTGCGTTTTTGCGACATCATTGATATTGGTCTAGTTTTGCCTCTCA
TCACAAGCCTCAAACACCTAACGATCCTTAACCTCTCACATTGTAGATTTCGCCATGAGA
GATGTGGCTATATAATTTGTAGCCGTGAACTTGAAACCATTCTTATCAAGATTGATAGAT
AAGTGTGAGACATTGATCATGTTGTGTGTAAATCTCAACTGCAAGTTCTGCGAAAAGGCA
TATTGCATTGGCAGATCACATGCTTTTTTCGAGAAGAATTGGCGTAACGATGAAATAGAG
GAATTTGAATTCTGAAACGTTGTAAAAACCTTTTGATGACTCTTAACAGATTATCATATT
CTGTTTTATAAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ74TF U 1
AF RR4EQ74JQ C 304
BS 1 683 RR4EQ74TF
BS 684 684 RR4EQ74JQ
BS 685 733 RR4EQ74TF
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BS 795 1033 RR4EQ74JQ

RD RR4EQ74TF 795 0 0
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CTTGGTTCCTTGCCTCTCACGAAAAGTCTCTTTGGAAAACCATCAACCTCGCAGATCTCC
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ACGAACATGTGTACCGTTGTAATACGATTTTGTTTGAAAGCACCAAATTCAGCAGCACTG
TCCCCATCAACTTATTCTTCAACTTCGATACCTACTTAACTGATGAGGATCTCATCATCG
CTGCGCAAAGGCAATGGAAGAATCTCCAAACGTTAATCATTGATCAACGCCAAGCATCAT
TAACCTGGAGACACGAGATTCGAGCTAGCGGAGAGAACTGTAAAAACCTCACTAACTTGA
AAATTATGGGGTGCCTTAACGAAGCTGAAGCTGGGGATATCGTTCGTTGGTTTCCAAACC
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GA*GTGGCTATATA
T

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DS 

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AACATGTGTACCGTTGTAATACGATTTTGTTTGAAAGCACCAAATTCAGCAGCACTGTCC
CCATCAACTTATTCTTCAACTTCGATACCTACTTAACTGATGAGGATCTCATCATCGCTG
CGCAAAGGCAATGGAAGAATCTCCAAACGTTAATCATTGATCAACGCCAAGCATCATTAA
CCTGGAGACACGAGATTCGAGCTAGCGGAGAGAACTGTAAAAACCTCACTAACTTGAAAA
TTATGGGGTGCCTTAACGAAGCTGAAGCTGGGGATATCGTTCGTTGGTTTCCAAACCTCA
AGAAGCTGAGTTTGCGTTTTTGCGACATCATTGATATTGGTCTAGTTTTGCCTCTCATCA
CAAGCCTCAAACACCTAACGATCCTTAACCTCTCACATTGTAGATTTCGCCATGAGAGAT
GTGGCTATATAATTTGTAGCCGTGAACTTGAAACCATTCTTATCAAGATTGATAGATAAG
TGTGAGACATTGATCATGTTGTGTGTAAATCTCAACTGCAAGTTCTGCGAAAAGGCATAT
TGCATTGGCAGATCACATGCTTTTTTCGAGAAGAATTGGCGTAACGATGAAATAGAGGAA
TTTGAATTCTGAAACGTTGTAAAAACCTTTTGATGACTCTTAACAGATTATCATATTCTG
TTTTATAAGC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4776Contig1 1202 2 2 U
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CTTCACCAATGGAGACAACAAATCCCATGGAAATTCCTGAAAGCACAAATAGCGGATGCT
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ATGATTTATCATCTGAGTTACCATCTGATTCAAATCAGCCTCTGGTTGCTGCACACATGG
AGAACAGAGCAGACCCCCTTACAGGACTTGAAGAAAAGGAATGTCTCCCGGTTAATATTG
AGAAATCTCTTTCCAGTACAGCCGTTTCCAATTCAGATGTTGCTAGTGTTGTCAGCTTAA
AGAGAAAACATTCAGATTGCAGTGGTGATGATGACAATCCGGAAACTAAGGCTGAGATTG
CAGAACGTCTCGTTAAACCAAAGCTAGAGGTGATGGAAGAAAAAGCACCTGTTGATATAT
TCAGCATTGTTAAAGGATTTGGGAGTAAAAAGAAACCCACGGTTCCAAAGACTACGGATA
AGTCTTCAGAAGGAGAGAATGCTGTTGGTTTGAGGGTGAAGAAGATTAAGAAGACACCGG
AAGATGATAAAGAGTCATTGGTTCTGGTTGAGAAACTAAGGAAAGAAATAAGAGAGGCCG
TTCGTAACAAATCAGTGGAAGACATCAGAAATGACCAATTTGATCCAAAACTATTGGCCG
CCTTCAGAGCTGCTGTGGCAGGTTCCAAAACGGATGAAGCACCTAGAAAAGTTCCGGCTC
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AGAAAATCTATGCAGATTCAAATGGGAAGCGGAAAACTGCATGGCATCGGGACTGTGAAG
TCGAGTTCTGGAAGCATCGGTGCATGAAAGCTGGAAAGCCTGAGAAAATTGAGACTCTGA
AGTCTGTTCTTAGCCTCTTGAAGAGAACCAGCTGACGCCGAGACAAACGTTTCATCTGAA
GC


BQ
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10 10 

AF RR4H078JQ C 1
AF RR4AE91TF U 371
BS 1 370 RR4H078JQ
BS 371 1202 RR4AE91TF

RD RR4H078JQ 817 0 0
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CAGTCGAGGCTATTTACTCCGGAAATTTTTCAGTCACAGTTGCTGATGATGGCGAGACAG
CTCTTGTCGTATCAACAGTCAAAGGAGACGAGTGGCCTATGAAACCAAGTGATACCACTG
CATCGCTAGTTCAAGCTACGGTGTACGGAGATCCTGATAGCTCGCAGCGGGAAATATGTT
GTAGGAAGGAAAATACAGAGGAGGCCCCAGCAAAATCGAAGTTCACGCAGTCCTTACGAC
ATGATTTATCATCTGAGTTACCATCTGATTCAAATCAGCCTCTGGTTGCTGCACACATGG
AGAACAGAGCAGACCCCCTTACAGGACTTGAAGAAAAGGAATGTCTCCCGGTTAATATTG
AGAAATCTCTTTCCAGTACAGCCGTTTCCAATTCAGATGTTGCTAGTGTTGTCAGCTTAA
AGAGAAAACATTCAGATTGCAGTGGTGATGATGACAATCCGGAAACTAAGGCTGAGATTG
CAGAACGTCTCGTTAAACCAAAGCTAGAGGTGATGGAAGAAAAAGCACCTGTTGATATAT
TCAGCATTGTTAAAGGATTTGGGAGTAAAAAGAAACCCACGGTTCCAAAGACTACGGCTA
AGTCTTCAGAAGGAGAGAATGCTGTTGGTTTGAGGGTGAAGAAGATTAAGAAGACACCGG
AAGATGATAAAGAGTCATTGGTTCTGGTTGAGAAACT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4AE91TF 832 0 0
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AGACCCCCTTACAGGACTTGAAGAAAAGGAATGTCTCCCGGTTAATATTGAGAAATCTCT
TTCCAGTACAGCCGTTTCCAATTCAGATGTTGCTAGTGTTGTCAGCTTAAAGAGAAAACA
TTCAGATTGCAGTGGTGATGATGACAATCCGGAAACTAAGGCTGAGATTGCAGAACGTCT
CGTTAAACCAAAGCTAGAGGTGATGGAAGAAAAAGCACCTGTTGATATATTCAGCATTGT
TAAAGGATTTGGGAGTAAAAAGAAACCCACGGTTCCAAAGACTACGGATAAGTCTTCAGA
AGGAGAGAATGCTGTTGGTTTGAGGGTGAAGAAGATTAAGAAGACACCGGAAGATGATAA
AGAGTCATTGGTTCTGGTTGAGAAACTAAGGAAAGAAATAAGAGAGGCCGTTCGTAACAA
ATCAGTGGAAGACATCAGAAATGACCAATTTGATCCAAAACTATTGGCCGCCTTCAGAGC
TGCTGTGGCAGGTTCCAAAACGGATGAAGCACCTAGAAAAGTTCCGGCTCTGGCATTGAA
GGCAAAGAAGTTGATGCTGCAGAAAGGAAAAGTCCGAGAGAATCTCACTAAGAAAATCTA
TGCAGATTCAAATGGGAAGCGGAAAACTGCATGGCATCGGGACTGTGAAGTCGAGTTCTG
GAAGCATCGGTGCATGAAAGCTGGAAAGCCTGAGAAAATTGAGACTCTGAAGTCTGTTCT
TAGCCTCTTGAAGAGAACCAGCTGACGCCGAGACAAACGTTTCATCTGAAGC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL4777Contig1 728 2 2 U
GGCTTACTGCCCCGGCTGAAAGTCCCAACACCGATGGCATCCATTTGAGCAATGCGGTCA
ACGTTCACATCGCTGACAGTTTAATAGCGACAGGAGACGATTGTATCTCAGTCGGTCGTG
GTTCCACCAATGTAACCGTCGAACGCGTGACTTGTGGCCCCGGACACGGCCTAAGTGTCG
GTAGTCTTGGTAAGTACCCGAACGAGGAGAATGTTGCCGGCATTCACTTTAAGAACTGCA
CCTTAAAAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCTCCAAGCA
CAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATGATGACAAACGTCAAGAACCCTATCATCA
TTGACCAGAACTACAGCACAAGAGGCGGAGATTCAAAAGTTGCGATAAGCAATGTGCTGT
TCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGATGAAGTTCAGATCATGTGCAGCAAAT
CAGTACCGTGCAAAGGAGTCAGCGTCGTTGATGTGGAGTTGAACTTGGTGGGTGACAAAG
GAGGTTTGGGCGGAGCTCTTTGTACTAACGCCAATGTTATCTCGGTGGAAAACTTAGCTT
CCCTATGTGTCCCAAATAATCTTTTTGGTATAAGTAATTTGATTTTGAAAAACAAATCAA
AAGTTTCCACAAACATTTTTGGTTTTTGTTTGTGAGTTAGTTTGTGAGTTTATCAACTAT
AATTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E096TF U 1
AF RR4E096JQ C 155
BS 1 460 RR4E096TF
BS 461 728 RR4E096JQ

RD RR4E096TF 460 0 0
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ACGTTCACATCGCTGACAGTTTAATAGCGACAGGAGACGATTGTATCTCAGTCGGTCGTG
GTTCCACCAATGTAACCGTCGAACGCGTGACTTGTGGCCCCGGACACGGCCTAAGTGTCG
GTAGTCTTGGTAAGTACCCGAACGAGGAGAATGTTGCCGGCATTCACTTTAAGAACTGCA
CCTTAAAAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCTCCAAGCA
CAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATGATGACAAACGTCAAGAACCCTATCATCA
TTGACCAGAACTACAGCACAAGAGGCGGAGATTCAAAAGTTGCGATAAGCAATGTGCTGT
TCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGATGAAGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4E096JQ 574 0 0
TGGCCCCGGACACGGCCTAAGTGTCGGTAGTCTTGGTAAGTACCCGAACGAGGAGAATGT
TGCCGGCATTCACTTTAAGAACTGCACCTTAAAAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAA
GAGTTGGGGTGGTTCGTCTCCAAGCACAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATGAT
GACAAACGTCAAGAACCCTATCATCATTGACCAGAACTACAGCACAAGAGGCGGAGATTC
AAAAGTTGCGATAAGCAATGTGCTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGA
TGAAGTTCAGATCATGTGCAGCAAATCAGTACCGTGCAAAGGAGTCAGCGTCGTTGATGT
GGAGTTGAACTTGGTGGGTGACAAAGGAGGTTTGGGCGGAGCTCTTTGTACTAACGCCAA
TGTTATCTCGGTGGAAAACTTAGCTTCCCTATGTGTCCCAAATAATCTTTTTGGTATAAG
TAATTTGATTTTGAAAAACAAATCAAAAGTTTCCACAAACATTTTTGGTTTTTGTTTGTG
AGTTAGTTTGTGAGTTTATCAACTATAATTGGAA

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL4778Contig1 583 2 3 U
GCTCATACTCTCGTGCTGGAAGAAGCAAACGTGTCACAGTCACAAACTCATACGAACACT
TTTACTGTCGAGACGTCTCTGTAGCCGTACCTTGGCCTGGCAAAATCAGTAACAGCAACA
GCCCGGACGAGTCTCCCATCACAGCCAATAACCCTCCAACACCTGTCAACGATCCAATCA
ACAACAAAACCGTCACCAACGGTATCATTTCGAGCGCCACAAACCGATACTTCTTCGATA
GAATCTTGGCGACATGGCCCGAGGAGAAACTTTTGCTGGCTGCAAAGAACCGGGCAAGAA
CTAGCCCTCGCGTGAGCGTCGACATGTCTAATGGACCGGTTAGCAGAAAACCGAGTGCTT
CGGCTTGGTCTATGGTGATTGTGACTGGCGGTTTACGAGGCGAGATCAGAACATTTCAGA
ATTTTGGATTACCGGTTCGTCTATGAAGCCATGGAGAGAGTTTTACAAATCAGCAAGCCC
AAGGCAAAAGTGAAAAAAAATTACTTAGTAAAAACACCTTCTCTAGTCAATAGTGTATAG
ATTGAGAGAAGGTTGGTTCTTCCAATAACTCTCTTTTCTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DP76TF U 1
AF RR4DP76JQ C 112
BS 1 124 RR4DP76TF
BS 125 125 RR4DP76JQ
BS 126 583 RR4DP76TF

RD RR4DP76TF 583 0 0
GCTCATACTCTCGTGCTGGAAGAAGCAAACGTGTCACAGTCACAAACTCATACGAACACT
TTTACTGTCGAGACGTCTCTGTAGCCGTACCTTGGCCTGGCAAAATCAGTAACAGCAACA
GCCCTGACGAGTCTCCCATCACAGCCAATAACCCTCCAACACCTGTCAACGATCCAATCA
ACAACAAAACCGTCACCAACGGTATCATTTCGAGCGCCACAAACCGATACTTCTTCGATA
GAATCTTGGCGACATGGCCCGAGGAGAAACTTTTGCTGGCTGCAAAGAACCGGGCAAGAA
CTAGCCCTCGCGTGAGCGTCGACATGTCTAATGGACCGGTTAGCAGAAAACCGAGTGCTT
CGGCTTGGTCTATGGTGATTGTGACTGGCGGTTTACGAGGCGAGATCAGAACATTTCAGA
ATTTTGGATTACCGGTTCGTCTATGAAGCCATGGAGAGAGTTTTACAAATCAGCAAGCCC
AAGGCAAAAGTGAAAAAAAATTACTTAGTAAAAACACCTTCTCTAGTCAATAGTGTATAG
ATTGAGAGAAGGTTGGTTCTTCCAATAACTCTCTTTTCTCACC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4DP76JQ 472 0 0
ACAGCAACAGCCCGGACGAGTCTCCCATCACAGCCAATAACCCTCCAACACCTGTCAACG
ATCCAATCAACAACAAAACCGTCACCAACGGTATCATTTCGAGCGCCACAAACCGATACT
TTTTCGATAGAATCTTGGCGACATGGCCCGAGGAGAAACTTTTGCTGGCTGCAAAGAACC
GGGCAAGAACTAGCCCTCGCGTGAGCGTCGACATGTCTAATGGACCGGTTAGCAGAAAAC
CGAGTGCTTCGGCTTGGTCTATGGTGATTGTGACTGGCGGTTTACGAGGCGAGATCAGAA
CATTTCAGAATTTTGGATTACCGGTTCGTCTATGAAGCCATGGAGAGAGTTTTACAAATC
AGCAAGCCCAAGGCAAAAGTGAAAAAAAATTACTTAGTAAAAACACCTTCTCTAGTCAAT
AGTGTATAGATTGAGAGAAGGTTGGTTCTTCCAATAACTCTCTTTTCTCACC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL4779Contig1 805 2 2 U
AGAAAGCCGTATTAGCAGGATTGTGGTTGAGGGATACGACACCTCTCTTCGTAGGGAAGA
TGTCGAAGAGGCTTTGAGAAAACATTTCGCTTCATGTGGAAACATAATACATGTTTATGT
TCCCATTAACGAGGAAACTGATATTCCCAACAGATTTTCCTTCATTTATGTTAAAGGAGA
AGACGAAGAAAAGGCGTTGAGGCTTAATGGAAGCGACATGGGAGGACGGATTTTACAAAC
TTATGCATACCCGTTTCAGGAAAATTACCTTGATGATGTCTTGGCTACTATGAAAGAAGC
CCGTCAGCCACAACGCACTTTGAAAGTTACCGGATATGACCCTTCCCTTTCTATGGATGA
TGTCGAGAGCAAGCTGTGTAAACATTTCGCACCAGCTAGTTGTTTTGCTTACAGGACATG
TGGTGGTCTCAAAAGCAAAGCTTTCGTTTATCTCGTTGGAGAAGACGATGTAGAGAAGGC
GCTGGAACTCAGTGGACGTTGTGTGGGAGGATTGAACGTTGTAGTTACCCAGGTTCTGCC
CAAAAAACCGATCAAGTGTGGCTACACTCGTCCACTTAATTGACTAATGAGAGCAGAAAG
CTGATCGAAAGCTATATATCTTTTATGAGGAAAATCAGAAGGAGCAGAAGAATAAGACTA
AAGCTCTCTCTTCTTGGGAGAAGACATATATGCTCTTTTGTGCTATTAACTTGTGTTGCA
ACGCAACATTTTTCTTTTTTGTCTGGATTGTTTACTAAAATGTTATCCAAGTTCATGCTC
TGCAAATAAAAAAAACTGGTTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E718TF U 1
AF RR4E718JQ C 12
BS 1 475 RR4E718TF
BS 476 805 RR4E718JQ

RD RR4E718TF 475 0 0
AGAAAGCCGTATTAGCAGGATTGTGGTTGAGGGATACGACACCTCTCTTCGTAGGGAAGA
TGTCGAAGAGGCTTTGAGAAAACATTTCGCTTCATGTGGAAACATAATACATGTTTATGT
TCCCATTAACGAGGAAACTGATATTCCCAACAGATTTTCCTTCATTTATGTTAAAGGAGA
AGACGAAGAAAAGGCGTTGAGGCTTAATGGAAGCGACATGGGAGGACGGATTTTACAAAC
TTATGCATACCCGTTTCAGGAAAATTACCTTGATGATGTCTTGGCTACTATGAAAGAAGC
CCGTCAGCCACAACGCACTTTGAAAGTTACCGGATATGACCCTTCCCTTTCTATGGATGA
TGTCGAGAGCAAGCTGTGTAAACATTTCGCACCAGCTAGTTGTTTTGCTTACAGGACATG
TGGTGGTCTCAAAAGCAAAGCTTTCGTTTATCTCGTTGGAGAAGACGATGTAGAG

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4E718JQ 794 0 0
TTAGCAGGATTGTGGTTGAGGGATACGACACCTCTCTTCGTAGGGAAGATGTCGAAGAGG
CTTTGAGAAAACATTTCGCTTCATGTGGAAACATAATACATGTTTATGTTCCCATTAACG
AGGAAACTGATATTCCCAACAGATTTTCCTTCATTTATGTTAAAGGAGAAGACGAAGAAA
AGGCGTTGAGGCTTAATGGAAGCGACATGGGAGGACGGATTTTACAAACTTATGCATACC
CGTTTCAGGAAAATTACCTTGATGATGTCTTGGCTACTATGAAAGAAGCCCGTCAGCCAC
AACGCACTTTGAAAGTTACCGGATATGACCCTTCCCTTTCTATGGATGATGTCGAGAGCA
AGCTGTGTAAACATTTCGCACCAGCTAGTTGTTTTGCTTACAGGACATGTGGTGGTCTCA
AAAGCAAAGCTTTCGTTTATCTCGTTGGAGAAGACGATGTAGAGAAGGCGCTGGAACTCA
GTGGACGTTGTGTGGGAGGATTGAACGTTGTAGTTACCCAGGTTCTGCCCAAAAAACCGA
TCAAGTGTGGCTACACTCGTCCACTTAATTGACTAATGAGAGCAGAAAGCTGATCGAAAG
CTATATATCTTTTATGAGGAAAATCAGAAGGAGCAGAAGAATAAGACTAAAGCTCTCTCT
TCTTGGGAGAAGACATATATGCTCTTTTGTGCTATTAACTTGTGTTGCAACGCAACATTT
TTCTTTTTTGTCTGGATTGTTTACTAAAATGTTATCCAAGTTCATGCTCTGCAAATAAAA
AAAACTGGTTATAG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL4780Contig1 1031 2 4 U
GGAATATCAACTCACCACAACCTTCTCTCTTACTTGTCTCTTTCTTTTAAATTCCTCTCC
CTCTAGCTATAAGAGTTATAAATAAATAAGAATAAAATGGACAAAAGGGGAGGAATATGT
AGTGGAGGTTCGGGATCATCAGGAGAAACAGAGGTGAGAAAAGGACCATGGACGATGGAA
GAAGATCTTATTCTTATCAACTATATCGCCAACCACGGGGATGGCGTTTGGAACACTCTC
GCCAAATCTGCAGGTCTAAAACGCACCGGGAAAAGTTGCCGGCTCCGGTGGCTGAACTAT
CTCCGCCCTGACGTACGACGTGGAAACATCACGCCGGAGGAGCAACTTATCATCATGGAA
CTTCATGCTAAGTGGGGAAACAGGTGGTCAAAAATCGCTAAACATCTTCCAGGAAGAACC
GATAACGAGATCAAAAATTTCTGGAGGACAAGAATACAAAAATACATCAAACAAACCGAT
GTAGCAACAACTGCAACGTCGTCCGTTGGATCTCAGAGCTCTGAAGTCAACGATCAAGTT
GCAAGCACGTCGGGACACAATGTCTTTTGTGCACAAGATCATGCAATGGAGACTTATTCT
CCTACGACAACGTCGTACCAACATACCAATATGGAATTCAACTATGGTAACTACTCTGCG
CCTGTGGCTCCGGTGACTACGGCTACGACAACAGCAGATTATCCTGTACCGATGACCGTT
GATGATCAAACCGGTGAAAACTATTGGGGCATGGATGATATCTGGTCATCAATGCATTTA
CTCAATGGTAATTGATTAATCAAGTATAGTCTCGATCGGAAAACAAAATATGGAATATAA
TTACTATGAGATTTGTGATTTTTAGTACTGTGATTAGTACGTGACATGTATATGGTTTTT
GCCTCGTTGTTTCGAGGTTTGGGGATATATTTTACATATAATATCAATGATCATAATCCT
TGATATATATTTTGAACTTTATTGCACCCCGTTGGATGTTATACATGAATAAAACTAAAT
GGGTTATGGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB81TF U 1
AF RR4GB81JQ C 304
BS 1 739 RR4GB81TF
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BS 741 776 RR4GB81TF
BS 777 1031 RR4GB81JQ

RD RR4GB81TF 776 0 0
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CTCTAGCTATAAGAGTTATAAATAAATAAGAATAAAATGGACAAAAGGGGAGGAATATGT
AGTGGAGGTTCGGGATCATCAGGAGAAACAGAGGTGAGAAAAGGACCATGGACGATGGAA
GAAGATCTTATTCTTATCAACTATATCGCCAACCACGGGGATGGCGTTTGGAACACTCTC
GCCAAATCTGCAGGTCTAAAACGCACCGGGAAAAGTTGCCGGCTCCGGTGGCTGAACTAT
CTCCGCCCTGACGTACGACGTGGAAACATCACGCCGGAGGAGCAACTTATCATCATGGAA
CTTCATGCTAAGTGGGGAAACAGGTGGTCAAAAATCGCTAAACATCTTCCAGGAAGAACC
GATAACGAGATCAAAAATTTCTGGAGGACAAGAATACAAAAATACATCAAACAAACCGAT
GTAGCAACAACTGCAACGTCGTCCGTTGGATCTCAGAGCTCTGAAGTCAACGATCAAGTT
GCAAGCACGTCGGGACACAATGTCTTTTGTGCACAAGATCATGCAATGGAGACTTATTCT
CCTACGACAACGTCGTACCAACATACCAATATGGAATTCAACTATGGTAACTACTCTGCG
CCTGTGGCTCCGGTGACTACGGCTACGACAACAGCAGATTATCCTGTACCGATGACCGTT
GATGATCAAACCGGTGAAA*CTATTGGGGCATGGATGATATCTGGTCATCAATGCA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4GB81JQ 728 0 0
CGCCCTGACGTACGACGTGGAAACATCACGCCGGAGGAGCAACTTATCATCATGGAACTT
CATGCTAAGTGGGGAAACAGGTGGTCAAAAATCGCTAAACATCTTCCAGGAAGAACCGAT
AACGAGATCAAAAATTTCTGGAGGACAAGAATACAAAAATACATCAAACAAACCGATGTA
GCAACAACTGCAACGTCGTCCGTTGGATCTCAGAGCTCTGAAGTCAACGATCAAGTTGCA
AGCACGTCGGGACACAATGTCTTTTGTGCACAAGATCATGCAATGGAGACTTATTTTCCT
ACGACAACGTCGTACCAACATACCAATATGGAATTCAACTATGGTAACTACTCTGCGCCT
GTGGCTCCGGTGACTACGGCTACGACAACAGCAGATTATCCTGTACCGATGACCGTTGAT
GATCAAACCGGTGAAAACTATTGGGGCATGGATGATATCTGGTCATCAATGCATTTACTC
AATGGTAATTGATTAATCAAGTATAGTCTCGATCGGAAAACAAAATATGGAATATAATTA
CTATGAGATTTGTGATTTTTAGTACTGTGATTAGTACGTGACATGTATATGGTTTTTGCC
TCGTTGTTTCGAGGTTTGGGGATATATTTTACATATAATATCAATGATCATAATCCTTGA
TATATATTTTGAACTTTATTGCACCCCGTTGGATGTTATACATGAATAAAACTAAATGGG
TTATGGAT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL4781Contig1 472 2 1 U
GCTCCATGGCCATTTCATTGCTAACAAACAAGAAAACTCGGGATCTGGTCATGATTCTCA
ACTCCAAAAGATTCCTAGATAGGCTTGTTTCGGAGCTGGAGGAGAAGAAGCACCGTGAAG
TGAAGTTAAAAGAGAGCTTGAAAGATGTGGGTAGGAAACGCATGGAGCTTCAGAATTCTC
TCTCTTCTATATGGCCAAAACAGGAAGCTGCCCTTGTGAAAACAAGAGCACTGAAAGATC
TATGTGAGACAAGTCTCTCTTCCATCTTTGACGGCAGACCTGTGAATATAAGAGGAGAGA
TCAATACTCTATTGAACGCTGGGGTTTCTGCTTAGTTTATAATCTTTTGTATTGGCTAGA
AAACTTTAGTTTCAGACCCCTTTTTTTACATGGATTTTTCTTGTTTCAAACTCTTTATTT
TCTATGCTATACTAAGAAACTTCCTTTTGACAATGACTAGTTTATTGTTATC


BQ
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AF RR4FQ69JQ C 1
AF RR4FQ69TF U 1
BS 1 472 RR4FQ69TF

RD RR4FQ69JQ 472 0 0
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TTTCTTCTATATGGCCAAAACAGGAAGCTGCCCTTGTGAAAACAAGAGCACTGAAAGATC
TATGTGAGACAAGTCTTTCTTCCATCTTTGACGGCAGACCTGTGAATATAAGAGGAGAGA
TCAATACTCTATTGAACGCTGGGGTTTCTGCTTAGTTTATAATCTTTTGTATTGGCTAGA
AAACTTTAGTTTCAGACCCCTTTTTTTACATGGATTTTTCTTGTTTCAAACTCTTTATTT
TCTATGCTATACTAAGAAACTTCCTTTTGACAATGACTAGTTTATTGTTATC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR4FQ69TF 472 0 0
GCTCCATGGCCATTTCATTGCTAACAAACAAGAAAACTCGGGATCTGGTCATGATTCTCA
ACTCCAAAAGATTCCTAGATAGGCTTGTTTCGGAGCTGGAGGAGAAGAAGCACCGTGAAG
TGAAGTTAAAAGAGAGCTTGAAAGATGTGGGTAGGAAACGCATGGAGCTTCAGAATTCTC
TCTCTTCTATATGGCCAAAACAGGAAGCTGCCCTTGTGAAAACAAGAGCACTGAAAGATC
TATGTGAGACAAGTCTCTCTTCCATCTTTGACGGCAGACCTGTGAATATAAGAGGAGAGA
TCAATACTCTATTGAACGCTGGGGTTTCTGCTTAGTTTATAATCTTTTGTATTGGCTAGA
AAACTTTAGTTTCAGACCCCTTTTTTTACATGGATTTTTCTTGTTTCAAACTCTTTATTT
TCTATGCTATACTAAGAAACTTCCTTTTGACAATGACTAGTTTATTGTTATC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL4782Contig1 1061 2 2 U
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CACACCTCCCATCCCTTGGTTCGAGCGTTTCAGGATCGCGTTAGAAGTCGCTTCGGCGCT
TGTCTTCCTCCACAAATCCAAGCCTAGACCCATCATTCACCGCGACCTCAAACCAGGAAA
CATCTTGCTTGACCAAAACTTCGTCAGTAAACTCGGGGACGTTGGTCTCTCCACTATGGT
TAACCAAGACGACGCTGCTTCTAAACTAACCGTCTTCAAGAAGACCAGCCCCGTGGGAAC
GCTCTGTTACATCGACCCCGAGTATCAGCGGACAGGGATCATCTCGCCTAAGTCAGATGT
GTACTCTCTAGGCGTTGTGATTCTGCAGCTCATAACCGCGAAGCCAGCCATAGCGATTAC
TCATATGGTGGAAGAAGCTATAGGGGACGATGCTGAGTTTATGGCATTGTTGGATGTGAA
AGCTGGATCCTGGCCTATTAGTGAGACTCGTGAGCTAGCTGCTTTGGGACTGTGTTGTAC
TGAAATGAGACGCAGAGACAGACCAGACCTTAAAGATCAGATCATACCGACTTTAGAAAG
GCTTTGGAAAGTTGTCGAAAAAGCTCAAAACTCACTCTCGAGAACTTCGTTGGATCCTCC
ATCTCATTTCATTTGCCCACTTCTCAAGGGAGTGATGAACCAGCCCTGCGTGGCGGCGGA
TGGGTACACTTACTATCGTGAAGCCATAGAGGACTGGCTGAGAGAGAATGATACGTCGCC
GGTGACGAACCTTCCACTTCCTAACAAGAACCTTCTTGCTAATTACACTCTTTACTCAGC
CATCATGGAGTGGAAAGCCAATAAATAATACTGAGAGAGGGAGAGAGACTCGAACAATAA
GTACGATGGATTCTTATCTATGTGTTTACTATTAAATATCTCTTTCGTGTGGTTCTCTCT
TTGTTCTTCTTCCTTTGTCTATGTTCCAACGATCTATCTTTTGTGTGATGAGATGCAAAG
ACTACAACACTAGAGATGGAGAGATAAATGTCTTTTGATCT


BQ
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AF RR4EK65TF U 1
AF RR4EK65JQ C 352
BS 1 745 RR4EK65TF
BS 746 1061 RR4EK65JQ

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TGTCTTCCTCCACAAATCCAAGCCTAGACCCATCATTCACCGCGACCTCAAACCAGGAAA
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GCTCTGTTACATCGACCCCGAGTATCAGCGGACAGGGATCATCTCGCCTAAGTCAGATGT
GTACTCTCTAGGCGTTGTGATTCTGCAGCTCATAACCGCGAAGCCAGCCATAGCGATTAC
TCATATGGTGGAAGAAGCTATAGGGGACGATGCTGAGTTTATGGCATTGTTGGATGTGAA
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TGAAATGAGACGCAGAGACAGACCAGACCTTAAAGATCAGATCATACCGACTTTAGAAAG
GCTTTGGAAAGTTGTCGAAAAAGCTCAAAACTCACTCTCGAGAACTTCGTTGGATCCTCC
ATCTCATTTCATTTGCCCACTTCTCAAGGGAGTGATGAACCAGCCCTGCGTGGCGGCGGA
TGGGTACACTTACTATCGTGAAGCC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EK65JQ 710 0 0
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GTGTTGTACTGAAATGAGACGCAGAGACAGACCAGACCTTAAAGATCAGATCATACCGAC
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GGATCCTCCATCTCATTTCATTTGCCCACTTCTCAAGGGAGTGATGAACCAGCCCTGCGT
GGCGGCGGATGGGTACACTTACTATCGTGAAGCCATAGAGGACTGGCTGAGAGAGAATGA
TACGTCGCCGGTGACGAACCTTCCACTTCCTAACAAGAACCTTCTTGCTAATTACACTCT
TTACTCAGCCATCATGGAGTGGAAAGCCAATAAATAATACTGAGAGAGGGAGAGAGACTC
GAACAATAAGTACGATGGATTCTTATCTATGTGTTTACTATTAAATATCTCTTTCGTGTG
GTTCTCTCTTTGTTCTTCTTCCTTTGTCTATGTTCCAACGATCTATCTTTTGTGTGATGA
GATGCAAAGACTACAACACTAGAGATGGAGAGATAAATGTCTTTTGATCT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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GGACAATTCACCCAATCATATCCTCTTACTGCGCTGTAAGAGAACGAACTCTCCCCCCCT
CTCTCTCTCCGACCTAGATTCCCTCCTCTCAATTGTCAGAAAAAAATGGCTGGTGCTAAG
AAGCTCTCATCATCAGCCAAGACTAAACCTTCAACTGTCTCTGGGAAAGATAAGGTTAGC
AATGGTGAAGACTTGGTGGGTTCAAAGGTTAGAGTTTGGTGGCCGATAGATCGAAAGTTC
TACAATGGAGTGGTTGATTCCTTTAACTCTCGCACTAAGAAACATCGGGTTTTTTATGAT
GATGGTGAGAAAGAGATCTTGGATATGGACAAGGAGAGGTGGGAGTTAATTGGAGATGAC
GATGATGATAATGCTGCTGATGAGGACAAATCTGGCGATGAGATCGCTGATGTTATCCCA
GAACCGCCTAACAGGAAGTCTGCTAGGACAAATGGTGTCATGGGTGACATTGGTGGGGGA
GATTGTAGCAGCGGCCTCGCGTCTGAGGTCGTGCAATAAGATTTCCGAAGCAACCAATGG
GAAGAAGAAAAGGGCTTCTTCGTCTTCATCAGAGGCTGTCTCTGAAAAAGTGACAAGACC
AATGCCTTCCTCTAAGAAGAGCAGCAAGAGGAAGAGGACTGATGACGAAGATGTGGGTGA
GGATGAGGATGAGCAAGCATCTGACGATGAATCCAAGCCTCTGCAGATTTTGGTGGATAA
GTTGAAGGGCAAGAAGAAGAAGAAGCAGGAGAAGGAATCCCCCAAAGAAGAGACCAAAGA
GGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGGGGAAGAGGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGGGGAAGA
AGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGAGGAAGAGGGTGAACAGGCTTAGACAAGAGAGTTTCG
CAGTCTATCTCAATGTGCAAGTATTTTAGAAGAGTTTTTAATTTATACAGCTGAGTCTTA
CTTGGTTAAAGTATAGGACTTGTAGGGATTTTTAGGTTATGTTGATTCG


BQ
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AF RR4CE54TF U 1
AF RR4CE54JQ C 297
BS 1 617 RR4CE54TF
BS 618 618 RR4CE54JQ
BS 619 633 RR4CE54TF
BS 634 1009 RR4CE54JQ

RD RR4CE54TF 633 0 0
GGACAATTCACCCAATCATATCCTCTTACTGCGCTGTAAGAGAACGAACTCTCCCCCCCT
CTCTCTCTCCGACCTAGATTCCCTCCTCTCAATTGTCAGAAAAAAATGGCTGGTGCTAAG
AAGCTCTCATCATCAGCCAAGACTAAACCTTCAACTGTCTCTGGGAAAGATAAGGTTAGC
AATGGTGAAGACTTGGTGGGTTCAAAGGTTAGAGTTTGGTGGCCGATAGATCGAAAGTTC
TACAATGGAGTGGTTGATTCCTTTAACTCTCGCACTAAGAAACATCGGGTTTTTTATGAT
GATGGTGAGAAAGAGATCTTGGATATGGACAAGGAGAGGTGGGAGTTAATTGGAGATGAC
GATGATGATAATGCTGCTGATGAGGACAAATCTGGCGATGAGATCGCTGATGTTATCCCA
GAACCGCCTAACAGGAAGTCTGCTAGGACAAATGGTGTCATGGGTGACATTGGTGGGGGA
GATTGTAGCAGCGGCCTCGCGTCTGAGGTCGTGCAATAAGATTTCCGAAGCAACCAATGG
GAAGAAGAAAAGGGCTTCTTCGTCTTCATCAGAGGCTGTCTCTGAAAAAGTGACAAGACC
AATGCCTTCCTCTAAGA*GAGCAGCAAGAGGAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4CE54JQ 713 0 0
TGATGATGGTGAGAAAGAGATCT*GGATATG*ACAAGGAGAGGTGGGAGTTAATTGGAGA
TGACGATGATGATAATGCTGCTGATGAGGACAAATCTGGCGATGAGATCGCTGATGTTAT
CCCAGAACCGCCTAACAGGAAGTCTGCTAGGACAAATGGTGTCATGGGTGACATTGGTGG
GG*AGATTGTAGCAGCGGCCTCGCGTCTGAGGTCGTGCAATAAGATTTCCGAAGCAACCA
ATGGGAAGAAGAAAAGGGCTTCTTCGTCTTCATCAGAGGCTGTCTCTGAAAAAGTGACAA
GACCAATGCCTTCCTTTAAGAAGAGCAGCAAGAGGAAGAGGACTGATGACGAAGATGTGG
GTGAGGATGAGGATGAGCAAGCATCTGACGATGAATCCAAGCCTCTGCAGATTTTGGTGG
ATAAGTTGAAGGGCAAGAAGAAGAAGAAGCAGGAGAAGGAATCCCCCAAAGAAGAGACCA
AAGAGGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGGGGAAGAGGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGGGG
AAGAAGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGAGGAAGAGGGTGAACAGGCTTAGACAAGAGAGT
TTCGCAGTCTATCTCAATGTGCAAGTATTTTAGAAGAGTTTTTAATTTATACAGCTGAGT
CTTACTTGGTTAAAGTATAGGACTTGTAGGGATTTTTAGGTTATGTTGATTCG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL4784Contig1 464 2 1 U
GGAATCTCTCCCTTGTTGTGAATTTCGGAGGCGAAGAAAAAAAAGAGAAAAGAAGATCGG
AGATGGCATCGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGTGATGACTTACATTACCT
ACTCAAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTCAAGGAGCCTTTCAAAGCTGAAG
CCCTTAATCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTCTCCAAATGGGCTGGCGGAAAGCCTGAGA
AACCAATTCTGCGTTCTGACACACCTGGAGTTTGAGATTTTTTTAGCGTTTCGATATCAA
GTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGATATTATGTACTCTGCAACATTTTCCTTC
TTTTGACTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTCGAGTGAGAGAGAGTGACCTCATTCCTAT
CTTGAAACTTTTTTTTTTTGAAAATGGCTTTCAAATTAAAGAGC


BQ
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AF RR4ES13JQ C 1
AF RR4ES13TF U 1
BS 1 464 RR4ES13TF

RD RR4ES13JQ 464 0 0
GGAATCTCTCCCTTGTTGTGAATTTCGGAGGCGAAGAAAAAAAAGAGAAAAGAAGATCGG
AGATGGCATCGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGTGATGACTTACATTACCT
ACTCAAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTCAAGGAGCCTTTCAAAGCTGAAG
CCCTTAATCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTCTCCAAATGGGCTGGCGGAAAGCCTGAGA
AACCAATTCTGCGTTCTGACACACCTGGAGTTTGAGATTTTTTTAGCGTTTCGATATCAA
GTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGATATTATGTACTCTGCAACATTTTCCTTC
TTTTGACTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTCGAGTGAGAGAGAGTGACCTCATTCCTAT
CTTGAAACTTTTTTTTTTTGAAAATGGCTTTCAAATTAAAGAGC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR4ES13TF 464 0 0
GGAATCTCTCCCTTGTTGTGAATTTCGGAGGCGAAGAAAAAAAAGAGAAAAGAAGATCGG
AGATGGCATCGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGTGATGACTTACATTACCT
ACTCAAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTCAAGGAGCCTTTCAAAGCTGAAG
CCCTTAATCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTCTCCAAATGGGCTGGCGGAAAGCCTGAGA
AACCAATTCTGCGTTCTGACACACCTGGAGTTTGAGATTTTTTTAGCGTTTCGATATCAA
GTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGATATTATGTACTCTGCAACATTTTCCTTC
TTTTGACTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTCGAGTGAGAGAGAGTGACCTCATTCCTAT
CTTGAAACTTTTTTTTTTTGAAAATGGCTTTCAAATTAAAGAGC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4785Contig1 421 2 1 U
GAAGAACTCGAACATGAGAATGTTGAAGATGGTGAAGAGCAGGAGCTTGACTTTTGGATG
CCTCCGGATGGAGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGAGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCG
GAGGATGAAGAGGAAAAGAATGTGGAAGAAGATCCAATAGGGGAGATCGATGAAGATGGG
ATGAGTAGCGTGGATGATTGCATAATAGGTGAAGTTGATGAAGATGGCCAAAATAGTTTG
GATGAAGCTCCTGAAAGTAAAAAGAGGAAGCCTGAAGAACTCAGTTCCAATAGCATTCCT
TCCAAGAAGAACAAGAAGAAGAATAAGGTCAAAACAACAGCTTCACAAATCTGATCTCTC
TCTTTTATGTTTTTTTTTTGGAATTTTCACTTATTAGTCTACACTACTACGTATTTCATA
C


BQ
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20 

AF RR4EU59JQ C 1
AF RR4EU59TF U 1
BS 1 421 RR4EU59TF

RD RR4EU59JQ 421 0 0
GAAGAACTCGAACATGAGAATGTTGAAGATGGTGAAGAGCAGGAGCTTGACTTTTGGATG
CCTCCGGATGGAGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGAGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCG
GAGGATGAAGAGGAAAAGAATGTGGAAGAAGATCCAATAGGGGAGATCGATGAAGATGGG
ATGAGTAGCGTGGATGATTGCATAATAGGTGAAGTTGATGAAGATGGCCAAAATAGTTTG
GATGAAGCTCCTGAAAGTAAAAAGAGGAAGCCTGAAGAACTCAGTTCCAATAGCATTCCT
TCCAAGAAGAACAAGAAGAAGAATAAGGTCAAAACAACAGCTTCACAAATCTGATCTCTC
TCTTTTATGTTTTTTTTTTGGAATTTTCACTTATTAGTCTACACTACTACGTATTTCATA
C

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4EU59TF 421 0 0
GAAGAACTCGAACATGAGAATGTTGAAGATGGTGAAGAGCAGGAGCTTGACTTTTGGATG
CCTCCGGATGGAGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGAGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCG
GAGGATGAAGAGGAAAAGAATGTGGAAGAAGATCCAATAGGGGAGATCGATGAAGATGGG
ATGAGTAGCGTGGATGATTGCATAATAGGTGAAGTTGATGAAGATGGCCAAAATAGTTTG
GATGAAGCTCCTGAAAGTAAAAAGAGGAAGCCTGAAGAACTCAGTTCCAATAGCATTCCT
TCCAAGAAGAACAAGAAGAAGAATAAGGTCAAAACAACAGCTTCACAAATCTGATCTCTC
TCTTTTATGTTTTTTTTTTGGAATTTTCACTTATTAGTCTACACTACTACGTATTTCATA
C

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

CO CL4786Contig1 819 2 2 U
GGGAGTCACTTGTGAGAGACACCAAAACCCTAGGGAGAGCCGTCTGGAAGCTAGCACGCC
ACCAAATCAATCAATGGAGTTACTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATGAAGAGTGTGGTTG
GAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATTAGTGCTGGGACTA
ATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTTATTTCCGTTTCGGACT
ATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTACACGACGCAGGAG
CACGAAGGATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCTTCCGGTGCAAGTAACAC
TTGGTACCGTCACTATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATGCACGGAAAATCAAAACG
CTGATTCTCAGCTCTACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTACCGTCTCAGTCAGAGGC
TTCCAGGCTCGAAAATTCTTTACCTTGACATCTACACTCCATTAATAGACATGATCAGAC
ATCCTCCCAGATATGGATTGGAAGAAACATTGAAAGGGTGTTGCGGGACGGGGCTGCTTG
AGGCAGGACCTCTATGCAAGCCATTGTCTCGGGTTTGTGAGGATGTTTCAAAGTACATGT
TCTTTGATTCTGTGCATCCATCACAAAAGGCGTACTCTGTCATAGCATCTTACGCCTTAC
AAAAGTTGTTCCCTCTCCTCTAATCTATTTATTTTTATCATTTGTGGATTTAAATTTTAA
TGTTGAAACTAAATATGGGCAGCATCAAACATTGTCTCC


BQ
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AF RR4EU24TF U 1
AF RR4EU24JQ C 135
BS 1 602 RR4EU24TF
BS 603 819 RR4EU24JQ

RD RR4EU24TF 602 0 0
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ACCAAATCAATCAATGGAGTTACTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATGAAGAGTGTGGTTG
GAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATTAGTGCTGGGACTA
ATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTTATTTCCGTTTCGGACT
ATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTACACGACGCAGGAG
CACGAAGGATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCTTCCGGTGCAAGTAACAC
TTGGTACCGTCACTATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATGCACGGAAAATCAAAACG
CTGATTCTCAGCTCTACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTACCGTCTCAGTCAGAGGC
TTCCAGGCTCGAAAATTCTTTACCTTGACATCTACACTCCATTAATAGACATGATCAGAC
ATCCTCCCAGATATGGATTGGAAGAAACATTGAAAGGGTGTTGCGGGACGGGGCTGCTTG
AG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4EU24JQ 685 0 0
AATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATTAGTGCTGGGACTAATGATATGATCTAT
AATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTTATTTCCGTTTCGGACTATCAAGATTATCTA
CTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTACACGACGCAGGAGCACGAAGGATTACA
GTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCTTCCGGTGCAAGTAACACTTGGTACCGTCACT
ATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATGCACGGAAAATCAAAACGCTGATTTTCAGCTC
TACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTACCGTCTCAGTCAGAGGCTTCCAGGCTCGAAA
ATTCTTTACCTTGACATCTACACTCCATTAATAGACATGATCAGACATCCTCCCAGATAT
GGATTGGAAGAAACATTGAAAGGGTGTTGCGGGACGGGGCTGCTTGAGGCAGGACCTCTA
TGCAAGCCATTGTCTCGGGTTTGTGAGGATGTTTCAAAGTACATGTTCTTTGATTCTGTG
CATCCATCACAAAAGGCGTACTCTGTCATAGCATCTTACGCCTTACAAAAGTTGTTCCCT
CTCCTCTAATCTATTTATTTTTATCATTTGTGGATTTAAATTTTAATGTTGAAACTAAAT
ATGGGCAGCATCAAACATTGTCTCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4787Contig1 605 2 5 U
TCATAAAGCCAAAGGTTGTATCTTTGAGGACTCTTTTAGAGACGACTTCTACACCTTTCA
CTATCTACTAGGGAGAAGGTTTTTGAAAGAAAAATATGTAGAAGGAGAAGAAGATTCTGG
CGAATCTGAAAATGGCCAAGTTCAAGTCAGCTTGGCAGCAAGCGGGTTTCTTCTATTCTG
CTGTTCGATTTGTTGTCCTTGCTTCCACAAGGAGAGGAAAGCAAATACTCACGAAGTACT
TCCCAAAGAATCTAACTCAGGTCACTTATAAATATCTCACTCTCTTTTTTTTTTTATTGA
ATATCTAGATATTGGACATTGAGGTTCATATTATTATGACAGTGCACCAAGGTTCGTCGT
TTGAAATGAGCCCTTCATCTGATAAGATTTCGTCAAGTTCGTCACGTGTACCTGAAAGCC
CCTCGAGATATGCTATGTCCCCGAAACCTAGTAGTACTAGGATGGGACCCTTGAATCTCA
CCATGAGTCAAATTATTGCAGCAACCGCTAATTTTTCCGACAGTAACCAAATCGGTGAAG
GAGGCTTCGGGATAGTCTATAAGGGCACTCTAGACGACGGTCAGGTTGTTGCCATTAAAC
GAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4CO18TF U 118
AF RR4CO18JQ C 1
BS 1 117 RR4CO18JQ
BS 118 300 RR4CO18TF
BS 301 301 RR4CO18JQ
BS 302 319 RR4CO18TF
BS 320 605 RR4CO18JQ

RD RR4CO18TF 202 0 0
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CTGCTGTTCGATTTGTTGTCCTTGCTTCCACAAGGAGAGGAAAGCAAATACTCACGAAGT
ACTTCCCAAAGAATCTAACTCAGGTCACTTATAAATATCTCACTCTCTTTTTTTTTTTAT
TGA*TATCTAGATATTGGACAT

QA 1 202 1 202
DS 

RD RR4CO18JQ 605 0 0
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CTATCTACTAGGGAGAAGGTTTTTGAAAGAAAAATATGTAGAAGGAGAAGAAGATTCTGG
CGAATCTGAAAATGGCCAAGTTCAAGTCAGCTTGGCAGCAAGCGGGTTTTTTTTATTCTG
CTGTTCGATTTGTTGTCCTTGCTTCCACAAGGAGAGGAAAGCAAATACTCACGAAGTACT
TCCCAAAGAATCTAACTCAGGTCACTTATAAATATCTCACTCTCTTTTTTTTTTTATTGA
ATATCTAGATATTTGACATTGAGGTTCATATTATTATGACAGTGCACCAAGGTTCGTCGT
TTGAAATGAGCCCTTCATCTGATAAGATTTCGTCAAGTTCGTCACGTGTACCTGAAAGCC
CCTCGAGATATGCTATGTCCCCGAAACCTAGTAGTACTAGGATGGGACCCTTGAATCTCA
CCATGAGTCAAATTATTGCAGCAACCGCTAATTTTTCCGACAGTAACCAAATCGGTGAAG
GAGGCTTCGGGATAGTCTATAAGGGCACTCTAGACGACGGTCAGGTTGTTGCCATTAAAC
GAGCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL4788Contig1 440 2 1 U
GGATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAAGATTAAGTTCTAAGCAAAAAGAG
AGAGAAAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCATTGG
CCAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
TGTGGTCAACGACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTAATTTC
TAATATATCCTCCTCTCTTTTGAGTTATTTAATAAAGTTGGAAGTGTTTTTTTGGGTAAT
TTTGGAAGGGGTTTTAATTTATATATTTAATAGATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAAT
TTGGGAGGGTTTTTAATTCT


BQ
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AF RR4D080JQ C 1
AF RR4D080TF U 1
BS 1 440 RR4D080TF

RD RR4D080JQ 440 0 0
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AGAGAAAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCATTGG
CCAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
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TAATATATCCTCCTCTCTTTTGAGTTATTTAATAAAGTTGGAAGTGTTTTTTTGGGTAAT
TTTGGAAGGGGTTTTAATTTATATATTTAATAGATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAAT
TTGGGAGGGTTTTTAATTCT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4D080TF 440 0 0
GGATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAAGATTAAGTTCTAAGCAAAAAGAG
AGAGAAAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCATTGG
CCAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
TGTGGTCAACGACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTAATTTC
TAATATATCCTCCTCTCTTTTGAGTTATTTAATAAAGTTGGAAGTGTTTTTTTGGGTAAT
TTTGGAAGGGGTTTTAATTTATATATTTAATAGATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAAT
TTGGGAGGGTTTTTAATTCT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL4789Contig1 1105 2 8 U
CAGATGGTTTTGCCTCCTGGGTTTAGGTTTCATCCAACAGACGAAGAACTCATCACCCAC
TATCTTCACAACAAGGTTCTCAACATTGATTTCTCAGCTAAAGCTATTGGTGAAGTGGAT
TTGAACAAAGCTGAGCCTTGGGAGTTGCCATATAAAGCAAAAATGGGTGAGAAAGAATGG
TACTTCTTCTGTGTGAGGGATAGAAAGTATCCAACCGGTTTGAGGACTAACCGGGCAACT
CAAGCCGGTTATTGGAAGGCTACAGGGAAGGATAAGGAGATTTTCAGAGGCAAATCACTA
GTTGGTATGAAGAAAACACTTGTTTTCTACAGAGGAAGAGCTCCAAAAGGGCAGAAAACA
AATTGGGTGATGCATGAGTATAGGCTTGATGGGAAGCTATCTGCTCACAACTTGCCCAAA
ACCGCCAAGAATGAATGGGTGATATGCAGAGTGTTTCATAAAACAGCTGGAGGCAAGAAG
ATCCCTATTTCGACTCTAATCCAAATTGGTTCTTATGGAGGTTCTAGCTTACCACCTTTA
AATGATTCTTCACCAAACAACAATGACAAAACCAAGACCGGACAGAGTTACGTGCCCTGC
TTCTCCAACCAAACTGAAACCAGAGGAACACTACTCAATTACTTCAGCAATAACCCTGCC
CTTTGCTCGATTCCACTATACCAACCTCAATCTCTCCATGTTTCTGATCCGGTTCTTGCT
CAAGAACAATCGGTTTCTCAAGCCATGTTTGACAACAACAGAAGGCAGAGCTTCAAAACG
TTGAGTGTTTCTCAGGAAACTGGAGTTTCTAATACCGATATATCATCATCAAATATTGAA
TTCGGGAGGAAAGGATTCGATCATCAAGAAGTTCCATCTTCCTCCACCGGTCCGGTTGAT
CTTGAACCATTCTGGAGTTACTGAAGATTCTAAAACATCAAAAGTTCATTATCTTAGGTC
ACAAGTAAGAAGAACTTCGCAGAAGTTTTATCTTCTAAGCGTGGTGTGCCAAGTTTGTAT
AGATTATTATTATATCAATGCTTCCCACTCTTTAGTGTGTTTTATTATTATATATTCAAC
TAATATTTGGTATTAGAGAGAAGGC


BQ
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AF RR4CX02TF U 1
AF RR4CX02JQ C 292
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CA*GAACAATCGGTTTC

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DS 

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AATATTGAATTCGGGAGGAAAGGATTCGATCATCAAGAAGTTCCATCTTCCTCCACCGGT
CCGGTTGATCTTGAACCATTCTGGAGTTACTGAAGATTCTAAAACATCAAAAGTTCATTA
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AGTTTGTATAGATTATTATTATATCAATGCTTCCCACTCTTTAGTGTGTTTTATTATTAT
ATATTCAACTAATATTTGGTATTAGAGAGAAGGC

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DS 



AS 1 2

CO CL4790Contig1 1105 2 8 U
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ATCTGAGGTCTTGGGGAATGAAGAACCAATAATAAACCAGGAAGGGACAACAAATGGTGA
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CTTCAAGCTAAAGCACCTGATTCTGAGTGTGAGAGCAACACGCACAGGGAGTTCATCGCT
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TTGAAGATGAGAAGTTATATTTACC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F994TF U 1
AF RR4F994JQ C 346
BS 1 671 RR4F994TF
BS 672 672 RR4F994JQ
BS 673 727 RR4F994TF
BS 728 728 RR4F994JQ
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BS 761 790 RR4F994TF
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ATCTGAGGTCTTGGGGAATGAAGAACCAATAATAAACCAGGAAGGGACAACAAATGGTGA
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TGCGAGGGAGAAGGAGAGGGAGGACAGATCCTTTCTTTAGCTGAATGTGAAGAACTGTAC
GGACCTGGGACAGAGAAACTAGTTGAGAAACCTCTCATTGAAGGATCTGCGGATAACGGT
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TCAAACTTCGAGAAGTCTTCCGTTCAAGAGAAGAAACTTCCCAAAAGGATCCCAAACTGT
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TATCATAGCA

QA 1 790 1 790
DS 

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TGTGAAGAACTGTACGGACCTGGGACAGAGAAACTAGTTGAGAAACCTCTCATTGAAGGA
TCTGCGGATAACGGTCTTCAAGCTAAAGCACCTGATTCTGAGTGTGAGAGCAACACGCAC
AGGGAGTTCATCGCTTCAAACTTCGAGAAGTCTTCCGTTCAAGAGAAGAAACTTCCCAAA
AGGATCCCAAACTGTAATCCAAGCGAGAAGCCTTCTAAAGAAGAGAAAAGCAAAGATGAT
GGGATCAGTGACGCCATCATCAAGAAGGTCGAAGCATACATCAAAGAACATATCAGACCA
CTGTGTAAGAGCAGAGTGATAAACGTGGATCAATACAAATGGGCAGTGACGAAAACCAGA
GAGAAAGTGATGAAGTATCATAGCAAAGCCAAGAGTGCTAACTTCTTGATCAAGGAGGGC
GACAAGATTAAGAGACTTGCCGAGCAATATGTTGAAGCAGCCGCTTCTTCTTCTGCCACC
GGAGCTCACAACAAGGACAAGTGCAAGTGAAGTGACAATCAGATGCGTAAATAAGATTTG
ACCAAGGAAAGAAATAGTTCAGTATTAAAAACGTAAATAGACTTTTAAGTTATCTATCTT
TTGTCTTCTCCACGAGTTGGGGATTATGTCTTCTCTCAGGCCACTACATTAGAACGCAGG
TCTGGAAAAAAAAATTTGAAGATGAGAAGTTATATTTACC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4792Contig1 925 2 6 U
GTCTATACGCTGAGATCTCTGACTTTGGTCTTGCTAAGCTCGACGAAGAAGAGAACACAC
ATATCAGCACAAGGATTGCGGGAACAATAGGTTACGTGGCTCCAGAGTATGCGATGAGAG
TCTACTTAACAGACAAAGCTGACGTCTACAGCTTCGGTGTTGTCTGTTTAGAGATTGTAA
GCGGGAAGAGCAACACAAACTACAGACCAAAGGAAGAGTTTGTGTACCTTCTTGATTGGG
CCTATGTCTTGCAAGAACAAGAGAACCTCCTGGAGCTTGTGGACATGGATCTCGATACAA
ACTTCTCCAAGAAGGAAGCAAAGAGGATGCTGAACATCGCTCTGCTCTGCACAAACCCAT
CTCCGACGCTAAGACCACCAATGTCATCCGTTGTGAGTATGTTAGAAGGGAAAAGCAAAG
TGGAACCACCTTTGGTGAAACGTGAGGCTGATCCAACAGGTGCGGCTGCTATGAGGTTTA
GGGCCTTTGAGCTTTTGTCACAAGACAGCGAGTCACAGACTTCTACCTTTGAGAGAGACA
GAGAAAAGAAAAGCTCGTCCTCGATGGATGTTCCTTGGGTTGACTCTTCGTGCTCTGCGC
CAGGCAAAGATGTTGACATGAAACGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAACGTTCATCATCAT
CGTCAAGGAAGCTTTTATATGATCTTACAGAGGTGAAGGTTGAGTAAAGAAGTGTATATC
TTCAGTCAAGAGCAAAGATGTTACCTTGCAAACAAGAAGAAAGTTCATTATCTTTGTTCA
TGGAGACTTTTGGATGAAAGAAAAGCACTGTATAGATTCTTTTGGTATTTTGTTTAATCA
AGATTTCAAAATTCACTTGCCACTAGAGAGATCTTTTTTTGTTTTGTTAATGCTATTGTG
TAAATTCTCTTTTGGATTACAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E862TF U 1
AF RR4E862JQ C 248
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BS 647 647 RR4E862JQ
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RD RR4E862TF 702 0 0
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TCTACTTAACAGACAAAGCTGACGTCTACAGCTTCGGTGTTGTCTGTTTAGAGATTGTAA
GCGGGAAGAGCAACACAAACTACAGACCAAAGGAAGAGTTTGTGTACCTTCTTGATTGGG
CCTATGTCTTGCAAGAACAAGAGAACCTCCTGGAGCTTGTGGACATGGATCTCGATACAA
ACTTCTCCAAGAAGGAAGCAAAGAGGATGCTGAACATCGCTCTGCTCTGCACAAACCCAT
CTCCGACGCTAAGACCACCAATGTCATCCGTTGTGAGTATGTTAGAAGGGAAAAGCAAAG
TGGAACCACCTTTGGTGAAACGTGAGGCTGATCCAACAGGTGCGGCTGCTATGAGGTTTA
GGGCCTTTGAGCTTTTGTCACAAGACAGCGAGTCACAGACTTCTACCTTTGAGAGAGACA
GAGAAAAGAAAAGCTCGTCCTCGATGGATGTTCCTTGGGTTGACTCTTCGTGCTCTGCGC
CAGGCAAAGATGTTGACATGAAACGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAA*CGTTCATCATCAT
CGTCAAG*AAGCTTTTATATGATCTTACAGAG
TGAAGTTGAG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4E862JQ 678 0 0
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CAAGAAGGAAGCAAAGAGGATGCTGAACATCGCTCTGCTCTGCACAAACCCATCTCCGAC
GCTAAGACCACCAATGTCATCCGTTGTGAGTATGTTAGAAGGGAAAAGCAAAGTGGAACC
ACCTTTGGTGAAACGTGAGGCTGATCCAACAGGTGCGGCTGCTATGAGGTTTAGGGCCTT
TGAGCTTTTGTCACAAGACAGCGAGTCACAGACTTCTACCTTTGAGAGAGACAGAGAAAA
GAAAAGCTCGTCCTCGATGGATGTTCCTTGGGTTGACTCTTCGTGCTCTGCGCCAGGCAA
AGATGTTGACATGAAACGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAACGTTCATCATCATCGTCAAG
GAAGCTTTTATATGATCTTACAGAGGTGAAGGTTGAGTAAAGAAGTGTATATCTTCAGTC
AAGAGCAAAGATGTTACCTTGCAAACAAGAAGAAAGTTCATTATCTTTGTTCATGGAGAC
TTTTGGATGAAAGAAAAGCACTGTATAGATTCTTTTGGTATTTTGTTTAATCAAGATTTC
AAAATTCACTTGCCACTAGAGAGATCTTTTTTTGTTTTGTTAATGCTATTGTGTAAATTC
TCTTTTGGATTACAGAGT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL4793Contig1 1095 2 6 U
GGTCAAACTAAGGCAATATACGCAAGAAGTTATGGCGAGAACCTTTTTAAACGACGGTGG
AACCGGTAGCTTGGGTTTAGTTTGGGGGTTGTTAATGGTTGCAGCCACCTTCTCCGTAAT
AGCCATGGCCGTATTTGTTTGCGGCGATAACAAAGAAACAGATCATCCAAGCGGCACTGG
AATTGGATCTGCTACGGCGTCTGGTATCACTTCGCTGCTCATGAAACTGAACAGTACACT
AAACGAACATATTAGCGTTCTCATTGGAGTGTAACGGCTACGCGCTTAATTCACCTGTGC
GTCCTCCTTTTATGTTTGAACGATTTCTTGAATTTTCAGACGAGAGAGATAGAGAGAGAG
AGAGGGAAAATACTAGTTTTACACTTCAGTGGTGGTAGAGAGAGATAGAGAGAGACGGTA
CAGAACAGCTGTAAAAGCACATGACCTCAATACAATTGGGGCCTCGGCCACCGGCTATAG
CTATACGCTGTTGCGGCTTCACGACCTAGATGCTTTGAAACGTCGTCCCGATATAGATGG
ATACAGACAAGGTTTCCTCTCTCCCCCTCTATGTGTGATCCGTAACGTCAGTGTTTGGTA
AACGATGCATTTAAGTTTCTACCTTTGGTGACTGTTCGAGATCTCTGCTAGGTCTAGCTC
GGATTGTATTATGGGAGAAAGCCCCTATGTTAAGGGAAATGATGCTGTTACCGGTTACAC
CATTTCTACTACTATTGGATGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGTTACATGGCACGAACGG
GTTATTGGAACAAGATCATTTGAAATTGTATTCCAGGTACACCAGGCAGTGGGTAAGTTT
TCGAAATCACTGATCAACTAACCATGATACTACAACGCGCTTCAGTTGATGTGAAGGAGA
TGGCTGGATTTGTGTAAAATGGATTGTCTCCAAGCTTATGGAAGATGCTTAGGACAGGAG
GACAGTAGTTAACTTCGAATAAGTGAGAATGATCAGAGGATACAATTCCAAACTTTAGTT
GTCTGTTAATCCATCAAGTTGGATATAAAAGGCATTACAAGATGTTATAAAACTAAAATG
AATCAATCAAGAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU84TF U 1
AF RR4GU84JQ C 395
BS 1 651 RR4GU84TF
BS 652 652 RR4GU84JQ
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BS 696 696 RR4GU84JQ
BS 697 744 RR4GU84TF
BS 745 1095 RR4GU84JQ

RD RR4GU84TF 744 0 0
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AACCGGTAGCTTGGGTTTAGTTTGGGGGTTGTTAATGGTTGCAGCCACCTTCTCCGTAAT
AGCCATGGCCGTATTTGTTTGCGGCGATAACAAAGAAACAGATCATCCAAGCGGCACTGG
AATTGGATCTGCTACGGCGTCTGGTATCACTTCGCTGCTCATGAAACTGAACAGTACACT
AAACGAACATATTAGCGTTCTCATTGGAGTGTAACGGCTACGCGCTTAATTCACCTGTGC
GTCCTCCTTTTATGTTTGAACGATTTCTTGAATTTTCAGACGAGAGAGATAGAGAGAGAG
AGAGGGAAAATACTAGTTTTACACTTCAGTGGTGGTAGAGAGAGATAGAGAGAGACGGTA
CAGAACAGCTGTAAAAGCACATGACCTCAATACAATTGGGGCCTCGGCCACCGGCTATAG
CTATACGCTGTTGCGGCTTCACGACCTAGATGCTTTGAAACGTCGTCCCGATATAGATGG
ATACAGACAAGGTTTCCTCTCTCCCCCTCTATGTGTGATCCGTAACGTCAGTGTTTGGTA
AACGATGCATTTAAGTTTCTACCTTTGGTGACTGTTCGAGATCTCTGCTAG*TCTAGCTC
GGATTGTATTATGGGAGAAAGCCCCTATGTTAAGG*AAATGATGCTGTTACCGGTTACAC
CATTTCTACTACTATTGGATGCAA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4GU84JQ 701 0 0
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ATTGGGGCCTCGGCCACCGGCTATAGCTATACGCTGTTGCGGCTTCACGACCTAGATGCT
TTGAAACGTCGTCCCGATATAGATGGATACAGACAAGGTTTCCTCTCTCCCCCTCTATGT
GTGATCCGTAACGTCAGTGTTTGGTAAACGATGCATTTAAGTTTCTACCTTTGGTGACTG
TTCGAGATCTCTGCTAGGTCTAGCTCGGATTGTATTATGGGAGAAAGCCCCTATGTTAAG
GGAAATGATGCTGTTACCGGTTACACCATTTCTACTACTATTGGATGCAAAAACGGTGAA
CCTAAACAGTTACATGGCACGAACGGGTTATTGGAACAAGATCATTTGAAATTGTATTCC
AGGTACACCAGGCAGTGGGTAAGTTTTCGAAATCACTGATCAACTAACCATGATACTACA
ACGCGCTTCAGTTGATGTGAAGGAGATGGCTGGATTTGTGTAAAATGGATTGTCTCCAAG
CTTATGGAAGATGCTTAGGACAGGAGGACAGTAGTTAACTTCGAATAAGTGAGAATGATC
AGAGGATACAATTCCAAACTTTAGTTGTCTGTTAATCCATCAAGTTGGATATAAAAGGCA
TTACAAGATGTTATAAAACTAAAATGAATCAATCAAGAAGT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL4794Contig1 1129 2 22 U
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AAGAAGATTAGAAGAGAAGGGTGTTATCAGTGACGAGAGAATGTTATTTGCTGCTGCTTG
CTATTCAGCAAAAGTAACACTAGCTGCCCTTGGAGAGATATTTGAAGCGGCACGTGCCAT
TATGAGTTGGCTTGGTGATTGTGCAAAGATTATCGCTTCTGATAATCATCCAGTACGATG
GACCACGCCTCTTGGTCTTCCTGTTGTGCAACCTTATTGCAGAAGTGAAAGACATCTGAT
AAGAACATCTCTTCAGGTTTTGGCTCTGCAGCGAGAGGGTAACACGGTGGATGTTAGGAA
ACAAAGAACAGCGTTTCCTCCCAACTTTGTGCACTCGCTGGACGGCACTCACATGATGAT
GACTGCCGTTGCATGTCGAGAGGCTGGCCTGAACTTTGCAGGTGTGCATGACTCTTACTG
GACGCATGCGTGCGATGTTGACACAATGAACAGAATACCTAGAGAGAAATTCGTTGAGCT
TTACAGCACACCGATCCTTGAAGATTTACTCCAAAGTTTCCAAGAGTCATACCCGAATCT
CGTGTTTCCTCCAGTACCAAAGAGAGGTGATTTCGATTTAAAGGAAGTGCTCAAATCACA
CTACTTCTTCAACTGAGTCACTGGCAAAACAGGAGTAAGTTTTTAACTTGGGGATCTTTC
TTGGTGCGCCTGTAAATAATCATCATCCGCCACCTCAAAGGAGATGGAACGAACCAGAAT
CAGCACGAAAGACTGCTACTGCTACTGCAACACACTAAGATTCTGACACAAATGTTGCAG
AAGAAGCTTTTAGACAAATCTACTCAAGACAATATTTATGCATCATTGAAGAAGTTTCTA
GCTCAACAGGTAGGTCCCTAGGCAGAGTATTAAATAGTGGATGCAAAGTCGTTGCATCAA
GCTTGTCTTTCTGGATCGAGAGAATAGGTTTAGTTATGCTGTATGTCATTCGTACTGTTG
TACAGGAGAGAGAGAGACCTTCGTATAGAAAGAACTCAAAAATCAAAAGGCTACTCTGTG
ATTTTTTGTAGCTAACTATTTTTGTCAAAACATGAGACATCTTTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BO58TF U 1
AF RR4BO58JQ C 316
BS 1 688 RR4BO58TF
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BS 791 808 RR4BO58TF
BS 809 1129 RR4BO58JQ

RD RR4BO58TF 808 0 0
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AAGAAGATTAGAAGAGAAGGGTGTTATCAGTGACGAGAGAATGTTATTTGCTGCTGCTTG
CTATTCAGCAAAAGTAACACTAGCTGCCCTTGGAGAGATATTTGAAGCGGCACGTGCCAT
TATGAGTTGGCTTGGTGATTGTGCAAAGATTATCGCTTCTGATAATCATCCAGTACGATG
GACCACGCCTCTTGGTCTTCCTGTTGTGCAACCTTATTGCAGAAGTGAAAGACATCTGAT
AAGAACATCTCTTCAGGTTTTGGCTCTGCAGCGAGAGGGTAACACGGTGGATGTTAGGAA
ACAAAGAACAGCGTTTCCTCCCAACTTTGTGCACTCGCTGGACGGCACTCACATGATGAT
GACTGCCGTTGCATGTCGAGAGGCTGGCCTGAACTTTGCAGGTGTGCATGACTCTTACTG
GACGCATGCGTGCGATGTTGACACAATGAACAGAATACCTAGAGAGAAATTCGTTGAGCT
TTACAGCACACCGATCCTTGAAGATTTACTCCAAAGTTTCCAAGAGTCATACCCGAATCT
CGTGTTTCCTCCAGTACCAAAGAGAGGTGATTTCGATTTAAAGGAAGTGCTCAAATCACA
CTACTTCTTCAACTGAGTCACTGGCAAA*CAGGAGTAAGTTTT*AACTTGGGGATCTTTC
TTGGTGCGC*TGTAAA*AATCATCATCCGC*ACCTCAAAG*AGATGGA*CGA*CCAGA*T
CAGCACGAA*GACTGCTACTGCTACTGC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4BO58JQ 814 0 0
AGG
TTTGGCTCTGCAGCGAGAGGGTAACACGGTGGATGT*AGGAAACAAAGAACAGCGTTTCC
TCCCAACTTTGTGCACTCGCTGGACGGCACTCACATGATGATGACTGCCGTTGCATGTCG
AGAGGCTGGCCTGAACTTTGCAGGTGTGCATGACTCTTACTGGACGCATGCGTGCGATGT
TGACACAATGAACAGAATACCTAGAGAGAAATTCGTTGAGCTTTACAGCACACCGATCCT
TGAAGATTTACTCCAAAGTTTCCAAGAGTCATACCCGAATCTCGTGTTTCCTCCAGTACC
AAAGAGAGGTGATTTCGATTTAAAGGAAGTGCTCAAATCACACTACTTCTTCAACTGAGT
CACTGGCAAAACAGGAGTAAGTTTTTAACTTGGGGATCTTTCTTGGTGCGCCTGTAAATA
ATCATCATCCGCCACCTCAAAGGAGATGGAACGAACCAGAATCAGCACGAAAGACTGCTA
CTGCTACTGCAACACACTAAGATTCTGACACAAATGTTGCAGAAGAAGCTTTTAGACAAA
TCTACTCAAGACAATATTTATGCATCATTGAAGAAGTTTCTAGCTCAACAGGTAGGTCCC
TAGGCAGAGTATTAAATAGTGGATGCAAAGTCGTTGCATCAAGCTTGTCTTTCTGGATCG
AGAGAATAGGTTTAGTTATGCTGTATGTCATTCGTACTGTTGTACAGGAGAGAGAGAGAC
CTTCGTATAGAAAGAACTCAAAAATCAAAAGGCTACTCTGTGATTTTTTGTAGCTAACTA
TTTTTGTCAAAACATGAGACATCTTTTATGT

QA 4 814 4 814
DS 



AS 1 2

CO CL4795Contig1 869 2 1 U
GCAGGTCTCTTGGAGGTCAATGGAAGATCGAGCTCAAGAAAAGCTTTTAAGCTTGCGTTT
GTGAGACAGGAGGATCTCTTCTTCTCGCAGTTGACTGTGAGGGAGACGCTTTCTTTCGCA
GCTGAGCTTCAGCTTCGGGAGATTTCTTCTCCTGAGGAGAGGGATGAGTATGTGAACAAC
CTCTTGTTCAGGCTTGGTCTGGTTAGCTGTGCGGATTCATGTGTTGGCGATGCGAAAGTT
CGTGGGATCAGCGGTGGAGAGAAGAAGCGGCTGTCACTTGCGTGTGAATTGATCGCTAGT
CCGTCTGTTATATTTGCTGATGAACCCACTACCGGGCTTGACGCCTTCCAGGCTGAACAA
GTGATGGAGACATTGCGAAAGCTTGCACAAGATCGACACACTGTGATCTGCTCCATACAC
CAGCCTCGAGGTTCGGTTTATGCTAAGTTTGACGACGTTGTGTTACTTACAGAAGGAGCT
TTGGTCTATGCCGGCCCTGCTGGGACAGAACCTCTGACGTATTTCGGAAACTTCGGGTTT
CTTTGCCCAGAGCACGTAAACCCTGCTGAGTTTTTAGCAGATCTTATATCAGTTGACTAT
AGCTCTTCGGATAGTGTCTACTCTTCGCAGAAGAGAGTACATGCTCTTGTCGATGCCTTC
TCCCAGCGTTCATCATCGATTCTTTATGCCACTCCCCTCGGCGTAAAACAAGAAGCCAAG
AACAGCATGAGACCTCGCAGAAACGCCATTGTTGAGAGGAAAGATGGATGGTGGAGGCAG
TTCTTTTTGTTGCTTAAGCGTGCATGGATGCAGCTTCTCGAGATGGGCCAACTAACAAGT
CCGTGCAAGAATGTCTGTTGCATCTGCTC


BQ
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AF RR4A101TFB U 1
AF RR4A101TF U 1
BS 1 869 RR4A101TF

RD RR4A101TFB 832 0 0
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QA 1 832 1 832
DS 

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CGTGGGATCAGCGGTGGAGAGAAGAAGCGGCTGTCACTTGCGTGTGAATTGATCGCTAGT
CCGTCTGTTATATTTGCTGATGAACCCACTACCGGGCTTGACGCCTTCCAGGCTGAACAA
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CAGCCTCGAGGTTCGGTTTATGCTAAGTTTGACGACGTTGTGTTACTTACAGAAGGAGCT
TTGGTCTATGCCGGCCCTGCTGGGACAGAACCTCTGACGTATTTCGGAAACTTCGGGTTT
CTTTGCCCAGAGCACGTAAACCCTGCTGAGTTTTTAGCAGATCTTATATCAGTTGACTAT
AGCTCTTCGGATAGTGTCTACTCTTCGCAGAAGAGAGTACATGCTCTTGTCGATGCCTTC
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QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL4796Contig1 774 2 6 U
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ACATTGTCTCTGCTGTGTTCTTAGCAACTGGTCAAGATCCAGCTCAAAACGTTGAGAGCT
CTCAGTGTATCACAATGATGGAAGCCATTAATGACGGGAAAGATATCCATATCTCGGTCA
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AACTTAAAATTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTGACTTGTAAACTCTTTTT
TTTTTAAATGTGGGGATTAAGAGTGAGAGAGGGAGAGATTTGTGATTGTCATTGTCTCCT
TCTTTCCTCTATCTCTCTCACTCATGGATAATTCATGTTCTCTTTGATTTGTCC


BQ
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AF RR4F645TF U 1
AF RR4F645JQ C 196
BS 1 616 RR4F645TF
BS 617 617 RR4F645JQ
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BS 639 651 RR4F645TF
BS 652 774 RR4F645JQ

RD RR4F645TF 656 0 0
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ACATTGTCTCTGCTGTGTTCTTAGCAACTGGTCAAGATCCAGCTCAAAACGTTGAGAGCT
CTCAGTGTATCACAATGATGGAAGCCATTAATGACGGGAAAGATATCCATATCTCGGTCA
CTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACAGTGGGAGGAGGAACACAGCTTGCGTCACAATCAG
CGTGTTTGAACTTGCTCGGAGTTAAAGGAGCAAGCAAGGAGTCGCCGGGGATGAACTCAA
GGAGGCTAGCGACGATAGTGGCAGGAGCAGTTTTGGCAGGAGAGTTATCACTTATGTCAG
CAATAGCAGCTGGACAACTTGTGAGGAGTCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACA
TCTCTGGAGCGACGACAACAACATGATCTGAATCATCATCATCTCTGTCTGGCCCAAAAC
TCGAAGGAGGACAAAAATGTAAAAGAAGGCAGGCTTTTTACAACTCATATTCACTCATAA
CTCTGTGGTGGACAACACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGTTCAATAAA
AACTTAAAATTGTTTT*GTTTGTTTGTTTTGTTTTTT*GTTTGACTTGTAA
CTCTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4F645JQ 579 0 0
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TCGGAGTTAAAGGAGCAAGCAAGGAGTCGCCGGGGATGAACTCAAGGAGGCTAGCGACGA
TAGTGGCAGGAGCAGTTTTGGCAGGAGAGTTATCACTTATGTCAGCAATAGCAGCTGGAC
AACTTGTGAGGAGTCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACATTTCTGGAGCGACGA
CAACAACATGATTTGAATCATCATCATCTCTGTCTGGCCCAAAACTCGAAGGAGGACAAA
AATGTAAAAGAAGGCAGGCTTTTTACAACTCATATTCACTCATAACTCTGTGGTGGACAA
CACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGTTCAATAAAAACTTAAAATTGTTT
TTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTGACTTGTAAACTCTTTTTTTTTTAAATGTGGGG
ATTAAGAGTGAGAGAGGGAGAGATTTGTGATTGTCATTGTCTCCTTCTTTCCTCTATCTC
TCTCACTCATGGATAATTCATGTTCTCTTTGATTTGTCC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL4797Contig1 861 2 2 U
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TGTTTAACAACTTCCCTCGCCTAAGAGCCACCTAGCCTGCAACTCTAAGTATACCGCATC
TAGTTACATCCCTTAAGACAGGGTCTGAGGCAACTCAAGAAGCTGCCTTGGATGCGTTGT
TTCTTCTGAGACAAGCTTGGTCAGCCTGTCCTGCTGAAGTTTCCAGGGCCCAGTCGGTTG
CTGCTGCAGACGCCATCCCTCTACTTCAGTACCTAATTCAATCAGGTCCACCCCGGTTCC
AGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCAATGCTTGCCAGGAACTCTAGTGGTGACAATCAAAC
GAGGTAATAACATGAAGCAATCCGTTGGTAACCCTAGCGTGTTCTGCAAGATAACACTTG
GTAACACACCTCCTAGACAAACCAAGGTGATATCGACCGGTCCAAATCCAGAGTGGGACG
AGAGTTTCTCATGGTCATTTGAGAGCCCTCCCAAAGGTCAAAAACTGCACATTTCATGCA
AGAACAAGAGCAAAATGGGAAAGAGTTCATTCGGGAAAGTAACGATCCAAATCGACCGGG
TGGTAATGCTGGGAGCAGTTGCAGGTGAATACAGTTTGTTACCAGAAAGCAAAAGTGGCC
CCAGAAACCTGGAAATCGAATTTCAGTGGTCTAACAAGTGAAAAAAGCACTACTTCATTT
ATATTATTATTTTTTTGTTGAGGCGAGAGTTGTTCAATCAAAACTTGTTTTTGGCAAATT
TTTCTATTATCGTTTTGATTATTGTAATGCTACATGTATATAGTTTTGTATTGTAATGTA
ATGTTTGGTGATTTATTACTG


BQ
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AF RR4GN72TF U 1
AF RR4GN72JQ C 266
BS 1 705 RR4GN72TF
BS 706 861 RR4GN72JQ

RD RR4GN72TF 705 0 0
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TGTTTAACAACTTCCCTCGCCTAAGAGCCACCTAGCCTGCAACTCTAAGTATACCGCATC
TAGTTACATCCCTTAAGACAGGGTCTGAGGCAACTCAAGAAGCTGCCTTGGATGCGTTGT
TTCTTCTGAGACAAGCTTGGTCAGCCTGTCCTGCTGAAGTTTCCAGGGCCCAGTCGGTTG
CTGCTGCAGACGCCATCCCTCTACTTCAGTACCTAATTCAATCAGGTCCACCCCGGTTCC
AGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCAATGCTTGCCAGGAACTCTAGTGGTGACAATCAAAC
GAGGTAATAACATGAAGCAATCCGTTGGTAACCCTAGCGTGTTCTGCAAGATAACACTTG
GTAACACACCTCCTAGACAAACCAAGGTGATATCGACCGGTCCAAATCCAGAGTGGGACG
AGAGTTTCTCATGGTCATTTGAGAGCCCTCCCAAAGGTCAAAAACTGCACATTTCATGCA
AGAACAAGAGCAAAATGGGAAAGAGTTCATTCGGGAAAGTAACGATCCAAATCGACCGGG
TGGTAATGCTGGGAGCAGTTGCAGGTGAATACAGTTTGTTACCAGAAAGCAAAAGTGGCC
CCAGAAACCTGGAAATCGAATTTCAGTGGTCTAACAAGTGAAAAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GN72JQ 596 0 0
TCAGTACCTAATTCAATCAGGTCCACCCCGGTTCCAGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCA
ATGCTTGCCAGGAACTCTAGTGGTGACAATCAAACGAGGTAATAACATGAAGCAATCCGT
TGGTAACCCTAGCGTGTTCTGCAAGATAACACTTGGTAACACACCTCCTAGACAAACCAA
GGTGATATCGACCGGTCCAAATCCAGAGTGGGACGAGAGTTTCTCATGGTCATTTGAGAG
CCCTCCCAAAGGTCAAAAACTGCACATTTCATGCAAGAACAAGAGCAAAATGGGAAAGAG
TTCATTCGGGAAAGTAACGATCCAAATCGACCGGGTGGTAATGCTGGGAGCAGTTGCAGG
TGAATACAGTTTGTTACCAGAAAGCAAAAGTGGCCCCAGAAACCTGGAAATCGAATTTCA
GTGGTCTAACAAGTGAAAAAAGCACTACTTCATTTATATTATTATTTTTTTGTTGAGGCG
AGAGTTGTTCAATCAAAACTTGTTTTTGGCAAATTTTTCTATTATCGTTTTGATTATTGT
AATGCTACATGTATATAGTTTTGTATTGTAATGTAATGTTTGGTGATTTATTACTG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL4798Contig1 1042 2 2 U
TTTTTAGAAAGTGAAGCTTCCATCGACAATCTGTAACCCTTCCATCTTCCATTAAAAATA
TCCTTAAATTCAAGCTTTAAGGCGATTATCTCACTACTCACACTTTAAAGCATTCAATCG
AACTCATGAGTCTTGACATGCTACACATCGATGAACAGGTTCCGTAAGTGCGAACCGTGT
ACCCAGATTCAGCGCTGTTTCACTTAGGGTTCTCTGTACACGCTAAATGGTTTCGATGCA
ACGCGCAGCAAACAGCAATCCCGGATGTCTGATGCCCCCTCTCCATACGGTTCAATGATG
GAACTTCTTTTGAAAAACTAACCGAGTCCGTCACTCTCATACCTACTCAACTGTTACGAT
TCGGTTACTTGCTTTGGCCAACACCAACAAACAACTTCCCGATATAATAATTGGTGAGCT
AAGTACAATCAGGAGCACAATCACGGACGGTATACCAGCGTGTAATGCTAACTCTTCGTC
TAGGGATGTAAATTTTTGTGTTAGAATGTTTGACTCTTTGGCTCTTGCATTTCATTAAAA
AAATTGATTAACTACGGGAAAGAGCCTAAAATTGTGTGTGCCACCAGTATCAATCCTAAG
ATTGTTGGGGGAAAGGTGCACATGGCCCTGAAGCAGCACAGCTTGAAGTTGTGGCAACAG
GATCAGATGCGGAAGTTGATAACACTTGCTATGTTACAGAGGCGCCATCTACATCTGATG
GTTCACTTGCCGGACGTACAGCATCAGACAAAGAACAAGTTGCTTTGGATGAGAATGCAC
TGAAGAACCCACATTTGGAATGAGTCTATCACTTATTAAACAACCACGTCTTCTCTTTAT
CAAATAATTGCTTTCGTATCTTTCAGTTTCCTTTGAGTCTATATTAAAATACTCAATGTA
GTGGTTGTTGTTTAAGTTAGTAGTAAACCATCTTTTCATTTTTCTTTAGTTCTATTTCTC
CTTTTAAAACTTTCAAATTTCTTTAGCTCTGTTTACCCCTTTTAAACTCTACGAGGTGGT
TGTTGTTCCAATTAGTAATGCA


BQ
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AF RR4D424TF U 1
AF RR4D424JQ C 359
BS 1 790 RR4D424TF
BS 791 1042 RR4D424JQ

RD RR4D424TF 790 0 0
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TCCTTAAATTCAAGCTTTAAGGCGATTATCTCACTACTCACACTTTAAAGCATTCAATCG
AACTCATGAGTCTTGACATGCTACACATCGATGAACAGGTTCCGTAAGTGCGAACCGTGT
ACCCAGATTCAGCGCTGTTTCACTTAGGGTTCTCTGTACACGCTAAATGGTTTCGATGCA
ACGCGCAGCAAACAGCAATCCCGGATGTCTGATGCCCCCTCTCCATACGGTTCAATGATG
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TCGGTTACTTGCTTTGGCCAACACCAACAAACAACTTCCCGATATAATAATTGGTGAGCT
AAGTACAATCAGGAGCACAATCACGGACGGTATACCAGCGTGTAATGCTAACTCTTCGTC
TAGGGATGTAAATTTTTGTGTTAGAATGTTTGACTCTTTGGCTCTTGCATTTCATTAAAA
AAATTGATTAACTACGGGAAAGAGCCTAAAATTGTGTGTGCCACCAGTATCAATCCTAAG
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GATCAGATGCGGAAGTTGATAACACTTGCTATGTTACAGAGGCGCCATCTACATCTGATG
GTTCACTTGCCGGACGTACAGCATCAGACAAAGAACAAGTTGCTTTGGATGAGAATGCAC
TGAAGAACCC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4D424JQ 684 0 0
ATTCGGTTACTTGCTTTGGCCAACACCAACAAACAACTTCCCGATATAATAATTGGTGAG
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TCTAGGGATGTAAATTTTTGTGTTAGAATGTTTGACTCTTTGGCTCTTGCATTTCATTAA
AAAAATTGATTAACTACGGGAAAGAGCCTAAAATTGTGTGTGCCACCAGTATCAATCCTA
AGATTGTTGGGGGAAAGGTGCACATGGCCCTGAAGCAGCACAGCTTGAAGTTGTGGCAAC
AGGATCAGATGCGGAAGTTGATAACACTTGCTATGTTACAGAGGCGCCATCTACATCTGA
TGGTTCACTTGCCGGACGTACAGCATCAGACAAAGAACAAGTTGCTTTGGATGAGAATGC
ACTGAAGAACCCACATTTGGAATGAGTCTATCACTTATTAAACAACCACGTCTTCTCTTT
ATCAAATAATTGCTTTCGTATCTTTCAGTTTCCTTTGAGTCTATATTAAAATACTCAATG
TAGTGGTTGTTGTTTAAGTTAGTAGTAAACCATCTTTTCATTTTTCTTTAGTTCTATTTC
TCCTTTTAAAACTTTCAAATTTCTTTAGCTCTGTTTACCCCTTTTAAACTCTACGAGGTG
GTTGTTGTTCCAATTAGTAATGCA

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL4799Contig1 444 2 1 U
GGAGAGATGGTGCGAAAGTAAAAAGAAACGAAAGTAGGAGAGACGTGATGAGAAACTAAG
TGTGGAAAGTACGTAATGGCCGCCTTCATTCAAATGGACATCGACCCCCAAGTTCGATAA
TAAATGAGATCAGACTTCAGCTTAGAGCAAAGCTTCTGGGATTGGACAGAGAGCTGCAGT
CCCTTGCGTTCTTCTGGCCCTAGGAACTCAGCTCATTCCCAGCAACTCACTCCTACTTAT
CTTTCTACTTGGTTCGCAAGATTTCAACTCCAGCCTGCTTTACTCGGTTCGTCTACTATT
GCGGTTCAAGGCTAGCTTCAATTGAGTTTCTTTTATTAAGTTAATATTATTAGCTCTGCA
TCTCCTATTTAGCTTTCGTTTAATCCCATAAGTGCGTTTGTATTGGTACCTCATTTAAGA
AAAAGAATAAATAAAGTAATATTT


BQ
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AF RR4A679JQ C 1
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QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C782JQ U 1
AF RR4CN54JQ U 1
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RD RR4C782JQ 501 0 0
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RD RR4CN54JQ 795 0 0
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QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DA39TF U 1
AF RR4DA39JQ C 102
BS 1 558 RR4DA39TF
BS 559 559 RR4DA39JQ
BS 560 659 RR4DA39TF
BS 660 864 RR4DA39JQ

RD RR4DA39TF 664 0 0
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CTAGTGGCAACTGGGAGTTTCAATCCTCCTGCGTTCATGCATTTACGCATGTTTGAGCTG
GCGAGAGATGCATTACGCTCGGAGGGGTTTCATGTTCTTGGAGGCTATATGTCTCCTGTA
AATGATGCATACAAGAAGGAGGGACTTTTATCTGCAGAGCATCGTCTAGAGATGTGCAAT
CTAGCTTGCAAAAGCTCCGACTTTATCATGGTTGATCCGTGGGAGGCATCCCAAGACAGC
TACCAACGAAGTTTGGTGGTTTTATCAAGGGTCAAGACTTTCCTTACAAACAATCGCCTT
GTACCATGGAATCTCTCAAAGTAATGCTACTATGTGGCTCGGATTTACTGCAATCTTTTT
GCACTCCCGGTGTTTGGATCCCTGAGCAGGTAAAGAGTATCTGTAAAGACTATGGGATTG
TGTGCATCCGTAGAGAAG*ACAAGATGTTGAAAACATGATCTTTGGTGACAGAATCTTAT
ACGAAACCCGTGATAACATCAGAATCGTCAACAATTTTGTTCCTAACCAGATTAGCTCA
GTAGA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4DA39JQ 763 0 0
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TTTACGCATGTTTGAGCTGGCGAGAGATGCATTACGCTCGGAGGGGTTTCATGTTCTTGG
AGGCTATATGTCTCCTGTAAATGATGCATACAAGAAGGAGGGACTTTTATCTGCAGAGCA
TCGTCTAGAGATGTGCAATCTAGCTTGCAAAAGCTCCGACTTTATCATGGTTGATCCGTG
GGAGGCATCCCAAGACAGCTACCAACGAAGTTTGGTGGTTTTATCAAGGGTCAAGACTTT
CCTTACAAACAATCGCCTTGTACCATGGAATCTCTCAAAGTAATGCTACTATGTGGCTCG
GATTTACTGCAATCTTTTTGCACTCCCGGTGTTTGGATCCCTGAGCAGGTAAAGAGTATC
TGTAAAGACTATGGGATTGTGTGCATCCGTAGAGAAGGACAAGATGTTGAAAACATGATC
TTTGGTGACAGAATCTTATACGAAACCCGTGATAACATCAGAATCGTCAACAATTTTGTT
CCTAACCAGATTAGCTCAAGTAGATTAAGGCAATGCATTTTGAGAGGATTATCGGTTAAG
TACTTGACCGAAGATGGAGTGATAGATTACATCAAACAACACCAACTTTACACAGAGCTC
AGATGACAAAAGCTGAGAGGATTGTTTACTTCACCAGATCAAATATTACTACAATTCAAA
TAATGTGATAAACAGAACGTAGTCATATTAAATGTTCTTCCTT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4802Contig1 711 2 1 U
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TCTTCACTGCTTGTCATATAAGTCTCAAAGACTTCTCCCTTCAAGTTGGAAACCAAGAAT
CTGGTTGTCTATTACCAAGTTTACCATCCGATGCTATATTCGATCAAGACACTGGAATAA
GCTTCACTTGTGATCTCAATGACAACATTCCAGCCCCATGGCCTTCTTCTTCTCAATCCT
CAGCCTCTACCTGTAAAAAACCTGTTAGAATCCCTGCTCTTCCTGCTGCAGCCTCCTCCC
AACCCAGTCTGTACAATGAGGAAGTGAAACGTTTGGTGGTCTTTGTATTGTCTATGGTTC
TTGTGATGCTTCTGTCATGACACCAGAACTAAACCGGATCCACGCTTATCTCTTACCGGT
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ATGTTGACATGACCGGTTCAAGTGCTTGAGTTTGTTTGAGGTATAAGTTTCGGAAAGTCT
TTTTCTTTATTGAAATTCATGATTCTTGGAAACCTTTTTTAATGTAAAGAA


BQ
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AF RR4A149TF U 1
AF RR4A149TFB U 1
BS 1 711 RR4A149TF

RD RR4A149TF 711 0 0
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TCTTCACTGCTTGTCATATAAGTCTCAAAGACTTCTCCCTTCAAGTTGGAAACCAAGAAT
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CAGCCTCTACCTGTAAAAAACCTGTTAGAATCCCTGCTCTTCCTGCTGCAGCCTCCTCCC
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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4A149TFB 711 0 0
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TCTTCACTGCTTGTCATATAAGTCTCAAAGACTTCTCCCTTCAAGTTGGAAACCAAGAAT
CTGGTTGTCTATTACCAAGTTTACCATCCGATGCTATATTCGATCAAGACACTGGAATAA
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CAGCCTCTACCTGTAAAAAACCTGTTAGAATCCCTGCTCTTCCTGCTGCAGCCTCCTCCC
AACCCAGTCTGTACAATGAGGAAGTGAAACGTTTGGTGGTCTTTGTATTGTCTATGGTTC
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ATGTTGACATGACCGGTTCAAGTGCTTGAGTTTGTTTGAGGTATAAGTTTCGGAAAGTCT
TTTTCTTTATTGAAATTCATGATTCTTGGAAACCTTTTTTAATGTAAAGAA

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL4803Contig1 1061 2 18 U
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ACACAAGTCACCATCCCACTCATTCACCCACATTCCTTTCCAATCTTTTCATACTTCTAT
TTCTGTCTCCGTCTTCGCTGCATTCTTGTGTGCCCAACAGGTTATTCCCGGGATGATGGA
TAAAGGGAAAGGAACTATACTCTTCACGGGTTGCTCGGCGTCATTGAATGGCGTTGCTGG
TTTCTCCGAGCTATGCTGTGGGAAATTTGCGTTGAGGGCACTTTCTCAATGCTTAGCAAG
AGAATATCAAGCTTTTGGAGTACATGTGGCTCATGTTATCATCGATGGTGTGGTTGGACC
TCCAAGAGAAACAAACATCCCACTGAGAGGAGTGGTCGCAGAACAATCATACAACGTTAG
AGGCGAAGATGCAGAAGGAGAAGGCGAAAGCTCGGGAGTGATGGGAATGGATCCTGATGT
ATTGGCTCAAACATATTGGAGCCTTCATGTTCAAGATCGGAGAGCTTGGACTCAAGAACT
CGATATCCGACCATCAAACACAAGGTTCTAGTAGTTAAACATGATTTGATTCGATTAATA
TATATATATGACTTGATTCTTCTGGTTTTTGATTTTTTTTATTAAATGTTACTTTGGTCT
TATGGTATGGTAAGTATGTGTGATCATTTGATATGTTTGTTCTTGCATTTGGAATGTAAA
ATACTAAAATATGTTATAAAAGGGTTGGTTTGCGATTGGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP38TF U 1
AF RR4CP38JQ C 315
BS 1 702 RR4CP38TF
BS 703 703 RR4CP38JQ
BS 704 722 RR4CP38TF
BS 723 723 RR4CP38JQ
BS 724 726 RR4CP38TF
BS 727 727 RR4CP38JQ
BS 728 737 RR4CP38TF
BS 738 738 RR4CP38JQ
BS 739 741 RR4CP38TF
BS 742 743 RR4CP38JQ
BS 744 766 RR4CP38TF
BS 767 767 RR4CP38JQ
BS 768 782 RR4CP38TF
BS 783 783 RR4CP38JQ
BS 784 790 RR4CP38TF
BS 791 791 RR4CP38JQ
BS 792 802 RR4CP38TF
BS 803 1061 RR4CP38JQ

RD RR4CP38TF 803 0 0
GTATAAAAGAAAAGGCGAGGAAAGGAAAGTGATCATATCATAAAGGACTGATGATGAGAA
ACGTAGGAAGTTCGAGCTCCGGCAGCAAAGGCATAGCGGCGGTGGTCGGCGTAGGTCCAA
AGCTAGGCCGTTCAGTCGCTCAAAAGTTCGCACATGAAGGCTACACCGTCGCCATTCTAG
CCCGCGATCTAGGCAGGTTATCTCGAGTGGTTGAAGAGATAGCGAGAGAAGAGAAAGCGC
AAGTGTTTGCTATAAGAATTGATTGTGCGGATCCAAGAAGCGTAAGAGAAGCCTTTGAAG
GAGTGTTGTCCTTAGGGTTTGTTGAGGTTTTGGTGTACAATGCTTATCACTCTTCTTCTT
ACACAAGTCACCATCCCACTCATTCACCCACATTCCTTTCCAATCTTTTCATACTTCTAT
TTCTGTCTCCGTCTTCGCTGCATTCTTGTGTGCCCAACAGGTTATTCCCGGGATGATGGA
TAAAGGGAAAGGAACTATACTCTTCACGGGTTGCTCGGCGTCATTGAATGGCGTTGCTGG
TTTCTCCGAGCTATGCTGTGGGAAATTTGCGTTGAGGGCACTTTCTCAATGCTTAGCAAG
AGAATATCAAGCTTTTGGAGTACATGTGGCTCATGTTATCATCGATGGTGTGGTTGGACC
TCCAAGAGAAACAAACATCCCACTGAGAGGAGTGGTCGCAGA*CAATCATACAACGTTAG
AG*CGA*GATGCAGAAG*AGA**GCGAAAGCTCGGGAGTGATGGGA*TGGATCCTGATGT
AT*GGCTCAA*CATATTGGAGC
T

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4CP38JQ 747 0 0
GGGTTTGTTGAGGTTTTGGTGTACAATGCTTATCACTCTTCTTCTTACACAAGTCACCAT
CCCACTCAT*CACCCACATTCCTTTCCAATCTTTTCATACTTCTATTTCTGTCTCCGTCT
TCGCTGCATTCTTGTGTGCCCAACAGGTTATTCCCGGGATGATGGATAAAGGGAAAGGAA
CTATACTCTTCACGGGTTGCTCGGCGTCATTGAATGGCGTTGCTGGTTTTTCCGAGCTAT
GCTGTGGGAAATTTGCGTTGAGGGCACTTTCTCAATGCTTAGCAAGAGAATATCAAGCTT
TTGGAGTACATGTGGCTCATGTTATCATCGATGGTGTGGTTGGACCTCCAAGAGAAACAA
ACATCCCACTGAGAGGAGTGGTCGCAGAACAATCATACAACGTTAGAGGCGAAGATGCAG
AAGGAGAAGGCGAAAGCTCGGGAGTGATGGGAATGGATCCTGATGTATTGGCTCAAACAT
ATTGGAGCCTTCATGTTCAAGATCGGAGAGCTTGGACTCAAGAACTCGATATCCGACCAT
CAAACACAAGGTTCTAGTAGTTAAACATGATTTGATTCGATTAATATATATATATGACTT
GATTCTTCTGGTTTTTGATTTTTTTTATTAAATGTTACTTTGGTCTTATGGTATGGTAAG
TATGTGTGATCATTTGATATGTTTGTTCTTGCATTTGGAATGTAAAATACTAAAATATGT
TATAAAAGGGTTGGTTTGCGATTGGTG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL4804Contig1 937 2 6 U
GGAAAGCAAAAATAAAAAAGAAAATCGTCTCTCTCTCTCTCTCACACTCGCCGGCTTATT
CTCCGGTCATCTCTTCTCCGTCGCTCAGATCCGTCAAGTGAATCGGATTGGAGGGGGGTG
CACACAAAAAAACACTGGTCTTGGATGTGTAAATGAGCATTATCCACAGATGTTATTTGC
AGCAGAAGGTGGAGGATTCTTCTCTTCATCAGCTTCTGGCTATACCAACGGTTTAGCCCT
TCTTCTACTAGGCCACAAGGATGAACCCCCCAAAAAACCCGTTAGAGTATCCCCGTGGAG
ACATTATCATCTCGTAGTCGAAGAAACTGACACCAAGCTTCAGTTAGATTCCTCTAAGAA
ATGGCTCTCACGTGCCTGCAATTCCCTCACGTGCTTTGGTCGCAAATCTGATAGACCGGA
GGAAAACCCCTCTCAACCACAAGATGAGGCACCACCACCAGAGAGTGTGGAATACGAATG
TGAAGTTGTTAGTAATAGGTTTGCACTTAAGAGCAGCCTCAAGAAAAGATCGTTTAGCGA
TGCTGTTCTTGCTGATGAAGATGATAATGATGATGATGATGTGGGTAGAGATAATGGTGT
GTTGAATCATGCTGACAGAAGGAAAGTCCAGTGGCCTGACACTTGTGGTATTGAGATTGC
TGAGGTCAGAGAGTTTGAGCCTAGTGAAGTGGATGAACTGGATGATGAGTTGCATCATGG
AAACAGAAAAAGCTGCATGTGCACAATCATGTGACCAGATCTTCGATCAAGAAGAAGAAG
CTAAAGGCATGTTTTCAGACTACTAAGGGCTTTCATTGGCGCAGCTCATATTGTTGAGGT
AGATGCGCTCTTTTTCTGGCCAAGGGCTTTTGCACCTTTGACATATTTATATTTATATAT
ATGGAGAAAGAGATGCGTATAGTTTTGGATAAGAAGA


BQ
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AF RR4CD25TF U 1
AF RR4CD25JQ C 244
BS 1 621 RR4CD25TF
BS 622 622 RR4CD25JQ
BS 623 664 RR4CD25TF
BS 665 665 RR4CD25JQ
BS 666 687 RR4CD25TF
BS 688 937 RR4CD25JQ

RD RR4CD25TF 698 0 0
GGAAAGCAAAAATAAAAAAGAAAATCGTCTCTCTCTCTCTCTCACACTCGCCGGCTTATT
CTCCGGTCATCTCTTCTCCGTCGCTCAGATCCGTCAAGTGAATCGGATTGGAGGGGGGTG
CACACAAAAAAACACTGGTCTTGGATGTGTAAATGAGCATTATCCACAGATGTTATTTGC
AGCAGAAGGTGGAGGATTCTTCTCTTCATCAGCTTCTGGCTATACCAACGGTTTAGCCCT
TCTTCTACTAGGCCACAAGGATGAACCCCCCAAAAAACCCGTTAGAGTATCCCCGTGGAG
ACATTATCATCTCGTAGTCGAAGAAACTGACACCAAGCTTCAGTTAGATTCCTCTAAGAA
ATGGCTCTCACGTGCCTGCAATTCCCTCACGTGCTTTGGTCGCAAATCTGATAGACCGGA
GGAAAACCCCTCTCAACCACAAGATGAGGCACCACCACCAGAGAGTGTGGAATACGAATG
TGAAGTTGTTAGTAATAGGTTTGCACTTAAGAGCAGCCTCAAGAAAAGATCGTTTAGCGA
TGCTGTTCTTGCTGATGAAGATGATAATGATGATGATGATGTGGGTAGAGATAATGGTGT
GTTGAATCATGCTGACAGAAG*AAAGTCCAGTGGCCTGACACTTGTGGTATTGAGATTGC
TGAG*TCAGAGAGTTTGAGCCTAGTGA
GTGGATGACTG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CD25JQ 694 0 0
TCTACTAGGCCACAAGGATGAACCCCCCAAAAAACCCGTTAGAGTATCCCCGTGGAGACA
TTATCATCTCGTAGTCGAAGAAACTGACACCAAGCTTCAGTTAGATTCCTCTAAGAAATG
GCTCTCACGTGCCTGCAATTCCCTCACGTGCTTTGGTCGCAAATCTGATAGACCGGAGGA
AAACCCCTCTCAACCACAAGATGAGGCACCACCACCAGAGAGTGTGGAATACGAATGTGA
AGTTGTTAGTAATAGGTTTGCACTTAAGAGCAGCCTCAAGAAAAGATCGTTTAGCGATGC
TGTTCTTGCTGATGAAGATGATAATGATGATGATGATGTGGGTAGAGATAATGGTGTGTT
GAATCATGCTGACAGAAGGAAAGTCCAGTGGCCTGACACTTGTGGTATTGAGATTGCTGA
GGTCAGAGAGTTTGAGCCTAGTGAAGTGGATGAACTGGATGATGAGTTGCATCATGGAAA
CAGAAAAAGCTGCATGTGCACAATCATGTGACCAGATCTTCGATCAAGAAGAAGAAGCTA
AAGGCATGTTTTCAGACTACTAAGGGCTTTCATTGGCGCAGCTCATATTGTTGAGGTAGA
TGCGCTCTTTTTCTGGCCAAGGGCTTTTGCACCTTTGACATATTTATATTTATATATATG
GAGAAAGAGATGCGTATAGTTTTGGATAAGAAGA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4805Contig1 1098 2 10 U
GCTTACCACCAATATTATCAACACACGGCGAGGCCTCCTCCGCAGCCTGGTGGTTACTCC
AATCAATTCCACTCTCCATCGCCACCACCGCACTGGGGACCACCTCCTCCTCCTGGTTAC
CCTCCTTACCCGATTCACTCTCACCAGCAGCCGTCGTTTAACCCCGCCGCCAACGGTAAC
ACTCAGTTTGCTCCCTCCCCCGCTGGACCTCGTCAGCCATATCCGCAGGAATGGTCTCAA
CAAGGTCACACAGCTCAAGCTAATAGCAACGCTGAGGATTGGGCACTAAAAGCTAAAGAA
TGGGCTGCAACGAACCAACCTAGTGGACAACAAGTCTACCATCAGTACCCTAATCAGAGC
TATCAAGATGTTCATCAACAGACGGCTCCAGGGTTGAGCTATCAGCAGTTTCCAGCTCCA
CATTATGCAACAGGAAACGAGGGTTATTCACATCAAGAAAACATGCCTACCACTTCAGCT
ATTCATCAGCAGGAGGGAAAGAAGAATCGGGCAATGCAACACAGCATCATGTGCAGATAG
GAGTGCCAGATGGTGGGGGGCCTGTTTGGGCAGAGCAGCAAATGCAATATGCATATGGAG
ATCAAACAGCCGCTCCAGTTAGTACTCTTCAGGATCATCCTTTACAGTTTGCTACCAGAG
AGAGTTCTGATTACGCTAGTCATCATAATGCGTGGCTGCCCCATGCCTCAACCGGAGTAG
TTTATCCTCCTATTCCTTCATCGGTACCTTCATTGCCATAGCATAATTCATCTATGGCTA
TGCCTCCATATGGAGGGTATACCCCACCAAATCTTCAGCCTGGTGGACCCCCTTATGCTT
TTGGAACAAGGCCCCCTCTTCACCCTGTTGCTGCTTTCATGGACGACTCACACGCGGCAT
CGTCTGTTCCTTCTAAAAGCGTTAATTTACCTAACTGGCTCAAGGAAGAGTTATCGAAGA
TCAAACCATCTCATGGAAAGCCTTCTTCAGGGAATTTTGAGGAGAGAGAGCCTATGGACG
ATGATGTACTTCATAAACCTCCCGAGAGATTTGATCAGCGTGACGACAAAAGGTTCAGCG
CTTCTAAATCTTCCGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY61TF U 1
AF RR4DY61JQ C 357
BS 1 632 RR4DY61TF
BS 633 633 RR4DY61JQ
BS 634 765 RR4DY61TF
BS 766 766 RR4DY61JQ
BS 767 783 RR4DY61TF
BS 784 784 RR4DY61JQ
BS 785 785 RR4DY61TF
BS 786 786 RR4DY61JQ
BS 787 806 RR4DY61TF
BS 807 1098 RR4DY61JQ

RD RR4DY61TF 806 0 0
GCTTACCACCAATATTATCAACACACGGCGAGGCCTCCTCCGCAGCCTGGTGGTTACTCC
AATCAATTCCACTCTCCATCGCCACCACCGCACTGGGGACCACCTCCTCCTCCTGGTTAC
CCTCCTTACCCGATTCACTCTCACCAGCAGCCGTCGTTTAACCCCGCCGCCAACGGTAAC
ACTCAGTTTGCTCCCTCCCCCGCTGGACCTCGTCAGCCATATCCGCAGGAATGGTCTCAA
CAAGGTCACACAGCTCAAGCTAATAGCAACGCTGAGGATTGGGCACTAAAAGCTAAAGAA
TGGGCTGCAACGAACCAACCTAGTGGACAACAAGTCTACCATCAGTACCCTAATCAGAGC
TATCAAGATGTTCATCAACAGACGGCTCCAGGGTTGAGCTATCAGCAGTTTCCAGCTCCA
CATTATGCAACAGGAAACGAGGGTTATTCACATCAAGAAAACATGCCTACCACTTCAGCT
ATTCATCAGCAGGAGGGAAAGAAGAATCGGGCAATGCAACACAGCATCATGTGCAGATAG
GAGTGCCAGATGGTGGGGGGCCTGTTTGGGCAGAGCAGCAAATGCAATATGCATATGGAG
ATCAAACAGCCGCTCCAGTTAGTACTCTTCAG*ATCATCCTTTACAGTTTGCTACCAGAG
AGAGTTCTGATTACGCTAGTCATCATAATGCGTGGCTGCCCCATGCCTCAACCGGAGTAG
TTTATCCTCCTATTCCTTCATCGGTACCTTCATTGCCATAGCATA*TTCATCTATGGCTA
TGC*TTCATATGGAGGGTATACCCCA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4DY61JQ 742 0 0
GAGCTATCAAGATGTTCATCAACAGACGGCTCCAGGGTTGAGCTATCAGCAGTTTCCAGC
TCCACATTATGCAACAGGAAACGAGGGTTATTCACATCAAGAAAACATGCCTACCACTTC
AGCTATTCATCAGCAGGAGGGAAAGAAGAATCGGGCAATGCAACACAGCATCATGTGCAG
ATAGGAGTGCCAGATGGTGGGGGGCCTGTTTGGGCAGAGCAGCAAATGCAATATGCATAT
GGAGATCAAACAGCCGCTCCAGTTAGTACTCTTCAGGATCATCCTTTACAGTTTGCTACC
AGAGAGAGTTCTGATTACGCTAGTCATCATAATGCGTGGCTGCCCCATGCCTCAACCGGA
GTAGTTTATCCTCCTATTCCTTCATCGGTACCTTCATTGCCATAGCATAATTCATCTATG
GCTATGCCTCCATATGGAGGGTATACCCCACCAAATCTTCAGCCTGGTGGACCCCCTTAT
GCTTTTGGAACAAGGCCCCCTCTTCACCCTGTTGCTGCTTTCATGGACGACTCACACGCG
GCATCGTCTGTTCCTTCTAAAAGCGTTAATTTACCTAACTGGCTCAAGGAAGAGTTATCG
AAGATCAAACCATCTCATGGAAAGCCTTCTTCAGGGAATTTTGAGGAGAGAGAGCCTATG
GACGATGATGTACTTCATAAACCTCCCGAGAGATTTGATCAGCGTGACGACAAAAGGTTC
AGCGCTTCTAAATCTTCCGACG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4806Contig1 1068 2 2 U
GGGTGTCTCGTCTCGTCTCGTCTCTCACCTCTCGCACACTCTCTCACTCTCTACTCTCTC
TCTCACTCTCATTCGTCAGATCTCCGAGTTCTTACCCTTACTTTTCAACAGTGTTGGGGT
TTCGGTTGCTTAAAGACGGAAGCTTTCCTCAAGATTTTGAGTTTTATTAGAGAATATCCC
CCCCTAAGCAATGGGAACAATGCACCGAAGTGGTTTAGCTCCTCGAAGAACAAACGAAAA
CGCAAAAGTTATTATGACAACAATCCTTGGAATCGTCTTTGGCACTTTTATTGGCGTCTC
ATTACCTTCTCTTTCTTTTAAGATTAACTTACCTTCGGCTCTTATATCATCTCTTGATGT
CGTGTCAGCTTACGAGTACATATTTATATGGGATGAAGATCTTGGTGTGGAGCACTTCAA
TGCGGATAAGTATATTCAGTTAGTTAAGAAGCATGGTTTAGAGATTTCTCAACCAGGTCT
AGAGCCCAACAATGGACTTACGTGGGAAATGACAAAGAGGCGAGGTGACCGAGAGGTTCA
CAAAGATACTAAAGAAAAAGCAGGATGGTGCAGTGACCCACATTTACCTCCTTGCGCTGC
GTTTGTGGAAATAATGGCGCCTGTGTTTTCTCGAGAAGCATGGCGATGTGTGTGGCATAT
GATTCAGAATGATCTGGTTCATGGATGGGGTCTAGACTTTGCTCTTAGAAGATGCGTTGA
ACCTGCTCATGAGAAGATTGGCGTTGTAGGTTCGCATTGGATCATTCACAAAGTGATACC
TTCGCTTGGAAGTCAAGGTAAGTCGGAGAATGGGAAAGCCCCATGGCAAGGAGTGAGAGA
GAGATGCAAAAAGGAGTGGACTATGTTTCAGAACCGATTAGCAGACGCTGATAAAGAGTA
CCTTGGGAGGATGGTCAAAGGATAGATTATAGATTTTTATATAATGTCATTATATAGAAA
AGAAACAAAAACACTTCCTATGTATATCAAACATGTGAAACCCTTTTTATTGATATTTTG
TGTGAGATTTATATGTTTGATTAAAACTTATGTTATGTTTCTATTTGA


BQ
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AF RR4AE14TF U 1
AF RR4AE14JQ C 309
BS 1 747 RR4AE14TF
BS 748 1068 RR4AE14JQ

RD RR4AE14TF 747 0 0
GGGTGTCTCGTCTCGTCTCGTCTCTCACCTCTCGCACACTCTCTCACTCTCTACTCTCTC
TCTCACTCTCATTCGTCAGATCTCCGAGTTCTTACCCTTACTTTTCAACAGTGTTGGGGT
TTCGGTTGCTTAAAGACGGAAGCTTTCCTCAAGATTTTGAGTTTTATTAGAGAATATCCC
CCCCTAAGCAATGGGAACAATGCACCGAAGTGGTTTAGCTCCTCGAAGAACAAACGAAAA
CGCAAAAGTTATTATGACAACAATCCTTGGAATCGTCTTTGGCACTTTTATTGGCGTCTC
ATTACCTTCTCTTTCTTTTAAGATTAACTTACCTTCGGCTCTTATATCATCTCTTGATGT
CGTGTCAGCTTACGAGTACATATTTATATGGGATGAAGATCTTGGTGTGGAGCACTTCAA
TGCGGATAAGTATATTCAGTTAGTTAAGAAGCATGGTTTAGAGATTTCTCAACCAGGTCT
AGAGCCCAACAATGGACTTACGTGGGAAATGACAAAGAGGCGAGGTGACCGAGAGGTTCA
CAAAGATACTAAAGAAAAAGCAGGATGGTGCAGTGACCCACATTTACCTCCTTGCGCTGC
GTTTGTGGAAATAATGGCGCCTGTGTTTTCTCGAGAAGCATGGCGATGTGTGTGGCATAT
GATTCAGAATGATCTGGTTCATGGATGGGGTCTAGACTTTGCTCTTAGAAGATGCGTTGA
ACCTGCTCATGAGAAGATTGGCGTTGT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4AE14JQ 760 0 0
CTCTTTCTTTTAAGATTAACTTACCTTCGGCTCTTATATCATCTCTTGATGTCGTGTCAG
CTTACGAGTACATATTTATATGGGATGAAGATCTTGGTGTGGAGCACTTCAATGCGGATA
AGTATATTCAGTTAGTTAAGAAGCATGGTTTAGAGATTTCTCAACCAGGTCTAGAGCCCA
ACAATGGACTTACGTGGGAAATGACAAAGAGGCGAGGTGACCGAGAGGTTCACAAAGATA
CTAAAGAAAAAGCAGGATGGTGCAGTGACCCACATTTACCTCCTTGCGCTGCGTTTGTGG
AAATAATGGCGCCTGTGTTTTCTCGAGAAGCATGGCGATGTGTGTGGCATATGATTCAGA
ATGATCTGGTTCATGGATGGGGTCTAGACTTTGCTCTTAGAAGATGCGTTGAACCTGCTC
ATGAGAAGATTGGCGTTGTAGGTTCGCATTGGATCATTCACAAAGTGATACCTTCGCTTG
GAAGTCAAGGTAAGTCGGAGAATGGGAAAGCCCCATGGCAAGGAGTGAGAGAGAGATGCA
AAAAGGAGTGGACTATGTTTCAGAACCGATTAGCAGACGCTGATAAAGAGTACCTTGGGA
GGATGGTCAAAGGATAGATTATAGATTTTTATATAATGTCATTATATAGAAAAGAAACAA
AAACACTTCCTATGTATATCAAACATGTGAAACCCTTTTTATTGATATTTTGTGTGAGAT
TTATATGTTTGATTAAAACTTATGTTATGTTTCTATTTGA

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL4807Contig1 874 2 2 U
GATGCGACGAGAACAAAGACCTGATTGCTTCCTCCGGCGCAATCAAGCCCCTCGTTAGAG
CGTTGAAGATGGGAACTCCCACGGCTAAGGAGAACGCCGCCTGCGCTCTCCTCCGGCTAT
CGCAGGTGGAGGATAACAAAGTCGCCATCGGAAGATCAGGTGCGATTCCTCTCCTTGTCA
ACCTTCTAGAAACAGGAGGAATCCGGGCCAAGAAGGACGCCTCCACGGCTCTCTACTCCC
TCTGCTCTGCTAAAGAGAACAAACTCAGAGCCGTGCAGTCTGGAATCATGAAGCCTCTCG
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TGGTGGAGATCGTGGAGGCGGGAACGCAGAGGCAGAAAGAGATAGCTGTGTCGATTCTGC
TTCAGCTCTGTGAGGAGAGTGTGGTGTATCGAACCATGGTGGCGAGGGAAGGAGCGATTC
CTCCGCTTGTGGCACTTACTCAGGCAGGAACAAGTCGAGCTAAGCAAAAGGCGGAGGCTT
TGATTGACTTCTTAAGGCAGCCTAGATCTGTTAACAGTAACGGTGGAAGATGATTCAACA
ACCTTCTTTCTTCTTTCCTTTTGTTTTTTTTCTTTACACTGTTAATGCTAAAGATACTTA
CACAGATGACAAACAATCAGACAGGGTAAGAAACTGTATATAGTTTTGTGCTCTAATATG
TATAAAGTTAGCTTTGCTTTGCCTCTGTAATCTAATATCTTCTTGCGTTTGGCTCTTTAT
TTTTCCTGTCGATTAATTTCATTTTGGTTTTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AY09TF U 1
AF RR4AY09JQ C 105
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BS 816 874 RR4AY09JQ

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TGATTGACTTCTTAAGGCAGCCTAGATCTGTTAACAGTAACGGTGGAAGATGATTCAACA
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QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4AY09JQ 770 0 0
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ACGGCTCTCTACTCCCTCTGCTCTGCTAAAGAGAACAAACTCAGAGCCGTGCAGTCTGGA
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QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A670TF U 1
AF RR4AQ11TF U 1
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DS 

RD RR4AQ11TF 433 0 0
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TATGGCGGTTGGAGGAAGATGGGGACGAGTTGAAGAAGAGGTTGCAGAAGAAGGGAGCTC
GAATGTGAATGAAGGAGAAGCAGAAGTCATTGAACCATCTGAAGTCAGGGCAGAGAGTGA
TCCATGGCAAGATTGATTTCAACATCTTTTCTTGTTTACTACTATAGTGAATTTTTGACG
AAAATGCTTCTGCTTTCTACTAGGATTGTCTTCTTCTTGTTTGGGGATACGAGTATCATG
GGTCTATGAAAGCCCATTATTGGATCACGCGAACGAAATAATTAATTCTATCAAAAGTAC
CTATGTTAAAGAA

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 2

CO CL4809Contig1 1030 2 2 U
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ATATTTTATTTACATACTTATTCTCACAGGCTCGTGGCATGAACTATCTTCACCATTGTA
GTCCACCCATCATTCACCGGGATCTGAAGTCATCAAATCTATTGGTTGATCGAAACTGGA
CAGTGAAGGTATTGTTTCCATTGTCAAATCAAATAAGTATCCATCATCATGGGTCAACTT
TCATATGATTTTAGAGATCAAATGATTTCAGTGAATGTAACCGGACGTCTCCAATGGAAT
AATTTTATTCATTTTATTTGTGACACGGTTTGAGAATATTAGCTTAGGTACAAAAATAAT
GGTGTAGGTCTAGTATATCTATTGTGTCAGAACTGAGAAGTTGAGTGAGAAAACATAAAG
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CGTATCAAGCATGAGACTTACCTCACTACAAAGACCGGAAGGGGAACGGTACTCAACAGA
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CTAACAATGCTTCTTCTCTTTGAACTCAGGTCTGACGTTTACAGCTTTGGAGTAGTACTA
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CCCCGTTTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY02TF U 1
AF RR4FY02JQ C 262
BS 1 699 RR4FY02TF
BS 700 1030 RR4FY02JQ

RD RR4FY02TF 699 0 0
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CGTATCCATATGGCATTTGACATTGTGAGTATTTGTTAAATCTAGATCATTGATAGTTGT
GCATATCGTGTTTTTTCAACTCTTTGGTTCGGTCACCGTACATCTCATCCAACATGTTGC
ATATTTTATTTACATACTTATTCTCACAGGCTCGTGGCATGAACTATCTTCACCATTGTA
GTCCACCCATCATTCACCGGGATCTGAAGTCATCAAATCTATTGGTTGATCGAAACTGGA
CAGTGAAGGTATTGTTTCCATTGTCAAATCAAATAAGTATCCATCATCATGGGTCAACTT
TCATATGATTTTAGAGATCAAATGATTTCAGTGAATGTAACCGGACGTCTCCAATGGAAT
AATTTTATTCATTTTATTTGTGACACGGTTTGAGAATATTAGCTTAGGTACAAAAATAAT
GGTGTAGGTCTAGTATATCTATTGTGTCAGAACTGAGAAGTTGAGTGAGAAAACATAAAG
CAAAATGTAAAGAGAGACTATTGATTCTAAGTAGAAACTAGTAATGAACTTAAATATGGC
TCAGTTTGCATCGTTAACTTACCGTATCATCTCAAATAGGTTGCTGACTTTGGTCTCTCG
CGTATCAAGCATGAGACTTACCTCACTACAAAGACCGGA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4FY02JQ 769 0 0
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TGTCAAATCAAATAAGTATCCATCATCATGGGTCAACTTTCATATGATTTTAGAGATCAA
ATGATTTCAGTGAATGTAACCGGACGTCTCCAATGGAATAATTTTATTCATTTTATTTGT
GACACGGTTTGAGAATATTAGCTTAGGTACAAAAATAATGGTGTAGGTCTAGTATATCTA
TTGTGTCAGAACTGAGAAGTTGAGTGAGAAAACATAAAGCAAAATGTAAAGAGAGACTAT
TGATTCTAAGTAGAAACTAGTAATGAACTTAAATATGGCTCAGTTTGCATCGTTAACTTA
CCGTATCATCTCAAATAGGTTGCTGACTTTGGTCTCTCGCGTATCAAGCATGAGACTTAC
CTCACTACAAAGACCGGAAGGGGAACGGTACTCAACAGACTCTTACCAAAATGATTCCTT
TCTTTTCTAGTTGAAGTGAATTATTTAATGTTGAATTCAGTTGCTTTTTTTACCTGTTTT
TCAGCCTCAATGGATGGCACCAGAGGTTCTTCGAAATGAAGCTGCTGATGAAAAGTATAT
TCTCATTTTGTGATTGGTTAAGTTCTTTTCCTTTCTTCTCTAACAATGCTTCTTCTCTTT
GAACTCAGGTCTGACGTTTACAGCTTTGGAGTAGTACTATGGGAGCTTGTGACTGAGAAG
ATTCCGTGGGAAAATCTAAATGCTATGCAGGTATAATTCCCCCGTTTAG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL4810Contig1 756 2 2 U
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ACCCGTTCTTACTTAAAGGGTATTATGGTCTTTTGCATCTCGTCAAACCGCTCTGATACC
AATTAAAGGACTCAAGATCGTTTGTATTCGATGTTCTTAATAAAACAGTACCTTCGTTTT
ATTATCTTCTTAACTTGTATGGGACTTAGATTGACATCTCACAGGGAGCAGTGGTCAGTC
AACGTTAGGAGCTGGTACAGAGAAGGTGGTCAAGAGGGCGCATATGGCTTAGGTTAGAAT
AACAAGATCTATGGATGCAGAGCTTATGCATTGATTTTTCCTTCATGTTTGCTTTTTCTT
ACTTTTGTATTTCCCCACTTTATGGGTGCTATATTTTTGATTCAGATTTCAAACACTTCA
ACATATCTACTAAAGATTTCAGCCAATCCCAGTAAATTGGTCGCCCATATTCTAAGTAGA
ACTATTATAGATTTCAGTTTTAATTTAGGAAAAAAATATTATTATGTAAAATTTTAAATT
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TAAACAAATCGAGAATCTAAATGCAACTATTAGATGGAGATCTTTGGCCGTCACGAAGCT
CAAGACTATAAAATTTAAAATAAAGAGGATATAACC


BQ
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AF RR4FH64TF U 1
AF RR4FH64JQ C 187
BS 1 636 RR4FH64TF
BS 637 756 RR4FH64JQ

RD RR4FH64TF 640 0 0
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ACCCGTTCTTACTTAAAGGGTATTATGGTCTTTTGCATCTCGTCAAACCGCTCTGATACC
AATTAAAGGACTCAAGATCGTTTGTATTCGATGTTCTTAATAAAACAGTACCTTCGTTTT
ATTATCTTCTTAACTTGTATGGGACTTAGATTGACATCTCACAGGGAGCAGTGGTCAGTC
AACGTTAGGAGCTGGTACAGAGAAGGTGGTCAAGAGGGCGCATATGGCTTAGGTTAGAAT
AACAAGATCTATGGATGCAGAGCTTATGCATTGATTTTTCCTTCATGTTTGCTTTTTCTT
ACTTTTGTATTTCCCCACTTTATGGGTGCTATATTTTTGATTCAGATTTCAAACACTTCA
ACATATCTACTAAAGATTTCAGCCAATCCCAGTAAATTGGTCGCCCATATTCTAAGTAGA
ACTATTATAGATTTCAGTTTTAATTTAGGAAAAAAATATTATTATGTAAAATTTTAAATT
TATTCTTTTTTTTAAACAAAATAAAATTTAAACAGCAAAATAAAAGTTGCTTAACGGTAC
GATTTGGAAGACTTCCTTTAAGTCTTCACATGTAAA
CACA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FH64JQ 570 0 0
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ATCTATGGATGCAGAGCTTATGCATTGATTTTTCCTTCATGTTTGCTTTTTCTTACTTTT
GTATTTCCCCACTTTATGGGTGCTATATTTTTGATTCAGATTTCAAACACTTCAACATAT
TTACTAAAGATTTCAGCCAATCCCAGTAAATTGGTCGCCCATATTTTAAGTAGAACTATT
ATAGATTTCAGTTTTAATTTAGGAAAAAAATATTATTATGTAAAATTTTAAATTTATTTT
TTTTTTTAAACAAAATAAAATTTAAACAGCAAAATAAAAGTTGCTTAACGGTACGATTTG
GAAGACTTCCTTTAAGTCTTCACATGTAAAACACACAATAATTAAAAATATATATAAACA
AATCGAGAATCTAAATGCAACTATTAGATGGAGATCTTTGGCCGTCACGAAGCTCAAGAC
TATAAAATTTAAAATAAAGAGGATATAACC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL4811Contig1 705 2 1 U
GGATTGCTGCAACAGAACCGCCATGTCTTCTTCTACAGCCTCAAGGTTTCTCCGGAAACT
ACCTCAAACCCTTGTTCGTATCTATCCCACTAGGGTTCTAAGCTCTTCGATTCATAAAAC
CACCGAGCCATCGCGTTCCTTACGGCGAATAGGATCCAGTCTTCTCCGACACGATTCCAT
CACTACAAGAAGCTTCTCCTCTCAAGAAGGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCT
GCAGGAGGATGAATTCCACAGATTAGCCAATGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGAT
TGAGGATTATGGTGATAATGTCCAGATTGATGGTTTCGACATTGATTATGGGAATGAAGT
TTTTACACTTAAGCTTGGATCGTTAGGCACGTATGTACTCAATAAGCAAACTCCTAACCG
ACAAATCTGGATGTCTTCACCTGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGGACCGTGATGC
TAATGCGTGGATTTACCGGAGGACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGGAAGAGGAGTT
GGAGAGTCTATGTGGCGAACCTATTCAACTCTCATGAGAACAATATTTGTGAGTTTATCT
AGGAACTTATGCCCTTCATTGGTATATCTCTATGAAACACCGAGAGGAATAAACAAACTA
GGCACAGCTGTTTCAATGTGAAAGCGATGTTTGTGATTATACTTC


BQ
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AF RR4BG82JQ C 1
AF RR4BG82TF U 1
BS 1 705 RR4BG82TF

RD RR4BG82JQ 705 0 0
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CACTACAAGAAGCTTCTCCTCTCAAGAAGGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCT
GCAGGAGGATGAATTCCACAGATTAGCCAATGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGAT
TGAGGATTATGGTGATAATGTCCAGATTGATGGTTTCGACATTGATTATGGGAATGAAGT
TTTTACACTTAAGCTTGGATCGTTAGGCACGTATGTACTCAATAAGCAAACTCCTAACCG
ACAAATCTGGATGTCTTCACCTGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGGACCGTGATGC
TAATGCGTGGATTTACCGGAGGACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGGAAGAGGAGTT
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AGGAACTTATGCCCTTCATTGGTATATCTCTATGAAACACCGAGAGGAATAAACAAACTA
GGCACAGCTGTTTCAATGTGAAAGCGATGTTTGTGATTATACTTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4BG82TF 705 0 0
GGATTGCTGCAACAGAACCGCCATGTCTTCTTCTACAGCCTCAAGGTTTCTCCGGAAACT
ACCTCAAACCCTTGTTCGTATCTATCCCACTAGGGTTCTAAGCTCTTCGATTCATAAAAC
CACCGAGCCATCGCGTTCCTTACGGCGAATAGGATCCAGTCTTCTCCGACACGATTCCAT
CACTACAAGAAGCTTCTCCTCTCAAGAAGGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCT
GCAGGAGGATGAATTCCACAGATTAGCCAATGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGAT
TGAGGATTATGGTGATAATGTCCAGATTGATGGTTTCGACATTGATTATGGGAATGAAGT
TTTTACACTTAAGCTTGGATCGTTAGGCACGTATGTACTCAATAAGCAAACTCCTAACCG
ACAAATCTGGATGTCTTCACCTGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGGACCGTGATGC
TAATGCGTGGATTTACCGGAGGACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGGAAGAGGAGTT
GGAGAGTCTATGTGGCGAACCTATTCAACTCTCATGAGAACAATATTTGTGAGTTTATCT
AGGAACTTATGCCCTTCATTGGTATATCTCTATGAAACACCGAGAGGAATAAACAAACTA
GGCACAGCTGTTTCAATGTGAAAGCGATGTTTGTGATTATACTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4812Contig1 825 2 2 U
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GTTTTTTTCTTAGTTCTCTCAATAATAAGATCACAAACCACAAAAATTCATAGTTATCTC
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TCTATCTCTGAGCTCGATTCTTTGCGCTCACTACGGCATAGAAACGCCAACACCTCAACA
ATTATGTGCGACCACCGCTGGAAGATGAGCTGAGGACAAGATCTGTTTGGAACCATAAGA
AACGAAGTTTTGGTTTGAAAACTATTTCATAATTGCTTGTTCTGTGACAGTAAAGAGGAG
ATGTGGAGGAGCAAGAGGAAGAAGAAGACAAGTTGCGTTTGAATTTGTGATGACGGCACC
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TTCATGAAGCTAATGATTTTGACGGGTTTGATCTGCTACTAGTCTAGAGCTGGGTCATGC
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TTGGTTATTCTCTCTTTCATCCAAGATTCTTAAAATGTGCAAAATGTTTTTTTGATTTAG
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BQ
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AF RR4G376TF U 1
AF RR4G376JQ C 191
BS 1 637 RR4G376TF
BS 638 825 RR4G376JQ

RD RR4G376TF 637 0 0
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ATGTGGAGGAGCAAGAGGAAGAAGAAGACAAGTTGCGTTTGAATTTGTGATGACGGCACC
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QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4G376JQ 635 0 0
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GTGTCAACAATTTTTTTCTGTTCATAACGTTTTCATCTACAAATGTGTTCACAAATATGT
AATGCACTCAAGTTTTGTTTGTGGATGTTATTTGG

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL4813Contig1 876 2 2 U
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AACATCGCTCTAAACCATCATCCTCTGCAAATGCAGTCTCTGATTCCACCGTTGGAAACT
CTTCAGATCCTGTGTCATTCTCATCTCCTTCAAACTCAAGTCCTGTCCTGGTCGAGACGG
TAAAGGAACCACCTCTCGAAACAAAGACACAACAGAAACTCAAGAAACCGAAAGCTACTT
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CCGGAAGAACGTCCCCGCCACAACCGACGAAGAAGGAAACGGCAGCAGAGAGTTTCGCCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ50TF U 1
AF RR4GQ50JQ C 236
BS 1 674 RR4GQ50TF
BS 675 876 RR4GQ50JQ

RD RR4GQ50TF 676 0 0
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ACAAGTTCAGATTCTCAGACATTATGCCTCCCTCATGGCTCTATAAGCTCAAAGGCATCA
TCAGAAAACACACTCCTGCTTCTCCCAGACGCCTCTCATCTTCCTCCTCCACCACTGATG
ATGCTTCTTCCTCAAGAAACACTCTCCGTCTTTCTTCATCTCCTTATCACCCTCATGTAC
CTCTCACCACCACTTCTCGGAATCATCGCTCTCCAAATGCAATCATTCTTGAGCCTTCTC
GGAACCATCGCTCAAAGCCATTCTCTGCAAATGCAATCACTGTAGAGCCTTCTTCTCGGA
AACATCGCTCTAAACCATCATCCTCTGCAAATGCAGTCTCTGATTCCACCGTTGGAAACT
CTTCAGATCCTGTGTCATTCTCATCTCCTTCAAACTCAAGTCCTGTCCTGGTCGAGACGG
TAAAGGAACCACCTCTCGAAACAAAGACACAACAGAAACTCAAGAAACCGAAAGCTACTT
CTCCAGGGATAAGGATCCGGGCGCATTCACCAAGAATCGCCAGAAAGAAGACAAAGGCCG
CCGGAAGAACGTCCCCGCCACAACCGACGAAGAAGGAAACGGCAGCAGAGAGTTTCGCCA
TAGTGTTGACTTCG
CG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GQ50JQ 641 0 0
TGTACCTCTCACCACCACTTCTCGGAATCATCGCTCTCCAAATGCAATCATTCTTGAGCC
TTCTCGGAACCATCGCTCAAAGCCATTCTCTGCAAATGCAATCACTGTAGAGCCTTCTTC
TCGGAAACATCGCTCTAAACCATCATCCTCTGCAAATGCAGTCTCTGATTCCACCGTTGG
AAACTCTTCAGATCCTGTGTCATTCTCATCTCCTTCAAACTCAAGTCCTGTCCTGGTCGA
GACGGTAAAGGAACCACCTCTCGAAACAAAGACACAACAGAAACTCAAGAAACCGAAAGC
TACTTCTCCAGGGATAAGGATCCGGGCGCATTCACCAAGAATCGCCAGAAAGAAGACAAA
GGCCGCCGGAAGAACGTCCCCGCCACAACCGACGAAGAAGGAAACGGCAGCAGAGAGTTT
CGCCATAGTGTTGACTTCGGCGGATCCAGAGAGAGACTTCAGAGAATCCATGGTCGAGAC
GATCGTCGAGAACAAGATCAAGGAACAGAAAGACCTTGAAGATCTTCTCGCATGTTACCT
TTCTCTCAACTCTAGTGAGTATCACGACACAATCATCAAGGCCTTTGAGAAAACATGGTT
TCATTTAACTCACTCTATGTAATATAACCAAAAGGCAAAAA

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL4814Contig1 821 2 4 U
GGGGAGGATAAACAATGGGTGTTCGTCTTCGACTCCCTCAGAAAACCTCACCACGATCAC
CTTCTTATCTCCTTCTATGCCTTCTTGCTCTCTCCTTCTTCTCCTTCACCGCTCTTCTTC
TCTATAAGGTGGACGACTTTATTGCTCAGACAAAAACTCTCGCCGGACATAACTTGGAAC
CCACTCCTTGGCACATTTTCCCGCGCAAATCATTCAGCGAAGCCTCGAGACGCTCTCAGG
CTTACCGGATCCTCCAATGCTCCTACTTCTCCTGTCCCTACAGACCTGTTATCGAACAAA
AGAGTCTCCTGTCGGATTCCTTGTCGGGTCGGCAAACCCAGCAAACCCAATGCCCAGACG
TTTTCAGATGGATTCAACGGGACTTAGAGCCATGGGGAGAGACAGGGGTGACTAGAGAGC
ACGTGGAGAAGGCGAAAGAGAATGCTGCCTTTAGAGTGGTGATACTCTCAGGAAAGCTCT
ACGTTGATCTCTACTATGCTTGTGTGCAGAGCAGAATGATGTTCACTGTTTGGGGGTTTC
TGCAGCTTCTCAACAAGTATCCTGGGATGGTTCCTGATGTTGACATGATGTTTGATTGCA
TGGATAAACCCATCATCAACAGGACTGAGCCTCAGTCTTTCCCAGCTCCGCTTTTTCGGT
ATTGCACCAATGAAGCTCATTTGGACATTCCTTTTCCTGATTGGTCCTTTTGGGGGTGGT
CGGAGACGAATCTAAGGCCGTGGGATGAAGAGTTTGGGGATATAAAGCAAGGGTCTAAGA
GAAGTAGCTGGGGCAGCAAGCAACCTAGAGCTTACTGGAAA


BQ
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AF RR4AO77TF U 1
AF RR4B505TF U 5
BS 1 454 RR4AO77TF
BS 455 455 RR4B505TF
BS 456 718 RR4AO77TF
BS 719 821 RR4B505TF

RD RR4AO77TF 718 0 0
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TCTATAAGGTGGACGACTTTATTGCTCAGACAAAAACTCTCGCCGGACATAACTTGGAAC
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CTTACCGGATCCTCCAATGCTCCTACTTCTCCTGTCCCTACAGACCTGTTATCGAACAAA
AGAGTCTCCTGTCGGATTCCTTGTCGGGTCGGCAAACCCAGCAAACCCAATGCCCAGACG
TTTTCAGATGGATTCAACGGGACTTAGAGCCATGGGGAGAGACAGGGGTGACTAGAGAGC
ACGTGGAGAAGGCGAAAGAGAATGCTGCCTTTAGGGTGGTGATACTCTCAGGAAAGCTCT
ACGTTGATCTCTACTATGCTTGTGTGCAGAGCAGAATGATGTTCACTGTTTGGGGGTTTC
TGCAGCTTCTCAACAAGTATCCTGGGATGGTTCCTGATGTTGACATGATGTTTGATTGCA
TGGATAAACCCATCATCAACAGGACTGAGCCTCAGTCTTTCCCAGCTCCGCTTTTTCGGT
ATTGCACCAATGAAGCTCATTTGGACATTCCTTTTCCTGATTGGTCCTTTTGGGGGTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4B505TF 817 0 0
G
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TATCTCCTTCTATGCCTTCTTGCTCTCTCCTTCTTCTCCTTCACCGCTCTTCTTCTCTAT
AAGGTGGACGACTTTATTGCTCAGACAAAAACTCTCGCCGGACATAACTTGGAACCCACT
CCTTGGCACATTTTCCCGCGCAAATCATTCAGCGAAGCCTCGAGACGCTCTCAGGCTTAC
CGGATCCTCCAATGCTCCTACTTCTCCTGTCCCTACAGACCTGTTATCGAACAAAAGAGT
CTCCTGTCGGATTCCTTGTCGGGTCGGCAAACCCAGCAAACCCAATGCCCAGACGTTTTC
AGATGGATTCAACGGGACTTAGAGCCATGGGGAGAGACAGGGGTGACTAGAGAGCACGTG
GAGAAGGCGAAAGAGAATGCTGCCTTTAGAGTGGTGATACTCTCAGGAAAGCTCTACGTT
GATCTCTACTATGCTTGTGTGCAGAGCAGAATGATGTTCACTGTTTGGGGGTTTCTGCAG
CTTCTCAACAAGTATCCTGGGATGGTTCCTGATGTTGACGTGATGTTTGATTGCATGGAT
AAACCCATCATCAACAGGACTGAGCCTCAGTCTTTCCCAGCTCCGCTTTTTCGGTATTGC
ACCAATGAAGCTCATTTGGACATTCCTTTTCCTGATTGGTCCTTTTGGGGGTGGTCGGAG
ACGAATCTAAGGCCGTGGGATGAAGAGTTTGGGGATATAAAGCAAGGGTCTAAGAGAAGT
AGCTGGGGCAGCAAGCAACCTAGAGCTTACTGGAAA

QA 2 817 2 817
DS 



AS 1 2

CO CL4815Contig1 1508 2 2 U
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TGTGACTGATGAAGTCATTGACAGCAACGGAGGGAAGGAAATAGCAGTTAAGTTTGTGAT
AAGTGACATTGTTGGTAGACTTTCTGGAAACCAACCTCTTAAAGAGTCACTTAGATCACC
TGCCAATCTTGAATCTGTGGAGAAGTCTTCGTTTTATCTTCGGTTAGAGAAGGATTTAAA
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AAGCAGACGCAGGATTGATAACATTATGGTTGATCTGGCCAAATCCATTGAGAAAGACAA
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AATTCATCTAAAACGCAAATTTGGGCAGTGGAAAGGTGGGAAGGAGTCTAAGAGTCAAAG
GATATTGAATTTTATGAATATGTCGAAGCTGTGAAATTAACTGGAGATCCTTATGTGCCT
GCTGGGAAGGTAGCATTTCGCGCAAAGATTGGGAGACGTTATGAGCTTCCACACAGAGGT
CTCATCCCTGAAGAATTTGGAGTGATTGCTAGATACAAAGGACAAGGTAGGCTTGCTGAT
CCTGGATTTCGTAATCCAAGATGGGTAGACGGCGAGCTTGTTATCCTGGATGGCAAGTAT
GTCAAAGGAGTACCTGTTGTTGGATTTGTCTATTGGGCACCTGAATATCACTTTGTGATG
TTCTTCAACCGTCTGAGGCTTCAAGCTTAGTGTTTTTTTTTGGCCTTCTCGCTCTACAAT
CGAGGAAGAGTTTTCTTCTGACTGTTGCCATTGCAAGTGTACTGGTTGGAACCGTTTTCA
CTATTTGCAGATTCATCGGATTGGTTATACCAAAAATAAGATTAACTTCAAGTTCAGGGG
TCACTCTCTTTGTATTTCTGGACCAGTAATGAGCTCGTTGATGGTGGCTCTATTGTTGTG
GAGCTTGGCTTAAGGCACCTATATTGCGGCTAGAATTAAACACGGCAGAGTTGATGATTA
TGCAAGTGAGTTAGTCGGATTGTTAGAAAAGAAACTGAATTGTAAAGTTAGAGAAGAAGT
CTAATAGATGTCTGTAAATTAATGTATGTTTCTCAAAGATTGCTATTTGATTGTACACAC
ATATGGTAAGAGTTGTTTCTAATGTATATTTTCAGTTTATATAATCACAGGAATCTGTGC
CTTGTTAC


BQ
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AF RR4AY70TF U 1
AF RR4AY70JQ C 689
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BS 803 1508 RR4AY70JQ

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DS 

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AGTGTTTTTTTTTGGCCTTCTCGCTCTACAATCGAGGAAGAGTTTTCTTCTGACTGTTGC
CATTGCAAGTGTACTGGTTGGAACCGTTTTCACTATTTGCAGATTCATCGGATTGGTTAT
ACCAAAAATAAGATTAACTTCAAGTTCAGGGGTCACTCTCTTTGTATTTCTGGACCAGTA
ATGAGCTCGTTGATGGTGGCTCTATTGTTGTGGAGCTTGGCTTAAGGCACCTATATTGCG
GCTAGAATTAAACACGGCAGAGTTGATGATTATGCAAGTGAGTTAGTCGGATTGTTAGAA
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TTTTCAGTTTATATAATCACAGGAATCTGTGCCTTGTTAC

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL4816Contig1 1145 2 4 U
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AAAAATAACCATGGAAGAAAATCAACAAGAAGCTTCATCAATGCCACTAGTTCCTATAGA
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TCATCAAACCTACGAAGATTCTTCTTCTTCCTTCATAGAGATGGACCCAAGATTGCCTCC
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CGTCATGCCTTATCTATCAAAAGCCACGTCAGTAGCTACGGAAGAAGAATATGAGCCGTT
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AAGATTAAGGAGATGTAGAACCGCTGGATCATCCGGAGGGATCGGTACCGACTCTAGGAT
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ACACGTTACACATGGAGTGGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGCAACTTGTGTTGTGTCTTTTG
TTGTTTCTCTCTCTTGAATTAAAAATACTGATGTGATGATTCCATGTGAATGTCTCATCT
GATGTGAATCAAGAATTTATCTTCTTTTTTACATGAGTAGGCACATATATAGGGCAGCTA
GCAGAATCAAGAAAATGTTTTCAGATTTTCTTGGCTGTTATAGTTTCTTTTCTATAATTC
AATCCTATATGTATCTTATATGTGCCTACCCATGTTTTACTTTCTGGTCCAATTTTGTTT
TGAAT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4A501TF U 1
AF RR4A501JQ C 310
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AAGATTAAGGAGATGTAGAACCGCTGGATCATCCGGAGGGATCGGTACCGACTCTAGGAT
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AATAAGTGTTGCAGATGATTACTATTGGAGAAGATCTTGTGACTCAGAGAGCTCCATTTA
CGAAGCCGTTCTTCATTGCAAGAAATCTTTCGAAAA*TGAGACTTA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4A501JQ 836 0 0
CGATGAAGATAACTCTTTAGTTCACGC*GACGAGCTTTTCCGTGACGGCTACGTCATGCC
TTATCTATCAAAAGCCACGTCAGTAGCTACGGAAGAAGAATATGAGCCGTTGGATACGAA
AACGGAGAAAAAGATGGAGACACGTGACATTAAGAGCAAGTCCCCTTCTTCTTGTAGAAA
GTTGAGAAGAGTTTCGAAATGGGTTTTGTTGTTTTTGACGCCATTGTGTAAAAGATTAAG
GAGATGTAGAACCGCTGGATCATCCGGAGGGATCGGTACCGACTCTAGGATCCGTCTAAC
GACGTTGTCTAGAAGCAGAGTTTATTCAGATGAAATGACTTCGTCGCCAAGAATAAGTGT
TGCAGATGATTACTATTGGAGAAGATCTTGTGACTCAGAGAGCTCCATTTACGAAGCCGT
TCTTCATTGCAAGAAATCTTTCGAAAAATGAGACTTAAGAATCCATGGAAAAGGAACAGG
TAGAGTAGAGATGGAGAATATTAAGCTTAAGAAGAATAAGCAAATTGCATTACACGTTAC
ACATGGAGTGGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGCAACTTGTGTTGTGTCTTTTGTTGTTTCTC
TCTCTTGAATTAAAAATACTGATGTGATGATTCCATGTGAATGTCTCATCTGATGTGAAT
CAAGAATTTATCTTCTTTTTTACATGAGTAGGCACATATATAGGGCAGCTAGCAGAATCA
AGAAAATGTTTTCAGATTTTCTTGGCTGTTATAGTTTCTTTTCTATAATTCAATCCTATA
TGTATCTTATATGTGCCTACCCATGTTTTACTTTCTGGTCCAATTTTGTTTTGAAT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL4817Contig1 577 2 2 U
TGGCGGCATCTGTTGTGACTCTATCTTCTCCCCCACCAGTTTCTCTGCCTCTCTCCTCAT
CTCGCTCTTCCTTATTCCCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGT
CTCTGGTGGCGAGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTCACTTGTAATGCCCTGTTTGGTC
TCGGTGTCCCTGAGCTTGCTGTGATTGCCGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGA
AGCTTCCTGAGATCGGAAAAAGTATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGTAATGAT
GCAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGA
CTCATCTCCCGTGTCAATGAGCAACAAGGCAGAGGACAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTC
AAAGGACAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTTTGCTTTGTGAAATGAGT
TTTAGATCCAATACTCTTGTTGAAGGAAGCAGAGTAGTCTTTCCTGTAAGAATTGGCTCC
ATAGTGTTTTGAATCTCTATCAAGCTCCTCTTCTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN26TF U 1
AF RR4DN26JQ C 127
BS 1 558 RR4DN26TF
BS 559 577 RR4DN26JQ

RD RR4DN26TF 558 0 0
TGGCGGCATCTGTTGTGACTCTATCTTCTCCCCCACCAGTTTCTCTGCCTCTCTCCTCAT
CTCGCTCTTCCTTATTCCCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGT
CTCTGGTGGCGAGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTCACTTGTAATGCCCTGTTTGGTC
TCGGTGTCCCTGAGCTTGCTGTGATTGCCGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGA
AGCTTCCTGAGATCGGAAAAAGTATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGTAATGAT
GCAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGA
CTCATCTCCCGTGTCAATGAGCAACAAGGCAGAGGACAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTC
AAAGGACAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTTTGCTTTGTGAAATGAGT
TTTAGATCCAATACTCTTGTTGAAGGAAGCAGAGTAGTCTTTCCTGTAAGAATTGGCTCC
ATAGTGTTTTGAATCTCT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4DN26JQ 451 0 0
TGGCGAGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTCACTTGTAATGCCCTGTTTGGTCTCGGTG
TCCCTGAGCTTGCTGTGATTGCCGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGAAGCTTC
CTGAGATCGGAAAAAGTATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGTAATGATGCAGGC
TGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGACTCATC
TCCCGTGTCAATGAGCAACAAGGCAGAGGACAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCAAAGGA
CAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTTTGCTTTGTGAAATGAGTTTTAGA
TCCAATACTCTTGTTGAAGGAAGCAGAGTAGTCTTTCCTGTAAGAATTGGCTCCATAGTG
TTTTGAATCTCTATCAAGCTCCTCTTCTCAA

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL4818Contig1 1032 2 4 U
GGAACGCCGGAGAGAGTCAATACGGCGGCGCGTGTAGGATTTCGAAAAAATGGGAGAGGA
GGAAGCAAGCAAAGGAGAAGATACGGTGGAGGAGATACGACGTATGAGTGGCTACGGCGG
AGATGTGATAGCCGTCGGTGGGTTTCCGACTTCAGACTCGGAATCTGACTCAGATTTGGC
GGCGGCGGAGATAATGATCGTATGGGCAATCCAAGGGCCAACATCGTTTGCTCCAAACAC
CTTAGTTTCACAGTCTTCTCTTGAGCTGCGTCTCTACGCTTGTGGTCACTCACTCTCTAT
TCTCCAGTCTCCGTGTTCACTGAACACGCCTGGAGTAACGGGGTCAGTGATGTGGGACAG
TGGAGTGGTGCTAGGGAAGTTCTTGGAGCACTCTGTTGATTCCAAGCTTCTTTCTCTTGA
AGGCAAGAAGATCGTCGAGCTGGGTTCTGGTTGTGGCTTAGTTGGTTGTGTCGCAGCACT
TCTGGGAGGGATTGTGGTCCTCACTGATCTCCCGGATAGACTGAGGCTACTTAAGAAGAA
CGTCGATACCGATTTGCATCGTGGGAACACAAGGGGATCTGCTGTTGTGCAGGAACTTGT
TTGGGGAGATGACCCTGATCCAGATTTGATTGAACCGTTCCCTGATTACGTATTGGGCTC
AGATGTTATCTACAGCGAAGAAGCTGCTCACCATTTGATCCAAACGCTTGTGCAACTCTG
CGGCGATCAAACTACAATCTTCCTATCAGGAGAACTACGTAACGATGCTGTTCTTGAGTA
CTTCTTAGAATCTGCGCTGAAACATTTTGCGCTAGGGCGTGTGGAACAAACACAGTGGCA
TCCGGATTATCGCAGCCGTAGAGTAGTGCTTTACGTTCTTGAGAAGAAGTCGAAGAGATG
CCTCGCAGATGTTTCTTCGCTTAATCAATCTTGTTAGCCCATTGAGGTTTGTTTTGTTTT
GTTTACACTACAGTGTATGATGACGTACCACTTAACGTGTTGAGATATTATAAACGATAT
GGCTGTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW04TF U 1
AF RR4FW04JQ C 268
BS 1 714 RR4FW04TF
BS 715 715 RR4FW04JQ
BS 716 725 RR4FW04TF
BS 726 1032 RR4FW04JQ

RD RR4FW04TF 725 0 0
GGAACGCCGGAGAGAGTCAATACGGCGGCGCGTGTAGGATTTCGAAAAAATGGGAGAGGA
GGAAGCAAGCAAAGGAGAAGATACGGTGGAGGAGATACGACGTATGAGTGGCTACGGCGG
AGATGTGATAGCCGTCGGTGGGTTTCCGACTTCAGACTCGGAATCTGACTCAGATTTGGC
GGCGGCGGAGATAATGATCGTATGGGCAATCCAAGGGCCAACATCGTTTGCTCCAAACAC
CTTAGTTTCACAGTCTTCTCTTGAGCTGCGTCTCTACGCTTGTGGTCACTCACTCTCTAT
TCTCCAGTCTCCGTGTTCACTGAACACGCCTGGAGTAACGGGGTCAGTGATGTGGGACAG
TGGAGTGGTGCTAGGGAAGTTCTTGGAGCACTCTGTTGATTCCAAGCTTCTTTCTCTTGA
AGGCAAGAAGATCGTCGAGCTGGGTTCTGGTTGTGGCTTAGTTGGTTGTGTCGCAGCACT
TCTGGGAGGGATTGTGGTCCTCACTGATCTCCCGGATAGACTGAGGCTACTTAAGAAGAA
CGTCGATACCGATTTGCATCGTGGGAACACAAGGGGATCTGCTGTTGTGCAGGAACTTGT
TTGGGGAGATGACCCTGATCCAGATTTGATTGAACCGTTCCCTGATTACGTATTGGGCTC
AGATGTTATCTACAGCGAAGAAGCTGCTCACCATTTGATCCAAACGCTTGTGCA*CTCTG
CGGCG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FW04JQ 765 0 0
GCGTCTCTACGCTTGTGGTCACTCACTCTCTATTCTCCAGTCTCCGTGTTCACTGAACAC
GCCTGGAGTAACGGGGTCAGTGATGTGGGACAGTGGAGTGGTGCTAGGGAAGTTCTTGGA
GCACTCTGTTGATTCCAAGCTTCTTTCTCTTGAAGGCAAGAAGATCGTCGAGCTGGGTTC
TGGTTGTGGCTTAGTTGGTTGTGTCGCAGCACTTCTGGGAGGGATTGTGGTCCTCACTGA
TCTCCCGGATAGACTGAGGCTACTTAAGAAGAACGTCGATACCGATTTGCATCGTGGGAA
CACAAGGGGATCTGCTGTTGTGCAGGAACTTGTTTGGGGAGATGACCCTGATCCAGATTT
GATTGAACCGTTCCCTGATTACGTATTGGGCTCAGATGTTATCTACAGCGAAGAAGCTGC
TCACCATTTGATCCAAACGCTTGTGCAACTCTGCGGCGATCAAACTACAATCTTCCTATC
AGGAGAACTACGTAACGATGCTGTTCTTGAGTACTTCTTAGAATCTGCGCTGAAACATTT
TGCGCTAGGGCGTGTGGAACAAACACAGTGGCATCCGGATTATCGCAGCCGTAGAGTAGT
GCTTTACGTTCTTGAGAAGAAGTCGAAGAGATGCCTCGCAGATGTTTCTTCGCTTAATCA
ATCTTGTTAGCCCATTGAGGTTTGTTTTGTTTTGTTTACACTACAGTGTATGATGACGTA
CCACTTAACGTGTTGAGATATTATAAACGATATGGCTGTTTACTT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4820Contig1 885 2 6 U
GCAGGCTGTAGAACAGTTTCTTCAGATACTGAAACAAAACTATGAGAAGACAAACGCTGG
AGAGACAGGAGTCACCGGAGGAGCCTCAGCTATACCTGAAACTGCTGGTCTGATCGGATG
GGCTATGAGTTCTTTGACTCTCAAGGGTAAGCCATTGGATCAACCGTCTCTTGCTTCTTC
TTCTTCAGCACCATCCCTAGCTTCTGCAGGCTCAAATGCTACAACCACAGCAACGGAGGC
TCCGAGTGTCAAAGCCAGTCATCATGCACGTTCCAACTCGGACTTCACAGATCAACCAGC
ACCACCATCTCCAACATCAACAGATGGTTGAGGAGATATTGAAAATGACATTAACGAAGG
TCATGAGAGCGACAAAGACGGTTGGGATCTTGATCCGATTGATGAACCAAAACCTGCTCC
AGCTCTCTCAAACATTCAAGCAGCTCAAAAACGACCTGTGTCTCAGCCTTCTAGACCTCC
AGCTACAAGCTCAAGACCAAAGATTAGCACGGCAAAAGCAGCTGCGAAATTGGAAGACGA
TGACATGTGGGGATCCTTAGCTGCTCCTCCACCTGCAACTACTTCAAGACCGTTGAACTT
GAAGAAGACAGTACAGTCTGATGATGAAGACCCTTGGGCTACCATTGCTGCTCCACCACC
AACCACCAGGGCAAAACCTTTGTCTCTTGGTCGTGGCCGAGCAGCCAAACCTGCAGCTCC
TAAACTTGGTGCCCAACGCATTAACCGAACCTCATTTGGAATGTGATGAACACTAGAGAA
AGAAGATACAATGTACATTTTTTTGAGAGCATCTCCAGATGACTCTAGCAACCAACAAAT
TATTTGTGATATCATTCATTTTAATCCCCAAAGAATGTCTCTATT


BQ
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AF RR4H763TF U 1
AF RR4H763JQB C 249
BS 1 675 RR4H763TF
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BS 713 885 RR4H763JQB

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TCCGAGTGTCAAAGCCAGTCATCATGCACGTTCCAACTCGGACTTCACAGATCAACCAGC
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TCATGAGAGCGACAAAGACGGTTGGGATCTTGATCCGATTGATGAACCAAAACCTGCTCC
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AACCACCAGGGCAAA*CCTTTGTCTCT*GGTCGTGGCCGAGCAGCCAAACCT

QA 1 712 1 712
DS 

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GGGGATCCTTAGCTGCTCCTCCACCTGCAACTACTTCAAGACCGTTGAACTTGAAGAAGA
CAGTACAGTTTGATGATGAAGACCCTTGGGCTACCATTGCTGCTCCACCACCAACCACCA
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CAATGTACATTTTTTTGAGAGCATCTCCAGATGACTCTAGCAACCAACAAATTATTTGTG
ATATCATTCATTTTAATCCCCAAAGAATGTCTCTATT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CK84TF U 1
AF RR4CK84JQ C 1
BS 1 372 RR4CK84TF
BS 373 751 RR4CK84JQ

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GATGGTGGAGAT

QA 1 372 1 372
DS 

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TTTCAATGGGTTTCATTTGATTCATCCACAAAGTCCGAGGCTTTCATCAATATCTCCAGT
CTCTGTGTCGCTCCCTTCGATTCAACATCGAACCCAGTTCCAAAGTTTGGTTCTTTGCAA
GGAGGAGGAGGAAGAAAAGAGCCGGGCAGGGAATAAGCCCGAGATTTCTGTTCAAGTCTC
TGTCTTTACTGTTTGCTAAACTTGGGATTCTACCGCAGCCGTTGGATCTCATCATTGCTG
ATTTAGGCGGGGGCGTTGATGGAGGAGGTGGTCGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGGAGAG
GATGGTGGAGATTTGTTTCACCCAGAAGGAAACGGAACAGAGTACCAACTTTGATTCTCG
TTTGTGTAATGCTGTGGATTTGTGGTTACTGCAAAGTCTCTGGGAAGGTGATAAAGAGTG
ATGAGGTTCTGAAGGTTTTAGGAGCTTGCTTGCTTGGTATCAGTTTTTTGAAAGAGCTGA
AGAGAGAGGCTACATCTTTGTTCTTTGTGTTTCTCTGTTTTGGTGTGGTTTTTGGATTCA
AGAAAGAGAGTTTTGTTAAGTTAGCTTCTCAAGTCAGGTCTTGTTCTTCTTCTTCGGTTC
TTCTTAGTAAGAGGAGATCTCGTAGAAGAGTCTAAACAAGTGTTGTGTTTGTTTCTAATA
TATTCAACCTCGAGGATTTTTGTTGTTTTCG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL4822Contig1 969 2 6 U
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AAGGTAGAGAGAGAGTTTGCGGAGGAGCTTCTTCGTAGGGTTCATCGTTATTAACGTTAA
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ATCCCTCGCTCATCCTCCTACCTCATCTGGGACATCATCATAGCCTCCTGCTTCTACTAC
GTCGCCACCACTTACTTCCCTCTCCTCCCTCACCCTCTCTTCTACTTCGCCTGGCCTCTC
TACTGGGCCTGCCAAGGCTGCGTCCTAACCGGCGTCTGGGTCATAGCTCACTGCGGCCAC
CACGCCTTCAGCGACTACCAGTGGCTTGACGACACCGTCGGTCTCATCTTCCACTCCTTC
CTCCTCGTCCCTTACTTCTCCTGGAAGTACAGTCACCGACGCCACCATTCCAACACCGGC
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GACGCAGGGACTGGCCTCGATGGTCTTCCTCTACGGAGTCCCTCTTTCTGATAGTCAACG
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CTCCCTCGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS14TF U 1
AF RR4CU82TF U 639
BS 1 657 RR4AS14TF
BS 658 658 RR4CU82TF
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BS 686 750 RR4AS14TF
BS 751 969 RR4CU82TF

RD RR4AS14TF 754 0 0
GGGACCAGAAACCAGAGAGAGGGTTTCATTACCAAAGAGAGAGATAGAAAGGAGAGAGAG
AAGGTAGAGAGAGAGTTTGCGGAGGAGCTTCTTCGTAGGGTTCATCGTTATTAACGTTAA
ATCTCTATCCCCCCTACGTTAGCTGAAGAAAACAATATGGGTGCAGGTGGAAGAGTGCAG
GTATCTCCTTCTCCAAAGAAGTCAGAAACCGATACCCTCAAACGCGTACCCTGCGAGACA
CCTCCCTTCACAGTAGGACAGCTCAAGAAAGCGATCCCACCGCACTGTTTCAAACGCTCC
ATCCCTCGCTCATCCTCCTACCTCATCTGGGACATCATCATAGCCTCCTGCTTCTACTAC
GTCGCCACCACTTACTTCCCTCTCCTCCCTCACCCTCTCTTCTACTTCGCCTGGCCTCTC
TACTGGGCCTGCCAAGGCTGCGTCCTAACCGGCGTCTGGGTCATAGCTCACTGCGGCCAC
CACGCCTTCAGCGACTACCAGTGGCTTGACGACACCGTCGGTCTCATCTTCCACTCCTTC
CTCCTCGTCCCTTACTTCTCCTGGAAGTACAGTCACCGACGCCACCATTCCAACACCGGC
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AAGTACCTCAACAACCCTCTAGGATGCACCGTCATGCTTACCGTCCAGTTCACCCTCGGC
TGGCCCTTGTACTTGGCCTTCAACGTCTCC
CGCA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4CU82TF 331 0 0
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TACCGTCCAGTTCACCCTCGGCTGGCCCTTGTACTTGGCCTTCAACGTCTCCGGCAGGCC
TTACGACGGAGGCTTCGCTTGCCATTTCCACCCCAACGCTCCCATCTACAACGACCGCGA
ACGCCTCCAGATATACGTCTCCGACGCAGGGACTGGCCTCGATGGTCTTCCTCTACGGAG
TCCCTCTTTCTGATAGTCAACGGGTTCTTAGTTTTGATCACTTACTTTGCAGCACACGCA
CCCTTTCGCTGCCTCACTACGACTCCCTCGG

QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 2

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CTTTGCTTCCCCTCAAATCTCACCAAATGCTACTCTTCGCCGTGCCTTCCTCCCTCGACC
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CCTTCCTCATCCACCGCCACCACCACCACCTTCTCCTCTTCCGCCACGTCATCATACGAA
TCCGAGAGTCACGACATTTCTCCTGAATTGTCCGCCGCTTTCGCTTCCCGTCGCTTCTTC
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ACCGTGAATACCACGAGGCTTCTAACCGGAGGTTCCGCCGTGAAACAACACGTATACTCA
CCGGATCCGTTAACTGACTTCCGACAATCAATGCAGGAGATGATTGATGCCGCCATTGTC
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TATTTAGCGTTGAATCCAACCGACATGCACAAGTTCATCATAAAGGCTTTCTCCGACACC
ATGGTCTCACTCTTGTCGGAAGAACGTCGGATGTGATGACGCAGCGGCCGCCTAGATTAA
AAAAAAATGATCGTGTAATAAACGACCCACGTGATTTTATTAATTAAGTCGATGGACCTA
ACATTTTTTTTACAT


BQ
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AF RR4H288TF U 1
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BS 1 736 RR4H288TF
BS 737 855 RR4H288JQ

RD RR4H288TF 736 0 0
CTTAACTCGTCTCTCTTTCACTCTAAAAAAATGCCAAAAATCATGTGGAAGAGTCTCCAT
CTTTGCTTCCCCTCAAATCTCACCAAATGCTACTCTTCGCCGTGCCTTCCTCCCTCGACC
GCCGCCGCCGCTGAGGATGACGATCCTAGCCGTCCCTCTATCGTTCTCATCAACAACTTC
AACCTACTCTACCACAATAATGACTACAAAAACCACAACCACCACCCCGCCGTTGACTTA
CCTTCCTCATCCACCGCCACCACCACCACCTTCTCCTCTTCCGCCACGTCATCATACGAA
TCCGAGAGTCACGACATTTCTCCTGAATTGTCCGCCGCTTTCGCTTCCCGTCGCTTCTTC
TTCTCTTCTCCTGGCCGATCAAATGCAATAACCGACTCACCGGAAACACGGTCAAGAGAA
CTCTCTGATAATAGCGACACTGCCGCTATCAACACAACAAAGAAAAAGAGCTACGACACT
ACCGTGAATACCACGAGGCTTCTAACCGGAGGTTCCGCCGTGAAACAACACGTATACTCA
CCGGATCCGTTAACTGACTTCCGACAATCAATGCAGGAGATGATTGATGCCGCCATTGTC
GCCGGCGATCTTAGCCATCCCGACGACGGTTATGATTACTTGAACGAGCTGCTTCTCAGT
TATTTAGCGTTGAATCCAACCGACATGCACAAGTTCATCATAAAGGCTTTCTCCGACACC
ATGGTCTCACTCTTGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4H288JQ 338 0 0
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AGATGATTGATGCCGCCATTGTCGCCGGCGATTTTAGCCATCCCGACGACGGTTATGATT
ACTTGAACGAGCTGCTTTTCAGTTATTTAGCGTTGAATCCAACCGACATGCACAAGTTCA
TCATAAGGGCTTTTTCCGACACCATGGTCTCACTCTTGTCGGAAGAACGTCGGATGTGAT
GACGCAGCGGCCGCCTAGATTAAAAAAAAATGATCGTGTAATAAACGACCCACGTGATTT
TATTAATTAAGTCGATGGACCTAACATTTTTTTTACAT

QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 2

CO CL4824Contig1 1029 2 2 U
GGGCCAGAAATCAGCATCACATTCCCCCGGAAAAAAAAAGAAAATAAAAATGTACTCGGC
GATTCGGTCGTCGCTTCCGCTAGATGGCAGCATGGTAGGAGACTATTCCGACGGAACTAA
CCTTCCCGTAGACGCCTGCTTGGTCCTAACTACTGACCCCAAACCCCGCCTTCGCTGGAC
TTCAGAGCTCCATGAGCGATTCGTCGACGCCGTCACCCAGCTCGGCGGTCCCGACAAAGC
AACGCCCAAAACGATAATGAGAACGATGGGGGTGAAGGGTCTCACTCTCTACCACCTCAA
ATCTCATCTTCAGAAATTCCGCCAGGGGAGGCAATCATGCAAAGAATCAACTGAAAACTC
TAAGGATGTTTCTTGTGTTGCGGAGAGTCAGGACACGGGTTCATCTTCAACGTCATCCTT
AAGATTGGCTGCCCAGGAACAGAACGAGAGTTACCAGGTTACTGAAGCTTTGCGTGCCCA
GATGGAAGTCCAAAGAAGACTACACGAGCAGCTAGAGGTGCAACGGCGACTACAGCTCAG
GATCGAGGCGCAGGGGAAGTATCTGCAATCGATTCTAGAGAAAGCTTGCAAGGCTATAGA
GGATCAAGCTGTTGCGTTCGCTGGGCTAGACGTAGCTAGAGAAGAGCTTTCAGAGCTAGC
CATAAAGGTCTCCGATGGGTGCCAAGGCCCATTCGACACCACCAAAATGACTGTTCCATC
CTTATCCGAACTTGCAGTAGCGATAGAGCACAAGAACAACTGTCCATCGCTGAGTTCAAG
CACTGTGGGAAGCCCTGTTTCAGCTTCGTTGATGAAGAAGAGGTATAGGGGTGTGCTTGG
AAACGGAGAAAGCCTTGTTATGGGTCATGAAGCTGGGTGGGTTATGCCTAGTAGTAGTAG
CCTTGGATGAAGGTAGAGAGGAGGCCAGATTTTAGATAATTTGCTTTGTTCTTGTAATTT
AAACTTGAAAAACTGTCGGCTAATGTATAAATTTGTTGAAGCTCTAGCGTCTCTTTTAGT
TTTGGTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H220TF U 1
AF RR4H220JQ C 236
BS 1 682 RR4H220TF
BS 683 1029 RR4H220JQ

RD RR4H220TF 682 0 0
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CCTTCCCGTAGACGCCTGCTTGGTCCTAACTACTGACCCCAAACCCCGCCTTCGCTGGAC
TTCAGAGCTCCATGAGCGATTCGTCGACGCCGTCACCCAGCTCGGCGGTCCCGACAAAGC
AACGCCCAAAACGATAATGAGAACGATGGGGGTGAAGGGTCTCACTCTCTACCACCTCAA
ATCTCATCTTCAGAAATTCCGCCAGGGGAGGCAATCATGCAAAGAATCAACTGAAAACTC
TAAGGATGTTTCTTGTGTTGCGGAGAGTCAGGACACGGGTTCATCTTCAACGTCATCCTT
AAGATTGGCTGCCCAGGAACAGAACGAGAGTTACCAGGTTACTGAAGCTTTGCGTGCCCA
GATGGAAGTCCAAAGAAGACTACACGAGCAGCTAGAGGTGCAACGGCGACTACAGCTCAG
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CATAAAGGTCTCCGATGGGTGC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4H220JQ 794 0 0
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AACTCTAAGGATGTTTCTTGTGTTGCGGAGAGTCAGGACACGGGTTCATCTTCAACGTCA
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GCCCAGATGGAAGTCCAAAGAAGACTACACGAGCAGCTAGAGGTGCAACGGCGACTACAG
CTCAGGATCGAGGCGCAGGGGAAGTATCTGCAATCGATTCTAGAGAAAGCTTGCAAGGCT
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CTAGCCATAAAGGTCTCCGATGGGTGCCAAGGCCCATTCGACACCACCAAAATGACTGTT
CCATCCTTATCCGAACTTGCAGTAGCGATAGAGCACAAGAACAACTGTCCATCGCTGAGT
TCAAGCACTGTGGGAAGCCCTGTTTCAGCTTCGTTGATGAAGAAGAGGTATAGGGGTGTG
CTTGGAAACGGAGAAAGCCTTGTTATGGGTCATGAAGCTGGGTGGGTTATGCCTAGTAGT
AGTAGCCTTGGATGAAGGTAGAGAGGAGGCCAGATTTTAGATAATTTGCTTTGTTCTTGT
AATTTAAACTTGAAAAACTGTCGGCTAATGTATAAATTTGTTGAAGCTCTAGCGTCTCTT
TTAGTTTTGGTGCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL4825Contig1 975 2 2 U
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AAGGTGCAAGTGGGAGTTGTTGAGTCTAGACTTGCAAGTAAGCATGTGTATAGTAGTTAG
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AGAAAAGAGTTGGAG


BQ
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AF RR4BP22TF U 1
AF RR4BP22JQ C 282
BS 1 724 RR4BP22TF
BS 725 975 RR4BP22JQ

RD RR4BP22TF 724 0 0
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TGATTAAACTTACAAAGTGAAGAAGAAGAAGTGGAAGCAAGGAAGCTTGCCACAGAAGAA
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GTTGGCAACATGAAGTCAAAGTAAGTTGGGTTGTGTAATAAGAAATTACACAACAACAAG
AAGA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BP22JQ 694 0 0
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GCATGTGTATAGTAGTTAGAGTAAAACTACTATATGTATGTGTGTTGTTGTTGTAAGAAA
AGTATCCAAGTTTGATATAAGAAAAGAGTTGGAG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4826Contig1 1062 2 10 U
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AAATGTTGAAGTATGACCCTAAAGACCGGCTTACAGCTAGTGAAGTGCTAAACCATCCGT
GGATTAAAGAAGACGGAGAGGCGTCAGACAAACCGCTTGACAATGCTGTGTTATCAAGGA
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TTGACTACTTGGAGTTTATATCAGCGACAATGCATATGAACAGAATCGAACGTGAGGATC
ACTTGTACACTGCTTTCCAGTACTTCGACAAGGATAACAGCGGTTACATAACAATGGAAG
AACTAGAGCAGGCCATGAAGAAATACAACATGGGTGATGACAAATCCATCAAAGAGATCA
TTGCTGAAGTTGACACCGATCGTGACGGGAAAATAAACTACGAAGAGTTCGTAGCGATGA
TGAAGAAGGGAAATCCAGAACTGGTGACTAACCGACGCAGAGTCAACATGTAAAACGAAT
GAACGTTGGAGACGGTGATGATAACCACAACAAGTCTCTTTCTCAATATGTTTCTCTCTG
ACGAGAGATCTTTTGATGTATCTTTTGTTTGCTTCGCTTCTTCCCTCTTTACTGTAACTT
AGCTTTGTTGGTTTTGTTACAATAATGTTGTTTGTTTCCCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CY69TF U 1
AF RR4CY69JQ C 302
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BS 742 763 RR4CY69TF
BS 764 1062 RR4CY69JQ

RD RR4CY69TF 770 0 0
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ATGGACCAGAGGCTGATATCTGGAGTGCTGGTGTGATTCTTTATATCCTTATCAGCGGTG
TCCCACCTTTTTGGGGAGAAAATGAGACAGGGATCTTTGATGCTATTCTAAAAGGAGAGC
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AACTAGAGCAG*CCATGA**GAATACAACATGGGTGATGACAA
TCCATCA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4CY69JQ 761 0 0
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GAAACAGTTCAGAGCGATGAACAAACTAAAGAAGATGGCACTGAAGGTCATAGCAGAGAA
CCTATCTGAAGAAGAAATCATTGGTCTGAAAGAGATGTTCAAAGCTCTAGACGTCGATAA
AAACGGAATAGTCACCTTGGAGGAGTTGAGAATCGGTCTCCCAAAGCTTGGCAATAAGAT
CTCTGAGGCTGAAATCAAACAGTTGATGGAAGCAGCTGATATGGATGGAGATGGATCGAT
TGACTACTTGGAGTTTATATCAGCGACAATGCATATGAACAGAATCGAACGTGAGGATCA
CTTGTACACTGCTTTCCAGTACTTCGACAAGGATAACAGCGGTTACATAACAATGGAAGA
ACTAGAGCAGGCCATGAAGAAATACAACATGGGTGATGACAAATCCATCAAAGAGATCAT
TGCTGAAGTTGACACCGATCGTGACGGGAAAATAAACTACGAAGAGTTCGTAGCGATGAT
GAAGAAGGGAAATCCAGAACTGGTGACTAACCGACGCAGAGTCAACATGTAAAACGAATG
AACGTTGGAGACGGTGATGATAACCACAACAAGTCTCTTTCTCAATATGTTTCTCTCTGA
CGAGAGATCTTTTGATGTATCTTTTGTTTGCTTCGCTTCTTCCCTCTTTACTGTAACTTA
GCTTTGTTGGTTTTGTTACAATAATGTTGTTTGTTTCCCCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL4827Contig1 894 2 5 U
ATGTATATAACATAACATTACAACCAAATTAACAAAGGAAAAAAAGTTCTGAAGCAACAA
AAATCCACTTTTCCTTAATACACAATAACGAAGCAGAGGTTTTGCTTTTACGGGCTTCCT
CTAGACATCTCTTTGATCATCATGAGATTTTCAAATGTTCTTCTTCAACCCATTGGTCCG
TACACAGAAGCTGCTGCATTCAGGTTCTTTCTTGAACCGGGTCCATCCTGATTCATACCG
GTTGGTTTATTCGATAACCGACGCTTATACCGCTTCAACACGGATGCAAAATTCTCTTTC
CCTTTTGGGAAAGCCACGTCTCAGCAACAGTACCGGTCCGGCCTTTCCTACAAGAGATTG
GTATTTCAACGTCTTTGATCAGCTCAAGAAGTGTGACTGCTGTTGTGCATTTGCCTTTGG
CTGGTCTTGCAGCCGGAGGTAACATTCCGTTTGAAGCTGAAGGCGGACTCGCTCTTTGGT
GGCTTGCCGGAATCTGAAGGCAGAAGCACGGTGTCATCGGTGTCCGAAGCTTTGAGAACG
CCGGGTCTATAACTCCCTGAAGGCGGTTGAGAACGTAAGTGTACTTTTCCCCAGAGCTCA
GGACGACTCTCCATGAGAGACAAGTCAAGGACACGGTGAATGCACCAAACTCCAAAGCTC
ACAATCAAATCAGCTCTCCAAACGCAACCATCTCCACAGTTAGGAACTGATGAAACCTGA
GCCTCGCCCATGTGGCCCACTTTCTCGCGTTTCAGCTTCGTAGATAAACTTTTCTCTTGC
AGCTACCTTGTCTATCAGTTCTTCATCGACTCCATCGCTTTGCCCAAACAACCATTCTGA
TCCTTCCAGTTTAATAAGCTTTAGTATACAGTTCCTGAACGACTGAAGAAGCTT


BQ
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AF RR4A318JQD U 1
AF RR4A318JQ U 152
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AAATCCACTTTTCCTTAATACACAATAACGAAGCAGAGGTTTTGCTTTTACGGGCTTCCT
CTAGACATCTCTTTGATCATCATGAGATTTTCAAATGTTCTTCTTCAACCCATTGGTCCG
TACACAGAAGCTGCTGCATTCAGGTTCTTTCTTGAACCGGGTCCATCCTGATTCATACCG
GTTGGTTTATTCGATAACCGACGCTTATACCGCTTCAACACGGATGCAAAATTCTCTTTC
CCTTTTGGGAAAGCCACGTCTCAGCAACAGTACCGGTCCGGCCTTTCCTACAAGAGATTG
GTATTTCAACGTCTTTGATCAGCTCAAGAAGTGTGACTGCTGTTGTGCATTTGCCTTTGG
CTGGTCTTGCAGCCGGAGGTAACATTCCGTTTGAAGCTGAAGGCGGACTCGCTCTTTGGT
GGCTTGCCGGAATCTGAAGGCAGAAGCACGGTGTCATCGGTGTCCGAAGCTTTGAGAACG
CCGGGTCTATAACTCCCTGAAGGCGGTTGAGAACGTAAGTGTACTTT*CCCCAGAGCTCA
GGACGACTCTCCATGAGAGACAAGTCAAGGACACGGTGAATGCACCAAACTCCAAAGCTC
ACAATCAAATCAGCTCTCCAAACGCAACCATCTCCACAGTTAGGAACTGATGAAACCTGA
GCCTCGCCCATGTGGCCCACTT*CTCGCGTTTCAGCTTCGTAGATAAACTTTTCTCTTGC
AGCTACCTTGTCTATCAGTTCTTCATCGACTCCATCGCTTTGCCCAAACAACCATTCTGA
TCCTTCCAGTTTAATAAGCTTTAGTATACAGTTCCTGAACGACTGAAGAAGCTT

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DS 

RD RR4A318JQ 719 0 0
CAAATGTTCTTCTTCAACCCATTGGTCCGTACACAGAAGCTGCTGCATTCAGGTTCTTTC
TTGAACCGGGTCCATCCTGATTCATACCGGTTGGTTTATTCGATAACCGACGCTTATACC
GCTTCAACACGGATGCAAAATTCTCTTTCCCTTTTGGGAAAGCCACGTCTCAGCAACAGT
ACCGGTCCGGCCTTTCCTACAAGAGATTGGTATTTCAACGTCTTTGATCAGCTCAAGAAG
TGTGACTGCTGTTGTGCATTTGCCTTTGGCTGGTCTTGCAGCCGGAGGTAACATTCCGTT
TGAAGCTGAAGGCGGACTCGCTCTTTGGTGGCTTGCCGGAATCTGAAGGCAGAAGCACGG
TGTCATCGGTGTCCGAAGCTTTGAGAACGCCGGGTCTATAACTCCCTGAAGGCGGTTGAG
AACGTAAGTGTACTTTTCCCCAGAGCTCAGGACGACTCTCCATGAGAGACAAGTCAAGGA
CACGGTGAATGCACCAAACTCCAAAGCTCACAATCAAATCAGCTCTCCAAACGCAACCAT
CTCCACAGTTAGGAACTGATGAAACCTGAGCCTCGCCCATGTGGCCCACTTTCTCGCGTT
TCAGCTTCGTAGATAAACTTTTCTCTTGCAGCTACCTTGTCTATCAGTTCTTCATCGACT
CCATCGCTTTGCCCAAACAACCATTCTGATCCTTCCAGTTTAATAAGCTTTAGTATACA

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4828Contig1 880 2 3 U
GTCTCATCCTCCTTACGAAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGAC
CGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAAGAGAAGCACAAGTCGCTTCCTCC
TACTTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCCGGGAAGCTCGT
CAAAGTCAAAGCCTCTTTCAAGATTCCGTCTGCTGCTTCATCTGCTAAACCGGCTGCGGC
GACGAAACCGGTTAAGAAGAAACCGGCTGCTTCGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGC
TGCTAAGGCCAAACCAGCTGCTAAAGGAACCAAGAAACCTGCCGCTGCTGCTAAGCCTAA
GGCAAAGACCACAACAACTAAAGCTGCTGCGAAGCCGAAGGCGAAAGTTACTGCGAAACC
TAAGACGAAGAGTGTAGCTGCGGTTTCGAAGACCAAGGCGGTTGCTGCTAAGCCTAAGGC
GAAGGAGATACCTTCTAAAGCTTCGAGGACTTCGAGTAGGACGTCTCCAGGGAAGAAGGC
TGCTCCTGCTAAGAAAGCGGCTGCGCCTGCGGCTAAGTAAGCTGCTGCGAGTAAGAAGGC
TCCGGCTAAGAGTGCGAAGGTGAAGTCTCCAGCGAAAAGAGCTTCGACGAGGAAGAAGTG
ATGATGGTTTCGCTTCTCTTAGGGTTAAAGTCTTTTGTATAATTGAATCGTCTATGAAGG
AAAGGGGCTTGTTTTTTTTTTTACTTCCAAAGTTTTATCTTTTGTTATATTTGTCTTTGG
TTTCTTCTCGAAACCCTTCTATCTTTGTAATTTTTGGTTTGTTTGAAATTTTAATAGCTC
TATATGTGATGGTTTGCAAAGACGTGCTTCTGCTTTGTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A979TF U 1
AF RR4AA15TF U 1
BS 1 833 RR4A979TF
BS 834 834 RR4AA15TF
BS 835 880 RR4A979TF

RD RR4A979TF 880 0 0
GTCTCATCCTCCTTACGAAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGAC
CGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAAGAGAAGCACAAGTCGCTTCCTCC
TACTTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCCGGGAAGCTCGT
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GACGAAACCGGTTAAGAAGAAACCGGCTGCTTCGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGC
TGCTAAGGCCAAACCAGCTGCTAAAGGAACCAAGAAACCTGCCGCTGCTGCTAAGCCTAA
GGCAAAGACCACAACAACTAAAGCTGCTGCGAAGCCGAAGGCGAAAGTTACTGCGAAACC
TAAGACGAAGAGTGTAGCTGCGGTTTCGAAGACCAAGGCGGTTGCTGCTAAGCCTAAGGC
GAAGGAGATACCTTCTAAAGCTTCGAGGACTTCGAGTAGGACGTCTCCAGGGAAGAAGGC
TGCTCCTGCTAAGAAAGCGGCTGCGCCTGCGGCTAAGTAAGCTGCTGCGAGTAAGAAGGC
TCCGGCTAAGAGTGCGAAGGTGAAGTCTCCAGCGAAAAGAGCTTCGACGAGGAAGAAGTG
ATGATGGTTTCGCTTCTCTTAGGGTTAAAGTCTTTTGTATAATTGAATCGTCTATGAAGG
AAAGGGGCTTGTTTTTTTTTTTACTTCCAAAGTTTTATCTTTTGTTATATTTGTCTTTGG
TTTCTTCTCGAAACCCTTCTATCTTTGTAATTTTTGGTTTGTTTGAAATTTTA*TAGCTC
TATATGTGATGGTTTGCAAAGACGTGCTTCTGCTTTGTAT

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR4AA15TF 860 0 0
GTCTCATCCTCCTTACGAAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGAC
CGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAAGAGAAGCACAAGTCGCTTCCTCC
TACTTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCCGGGAAGCTCGT
CAAAGTCAAAGCCTCTTTCAAGATTCCGTCTGCTGCTTCATCTGCTAAACCGGCTGCGGC
GACGAAACCGGTTAAGAAGAAACCGGCTGCTTCGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGC
TGCTAAGGCCAAACCAGCTGCTAAAGGAACCAAGAAACCTGCCGCTGCTGCTAAGCCTAA
GGCAAAGACCACAACAACTAAAGCTGCTGCGAAGCCGAAGGCGAAAGTTACTGCGAAACC
TAAGACGAAGAGTGTAGCTGCGGTTTCGAAGACCAAGGCGGTTGCTGCTAAGCCTAAGGC
GAAGGAGATACCTTCTAAAGCTTCGAGGACTTCGAGTAGGACGTCTCCAGGGAAGAAGGC
TGCTCCTGCTAAGAAAGCGGCTGCGCCTGCGGCTAAGTAAGCTGCTGCGAGTAAGAAGGC
TCCGGCTAAGAGTGCGAAGGTGAAGTCTCCAGCGAAAAGAGCTTCGACGAGGAAGAAGTG
ATGATGGTTTCGCTTCTCTTAGGGTTAAAGTCTTTTGTATAATTGAATCGTCTATGAAGG
AAGGGGGCTTGTTTTTTTTTTTACTTCCAAAGTTTTATCTTTTGTTATATTTGTCTTTGG
TTTCTTCTCGAAACCCTTCTATCTTTGTAATTTTTGGTTTGTTTGAAATTTTAATAGCTC
TATATGTGATGGTTTGCAAA

QA 1 860 1 860
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4830Contig1 639 2 2 U
CCGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGCTACATTTATTGCCTTAAGCAAA
GGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATATGGAATAACAATA
GAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAACCAGAGGACTTGATGTTTTGTTTTAACTTAGTT
TCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGAAAATCACATGGTAAAGAGCAGCAAGTGCAGC
ACCAATGAAGGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGGTCTTTGTTGTA
AATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGATTGGGATGGT
TGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAATAGGGACATG
AGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAAAAAACTGTGTAAACGAGGACGAA
TGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGCCACAGTGTT
GGCTCCTCCTCCTAAAGCCCCCCCATACATGGTCTTACGACTTTGCGGAGACCTGTGTTT
TTGGTAAACAGTCGCCCGGGCCTGGTCACTGCGACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A046TFB C 1
AF RR4A046JQ U 170
BS 1 169 RR4A046TFB
BS 170 639 RR4A046JQ

RD RR4A046TFB 624 0 0
CCGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGCTACATTTATTGCCTTAAGCAAA
GGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATATGGAATAACAATA
GAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAACCAGAGGACTTGATGTTTTGTTTTAACTTAGTT
TCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGAAAATCACATGGTAAAGAGCAGCAAGTGCAGC
ACCAATGAAGGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGGTCTTTGTTGTA
GATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGATTGGGATGGT
TGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAATAGGGACATG
AGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAGAAAACTGTGTAAACGAGGACGAA
TGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGCCACAGTGTT
GGCTCCTCCTCCTAGAGCCCCCCCATACATGGTCTTACGACTTTGCGGAGACCTGTGTTT
TTGGTAAACAGTCGCCCGGGCCTG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4A046JQ 470 0 0
TTAACTTAGTTTCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGAAAATCACATGGTAAAGAGCA
GCAAGTGCAGCACCAATGAAGGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGG
TCTTTGTTGTAAATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTG
ATTGGGATGGTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGA
ATAGGGACATGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAAAAAACTGTGTAA
ACGAGGACGAATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGA
GCCACAGTGTTGGCTCCTCCTCCTAAAGCCCCCCCATACATGGTCTTACGACTTTGCGGA
GACCTGTGTTTTTGGTAAACAGTCGCCCGGGCCTGGTCACTGCGACCCCC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL4831Contig1 1064 2 2 U
GGATATCTCAGACGAAGACAAAGCGACTCTCAAGAAGGGTGCTTTTCCTTAGAAAATGGC
AGGCAGAGAAATTCTCCATAAGATGAAGGCCGGGATCTGCGGAGCAGCTCCTCCTGACAT
GGGAAGAGGCAAAAGCAAGATGTGGAAGAACATCACTCACGGTTTCCACTTCGTCAAAGG
CAAGCCAAGCCATCCCATGGAGGACTACGTAGTCTCTGAATTCGAGAAAGTCGAGGCCAT
GAGCTCGGTCTGTTTGCCATCTTTGATGGTCACTTGGGTCATGACGTTGCCAAGTACTTG
CAGACCAATCTCTTTGACAACATTCTTCAAGAGAAGGAGTTTTGGAGTGACACGGAGAAT
GCAATAAGAAACGCGTACAGATCAACAGACGCGGTGATACTGCAGCAGTCTCTCAAGCTT
GGTAAAGGCGGGTCAACGGCTGTAACGGGGATTCTAGTCGATGGTCAAAAGCTAGTGGTT
GCTAACGTTGGAGACTCCAGGGCAGTGATGTCCAAGAAGGGCGTTGCGCACCAGCTCTCG
GTTGATCACGATCCAAGCAAGGAGAGGAAAGATATAGAGAAGCGAGGTGGCTTTGTATCT
AACATTCCAGGGGATGTTCCACGTGTAGATGGACAGTTAGCGGTTGCGAGAGCGTTTGGA
GATAAGAGCTTAAAGATACATTTGAGTTCAGAGCCTGATATCACACACCAGGCGATTGAT
GAGCAGACTGAGTTCATCGTTTTCGCCAGTGATGGTATTTGGAAGGTGATGTCGAACCAA
GAAGCGGGTGATGTGATCAAGAGTGTGAAAGATCCGCAAGCAGCAGCAAAGCACTTGATA
GAGGTAGCTTTATTTAAGAAGAGCAAAGACGACATCTCTTGTATCGTTGTAAAGTTCCAC
TAGTCTCTTTGAAGCCTTTGTCTATAAAATGACCATCAAGTTTGCAAGATAGAGTTATTA
TGTGTGTTTTCAAGTTTTTTGTAAAATGTTAAATCAGTAATGAAGTTTTTCAGAAGATGT
AATTTTTTTTTTTTTATGTTTGGAAAGTGTTTGATATTTCCCCT


BQ
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AF RR4FT83TF U 1
AF RR4FT83JQ C 328
BS 1 758 RR4FT83TF
BS 759 1064 RR4FT83JQ

RD RR4FT83TF 761 0 0
GGATATCTCAGACGAAGACAAAGCGACTCTCAAGAAGGGTGCTTTTCCTTAGAAAATGGC
AGGCAGAGAAATTCTCCATAAGATGAAGGCCGGGATCTGCGGAGCAGCTCCTCCTGACAT
GGGAAGAGGCAAAAGCAAGATGTGGAAGAACATCACTCACGGTTTCCACTTCGTCAAAGG
CAAGCCAAGCCATCCCATGGAGGACTACGTAGTCTCTGAATTCGAGAAAGTCGAGGCCAT
GAGCTCGGTCTGTTTGCCATCTTTGATGGTCACTTGGGTCATGACGTTGCCAAGTACTTG
CAGACCAATCTCTTTGACAACATTCTTCAAGAGAAGGAGTTTTGGAGTGACACGGAGAAT
GCAATAAGAAACGCGTACAGATCAACAGACGCGGTGATACTGCAGCAGTCTCTCAAGCTT
GGTAAAGGCGGGTCAACGGCTGTAACGGGGATTCTAGTCGATGGTCAAAAGCTAGTGGTT
GCTAACGTTGGAGACTCCAGGGCAGTGATGTCCAAGAAGGGCGTTGCGCACCAGCTCTCG
GTTGATCACGATCCAAGCAAGGAGAGGAAAGATATAGAGAAGCGAGGTGGCTTTGTATCT
AACATTCCAGGGGATGTTCCACGTGTAGATGGACAGTTAGCGGTTGCGAGAGCGTTTGGA
GATAAGAGCTTAAAGATACATTTGAGTTCAGAGCCTGATATCACACACCAGGCGATTGAT
GAGCAGACTGAGTTCATCGTTTTCGCCAGTGATGGTAT
CTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4FT83JQ 737 0 0
CAAGAGAAGGAGTTTTGGAGTGACACGGAGAATGCAATAAGAAACGCGTACAGATCAACA
GACGCGGTGATACTGCAGCAGTCTCTCAAGCTTGGTAAAGGCGGGTCAACGGCTGTAACG
GGGATTCTAGTCGATGGTCAAAAGCTAGTGGTTGCTAACGTTGGAGACTCCAGGGCAGTG
ATGTCCAAGAAGGGCGTTGCGCACCAGCTCTCGGTTGATCACGATCCAAGCAAGGAGAGG
AAAGATATAGAGAAGCGAGGTGGCTTTGTATCTAACATTCCAGGGGATGTTCCACGTGTA
GATGGACAGTTAGCGGTTGCGAGAGCGTTTGGAGATAAGAGCTTAAAGATACATTTGAGT
TCAGAGCCTGATATCACACACCAGGCGATTGATGAGCAGACTGAGTTCATCGTTTTCGCC
AGTGATGGTATTTGGAAGGTGATGTCGAACCAAGAAGCGGGTGATGTGATCAAGAGTGTG
AAAGATCCGCAAGCAGCAGCAAAGCACTTGATAGAGGTAGCTTTATTTAAGAAGAGCAAA
GACGACATCTCTTGTATCGTTGTAAAGTTCCACTAGTCTCTTTGAAGCCTTTGTCTATAA
AATGACCATCAAGTTTGCAAGATAGAGTTATTATGTGTGTTTTCAAGTTTTTTGTAAAAT
GTTAAATCAGTAATGAAGTTTTTCAGAAGATGTAATTTTTTTTTTTTTATGTTTGGAAAG
TGTTTGATATTTCCCCT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL4832Contig1 750 2 2 U
GCCTCCAAGTTCACTTTAGAGAATGCAAAGGCGTGATTCTGAATATAGTGGTGGCGGGAA
CTGATACGGCCGCTGCGGCGGTTGTGTGGGGAATGACGTATTTGATGAAGTACCCTCAAG
TGATGAAGAAAGCTCAAGCAGAAGTGAGGGAGTATGCAAGGGAGAAAGGCTCAACTTTCA
TTACTGAAGACGACGTGAAGAACCTTCCTTACTTCAGAGCCTTAGTTAAATAAACCTTAA
GGATCGAACCTGTGATTCCTCTCCTTATCCCTCGTGCTTGTATTCAAGGCACCAAGATCG
CTGGTTACGACATCCCTGCGGGGACTACTGTCAACGTCAACGCATGGGCCGTTTCCCGCG
ACGAGAAGGAGTGGGGCCCTAACCCTGACGAGTTCAGACCAGAGAGGTTTCTTGAGAAGG
ACGTTGACTTCAAAGGCACGGACTACGAGTTTATACCGTTCGGGTCAGGCAGGAGAATGT
GCCCTGGGATGCGTCTTGGTGCGGCGATGCTAGAGGTTCCATTTGCGAACCTTCTCCTCA
AGTTCGACTTCAAACTTCCCAATGGAATGAAAGCAGAAGAGATCAACATGGATGTCATGA
CTGGTCTTGCTATGCACAAGTCGGATCATCTGAAGCTTGTTCCGGAGAAAGTGAGCAAGT
GATAGTTTCTAATGGTCAAATAAATGTATCACTCTGGTTGTATAATATATATATATATGT
TCCTGTAGTGTACTATGCTCTTTGGTTTGG


BQ
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AF RR4FP08TF U 1
AF RR4FP08JQ C 87
BS 1 517 RR4FP08TF
BS 518 750 RR4FP08JQ

RD RR4FP08TF 517 0 0
GCCTCCAAGTTCACTTTAGAGAATGCAAAGGCGTGATTCTGAATATAGTGGTGGCGGGAA
CTGATACGGCCGCTGCGGCGGTTGTGTGGGGAATGACGTATTTGATGAAGTACCCTCAAG
TGATGAAGAAAGCTCAAGCAGAAGTGAGGGAGTATGCAAGGGAGAAAGGCTCAACTTTCA
TTACTGAAGACGACGTGAAGAACCTTCCTTACTTCAGAGCCTTAGTTAAATAAACCTTAA
GGATCGAACCTGTGATTCCTCTCCTTATCCCTCGTGCTTGTATTCAAGGCACCAAGATCG
CTGGTTACGACATCCCTGCGGGGACTACTGTCAACGTCAACGCATGGGCCGTTTCCCGCG
ACGAGAAGGAGTGGGGCCCTAACCCTGACGAGTTCAGACCAGAGAGGTTTCTTGAGAAGG
ACGTTGACTTCAAAGGCACGGACTACGAGTTTATACCGTTCGGGTCAGGCAGGAGAATGT
GCCCTGGGATGCGTCTTGGTGCGGCGATGCTAGAGGT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR4FP08JQ 664 0 0
TGGGGAATGACGTATTTGATGAAGTACCCTCAAGTGATGAAGAAAGCTCAAGCAGAAGTG
AGGGAGTATGCAAGGGAGAAAGGCTCAACTTTCATTACTGAAGACGACGTGAAGAACCTT
CCTTACTTCAGAGCCTTAGTTAAATAAACCTTAAGGATCGAACCTGTGATTCCTCTCCTT
ATCCCTCGTGCTTGTATTCAAGGCACCAAGATCGCTGGTTACGACATCCCTGCGGGGACT
ACTGTCAACGTCAACGCATGGGCCGTTTCCCGCGACGAGAAGGAGTGGGGCCCTAACCCT
GACGAGTTCAGACCAGAGAGGTTTCTTGAGAAGGACGTTGACTTCAAAGGCACGGACTAC
GAGTTTATACCGTTCGGGTCAGGCAGGAGAATGTGCCCTGGGATGCGTCTTGGTGCGGCG
ATGCTAGAGGTTCCATTTGCGAACCTTCTCCTCAAGTTCGACTTCAAACTTCCCAATGGA
ATGAAAGCAGAAGAGATCAACATGGATGTCATGACTGGTCTTGCTATGCACAAGTCGGAT
CATCTGAAGCTTGTTCCGGAGAAAGTGAGCAAGTGATAGTTTCTAATGGTCAAATAAATG
TATCACTCTGGTTGTATAATATATATATATATGTTCCTGTAGTGTACTATGCTCTTTGGT
TTGG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL4833Contig1 942 2 2 U
CCGTCGATATTCCATTGGATACGGTGAATGACTCTTCAAAGAAACAGAGGGAGCTTTCTG
ATTGGGAATCTGAGCTTAAGAAGAGAGAAATGGATATTAAAAGAAGAGAAGATGCTGTTG
CTAAATCTGGCGTGAAGACAAGCAATAAAAACTGGCCACCTTTTTTCCCTATTATACACC
ACGACATTGCTAATGAGATACCAGTTCATGCTCAGAAACTCCAATATCTGGCATTTGCTA
GTTGGTTGGGTATAGTTTTGTGTCTCGTATTCAATGTCATTGCAGTGATAGTCTGCTGGA
TTAAAGGCGGAGGTGTCAAAATCTTTTTTCTTGCCACGATCTATGCGCTGCTTGGATGTC
CAATTTCATATCTATTATGGTATAGGCCTCTCTACCGAGCTATGAGGACTGACAGCGCTC
TGAAGTTCGGTTGGTTTTTCTTCTTCTACCTGATTCACATTGGCTTCTGCATATTTGCTG
CCATTGCTCCTCCGATCCTTTTCCGCGGCTTGTCATTAACGGGTGTGCTGGCAGCAATTG
ATGTAATCAGAGCCAGTTTACTAGCCGGGATCTTCTACTTTGTCGGCTTTGGTCTGTTCT
GCTTGGAGGCGCTTCTCAGTGTGTGGGTTCTCCAGAAAATATACATCTACTTCAGGGGAA
ACAAGTAAACAAGGCATATACACTAGAGCAAAATGCCATACTTCTCCAACGATACCGCTC
TCTTAGAAGATTTGAGTATAGTACTATACTATCTTGCTACTAATGTAATTACCATTTGTG
TGTCTGGGATAATACTCTGTTGTGATGTGTTTGTATTTTGTTTTATTGTGTGGTGCTGTC
TTCGTTTAGTAGTTGCAGTGGCAAAATAAATACTCTATGTTCTGTTATTACGTTGAGGAT
TGACATTTTTGGGGTTGCAAAAGAGTATAGATTCGATTTATC


BQ
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DS 

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CO48TF U 1
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QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CO48JQ 811 0 0
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CGTCGTCATAAACATAATACGACGCCTGTAGGAGTAGGGTGTACTCTAAAGATGAAGAAG
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CAACATCCCAGGTATTTTGTTTCTATAGATTAATTTAATCAAAAACTAGTTTCATTATAA
TAATTCGAAATTGGTTTTAAATTTTGTACTTTATTTTTATCTAGTTAATATATGATTAGT
ATATCAGTTATTTCTTCGCTTGGGGGTTAATGATGGCTTATTCTAGGAACTTTATCGACT
TAAATCAGAGTCTTTTTCAAGTTTTAACGTTAGCTTAATTGTGTGAGCCATCTAAAGACT
AAAAGTTGCTTCAGCATTTTACTAACGAATTGGAAACTATTAGTAGAATCTTGTTCTCTA
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CAACAAATCACAAAAAGAAGCAACCGTTTAC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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GTTTTAACGTGACAAAAGATGAAGTTTGGAGAGACGTTCACGGAATATCTACATGGAGAA
GAGGAGTGGTTCCTAGAAAAATGTCGTTACGTTGAATATAAGAAACTCAAGAAAGTGCTG
AAGAAGTGCAAGACATGTAACTCCACAAGATCGGATGATGAACACATCATCTCATCGGCT
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GAGGAGCTGATGAAGGAAGCTTCTGACGTGGCAGGATTCTTCAAGTCAAGAGTCAGGCAT
CTTCTCCATCTTCATGTAGCCACTGGGATGCAAAGATACCTAATACGTCTACGCAGATGC
TTCACTGACGAAAAGCAAGCTTTGATCCATGAGGGCCACATCTTGATTCACTACATAACA
ATGAATGCTATTGCCATCCGTAAAATCCTAAAGAAATATGACAAGGTGCATGGCTCAGAG
AATGGGAAGAATTTTAAGTTGAAAATGCGAGCAGAGCGCATAGAGCTCTTGCACTCACCT
TGGCTTATAGAACTTGGAGCCTTTATCTCAACTCTGGTCTTGACAAAGTTGGAAACTTCA
AGAACTCGTTTGGCCGCGTCTTATGTGAAAATCTCAACGAAGACCAACCAGTGATGAAAC
TCATGCTGCCTAACTCAATAGAGCTTGAGTTTGATCTAACTTGCGCAATATGTCTGGAAA
CAGTATTCAATCCCTACGCTTTGAAGTGCGGTCACATATTTTGTAAAGCGTGTGCATGCT
CGTCTGCTTCTGTAATGATTTTCCAAGGCGTTAAAGCTGCACCACAATGTTCCAAATGTC
CCATATGCAGAGAGGTTGGAGTTTATGCAGAAGCAGTTCACATGATCGAGCTTCACCTTC
TGTTAAAGATACGAAGCAAAGAGTATTGGAAGGAGAGGATGATGGGGGAACGGTCTGAGA
TGGTGAAGCAGTCGAAGATGTTTTGGAACGAGCAGACGATGCAAATGATCGGTTACTAAT
TGTTTACTTCCTCAATTATAAAAATGGTGATGAAAAATAGCTAAATTTTTATTATTCTCA
GAAATTATAGTTTAACTAGTTCTTTTCTTTTCTTTTAACATTTGCACCAGAAAAAAAACT
AGTTCTTTTCCTTTGATAAAACATGAATCAAGTTGTATTTGTTTTTATGATGTTACTGGA
TACCTTTTGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI11TF U 1
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BS 759 1331 RR4AI11JQ

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TGGCTTATAGAACTTGGAGCCTTTATCTCAACTCTGGTCTTGACAAAGTTGGAAACTTCA
AGAACTCGTTTGGCCGCGTCTTATGTGAAAATCTCAAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4AI11JQ 716 0 0
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GGAGCCTTTATCTCAACTCTGGTCTTGACAAAGTTGGAAACTTCAAGAACTCGTTTGGCC
GCGTCTTATGTGAAAATCTCAACGAAGACCAACCAGTGATGAAACTCATGCTGCCTAACT
CAATAGAGCTTGAGTTTGATCTAACTTGCGCAATATGTCTGGAAACAGTATTCAATCCCT
ACGCTTTGAAGTGCGGTCACATATTTTGTAAAGCGTGTGCATGCTCGTCTGCTTCTGTAA
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TTGGAGTTTATGCAGAAGCAGTTCACATGATCGAGCTTCACCTTCTGTTAAAGATACGAA
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AGATGTTTTGGAACGAGCAGACGATGCAAATGATCGGTTACTAATTGTTTACTTCCTCAA
TTATAAAAATGGTGATGAAAAATAGCTAAATTTTTATTATTCTCAGAAATTATAGTTTAA
CTAGTTCTTTTCTTTTCTTTTAACATTTGCACCAGAAAAAAAACTAGTTCTTTTCCTTTG
ATAAAACATGAATCAAGTTGTATTTGTTTTTATGATGTTACTGGATACCTTTTGAC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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GGCGTGTCCTAAATGCGACTTTTTAAACTTTGCGAGAAATGAAAGATGCAGAGAGTGCAA
TGAAGTCGCTGACAGACGATCTGTTGCTGCTGTTGTCAAGGAAGGAGACTGGCTGTGTCC
TGAGTGCAATTTCTCAAACTTCTCAAGAAACCAGAGCTGTCTGAAATGCAAAGCAAAGGG
ACCAAAGAGAAGTTCAATGGAGAATATTGAAATGAAAAAGGGAGACTGGAACTGCTCTGG
GTGTGGATTCATGAACTTTTCTAGCAACAAAAAGTGTAAACAGTGTCGGGAACAACGTCC
CCAAAGGCAGCTTGAGCCTGGAGAATGGGAATGTCCCTCATGCGACTTCTTGAACTATAG
GAGAAACACTGTTTGCAAGAAGTGTGAGTGCAAACGACCTAGTGAATCCAACAACCATGA
AGATGATCATTCATGGAAGCGGCCTGCCTTACTCTAAACTGTTCCCTTTAGCCTTTTTGT
AAACTTTTGATTTTTGAACTTACCAGCTTGGCAGCTTGCT


BQ
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AF RR4C364TF U 1
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BS 714 734 RR4C364TF
BS 735 760 RR4C364JQ

RD RR4C364TF 745 0 0
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TGTTCATGAGTCTGCAAGAAGACTTCTTTTGGAGTTGCTTGAGCTCAGTGAGACGCCTGT
AAATCCTGTTTTGCCCAGACCTGCGGCGGCCAAGGTAGCGTTGCCTCCTAAGGAGAGAGT
TTTTAAATCTAGGAGTGATGAGCCTTCGCAACGTGTTCGGTCTCAGTACAATGCAGACTG
GGCGTGTCCTAAATGCGACTTTTTAAACTTTGCGAGAAATGAAAGATGCAGAGAGTGCAA
TGAAGTCGCTGACAGACGATCTGTTGCTGCTGTTGTCAAGGAAGGAGACTGGCTGTGTCC
TGAGTGCAATTTCTCAAACTTCTCAAGAAACCAGAGCTGTCTGAAATGCAAAGCAAAGGG
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GTGTGGATTCATGAACTTTTCTAGCAACAAAAAGTGTAAACAGTGTCGGGAACAACGTCC
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AGATGATCATTCATGGAAGCGGC*TGC*TTACTCTAA*CTGT*CCCTTTAGC*TTTTTGT
AAACTTTTGATTTT
GACTACAGCTG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4C364JQ 759 0 0
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GTTCATGAGTCTGCAAGAAGACTTCTTTTGGAGTTGCTTGAGCTCAGTGAGACGCCTGTA
AATCCTGTTTTGCCCAGACCTGCGGCGGCCAAGGTAGCGTTGCCTCCTAAGGAGAGAGTT
TTTAAATCTAGGAGTGATGAGCCTTCGCAACGTGTTCGGTCTCAGTACAATGCAGACTGG
GCGTGTCCTAAATGCGACTTTTTAAACTTTGCGAGAAATGAAAGATGCAGAGAGTGCAAT
GAAGTCGCTGACAGACGATCTGTTGCTGCTGTTGTCAAGGAAGGAGACTGGCTGTGTCCT
GAGTGCAATTTCTCAAACTTCTCAAGAAACCAGAGCTGTCTGAAATGCAAAGCAAAGGGA
CCAAAGAGAAGTTCAATGGAGAATATTGAAATGAAAAAGGGAGACTGGAACTGCTCTGGG
TGTGGATTCATGAACTTTTCTAGCAACAAAAAGTGTAAACAGTGTCGGGAACAACGTCCC
CAAAGGCAGCTTGAGCCTGGAGAATGGGAATGTCCCTCATGCGACTTCTTGAACTATAGG
AGAAACACTGTTTGCAAGAAGTGTGAGTGCAAACGACCTAGTGAATCCAACAACCATGAA
GATGATCATTCATGGAAGCGGCCTGCCTTACTCTAAACTGTTCCCTTTAGCCTTTTTGTA
AACTTTTGATTTTTGAACTTACCAGCTTGGCAGCTTGCT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL4837Contig1 1108 2 2 U
GCAAATATCAAAGCCCTATACAGAAGGGGTCAAGCTTACAGAGATCTTGGCCTGTTTGAA
GATGCCGTCTCCGATCTAAGCAAGGCCCATGAAGTTTCCCCTGAAGATGAGATAATTGCT
GATGTCCTAAGAGATGCTAAGGAAAAAAATACTATTAATTCTGGAGAAAATAAAAAAACC
ATCTAAAGAGAGGTTACTGAGACACAACGAGAAAGCAACGGTGGTGGTCATGCTCAGGGC
GTTAAAACCGAACTCGATGGATTGCAGGCTCTCAGATATGATCCAGAAGCAATCAGAACG
TTCCAGAACTTCATTACAAAAACTGATCCGGACACACTTGCTTCTCTGAGCGGAGGCAAA
GCTGGAGACATGTCACCAGACATGTTCAAAACAGCCTCGAGCATGATAGGTAAAATGTCT
CCCGAGGAGATTCAGAAAATGGTCCAGACAGCCTCTTCATCTAAAGGAGACAGCCCTTTC
GCTTCTGCTGGGCCATCTGCAGATAAACGGGTTTACGCCCACACCTGACATGCTTAAACT
CGCATCTGATATGATGAGTAAGATGTCACCAGAAGAGCGTGAGAGGATGTTTAACATGGC
ATCGTCTTTGAAAGCAAATGCTCCTGTCTCAACATCATACAGTAATGCTGAAGCAACTGA
GCCACGGGAGACTTTAGGAGCTAGTGGGATTAGTAGTTTTGGCAGGTGAGTCTAGTAGAG
GTTTTGAACCAAGCATCCCTTTTGCTCCACCTGCTGACTTGCAGGAGCAGATGAGAAACC
AAATGAAAGATCCAGCGATGCGGCAGATGTTCACGTCTAGGATTAAGAACATGAACCCGG
AGATGATGGCTAGCATGAGCGAACAGTTCGGAATGAAGCTGTCTCGAGAAGATGCGGCAA
AAGCTCAAGAAGCCATGGCTTCTCTTTCTCCCGAAGCTTTGGAGAAAATGGTACGCACTC
GGTTTAGGAATATATTGCAGAACTGACTGTATTAGTTTATCTCATTTGTTACTTTGGAGA
AAGCTTTCCAATGTTAAAAAGAAAACGCTATTTTCTTCTTTTAGATATTCGTAATCTTAT
AAAGCATATATCGTACCTTTCTCGACCG


BQ
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AF RR4BI78TF U 1
AF RR4BI78JQ C 257
BS 1 697 RR4BI78TF
BS 698 1108 RR4BI78JQ

RD RR4BI78TF 697 0 0
GCAAATATCAAAGCCCTATACAGAAGGGGTCAAGCTTACAGAGATCTTGGCCTGTTTGAA
GATGCCGTCTCCGATCTAAGCAAGGCCCATGAAGTTTCCCCTGAAGATGAGATAATTGCT
GATGTCCTAAGAGATGCTAAGGAAAAAAATACTATTAATTCTGGAGAAAATAAAAAAACC
ATCTAAAGAGAGGTTACTGAGACACAACGAGAAAGCAACGGTGGTGGTCATGCTCAGGGC
GTTAAAACCGAACTCGATGGATTGCAGGCTCTCAGATATGATCCAGAAGCAATCAGAACG
TTCCAGAACTTCATTACAAAAACTGATCCGGACACACTTGCTTCTCTGAGCGGAGGCAAA
GCTGGAGACATGTCACCAGACATGTTCAAAACAGCCTCGAGCATGATAGGTAAAATGTCT
CCCGAGGAGATTCAGAAAATGGTCCAGACAGCCTCTTCATCTAAAGGAGACAGCCCTTTC
GCTTCTGCTGGGCCATCTGCAGATAAACGGGTTTACGCCCACACCTGACATGCTTAAACT
CGCATCTGATATGATGAGTAAGATGTCACCAGAAGAGCGTGAGAGGATGTTTAACATGGC
ATCGTCTTTGAAAGCAAATGCTCCTGTCTCAACATCATACAGTAATGCTGAAGCAACTGA
GCCACGGGAGACTTTAGGAGCTAGTGGGATTAGTAGT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4BI78JQ 852 0 0
ATGGATTGCAGGCTCTCAGATATGATCCAGAAGCAATCAGAACGTTCCAGAACTTCATTA
CAAAAACTGATCCGGACACACTTGCTTCTCTGAGCGGAGGCAAAGCTGGAGACATGTCAC
CAGACATGTTCAAAACAGCCTCGAGCATGATAGGTAAAATGTCTCCCGAGGAGATTCAGA
AAATGGTCCAGACAGCCTCTTCATCTAAAGGAGACAGCCCTTTCGCTTCTGCTGGGCCAT
CTGCAGATAAACGGGTTTACGCCCACACCTGACATGCTTAAACTCGCATCTGATATGATG
AGTAAGATGTCACCAGAAGAGCGTGAGAGGATGTTTAACATGGCATCGTCTTTGAAAGCA
AATGCTCCTGTCTCAACATCATACAGTAATGCTGAAGCAACTGAGCCACGGGAGACTTTA
GGAGCTAGTGGGATTAGTAGTTTTGGCAGGTGAGTCTAGTAGAGGTTTTGAACCAAGCAT
CCCTTTTGCTCCACCTGCTGACTTGCAGGAGCAGATGAGAAACCAAATGAAAGATCCAGC
GATGCGGCAGATGTTCACGTCTAGGATTAAGAACATGAACCCGGAGATGATGGCTAGCAT
GAGCGAACAGTTCGGAATGAAGCTGTCTCGAGAAGATGCGGCAAAAGCTCAAGAAGCCAT
GGCTTCTCTTTCTCCCGAAGCTTTGGAGAAAATGGTACGCACTCGGTTTAGGAATATATT
GCAGAACTGACTGTATTAGTTTATCTCATTTGTTACTTTGGAGAAAGCTTTCCAATGTTA
AAAAGAAAACGCTATTTTCTTCTTTTAGATATTCGTAATCTTATAAAGCATATATCGTAC
CTTTCTCGACCG

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

CO CL4838Contig1 440 2 1 U
GGAACACCTCTATATTCATTCACTTCACTTACTAACGTATCTCCATAATATTCTCCGAGA
GACATACGCTGGATAATCTCACCGCCGGCGTTGACTTTCACCGCTGATGGCTCGGTGGGG
ACCACTATAAGCTTAACGGAGTTGGAGGCGATCCAGAAATCTCCACCGTCTGTTCTCCTT
ATGTTGTCCGGACCAGGGATCGAAGGTACGAAAACGTCCCACGTGTTGACTTTTGGACCC
TTGATCCAATACCTTAAGATACGATTCCTCAAGAACTCTCCCACAAGAACAAACTCTCCG
TCGGAGCTCACGGCGCATCCGGCGGAGCCACTGAGACCGCTTAACAAAACGGTTATGCTT
TTCGTCTTTGGGTCGTACCTAAAGAACCTCCCCGTTCCATCATTAACAGCAACCGCCAAG
ACAAGTTGACTGTAATAACG


BQ
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AF RR4GE37JQ C 1
AF RR4GE37TF U 1
BS 1 440 RR4GE37TF

RD RR4GE37JQ 440 0 0
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GACATACGCTGGATAATCTCACCGCCGGCGTTGACTTTCACCGCTGATGGCTCGGTGGGG
ACCACTATAAGCTTAACGGAGTTGGAGGCGATCCAGAAATCTCCACCGTCTGTTCTCCTT
ATGTTGTCCGGACCAGGGATCGAAGGTACGAAAACGTCCCACGTGTTGACTTTTGGACCC
TTGATCCAATACCTTAAGATACGATTCCTCAAGAACTCTCCCACAAGAACAAACTCTCCG
TCGGAGCTCACGGCGCATCCGGCGGAGCCACTGAGACCGCTTAACAAAACGGTTATGCTT
TTCGTCTTTGGGTCGTACCTAAAGAACCTCCCCGTTCCATCATTAACAGCAACCGCCAAG
ACAAGTTGACTGTAATAACG

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4GE37TF 440 0 0
GGAACACCTCTATATTCATTCACTTCACTTACTAACGTATCTCCATAATATTCTCCGAGA
GACATACGCTGGATAATCTCACCGCCGGCGTTGACTTTCACCGCTGATGGCTCGGTGGGG
ACCACTATAAGCTTAACGGAGTTGGAGGCGATCCAGAAATCTCCACCGTCTGTTCTCCTT
ATGTTGTCCGGACCAGGGATCGAAGGTACGAAAACGTCCCACGTGTTGACTTTTGGACCC
TTGATCCAATACCTTAAGATACGATTCCTCAAGAACTCTCCCACAAGAACAAACTCTCCG
TCGGAGCTCACGGCGCATCCGGCGGAGCCACTGAGACCGCTTAACAAAACGGTTATGCTT
TTCGTCTTTGGGTCGTACCTAAAGAACCTCCCCGTTCCATCATTAACAGCAACCGCCAAG
ACAAGTTGACTGTAATAACG

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL4839Contig1 739 2 2 U
GCATGGAGGCAGTTCCTGAAAACAAAGACACTCCAATCAACTTAGCTCAACATACATACT
GGAACTTATCGGGCCACGACTCAGGAAACATTCTTGACCACAGGATCCAAATCTGGGGTT
CTCATATCACCCCCGTGGATCAACACTCAGTTCCTACGGGGGAGCTCTTGCCGGTGAAAG
GAACTCCTTTTGATTTCACAGAGGAGAAACGGATAGGAGAGCGTATAGGAGAGGTGGGGA
TTGGGTACGATCACAACTACGTGTTGGACTGTCCTGATCAAGAGAAAGTCGGGCTGACAC
ACGCGGCGAGGCTTAGAGACGGTGAGAGCTCAAGGGTGATGGACTTGTGGACCGATCGAT
GTTCCCGGTGTGCAGTTTTATACGGGGAACTATGTGGATGGAGTGGTGGGGAAAGGGAAT
GCGGTTTATGGGAAGCATGCAGGTGTGTGCCTTGAGACGCAAGGGTTCCCGAACGCGATT
AACCAGAAGAGTTTCCCGTGTGTTGTGGTCAAGGCTGGTGAGAAGTACAAGCACACTATG
CTGTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTGAAACTGGTGGTAGTGATGCTGCTGGATGGATGTGTT
TTTAGGTGTTAGATTTTGGGATAAATAAAATGCCGGTTCGTTGGTTCATAGAACCGGAAA
AGAGTAATTGTAGTTTTATCTTTTGTCACTATGATCTCCATATTGAATTTCTTTTAGTAC
TGATTTATTATTTTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV37TF U 1
AF RR4DV37JQ C 123
BS 1 552 RR4DV37TF
BS 553 739 RR4DV37JQ

RD RR4DV37TF 552 0 0
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GAACTCCTTTTGATTTCACAGAGGAGAAACGGATAGGAGAGCGTATAGGAGAGGTGGGGA
TTGGGTACGATCACAACTACGTGTTGGACTGTCCTGATCAAGAGAAAGTCGGGCTGACAC
ACGCGGCGAGGCTTAGAGACGGTGAGAGCTCAAGGGTGATGGACTTGTGGACCGATCGAT
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AACCAGAAGAGTTTCCCGTGTGTTGTGGTCAAGGCTGGTGAGAAGTACAAGCACACTATG
CTGTTTGAGTTT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4DV37JQ 617 0 0
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ACTCCTTTTGATTTCACAGAGGAGAAACGGATAGGAGAGCGTATAGGAGAGGTGGGGATT
GGGTACGATCACAACTACGTGTTGGACTGTCCTGATCAAGAGAAAGTCGGGCTGACACAC
GCGGCGAGGCTTAGAGACGGTGAGAGCTCAAGGGTGATGGACTTGTGGACCGATCGATGT
TCCCGGTGTGCAGTTTTATACGGGGAACTATGTGGATGGAGTGGTGGGGAAAGGGAATGC
GGTTTATGGGAAGCATGCAGGTGTGTGCCTTGAGACGCAAGGGTTCCCGAACGCGATTAA
CCAGAAGAGTTTCCCGTGTGTTGTGGTCAAGGCTGGTGAGAAGTACAAGCACACTATGCT
GTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTGAAACTGGTGGTAGTGATGCTGCTGGATGGATGTGTTTT
TAGGTGTTAGATTTTGGGATAAATAAAATGCCGGTTCGTTGGTTCATAGAACCGGAAAAG
AGTAATTGTAGTTTTATCTTTTGTCACTATGATCTCCATATTGAATTTCTTTTAGTACTG
ATTTATTATTTTATCAC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL4840Contig1 519 2 3 U
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ATTGACCATAATGAAAACATTGAAACATGACTCTTCCCTGATTTTACAAAAGCCGCAAAC
ATTTTTTTTTTGGAAAACTGAAAACTTGAGAACATCTACCTTTGTTTTTTTTGTTCTCCT
TTTCTTGGTAGGATTCCTCTAGTTAGGAAAAATCAAACACCATTTGTGACAACAACATTG
AATCAAAACCATTTTCTATGTAAATCAAAATTTTAACTCCCGACAGTTCCAAAAATCTTG
GAAACACCATGTGAAGCCTTAGGGCAAAACAGCTTCTTCAGTTCTTCATACCTCTCAACA
TCAAACTCATCAAGACTCATCAGTTTCCTCTGTTTAGCCTCGAACCTGCTTTGGTAAAAC
CCTTCAAAAGAAGGCTCTCTCGACGTCCTGAGGAAGAAACCGTACCCAGCCATAAAGTAC
ATGGACGTGACGTAGAAACAGATTGGCTCCATCACATCC


BQ
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AF RR4BD21JQ U 204
AF RR4BD21TF C 1
BS 1 203 RR4BD21TF
BS 204 399 RR4BD21JQ
BS 400 519 RR4BD21TF

RD RR4BD21JQ 196 0 0
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ATCAAAATTTTAACTCCCGACAGTTCCAAAAATCTTGGAAACACCATGTGAAGCCTTAGG
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TTTCCTCTGTTTAGCC

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR4BD21TF 519 0 0
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ATTGACCATAATGAAAACATTGAAACATGACTCTTCCCTGATTTTACAAAAGCCGCAAAC
ATTTTTTTTTTGGAAAACTGAAAACTTGAGAACATCTACCTTTGTTTTTTTTGTTCTCCT
TTTCTTGGTAGGATTCCTCTAGTTAGGAAAAATCAGACACCATTTGTGACAACAACATTG
AATCAAAACCATTTTCTATGTAAATCAAAATTTTAACTCCCGACAGTTCCAAGAATCTTG
GAAACACGATGTGAAGCCTTAGGGCAAAACAGCTTCTTCAGTTCTTCATACCTCTCAACA
TCAAACTCATCAAGACTCATCAGTTTCCTCTGTTTAGCCTCGAACCTGCTTTGGTAAAAC
CCTTCAAAAGAAGGCTCTCTCGACGTCCTGAGGAAGAAACCGTACCCAGCCATAAAGTAC
ATGGACGTGACGTAGAAACAGATTGGCTCCATCACATCC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL4841Contig1 1020 2 10 U
TTTTTTTAATTACTTCTGGGTTGCCCTTTTCCTCTCCCCCCACACAGCAACACCAAAGTT
TTCAGGATCCAAGAACTGAAGAGGCGAGAAGAACCCAGATTCACACGATCATTCCTGGTT
AGTTTTTCTTGTTTTCTACTCCGTTTTTTTTACTTTTTGATTTAATCCCGGGTAAATGCA
CCTGTCTTTCTCTGTGTTTTTTTTTCTGTTTTTCTTCCCAAGAAAATATATTTTATTAGA
AAATTTAGAAAGGAAGCTGCTGAGAAATAGCTTTCTTCTCTTTCCAATGGCATTTTTTCT
TTGTTCTCACATCCCATTTTTACTTCACATAACACATTCAATGGATAATCACATTCAATG
GATCTAATCTGACTTACAAACAAAATGGAGGCTTCGCTTTAAAAGTTTATATCCTTTAAC
ATTGTTACCAAAAAAAAAAAAGTTTATATCACTTTTTGGGTTTTCTTCTTCTTTAGATAG
TCAAAGTAGGTCCGGTTCTCCTAACATTTTACTAAAAAAAATAAAAAGTAGGTCCGGTTC
TCAAGGAATCTAGTTATACGATTTACCAAATTTTCGGTTCAGTGTAAATCAAACAAATAA
AAACAGAAACAGAAACAAAAAAATTTAAAAACTAAACTATTCTTTGACGCGGCAATTAGT
GCACATACCGAACTGAACCTTTAAGTTTATATAAGTTTAATCGAGTGTCTGGTTTAATTT
ATTATTAATGGAATTTGGTTTAGTATTGCTATTGTCTTAGTTCGGTTCTATACAAATTAA
ACTGTTTTATTTTATATTAGTAGAAGGGTGTGAATTGGGTCAAATTCGGTTTGGTTCAAT
TAAAATTAAATGGGGGTAAACTGTGCGGTCTGGTATTGAGCTTCAAGCCAGATAGCGAAT
CTGAGAGTTGGTGGGTGTCTAGTTACATTTTTACCCAGAAAAAAAGAAATCAACTTAATC
AAAGAGCCGTACGTTTTGTATTACGTGATTACCGTGCAAGAAAAAACTATTTACATATGT


BQ
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AF RR4BV09TF U 1
AF RR4BV09JQ C 317
BS 1 716 RR4BV09TF
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RD RR4BV09TF 768 0 0
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TTGTTCTCACATCCCATTTTTACTTCACATAACACATTCAATGGATAATCACATTCAATG
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ATTGTTACCAAAAAAAAAAAAGTTTATATCACTTTTTGGGTTTTCTTCTTCTTTAGATAG
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TCAAGGAATCTAGTTATACGATTTACCAAATTTTCGGTTCAGTGTAAATCAAACAAATAA
AAACAGAAACAGAAACAAAAAAATTTAAAAACTAAACTATTCTTTGACGCGGCAATTAGT
GCACATACCGAACTGAACCTTTAAGTTTATATAAGTTTAATCGAGTGTCTGGTTTA*TTT
AT*ATTAATGGA*TTTGGTTTAGTAT*GCTATTGTCTTAGTTCGGT
CT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BV09JQ 704 0 0
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TCTCCTAACATTTTACTAAAAAAAATAAAAAGTAGGTCCGGTTCTCAAGGAATCTAGTTA
TACGATTTACCAAATTTTCGGTTCAGTGTAAATCAAACAAATAAAAACAGAAACAGAAAC
AAAAAAATTTAAAAACTAAACTATTCTTTGACGCGGCAATTAGTGCACATACCGAACTGA
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GGTTTAGTATTGCTATTGTCTTAGTTCGGTTCTATACAAATTAAACTGTTTTATTTTATA
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QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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TAAGCGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI92TF U 1
AF RR4AI92JQ C 16
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BS 721 727 RR4AI92JQ

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GCCAATCGAAAGCTGAAGCGACCAGCACCGACCAGAGACTGAAAACAAGAGGAAGGAAGA
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ATGCTTCCAAGGCAGAGACCAGGAAGAGTGAATATAATAAGAGTATGCAACAGTACAACA
TGAAACTGGCTAATGGAACCAGTAGAGGTGAAGATGATGAGTCCAAGTCTGAAGTGGACG
AAGCTGGAGGAGGAAGCGAAGAGGAGGAAGAAGACGATGATTAAGGAGGCTTTCTAGTTA
TTGCTATTTGACTGACTCATATTTGAGGATGGGATTAGGAATTTAAGTGTGACCTTAAAC
TTAAAAGAAAAATGGTTATGCTTTGTGTGTTTTGTAATACTAAGAACCTCATTTGCTACT
TGTTTCGTGTTTAGGTCAGTTGTATGGTCGGATAATATCAGTTGGGATGCTATATCTCCT
CATTACCTTCTGTGTTTATTTATTAAGGATTTATTTGACGAGTGGTATATGGGTTTAGTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AI92JQ 712 0 0
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AAGCGACCAGCACCGACCAGAGACTGAAAACAAGAGGAAGGAAGAAGAAGACGGCGACGA
AGGACCCAAACAAACCAAAGAGACCTCCAAGCGCTTTCTTCGTCTTCCTAGATGATTTTC
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AGACCAGGAAGAGTGAATATAATAAGAGTATGCAACAGTACAACATGAAACTGGCTAATG
GAACCAGTAGAGGTGAAGATGATGAGTCCAAGTCTGAAGTGGACGAAGCTGGAGGAGGAA
GCGAAGAGGAGGAAGAAGACGATGATTAAGGAGGCTTTCTAGTTATTGCTATTTGACTGA
CTCATATTTGAGGATGGGATTAGGAATTTAAGTGTGACCTTAAACTTAAAAGAAAAATGG
TTATGCTTTGTGTGTTTTGTAATACTAAGAACCTCATTTGCTACTTGTTTCGTGTTTAGG
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TTATTTATTAAGGATTTATTTGACGAGTGGTATATGGGTTTAGTTTAAGCGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL4843Contig1 562 2 4 U
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AAGGAAACTTCAGCGTAATGGAGACTGTTCCACGTCATGCGTCGTGGACATCGTGCTTGA
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ATGTAAGTTTGTAAGCAAACCCAGGGTTAACTTTTAACCCCGCATCCTTGTTTTTTATCT
CCCGAGTTAATTAGATTTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP88TF U 1
AF RR4EP88JQ C 1
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BS 320 320 RR4EP88JQ
BS 321 432 RR4EP88TF
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RD RR4EP88TF 432 0 0
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TTAAGTGTGTTT

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR4EP88JQ 562 0 0
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AAGGAAACTTCAGCGTAATGGAGACTGTTCCACGTCATGCGTCGTGGACATCGTGCTTGA
CGGAGTTTCCGATACCGTTGATCAGATGCTTGGGAACGCTTTCTGCTGGAACCGTACGGA
CTACGTTAGAATCCAGGTGAGCGGTTTGACTAGCGGCGGAGATGGAATTGTGGGGCCGAG
AAAAACGGCGGAGGAGTTGTTGAAAGAGAGAGGTGTCGAAACGGCACCGTTCGGAGGGAA
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TTAAGTGTGTTTTATTGTTATTTTATTTAGGATCTAAGCATAATATAAAGAGTGCCCGTG
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CCCGAGTTAATTAGATTTTCTC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL4844Contig1 868 2 2 U
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AGCAATAGATCTAACACAGCAACTAGTAATTTAGAGCTAAGACTACAGGGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGGATGGATAAGATGAATCAGGCGTTTGAGAAGATGAAGATGTTGGTGGGTATG
GAGGTTGAAGACGAGGAACGTGCTGCCGAAGAAGAAAGCTCTCTCTCATTCATGGAAGAT
CTCAATCGCAATTGCGCTTTGACTACCAAACAGAGATTCTATGGATTTGCGATTTGCTTG
TCAGCTGGCTTGGCATGTACTCTTTTGTCAATGCTTGTTTTCTTCAATCCGATCAAGTTT
GGCTTCTATTCACTCTTGGAAATTTGATGGCACTTGGGAGCACAGCATTCCTTATTGGCC
CACAGAGGCAGGTGACGATGATGCTTGACCCAGCTCGCATCTACGCTACTGCTTTGTATC
TTGCCAGCATTATCATTGCCTTGTTTTGCGCTCTCTATGTTCGTAACAAGCTGCTGACGC
TACTTGCTATCATTCTCGAGTTCTCTGGTCTAATATGGTATAGCTTGAGCTACATCCCTT
TTGCAAGGACCATGGTCTCAAAGGTGTTCATGACTTGTTTCGACACCGAGTTTTGAGCAC
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TCTTAACATGAACTTCATGTCTTCACAACTCGTAGCACAGTTTGTTGTATATTTTGCTGT
GGAAAATAACGTAGATTTTGTGCGGCTC


BQ
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AF RR4AF16TF U 1
AF RR4AF16JQ C 4
BS 1 829 RR4AF16TF
BS 830 868 RR4AF16JQ

RD RR4AF16TF 829 0 0
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GGCTTCTATTCACTCTTGGAAATTTGATGGCACTTGGGAGCACAGCATTCCTTATTGGCC
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TACTTGCTATCATTCTCGAGTTCTCTGGTCTAATATGGTATAGCTTGAGCTACATCCCTT
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QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4AF16JQ 865 0 0
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GCTGGCTTGGCATGTACTCTTTTGTCAATGCTTGTTTTCTTCAATCCGATCAAGTTTGGC
TTCTATTCACTCTTGGAAATTTGATGGCACTTGGGAGCACAGCATTCCTTATTGGCCCAC
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CCAGCATTATCATTGCCTTGTTTTGCGCTCTCTATGTTCGTAACAAGCTGCTGACGCTAC
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TAACATGAACTTCATGTCTTCACAACTCGTAGCACAGTTTGTTGTATATTTTGCTGTGGA
AAATAACGTAGATTTTGTGCGGCTC

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL4845Contig1 784 2 2 U
GGATGGTAATAACTTGCTGAAGAAGCTCTTTGCTGAGGTAAATCAAGATTCACAAAACTT
TTTACATCTTTTCCCGTAACATTGTCCTTCAACAAAGAAAAAAAATGGGTGAGAATCCAT
GGCAGCCTCTTCTCCTGACCTTCGAGAAACTATCGAATTGCGTCCAAACTCATCTCTCTA
ATTTCATCGGAGGCACCAAAAGTACTCCTCGTTCGTCATCCACAATCCAAAACCCAATCT
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AGGACAAGTCTATAGGTCCTGTGACTAAAGAAGATCTCGGGAGGGCTACTTGGACTTTTC
TGCACACTCTTGCTGCGCAGTATCCAGAAAGACCAACCAGGCAGCAAAAGAAGGATGTTA
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AAGAGATCCTAAGATCGAATCCTCCACAAGCTGGATCTCAGGAAGAGTTCTCGCAGTGGC
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GAGTGGATGCAAGATGGGGGCAAGTTAGAGTGCGAGCAGAAAAGTTGTGATCTTCATGGA
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AGTAATTGCACCCTATATACATGTTTCAAAGTTTATTTGCAGTTTTGGTAAAGACACTGT
TCAT


BQ
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20 20 20 10 

AF RR4DJ92TF U 1
AF RR4DJ92JQ C 65
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BS 784 784 RR4DJ92JQ

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GGCAGCCTCTTCTCCTGACCTTCGAGAAACTATCGAATTGCGTCCAAACTCATCTCTCTA
ATTTCATCGGAGGCACCAAAAGTACTCCTCGTTCGTCATCCACAATCCAAAACCCAATCT
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AAGAGATCCTAAGATCGAATCCTCCACAAGCTGGATCTCAGGAAGAGTTCTCGCAGTGGC
TTTGCCATGTACACAACACCGTAAATAGAAGTTTGGGGAAATTGGTGTTCCCTTGCGAGA
GAGTGGATGCAAGATGGGGGCAAGTTAGAGTGCGAGCAGAAAAGTTGTGATCTTCATGGA
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AGTAATTGCACCCTATATACATGTTTCAAAGTTTATTTGCAGTTTTGGTAAAGACACTGT
TCA

QA 1 783 1 783
DS 

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GCCTCTTCTCCTGACCTTCGAGAAACTATCGAATTGCGTCCAAACTCATCTCTCTAATTT
CATCGGAGGCACCAAAAGTACTCCTCGTTCGTCATCCACAATCCAAAACCCAATCTCCTT
AGACTCTCCTCCACTAATCACAACCAACAATTCTAATCCTCAGAAACTTCCTCTCAAGGA
CAAGTCTATAGGTCCTGTGACTAAAGAAGATCTCGGGAGGGCTACTTGGACTTTTTTGCA
CACTCTTGCTGCGCAGTATCCAGAAAGACCAACCAGGCAGCAAAAGAAGGATGTTAAAGA
ACTGATGGGGATACTTTCTCGAATGTACCCTTGTAGAGAATGCGCTGATCACTTCAAAGA
GATCCTAAGATCGAATCCTCCACAAGCTGGATCTCAGGAAGAGTTCTCGCAGTGGCTTTG
CCATGTACACAACACCGTAAATAGAAGTTTGGGGAAATTGGTGTTCCCTTGCGAGAGAGT
GGATGCAAGATGGGG*CAAGTTAGAGTGCGAGCAGAAAAGTTGTGATCTTCATGGAACTT
CTATGGACTTCTAGACATCATTATATTTTTACAAATTTACTACCCATTTTATTTAGAGTA
ATTGCACCCTATATACATGTTTCAAAGTTTATTTGCAGTTTTGGTAAAGACACTGTTCAT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL4846Contig1 1003 2 2 U
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TAAGAAGAAGAACAACAAGAAGCGATCCGAACCTGATCCAGACTTACCTTCAACGCGTGA
TTCCGGTGTTATTGATGAAGATAGAGACGGAGTGTTAGTTGACGACGAGCCAACGATGGG
TGATAAGTTCTCGAGTCTTAACTTACTAGGCGGAGAGAAAGTTGTCACTGATGATAATAA
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CTCGCTTCTACTTGATTGCTTGTACAACCGAGATGAACAGGTGATTGCTAACTCGGTTGC
TAAGTTGAATTCAGCAGAAGTACTCAAGCTTTTGAATTCTCTTTTACCAATATTACAGTC
AAGGGGTGCAGTGTTAGCTTGTGCGATTCCTTGGATAAAGTGTCTGTTACTTACTCATTC
CAGTGGGATTATGTCCCAGGAGTCATCGTTGCTTGCGTTGAACTCCATGTACCAGCTCAT
TGAATCACGGATATCAACTCTTCACACTGCTGTACAAGTTTCAAGCGAATTGGACTTGAT
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GAAAGAGTTTTATTTTTCTTAAAAGAAGGTTGAGGTCAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AR23TF U 1
AF RR4AR23JQ C 284
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BS 730 1003 RR4AR23JQ

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TGTGGACGACTTGGATGAAGAAGAAGAAGATGAAAGTCCTGTGATCTATGAGGACAAGGA
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QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4AR23JQ 720 0 0
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CTGTTACTTACTCATTCCAGTGGGATTATGTCCCAGGAGTCATCGTTGCTTGCGTTGAAC
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AGCGAATTGGACTTGATTGTGGACGACTTGGATGAAGAAGAAGAAGATGAAGGTCCTGTG
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TTTGAAGATTTTGACGACATGAGCGATTGAGAAGACTTCCTTAAAACGGAAATAGTTTTG
ATTTGTGTTGAGGTACAAGTCTCGGCACGAATTTTGTAATACGCAATGGTTTGTATCAGC
TATAGACTATGTACTAAGAAAGAGTTTTATTTTTCTTAAAAGAAGGTTGAGGTCAATATG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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GAGCGCAACCTCCTCTCCGTGGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGCCGCGCCTCGTGG
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TGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCATCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCT
ACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTAAGGAGA
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ATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTAGATACAC
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CTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGC
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TTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGAAGG
TTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACAATTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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AF RR4E457TF U 1
AF RR4E457JQ C 58
BS 1 717 RR4E457TF
BS 718 718 RR4E457JQ
BS 719 765 RR4E457TF
BS 766 766 RR4E457JQ
BS 767 780 RR4E457TF
BS 781 819 RR4E457JQ

RD RR4E457TF 780 0 0
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CGGATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGAGGACCGCGTCAAG
ACGATCCGCGACTACAAGGCGAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACGGGATCC
TGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCATCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCT
ACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTAAGGAGA
GGGACGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATTCTCCTG
ATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTAGATACAC
TAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCA
CTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGC
CAACAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGTGTCTAATCAACAGAG
ATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTTTATCTCCTTTTTT*CC
TTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTT*CAAATCATGGAAGG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4E457JQ 762 0 0
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TGGCGGATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGAGGACCGCGTC
AAGACGATCCGCGACTACAAGGCGAGATCGAGACGGAGCTCGCGGGGATCTGCGACGGGA
TCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCATCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGT
TCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGTAAGG
AGAGGGACGATGCGGCTGATAACCCCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATTCTC
CTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTAGATA
CACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACC
TCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAA
AGCCAACAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGTGTCTAATCAACA
GAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTTTATCTCCTTTTTT
TCCTTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGA
AGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACAATTTAATT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL4848Contig1 839 2 2 U
GCAATATGTGACCAACATTATAATCCATGGTTTAAACATACATGACTGTAGGCAAGGTGG
GAACACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGGAGGACTATATCGGATGGTGA
TGGTGTGTCCATCTTCGGCGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTG
TAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCTATAACTATCTCTAATAATTA
CTTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACACGTATGTGCAAGACAA
GAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCTCGTCCAAAGAATGCC
AAGATGCCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAACGACTACACACATTGGGAAATGTA
TGCAATTGGAGGAAGTGCAAATCCTACCATCACCTCCCAAGGCAACCGTTTTCTTGCTCC
TGATGGTCCTGATGACAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCACCCGAGAGTGAATGGAG
TAATTGGAACTGGAGATCAGAAGGAGATCTAATGCTTAACGGTGTATTCTTTACACTTTC
TGGAGCTGGACCAACTAAATCGTCAAGCTATTCAAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGACC
GTCCTCTCGTGTTGGTGGTTTAACTATAGCATCGGGTGCACTCAGCTGCAAAAAGGGTTC
TCACTGCTGACCACACCAGCGTGTATTTATGTGTGTGTGTATATAATATAATGAAACTAG
CAACTTGAAAGCTAGTTATGTAATAATCTTAATGAAAAAAGTGAAGAAGCGTTGATTAC


BQ
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AF RR4DV13TF U 1
AF RR4DV13JQ C 1
BS 1 710 RR4DV13TF
BS 711 839 RR4DV13JQ

RD RR4DV13TF 710 0 0
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CTTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACACGTATGTGCAAGACAA
GAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCTCGTCCAAAGAATGCC
AAGATGCCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAACGACTACACACATTGGGAAATGTA
TGCAATTGGAGGAAGTGCAAATCCTACCATCACCTCCCAAGGCAACCGTTTTCTTGCTCC
TGATGGTCCTGATGACAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCACCCGAGAGTGAATGGAG
TAATTGGAACTGGAGATCAGAAGGAGATCTAATGCTTAACGGTGTATTCTTTACACTTTC
TGGAGCTGGACCAACTAAATCGTCAAGCTATTCAAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGACC
GTCCTCTCGTGTTGGTGGTTTAACTATAGCATCGGGTGCACTCAGCTGCA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4DV13JQ 839 0 0
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TGGTGTGTCCATCTTCGGCGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTG
TAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCTATAACTATCTCTAATAATTA
CTTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACACGTATGTGCAAGACAA
GAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCTCGTCCAAAGAATGCC
AAGATGCCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAACGACTACACACATTGGGAAATGTA
TGCAATTGGAGGAAGTGCAAATCCTACCATCACCTCCCAAGGCAACCGTTTTCTTGCTCC
TGATGGTCCTGATGACAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCACCCGAGAGTGAATGGAG
TAATTGGAACTGGAGATCAGAAGGAGATCTAATGCTTAACGGTGTATTCTTTACACTTTC
TGGAGCTGGACCAACTAAATCGTCAAGCTATTCAAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGACC
GTCCTCTCGTGTTGGTGGTTTAACTATAGCATCGGGTGCACTCAGCTGCAAAAAGGGTTC
TCACTGCTGACCACACCAGCGTGTATTTATGTGTGTGTGTATATAATATAATGAAACTAG
CAACTTGAAAGCTAGTTATGTAATAATCTTAATGAAAAAAGTGAAGAAGCGTTGATTAC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL4849Contig1 842 2 4 U
GTGAAACTGTGCATGACGAGCGCATCAGAACTCTTCTCTACTCGAAGATCGCGTCCGGGC
AGATCCAACACGGATTTAGAATCCGACTCCCCTCTGTATCGACACCACTCACATCATCAT
CACCGTCACGGAATCCATCATCGTAATCACCGTCACGATTCGGACGGCTGTGATTCTCTC
CGGCGTGTTTCGCCGCGTCTCCGACGCTTCTGTCACAATCTTGGTCTTCCGGAACGTGGT
AGACCTACTCGTGACGTGCAAGGCACTCCACAGTATTTGGAAACTGAAAGTAACAGTTTC
GGAAACCTAAATGGATCCGAGAGGCTTCCTGGATCTGTTCTTCTCGCAAGGGCAAGACTT
GTCCAAAGATTGAGAGGAGTTTCTTCGTCTAGTAACAGCTCCTCATTTCACTCCTCAGAT
GGGGTTCAAGTGTCTTATGAATGTAACAAGAAGCCACATGGTCTCACACAAGGTGCCATT
AATGGTTTACGCCGGCAAACTTTTAGCTCAGCCGATGTTAAAACCGAGAGGAGAGATTGC
AGTATATGTTTAGAGAGCTTCACTAATGGCGACAGGCTTATATCCTTGCCATGTACCCAT
AGTTTCCATTCCTCGTGCTTAAACCCTTGGCTTAAAGCTTGTGGAGATTGCCCTTGTTGC
CGTAGAGCCATAGTTAAATTATATAGAAAACTGTAAATAGATATTTCCTTATCCATAGGC
ACACGCATCTTCTGCTCTTGCTCTAGACAGATCTTCCAGTTTTGTCGCGCATTTGAGTGT
TTTTCTGTCACATGTTTGTGTTTGTTAACGGTTTTGTTCATTTTAATCTCTCTTCTTAAT
CC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4BR44TF U 1
AF RR4BR44JQ C 221
BS 1 643 RR4BR44TF
BS 644 644 RR4BR44JQ
BS 645 666 RR4BR44TF
BS 667 842 RR4BR44JQ

RD RR4BR44TF 666 0 0
GTGAAACTGTGCATGACGAGCGCATCAGAACTCTTCTCTACTCGAAGATCGCGTCCGGGC
AGATCCAACACGGATTTAGAATCCGACTCCCCTCTGTATCGACACCACTCACATCATCAT
CACCGTCACGGAATCCATCATCGTAATCACCGTCACGATTCGGACGGCTGTGATTCTCTC
CGGCGTGTTTCGCCGCGTCTCCGACGCTTCTGTCACAATCTTGGTCTTCCGGAACGTGGT
AGACCTACTCGTGACGTGCAAGGCACTCCACAGTATTTGGAAACTGAAAGTAACAGTTTC
GGAAACCTAAATGGATCCGAGAGGCTTCCTGGATCTGTTCTTCTCGCAAGGGCAAGACTT
GTCCAAAGATTGAGAGGAGTTTCTTCGTCTAGTAACAGCTCCTCATTTCACTCCTCAGAT
GGGGTTCAAGTGTCTTATGAATGTAACAAGAAGCCACATGGTCTCACACAAGGTGCCATT
AATGGTTTACGCCGGCAAACTTTTAGCTCAGCCGATGTTAAAACCGAGAGGAGAGATTGC
AGTATATGTTTAGAGAGCTTCACTAATGGCGACAGGCTTATATCCTTGCCATGTACCCAT
AGTTTCCATTCCTCGTGCTTAAACCCTTGGCTTAAAGCTTGTG*AGATTGCCCTTGTTGC
CGTAGA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4BR44JQ 622 0 0
TTGGTCTTCCGGAACGTGGTAGACCTACTCGTGACGTGCAAGGCACTCCACAGTATTTGG
AAACTGAAAGTAACAGTTTCGGAAACCTAAATGGATCCGAGAGGCTTCCTGGATCTGTTC
TTCTCGCAAGGGCAAGACTTGTCCAAAGATTGAGAGGAGTTTCTTCGTCTAGTAACAGCT
CCTCATTTCACTCCTCAGATGGGGTTCAAGTGTCTTATGAATGTAACAAGAAGCCACATG
GTCTCACACAAGGTGCCATTAATGGTTTACGCCGGCAAACTTTTAGCTCAGCCGATGTTA
AAACCGAGAGGAGAGATTGCAGTATATGTTTAGAGAGCTTCACTAATGGCGACAGGCTTA
TATCCTTGCCATGTACCCATAGTTTCCATTCCTCGTGCTTAAACCCTTGGCTTAAAGCTT
GTGGAGATTGCCCTTGTTGCCGTAGAGCCATAGTTAAATTATATAGAAAACTGTAAATAG
ATATTTCCTTATCCATAGGCACACGCATCTTCTGCTCTTGCTCTAGACAGATCTTCCAGT
TTTGTCGCGCATTTGAGTGTTTTTCTGTCACATGTTTGTGTTTGTTAACGGTTTTGTTCA
TTTTAATCTCTCTTCTTAATCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL4850Contig1 765 2 3 U
GGGGGCTACAAAGTTACCTTCTTCTCTTCTAGAGCCATGGCCGCCACCGTAGAAATCGAC
GCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAATGAGGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTTGAC
GACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCTGCAAAACAC
GCCACCTTTGTCCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTGTCAAGAGGTTCAGGAAAGCTCAG
TGCCCTATTGTCGAGAGGCTCACTAACTCCCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAG
AAGTCGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGAC
GCCAACCCTATTCAAGTTATCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCG
ACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTCAGGAGACAGGCCGTTGATATCTCTCCTCTGAGA
CGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAAC
ATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTCGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAAGGATCTTCC
AACAGTTATGCCATCAAGAAGAAAGATGAGATCGAGAGAGTTGCTAAAGCCAACCGTTAA
GGGTTCTTCCTTAGTTTTTTTGCATTATTATCTCAAATAAGCTTTTGTGCTGTTTTCGTT
AGCTTTTGATAATGTTAAAGAATATTTCTCCCATCTTTTAATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GW48TF U 1
AF RR4GW48JQ C 52
BS 1 680 RR4GW48TF
BS 681 681 RR4GW48JQ
BS 682 765 RR4GW48TF

RD RR4GW48TF 765 0 0
GGGGGCTACAAAGTTACCTTCTTCTCTTCTAGAGCCATGGCCGCCACCGTAGAAATCGAC
GCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAATGAGGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTTGAC
GACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCTGCAAAACAC
GCCACCTTTGTCCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTGTCAAGAGGTTCAGGAAAGCTCAG
TGCCCTATTGTCGAGAGGCTCACTAACTCCCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAG
AAGTCGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGAC
GCCAACCCTATTCAAGTTATCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCG
ACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTCAGGAGACAGGCCGTTGATATCTCTCCTCTGAGA
CGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAAC
ATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTCGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAAGGATCTTCC
AACAGTTATGCCATCAAGAAGAAAGATGAGATCGAGAGAGTTGCTAAAGCCAACCGTTAA
GGGTTCTTCCTTAGTTTTTT*GCATTATTATCTCAAATAAGCTTTTGTGCTGTTTTCGTT
AGCTTTTGATAATGTTAAAGAATATTTCTCCCATCTTTTAATGAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4GW48JQ 714 0 0
GAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAATGAGGTCAAGCTCTTCAACCGTTGG
AGCTTTGACGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCT
GCAAAACACGCCACCTTTGTCCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTGTCAAGAGGTTCAGG
AAAGCTCAGTGCCCTATTGTCGAGAGGCTCACTAACTCCCTCATGATGCACGGGAGGAAC
AACGGTAAGAAGTCGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTC
TTGACTGACGCCAACCCTATTCAAGTTATCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGT
GAAGATGCGACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTCAGGAGACAGGCCGTTGATATCTCT
CCTCTGAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGCACGTGAAGCTGCC
TTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTCGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAA
GGATCTTCCAACAGTTATGCCATCAAGAAGAAAGATGAGATCGAGAGAGTTGCTAAGGCC
AACCGTTAAGGGTTCTTCCTTAGTTTTTTTGCATTATTATCTCAAATAAGCTTTTGTGCT
GTTTTCGTTAGCTTTTGATAATGTTAAAGAATATTTCTCCCATCTTTTAATGAA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL4851Contig1 1122 2 2 U
GGGACAGAGAGATGAGACAGAGAGAGAGAGATGAGAGATTGAATGCGGAAGAAGAAGATA
CCTGTCTTTTTCTCTTCTCATCTCAACTCTTCCTCTGATCCTCTCCATTCTTTATCTGAA
ACACGACAGAGAGATGAGAGATAAGAGATGAGACGGAGAGATGAGAGGTAAGAGATGAGA
CAGAGAGATGAGAGATTGAGATTACAGGAGGAAAAAGAAGAGACTGGTCTGAGTTCGTCA
TTGTCGTCACCTCCCGTAACGCCTCTCCCCTCTGCAGCCGGATTCGAACCCAACTGTACC
CAGAACAACAACCCATCACCGCTCAATGAGAAGCTTGAGTGATAACGACTGTAACGAAAT
GGTGGTGGTGGTGTCGATGATAACAGAGAGAAGACAGATATCTCGGCTTGGTCTGCGTGA
ATCCTCTCTGGTCTCTTTAGCTTCGTGAAGAACAGATGTGGGAGCTGGAAAGTCTGCGGT
TTTAAACAGTTTAATTGGGCATCCTGTTCTACCTACGGGTGAGAATGGTGCTACACGGGC
TCCTATAATACTTGACTTGAGCAGGGAGTCTTCTTTGAGTAGCAAGGTGCTCTGAGACAC
TCTCTTCAAGATAGGCTTAGCAAAGGAGCCTCTGGGAAGAATCGTGATGAAATATATTTG
AAACTTCGTACCAGCACTGAAAATGGTCGATCATGATTACGTGGAGTATAACAACTCTCC
CACAACGAGTTCATCTCAGGATCACTCTCCATGGCTCTCTGCTTAGCATCATTTCCCCTT
TATAAGTCTGATGCAAGGAGCTTGACGACAGAGGAGGCAAGGCGTTGTGCTGTGGGGATG
CGAATCGTGGTGTGGTGCGGCACTAGGAGATAGATCTTTAGGTTCTGAAATTTTATGTGT
AGCTTTGGAAGGCGAAGAACACTTGGCATCAGATAGATACACTTGTACTCCACTATTATC
ATCTTGGTTGTCATGGCGATGACAGTGAAGACTTAGCTTTAGGTGTATGTTTTTGGTTTA
GCTATAGGTTTATGTTTTGGTTTAGTTATGGTTTAGATTTTTTGGTTTTGTTTTTGGTAA
TTTTGTAAACAATTTCGATATATAGAATTTTAAAATATTTTT


BQ
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AF RR4DG85TF U 1
AF RR4DG85JQ C 293
BS 1 746 RR4DG85TF
BS 747 1122 RR4DG85JQ

RD RR4DG85TF 746 0 0
GGGACAGAGAGATGAGACAGAGAGAGAGAGATGAGAGATTGAATGCGGAAGAAGAAGATA
CCTGTCTTTTTCTCTTCTCATCTCAACTCTTCCTCTGATCCTCTCCATTCTTTATCTGAA
ACACGACAGAGAGATGAGAGATAAGAGATGAGACGGAGAGATGAGAGGTAAGAGATGAGA
CAGAGAGATGAGAGATTGAGATTACAGGAGGAAAAAGAAGAGACTGGTCTGAGTTCGTCA
TTGTCGTCACCTCCCGTAACGCCTCTCCCCTCTGCAGCCGGATTCGAACCCAACTGTACC
CAGAACAACAACCCATCACCGCTCAATGAGAAGCTTGAGTGATAACGACTGTAACGAAAT
GGTGGTGGTGGTGTCGATGATAACAGAGAGAAGACAGATATCTCGGCTTGGTCTGCGTGA
ATCCTCTCTGGTCTCTTTAGCTTCGTGAAGAACAGATGTGGGAGCTGGAAAGTCTGCGGT
TTTAAACAGTTTAATTGGGCATCCTGTTCTACCTACGGGTGAGAATGGTGCTACACGGGC
TCCTATAATACTTGACTTGAGCAGGGAGTCTTCTTTGAGTAGCAAGGTGCTCTGAGACAC
TCTCTTCAAGATAGGCTTAGCAAAGGAGCCTCTGGGAAGAATCGTGATGAAATATATTTG
AAACTTCGTACCAGCACTGAAAATGGTCGATCATGATTACGTGGAGTATAACAACTCTCC
CACAACGAGTTCATCTCAGGATCACT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4DG85JQ 830 0 0
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AACGAAATGGTGGTGGTGGTGTCGATGATAACAGAGAGAAGACAGATATCTCGGCTTGGT
CTGCGTGAATCCTCTCTGGTCTCTTTAGCTTCGTGAAGAACAGATGTGGGAGCTGGAAAG
TCTGCGGTTTTAAACAGTTTAATTGGGCATCCTGTTCTACCTACGGGTGAGAATGGTGCT
ACACGGGCTCCTATAATACTTGACTTGAGCAGGGAGTCTTCTTTGAGTAGCAAGGTGCTC
TGAGACACTCTCTTCAAGATAGGCTTAGCAAAGGAGCCTCTGGGAAGAATCGTGATGAAA
TATATTTGAAACTTCGTACCAGCACTGAAAATGGTCGATCATGATTACGTGGAGTATAAC
AACTCTCCCACAACGAGTTCATCTCAGGATCACTCTCCATGGCTCTCTGCTTAGCATCAT
TTCCCCTTTATAAGTCTGATGCAAGGAGCTTGACGACAGAGGAGGCAAGGCGTTGTGCTG
TGGGGATGCGAATCGTGGTGTGGTGCGGCACTAGGAGATAGATCTTTAGGTTCTGAAATT
TTATGTGTAGCTTTGGAAGGCGAAGAACACTTGGCATCAGATAGATACACTTGTACTCCA
CTATTATCATCTTGGTTGTCATGGCGATGACAGTGAAGACTTAGCTTTAGGTGTATGTTT
TTGGTTTAGCTATAGGTTTATGTTTTGGTTTAGTTATGGTTTAGATTTTTTGGTTTTGTT
TTTGGTAATTTTGTAAACAATTTCGATATATAGAATTTTAAAATATTTTT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL4852Contig1 791 2 2 U
GGAGAACTCAACTGGCTCACTTGATGTCCTAGTTACTGACAGTAATAATAATCTTCACGC
GTCTTCAGGGAGGAACTTGAGTGATAGCGAGACAGAGAGCGGGGAGTTGAGTTCTTGGAC
GAGGACTGGTGGACCGTTGATGAGAACAGCTTCTGCTAATCTGTTCACTGACTTCGTTCA
CGGTCTTGATGTCGACATTGCGTTGGCAAGAGGGTTTACTAGCAGCAGCCCCAATTCTCC
AGCGGTTCCTGGCCCGGTTAGTCCGAGCTTTAGTCCGAGGTCGAGATCCGTGGCGGCTCA
ATCCGAGAGCGAAGCTGACAAGAGGGAATCTAGCAACGTTCTTGGAGCAGCAGCGAACGG
TTCAAGGATAACGGTTACCGAAGGTGATCTTCTACAGCCTGAGAGAACGAGTAATGGTTT
TGTGTTGAACGTTGTTAGAAGAGAGGACTTGGGAATGAATGTCGGGAATGAGATGCCGGA
GAGTGTACAGCTTGATATACATGAGAGGGAGATGGATAATAGCTCTGTTTCAGAACATGA
CCAAGAAGATGATGATGATGATGATGATGAAGAAGTAGAACATGAGGGCTCAGTTCCGGT
TACCGTTTCTTCAAAAGATTCCGGTTTACACGGACCGATATCTGATACTGTTATAGATGC
TTAGACTGATTGATCCGAGTGAAGAGATTGTCAACTGATTGAAGTTAGATTCTTGTTCAG
GGAGAGTTTATAAAGTGTTATAATGCTTTGTAAATAGAATAACTATAAGCCATAAGGTTT
GTGTTGTGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL82TF U 1
AF RR4EL82JQ C 287
BS 1 693 RR4EL82TF
BS 694 791 RR4EL82JQ

RD RR4EL82TF 698 0 0
GGAGAACTCAACTGGCTCACTTGATGTCCTAGTTACTGACAGTAATAATAATCTTCACGC
GTCTTCAGGGAGGAACTTGAGTGATAGCGAGACAGAGAGCGGGGAGTTGAGTTCTTGGAC
GAGGACTGGTGGACCGTTGATGAGAACAGCTTCTGCTAATCTGTTCACTGACTTCGTTCA
CGGTCTTGATGTCGACATTGCGTTGGCAAGAGGGTTTACTAGCAGCAGCCCCAATTCTCC
AGCGGTTCCTGGCCCGGTTAGTCCGAGCTTTAGTCCGAGGTCGAGATCCGTGGCGGCTCA
ATCCGAGAGCGAAGCTGACAAGAGGGAATCTAGCAACGTTCTTGGAGCAGCAGCGAACGG
TTCAAGGATAACGGTTACCGAAGGTGATCTTCTACAGCCTGAGAGAACGAGTAATGGTTT
TGTGTTGAACGTTGTTAGAAGAGAGGACTTGGGAATGAATGTCGGGAATGAGATGCCGGA
GAGTGTACAGCTTGATATACATGAGAGGGAGATGGATAATAGCTCTGTTTCAGAACATGA
CCAAGAAGATGATGATGATGATGATGATGAAGAAGTAGAACATGAGGGCTCAGTTCCGGT
TACCGTTTCTTCAAAAGATTCCGGTTTACACGGACCGATATCTGATACTGTTATAGATGC
TTAGACTGATTGATCCGAGTGAAGAGATTGTCA
CTGAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4EL82JQ 505 0 0
TCCGTGGCGGCTCAATCCGAGAGCGAAGCTGACAAGAGGGAATCTAGCAACGTTCTTGGA
GCAGCAGCGAACGGTTCAAGGATAACGGTTACCGAAGGTGATCTTCTACAGCCTGAGAGA
ACGAGTAATGGTTTTGTGTTGAACGTTGTTAGAAGAGAGGACTTGGGAATGAATGTCGGG
AATGAGATGCCGGAGAGTGTACAGCTTGATATACATGAGAGGGAGATGGATAATAGCTCT
GTTTCAGAACATGACCAAGAAGATGATGATGATGATGATGATGAAGAAGTAGAACATGAG
GGCTCAGTTCCGGTTACCGTTTCTTCAAAAGATTCCGGTTTACACGGACCGATATCTGAT
ACTGTTATAGATGCTTAGACTGATTGATCCGAGTGAAGAGATTGTCAACTGATTGAAGTT
AGATTCTTGTTCAGGGAGAGTTTATAAAGTGTTATAATGCTTTGTAAATAGAATAACTAT
AAGCCATAAGGTTTGTGTTGTGTGC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL4853Contig1 990 2 2 U
GAAAACATCACTTGCAAGACTTTTCTTCTTCTGTCTTGTCTGCATATAAGAAAATAAAAT
ATGGCAACCATCGAGGAAAGCTCTGATTTGGATGATATACAGAAGCATCTATTTGAGGAC
CTGATGATCCCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTGTCTTTGATGATGCTGATTTTTTCTCA
GGACTCTGGTCTCTAGAACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGTT
CTTGATCCAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAACA
ACTACAACTACAACAACAACTACAACTACAACCACAGCATCAACTGAGGTTGAAACTGTC
TCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGAGACAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAGG
AGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGATT
TGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTGATGCTGCAAGAGCTTATGACTATGAAGCTTTT
AAGCTAAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGCT
CCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAACCGATGTACCGGAGCCTCAAGGAACAACT
TCCAGTAATTCATCATCGAACTAATGGGATTGGTGATGCTTAAGTTTTAATTAGTATAGG
TAAATATCTAAGTATGTGAAGTATCATGTATATAGAGCGAGGAAAAATGTTGGATTAGTG
TAGTTAATGTGTAATAAAGAGTTCCTGTGACAATGGAACTACTGTGTTCTTTCATGGCTC
AAAGAGGCTCAGGATGAATCTGAAGTATTAATTGGGTAGAGATGTCCAGAGAGTATGAAT
CAAAGAATTGAGTAGATGTGCAAGTTGCAAGAGGGACCAGAATTTAAAATAAATAAATAA
AATGTACCCAAGTGTTGTCTCATGGTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EK05TF U 1
AF RR4EK05JQ C 209
BS 1 648 RR4EK05TF
BS 649 990 RR4EK05JQ

RD RR4EK05TF 648 0 0
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ATGGCAACCATCGAGGAAAGCTCTGATTTGGATGATATACAGAAGCATCTATTTGAGGAC
CTGATGATCCCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTGTCTTTGATGATGCTGATTTTTTCTCA
GGACTCTGGTCTCTAGAACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGTT
CTTGATCCAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAACA
ACTACAACTACAACAACAACTACAACTACAACCACAGCATCAACTGAGGTTGAAACTGTC
TCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGAGACAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAGG
AGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGATT
TGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTGATGCTGCAAGAGCTTATGACTATGAAGCTTTT
AAGCTAAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGCT
CCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAACCGATGTACCGGAGCCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4EK05JQ 782 0 0
CAAG
TCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCT
GCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAACAACTACAACTACAACAACAACTACAACTACAAC
CACAGCATCAACTGAGGTTGAAACTGTCTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGA
GACAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCG
AGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGATTTGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTGATGC
TGCAAGAGCTTATGACTATGAAGCTTTTAAGCTAAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTT
TCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGCTCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAC
CGATGTACCGGAGCCTCAAGGAACAACTTCCAGTAATTCATCATCGAACTAATGGGATTG
GTGATGCTTAAGTTTTAATTAGTATAGGTAAATATCTAAGTATGTGAAGTATCATGTATA
TAGAGCGAGGAAAAATGTTGGATTAGTGTAGTTAATGTGTAATAAAGAGTTCCTGTGACA
ATGGAACTACTGTGTTCTTTCATGGCTCAAAGAGGCTCAGGATGAATCTGAAGTATTAAT
TGGGTAGAGATGTCCAGAGAGTATGAATCAAAGAATTGAGTAGATGTGCAAGTTGCAAGA
GGGACCAGAATTTAAAATAAATAAATAAAATGTACCCAAGTGTTGTCTCATGGTTGGG

QA 5 782 5 782
DS 



AS 1 2

CO CL4854Contig1 1057 2 2 U
GGAGGCGTTTGAGCACAACACGTGTGTTAATAAATCGAGTATCATGCGGGCGATCACCGC
AGCTTACTTCAGAAGCAATGAAGTTGACAGTCTTGTCAGTTTCGTCAAGCGTGCAGAGTC
TGCTGGTTGGAAACTATGCAGGTCTCTCTACCACTGTAAGATAATGATGTATGGGTCCCA
AAAACGCTTTGAAGAAATGGAAGGTGTTGTAAATGAGATGGGTGAGACTAATTATGGGCT
TGTGACTAAAACGTTTGCGATTATGGTTAAGTCTTATAGAAGTCACGGAATGGAGTCGAA
TGCTGAGAGAGTTATGGGAAAGATGCTGAAACATGGGTGTCTACATATTTCAAAAGCACA
TCCAACTCAATCGGCTTTAGATGCAAGTCAAGTTGCGTAAAGAATCCTGGTGTTTTGATT
TGTTCAGTGTCTTTATATCAAGGGTTAGCAGTGGCCATTCAGAGGATCAGAAGGCTCTGT
AGAAGTGTGCCACATGAGCCTTGATAAAAAGATGAGGAATAGGCTTCCACAGGAGTTTTG
TGATGAGGTATAACACCTTTTATCTCCCGTCATGAGTGAATCAGTCATCATTATGCAGCC
AAGTTGTACATGTTAACGGCAAGAGTTTGAAGCTTCCATGGCAGATTTTTAAACATATTG
GTGGATGAGAACCTCAGTAAAACGAAATTTCATGAGGACAAGGTTTGCTTTTTTTTACTT
GTGTAACAGCTGATAGATTTTTCTTTTTTAAGAAAATGAAGAACAGGCTTTGCCAAGTGA
AGTTGTTAGTTACCTTGAGAAACCTGACTGACATTTGCAATGTGTGTCTCTTCCTGCCAG
CTCTCTGTGGGTCCAATTTTCCGGTTGCTCTTAAGTTAAAACTTCTGTTGTTAGGTTATT
TGCTCTGTTGTTTTGCATTGAGCTATGTTTGTAGTTAGAGGAATAGATAAGCTCAGTTAC
ACCAAGGTTTCAGTATAGATTAGTGGGGACATCATTTGCTAATTTACAACATATTCAGAA
ATTCTTTTAATTAATAAGCCATGGAGCCTTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DS79TF U 1
AF RR4DS79JQ C 253
BS 1 688 RR4DS79TF
BS 689 1057 RR4DS79JQ

RD RR4DS79TF 692 0 0
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AGCTTACTTCAGAAGCAATGAAGTTGACAGTCTTGTCAGTTTCGTCAAGCGTGCAGAGTC
TGCTGGTTGGAAACTATGCAGGTCTCTCTACCACTGTAAGATAATGATGTATGGGTCCCA
AAAACGCTTTGAAGAAATGGAAGGTGTTGTAAATGAGATGGGTGAGACTAATTATGGGCT
TGTGACTAAAACGTTTGCGATTATGGTTAAGTCTTATAGAAGTCACGGAATGGAGTCGAA
TGCTGAGAGAGTTATGGGAAAGATGCTGAAACATGGGTGTCTACATATTTCAAAAGCACA
TCCAACTCAATCGGCTTTAGATGCAAGTCAAGTTGCGTAAAGAATCCTGGTGTTTTGATT
TGTTCAGTGTCTTTATATCAAGGGTTAGCAGTGGCCATTCAGAGGATCAGAAGGCTCTGT
AGAAGTGTGCCACATGAGCCTTGATAAAAAGATGAGGAATAGGCTTCCACAGGAGTTTTG
TGATGAGGTATAACACCTTTTATCTCCCGTCATGAGTGAATCAGTCATCATTATGCAGCC
AAGTTGTACATGTTAACGGCAAGAGTTTGAAGCTTCCATGGCAGATTTTTAAACATATTG
GTGGATGAGAACCTCAGTAAAACGAAAT
CTCA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4DS79JQ 805 0 0
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TATGGGAAAGATGCTGAAACATGGGTGTCTACATATTTCAAAAGCACATCCAACTCAATC
GGCTTTAGATGCAAGTCAAGTTGCGTAAAGAATCCTGGTGTTTTGATTTGTTCAGTGTCT
TTATATCAAGGGTTAGCAGTGGCCATTCAGAGGATCAGAAGGCTCTGTAGAAGTGTGCCA
CATGAGCCTTGATAAAAAGATGAGGAATAGGCTTCCACAGGAGTTTTGTGATGAGGTATA
ACACCTTTTATCTCCCGTCATGAGTGAATCAGTCATCATTATGCAGCCAAGTTGTACATG
TTAACGGCAAGAGTTTGAAGCTTCCATGGCAGATTTTTAAACATATTGGTGGATGAGAAC
CTCAGTAAAACGAAATTTCATGAGGACAAGGTTTGCTTTTTTTTACTTGTGTAACAGCTG
ATAGATTTTTCTTTTTTAAGAAAATGAAGAACAGGCTTTGCCAAGTGAAGTTGTTAGTTA
CCTTGAGAAACCTGACTGACATTTGCAATGTGTGTCTCTTCCTGCCAGCTCTCTGTGGGT
CCAATTTTCCGGTTGCTCTTAAGTTAAAACTTCTGTTGTTAGGTTATTTGCTCTGTTGTT
TTGCATTGAGCTATGTTTGTAGTTAGAGGAATAGATAAGCTCAGTTACACCAAGGTTTCA
GTATAGATTAGTGGGGACATCATTTGCTAATTTACAACATATTCAGAAATTCTTTTAATT
AATAAGCCATGGAGCCTTTTGTTTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL4855Contig1 785 2 3 U
TTTGCCTTTAGAAGAGGTTGGAGTGGGTGGAGTACGCTTGCATCGCTGGTATAATTTGCA
CGGAGGGGTTGTAGGGGGTGGAGTACGCTTGCATCGCTGGTAGAGTTGGCACGGAATAGA
CGGAGGACCAATAAAGTAGCGGCGTTGCCTTTGGACTGTCACTTGATCAGGATGGTTTGT
CTCTTCTGCACCAGCGCCAACCAAATGCATTACTCATTTATATATGGTTTGGCAATTCTC
GTATTGATTTGTAGCCCAGCATAGCTAAAGGCGAATCAAAAATTAAATTGGGTTGTAAGA
CAAAAATTGTCTTCTTCTTCATATCCACTTAATTCTTTTATCCACAAAACCTAAATTTAT
GTTTGAATCGAACCAAAAAGAGAAAAAACTACCAAAATTTATTCTAATTTTAAAAGTTAG
AATTAGTTTGGTTTAATAAATATATATGAACTAAAACTTTTGTTAAAAAAAAAGAAAAAG
AAAACCAATCGATGTTTTATGTTCAGTATTATTACCTTTGTTATTTCGTATTCTTTAATC
GAGAATCCAAAAAATATCAAGAACGCAATAAAACATTAAAATTTAACACCCTTGAGTTAA
ATTACCTAACTGGTAAACCAAAATAGTCATGACTTATGAAAGACAAAAAAGACTCACTGA
GTTCGTGGAGCTCCGTTTCTGCGCCAAGGGCTTTTTCCATATGCGGAAACACAATAAGAA
GAAGAAGAAAGGAAAACATGCAGGAGACTATGGAAGATGTCATTATTTCTTTTTAGTTTA
CTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4BG28JQ U 267
AF RR4BG28TF C 1
BS 1 266 RR4BG28TF
BS 267 702 RR4BG28JQ
BS 703 785 RR4BG28TF

RD RR4BG28JQ 436 0 0
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ACTTAATTCTTTTATCCACAAAACCTAAATTTATGTTTGAATCGAACCAAAAAGAGAAAA
AACTACCAAAATTTATTCTAATTTTAAAAGTTAGAATTAGTTTGGTTTAATAAATATATA
TGAACTAAAACTTTTGTTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAACCAATCGATGTTTTATGTTCAG
TATTATTACCTTTGTTATTTCGTATTCTTTAATCGAGAATCCAAAAAATATCAAGAACGC
AATAAAACATTAAAATTTAACACCCTTGAGTTAAATTACCTAACTGGTAAACCAAAATAG
TCATGACTTATGAAAGACAAAAAAGACTCACTGAGTTCGTGGAGCTCCGTTTCTGCGCCA
AGGGCTTTTTCCATAT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR4BG28TF 785 0 0
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CGGAGGGGTTGTAGGGGGTGGAGTACGCTTGCATCGCTGGTAGAGTTGGCACGGAATAGA
CGGAGGACCAATAAAGTAGCGGCGTTGCCTTTGGACTGTCACTTGATCAGGATGGTTTGT
CTCTTCTGCACCAGCGCCAACCAAATGCATTACTCATTTATATATGGTTTGGCAATTCTC
GTATTGATTTGTAGCCCAGCATAGCTAAAGGCGAATCAAAAATTAAATTGGGTTGTAAGA
CAAAAATTGTCTTCTTCTTCATATCCACTTAATTCTTTTATCCACAAAACCTAAATTTAT
GTTTGAATCGAACCAAAAAGAGAAAAAACTACCAAAATTTATTCTAATTTTAAAAGTTAG
AATTAGTTTGGTTTAATAAATATATATGAACTAAAACTTTTGTTAAAAAAAAAGAAAAAG
AAAACCAATCGATGTTTTATGTTCAGTATTATTACCTTTGTTATTTCGTATTCTTTAATC
GAGAATCCAAAAAATATCAAGAACGCAATAAAACATTAAAATTTAACACCCTTGAGTTAA
ATTACCTAACTGGTAAACCAAAATAGTCATGACTTATGAAAGACAAAAAAGACTCACTGA
GTTCGTGGAGCTCCGTTTCTGCGCCAAGGGCTTTTTCCATATGCGGAAACACAATAAGAA
GAAGAAGAAAGGAAAACATGCAGGAGACTATGGAAGATGTCATTATTTCTTTTTAGTTTA
CTCCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4856Contig1 657 2 2 U
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GAAACGAAGGAGCTACTCAATCTGAAGTCATCGAGGCAGCTACGCTCGCAAACGCTCACA
GCTTCATCACCTCTCTACCACAAGGCTACTCTACCAAAGTAGGTGAACGCGGCGTTCAGA
TGTCAGGCGGTCAGAGACAGAGGATAGCTATCGCTAGAGCCATCCTCAGGAATCCTGAGA
TTCTGCTCCTTGACGAAGCCACTAGCGCTTTGGATATTGAGTCCGAGCGTGTGGTACAAC
AAGCATTGGATCGGTTAATGACAAACCGGACAACGGTGGTGGTTGCTCACCGGTTATCGA
CGATCCAGAACGCGGACACGATAAGTGTGCTACATGGAGGCAAGATCGTAGAGCAAGGCA
GCCACCATAGGCTCGTTATGAACAAGACGGGTCCTTATTTTAAACTCATCAGCCTTCAGC
AGCAGCAGCATCCTTAAATACTTATATGGATAATTGTTTTAAACTCTTAATTTGTTTTTG
TGGAAAATATTGATCATACCTATATATTTACCCAATGTGATTATATTAATCATCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D089TF U 1
AF RR4D089JQ C 197
BS 1 636 RR4D089TF
BS 637 657 RR4D089JQ

RD RR4D089TF 636 0 0
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GCTTCATCACCTCTCTACCACAAGGCTACTCTACCAAAGTAGGTGAACGCGGCGTTCAGA
TGTCAGGCGGTCAGAGACAGAGGATAGCTATCGCTAGAGCCATCCTCAGGAATCCTGAGA
TTCTGCTCCTTGACGAAGCCACTAGCGCTTTGGATATTGAGTCCGAGCGTGTGGTACAAC
AAGCATTGGATCGGTTAATGACAAACCGGACAACGGTGGTGGTTGCTCACCGGTTATCGA
CGATCCAGAACGCGGACACGATAAGTGTGCTACATGGAGGCAAGATCGTAGAGCAAGGCA
GCCACCATAGGCTCGTTATGAACAAGACGGGTCCTTATTTTAAACTCATCAGCCTTCAGC
AGCAGCAGCATCCTTAAATACTTATATGGATAATTGTTTTAAACTCTTAATTTGTTTTTG
TGGAAAATATTGATCATACCTATATATTTACCCAAT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4D089JQ 461 0 0
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ACAGAGGATAGCTATCGCTAGAGCCATCCTCAGGAATCCTGAGATTTTGCTCCTTGACGA
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AATGACAAACCGGACAACGGTGGTGGTTGCTCACCGGTTATCGACGATCCAGAACGCGGA
CACGATAAGTGTGCTACATGGAGGCAAGATCGTAGAGCAAGGCAGCCACCATAGGCTCGT
TATGAACAAGACGGGTCCTTATTTTAAACTCATCAGCCTTCAGCAGCAGCAGCATCCTTA
AATACTTATATGGATAATTGTTTTAAACTCTTAATTTGTTTTTGTGGAAAATATTGATCA
TACCTATATATTTACCCAATGTGATTATATTAATCATCTCG

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

CO CL4857Contig1 501 2 2 U
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ACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACCGAAGCGTTCCGT
GTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCGGCTGCTGAGCTCCGTCACGTGATGACA
AACTTAGGCGAGAAGCTCACGGATGAAGAGGTCGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTT
GATGGTGATGGTCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTTAAGGTCATGATGGCTAAGTGATGC
TTTTGGTTTTGGTTTGCCTCTCTTACCAAAACTCTTTTTATGTAATTTTTATATTTACCT
ATGTATGTTGTTAAATTTTTATTCATGGGACTCGGTTCTGTTTTCTGGTTGTTTTAAGAC
CAAATGCCATCTATTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BC88JQ C 1
AF RR4BC88TF U 66
BS 1 65 RR4BC88JQ
BS 66 501 RR4BC88TF

RD RR4BC88JQ 501 0 0
GGAATCTACAGGTTAACGAAGAGAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCACCGACGATCAG
ATCTCCGAATTCGAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGCGACGGTTGCATTACC
ACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACCGAAGCGTTCCGT
GTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCGGCTGCTGAGCTCCGTCACGTGATGACA
AACTTAGGCGAGAAGCTCACGGATGAAGAGGTCGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTT
GATGGTGATGGTCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTTAAGGTCATGATGGCTAAGTGATGC
TTTTGGTTTTGGTTTGCCTCTCTTACCAAAACTCTTTTTATGTAATTTTTATATTTACCT
ATGTATGTTGTTAAATTTTTATTCATGGGACTCGGTTCTGTTTTCTGGTTGTTTTAAGAC
CAAATGCCATCTATTTTATGC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4BC88TF 436 0 0
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GGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACCGAAGCGTTCCGTGTTTT
CGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCGGCTGCTGAGCTCCGTCACGTGATGACAAACTT
AGGCGAGAAGCTCACGGATGAAGAGGTCGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGG
TGATGGTCAGATTAACTATGAGGAGTTTGTTAAGGTCATGATGGCTAAGTGATGCTTTTG
GTTTTGGTTTGCCTCTCTTACCAAAACTCTTTTTATGTAATTTTTATATTTACCTATGTA
TGTTGTTAAATTTTTATTCATGGGACTCGGTTCTGTTTTCTGGTTGTTTTAAGACCAAAT
GCCATCTATTTTATGC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL4858Contig1 436 2 1 U
TTTTTCGCGAACCGAAAAGAAAAAAAAGTCTCTCCCCTCTCCGAGACGAAACGAAGGCGA
TTGTGGAGACCTCGATTCCGAAGTACCAGGTGAGAATGCTGGTTACGCGTGTGTCTGAAC
TGGAGAGACTCCTGCGAGGTTCAGTACAAGAGCATGTGCAAGATGAAGTCACGGGTCCAG
CTGCTGTCTCTTCCTAGTTCAGTCACGGGTGGTATCTTTTTGCTTGATGTTCCATGTGAA
CCAAGTCACGGGTTGTATCTTTTTCTTTGTAAAACGATCTGTAGGTTGTCTTTATAAGTC
GGTTTGTAGAGCTCAGAGCTCAGACTATGTACCAAACTCTCCTTCTCCTTTGTTCAAACT
TTAAACTCGGCTTTGTAGTGTAATAACAAACTCTCCTTGTACACTCTCTCAACAGGTTTG
CATTATGTGTTTGTAT


BQ
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AF RR4GV76JQ C 1
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CATTATGTGTTTGTAT

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DS 

RD RR4GV76TF 436 0 0
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TTGTGGAGACCTCGATTCCGAAGTACCAGGTGAGAATGCTGGTTACGCGTGTGTCTGAAC
TGGAGAGACTCCTGCGAGGTTCAGTACAAGAGCATGTGCAAGATGAAGTCACGGGTCCAG
CTGCTGTCTCTTCCTAGTTCAGTCACGGGTGGTATCTTTTTGCTTGATGTTCCATGTGAA
CCAAGTCACGGGTTGTATCTTTTTCTTTGTAAAACGATCTGTAGGTTGTCTTTATAAGTC
GGTTTGTAGAGCTCAGAGCTCAGACTATGTACCAAACTCTCCTTCTCCTTTGTTCAAACT
TTAAACTCGGCTTTGTAGTGTAATAACAAACTCTCCTTGTACACTCTCTCAACAGGTTTG
CATTATGTGTTTGTAT

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

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CACAGACACAGCCTTTAATTACAGACACTTCCAAGAACCATGGTTACTACAGAGACAGAG
AGCCAAGTGAAGAGTTTCAAAAATCAATTATTATCAAGACAAGTTCGGGATACAAGCTCC
TCCTCCACCTTCACCACTTTGCTGCTGCTGCTCTTTCCAGATTCTTCCAGTAACTCGCAG
TTTCAGCTCTTTCCTGTCTCCACCCGAGAAGAAAAAAGCCATATTCCTCTGTATGATTAG
CCCATCATGACTGTCTCTAACTTTCCTGTGACTGTCTCTTACGCTTCTCGGCGTTCCTTC
CCAAATCAGCTTCCGACCATAACCTCCAACTTCTAAACTGTAGTTGTAGTTCCGAGCTTC
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GGCGTTTTCGACTTCACGGGGATTAGACTTGACATAACGATGGTTGAAAGTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C413JQ U 1
AF RR4FL37JQ U 44
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QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DZ90JQ C 1
AF RR4DZ90TF U 1
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RD RR4DZ90JQ 437 0 0
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CGCTCATCTTAGACTGTTGTAGCATTATCATCAGATCTTTTTTTACTCTAAAAAGCTGGT
AAAACTATCAAGACGTTCACACGCCACTTGAGTCTGCAGAAGATCGACAAGGTTATGCTA
CTGCCACGAGCTTCTTGTATTGTTTGTTTTGAGGAAAGAAAGAAAAAAATTGCTAAAGGA
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ATATGGTGAATGATTAG

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4DZ90TF 437 0 0
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CGTGACCGTGTTACAGCATTCGTGGAAAACTGGGTGGCAGGTAAAGCGGTTGAATGATAC
CGCTCATCTTAGACTGTTGTAGCATTATCATCAGATCTTTTTTTACTCTAAAAAGCTGGT
AAAACTATCAAGACGTTCACACGCCACTTGAGTCTGCAGAAGATCGACAAGGTTATGCTA
CTGCCACGAGCTTCTTGTATTGTTTGTTTTGAGGAAAGAAAGAAAAAAATTGCTAAAGGA
TTAATCGTTAATTTTTGTTGTCTTTAGCCTCTTTGTTTTGTTTGATTCATTTCATTTGCA
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ATATGGTGAATGATTAG

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

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TAAGGTAAAGCTTCCCTACTTAGAGATGTTGAGTTTTGTTGGTTTTCTTAGGTCTTATTG
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BQ
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AF RR4EN90TF U 30
AF RR4FN59TF U 1
BS 1 147 RR4FN59TF
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RD RR4EN90TF 450 0 0
GG
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ACAGAGCTGTTCTTAATGGATTTTTCAAATCTCTGTCTTTTGATAATCAAAGGCTTCTGT
TGTGTTTCAATTTTGACCTTTTGTTAATCATCATTCCAATTCCCAATCCCGTCGACTTTT
TGATTAGAAATCTTAATTCACCGAATCAACTCAACTTCTTTTTAAAGGGAATCAGTTTTT
ACCGTCTTTATATAAGCTGTTCTTAGCT

QA 3 450 3 450
DS 

RD RR4FN59TF 638 0 0
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TAAATACAAATCTTTCAGAAGGGAGAGTTTGATTATGTTTTTGTTGTGTAATGCTTTCGA
TCTGTCAGATCGATTCCCGACTTCGCTTGGCGATTTGTAATTTTCGCATGGCGATTTTCT
TTTGTTTTTTAGTTGTGTAATAAAACCAAAAACAGAGCTGTTCTTAATGGATTTTTCAAA
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ATCATTCCAATTCCCAATCCCGTCGACTTTTTGATTAGAAATCTTAATTCACCGAATCAA
CTCAACTTCTTTTTAAAGGGAATCAGTTTTTACCGTCTTTATATAAGCTGTTCTTAGCTT
TAAGGTAAAGCTTCCCTACTTAGAGATGTTGAGTTTTGTTGGTTTTCTTAGGTCTTATTG
GAGCGGAGTCAGCAGAGATGGCGTTTAATACGGTCCATCAAAGATTCTATCTTCAATCCG
ACTTAAGCTTCCTCTGTTCTTAATGATCGGTGAATCAT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

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CCATTTTCAGGCTTTCACCATTACAGATTTACTGAAACTGTTGGAATGATGAATGCTTTC
TTG


BQ
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AF RR4AS76TF U 1
AF RR4AS76JQ C 1
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BS 446 663 RR4AS76JQ

RD RR4AS76TF 445 0 0
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TCTATATCACTAACTTCGAAAGAGAGACAAGAAGTTATTATTGAAAAGGTTGTGCGCAAC
AAGCGCAAGAGTATCACTATTGTTAAAGGACTAGAACTGTTTGGGATAAAACTCAGTGAT
GCATCTAAAAAGCTCGGGAAGAAGTTTGCCACTGGAGCTTCAGTTGTCAAGGGACCAACT
GAAAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATATAATCTATGACATCGTTGAGTTCATTACA
GACACTTGGCCCGACGTACTTGAAAGATCCATTTTCTTCATTGAAGATGGGAAGAAGGTT
CAAGCTGGTTGATGACCACCTCCTGAGTCCTGTCTTTTTTTTTTTTGGGGCATGGCAGGT
TCACGTAGACAAAGCTAGTTTCCGA

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR4AS76JQ 663 0 0
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TCTATATCACTAACTTCGAAAGAGAGACAAGAAGTTATTATTGAAAAGGTTGTGCGCAAC
AAGCGCAAGAGTATCACTATTGTTAAAGGACTAGAACTGTTTGGGATAAAACTCAGTGAT
GCATCTAAAAAGCTCGGGAAGAAGTTTGCCACTGGAGCTTCAGTTGTCAAGGGACCAACT
GAAAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATATAATTTATGACATCGTTGAGTTCATTACA
GACACTTGGCCCGACGTACTTGAAAGATCCATTTTTTTCATTGAAGATGGGAAGAAGGTT
CAAGCTGGTTGATGACCACCTCCTGAGTCCTGTCTTTTTTTTTTTTGGGGCATGGCAGGT
TCACGTAGACAAAGCTAGTTTCCGATTCCTCCTATGTGTTTTGGAGGAAACGCCACGCTA
TAATAACTTATACAACATAACATATATATATAGCTTTCTTGCGCGGGTTGTGATAATTCC
TGTTGGTTTCTCCAAGCATCTCTGTTTGTGACATTTAAAATGTGTTTCTTGAATCCTGAT
CCATTTTCAGGCTTTCACCATTACAGATTTACTGAAACTGTTGGAATGATGAATGCTTTC
TTG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL4863Contig1 1050 2 4 U
GGGTGTCTCCCCTCACTCTACAAAACGTATCATCCACTTTCAGAAACGTCGCATTAAAGC
TTTGTAACATACACAAACACACTAAGGAAGAGAGACAGAGAGAGATTTGATTATCTGATC
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AGACAGCAATCGAAAATGGTTAAGATAGCTTTAGGGGTCATCCTCTCTCTGATCCTCGTC
GTATTTCTTAGATTCACCGTCAAGAATCACAACCACTTCTTTGTTGCCTCTGAGCTCATC
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CTTTCTTTAAAGTCTCAAGAAGTGACAGCAGTGTTTCTTGCTGTGAGGCTGATCTGCAGT
ATAAACATGGAAGGTGATATCCATACAGTTCTCGATTTCGCCACTTTGGTTTCGACTTTA
TGGGTCATTTATATGATTCGGTTCAAGCTGAAAGCATCTTATGTGAAGACTCTGGACAAT
TTCCACCATTACTATGTGCTTGTTCCATCTGCTATCCTTGCTTTCATTATCCACCCGAGT
TCGAGATATACTTACATCAACCGTGTCATGTGGGCGTTTTGCGTTTACTCGGAATCTGTC
TCTGTTCTGCCTCAGCTTCGATTAATGCAGAATGCTCAAATCATAGAGCCTTTCACAGCT
CATTACGTGTTTGCGCTAGGTATCGCTAGATTTTTAGCATGCGCTCATTGGCTTATCCAG
GTCTTTGAGACTCGTGTACATTACCTATGGCTGATCGGCGCTGGTTACTTCTGGTTCCCG
ATGGCTCTATTAGCCGAGGCCGTTCAAACCTTCATCCTTGCTGACTTCTGCTACTACTAT
GTCAAAAGTGCTATGGAGGGTCAGCTTGTATTGAAGATGCCCGTTTAGATCAGTACAGAT
GAATACCGATACATTTTGTTGTTTTGTCAATTTAAGTTACCTGTAACCAAATTAGATGCT
CAAAATAATCGAGACGGGTTTCTTTCTTCT


BQ
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AF RR4GC93TF U 1
AF RR4GC93JQ C 327
BS 1 754 RR4GC93TF
BS 755 755 RR4GC93JQ
BS 756 768 RR4GC93TF
BS 769 1050 RR4GC93JQ

RD RR4GC93TF 768 0 0
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TTTGTAACATACACAAACACACTAAGGAAGAGAGACAGAGAGAGATTTGATTATCTGATC
AAACCAAAAATGGGGAAGAGAAGAGGCGTATCCGCCGTCAACGTTGTATTTGGGTGGCTG
AGACAGCAATCGAAAATGGTTAAGATAGCTTTAGGGGTCATCCTCTCTCTGATCCTCGTC
GTATTTCTTAGATTCACCGTCAAGAATCACAACCACTTCTTTGTTGCCTCTGAGCTCATC
CATGCCGCCGGAATCATAATCCTCATCTATAAACTCACCCGTCAAAAGACTTGCTCGGGT
CTTTCTTTAAAGTCTCAAGAAGTGACAGCAGTGTTTCTTGCTGTGAGGCTGATCTGCAGT
ATAAACATGGAAGGTGATATCCATACAGTTCTCGATTTCGCCACTTTGGTTTCGACTTTA
TGGGTCATTTATATGATTCGGTTCAAGCTGAAAGCATCTTATGTGAAGACTCTGGACAAT
TTCCACCATTACTATGTGCTTGTTCCATCTGCTATCCTTGCTTTCATTATCCACCCGAGT
TCGAGATATACTTACATCAACCGTGTCATGTGGGCGTTTTGCGTTTACTCGGAATCTGTC
TCTGTTCTGCCTCAGCTTCGATTAATGCAGAATGCTCAAATCATAGAGCCTTTCACAGCT
CATTACGTGTTTGCGCTAGGTATCGCTAGATTTT*AGCATGCGCTCAT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4GC93JQ 724 0 0
CTATAAACTCACCCGTCAAAAGACTTGCTCGGGTCTTTCTTTAAAGTCTCAAGAAGTGAC
AGCAGTGTTTCTTGCTGTGAGGCTGATCTGCAGTATAAACATGGAAGGTGATATCCATAC
AGTTCTCGATTTCGCCACTTTGGTTTCGACTTTATGGGTCATTTATATGATTCGGTTCAA
GCTGAAAGCATCTTATGTGAAGACTCTGGACAATTTCCACCATTACTATGTGCTTGTTCC
ATCTGCTATCCTTGCTTTCATTATCCACCCGAGTTCGAGATATACTTACATCAACCGTGT
CATGTGGGCGTTTTGCGTTTACTCGGAATCTGTCTCTGTTCTGCCTCAGCTTCGATTAAT
GCAGAATGCTCAAATCATAGAGCCTTTCACAGCTCATTACGTGTTTGCGCTAGGTATCGC
TAGATTTTTAGCATGCGCTCATTGGCTTATCCAGGTCTTTGAGACTCGTGTACATTACCT
ATGGCTGATCGGCGCTGGTTACTTCTGGTTCCCGATGGCTCTATTAGCCGAGGCCGTTCA
AACCTTCATCCTTGCTGACTTCTGCTACTACTATGTCAAAAGTGCTATGGAGGGTCAGCT
TGTATTGAAGATGCCCGTTTAGATCAGTACAGATGAATACCGATACATTTTGTTGTTTTG
TCAATTTAAGTTACCTGTAACCAAATTAGATGCTCAAAATAATCGAGACGGGTTTCTTTC
TTCT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL4864Contig1 1144 2 2 U
GGAGGACTTCAATGTTATCCGCCGTTTCCACTTTCTATAATGTTAGTCCGCAAATATCTC
CTCTCATCTCTTTGCCTCCCCTATCTATATTGTTCAACGTATTTCTATCGTTCAAAAAGA
GTATTTGTTTTAATTCGCTGATAATTGCTATCCACATTAAATCCAGTAACTATGTCAAGC
TCTGCCTTTCCTTCATGTCAATCTATATATAGAAGAGGGTTGAGAGCAGGATGGATCTTC
AGAACCACTCCACAACCTCCGTTCCCAACCTCTACCCTCTCTTTGCCACCTCTTCTGGCG
TCCGGATGCCGTCCCGGAATCCACTGCTCTGTTTCGGCCGGCGGAACCACAAAACTATCC
GTGGAGAATGTCCCTGGCAGATCATGGAGCTTCGAGATAGATTCAGTCGAGAACGCCATC
TTCAGAGATGGCTCTCCGATTCAGGCCTCCCGCTGCAAAAATGGCTATCGACAGAGTCGA
CATCGGAGAAAGAAAAATTCTTATCTTTAACTCTATAGGTTCGTAATGAGAAGGAATCTT
TGGTGAGCAATTTGGAGAGTCGAGCGAGACTAATTAACAGCGAAGAGACGCAGCAAAATA
TGCTCTTCTCTTCTAAAGAATATGTTGAGCAGCTTGAAAAGGAAAACATGCCACTGATGA
AAGCTCTAGCGCACATAAAGTAACCATCTTTCTCTTTTATGAGTTTGATGAGCGTTGTTT
TTGGCGGTGAATGTTTGCTTTTTGTTTTGTTTTTGGGTTGCAGTAAAATTATTGAGCTTA
GCAGGGTTGAGTTTCAGAAACTAAGGATCAACTTACGGAATGTGCAGGAAAAGAATTTGC
AGCTTGCGCGGAGCTAAAATCAAACAGAGACAGGGTATGATTTTCTGGAATTGAAGTTGC
TCAAAACGAAGCTTTCCTATTTCATTATATTACAACTTCCTTGACCAACTGACATAATGT
ACGTTTTTAGCTCAAACTACTTCAGCATGAACTTGGCTGCAAGAATGTATTACTCGAACC
CAGGGCGCTTCCTCTTTGGCGCTTACCACTGGACCACCATAAAGTGGTTGCACTTTAGTT
GTCTCTTTGATATGCTGTAAACTATTTCTTATTGGTGTAAGAATTACAATGACTTCTTTA
CTTC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4AO61TF U 1
AF RR4AO61JQ C 320
BS 1 754 RR4AO61TF
BS 755 1144 RR4AO61JQ

RD RR4AO61TF 754 0 0
GGAGGACTTCAATGTTATCCGCCGTTTCCACTTTCTATAATGTTAGTCCGCAAATATCTC
CTCTCATCTCTTTGCCTCCCCTATCTATATTGTTCAACGTATTTCTATCGTTCAAAAAGA
GTATTTGTTTTAATTCGCTGATAATTGCTATCCACATTAAATCCAGTAACTATGTCAAGC
TCTGCCTTTCCTTCATGTCAATCTATATATAGAAGAGGGTTGAGAGCAGGATGGATCTTC
AGAACCACTCCACAACCTCCGTTCCCAACCTCTACCCTCTCTTTGCCACCTCTTCTGGCG
TCCGGATGCCGTCCCGGAATCCACTGCTCTGTTTCGGCCGGCGGAACCACAAAACTATCC
GTGGAGAATGTCCCTGGCAGATCATGGAGCTTCGAGATAGATTCAGTCGAGAACGCCATC
TTCAGAGATGGCTCTCCGATTCAGGCCTCCCGCTGCAAAAATGGCTATCGACAGAGTCGA
CATCGGAGAAAGAAAAATTCTTATCTTTAACTCTATAGGTTCGTAATGAGAAGGAATCTT
TGGTGAGCAATTTGGAGAGTCGAGCGAGACTAATTAACAGCGAAGAGACGCAGCAAAATA
TGCTCTTCTCTTCTAAAGAATATGTTGAGCAGCTTGAAAAGGAAAACATGCCACTGATGA
AAGCTCTAGCGCACATAAAGTAACCATCTTTCTCTTTTATGAGTTTGATGAGCGTTGTTT
TTGGCGGTGAATGTTTGCTTTTTGTTTTGTTTTT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AO61JQ 825 0 0
TCCACTGCTCTGTTTCGGCCGGCGGAACCACAAAACTATCCGTGGAGAATGTCCCTGGCA
GATCATGGAGCTTCGAGATAGATTCAGTCGAGAACGCCATCTTCAGAGATGGCTCTCCGA
TTCAGGCCTCCCGCTGCAAAAATGGCTATCGACAGAGTCGACATCGGAGAAAGAAAAATT
CTTATCTTTAACTCTATAGGTTCGTAATGAGAAGGAATCTTTGGTGAGCAATTTGGAGAG
TCGAGCGAGACTAATTAACAGCGAAGAGACGCAGCAAAATATGCTCTTCTCTTCTAAAGA
ATATGTTGAGCAGCTTGAAAAGGAAAACATGCCACTGATGAAAGCTCTAGCGCACATAAA
GTAACCATCTTTCTCTTTTATGAGTTTGATGAGCGTTGTTTTTGGCGGTGAATGTTTGCT
TTTTGTTTTGTTTTTGGGTTGCAGTAAAATTATTGAGCTTAGCAGGGTTGAGTTTCAGAA
ACTAAGGATCAACTTACGGAATGTGCAGGAAAAGAATTTGCAGCTTGCGCGGAGCTAAAA
TCAAACAGAGACAGGGTATGATTTTCTGGAATTGAAGTTGCTCAAAACGAAGCTTTCCTA
TTTCATTATATTACAACTTCCTTGACCAACTGACATAATGTACGTTTTTAGCTCAAACTA
CTTCAGCATGAACTTGGCTGCAAGAATGTATTACTCGAACCCAGGGCGCTTCCTCTTTGG
CGCTTACCACTGGACCACCATAAAGTGGTTGCACTTTAGTTGTCTCTTTGATATGCTGTA
AACTATTTCTTATTGGTGTAAGAATTACAATGACTTCTTTACTTC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL4865Contig1 1081 2 2 U
GGGACTTTGATACCATATTGAATGGGTCTACAACCAACCAGAGACCAAAGAGAAAAGTGG
TAATCATTGGAGCAGAGAAGGGAAACTAAAAAAAAACAAAACAAAAGAAACAGGATAACT
CTCTGAGTTTCATTACCAATGACCCGAGGATTGGTTCTGGGAATCATCTGGATGATGTGC
TGTCTTTGCCCATCATATCAACAAGATCTGCCGTTTGTCTTCCACAGCTTCGGCTATGAT
AGTTATCTTCACCTTGACGGTGGTGCAACGATCCTTCCACGCAGTGGTGTCCTGCAACTG
ACAAGTGAAAATACCCTCCAGGCGGGTCATGCTTATCTTAAGCAGCCGATTGATTTCAAT
TCATCTGAACCAGTCTCCTTCTCGACACAATTTGTGTGTGCGCTGGTCCCTGCAGGTGAT
CCTAGTGGCCATGGCTTGGCGTTTTTTGTGTCTCATTCCACTGATTTTAAAGACGCGGAA
GCAACTCGATTCTTCGGGCTTTTCAACCCAAATGGATCTTCTTCCACTCGTGTTCTTGCT
GTTGAGCTTGATATATCTAAAGCTCTAGATTTGTTGGACATCAGTGATAATCACGTTGGG
ATCGATGTGAATAGCGCGGTGTCCAAACTATCGGCCAACGCTTCTTATTTTTCAGACAAG
GAAGGTAGAAACAAAGACATAAAACTCTTGAGTGGAGATCCTATTCAGGTTTGGATTGAT
TACCAAGGAACAACACTCAATGTTACACTGGCCCCTCATAAAACCAAGAAGCCAAGCCGA
CCTCTTTTGTCATCCACATCCATCAATCTTACCGAGATTGTCCAGGGTAGAAGAATGTTT
TTCGGCTTTTCAGGTGCAACGGGGGCAATCATGACCAACCACTACATACTCGGGTGGAGT
TTTAGCAAAAGCCTGGCATCGCTGCCCAACATTGACTTCTCAAGACTTTCCAAAGTTCCT
TCTACAAGCACTAGAAACAGGCTTACGTCTCTGGTGCTTGATGCTCTGCTTGGTTTAATA
GCTTTCTTAGTTTTGGGGTTCCTTACTGGAGTTTGTTTGTATAGGAGAAACTTGTACGCC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4GH60TF U 1
AF RR4GH60JQ C 280
BS 1 711 RR4GH60TF
BS 712 1081 RR4GH60JQ

RD RR4GH60TF 719 0 0
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TCATCTGAACCAGTCTCCTTCTCGACACAATTTGTGTGTGCGCTGGTCCCTGCAGGTGAT
CCTAGTGGCCATGGCTTGGCGTTTTTTGTGTCTCATTCCACTGATTTTAAAGACGCGGAA
GCAACTCGATTCTTCGGGCTTTTCAACCCAAATGGATCTTCTTCCACTCGTGTTCTTGCT
GTTGAGCTTGATATATCTAAAGCTCTAGATTTGTTGGACATCAGTGATAATCACGTTGGG
ATCGATGTGAATAGCGCGGTGTCCAAACTATCGGCCAACGCTTCTTATTTTTCAGACAAG
GAAGGTAGAAACAAAGACATAAAACTCTTGAGTGGAGATCCTATTCAGGTT
GGATTGAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4GH60JQ 802 0 0
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AAGCAGCCGATTGATTTCAATTCATCTGAACCAGTCTCCTTCTCGACACAATTTGTGTGT
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TCTTCCACTCGTGTTCTTGCTGTTGAGCTTGATATATCTAAAGCTCTAGATTTGTTGGAC
ATCAGTGATAATCACGTTGGGATCGATGTGAATAGCGCGGTGTCCAAACTATCGGCCAAC
GCTTCTTATTTTTCAGACAAGGAAGGTAGAAACAAAGACATAAAACTCTTGAGTGGAGAT
CCTATTCAGGTTTGGATTGATTACCAAGGAACAACACTCAATGTTACACTGGCCCCTCAT
AAAACCAAGAAGCCAAGCCGACCTCTTTTGTCATCCACATCCATCAATCTTACCGAGATT
GTCCAGGGTAGAAGAATGTTTTTCGGCTTTTCAGGTGCAACGGGGGCAATCATGACCAAC
CACTACATACTCGGGTGGAGTTTTAGCAAAAGCCTGGCATCGCTGCCCAACATTGACTTC
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GATGCTCTGCTTGGTTTAATAGCTTTCTTAGTTTTGGGGTTCCTTACTGGAGTTTGTTTG
TATAGGAGAAACTTGTACGCCG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAGCGTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN38JQ U 1
AF RR4C024TF C 202
BS 1 383 RR4EN38JQ
BS 384 384 RR4C024TF
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RD RR4EN38JQ 686 0 0
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CTATACATATCTTCTTCCGGCAACTCCAGCATCCCTCTGATCACATTCAGTCCAAGATTG
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ACGTGGAAGTAAGGGAAGTTCTTGGGTATCGAGTTCCTGAGACCCTTCACGCTCGTGTCT
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AAGTAGAGAGGTCCTTCTTTCGCTATCTCCTGAGGGATCGGGATGCACTCTATCATACAG
TGGCGGCGCTGCTGAGACAAACCGATCACCGTCTCCAGAAACACAGCGTCTTTGCCTTCT
TTCGCAAACATCATAATGAGACACTTCTTGAAATTCCGGATCTCGTCCCAGACATTGTCG
TCTACGCTTCTGCTGGCTGCCTCGTGCTGCATTGGTAAGATACAGCAATGACCTGGGACA
AGGG*CTGTTGTTGTGGTAACATGAG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4C024TF 650 0 0
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TGACTCCACTCGCTCTCTGCTTCGTCGATCGCCTTCTTGAAGTAGAGAGGTCCTTCTTTC
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CACTTCTTGAAATTCCGGATCTCGTCCCAAACATTGTCGTCGACGCTTCTGCTGGCTGCC
TCGTGCTGCATTGGTAAGATACAGCAATGGCCTGGGACAAGGGGCTGTTGTTGCGGTAAC
ATGAGATAGGTGAAGTTTGCGATTGACACAACCAAGTGTTTCGGCCGCTTTGGGTTCTCG
AAACAGAAGAGACAGCGTTCTTGCTGTGTCATGATGCGTTTCACACGGTTGTCTTTTTCA
GGAACGTTGCTGCTTTCCCGCTTCCGGGACTTTTTGCTTGGAGCGTCTCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4868Contig1 1397 2 2 U
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ATTTGGAATCGGACATACTTTCTAGGGTTCCAGCGAAGTCTCTATGGGAATTGAAATCGA
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AGTTAGGTGAATCGGTGAAAGAATCGATGTTACTGAGCGATCTTAGGGTTTACGCAATCG
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TCACAGATGTAAATGGTTCAAACGATTTGAAAATCAATGAGATATTTCACTGCGACGGTT
TAATGTTATGCTCGATGACGAGTAAACTTGCGGTTTGGAACCCATGTACTGGTCAGACTA
GGAGCATCGAACCCGGGACTTGTTGTTACTCTTATGATGATGCATATGCTTTAGGATACA
CCACTTCTTCTACTGGCCATCGTAGCTACAAAATCTTGAGACGTTTTTATCGTCAAAACG
ACAAGAAAGTGTTGGGTGAGATGTATGATCTTAGCTCCGATGGTTCGTGGAGGGTTCTTG
ATGATACCTTTCCTCCTCTTGGCTACTCCGTGAGTCCCAACGGCGTGTCTTTGAAAGGAG
ACGCTTACTTTGTTGCTCCTCGAGACAAAGTAAATGATGTTTTCTTGATCACAAAATTCG
ATTTCACAACCGAGACGCTCGTTCGTCTCTCTCTTCCGTTTCAGAGTCTTCATCCTTGGG
ATAAAGCGTTTCTTTCGGTCGTTAGAGATGAAAAAATTGCCTTGTTATACGTTTGTAAAT
GCGAAGGGGCCATGAGGATATGGATGACCAATAAGATTGATGATGAAGCTAAAGACCTGT
CGTGGGGGAACGACTTTGTCATGAGAATCGGTTGTCATAAAAACAACTTGTATTTCGGAA
GCTTCTTGTTCGACCAAGAGAATAGAGTGGCGGTACTGTCTTGTGCAGCACTGGGTCGAA
AATATTCTAACAGAATCTTCGTTGCTGACGACAGTGACAAGTATAGGAATAAACAAGTTT
ATGAAGCTAAGACATCTACTTTCGATTGGCCACGTCTCATCAGTTATGCTCCGAGTTTGG
TTCACATTCCGAAAAGTACACCTAAGAGGAGGCATAAGAAACAGAGGTTGTTAGCTAGCC
CTTAAATGAATTACTCTTTCTTTTTGTTTTTTTCTTCTCGTGTTGGTGATGTTCTTCTGG
TTTGTTTCGGTTTAGTCGACGCTTGATTATGATTTTCTTGTTTTCCTTTTTGTCTATTGG
ATCCTTTGTTCAAATACAATGTTCAAGCTTGTACCCAATTCCGCTTTTAATATGAATTAC
TCATGGATTCTGAATAG


BQ
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AF RR4DT40TF U 1
AF RR4DT40JQ C 705
BS 1 769 RR4DT40TF
BS 770 1397 RR4DT40JQ

RD RR4DT40TF 769 0 0
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CTTGCAAACGATGGCACGCTTTGTTCAGGGATCGGAAGTTCGCGGAGAAGAACAAGAACA
AGTTAGGTGAATCGGTGAAAGAATCGATGTTACTGAGCGATCTTAGGGTTTACGCAATCG
CCGGCGGAGATCTCCTCCTCCAAAAAAACAAAAACGGATCTATCGAGTTTACAGGTAAAC
TCACAGATGTAAATGGTTCAAACGATTTGAAAATCAATGAGATATTTCACTGCGACGGTT
TAATGTTATGCTCGATGACGAGTAAACTTGCGGTTTGGAACCCATGTACTGGTCAGACTA
GGAGCATCGAACCCGGGACTTGTTGTTACTCTTATGATGATGCATATGCTTTAGGATACA
CCACTTCTTCTACTGGCCATCGTAGCTACAAAATCTTGAGACGTTTTTATCGTCAAAACG
ACAAGAAAGTGTTGGGTGAGATGTATGATCTTAGCTCCGATGGTTCGTGGAGGGTTCTTG
ATGATACCTTTCCTCCTCTTGGCTACTCCGTGAGTCCCAACGGCGTGTCTTTGAAAGGAG
ACGCTTACTTTGTTGCTCCTCGAGACAAAGTAAATGATGTTTTCTTGATCACAAAATTCG
ATTTCACAACCGAGACGCTCGTTCGTCTCTCTCTTCCGTTTCAGAGTCT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4DT40JQ 693 0 0
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AGTCTTCATCCTTGGGATAAAGCGTTTCTTTCGGTCGTTAGAGATGAAAAAATTGCCTTG
TTATACGTTTGTAAATGCGAAGGGGCCATGAGGATATGGATGACCAATAAGATTGATGAT
GAAGCTAAAGACCTGTCGTGGGGGAACGACTTTGTCATGAGAATCGGTTGTCATAAAAAC
AACTTGTATTTCGGAAGCTTCTTGTTCGACCAAGAGAATAGAGTGGCGGTACTGTCTTGT
GCAGCACTGGGTCGAAAATATTCTAACAGAATCTTCGTTGCTGACGACAGTGACAAGTAT
AGGAATAAACAAGTTTATGAAGCTAAGACATCTACTTTCGATTGGCCACGTCTCATCAGT
TATGCTCCGAGTTTGGTTCACATTCCGAAAAGTACACCTAAGAGGAGGCATAAGAAACAG
AGGTTGTTAGCTAGCCCTTAAATGAATTACTCTTTCTTTTTGTTTTTTTCTTCTCGTGTT
GGTGATGTTCTTCTGGTTTGTTTCGGTTTAGTCGACGCTTGATTATGATTTTCTTGTTTT
CCTTTTTGTCTATTGGATCCTTTGTTCAAATACAATGTTCAAGCTTGTACCCAATTCCGC
TTTTAATATGAATTACTCATGGATTCTGAATAG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL4869Contig1 435 2 1 U
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AATCTGAGAAACCTCCTTTCAGACTTGCCGTCGATGACACGAAACCTGTTCTTCAGGATC
CGATTGTGAGATCGGACCCAACGGAGACAGAAGAAGCTGTGCTCAGATTGCCATCCTTCC
CCCCACTCATCAGACCTTCTGAATCGTAACTGATGATCATAGAATCCACATTAGCTGCTT
TTAAGACCAGACAAGTGCCGGCGGGAACAGACCAGAGTGTATTTTCATTGCATTAATATC
ACAATGTAAGAAGCATTGCAAAACTTCTAAAGTTTGTTTGTTTTTTTCTTGTTAAAAGTG
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TTCCTATTTTTTTCC


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AF RR4G085JQ C 1
AF RR4G085TF U 1
BS 1 435 RR4G085TF

RD RR4G085JQ 435 0 0
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AATCTGAGAAACCTCCTTTCAGACTTGCCGTCGATGACACGAAACCTGTTCTTCAGGATC
CGATTGTGAGATCGGACCCAACGGAGACAGAAGAAGCTGTGCTCAGATTGCCATCCTTCC
CCCCACTCATCAGACCTTCTGAATCGTAACTGATGATCATAGAATCCACATTAGCTGCTT
TTAAGACCAGACAAGTGCCGGCGGGAACAGACCAGAGTGTATTTTCATTGCATTAATATC
ACAATGTAAGAAGCATTGCAAAACTTCTAAAGTTTGTTTGTTTTTTTCTTGTTAAAAGTG
GTTATCCTGTAACTTGAGAGAGACATTTGTGCCATCGAAGCCTTGAATGAGTAACCAACA
TTCCTATTTTTTTCC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR4G085TF 435 0 0
GGGAGAACACGATGGGGAAAGCTTCAGAGACACCGACGAACGCTCGTAAATCAGAAGTCA
AATCTGAGAAACCTCCTTTCAGACTTGCCGTCGATGACACGAAACCTGTTCTTCAGGATC
CGATTGTGAGATCGGACCCAACGGAGACAGAAGAAGCTGTGCTCAGATTGCCATCCTTCC
CCCCACTCATCAGACCTTCTGAATCGTAACTGATGATCATAGAATCCACATTAGCTGCTT
TTAAGACCAGACAAGTGCCGGCGGGAACAGACCAGAGTGTATTTTCATTGCATTAATATC
ACAATGTAAGAAGCATTGCAAAACTTCTAAAGTTTGTTTGTTTTTTTCTTGTTAAAAGTG
GTTATCCTGTAACTTGAGAGAGACATTTGTGCCATCGAAGCCTTGAATGAGTAACCAACA
TTCCTATTTTTTTCC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL4870Contig1 435 2 1 U
GAATCTTTCTCATGGCGGCTCTCTCCACCATCTACCACCCACTCTGTGCACACCACAACC
ACCGTACAACAAGACACAGCGTCAGATCTCTGACTGTGATGTCTTGTCGGAAGCAGAAAT
CACCGGAAGAGAGTGGAGGAGTGATCAAGAGAACAGTGGTAAGGATGATTTCAGAGGCTG
AGAAGATTGGGAAGAATCTGAAGCCAGAGAAGAAAGGAGGAGACATGAAGGATCTGATGC
TTATGAGTCTTTCTTTTGCAGTTTATGTCTATATATCTCAACTAATGGTATGTGCTTACT
TCTCCTGGACCCATGTCGCTCTCCCCAATCCCTCATGGTAGTTTAGCTAAGGTAGATCAT
TTCTTCTGCCCCTCAAGTCACAATTATGTTATGTATATATTTTGCACATCATTTATAAGA
TTACCAAGCTCTCTC


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AF RR4DF70JQ C 1
AF RR4DF70TF U 1
BS 1 435 RR4DF70TF

RD RR4DF70JQ 435 0 0
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TTATGAGTCTTTCTTTTGCAGTTTATGTCTATATATCTCAACTAATGGTATGTGCTTACT
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TTACCAAGCTCTCTC

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DS 

RD RR4DF70TF 435 0 0
GAATCTTTCTCATGGCGGCTCTCTCCACCATCTACCACCCACTCTGTGCACACCACAACC
ACCGTACAACAAGACACAGCGTCAGATCTCTGACTGTGATGTCTTGTCGGAAGCAGAAAT
CACCGGAAGAGAGTGGAGGAGTGATCAAGAGAACAGTGGTAAGGATGATTTCAGAGGCTG
AGAAGATTGGGAAGAATCTGAAGCCAGAGAAGAAAGGAGGAGACATGAAGGATCTGATGC
TTATGAGTCTTTCTTTTGCAGTTTATGTCTATATATCTCAACTAATGGTATGTGCTTACT
TCTCCTGGACCCATGTCGCTCTCCCCAATCCCTCATGGTAGTTTAGCTAAGGTAGATCAT
TTCTTCTGCCCCTCAAGTCACAATTATGTTATGTATATATTTTGCACATCATTTATAAGA
TTACCAAGCTCTCTC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4872Contig1 1076 2 12 U
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AGCAGCAAGTTGGATCCTCAACGTTTGCCTTCTTTGGGTTTAACGGAACCGCTGGTGTGT
GGAGAATCTCAGCTCTGAATGAGTCAGGAGGGTGGAATGACCAGACAACAGTAGAAGACA
TGGACTTAGCTGTAAGAGCCACACTCAGAGGCTGGAAGTTACTATATCTCGATGATCTCA
AGGTGAAAAGTGAGTTACCATGTTCCTTCAACGCCCTCCGTAGCCAGCAGCATAGATGGA
CTTGTGGCCCTGCAAATCTATTCAGGAAAATGGCTGGACAAATAATAAGAAGCGACAATG
TCTCTCTATGGAAGAAGTTGTATATGCTGTACAGCTTCTTCTTCATGCGCAAGCTCGTGG
CTCACATCCTCTCCTTCTGCTTCTACTGTGTTATCTTGCCAGCTACTGTTCTGTTCCCAG
AAGTCACAGTTCCCAAATGGGCTGCGTTTTATCTCCCTTCTTTAATCACTCTCCTCATCG
CACTCGGTAGACTAAGATCAATCCACCTTTTGGCGTTTTGGGTTCTGTTTGAGAACGCAA
TGTCGCTGCTTAGAACAAAGGCACTGGTCATGGGCTTGTTTGAAACAGGAAGAGTACAAG
AATGGGTTGTGACAGAGAAGTTAGGTGATGGTCTCAAGACGAAGCTGATTGCACAAGAAC
CTAAAGAAGAACATCACGTCAGATTCAGAGATAGGGTGCATCTGCTGGAGCTATTGGTTG
GAGTGTACCTGTTGTTCTGCGGATGCTACGACATCATATACGGGAAGAGGACACTGTTTT
TGTACCTTCTGTTGCAGTCAACGGGCTTCTTCGTTGTTGGTTTTGGATTTGTGGGCATGT
ATGTTGCTGCTGCTTCATCGTAACATTTTAGATATTAGATCAAAGAGTCTCAATATGATG
TCTCAAGAGGTTTTTAGTTGTTGATACCATATTGAGATTACCCTACCCCTTTTTGTTTGG
GAGGTCTGAGAATAATATGATATATACACTTTGTATTACCACTTGAGTGTTTGTGT


BQ
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AF RR4H420TF U 1
AF RR4CU84JQ C 314
BS 1 648 RR4H420TF
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GGAGAATCTCAGCTCTGAATGAGTCAGGAGGGTGGAATGACCAGACAACAGTAGAAGACA
TGGACTTAGCTGTAAGAGCCACACTCAGAGGCTGGAAGTTACTATATCTCGATGATCTCA
AGGTGAAAAGTGAGTTACCATGTTCCTTCAACGCCCTCCGTAGCCAGCAGCATAGATGGA
CTTGTGGCCCTGCAAATCTATTCAGGAAAATGGCTGGACAAATAATAAGAAGCGACAATG
TCTCTCTATGGAAGAAGTTGTATATGCTGTACAGCTTCTTCTTCATGCGCAAGCTCGTGG
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AAGTCACAGTTCCCAAATGGGCTGCGTTTTATCTCCCTTCTTTAATCACTCTCCTCATCG
CACTCGGTAGACTAAGATCAATCCACCTTTTGGCGTTTTGGGTTCTGTTTGAGAACGCAA
TGTCGCTGCTTAGAACAAAGGCACTGGTCATGGGCTTGTTTGAAACAG*AAGAGTACAAG
AATGGGTTGTGACAGAGAAGTTAG*TGATGGTCTCA*GACGAAGCTGATTGCACAAGAAC
CTAAAGAAGAA*ATCACGTCAGATTCAGAGATAGG*TGCATCTGCTGGAGCTATT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4CU84JQ 763 0 0
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GAAGTTGTATATGCTGTACAGCTTCTTCTTCATGCGCAAGCTCGTGGCTCACATCCTCTC
CTTCTGCTTCTACTGTGTTATCTTGCCAGCTACTGTTCTGTTCCCAGAAGTCACAGTTCC
CAAATGGGCTGCGTTTTATCTCCCTTCTTTAATCACTCTCCTCATCGCACTCGGTAGACT
AAGATCAATCCACCTTTTGGCGTTTTGGGTTCTGTTTGAGAACGCAATGTCGCTGCTTAG
AACAA*GGCACTGGTCATGGGCTTGTTTGAAACAGGAAGAGTACAAGAATGGGTTGTGAC
AGAGAAGTTAGGTGATGGTCTCAAGACGAAGCTGATTGCACAAGAACCTAAAGAAGAACA
TCACGTCAGATTCAGAGATAGGGTGCATCTGCTGGAGCTATTGGTTGGAGTGTACCTGTT
GTTCTGCGGATGCTACGACATCATATACGGGAAGAGGACACTGTTTTTGTACCTTCTGTT
GCAGTCAACGGGCTTCTTCGTTGTTGGTTTTGGATTTGTGGGCATGTATGTTGCTGCTGC
TTCATCGTAACATTTTAGATATTAGATCAAAGAGTCTCAATATGATGTCTCAAGAGGTTT
TTAGTTGTTGATACCATATTGAGATTACCCTACCCCTTTTTGTTTGGGAGGTCTGAGAAT
AATATGATATATACACTTTGTATTACCACTTGAGTGTTTGTGT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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AAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTG
TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA
CCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGTGGGCTCTGCCCGTT
GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCAT
TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG
GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGATCCTCAAAACGATGACGTTGTGGCCGATCCT
GATCCAGCCTTTGCTCCCTCCGCTCCCCCGCCGGCTTCTTCTCTTGCTACTCCGTCTTCT
CAAGCTCCCGGAGTTCTCCTCACCGTCACTTTCGCCGCCGTGCCTTGTTTCTTGCTCCGG
CTTCTTGCCGTATCAGCTTTGTAGTTCATTTATATACTCACGTACGTATTTGTTTTCATG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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AF RR4BC84TF U 1
AF RR4BC84JQ C 438
BS 1 598 RR4BC84TF

RD RR4BC84TF 598 0 0
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TTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAA
CCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGTGGGCTCTGCCCGTT
GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCAT
TCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGG
GTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGATCCTCAAAACGATGACGTTGTGGCCGATCCT
GATCCAGCCTTTGCTCCCTCCGCTCCCCCGCCGGCTTCTTCTCTTGCTACTCCGTCTTCT
CAAGCTCCCGGAGTTCTCCTCACCGTCACTTTCGCCGCCGTGCCTTGTTTCTTGCTCCGG
CTTCTTGCCGTATCAGCTTTGTAGTTCATTTATATACTCACGTACGTATTTGTTTTCATG
AGTTTAATTGTCTCAAAAATGATCATTTTATATATCTCGAAATAAACATTTTTTATCC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BC84JQ 161 0 0
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TTTGTAGTTCATTTATATACTCACGTACGTATTTGTTTTCATGAGTTTAATTGTCTCAAA
AATGATCATTTTATATATCTCGAAATAAACATTTTTTATCC

QA 1 161 1 161
DS 



AS 1 2

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TCCAGTTCGTGATCATCGCTGCTTTCTGTGAAAGAGATTCTCAGGCTTGGGTTTTTCACT
CCGGTTGGGAGCTTTTCACCATCCTCTACGCAGGAATAGTGGCGTCTGGAATCGCGTTTG
CGATTCAGATTTGGTGTATTGACAGAGGGGGTCCAGTTTTCGTTGCGGTTTACCAACCTG
TTCAGACTTAGGTCGTTGCGATTATGGCTTCGATTGCTTTAGTTGAAGAGTTTTACTTGG
GCGGGATTATTGGAGCTGTGCTGATCATAGCGGGACTCTACTTTGTGTTGTATGGTAAGA
GCGAAGAGAGGAAGTTTGCAGCTCTTGAGAAGGCAATGATCCAGTCCTCCGCGGAGCATG
TTATCGAGCGTGCACCCGTTTCTCGCGGCTCCATCAAGTCGTCCATCACAGCTCCACTGC
TCCATCAGTCAACGGACAACGTTTGACTTATCGAGTCTCTCTATCAAATAATTACAACGC
CATTACCCAATGGTGTGCCGTTGTGTGTTTATGACTTTTGTGTCTGCTTTTTTTTAGTTT
TTTTTCTTAATATGTTGCCTAAGAAAAGTCGTTTTTGAGGAGGGAAAAGAAGTAGATGAG
ACATCATTGTTCATGAGGATGCTGGTGAAGATGACAATGATAATGATGGTGATGATGAAG
ACTATGTGGAAGCTTGGATTTTGGACCTTTCAGTACTATTATATTTGGCTGATATATTAG
TGCCCTTGTATTACATTTCTTGTGGTTTTTATTTCGCTTTTCTATCATCAATAGAATGTT
ATAATTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G776TF U 1
AF RR4G776JQ C 225
BS 1 654 RR4G776TF
BS 655 655 RR4G776JQ
BS 656 664 RR4G776TF
BS 665 911 RR4G776JQ

RD RR4G776TF 667 0 0
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TTCTTAAATCTTATCCGGCCAGGCTCTCGGTTACGTCTTACACCCTTTTGTTCGGAATTA
TCCAGTTCGTGATCATCGCTGCTTTCTGTGAAAGAGATTCTCAGGCTTGGGTTTTTCACT
CCGGTTGGGAGCTTTTCACCATCCTCTACGCAGGAATAGTGGCGTCTGGAATCGCGTTTG
CGATTCAGATTTGGTGTATTGACAGAGGGGGTCCAGTTTTCGTTGCGGTTTACCAACCTG
TTCAGACTTAGGTCGTTGCGATTATGGCTTCGATTGCTTTAGTTGAAGAGTTTTACTTGG
GCGGGATTATTGGAGCTGTGCTGATCATAGCGGGACTCTACTTTGTGTTGTATGGTAAGA
GCGAAGAGAGGAAGTTTGCAGCTCTTGAGAAGGCAATGATCCAGTCCTCCGCGGAGCATG
TTATCGAGCGTGCACCCGTTTCTCGCGGCTCCATCAAGTCGTCCATCACAGCTCCACTGC
TCCATCAGTCAACGGACAACGTTTGACTTATCGAGTCTCTCTATCAAATAATTACAACGC
CATTACCCAATGGTGTGCCGTTGTGTGTTTATGACTTTTGTGTCTGCTTTTTTT*AGTTT
TTTT
CTA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4G776JQ 687 0 0
TCTGGAATCGCGTTTGCGATTCAGATTTGGTGTATTGACAGAGGGGGTCCAGTTTTCGTT
GCGGTTTACCAACCTGTTCAGACTTAGGTCGTTGCGATTATGGCTTCGATTGCTTTAGTT
GAAGAGTTTTACTTGGGCGGGATTATTGGAGCTGTGCTGATCATAGCGGGACTCTACTTT
GTGTTGTATGGTAAGAGCGAAGAGAGGAAGTTTGCAGCTCTTGAGAAGGCAATGATCCAG
TCCTCCGCGGAGCATGTTATCGAGCGTGCACCCGTTTCTCGCGGCTCCATCAAGTCGTCC
ATCACAGCTCCACTGCTCCATCAGTCAACGGACAACGTTTGACTTATCGAGTCTCTCTAT
CAAATAATTACAACGCCATTACCCAATGGTGTGCCGTTGTGTGTTTATGACTTTTGTGTC
TGCTTTTTTTTAGTTTTTTTTCTTAATATGTTGCCTAAGAAAAGTCGTTTTTGAGGAGGG
AAAAGAAGTAGATGAGACATCATTGTTCATGAGGATGCTGGTGAAGATGACAATGATAAT
GATGGTGATGATGAAGACTATGTGGAAGCTTGGATTTTGGACCTTTCAGTACTATTATAT
TTGGCTGATATATTAGTGCCCTTGTATTACATTTCTTGTGGTTTTTATTTCGCTTTTCTA
TCATCAATAGAATGTTATAATTTGCAC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL4875Contig1 480 2 2 U
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TTCTTTTGGAAAAAAATGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FW35JQ C 1
AF RR4FW35TF U 1
BS 1 435 RR4FW35TF
BS 436 480 RR4FW35JQ

RD RR4FW35JQ 480 0 0
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AGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGT
CACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAG
ATTGTCTAGAAACAGAAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGC
TGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGT
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TTCTTTTGGAAAAAAATGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4FW35TF 435 0 0
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ATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCC
AGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGT
CACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAG
ATTGTCTAGAAACAGAAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGC
TGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGT
TTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGC
TTCTTTTGGAAAAAA

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL4876Contig1 520 2 1 U
GGGGACTCCCCGACCCAAAAGAAATATCCCACAAAAATGGAGTTTCTCCGCAAGTTCAAA
TTTCCCGCGAGATCCAAGTCCCCGATCTTCGTCTTTACAGTCACCGGCCTAGCTATCACC
GCCGTCACCAGCAGCGCCGCCGTTTCCGTTTTCCGGGACTCTGCTTCCGTTCATCACCCC
AACAAAATCGCGACGGCGGTTGAAGGCGTCGTCCGTTCTTCTCGCGCTATCTACGCCATC
ACTCTCACCGTCGCTGATTACAAGTATAGTTTGCGTAGAGTGACGTCGGATTCCGATGAG
TACATACAGAGGTTAACAGAGGTTCATTCACGGTCTGCCAAACGAATTCTTAAACTGTGT
GAAAGTAATAAAGGTTTCTATGTGAAAGCTGGTCAGTTCGTGGCCACGTTGAAGCTGGTT
CCCAAAGAGTATTCTTTGGCCCTTTCCTCGTTGCAGGACCAGGTGTGAATACTAATAATG
ATTAGAACTCGTTGTGTTTTCTCTTTTTGAAAAATATGGA


BQ
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AF RR4EK76TF U 1
AF RR4EK76JQ C 89
BS 1 520 RR4EK76TF

RD RR4EK76TF 520 0 0
GGGGACTCCCCGACCCAAAAGAAATATCCCACAAAAATGGAGTTTCTCCGCAAGTTCAAA
TTTCCCGCGAGATCCAAGTCCCCGATCTTCGTCTTTACAGTCACCGGCCTAGCTATCACC
GCCGTCACCAGCAGCGCCGCCGTTTCCGTTTTCCGGGACTCTGCTTCCGTTCATCACCCC
AACAAAATCGCGACGGCGGTTGAAGGCGTCGTCCGTTCTTCTCGCGCTATCTACGCCATC
ACTCTCACCGTCGCTGATTACAAGTATAGTTTGCGTAGAGTGACGTCGGATTCCGATGAG
TACATACAGAGGTTAACAGAGGTTCATTCACGGTCTGCCAAACGAATTCTTAAACTGTGT
GAAAGTAATAAAGGTTTCTATGTGAAAGCTGGTCAGTTCGTGGCCACGTTGAAGCTGGTT
CCCAAAGAGTATTCTTTGGCCCTTTCCTCGTTGCAGGACCAGGTGTGAATACTAATAATG
ATTAGAACTCGTTGTGTTTTCTCTTTTTGAAAAATATGGA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4EK76JQ 432 0 0
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TTTTCCGGGACTCTGCTTCCGTTCATCACCCCAACAAAATCGCGACGGCGGTTGAAGGCG
TCGTCCGTTCTTCTCGCGCTATCTACGCCATCACTCTCACCGTCGCTGATTACAAGTATA
GTTTGCGTAGAGTGACGTCGGATTCCGATGAGTACATACAGAGGTTAACAGAGGTTCATT
CACGGTCTGCCAAACGAATTCTTAAACTGTGTGAAAGTAATAAAGGTTTCTATGTGAAAG
CTGGTCAGTTCGTGGCCACGTTGAAGCTGGTTCCCAAAGAGTATTCTTTGGCCCTTTCCT
CGTTGCAGGACCAGGTGTGAATACTAATAATGATTAGAACTCGTTGTGTTTTCTCTTTTT
GAAAAATATGGA

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

CO CL4877Contig1 451 2 1 U
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AAACAATGACCCGGTTTTCAACGGCAGTCTTCAAGAGCTATCCACAAATGATATCATAGC
ACTTCTCTACACATCCATATTTGGCAGTGCGGTTAGCCACGGTGTTTACTTCTACAGCGC
TACTAAAGGAAGCTTGACTAAACTCAGCTCACTCACCTTCTTGACACCAATGTTTGCATC
AATCTTTGGGTATCTATACCTTGATGAGACTTTCTCCTCGTTGCAACTGGTCGGAGCAGC
CGTCACTTTGGTCGCTATATACTTGGTCAACTTTCCAGAAGGCAACGATTGATAAACACT
CTCAGCCGTTACATTTGTATCTATAATAAAGTGAATAATCATAGGCCAGTGTTAAACCTT
AAGTCAACGTTTTATATTAACAGTAGAAATG


BQ
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AF RR4CO88JQ C 1
AF RR4CO88TF U 1
BS 1 451 RR4CO88TF

RD RR4CO88JQ 451 0 0
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AAACAATGACCCGGTTTTCAACGGCAGTTTTCAAGAGCTATCCACAAATGATATCATAGC
ACTTCTCTACACATCCATATTTGGCAGTGCGGTTAGCCACGGTGTTTACTTTTACAGCGC
TACTAAAGGAAGCTTGACTAAACTCAGCTCACTCACCTTCTTGACACCAATGTTTGCATC
AATCTTTGGGTATCTATACCTTGATGAGACTTTCTCCTCGTTGCAACTGGTCGGAGCAGC
CGTCACTTTGGTCGCTATATACTTGGTCAACTTTCCAGAAGGCAACGATTGATAAACACT
TTCAGCCGTTACATTTGTATCTATAATAAAGTGAATAATCATAGGCCAGTGTTAAACCTT
AAGTCAACGTTTTATATTAACAGTAGAAATG

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4CO88TF 451 0 0
GATGGCAACCGGCTGGCATATGGTTATAGGTGGCCTTCCTCTTCTGGCTATATCCGCTAT
AAACAATGACCCGGTTTTCAACGGCAGTCTTCAAGAGCTATCCACAAATGATATCATAGC
ACTTCTCTACACATCCATATTTGGCAGTGCGGTTAGCCACGGTGTTTACTTCTACAGCGC
TACTAAAGGAAGCTTGACTAAACTCAGCTCACTCACCTTCTTGACACCAATGTTTGCATC
AATCTTTGGGTATCTATACCTTGATGAGACTTTCTCCTCGTTGCAACTGGTCGGAGCAGC
CGTCACTTTGGTCGCTATATACTTGGTCAACTTTCCAGAAGGCAACGATTGATAAACACT
CTCAGCCGTTACATTTGTATCTATAATAAAGTGAATAATCATAGGCCAGTGTTAAACCTT
AAGTCAACGTTTTATATTAACAGTAGAAATG

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL4878Contig1 685 2 2 U
GAAACAAGAGACCACACATGGAGCCAAAAACTTTCTTCTGCTTTATTTTTCTCATAGTCA
CCGCCGGTTTCATCATCTCTTTCACTTCCACTAACTTCCCCCACGCGCCGTCGTCTACCA
CAGGGCTTCTTGACTGCACCGACTCTTCCTCTTCACCTCTTTGCGCATCAAGAAACTTCC
TCTTCAACAAACAAAAACCACCATTTTCTAAACAAGATCCTAAACCAAAACCCAAGAACC
ATGACCACTTGTCCGACACAGCGAACCACCCTCTGGACCCACTTACTGTCATGGAGTTTA
ACAAAGTCCTATCTCTCCTCTCCTCTCACGCGCTCTTCTCCTCAGGCGCACCACACGCGT
TCCACTCCATCGTCCTTGAAGAGCCGGAAAAGAATCTCGTTAGAGCATGGGAAAAAGGAA
ACCCACTTCCTCCGAGAAAAGCTTCCGTCATCGCACGCGTTGGCCCGGACACGCACGTGC
TAACCGTTGACCTTTCTTCTTCTCGGGTCGACATAGTGGATGGTCCGGTTCGTGCTTCGG
GTTACCCGATGATGACTCTAGAAGAGATGAATGACGCGACGTTCGCACCGTTTACAAACG
CTGATGTCAACCGTACGATTGTCGCTCGTGGAGTTAATCTGACGGATGTGTGTTGCTTCC
CGTTATCAAGTGGTTGGTACGGTAG


BQ
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AF RR4EZ95TF U 1
AF RR4EZ95JQ C 58
BS 1 497 RR4EZ95TF
BS 498 685 RR4EZ95JQ

RD RR4EZ95TF 497 0 0
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CCGCCGGTTTCATCATCTCTTTCACTTCCACTAACTTCCCCCACGCGCCGTCGTCTACCA
CAGGGCTTCTTGACTGCACCGACTCTTCCTCTTCACCTCTTTGCGCATCAAGAAACTTCC
TCTTCAACAAACAAAAACCACCATTTTCTAAACAAGATCCTAAACCAAAACCCAAGAACC
ATGACCACTTGTCCGACACAGCGAACCACCCTCTGGACCCACTTACTGTCATGGAGTTTA
ACAAAGTCCTATCTCTCCTCTCCTCTCACGCGCTCTTCTCCTCAGGCGCACCACACGCGT
TCCACTCCATCGTCCTTGAAGAGCCGGAAAAGAATCTCGTTAGAGCATGGGAAAAAGGAA
ACCCACTTCCTCCGAGAAAAGCTTCCGTCATCGCACGCGTTGGCCCGGACACGCACGTGC
TAACCGTTGACCTTTCT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4EZ95JQ 628 0 0
TCACCGCCGGTTTCATCATCTCTTTCACTTCCACTAACTTCCCCCACGCGCCGTCGTCTA
CCACAGGGCTTCTTGACTGCACCGACTCTTCCTCTTCACCTCTTTGCGCATCAAGAAACT
TCCTCTTCAACAAACAAAAACCACCATTTTTTAAACAAGATCCTAAACCAAAACCCAAGA
ACCATGACCACTTGTCCGACACAGCGAACCACCCTCTGGACCCACTTACTGTCATGGAGT
TTAACAAAGTCCTATCTCTCCTCTCCTCTCACGCGCTCTTCTCCTCAGGCGCACCACACG
CGTTCCACTCCATCGTCCTTGAAGAGCCGGAAAAGAATCTCGTTAGAGCATGGGAAAAAG
GAAACCCACTTCCTCCGAGAAAAGCTTCCGTCATCGCACGCGTTGGCCCGGACACGCACG
TGCTAACCGTTGACCTTTCTTCTTCTCGGGTCGACATAGTGGATGGTCCGGTTCGTGCTT
CGGGTTACCCGATGATGACTCTAGAAGAGATGAATGACGCGACGTTCGCACCGTTTACAA
ACGCTGATGTCAACCGTACGATTGTCGCTCGTGGAGTTAATCTGACGGATGTGTGTTGCT
TCCCGTTATCAAGTGGTTGGTACGGTAG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL4879Contig1 445 2 1 U
GGAGAACCCTAATTTCATTCACCCTTCTATGCTTCTCCTCTCCCCCCCCAATCTCTTCTA
GGGTTTAGTGGTTGACCCCTTCTTCCCTCTAATGGGTGCCGTCGCCATCAATCGCAAGCG
CACGGAAGATTCCATGAACTTCAACCAACAATCCCCATCCCAATCTTCGAACAAGAAACG
CAGATTCTCCTTCGGAATCACCTCTCCAGATTCCAACAAGCCATCTTCTTCGTCGAGGAT
CTCGAGGTATCCCGACGCGAAAGCTCCTCTCAGACGAGAGATTCACGCCCCCAGCAGAGC
CAGTCTCAGATACGGCTTGCCTAAGCCCAGACCGATCGATCAGTACAGGAGGAGAGCTTT
CGATGCGTTGAGGTTCTTTACGAAAGAGAAAGTGGTTATCGATTTGGGGGATGAAGAGCT
GGAAGTTGTTGTTGATTATGATCTT


BQ
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AF RR4AH73TF U 1
AF RR4AH80TF U 1
BS 1 445 RR4AH73TF

RD RR4AH73TF 445 0 0
GGAGAACCCTAATTTCATTCACCCTTCTATGCTTCTCCTCTCCCCCCCCAATCTCTTCTA
GGGTTTAGTGGTTGACCCCTTCTTCCCTCTAATGGGTGCCGTCGCCATCAATCGCAAGCG
CACGGAAGATTCCATGAACTTCAACCAACAATCCCCATCCCAATCTTCGAACAAGAAACG
CAGATTCTCCTTCGGAATCACCTCTCCAGATTCCAACAAGCCATCTTCTTCGTCGAGGAT
CTCGAGGTATCCCGACGCGAAAGCTCCTCTCAGACGAGAGATTCACGCCCCCAGCAGAGC
CAGTCTCAGATACGGCTTGCCTAAGCCCAGACCGATCGATCAGTACAGGAGGAGAGCTTT
CGATGCGTTGAGGTTCTTTACGAAAGAGAAAGTGGTTATCGATTTGGGGGATGAAGAGCT
GGAAGTTGTTGTTGATTATGATCTT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR4AH80TF 436 0 0
GGAGAACCCTAATTTCATTCACCCTTCTATGCTTCTCCTCTCCCCCCCCAATCTCTTCTA
GGGTTTAGTGGTTGACCCCTTCTTCCCTCTAATGGGTGCCGTCGCCATCAATCGCAAGCG
CACGGAAGATTCCATGAACTTCAACCAACAATCCCCATCCCAATCTTCGAACAAGAAACG
CAGATTCTCCTTCGGAATCACCTCTCCAGATTCCAACAAGCCATCTTCTTCGTCGAGGAT
CTCGAGGTATCCCGACGCGAAAGCTCCTCTCAGACGAGAGATTCACGCCCCCAGCAGAGC
CAGTCTCAGATACGGCTTGCCTAAGCCCAGACCGATCGATCAGTACAGGAGGAGAGCTTT
CGATGCGTTGAGGTTCTTTACGAAAGAGAAAGTGGTTATCGATTTGGGGGATGAAGAGCT
GGAAGTTGTTGTTGAT

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL4880Contig1 832 2 2 U
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CTCGCCCTGTGTACGGAACCTCCCTTGACGTCTGCTTCTCCAACATCTACCCACCCTACT
ATGTACGGATACCCCAAAATCGGCCACCAATTTTTCCCTCCGCCGGAGAGAAACCAATCG
TTTCAACATAGCTCTTCTTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTGAAGCCTGAG
TATCGTATTACTCCACCCCCTCAGTTGTTGCCTCGATCTGGAGATATTCCTCGCAGCGGT
TTTCAGCTCGATTTCGGTCTGGAAAGGACAGTCCTTGCGGAGGCTGAGAAAGACAACCCG
GACTGGAGTAAGTTTTGTTCCGAGAATCCTCCACCGCCTAAGTTTCCACAACCACCACTA
CCTTCTTCATTGGGTGTAGATCCTCTAGTGATGAAGTATACTGCGTCTGGGCTTAACCGA
GAAGCTGTCAACATTGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCTACTAAGGTTCAGGAATTT
GCAAATGGGTTCACAGCGATACGGGAGATGGGATTTCCAACAAACGCTGTTGCTGAAGCT
CTCTTCATGTTTGACAACGACACTGACAAAGCTTTGTCACATTTGCTCCATGCTTCTTCT
TGAACCCTTCTTTCGAGTATTCTTCTACATAGTTTTTATATAAAGTAAACATCAAATTTG
ATTCAAACATTAAGGTCGACCAAGTATATAAATTGAGGGGGGGGGGGGGTTTCTTCTTTT
TTCTTTTGTTAATGGATGATTTGTTTTACTTTAGAGATGTGTTTTGATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GJ60TF U 1
AF RR4GJ60JQ C 253
BS 1 699 RR4GJ60TF
BS 700 832 RR4GJ60JQ

RD RR4GJ60TF 699 0 0
GAATCAATGCCCCATCTCTTTTAATTACGAGTACGGGAACAAGTGTGGACCCCTCCTACG
CTCGCCCTGTGTACGGAACCTCCCTTGACGTCTGCTTCTCCAACATCTACCCACCCTACT
ATGTACGGATACCCCAAAATCGGCCACCAATTTTTCCCTCCGCCGGAGAGAAACCAATCG
TTTCAACATAGCTCTTCTTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTGAAGCCTGAG
TATCGTATTACTCCACCCCCTCAGTTGTTGCCTCGATCTGGAGATATTCCTCGCAGCGGT
TTTCAGCTCGATTTCGGTCTGGAAAGGACAGTCCTTGCGGAGGCTGAGAAAGACAACCCG
GACTGGAGTAAGTTTTGTTCCGAGAATCCTCCACCGCCTAAGTTTCCACAACCACCACTA
CCTTCTTCATTGGGTGTAGATCCTCTAGTGATGAAGTATACTGCGTCTGGGCTTAACCGA
GAAGCTGTCAACATTGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCTACTAAGGTTCAGGAATTT
GCAAATGGGTTCACAGCGATACGGGAGATGGGATTTCCAACAAACGCTGTTGCTGAAGCT
CTCTTCATGTTTGACAACGACACTGACAAAGCTTTGTCACATTTGCTCCATGCTTCTTCT
TGAACCCTTCTTTCGAGTATTCTTCTACATAGTTTTTAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4GJ60JQ 580 0 0
CCACCCCCTCAGTTGTTGCCTCGATCTGGAGATATTCCTCGCAGCGGTTTTCAGCTCGAT
TTCGGTCTGGAAAGGACAGTCCTTGCGGAGGCTGAGAAAGACAACCCGGACTGGAGTAAG
TTTTGTTCCGAGAATCCTCCACCGCCTAAGTTTCCACAACCACCACTACCTTTTTCATTG
GGTGTAGATCCTCTAGTGATGAAGTATACTGCGTCTGGGCTTAACCGAGAAGCTGTCAAC
ATTGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCTACTAAGGTTCAGGAATTTGCAAATGGGTTC
ACAGCGATACGGGAGATGGGATTTCCAACAAACGCTGTTGCTGAAGCTCTCTTCATGTTT
GACAACGACACTGACAAAGCTTTGTCACATTTGCTCCATGCTTTTTCTTGAACCCTTCTT
TCGAGTATTTTTCTACATAGTTTTTATATAAAGTAAACATCAAATTTGATTCAAACATTA
AGGTCGACCAAGTATATAAATTGAGGGGGGGGGGGGGTTTCTTCTTTTTTCTTTTGTTAA
TGGATGATTTGTTTTACTTTAGAGATGTGTTTTGATCAGC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL4881Contig1 592 2 2 U
AATCCACTTTAAGATTCATTCAAGAAAAAAAAGGAAGTATCATGCACGAAACATGACGAA
AGTATATAGACACACACATATGCATAAACGAAAGAGGACGTGATAATGATCAAGCATCAA
TCATCATTCCTGGTCTTGGAGGAATGTGGTCGTCCATGTCAGCAACCATCATCTCGACGA
ACTTCATGTAGTTGATAGGTTCAGGAGAATCTTCGTTCCTCTTCTCCCACACCATAGTGA
CTTTGCAGATGCAACCTTCCTTAGAAGTGGGGATGAACTGGTAAATTACAACATACACCT
TTAGTTCCTCCATCACGTGACCGTCGAGCCCATTGATCGTCAAGACCATATTTTCGTCGT
CCATCTCTGTCATCTCCTTGAAAATCTCCTCCTTCCCGTCACGAGTGTAGTTCCAGATTT
TAATGGTGCCGCGAGAGTCCCAATCGCCCTCGTGGACGGTGACTCCTTGGATGTGATGAC
CGATGGCGTCGGGGAAGAGGTTATGCTCGCTCCTCCATCTCTTGTAGTGTTTCTCTGCCT
TTCCCTTTAGAGGCACCTCCGTCACGTATGTTCCTGACATCGCCATTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BT39TF C 1
AF RR4BT39JQ U 149
BS 1 148 RR4BT39TF
BS 149 592 RR4BT39JQ

RD RR4BT39TF 583 0 0
AATCCACTTTAAGATTCATTCAAGAAAAAAAAGGAAGTATCATGCACGAAACATGACGAA
AGTATATAGACACACACATATGCATAAACGAAAGAGGACGTGATAATGATCAAGCATCAA
TCATCATTCCTGGTCTTGGAGGAATGTGGTCGTCCATGTCAGCAACCATCATCTCGACGA
ACTTCATGTAGTTGATAGGTTCAGGAGAATCTTCGTTCCTCTTCTCCCACACCATAGTGA
CTTTGCAGATGCAACCTTCCTTAGAAGTGGGGATGAACTGGTAAATTACAACATACACCT
TTAGTTCCTCCATCACGTGACCGTCGAGCCCATTGATCGTCAAGACCATATTTTCGTCGT
CCATCTCTGTCATCTCCTTGAAAATCTCCTCCTTCCCGTCACGAGTGTAGTTCCAGATTT
TAATGGTGCCGCGAGAGTCCCAATCGCCCTCGTGGACGGTGACTCCTTGGATGTGATGAC
CGATGGCGTCGGGGAAGAGGTTATGCTCGCTCCTCCATCTCTTGTAGTGTTTCTCTGCCT
TTCCCTTTAGAGGCACCTCCGTCACGTATGTTCCTGACATCGC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4BT39JQ 444 0 0
GTCGTCCATGTCAGCAACCATCATCTCGACGAACTTCATGTAGTTGATAGGTTCAGGAGA
ATCTTCGTTCCTCTTCTCCCACACCATAGTGACTTTGCAGATGCAACCTTCCTTAGAAGT
GGGGATGAACTGGTAAATTACAACATACACCTTTAGTTCCTCCATCACGTGACCGTCGAG
CCCATTGATCGTCAAGACCATATTTTCGTCGTCCATCTCTGTCATCTCCTTGAAAATCTC
CTCCTTCCCGTCACGAGTGTAGTTCCAGATTTTAATGGTGCCGCGAGAGTCCCAATCGCC
CTCGTGGACGGTGACTCCTTGGATGTGATGACCGATGGCGTCGGGGAAGAGGTTATGCTC
GCTCCTCCATCTCTTGTAGTGTTTCTCTGCCTTTCCCTTTAGAGGCACCTCCGTCACGTA
TGTTCCTGACATCGCCATTGATCC

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 2

CO CL4882Contig1 735 2 2 U
AAACTTATCGTTTGAAACTAAAAAAGAAGAGACCACCAAACAAAAACAAAAATGGCGTCC
AAAACCATCTTCTTCTCTTTCTTAGTCGTCTCCGCCGTGTGTTTGTCCACTCTCGCCGGT
TTTGTCGCCGCCGATGCTGACGATTTTGACCTTTTCCAGATTCAGGGATCTGTTTACTGT
GACACCTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCGAAGGTGCGAAAGTG
AAGTTGGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGACTAAAGAAGCCATTACC
GACAAATCAGGAAGCTACAAGATTGAAGTAACCGGTGATCACGAAGAAGAACTTTTGCGA
GCTCGTGTTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGACGTAAGCAGAGACGCCCTAC
TTACGTAACGCCGCTAAGATTCAGTTTAACAGCGAATGACGGAATCGTCTCTCACGAGAC
ACGTATCGTTAACCCCTCTTTGGTTTCATGGTTAAGACGCCATTAGCCCGATTGTCCCCG
CTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTCTACCTGACGTCACCTTTTAAGCGAAGAAAGAAGATA
TATTACGTCAGAGATATAAATTTCTACATGCTTAATCTTGAAGGGTTTTCCGTCAAATTT
ATCAAGGATTTATTGTTATGAATTAATATCTACATTGTTGTGAAAGTGTGTTTTATTATT
GAATCAAAGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT65TF U 1
AF RR4AT65JQ C 91
BS 1 561 RR4AT65TF
BS 562 735 RR4AT65JQ

RD RR4AT65TF 561 0 0
AAACTTATCGTTTGAAACTAAAAAAGAAGAGACCACCAAACAAAAACAAAAATGGCGTCC
AAAACCATCTTCTTCTCTTTCTTAGTCGTCTCCGCCGTGTGTTTGTCCACTCTCGCCGGT
TTTGTCGCCGCCGATGCTGACGATTTTGACCTTTTCCAGATTCAGGGATCTGTTTACTGT
GACACCTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCGAAGGTGCGAAAGTG
AAGTTGGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGACTAAAGAAGCCATTACC
GACAAATCAGGAAGCTACAAGATTGAAGTAACCGGTGATCACGAAGAAGAACTTTTGCGA
GCTCGTGTTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGACGTAAGCAGAGACGCCCTAC
TTACGTAACGCCGCTAAGATTCAGTTTAACAGCGAATGACGGAATCGTCTCTCACGAGAC
ACGTATCGTTAACCCCTCTTTGGTTTCATGGTTAAGACGCCATTAGCCCGATTGTCCCCG
CTGCTTTCAAGGAGCTCGGTA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4AT65JQ 645 0 0
TCCGCCGTGTGTTTGTCCACTCTCGCCGGTTTTGTCGCCGCCGATGCTGACGATTTTGAC
CTTTTCCAGATTCAGGGATCTGTTTACTGTGACACCTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGT
CTCAGCAAATTCCTCGAAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGA
ACCCTAACGTTGACTAAAGAAGCCATTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATTGAAGTA
ACCGGTGATCACGAAGAAGAACTTT*GCGAGCTCGTGTT*GGTCCAATCACCAGACAGTG
GTTGCAGTGACGTAAGCAGAGACGCC*TACTTACGTAACGCCGCTAAGAT*CAGTTTAAC
AGCGAATGACGGAATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCC*TCTT*GGTTTCATG
GTTAAGACGCCATTAGCC*GATTGTCCC*GCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTCTACCTG
ACGTCACCTTTTAAGCGAAGAAAGAAGATATATTACGTCAGAGATATAAATTTCTACATG
CTTAATCTTGAAGGGTTTTCCGTCAAATTTATCAAGGATTTATTGTTATGAATTAATATC
TACATTGTTGTGAAAGTGTGTTTTATTATTGAATCAAAGTGTTCC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL4883Contig1 1049 2 2 U
GGGATTTTCTTACTATAACTCAAATTAATCAATTAAATAAAAATGGCTTTTTGGTCTGCT
GAGAATGCCACTAAAGCCTACCTCACCACATTGAAAACGGATCAAAGAACAAAAGAACCA
AACGTGGCTGAATTCATATCGGCTCTAGCCGCGGGAAATAACGCAAGAAAGATCGCCGTG
GCTTGTGCCGGAGCAGCAAACGCTGACATACTCACTGCCCTAATCGCTGCGGCTAATCAA
ACGCGCGGTCAAGTGGTATGCGTTTTACGTGGCATCGAAGAACTCATCATATCCAAGAAA
ATGTTGGAACCATCAGAGATTCATCATATACAATTCGTAGTCGGAGAATCTAATGACAAC
GCTCTAATTAGTGACCATTTCGGAGAAGCTGATTTCGTCCTCGTTGATTGTAACATCAAG
AACCACCAAGATATCGTTAGAAAGATCGTTAATCACCACGAAGAAAACGCAAGAAACGGC
GGTGGAAGCGGTGCGGCGGTTGTGGTGGGTTATAACGCGTTTTCGAGAGGATCTTGGAGG
TTTAGCGATGGGAGGAAAACGCAGTTTTTGCCTATAGGTGAAGGGTTGCTGGTGACGAGG
GTCAACGATGATGGTAACTATAACCAGAAGATGGTGAAAAAAAACAATGATGATCATCAT
CAGCACCCTGGTCATGTGAGAAAGAGTCATTGGGTGGTGAGAGTTGATAAGTGCACAGGA
GAGAAGCATGTGTTTAGGGTAAGGGTTCCACGAGGAGAAGCCATTATTGAAGCTTAAATT
AGATCTTTTATATTATTGGACAGTTTAGAGAAAAAATCACCTCTGTGATGACGAGTGAGA
GTAGTAAGAAGATTAGTTATTTGGTACAAGTAATTAAAAAGAGTTTGGATTGGTATTAGA
GTATTATGTTGCATCAAGTTTTTTTAATTTATTTAAGAACTTCTTTTTTTGTGCACTAAA
AACTTTTTTCTTTTTTTGTAAGTGTGAATATACATGAAGAGTTGTGTTCGTTTTTAATTT
CTTTTCTCATTTTGGATTTTACTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G172TF U 1
AF RR4G172JQ C 547
BS 1 733 RR4G172TF
BS 734 1049 RR4G172JQ

RD RR4G172TF 733 0 0
GGGATTTTCTTACTATAACTCAAATTAATCAATTAAATAAAAATGGCTTTTTGGTCTGCT
GAGAATGCCACTAAAGCCTACCTCACCACATTGAAAACGGATCAAAGAACAAAAGAACCA
AACGTGGCTGAATTCATATCGGCTCTAGCCGCGGGAAATAACGCAAGAAAGATCGCCGTG
GCTTGTGCCGGAGCAGCAAACGCTGACATACTCACTGCCCTAATCGCTGCGGCTAATCAA
ACGCGCGGTCAAGTGGTATGCGTTTTACGTGGCATCGAAGAACTCATCATATCCAAGAAA
ATGTTGGAACCATCAGAGATTCATCATATACAATTCGTAGTCGGAGAATCTAATGACAAC
GCTCTAATTAGTGACCATTTCGGAGAAGCTGATTTCGTCCTCGTTGATTGTAACATCAAG
AACCACCAAGATATCGTTAGAAAGATCGTTAATCACCACGAAGAAAACGCAAGAAACGGC
GGTGGAAGCGGTGCGGCGGTTGTGGTGGGTTATAACGCGTTTTCGAGAGGATCTTGGAGG
TTTAGCGATGGGAGGAAAACGCAGTTTTTGCCTATAGGTGAAGGGTTGCTGGTGACGAGG
GTCAACGATGATGGTAACTATAACCAGAAGATGGTGAAAAAAAACAATGATGATCATCAT
CAGCACCCTGGTCATGTGAGAAAGAGTCATTGGGTGGTGAGAGTTGATAAGTGCACAGGA
GAGAAGCATGTGT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4G172JQ 503 0 0
GATGGGAGGAAAACGCAGTTTTTGCCTATAGGTGAAGGGTTGCTGGTGACGAGGGTCAAC
GATGATGGTAACTATAACCAGAAGATGGTGAAAAAAAACAATGATGATCATCATCAGCAC
CCTGGTCATGTGAGAAAGAGTCATTGGGTGGTGAGAGTTGATAAGTGCACAGGAGAGAAG
CATGTGTTTAGGGTAAGGGTTCCACGAGGAGAAGCCATTATTGAAGCTTAAATTAGATCT
TTTATATTATTGGACAGTTTAGAGAAAAAATCACCTCTGTGATGACGAGTGAGAGTAGTA
AGAAGATTAGTTATTTGGTACAAGTAATTAAAAAGAGTTTGGATTGGTATTAGAGTATTA
TGTTGCATCAAGTTTTTTTAATTTATTTAAGAACTTCTTTTTTTGTGCACTAAAAACTTT
TTTCTTTTTTTGTAAGTGTGAATATACATGAAGAGTTGTGTTCGTTTTTAATTTCTTTTC
TCATTTTGGATTTTACTTTTGGC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL4884Contig1 918 2 2 U
CCAAGCATCAGCTAATGGAGATCAATACCTCAGAGGATTCAAGAATCGAGGAGCTGCGTA
AACTCTCACAGGAGAGAGACAAGACGTGGCAATCTGAGGTTGATGCTATGAAGAGACAAC
ACGGAATGGACTCAGCTGCTTTGTCTTGTGCCATTACCGAGGTACAAAAGCTGAAGTCAA
AGCTCTTCGAGACTGAGTCCGAGCTAGAGAAGTCTAGGTTTGAGGTAAGGTCTTTAGAGA
AACTCGTTAGAGACTCATCATCATCAGGGGAAGTGGAAACTCTGAAAGAAGCAATGGAAC
TTGCGAGGCAAGAGATAAGCCAGTTGAAATCTGCTGTTGAAGCAGCGGAGAGAAGGTACC
AAGATGAGTATATACAGAGCACGTTGCAGATAAGAAGCGCTTACGAACAAGCAGAGGCGG
TTAAGACAAAGTGTGCACAGAGAGAGGCAGAGTTAGCTGAAGAGCTGAAGAGAACCGAAG
CTGAGGCTTTGCGCAAAGGATGTGAAGTTGCTGAAGATTTCAAGAAGCTCGAGTCAGATT
TAGTGGAAGTGAGAGGGTGTTTGGTTGATAAGGAGATGGAGTTGCAGAGGCTGAGAAGTG
AAATGGAGAAGGGAGTTGAGACCGCAAACAATGAAGCCATGGAAGCTGAGCTAAGAAGAG
TGAAGGTTCAGTGTGAGCAGTGGAGGAAAGCGGCTGAGACGGCAGCTTCTATACTGAACA
GTGAAGAGGAGAGAACTGATTCTATTGAGAATGGTAAAATGTTGAAGAAGTTTGGTGTGT
TGCTAAAGAAAAACCACAAGTAATAATATGATTCTTTGTTTTGGTTTTATTTTAAGATAT
TTAAAAAATTGGCATTGCTATTGTTTGTAAATTTGTAAAATTCGATTTGATTTCTATAAG
TGTATTTTCTTGTCTTCT


BQ
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GTTTTATTTTAAGATATTTAAAAAATTGGCATTGCTATTGTTTGTAAATTTGTAAAATTC
GATTTGATTTCTATAAGTGTATTTTCTTGTCTTCT

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CCCAAAAACTCTTCCTTTTTATTTTTCCCCTGATTACGATAAAAAAAAAAGAGCTCTGGG
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GTTTCCAAGGTTATTGAGCTTTTGCAATGGCTAACGACCATTGGGGTGAAACAAGTTGGT
CTTTTTGACTCCCAAGGTTTATTGAAGAAATCCAAGGATATGATCCTTGAAATGGTGCCT
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CAGGGTCCTGATCTGTTGCTGGTTTATGGACCTGTAAGGAGCCACCTCGGTTTCCCTGCT
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TGTGATTACAGAGAGAGCAGAGCTTCCAATAGAAATTTTTGAATGTGATTCACATATTTG
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G018TF U 1
AF RR4G018JQ C 583
BS 1 751 RR4G018TF
BS 752 752 RR4G018JQ
BS 753 783 RR4G018TF
BS 784 784 RR4G018JQ
BS 785 794 RR4G018TF
BS 795 1329 RR4G018JQ

RD RR4G018TF 794 0 0
GGGGGTCTGATCAAGAAGCTAATAGACTCTCGAAAGTGTCTCTCTTTTCTCTTCTCACCT
CCCAAAAACTCTTCCTTTTTATTTTTCCCCTGATTACGATAAAAAAAAAAGAGCTCTGGG
TTTTAGGATAAGCTAATAGACCCATCTTATTTTTGTTTCGATTTATCCGCAGATTATATG
GATTTCAATGATCCGATGCTGGTCCTAAGTTCCTGGATTGGTCAAATTGTTGATTTTGGA
CTTGATTTGCTATGGCGTTTCATACACATTGTTGTGAGCTTATGTCACATTGTCTCTGGC
ACCTTTGAGGCGATAGAAAGCTATGCGATCTCCTTAGGATTGATTCAAAAATACAGTTCA
ATCGATATCGAAAAGCTCAAGTGTCTAGCGGTTGTAGTGGACATAGAAGCAGCTCGAGAT
GTTTCCAAGGTTATTGAGCTTTTGCAATGGCTAACGACCATTGGGGTGAAACAAGTTGGT
CTTTTTGACTCCCAAGGTTTATTGAAGAAATCCAAGGATATGATCCTTGAAATGGTGCCT
CGTTCAGTCTTGTTACAGGTATTATATAAAGCATACCTTCTTCAATGTGCTACTGTGGTC
ATGAATCAAATCTTTAGCTTCTCCCTAGCTCATGATTAGTAAAAGTATCTGCAAAATGGA
GGTACGTTTGATTGCTACTTTACCTGCTTGCAGGAGACTGGTGAGAGAGATATTTCGTCT
GACCGCATTGCTTTAGAATTCGTTTCGTCTC*TGACAATAAAGAAGCTGTTGTGAAAGCA
GCCCACGTACTACT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4G018JQ 747 0 0
CAATGTGCTACTGTGGTCATGAATCAAATCTTTAGCTTCTCCCTAGCTCATGATTAGTAA
AAGTATCTGCAAAATGGAGGTACGTTTGATTGCTACTTTACCTGCTTGCAGGAGACTGGT
GAGAGAGATATTTCGTCTGACCGCATTGCTTTAGAATTCGTTTCGTCTCCTGACAATAAA
GAAGCTGTTGTGAAAGCAGCCAACGTACTACTTGAGAAGTACTTGAAATCCAGCCATCCT
GACAAGGGTGACGAAGGGGAAAACGTTTTTACAGAGTCTCATCTGAACGAAGCATTAAGA
GTTGTTGGTGAGAATGTACAGGGTCCTGATCTGTTGCTGGTTTATGGACCTGTAAGGAGC
CACCTCGGTTTCCCTGCTTGGAGACTTCGATACACTGAGATTGTACATATGGGATCGTTG
AAGTATATGAGATATGGCTCCCTTTTGAAGGCAATCCACAAATTTACAGGCGTGAGGCAA
AACTATGGGGTTTGATGGTGTGATTACAGAGAGAGCAGAGCTTCCAATAGAAATTTTTGA
ATGTGATTCACATATTTGTCGTTCAAAGGAGACATTGTTGGAGAGCTGTTAATTCAGTGC
ACCCACCATTGTTGCCAATTTGTTCACATCTTGTTCTGACAATTTCATGTTATACAGATT
CACAACTCATAACTGACATAGGCATTGGCATTGTATATGAGTTTTAAGTACTAATGAGCT
GGACCAATCCACCCCAGTAGTGGTCAT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL4886Contig1 915 2 2 U
GGAAATTAATCTTTGCTCCTATCTTTTCCTACCAATTAACTAGAAACCAGTTATATACAT
CTCCATCAAAACCCTCTCTAGCAATGGCTCCTCAAAACCAACAGCCTAGGCGAACGCAAC
CGCAACCGCTGCCAGGTAGGGGTTTGAACCCCGTCCTATGCATCATCTTTGCTCTTGTCC
TCCTAGGACTCCTTGTGGGTCTCGCTATATTGATCACATACCTCACCCTCAGGCCAAAGA
AACTCGTCTATACGGTAGAATCCGCCTCGGTCCAAGATTTTGCCATAGCCAAGGACGATC
ACATTAGCGCCAAATTCAACTATGTGATCAAATCATACAACCCGGAGAAACATGTCTCCG
TGAGATATCACTCCATGCGCATCTCCACGGCTCACCATAACCAGTCAGTGGCTCACAAGG
AGATCCCTGCCTTCAAGCAGCGTCCTAAGAACGATACAAGGATTGAGACACAGCTTGTAT
CCCACAACGTCGCATTGTCTAAGTTTAATGCTAAGGACTTGAGGGCTGAAACGACCAAAG
GGCTGATCGAAATGGAAGTCTATATAACGGCTAGAGTGAGTTACAAGACGTGGATTTTTC
GGTCAAGGAGACGTACGTTGAAGGCTGTATGTACGCCAATAATGATCAACGTTACGGCGA
ACTCGTTGGATGGATTTCAGAGAGTTTTATGCAAAACTCGTCTTTAGTTTGGATTATTTA
TCAACTTGAAATGGTTCGATTTGTGTGCATCAATACGTTTATAAGTTAATTTGCCATGTG
TCCTTGATTGATTGTGTGTATGTGTATGTTTCTTTTGAAGTTCTTTGTTTTTTTTGTTCT
TTTGTATGCATTCACTTATCCATTTTTATCTTCTCATTATTATTCTTTTTATATGATAAA
ATGTTTTATATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DE26TF U 1
AF RR4DE26JQ C 199
BS 1 617 RR4DE26TF
BS 618 915 RR4DE26JQ

RD RR4DE26TF 617 0 0
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CTCCATCAAAACCCTCTCTAGCAATGGCTCCTCAAAACCAACAGCCTAGGCGAACGCAAC
CGCAACCGCTGCCAGGTAGGGGTTTGAACCCCGTCCTATGCATCATCTTTGCTCTTGTCC
TCCTAGGACTCCTTGTGGGTCTCGCTATATTGATCACATACCTCACCCTCAGGCCAAAGA
AACTCGTCTATACGGTAGAATCCGCCTCGGTCCAAGATTTTGCCATAGCCAAGGACGATC
ACATTAGCGCCAAATTCAACTATGTGATCAAATCATACAACCCGGAGAAACATGTCTCCG
TGAGATATCACTCCATGCGCATCTCCACGGCTCACCATAACCAGTCAGTGGCTCACAAGG
AGATCCCTGCCTTCAAGCAGCGTCCTAAGAACGATACAAGGATTGAGACACAGCTTGTAT
CCCACAACGTCGCATTGTCTAAGTTTAATGCTAAGGACTTGAGGGCTGAAACGACCAAAG
GGCTGATCGAAATGGAAGTCTATATAACGGCTAGAGTGAGTTACAAGACGTGGATTTTTC
GGTCAAGGAGACGTACG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4DE26JQ 717 0 0
GTCTCGCTATATTGATCACATACCTCACCCTCAGGCCAAAGAAACTCGTCTATACGGTAG
AATCCGCCTCGGTCCAAGATTTTGCCATAGCCAAGGACGATCACATTAGCGCCAAATTCA
ACTATGTGATCAAATCATACAACCCGGAGAAACATGTCTCCGTGAGATATCACTCCATGC
GCATCTCCACGGCTCACCATAACCAGTCAGTGGCTCACAAGGAGATCCCTGCCTTCAAGC
AGCGTCCTAAGAACGATACAAGGATTGAGACACAGCTTGTATCCCACAACGTCGCATTGT
CTAAGTTTAATGCTAAGGACTTGAGGGCTGAAACGACCAAAGGGCTGATCGAAATGGAAG
TCTATATAACGGCTAGAGTGAGTTACAAGACGTGGATTTTTCGGTCAAGGAGACGTACGT
TGAAGGCTGTATGTACGCCAATAATGATCAACGTTACGGCGAACTCGTTGGATGGATTTC
AGAGAGTTTTATGCAAAACTCGTCTTTAGTTTGGATTATTTATCAACTTGAAATGGTTCG
ATTTGTGTGCATCAATACGTTTATAAGTTAATTTGCCATGTGTCCTTGATTGATTGTGTG
TATGTGTATGTTTCTTTTGAAGTTCTTTGTTTTTTTTGTTCTTTTGTATGCATTCACTTA
TCCATTTTTATCTTCTCATTATTATTCTTTTTATATGATAAAATGTTTTATATTTGT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL4887Contig1 1219 2 2 U
GCGTAGCATCTAGAGGAGCCAGAGAGCTGAGAGAGAGAGAAAGCATTACATTGATCATGA
GCGTCTTTGAACGCGAAGCTCTTTAAGTACATAGCCGAGTGCTTCAATTCGGGAAAAAGG
AGAAGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTGCACTTGTCTTGCTCTTCT
TATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGCGTTCATCTCTCCTTCAAAAACAT
CCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAACGAGAA
AGGTGGTACGATGGGAGAGGAAGAGAAACGACGGAGACTGCCAAAGCACGTGGCGATTAT
ATTGGACGGAAACAGACGTTGGGCGGAGAAACGAGGACTCGGAACATCGGAAGGTCACCA
GGCCGGAGCGAGGAGGCTCATCGAGAATGCTAAGGACTGTTTCGCTATGGGGATAAACAC
TGTCTCACTCTTTGCTTTCTCCACCGAAAATTGGGCAAGACCTGAGGATGAAGTTAACGG
CCTGATGGCCTTGTTTGAGAAACATTTGAGGTCTGAGATGGCTTTCTTTTGGAGTGATAA
AATCAAGATCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAAATCTCCCAGTCGCTTCTAGGTTTGAT
AAAAGAAGCAGAGGAAGCTACAAAGAGCTACGAAGAGAAGCATCTCATTATAGCAATAGA
CTATAGTGGAAGATTTGATATCTTACAAGCTTGCAAAAGTCTTGCAGAAAAGGCCAAAAA
CGGGCTGATCCAAGTAGAGGACATTGACGAGGATGTGATGGAGAAAGAGTTGATGACAAA
CTGTAGTGAGTTCCCAAACCCTGACCTATTGATTAGAACGAGCGGAGAGCAAAGGATCAG
TAACTTCTTCCTATGGCAATCTGCTTACACTGAGCTCTACTTTCCTAACGTTCTATGGCC
TGACTTCGGTGAGGCTGAGTATCTTGAGGCCTTGACTTGGTATCAGCAAAGGCAGAGGCG
ATTCGGTCTACGAGTTTAGAATTTGAGTGTTATGTCTCACAAATAAATTGTTTCAAGTAT
AGTAGTAGTGGTCCGATTGTTTCAAACATATATACTTTGCCTTTGTTTTTTTACGTTTAC
TAATTATAAGTTACTTTTTTCACACTTACAAATTATGAGAGTTGTAAATAACTATTTAAA
ACTATATCATGATTTAAGC


BQ
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AF RR4AR90TF U 1
AF RR4AR90JQ C 359
BS 1 728 RR4AR90TF
BS 729 1219 RR4AR90JQ

RD RR4AR90TF 728 0 0
GCGTAGCATCTAGAGGAGCCAGAGAGCTGAGAGAGAGAGAAAGCATTACATTGATCATGA
GCGTCTTTGAACGCGAAGCTCTTTAAGTACATAGCCGAGTGCTTCAATTCGGGAAAAAGG
AGAAGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTGCACTTGTCTTGCTCTTCT
TATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGCGTTCATCTCTCCTTCAAAAACAT
CCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAACGAGAA
AGGTGGTACGATGGGAGAGGAAGAGAAACGACGGAGACTGCCAAAGCACGTGGCGATTAT
ATTGGACGGAAACAGACGTTGGGCGGAGAAACGAGGACTCGGAACATCGGAAGGTCACCA
GGCCGGAGCGAGGAGGCTCATCGAGAATGCTAAGGACTGTTTCGCTATGGGGATAAACAC
TGTCTCACTCTTTGCTTTCTCCACCGAAAATTGGGCAAGACCTGAGGATGAAGTTAACGG
CCTGATGGCCTTGTTTGAGAAACATTTGAGGTCTGAGATGGCTTTCTTTTGGAGTGATAA
AATCAAGATCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAAATCTCCCAGTCGCTTCTAGGTTTGAT
AAAAGAAGCAGAGGAAGCTACAAAGAGCTACGAAGAGAAGCATCTCATTATAGCAATAGA
CTATAGTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4AR90JQ 861 0 0
ATATTGGACGGAAACAGACGTTGGGCGGAGAAACGAGGACTCGGAACATCGGAAGGTCAC
CAGGCCGGAGCGAGGAGGCTCATCGAGAATGCTAAGGACTGTTTCGCTATGGGGATAAAC
ACTGTCTCACTCTTTGCTTTCTCCACCGAAAATTGGGCAAGACCTGAGGATGAAGTTAAC
GGCCTGATGGCCTTGTTTGAGAAACATTTGAGGTCTGAGATGGCTTTCTTTTGGAGTGAT
AAAATCAAGATCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAAATCTCCCAGTCGCTTCTAGGTTTG
ATAAAAGAAGCAGAGGAAGCTACAAAGAGCTACGAAGAGAAGCATCTCATTATAGCAATA
GACTATAGTGGAAGATTTGATATCTTACAAGCTTGCAAAAGTCTTGCAGAAAAGGCCAAA
AACGGGCTGATCCAAGTAGAGGACATTGACGAGGATGTGATGGAGAAAGAGTTGATGACA
AACTGTAGTGAGTTCCCAAACCCTGACCTATTGATTAGAACGAGCGGAGAGCAAAGGATC
AGTAACTTCTTCCTATGGCAATCTGCTTACACTGAGCTCTACTTTCCTAACGTTCTATGG
CCTGACTTCGGTGAGGCTGAGTATCTTGAGGCCTTGACTTGGTATCAGCAAAGGCAGAGG
CGATTCGGTCTACGAGTTTAGAATTTGAGTGTTATGTCTCACAAATAAATTGTTTCAAGT
ATAGTAGTAGTGGTCCGATTGTTTCAAACATATATACTTTGCCTTTGTTTTTTTACGTTT
ACTAATTATAAGTTACTTTTTTCACACTTACAAATTATGAGAGTTGTAAATAACTATTTA
AAACTATATCATGATTTAAGC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 2

CO CL4888Contig1 947 2 4 U
ATTGGGTTGATAAATGCAAAATCAACGAGATTTACCGTTATAAAACTGAGGAGTACTCTA
CTGATGCAACCAACAAGTTCAACATCTACCCGGACCAGGTTTCTCCGTGGTTAATGGACT
GGATTCCTGAAAGCCGTAGGTGTGGTTTTCTTGTGGGAAACCTCCAGCCTGCTCACATGG
ACTTTAGGTTCTTCACTTTGGGAAACCTTTGGTCAGTTATTTCTTCTTTGGGCAAGACAG
AACCAAGCTATACTGAATTTGATCGAAGAGAAATGGGATGATCTCATTGGACATATGCCA
CTTAAGATATGTTTCCCAGCTTTGGAGTCTGCAGAGTGGCATATAATCACTGGGAGTGAC
CCAAAGAACACGCCTTGGTCTTACCATAACGGCGGGTCATGGCCAACGCTTCTCTGGCAA
TTCACACTGGCATGCATGAAGATGGGTAGACCAGAGCTAGCAGAGAAAGCAGTTGCATTG
GCTGAGAAGAGGCTCCAAGCTGACCGGTGGCCTGAGTACTACGATACAAGATACGGGAAG
TTCATCGGAAAAAAGTCTAGGCTTTACCAGACATAGACGATTGCTGGTTTCTTGACAGCC
AAGCAGCTATTGCAGAATCCTGAAATGGCATCTTCCTTGTTCTGGGAAGAAGATCTTGAG
CTTCTAGAGACTTGTGTTTGTGTTCTATCCAAATCAGGCCGGAAGAGTTGCTCTAGAGCC
GCAGCAAAGTCTCAGATTCTTATCTAAATTGGTTTTGTCCATGGACTGGATTAAGATGTA
AAGTTCATGTTGCAACAAATATCACGTGTCTGTATATAAGAAATCGGTGGTTGACACTTG
ACACTAGTAGTACTTTTCTACAATTAGTAAAAAGATAAGTACTATGTTGTCTGGTAATGT
TCTAACATGTTAACCAAAGTAATATAGTAAATAACAATTTTGATTGT


BQ
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AF RR4CO76TF U 1
AF RR4CO76JQ C 220
BS 1 650 RR4CO76TF
BS 651 651 RR4CO76JQ
BS 652 670 RR4CO76TF
BS 671 947 RR4CO76JQ

RD RR4CO76TF 670 0 0
ATTGGGTTGATAAATGCAAAATCAACGAGATTTACCGTTATAAAACTGAGGAGTACTCTA
CTGATGCAACCAACAAGTTCAACATCTACCCGGACCAGGTTTCTCCGTGGTTAATGGACT
GGATTCCTGAAAGCCGTAGGTGTGGTTTTCTTGTGGGAAACCTCCAGCCTGCTCACATGG
ACTTTAGGTTCTTCACTTTGGGAAACCTTTGGTCAGTTATTTCTTCTTTGGGCAAGACAG
AACCAAGCTATACTGAATTTGATCGAAGAGAAATGGGATGATCTCATTGGACATATGCCA
CTTAAGATATGTTTCCCAGCTTTGGAGTCTGCAGAGTGGCATATAATCACTGGGAGTGAC
CCAAAGAACACGCCTTGGTCTTACCATAACGGCGGGTCATGGCCAACGCTTCTCTGGCAA
TTCACACTGGCATGCATGAAGATGGGTAGACCAGAGCTAGCAGAGAAAGCAGTTGCATTG
GCTGAGAAGAGGCTCCAAGCTGACCGGTGGCCTGAGTACTACGATACAAGATACGGGAAG
TTCATCGGAAAAAAGTCTAGGCTTTACCAGACATAGACGATTGCTGGTTTCTTGACAGCC
AAGCAGCTATTGCAGAATCCTGAAATGGCATCTTCCTTGTTCTGGGAAGA*GATCTTGAG
CTTCTAGAGA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4CO76JQ 728 0 0
TTTCTTCTTTGGGCAAGACAGAACCAAGCTATACTGAATTTGATCGAAGAGAAATGGGAT
GATCTCATTGGACATATGCCACTTAAGATATGTTTCCCAGCTTTGGAGTCTGCAGAGTGG
CATATAATCACTGGGAGTGACCCAAAGAACACGCCTTGGTCTTACCATAACGGCGGGTCA
TGGCCAACGCTTTTCTGGCAATTCACACTGGCATGCATGAAGATGGGTAGACCAGAGCTA
GCAGAGAAAGCAGTTGCATTGGCTGAGAAGAGGCTCCAAGCTGACCGGTGGCCTGAGTAC
TACGATACAAGATACGGGAAGTTCATCGGAAAAAAGTTTAGGCTTTACCAGACATAGACG
ATTGCTGGTTTCTTGACAGCCAAGCAGCTATTGCAGAATCCTGAAATGGCATCTTCCTTG
TTCTGGGAAGAAGATCTTGAGCTTCTAGAGACTTGTGTTTGTGTTCTATCCAAATCAGGC
CGGAAGAGTTGCTCTAGAGCCGCAGCAAAGTCTCAGATTCTTATCTAAATTGGTTTTGTC
CATGGACTGGATTAAGATGTAAAGTTCATGTTGCAACAAATATCACGTGTCTGTATATAA
GAAATCGGTGGTTGACACTTGACACTAGTAGTACTTTTCTACAATTAGTAAAAAGATAAG
TACTATGTTGTCTGGTAATGTTCTAACATGTTAACCAAAGTAATATAGTAAATAACAATT
TTGATTGT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL4889Contig1 978 2 4 U
GACGCGCTTTTGTAATAAGAATACCAAAGATGGTGACGACGGCGACGTGCGTCGTCGGAG
CTCCATTGGTAGTTACTCGTTCTAGACGGATTCCGACGACCTTAAAGTGCTTCGCTTCCA
CCGCCAATTCTGAGCTTCTCCGTTCCCAGCTCGATCGTCTTCACGCGGAGGCAGAGTTCA
CTCGTGCTAAAGCAAATAGTAATAGGTTGAGGCTTTTGAGATTATCCGAAGCTGCAGAGA
ATCTAAGGAGACAAGCATCTGTAAGCGTTCAGACAGGGAAAGAGAACGATGCAAGAGAAC
TGCTTCTCCAGAAGAAGAAAGTCATGCAAGCTTTGGACAAGGCCAAATCCCGTATCGAGT
TGCTCGATGCCCTTTCTTCCAAACTTAACGAGGCAATATCTGCCAAGGAAACACAGCTGA
TTGGGAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAATAATAATACTTCAGATGGAG
TTCGCATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAGAACGGCACAGCCGACTTGGATT
CTCAGGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGAACAACACCAAGAAGAGGCTTTAA
CTGGCAGCATCTTCAGAGAAGTGTCTTCTTATGAATCTTTCCTGGAAAAATTAGACCAGA
AACTTGGCAGAATCGAGGCTGAACTAGTCACTGTTGTGAACGTTGCGTCCTTGGTGCTTA
GTCATGAAGATAAACCCAATAATCTAAAGGTTCAGCAAACATCAGAAATTCTTGAAGAGA
TTCGTTCTGTCAGGGAAAGGATTGCAAATATCATTTCCAAAGAAGCAAACATCAGTTAGT
GCCTCAAGCTCCTTCTTGGGTATGAACAGTCTAAGCATTTATATACTCATTCAGGTCCAT
GGCTCTTCTTTGATGTGATGTGATGTGATGTGAATATTAAATTTCTTGTTAATGTTGGGT
ACATTAAATTTTGATGAG


BQ
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AF RR4CR49TF U 1
AF RR4CR49JQ C 231
BS 1 649 RR4CR49TF
BS 650 650 RR4CR49JQ
BS 651 671 RR4CR49TF
BS 672 978 RR4CR49JQ

RD RR4CR49TF 679 0 0
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CTCCATTGGTAGTTACTCGTTCTAGACGGATTCCGACGACCTTAAAGTGCTTCGCTTCCA
CCGCCAATTCTGAGCTTCTCCGTTCCCAGCTCGATCGTCTTCACGCGGAGGCAGAGTTCA
CTCGTGCTAAAGCAAATAGTAATAGGTTGAGGCTTTTGAGATTATCCGAAGCTGCAGAGA
ATCTAAGGAGACAAGCATCTGTAAGCGTTCAGACAGGGAAAGAGAACGATGCAAGAGAAC
TGCTTCTCCAGAAGAAGAAAGTCATGCAAGCTTTGGACAAGGCCAAATCCCGTATCGAGT
TGCTCGATGCCCTTTCTTCCAAACTTAACGAGGCAATATCTGCCAAGGAAACACAGCTGA
TTGGGAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAATAATAATACTTCAGATGGAG
TTCGCATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAGAACGGCACAGCCGACTTGGATT
CTCAGGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGAACAACACCAAGAAGAGGCTTTAA
CTGGCAGCATCTTCAGAGAAGTGTCTTCTTATGAATCTTTCCTGGAAAA*TTAGACCAGA
AACTTGGCAGA
TCGAGCTG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CR49JQ 748 0 0
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GCAAGAGAACTGCTTCTCCAGAAGAAGAAAGTCATGCAAGCTTTGGACAAGGCCAAATCC
CGTATCGAGTTGCTCGATGCCCTTTCTTCCAAACTTAACGAGGCAATATCTGCCAAGGAA
ACACAGCTGATTGGGAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAATAATAATACT
TCAGATGGAGTTCGCATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAGAACGGCACAGCC
GACTTGGATTCTCAGGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGAACAACACCAAGAA
GAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAGAGAAGTGTCTTCTTATGAATCTTTCCTGGAAAAA
TTAGACCAGAAACTTGGCAGAATCGAGGCTGAACTAGTCACTGTTGTGAACGTTGCGTCC
TTGGTGCTTAGTCATGAAGATAAACCCAATAATCTAAAGGTTCAGCAAACATCAGAAATT
CTTGAAGAGATTCGTTCTGTCAGGGAAAGGATTGCAAATATCATTTCCAAAGAAGCAAAC
ATCAGTTAGTGCCTCAAGCTCCTTCTTGGGTATGAACAGTCTAAGCATTTATATACTCAT
TCAGGTCCATGGCTCTTCTTTGATGTGATGTGATGTGATGTGAATATTAAATTTCTTGTT
AATGTTGGGTACATTAAATTTTGATGAG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4890Contig1 745 2 2 U
ATCATGGCTCCGGTGTCGGCGCTCGCAAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCC
GTGGGAAAGACGAGCATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAG
GCCACGATTGGTATTGATTTTCTATCAAAAAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCT
GCAGCTATGGGATACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCCAGTTACATTAG
GGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACAC
TACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGT
GGGAAATAAAACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGCGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAA
GGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAA
GGCGCTTTTCCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTCGACAAA
GCAAGAGGACATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCA
ACAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAGAACAACAACAAAACACACACACACACACACAA
AACTCCTCGAGCCTTCGCATGATCCCAAACACTATCATCGTCCGTCTCTGTAAAATTTTT
GCCTGCTTTATAATCAGATTTTTTT


BQ
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AF RR4G683TF U 1
AF RR4G683JQ C 175
BS 1 607 RR4G683TF
BS 608 745 RR4G683JQ

RD RR4G683TF 607 0 0
ATCATGGCTCCGGTGTCGGCGCTCGCAAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCC
GTGGGAAAGACGAGCATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAG
GCCACGATTGGTATTGATTTTCTATCAAAAAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCT
GCAGCTATGGGATACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCCAGTTACATTAG
GGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACAC
TACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGT
GGGAAATAAAACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGCGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAA
GGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAA
GGCGCTTTTCCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTCGACAAA
GCAAGAGGACATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCA
ACAGCAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4G683JQ 571 0 0
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CATTAGGGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCT
AAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGT
ACTTGTGGGAAATAAAACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGCGTCGATAGAGGAAGCAGA
AGCTAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAA
CATTAAGGCGCTTTTCCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTC
GACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTT
GGCTCAACAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAGAACAACAACAAAACACACACACACAC
ACACAAAACTCCTCGAGCCTTCGCATGATCCCAAACACTATCATCGTCCGTCTCTGTAAA
ATTTTTGCCTGCTTTATAATCAGATTTTTTT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL4891Contig1 450 2 1 U
GTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCTTATTAGACAACGATGACTTGCTCCAAAGC
GTCACTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAAATTCCAAGAAATTCCACTATTGATATGACG
CGAGAACCAGGGCATGTACTCAACGTAGCAATTGAGGGAAATCAAGTTGGGAGTGTGAAG
AGCAAACCCTTGTGTAGGTCAATCTTAGACTTGTACATTGGTGAAGAACCGTTTGATAAG
AATGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGGCTTCTATAGCCGCTGTTGACAACAAGTAG
TACCAGGTCATGAGATTTCAGAAGAAAAAATGATAAAACAAACCAAGTGTGGTCTTTGCT
ATCGTAATCTCTATATTATAATACTGTTGAGGTATTTTTAATGAAAAAGATTGCTACCTT
GAGGGATGGTTCAGGGTTTTGTTTAAGTCC


BQ
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AF RR4FL77JQ C 1
AF RR4FL77TF U 1
BS 1 450 RR4FL77TF

RD RR4FL77JQ 450 0 0
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GTCACTAGCTTCTTCAAAGACGAGTATAAAATTCCAAGAAATTCCACTATTGATATGACG
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AGCAAACCCTTGTGTAGGTCAATTTTAGACTTGTACATTGGTGAAGAACCGTTTGATAAG
AATGCAAGAGAGGATTTTTTAGACAATGTGGCTTCTATAGCCGCTGTTGACAACAAGTAG
TACCAGGTCATGAGATTTCAGAAGAAAAAATGATAAAACAAACCAAGTGTGGTCTTTGCT
ATCGTAATCTCTATATTATAATACTGTTGAGGTATTTTTAATGAAAAAGATTGCTACCTT
GAGGGATGGTTCAGGGTTTTGTTTAAGTCC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4FL77TF 450 0 0
GTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCTTATTAGACAACGATGACTTGCTCCAAAGC
GTCACTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAAATTCCAAGAAATTCCACTATTGATATGACG
CGAGAACCAGGGCATGTACTCAACGTAGCAATTGAGGGAAATCAAGTTGGGAGTGTGAAG
AGCAAACCCTTGTGTAGGTCAATCTTAGACTTGTACATTGGTGAAGAACCGTTTGATAAG
AATGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGGCTTCTATAGCCGCTGTTGACAACAAGTAG
TACCAGGTCATGAGATTTCAGAAGAAAAAATGATAAAACAAACCAAGTGTGGTCTTTGCT
ATCGTAATCTCTATATTATAATACTGTTGAGGTATTTTTAATGAAAAAGATTGCTACCTT
GAGGGATGGTTCAGGGTTTTGTTTAAGTCC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL4892Contig1 453 2 1 U
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GCTTTGAAGCAGAGAGAGAACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAG
AAGGTGCAATCGATCACAGATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACT
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TCATCCTTCTCCAATAATCTCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCATCCACAATTAATTAC
TTTTCAGACAACGTTTCTTAATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTT
ATCCTGTGTTAATTTTCTTATTTTTTTATTTTCATATTTTAATAGTACAGATGTTTGAAC
AAAACTTAAGTTCATTCTATGGAGTGAACTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EA19JQ C 1
AF RR4EA19TF U 1
BS 1 453 RR4EA19TF

RD RR4EA19JQ 453 0 0
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GCTTTGAAGCAGAGAGAGAACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAG
AAGGTGCAATCGATCACAGATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACT
TCTAATCTCGACCAGGACGGCGCTTCCTCAGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGC
TCATCCTTTTCCAATAATCTTTAAGTATTTTTAGCTGTAACAGCATCCACAATTAATTAC
TTTTCAGACAACGTTTTTTAATTAAATTGTAGTTTTTTTATTTGATTCTGTTGTTACCTT
ATCCTGTGTTAATTTTCTTATTTTTTTATTTTCATATTTTAATAGTACAGATGTTTGAAC
AAAACTTAAGTTCATTTTATGGAGTGAACTTTT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4EA19TF 453 0 0
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GCTTTGAAGCAGAGAGAGAACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAG
AAGGTGCAATCGATCACAGATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACT
TCTAATCTCGACCAGGACGGCGCTTCCTCAGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGC
TCATCCTTCTCCAATAATCTCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCATCCACAATTAATTAC
TTTTCAGACAACGTTTCTTAATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTT
ATCCTGTGTTAATTTTCTTATTTTTTTATTTTCATATTTTAATAGTACAGATGTTTGAAC
AAAACTTAAGTTCATTCTATGGAGTGAACTTTT

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 2

CO CL4893Contig1 437 2 2 U
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ACAAAACCTCACATTCATTTCTTCATCGCTTGTATCCCAAGGCAACCACCGGGAGACTCA
CTTTATGCCCGCGGCTTCCTTTCAACGTAACCTCTCCAAAGGCCTCCCTGCTCGGTCCAT
GACCGTTGAAGTCGTCATCAGAGCTGATTTGATGGCGGCTGGACTCCACTGAGGATGCTT
CTGTTTCACCAATGCAGCTATACCGGCGATGTGCGGTGCAGCCATGCTTGTACCAGAGAT
CAGTGCAAATCCACACCGACGTAGTTAGCCTCGTCTGTTCCGTTCTGAGACCATGCGGAC
CAGATCAGAGAGCCTGGAGCAAGAATATCTGGTTTGAGGAGATCAGCATCCTGAAAGCTG
AAATCTTTGGTGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FJ55TF C 1
AF RR4FJ55JQ U 14
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BS 14 437 RR4FJ55JQ

RD RR4FJ55TF 437 0 0
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ACAAAACCTCACATTCATTTCTTCATCGCTTGTATCCCAAGGCAACCACCGGGAGACTCA
CTTTATGCCCGCGGCTTCCTTTCAACGTAACCTCTCCAAAGGCCTCCCTGCTCGGTCCAT
GACCGTTGAAGTCGTCATCAGAGCTGATTTGATGGCGGCTGGACTCCACTGAGGATGCTT
CTGTTTCACCAATGCAGCTATACCGGCGATGTGCGGTGCAGCCATGCTTGTACCAGAGAT
CAGTGCAAATCCACACCGACGTAGTTAGCCTCGTCTGTTCCGTTCTGAGACCATGCGGAC
CAGATCAGAGAGCCTGGAGCAAGAATATCTGGTTTGAGGAGATCAGCATCCTGAAAGCTG
AAATCTTTGGTGTTGGC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4FJ55JQ 424 0 0
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TTCATTTCTTCATCGCTTGTATCCCAAGGCAACCACCGGGAGACTCACTTTATGCCCGCG
GCTTCCTTTCAACGTAACCTCTCCAAAGGCCTCCCTGCTCGGTCCATGACCGTTGAAGTC
GTCATCAGAGCTGATTTGATGGCGGCTGGACTCCACTGAGGATGCTTCTGTTTCACCAAT
GCAGCTATACCGGCGATGTGCGGTGCAGCCATGCTTGTACCAGAGATCAGTGCAAATCCA
CACCGACGTAGTTAGCCTCGTCTGTTCCGTTCTGAGACCATGCGGACCAGATCAGAGAGC
CTGGAGCAAGAATATCTGGTTTGAGGAGATCAGCATCCTGAAAGCTGAAATCTTTGGTGT
TGGC

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 2

CO CL4894Contig1 593 2 3 U
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TAAACATGGATTAAAAATCTAACAGAAAACCTCTGTTTGAATCCAAGAAAATGATGAGAC
ACAAAAAAAAACATTTTTCTTTTAAAAAGGACATTTTTCTTTTAAAAAGGAACTTTTTCT
TTTCTAAATGGTACTGTTGAATGAAGAAACTGCATGATTAGCAAATGAGGCCCCTGAAAA
AAAAGCATTCAAGTTATCTCTAGTCCCAGAGCTAGACGATGCATTATAAGAAGAAGGGTC
CGTGTAGTTGTTGTTGTTTCTGTTCACTTCATCTGGCTTTGTCTCCACGGGTCCTCTCAC
TTTCAAGTCCATAAAATCAGACATCAAACCCGGCCTGGTGATTCCCCTCGTGTCTATATC
CTTCTCCCCTGTCAACAGCTTCACCACCGTGGACATGGTTGGTCTCAGCTTTGGACTGTC
TTGCGTGCACAGAAGACCGATCTTTAGGTACCGGCAAGCTTCCTCTGCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD75JQ U 11
AF RR4BD75TF C 1
BS 1 10 RR4BD75TF
BS 11 472 RR4BD75JQ
BS 473 593 RR4BD75TF

RD RR4BD75JQ 462 0 0
AGTCACTGACCTCTTTTGACCAATTTAAATTCAAACTTATGTACATATACACTCAAATAT
TTGTTTACAACTAAAAGACAACCTTAAACAAGTGTAAGGCTTCTCTACAGTAAACATGGA
TTAAAAATCTAACAGAAAACCTCTGTTTGAATCCAAGAAAATGATGAGACACAAAAAAAA
ACATTTTTCTTTTAAAAAGGACATTTTTCTTTTAAAAAGGAACTTTTTCTTTTCTAAATG
GTACTGTTGAATGAAGAAACTGCATGATTAGCAAATGAGGCCCCTGAAAAAAAAGCATTC
AAGTTATCTCTAGTCCCAGAGCTAGACGATGCATTATAAGAAGAAGGGTCCGTGTAGTTG
TTGTTGTTTCTGTTCACTTCATCTGGCTTTGTCTCCACGGGTCCTCTCACTTTCAAGTCC
ATAAAATCAGACATCAAACCCGGCCTGGTGATTCCCCTCGTG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4BD75TF 593 0 0
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ACTCAAATATTTGTTTACAACTAAAAGACAACCTTAAACAAGTGTAAGGCTTCTCTACAG
TAGACATGGATTAAAAATCTAACAGAAAACCTCTGTTTGAATCCAAGAAAATGATGAGAC
ACAAAAAAAAACATTTTTCTTTTAAAAAGGACATTTTTCTTTTAAAAAGGAACTTTTTCT
TTTCTAAATGGTACTGTTGAATGAAGAAACTGCATGATTAGCAGATGAGGCCCCTGAAGA
GAAAGCATTCGAGTTATCTCTAGTCCCAGAGCTAGACGATGCATTATAAGAAGAAGGGTC
CGTGTAGTTGTTGTTGTTTCTGTTCACTTCATCTGGCTTTGTCTCCACGGGTCCTCTCAC
TTTCAAGTCCATAAAATCAGACATCAAACCCGGCCTGGTGATTCCCCTCGTGTCTATATC
CTTCTCCCCTGTCAACAGCTTCACCACCGTGGACATGGTTGGTCTCAGCTTTGGACTGTC
TTGCGTGCACAGAAGACCGATCTTTAGGTACCGGCAAGCTTCCTCTGCGTCCC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL4895Contig1 812 2 3 U
CAAAAAAAGGGAGAGACTGATATTTATACAAACGTTGTATGTTACAACTAATGTAAGAGA
GAGTATGTCTGAGGTTTTCTACAAAACGACATATGATACACCTATACTTTATAATGCTGA
TTCAAACGAATAAAAGGATTCAGCAAACACACATCAAAAGTTCAGTATGGTAAAAAAAAA
GGATGAATGTTTGGAGCATCAACAACCTCAGATCCCACTCTCGAACATTAGATCAAACGT
CGTATACAGGTAGTCGTTCTTCGATGGTTATACGACATACTGGACACTTTTTACACTTGT
CTGAACAGAGACTGCAAAAAACACGGTGTCTACATGGAAGCAGTACCAAACTGATTTCTC
TTTCAAAGCAAACCCTACACAGCACTTTCTCATTTTGCAGCCTTTCATACTCTTGCTGGC
TGAATTTTGTAATCTCGGTTTGTTCACCAAGTGCGGCTTGAAGTCTCCACACCTCTTCAG
CAAGATCTTCCTTTGGCATTTTCTTGACTATCTCAGGAGGATGACCACTGAAGGTATTGT
AACCAGATTCTCCATCAATGTAAAGTCGAGATTGTTCCTCCCTGCTTCCTTCATCAATGG
ACCACCAACCTAATAGCCTAGAACCATGGTGCAAGAAACCCAAGCAATCGTGTGCTCTTG
ATGAAAATCTAAAATAGAATCCTGGTCCAGCTTCCCCACGTAGTAAGACGACGATCTTCT
CTATTAGTTTAGATGCAGCAAAGAGAACACCAAGGCCTTGCAGTAAGAAAAGTGGAGAAA
ACAAGACTGGGAGTGATATATCCTTAGCTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP80JQ U 1
AF RR4C886JQ U 1
BS 1 318 RR4C886JQ
BS 319 319 RR4CP80JQ
BS 320 812 RR4C886JQ

RD RR4CP80JQ 715 0 0
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GAGTATGTCTGAGGTTTTCTACAAAACGACATATGATACACCTATACTTTATAATGCTGA
TTCAAACGAATAAAAGGATTCAGCAAACACACATCAAAAGTTCAGTATGGTAAAAAAAAA
GGATGAATGTTTGGAGCATCAACAACCTCAGATCCCACTCTCGAACATTAGATCAAACGT
CGTATACAGGTAGTCGTTCTTCGATGGTTATACGACATACTGGACACTTTTTACACTTGT
CTGAACAGAGACTGCAAAAAACACGGTGTCTACATGGAAGCAGTACCAAACTGATTTCTC
TTTCAAAGCAAACCCTACACAGCACTTTCTCATTTTGCAGCCTTTCATACTCTTGCTGGC
TGAATTTTGTAATCTCGGTTTGTTCACCAAGTGCGGCTTGAAGTCTCCACACCTCTTCAG
CAAGATCTTCCTTTGGCATTTTCTTGACTATCTCAGGAGGATGACCACTGAAGGTATTGT
AACCAGATTCTCCATCAATGTAAAGTCGAGATTGTTCCTCCCTGCTTCCTTCATCAATGG
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ATGAAAATCTAAAATAGAATCCTGGTCCAGCTTCCCCACGTAGTAAGACGACGAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4C886JQ 812 0 0
CAAAAAAAGGGAGAGACTGATATTTATACAAACGTTGTATGTTACAACTAATGTAAGAGA
GAGTATGTCTGAGGTTTTCTACAAAACGACATATGATACACCTATACTTTATAATGCTGA
TTCAAACGAATAAAAGGATTCAGCAAACACACATCAAAAGTTCAGTATGGTAAAAAAAAA
GGATGAATGTTTGGAGCATCAACAACCTCAGATCCCACTCTCGAACATTAGATCAAACGT
CGTATACAGGTAGTCGTTCTTCGATGGTTATACGACATACTGGACACTTTTTACACTTGT
CTGAACAGAGACTGCAAAGAACACGGTGTCTACATGGAAGCAGTACCAAACTGATTTCTC
TTTCAAAGCAAACCCTACACAGCACTTTCTCATTTTGCAGCCTTTCATACTCTTGCTGGC
TGAATTTTGTAATCTCGGTTTGTTCACCAAGTGCGGCTTGAAGTCTCCACACCTCTTCAG
CAAGATCTTCCTTTGGCATTTTCTTGACTATCTCAGGAGGATGACCACTGAAGGTATTGT
AACCAGATTCTCCATCAATGTAAAGTCGAGATTGTTCCTCCCTGCTTCCTTCATCAATGG
ACCACCAACCTAATAGCCTAGAACCATGGTGCAAGAAACCCAAGCAATCGTGTGCTCTTG
ATGAAAATCTAAAATAGAATCCTGGTCCAGCTTCCCCACGTAGTAAGACGACGATCTTCT
CTATTAGTTTAGATGCAGCAAAGAGAACACCAAGGCCTTGCAGTAAGAAAAGTGGAGAAA
ACAAGACTGGGAGTGATATATCCTTAGCTCTC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL4896Contig1 931 2 2 U
GGAATCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTCATACGCTATAAACCGGAGATAGGATCCCAGGAG
ATAAAGATGTCGTCGAGTGTGGTGGAGGAGATACAATGTGGGTCTACGTTGTTCGAGGAA
GAGGAGCTACAAGAGATGAGTGGGGTCAACGTTGGTGGCGGTTACGTTGAGGTCATGTGT
GGTTGTACTAGCCACCGTTACGGCGATGCCGTTGCTAGGCTTAGGGTTTTCCCCAACGGC
GATCTCGAAATCACCTGCGAATGCACCCCTGGCTGTGACGAAGACAAGTTAACACCAGCT
GCATTCGAGAAGCATTCTGGCAGAGAAACGGCTAGGAAGTGGAAGAACAATGTGTGGGTT
ATCATTGGAGGAGAAAAAGTTCCATTGTCAAAGACAGTATTGCTCAAATACTACAAAGAA
TCATCAAAGAAGTTGAACAGATCAAACAGATCACAAGGCACGAAAGTATTCCACAGAGAT
GAGTTTGTTGGGTGCATCGAATGCGGCAAAGAGAGGAGGTTCAGGTTGAGGAGCAGAGAC
GAATGCCGCTTGCACCACAACGCAATAGCTGATCCAAACTGGAAATGCTCAGACTTTCCA
TACGACAAGATAACATGTGAGGCAGAGGAAGAGAGAGGAAGCAGGAAAGTGTATAAAGGC
TGCACACGTTCACCGACTTGCAAAGGCTGCACTTCTTGCGTCTGCTTTGGCTGCGAGTTA
TGCCGTTTCTCTGATTGTTCTTGCCAGACCTGCGTCGATTTCACCAGCAACGTCGAAGCT
TAGAAGAAAACCAAACATTTTACTAATGAAAAATGTCTTTTAGAGAGACTACTTGGTGGT
TGCATTTAATATTTTATTATTCTAAAAATTCTGAAACTGTTATATCTACTTGTTATCTTA
TGGGTCGTTGAATGGAGCAGTTGGAAAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY82TF U 1
AF RR4DY82JQ C 202
BS 1 639 RR4DY82TF
BS 640 931 RR4DY82JQ

RD RR4DY82TF 639 0 0
GGAATCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTCATACGCTATAAACCGGAGATAGGATCCCAGGAG
ATAAAGATGTCGTCGAGTGTGGTGGAGGAGATACAATGTGGGTCTACGTTGTTCGAGGAA
GAGGAGCTACAAGAGATGAGTGGGGTCAACGTTGGTGGCGGTTACGTTGAGGTCATGTGT
GGTTGTACTAGCCACCGTTACGGCGATGCCGTTGCTAGGCTTAGGGTTTTCCCCAACGGC
GATCTCGAAATCACCTGCGAATGCACCCCTGGCTGTGACGAAGACAAGTTAACACCAGCT
GCATTCGAGAAGCATTCTGGCAGAGAAACGGCTAGGAAGTGGAAGAACAATGTGTGGGTT
ATCATTGGAGGAGAAAAAGTTCCATTGTCAAAGACAGTATTGCTCAAATACTACAAAGAA
TCATCAAAGAAGTTGAACAGATCAAACAGATCACAAGGCACGAAAGTATTCCACAGAGAT
GAGTTTGTTGGGTGCATCGAATGCGGCAAAGAGAGGAGGTTCAGGTTGAGGAGCAGAGAC
GAATGCCGCTTGCACCACAACGCAATAGCTGATCCAAACTGGAAATGCTCAGACTTTCCA
TACGACAAGATAACATGTGAGGCAGAGGAAGAGAGAGGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4DY82JQ 730 0 0
GGCGATGCCGTTGCTAGGCTTAGGGTTTTCCCCAACGGCGATCTCGAAATCACCTGCGAA
TGCACCCCTGGCTGTGACGAAGACAAGTTAACACCAGCTGCATTCGAGAAGCATTCTGGC
AGAGAAACGGCTAGGAAGTGGAAGAACAATGTGTGGGTTATCATTGGAGGAGAAAAAGTT
CCATTGTCAAAGACAGTATTGCTCAAATACTACAAAGAATCATCAAAGAAGTTGAACAGA
TCAAACAGATCACAAGGCACGAAAGTATTCCACAGAGATGAGTTTGTTGGGTGCATCGAA
TGCGGCAAAGAGAGGAGGTTCAGGTTGAGGAGCAGAGACGAATGCCGCTTGCACCACAAC
GCAATAGCTGATCCAAACTGGAAATGCTCAGACTTTCCATACGACAAGATAACATGTGAG
GCAGAGGAAGAGAGAGGAAGCAGGAAAGTGTATAAAGGCTGCACACGTTCACCGACTTGC
AAAGGCTGCACTTCTTGCGTCTGCTTTGGCTGCGAGTTATGCCGTTTCTCTGATTGTTCT
TGCCAGACCTGCGTCGATTTCACCAGCAACGTCGAAGCTTAGAAGAAAACCAAACATTTT
ACTAATGAAAAATGTCTTTTAGAGAGACTACTTGGTGGTTGCATTTAATATTTTATTATT
CTAAAAATTCTGAAACTGTTATATCTACTTGTTATCTTATGGGTCGTTGAATGGAGCAGT
TGGAAAAGTT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4897Contig1 447 2 2 U
GAGGCAGCACCAAGAGGGTCACGTCCAGAACGCCAACCTCGGGTGTATGAACCTGCGTTC
AGAGTCTATGTGGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAACGGTCGTCTAGAACAAGTTTTC
AGTGAGCATGGTAAAGTTGTGGAAGCTCGTGTGGTTTATGACCGTGAGACAGGTCGTTCA
CGTGGGTTCGGTTTTGTCACAATGTCTAACGAGACTGAACTCAACGACGCTATTGCTGCT
CTCGATGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCAATCAGAGTGAACGTAGCGGAGGAGCGTCCG
AGGCGCGGGTTTTAAAAGGATTGAGATTATCTCTTCTGCCAGTTTCCTCTCTCTCTCTCT
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GTCCGAACACCTTTGATGATTTTTTGT


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AGAGTCTATGTGGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAACGGTCGTCTAGAACAAGTTTTC
AGTGAGCATGGTAAAGTTGTGGAAGCTCGTGTGGTTTATGACCGTGAGACAGGTCGTTCA
CGTGGGTTCGGTTTTGTCACAATGTCTAACGAGACTGAACTCAACGACGCTATTGCTGCT
CTCGATGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCAATCAGAGTGAACGTAGCGGAGGAGCGTCCG
AGGCGCGGGTTTTAAAAGGATTGAGATTATCTCTTCTGCCAGTTTCCTCTCTCTCTCTCT
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DS 



AS 1 2

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CCTCCGTCACGAGATGTCTCTCCTCCGCCTCTTCGAGACTGTCTCCGATGACTGCGTCGT
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TCTGTTAGGATTATTTGGAAAGAAGCCACTTTCGATTAGGCTTAAAGGAGTTACGGATGA
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TGGAGTCCTTCGGAAGTTTTAGATCTTAAAATCGAAGCCCGTGGAGTAGCTCCAGAGGGA
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GAGGAAGGGATGGTGAAGAGGATACGTGGTTGGACTTTCTCTGCAAGAGTTTCTAGCGAC
TTTGAACATTCCATGAGATTCGCAGCTCGTGGAATCTTTAACAACCTCTTGCCTGATGTT
CACATCTTCAACGATCACAAATCTGGCCCTCACGCTGGAAAATCACCTGGAGTTGAAATA
GCTTCACGGCTTCTCCAGGAGATTGAGAAAGGCGGAGTTGTTGATTCAACACACCAGGGA
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BQ
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AF RR4AC26JQ C 347
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CCTCCGTCACGAGATGTCTCTCCTCCGCCTCTTCGAGACTGTCTCCGATGACTGCGTCGT
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TCTGTTAGGATTATTTGGAAAGAAGCCACTTTCGATTAGGCTTAAAGGAGTTACGGATGA
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TGGAGTCCTTCGGAAGTTTTAGATCTTAAAATCGAAGCCCGTGGAGTAGCTCCAGAGGGA
GGTGGAGAAGTTCTTTTAACTGTTCCAAATGTTCAGACTCTTACTGCGTTCCAGTGGGTA
GAGGAAGGGATGGTGAAGAGGATACGTGGTTGGACTTTCTCTGCAAGAGTTTCTAGCGAC
TTTGAACATTCCATGAGATTCGCAGCTCGTGGAATCTTTAACAACCTCTTGCCTGATGTT
CACATCTTCAACGATCACAAATCTGGCCCTCACGCTGGAAAATCACCTGGAGTTGAAATA
GCTT

QA 1 784 1 784
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GAGTTTCTAGCGACTTTGAACATTCCATGAGATTCGCAGCTCGTGGAATCTTTAACAACC
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CTGGAGTTGAAATAGCTTCACGGCTTCTCCAGGAGATTGAGAAAGGCGGAGTTGTTGATT
CAACACACCAGGGATTGTTGTTTATACTATGTGCGTTATGCCAACAAGACGTGTCAAAGG
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DS 



AS 1 2

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TTGGCTATTTGATTCTG


BQ
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AF RR4DQ92TF U 1
AF RR4DQ92JQ C 203
BS 1 640 RR4DQ92TF
BS 641 857 RR4DQ92JQ

RD RR4DQ92TF 640 0 0
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QA 1 640 1 640
DS 

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AACGACTCTTGACGGGAGTAACCTGACGATTCCGGTTCTGGATATTGTTAAACCGGGTCA
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TAAGAGAGTGCTTGGTGGAGCCTGAAGAGCTGAATGTTTAGTTTTCATTTCAAAGTAAGC
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AGAAAGTTCTGAATAAATGAGGTTGTTCCACTGTGAGTATCAGACATTTTAATAATGGCT
GTCACGGACAGAACATATCCTACTTTTTAAGTAGAACTTTGGCTATTTGATTCTG

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AP25TF U 1
AF RR4AD71TF U 1
BS 1 763 RR4AD71TF

RD RR4AP25TF 711 0 0
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TTGCTTCTTGAGATGAATCCTCTTTACAAGAAGATCCCGGTTCTCATCCACAATGGTAAA
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CCTTACTTTGGTGGTGATAGATTCGGGTTTGTAGACATTGCCCTGATTGGATTCTACAGT
TGGTTTCCAGGGTACCAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAACCAGAGTGTTCTAAACTG
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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4AD71TF 763 0 0
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GAGGTGATCCTTCTGAATTTCTGGCCGAGTATGTTTGGGATGAGGACTATGATTGCTTTG
AAGGAGAAAAAAGTGAAGTACGAATACAGAGAAGAAGATCTTCTCAACAACAAGAGTGCC
TTGCTTCTTGAGATGAATCCTCTTTACAAGAAGATCCCGGTTCTCATCCACAATGGTAAA
CCAATCTGTGAATCTGTCATACAGGTCCAGTACATAGACCAGATCTGGTCAGACAAGAAC
CCGTTACTCCCTACTGATCCTTACCAGAGAGCTCAAGCCTTGTTTTGGGCTGACTTCATT
GACAAGAAGTTGTATGTTTGTGGGAGGAAGACTTGGGCAACAAAAGGCGAGGAGCTAGAA
GAAGCCAAAAAGGAGTTCATTGAAATACTAAAGACTCTTCAATCCGAGCTTGGAGACAAG
CCTTACTTTGGTGGTGATAGATTCGGGTTTGTAGACATTGCCCTGATTGGATTCTACAGT
TGGTTTCCAGGGTACCAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAACCAGAGTGTTCTAAACTG
ATGGATTGGGGAAGGAGGTGTATGGAGAGGGAGAGTGTAGCTACATCCTTGCCTACTCCT
GAGAGAGTTGTTGGGTTCATTTTACAGCTTAAGAAGCTCTATGGGGTCGAGTAAGACAAG
ATCTATGTTGTGTTTCAGCTCTTTTGTTGTGTTGTGTGTTTCT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4901Contig1 930 2 2 U
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CTCTCTCTCAATATTTTCTTAAAAAAAAAAAAATTTTCAAATAAATCTTGTTTTTTTTTT
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TGCTTCTGCAGAATTGAGTGATTTGCCATTTCCTCTGATCCTTTTTCAAATCATATGACG
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TGAATTACAGTGTAGATTCATAGACATGCACTACCATCTGACCTCTGTTTTCTAACTATT
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ATTTAATGATAATCCCATGATTATTAATCACTAGATCACCATCTTTCGGCTGAGGTTGCA
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TTGGATAATAACCAAGAAACGGCTTTGTGACTATTTTCTGTTGTTTCGTCAACGTGTTTG
AGATTGTAAATTTAAATTCTCTTAGTTTGT


BQ
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AF RR4D836TF U 1
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TGCTTCTGCAGAATTGAGTGATTTGCCATTTCCTCTGATCCTTTTTCAAATCATATGACG
TGTTTTTATTATTGCAAAGTGGGGAATGAGGATGTTTATTAAACCATACGTCTGCAAATC
TGAATTACAGTGTAGATTCATAGACATGCACTACCATCTGACCTCTGTTTTCTAACTATT
TTTCTTAAACCAGTCTTATTATTTGGTTTGCTGCAATCGATGATGAATAAAATCGTCCAT
ATTTAATGATAATCCCATGATTATTAATCACTAGATCACCAT

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DS 

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TATTGCAAAGTGGGGAATGAGGATGTTTATTAAACCATACGTCTGCAAATCTGAATTACA
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TCATATGTTTTTCCTTTTAAGAAATTTTCAATGGTATTTGATTTACACTGTTAGGTTAGC
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ATTTAAATTCTCTTAGTTTGT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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CTTCCGTTCCAGCTTCATCAACAATGGATCTGCATCGAAAGGCTCGCACACGTCGCAGCC
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TATTTCCAACTAGGTGAGCTGGCGTATTGGTTTTACCCGTGAGTTTGAAGGATTTTTATA
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CTGTTATGGATTTAGAATATATCTTTGGATGAATCACTTTGGTACCCATCATTTCCTTCT
TACGTCTTTTGTCCATTTATATTGCTTGGGTACCATGTTTTAAGTTTTGATTAGAGTTGT
AAAGAAGAGGTATACTATTATTCGTTAATCGTTC


BQ
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AF RR4FF39TF U 1
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QA 1 538 1 538
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GTTTTAAGTTTTGATTAGAGTTGTAAAGAAGAGGTATACTATTATTCGTTAATCGTTC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL4903Contig1 943 2 4 U
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CTTTGGCTTACTCTAGGGGAGATTCAAGAAAAGACGGTGACAACAAGACTCTTCACAGAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH82TF U 1
AF RR4GH82JQ C 261
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BS 679 679 RR4GH82JQ
BS 680 696 RR4GH82TF
BS 697 943 RR4GH82JQ

RD RR4GH82TF 699 0 0
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TGGACTTAGAGAGCTTCAGGGTAGGTCTTACCCCAACAGTCTTCTACATTCCTGGTTTCA
TCACTGACCAAGAGGAAACTCAGCTCCTCAATCATATATATGGAGCATCTGGTTCCAAGT
GGAAGACGTTAAAGAACAGAAGATTACAGAACTGGGGTGGTATGGTCCATGAAAAGGGTC
TTGTTCCCCAAGAGTTGCCTTCTTGGCTGACAAAGATTACCGAGAAAATTAATGAAAGCT
CTGGTCTTTTCCCTTCTGCTATAAATCATGTCCTCATCAATGAATACCATCCTGACCAAG
GGATAATGCCGCACCAAGATGGACCAGCTTATTTTCCTGTTGTAGCTATCCTGTCTCTAG
GTTCACCTGTCGTGATGGACTTTAGTCCGCATTTGAGATTAATATCAGGCGATGATGACG
TTTCCAGAGATCAAAGTGGAAAGAGTGGTGTGTCTGAGAGAGATAATCAAAACTCATTCT
CTGTTTTGATGATGCCTCGAAGCCTACTAATCTTCAAAGATGAAGCTTACTCAGATTACC
TCCACGGCATTAGCGATAGTCCAACACATTGCTACAAACAGGTCGTTAATGAAACTGAAG
CTTTGGCTTACTCTAGGG*AGATTCAAGAAAAGACG
TGA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4GH82JQ 683 0 0
TCTTGGCTGACAAAGATTACCGAGAAAATTAATGAAAGCTCTGGTCTTTTCCCTTCTGCT
ATAAATCATGTCCTCATCAATGAATACCATCCTGACCAAGGGATAATGCCGCACCAAGAT
GGACCAGCTTATTTTCCTGTTGTAGCTATCCTGTCTCTAGGTTCACCTGTCGTGATGGAC
TTTAGTCCGCATTTGAGATTAATATCAGGCGATGATGACGTTTCCAGAGATCAAAGTGGA
AAGAGTGGTGTGTCTGAGAGAGATAATCAAAACTCATTCTCTGTTTTGATGATGCCTCGA
AGCCTACTAATCTTCAAAGATGAAGCTTACTCAGATTACCTCCACGGCATTAGCGATAGT
CCAACACATTGCTACAAACAGGTCGTTAATGAAACTGAAGCTTTGGCTTACTCTAGGGGA
GATTCAAGAAAAGACGGTGACAACAAGACTCTTCACAGAGACCAAACTCGCGTGTCACTT
ACCTGCCGTTTAGTGCCCAAAGTCCATAAGAATCTTTTCAGGTTTTAGAGAAAACATAAC
AATGTAGTTTCCCTTCTGACATTGTGGTTGTCTTGCCGTTTTGACTGGGGAAACCGGCAG
GATTTGTTAACATGGGAACCGAAAACGGTACGATTTGTGTGTTTGTGAAGAGATAGGATT
ATAATATGAGCCCTACATTTTAG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL4904Contig1 626 2 5 U
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TGTGTTGTTTAACCATAAGATCCAATTGTTTGACAAAAGTTCAACACCACATGTACACTA
ACTTGATGAAATAGGCTTGACCTTCTCCCGCATGTACTGCAGTAAATGTTCACGTTTCCA
GTTGTCGATTCTGATGGTTTCCTTATGTTCACCATCTTCATCCAACATGATCAACTTGGG
AGGCGAGTTGAAAATGTACTGAACATTAACACTAGGGAACTTTTCTTTCTCTTCTTCAAT
AAAACCAAAAATCTCAGGGTAGAAAACCAGCTTCCTCATACACACCTCTAATATAGCCCC
TGAGTAAGTAACCTTACTCATGGAATCCTCAGAATCATCAGCGCAACATTTCAAGCAATC
AGATACCAACTCTTGATCCTTGACGTATTCAGAGAGTGAGCGGCAATCGGAGCAGAGAGC
GAGACCGGTGAACCCTAGATCCTCGCATTGTTTAGTGCTCAGCTGCTCTTTGCTGAGATC
GTCGATGTCAACACCATAATCATCACCATCGCCTTCGTCCACCACACTCCAGCCATCTCT
CTCTCTTTCGCATCAACAGATCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GF06JQ U 9
AF RR4GF06TF C 1
BS 1 8 RR4GF06TF
BS 9 105 RR4GF06JQ
BS 106 106 RR4GF06TF
BS 107 454 RR4GF06JQ
BS 455 626 RR4GF06TF

RD RR4GF06JQ 446 0 0
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TTAACCATAAGATCCAATTGTTTGACAAAAGTTCAACCCCACATGTACACTAACTTGATG
AAATAGGCTTGACCTTCTCCCGCATGTACTGCAGTAAATGTTCACGTTTCCAGTTGTCGA
TTCTGATGGTTTCCTTATGTTCACCATCTTCATCCAACATGATCAACTTGGGAGGCGAGT
TGAAAATGTACTGAACATTAACACTAGGGAACTTTTCTTTCTCTTCTTCAATAAAACCAA
AAATCTCAGGGTAGAAAACCAGCTTCCTCATACACACCTCTAATATAGCCCCTGAGTAAG
TAACCTTACTCATGGAATCCTCAGAATCATCAGCGCAACATTTCAAGCAATCAGATACCA
ACTCTTGATCCTTGACGTATTCAGAG

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4GF06TF 626 0 0
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TGTGTTGTTTAACCATAAGATCCAATTGTTTGACAAAAGTTCAACACCACATGTACACTA
ACTTGATGAAGTAGGCTTGACCTTCTCCCGCATGTACTGCAGTAGATGTTCACGTTTCCA
GTTGTCGATTCTGATGGTTTCCTTATGTTCACCATCTTCATCCAACATGATCAACTTGGG
AGGCGAGTTGAAAATGTACTGAACATTAACACTAGGGAACTTTTCTTTCTCTTCTTCAAT
AAAACCAAAAATCTCAGGGTAGAAAACCAGCTTCCTCATACACACCTCTAATATAGCCCC
TGAGTAAGTAACCTTACTCATGGAATCCTCAGAATCATCAGCGCAACATTTCAAGCAATC
AGATACCAACTCTTGATCCTTGACGTATTCAGAGAGTGAGCGGCAATCGGAGCAGAGAGC
GAGACCGGTGAACCCTAGATCCTCGCATTGTTTAGTGCTCAGCTGCTCTTTGCTGAGATC
GTCGATGTCAACACCATAATCATCACCATCGCCTTCGTCCACCACACTCCAGCCATCTCT
CTCTCTTTCGCATCAACAGATCCCCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL4905Contig1 860 2 2 U
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ATAGTCTTAAGAGTTCTTGTCGGTAGATCCAGAGGTCTGTGATGTTTGAGATTGCCCGTA
CCATCTGAGAGTTTTATCTCGTTGATGAGTTGTTTCCTCTAGTTTCTGAGGCTTTTGTAT
CTATTTCTATACGTTTTTGTTTTTGAATTATTAGGCGGTGATGATGAAAAAAAGATTACC
ATCAAACTTTGAGAGATTCACAGCTCGATGCATACTTCTTTATATTACCTGAGCCTAGTT
ATGTTTTGATCTACTTTTGTCTTGTTTTTGAACGGAAGGCAATAAATTAGAGTCTCTGGT
TCACTTATCAATAGTGTATTAAGCGCTGTACGTTGCCGAAATTGAATAAGGCTGTATTCT
GGTACGTGTTCTAGTTTTAAATAGTTCATTTGCATTCAAATGGCCTTTACATACATTGGT
TACTTTGATTATCTTGTGTTTGATTTATTGTTTTTTTTCCTTTAGGCAACAATTTAGAGT
CTCTGATTCACTTCTTGATAGTGGATAAAGCGCTGTACGTTGCCGATATTGACATTGGTT
CAAAGATTTCTCTATTGGCTTCAGATTGGTTTTGACCAATACGATCAATGTCCCTATATT
TTATCTGTTTTTTTGTAACGAGTTGTTATTTTTTTCTGTTTAGTGTTGTAGTTGTCTTAT
AACATTGGTTAATACGGTAATATTCTATTTGTTGTTGATAGTGCAAAGTGTATCATCTGG
CACTCAGAGTTTCATAGGTAGATTCTGCTCAGAGATAAAATTTGTACTATCTACCACCTA
TAGAAAAGATAGATGTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG25TF U 1
AF RR4FG25JQ C 213
BS 1 640 RR4FG25TF
BS 641 860 RR4FG25JQ

RD RR4FG25TF 640 0 0
GGATTCAAGAGGTGTTTCTCCATTCTTACTGTTTTCTCTCTCTAATTATACGTTATGGTT
ATAGTCTTAAGAGTTCTTGTCGGTAGATCCAGAGGTCTGTGATGTTTGAGATTGCCCGTA
CCATCTGAGAGTTTTATCTCGTTGATGAGTTGTTTCCTCTAGTTTCTGAGGCTTTTGTAT
CTATTTCTATACGTTTTTGTTTTTGAATTATTAGGCGGTGATGATGAAAAAAAGATTACC
ATCAAACTTTGAGAGATTCACAGCTCGATGCATACTTCTTTATATTACCTGAGCCTAGTT
ATGTTTTGATCTACTTTTGTCTTGTTTTTGAACGGAAGGCAATAAATTAGAGTCTCTGGT
TCACTTATCAATAGTGTATTAAGCGCTGTACGTTGCCGAAATTGAATAAGGCTGTATTCT
GGTACGTGTTCTAGTTTTAAATAGTTCATTTGCATTCAAATGGCCTTTACATACATTGGT
TACTTTGATTATCTTGTGTTTGATTTATTGTTTTTTTTCCTTTAGGCAACAATTTAGAGT
CTCTGATTCACTTCTTGATAGTGGATAAAGCGCTGTACGTTGCCGATATTGACATTGGTT
CAAAGATTTCTCTATTGGCTTCAGATTGGTTTTGACCAAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4FG25JQ 648 0 0
AGGCGGTGATGATGAAAAAAAGATTACCATCAAACTTTGAGAGATTCACAGCTCGATGCA
TACTTCTTTATATTACCTGAGCCTAGTTATGTTTTGATCTACTTTTGTCTTGTTTTTGAA
CGGAAGGCAATAAATTAGAGTCTCTGGTTCACTTATCAATAGTGTATTAAGCGCTGTACG
TTGCCGAAATTGAATAAGGCTGTATTCTGGTACGTGTTCTAGTTTTAAATAGTTCATTTG
CATTCAAATGGCCTTTACATACATTGGTTACTTTGATTATCTTGTGTTTGATTTATTGTT
TTTTTTCCTTTAGGCAACAATTTAGAGTCTTTGATTCACTTCTTGATAGTGGATAAAGCG
CTGTACGTTGCCGATATTGACATTGGTTCAAAGATTTCTCTATTGGCTTCAGATTGGTTT
TGACCAATACGATCAATGTCCCTATATTTTATCTGTTTTTTTGTAACGAGTTGTTATTTT
TTTCTGTTTAGTGTTGTAGTTGTCTTATAACATTGGTTAATACGGTAATATTCTATTTGT
TGTTGATAGTGCAAAGTGTATCATCTGGCACTCAGAGTTTCATAGGTAGATTCTGCTCAG
AGATAAAATTTGTACTATCTACCACCTATAGAAAAGATAGATGTATAT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4906Contig1 807 2 2 U
TTTTTTTTCAACTTACTTGTCATATCTCATTTTTCCTTGCAGGGACATCATCACTTACCT
GAAACCAGAGGACTTTGTTTGTCTGAAGAACAAACCGTCACAACAGTGTTGAGGAGACCA
AAGATTGGGGCAGGCTACAAGCTGATAGACATGATCACTGAGCCTTGCAGGCTGGTGCGC
CGTTGTGAAGTCACTGCTATTCTCATTTTATATGGTCTTCCCCGTTTGTTAACTGGATCA
ATCCTAGCTCATGAGATGATGCATGCATGGCTTCGACTAAACGGGTATCCAAATCTTAGA
CCAGAAGTGGAAGAAGGGATATGTCAGGTTTTAGCTCACATGTGGTTGGAATCTGAGACT
TATGCTGGCTCTACATTGATAGACATTGCATCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTTCATCATCA
GCCGCTGTGGCGATTGCATCGTCCAAGAAAGGGGAGAGGTCTGATTTTGAGAAGAAACTT
GGTGAGTTTTTCAAGCACCAGATAGAGTCAGATTCTTCATCTGCATACGGGGATGGGTTC
AGGCAAGGTAACCAAGCTGTTCTTACCCATGGTCTGAAGCGAACCCTTGATCATATTCGC
TTGACCGGTACATTTCCTTAAATGGGATCATTTGAAACGATAAAGAGATAAACAAAAAGG
CTTTGCTATATAGTTTTTAGAGTATAAACTGAGAAAAATGGGTTAAAATGTATAGTTTCA
AATACACATTTGAAGAGTCGTAAAGTTTCTACCTCCCGACTCCAATATACTTTTACTGCG
TTTTAAAAGGCTTTATTACGGCCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP52TF U 1
AF RR4DP52JQ C 222
BS 1 658 RR4DP52TF
BS 659 807 RR4DP52JQ

RD RR4DP52TF 658 0 0
TTTTTTTTCAACTTACTTGTCATATCTCATTTTTCCTTGCAGGGACATCATCACTTACCT
GAAACCAGAGGACTTTGTTTGTCTGAAGAACAAACCGTCACAACAGTGTTGAGGAGACCA
AAGATTGGGGCAGGCTACAAGCTGATAGACATGATCACTGAGCCTTGCAGGCTGGTGCGC
CGTTGTGAAGTCACTGCTATTCTCATTTTATATGGTCTTCCCCGTTTGTTAACTGGATCA
ATCCTAGCTCATGAGATGATGCATGCATGGCTTCGACTAAACGGGTATCCAAATCTTAGA
CCAGAAGTGGAAGAAGGGATATGTCAGGTTTTAGCTCACATGTGGTTGGAATCTGAGACT
TATGCTGGCTCTACATTGATAGACATTGCATCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTTCATCATCA
GCCGCTGTGGCGATTGCATCGTCCAAGAAAGGGGAGAGGTCTGATTTTGAGAAGAAACTT
GGTGAGTTTTTCAAGCACCAGATAGAGTCAGATTCTTCATCTGCATACGGGGATGGGTTC
AGGCAAGGTAACCAAGCTGTTCTTACCCATGGTCTGAAGCGAACCCTTGATCATATTCGC
TTGACCGGTACATTTCCTTAAATGGGATCATTTGAAACGATAAAGAGATAAACAAAAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4DP52JQ 586 0 0
CCGTTTGTTAACTGGATCAATCCTAGCTCATGAGATGATGCATGCATGGCTTCGACTAAA
CGGGTATCCAAATCTTAGACCAGAAGTGGAAGAAGGGATATGTCAGGTTTTAGCTCACAT
GTGGTTGGAATCTGAGACTTATGCTGGCTCTACATTGATAGACATTGCATCTTCTTCTTC
TTCGTCTTCTTCATCATCAGCCGCTGTGGCGATTGCATCGTCCAAGAAAGGGGAGAGGTC
TGATTTTGAGAAGAAACTTGGTGAGTTTTTCAAGCACCAGATAGAGTCAGATTCTTCATC
TGCATACGGGGATGGGTTCAGGCAAGGTAACCAAGCTGTTCTTACCCATGGTCTGAAGCG
AACCCTTGATCATATTCGCTTGACCGGTACATTTCCTTAAATGGGATCATTTGAAACGAT
AAAGAGATAAACAAAAAGGCTTTGCTATATAGTTTTTAGAGTATAAACTGAGAAAAATGG
GTTAAAATGTATAGTTTCAAATACACATTTGAAGAGTCGTAAAGTTTCTACCTCCCGACT
CCAATATACTTTTACTGCGTTTTAAAAGGCTTTATTACGGCCCACT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL4907Contig1 1058 2 2 U
CTCAGAATTTTTTCTTCTTCAATTGTTTTCTGGCCAACGTCCGGTAGCTTTTTAATTTTT
ATTCTTTTTCTTGAGAATTCGATCTATGTAAGAGCTTAAAAATCTATGGTATGTCCTGAA
GAGTTTTTTTTCAGATTTGACTCCGATTTTGGCAGAATCTGGAAGTGAAGATGTTTTATT
GGGTGGTTTTCGGTTGCATCTGTGATAGTTCGATGGGCTATTCATTGGAAGACATGGTGT
TATAATGTGAAGAGACAAAACTTGATCTTCTAGTAAGTATCAATGAATCTGATGCAGTGC
TGCAACAACGGATTTCCGCATAAGATTTTCTCTTTTAGTCACCAAATTGTTATCTTTGAA
GTTTTAAGTCTAAATTTTCTTAGGTTTTGGTGTTTTTTACTTCTAAATTAGGTTTTTCTG
GTTTGTGTTTTGCTTTCAAATTGTTCATGGGGCTTCCTAAAGCTAATGATGAACAATATT
GATAAAAGTAATCAAAGAAGAAAATCTCTCAAAACATGAGAAGTATTAGTATTAATAAGT
AGCCGCCTGCTATTGTAGATCCAGGTGGATGGCAGCCCCAGAGCAGCCGAAAGAGAGAAT
CTGAACTGAGAGATGGAACTTGAGTCCGCCATGGTGGAAGAGAAACCTCCTCAAGACAGT
ACCCAGATGCAAGTGTCAGTGTCATCACCACAAGAGAACGCGAAGAAAGATGTTCGATGG
AGGCACTGCATCATCAAACGAAGACACCAAGCAACAACTTCAAAGTCCAAAAGATCTCAA
CGCTGGATCTATTTTGACCAACTCCATAGACCAGCACAGTTTGCAAGTTTGGGTAAGAGG
ATAGACGAGGACGAGGAGAAAAATTATGATGAAGAAGGTTAAGGCAAAACAGCACCAAAT
AGGACATAAATAGAGTAGCAGCATTTAGCGGTTAGTCTAGAAAATGCTTCTTCTGTTGTC
AAAATCTCCTACCTGTTTCCATGTATTGTAATGAATCAAAGATTGTACGCCCTTTAAAAA
TTCTTTATCTATCCTTATATGTTATTCATCAGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AR16TF U 1
AF RR4AR16JQ C 295
BS 1 731 RR4AR16TF
BS 732 1058 RR4AR16JQ

RD RR4AR16TF 731 0 0
CTCAGAATTTTTTCTTCTTCAATTGTTTTCTGGCCAACGTCCGGTAGCTTTTTAATTTTT
ATTCTTTTTCTTGAGAATTCGATCTATGTAAGAGCTTAAAAATCTATGGTATGTCCTGAA
GAGTTTTTTTTCAGATTTGACTCCGATTTTGGCAGAATCTGGAAGTGAAGATGTTTTATT
GGGTGGTTTTCGGTTGCATCTGTGATAGTTCGATGGGCTATTCATTGGAAGACATGGTGT
TATAATGTGAAGAGACAAAACTTGATCTTCTAGTAAGTATCAATGAATCTGATGCAGTGC
TGCAACAACGGATTTCCGCATAAGATTTTCTCTTTTAGTCACCAAATTGTTATCTTTGAA
GTTTTAAGTCTAAATTTTCTTAGGTTTTGGTGTTTTTTACTTCTAAATTAGGTTTTTCTG
GTTTGTGTTTTGCTTTCAAATTGTTCATGGGGCTTCCTAAAGCTAATGATGAACAATATT
GATAAAAGTAATCAAAGAAGAAAATCTCTCAAAACATGAGAAGTATTAGTATTAATAAGT
AGCCGCCTGCTATTGTAGATCCAGGTGGATGGCAGCCCCAGAGCAGCCGAAAGAGAGAAT
CTGAACTGAGAGATGGAACTTGAGTCCGCCATGGTGGAAGAGAAACCTCCTCAAGACAGT
ACCCAGATGCAAGTGTCAGTGTCATCACCACAAGAGAACGCGAAGAAAGATGTTCGATGG
AGGCACTGCAT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4AR16JQ 764 0 0
CAGTGCTGCAACAACGGATTTCCGCATAAGATTTTCTCTTTTAGTCACCAAATTGTTATC
TTTGAAGTTTTAAGTCTAAATTTTCTTAGGTTTTGGTGTTTTTTACTTCTAAATTAGGTT
TTTCTGGTTTGTGTTTTGCTTTCAAATTGTTCATGGGGCTTCCTAAAGCTAATGATGAAC
AATATTGATAAAAGTAATCAAAGAAGAAAATCTCTCAAAACATGAGAAGTATTAGTATTA
ATAAGTAGCCGCCTGCTATTGTAGATCCAGGTGGATGGCAGCCCCAGAGCAGCCGAAAGA
GAGAATCTGAACTGAGAGATGGAACTTGAGTCCGCCATGGTGGAAGAGAAACCTCCTCAA
GACAGTACCCAGATGCAAGTGTCAGTGTCATCACCACAAGAGAACGCGAAGAAAGATGTT
CGATGGAGGCACTGCATCATCAAACGAAGACACCAAGCAACAACTTCAAAGTCCAAAAGA
TCTCAACGCTGGATCTATTTTGACCAACTCCATAGACCAGCACAGTTTGCAAGTTTGGGT
AAGAGGATAGACGAGGACGAGGAGAAAAATTATGATGAAGAAGGTTAAGGCAAAACAGCA
CCAAATAGGACATAAATAGAGTAGCAGCATTTAGCGGTTAGTCTAGAAAATGCTTCTTCT
GTTGTCAAAATCTCCTACCTGTTTCCATGTATTGTAATGAATCAAAGATTGTACGCCCTT
TAAAAATTCTTTATCTATCCTTATATGTTATTCATCAGAAGTCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4908Contig1 915 2 10 U
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GCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTCTGCATACCTTACTCAACT
ACTTCGCTCTCACTATCTTTCTCGAACCGATCTGCATTCTCTGTGCGGATTTCTACTCGA
ACCAACAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGCCGGAACC
AACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTTCATGTTGAACCAGGA
AAAGGAGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGCACAGTGGAG
AGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTAAACATCCTCTTCGTTTTGGTCGAGGAAGCAAAT
GTATTCAAAGAAACCAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGAT
TTGAGCACATACGAAGAAACACGTCTCAACGAATCTGATATGGGCGAAAAGACGAGATGG
CTGAAAGAAGGAATGGAATGCAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAA
CTGCCTAATACGGTTACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGCCTTCGCGGTGATACT
GCACAAGGTGGATCAAAGCCTGCAACAGTGGAAACGGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTC
TTTGTTAACATTGGCGAAGAAATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGG
GCGTGAACCGTGTCTACACCTACTTAAATCGGATCCAGAATTCAATTCCGATGAGGCAAT
TATAATCATTTTTGTATCTACTAGCGTCGACCCGCCCTTCGGGCGGGATGTATATTTAAT
AATTGTTGAAACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG09TF U 1
AF RR4EG09JQ C 261
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BS 669 715 RR4EG09TF
BS 716 915 RR4EG09JQ

RD RR4EG09TF 719 0 0
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TTGAGCACATACGAAGAAACACGTCTCAACGAATCTGATATGGGCGAAAAGACGAGATGG
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ACTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4EG09JQ 655 0 0
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GTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGAAGAAAC
ACGTCTCAACGAATCTGATATGGGCGAAAAGACGAGATGGCTGAAAGAAGGAATGGAATG
CAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTGCCTAATACGGTTACGCT
CAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGCCTTCGCGGTGATACTGCACAAGGTGGATCAAAGCC
TGCAACAGTGGAAACGGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATTGGCGAAGA
AATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTCTACACC
TACTTAAATCGGATCCAGAATTCAATTCCGATGAGGCAATTATAATCATTTTTGTATCTA
CTAGCGTCGACCCGCCCTTCGGGCGGGATGTATATTTAATAATTGTTGAAACAAT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4910Contig1 1014 2 10 U
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GCAAAGACATCCGCAGGCTAAACCTAAAATCTCTGAGGCTCAAATAGGTCTTGTTCAGCA
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GAAACAGAGGATTGCAATAGCGAGAGCAGTGCTCAAGAACCCTACTGTGTTGCTTCTTGA
TGAAGCAACAAGCGCACTAGATGCGGAATCGGAATGCGTGCTGCAGGAAGCTTTGGAGAG
GCTCATGAGAGGCCGGACCACCGTGGTAGTTGCTCACCGTTTGTCGACCATAAGAGGGGT
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CGTTAGCCGACCAGAGGGAGCTTATTCAAGGCTGTTACAGCTTCAAACACATAGGATTTG
AGCTTACTTAAGGCTGTTACAGCTTCAAACGCTTATGATTTGATGAATGATGGATTTACG
AACAAAAGTTGGCTTGTGTAACTTTTATCAAAACTTTAATATGGGAGGTTTCTATGGACT
ATAATGATAATATGAATAGGTGTAGATATTGAAGCTTTTGAGTGTTATGAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES70TF U 1
AF RR4ES70JQ C 288
BS 1 646 RR4ES70TF
BS 647 647 RR4ES70JQ
BS 648 671 RR4ES70TF
BS 672 672 RR4ES70JQ
BS 673 708 RR4ES70TF
BS 709 709 RR4ES70JQ
BS 710 718 RR4ES70TF
BS 719 719 RR4ES70JQ
BS 720 738 RR4ES70TF
BS 739 1014 RR4ES70JQ

RD RR4ES70TF 741 0 0
GCATCCGTGGAGGTGAAGCTGTTGGTTCTGTTTTCTCGGTCTTGGATAGGCAAACCAGGA
TTGACCCGGACGACGCAGATGCTGATCCGGTCGAGACAATCCGTGGAGACATTGATTTTA
GGCATGTGGACTTTGCTTACCCTTCAAGACCGGACGTCATGGTGTTCAGAGATTTCAACC
TCAGAATCAGAGCTGGACATAGCCAAGCTCTTGTCGGGGCCAGTGGCTCGGGGAAAAGTT
CTGTGATCGCAATGATCGAGCGGTTTTATGATCCCCTTTCCGGAAAAGTCATGATTGACG
GCAAAGACATCCGCAGGCTAAACCTAAAATCTCTGAGGCTCAAATAGGTCTTGTTCAGCA
AGAGCCAGCTCTTTTCGCAGCAACCATCTTCGACAACATTGCATATGGGAAAGATGGTGC
CACTGAGTCCGAGGTTATTGAGGCTGCTCGAGCAGCAAACGCTCATGGTTTCATCAGTGG
TTTGCCGGAAGGTTACCAAACTCCAGTGGGTGAAAGAGGAGTGCAGTTATCAGGTGGACA
GAAACAGAGGATTGCAATAGCGAGAGCAGTGCTCAAGAACCCTACTGTGTTGCTTCTTGA
TGAAGCAACAAGCGCACTAGATGCGGAATCGGAATGCGTGCTGCAG*AAGCTTTGGAGAG
GCTCATGAGAG*CCGGACCACCGTGGTAGTTGCTCACCGTTTGTCGAC*ATAAGAGGG*T
TGATTCCATTGGTGTGAT
CAA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4ES70JQ 727 0 0
GTCATGATTGACGGCAAAGACATCCGCAGGCTAAACCTAAAATCTCTGAGGCTCAAATAG
GTCTTGTTCAGCAAGAGCCAGCTCTTTTCGCAGCAACCATCTTCGACAACATTGCATATG
GGAAAGATGGTGCCACTGAGTCCGAGGTTATTGAGGCTGCTCGAGCAGCAAACGCTCATG
GTTTCATCAGTGGTTTGCCGGAAGGTTACCAAACTCCAGTGGGTGAAAGAGGAGTGCAGT
TATCAGGTGGACAGAAACAGAGGATTGCAATAGCGAGAGCAGTGCTCAAGAACCCTACTG
TGTTGCTTCTTGATGAAGCAACAAGCGCACTAGATGCGGAATCGGAATGCGTGCTGCAGG
AAGCTTTGGAGAGGCTCATGAGAGGCCGGACCACCGTGGTAGTTGCTCACCGTTTGTCGA
CCATAAGAGGGGTTGATTCCATTGGTGTGATTCAAGATGGGAGGATTGTGGAGCAAGGAA
GCCATTCCGAGCTCGTTAGCCGACCAGAGGGAGCTTATTCAAGGCTGTTACAGCTTCAAA
CACATAGGATTTGAGCTTACTTAAGGCTGTTACAGCTTCAAACGCTTATGATTTGATGAA
TGATGGATTTACGAACAAAAGTTGGCTTGTGTAACTTTTATCAAAACTTTAATATGGGAG
GTTTCTATGGACTATAATGATAATATGAATAGGTGTAGATATTGAAGCTTTTGAGTGTTA
TGAACTC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL4911Contig1 562 2 3 U
TTTTTTGGGAAATTAAGTTAATAACTTATTACTTGAATTCAGACAAAGGAGAGTGAGGTG
CTAGAGAACACATTGATCGGGTAAACATCCATACACCGATCGAACTTATTATACGATGCA
AACCCTAAAACAGAAGAAAATAACAAAATCTTCTCAACTACGTCGTTCAGGTGACCATTG
TGGCAACGATGGGCTGAAATGTGTAGATGCAACTCTTGAGTCAAGCAGCTCCATGATTGG
CGTGAAGCTCACACATCTCGGCACCTTGTACTGGTTAATCGATGCGCCTCGGGAGATGGC
ATAATCCATGAGCTCCTCAAACGTCCCATTCTTCACCACACGTATCTCGAGTGGTCCAAC
GGACTTATCAGCAACCCGGCTTTGTCTATAAACAGAGTTCAACGACTCCTCCATTTCAAG
ACAGCACTTAGCCATAACCTCGTCGCTGGGAGGGTTGTCTCGATCCTTCACTAATAGCTC
CCAGTAGATGACGTAATGGCCAGGTATAGTCTTGGTATCTGCGTAGCTCGTGTACTCTAT
CACACGTGTCCCTTGCTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS74JQ U 47
AF RR4FS74TF C 1
BS 1 46 RR4FS74TF
BS 47 491 RR4FS74JQ
BS 492 562 RR4FS74TF

RD RR4FS74JQ 445 0 0
AGGAGAGTGAGGTGCTAGAGAACACATTGATCGGGTAAACATCCATACACCGATCGAACT
TATTATACGATGCAAACCCTAAAACAGAAGAAAATAACAAAATCTTCTCAACTACGTCGT
TCAGGTGACCATTGTGGCAACGATGGGCTGAAATGTGTAGATGCAACTCTTGAGTCAAGC
AGCTCCATGATTGGCGTGAAGCTCACACATCTCGGCACCTTGTACTGGTTAATCGATGCG
CCTCGGGAGATGGCATAATCCATGAGCTCCTCAAACGTCCCATTCTTCACCACACGTATC
TCGAGTGGTCCAACGGACTTATCAGCAACCCGGCTTTGTCTATAAACAGAGTTCAACGAC
TCCTCCATTTCAAGACAGCACTTAGCCATAACCTCGTCGCTGGGAGGGTTGTCTCGATCC
TTCACTAATAGCTCCCAGTAGATGA

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR4FS74TF 562 0 0
TTTTTTGGGAAATTAAGTTAATAACTTATTACTTGAATTCAGACAAAGGAGAGTGAGGTG
CTAGAGAACACATTGATCGGGTAAACATCCATACACCGATCGAACTTATTATACGATGCA
AACCCTAAAACAGAAGAAAATAACAAAATCTTCTCAACTACGTCGTTCAGGTGACCATTG
TGGCAACGATGGGCTGAAATGTGTAGATGCAACTCTTGAGTCAAGCAGCTCCATGATTGG
CGTGAAGCTCACACATCTCGGCACCTTGTACTGGTTAATCGATGCGCCTCGGGAGATGGC
ATAGTCCATGAGCTCCTCAAACGTCCCATTCTTCACCACACGTATCTCGAGTGGTCCAAC
GGACTTATCAGCAACCCGGCTTTGTCTATAAACAGAGTTCAACGACTCCTCCATTTCAAG
ACAGCACTTAGCCATAACCTCGTCGCTGGGAGGGTTGTCTCGATCCTTCACTAGTAGCTC
CCAGTAGATGACGTAATGGCCAGGTATAGTCTTGGTATCTGCGTAGCTCGTGTACTCTAT
CACACGTGTCCCTTGCTCCTTC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL4912Contig1 1014 2 10 U
GAGGAGGAATGCTTGCAGAGTTTGCAGAACCGTATTGATGTAGCTTATGACAGCACCATA
CCTCTGCATCAGGAAGCGCTGAGGGATCTGTGGAAACTTGCCTTTCCTGAAGAAGAGCTT
CATGGATTGATATCTGAGCAGTGGAAAGAGATGGGTTGGCAGGGCAAAGATCCGTCTACT
GATTTTAGGGGTGGTGGTTTCATATCGCTTGAAAACTTGCTGTACTTCGCCAGAAACTTT
CAGAAATCCTTCCAGGACCTTTTGAGGAAGCAGGTTGGGGATAGGTCCGTATGGGAATAC
CCTTTTGCTGTTGCTGGTATCAACCTAACATTCATGCTCATTCAGATGCTTGACCTTGAA
GCAGTAAAACCTCGAACAGTTGTTGGGGCAACTTTTCTGAAGTTCCTCTCTGAGAACGAG
TCTGCCTTTGACCTTCTGTATTGCATTACATTCAAGCTAATGGATCAGCAATGGCTTTCA
ATGCGTGCCTCATACATGGAGTTTAACACGGTGATGAAATCAACAAGGAGACAGCTGGAG
AGAGAGCTGATGCTGGAAGACATAATGCATCTTGAAGACTTGCCCTCCTACGCCCTTCTC
TCTCAATAGCCTTTTAAGAGTTTCTAACCTCAACACTCCCGCAATAATAACACAAAAGGT
TGCTCGCTTGTGCCTCTTCTTTGACCTTTTCTTCTACTGTTTGTTGGTTGCCTATATGAA
ACAACTCTAAAACTGAGTTGTTGTTGTTATATTAAAACAAGGAAGAGGGGGAGATAGATA
AGGAGGGTTGGGATAAAACTCAATTTGATTGTGGGGGTTGGAAACTAGTGAGTTTGTAAC
GACGTTGAGGGTTTTTAGTAACTGAGTGTTGATTGATCTTTGATTCGGTGATGTTGTGTG
TGGGGATAACAAATCAGTTGGTTTATCTCCAAAATTCAAAAGCAGTTTCAGTGGCTAACA
CTTCATATATTTGTGTGTTAACCCGTTGGTGTATATCAAAAGTTGCTTAGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G282TF U 1
AF RR4G282JQ C 296
BS 1 658 RR4G282TF
BS 659 659 RR4G282JQ
BS 660 685 RR4G282TF
BS 686 686 RR4G282JQ
BS 687 723 RR4G282TF
BS 724 724 RR4G282JQ
BS 725 731 RR4G282TF
BS 732 732 RR4G282JQ
BS 733 747 RR4G282TF
BS 748 1014 RR4G282JQ

RD RR4G282TF 747 0 0
GAGGAGGAATGCTTGCAGAGTTTGCAGAACCGTATTGATGTAGCTTATGACAGCACCATA
CCTCTGCATCAGGAAGCGCTGAGGGATCTGTGGAAACTTGCCTTTCCTGAAGAAGAGCTT
CATGGATTGATATCTGAGCAGTGGAAAGAGATGGGTTGGCAGGGCAAAGATCCGTCTACT
GATTTTAGGGGTGGTGGTTTCATATCGCTTGAAAACTTGCTGTACTTCGCCAGAAACTTT
CAGAAATCCTTCCAGGACCTTTTGAGGAAGCAGGTTGGGGATAGGTCCGTATGGGAATAC
CCTTTTGCTGTTGCTGGTATCAACCTAACATTCATGCTCATTCAGATGCTTGACCTTGAA
GCAGTAAAACCTCGAACAGTTGTTGGGGCAACTTTTCTGAAGTTCCTCTCTGAGAACGAG
TCTGCCTTTGACCTTCTGTATTGCATTACATTCAAGCTAATGGATCAGCAATGGCTTTCA
ATGCGTGCCTCATACATGGAGTTTAACACGGTGATGAAATCAACAAGGAGACAGCTGGAG
AGAGAGCTGATGCTGGAAGACATAATGCATCTTGAAGACTTGCCCTCCTACGCCCTTCTC
TCTCAATAGCCTTTTAAGAGTTTCTAACCTCAACACTCCCGCAATAATAACACAAAAG*T
TGCTCGCTTGTGCCTCTTCTTTGAC*TTTTCTTCTACTGTTTGTTGGTTGCCTATATGAA
ACA*CTCTAAA*CTGAGTTGTTGTTGT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4G282JQ 719 0 0
AATACCCTTTTGCTGTTGCTGGTATCAACCTAACATTCATGCTCATTCAGATGCTTGACC
TTGAAGCAGTAAAACCTCGAACAGTTGTTGGGGCAACTTTTCTGAAGTTCCTCTCTGAGA
ACGAGTCTGCCTTTGACCTTCTGTATTGCATTACATTCAAGCTAATGGATCAGCAATGGC
TTTCAATGCGTGCCTCATACATGGAGTTTAACACGGTGATGAAATCAACAAGGAGACAGC
TGGAGAGAGAGCTGATGCTGGAAGACATAATGCATCTTGAAGACTTGCCCTCCTACGCCC
TTCTCTCTCAATAGCCTTTTAAGAGTTTCTAACCTCAACACTCCCGCAATAATAACACAA
AAGGTTGCTCGCTTGTGCCTCTTCTTTGACCTTTTCTTCTACTGTTTGTTGGTTGCCTAT
ATGAAACAACTCTAAAACTGAGTTGTTGTTGTTATATTAAAACAAGGAAGAGGGGGAGAT
AGATAAGGAGGGTTGGGATAAAACTCAATTTGATTGTGGGGGTTGGAAACTAGTGAGTTT
GTAACGACGTTGAGGGTTTTTAGTAACTGAGTGTTGATTGATCTTTGATTCGGTGATGTT
GTGTGTGGGGATAACAAATCAGTTGGTTTATCTCCAAAATTCAAAAGCAGTTTCAGTGGC
TAACACTTCATATATTTGTGTGTTAACCCGTTGGTGTATATCAAAAGTTGCTTAGATAT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4913Contig1 992 2 2 U
GGATAAGTCATTGGTCAAGAAGAGAGTTTCATACCAGGAATAAGACTCTTCCTCCTACAT
TTAAACCTAATCCCCCTTTTCCCCTTCTCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTACTTTTTCTTCT
TCTTCCGTATCTGCGATTCACTGATCGGATCCGATGAAGGAGATTACTGATTCCGTCGAT
CCCAGGATCATGTTCAAGCATCAATCCCTTATGCAGGATTATCACGACTTGCAAAAGGAA
ACAGAGTTTAAGATGAGGAAGTTGGAGATGATGAAACAGAGACGATCAAACCTTGACGCA
GAAGTTAGGTTCTTGAGGCGTAGATACAAACACTTGAAGCAAGACCAAACTCTTGAAACA
TCTCCCGACATGTTGAAGGTGCCTAGTAAACAGAGTGGCAAAAGAAAGAAGTACTCTGCT
CCTTGCAATGAGAAGGAAGCATTGGCGTTATTAGATAATGCAAATTGTGAATTGGACAAT
AAGAATCCGAAAAGGACGAGAGGGAACGAGGTTCTGTCAAACACCACTCCTCTTCCTGAT
CTTAATGGAGATGGGAGCACTGACAAAGTCCCGACGGGCTTTGACCTAAACCAGATCTCG
AGAGAAGAAGAGGAACCGGAAGCGAATGGTGGACAAGTGCTCGCTGAGGCGACAAAGAAG
GAAGTGCTTGGTGATGGAATCGACGATCTACGTGGTGGAATGAAGTTGCCGATATGCAGA
GACGTGGAGAAAGAGTTGAACAGAACAGCAGTGAAGAGGAAGGTTTCATGGCAAGATCCA
GTGGCTTTGAGTGTTTGAGAGGGGATTTAAGTAAGACTATCAAGTAGGATTCTGAGATAT
TGTGATTTACCCCAATATGCACATATTCTTTAAAGGGCTTTTATATATGCACAGGTGTAG
TAGATATATGAAGATTTTATCGGTTTGAATTCATAATTTTCATATGTTCCAACATCCAAT
TTGGTGATTACAGAATCTCATTTGATGTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DU44TF U 1
AF RR4DU44JQ C 214
BS 1 604 RR4DU44TF
BS 605 992 RR4DU44JQ

RD RR4DU44TF 604 0 0
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TTAAACCTAATCCCCCTTTTCCCCTTCTCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTACTTTTTCTTCT
TCTTCCGTATCTGCGATTCACTGATCGGATCCGATGAAGGAGATTACTGATTCCGTCGAT
CCCAGGATCATGTTCAAGCATCAATCCCTTATGCAGGATTATCACGACTTGCAAAAGGAA
ACAGAGTTTAAGATGAGGAAGTTGGAGATGATGAAACAGAGACGATCAAACCTTGACGCA
GAAGTTAGGTTCTTGAGGCGTAGATACAAACACTTGAAGCAAGACCAAACTCTTGAAACA
TCTCCCGACATGTTGAAGGTGCCTAGTAAACAGAGTGGCAAAAGAAAGAAGTACTCTGCT
CCTTGCAATGAGAAGGAAGCATTGGCGTTATTAGATAATGCAAATTGTGAATTGGACAAT
AAGAATCCGAAAAGGACGAGAGGGAACGAGGTTCTGTCAAACACCACTCCTCTTCCTGAT
CTTAATGGAGATGGGAGCACTGACAAAGTCCCGACGGGCTTTGACCTAAACCAGATCTCG
AGAG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4DU44JQ 779 0 0
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AAACAGAGACGATCAAACCTTGACGCAGAAGTTAGGTTCTTGAGGCGTAGATACAAACAC
TTGAAGCAAGACCAAACTCTTGAAACATCTCCCGACATGTTGAAGGTGCCTAGTAAACAG
AGTGGCAAAAGAAAGAAGTACTCTGCTCCTTGCAATGAGAAGGAAGCATTGGCGTTATTA
GATAATGCAAATTGTGAATTGGACAATAAGAATCCGAAAAGGACGAGAGGGAACGAGGTT
CTGTCAAACACCACTCCTCTTCCTGATCTTAATGGAGATGGGAGCACTGACAAAGTCCCG
ACGGGCTTTGACCTAAACCAGATCTCGAGAGAAGAAGAGGAACCGGAAGCGAATGGTGGA
CAAGTGCTCGCTGAGGCGACAAAGAAGGAAGTGCTTGGTGATGGAATCGACGATCTACGT
GGTGGAATGAAGTTGCCGATATGCAGAGACGTGGAGAAAGAGTTGAACAGAACAGCAGTG
AAGAGGAAGGTTTCATGGCAAGATCCAGTGGCTTTGAGTGTTTGAGAGGGGATTTAAGTA
AGACTATCAAGTAGGATTCTGAGATATTGTGATTTACCCCAATATGCACATATTCTTTAA
AGGGCTTTTATATATGCACAGGTGTAGTAGATATATGAAGATTTTATCGGTTTGAATTCA
TAATTTTCATATGTTCCAACATCCAATTTGGTGATTACAGAATCTCATTTGATGTGTCG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL4914Contig1 1025 2 2 U
GGCGCAAAGATGAAATCAACATTGTCTATCATGGGTAACAGTTACCACCGAAATGAGCAG
ACAATAATGCACAGTGGTTTGGATAGTAGAATATCTTCCTGTTTCGGTAGAGATGAGACC
CTTTCGTTGTTTCACGCCCTCGGAAAATTTCTCCACAACAAAAGAGAGACTACTGATAAC
GTTATTATATCAGATTGCAGTAACCATCTTGTGCATAGCCAGTTTGCAAGGTTACCACTG
AAGATGGAGGAGCCAGAGAAGGTTCTTAGCCAAGCTCATGGACAGGCAGGCCGGGTTGTG
GATTTTCTTCATGAAAATGAGACACAAGAGAGTTTACCAAGCCTTACATGGATGTGTACT
TACTATGAACTCAAAACGTTTATGAAGTGTTAGATTTTCTGAGTGACGGAGCCATAGAAG
ATGCCTGGTGCGTGTCTTCCTATTTAGCGGATGCTGATCTCCTTCTCGCAGCTTTAAGAG
GAAAAATGAGTGTACATAACAAAACAGAGGACGTTCTACAATCAGTCGGTGCCTCGGTGG
CTGTTCGTGGTGTGTTGTATGGAAACAAGCAGCCATGGTCATCCAGATGGCACGTGATTC
GCAAGCCAAAACTCTGGCAAGTGGAACAATCCTCAATACAAGCCAAGAAGAATCTGAGAG
AGCAGATGAACATAGGATACGAGCGGTCAAGAATGGCAGATATGTCAGTGATGGCTACAG
AGTACAGTCCTGTGCTGAAATGGCTAAGCTACAGGGCGTACGCAGATGTGGTTTCAGAAA
AGGAGGAAGAGACGGATGAGGAGAAGAATGAAACTTCTGAAGATGATGAAATACAAGACT
GGTGACATTTACCATCTTTAGTCTCCTTTTATGTTTAGTCAAATGAATTTGGTAGGATAG
TTCACATCAATGGAAAAGGGCTAATTGTTCTGCTTACTTCTAAATTGGAAATTGACAGTC
ACTTCGCTATCTAACAATGTGCACAGAAAAGTTTATCCTTGGTTTGATCAAGCGAATTTT
AAACC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4EI85TF U 1
AF RR4EI85JQ C 403
BS 1 760 RR4EI85TF
BS 761 1025 RR4EI85JQ

RD RR4EI85TF 760 0 0
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ACAATAATGCACAGTGGTTTGGATAGTAGAATATCTTCCTGTTTCGGTAGAGATGAGACC
CTTTCGTTGTTTCACGCCCTCGGAAAATTTCTCCACAACAAAAGAGAGACTACTGATAAC
GTTATTATATCAGATTGCAGTAACCATCTTGTGCATAGCCAGTTTGCAAGGTTACCACTG
AAGATGGAGGAGCCAGAGAAGGTTCTTAGCCAAGCTCATGGACAGGCAGGCCGGGTTGTG
GATTTTCTTCATGAAAATGAGACACAAGAGAGTTTACCAAGCCTTACATGGATGTGTACT
TACTATGAACTCAAAACGTTTATGAAGTGTTAGATTTTCTGAGTGACGGAGCCATAGAAG
ATGCCTGGTGCGTGTCTTCCTATTTAGCGGATGCTGATCTCCTTCTCGCAGCTTTAAGAG
GAAAAATGAGTGTACATAACAAAACAGAGGACGTTCTACAATCAGTCGGTGCCTCGGTGG
CTGTTCGTGGTGTGTTGTATGGAAACAAGCAGCCATGGTCATCCAGATGGCACGTGATTC
GCAAGCCAAAACTCTGGCAAGTGGAACAATCCTCAATACAAGCCAAGAAGAATCTGAGAG
AGCAGATGAACATAGGATACGAGCGGTCAAGAATGGCAGATATGTCAGTGATGGCTACAG
AGTACAGTCCTGTGCTGAAATGGCTAAGCTACAGGGCGTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4EI85JQ 623 0 0
GTGACGGAGCCATAGAAGATGCCTGGTGCGTGTCTTCCTATTTAGCGGATGCTGATCTCC
TTCTCGCAGCTTTAAGAGGAAAAATGAGTGTACATAACAAAACAGAGGACGTTCTACAAT
CAGTCGGTGCCTCGGTGGCTGTTCGTGGTGTGTTGTATGGAAACAAGCAGCCATGGTCAT
CCAGATGGCACGTGATTCGCAAGCCAAAACTCTGGCAAGTGGAACAATCCTCAATACAAG
CCAAGAAGAATCTGAGAGAGCAGATGAACATAGGATACGAGCGGTCAAGAATGGCAGATA
TGTCAGTGATGGCTACAGAGTACAGTCCTGTGCTGAAATGGTTAAGCTACAGGGCGTACG
CAGATGTGGTTTCAGAAAAGGAGGAAGAGACGGATGAGGAGAAGAATGAAACTTCTGAAG
ATGATGAAATACAAGACTGGTGACATTTACCATCTTTAGTCTCCTTTTATGTTTAGTCAA
ATGAATTTGGTAGGATAGTTCACATCAATGGAAAAGGGCTAATTGTTCTGCTTACTTCTA
AATTGGAAATTGACAGTCACTTCGCTATCTAACAATGTGCACAGAAAAGTTTATCCTTGG
TTTGATCAAGCGAATTTTAAACC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4916Contig1 763 2 2 U
GCAATACGTTTTGAGCCTAAGAGACAGAGACCAGTTGATGGTGTTGCTGGTGCACAACAG
GATCTAAGAAGCTTTAGCCTTGTATTCGAGTACATCAAAGCTTTGCCTGCGGGTCAAGAA
ACCGATTTTATTTTGGTTTCATGTACTGGTTCTGGAGTAGAACCCAACAGAAGGGAGCAA
GTGTTAAAAGCTAAGAGAGCTGGTGAAGATTCATTGAGAAGATCAGGCCTTGGATACACC
ATTATCCGTCCCGGTCCCTTGAAGGAAGAGCCAGGCGGTCAACGAGCTCTGATATTTGAT
CAGGGAAACAGAATATCTCAGGGAATCAGTTGCGCTGATGTGGCTGACATTTGTGTCAAG
TCACTACACGATTCAACAGCGAGAAACAAAAGCTTTGATGTTTGCCATGAATACGTCGCT
GAGCAAGGAATAGAACTGTACGAGCTGGTGGCTCATTTGCCAGACAAGGCGAACAACTAT
CTGACTCCTGCTTTATCTGTACTTGAGAAGAACACATGATACGCAAAGTGAAAAGAAGAA
TCCTTGATTCCCATTTTGTCTCTTGTAATTCATCTCAACCCCCATATCCATATACACTAC
TACATAAATACATACGTCTCTCTTGTATAATTTTGTACAGACAAAGAATCTCTTCTTCCT
TCCTTCCTCGGTATCTATCTCCAGTAACATTGTTTTGTTATATTCAGCTTTTTGAGTTTG
TGTAGTAATACAAGAAAAGGGCGTGAGACTCTTGTTTTCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR42TF U 1
AF RR4AR42JQ C 22
BS 1 731 RR4AR42TF
BS 732 763 RR4AR42JQ

RD RR4AR42TF 731 0 0
GCAATACGTTTTGAGCCTAAGAGACAGAGACCAGTTGATGGTGTTGCTGGTGCACAACAG
GATCTAAGAAGCTTTAGCCTTGTATTCGAGTACATCAAAGCTTTGCCTGCGGGTCAAGAA
ACCGATTTTATTTTGGTTTCATGTACTGGTTCTGGAGTAGAACCCAACAGAAGGGAGCAA
GTGTTAAAAGCTAAGAGAGCTGGTGAAGATTCATTGAGAAGATCAGGCCTTGGATACACC
ATTATCCGTCCCGGTCCCTTGAAGGAAGAGCCAGGCGGTCAACGAGCTCTGATATTTGAT
CAGGGAAACAGAATATCTCAGGGAATCAGTTGCGCTGATGTGGCTGACATTTGTGTCAAG
TCACTACACGATTCAACAGCGAGAAACAAAAGCTTTGATGTTTGCCATGAATACGTCGCT
GAGCAAGGAATAGAACTGTACGAGCTGGTGGCTCATTTGCCAGACAAGGCGAACAACTAT
CTGACTCCTGCTTTATCTGTACTTGAGAAGAACACATGATACGCAAAGTGAAAAGAAGAA
TCCTTGATTCCCATTTTGTCTCTTGTAATTCATCTCAACCCCCATATCCATATACACTAC
TACATAAATACATACGTCTCTCTTGTATAATTTTGTACAGACAAAGAATCTCTTCTTCCT
TCCTTCCTCGGTATCTATCTCCAGTAACATTGTTTTGTTATATTCAGCTTTTTGAGTTTG
TGTAGTAATAC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4AR42JQ 742 0 0
AGACAGAGACCAGTTGATGGTGTTGCTGGTGCACAACAGGATCTAAGAAGCTTTAGCCTT
GTATTCGAGTACATCAAAGCTTTGCCTGCGGGTCAAGAAACCGATTTTATTTTGGTTTCA
TGTACTGGTTCTGGAGTAGAACCCAACAGAAGGGAGCAAGTGTTAAAAGCTAAGAGAGCT
GGTGAAGATTCATTGAGAAGATCAGGCCTTGGATACACCATTATCCGTCCCGGTCCCTTG
AAGGAAGAGCCAGGCGGTCAACGAGCTCTGATATTTGATCAGGGAAACAGAATATCTCAG
GGAATCAGTTGCGCTGATGTGGCTGACATTTGTGTCAAGTCACTACACGATTCAACAGCG
AGAAACAAAAGCTTTGATGTTTGCCATGAATACGTCGCTGAGCAAGGAATAGAACTGTAC
GAGCTGGTGGCTCATTTGCCAGACAAGGCGAACAACTATCTGACTCCTGCTTTATCTGTA
CTTGAGAAGAACACATGATACGCAAAGTGAAAAGAAGAATCCTTGATTCCCATTTTGTCT
CTTGTAATTCATCTCAACCCCCATATCCATATACACTACTACATAAATACATACGTCTCT
CTTGTATAATTTTGTACAGACAAAGAATCTCTTCTTCCTTCCTTCCTCGGTATCTATCTC
CAGTAACATTGTTTTGTTATATTCAGCTTTTTGAGTTTGTGTAGTAATACAAGAAAAGGG
CGTGAGACTCTTGTTTTCTATC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4917Contig1 851 2 2 U
GAACGAGGACTTTGTCAGAGGCCAGCCTTACCTAATGAAGAACATCCACAGGCGAAAACC
TGTCCACAGCCACTCGTTACAGAACCTACAAGCGCAGAGTCCTTTGTCCGAATCAGAAAG
ACAGAGCATGAAGGATCAGATCGAGAGGCTGAAAAGGGAAAAAGATGTCCTTCTCGCGGA
TTTACAGAGCCAAGAGCTCGAGCGTAAAGGGTTCGAGCTGCAAGTCACAGCGCTGAGAGA
TCGGTTGCAGCATATGGAGCAGCGTCAGAGATCTATAGTGACGTTCGTTTCGCAGGTTTT
GGAGAAACCGGGGCTTTCTCTAAACCTCGAAACCCACGAGAGAAGGAAAAGAAAGCTGCA
AGAGACGACTTCTTCTCTGCTTCCGAGCAGGTCGCATGCTGAGCAGGTGGAGAAGTTAGA
GTCTTCTTTAACGTTCTTGGAGAATCTTGCCATGGAATCGTGTGATAAGAGTATGGATAT
CGATGTGAACGAGTCAACTAGCTTCGCGGAGAGTCTAAGTAATGGAAATGATAACCGAGC
CAAGTCAACAAAGATTGATATGAACGTAGAGCCTGTTACTACCATTGCTGCTGCTGCTCC
AAAGACAGGGGTTAACGATGTGTTTTGGGAGCAGTGTTTGACAGAGAATCCGGGATCGAT
TGAACAGCAGGAAGTTCAGTCAGAGAGAAGAGATGTTGATGCAAATAAGATTGGAGATGG
AAGGACGTTTTGGTGGAATGCTAAGAATGTAAATGATATTGCAGAGAGAGTTTGACTTTG
ATATTTGAAGCTCTTTGTAAAATAGATTTTTTTTTTCGATACTTCTGGAGACAACCATTG
ACTTGTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B333TF U 1
AF RR4B333JQ C 169
BS 1 666 RR4B333TF
BS 667 851 RR4B333JQ

RD RR4B333TF 666 0 0
GAACGAGGACTTTGTCAGAGGCCAGCCTTACCTAATGAAGAACATCCACAGGCGAAAACC
TGTCCACAGCCACTCGTTACAGAACCTACAAGCGCAGAGTCCTTTGTCCGAATCAGAAAG
ACAGAGCATGAAGGATCAGATCGAGAGGCTGAAAAGGGAAAAAGATGTCCTTCTCGCGGA
TTTACAGAGCCAAGAGCTCGAGCGTAAAGGGTTCGAGCTGCAAGTCACAGCGCTGAGAGA
TCGGTTGCAGCATATGGAGCAGCGTCAGAGATCTATAGTGACGTTCGTTTCGCAGGTTTT
GGAGAAACCGGGGCTTTCTCTAAACCTCGAAACCCACGAGAGAAGGAAAAGAAAGCTGCA
AGAGACGACTTCTTCTCTGCTTCCGAGCAGGTCGCATGCTGAGCAGGTGGAGAAGTTAGA
GTCTTCTTTAACGTTCTTGGAGAATCTTGCCATGGAATCGTGTGATAAGAGTATGGATAT
CGATGTGAACGAGTCAACTAGCTTCGCGGAGAGTCTAAGTAATGGAAATGATAACCGAGC
CAAGTCAACAAAGATTGATATGAACGTAGAGCCTGTTACTACCATTGCTGCTGCTGCTCC
AAAGACAGGGGTTAACGATGTGTTTTGGGAGCAGTGTTTGACAGAGAATCCGGGATCGAT
TGAACA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4B333JQ 683 0 0
CCTTCTCGCGGATTTACAGAGCCAAGAGCTCGAGCGTAAAGGGTTCGAGCTGCAAGTCAC
AGCGCTGAGAGATCGGTTGCAGCATATGGAGCAGCGTCAGAGATCTATAGTGACGTTCGT
TTCGCAGGTTTTGGAGAAACCGGGGCTTTCTCTAAACCTCGAAACCCACGAGAGAAGGAA
AAGAAAGCTGCAAGAGACGACTTCTTCTCTGCTTCCGAGCAGGTCGCATGCTGAGCAGGT
GGAGAAGTTAGAGTCTTCTTTAACGTTCTTGGAGAATCTTGCCATGGAATCGTGTGATAA
GAGTATGGATATCGATGTGAACGAGTCAACTAGCTTCGCGGAGAGTCTAAGTAATGGAAA
TGATAACCGAGCCAAGTCAACAAAGATTGATATGAACGTAGAGCCTGTTACTACCATTGC
TGCTGCTGCTCCAAAGACAGGGGTTAACGATGTGTTTTGGGAGCAGTGTTTGACAGAGAA
TCCGGGATCGATTGAACAGCAGGAAGTTCAGTCAGAGAGAAGAGATGTTGATGCAAATAA
GATTGGAGATGGAAGGACGTTTTGGTGGAATGCTAAGAATGTAAATGATATTGCAGAGAG
AGTTTGACTTTGATATTTGAAGCTCTTTGTAAAATAGATTTTTTTTTTCGATACTTCTGG
AGACAACCATTGACTTGTGGTCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL4918Contig1 744 2 5 U
GACTGAAGGTGGAAAGGATCGAAAGTGAAGGAGCTGAAAGAAGCTTTCAAGGAGCTAACC
AAGTGGTGGAAAGAGAGTCTCGCTAGCGAGAACGTGGACGATGTTAAAATCAGTAACCGA
TTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGACGTCCAAGTTTGGATGGAGTGCAAATATGGAG
AGGATCATGCAGTCCCAAACTCTCTCCGATGCAAACAAGCAAGCTTACATGCGAGGAAAG
CGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACCCAATCACCAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTGCT
AGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGCACAGCTCATGTACCAGACAGCTTTG
ATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGACTTTGCAGGCCGTATCTACAACTCC
GTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGTAGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAGAG
GAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACCAAATCAGATGACTTGCCTGGTGTTTTA
AACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACCAACCAAGGACGAACTGTAGATTTCA
CTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTCTCTACTGTCTTAGTTAAAAACAGAACATCGTGTTC
CACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTTTTTACTATATGGTTTTTGATGAATTATGTAATA
GCAGCACAACTTTGATTCTAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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AF RR4BT31TF U 58
AF RR4C318JQ C 1
BS 1 58 RR4C318JQ
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BS 276 524 RR4BT31TF
BS 525 744 RR4C318JQ

RD RR4BT31TF 467 0 0
G
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GATTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGACGTCCAAGTTTGGATGGAGTGCAAATATGG
AGAGGATCATGCAGTCCCAAACTCTCTCCGATGCAAACAAGCAAGCTTACATGCGAGGAA
AGCGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACCCAATCATCAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTG
CTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGCACAGCTCATGTACCAGACAGCTT
TGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGACTTTGCAGGCCGTATCTACAACT
CCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGTAGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAG
AGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACCAAATCAGATGA

QA 2 467 2 467
DS 

RD RR4C318JQ 744 0 0
GACTGAAGGTGGAAAGGATCGAAAGTGAAGGAGCTGAAAGAAGCTTTCAAGGAGCTAACC
AAGTGGTGGAAAGAGAGTCTCGCTAGCGAGAACGTGGACGATGTTAACATCAGTAACCGA
TTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGACGTCCAAGTTTGGATGGAGTGCAAATATGGAG
AGGATCATGCAGTCCCAAACTCTTTCCGATGCAAACAAGCAAGCTTACATGCGAGGAAAG
CGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACCCAATCACCAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTGCT
AGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGCACAGCTCATGTACCAGACAGCTTTG
ATCGAGAGTGGGTTCATACTCAACGACCCAAAGGACTTTGCAGGCCGTATCTACAACTCC
GTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGTAGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAGAG
GAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACCAAATCAGATGACTTGCCTGGTGTTTTA
AACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACCAACCAAGGACGAACTGTAGATTTCA
CTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTCTCTACTGTCTTAGTTAAAAACAGAACATCGTGTTC
CACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTTTTTACTATATGGTTTTTGATGAATTATGTAATA
GCAGCACAACTTTGATTCTAGACC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4919Contig1 450 2 1 U
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ATCGGGGAACGTGGGGAAGGACACGACGGAAGAGCAGAAGAATGCAAACCCTGTGGCGTT
GCTGCTCTCATCAGCCATGATGCTTAGACATCTTCAGTTCCCTTCTTTTGCTGATAGGCT
TGAAACCGCTGTGAAGCGTGTCATCGCTGAAGGAAAATGCAGTACTGAAGATCTTGGCGG
AAAGAGTACAACCCAAGAGGTCGTCGACGCTGTCATTTCGAAATTGGATTGAATCATTTC
ATCACTGCTCAAGATAAGTGAGTGGTATGTATGATTCACACACGCAGTCTACGGATGTGT
GTGCCTTTTTTTTTCTTCCACATTCTTCCAGGATAACTCGAAACTGGCACTGAGAGTAAT
AAAAGAACATGGTTTTGTTGATATATTTTT


BQ
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AF RR4BE54JQ C 1
AF RR4BE54TF U 1
BS 1 450 RR4BE54TF

RD RR4BE54JQ 450 0 0
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ATCGGGGAACGTGGGGAAGGACACGACGGAAGAGCAGAAGAATGCAAACCCTGTGGCGTT
GCTGCTCTCATCAGCCATGATGCTTAGACATCTTCAGTTCCCTTCTTTTGCTGATAGGCT
TGAAACCGCTGTGAAGCGTGTCATCGCTGAAGGAAAATGCAGTACTGAAGATCTTGGCGG
AAAGAGTACAACCCAAGAGGTCGTCGACGCTGTCATTTCGAAATTGGATTGAATCATTTC
ATCACTGCTCAAGATAAGTGAGTGGTATGTATGATTCACACACGCAGTCTACGGATGTGT
GTGCCTTTTTTTTTCTTCCACATTCTTCCAGGATAACTCGAAACTGGCACTGAGAGTAAT
AAAAGAACATGGTTTTGTTGATATATTTTT

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR4BE54TF 450 0 0
GGGAGTCATGCCTGGAGGAAACGTTGGAGCAGAGTATGCAGTGTTTGAGCAAGGGGCATC
ATCGGGGAACGTGGGGAAGGACACGACGGAAGAGCAGAAGAATGCAAACCCTGTGGCGTT
GCTGCTCTCATCAGCCATGATGCTTAGACATCTTCAGTTCCCTTCTTTTGCTGATAGGCT
TGAAACCGCTGTGAAGCGTGTCATCGCTGAAGGAAAATGCAGTACTGAAGATCTTGGCGG
AAAGAGTACAACCCAAGAGGTCGTCGACGCTGTCATTTCGAAATTGGATTGAATCATTTC
ATCACTGCTCAAGATAAGTGAGTGGTATGTATGATTCACACACGCAGTCTACGGATGTGT
GTGCCTTTTTTTTTCTTCCACATTCTTCCAGGATAACTCGAAACTGGCACTGAGAGTAAT
AAAAGAACATGGTTTTGTTGATATATTTTT

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL4920Contig1 1005 2 2 U
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GAACCACTGGAACTGCATCTGTCTCGTTCTCTTCATTGAACCTAACTATGATGCCGGCTC
AGAAGGAAGGTGAGGCTGATTCGTTATCTGAAGCCTCTAATCATTCAGAAGATATTGGTA
TTATAGAAGACAGCCCAATGGAAAATATTCATGAAGCAGAAACCGGTGAGAGTCCATCAA
GAGAGACGGTCTCTTTATTTTCTGCAGCCCTGGGTCCTAGCACTGACCACAACACTGAGA
GCGAAGAACTCGCATCAACTCACGACGAGCTTTTGGTTGCATCGAGTCAAGATGGCAGAG
ACGAGGAGAAGCAATTGGAGAATGATCTTGGAACTGGGGACAAGACGAGTGAAGATCTTA
GAATTGGGGACAAGACAGATGAAGATCTTGAAATCGAAGACAAGATGAGGGATGATCTTG
GAACTGAGCAGAAGACGGGTGCTGATCTTGGAACTGAGGACAAGACGAGTGGAGGTCTTG
GAACTGAGGACAAGATGAATGAAGATCCTGGGATTGAGGAGAAGAAGTGTGATAATCTTG
GAATAGAGGACAAGACGCGTGATGATCTTGTAACTGAGGAGAAGACGATTGAAGGTGATG
GGGATGGTTGTGATGGGAAGGAGAAGGAGTCAATGGAGGAGGAAGAAGATGAGAAGTGAG
CTGCAAAACGGCCAAGGCTGTCTTCTTCCACAGGCGAAGTTGAGGAGATGGAGATAAATT
GATTGTGACATGTATTAACTTTGTCATCGGTCTTTGATTAGTTAGAAAGGATTTAATATC
AACCAACACGTTGTAGGAAAATGTTTATAGGCGCGATGTAGGGACTTTTCTTCAAAAGAA
CTGAAAAATATATTTTATCAGTATGATAAAAACCAAATCACATTCTCTATTTTTGTTTGG
ATCGGTTTCAACACCCATAATATAAAAGGTAGACGTTTGTAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A539TF U 1
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BS 731 1005 RR4A539JQ

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GAACCACTGGAACTGCATCTGTCTCGTTCTCTTCATTGAACCTAACTATGATGCCGGCTC
AGAAGGAAGGTGAGGCTGATTCGTTATCTGAAGCCTCTAATCATTCAGAAGATATTGGTA
TTATAGAAGACAGCCCAATGGAAAATATTCATGAAGCAGAAACCGGTGAGAGTCCATCAA
GAGAGACGGTCTCTTTATTTTCTGCAGCCCTGGGTCCTAGCACTGACCACAACACTGAGA
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GAATTGGGGACAAGACAGATGAAGATCTTGAAATCGAAGACAAGATGAGGGATGATCTTG
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CTGCAAAACG

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DS 

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ATCGAGTCAAGATGGCAGAGACGAGGAGAAGCAATTGGAGAATGATCTTGGAACTGGGGA
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CAAGATGAGGGATGATCTTGGAACTGAGCAGAAGACGGGTGCTGATCTTGGAACTGAGGA
CAAGACGAGTGGAGGTCTTGGAACTGAGGACAAGATGAATGAAGATCCTGGGATTGAGGA
GAAGAAGTGTGATAATCTTGGAATAGAGGACAAGACGCGTGATGATCTTGTAACTGAGGA
GAAGACGATTGAAGGTGATGGGGATGGTTGTGATGGGAAGGAGAAGGAGTCAATGGAGGA
GGAAGAAGATGAGAAGTGAGCTGCAAAACGGCCAAGGCTGTCTTCTTCCACAGGCGAAGT
TGAGGAGATGGAGATAAATTGATTGTGACATGTATTAACTTTGTCATCGGTCTTTGATTA
GTTAGAAAGGATTTAATATCAACCAACACGTTGTAGGAAAATGTTTATAGGCGCGATGTA
GGGACTTTTCTTCAAAAGAACTGAAAAATATATTTTATCAGTATGATAAAAACCAAATCA
CATTCTCTATTTTTGTTTGGATCGGTTTCAACACCCATAATATAAAAGGTAGACGTTTGT
AACTG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

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AGTTTTCGGTAGAGGTGGCAGCTAGGTTCTTGGTGCATCCCAATCTGACTTCTGCGACGA
AGATGTCTGTCGCATCCGCAAGAATAATGTGATTAGCACGCTTGACATATGGCCATGGAA
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GGGAGTAGTTATTATTGAGGACGACAACCCTTACGACATGGAGGAGATGCTTATGCCACT
GCACAAGTATCTCGACACCCCTACTGCTCATGACATTATCCACAACGGAGCAACGTTTCA
GATTGCAGGATTGACAAACAATTCACGTTTATCAGAAGCACACGAGGTTCGGCATTGTGT
GCAGAAGTACAGAAACCTCGGTGAGCCTGTTCTCCAAGTGGCCAAGAGAAGGTTAGACAG
CATGTTGTATGTTGGACTGACAGAAGAGCACAGGGAATCTGCATCGCTTTTTGCTAATGT
TGTGGGTTCTCAGGTGCTTTCTCAATTGGGTGCGTCAAATGCAACTGCAAAAACGGAAAC
TACTAAACAAGAAGCAAGTGTTACAGTTTCAGAATCTGGATCAGATAAGAGTGAAACCCA
GAATGGTACATCTGAAGTTGCATCTAATAAGATAGAAGCTAAGAGTGGAAATATGACGGT
AAAAACCTTAATGGAAGTCTATGAGGGATGCATTACTCATCTAAGAAAGTCCCAAGGAAC
CAGACGTGTCAACTCCTTGAAGAGAATCTCGCCAGCTAATTTTACCAGAGGGACGCGTTC
AAGAGTTCCTAACGAGGTCATTCAGCAGATCAAATCGCTTAACAATCTAGATGTGGAGCT
TTACAAGTATGCTAAAGAGATCTTTGTCAAAGAGCATGAACTAGTGTCGAATAAAATGGT
TTCAACTTCGAAGGGGAGCATTGTTGATCTGCAGAACGTATTTGGAGAAATGGAGGGTGA
GAAGCTGTGGAAGTTGGTATCAGTGGCATTGATGCTGTTACTGCTCTTCCTCTTGTTTCT
ATTTGTAAACGCTAGAAGGAGAAGAACCTCTAAAGTTAAGATTTGATCATTCTCACTTTC
TTTTGGGCCAAATTCAGCAATTAGGAGAAGTTTCTGGGTCTAATTGTAATATTTATTTTT
TCTTTTCCTGGAAAAGAAAAAGTTTTGGGTGTTTGCCTTACAGGTGAAAAATGAAAAAAT
TAGAAGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C159TF U 1
AF RR4C159JQ C 452
BS 1 552 RR4C159TF
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BS 554 588 RR4C159TF
BS 589 1268 RR4C159JQ

RD RR4C159TF 588 0 0
GGAGAACCTCGGTGATGACAATAGTCCGGGACCCCGTTGCGCGTGTCCTGAGCACTTATG
AGTTTTCGGTAGAGGTGGCAGCTAGGTTCTTGGTGCATCCCAATCTGACTTCTGCGACGA
AGATGTCTGTCGCATCCGCAAGAATAATGTGATTAGCACGCTTGACATATGGCCATGGAA
GTACCTTGTTCCATGGATGCGAGAAGACCTGTTTGCTCGGAGAGATGCACGAAAACTCAA
GGGAGTAGTTATTATTGAGGACGACAACCCTTACGACATGGAGGAGATGCTTATGCCACT
GCACAAGTATCTCGACACCCCTACTGCTCATGACATTATCCACAACGGAGCAACGTTTCA
GATTGCAGGATTGACAAACAATTCACGTTTATCAGAAGCACACGAGGTTCGGCATTGTGT
GCAGAAGTACAGAAACCTCGGTGAGCCTGTTCTCCAAGTGGCCAAGAGAAGGTTAGACAG
CATGTTGTATGTTGGACTGACAGAAGAGCACAGGGAATCTGCATCGCTTTTTGCTAATGT
TGTGGGTTCTCATGTGCTTTCTCAATTGGGTGCGTCAAATGCAACTGC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4C159JQ 817 0 0
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AGGGAATCTGCATCGCTTTTTGCTAATGTTGTGGGTTCTCAGGTGCTTTCTCAATTGGGT
GCGTCAAATGCAACTGCAAAAACGGAAACTACTAAACAAGAAGCAAGTGTTACAGTTTCA
GAATCTGGATCAGATAAGAGTGAAACCCAGAATGGTACATCTGAAGTTGCATCTAATAAG
ATAGAAGCTAAGAGTGGAAATATGACGGTAAAAACCTTAATGGAAGTCTATGAGGGATGC
ATTACTCATCTAAGAAAGTCCCAAGGAACCAGACGTGTCAACTCCTTGAAGAGAATCTCG
CCAGCTAATTTTACCAGAGGGACGCGTTCAAGAGTTCCTAACGAGGTCATTCAGCAGATC
AAATCGCTTAACAATCTAGATGTGGAGCTTTACAAGTATGCTAAAGAGATCTTTGTCAAA
GAGCATGAACTAGTGTCGAATAAAATGGTTTCAACTTCGAAGGGGAGCATTGTTGATCTG
CAGAACGTATTTGGAGAAATGGAGGGTGAGAAGCTGTGGAAGTTGGTATCAGTGGCATTG
ATGCTGTTACTGCTCTTCCTCTTGTTTCTATTTGTAAACGCTAGAAGGAGAAGAACCTCT
AAAGTTAAGATTTGATCATTCTCACTTTCTTTTGGGCCAAATTCAGCAATTAGGAGAAGT
TTCTGGGTCTAATTGTAATATTTATTTTTTCTTTTCCTGGAAAAGAAAAAGTTTTGGGTG
TTTGCCTTACAGGTGAAAAATGAAAAAATTAGAAGCG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4923Contig1 1132 2 12 U
GGAACCTGCGCCTCCCTCCTCGAACATGGCTGCTCCCAGAATCTAGAGAGAAAAGCTGCA
CATACAAGTAACTACACCGATACAAAAGAACCGAAGAACACCAATCAGATATGATTCTAG
CCCAGCTTCCGAGATTTCATCTATCTCTCTCTCCCTCGCATTTCAATTTCTTAAACCAAC
GGTCTAAGCCACCGGTTTCACTAGCCAGAACCGTCTTCTCGTTCGCGCCCAAATCCAATC
TCGCCACGGTCGAGCCCATACCGCTCCCGGTCTCCGATTCGTCCGACCTAGAAGATGATG
CTCCTGTGGAGATTCCGCTCGACAAGCTTTTCGTTCCGCCGGACACGGATATCTCCCGGG
ACGACCCGTCGAGTCTGACGGCGAGGATACTGAAGGGCTCGAACATAGTGCTCAGCAAGT
ACGCGAGGGACGCGCAGGTGGCTCAGGCCGACTACGTGAAGAGCAGCGTCCGGACGGAGG
ATTGTCCTGCGGATGGGCTGCCGGAGTTCGCGCTTGTCGGGAGGTCCAACGTTGGGAAAT
CTTCGCTGCTCAATTCGTTGGTCAGGAGGAAACGCCTTGCCTTGACCTCTAAGAAACCTG
GAAAGACGCAATGCATTAATCATTTCCGTATCAACGACAATCGGTACTTGGTCGATTTGC
CTGGCTACGGGTATGCATCAGCACCGCATGAACTCAAACAAGACTGGAACAAATTCAAAG
ACTATTTCCTCAATCGATCTACATTAGTCTCAGTGTTTTTGCTAGTCGATGCCAGCATTC
CTCCTAAGCAAATCGATCTCGATTACGCTAGCTGGCTTGGTCAAAACCAGGTTCCTATGA
CTATGGTATTCACTAAATGCGACAAGAGGAAGAAGAAGAAAAACGGAGGGAAGAGACCAG
AAGAGAATATAAAGGAGTTTCAAGATTTGATACAAGGATTCTTTGAGACAACACCACCAT
GGATTATGACCAGCAGTGTGACAAATCAAGGTCGTGACGAGATATTGTTGCATATGGCTC
AGCTAAGAAACTACTGGCTCAAACGCTAAGAAACCAACCTCACTTCTATGTATCATCTTT
ATTAGAAAGGAGACATCTGTGTTAAAAGACAGTAGTGTACCAACTATTGGGC


BQ
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AF RR4EW17TF U 1
AF RR4EW17JQ C 453
BS 1 700 RR4EW17TF
BS 701 701 RR4EW17JQ
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BS 733 733 RR4EW17JQ
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BS 781 783 RR4EW17JQ
BS 784 803 RR4EW17TF
BS 804 1132 RR4EW17JQ

RD RR4EW17TF 811 0 0
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CATACAAGTAACTACACCGATACAAAAGAACCGAAGAACACCAATCAGATATGATTCTAG
CCCAGCTTCCGAGATTTCATCTATCTCTCTCTCCCTCGCATTTCAATTTCTTAAACCAAC
GGTCTAAGCCACCGGTTTCACTAGCCAGAACCGTCTTCTCGTTCGCGCCCAAATCCAATC
TCGCCACGGTCGAGCCCATACCGCTCCCGGTCTCCGATTCGTCCGACCTAGAAGATGATG
CTCCTGTGGAGATTCCGCTCGACAAGCTTTTCGTTCCGCCGGACACGGATATCTCCCGGG
ACGACCCGTCGAGTCTGACGGCGAGGATACTGAAGGGCTCGAACATAGTGCTCAGCAAGT
ACGCGAGGGACGCGCAGGTGGCTCAGGCCGACTACGTGAAGAGCAGCGTCCGGACGGAGG
ATTGTCCTGCGGATGGGCTGCCGGAGTTCGCGCTTGTCGGGAGGTCCAACGTTGGGAAAT
CTTCGCTGCTCAATTCGTTGGTCAGGAGGAAACGCCTTGCCTTGACCTCTAAGAAACCTG
GAAAGACGCAATGCATTAATCATTTCCGTATCAACGACAATCGGTACTTGGTCGATTTGC
CTGGCTACGGGTATGCATCAGCACCGCATGAACTCAAACA*GACTGGAACAAATTCAAAG
ACTATTTCCTCA*TCGATCTACATTAGTCTCAGTGTTTT*GCTAGTCGATGC*AGCATTC
T**CTAAGCAAATCGATCTCGAT
ACGCTAGC

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DS 

RD RR4EW17JQ 680 0 0
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CTTGTCGGGAGGTCCAACGTTGGGAAATCTTCGCTGCTCAATTCGTTGGTCAGGAGGAAA
CGCCTTGCCTTGACCTCTAAGAAACCTGGAAAGACGCAATGCATTAATCATTTCCGTATC
AACGACAATCGGTACTTGGTCGATTTGCCTGGCTACGGGTATGCATCAGCACCGCATGAA
CTCAAACAAGACTGGAACAAATTCAAAGACTATTTCCTCAATCGATCTACATTAGTCTCA
GTGTTTTTGCTAGTCGATGCCAGCATTCCTCCTAAGCAAATCGATCTCGATTACGCTAGC
TGGCTTGGTCAAAACCAGGTTCCTATGACTATGGTATTCACTAAATGCGACAAGAGGAAG
AAGAAGAAAAACGGAGGGAAGAGACCAGAAGAGAATATAAAGGAGTTTCAAGATTTGATA
CAAGGATTCTTTGAGACAACACCACCATGGATTATGACCAGCAGTGTGACAAATCAAGGT
CGTGACGAGATATTGTTGCATATGGCTCAGCTAAGAAACTACTGGCTCAAACGCTAAGAA
ACCAACCTCACTTCTATGTATCATCTTTATTAGAAAGGAGACATCTGTGTTAAAAGACAG
TAGTGTACCAACTATTGGGC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL4924Contig1 1050 2 6 U
GCTGAATAGGAACATGTGGGAGTCTCTGGTTTGTATGCTTAAAGGATCAGCTAAAGATGA
GAGTAACGTCTAAAGCTAGTGGTAGACATCATTTTCGTGGGGAGGCTGAGTACTCCTTCG
TCTTCCAGGATTATAATTGCACGGTGGAGTTCTTTGTTTCACCGTTTTTGGTTCAAGAAA
ACGAGATTGTTGACAAGAAGGGAACAAAGAAGGAGACGCTACGTCTTGATCTGGTTGGGA
AGTCTTCGGAGCAGTACAAAGGAGCTGATATTATTGTCTTTAATACCGGACATTGGTGGA
CTCACGAGAAAACATCCAAAGGGGAGGATTATTATCAAGAAGGGAGCAATGTGTATCACG
AACTCGCGGTACTCGAAGCTTTCCGTAAAGCTTTGACCACATGGGGTCGATGGGTTGAGA
AGAATGTGAACCCTGACAAGTCCCTTGTTTTCTTCCGTGGCTACTCGGCCTCGCATTTCA
GCGGTGGGCAATGGAACTCGGGAGGAGCGTGCGATAGCGAAACGGAACCGATCAGGAACG
AGACGTACCTAACACCGTACCCGGATAAAATGAAGGTGCTGGGAGAGTGTTGAGGGGGTA
TGAGAACGCCTGTAACGTATCTTAACATCACCAGATTAACGGACTACAGAAAGGATGGCC
ACCCTTCGGTGTATCGGAAACAGAGCTTATCGGATAAAGAGAAGAAAACGCCGTTGCTGT
ATCAAGACTGCAGCCACTGGTGCCTCCCTGGTGTTCCAGACTCTTGGAACGAGATCCTTT
ACGCTGAGCTGCTGGTCAAACTCAATCAGCTTGGCCAAACACAACGGAAACCTTAAAAAG
GTTTTTTTTCCATCTCGAATACTTGTTTGATCTCTGGATTACTTCGGTTTGATTGTTTTT
AGTTGGTTATAGAATGTGTAGAGTAAAAAAAGATGAAAAGCATGGTTTACTCTCTTATGT
CTTTGCTACAATTTATTGTAAATGCTTTTGTTACCACGGTTACTATACTTGGCTCCAAAG
AAATATTTTATAATGGAATTGATTACAGCG


BQ
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AF RR4BS91TF U 1
AF RR4BS91JQ C 300
BS 1 702 RR4BS91TF
BS 703 705 RR4BS91JQ
BS 706 724 RR4BS91TF
BS 725 725 RR4BS91JQ
BS 726 753 RR4BS91TF
BS 754 1050 RR4BS91JQ

RD RR4BS91TF 753 0 0
GCTGAATAGGAACATGTGGGAGTCTCTGGTTTGTATGCTTAAAGGATCAGCTAAAGATGA
GAGTAACGTCTAAAGCTAGTGGTAGACATCATTTTCGTGGGGAGGCTGAGTACTCCTTCG
TCTTCCAGGATTATAATTGCACGGTGGAGTTCTTTGTTTCACCGTTTTTGGTTCAAGAAA
ACGAGATTGTTGACAAGAAGGGAACAAAGAAGGAGACGCTACGTCTTGATCTGGTTGGGA
AGTCTTCGGAGCAGTACAAAGGAGCTGATATTATTGTCTTTAATACCGGACATTGGTGGA
CTCACGAGAAAACATCCAAAGGGGAGGATTATTATCAAGAAGGGAGCAATGTGTATCACG
AACTCGCGGTACTCGAAGCTTTCCGTAAAGCTTTGACCACATGGGGTCGATGGGTTGAGA
AGAATGTGAACCCTGACAAGTCCCTTGTTTTCTTCCGTGGCTACTCGGCCTCGCATTTCA
GCGGTGGGCAATGGAACTCGGGAGGAGCGTGCGATAGCGAAACGGAACCGATCAGGAACG
AGACGTACCTAACACCGTACCCGGATAAAATGAAGGTGCTGGGAGAGTGTTGAGGGGGTA
TGAGAACGCCTGTAACGTATCTTAACATCACCAGATTAACGGACTACAGAAAGGATGGCC
ACCCTTCGGTGTATCGGAAACAGAGCTTATCGGATAAAGAGAG**AAACGCCGTTGCTGT
ATCA*GACTGCAGCCACTGGTGCCTCCCTGGTG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4BS91JQ 751 0 0
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GAACTCGCGGTACTCGAAGCTTTCCGTAAAGCTTTGACCACATGGGGTCGATGGGTTGAG
AAGAATGTGAACCCTGACAAGTCCCTTGTTTTCTTCCGTGGCTACTCGGCCTCGCATTTC
AGCGGTGGGCAATGGAACTCGGGAGGAGCGTGCGATAGCGAAACGGAACCGATCAGGAAC
GAGACGTACCTAACACCGTACCCGGATAAAATGAAGGTGCTGGGAGAGTGTTGAGGGG*T
ATGAGAACGCCTGTAACGTATTTTAACATCACCAGATTAACGGACTACAGAAAGGATGGC
CCCCCTTCGGTGTATCGGAAACAGAGCTTATCGGATAAAGAGAAGAAAACGCCGTTGCTG
TATCAAGACTGCAGCCACTGGTGCCTCCCTGGTGTTCCAGACTCTTGGAACGAGATCCTT
TACGCTGAGCTGCTGGTCAAACTCAATCAGCTTGGCCAAACACAACGGAAACCTTAAAAA
GGTTTTTTTTCCATCTCGAATACTTGTTTGATCTCTGGATTACTTCGGTTTGATTGTTTT
TAGTTGGTTATAGAATGTGTAGAGTAAAAAAAGATGAAAAGCATGGTTTACTCTCTTATG
TCTTTGCTACAATTTATTGTAAATGCTTTTGTTACCACGGTTACTATACTTGGCTCCAAA
GAAATATTTTATAATGGAATTGATTACAGCG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL4925Contig1 575 2 1 U
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AAACAGTTTTCCTCTGAAAGATGGGTTTCTCGAACGCTGGAATTGGTCTCTCCGATCAAA
ACAATCTCTGCGAAACGGAACTAGGGTTTTCAGACCAAAGCGTTCAAGAATTCCGGCCAG
ATCAAGATCTTGAAACTAAAGTCGGAGAGATACCTAATACTCCACGCGGAGGAGTAAAAG
TAAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTTATGTAAGACTCCGACACGCCTCGACCAGATTC
TCCCGAATATTACAAATATTTGTCCTCCGGCGCCAAGGAAGCCTAAGAGAGTCCCATCGA
GAAGTTTGAAGGTTCGAGATTCTTATAGAAGCAGGAGAAGGATCATTTTGAACGTTTCTA
GAGAGGTCGATTCTATGTTTCACTCAGTGGCATCTCTAGGTAATCAAGTTAAGAAAGCCA
GACGTATTTGATGTTTCATATGTATATGTATAATAACGTAGCTACATGTAACCAAATTGT
AATAAACTACTAGTTATGAAATGTAGTGGGATGCC


BQ
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AF RR4D989JQ C 1
AF RR4D989TF U 1
BS 1 575 RR4D989TF

RD RR4D989JQ 575 0 0
TTTTTCTTCTTCTCTCACTCACATCAGAACTATTTAACCCTTCCCCTTTTTAAGTTTGAG
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ACAATCTCTGCGAAACGGAACTAGGGTTTTCAGACCAAAGCGTTCAAGAATTCCGGCCAG
ATCAAGATCTTGAAACTAAAGTCGGAGAGATACCTAATACTCCACGCGGAGGAGTAAAAG
TAAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTTATGTAAGACTCCGACACGCCTCGACCAGATTC
TCCCGAATATTACAAATATTTGTCCTCCGGCGCCAAGGAAGCCTAAGAGAGTCCCATCGA
GAAGTTTGAAGGTTCGAGATTCTTATAGAAGCAGGAGAAGGATCATTTTGAACGTTTCTA
GAGAGGTCGATTCTATGTTTCACTCAGTGGCATCTCTAGGTAATCAAGTTAAGAAAGCCA
GACGTATTTGATGTTTCATATGTATATGTATAATAACGTAGCTACATGTAACCAAATTGT
AATAAACTACTAGTTATGAAATGTAGTGGGATGCC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4D989TF 575 0 0
TTTTTCTTCTTCTCTCACTCACATCAGAACTATTTAACCCTTCCCCTTTTTAAGTTTGAG
AAACAGTTTTCCTCTGAAAGATGGGTTTCTCGAACGCTGGAATTGGTCTCTCCGATCAAA
ACAATCTCTGCGAAACGGAACTAGGGTTTTCAGACCAAAGCGTTCAAGAATTCCGGCCAG
ATCAAGATCTTGAAACTAAAGTCGGAGAGATACCTAATACTCCACGCGGAGGAGTAAAAG
TAAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTTATGTAAGACTCCGACACGCCTCGACCAGATTC
TCCCGAATATTACAAATATTTGTCCTCCGGCGCCAAGGAAGCCTAAGAGAGTCCCATCGA
GAAGTTTGAAGGTTCGAGATTCTTATAGAAGCAGGAGAAGGATCATTTTGAACGTTTCTA
GAGAGGTCGATTCTATGTTTCACTCAGTGGCATCTCTAGGTAATCAAGTTAAGAAAGCCA
GACGTATTTGATGTTTCATATGTATATGTATAATAACGTAGCTACATGTAACCAAATTGT
AATAAACTACTAGTTATGAAATGTAGTGGGATGCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL4926Contig1 709 2 2 U
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ATGGGTTTAGGAGACAACACACTAGTCGGGTATTGGCCAGCAGAGCTATTCACCCACTTA
GCCGACCATGCAACCACCGTGGAATGGGTAGGTGAGGTCGTGAACACACGTGCTTCAGGC
CGGCACACGACGACCCAAATGGGTTCTGGTCATTTCCCTGACGAAGGGTTTGGAAAAGCA
AGTTACTTCCGGAACTTGGAGATTGTTGATTCAGACAACAGTCTCGTACCGGTGCATGAT
GTCAAGATATTAGCCGAGAACACCGAATGTTGCGACATCAAGAGTTCGTATAATAATGAG
TGGGGAACTTATTTTTACTATGGTGGTCCCGGGTTTAATCCTAGGTGTAACTGAAAAAAA
GTGTACATAGGATCGAATGTGTATTTTTTAAAGTATGGGTAGTGAAGATTGAATATTGGC
TTATTGTTTTTCATTTCTCAGTTGTTGATTAAACCTAGTAATGGTTGGCTAGATGCTTAA
ACACCAAGAGAGATTTGACTTCAGACTTCAAAAATATGCAGGAGTCACTCTATTAGATTT
GTTGTTTAACTATTAGTGGACCACAGAAATCATGTATGAATCGACATCAGGGGTAATATT
TTGATTACCTAATAGGAAAGCAAAAGAGGAAAGATCAAGAAAATTGGTC


BQ
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AF RR4DV72TF U 1
AF RR4DV72JQ C 29
BS 1 180 RR4DV72TF
BS 181 709 RR4DV72JQ

RD RR4DV72TF 180 0 0
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ATGGGTTTAGGAGACAACACACTAGTCGGGTATTGGCCAGCAGAGCTATTCACCCACTTA
GCCGACCATGCAACCACCGTGGAATGGGTAGGTGAGGTCGTGAACACACGTGCTTCAGGC

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR4DV72JQ 681 0 0
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GGTATTGGCCAGCAGAGCTATTCACCCACTTAGCCGACCATGCAACCACCGTGGAATGGG
TAGGTGAGGTCGTGAACACACGTGCTTCAGGCCGGCACACGACGACCCAAATGGGTTCTG
GTCATTTCCCTGACGAAGGGTTTGGAAAAGCAAGTTACTTCCGGAACTTGGAGATTGTTG
ATTCAGACAACAGTCTCGTACCGGTGCATGATGTCAAGATATTAGCCGAGAACACCGAAT
GTTGCGACATCAAGAGTTCGTATAATAATGAGTGGGGAACTTATTTTTACTATGGTGGTC
CCGGGTTTAATCCTAGGTGTAACTGAAAAAAAGTGTACATAGGATCGAATGTGTATTTTT
TAAAGTATGGGTAGTGAAGATTGAATATTGGCTTATTGTTTTTCATTTCTCAGTTGTTGA
TTAAACCTAGTAATGGTTGGCTAGATGCTTAAACACCAAGAGAGATTTGACTTCAGACTT
CAAAAATATGCAGGAGTCACTCTATTAGATTTGTTGTTTAACTATTAGTGGACCACAGAA
ATCATGTATGAATCGACATCAGGGGTAATATTTTGATTACCTAATAGGAAAGCAAAAGAG
GAAAGATCAAGAAAATTGGTC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL4927Contig1 1357 2 6 U
GGACCACAGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCTGTTGGTTTTGAAAGTTAAAGTCGG
AGACGCGTAGGAGAGAATCTCCGTTAGGTACTCAGACGAGTAGTTTCTTCCCTCTTTCGC
CGCAGCAAACGATGGATGCTGCTAGCAACAACACCACCGCTAGTAACGTCGCCCAAGCGA
TTCTCGCCGTCCTCGATTACAACTCCACCCCCGATGCTCGCAGAGCTGCCGTTGCATTCC
TCGAATCCATTAAGTGTGGAGATATCAGGGTTCTAGCACACGTGTCCTTACTTCTAGTAA
AGAAGGAATGCTCTTCAGAAATCCGTCTTCATGCCTTCAAAATGTTACAGCATCTGGTTA
GACTCAGGTGGGAAGAGTTAAGCCCTTCAGAACGCAGGGATTTTGCCAAGGTCTCTGTTG
ACCTAATGTCAGAGATTGCTAGTCCATCTGAGGAATGGTCTCTGAAGAGTCAGTCAGCTG
CCCTTGTAGCTGAGATAGTTAGAAGAGAAGGCCCCGATCTTTGGCAGGAGTTGTTTCCTT
CACTAACCTCCTTGTCTGCACAGGGCCCACTACAAGCTGAAGTGGTCTCAATGATGCTCA
GATGGCTTCCTGAAGATATTACAGTTCACAATGAGGACTTGGATGGAGACAGGCGTCGGC
TGCTGTTGCGGGGACTTACTCAATCTTTGCCTGAGATTTTACCTTTATTGTATAATCTTC
TCGAGAGACACTTTGGAGCTGCAATGAATGAAGCTAGTAGGCTACACGCTGACTTAGCAA
AACAGCACGCGGCTGTGGTCATAGCTTGTTTAAATGCCATCAATGCATTTGCCGAATGGG
CTCCTGTTTTAGATCTTTCTAGATACGGAATCATTAACGGGTGCGGTGCGTTACTTTCCT
CTCCTGACTTCCGTCTTCATGCTTGTGATTTTTTCAAACTTGTCTGCTCAAGAAAAAGAC
CCAGTGATGTTTTTGGTACGGAATACGATGCTGCGATTAGCAGTCTGTTTCAGAGTTTGA
TGAATGTCTCCAGAGAATTCTTATACAGATCAGCATCGTCTGGTGGGGGTATCGATGAAA
GTGATTATGAGTTTGCTGAGTGTATATGTGAAAGCTTGGTTTCTTTAGGCTCAGCAAACC
TCCAATGTATTGCCACTGATGGTGGTGTATTGGCTCTCTACCTTCAGCAGATGCTTGGTT
TCTTTCAACACTTTAAGTTGGGTCTTCACTTTGAAGCAATGCTCTTCTGGCTGGCATTAA
TGAGGGATTTACTTACAAAGCCAAAGGCTGCTGCTAATCCAAGTGGAGAGGGACTAGCAA
TTGGTGGCATCCAAAGTTCAAGCCAAGTTGATAACGG


BQ
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AF RR4GU01TF U 1
AF RR4GU01JQ C 683
BS 1 760 RR4GU01TF
BS 761 761 RR4GU01JQ
BS 762 781 RR4GU01TF
BS 782 782 RR4GU01JQ
BS 783 795 RR4GU01TF
BS 796 1357 RR4GU01JQ

RD RR4GU01TF 795 0 0
GGACCACAGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCTGTTGGTTTTGAAAGTTAAAGTCGG
AGACGCGTAGGAGAGAATCTCCGTTAGGTACTCAGACGAGTAGTTTCTTCCCTCTTTCGC
CGCAGCAAACGATGGATGCTGCTAGCAACAACACCACCGCTAGTAACGTCGCCCAAGCGA
TTCTCGCCGTCCTCGATTACAACTCCACCCCCGATGCTCGCAGAGCTGCCGTTGCATTCC
TCGAATCCATTAAGTGTGGAGATATCAGGGTTCTAGCACACGTGTCCTTACTTCTAGTAA
AGAAGGAATGCTCTTCAGAAATCCGTCTTCATGCCTTCAAAATGTTACAGCATCTGGTTA
GACTCAGGTGGGAAGAGTTAAGCCCTTCAGAACGCAGGGATTTTGCCAAGGTCTCTGTTG
ACCTAATGTCAGAGATTGCTAGTCCATCTGAGGAATGGTCTCTGAAGAGTCAGTCAGCTG
CCCTTGTAGCTGAGATAGTTAGAAGAGAAGGCCCCGATCTTTGGCAGGAGTTGTTTCCTT
CACTAACCTCCTTGTCTGCACAGGGCCCACTACAAGCTGAAGTGGTCTCAATGATGCTCA
GATGGCTTCCTGAAGATATTACAGTTCACAATGAGGACTTGGATGGAGACAGGCGTCGGC
TGCTGTTGCGGGGACTTACTCAATCTTTGCCTGAGATTTTACCTTTATTGTATAATCTTC
TCGAGAGACACTTTGGAGCTGCAATGAATGAAGCTAGTAG*CTACACGCTGACTTAGCAA
A*CAGCACGCGGCTG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4GU01JQ 675 0 0
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AATGAATGAAGCTAGTAGGCTACACGCTGACTTAGCAAAACAGCACGCGGCTGTGGTCAT
AGCTTGTTTAAATGCCATCAATGCATTTGCCGAATGGGCTCCTGTTTTAGATCTTTCTAG
ATACGGAATCATTAACGGGTGCGGTGCGTTACTTTCCTCTCCTGACTTCCGTCTTCATGC
TTGTGATTTTTTCAAACTTGTCTGCTCAAGAAAAAGACCCAGTGATGTTTTTGGTACGGA
ATACGATGCTGCGATTAGCAGTCTGTTTCAGAGTTTGATGAATGTCTCCAGAGAATTCTT
ATACAGATCAGCATCGTCTGGTGGGGGTATCGATGAAAGTGATTATGAGTTTGCTGAGTG
TATATGTGAAAGCTTGGTTTCTTTAGGCTCAGCAAACCTCCAATGTATTGCCACTGATGG
TGGTGTATTGGCTCTCTACCTTCAGCAGATGCTTGGTTTCTTTCAACACTTTAAGTTGGG
TCTTCACTTTGAAGCAATGCTCTTCTGGCTGGCATTAATGAGGGATTTACTTACAAAGCC
AAAGGCTGCTGCTAATCCAAGTGGAGAGGGACTAGCAATTGGTGGCATCCAAAGTTCAAG
CCAAGTTGATAACGG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4928Contig1 691 2 3 U
GTCAAACACACGTGTAACACTTTTATATCTTTTGAAGCAGCAAGTTTGTTTTATCACACT
ACACTATAGATATTACATGAATATAAATTTACATTTATCTTAAAATACAAGAGAAGCTAG
CGCCTTGAGCTCGGTGGCTTCCGGGAAACTGCATAAGGTGACTGAAACCCAACTGTTTCC
ACGTCTTCAACAGTTCTGATCAACCTTCTTATTCTCGCTTCTTCCATCAGCGACCGCTGC
AGTAACTGCCCCTGCACGTCTGCAAGCGACCGGTTCCTTGGAAGTGTGCGGTTGTCTGAA
CTGGAACTGGATGCCGCGTACAAGTTGGCCTGCCCTGAATGTAGATGATGGCTTTCTTCG
GGGAAAAACCTCGTCACGCTGTGAGTTCTGTTCACAGCAGAAGGTTGGGAGCTGTGCTCA
TCAACAGATATGTAGTTGAGGTTGGAGTAAGACCCTGTGTCGGTAGAACTTTGAAAATGC
ATCTCATCGTGATAATCATCTTGTAGCCAATCTTGACGGCCTCGTGGCATGTAGTTCGAG
AGTGAAGCTTGAGAGAATGGTGAGTGGGAGGATGAAGAGTGATAATCATGAGGGGTTTCC
TCACCTTCCTCGTACCTCCAACCATGCACCAAAGAAGAGATCTCTCCATCAATCATTTCA
GCAATCTCGACTGGATCCCAATCTGTGATCT


BQ
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AF RR4FV84JQ U 46
AF RR4FR53JQ U 1
BS 1 474 RR4FR53JQ
BS 475 475 RR4FV84JQ
BS 476 691 RR4FR53JQ

RD RR4FV84JQ 454 0 0
TTGTTTTATCACACTACACTATAGATATTACATGAATATAAATTTACATTTATCTTAAAA
TACAAGAGAAGCTAGCGCCTTGAGCTCGGTGGCTTCCGGGAAACTGCATAAGGTGACTGA
AACCCAACTGTTTCCACGTCTTCAACAGTTCTGATCAACCTTCTTATTCTCGCTTCTTCC
ATCAGCGACCGCTGCAGTAACTGCCCCTGCACGTCTGCAAGCGACCGGTTCCTTGGAAGT
GTGCGGTTGTCTGAACTGGAACTGGATGCCGCGTACAAGTTGGCCTGCCCTGAATGTAGA
TGATGGCTTTCTTCGGGGAAAAACCTCGTCACGCTGTGAGTTCTGTTCACAGCAGAAGGT
TGGGAGCTGTGCTCATCAACAGATATGTAGTTGAGGTTGGAGTAAGACCCTGTGTCGGTA
GAACTTTGAAAATGCATCTCATCGTGATAATCAT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4FR53JQ 691 0 0
GTCAAACACACGTGTAACACTTTTATATCTTTTGAAGCAGCAAGTTTGTTTTATCACACT
ACACTATAGATATTACATGAATATAAATTTACATTTATCTTAAAATACAAGAGAAGCTAG
CGCCTTGAGCTCGGTGGCTTCCGGGAAACTGCATAAGGTGACTGAAACCCAACTGTTTCC
ACGTCTTCAACAGTTCTGATCAACCTTCTTATTCTCGCTTCTTCCATCAGCGACCGCTGC
AGTAACTGCCCCTGCACGTCTGCAAGCGACCGGTTCCTTGGAAGTGTGCGGTTGTCTGAA
CTGGAACTGGATGCCGCGTACAAGTTGGCCTGCCCTGAATGTAGATGATGGCTTTCTTCG
GGGAAAAACCTCGTCACGCTGTGAGTTCTGTTCACAGCAGAAGGTTGGGAGCTGTGCTCA
TCAACAGATATGTAGTTGAGGTTGGAGTAAGACCCTGTGTCGGTAGAACTTTGAGAATGC
ATCTCATCGTGATAATCATCTTGTAGCCAATCTTGACGGCCTCGTGGCATGTAGTTCGAG
AGTGAAGCTTGAGAGAATGGTGAGTGGGAGGATGAAGAGTGATAATCATGAGGGGTTTCC
TCACCTTCCTCGTACCTCCAACCATGCACCAAAGAAGAGATCTCTCCATCAATCATTTCA
GCAATCTCGACTGGATCCCAATCTGTGATCT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4930Contig1 792 2 2 U
GGGATCAGTTTGCTCTGTGTTTTAAATGCTACTACAGTTTCTGTACTCTCTGTAACGAAA
AGCGACACGTGGGAGGTACCTGTATGAGCCCGGAGCTCAGGCTTCAAATCTTGGAGGAAC
GTCAAAGTTCGTCACGTCTTGGAGAGGAACAAAGGCGAAAAGAAAGGGAAATGATCAATG
AGATGATCAGCGTGAGTGTGATAAAGCAAAGCGCAAAGCAATGCCCGTCTTGCAAAATGG
CTATCTCAAGAACCGGTGGCTGTAATAAAATGGTTTGTAATAACTGTGGCCAGTTCTTTT
GCTACCGTTGCAATAAAGCTATCACTGGTTATAAACATTTCAGAGAGGGAACATGTGAGC
TATTCCCACAGGACGCGATCCAAGAATGGAACGAAATGAATGAGCTACAAGTTTTTCAGA
TTCAAGCTCAGTTGTTTGCACCACACGGTCAGTTTCCACAGCGCGGTCAGATATGTCCTA
ATTGCCGCCAGTTCAACCTAAAGGCGGGAAACAACAATCACTTGTTTTGCTGGGCGTGTC
AAGCACATTTCTGTTACCTTTGCAAGAAAGTGGTGAAGCGATGTGCTCAGCATTATGGAC
CAAAGGGTTGCAAGCAGCACACTGATGGGTAAAGGCGTGTTTCAGAAGATGATTAACATA
TTAGTGCTGTTCGTTTGGTCGACGATGATTATGTTTCCCTTCTCCAGTGGTTGTCGTTTG
TTTTTTTTTTTTTTGAACTTTTGATGAGGTTGTCGTTTGTTATAAGGTCAAAAGAAACAT
TATGAAGTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DS78TF U 1
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TTTTTTTTTTTT
GACT

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AATAAAATGGTTTGTAATAACTGTGGCCAGTTCTTTTGCTACCGTTGCAATAAAGCTATC
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BQ
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CTTCTCTGCTTGATACACAACTTTGTTCATAATCTTAATTTCGTTTTATAATCTACAGTA
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QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL4932Contig1 1083 2 2 U
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AGC


BQ
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10 10 10 

AF RR4BE39TF U 1
AF RR4BE39JQ C 338
BS 1 752 RR4BE39TF
BS 753 1083 RR4BE39JQ

RD RR4BE39TF 752 0 0
GGATCCCTCGAAGTAATCAGAGATAAAGAGATCATCAGGTACGGAGCTCGATTCCATCAC
CGTTAGGCGCAGACTCGCTACCGTCGCCGCTCACTTCCCGTCAGCAACCAACGATCCCAT
CTCTGCGGCGTCTCTCGTCCCCTTGAACTGTAGTAGCAGTTTGAACTCTGTCATCAGAAG
TTGTGACAATAAAATCGCTTTTGCGCGGCAAGCATCTTCTGAACAAGGCTTCTTTATGAG
GCAGGCTTCCCCTGACCAGTTTATACCTCAGTCTAGCGGCATCAGTTTGAAGAACTCTGT
CATTAGAAGAGGTGACAGCAGGCTCTATTTTTCTCGTCAAGCTTCTTCTGCACAGGGTCT
TTTCATGAGGCAGGCTTCCACTGACGAGGGGACCATACCTCAGGACGCTGCATCTACCAA
GACGAATGGATTCCCTTCTTCTACAGAACAACCTTTGGTTTCCAGACCTGAGTACGCCCC
GCCACATTTTTCCAAGCCCACCGCAAAAGAAGAGTTCTTTGTTTTGTCTGATTTGCTAAA
CCAGCCAAAGGAAAACTTGGAAAAGCCATATATCCCTGACCTTCCTAAGTTAGCCAATCC
AGGGACTGTCTTGTCTCGGAGATCGAATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGC
AGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGAGTGGAGGTCGACAACATAAACTT
GACTGTGACAGGGAGACGCACAGCTGTCTGTC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4BE39JQ 746 0 0
CAAGCTTCTTCTGCACAGGGTCTTTTCATGAGGCAGGCTTCCACTGACGAGGGGACCATA
CCTCAGGACGCTGCATCTACCAAGACGAATGGATTCCCTTCTTCTACAGAACAACCTTTG
GTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCGCCACATTTTTCCAAGCCCACCGCAAAAGAAGAGTTC
TTTGTTTTGTCTGATTTGCTAAACCAGCCAAAGGAAAACTTGGAAAAGCCATATATCCCT
GACCTTCCTAAGTTAGCCAATCCAGGGACTGTCTTGTCTCGGAGATCGAATGTTGCAGAA
TATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGA
GTGGAGGTCGACAACATAAACTTGACTGTGACAGGGAGACGCACAGCTGTCTGTCAAAAA
GCTGATGCAGGCACCAAAGGTTCAATCTGTGGGTATCACAAGCAAGAAATACTACAAGGA
CCTTTCAAAGTTTCCTGGCCACTACCCAGCAACGTGAACAAGGATAACGTTTCTGCTGAA
TTTATGGATGGGCTTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTTTGAGGGATCATTATACGTAAA
CGGTAAACAATATGTGCATAAAATAATGTTGTTTGTGTGAATGAAGAGAAAGAAAAGCAA
AAACTGATATTATGTAAAATAGTATGGTGTTTATATATACAGACTGCAGACAGGCATGCT
CAGTTAATAGAGTCAGCCATGTAAGC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4933Contig1 1027 2 2 U
GGACGCCCTCCACGGCGACATCGGCGCTCTCTCCTCCCGCGACGTCCTCGTCCTCTTCAG
CAAATCCGGCTCCACCGAGGAGCTTCTCCGCCTCGTCCCCTGCGCTAAGGCCAGAGGAGC
CTTCCTCGTCTCTCTCACCTCCGTTCCCGGGAATCCTCTCGCCGGAGTCTGCGATATGAA
CGTGCATTTGCCGTTGCAGAGGGAGTTGTGTCCGTTTAATCTCGCTCCCGTGACGTCTAC
GGCGATCCAGATGGTGTTTGGTGATACGATTGCGGTTGCGCTTATGGCGACTAGGAATCT
AACGAAGGATGAGTATGGAGCTAATCATCCCGCTGGTAGGATCGGCAAGAGCTTGATTTT
CAAGGTAAAGGATGTTATGAAGAAGAAAGAAGAGCTTCCGGTTTGTAGAGAAGGAGACTT
GATAATGGATCAACTAGTTGAGCTAACCAGCAAAGGATGTGGGTGTTTGCTTGTGGTTGA
TGAACATCATCGCTTGATCGGTACATTCACAGATGGAGATCTTCGCCGAACTCTTAAAGC
AAGTGGAGAAGCTATCTTCAAACTCAGTGTTGGAGAAATGTGCAACAGGCAAGAGACAGA
AAAACTCTGCTTTAGATCCCCTATAAACAACAATGGGTTTTGTTGATCCTTATTGTTTTG
AAAACAGGAAGCCGAGAACAATTGGACCGGAAACAATGGCAGTTGAAGCGATGAAGAAAA
TGGAGTCACCGCCATCACCTGTACAGTTTCTACCTGTGGTCACTGAAGACAACACCTTGA
TTGTAATTGTAACATTGCATGGTTTGGTTTCAGCTGGTCTCTGAATACGAAGCTGCCTCT
ATGTCCGAGTTACACACATAAGTTCATTCTTTTTTTACGTTGTGTATTGTTGGTGATGTT
CACAGCTAGTGAATGATTGTATTGTATCTATTAGTACACTCCCATGTATTGCATTCTCTT
TACTATTTACGCAAAAGATATGTATAGAGAGTATAAGAAGTTTCTTATATCTTTGTCCTC
TCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ30TF U 1
AF RR4FZ30JQ C 264
BS 1 711 RR4FZ30TF
BS 712 1027 RR4FZ30JQ

RD RR4FZ30TF 711 0 0
GGACGCCCTCCACGGCGACATCGGCGCTCTCTCCTCCCGCGACGTCCTCGTCCTCTTCAG
CAAATCCGGCTCCACCGAGGAGCTTCTCCGCCTCGTCCCCTGCGCTAAGGCCAGAGGAGC
CTTCCTCGTCTCTCTCACCTCCGTTCCCGGGAATCCTCTCGCCGGAGTCTGCGATATGAA
CGTGCATTTGCCGTTGCAGAGGGAGTTGTGTCCGTTTAATCTCGCTCCCGTGACGTCTAC
GGCGATCCAGATGGTGTTTGGTGATACGATTGCGGTTGCGCTTATGGCGACTAGGAATCT
AACGAAGGATGAGTATGGAGCTAATCATCCCGCTGGTAGGATCGGCAAGAGCTTGATTTT
CAAGGTAAAGGATGTTATGAAGAAGAAAGAAGAGCTTCCGGTTTGTAGAGAAGGAGACTT
GATAATGGATCAACTAGTTGAGCTAACCAGCAAAGGATGTGGGTGTTTGCTTGTGGTTGA
TGAACATCATCGCTTGATCGGTACATTCACAGATGGAGATCTTCGCCGAACTCTTAAAGC
AAGTGGAGAAGCTATCTTCAAACTCAGTGTTGGAGAAATGTGCAACAGGCAAGAGACAGA
AAAACTCTGCTTTAGATCCCCTATAAACAACAATGGGTTTTGTTGATCCTTATTGTTTTG
AAAACAGGAAGCCGAGAACAATTGGACCGGAAACAATGGCAGTTGAAGCGA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4FZ30JQ 764 0 0
ATACGATTGCGGTTGCGCTTATGGCGACTAGGAATCTAACGAAGGATGAGTATGGAGCTA
ATCATCCCGCTGGTAGGATCGGCAAGAGCTTGATTTTCAAGGTAAAGGATGTTATGAAGA
AGAAAGAAGAGCTTCCGGTTTGTAGAGAAGGAGACTTGATAATGGATCAACTAGTTGAGC
TAACCAGCAAAGGATGTGGGTGTTTGCTTGTGGTTGATGAACATCATCGCTTGATCGGTA
CATTCACAGATGGAGATCTTCGCCGAACTCTTAAAGCAAGTGGAGAAGCTATCTTCAAAC
TCAGTGTTGGAGAAATGTGCAACAGGCAAGAGACAGAAAAACTCTGCTTTAGATCCCCTA
TAAACAACAATGGGTTTTGTTGATCCTTATTGTTTTGAAAACAGGAAGCCGAGAACAATT
GGACCGGAAACAATGGCAGTTGAAGCGATGAAGAAAATGGAGTCACCGCCATCACCTGTA
CAGTTTCTACCTGTGGTCACTGAAGACAACACCTTGATTGTAATTGTAACATTGCATGGT
TTGGTTTCAGCTGGTCTCTGAATACGAAGCTGCCTCTATGTCCGAGTTACACACATAAGT
TCATTCTTTTTTTACGTTGTGTATTGTTGGTGATGTTCACAGCTAGTGAATGATTGTATT
GTATCTATTAGTACACTCCCATGTATTGCATTCTCTTTACTATTTACGCAAAAGATATGT
ATAGAGAGTATAAGAAGTTTCTTATATCTTTGTCCTCTCATACC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4934Contig1 791 2 3 U
GGTCGAAAAACAATGGCGGCCACTCCGCACGTTTCGCCAACTCTTTCCCGCTACAAATTC
TTCTCAGCTTCCGCAGTCGAAAACCCTAATTTCTATCCACATCAAATTATCAACAGTCGT
CGACGGAAATCGACCAAATCGCATCTTCAAGCGCAGCACAACAATAGTACCAATATTAGC
TATGGTCCTCGGACGACGACGGAACTCGCCTCCTCGAAGAAACTACGGATTAGGCAAATG
GAGATCGAGCAAGGACAAATAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCTAAAGGATATGAGTGACGAC
GAAGCGAGTCTGCTATCGTTGAGCATGAAACCGGACAGAAACATGGCGTTGCTCGACGAT
TACGAGATGGAGGAGGAGCTTGGCCACGCTCCTCCCGGTACCAATCATCGTAGCGGATAC
GTGGCGGTGGTTGGGATGCCGAACGTGGGGAAAAGCACGCTTTCGAATCAAATGATTGGC
CAGAAGATCTCTATCGTTACCGATAAACCCCAAACCACGAGGCATCGGATTCTCGGTATC
TGTTCCAGCCCTGATTATCAGATGATACTTTATGATACGCCTGGTGTGATCGAGAAGAAG
ATGCACAGTTAGATACTATGATGATGAAGAATGTCCGTGATGCTGCCATCAACGCTGATT
GCGTTGTCATTCTTGTTGATGCTTGTAAACTCCTGCTAATATAGACGAGTCTTGAAAGAG
GGCTTGGGAGACCTTGAAAAGAGCCACCTATGCTGCTTGTTATGAATAGAAGATCTCATA
AACCTGGTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G510TF U 164
AF RR4FV55TF U 1
BS 1 334 RR4FV55TF
BS 335 336 RR4G510TF
BS 337 791 RR4FV55TF

RD RR4G510TF 274 0 0
ATAGTACCAATATTAGCTATGGTCCTCGGACGACGACGGAACTCGCCTCCTCGAAGAAAC
TACGGATTAGGCAAATGGAGATCGAGCAAGGACAAATAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCTAG
AGGATATGAGTGACGACGAAGCGAGTCTGCTATCGTTGAGCATGAAACCGGACAGAAACA
TGGCGTTGCTCGACGATTACGAGATGGAGGAGGAGCTTGGCCACGCTCCTCCGGGTACCA
ATCATCGTAGCGGATACGTGGCGGTGGTTGGGAT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR4FV55TF 791 0 0
GGTCGAAAAACAATGGCGGCCACTCCGCACGTTTCGCCAACTCTTTCCCGCTACAAATTC
TTCTCAGCTTCCGCAGTCGAAAACCCTAATTTCTATCCACATCAAATTATCAACAGTCGT
CGACGGAAATCGACCAAATCGCATCTTCAAGCGCAGCACAACAATAGTACCAATATTAGC
TATGGTCCTCGGACGACGACGGAACTCGCCTCCTCGAAGAAACTACGGATTAGGCAAATG
GAGATCGAGCAAGGACAAATAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCTAAAGGATATGAGTGACGAC
GAAGCGAGTCTGCTATCGTTGAGCATGAAACCGG**AGAAACATGGCGTTGCTCGACGAT
TACGAGATGGAGGAGGAGCTTGGCCACGCTCCTCCCGGTACCAATCATCGTAGCGGATAC
GTGGCGGTGGTTGGGATGCCGAACGTGGGGAAAAGCACGCTTTCGAATCAAATGATTGGC
CAGAAGATCTCTATCGTTACCGATAAACCCCAAACCACGAGGCATCGGATTCTCGGTATC
TGTTCCAGCCCTGATTATCAGATGATACTTTATGATACGCCTGGTGTGATCGAGAAGAAG
ATGCACAGTTAGATACTATGATGATGAAGAATGTCCGTGATGCTGCCATCAACGCTGATT
GCGTTGTCATTCTTGTTGATGCTTGTAAACTCCTGCTAATATAGACGAGTCTTGAAAGAG
GGCTTGGGAGACCTTGAAAAGAGCCACCTATGCTGCTTGTTATGAATAGAAGATCTCATA
AACCTGGTGAG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL4935Contig1 973 2 2 U
GATACTAGGCAAAGAAAACCTCAATAAAAATGGGGCCTCGTAAGAGTCGTGGCTTACATA
ACAGCAAAACTTGATCATGTTCCAAACAAAGCGCGAGAGAGAGAGAGAGCTGTCTGCTAA
AATATTATAACCAAGATAAACGGCACTGAGATGAAAGAAACAAAAAAAAACACATTTTAA
TATTCGAGATTCGAAATGCTCCTTAAAACTTAGTTAGACTCAATGTGCTTCTTGACGATA
TTGAGCGCAGTTGTATCCTCACCGTAGTCCTGAAAACGGCAATCACGAAACACACAGAGA
TGATGCATTAAGTAAATGACCAGAAGATACAATAACAGATATTTTCTCATTTAACATGTA
CTGAGACGAAAAGACAAAATACCTTGACTACAAGACAGGAGCATCCAACAACCTTTCTGG
CATTGCCCTCAGAGTCAATCTTACAGAGCTGAAACAACATCATTAAAAAAAATGTTAACT
GAATATTCATTCATTCAGAAAGGTACTGTATATGGAGATTAAATGACTTACACCAGCCCA
TTCACCAAGGGTCTTGGCACTTGGAACTGTAAGCAAGTTGATGCTGTGATCAGCGCAGAG
AGCCTTGACGAGCTTCACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAAGACACAGAGCTG
AGCCACACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTCTCATGGAGACCACGTACAACACCACCATG
AGCACGAGCTTTCCTAAGAGTCAGCTCCAATGCGGTCAACAAGTCCATGTCCTCTGGGAT
GATGGCCGCTGGCTCAGCAACGGGAGGAACAGCAACGGGAGCAGCCTCGTCACTGAATCA
GAAAGGATCCAGACAATCAAAATCCAGAATGTAAGGCTCCATTGTATATATATTCAAGTC
CAAAACTAAACAGGCAAGATATTTAATTAATTCAAAAAGCTAAAATGGAGCTTAGTCATC
ACTGATTCCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H318TF U 1
AF RR4H318JQ C 168
BS 1 624 RR4H318TF
BS 625 973 RR4H318JQ

RD RR4H318TF 624 0 0
GATACTAGGCAAAGAAAACCTCAATAAAAATGGGGCCTCGTAAGAGTCGTGGCTTACATA
ACAGCAAAACTTGATCATGTTCCAAACAAAGCGCGAGAGAGAGAGAGAGCTGTCTGCTAA
AATATTATAACCAAGATAAACGGCACTGAGATGAAAGAAACAAAAAAAAACACATTTTAA
TATTCGAGATTCGAAATGCTCCTTAAAACTTAGTTAGACTCAATGTGCTTCTTGACGATA
TTGAGCGCAGTTGTATCCTCACCGTAGTCCTGAAAACGGCAATCACGAAACACACAGAGA
TGATGCATTAAGTAAATGACCAGAAGATACAATAACAGATATTTTCTCATTTAACATGTA
CTGAGACGAAAAGACAAAATACCTTGACTACAAGACAGGAGCATCCAACAACCTTTCTGG
CATTGCCCTCAGAGTCAATCTTACAGAGCTGAAACAACATCATTAAAAAAAATGTTAACT
GAATATTCATTCATTCAGAAAGGTACTGTATATGGAGATTAAATGACTTACACCAGCCCA
TTCACCAAGGGTCTTGGCACTTGGAACTGTAAGCAAGTTGATGCTGTGATCAGCGCAGAG
AGCCTTGACGAGCTTCACGTAATC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4H318JQ 806 0 0
AAACACATTTTAATAT*CGAGATTCGAAATGCTC*TTAAAACTTAGTTAGACTCAATGTG
CTTCTTGACGATATTGAGCGCAGTTGTATCCTCACCGTAGTCCTGAAAACGGCAATCACG
AAACACACAGAGATGATGCATTAAGTAAATGACCAGAAGATACAATAACAGATATTTTCT
CATTTAACATGTACTGAGACGAAAAGACAAAATACCTTGACTACAAGACAGGAGCATCCA
ACAACCTTTCTGGCATTGCCCTCAGAGTCAATCTTACAGAGCTGAAACAACATCATTAAA
AAAAATGTTAACTGAATATTCATTCATTCAGAAAGGTACTGTATATGGAGATTAAATGAC
TTACACCAGCCCATTCACCAAGGGTCTTGGCACTTGGAACTGTAAGCAAGTTGATGCTGT
GATCAGCGCAGAGAGCCTTGACGAGCTTCACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCA
AGACACAGAGCTGAGCCACACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTCTCATGGAGACCACGTA
CAACACCACCATGAGCACGAGCTTTCCTAAGAGTCAGCTCCAATGCGGTCAACAAGTCCA
TGTCCTCTGGGATGATGGCCGCTGGCTCAGCAACGGGAGGAACAGCAACGGGAGCAGCCT
CGTCACTGAATCAGAAAGGATCCAGACAATCAAAATCCAGAATGTAAGGCTCCATTGTAT
ATATATTCAAGTCCAAAACTAAACAGGCAAGATATTTAATTAATTCAAAAAGCTAAAATG
GAGCTTAGTCATCACTGATTCCACAT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL4936Contig1 448 2 1 U
GATTCTTCACCTGTTACAACTCATCATCTGCCAAGCCGGTCTGACTCAACTGCTCTCTCC
AATGGTAATAAACCTTCTACAGAGACTGAGAAACAAGACGAAAGATCAGACAAGTCTGAA
GTGCAGGAGCCATCACAACTAAACATCTCTGATGCAACCGCCTTGTCTAATGGTGAATCT
GATGCAGGACTAAGAAACATGAATCTTCCGATAATGCTTCACAACTGGACAACTCAGGAA
AGCAGGACTCATCCGATAATGCTTGATGATCATGATCTCAGAATCAAATATCTAACAATC
TCAAATGATCCCCCTTCCCTTTTTTGTCAATCTTTTTTGGAAGGAGATCTTGGAAATGGT
TTATCATCTTATACTCTTTTTTTTTCTTTTTGGTTTCATCCATAGCTGAAACAAAATAGG
AAATGAACAATGTTTTTAAATTGGTTAA


BQ
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AF RR4AY30JQ C 1
AF RR4AY30TF U 1
BS 1 448 RR4AY30TF

RD RR4AY30JQ 448 0 0
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GATGCAGGACTAAGAAACATGAATCTTCCGATAATGCTTCACAACTGGACAACTCAGGAA
AGCAGGACTCATCCGATAATGCTTGATGATCATGATCTCAGAATCAAATATCTAACAATC
TCAAATGATCCCCCTTCCCTTTTTTGTCAATCTTTTTTGGAAGGAGATCTTGGAAATGGT
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AAATGAACAATGTTTTTAAATTGGTTAA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4AY30TF 448 0 0
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AATGGTAATAAACCTTCTACAGAGACTGAGAAACAAGACGAAAGATCAGACAAGTCTGAA
GTGCAGGAGCCATCACAACTAAACATCTCTGATGCAACCGCCTTGTCTAATGGTGAATCT
GATGCAGGACTAAGAAACATGAATCTTCCGATAATGCTTCACAACTGGACAACTCAGGAA
AGCAGGACTCATCCGATAATGCTTGATGATCATGATCTCAGAATCAAATATCTAACAATC
TCAAATGATCCCCCTTCCCTTTTTTGTCAATCTTTTTTGGAAGGAGATCTTGGAAATGGT
TTATCATCTTATACTCTTTTTTTTTCTTTTTGGTTTCATCCATAGCTGAAACAAAATAGG
AAATGAACAATGTTTTTAAATTGGTTAA

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL4937Contig1 448 2 1 U
GGGGTGCGGATAGCTCTCATGAATCTACTGAGGCCATAGAAGCTGCGAAGTCACTAGCTT
TGTCAAGCGGTGCTGTTGTTGCGGTTTCAGGAGCTGTTGATATTGTTACGGATGGGAAAC
GGGTTATCGGTGTCCACAACGGGGCAAAGATGATGCAGAAGATCACTGCCACTGGATGTT
CGCTAGCTGGTCTGGTTGCTGCGTTTCTTGCTGTCGATCCGTTACAGCCGCTGGAAGCTA
CTGTTTCCGCTATGTCTGTCTTCGGCATCGCGGGTGAGTTGGGTGAAGAGTTGGCGAATG
GTCCAGCTTCTTTGAGAATGCATTTGATTGATTCTCTTTACGGTTTGGATGAAACCACTG
TGCTTAACCGTGTGAAAATCGCGAGTTTGGGTTGATGTACAAACAAGACTTTGTGATTTG
CTTTCAATCAATAAGTGTTACACATAAC


BQ
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AF RR4AK60JQ C 1
AF RR4AK60TF U 1
BS 1 448 RR4AK60TF

RD RR4AK60JQ 448 0 0
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GGGTTATCGGTGTCCACAACGGGGCAAAGATGATGCAGAAGATCACTGCCACTGGATGTT
CGCTAGCTGGTCTGGTTGCTGCGTTTCTTGCTGTCGATCCGTTACAGCCGCTGGAAGCTA
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QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4AK60TF 448 0 0
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GGGTTATCGGTGTCCACAACGGGGCAAAGATGATGCAGAAGATCACTGCCACTGGATGTT
CGCTAGCTGGTCTGGTTGCTGCGTTTCTTGCTGTCGATCCGTTACAGCCGCTGGAAGCTA
CTGTTTCCGCTATGTCTGTCTTCGGCATCGCGGGTGAGTTGGGTGAAGAGTTGGCGAATG
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CTTTCAATCAATAAGTGTTACACATAAC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL4938Contig1 576 2 5 U
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ATGCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGGCATGATCATCT
CGCGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTGGATCGCCGATA
ATGGAAGTGACGTGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTACAAATTTTATG
ACTATTCTTCTGGAGTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTACGATACTAAAT
ATATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGACAATTCTCCTTCACAACTCCCCCGA
AGGTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGGACAAACCTATG
CTTAACGAAACCTTGTACCAATACATGTCGAACCCT


BQ
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AF RR4C733TF U 54
AF RR4GE35TF U 1
BS 1 85 RR4GE35TF
BS 86 86 RR4C733TF
BS 87 242 RR4GE35TF
BS 243 243 RR4C733TF
BS 244 576 RR4GE35TF

RD RR4C733TF 418 0 0
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ATCATCTCGCGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTGGATC
GCCGATAATGGAAGTGACGTGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTACAAA
TTTTATGACTATTCTTCTGGAGTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTACGAT
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QA 1 418 1 418
DS 

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GACAAGCCCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCCACCCGGTCACA
ATGCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGGCATGATCATCT
CGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTGGATCGCCGATA
ATGGAAGTGACGTGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTACAAATTTTATG
ACTATTCTTCTGGAGTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTACGATACTAAAT
ATATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGACAATTCTCCTTCACAACTCCCCCGA
AGGTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGGACAAACCTATG
CTTAACGAAACCTTGTACCAATACATGTCGAACCCT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL4939Contig1 855 2 2 U
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TGGATTCAGTAGTGCATTATCTGCTTTTGACATTGAAGAAGAAACAAGAGACAAAATGGT
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AATGCCTCGTGTTTGGACCGGAAAAGAAGATCTTCGAGCAATTACTAAAGCAGCTAGATC
AGCTTCCTTGAAGTTGCTCTCAGTAATGGCTGTAATGCGATTGAGTGATGAAACCGATAG
CATCGAGAAGACACTAACTGTCGCTCTTTTGGATTCAACAACGTCTAAGAAAAGCATTAC
AGCATCTGATCCATTGGCTTCAAGCACTTGGGATGAGATTCCATCATCAAGAACTTTGAC
CACACCGGTCCAGTGTAAATCTATATGGAGACAGTTCAAGACAGAAACTGAGTATACAGT
GACTCAAGCCATATCTGCACAGGAAGCGAATAAGCGTGGTAATAACTGGTTACCCCCTCC
ATGGGCTATTTTTGCATTGATCATACTTGGATTCAACGAGTTCATGACTCTTCTAAGAAA
CCCTCTCTATCTTGGTGTCTTGTTTGTTGGTTTCTTACTTCTGAAAGCACTCTGGACGCA
ACTGGATATCCCTGGCGAGTTTCGCAATGGTGCACTTCCAGGGCTCATTTCGATATCAGC
AAAGTTTGTTCCCAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4AL24TF U 1
AF RR4AP74TF U 1
BS 1 850 RR4AL24TF
BS 851 855 RR4AP74TF

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TGGATTCAGTAGTGCATTATCTGCTTTTGACATTGAAGAAGAAACAAGAGACAAAATGGT
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CACACCGGTCCAGTGTAAATCTATATGGAGACAGTTCAAGACAGAAACTGAGTATACAGT
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CCCTCTCTATCTTGGTGTCTTGTTTGTTGGTTTCTTACTTCTGAAAGCACTCTGGACGCA
ACTGGATATCCCTGGCGAGTTTCGCAATGGTGCACTTCCAGGGCTCATTTCGATATCAGC
AAAGTTTGTT

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4AP74TF 855 0 0
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GTGATCAAACGTGGACAACAGTAAGAAGCTTCATGGACGTGAAACCGAATCTGCTGTTTC
TGGATTCAGTAGTGCATTATCTGCTTTTGACATTGAAGAAGAAACAAGAGACAAAATGGT
GAAGAGTCTTCAGGAGTATTCAAAAGGTGTCATAGAAACTAAGGCCAAGGAAGAAGCTGG
AAAGGTTTTGATGCGTATGAAAGATAGGTTTGCTACAATCTTCAGCAATGATGCTGATTC
AATGCCTCGTGTTTGGACCGGAAAAGAAGATCTTCGAGCAATTACTAAAGCAGCTAGATC
AGCTTCCTTGAAGTTGCTCTCAGTAATGGCTGTAATGCGATTGAGTGATGAAACCGATAG
CATCGAGAAGACACTAACTGTCGCTCTTTTGGATTCAACAACGTCTAAGAAAAGCATTAC
AGCATCTGATCCATTGGCTTCAAGCACTTGGGATGAGATTCCATCATCAAGAACTTTGAC
CACACCGGTCCAGTGTAAATCTATATGGAGACAGTTCAAGACAGAAACTGAGTATACAGT
GACTCAAGCCATATCTGCACAGGAAGCGAATAAGCGTGGTAATAACTGGTTACCCCCTCC
ATGGGCTATTTTTGCATTGATCATACTTGGATTCAACGAGTTCATGACTCTTCTAAGAAA
CCCTCTCTATCTTGGTGTCTTGTTTGTTGGTTTCTTACTTCTGAA*GCACTCTGGACGCA
ACTGGATATCCCTGGCGAGTTTCGCAATGGTGCACTTCCAGG*CTCATTTCGATATCAGC
AAAGTTTGTTCCCAC

QA 1 855 1 855
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TATTAACACATTTCAATCCCTGTTTAGTTTTCTTTACATTTTGCAGCTCACGGCTTTTGT
AATGCTTTTGAACTGTAGAAGAACAACAGCACTTTATAAATCTTCAATAATTTTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EJ96TF U 1
AF RR4FI67TF U 1
BS 1 424 RR4EJ96TF
BS 425 658 RR4FI67TF

RD RR4EJ96TF 424 0 0
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GTTTGCCTTTCACACAGGTTGTTCTCCATCAACCCTTCTTTACTACTGAACCACTTACCA
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AGACTTCTTCGACTCTCGGAGATGAAAATCTTGATATATACAGGAGTACACTCGCTGCAA
TGAGAGCCATACGAGGGTTGCAAAAGGCCAGCTCGACCTACAATCCTCTATCATTCTCTT
CGCTTCTTAAGAACGAGGATGATGAGACTGTGACAGCTGAAAACTCTCCAAACTCTGAGA
ATCT

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4FI67TF 658 0 0
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GTTTGCCTTTCACACAGGTTGTTCTCCATCAACCCTTCTTTACTACTGAACCACTTACCA
GGTTAGTTCGTGAATGTGAGGCCAATCTTGAGCTCCTCTTCCCATCTGAAGCCGAAGTTG
TGGAGTTTTCTAACGCAGTCTCATCCTCACATCAAAACTACTCACCGAGAATCTCAGCTC
AGACTTCTTCGACTCTCGGAGATGAAAATCTTGATATATACAGGAGTACACTCGCTGCAA
TGAGAGCCATACGAGGGTTGCAAAAGGCCAGCTCGACCTACAATCCTCTATCATTCTCTT
CGCTTCTTAAGAACGAGGATGATGAGACTGTGACAGCTGAAAACTCTCCAAACTCTGAGA
ATCTGCAGAGCAAAGATGAATCAGATAAGGAAGACAATGGACCTTCCCCCTGATGCCTCC
TTGTTGTGATCAAGATTTTGAGAATTTGCTTCTTCTTATCACCCTGACATGTCCTTAAAG
TATTAACACATTTCAATCCCTGTTTAGTTTTCTTTACATTTTGCAGCTCACGGCTTTTGT
AATGCTTTTGAACTGTAGAAGAACAACAGCACTTTATAAATCTTCAATAATTTTGTCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL4942Contig1 449 2 1 U
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ATGACAAAAGCCTTCTCAATACAAGCAACAAGGAATGTTAGTAACTATGTAACAAAACAA
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TGATCTCTCTCTCTTGCATATGGAAATGAAAAGCGCTTTGAAACTTTTGCTTGTAATATT
GAAAACCAAATCATTATGTGTTGTGTTGC


BQ
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AF RR4E631JQ C 1
AF RR4E631TF U 1
BS 1 449 RR4E631TF

RD RR4E631JQ 449 0 0
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ATAAAGAGGAAGCTGAGACTAGAGTTTGTTTAGACTTGAATCTTTCTCTGTAGTTGACGA
ATGACAAAAGCCTTCTCAATACAAGCAACAAGGAATGTTAGTAACTATGTAACAAAACAA
AATGTGCCTTTGGATTCTAATTTTGCTTGAAGGGGAGATGACAGGATATGCAAACGCGCC
GTTGACTGCATCAATGCATCATGTTGCCTGATACATAATCAACCAACCCTTGATCTCTTC
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TGATCTCTCTCTCTTGCATATGGAAATGAAAAGCGCTTTGAAACTTTTGCTTGTAATATT
GAAAACCAAATCATTATGTGTTGTGTTGC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR4E631TF 449 0 0
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ATAAAGAGGAAGCTGAGACTAGAGTTTGTTTAGACTTGAATCTTTCTCTGTAGTTGACGA
ATGACAAAAGCCTTCTCAATACAAGCAACAAGGAATGTTAGTAACTATGTAACAAAACAA
AATGTGCCTTTGGATTCTAATTTTGCTTGAAGGGGAGATGACAGGATATGCAAACGCGCC
GTTGACTGCATCAATGCATCATGTTGCCTGATACATAATCAACCAACCCTTGATCTCTTC
TTCCGTTAAGAAAAGCAACTCGGAGCTGGACAATGGGAAGTGTGTGTTGAACCCTGTTCT
TGATCTCTCTCTCTTGCATATGGAAATGAAAAGCGCTTTGAAACTTTTGCTTGTAATATT
GAAAACCAAATCATTATGTGTTGTGTTGC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL4943Contig1 995 2 2 U
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GGGCCGGAATCGCGATCGACTCCGATATCAGCATCATCGCCGGCTTCGTCTTCCTCGCCG
AGCGGGAAACGAACAAGAGATCCAGAAGACGAGGTCTATCTCGATAATCTCCGCTCCCAA
AAACGTTATCTCAGCGAGATAATGGCTTGCAGTTTAAACGGACTAACCGTGGGAGACTCA
GTCTCCGTCAACATGTTAGACTCTCCTACTCGCTCTGAGTCCTTTCTTTCTCCCAACTAC
CACTACAGGGATGACATGCCATTACAATACTCTCCCATGTCAGAAGACTCGGACGAAGCC
AGATTCTGCGAGGACCCAATAACAAGCACTAGCTCATCTCAACCCGAGAGCCGTCCCACT
AGTCCTGTCTCACCTTACAGATACCAAAGACCTTTTACTTCAACAACCTCATACTATTCA
CATACGTGCCCTGTCTCCATGAGCACTAATGCAACTAGTACTAGTACTACTCCACAGTCT
CGCCAAAGAGGTTCTGATACTGAAGGAAGGTTTCCGTCGTCGCCTAGCGATATCTGCCAT
TCGAGTGATTTGAGAAGGACCGCTCTACTCAGGTCTGTTCAGATGAGAACACAGCCTTGT
GGTCATGCTTCAAGTTCTGGGACGAGCAGTGTTGACGGTGGTGAAGAGAGGATGTGCTTC
AAGTCTATGGAAGAAGATAACAGAGGGGAAGATATCTCTTATACTGAAGTCTCTGGTAAG
AGCAAGTCTTGTAAAGCACTGGACATGAGACTATGTGAAAGATGATGAAATACAATAGTT
TCGATCTCAACAAACGATTTCTTCTGAGATTTATCCACATTATATATATGTTGTGTGGAT
TGCAATGAAGAACACTCCATTAAAGCTCTCATATGTCTATCAATGCATTTGGTTGTGAAT
CCTTTCATCTTCAATGTCATGGAAGATCTTTCACC


BQ
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AF RR4EE89TF U 1
AF RR4EE89JQ C 438
BS 1 697 RR4EE89TF
BS 698 995 RR4EE89JQ

RD RR4EE89TF 703 0 0
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GGGCCGGAATCGCGATCGACTCCGATATCAGCATCATCGCCGGCTTCGTCTTCCTCGCCG
AGCGGGAAACGAACAAGAGATCCAGAAGACGAGGTCTATCTCGATAATCTCCGCTCCCAA
AAACGTTATCTCAGCGAGATAATGGCTTGCAGTTTAAACGGACTAACCGTGGGAGACTCA
GTCTCCGTCAACATGTTAGACTCTCCTACTCGCTCTGAGTCCTTTCTTTCTCCCAACTAC
CACTACAGGGATGACATGCCATTACAATACTCTCCCATGTCAGAAGACTCGGACGAAGCC
AGATTCTGCGAGGACCCAATAACAAGCACTAGCTCATCTCAACCCGAGAGCCGTCCCACT
AGTCCTGTCTCACCTTACAGATACCAAAGACCTTTTACTTCAACAACCTCATACTATTCA
CATACGTGCCCTGTCTCCATGAGCACTAATGCAACTAGTACTAGTACTACTCCACAGTCT
CGCCAAAGAGGTTCTGATACTGAAGGAAGGTTTCCGTCGTCGCCTAGCGATATCTGCCAT
TCGAGTGATTTGAGAAGGACCGCTCTACTCAGGTCTGTTCAGATGAGAACACAGCCTTGT
GGTCATGCTTCAAGTTCTGGGACGAGCAGTGTTGACG
TGGTGA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4EE89JQ 558 0 0
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CATGAGCACTAATGCAACTAGTACTAGTACTACTCCACAGTCTCGCCAAAGAGGTTCTGA
TACTGAAGGAAGGTTTCCGTCGTCGCCTAGCGATATCTGCCATTCGAGTGATTTGAGAAG
GACCGCTCTACTCAGGTCTGTTCAGATGAGAACACAGCCTTGTGGTCATGCTTCAAGTTC
TGGGACGAGCAGTGTTGACGGTGGTGAAGAGAGGATGTGCTTCAAGTCTATGGAAGAAGA
TAACAGAGGGGAAGATATCTCTTATACTGAAGTCTCTGGTAAGAGCAAGTCTTGTAAAGC
ACTGGACATGAGACTATGTGAAAGATGATGAAATACAATAGTTTCGATCTCAACAAACGA
TTTCTTCTGAGATTTATCCACATTATATATATGTTGTGTGGATTGCAATGAAGAACACTC
CATTAAAGCTCTCATATGTCTATCAATGCATTTGGTTGTGAATCCTTTCATCTTCAATGT
CATGGAAGATCTTTCACC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL4944Contig1 449 2 1 U
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TACTTGAACGAAGCCAGAGTGCTTCACAGTTTCATGACCGGGTTTGTGAGCAAGAACCCT
AGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTGATGTGGATATTGGGGTGAATGATCATGGGGAGGAT
AGTTACAAGGAAGGAGAGGTGTATGGAAGGATGTATTTTGGTAAGAACTTTGATCGGTTA
GTGAAGATTAAAACGGCTGTGGATCCAGATAATTTCTTCAGGAATGAGCAGAGTATACCT
ACCTTGCCAAGTAAGGCATAATAAGATACATATATTGTTTATCATTTTGATATAAAGATT
GGTTTTTACTTTTAATGTAATGCTTTGGTGAAGCAATATGGAATGTATGGTTTTGGATAT
TTGTATATTGAAATAGTTTCTATGTATGC


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AF RR4EY43JQ C 1
AF RR4EY43TF U 1
BS 1 449 RR4EY43TF

RD RR4EY43JQ 449 0 0
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TACTTGAACGAAGCCAGAGTGCTTCACAGTTTCATGACCGGGTTTGTGAGCAAGAACCCT
AGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTGATGTGGATATTGGGGTGAATGATCATGGGGAGGAT
AGTTACAAGGAAGGAGAGGTGTATGGAAGGATGTATTTTGGTAAGAACTTTGATCGGTTA
GTGAAGATTAAAACGGCTGTGGATCCAGATAATTTCTTCAGGAATGAGCAGAGTATACCT
ACCTTGCCAAGTAAGGCATAATAAGATACATATATTGTTTATCATTTTGATATAAAGATT
GGTTTTTACTTTTAATGTAATGCTTTGGTGAAGCAATATGGAATGTATGGTTTTGGATAT
TTGTATATTGAAATAGTTTCTATGTATGC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR4EY43TF 449 0 0
GGAACACGAGAGCCAAGAAAGCATCATCCTCTCTCCTCGTCTCCGGAGCTAGAGAAGGGT
TACTTGAACGAAGCCAGAGTGCTTCACAGTTTCATGACCGGGTTTGTGAGCAAGAACCCT
AGAGGTGCTTACTTTAACTACCGTGATGTGGATATTGGGGTGAATGATCATGGGGAGGAT
AGTTACAAGGAAGGAGAGGTGTATGGAAGGATGTATTTTGGTAAGAACTTTGATCGGTTA
GTGAAGATTAAAACGGCTGTGGATCCAGATAATTTCTTCAGGAATGAGCAGAGTATACCT
ACCTTGCCAAGTAAGGCATAATAAGATACATATATTGTTTATCATTTTGATATAAAGATT
GGTTTTTACTTTTAATGTAATGCTTTGGTGAAGCAATATGGAATGTATGGTTTTGGATAT
TTGTATATTGAAATAGTTTCTATGTATGC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL4945Contig1 884 2 6 U
GGACACTCCCCTGAATTTGGTAGATCGTCTTCGTCCACAGGATCGAGATGCGTTCGTTAG
GGTTGATGTTTTGGCGGATCTCGTTTCTTCTGGCGTTATCAATCTCACTCTCAGCTTCAT
CGGATGATCAGTTCACAATCGACGGAACAGTACTCGAACTCACCGACTCCAACTTCGAAT
CCGCGATTTCCACTTTCGATTGCGTCTTCGTCGATTTCTACGCTCCTTGGTGTGGTCACT
GCAAGCGTCTTAACCCTGAGGTCTTCTCTTCTTCTCGATCGATCTACCTTCTTAGATTGC
TTATCGGATTTCGAAATCGTAAAGCTTTAGCTTCGTTATTGATCCTTCTTCTTCTCGATC
TGGTGCAGTTAGATGCAGCTGCTCCTATTCTTGCTAAATTGAAGCAGCCCATCGTCATTG
CAAAGCTTAACGCTGACAAATACTCTCGTCTCGCACGCAAGCTTGAGATCGAGTATGCCT
TCTTTAGCTCTGTATTCTGAAAAGTTTGAATCTTTAGCTTAAAGTAATAGTTTTTTTTAA
AGCTGATCTGCTGTTCTTTAACGCAGTGCATTCCCCACCCTCATGCTCTATAACCATTGG
CCTCCATTAGTTTTCAACCATTTTCGGGCTTATCTGTGTTCGTTTGTCACAGAAGAAAGC
TGCCTGTGTAGTTTGCTAAGAAAGGGTTTTTGTATTCACCTTGCGAAAATAGTTTGTGCG
ACTTAGTGTCTATCCTAGAACCTTAGTTGTGTTTGAACAGTGTAGCAGACTCTATCGACG
ATGTTTTAGAGTTGGAGTTGATGTACATAAAATTGAACAGATGTTTTACTTTTACCTTTT
TGGTGGGTACTGGTTTAAAGAACGTTGTTTTTTCTTTTCTCTTC


BQ
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AF RR4BI75TF U 1
AF RR4BI75JQ C 15
BS 1 811 RR4BI75TF
BS 812 812 RR4BI75JQ
BS 813 826 RR4BI75TF
BS 827 827 RR4BI75JQ
BS 828 867 RR4BI75TF
BS 868 884 RR4BI75JQ

RD RR4BI75TF 867 0 0
GGACACTCCCCTGAATTTGGTAGATCGTCTTCGTCCACAGGATCGAGATGCGTTCGTTAG
GGTTGATGTTTTGGCGGATCTCGTTTCTTCTGGCGTTATCAATCTCACTCTCAGCTTCAT
CGGATGATCAGTTCACAATCGACGGAACAGTACTCGAACTCACCGACTCCAACTTCGAAT
CCGCGATTTCCACTTTCGATTGCGTCTTCGTCGATTTCTACGCTCCTTGGTGTGGTCACT
GCAAGCGTCTTAACCCTGAGGTCTTCTCTTCTTCTCGATCGATCTACCTTCTTAGATTGC
TTATCGGATTTCGAAATCGTAAAGCTTTAGCTTCGTTATTGATCCTTCTTCTTCTCGATC
TGGTGCAGTTAGATGCAGCTGCTCCTATTCTTGCTAAATTGAAGCAGCCCATCGTCATTG
CAAAGCTTAACGCTGACAAATACTCTCGTCTCGCACGCAAGCTTGAGATCGAGTATGCCT
TCTTTAGCTCTGTATTCTGAAAAGTTTGAATCTTTAGCTTAAAGTAATAGTTTTTTTTAA
AGCTGATCTGCTGTTCTTTAACGCAGTGCATTCCCCACCCTCATGCTCTATAACCATTGG
CCTCCATTAGTTTTCAACCATTTTCGGGCTTATCTGTGTTCGTTTGTCACAGAAGAAAGC
TGCCTGTGTAGTTTGCTAAGAAAGGGTTTTTGTATTCACCTTGCGAAAATAGTTTGTGCG
ACTTAGTGTCTATCCTAGAACCTTAGTTGTGTTTGAACAGTGTAGCAGACTCTATCGACG
ATGTTTTAGAGTTGGAGTTGATGTACATAAA*TTGAACAGATGTTT*ACTTTTACCTTTT
TGGTGGGTACTGGTTTAAAGAACGTTG

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR4BI75JQ 870 0 0
ATTTGGTAGATCGTCTTCGTCCACAGGATCGAGATGCGTTCGTTAGGGTTGATGTTTTGG
CGGATCTCGTTTCTTCTGGCGTTATCAATCTCACTCTCAGCTTCATCGGATGATCAGTTC
ACAATCGACGGAACAGTACTCGAACTCACCGACTCCAACTTCGAATCCGCGATTTCCACT
TTCGATTGCGTCTTCGTCGATTTCTACGCTCCTTGGTGTGGTCACTGCAAGCGTCTTAAC
CCTGAGGTCTTCTCTTCTTCTCGATCGATCTACCTTCTTAGATTGCTTATCGGATTTCGA
AATCGTAAAGCTTTAGCTTCGTTATTGATCCTTCTTCTTCTCGATCTGGTGCAGTTAGAT
GCAGCTGCTCCTATTCTTGCTAAATTGAAGCAGCCCATCGTCATTGCAAAGCTTAACGCT
GACAAATACTCTCGTCTCGCACGCAAGCTTGAGATCGAGTATGCCTTCTTTAGCTCTGTA
TTCTGAAAAGTTTGAATCTTTAGCTTAAAGTAATAGTTTTTTTTAAAGCTGATCTGCTGT
TCTTTAACGCAGTGCATTCCCCACCCTCATGCTCTATAACCATTGGCCTCCATTAGTTTT
CAACCATTTTCGGGCTTATCTGTGTTCGTTTGTCACAGAAGAAGGCTGCCTGTGTAGTTT
GCTAAGAAAGGGTTTTTGTATTCACCTTGCGAAAATAGTTTGTGCGACTTAGTGTCTATC
CTAGAACCTTAGTTGTGTTTGAACAGTGTAGCAGACTCTATCGACGATGTTTTAGAGTTG
GAGTTGATGTACATAAAATTGAACAGATGTTTTACTTTTACCTTTTTGGTGGGTACTGGT
TTAAAGAACGTTGTTTTTTCTTTTCTCTTC

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 2

CO CL4946Contig1 1131 2 2 U
GGGGGGATGCCAATGGAGTGTTCCACACGGCAAAACTAGCGGCACATAGCGCACTTAATG
AGGTGATCGTATCAGCCGGGGCCATCGCTAGCCCTCAACTGCTTATGTTGAGTGGTGTTG
GCCCTGCGTCTCATCTAGCAGACCATGGAGTGGAACCGGTAATCCTAGATCAACCCATGG
TGGGACAAGGAATGTGTGATAATCCGATGAACGCTGTCCTCATCCCATCCCCGGAACCCG
TAGAAGTGTCCCTTGTCCAAGTCGCTGGAATCCCCCATTTTGGTAGTTACATTGAAGGCG
GGAGTGGGTTAAGTCTCTCTATTAGTTTGACGCATAGCTTCTTCAGTGCTGTTATAAATG
TTCTCAATGAGATGAAACTTCCCACCAAAACCCTCTCACGCTTTTTCAAGCTATTGGATC
TTCGAGTTAATGTGACAACACAAGCAGGTGGGATGGTTCAGAAAGTTGATTGGCCGATCT
CGAGAGGTCATTTGGAACTGCGGAACACGAATCCAGACGATAATCCTTCAGTCACATTTA
ACTACTACCAAGAACAAGAAGATTTGAATAACTGTGTTGAAGGACTTAGTACTATAATTA
AAGTGATGGATTCGAAGAAGTACTCCAAGTACATGTTACCTGGAGTGACCGGACGGGGAT
TGTTAGATTTCATTCTTGGTCTGCCCATCAATGTGAGGCAAAGGCACATACAATCATTGT
TCGATTTGAAGCAATATTGTAAAGATACGGTGATGACTATTTATCATTACCATGGAGGTT
GTCAAGTTGGAAAAGTGGTCGACAATGATTACAAAGTATTAGGGACTGATGCTTTGAGGG
TCATTGATGCCTCCACGTTTCTCAAGACCCCAGGGACTAATCCTCAAGCTACGATCATGA
TGCTCGGTAGGTATATGGTGCAGAAGATTCTTCGAGAGAGAGCGGATTTTCTGGAAACTA
AAGAAGAAGCATGATTATGTAAATTTGCTCAGAAGTATTTGTTATCGGAGATTGCTTCTG
CAAGATCACATATTGCAAGTGCATTTTCGCTTGTACGTGATGTAATGTTTTTTGCTAAAA
CTTTTTCTATTAAAACGTGATGTAATGTTATATAAGAAAAAAATTACATCC


BQ
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AF RR4FW83TF U 1
AF RR4FW83JQ C 425
BS 1 698 RR4FW83TF
BS 699 1131 RR4FW83JQ

RD RR4FW83TF 698 0 0
GGGGGGATGCCAATGGAGTGTTCCACACGGCAAAACTAGCGGCACATAGCGCACTTAATG
AGGTGATCGTATCAGCCGGGGCCATCGCTAGCCCTCAACTGCTTATGTTGAGTGGTGTTG
GCCCTGCGTCTCATCTAGCAGACCATGGAGTGGAACCGGTAATCCTAGATCAACCCATGG
TGGGACAAGGAATGTGTGATAATCCGATGAACGCTGTCCTCATCCCATCCCCGGAACCCG
TAGAAGTGTCCCTTGTCCAAGTCGCTGGAATCCCCCATTTTGGTAGTTACATTGAAGGCG
GGAGTGGGTTAAGTCTCTCTATTAGTTTGACGCATAGCTTCTTCAGTGCTGTTATAAATG
TTCTCAATGAGATGAAACTTCCCACCAAAACCCTCTCACGCTTTTTCAAGCTATTGGATC
TTCGAGTTAATGTGACAACACAAGCAGGTGGGATGGTTCAGAAAGTTGATTGGCCGATCT
CGAGAGGTCATTTGGAACTGCGGAACACGAATCCAGACGATAATCCTTCAGTCACATTTA
ACTACTACCAAGAACAAGAAGATTTGAATAACTGTGTTGAAGGACTTAGTACTATAATTA
AAGTGATGGATTCGAAGAAGTACTCCAAGTACATGTTACCTGGAGTGACCGGACGGGGAT
TGTTAGATTTCATTCTTGGTCTGCCCATCAATGTGAGG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4FW83JQ 707 0 0
AGTTAATGTGACAACACAAGCAGGTGGGATGGTTCAGAAAGTTGATTGGCCGATCTCGAG
AGGTCATTTGGAACTGCGGAACACGAATCCAGACGATAATCCTTCAGTCACATTTAACTA
CTACCAAGAACAAGAAGATTTGAATAACTGTGTTGAAGGACTTAGTACTATAATTAAAGT
GATGGATTCGAAGAAGTACTCCAAGTACATGTTACCTGGAGTGACCGGACGGGGATTGTT
AGATTTCATTCTTGGTCTGCCCATCAATGTGAGGCAAAGGCACATACAATCATTGTTCGA
TTTGAAGCAATATTGTAAAGATACGGTGATGACTATTTATCATTACCATGGAGGTTGTCA
AGTTGGAAAAGTGGTCGACAATGATTACAAAGTATTAGGGACTGATGCTTTGAGGGTCAT
TGATGCCTCCACGTTTCTCAAGACCCCAGGGACTAATCCTCAAGCTACGATCATGATGCT
CGGTAGGTATATGGTGCAGAAGATTCTTCGAGAGAGAGCGGATTTTCTGGAAACTAAAGA
AGAAGCATGATTATGTAAATTTGCTCAGAAGTATTTGTTATCGGAGATTGCTTCTGCAAG
ATCACATATTGCAAGTGCATTTTCGCTTGTACGTGATGTAATGTTTTTTGCTAAAACTTT
TTCTATTAAAACGTGATGTAATGTTATATAAGAAAAAAATTACATCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL4947Contig1 475 2 1 U
AATTTGTAAAGTCTCTTCTTTTATGGGTTTTGCAGATTCCTCGAAGCAGTTTGGTTAAAA
GTAAAATGGTTGTGGTTGGGAATGTTTCTGCAGCGAATTTGCCTTATCAATATGGGTTTT
TGAAGGCAATTTCATCTGGTGGTTGTGATTTAATGGGACACCGCAGTTTCAAAATTTCAA
CTTGTTCACAAGCTCTTAAGACAAGAACAAGGAGGAGTGCTGGTCCTTTGAAGGTAGTTT
GTGTGAATATACCAAGGCCAGAGCTAGAGAACACTGTCAACTTCTTAGAAGCTGCAAGTT
TGCCTGCATCTTTCCGTAGTGCTCCTCGTCCTGCGAAGCCTTTAAAAGTTGTGATCGCTG
GTGCTGGGTTGGCTGGATTGTCAACAGCAAAGTACCTGGCTGATGCAGGACATATACCTC
TGTTGCTCGAAGCAAGAGATGTTCTTGGTGGAAAGATAGCTGCATGGAAGGATGA


BQ
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AF RR4C101TF U 1
AF RR4C391TF U 1
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QA 1 475 1 475
DS 

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TGAAGGCAATTTCATCTGGTGGTTGTGATTTAATGGGACACCGCAGTTTCAAAATTTCAA
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GTGTGAATATACCAAGGCCAGAGCTAGAGAACACTGTCAACTTCTTAGAAGCTGCAAGTT
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TGTTGCTCGAAGCAAGAGATGTTCTTGGT

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4EG25TF U 1
AF RR4EG25JQ C 274
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BS 710 841 RR4EG25JQ

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GAGCATTCGCAAAAGTAAGACGCTTTGGAGAATGGTATGGGACATTTTCCAAATGTGTAA
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CACTTGTG

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DS 

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GTTTTGCTAGTTTTTTTCACTTGTGGTGATGGTTTGGTTTTAATGAGGCTGTGTGGGGTT
TCATTGTAATTTGGATCATTGCCTTCCCAAATTATAGTGTCATGTGTGATGTGACATTCA
AATATTTAAATTAGCAAATATTAGTTAC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

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CTCTGAGCCACTGAAGAGAAGTTGTCAAAGAGGCTGTCATCACGCCCATCGTACATCAAG
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TCTGCAGCTATTGTGCCACATATTTGGGCTAGTTTGAGGTCTCCATGCTCTTTAGCATGG
CGTGCTGTGTTTCCGTGAGAGACGA


BQ
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AF RR4CD50JQ U 1
AF RR4GD07JQ U 44
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BS 513 513 RR4GD07JQ
BS 514 521 RR4CD50JQ
BS 522 522 RR4GD07JQ
BS 523 566 RR4CD50JQ
BS 567 567 RR4GD07JQ
BS 568 805 RR4CD50JQ

RD RR4CD50JQ 805 0 0
TCTTGAAGCAAGTTTCTTATTAATGGATAAAGAAGTTCTCTCTGCAATGAACTGAAACAA
AACTCCAGAGTGAAAACTGAGTACAGACCAAACAGTGCAACTGTTCAACTACAAGAAGTT
TACTCAAAGGACCAAACACAAAACATATAGAGACTTGAAAAGAAAAAACAAAGCTACTAA
ATCACTGCTTCTCAGCTTTGTAACTAGACCCACGAACATTATCACAAACCATAGTAATCT
ACACCAATTTCAAGAGCAGACAGATCAAATGAGGAGCGGAAAGGAAGAGGGTTTCATGTC
TGAGTCCCGTTTTAAAGCTGCACTTCTCTGTCATGTATCCAGCTGAAAGGAATCTTGGGT
CCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCATCCAACCTCCTGATTCTCGGAGTCAGCCCA
CATAAGTAGTCTTGTGCTTTGTTTCCTTCACCCGAAAGCCCCTTTAAGTTCTCGATCTTC
CACCTCCCAACCAAAAACTCAAGAATGTCTGCGTAGTCTTTGGCAGTGTAAACACCGAGC
CTCTGAGCCACTGAAGAGAAGTTGTCGAAGAGGCTGTCATCACGCCCATCGTACATCAAG
TGAGCAGGCATCGAGATTTTCTTTCTCATCATGTCTGCAAACGCCATGACAGTACCATCA
GGATCAATCTCAAAGAGCTTCTCAACTATCTTGGTGTAAGCGGTCTCGTGACGCTTCTCG
TCTGCAGCTATTGTGCCACATATTTGGGCTAGTTTGAGGTCTCCATGCTCTTTAGCATGG
CGTGCTGTGTTTCCGTGAGAGACGA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4GD07JQ 756 0 0
A
CAATGAACTGAAACAAAACTCCAGAGTGAAAACTGAGTACAGACCAAACAGTTCAACTGT
TCAACTACAAGAAGTTTACTCAAAGAACCAAACACAAAACATATAGAGACTTGAAAGAAA
AAAACAAAGCTACTAAATCACTGCTTCTCAGCTTTGTAACTAGACCCACGGACATTATCA
CAAACCATAGTAATCTACACCAATTTCAAGAGCAGACAGATCAAATGAGGAGCGGAGAGG
AAGAGG*TTTCATGTCTGAGTCCCGTTTTAAAGCTGCACTTCTCTGTCATGTATCCAGCT
GAAAGGAATCTTGGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCATCCAACCTCCTGAT
TCTCGGAGTCAGCCCACATAAGTAGTCTTGTGCTTTGTTTCCTTCACCCGAAAGCCCCTT
TAAGTTCTCAATCTTCCACCTCCCAACCAAAAACTCAAGAATGTCCGCATAGTCTTTAGC
AGTGTAAACACCGAGCCTCTGAGCCACTGAAGAGAAGTTGTCAAAGAGGCTGTCATCACG
CCCATCGTACATCAAGTGAGCAGGCATCGAGATTTTCTTTCTCATCATGTCTGCAAACGC
CATGACAGTACCATCAGGATCAATCTCAAAGAGCTTCTCAACTATCTTGGTGTAAGCGGT
CTCGTGACGCTTCTCGTCTGCAGCTATTGTGCCACATATTTGGGCTAGTTTGAGGTCTCC
ATGCTCTTTAGCATGGCGTGCTGTGTTTCCGTGAG

QA 2 756 2 756
DS 



AS 1 2

CO CL4950Contig1 693 2 1 U
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GTAAAGGGAGAGTGAGTGTGGATTTGAGTGTAATCGAGGAGGAGATAGAGAGAGAAACAT
CGTCGCTGGGCGTTCTTTCGGATCCAATGCGAATAAAGGCATTGTATTCAATCTAAATCG
GAAAAAAATATGAAAGGCGGAGGAGGAAGCGTCGGAGGAGGAGGAGGAAAACGCCGGTGG
AATGTTCTGGTGATTGGAGTGTTGGTTCTTGTAATCCTATCGATGCTGGTTCCTCTTGCT
TTCTTGCTCGGCCTTCACAACACCTTTCACTCTCCTGGGATTGTCACTGTCCAGCCTTCT
TCTCCTTTCGAGAGAAGCCGAATCAACGCTACCAAACATTCCCAGACAGATCTGTCTGAA
AGAGTCGACCAAGTTCTCCAGCAAATCAATCCAGTGCTTCCCAAGAAAACCGAGATTACC
GAAGGTTACAGAGATATGAATAGCACAAGCATCAGTGATTCTAAAAACAGAGACACCCAA
ACGATAAAAAACGCAGCCACATTGCACTACAATGGGAACATGAAGCCGTGGCTAGAGCTG
GGAATCCCACAGTACAAAGACTTTTGGAGAAATCATCTGAATCGAGAAGATCGATTCTTG
AGTGACTGTAACGTGAACCCTTGATGAGAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FP32TF U 1
AF RR4FP32JQ C 229
BS 1 693 RR4FP32TF

RD RR4FP32TF 693 0 0
GGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGAAGCGAGGGGAGAGAGAGAGAGAGACATTGCAATCGT
GTAAAGGGAGAGTGAGTGTGGATTTGAGTGTAATCGAGGAGGAGATAGAGAGAGAAACAT
CGTCGCTGGGCGTTCTTTCGGATCCAATGCGAATAAAGGCATTGTATTCAATCTAAATCG
GAAAAAAATATGAAAGGCGGAGGAGGAAGCGTCGGAGGAGGAGGAGGAAAACGCCGGTGG
AATGTTCTGGTGATTGGAGTGTTGGTTCTTGTAATCCTATCGATGCTGGTTCCTCTTGCT
TTCTTGCTCGGCCTTCACAACACCTTTCACTCTCCTGGGATTGTCACTGTCCAGCCTTCT
TCTCCTTTCGAGAGAAGCCGAATCAACGCTACCAAACATTCCCAGACAGATCTGTCTGAA
AGAGTCGACCAAGTTCTCCAGCAAATCAATCCAGTGCTTCCCAAGAAAACCGAGATTACC
GAAGGTTACAGAGATATGAATAGCACAAGCATCAGTGATTCTAAAAACAGAGACACCCAA
ACGATAAAAAACGCAGCCACATTGCACTACAATGGGAACATGAAGCCGTGGCTAGAGCTG
GGAATCCCACAGTACAAAGACTTTTGGAGAAATCATCTGAATCGAGAAGATCGATTCTTG
AGTGACTGTAACGTGAACCCTTGATGAGAAAGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4FP32JQ 465 0 0
AAACGCCGGTGGAATGTTCTGGTGATTGGAGTGTTGGTTCTTGTAATCCTATCGATGCTG
GTTCCTCTTGCTTTCTTGCTCGGCCTTCACAACACCTTTCACTCTCCTGGGATTGTCACT
GTCCAGCCTTCTTCTCCTTTCGAGAGAAGCCGAATCAACGCTACCAAACATTCCCAGACA
GATCTGTTTGAAAGAGTCGACCAAGTTTTCCAGCAAATCAATCCAGTGCTTCCCAAGAAA
ACCGAGATTACCGAAGGTTACAGAGATATGAATAGCACAAGCATCAGTGATTCTAAAAAC
AGAGACACCCAAACGATAAAAAACGCAGCCACATTGCACTACAATGGGAACATGAAGCCG
TGGCTAGAGCTGGGAATCCCACAGTACAAAGACTTTTGGAGAAATCATTTGAATCGAGAA
GATCGATTCTTGAGTGACTGTAACGTGAACCCTTGATGAGAAAGT

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL4951Contig1 712 2 1 U
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CAGTGATTTACCGTTGCAGCATTATTGGATACCAAGATGCTCTCTACGTACATTCTAACC
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CTGTGATCTTACAGAGCTGTAACATCTACGCGCGTAAGCCAATGCCTCAGCAGAAGATCA
CCATCACGGCTCAGAACCGGAAAGACCCGAACCAGAACACGGGGATCTCGATCCACGCTT
GTAAGCTACTGGCCACGGCTGATCTTGAAGCCTCAAAAGGTAGTTATCCGACGTATCTCG
GCCGTCCATGGAAGTTATACTCTAGAGTTGTGTACATGATGTCGGATATGGGGGACCATA
TTAACCCGAGAGGATGGTTGGAGTGGAACGGTCCGTTTGCGTTGGACTCTTTGTACTACG
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ATCACGTTATTACTTCAACAATCGAGGCAAGTAAGTTCACGGTGGGTCAGTTCATTGGAG
GTTCATCGTGGTTACCATCCACTGGCGTGACAACAAATAATTACGTCTTATCTGTACGAT
GATGATGTGTTAATTATCACTGCTTATCAATGAATTGTTCCTTTGATGAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A614JQ C 1
AF RR4A614TF U 1
BS 1 712 RR4A614TF

RD RR4A614JQ 712 0 0
GGAATTACGCCGGACCGGGGAAGCACCAGGCTGTGGCACTCCGTGTCGGAGGAGACCACG
CAGTGATTTACCGTTGCAGCATTATTGGATACCAAGATGCTCTCTACGTACATTCTAACC
GGCAGTTTTACCGCGAATGCGACATTTATGGAACGGTCGATTTTATATTCGGAAACGCAG
CTGTGATCTTACAGAGCTGTAACATCTACGCGCGTAAGCCAATGCCTCAGCAGAAGATCA
CCATCACGGCTCAGAACCGGAAAGACCCGAACCAGAACACGGGGATCTCGATCCACGCTT
GTAAGCTACTGGCCACGGCTGATCTTGAAGCCTCAAAAGGTAGTTATCCGACGTATCTCG
GCCGTCCATGGAAGTTATACTCTAGAGTTGTGTACATGATGTCGGATATGGGGGACCATA
TTAACCCGAGAGGATGGTTGGAGTGGAACGGTCCGTTTGCGTTGGACTCTTTGTACTACG
GTGAGTATATGAACCGAGGACCGGGAGCAGGTTTGGGTCAACGGGTCAAGTGGCCTGGTT
ATCACGTTATTACTTCAACAATCGAGGCAAGTAAGTTCACGGTGGGTCAGTTCATTGGAG
GTTCATCGTGGTTACCATCCACTGGCGTGACAACAAATAATTACGTCTTATCTGTACGAT
GATGATGTGTTAATTATCACTGCTTATCAATGAATTGTTCCTTTGATGAACT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4A614TF 712 0 0
GGAATTACGCCGGACCGGGGAAGCACCAGGCTGTGGCACTCCGTGTCGGAGGAGACCACG
CAGTGATTTACCGTTGCAGCATTATTGGATACCAAGATGCTCTCTACGTACATTCTAACC
GGCAGTTTTACCGCGAATGCGACATTTATGGAACGGTCGATTTTATATTCGGAAACGCAG
CTGTGATCTTACAGAGCTGTAACATCTACGCGCGTAAGCCAATGCCTCAGCAGAAGATCA
CCATCACGGCTCAGAACCGGAAAGACCCGAACCAGAACACGGGGATCTCGATCCACGCTT
GTAAGCTACTGGCCACGGCTGATCTTGAAGCCTCAAAAGGTAGTTATCCGACGTATCTCG
GCCGTCCATGGAAGTTATACTCTAGAGTTGTGTACATGATGTCGGATATGGGGGACCATA
TTAACCCGAGAGGATGGTTGGAGTGGAACGGTCCGTTTGCGTTGGACTCTTTGTACTACG
GTGAGTATATGAACCGAGGACCGGGAGCAGGTTTGGGTCAACGGGTCAAGTGGCCTGGTT
ATCACGTTATTACTTCAACAATCGAGGCAAGTAAGTTCACGGTGGGTCAGTTCATTGGAG
GTTCATCGTGGTTACCATCCACTGGCGTGACAACAAATAATTACGTCTTATCTGTACGAT
GATGATGTGTTAATTATCACTGCTTATCAATGAATTGTTCCTTTGATGAACT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL4952Contig1 455 2 1 U
GCCTTGTACAAAGTTTGCCAAGGGTTTACCGGGAAAGTCATCTCACATGAGTTGAAACAA
GTAGCCGAAGAGGTGAGAGATGGTATAAGAGACAAGATATTAGGCATCCCAATGTTTGTT
CAAGTTTACAGCGAAATCAAAAAGAGCTTGGAAGCGAAAAGGGAGAAGAGAAAACGGGAG
GAGAAGATAATGGCAGTGATAAACCCTGAGAGAAACGCAAAGAGGAAGCTGAAGCTAGCC
TCCAAGAACAAGGCTAACAAGAAGAGGAGGACTATGAACAGTAAGATGGATAGATGGTCA
CGCTCTTGAGCTCCCATAATGTCCTAGCTTTTTTATTTTATATAAAAAGCTTATATCACC
AAATACACTTGTTATTTCATATTTAGGTTACAACTTCAGTTTTTAGGTTTGTATGTCTTG
TTTCCTACTATTATTTTAATTTTTTTTTTGGGACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D447TF U 1
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CAAGTTTACAGCGAAATCAAAAAGAGCTTGGAAGCGAAAAGGGAGAAGAGAAAACGGGAG
GAGAAGATAATGGCAGTGATAAACCCTGAGAGAAACGCAAAGAGGAAGCTGAAGCTAGCC
TCCAAGAACAAGGCTAACAAGAAGAGGAGGACTATGAACAGTAAGATGGATAGATGGTCA
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AAATACACTTGTTATTTCATATTTAGGTTACAACTTCAGTTTTTAGGTTTGTATGTCTTG
TTTCCTACTATTATTTTAATTTTTTTTTTGGGACC

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DS 

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TAGCCGAAGAGGTGAGAGATGGTATAAGAGACAAGATATTAGGCATCCCAATGTTTGTTC
AAGTTTACAGCGAAATCAAAAAGAGCTTGGAAGCGAAAAGGGAGAAGAGAAAACGGGAGG
AGAAGATAATGGCAGTGATAAACCCTGAGAGAAACGCAAAGAGGAAGCTGAAGCTAGCCT
CCAAGAACAAGGCTAACAAGAAGAGGAGGACTATGAACAGTAAGATGGATAGATGGTCAC
GCTCTTGAGCTCCCATAATGTCCTAGCTTTTTTATTTTATATAAAAAGCTTATATCACCA
AATACACTTGTTATTTCATATTTAGGTTACAACTTCAGTTTTTAGGTTTGTATGTCTTGT
TTCCTACTATTATTTTAATTTTTTTTTTGGGACC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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AAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGTATAAGACAACGTCCTTGGGGAAAATGGGCT
GCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCAAGAGTGTGGCTTGGAACTTTCAAAACTGCC
GAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCAGCTCGTAGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAG
GTGAATTTCCCAGAGGAGAACCCACTTGCCAACAAGGTGGCTAAACCTAACCCAAACCCA
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GAGGTTAACAGCAGCAACAACAACAACAATCAATTTGGTAATGGGTATCATCAGTTATTC
AGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCTGAGTTTGGTTGGAACGATCAAGCT
CCTATAACTCCTGAGATCTCTTCTGCGTTTATCAACAACAACAACTCTGCTCTATTCGTT
GAGGAAGCTGATCCAGCTAAGAAATTTAAGGCCATGGATTTCGAGACACCTTACAACAAC
ACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAAGACGCCGCCGACTCAGGACAATGG
TACAAACCCTATGGAACTATGGAGCATTGATGAGATCGATTCCATGATTGGAGGAGTCTT
CTGAAGAGATCCGTTGTCATTTAAAACATTTTGAACTCTTTCTGGTGGTCTTTTGTATTC
GCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGCGCACCCAAGCGTCTCCCTTAAACATTGTCATAA
CTCATAAGTTAATATGTTG


BQ
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AF RR4DT33TF U 1
AF RR4DT33JQ C 171
BS 1 623 RR4DT33TF
BS 624 919 RR4DT33JQ

RD RR4DT33TF 623 0 0
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AAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGTATAAGACAACGTCCTTGGGGAAAATGGGCT
GCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCAAGAGTGTGGCTTGGAACTTTCAAAACTGCC
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GAGGTTAACAGCAGCAACAACAACAACAATCAATTTGGTAATGGGTATCATCAGTTATTC
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QA 1 623 1 623
DS 

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GGAGAAACAAGAGGTTAACAGCAGCAACAACAACAACAATCAATTTGGTAATGGGTATCA
TCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCTGAGTTTGGTTGGAA
CGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTCTTCTGCGTTTATCAACAACAACAACTCTGC
TCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCTAAGAAATTTAAGGCCATGGATTTCGAGACACC
TTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAAGACGCCGCCGACTC
AGGACAATGGTACAAACCCTATGGAACTATGGAGCATTGATGAGATCGATTCCATGATTG
GAGGAGTCTTCTGAAGAGATCCGTTGTCATTTAAAACATTTTGAACTCTTTCTGGTGGTC
TTTTGTATTCGCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGCGCACCCAAGCGTCTCCCTTAAAC
ATTGTCATAACTCATAAGTTAATATGTTG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4954Contig1 665 2 2 U
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CAAAGGGTTAACATGGCAGATGACAAAGAGAAGAGGAGATCGTGAAGTCCACAAGATAAC
GGAAGAAAAACCTGGATGGTGCTCAGATCCTCACCTCCCTCCATGTGCTGCATTCGTTGA
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CGAGAAGATAGGTGTAGTAGATTCTCAGTGGATCATTCATCAAACTGTCCCTTCCCTTGG
CAGCCAAGGTGAGGCAGTAGATGGAAAAGCACCGTGGCAAGGGGTGAGGGACAGATGCAA
AAAGTAGTGGACCATGTTCCGGAGTAGAATGGCTAACGCAGAAAAGGATTATTTCAAATC
TTTACAAGTTGAAAGCTCCTCCAATTCAACTGCAACCACCGTTTAAATAGGAGAGAGTTG
TTAAAATAGTCAGGCCGAGACCGCTGACAGATAGAGTTTACAGAGTGTATTTGCGTTTAC
ATATATAGTTATGTATATGATAATGTAGTGGATACTCATGTCTTAGCTTACAACAAAATC
TTCCA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4AH53TF U 1
AF RR4AH53JQ C 23
BS 1 125 RR4AH53TF
BS 126 665 RR4AH53JQ

RD RR4AH53TF 125 0 0
ACATAAAAGCTGGTGAGGAAGCATGGCCTTTGAGATTTCCCAACCTGGCTTGGAACCAAA
CAAAGGGTTAACATGGCAGATGACAAAGAGAAGAGGAGATCGTGAAGTCCACAAGATAAC
GGAAG

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR4AH53JQ 643 0 0
CATGCCC
TTGAGATTTCCCAACCTGGCTTGGAACCAAACAAAGGGTTAACATGGCAGATGACAAAGA
GAAGAGGAGATCGTGAAGTCCACAAGATAACGGAAGAAAAACCTGGATGGTGCTCAGATC
CTCACCTCCCTCCATGTGCTGCATTCGTTGAGATCATGGCTCCTGTATTTTCAATAGACG
CCTGGAGATGCGTGTGGCATATGATCCAGAATGATTTGGTTCACGGTTGGGGACTTGACT
TTGCACTCAGAAGATGTGCTGAGCCTGCACACGAGAAGATAGGTGTAGTAGATTCTCAGT
GGATCATTCATCAAACTGTCCCTTCCCTTGGCAGCCAAGGTGAGGCAGTAGATGGAAAAG
CACCGTGGCAAGGGGTGAGGGACAGATGCAAAAAGTAGTGGACCATGTTCCGGAGTAGAA
TGGCTAACGCAGAAAAGGATTATTTCAAATCTTTACAAGTTGAAAGCTCCTCCAATTCAA
CTGCAACCACCGTTTAAATAGGAGAGAGTTGTTAAAATAGTCAGGCCGAGACCGCTGACA
GATAGAGTTTACAGAGTGTATTTGCGTTTACATATATAGTTATGTATATGATAATGTAGT
GGATACTCATGTCTTAGCTTACAACAAAATCTTCCA

QA 8 643 8 643
DS 



AS 1 2

CO CL4955Contig1 1336 2 6 U
GGAGACATTTGTATCGATTTTGAGATCAAGAGATTCATCGAACCGTATCGTGCCTGTATC
CGGAAGAAATACGTCTCCTTTATCTGTTACTCTCAGATTATAGTTTCATAAATGGCGTAC
GAGAAAGAGCTTGATGCCGCTAAGAAAGCTTCTTCACTCGCAGCTCGCCTCTGTCAGAAA
GTTCAAAAGGCTTTGTTGCAGTCTGATGTTCAATCAAAATCTGATAAAAGTCCAGTCACC
GTTGCTGATTATGGTTCACAAGCAGTTGTTAGTTTACTCTTACAAAGAGAACTCAGCTCT
GAACCATTTTCACTGGTCGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTCCGAAAGGATGGTTCTCAG
GATATTCTTGAGCGCATCACCAAACTCGTCAACGACGCTTTGGCTAATGAGGATCTACTC
AAACCCATTGACTCTGCTTTATCAACAGATGATCTTCTCAGAGCCATTGACTGCGGCACA
TCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTAAAGGA
TTTTTGAGGGGGAGATCAGTACGCAGTAGCGCTAGGATTGCTAGAGGAAGGGAAAAGTAG
TGTTAGGTGTGCTCGCTTGTCCAAATTTGCCATTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCAACA
AGCACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAGGAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAA
TCGGTTCAGGGACATACATGCAGCCTTTGGATTCGAGATCTGATCCAGTCAAAGTACATG
TCTCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCCTTCTTTGAATCATTTGAAGGAGCTCACC
CTCTTCATGATCTATCCAGCTCCATTGCCAATAAACTTGGTGTGAAAGCGCCACCAGTGC
GTATCGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTATCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTGA
GGTTTCCTCATAAAGGATACCGCGAGAAGATTTGGGACCATGTAGCTGGTGCTATAGTTG
TTACAGAGGCTGGTGGGATCGTGACGGATGCAGGTGGAAAGGCATTGGATTTCTCGAAAG
GGAAGTATCTTGATTTGGACACAGGGATTATTGTTGCTAATGAGAAGCTAATGCCTCTGC
TTTTGAAAGCTGTTCGTGACTCCATCGCTGAGCAAGAGAAAGAAGCTTCATCTCTCTGAT
TCTTTCCTTTGTAACTCATTGTGTCTTTTCACCACCACCAGAAGGAATAATGTTTCATTA
CACACTGAGAGTCTTCTTTGGTGTCTTTTATTTATGTGCAATAATATTATTCTCTCAATA
TTCACTTTATAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B250TF U 1
AF RR4B250JQ C 393
BS 1 551 RR4B250TF
BS 552 552 RR4B250JQ
BS 553 595 RR4B250TF
BS 596 596 RR4B250JQ
BS 597 829 RR4B250TF
BS 830 1336 RR4B250JQ

RD RR4B250TF 829 0 0
GGAGACATTTGTATCGATTTTGAGATCAAGAGATTCATCGAACCGTATCGTGCCTGTATC
CGGAAGAAATACGTCTCCTTTATCTGTTACTCTCAGATTATAGTTTCATAAATGGCGTAC
GAGAAAGAGCTTGATGCCGCTAAGAAAGCTTCTTCACTCGCAGCTCGCCTCTGTCAGAAA
GTTCAAAAGGCTTTGTTGCAGTCTGATGTTCAATCAAAATCTGATAAAAGTCCAGTCACC
GTTGCTGATTATGGTTCACAAGCAGTTGTTAGTTTACTCTTACAAAGAGAACTCAGCTCT
GAACCATTTTCACTGGTCGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTCCGAAAGGATGGTTCTCAG
GATATTCTTGAGCGCATCACCAAACTCGTCAACGACGCTTTGGCTAATGAGGATCTACTC
AAACCCATTGACTCTGCTTTATCAACAGATGATCTTCTCAGAGCCATTGACTGCGGCACA
TCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTAAAGGA
TTTTTGAGGGG*AGATCAGTACGCAGTAGCGCTAGGATTGCTAGAGGAAGGGAAA*GTAG
TGTTAGGTGTGCTCGCTTGTCCAAATTTGCCATTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCAACA
AGCACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAGGAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAA
TCGGTTCAGGGACATACATGCAGCCTTTGGATTCGAGATCTGATCCAGTCAAAGTACATG
TCTCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCCTTCTTTGAATCATTTGA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4B250JQ 944 0 0
CGACGCTTTGGCTAATGAGGATCTACTCAAACCCATTGACTCTGCTTTATCAACAGATGA
TCTTCTCAGAGCCATTGACTGCGGCACATCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGT
CTTGGACCCCATTGATGGCACTAAAGGATTTTTGAGGGGGAGATCAGTACGCAGTAGCGC
TAGGATTGCTAGAGGAAGGGAAAAGTAGTGTTAGGTGTGCTCGCTTGTCCAAATTTGCCA
TTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCAACAAGCACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAG
GAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAATCGGTTCAGGGACATACATGCAGCCTTTGGAT
TCGAGATCTGATCCAGTCAAAGTACATGTCTCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCC
TTCTTTGAATCATTTGAAGGAGCTCACCCTCTTCATGATCTATCCAGCTCCATTGCCAAT
AAACTTGGTGTGAAAGCGCCACCAGTGCGTATCGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTA
TCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTGAGGTTTCCTCATAAAGGATACCGCGAGAAGATT
TGGGACCATGTAGCTGGTGCTATAGTTGTTACAGAGGCTGGTGGGATCGTGACGGATGCA
GGTGGAAAGGCATTGGATTTCTCGAAAGGGAAGTATCTTGATTTGGACACAGGGATTATT
GTTGCTAATGAGAAGCTAATGCCTCTGCTTTTGAAAGCTGTTCGTGACTCCATCGCTGAG
CAAGAGAAAGAAGCTTCATCTCTCTGATTCTTTCCTTTGTAACTCATTGTGTCTTTTCAC
CACCACCAGAAGGAATAATGTTTCATTACACACTGAGAGTCTTCTTTGGTGTCTTTTATT
TATGTGCAATAATATTATTCTCTCAATATTCACTTTATAGATCC

QA 1 944 1 944
DS 



AS 1 2

CO CL4956Contig1 453 2 1 U
GGGAATCGCCCTCAGATTCTGTATCATCTCTTCCAGTTCCGTGTAGAATCTCACATTCTC
CGGATCCTTAACTTTGATGTGATTAGGGATGCGAGAGATGTGGATAGGTACCTTGTTATT
GATATTAACTACTTTCCTGGGTATGCTAAGATGCCGTGTTATGAGCCTGTGTTGACGGAC
TTCTTCTGGGACATGGTCACAAAGAAGAAGAGTCATGTCTGAGAGAACTATCTGCCAAGT
TGTTTTAGCGGGTACATTCCTTAGGGAGGGTTTCTACTATCTCAATCTGCCCTGCTAATT
TTCATTTGGATTATTGAACTTGTGCTTCTTTTTTTTTTGTTATTGTTTCTTGGATGTTAT
TCTCTTGTTTACTTCCAAGTTTTGCAAAGCCTTGTTCATTGTTCAGATGCATAACTGTTG
CTACTATTGAGAAATGAGAATCGTTGGATTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F769JQ C 1
AF RR4F769TF U 1
BS 1 453 RR4F769TF

RD RR4F769JQ 453 0 0
GGGAATCGCCCTCAGATTCTGTATCATCTCTTCCAGTTCCGTGTAGAATCTCACATTCTC
CGGATCCTTAACTTTGATGTGATTAGGGATGCGAGAGATGTGGATAGGTACCTTGTTATT
GATATTAACTACTTTCCTGGGTATGCTAAGATGCCGTGTTATGAGCCTGTGTTGACGGAC
TTCTTCTGGGACATGGTCACAAAGAAGAAGAGTCATGTCTGAGAGAACTATCTGCCAAGT
TGTTTTAGCGGGTACATTCCTTAGGGAGGGTTTCTACTATCTCAATCTGCCCTGCTAATT
TTCATTTGGATTATTGAACTTGTGCTTCTTTTTTTTTTGTTATTGTTTCTTGGATGTTAT
TCTCTTGTTTACTTCCAAGTTTTGCAAAGCCTTGTTCATTGTTCAGATGCATAACTGTTG
CTACTATTGAGAAATGAGAATCGTTGGATTTCC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4F769TF 453 0 0
GGGAATCGCCCTCAGATTCTGTATCATCTCTTCCAGTTCCGTGTAGAATCTCACATTCTC
CGGATCCTTAACTTTGATGTGATTAGGGATGCGAGAGATGTGGATAGGTACCTTGTTATT
GATATTAACTACTTTCCTGGGTATGCTAAGATGCCGTGTTATGAGCCTGTGTTGACGGAC
TTCTTCTGGGACATGGTCACAAAGAAGAAGAGTCATGTCTGAGAGAACTATCTGCCAAGT
TGTTTTAGCGGGTACATTCCTTAGGGAGGGTTTCTACTATCTCAATCTGCCCTGCTAATT
TTCATTTGGATTATTGAACTTGTGCTTCTTTTTTTTTTGTTATTGTTTCTTGGATGTTAT
TCTCTTGTTTACTTCCAAGTTTTGCAAAGCCTTGTTCATTGTTCAGATGCATAACTGTTG
CTACTATTGAGAAATGAGAATCGTTGGATTTCC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4958Contig1 754 2 3 U
TTCTATAAGAAAAGATTGCTAGAAGATATACAAGTTACTGATATCAGGTGCCAAGGATCA
AACTAATAAACTTAACGTGAGCACAACCACCGAATATTATCGTTTAGCAAATCTGGTGAG
ATACGATTTGGAGTACGCCCCAAGGTTTCGTAATAACCTAAGCATCTCTCCCTTTAGCCT
CTACATATTATAAATATGTAGAACTCTCTTCATATTGAAACCACTACCACAAAAACTCTA
CCGTCAAAAACACCTATGGCTTCTAACAGAGATACTTTTGATATTCTACTTTTTGACCTT
GATGAAACATTGTCACCATCAGTTCAAACATTCATCGACTGTAAACCTTCTCATCTTCCC
TCTTTTCAAAGCGAGTCAACCCAGAAACTATTTTCTGAATGCACTTTGCTTTCCTTTGCT
CTATTTCGTCTACATTTGTGGCAGTTGCTCCCAGCAGTTTAGTTTAAAACTTACTGCAGA
GGAAAATCAGAACATGTATTTGAAGTTGCTGAAGAGACTTGCGGTCATTTAGTTCCAGTT
GCTCCATCCTGACAAACAAATATTTTTTTTAGATCCTGAAGAACAAAGACAACAGATACT
ACTTAGTTATTGTAACTGAAAAATGACTTATCTAAAAAGTTCCTTCATTCGTCTTCATTA
CTTCCAACAACTGAACGGTCGGAGTTGAGTTTTACAGATCCATGAGTTTGAGACCAGGAC
ATTCGGTGGTAATAAGGAGAGAATGTTATCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C380JQ U 65
AF RR4C380TF C 1
BS 1 64 RR4C380TF
BS 65 341 RR4C380JQ
BS 342 754 RR4C380TF

RD RR4C380JQ 277 0 0
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GATTTGGAGTACGCCCCAAGGTTTCGTAATAACCTAAGCATCTCTCCCTTTAGCCTCTAC
ATATTATAAATATGTAGAACTCTCTTCATATTGAAACCACTACCACAAAAACTCTACCGT
CAAAAACACCTATGGCTTCTAACAGAGATACTTTTGATATTCTACTTTTTGACCTTGATG
AAACATTGTCACCATCAGTTCAAACATTCATCGACTG

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR4C380TF 754 0 0
TTCTATAAGAAAAGATTGCTAGAAGATATACAAGTTACTGATATCAGGTGCCAAGGATCA
AACTAATAAACTTAACGTGAGCACAACCACCGAATATTATCGTTTAGCAAATCTGGTGAG
ATACGATTTGGAGTACGCCCCAAGGTTTCGTAATAACCTAAGCATCTCTCCCTTTAGCCT
CTACATATTATAAATATGTAGAACTCTCTTCATATTGAAACCACTACCACAAAAACTCTA
CCGTCAAAAACACCTATGGCTTCTAACAGAGATACTTTTGATATTCTACTTTTTGACCTT
GATGAAACATTGTCACCATCAGTTCAAACATTCATCGACTGTAAACCTTCTCATCTTCCC
TCTTTTCAAAGCGAGTCAACCCAGAAACTATTTTCTGAATGCACTTTGCTTTCCTTTGCT
CTATTTCGTCTACATTTGTGGCAGTTGCTCCCAGCAGTTTAGTTTAAAACTTACTGCAGA
GGAAAATCAGAACATGTATTTGAAGTTGCTGAAGAGACTTGCGGTCATTTAGTTCCAGTT
GCTCCATCCTGACAAACAAATATTTTTTTTAGATCCTGAAGAACAAAGACAACAGATACT
ACTTAGTTATTGTAACTGAAAAATGACTTATCTAAAAAGTTCCTTCATTCGTCTTCATTA
CTTCCAACAACTGAACGGTCGGAGTTGAGTTTTACAGATCCATGAGTTTGAGACCAGGAC
ATTCGGTGGTAATAAGGAGAGAATGTTATCATCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL4959Contig1 1065 2 4 U
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GAAGAGAGGAGTACGTATTGTCAACGTTGCTCGGGGTGGAGTGATTGACGAGGAAGCTCT
CTTGAGGGCGCTTGACTCTGGTCTTGTCGCTCAGGCTGCTCTTGATGTTTTCACTGTGGA
GCCGCCTGTTAAAGACAACAAGTTGGTGTTGCATGAGAGTGTAACCGCCACGCCTCATCT
TGGTGCCAGTACTATGGAGGCTCAGGAAGGAGTGGCGGTAGAAATCGCTGAAGCTGTTGT
TGGAGCCTTGAGAGGAGAACTTGCTACTACTGCGGTCAATGCACCAATGGTTCCACCAGA
GGTGTTGAGGGAGCTGAAACCGTATGTTGTGCTAGCTGAAAAGCTTGGGAGATTGGCTGT
ACAACTTGTAACCGGTGGAAGCGGTGTGGATGCAGTGAAAGTGACTTACGCTTCTTCAAG
ATGTCCTGATGACCTAGACACAAGACTACTCCGTGCCATGGTCATAAAGGAACTCATTGA
ACCCATTTCCAGCGTGTTCATAAACCTGGTTAACTCTGATTACGTTGCTAAGCAACGCGG
AGTCAAAATCTCAGAAGAACGAATGGTTCTAGACGGCTCACCTGAGGAACCAATTGAGTA
CATAACTGTCCGGATAGCAAACGTTGAATCAAGATTTGCAAGCGCGTTATTTGAGTCAGG
AGAGATCAAAGTAGAAGGCAGAGTGAAACAAGGAGTTCCAAGTCTAACAAAAGTGGGGTT
ATTTGGAGTGGATGTGAGTTTAGAAGGGAGCGTGATTCTGTGCAGGCAAGTTGATCAGCC
TGGGATGATTGGCAAAGTTGCTAGCATCTTAGGAGATGAAAACGTGAATGTGAGCTTCAT
GAGCGTTGGAAGGATAGCTCCGGGGAAGCAAGCGGTGATGGCTATTGGTGTAGATGAACA
ACCTAGCAAGGAAACTTTGAAGAAGATCGGTGACATTTCTGCCATTGAAGAGTTTGTTTT
TCTTAAACTATAGTTTAATACATTCCATTGATGCACATAAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F032TF U 1
AF RR4F032JQ C 420
BS 1 531 RR4F032TF
BS 532 532 RR4F032JQ
BS 533 542 RR4F032TF
BS 543 1065 RR4F032JQ

RD RR4F032TF 542 0 0
GCACCTTCCCCTCACCGCTGCTACGTCCAAGATGCTGAATGACGAGACCTTTGCGAGGAT
GAAGAGAGGAGTACGTATTGTCAACGTTGCTCGGGGTGGAGTGATTGACGAGGAAGCTCT
CTTGAGGGCGCTTGACTCTGGTCTTGTCGCTCAGGCTGCTCTTGATGTTTTCACTGTGGA
GCCGCCTGTTAAAGACAACAAGTTGGTGTTGCATGAGAGTGTAACCGCCACGCCTCATCT
TGGTGCCAGTACTATGGAGGCTCAGGAAGGAGTGGCGGTAGAAATCGCTGAAGCTGTTGT
TGGAGCCTTGAGAGGAGAACTTGCTACTACTGCGGTCAATGCACCAATGGTTCCACCAGA
GGTGTTGAGGGAGCTGAAACCGTATGTTGTGCTAGCTGAAAAGCTTGGGAGATTGGCTGT
ACAACTTGTAACCGGTGGAAGCGGTGTGGATGCAGTGAAAGTGACTTACGCTTCTTCAAG
ATGTCCTGATGACCTAGACACAAGACTACTCCGTGCCATGGTCATAAAGGA*CTCATTGA
AC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4F032JQ 646 0 0
TACAACTTGTAACCGGTGGAAGCGGTGTGGATGCAGTGAAAGTGACTTACGCTTCTTCAA
GATGTCCTGATGACCTAGACACAAGACTACTCCGTGCCATGGTCATAAAGGAACTCATTG
AACCCATTTCCAGCGTGTTCATAAACCTGGTTAACTCTGATTACGTTGCTAAGCAACGCG
GAGTCAAAATCTCAGAAGAACGAATGGTTCTAGACGGCTCACCTGAGGAACCAATTGAGT
ACATAACTGTCCGGATAGCAAACGTTGAATCAAGATTTGCAAGCGCGTTATTTGAGTCAG
GAGAGATCAAAGTAGAAGGCAGAGTGAAACAAGGAGTTCCAAGTCTAACAAAAGTGGGGT
TATTTGGAGTGGATGTGAGTTTAGAAGGGAGCGTGATTCTGTGCAGGCAAGTTGATCAGC
CTGGGATGATTGGCAAAGTTGCTAGCATCTTAGGAGATGAAAACGTGAATGTGAGCTTCA
TGAGCGTTGGAAGGATAGCTCCGGGGAAGCAAGCGGTGATGGCTATTGGTGTAGATGAAC
AACCTAGCAAGGAAACTTTGAAGAAGATCGGTGACATTTCTGCCATTGAAGAGTTTGTTT
TTCTTAAACTATAGTTTAATACATTCCATTGATGCACATAAGAAAA

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL4960Contig1 815 2 4 U
AGCCCTCTCTCTCAACCCTTTCCTCCGCTCGGCCTCTCTCGACTCCGTCGAGTCCGTCCT
CAACTTCCTCCAGTCAAAAGGAATCTACCCGAACGACCTCCCGAGGATCTTGGGGATGTG
TCCTAAGATCCTCACTTCCGACGTCAGAACAGAACTCAACCCTGTTTTCGTGTTCCTGTC
GAGTGATCTCCGCGTCCCCGATAATGCGTTCAGAAGAGTGGTCAAGAAATGCCCGAGGCT
ACTGATCAGCAGCGTGGAGGACCAGCTCAAGCCTGCGCTGTTCTACCTGCAGAGACTTGG
TTTCAAGGATCTTGATGCCCTTGCTTACCAGGATCCTGTCTTGTTGGTGTCTAGTGTTGA
ACACACTCTCATCCCAAAGCTTAGATTCTTGGAGAGTATAGGGTTCACGAGATCAGAGGC
GATTGGAATGATACTTAGATGTCCAGCTCTGTTCACATTCAGCATAGAGAACAACTTTAA
ACCGAAGCTCGATTACTTCATGCGCGAGATCAAAGGTAGACTGGAGAATCTGAAGGAGTT
TCCGCAGTATTTTGCGTTCAGTCTAGAGAAAAGGATAAAGCCTAGGCACCTGGAGTCGAT
GGAGAGAGGTTTGGAATTGCCGTTGTCGTTGATGCTTAAGAGCACTGATGAGGAGTTCGA
GCAATTGCTCCAGCAAACAAAGCACTCTTCAGTGGTAAATGTGTAATCTTATTGTTGTAT
ATGGTGGGGAAGTGTTACAGTGTGTATTAATAGTATTTTGACATTGTTCCATGTGTATGT
GAAATTGATATATGGTACCAATGACCAGTTGAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GH33JQ C 1
AF RR4A560TF U 321
BS 1 321 RR4GH33JQ
BS 322 502 RR4A560TF
BS 503 503 RR4GH33JQ
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RD RR4GH33JQ 770 0 0
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TCCGCAGTATTTTGCGTTCAGTCTAGAGAAAAGGATAAAGCCTAGGCACCTGGAGTCGAT
GGAGAGAGGTTTGGAATTGCCGTTGTCGTTGATGCTTAAGAGCACTGATGAGGAGTTTGA
GCAATTGCTCCAGCAAACAAAGCACTCTTCAGTGGTAAATGTGTAATCTTATTGTTGTAT
ATGGTGGGGAAGTGTTACAGTGTGTATTAATAGTATTTTGACATTGTTCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4A560TF 495 0 0
G
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TCTAGAGAAAAGGATAAAGCCTAGGCACCTGGAGTCGATGGAGAGAGGTTTGGAATTGCC
GTTGTCGTTGATGCTTAAGAGCACTGATGAGGAGTTCGAGCAATTGCTCCAGCAAACAAA
GCACTCTTCAGTGGTAAATGTGTAATCTTATTGTTGTATATGGTGGGGAAGTGTTACAGT
GTGTATTAATAGTATTTTGACATTGTTCCATGTGTATGTGAAATTGATATATGGTACCAA
TGACCAGTTGAAAG

QA 2 495 2 495
DS 



AS 1 2

CO CL4961Contig1 733 2 2 U
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AAGCAAAATCTGGATTCTCAACACCTCAATGACCAATATGAGTTGACAAAAAAAAACAAT
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AACTTGTGAACCAAGAAGCTGCAAAGAAGAAGATAGTGGCGATCTAACAGATGAAGCAGA
GGATCTAAAGGGTCTGACGAAATCAAGGCTTGAAGGCAGAGAAAGCGACGACTGAGTTAT
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TTGCGACCGTATCAAAGTCCACCGCTGGTTCTGGGTTAAATTGGTTGATAGAGGGATGAA
GCCATCCAGTGTTGATAGCCTTCACGGTGGCGATGGCTTCAAGACCTCCAGCTGCACCGA
GGCAGTGACCTATCATAGACTTGGTGGCATTGATTTTGATCCCTGATGTGCTCTTGAATA
CCTTTTTAATGGCATTAATCTCAGCAAGATCACCAGCCAGAGTGGAAGTTGCATGCGCAT
TGATGTAATTTACCTCCTCAGGTGATACACCAGCATCTTCAAGGCAGCTCTCAATGCAGG
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CACCTCCAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AC08TF C 1
AF RR4AC08JQ U 22
BS 1 21 RR4AC08TF
BS 22 733 RR4AC08JQ

RD RR4AC08TF 733 0 0
TTTATAAAATTAGGCAAATATGGAACGAACTAAGATACAACATTCCGTACACAGATTGAC
AAGCAAAATCTGGATTCTCAACACCTCAATGACCAATATGAGTTGACAAAAAAAAACAAT
GACCAATAAGAACAAAAAGCTGAAAGAAACATAAAACGCCAGAGCAAGAGCAAGAGCTCA
AACTTGTGAACCAAGAAGCTGCAAAGAAGAAGATAGTGGCGATCTAACAGATGAAGCAGA
GGATCTAAAGGGTCTGACGAAATCAAGGCTTGAAGGCAGAGAAAGCGACGACTGAGTTAT
GTCCACCGAAACCAAACGAGTTTGATATGGCAACATTCACCTCATGCTGCTTCTTCTCGT
TTGCGACCGTATCAAAGTCCACCGCTGGTTCTGGGTTAAATTGGTTGATAGAGGGATGAA
GCCATCCAGTGTTGATAGCCTTCACGGTGGCGATGGCTTCAAGACCTCCAGCTGCACCGA
GGCAGTGACCTATCATAGACTTGGTGGCATTGATTTTGATCCCTGATGTGCTCTTGAATA
CCTTTTTAATGGCATTAATCTCAGCAAGATCACCAGCCAGAGTGGAAGTTGCATGCGCAT
TGATGTAATTTACCTCCTCAGGTGATACACCAGCATCTTCAAGGCAGCTCTCAATGCAGG
AAGAGACACCAAGTCCATCAGCTCTTGGATCAGTCATATGATGAGCATCACAATTTACAG
CACCTCCAAGATC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4AC08JQ 712 0 0
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CACCTCAATGACCAATATGAGTTGACAAAAAAAAACAATGACCAATAAGAACAAAAAGCT
GAAAGAAACATAAAACGCCAGAGCAAGAGCAAGAGCTCAAACTTGTGAACCAAGAAGCTG
CAAAGAAGAAGATAGTGGCGATCTAACAGATGAAGCAGAGGATCTAAAGGGTCTGACGAA
ATCAAGGCTTGAAGGCAGAGAAAGCGACGACTGAGTTATGTCCACCGAAACCAAACGAGT
TTGATATGGCAACATTCACCTCATGCTGCTTCTTCTCGTTTGCGACCGTATCAAAGTCCA
CCGCTGGTTCTGGGTTAAATTGGTTGATAGAGGGATGAAGCCATCCAGTGTTGATAGCCT
TCACGGTGGCGATGGCTTCAAGACCTCCAGCTGCACCGAGGCAGTGACCTATCATAGACT
TGGTGGCATTGATTTTGATCCCTGATGTGCTCTTGAATACCTTTTTAATGGCATTAATCT
CAGCAAGATCACCAGCCAGAGTGGAAGTTGCATGCGCATTGATGTAATTTACCTCCTCAG
GTGATACACCAGCATCTTCAAGGCAGCTCTCAATGCAGGAAGAGACACCAAGTCCATCAG
CTCTTGGATCAGTCATATGATGAGCATCACAATTTACAGCACCTCCAAGATC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL4962Contig1 272 2 1 U
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CTTCTCCCATCCACCAGTGTCAGCCTTGGAATGAGCCAAGAGGTATAAAACGGTCGCAAT
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CGAAAGCGTTTTGCCTTCTTGGTACACGCCTTTGCTTTTGGTGTGGTAAGCGTTCTTCGC
CGATCCAGCCAACAAGCACGCCTCCGCACCTA


BQ
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AF RR4EO10JQ C 1
AF RR4EO10TF U 1
BS 1 272 RR4EO10TF

RD RR4EO10JQ 272 0 0
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CTTCTCCCATCCACCAGTGTCAGCCTTGGAATGAGCCAAGAGGTATAAAACGGTCGCAAT
CAAAGACATGAGAGTCAAAGCAGCTCCAGCAGCGAATACACCAACGGGTAAGACCGCACA
CGAAAGCGTTTTGCCTTCTTGGTACACGCCTTTGCTTTTGGTGTGGTAAGCGTTCTTCGC
CGATCCAGCCAACAAGCACGCCTCCGCACCTA

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR4EO10TF 272 0 0
GGGGGGAGCATCTGCAGGAGGAGGAGCAGCAGAAGTCATACCAATCCCATCGTCACGATG
CTTCTCCCATCCACCAGTGTCAGCCTTGGAATGAGCCAAGAGGTATAAAACGGTCGCAAT
CAAAGACATGAGAGTCAAAGCAGCTCCAGCAGCGAATACACCAACGGGTAAGACCGCACA
CGAAAGCGTTTTGCCTTCTTGGTACACGCCTTTGCTTTTGGTGTGGTAAGCGTTCTTCGC
CGATCCAGCCAACAAGCACGCCTCCGCACCTA

QA 1 272 1 272
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4964Contig1 826 2 3 U
GTTTCACAGTTTCTCCGACCACATTTGGTCCGCAAAAGCTGGGACTATCTCAACTTCGTC
CTCGTCCTCTTCGCCGTTATATGCGGTTTCCTCAGCCGCAACACTGATAACGACGAAAGC
AGCAATCACAACAAGGAAGAAGTCGGTAAAAATAATGAGCGCGGGGTTCGTGTATCCACG
CCGCGTTATTGGATCGATGATCACGGAGGTGATCAGTTTCCCGACCAGACGGTGTACAAG
AGGAGGTTTAGCAGTTTAAGGAGTAGTAGCTCGTATCCAGATCTGCGGCTCGGAGAAATT
GAATCCGATGAACGGTGGAGATTTTACGACGATACACGTGTAAGTCGATGCCGTTATGAA
TCTTCAGATCCTCCGATTTATCGAGCAGGGAGCGGTTTCGAAACTGAGAAAGCTGAAGTA
GTAGAAGAGCTATCAGCGCCTTCTAATCCGCTGCCTCAGCCTTCTGCTCCTCCGTATCCT
CTTTCTCCTCCGCCATCTCCGCCTCCTGCTCCTCCACCGTCGAAGCCAGCGAAGAGGAGG
ACAAAGAGAGTGCACCAAGATGTTGCTGCAAAGGAAGAGAAGAAGCAAAGTGGTGATTCT
GTTGCAGCGGCGACACCTCTGATCACTCCGGTTCCGGTACCGGAGAGCAGTAAACATGAG
AAGAAGAAAGGCGGAGGAGCAACTAAAGACTTTCTTATTGCTTTACGGAAAAAGAAGAAG
AAGCAAAGGCAACAGAGCATCGACGGTCTCGATTTACTCTTCGGCTCCGATCCTCCATTT
GATTATTCACCGCCCCCGCCACCTCCTCCACCACCTTTCTTCCAGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B152TF U 6
AF RR4B152JQ C 1
BS 1 5 RR4B152JQ
BS 6 666 RR4B152TF
BS 667 826 RR4B152JQ

RD RR4B152TF 661 0 0
ACAGTTTCTCCGACCACATTTGGTCCGCAAAAGCTGGGACTATCTCAACTTCGTCCTCGT
CCTCTTCGCCGTTATATGCGGTTTCCTCAGCCGCAACACTGATAACGACGAAAGCAGCAA
TCACAACAAGGAAGAAGTCGGTAAAAATAATGAGCGCGGGGTTCGTGTATCCACGCCGCG
TTATTGGATCGATGATCACGGAGGTGATCAGTTTCCCGACCAGACGGTGTACAAGAGGAG
GTTTAGCAGTTTAAGGAGTAGTAGCTCGTATCCAGATCTGCGGCTCGGAGAAATTGAATC
CGATGAACGGTGGAGATTTTACGACGATACACGTGTAAGTCGATGCCGTTATGAATCTTC
AGATCCTCCGATTTATCGAGCAGGGAGCGGTTTCGAAACTGAGAAAGCTGAAGTAGTAGA
AGAGCTATCAGCGCCTTCTAATCCGCTGCCTCAGCCTTCTGCTCCTCCGTATCCTCTTTC
TCCTCCGCCATCTCCGCCTCCTGCTCCTCCACCGTCGAAGCCAGCGAAGAGGAGGACAAA
GAGAGTGCACCAAGATGTTGCTGCAAAGGAAGAGAAGAAGCAAAGTGGTGATTCTGTTGC
AGCGGCGACACCTCTGATCACTCCGGTTCCGGTACCGGAGAGCAGTAAACATGAGAAGAA
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4B152JQ 826 0 0
GTTTCACAGTTTCTCCGACCACATTTGGTCCGCAAAAGCTGGGACTATCTCAACTTCGTC
CTCGTCCTCTTCGCCGTTATATGCGGTTTCCTCAGCCGCAACACTGATAACGACGAAAGC
AGCAATCACAACAAGGAAGAAGTCGGTAAAAATAATGAGCGCGGGGTTCGTGTATCCACG
CCGCGTTATTGGATCGATGATCACGGAGGTGATCAGTTTCCCGACCAGACGGTGTACAAG
AGGAGGTTTAGCAGTTTAAGGAGTAGTAGCTCGTATCCAGATCTGCGGCTCGGAGAAATT
GAATCCGATGAACGGTGGAGATTTTACGACGATACACGTGTAAGTCGATGCCGTTATGAA
TCTTCAGATCCTCCGATTTATCGAGCAGGGAGCGGTTTCGAAACTGAGAAAGCTGAAGTA
GTAGAAGAGCTATCAGCGCCTTCTAATCCGCTGCCTCAGCCTTCTGCTCCTCCGTATCCT
CTTTCTCCTCCGCCATCTCCGCCTCCTGCTCCTCCACCGTCGAAGCCAGCGAAGAGGAGG
ACAAAGAGAGTGCACCAAGATGTTGCTGCAAAGGAAGAGAAGAAGCAAAGTGGTGATTCT
GTTGCAGCGGCGACACCTCTGATCACTCCGGTTCCGGTACCGGAGAGCAGTAAACATGAG
AAGAAGAAAGGCGGAGGAGCAACTAAAGACTTTCTTATTGCTTTACGGAAAAAGAAGAAG
AAGCAAAGGCAACAGAGCATCGACGGTCTCGATTTACTCTTCGGCTCCGATCCTCCATTT
GATTATTCACCGCCCCCGCCACCTCCTCCACCACCTTTCTTCCAGT

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL4965Contig1 806 2 2 U
GGGTAAAGACAAAACAGTATAAGGAAACTGTTTGGGAAACGGACGCGCGAGACCAGAGAG
CAAAATGTCCAGAACTACACGCAGCTCGGAAAAACGAAGGCTCCAGTATCTACAAGACAT
CCAAAGTTTGCAAGAGGAGATCAAGTTGTTACAGATTACCAATGAGAAACTGAATGGTGT
TGGTCTCGATGATATGAGCTTCACCGAGCTGGCCTCACTTAGAAGTATGTTGGATGAGGG
CTTCCGCATTGTGACAGAAGAAATAGAAAATGCATACGACAAAGTAGCAGTCAAGCGGAT
TTTTGAGGACGATCTTATGGGGGGAAAGGACTGGATTGATAGAATAGACAAAGAAGATTT
GGCCTACCAATCCCTTCTAGCGAGGAGAAGAGGAGCTTTGAGGAAGAAGGCTAGAGAATT
CCGCCTCAGCCCTCCAGAAACCCAACCTTGGCGTAGCAATGACCCTGACCCTGAAAGACT
GGAAACTCTAGAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACGAGAGAATGATTGGTAA
AGAGCTTGACGGTATGAGTTACTATGAGCTGTGTGTGTTGAGCTCAGAGATATCGACTGC
TGAGATAAAAGTTGGAGCGATGAAAGATATAAAACATGCTGAAGAGATGGAGAAGGCAAA
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CGTGACTTAGAGCATTTTCATTGAGAACTCTTAAGAAGGGTTCACACATTTCCCAAAAAA
AAATATTAAAATAAGCAAATCTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EJ12TF U 1
AF RR4EJ12JQ C 208
BS 1 635 RR4EJ12TF
BS 636 806 RR4EJ12JQ

RD RR4EJ12TF 635 0 0
GGGTAAAGACAAAACAGTATAAGGAAACTGTTTGGGAAACGGACGCGCGAGACCAGAGAG
CAAAATGTCCAGAACTACACGCAGCTCGGAAAAACGAAGGCTCCAGTATCTACAAGACAT
CCAAAGTTTGCAAGAGGAGATCAAGTTGTTACAGATTACCAATGAGAAACTGAATGGTGT
TGGTCTCGATGATATGAGCTTCACCGAGCTGGCCTCACTTAGAAGTATGTTGGATGAGGG
CTTCCGCATTGTGACAGAAGAAATAGAAAATGCATACGACAAAGTAGCAGTCAAGCGGAT
TTTTGAGGACGATCTTATGGGGGGAAAGGACTGGATTGATAGAATAGACAAAGAAGATTT
GGCCTACCAATCCCTTCTAGCGAGGAGAAGAGGAGCTTTGAGGAAGAAGGCTAGAGAATT
CCGCCTCAGCCCTCCAGAAACCCAACCTTGGCGTAGCAATGACCCTGACCCTGAAAGACT
GGAAACTCTAGAGATCGAGAAAGAGAGACTACGTCTTTTAAACGAGAGAATGATTGGTAA
AGAGCTTGACGGTATGAGTTACTATGAGCTGTGTGTGTTGAGCTCAGAGATATCGACTGC
TGAGATAAAAGTTGGAGCGATGAAAGATATAAAAC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4EJ12JQ 599 0 0
GCTGGCCTCACTTAGAAGTATGTTGGATGAGGGCTTCCGCATTGTGACAGAAGAAATAGA
AAATGCATACGACAAAGTAGCAGTCAAGCGGATTTTTGAGGACGATCTTATGGGGGGAAA
GGACTGGATTGATAGAATAGACAAAGAAGATTTGGCCTACCAATCCCTTCTAGCGAGGAG
AAGAGGAGCTTTGAGGAAGAAGGCTAGAGAATTCCGCCTCAGCCCTCCAGAAACCCAACC
TTGGCGTAGCAATGACCCTGACCCTGAAAGACTGGAAACTCTAGAGATCGAGAAAGAGAG
ACTACGTCTTTTAAACGAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTTGACGGTATGAGTTACTATGA
GCTGTGTGTGTTGAGCTCAGAGATATCGACTGCTGAGATAAAAGTTGGAGCGATGAAAGA
TATAAAACATGCTGAAGAGATGGAGAAGGCAAAACGTCCAAGCTAGGACGACGGTCAACA
AGGAACGACCAATCTCCCGAGGACAGATATGATCGTGACTTAGAGCATTTTCATTGAGAA
CTCTTAAGAAGGGTTCACACATTTCCCAAAAAAAAATATTAAAATAAGCAAATCTTGCG

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL4966Contig1 759 2 1 U
GGGCACGGACAGTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTCCCAACAAACTTTGAAATCGAAATCC
AGTTTTGTCGAATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGTGAGCGAATCAAACGTGTATATTC
TGCCAGATCGTGCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGAAGGTC
GTCGCGTTTCAGGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAA
CACGTCCCAACTGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCAC
ATGTTAAGTGTGGGACAAGAACTGCTGCTCAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTC
GGTTTTCACCAGCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCACTG
CCTTTTATGCCCAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTT
ATTGAAGCACAGAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTCCTTCAAAAGTGTAACTGAAA
CCAACTTATCTAACTTCATTGCGGTGCTAAAATTGGTGCTATATCTCTTTTTCATTTACC
GGCATGCCTGTTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAAGAAGGACGTGT
CGTGTAATTTTATGTAATTTCTGTCGCTTGCCCAATAGTTGTAGGCAGGGAAACCATTCT
CATATTTAAAGGGTATGAAATATAGACATTAATGATTCT


BQ
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AF RR4BH25TF U 1
AF RR4BG85TF U 1
BS 1 759 RR4BG85TF

RD RR4BH25TF 709 0 0
GGGCACGGACAGTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTCCCAACAAACTTTGAAATCGAAATCC
AGTTTTGTCGAATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGTGAGCGAATCAAACGTGTATATTC
TGCCAGATCGTGCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGAAGGTC
GTCGCGTTTCAGGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAA
CACGTCCCAACTGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCAC
ATGTTAAGTGTGGGACAAGAACTGCTGCTCAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTC
GGTTTTCACCAGCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCACTG
CCTTTTATGCCCAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTT
ATTGAAGCACAGAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTCCTTCAAAAGTGTAACTGAAA
CCAACTTATCTAACTTCATTGCGGTGCTAAAATTGGTGCTATATCTCTTTTTCATTTACC
GGCATGCCTGTTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAAGAAGGACGTGT
CGTGTAATTTTATGTAATTTCTGTCGCTTGCCCAATAGTTGTAGGCAGG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4BG85TF 759 0 0
GGGCACGGACAGTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTCCCAACAAACTTTGAAATCGAAATCC
AGTTTTGTCGAATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGTGAGCGAATCAAACGTGTATATTC
TGCCAGATCGTGCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGAAGGTC
GTCGCGTTTCAGGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAA
CACGTCCCAACTGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCAC
ATGTTAAGTGTGGGACAAGAACTGCTGCTCAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTC
GGTTTTCACCAGCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCACTG
CCTTTTATGCCCAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTT
ATTGAAGCACAGAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTCCTTCAAAAGTGTAACTGAAA
CCAACTTATCTAACTTCATTGCGGTGCTAAAATTGGTGCTATATCTCTTTTTCATTTACC
GGCATGCCTGTTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAAGAAGGACGTGT
CGTGTAATTTTATGTAATTTCTGTCGCTTGCCCAATAGTTGTAGGCAGGGAAACCATTCT
CATATTTAAAGGGTATGAAATATAGACATTAATGATTCT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4968Contig1 761 2 8 U
GCAATGCAATCTGGTTATAGTAGGCCATTCTATGGGAATCCTATGCACCAAGGAGGTGAT
AAGCAGCAGCAGAACATGTTGCCGGTTCCTCAGTCACTCAATCCACACTCCATTCCTCAA
CAGCTGCCGTCGATGCAGCTTTCACAGCTACAACGCCCTATGCAGCCTCCTCAGCATGTT
AGACCATCCATGCAGACATCTCAGCCATCAGAGCAGGGAGTACCATTACAAAACCAGTAT
CAGATCCCATTGCATCCGATGCAGATGATGCAACAGAGCCAAGTCCCGCCTTACTATCAC
CCACTTCAACAACAAGAGACCCCTCATGTTCAGCAACAGCAACCACAGCAACAGGCTGTT
CAAGTTCAGCAAGGAGCTGGGAGTTCTCAGCAACAAGAATGTGGAATGTCATTACATGAT
TACTTGCAATCCCCAGAAACCATTCAGGCTCTACTAAGTAACCGCGAGAAGCTCACACAG
CTTCTGGAACAGAACCCAAAGCTAATGCAGATGCTACAGGAAAAACTAGGGCCGCGGTGA
GGAGAAAGAGCCCACTACTCGACAAATATATCAAAATCCCTGGCTTTTTAGCTGCTTTTG
GTTTATGTAATGTTTAATTTACAATATAACATGTACATTTGTTTCAGTTTGATATGTAGA
CAAGCTGTAAACGCTCGTTTGTTGTTGTTTAGTTTAGACTGTGATGTACATTGGTAAAGA
AGAGAAACACTCTTCACGTCCGAGTCTTTAGCTCTTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FC29TF U 1
AF RR4FC29JQ C 255
BS 1 662 RR4FC29TF
BS 663 663 RR4FC29JQ
BS 664 685 RR4FC29TF
BS 686 686 RR4FC29JQ
BS 687 694 RR4FC29TF
BS 695 695 RR4FC29JQ
BS 696 719 RR4FC29TF
BS 720 761 RR4FC29JQ

RD RR4FC29TF 719 0 0
GCAATGCAATCTGGTTATAGTAGGCCATTCTATGGGAATCCTATGCACCAAGGAGGTGAT
AAGCAGCAGCAGAACATGTTGCCGGTTCCTCAGTCACTCAATCCACACTCCATTCCTCAA
CAGCTGCCGTCGATGCAGCTTTCACAGCTACAACGCCCTATGCAGCCTCCTCAGCATGTT
AGACCATCCATGCAGACATCTCAGCCATCAGAGCAGGGAGTACCATTACAAAACCAGTAT
CAGATCCCATTGCATCCGATGCAGATGATGCAACAGAGCCAAGTCCCGCCTTACTATCAC
CCACTTCAACAACAAGAGACCCCTCATGTTCAGCAACAGCAACCACAGCAACAGGCTGTT
CAAGTTCAGCAAGGAGCTGGGAGTTCTCAGCAACAAGAATGTGGAATGTCATTACATGAT
TACTTGCAATCCCCAGAAACCATTCAGGCTCTACTAAGTAACCGCGAGAAGCTCACACAG
CTTCTGGAACAGAACCCAAAGCTAATGCAGATGCTACAGGAAAAACTAGGGCCGCGGTGA
GGAGAAAGAGCCCACTACTCGACAAATATATCAAAATCCCTGGCTTTTTAGCTGCTTTTG
GTTTATGTAATGTTTAATTTACAATATAACATGTACATTTGTTTCAGTTTGATATGTAGA
CA*GCTGTAAACGCTCGTTTGTTGT*GTTTAGTT*AGACTGTGATGTACATTGGTAAAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FC29JQ 507 0 0
TCCGATGCAGATGATGCAACAGAGCCAAGTCCCGCCTTACTATCACCCACTTCAACAACA
AGAGACCCCTCATGTTCAGCAACAGCAACCACAGCAACAGGCTGTTCAAGTTCAGCAAGG
AGCTGGGAGTTCTCAGCAACAAGAATGTGGAATGTCATTACATGATTACTTGCAATCCCC
AGAAACCATTCAGGCTCTACTAAGTAACCGCGAGAAGCTCACACAGCTTCTGGAACAGAA
CCCAAAGCTAATGCAGATGCTACAGGAAAAACTAGGGCCGCGGTGAGGAGAAAGAGCCCA
CTACTCGACAAATATATCAAAATCCCTGGCTTTTTAGCTGCTTTTGGTTTATGTAATGTT
TAATTTACAATATAACATGTACATTTGTTTCAGTTTGATATGTAGACAAGCTGTAAACGC
TCGTTTGTTGTTGTTTAGTTTAGACTGTGATGTACATTGGTAAAGAAGAGAAACACTCTT
CACGTCCGAGTCTTTAGCTCTTCTTAC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL4969Contig1 897 2 2 U
GGAACTCAACACTTGAAGAAAATAAAAAAGATTCGATCTTCAAATGGCTTCGGACAAAGA
TATGATCGCGAGAATCTCTATTGAGCCTGAGAATCAATCACTTCTCGATCATCACACGGA
GAACCACTTCACCGCTGGAGAGGTCGTTCGTGACATCATCATCGACGTCTCCGACGGTTT
AACCGTTCCTTTTGCACTCGCCGCCGGGCTCTCCGGTGCTAATGCCTCTTCTTCTATCGT
ATTCACCGCTGGTTTGGCTGAAGTCGCTGCAGGCGCTATCTCCATGGGACTCGGCGGGTA
CTTAGCGGCCAAGAGTGAAGCAGATCACTACGCGAGAGAGATGAAACGAGAACAAGAAGA
GATCGTGGCAGTTCCTGAGACTGAGGCAGCTGAGGTGGAAGAGATTCTGGCACAGTATGG
TGTAGAGCCACATGAATCTTCACCGGTTGTTAATGCTCTTCGTAAGAATCCTCAAGCATG
GCTTGATTTTATGATGAGGTTTGAGCTGGGACTAGAGAAGCCTGATCCAAAGAGAGCTCT
GCAAAGCGCGTTCACGATTGCAATCGCTTATGTTCTTGGAGGTTTAGTACCGCTATTTCC
CTACATGTTCATACCGCAAGCCTTAAATGCGGTAGTGGCGTCTGCGGTTATAACTCTGAT
CGCTCTCTTCATATTTGGCTATGGAAAAGGACATTTCACCGGCAGCAGACCCTTTAGGAG
TGCGTTTGAAACCACTTTTATAGGAGCGATAGCCTCAGCAGCTGCTTTCTGTTTGGCTAA
AGTGGTGCAACATTAACGATAACAAAAACTAATGTTGCATTTAATGTTTTAAATTTGAGA
CTTGTTTGTTGCATGCAATGTGGTGGTTGTCACGGTAAAAGTAAAACTTATTGCGAC


BQ
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AF RR4GK35TF U 1
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BS 691 897 RR4GK35JQ

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GCTTGATTTTATGATGAGGTTTGAGCTGGGACTAGAGAAGCCTGATCCAAAGAGAGCTCT
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CTACATGTTCATACCGCAAGCCTTAAATGCGGTAGTGGCGTCTGCGGTTATAACTCTGAT
CGCTCTCTTCATATTTGGCTATGGAAAAGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4GK35JQ 658 0 0
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AAGTGGTGCAACATTAACGATAACAAAAACTAATGTTGCATTTAATGTTTTAAATTTGAG
ACTTGTTTGTTGCATGCAATGTGGTGGTTGTCACGGTAAAAGTAAAACTTATTGCGAC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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TTAATTTTTTTCTAAAGATT


BQ
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AF RR4D870JQ C 1
AF RR4D870TF U 1
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TTCACTAAATAAAATACCTACAACCAAAATATATGTACTAAAATGAAGGAAAAAGATTCT
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TTAATTTTTTTTTAAAGATT

QA 1 440 1 440
DS 

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ACGTTGGAGAAGTTGAAGCCGTGAACAAGTTGGCGTGCCGCTTTACTGGTCGCAGATTCA
AGGGAAAATGCGGAAATAATGGAAATAGTATATGTACAAGGGAAGTAAAGGAGTTCATAG
CCAAATATCCAGACGAGAGCAAGAGCGTTCTAGGCGAGATGCGTTGTAATTGTACTAACA
TTCCAGTCAAGGCAAACGAGGGAATCAGACGTGAATGTAGCTGTAGATATGATTGCAACT
TTCACTAAATAAAATACCTACAACCAAAATATATGTACTAAAATGAAGGAAAAAGATTCT
AGAGATTTTAATATCGATTTGATAAAAATCCATATCAGTCTAATGTTTTTGCAAATTTGA
TTAATTTTTTTCTAAAGATT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

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TTATTTTACTTTTGAATTTGGTAACCTTGTAGACGTAAAGATTGGAAAGAGTACATTTTG
GCTTGTTTTGTTTCCTATGCAGTCAGTCAATCTGTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CL35TF U 1
AF RR4CL35JQ C 194
BS 1 588 RR4CL35TF
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RD RR4CL35TF 669 0 0
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AAGGGGAAGTCACAGGCTGTGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAGCTTAGGACCAAG
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TACTAGAAAACCCGCATCTATCTTTTGGTTTAAACATTGCTTTGTTTT*ACCTTTGAATT
TTATTTTACTTTTGAATTTGGTA*CCTTGTAGACGTAAAGATTGGAAAGAGTACATTTTG
GCTTGTTTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4CL35JQ 507 0 0
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TTGAAGGAGTCCCACCTCCTTACGACAAGGTCAAGAGGATGGTTATTCCTGATGCTTTCA
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TTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTGGAGGTCAAAAGAAAGGGGAAGTCAC
AGGCTGTGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAGCTTAGGACCAAGGCCGAGAAGGTTG
CGGAGGAGAAACTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCGATCAAATACTAGAAAACCC
GCATCTATCTTTTGGTTTAAACATTGCTTTGTTTTTACCTTTGAATTTTATTTTACTTTT
GAATTTGGTAACCTTGTAGACGTAAAGATTGGAAAGAGTACATTTTGGCTTGTTTTGTTT
CCTATGCAGTCAGTCAATCTGTTATGG

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL4972Contig1 714 2 3 U
GCACTGTCACCGGCGAGAATCCGGATGAGAGGACTTTAGATCGTTTGATCTCTACAGGGG
AAAGTGAGAGATTCTTGCAAAAAGCAATACAAGAACAAGGAAGAGGACGTGTCTTAGACA
CCATCAACGAGATCCGAGAAAGGCATGACGCTGTTAAAGACATTGAGAAGAATCTCAGGG
AGCTCCACCAAGTGTTTCTAGACATGGCGGTCCTGGTCGAGCACCAGGGAGCTCAGCTGG
ACGACATCGAGAGCCACGTGGGCCGAGCTAGCTCCTTTATCCGAGGAGGAACTGAGCAGC
TGCAAACCGCTCGGGTTTACCAGAAGAACACACGTAAATGGACATGTTACGCTATTCTCA
TTCTCATCATCATTATTGTCGTTGTGGTTCTTGTTGTTGTTAAACCATGGAACAACAACG
GAGGTGGCGGTGGTGGTGGAGGAGGAAATCCGCCAACTTCAGGTCAAGGGACGCCACCAA
GTCCTCCTCAGGCTAGGCGTCTTCTATTGCGTTGAAGTGAGTTTGGTAATTTGCAAATCT
ATTCTTTCTTTGAAACTTTTTTAATCAAACCACAGTAGATGATTTCCTTTGTATCTATCT
ATGATTCTATGTTGCTATTATTTTGGTGCACTTTATATGATTTTATGTTTCTTGTTGTGT
TTGGCTGAGGTATAGTCTCATCCTGAAAATTGAATAGTAGCTTCAGTACACTGT


BQ
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AF RR4C861JQ C 1
AF RR4C861TF U 1
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RD RR4C861JQ 714 0 0
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GTCCTCCTCAGGCTAGGCGTCTTCTATTGCGTTGAAGTGAGTTTGGTAATTTGCAAATCT
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QA 1 714 1 714
DS 

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AGCTCCACCAAGTGTTTCTAGACATGGCGGTCCTGGTCGAGCACCAGGGAGCTCAGCTGG
ACGACATCGAGAGCCACGTGGGCCGAGCTAGCTCCTTTATCCGAGGAGGAACTGAGCAGC
TGCAAACCGCTCGGGTTTACCAGAAGAACACACGTAAATGGACATGTTACGCTATTCTCA
TTCTCATCATCATTATTGTCGTTGTGGTTCTTGTTGTTGTTAAACCATGGAACAACAACG
GAGGTGGCGGTGGTGGTGGAGGAGGAAATCCGCCAACTTCAGGTCAAGGGACGCCACCAA
GTCCTCCTCAGGCTAGGCGTCTTCTATTGCGTTGAAGTGAGTTTGGTAATTTGCAAATCT
ATTCTTTCTTTGAAACTTTTTTAATCAAACCACAGTAGATGATTTCCTTTGTATCTATCT
ATGATTCTATGTTGCTATTATTTTGGTGCACTTTATATGATTTTATGTTTCTTGTTGTGT
TTGGCTGAG*TATAGTCTCATCCTGAAAATTGAATAGTAGCTTCAGTACACTGT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL4973Contig1 955 2 2 U
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GTGGATTCAAGACTCCATAACTTCAAACACGCCGTCTCTTCCAACAAAACTTTCTTGGAT
GAACACGTCTCAGCCGTAAATAATCTGGCTAAAGACGCAAAAAGAAAATGGGAGACGTTT
TCTAGCAAGCTGAGAATGACGCCAAAGAAGGTGCTGATTTCTCGGCTGCAAAACATTGTC
GAATGGAGTTACTACTTCAGCAATCTGTGAGTCATGCGGAATCAGCTTTTAAACACTGCA
AGACGACTCACGAATCGTTAAAGGAGATGAACGGTAAGCAAGTTGCAGATGTCTCTTCAC
TTGTTAAGTCTGCTTGTGATAATAACGAGGAGCACGACACCGAAGTAGATTCTGCAAGGA
CTGCGGCTGAGAAAGATGTAACCACGAACAGCGATGAGATAATCCAGCACATTTATCGCA
TTTCAGAGGATGAGAAAGCGTCTGTATCACAAATATTGGACAATGTCAAGACACATGAAA
AGGCTCTTCAAAGTTTCCAACAGGATCATTGCTGCAAAGCCAGATGCATTGAGGATAAAG
CTCAAGAAACTTTTCAACAAAGATACATGGAGTATGAGCCCACAGGGACAACTCCGTCTA
AGAGTGAACCGGAGGTCCCAACCAAAGCCACTATTGAATCACTTCGAGCAAAGCCAGTGG
AGTCATTGGTTGAAGCGTTCCGCGAAAACAACTCTTATGAATCCTTTGCGGCGAAAGAAA
CAAAACCGCAACAGCTAACACGGTCGCCTCTCTCACAAGTCAACTAGGGAACCACCTCTG
TTCCGTTTTATGCTCAATTTGGTTTTTTGAAAGTAGTGTCTGTCTGTATAACTATATTAT
CTTTGTGCACATTGTGAAAGTATGCGATCAAATCAATGAAGATCTTGCAGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EM56TF U 1
AF RR4EM56JQ C 269
BS 1 596 RR4EM56TF
BS 597 955 RR4EM56JQ

RD RR4EM56TF 596 0 0
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GTGGATTCAAGACTCCATAACTTCAAACACGCCGTCTCTTCCAACAAAACTTTCTTGGAT
GAACACGTCTCAGCCGTAAATAATCTGGCTAAAGACGCAAAAAGAAAATGGGAGACGTTT
TCTAGCAAGCTGAGAATGACGCCAAAGAAGGTGCTGATTTCTCGGCTGCAAAACATTGTC
GAATGGAGTTACTACTTCAGCAATCTGTGAGTCATGCGGAATCAGCTTTTAAACACTGCA
AGACGACTCACGAATCGTTAAAGGAGATGAACGGTAAGCAAGTTGCAGATGTCTCTTCAC
TTGTTAAGTCTGCTTGTGATAATAACGAGGAGCACGACACCGAAGTAGATTCTGCAAGGA
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AGGCTCTTCAAAGTTTCCAACAGGATCATTGCTGCAAAGCCAGATGCATTGAGGAT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4EM56JQ 687 0 0
GAGTCATGCGGAATCAGCTTTTAAACACTGCAAGACGACTCACGAATCGTTAAAGGAGAT
GAACGGTAAGCAAGTTGCAGATGTCTCTTCACTTGTTAAGTCTGCTTGTGATAATAACGA
GGAGCACGACACCGAAGTAGATTCTGCAAGGACTGCGGCTGAGAAAGATGTAACCACGAA
CAGCGATGAGATAATCCAGCACATTTATCGCATTTCAGAGGATGAGAAAGCGTCTGTATC
ACAAATATTGGACAATGTCAAGACACATGAAAAGGCTCTTCAAAGTTTCCAACAGGATCA
TTGCTGCAAAGCCAGATGCATTGAGGATAAAGCTCAAGAAACTTTTCAACAAAGATACAT
GGAGTATGAGCCCACAGGGACAACTCCGTCTAAGAGTGAACCGGAGGTCCCAACCAAAGC
CACTATTGAATCACTTCGAGCAAAGCCAGTGGAGTCATTGGTTGAAGCGTTCCGCGAAAA
CAACTCTTATGAATCCTTTGCGGCGAAAGAAACAAAACCGCAACAGCTAACACGGTCGCC
TCTCTCACAAGTCAACTAGGGAACCACCTCTGTTCCGTTTTATGCTCAATTTGGTTTTTT
GAAAGTAGTGTCTGTCTGTATAACTATATTATCTTTGTGCACATTGTGAAAGTATGCGAT
CAAATCAATGAAGATCTTGCAGGATCT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL4974Contig1 543 2 2 U
GGAGTTTTGGTCGGAAAAAAAAAAAAAAAGAACCTGCGTGAAGCTTCGTCCTTTTTGCGT
GTGGGGGAAATCGCCTGGGTGGATTCTCTTCTCTCCCAGAAGATTTTGCGTTGCCAGCGT
ATCTCAATCTAACACCGCCGAGTCGACTCGCTCCACCGAGCCATGAATCGGCTGAGAGGG
CGAGGGGCATGGATTCTAGGTTCGGCAGCTATGCCTCATCTTAAGAAGAGAGCCCAGAAC
TCATTGGTCGCTATCCAAGACTCCTATCTCTCCACCAAGGATTTGCTGGAGAGGCAGAGG
GTCGTGTTTACAGTTGCAACTTCTGTTGCATCTGTTGCTACCGCTTGGATTGGTTATTCA
TTACGACACTACAATGAAACTAGGATCGATCAGAGGCTGGAATCTATTGAGAATGCGATG
AAACACACACATGAGTTGGAACGAGGGGAACTCAAGGAGCTTGTGGATCCAGTGGGTTCC
AGGTTCACTTCAACAATTGCCACCGCTGGAACCACTTTGATCATCGGGTTTGTTGTTTTC
CCC


BQ
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10 10 10 

AF RR4E344TF U 1
AF RR4E344JQ C 89
BS 1 540 RR4E344TF
BS 541 543 RR4E344JQ

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GTGGGGGAAATCGCCTGGGTGGATTCTCTTCTCTCCCAGAAGATTTTGCGTTGCCAGCGT
ATCTCAATCTAACACCGCCGAGTCGACTCGCTCCACCGAGCCATGAATCGGCTGAGAGGG
CGAGGGGCATGGATTCTAGGTTCGGCAGCTATGCCTCATCTTAAGAAGAGAGCCCAGAAC
TCATTGGTCGCTATCCAAGACTCCTATCTCTCCACCAAGGATTTGCTGGAGAGGCAGAGG
GTCGTGTTTACAGTTGCAACTTCTGTTGCATCTGTTGCTACCGCTTGGATTGGTTATTCA
TTACGACACTACAATGAAACTAGGATCGATCAGAGGCTGGAATCTATTGAGAATGCGATG
AAACACACACATGAGTTGGAACGAGGGGAACTCAAGGAGCTTGTGGATCCAGTGGGTTCC
AGGTTCACTTCAACAATTGCCACCGCTGGAACCACTTTGATCATCGGGTTTGTTGTTTTC
ACC

QA 1 540 1 540
DS 

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CGCTCCACCGAGCCATGAATCGGCTGAGAGGGCGAGGGGCATGGATTCTAGGTTCGGCAG
CTATGCCTCATCTTAAGAAGAGAGCCCAGAACTCATTGGTCGCTATCCAAGACTCCTATC
TCTCCACCAAGGATTTGCTGGAGAGGCAGAGGGTCGTGTTTACAGTTGCAACTTCTGTTG
CATCTGTTGCTACCGCTTGGATTGGTTATTCATTACGACACTACAATGAAACTAGGATCG
ATCAGAGGCTGGAATCTATTGAGAATGCGATGAAACACACACATGAGTTGGAACGAGGGG
AACTCAAGGAGCTTGTGGATCCAGTGGGTTCCAGGTTCACTTCAACAATTGCCACCGCTG
GAACCACTTTGATCATCGGGTTTGTTGTTTTCCCC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 2

CO CL4975Contig1 452 2 1 U
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ATATAGGCAACTGGTTTGAGGGTCTTCAGGATATTGATACAGCAGGGCTTGATGAAGTTC
CTATGGATGATCTCTCTTTCATGTTTGGATAAAAAGAGGAAAATACTCACAGAGAGATGA
ATTGAGCTGATGCATACCCCATCACAAGTAAAAAGTTAATTTTTAAGTTGTATATTTGTA
CTGAATAGTGATTATCTGCCTTCAAGGCCAGTATTAAACTATGATCTAATATAAATGTAT
TTCCATTTTTCAAAAGAATATTTCTTTGATTT


BQ
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AF RR4ER21JQ C 1
AF RR4ER21TF U 1
BS 1 452 RR4ER21TF

RD RR4ER21JQ 452 0 0
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CTATGGATGATCTCTCTTTCATGTTTGGATAAAAAGAGGAAAATACTCACAGAGAGATGA
ATTGAGCTGATGCATACCCCATCACAAGTAAAAAGTTAATTTTTAAGTTGTATATTTGTA
CTGAATAGTGATTATCTGCCTTCAAGGCCAGTATTAAACTATGATCTAATATAAATGTAT
TTCCATTTTTCAAAAGAATATTTCTTTGATTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4ER21TF 452 0 0
GCAGCAAGAACGAAAACCAATCAAGATCGACAACAACAACTCACCCAACAGGTCCAATAA
GCAGAGGCAACTCGAACCGAGGAGGTGTCTCTGGAGATGGCGCAGCAGTAGATGAGGAAG
CTCCAATAGATTTCTCAAAACTAACGTTCCATGATCTAGAGGAAATGGATGAGCAGGCAG
ATATAGGCAACTGGTTTGAGGGTCTTCAGGATATTGATACAGCAGGGCTTGATGAAGTTC
CTATGGATGATCTCTCTTTCATGTTTGGATAAAAAGAGGAAAATACTCACAGAGAGATGA
ATTGAGCTGATGCATACCCCATCACAAGTAAAAAGTTAATTTTTAAGTTGTATATTTGTA
CTGAATAGTGATTATCTGCCTTCAAGGCCAGTATTAAACTATGATCTAATATAAATGTAT
TTCCATTTTTCAAAAGAATATTTCTTTGATTT

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL4976Contig1 922 2 12 U
GGGTTCCCGTCTGTACTCTCTCCCGGTGACTATAGAGTCTCGTAGCCGTCGCCGTTGGCT
TATCCTCTTTAGGTGAACTAAGGTTTCCCTTTTTCGTCCCCATGGCTTCTCCACCAGAGG
AGATGGATGAAGAAATTCAATCCCCGCCAAAGAGCACTTACAAGGATCCTGACGATGGAA
GGCAACGATTCTTACTTGAACTTGAATTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACATCC
ACTACCTGGCGCAGAATCGGTATTTTGAAGATGAAGCATTTATTGAGTACCTCAAGTATC
TTCAATACTGGCAGCGACCTGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACATTGCCTATATT
TCCTTGAACTTCTTCAAAACCCCAACTTCAGGAGTGCCATGGCCCATCCTGCAAACAAGG
AATTGGCACATAGGCAACAGTTTTACTATTGGAAGAACTACAGAAACAACAGGCTGAAGC
ACATTCTACCTCGTCCTCTTCCAGAGCCTGTAGCTCCACAACCGCCACCTGTGCCTTCAT
CTTCTCTTCCTCCTGCCCCATCTGCACCTGCTGCTCCCTCTCCAGCTATTTCTCCTATGC
AGTACAATAATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGGGTCGGAATATGGTTTCTGCTGGAATTG
ATCGTAGGAAGAGAAAGAAAGGTCCATAAGGCATATCTTGCTCTGAAGCAAACACCATGG
TGTCCGGGGATATGTTTTCCTGCTTTTTCTAGAGAGGGGAAACCTGCTTGACTCAGGTTA
CAAAAATGTCGAAAACTCTGGGCATAGAGATTGATGATATTAAGCCTGTCGGCTTTATAG
TAAATGGTAGTTGTGAGATTGATTCTGTTTCCTATTTTTCGTTGCTCTAGGCTCCAACCG
GAGCCTTACTCATACTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F268TF U 1
AF RR4F268JQ C 336
BS 1 667 RR4F268TF
BS 668 668 RR4F268JQ
BS 669 690 RR4F268TF
BS 691 691 RR4F268JQ
BS 692 711 RR4F268TF
BS 712 712 RR4F268JQ
BS 713 758 RR4F268TF
BS 759 759 RR4F268JQ
BS 760 776 RR4F268TF
BS 777 777 RR4F268JQ
BS 778 786 RR4F268TF
BS 787 922 RR4F268JQ

RD RR4F268TF 786 0 0
GGGTTCCCGTCTGTACTCTCTCCCGGTGACTATAGAGTCTCGTAGCCGTCGCCGTTGGCT
TATCCTCTTTAGGTGAACTAAGGTTTCCCTTTTTCGTCCCCATGGCTTCTCCACCAGAGG
AGATGGATGAAGAAATTCAATCCCCGCCAAAGAGCACTTACAAGGATCCTGACGATGGAA
GGCAACGATTCTTACTTGAACTTGAATTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACATCC
ACTACCTGGCGCAGAATCGGTATTTTGAAGATGAAGCATTTATTGAGTACCTCAAGTATC
TTCAATACTGGCAGCGACCTGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACATTGCCTATATT
TCCTTGAACTTCTTCAAAACCCCAACTTCAGGAGTGCCATGGCCCATCCTGCAAACAAGG
AATTGGCACATAGGCAACAGTTTTACTATTGGAAGAACTACAGAAACAACAGGCTGAAGC
ACATTCTACCTCGTCCTCTTCCAGAGCCTGTAGCTCCACAACCGCCACCTGTGCCTTCAT
CTTCTCTTCCTCCTGCCCCATCTGCACCTGCTGCTCCCTCTCCAGCTATTTCTCCTATGC
AGTACAATAATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGGGTCGGAATATGGTTTCTGCTGGAATTG
ATCGTAG*AAGAGAAAGAAAGGTCCATAAG*CATATCTTGCTCTGAAGCAA*CACCATGG
TGTCCGGGGATATGTTTTCCTGCTTTTTCTAGAGAGGG*AAACCTGCTTGACTCAG*TTA
CAAAAA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4F268JQ 587 0 0
ATTATGTATCCACATTGCCTATATTTCCTTGAACTTCTTCAAAACCCCAACTTCAGGAGT
GCCATGGCCCATCCTGCAAACAAGGAATTGGCACATAGGCAACAGTTTTACTATTGGAAG
AACTACAGAAACAACAGGCTGAAGCACATTCTACCTCGTCCTCTTCCAGAGCCTGTAGCT
CCACAACCGCCACCTGTGCCTTCATCTTCTCTTCCTCCTGCCCCATCTGCACCTGCTGCT
CCCTCTCCAGCTATTTCTCCTATGCAGTACAATAATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGGGT
CGGAATATGGTTTCTGCTGGAATTGATCGTAGGAAGAGAAAGAAAGGTCCATAAGGCATA
TCTTGCTCTGAAGCAAACACCATGGTGTCCGGGGATATGTTTTCCTGCTTTTTCTAGAGA
GGGGAAACCTGCTTGACTCAGGTTACAAAAATGTCGAAAACTCTGGGCATAGAGATTGAT
GATATTAAGCCTGTCGGCTTTATAGTAAATGGTAGTTGTGAGATTGATTCTGTTTCCTAT
TTTTCGTTGCTCTAGGCTCCAACCGGAGCCTTACTCATACTTTTTAC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4978Contig1 1112 2 2 U
GGAAATCAGACATGAGGTTGAAGAACTGAAGAAGTTAGAGAATCTGAAAGTTACACTAGA
TGATATGTCAATGGCTAAAATGCAGCTGTCCAATTTAGAGCGTAGCTGGGAAAAAGTGTC
TGCTCTGAAGCAGAAGGTTGTTGTTACTCGGGACGAGGAACTAGACTTGCAAAATGGAGC
CAGCACTGTGAGTAATAGCGAAGATGGTTATAATAACTCAAACAATGGCTCAAGCCCTTC
GTCCGCCATTCCATTTTCATGGATAAAGCAATACACTAATCTGATATTCAAGACTCCTCC
TCCAGAGACGTCGCTTCCAATGCATCATCATGAAGAAGGAGGAGGGGGATTGCCTTCAGA
AAAGTTGAAGCTAGATTCATCGAAAAGAGAAGAAAAGGCTTACACCGAGGGGCTGACTAT
TGCAGTTGAAAGACTTGAAGCCGGAAGGAAAAGAAGAGGTAACAACGCATCTGGAAGTGA
CACTAATGAAACAAGCAATCACAAGAAGAGGAAACATGATGTTACCCGTGAAGCTGATCC
CGGAGAGTGTAATTTCAAGCCCTCAGAATGTGCCCGAGGACAAACACGAACTGCCATCAA
ACCAAACCCAGGCACCACCAAGTGGTATGGTAGTCCTCAGTGAAATCGTGAAGATCACAG
AAGTAACGTGTGAGACAGAGGTTATCAACAAAGTGTCAAACATTGACTGTTCAGATGATC
TTTCGGAAGAAGGAACAAAGATGGTAGAGGAGGAGAAACAAGATAGGGATTGCAATCAGA
CCGGGATAAAGGAGAAGGATTTTGACGATGGTGGCATTGTAACATGAGTTAAGATGACAG
GAGGTATAAGCATATAAGGAACTTTATGAATCCTTAAGGGTTTGTTTTTGGATTAGATTT
GAGTATGTAAATGGATTTGATTGGTTTTAAAACTCTCTGTAGATGTTATATAACTCAGAG
TCATTATTATTTGTGTTTTTTTCAGATTTTAAGTGAGTAGAGTGATGGTAGGTAGATACG
ATTCGTTGGTTTCTTGCGTGTTGCAGTGTTTGCCTGAGAAAATGATTTGTCGGTTTCAAG
ACTCTTGAGTTTGATTACCAGTCTCGGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BW57TF U 1
AF RR4BW57JQ C 539
BS 1 658 RR4BW57TF
BS 659 1112 RR4BW57JQ

RD RR4BW57TF 658 0 0
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TGATATGTCAATGGCTAAAATGCAGCTGTCCAATTTAGAGCGTAGCTGGGAAAAAGTGTC
TGCTCTGAAGCAGAAGGTTGTTGTTACTCGGGACGAGGAACTAGACTTGCAAAATGGAGC
CAGCACTGTGAGTAATAGCGAAGATGGTTATAATAACTCAAACAATGGCTCAAGCCCTTC
GTCCGCCATTCCATTTTCATGGATAAAGCAATACACTAATCTGATATTCAAGACTCCTCC
TCCAGAGACGTCGCTTCCAATGCATCATCATGAAGAAGGAGGAGGGGGATTGCCTTCAGA
AAAGTTGAAGCTAGATTCATCGAAAAGAGAAGAAAAGGCTTACACCGAGGGGCTGACTAT
TGCAGTTGAAAGACTTGAAGCCGGAAGGAAAAGAAGAGGTAACAACGCATCTGGAAGTGA
CACTAATGAAACAAGCAATCACAAGAAGAGGAAACATGATGTTACCCGTGAAGCTGATCC
CGGAGAGTGTAATTTCAAGCCCTCAGAATGTGCCCGAGGACAAACACGAACTGCCATCAA
ACCAAACCCAGGCACCACCAAGTGGTATGGTAGTCCTCAGTGAAATCGTGAAGATCAC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4BW57JQ 574 0 0
T
CCGGAGAGTGTAATTTCAAGCCCTCAGAATGTGCCCGAGGACAAACACGAACTGCCATCA
AACCAAACCCAGGCACCACCAAGTGGTATGGTAGTCCTCAGTGAAATCGTGAAGATCACA
GAAGTAACGTGTGAGACAGAGGTTATCAACAAAGTGTCAAACATTGACTGTTCAGATGAT
CTTTCGGAAGAAGGAACAAAGATGGTAGAGGAGGAGAAACAAGATAGGGATTGCAATCAG
ACCGGGATAAAGGAGAAGGATTTTGACGATGGTGGCATTGTAACATGAGTTAAGATGACA
GGAGGTATAAGCATATAAGGAACTTTATGAATCCTTAAGGGTTTGTTTTTGGATTAGATT
TGAGTATGTAAATGGATTTGATTGGTTTTAAAACTCTCTGTAGATGTTATATAACTCAGA
GTCATTATTATTTGTGTTTTTTTCAGATTTTAAGTGAGTAGAGTGATGGTAGGTAGATAC
GATTCGTTGGTTTCTTGCGTGTTGCAGTGTTTGCCTGAGAAAATGATTTGTCGGTTTCAA
GACTCTTGAGTTTGATTACCAGTCTCGGGTTTT

QA 2 574 2 574
DS 



AS 1 2

CO CL4979Contig1 875 2 5 U
AGCGAAGATCATGCCGTGATCAGTGACTGTGTCATATCTCTCGGTTCTCAAGCTAATAAA
AAGATCTTGATCGTCAATACTCTGCTCATTTGCTGGCAAGAAACAATAAAAGGGTTTTTT
GTTTGAGGAACTATTAACACTGCTCCTCTGTGGCATGCTTTCAGGATTAAACCCGTCCTT
CTGTTCATGATGCATGAAGCGCGGGAAACCGAGTGAAGAATTTGGTATAATTGGTGGTGA
AGGAGAATCAATGGTGATTGGATTTCTAAATGTGGTTCCTGAATCTTGAAAATGATTTTT
TAATCTCTGGTCAACGGGCTTGATTTGTTTACCATTTCTTGACATTGTTACCGTCGGTCC
CACGTCACATCTTGATGACTCTGCCATAACTTGCCATGGCCTTTTTGGAGCCACGATCTT
TTCATGGTTATGGCTAGATGTTGGGTTTGGAGGGTGGTCTATGAATTGATAAAACCCTGG
ATTCGGTAGATTCATCGGTGGGAGATAGTGAAGACACGAATCATGATTCCTTTGAAAAAC
TGGAGCCGGAGGGATCAGATCACTAGGGAAAGATCCGGCTGTAAAATAAGACGGGAACGG
GTAAACCGGACCGGCTCTCACGGTGGGGGATGGAAGAACAACGGACGGAGGTCTTTCCGT
CTGAGGAGGATGAGGAGGAAGTGGTGTGTGTTGTTCTTCAAGACGGATCTTCTCGAGTTC
GGCGACACCAGGACCTCTTCGAGGAACTCTTCTTTTCCCATTGTTATTACTCTTCTGTTT
TTTCGGACGCGGACCAGTGTAATCATCTCCATAGTTTCCAATGGTTGTTTTGCTACACAT
TTTTATTTCTTTCTAGGTTTAGTGTATCATATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI65JQ U 11
AF RR4BI65TF C 1
BS 1 10 RR4BI65TF
BS 11 412 RR4BI65JQ
BS 413 413 RR4BI65TF
BS 414 487 RR4BI65JQ
BS 488 875 RR4BI65TF

RD RR4BI65JQ 477 0 0
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TCGTCAATACTCTGCTCATTTGCTGGCAAGAAACAATAAAAGGGTTTTTTGTTTGAGGAA
CTATTAACACTGCTCCTCTGTGGCATGCTTTCAGGATTAAACCCGTCCTTCTGTTCATGA
TGCATGAAGCGCGGGAAACCGAGTGAAGAATTTGGTATAATTGGTGGTGAAGGAGAATCA
ATGGTGATTGGATTTCTAAATGTGGTTCCTGAATCTTGAAAATGATTTTTTAATCTCTGG
TCAACGGGCTTGATTTGTTTACCATTTCTTGACATTGTTACCGTCGGTCCCACGTCACAT
CTTGATGACTCTGCCATAACTTGCCATGGCCTTTTTGGAGCCCCGATCTTTTCATGGTTA
TGGCTAGATGTTGGGTTTGGAGGGTGGTCTATGAATTGATAAAACCCTGGATTCGGT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR4BI65TF 875 0 0
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AAGATCTTGATCGTCAATACTCTGCTCATTTGCTGGCAAGAAACAGTAGAAGGGTTTTT*
GTTTGAGGAACTATTAGCACTGCTCCTCTGTGGCATGCTTTCAGGATTAAACCCGTCCTT
CTGTTCATGATGCATGAAGCGCGGGAAACCGAGTGAAGAATTTGGTATAATTGGTGGTGA
AGGAGAATCAATGGTGATTGGATTTCTAAATGTGGTTCCTGAATCTTGAAAATGATTTTT
TAATCTCTGGTCAACGGGCTTGATTTGTTTACCATTTCTTGACATTGTTACCGTCGGTCC
CACGTCACATCTTGATGACTCTGCCATAACTTGCCATGGCCTTTTTGGAGCCACGATCTT
TTCATGGTTATGGCTAGATGTTGGGTTTGGAGGGTGGTCTATGAATTGATAAAACCCTGG
ATTCGGTAGATTCATCGGTGGGAGATAGTGAAGACACGAATCATGATTCCTTTGAAAAAC
TGGAGCCGGAGGGATCAGATCACTAGGGAAAGATCCGGCTGTAAAATAAGACGGGAACGG
GTAAACCGGACCGGCTCTCACGGTGGGGGATGGAAGAACAACGGACGGAGGTCTTTCCGT
CTGAGGAGGATGAGGAGGAAGTGGTGTGTGTTGTTCTTCAAGACGGATCTTCTCGAGTTC
GGCGACACCAGGACCTCTTCGAGGAACTCTTCTTTTCCCATTGTTATTACTCTTCTGTTT
TTTCGGACGCGGACCAGTGTAATCATCTCCATAGTTTCCAATGGTTGTTTTGCTACACAT
TTTTATTTCTTTCTAGGTTTAGTGTATCATATTCC

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL4980Contig1 1071 2 16 U
GGGCCGGTTCCTCTTCAATACAAAACGCAAAGGCAGAGGAGACTCGGTTCTGTCTGTATG
GAAGCCAACACTGGATTGAGAGATGCAATCAGCTGGCTTCCTGACGAGGTTCTGGGCAAG
ATCTTGTCCTTACTTCCCACAAAACAAGCTGCTTCAACATCTGTTCTTGCTAAAAAGTGG
AGGCATGTGTTTAGGTTAGTGCACACTCTTGATTTCGATGACTCTGTGTTGCTGCAACCG
GAAGAGGGTAAAGAAGAGTGGCCTGTGATCCGAGAGAGCTTCAGAAACTTTGTGGACAGA
ACACTCGCTTTGCAATCCGGTTCTCCTATCAATAACTTCTCTCTGAAGTTTCACATTCAC
GAGAGCAGGGAGATGGCTTATGTGTCTGCCTGGATATGTAATGCACTAGAGCGTGGTGTT
TTGGAGATGAGCCTAAGTTTAAAGAGTAAGCATCATGAACTCTTTCTGCCCTCCCAGCTC
TTAACGAGCAAGACGCTGGTTAAGCTGACACTGGGAACACAAATTTATCTCGAGAAGTTC
CCTCCAAATCCGTCTCTTCCAGCTCTCAAGAGTCTCTTCATAGACTCTATTTTTTTTGAA
GGTGACGATCTGTGTGGTGTGCTTCTACGTGGTTTTCCAGTGCTGGAGGAGTTATATGTA
CGTCACGAAAATTGTGAAGGAACCCCATACTCTATATGTAGTCCGAACATCAAGAAGCTC
AGTTTACCATGACTTTGAGGTTTTAAGGGGTGGTATGTCATTTAATACACCAAGCCTTGT
GTTTTTCAGCTACCGCGATCATGCGTTAGAGGAGTACACAGATGTGAACTTGGCTTCTCT
AGTGGAAGCTAGGCTAGATATTCATTATTCTAAATGGATCGGGGATCCGGATCTATCGGG
TCTCGTTACAGGGATTGGCAACGTCGAGATCCTGCATCTTTCTCCCGCTTCTGCTGATGT
AAGTCTTGTTTGTGTTTTTTTTTTTCTCTTTTACTTGGGAAAAAGCTTCCTATTCATCTT
CACTCGTTGAATCCGTTTATTACTTTGGTTATGTGATTACTAGATTAGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BQ46TF U 1
AF RR4BQ46JQ C 287
BS 1 601 RR4BQ46TF
BS 602 602 RR4BQ46JQ
BS 603 679 RR4BQ46TF
BS 680 680 RR4BQ46JQ
BS 681 706 RR4BQ46TF
BS 707 707 RR4BQ46JQ
BS 708 727 RR4BQ46TF
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BS 729 739 RR4BQ46TF
BS 740 741 RR4BQ46JQ
BS 742 749 RR4BQ46TF
BS 750 750 RR4BQ46JQ
BS 751 764 RR4BQ46TF
BS 765 765 RR4BQ46JQ
BS 766 774 RR4BQ46TF
BS 775 1071 RR4BQ46JQ

RD RR4BQ46TF 774 0 0
GGGCCGGTTCCTCTTCAATACAAAACGCAAAGGCAGAGGAGACTCGGTTCTGTCTGTATG
GAAGCCAACACTGGATTGAGAGATGCAATCAGCTGGCTTCCTGACGAGGTTCTGGGCAAG
ATCTTGTCCTTACTTCCCACAAAACAAGCTGCTTCAACATCTGTTCTTGCTAAAAAGTGG
AGGCATGTGTTTAGGTTAGTGCACACTCTTGATTTCGATGACTCTGTGTTGCTGCAACCG
GAAGAGGGTAAAGAAGAGTGGCCTGTGATCCGAGAGAGCTTCAGAAACTTTGTGGACAGA
ACACTCGCTTTGCAATCCGGTTCTCCTATCAATAACTTCTCTCTGAAGTTTCACATTCAC
GAGAGCAGGGAGATGGCTTATGTGTCTGCCTGGATATGTAATGCACTAGAGCGTGGTGTT
TTGGAGATGAGCCTAAGTTTAAAGAGTAAGCATCATGAACTCTTTCTGCCCTCCCAGCTC
TTAACGAGCAAGACGCTGGTTAAGCTGACACTGGGAACACAAATTTATCTCGAGAAGTTC
CCTCCAAATCCGTCTCTTCCAGCTCTCAAGAGTCTCTTCATAGACTCTATTTTTTTTGAA
G*TGACGATCTGTGTGGTGTGCTTCTACGTGGTTTTCCAGTGCTGGAGGAGTTATATGTA
CGTCACGAAAATTGTGAAG*AACCCCATACTCTATATGTAGTCCGA*CATCAAGAAGCTC
AGTTTAC*ATGACTTTGAG**TTTAAGGG*TGGTATGTCATTTA*TACACCAAG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4BQ46JQ 785 0 0
ACTTTGTGGACAGAACACTCGCTTTGCAATCCGGTTCTCCTATCAATAACTTCTCTCTGA
AGTTTCACATTCACGAGAGCAGGGAGATGGCTTATGTGTCTGCCTGGATATGTAATGCAC
TAGAGCGTGGTGTTTTGGAGATGAGCCTAAGTTTAAAGAGTAAGCATCATGAACTCTTTC
TGCCCTCCCAGCTCTTAACGAGCAAGACGCTGGTTAAGCTGACACTGGGAACACAAATTT
ATCTCGAGAAGTTCCCTCCAAATCCGTCTCTTCCAGCTCTCAAGAGTCTCTTCATAGACT
CTATTTTTTTTGAAGGTGACGATCTGTGTGGTGTGCTTCTACGTGGTTTTCCAGTGCTGG
AGGAGTTATATGTACGTCACGAAAATTGTGAAGGAACCCCATACTCTATATGTAGTCCGA
ACATCAAGAAGCTCAGTTTACCATGACTTTGAGGTTTTAAGGGGTGGTATGTCATTTAAT
ACACCAAGCCTTGTGTTTTTCAGCTACCGCGATCATGCGTTAGAGGAGTACACAGATGTG
AACTTGGCTTCTCTAGTGGAAGCTAGGCTAGATATTCATTATTCTAAATGGATCGGGGAT
CCGGATCTATCGGGTCTCGTTACAGGGATTGGCAACGTCGAGATCCTGCATCTTTCTCCC
GCTTCTGCTGATGTAAGTCTTGTTTGTGTTTTTTTTTTTCTCTTTTACTTGGGAAAAAGC
TTCCTATTCATCTTCACTCGTTGAATCCGTTTATTACTTTGGTTATGTGATTACTAGATT
AGGAT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4981Contig1 1374 2 2 U
GGGCTCTGCTTGGGACGAGTCGAAGATCGTGGCGAGGTTAACTGCAACGTTTATGCGTTT
GTCAGAGAGGCTTAGTGGGTTTCTCAGCGAAGGTCAGTCAGTGTTCATGTCTGCTAGGTT
GTTTGATAGAATTGCTATGCTTTTAGAAGATTCTCGGCTGTACGAGCGCTTTAGTGAGAT
AAGATCAAAGCTTTTGAGTTTGATCGAGTCGAGGCAAAACTCAGGGCTTGGTAACCAAAT
CAGAGAGTTGACTCAGCGCCTTGTGAATCTTCTTGACGATGGTCAAAGGTCTGTCTCGCC
TCAGCTGATTGATCTGCAAGAGCGGCTCACCTCGACCATTGAGGATTTTCAGAAGCAGCT
TGATCTGATCGTTAAGTATGACTGGGATTTTGATAACTACTTGGAAGAGGATGTCCCTGC
TGCGATTGAGTATGTAAGAGCGCAATGCAAGCCAAAGGACGGTAAGCTATTAGCAATTGG
GCACTCAATGGGAGGTATCTTACTCTATGCAATGCTGTCACGTTGTGCTTTTGAGGGTAG
GGAACCTTGCCTGGCAGCTGTGGCAACTTTGGCTTCATCGCTAGATTACACAACTTCAGA
TTCTGCCCTCAAATTGCTCATACCTCTTGCCGATCCTGCACAAGCTCTGAGCGTTCCAGT
TGTTCCTTTGGGAGCTCTCTTGGCTGCAGCTTATCCTCTTTCGTCCCGACCTCCATACGT
TTTATCTTGGCTTAACGATTTGATATCATCAACGGATATGATGCACCCTGAACAGTTAGA
GAAGCTCGTCTTGAATAATTTCTGTACCATACCAGCAAAACTTCTTATACAGCTGACAAC
AGCCTTTCAGCGGGAGGCTTACGCGATCGTAGTGGTAAATTTTACTACAAGGATCATCTT
TCCGGAACCAGTGTCCCTGTCTTAGCTCTTGCGGGTGATCGGGACCTGATCCGTCCCCCT
GTAGCTGTAGAAGACACTGTTAAGCTGTTCCCTGAGAACCTGGTCACTTATAAGGAACTT
GGAGAACCAGACGGACCACATTATGCGCACTATGATTTGGTTGGTGGACGACTGGCAGTG
GAGCAAGTCTATCCTTGCATAACTGAATTTCTTAGCCACCATGATTCTGCATAAGTGAAA
CTCTCTGATCTTCTGTCCCGGACATGCAATGTTGCGCTATGGTGGTGTCTAATCAGAAGG
GACTGTTAATAAGGATGTCATCTCCGTTTAAGGCATGTACATTTAGTGTTCCGGCGAACT
GTACATTAGCTTATGAGGCATTTTTTCACCTTGTACATCTTTTGGACGGATTATCCATTA
TACTAATTGTACAGACATGGGATTCAAGTGTATATTTTATGTCTTGGATCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G951TF U 1
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AAGATCAAAGCTTTTGAGTTTGATCGAGTCGAGGCAAAACTCAGGGCTTGGTAACCAAAT
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TTTATCTTGG

QA 1 730 1 730
DS 

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ACAGCTGACAACAGCCTTTCAGCGGGAGGCTTACGCGATCGTAGTGGTAAATTTTACTAC
AAGGATCATCTTTCCGGAACCAGTGTCCCTGTCTTAGCTCTTGCGGGTGATCGGGACCTG
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TCCACC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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CGTTGGCTTTT


BQ
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AF RR4A052JQD C 1
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CGTTGGCTTTT

QA 1 431 1 431
DS 

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AAGACAGAAAAGACTGAAGAGGAGAAAACATTCAAGAAAAGAGCAAAGTTCTTTCTAGCT
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CTCTCTTCTTCCTAGACACAATAATCTCTCTGCTTTTTCTTAAATTTTTAGTTAAAGAGA
GAGAGGCTAAATGTGAGGTTAGTCACACATTATAATCATTTTTTCATTCCGAAGGAGATT
CGTTGGCTTTT

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C834JQ C 1
AF RR4C834TF U 1
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QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4C834TF 358 0 0
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GGAAGAGATGGGATGGTAATGGTGATGTTGAACTGTATAAAAAAACTCTATTATTGCG

QA 1 358 1 358
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TAGCTTGGCCTCCTTGTACCGTCCTCCTTTTCATCTTATGTTACACGGCTCCTTTGAACA
GGCAAAAGCTACGTCTAGCTCTCAGGATAAATGGCTTCTCGTTAACCTCCAATCTACCAC
GGAGTTCAGCTCTCACATGCTAAATCGTGATACATGGGCAAATGAAGCTGTTTCTCAGAC
TATCAAGGCCAACTTCATCTTCTGGCAGGTCTATGATGATACCACGGAAGGAAAGAAGGT
TTGCACATACTACAAGCTCGAGTCCATTCCTGTGGTGCTTGTAATTGATCCTACAACTGG
TCAAAGATGAGAATGTGGTCTGGATGGTCGAACCAGAGATCTGCTAGAGGATCTGGTGCC
TTCATGGACGTGGTCCTCGTGACACTTTGCTCTCTCTCAAGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E201TF U 1
AF RR4E942TF U 1
BS 1 564 RR4E201TF
BS 565 763 RR4E942TF

RD RR4E201TF 564 0 0
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TGCACAGTCTTGGGGGGCGGCTGATACAGGAAATGAAAGGATGCAGAACGATGTAGTAGA
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GGAGTTCAGCTCTCACATGCTAAATCGTGATACATGGGCAAATGAAGCTGTTTCTCAGAC
TATCAAGGCCAACTTCATCTTCTG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4E942TF 763 0 0
GGGTAAAAGTATTCTTCCTTCTGGTACAAACACTCAGCCAACGGTGGACGATCCAATGGC
TGCACAGTCTTGGGGGGCGGCTGATACAGGAAATGAAAGGATGCAGAACGATGTAGTAGA
TGATGAAGTGCGTGCTCCTTTACCTGTTGTGAGGGAGACTCTTTATGGTGACTCTATGTA
TTACGGAGCAACGAGGGTGGGAAACTCTCAGCGGGAACCAGCTTCTTTGATTGCTTTCCG
TAACTTCAGCGAAGAGCCAAAGAGCCCTGGAATTTGGGAGCCAGATGAGGTTGGTGCTTC
CTCTGCCTCTGCATCTGGCTCAGCTTCTGCGCCAGAGGCAGCAGCATCAGCTCCTCGGGA
TAGCTTGGCCTCCTTGTACCGTCCTCCTTTTCATCTTATGTTACACGGCTCCTTTGAACA
GGCAAAAGCTACGTCTAGCTCTCAGGATAAATGGCTTCTCGTTAACCTCCAATCTACCAC
GGAGTTCAGCTCTCACATGCTAAATCGTGATACATGGGCAAATGAAGCTGTTTCTCAGAC
TATCAAGGCCAACTTCATCTTCTGGCAGGTCTATGATGATACCACGGAAGGAAAGAAGGT
TTGCACATACTACAAGCTCGAGTCCATTCCTGTGGTGCTTGTAATTGATCCTACAACTGG
TCAAAGATGAGAATGTGGTCTGGATGGTCGAACCAGAGATCTGCTAGAGGATCTGGTGCC
TTCATGGACGTGGTCCTCGTGACACTTTGCTCTCTCTCAAGAA

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4986Contig1 617 2 2 U
TAAACTACAACAAGCTTAATTTTCCGAACATCAACAGCAAGAAAACCCTAAAGCCCTTGA
TCAAGTTTCTCTTAGACAATGGCGAATACTTGTAGAATCAGCTTTATCTGCATCATGGTC
CTCTTGCTCTTCACTAATCACTTAGCTCTTTCTTCTTCTGCCCGGCTCCGATTTATAGAA
GGTCAAGATCTTGTTCACGGGAAGCAAACCAATCTCTTGAACCTTGATGAGATTGAGAAA
GCTGATAGGGCACGTCTCGGTTACTTGTTTGGCATGATTGATGAGGCAGAGACCAATCGC
GTCGAGGAGGTTGATTGTCTCTCGCCTCCGTTTTGCTCCAAGCCTCTATATGTTTGAAGC
TCTTATAAGCACGTGCTCATGATATTAATTTATGATGAGTCTGCTTGTACGGGGCATATG
AAAGAGAACAATAATTCTTCATTGGTGGAGATGAAGTAACTGAACCAATAATAGCACACA
AATTTAGAAGTGTACTGTCTTTCTGTTTGGTTTTTTGTTTTCGTTTTCTTTTTCTTGTTC
AATAAGTTAGCGTTTAAGGTTTCGCTCTTAGGATATAGTTTCGTTGAAATTGATGAATAA
TATGAGAATTGCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AA51JQ C 1
AF RR4AA51TF U 173
BS 1 172 RR4AA51JQ
BS 173 617 RR4AA51TF

RD RR4AA51JQ 617 0 0
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TCAAGTTTCTCTTAGACAATGGCGAATACTTGTAGAATCAGCTTTATCTGCATCATGGTC
CTCTTGCTCTTCACTAATCACTTAGCTCTTTCTTCTTCTGCCCGGCTCCGATTTATAGAA
GGTCAAGATCTTGTTCACGGGAAGCAAACCAATCTCTTGAACCTTGATGAGATTGAGAAA
GCTGATAGGGCACGTCTCGGTTACTTGTTTGGCATGATTGATGAGGCAGAGACCAATCGC
GTCGAGGAGGTTGATTGTCTCTCGCCTCCGTTTTGCTCCAAGCCTCTATATGTTTGAAGC
TCTTATAAGCACGTGCTCATGATATTAATTTATGATGAGTCTGCTTGTACGGGGCATATG
AAAGAGAACAATAATTCTTCATTGGTGGAGATGAAGTAACTGAACCAATAATAGCACACA
AATTTAGAAGTGTACTGTCTTTCTGTTTGGTTTTTTGTTTTCGTTTTCTTTTTCTTGTTC
AATAAGTTAGCGTTTAAGGTTTCGCTCTTAGGATATAGTTTCGTTGAAATTGATGAATAA
TATGAGAATTGCTTGCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4AA51TF 445 0 0
TTATAGAAGGTCAAGATCTTGTTCACGGGAAGCAAACCAATCTCTTGAACCTTGATGAGA
TTGAGAAAGCTGATAGGGCACGTCTCGGTTACTTGTTTGGCATGATTGATGAGGCAGAGA
CCAATCGCGTCGAGGAGGTTGATTGTCTCTCGCCTCCGTTTTGCTCCAAGCCTCTATATG
TTTGAAGCTCTTATAAGCACGTGCTCATGATATTAATTTATGATGAGTCTGCTTGTACGG
GGCATATGAAAGAGAACAATAATTCTTCATTGGTGGAGATGAAGTAACTGAACCAATAAT
AGCACACAAATTTAGAAGTGTACTGTCTTTCTGTTTGGTTTTTTGTTTTCGTTTTCTTTT
TCTTGTTCAATAAGTTAGCGTTTAAGGTTTCGCTCTTAGGATATAGTTTCGTTGAAATTG
ATGAATAATATGAGAATTGCTTGCC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL4987Contig1 878 2 4 U
TAGAGAAAGGAGAAGAACCGGCGGCGCTCATCACCACCACCGCCACCATCGTTCGTTACA
ACCACCAGCATCGCCATCTCTCCCGTCCCCCATCGCTTGTAACGACCACCATCGCTTCTC
AGATCCGTCTTCACCAGAGTCGCCACCACCACCCGTCACGCTCATCATAACCACAACTGA
TCAGTTCTCTGTCTCTCATTCCCTCTGTGTTTATTTTATTTTGTTCTTGTTACAGGAAGC
TTGTTCCAAGAAATTGCTCAATGATAGGCTGAAGTGAAGTTTATGCTTTATATGATTTGA
TTTGAAGTTTAAATTCGTTTTTTTTAATTATGTGTGTTGCAGAAGTCCAAGAGGGATGAG
TATGCCAAAACTGTCTCCAAACGTTTGCAAGATATAGTTTAAGCTTGTCTGATTTGTTTG
TTTAGAGTGTTTGCTCAAATTACTCAACTTTCTTATGGTTGTTGCTGGACTTGGCATGAT
CGTTTATGGTATCTACTTGTTTGTCAAGTACAAGAGAGCACCCGATGATAACTCTCTTAA
CTTCAACGGCGACGGCCAGAGTTACATCTCTTTCGGGAGGCCCATGCTTAGGGCTGTCTC
TCTCTCTTCCAATGTCTTTGACAATCTCCCCAAAGTTTGGTTTATCTACTTGTTCATTGG
GTGGCTCTGTTTGTTATCTCTGGTGGAAGCTTTATGAAGGTGCTCAGACTTTGAGGAAGG
TGGAAGCTTGATGGAGGTGCTCGATGCCATTCAAAGTAGATATCTTGCTGGTGTTTGAAG
TGTCGATAGTGGATAATGTTGTATGTACTTGTGTGTGATGATTTGTATGAAAGTGATAAT
GTGGTGTTATGGGATTTAAATAATTATATTGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C676TF U 1
AF RR4C676JQ C 131
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BS 155 582 RR4C676TF
BS 583 878 RR4C676JQ

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ACCACCAGCATCGCCATCTCTCCCGTCCCCCATCGCTTGTAACGACCACCATCGCTTCTC
AGATCCGTCTTCACCAGAGTCGCCACCACCACC*GTCACGCTCATCATAACCACAACTGA
TCAGTTCTCTGTCTCTCATTCCCTCTGTGTTTATTTTATTTTGTTCTTGTTACAGGAAGC
TTGTTCCAAGAAATTGCTCAATGATAGGCTGAAGTGAAGTTTATGCTTTATATGATTTGA
TTTGAAGTTTAAATTCGTTTTTTTTAATTATGTGTGTTGCAGAAGTCCAAGAGGGATGAG
TATGCCAAAACTGTCTCCAAACGTTTGCAAGATATAGTTTAAGCTTGTCTGATTTGTTTG
TTTAGAGTGTTTGCTCAAATTACTCAACTTTCTTATGGTTGTTGCTGGACTTGGCATGAT
CGTTTATGGTATCTACTTGTTTGTCAAGTACAAGAGAGCACCCGATGATAACTCTCTTAA
CTTCAACGGCGACGGCCAGAGTTACATCTCTTTCGGGAGGCC
ATGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4C676JQ 748 0 0
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GTCTCTCATTCCCTCTGTGTTTATTTTATTTTGTTCTTGTTACAGGAAGCTTGTTCCAAG
AAATTGCTCAATGATAGGCTGAAGTGAAGTTTATGCTTTATATGATTTGATTTGAAGTTT
AAATTCGTTTTTTTTAATTATGTGTGTTGCAGAAGTCCAAGAGGGATGAGTATGCCAAAA
CTGTCTCCAAACGTTTGCAAGATATAGTTTAAGCTTGTTTGATTTGTTTGTTTAGAGTGT
TTGCTCAAATTACTCAACTTTCTTATGGTTGTTGCTGGACTTGGCATGATCGTTTATGGT
ATCTACTTGTTTGTCAAGTACAAGAGAGCACCCGATGATAACTCTCTTAACTTCAACGGC
GACGGCCAGAGTTACATCTCTTTCGGGAGGCCCATGCTTAGGGCTGTCTCTCTCTCTTCC
AATGTCTTTGACAATCTCCCCAAAGTTTGGTTTATCTACTTGTTCATTGGGTGGCTCTGT
TTGTTATCTCTGGTGGAAGCTTTATGAAGGTGCTCAGACTTTGAGGAAGGTGGAAGCTTG
ATGGAGGTGCTCGATGCCATTCAAAGTAGATATCTTGCTGGTGTTTGAAGTGTCGATAGT
GGATAATGTTGTATGTACTTGTGTGTGATGATTTGTATGAAAGTGATAATGTGGTGTTAT
GGGATTTAAATAATTATATTGTTTTTTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4988Contig1 1055 2 2 U
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TTGCAATCGCTCCGAGATTAAAAGATTCCGCCATGGACGATAATAGACAATCTCCATCGA
CGGCGATACTTCAATTCGCTCCATTGAACAGCTCCGTCGACGAAGGTTTCTGGCACAGCT
TTTCCTCTCTGAAACTCGATAAGCTCGGAATCGACGATTCTCCGATCCCCATCACCGGTT
TCTATGCACCGTGTTCTCATCCACAAGTCTCAAACCATCTGACTCTTCTTTCCGAGTCAT
TATTGCTTTCTTCAGATCAACAGTCATCGTCGATTCACGGGAATAGGAACAAGTGTCCTG
TTCCAGGGACTCTCTACAACACCAACACCGTCGAAAACTTTACTAAACTCGACAAACAAA
GCTTGTTAAAAGCAGAAGCAAACAAGATTTGGGAAGATATTCAATCGGGAAAAGCTCTCG
AGGACTGTGCTTGTTTAGCTAGGTTCTTTGTTATCTCGTTTGCTGACCTTAAGAAGTGGA
GTTTTCGTTATTGGTTTGCGTTCCCTGCTCTTGTGCTTGATCCTCCTGCGAGTTTGGTCG
AATTAAAGCCAGCTTCACAGCATTTTACTCTAGAAGAAGCAGAATCAGTATCTGCTGCTT
GTAATGAGTGGAGAGACTCAAGTTTAACTACAGATGTTCCGTTCTTTCTGGTTTCGGTTT
CTTCTGATGATTCAAGAGCTACCATCAGACATCTTAAAGACTGGGAAGCTTGCCAAGAAG
ATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGG
TACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATA
ATCAAGATTGCTTTTTTCTTTTGGGATTAGCATTTTCTCAAGTTTTATGATTCTAAGTGA
TATGACTTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTAACACTCCTTTTGAGTGATGTTACCAAGT
ATCCTATGGCAATAGTTACTTCATGTCATTTGTTT


BQ
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AF RR4ED04TF U 1
AF RR4ED04JQ C 263
BS 1 712 RR4ED04TF
BS 713 1055 RR4ED04JQ

RD RR4ED04TF 712 0 0
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TTGCAATCGCTCCGAGATTAAAAGATTCCGCCATGGACGATAATAGACAATCTCCATCGA
CGGCGATACTTCAATTCGCTCCATTGAACAGCTCCGTCGACGAAGGTTTCTGGCACAGCT
TTTCCTCTCTGAAACTCGATAAGCTCGGAATCGACGATTCTCCGATCCCCATCACCGGTT
TCTATGCACCGTGTTCTCATCCACAAGTCTCAAACCATCTGACTCTTCTTTCCGAGTCAT
TATTGCTTTCTTCAGATCAACAGTCATCGTCGATTCACGGGAATAGGAACAAGTGTCCTG
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GCTTGTTAAAAGCAGAAGCAAACAAGATTTGGGAAGATATTCAATCGGGAAAAGCTCTCG
AGGACTGTGCTTGTTTAGCTAGGTTCTTTGTTATCTCGTTTGCTGACCTTAAGAAGTGGA
GTTTTCGTTATTGGTTTGCGTTCCCTGCTCTTGTGCTTGATCCTCCTGCGAGTTTGGTCG
AATTAAAGCCAGCTTCACAGCATTTTACTCTAGAAGAAGCAGAATCAGTATCTGCTGCTT
GTAATGAGTGGAGAGACTCAAGTTTAACTACAGATGTTCCGTTCTTTCTGGT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4ED04JQ 793 0 0
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GTCATCGTCGATTCACGGGAATAGGAACAAGTGTCCTGTTCCAGGGACTCTCTACAACAC
CAACACCGTCGAAAACTTTACTAAACTCGACAAACAAAGCTTGTTAAAAGCAGAAGCAAA
CAAGATTTGGGAAGATATTCAATCGGGAAAAGCTCTCGAGGACTGTGCTTGTTTAGCTAG
GTTCTTTGTTATCTCGTTTGCTGACCTTAAGAAGTGGAGTTTTCGTTATTGGTTTGCGTT
CCCTGCTCTTGTGCTTGATCCTCCTGCGAGTTTGGTCGAATTAAAGCCAGCTTCACAGCA
TTTTACTCTAGAAGAAGCAGAATCAGTATCTGCTGCTTGTAATGAGTGGAGAGACTCAAG
TTTAACTACAGATGTTCCGTTCTTTCTGGTTTCGGTTTCTTCTGATGATTCAAGAGCTAC
CATCAGACATCTTAAAGACTGGGAAGCTTGCCAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTC
CTCACTGGATTCGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACT
GGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGATTGCTTTTTTCTTTT
GGGATTAGCATTTTCTCAAGTTTTATGATTCTAAGTGATATGACTTTTTGTCAGATTTAT
GTAAGACTTAACACTCCTTTTGAGTGATGTTACCAAGTATCCTATGGCAATAGTTACTTC
ATGTCATTTGTTT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL4989Contig1 857 2 2 U
GGAAATCTAAACTAATAATAATATGGCCACTAAAATCTTCTCCCCAACTCCTCCCGTCAT
CTCCGCCACCTCAGCCACCACCAAAACGCCGGTCCTCCCCAAGGCGATAGTATCGCGATG
TCTAGGAACCTCTCTTTCTGCCGTTGTCGCCGCGACTGCCGTCCTGACGATGGTTCCGGC
GTTGCCTGCTGCGGGTGAGGGAAACCAAGCTTACAAATTATACTACGGGACAGCAGCGAG
CGCGGCGAACTATGGCGGATACGGAGGGAACTCGGACAGGAAGACATCGGCCGAGTATGT
TTACGACGTGCCGGAAGGGTGGAAGGAGAGACTGGTGTCGAAAGTGGAGAAGGGCACAAA
CGGAACAGACAGCGAATTCTACAACCCGAAGAAGAGGACAGAGAAGGAGTACCTTACGTT
CTTGTCGGGGTTCAGACAGCTGGCGCCGAGGGATGTGATCCTCAACAACCTTGCCTTGTC
GGACGTGGAGCTCCAGGATCTGATAGCAAGCGCTGATAAAGTGGTGTCCGAGGAAAAGAA
AGATGAAGAGACAGGGCAGGTGTACTATCTATACGAGATCGATGGAGTAGGGAAGCACAG
TCTGATAACAGTCACTTTCGCTAAGAACAAGCTATATGCCCATTTCGTCAACGCCCCTGC
GCCCGAGTGGAACCGCGACCAAGACACATTAACCCACCTTCGGGACTCCTTCAAGACCGT
ATCTTCTTCTTGATTCTCCTACTCGTTTCTTGTTGATTTGGATGTATCGATATGATCAAT
CATCCTTGTTGGATTGTATCTTGTTGAATATTGTACATGGAAGAGTTGAAGTTTGCATTG
CAATCCTTATCTCATCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C796TF U 1
AF RR4C796JQ C 254
BS 1 698 RR4C796TF
BS 699 857 RR4C796JQ

RD RR4C796TF 698 0 0
GGAAATCTAAACTAATAATAATATGGCCACTAAAATCTTCTCCCCAACTCCTCCCGTCAT
CTCCGCCACCTCAGCCACCACCAAAACGCCGGTCCTCCCCAAGGCGATAGTATCGCGATG
TCTAGGAACCTCTCTTTCTGCCGTTGTCGCCGCGACTGCCGTCCTGACGATGGTTCCGGC
GTTGCCTGCTGCGGGTGAGGGAAACCAAGCTTACAAATTATACTACGGGACAGCAGCGAG
CGCGGCGAACTATGGCGGATACGGAGGGAACTCGGACAGGAAGACATCGGCCGAGTATGT
TTACGACGTGCCGGAAGGGTGGAAGGAGAGACTGGTGTCGAAAGTGGAGAAGGGCACAAA
CGGAACAGACAGCGAATTCTACAACCCGAAGAAGAGGACAGAGAAGGAGTACCTTACGTT
CTTGTCGGGGTTCAGACAGCTGGCGCCGAGGGATGTGATCCTCAACAACCTTGCCTTGTC
GGACGTGGAGCTCCAGGATCTGATAGCAAGCGCTGATAAAGTGGTGTCCGAGGAAAAGAA
AGATGAAGAGACAGGGCAGGTGTACTATCTATACGAGATCGATGGAGTAGGGAAGCACAG
TCTGATAACAGTCACTTTCGCTAAGAACAAGCTATATGCCCATTTCGTCAACGCCCCTGC
GCCCGAGTGGAACCGCGACCAAGACACATTAACCCACC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4C796JQ 604 0 0
GGCGGATACGGAGGGAACTCGGACAGGAAGACATCGGCCGAGTATGTTTACGACGTGCCG
GAAGGGTGGAAGGAGAGACTGGTGTCGAAAGTGGAGAAGGGCACAAACGGAACAGACAGC
GAATTCTACAACCCGAAGAAGAGGACAGAGAAGGAGTACCTTACGTTCTTGTCGGGGTTC
AGACAGCTGGCGCCGAGGGATGTGATCCTCAACAACCTTGCCTTGTCGGACGTGGAGCTC
CAGGATCTGATAGCAAGCGCTGATAAAGTGGTGTCCGAGGAAAAGAAAGATGAAGAGACA
GGGCAGGTGTACTATCTATACGAGATCGATGGAGTAGGGAAGCACAGTCTGATAACAGTC
ACTTTCGCTAAGAACAAGCTATATGCCCATTTCGTCAACGCCCCTGCGCCCGAGTGGAAC
CGCGACCAAGACACATTAACCCACCTTCGGGACTCCTTCAAGACCGTATCTTCTTCTTGA
TTCTCCTACTCGTTTCTTGTTGATTTGGATGTATCGATATGATCAATCATCCTTGTTGGA
TTGTATCTTGTTGAATATTGTACATGGAAGAGTTGAAGTTTGCATTGCAATCCTTATCTC
ATCG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL4990Contig1 936 2 2 U
GAGCTGTGTCCCGGTCGGTTCGAAGGTGTACGTGTTTAACGACCTCTCAGTGCTCATCTT
CGACTGCACGTCTCACACGGTTCAGCGCATGTCTAACTTTCCTGAGCGGATGTCTTATAA
AGAGGTTAACGTCATCGGGAAGAAGGTTTATGTGATTGGTGATGCGTTGTGTCATTACGT
CGAGCAGACAGGGTGGATGAAATGGTGGAGGAAGGCAGTCACGGTGTTTGATACAGAAAC
CCAATTGTTGGAGCCTAAGTTGGTAAACGAAGACATGGCTGTTGGTCTAGGTCCCTTTTG
GTCTGATTCTGTTGTGATGGATGGTAAGATTTACCTGAAAGGTCACATGAATGGTAATTC
TTTTGCTTACGAACCAGAGGAAAGGAAATGGGAAGTGATGGACGAGGTGATGGATTCTAA
GGAATGGGAGGGTTCGTGTGTGGTTGACGACGTCTTGTACTATCATGATCGGTCCGGGAA
GGCGTTGCGGGCGTATGATCCGAATCAGAGCGGTTGGAGTGTTGTTAATGGTTTGGAGGA
GTTTTTGGCTGTGGAGACTGCTCGTTCAGGTTGGTCAAGAACGGTGAGTTACGGTCCGGA
TAAGCTGGCTCTCTTCTTTCCTAAAAGACAGTACGGCGAGAAGACGATTTGCTGTGCAGA
GATTGCTTTGGAAAGGCGCCAAGGAGGAGAGATTTGGGGTAAGGTCCAGTGGTGTCATAT
TGTCATTGGCGGTGAGCTTTTTGACATGGTGGAATTTGTGGCTGTTACTGTTTGATGCAT
TTATAGATCCCTTCGTATTTTAACTATCCTAAATGATCTTGTGTGGTTGTAAGTTTGCTA
ACATCGGTAATGTAAGACAAAACCTTGAGAGCTTGTTGTTTTGTGTTGTCCTTTAAAACT
CGTGTTATGTTTTAATCTTTAGATTGCTTCCTTGAG


BQ
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AF RR4GC72TF U 1
AF RR4GC72JQ C 120
BS 1 565 RR4GC72TF
BS 566 936 RR4GC72JQ

RD RR4GC72TF 565 0 0
GAGCTGTGTCCCGGTCGGTTCGAAGGTGTACGTGTTTAACGACCTCTCAGTGCTCATCTT
CGACTGCACGTCTCACACGGTTCAGCGCATGTCTAACTTTCCTGAGCGGATGTCTTATAA
AGAGGTTAACGTCATCGGGAAGAAGGTTTATGTGATTGGTGATGCGTTGTGTCATTACGT
CGAGCAGACAGGGTGGATGAAATGGTGGAGGAAGGCAGTCACGGTGTTTGATACAGAAAC
CCAATTGTTGGAGCCTAAGTTGGTAAACGAAGACATGGCTGTTGGTCTAGGTCCCTTTTG
GTCTGATTCTGTTGTGATGGATGGTAAGATTTACCTGAAAGGTCACATGAATGGTAATTC
TTTTGCTTACGAACCAGAGGAAAGGAAATGGGAAGTGATGGACGAGGTGATGGATTCTAA
GGAATGGGAGGGTTCGTGTGTGGTTGACGACGTCTTGTACTATCATGATCGGTCCGGGAA
GGCGTTGCGGGCGTATGATCCGAATCAGAGCGGTTGGAGTGTTGTTAATGGTTTGGAGGA
GTTTTTGGCTGTGGAGACTGCTCGT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4GC72JQ 817 0 0
AAGAGGTTAACGTCATCGGGAAGAAGGTTTATGTGATTGGTGATGCGTTGTGTCATTACG
TCGAGCAGACAGGGTGGATGAAATGGTGGAGGAAGGCAGTCACGGTGTTTGATACAGAAA
CCCAATTGTTGGAGCCTAAGTTGGTAAACGAAGACATGGCTGTTGGTCTAGGTCCCTTTT
GGTCTGATTCTGTTGTGATGGATGGTAAGATTTACCTGAAAGGTCACATGAATGGTAATT
CTTTTGCTTACGAACCAGAGGAAAGGAAATGGGAAGTGATGGACGAGGTGATGGATTCTA
AGGAATGGGAGGGTTCGTGTGTGGTTGACGACGTCTTGTACTATCATGATCGGTCCGGGA
AGGCGTTGCGGGCGTATGATCCGAATCAGAGCGGTTGGAGTGTTGTTAATGGTTTGGAGG
AGTTTTTGGCTGTGGAGACTGCTCGTTCAGGTTGGTCAAGAACGGTGAGTTACGGTCCGG
ATAAGCTGGCTCTCTTCTTTCCTAAAAGACAGTACGGCGAGAAGACGATTTGCTGTGCAG
AGATTGCTTTGGAAAGGCGCCAAGGAGGAGAGATTTGGGGTAAGGTCCAGTGGTGTCATA
TTGTCATTGGCGGTGAGCTTTTTGACATGGTGGAATTTGTGGCTGTTACTGTTTGATGCA
TTTATAGATCCCTTCGTATTTTAACTATCCTAAATGATCTTGTGTGGTTGTAAGTTTGCT
AACATCGGTAATGTAAGACAAAACCTTGAGAGCTTGTTGTTTTGTGTTGTCCTTTAAAAC
TCGTGTTATGTTTTAATCTTTAGATTGCTTCCTTGAG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL4991Contig1 1054 2 6 U
GTTTACCTGGCCAACTAGTACAAGACCTGCGACTTACACAGTATAAATTTATATGAAAAT
TATTTTTAAAAATATGATATGCAAAAAATTTATATTCTTGATTGAATTAATATTTTTGGC
CCTTAAAACATTTTTTAAAACATTTTTATTAATTACATAATTTGTCAACTGATAAGCTGA
TCTCATTTTAAAAATATTTTAGGTCAAAAAATCACTTATCGCATAAGAACCTAACGTTTA
GGTCGGAGAATCTCAGATCTACTATTTAGTTACAATGAAACTATGTCAGCTCGGTTTTAT
ATCATGATTTAGCAAATTTAAGTTCAATTATGGCTATCAATGCAGACCCGACTTGTAAAC
GCTGTGGCAACTCGGAATCTATCATTCATCTTCTCTTCCACTGTCCCTTTGCGCAAAAGG
TATGGTCTTTAGCACCCTTTGTTGAAGAAATGGATGTCAGAGGAATGATAGATTTGGTTG
AGAGCTGGCCATCAATCTGCAACTTAAAATGTTTGCCTCCTACGGGGATTCCCTCAGGCT
CTCTGTTTCCTTGGATCTTATGGTCATTATGGAAAGCTAGGAATATATTTGTTTTTTGAA
GGGTTCTCTCTCTCACCGGAGGACACATTGACTACGGCAATCAAACTGGCTCGAGAATGG
AGTCTAAACAGCAAACCGGAGAAAGTAGTGGGACAGAGAAGTACGAATCCTGTTCCTCCT
CTGCTAGCGGACGAGACTGTGGTTCGATCAGATGCTGCGTGGAATGCTTCTTCGAAGACT
GCAGGACTTGGATGGGCGGTTATAGAGCAACCTCAGAACCGTGAGTTCCAGAAACAGATG
GAGTTCGTCTCGTCGCCTTTAGTGGCGGAGGCCTTGGCTCTGAGAGAAGCAGTCCTTACC
TGTAAACGGTTGGCATTGAAGACAGTGCGTTTTGAGTTGGACTCAGCTCAACTAGTTAAA
TGCTGTAACTCTACAGGAGGCCTCATGGAGATCCATAGTGTAGCTGCTGACATCCTTGCT
CTCTCGATGGATTTTGATTCTGTTTTGTTTGTTT


BQ
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AF RR4AK49TF U 1
AF RR4AK49JQ C 393
BS 1 809 RR4AK49TF
BS 810 810 RR4AK49JQ
BS 811 828 RR4AK49TF
BS 829 829 RR4AK49JQ
BS 830 852 RR4AK49TF
BS 853 1054 RR4AK49JQ

RD RR4AK49TF 852 0 0
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TATTTTTAAAAATATGATATGCAAAAAATTTATATTCTTGATTGAATTAATATTTTTGGC
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ATCATGATTTAGCAAATTTAAGTTCAATTATGGCTATCAATGCAGACCCGACTTGTAAAC
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CTCTGTTTCCTTGGATCTTATGGTCATTATGGAAAGCTAGGAATATATTTGTTTTTTGAA
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AGTCTAAACAGCAAACCGGAGAAAGTAGTGGGACAGAGAAGTACGAATCCTGTTCCTCCT
CTGCTAGCGGACGAGACTGTGGTTCGATCAGATGCTGCGTGGAATGCTTCTTCGAAGACT
GCAGGACTTGGATGGGCGGTTATAGAGCA*CCTCAGAACCGTGAGTTC*AGAAACAGATG
GAGTTCGTCTCG

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4AK49JQ 662 0 0
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TTGCCTCCTACGGGGATTCCCTCAGGCTCTCTGTTTCCTTGGATCTTATGGTCATTATGG
AAAGCTAGGAATATATTTGTTTTT*GAAGGGTTCTCTCTCTCACCGGAGGACACATTGAC
TACGGCAATCAAACTGGCTCGAGAATGGAGTCTAAACAGCAAACCGGAGAAAGTAGTGGG
ACAGAGAAGTACGAATCCTGTTCCTCCTCTGCTAGCGGACGAGACTGTGGTTCGATCAGA
TGCTGCGTGGAATGCTTCTTCGAAGACTGCAGGACTTGGATGGGCGGTTATAGAGCAACC
TCAGAACCGTGAGTTCCAGAAACAGATGGAGTTCGTCTCGTCGCCTTTAGTGGCGGAGGC
CTTGGCTCTGAGAGAAGCAGTCCTTACCTGTAAACGGTTGGCATTGAAGACAGTGCGTTT
TGAGTTGGACTCAGCTCAACTAGTTAAATGCTGTAACTCTACAGGAGGCCTCATGGAGAT
CCATAGTGTAGCTGCTGACATCCTTGCTCTCTCGATGGATTTTGATTCTGTTTTGTTTGT
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL4992Contig1 1110 2 6 U
GGTTGGAAGTGGGTTTGATGTCAGCTGTGCGGTCTATGGGAGTCAGCGTTATGTTCGCTT
CTCTCCGGAAGTCTTGTCATTTGCTAAGGTTGCAGTTACGGGTTTGCCATTACATGAAGT
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AGACCACTGGGATGTTTATCTAGGAGTCATCAAGTTTTGTAGTGTGCTTACTTCTGAAAA
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AAGAGATGCTATGTTGAGGATTAGGATTCTTATGCGGTAGATGGGTGAAGCTGCTGGTGT
TCCAATAGAACCTGAATCTCAAACTCAACTTTTGGATTCTACAATGAATGCGGGGGTTCT
ACTTGCTGGTGTTCCTGGGGCTGGTGGGTTTGATGCCATATTTGCAATTACTCTATGGGA
TTCTGGAAGCAAACTGACCCAGGCATGGAGTTCACACAATGTTCTGGCGTTGTTGGTGAA
AGAAGATCCACACGGCGTTTGCCTAGAAAGTAGTGATCCACGCACCACAGGTATTACTTC
AGGCGTTTCATCAATTCATATTGAGTAAGCAACATTGGTTGGCAGCGTCCAATGAATTAG
GCTCATCACCAAGGCTGGTTGAGTATACTATTTTGCATATAGACTTGGGTGCTAAGTGCA
TCTTTTCACCCATTTGTAAGTCTTTTGACTCTTTGGAAAAAACTAGCGGAAAGAAAAAAC
AAATTAAGGAATAATTTAGAATGTTCTTATTTGTGTTTGTTTCAATTCACTGCTTCTGAC
GTTGGTATCTCAATGCTTGAAAAAGTAGTATCCAAATCTACATTGATCTTTACAAGAACA
AGTTTCATAGACTATCGAGATTTTCTTTGC


BQ
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AF RR4FP28TF U 1
AF RR4FP28JQ C 246
BS 1 612 RR4FP28TF
BS 613 613 RR4FP28JQ
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BS 700 721 RR4FP28TF
BS 722 1110 RR4FP28JQ

RD RR4FP28TF 721 0 0
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CTCTCCGGAAGTCTTGTCATTTGCTAAGGTTGCAGTTACGGGTTTGCCATTACATGAAGT
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AAGAGATGCTATGTTGAGGATTAGGATTCTTATGCGGTAGATGGGTGAAGCTGCTGGTGT
TCCAATAGAACCTGAATCTCAAACTCAACTTTTGGATTCTACAATGAATGCGGGGGTTCT
ACTTGCTGGTGT*CCTGGGGCTGGTGGGTTTGATGCCATATTTGCAATTACTCTATGGGA
TTCTGGAAGCAAACTGACCCAGGCATGGAGTTCACACA*TGTTCTGGCGTTGTTGGTGAA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FP28JQ 865 0 0
TGCTGTAAG
AGTGGCAAACGTCTGATCCAGAGAA*GCACGAGAAAACTG*CAAAAGT*GTCTGATGCAA
ATTTGGAGCTGGAAACTAAGCTAAACAGTCTGAGCAAATTAGCCAAAGACCACTGGGATG
TTTATCTAGGAGTCATCAAGTTTTGTAGTGTGCTTACTTCTGAAAAGTGGGTGCTACATG
CTACTGAACCAATCAACGAAGCGGTTATTAGAGAACTCTTAGGAGCAAGAGATGCTATGT
TGAGGATTAGGATTCTTATGCGGTAGATGGGTGAAGCTGCTGGTGTTCCAATAGAACCTG
AATCTCAAACTCAACTTTTGGATTCTACAATGAATGCGGGGGTTCTACTTGCTGGTGTTC
CTGGGGCTGGTGGGTTTGATGCCATATTTGCAATTACTCTATGGGATTCTGGAAGCAAAC
TGACCCAGGCATGGAGTTCACACAATGTTCTGGCGTTGTTGGTGAAAGAAGATCCACACG
GCGTTTGCCTAGAAAGTAGTGATCCACGCACCACAGGTATTACTTCAGGCGTTTCATCAA
TTCATATTGAGTAAGCAACATTGGTTGGCAGCGTCCAATGAATTAGGCTCATCACCAAGG
CTGGTTGAGTATACTATTTTGCATATAGACTTGGGTGCTAAGTGCATCTTTTCACCCATT
TGTAAGTCTTTTGACTCTTTGGAAAAAACTAGCGGAAAGAAAAAACAAATTAAGGAATAA
TTTAGAATGTTCTTATTTGTGTTTGTTTCAATTCACTGCTTCTGACGTTGGTATCTCAAT
GCTTGAAAAAGTAGTATCCAAATCTACATTGATCTTTACAAGAACAAGTTTCATAGACTA
TCGAGATTTTCTTTGC

QA 10 865 10 865
DS 



AS 1 2

CO CL4993Contig1 937 2 6 U
GGGAGTTTGACTCCTAACCCTAGCCACCGCAACCGAGGCCTCACCGCAACCAGATGCAGA
TCCGATGCCACTGAGATCTTTTCCTCCAACAGAAAGACGAACCCAGGCACCAGTGACTGG
CTAGAGGCTTCTGAGTTCTGACTGTTTCCCCGTCGCCTTGTAACGGAAAGAGCCCGCCGT
TAGACCTACGAGCCACAAAATTACAGAGTTCTCGTTTAATTGTGTTGTTGTGCAGATTCC
TGGGGTTGGTAACCAGTACAGGTACCGGCGAAGCTGTCGAAACCCTAGTGCCTCCAGCAA
CATTTCTCGTCCTCTTCAGCAAATCCGGCACCACCGAGGAGCTTCTCTTTCTCGTCCCCT
GCGAACCAAGTAGGAGTATGCAGCTAATCATCGGGAAGAGCTTAATCTTCAAGAGAGATG
AGCTTCCTGTTTGTAAAGGAGGAGACTTGAGAAGTTATCTTCAAATTCAGTGCTGGAGAA
ACGTGTAACAGGAAGCCGAGGACAATTGGATCAGAGATGATCATGGATCGACTAACTATG
CTGCCGATAAGGTCTTGGAAATGATCCGACCCTTGGAAGCATGTGCACAAGTGGACCAGT
TGCCTTGCTGTTGAGAAGGAAGAGTGGAAATTTGATACACTGTGATTTATGACACGCACT
CGAGCTGTTATCTTCTGCAACACTAAACGAAAGGTTTGCTTGGTTTCTGCAACTCTTCCT
CACGAGATTTTGGAGATGACATCAAATTTTATGACGGAGCCCATGAAGATACTTGTGAAG
CTTGATGAGTAGACTCTTGACGGCAAGAGGATTAAGTTTAGATTTTTGGTTTATTTAAGT
TTATCATTTAGTTTAGGTTCTTTTCTGGTTTTAGTTTGGTAAACTGGAATTTGGTTGTAA
ACTGATTTTAATTTATAAATAAAATTATTTTTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G371TF U 1
AF RR4G371JQ C 298
BS 1 569 RR4G371TF
BS 570 570 RR4G371JQ
BS 571 693 RR4G371TF
BS 694 694 RR4G371JQ
BS 695 752 RR4G371TF
BS 753 937 RR4G371JQ

RD RR4G371TF 752 0 0
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TCCGATGCCACTGAGATCTTTTCCTCCAACAGAAAGACGAACCCAGGCACCAGTGACTGG
CTAGAGGCTTCTGAGTTCTGACTGTTTCCCCGTCGCCTTGTAACGGAAAGAGCCCGCCGT
TAGACCTACGAGCCACAAAATTACAGAGTTCTCGTTTAATTGTGTTGTTGTGCAGATTCC
TGGGGTTGGTAACCAGTACAGGTACCGGCGAAGCTGTCGAAACCCTAGTGCCTCCAGCAA
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GCGAACCAAGTAGGAGTATGCAGCTAATCATCGGGAAGAGCTTAATCTTCAAGAGAGATG
AGCTTCCTGTTTGTAAAGGAGGAGACTTGAGAAGTTATCTTCAAATTCAGTGCTGGAGAA
ACGTGTAACAGGAAGCCGAGGACAATTGGATCAGAGATGATCATGGATCGACTAACTATG
CTGCCGATAAGGTCTTGGAAATGATCCGAGCCTTGGAAGCATGTGCACAAGTGGACCAGT
TGCCTTGCTGTTGAGAAGGAAGAGTGGAAATTTGATACACTGTGATTTATGACACGCACT
CGAGCTGTTATCTTCTGCAACACTAAACGAAAG*TTTGCTTGGTTTCTGCAACTCTTCCT
CACGAGATTTTGGAGATGACATCAAATTTTAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4G371JQ 640 0 0
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CCTGCGAACCAAGTAGGAGTATGCAGCTAATCATCGGGAAGAGCTTAATCTTCAAGAGAG
ATGAGCTTCCTGTTTGTAAAGGAGGAGACTTGAGAAGTTATCTTCAAATTCAGTGCTGGA
GAAACGTGTAACAGGAAGCCGAGGACAATTGGATCAGAGATGATCATGGATCGACTAACT
ATGCTGCCGATAAGGTCTTGGAAATGATCCGACCCTTGGAAGCATGTGCACAAGTGGACC
AGTTGCCTTGCTGTTGAGAAGGAAGAGTGGAAATTTGATACACTGTGATTTATGACACGC
ACTCGAGCTGTTATCTTCTGCAACACTAAACGAAAGGTTTGCTTGGTTTCTGCAACTCTT
CCTCACGAGATTTTGGAGATGACATCAAATTTTATGACGGAGCCCATGAAGATACTTGTG
AAGCTTGATGAGTAGACTCTTGACGGCAAGAGGATTAAGTTTAGATTTTTGGTTTATTTA
AGTTTATCATTTAGTTTAGGTTCTTTTCTGGTTTTAGTTTGGTAAACTGGAATTTGGTTG
TAAACTGATTTTAATTTATAAATAAAATTATTTTTATTTC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL4994Contig1 674 2 3 U
GGACGTTAGCAAAGACCGTAGTATGAATATATTCTTCATATCTGTGTGACAACAGCTTGC
ACGTGTGTACATATAGATATGATTTTTAAGTGCCTCTGGCTAGCATTTCCTGATACCTCT
TGAATGACAAGAGTTTTTGAAGCTTCATCTGCTTATGAAATCTTGAAATGAAGAGATCTG
CGACATGGTCGATCTCATCTTCTAGCTTGAAACTCGCTCCTTCTTCTTCCTTCGAGCTCC
TCACCATATCTATCACAGAACTTCCTTGACATTCATCCAACTCCTCAAAATCCTCTTCTC
CTTCGAACAACTTGTGAGTCATATCAGGATACTTTTCGTTTCCCTCCTCTTGTACGTCGT
AAATCTCATGGTTAGCCACTGTGGATACCCCATTATTGTATAGGATTATAGCCTTGCTCT
CGTCTTGGTCGTGGTCGGTGTCTTGGCCTTGATCTGCATGACCTAGGAGGTTGTGGATCT
TGTTGGAAATAGAACGGAAACCGAGCTTCTTGTCTTTCACGAGGGACAACATGAGGAGTC
TTGTTTTGAAGGCACTCGTGATCTGTTTGATCCATGCCTTGGCTTTCTTCATTTTTCTCT
TTGTAAGAGCTATAAGCTTCAAAACAATGATTGTTAATGGTGTTTCTTCTACGGTGAAAG
ATGATGTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM41JQ U 44
AF RR4FM41TF C 1
BS 1 43 RR4FM41TF
BS 44 489 RR4FM41JQ
BS 490 674 RR4FM41TF

RD RR4FM41JQ 446 0 0
GTGTGACAACAGCTTGCACGTGTGTACATATAGATATGATTTTTAAGTGCCTCTGGCTAG
CATTTCCTGATACCTCTTGAATGACAAGAGTTTTTGAAGCTTCATCTGCTTATGAAATCT
TGAAATGAAGAGATCTGCGACATGGTCGATCTCATCTTCTAGCTTGAAACTCGCTCCTTC
TTCTTCCTTCGAGCTCCTCACCATATCTATCACAGAACTTCCTTGACATTCATCCAACTC
CTCAAAATCCTCTTCTCCTTCGAACAACTTGTGAGTCATATCAGGATACTTTTCGTTTCC
CTCCTCTTGTACGTCGTAAATCTCATGGTTAGCCACTGTGGATACCCCATTATTGTATAG
GATTATAGCCTTGCTCTCGTCTTGGTCGTGGTCGGTGTCTTGGCCTTGATCTGCATGACC
TAGGAGGTTGTGGATCTTGTTGGAAA

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4FM41TF 674 0 0
GGACGTTAGCAAAGACCGTAGTATGAATATATTCTTCATATCTGTGTGACAACAGCTTGC
ACGTGTGTACATATAGATATGATTTTTAAGTGCCTCTGGCTAGCATTTCCTGATACCTCT
TGAATGACAAGAGTTTTTGAAGCTTCATCTGCTTATGAAATCTTGAAATGAAGAGATCTG
CGACATGGTCGATCTCATCTTCTAGCTTGAAACTCGCTCCTTCTTCTTCCTTCGAGCTCC
TCACCATATCTATCACAGAACTTCCTTGACATTCATCCAACTCCTCAAAATCCTCTTCTC
CTTCGAACAACTTGTGAGTCATATCAGGATACTTTTCGTTTCCCTCCTCTTGTACGTCGT
AAATCTCATGGTTAGCCACTGTGGATACCCCATTATTGTATAGGATTATAGCCTTGCTCT
CGTCTTGGTCGTGGTCGGTGTCTTGGCCTTGATCTGCATGACCTAGGAGGTTGTGGATCT
TGTTGGAAATAGAACGGAAACCGAGCTTCTTGTCTTTCACGAGGGACAACATGAGGAGTC
TTGTTTTGAAGGCACTCGTGATCTGTTTGATCCATGCCTTGGCTTTCTTCATTTTTCTCT
TTGTAAGAGCTATAAGCTTCAAAACAATGATTGTTAATGGTGTTTCTTCTACGGTGAAAG
ATGATGTTGCTTCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL4995Contig1 809 2 6 U
GGCTGCTCCGGTATGGATTCTGCTGGAGAGATCGTCGTCAACGATGGCAAAATCACTCTC
GAGGGTTTCACTGTAGCTGCTCGAGCTTTCTCCGATAAATGGAAAAGACATAACCTTTCT
CTCCCTCCTTGGTCATGGGTTCCTCTGATCAACCGAACTATTTTACCTAAGAAGGAGGAA
GGTTACTTATCGCTAGAGAAAGTCATCATTCTCACTTCACTTGATGGAAGTGCTGAACAG
GAGTCTATAGATGCAACATCTTATTGGTCTGAGAAGGAAGAAGCAGATGATGATGATCAC
ACGGTCTTGGTGTTACAAAACGTTGAAGATGAAGCGCACTACTATGATTACCATATCGTT
TACAGTGCATCTTACATGGTTCCTATGCTATACTTTCGTGGATACTCTAGTGATGGAAAG
CCTCTATCTATGGATGTGATCAAAAGAGATCTGCCCTCGAGCTCTGTTAGTCTTTTGTTG
GAATCCAAGTGGACATTTATAACACAGGAGGAACATCCGTATTTGAACAGGCCGTGGTTC
AAGCTGCATCCATGTGGAACTGAGGAATGGATCAAGCTGCTTTCCGAAAGCAGCAGCTTA
AATGACTGTCGGATGCCGATTGATTTGTACTTGGTTTCATGGTTCTCTGTTGTTGGGCAG
GTGGTTGGTCTTAAAATCCCTCATGAGATGCTGATTTAGATATGGTCTGTATTCCAATTA
TAGGATTAGTCGATGGCTCTAAAGCCCTCAAGACGATGCGGTTACTATGGTACACATTTG
TGAATGATCTTTTCACATGACACATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4ED67TF U 1
AF RR4ED67JQ C 271
BS 1 660 RR4ED67TF
BS 661 661 RR4ED67JQ
BS 662 712 RR4ED67TF
BS 713 713 RR4ED67JQ
BS 714 724 RR4ED67TF
BS 725 809 RR4ED67JQ

RD RR4ED67TF 724 0 0
GGCTGCTCCGGTATGGATTCTGCTGGAGAGATCGTCGTCAACGATGGCAAAATCACTCTC
GAGGGTTTCACTGTAGCTGCTCGAGCTTTCTCCGATAAATGGAAAAGACATAACCTTTCT
CTCCCTCCTTGGTCATGGGTTCCTCTGATCAACCGAACTATTTTACCTAAGAAGGAGGAA
GGTTACTTATCGCTAGAGAAAGTCATCATTCTCACTTCACTTGATGGAAGTGCTGAACAG
GAGTCTATAGATGCAACATCTTATTGGTCTGAGAAGGAAGAAGCAGATGATGATGATCAC
ACGGTCTTGGTGTTACAAAACGTTGAAGATGAAGCGCACTACTATGATTACCATATCGTT
TACAGTGCATCTTACATGGTTCCTATGCTATACTTTCGTGGATACTCTAGTGATGGAAAG
CCTCTATCTATGGATGTGATCAAAAGAGATCTGCCCTCGAGCTCTGTTAGTCTTTTGTTG
GAATCCAAGTGGACATTTATAACACAGGAGGAACATCCGTATTTGAACAGGCCGTGGTTC
AAGCTGCATCCATGTGGAACTGAGGAATGGATCAAGCTGCTTTCCGAAAGCAGCAGCTTA
AATGACTGTCGGATGCCGATTGATTTGTACTTGGTTTCATGGTTCTCTGTTGTTGGGCAG
*TGGTTGGTCTTAAAATCCCTCATGAGATGCTGATTTAGATATGGTCTGTAT*CCAATTA
TAGG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4ED67JQ 539 0 0
GAGAAGGAAGAAGCAGATGATGATGATCACACGGTCTTGGTGTTACAAAACGTTGAAGAT
GAAGCGCACTACTATGATTACCATATCGTTTACAGTGCATCTTACATGGTTCCTATGCTA
TACTTTCGTGGATACTCTAGTGATGGAAAGCCTCTATCTATGGATGTGATCAAAAGAGAT
CTGCCCTCGAGCTCTGTTAGTCTTTTGTTGGAATCCAAGTGGACATTTATAACACAGGAG
GAACATCCGTATTTGAACAGGCCGTGGTTCAAGCTGCATCCATGTGGAACTGAGGAATGG
ATCAAGCTGCTTTCCGAAAGCAGCAGCTTAAATGACTGTCGGATGCCGATTGATTTGTAC
TTGGTTTCATGGTTCTCTGTTGTTGGGCAGGTGGTTGGTCTTAAAATCCCTCATGAGATG
CTGATTTAGATATGGTCTGTATTCCAATTATAGGATTAGTCGATGGCTCTAAAGCCCTCA
AGACGATGCGGTTACTATGGTACACATTTGTGAATGATCTTTTCACATGACACATTTGC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL4996Contig1 968 2 2 U
TTTTTCTGATGGCAAAAATCGTAAACAGGTACCCATGAAGAAAGAAAATGGTCAAACAGC
TTTGGTGCCACTTTTCCAGAGTCAAGAAACTTTTTCCGGGAAGGTTTGCATTGAACCATA
TCAAGAGAAAAAGGTGGAGCATAATGGTGTCAAAGTTGAGCTTCTTGGTCAAATAGAAAT
GTACTTTGACAGAGGAAACTTCTATGACTTCACTTCCTTGGTTCGTGAATTGGATGTCCC
TGGAGATATATACGAGAGAAAGACATACCCTTTCGAGTTTCCAACTGTCGAGATGCCATA
TGATACATACAATGGTGTCAATGTGCGCCTAAGAGATGTCCTCAAAGTTACCGTCACTCG
TGGCTACGCTGGAAGCATCGTGGAATACCAGGAATTCATGGTTCGGAACTATGCTCCACC
TCCTCCAATTAATAACAGCATCAAGATGGAAGTTGGGATAGAGGATTGCCTGCACATTGA
GTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTATCACCTAAAAGATGTCATCCTTGGCAAAATATACTT
TCTTCTTGTGAGGATCAAGATGAAGAATATGGATCTTGAGATACGGAGGTGGGAATCAAC
AGGTGCTGGTGCTAATACTCATGTCGAGACAGAAACACTTGCCGAATTTGAGTTGATGGA
TGGAACCCCAGTTAGAGGTGAGTCAATACCTGTAAGACTGTTTCTTGCCCCGTACGATCT
TACACCAACGCATCGCAACATCAACAACAAATTCAGCGTCAAGTATTATCTAAATCTTGT
ACTGGTTGATGAAGAGGATCGCAGATACTTCAAGCAGCAAGAAATCACGTTGTACAGGTT
GAAGGCAGACACATCATCTGTTTGAGTCTTGTGTAAAGCCTTTTTAGACTTTGTGTACTC
AGATTTTAGCTAAAGACTTTGTTATTTGGGTTTGGAAGTTAGAATGAATAATAGTTTGGT
CATTGATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G627TF U 1
AF RR4G627JQ C 223
BS 1 668 RR4G627TF
BS 669 968 RR4G627JQ

RD RR4G627TF 672 0 0
TTTTTCTGATGGCAAAAATCGTAAACAGGTACCCATGAAGAAAGAAAATGGTCAAACAGC
TTTGGTGCCACTTTTCCAGAGTCAAGAAACTTTTTCCGGGAAGGTTTGCATTGAACCATA
TCAAGAGAAAAAGGTGGAGCATAATGGTGTCAAAGTTGAGCTTCTTGGTCAAATAGAAAT
GTACTTTGACAGAGGAAACTTCTATGACTTCACTTCCTTGGTTCGTGAATTGGATGTCCC
TGGAGATATATACGAGAGAAAGACATACCCTTTCGAGTTTCCAACTGTCGAGATGCCATA
TGATACATACAATGGTGTCAATGTGCGCCTAAGAGATGTCCTCAAAGTTACCGTCACTCG
TGGCTACGCTGGAAGCATCGTGGAATACCAGGAATTCATGGTTCGGAACTATGCTCCACC
TCCTCCAATTAATAACAGCATCAAGATGGAAGTTGGGATAGAGGATTGCCTGCACATTGA
GTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTATCACCTAAAAGATGTCATCCTTGGCAAAATATACTT
TCTTCTTGTGAGGATCAAGATGAAGAATATGGATCTTGAGATACGGAGGTGGGAATCAAC
AGGTGCTGGTGCTAATACTCATGTCGAGACAGAAACACTTGCCGAATTTGAGTTGATGGA
TGGAACCC
AGTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4G627JQ 746 0 0
TCGTGAATTGGATGTCCCTGGAGATATATACGAGAGAAAGACATACCCTTTCGAGTTTCC
AACTGTCGAGATGCCATATGATACATACAATGGTGTCAATGTGCGCCTAAGAGATGTCCT
CAAAGTTACCGTCACTCGTGGCTACGCTGGAAGCATCGTGGAATACCAGGAATTCATGGT
TCGGAACTATGCTCCACCTCCTCCAATTAATAACAGCATCAAGATGGAAGTTGGGATAGA
GGATTGCCTGCACATTGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTATCACCTAAAAGATGTCAT
CCTTGGCAAAATATACTTTCTTCTTGTGAGGATCAAGATGAAGAATATGGATCTTGAGAT
ACGGAGGTGGGAATCAACAGGTGCTGGTGCTAATACTCATGTCGAGACAGAAACACTTGC
CGAATTTGAGTTGATGGATGGAACCCCAGTTAGAGGTGAGTCAATACCTGTAAGACTGTT
TCTTGCCCCGTACGATCTTACACCAACGCATCGCAACATCAACAACAAATTCAGCGTCAA
GTATTATCTAAATCTTGTACTGGTTGATGAAGAGGATCGCAGATACTTCAAGCAGCAAGA
AATCACGTTGTACAGGTTGAAGGCAGACACATCATCTGTTTGAGTCTTGTGTAAAGCCTT
TTTAGACTTTGTGTACTCAGATTTTAGCTAAAGACTTTGTTATTTGGGTTTGGAAGTTAG
AATGAATAATAGTTTGGTCATTGATC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4997Contig1 953 2 2 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCGCTTTGGTTTCTCGATTCCCAAATGTTGAGAAGAAA
ACCCACAAAAATCCAACTCAAAATCGAAGATCGCTAAGAGCTCGAACAGTCCCGCAAATC
AGAACAACCAGCCACCACCACCACCACTACCACCTCCTCCTCCTCTCTCCTTCACCTCAT
CGACCCTAATAAACACCAAAACCCTCCACCAGCGCAACCTCTTCTTCGACACCCCCCAGT
ACGATCTCTCCCTCCGCCGCGCCGTCCTCCGCCTCCGTTTCCTCGGGAACAACACACCTT
CTCCGCCGCCGAGCTGCATCCTCTCTCTGAAGGCGAAACCGACGCTGGCCAACGGGATCA
GCCGCGTGGAGGAAGACGAGGAGGAGATCGACGCCGGGTTAGCGAAAGAGTGCGTGGATT
CGCCGTATAAGCTGTCGGATCTCGGATCTAGGGTTTTGAATAGGGTTAGAGAGGAGTACG
GGTTTAAAGACTTCTCACGGTTTGTTTGTCTCGGTGGGTTCGAGAATGTGAGGAATGTGT
ACGAGTGGAGAGGCGTGAAACTCGAGGTTATGAGACCAAGTTTGATTTTGGGAACTGCTA
TGAGGTTGAGTGCGAGACTGAGGAACCTGAACGTGTCAAGTCTATGATCGCTGAGTTTCT
CTCTGAGAACAGTGTTGAATTTAAGGATTCGGATATGACCAAGTTTGCTGTTTTCCGTTC
AGGAAAGCTTCCTTGATGGTGGAGTATCTGAGATTGAAGAAATGGTGCATCTTATGGTTA
TGAGTTCAAGGATTTTGGTCACCAGCATGATCAAGTTGTATTTGATTACTATAAAGTTTT
ACTATTGATTTGGATGATCTTAGTTTACACTATTTCTTAAGGCCATTTGCATCGCGTCTT
GTTTACTATATATATCTCCCACGAATGGAAACACAAGTACTATATTTATGTAT


BQ
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AF RR4H221TF U 1
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BS 1 657 RR4H221TF
BS 658 953 RR4H221JQ

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QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4H221JQ 731 0 0
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TGATTTTGGGAACTGCTATGAGGTTGAGTGCGAGACTGAGGAACCTGAACGTGTCAAGTC
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TATTTATGTAT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCTCGATGTTACTCGCTTCCAAAGCCGACGTCTCGAGAAACGACAGACCTTCCTTCTCAG
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TTTTGGTTTTCGTCTCC


BQ
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AF RR4B865JQ U 215
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BS 1 214 RR4B865TF
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BS 662 737 RR4B865TF

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QA 1 447 1 447
DS 

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TTTTGGTTTTCGTCTCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CY53JQ C 1
AF RR4CY53TF U 1
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RD RR4CY53JQ 269 0 0
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TTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCT
TATTACAATCTTCTTGTTGTGGGGTTCATTGGACCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGAT
CCTTACGATTCTTGAAGTTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAA
TTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAA

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR4CY53TF 269 0 0
GCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTT
TTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCT
TATTACAATCTTCTTGTTGTGGGGTTCATTGGACCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGAT
CCTTACGATTCTTGAAGTTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAA
TTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAA

QA 1 269 1 269
DS 



AS 1 2

CO CL5001Contig1 695 2 1 U
CATTCATATCAGCAACTATGGCTCGCATTGACTCTCTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCATCG
CCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAA
CCGGAACGAAAGATGACTCCGGCACCGATTCAATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAAA
CTGGTCAGTACATCGACATTGGAGACCTAGAGAGATGGGGTGGTGTAATGGGACGAGGTC
ACGACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCGGTGTCTTCCGA
GCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCACCGGTGGTAAGCCAGGCTGGTATG
TTGAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGAGCTGGAGCTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCG
ATTAGAGCAGTGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCACATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAA
CTGCCCGCAGACGGTGAGTGCCAGTGTTGGTGTAGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTC
TTCAATCGTCTGAAAGCGTCGAGGGGACGTAGCACGGCAATATATAATGCAAAATCGAAT
AAAATTGTCTGTCAACGCGTGACAGCAATAATGTAGACTGAATAAAACTGCCTCCTTGTG
AGTGTGGGATGGCATTGATCTCAAAGTTCCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G019TF U 1
AF RR4G019JQ C 320
BS 1 695 RR4G019TF

RD RR4G019TF 695 0 0
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CCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAA
CCGGAACGAAAGATGACTCCGGCACCGATTCAATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAAA
CTGGTCAGTACATCGACATTGGAGACCTAGAGAGATGGGGTGGTGTAATGGGACGAGGTC
ACGACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCGGTGTCTTCCGA
GCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCACCGGTGGTAAGCCAGGCTGGTATG
TTGAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGAGCTGGAGCTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCG
ATTAGAGCAGTGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCACATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAA
CTGCCCGCAGACGGTGAGTGCCAGTGTTGGTGTAGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTC
TTCAATCGTCTGAAAGCGTCGAGGGGACGTAGCACGGCAATATATAATGCAAAATCGAAT
AAAATTGTCTGTCAACGCGTGACAGCAATAATGTAGACTGAATAAAACTGCCTCCTTGTG
AGTGTGGGATGGCATTGATCTCAAAGTTCCAATCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4G019JQ 376 0 0
TCTGAACTCTGACGGCACCGGTGGTAAGCCAGGCTGGTATGTTGAATACGTGGAGGTAAA
GACGACCAGAGCTGGAGCTGAGACCAGGCGTCAGTACTTCGATTAGAGCAGTGGCTTGCC
GTCGACGAGCCGCCACATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCCGCAGACGGTGAGT
GCCAGTGTTGGTGTAGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCGTCTGAAAGCGT
CGAGGGGACGTAGCACGGCAATATATAATGCAAAATCGAATAAAATTGTCTGTCAACGCG
TGACAGCAATAATGTAGACTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGAT
CTCAAAGTTCCAATCC

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 2

CO CL5002Contig1 568 2 14 U
GCTTCATCAGGAACCCTTCACTAGGCTTTCTTTTGTGAAGCTGCAGATTTAATGGCGGAC
TTCCCAAGCGTTGAAGGTTTGAAAACGCTCTTGGGATTAATAGCCTTTCTGATTTTGAAA
GCAGCCCATGCTGTCCCAAAAGCATGTCCCACTGCCTCTAGCCCTTCGTTTGTCGCCTCA
GCCGCTTTACCACCATGTCTGTGATCAACAAGCTCGGTTGCAACGGTGGACGAGGTTGAC
ATTACGTTCCTTCCAGCTACTTCAAAAGCGTCACATACCTTATTGAATCCGTCAAGAGTT
GCAAGGACGATTTCTCCAGGAAAAAGGCTAAAAAATTTCCTCCCTACTTTGGTGTTAGCC
ACTGAACTGGTGAAAAACCCTGAAACCTTAATGACTCCAGAAAGAATACCATTTGCCACA
TCCTCTGTCATCTTGGTCATCTTCTTAACCCTCTGGATTCTTTTCAAGGTGTCAGGGTGA
ACATCCCTCTCCTTCTCAGCCTTACTCAACCTCCGTTTCATGAAATCATTCCCCCACTTG
AGCCGATCCATAGTCACATCCCCACACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ69JQ U 1
AF RR4BT38JQ U 5
BS 1 63 RR4GZ69JQ
BS 64 64 RR4BT38JQ
BS 65 82 RR4GZ69JQ
BS 83 83 RR4BT38JQ
BS 84 322 RR4GZ69JQ
BS 323 323 RR4BT38JQ
BS 324 332 RR4GZ69JQ
BS 333 333 RR4BT38JQ
BS 334 374 RR4GZ69JQ
BS 375 375 RR4BT38JQ
BS 376 401 RR4GZ69JQ
BS 402 402 RR4BT38JQ
BS 403 471 RR4GZ69JQ
BS 472 568 RR4BT38JQ

RD RR4GZ69JQ 471 0 0
GCTTCATCAGGAACCCTTCACTAGGCTTTCTTTTGTGAAGCTGCAGATTTAATGGCGGAC
TTCGCAAGCGTTGAAGGTTTGAGAACGCTCTTGGGATTAATAGCCTTTCTGATTTTGAAA
GCAGCCCATGCTGTCCCAAAAGCATGTCCCACTGCCTCTAGCCCTTCGTTTGTCGCCTCA
GCCGCTTTACCACCATGTCTGTGATCAACAAGCTCGGTTGCAACGGTGGACGAGGTTGAC
ATTACGTTCCTTCCAGCTACTTCAAAAGCGTCACATACCTTATTGAATCCGTCAAGAGTT
GCAAGGACGATTTCTCCAGGAAGAAGGCTAAAGAATTTCCTCCCTACTTTGGTGTTAGCC
ACTGAACTGGTGAAGAACCCTGAAACCTTAATGACTCCAGAGAGAATACCATTTGCCACA
TCCTCTGTCATCTTGGTCATCTTCTTAACCCTCTGGATTCTTTTCAAGGTG

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4BT38JQ 564 0 0
CATCAGGAACCCTTCACTAGGCTTTCTTTTGTGAAGCTGCAGATTTAATGGCGGACTTCC
CAAGCGTTGAAGGTTTGAAAACGCTCTTGGGATTAATAGCCTTTCTGATTTTGAAAGCAG
CCCATGCTGTCCCAAAAGCATGTCCCACTGCCTCTAGCCCTTCGTTTGTCGCCTCAGCCG
CTTTACCACCATGTCTGTGATCAACAAGCTCGGTTGCAACGGTGGACGAGGTTGACATTA
CGTTCCTTCCAGCTACTTCAAAAGCGTCACATACCTTATTGAATCCGTCAAGAGTTGCAA
GGACGATTTCTCCAGGAAAAAGGCTAAAAAATTTCCTCCCTACTTTGGTGTTAGCCACTG
AACTGGTGAAAAACCCTGAAACCTTAATGACTCCAGAAAGAATACCATTTGCCACATCCT
CTGTCATCTTGGTCATCTTCTTAACCCTCTGGATTCTTTTCAAGGTGTCAGGGTGAACAT
CCCTCTCCTTCTCAGCCTTACTCAACCTCCGTTTCATGAAATCATTCCCCCACTTGAGCC
GATCCATAGTCACATCCCCACACC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL5003Contig1 660 2 2 U
GCCCTCCGTCTGCAAACGAACCAAACCTCCCACCGGAACATACTACAAGATGTTTCAAAC
GTGTAGCAAACGGAGGCTAAACCGCACCCTCCCTCCTCCAAGACTCTCCTTCGAGAACTT
GGAGTTCTTCGTCGACATTTGGTCGGAAGATAAACCGGTTTACTCCGGTTTAATACCCGG
TCTTGCGATGGAAACCGGGATCAAAGCTTTGCCATCAGGAATCAGCAACGTTCTTAGGAT
TCACTTTGGCGAAACCCGATTACAAAATGGTTGTTCCCGCTGAGCCAAGATTCACTATTC
CGTTAAACCAGACGGTGAGTGTCTCTATGCTTGTGGGAAGGAATGATTCAGACAAGGTTG
CTAGGATAATCAACCGGTCTGTCTTTGAGTATATCGACCGTTCGTCGTACCGGGCTCTTG
CTTTTGAGTATCTCGACTTATCCCTTATTACCCTTTTGTCTTTGGGATACGAGCATGGGT
CTCTTTGCTTTTCATGGATGCTGAGAATATAAACGATGGGGTTCTCGACGTTTTCGGGAT
TCAGTTGGATTTCTGTGATGTTGCTGAGACTAAAGAAGAGGTTTTGTGGCTTCTTGATAT
GCTTGATTGGAAATGAAAACATGCTTTTAAGACTCTTTAATCACCTTAAAGCTCCTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CT88TF U 1
AF RR4CT88JQ C 97
BS 1 272 RR4CT88TF
BS 273 660 RR4CT88JQ

RD RR4CT88TF 283 0 0
GCCCTCCGTCTGCAAACGAACCAAACCTCCCACCGGAACATACTACAAGATGTTTCAAAC
GTGTAGCAAACGGAGGCTAAACCGCACCCTCCCTCCTCCAAGACTCTCCTTCGAGAACTT
GGAGTTCTTCGTCGACATTTGGTCGGAAGATAAACCGGTTTACTCCGGTTTAATACCCGG
TCTTGCGATGGAAACCGGGATCAAAGCTTTGCCATCAGGAATCAGCAACGTTCTTAGGAT
TCACTTTGGCGAAACCCGATTACAAAATGGTT
TGTTTCCCGCT

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR4CT88JQ 564 0 0
TCCAAGACTCTCCTTCGAGAACTTGGAGTTCTTCGTCGACATTTGGTCGGAAGATAAACC
GGTTTACTCCGGTTTAATACCCGGTCTTGCGATGGAAACCGGGATCAAAGCTTTGCCATC
AGGAATCAGCAACGTTCTTAGGATTCACTT*GGCGAAACCCGATTACAAAATGGTTGTTC
CCGCTGAGCCAAGATTCACTATTCCGTTAAACCAGACGGTGAGTGTCTCTATGCTTGTGG
GAAGGAATGATTCAGACAAGGTTGCTAGGATAATCAACCGGTCTGTCTTTGAGTATATCG
ACCGTTCGTCGTACCGGGCTCTTGCTTTTGAGTATCTCGACTTATCCCTTATTACCCTTT
TGTCTTTGGGATACGAGCATGGGTCTCTTTGCTTTTCATGGATGCTGAGAATATAAACGA
TGGGGTTCTCGACGTTTTCGGGATTCAGTTGGATTTCTGTGATGTTGCTGAGACTAAAGA
AGAGGTTTTGTGGCTTCTTGATATGCTTGATTGGAAATGAAAACATGCTTTTAAGACTCT
TTAATCACCTTAAAGCTCCTTCAG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL5004Contig1 594 2 1 U
GGAGAATATATCACGAGTATCGACAACAAAAACTTCTACACTTATTAATTGAGCAAGACT
GACTCTCCAAGTCATAATCTTTATCAAATTTTGAATCATGAAGGGTACTACTTTGGTTAT
GGTATCTTGTGTTTTCATATGTTTCATTCTGAGTCATGGGAAAGACGGGGATTGTTGGGA
TGAAATCCCATTCCCTGGAAAATGCAGCAAACATGGAAAAAAAGAATGCTTCAAAGAAAT
GCTTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTTCGCTGCAACTGTATAAACTGGGAACATGA
CAAATCAAGTGAGGAAGGACATGTTGTAAAACATAGTCAGGAGCATACAGAGCATGAACA
TATCTGCCAATGTCTGAGAGTTGTTGCCGGTGATTGCGTGCCAGGAAAAGAGTAACAGAG
TTTTTGGTGATCACATAGATAAACAATGATGGTGATCTGATGTTATTTTTGGTGGTGACA
CATAGATAAACAATGGTGGTAATAAAATTATACGTTATCAGTTATATGACTATATGTTTT
CAATCTGTCCCATCACTATTTTTTAATTTTCGTATAAATAATTACAAGATGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GC12TF U 1
AF RR4GC12JQ C 152
BS 1 594 RR4GC12TF

RD RR4GC12TF 594 0 0
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GACTCTCCAAGTCATAATCTTTATCAAATTTTGAATCATGAAGGGTACTACTTTGGTTAT
GGTATCTTGTGTTTTCATATGTTTCATTCTGAGTCATGGGAAAGACGGGGATTGTTGGGA
TGAAATCCCATTCCCTGGAAAATGCAGCAAACATGGAAAAAAAGAATGCTTCAAAGAAAT
GCTTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTTCGCTGCAACTGTATAAACTGGGAACATGA
CAAATCAAGTGAGGAAGGACATGTTGTAAAACATAGTCAGGAGCATACAGAGCATGAACA
TATCTGCCAATGTCTGAGAGTTGTTGCCGGTGATTGCGTGCCAGGAAAAGAGTAACAGAG
TTTTTGGTGATCACATAGATAAACAATGATGGTGATCTGATGTTATTTTTGGTGGTGACA
CATAGATAAACAATGGTGGTAATAAAATTATACGTTATCAGTTATATGACTATATGTTTT
CAATCTGTCCCATCACTATTTTTTAATTTTCGTATAAATAATTACAAGATGGAC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4GC12JQ 443 0 0
AGTCATGGGAAAGACGGGGATTGTTGGGATGAAATCCCATTCCCTGGAAAATGCAGCAAA
CATGGAAAAAAAGAATGCTTCAAAGAAATGCTTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTT
CGCTGCAACTGTATAAACTGGGAACATGACAAATCAAGTGAGGAAGGACATGTTGTAAAA
CATAGTCAGGAGCATACAGAGCATGAACATATCTGCCAATGTCTGAGAGTTGTTGCCGGT
GATTGCGTGCCAGGAAAAGAGTAACAGAGTTTTTGGTGATCACATAGATAAACAATGATG
GTGATCTGATGTTATTTTTGGTGGTGACACATAGATAAACAATGGTGGTAATAAAATTAT
ACGTTATCAGTTATATGACTATATGTTTTCAATCTGTCCCATCACTATTTTTTAATTTTC
GTATAAATAATTACAAGATGGAC

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 2

CO CL5005Contig1 447 2 1 U
GGACGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTCCA
AGCTAAGAAGTCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAAA
TGCTCGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACATT
GGTCATCTTGGCGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGGC
TTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAG
GTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGTT
TTTGCCATGTTTCTTCGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTTCTTTTTTG
CTGATCTATAAAAGATATTTTAAGTTT


BQ
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AF RR4DM20JQ C 1
AF RR4DM20TF U 1
BS 1 447 RR4DM20TF

RD RR4DM20JQ 447 0 0
GGACGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTCCA
AGCTAAGAAGTCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAAA
TGCTCGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACATT
GGTCATCTTGGCGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTTTGCGGC
TTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAG
GTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGTT
TTTGCCATGTTTCTTCGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTTCTTTTTTG
CTGATCTATAAAAGATATTTTAAGTTT

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR4DM20TF 447 0 0
GGACGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTCCA
AGCTAAGAAGTCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAAA
TGCTCGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACATT
GGTCATCTTGGCGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGGC
TTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAG
GTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGTT
TTTGCCATGTTTCTTCGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTTCTTTTTTG
CTGATCTATAAAAGATATTTTAAGTTT

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

CO CL5006Contig1 904 2 2 U
GGGCATCCAGAAGAGAAATAGCTCTATCCATTATCGCCGTCGCGTCTTCTTCCATCATCT
CCTCCTCCTGTTACTTCTCGTCTCCGGCGCTCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCTGACTCCG
GCGGAGTAAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGAAGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATC
AGGTCTGCGCTTTGTAAATGGTTATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGTCGATGAAAG
TAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAG
AACCTCTCCCACCAAATGTATGTTCAGTTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCC
TGATTCTTTTCATATAATGATCCAATCCCTACTTCATAGTCAAATGTTATTGCTAAGAGT
CACACATTGATTACCTTTGGGCTGGCTAGCTAGTACCTTTAAGCTAGAATTGGTTTCTTC
TGAAACTTTCAGAAAGCCAATCATACAACCGTGATCGTAGAATTGGTTTCTTCAGAAACT
ATATATTGTTAAGAGATCACAAAGATTGTGTGCATAAGCATATAATTATAATTCAAGATT
AATTTCATTTGTATTCTTTGTTTTTTTTTCTTGTTGTGTGTGTTTGTTTTGCAGTTCTTT
GACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGT
TCTACTCTTGGAACTCTCGTTTTCGATATCGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGA
TGATTCATACAGCCAGCCGTTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATGTCA
TAAAATAAACAATTACAATTACACAAAATCTTTAGTAAGCATTTGCATATGGTTAGTTGA
ATCT


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4FK85TF U 1
AF RR4FK85JQ C 246
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BS 690 904 RR4FK85JQ

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CCTCCTCCTGTTACTTCTCGTCTCCGGCGCTCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCTGACTCCG
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ATATATTGTTAAGAGATCACAAAGATTGTGTGCATAAGCATATAATTATAATTCAAGATT
AATTTCATTTGTATTCTTTGTTTTTTTTTCTTGTTGTGTGTGTTTGTTTTGCAGTTCTTT
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DS 

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GGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAGAACCT
CTCCCACCAAATGTATGTTCAGTTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCCTGATT
CTTTTCATATAATGATCCAATCCCTACTTCATAGTCAAATGTTATTGCTAAGAGTCACAC
ATTGATTACCTTTGGGCTGGCTAGCTAGTACCTTTAAGCTAGAATTGGTTTCTTCTGAAA
CTTTCAGAAAGCCAATCATACAACCGTGATCGTAGAATTGGTTTCTTCAGAAACTATATA
TTGTTAAGAGATCACAAAGATTGTGTGCATAAGCATATAATTATAATTCAAGATTAATTT
CATTTGTATTCTTTGTTTTTTTTTCTTGTTGTGTGTGTTTGTTTTGCAGTTCTTTGACAG
ACAAAGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGTTCTAC
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CATACAGCCAGCCGTTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATGTCATAAAA
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4EF18TF U 1
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AGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCCTT
TAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAAGCTGCTGAATTGG
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TAAATCCTTTGGCAGAGGAAGAGTTTGGGTTTGATCAGAGTGGTGCACTCACCATCCCTT
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DS 

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TTGGCAGAGGAAGAGTTTGGGTTTGATCAGAGTGGTGCACTCACCATCCCTTGCGAGGTC
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GACACTCCCGCTGGGGATGATGCAGTAGCAGCAAATGAAGACTAAATACAAATCAAGTGA
TGAACAACTCTTAAAAACTCTTCTTTTGTTATTATGGTTATTGTTATCCTTTATTATCAT
TTTAATCATATGGAATTGTTAGGGATCGTTACTCTGGGGTGTAATTGTAAAATCAGATTA
TCTTTGTATTTTCCTGGTTCTTATTTTCTTCTCCATTATTTTGC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTACAAAAAAAAATTATGTACTTAGATTCAAAATAATGCTCAAGTCGAAATTCCGGTTCA
ATCGGAGCAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4ES65JQ C 1
AF RR4ES65TF U 1
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ATCGGAGCAT

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DS 

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GAACAATTCTTTGGTCTCGCCGGAGCTTCTTTCAGAGGAGAAAACGAGAACTCCTTACAC
GGAGGAGCAGCTTCTCCGGTTGTTCAGGATATTCGATACTGACGGTAATGGGTTTATCAC
TGCAAAGGAATTGGCTCATTCCATGGCTAGGCTTGGCCATGCCTTGACGGTGGCGGAATT
AACAGGGATGATTAAGGAGGCTGATAGCGACGGAGACGGCCGGATTAATTTTCAGGAGTT
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TGGCTTTTCCCTCATTTGCCATTTATTATTTTTTAGTTTCTATGATTAGTTCTCACTAAT
CTACAAAAAAAA*TTATGTACTTAGATTCAAAATAATGCTCAAGTCGAAATTCCG*TTCA
ATCGGAGCA

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

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TCTTTGTTTGGCCACAAATAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GG62JQ U 53
AF RR4GG62TF C 1
BS 1 52 RR4GG62TF
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BS 506 685 RR4GG62TF

RD RR4GG62JQ 453 0 0
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QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4GG62TF 685 0 0
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TCTTTGTTTGGCCACAAATAGATCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

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AGCTCGAATAATATAAGAAATTTAGAG


BQ
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AF RR4FK62TF U 1
AF RR4FK62JQ C 298
BS 1 739 RR4FK62TF
BS 740 987 RR4FK62JQ

RD RR4FK62TF 745 0 0
GGAAGAACACAACACAATGAGGACTAGAACAAGTCAAACCCACGAGCTCAAGCTTCTCCT
CGTTTGTCTTTTCGCGTCCTTGGTTCTCATCTTCATCGTTAGATCAACTCTTACGACTTC
ACAGGAACACCAGACTCCAGAAGACACGAGATCAGAGGGTTGCGCTGGTGCCTCAATAAG
CTACCACGTTCCCTGGCGCAAGCGTTGATCCATTACTCTACTTCAGTTATCACACCTCAA
CAAACGCTCAAGGAAATAATTGTCAGCAGTAGAGCACTCGAGAAGAAGTCACCCTGCAAC
TTCTTGGTGTTTGGTCTAGGCCATGACAGCCTCATGTGGAGCTCTCTCAACTATGGTGGC
CGAACAGTATTCCTTGAAGAAGATGAGGCCTGGATAAAACAGAACAAGAGACGGTTTCCA
ATGCTGGAGTCATACCATGTAACATATGATAGTAAAGTCAACCAAGCAGAGAATCTCATA
GAAGTTGGGAAAGGACCTGAATGCACAGCCGTTGGAGATCCAAGGTACTCAATGTGTCAG
CTAGCACTCAAGGGTCTGCCTGCAGAGATCTATGAGACTAGTTGGGATCTAATCATGGTC
GATGCACCCACTGGCTACTACGACGAGGCTCCTGGGAGTATGACAGCAATTTACACGGCG
GGGATGATGGCAAGGAACCGGAAGCGGGCAGGAGAGACCGACGTGTTTGTGCACGATGTG
AATAGGGAAGTAGAAGACA
GTTCTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4FK62JQ 690 0 0
AACTTCTTGGTGTTTGGTCTAGGCCATGACAGCCTCATGTGGAGCTCTCTCAACTATGGT
GGCCGAACAGTATTCCTTGAAGAAGATGAGGCCTGGATAAAACAGAACAAGAGACGGTTT
CCAATGCTGGAGTCATACCATGTAACATATGATAGTAAAGTCAACCAAGCAGAGAATCTC
ATAGAAGTTGGGAAAGGACCTGAATGCACAGCCGTTGGAGATCCAAGGTACTCAATGTGT
CAGCTAGCACTCAAGGGTCTGCCTGCAGAGATCTATGAGACTAGTTGGGATCTAATCATG
GTCGATGCACCCACTGGCTACTACGACGAGGCTCCTGGGAGTATGACAGCAATTTACACG
GCGGGGATGATGGCAAGGAACCGGAAGCGGGCAGGAGAGACCGACGTGTTTGTGCACGAT
GTGAATAGGGAAGTAGAAGACAAGTTCTCTAAAGCCTTCTTGTGTGAAGGGTACATGAAG
AAACAAGAAGGAAGACTAAGGCATTTCGTTATCCCTACCTATAGAGATGGTTCAGACTCC
GAATCAAATAGACCCTTTTGTCCATAGTTGACACAATGTTACCAAATTTGAACTCTTTAA
TGTTCCTTATTGTTTTCTACTGAGCCTAGACAAAAAAAAAGTCTATAGCAAGAAAGTAGA
CAAAGCTCGAATAATATAAGAAATTTAGAG

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL5012Contig1 954 2 8 U
GGTTCTGGTGTCGGAGATTACGGCGTCTGTGTGTCCATAACAATACTCAATCAATCCCAA
ATGTTCTTTGAAGCTTCACTATCTTCGATGGCGCGAACAGAGTTCACAAGGCTGGTGCGT
ATTGGCTAGACTGGCTTCTGATTCGTGTGCGTTTGTTCCTCCCGGCAACTGTGATGAGTC
GTCTATGGCTACGTCGGTGAACGGAAGGAAGGACGCATCATTTTGGACTTTCCCAGCCTC
GACATCTGCGTGAAGGTGACCTGAACAGGAAGTTGTACTCTGGTCTTCAGAGACAACATG
TGCAGAGGTTTTCTCACTCTCCGCTTGGTCAACGGGAGAAACAAAGCCCCAGAGACGCGC
ACATGATAAAGCAGCTCATCCGCGATGCCCTGAGTTTGTATATTCAGGCAGAGTTGCAAT
GTCTTTCTGGTTTGCAGTTTTGCTGGATGAAGATGGAGCCAATCCCTCAAACCCGATTTT
TATAGAGGAATGTTTGTAGTTCAAAGCCATATGGTGATGACTTCAACTCCCCTCTGCACG
ATTCAAAGCCCCTGTTCCTTACCTTGGTATCTTGGTTTGAGGATATGCGCCTTCGGTGTT
GTTGCGATGGTCATGGTTATAACTCTTATCTTGTGGTACCATCGCTATGGTCTTATGTTG
GTTTACTCAAACTAGGATGTTCCATAGGTTTAGGATTTTGCTTTATAATCAGTGTTTTTA
GTGGTAGAATTAGGTGGTGTAAGAGGCGGTTCATTCTGAGTTTTAGGATGAACTCGTACT
CGCAGTGGTTAAAAAATACAGTAATGTACTCTAGGTTGCGCTGGATCCGAGTGAGAAATC
ACCTAGTGAGTGTTCTAGGGTGTTGCTAAGATGCATTGCTGTATATGCGGTAAAACTTGT
GTGGTCAAAATCTTTGTACCCAATTTATCGGTTAATAAATAGTTGATGTGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX78TF U 1
AF RR4CN60TF U 218
BS 1 251 RR4CX78TF
BS 252 252 RR4CN60TF
BS 253 269 RR4CX78TF
BS 270 270 RR4CN60TF
BS 271 456 RR4CX78TF
BS 457 457 RR4CN60TF
BS 458 675 RR4CX78TF
BS 676 954 RR4CN60TF

RD RR4CX78TF 682 0 0
GGTTCTGGTGTCGGAGATTACGGCGTCTGTGTGTCCATAACAATACTCAATCAATCCCAA
ATGTTCTTTGAAGCTTCACTATCTTCGATGGCGCGAACAGAGTTCACAAGGCTGGTGCGT
ATTGGCTAGACTGGCTTCTGATTCGTGTGCGTTTGTTCCTCCCGGCAACTGTGATGAGTC
GTCTATGGCTACGTCGGTGAACGGAAGGAAGGACGCATCATTTTGGACTTTCCCAGCCTC
GACATCTGCGTTAAGGTGACCTGAACAGGGAGTTGTACTCTGGTCTTCAGAGACAACATG
TGCAGAGGTTTTCTCACTCTCCGCTTGGTCAACGGGAGAAACAAAGCCCCAGAGACGCGC
ACATGATAAAGCAGCTCATCCGCGATGCCCTGAGTTTGTATATTCAGGCAGAGTTGCAAT
GTCTTTCTGGTTTGCAGTTTTGCTGGATGAAGATGGGGCCAATCCCTCAAACCCGATTTT
TATAGAGGAATGTTTGTAGTTCAAAGCCATATGGTGATGACTTCAACTCCCCTCTGCACG
ATTCAAAGCCCCTGTTCCTTACCTTGGTATCTTGGTTTGAGGATATGCGCCTTCGGTGTT
GTTGCGATGGTCATGGTTATAACTCTTATCTTGTGGTACCATCGCTATGGTCTTATGTTG
GTTTACTCAAACTAG
ATGTTCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4CN60TF 737 0 0
G
CATTTTGGACTTTCCCAGCCTCGACATCTGCGTGAAGGTGACCTGAACAGGAAGTTGTAC
TCTGGTCTTCAGAGACAACATGTGCAGAGGTTTTCTCACTCTCCGCTTGGTCAACGGGAG
AAACAAAGCCCCAGAGACGCGCACATGATAAAGCAGCTCATCCGCGATGCCCTGAGTTTG
TATATTCAGGCAGAGTTGCAATGTCTTTCTGGTTTGCAGTTTTGCTGGATGAAGATGGAG
CCAATCCCTCAAACCCGATTTTTATAGAGGAATGTTTGTAGTTCAAAGCCATATGGTGAT
GACTTCAACTCCCCTCTGCACGATTCAAAGCCCCTGTTCCTTACCTTGGTATTTTGGTTT
GAGGATATGCGCCTTCGGTGTTGTTGCGATGGTCATGGTTATAACTCTTATCTTGTGGTA
CCATCGCTATGGTCTTATGTTGGTTTACTCAAACTAGGATGTTCCATAGGTTTAGGATTT
TGCTTTATAATCAGTGTTTTTAGTGGTAGAATTAGGTGGTGTAAGAGGCGGTTCATTCTG
AGTTTTAGGATGAACTCGTACTCGCAGTGGTTAAAAAATACAGTAATGTACTCTAGGTTG
CGCTGGATCCGAGTGAGAAATCACCTAGTGAGTGTTCTAGGGTGTTGCTAAGATGCATTG
CTGTATATGCGGTAAAACTTGTGTGGTCAAAATCTTTGTACCCAATTTATCGGTTAATAA
ATAGTTGATGTGGAGT

QA 2 737 2 737
DS 



AS 1 2

CO CL5013Contig1 820 2 2 U
GCAACAAGATCTATCAAACGCTATGGGTTCAATGTACACAGCTGTTCTGTTCCTCGGTCT
ACAGAACGCTGCCTCAGTGCAACCAGTGGTCAACGTCGAGAGAACAGTCTTTTACCGAGA
ACAAGCCGCCGGAATGTACTCTGCCATGCCGTATGCTTTCGCTCAGGTCTTCATAGAGAT
GCCGTACGTTCTTGTGCAAGCGGTGGTGTACGGTCTCATAGTGTATGCGATGATAGGATT
CGAGTGGACCGCTGCTAAGTTCTTCTGGTACCTCTTCTTTATGTATGGATCGTTCTTGAC
TTTCACCTTCTATGGTATGATGGCTGTTGCTATGACTCCTAACCACCACATCGCCTCCGT
CGTCTCCTCCGCTTTCTATGGTATCTGGAATCTCTTCTCCGGCTTCCTCATCCCTCGTCC
GAGTATGCCGGTTTGGTGGGAGTGGTACTACTGGCTTTGCCCTGTTTCATGGACATTGTA
TGGATTAATCACATCGCAGTTCGGTGATATTACGGAGCCTATGGCAGATGGTACGAGCGT
GAAGCAATTTATTAAAGATTTCTATGGATTCAGAGAAGGTTTCTTGGGAGTGGTGGCTGC
CATGAACGTCATCTTCCCATTGGCATTTACCATCATCTTTGCTATTGGAATCAAGAGTTT
CAATTTCCAGAAGAGATAGACCAGTTTTACATTCTTTATTATACACTTGCATTCTACTTC
CTGTAACACAAATAAAAAGGCATTTTTTTGTTTTGTTTATACAATTATACGCTCTTCATT
CTTATTGTAATGATAAATCAATAATATTAAGATTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D956TF U 1
AF RR4D956JQ C 143
BS 1 573 RR4D956TF
BS 574 820 RR4D956JQ

RD RR4D956TF 573 0 0
GCAACAAGATCTATCAAACGCTATGGGTTCAATGTACACAGCTGTTCTGTTCCTCGGTCT
ACAGAACGCTGCCTCAGTGCAACCAGTGGTCAACGTCGAGAGAACAGTCTTTTACCGAGA
ACAAGCCGCCGGAATGTACTCTGCCATGCCGTATGCTTTCGCTCAGGTCTTCATAGAGAT
GCCGTACGTTCTTGTGCAAGCGGTGGTGTACGGTCTCATAGTGTATGCGATGATAGGATT
CGAGTGGACCGCTGCTAAGTTCTTCTGGTACCTCTTCTTTATGTATGGATCGTTCTTGAC
TTTCACCTTCTATGGTATGATGGCTGTTGCTATGACTCCTAACCACCACATCGCCTCCGT
CGTCTCCTCCGCTTTCTATGGTATCTGGAATCTCTTCTCCGGCTTCCTCATCCCTCGTCC
GAGTATGCCGGTTTGGTGGGAGTGGTACTACTGGCTTTGCCCTGTTTCATGGACATTGTA
TGGATTAATCACATCGCAGTTCGGTGATATTACGGAGCCTATGGCAGATGGTACGAGCGT
GAAGCAATTTATTAAAGATTTCTATGGATTCAG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4D956JQ 678 0 0
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GTGGTGTACGGTCTCATAGTGTATGCGATGATAGGATTCGAGTGGACCGCTGCTAAGTTC
TTCTGGTACCTCTTCTTTATGTATGGATCGTTCTTGACTTTCACCTTCTATGGTATGATG
GCTGTTGCTATGACTCCTAACCACCACATCGCCTCCGTCGTCTCCTCCGCTTTCTATGGT
ATCTGGAATCTCTTCTCCGGCTTCCTCATCCCTCGTCCGAGTATGCCGGTTTGGTGGGAG
TGGTACTACTGGCTTTGCCCTGTTTCATGGACATTGTATGGATTAATCACATCGCAGTTC
GGTGATATTACGGAGCCTATGGCAGATGGTACGAGCGTGAAGCAATTTATTAAAGATTTC
TATGGATTCAGAGAAGGTTTCTTGGGAGTGGTGGCTGCCATGAACGTCATCTTCCCATTG
GCATTTACCATCATCTTTGCTATTGGAATCAAGAGTTTCAATTTCCAGAAGAGATAGACC
AGTTTTACATTCTTTATTATACACTTGCATTCTACTTCCTGTAACACAAATAAAAAGGCA
TTTTTTTGTTTTGTTTATACAATTATACGCTCTTCATTCTTATTGTAATGATAAATCAAT
AATATTAAGATTTGAACC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5014Contig1 903 2 4 U
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CCTCCATCGTAAACACTTGTCACTCGAGATTTCTGATTTTTATAAACCCTAATTCTCTCC
GCCGTTCCAATCTCGTCACATTGGTTCCGTGAAGAATGGTGGAGAATTCAGTAAAACCAT
CCTCAAAAGACACATTGTCATCTAGACCGATGGGGAGAAACCTAAAAGGTGTTGGTGATC
TTGCAGAAGACTTATCTCATATCAGTGATGCTGAGGTTGCTGGTTATCTAAATACTAAAG
CAGAGTCCCTTTTGATAAAGATGGCGTGGGAGATGATGAACCCTGATTACAAAAAGGGAA
CGCAGAGGAAACCTACTACAGTGAAAAAGAAAGATCCTGTTAGTAAGACTGTTGCTCCTC
CTAGTAAGAAAACTTCTGCAACCACAACACAAACCAACGCAGAAAGTGAAAAGAAAAAGA
GACTGAGTTCATATATCAACTTGGATGTCTTGGATAAGCTATTTGATGATGAGGAGAACT
CTCCAAAGAGGACTAAGTTAGGGGACGCAGTCGTTGTCAGTGACCAGATGGAAAATTTAC
AGCAAAGGAGTGAAGAACGCCTTTTGGAACCTGAGGATTTTGAAGAAGGTGAACCAGTTT
GGAACGAGGATTACAGTAATGAAGATGCTAATGGAGGACAGGACGAGTTTTACGGTGACG
CTGATCTTGAATATGAAGACGAAGGAGAAGATAATGAAGATATAATTTGGTGATCTCATC
ATACATTGTGAAGTGATCTCAACATATCTTACTCAACAACATTGAATTATTATTTTTTTT
GACAAAAATCTTTTAAATTACATTCATTATTTTCCTATCAAATAAATGAAATCCTTCACA
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4F138TF U 1
AF RR4F138JQ C 126
BS 1 546 RR4F138TF
BS 547 547 RR4F138JQ
BS 548 559 RR4F138TF
BS 560 903 RR4F138JQ

RD RR4F138TF 559 0 0
GGAAGAAAAATAAAAAAATAGAAAAAGAATTAAAACCACCTTCTCCCTCCGATGCGGTCT
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GCCGTTCCAATCTCGTCACATTGGTTCCGTGAAGAATGGTGGAGAATTCAGTAAAACCAT
CCTCAAAAGACACATTGTCATCTAGACCGATGGGGAGAAACCTAAAAGGTGTTGGTGATC
TTGCAGAAGACTTATCTCATATCAGTGATGCTGAGGTTGCTGGTTATCTAAATACTAAAG
CAGAGTCCCTTTTGATAAAGATGGCGTGGGAGATGATGAACCCTGATTACAAAAAGGGAA
CGCAGAGGAAACCTACTACAGTGAAAAAGAAAGATCCTGTTAGTAAGACTGTTGCTCCTC
CTAGTAAGAAAACTTCTGCAACCACAACACAAACCAACGCAGAAAGTGAAAAGAAAAAGA
GACTGAGTTCATATATCAACTTGGATGTCTTGGATAAGCTATTTGATGATGAGGAGAACT
CTCCAA*GAGGACTAAGTT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4F138JQ 778 0 0
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GAAGACTTATCTCATATCAGTGATGCTGAGGTTGCTGGTTATCTAAATACTAAAGCAGAG
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AAGAAAACTTCTGCAACCACAACACAAACCAACGCAGAAAGTGAAAAGAAAAAGAGACTG
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AAGAGGACTAAGTTAGGGGACGCAGTCGTTGTCAGTGACCAGATGGAAAATTTACAGCAA
AGGAGTGAAGAACGCCTTTTGGAACCTGAGGATTTTGAAGAAGGTGAACCAGTTTGGAAC
GAGGATTACAGTAATGAAGATGCTAATGGAGGACAGGACGAGTTTTACGGTGACGCTGAT
CTTGAATATGAAGACGAAGGAGAAGATAATGAAGATATAATTTGGTGATCTCATCATACA
TTGTGAAGTGATCTCAACATATCTTACTCAACAACATTGAATTATTATTTTTTTTGACAA
AAATCTTTTAAATTACATTCATTATTTTCCTATCAAATAAATGAAATCCTTCACATTG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5015Contig1 543 2 1 U
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CATAGTAGAGAGAAGATTACTGAAGATATGAGTGCAGACTGGGGACCAGTGATTGTAGCA
GTCGCTCTGTTCATCCTACTCTCACCAGGATTGCTCTTTCAGCTACCGGCGAGGACAAGA
GTGATGGAGTTCGGTAACATGAGCACAAGTGGAATTTCGATTTTGGTCCATGCCATTATT
TACTTCTGTATACTCACTATCTTGGTCATAGCCATGCAAATTCACATCCATTTCTGATCT
TGTAGTATAACAAAGGCAAACTTCTTTGTATTCAAATTTTACCTTTTTTCTGCTACTTAT
TTTGCTAATCTCTGACATTTGGCTCATAGTGTTCCAAGCAGGGTGACAAAAAAATGGTTG
TATACAAATAAAATATGTAATTTTGTATTTTCCCAAATTCAATTTCTAACCTTTAAGTAC
GAAGGTTCAGATCTTTTTTAAGGTCCAGACTTTAATTGGTATAAAACATTTACGAGATGG
CGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RR4AV48JQ C 1
AF RR4AV48TF U 1
BS 1 543 RR4AV48TF

RD RR4AV48JQ 543 0 0
GGAATCACACATCTTACTTCATCTGCAAGAACAAGAGCCTATTACATAAAAAACACATAT
CATAGTAGAGAGAAGATTACTGAAGATATGAGTGCAGACTGGGGACCAGTGATTGTAGCA
GTCGCTCTGTTCATCCTACTCTCACCAGGATTGCTCTTTCAGCTACCGGCGAGGACAAGA
GTGATGGAGTTCGGTAACATGAGCACAAGTGGAATTTCGATTTTGGTCCATGCCATTATT
TACTTCTGTATACTCACTATCTTGGTCATAGCCATGCAAATTCACATCCATTTCTGATCT
TGTAGTATAACAAAGGCAAACTTCTTTGTATTCAAATTTTACCTTTTTTCTGCTACTTAT
TTTGCTAATCTCTGACATTTGGCTCATAGTGTTCCAAGCAGGGTGACAAAAAAATGGTTG
TATACAAATAAAATATGTAATTTTGTATTTTCCCAAATTCAATTTCTAACCTTTAAGTAC
GAAGGTTCAGATCTTTTTTAAGGTCCAGACTTTAATTGGTATAAAACATTTACGAGATGG
CGT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4AV48TF 543 0 0
GGAATCACACATCTTACTTCATCTGCAAGAACAAGAGCCTATTACATAAAAAACACATAT
CATAGTAGAGAGAAGATTACTGAAGATATGAGTGCAGACTGGGGACCAGTGATTGTAGCA
GTCGCTCTGTTCATCCTACTCTCACCAGGATTGCTCTTTCAGCTACCGGCGAGGACAAGA
GTGATGGAGTTCGGTAACATGAGCACAAGTGGAATTTCGATTTTGGTCCATGCCATTATT
TACTTCTGTATACTCACTATCTTGGTCATAGCCATGCAAATTCACATCCATTTCTGATCT
TGTAGTATAACAAAGGCAAACTTCTTTGTATTCAAATTTTACCTTTTTTCTGCTACTTAT
TTTGCTAATCTCTGACATTTGGCTCATAGTGTTCCAAGCAGGGTGACAAAAAAATGGTTG
TATACAAATAAAATATGTAATTTTGTATTTTCCCAAATTCAATTTCTAACCTTTAAGTAC
GAAGGTTCAGATCTTTTTTAAGGTCCAGACTTTAATTGGTATAAAACATTTACGAGATGG
CGT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL5016Contig1 958 2 2 U
GGAGGAATATATATATAGCAAAAAAAAAAGAATATATATATAGCAAAAGAGTATATATAT
AGCAAAAAAAGAATATATATATAGCAAAAAAAAAGAATATATTTTTCTTGATTTTTCAGT
GTAGTTTATGTAGATCTGTGGTATTTTGGCTTGGATATTTCAAAAAACAGAGTTAGATCT
AGGTTTCCAGATCTAAAAAGATGAACGGATCTCAAAGGTTGCGGATCTCCTCCACCATGG
TCTTGCCGTGTTGGTTTCTGGTTCGTGACAGTCTCGGGTTTCAGTGTCTCCATCAATCCC
AGAAAGTTTACCTTCTTCTTAGTTTAAGGTACTTATTTTCTTAGATTGGTGGTTTAGTTC
ATCTCTGGATTGTTGGTGGTTCTATTAGTTTGCTTCTGGTGATGATTTCATCTTGTTTGG
AGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATAGATTCTTCAGTGAACTTTCTCTA
GTTCTCCTTTGGTTACGAAGTCTCCGGCTCAATCAAAAGGAAATGGAGCTTTTGCTCTTT
CTTGCTTCTCAGCTGTGGGTGTTCGAATGTTAATGTTGATGCTTCGGCTCCCTTGGATGG
TTCATTGCGGTTGACCTTGTGGCTCGTGGTATGTTCCGGAGCAATAGAAGGAGGTCTTTG
TGGTGGCTATCTTCAATAATCCGGCTGCAGTGGCGTTGCTTCTCTTTCAATACTCTTTCT
GATCTTGATGAAGTCTCTGCTAGGGTGTCTTGTTTTGTTGATTTAACTCTGTTGCTTGAT
GTACTCTAAGTGTCCAGTGTAGTTTAACCGTTTGGCTCCGGAGAATCATTGATTCTGTCG
GCTTATGTCTCCAAGGACTGTCTGTTTAGTCCGTTGGCTTGTGGATGTGGGTGGGGTTAG
TTTAACTCTTCACTTGTAATCAAACGTTTCTTTTGGGTTCAATATAATCATCTAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 817 958 RR4BH06JQ

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AGGTTTCCAGATCTAAAAAGATGAACGGATCTCAAAGGTTGCGGATCTCCTCCACCATGG
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TATGTTCCGGAGCAATAGAAGGAGGTCTTTGTGGTGGCTATCTTCAATAATCCGGCTGCA
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TCCGTTGGCTTGTGGATGTGGGTGGGGTTAGTTTAACTCTTCACTTGTAATCAAACGTTT
CTTTTGGGTTCAATATAATCATCTAGTGC

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DS 



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BQ
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AF RR4AH03TF U 1
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BS 1 717 RR4AH03TF
BS 718 1246 RR4AH03JQ

RD RR4AH03TF 717 0 0
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ATCATTATTATCAGAGGTAACCTCCCGAACCTGTATACTATATATGTTTCTTCACTGCGG
TGAAAATTACAATCTTCTAAGAGATCTCAAATTCTAGACTTTCTAAAGCTTCAAATCTTG
CAATGGCAAATTCATACACGCTTCTTGCTGACTTGAAGACGGGACGTTGTTCAAACACGG
CTGAGGTGCGTCTTCTCCGGTTCTGGGAGGCTCGGAATACTAAGAAAGGAGGAGAGCTGA
TGAGTCTCGACATGCTCTTCTTGGATGAGCAGTCGACCCTTATCCAAAGAACCATGAGTG
CGACCCGCAGCCACACGTACCGACCATATCTCAGTGAGGGATCCATTTACTCTCTTAGTG
GTTTTGATGTTACACGGAGCAACAGCAATTTTCGTCTGTCGGATGCCTCTGTCTCCATTC
AATTCAGCGATGGCACAATGTTCGTACAAGTTACTGATTTTGACAAGGTGATACCAACTG
AGATGTTTTGGTTCCGGAGCTACGACCAGATATTAGCACTCGCAAATACCAACAGACAAC
TACCAGATATGCTTGGTGAGTTAAGTGCAATACGGAGCTTTGTACAATCTCAGTGGGTTT
GACGTCACAAGAGCCAACCACCATTTTAAGTGGTCCGATTCATCTGCCTAATTTGTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AH03JQ 774 0 0
CTCCATTCAATTCAGCGATGGCACAATGTTCGTACAAGTTACTGATTTTGACAAGGTGAT
ACCAACTGAGATGTTTTGGTTCCGGAGCTACGACCAGATATTAGCACTCGCAAATACCAA
CAGACAACTACCAGATATGCTTGGTGAGTTAAGTGCAATACGGAGCTTTGTACAATCTCA
GTGGGTTTGACGTCACAAGAGCCAACCACCATTTTAAGTGGTCCGATTCATCTGCCTAAT
TTGTTTGAACAAGGGAATTACGTAGTTCGTTGATCCAGTTGATGACTTCATTGCGGAAGT
GAGTCTTAGCAATGTAACTTGCAATGACCACACCCAAACACCTCAGCGCATATCCATTGA
CAGGGTACAAGGATACAGAGATGTATTTCCCGAAGCACTCAGTAACAATAACAGGAAAGT
ACTATCATATGAGACATATCATGGCATTACACATAGCAGTCTGGTGAGTCGTTTTTCCTC
ATGGATGGACTAGAGTGGGAAGATTGATACAAGAGGAGATTCGCACTGTACTATGTAGAC
TATGCAGACCATTTGGGACGACAGAGAAACAATCTGCCAAGTTGCTCGCCATGCTCCTTG
AGAACACCGGAACAAGTTATAAAATGATGAAAGAAGAAATATACCTTCAACAACTCTGTT
TAACAGAACATATAATGTAATGTGTGTGTGCGCTTTTATATCTTAAAATAGTGTAAGCCA
ACGATGTATGTAGTTATGTAGTAGTTAATGAATAAAAAATGTAACTCATGTCAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5018Contig1 1067 2 4 U
GGCAGCATGCAAGCTCTTGAGAAGAAAGTGCACTCAAGAATGTGTTTTTGCGCCCTATTT
TCCACCAACTCAGCCTCAAAAGTTTATATATGTTCACAAAGTCTTTGGAGCAAGCAATGT
AACCAAGATCCTCAACGATCTCCCACCTCCAAACCGAGAAGACGCTGTTAATTCCCTCTA
CTATGAAGCCGAGGCTCGTATCCGTGACCCAATCTACGGATGCGTTGGTCTCATCTCCTT
CTTACAACAATGTCTCAAGAAAATCCAACAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGC
AGGTTACATTGGACCCGATGCTGTGAATCCGCAACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAA
CAATCCTCCACCAAATTTCATGATGACTATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCA
AGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACCAAACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGA
TGAGCAGATGCAACTCATGGGTACTGATGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAG
AGGAGATCACCAACAAGAGATGTTCAATGGTTACGGGATAGACAACAATGGGTCGGTTAC
AGCCACAGGGTATAACCAGATGGATGTGAACGATCACACGGCTGGTGGGTCGTTGTCTGG
ACCATCTCTTGCTTTAGGAAGCTTTGGTGATGCTTATCAAATGGGTCACGAGACAGAGCA
TCACATCAGTCATGATCAGCTTCAGACACAGCTTATGCTTCAGCCTCCATTACAGGAAGG
TCAAGAGCAAAATGAAGGACAGTTTCTGATGCAGCCAATGGGACAAGAGAATCTCCATGA
AGAAGAGGATGAGGAAGAGCTTGAGCCGCCGGTTAAGTGGAGGAAATCTGACAGCAAGGA
AGCTAGTTATTGATTAAAACCAAGAAAATAAGACATTTTCATTCGATGGATAGTTACTCT
TGAGGGTTTAAGTTGCTTTTTTTTAATTTAATAAATGGCATTATTCATTGATTAATGTTA
GCATCGACAGATTCAACATTCTAAAGCTGAATATGCATCACTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE20TF U 1
AF RR4EE20JQ C 347
BS 1 677 RR4EE20TF
BS 678 678 RR4EE20JQ
BS 679 767 RR4EE20TF
BS 768 1067 RR4EE20JQ

RD RR4EE20TF 772 0 0
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CTATGAAGCCGAGGCTCGTATCCGTGACCCAATCTACGGATGCGTTGGTCTCATCTCCTT
CTTACAACAATGTCTCAAGAAAATCCAACAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGC
AGGTTACATTGGACCCGATGCTGTGAATCCGCAACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAA
CAATCCTCCACCAAATTTCATGATGACTATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCA
AGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACCAAACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGA
TGAGCAGATGCAACTCATGGGTACTGATGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAG
AGGAGATCACCAACAAGAGATGTTCAATGGTTACGGGATAGACAACAATGGGTCGGTTAC
AGCCACAGGGTATAACCAGATGGATGTGAACGATCACACGGCTGGTGGGTCGTTGTCTGG
ACCATCTCTTGCTTTAG*AAGCTTTGGTGATGCTTATCAAATGGGTCACGAGACAGAGCA
TCACATCAGTCATGATCAGCTTCAGACACAGCTTATGCTTCAGCCTC
ATTAC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4EE20JQ 721 0 0
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GGAGTGGTCCCTCAAGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACCAAACATGCCTCAGCATCAA
CATCAACCGCAAGATGAGCAGATGCAACTCATGGGTACTGATGCACAGAGAATGGCTGCA
ATGATTTTGGAGAGAGGAGATCACCAACAAGAGATGTTCAATGGTTACGGGATAGACAAC
AATGGGTCGGTTACAGCCACAGGGTATAACCAGATGGATGTGAACGATCACACGGCTGGT
GGGTCGTTGTCTGGACCATCTCTTGCTTTAGGAAGCTTTGGTGATGCTTATCAAATGGGT
CACGAGACAGAGCATCACATCAGTCATGATCAGCTTCAGACACAGCTTATGCTTCAGCCT
CCATTACAGGAAGGTCAAGAGCAAAATGAAGGACAGTTTCTGATGCAGCCAATGGGACAA
GAGAATCTCCATGAAGAAGAGGATGAGGAAGAGCTTGAGCCGCCGGTTAAGTGGAGGAAA
TCTGACAGCAAGGAAGCTAGTTATTGATTAAAACCAAGAAAATAAGACATTTTCATTCGA
TGGATAGTTACTCTTGAGGGTTTAAGTTGCTTTTTTTTAATTTAATAAATGGCATTATTC
ATTGATTAATGTTAGCATCGACAGATTCAACATTCTAAAGCTGAATATGCATCACTTTTT
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5019Contig1 883 2 8 U
GGATGGCTCTAGTCCCAAACCATACTTAAACTCATCAGTTCCTTGTCACAAGGAAGTTGA
TCTTCTTAACCAAACCAAATATTTTCCTTGTCTTTTAATTCCATCTTTATTTTTAATTGT
TTCTGTGTTATTGAAACATGGATTTGCGATCATCATGTATGGTTCAGATGACAACGTTAA
GATGGATCATAACGATCACAATGTTGATGATGATGAGAGGAGGAGAATCGATGAGATTGG
ATCTGGAATCAGGCATGACCAAATGCATCGCCGACGACATCAAATTAAATTATCTGACTG
TCGGAACTTCCGTCGTCAATCCCAACGAAGCTCTCCATCTTCCTGCTTCCCACAAAATCA
TTGTCACTGTGGCGTCACCTAAATGGCACACTCAACACGAAGCAAGAGATGTGGAGTCTG
GGAAATTCGTGTTCACGGCGGTGGAAGACGGCGATTACACAACGTGTTTTATAGCTCCTG
TTTTTAAACCTCCGGCCAAATTCGCCGTTGATTTCGAATGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTA
AAGATTGGGCCACCATCGCCAAGAGAGGCCAGATCAACATGCTGGAGGTGGAGGTGAGGA
AACTACTGGACGTGACGGAGTCTATACACGACGAAATGTTTCTACTCCGGGAGAGGGAGC
GGGAAATGCAGGAGCTAAACCGGTCGACCAACTCGAGAATGGCGGGTCTAAGTTTATTTT
CATTGTTGGTTACGTTTTCGGTAGCCGGCATACAACTGTGGCATCTCAAGTCATTCTTGG
AGAGGAAGAAGCTTCTCTAATATTTTTGCCTTTATCAGATTTTGGTGTTGTCAGTTTTAG
CTTATTTTTTAAACTAAATAAATCTCTTTCTCTACCTTGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP45TF U 1
AF RR4FP45JQ C 276
BS 1 671 RR4FP45TF
BS 672 672 RR4FP45JQ
BS 673 688 RR4FP45TF
BS 689 689 RR4FP45JQ
BS 690 710 RR4FP45TF
BS 711 711 RR4FP45JQ
BS 712 736 RR4FP45TF
BS 737 883 RR4FP45JQ

RD RR4FP45TF 736 0 0
GGATGGCTCTAGTCCCAAACCATACTTAAACTCATCAGTTCCTTGTCACAAGGAAGTTGA
TCTTCTTAACCAAACCAAATATTTTCCTTGTCTTTTAATTCCATCTTTATTTTTAATTGT
TTCTGTGTTATTGAAACATGGATTTGCGATCATCATGTATGGTTCAGATGACAACGTTAA
GATGGATCATAACGATCACAATGTTGATGATGATGAGAGGAGGAGAATCGATGAGATTGG
ATCTGGAATCAGGCATGACCAAATGCATCGCCGACGACATCAAATTAAATTATCTGACTG
TCGGAACTTCCGTCGTCAATCCCAACGAAGCTCTCCATCTTCCTGCTTCCCACAAAATCA
TTGTCACTGTGGCGTCACCTAAATGGCACACTCAACACGAAGCAAGAGATGTGGAGTCTG
GGAAATTCGTGTTCACGGCGGTGGAAGACGGCGATTACACAACGTGTTTTATAGCTCCTG
TTTTTAAACCTCCGGCCAAATTCGCCGTTGATTTCGAATGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTA
AAGATTGGGCCACCATCGCCAAGAGAGGCCAGATCAACATGCTGGAGGTGGAGGTGAGGA
AACTACTGGACGTGACGGAGTCTATACACGACGAAATGTTTCTACTCCGGGAGAGGGAGC
GGGAAATGCAG*AGCTAAACCGGTCGAC*AACTCGAGAATGGCGGGTCTA*GTTTATTTT
CATTGTTGGTTACGTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4FP45JQ 608 0 0
GACATCAAATTAAATTATCTGACTGTCGGAACTTCCGTCGTCAATCCCAACGAAGCTCTC
CATCTTCCTGCTTCCCACAAAATCATTGTCACTGTGGCGTCACCTAAATGGCACACTCAA
CACGAAGCAAGAGATGTGGAGTCTGGGAAATTCGTGTTCACGGCGGTGGAAGACGGCGAT
TACACAACGTGTTTTATAGCTCCTGTTTTTAAACCTCCGGCCAAATTCGCCGTTGATTTC
GAATGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTAAAGATTGGGCCACCATCGCCAAGAGAGGCCAGATC
AACATGCTGGAGGTGGAGGTGAGGAAACTACTGGACGTGACGGAGTCTATACACGACGAA
ATGTTTCTACTCCGGGAGAGGGAGCGGGAAATGCAGGAGCTAAACCGGTCGACCAACTCG
AGAATGGCGGGTCTAAGTTTATTTTCATTGTTGGTTACGTTTTCGGTAGCCGGCATACAA
CTGTGGCATCTCAAGTCATTCTTGGAGAGGAAGAAGCTTCTCTAATATTTTTGCCTTTAT
CAGATTTTGGTGTTGTCAGTTTTAGCTTATTTTTTAAACTAAATAAATCTCTTTCTCTAC
CTTGGATT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL5020Contig1 610 2 1 U
GATACATCGGTTCAATGGTTGTTGGGGTTTGCTACGGAGTCCGGTTAGCCATAACAGTAC
CGACAGCCTCCGAGCTATTCGGCCTCAAATACTACGGACTCATCTACAACATCCTCATAC
TGAACTTACCACTTGGCTCGTTCCTCTTCTCGGGTCTTCTCGCTGGTTTACTCTATGATG
CCCAAGCTACACCAACTCCTGGTGGAGGCAATACGTGTGTAGGAGCCCATTGTTTCCGTC
TTGTCTTTATTGTAATGGGGTTTACTTCCATTATAGGTGTTGGTCTTGACATCTTGCTTG
CGTTTAGAACGAAGGATATATATGCGAGGATTCATGGGAGCAAGAATGCTAAGAAACCTA
GTGGTAATCTTCGATGAGTCTCAAGTTGAATACATGATTTTCTTTTAGTAAAATCATTTT
TGGGTATGTTACTTATACTAGTATTTTGTGTCTATTTTTGAAAGTTTTTATGTTAATTAT
TTTACTAGACGGTATGGATGAATTGTACACTTTGTACATTCGTGATTATTGTTGTTAAAG
GCGGTTTAAGTGTATTAAACCAGTTGTATGGTCTACGTTCATATAATGGGAAATCGATGA
ATTACATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GX29TF U 1
AF RR4GX29JQ C 160
BS 1 610 RR4GX29TF

RD RR4GX29TF 610 0 0
GATACATCGGTTCAATGGTTGTTGGGGTTTGCTACGGAGTCCGGTTAGCCATAACAGTAC
CGACAGCCTCCGAGCTATTCGGCCTCAAATACTACGGACTCATCTACAACATCCTCATAC
TGAACTTACCACTTGGCTCGTTCCTCTTCTCGGGTCTTCTCGCTGGTTTACTCTATGATG
CCCAAGCTACACCAACTCCTGGTGGAGGCAATACGTGTGTAGGAGCCCATTGTTTCCGTC
TTGTCTTTATTGTAATGGGGTTTACTTCCATTATAGGTGTTGGTCTTGACATCTTGCTTG
CGTTTAGAACGAAGGATATATATGCGAGGATTCATGGGAGCAAGAATGCTAAGAAACCTA
GTGGTAATCTTCGATGAGTCTCAAGTTGAATACATGATTTTCTTTTAGTAAAATCATTTT
TGGGTATGTTACTTATACTAGTATTTTGTGTCTATTTTTGAAAGTTTTTATGTTAATTAT
TTTACTAGACGGTATGGATGAATTGTACACTTTGTACATTCGTGATTATTGTTGTTAAAG
GCGGTTTAAGTGTATTAAACCAGTTGTATGGTCTACGTTCATATAATGGGAAATCGATGA
ATTACATTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4GX29JQ 451 0 0
TCGCTGGTTTACTTTATGATGCCCAAGCTACACCAACTCCTGGTGGAGGCAATACGTGTG
TAGGAGCCCATTGTTTCCGTCTTGTCTTTATTGTAATGGGGTTTACTTCCATTATAGGTG
TTGGTCTTGACATCTTGCTTGCGTTTAGAACGAAGGATATATATGCGAGGATTCATGGGA
GCAAGAATGCTAAGAAACCTAGTGGTAATCTTCGATGAGTCTCAAGTTGAATACATGATT
TTCTTTTAGTAAAATCATTTTTGGGTATGTTACTTATACTAGTATTTTGTGTCTATTTTT
GAAAGTTTTTATGTTAATTATTTTACTAGACGGTATGGATGAATTGTACACTTTGTACAT
TCGTGATTATTGTTGTTAAAGGCGGTTTAAGTGTATTAAACCAGTTGTATGGTCTACGTT
CATATAATGGGAAATCGATGAATTACATTTC

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL5021Contig1 871 2 2 U
ACAGCAAGAGCAAGAGAAAGATACTCAATAGTACGTATCTTCTTGATGCCTTCGCATATT
GGGGAAGTGAAGCCATTACAAGAGTGAGTCCTGAAAACACTCCACGATACAAAGGAATAA
GAGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAATCGATTGTTAAAAACTTGAAATCCGATCCAA
AACATTCATATTGATGGGTCTTTTCTCATTTTCCGCCTGTTGATGGGAGCTTTAGTTCCT
CCGCTTCTCAAGTTTCAGAAGGAAGGAGGCCTCTGTCCCATGTCTCTGTTGATGTTCAGT
AACCGGAATCCTCTTGTGCTCTGCTCGCAGGATGGGACCAGATAGTCGAGCCTTAAAACC
GCTGCTTCCATCTGCGCTTCTTCTGTTGGTTCCTCCTCGTCGGTTTGGATTCTCAGGAGT
ACAGCTTGTCTTCTTCTTGAGCTAGCAGCGTCTAGAATGGATTATCTCCGGTTTGAGATG
GCCGGGCCAAGACATTGCCGACCCTGCTGCGCATGTCCTCTGGTTGGAATCGGCTCGGGA
TGGTCTGCGGTTCCTCAGACCGTTCTCCTGCTGTGATTTCTGTTGACTCGTGCGGTTTTT
ATGCAGGTCCAGGCATCAAGGTTCTCGCTGTGCTCTTCTATTACTCAAAGGTTGTTCATG
GAACCATAATGTCAGTAAAGGTTTAATCTCATCCATATGGCTGGGATCGATCCTTCTTTT
GTCTTAGTGAGTCTTTTTTAACTTTTTGTGTGGCTCCTTAAGACACCCCTGCTATGAATA
GCAACTTAGTTACACTAGCTTTGATTCATCAAGCTAATTGTATTTCACTGTTTCGTTATT
GATTTAATGAAATGAAATTCACATACTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES27TF U 1
AF RR4ES27JQ C 108
BS 1 554 RR4ES27TF
BS 555 871 RR4ES27JQ

RD RR4ES27TF 554 0 0
ACAGCAAGAGCAAGAGAAAGATACTCAATAGTACGTATCTTCTTGATGCCTTCGCATATT
GGGGAAGTGAAGCCATTACAAGAGTGAGTCCTGAAAACACTCCACGATACAAAGGAATAA
GAGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAATCGATTGTTAAAAACTTGAAATCCGATCCAA
AACATTCATATTGATGGGTCTTTTCTCATTTTCCGCCTGTTGATGGGAGCTTTAGTTCCT
CCGCTTCTCAAGTTTCAGAAGGAAGGAGGCCTCTGTCCCATGTCTCTGTTGATGTTCAGT
AACCGGAATCCTCTTGTGCTCTGCTCGCAGGATGGGACCAGATAGTCGAGCCTTAAAACC
GCTGCTTCCATCTGCGCTTCTTCTGTTGGTTCCTCCTCGTCGGTTTGGATTCTCAGGAGT
ACAGCTTGTCTTCTTCTTGAGCTAGCAGCGTCTAGAATGGATTATCTCCGGTTTGAGATG
GCCGGGCCAAGACATTGCCGACCCTGCTGCGCATGTCCTCTGGTTGGAATCGGCTCGGGA
TGGTCTGCGGTTCC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4ES27JQ 764 0 0
TACAAAGGAATAAGAGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAATCGATTGTTAAAAACTTG
AAATCCGATCCAAAACATTCATATTGATGGGTCTTTTCTCATTTTCCGCCTGTTGATGGG
AGCTTTAGTTCCTCCGCTTCTCAAGTTTCAGAAGGAAGGAGGCCTCTGTCCCATGTCTCT
GTTGATGTTCAGTAACCGGAATCCTCTTGTGCTCTGCTCGCAGGATGGGACCAGATAGTC
GAGCCTTAAAACCGCTGCTTCCATCTGCGCTTCTTCTGTTGGTTCCTCCTCGTCGGTTTG
GATTCTCAGGAGTACAGCTTGTCTTCTTCTTGAGCTAGCAGCGTCTAGAATGGATTATCT
CCGGTTTGAGATGGCCGGGCCAAGACATTGCCGACCCTGCTGCGCATGTCCTCTGGTTGG
AATCGGCTCGGGATGGTCTGCGGTTCCTCAGACCGTTCTCCTGCTGTGATTTCTGTTGAC
TCGTGCGGTTTTTATGCAGGTCCAGGCATCAAGGTTCTCGCTGTGCTCTTCTATTACTCA
AAGGTTGTTCATGGAACCATAATGTCAGTAAAGGTTTAATCTCATCCATATGGCTGGGAT
CGATCCTTCTTTTGTCTTAGTGAGTCTTTTTTAACTTTTTGTGTGGCTCCTTAAGACACC
CCTGCTATGAATAGCAACTTAGTTACACTAGCTTTGATTCATCAAGCTAATTGTATTTCA
CTGTTTCGTTATTGATTTAATGAAATGAAATTCACATACTTACC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5022Contig1 709 2 19 U
ATTTAAATAGCTTTTACAACGAACATTCACACTCACATATGGAGAACAATAACATTACAA
AGGTAGAAAAAACATAATTAAGGTAGATAGAAAATTTACAAACTGTCTTATGTCGTTCAC
ATAAACAAAGAGTTCCCATTTTAGTTCACAAAGTATTTATAGAATTTGTTTCAATTGATG
ACAAAACAAAAAAAGGTTCCCAAGCCCGTGGATGATGATCTGAACAGTGGAAAAAACATT
TAACCAAACCAATATTACCGAAAAGGGGTCGGGAGGATGTTGACTTTAATCCATACGAGG
TTCAAAGGGTCTAAAGTTGTAGCTTTCCCAATTTTCCCGAAGGGCTGGGTTTGACTCCCA
CCATTGCTCAAGTCCATGAGCCTTCTTCAACTTATACCACGGCTTCTTAAGCAAATTAGT
TGTCTCAACTTTAAATTTGTTCATGTTTACTAACATATCGGCTGACGAAAAAAGTTGAAT
AGGTTCTCCGCTTTCTATTCCGAAAGCTAGACACCTAAGAGAGATTGCAGCACCTTTACT
CCCAAATTTGCCTAATCCGATACATGCCATGTATTTTTTGTATTTCACAATATTAATGCA
TTCTGAACAGACTCCATCTGATGGGTTAACATATAAGTAAGGTGTCCACGCTGCTATTCT
TGGATCGTTTTCTCGGGTCTTTAGATGAGCGACCGCGGCTACGGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C514JQ U 16
AF RR4FT89JQ U 1
BS 1 68 RR4FT89JQ
BS 69 69 RR4C514JQ
BS 70 92 RR4FT89JQ
BS 93 93 RR4C514JQ
BS 94 97 RR4FT89JQ
BS 98 98 RR4C514JQ
BS 99 123 RR4FT89JQ
BS 124 124 RR4C514JQ
BS 125 190 RR4FT89JQ
BS 191 191 RR4C514JQ
BS 192 234 RR4FT89JQ
BS 235 235 RR4C514JQ
BS 236 304 RR4FT89JQ
BS 305 305 RR4C514JQ
BS 306 433 RR4FT89JQ
BS 434 434 RR4C514JQ
BS 435 470 RR4FT89JQ
BS 471 471 RR4C514JQ
BS 472 709 RR4FT89JQ

RD RR4C514JQ 492 0 0
ACAACGAACATTCACACTCACATGTGGAGAACAATAACATTACAAAGGTAGAAAAAACAT
AATTAAGGTAGATAGAAAATTTACAAACTGTCTTATGTCGTTCACATAAACAAAGAGTTC
CCATTTTAGTTCACAAAGTATTTATAGAATTTGTTTCAATTGATGACAAAACAAAAAAAG
GTTCCCAAGCCCGTGGATGATGATCTGAACAGTGGAAAAAACATTTAACCAAACCAATAT
TACCGAAAAGGGGTCGGGAGGATGTTGACTTTAGTCCATACGAGGTTCAAAGGGTCTAAA
GTTGTAGCTTTCCCAATTTTCCCGAAGGGCTGGGTTTGACTCCCACCATTGCTCAAGTCC
ATGAGCCTTCTTCAACTTATACCACGGCTTCTTAAGCAAATTAGTTGTCTCAACTTTAAA
TTTGTTCATGTTTACTAACATATCGGCTGACGAAAAAAGTTGAATAGGTTCTCCGCTTTC
TATTCCGAAAGC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4FT89JQ 709 0 0
ATTTAAATAGCTTTTACAACGAACATTCACACTCACATATGGAGAACAATAACATTACAA
AGGTAGAAGAAACATAATTAAGGTAGATAGAAGATTTCCAAACTGTCTTATGTCGTTCAC
ATAGACAAAGAGTTCCCATTTTAGTTCACAAAGTATTTATAGAATTTGTTTCAATTGATG
ACAAAACAAAGAAAGGTTCCCAAGCCCGTGGATGATGATCTGAACAGTGGAAAAGACATT
TAACCAAACCAATATTACCGAAAAGGGGTCGGGAGGATGTTGACTTTAATCCATACGAGG
TTCAGAGGGTCTAAAGTTGTAGCTTTCCCAATTTTCCCGAAGGGCTGGGTTTGACTCCCA
CCATTGCTCAAGTCCATGAGCCTTCTTCAACTTATACCACGGCTTCTTAAGCAAATTAGT
TGTCTCAACTTTAGATTTGTTCATGTTTACTAACATATCGGCTGACGAAAGAAGTTGAAT
AGGTTCTCCGCTTTCTATTCCGAAAGCTAGACACCTAAGAGAGATTGCAGCACCTTTACT
CCCAAATTTGCCTAATCCGATACATGCCATGTATTTTTTGTATTTCACAATATTAATGCA
TTCTGAACAGACTCCATCTGATGGGTTAACATATAAGTAAGGTGTCCACGCTGCTATTCT
TGGATCGTTTTCTCGGGTCTTTAGATGAGCGACCGCGGCTACGGTCCCT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL5023Contig1 930 2 2 U
GGCTCCTGCTTCTGATCGAGTTCTTTTGAGTCCTTGTCTCTGGCTTTCTTCTTCTTCCTC
CTCCCCGGGCAAGTCCTCTGATTCTTCAACAGGAAAACAAGATGGACTCCTCTGGTACAA
AGACTCTGGCCACCACCTACTCGGTGAGTTCTCAATGGCGGCTGTTCAGGCCAACAACCT
TCTCGAGGATCATAGCCAAGTTGAGTCTGACCCTTTGAGTCACTTGATTCAGCAACGACA
GCTGCTAAGTATCAATCTGGAAAGTCTGACCCTTTGAGGAACTGCTTTGGATTTGGTTGG
AGTGCCTTTGCCTGAGGACACCATCTCCGCTGCTAAAGACTCAGATGTTGTGCTTCTTGG
AGCCATCAGAGGGTATAAATGGGATAAGAATGAAAAACATCTGAAGCCTGAGACTGGGTT
ACTTCAACTTCGGGCCGCTCTTAAAGTCTTTGCTAATCTCAGACCTGCTAATGTTCTTCC
ACAGGCCTCGATTTTATGGAGGAGACGAGTAACAGCATTAGCCTCTGAATATCCTGATTT
TGAGCTGTCACATATGTATGTTGACAATGCTGCAATGCAGCTTGTTCGTGACCCTAAACA
GTTTGACACCATTGTCACAAAGAACAATATGATCACGTCTGAACAAAGACATGTGCTGTT
TATTACAGGGACCTGGACTCTTTGAACCAATACATTGTTCTGCACCTACGTTAGAGAGAG
GTCAGAGACTTGGAAGATAACTCTTTTTTTATTAGCTAGGTAAGATTTTTTTGAACATTT
AGTTAGATTACAATATTTTGCTCTCGGTAAAACCGTATAAGTAAAGGTCATCATCTTCTC
TTCCAAACAGAACAGCAGCTAAGTTTGTAACATGAATCTCATTTATTTGTGAATATAAGG
ACTCCTCAATGGAGTCCACTATTGGACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ42TF U 1
AF RR4EQ42JQ C 217
BS 1 664 RR4EQ42TF
BS 665 930 RR4EQ42JQ

RD RR4EQ42TF 664 0 0
GGCTCCTGCTTCTGATCGAGTTCTTTTGAGTCCTTGTCTCTGGCTTTCTTCTTCTTCCTC
CTCCCCGGGCAAGTCCTCTGATTCTTCAACAGGAAAACAAGATGGACTCCTCTGGTACAA
AGACTCTGGCCACCACCTACTCGGTGAGTTCTCAATGGCGGCTGTTCAGGCCAACAACCT
TCTCGAGGATCATAGCCAAGTTGAGTCTGACCCTTTGAGTCACTTGATTCAGCAACGACA
GCTGCTAAGTATCAATCTGGAAAGTCTGACCCTTTGAGGAACTGCTTTGGATTTGGTTGG
AGTGCCTTTGCCTGAGGACACCATCTCCGCTGCTAAAGACTCAGATGTTGTGCTTCTTGG
AGCCATCAGAGGGTATAAATGGGATAAGAATGAAAAACATCTGAAGCCTGAGACTGGGTT
ACTTCAACTTCGGGCCGCTCTTAAAGTCTTTGCTAATCTCAGACCTGCTAATGTTCTTCC
ACAGGCCTCGATTTTATGGAGGAGACGAGTAACAGCATTAGCCTCTGAATATCCTGATTT
TGAGCTGTCACATATGTATGTTGACAATGCTGCAATGCAGCTTGTTCGTGACCCTAAACA
GTTTGACACCATTGTCACAAAGAACAATATGATCACGTCTGAACAAAGACATGTGCTGTT
TATT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4EQ42JQ 714 0 0
GAGTCACTTGATTCAGCAACGACAGCTGCTAAGTATCAATCTGGAAAGTCTGACCCTTTG
AGGAACTGCTTTGGATTTGGTTGGAGTGCCTTTGCCTGAGGACACCATCTCCGCTGCTAA
AGACTCAGATGTTGTGCTTCTTGGAGCCATCAGAGGGTATAAATGGGATAAGAATGAAAA
ACATCTGAAGCCTGAGACTGGGTTACTTCAACTTCGGGCCGCTCTTAAAGTCTTTGCTAA
TCTCAGACCTGCTAATGTTCTTCCACAGGCCTCGATTTTATGGAGGAGACGAGTAACAGC
ATTAGCCTCTGAATATCCTGATTTTGAGCTGTCACATATGTATGTTGACAATGCTGCAAT
GCAGCTTGTTCGTGACCCTAAACAGTTTGACACCATTGTCACAAAGAACAATATGATCAC
GTCTGAACAAAGACATGTGCTGTTTATTACAGGGACCTGGACTCTTTGAACCAATACATT
GTTCTGCACCTACGTTAGAGAGAGGTCAGAGACTTGGAAGATAACTCTTTTTTTATTAGC
TAGGTAAGATTTTTTTGAACATTTAGTTAGATTACAATATTTTGCTCTCGGTAAAACCGT
ATAAGTAAAGGTCATCATCTTCTCTTCCAAACAGAACAGCAGCTAAGTTTGTAACATGAA
TCTCATTTATTTGTGAATATAAGGACTCCTCAATGGAGTCCACTATTGGACCCG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL5024Contig1 1009 2 2 U
GATGATTCTGATTCAATGCCACGTGTTTGGACTGGAAAGGAGGACATCAGAGAAATCACC
AAAATGGCTCGTTCTGCATCCTTGAAGCTGCTTTCCGTTATGGCTGTCATCCGCTTGGAT
GATGAACTCGACAATATTGAGAAGACATTGACTCTCGCTCTGGTTAATCCTACGAGCAAC
AATGCTACCAACAGGAGCATCAGCACAATTGATTCACTTGCGTCAAGCACTTGGGAGCAG
GTTGCACCAGAAAAGACGTTGATCACACCTGTACAGTGTAAATCACTGTGGAGACAATTC
AAAAACGAGACAGAATATACCGTTACACAGGCCATTTCTGCACAGGAAGCTAACCGACGG
AATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGCAATCCTTGCCCTGGTCGTTCTTGGATTCAAT
GAATTTATGACTCTCTTAAGAAATCCTCTATGGCTCTTGGCTCTGTTTGTTGGATACCTT
GTTTCCAAAGCCTTGTGGGTGCAACTAAACATTTCAGAAGAGTTCCGCAACGGAGCGCTA
CCTGGACTTCTTTCCTTGTCAACCAAATTTCTGCCAACGGTAATGAACCTCCTCAAGAAA
CTAGCGGAAGAAGGACAAGCGCCGCCATCCACAAATACCAACCAAACTGCGATGAGCTCC
TCCGCTCAATCCGAGGTTACAACCAATGGTGAAATCAGCAGCAGTAGCAGCAGCTCCGGT
TCGTCTCCAGCGAGATCTGTTCCCATTGACACGAGTTCATAGAACAAAGCCCACGAACCT
ATATATACTTAAAAAGTTTCGTTACCCTTTACAAAAGGGTATCTCTCATTTTTGGTGTTG
AGCAAGAGGGATTCACCGAGAGCACTACGTTTTATGTCACTGAAGGCATTGGTTACACTT
TCAGGTGCCAAAGCCGTCTTGTATGTTACTAGTCAAAGATTCTGTTGCAGACAAAAAATT
TGTGATTTGTTTGCGAGTTTATGTAGTGATGTGGTTTATTGTATCTGAT


BQ
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AF RR4GB79TF U 1
AF RR4GB79JQ C 284
BS 1 712 RR4GB79TF
BS 713 1009 RR4GB79JQ

RD RR4GB79TF 712 0 0
GATGATTCTGATTCAATGCCACGTGTTTGGACTGGAAAGGAGGACATCAGAGAAATCACC
AAAATGGCTCGTTCTGCATCCTTGAAGCTGCTTTCCGTTATGGCTGTCATCCGCTTGGAT
GATGAACTCGACAATATTGAGAAGACATTGACTCTCGCTCTGGTTAATCCTACGAGCAAC
AATGCTACCAACAGGAGCATCAGCACAATTGATTCACTTGCGTCAAGCACTTGGGAGCAG
GTTGCACCAGAAAAGACGTTGATCACACCTGTACAGTGTAAATCACTGTGGAGACAATTC
AAAAACGAGACAGAATATACCGTTACACAGGCCATTTCTGCACAGGAAGCTAACCGACGG
AATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGCAATCCTTGCCCTGGTCGTTCTTGGATTCAAT
GAATTTATGACTCTCTTAAGAAATCCTCTATGGCTCTTGGCTCTGTTTGTTGGATACCTT
GTTTCCAAAGCCTTGTGGGTGCAACTAAACATTTCAGAAGAGTTCCGCAACGGAGCGCTA
CCTGGACTTCTTTCCTTGTCAACCAAATTTCTGCCAACGGTAATGAACCTCCTCAAGAAA
CTAGCGGAAGAAGGACAAGCGCCGCCATCCACAAATACCAACCAAACTGCGATGAGCTCC
TCCGCTCAATCCGAGGTTACAACCAATGGTGAAATCAGCAGCAGTAGCAGCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4GB79JQ 726 0 0
CACTGTGGAGACAATTCAAAAACGAGACAGAATATACCGTTACACAGGCCATTTCTGCAC
AGGAAGCTAACCGACGGAATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGCAATCCTTGCCCTGG
TCGTTCTTGGATTCAATGAATTTATGACTCTCTTAAGAAATCCTCTATGGCTCTTGGCTC
TGTTTGTTGGATACCTTGTTTCCAAAGCCTTGTGGGTGCAACTAAACATTTCAGAAGAGT
TCCGCAACGGAGCGCTACCTGGACTTCTTTCCTTGTCAACCAAATTTCTGCCAACGGTAA
TGAACCTCCTCAAGAAACTAGCGGAAGAAGGACAAGCGCCGCCATCCACAAATACCAACC
AAACTGCGATGAGCTCCTCCGCTCAATCCGAGGTTACAACCAATGGTGAAATCAGCAGCA
GTAGCAGCAGCTCCGGTTCGTCTCCAGCGAGATCTGTTCCCATTGACACGAGTTCATAGA
ACAAAGCCCACGAACCTATATATACTTAAAAAGTTTCGTTACCCTTTACAAAAGGGTATC
TCTCATTTTTGGTGTTGAGCAAGAGGGATTCACCGAGAGCACTACGTTTTATGTCACTGA
AGGCATTGGTTACACTTTCAGGTGCCAAAGCCGTCTTGTATGTTACTAGTCAAAGATTCT
GTTGCAGACAAAAAATTTGTGATTTGTTTGCGAGTTTATGTAGTGATGTGGTTTATTGTA
TCTGAT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL5025Contig1 354 2 1 U
GGGCCTCGCGTGCGCAGCCGCAAATCGGACGACTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTC
ATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATT
CGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACC
AAGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGATTGCTTTTTTCTTTTGGGATTAGCAT
TTTCTCAAGTTTTATGATTCTAAGTGATATGACTTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTAA
CACTCCTTTTGAGTGATGTTACCAAGTATCCTATGGCAATAGTTACTTCATGCC


BQ
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AF RR4FH66JQ C 1
AF RR4FH66TF U 1
BS 1 354 RR4FH66TF

RD RR4FH66JQ 354 0 0
GGGCCTCGCGTGCGCAGCCGCAAATCGGACGACTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTC
ATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATT
CGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACC
AAGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGATTGCTTTTTTCTTTTGGGATTAGCAT
TTTCTCAAGTTTTATGATTCTAAGTGATATGACTTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTAA
CACTCCTTTTGAGTGATGTTACCAAGTATCCTATGGCAATAGTTACTTCATGCC

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR4FH66TF 354 0 0
GGGCCTCGCGTGCGCAGCCGCAAATCGGACGACTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTC
ATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATT
CGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACC
AAGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGATTGCTTTTTTCTTTTGGGATTAGCAT
TTTCTCAAGTTTTATGATTCTAAGTGATATGACTTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTAA
CACTCCTTTTGAGTGATGTTACCAAGTATCCTATGGCAATAGTTACTTCATGCC

QA 1 354 1 354
DS 



AS 1 2

CO CL5026Contig1 453 2 2 U
GGTCTCATATAACGGTCCAATATATGATATGACCGTTGTAACTTTCAAGCTCCATCTCTC
TTTTCCTCTCTAAAGATATTTAATAATTATGTTTATTTATAAAATATACTTTTTCATTAC
CCTGCCTTAAGTAAAGCTCCCTTGGTTAACCTAAAGTTTGAAGTTTATTTAGTTTGCTGC
ATTAATATAAGTTTTAAAACCTAGAAAATGCTTGATAGGATTTTAAAAGTCTCAAACTGC
ATGCCTTTTTTTTGTAAGCAAAGAGTTTGTATGGTGACCAAGGTTGTTGTTCAAAATAAC
TGAAAGAATCCAGTACGTTCATGTTCATTTAGTGTCGTGATCTGTGATTTGGTTTAGTTA
CAGGTTGCAGATCTTGCGACTGGCCGTAAGTCGTAGATTTTTTTTGTTTTGCTGTCTTGC
GATCAGCACTGTAAAATTAGATATTTAACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CP18JQ C 1
AF RR4CP18TF U 6
BS 1 5 RR4CP18JQ
BS 6 453 RR4CP18TF

RD RR4CP18JQ 453 0 0
GGTCTCATATAACGGTCCAATATATGATATGACCGTTGTAACTTTCAAGCTCCATCTCTC
TTTTCCTCTCTAAAGATATTTAATAATTATGTTTATTTATAAAATATACTTTTTCATTAC
CCTGCCTTAAGTAAAGCTCCCTTGGTTAACCTAAAGTTTGAAGTTTATTTAGTTTGCTGC
ATTAATATAAGTTTTAAAACCTAGAAAATGCTTGATAGGATTTTAAAAGTCTCAAACTGC
ATGCCTTTTTTTTGTAAGCAAAGAGTTTGTATGGTGACCAAGGTTGTTGTTCAAAATAAC
TGAAAGAATCCAGTACGTTCATGTTCATTTAGTGTCGTGATCTGTGATTTGGTTTAGTTA
CAGGTTGCAGATCTTGCGACTGGCCGTAAGTCGTAGATTTTTTTTGTTTTGCTGTCTTGC
GATCAGCACTGTAAAATTAGATATTTAACAAAA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4CP18TF 448 0 0
CATATAACGGTCCAATATATGATATGACCGTTGTAACTTTCAAGCTCCATCTCTCTTTTC
CTCTCTAAAGATATTTAATAATTATGTTTATTTATAAAATATACTTTTTCATTACCCTGC
CTTAAGTAAAGCTCCCTTGGTTAACCTAAAGTTTGAAGTTTATTTAGTTTGCTGCATTAA
TATAAGTTTTAAAACCTAGAAAATGCTTGATAGGATTTTAAAAGTCTCAAACTGCATGCC
TTTTTTTTGTAAGCAAAGAGTTTGTATGGTGACCAAGGTTGTTGTTCAAAATAACTGAAA
GAATCCAGTACGTTCATGTTCATTTAGTGTCGTGATCTGTGATTTGGTTTAGTTACAGGT
TGCAGATCTTGCGACTGGCCGTAAGTCGTAGATTTTTTTTGTTTTGCTGTCTTGCGATCA
GCACTGTAAAATTAGATATTTAACAAAA

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL5027Contig1 946 2 2 U
GGGACAGCTTGGGATCGGGGAAGGCGTGGTTGAAGCGTTGGTTCCTTCAAAGGTTGAAGC
TTTAGGTCAAGAACACATCGTTAAGGTGTCGTTAGGTTGGGGGCACGGACTTGCTCTTAC
TGTTGATGGTAAGGTTTTTGGGTGGGGTTATGTAGCTGATGGGAGAGTAGGGAATGTTGG
ACTTCCGCTTGAGGCGTCTCCTCTTGATTCATTTACAAATGGGTATGATGAGGAGGCAGC
TAGGAAGAAAGTTGCGGAAGCTATGAGGAAGGAGAACAACATGCCTATAGCTTGGGAGCC
TCGTCTGGTGGAAGAGTTGCGTGGTGTGAAGGTGGACGATATTGCGTGCGGGTCCGATCA
CTCGTTAGTGCTTTGTCGTGATGGGACTCTTTTGAGCTCTGGGAGCAATGTGTATGGTCA
GTTGGGTCGTAGGTGTAAGCAAGACCTAGGAATGTCACCTGTTGATATAACCGGGTCTCC
GGTTTCAATAGCAGCTGGTCTTGGTCATTCTCTAGCGATCTGCAATGTTGATTCAGATTC
CAATGCGAGGAGGGTTGTTGTCTCATCATGGGGTTGGAACCGTAGCCAGCAGCTTGGCAG
GGGTAAGCCAGAAGAGGTGCCGAGAGAAGTGGAGGGTTTGGATGGGGAAACTCCAGCTTC
GGTATCAGCAGGGCGTGTGCATTCCTCGTGTGTAACAGAGAAAGGAGAAGCTTGGGTTTG
GGGATGCGGAAAGAGCGGTAGGCTTGGTTTAGGAAGTTCGGTTGATGAACCTGAACCGAT
GTTGCTGGAAGACATCGAGGGTTGTGTTCTTCAAGCAGTTGCTGGATTTGATCACAGCCT
TATCTTAGTGTCTGATTGTCTAGATTAATCTTAGGAATAAAGGCAAACTTCCACTACTAC
TGGAGATCTTGTTTGTTATCATTTTTGTAAGAGCATAGAAATAAAT


BQ
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GTTGGGTCGTAGGTGTAAGCAAGACCTAGGAATGTCACCTGTTGATATAACCGGGTCTCC
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TGAGGAAGGAGAACAACATGCCTATAGCTTGGGAGCCTCGTCTGGTGGAAGAGTTGCGTG
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GGACTCTTTTGAGCTCTGGGAGCAATGTGTATGGTCAGTTGGGTCGTAGGTGTAAGCAAG
ACCTAGGAATGTCACCTGTTGATATAACCGGGTCTCCGGTTTCAATAGCAGCTGGTCTTG
GTCATTCTCTAGCGATCTGCAATGTTGATTCAGATTCCAATGCGAGGAGGGTTGTTGTCT
CATCATGGGGTTGGAACCGTAGCCAGCAGCTTGGCAGGGGTAAGCCAGAAGAGGTGCCGA
GAGAAGTGGAGGGTTTGGATGGGGAAACTCCAGCTTCGGTATCAGCAGGGCGTGTGCATT
CCTCGTGTGTAACAGAGAAAGGAGAAGCTTGGGTTTGGGGATGCGGAAAGAGCGGTAGGC
TTGGTTTAGGAAGTTCGGTTGATGAACCTGAACCGATGTTGCTGGAAGACATCGAGGGTT
GTGTTCTTCAAGCAGTTGCTGGATTTGATCACAGCCTTATCTTAGTGTCTGATTGTCTAG
ATTAATCTTAGGAATAAAGGCAAACTTCCACTACTACTGGAGATCTTGTTTGTTATCATT
TTTGTAAGAGCATAGAAATAAAT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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ATGATAGAAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGTACCACATAAAGAGTTTTAAATCCTAG
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AATTTCCTTGTTTGTGCGTTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGTTTGCAAA
CTCAAGAGGATTGCCGATGGACAGCACCATATCCCCAACAGAAACATCCTTGGAGATTCC
AAACTTTGCAGGAGAGAATGAAGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGACTAGTGCGAGATC
ATAATCTGCATCATAATCAGCAACAACTCCTCGAAACGTTTGACCACAGTTCAATATCTT
TACCTCCATTCGCTTCGAACGATAGACATGACTCGTTCTAAACTTGTGGGGGTTGAGGAC
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GTC


BQ
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10 10 10 

AF RR4FM63TF C 1
AF RR4BN43JQ U 7
BS 1 7 RR4FM63TF
BS 8 723 RR4BN43JQ

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GTGATAGAAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGTACCACATAAAGAGTTTTAAATCCTAG
AATCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTTAGCACTGTGTCTATGGGCTACCAGTTTCT
CTCCTTCATGACCTTCAGTACTGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAACACCCACTCCGTC
CCCAAATGCGCAGTTAACGCCGATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAACCGGACCTCCAGA
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AATTTCCTTGTTTGTGCGTTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGTTTGCAAA
CTCAAGAGGATTGCCGATGG
CC

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DS 

RD RR4BN43JQ 717 0 0
A
CATGCAAAAAGTCGGTTGTCTCCACTCGGGTTAAGAAGGTTATTAAGTTGACAATGATAG
AAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGTACCACATAAAGAGTTTTAAATCCTAGAATCTAC
CAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTTAGCACTGTGTCTATGGGCTACCAGTTTCTCTCCTTC
ATGACCTTCAGTACTGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAACACCCACTCCGTCCCCAAAT
GCGCAGTTAACGCCGATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAACCGGACCTCCAGAGTTACCC
TCTTTCAAAGCACAATCAGTTTGGAGATAGAATTTGCAATTGCCTTCTATGCCAATTTCC
TTGTTTGTGCGTTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGTTTGCAAACTCAAGA
GGATTGCCGATGGACAGCACCATATCCCCAACAGAAACATCCTTGGAGATTCCAAACTTT
GCAGGAGAGAATGAAGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGACTAGTGCGAGATCATAATCT
GCATCATAATCAGCAACAACTCCTCGAAACGTTTGACCACAGTTCAATATCTTTACCTCC
ATTCGCTTCGAACGATAGACATGACTCGTTCTAAACTTGTGGGGGTTGAGGACGAAATGA
CCACAAGTTATTATTTTGCCTTCTCCCCCAAACAAAATCCCAGAGCCATAACAGTC

QA 2 717 2 717
DS 



AS 1 2

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AGATCGGTCTAGTGTCCATCTTGCTTAAAAAAACAGCCGAGGCAGCAATTAAGGACAGCA
AGAACCTAAGAAAACTATATTCAACAAGAGTCAACTCTGCAAGATAGTTTGCTAAGGACT
TCATCTCAATGTGGTGAGCCTGATCAGACGCTCGAGCTGCTTGAATGAACATACTGAAAC
GCAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATTGACTTAATATTACATATT
GTTTAGATTGAAGTAAATATAACGTATTAGTGTTTGATCTGAGAAACGTTTTGGTGGTGG
GAACTGATAACCGAAAGCGCAGGAAGTTTAAACCTGAGTCTCCAGGGCCACTACTTGGAG
TCTTGTGTATGTATTGTCTGGAATGAAGCAAAACTCCTCCAACCTTGGTGCACAAATCTC
TTTCATACTTTCTTCAGAGACTCAACAAGAAGAGTGTCTTAGTTAATTCACTTGTGCTGA
CATTTTTAATACTCATATTGCAAAAGTGAATGTTAGAAGTGTGGGAACTCGGGAGGATAA
TACTCTCATTATCGCTGTTTCTTAAGGGGTCTTTTAGAGTAGTTAGTAATTAAAGAAAAA
GGAAAATAGATATATTAAATTAAGAGGAGGAAGAAAGTTTTTTATTGGACACGTGTTGTT
GATAGGAGAAGGAAACATCTCCTCTCTCTCTCTATATATATATCAAATCCCTGAAACAAG
CACTTGATCTCAT


BQ
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AF RR4EI40TF U 1
AF RR4EI40JQ C 599
BS 1 713 RR4EI40TF
BS 714 913 RR4EI40JQ

RD RR4EI40TF 713 0 0
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GGCGTCTCATATCTAGTATAGTGCTGTAGAGTTGAGTTCTTTAAGCAATAACATTTCACA
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AGATCGGTCTAGTGTCCATCTTGCTTAAAAAAACAGCCGAGGCAGCAATTAAGGACAGCA
AGAACCTAAGAAAACTATATTCAACAAGAGTCAACTCTGCAAGATAGTTTGCTAAGGACT
TCATCTCAATGTGGTGAGCCTGATCAGACGCTCGAGCTGCTTGAATGAACATACTGAAAC
GCAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATTGACTTAATATTACATATT
GTTTAGATTGAAGTAAATATAACGTATTAGTGTTTGATCTGAGAAACGTTTTGGTGGTGG
GAACTGATAACCGAAAGCGCAGGAAGTTTAAACCTGAGTCTCCAGGGCCACTACTTGGAG
TCTTGTGTATGTATTGTCTGGAATGAAGCAAAACTCCTCCAACCTTGGTGCACAAATCTC
TTTCATACTTTCTTCAGAGACTCAACAAGAAGAGTGTCTTAGTTAATTCACTTGTGCTGA
CATTTTTAATACTCATATTGCAAAAGTGAATGTTAGAAGTGTGGGAACTCGGG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4EI40JQ 315 0 0
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GACATTTTTAATACTCATATTGCAAAAGTGAATGTTAGAAGTGTGGGAACTCGGGAGGAT
AATACTCTCATTATCGCTGTTTCTTAAGGGGTCTTTTAGAGTAGTTAGTAATTAAAGAAA
AAGGAAAATAGATATATTAAATTAAGAGGAGGAAGAAAGTTTTTTATTGGACACGTGTTG
TTGATAGGAGAAGGAAACATCTCCTCTCTCTCTCTATATATATATCAAATCCCTGAAACA
AGCACTTGATCTCAT

QA 1 315 1 315
DS 



AS 1 2

CO CL5030Contig1 994 2 10 U
TTTTTTAACTTTCTCTTGCTTACAGAATCGTCTCCCTCCACCTTCCGCCGTCTTGAGATT
GAGAATCAATCAATCAAAGCATAGAAATCAATAATCTCAGACACATCTGGAAATGGTTTA
AAGGGATGAAGAGTTTTGATTTGCATAAGCTTATATTATGGCGCAGTGCATAGACGGTTT
CAAGCATTTATGCACCTCTGTTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATTTGTATAAACAACCTGG
TGGCCTTGGTGACCCTGAATTGCTTGCCAGAGACACTGCTTTTAGTGTGAGTGAAATAGA
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CAAGGAAGAGTTTCAGTTGGCTTTATTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCAGA
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TCGTGCTCTCTCTGTCTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCACTTTTCATT
TCAGCTATATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATCGAACGGGAAGAGCTGAAACAAATGGT
TGTGGCTACGCTTGCTGAATCTGGAATGAACTTGATGGATACTGTCATTGAGGATATCAT
CGACAAGACGTTTGAAGAAGCAGACACAAAACACGATGGAAAGATTGACTGGGAGGAGTG
GAGAAGCCTTGTTCTCAGACATCCCAGCCTTCTCAAGAACATGACTCTTCAGTATCTCAA
GGATATCACGACTACGTTTCCAAGCTTTGTGTTCCACTCTCAAGTTGAAGATACCTGATG
ATGGGAAAAAAGAAAAAAAACAGCAAGCAGCAAGAGTTTATGTTTTTTTTTGGTCATTTG
TTTCGTTGATTTTTTTTCTTTTCTTGTGAAGCAAAATACAAAGTTTATTTGTTTTCATTG
AGCTATTTCTGTGAAGCAGATTTCTTTTCGGTAC


BQ
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AF RR4CZ81TF U 1
AF RR4CZ81JQ C 259
BS 1 652 RR4CZ81TF
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RD RR4CZ81TF 723 0 0
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GAGAATCAATCAATCAAAGCATAGAAATCAATAATCTCAGACACATCTGGAAATGGTTTA
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CAAGCATTTATGCACCTCTGTTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATTTGTATAAACAACCTGG
TGGCCTTGGTGACCCTGAATTGCTTGCCAGAGACACTGCTTTTAGTGTGAGTGAAATAGA
AGCTCTTTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCCGTTATTGACGATGGACTAATCAA
CAAGGAAGAGTTTCAGTTGGCTTTATTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCAGA
TCGGGTTTTTGATTTGTTTGATACAAAGCACAATGGGATACTAGGGTTCGAGGAGTTTGC
TCGTGCTCTCTCTGTCTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCACTTTTCATT
TCAGCTATATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATCGAACGGGAAGAGCTGAAACAAATGGT
TGTGGCTACGCTTGCTGAATCTGGAATGAACTTGATGGATACTGTCATTGAG*ATATCAT
CGACA*GACGTTTGAAGAAGCAGACACAAA*CACGATGGAAAGAT*GACTGGGAGGAGTG
GAG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CZ81JQ 736 0 0
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TGATACAAAGCACAATGGGATACTAGGGTTCGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCTGTCTT
TCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCACTTTTCATTTCAGCTATATGATCTTAA
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ATCTGGAATGAACTTGATGGATACTGTCATTGAGGATATCATCGACAAGACGTTTGAAGA
AGCAGACACAAAACACGATGGAAAGATTGACTGGGAGGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTCAG
ACATCCCAGCCTTCTCAAGAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTT
TCCAAGCTTTGTGTTCCACTCTCAAGTTGAAGATACCTGATGATGGGAAAAAAGAAAAAA
AACAGCAAGCAGCAAGAGTTTATGTTTTTTTTTGGTCATTTGTTTCGTTGATTTTTTTTC
TTTTCTTGTGAAGCAAAATACAAAGTTTATTTGTTTTCATTGAGCTATTTCTGTGAAGCA
GATTTCTTTTCGGTAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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GTGTGATGGAGTTTGAAGGTCACTTGAGCTCATATGATCACAACCATAAGAAGAGATTCA
AAGAGATGAAAGAAATGCACGGTGCAAGCAGCCGGGATGATAGGAAGAAGCGAGAGCAGC
AGCGTCAAGAGAGGGAGCTAACTAAAATGGCTGATGCTCGTAAACAACAGCAGATGCAAC
AGCAGAACATGCAAGAAGACCCAGAGAATGCCCCAGTTCCATTGCCTGCAAAGACCACTC
TTGCACCACTTGTTGTCCAAGATCAGCGGAAGTCTTTGAAGTTTGGCTTTTCTTCAAAAA
GCGGCAGTACATCAAAGAACCAACCCAAGAGCAGCATCAAGAAGCCTAAAATAGCAATTG
CATCGGTTTTTGGCAACGATAGCGACGAAGACTAATGGTTTACATCATCATCGAGAATAT
TGTACTAAATGTAATTCTATTTTATGGTACTTCCTTTCACTGAACATGGTCTGAAAAAAT
CTTCACATCTCAGGACCACAACATAGCCTTGCAACTTTTTGTGTTTATTAAAGGAAATCT
TATAAGACATTTTGGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI32TF U 1
AF RR4GI32JQ C 1
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BS 252 557 RR4GI32JQ

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TTGCACCACTT

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DS 

RD RR4GI32JQ 557 0 0
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AAGAGATGAAAGAAATGCACGGTGCAAGCAGCCGGGATGATAGGAAGAAGCGAGAGCAGC
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AGCAGAACATGCAAGAAGACCCAGAGAATGCCCCAGTTCCATTGCCTGCAAAGACCACTC
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CATCGGTTTTTGGCAACGATAGCGACGAAGACTAATGGTTTACATCATCATCGAGAATAT
TGTACTAAATGTAATTCTATTTTATGGTACTTCCTTTCACTGAACATGGTCTGAAAAAAT
CTTCACATCTCAGGACCACAACATAGCCTTGCAACTTTTTGTGTTTATTAAAGGAAATCT
TATAAGACATTTTGGCT

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL5032Contig1 770 2 3 U
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TACAGATAAAACAGTAGTTTATGAATCAAAAACAAATTAAATGACACAAACTGCTTCTTC
TTGTTCATCAAAGGCAGGCATGTGGAGAGGTTTATGAATCAAAACAACTTGAAAATATCA
TCATGCACTGGGAGGTTTGTAGAGCTTCTCAGCCATCTTCCTATACTCTTCTTGGTTGCT
CCAGAGCTGCGCTGCTTGAGTGTTCAGTGGTGAGCTGATGTTGGGTTCTCCCAAAAGGCT
CTGAACGGATAGTAGGATTGTCCTCACATCATAAGCAGAAAACCATTTATCCTGGAGAAT
GTCCAAGCAGATGTTGCCATAGAGATCAACATTGGGGTGGAAGCAACAAGTGTGGAACTT
GATCTTTGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGAAAGAGAGTGAGAGTATGTACTCAGT
TCCTTCAAAGACAGTATCTTTGCTTCCTGTTATTGTCCCTTTCCAACACAAGATGTTGTC
TTCCTCTGGGAATGCCGATATTCCCGGGTCACCGCCCATCATCAAGCCCATTAGCTCAGA
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TGACCCGTTTGACGCCGGAGGATCCGCCGGAGTGTTTCCTTGGTACCCATTTACGGCAGC
CATCACTTTCGCTTTCTTTTACTCAGGAGGAGAGCCAAGATCCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CA69TF C 1
AF RR4CA69JQ U 7
BS 1 6 RR4CA69TF
BS 7 743 RR4CA69JQ
BS 744 770 RR4CA69TF

RD RR4CA69TF 770 0 0
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TACAGATAAAACAGTAGTTTATGAATCAGAAACAAATTAAATGACACAAACTGCTTCTTC
TTGTTCATCAAAGGCAGGCATGTGGAGAGGTTTATGAATCAGAACAACTTGAAGATATCA
TCATGCACTGGGAGGTTTGTAGAGCTTCTCAGCCATCTTCCTATACTCTTCTTGGTTGCT
CCAGAGCTGCGCTGCTTGAGTGTTCAGTGGTGAGCTGATGTTGGGTTCTCCCAAAAGGCT
CTGAACGGATAGTAGGATTGTCCTCACATCATAAGCAGAAGACCATTTATCCTGGAGAAT
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GATCTTTGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGAAAGAGAGTGAGAGTATGTACTCAGT
TCCTTCAAAGACAGTATCTTTGCTTCCTGTTATTGTCCCTTTCCAACACAAGATGTTGTC
TTCCTCTGGGAATGCCGATATTCCCGGGTCACCGCCCATCATCAAGCCCATTAGCTCAGA
TTGCAGCCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTCAACAGTCTTTGTCGGAGGCGCAGATTGCTT
TGACCCGTTTGACGCCGGAGGATCCGCCGGAGTGTTTCCTTGGTACCCATTTACGGCAGC
CATCACTTTCGCTTTCTTTTACTCAGGAGGAGAGCCAAGATCCTTCTTCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4CA69JQ 737 0 0
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ATCAAAGGCAGGCATGTGGAGAGGTTTATGAATCAAAACAACTTGAAAATATCATCATGC
ACTGGGAGGTTTGTAGAGCTTCTCAGCCATCTTCCTATACTCTTCTTGGTTGCTCCAGAG
CTGCGCTGCTTGAGTGTTCAGTGGTGAGCTGATGTTGGGTTCTCCCAAAAGGCTCTGAAC
GGATAGTAGGATTGTCCTCACATCATAAGCAGAAAACCATTTATCCTGGAGAATGTCCAA
GCAGATGTTGCCATAGAGATCAACATTGGGGTGGAAGCAACAAGTGTGGAACTTGATCTT
TGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGAAAGAGAGTGAGAGTATGTACTCAGTTCCTTC
AAAGACAGTATCTTTGCTTCCTGTTATTGTCCCTTTCCAACACAAGATGTTGTCTTCCTC
TGGGAATGCCGATATTCCCGGGTCACCGCCCATCATCAAGCCCATTAGCTCAGATTGCAG
CCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTCAACAGTCTTTGTCGGAGGCGCAGATTGCTTTGACCC
GTTTGACGCCGGAGGATCCGCCGGAGTGTTTCCTTGGTACCCATTTACGGCAGCCATCAC
TTTCGCTTTCTTTTACT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5033Contig1 919 2 4 U
GGAATCCCCCTTCGCGATAAAAAAACCCCAATCCCCCTAAAATTGTCCATCGTCTTCTCA
GCTTCTAACTTCGTCCAATCTCCGTTACCCAACCTCCTCTACAGTCAAACGTTTGCTTCA
ATCTCCTCTTAACGTTCTTCAACTAATGTTGCTCATATTTTGGTTAGTATCAGGTACCTC
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AAGAAGTTTTGAGAAAGTGTTTGTCCTGTGGCAAAGTGACTGAACTAAAATGAGGATTAT
AATGAAATGCAAGAGTTATCATTAGGCAAAATGAGATATCCGATAGTAATCTTCTATACT
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ATGTTCAACCAGTATGTATAAAGATTGACCATATTTAGACAAGCCTATGCATGGATTGAC
CATATATTATCAAATCTGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN47TF U 1
AF RR4GN47JQ C 218
BS 1 617 RR4GN47TF
BS 618 618 RR4GN47JQ
BS 619 650 RR4GN47TF
BS 651 919 RR4GN47JQ

RD RR4GN47TF 654 0 0
GGAATCCCCCTTCGCGATAAAAAAACCCCAATCCCCCTAAAATTGTCCATCGTCTTCTCA
GCTTCTAACTTCGTCCAATCTCCGTTACCCAACCTCCTCTACAGTCAAACGTTTGCTTCA
ATCTCCTCTTAACGTTCTTCAACTAATGTTGCTCATATTTTGGTTAGTATCAGGTACCTC
AATATTGACACATCTGGAAGGCATGTGCGGAAGAAGAGCTCAAACAGAGTCGGTGAAGCA
GCAAACCAACATGGAAAAAAAACATATGGTTACGGAAAGCTTTAAATTGAAAAAGGAAGA
AAGTGTTGATGAGAGATTGGATTTAGGTGACAGTGAACCAGGGTTTGATGCTGATCATGA
ATATGGTGAAGGGGAGTTTGAAGAGAGAGAATTGAAGCAGGAGGAACATGGGTTGCTTAA
TCAGATGGATGAAAAACTTGAGGAGGAAACAGAGGCCGATGAAAATGCAGGTGAGTTTAC
CGACGACATTGGGAGGAGCTAGAGTGTCAAAGTAGTGATGTGCATGCTTATGATGAAATT
AAGCGTGGAGAAGCTGTTGATGTATAAGAAGAAAGAGAAGAACATCATGATGTGCTCCAT
GAAGACGCTCGCTTAAG*AGTTTGAAATATTTGTTAGAAGCTTAGACAAA
GTAC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4GN47JQ 702 0 0
GCTCAAACAGAGTCGGTGAAGCAGCAAACCAACATGGAAAAAAAACATATGGTTACGGAA
AGCTTTAAATTGAAAAAGGAAGAAAGTGTTGATGAGAGATTGGATTTAGGTGACAGTGAA
CCAGGGTTTGATGCTGATCATGAATATGGTGAAGGGGAGTTTGAAGAGAGAGAATTGAAG
CAGGAGGAACATGGGTTGCTTAATCAGATGGATGAAAAACTTGAGGAGGAAACAGAGGCC
GATGAAAATGCAGGTGAGTTTACCGACGACATTGGGAGGAGCTAGAGTGTCAAAGTAGTG
ATGTGCATGCTTATGATGAAATTAAGCGTGGAGAAGCTGTTGATGTATAAGAAGAAAGAG
AAGAACATCATGATGTGCTCCATGAAGACGCTCGCTTAAGGAGTTTGAAATATTTGTTAG
AAGCTTAGACAAAAGTACTACGGAAGAAGTTTTGAGAAAGTGTTTGTCCTGTGGCAAAGT
GACTGAACTAAAATGAGGATTATAATGAAATGCAAGAGTTATCATTAGGCAAAATGAGAT
ATCCGATAGTAATCTTCTATACTTAAGTATTAGATCGAGAGTTTGTGTAGCTTTATAGTG
TACATAATGCTCTTGGTCATCGTATGTTCAACCAGTATGTATAAAGATTGACCATATTTA
GACAAGCCTATGCATGGATTGACCATATATTATCAAATCTGA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5034Contig1 944 2 2 U
TGATGAGAGGAGACATGTGCTTAGCTGTGAAGAGAGGATACAGATTTTGAAAGGTGTGGC
GTCAGGGATATTGTATTTACACGAAGGATGGGACTCTAAGGTGTTACATAGAGATATAAA
AGCTAGTAACGTGTTGCTTGACAGAGACATGATCCCTAGGCTGAGTGATTTTGGGTTAGC
TAGGGTACATGTACATGAGCAAGCTATTAGGACAACGAGGGTGGTTGGTACAGCTGGTTA
TTTAGCTCCTGAGGTGGTTAAGACAGGTCGTGCATCGACACAGACCGATGTTTTTGCGTA
CGGTGTGCTGGTTCTTGAAGTGATGTGTGGGAGGAGACCTATTGAAGAAGGGAAGAAACC
GTTGATGGATTGGGTTTGGGGTTTGTTGGAGAAAGGTGAGATTCTGAGAGGGCTTGATCC
TAGGATGGTGATGACACAAGACACTAGTGGGGCAGAGAGAGTAATGCAGCTTGGTTTGCT
TTGTGCACATCCTGATCCGGGGAAGAGACCGTCTATGAGACAAGTGGTTCAAGTGTTTGA
AGGCGAGAAGGCTGAGGTCTTTGGGGCTGAAAGTAGTGAAGATGTTGAGTCATGGATGGT
GATGAAGTTTGGGTCTTGGCGAAGTTCGAGAGAGTTTTCGTATGGAAGCTCGTCGCATCC
GACCATAGAGCAGCTCAGACTTCAGTCTCTGTCTGTGTCTCTTTCGTCTTGGAATAGCTC
TATTTTAGATGGGCGGTGATGATAATACAAAGAAGGCTTGAGAGACTTCAAGAATGCAGT
TATCTTTAGCCCTACTTGGGTTCTTGTTGTGTACATACAAGGTTTTGTAAAGGCGTTACA
TTTATACATGTATTGTTGTTGTTAGTGTTTTTGTTTTCTTTTTGGATTTTTTTCCAACTT
TTTGTATTGTAAAATAAATAAAATAATAATTTGTGTCAGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G804TF U 1
AF RR4G804JQ C 108
BS 1 536 RR4G804TF
BS 537 944 RR4G804JQ

RD RR4G804TF 536 0 0
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GTCAGGGATATTGTATTTACACGAAGGATGGGACTCTAAGGTGTTACATAGAGATATAAA
AGCTAGTAACGTGTTGCTTGACAGAGACATGATCCCTAGGCTGAGTGATTTTGGGTTAGC
TAGGGTACATGTACATGAGCAAGCTATTAGGACAACGAGGGTGGTTGGTACAGCTGGTTA
TTTAGCTCCTGAGGTGGTTAAGACAGGTCGTGCATCGACACAGACCGATGTTTTTGCGTA
CGGTGTGCTGGTTCTTGAAGTGATGTGTGGGAGGAGACCTATTGAAGAAGGGAAGAAACC
GTTGATGGATTGGGTTTGGGGTTTGTTGGAGAAAGGTGAGATTCTGAGAGGGCTTGATCC
TAGGATGGTGATGACACAAGACACTAGTGGGGCAGAGAGAGTAATGCAGCTTGGTTTGCT
TTGTGCACATCCTGATCCGGGGAAGAGACCGTCTATGAGACAAGTGGTTCAAGTGT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4G804JQ 837 0 0
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ATTTTGGGTTAGCTAGGGTACATGTACATGAGCAAGCTATTAGGACAACGAGGGTGGTTG
GTACAGCTGGTTATTTAGCTCCTGAGGTGGTTAAGACAGGTCGTGCATCGACACAGACCG
ATGTTTTTGCGTACGGTGTGCTGGTTCTTGAAGTGATGTGTGGGAGGAGACCTATTGAAG
AAGGGAAGAAACCGTTGATGGATTGGGTTTGGGGTTTGTTGGAGAAAGGTGAGATTCTGA
GAGGGCTTGATCCTAGGATGGTGATGACACAAGACACTAGTGGGGCAGAGAGAGTAATGC
AGCTTGGTTTGCTTTGTGCACATCCTGATCCGGGGAAGAGACCGTCTATGAGACAAGTGG
TTCAAGTGTTTGAAGGCGAGAAGGCTGAGGTCTTTGGGGCTGAAAGTAGTGAAGATGTTG
AGTCATGGATGGTGATGAAGTTTGGGTCTTGGCGAAGTTCGAGAGAGTTTTCGTATGGAA
GCTCGTCGCATCCGACCATAGAGCAGCTCAGACTTCAGTCTCTGTCTGTGTCTCTTTCGT
CTTGGAATAGCTCTATTTTAGATGGGCGGTGATGATAATACAAAGAAGGCTTGAGAGACT
TCAAGAATGCAGTTATCTTTAGCCCTACTTGGGTTCTTGTTGTGTACATACAAGGTTTTG
TAAAGGCGTTACATTTATACATGTATTGTTGTTGTTAGTGTTTTTGTTTTCTTTTTGGAT
TTTTTTCCAACTTTTTGTATTGTAAAATAAATAAAATAATAATTTGTGTCAGTGTTC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL5035Contig1 730 2 9 U
CGAGCAATCGTTTTGTAACTTTAAGAGATAAGAAAACACCAAATGTTACAAACTTGACTT
CAAGGCAGAGCCAAGCTTAGAAAGTTTTTTTTTCTGTACAATGTAGCAGTCGATTTTTCT
CGCTAAAGATGAGACCGACGATGCTGCAAGTTAGAGATGTAGTAAAGAATCCTCTTCTTG
TCGTCAGGGGTTAATGAGAAAGGAGGGTTTAGAGGAAGAGTCACTGCTTCCTCTATTATA
AAGGAGAGTAGAAGAATTGCTTTCTTGTATAATCTTGCTGCACTTTCCTTGTTATTCAAA
TATTCTTCCGCCCCACCACTCTTGCCGTACGCTAGTGCCTTCCCGTAAATTGTTTCCATG
GCATCAGGCATATGAGTAGCAGCGCTTGTTTCGTTTAATCGAGCTGATGAAGTCTCAGCC
TGGTTAAACGCGGTAACAAACTCTTGCGTCACCCAAGTTTTAGCTACTGCTGGTGAATTT
AAATCAGGATTCGAAGTCCCTGGAGCTGCGGTGTTCACTCTATCCTCTCCAACGGACACC
ATCCAAGAATCGCATATCTCTAAAGCTTTCCTCCACGCAGCTAAAACAACGAGCGTAACA
GCAAAAGATTCCTTCACCTGTCCTGCATTGTCCATCTCACGAGCTACTTCTGTAAGTGCT
TCTGCATACTGATGCAAAAGTTGGAGCTTCATTGGAGGGTGAACGATAGTTAACCGTTGG
AATTCTGTTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD52JQ U 94
AF RR4GZ73JQ U 1
BS 1 133 RR4GZ73JQ
BS 134 134 RR4BD52JQ
BS 135 164 RR4GZ73JQ
BS 165 165 RR4BD52JQ
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BS 343 343 RR4BD52JQ
BS 344 491 RR4GZ73JQ
BS 492 492 RR4BD52JQ
BS 493 730 RR4GZ73JQ

RD RR4BD52JQ 489 0 0
CTGTACAATGTAGCAGTCGATTTTTC**GCTAAAGATGAGACCGACGATGCTGCAAGTTA
GAGATGTAGTAAAGAATCCTCTTCTTGTCGTCAGGGGTTAATGAGAAAGGAGGGTTTAGA
GGAAGAGTCACTGCTTCCTCTATTATAAAGGAGAGTAGAAGAATTGCTTTCTTGTATAAT
CTTGCTGCACTTTCCTTGTTATTCTAATATTCTTCCGCCCCACCACTCTTGCCGTACGCT
AGTGCCTTCCCGTATATTGTTTCCAT**CATCAGGCATATGAGTAGCAGCGCTTGTTTCG
TTTAATCGAGCTGATGAAGTCTCAGCCTGGTTAAACGCGGTAACAAACTCTTGTGTCACC
CAAGTTTTAGCTACTGCTGGTGAATTTAAATCAGGATTCGAAGTCCCTGGAGCTGTTGTG
TTCACTCTATCCTCTCCAACGGACACCATCCAAGAATCGCATATCTCTAAAGCTTTCCTC
CATGCAGC
C

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4GZ73JQ 730 0 0
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CAAGGCAGAGCCAAGCTTAGAAAGTTTTTTTTTCTGTACAATGTAGCAGTCGATTTTTCT
CGCTAAAGATGAGTCCGACGATGCTGCAAGTTAGAGATGTAGTAGAGAATCCTCTTCTTG
TCGTCAGGGGTTAATGAGAAAGGAGGGTTTAGAGGAAGAGTCACTGCTTCCTCTATTATA
AAGGAGAGTAGAAGAATTGCTTTCTTGTATAATCTTGCTGCACTTTCCTTGTTATTCAAA
TATTCTTCCGCCCCACCACTCTTGCCGTACGCTAGTGCCTTCTCGTAAATTGTTTCCATG
GCATCAGGCATATGAGTAGCAGCGCTTGTTTCGTTTAATCGAGCTGATGAAGTCTCAGCC
TGGTTAAACGCGGTAACAAACTCTTGCGTCACCCAAGTTTTAGCTACTGCTGGTGAATTT
AAATCAGGATTTGAAGTCCCTGGAGCTGCGGTGTTCACTCTATCCTCTCCAACGGACACC
ATCCAAGAATCGCATATCTCTAAAGCTTTCCTCCACGCAGCTAAAACAACGAGCGTAACA
GCAAAAGATTCCTTCACCTGTCCTGCATTGTCCATCTCACGAGCTACTTCTGTAAGTGCT
TCTGCATACTGATGCAAAAGTTGGAGCTTCATTGGAGGGTGAACGATAGTTAACCGTTGG
AATTCTGTTA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL5036Contig1 830 2 2 U
AAACCTCCTACTGCCGGTAAAAGCGGTCTGCTCAGAGCGGACGGAGGAGACTCCATCGCC
TTCCCAAAGGTCCTTATCGACGGTCCTTACGGTGCTCCGGCACAAGACTACAAAAAATAC
GACGTGGTACTCCTCGTAGGTCTTGGCATTGGAGCCACGCCTATGATCAGTATCCTCAAG
GACATCATCAACAACATGAAGTCGCATGACCGTGATAGTGACATCGAGAACAACAACAGT
AATGGGAATAGTAAAGGGTTTAAGACGAAGAAAGCTTATTTCTACTGGGTGACTAGAGAG
CAAGGATCGTTTGAGTGGTTTAAGGGGATAATGGACGAGGTTTCGGAGCTGGACGAGGAA
GGAGTGATCGAGCTACACAACTATTGCACGAGTGTGTACGAGGAATGAGATGCTAGGGTT
GCTCTTATTGCTATGCTTCAGTCGTTGCAACACGCTAAGAACGGTGTTGATGTCGTCTCG
GGGACACGGGTTAAGTCCCACTTCGCTAAACCTAACTGGAGACAAGTGTACAAGAGGATC
GCTGTTCAGCATCCCGACAAAAGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCAGGACTGACA
AAGGACCTGAAAAATCTAGCTTTGGATTTCTCTCGAAAGACGAGCACCAAGTTTGACTTC
CACAAAGAGAACTTCTAAATTCCAATTTATATAAATTGGGAGGAAGTTGCGTAGAGAATA
AAACAAGAAACTGCATATAAATTTTCTTTTATAAAAAATATTTGAGTTTGTATTCCTTCG
TTTCTTCTTTCCTACTTTTTGTTCAGTTTTACGGAATTTAGTCTATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E538TF U 1
AF RR4E538JQ C 155
BS 1 600 RR4E538TF
BS 601 830 RR4E538JQ

RD RR4E538TF 600 0 0
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TTCCCAAAGGTCCTTATCGACGGTCCTTACGGTGCTCCGGCACAAGACTACAAAAAATAC
GACGTGGTACTCCTCGTAGGTCTTGGCATTGGAGCCACGCCTATGATCAGTATCCTCAAG
GACATCATCAACAACATGAAGTCGCATGACCGTGATAGTGACATCGAGAACAACAACAGT
AATGGGAATAGTAAAGGGTTTAAGACGAAGAAAGCTTATTTCTACTGGGTGACTAGAGAG
CAAGGATCGTTTGAGTGGTTTAAGGGGATAATGGACGAGGTTTCGGAGCTGGACGAGGAA
GGAGTGATCGAGCTACACAACTATTGCACGAGTGTGTACGAGGAATGAGATGCTAGGGTT
GCTCTTATTGCTATGCTTCAGTCGTTGCAACACGCTAAGAACGGTGTTGATGTCGTCTCG
GGGACACGGGTTAAGTCCCACTTCGCTAAACCTAACTGGAGACAAGTGTACAAGAGGATC
GCTGTTCAGCATCCCGACAAAAGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCAGGACTGACA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4E538JQ 676 0 0
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ATAGTGACATCGAGAACAACAACAGTAATGGGAATAGTAAAGGGTTTAAGACGAAGAAAG
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TGTACGAGGAATGAGATGCTAGGGTTGCTCTTATTGCTATGCTTCAGTCGTTGCAACACG
CTAAGAACGGTGTTGATGTCGTCTCGGGGACACGGGTTAAGTCCCACTTCGCTAAACCTA
ACTGGAGACAAGTGTACAAGAGGATCGCTGTTCAGCATCCCGACAAAAGAATCGGAGTCT
TCTATTGTGGGGCACCAGGACTGACAAAGGACCTGAAAAATCTAGCTTTGGATTTCTCTC
GAAAGACGAGCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAACTTCTAAATTCCAATTTATATAA
ATTGGGAGGAAGTTGCGTAGAGAATAAAACAAGAAACTGCATATAAATTTTCTTTTATAA
AAAATATTTGAGTTTGTATTCCTTCGTTTCTTCTTTCCTACTTTTTGTTCAGTTTTACGG
AATTTAGTCTATTGCC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5037Contig1 446 2 1 U
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TTTTTTTGTTTCTTCTTAGATCTGACAGCCAGAAGATGAAAAATATTCACAATGATTCAG
CCTAATGTAACACCGACAAAGCTTACATCCACTGCGGCTCAGACTGCAATAACGATGAAG
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TTCTTCTTATTCTGATTTTTGATTTAAGATTCTTATTATTCTAGATTTAGGGATTTAAGG
TTATTAAAGTGAATTCTGGGTTTTCTCTGATTTTAGAGTTCTTATTATTATGGTTTCTTT
CGATCTAGGGTTGTTAAAGATATTCATGGGTTTTCTATGATTTAGGATTCTCATTCTTCT
TTTCACAATATTATTTCGTGTTTAGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CU44JQ C 1
AF RR4CU44TF U 1
BS 1 446 RR4CU44TF

RD RR4CU44JQ 446 0 0
GGCTCCTATTTTATTTCTTCTTCTCTCTTTCTTTCCTCTGCGATTTTTCTCTTCTTTCTC
TTTTTTTGTTTCTTCTTAGATCTGACAGCCAGAAGATGAAAAATATTCACAATGATTCAG
CCTAATGTAACACCGACAAAGCTTACATCCACTGCGGCTCAGACTGCAATAACGATGAAG
AAAATGACGAAAATTAGAAGAAAAAGAGTTTAAGAACATCTGGTTTTTGATTTATCATGA
TTCTTCTTATTCTGATTTTTGATTTAAGATTCTTATTATTCTAGATTTAGGGATTTAAGG
TTATTAAAGTGAATTCTGGGTTTTCTCTGATTTTAGAGTTCTTATTATTATGGTTTCTTT
CGATCTAGGGTTGTTAAAGATATTCATGGGTTTTCTATGATTTAGGATTCTCATTCTTCT
TTTCACAATATTATTTCGTGTTTAGA

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR4CU44TF 446 0 0
GGCTCCTATTTTATTTCTTCTTCTCTCTTTCTTTCCTCTGCGATTTTTCTCTTCTTTCTC
TTTTTTTGTTTCTTCTTAGATCTGACAGCCAGAAGATGAAAAATATTCACAATGATTCAG
CCTAATGTAACACCGACAAAGCTTACATCCACTGCGGCTCAGACTGCAATAACGATGAAG
AAAATGACGAAAATTAGAAGAAAAAGAGTTTAAGAACATCTGGTTTTTGATTTATCATGA
TTCTTCTTATTCTGATTTTTGATTTAAGATTCTTATTATTCTAGATTTAGGGATTTAAGG
TTATTAAAGTGAATTCTGGGTTTTCTCTGATTTTAGAGTTCTTATTATTATGGTTTCTTT
CGATCTAGGGTTGTTAAAGATATTCATGGGTTTTCTATGATTTAGGATTCTCATTCTTCT
TTTCACAATATTATTTCGTGTTTAGA

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL5038Contig1 486 2 1 U
GAAATCATATAATCTAGTGTGGGGGGGGGGCAACTTCCCTAAATCCTCTCAGCAGCAGGT
CCACCAACATCTGCATCCCCATTCTCCTTAGCCGACTTGAACACCGTCGTAAAATAGCCG
CTGCTTTCACCATTCTCCTCCTGGCTATAATCAGAGCCAGGCGTTGTTGTTAGAACCACC
ACCCTCTAGGAGCTCTTGATGTCCCCTATCATCTCATCAGCAACAGACGACGAGCCACAC
TCTCTCATCGATCTCACCATGTCTATAGGATCATATCCAAGTCTTCCGAATGCTGCTGGA
TGTACTTGATCATCATCTCGGCTAAGCTCTCGTTCATCTCCGCAAAAACATCAACTTTAG
AGAACTCATGCATCCTGTAGAGATCTTAAACTACATAAAGATCGAAACTTTTTGACTCCA
AACAATTAAAAAAAACCTAAACTCAATGATCAAACAGTCAAATGTGATTAAACTCCAATC
AATCAG


BQ
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TGTACTTGATCATCATCTCGGCTAAGCTCTCGTTCATCTCCGCAAAAACATCAACTTTAG
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GGCGTTGTTGTTAGAACCACCACCCTCTAGGAGCTCTTGATGTCCCCTATCATCTCATCA
GCAACAGACGACGAGCCACACTCTCTCATCGATCTCACCATGTCTATAGGATCATATCCA
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AAATGTGATTAAACTCCAATCAATCAG

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

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TTGACGCTGTGATCGTATCCTCAGAAGTCGGATACGAGAAGCCTGATGACCTAATCTTCA
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AF RR4AQ23JQ C 320
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BS 767 1079 RR4AQ23JQ

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TTTAGCTCTCGTCCAATGGAGGTATTGGAGCACCACTGGAGTGTCTGGCATTACTAATAC
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TTATGCGTTTTAGTCATTTGTTGTGTATTAAATAAAAACATGTTGCTATGATTATATCCA
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DS 



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AS 1 2

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AGTTTGCTGATATTACAGTCAGGTTTGAGCCGTTGGAAGCAGGATCAGGATACGAGTTCA
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AF RR4AT40TF U 1
AF RR4AT40JQ C 1
BS 1 434 RR4AT40TF
BS 435 820 RR4AT40JQ

RD RR4AT40TF 434 0 0
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AGTTTGCTGATATTACAGTCAGGTTTGAGCCGTTGGAAGCAGGATCAGGATACGAGTTCA
AGAGTGAGATCAAAGGAGGAGCGGTGCCAAGAGAGTATATCCCCGGTGTGATGAAAGGAC
TTGAGGAGTGTATGGGCTCAGGTGTGCTTGCGGGTTTTCCGGTTGTTGACGTCCGTGCTT
GTCTAGTTGATGGATCATACCATGATGTGGACTCGAGCGTGCTAGCTTTCCAGCTAGCTG
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TGAGAGTTGAAGTTGTTACACCTGAAGAACATCTTGGTGATGTCATTTGGTGATCTTAAC
TCTAGAAGAGGTCA

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR4AT40JQ 820 0 0
GTATCTCAAAAGTAGCTGAAGTGAAATACACACACAAGAAGCAATCAGGTGGACAAGGAC
AGTTTGCTGATATTACAGTCAGGTTTGAGCCGTTGGAAGCAGGATCAGGATACGAGTTCA
AGAGTGAGATCAAAGGAGGAGCGGTGCCAAGAGAGTATATCCCCGGTGTGATGAAAGGAC
TTGAGGAGTGTATGGGCTCAGGTGTGCTTGCGGGTTTTCCGGTTGTTGACGTCCGTGCTT
GTCTAGTTGATGGATCATACCATGATGTGGACTCGAGCGTGCTAGCTTTCCAGCTAGCTG
CGAGAGGAGCTTTCCGTGAAGGGATGAGGAAAGCTGGTCCGAGAATGCTTGAACCTATCA
TGAGAGTTGAAGTTGTTACACCTGAAGAACATCTTGGTGATGTCATT*GGTGATCTTAAC
TCTAGAAGAGGTCAGATCAACAGCTTTGGAGACAAACCCGGTGGTCTCAAGGTGGTGGAT
TCTCTGGTTCCATTAGCTGAGATGTTTCAGTATGTGAGCACACTAAGAGGGATGACAAAA
GGTCGTGCATCTTACACAATGCAGTTGGCTAAGTTCGATGTTGTTCCTCAGCATATTCAG
AACCAGCTTTCGTCCAAGGACCAAGAAGTTGCTGCTTAAGACGGACAGATTATGTTTTCA
TGGTCAGAAAGTACACTGAAGACATATACATGTGTTATCATGATAATGTTTAAATCATTT
TATATAGTTTTGTTTTTGATCAAGAGAAACAAACATGTTTAAATTTCTTTTTATGTGGAT
GCTAAAGTAAGTTTGGGAATGGTAAATAACATTTTGAAGG

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL5042Contig1 755 2 4 U
TATCTTGACTTAATCAAATGTTTCCCCCCATCATCTTTTCTGTTTTCACAACTTTTTATA
AACTTCATGATAATGGTCTCTCAATCAATAACTGAACAAACAGAGCATAGTTTACAGTTT
TTACAACTTTATGGTTTCTTTATATATACATCAAAGCATATCATTCTTCAAAGAGCACAG
TCAAAAACCTTCGTTCCCCCTTAACTGATAAGTTTGTTCACACGTCTGAGTGCAGGCCAG
AACTACAGCTTCTTGTGTCGGACGAAGGTGGTGATGATGATTCTTTTGTCCTGAATCGGG
AAATTATGAGCCTCGCCATATTCTCACCAGCCACTGCACTTGTCTCCATCGTGCTAGCCG
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CACTGAAGAGCTCATCAAGCAATGAATCTGATGCTGCTTGTCGTGTAAATATCTTGTATG
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GGTTCAAAAGCCCCCTCACGAATGTCGCGTGTGTGTGCTGCAACTCCCTCTTGGGAATCG
AGATGGCGGGTGAGAACTGAATATCCACCTCGTCC


BQ
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AF RR4CO61TF C 1
AF RR4CO61JQ U 21
BS 1 20 RR4CO61TF
BS 21 716 RR4CO61JQ
BS 717 717 RR4CO61TF
BS 718 755 RR4CO61JQ

RD RR4CO61TF 755 0 0
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AACTTCATGATAATG*TCTCTCAATCAATAACTGAACAAACAGAGCATAGTTTACAGTTT
TTACAACTTTATGGTTTCTTTATATATACATCAAAGCATATCATTCTTCAAAGAGCACAG
TCAAAAACCTTCGTTCCCCCTTAACTGATAAGTTTGTTCACACGTCTGAGTGCAGGCCAG
AACTACAGCTTCTTGTGTCGGACGAAGGTGGTGATGATGATTCTTTTGTCCTGAATCGGG
AAATTATGAGCCTCGCCATATTCTCACCAGCCACTGCACTTGTCTCCATCGTGCTAGCCG
CGTTTTCAAAAGCATTTACATAGTACAAATGATGGTCATCTAATATGAACGGTGCAAATA
CTTCAGGCGCGTGGTACTTTGGGTACGCACCCCAGTCCATGCGAACAGTTTCTGTTCTTG
CACTGAAGAGCTCATCAAGCAATGAATCTGATGCTGCTTGTCGTGTAAATATCTTGTATG
TCATATCTGTTCCACTATACTTCCTAAGTATCGAGATGGATGAGAATGGGATTAGAGGAT
CTTCAAGAGTTCCCACCAAAGCTGGAACATCCGAAACAGATTTCATCCCAAAATACCCAG
GGTTCAAAAGCCCCCTCACGAATGTCGCGTGTGTGTGCTGCAACTCCCTCTTGGGAATCG
AGATGGCGGGTGAGAACTGAATATCCACCTCGTCC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4CO61JQ 735 0 0
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TCAATCAATAACTGAACAAACAGAGCATAGTTTACAGTTTTTACAACTTTATGGTTTCTT
TATATATACATCAAAGCATATCATTCTTCAAAGAGCACAGTCAAAAACCTTCGTTCCCCC
TTAACTGATAAGTTTGTTCACACGTCTGAGTGCAGGCCAGAACTACAGCTTCTTGTGTCG
GACGAAGGTGGTGATGATGATTCTTTTGTCCTGAATCGGGAAATTATGAGCCTCGCCATA
TTCTCACCAGCCACTGCACTTGTCTCCATCGTGCTAGCCGCGTTTTCAAAAGCATTTACA
TAGTACAAATGATGGTCATCTAATATGAACGGTGCAAATACTTCAGGCGCGTGGTACTTT
GGGTACGCACCCCAGTCCATGCGAACAGTTTCTGTTCTTGCACTGAAGAGCTCATCAAGC
AATGAATCTGATGCTGCTTGTCGTGTAAATATCTTGTATGTCATATCTGTTCCACTATAC
TTCCTAAGTATCGAGATGGATGAGAATGGGATTAGAGGATCTTCAAGAGTTCCCACCAAA
GCTGGAACATCCGAAACAGATTTCATCCCAAAATACCCAGGGTTCAAAAGCCCCCTCACG
AATGTCGCGTGTGTGTGCTGCAACTCCCTCTTGGGA*TCGAGATGGCGGGTGAGAACTGA
ATATCCACCTCGTCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5043Contig1 982 2 12 U
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AATACTGCTCATTGTCTTGGCCTCCCATGGAGTTCTTGCCCAGAACAATTCTTCAATACC
TAAATTAAGAAGAAGTGATTTTCCAGAAGATTTCATTTTTGGGTCTGCAACATCTGCTTA
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TGAAAAATACCCAGAGAAGATAAAGGATGGTAGCAATGGGTCTGTTGCAGATAACTCTTA
CCATCTTTACAAGGAAGATGTGGCTTTATTGCATCAAATTGGCTTCAATGCTTACAGATT
CTCAATCTCGTGGTCGAGAATATTGCCTCGTGGGAATCTAAAGGGAGGAATAAACCAAGC
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TGCCACCATGTTCCATTGGGACACACCACAAGGTCTTGAAGATGCTTACGGTGGATTCCG
TGGCTCAGAGATTGTAAACGATTTCCGTGATTATGCCGATATTTGCTTTAAGAATTTCGG
AGATAGAGTGAAGCACCGGATGACATTGAACGAGCCATTGACAGTGGTGCAACAAGGCTA
TGTTGCACGTGCAATGGCTCCAGGAAGATACTCCAAATTCACAAACCCTAATTGCACCGC
TGGAGATGGAGCCACCGAGCCTTATATCGTTGGTCACAACCTCATCCTTGCTCACGGAGC
CGCTGTCCAAGTCTACCGAGAAAAATACAAGGCATCTCAAAAGGGTCAAGTTGGTATCGC
TTTGAACGCGGGTTGGAACTTGCCCTATACAGAATCGACCGAAGATAGGTTAGCCGTGGC
ACGAGCCATGGCCTTCACATTTGACTACTTCATGGAGCCACTCGTGACCGGTAAATGCCC
TATCGACATGGTCAACAACGTA


BQ
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AF RR4GK95TF U 1
AF RR4A529TF U 234
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CG

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DS 

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G
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QA 2 749 2 749
DS 



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BQ
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AF RR4DW50JQ C 1
AF RR4DW50TF U 1
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DS 

RD RR4DW50TF 447 0 0
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QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

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TTTGAGTCTTTAAGTCAATTCTAGAAATTTGGCATTTTGGATAATAATTAACTTGTTTTC
TAATTGCAATTTTGGAAGATGTATGTTTTCTAACAGAGTCGAGAGTGATATATATATAAA
CAACTATGTCTTTTAT


BQ
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AF RR4EV39TF U 1
AF RR4EV39JQ C 181
BS 1 627 RR4EV39TF
BS 628 856 RR4EV39JQ

RD RR4EV39TF 627 0 0
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GCTAATGCTCTGGAATACCTTCATCTCTACTGTGACCCACCTCTCTGTCACAGAGACATA
AAGTCAAGCAACATATTACTCGACGAGAACTTTGTTGCTAAGCTTGCAGATTTTGGCCTT
GCACATGCTTCCAGATACGGCTCCATTTGTTTTGAACCTATTAATACTGATATCCGTGGA
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GTTGTGAGATGGTGCACAGAGAAAGAAGGCGTGGCTAGGCCATCGATCAAGCAAGTCCTG
AGGCTGCTTTGCGAGAGCTGTGATCCGTTGCATCTGGAGCTCGCAATGGCGGTTGAGGAG
CACAAAGGGAGGTCACTGAGAGGTGAC

QA 1 627 1 627
DS 

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ACTCCAGGCTATGTAGATCCAGAGTACGTTGTAACACAAGAACTAACAGAGAAGAGCGAC
GTGTACAGCTACGGAGTGGTGTTACTAGAGATCATAACAGGCAGAAGAGCTGTCGATGAA
GGTAGGAACCTTGTGGAAATGTCTCAGCCTTTACTGGTATCAGAATCAAGACGGGTAGAT
CTTGTGGATTCAAGAATCAAAGACTGCATAGATGGTGAACAGCTGGAAACAGTGGTGGCG
GTTGTGAGATGGTGCACAGAGAAAGAAGGCGTGGCTAGGCCATCGATCAAGCAAGTCCTG
AGGCTGCTTTGCGAGAGCTGTGATCCGTTGCATCTGGAGCTCGCAATGGCGGTTGAGGAG
CACAAAGGGAGGTCACTGAGAGGTGACTCAGGCTTGGCTTCTTCATCTAGTACTACTTCA
AGGTCGCATTGTAGCAGGAGTTTCTTGCTGAGACTGGCTCTCCACCAAATGGTCTCTCCT
TTTGAGTCTTTAAGTCAATTCTAGAAATTTGGCATTTTGGATAATAATTAACTTGTTTTC
TAATTGCAATTTTGGAAGATGTATGTTTTCTAACAGAGTCGAGAGTGATATATATATAAA
CAACTATGTCTTTTAT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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GCTCCTTGGAACTCACCGATCATGAAACTTAGGCGAATCCTCGGTTCCGTTTCGAGTCTC
GCTACAGAGAAGCTCTCTTCGTCTTCGTATTCTTCCCGTTGCCCGTCGAGACAGATCTTC
ACGGCGCGGTCGGCATCATCTTCTTCGCGACGAAATGCCGGAAGTAACCGCTCAGAAGCG
TTACCCGGGAACCACGTCAAATGGGCATCGCTTGGTTCAGTCAGAAACTCGAGATTCGCG
TCCGGGTTCTCACCGTTGAAGCCGAAACCGTTGGATTCGATCATGGATTTGGATAGAGCC
AAAACCAAATCGCCGGAGGAGCTCACTTCGATCTGGGACGATTATCATTTGGGACGAGGG
CATATTGGAATCACTATGAAAGCTCAGCTTTATCGTTTGTTGGAGCAACGAGCAGCTGAG
TGCCGTTACTTTGTTATTCCATTGTGGAGAGGAAATGGTTACATTACAATGTTTGCTCAA
GTTGAAGCGCCTCACATTATTTTCACTGGTCTCGAAGACTACAAAGCGAGAGGAACTGAA
GCGGCTCCTTACTTGACAAGCAAATTCTACACTGAGCTTTCAGAGACGAAAGACTTGGTG
TTTATCCGAGGTGACGTTGTGTTCACAAGCAAGCTCACAGACGAGGAGGGGAAATGGCTG
ATGGAGACAGCTCAGTCGTTTTACTTGAACGACAACCGGTACAAACTGCTCGAGCGGTTC
AATAAACATACTCATGAGTTTGAGTTCAAGATGTGTTACAAGCTCTGGATATGCCTGTCC
TCTGATTTGGTTAAAAATCAGGACTAAAACTTCTCTGTTTTTCTTTCTTTATGAGATATC
ATTGTATTAGAATTGCTTGTGGGAATATTAAATTTCCAGAGATTTTGCTCTTAAATAAAC
GCGCTCTTGAATGAACAATTCGAAAATGTGATGTTCTTTTTGGTGGTGTACTGAAAAAGT
TTAAAGCGAGTTATATTAAAATAACAGATTACATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FK75TF U 1
AF RR4FK75JQ C 327
BS 1 701 RR4FK75TF
BS 702 1057 RR4FK75JQ

RD RR4FK75TF 701 0 0
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GCTCCTTGGAACTCACCGATCATGAAACTTAGGCGAATCCTCGGTTCCGTTTCGAGTCTC
GCTACAGAGAAGCTCTCTTCGTCTTCGTATTCTTCCCGTTGCCCGTCGAGACAGATCTTC
ACGGCGCGGTCGGCATCATCTTCTTCGCGACGAAATGCCGGAAGTAACCGCTCAGAAGCG
TTACCCGGGAACCACGTCAAATGGGCATCGCTTGGTTCAGTCAGAAACTCGAGATTCGCG
TCCGGGTTCTCACCGTTGAAGCCGAAACCGTTGGATTCGATCATGGATTTGGATAGAGCC
AAAACCAAATCGCCGGAGGAGCTCACTTCGATCTGGGACGATTATCATTTGGGACGAGGG
CATATTGGAATCACTATGAAAGCTCAGCTTTATCGTTTGTTGGAGCAACGAGCAGCTGAG
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GTTGAAGCGCCTCACATTATTTTCACTGGTCTCGAAGACTACAAAGCGAGAGGAACTGAA
GCGGCTCCTTACTTGACAAGCAAATTCTACACTGAGCTTTCAGAGACGAAAGACTTGGTG
TTTATCCGAGGTGACGTTGTGTTCACAAGCAAGCTCACAGA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4FK75JQ 731 0 0
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GCTTTATCGTTTGTTGGAGCAACGAGCAGCTGAGTGCCGTTACTTTGTTATTCCATTGTG
GAGAGGAAATGGTTACATTACAATGTTTGCTCAAGTTGAAGCGCCTCACATTATTTTCAC
TGGTCTCGAAGACTACAAAGCGAGAGGAACTGAAGCGGCTCCTTACTTGACAAGCAAATT
CTACACTGAGCTTTCAGAGACGAAAGACTTGGTGTTTATCCGAGGTGACGTTGTGTTCAC
AAGCAAGCTCACAGACGAGGAGGGGAAATGGCTGATGGAGACAGCTCAGTCGTTTTACTT
GAACGACAACCGGTACAAACTGCTCGAGCGGTTCAATAAACATACTCATGAGTTTGAGTT
CAAGATGTGTTACAAGCTCTGGATATGCCTGTCCTCTGATTTGGTTAAAAATCAGGACTA
AAACTTCTCTGTTTTTCTTTCTTTATGAGATATCATTGTATTAGAATTGCTTGTGGGAAT
ATTAAATTTCCAGAGATTTTGCTCTTAAATAAACGCGCTCTTGAATGAACAATTCGAAAA
TGTGATGTTCTTTTTGGTGGTGTACTGAAAAAGTTTAAAGCGAGTTATATTAAAATAACA
GATTACATATT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5047Contig1 775 2 2 U
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AGGGCTGTGTGTGATCGTTAGAGATGTCGAGCTCACAGTTCCGGTACACGCAGACGCCGT
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AGTTTACTGATGTGGAAACTGCTTCAGCGGCAAGGAGTGCGCTAGATGGCAGAAGTATAC
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BQ
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AF RR4BL61TF U 1
AF RR4CY38TF U 1
BS 1 699 RR4BL61TF
BS 700 775 RR4CY38TF

RD RR4BL61TF 699 0 0
GGGATTTGAGCTTCCGTATAGATTCCATTCCGATCACTCAGAGAAGAGGGAATCGAGGCG
AGGGCTGTGTGTGATCGTTAGAGATGTCGAGCTCACAGTTCCGGTACACGCAGACGCCGT
CGAAGGTGGTGCACCTGCGGAATCTACCGTGGGAATGCGTGGAAGAAGAGCTCATCGACC
TGTGCAAACGATTCGGAAAGATCGTCAATACGAAGACCAATGTCGGCGCCAATCGCAACC
AAGCCTTCGTTGAATTCGCTGAGTTGAATCAGGCGATATCAATGGTTTCGTATTATGCTT
CATCTTCGGAGCCGGCACAGATTCGTGGGAAAACTATTTATATACGGTACTCTAATCGGC
ATGAGATTGTGAACAATCAGAGTCCTGGTGAAGTCCCTGGAAACGTCCTCTTGGTTACCT
TTGAAGGAGTCGAATCTCACCATCTCAGCATCGATGTCATCCATCTGGTGTTTTCTGCTT
TTGGATTCGTGCACAAAATTGCCACTTTTGAGAAAGCTGCTGGTTTCCAGGCACTAGTTC
AGTTTACTGATGTGGAAACTGCTTCAGCGGCAAGGAGTGCGCTAGATGGCAGAAGTATAC
CCAAATATCTGCTTCCAGAACATGTTGCCTCTTGCAATTTGCGAATGTCTTATTCAGCTC
ATACTGATCTAAACATCAAGTTTCAGTCCCACCGTAGCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4CY38TF 775 0 0
GGGATTTGAGCTTCCGTATAGATTCCATTCCGATCACTCAGAGAAGAGGGAATCGAGGCG
AGGGCTGTGTGTGATCGTTAGAGATGTCGAGCTCACAGTTCCGGTACACGCAGACGCCGT
CGAAGGTGGTGCACCTGCGGAATCTACCGTGGGAATGCGTGGAAGAAGAGCTCATCGACC
TGTGCAAACGATTCGGAAAGATCGTCAATACGAAGACCAATGTCGGCGCCAATCGCAACC
AAGCCTTCGTTGAATTCGCTGAGTTGAATCAGGCGATATCAATGGTTTCGTATTATGCTT
CATCTTCGGAGCCGGCACAGATTCGTGGGAAAACTATTTATATACGGTACTCTAATCGGC
ATGAGATTGTGAACAATCAGAGTCCTGGTGAAGTCCCTGGAAACGTCCTCTTGGTTACCT
TTGAAGGAGTCGAATCTCACCATCTCAGCATCGATGTCATCCATCTGGTGTTTTCTGCTT
TTGGATTCGTGCACAAAATTGCCACTTTTGAGAAAGCTGCTGGTTTCCAGGCACTAGTTC
AGTTTACTGATGTGGAAACTGCTTCAGCGGCAAGGAGTGCGCTAGATGGCAGAAGTATAC
CCAAATATCTGCTTCCAGAACATGTTGCCTCTTGCAATTTGCGAATGTCTTATTCAGCTC
ATACTGATCTAAACATCAAGTTTCAGTCCCACCGTAGCAGGATTACATGAATCCATACCT
TCCAGTGATCATACCGCAATGGACGGGTCTATGCAGCCTGCTTTGGGTGCTGATG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL5048Contig1 859 2 4 U
GGACGTTACAGAAGCATGTTAAACACAACAAACAAACAAAAAATCATGCCAAAAAAATAG
AAAGGAGAAACTAGGAAGTTTGATTTTCTTGGAATTTAAATACAAAAGAATTAAAAAAAC
TACTATGCTTTCTTCACACGTGAGTTGCAAAAGAAGAATTGAGTAAAAGAGAGACCCATG
GGGCTCAAGAACATTGCTGAACCGGGTTGGTCGTTTTGGCCGGTTTAGCTACGGTCTTCT
CACCATCCTGTTTCATTTCTTCCAAACGCTTTGCTACCTTGATGGAGTAAGCCAATGGAA
GTAAAGTATCAGGATCCATGGCATCTTCAGGAAAGTTCCTTAAAGCATGCATCAGTTCCT
CAAATGGCAATTTCACCAAATCATCATGGCAATGCTTCAACAATGCTAACCCCACTTTGA
ACACAATAATTATACCCTCTGCTAGAAACACATCCCAGATTCTTAGAGCTGAGTGGAAAG
GAAACGAGTAGGAGAAGACTGTTATGAACCACTGGCTTGCATACATACTCGGATTGATCA
TTTCTTGAGTGAAGTGTTCTCCTAGTTTTGGCATTAGCTCTCTTACCAACTGATCAAACT
GTAACAGATATTTCTGTACCAGAGGAAGCCCTGCCTGATACAATACTTCCATTGGGGAGT
GAACAGCTCCTTTGAGTAATGCAACTAGTAACCAGAAGGCATCTTCTTCGCTCATATAAA
GAAGCAACAAACCGGCTACGAACCCCATTCCCTGAACGTATCCGACATCTCTGTCATAGA
CAGAGTACGCTTTCAGAACATTGTACAGTGATCTTTGGCCTGGTCCATGTCTCTTCTGGA
AGAAACATGAGACGGGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A326JQD U 1
AF RR4A326JQ U 93
BS 1 190 RR4A326JQD
BS 191 191 RR4A326JQ
BS 192 818 RR4A326JQD
BS 819 859 RR4A326JQ

RD RR4A326JQD 818 0 0
GGACGTTACAGAAGCATGTTAAACACAACAAACAAACAAAAAATCATGCCAAAAAAATAG
AAAGGAGAAACTAGGAAGTTTGATTTTCTTGGAATTTAAATACAAAAGAATTAAAAAAAC
TACTATGCTTTCTTCACACGTGAGTTGCAAAAGAAGAATTGAGTAAAAGAGAGACCCATG
GGGCTCAAGATCATTGCTGAACCGGGTTGGTCGTTTTGGCCGGTTTAGCTACGGTCTTCT
CACCATCCTGTTTCATTTCTTCCAAACGCTTTGCTACCTTGATGGAGTAAGCCAATGGAA
GTAAAGTATCAGGATCCATGGCATCTTCAGGAAAGTTCCTTAAAGCATGCATCAGTTCCT
CAAATGGCAATTTCACCAAATCATCATGGCAATGCTTCAACAATGCTAACCCCACTTTGA
ACACAATAATTATACCCTCTGCTAGAAACACATCCCAGATTCTTAGAGCTGAGTGGAAAG
GAAACGAGTAGGAGAAGACTGTTATGAACCACTGGCTTGCATACATACTCGGATTGATCA
TTTCTTGAGTGAAGTGTTCTCCTAGTTTTGGCATTAGCTCTCTTACCAACTGATCAAACT
GTAACAGATATTTCTGTACCAGAGGAAGCCCTGCCTGATACAATACTTCCATTGGGGAGT
GAACAGCTCCTTTGAGTAATGCAACTAGTAACCAGAAGGCATCTTCTTCGCTCATATAAA
GAAGCAACAAACCGGCTACGAACCCCATTCCCTGAACGTATCCGACATCTCTGTCATAGA
CAGAGTACGCTTTCAGAACATTGTACAGTGATCTTTGG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4A326JQ 767 0 0
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GAAGAATTGAGTAAAAGAGAGACCCATGGGGCTCAAGAACATTGCTGAACCGGGTTGGTC
GTTTTGGCCGGTTTAGCTACGGTCTTCTCACCATCCTGTTTCATTTCTTCCAAACGCTTT
GCTACCTTGATGGAGTAAGCCAATGGAAGTAAAGTATCAGGATCCATGGCATCTTCAGGA
AAGTTCCTTAAAGCATGCATCAGTTCCTCAAATGGCAATTTCACCAAATCATCATGGCAA
TGCTTCAACAATGCTAACCCCACTTTGAACACAATAATTATACCCTCTGCTAGAAACACA
TCCCAGATTCTTAGAGCTGAGTGGAAAGGAAACGAGTAGGAGAAGACTGTTATGAACCAC
TGGCTTGCATACATACTCGGATTGATCATTTCTTGAGTGAAGTGTTCTCCTAGTTTTGGC
ATTAGCTCTCTTACCAACTGATCAAACTGTAACAGATATTTCTGTACCAGAGGAAGCCCT
GCCTGATACAATACTTCCATTGGGGAGTGAACAGCTCCTTTGAGTAATGCAACTAGTAAC
CAGAAGGCATCTTCTTCGCTCATATAAAGAAGCAACAAACCGGCTACGAACCCCATTCCC
TGAACGTATCCGACATCTCTGTCATAGACAGAGTACGCTTTCAGAACATTGTACAGTGAT
CTTTGGCCTGGTCCATGTCTCTTCTGGAAGAAACATGAGACGGGAAA

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5049Contig1 1032 2 2 U
GGATCTCTGTCAACGCCTGCTGTCCGTAACCTTGCTAAAGACCTTGGCATAGACATCAAC
CTCGTTATTGGAAGTGGTAAAGACGGGAGAGTTTTGAAAGAAGATGTTCTTCAATTCAGT
GGCCAGAAAGAAAACTCATTTGATTCGGTTCTTTCTGAGAATACTGTTATAAGAGGAGAC
TTGGTTTCCACTACAGCGAGTAACTTTGAAGATCAGATAGTTCCTCTGAGGGGATTCAAC
AGAGCGATGGTGAAGACAATGACTATGGCTACAAAAGTACCACATTTTCATTTCGTTGAA
GAGATAAACTGCGACGCCCTTGTGAAGCTCAAGCATTTCTTCAAAGAGAACAACACAGAT
TCCACCGTCAAACACACGTTCCTTCCCACTCTAATCAAGTCACTCTCAATGGCTCTAACC
AAATACCCCTTCGTGAATGGTTGCTTCAACGAGGAGGCGTTAGAGATCATCCTTAAAGGT
TCACACAACATTGGAGTTGCGATGGCTACTGAACATGGTCTTGTGGTTCCTAACATAAAG
AACGTTCAGTCACTATCTTTGCTAGAGATAACCAAAGAGCTGTCACGGTTACGACATTTG
GCGACAAACAACAAGCTTAGCCCCGAGGATGTAACCGGTGGGACCATAACTCTGAGTAAC
ATTGGAGCAATCGGGTGGGAAGTTTGGTTCTCCTCTTCTAAACTTACCTGAAGTTGCCAT
CATCGCTCTTGGGAGAATCGAGAAAGTTCCAAAGTTTAAAGAAGACGGATCTGTTTATCC
TGCATCGACGATGATGGTTAACATCGCTGCGGATCATAGAGTTCTGGATGGAGCAACGGT
GGCTCGGTTTTGCTGCCAGTGGAAAGAGTATATTGAGAAACCGGAGTTGCTAATGCTTCA
AATGAGATAAATAACAAAACAAAGGAGATTTCATGTTTCTTTGTAAAAGCGTCTCTTAAT
TTGAATCATGTATAAGAGAGAACCTGAATTGTATGAATCCTAATGTTCGAATAAGACCAC
GTTTAGTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA84TF U 1
AF RR4HA84JQB C 224
BS 1 741 RR4HA84TF
BS 742 1032 RR4HA84JQB

RD RR4HA84TF 741 0 0
GGATCTCTGTCAACGCCTGCTGTCCGTAACCTTGCTAAAGACCTTGGCATAGACATCAAC
CTCGTTATTGGAAGTGGTAAAGACGGGAGAGTTTTGAAAGAAGATGTTCTTCAATTCAGT
GGCCAGAAAGAAAACTCATTTGATTCGGTTCTTTCTGAGAATACTGTTATAAGAGGAGAC
TTGGTTTCCACTACAGCGAGTAACTTTGAAGATCAGATAGTTCCTCTGAGGGGATTCAAC
AGAGCGATGGTGAAGACAATGACTATGGCTACAAAAGTACCACATTTTCATTTCGTTGAA
GAGATAAACTGCGACGCCCTTGTGAAGCTCAAGCATTTCTTCAAAGAGAACAACACAGAT
TCCACCGTCAAACACACGTTCCTTCCCACTCTAATCAAGTCACTCTCAATGGCTCTAACC
AAATACCCCTTCGTGAATGGTTGCTTCAACGAGGAGGCGTTAGAGATCATCCTTAAAGGT
TCACACAACATTGGAGTTGCGATGGCTACTGAACATGGTCTTGTGGTTCCTAACATAAAG
AACGTTCAGTCACTATCTTTGCTAGAGATAACCAAAGAGCTGTCACGGTTACGACATTTG
GCGACAAACAACAAGCTTAGCCCCGAGGATGTAACCGGTGGGACCATAACTCTGAGTAAC
ATTGGAGCAATCGGGTGGGAAGTTTGGTTCTCCTCTTCTAAACTTACCTGAAGTTGCCAT
CATCGCTCTTGGGAGAATCGA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4HA84JQB 809 0 0
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ATTTTCATTTCGTTGAAGAGATAAACTGCGACGCCCTTGTGAAGCTCAAGCATTTCTTCA
AAGAGAACAACACAGATTCCACCGTCAAACACACGTTCCTTCCCACTCTAATCAAGTCAC
TCTCAATGGCTCTAACCAAATACCCCTTCGTGAATGGTTGCTTCAACGAGGAGGCGTTAG
AGATCATCCTTAAAGGTTCACACAACATTGGAGTTGCGATGGCTACTGAACATGGTCTTG
TGGTTCCTAACATAAAGAACGTTCAGTCACTATCTTTGCTAGAGATAACCAAAGAGCTGT
CACGGTTACGACATTTGGCGACAAACAACAAGCTTAGCCCCGAGGATGTAACCGGTGGGA
CCATAACTTTGAGTAACATTGGAGCAATCGG*TGGGAAGTTTGGTTCTCCTCTTCTAAAC
TTACCTGAAGTTGCCATCATCGCTCTTGGGAGAATCGAGAAAGTTCCAAAGTTTAAAGAA
GACGGATCTGTTTATCCTGCATCGACGATGATGGTTAACATCGCTGCGGATCATAGAGTT
CTGGATGGAGCAACGGTGGCTCGGTTTTGCTGCCAGTGGAAAGAGTATATTGAGAAACCG
GAGTTGCTAATGCTTCAAATGAGATAAATAACAAAACAAAGGAGATTTCATGTTTCTTTG
TAAAAGCGTCTCTTAATTTGAATCATGTATAAGAGAGAACCTGAATTGTATGAATCCTAA
TGTTCGAATAAGACCACGTTTAGTGTTTG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

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ATTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCAAAGTAGACTGTTGTCATGCTTTT
CCATAAATCTCTGTGATTGCTTTTCTTAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGTTGTT
ACATTTATGTTTGAACAATCTTCTATAGATCTTGTTTTGCTTAATCCCTTTTATTACCTA
CAAGTTCATGAATTAAGTGAAAAATTAGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GK52JQ C 1
AF RR4GK52TF U 1
BS 1 272 RR4GK52TF

RD RR4GK52JQ 272 0 0
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ATTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCAAAGTAGACTGTTGTCATGCTTTT
CCATAAATCTCTGTGATTGCTTTTCTTAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGTTGTT
ACATTTATGTTTGAACAATCTTCTATAGATCTTGTTTTGCTTAATCCCTTTTATTACCTA
CAAGTTCATGAATTAAGTGAAAAATTAGTTGC

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR4GK52TF 272 0 0
GGGATCCGAGTTCGGCGATTTCACTATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGCATGAGGAG
ATTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCAAAGTAGACTGTTGTCATGCTTTT
CCATAAATCTCTGTGATTGCTTTTCTTAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGTTGTT
ACATTTATGTTTGAACAATCTTCTATAGATCTTGTTTTGCTTAATCCCTTTTATTACCTA
CAAGTTCATGAATTAAGTGAAAAATTAGTTGC

QA 1 272 1 272
DS 



AS 1 2

CO CL5051Contig1 785 2 2 U
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TTCAAGGTTTCTCCGGTAACTACCGAGGTCTCTCAACCTCCCTCAAACCCTTGCTCGTAT
CCATCCCACTAGGGTTTTAAGCGCTTCGATTCATAAAACCGCCGAGCCATCGCATTCGTT
ATGGCGAATAGGATCAAGTCTTCTCCGACACGATTCCATCACTACCAGAAGCTACTCCTC
TCAAGAAGGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCTGCAGGAGGATGAGTTCCACAG
ATTAGCCAATGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGATTGAGGATTATGGTGATAATAT
CCAGATTGATGGGTTCGACATAGATTATGGGAATGAAGTTCTTACACTTAAGCTTGGATC
TTTAGGCACATATGTACTCAATAAGCAAACTCCTAACCGACAAATCTGGATGTCTTCACC
TGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGGACCGTGATGCTAATGCGTGGATTTACCGGAG
GACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGGAAGAGGAGTTGGAGAGTCCATGTGGCGAACC
TATTCAACTCTCATGAGAACAATATTTGTGAGTTTTATCTAGGAACTGTTATGCCCTTCA
ATGGTATATCTCTATGAAACATCGAGAAGAATAAACAAACTAGGCACGAGAATAAAAAAG
TTGTTTCAGTGTGAAAGCGATGTTTGTGATTATACTTTTAACAGTATTGTCTCAGCGTAC
ATACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4A766TF U 1
AF RR4A766JQ C 1
BS 1 699 RR4A766TF
BS 700 785 RR4A766JQ

RD RR4A766TF 699 0 0
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TCAAGAAGGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCTGCAGGAGGATGAGTTCCACAG
ATTAGCCAATGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGATTGAGGATTATGGTGATAATAT
CCAGATTGATGGGTTCGACATAGATTATGGGAATGAAGTTCTTACACTTAAGCTTGGATC
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TATTCAACTCTCATGAGAACAATATTTGTGAGTTTTATCTAGGAACTGTTATGCCCTTCA
ATGGTATATCTCTATGAAACATCGAGAAGAATAAACAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4A766JQ 785 0 0
GGGAGAGAGACGCGACGACCGTTATTGCAGCAACAGAACCGCCATGGCTTCTTCTACAGC
TTCAAGGTTTCTCCGGTAACTACCGAGGTCTCTCAACCTCCCTCAAACCCTTGCTCGTAT
CCATCCCACTAGGGTTTTAAGCGCTTCGATTCATAAAACCGCCGAGCCATCGCATTCGTT
ATGGCGAATAGGATCAAGTCTTCTCCGACACGATTCCATCACTACCAGAAGCTACTCCTC
TCAAGAAGGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCTGCAGGAGGATGAGTTCCACAG
ATTAGCCAATGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGATTGAGGATTATGGTGATAATAT
CCAGATTGATGGGTTCGACATAGATTATGGGAATGAAGTTCTTACACTTAAGCTTGGATC
TTTAGGCACATATGTACTCAATAAGCAAACTCCTAACCGACAAATCTGGATGTCTTCACC
TGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGGACCGTGATGCTAATGCGTGGATTTACCGGAG
GACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGGAAGAGGAGTTGGAGAGTCCATGTGGCGAACC
TATTCAACTCTCATGAGAACAATATTTGTGAGTTTTATCTAGGAACTGTTATGCCCTTCA
ATGGTATATCTCTATGAAACATCGAGAAGAATAAACAAACTAGGCACGAGAATAAAAAAG
TTGTTTCAGTGTGAAAGCGATGTTTGTGATTATACTTTTAACAGTATTGTCTCAGCGTAC
ATACG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

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GTCAAAACCACCCAAAGGCTTTCCTGATTTCCTCGGCTCTGTGAATTTGAAATACCTGAA
GCTTGGCTACATTTACTTGCTCTCTCTTTCCAACACCTTCTGCTTCTTTCTTCCTCCTCT
TCTCCTTCTCTTCATCTTTGTTTCTCGGTTCCTCCCACTCTTGGTTTATCCTCTATCCAT
CTTCTTGCTTCTTCTCCTTTACCACTTCCTCACTCCTTCCTCTGTTTTCCTTCTTGATTT
CTCATGTTACCGTCCACCTGATCATTTCAAGATCACGAAAAGCGACTTCATCGAGCTGGC
AATGAAGTCTGGCAACTTCAACGAGACTTCCATCGAGCTCCAAATAAAAGTTTTGGAGCA
ATCAGGCATAGGAGAGGAGAGCTACATGCCGAGAGTGGTCTTCAAGCCTGGTCACAAACT
CCCTCCGTGATGGACGCGAAGAAGCAGCGATGGTCATCTTCGGAGCCATCGACGAGCTTC
TCGCAGCCACCAAGATCAACGTGAAGCATATCAAGATCCTGGTCCTCAACTGCGGAGTCC
TCAACACCACGCCTTCTCTCTCGGCGATGGTGATCAACCACTACAAGCTGAGCACAACAC
GGAGAGCTACAACCTCGTGGTATGGGGTGCGGCGCTGAATCATAGCGGTGATTTAGCAAA
GATCTTTGACGCTCATCGAGCTCGTACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP43TF U 1
AF RR4DP65TF U 1
BS 1 287 RR4DP43TF
BS 288 288 RR4DP65TF
BS 289 296 RR4DP43TF
BS 297 297 RR4DP65TF
BS 298 307 RR4DP43TF
BS 308 748 RR4DP65TF

RD RR4DP43TF 310 0 0
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GTCAAAACCACCCAAAGGCTTTCCTGATTTCCTCGGCTCTGTGAATTTGAAATACCTGAA
GCTTGGCTACATTTACTTGCTCTCTCTTTCCAACACCTTCTGCTTCTTTCTTCCTCCTCT
TCTCCTTCTCTTCATCTTTGTTTCTCGGTTCCTCCCACTCTTGGTTTATCCTCTATCCAT
CTTCTTGCTTCTTCTCCTTTACCACTTCCTCACTCCTTCCTCTGTTT*CCTTCTTG*TTT
CTCATGT
ACC

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR4DP65TF 748 0 0
GGATGCTTGAAGCAAAATGAAAAAAGAGGTAACAAAGATGATGAATGGTGGTGGAGTTGA
GTCAAAACCACCCAAAGGCTTTCCTGATTTCCTCGGCTCTGTGAATTTGAAATACCTGAA
GCTTGGCTACATTTACTTGCTCTCTCTTTCCAACACCTTCTGCTTCTTTCTTCCTCCTCT
TCTCCTTCTCTTCATCTTTGTTTCTCGGTTCCTCCCACTCTTGGTTTATCCTCTATCCAT
CTTCTTGCTTCTTCTCCTTTACCACTTCCTCACTCCTTCCTCTGTTTTCCTTCTTGATTT
CTCATGTTACCGTCCACCTGATCATTTCAAGATCACGAAAAGCGACTTCATCGAGCTGGC
AATGAAGTCTGGCAACTTCAACGAGACTTCCATCGAGCTCCAAATAAAAGTTTTGGAGCA
ATCAGGCATAGGAGAGGAGAGCTACATGCCGAGAGTGGTCTTCAAGCCTGGTCACAAACT
CCCTCCGTGATGGACGCGAAGAAGCAGCGATGGTCATCTTCGGAGCCATCGACGAGCTTC
TCGCAGCCACCAAGATCAACGTGAAGCATATCAAGATCCTGGTCCTCAACTGCGGAGTCC
TCAACACCACGCCTTCTCTCTCGGCGATGGTGATCAACCACTACAAGCTGAGCACAACAC
GGAGAGCTACAACCTCGTGGTATGGGGTGCGGCGCTGAATCATAGCGGTGATTTAGCAAA
GATCTTTGACGCTCATCGAGCTCGTACG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL5053Contig1 755 2 5 U
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CTAATGAGCTTGTGTAGGCAACAGGTTTTGCTTGTTAGGAACTGTGACATTTGTATACAA
CTTTTACATAATTTGATAAGCATTTTGTTGTATCGAATCTGACATTTTGTTGTAGGCATA
TGTATGTTGTTGATGATCCGTTTGGTAGGTCTGATTATAATATAACACAGGAGGCTGTGT
TTGTTGTTGCCATGTTTCTCACGCGGTTTTTCGGGAGGAGATTCTTGGCTGTGGCTGCAT
CGACGAGATCGGAGTCAACTACTGCAGCAGCAGCAGCTGCCTCGACTGCTAGGATTGCCA
AGAACCCTCTCGAAGAGTTCTTCGAGTTCGATAGAAGCCAGGAAGAAGACAAACCTGTTG
TCTACGGACGAGGATGGAAAGCTTCGGAACTGAGGCTCAAATCATGGGATGATCTTCAGA
AGCTGTGGTACGTTCTTCTCAAAGAGAAGAACATGTTGATGACTCAGCGTCAGATGCTTC
AAGCTCAGAACATGATGTTTCCTAACCCTGAACGCATTCCTAAGGTGAGGAGATCAATGT
GCCGCATAAAGCATGTCCTGACAGAGAGAGCTATTGAAGAACCGGATCCCAGAAGATCTG
CCGAGATGAAGAGAATGGTCAATGCTATGTGATCTTCTTGTGCTTCTCTTATCAACCAAG
CAATGAATTTGAGTCAATCGCATTTGGGATTTGAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT25TF U 1
AF RR4FE26TF U 3
BS 1 674 RR4BT25TF
BS 675 675 RR4FE26TF
BS 676 714 RR4BT25TF
BS 715 715 RR4FE26TF
BS 716 755 RR4BT25TF

RD RR4BT25TF 755 0 0
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CTTTTACATAATTTGATAAGCATTTTGTTGTATCGAATCTGACATTTTGTTGTAGGCATA
TGTATGTTGTTGATGATCCGTTTGGTAGGTCTGATTATAATATAACACAGGAGGCTGTGT
TTGTTGTTGCCATGTTTCTCACGCGGTTTTTCGGGAGGAGATTCTTGGCTGTGGCTGCAT
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TCTACGGACGAGGATGGAAAGCTTCGGAACTGAGGCTCAAATCATGGGATGATCTTCAGA
AGCTGTGGTACGTTCTTCTCAAAGAGAAGAACATGTTGATGACTCAGCGTCAGATGCTTC
AAGCTCAGAACATGATGTTTCCTAACCCTGAACGCATTCCTAAGGTGAGGAGATCAATGT
GCCGCATAAAGCATGTCCTGACAGAGAGAGCTATTGAAGAACCGGATCCCAGAAGATCTG
CCGAGATGAAGAGA*TGGTCAATGCTATGTGATCTTCTTGTGCTTCTCTTATCA*CCAAG
CAATGAATTTGAGTCAATCGCATTTGGGATTTGAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4FE26TF 737 0 0
GG
GCCGTCATTTGCACCCCCGTTCTCTCTCTCTC**CGGTGAGTTCTTATTTCTTCTGCTAA
TGAGCTTGTGTAGGCAACAGGTTTTGCTTGTTAGGAACTGTGACATTTGTATACAACTTT
TACATAATTTGATAAGCATTTTGTTGTATCGAATCTGACATTTTGTTGTAGGCATATGTA
TGTTGTTGATGATCCGTTTGGTAGGTCTGATTATAATATAACACAGGAGGCTGTGTTTGT
TGTTGCCATGTTTCTCACGCGGTTTT*CGGGAGGAGATTCTTGGCTGTGGCTGCATCGAC
GAGATCGGAGTCAACTACTGCAGCAGCAGCAGCTGCCTCGACTGCTAGGATTGCCAAGAA
CCCTCTCGAAGAGTTCTTCGAGTTCGATAGAAGCCAGGAAGAAGACAAACCTGTTGTCTA
CGGACGAGGATGGAAAGCTTCGGAACTGAGGCTCAAATCATGGGATGATCTTCAGAAGCT
GTGGTACGTTCTTCTCAAAGAGAAGAACATGTTGATGACTCAGCGTCAGATGCTTCAAGC
TCAGAACATGATGTTTCCTAACCCTGAACGCATTCCTAAGGTGAGGAGATCAATGTGCCG
CATAAAGCATGTCCTGACAGAGAGAGCTATTGAAGAACCGGATCCCAGAATATCTGCCGA
GATGAAGAGAATGGTCAATGCTATGTGATCTTCTTGTGCTTCTCTTATCAACCAAGCAAT
GAATTTGAGTCAAT
T

QA 3 736 3 736
DS 



AS 1 2

CO CL5054Contig1 495 2 1 U
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AGAAGAAAGAAAGATGGGAGATAATAAAGTAAGTGGAACGACAAAGACACCTGCTGATTT
CCTCAAATCCATCCGTGGCAGACCCGTTGTTGTCAAGCTCAACTCTGGTGTCGATTATCG
AGGCATTCTTGCTTGTCTTGATGGCTATATGAACATAGCAATGGAGCAGACAGAAGAGTA
TGTTAACGGCCAGCTCAAGAACAAATACGGCGATGCCTTTATCCGTGGAAACAATGTTCT
TTACATCAGTACAGTCAACACACCTTTGGCCGACGGAGCTTAGACCCCTTCCTCATGCAT
CATCATCATCAGCAATGGCTACCTTCTTTGTTCTCTTTCTAAAACAACTCTTGCACCTGA
CGAATGCCATGTATCAAAGATGTTTGTTTTTCATAAAAATGAATTTTTTTTTATAAGCAT
GTTAACTGCAGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FJ70JQ C 1
AF RR4FJ70TF U 1
BS 1 495 RR4FJ70TF

RD RR4FJ70JQ 495 0 0
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CCTCAAATCCATCCGTGGCAGACCCGTTGTTGTCAAGCTCAACTCTGGTGTCGATTATCG
AGGCATTCTTGCTTGTCTTGATGGCTATATGAACATAGCAATGGAGCAGACAGAAGAGTA
TGTTAACGGCCAGCTCAAGAACAAATACGGCGATGCCTTTATCCGTGGAAACAATGTTCT
TTACATCAGTACAGTCAACACACCTTTGGCCGACGGAGCTTAGACCCCTTCCTCATGCAT
CATCATCATCAGCAATGGCTACCTTCTTTGTTCTCTTTCTAAAACAACTCTTGCACCTGA
CGAATGCCATGTATCAAAGATGTTTGTTTTTCATAAAAATGAATTTTTTTTTATAAGCAT
GTTAACTGCAGTCCC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4FJ70TF 495 0 0
TTTTTTCTTCGCTGGAGTAATAGTAGTAGGTCAGGATCGTAGCTGAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAAGAAAGATGGGAGATAATAAAGTAAGTGGAACGACAAAGACACCTGCTGATTT
CCTCAAATCCATCCGTGGCAGACCCGTTGTTGTCAAGCTCAACTCTGGTGTCGATTATCG
AGGCATTCTTGCTTGTCTTGATGGCTATATGAACATAGCAATGGAGCAGACAGAAGAGTA
TGTTAACGGCCAGCTCAAGAACAAATACGGCGATGCCTTTATCCGTGGAAACAATGTTCT
TTACATCAGTACAGTCAACACACCTTTGGCCGACGGAGCTTAGACCCCTTCCTCATGCAT
CATCATCATCAGCAATGGCTACCTTCTTTGTTCTCTTTCTAAAACAACTCTTGCACCTGA
CGAATGCCATGTATCAAAGATGTTTGTTTTTCATAAAAATGAATTTTTTTTTATAAGCAT
GTTAACTGCAGTCCC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 2

CO CL5055Contig1 543 2 8 U
GGAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAAGGAAAAAAAATGTCGGGTCGTGG
AAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAAGTTCTGAGAGA
CAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGGCTCGCAGGGGTGGAGTCAA
GCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAA
CGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGACTGTGACGGCCAT
GGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGATTTGGCGGTTGAGG
GTCTTTTGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTGGAAAATTC
TAATCAAATCGTGTTATTTGCGTTTTTAATTCTGTTTGGTTACGGTCTTTGTGTGTTGCG
GTAGCGTTTCGTTACATGTAATGTAATTACGCATTTTATCTATGAAGCTGTTCGAGTTTA
TGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 

AF RR4AY82TF U 1
AF RR4EI39TF U 1
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BS 136 136 RR4EI39TF
BS 137 412 RR4AY82TF
BS 413 413 RR4EI39TF
BS 414 521 RR4AY82TF
BS 522 523 RR4EI39TF
BS 524 539 RR4AY82TF
BS 540 543 RR4EI39TF

RD RR4AY82TF 539 0 0
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AAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAAGTTCTGAGAGA
CAACATCCAGGGAATTACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGGCTCGCAGGGGTGGAGTCAA
GCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAA
CGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGACTGTGACGGCCAT
GGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGATTTGGCGGTTGAGG
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TAATCAAATCGTGTTATTTGCGTTTTTAATTCTGTTTGGTTACGGTCTTTGTGTGTTGCG
GTAGCGTTTCGTTACATGTAATGTAATTACGCATTTTATCT**GAAGCTGTTCGAGTTT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4EI39TF 543 0 0
GGAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAAGGAAAAAAA*TGTCGGGTCGTGG
AAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAAGTTCTGAGAGA
CAACATCCAGGGAGTCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGGCTCGCAGGGGTGGAGTCAA
GCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAA
CGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGACTGTGACGGCCAT
GGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGATTTGGCGGTTGAGG
GTCTTTTGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTGGAAATTTC
TAATCAAATCGTGTTATTTGCGTTTTTAATTCTGTTTGGTTACGGTCTTTGTGTGTTGCG
GTAGCGTTTCGTTACATGTAATGTAATTACGCATTTTATCTATGAAGCTGTTCGAGTTTA
TGA

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL5056Contig1 631 2 2 U
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GTCGGATGTCAACGGTAAATTGGACGCGAGTATCGATCTCAGTGCTCGACGCGTGGTCTA
CTCCTCCCTCGGCGGCTCGTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGTTCCGTGTTTTCTCAATA
TCCTCACTCTTTAATTACGATTCATTAGCGTTTACGTATACGTAGCGTGATTGATTGCTA
GATGATTCATTTTGTTGTGTTGGGCGTAGGGAGTCCTGTAACAAGATGGGCGTCGATTGC
TTTCGGTGCTGGAATCGGTATTGGATCTGCATACGCTGATTGTGCTCGTCTCTTCGATTC
TTCATCGTCAGCCACTTTGTTACCTCCACCCAAGTCTTCTTCTTCTGTATCTCAGGCTGC
AGAAGAGTAAGAGAAGCGTGGGGTATAAACCCAAACATTGATGATGGGTTTCTAATACAA
GAGTTGTTATAATTTTGTATGAAACTGGCTGTTGATCTTGCATGACATGGCTTCTGAGAT
AATATATGCACATTGTTATACCTTTGCTTTTCATTGGTTCTGTACACACTGACTAGTGTT
TATTGACACACCCATTCCGACTCCTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E743JQ C 1
AF RR4E743TF U 122
BS 1 121 RR4E743JQ
BS 122 631 RR4E743TF

RD RR4E743JQ 631 0 0
GGGAGGGATCAAATCGGAAAGTAGGACCGAGTCGGAAATGGAAAAGAAGAGTAACGGGGA
GTCGGATGTCAACGGTAAATTGGACGCGAGTATCGATCTCAGTGCTCGACGCGTGGTCTA
CTCCTCCCTCGGCGGCTCGTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGTTCCGTGTTTTCTCAATA
TCCTCACTCTTTAATTACGATTCATTAGCGTTTACGTATACGTAGCGTGATTGATTGCTA
GATGATTCATTTTGTTGTGTTGGGCGTAGGGAGTCCTGTAACAAGATGGGCGTCGATTGC
TTTCGGTGCTGGAATCGGTATTGGATCTGCATACGCTGATTGTGCTCGTCTCTTCGATTC
TTCATCGTCAGCCACTTTGTTACCTCCACCCAAGTCTTCTTCTTCTGTATCTCAGGCTGC
AGAAGAGTAAGAGAAGCGTGGGGTATAAACCCAAACATTGATGATGGGTTTCTAATACAA
GAGTTGTTATAATTTTGTATGAAACTGGCTGTTGATCTTGCATGACATGGCTTCTGAGAT
AATATATGCACATTGTTATACCTTTGCTTTTCATTGGTTCTGTACACACTGACTAGTGTT
TATTGACACACCCATTCCGACTCCTTTTTGC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4E743TF 510 0 0
TCCTCCCTCGGCGGCTCGTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGTTCCGTGTTTTCTCAATAT
CCTCACTCTTTAATTACGATTCATTAGCGTTTACGTATACGTAGCGTGATTGATTGCTAG
ATGATTCATTTTGTTGTGTTGGGCGTAGGGAGTCCTGTAACAAGATGGGCGTCGATTGCT
TTCGGTGCTGGAATCGGTATTGGATCTGCATACGCTGATTGTGCTCGTCTCTTCGATTCT
TCATCGTCAGCCACTTTGTTACCTCCACCCAAGTCTTCTTCTTCTGTATCTCAGGCTGCA
GAAGAGTAAGAGAAGCGTGGGGTATAAACCCAAACATTGATGATGGGTTTCTAATACAAG
AGTTGTTATAATTTTGTATGAAACTGGCTGTTGATCTTGCATGACATGGCTTCTGAGATA
ATATATGCACATTGTTATACCTTTGCTTTTCATTGGTTCTGTACACACTGACTAGTGTTT
ATTGACACACCCATTCCGACTCCTTTTTGC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL5057Contig1 829 2 4 U
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ACCCTTCTCAGCTAAAGAGTTCTATGTAAATGCTTATCTCTTTAATGACTACTGGGAAGA
TATAGGAACGATAAGATCATTCTTTGACGCAAATCTCGCCCTCACTGAGCACCCACCTGC
ATTCAGTTTCTACGACGCAGCAAAGCCAATATATACATCAAGGAGGAACCTGCCACCATC
AAAAATAGACGGCTCCAAGCTCATTGATTCGATCATTTCTCATGGAAGCTTCTTAACCAA
CTGCTTAATTGAGCACAGCATTGTGGGAATTAGATCAAGAGTAGGCAGTAATGTTCAGTT
GAAGGACACTGTGATGCTTGGGGCAGACTTCTACGAAACTGAAGCAGAAGTTGCAGCACT
ACTAGCTGAAGGAAAAGTTCCCATTGGAATAGGAGAGAACACAAAGATTAAAGAATGCAT
TATAGACAAGAATGCTAGAGTTGGGAAGAATGTAGTTATCGCAAACTCGGAGGGAGTACA
AGAAGCAGATAGGTCATCCGATGGGTTTTACATCAGATCAGGCATCACAGTGATCTTGAA
GAACTCAGTAATTGCAGATGGAGTTGTGATATGAGACTTTTTTAAGTTTTTAAAATTGTG
AGAACTAAGAATTCAAAGCGGAAAAAGTCAAAACTATATTTTAATCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D755TF U 1
AF RR4D755JQ C 188
BS 1 591 RR4D755TF
BS 592 592 RR4D755JQ
BS 593 669 RR4D755TF
BS 670 829 RR4D755JQ

RD RR4D755TF 669 0 0
GTAAAGGAGGTGACCTGAAAGCAATGGCTGTAGACACAACTGTTCTAGGTCTTTCCAAGG
AGGAGCTGAAAAGAAACCATACATTGCGTCAATGGGGGTTTATGTTTTCAAGAAAGAGAT
ACTGTTGAATCTCTTGAGATGGCGTTTCCCAACAGCAAATGACTTTGGCTCAGAGATTAT
ACCCTTCTCAGCTAAAGAGTTCTATGTAAATGCTTATCTCTTTAATGACTACTGGGAAGA
TATAGGAACGATAAGATCATTCTTTGACGCAAATCTCGCCCTCACTGAGCACCCACCTGC
ATTCAGTTTCTACGACGCAGCAAAGCCAATATATACATCAAGGAGGAACCTGCCACCATC
AAAAATAGACGGCTCCAAGCTCATTGATTCGATCATTTCTCATGGAAGCTTCTTAACCAA
CTGCTTAATTGAGCACAGCATTGTGGGAATTAGATCAAGAGTAGGCAGTAATGTTCAGTT
GAAGGACACTGTGATGCTTGGGGCAGACTTCTACGAAACTGAAGCAGAAGTTGCAGCACT
ACTAGCTGAAGGAAAAGTTCCCATTGGAATAGGAGAGAACACAAAGATTAA*GAATGCAT
TATAGACAAGAATGCTAGAGTTGGGAAGAATGTAGTTATCGCAAACTCGGAGGGAGTACA
AGAAGCAGA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4D755JQ 642 0 0
TCAGCTAAAGAGTTCTATGTAAATGCTTATCTCTTTAATGACTACTGGGAAGATATAGGA
ACGATAAGATCATTCTTTGACGCAAATCTCGCCCTCACTGAGCACCCACCTGCATTCAGT
TTCTACGACGCAGCAAAGCCAATATATACATCAAGGAGGAACCTGCCACCATCAAAAATA
GACGGCTCCAAGCTCATTGATTCGATCATTTCTCATGGAAGCTTCTTAACCAACTGCTTA
ATTGAGCACAGCATTGTGGGAATTAGATCAAGAGTAGGCAGTAATGTTCAGTTGAAGGAC
ACTGTGATGCTTGGGGCAGACTTCTACGAAACTGAAGCAGAAGTTGCAGCACTACTAGCT
GAAGGAAAAGTTCCCATTGGAATAGGAGAGAACACAAAGATTAAAGAATGCATTATAGAC
AAGAATGCTAGAGTTGGGAAGAATGTAGTTATCGCAAACTCGGAGGGAGTACAAGAAGCA
GATAGGTCATCCGATGGGTTTTACATCAGATCAGGCATCACAGTGATCTTGAAGAACTCA
GTAATTGCAGATGGAGTTGTGATATGAGACTTTTTTAAGTTTTTAAAATTGTGAGAACTA
AGAATTCAAAGCGGAAAAAGTCAAAACTATATTTTAATCAAA

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL5058Contig1 580 2 1 U
GGGCCGCCTCTTTCATTTTCTCTGTGGCGGCCTGAGCTTTGCGAAAATGGTTCAACGTCT
TGTTTACCGATCACGCCACTCTTACGCCACCAAATCAAACCAACACCGCATCGTCAAAAC
TCCCGGTGGGAAGTTGACTTTCCAGACGACGAAGAAGAGAGCTAGTGGACCTAAGTGCCC
TGTCACTGGCAAGCGAATCCAAGGGATTCCTCATCTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTC
GAGGTTGTCGAGGAACAGGAGGACAGTGAACCGAGCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCT
TGCTGTTAAAGACAGGATCGTTAGGGCGTTCTTGGTGGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAA
GGTTTTGAAGCTTCAGAAGGCTAAGGAGAAGACTGCACCAAAGAATTAGATAACTTCTTT
TGTGGAGAGTTTTGCGGTAATGTGATGTGTGAGAGGAATATGTAAGGGAGATCGTTAGAC
ATGAGTTTTGATTCACCAGATTTTGTTATTTTGATTTCAGTTGAGATATTACTTTCATGA
ATTGTCTCTGTTTGTGTTTATTGGTTTACCAGTTACCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C748TF U 1
AF RR4C748JQ C 63
BS 1 580 RR4C748TF

RD RR4C748TF 580 0 0
GGGCCGCCTCTTTCATTTTCTCTGTGGCGGCCTGAGCTTTGCGAAAATGGTTCAACGTCT
TGTTTACCGATCACGCCACTCTTACGCCACCAAATCAAACCAACACCGCATCGTCAAAAC
TCCCGGTGGGAAGTTGACTTTCCAGACGACGAAGAAGAGAGCTAGTGGACCTAAGTGCCC
TGTCACTGGCAAGCGAATCCAAGGGATTCCTCATCTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTC
GAGGTTGTCGAGGAACAGGAGGACAGTGAACCGAGCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCT
TGCTGTTAAAGACAGGATCGTTAGGGCGTTCTTGGTGGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAA
GGTTTTGAAGCTTCAGAAGGCTAAGGAGAAGACTGCACCAAAGAATTAGATAACTTCTTT
TGTGGAGAGTTTTGCGGTAATGTGATGTGTGAGAGGAATATGTAAGGGAGATCGTTAGAC
ATGAGTTTTGATTCACCAGATTTTGTTATTTTGATTTCAGTTGAGATATTACTTTCATGA
ATTGTCTCTGTTTGTGTTTATTGGTTTACCAGTTACCACC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4C748JQ 518 0 0
TTTACCGATCACGCCACTCTTACGCCACCAAATCAAACCAACACCGCATCGTCAAAACTC
CCGGTGGGAAGTTGACTTTCCAGAGGACGAAGAAGAGAGCTAGTGGACTTAAGTGCCCTG
TCACTGGCAAGCGAATCCAAGGGATTCCTCATCTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTCGA
GGTTGTCGAGGAACAGGAGGACAGTGAACCGAGCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCTTG
CTGTTAAAGACAGGATCGTTAGGGCGTTCTTGGTGGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGG
TTTTGAAGCTTCAGAAGGCTAAGGAGAAGACTGCACCAAAGAATTAGATAACTTCTTTTG
TGGAGAGTTTTGCGGTAATGTGATGTGTGAGAGGAATATGTAAGGGAGATCGTTAGACAT
GAGTTTTGATTCACCAGATTTTGTTATTTTGATTTCAGTTGAGATATTACTTTCATGAAT
TGTCTCTGTTTGTGTTTATTGGTTTACCAGTTACCACC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL5059Contig1 414 2 3 U
ACCTCACACAGAGATTACCTGAGGGAGGGAATGGAGGAGTCACGAGAATCGCCGCCGGCT
GAACACGGCTTTTACATGCCGGCGGAGTGGGAGCCTCATGCTCAAACATGGATCGGTTGG
CCTGAACGGCAGGATAACTGGAGGCACAACGCTTTACCTGCACAACGAGTGTTTGTAGAT
GTTGCAGAGGCTATCTCGAAGTTCGAACCTGTGACAGTCTGTGCAAGCCCCTCTCAATGG
GAGAATGCAAGGAAACAGCTTCCAGAGGATATCAGAATTGTTGAGATGAGCATGAATGAT
TCTTGGTTCCGTGACTCTGGACCTACTTTTGTTGTGCGAAAAAGACCACTAAAACTCACT
GCTATTAACCGAAACATTGCTGGAATTGACTGGAACTTCAATGCTTGGGGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4EQ39TF U 1
AF RR4EQ52TF U 36
BS 1 274 RR4EQ39TF
BS 275 275 RR4EQ52TF
BS 276 414 RR4EQ39TF

RD RR4EQ39TF 414 0 0
ACCTCACACAGAGATTACCTGAGGGAGGGAATGGAGGAGTCACGAGAATCGCCGCCGGCT
GAACACGGCTTTTACATGCCGGCGGAGTGGGAGCCTCATGCTCAAACATGGATCGGTTGG
CCTGAACGGCAGGATAACTGGAGGCACAACGCTTTACCTGCACAACGAGTGTTTGTAGAT
GTTGCAGAGGCTATCTCGAAGTTCGAACCTGTGACAGTCTGTGCAAGCCCCTCTCAATGG
GAGAATGCAAGGAAACAGCTTCCAGAGGATATCATAATTGTTGAGATGAGCATGAATGAT
TCTTGGTTCCGTGACTCTGGACCTACTTTTGTTGTGCGAAAAAGACCACTAAAACTCACT
GCTATTAACCGAAACATTGCTGGAATTGACTGGAACTTCAATGCTTGGGGAGGA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4EQ52TF 375 0 0
GGAGTCACGAGAATCGCCGCCGGCTGAACACGGCTTTTACATGCCGGCGGAGTGGGAGCC
TCATGCTCAAACATGGATCGGTTGGCCTGAACGGCAGGATAACTGGAGGCACAACGCTTT
ACCTGCACAACGAGTGTTTGTAGATGTTGCAGAGGCTATCTCGAAGTTCGAACCTGTGAC
AGTCTGTGCAAGCCCCTCTCAGTGGGAGAATGCAAGGAAACAGCTTCCAGAGGATATCAG
AGTTGTTGAGATGAGCATGAATGATTCTTGGTTCCGTGACTCTGGACCTACTTTTGTTGT
GCGAAAAAGACCACTAAAACTCAGTGCTATTAACCGAAACATTGCTGGAATTGACTGGAA
CTTCAATGCTTGGGG

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL5060Contig1 667 2 1 U
GGTTGATTCTTCTTCCTTTCTGCATCGAAATATCTGGAGGAAATGATGCAGAATTGTTCA
TTTATTAACCGGAGAAGGAGTTTCGAAGATGATGATGTACCGATCTCAGATAGAACGTTA
GAGATAAATTCTCACATCTCTGTTCCTTGTCATTTGAAACAGTGTCTTGATCTCAAGACA
GGAGAGGTTTACTACATAAACCGGAACACCGGAATGAAAGTGGAGGAAGACAACAACAAC
AACAACAATGTATATGATGATTTCAGTGGAGAATCGGATGTAACTGTTGTTTCAGAAGAC
GATGGCTCTTATTATGAAAGCGAAGAATCTTCATCAGAGTCATCGATAGAGAATCACAAA
GAGGAGAGTGAAGTTCTCGTGGTAGCTGGTTGCAAAGCTTGTTATATTTATTACATGGTA
CCTAAACTCTTGAAAGATTGCCCCAAATGTGCATCTCAGCTTCTCCACTTTGATCGACTT
CACTCTTCTTCCCCTTAACCAAACCTCTTTTTATCCTCATTCTCTTCATATAGATTTGTA
AGTTTCCTTTTCATCCCTTAAATCGTATATGTATGAACTATTGGTCATGTTGTGTCTCGA
TCGCATTAACACGAGGTTTGATGGCACTGTTTCAAACACTAAATAACAATAACAAAAAAT
ACGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A655TF U 1
AF RR4A655JQ C 157
BS 1 667 RR4A655TF

RD RR4A655TF 667 0 0
GGTTGATTCTTCTTCCTTTCTGCATCGAAATATCTGGAGGAAATGATGCAGAATTGTTCA
TTTATTAACCGGAGAAGGAGTTTCGAAGATGATGATGTACCGATCTCAGATAGAACGTTA
GAGATAAATTCTCACATCTCTGTTCCTTGTCATTTGAAACAGTGTCTTGATCTCAAGACA
GGAGAGGTTTACTACATAAACCGGAACACCGGAATGAAAGTGGAGGAAGACAACAACAAC
AACAACAATGTATATGATGATTTCAGTGGAGAATCGGATGTAACTGTTGTTTCAGAAGAC
GATGGCTCTTATTATGAAAGCGAAGAATCTTCATCAGAGTCATCGATAGAGAATCACAAA
GAGGAGAGTGAAGTTCTCGTGGTAGCTGGTTGCAAAGCTTGTTATATTTATTACATGGTA
CCTAAACTCTTGAAAGATTGCCCCAAATGTGCATCTCAGCTTCTCCACTTTGATCGACTT
CACTCTTCTTCCCCTTAACCAAACCTCTTTTTATCCTCATTCTCTTCATATAGATTTGTA
AGTTTCCTTTTCATCCCTTAAATCGTATATGTATGAACTATTGGTCATGTTGTGTCTCGA
TCGCATTAACACGAGGTTTGATGGCACTGTTTCAAACACTAAATAACAATAACAAAAAAT
ACGAATC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4A655JQ 511 0 0
AAACAGTGTCTTGATCTCAAGACAGGAGAGGTTTACTACATAAACCGGAACACCGGAATG
AAAGTGGAGGAAGACAACAACAACAACAACAATGTATATGATGATTTCAGTGGAGAATCG
GATGTAACTGTTGTTTCAGAAGACGATGGCTCTTATTATGAAAGCGAAGAATCTTCATCA
GAGTCATCGATAGAGAATCACAAAGAGGAGAGTGAAGTTCTCGTGGTAGCTGGTTGCAAA
GCTTGTTATATTTATTACATGGTACCTAAACTCTTGAAAGATTGCCCCAAATGTGCATCT
CAGCTTCTCCACTTTGATCGACTTCACTCTTCTTCCCCTTAACCAAACCTCTTTTTATCC
TCATTCTCTTCATATAGATTTGTAAGTTTCCTTTTCATCCCTTAAATCGTATATGTATGA
ACTATTGGTCATGTTGTGTCTCGATCGCATTAACACGAGGTTTGATGGCACTGTTTCAAA
CACTAAATAACAATAACAAAAAATACGAATC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CATCTATATAAAATGAAAAGAAAGATTTGTGTTTAGCTCGCCTACACAAGCCAGGGATTC
TACTTGACTTTTCAGATGTTGCTTATCCAGGCTTGGTGGTAAGGGGATGGGTTAAGCCAG
CTCGTGACAAAAGTACCTCTCGGACGAGTTTTCTCGATTACAAGATCGAGTTCTCAAAAA
TAAATAAATGCGTACAGATATAGATAAAGTGTGCAGTGAGGGATCTTTATAGGTAACCAG
TCTTTACTTAACTCGACCCAAGTAATGCCCAAAGACTCCCATGCTTTTCTTGGTTGGACC
AACCGGCACCGGCAATTTCCGACGAGTCTTTCAGAATTTGAAGAGCAAGAAGCGGAACTA
CAAGAAAGCTTTCTTTATCTTTATGGATAACCAATTCATTTTCAAATATAGTTGGGAGAC
TTTACCCAAGAAATGGGTCAAAAAAATGGAAAGATCGGAACATGGGAATAGATTTGATAC
CAATACGGACTACCTATTTCAATTGTTGTGCTTTCTCAAATTGCATACCTATACAAGGGT
TCAAGTTTTGATCGATATTTGCGGAGTTGATTATCCCTCCCGAAAACGAAGATTTGAAGT
GGTCTATAATTTACTGAGTACTCGGTATAACTCACGCATTCGTGTACAAACCAGTGCAGA
CGAAGTAACACGAATATCTTCGGTAGTAAGTCTATTTCCATCAGCCGGCTGGTGGGAGCG
AGAAGTTTGGGATATGTTTGGTGTTTCTTTCATCAATCATCCGGATCTACGCCGTATATT
AACAGATTATGGTTTCGAGGGTCATCCATTACGAAAAGACTTTCCTCTGAGTGGATATGT
GGAAGTACGCTATGATGATCCAGAGAAACGTGTGGTTTCTGAACCCATTGAGATGACCCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GF89TF U 1
AF RR4GF89JQ C 193
BS 1 492 RR4GF89TF
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RD RR4GF89TF 649 0 0
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TACTTGACTTTTCAGATGTTGCTTATCCAGGCTTGGTGGTAAGGGGATGGGTTAAGCCAG
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TAAATAAATGCGTACAGATATAGATAAAGTGTGCAGTGAGGGATCTTTATAGGTAACCAG
TCTTTACTTAACTCGACCCAAGTAATGCCCAAAGACTCCCATGCTTTTCTTGGTTGGACC
AACCGGCACCGGCAATTTCCGACGAGTCTTTCAGAATTTGAAGAGCAAGAAGCGGAACTA
CAAGAAAGCTTTCTTTATCTTTATGGATAACCAATTCATTTTCAAATATAGTTGGGAGAC
TTTACCCAAGAA*TGGGTCAAAAAAATGGAAAGATCGGAACATGGGAATAGATTTGATAC
CAATACGGACTACCTATTTCAATTGTTGTGCTTTCTCAAATTGCATACCTATACAAGGGT
TCAAGTTTTGATCGATATTTGCGGAGTTGATTATCCCTCCCGAAAACGA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4GF89JQ 768 0 0
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TACAGATATAGATAAAGTGTGCAGTGAGGGATCTTTATAGGTAACCAGTCTTTACTTAAC
TCGACCCAAGTAATGCCCAAAGACTCCCATGCTTTTCTTGGTTGGACCAACCGGCACCGG
CAATTTCCGACGAGTCTTTCAGAATTTGAAGAGCAAGAAGCGGAACTACAAGAAAGCTTT
CTTTATCTTTATGGATAACCAATTCATTTTCAAATATAGTTGGGAGACTTTACCCAAGAA
ATGGGTCAAAAAAATGGAAAGATCGGAACATGGGAATAGATTTGATACCAATACGGACTA
CCTATTTCAATTGTTGTGCTTTCTCAAATTGCATACCTATACAAGGGTTCAAGTTTTGAT
CGATATTTGCGGAGTTGATTATCCCTCCCGAAAACGAAGATTTGAAGTGGTCTATAATTT
ACTGAGTACTCGGTATAACTCACGCATTCGTGTACAAACCAGTGCAGACGAAGTAACACG
AATATCTTCGGTAGTAAGTCTATTTCCATCAGCCGGCTGGTGGGAGCGAGAAGTTTGGGA
TATGTTTGGTGTTTCTTTCATCAATCATCCGGATCTACGCCGTATATTAACAGATTATGG
TTTCGAGGGTCATCCATTACGAAAAGACTTTCCTCTGAGTGGATATGTGGAAGTACGCTA
TGATGATCCAGAGAAACGTGTGGTTTCTGAACCCATTGAGATGACCCG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL5063Contig1 1456 2 6 U
GGAGTCGAGTAATTTGGTAATAATGGTGGTGGCCGTGGGTGTGCTCCACCTCCTCTCATC
GTCTTCTTCGCGAATCGTTTGTTTATCTACTTCTTCTCGCCCTCCCCTATCAGCTGCTGT
TGCTAAAGTGGTACTTAAAAAGGGAAAGACACAGCTGTTCAAAGACGTAAGTCCAATGGT
GTACAGTGGAGCGGTGGACAGGATCATCGGAAAGCCACCTCCAAAGACCGGAGACGTCGT
CATTGTCGCCGACGGCACCGAGAATCCCATCGGCTGGGGTTTGTATAACTCCGTTTCTAT
GTTCTGTGTTCGCCTTATGCAGCTCCAACACGAATCCACCAGAGATCCTTCTTGTGCACT
CAACGTTGAGAAGCTTCTCCAGACTAGAATCACTCAAGCTGTTCAGTTAAGGAATCATTT
GGGACTCCCCTCGGAAAATAACCACACTAATGCTTATCGTCTTGTCAACAGTGAGGGAGA
TAGATTGTCTGGATTGATAGTGGATGTGTTTGGAGATATAGCTGTGGTTGCATCCTCAGC
TGCTTGGGTTGAAAAGTACTGGAATCATGTGGAGGCTTGCTTGAGATCATCAGTCCATGG
AATTAATCACATCAACTGGAGACCTTCTCTTGATCTTCTCAAAGAAGATGGCTTTGATAT
CTCCTCTTTTAAACTAACACAATCATCATCATCATCATCTCCTCCTCTCCCCGAGAGATC
AATGGTGGTGGAAAATGGAATCACTTACGCAATCTCGCTAGAGGGACAGAAGACAGGGTT
CTACACCGATCAACGCGAAAACCGTCACTTCATATCAACCATCTCCGCTGGCAAAAGAGT
TCTTGATCTCTGCTGCTATAGTGGTGGTTTCGCACTTAATGCTGCCAGAGGAGGTGCTAC
CAGTGTCCTCGGGATTGATTCATCTTTACCTGCTTTGGAGCTGGCCAGAGAGAATGTAAT
CCTCAACCATATGGATCCAGGGAAGGTTGTTTTCTTCAAACAAGATTCTACAGAATTCAT
GAAGGGTGCTCTGTCAAGGGAAGAGACTTGGGACATTGTCATCCTTGACCCTCCTAAGCT
AGCTCCAAGGAAAAAGGTTTTACATAACGCGGCAGGAATGTACAGAAATCTCAACTCGTT
GGCAATGAGATTGACAAGCGGTGGAGGTTTGTTGATGACATGCTCATGTTCAGGTGCCAT
GACACAGGGTGGAAAGTTCTTGGGCATTCTTCAGAGCGCTGCAGCAATGGCTGGGAGGAA
GATAACTGTGGTTAGGGAAGCTGGAGCTGCTTCTGATCACCCACTTGACCCATCCTACCC
TCAGGGCCACTATCTCTCCAATATTCTCCTTCGGGTCCTCTGAGTTTTGGTTTCAACAAT
AGCTCAATTTTTTTATTTTTAATGTTGGTTGGGGACCAAAGTAATTTAAGTTTGAAACAA
GAAGAAAAGTTTAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT33TF U 1
AF RR4FT33JQ C 630
BS 1 711 RR4FT33TF
BS 712 712 RR4FT33JQ
BS 713 734 RR4FT33TF
BS 735 735 RR4FT33JQ
BS 736 747 RR4FT33TF
BS 748 1456 RR4FT33JQ

RD RR4FT33TF 747 0 0
GGAGTCGAGTAATTTGGTAATAATGGTGGTGGCCGTGGGTGTGCTCCACCTCCTCTCATC
GTCTTCTTCGCGAATCGTTTGTTTATCTACTTCTTCTCGCCCTCCCCTATCAGCTGCTGT
TGCTAAAGTGGTACTTAAAAAGGGAAAGACACAGCTGTTCAAAGACGTAAGTCCAATGGT
GTACAGTGGAGCGGTGGACAGGATCATCGGAAAGCCACCTCCAAAGACCGGAGACGTCGT
CATTGTCGCCGACGGCACCGAGAATCCCATCGGCTGGGGTTTGTATAACTCCGTTTCTAT
GTTCTGTGTTCGCCTTATGCAGCTCCAACACGAATCCACCAGAGATCCTTCTTGTGCACT
CAACGTTGAGAAGCTTCTCCAGACTAGAATCACTCAAGCTGTTCAGTTAAGGAATCATTT
GGGACTCCCCTCGGAAAATAACCACACTAATGCTTATCGTCTTGTCAACAGTGAGGGAGA
TAGATTGTCTGGATTGATAGTGGATGTGTTTGGAGATATAGCTGTGGTTGCATCCTCAGC
TGCTTGGGTTGAAAAGTACTGGAATCATGTGGAGGCTTGCTTGAGATCATCAGTCCATGG
AATTAATCACATCAACTGGAGACCTTCTCTTGATCTTCTCAAAGAAGATGGCTTTGATAT
CTCCTCTTTTAAACTAACACAATCATCATCATCATCATCTCCTCCTCTCCC*GAGAGATC
AATGGTGGTGGAAA*TGGAATCACTTA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4FT33JQ 827 0 0
TCTGATC
TCTCAAAGAAGATGGCTTTGATATCTCCTCTTT*AAACTAACACAATCATCATCATCATC
ATCTCCTCCTCTCCCCGAGAGATCAATGGTGGTGGAAAATGGAATCACTTACGCAATCTC
GCTAGAGGGACAGAAGACAGGGTTCTACACCGATCAACGCGAAAACCGTCACTTCATATC
AACCATCTCCGCTGGCAAAAGAGTTCTTGATCTCTGCTGCTATAGTGGTGGTTTCGCACT
TAATGCTGCCAGAGGAGGTGCTACCAGTGTCCTCGGGATTGATTCATCTTTACCTGCTTT
GGAGCTGGCCAGAGAGAATGTAATCCTCAACCATATGGATCCAGGGAAGGTTGTTTTCTT
CAAACAAGATTCTACAGAATTCATGAAGGGTGCTCTGTCAAGGGAAGAGACTTGGGACAT
TGTCATCCTTGACCCTCCTAAGCTAGCTCCAAGGAAAAAGGTTTTACATAACGCGGCAGG
AATGTACAGAAATCTCAACTCGTTGGCAATGAGATTGACAAGCGGTGGAGGTTTGTTGAT
GACATGCTCATGTTCAGGTGCCATGACACAGGGTGGAAAGTTCTTGGGCATTCTTCAGAG
CGCTGCAGCAATGGCTGGGAGGAAGATAACTGTGGTTAGGGAAGCTGGAGCTGCTTCTGA
TCACCCACTTGACCCATCCTACCCTCAGGGCCACTATCTCTCCAATATTCTCCTTCGGGT
CCTCTGAGTTTTGGTTTCAACAATAGCTCAATTTTTTTATTTTTAATGTTGGTTGGGGAC
CAAAGTAATTTAAGTTTGAAACAAGAAGAAAAGTTTAAGT

QA 8 827 8 827
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5065Contig1 986 2 2 U
GGGATTGTATCGGAAAGCTACGTCTCCAATCCCAAAGCACTGAACTTTCAAGTCTCTTCC
CTGAGTTCTTCTCCTCACCGCAGAACACGAACCTGGAGAATCAGAAGTTCACCGGAAGAG
AACGCAGCAAACTCGAGCGGCGGCGGCGGAGGAGATTTGAAGAAGTCTCTGTCCGGTATT
GTCGGAAACCAAGTCGAGGAGCTTCTGAGCAGAGAAGAGAACAAGAACTTACTCGACGGT
CTGGAAAAAGCTTCGATGAGGGTGGAGGTTGTGAAGAGAGAGCTCGCGGAGATTGAGAGG
CGAGAACTCGAGGCGAAGCTGTTGCAGGATTATGTTGATAAGCTCGAATCAAGAGCCGCT
GAGATCGCAGAATGCCAGCAGGAGATTGTCGCAGCAAGGACAATGGTCGAGGAAGCAGAA
CGCTCCTTGTCCTTAGCAGAGACTGATGCATCAATTGGAAGTTCAGAAAACGGATATTCG
ATTGATAAAGACAAGGAGAGATTGGAATCAGCGAAAGCGGCAGCCATTGCAGCTGCGGTT
GGGACCGTTGCAGAAGTCCCGTTTGCTCTTTCTCAAGTCTCGAGCATTGAGCAGCTTGTT
CTCCCCCTGGGAGTAGCGTTTGCAAGCTGTGCGTTGTTTGGTGTCACATTCAGGTATGTA
ATCAGAAGAGATTTGGATGATAGTCATCTCAAATCAGGGGCCGTTGCAGCCTTTGGATTT
GTCAAAGGACTTGGTATGTTAAGCAGAGGACCGCCACTGGAGCTGAGCTGGGAAAGCTTG
TTTTCTCATGGAATAGATGGCGCCGTTTTAGTATCTCAGAGCGTGTTGATATTCGCGTTT
GCGTCTATAAGTTTGGACTTTTGTTTTAAAATGAAGCTCTTGAAACCATTTCCAAGCTCT
GCTCAGATGTAGAAGCAGTAGTTAAAAAGGTAGAAACGCAAAAAAGAAAAAACATTGTAT
ATTTTCTTTGAAGATTTATGTATCAA


BQ
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AF RR4BV66TF U 1
AF RR4BV66JQ C 134
BS 1 651 RR4BV66TF
BS 652 986 RR4BV66JQ

RD RR4BV66TF 651 0 0
GGGATTGTATCGGAAAGCTACGTCTCCAATCCCAAAGCACTGAACTTTCAAGTCTCTTCC
CTGAGTTCTTCTCCTCACCGCAGAACACGAACCTGGAGAATCAGAAGTTCACCGGAAGAG
AACGCAGCAAACTCGAGCGGCGGCGGCGGAGGAGATTTGAAGAAGTCTCTGTCCGGTATT
GTCGGAAACCAAGTCGAGGAGCTTCTGAGCAGAGAAGAGAACAAGAACTTACTCGACGGT
CTGGAAAAAGCTTCGATGAGGGTGGAGGTTGTGAAGAGAGAGCTCGCGGAGATTGAGAGG
CGAGAACTCGAGGCGAAGCTGTTGCAGGATTATGTTGATAAGCTCGAATCAAGAGCCGCT
GAGATCGCAGAATGCCAGCAGGAGATTGTCGCAGCAAGGACAATGGTCGAGGAAGCAGAA
CGCTCCTTGTCCTTAGCAGAGACTGATGCATCAATTGGAAGTTCAGAAAACGGATATTCG
ATTGATAAAGACAAGGAGAGATTGGAATCAGCGAAAGCGGCAGCCATTGCAGCTGCGGTT
GGGACCGTTGCAGAAGTCCCGTTTGCTCTTTCTCAAGTCTCGAGCATTGAGCAGCTTGTT
CTCCCCCTGGGAGTAGCGTTTGCAAGCTGTGCGTTGTTTGGTGTCACATTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4BV66JQ 853 0 0
TCGAGCGG
GGCGGCGGAGGAGATT*GAAGAAGTCTCTGTCCGGTATTGTCGGAAACCAAGTCGAGGAG
CTTCTGAGCAGAGAAGAGAACAAGAACTTACTCGACGGTCTGGAAAAAGCTTCGATGAGG
GTGGAGGTTGTGAAGAGAGAGCTCGCGGAGATTGAGAGGCGAGAACTCGAGGCGAAGCTG
TTGCAGGATTATGTTGATAAGCTCGAATCAAGAGCCGCTGAGATCGCAGAATGCCAGCAG
GAGATTGTCGCAGCAAGGACAATGGTCGAGGAAGCAGAACGCTCCTTGTCCTTAGCAGAG
ACTGATGCATCAATTGGAAGTTCAGAAAACGGATATTCGATTGATAAAGACAAGGAGAGA
TTGGAATCAGCGAAAGCGGCAGCCATTGCAGCTGCGGTTGGGACCGTTGCAGAAGTCCCG
TTTGCTCTTTCTCAAGTCTCGAGCATTGAGCAGCTTGTTCTCCCCCTGGGAGTAGCGTTT
GCAAGCTGTGCGTTGTTTGGTGTCACATTCAGGTATGTAATCAGAAGAGATTTGGATGAT
AGTCATCTCAAATCAGGGGCCGTTGCAGCCTTTGGATTTGTCAAAGGACTTGGTATGTTA
AGCAGAGGACCGCCACTGGAGCTGAGCTGGGAAAGCTTGTTTTCTCATGGAATAGATGGC
GCCGTTTTAGTATCTCAGAGCGTGTTGATATTCGCGTTTGCGTCTATAAGTTTGGACTTT
TGTTTTAAAATGAAGCTCTTGAAACCATTTCCAAGCTCTGCTCAGATGTAGAAGCAGTAG
TTAAAAAGGTAGAAACGCAAAAAAGAAAAAACATTGTATATTTTCTTTGAAGATTTATGT
ATCAA

QA 9 853 9 853
DS 



AS 1 2

CO CL5066Contig1 876 2 8 U
GGGAGCTCAGAGCCAAAAGATCATGGAGGAAAGACAAGAACTTGCATTGACCCAGTTGAG
AAAATCGGTCGAGAAACTCTCTTCTTCCACAGAGGGATATGAAGTGCCGACATTGATGAG
GTTCCTGGTTGCAAGATCAATGAATCCAGACAAGGCAGCAAAGATGTTTGTAGACTGGCA
AAAGTGGAGAACCTCTTTGGTTCCTCCAAATGGGATTACAGACTCAGAAGTGAAGGATGA
ATTGGAGTTTAGAAAGGTCTGTCTTCAGGGTCCAACCAAATCTGGACACGCTATGGTGCT
TGTCATAACCTCTAAACATTTTCCTGCTAAGGATCAAGTTATCTTCAAGAAGTTTGTTGT
TCATGTGCTAGACAAAACAATCGCAAGTGGCATCAAAGGCAAAGAAGTAGGAGATGAGAA
GTTAGTAGCTGTTATCGATCTGTCGAACATTACATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGACT
CATCACTGGTTTTCAATTCTTACAATCTTACTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACAT
CTTGCACATGCCTGGATTCTTCTTGACCGTTTGGAGATTTGTTTGCCGTTTTCTAGAGAA
AACGACGCAAGAAAAGATTGTGATAGTAACGGATGGAGAAGAAGAGAGAAAGTTCAAGGA
AGAGATCGGAGTAAATGCCTTGCCGGAAGAATATGGTGGTAAAGCTAAGCTCACACCAAT
CCAAGATGTTCTTCTTACTCACAGTGCTCCACAACTGTTAACAACAAACAATAATAATGT
TTAAGCGTGTACTGCTTTTAGTATTTTTACTATGTAATGATCATAACAGAACTTTGGTTA
GAGAAGCAATGAAACACATGAGAAGCTTCCCACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FL10TF U 1
AF RR4FL10JQ C 239
BS 1 656 RR4FL10TF
BS 657 657 RR4FL10JQ
BS 658 687 RR4FL10TF
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BS 761 876 RR4FL10JQ

RD RR4FL10TF 760 0 0
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AAAATCGGTCGAGAAACTCTCTTCTTCCACAGAGGGATATGAAGTGCCGACATTGATGAG
GTTCCTGGTTGCAAGATCAATGAATCCAGACAAGGCAGCAAAGATGTTTGTAGACTGGCA
AAAGTGGAGAACCTCTTTGGTTCCTCCAAATGGGATTACAGACTCAGAAGTGAAGGATGA
ATTGGAGTTTAGAAAGGTCTGTCTTCAGGGTCCAACCAAATCTGGACACGCTATGGTGCT
TGTCATAACCTCTAAACATTTTCCTGCTAAGGATCAAGTTATCTTCAAGAAGTTTGTTGT
TCATGTGCTAGACAAAACAATCGCAAGTGGCATCAAAGGCAAAGAAGTAGGAGATGAGAA
GTTAGTAGCTGTTATCGATCTGTCGAACATTACATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGACT
CATCACTGGTTTTCAATTCTTACAATCTTACTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACAT
CTTGCACATGCCTGGATTCTTCTTGACCGTTTGGAGATTTGTTTGCCGTTTTCTAGAGAA
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AGAGATCGGAGTAAATGCCTTGCCGGA*GAATATGGTGGTAAAGCTAAGCTCACAC*AAT
CCAAGATGTTCTTCTTACTCACAGTGCTCCACAACTGTTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4FL10JQ 638 0 0
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CTTGTCATAACCTCTAAACATTTTCCTGCTAAGGATCAAGTTATCTTCAAGAAGTTTGTT
GTTCATGTGCTAGACAAAACAATCGCAAGTGGCATCAAAGGCAAAGAAGTAGGAGATGAG
AAGTTAGTAGCTGTTATCGATCTGTCGAACATTACATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGA
CTCATCACTGGTTTTCAATTCTTACAATCTTACTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTAC
ATCTTGCACATGCCTGGATTCTTCTTGACCGTTTGGAGATTTGTTTGCCGTTTTCTAGAG
AAAACGACGCAAGAAAAGATTGTGATAGTAACGGATGGAGAAGAAGAGAGAAAGTTCAAG
GAAGAGATCGGAGTAAATGCCTTGCCGGAAGAATATGGTGGTAAAGCTAAGCTCACACCA
ATCCAAGATGTTCTTCTTACTCACAGTGCTCCACAACTGTTAACAACAAACAATAATAAT
GTTTAAGCGTGTACTGCTTTTAGTATTTTTACTATGTAATGATCATAACAGAACTTTGGT
TAGAGAAGCAATGAAACACATGAGAAGCTTCCCACTTT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGAGAACAAACACACACAATGGTTGTTGGTATGGCTGCGGTTGGTCAATGGACTCCTCT
CTGTCTCGCCTCGCCGAGAGCAAAGTCGGCAACTTGCAATTCAAACCTTTCTCCAACCAC
AACCACCGTTAGCTCGCGCACAGAGCTGGCCGCATTTCGTCCTCAGTTCCGTTTATTCTC
TCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCCCCGCCGATTCGGGAATCTT
CCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGTAAAAGCGTTTCCCCCTCTAACGATACATGCTCT
CTTTACTTTTGTTTACTACTTATTATATGTTTCAGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTA
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AGAAGGGTTTTAAACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAATGTCCAAAAGATTTGGCCGAGG
AACATTATAAGGATCTTAGTGCTAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTT
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TGATTGGGAAAACAGACCCCCTTCAAGCTGAACCTGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTG
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BQ
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AF RR4DS82TF U 1
AF RR4B476TF U 498
BS 1 648 RR4DS82TF
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BS 713 748 RR4DS82TF
BS 749 876 RR4B476TF

RD RR4DS82TF 748 0 0
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CTGTCTCGCCTCGCCGAGAGCAAAGTCGGCAACTTGCAATTCAAACCTTTCTCCAACCAC
AACCACCGTTAGCTCGCGCACAGAGCTGGCCGCATTTCGTCCTCAGTTCCGTTTATTCTC
TCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCCCCGCCGATTCGGGAATCTT
CCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGTAAAAGCGTTTCCCCCTCTAACGATACATGCTCT
CTTTACTTTTGTTTACTACTTATTATATGTTTCAGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTA
TGGTCAAACCAGACGGCATCCAACGAGGCCTTGTAGGAGAAATCATCTCTCGTTTTGAGA
AGAAGGGTTTTAAACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAATGTCCAAAAGATTTGGCCGAGG
AACATTATAAGGATCTTAGTGCTAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTT
CTGGCCCTGTTGTGTGTATGGCTTGGGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGC
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TACAAACTGGAAG*AACATTGTGCATGGTAGTGATAGTCCTGAAA*CGGAA*GCGTGAGA
TTGCTTTGTGGTTCAAAGAAAGCGAGCT

QA 1 748 1 748
DS 

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ATGGCTTGGGAAGGTTTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGATTGGGAAAACAGAC
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ATTGTGCATGGTAGTGATAGTCCTGAAAACGGAAAGCGTGAGATTGCTTTGTGGTTCAAA
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AGAAGACAGATCCAATACTTTTTTTCTTGCTACTGAGTGCGAACGGCTTGGTCCTTTGTT
TTTTCTTTTTTAATTTTGG

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 2

CO CL5069Contig1 508 2 1 U
GGGAAACCCTCTTTCTTGTACGCGTCGTTGAAACGCGAGGAACAAAAGCTTGATCTCCTC
CCTCCTCCCTCCTCCCTCCCGTCGCCGGAAAATGGCAACTGGTGGAAAAGTCTCCTTCAA
AGTCACTCTCACTTCGGATCCTAAGCTTCCTTTCAAAGTATTCAGCGTACCAGAGGGAGC
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CGCCATCATCACCAATGATGGGATCGGGATCAATCCCCAACAGAGCGCAGGAAACGTGTT
CTTGAAGCATGGGTCTGAATTAAGACTCATCCCGCGTGACAGAGTCGGAGCTGCGTTTTG
TTAATTGATCCATGAATCTTTGTTACCAGTGAGTGAAACACAGTACCAAAACCATACTAC
TAAAAAAACTTAAAACATATTGAAATGGTTATTGTACACAACTTTGTTATCTTTGAATAA
ATATGTGACGTTCACATCCTTTCAAGAC


BQ
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AF RR4ER91JQ C 1
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QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

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BQ
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TGAAGATAGTTGGGTTTCAG

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DS 



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C


BQ
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10 

AF RR4AB56TF U 1
AF RR4AB56JQ C 124
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BS 823 901 RR4AB56JQ

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GT

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CAAAAGAAACACCCCCATTGCTCATGCTGTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCAC
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QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

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BQ
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DS 

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AGAAGATGAAGAGGAAGTCCAGGAGGAGCAATGACGGTAAAAAGAAGAAAAGTCCTCGTA
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QA 1 507 1 507
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4C946JQ C 1
AF RR4C946TF U 1
BS 1 726 RR4C946TF

RD RR4C946JQ 726 0 0
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ATCATCTACAGTTCGGTTTGTTGATCTCAAGCGCAGGAGATACTATTTCCCACTTATGGT
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CAGTACAATCTTTGAATCTGCAGGAGTCACATCGAGTAACGCAGCAACGTTTGGGGTCGG
TGCTATTCAGGTAGTGGCGACTACAATATCAACATGGTTGGTGGACAAAGTAGGTCGTCG
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CTTCTACCTTAAGGAATTTGTGTCTCATGATTCGGACATGTACAGTATGCTGAGCATCTT
GTCAGTTGTTGGAGTAGTGGCAATGGTTGTTTCTTTCTCACTGGGAATGGGACCAATTCC
GTGGCTCATTATGTTTGAGATTCTTCCTGTAAACATAAAGGGTTTAGCTGGAAGTATAGC
TACTTTAGCCAATTGGTTCATCTCTTGGTTGATTACTATGACTGCAAACTTGCTCTTAGC
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CAGATG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4C946TF 726 0 0
GACTGATATTACCGTTGAGGTTAATGAAATCAAGAGATCTGTGGGAACATCTACAAAACG
ATCATCTACAGTTCGGTTTGTTGATCTCAAGCGCAGGAGATACTATTTCCCACTTATGGT
TGGTATAGGGTTGCTTGTACTTCAACAACTCGGTGGAATTAATGGTGTCCTGTCCTATTC
CAGTACAATCTTTGAATCTGCAGGAGTCACATCGAGTAACGCAGCAACGTTTGGGGTCGG
TGCTATTCAGGTAGTGGCGACTACAATATCAACATGGTTGGTGGACAAAGTAGGTCGTCG
GCTTCTTCTTACCATCTCTTCTGTTGGGATGACGATTAGCCTAGTGATTGTTGCAGCTGC
CTTCTACCTTAAGGAATTTGTGTCTCATGATTCGGACATGTACAGTATGCTGAGCATCTT
GTCAGTTGTTGGAGTAGTGGCAATGGTTGTTTCTTTCTCACTGGGAATGGGACCAATTCC
GTGGCTCATTATGTCTGAGATTCTTCCTGTAAACATAAAGGGTTTAGCTGGAAGTATAGC
TACTTTAGCCAATTGGTTCATCTCTTGGTTGATTACTATGACTGCAAACTTGCTCTTAGC
CTGGAGCAGTGGAGGAACTTTCACTCTATACGGTTTGGTTTGTGCATTCACGGTGGTGTT
TGTAACTCTGTGGGTTCCTGAGACCAAAGGCAAAACCCTTGAAGAACTTCAAGCTTTGTT
CAGATG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL5075Contig1 1290 2 6 U
GGGAGAACAAGGCAGCTCCTGAATCCCTAAAGCCTTAAAACCTCTCTCTGTTCTCTTCGC
TGAGAGTATTCATTTTCACAAAGGAGATGAGTATCCCAATGGAGCTGATGTCCATCAGAA
CCCCCAATTCAACCTTCCTCCTCCACAGACCTCACTCTCGCCCACCACCCGCCACGCTTC
CTTCTCTCCGTTCCCAGCACCTCCCCACCCGACGCCACTCCACTTCTCCCTCTCTCGTTT
CTTGTACTGGAAGGCTGCCTCTCGGGTTTACCTCAGATACCAAGCTTAATCGCTCCTTCT
TCGTTGCTTCCGCTGCTTCCCACGAGGATTCGGAACCATCAGGTGTTGAGGTGGAGAAGG
AGAAGGAGAAGAGTGTAGTAGATGGTGACGATGTTGATACATCTCAGGAAGCGTGGAAGC
AGACCCTCGCGTCTGTCAAGGAGCAGGTCTCGAAGATTCAGAGCGTGTCGTCGGAGGCGT
ACAATGTGAACTCCCAAAAGGCGATGACTATTTTGAAAGATACTTCCGAGCAGCTTAGGA
TTCAAGCGGAGAAGGCCAAGGAAGAGTTGGGAACGAAGGCTAAAGAGGTTGGGGAGGGAG
GGAGAGAGTATATTTTGAAAGCAGCTGAGGAGTCACCTTCGGATGTGAAGGAGATTGTTG
AAGCTTTCTCTTCCACTGAGGATCTTAGGGATGTGTCTCGGACTCAAGATTTCCATGTTG
GGATACCTTATGGTCTGCTTCTGTTCGTGGGTGGGTTTCTTTCCTTTATGATATCGGGGA
GTATTCCTGCCATTAGGTTTGGGTTCATTCTTGGTGGAGCTCTTTTTGCACTGAGTATGG
CTAGTCTTAAGGCTCAGAGGATTGGAGAGTCATCTGCTAAGTTCTTAAAAGGACAGATGG
CTATAGTGGCAATCATATTTTTGAGAGAGTTGAAGTTGGTACTGTTTCAGAGATCTACCT
TCATGGGGTTCTTAACCACCCTTACGAGTGGCGGTGTGTTGGCGTTTTACGGGTACAAGT
TGATGAGCAACAAAGAAAAGGGACCAAACAAAGAACAAGCTGGAGAAGGAGATGAAACAA
GCGAAGGGTTTGTAAGAAGAGAAGGATAGAGAAATGGTAACATGAGCCTCATACTCTGTT
ATAGTGATATCCGAACTCTTATCTTCTCTCTTTTTAAGTTGTGTACAACTTTTGTGATCA
ATCATCTTCTAAACTTCTGTGTACTTATCTGTATTTGGATTTTGTGGAGACCTTTTACCA
CATATCAATAAACAAGAACAAGTTAGGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E192TF U 1
AF RR4E192JQ C 517
BS 1 578 RR4E192TF
BS 579 579 RR4E192JQ
BS 580 680 RR4E192TF
BS 681 681 RR4E192JQ
BS 682 786 RR4E192TF
BS 787 1290 RR4E192JQ

RD RR4E192TF 786 0 0
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TGAGAGTATTCATTTTCACAAAGGAGATGAGTATCCCAATGGAGCTGATGTCCATCAGAA
CCCCCAATTCAACCTTCCTCCTCCACAGACCTCACTCTCGCCCACCACCCGCCACGCTTC
CTTCTCTCCGTTCCCAGCACCTCCCCACCCGACGCCACTCCACTTCTCCCTCTCTCGTTT
CTTGTACTGGAAGGCTGCCTCTCGGGTTTACCTCAGATACCAAGCTTAATCGCTCCTTCT
TCGTTGCTTCCGCTGCTTCCCACGAGGATTCGGAACCATCAGGTGTTGAGGTGGAGAAGG
AGAAGGAGAAGAGTGTAGTAGATGGTGACGATGTTGATACATCTCAGGAAGCGTGGAAGC
AGACCCTCGCGTCTGTCAAGGAGCAGGTCTCGAAGATTCAGAGCGTGTCGTCGGAGGCGT
ACAATGTGAACTCCCAAAAGGCGATGACTATTTTGAAAGATACTTCCGAGCAGCTTAGGA
TTCAAGCGGAGAAGGCCAAGGAAGAGTTGGGAACGAAG*CTAAAGAGGTTGGGGAGGGAG
GGAGAGAGTATATTTTGAAAGCAGCTGAGGAGTCACCTTCGGATGTGAAGGAGATTGTTG
AAGCTTTCTCTTCCACTGAG*ATCTTAGGGATGTGTCTCGGACTCAAGATTTCCATGTTG
GGATACCTTATGGTCTGCTTCTGTTCGTGGGTGGGTTTCTTTCCTTTATGATATCGGGGA
GTATTC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4E192JQ 774 0 0
AAGATACTTCCGAGCAGCTTAGGATTCAAGCGGAGAAGGCCAAGGAAGAGTTGGGAACGA
AGGCTAAAGAGGTTGGGGAGGGAGGGAGAGAGTATATTTTGAAAGCAGCTGAGGAGTCAC
CTTCGGATGTGAAGGAGATTGTTGAAGCTTTCTCTTCCACTGAGGATCTTAGGGATGTGT
CTCGGACTCAAGATTTCCATGTTGGGATACCTTATGGTCTGCTTCTGTTCGTGGGTGGGT
TTCTTTCCTTTATGATATCGGGGAGTATTCCTGCCATTAGGTTTGGGTTCATTCTTGGTG
GAGCTCTTTTTGCACTGAGTATGGCTAGTCTTAAGGCTCAGAGGATTGGAGAGTCATCTG
CTAAGTTCTTAAAAGGACAGATGGCTATAGTGGCAATCATATTTTTGAGAGAGTTGAAGT
TGGTACTGTTTCAGAGATCTACCTTCATGGGGTTCTTAACCACCCTTACGAGTGGCGGTG
TGTTGGCGTTTTACGGGTACAAGTTGATGAGCAACAAAGAAAAGGGACCAAACAAAGAAC
AAGCTGGAGAAGGAGATGAAACAAGCGAAGGGTTTGTAAGAAGAGAAGGATAGAGAAATG
GTAACATGAGCCTCATACTCTGTTATAGTGATATCCGAACTCTTATCTTCTCTCTTTTTA
AGTTGTGTACAACTTTTGTGATCAATCATCTTCTAAACTTCTGTGTACTTATCTGTATTT
GGATTTTGTGGAGACCTTTTACCACATATCAATAAACAAGAACAAGTTAGGCCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5076Contig1 694 2 3 U
GGACTACTGATCTGATTCTTCCTCCTCCGACAAACCTGTTTCTCCTTCAATAAATCAAAT
GGCTGCAGCTTTGGTTTCCAGATTATCTCGTGGACGCTCATTGCTTGGAGGTCTTAAAAA
TGATTTCTCCGGATCAATGATTACTTCCACTGGAATGATGAATGAGAGTATCCTCTCTCA
GCAGCAGCAACAGCGAAGGACATTCATTCAAATGGGAACGGTTCTGAAAGTGGTGGACAA
CTCAGGAGCCAAGAAAGTGATGTGTATCCAAGCGCTAAAGGGTAAGAAAGGAGCTAGGCT
TGGGGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAAGCGATGCCAAACGGTAAAGTGAAGAAAGG
AGCGGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCTGCGATGCAGAGAGGTCGTGTTGATGGAAG
CGAAGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTTCTCGTTGATAATAAAGGCAAGAAGACTAA
AACCGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTGTTTGGTCCCGTTCCTCATGAGCTCCGTAA
GAAGAAGCATCTCAAGATTCTTGCTTTGGCTCAACACATTGCTTGAGACAACCAACCAAC
ATCAAGCGCTAGAACCAGCTATCTTTTTTTTTATGTTCTTTTGTAAACTCTTATCAATAA
TCTTTTTTTTTTCTTGGTTAAGTCTTCGTTAAGC


BQ
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AF RR4F641TF U 1
AF RR4F641JQ C 182
BS 1 631 RR4F641TF
BS 632 632 RR4F641JQ
BS 633 694 RR4F641TF

RD RR4F641TF 694 0 0
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GGCTGCAGCTTTGGTTTCCAGATTATCTCGTGGACGCTCATTGCTTGGAGGTCTTAAAAA
TGATTTCTCCGGATCAATGATTACTTCCACTGGAATGATGAATGAGAGTATCCTCTCTCA
GCAGCAGCAACAGCGAAGGACATTCATTCAAATGGGAACGGTTCTGAAAGTGGTGGACAA
CTCAGGAGCCAAGAAAGTGATGTGTATCCAAGCGCTAAAGGGTAAGAAAGGAGCTAGGCT
TGGGGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAAGCGATGCCAAACGGTAAAGTGAAGAAAGG
AGCGGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCTGCGATGCAGAGAGGTCGTGTTGATGGAAG
CGAAGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTTCTCGTTGATAATAAAGGCAAGAAGACTAA
AACCGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTGTTTGGTCCCGTTCCTCATGAGCTCCGTAA
GAAGAAGCATCTCAAGATTCTTGCTTTGGCTCAACACATTGCTTGAGACAACCAACCAAC
ATCAAGCGCTAGAACCAGCTATCTTTTTTTT*ATGTTCTTTTGTAAACTCTTATCAATAA
TCTTTTTTTTTTCTTGGTTAAGTCTTCGTTAAGC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4F641JQ 513 0 0
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GGGGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAAGCGATGCCAAACGGTAAAGTGAAGAAAGGA
GCGGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCTGCGATGCAGAGAGGTCGTGTTGATGGAAGC
GAAGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTTCTCGTTGATAATAAAGGCAAGAAGACTAAA
ACCGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTGTTTGGTCCCGTTCCTCATGAGCTCCGTAAG
AAGAAGCATCTCAAGATTCTTGCTTTGGCTCAACACATTGCTTGAGACAACCAACCAACA
TCAAGCGCTAGAACCAGCTATCTTTTTTTTTATGTTCTTTTGTAAACTCTTATCAATAAT
CTTTTTTTTTTCTTGGTTAAGTCTTCGTTAAGC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5078Contig1 1048 2 10 U
GGAAGCTGGAGATCGCCTATTTTGTAAATTTAATAACTTCTTCGTCTGAACTCTTTTTTA
TATGATTCTTCTTCAAGGACCTTTGTAATTAAGCTGGCTATATTCTCCAGGTGGTTTCAT
GCGTTTATTGCTTGTGGTGGAGAAGATATGCTTCAAACAATGAACACATGTCCTGATGCT
TTCCATGATCATATCAGATAAGATTATGAACTGAAAGGATTGATGCAGAAGCAAGCTAAT
CGGATGAGATCTATTGGTAAGGGTCAATGTCTATCGCAAGATCCAGCCATAGAGACTTCT
GAAGTTTGAAGGGAAGATATGATATTTCCCTTCATTTTCAAATTGCAGATGCGTGAAAAC
GATACTGGGGTCGTGTTTAAGGAGGTAACGATTTACAAAATCATACTTGATACAAAGTTT
AAAAGCTCCCAGTTATCATTATTACATATGGTCAATGTTTGGAGAATCTTTGACTATCAA
CTATTGTTTGCCAGTGTAGATTAACAACGACGTGTTTAGAGTTTGTAAAAGATTTCAAGA
AACAGAACAACAAGGCTGGGAGCTTTTACGCCGGTGTTATCTTTATTAACTAATGCATTT
GCAGCTGCAATAATATTATTCACTCCCAGACACCTACCTTCACAGTGTCTGCAATCAGCG
ATGATATTTGTTCCTGAAAACTCACACTGTAACCCCTGTTCACGTGACCAACTTTGTTTC
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GGGTGACGAGACTCCAAACATAATAGAAGTTGATCCCCACCGATGCCACTAAACTTTGGA
GCCGCAGACGCCCACGTGTGTTATCCTAGCAAGTTCAGCAAACCTTTGTTCCCAATTAGA
TTTCCTTCCCTGTTTTACAAGCTCTGGAATAAGCTACAGCTACTACTCTTTTCTTATGTT
TTAAGTTTTTTTTTTTTTAGTTACCTTCAATCAAGCTCCGGTGGGATTGTAGTAATTTGG
CAACATTAATAAAGAGAGCCTTGACGGG


BQ
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AF RR4CL15TF U 1
AF RR4CL15JQ C 259
BS 1 723 RR4CL15TF
BS 724 724 RR4CL15JQ
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RD RR4CL15TF 794 0 0
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TATGATTCTTCTTCAAGGACCTTTGTAATTAAGCTGGCTATATTCTCCAGGTGGTTTCAT
GCGTTTATTGCTTGTGGTGGAGAAGATATGCTTCAAACAATGAACACATGTCCTGATGCT
TTCCATGATCATATCAGATAAGATTATGAACTGAAAGGATTGATGCAGAAGCAAGCTAAT
CGGATGAGATCTATTGGTAAGGGTCAATGTCTATCGCAAGATCCAGCCATAGAGACTTCT
GAAGTTTGAAGGGAAGATATGATATTTCCCTTCATTTTCAAATTGCAGATGCGTGAAAAC
GATACTGGGGTCGTGTTTAAGGAGGTAACGATTTACAAAATCATACTTGATACAAAGTTT
AAAAGCTCCCAGTTATCATTATTACATATGGTCAATGTTTGGAGAATCTTTGACTATCAA
CTATTGTTTGCCAGTGTAGATTAACAACGACGTGTTTAGAGTTTGTAAAAGATTTCAAGA
AACAGAACAACAAGGCTGGGAGCTTTTACGCCGGTGTTATCTTTATTAACTAATGCATTT
GCAGCTGCAATAATATTATTCACTCCCAGACACCTACCTTCACAGTGTCTGCAATCAGCG
ATGATATTTGTTCCTGAAAACTCACACTGTAACCCCTGTTCACGTGACCAACTTTGTTTC
AGG*TGAAG*CAGCAGCAGCAACAATCTAAG**AACACACGCTTCTGGACGCATTCATTC
GG*TGACGAGACTC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4CL15JQ 790 0 0
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ATGATATTTCCCTTCATTTTCAAATTGCAGATGCGTGAAAACGATACTGGGGTCGTGTTT
AAGGAGGTAACGATTTACAAAATCATACTTGATACAAAGTTTAAAAGCTCCCAGTTATCA
TTATTACATATGGTCAATGTTTGGAGAATCTTTGACTATCAACTATTGTTTGCCAGTGTA
GATTAACAACGACGTGTTTAGAGTTTGTAAAAGATTTCAAGAAACAGAACAACAAGGCTG
GGAGCTTTTACGCCGGTGTTATCTTTATTAACTAATGCATTTGCAGCTGCAATAATATTA
TTCACTCCCAGACACCTACCTTCACAGTGTCTGCAATCAGCGATGATATTTGTTCCTGAA
AACTCACACTGTAACCCCTGTTCACGTGACCAACTTTGTTTCAGGGTGAAGGCAGCAGCA
GCAACAATTTAAGGAACCACACGCTTCTGGACGCATTCATTCGGGTGACGAGACTCCAAA
CATAATAGAAGTTGATCCCCACCGATGCCACTAAACTTTGGAGCCGCAGACGCCCACGTG
TGTTATCCTAGCAAGTTCAGCAAACCTTTGTTCCCAATTAGATTTCCTTCCCTGTTTTAC
AAGCTCTGGAATAAGCTACAGCTACTACTCTTTTCTTATGTTTTAAGTTTTTTTTTTTTT
AGTTACCTTCAATCAAGCTCCGGTGGGATTGTAGTAATTTGGCAACATTAATAAAGAGAG
CCTTGACGGG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL5079Contig1 743 2 4 U
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CCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAGAAGAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAG
GGAAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGCGTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGAC
TCTAGGTGGTAGCAGCAGCAACGAAAGCAGCGGAAGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGC
CGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACCGGTTTAGCAGCACCGTCACCAACTCCAAG
TCTTATAATAGATGAAACCCTTCCGACCACATCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGGAC
CAGGCTTGTGGGCAAGTTCAATCTTCATCACACTGTTAACGACATTCGAGGTTTCATCGA
CTCTTCTCGACCTGGAGCGCCGGTTAACTACCAGCTTCAGACGATGGGGTTCCCACCTGC
GCCTTTGACTGATCCCACTCAGACCATTGAGCAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTTCT
TCAGAAGTTCTAGAAGGTTTCTTCTTTTCTTTTTGTATTTCGATATGGATTATGATCAGA
GCTTCATAACTGTTATTGTAATCATAAAAAAAGATGGTTGGCATGTCTGTAAGTTACTTA
TACGCAGCATAAATGATCTCTCTCATGTGGGAAGAAAAGACTTGTGTTATAGGTTTTCTT
AATTTATCGAAAATAATTATTTC


BQ
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AF RR4CO80JQ C 1
AF RR4GX81TF U 384
BS 1 385 RR4CO80JQ
BS 386 500 RR4GX81TF
BS 501 501 RR4CO80JQ
BS 502 743 RR4GX81TF

RD RR4CO80JQ 743 0 0
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CCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAGAAGAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAG
GGAAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGCGTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGAC
TCTAGGTGGTAGCAGCAGCAACGAAAGCAGCGGAAGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGC
CGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACCGGTTTAGCAGCACCGTCACCAACTCCAAG
TCTTATAATAGATGAAACCCTTCCGACCACATCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGGAC
CAGGCTTGTGGGCAAGTTCAATCTTCATCACACTGTTAACGACATTCGAGGTTTCATCGA
CTCTTCTCGACCTGGAGCGCCGGTTAACTACCAGCTTCAGACGATGGGGTTCCCACCTGC
GCCTTTGACTGATCCCACTCAGACCATTGAGCAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTTCT
TCAGAAGTTCTAGAAGGTTTCTTCTTTTCTTTTTGTATTTCGATATGGATTATGATCAGA
GCTTCATAACTGTTATTGTAATCATAAAAAAAGATGGTTGGCATGTCTGTAAGTTACTTA
TACGCAGCATAAATGATCTCTCTC**GTGGGAAGAAAAGACTTGTGTTATAGGTTTTCTT
AATTTATCGAAAATAATTATTTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4GX81TF 360 0 0
GC
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AACTACCAGCTTCAGACGATGGGGTTCCCACCTGCGCCTTTGACTGATCCCACTCGGACC
ATTGAGCAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTTCTTCAGAAGTTCTAGAAGGTTTCTTCT
TTTCTTTTTGTATTTCGATATGGATTATGATCAGAGCTTCATAACTGTTATTGTAATCAT
AAAAAAAGATGGTTGGCATGTCTGTAAGTTACTTATACGCAGCATAAATGATCTCTCTCA
TGTGGGAAGAAAAGACTTGTGTTATAGGTTTTCTTAATTTATCGAAAATAATTATTTC

QA 3 360 3 360
DS 



AS 1 2

CO CL5080Contig1 958 2 2 U
GGAGGAAACTGTTATTGTTGAGTTTTGTCATAATACAAAATCTTTGAGCCTAGATCTCAT
CCCATATAATCAGAGCGATTGGATAAGATCGAATCTCTTGTCGAATTGGAATCTGAGGAT
GGTTGAGGTAGAATCGCATTTGTATTCATCGAGAGCAGGAGGAAGTTTCAGCATTCTCTT
GAGCTTGTTGTAGCACACTTTTGTTTTGAACTCGAAATTTTGTTCTCGGATCCTTAGAAC
CGAAAAAAAATTGTTCTCGGATCTTAGGAGGAGGATGTGTGATTTGATCGCTCGTACGGG
TCGGCTCCAGCAACGCTACGAGAATGGCTGCCGTCTCGTTGCCGGGTGCATTCCATTTAG
ATATAGAAGAAACTCCGAAGAAGTGGGTGATTCTTCTGACTGTGGGAAAGTGGTTGAAGT
GTTGATGATCACTTCTTCTAGTGGACCTGGACTTCTCTTTCCAAGGGGAGGGTGGGAGAA
TGATGAGACAGTTAGGGAGGCTGCAGCTAGAGAAGCTGTCGAAGAAGCTGGAGTTCGCGG
GATTTTACTGGATTTGTTGGGAGAATACGAGTTCAAGAGCAAGACTCACCAAGACGAGTT
TTGCCCTGAAAGATTGTGTAAAGCTGCAATGTACGCTCTTTATGTGAAGGAAGAGCTGGA
CTCATGGCCCGAACAGGAGAGGAGAAGTCGGACGTGGCTCACGATTCCTGAAGCTGTTGA
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TCATTTTTTTTTTGTCAACATAGGATTTTTTGTCATCATTTGTTTCCTGCGTTTCCAAGG
CATTTTACATCACGTGAACAATGTTGGTGAAAGCAATGTGCAACATAAACTTAATTTC


BQ
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AF RR4DJ23TF U 1
AF RR4DJ23JQ C 407
BS 1 645 RR4DJ23TF
BS 646 958 RR4DJ23JQ

RD RR4DJ23TF 645 0 0
GGAGGAAACTGTTATTGTTGAGTTTTGTCATAATACAAAATCTTTGAGCCTAGATCTCAT
CCCATATAATCAGAGCGATTGGATAAGATCGAATCTCTTGTCGAATTGGAATCTGAGGAT
GGTTGAGGTAGAATCGCATTTGTATTCATCGAGAGCAGGAGGAAGTTTCAGCATTCTCTT
GAGCTTGTTGTAGCACACTTTTGTTTTGAACTCGAAATTTTGTTCTCGGATCCTTAGAAC
CGAAAAAAAATTGTTCTCGGATCTTAGGAGGAGGATGTGTGATTTGATCGCTCGTACGGG
TCGGCTCCAGCAACGCTACGAGAATGGCTGCCGTCTCGTTGCCGGGTGCATTCCATTTAG
ATATAGAAGAAACTCCGAAGAAGTGGGTGATTCTTCTGACTGTGGGAAAGTGGTTGAAGT
GTTGATGATCACTTCTTCTAGTGGACCTGGACTTCTCTTTCCAAGGGGAGGGTGGGAGAA
TGATGAGACAGTTAGGGAGGCTGCAGCTAGAGAAGCTGTCGAAGAAGCTGGAGTTCGCGG
GATTTTACTGGATTTGTTGGGAGAATACGAGTTCAAGAGCAAGACTCACCAAGACGAGTT
TTGCCCTGAAAGATTGTGTAAAGCTGCAATGTACGCTCTTTATGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4DJ23JQ 552 0 0
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GGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGTTAGGGAGGCTGCAGCTAGAGAAGCTGTCGAAGAA
GCTGGAGTTCGCGGGATTTTACTGGATTTGTTGGGAGAATACGAGTTCAAGAGCAAGACT
CACCAAGACGAGTTTTGCCCTGAAGGATTGTGTAAAGCTGCAATGTACGCTCTTTATGTG
AAGGAAGAGCTGGACTCATGGCCCGAACAGGAGAGGAGAAGTCGGACGTGGCTCACGATT
CCTGAAGCTGTTGAGAATTGTCGTCATGCATGGATGAAATGTGCCTTGGAGGATGGCTTC
TGTAAATGGCACCAGGACAAAGGACTTCAGCTTATCCAATAAACCCCATACTTCTTTTCT
CGTGCCTCTACCATTCATTTTTTTTTTGTCAACATAGGATTTTTTGTCATCATTTGTTTC
CTGCGTTTCCAAGGCATTTTACATCACGTGAACAATGTTGGTGAAAGCAATGTGCAACAT
AAACTTAATTTC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL5081Contig1 508 2 1 U
GGGATTTAGTAGTCCCGGTTCAGAAAACCGTGTGCAAGCTATTGCCGATTACAAGCGAAT
TGATTATCTATGCAGTCATCTATGTTTTCTCCGCAAGGTCATCACGGAGAAGGGTGTCAA
CGTGAGAGGATACTTTGCATGGTCTCTTGGAGATAATTATGAATTCTGTAAAGGTTTTAC
CGTCAGATTTGGACTCAGTTATGTTAATTGGGACGATATCGACGATAGAAACCTCAAAGA
ATCGGGTAAATGGTACCAGAGATTCATTAACGGGACCGCTAAAAATCATGCGAAACAAGA
TTTCCTCCGCTCAAGCCTTTCATCCCAGAGTCAGAAGAAGAGGCTTGCTGATGCATGAAA
CACTTTCCACCATCAGATCATCTCTGTGTCTCTCACTCTTCCTACTTGCTCCATATATAG
TTAAGGAGCTTCTTCTGTCTACAATGTACTAAATAAATAATCTTAATTAAAAGATGATCA
ATTACTAGTGAATAAAAATAATTTATCT


BQ
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AF RR4GG21JQ C 1
AF RR4GG21TF U 1
BS 1 508 RR4GG21TF

RD RR4GG21JQ 508 0 0
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QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4GG21TF 508 0 0
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CGTGAGAGGATACTTTGCATGGTCTCTTGGAGATAATTATGAATTCTGTAAAGGTTTTAC
CGTCAGATTTGGACTCAGTTATGTTAATTGGGACGATATCGACGATAGAAACCTCAAAGA
ATCGGGTAAATGGTACCAGAGATTCATTAACGGGACCGCTAAAAATCATGCGAAACAAGA
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CACTTTCCACCATCAGATCATCTCTGTGTCTCTCACTCTTCCTACTTGCTCCATATATAG
TTAAGGAGCTTCTTCTGTCTACAATGTACTAAATAAATAATCTTAATTAAAAGATGATCA
ATTACTAGTGAATAAAAATAATTTATCT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4EJ67JQ C 1
AF RR4EJ67TF U 1
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QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4EJ67TF 512 0 0
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TCTCTTCTTTTATGAAGAAGAAAAAGCTGTTGTTTTACTTTGTTTGAGTCTTTGTCATTA
AGACAATCATATCGGGTTTGGTCTCTTTATATTGGTTTTTGAAGGTGGTGATATAACTTT
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QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL5083Contig1 746 2 2 U
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TTAGAAAGACGGTTTTCGGTTTGGTT


BQ
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AF RR4AG29JQ C 1
AF RR4AG29TF U 1
BS 1 722 RR4AG29TF
BS 723 746 RR4AG29JQ

RD RR4AG29JQ 746 0 0
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AGTGCGTTCACTGCGGTTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAGTCTCTCGTACTGTTTT
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CCCTGACTAATTTCCCTTTGAAGAACTTCTAATTGTCAAGTCTTTGTGTTGCTGTTGAGA
TTAGAAAGACGGTTTTCGGTTTGGTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AG29TF 722 0 0
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CTGAGATGGATACACATGATGGCAAGAGAAAGTGTGAAGCTTTATGGCCAATCTTCAAAC
TCTCTCATCAGAGGAGTCGCTATGTCTATGACCTTTATTACCGCAGGAAGGAGATATCTA
AAGAGCTCTACGAGTTCTGCTTGGACCAGGGATATGCTGATCGTAACCTCATTGCCAAAT
GGAAGAAATCGGGGTATGAGCGTCTATGTTGCTTGCGGTGCATACAGCCGAGAGACCACA
ACTACGGAACAACATGTGTATGTCGTGTTCCCAAACACTTGCGTGAAGAGAAAGCGATTG
AGTGCGTTCACTGCGGTTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAGTCTCTCGTACTGTTTT
CTTCACCACTGTCACTCTCTTGGATGTATTTCTATATATTTGTCAAATCTGGATCATGTA
CCCTGACTAATTTCCCTTTGAAGAACTTCTAATTGTCAAGTCTTTGTGTTGCTGTTGAGA
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL5084Contig1 512 2 2 U
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TATGAGACCTTAACCATCTATAAAGATGGATGATGTATTCTGGCCACCCTTATAATAAGG
GTTCCTAAAATTTAAACATACATTTTGATTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4EV52TF U 1
AF RR4FH28TF U 1
BS 1 508 RR4EV52TF
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RD RR4EV52TF 508 0 0
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GTTCCTAAAATTTAAACATACATTTTGA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4FH28TF 512 0 0
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GACACAACACGGAAGACGCTCTGAATCAAACACACCTCACCCTAGCTGTCCAACTACACC
AACCATGGCTCATCTCCTATCCATCTTCTTCACAATTTCAACCACAGAAGCGTTGAAAGT
TATCCTAATCCTCCTTCTCCCAATCATCATGACCACTATCAGTTTTATGATCCTGAGTCT
CAACACAAAGCAGCTGAATCTTCCACACATCATTCTACTGCACATGAAAGTGCATCCGTG
AAACTTCCTCCTAAACGACCAGCAAACGCTTAAAGAGACGGAGATTCTTGATTTACATAT
TTTCATGTCGTGCAATTGATATATTGCCATAAGCACTTTTACACTACTACATGTATCATG
TATGAGACCTTAACCATCTATAAAGATGGATGATGTATTCTGGCCACCCTTATAATAAGG
GTTCCTAAAATTTAAACATACATTTTGATTCC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

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GCTTTGCAGTACTCTTTGACTTTCTTCTCATAGGCTGCACGGTCTCCCATCAAGAAAGAG
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TCATATAGACTGTTAGTGGGGCCATGGAAAGTAACATAGAACATCTGCAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR15JQ U 17
AF RR4BR15TF C 1
BS 1 20 RR4BR15TF
BS 21 553 RR4BR15JQ
BS 554 714 RR4BR15TF

RD RR4BR15JQ 537 0 0
AAAA
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TCCTAAAGAATTAAATAGTGTTTACAAATTTACAGAGGAGTGATTTTTTTTTCTCCTCTA
TATGGAATGAACATCAATGGGTTTATATATATGGAAATGAAGTGCAAAAAAAGGTTGATT
TGTAACACACACAAGTCATCATCAAGGATCTGCTTTTCCAGCGATTTCATCGTTGTCATC
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TAAATCCTCAGGTGCTCCTATGTCCTCTGGTTTAGCATATGCTTTGCAGTACTCTTTGAC
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ATCAAATGGGTTTGGATATAAAAGCAGTTGAGGAAAAAATGACTCGAAAACATTGATAAA
ATCAAACATTGGGCTCCATGTCTGGTTTATTACATCTAAGCAAACAGCACCCG

QA 5 537 5 537
DS 

RD RR4BR15TF 714 0 0
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AGTGCAAAGAAAGGTTGATTTGTAACACACACAAGTCATCATCAAGGATCTGCTTTTCCA
GCGATTTCATCGTTGTCATCCGAGTCTGAACCACGTTCGCTCATGCTATCATCATCATCG
TCGTCATCCTCATCATCACTTAAATCCTCAGGTGCTCCTATGTCCTCTGGTTTAGCATAT
GCTTTGCAGTACTCTTTGACTTTCTTCTCATAGGCTGCACGGTCTCGCATCAAGAGAGAG
GCAGCTTCTCCATTGAATGGATCAGATGGGTTTGGATATAGAAGCAGTTGAGGAAGAAAT
GACTCGAAGACATTGATAAGATCAAACATTGGGCTCCATGTCTGGTTTATTACATCTAAG
CAAACAGCACCCGAAGATTCATCAACATTGGGGTGATAAATCTTGTTAACGAAACCAACA
GAAGGAGATTTGTAAGGATAAGCTTCAGGAAGTTCGACTTTGATCTTCCATACACCTCCC
TCATATAGACTGTTAGTGGGGCCATGGAAAGTAACATAGAACATCTGCAAATCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL5086Contig1 669 2 1 U
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CGCAGGAGTATTCGAGCAACACTGACCATGGTTACATCTTGCTCTATGAGAGCCTTGGAC
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TAGTAATGATGGTATATGTTTGTGACTTAAAAGGTCAATTCCATTGACAGTTACTCTTTT
TTGTTGACTTTCTCTATGTCTCTCTCCCAGAGAGTGAGTTTTTAAATTGGAAATGTTTTA
TTTAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FZ72TF U 1
AF RR4FZ72JQ C 160
BS 1 669 RR4FZ72TF

RD RR4FZ72TF 669 0 0
GCAGTTCCATTACTAGCTGTTTGAAAAACTTCAGCTCCACTGAGACGCTTCACGCCGAAG
ACAAGTTTTTCTGTGACAAATGCTGCAGCTTACAAGAAGCACAAAAGAGGATGAAGATCA
AGAAGCCACCACACATCTTAGTCATCCATCTAAAACGGTTCAAGTACATGGAACAGCTAG
GCCGCTACAAGAAGCTCTCTTACAGAGTTGTCTTCCCTTTGGAACTGAAACTGAGCAACA
CCGTGGAGCCATACACAGACGTTGAGTATTCACTCTTTGCAGTGGTGGTTCATGTAGGAA
GTGGACCGAACCATGGTCATTACGTAAGCCTAGTGAAAAGCCATAACCATTGGCTCTTCT
TTGATGATGAGAACGTGGAGATGATTGAAGAATCGGCTGTGCAAACATTCTTTGGATCGT
CGCAGGAGTATTCGAGCAACACTGACCATGGTTACATCTTGCTCTATGAGAGCCTTGGAC
CAACCAAGTAAAAGCTGTATCACAGAAAAAGGACTTGCTTCGCTTTCTTCTTTAACTTAT
TAGTAATGATGGTATATGTTTGTGACTTAAAAGGTCAATTCCATTGACAGTTACTCTTTT
TTGTTGACTTTCTCTATGTCTCTCTCCCAGAGAGTGAGTTTTTAAATTGGAAATGTTTTA
TTTAAACTC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4FZ72JQ 510 0 0
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TGGAACTGAAACTGAGCAACACCGTGGAGCCATACACAGACGTTGAGTATTCACTCTTTG
CAGTGGTGGTTCATGTAGGAAGTGGACCGAACCATGGTCATTACGTAAGCCTAGTGAAAA
GCCATAACCATTGGCTCTTCTTTGATGATGAGAACGTGGAGATGATTGAAGAATCGGCTG
TGCAAACATTCTTTGGATCGTCGCAGGAGTATTCGAGCAACACTGACCATGGTTACATCT
TGCTCTATGAGAGCCTTGGACCAACCAAGTAAAAGCTGTATCACAGAAAAAGGACTTGCT
TCGCTTTCTTCTTTAACTTATTAGTAATGATGGTATATGTTTGTGACTTAAAAGGTCAAT
TCCATTGACAGTTACTCTTTTTTGTTGACTTTCTCTATGTCTCTCTCCCAGAGAGTGAGT
TTTTAAATTGGAAATGTTTTATTTAAACTC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL5087Contig1 1095 2 2 U
GGGACGAAGAAGAAACCATGGCGGGAATCAATACGCAGAAGCAGCTTCTCTCTCTGATCC
GCGACTTCACCTCTGAAAGATCTCGTGGAGAGCAAAGAGTGGCTGGATTGAAGAAGCGGA
TCGAGTCTCTACAATCGGAAGTTGAAGCAGCGAACGAAGAAGTTGAACATGCGAAACGTA
TCAAAGAAGTGGCGGAAGAGGAGCTCAACGGCTACGAAGTTGAATCGTCTTTGAACGATG
CTACGATTCAATCTCTAGAGGCAAGGATTGCTCTTCTTCAGGATGAAGTTTCAACTGTTG
GCAATGAAGTGGATGCTCTCAAGAACAAGGAAGGATTACTTAGAGATCAATTTATAAGCC
AAATGGTTGAGCTGAACAAGGAAATAAGGGTGTTCCAGAGAACTGTAGCCTCCAGTGTGG
GCAATGATGATAGTACTAGCATAACTGCAAAGATGTCAAAGTTTTTGAGGATGGTCATGG
AGCTGATCCACAAGCTATCAAGGATATGCTATCTGATGTAAATTCTCAATTAGCACAAGA
GGAGGAAGGATACCTAGAAGAGCTGAACATAAAAGAAAAGCTGCAGAAAGAGCTTGATGA
ATATGAGAAGAAGATGTCACTCATGGAGGCTATAACAGAGAAAACAAATTCAGTGCAAAA
TCTCGCTAGGCAGAGTTCTGAGCTGGAACAGACATTGGCTTCACTGGGTGAGGAGCTGCA
GAAGAGGTGCCGATGCCAACATTGCCAGGCAGAAAATTTGGAAGTCTTGAGCTTACTTCT
CCAAGGAGACCAAGATATGGCGGTGTCTTAGTTAAAAACAAGCTTACCTATGAGTTGCTC
GAGGGAAGGTTGATTTACTCCGGTTCCAAAATAGTAAGACGTCCACTTTCACCTCTGAGG
ATATAAGTAACCAATTACTATAGAAATTTTACTAAATGCGTAATGATGAAGCAAACACTA
GTCCGTGTCTTCAACACTTATTACGTTTTTCTGTTTTAATCTCTTAAAATCTTTGATACC
GAGTCATGCTTTCCCTGCTCTTACAAGAAAAACAAACTAAGTACGCATCTTGATGGTTTC
CCTGCTCTTCATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G775TF U 1
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BS 710 1095 RR4G775JQ

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QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4G775JQ 793 0 0
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ATGAGAAGAAGATGTCACTCATGGAGGCTATAACAGAGAAAACAAATTCAGTGCAAAATC
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AGAGGTGCCGATGCCAACATTGCCAGGCAGAAAATTTGGAAGTCTTGAGCTTACTTCTCC
AAGGAGACCAAGATATGGCGGTGTCTTAGTTAAAAACAAGCTTACCTATGAGTTGCTCGA
GGGAAGGTTGATTTACTCCGGTTCCAAAATAGTAAGACGTCCACTTTCACCTCTGAGGAT
ATAAGTAACCAATTACTATAGAAATTTTACTAAATGCGTAATGATGAAGCAAACACTAGT
CCGTGTCTTCAACACTTATTACGTTTTTCTGTTTTAATCTCTTAAAATCTTTGATACCGA
GTCATGCTTTCCCTGCTCTTACAAGAAAAACAAACTAAGTACGCATCTTGATGGTTTCCC
TGCTCTTCATCTT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4EN53JQ C 1
AF RR4EN53TF U 1
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TTTAAACTATTCTACCGATGCATGCGCTCTAAGCCAGGAGAGGAACCAACAGAGCCATTT
ACATACCTTGACCTGGAACCTCCGAAAAGAGATGTAAAACTTGAGGAAAAGTGAAGTCCA
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TGATACTTGGAGTTCCATTTCTGTTTATGTTCTGATAGTTATGTTCACCTGCAAGCCTCA
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QA 1 513 1 513
DS 

RD RR4EN53TF 513 0 0
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GTCGAGGACGTCGTCCAGGCGTTTTTCGAGGGAAACCCATTTAAGACGGTCCCAGGACCT
TTTAAACTATTCTACCGATGCATGCGCTCTAAGCCAGGAGAGGAACCAACAGAGCCATTT
ACATACCTTGACCTGGAACCTCCGAAAAGAGATGTAAAACTTGAGGAAAAGTGAAGTCCA
ACTCCTTTTGTTTTCCTTGGAAATTTTTAACTGAGAGCATGTAAGCGCCAAGACTGTGGT
TTTAAGTTTCTCTTCAACATGTAATAGCAACATCGTATTTCATCATGGTGCCAATAAAAT
TGATACTTGGAGTTCCATTTCTGTTTATGTTCTGATAGTTATGTTCACCTGCAAGCCTCA
ATCTGAATCAGAATAAGATTTACAGTTTATCTC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL5090Contig1 811 2 4 U
GACCTGCACCGCAGCTTCCAGGTGCTAACAAACCGGTTGTAGTGGTTCGTTTTTGCCCTG
TTGCATTCAAACTCCGTGGTTCAAGTTCTGAAGAAGGTGGTTTCTTCAAGCTTCCTTACC
GTATCGTATTTGCCATTGCAACATTAAATTCGGTGTACATATATGACACGGAGTGTGTCG
CTCCTATTGCAGTCCTCGCAGGTCTCCACTACGCTGCAATAACTGATGTAACATGGTCAC
CAACTGCGTCTTATCTAGCACTGTCCTCACAAGATGGTTATTGCACACTTGTTGAATTTG
AAGATAACGAACTAGGAGAGCCTGTCTCCATCTCAGCAGTCGGAAAGAAATCAGCGGATA
GCGAAGAGAGAAAGCATGTTTTAGAGAAAACCGATGAGCTGATGACCGAAGCAATACCAG
ACGAGACAAGTAAACAGGCTGAATCAGAACAAGACCAAGAGAAACGAAAGCCATTGCCGA
GCAAAATTACCATGGAGGAGGGTGAGGAGAAAAAGCAGGTTATGCATAGAACTGATGAAG
TAATGGCGGAAACAAGATCAGAGGGAGAGAAACAGCCACTGCAGAGCAAAGTTAACACAC
CTGTCTCAAGTAAACCGGCAAGGAAACGCATCACACCCATGGCTATTGACCCCTAACTGC
TGATTACGCTACTCTTTGTTTCCATATTTGTTTACTATTTATCTTTCTTATCATAGGCTA
CCATAATGAATCAATCAAGGAGTGTTGTGTGGGGCTCTTTGCCTCTTAAAACAAGCCAAG
CTCACAGTTTCAAAAGTTGATTGGCTCGCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F141TF U 1
AF RR4F141JQ C 101
BS 1 518 RR4F141TF
BS 519 519 RR4F141JQ
BS 520 618 RR4F141TF
BS 619 811 RR4F141JQ

RD RR4F141TF 618 0 0
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CTGTCTCAAGTAAACCGG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4F141JQ 711 0 0
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ATATGACACGGAGTGTGTCGCTCCTATTGCAGTCCTCGCAGGTCTCCACTACGCTGCAAT
AACTGATGTAACATGGTCACCAACTGCGTCTTATCTAGCACTGTCCTCACAAGATGGTTA
TTGCACACTTGTTGAATTTGAAGATAACGAACTAGGAGAGCCTGTCTCCATCTCAGCAGT
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GATGACCGAAGCAATACCAGACGAGACAAGTAAACAGGCTGAATCAGAACAAGACCAAGA
GAAACGAAAGCCATTGCCGAGCAAAATTACCATGGAGGAGGGTGAGGAGAAAAAGCAGGT
TATGCATAGAACTGATGAAGTAATGGCGGAAACAAGATCAGAGGGAGAGAAACAGCCACT
GCAGAGCAAAGTTAACACACCTGTCTCAAGTAAACCGGCAAGGAAACGCATCACACCCAT
GGCTATTGACCCCTAACTGCTGATTACGCTACTCTTTGTTTCCATATTTGTTTACTATTT
ATCTTTCTTATCATAGGCTACCATAATGAATCAATCAAGGAGTGTTGTGTGGGGCTCTTT
GCCTCTTAAAACAAGCCAAGCTCACAGTTTCAAAAGTTGATTGGCTCGCCT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

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GGCATGCAACTAAGGGAGAGATGTATCTATCGTTCTTCTATTTTGCCTTATTTGTTCGAT
TTTATTTGAATTTGAAGTGAAGGGTTCTTAAATAAGAGATCCGCTAGATGGCAAGTCATC
TAGATTGATGAATGTTGTTGATTTTCGGCTTGCAACTCCAAGAAAGTCACTTCCCCT


BQ
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AF RR4G393JQ C 1
AF RR4G393TF U 1
BS 1 477 RR4G393TF

RD RR4G393JQ 477 0 0
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TTTCGCGGCGGACAGCGATAACTTGGCGCCGAAGGTAACGCTTCACATGACGTCGCTCGA
TCTGAAGCTGCCCGTGGAGAACACGCTCATCCACAGCAGCGCGGGAACGCTGGCGTGTCT
GTCGATGGCGGGGATACCGCTGAACGCGAACGCTGCTTTGAACGTGATCGCGAATCTCCA
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GGCATGCAACTAAGGGAGAGATGTATCTATCGTTCTTCTATTTTGCCTTATTTGTTCGAT
TTTATTTGAATTTGAAGTGAAGGGTTCTTAAATAAGAGATCCGCTAGATGGCAAGTCATC
TAGATTGATGAATGTTGTTGATTTTCGGCTTGCAACTCCAAGAAAGTCACTTCCCCT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR4G393TF 477 0 0
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TTTCGCGGCGGACAGCGATAACTTGGCGCCGAAGGTAACGCTTCACATGACGTCGCTCGA
TCTGAAGCTGCCCGTGGAGAACACGCTCATCCACAGCAGCGCGGGAACGCTGGCGTGTCT
GTCGATGGCGGGGATACCGCTGAACGCGAACGCTGCTTTGAACGTGATCGCGAATCTCCA
GCAGCAGAATCTGAGGATCTTGTTTGATGTTCCTAATTCCCGCCTAGGCATTGCTACTGA
GGCATGCAACTAAGGGAGAGATGTATCTATCGTTCTTCTATTTTGCCTTATTTGTTCGAT
TTTATTTGAATTTGAAGTGAAGGGTTCTTAAATAAGAGATCCGCTAGATGGCAAGTCATC
TAGATTGATGAATGTTGTTGATTTTCGGCTTGCAACTCCAAGAAAGTCACTTCCCCT

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL5092Contig1 544 2 2 U
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AGGAAGCACCTAGTCAACGGCGTTCGTTCATGGGCTTTCCCACGCGCCGTCGCATCTGAT
CTCTCTGCCTCTAGGAATGGTCACACGTCGGCGTATGATAAAAACGTAGAAGAAGAATTG
CAATCGAGTAAAGTGCCTGATGAATTGATAAAGCCTGATGACTCTGACAAATATTGGTCT
CCTCATCCTCGAACCGGTGTCTTTGGACCTTCGACCTCATCTTCCACCACCGACATAACC
GAGGAGAATCGCAGCAGTCAAGATGACTCAGTAATGGAGGAGAAAGCTTGGTTCCGTCCA
ACAAGTCTCGAGGATTTGGACAAGACTCAGCATTCGTAGGAAGCAAACTCTTTCCTTGAT
GTTATTTGTGTGTTTGATAATGTTGTAATAAAATTCGAAGTCACACTATTACGTTATGTT
ACAATAACGAACTAAACTGTCGGTGTTATGATATTTATGAACGTGATTGTAACGCTTGTT
TTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RR4CV06JQ C 1
AF RR4CV06TF U 32
BS 1 31 RR4CV06JQ
BS 32 544 RR4CV06TF

RD RR4CV06JQ 544 0 0
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AGGAAGCACCTAGTCAACGGCGTTCGTTCATGGGCTTTCCCACGCGCCGTCGCATCTGAT
CTCTCTGCCTCTAGGAATGGTCACACGTCGGCGTATGATAAAAACGTAGAAGAAGAATTG
CAATCGAGTAAAGTGCCTGATGAATTGATAAAGCCTGATGACTCTGACAAATATTGGTCT
CCTCATCCTCGAACCGGTGTCTTTGGACCTTCGACCTCATCTTCCACCACCGACATAACC
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ACAAGTCTCGAGGATTTGGACAAGACTCAGCATTCGTAGGAAGCAAACTCTTTCCTTGAT
GTTATTTGTGTGTTTGATAATGTTGTAATAAAATTCGAAGTCACACTATTACGTTATGTT
ACAATAACGAACTAAACTGTCGGTGTTATGATATTTATGAACGTGATTGTAACGCTTGTT
TTGC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4CV06TF 513 0 0
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GGGCTTTCCCACGCGCCGTCGCATCTGATCTCTCTGCCTCTAGGAATGGTCACACGTCGG
CGTATGATAAAAACGTAGAAGAAGAATTGCAATCGAGTAAAGTGCCTGATGAATTGATAA
AGCCTGATGACTCTGACAAATATTGGTCTCCTCATCCTCGAACCGGTGTCTTTGGACCTT
CGACCTCATCTTCCACCACCGACATAACCGAGGAGAATCGCAGCAGTCAAGATGACTCAG
TAATGGAGGAGAAAGCTTGGTTCCGTCCAACAAGTCTCGAGGATTTGGACAAGACTCAGC
ATTCGTAGGAAGCAAACTCTTTCCTTGATGTTATTTGTGTGTTTGATAATGTTGTAATAA
AATTCGAAGTCACACTATTACGTTATGTTACAATAACGAACTAAACTGTCGGTGTTATGA
TATTTATGAACGTGATTGTAACGCTTGTTTTGC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL5093Contig1 848 2 4 U
GTGAAGAAGTGGATCCATTACCTTCTCTTTTCAAAGTGATCATCAGAAGGTTGATTTCAT
GGCATGTCCTGCCTCCTACTTGTGTGCCTGATAGCTGCATTGTCAACATCTACGATGAAG
GTGACTGTATACCTCCTCACATCGACAACCACGACTTTCTCCGTCCCTTCTGCACCATCT
CTTTCCTCAGTGAATGCAACATTCTCTTTGGCTCGAACCTTAAAATAGAAGGTCCTGGTG
CATTCTCCGGTTCATTCTCAGTACCGCTTCCTGTAGGATCAGTTCTGGTGTTAAATGGAA
ATGGAGCGGATGTAGCTAGACACTGTGTACCTGCAGTTCCCACAAAAAGGTTGCATCCAT
TTATATTACACTTAGTAACCACCACTAAAGCTTCTCATTTGAGTGTTTCTTTTTGGCTAC
AGGATATCAATCACGTTTAGGAAAATGGATGAGTCGAAACACCCGGTTTGGTTCACTCCA
GAACCTGATTTGCAAGGGATCGAGCCACTGCCGTTGGACCTGAACCGGTCTGATTCTGCT
GCAAGGTCCTCAGGATCAAGCAACAGCCACAACGGTAGTAACAGAAGAGGAGGGTATGGA
CGTAGAGGAGGTGGAGGAGGAAACAATTACGAGACGAGAGGTTACTATAATGCTGAGAGA
AGCAGTGAACAGTATGACTCTAGAGAATGGTCATCAGGCCAGAGAAGAGGTAGGCCACGA
CCTAGTGGAACCTCCTAAGGTTATATTATTATATACTTCCATTTCCGAAGATGAAATTTA
TTCTACATTACTAACGAATATGTACAACATATGTCCTAATTTTAAGTCCCATTCAAACAT
TTTTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB90TF U 1
AF RR4CB90JQ C 172
BS 1 610 RR4CB90TF
BS 611 611 RR4CB90JQ
BS 612 693 RR4CB90TF
BS 694 848 RR4CB90JQ

RD RR4CB90TF 693 0 0
GTGAAGAAGTGGATCCATTACCTTCTCTTTTCAAAGTGATCATCAGAAGGTTGATTTCAT
GGCATGTCCTGCCTCCTACTTGTGTGCCTGATAGCTGCATTGTCAACATCTACGATGAAG
GTGACTGTATACCTCCTCACATCGACAACCACGACTTTCTCCGTCCCTTCTGCACCATCT
CTTTCCTCAGTGAATGCAACATTCTCTTTGGCTCGAACCTTAAAATAGAAGGTCCTGGTG
CATTCTCCGGTTCATTCTCAGTACCGCTTCCTGTAGGATCAGTTCTGGTGTTAAATGGAA
ATGGAGCGGATGTAGCTAGACACTGTGTACCTGCAGTTCCCACAAAAAGGTTGCATCCAT
TTATATTACACTTAGTAACCACCACTAAAGCTTCTCATTTGAGTGTTTCTTTTTGGCTAC
AGGATATCAATCACGTTTAGGAAAATGGATGAGTCGAAACACCCGGTTTGGTTCACTCCA
GAACCTGATTTGCAAGGGATCGAGCCACTGCCGTTGGACCTGAACCGGTCTGATTCTGCT
GCAAGGTCCTCAGGATCAAGCAACAGCCACAACGGTAGTAACAGAAGAGGAGGGTATGGA
CGTAGAGGAG*TGGAGGAGGAAACAATTACGAGACGAGAGGTTACTATAATGCTGAGAGA
AGCAGTGAACAGTATGACTCTAGAGAATGGTCA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4CB90JQ 677 0 0
GCACCATCTCTTTCCTCAGTGAATGCAACATTCTCTTTGGCTCGAACCTTAAAATAGAAG
GTCCTGGTGCATTCTCCGGTTCATTCTCAGTACCGCTTCCTGTAGGATCAGTTCTGGTGT
TAAATGGAAATGGAGCGGATGTAGCTAGACACTGTGTACCTGCAGTTCCCACAAAAAGGT
TGCATCCATTTATATTACACTTAGTAACCACCACTAAAGCTTCTCATTTGAGTGTTTCTT
TTTGGCTACAGGATATCAATCACGTTTAGGAAAATGGATGAGTCGAAACACCCGGTTTGG
TTCACTCCAGAACCTGATTTGCAAGGGATCGAGCCACTGCCGTTGGACCTGAACCGGTCT
GATTTTGCTGCAAGGTCCTCAGGATCAAGCAACAGCCACAACGGTAGTAACAGAAGAGGA
GGGTATGGACGTAGAGGAGGTGGAGGAGGAAACAATTACGAGACGAGAGGTTACTATAAT
GCTGAGAGAAGCAGTGAACAGTATGACTCTAGAGAATGGTCATCAGGCCAGAGAAGAGGT
AGGCCACGACCTAGTGGAACCTCCTAAGGTTATATTATTATATACTTCCATTTCCGAAGA
TGAAATTTATTCTACATTACTAACGAATATGTACAACATATGTCCTAATTTTAAGTCCCA
TTCAAACATTTTTCCGC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL5094Contig1 802 2 5 U
GGATTGAAACCCAATATCAGAGTAAAATAAAACAAACAGAGAAAATGTGTGGCGACTATT
TCTGGGGTTTCCATCCCACTTCCAACCTTCAATCCACCAGCCAGCAAGAAGTGGCGTTGA
AAGAGGAGGCAGTGGAGAAAAAGAAGAGAGAGCCACCGACGGAGAAAAGGAGGAGGAAGA
ACGTTTACAGAGGGATACACAAGCGTCCATGGGGAAAATGGGCGTCAGAGATACGAGATC
CACGAAAAGGCACCAGAGTCTGGCTCGGAACATTCAACACTGCGGAGGAAGCCGCCATGG
CTTATGATGTGGCGGCTAAGCGTATCCGAGGCGACAAAGCCAAGCTCAACTTCCCGGATC
TCCTTCATACTTCTCCACTATCAGAAGATCTGCCTCCGGCGAAGAAGCTCTGTGTATACT
CTCAGAGCGAGTTGACTCACCCGAGTTCGCCGGTTGAGTGCTTTGGGTTCGGGAACGGTG
ACGAGTTTCGGAACCCGAGTTACGGGTTTGAGTCTGGTTACGATCTTAAGCAGCAGATAT
CGAGCTTGGAGTCTTTCCTTGAGCTGGACGGTACCACGGCGGAGCAGCCGAGTTAGCTCG
ACGAGTCTGTGGATATGTGGATGATTGATGATATTATCTCATCGTATGCATAAGTAAAGT
TAAAGTAAAATAAATGAAAATTAAATGAAGTCTGTAATGAATATGTAACCGCCCTTACTT
TTTAAGGCTTTACCGTTACATAGAACTGATGATGATGATTATGTGTTGTGGTTTGGTAAT
GTGTAGAAATAAGGTTTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EY57TF U 587
AF RR4EY57JQ C 1
BS 1 586 RR4EY57JQ
BS 587 603 RR4EY57TF
BS 604 604 RR4EY57JQ
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BS 714 802 RR4EY57JQ

RD RR4EY57TF 127 0 0
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TGCATAAGTAAAGTTAAAGTAAAATAAATGAAAATTAAATGAAGTCTGTAATGAATATGT
AACCGCC

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR4EY57JQ 802 0 0
GGATTGAAACCCAATATCAGAGTAAAATAAAACAAACAGAGAAAATGTGTGGCGACTATT
TCTGGGGTTTCCATCCCACTTCCAACCTTCAATCCACCAGCCAGCAAGAAGTGGCGTTGA
AAGAGGAGGCAGTGGAGAAAAAGAAGAGAGAGCCACCGACGGAGAAAAGGAGGAGGAAGA
ACGTTTACAGAGGGATACACAAGCGTCCATGGGGAAAATGGGCGTCAGAGATACGAGATC
CACGAAAAGGCACCAGAGTCTGGCTCGGAACATTCAACACTGCGGAGGAAGCCGCCATGG
CTTATGATGTGGCGGCTAAGCGTATCCGAGGCGACAAAGCCAAGCTCAACTTCCCGGATC
TCCTTCATACTTCTCCACTATCAGAAGATCTGCCTCCGGCGAAGAAGCTCTGTGTATACT
CTCAGAGCGAGTTGACTCACCCGAGTTCGCCGGTTGAGTGCTTTGGGTTCGGGAACGGTG
ACGAGTTTCGGAACCCGAGTTACGGGTTTGAGTCTGGTTACGATCTTAAGCAGCAGATAT
CGAGCTTGGAGTCTTTCCTTGAGCTGGACGGTACCACGGCGGAGCAGCCGAGTTAGCTCG
ACGAGTCTGTGGATATGTGGATGATTGATGATATTATCTCATCGTATGCATAAGTAAAGT
TAAAGTAAAATAAATGAAAATTAAATGAAGTCTGTAATGAATATGTAACCGCCCTTACTT
TTTAAGGCTTTACCGTTACATAGAACTGATGATGATGATTATGTGTTGTGGTTTGGTAAT
GTGTAGAAATAAGGTTTGTTGT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL5095Contig1 1013 2 8 U
CCTGAAACGCTTAAAAATTTTACTCAGAATAAAAGGCAGGATAAGAAGTCTTCATATGCA
GAGCCTAGCCAATCCCTCTCTAATCGAAGAAACAAGGATGTTGCTGAACCTTGGGATTCC
AAATTAAACCTTTGGAAACCTTTAAATTTTCTTGTGGATGTGGCAAACGGAACAAAATCT
GAGCATGGAAATGCATCTCACACTGATTTTCAGGGGAATAAAACCAAAACGAAGGATTAT
AAACGAAAATGCAAACTTGAGGAAGAGATCAGCAATAATGGCGATCCTACAACATCAGAA
ACGGCTACGCTTAAAAGAACGCGCAGGACTCGCCGTAAAAGGTCATCCACTTTTGGTGAT
TCACGAATTCCACCACTACCAGATACTGAAAGCCTGAAACAGGAGAGGAGAAAGGGTCCG
GTTTGGTTCTCACTTGTAGCTTCAAATAATCGGAAGGAGAAACATCATTGCCTCAGATTC
CGGCAAACTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCGCTTATCCAAAAGTACC
TCATGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGAAAACTGAGATAGAGATAAGATGTATGGGAGAAGC
AGTGATCCCAACGTTGGAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGGAAACAACTTCTAA
GCATGAAAGAGTGGCTGCAACCATAGGTTCATCCGCAAAGGAATTTGTAATGGTGCTAGC
TTATGCTCGGAAGGTCCCTGAATGCAACAACAACTAAAAGAAGTGTTCAATAATGAAGTG
AAGTGTAGGAGCAGTAGCAGTGGAATGTATTGTGTAGTTTGTAATGATACATATATATTT
TCTTATAAATCTGAAAATGAATGATCGGTGAGAATATTCAAGATTTGCTTTTTTAAAAAG
AAAAAGGTGAGTGTATGTCTTTTTAGACATTTGAATGTATGATCAGATAGAGGATAATGT
TGTCATTTCTATGAAATTTGGTTCCTTTGTTTGGACTAAAGGAGATGTACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CX49TF U 1
AF RR4CX49JQ C 192
BS 1 649 RR4CX49TF
BS 650 650 RR4CX49JQ
BS 651 686 RR4CX49TF
BS 687 687 RR4CX49JQ
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BS 704 728 RR4CX49TF
BS 729 1013 RR4CX49JQ

RD RR4CX49TF 728 0 0
CCTGAAACGCTTAAAAATTTTACTCAGAATAAAAGGCAGGATAAGAAGTCTTCATATGCA
GAGCCTAGCCAATCCCTCTCTAATCGAAGAAACAAGGATGTTGCTGAACCTTGGGATTCC
AAATTAAACCTTTGGAAACCTTTAAATTTTCTTGTGGATGTGGCAAACGGAACAAAATCT
GAGCATGGAAATGCATCTCACACTGATTTTCAGGGGAATAAAACCAAAACGAAGGATTAT
AAACGAAAATGCAAACTTGAGGAAGAGATCAGCAATAATGGCGATCCTACAACATCAGAA
ACGGCTACGCTTAAAAGAACGCGCAGGACTCGCCGTAAAAGGTCATCCACTTTTGGTGAT
TCACGAATTCCACCACTACCAGATACTGAAAGCCTGAAACAGGAGAGGAGAAAGGGTCCG
GTTTGGTTCTCACTTGTAGCTTCAAATAATCGGAAGGAGAAACATCATTGCCTCAGATTC
CGGCAAACTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCGCTTATCCAAAAGTACC
TCATGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGAAAACTGAGATAGAGATAAGATGTATGGGAGAAGC
AGTGATCCCAACGTTGGAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGGAA*CAACTTCTAA
GCATGAAAGAGTGGCTGCAACCATAG*TTCATCCGCAAAGGA*TTTGTAATGGTGCTAGC
TTATGCTC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CX49JQ 822 0 0
TGCATCTCACACTGATTT*CAGGG*AATAAAACCAAAACGAAGGATTATAAACGAAAATG
CAAACTTGAGGAAGAGATCAGCAATAATGGCGATCCTACAACATCAGAAACGGCTACGCT
TAAAAGAACGCGCAGGACTCGCCGTAAAAGGTCATCCACTTTTGGTGATTCACGAATTCC
ACCACTACCAGATACTGAAAGCCTGAAACAGGAGAGGAGAAAGGGTCCGGTTTGGTTCTC
ACTTGTAGCTTCAAATAATCGGAAGGAGAAACATCATTGCCTCAGATTCCGGCAAACTAC
TTGAGAATAAGGGATGGAAATATTCCAGTTTCGCTTATCCAAAAGTACCTCATGAGGAAG
CTTGATCTCAAGAGAAAACTGAGATAGAGATAAGATGTATGGGAGAAGCAGTGATCCCAA
CGTTGGAGCTTCACAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGGAAACAACTTCTAAGCATGAAAGAG
TGGCTGCAACCATAGGTTCATCCGCAAAGGAATTTGTAATGGTGCTAGCTTATGCTCGGA
AGGTCCCTGAATGCAACAACAACTAAAAGAAGTGTTCAATAATGAAGTGAAGTGTAGGAG
CAGTAGCAGTGGAATGTATTGTGTAGTTTGTAATGATACATATATATTTTCTTATAAATC
TGAAAATGAATGATCGGTGAGAATATTCAAGATTTGCTTTTTTAAAAAGAAAAAGGTGAG
TGTATGTCTTTTTAGACATTTGAATGTATGATCAGATAGAGGATAATGTTGTCATTTCTA
TGAAATTTGGTTCCTTTGTTTGGACTAAAGGAGATGTACACG

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5096Contig1 880 2 4 U
GGAGCCATATCCTCTTGACATGAGGGGAGAGTTAGATGACACAGCTGCCTTCAAAAATTT
CAACAAGTGGGGAGACATTGAATTTCCTCTGCCATTTGGAAGTGTACTCAGTCCAACGGA
GAGCTTCATCCATGGTTTAGATGAGAAGACAAGTGCTTCTTTGAAGTTCACTGTTCTGAA
TCCTAAAGGTCGCATTTGGACAATGGTAGCTGGAGGCGGTGCTAGCGTCATATATGCTGA
TACGGTTGGAGATTTAGGCTATGCATCAGAGCTCGGGAACTACGCAGAGTATAGTGGAGC
ACCTAATGAGGAAGAGGTGTTACAATACGCAAGAGTTGTCATTGATTGTGCGACTGCTGA
TCCTGATGGGCGCAAACGAGCTTTGCTCATTGGAGGTGGCATTGCCAACCTCACTGACGT
TGCAGCTACTTTCAACGGTATCATCCGCGCTCTAAGAGAAAAGGAAACAAGACTGAAGGC
ATCAAGAATGCACATTTACGTAAGAAGAGGTGGTCCTAATTACCATACTGGTTTGGCTAG
AATGCGTGCTCTTGGAGAGGAACTCGGTGTTCCTCTTGAGGTATATGGACCAGAAGCAAC
GATGACAGGAATTTGCAAACGAGCCATTGACTGCATCATGTTGCCTGATGCGTAATCAAC
CAAACCTGAGATCTTTTCTTCAGTTGAAAAAAGCACAACATACGTGGAGCTGGAGACTGG
GAGGAGTGTGAGTGTGTTGATTAATGTTCTTCACCTCTCTTTCTACATAAGAAATTTAAA
CGCTCTTTGAAACTTTTTATTTTGTGAATGTGTGAATTTGAAAACCAGATCATTGTGTTG
CATGTGTAAAATTTGTAATCAAAACAGTCAAAATCCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G802TF U 1
AF RR4G802JQ C 229
BS 1 691 RR4G802TF
BS 692 692 RR4G802JQ
BS 693 735 RR4G802TF
BS 736 880 RR4G802JQ

RD RR4G802TF 735 0 0
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TCCTAAAGGTCGCATTTGGACAATGGTAGCTGGAGGCGGTGCTAGCGTCATATATGCTGA
TACGGTTGGAGATTTAGGCTATGCATCAGAGCTCGGGAACTACGCAGAGTATAGTGGAGC
ACCTAATGAGGAAGAGGTGTTACAATACGCAAGAGTTGTCATTGATTGTGCGACTGCTGA
TCCTGATGGGCGCAAACGAGCTTTGCTCATTGGAGGTGGCATTGCCAACCTCACTGACGT
TGCAGCTACTTTCAACGGTATCATCCGCGCTCTAAGAGAAAAGGAAACAAGACTGAAGGC
ATCAAGAATGCACATTTACGTAAGAAGAGGTGGTCCTAATTACCATACTGGTTTGGCTAG
AATGCGTGCTCTTGGAGAGGAACTCGGTGTTCCTCTTGAGGTATATGGACCAGAAGCAAC
GATGACAGGAATTTGCAAACGAGCCATTGACTGCATCATGTTGCCTGATGCGTAATCAAC
CAAACCTGAGATCTTTTCTTCAGTTGAAAAA*GCACAACATACGTGGAGCTGGAGACTGG
GAGGAGTGTGAGTGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4G802JQ 652 0 0
CATATATGCTGATACGGTTGGAGATTTAGGCTATGCATCAGAGCTCGGGAACTACGCAGA
GTATAGTGGAGCACCTAATGAGGAAGAGGTGTTACAATACGCAAGAGTTGTCATTGATTG
TGCGACTGCTGATCCTGATGGGCGCAAACGAGCTTTGCTCATTGGAGGTGGCATTGCCAA
CCTCACTGACGTTGCAGCTACTTTCAACGGTATCATCCGCGCTCTAAGAGAAAAGGAAAC
AAGACTGAAGGCATCAAGAATGCACATTTACGTAAGAAGAGGTGGTCCTAATTACCATAC
TGGTTTGGCTAGAATGCGTGCTCTTGGAGAGGAACTCGGTGTTCCTCTTGAGGTATATGG
ACCAGAAGCAACGATGACAGGAATTTGCAAACGAGCCATTGACTGCATCATGTTGCCTGA
TGCGTAATCAACCAAACCTGAGATCTTTTCTTCAGTTGAAAAAAGCACAACATACGTGGA
GCTGGAGACTGGGAGGAGTGTGAGTGTGTTGATTAATGTTCTTCACCTCTCTTTCTACAT
AAGAAATTTAAACGCTCTTTGAAACTTTTTATTTTGTGAATGTGTGAATTTGAAAACCAG
ATCATTGTGTTGCATGTGTAAAATTTGTAATCAAAACAGTCAAAATCCTATT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5097Contig1 1005 2 2 U
AAGAAGCTCCTCTTCTTTGCCCAACAAGCTCAGAGACGTAAGGGTAAAGCTGGAAGAGCG
AAGAATGTCATATTCTCAGAAGATAGAGGACGCTATATAAAGCCAATGCTTCCAAAGGGT
CCAGTAAAAAGATTAGCAGTGGATGCAACACTTAGAGCAGCTGCGCCTTACCAGAAATTG
CGCAGAGAGAAAGATATATCAGGAACTAGGAAAGTCTTTGTCGAGAAAACAGATATGAGG
GCCAAAAGAATGGCAAGGAAAGCTGGAGCCCTGGTTATATTCGTGGTTGACGCAAGTGGC
AGCATGGCGTTGAATCGTATGCAAAACGCCAAAGGTGCTGCACTCAAATTACTGGCAGAG
AGCTATACTAGTAGGGATCAGGTTGCGATTATTCCATTCAGAGGAGATGCTGCGGAAGTG
CTATTGCCCCCATCTAGATCAATTGCAATGGCAAGAAATCGTCTTGAGAGACTTCCTTGT
GGTGGTGGTTCTCCTCTTGCCCATGGTCTAACAACGTCGGTAAGAGTGGGACTTAACGCA
GAGAAGAGTGGTGATGTGGGGCGTATAATGATTGTTGCAATAACCGATGGTCGAGCCAAC
ATTACGCTGAAAAGATCAACTGATCCAGAGGGTATTGCCCCCGATGCTCCTAGACCCTCC
TCACAAGAATTGAAAGATGAGATTCTGGAAGTTGCAGGGAAGATATACAAGGCTGGGATG
TCTCTACTAGTGATAGATACAGAGAACAAGTTTGTCTCAACTGGTTTTGCCAAGGAGATT
GCAAGAGTTGCTCAAGGAAAATATTATTACTTGCCAAATGCTTCGGATGCAGTCATTTCG
GCTACAACTAAAGATGCTTTATCAGCTTTGAAGAACTCTTAGACCTCACTTGTCCCTGCA
ATATTTGGTTTATGATTCCGGTTTACGTTTTTGTACATTTTAATTTCCTTTTTTGACCCA
ACTAAACCAACATTTCATTCATCAAATATGGAAACGATATAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GX34TF U 1
AF RR4GX34JQ C 181
BS 1 698 RR4GX34TF
BS 699 1005 RR4GX34JQ

RD RR4GX34TF 704 0 0
AAGAAGCTCCTCTTCTTTGCCCAACAAGCTCAGAGACGTAAGGGTAAAGCTGGAAGAGCG
AAGAATGTCATATTCTCAGAAGATAGAGGACGCTATATAAAGCCAATGCTTCCAAAGGGT
CCAGTAAAAAGATTAGCAGTGGATGCAACACTTAGAGCAGCTGCGCCTTACCAGAAATTG
CGCAGAGAGAAAGATATATCAGGAACTAGGAAAGTCTTTGTCGAGAAAACAGATATGAGG
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AGCATGGCGTTGAATCGTATGCAAAACGCCAAAGGTGCTGCACTCAAATTACTGGCAGAG
AGCTATACTAGTAGGGATCAGGTTGCGATTATTCCATTCAGAGGAGATGCTGCGGAAGTG
CTATTGCCCCCATCTAGATCAATTGCAATGGCAAGAAATCGTCTTGAGAGACTTCCTTGT
GGTGGTGGTTCTCCTCTTGCCCATGGTCTAACAACGTCGGTAAGAGTGGGACTTAACGCA
GAGAAGAGTGGTGATGTGGGGCGTATAATGATTGTTGCAATAACCGATGGTCGAGCCAAC
ATTACGCTGAAAAGATCAACTGATCCAGAGGGTATTGCCCCCGATGCTCCTAGACCCTCC
TCACAAGAATTGAAAGATGAGATTCTGGAAGTTGCAGG
AGATAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4GX34JQ 825 0 0
CGCAGAGAGAAAGATATATCAGGAACTAGGAAAGTCTTTGTCGAGAAAACAGATATGAGG
GCCAAAAGAATGGCAAGGAAAGCTGGAGCCCTGGTTATATTCGTGGTTGACGCAAGTGGC
AGCATGGCGTTGAATCGTATGCAAAACGCCAAAGGTGCTGCACTCAAATTACTGGCAGAG
AGCTATACTAGTAGGGATCAGGTTGCGATTATTCCATTCAGAGGAGATGCTGCGGAAGTG
CTATTGCCCCCATCTAGATCAATTGCAATGGCAAGAAATCGTCTTGAGAGACTTCCTTGT
GGTGGTGGTTCTCCTCTTGCCCATGGTCTAACAACGTCGGTAAGAGTGGGACTTAACGCA
GAGAAGAGTGGTGATGTGGGGCGTATAATGATTGTTGCAATAACCGATGGTCGAGCCAAC
ATTACGCTGAAAAGATCAACTGATCCAGAGGGTATTGCCCCCGATGCTCCTAGACCCTCC
TCACAAGAATTGAAGGATGAGATTCTGGAAGTTGCAGGGAAGATATACAAGGCTGGGATG
TCTCTACTAGTGATAGATACAGAGAACAAGTTTGTCTCAACTGGTTTTGCCAAGGAGATT
GCAAGAGTTGCTCAAGGAAAATATTATTACTTGCCAAATGCTTCGGATGCAGTCATTTCG
GCTACAACTAAAGATGCTTTATCAGCTTTGAAGAACTCTTAGACCTCACTTGTCCCTGCA
ATATTTGGTTTATGATTCCGGTTTACGTTTTTGTACATTTTAATTTCCTTTTTTGACCCA
ACTAAACCAACATTTCATTCATCAAATATGGAAACGATATAGAGT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL5098Contig1 979 2 2 U
GCATGAGTTTGGACTTCCTTTGTTCCGGGAATCGTTCCTTCCTCAAATGGACCCAAACAA
GATCACCTTCCTGAAAGATCATTTCTTTTCTCTTCTTGTCTGCAAGTCGTTTGTAGCCTT
TGGTCTTGGCTTCAATGTTGGCCCGGACCTGTTCATGCAGCTTCTTGATCGTGTCCACCT
TCCTCTTGCCATCTGTACTAACTCGTTCACTCAAAGGCAAAGGTAAAAGATCAAGTGGAG
ACAAAGGATTAAATCCATAAACAACCTCAAAAGGAGAAAACTTAGTAGCTGAATGTAATG
CGTGATTGTAAGCAAACTCAACATGAGGCAAACATTCTTCCCAAGTCTTAAGATTCTTTT
AACCAAAGATCTAAGCAAAGCAGACAAGGTTCGATTAACTACTTCAGTTTGCCCATCAGT
TTGCGGATGACAAGTTGTAGAGAACATCAATCTAGTACCTAGCTTAGACCACAAGGTCTT
CCAAAAATAGCTAAGGAACTTAGCATCACGATCAGAGACAATGGTCTTAGGCATTCCATG
CAATCTAACAACTTCCTTAAAGAATAAATCTGCAACTTGCACAGCATCATCAGTTTTGTG
ACAAGGAATGAAATGAGCCATTTTTGAGAACCTATCTACAACCACAAAGATAGAATCTCG
TCCAGCTTTGGACCTAGGCAAACCAAGCACAAAATCCATAGAAATGTCTACCCAAGGATG
AGAGGGAATGGGTAGAGCTGAGTACAAACTGTGGTTTGATGCTTTAGGCTTAGACTTCTT
GCACACCACACATCGGCCACAGATCCTCTCAACATCTTTCATCAAACTCGGCCAATAGAA
GTGGTCATGAACAGCCTTGTAAGTCTTCTTGACACCAAAGTGTCCCATAAGTCCTCCTCC
ATGAGCTTCCCTGAGAAACAACTCCCTCAAAGAACATTGGGGCACACACAAACGGTTATC
AAAGAATAAGAAACCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AE03TF U 1
AF RR4AE03JQ C 200
BS 1 713 RR4AE03TF
BS 714 979 RR4AE03JQ

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GCATGAGTTTGGACTTCCTTTGTTCCGGGAATCGTTCCTTCCTCAAATGGACCCAAACAA
GATCACCTTCCTGAAAGATCATTTCTTTTCTCTTCTTGTCTGCAAGTCGTTTGTAGCCTT
TGGTCTTGGCTTCAATGTTGGCCCGGACCTGTTCATGCAGCTTCTTGATCGTGTCCACCT
TCCTCTTGCCATCTGTACTAACTCGTTCACTCAAAGGCAAAGGTAAAAGATCAAGTGGAG
ACAAAGGATTAAATCCATAAACAACCTCAAAAGGAGAAAACTTAGTAGCTGAATGTAATG
CGTGATTGTAAGCAAACTCAACATGAGGCAAACATTCTTCCCAAGTCTTAAGATTCTTTT
AACCAAAGATCTAAGCAAAGCAGACAAGGTTCGATTAACTACTTCAGTTTGCCCATCAGT
TTGCGGATGACAAGTTGTAGAGAACATCAATCTAGTACCTAGCTTAGACCACAAGGTCTT
CCAAAAATAGCTAAGGAACTTAGCATCACGATCAGAGACAATGGTCTTAGGCATTCCATG
CAATCTAACAACTTCCTTAAAGAATAAATCTGCAACTTGCACAGCATCATCAGTTTTGTG
ACAAGGAATGAAATGAGCCATTTTTGAGAACCTATCTACAACCACAAAGATAGAATCTCG
TCCAGCTTTGGACCTAGGCAAACCAAGCACAAAATCCATAGAAATGTCTACCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4AE03JQ 780 0 0
AACTCGTTCACTCAAAGGCAAAGGTAAAAGATCAAGTGGAGACAAAGGATTAAATCCATA
AACAACCTCAAAAGGAGAAAACTTAGTAGCTGAATGTAATGCGTGATTGTAAGCAAACTC
AACATGAGGCAAACATTCTTCCCAAGTCTTAAGATTCTTTTAACCAAAGATCTAAGCAAA
GCAGACAAGGTTCGATTAACTACTTCAGTTTGCCCATCAGTTTGCGGATGACAAGTTGTA
GAGAACATCAATCTAGTACCTAGCTTAGACCACAAGGTCTTCCAAAAATAGCTAAGGAAC
TTAGCATCACGATCAGAGACAATGGTCTTAGGCATTCCATGCAATCTAACAACTTCCTTA
AAGAATAAATCTGCAACTTGCACAGCATCATCAGTTTTGTGACAAGGAATGAAATGAGCC
ATTTTTGAGAACCTATCTACAACCACAAAGATAGAATCTCGTCCAGCTTTGGACCTAGGC
AAACCAAGCACAAAATCCATAGAAATGTCTACCCAAGGATGAGAGGGAATGGGTAGAGCT
GAGTACAAACTGTGGTTTGATGCTTTAGGCTTAGACTTCTTGCACACCACACATCGGCCA
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TAAGTCTTCTTGACACCAAAGTGTCCCATAAGTCCTCCTCCATGAGCTTCCCTGAGAAAC
AACTCCCTCAAAGAACATTGGGGCACACACAAACGGTTATCAAAGAATAAGAAACCAGCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

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AGGCGAACAGGTTTTCTTCTTCGTCCGCCGCCGCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACA
AGGCGAAACAAGCCGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTA
ATTAATTAAGACAAATGGATAGAGATTTTTTCTGCCGTCGATTGGATCCGACAGGTTGTA
TCTTTGTCGGAGCTGTGAAATCGGATTGTACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAAC
GGATTCGAATTGTACAAAGCATAAATGATACTTGTACAGAATTCGGGGAAGAATATAAAA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4F309TF U 1
AF RR4F309JQ C 131
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BS 649 662 RR4F309JQ

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AGGCGAACAGGTTTTCTTCTTCGTCCGCCGCCGCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACA
AGGCGAAACAAGCCGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTA
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QA 1 648 1 648
DS 

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GTTTTCTTCTTCGTCCGCCGCCGCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCGAAACA
AGCCGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTAATTAAG
ACAAATGGATAGAGATTTTTTCTGCCGTCGATTGGATCCGACAGGTTGTATCTTTGTCGG
AGCTGTGAAATCGGATTGTACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAACGGATTCGAAT
TGTACAAGGCATAAATGATACTTGTACAGAATTCGGGGAAGAATATAAAAAG

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CP60JQ C 1
AF RR4CP60TF U 1
BS 1 445 RR4CP60TF

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QA 1 445 1 445
DS 

RD RR4CP60TF 445 0 0
GACAACTGTTGTTAATTGAATCAAAACTAACAAGCCTAAGAGATAATATATTAATCCAGT
GAATATACTTTTATTGTTTTGAGGCCAACAAATAAATAAAATGCGTGTATGTGCCTGCAG
CATGAAACTTGCTGAAGTATCAGAGTATATGCTTACAAGTCCATAGACTCTGCCTGTCTG
GCATGTGTCGAGTTACGTTCTGATAGCCAAAATATCTCTTTTACCGTATGTCGTACAAAA
CAAAAAGTCGTACAACACGCAACTTTTTAATAATAAAAATTCTCAAAACATCTCTCTTCT
ATCTTCTCGCTTTGTTTCGATCGCTTTCACATTTGTTAAACGCTCCTCTCTATGTTATGA
GGATAATCTGGCAAAACGGGTTTTTAAGAGGCCTTGTAAGAACCCAAACCCAAATCCAAA
TTTAAATGAACCAAGTATGTTTGTG

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL5101Contig1 846 2 2 U
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GTTGTGTACTGGTTTCTTTTGCTCAAGTCTACCTTCGCCCCTCGTAAAGGCTTCACATAC
ACGACAATCCATGCTTTGCTGATGGTGATTGGCTTTATTCTTGTAAGTGGAGAAGCGATT
TTGATACACAGATGGTTGCCCGGTTCAAAGAAAACGAAGAAAGCAGTTCATTTATTCCTA
CAAGGAGTGGCATTACTCTCTGCACTCTTTGGAATGTGGACAAAGTTCCATTATGAATCA
GGAATCTTCTCTAATTTCTACAGTCTCCATTCTTGGATGGGTTTACTCTCTGTTTCTCTC
TTTGCTGCCCAGTGGGTGACTGGGTTCTTGAGCTTCTGGCAAAGAGGACAAGTACGGGAA
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GCCATTGCCACCGCTGAGACCGGGCTACTTGTGAAGCTGACACACCTACAGACCAAGAGA
AACCTCCCGAGACGCTGTGCTGAAGCAGTGGTCCTCAATGGTGTAGGGCTCGGCTTGGTT
CTACTGTGTGCCATTGTTATTGCTTCCGCTGTTTTGCCCAAGTCTTCTGGTAATGAGAAA
ATCGTTTATTCATCTCAAGACCGTCCCAAATGTTTGGCTTCTTGACTTCTCTTTTTCTTT
TTTCCTTTTTCTTTCTTCTAATTTTTATGTTTTGATTTTTGGGGGACAAACTACACTGTC
TCTGGTATACGCAAAATGAACAAATTGGTTCTTTTAAAAATATATTACTTGATGATTCTT
CTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM58TF U 1
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TTGATACACAGATGGTTGCCCGGTTCAAAGAAAACGAAGAAAGCAGTTCATTTATTCCTA
CAAGGAGTGGCATTACTCTCTGCACTCTTTGGAATGTGGACAAAGTTCCATTATGAATCA
GGAATCTTCTCTAATTTCTACAGTCTCCATTCTTGGATGGGTTTACTCTCTGTTTCTCTC
TTTGCTGCCCAGTGGGTGACTGGGTTCTTGAGCTTCTGGCAAAGAGGACAAGTACGGGAA
ACAACGAGAACCACGTTGCTTCCATGGCACGTCTTTCTCGGACTCTACATCTACGGTCTG
GCCATTGCCACCGCTGAGACCGGGCTACTTGTGAAGCTGACACACCTACAGACCAAGAGA
AACCTCCCGAGACGCTGTGCTGAAGCAGTGGTCCTCAATGGTGTAGGGCTCGGCTTGGTT
CTACTGTGTGCCATTGTTATTGCTTCCGCTGTTTTGCCCAAGTCTTCTGGTAATGAGAAA
ATCGTTTATTCATCTCAAGACCGTCCCAAATGTTTGGCTTCTTGACTTCTCTTTT
C

QA 1 715 1 715
DS 

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TTTGCTCAAGTCTACCTTCGCCCCTCGTAAAGGCTTCACATACACGACAATCCATGCTTT
GCTGATGGTGATTGGCTTTATTCTTGTAAGTGGAGAAGCGATTTTGATACACAGATGGTT
GCCCGGTTCAAAGAAAACGAAGAAAGCAGTTCATTTATTCCTACAAGGAGTGGCATTACT
CTCTGCACTCTTTGGAATGTGGACAAAGTTCCATTATGAATCAGGAATCTTCTCTAATTT
CTACAGTCTCCATTCTTGGATGGGTTTACTCTCTGTTTCTCTCTTTGCTGCCCAGTGGGT
GACTGGGTTCTTGAGCTTCTGGCAAAGAGGACAAGTACGGGAAACAACGAGAACCACGTT
GCTTCCATGGCACGTCTTTCTCGGACTCTACATCTACGGTCTGGCCATTGCCACCGCTGA
GACCGGGCTACTTGTGAAGCTGACACACCTACAGACCAAGAGAAACCTCCCGAGACGCTG
TGCTGAAGCAGTGGTCCTCAATGGTGTAGGGCTCGGCTTGGTTCTACTGTGTGCCATTGT
TATTGCTTCCGCTGTTTTGCCCAAGTCTTCTGGTAATGAGAAAATCGTTTATTCATCTCA
AGACCGTCCCAAATGTTTGGCTTCTTGACTTCTCTTTTTCTTTTTTCCTTTTTCTTTCTT
CTAATTTTTATGTTTTGATTTTTGGGGGACAAACTACACTGTCTCTGGTATACGCAAAAT
GAACAAATTGGTTCTTTTAAAAATATATTACTTGATGATTCTTCTGTCT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGTAGAAAAGGAGAAAAAAAAACATGAAAGAGATGGGAGTTATAGTGTTTCTTCTACTTC
ATTCGATCTTCTACACTGCCTTTTGCTTCAAAGATGGTAAGTCCCTCGTTATGCAAATCT
CTCATTTTCTTATTTAAACTAAAGCAAGCATAAGAAAAACATCGTTAGGTATGAAAAATA
ATTTTACAGTTTTCATTCACATCATGTTTACACCTTGTATGTCAAAATAGTTTCATTTGT
ATTGCACCACAAGTCATGAATACTACTATTTGATAACTAGTAGATTCGTGACATCAATAC
GTCTAGCTCCCCTTCAAGATGTTAATTTTCTTTCTTTGTGTATCATTAGATGCTTCTTAA
CCAATAGACAAGAACAGAATAGCTTTGTGAATTTAAATACCAAACATAATTACTTGAAGA
GAATATTGGATGGAAGTATTTAACTGTTACAGTGAGACAGATCTGTATACATGCACATGG
TATTTGTCAATGGTTTACAATAAATGCATCAGTAAATACTCATACCTTCCAATCTGCAAC
ATTTTATTATTCTTTTAGTAATTTGAAAATTTTGCACTTCAACTTTTCTTCAATTATTAT
ATCATATCATAGATCTAAAACAGCAAAACCATTATTGAGTAAACATTCCCATGTTAAACA
AAAGTGAAAATGTACTTTACTAGAATCATTGTCACCAACTATATACGTACACTAGTTCCA
TGTGGCTTGAGAAATTTTGTTTTTACATTTTGCTATTAACTATAACCTTTTG


BQ
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AF RR4GJ49TF U 1
AF RR4GJ49JQ C 174
BS 1 691 RR4GJ49TF
BS 692 832 RR4GJ49JQ

RD RR4GJ49TF 691 0 0
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GAATATTGGATGGAAGTATTTAACTGTTACAGTGAGACAGATCTGTATACATGCACATGG
TATTTGTCAATGGTTTACAATAAATGCATCAGTAAATACTCATACCTTCCAATCTGCAAC
ATTTTATTATTCTTTTAGTAATTTGAAAATTTTGCACTTCAACTTTTCTTCAATTATTAT
ATCATATCATAGATCTAAAACAGCAAAACCA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4GJ49JQ 659 0 0
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TTCTTAACCAATAGACAAGAACAGAATAGCTTTGTGAATTTAAATACCAAACATAATTAC
TTGAAGAGAATATTGGATGGAAGTATTTAACTGTTACAGTGAGACAGATCTGTATACATG
CACATGGTATTTGTCAATGGTTTACAATAAATGCATCAGTAAATACTCATACCTTCCAAT
TTGCAACATTTTATTATTCTTTTAGTAATTTGAAAATTTTGCACTTCAACTTTTCTTCAA
TTATTATATCATATCATAGATCTAAAACAGCAAAACCATTATTGAGTAAACATTCCCATG
TTAAACAAAAGTGAAAATGTACTTTACTAGAATCATTGTCACCAACTATATACGTACACT
AGTTCCATGTGGCTTGAGAAATTTTGTTTTTACATTTTGCTATTAACTATAACCTTTTG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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CGGTGCTATATTTGTTGTTTGCTTATTAATCACTTCCAGTGCCTGGAGTTCATCCATCAT
TGTTCTTGTGTTAGTGATGATACTCGCGGACCTCATGGGTGTAATGGTGGTTTTGGGAAT
TCAACTCAATGCAGTTTCTGTTGTGAATTTGATAATGTCAATCGGGATTGCTGTAGAATT
CTGCGTGCACATATCACATGCCTTCCTGATGAGTAATGGGAACAGAGAACAAAGAGCGAG
GCAGGCACTGGAAACCATGGGAGCTTCGGTTTTCAGTGGGATCACACTCACAAAACTTGT
TGGAGTGATGGTGCTTTGCTTCGCACGATCGGAGATATTTGTGGTGTATTACTTTCAAAT
GTACTTGGCTTTGGTTATAATCGGCTTCTTGCATGGGCTCGTTTTCTTACCTGTCATACT
AAGTTTAGCTGGGCCACCACAGATACACTTGGACACGGAGGAGGAGCAGCAGAGGAGAGA
CGAAGCTTCTTCTTCCCTATTGAACTGAGTAACTCGACAGACTTATCAAGTTTGAAAAAC
TTTAACATATACTCTTATGATTCAAATAAGTTTTAGACAGTGTCGAGAACACTAAAGAAG
CAATACTGTATGCTCTGTATCAAAGTTTAGGCAATAGGACTTTGGCCCCCAAACTATGGC
ATGTTGGTACAGTTTTTTTTTTTAAACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW91TF U 1
AF RR4GW91JQ C 120
BS 1 633 RR4GW91TF
BS 634 868 RR4GW91JQ

RD RR4GW91TF 633 0 0
GCACACTCCACTTAACACACAAGGTGACTATGTTAATTCACTACGAGCTGCCCGGGAGTT
CAGTTCAAGAATGTCTAATTTGTTGAAGATTGACATCTTTCCATATTCTGTGTTCTACAT
TTTCTTTGAGCAATATCTGAATATCTGGACCGTAGCTTTGTCAAACCTGGCTATAGCAAT
CGGTGCTATATTTGTTGTTTGCTTATTAATCACTTCCAGTGCCTGGAGTTCATCCATCAT
TGTTCTTGTGTTAGTGATGATACTCGCGGACCTCATGGGTGTAATGGTGGTTTTGGGAAT
TCAACTCAATGCAGTTTCTGTTGTGAATTTGATAATGTCAATCGGGATTGCTGTAGAATT
CTGCGTGCACATATCACATGCCTTCCTGATGAGTAATGGGAACAGAGAACAAAGAGCGAG
GCAGGCACTGGAAACCATGGGAGCTTCGGTTTTCAGTGGGATCACACTCACAAAACTTGT
TGGAGTGATGGTGCTTTGCTTCGCACGATCGGAGATATTTGTGGTGTATTACTTTCAAAT
GTACTTGGCTTTGGTTATAATCGGCTTCTTGCATGGGCTCGTTTTCTTACCTGTCATACT
AAGTTTAGCTGGGCCACCACAGATACACTTGGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4GW91JQ 749 0 0
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TCGGTGCTATATTTGTTGTTTGCTTATTAATCACTTCCAGTGCCTGGAGTTCATCCATCA
TTGTTCTTGTGTTAGTGATGATACTCGCGGACCTCATGGGTGTAATGGTGGTTTTGGGAA
TTCAACTCAATGCAGTTTCTGTTGTGAATTTGATAATGTCAATCGGGATTGCTGTAGAAT
TCTGCGTGCACATATCACATGCCTTCCTGATGAGTAATGGGAACAGAGAACAAAGAGCGA
GGCAGGCACTGGAAACCATGGGAGCTTCGGTTTTCAGTGGGATCACACTCACAAAACTTG
TTGGAGTGATGGTGCTTTGCTTCGCACGATCGGAGATATTTGTGGTGTATTACTTTCAAA
TGTACTTGGCTTTGGTTATAATCGGCTTCTTGCATGGGCTCGTTTTCTTACCTGTCATAC
TAAGTTTAGCTGGGCCACCACAGATACACTTGGACACGGAGGAGGAGCAGCAGAGGAGAG
ACGAAGCTTCTTCTTCCCTATTGAACTGAGTAACTCGACAGACTTATCAAGTTTGAAAAA
CTTTAACATATACTCTTATGATTCAAATAAGTTTTAGACAGTGTCGAGAACACTAAAGAA
GCAATACTGTATGCTCTGTATCAAAGTTTAGGCAATAGGACTTTGGCCCCCAAACTATGG
CATGTTGGTACAGTTTTTTTTTTTAAACT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5105Contig1 932 2 2 U
GGGCGTGCTTGCTTAAACACAAACCTTTTAATTCTCGAAAAAAAAAGCTCAAGACCTTTC
GTGTACGGCCGACAAGCCTACCTTTCTCTCTCTTCGCTTCTCCACCAACTCTCTCCCTCT
CTCTCCTCAGTCCTCACCAACTACCACTAGTCTACACCTACCCCCGAATGCCCTAATAAC
TCCTTCATACATACATCTCTCTTTCTCTCTGCTAATGATCCTCTGTCTCTTCCTCTGATT
CTCAATCCTCTGTTTTCTCCACCTCCTCTGTTTTTTTTCTACTCATCAATGGAGTCCTCA
CTGTTATTAACGAGATCATCTTCTAATCCCCCTGCAATTAGGTTCCAGACCTATCTACGC
TTGCTACCCCCTTCTCAGCTATCCAAACCTTCCTTCTCTGTCCTCTGTTCTCTCCCTCCC
TCCAAGCCACCACCACGCTACAGAACCAGCTCCGTTCACGCCGTCACAACCCTCAACGGA
TCGGTGTCAGGAAAGAAACGAGTGGACGAAAGCGAGAGCTTGACACTCGAAGGCATCAGA
AACTCCTTGATCCGACAAGAGGACAGTATCATATTCGGTCTGCTAGAGAGAGCCAAGTAC
TGTTACAACGAAGAAGAAGAGGTTGATGAATCTCATGTTTATAAAATTAGTCCTATCTTG
GTGGGGCACTTGTATGGAGATTGGATCATGCCCTTGACAAAAGAAGTTCAAGTGGAGTAC
TTGCTCAGAAGACTAGACTGAAAAAAAACAAAATGGCTTTGGTTTGGTAGTAACGTTTTT
GTTTTTTTAGGAATGTTGTTTGGTTGTTTTATCCTTTTACAAATCTCTCTCTCAACGTTG
TTACACACTATATTATGCCCATGTTTGGTTCCACTGTACAAAAGTTGCTTGTGGTTTTCA
AGGTTACATGCTAAAACAGTACTCATAATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW27TF U 1
AF RR4FW27JQ C 176
BS 1 696 RR4FW27TF
BS 697 932 RR4FW27JQ

RD RR4FW27TF 696 0 0
GGGCGTGCTTGCTTAAACACAAACCTTTTAATTCTCGAAAAAAAAAGCTCAAGACCTTTC
GTGTACGGCCGACAAGCCTACCTTTCTCTCTCTTCGCTTCTCCACCAACTCTCTCCCTCT
CTCTCCTCAGTCCTCACCAACTACCACTAGTCTACACCTACCCCCGAATGCCCTAATAAC
TCCTTCATACATACATCTCTCTTTCTCTCTGCTAATGATCCTCTGTCTCTTCCTCTGATT
CTCAATCCTCTGTTTTCTCCACCTCCTCTGTTTTTTTTCTACTCATCAATGGAGTCCTCA
CTGTTATTAACGAGATCATCTTCTAATCCCCCTGCAATTAGGTTCCAGACCTATCTACGC
TTGCTACCCCCTTCTCAGCTATCCAAACCTTCCTTCTCTGTCCTCTGTTCTCTCCCTCCC
TCCAAGCCACCACCACGCTACAGAACCAGCTCCGTTCACGCCGTCACAACCCTCAACGGA
TCGGTGTCAGGAAAGAAACGAGTGGACGAAAGCGAGAGCTTGACACTCGAAGGCATCAGA
AACTCCTTGATCCGACAAGAGGACAGTATCATATTCGGTCTGCTAGAGAGAGCCAAGTAC
TGTTACAACGAAGAAGAAGAGGTTGATGAATCTCATGTTTATAAAATTAGTCCTATCTTG
GTGGGGCACTTGTATGGAGATTGGATCATGCCCTTG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FW27JQ 757 0 0
TAACTCCT
TTCATACATACATCTCTCTTTCTCTCTGCTAATGATCCTCTGTCTCTTCCTCTGATTCTC
AATCCTCTGTTTTCTCCACCTCCTCTGTTTTTTTTCTACTCATCAATGGAGTCCTCACTG
TTATTAACGAGATCATCTTCTAATCCCCCTGCAATTAGGTTCCAGACCTATCTACGCTTG
CTACCCCCTTTTCAGCTATCCAAACCTTCCTTCTCTGTCCTCTGTTCTCTCCCTCCCTCC
AAGCCACCACCACGCTACAGAACCAGCTCCGTTCACGCCGTCACAACCCTCAACGGATCG
GTGTCAGGAAAGAAACGAGTGGACGAAAGCGAGAGCTTGACACTCGAAGGCATCAGAAAC
TCCTTGATCCGACAAGAGGACAGTATCATATTCGGTCTGCTAGAGAGAGCCAAGTACTGT
TACAACGAAGAAGAAGAGGTTGATGAATCTCATGTTTATAAAATTAGTCCTATCTTGGTG
GGGCACTTGTATGGAGATTGGATCATGCCCTTGACAAAAGAAGTTCAAGTGGAGTACTTG
CTCAGAAGACTAGACTGAAAAAAAACAAAATGGCTTTGGTTTGGTAGTAACGTTTTTGTT
TTTTTAGGAATGTTGTTTGGTTGTTTTATCCTTTTACAAATCTCTCTCTCAACGTTGTTA
CACACTATATTATGCCCATGTTTGGTTCCACTGTACAAAAGTTGCTTGTGGTTTTCAAGG
TTACATGCTAAAACAGTACTCATAATTGT

QA 9 757 9 757
DS 



AS 1 2

CO CL5106Contig1 815 2 2 U
GGAAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAG
ATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAG
CTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTG
TACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGC
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AGCCAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGG
AATCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGA
CAGCTCAGATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGACTT
TGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCATTTT
TCAAATCGGGTATCATCAGGGGCAACAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGA
GAATAATTACATGTTGGGTTGGTTACCTTTCGACACCAACTCTATTTGAAACTTTCTTCA
TATATATATTTTTTGACATTTTTATATCAAAACTTTCTCCTAGGTCCCCTATTAGGCTAC
ATGAATAACTACCTCTCTCTATATTTGTGTAGCGTGCATGTTTGTGTGTGTGTAATGTTT
ATTATGATGCTCTTCTATATTTCAATAAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV24TF U 1
AF RR4BV24JQ C 186
BS 1 703 RR4BV24TF
BS 704 815 RR4BV24JQ

RD RR4BV24TF 709 0 0
GGAAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAG
ATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAG
CTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTG
TACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGC
AACTACGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGT
AGCCAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGG
AATCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGA
CAGCTCAGATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGACTT
TGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCATTTT
TCAAATCGGGTATCATCAGGGGCAACAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGA
GAATAATTACATGTTGGGTTGGTTACCTTTCGACACCAACTCTATTTGAAACTTTCTTCA
TATATATATTTTTTGACATTTTTATATCAAAACTTTCTCCTAG
TCCCCT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4BV24JQ 630 0 0
GTTTTGCAGTAACTCGAGCAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAACTA
CGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGCCA
GCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAATTT
ATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAGCT
CAGATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGACTTTGGGC
GTCATCAACCACAACAACAAGCTTTTTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCATTTTTCAAA
TCGGGTATCATCAGGGGCAACAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGAGAATA
ATTACATGTTGGGTTGGTTACCTTTCGACACCAACTCTATTTGAAACTTTCTTCATATAT
ATATTTTTTGACATTTTTATATCAAAACTTTCTCCTAGGTCCCCTATTAGGCTACATGAA
TAACTACCTCTCTCTATATTTGTGTAGCGTGCATGTTTGTGTGTGTGTAATGTTTATTAT
GATGCTCTTCTATATTTCAATAAGTTTTCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL5107Contig1 750 2 2 U
GGGATCTATTTTGTAGCTCTTCCTCTCGTATCTTCGCCCAGACAAGAAGCTACCTTTATC
CGAGGAGTTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTTTCGTACAACCAAATCTTCGAAACCC
TAATATTAAGACCAGGCTTCAGCAAATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCAGGTTCATGTCTG
ATCTTGAAGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACG
CTTGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAA
GCCTGACCACTGCCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACC
TCAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCGGGACTCTGAACTAGGACAGGTTA
TTCAGCTACAAGGTGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGG
TAAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCAAATTCTACATACTTGGTTGTTA
GTTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATTAATCAATCAGCCCTTCTCAAAGG
CAGTATAAACAATCACTTATGTATGATCAATAATGTTTTATATATATTGTCAGAAAACAA
AAATTAATGGTTTGTTTATGAGCGAATGTAACACAAATGTATGAACTTTTGATTTGCGAT
TGTACCGTGAGAATAAACAGTGGTAATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ60TF U 1
AF RR4GQ60JQ C 88
BS 1 599 RR4GQ60TF
BS 600 750 RR4GQ60JQ

RD RR4GQ60TF 599 0 0
GGGATCTATTTTGTAGCTCTTCCTCTCGTATCTTCGCCCAGACAAGAAGCTACCTTTATC
CGAGGAGTTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTTTCGTACAACCAAATCTTCGAAACCC
TAATATTAAGACCAGGCTTCAGCAAATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCAGGTTCATGTCTG
ATCTTGAAGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACG
CTTGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAA
GCCTGACCACTGCCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACC
TCAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCGGGACTCTGAACTAGGACAGGTTA
TTCAGCTACAAGGTGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGG
TAAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCAAATTCTACATACTTGGTTGTTA
GTTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATTAATCAATCAGCCCTTCTCAAAG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4GQ60JQ 663 0 0
TTCCCTTTTCGTACAACCAAATCTTCGAAACCCTAATATTAAGACCAGGCTTCAGCAAAT
CCTTGTCTGTTTGTTCCCTCAGGTTCATGTCTGATCTTGAAGTTCAAGTCCCCACTGCCT
TTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTTGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGC
ACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGACCACTGCCCAGGGCCTTAAGA
AAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTCAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCA
CTGTCGTCCGGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTACAAGGTGATCAGAGGAAGA
ACGTCTCTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGTAAAGAAGGATAACATCAAGATCCATG
GTTTTTGAGCAAATTCTACATACTTGGTTGTTAGTTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAAT
TTGCGTAATTAATCAATCAGCCCTTCTCAAAGGCAGTATAAACAATCACTTATGTATGAT
CAATAATGTTTTATATATATTGTCAGAAAACAAAAATTAATGGTTTGTTTATGAGCGAAT
GTAACACAAATGTATGAACTTTTGATTTGCGATTGTACCGTGAGAATAAACAGTGGTAAT
CCG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5108Contig1 1029 2 4 U
GGGATTGTAAACAGCAAAGAATTAAAACACAGCGAAAAATCAAGAATTGATTCCCTAATA
AGAATCGACGGGAAGAGGAGCAATCGAATTTCCCGGAGGATGCTGCTAGGAGCCCCAAAG
ATTCTGTTAAATTGAAAAAAATGGGGGGAGAAGATTCTGAACGCGATAAAGATGGAAAGT
GGAAACCTCCGCCGCCGCAGAAGGCCGACTTAAAGCTTTGGGGAATCCTCGCCTTTACTG
TAATCGGCGCAACCGCCACCACTTTCGCCGTAGGTAGAGCACAGTCAGCAGCGCGGAGAG
GAACCAAAGGCGGTTCTTTCAGAACAGCTTATCAGGAGGAAGCTTGGAGAAGGTACAATA
AACGGATGCAAGAGGAGTATGAGGAAGAGCTTGAGAGAGTGGAACGTATTAGGCGTATGC
AAAGCGTATTCAACAGGGAGAGTAACAAATTTAGAGGGGGCTTCGAGAACTGGAAGGAAA
ATGATCCTAATGCTCACCAGTACCATCAGCAGTATCAGCGAAATGATTGGTACTGGAAAG
CTGAGTCTACCTTTAGAAACCAAAGGACCAATCACCAGGAGCCTCCTCCAAAACAGACTA
GAGTCTATCCACTGTCGCATCACTACTCTGTTTTAGGGCTCAGCAGGTCCAGGGCAACTC
CATACACAGAAGCTGAGATTAAGAAAGCCTTCAGGGAGGAGGCGATGGAGTTCCATCCAG
ACCAAAATCAAGATAACAAAGATGTAGCTGAGGCAAAATTCAAAGAGGTGTTACTTTCGT
ATGAAGCTATAAAAGAGGAAAGAAAAGACAAGTAGGTTTTTTTTGTTAAAGAGATCAAAT
CTTTTTCCCCAATACAGGCGACGAATGTCGATATATGAAACAGCTTTCTTCGGGTGTGTT
CGCATTATAGGTTCATTTATATAATAATTTTATGGTTTGTGTTCGACGCAGTTGTGGTTC
TTTGTTGTAATATAACGAAACCAAGTCCAGATTAATTAAGATGGAAATAAGGAAAACATA
AGAACAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB76TF U 1
AF RR4FB76JQ C 273
BS 1 646 RR4FB76TF
BS 647 647 RR4FB76JQ
BS 648 690 RR4FB76TF
BS 691 1029 RR4FB76JQ

RD RR4FB76TF 690 0 0
GGGATTGTAAACAGCAAAGAATTAAAACACAGCGAAAAATCAAGAATTGATTCCCTAATA
AGAATCGACGGGAAGAGGAGCAATCGAATTTCCCGGAGGATGCTGCTAGGAGCCCCAAAG
ATTCTGTTAAATTGAAAAAAATGGGGGGAGAAGATTCTGAACGCGATAAAGATGGAAAGT
GGAAACCTCCGCCGCCGCAGAAGGCCGACTTAAAGCTTTGGGGAATCCTCGCCTTTACTG
TAATCGGCGCAACCGCCACCACTTTCGCCGTAGGTAGAGCACAGTCAGCAGCGCGGAGAG
GAACCAAAGGCGGTTCTTTCAGAACAGCTTATCAGGAGGAAGCTTGGAGAAGGTACAATA
AACGGATGCAAGAGGAGTATGAGGAAGAGCTTGAGAGAGTGGAACGTATTAGGCGTATGC
AAAGCGTATTCAACAGGGAGAGTAACAAATTTAGAGGGGGCTTCGAGAACTGGAAGGAAA
ATGATCCTAATGCTCACCAGTACCATCAGCAGTATCAGCGAAATGATTGGTACTGGAAAG
CTGAGTCTACCTTTAGAAACCAAAGGACCAATCACCAGGAGCCTCCTCCAAAACAGACTA
GAGTCTATCCACTGTCGCATCACTACTCTGTTTTAGGGCTCAGCAG*TCCAGGGCAACTC
CATACACAGAAGCTGAGATTAAGAAAGCCT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4FB76JQ 757 0 0
GGTAGAGCACAGTCAGCAGCGCGGAGAGGAACCAAAGGCGGTTCTTTCAGAACAGCTTAT
CAGGAGGAAGCTTGGAGAAGGTACAATAAACGGATGCAAGAGGAGTATGAGGAAGAGCTT
GAGAGAGTGGAACGTATTAGGCGTATGCAAAGCGTATTCAACAGGGAGAGTAACAAATTT
AGAGGGGGCTTCGAGAACTGGAAGGAAAATGATCCTAATGCTCACCAGTACCATCAGCAG
TATCAGCGAAATGATTGGTACTGGAAAGCTGAGTCTACCTTTAGAAACCAAAGGACCAAT
CACCAGGAGCCTCCTCCAAAACAGACTAGAGTCTATCCACTGTCGCATCACTACTCTGTT
TTAGGGCTCAGCAGGTCCAGGGCAACTCCATACACAGAAGCTGAGATTAAGAAAGCCTTC
AGGGAGGAGGCGATGGAGTTCCATCCAGACCAAAATCAAGATAACAAAGATGTAGCTGAG
GCAAAATTCAAAGAGGTGTTACTTTCGTATGAAGCTATAAAAGAGGAAAGAAAAGACAAG
TAGGTTTTTTTTGTTAAAGAGATCAAATCTTTTTCCCCAATACAGGCGACGAATGTCGAT
ATATGAAACAGCTTTCTTCGGGTGTGTTCGCATTATAGGTTCATTTATATAATAATTTTA
TGGTTTGTGTTCGACGCAGTTGTGGTTCTTTGTTGTAATATAACGAAACCAAGTCCAGAT
TAATTAAGATGGAAATAAGGAAAACATAAGAACAGAG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL5109Contig1 742 2 5 U
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ATCCATCATCATCATCGTACAGGTTCTTTATTACACTAATGTTCAGGGAAAAGGAAATGT
AAGGAAAGGGGGTCAAGAGTTTTGGAGCAAATTGTCGAAATAAAGGTTTAAAACATATCT
AGCGGCGGAAAGAACATCAAGGCGTCTCTCACTAGGCTCGTACTTACCTTTCCGGAGCTG
ATACCGATGAGTTACCGCCGAGATTGTGTACGTTTGACCTTCTATCATTACGTTCTCTCC
GCACTGAAGATTATGAGGAAGGCAACGAACGCCGAGAGATTTAGGTGGGGGAGTAATTTC
AATGACTTTATAAGGAGAAATGCTTTGATGATCTCTTCCTCCTTTCTCCTTCTTTCTGCA
ATCTATCCTCCTCCTCCTCTCTACCTGCCACATCTCTCCATTTTTCAAACAACCCTAATA
ATCAGAAAAACAATTTTAAAAAGAAGGGACTGATTGCAATGAAACTCGCTTCTGAGAATC
GTTACTTTTCCGATGCAGACGATGTTAGATGCAACTAGTGTTGCCATCTCCGGAATATCT
GTTTCTCAAGCCCAGAAAATGCTGCTAATGTAACAGAGATAAGAGAGAGAGATAGAGAGA
ATCAAAACGATGATGAAAAGTTGGCTTGGTGAAATTTCCGGGGAAGAACTCAAGTTTTTC
TGAATAGTGAAATGGAAAACCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF02JQ U 2
AF RR4DF02TF C 1
BS 1 1 RR4DF02TF
BS 2 375 RR4DF02JQ
BS 376 376 RR4DF02TF
BS 377 502 RR4DF02JQ
BS 503 742 RR4DF02TF

RD RR4DF02JQ 501 0 0
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GCGGCGGAAAGAACATCAAGGCGTCTCTCACTAGGCTCGTACTTACCTTTCCGGAGCTGA
TACCGATGAGTTACCGCCGAGATTGTGTACGTTTGACCTTCTATCATTACGTTCTCTCCG
CACTGAAGATTATGAGGAAGGCAACGAACGCCGAGAGATTTAGGTGGGGGAGTAATTTCA
ATGACTTTATAAGGGGAAATGCTTTGATGATCTCTTCCTCCTTTCTCCTTCTTTCTGCAA
TCTATCCTCCTCCTCCTCTCTACCTGCCACATCTCTCCATTTTTCAAACAACCCTAATAA
TCAGAAAAACAATTTTAAAAA

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4DF02TF 742 0 0
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ATCCATCATCATCATCGTACAGGTTCTTTATTACACTAATGTTCAGGGAAAAGGAAATGT
AAGGAAAGGGGGTCAAGAGTTTTGGAGCAAATTGTCGAAATAAAGGTTTAAAACATATCT
AGCGGCGGAAAGAACATCAAGGCGTCTCTCACTAGGCTCGTACTTACCTTTCCGGAGCTG
ATACCGATGAGTTACCGCCGAGATTGTGTACGTTTGACCTTCTATCATTACGTTCTCTCC
GCACTGAAGATTATGAGGAAGGCAACGAACGCCGAGAGATTTAGGTGGGGGAGTAATTTC
AATGACTTTATAAGGAGAAATGCTTTGATGATCTCTTCCTCCTTTCTCCTTCTTTCTGCA
ATCTATCCTCCTCCTCCTCTCTACCTGCCACATCTCTCCATTTTTCAAACAACCCTAATA
ATCAGAAAAACAATTTTAAAAAGAAGGGACTGATTGCAATGAAACTCGCTTCTGAGAATC
GTTACTTTTCCGATGCAGACGATGTTAGATGCAACTAGTGTTGCCATCTCCGGAATATCT
GTTTCTCAAGCCCAGAAAATGCTGCTAATGTAACAGAGATAAGAGAGAGAGATAGAGAGA
ATCAAAACGATGATGAAAAGTTGGCTTGGTGAAATTTCCGGGGAAGAACTCAAGTTTTTC
TGAATAGTGAAATGGAAAACCC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL5110Contig1 845 2 2 U
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CTTCATCATCTCCGATCGCCGCCGTCTTCTCCGTCGCGCTTCTTCTGTTCTACTTCTCTC
AAGCTACTCTTGGAGCGCCTTGTCCAATCAATGGGTTGCCAATAGTGAGGAATATAAGTG
AACTTCCTCAGGATAACTATGGAAGACCAGGCCTTTCTCACATGACTCTTGCTGGCTCTG
TTTTGCACGGAATGAAAGAGGTTGAGATATGGCTTCAAACATTTGCTCCAGGTTCAGGGA
CACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTAAGGGCACTGGTACTT
TCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTGAGTTCCCAATCTTTG
CCAACAGTACTATTCATATTCCCATCAATGATACTCATCAGGTCAAGAACACTGGTCATG
AGGACCTGCAGGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAGTGTTCACATACGATG
ACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACTATTGGGATGAGCAAT
GCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGTTCACTCTTTCCAAAC
TCTTTAAGTGAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAAATATGTAACAGAGCTACATCCTAATT
GCAATTTACCTACACTTATTAGTTTGCAGAACAGTTAATGTGGTCTATATTTATGTTTGT
TAACATACACTCTTGACATTTGATCTTTATACTTGTCCCTGTATTAATGCCATAACATTT
AGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RR4F191TF U 1
AF RR4F191JQ C 227
BS 1 737 RR4F191TF
BS 738 845 RR4F191JQ

RD RR4F191TF 737 0 0
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CTTCATCATCTCCGATCGCCGCCGTCTTCTCCGTCGCGCTTCTTCTGTTCTACTTCTCTC
AAGCTACTCTTGGAGCGCCTTGTCCAATCAATGGGTTGCCAATAGTGAGGAATATAAGTG
AACTTCCTCAGGATAACTATGGAAGACCAGGCCTTTCTCACATGACTCTTGCTGGCTCTG
TTTTGCACGGAATGAAAGAGGTTGAGATATGGCTTCAAACATTTGCTCCAGGTTCAGGGA
CACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTAAGGGCACTGGTACTT
TCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTGAGTTCCCAATCTTTG
CCAACAGTACTATTCATATTCCCATCAATGATACTCATCAGGTCAAGAACACTGGTCATG
AGGACCTGCAGGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAGTGTTCACATACGATG
ACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACTATTGGGATGAGCAAT
GCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGTTCACTCTTTCCAAAC
TCTTTAAGTGAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAAATATGTAACAGAGCTACATCCTAATT
GCAATTTACCTACACTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4F191JQ 619 0 0
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TCCAGGTTCAGGGACACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTAA
GGGCACTGGTACTTTCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTGA
GTTCCCAATCTTTGCCAACAGTACTATTCATATTCCCATCAATGATACTCATCAGGTCAA
GAACACTGGTCATGAGGACCTGCAGGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAGT
GTTCACATACGATGACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACTA
TTGGGATGAGCAATGCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGTT
CACTCTTTCCAAACTCTTTAAGTGAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAAATATGTAACAGA
GCTACATCCTAATTGCAATTTACCTACACTTATTAGTTTGCAGAACAGTTAATGTGGTCT
ATATTTATGTTTGTTAACATACACTCTTGACATTTGATCTTTATACTTGTCCCTGTATTA
ATGCCATAACATTTAGACC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL5111Contig1 508 2 2 U
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TCTTCATGCAATAAAGAGAAAATGTACAATCAATTTGCACTAAGCTATAACAGGAGAGAA
AACTAATGGATGTCTCTAGACTTGTGAACTTGTTACGCAACTCCACCTTCTAGCTGGACA
TCCCTCGCCTAGAATCATAAGCGTCCCCATATTGTTTGCTGACAGATTGTACACATACTT
GTTTTGTTTGCCTTTCTCTCTCCAAGAAACGAAAGACACAATCCACTTGAAGACCGTTCC
TACAGAGAACGCTTTCAGAAACGGTATTTTGCTAACCGGGTTTCGCCTTGTGACAGTTTC
CTTTGATAAATGCTGTGCGATCTCTTTCAGCAACACCAGCTGAGCTTGGTCAGTCCGCAT
CGATACAATGACCTGTCTCAGTGACTCCCTGTCAGCCTCAAGTGCTTGAAGCCTTGTGTA
TAGCTTCTCATTATCTGTCTCGTAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GS50TF C 1
AF RR4GS50JQ U 378
BS 1 381 RR4GS50TF
BS 382 508 RR4GS50JQ

RD RR4GS50TF 497 0 0
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TCTTCATGCAATAAAGAGAAAATGTACAATCAATTTGCACTAAGCTATAACAGGAGAGAA
AACTAATGGATGTCTCTAGACTTGTGAACTTGTTACGCAACTCCACCTTCTAGCTGGACA
TCCCTCGCCTAGAATCATAAGCGTCCCCATATTGTTTGCTGACAGATTGTACACATACTT
GTTTTGTTTGCCTTTCTCTCTCCAAGAAACGAAAGACACAATCCACTTGAAGACCGTTCC
TACAGAGAACGCTTTCAGAAACGGTATTTTGCTAACCGGGTTTCGCCTTGTGACAGTTTC
CTTTGATAAATGCTGTGCGATCTCTTTCAGCAACACCAGCTGAGCTTGGTCAGTCCGCAT
CGATACAATGACCTGTCTCAGTGACTCCCTGTCAGCCTCAAGTGCTTGAAGCCTTGTGTA
TAGCTTCTCATTATCTG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4GS50JQ 131 0 0
CGAA
CTCTTTCAGCAACACCAGCTGAGCTTGGTCAGTCCGCATCGATACAATGACCTGTCTCAG
TGACTCCCTGTCAGCCTCAAGTGCTTGAAGCCTTGTGTATAGCTTCTCATTATCTGTCTC
GTAAACT

QA 5 131 5 131
DS 



AS 1 2

CO CL5112Contig1 765 2 2 U
GGACACTCCATTCACCCACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTCTTTCACAACAATCTCTGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACAGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
ACCATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTCTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
ATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTTG
GTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGTT


BQ
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AF RR4CY26TF U 1
AF RR4CY26JQ C 416
BS 1 719 RR4CY26TF
BS 720 765 RR4CY26JQ

RD RR4CY26TF 719 0 0
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AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTCTTTCACAACAATCTCTGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACAGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
ACCATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTCTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
ATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4CY26JQ 350 0 0
TTTT
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ATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAA
TCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCT
GTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTCTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGA
AATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTT
GGTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGTT

QA 5 350 5 350
DS 



AS 1 2

CO CL5113Contig1 1087 2 6 U
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ATCTGGAATTGGCATCTGTCTATAGAGAGGAATCGTTTCCTATCTGTTAGGCTTTTTCCA
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ACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGATTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGATGTT
GAGTTTCTTGATCTCAAAATCTGCCCTTTGAATGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCA
ACGGATACAACGATGCAATCAATCTCAACGCAAACCACTCTCAAATGCTTATCCCGTATG
CTAGAAGAAAACATCCTCTACGACGTAACCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCGCT
CACAAGGCCATCCTCTCCGCCAGCTCAAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCATCACGACCTC
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CTCCTTAGCTACCTCTACGGAAGCATAACGCAGGAAGACTTCTGGAAACACACGCTCGCG
CTTCTAGGAGCCGCCAACAAGTACGATATCACGGATCTGAAAGCGGCATGCGAGGAGAGC
CTGATGGAAGATATAAACTCCGGGAACGTGCTGGAGAGGCTGCAGGAGGCTTGGCTTTAT
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ATGTTCCAGGAGGTTTTGTCGGTGTGGAAACCGGTTTGAGAAATAATATTATACTTTTGA
AACATTTGTTTTCAAAATGTTTCAGTTTGATTGTGTTATGTGTCTATAATCATATGATAT
CTTGCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB18TF U 1
AF RR4BB18JQ C 266
BS 1 693 RR4BB18TF
BS 694 694 RR4BB18JQ
BS 695 788 RR4BB18TF
BS 789 789 RR4BB18JQ
BS 790 801 RR4BB18TF
BS 802 1087 RR4BB18JQ

RD RR4BB18TF 806 0 0
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TGGCGGATTGAAAATTTTGGACCTTGCTCTTTCAAAAAGTCTGATCCTTTCAAAGTTGGA
ATCTGGAATTGGCATCTGTCTATAGAGAGGAATCGTTTCCTATCTGTTAGGCTTTTTCCA
GAACTCTCTCGTGTATCCAAGGAACAACCTCCTATTGCTAAATTTGTTCTTCGTGTCTCC
AACGTTGGCCCTAACCGTAAACTATACATCTCTCCTGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACA
ACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGATTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGATGTT
GAGTTTCTTGATCTCAAAATCTGCCCTTTGAATGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCA
ACGGATACAACGATGCAATCAATCTCAACGCAAACCACTCTCAAATGCTTATCCCGTATG
CTAGAAGAAAACATCCTCTACGACGTAACCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCGCT
CACAAGGCCATCCTCTCCGCCAGCTCAAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCATCACGACCTC
AAGGAGAAAGAGTCATCCACCATCCACATCGACGACATGTCTAGAGAATCCTGCATGGCG
CTCCTTAGCTACCTCTACGGAAGCATAACGCAG*AAGACTTCTGGAAACACACGCTCGCG
CTTCTAGGAGCCGCCAACAAGTACGATATCACGGATCTGAAAGCGGCATGCGAGGAGAGC
CTGATGGA*GATATAAACTCC
CGGGA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4BB18JQ 822 0 0
ACATCTCTCCTGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACAACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGG
ATTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGATGTTGAGTTTCTTGATCTCAAAATCTGCC
CTTTGAATGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGGATACAACGATGCAATCAATCT
CAACGCAAACCACTCTCAAATGCTTATCCCGTATGCTAGAAGAAAACATCCTTTACGACG
TAACCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCGCTCACAAGGCCATCCTCTCCGCCAGCT
CAAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCATCACGACCTCAAGGAGAAAGAGTCATCCACCATCC
ACATCGACGACATGTCTAGAGAATCCTGCATGGCGCTCCTTAGCTACCTCTACGGAAGCA
TAACGCAGGAAGACTTCTGGAAACACAGGCTCGCGCTTTTAGGAGCCGCCAACAAGTACG
ATATCACGGATCTGAAGGCGGCATGCGAGGAGAGCCTGATGGAAGATATAAACTCCGGGA
ACGTGCTGGAGAGGCTGCAGGAGGCTTGGCTTTATCAGCTGGAGAAACTGAAGAAAGGGT
GTTTGATGTATTTGTTTGATTTCGGAAAGATTTATGATGTCAGGGAGGAGATCAGCGGTT
TCTTCAGGCAGGCTGATCGTGAGCTGATGCTGGAGATGTTCCAGGAGGTTTTGTCGGTGT
GGAAACCGGTTTGAGAAATAATATTATACTTTTGAAACATTTGTTTTCAAAATGTTTCAG
TTTGATTGTGTTATGTGTCTATAATCATATGATATCTTGCTT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5114Contig1 936 2 10 U
GATAGTGGAGGGAGAAGAAGCTTCCTTCTTTGCGCTCGTGGATGGAGAGAACGCCATTCC
TCTAGAATCTGCTCAGGACCACAAGAGGGTTGGAGATGGAGACACCGGTCCGAACACAGG
AGGGATGGGAGCTTATTCTCCTGCACCGGTTTTGACCGAGGAGCTTCAGGATGTGGTGAT
GGAGACTATAATCCATCCTACTGTTAAGGGAATGGCTGAAGAAGGGTGTAAGTTCGTCGG
TGTTCTGTTTGCTGGTCTCATGATTGAGAAGAAATCCGGTTTACCTAAGCTGATTGAGTT
CAATGTCCGGTTTGGAGATCCGGAATGTCAGGTACTGATGATGCGTCTAGAGTCTGACTT
AGCCAAAGTTTTGCTAGCGGCTTGTAGAGGCGAGCTAAAGGGTGTGTCGCTGGACTGGTC
TAAAGATTCAGCAATGGTGGTTGTAATGGCGAGCAGAGGCTATCCAGGTGCTTACGAGAA
AGGATCCATCATCAGAAACCTTGAAGAAGCTGAGAGAGTTGCTCCAGGAGTGAAGGTTTT
CCATGCTGGGACGGGTCTTGATAAAGAAGGGAACGTTGTGGCGAGTGGGGGACGTGTTCT
TGGTGTCACAGCTAAGGGTGGAGACTTGGAAGAGGCGCGAGAAAGAGCGTATATGGCGGT
CGGACAGATCAACGGGCCGGGAGGTTTCTTTAGGAGTGATATTGGTTGGAGAGCGCTTCT
ACAGAAACAACAAGTAGCTTCAAAAGAGTGAAGAGAGAAACTTTTGTTTGTAATGGTTGC
GCGTGTAACCAATTGAAATCTTATTATGATAATAAATTCACCAGGCTTAAGGGTAAACAT
TTTCTAAAGCAGCCAATAGGCTCTCTTTGTTGCTCTCATTAAAAAATTCTGACAAAATCA
TATTTAAGGTTTCAAAACATTGGAAATTTGATCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F920TF U 1
AF RR4F920JQ C 206
BS 1 617 RR4F920TF
BS 618 618 RR4F920JQ
BS 619 671 RR4F920TF
BS 672 673 RR4F920JQ
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BS 695 722 RR4F920TF
BS 723 936 RR4F920JQ

RD RR4F920TF 722 0 0
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TCTAGAATCTGCTCAGGACCACAAGAGGGTTGGAGATGGAGACACCGGTCCGAACACAGG
AGGGATGGGAGCTTATTCTCCTGCACCGGTTTTGACCGAGGAGCTTCAGGATGTGGTGAT
GGAGACTATAATCCATCCTACTGTTAAGGGAATGGCTGAAGAAGGGTGTAAGTTCGTCGG
TGTTCTGTTTGCTGGTCTCATGATTGAGAAGAAATCCGGTTTACCTAAGCTGATTGAGTT
CAATGTCCGGTTTGGAGATCCGGAATGTCAGGTACTGATGATGCGTCTAGAGTCTGACTT
AGCCAAAGTTTTGCTAGCGGCTTGTAGAGGCGAGCTAAAGGGTGTGTCGCTGGACTGGTC
TAAAGATTCAGCAATGGTGGTTGTAATGGCGAGCAGAGGCTATCCAGGTGCTTACGAGAA
AGGATCCATCATCAGAAACCTTGAAGAAGCTGAGAGAGTTGCTCCAGGAGTGAAGGTTTT
CCATGCTGGGACGGGTCTTGATAAAGAAGGGAACGTTGTGGCGAGTGGGGGACGTGTTCT
TGGTGTCACAGCTAAGG*TGGAGACTTGGAAGAGGCGCGAGAAAGAGCGTATATGGCGGT
CGGACAGATCACTGGGCCGGGAG*TTTCTTTAG*AGTGATATTGGTTGGAGAGCGCTTCT
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4F920JQ 731 0 0
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GAGAAGAAATCCGGTTTACCTAAGCTGATTGAGTTCAATGTCCGGTTTGGAGATCCGGAA
TGTCAGGTACTGATGATGCGTCTAGAGTCTGACTTAGCCAAAGTTTTGCTAGCGGCTTGT
AGAGGCGAGCTAAAGGGTGTGTCGCTGGACTGGTCTAAAGATTCAGCAATGGTGGTTGTA
ATGGCGAGCAGAGGCTATCCAGGTGCTTACGAGAAAGGATCCATCATCAGAAACCTTGAA
GAAGCTGAGAGAGTTGCTCCAGGAGTGAAGGTTTTCCATGCTGGGACGGGTCTTGATAAA
GAAGGGAACGTTGTGGCGAGTGGGGGACGTGTTCTTGGTGTCACAGCTAAGGGTGGAGAC
TTGGAAGAGGCGCGAGAAAGAGCGTATATGGCGGTCGGACAGATCAACTGGCCGGGAGGT
TTCTTTAGGAGTGATATTGGTTGGAGAGCGCTTCTACAGAAACAACAAGTAGCTTCAAAA
GAGTGAAGAGAGAAACTTTTGTTTGTAATGGTTGCGCGTGTAACCAATTGAAATCTTATT
ATGATAATAAATTCACCAGGCTTAAGGGTAAACATTTTCTAAAGCAGCCAATAGGCTCTC
TTTGTTGCTCTCATTAAAAAATTCTGACAAAATCATATTTAAGGTTTCAAAACATTGGAA
ATTTGATCCGC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5115Contig1 758 2 2 U
TTTTATATAAACCCTAGAAAAGGCTTGTTTTTCGCGTTCAGGTGCGATCTCGCTCGTCTT
TAAGATATGACGGTGATGAATCCCTCCTTGTGTATCGGTACACAACCATCGGTCTACCCT
CCTTCTCATTCTGGCAAGTTCCATGGGCGTTACTATCCTCCTACTGGAGTTCCTATGCAA
TCCCATAGCCAGATTAAATTTCCTTCTCTCAAGGCAGTTGCAAGTACAGGAGGAGCCTTT
TTTACCAAAGGATTTGGTTTCGGTTCTGAGAGCAAAACATCTGTCTTTGCATGTAACGCT
GCCCTGAATGCAAAGTGCAGTCAAGGGCAAACGCAGACTGTTACTCGGGAATCACCAACC
ATCACACTAGCTCCTACACATGGAAAGGAGAAATCCCCAAAGCTTGATGATGGTGGAAGC
GGGTTCCCACCTCGGGATGATGGTGGTGGTGGCGGCGGTGGAGGAGGTGGAGAGAGCTTC
TCTGGTGGATTCTTCCTTTTCGGGTTTCTTACGTTCATGGGTTACTTGAAAGATTTGGAG
GGCGAACATGAAAGCAGTCACTAGAGAGAGAGGGGGGAGGAGGGAACAACAATATATGAT
CATCTCACCAACAGACAAATTATTCAAAACAGATAATAATAAAGCCTCTACTAGTGCTCT
ACCAATTAGGCAACACATTTGTATGTTTCATCGATTTCTGATTATGAATCAGACAGAATT
TTTGTTATCTCAGGCATAATACAAATGTTCAAAGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EK32TF U 1
AF RR4EK32JQ C 92
BS 1 604 RR4EK32TF
BS 605 758 RR4EK32JQ

RD RR4EK32TF 604 0 0
TTTTATATAAACCCTAGAAAAGGCTTGTTTTTCGCGTTCAGGTGCGATCTCGCTCGTCTT
TAAGATATGACGGTGATGAATCCCTCCTTGTGTATCGGTACACAACCATCGGTCTACCCT
CCTTCTCATTCTGGCAAGTTCCATGGGCGTTACTATCCTCCTACTGGAGTTCCTATGCAA
TCCCATAGCCAGATTAAATTTCCTTCTCTCAAGGCAGTTGCAAGTACAGGAGGAGCCTTT
TTTACCAAAGGATTTGGTTTCGGTTCTGAGAGCAAAACATCTGTCTTTGCATGTAACGCT
GCCCTGAATGCAAAGTGCAGTCAAGGGCAAACGCAGACTGTTACTCGGGAATCACCAACC
ATCACACTAGCTCCTACACATGGAAAGGAGAAATCCCCAAAGCTTGATGATGGTGGAAGC
GGGTTCCCACCTCGGGATGATGGTGGTGGTGGCGGCGGTGGAGGAGGTGGAGAGAGCTTC
TCTGGTGGATTCTTCCTTTTCGGGTTTCTTACGTTCATGGGTTACTTGAAAGATTTGGAG
GGCGAACATGAAAGCAGTCACTAGAGAGAGAGGGGGGAGGAGGGAACAACAATATATGAT
CATC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4EK32JQ 667 0 0
GTATCGGTACACAACCATCGGTCTACCCTCCTTCTCATTCTGGCAAGTTCCATGGGCGTT
ACTATCCTCCTACTGGAGTTCCTATGCAATCCCATAGCCAGATTAAATTTCCTTCTCTCA
AGGCAGTTGCAAGTACAGGAGGAGCCTTTTTTACCAAAGGATTTGGTTTCGGTTCTGAGA
GCAAAACATCTGTCTTTGCATGTAACGCTGCCCTGAATGCAAAGTGCAGTCAAGGGCAAA
CGCAGACTGTTACTCGGGAATCACCAACCATCACACTAGCTCCTACACATGGAAAGGAGA
AATCCCCAAAGCTTGATGATGGTGGAAGCGGGTTCCCACCTCGGGATGATGGTGGTGGTG
GCGGCGGTGGAGGAGGTGGAGAGAGCTTCTCTGGTGGATTCTTCCTTTTCGGGTTTCTTA
CGTTCATGGGTTACTTGAAAGATTTGGAGGGCGAACATGAAAGCAGTCACTAGAGAGAGA
GGGGGGAGGAGGGAACAACAATATATGATCATCTCACCAACAGACAAATTATTCAAAACA
GATAATAATAAAGCCTCTACTAGTGCTCTACCAATTAGGCAACACATTTGTATGTTTCAT
CGATTTCTGATTATGAATCAGACAGAATTTTTGTTATCTCAGGCATAATACAAATGTTCA
AAGATTT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5118Contig1 1022 2 4 U
GGGCTGAGCCACTGGCTTCTTCTCCGTCGACAGAACTATAGCCGAGGTGCTTCTTCTCAG
CACTGCTTGTCGTCCGAAATGAGTATCTCTGGTGCTGCACTTGGTTCAGGCAGAATTTTA
GGAAGAGCGGTAGAGTTTGGGAAAACTCATGTGGTTAGGCCCAAAGGGAAACACCAAGCT
ACTATTGTCTGGCTACATGGTCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGCTTTTGGAG
ACACTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCAACTGCTCCTTCTCAACCTATAAGT
TTATTTGGTGGTTTTCCCTCTACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGGCATCAATGAAGATGGA
CCTGATGATGTAGAAGGACTGGATGGGGCTGCCGCACATGTTGCAAATTTGTTATCGAAT
GAGCCTGGTGACATTAAATTAGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCAGGGACGTCTTTA
TATTCTGCGACATGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAAT
TTAAGCACAGTCATTGGCTTAAGCGGTTGGCTTCCTTGTGCAAAGACACTGGCTGGCAAA
CTAGAAGAGGAACAAATCAAGAACCGAGCCGCGTCCTTACCAATTTTAGTTTGTCATGGA
AAAGGTGATGATGTGGTACCGTACAAGTTTGGGGAGAAATCTTCACAAGCCTTGATATCA
CATGGGTTTAAGAAAACCACCTTCAAAACTTACACTGACTTGGCCACTATACCATCCCAC
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GCTTTTCAATCATGTCACTTTTTGATGAAAAAACCCTTCAAAATCTTGAAAGTTTCATTG
ATTTTGATTAGATCCTTCCTTCGTATTTTCACTTTAATATGTATACATTGGAGTATTTAT
GTAACATCAAATATTAGTAGCGGTAGTCTTAAAAGTTGAGAGATTAAGAAGTATTAGATT
TT


BQ
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10 10 

AF RR4GY71TF U 1
AF RR4GY71JQ C 281
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CACTGCTTGTCGTCCGAAATGAGTATCTCTGGTGCTGCACTTGGTTCAGGCAGAATTTTA
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ACTATTGTCTGGCTACATGGTCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGCTTTTGGAG
ACACTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCAACTGCTCCTTCTCAACCTATAAGT
TTATTTGGTGGTTTTCCCTCTACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGGCATCAATGAAGATGGA
CCTGATGATGTAGAAGGACTGGATGGGGCTGCCGCACATGTTGCAAATTTGTTATCGAAT
GAGCCTGGTGACATTAAATTAGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCAGGGACGTCTTTA
TATTCTGCGACATGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAAT
TTAAGCACAGTCATTGGCTTAAGCGGTTGGCTTCCTTGTGCAAAGACACTGGCTGGCAAA
CTAGAAGAGGA*CAAATCAAGAACCGAGCCGCGTCCTTACCAATTTTAGTTTGTCATG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GY71JQ 742 0 0
CTCT
TTCTCAACCTATAAGTTTATTTGGTGGTTTTCCCTCTACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGG
CATCAATGAAGATGGACCTGATGATGTAGAAGGACTGGATGGGGCTGCCGCACATGTTGC
AAATTTGTTATCGAATGAGCCTGGTGACATTAAATTAGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGG
TGCAGGGACGTCTTTATATTCTGCGACATGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAA
TCCTTACCCTATCAATTTAAGCACAGTCATTGGCTTAAGCGGTTGGCTTCCTTGTGCAAA
GACACTGGCTGGCAAACTAGAAGAGGAACAAATCAAGAACCGAGCCGCGTCCTTACCAAT
TTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTGATGATGTGGTACCGTACAAGTTTGGGGAGAAATCTTC
ACAAGCCTTGATATCACATGGGTTTAAGAAAACCACCTTCAAAACTTACACTGACTTGGC
CACTATACCATCCCACAGGAGATGGATGAGTTATGCTCGTGGTTAACATCTAACCTCGGC
CTGGAAGGTTGAAAAGGCTTTTCAATCATGTCACTTTTTGATGAAAAAACCCTTCAAAAT
CTTGAAAGTTTCATTGATTTTGATTAGATCCTTCCTTCGTATTTTCACTTTAATATGTAT
ACATTGGAGTATTTATGTAACATCAAATATTAGTAGCGGTAGTCTTAAAAGTTGAGAGAT
TAAGAAGTATTAGATTTT

QA 5 742 5 742
DS 



AS 1 2

CO CL5119Contig1 951 2 6 U
GCAGCAATCTGAAGAGCAAATTTTGGGGTCGGTCGATTCAGCTTGATCCTGTTGGTGTGT
TGACTTTGCAGTTTGATGATGGAGAAATCCTTCAGTGGAGTAAGGTGACTACATCTATAT
ACAATCTCATACTTGGTAAACTTTACTGTGATCACTATGGCACTATGCGTATCGAGGGCA
GTGCTGAATACTCTTGTAAACTTAAATTCAAAGAGCAGTCGATCATTGACCGAAATCCTC
ACCAGGTTCATGGTATAGTTCAAGACAAGAGTGGGAAGACAGTGGCAACGATGTTTGGGA
AATGGGATGAGAGCATGCACTATGTGACGGGTGATTGTTCTGGGGAGGGGAAACTGAGCG
AAGATATGTTAGGAGCTCAAGTTCTCTGGAAACGGAGCAAACCCCCTGGAAACACAACAA
AGTATAATCTAACACGTTTCGCAATCACGCTGAACGAGCTTACACTTGGGCTGAAGGAGA
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TTGAAATGGCCAACACAGAGAAGTTGCGGCTGGAACAGCGACAGCGTCAGGCTAGGAAGA
TGCAGGAGAGAGGATGGAAGCCGAGGTGGTTCACGAAAGAGAAAGGAAGCGAGGCTTACC
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TCTTCGGTCACATCGATTCCGAACAACAAATTGAGTAAATAAGCATAAGTTTCAATTCTG
GTCTCATCGATTCTTAAAACCACAAAATCTTTATCTTCTTCCTTTCTTTTCATTATAGTT
TGGTGTTTTCTCTTTTTTTTTCATGGTCTTTTTATTCTTTACTCGCAAGTTTGCCTTACA
GAACATCTCCTGTCTTTTTCTTTTGTAATCAAGAAAAAGTTCGACACGTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EG87TF U 1
AF RR4EG87JQ C 214
BS 1 545 RR4EG87TF
BS 546 546 RR4EG87JQ
BS 547 605 RR4EG87TF
BS 606 606 RR4EG87JQ
BS 607 734 RR4EG87TF
BS 735 951 RR4EG87JQ

RD RR4EG87TF 734 0 0
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AAGATATGTTAGGAGCTCAAGTTCTCTGGAAACGGAGCAAACCCCCTGGAAACACAACAA
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TCTTCGGTCACATC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4EG87JQ 738 0 0
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AGTAAATAAGCATAAGTTTCAATTCTGGTCTCATCGATTCTTAAAACCACAAAATCTTTA
TCTTCTTCCTTTCTTTTCATTATAGTTTGGTGTTTTCTCTTTTTTTTTCATGGTCTTTTT
ATTCTTTACTCGCAAGTTTGCCTTACAGAACATCTCCTGTCTTTTTCTTTTGTAATCAAG
AAAAAGTTCGACACGTAC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL5120Contig1 822 2 4 U
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TGCTGAAAGTTGCCAAGCTTCTCCACGCTAGAGGCTTCCACGTCACCTTCGTCAACACCG
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CCTTTCGCTTCGAGACTATCCCTGATGGTCTTCCTTGGACCGACGTAGACGCTAAGCAGG
ACATGCTTAAGCTTATAGACTCCACCATGAGGAACTGTTTATCCCCGTTCAAAGATCTTC
TCACCCGGTTGAACTCCGGTTTTGATGTACCGCCGGTTAACTGTATCGTCTCTGACGCTT
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BQ
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AF RR4GZ35TF U 1
AF RR4GZ35JQ C 266
BS 1 753 RR4GZ35TF
BS 754 754 RR4GZ35JQ
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RD RR4GZ35TF 788 0 0
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CCTTTCGCTTCGAGACTATCCCTGATGGTCTTCCTTGGACCGACGTAGACGCTAAGCAGG
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TCACCCGGTTGAACTCCGGTTTTGATGTACCGCCGGTTAACTGTATCGTCTCTGACGCTT
CAATGAGTTTTACTATTGACGCGGCGGAGGAGCTTGAGATTCCGGTGGTTCTGCTTTGGA
CGAATAGCGCTACTGCGCTTATCTTGTATCTTCACTATCAAAAACTCATCGAGAATGGGA
TCATTCCGGTAAAAGGAGGGGACAAAGTTGGATAAGCATCAACTTGAGGAAAACGAGAGA
TGTCGAATATGACTTACAAAATTTGGATTGGAGTGGACAATAATGAAAGCCTGTGCTCTG
ACGGCTTTAGATTCTAGTATTATGTTTAGATCGAGCAGTTCTTATTACTACTATATTTAT
TGATAAGTATTATCTTTCTTTTTACCAAAAAAA*GTCCTATCTTTCTTGTCGCCATTAAA
AAGAAA
AA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4GZ35JQ 557 0 0
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GTATCTTCACTATCAAAAACTCATCGAGAATGGGATCATTCCGGTAAAAGGAGGGGACAA
AGTTGGATAAGCATCAACTTGAGGAAAACGAGAGATGTCGAATATGACTTACAAAATTTG
GATTGGAGTGGACAATAATGAAAGCCTGTGCTCTGACGGCTTTAGATTCTAGTATTATGT
TTAGATCGAGCAGTTCTTATTACTACTATATTTATTGATAAGTATTATCTTTCTTTTTAC
CAAAAAAAAGTCCTATCTTTCTTGTCGCCATTAAAAAGAAACAATCTGTCTTTTCCAATA
ATAATTTATTAGTAGAG

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL5121Contig1 706 2 1 U
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ACTCCCTCTAGACCCATTCACACTCCACAACCATCCAGATACTCCCGAGGAGGAGGAAGA
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AAATCCGTAAGCAACATGAGTATCGATTCCACTGTTTCAATGCCTGCAACGATTGGGAAG
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TCTCAGATGATTTGTTTTACGAGTGTTTGATGATTTTGAGTGATGATGTTTGTAATCTGA
AGTTACGAGTTTACAGATGTTATGTTAATAATAAAAAGTAAACAGC


BQ
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AF RR4CI62JQ C 1
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TCC


BQ
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20 20 20 

AF RR4FN87TF C 1
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TCC

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BQ
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AF RR4G420JQ C 1
AF RR4G420TF U 1
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QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL5124Contig1 707 2 2 U
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CACATCATAAACTGCATCAAGTGAGCCATTCAACTCCTCCAAGCAGGAGACGAAACCTTT
TGTCTTGGGAAGCAACACATTGTTCAGTATTGGAAGGCCATTTTCAGCTGCAAACTTCTT
GCTCCTTTCGCATTTAGCCTCTGTGTAATCTGTGCCCTCGGGGAAAA


BQ
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AF RR4DQ68JQ U 1
AF RR4DZ65JQ U 1
BS 1 507 RR4DQ68JQ
BS 508 707 RR4DZ65JQ

RD RR4DQ68JQ 511 0 0
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AAAA

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DS 

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TCTCAACCTCAAAATATAATACTAAAATATAAACATTAAAAGATAGGTTTATTTGTTTGC
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AGCATAGGTCAAGTAGGCACAGACCAAAGAGACATAGATCTTGAATCAGATCATCGACGA
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CTTTTCTTCATTTGGGATTTGGCTTTGGCTGATACGACGGATGTGGATGTGAACTTCTGA
TGGTTCAGTACCATAGACATTGTCTAAGAAAGACGGACAACGGGTTTTGTAACCGATGGT
CACATCATAAACTGCATCAAGTGAGCCATTCAACTCCTCCAAGCAGGAGACGAAACCTTT
TGTCTTGGGAAGCAACACATTGTTCAGTATTGGAAGGCCATTTTCAGCTGCAAACTTCTT
GCTCCTTTCGCATTTAGCCTCTGTGTAATCTGTGCCCTCGGGGAAAA

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL5125Contig1 504 2 1 U
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TAGCGATCTTTGGTCTTTTATTAATTACAATATTTTTTCTTTTGTATTTAATTCGGATCT
TTATTTGAATATCAGTATGAACAG


BQ
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AF RR4AT92JQ C 1
AF RR4AT92TF U 1
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CAACTTGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAGCTCTGAAGATCAGGGGTAACT
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QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4AT92TF 504 0 0
GAGCTTAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACTCGACGCT
GCGAGGAATACTAATGCTAAGACTATGGGTCCTGTCCCATTGCCCACCAAGAAGCGTATC
TACTGTGTTCTCAAGTCTCCTCACGTTCACAAGGATGCAAGGTTCCATTTTGAGATCAGG
ACCCACCAGCGAATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCTCAGACCATTGATTCCTTGATG
CAACTTGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAGCTCTGAAGATCAGGGGTAACT
ACTACAATGATGATGGGAACTTGCATTGCATGAACAGACTGTTTCAGATCAACGACGTTG
GTTAGAACTTGTAAGCCCTGTATACTCTTTTTGAGAGCCTCTGTAATGAGTATTTTCTGT
TAGCGATCTTTGGTCTTTTATTAATTACAATATTTTTTCTTTTGTATTTAATTCGGATCT
TTATTTGAATATCAGTATGAACAG

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5126Contig1 800 2 8 U
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ATTCTTAGTTCTTTCATCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM62TF U 1
AF RR4GM62JQ C 236
BS 1 722 RR4GM62TF
BS 723 723 RR4GM62JQ
BS 724 731 RR4GM62TF
BS 732 732 RR4GM62JQ
BS 733 753 RR4GM62TF
BS 754 756 RR4GM62JQ
BS 757 780 RR4GM62TF
BS 781 800 RR4GM62JQ

RD RR4GM62TF 780 0 0
GGGAGAAAGTAAAAATAATAAAAAGGGAGGAAAAATGGTTACCACCCGGCAAAAGAAGGC
CAGAGTCACCACATCTTCTCACCGCAGGCAACTACCGGAGCCAGATTCTTCGGTTAAGAA
GTTCTTCAAGGTGGTTTTACCGTCAACAATGAAGAGAAACATGCTGATGATTCCACCAAG
ATTTGTGAAGCTACAAGGGTCTACACTCTCTGAAGTCGTTACATTGGAGACTCCTGCGGG
ATTCAGGCGTTCGATAAAGCTTAAGCGGATCGGTGAAGAGATTTGGTTACATGTCGGTTG
GAGCGAGTTTGCAGAGGCTCATTCCATCAGCGAAGGCCATTTTCTCTTCTTCGACTACAA
AGGAAACTCAAGTTTCAGCGTAATGATCTTCAATGTCTCGGCTTGCGAGATTGATTATCC
ACTGGATGCAGTTCATATCAGTGACAGCGACGATGACGTGATGGACGTCACAGACGAAGG
GTTTCTTGGAACCCAAGGTGCTAGGAGAAATGATCAATCTGTTGATGGTAGTGGTAAGAG
ACCAAGAGACGACGAGTTTGAAAAGATTCTAAACGATGTTGATGGGATCAATTCAATCAA
ACCGCTTGAGGAAGAAGAAGGCAAGAGAGTCTTCAGGGGACACCAGTTCTTTTAACAGTA
CAGAAGACCTGCATGTGTTTATGTTGTTGTGTAATGTAAAATATTGTACTTCCTTAATGA
AA*CTCAAAAA*CTTGGAACTGTAATGTCTTAA**CAAACTGTAACCAGGTCTTGTTTTG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4GM62JQ 565 0 0
GCGGGATTCAGGCGTTCGATAAAGCTTAAGCGGATCGGTGAAGAGATTTGGTTACATGTC
GGTTGGAGCGAGTTTGCAGAGGCTCATTCCATCAGCGAAGGCCATTTTTTTTTTTTCGAC
TACAAAGGAAACTCAAGTTTCAGCGTAATGATCTTCAATGTCTCGGCTTGCGAGATTGAT
TATCCACTGGATGCAGTTCATATCAGTGACAGCGACGATGACGTGATGGACGTCACAGAC
GAAGGGTTTCTTGGAACCCAAGGTGCTAGGAGAAATGATCAATCTGTTGATGGTAGTGGT
AAGAGACCAAGAGACGACGAGTTTGAAAAGATTTTAAACGATGTTGATGGGATCAATTCA
ATCAAACCGCTTGAGGAAGAAGAAGGCAAGAGAGTTTTCAGGGGACACCAGTTTTTTTAA
CAGTACAGAAGACCTGCATGTGTTTATGTTGTTGTGTAATGTAAAATATTGTACTTCCTT
AATGAAAACTCAAAAAACTTGGAACTGTAATGTCTTAAACAAAACTGTAACCAGGTCTTG
TTTTGATTCTTAGTTCTTTCATCAC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL5127Contig1 504 2 1 U
GGAAGCAGAGATCGAAGCAGAAGGGAGGAGCGATTTGTTTTCATCCCAATCCTCGACGAT
TCAAATCTCTTCGTTCCCTAAAACCATGGCTACGATACCAGTAAGCCCGAAGCCATTCTT
GAACAATTTGACTGGAAAGACGGTTATTTTAAGCTTAAATGGGGAATGGAATACAAAGGT
TTCCTGCCTCTGTTGACTCCTACATGAACTTGCAGCTGGGAAACACCGAGGAATATATCG
ATGGACAACTGACAGGAAACCTTGGAGAGATCTTGATCAGATGCAACAACGTTTTGTATG
TCCGAGGTGTCCCAGAAGATGAAGAACTCGCGGACGCTGAACAAGACTAGCCTGGTACCA
ATGACGTAGAGATCGCTAGTCTGTTTGAAGTCGTGTCGTGTATTCTATGAGCGTTTTAAA
CCCATTTTACTCTTCATAAATATTTTTAAGTTGTTTGATACCTTAAAACCAGAACGTTAC
AAGCAGTTTAGCTCTTTATGAGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AW60TF U 1
AF RR4AX25TF U 1
BS 1 504 RR4AW60TF

RD RR4AW60TF 504 0 0
GGAAGCAGAGATCGAAGCAGAAGGGAGGAGCGATTTGTTTTCATCCCAATCCTCGACGAT
TCAAATCTCTTCGTTCCCTAAAACCATGGCTACGATACCAGTAAGCCCGAAGCCATTCTT
GAACAATTTGACTGGAAAGACGGTTATTTTAAGCTTAAATGGGGAATGGAATACAAAGGT
TTCCTGCCTCTGTTGACTCCTACATGAACTTGCAGCTGGGAAACACCGAGGAATATATCG
ATGGACAACTGACAGGAAACCTTGGAGAGATCTTGATCAGATGCAACAACGTTTTGTATG
TCCGAGGTGTCCCAGAAGATGAAGAACTCGCGGACGCTGAACAAGACTAGCCTGGTACCA
ATGACGTAGAGATCGCTAGTCTGTTTGAAGTCGTGTCGTGTATTCTATGAGCGTTTTAAA
CCCATTTTACTCTTCATAAATATTTTTAAGTTGTTTGATACCTTAAAACCAGAACGTTAC
AAGCAGTTTAGCTCTTTATGAGAG

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4AX25TF 504 0 0
GGAAGCAGAGATCGAAGCAGAAGGGAGGAGCGATTTGTTTTCATCCCAATCCTCGACGAT
TCAAATCTCTTCGTTCCCTAAAACCATGGCTACGATACCAGTAAGCCCGAAGCCATTCTT
GAACAATTTGACTGGAAAGACGGTTATTTTAAGCTTAAATGGGGAATGGAATACAAAGGT
TTCCTGCCTCTGTTGACTCCTACATGAACTTGCAGCTGGGAAACACCGAGGAATATATCG
ATGGACAACTGACAGGAAACCTTGGAGAGATCTTGATCAGATGCAACAACGTTTTGTATG
TCCGAGGTGTCCCAGAAGATGAAGAACTCGCGGACGCTGAACAAGACTAGCCTGGTACCA
ATGACGTAGAGATCGCTAGTCTGTTTGAAGTCGTGTCGTGTATTCTATGAGCGTTTTAAA
CCCATTTTACTCTTCATAAATATTTTTAAGTTGTTTGATACCTTAAAACCAGAACGTTAC
AAGCAGTTTAGCTCTTTATGAGAG

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5128Contig1 418 2 1 U
GTCAAGGGACGGAGGAAACCGGTTCGCTATTCACCGTGGCGTTTCAGATTTTGGTTAACT
CTCTTCCCACGGCTAAGCTCAACGTGGAATCAATCGAGACCGTTAGTAATCTGATATCTT
GCACCGTTCAGAAAATCAGAGCCGCTCTTCGATGCGATAAATAGCTGGGGCTTTTTTGGA
GTCAAGAACGAACCGATGCCTGTGGTGTGGTCCGTTTTGATGGTTCGGGCATTGACTCGC
TGATTAGTTTTGTGTGTACATTTTGGTGATTAGGCTAATGAGTCTGAAGATTATAAAATG
AAACAATTCTCTTTCTGTTAAACGAGATATTATATTATTAGAACTACTTTTATATGAACT
ACCATCACTTTGTGATGTCACAAATCTCACTGATTAATGATTTAATATTGTGCGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F449TF U 1
AF RR4F449JQ C 172
BS 1 418 RR4F449TF

RD RR4F449TF 418 0 0
GTCAAGGGACGGAGGAAACCGGTTCGCTATTCACCGTGGCGTTTCAGATTTTGGTTAACT
CTCTTCCCACGGCTAAGCTCAACGTGGAATCAATCGAGACCGTTAGTAATCTGATATCTT
GCACCGTTCAGAAAATCAGAGCCGCTCTTCGATGCGATAAATAGCTGGGGCTTTTTTGGA
GTCAAGAACGAACCGATGCCTGTGGTGTGGTCCGTTTTGATGGTTCGGGCATTGACTCGC
TGATTAGTTTTGTGTGTACATTTTGGTGATTAGGCTAATGAGTCTGAAGATTATAAAATG
AAACAATTCTCTTTCTGTTAAACGAGATATTATATTATTAGAACTACTTTTATATGAACT
ACCATCACTTTGTGATGTCACAAATCTCACTGATTAATGATTTAATATTGTGCGTAGC

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR4F449JQ 247 0 0
TTTTTTGGAGTCAAGAACGAACCGATGCCTGTGGTGTGGTCCGTTTTGATGGTTCGGGCA
TTGACTCGCTGATTAGTTTTGTGTGTACATTTTGGTGATTAGGCTAATGAGTCTGAAGAT
TATAAAATGAAACAATTCTCTTTCTGTTAAACGAGATATTATATTATTAGAACTACTTTT
ATATGAACTACCATCACTTTGTGATGTCACAAATCTCACTGATTAATGATTTAATATTGT
GCGTAGC

QA 1 247 1 247
DS 



AS 1 2

CO CL5129Contig1 856 2 8 U
TCATCATCATCGTCACCATCGCTCTTCTCTTCCTCGACACCTCCTCCTCCCTCCCTGATC
CTTCCTTCTACGATTACCTCCGCGAGAGCGGCCTCCCCGCGGGGATAGTCCCCAAGGGAG
TCACCAACTTCTCCATCGACGTCAAAACGGGCCGTTTCACCGTCGCCCTCCCCGTCCCCT
GCGACGCGAAGTTCGAGAACCAGTTCCACTTCGACTACAACATCTCCGGCGTCCTCTCCG
ACGGCCGGATCGGGAACCTGTCCGGCGTCACGCAGAAGGAGCTCTTCCTGTGGTTCGCCG
TCAAGGGGATATACGTGGATCCCGTCAGCTCGGGGCTCATCCACTTCGATGTCGGCGTCG
CTGATAAGCAGCTCTCTCTGTCGCTGTTCGAGTCGCCTCGCGATTGCACCGCCGCGGAGT
TTGATCGCCGCTCCGTCGTTGATCATCTCTCTGAGCCTCGTGATGATGATGATCTGAAGA
AGCAATCTTCTGGAGATATACAGTCGATCTTTGGACCACCGAGGAATCGCTGGACAGTAT
CATCTTAGTTCTTTTTCTTTTTGGGAAAGAGCTGCAAGTTCCACTGAATACTGATGATGT
CGTCGTCTCTGGTATGGCGTGCCTTGTAAGGAGTCTGGGTTTTAAGTTTTTTTTTTTTTT
GTGTGGTATACTATATCAGTTAGTATCAGCACTACTAGTATAAAGCTTCGCGTAGAGAAA
CTTAGGAGGTATGAGTACTTTTTTGGTTTGTAATAGATTAGGAGTTTAAGACATAATACA
TATATGCTGCGTGTGGATTTTTTTTCAGATCAGACCCATTGGTGTGTTCTGTTATCACTC
TTTATGATGCATGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ28TF U 1
AF RR4CQ28JQ C 193
BS 1 622 RR4CQ28TF
BS 623 623 RR4CQ28JQ
BS 624 630 RR4CQ28TF
BS 631 631 RR4CQ28JQ
BS 632 680 RR4CQ28TF
BS 681 681 RR4CQ28JQ
BS 682 708 RR4CQ28TF
BS 709 856 RR4CQ28JQ

RD RR4CQ28TF 708 0 0
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CTTCCTTCTACGATTACCTCCGCGAGAGCGGCCTCCCCGCGGGGATAGTCCCCAAGGGAG
TCACCAACTTCTCCATCGACGTCAAAACGGGCCGTTTCACCGTCGCCCTCCCCGTCCCCT
GCGACGCGAAGTTCGAGAACCAGTTCCACTTCGACTACAACATCTCCGGCGTCCTCTCCG
ACGGCCGGATCGGGAACCTGTCCGGCGTCACGCAGAAGGAGCTCTTCCTGTGGTTCGCCG
TCAAGGGGATATACGTGGATCCCGTCAGCTCGGGGCTCATCCACTTCGATGTCGGCGTCG
CTGATAAGCAGCTCTCTCTGTCGCTGTTCGAGTCGCCTCGCGATTGCACCGCCGCGGAGT
TTGATCGCCGCTCCGTCGTTGATCATCTCTCTGAGCCTCGTGATGATGATGATCTGAAGA
AGCAATCTTCTGGAGATATACAGTCGATCTTTGGACCACCGAGGAATCGCTGGACAGTAT
CATCTTAGTTCTTTTTCTTTTTGGGAAAGAGCTGCAAGTTCCACTGAATACTGATGATGT
CGTCGTCTCTGGTATGGCGTGC*TTGTAAG*AGTCTGGGTTTTAAGTTTTTTTTTTTTTT
GTGTGGTATACTATATCAGT*AGTATCAGCACTACTAGTATAAAGCTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4CQ28JQ 664 0 0
TCGAGAACCAGTTCCACTTCGACTACAACATCTCCGGCGTCCTCTCCGACGGCCGGATCG
GGAACCTGTCCGGCGTCACGCAGAAGGAGCTCTTCCTGTGGTTCGCCGTCAAGGGGATAT
ACGTGGATCCCGTCAGCTCGGGGCTCATCCACTTCGATGTCGGCGTCGCTGATAAGCAGC
TCTCTCTGTCGCTGTTCGAGTCGCCTCGCGATTGCACCGCCGCGGAGTTTGATCGCCGCT
CCGTCGTTGATCATCTCTTTGAGCCTCGTGATGATGATGATCTGAAGAAGCAATTTTCTG
GAGATATACAGTCGATCTTTGGACCACCGAGGAATCGCTGGACAGTATCATTTTAGTTCT
TTTTCTTTTTGGGAAAGAGCTGCAAGTTCCACTGAATACTGATGATGTCGTCGTCTCTGG
TATGGCGTGCCTTGTAAGGAGTCTGGGTTTTAAGTTTTTTTTTTTTTTGTGTGGTATACT
ATATCAGTTAGTATCAGCACTACTAGTATAAAGCTTCGCGTAGAGAAACTTAGGAGGTAT
GAGTACTTTTTTGGTTTGTAATAGATTAGGAGTTTAAGACATAATACATATATGCTGCGT
GTGGATTTTTTTTCAGATCAGACCCATTGGTGTGTTCTGTTATCACTCTTTATGATGCAT
GAAT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5130Contig1 720 2 14 U
GGGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAACCACAAGAACTACAACGGTCTAGGAGAT
GAGAAGGATAAGCGGTTTCAGATCTTCATGGACAACGCGAGGTTCGTGCAAGAGCACAAC
TCTGCCCCGAACCAGAGTTACCAACTCGGGTTGACCCGGTTCGCTGATCTGACCAACGAA
GAGTTTCGAGCCATTTACTTGAGGAAGAAGAAGATGGAGAGGAGGACTAGGGTTCCGGTG
GAGTCAGAGAGGTATCTACACAAGGTTGGAGATAGCTTGCCTGATGAAGTTGACTGAAGA
GCCAAAGGTGCCGTTGTTCCCGTCAGAGATCAAGGAGAATGTGGGAGTAGTTGGGCGTTT
TCGACGACCGGAGCGATTGAAGGAATGCACCAGATCAAGACAGGGGAGTTAGTATCTCTG
TCGGCGCAAGAACTTATTGATTGTGACAAAAATTACAATGAGGGATGTGGTGGTGGTCTC
ATGGACGCTGCTTTTATCTTCATTACTGAAAATGGTGGTCTTGACACAGAGGAAGATTAC
CCTTACACGGCCACTGATACTAACACATGCAATTCCGACAAGAAGAACACTCACGTTGTT
ACAATCGATGGTTATGAGGATGTTCCTTGGAACGACGAGAAGTCTTTGAAGAAAGCTGTT
GCTCATCAACCAGTTAGTGTTGCAATTGAAGCCGGTGGACGAGAATTCCAGCTTTACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE79TF U 1
AF RR4BR76TF U 74
BS 1 80 RR4CE79TF
BS 81 81 RR4BR76TF
BS 82 296 RR4CE79TF
BS 297 297 RR4BR76TF
BS 298 368 RR4CE79TF
BS 369 369 RR4BR76TF
BS 370 505 RR4CE79TF
BS 506 506 RR4BR76TF
BS 507 509 RR4CE79TF
BS 510 510 RR4BR76TF
BS 511 558 RR4CE79TF
BS 559 559 RR4BR76TF
BS 560 612 RR4CE79TF
BS 613 720 RR4BR76TF

RD RR4CE79TF 612 0 0
GGGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAACCACAAGAACTACAACGGTCTAGGAGAT
GAGAAGGATAAGCGGTTTCATATCTTCATGGACAACGCGAGGTTCGTGCAAGAGCACAAC
TCTGCCCCGAACCAGAGTTACCAACTCGGGTTGACCCGGTTCGCTGATCTGACCAACGAA
GAGTTTCGAGCCATTTACTTGAGGAAGAAGAAGATGGAGAGGAGGACTAGGGTTCCGGTG
GAGTCAGAGAGGTATCTACACAAGGTTGGAGATAGCTTGCCTGATGAAGTTGACTGGAGA
GCCAAAGGTGCCGTTGTTCCCGTCAGAGATCAAGGAGAATGTGGGAGTAGTTGGGCGTTT
TCGACGACTGGAGCGATTGAAGGAATGCACCAGATCAAGACAGGGGAGTTAGTATCTCTG
TCGGCGCAAGAACTTATTGATTGTGACAAAAATTACAATGAGGGATGTGGTGGTGGTCTC
ATGGACGCTGCTTTTATCTTCATTATTGACAATGGTGGTCTTGACACAGAGGAAGATTAC
CCTTACACGGCCACTGATGCTAACACATGCAATTCCGACAAGAAGAACACTCACGTTGTT
ACAATCGATGGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4BR76TF 647 0 0
GGTTTCAGATCTTCATGGACAACGCGAGGTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGCCCCGAACC
AGAGTTACCAACTCTGGTTGACCCGGTTCGCTGATCTGACCAACGAAGAGTTTCGAGCCA
TTTACTTGAGGAAGAAGAAGATGGAGAGGAGGACTAGGGTTCCGGTGGAGTCAGAGAGGT
ATCTACACAAGGTTGGAGATAGCTTGCCTGATGAAGTTGACTGAAGAGCCAAAGGTGCCG
TTGTTCCCGTCAGAGATCAAGGAGAATGTGGGAGTAGTTGGGCGTTTTCGACGACCGGAG
CGATTGAAGGAATGCACCAGATCAAGACAGGGGAGTTAGTATCTCTGTCGGCGCAAGAAC
TTATTGATTGTGACAAAAATTACAATGAGGGATGTGGTGGTGGTCTCATGGACGCTGCTT
TTATCTTCATTACTGAAAATGGTGGTCTTGACACTGAGGAAGATTACCCTTACACGGCCA
CTGATACTAACACATGCAATTCCGTCAAGAAGAACACTCACGTTGTTACAATCGATGGTT
ATGAGGATGTTCCTTGGAACGACGAGAAGTCTTTGAAGAAAGCTGTTGCTCATCAACCAG
TTAGTGTTGCAATTGAAGCCGGTGGACGAGAATTCCAGCTTTACAAA

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL5131Contig1 701 2 1 U
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AATTGTGAATTTCATCCTTGCTGTTGGTTTGGCCATGACGGTTCTTGTTACAAAGTTGGC
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TGCACCCTCCATATTTTCAAGCAGTTCCGGCGCTGGCCAAGGACTTTCTTTAGGGGTTTT
AAATTTGGCGATTGTGATACCACAAATGATAGTATCACTAGGAGGAGGACCTTTCGATGC
TTTATTTGGCGGTGGAAACCTACCAGCATTTATTGTGGGAGCAATCGCATCGGCGATCAG
TGGAGTATTAGCGTTAACCGTTTTACCTTCACCGCCACCGGACGCACCTGACTTGAAGTC
AGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTACTTTTTATGTTTATAATTTTCTTATAAAACTCAT
CATCAAATACAGTAATATATTTCAAAACTACAAAACCCCAAAAAAAAGAATACAAAAAGT
GATAAAGTATAATAACCTTGGGTTATCTGTATTTCACCCTTCCGTTTAGTTCTTGTTCTT
GTTACCGATTATCAATTTAAAGTAGATTTTGTTTTTCAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B857JQ C 1
AF RR4B857TF U 1
BS 1 701 RR4B857TF

RD RR4B857JQ 701 0 0
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AATTGTGAATTTCATCCTTGCTGTTGGTTTGGCCATGACGGTTCTTGTTACAAAGTTGGC
GGCGGATTACCGCAAAACCGCCGGTCCTTATGCCGGACCGTCGTCTGGTATTAGAGCTGG
AGCGTTAAGTCTCTTTGCTGTTCTTGGTATCCCATTATCTATTACTTTCAGTATTCCGTT
TGCACCCTCCATATTTTCAAGCAGTTCCGGCGCTGGCCAAGGACTTTCTTTAGGGGTTTT
AAATTTGGCGATTGTGATACCACAAATGATAGTATCACTAGGAGGAGGACCTTTCGATGC
TTTATTTGGCGGTGGAAACCTACCAGCATTTATTGTGGGAGCAATCGCATCGGCGATCAG
TGGAGTATTAGCGTTAACCGTTTTACCTTCACCGCCACCGGACGCACCTGACTTGAAGTC
AGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTACTTTTTATGTTTATAATTTTCTTATAAAACTCAT
CATCAAATACAGTAATATATTTCAAAACTACAAAACCCCAAAAAAAAGAATACAAAAAGT
GATAAAGTATAATAACCTTGGGTTATCTGTATTTCACCCTTCCGTTTAGTTCTTGTTCTT
GTTACCGATTATCAATTTAAAGTAGATTTTGTTTTTCAAAT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4B857TF 701 0 0
GATGTCGCTTGGTGTTGAGTGGATTGGTAAGAAAGTGGGTGGTGCTAAGCGGCTTTGGGG
AATTGTGAATTTCATCCTTGCTGTTGGTTTGGCCATGACGGTTCTTGTTACAAAGTTGGC
GGCGGATTACCGCAAAACCGCCGGTCCTTATGCCGGACCGTCGTCTGGTATTAGAGCTGG
AGCGTTAAGTCTCTTTGCTGTTCTTGGTATCCCATTATCTATTACTTTCAGTATTCCGTT
TGCACCCTCCATATTTTCAAGCAGTTCCGGCGCTGGCCAAGGACTTTCTTTAGGGGTTTT
AAATTTGGCGATTGTGATACCACAAATGATAGTATCACTAGGAGGAGGACCTTTCGATGC
TTTATTTGGCGGTGGAAACCTACCAGCATTTATTGTGGGAGCAATCGCATCGGCGATCAG
TGGAGTATTAGCGTTAACCGTTTTACCTTCACCGCCACCGGACGCACCTGACTTGAAGTC
AGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTACTTTTTATGTTTATAATTTTCTTATAAAACTCAT
CATCAAATACAGTAATATATTTCAAAACTACAAAACCCCAAAAAAAAGAATACAAAAAGT
GATAAAGTATAATAACCTTGGGTTATCTGTATTTCACCCTTCCGTTTAGTTCTTGTTCTT
GTTACCGATTATCAATTTAAAGTAGATTTTGTTTTTCAAAT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

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TTGAAACACACTCATGCGGGAGGAACCATGGATCTGCATGCTTTGAATGTCCAGATATTC
ATTAAGATGCACAGATCAGATTACGCTGAGAAGCAGCTTAGAGTGATGCAACAGTACGAC
GAAGACCACACTCTCACCCAACTTGCTACCGCATGGTTGAACTTGGCAGTGGGTGGCTCG
AAGATACAAGAAGCTCATCTCATTTTCCAGGATTTCTCTGAGAGGTACCCGATGACATGC
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AAATATAAAACTCCAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL48TF U 1
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BS 706 736 RR4BL48JQ

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QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4BL48JQ 736 0 0
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GTGGTCTGCAGTCTCCATGTTGGCAAATCATCTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAAACTA
TCACACCCTGAACATGTACTTGTGAAGCGTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGA
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TCAGTCTATGAATCAGTTTTTGCCTTTTGAGTATGTAACGTTTGCCATCTCGTTGCTTTT
AAATATAAAACTCCAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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TAATGTAAAACTTGTTTATTTATATATTCTTCACAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FY89JQ C 1
AF RR4FY89TF U 1
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CAAACAACAACACCTCTCTTTATGAAATGTAAAAAACTCTTGAGCATTACTCACACATCA
TAATGTAAAACTTGTTTATTTATATATTCTTCACAACC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR4FY89TF 458 0 0
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GTTGATCGGCGTAGAGATTGGGAAAGGCCTTGATCTTCCTCTGTAATATGTGTTCTTCCC
CAAACAACAACACCTCTCTTTATGAAATGTAAAAAACTCTTGAGCATTACTCACACATCA
TAATGTAAAACTTGTTTATTTATATATTCTTCACAACC

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL5134Contig1 675 2 2 U
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CTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGG
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TCTTTTTGTCGTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E143TF U 1
AF RR4E779TF U 92
BS 1 599 RR4E143TF
BS 600 675 RR4E779TF

RD RR4E143TF 599 0 0
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TTTCAGGCAGGTTAGAAGGAGAGAGATGGCGTTTGTGACCACTGCAGAAGTTTGTGACGC
GAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGTCAGCTCCGAGCTCTGCAACCCTGTTTCCAAATTTA
CGGTCGTCGTCAAATCTTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTTTTTGAAGACAATGG
CTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGG
AGGAAGTCTACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGG
ATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGCTGCATCAGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGCGA
CATTGGGGTGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCTATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGA
ACAGAGAGTCCCACTCAACATAGCAGGCACCAGGATTTGCGATGGCGAGTGGCTTTATGC
AGATACTGATGGTATCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAAGAAGA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4E779TF 584 0 0
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CGAGCTCTGCAACCCTGTTTCCAAATTTACGGTCGTCGTCAAATCTTCTCAGGTCCTGTT
GTTACTGTCAAAGTTTTTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGC
AATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGTCTACGCTGTGCTATACTCGGAGGA
AACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGCTGCATC
AGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGCGACATTGGGGTGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCT
ATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACAGAGAGTCCCACTCAACATAGCAGGCACC
AGGATTTGCGATGGCGAGTGGCTTTATGCAGATACTGATGGTATCCTTGTTTCTCATATC
GAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAAGAACGTGTTACTTGGTTTGTTTGAACTTTGAATG
TTGAAGAAAGCTTTGTCGGTAAAATTGCATCTTTTTGTCGTTTG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5136Contig1 725 2 2 U
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GGAGATCGAAATGGCAACAGTTCCAGGACAGCTAGTCTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAA
CTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAG
CAACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCGAACAAGAAGACAGT
GACCATTCAGGTAGCTGACAAGGAGCAAGGCGTGGTACTCGGAACCACCAAGACCAAGAA
GCAGAACAAGCCTAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAAGAGTTCCCTAGGAT
GGCCAAAGCTGTAGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGC
AGCACTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAGGGTATTAGAGTCGCCAAATCTGGTCCCAA
GAGGAGGAACAGGCAGGCTTAAAGAATCCACCACTCAACGAACATTTTTACTTCTAAAAA
AAGTTTGTTTTGAGAGTTTCAGACAGTGCTTGCTTATAGGTTAAAGATTATTTTTGGATA
GCTGAGAATCTTGCTTGAAACACCTCCTTTTCTCACAAAATGATATTAAAAACTATTTTT
AATATTGTATTCCAGCTAAAGAGTGCCATATCTTGTAGAATCTGAAATGAATTAAAGAAC
AGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 

AF RR4FH27TF U 1
AF RR4FH27JQ C 215
BS 1 722 RR4FH27TF
BS 723 725 RR4FH27JQ

RD RR4FH27TF 724 0 0
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GGAGATCGAAATGGCAACAGTTCCAGGACAGCTAGTCTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAA
CTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAG
CAACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCGAACAAGAAGACAGT
GACCATTCAGGTAGCTGACAAGGAGCAAGGCGTGGTACTCGGAACCACCAAGACCAAGAA
GCAGAACAAGCCTAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAAGAGTTCCCTAGGAT
GGCCAAAGCTGTAGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGC
AGCACTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAGGGTATTAGAGTCGCCAAATCTGGTCCCAA
GAGGAGGAACAGGCAGGCTTAAAGAATCCACCACTCAACGAACATTTTTACTTCTAAAAA
AAGTTTGTTTTGAGAGTTTCAGACAGTGCTTGCTTATAGGTTAAAGATTATTTTTGGATA
GCTGAGAATCTTGCTTGAAACACCTCCTTTTCTCACAAAATGATATTAAAAACTATTTTT
AATATTGTATTCCAGCTAAAGAGTGCCATATCTTGTAGAATCTGAAATGAATTAAAGAAC
AG
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4FH27JQ 511 0 0
TCTGGTTTGGCGAACAAGAAGACAGTGACCATTCAGGTAGCTGACAAGGAGCAAGGCGTG
GTACTCGGAACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGCTCTCTGTTAACAAGTCT
GTCCTCAAGAAAGAGTTCCCTAGGATGGCCAAAGCTGTAGCCAACCAGGTTGTGGACAAC
TACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCACTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAGGGT
ATTAGAGTCGCCAAATCTGGTCCCAAGAGGAGGAACAGGCAGGCTTAAAGAATCCACCAC
TCAACGAACATTTTTACTTTTAAAAAAAGTTTGTTTTGAGAGTTTCAGACAGTGCTTGCT
TATAGGTTAAAGATTATTTTTGGATAGCTGAGAATCTTGCTTGAAACACCTCCTTTTCTC
ACAAAATGATATTAAAAACTATTTTTAATATTGTATTCCAGCTAAAGAGTGCCATATCTT
GTAGAATCTGAAATGAATTAAAGAACAGGTT

QA 1 511 1 511
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5138Contig1 504 2 1 U
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ACACTCCTCGGCCTATTGCGCCGGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTG
TTATCCTCGGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTA
TATTCTGTGCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCT
CCATGGCTATGATGTTTGCTATAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGAC
CCGCGACAAAGAAATAATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTATATTACATCTTCTTTTA
TCAAATCTTGTTTGGTTCTTGTTTCAGCACTTTTTTAAGTTATAAGTTGCGACATGGTGA
AATTTGAAGCCTAGCGTTTTGTTC


BQ
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AF RR4E988JQ C 1
AF RR4E988TF U 1
BS 1 504 RR4E988TF

RD RR4E988JQ 504 0 0
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ACACTCCTCGGCCTATTGCGCCGGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTG
TTATCCTCGGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTA
TATTCTGTGCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCT
CCATGGCTATGATGTTTGCTATAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGAC
CCGCGACAAAGAAATAATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTATATTACATCTTCTTTTA
TCAAATCTTGTTTGGTTCTTGTTTCAGCACTTTTTTAAGTTATAAGTTGCGACATGGTGA
AATTTGAAGCCTAGCGTTTTGTTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4E988TF 504 0 0
GGAGATCAGGTTTTACAGTGAGTGCAATCTTAGAGAGAAAAAGAAGATAGAGAATGTCTC
ACAGTCACGGGAACGCTCCGTCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTT
ACACTCCTCGGCCTATTGCGCCGGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTG
TTATCCTCGGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTA
TATTCTGTGCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCT
CCATGGCTATGATGTTTGCTATAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGAC
CCGCGACAAAGAAATAATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTATATTACATCTTCTTTTA
TCAAATCTTGTTTGGTTCTTGTTTCAGCACTTTTTTAAGTTATAAGTTGCGACATGGTGA
AATTTGAAGCCTAGCGTTTTGTTC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5139Contig1 1014 2 10 U
GGAACATATGGCATTCTAAAGCACAAAGAATCAAACAAACAAATAATTTAGTAAGTATAT
GGTGAATCGGCCGTCCAAGAACAAGTTCACCATGAAAACAAAATATGGAGCAGCAGTTGC
ACCCGTCTTCGTCCTTGCTGGTGCCTATGTTGCTTGGAATTACATAAATCATCGTCTATG
GAGGAAGAAGGACGACAACAATGGTCAAGATATCAGAAAAAGCAACCATAAAAGCCCTAT
GGAACAACGAAAAGGCGCTAAAAGCATTAGTAAGGAGGCTTCTTTAGCAAGACGTGGAAA
GGATCAGAAAACCCTCTCAAGATCTGTTTCAATGGGGGCTATTCGAGGAGGAAAAGTGGC
ATTGCAGAGATTGCTTGATTTGCACTCGTATCATCTTGATACTTCTTCCCTTGTAAATGC
TGAGACTGAATTTGAATCTTTGCTTTCCAAGGAAAAGCCGGATTTTGGGTTGCTTCAGAG
AGACATTGTGAAGATGGAAATGAGTGGAAAAGAAGCAAAAGGAGTTGAGATATTGAAGAA
AGCATTGGAGAAAGCGAAAGCAGAAGGAAAAGGTCATGAGGCTTATGAGATTGGGATGTT
GCTTGTGGAGATGTTGATCTACATGGGAAACATTGAAGAGACTTTAAAATGTAAGTGTTT
AGAGGATGATTTCATTACAGGTTCAGGGAGATTCAGATGGGTCTACAATGGCCTGGAAGC
TCAGAGGAATGTGGGACTCACGAAATCACATTAGATGAGTTCAAGAAAGTAATGGAATCT
CTCAAGCACGAAATTGAAGACAGCAAGAAAAGACAAACCGTAAACTCAATTCCACGTGAG
ACAAAAGAAAATTGACTTGGAAGATATGTTTCAATAATTTCAAGAAATGGTGTTGTTATC
CATGAATTAATAGAAATATTTGGTTCACTACTCTTGAAAAACAGACATCAACTTATACCA
ATCTAATATATGTCATATTCAAATACTGTTTCTTCAATATCATCAAATACCGAC


BQ
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AF RR4G518TF U 1
AF RR4G518JQ C 242
BS 1 680 RR4G518TF
BS 681 681 RR4G518JQ
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BS 730 744 RR4G518TF
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RD RR4G518TF 747 0 0
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TCAGAGGA*TGTGGGACTCACGAA
TCA

QA 1 744 1 744
DS 

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GATCAGAAAACCCTCTCAAGATCTGTTTCAATGGGGGCTATTCGAGGAGGAAAAGTGGCA
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GAGACTGAATTTGAATCTTTGCTTTCCAAGGAAAAGCCGGATTTTGGGTTGCTTCAGAGA
GACATTGTGAAGATGGAAATGAGTGGAAAAGAAGCAAAAGGAGTTGAGATATTGAAGAAA
GCATTGGAGAAAGCGAAAGCAGAAGGAAAAGGTCATGAGGCTTATGAGATTGGGATGTTG
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TCAAGCACGAAATTGAAGACAGCAAGAAAAGACAAACCGTAAACTCAATTCCACGTGAGA
CAAAAGAAAATTGACTTGGAAGATATGTTTCAATAATTTCAAGAAATGGTGTTGTTATCC
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QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CH48TF U 1
AF RR4CR44TF U 1
BS 1 630 RR4CH48TF
BS 631 640 RR4CR44TF

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QA 1 630 1 630
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AAGAAGAATCTGAAGAGTTTTCTTATTCTTCACCGGGTAAACGGGTCGGATCTTTCTCAA
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TCAGACCCAACAACCCTCTTATCACCCATCAGTTCTTCCCGGAGATGGAATCTAGCGTAG
GAGACGATGGTAGTGGTGGTCCCGGGTCAGGCTTTCCTCGGTCTCACTGGTTTGGTGTTA
ACTTTTCTCAGTCGGATCTAGCTACCGGATCATCGGTAGGTAAACCCGCAACTGTTGCTG
CCGTGGTGGAGCCGGCACAGCCGTTAAAGAAGAGCCGGCGTGGACCAAGGTCAAGGAGTT
CTCAGTATAGAGGCGTTACGTTTTACCGGCGAACCGGAAGATGGGAGTCTCATATTTGGG
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ATTATGATAATGACATGA*GCAGATGACGATTTACTAAGA

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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GGCCAGTGACTTTGATATTAATGACCACATCGACTTCGATGGGAAACCCTGTAGGGTATG
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TCTCGATCTTGTGTATAGTTTGTGTGTGTGGCCTCGATCCGTAATTAGATGGTTCTTGGT
TAGAAAATTATGATCTATTTGCTTACAGTTTTGTTTCGTCTAATTTACGATCCAAATTTT
ATTAATTTCGTTTCAGGTGATTAGTGTCTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 8 519 RR4DO63JQ
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AAAAAAAAAAAAAATTAAAACTCGGGTTTCAATCTCTCTCTCGCGTGCTAGAACATGACG
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QA 1 512 1 512
DS 

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GGCCAGTGACTTTGATATTAATGACCACATCGACTTCGATGGGAAACCCTGTAGGGTATG
ATTTCGATTTCCCCTCAATCTCCGTCTCTCTCTCTTCTTGTTAACCATATGATTCTAAAA
TCTCGATCTTGTGTATAGTTTGTGTGTGTGGCCTCGATCCGTAATTAGATGGTTCTTGGT
TAGAAAATTATGATCTATTTGCTTACAGTTTTGTTTCGTCTAATTTACGATCCAAATTTT
ATTAATTTCGTTTCAGGTGATTAGTGTCTCCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

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GGGAAATGACGACGATGATAATGATAGGCGATCTTCCAGACGATTTGGAATCGGAGATAC
TCTCGAGGGTCCCGGCCAAGTCTCTATGGGAACTGAAAGCTACTTGCAAACGATGGTACG
CACTGTTCAGAGATCCGAGGTTCGTGGAGAAGAACAAGAGGTTGGGTAAAGCAGCGAGGG
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GGCTCGTGGTTTGGAATCCATGTACCGGTCAAAGGAGGAAGATCAAACCAAGAACTCGTT
ACCGCACTGAAGATAAGTTTGCTCTAGGATACACCACATCTTCTTCTTCTTCTTCTGGCC
GTAGCTACAAAATCTTCAAGTATAGGTTTTATAGAAACAGCCAGAAACTGTGGGTTGCTG
ATTGTGAGATCTATGAGCTTTGCTCTGATTCTTGGAGAGTTCTTGATTCCTTCACTCTTT
TTGACTCTGACCTGTTTTTCAACGGCATGTCTTTGAAAGGAGATACTTATTGGGTTGCTT
CTGGACCTGTAAGAGAAGGAACCGATTTTTTCTTGATGAAGTTTGATTTCACGGCAGAGA
TATTTGTGCGTCTCCCTCTTCCGTTTAAGAGTTCTAATATTTTAGATACCAAGCTTCTTT
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TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4CX88TF U 1
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QA 1 734 1 734
DS 

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TTTTCAACGGCATGTCTTTGAAAGGAGATACTTATTGGGTTGCTTCTGGACCTGTAAGAG
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AGAACAAAGTGGCAGTGTGTTGTGACAAGTTCACGAGTGATGGAGATAGGACAATGGTCT
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TTAATTGGCCACTTGTCCTCACTTATGTTCCAAGCTTGGTTTCGATTC

QA 15 842 15 842
DS 



AS 1 2

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TGGTCCCGAATCGATCGAACATCTTATTATCTAGTGGTGGGATCAGGAAATCAAGACTTG
TGATTCGAAACGGAACCTCAGATGGTTACGTGGTCGGTGATAATGATGACTTGGGTAGTA
TAGCTACCAGAAGAGGAGACTCTAAATCAAAGGTTTTGATTCCTGGTCTGCCTGACCAAT
CAAACGGCGACGCAGCTAGAATCACTACTTCTCGGTGCGAGTGGAAGCCTAACCTCACTG
TACACTACGAGAAATCCGGCTGTGGCAACGTGGAGGCTCCCGCGGTGTTGCTTCTTCCTG
GATTTGGTGTTGGTTCTTTCCACTACGAGAAACAGCTTGCGGATTTGGGAAGGGATTATC
GAGTTTGGGCGGTTGATTTTGTTGGACAGGGTTTGTCTCTCCCCACTCAAGATCCCACTA
CTACTACTACTACTACTAGTACTAGTACTACCTTGTCTGAAGAAACAAGTGTCTTGGGAG
TTAAGGAACCGTTTTGGGGTTTTGGTGATGAAGCTAAGCCATGGGCTGATCAACTTGTAT
ACTCGTTGGATCTCTGGAGGGAACAAGTTCAGTATATTGTAGAAGAGGTTATCGGTGAGC
CAGTGTACATTGCAGGGAACTCGCTTGGAGGCTATGTAGCTCTCTACTTTGCAGCAACCC
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TACCGCCAAGAGTGAAAAAACTCACAGAATTGGTGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E309TF U 1
AF RR4E309JQ C 201
BS 1 703 RR4E309TF
BS 704 939 RR4E309JQ

RD RR4E309TF 708 0 0
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TAATCTCACAGAACTTCCTGCCTCACTGCTCTCTCGTGACTTGGAGTGGTAGTAACAGAT
TGGTCCCGAATCGATCGAACATCTTATTATCTAGTGGTGGGATCAGGAAATCAAGACTTG
TGATTCGAAACGGAACCTCAGATGGTTACGTGGTCGGTGATAATGATGACTTGGGTAGTA
TAGCTACCAGAAGAGGAGACTCTAAATCAAAGGTTTTGATTCCTGGTCTGCCTGACCAAT
CAAACGGCGACGCAGCTAGAATCACTACTTCTCGGTGCGAGTGGAAGCCTAACCTCACTG
TACACTACGAGAAATCCGGCTGTGGCAACGTGGAGGCTCCCGCGGTGTTGCTTCTTCCTG
GATTTGGTGTTGGTTCTTTCCACTACGAGAAACAGCTTGCGGATTTGGGAAGGGATTATC
GAGTTTGGGCGGTTGATTTTGTTGGACAGGGTTTGTCTCTCCCCACTCAAGATCCCACTA
CTACTACTACTACTACTAGTACTAGTACTACCTTGTCTGAAGAAACAAGTGTCTTGGGAG
TTAAGGAACCGTTTTGGGGTTTTGGTGATGAAGCTAAGCCATGGGCTGATCAACTTGTAT
ACTCGTTGGATCTCTGGAGGGAACAAGTTCAGTATATTGTAGA
GAGGT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4E309JQ 739 0 0
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TCTAAATCAAAGGTTTTGATTCCTGGTCTGCCTGACCAATCAAACGGCGACGCAGCTAGA
ATCACTACTTCTCGGTGCGAGTGGAAGCCTAACCTCACTGTACACTACGAGAAATCCGGC
TGTGGCAACGTGGAGGCTCCCGCGGTGTTGCTTCTTCCTGGATTTGGTGTTGGTTCTTTC
CACTACGAGAAACAGCTTGCGGATTTGGGAAGGGATTATCGAGTTTGGGCGGTTGATTTT
GTTGGACAGGGTTTGTCTCTCCCCACTCAAGATCCCACTACTACTACTACTACTACTAGT
ACTAGTACTACCTTGTCTGAAGAAACAAGTGTCTTGGGAGTTAAGGAACCGTTTTGGGGT
TTTGGTGATGAAGCTAAGCCATGGGCTGATCAACTTGTATACTCGTTGGATCTCTGGAGG
GAACAAGTTCAGTATATTGTAGAAGAGGTTATCGGTGAGCCAGTGTACATTGCAGGGAAC
TCGCTTGGAGGCTATGTAGCTCTCTACTTTGCAGCAACCCATCCTCATCTGGTCAAAGGT
GTCACGTTGCTTAACGCAACACCTTTCTGGGGTTTCTTCCCTAATCCAGTACGCTCCCCA
CGGCTAGCACGTCTCTTTCCATGGTCTGGAACTTTCCCTTTACCGCCAAGAGTGAAAAAA
CTCACAGAATTGGTGTGGC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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TGGTTAACCCTTCGATCTTTCTCTAGCGCAGCACACCTTTCTTTGCACAAACCCTAGAAG
AATCCTCCGGAAATGTCGTTATTATTTTGTCGAGCTTCTTCGTCTACAGTTGCCGCTCGT
CCCTTCAGAGCGGTTAGATCTCCGGTGAATCTCCAAGCTGGTGCCCAGAGAGTGACTCTT
GGTGGTGGTAGCTATCAGTTCAGCCGCTCATCATCGCTGATGTCATTCTCGAGGGGTTCG
AAGCTAAGTGCTATCACCGCCGACGCTAATCTGGTTAGCGTTCTCGAATCTGAAATCGAA
GGCACCTTTGTTAACGAAGATCCTGAGTTGCCAGAAGGGTTTCCTTTCCGCATCAATGAT
CTGACATGGCAACAAGATATACGTATGATTAGAGAGTTTAAGGATGAAACCATTTTTGTC
GAAATTGACCCTTATGCGCCGTTTGATAAGGAAGAACTATTAAAAGAAGGAATTGCCATG
ATCATCAATGTTACGAAAAAAGATGATGGTCCCTGTCTTGAGTTTGAAGTCGAAGCTTTT
GTAGATGAGATTATCATCAATGGTGTATACGTCCTACAACCCCATGAACCTACGTACCCC
TACAAAGGCCCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAAAAGGCTTTCCACAGGTTT
TTGGAGATCAGAGGGTTCAAGCCCACCATCACTGAGTTTATGGCTGATTGTATGGCCAAC
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AATTTTTAGGTGAAAATTTATCTTGGATGAACTTGTTATCACCATTATCTTGCAATGAGT
TGCTAGTTGTTTTGACAATATTTGTTTCAATTTCCCCAATGAAAACTTGTCACTTTTCGT
TAG


BQ
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10 10 10 

AF RR4GL56TF U 1
AF RR4GL56JQ C 353
BS 1 664 RR4GL56TF
BS 665 963 RR4GL56JQ

RD RR4GL56TF 664 0 0
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TGGTTAACCCTTCGATCTTTCTCTAGCGCAGCACACCTTTCTTTGCACAAACCCTAGAAG
AATCCTCCGGAAATGTCGTTATTATTTTGTCGAGCTTCTTCGTCTACAGTTGCCGCTCGT
CCCTTCAGAGCGGTTAGATCTCCGGTGAATCTCCAAGCTGGTGCCCAGAGAGTGACTCTT
GGTGGTGGTAGCTATCAGTTCAGCCGCTCATCATCGCTGATGTCATTCTCGAGGGGTTCG
AAGCTAAGTGCTATCACCGCCGACGCTAATCTGGTTAGCGTTCTCGAATCTGAAATCGAA
GGCACCTTTGTTAACGAAGATCCTGAGTTGCCAGAAGGGTTTCCTTTCCGCATCAATGAT
CTGACATGGCAACAAGATATACGTATGATTAGAGAGTTTAAGGATGAAACCATTTTTGTC
GAAATTGACCCTTATGCGCCGTTTGATAAGGAAGAACTATTAAAAGAAGGAATTGCCATG
ATCATCAATGTTACGAAAAAAGATGATGGTCCCTGTCTTGAGTTTGAAGTCGAAGCTTTT
GTAGATGAGATTATCATCAATGGTGTATACGTCCTACAACCCCATGAACCTACGTACCCC
TACA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4GL56JQ 611 0 0
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TTTTTGTCGAAATTGACCCTTATGCGCCGTTTGATAAGGAAGAACTATTAAAAGAAGGAA
TTGCCATGATCATCAATGTTACGAAAAAAGATGATGGTCCCTGTCTTGAGTTTGAAGTCG
AAGCTTTTGTAGATGAGATTATCATCAATGGTGTATACGTCCTACAACCCCATGAACCTA
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TGGCCAACAAAGACAGCAGGGAGCGTCGTCAGTGGCTCTATGATGTCCAGTCTTTTGTTG
AGATGTGAAATTTTTAGGTGAAAATTTATCTTGGATGAACTTGTTATCACCATTATCTTG
CAATGAGTTGCTAGTTGTTTTGACAATATTTGTTTCAATTTCCCCAATGAAAACTTGTCA
CTTTTCGTTAG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL5145Contig1 762 2 3 U
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CCAGACCGATATTACTCTATTTGTAGAAGTTAAAAACGATTTATATAAATCGAGTGAGAA
AATTACCGCAGCTTCCCTGATCTTTAACCTCAGCGACGGCACCTTCCTTCCTCCAGTCAA
CGCTCTCCGGGATAGCGTCACCTACACGCGCCTCGTAGCGAAGGCTGGTCTTGGTGGCTT
TCCTCTTGAGCCTAGACCCGAGGTACATGGATCTATACTCATCGTTAGTGAGATCCGCGA
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CGTGTTTCACTAGCCACTCCTCGTACAGTCTTGAAACTTCGGCATCGCTTCTGGAAGAGA
CGGTGCGGTGGTTTTTGTCATAGGAAATGATTGACATATCCATCGCTGATGATACCACGA
TCATCGTTAAGAAGAGGATCACGGTAGCTGAGTTAAGGAGCTTCATTTTCTTTTCACTGT
TTTTCTTTGAAGGAGAAGGAAAGATGATGAAAGATACGATCC


BQ
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AF RR4BO03TF C 1
AF RR4BO03JQ U 10
BS 1 21 RR4BO03TF
BS 22 728 RR4BO03JQ
BS 729 762 RR4BO03TF

RD RR4BO03TF 762 0 0
TTTTTTGTATTGCAGTGTGAATTAACAAATCATCAGGCATGAAGTTTATT*ACTCTCCCT
AAAGTCACAAATGGAGAGGAAAGACTACTATGGGGACTGACATCGTCAGGGACCTCACCC
AACATTCTTGGAAGGGGCATATATGTCTTTCCCCACAAGTTCCAATACTTTTTGAACGAA
CCAGACCGATATTACTCTATTTGTAGAAGTTAAAAACGATTTATATAAATCGAGTGAGAA
AATTACCGCAGCTTCCCTGATCTTTAACCTCAGCGACGGCACCTTCCTTCCTCCAGTCAA
CGCTCTCCGGGATAGCGTCACCTACACGCGCCTCGTAGCGAAGGCTGGTCTTGGTGGCTT
TCCTCTTGAGCCTAGACCCGAGGTACATGGATCTATACTCATCGTTAGTGAGATCCGCGA
ACTTCGTAAAACCCAGTCTGTAACTAAGGTTCTTCCCGTTGTGTTCGTCTATGAAACGGA
GATTGTCTTTAAAGATCTCGAACCGTCGATCTTTCTCTGTAAGAGAATTCTGAGCCTTCC
CGTGTTTCACTAGCCACTCCTCGTACAGTCTTGAAACTTCGGCATCGCTTCTGGAAGAGA
CGGTGCGGTGGTTTTTGTCATAGGAAATGATTGACATATCCATCGCTGATGATACCACGA
TCATCGTTAAGAAGAGGATCACGGTAGCTGAGTTAAGGAGCTTCATTTTCTTTTCACTGT
TTTTCTTTGAAGGAGAAGGAAAGATGATGAAAGATACGATCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BO03JQ 719 0 0
GCAGTGGTGAAT
TTAACAAATCATCAGGCATGAAGTTTATTTACTCTCCCTAAAGTCACAAATGGAGAGGAA
AGACTACTATGGGGACTGACATCCTCAGGGACCTCACCCAACATTCTTGGAAGGGGCATA
TATGTCTTTCCCCACAAGTTCCAATACTTTTTGAACGAACCAGACCGATATTACTCTATT
TGTAGAAGTTAAAAACGATTTATATAAATCGAGTGAGAAAATTACCGCAGCTTCCCTGAT
CTTTAACCTCAGCGACGGCACCTTCCTTCCTCCAGTCAACGCTCTCCGGGATAGCGTCAC
CTACACGCGCCTCGTAGCGAAGGCTGGTCTTGGTGGCTTTCCTCTTGAGCCTAGACCCGA
GGTACATGGATCTATACTCATCGTTAGTGAGATCCGCGAACTTCGTAAAACCCAGTCTGT
AACTAAGGTTCTTCCCGTTGTGTTCGTCTATGAAACGGAGATTGTCTTTAAAGATCTCGA
ACCGTCGATCTTTCTCTGTAAGAGAATTCTGAGCCTTCCCGTGTTTCACTAGCCACTCCT
CGTACAGTCTTGAAACTTCGGCATCGCTTCTGGAAGAGACGGTGCGGTGGTTTTTGTCAT
AGGAAATGATTGACATATCCATCGCTGATGATACCACGATCATCGTTAAGAAGAGGATCA
CGGTAGCTGAGTTAAGGAGCTTCATTTTCTTTTCACTGTTTTTCTTT

QA 13 719 13 719
DS 



AS 1 2

CO CL5146Contig1 770 2 6 U
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TGAAGATTTTGATACTCGTGTTATAGATTATGGTTTGGGGAAGCTAGTAGTGAGTTCTTC
TCGGGACTCTAACGATAGCTCGTTTAGTAACGGAGATCTCGGGGAGGTTGGCTACGTTGC
GCCCGAGTGTTCGAGCACTATGGTTGCGTCTTTGAGTGGGGATGTGTATGCGTTTGGGGT
TGTGCTTCTTGAGATTGTTACGGGACGAAAGCCGGTTTCGTTTGACAGTGGTGAAGATGG
GTTTAATGGGAGTTTAGTGGATTGGGTGAGTAAGCATTTGAGTAATGGGAGAAGCAGAGA
TGTGGTTGATAGAAGTTTGATTGGTCAAGGATATGATGATGATGAGATCATGCAGTTTTT
GAGAATCGCGTGTAGCTGTGTTGTGTCGAGGCCAAAAGAAAGACCATTGATGATCCAGTT
TTATGAGTCTTTGAAGAAGTTGGGAGATCGATATGGTTTCTTCTCTGACCATAGTGATGA
GTTTGTTTCCACTGATGTATAACAAAGAACACCGAGTTAAACTGATTTGAGAGTATGATG
ATTATGCTGCTGCTGCTTTGTAAGTACAAAGATCGATGCATTCTTTACCACATACTTGCG
TAATGTTTTCACTTTTAACTGGTTTTTTTGGTTGTGTTGTTATAGTTTTTTTCTCTACAG
ATCTTTGCACTTATAAAGTGTGTTGGTTATGAATAAAATTTTGCAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CN69TF U 1
AF RR4CN69JQ C 164
BS 1 648 RR4CN69TF
BS 649 649 RR4CN69JQ
BS 650 668 RR4CN69TF
BS 669 669 RR4CN69JQ
BS 670 682 RR4CN69TF
BS 683 770 RR4CN69JQ

RD RR4CN69TF 682 0 0
CCATGGATGTGAACATGCGTGTATGCATCAGTACATTAGCTCAAATGTGATTCTTCTAGA
TGAAGATTTTGATACTCGTGTTATAGATTATGGTTTGGGGAAGCTAGTAGTGAGTTCTTC
TCGGGACTCTAACGATAGCTCGTTTAGTAACGGAGATCTCGGGGAGGTTGGCTACGTTGC
GCCCGAGTGTTCGAGCACTATGGTTGCGTCTTTGAGTGGGGATGTGTATGCGTTTGGGGT
TGTGCTTCTTGAGATTGTTACGGGACGAAAGCCGGTTTCGTTTGACAGTGGTGAAGATGG
GTTTAATGGGAGTTTAGTGGATTGGGTGAGTAAGCATTTGAGTAATGGGAGAAGCAGAGA
TGTGGTTGATAGAAGTTTGATTGGTCAAGGATATGATGATGATGAGATCATGCAGTTTTT
GAGAATCGCGTGTAGCTGTGTTGTGTCGAGGCCAAAAGAAAGACCATTGATGATCCAGTT
TTATGAGTCTTTGAAGAAGTTGGGAGATCGATATGGTTTCTTCTCTGACCATAGTGATGA
GTTTGTTTCCACTGATGTATAACAAAGAACACCGAGTTAAACTGATTTGAGAGTATGATG
ATTATGCTGCTGCTGCTTTGTAAGTACAAAGATCGATGCATTCTTTAC*ACATACTTGCG
TAATGTTT*CACTTTTAACTGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4CN69JQ 607 0 0
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GTGTATGCGTTTGGGGTTGTGCTTCTTGAGATTGTTACGGGACGAAAGCCGGTTTCGTTT
GACAGTGGTGAAGATGGGTTTAATGGGAGTTTAGTGGATTGGGTGAGTAAGCATTTGAGT
AATGGGAGAAGCAGAGATGTGGTTGATAGAAGTTTGATTGGTCAAGGATATGATGATGAT
GAGATCATGCAGTTTTTGAGAATCGCGTGTAGCTGTGTTGTGTCGAGGCCAAAAGAAAGA
CCATTGATGATCCAGTTTTATGAGTCTTTGAAGAAGTTGGGAGATCGATATGGTTTTTTT
TCTGACCATAGTGATGAGTTTGTTTCCACTGATGTATAACAAAGAACACCGAGTTAAACT
GATTTGAGAGTATGATGATTATGCTGCTGCTGCTTTGTAAGTACAAAGATCGATGCATTC
TTTACCACATACTTGCGTAATGTTTTCACTTTTAACTGGTTTTTTTGGTTGTGTTGTTAT
AGTTTTTTTCTCTACAGATCTTTGCACTTATAAAGTGTGTTGGTTATGAATAAAATTTTG
CAACCCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL5147Contig1 756 2 4 U
GAAAGACAAATAACACCAATAGTATTGAAAGTTCACTAATCTGACAAACAAAACCAATCT
GCCAACTATGTCTATGAAATTAAAAAAAACAAATACAAGTAAGACATCCTAATCTAATCA
TTCATAGAGAACAACTAGGTATTCAGAGGCCAAGACACAATCAATTCAAGTGAAGAGAGA
CATAGGTCAAAGCAGCAATACATTCATCAATCCAGAGATTCTAAAGACGCTGCAATCACG
TAATCACCATTAAGCACAAAAACCATCTTCGCCCTGTCAACAAACCATTCAGTAATGCGG
TGGACCGTTGGGGTACATTCCTCCAGGAGGAACTCTCGGAGCTGTGGAGGAACCAACAGG
CTGATGCTGTCCAGGATACCCTGAAGCTGATGAATGCCCATAATGCCCACTCTCTGGATA
ACCACCACCAGCCATCGAACTTGGTGGCATTCTATACGGACCACTTCCAGCACCAGGCCC
ACCATAACCACCACCAGTAGTACCAAGACCATAACCCCCAGATCCTGGATGACCACCGTA
TCCACCATAATGACCAGCATACGCACCTCCATATCCACCACCCATAGAAGACGGTGTGTG
ATTCATCTGATGCGGTGGCGGTGGTCCTCCAGAGTACCCACCGTAACCACCTACACCACC
AGGTCCACCATAAGGTCCAGGAGGAGGAGCAACACCCATTCCATTACCATGACCATGACC
GTTCCCAGGACCAGCAACAACATCTTTACCTGGACC


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN43JQ U 1
AF RR4FT23JQ U 61
BS 1 541 RR4EN43JQ
BS 542 542 RR4FT23JQ
BS 543 570 RR4EN43JQ
BS 571 756 RR4FT23JQ

RD RR4EN43JQ 570 0 0
GAAAGACAAATAACACCAATAGTATTGAAAGTTCACTAATCTGACAAACAAAACCAATCT
GCCAACTATGTCTATGAAATTAAAAAAAACAAATACAAGTAAGACATCCTAATCTAATCA
TTCATAGAGAACAACTAGGTATTCAGAGGCCAAGACACAATCAATTCAAGTGAAGAGAGA
CATAGGTCAAAGCAGCAATACATTCATCAATCCAGAGATTCTAAAGACGCTGCAATCACG
TAATCACCATTAAGCACAAAAACCATCTTCGCCCTGTCAACAAACCATTCAGTAATGCGG
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CTGATGCTGTCCAGGATACCCTGAAGCTGATGAATGCCCATAATGCCCACTCTCTGGATA
ACCACCACCAGCCATCGAACTTGGTGGCATTCTATACGGACCACTTCCAGCACCAGGCCC
ACCATAACCACCACCAGTAGTACCAAGACCATAACCCCCAGATCCTGGATGACCACCGTA
TTCACCATAATGACCAGCATACGCACCTCC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4FT23JQ 696 0 0
GCCAACTATGTCTATGAAATTAAAAAAAACAAATACAAGTAAGACATCCTAATCTAATCA
TTCATAGAGAACAACTAGGTATTCAGAGGCCAAGACACAATCAATTCAAGTGAAGAGAGA
CATAGGTCAAAGCAGCAATACATTCATCAATCCAGAGATTCTAAAGATGCTGCAATCACG
TAATCACCATTAAGCACAAAAACCATCTTCGCCCTGTCAACAAACCATTCAGTAATGCGG
TGGACCGTTGGGGTACATTCCTCCAGGAGGAACTCTCGGAGCTGTGGAGGAACCAACAGG
CTGATGCTGTCCAGGATACCCTGAAGCTGATGAATGCCCATAATGCCCACTCTCTGGATA
ACCACCACCAGCCATCGAACTTGGTGGCATTCTATACGGACCACTTCCAGCACCAGGCCC
ACCATAACCACCACCAGTAGTACCAAGACCATAACCCCCAGATCCTGGATGACCACCGTA
TCCACCATAATGACCAGCATACGCACCTCCATATCCACCACCCATAGAAGACGGTGTGTG
ATTCATCTGATGCGGTGGCGGTGGTCCTCCAGAGTACCCACCGTAACCACCTACACCACC
AGGTCCACCATAAGGTCCAGGAGGAGGAGCAACACCCATTCCATTACCATGACCATGACC
GTTCCCAGGACCAGCAACAACATCTTTACCTGGACC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5148Contig1 889 2 2 U
GGGCCCTCTTTTGATTCGAAACCCTCTCCCTTGTTCAAAATGACAGGCTTCTCTGTGTCC
CTGATCGTGTCGAACTTATCAAACGTCGCCTCGTATCTGTCTCCCATCTTCGAGACCATC
CCGTCGACGAAGGTTGTTCCAGCGCAGATCGAGAAGGTCGTCTCTCTCGTCTCACGCACC
GGCAGAGATTTGCAGCGTTACGATAACTCAGGCTATCGTCAAGTCGTCGGATGCGTACCG
TACAGATACAAGAAACAACAAGGCAATGGAACCGAGTCCAAAGAGATCGAACTTCTCCTT
ATCAGTGCTCAGAAGGGTAAAGGAATGTTATTCCCAAAAGGAGGTTGGGAGATTGATGAG
TCTATGGAGGAAGCAGCTTTGAGAGAGACGATCGAGGAAGCCGGTGTGACGGGAGAGCTA
GAGGAAAGGCTTGGGAAATGGCAATACAAGAGTAAAAGACAGAGCGTGATCCACGAAGGT
TACATGTTTGCGTTGCTTGTTGACCAAGAATATGAGCGGTGGCCTGAAGCGGAGACTAGA
CGGCGGAGATGGGTTGGTTTGGACGAAGCGAGAGAGGTTTGTCAGAATTGGTGGATGAGA
GATGCTCTCGAAGCATTTGTTAACCTGAAATGTGAGGCCGAGGAGGTTGAGATTTGAAGC
TGATGATGTTTAGTTTTGGTGGAACAGAGGTTTTAGACTTAGAAACCTGTCGTCTGGGAT
CAGAAGAAGAAGCTTCCTGAGGGGATTCGTTGGGTCAACAGCATCTCTCTGTCTCTTTGA
GAGTTGTGTAAAAAGTTTTGATTGTTTGGAGATAACATGTCAACTATATTCTAATTTTTA
TTCCAATCTTTTTGTATTTTATAATTCATTCATTCTTTGATTGTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A880TF U 1
AF RR4A880JQ C 126
BS 1 775 RR4A880TF
BS 776 889 RR4A880JQ

RD RR4A880TF 775 0 0
GGGCCCTCTTTTGATTCGAAACCCTCTCCCTTGTTCAAAATGACAGGCTTCTCTGTGTCC
CTGATCGTGTCGAACTTATCAAACGTCGCCTCGTATCTGTCTCCCATCTTCGAGACCATC
CCGTCGACGAAGGTTGTTCCAGCGCAGATCGAGAAGGTCGTCTCTCTCGTCTCACGCACC
GGCAGAGATTTGCAGCGTTACGATAACTCAGGCTATCGTCAAGTCGTCGGATGCGTACCG
TACAGATACAAGAAACAACAAGGCAATGGAACCGAGTCCAAAGAGATCGAACTTCTCCTT
ATCAGTGCTCAGAAGGGTAAAGGAATGTTATTCCCAAAAGGAGGTTGGGAGATTGATGAG
TCTATGGAGGAAGCAGCTTTGAGAGAGACGATCGAGGAAGCCGGTGTGACGGGAGAGCTA
GAGGAAAGGCTTGGGAAATGGCAATACAAGAGTAAAAGACAGAGCGTGATCCACGAAGGT
TACATGTTTGCGTTGCTTGTTGACCAAGAATATGAGCGGTGGCCTGAAGCGGAGACTAGA
CGGCGGAGATGGGTTGGTTTGGACGAAGCGAGAGAGGTTTGTCAGAATTGGTGGATGAGA
GATGCTCTCGAAGCATTTGTTAACCTGAAATGTGAGGCCGAGGAGGTTGAGATTTGAAGC
TGATGATGTTTAGTTTTGGTGGAACAGAGGTTTTAGACTTAGAAACCTGTCGTCTGGGAT
CAGAAGAAGAAGCTTCCTGAGGGGATTCGTTGGGTCAACAGCATCTCTCTGTCTC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4A880JQ 764 0 0
GACGAAGGTTGTTCCAGCGCAGATCGAGAAGGTCGTCTCTCTCGTCTCACGCACCGGCAG
AGATTTGCAGCGTTACGATAACTCAGGCTATCGTCAAGTCGTCGGATGCGTACCGTACAG
ATACAAGAAACAACAAGGCAATGGAACCGAGTCCAAAGAGATCGAACTTCTCCTTATCAG
TGCTCAGAAGGGTAAAGGAATGTTATTCCCAAAAGGAGGTTGGGAGATTGATGAGTCTAT
GGAGGAAGCAGCTTTGAGAGAGACGATCGAGGAAGCCGGTGTGACGGGAGAGCTAGAGGA
AAGGCTTGGGAAATGGCAATACAAGAGTAAAAGACAGAGCGTGATCCACGAAGGTTACAT
GTTTGCGTTGCTTGTTGACCAAGAATATGAGCGGTGGCCTGAAGCGGAGACTAGACGGCG
GAGATGGGTTGGTTTGGACGAAGCGAGAGAGGTTTGTCAGAATTGGTGGATGAGAGATGC
TCTCGAAGCATTTGTTAACCTGAAATGTGAGGCCGAGGAGGTTGAGATTTGAAGCTGATG
ATGTTTAGTTTTGGTGGAACAGAGGTTTTAGACTTAGAAACCTGTCGTCTGGGATCAGAA
GAAGAAGCTTCCTGAGGGGATTCGTTGGGTCAACAGCATCTCTCTGTCTCTTTGAGAGTT
GTGTAAAAAGTTTTGATTGTTTGGAGATAACATGTCAACTATATTCTAATTTTTATTCCA
ATCTTTTTGTATTTTATAATTCATTCATTCTTTGATTGTTAATT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5149Contig1 820 2 3 U
GTAACTCTCTCCCCGGCGGTTTATCTGTCGTACGTCGTGAGGGAGGTTGATACTCTGGCG
GGGATCGCGAGGAGGTATGAGACTACTGTTACGGATTTGATGAATGTGAATGCCATGGGA
GCTCCTGATGTTAGCTCCGGTGATATCCTCGCTGTTCCTTTGTCTGCTTGTGCTTCAAAC
TTTCCCAAGTACGCTTCGGATTATGGATTGATTGTTCCAAATGGTAGCTATGCTCTAGCT
GCAGGTCATTGCGTGCAATGTAGCTGTGCTCTAGGGAGCCGCAGTTTGTATTGTGAGCCG
GCTTCTTTAGCAGTCTCTTGCTCGAGTATGCAGTGTAGAAGCAGCAACCTCATGCTCGGT
AACATCACGGTGCAGCAGAGTAGCGCTGGCTGTAACGTTACAAGCTGTGATTACAATGGT
TTCGCTAACGGCACTATCTTGACCATGCTATCTAGGTCTCTTCAACCACGATGTCCCGGA
CCTCCACAATTTGCGCCGCTTCTAGCTCCACCAGACACTCTTCCTAAGGATATAATGTAT
GCACCAGCGCCTTCACCGGATTTTGATGGACCAGGATCCATAGCATCGTCGCCAAGATCA
TCCATGCTTCCTTCAGGCGGTGGTTCCTTCCCAGGTAACCCCGCAAGTGGTCCAGCCGGA
AGCATCTCAATGGCAACTGCCTCCTCCGTTAGCCACTTCTTTATCACATTTCTCATCTCC
ATTTCTTTATTCTCCTTTGTTTTCTCTTCTTGTTGATTGATTCAACAACATTTTGTTATT
TATTTTCCGCGCATTTAATTTAAAACTCTGGAAAGACTAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B691JQ C 1
AF RR4B691TF U 1
BS 1 13 RR4B691TF
BS 14 14 RR4B691JQ
BS 15 820 RR4B691TF

RD RR4B691JQ 820 0 0
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GGGATCGCGAGGAGGTATGAGACTACTGTTACGGATTTGATGAATGTGAATGCCATGGGA
GCTCCTGATGTTAGCTCCGGTGATATCCTCGCTGTTCCTTTGTCTGCTTGTGCTTCAAAC
TTTCCCAAGTACGCTTCGGATTATGGATTGATTGTTCCAAATGGTAGCTATGCTCTAGCT
GCAGGTCATTGCGTGCAATGTAGCTGTGCTCTAGGGAGCCGCAGTTTGTATTGTGAGCCG
GCTTCTTTAGCAGTCTCTTGCTCGAGTATGCAGTGTAGAAGCAGCAACCTCATGCTCGGT
AACATCACGGTGCAGCAGAGTAGCGCTGGCTGTAACGTTACAAGCTGTGATTACAATGGT
TTCGCTAACGGCACTATCTTGACCATGCTATCTAGGTCTCTTCAACCACGATGTCCCGGA
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GCACCAGCGCCTTCACCGGATTTTGATGGACCAGGATCCATAGCATCGTCGCCAAGATCA
TCCATGCTTCCTTCAGGCGGTGGTTCCTTCCCAGGTAACCCCGCAAGTGGTCCAGCCGGA
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ATTTCTTTATTCTCCTTTGTTTTCTCTTCTTGTTGATTGATTCAACAACATTTTGTTATT
TATTTTCCGCGCATTTAATTTAAAACTCTGGAAAGACTAT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4B691TF 820 0 0
GTAACTCTCTCCC*GGCGGTTTATCTGTCGTACGTCGTGAGGGAGGTTGATACTCTGGCG
GGGATCGCGAGGAGGTATGAGACTACTGTTACGGATTTGATGAATGTGAATGCCATGGGA
GCTCCTGATGTTAGCTCCGGTGATATCCTCGCTGTTCCTTTGTCTGCTTGTGCTTCAAAC
TTTCCCAAGTACGCTTCGGATTATGGATTGATTGTTCCAAATGGTAGCTATGCTCTAGCT
GCAGGTCATTGCGTGCAATGTAGCTGTGCTCTAGGGAGCCGCAGTTTGTATTGTGAGCCG
GCTTCTTTAGCAGTCTCTTGCTCGAGTATGCAGTGTAGAAGCAGCAACCTCATGCTCGGT
AACATCACGGTGCAGCAGAGTAGCGCTGGCTGTAACGTTACAAGCTGTGATTACAATGGT
TTCGCTAACGGCACTATCTTGACCATGCTATCTAGGTCTCTTCAACCACGATGTCCCGGA
CCTCCACAATTTGCGCCGCTTCTAGCTCCACCAGACACTCTTCCTAAGGATATAATGTAT
GCACCAGCGCCTTCACCGGATTTTGATGGACCAGGATCCATAGCATCGTCGCCAAGATCA
TCCATGCTTCCTTCAGGCGGTGGTTCCTTCCCAGGTAACCCCGCAAGTGGTCCAGCCGGA
AGCATCTCAATGGCAACTGCCTCCTCCGTTAGCCACTTCTTTATCACATTTCTCATCTCC
ATTTCTTTATTCTCCTTTGTTTTCTCTTCTTGTTGATTGATTCAACAACATTTTGTTATT
TATTTTCCGCGCATTTAATTTAAAACTCTGGAAAGACTAT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL5150Contig1 758 2 6 U
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AACTTCTTGACTCCTATGAGGATCATCAGAGACGCGATCTTGGCGGTGGAAGGACCGAGT
CCTGTCGTGGTGTCGGAAGGAGCTAATACGATGGATGTGGGAAGATCTGTTTTGGTTCAG
AGAGAGCCGAGGACGAGGCTTGATGCAGGGACTTGGGGGACAATGGGTGTTGGTTTGGGT
TATTGTATTGCTGCCGCCGTTGCTTCTCCTGATCGGCTTGTTGTCGCTGTTGAAGGTGAC
TCTGGTTTTGGATTCAGCGCCATGGAAGTTGAGACATTGGTTCGATACAATCTCGCTGTG
GTGGTGATAGTTTTCAACAATGGTGGTGTCTATGGAGGTGACAGGGGGAGTCCTGAAGAG
ATCTCGGGTCCTCATAAAGAAGATTCCAGCACCAACATCGTTTGTTCCAAATGCAGGGTA
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GTGTGTAAATGTTGAAGTTATATTGTTGGAACAAAAACGTTTAAGCATTTTCGTTTTTCA
CTATTACCAAATTTGAATAAAAAACACCGTTTCTCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B449JQ C 1
AF RR4B449TF U 426
BS 1 425 RR4B449JQ
BS 426 630 RR4B449TF
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BS 632 743 RR4B449TF
BS 744 744 RR4B449JQ
BS 745 758 RR4B449TF

RD RR4B449JQ 758 0 0
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AGAGAGCCGAGGACGAGGCTTGATGCAGGGACTTGGGGGACAATGGGTGTTGGTTTGGGT
TATTGTATTGCTGCCGCCGTTGCTTCTCCTGATCGGCTTGTTGTCGCTGTTGAAGGTGAC
TCTGGTTTTGGATTCAGCGCCATGGAAGTTGAGACATTGGTTCGATACAATCTCGCTGTG
GTGGTGATAGTTTTCAACAATGGTGGTGTCTATGGAGGTGACAGGGGGAGTCCTGAAGAG
ATCTCGGGTCCTCATAAAGAAGAT*CCAGCACCAACATCGTTTGTTCCAAATGCAGGGTA
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TAAGACCGCTCTCTCTGAGTCCTTCGCTGCGAGAAAGCCTGCGGTGGTTAATGTTATTAT
AGATCCTTTTGCCGGTGCTGAGAGTGGGAGGTTGCAGCACAAGAACTAGAAGCTCTTATG
GTGTGTAAATGTTGAAGTTATATTGTTGGAACAAAAACGTTTAAGCATTTTCGTTTTTCA
CTATTACCAAATTTGAATAAAAAACACCGTTTCTCGTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4B449TF 333 0 0
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CCGCTCTCTCTGAGTCCTTCGCTGCGAGAAAGCCTGCGGTGGTTAATGTTATTATAGATC
CTTTTGCCGGTGCTGAGAGTGGGAG*TTGCAGCACAAGAACTAGAAGCTCTTATGGTGTG
TAAATGTTGAAGTTATATTGTTGGAACAAAAACGTTTAAGCATTTTCGTTTTTCACTATT
ACCAAATTTGAATAAAAA*CACCGTTTCTCGTT

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 2

CO CL5151Contig1 502 2 1 U
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TCATGTCTTGCTCATCTTTTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FU20TF U 1
AF RR4GJ39TF U 1
BS 1 502 RR4FU20TF

RD RR4FU20TF 502 0 0
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ACATGTTTTCTTCCCCTTTGATTTGTTTTTGCTTTGGTGATTTTTATGTGAAGTATGAAC
TCATGTCTTGCTCATCTTTTGA

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4GJ39TF 502 0 0
GGGCGGAAAAAAGCTTAGAAAGGAAAAAAAAAAATGGCGGATCAGCTGAGCTCCAAGACA
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TGATGGCTAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGG
TTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCGGAGCTTCGACACGTGATGACGA
ACCTCGGGGAGAAACTCACCGACGAGGAGGTTGATGAGATGATCAGAGAGGCTGATGTTG
ATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAAGTGATGGA
GAGAGAGAGAGTGAATCTTTCTTTCTCGTTATGACTTGTTCCTGTTTGCTGTCATGTAGA
ACATGTTTTCTTCCCCTTTGATTTGTTTTTGCTTTGGTGATTTTTATGTGAAGTATGAAC
TCATGTCTTGCTCATCTTTTGA

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL5152Contig1 371 2 2 U
TTTTTTTCGTGGTGGCCGTTGGTTCTTTTACCGCTGCCAGTCATCCCTCTCTGGAGCACC
AGCGAGACTTTGGCCCATGATGTGAAGCCAGAGAGCTCGAGTTTGGAGGTGGTTTGTGTG
GTTTTAACTAGATCTGGATCATATCTGGCGGATCTGTGATAAGGTTACAGTTGAGGTTTC
ACCGGTGGTAAAGGGCCTCTTTTCCCTTGTCATTTCGTTTACCCTCAACTTCTTCGTTCT
TCGACCTGTGGAGATCCTCGATCTAAGCGGTATAGAATATCTGGTTTCCATTGTTGTGTG
GAAACTTATGTTGAATTCTTCTGTCTGTAAATTTTAAAGGGAATTATTGGTCATTTTTTG
GTTGTTTGATC


BQ
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AF RR4FO44JQ C 1
AF RR4FO44TF U 8
BS 1 7 RR4FO44JQ
BS 8 371 RR4FO44TF

RD RR4FO44JQ 371 0 0
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AGCGAGACTTTGGCCCATGATGTGAAGCCAGAGAGCTCGAGTTTGGAGGTGGTTTGTGTG
GTTTTAACTAGATCTGGATCATATCTGGCGGATCTGTGATAAGGTTACAGTTGAGGTTTC
ACCGGTGGTAAAGGGCCTCTTTTCCCTTGTCATTTCGTTTACCCTCAACTTCTTCGTTCT
TCGACCTGTGGAGATCCTCGATCTAAGCGGTATAGAATATCTGGTTTCCATTGTTGTGTG
GAAACTTATGTTGAATTCTTCTGTCTGTAAATTTTAAAGGGAATTATTGGTCATTTTTTG
GTTGTTTGATC

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR4FO44TF 364 0 0
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CTTTGGCCCATGATGTGAAGCCAGAGAGCTCGAGTTTGGAGGTGGTTTGTGTGGTTTTAA
CTAGATCTGGATCATATCTGGCGGATCTGTGATAAGGTTACAGTTGAGGTTTCACCGGTG
GTAAAGGGCCTCTTTTCCCTTGTCATTTCGTTTACCCTCAACTTCTTCGTTCTTCGACCT
GTGGAGATCCTCGATCTAAGCGGTATAGAATATCTGGTTTCCATTGTTGTGTGGAAACTT
ATGTTGAATTCTTCTGTCTGTAAATTTTAAAGGGAATTATTGGTCATTTTTTGGTTGTTT
GATC

QA 1 364 1 364
DS 



AS 1 2

CO CL5153Contig1 873 2 4 U
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GTGGTTTCTGGTCGTTTCTTCATCTCTACTCTTCCAAACACCAACTCGCACCCACAACTA
AAAAAGTTAGCCATTCTTCTAGGCCAAGAAACCAGAGAACAGAGACAACAGAGACACCCA
AGAGGGTCCTTGGTGGAGGAGGTATTGATGTAATAGTGGAGGAGGAAGATGAGAGTCCTA
GTAACAAAGTGGTTGTAGAAACGCCAACAAACAGTGTTGGCAGTGGTAATGGATCTTCTT
TTGGGAGGAAAGTGTTGAGGTCTAGATCTGTAAGGTGTGGAAGCAAAAGCTTCTCTGGAG
ACTTCTTTGAGAGGATCTCTAATGGGTTTGGAGATTGCGCTTTGAGAAGGATTGAGTCAC
AGAGAGAACCCACAAAGGTTATTAGTAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAAGCAGCTG
ATGATGCCATGAGTGAAATGGTGAAATGTGGTGGTATCTTTGGTGGGTTTATGATTATGA
CATCATCATCATCAACAGTTGATCATCATCATAAGATGGGGAATAGAAGCTGGGGATGGG
CTTTTGCTAGTCCAATGAGAGCCAAGGCTACTACACATAGAGGTCGTACTATTACAGAGT
CTTCAACTACTGACAAGAGCACACCTCCAAACTTGGACTCAATTTCTCCCTTGGTTGCTA
TGAAAAGCTAAAAGAGAGAGAGAGATACATTATAAATTAAGTACTTTTAATCTCGATATC
TTATTTTATTCATGTGTTTAGTTAGGCTGTTCTTTTGTTCTTTAGACATTGGTTTTGATC
TTTTGAGTTCAACTAGTAATGTAATATCACACT


BQ
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AF RR4E653TF U 1
AF RR4E653JQ C 198
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BS 344 358 RR4E653TF
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RD RR4E653TF 358 0 0
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QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4E653JQ 676 0 0
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AATGTAATATCACACT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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CATGGTATTATGGATTAGGAATGGTGTTTTTGGCTCTTGCTGCCATCTCTTTGCCCTACA
TGTTAGGGGTCACCGCTTTATTTTTGAGGTTGGGTCTGATGATAGCTGTAGCCATGGTTC
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GTGTGTCGCAGTGTAACTCACAACGCACCTTTTGTATGCTTTCTTTATTCTGTTAGGACA
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BQ
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AF RR4AR74TF U 1
AF RR4AR74JQ C 9
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BS 777 777 RR4AR74JQ
BS 778 828 RR4AR74TF

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GCAATCAGATCAGACATCTATATTACAAAGTCAGATCTAATGGAACACTTGGTTATAGTG
GTGTATCGACATTGTCTACCATGAATCCAAACTATCAACTTCACACTGGCTCACACTCTA
AGCTTCCTCAATACTTGGGGTCAGTTTCAGTTGTAGTCTGTTTTGTGGCTGTTTTGACAT
CCATTGGAGTTTCCTTTATGATTGTTCCAAGGCAAATCATGCCATGGACTGGCTTGATTT
TGATGTATGAGTGGACATTTACAATCTTCTTCCTATTATACGGTGGCTTCCTACTTATAG
TGTACCAGTATGGCAAGAAAGTAGCAGTTCAATCAGGATCTCCTTCATCGCCAACAGAAT
CATCGTTGGATGATTCAGGAAAAGGTCATCAGCGGGCAGATGCGTCTTGTGACTTTACTA
CATGGTATTATGGATTAGGAATGGTGTTTTTGGCTCTTGCTGCCATCTCTTTGCCCTACA
TGTTAGGGGTCACCGCTTTATTTTTGAGGTTGGGTCTGATGATAGCTGTAGCCATGGTTC
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GTGTGTCGCAGTGTAACTCACAACGCACCTTTTGTATGCTTTCTTTATTCTGTTAG*ACA
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QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4AR74JQ 820 0 0
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ATCAGACATCTATATTACAAAGTCAGATCTAATGGAACACTTGGTTATAGTGGTGTATCG
ACATTGTCTACCATGAATCCAAACTATCAACTTCACACTGGCTCACACTCTAAGCTTCCT
CAATACTTGGGGTCAGTTTCAGTTGTAGTCTGTTTTGTGGCTGTTTTGACATCCATTGGA
GTTTCCTTTATGATTGTTCCAAGGCAAATCATGCCATGGACTGGCTTGATTTTGATGTAT
GAGTGGACATTTACAATCTTCTTCCTATTATACGGTGGCTTCCTACTTATAGTGTACCAG
TATGGCAAGAAAGTAGCAGTTCAATCAGGATCTCCTTCATCGCCAACAGAATCATCGTTG
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TATGGATTAGGAATGGTGTTTTTGGCTCTTGCTGCCATCTCTTTGCCCTACATGTTAGGG
GTCACCGCTTTATTTTTGAGGTTGGGTCTGATGATAGCTGTAGCCATGGTTCTAGTTTCG
TTCATGACTTATGCTTCAGAGCACCTCGCAGTCAGATGGTTCCTCAAAGGTCTAGAAGAC
CGTGACACGACTAGAACTAAGTCAATCTGTTTCCTCTGCTGACATTTAAAAAGTGTGTCG
CAGTGTAACTCACAACGCACCTTTTGTATGCTTTCTTTATTCTGTTAGGACAGCTCCTGA
GTTTTGTACTTTCTTGTGTTATTATATCATTCTTCTTTAC

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

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GGACTGTGTAATGTTACGAATAATGATGGATTCAGCTTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B883JQ C 1
AF RR4B883TF U 1
BS 1 701 RR4B883TF

RD RR4B883JQ 701 0 0
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GAGTCGAATCCATGTTCCCTTTGTATTCTCCAAACCTGAGGGAGATTAAGGTTTTGGACA
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GGACTGTGTAATGTTACGAATAATGATGGATTCAGCTTTTG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4B883TF 701 0 0
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GGACTGTGTAATGTTACGAATAATGATGGATTCAGCTTTTG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5157Contig1 918 2 4 U
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ATTTCGTGTGGGGACCGGACTACTTTCACAATGACACACTTCTCTTTTTCATTTTCGTAT
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TTAATTTCTTTCTTTTTTTTTCTCTAAAGAATATTATGTTATTACCTTCTTTTTTGGGGT
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TAAATGTATTCAATCTTTTTCTTCCTATTTTCTTATATATTCTGATTTGGAAGTTAATAA
AAAATTAAGGGCTTGTAAATTCTTATCTATGACATTGTTAGTAGTATCATTTTCTATCAT
TAATATTTTTGTTGAATTTTTTTTCATGAATAACAGAAATTCATATTATTTTACCTTGAT
CATTTGAGTTTGAAATTTTAGTATATATGCATAAAATATGAATTTTTAGTTAAGATAGGA
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CTCATATCTCATAATATATACCTATATTATCATTTTAATGTATCCACTATCAATAAATGT
TAGTTTTAAATTTATATATTGCAAAAATCTTCTACTAAAATATGTTCTATGACTATTAGT
AATTTAGTATATAATCATAGAAAAGAACTTAAAAGATAAAATCATAAGGGACAGGGCTAG
TAGCCCACTATTTAATTTCAAAGGCCCATTAGGCTCTTGAGAATACATCGTTGCTCTCTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E264TF U 1
AF RR4E264JQ C 194
BS 1 686 RR4E264TF
BS 687 687 RR4E264JQ
BS 688 699 RR4E264TF
BS 700 918 RR4E264JQ

RD RR4E264TF 704 0 0
GAGGGATGGACGAGAGATACGATGATTGTAGTTTTGAAGCCAACAGACAAAAACTAATTC
ATTTCGTGTGGGGACCGGACTACTTTCACAATGACACACTTCTCTTTTTCATTTTCGTAT
GGGACAACCTCCACTATACTAGAAGTACATACATTTCTTTCTTTTGCTAATACCAAATTC
TTAATTTCTTTCTTTTTTTTTCTCTAAAGAATATTATGTTATTACCTTCTTTTTTGGGGT
CAAATTATCTTTGAGTTAATTAATCCTATGATGCCAAAAGAATCAGTTTTTAGATTTGAC
TAAATGTATTCAATCTTTTTCTTCCTATTTTCTTATATATTCTGATTTGGAAGTTAATAA
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CATTTGAGTTTGAAATTTTAGTATATATGCATAAAATATGAATTTTTAGTTAAGATAGGA
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CTCATATCTCATAATATATACCTATATTATCATTTTAATGTATCCACTATCAATAAATGT
TAGTTTTAAATTTATATATTGCAAAA*TCTTCTACTAAA
TATGT

QA 1 699 1 699
DS 

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AGTTAATTAATCCTATGATGCCAAAAGAATCAGTTTTTAGATTTGACTAAATGTATTCAA
TCTTTTTCTTCCTATTTTCTTATATATTCTGATTTGGAAGTTAATAAAAAATTAAGGGCT
TGTAAATTCTTATCTATGACATTGTTAGTAGTATCATTTTCTATCATTAATATTTTTGTT
GAATTTTTTTTCATGAATAACAGAAATTCATATTATTTTACCTTGATCATTTGAGTTTGA
AATTTTAGTATATATGCATAAAATATGAATTTTTAGTTAAGATAGGAAATTAATCTAAAT
GATTGATTTTCTTATCTTTTTAAAAGGAGATAATACCAAATTTTATGCTCATATCTCATA
ATATATACCTATATTATCATTTTAATGTATCCACTATCAATAAATGTTAGTTTTAAATTT
ATATATTGCAAAAATCTTCTACTAAAATATGTTCTATGACTATTAGTAATTTAGTATATA
ATCATAGAAAAGAACTTAAAAGATAAAATCATAAGGGACAGGGCTAGTAGCCCACTATTT
AATTTCAAAGGCCCATTAGGCTCTTGAGAATACATCGTTGCTCTCTTTAGAAACTCTCGC
ATAAAACTATAGTGGGGGAGACCGAAAGAAAAAGAATCAGTCTCGAAACTTTTGTCGGAT
TTCCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGTTTGTGAAGATGGCATCAAAGTTGATACAAGTTCAGTCAAAGGCATGTGAGGCTTCCA
AGTTTGTGGCCAAGCATGGAACTTCTTACTACAGGCAGTTGCTTGAGAAGAACAAGCACT
ATGTCCAGGAACCTGCTACGGTGGACAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAACTTCTCTACA
CCCGTCTTGCTAGGTCCTTCCTTCTCCCTCAACATTCTCATGGTCGTAGACTGTTCTTGG
AACTGAAAATGGCATTACTTAGAATCCTTTGTTGTTTTCTCCTCTAATAGATGGGACTCT
AATTCAAGTTTTTATTTTGTCTATTCTTTAGTATCTCTGCATTGAATTGTTTGTCGTCTT
GTTTAGCCCTTTGTCGTAGTTTACAGGATTATGTTTTAAGGTGGTCAAGCTTGAGTTGTT
TTTGATCAATAAATCTATAAGC


BQ
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AF RR4GH73JQ C 1
AF RR4GH73TF U 1
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CCCGTCTTGCTAGGTCCTTCCTTCTCCCTCAACATTCTCATGGTCGTAGACTGTTCTTGG
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DS 

RD RR4GH73TF 502 0 0
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GGTTTGTGAAGATGGCATCAAAGTTGATACAAGTTCAGTCAAAGGCATGTGAGGCTTCCA
AGTTTGTGGCCAAGCATGGAACTTCTTACTACAGGCAGTTGCTTGAGAAGAACAAGCACT
ATGTCCAGGAACCTGCTACGGTGGACAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAACTTCTCTACA
CCCGTCTTGCTAGGTCCTTCCTTCTCCCTCAACATTCTCATGGTCGTAGACTGTTCTTGG
AACTGAAAATGGCATTACTTAGAATCCTTTGTTGTTTTCTCCTCTAATAGATGGGACTCT
AATTCAAGTTTTTATTTTGTCTATTCTTTAGTATCTCTGCATTGAATTGTTTGTCGTCTT
GTTTAGCCCTTTGTCGTAGTTTACAGGATTATGTTTTAAGGTGGTCAAGCTTGAGTTGTT
TTTGATCAATAAATCTATAAGC

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

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ATTTCCTCAAACTTCTTGCGGAGAAGAAACAGTTGAAACCTCTGATTGAGAAGGCCAAGA
AACAGAAGACAGAAAGTTCCACTTGAGAAAAAAAACCAGAACCTGTCTTATGTCGGTCTT
GCCAAGAGGCATTTGATACACTCTCCTGTCGTTATGTCTTTTATCACACAAGAAATAGAT
TTTCTCTAGATGAAGTTTGATTCCCAATGGTTTTTGTTGGTTTTACATTCACAGTGAGTA
ATCTATCTGAAAGGTTATTAACATGTTTTGTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4HB81TF U 1
AF RR4HB81JQB C 576
BS 1 644 RR4HB81TF
BS 645 645 RR4HB81JQB
BS 646 707 RR4HB81TF
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RD RR4HB81TF 707 0 0
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GTCCGCTCTCTCTACCTGCGTTTGTTCGCTTTTCCTCTCTCTAGCTCGTTTCATCATGTC
TTGGTGCACGATCGAGTCGGATCCTGGTGTGTTTACAGAGCTTATTCAACAAATGCAAGT
CAAAGGTGTCCAGGTTGAAGAGTTGTACTCCCTTGATCTTGATTCTCTCAATAACCTCAG
ACCCGTGTACGGTCTGATCTTTCTTTTCAAATGGCAAGCTGGCGTAAAAGATGATCGCCC
AACAATCCAAGATCCAGTTTCTAACCTCTTTTTTGCAAACCAGGTCATTAACAATGCTTG
TGCAACCCAAGCGATCTTGTCTATCCTCTTGAACTCTCCCGACGTCGACATCGGTCCTGA
GCTCTCGACACTGAAAGAGTTCACCAAGAACTTCCCATCTGACCTCAAGGGCTTGGCCAT
CAACAACAGCGAGGCGATAAGGACAGCTCACAACTCTTTCGCAAGGCCTGAGCCATTTGT
CCCCGAGGAACAGAAAGCTGCCACGAAAGACGACGACGTCTACCATTTCATAAGCTACAT
ACCTGTGGATGGAGTCTTGTACGAGCTCGACGGTCTCAAGGAAG*ACCCATCAGTCTTGG
TCCGTGCCCCGGGGACCAGAGCGGGTATAGAGTGGCTGCAGCTGGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4HB81JQB 721 0 0
ACGTCTACCATTTCATAAGCTACATACCTGTGGATGGAGTCTTGTACGAGCTCGACGGTC
TCAAGGAAGGACCCATCAGTCTTGGTCCGTGCCCCGGGGACCAGAGCGG*TATAGAGTGG
CTGCAGCTGGTTCAGCCGGTGATCCAAGAGAGGATCGAGAGGTACTCGCAGAGCGAGATT
AGGTTCAATCTTTTGGCTGTGATTAAAAACAGGAAGGATATTTACACGGCGGAGCTCAAG
GAGCTTCAGAGGCAGAGGGAGCAGATGGTGCAGGAGTTGGCTGGTGTGGAGAAGAGCCGT
GCGGGGGAGCTTGAGGTGTTGATCGGTGAAGTGAGGAGCGGGATCGAAGCTGTGAGTGAT
AAGATTGTGATGGAGGAGGAGAAGTTCATGAAATGGAAGACGGAGAATATTAGGAGGAAG
CACAACTACATTCCGTTTTTGTTCAATTTCCTCAAACTTCTTGCGGAGAAGAAACAGTTG
AAACCTCTGATTGAGAAGGCCAAGAAACAGAAGACAGAAAGTTCCACTTGAGAAAAAAAA
CCAGAACCTGTCTTATGTCGGTCTTGCCAAGAGGCATTTGATACACTCTCCTGTCGTTAT
GTCTTTTATCACACAAGAAATAGATTTTCTCTAGATGAAGTTTGATTCCCAATGGTTTTT
GTTGGTTTTACATTCACAGTGAGTAATCTATCTGAAAGGTTATTAACATGTTTTGTGCTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5161Contig1 1043 2 2 U
GGATCCAAGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGATGTCGCAGCTCTTAT
CTTCTCCTCCAATGGCGGTAAACTCCAAAATCTTCTTAACCCATCGATTCCCAGAAGCTC
GTTTTCTCACCGCCGGTGGTTTCGTCGGAAAAGGGCATTGCTTCGGCGTGAAAGTGAAAC
CGATGGAGGAGAGGGTGAAGCTAACGGTGAAGTCTCGGTATAGCGACTCATCTTCACCAC
CTTACTCTCCTCCGCAAAACGGGGAAGGAGGATCTTCGCCGCGGTTTTATGTGGGTCATT
CTATTTACAAAGGGAAAGCTGCTCTTACTATTGAGCCTCGTGCCCCCGAGTTTGTGTCTT
TACAATCTGGTGCGTTCAAGCTTTCCAAGGAAGGGTTCTTGCTCCTCCAGTTTGCTCCTG
CAGCTGGTGTTCGCCAGTACGATTGGAGCAGGAAACAGGTCTTCTCGTTATCAGTTACAG
AGATTGGTAATTTAGTTAGCCTTGGGCCGAAGGAATCATGTGAGTTCTTCCATGATCCTA
ACAAGGGAAAAGGTAGTGACGAAGGTAAAGTGAGGAAAGTGCTGAAAGTTGAACCCCTTC
CAGACGGTTCTGGCCGCTTCTTTAACCTGAGTGCTCAAAACAAGCTTTTGAATGTAGATG
AGAGTGTATACATACCTATCACTAAAGCAGAGTTTGCTGTTCTCATCTCTGCTTTCAACT
TCATCTTGCCCCACCTTATAGGGTGGCAAGCATTTGCAAACTCTATCAAACCAGAAGACT
CTAATCGTCTTAACAATGCGTCACCTAAGTATGGAGGAGACTACGAATGGAGTAGATGAT
TGAGAATCACAGACAACCTTGCAAACTCGGTTCTTGTGTCCATCCCATTATTTTGTTATC
GCAGTCAACGAGTAGCAGTAGAGACTGAAGCAGTGTTTTAGACCAAATGGGATGTGTTGT
TGTGTAGGAAAAAAACATTTTGTAGTGAAGACTCGAGAGCAAACGGTTGGAATTTTGGTA
ATACAAGAATCAGTTTTGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G392TF U 1
AF RR4G392JQ C 261
BS 1 737 RR4G392TF
BS 738 1043 RR4G392JQ

RD RR4G392TF 737 0 0
GGATCCAAGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGATGTCGCAGCTCTTAT
CTTCTCCTCCAATGGCGGTAAACTCCAAAATCTTCTTAACCCATCGATTCCCAGAAGCTC
GTTTTCTCACCGCCGGTGGTTTCGTCGGAAAAGGGCATTGCTTCGGCGTGAAAGTGAAAC
CGATGGAGGAGAGGGTGAAGCTAACGGTGAAGTCTCGGTATAGCGACTCATCTTCACCAC
CTTACTCTCCTCCGCAAAACGGGGAAGGAGGATCTTCGCCGCGGTTTTATGTGGGTCATT
CTATTTACAAAGGGAAAGCTGCTCTTACTATTGAGCCTCGTGCCCCCGAGTTTGTGTCTT
TACAATCTGGTGCGTTCAAGCTTTCCAAGGAAGGGTTCTTGCTCCTCCAGTTTGCTCCTG
CAGCTGGTGTTCGCCAGTACGATTGGAGCAGGAAACAGGTCTTCTCGTTATCAGTTACAG
AGATTGGTAATTTAGTTAGCCTTGGGCCGAAGGAATCATGTGAGTTCTTCCATGATCCTA
ACAAGGGAAAAGGTAGTGACGAAGGTAAAGTGAGGAAAGTGCTGAAAGTTGAACCCCTTC
CAGACGGTTCTGGCCGCTTCTTTAACCTGAGTGCTCAAAACAAGCTTTTGAATGTAGATG
AGAGTGTATACATACCTATCACTAAAGCAGAGTTTGCTGTTCTCATCTCTGCTTTCAACT
TCATCTTGCCCCACCTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4G392JQ 783 0 0
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GCTCTTACTATTGAGCCTCGTGCCCCCGAGTTTGTGTCTTTACAATCTGGTGCGTTCAAG
CTTTCCAAGGAAGGGTTCTTGCTCCTCCAGTTTGCTCCTGCAGCTGGTGTTCGCCAGTAC
GATTGGAGCAGGAAACAGGTCTTCTCGTTATCAGTTACAGAGATTGGTAATTTAGTTAGC
CTTGGGCCGAAGGAATCATGTGAGTTCTTCCATGATCCTAACAAGGGAAAAGGTAGTGAC
GAAGGTAAAGTGAGGAAAGTGCTGAAAGTTGAACCCCTTCCAGACGGTTCTGGCCGCTTC
TTTAACCTGAGTGCTCAAAACAAGCTTTTGAATGTAGATGAGAGTGTATACATACCTATC
ACTAAAGCAGAGTTTGCTGTTCTCATCTCTGCTTTCAACTTCATCTTGCCCCACCTTATA
GGGTGGCAAGCATTTGCAAACTCTATCAAACCAGAAGACTCTAATCGTCTTAACAATGCG
TCACCTAAGTATGGAGGAGACTACGAATGGAGTAGATGATTGAGAATCACAGACAACCTT
GCAAACTCGGTTCTTGTGTCCATCCCATTATTTTGTTATCGCAGTCAACGAGTAGCAGTA
GAGACTGAAGCAGTGTTTTAGACCAAATGGGATGTGTTGTTGTGTAGGAAAAAAACATTT
TGTAGTGAAGACTCGAGAGCAAACGGTTGGAATTTTGGTAATACAAGAATCAGTTTTGTT
CTT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL5162Contig1 991 2 2 U
GCCTGATGAGGTAACGGATTACCACATAGCCCATCATATCGTGCGTGTCCACCAGAAACA
AGAAGCTGCTCTTTCACCTGAATTTACTACCGTACAACTCAAGCGCTACATTGCATATGC
CAAAACGTTAAAGCCAAAGCTAAGCCCCGAAGTAAGAAAGCTACTTGTCGAGTCTTATGT
TGTTCTACGCAGAGGCGATACAACCCCTGGCACAAGAGTCGCATATCGAATGACAGTGAG
GCAGCTGGAGGCTCTGATCAGGCTCTCGGAAGCCATTGCTAGGAGTCATTTAGAAACTCT
GGTGAAACCAAGTCATGTTCTTTTAGCTGTCAAACTTTTAAAAACCTCAGTTATCAGTGT
TGAGTCAGGTGATATTGATCTTTCGGAGTACGAAGATGCTAACGGTGACAACATGGACGA
CACAAATGACGCTGAAAATCCTGGTAACGGAGATGAAGATCAACAGAATGGTGCAGCCGA
GCCAGCTCCTGCTGCTACTGCAGATAATGGAGCAGCAGCTCCAAAGCTGGTGATTAGCGA
GGAAGAATATGATAAAATCACACAGGCCTTAGTCATTCGCCTTAGACAACACGAAGAAAC
TGTTGACAAAGACAGTTCTGAATTGCCTGGAATGAGACAAAAGGAGCTGATACGATGGTA
CATCGATCAGCAGAACGAAAAAAAGAAATACAGTTCGCAAGAGCAAGTCAAACTCGATAT
CAAGAAACTAAGAGCCATTATTGAGAGTTTGGTATGCAAAGAAGGCCACCTTATAGTGTT
GGCCAATGAGCAAGAAGCAGCAGAAGCTGAGGAAACAAGAAGAAGAGCTTCCCAGAGAGA
TGAGAGGATCTTGACCGTTGCTCCAAACTATGTTATCGAGTGATGTTACGAAATGTTGTG
TTTAATTTGTAGTTCTAAGTAGAATCCTGCCTAAAACCTTTCGTTATGTCATTTGGAACT
AATTTTTATTGGATTCCTTTAGCTCAGTTTC


BQ
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AF RR4BJ08TF U 1
AF RR4BJ08JQ C 190
BS 1 679 RR4BJ08TF
BS 680 991 RR4BJ08JQ

RD RR4BJ08TF 679 0 0
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CATCGATCAGCAGAACGAA

QA 1 679 1 679
DS 

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AAGTCATGTTCTTTTAGCTGTCAAACTTTTAAAAACCTCAGTTATCAGTGTTGAGTCAGG
TGATATTGATCTTTCGGAGTACGAAGATGCTAACGGTGACAACATGGACGACACAAATGA
CGCTGAAAATCCTGGTAACGGAGATGAAGATCAACAGAATGGTGCAGCCGAGCCAGCTCC
TGCTGCTACTGCAGATAATGGAGCAGCAGCTCCAAAGCTGGTGATTAGCGAGGAAGAATA
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AAGAGCCATTATTGAGAGTTTGGTATGCAAAGAAGGCCACCTTATAGTGTTGGCCAATGA
GCAAGAAGCAGCAGAAGCTGAGGAAACAAGAAGAAGAGCTTCCCAGAGAGATGAGAGGAT
CTTGACCGTTGCTCCAAACTATGTTATCGAGTGATGTTACGAAATGTTGTGTTTAATTTG
TAGTTCTAAGTAGAATCCTGCCTAAAACCTTTCGTTATGTCATTTGGAACTAATTTTTAT
TGGATTCCTTTAGCTCAGTTTC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL5163Contig1 700 2 1 U
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TTTCAGCAACGTATCTCCCAATCCAGTGTTTTTAATAATT


BQ
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AF RR4AI07JQ C 1
AF RR4AI07TF U 1
BS 1 700 RR4AI07TF

RD RR4AI07JQ 700 0 0
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TCTTTTGTCTGTTATAATAAATGAGCCGTGTTGTGTCGGACAAGCAACGCTTTGTGTTCT
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QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4AI07TF 700 0 0
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TGGGCCCAATCCTCCGGATCCTTATCCGGCGCTGCGGAGGCGGTGGGTTTTGGGATCGTT
GACTCGGCTGCGCATGATAGCGCGGAAGGGGTTGTGGAGGCTACTGTGGGCCTTGCGGAG
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CCGGAGCTTTGTGAGATTCTTGGTTTAAAGGCGACCGTCTTTGCTACACCCAAGCTCTAA
AGACTCTCTTTTGAGTGCGATTGTTTTTTTTTTTGTTTTAAATCAAAACCAGTTTCTTTA
TGGGGGCAAAACACATGATTAAGTTATAATGATGATCACAGAGACGAGAAAAATGTTCAG
TCTTTTGTCTGTTATAATAAATGAGCCGTGTTGTGTCGGACAAGCAACGCTTTGTGTTCT
TTTCAGCAACGTATCTCCCAATCCAGTGTTTTTAATAATT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5164Contig1 713 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B016JQ C 1
AF RR4B016TF U 96
BS 1 95 RR4B016JQ
BS 96 713 RR4B016TF

RD RR4B016JQ 713 0 0
GGACAGTTGTGTCTTCCTGAATTCTCTAATCTCTTGATCAAATGGGGAGCGAGGAAGTCG
TGGTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTACA
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TGTGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAAGATCTACTTCA
AAACTCCGATGGGACTCGGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGATGAGGAAGAGA
AACGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAATAAAACATTTTATTATGATAAATAAATT
ATATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTT*CTGTTTTCACTCTTATCAGGTTGCTTT*CTAT
GCCATTACTAAAAAAA*TTATGTTGACAATTATGAAAAGAAGTAAAATTCGTTTTGTGAT
GCAATGGTTATAATTTGTAATTGAAATCGATAAAGAAAAATAATTTCAGTTCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4B016TF 618 0 0
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ACCTTATACATGGATGAGGAAGAGAAACGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAATAA
AACATTTTATTATGATAAATAAATTATATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTTTCTGTTTT
CACTCTTATCAGGTTGCTTTTCTATGCCATTACTAAAAAAAATTATGTTGACAATTATGA
AAAGAAGTAAAATTCGTTTTGTGATGCAATGGTTATAATTTGTAATTGAAATCGATAAAG
AAAAATAATTTCAGTTCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL5165Contig1 768 2 6 U
GGGCCCACAAACATCGTTAAAGACGCAACTTCTTTCTTGTTTCTTCTTCTTCATTGCTAT
CTTCATCATTTTCTTCGCTTCTTCTTGTACTTTTTCTTTTGCATACATGGCGATCTGGTT
TGCTAGATCCAGAAACCTCGTTTCTAGCTTGAGACAGAACCTGGGTTTGTCGGCGATTCT
CATCAAGCGCAACTACACTTCTCCTCGTCCTGTTTTTACAAATTATCAGTTATCTTCGAG
GGTGTTTTTGAATCCCTTCACTAGCTTCCGTCACGAGTCTACGGCAGTGGAGACACAGCC
TGATTTGGTTCAACAGAGTGATCATGAGGATGATGCCCAGGAATTGGATTTTCCGGGCGG
CAAAGTCGGTTACACATCTGAGATGAAATTCATACCGGGATCATCTTCTCGGAGAATTCC
ATGCTATCGAGTTCTTAACGAACATGGAAGCATCATCTCCAACAGCGATTATGTTCCGGT
GAGCGAGAAACTCGCGATTAGAATGTACGAACAGATGGCGACGCTTCAGGTGATGGACCA
CATCTTCCACGAAGCTCAACGTCAAGGGAGAATCTCTTTCTACCTCACTTCCCGTCGGAG
AAGAAGCCATCAACATCGCATCAGCCGCCGCTCTCAGTTCATAAGACGTTGTGTTACCTC
AGTACAGAGAGCCTGGAGTGCTTCTATGGCGTGGCTTCACGTTAGAGGAGTTTGCGAATC
AGTGCTTTGGTAACAAAGCTGATTACGAAAAGCAGACAGATGCTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G785TF U 1
AF RR4CU85TF U 91
BS 1 263 RR4G785TF
BS 264 264 RR4CU85TF
BS 265 547 RR4G785TF
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BS 549 617 RR4G785TF
BS 618 768 RR4CU85TF

RD RR4G785TF 617 0 0
GGGCCCACAAACATCGTTAAAGACGCAACTTCTTTCTTGTTTCTTCTTCTTCATTGCTAT
CTTCATCATTTTCTTCGCTTCTTCTTGTACTTTTTCTTTTGCATACATGGCGATCTGGTT
TGCTAGATCCAGAAACCTCGTTTCTAGCTTGAGACAGAACCTGGGTTTGTCGGCGATTCT
CATCAAGCGCAACTACACTTCTCCTCGTCCTGTTTTTACAAATTATCAGTTATCTTCGAG
GGTGTTTTTGAATCCCTTCACTATCTTCCGTCACGAGTCTACGGCAGTGGAGACACAGCC
TGATTTGGTTCAACAGAGTGATCATGAGGATGATGCCCAGGAATTGGATTTTCCGGGCGG
CAAAGTCGGTTACACATCTGAGATGAAATTCATACCGGGATCATCTTCTCGGAGAATTCC
ATGCTATCGAGTTCTTAACGAACATGGAAGCATCATCTCCAACAGCGATTATGTTCCGGT
GAGCGAGAAACTCGCGATTAGAATGTACGAACAGATGGCGACGCTTCAGGTGATGGACCA
CATCTTCTACGAAGCTCAACGTCAAGGGAGAATCTCTTTCTACCTCACTTCCCGTCGGAG
AAGAAGCCATCAACATC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4CU85TF 678 0 0
TTTTTCTTTTGCATACATGGCGATCTGGTTTGCTAGATCCAGAAACCTCGTTTCTAGCTT
GAGACAGAACCTGGGTTTGTCGGCGATTCTCATCAAGCGCAACTACACTTCTCCTCGTCC
TGTTTTTACAAATTATCAGTTATCTTCGAGGGTGTTTTTGAATCCCTTCACTAGCTTCCG
TCACGAGTCTACGGCAGTGGAGACGCAGCCTGATTTGGTTCAACAGAGTGATCATGAGGA
TGATGCCCAGGAATTGGATTTTCCGGGCGGCAAAGTCGGTTACACATCTGAGATGAAATT
CATACCGGGATCATCTTCTCGGAGAATTCCATGCTATCGAGTTCTTAACGAACGTGGAAG
CATCATCTCCAACAGCGATTATGTTCCGGTGAGCGAGAAACTCGCGATTAGAATGTACGA
ACAGATGGCGACGCTTCAGGTGATGGACCACATCTTCCACGAAGCTCAACGTCAAGGGAG
AATCTCTTTCTACCTCACTTCC*GTCGGAGAAGAAGCCATCAACATCGCATCAGCCGCCG
CTCTCAGTTCATAAGACGTTGTGTTACCTCAGTACAGAGAGCCTGGAGTGCTTCTATGGC
GTGGCTTCACGTTAGAGGAGTTTGCGAATCAGTGCTTTGGTAACAAAGCTGATTACGAAA
AGCAGACAGATGCTTATC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5166Contig1 979 2 4 U
GGGTTCAAGCGAAGTCGCAACTCTCATCTTCGACGGCGTGACAGTGTCGATTCAGAATTC
CCTCACCATAACAGTCTGAGTTAAGAGTCCGTGTTTAATTCCCTCACCACTATGTCGTCT
TCAATGTTCTTCTTCGATCTGAGAGGCGGTGATGTTACAGTATAAATAGGTGTGAGATTT
CTTCCATTCAACTCATCTTCACTTCGAATCTCTCATTCAATATCAATATCCAAACTGGAG
AAGAAGAAGCTACTGTGAAACTGTATCAAACTCAGCAGACTGCTATTGGCAAGTTCATGG
TCTATGAACTGATAAAAACGAGTGGGATTGGTGCAATCAAAAGGCGATTCAAGGGAAAAT
CATTTTTTATGTATTTACTTAGTAATGAAAGAAGATTTTAACATGTAGAATATTGCATGT
TTTGAACTCTGTATGTGATCCTGATATTCTAAGGATGTAGGATAATGACTTTATCTGCAC
CAGAAGGGTCACTGGTATCAAGATGGACAAAGATGGTGTTACGTTTCTTGCTCCAACTGT
ACTAAGAAGCTTCAACGGACTGTCTCAGCCTTTTCCGTCTGCATTGCATCATCAAACTTT
CATAATCTCACGCATCTTTAGCCAAGGTGACCGTATGCCACTCTCTGCCTTTGTTGATGA
TGGAGCAGCAATGACAATGGAGATGATATATGCTCGGTGCCATCTCGGTACCTACTAAGG
TGGACACGGGTGGTAGTACATTTCAGGAAGCATCGACTACATGAGCAGCTCCAAGCGGTG
TCAACACAAAGAAGCCTCCAGCGCAAACAGTTTCCAAGATGGGAAAGAAAACACGCATGT
CATAGGTAAGACAATGACAGCGGTTTAGATGAGCATTGGACACAGTATTTCATCTTTGAA
CAATGCTAATGCATTAATATTTTTTTTGAACAAGCATGTTTTTGTTCTCACGTTCTGCTT
AAAAGAAAGAGGTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR95TF U 1
AF RR4CR95JQ C 204
BS 1 626 RR4CR95TF
BS 627 627 RR4CR95JQ
BS 628 715 RR4CR95TF
BS 716 979 RR4CR95JQ

RD RR4CR95TF 715 0 0
GGGTTCAAGCGAAGTCGCAACTCTCATCTTCGACGGCGTGACAGTGTCGATTCAGAATTC
CCTCACCATAACAGTCTGAGTTAAGAGTCCGTGTTTAATTCCCTCACCACTATGTCGTCT
TCAATGTTCTTCTTCGATCTGAGAGGCGGTGATGTTACAGTATAAATAGGTGTGAGATTT
CTTCCATTCAACTCATCTTCACTTCGAATCTCTCATTCAATATCAATATCCAAACTGGAG
AAGAAGAAGCTACTGTGAAACTGTATCAAACTCAGCAGACTGCTATTGGCAAGTTCATGG
TCTATGAACTGATAAAAACGAGTGGGATTGGTGCAATCAAAAGGCGATTCAAGGGAAAAT
CATTTTTTATGTATTTACTTAGTAATGAAAGAAGATTTTAACATGTAGAATATTGCATGT
TTTGAACTCTGTATGTGATCCTGATATTCTAAGGATGTAGGATAATGACTTTATCTGCAC
CAGAAGGGTCACTGGTATCAAGATGGACAAAGATGGTGTTACGTTTCTTGCTCCAACTGT
ACTAAGAAGCTTCAACGGACTGTCTCAGCCTTTTCCGTCTGCATTGCATCATCAAACTTT
CATAATCTCACGCATCTTTAGCCAAG*TGACCGTATGCCACTCTCTGCCTTTGTTGATGA
TGGAGCAGCAATGACAATGGAGATGATATATGCTCGGTGCCATCTCGGTACCTAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CR95JQ 776 0 0
TCGAATCTCTCATTCAATATCAATATCCAAACTGGAGAAGAAGAAGCTACTGTGAAACTG
TATCAAACTCAGCAGACTGCTATTGGCAAGTTCATGGTCTATGAACTGATAAAAACGAGT
GGGATTGGTGCAATCAAAAGGCGATTCAAGGGAAAATCATTTTTTATGTATTTACTTAGT
AATGAAAGAAGATTTTAACATGTAGAATATTGCATGTTTTGAACTCTGTATGTGATCCTG
ATATTCTAAGGATGTAGGATAATGACTTTATCTGCACCAGAAGGGTCACTGGTATCAAGA
TGGACAAAGATGGTGTTACGTTTCTTGCTCCAACTGTACTAAGAAGCTTCAACGGACTGT
CTCAGCCTTTTCCGTCTGCATTGCATCATCAAACTTTCATAATCTCACGCATCTTTAGCC
AAGGTGACCGTATGCCACTCTCTGCCTTTGTTGATGATGGAGCAGCAATGACAATGGAGA
TGATATATGCTCGGTGCCATCTCGGTACCTACTAAGGTGGACACGGGTGGTAGTACATTT
CAGGAAGCATCGACTACATGAGCAGCTCCAAGCGGTGTCAACACAAAGAAGCCTCCAGCG
CAAACAGTTTCCAAGATGGGAAAGAAAACACGCATGTCATAGGTAAGACAATGACAGCGG
TTTAGATGAGCATTGGACACAGTATTTCATCTTTGAACAATGCTAATGCATTAATATTTT
TTTTGAACAAGCATGTTTTTGTTCTCACGTTCTGCTTAAAAGAAAGAGGTTCATCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL5167Contig1 735 2 2 U
GCAAAGGAGGTTGTGTTTTTATTCACTTGTGTTTATAATAAACAATCACATTTTGTATAC
CAAAACTGAAGAAAATCAAAGTCGTTGTATCTCTCAATATGGATTAACTAAGAGACACTC
TTCATTAAGCTAGTCCATTTTCCCTAGAGATTATTCTCTTCCTTGCCTTCTCAGCCTGTT
TTTCCCAATCCACGGAAGTTGTGACTATAGCCAGAATAGTTGCTTGAACAGCGGATCCAA
CCACAACACCGCACCACAATCCTTTTCCGTTAAACCCATGACTGAAAGCTAAGTAAAGTC
CAACCGGAGCTCCTACGAGATAATAAGACACCACATTGTTCCAAGCTCCAATGTGTTGCC
ACCCACTTCCCCTAGCAACCCCATTAAGAACTGCAGTAAATCCATCTAAGATGAAGGAAA
GACAGAGCAAAGGAGACAGGTCCGTGACATAGTCCACAACTTCTTTGCTGTTGCTGAATG
CGTATCCGACGATATTCCGGCAGGTGAAGAGAAGCGTGCTGAAGAAAACTGACTCTATCA
GCCAGAGACAAAGACCTGCAAATATTGATACCCTAGCAACTTGAGGACTCCCAGCTCCCA
AATTGTTTGCCACGCGTGTGCTCACAGCCGCCGCAACTCCATTTGAAATTACATAGTGCA
ATGTTTCTGTTGTAAGACATATTGAAAGAACAGAGGTCTCGAGTTTCGGGTTTGGGAGTA
GTCCTGAGGCGAGTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A696JQ U 1
AF RR4AL15JQ U 1
BS 1 722 RR4A696JQ
BS 723 735 RR4AL15JQ

RD RR4A696JQ 722 0 0
GCAAAGGAGGTTGTGTTTTTATTCACTTGTGTTTATAATAAACAATCACATTTTGTATAC
CAAAACTGAAGAAAATCAAAGTCGTTGTATCTCTCAATATGGATTAACTAAGAGACACTC
TTCATTAAGCTAGTCCATTTTCCCTAGAGATTATTCTCTTCCTTGCCTTCTCAGCCTGTT
TTTCCCAATCCACGGAAGTTGTGACTATAGCCAGAATAGTTGCTTGAACAGCGGATCCAA
CCACAACACCGCACCACAATCCTTTTCCGTTAAACCCATGACTGAAAGCTAAGTAAAGTC
CAACCGGAGCTCCTACGAGATAATAAGACACCACATTGTTCCAAGCTCCAATGTGTTGCC
ACCCACTTCCCCTAGCAACCCCATTAAGAACTGCAGTAAATCCATCTAAGATGAAGGAAA
GACAGAGCAAAGGAGACAGGTCCGTGACATAGTCCACAACTTCTTTGCTGTTGCTGAATG
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GCCAGAGACAAAGACCTGCAAATATTGATACCCTAGCAACTTGAGGACTCCCAGCTCCCA
AATTGTTTGCCACGCGTGTGCTCACAGCCGCCGCAACTCCATTTGAAATTACATAGTGCA
ATGTTTCTGTTGTAAGACATATTGAAAGAACAGAGGTCTCGAGTTTCGGGTTTGGGAGTA
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4AL15JQ 735 0 0
GCAAAGGAGGTTGTGTTTTTATTCACTTGTGTTTATAATAAACAATCACATTTTGTATAC
CAAAACTGAAGAAAATCAAAGTCGTTGTATCTCTCAATATGGATTAACTAAGAGACACTC
TTCATTAAGCTAGTCCATTTTCCCTAGAGATTATTCTCTTCCTTGCCTTCTCAGCCTGTT
TTTCCCAATCCACGGAAGTTGTGACTATAGCCAGAATAGTTGCTTGAACAGCGGATCCAA
CCACAACACCGCACCACAATCCTTTTCCGTTAAACCCATGACTGAAAGCTAAGTAAAGTC
CAACCGGAGCTCCTACGAGATAATAAGACACCACATTGTTCCAAGCTCCAATGTGTTGCC
ACCCACTTCCCCTAGCAACCCCATTAAGAACTGCAGTAAATCCATCTAAGATGAAGGAAA
GACAGAGCAAAGGAGACAGGTCCGTGACATAGTCCACAACTTCTTTGCTGTTGCTGAATG
CGTATCCGACGATATTCCGGCAGGTGAAGAGAAGCGTGCTGAAGAAAACTGACTCTATCA
GCCAGAGACAAAGACCTGCAAATATTGATACCCTAGCAACTTGAGGACTCCCAGCTCCCA
AATTGTTTGCCACGCGTGTGCTCACAGCCGCCGCAACTCCATTTGAAATTACATAGTGCA
ATGTTTCTGTTGTAAGACATATTGAAAGAACAGAGGTCTCGAGTTTCGGGTTTGGGAGTA
GTCCTGAGGCGAGTA

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5168Contig1 937 2 2 U
GGAACGATCGCCGGCGGGGGTTACATGGTGGAGAACCAGAGCTGCAGGAGAGAAGAGGCA
AGGCGATCGTTTGCCGGTCTCATCGATGAGATTTTATTCCTAATCAAGTGGTCTACCTGG
CTAATCAAGGAGTCCAGAGGTCGAAAAGTCTGACGGTGAAGGCCCGCATTCCTTTCGGAC
CAGATGATATAGATCGAGGCTTGCCAACACCAAAGAGATAGTTGAGTGGAGTTACTTCTC
TTGGGAAGAGTCTGCATGCACTGAAGCGTTGAATCCCAGTTCGGCGAAGCCACCAACGAG
CATCGTGAAGCAATCGCAGACCAGATTCCAAAGCTATAGGAGCACTCAAACAACAAATGG
TTTCGACTCTCCTCAGCAGAGTTACAGAGAAGACAAGTAGTAGGCGTTTGAAGACCCCAG
CTGTGGAGTCTGTCTCTAGTTGGGCACCTGTTGAGCACGAAAAGCCAAGTGAGAAAGCAG
TGACGAGGGATTCCTCGCTTAATCCAAACCGCCGGAAACCACTGGACTTGTTGGTAAGAA
CCCCGCAGCTCATGGTAAACCTGTGATGTTGAGTAGTTCAGCGAAAGATTGTTTGCAACT
ATCCAATCATAACAGTCCTCTTCATCTGTGAGCTCAATGGTAGTAAGATAAGTAGCCAAG
TTGACTTGATTGTCTGATCTCGCAGATGGAATTCTCCAGGATCCATTTACTAGTCTTTTT
CTGCATATTGAAGAAGACTAGTAAAAAGAGAGGATGATAAGATAGAACAAAAAAAGAGAG
ATGAGTAAATCTGATATTATACAGGTTTCTAATCAAAGTTTCTTGCTAAAAAAAGACAGG
TAATTCAGTTTGTTACTTATATTATTTCGTATTTGTCTGGCTTGAAAATACAATATCTCA
TGCAAAGACTTGTTCTTGCGAGTACAAATTTTGAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GC22TF U 1
AF RR4GC22JQ C 241
BS 1 746 RR4GC22TF
BS 747 937 RR4GC22JQ

RD RR4GC22TF 747 0 0
GGAACGATCGCCGGCGGGGGTTACATGGTGGAGAACCAGAGCTGCAGGAGAGAAGAGGCA
AGGCGATCGTTTGCCGGTCTCATCGATGAGATTTTATTCCTAATCAAGTGGTCTACCTGG
CTAATCAAGGAGTCCAGAGGTCGAAAAGTCTGACGGTGAAGGCCCGCATTCCTTTCGGAC
CAGATGATATAGATCGAGGCTTGCCAACACCAAAGAGATAGTTGAGTGGAGTTACTTCTC
TTGGGAAGAGTCTGCATGCACTGAAGCGTTGAATCCCAGTTCGGCGAAGCCACCAACGAG
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TTTCGACTCTCCTCAGCAGAGTTACAGAGAAGACAAGTAGTAGGCGTTTGAAGACCCCAG
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CCCCGCAGCTCATGGTAAACCTGTGATGTTGAGTAGTTCAGCGAAAGATTGTTTGCAACT
ATCCAATCATAACAGTCCTCTTCATCTGTGAGCTCAATGGTAGTAAGATAAGTAGCCAAG
TTGACTTGATTGTCTGATCTCGCAGATGGAATTCTCCAGGATCCATTTACTAGTCTTTTT
CTGCATATTGAAGAAGACTAGTAAAA
G

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4GC22JQ 697 0 0
TTGGGAAGAGTCTGCATGCACTGAAGCGTTGAATCCCAGTTCGGCGAAGCCACCAACGAG
CATCGTGAAGCAATCGCAGACCAGATTCCAAAGCTATAGGAGCACTCAAACAACAAATGG
TTTCGACTCTCCTCAGCAGAGTTACAGAGAAGACAAGTAGTAGGCGTTTGAAGACCCCAG
CTGTGGAGTCTGTCTCTAGTTGGGCACCTGTTGAGCACGAAAAGCCAAGTGAGAAAGCAG
TGACGAGGGATTCCTCGCTTAATCCAAACCGCCGGAAACCACTGGACTTGTTGGTAAGAA
CCCCGCAGCTCATGGTAAACCTGTGATGTTGAGTAGTTCAGCGAAAGATTGTTTGCAACT
ATCCAATCATAACAGTCCTCTTCATCTGTGAGCTCAATGGTAGTAAGATAAGTAGCCAAG
TTGACTTGATTGTCTGATCTCGCAGATGGAATTCTCCAGGATCCATTTACTAGTCTTTTT
CTGCATATTGAAGAAGACTAGTAAAAAGAGAGGATGATAAGATAGAACAAAAAAAGAGAG
ATGAGTAAATCTGATATTATACAGGTTTCTAATCAAAGTTTCTTGCTAAAAAAAGACAGG
TAATTCAGTTTGTTACTTATATTATTTCGTATTTGTCTGGCTTGAAAATACAATATCTCA
TGCAAAGACTTGTTCTTGCGAGTACAAATTTTGAATG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL5169Contig1 757 2 2 U
GAGAAGTGTTAAAACTGGAGGGTAGTAACAATGCCTTCTAATTCTGGAGATGATAATGTT
CTTCAAGTTCTCATCAAGAACTTCGATGTCCTTGCTCTCCCATTGGTTGCTCTCGTCTAC
CCTCTATATGCATCAGTGAAAGCGATAGAGACAAAATCATTAGCAGAAGACGAGCAATGG
CTCACCTACTGGGTTCTCTACGCAATCATCTCCCTCTTCGAACTCATTTTCTCCAAACTT
CTTGATTGGTTTCCGATATGGCCGTTCTTGAAGCTGATCGGGATATGCTGGCTTGTGCTA
CCACAGTTTAATGGAGCAGAACATGTCTACAGACATTTCATCAGGCCATTCTACATGAAT
CCTCAAAGAGCTTCCACCAATATTTGGTATGTTCCTCAAAAGAAATTGAACTTCTATCCC
AAACGTGACGACGATGACATCCTCACTGCTGCTGAGAAATACATGGAAAAACACGGCACT
GACGCATTTGAGAGAATGATCGTCAAGAAGGATAGTTATGAAAGAGGGAGGAGAGGAGGA
GGAAGCAATGATTACATGACCTTTGATGACGACTATAGGTACTAAGTTTACCATGTTTAT
TATGGGTGATCGATCACTGTTATCGTCAATCTGTTTGGTCACATTCAGTTGTAAGCTAGA
TGTGTGACTATTGTCTTATAGATGGCTTTTATAATTGCCGGGTTTATGTATAAGTATTAT
CCCTATGTAGTAGTGACATGTTTGCATTTTATATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FH88TF U 1
AF RR4FH88JQ C 40
BS 1 674 RR4FH88TF
BS 675 757 RR4FH88JQ

RD RR4FH88TF 674 0 0
GAGAAGTGTTAAAACTGGAGGGTAGTAACAATGCCTTCTAATTCTGGAGATGATAATGTT
CTTCAAGTTCTCATCAAGAACTTCGATGTCCTTGCTCTCCCATTGGTTGCTCTCGTCTAC
CCTCTATATGCATCAGTGAAAGCGATAGAGACAAAATCATTAGCAGAAGACGAGCAATGG
CTCACCTACTGGGTTCTCTACGCAATCATCTCCCTCTTCGAACTCATTTTCTCCAAACTT
CTTGATTGGTTTCCGATATGGCCGTTCTTGAAGCTGATCGGGATATGCTGGCTTGTGCTA
CCACAGTTTAATGGAGCAGAACATGTCTACAGACATTTCATCAGGCCATTCTACATGAAT
CCTCAAAGAGCTTCCACCAATATTTGGTATGTTCCTCAAAAGAAATTGAACTTCTATCCC
AAACGTGACGACGATGACATCCTCACTGCTGCTGAGAAATACATGGAAAAACACGGCACT
GACGCATTTGAGAGAATGATCGTCAAGAAGGATAGTTATGAAAGAGGGAGGAGAGGAGGA
GGAAGCAATGATTACATGACCTTTGATGACGACTATAGGTACTAAGTTTACCATGTTTAT
TATGGGTGATCGATCACTGTTATCGTCAATCTGTTTGGTCACATTCAGTTGTAAGCTAGA
TGTGTGACTATTGT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4FH88JQ 718 0 0
AATTCTGGAGATGATAATGTTCTTCAAGTTCTCATCAAGAACTTCGATGTCCTTGCTCTC
CCATTGGTTGCTCTCGTCTACCCTCTATATGCATCAGTGAAAGCGATAGAGACAAAATCA
TTAGCAGAAGACGAGCAATGGCTCACCTACTGGGTTCTCTACGCAATCATCTCCCTCTTC
GAACTCATTTTCTCCAAACTTCTTGATTGGTTTCCGATATGGCCGTTCTTGAAGCTGATC
GGGATATGCTGGCTTGTGCTACCACAGTTTAATGGAGCAGAACATGTCTACAGACATTTC
ATCAGGCCATTCTACATGAATCCTCAAAGAGCTTCCACCAATATTTGGTATGTTCCTCAA
AAGAAATTGAACTTCTATCCCAAACGTGACGACGATGACATCCTCACTGCTGCTGAGAAA
TACATGGAAAAACACGGCACTGACGCATTTGAGAGAATGATCGTCAAGAAGGATAGTTAT
GAAAGAGGGAGGAGAGGAGGAGGAAGCAATGATTACATGACCTTTGATGACGACTATAGG
TACTAAGTTTACCATGTTTATTATGGGTGATCGATCACTGTTATCGTCAATCTGTTTGGT
CACATTCAGTTGTAAGCTAGATGTGTGACTATTGTCTTATAGATGGCTTTTATAATTGCC
GGGTTTATGTATAAGTATTATCCCTATGTAGTAGTGACATGTTTGCATTTTATATATG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL5170Contig1 984 2 2 U
TTTTTCAATTGCCATCTTTGCGTTTTGCTCGAATCCAACGGTTGGCTTTAACTAAGATCT
TATTAGATCAACGAGGATATTTTCTTTGTTTGCATTGTTTTGGTAGGAGGAACCAATATG
GGTCTAGAAGATGAAAAGAAGAAAGGAGAAGCTTCAGGAGAAACATCAGATAGAGAAAAT
ACGCTAAGCAGAATGAACAGTGAAAGCTCCTTGTCTCCGACAGAAGATGATGAAGAAGAC
GAAGAGAGGAAGCCCGAACTCGGCCCCATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGAT
AAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAGGAGCAGCTTATCGGTGTCGTGGATTTTGAA
GATGTCGGAGAGACACCGGATCCTGTAGTAAAGATCCTACACTTGACAGTTAGGTCCCCA
GACAGAGAGGAGATGGTGTTGACGATACCTGATGATGGAGTGCCAAACCCGAAAGGTCCT
TGGTTCACAATAAAGGAAGGATCCAAGTACACACTTGTCTTCAACTTCCGTGTCACCAAC
AATATCGTTTCGGGCCTTCGCTATAACAATACCGTTTGGAAAACCGGTGTCAAGGTGGAT
AGTACGAAAGCAATGCTTGGGACGTTTAGTCCTCAAGCTGAGCCTTACCAACATATAATG
CCTGAAGAAACGACGCCGTCAGGTATTTTCGCTAGAGGATCCTATTCCGCAAGGACGTAG
TTCGTTGATGACGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAATTACACCTTCGACATCCGCAAG
AATTGGCAATGATCCACCTAATTCAACACCTTCTTAATTCCAAACCTATGCAGACCAAAG
CTCTTTTGATAATATTCCTTTTTTTCTACCTTACATTATCTGACCACATACTAGAAAACC
TTTTCTTTTTGACAACGACTAGAAAACTTATTTAGCTTTGGATTAAGTGATCATGAATAA
AATATATCGTACGAGTGTTTATCC


BQ
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AF RR4GA79TF U 1
AF RR4GA79JQ C 177
BS 1 682 RR4GA79TF
BS 683 984 RR4GA79JQ

RD RR4GA79TF 690 0 0
TTTTTCAATTGCCATCTTTGCGTTTTGCTCGAATCCAACGGTTGGCTTTAACTAAGATCT
TATTAGATCAACGAGGATATTTTCTTTGTTTGCATTGTTTTGGTAGGAGGAACCAATATG
GGTCTAGAAGATGAAAAGAAGAAAGGAGAAGCTTCAGGAGAAACATCAGATAGAGAAAAT
ACGCTAAGCAGAATGAACAGTGAAAGCTCCTTGTCTCCGACAGAAGATGATGAAGAAGAC
GAAGAGAGGAAGCCCGAACTCGGCCCCATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGAT
AAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAGGAGCAGCTTATCGGTGTCGTGGATTTTGAA
GATGTCGGAGAGACACCGGATCCTGTAGTAAAGATCCTACACTTGACAGTTAGGTCCCCA
GACAGAGAGGAGATGGTGTTGACGATACCTGATGATGGAGTGCCAAACCCGAAAGGTCCT
TGGTTCACAATAAAGGAAGGATCCAAGTACACACTTGTCTTCAACTTCCGTGTCACCAAC
AATATCGTTTCGGGCCTTCGCTATAACAATACCGTTTGGAAAACCGGTGTCAAGGTGGAT
AGTACGAAAGCAATGCTTGGGACGTTTAGTCCTCAAGCTGAGCCTTACCAACATATAATG
CCTGAAGAAACGACGCCGTCAG
TATTTTCG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4GA79JQ 808 0 0
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AGATAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAGGAGCAGCTTATCGGTGTCGTGGATTT
TGAAGATGTCGGAGAGACACCGGATCCTGTAGTAAAGATCCTACACTTGACAGTTAGGTC
CCCAGACAGAGAGGAGATGGTGTTGACGATACCTGATGATGGAGTGCCAAACCCGAAAGG
TCCTTGGTTCACAATAAAGGAAGGATCCAAGTACACACTTGTCTTCAACTTCCGTGTCAC
CAACAATATCGTTTCGGGCCTTCGCTATAACAATACCGTTTGGAAAACCGGTGTCAAGGT
GGATAGTACGAAAGCAATGCTTGGGACGTTTAGTCCTCAAGCTGAGCCTTACCAACATAT
AATGCCTGAAGAAACGACGCCGTCAGGTATTTTCGCTAGAGGATCCTATTCCGCAAGGAC
GTAGTTCGTTGATGACGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAATTACACCTTCGACATCCG
CAAGAATTGGCAATGATCCACCTAATTCAACACCTTCTTAATTCCAAACCTATGCAGACC
AAAGCTCTTTTGATAATATTCCTTTTTTTCTACCTTACATTATCTGACCACATACTAGAA
AACCTTTTCTTTTTGACAACGACTAGAAAACTTATTTAGCTTTGGATTAAGTGATCATGA
ATAAAATATATCGTACGAGTGTTTATCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL5171Contig1 642 2 2 U
GGGCTGCCACAGCGGCCACGAAACAAGCTGAAAATATGGATTCCATTATTAAGGTAGCAG
AACTGGCATCAGAGGCGGTTTCACAAGCTGGGATACTTGTTTCAATGGGTCATCCTCCGT
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GAGCTTTTGCTAGTCCCAGCACTACGCATACTGAGTTGGATGGCTCTCGGAGAACAGCTG
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CAGACTTGGCTAAACACACGGCTGTAGCTTTCGAGCCAGCAGTTGGGTCAAAATCTTCGA
TTGACACCCAGACTGAAAGTGAGCAGATTATGAAAAAAACAAACGACGAGTGCATCAAGG
AAGGTTCTCAAGTAGAGGTTTTCAAGGAAGGACCTGAATTAAGAACTGCATGGTACTCTG
CCAATGTATTGGGCTTAGAGGATGGGAAAGCTTATGTGCTGTTCAATGACCTTTCTGTAG
AACAAGGAACAGATAAGCTGAGGAGTGGGTAGCCCTCAAGGT


BQ
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AF RR4DV10TF U 1
AF RR4E602TF U 1
BS 1 619 RR4DV10TF
BS 620 642 RR4E602TF

RD RR4DV10TF 619 0 0
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CGGAAGTTCAGCCCTGTAAAGTGGGTGTATTAGAAAAAGAAACTGTGACTACTAGTGATA
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CCAATGTATTGGGCTTAGAGGATGGGAAAGCTTATGTGCTGTTCAATGACCTTTCTGTAG
AACAAGGAACAGATAAGCT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4E602TF 642 0 0
GGGCTGCCACAGCGGCCACGAAACAAGCTGAAAATATGGATTCCATTATTAAGGTAGCAG
AACTGGCATCAGAGGCGGTTTCACAAGCTGGGATACTTGTTTCAATGGGTCATCCTCCGT
CGCTCAATAAGCTGGTGGAGGTGGGTCCAAGTGGTTACTGGAGGCAGGCTCGAGAATCCG
CGGAAGTTCAGCCCTGTAAAGTGGGTGTATTAGAAAAAGAAACTGTGACTACTAGTGATA
GAGCTTTTGCTAGTCCCAGCACTACGCATACTGAGTTGGATGGCTCTCGGAGAACAGCTG
GTGGTCAAGGTCTAGTTTCTACCACTGGAAAGAAAACAAATGGACGGAAAGGTCAAAGTG
CAGACTTGGCTAAACACACGGCTGTAGCTTTCGAGCCAGCAGTTGGGTCAAAATCTTCGA
TTGACACCCAGACTGAAAGTGAGCAGATTATGAAAAAAACAAACGACGAGTGCATCAAGG
AAGGTTCTCAAGTAGAGGTTTTCAAGGAAGGACCTGAATTAAGAACTGCATGGTACTCTG
CCAATGTATTGGGCTTAGAGGATGGGAAAGCTTATGTGCTGTTCAATGACCTTTCTGTAG
AACAAGGAACAGATAAGCTGAGGAGTGGGTAGCCCTCAAGGT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL5172Contig1 689 2 7 U
GATCAGGGACTAAAACTTGGACAATGAAACAAGTGAAACCTTCCTGGTTGGGTAAGTTGC
TCAGACATGATGTTGCAAGTTTATATTCTTTGGAACTTGCAAGTAAAGGGATGATGGTTT
GACCAATCGCATTTTGGGTGAGTCTAGAGCTAGCTCATCCATGAGTGCCACATAATATGT
TGGTGTGAAGAAAATTAAGTCAGTAATGGTGTTCGAGCTAAATTCATACGTCCACAACTC
TCCTCTGCATGTATAAACTGTCTCTGGCCTACCCTCTTATAAGTTAACATATCTTTTGAG
TTAGTAACGTCTCTAGCTGCATTGCACAATAGTGATGAGTTTCTCTGCATGAACAAAGTT
GAGAGCATTGAGACAAGCAATGGATGGAGCTTACATGTGTGCCCTGCATCTGCTTAGATG
GTGACAAGTTAGCTGAAACTGCTACCGGGAGCGGTGAGGCCCCCAGTGAACCAAAAGCCA
ACACTCAATGAAACCAAAACAGCTGCTCAATCAACTCTTTGCGGGACCTAGGCATCAGAA
CCACATGTTGCATCAATGGAGAGGGCACTGAAAAAAACCGCGCAATGCTTAGATGTATAA
GTTACCCATATGAATAGTTTTCTTGATTTTTTAAGTCTTTGTTTCCATTTTTTTATTCTA
AAACATCTGTTTTTAGTTTCATTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GU56TF U 94
AF RR4GU56JQ C 1
BS 1 93 RR4GU56JQ
BS 94 576 RR4GU56TF
BS 577 577 RR4GU56JQ
BS 578 584 RR4GU56TF
BS 585 585 RR4GU56JQ
BS 586 621 RR4GU56TF
BS 622 689 RR4GU56JQ

RD RR4GU56TF 528 0 0
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GATGAGTTTCTCTGCATGAACAAAGTTGAGAGCATTGAGACAAGCAATGGATGGAGCTTA
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GTGAGGCCCCCAGTGAACCAAAAGCCAACACTCAATGAAACCAAAACAGCTGCTCAATCA
ACTCTTTGCGGGACCTAGGCATCAGAACCACATGTTGCATCAATGGAGAGGGCACTGAAA
AAA*CCGCGCA*TGCTTAGATGTATAAGTTACCCATATGAATAGTTTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4GU56JQ 689 0 0
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GACCAATCGCATTTTGGGTGAGTCTAGAGCTAGCTCATCCATGAGTGCCACATAATATGT
TGGTGTGAAGAAAATTAAGTCAGTAATGGTGTTCGAGCTAAATTCATACGTCCACAACTT
TCCTCTGCATGTATAAACTGTTTCTGGCCTACCCTCTTATAAGTTAACATATCTTTTGAG
TTAGTAACGTCTCTAGCTGCATTGCACAATAGTGATGAGTTTCTCTGCATGAACAAAGTT
GAGAGCATTGAGACAAGCAATGGATGGAGCTTACATGTGTGCCCTGCATCTGCTTAGATG
GTGACAAGTTAGCTGAAACTGCTACCGGGAGCGGTGAGGCCCC*AGTGAACCAAAAGCCA
ACACTCAATGAAACCAAAACAGCTGCTCAATCAACTCTTTGCGGGACCTAGGCATCAGAA
CCACATGTTGCATCAATGGAGAGGGCACTGAAAAAAACCGCGCAATGCTTAGATGTATAA
GTTACCCATATGAATAGTTTTCTTGATTTTTTAAGTCTTTGTTTCCATTTTTTTATTCTA
AAACATCTGTTTTTAGTTTCATTTTTTAT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL5173Contig1 977 2 4 U
GTGATGAAGTTAAGGGGAGTCAAACTGTCCGGAGAGAGTATGATGAAAAGTGCAGAGTTT
TAAGAGAACTTGAATCAGAAGGCAAAGGTTCAAAAACAATAGACAAGACACGTGCAGTAG
TCAAGGACCTTCACTCCAGAATCAGAGTGGCTATTCATAGGATCGACTCAATATCGAGAC
GGATTGAAGAGCTCCGTGACAAAGAGCTCCAACCTCAACTCGAAGAACTCATTGAAGGGT
TGAGTCGAATGTGGGAAGTGATGTTGGAATGCCACAAGGTTCAGTTTAGGTTAATCTCAG
CGTGTCACAGAAGCGGTAACATTAAACTCAACATGCAGTCAGAGTTGCACAGACAAGTAA
CATGTCACCTTGAAGATGAACTCAGGGGGTTGGCTTCAAGCTTCACAAAGTGGATCACAG
GTCAAAGATCATATATTAAAGCTATAAACGAATGGCTGGAGAAATGTGTCACCTTACCAC
AAAGATCCTCCAAGCGGAAAAGGCGCGTGCCTGAAATCTCTCCGAGGAACCATGGTCCCC
CCATTTACGCAACATGTGGAATCTGGCTAGAGAAGCTCGAAGCTTTACCTACCAAAGAGG
TTTCGAGCTCCATCAAAGCGCTTGCTTCTGATGTCGCCAGGTTCTTGCCACGGCAGGAGA
AGAATCGCAACAAGAAACATCGGTCTGGCGAGAACCAGAACGATCACCTGTTGCAAGATG
AGACGTTGGAAGATTGTGGTCCGGGATTTGATCGGTTTAGGACAAGCTTGGAAGGATTTG
CTGGCCAGCTCAACCAGTTTGCAGAACTGTCAGTGAAATTGTATGAGGAACTTAAGAAGG
GTATCCAAGAAGCCAAGAACAAGTACGAGCATATGAAGGCTTATTCCCAGGGTAACTAAG
ATTTATTTTATTTTTTTCATTTTCTGGTAAGAATGGAGTTTGTGACAGGTCAAAGTTTTA
AAGAGACAAATTGGATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ88TF U 1
AF RR4CZ88JQ C 224
BS 1 693 RR4CZ88TF
BS 694 694 RR4CZ88JQ
BS 695 735 RR4CZ88TF
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RD RR4CZ88TF 735 0 0
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TAAGAGAACTTGAATCAGAAGGCAAAGGTTCAAAAACAATAGACAAGACACGTGCAGTAG
TCAAGGACCTTCACTCCAGAATCAGAGTGGCTATTCATAGGATCGACTCAATATCGAGAC
GGATTGAAGAGCTCCGTGACAAAGAGCTCCAACCTCAACTCGAAGAACTCATTGAAGGGT
TGAGTCGAATGTGGGAAGTGATGTTGGAATGCCACAAGGTTCAGTTTAGGTTAATCTCAG
CGTGTCACAGAAGCGGTAACATTAAACTCAACATGCAGTCAGAGTTGCACAGACAAGTAA
CATGTCACCTTGAAGATGAACTCAGGGGGTTGGCTTCAAGCTTCACAAAGTGGATCACAG
GTCAAAGATCATATATTAAAGCTATAAACGAATGGCTGGAGAAATGTGTCACCTTACCAC
AAAGATCCTCCAAGCGGAAAAGGCGCGTGCCTGAAATCTCTCCGAGGAACCATGGTCCCC
CCATTTACGCAACATGTGGAATCTGGCTAGAGAAGCTCGAAGCTTTACCTACCAAAGAGG
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AGAATCGCAACAAGAAACATCGGTCTGGCGAGA*CCAGAACGATCACCTGTTGCAAGATG
AGACGTTGGAAGATT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4CZ88JQ 754 0 0
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GTTTAGGTTAATCTCAGCGTGTCACAGAAGCGGTAACATTAAACTCAACATGCAGTCAGA
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CACAAAGTGGATCACAGGTCAAAGATCATATATTAAAGCTATAAACGAATGGCTGGAGAA
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CTTGCCACGGCAGGAGAAGAATCGCAACAAGAAACATCGGTCTGGCGAGAACCAGAACGA
TCACCTGTTGCAAGATGAGACGTTGGAAGATTGTGGTCCGGGATTTGATCGGTTTAGGAC
AAGCTTGGAAGGATTTGCTGGCCAGCTCAACCAGTTTGCAGAACTGTCAGTGAAATTGTA
TGAGGAACTTAAGAAGGGTATCCAAGAAGCCAAGAACAAGTACGAGCATATGAAGGCTTA
TTCCCAGGGTAACTAAGATTTATTTTATTTTTTTCATTTTCTGGTAAGAATGGAGTTTGT
GACAGGTCAAAGTTTTAAAGAGACAAATTGGATC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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ACCGGTGTTTCACCCACTGGAGCCTTACTTGGCTTGTCTTAAACTCGACGGAAAGTTGAT
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CACCTAAAGATAAAAGAATAAATATTAATATGAGCATTTATATGCTACTA


BQ
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AF RR4FX40JQ C 1
AF RR4EN22TF U 239
BS 1 238 RR4FX40JQ
BS 239 291 RR4EN22TF
BS 292 292 RR4FX40JQ
BS 293 770 RR4EN22TF

RD RR4FX40JQ 755 0 0
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TCTCATGGGCGTTATTAACACTCCTCTTCAGTTCGTCACCCCTCTCATCATTCTTGGGAG
GAAAGTAATATCAGGAAGCTTTATTGGGAGCATTAAAGAGACAGAAGAAGTGTTGGCTTT
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TGCTTTTGAGAGGCTTCACAAGAACGATGTGCGTTACAGGTTTGTGGTTGATGTTGCCGG
AAGCAATCTGGTCGAGGAGGCTGCAACAGCTACAAAATGAAACAGAGTAACTAAGTAATG
CGATATGGGTCCTATGTATGTTTTGTGGTGTCTTATTCAATGGTTCAGAAGTGAATGCTT
TGGTGTATCATTTGATGTTTACTTTTGCTTTAAATGTGGATTTTATGTCATTGTCTTTTT
CACCTAAAGATAAAAGAATAAATATTAATATGA
CC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4EN22TF 532 0 0
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AGGAAAGTAATATCAGGAAGCTTTATTGGGAGCATTAAAGAGACAGAAGAAGTGTTGGCT
TTCTGCAAAGAGAAAGGTCTTACGTCGACAATTGAAGTGGTGAAGATGGGTGAGCTCAAC
ACTGCTTTTGAGAGGCTTCACAAGAACGATGTGCGTTACAGGTTTGTGGTTGATGTTGCC
GGAAGCAATCTGGTCGAGGAGGCTGCAACAGCTACAAAATGAAACAGAGTAACTAAGTAA
TGCGACATGGGTCCTATGTATGTTTTGTGGTGTCTTATTCAATGGTTCAGAAGTGAATGC
TTTGGTGTATCATTTGATGTTTACTTTTGCTTTAAATGTGGATTTTATGTCATTGTCTTT
TTCACCTAAAGATAAAAGAATAAATATTAATATGAGCATTTATATGCTACTA

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL5175Contig1 876 2 2 U
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AATCTGTTTCGAGCTTCTTGAGATGCTCAAAGCTCACAAGAAAGGTATCCGACGTGCCAC
TGTCAACACTTTTGGATACATCGCCAAAGCCATTGGACCACAAGACGTTCTCGCCACGTT
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TATTGTCGCTGAGACATGCTCTCCGTTTACGGTCTTGCCCGCTTTGATGAACGAGTACCG
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TGGAGAGATGGGCAAGGATTACATATACGCGGTCACACCGTTGCTGGAGGATGCGCTCAT
GGACAGGGACTTGGTTCACAGGCAAACCGCAGCTTCAGCAGTGGAACACATGGCGTTAGG
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AGTGGCGTTGGGTGCAGCTGTGATACTGAACTATTGTCTGCAGGGTCTGTTCCATCCGGC
TCGCAAGGTCCGTGAAGTGTACTGGAAGATTTACAATTCGCTCTACATTGGTGCTCAGGA
CACGCTCGTTGCTGCTTACCCGGTTCTTGAAGATGAGCAGAACAATGTTTATAGCCGACC
AGAGTTGACGATGTTTCTGTGAAGGAAACGTTAAGACACAATTTAGTATCTCCTGTTTTA
TTCGGTAATCGGTTTGTTGCAAAGGCTTGCTTTGTA


BQ
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AF RR4GS26TF U 1
AF RR4GS26JQ C 152
BS 1 658 RR4GS26TF
BS 659 876 RR4GS26JQ

RD RR4GS26TF 662 0 0
GCTTGTTGGTAGGATTGCTGATCGTGGTGCTGAGTTTGTTCCAGCAAGGGAATGGATGAG
AATCTGTTTCGAGCTTCTTGAGATGCTCAAAGCTCACAAGAAAGGTATCCGACGTGCCAC
TGTCAACACTTTTGGATACATCGCCAAAGCCATTGGACCACAAGACGTTCTCGCCACGTT
GCTGAACAATCTCAAAGTCCAAGAGCGCCAGAACCGTGTCTGCACCACAGTGGCAATCGC
TATTGTCGCTGAGACATGCTCTCCGTTTACGGTCTTGCCCGCTTTGATGAACGAGTACCG
TGTTCCAGAGCTCAACGTCCAGAACGGTGTCCTGAAATCACTCTCTCTCTTCGAGTACAT
TGGAGAGATGGGCAAGGATTACATATACGCGGTCACACCGTTGCTGGAGGATGCGCTCAT
GGACAGGGACTTGGTTCACAGGCAAACCGCAGCTTCAGCAGTGGAACACATGGCGTTAGG
TGTAGCTGGTTTGGGATGCGAAGACGCTCTGGTTCACTTGCTCAACTTCATCTGGCCGAA
CATCTTCGAGACATCTCCTCACGTGATCAACGCTGTGATGGAAGCCATTGAAGGAATGAG
AGTGGCGTTGGGTGCAGCTGTGATACTGAACTATTGTCTGCAGGGTCTGTTCCATCCG
CTCG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GS26JQ 725 0 0
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AACCGTGTCTGCACCACAGTGGCAATCGCTATTGTCGCTGAGACATGCTCTCCGTTTACG
GTCTTGCCCGCTTTGATGAACGAGTACCGTGTTCCAGAGCTCAACGTCCAGAACGGTGTC
CTGAAATCACTCTCTCTCTTCGAGTACATTGGAGAGATGGGCAAGGATTACATATACGCG
GTCACACCGTTGCTGGAGGATGCGCTCATGGACAGGGACTTGGTTCACAGGCAAACCGCA
GCTTCAGCAGTGGAACACATGGCGTTAGGTGTAGCTGGTTTGGGATGCGAAGACGCTCTG
GTTCACTTGCTCAACTTCATCTGGCCGAACATCTTCGAGACATCTCCTCACGTGATCAAC
GCTGTGATGGAAGCCATTGAAGGAATGAGAGTGGCGTTGGGTGCAGCTGTGATACTGAAC
TATTGTCTGCAGGGTCTGTTCCATCCGGCTCGCAAGGTCCGTGAAGTGTACTGGAAGATT
TACAATTCGCTCTACATTGGTGCTCAGGACACGCTCGTTGCTGCTTACCCGGTTCTTGAA
GATGAGCAGAACAATGTTTATAGCCGACCAGAGTTGACGATGTTTCTGTGAAGGAAACGT
TAAGACACAATTTAGTATCTCCTGTTTTATTCGGTAATCGGTTTGTTGCAAAGGCTTGCT
TTGTA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5176Contig1 1432 2 6 U
GGATCTTTTCTCTCTCGACCACAAGTTCTCGCGTCTTCTCCCCTCCGGCGTACGGACGGC
GCGTCTGCGCGAGTGCCGGGGCCGGAGAGGTCCCTCTCTTCTCCTCCTTGTTTTCTTCTT
TGCTCTCGTCTGTATCTATCCTCCTTTGCTCGATATGCTCGTGTTTCTAGGTTGGGGCTC
ACGGAATCCGGCGGAAGCTTCAGTCGCGAGGAGCTGATTCATGGTGGAAGTGGCTCCTTC
TCCGGACCTGCGGCGAGGGTTCTGTGAGATGGAGAGGTTGAGGGTCGGTTTTTGGGTTTA
TGGAGTGGTTCGTGTTTTCCAATCTGGATCTCTCCGGTCGTCATCGTCGTGGAGTGGAGG
CGACGGGTCTCGTCACGGCCAGGTTTGTCGGTGGTAAACTGCTGCAGATCTTGTGTTCCG
TGCTTGTTTGGTGATGGCGTTGGTTACTTAGGGTTTCTTCGGGTCGGAGAGATTCCCGTA
CCCTCTTGCCGTTATCAAGAGTTCTTCGGTCTCTGTTGAGAGATGGAGGCGAGTCTTAAG
GCGGATGCAATCGTGGTGAAAGTGTCCTGCTTGATGCCTCGTGCGTGTGCGTCTGGTTAC
CCTTCAATGGGTCGTCTATGGCTTTGAGAAGTCTCTAGATGAACCGCAACTCTTTTGGAG
CTTCCTCTTCCGGCGTCCTGCTGAGTTCTCTCCGCGAGTTTGGTGACGGCTTCACTCGAG
GAGTTTAAGTCTCATGTTCTTCATCGTGGTATCATTCCTCTGGCTCGGGGGTTGATTATT
AGTGTTCAAGGAACTGGTCCTTTGGTTCTCAAAGGTCAGAGATGCGTAGACGGTTCTCGG
GAGTCATTAGCCGTCTACGAGCCAGCATCTCGTCACAACTCACATCCCGACGCCGTAGTG
TTTTATGGTGGTGAAGCTGACTTTCTTGCAGATTTTGGGACTGCTTTTCAGGATGTGGTG
GTGTAGACAACCCGTCTTTTGTGCAGGTTTCGTTGATGGCGGAAGCGAGCGCTTGCTCAT
TTGGGAAGTGGTTCAGGCGTTGTGTGGCGCTGCGTTCATTCTGGCTTTGGTGGCAATCGC
AAGGCATTGGTATGTACTTGAACTCTCCCCTTCTGTCGTCTAGAGCTTCATTAACAGATA
AAGTTATGAGCTTTGTGGAGATCATCGGGAACTAGCTACTCCGGAAACGTCAAGGGAACT
CCCGGCATCCTAGGAAACTAGGAGAACCTCACTTTCCCGAGAATCACGTTGATGGTTGAG
AACGCCTACCGATATCGAAGGATTTCGAAAAACACTCTAGCGGAATGTGCCGGGTTTAGT
GGGTGGGCGAAGCTATGTTTGTAATAGAGAGAATTCGACATTTTGTTCAAAGCAAGTTTG
TAACCGTATCTGATTCCCGATTCTTCGGGCAGATTTTATATATATATAATTC


BQ
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AF RR4BV90TF U 1
AF RR4BV90JQ C 656
BS 1 686 RR4BV90TF
BS 687 687 RR4BV90JQ
BS 688 708 RR4BV90TF
BS 709 709 RR4BV90JQ
BS 710 766 RR4BV90TF
BS 767 1432 RR4BV90JQ

RD RR4BV90TF 766 0 0
GGATCTTTTCTCTCTCGACCACAAGTTCTCGCGTCTTCTCCCCTCCGGCGTACGGACGGC
GCGTCTGCGCGAGTGCCGGGGCCGGAGAGGTCCCTCTCTTCTCCTCCTTGTTTTCTTCTT
TGCTCTCGTCTGTATCTATCCTCCTTTGCTCGATATGCTCGTGTTTCTAGGTTGGGGCTC
ACGGAATCCGGCGGAAGCTTCAGTCGCGAGGAGCTGATTCATGGTGGAAGTGGCTCCTTC
TCCGGACCTGCGGCGAGGGTTCTGTGAGATGGAGAGGTTGAGGGTCGGTTTTTGGGTTTA
TGGAGTGGTTCGTGTTTTCCAATCTGGATCTCTCCGGTCGTCATCGTCGTGGAGTGGAGG
CGACGGGTCTCGTCACGGCCAGGTTTGTCGGTGGTAAACTGCTGCAGATCTTGTGTTCCG
TGCTTGTTTGGTGATGGCGTTGGTTACTTAGGGTTTCTTCGGGTCGGAGAGATTCCCGTA
CCCTCTTGCCGTTATCAAGAGTTCTTCGGTCTCTGTTGAGAGATGGAGGCGAGTCTTAAG
GCGGATGCAATCGTGGTGAAAGTGTCCTGCTTGATGCCTCGTGCGTGTGCGTCTGGTTAC
CCTTCAATGGGTCGTCTATGGCTTTGAGAAGTCTCTAGATGAACCGCAACTCTTTTGGAG
CTTCCTCTTCCGGCGTCCTGCTGAGT*CTCTCCGCGAGTTTGGTGACG*CTTCACTCGAG
GAGTTTAAGTCTCATGTTCTTCATCGTGGTATCATTCCTCTGGCTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BV90JQ 777 0 0
TGGAGCTTCCTCTTCCGGCGTCCTGCTGAGTTCTCTCCGCGAGTTTGGTGACGGCTTCAC
TCGAGGAGTTTAAGTCTCATGTTCTTCATCGTGGTATCATTCCTCTGGCTCGGGGGTTGA
TTATTAGTGTTCAAGGAACTGGTCCTTTGGTTCTCAAAGGTCAGAGATGCGTAGACGGTT
CTCGGGAGTCATTAGCCGTCTACGAGCCAGCATCTCGTCACAACTCACATCCCGACGCCG
TAGTGTTTTATGGTGGTGAAGCTGACTTTCTTGCAGATTTTGGGACTGCTTTTCAGGATG
TGGTGGTGTAGACAACCCGTCTTTTGTGCAGGTTTCGTTGATGGCGGAAGCGAGCGCTTG
CTCATTTGGGAAGTGGTTCAGGCGTTGTGTGGCGCTGCGTTCATTCTGGCTTTGGTGGCA
ATCGCAAGGCATTGGTATGTACTTGAACTCTCCCCTTCTGTCGTCTAGAGCTTCATTAAC
AGATAAAGTTATGAGCTTTGTGGAGATCATCGGGAACTAGCTACTCCGGAAACGTCAAGG
GAACTCCCGGCATCCTAGGAAACTAGGAGAACCTCACTTTCCCGAGAATCACGTTGATGG
TTGAGAACGCCTACCGATATCGAAGGATTTCGAAAAACACTCTAGCGGAATGTGCCGGGT
TTAGTGGGTGGGCGAAGCTATGTTTGTAATAGAGAGAATTCGACATTTTGTTCAAAGCAA
GTTTGTAACCGTATCTGATTCCCGATTCTTCGGGCAGATTTTATATATATATAATTC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL5177Contig1 783 2 2 U
GGCCTGGACGCCCTGTCCTCGTTGTCTGCTCGGAGCTCACTCCTACTAGCAGCGGAGGTA
AGGACGCCTACAAACTTAGTATATGTTAAACAAACTTGGACAAGAACCTTAAATTCCTAA
AAATATTTTTCTAAGGCCGGTCACCGGAGGTTGAGGAACTTCAGATTCACATTAGGGTGA
TAACCAAAGAGATGGAGAAAAATTGAGCTCTGAAAATCGGCTTCTTAAGGAAAAGGCACT
TGAATTTCAGCTTCGTGCTGAGAAAGCTGAGGCTCGACTTCGTGCCGAGCCTAGGCTTCA
ACGAAGTAGCTTCCCTTAACATCATACGCAGTTCTTGTTTCTTGGACTCTTTATGTTGCT
ATATAACATTGTAAAACGCTCTAGATAATCATCATTGCCAAAATCTTGGTTTCTTGAAGC
CTACTGATCAACTCATCATGTAAGCGAACTTATCAACTCTAGCCAACACTTAAAAGGCCA
TAGCAGCCAACTTCAGGTACAATATGCGACTCACTGATTGTGGCATGCAACTCCTAGATA
CAAAAACGATTCATCTCTCACACACATCTCTTCTACCTGTATCACGCAAATATTGACCAA
CTTCACATATTTCTCACAAACACACGATTCAGTAATGTAAGTATCACTTCATAATGGCCA
AAGCCTGTTAATGTCTATATCCTTCAAGTCTAAGTTAGACTGTCTAACATGTTTCTCGAG
ATAAAGATGGTTGTGTAACATGTATATCAGATTCCTTTAATGTCTATATAATTATATTCT
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RR4F086TF U 1
AF RR4F086JQ C 135
BS 1 683 RR4F086TF
BS 684 783 RR4F086JQ

RD RR4F086TF 683 0 0
GGCCTGGACGCCCTGTCCTCGTTGTCTGCTCGGAGCTCACTCCTACTAGCAGCGGAGGTA
AGGACGCCTACAAACTTAGTATATGTTAAACAAACTTGGACAAGAACCTTAAATTCCTAA
AAATATTTTTCTAAGGCCGGTCACCGGAGGTTGAGGAACTTCAGATTCACATTAGGGTGA
TAACCAAAGAGATGGAGAAAAATTGAGCTCTGAAAATCGGCTTCTTAAGGAAAAGGCACT
TGAATTTCAGCTTCGTGCTGAGAAAGCTGAGGCTCGACTTCGTGCCGAGCCTAGGCTTCA
ACGAAGTAGCTTCCCTTAACATCATACGCAGTTCTTGTTTCTTGGACTCTTTATGTTGCT
ATATAACATTGTAAAACGCTCTAGATAATCATCATTGCCAAAATCTTGGTTTCTTGAAGC
CTACTGATCAACTCATCATGTAAGCGAACTTATCAACTCTAGCCAACACTTAAAAGGCCA
TAGCAGCCAACTTCAGGTACAATATGCGACTCACTGATTGTGGCATGCAACTCCTAGATA
CAAAAACGATTCATCTCTCACACACATCTCTTCTACCTGTATCACGCAAATATTGACCAA
CTTCACATATTTCTCACAAACACACGATTCAGTAATGTAAGTATCACTTCATAATGGCCA
AAGCCTGTTAATGTCTATATCCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4F086JQ 649 0 0
GGCCGGTCACCGGAGGTTGAGGAACTTCAGATTCACATTAGGGTGATAACCAAAGAGATG
GAGAAAAATTGAGCTCTGAAAATCGGCTTCTTAAGGAAAAGGCACTTGAATTTCAGCTTC
GTGCTGAGAAAGCTGAGGCTCGACTTCGTGCCGAGCCTAGGCTTCAACGAAGTAGCTTCC
CTTAACATCATACGCAGTTCTTGTTTCTTGGACTCTTTATGTTGCTATATAACATTGTAA
AACGCTCTAGATAATCATCATTGCCAAAATCTTGGTTTCTTGAAGCCTACTGATCAACTC
ATCATGTAAGCGAACTTATCAACTCTAGCCAACACTTAAAAGGCCATAGCAGCCAACTTC
AGGTACAATATGCGACTCACTGATTGTGGCATGCAACTCCTAGATACAAAAACGATTCAT
CTCTCACACACATCTCTTCTACCTGTATCACGCAAATATTGACCAACTTCACATATTTCT
CACAAACACACGATTCAGTAATGTAAGTATCACTTCATAATGGCCAAAGCCTGTTAATGT
CTATATCCTTCAAGTCTAAGTTAGACTGTCTAACATGTTTCTCGAGATAAAGATGGTTGT
GTAACATGTATATCAGATTCCTTTAATGTCTATATAATTATATTCTTGC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL5178Contig1 780 2 1 U
GAAACACAAACTCAGAAAAATGGCAGCAACCGCCGGAACAGCATCATCGTCCCATCTTCT
TCTCTCAAGCTCTCGCCATGTGGCGGCCTCACCTCAGCCACGAATCCTTTTCCCATCTCT
GAGCGGGAAAAGAGTAGCAGCTGGGAAAAACCATCATGATGCTACTGGAGTGAGGTGTAT
GGCGGTTGCGACGGATGCTACGGCGGAAACTAAACCGGCTGCGAAGAAGAAGAGTGGGTA
TGAGCTTCAGACACTGACGAGCTGGTTGCTCAGACAGGAGATGAAAGGGGAGATAGATAC
TGAGCTGACAATAGTGATGTCTAGCATAGCGATGGCATGTAAACAGATCGCTTCTCTAGT
CCAGCGTGCCGGAATCTCTAATCTGACCGGTGTTCAAGGAGCTGCTAACATTCAGGGAGA
GGATCAGAAGAAGCTTGACGTCATCTCTAATGAGGTGTTTTCTAACTGTTTGAGATCAAG
TGGAAGAACGGGAATAATAGCGTCGGAGGAAGAGGACGTGCCAGTAGCAGTGGAGGAAAG
TTACTCCGGCAATTACGTAGTCGTGTTCGACCCTCTTGACGGTTCCTCCAACATTGACGC
AGCAGTCTCCACCGGTTCTATCTTTGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGTCTCCCAGA
CAACTCCGACGACACCTCCGCTCTCGGGTCAGAGAAGAAGTGTATAGTAAACGTGTGCCA
GCCAGGGAAAACTTGCTAGCAGCCGGCTACTGTATGTACTCAGCTCAGTCATCTTCGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E045TF U 1
AF RR4DV58TF U 1
BS 1 780 RR4DV58TF

RD RR4E045TF 501 0 0
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TCTCTCAAGCTCTCGCCATGTGGCGGCCTCACCTCAGCCACGAATCCTTTTCCCATCTCT
GAGCGGGAAAAGAGTAGCAGCTGGGAAAAACCATCATGATGCTACTGGAGTGAGGTGTAT
GGCGGTTGCGACGGATGCTACGGCGGAAACTAAACCGGCTGCGAAGAAGAAGAGTGGGTA
TGAGCTTCAGACACTGACGAGCTGGTTGCTCAGACAGGAGATGAAAGGGGAGATAGATAC
TGAGCTGACAATAGTGATGTCTAGCATAGCGATGGCATGTAAACAGATCGCTTCTCTAGT
CCAGCGTGCCGGAATCTCTAATCTGACCGGTGTTCAAGGAGCTGCTAACATTCAGGGAGA
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TGGAAGAACGGGAATAATAGC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4DV58TF 780 0 0
GAAACACAAACTCAGAAAAATGGCAGCAACCGCCGGAACAGCATCATCGTCCCATCTTCT
TCTCTCAAGCTCTCGCCATGTGGCGGCCTCACCTCAGCCACGAATCCTTTTCCCATCTCT
GAGCGGGAAAAGAGTAGCAGCTGGGAAAAACCATCATGATGCTACTGGAGTGAGGTGTAT
GGCGGTTGCGACGGATGCTACGGCGGAAACTAAACCGGCTGCGAAGAAGAAGAGTGGGTA
TGAGCTTCAGACACTGACGAGCTGGTTGCTCAGACAGGAGATGAAAGGGGAGATAGATAC
TGAGCTGACAATAGTGATGTCTAGCATAGCGATGGCATGTAAACAGATCGCTTCTCTAGT
CCAGCGTGCCGGAATCTCTAATCTGACCGGTGTTCAAGGAGCTGCTAACATTCAGGGAGA
GGATCAGAAGAAGCTTGACGTCATCTCTAATGAGGTGTTTTCTAACTGTTTGAGATCAAG
TGGAAGAACGGGAATAATAGCGTCGGAGGAAGAGGACGTGCCAGTAGCAGTGGAGGAAAG
TTACTCCGGCAATTACGTAGTCGTGTTCGACCCTCTTGACGGTTCCTCCAACATTGACGC
AGCAGTCTCCACCGGTTCTATCTTTGGTATCTACAGCCCCAATGACGAGTGTCTCCCAGA
CAACTCCGACGACACCTCCGCTCTCGGGTCAGAGAAGAAGTGTATAGTAAACGTGTGCCA
GCCAGGGAAAACTTGCTAGCAGCCGGCTACTGTATGTACTCAGCTCAGTCATCTTCGTTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5179Contig1 770 2 1 U
GCATTATCAAATGTCCAAAGGGTAATATATAATTCCATCACATAGTAAAACACCAAATCC
AAAAACGTACAAAATTTTCATGGTCTTGTTGGGGGTTCGTTCACGTTTTGCTTATAGACT
TCCTGAACACCTGACGTCCAAAGTTCAGAAACCCTTTAAAAAGTCTTCACCAGTCAAAAG
TTGTATCTTTAAACTACTTCACAGTTACGAGAGCTTCAAGATTTTTCTGGACCACCCACC
CTTGTGGATAAGGGACATCTAGGGCATCCAAGTGAAGATGCCAGTTCAGTATCCTCGAGC
AAGCTGGTGGAACACCTTCCATGTCGCTTTCATCTGCCACCACCTGCTCTATAAATGTTG
TCTCTTGGAAACCTTCCTTGACGGTGTCTAGTTGGCGGGTTGAATGTGAAAAGGGACGTC
GCCATCTTTTGGGGTCCCAGAGTATAGTGCTGTTAAGCAAATCCGGACATATCAACATGG
AACCTCCGTAGTCTTTTACTCTTCTCATTAGTGTGCCATCCAATTACTTGACTTCCGTCG
CATACTGGACCTTCAAGAATTGCCTTGTTCTTGCTTGGCGCTAGCATTGCAACAGGCCAA
GTTCCAAATCGTCTGATCTGTCTCAAGCTCCGAAACAGCTCAAGCGAGTATACATTATCA
TCATCAGCAAAGTAAACAACACCATCGAGCTTATGCAACTCGATATGCTCCAACGCAGTG
TTCCTCTGGTGAACACCTCTGTCCTTGACACTCGTCGTGGTGTTCCTCTT


BQ
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AF RR4A386JQ U 1
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AAAAACGTACAAAATTTTCATGGTCTTGTTGGGGGTTCGTTCACGTTTTGCTTATAGACT
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AAGCTGGTGGAACACCTTCCATGTCGCTTTCATCTGCCACCACCTGCTCTATAAATGTTG
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GCCATCTTTTGGGGTCCCAGAGTATAGTGCTGTTAAGCAAATCCGGACATATCAACATGG
AACCTCCGTAGTCTTTTACTCTTCTCATTAGTGTGCCATCCAATTACTTGACTTCCGTCG
CATACTGGACCTTCAAGAATTGCCTTGTTCTTGCTTGGCGCTAGCATTGCAACAGGCCAA
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TCATCAGCAAAGTAAACAACACCATCGAGCTTATGCAACTCGATATGCTCCAACGCAGTG
TTCCTCTGGTGAACACCTCTGTCCTTGACACTCGTCGTGGTGTTCCTCTT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BS83JQ C 1
AF RR4BS83TF U 1
BS 1 527 RR4BS83TF

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AAAATGCTCTGTTTTTTTCTATGTGGGTTCGGAGGAGAAGATGGGAAAAGGAGAGGGCAC
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QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4BS83TF 527 0 0
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CGGCGGTGGTTTCTTCCAGTTTGTGAAAACAGAGCAGACGGAGGATCACGACGACTTTCT
GAGTGGGGAAGAAGCTTGCGTTTTTTCTCCGATGAGCAACCGCCGTCTCTGCACTGGTAC
TCCGCCGTTGATCACTGGACTTGAAGCTTTAAACGCCGGAAGAGGTTTTTGGATTGGATT
AAAATGCTCTGTTTTTTTCTATGTGGGTTCGGAGGAGAAGATGGGAAAAGGAGAGGGCAC
AGTGGGAATAATGGGAAAATGGAAGGGTGAATGGGAAAATAAGGAAGGTTAGATATGGGC
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TGGAATCTTTAATAGAATTCGACTAAGCTAAATCCTAAATCCAAATT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGATGCAACGGTCCATGCTCCGGGGTTAAAACCATCAATACCGACAGAAAGATATCTGGT
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BQ
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AF RR4GS24TF U 1
AF RR4GS24JQ C 526
BS 1 586 RR4GS24TF
BS 587 1178 RR4GS24JQ

RD RR4GS24TF 586 0 0
TTTTTCTCTATGCAAAATCTCCCATCATTTCCATAGATTGCTTCCGCTTGTCATTTCCCT
TTGAGTCCTATTTGTTTGATCTTTTATATTTTATCACTTCATAAACTAGTCACTAACTAA
ACAACAAATACACACACATACAAAATAGAGATGGATGATGAAAAGAAGAGTGCCCATTTT
CGCCAAATCTCAACTCATAAACCACAGCTACTTGTCCTCTCCTCGATCCAAGAGCAACCT
TCTTCAAAGATCTCAGATAAGCCCACAATAAAAGCTTCTGTTGCTGATGTAGACTCCGAG
ATTGGAGTATTCGGTGCAGAAAAGTACTTCAGCATGAAACTAGATCATGTTGACTCCATG
GTGGATATCAATAAGCAACCCGAGAAGGAAAACAAAGAGTATCATCATCATCCTTATCCT
CATACTCGTACTCAGTTGACGAAAACGACGTCATCTAGATCAAGAACAAGCCGACATGGG
ACGCCAAGTGTAAGATCCGAGTCAAGTTACAACAGTCAGACCTTTCTCATGAGGCTTAAC
ACCAACAATGACAATAAGCAGCGGAAAACAAACGATGCAAGCGTCT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4GS24JQ 653 0 0
CTCATGAGGCTTAACACCAACAATGACAATAAGCAGCGGAAAACAAACGATGCAAGCGTC
TCTTTTGGTGGGTTTAGATGCAACGGTCCATGCTCCGGGGTTAAAACCATCAATACCGAC
AGAAAGATATCTGGTAGAGGTAGAAATTATGATCGAGATTTCGTTGCTTACGACGCAAGA
AAGCACATGGACAAAGCAAAACCCATCATTCCAATACCTATCCAAAGGTCAGATATCGCC
ATGAACCTCGAGAGAAAGCTCTCTATGCTTACGTGGGACGCGATACCAAACCACAAGAAC
AACATTCACAGAAATGGTAACAACTCTTCGGTGAGCAGCAAGACACAATTAGAGGAGGAG
GAGGCAGCAAGTGAAGCGAGTTCCGATTTGTTCGAGATTGAGAACATAACGAGCAGTACT
GTCTATGAGCCTAGTGAGGTTAGCATTGGATGGAGTGTGGTGACCGGAAGTATGGCAGAA
CAATCGGTGATTTCGGACTTCGATATGATGAAGAGAGGCACGAGAAGTGGTTTGGTGGTT
AAAACCAAACCGGTGGTTGCTGAGAAAGTCCGGTCGGGTGGGTTTTTGTCGGGTTGCAAG
AGTCACAAAGCTGTCTCGGTTGTTGATAGTACTAGAAATGTTAAAGAAGCAGC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5184Contig1 901 2 2 U
GGCCCCTTTCCGTCGAACTCGGTCTCTCTCCGTATCAATCTCCCTCGAGATCCACGGATC
CGTCGTCCTTCTCCGTCAAGATTCATCATCAAAACTTCTGGAATCAGAGCATATCACAAT
TCATTTCCAGTTTTGGAGAATTTCGATTTTCTCGCTGGAGTTCTTCTGTTTGCCGATGAT
CTAAGTGCTTCTTCCCCACTCGTTTCGGAGATCTGAGAACCTAATTACATTTTCTATCAA
AATTCTCAGAAACTAGGTCTCACAAGCATATCCCTGGTGGGGGAATTTTTTGAGTCCCTC
AATTTCAGATTTCGGTTATTATATGATTTTTTGTTTTGTTTTTAATTTGAATTTTGATAT
TTTTGCAGCCATGAAGCGGATAAGAGATGGCTCCGGCTCTCAATTTCGACGCACTTTGGC
TTCTTCTCGAGGCGAATTATATGGACAATCTCCGGTCCCTGGCAGTGGTGACACCGAAGA
AGGAAGAGGAGAAGGAGCGAGAATCACTAGTAGTGGGGACGTTGCCTCTCAGAAATTAAA
AACCAATGATGCCTTGTCGTACCTCAAGGATGTTAAGGACATGTTTTATGATCAACGGGA
GACATATGACAGGTTTCTTGAGGTTATGAAAGATTTTAAATCTTGAGAAGCATATCTTCG
ATGTATATCACACTCTCCTGGAGAGCAAGAACCAGTTCTTGTATTCAGGCTTCACCTTCA
TCCAAAACCAGATTTGATAGCTGGAACCCATGCCTTGGAGATAGCAAATAAGCAAATGTT
CAACGTGATGTTGGTGATGTTGTAATCGAGTCTCTGAAACTTCACATGGATGTGAATGAT
AGTTGTTTCAACATTTTTATAGCTATTTTATAAATATTTATAAAATAAGTTATAACCTCT
T


BQ
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10 

AF RR4EG81TF U 1
AF RR4EG81JQ C 242
BS 1 746 RR4EG81TF
BS 747 901 RR4EG81JQ

RD RR4EG81TF 746 0 0
GGCCCCTTTCCGTCGAACTCGGTCTCTCTCCGTATCAATCTCCCTCGAGATCCACGGATC
CGTCGTCCTTCTCCGTCAAGATTCATCATCAAAACTTCTGGAATCAGAGCATATCACAAT
TCATTTCCAGTTTTGGAGAATTTCGATTTTCTCGCTGGAGTTCTTCTGTTTGCCGATGAT
CTAAGTGCTTCTTCCCCACTCGTTTCGGAGATCTGAGAACCTAATTACATTTTCTATCAA
AATTCTCAGAAACTAGGTCTCACAAGCATATCCCTGGTGGGGGAATTTTTTGAGTCCCTC
AATTTCAGATTTCGGTTATTATATGATTTTTTGTTTTGTTTTTAATTTGAATTTTGATAT
TTTTGCAGCCATGAAGCGGATAAGAGATGGCTCCGGCTCTCAATTTCGACGCACTTTGGC
TTCTTCTCGAGGCGAATTATATGGACAATCTCCGGTCCCTGGCAGTGGTGACACCGAAGA
AGGAAGAGGAGAAGGAGCGAGAATCACTAGTAGTGGGGACGTTGCCTCTCAGAAATTAAA
AACCAATGATGCCTTGTCGTACCTCAAGGATGTTAAGGACATGTTTTATGATCAACGGGA
GACATATGACAGGTTTCTTGAGGTTATGAAAGATTTTAAATCTTGAGAAGCATATCTTCG
ATGTATATCACACTCTCCTGGAGAGCAAGAACCAGTTCTTGTATTCAGGCTTCACCTTCA
TCCAAAACCAGATTTGATAGCTGGAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4EG81JQ 660 0 0
ATTCTCAGAAACTAGGTCTCACAAGCATATCCCTGGTGGGGGAATTTTTTGAGTCCCTCA
ATTTCAGATTTCGGTTATTATATGATTTTTTGTTTTGTTTTTAATTTGAATTTTGATATT
TTTGCAGCCATGAAGCGGATAAGAGATGGCTCCGGCTCTCAATTTCGACGCACTTTGGCT
TCTTCTCGAGGCGAATTATATGGACAATCTCCGGTCCCTGGCAGTGGTGACACCGAAGAA
GGAAGAGGAGAAGGAGCGAGAATCACTAGTAGTGGGGACGTTGCCTCTCAGAAATTAAAA
ACCAATGATGCCTTGTCGTACCTCAAGGATGTTAAGGACATGTTTTATGATCAACGGGAG
ACATATGACAGGTTTCTTGAGGTTATGAAAGATTTTAAATCTTGAGAAGCATATCTTCGA
TGTATATCACACTCTCCTGGAGAGCAAGAACCAGTTCTTGTATTCAGGCTTCACCTTCAT
CCAAAACCAGATTTGATAGCTGGAACCCATGCCTTGGAGATAGCAAATAAGCAAATGTTC
AACGTGATGTTGGTGATGTTGTAATCGAGTCTCTGAAACTTCACATGGATGTGAATGATA
GTTGTTTCAACATTTTTATAGCTATTTTATAAATATTTATAAAATAAGTTATAACCTCTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL5185Contig1 645 2 9 U
TGGCATTTGAACACGTCGAAAAGTTGTTAACTGTCGCAGCATCTCTTCACAGAAAGTTCC
TTGACGCATCACGCCTAGCTCAAGTTGTATTCAGTGACTTCTACGGCAATTATGTTCCAA
TGATGGGAATAAACCCAAATGAAGAAGAGAACAAAAGCAGGACGGAGATGCAAGTAGGGA
GACAGGAAGTGAGTTTGAGAGAGAGACAAGTGGTGTCGAATCTGTTCTCGCCACCATCCG
CGAACCAGTCTTGGAGAAAAGTGTTGAGTATGGGGAACCTACTAAACAGACACGAACCCA
TTCTCAGGGAGATCATTTTCTCCACCGGAGATGACGTCAACAACGGAATCCATTATGCAG
CCGCCGCTGACGTGGCGGCCAGCAGTGACCGAAGAGGGGAAGAAATCGAGACACATAGAA
TGTACGTCTCTGGAACATCTAACGATCTCCGAGTTGCACTCTCTGTCACTTCCTGCGATT
GATTCTTCTTTTCTTCATTTTGGTTTAATTTTTAGTTAACACATTTGTTATTTAACAGAA
ATTTAGCAGATGAACATTTTTCAAATCTTAAGTTGTCATTGATGTGTATTGATTCAGACA
ACAAATAAAATTATGCAATATAAATGTAATTTAAATATTTATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH09JQ C 1
AF RR4G514TF U 91
BS 1 91 RR4AH09JQ
BS 92 238 RR4G514TF
BS 239 239 RR4AH09JQ
BS 240 277 RR4G514TF
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BS 288 288 RR4AH09JQ
BS 289 636 RR4G514TF
BS 637 645 RR4AH09JQ

RD RR4AH09JQ 645 0 0
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TTGACGCATCACGCCTAGCTCAAGTTGTATTCAGTGACTTTTACGGCATTTATGTTCCAA
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GACAGGAAGTGAGTTTGAGAGAGAGACAAGTGGTGTCGAATCTGTTCTCGCCACCATCCG
CGAACCAGTCTTGGAGAAAAGTGTTGAGTATGGGGAACCTACTAAACAGGCACGAACCCA
TTTTCAGGGAGATCATTTTCTCCACCGGAGATGACGTCAACAACGGAATCCATTATGCAG
CCGCCGCTGACGTGGCGGCCAGCAGTGACCGAAGAGGGGAAGAAATCGAGACACGTAGAA
TGTACGTTTCTGGAACATCTAACGATCTCCGAGTTGCACTCTCTGTTACTTCCTGCGATT
GATTCTTCTTTTCTTCATTTTGGTTTAATTTTTAGTTAACACATTTGTTATTTAACAGAA
ATTTAGCAGATGAACATTTTTCAAATCTTAAGTTGTCATTGATGTGTATTGATTCAGACA
ACAAATAAAATTATGCAATATAAATGTAATTTAAATATTTATAGC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4G514TF 546 0 0
G
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CAAAAGCAGGACGGAGATGCAAGTAGGGAGACAGGAAGTGAGTTTGAGAGAGAGACAAGT
GGTGTCGAATCTGTTCTCGCCACCATCGGCGAACCAGTCTTGGAGAAAAGTGTTGAGTAT
GGGGAATCTACTAAACGGACACGAACCCATTCTCAGGGAGATCATTTTCTCCACCGGAGA
TGACGTCAACAACGGAATCCATTATGCAGCCGCCGCTGACGTGGCGGCCAGCAGTGACCG
AAGAGGGGAAGAAATCGAGACACATAGAATGTACGTCTCTGGAACATCTAACGATCTCCG
AGTTGCACTCTCTGTCACTTCCTGCGATTGATTCTTCTTTTCTTCATTTTGGTTTAATTT
TTAGTTAACACATTTGTTATTTAACAGAAATTTAGCAGATGAACATTTTTCAAATCTTAA
GTTGTCATTGATGTGTATTGATTCAGACAACAAATAAAATTATGCAATATAAATGTAATT
TAAAT

QA 2 546 2 546
DS 



AS 1 2

CO CL5186Contig1 785 2 4 U
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TCATCATCAACACCTTTTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTCCGTGAACTCAACAGCAACT
CCTCCGATGCGTTGGACAAGATTGGGTTCGAGACGTTGACGGACAAGAGCAAGCTCGATG
GCCAGCCTGAGCTTTTCATCCACATCATCCCCGATAAGACTAACAACACCTTGACAATCA
TCGATAGTGGTATCGGTATGACCAAGGCTGATTTGGTTAACAACCTTGGAACCATTGCTA
GGTCTGGCACCAAGGAGTTTATGGAGGCCTTGGCCGCTGGTGCTGATGTCAGCATGATTG
GGCAGTTCGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTATCGTCACCA
CCAAGCACAATGATGACGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGTTCTTTCACCG
TCACGAGAGATACCTCTGGTGAGAGTCTTGGTAGAGGTACGAAGATGACGCCTCATCTGA
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CTGAGTTTATAAGCTACCCTATCTCCCTGTGGGTTGAGAAGACTGTTGAGAAGGAGATAT
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AGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DO91TF U 1
AF RR4DO91JQ C 192
BS 1 641 RR4DO91TF
BS 642 642 RR4DO91JQ
BS 643 713 RR4DO91TF
BS 714 785 RR4DO91JQ

RD RR4DO91TF 713 0 0
GGGATCTAATTTCTTGATAAAAACCCTAAGATAGATCTCGCAACGTTAATCACAGCAAAC
GAACGATGGCAGACGCAGAGACTTTCGCATTCCAGGCGGAGATCAACCAATTGCTCTCCC
TCATCATCAACACCTTTTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTCCGTGAACTCAACAGCAACT
CCTCCGATGCGTTGGACAAGATTGGGTTCGAGACGTTGACGGACAAGAGCAAGCTCGATG
GCCAGCCTGAGCTTTTCATCCACATCATCCCCGATAAGACTAACAACACCTTGACAATCA
TCGATAGTGGTATCGGTATGACCAAGGCTGATTTGGTTAACAACCTTGGAACCATTGCTA
GGTCTGGCACCAAGGAGTTTATGGAGGCCTTGGCCGCTGGTGCTGATGTCAGCATGATTG
GGCAGTTCGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTATCGTCACCA
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TCACGAGAGATACCTCTGGTGAGAGTCTTGGTAGAGGTACGAAGATGACGCCTCATCTGA
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CTGAGTTTATAAGCTACCCTATCTCCCTGTGGGTTGAGAAGACTGTTGAGAAG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4DO91JQ 594 0 0
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CTTTTCATCCACATCATCCCCGATAAGACTAACAACACCTTGACAATCATCGATAGTGGT
ATCGGTATGACCAAGGCTGATTTGGTTAACAACCTTGGAACCATTGCTAGGTCTGGCACC
AAGGAGTTTATGGAGGCCTTGGCCGCTGGTGCTGATGTCAGCATGATTGGGCAGTTCGGT
GTTGGTTTTTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTATCGTCACCACCAAGCACAAT
GATGACGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGTTCTTTCACCGTCACGAGAGAT
ACCTCTGGTGAGAGTCTTGGTAGAGGTACGAAGATGACGCCTCATTTGAAGGAGGATCAG
TTGGAGTATCTTGAGGAGAGGAGGCTTAAGGATTTGGTGAAGAAGCACTTTGAGTTTATA
AGCTACCCTATCTCCCTGTGGGTTGAGAAGACTGTTGAGAAGGAGATATCTGATGACGAG
GATGAAGAGGAGAAGAAGGATGAGGAGGGTAAGGTGGAGGAAGTAGACGAGGAG

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL5187Contig1 700 2 2 U
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ATGGCTCGTTCCCTTTCGATCTCTCTCTCTAAAACCCGACTCACCACAGCAGCTGCAGCC
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GATCTCCACGAAACCGACACCTCCTCGCCGTCGGATCCATTGATACAGAAGCTCGAGGAC
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TAGTTGTTGTATACTTGTAGCATGTAAGCATTTCCCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP17TF U 1
AF RR4EP17JQ C 185
BS 1 693 RR4EP17TF
BS 694 700 RR4EP17JQ

RD RR4EP17TF 693 0 0
TTTTTTCTAATTACAGCTTTGAAACAGAACACAAAACCAAACATCTCCACTTCCGTCTCT
ATGGCTCGTTCCCTTTCGATCTCTCTCTCTAAAACCCGACTCACCACAGCAGCTGCAGCC
TCTCTCCTCCCTTCGTCACGCCTCTTATCCTTCCGATCTCAATCCTCCGATCGCGGCGGC
GATCTCCACGAAACCGACACCTCCTCGCCGTCGGATCCATTGATACAGAAGCTCGAGGAC
GCCGTTCACCGGATATTCGTCCGACGAGCGGCGCCTGATTGGCTCCCGTTTGTTCCAGGC
GCTTCGTATTATGTCCCGTCTCCAGGATCCGGGTCCCAGACTCACGGGGTCGCTCAGCTC
GTTGCGAAGCTGGCCAATCCGTTAACCGACGAAGAAACTCTATCCACCAATTCGTCTCAC
GGTTGGCCTTCCTCTGATTATTTCCTCAAGGGTGGACAACCTCGATTGATGGAGACTAAG
ATCGAGACTAGTTCAAATACCGAGTATCACTCTGAGGACGAGGAAGGTTAAAAGCTGCAC
TATTTTTGAATATAATGATCATATGAAAACGAGCAGGGAGGACTATTATGACTACGGCCA
TACCAAAGTGCAACCATGTTTCTTTATTAATCCCAGAATGTTAACTAATTCGAATAAGAC
TAGTTGTTGTATACTTGTAGCATGTAAGCATTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4EP17JQ 516 0 0
TCCACGAAACCGACACCTCCTCGCCGTCGGATCCATTGATACAGAAGCTCGAGGACGCCG
TTCACCGGATATTCGTCCGACGAGCGGCGCCTGATTGGCTCCCGTTTGTTCCAGGCGCTT
CGTATTATGTCCCGTCTCCAGGATCCGGGTCCCAGACTCACGGGGTCGCTCAGCTCGTTG
GGAAGCTGGCCAATCCGTTAACCGACGAAGAAACTCTATCCACCAATTCGTCTCACGGTT
GGCCTTCCTCTGATTATTTCCTCAAGGGTGGACAACCTCGATTGATGGAGACTAAGATCG
AGACTAGTTCAAATACCGAGTATCACTCTGAGGACGAGGAAGGTTAAAAGCTGCACTATT
TTTGAATATAATGATCATATGAAAACGAGCAGGGAGGACTATTATGACTACGGCCATACC
AAAGTGCAACCATGTTTCTTTATTAATCCCAGAATGTTAACTAATTCGAATAAGACTAGT
TGTTGTATACTTGTAGCATGTAAGCATTTCCCCTTT

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL5188Contig1 979 2 2 U
CTCGATCGGTTGTTTGAGCTCTCCATCTATATTCCATTAGGAGAAAAAAAGATAGAAAGA
TTAGATGGAGGTGATGGTTGGTTCTTCGTTTGGAATCGGCATGGCGGCGTGCGTTAGAGA
TCGGACCGGCGTCTCGGCGCAGGATAAGACCGTACCGGCGGCGGCTCTGTTTTCGGCGGA
TGAATCGGGAAGAGGTGGATCGCAGATCGGGCTTGCTAGTCGGATCGGATTAAGGATGAG
TAGAAAATCGCCGGAGGTATCATCGGAGGATAGTTCATCGTCGATCGGAGAGTGCAGCGA
AAACGAGAGGAAGAAGAAGACGACGCCGTTTCAGTCCAGAGAGCAGGAGGAGGAGGAACA
CTTGTTTCGTTTAGTTCCTCTTTAGAAGACTCTCTGCCGATTAAGAGAGGATTATCAAAC
CATTACGTAGGGAAATCGAAATCTTTTGGGAACTTAATGGAACCGATGATGAACATCAAC
GCAAAAGATCTCGAGAAAGGAGAGAATCCATTCAACAAGAGGAGGAGATTGCTTATTGCT
AATAAGCTGAGGAGCAGAGGAAGATCCATGTCGGTTTCGAATTTTTACTCTTGGCAGAAC
CCTAATTCTATGTCGTTACTTGCAGTCCAAGAACACAATGAAGTGAATCATCATGATGAT
GATGACTATGAGGAAAATGAAGGTGATGATGATCAAACTATAAAGTTGTTGGGGAAGAGG
AATATGTTGATGAAAAATAAGAGAGATTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGTCTT
AGTAGTTTGCAAGAAGAAGAAGATGATGATGATGAGGGGGGAGTTGATGATGAGTGATTA
ATCAGTAACATGGTTTAGTGATACTTGTTTTCAATTTGTTCTTCTCTTGTGAATTTGATT
AGAGGAAGTTTCAGTGTTCACACAAGTGGTGGAAGATTTGATTTGTTGGAATATATTATT
TATTTAGTAGACTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR22TF U 1
AF RR4AR22JQ C 187
BS 1 677 RR4AR22TF
BS 678 979 RR4AR22JQ

RD RR4AR22TF 677 0 0
CTCGATCGGTTGTTTGAGCTCTCCATCTATATTCCATTAGGAGAAAAAAAGATAGAAAGA
TTAGATGGAGGTGATGGTTGGTTCTTCGTTTGGAATCGGCATGGCGGCGTGCGTTAGAGA
TCGGACCGGCGTCTCGGCGCAGGATAAGACCGTACCGGCGGCGGCTCTGTTTTCGGCGGA
TGAATCGGGAAGAGGTGGATCGCAGATCGGGCTTGCTAGTCGGATCGGATTAAGGATGAG
TAGAAAATCGCCGGAGGTATCATCGGAGGATAGTTCATCGTCGATCGGAGAGTGCAGCGA
AAACGAGAGGAAGAAGAAGACGACGCCGTTTCAGTCCAGAGAGCAGGAGGAGGAGGAACA
CTTGTTTCGTTTAGTTCCTCTTTAGAAGACTCTCTGCCGATTAAGAGAGGATTATCAAAC
CATTACGTAGGGAAATCGAAATCTTTTGGGAACTTAATGGAACCGATGATGAACATCAAC
GCAAAAGATCTCGAGAAAGGAGAGAATCCATTCAACAAGAGGAGGAGATTGCTTATTGCT
AATAAGCTGAGGAGCAGAGGAAGATCCATGTCGGTTTCGAATTTTTACTCTTGGCAGAAC
CCTAATTCTATGTCGTTACTTGCAGTCCAAGAACACAATGAAGTGAATCATCATGATGAT
GATGACTATGAGGAAAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4AR22JQ 793 0 0
GGGAAGAGGTGGATCGCAGATCGGGCTTGCTAGTCGGATCGGATTAAGGATGAGTAGAAA
ATCGCCGGAGGTATCATCGGAGGATAGTTCATCGTCGATCGGAGAGTGCAGCGAAAACGA
GAGGAAGAAGAAGACGACGCCGTTTCAGTCCAGAGAGCAGGAGGAGGAGGAACACTTGTT
TCGTTTAGTTCCTCTTTAGAAGACTCTCTGCCGATTAAGAGAGGATTATCAAACCATTAC
GTAGGGAAATCGAAATCTTTTGGGAACTTAATGGAACCGATGATGAACATCAACGCAAAA
GATCTCGAGAAAGGAGAGAATCCATTCAACAAGAGGAGGAGATTGCTTATTGCTAATAAG
CTGAGGAGCAGAGGAAGATCCATGTCGGTTTCGAATTTTTACTCTTGGCAGAACCCTAAT
TCTATGTCGTTACTTGCAGTCCAAGAACACAATGAAGTGAATCATCATGATGATGATGAC
TATGAGGAAAATGAAGGTGATGATGATCAAACTATAAAGTTGTTGGGGAAGAGGAATATG
TTGATGAAAAATAAGAGAGATTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGTCTTAGTAGT
TTGCAAGAAGAAGAAGATGATGATGATGAGGGGGGAGTTGATGATGAGTGATTAATCAGT
AACATGGTTTAGTGATACTTGTTTTCAATTTGTTCTTCTCTTGTGAATTTGATTAGAGGA
AGTTTCAGTGTTCACACAAGTGGTGGAAGATTTGATTTGTTGGAATATATTATTTATTTA
GTAGACTTTTTCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL5189Contig1 823 2 4 U
CTTCCTCTGGAATCACTCTTATTCATGGCCTCCGCAATATGATGGACTTTAATGAGTTTC
TGGAAGAATGGTCTGACAACAGCATGGACACCACTTACACAATGGTGATAACCGATGATT
ATGGGATTTGCTTATCCTCCTCTTCTTGGGCTTTTTGAATTTCTCTAAGCTTTTGTGCAT
ATCCAAAAGATGGTCGGCTCATTTGCCCCTTTGCCAATCAAAGCAATCCCCAGACATAGA
GTGTTGCCCTGTGACTTTTGTCTGGGAAGCTTTTATTGTCTGATAATTACGCAGATACAA
CAGATGAGATGAATTCGACCCGGAGTAAACCTCTCTACAGGAGTAAACCTCTCTACGTGT
GCAACATATGCGATACTTATTTCGAAGAAGAATTCAGCCCTCATCTCAAATTCAGCACTC
ATCTCAAGGGTGAAGGACACAGAACAAAGTTGTTTGATATAGCGGCTAGAGACTCCAGCA
ACGGTGAGCTTAAACATTTTTGCCAAGTTTGCAATTATCCCGCCGACGTCGATTTTAACT
TACGCCTCCATAACCAAAGTGAAGAACATAAGCTGGCTGCGAAAAAGGCTCAAGAAGAGG
ACAATTGCGAGAGCAGTAACAGAGTAGGATCCGGTTGGCGAGATAAGAAGCAATCTCTCT
TGAACGAGGCAAACAGTGAAGATCATTGATCATTGTTGTGTTTAAGTTTACTGCATAATA
CTTATCTTATTATGTTTAATAGTTTGTTCGTCCGCCACTAAAATATTTCTAAGTCTTGTT
TGTTTACTTTTTTTTATCGGTTAAAATGAAAATCTTAATCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B486TF U 1
AF RR4B486JQ C 8
BS 1 398 RR4B486TF
BS 399 399 RR4B486JQ
BS 400 425 RR4B486TF
BS 426 823 RR4B486JQ

RD RR4B486TF 425 0 0
CTTCCTCTGGAATCACTCTTATTCATGGCCTCCGCAATATGATGGACTTTAATGAGTTTC
TGGAAGAATGGTCTGACAACAGCATGGACACCACTTACACAATGGTGATAACCGATGATT
ATGGGATTTGCTTATCCTCCTCTTCTTGGGCTTTTTGAATTTCTCTAAGCTTTTGTGCAT
ATCCAAAAGATGGTCGGCTCATTTGCCCCTTTGCCAATCAAAGCAATCCCCAGACATAGA
GTGTTGCCCTGTGACTTTTGTCTGGGAAGCTTTTATTGTCTGATAATTACGCAGATACAA
CAGATGAGATGAATTCGACCCGGAGTAAACCTCTCTACAGGAGTAAACCTCTCTACGTGT
GCAACATATGCGATACTTATTTCGAAGAAGAATTCAGCTCTCATCTCAAATTCAGCACTC
ATCTC

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4B486JQ 816 0 0
TGGAATCACTCTTATTCATGGCCTCCGCAATATGATGGACTTTAATGAGTTTCTGGAAGA
ATGGTCTGACAACAGCATGGACACCACTTACACAATGGTGATAACCGATGATTATGGGAT
T*GCTTATCCTCCTCTTCTTGGGCTTTTTGAATT*CTCTAAGCTTT*GTGCATATCCAAA
AGATGGTCGGCTCATT*GCCC**TTGCCAATCAAAGCAATCCC*AGACATAGAGTGTTGC
CCTGTGACTTT*GTCTGGGAAGCTTT*ATTGTCTGATAATTACGCAGATACAACAGATGA
GATGAATTCGACCCGGAGTAAACCTCTCTACAGGAGTAAACCTCTCTACGTGTGCAACAT
ATGCGATACTTATTTCGAAGAAGAATTCAGCCCTCATCTCAAATTCAGCACTCATCTCAA
GGGTGAAGGACACAGAACAAAGTTGTTTGATATAGCGGCTAGAGACTCCAGCAACGGTGA
GCTTAAACATTTTTGCCAAGTTTGCAATTATCCCGCCGACGTCGATTTTAACTTACGCCT
CCATAACCAAAGTGAAGAACATAAGCTGGCTGCGAAAAAGGCTCAAGAAGAGGACAATTG
CGAGAGCAGTAACAGAGTAGGATCCGGTTGGCGAGATAAGAAGCAATCTCTCTTGAACGA
GGCAAACAGTGAAGATCATTGATCATTGTTGTGTTTAAGTTTACTGCATAATACTTATCT
TATTATGTTTAATAGTTTGTTCGTCCGCCACTAAAATATTTCTAAGTCTTGTTTGTTTAC
TTTTTTTTATCGGTTAAAATGAAAATCTTAATCCCG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5190Contig1 1081 2 8 U
GATTCTTGGTGCAGTTCACAATCCGATGCTCCTCATCGTTGTTGCAATCTTCTTTACGGT
TGTTGCTGCGCTTTTTATTTGGAATGGTTGTTGGGTGAGACGTGGGGTCACTGATTTCAT
TGCTCGTTATCCTGATGCTGACCTTAGAACTGCCAAAAATGGTCAATTCGTCAAGGTCAC
TGGGGTGGTTACTTGTGGTAATGTGCCGCTGGAGTCATCATTTAACAGAGTTCCCAGATG
TGTGTACACATCCACATCTCTATACGAGTATCGTGGATGGGGTTCAAAGCCAGCCAATTC
TTCACATCGTTGCTTCACATGGGGACTGAGATCATCAGAGAGACATGTGGTGGACTTTTA
CATATCAGATTTTCAATCTGGACTCAGAGCCTTAGTCAAAACCGGTAATGGTTCAAAGGT
AACGCCTCTTGTAGATGATTCTGTTGTCATCGACTTTAAGCACGGAAGTGAGAAAGAGTC
TCCAGATTTTGTTCGGTGGTTAAGGCAGAAGAATCTATCAAGCGATGATCGAATCATGCG
ACTCAAAGAAGGGTATATAAAAGAAGGAAGCACAGTGAGTGTGATAGGAGTGGTGCAGAG
AAACGACAATGTGTTGATGATAGTGCCATCATCTGAGCCGATTACAGCCGGTTGGCAATG
GAGTAGATGCACATTCCCAACAAGCCTTGAAGGAATCGTGTTGAGATGCGAAGACTCGTC
GAACGTTGATGCAATACCGGTTTAAGTCCATCATCATCATCATCGACATCAGAGTTTGGG
TTCATTAAATACTTTATGAATCTTGAAAAATGTGGTTCTTTCTGGTGCTTCCGTTTGGTG
GGTGGTTGGTCATTAAAAACTTCTTTCAACTTCACTATTCTTTTTTAAATTCAATTTTTT
TTTGGTTTTCCGAGTTATTACTGTTAGGGATGATGGTGATGAGATGGCGATGGTGGTAGT
GGATATGGTTTCATATTCCTAAGATGAGCTAATTGTGTTGTTCTTCTTCTTTGTATAGCT
CTTTTAAGTAAATTCGTTTTGGATAGAAACTTGTGTACTGAAGATGTTATATGTTATGTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4FV28TF U 1
AF RR4FV28JQ C 237
BS 1 692 RR4FV28TF
BS 693 693 RR4FV28JQ
BS 694 711 RR4FV28TF
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BS 750 768 RR4FV28TF
BS 769 1081 RR4FV28JQ

RD RR4FV28TF 768 0 0
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TGCTCGTTATCCTGATGCTGACCTTAGAACTGCCAAAAATGGTCAATTCGTCAAGGTCAC
TGGGGTGGTTACTTGTGGTAATGTGCCGCTGGAGTCATCATTTAACAGAGTTCCCAGATG
TGTGTACACATCCACATCTCTATACGAGTATCGTGGATGGGGTTCAAAGCCAGCCAATTC
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CATATCAGATTTTCAATCTGGACTCAGAGCCTTAGTCAAAACCGGTAATGGTTCAAAGGT
AACGCCTCTTGTAGATGATTCTGTTGTCATCGACTTTAAGCACGGAAGTGAGAAAGAGTC
TCCAGATTTTGTTCGGTGGTTAAGGCAGAAGAATCTATCAAGCGATGATCGAATCATGCG
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QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4FV28JQ 845 0 0
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AT*CTTCACATCGTTGCTTCACATGGGGACTGAGATCATCAGAGAGACATGTGGTGGACT
TTTACATATCAGATTTTCAATCTGGACTCAGAGCCTTAGTCAAAACCGGTAATGGTTCAA
AGGTAACGCCTCTTGTAGATGATTCTGTTGTCATCGACTTTAAGCACGGAAGTGAGAAAG
AGTCTCCAGATTTTGTTCGGTGGTTAAGGCAGAAGAATCTATCAAGCGATGATCGAATCA
TGCGACTCAAAGAAGGGTATATAAAAGAAGGAAGCACAGTGAGTGTGATAGGAGTGGTGC
AGAGAAACGACAATGTGTTGATGATAGTGCCATCATTTGAGCCGATTACAGCCGGTTGGC
AATGGAGTAGATGCACATTCCCAACAAGCCTTGAAGGAATCGTGTTGAGATGCGAAGACT
CGTCGAACGTTGATGCAATACCGGTTTAAGTCCATCATCATCATCATCGACATCAGAGTT
TGGGTTCATTAAATACTTTATGAATCTTGAAAAATGTGGTTCTTTCTGGTGCTTCCGTTT
GGTGGGTGGTTGGTCATTAAAAACTTCTTTCAACTTCACTATTCTTTTTTAAATTCAATT
TTTTTTTGGTTTTCCGAGTTATTACTGTTAGGGATGATGGTGATGAGATGGCGATGGTGG
TAGTGGATATGGTTTCATATTCCTAAGATGAGCTAATTGTGTTGTTCTTCTTCTTTGTAT
AGCTCTTTTAAGTAAATTCGTTTTGGATAGAAACTTGTGTACTGAAGATGTTATATGTTA
TGTTC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL5191Contig1 914 2 4 U
TTTTTTTCATCTCTCTCCTCTCTTTTCAGACAACGCCTGACTGCTGCTCCTTCCGGTAAA
CTCTTCGCCGTCAAGGTGACGCATTTAATTGCCGAAATTTTTTTCTCCGATAAAGGATAC
TACTGAGCTTCTCGTTTGCCATCAGACTGGAAGAAGAAGAAGATTTATATGGGTTTCCTT
GTAGCCGCCATTAATGTTCCTCCTCCTACATTGATCCATCAACAAGTGAAATCGAATAAG
CATGGTTGTAGTAAAGAAGAAAAGATTCAAGAGAGATGTTTGTTTGCTCGTCGTGGTTTC
TTGCACTGTGTTGGTGGTGCTTCGTTGATGGCCACACTTGAGTTCTCTGGATTACAAGCT
GCTCAAGCAGAGGGTAGAGAGAGAAGGAGTTGTTGGTGCTTTCAAGTCTTTGTTTGATCC
TAACGAGAGAACAAAATCTGGCAAAGAGCTACCGAAAGCTTACTTGAAATCTGCAAGGGA
GGTTGTGAAAACGATGAGGGAGTCTCTTAAAGAAAACCCAAAAGACAATGCTAAGTTTAG
AAGAAGCGCTGACTCCGCCAAGGAGTCGATTCGTGATTACTTGAGCAACTGGAGAGGGCA
GGAGAGTGTAGCTGGAGAAGAATCTTACGCGGAGCTGGAGAAAGTCATCCGAGCTCTGGC
GACGTTTTACTCGAAGGCGGGACCTTCTGCACCTCTTCCTGACGAGGTTAAGACTCAGAT
TTTGGATGATCTTAATAGAGCTGAAGAGTTTTTGTGACAGCTTTCTCTCTTATCAGATCC
TGCAGCTATGTATTGATGCTTACACATACAAGTCTTAGTACTTGCGAAAAAAGTAACTGA
AAATTTTTGAGATAAAAAGTATGCAAAACTAAACACTGCTCCAAAAATTACTAATGGAAT
GTTATATATAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV83TF U 1
AF RR4DV83JQ C 235
BS 1 676 RR4DV83TF
BS 677 677 RR4DV83JQ
BS 678 744 RR4DV83TF
BS 745 914 RR4DV83JQ

RD RR4DV83TF 744 0 0
TTTTTTTCATCTCTCTCCTCTCTTTTCAGACAACGCCTGACTGCTGCTCCTTCCGGTAAA
CTCTTCGCCGTCAAGGTGACGCATTTAATTGCCGAAATTTTTTTCTCCGATAAAGGATAC
TACTGAGCTTCTCGTTTGCCATCAGACTGGAAGAAGAAGAAGATTTATATGGGTTTCCTT
GTAGCCGCCATTAATGTTCCTCCTCCTACATTGATCCATCAACAAGTGAAATCGAATAAG
CATGGTTGTAGTAAAGAAGAAAAGATTCAAGAGAGATGTTTGTTTGCTCGTCGTGGTTTC
TTGCACTGTGTTGGTGGTGCTTCGTTGATGGCCACACTTGAGTTCTCTGGATTACAAGCT
GCTCAAGCAGAGGGTAGAGAGAGAAGGAGTTGTTGGTGCTTTCAAGTCTTTGTTTGATCC
TAACGAGAGAACAAAATCTGGCAAAGAGCTACCGAAAGCTTACTTGAAATCTGCAAGGGA
GGTTGTGAAAACGATGAGGGAGTCTCTTAAAGAAAACCCAAAAGACAATGCTAAGTTTAG
AAGAAGCGCTGACTCCGCCAAGGAGTCGATTCGTGATTACTTGAGCAACTGGAGAGGGCA
GGAGAGTGTAGCTGGAGAAGAATCTTACGCGGAGCTGGAGAAAGTCATCCGAGCTCTGGC
GACGTTTTACTCGAAG*CGGGACCTTCTGCACCTCTTCCTGACGAGGTTAAGACTCAGAT
TTTGGATGATCTTAATAGAGCTGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4DV83JQ 680 0 0
AATAAGCATGGTTGTAGTAAAGAAGAAAAGATTCAAGAGAGATGTTTGTTTGCTCGTCGT
GGTTTCTTGCACTGTGTTGGTGGTGCTTCGTTGATGGCCACACTTGAGTTCTCTGGATTA
CAAGCTGCTCAAGCAGAGGGTAGAGAGAGAAGGAGTTGTTGGTGCTTTCAAGTCTTTGTT
TGATCCTAACGAGAGAACAAAATCTGGCAAAGAGCTACCGAAAGCTTACTTGAAATCTGC
AAGGGAGGTTGTGAAAACGATGAGGGAGTCTCTTAAAGAAAACCCAAAAGACAATGCTAA
GTTTAGAAGAAGCGCTGACTCCGCCAAGGAGTCGATTCGTGATTACTTGAGCAACTGGAG
AGGGCAGGAGAGTGTAGCTGGAGAAGAATCTTACGCGGAGCTGGAGAAAGTCATCCGAGC
TCTGGCGACGTTTTACTCGAAGGCGGGACCTTCTGCACCTCTTCCTGACGAGGTTAAGAC
TCAGATTTTGGATGATCTTAATAGAGCTGAAGAGTTTTTGTGACAGCTTTCTCTCTTATC
AGATCCTGCAGCTATGTATTGATGCTTACACATACAAGTCTTAGTACTTGCGAAAAAAGT
AACTGAAAATTTTTGAGATAAAAAGTATGCAAAACTAAACACTGCTCCAAAAATTACTAA
TGGAATGTTATATATAATAC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL5192Contig1 812 2 2 U
GTCCTTCTCAATGCAGAAGCAGAGCATTCTTCATTCGGAGCACCTAATACTTGGGACCGG
ATTGGTTCAACCGATAAAAACTAGTGCACTTCCTAGGTGGATCAGTCGCAGCGATGGAGT
CAGACTGTCGTTTCTGAGAGCTGAAGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCCAT
GACTATAATTAACAAAAGCTGCACGTGGAGAGCGAATAGCCTAGGACAGGAGATCCAAGC
GGACTTGAGTGATGAAGACGAAGAAGATCTATGTCCGGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCAA
GACAGATGAAGAACTTCTTAGAGTCCTGGAGAAAGCCAAACAGACTAACACTTTGGTTGT
GGTTGATTTCTATCGTCCTTCATGTGGTAGTTGTAAATACATAGAGCAGGGCTTCTCGAA
GCTCTGCAAGCAATCTGGTGACCAAGAAGCTCCCGCTATCTTCCTTAAGCATAATGTGAT
AGATGAATATGACGAACAATCTGAAGTCGCTGAAAGGCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTCT
CTTCCACTTCTACAAAAATGGAGTTCTGTTAGAAGCATTTGCTACTAGAGACAAGGGGAG
GATTGACGCTTCTATAGCCAAATATACTTCCTCTGAATCCTCAAGCACCTCGGACTAAAC
CGCACTTTTGGTTCTCTATCTTTCAAATCATAGATAATGATGTAAACTATATTGAGCTGT
TGTAAAGATACCTGAACAGCCATCATTTTGTATCATACTGAATAAGACAGATGCAACATT
TCTTTTTCTAATATTGTAATTTTGATTTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D285TF U 1
AF RR4D285JQ C 149
BS 1 741 RR4D285TF
BS 742 812 RR4D285JQ

RD RR4D285TF 741 0 0
GTCCTTCTCAATGCAGAAGCAGAGCATTCTTCATTCGGAGCACCTAATACTTGGGACCGG
ATTGGTTCAACCGATAAAAACTAGTGCACTTCCTAGGTGGATCAGTCGCAGCGATGGAGT
CAGACTGTCGTTTCTGAGAGCTGAAGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCCAT
GACTATAATTAACAAAAGCTGCACGTGGAGAGCGAATAGCCTAGGACAGGAGATCCAAGC
GGACTTGAGTGATGAAGACGAAGAAGATCTATGTCCGGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCAA
GACAGATGAAGAACTTCTTAGAGTCCTGGAGAAAGCCAAACAGACTAACACTTTGGTTGT
GGTTGATTTCTATCGTCCTTCATGTGGTAGTTGTAAATACATAGAGCAGGGCTTCTCGAA
GCTCTGCAAGCAATCTGGTGACCAAGAAGCTCCCGCTATCTTCCTTAAGCATAATGTGAT
AGATGAATATGACGAACAATCTGAAGTCGCTGAAAGGCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTCT
CTTCCACTTCTACAAAAATGGAGTTCTGTTAGAAGCATTTGCTACTAGAGACAAGGGGAG
GATTGACGCTTCTATAGCCAAATATACTTCCTCTGAATCCTCAAGCACCTCGGACTAAAC
CGCACTTTTGGTTCTCTATCTTTCAAATCATAGATAATGATGTAAACTATATTGAGCTGT
TGTAAAGATACCTGAACAGCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4D285JQ 664 0 0
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCCATGACTATAATTAACAAAAGCTGCACGTGG
AGAGCGAATAGCCTAGGACAGGAGATCCAAGCGGACTTGAGTGATGAAGACGAAGAAGAT
CTATGTCCGGTTGAGTGTGTCACTGAGTTCAAGACAGATGAAGAACTTCTTAGAGTCCTG
GAGAAAGCCAAACAGACTAACACTTTGGTTGTGGTTGATTTCTATCGTCCTTCATGTGGT
AGTTGTAAATACATAGAGCAGGGCTTCTCGAAGCTCTGCAAGCAATCTGGTGACCAAGAA
GCTCCCGCTATCTTCCTTAAGCATAATGTGATAGATGAATATGACGAACAATCTGAAGTC
GCTGAAAGGCTCCGTATCAAGTCAGTTCCTCTCTTCCACTTCTACAAAAATGGAGTTCTG
TTAGAAGCATTTGCTACTAGAGACAAGGGGAGGATTGACGCTTCTATAGCCAAATATACT
TCCTCTGAATCCTCAAGCACCTCGGACTAAACCGCACTTTTGGTTCTCTATCTTTCAAAT
CATAGATAATGATGTAAACTATATTGAGCTGTTGTAAAGATACCTGAACAGCCATCATTT
TGTATCATACTGAATAAGACAGATGCAACATTTCTTTTTCTAATATTGTAATTTTGATTT
GAGT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5193Contig1 807 2 6 U
ATGGCAGAAGAGGTGATTCTTTTGGATTACTGGGCGAGCATGTTTGGGATGAGGACAAGG
ATTGCTCTGGAAGAGAAAGGAGTGAAATATGAATACAGAGAAGAAGATCTTAGTAACAAG
AGCTCTTTGCTTCTTGAGATGAACCCAATTCACAAGAAGATTCCTGTTTTGATTCACAAT
GGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATACAGTTTGAGCACATCGATCAAGTCTGGCCTGGT
ACAAACCCTATTCTCCCATCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGATTCTGGTCAGAC
TACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCAAAGGTTTACATAGAGAAACAGGGGAGAAG
CAAGAGGCAGCAAGGATGGAGTTTATCGAAGTGCTCAAGACCCTTGACTCGGAGCTAGGA
GACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACATTGCCTCTATAGGATTC
CACAGTTGGTTTCGTACGTACGAGGTTATTGCAAATTTCAGCATTGTGGCAGAGTATCCT
AAGTTAATTGCTTGGGCAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAATTGTGGCTAAAGTCTTGCCC
GACTCTGATAAGGTGCTAAAGTCAGTCTCTGACTATCGGAAGAAGATTTTAGGAATCAAC
TAGATTCATATGCAGAACGTCCCATGTTATGTTATATTTTCCTTGAAGATGTATCTCTCC
GCAATAACTATTATATAACATAATATCCCCACTTAACTATGATCTTGTGTTAGATTTTTA
TGAAAATTACAAAATTTATTTCGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB77TF U 1
AF RR4EB77JQ C 167
BS 1 504 RR4EB77TF
BS 505 505 RR4EB77JQ
BS 506 612 RR4EB77TF
BS 613 613 RR4EB77JQ
BS 614 639 RR4EB77TF
BS 640 807 RR4EB77JQ

RD RR4EB77TF 639 0 0
ATGGCAGAAGAGGTGATTCTTTTGGATTACTGGGCGAGCATGTTTGGGATGAGGACAAGG
ATTGCTCTGGAAGAGAAAGGAGTGAAATATGAATACAGAGAAGAAGATCTTAGTAACAAG
AGCTCTTTGCTTCTTGAGATGAACCCAATTCACAAGAAGATTCCTGTTTTGATTCACAAT
GGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATACAGTTTGAGCACATCGATCAAGTCTGGCCTGGT
ACAAACCCTATTCTCCCATCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGATTCTGGTCAGAC
TACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCAAAGGTTTACATAGAGAAACAGGGGAGAAG
CAAGAGGCAGCAAGGATGGAGTTTATCGAAGTGCTCAAGACCCTTGACTCGGAGCTAGGA
GACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACATTGCCTCTATAGGATTC
CACAGTTGGTTTCGTACGTACGAG*TTATTGCAAATTTCAGCATTGTGGCAGAGTATCCT
AAGTTAATTGCTTGGGCAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAATTGTGGCTAAAGTCTTGCCC
GACTCTGATAAG*TGCTAAAGTCAGTCTCTGACTATCGG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4EB77JQ 641 0 0
TTTTGATTCACAATGGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATACAGTTTGAGCACATCGATC
AAGTCTGGCCTGGTACAAACCCTATTCTCCCATCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTA
GATTCTGGTCAGACTACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCAAAGGTTTACATAGAG
AAACAGGGGAGAAGCAAGAGGCAGCAAGGATGGAGTTTATCGAAGTGCTCAAGACCCTTG
ACTCGGAGCTAGGAGACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACATTG
CCTCTATAGGATTCCACAGTTGGTTTCGTACGTACGAGGTTATTGCAAATTTCAGCATTG
TGGCAGAGTATCCTAAGTTAATTGCTTGGGCAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAATTGTGG
CTAAGGTCTTGCCCGACTCTGATAAGGTGCTAAAGTCAGTCTCTGACTATCGGAAGAAGA
TTTTAGGAATCAACTAGATTCATATGCAGAACGTCCCATGTTATGTTATATTTTCCTTGA
AGATGTATCTCTCCGCAATAACTATTATATAACATAATATCCCCACTTAACTATGATCTT
GTGTTAGATTTTTATGAAAATTACAAAATTTATTTCGAAGC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL5194Contig1 857 2 6 U
GGAACTCCAGTGTCGGCATGGAAAACACTTGGGGTGACGACAAGATCCTCAGCTACAACG
ATGTTGTCCTCAGGAGATCAGATTTGGACATCCTTAACGGACCCAATTTTCTAAACGACC
GTGTCATCGAATTCTACCTAAGCTACTTATCCACACTCCACACTTCCCCTACCATCTCAC
TAATCCCTCCCTCCATCGCCTTCTGGATCTCAAACTGTCCCGACGCTGAATCACTCAAAG
ACTTCATGAAACCCCTTAGGCTACTCGACAGCGAGCTCGTGATATTGCCTGTAAACGACA
ACCTCAATGTCGAGCTAGCTGAAGGCGGGTTACACTGGAGCTTACTCGTGTACTACAAAG
AAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGATAGCTTTATGGGGTCGAATCGATGGAATGCGAGAC
AGCTCTACAGGGCGGTTTCTCCATTGTGTCTGATGGAGATGCTGCGTATAGAGAATGCAG
TGATACACCGCAGCAGAAGAATGGGTACGACTGTGGTGTGTACCTTCTCGCAAACGCTCA
GGTTATATGCAAATGGTTTAGCTCTGATGGAGTGAAGAACCGGGATGAGCTTTGGTTAGG
TGATGTGAAAGAGACTGTACCGGATGTGGCTAACCATTTGCGAGAAGAGATATTGGGGTT
GATCAAAACGTTGATGTCTGAGAAGAGTGTGAGTAAATGAGAGATGCTTGTTGAAGACTT
TTTTTGTAACTTTTTACCGGATCTAATACATTTGATATTTTCACCTGTTATTGTTGTACT
TTTAAGTGTAACTTGAAATCGATAACGAGTGCTTTGTGAATGTGATCAATTGGTAAATAA
AATAAAATATCCGCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK29TF U 1
AF RR4EK29JQ C 206
BS 1 683 RR4EK29TF
BS 684 684 RR4EK29JQ
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BS 698 728 RR4EK29TF
BS 729 857 RR4EK29JQ

RD RR4EK29TF 728 0 0
GGAACTCCAGTGTCGGCATGGAAAACACTTGGGGTGACGACAAGATCCTCAGCTACAACG
ATGTTGTCCTCAGGAGATCAGATTTGGACATCCTTAACGGACCCAATTTTCTAAACGACC
GTGTCATCGAATTCTACCTAAGCTACTTATCCACACTCCACACTTCCCCTACCATCTCAC
TAATCCCTCCCTCCATCGCCTTCTGGATCTCAAACTGTCCCGACGCTGAATCACTCAAAG
ACTTCATGAAACCCCTTAGGCTACTCGACAGCGAGCTCGTGATATTGCCTGTAAACGACA
ACCTCAATGTCGAGCTAGCTGAAGGCGGGTTACACTGGAGCTTACTCGTGTACTACAAAG
AAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGATAGCTTTATGGGGTCGAATCGATGGAATGCGAGAC
AGCTCTACAGGGCGGTTTCTCCATTGTGTCTGATGGAGATGCTGCGTATAGAGAATGCAG
TGATACACCGCAGCAGAAGAATGGGTACGACTGTGGTGTGTACCTTCTCGCAAACGCTCA
GGTTATATGCAAATGGTTTAGCTCTGATGGAGTGAAGAACCGGGATGAGCTTTGGTTAGG
TGATGTGAAAGAGACTGTACCGGATGTGGCTAACCATTTGCGAGAAGAGATATTGGGGTT
GATCAAAACGTTGATGTCTGAGA*GAGTGTGAGTAA*TGAGAGATGCTTGTTGAAGACTT
TTTTTGTA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4EK29JQ 652 0 0
GATCTCAAACTGTCCCGACGCTGAATCACTCAAAGACTTCATGAAACCCCTTAGGCTACT
CGACAGCGAGCTCGTGATATTGCCTGTAAACGACAACCTCAATGTCGAGCTAGCTGAAGG
CGGGTTACACTGGAGCTTACTCGTGTACTACAAAGAAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGA
TAGCTTTATGGGGTCGAATCGATGGAATGCGAGACAGCTCTACAGGGCGGTTTCTCCATT
GTGTCTGATGGAGATGCTGCGTATAGAGAATGCAGTGATACACCGCAGCAGAAGAATGGG
TACGACTGTGGTGTGTACCTTCTCGCAAACGCTCAGGTTATATGCAAATGGTTTAGCTCT
GATGGAGTGAAGAACCGGGATGAGCTTTGGTTAGGTGATGTGAAGGAGACTGTACCGGAT
GTGGCTAACCATTTGCGAGAAGAGATATTGGGGTTGATCAAAAGGTTGATGTCTGAGAAG
AGTGTGAGTAAATGAGAGATGCTTGTTGAAGACTTTTTTTGTAACTTTTTACCGGATCTA
ATACATTTGATATTTTCACCTGTTATTGTTGTACTTTTAAGTGTAACTTGAAATCGATAA
CGAGTGCTTTGTGAATGTGATCAATTGGTAAATAAAATAAAATATCCGCCGT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5195Contig1 736 2 4 U
GGGGTCCCTTCGATTTGCTTCGCCCTACGTTTCTGTTTCGGTTTCTCTTTCTCTTCCTGT
CCGTTCAGATCTTCGTCTCCCGATTTGTGGAATTTCTGTCAAAGGGTCTGCTCTAACATG
TCAGGAAGAAAGGAAACAGTGTTAGATTTGGCCAAGTTTATTGATAAAGGTGTGCAAGTT
AAGCTCACCGGTGGTTGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTATGATCAGTTGCTCAAC
CTTGTTCTGGACGGGGCTGTTGAGTCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAAGACTACC
GACCAAACAAGACCTCTTGGTTTAATTGTTTGTCGTGGAACTGCGGTGATGCTCGTCTCA
CCAACGGATGGCACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTCCAACCAGAGGCTGTCTAAAGT
GTTTCTTTCAATACATAATCTCTCTCTCTCTCATTTATGTTTTTTAAGTTGGGGTTTTTT
AGAGGGTATTATGCATCAAAGTATTTGCCATGGAATTGGAAACAATTATTTTAATGGGCT
CAGGTCCGACTCTGCCTAACAATTAGAGTGTGATTTGAACTGTTTCTGAGTTTGATCATT
GAACAAAATGAAGTTGGTGGTAACAAACCTCAAGCTCCTTGTACCAGTCCTCTTGTTATG
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GCTCACACTTCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH11TF U 1
AF RR4CH11JQ C 21
BS 1 680 RR4CH11TF
BS 681 681 RR4CH11JQ
BS 682 728 RR4CH11TF
BS 729 736 RR4CH11JQ

RD RR4CH11TF 728 0 0
GGGGTCCCTTCGATTTGCTTCGCCCTACGTTTCTGTTTCGGTTTCTCTTTCTCTTCCTGT
CCGTTCAGATCTTCGTCTCCCGATTTGTGGAATTTCTGTCAAAGGGTCTGCTCTAACATG
TCAGGAAGAAAGGAAACAGTGTTAGATTTGGCCAAGTTTATTGATAAAGGTGTGCAAGTT
AAGCTCACCGGTGGTTGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTATGATCAGTTGCTCAAC
CTTGTTCTGGACGGGGCTGTTGAGTCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAAGACTACC
GACCAAACAAGACCTCTTGGTTTAATTGTTTGTCGTGGAACTGCGGTGATGCTCGTCTCA
CCAACGGATGGCACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTCCAACCAGAGGCTGTCTAAAGT
GTTTCTTTCAATACATAATCTCTCTCTCTCTCATTTATGTTTTTTAAGTTGGGGTTTTTT
AGAGGGTATTATGCATCAAAGTATTTGCCATGGAATTGGAAACAATTATTTTAATGGGCT
CAGGTCCGACTCTGCCTAACAATTAGAGTGTGATTTGAACTGTTTCTGAGTTTGATCATT
GAACAAAATGAAGTTGGTGGTAACAAACCTCAAGCTCCTTGTACCAGTCCTCTTGTTATG
GTGTTCTTATAGCTCCGCCA*GAGACATTGTCTTTGGGCATGGTCTGCGACTTACTCTGA
GCTCACAC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CH11JQ 716 0 0
TCG
CCTACGTTTCTGTTTCGGTTTCTCTTTCTCTTCCTGTCCGTTCAGATCTTCGTCTCCCGA
TTTGTGGAATTTCTGTCAAAGGGTCTGCTCTAACATGTCAGGAAGAAAGGAAACAGTGTT
AGATTTGGCCAAGTTTATTGATAAAGGTGTGCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTTGACAAGT
CACTGGAACTCTCAAGGGCTATGATCAGTTGCTCAACCTTGTTCTGGACGGGGCTGTTGA
GTCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAAGACTACCGACCAAACAAGACCTCTTGGTTT
AATTGTTTGTCGTGGAACTGCGGTGATGCTCGTCTCACCAACGGATGGCACTGAAGAAAT
CGCTAACCCGTTTGTCCAACCAGAGGCTGTCTAAAGTGTTTCTTTCAATACATAATCTCT
CTCTCTCTCATTTATGTTTTTTAAGTTGGGGTTTTTTAGAGGGTATTATGCATCAAAGTA
TTTGCCATGGAATTGGAAACAATTATTTTAATGGGCTCAGGTCCGACTCTGCCTAACAAT
TAGAGTGTGATTTGAACTGTTTCTGAGTTTGATCATTGAACAAAATGAAGTTGGTGGTAA
CAAACCTCAAGCTCCTTGTACCAGTCCTCTTGTTATGGTGTTCTTATAGCTCCGCCAAGA
GACATTGTCTTTGGGCATGGTCTGCGACTTACTCTGAGCTCACACTTCTCAGC

QA 4 716 4 716
DS 



AS 1 2

CO CL5196Contig1 995 2 10 U
GCTGGTGACTCGGCTTGTATGCTTCCAACGCAGACCATCCCATCTTCTTGTTTGGAAAAG
ATCAGAACATGGACCACCAAGTTTGCGAAGAAGCTAAATGTTTGTGGGCTGATGAACTGT
CAGTACGCAATCACATCATCTGGCGATGTTTACTTGCTGGAAGCAAATCCACGAGCTTCA
CGTACTGTCCCTTTCGTCTCAAAGGCCATTGGACACCCTCTTGCCAAGTATGCAGCTCTG
GTCATGTCTGGAAAATCTCTCAAAGATCAGAATTTCGAAGAAGAAGTTATCCCTAAACAC
ATCTCTGTGAAAGAAGCTGTTTTCCCATTTGAGAAGTTCCAAGGTTGTGATGTGATACTC
GGGCCAGAGATGAGAAGCACAGGGGAAGTGATGAGCATCAGTTCCGAGTTCCCAAGCGCC
TTTGCAATGGCTCAGATTGCTGCAGGTCAAAAGCTACCTTTAAATGGTACTGTCTTCCTC
AGCTTAAACGATATGACCAAACCGCACCTGGAGAAAATTGCAGTCTCCTTCCTAGACCTT
GGGTTTAAGATCGTTGCTACATCAGGAACAGCGCATTTCCTGGAGTTGAAAGGCATTCCA
GTGGAGAGAGTGTTGAAGTTGCATGAAGGAAGACCACATGCTGCTGATATGGTGGCTAAT
GGTCAGATTCATCTGATGTTGATCACAAGCTCAGGTGATGCTCTTGATCAGAAAGATGGG
AGGCAGCTCAGACAGATGGCTCTAGCTTACAAGGTCCCGGTTATCACCACTGTTGCTGGA
GCATTGGCCACGGCTGAGGGAATCAAGAGCTTGAAGTCAAGTGCTATTAATATGACTGCT
CTTCAGGACTTCTTTGAGATTAAGAATGCATCCTCTTTACTCGTCTGAGTCAAGTTTTTA
TTTTTCTGTGTGTTTGTTCGTTTGTGTGGAACCCTTTATGACTTCAATGTTAGACGGATT
TTGTTTTCTTATAAGCATTTCTATGAATAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G979TF U 1
AF RR4G979JQ C 257
BS 1 694 RR4G979TF
BS 695 695 RR4G979JQ
BS 696 710 RR4G979TF
BS 711 711 RR4G979JQ
BS 712 722 RR4G979TF
BS 723 723 RR4G979JQ
BS 724 747 RR4G979TF
BS 748 748 RR4G979JQ
BS 749 784 RR4G979TF
BS 785 995 RR4G979JQ

RD RR4G979TF 784 0 0
GCTGGTGACTCGGCTTGTATGCTTCCAACGCAGACCATCCCATCTTCTTGTTTGGAAAAG
ATCAGAACATGGACCACCAAGTTTGCGAAGAAGCTAAATGTTTGTGGGCTGATGAACTGT
CAGTACGCAATCACATCATCTGGCGATGTTTACTTGCTGGAAGCAAATCCACGAGCTTCA
CGTACTGTCCCTTTCGTCTCAAAGGCCATTGGACACCCTCTTGCCAAGTATGCAGCTCTG
GTCATGTCTGGAAAATCTCTCAAAGATCAGAATTTCGAAGAAGAAGTTATCCCTAAACAC
ATCTCTGTGAAAGAAGCTGTTTTCCCATTTGAGAAGTTCCAAGGTTGTGATGTGATACTC
GGGCCAGAGATGAGAAGCACAGGGGAAGTGATGAGCATCAGTTCCGAGTTCCCAAGCGCC
TTTGCAATGGCTCAGATTGCTGCAGGTCAAAAGCTACCTTTAAATGGTACTGTCTTCCTC
AGCTTAAACGATATGACCAAACCGCACCTGGAGAAAATTGCAGTCTCCTTCCTAGACCTT
GGGTTTAAGATCGTTGCTACATCAGGAACAGCGCATTTCCTGGAGTTGAAAGGCATTCCA
GTGGAGAGAGTGTTGAAGTTGCATGAAGGAAGACCACATGCTGCTGATATGGTGGCTAAT
GGTCAGATTCATCTGATGTTGATCACAAGCTCAG*TGATGCTCTTGATCA*AAAGATGGG
AG*CAGCTCAGACAGATGGCTCTAGCT*ACAAGGTCCCGGTTATCACCACTGTTGCTGGA
GCAT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4G979JQ 739 0 0
CTCTCAAAGATCAGAATTTCGAAGAAGAAGTTATCCCTAAACACATCTCTGTGAAAGAAG
CTGTTTTCCCATTTGAGAAGTTCCAAGGTTGTGATGTGATACTCGGGCCAGAGATGAGAA
GCACAGGGGAAGTGATGAGCATCAGTTCCGAGTTCCCAAGCGCCTTTGCAATGGCTCAGA
TTGCTGCAGGTCAAAAGCTACCTTTAAATGGTACTGTCTTCCTCAGCTTAAACGATATGA
CCAAACCGCACCTGGAGAAAATTGCAGTCTCCTTCCTAGACCTTGGGTTTAAGATCGTTG
CTACATCAGGAACAGCGCATTTCCTGGAGTTGAAAGGCATTCCAGTGGAGAGAGTGTTGA
AGTTGCATGAAGGAAGACCACATGCTGCTGATATGGTGGCTAATGGTCAGATTCATCTGA
TGTTGATCACAAGCTCAGGTGATGCTCTTGATCAGAAGGATGGGAGGCAGCTCAGACAGA
TGGCTCTAGCTTACAAGGTCCCGGTTATCACCACTGTTGCTGGAGCATTGGCCACGGCTG
AGGGAATCAAGAGCTTGAAGTCAAGTGCTATTAATATGACTGCTCTTCAGGACTTCTTTG
AGATTAAGAATGCATCCTCTTTACTCGTCTGAGTCAAGTTTTTATTTTTCTGTGTGTTTG
TTCGTTTGTGTGGAACCCTTTATGACTTCAATGTTAGACGGATTTTGTTTTCTTATAAGC
ATTTCTATGAATAATCTCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL5197Contig1 906 2 2 U
GAAGGTGATTCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGTATGTATATCTTGATGTT
GAAGATGTCCGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTATCTACTCTTTCCATCACT
TACCTTGATGCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAGTAGAAGGAGACACTGAA
CTGCAGATACCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCCTGGCAAAGAAAGGAGCA
CCAAAACTGAATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTACAGTCAAAGTTACTATA
CCAAATCAAATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAACTTGCTTCTCTGAGTGAT
ACGTCTGGCAACCGGCTGCGAACTCGTGCTAAGCCTCAGCAATCCACTACTCTAAACAGT
GCACCTATTAGCTCAGAAAACAGGACGGATGAAGTTAGGGAGAAAAGCCAAGAACCAGAG
CAAGAAAACGACTTGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAGGATCGGTCGCAAATGGAGCC
ATGAAATGGCTGAGAGGTAACCTCTAGAGATCCATGTTCAACTAACATGACCTGCTTTAA
AAGGTATTCTCGGCTGCACCCATGGTACCAATGTGGAAAGAAATGTTAATTGTTTCATTT
GTTGATGTGAGGGTCTTTTGCAGAAAGCTCTTTATTCCTTTTCAGTTTGGTGGATGTTAT
TTGCCAAGTCATAATGATTTGATGCGTGAAAAGAGAGCGATTCTGCTCTAACTGCCCCAT
TCCTTTTATTAGTACAAATACAACCGGTGTTTCGAGTTAGTTTTGTGTTTTTGGTAAAAA
AGAAAAAAATCAGAGAGCTGTAATAGATAATTATTGGTTTTTGATGGAGTCAGAGTGATT
GAACTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR09TF U 1
AF RR4DR09JQ C 161
BS 1 672 RR4DR09TF
BS 673 906 RR4DR09JQ

RD RR4DR09TF 678 0 0
GAAGGTGATTCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGTATGTATATCTTGATGTT
GAAGATGTCCGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTATCTACTCTTTCCATCACT
TACCTTGATGCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAGTAGAAGGAGACACTGAA
CTGCAGATACCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCCTGGCAAAGAAAGGAGCA
CCAAAACTGAATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTACAGTCAAAGTTACTATA
CCAAATCAAATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAACTTGCTTCTCTGAGTGAT
ACGTCTGGCAACCGGCTGCGAACTCGTGCTAAGCCTCAGCAATCCACTACTCTAAACAGT
GCACCTATTAGCTCAGAAAACAGGACGGATGAAGTTAGGGAGAAAAGCCAAGAACCAGAG
CAAGAAAACGACTTGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAGGATCGGTCGCAAATGGAGCC
ATGAAATGGCTGAGAGGTAACCTCTAGAGATCCATGTTCAACTAACATGACCTGCTTTAA
AAGGTATTCTCGGCTGCACCCATGGTACCAATGTGGAAAGAAATGTTAATTGTTTCATTT
GTTGATGTGAGG
TCTTTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4DR09JQ 746 0 0
CAGTAGAAGGAGACACTGAACTGCAGATACCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGG
TCCTGGCAAAGAAAGGAGCACCAAAACTGAATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGT
TTACAGTCAAAGTTACTATACCAAATCAAATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGG
AACTTGCTTCTCTGAGTGATACGTCTGGCAACCGGCTGCGAACTCGTGCTAAGCCTCAGC
AATCCACTACTCTAAACAGTGCACCTATTAGCTCAGAAAACAGGACGGATGAAGTTAGGG
AGAAAAGCCAAGAACCAGAGCAAGAAAACGACTTGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAG
GATCGGTCGCAAATGGAGCCATGAAATGGCTGAGAGGTAACCTCTAGAGATCCATGTTCA
ACTAACATGACCTGCTTTAAAAGGTATTTTCGGCTGCACCCATGGTACCAATGTGGAAGG
AAATGTTAATTGTTTCATTTGTTGATGTGAGGGTCTTTTGCAGAAAGCTCTTTATTCCTT
TTCAGTTTGGTGGATGTTATTTGCCAAGTCATAATGATTTGATGCGTGAAAAGAGAGCGA
TTCTGCTCTAACTGCCCCATTCCTTTTATTAGTACAAATACAACCGGTGTTTCGAGTTAG
TTTTGTGTTTTTGGTAAAAAAGAAAAAAATCAGAGAGCTGTAATAGATAATTATTGGTTT
TTGATGGAGTCAGAGTGATTGAACTC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL5198Contig1 1395 2 4 U
GGACACAAAGTCATCGTTCCTTTATCTCTTTTCCTTTATACTTCTTTACTTTCTGATATC
AGCATATATGGCAGCAAAGCTAATATCCACCGGTTCTCGTCACACTACTTTACCAGAAAA
CTATGTTCGGCCACTCTCCGACCGTCCACATCTCTCCGATGTCTCTCCACTTGAAAATTT
CCCTCTCATCGATCTATCTTCCACAGATCGATCTCGGCTCGTCCAACAAATCCACCAAGC
TTGCTCCCGATTCGGGTTTTTTCAGGTCATAAATCACAGAGTTGGCAAAGAAACAATTGA
TGGAATGCTGAGTGTTGCGAACGAGTTCTTTAGCATGTCTATAGAGGAAAAAATGAAGTT
GTACTCGGACGATCCAACGAAGACGACGAGATTATCAACGAGCTTCAATGTGAAAAAAGA
AGAGGTCAACAATTGGAGAGACTATCTTAGACTCCATTGTTATCCTATCAGCAAGTATGT
CCATGAGTGGCCTTCAAACCCTCCTTCTTTCAAGGAAGTTGTGAGTAGATATAGTGCAGA
AGTAAGAGAACTGGGATTTATAATAGAGGAACTGATATCAGAGAGCTTGGGCTTAGAAAA
AGATCACATGAGGAAAGTGCTTGGTGAACAAGGTCAACACATGGCAGTCAACTATTATCC
TCCATGTCCGGAGCCTGAGCCCACTTATGGTTTACCTGCTCATACCGACCCAAATGCCCT
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GGGCCTTAATTTTCC


BQ
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DS 

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AGTAACAAACACCGAAAAACCGAGACTATCGGTTGCATCATTTCTGTGCCCAGCTGACTG
CGCTGTCATAAGCCCGGCAAAGCCCTTGTGGGAAACTGAAGAGGACGGGACTAAGCCAAT
ATACAGAGACTACACTTACGCAGAGTACTACAAGAAGTTTTGGAGTAGGAATCTGGACCA
AGAACATTGCCTTGAGAACTTTCTAAACGACTAGATACTATACATACATATATGTGTCTC
TTTGTATGTGTAGTAGCAGGTTCGGCCAGGAGCGGATCCAAAATGAGTTTTAGTGTGTGT
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TGGGTTCACTTTTGGGCCCGGTCCTCTGGGAAGAAGTTAAGGAAGTATGGACTTCTGAGC
TTCAATACTATAAAATATTTTGGGCCTTAATTTTCC

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DS 



AS 1 2

CO CL5199Contig1 747 2 2 U
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TCACTGTCTCCTGAAGTCTCAACCTTCTCCACTCTCAGTATGAGCTGCTTCTGTTCTTGT
TGCTGCTCATCTAATCCCCCAACCTCCTGAAACTTGGTGTTACGCGACATATGTGCTCTT
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GATCCTCTTTTCCCTCCGTCAAGAAAA


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AF RR4ED58JQ U 1
AF RR4GL03JQ U 1
BS 1 733 RR4ED58JQ
BS 734 747 RR4GL03JQ

RD RR4ED58JQ 733 0 0
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AAGAAAATACTGTAAAATACTTTGAAAACATAAAAAACAAATTGTGATTACAATCCTACT
TCTTATGATCTCTTTATCACACTCTTATATGTACAAATATCAGTTGTAGTAAGCTAAAAC
GCTACAGCTTCAGTTCTCAACACTAATCAAGAACAGAGCTTTGGAAGAAACCTGTTGCTT
CCTCTGCTATTGCTCTTGGTTCTCTTCTTGATTACTTCCATCTGAGTCTGCATTTTCAAA
CACGCTCTCTCCAACTCCATTACCCTCCATTGTATCCCTTCTATATGCTCTTTCAACTTC
TCACTGTCTCCTGAAGTCTCAACCTTCTCCACTCTCAGTATGAGCTGCTTCTGTTCTTGT
TGCTGCTCATCTAATCCCCCAACCTCCTGAAACTTGGTGTTACGCGACATATGTGCTCTT
GATTGGACTGAAAGCTTCTCGTAACTCAAAGCTCTTATCAAGTTGAGTCTTTCACCATTG
GTTAATCCTGCATGAGCCTCGAGATACATACCAATGGCACGGTAGATATCTTCATGAGAC
TCTCTAGCTGAGTCTGGAACGAGCGTGAGGAGAGACAGAAACTTTGAAGGTTTCAAGCAA
GGATCAGGTGCCACTTCAGCAATGTACTGATCAATCAACCTCGCCACTTTCTTCACCTGT
GATCCTCTTTTCC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4GL03JQ 747 0 0
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AAGAAAATACTGTAAAATACTTTGAAAACATAAGAAACAAATTGTGATTACAATCCTACT
TCTTATGATCTCTTTATCACACTCTTATATGTACAAATATCAGTTGTAGTAAGCTAAAAC
GCTACAGCTTCAGTTCTCAACACTAATCAAGAACAGAGCTTTGGAAGAGACCTGTTGCTT
CCTCTGCTATTGCTCTTGGTTCTCTTCTTGATTACTTCCATCTGAGTCTGCATTTTCAAA
CACGCTCTCTCCAACTCCATTACCCTCCATTGTATCCCTTCTATATGCTCTTTCAACTTC
TCACTGTCTCCTGAAGTCTCAACCTTCTCCACTCTCAGTATGAGCTGCTTCTGTTCTTGT
TGCTGCTCATCTAATCCCCCAACCTCCTGAAACTTGGTGTTACGCGACATATGTGCTCTT
GATTGGACTGAAAGCTTCTCGTAACTCAAAGCTCTTATCAAGTTGAGTCTTTCACCATTG
GTTAATCCTGCATGAGCCTCGAGATACATATCAATGGCACGGTAGATATCTTCATGAGAC
TCTCTAGCTGAGTCTGGAACGAGCGTGAGGAGAGACAGAAACTTTGAAGGTTTCAAGCAA
GGATCAGGTGCCACTTCAGCAATGTACTGATCAATCAACCTCGCCACTTTCTTCACCTGT
GATCCTCTTTTCCCTCCGTCAAGAAAA

QA 1 747 1 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5201Contig1 986 2 8 U
GGACCGCTTACGGTGGTCATCTTTGTAACGTCACTTAGAAACATTAATCCAAGCATTAAC
ATTTTCTATGCTACCCTCCCACTCTCTCGAATTGAATCGACCATATCATCTAATCGCATG
AAACTTCGCCTATAAATGGCTTTGTTGCCTTGGTTGAGCAGTCCTATCAAAGCAAAATCC
CAAAGGTCATCCTCTGTCAAGCATCAAATCCGCGAATTCATTTATTCTTCTTGCCGATTT
AAAAGCTTGATGATGTTCAAACACCGCGGAGGTTGTCTCCTCAGATTCCGAGAGGCAAGA
AATGTTCAGAAAGGCGGTCAACTCACGGGTCTCCACATGCTTCTCCTGTTAGCCAACACA
ATGTTTAATTAGCTCTTCCTATTTAACCATTTTGATAGTCCGCTCTTATTATGTGTTTCT
AAAACAGTCAAATAGTCAACGAGAAGGTACCTATTAACAATCTTATTCCTAATATATGTT
TTTGGATTCAATTGTTAAACTAAGTCACTAAACAAAATTTATTTACTCTGTTTTTTCAGT
CAGTTTTGATTCAAGGTTTCTGGTACTGATGTCGCTGGAATCACGTTTCACTGACCATGC
AGCTTTGCCGAGGTCACGGAACAAGTGACCACTGACCATCCCAGCAGAGAAGTTTATTTT
TTCAAAAGTATGATCAACTCATGGCTTTGGCTAGCACCAACGTGGATTTGGCTGACATCA
CGGGCGAAGTTAGTAGTATCAACACTGTTTTTGATGATGAAAACCAGTCCATTCAGCGTG
TGATGATAACAATCCAATTGGACAGGAAAAACACATCTCTTTCTCTCTGCGAATCAAAAC
TGGGTTAGATCCAGCGACTATAGCTTCCTTGATCTTACTGAGAAGATCGAAGTTCACTCA
TTTATCTAACTAAACTTGTGATTCGGTTTTGTATAATGAAAATAATTCAGAACAAACTCA
GTTTGAATTGGATTCAATACTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D560TF U 1
AF RR4D560JQ C 287
BS 1 751 RR4D560TF
BS 752 752 RR4D560JQ
BS 753 762 RR4D560TF
BS 763 763 RR4D560JQ
BS 764 791 RR4D560TF
BS 792 792 RR4D560JQ
BS 793 806 RR4D560TF
BS 807 986 RR4D560JQ

RD RR4D560TF 806 0 0
GGACCGCTTACGGTGGTCATCTTTGTAACGTCACTTAGAAACATTAATCCAAGCATTAAC
ATTTTCTATGCTACCCTCCCACTCTCTCGAATTGAATCGACCATATCATCTAATCGCATG
AAACTTCGCCTATAAATGGCTTTGTTGCCTTGGTTGAGCAGTCCTATCAAAGCAAAATCC
CAAAGGTCATCCTCTGTCAAGCATCAAATCCGCGAATTCATTTATTCTTCTTGCCGATTT
AAAAGCTTGATGATGTTCAAACACCGCGGAGGTTGTCTCCTCAGATTCCGAGAGGCAAGA
AATGTTCAGAAAGGCGGTCAACTCACGGGTCTCCACATGCTTCTCCTGTTAGCCAACACA
ATGTTTAATTAGCTCTTCCTATTTAACCATTTTGATAGTCCGCTCTTATTATGTGTTTCT
AAAACAGTCAAATAGTCAACGAGAAGGTACCTATTAACAATCTTATTCCTAATATATGTT
TTTGGATTCAATTGTTAAACTAAGTCACTAAACAAAATTTATTTACTCTGTTTTTTCAGT
CAGTTTTGATTCAAGGTTTCTGGTACTGATGTCGCTGGAATCACGTTTCACTGACCATGC
AGCTTTGCCGAGGTCACGGAACAAGTGACCACTGACCATCCCAGCAGAGAAGTTTATTTT
TTCAAAAGTATGATCAACTCATGGCTTTGGCTAGCACCAACGTGGATTTGGCTGACATCA
CGGGCGAAGTTAGTAGTATCAACACTGTTTT*GATGATGAAA*CCAGTCCATTCAGCGTG
TGATGATAACA*TCCAATTGGACAGG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4D560JQ 700 0 0
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TGTTAGCCAACACAATGTTTAATTAGCTCTTCCTATTTAACCATTTTGATAGTCCGCTCT
TATTATGTGTTTCTAAAACAGTCAAATAGTCAACGAGAAGGTACCTATTAACAATCTTAT
TCCTAATATATGTTTTTGGATTCAATTGTTAAACTAAGTCACTAAACAAAATTTATTTAC
TCTGTTTTTTCAGTCAGTTTTGATTCAAGGTTTCTGGTACTGATGTCGCTGGAATCACGT
TTCACTGACCATGCAGCTTTGCCGAGGTCACGGAACAAGTGACCACTGACCATCCCAGCA
GAGAAGTTTATTTTTTCAAAAGTATGATCAACTCATGGCTTTGGCTAGCACCAACGTGGA
TTTGGCTGACATCACGGGCGAAGTTAGTAGTATCAACACTGTTTTTGATGATGAAAACCA
GTCCATTCAGCGTGTGATGATAACAATCCAATTGGACAGGAAAAACACATCTCTTTCTCT
CTGCGAATCAAAACTGGGTTAGATCCAGCGACTATAGCTTCCTTGATCTTACTGAGAAGA
TCGAAGTTCACTCATTTATCTAACTAAACTTGTGATTCGGTTTTGTATAATGAAAATAAT
TCAGAACAAACTCAGTTTGAATTGGATTCAATACTTGGCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5202Contig1 797 2 2 U
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CTTAATATGAAATCTTCCGCTGGTTTCTCGGCTTCAGGATTAATTGACCCAAACTCATAC
AACCGAAACATACCGGGGAATTATCATTACGGTGGATCAAGAGCAGCGGGTTCCTCTTCT
TACAGGAAATCATATGGCGATGACTCGAGCTACTACTATCAAGGAAACTATAACAATAGT
TCTCAAGGAATGTACAGCAACGGTCCGAGATATCCTGGTCCATTAAATGGATCACCAGAC
TATAACCGGAACTACAACAAACAACAGAACCGTGGTGGAACCAGAGCTGGTTTATCGACA
GAAGATAACAACGGCAGAAGCAAACAGCAATCGTATTCAAGCTATACAGAAGCTGCTAAT
GCAAATAACAACCCATTGCCATCACCGCCAACACTATGGATTGGTACACCACCACCGCAA
GGTGGGAATTTCGGCGGTGGATACTATAGGGAAGGAGTTGGGTATGGTGAGATGAATGGA
AAGGAAGTGATTTATCAGCCTAAGACGCAACCAAGTCATCGAGAATGAGATTAGATTCCG
TCTGTCTGTCGATAACCAAGTTTCTTTCATTTTCTGCGCTGCCGTTTTCTAGTCTGGTTA
GAGATGCTGTCTCTTCTCCCATATTTGCACTTTTGTTATTTATTCTCAAAAATTTCTTGC
TGAACGCAAATGTATAATGTACGTTTTGGTAGAGTTTCTTACACCTTTTTTAATCAAGTG
ATATTTTGACATATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4BA04TF U 1
AF RR4BA04JQ C 66
BS 1 796 RR4BA04TF
BS 797 797 RR4BA04JQ

RD RR4BA04TF 796 0 0
GCTGGTGCTATAGCCGGAAATACACTGGGAGAAGCAGCTCATCGTCTGATCAAAAACACC
CTTAATATGAAATCTTCCGCTGGTTTCTCGGCTTCAGGATTAATTGACCCAAACTCATAC
AACCGAAACATACCGGGGAATTATCATTACGGTGGATCAAGAGCAGCGGGTTCCTCTTCT
TACAGGAAATCATATGGCGATGACTCGAGCTACTACTATCAAGGAAACTATAACAATAGT
TCTCAAGGAATGTACAGCAACGGTCCGAGATATCCTGGTCCATTAAATGGATCACCAGAC
TATAACCGGAACTACAACAAACAACAGAACCGTGGTGGAACCAGAGCTGGTTTATCGACA
GAAGATAACAACGGCAGAAGCAAACAGCAATCGTATTCAAGCTATACAGAAGCTGCTAAT
GCAAATAACAACCCATTGCCATCACCGCCAACACTATGGATTGGTACACCACCACCGCAA
GGTGGGAATTTCGGCGGTGGATACTATAGGGAAGGAGTTGGGTATGGTGAGATGAATGGA
AAGGAAGTGATTTATCAGCCTAAGACGCAACCAAGTCATCGAGAATGAGATTAGATTCCG
TCTGTCTGTCGATAACCAAGTTTCTTTCATTTTCTGCGCTGCCGTTTTCTAGTCTGGTTA
GAGATGCTGTCTCTTCTCCCATATTTGCACTTTTGTTATTTATTCTCAAAAATTTCTTGC
TGAACGCAAATGTATAATGTACGTTTTGGTAGAGTTTCTTACACCTTTTTTAATCAAGTG
ATATTTTGACATATCT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4BA04JQ 732 0 0
TATGAAATCTTCCGCTGGTTTCTCGGCTTCAGGATTAATTGACCCAAACTCATACAACCG
AAACATACCGGGGAATTATCATTACGGTGGATCAAGAGCAGCGGGTTCCTCTTCTTACAG
GAAATCATATGGCGATGACTCGAGCTACTACTATCAAGGAAACTATAACAATAGTTCTCA
AGGAATGTACAGCAACGGTCCGAGATATCCTGGTCCATTAAATGGATCACCAGACTATAA
CCGGAACTACAACAAACAACAGAACCGTGGTGGAACCAGAGCTGGTTTATCGACAGAAGA
TAACAACGGCAGAAGCAAACAGCAATCGTATTCAAGCTATACAGAAGCTGCTAATGCAAA
TAACAACCCATTGCCATCACCGCCAACACTATGGATTGGTACACCACCACCGCAAGGTGG
GAATTTCGGCGGTGGATACTATAGGGAAGGAGTTGGGTATGGTGAGATGAATGGAAAGGA
AGTGATTTATCAGCCTAAGACGCAACCAAGTCATCGAGAATGAGATTAGATTCCGTCTGT
CTGTCGATAACCAAGTTTCTTTCATTTTTTGCGCTGCCGTTTTCTAGTCTGGTTAGAGAT
GCTGTCTCTTCTCCCATATTTGCACTTTTGTTATTTATTCTCAAAAATTTCTTGCTGAAG
GCAAATGTATAATGTACGTTTTGGTAGAGTTTCTTACACCTTTTTTAATCAAGTGATATT
TTGACATATCTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5203Contig1 756 2 8 U
CCCCAATATAGTTACATTTAGCTTTATTGCTTTACAGGTCCAACAATACAATACAAAACA
AATTTTAGCAAAGAGCAATCTCTAGAGTTTAATTATTCCTTCCAACAATACAATACAAAA
CGAATTGGTCAGGCCAGCTCCAAAATGCATATATGTGCATGATCAAAAGCTCCAACGCTG
GCCACCCTTCCCCTCCACTTGCACACTTTGTTGGTTCAAGTATGAAAGTAAAGGCCAGTG
ATACAAAACATTTAAAAGAAGATATTGAGAAACATAAAGATTTAGCTTCAAGCAACGTTT
TCAGACCCATTAGCATCGCATGTCAAATTTAGAACCTCCATTAGTTCCATTCGATATTCC
AAACCTCTGAAATAATGTCCTAACAACATGCACCAAAAAAGAAGACGGGCAAGGTAATCT
CGAGTTAGTGAGATGAGAGGTTGATAATGAAGCGAAGTGTTCTCTACAAGCTCAGCACAA
TCTTCATCGCCTTTAGCATTTACAGTTTCAGTAGGTGGAGCTTCCGATGCGGGCAATTTA
AAGTGCATTTTCGGTGATAGGGTTGCGAGTAGACCGTGAACAACAGAGTGGATCGTCTCT
TTCACCTCAGGAGCCGCGGGTTCTGACAACTCAGCTACCTTCTCAGGTTGCAACGATCTT
AAATAGTCTAACAAATCATTCTTCTCTTCCCCAACAAACTGCTGCATTTGAAGGGCAGCG
TTTTTTCGTCTCACTTCTTGTAATTCTTTTTTGACA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM87JQ U 1
AF RR4CG32JQ U 1
BS 1 370 RR4BM87JQ
BS 371 371 RR4CG32JQ
BS 372 398 RR4BM87JQ
BS 399 399 RR4CG32JQ
BS 400 540 RR4BM87JQ
BS 541 541 RR4CG32JQ
BS 542 709 RR4BM87JQ
BS 710 756 RR4CG32JQ

RD RR4BM87JQ 709 0 0
CCCCAATATAGTTACATTTAGCTTTATTGCTTTACAGGTCCAACAATACAATACAAAACA
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CGAATTGGTCAGGCCAGCTCCAAAATGCATATATGTGCATGATCAAAAGCTCCAACGCTG
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ATACAAAACATTTAAAAGAAGATATTGAGAAACATAAAGATTTAGCTTCAAGCAACGTTT
TCAGACCCATTAGCATCGCATGTCAAATTTAGAACCTCCATTAGTTCCATTCGATATTCC
AAACCTCTGAGATAATGTCCTAACAACATGCACCAAAAGAGAAGACGGGCAAGGTAATCT
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GAGTGCATTTTCGGTGATAGGGTTGCGAGTAGACCGTGAACAACAGAGTGGATCGTCTCT
TTCACCTCAGGAGCCGCGGGTTCTGACAACTCAGCTACCTTCTCAGGTTGCAACGATCTT
AAATAGTCTAACAAATCATTCTTCTCTTCCCCAACAAACTGCTGCATTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4CG32JQ 756 0 0
CCCCAATATAGTTACATTTAGCTTTATTGCTTTACAGGTCCAACAATACAATACAAAACA
AATTTTAGCAAAGAGCAATCTCTAGAGTTTAATTATTCCTTCCAACAATACAATACAAAA
CGAATTGGTCAGGCCAGCTCCAAAATGCATATATGTGCATGATCAAAAGCTCCAACGCTG
GCCACCCTTCCCCTCCACTTGCACACTTTGTTGGTTCAAGTATGAAAGTAAAGGCCAGTG
ATACAAAACATTTAAAAGAAGATATTGAGAAACATAAAGATTTAGCTTCAAGCAACGTTT
TCAGACCCATTAGCATCGCATGTCAAATTTAGAACCTCCATTAGTTCCATTCGATATTCC
AAACCTCTGAAATAATGTCCTAACAACATGCACCAAAAAAGAAGACGGGCAAGGTAATCT
CGAGTTAGTGAGATGAGAGGTTGATAATGAAGCGAAGTGTTCTCTACAAGCTCAGCACAA
TCTTCATCGCCTTTAGCATTTACAGTTTCAGTAGGTGGAGCTTCCGATGCGGGCAATTTA
AAGTGCATTTTCGGTGATAGGGTTGCGAGTAGACCGTGAACAACAGAGTGGATCGTCTCT
TTCACCTCAGGAGCCGCGGGTTCTGACAACTCAGCTACCTTCTCAGGTTGCAACGATCTT
AAATAGTCTAACAAATCATTCTTCTCTTCCCCAACAAACTGCTGCATTTGAAGGGCAGCG
TTTTTTCGTCTCACTTCTTGTAATTCTTTTTTGACA

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5204Contig1 656 2 1 U
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CAGAATCAATGAGCACCCTTTGGCATTGCTTGCTGCGGAGACAAAGAAACTTATGAAAAA
GGACTCTACCATCTTTATGCCAATATTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGTTTTC
TGCATCTCTTATTCACAAGTTTTATGGAAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTACTGA
ACACTTGACTGAGGATGTTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAATATTT
ACTGGAGCTAATGACCTCTGTCTGCGGAGAGGATACAAATGGACCTTACTTCAGAAAATT
AATTCCATATGAGCTCGAATCTCTCTCTGGCACGTTGGTTTTGAGATGGATCAATGCACA
GCTGGGAAGAATTTTGAGTTGGGTGGAGCGAGCTATTAAACAAGAGCATTGGGACCCAAT
ATCACCTCAACAGCGGCATGGGAGCTCAATTGTTGAAGTTTTCAGGATCGTTGAAGAGAC
TGTTGATCAATTTTTTGAGCCGAAAGTTCCAATGAGATCCATTGAACTAAGCGCTTTACT
TCGTGGTATTGACAATGCATTTCAAGTATATACTAACCATGTCATGGAGAAGCTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F258TF U 1
AF RR4F236TF U 1
BS 1 656 RR4F236TF

RD RR4F258TF 521 0 0
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CAGAATCAATGAGCACCCTTTGGCATTGCTTGCTGCGGAGACAAAGAAACTTATGAAAAA
GGACTCTACCATCTTTATGCCAATATTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGTTTTC
TGCATCTCTTATTCACAAGTTTTATGGAAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTACTGA
ACACTTGACTGAGGATGTTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAATATTT
ACTGGAGCTAATGACCTCTGTCTGCGGAGAGGATACAAATGGACCTTACTTCAGAAAATT
AATTCCATATGAGCTCGAATCTCTCTCTGGCACGTTGGTTTTGAGATGGATCAATGCACA
GCTGGGAAGAATTTTGAGTTGGGTGGAGCGAGCTATTAAACAAGAGCATTGGGACCCAAT
ATCACCTCAACAGCGGCATGGGAGCTCAATTGTTGAAGTTT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4F236TF 656 0 0
GATTTCATCTTCCACCAAGAATACGTTCACAAGGATGTCACTTACCATTGATAGATCAGA
CAGAATCAATGAGCACCCTTTGGCATTGCTTGCTGCGGAGACAAAGAAACTTATGAAAAA
GGACTCTACCATCTTTATGCCAATATTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGTTTTC
TGCATCTCTTATTCACAAGTTTTATGGAAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTACTGA
ACACTTGACTGAGGATGTTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAATATTT
ACTGGAGCTAATGACCTCTGTCTGCGGAGAGGATACAAATGGACCTTACTTCAGAAAATT
AATTCCATATGAGCTCGAATCTCTCTCTGGCACGTTGGTTTTGAGATGGATCAATGCACA
GCTGGGAAGAATTTTGAGTTGGGTGGAGCGAGCTATTAAACAAGAGCATTGGGACCCAAT
ATCACCTCAACAGCGGCATGGGAGCTCAATTGTTGAAGTTTTCAGGATCGTTGAAGAGAC
TGTTGATCAATTTTTTGAGCCGAAAGTTCCAATGAGATCCATTGAACTAAGCGCTTTACT
TCGTGGTATTGACAATGCATTTCAAGTATATACTAACCATGTCATGGAGAAGCTAG

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL5205Contig1 428 2 1 U
GGTCGCACTGGGTTCAGGGCTACCATAAAGCCATTGCTTCCGTTGGGAAACCGTCCACGT
TTTACGTTTGGGTGTTGCTCTCTGGCGTCTTCTACCATCTGTACAACCAGTCTTCTTACC
AGGCCCTCGACGAGATCAGTCCTTTGACTTTCTCTGTTGGGAACACGATGAAGAGAGTGG
TGGTGATCGTCTCCTCGGTTTTGGTGTTTAGGAACCCTGTGAGGCTTCTGAATGCTCTTG
GTTCGGCTATCGCGATTTTCGGTACTTTCTTGTACTCTCAGGCTACTGCCAAGAAGAAGA
AGATTGAGGCTGGAGATGGTGATGATAAGAAGGACTAAGATGGCTACTCCAAGCTTTTGA
TTATTATTCCTCGGTTTTGTTGTTTTTTTGTTGTTTTTCCATTTCTGTTCAAGACTCTTT
TAGTTGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AS79JQ C 1
AF RR4AS79TF U 1
BS 1 428 RR4AS79TF

RD RR4AS79JQ 428 0 0
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TTATTATTCCTCGGTTTTGTTGTTTTTTTGTTGTTTTTCCATTTCTGTTCAAGACTCTTT
TAGTTGCT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR4AS79TF 428 0 0
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TTTACGTTTGGGTGTTGCTCTCTGGCGTCTTCTACCATCTGTACAACCAGTCTTCTTACC
AGGCCCTCGACGAGATCAGTCCTTTGACTTTCTCTGTTGGGAACACGATGAAGAGAGTGG
TGGTGATCGTCTCCTCGGTTTTGGTGTTTAGGAACCCTGTGAGGCTTCTGAATGCTCTTG
GTTCGGCTATCGCGATTTTCGGTACTTTCTTGTACTCTCAGGCTACTGCCAAGAAGAAGA
AGATTGAGGCTGGAGATGGTGATGATAAGAAGGACTAAGATGGCTACTCCAAGCTTTTGA
TTATTATTCCTCGGTTTTGTTGTTTTTTTGTTGTTTTTCCATTTCTGTTCAAGACTCTTT
TAGTTGCT

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

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CTCTGGTGTTTATTTATTGTCAATTCAGTTTCTTTACAAGC


BQ
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AF RR4GA23JQ C 1
AF RR4GA23TF U 1
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DS 

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CGTAAAATGTATTTTTATTCGTGCATCTGGTTTTCCTTAACCGGATCTGGGTTTTCCATA
ACCGGATCTGTGTTTCCCAAAATTTTGATTTTTTTTTTAAATACACATTGTGAATCCTTC
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CTCTGGTGTTTATTTATTGTCAATTCAGTTTCTTTACAAGC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4D130JQ C 1
AF RR4D130TF U 1
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QA 1 525 1 525
DS 

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GACAGAAGCGCAAGATAGCAAGTGCTTGAGAGAATACGGTGGCGATGTTGGCTTCCAATT
CTGTGCGCCTCGGATATTTCCTACGTTTTGTCACACAAGATGCCGTGAGAACAAGGGGGC
TAAAGGTGGAAGATGCCGTTGGGGAGAAGGACGTAAAGTTACGTGCTTATGCGATTATTG
CAACGATCAACCCTAGTCATAACGTCTAAGCAATCGGTAATACACTGTGGCTGCAAAACG
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QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL5208Contig1 777 2 2 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D842TF U 1
AF RR4D842JQ C 38
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ACCTGTTGCATGAAGGTACTTGCCTTCGTCGTGTCCTCAGTACCAGCGACTGATAAACCA
ATGGTTTTTATCTTTCATGTATTTTGCGTCTTTCCTGAGCAACGGACTCAAGTCGTGTGT
GTCCTGTCCTATCCTTCGGTAAAATTTGGTTAAAGACCGAGCATCATCATTAATAATAAG
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QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

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CTGCAAAGTACATTGTCTCCTCCTCGCC


BQ
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AF RR4CM85TF C 1
AF RR4CM85JQ U 21
BS 1 20 RR4CM85TF
BS 21 568 RR4CM85JQ

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CTGCAGAGTACAT

QA 1 553 1 553
DS 

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TTAATCCTTTTCTTCATGATTGATGAGACCGTTGGGCTGTAATAGTCATTACTCCTCTGC
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TCCTCGCC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EH80TF U 1
AF RR4EH80JQ C 83
BS 1 603 RR4EH80TF
BS 604 751 RR4EH80JQ

RD RR4EH80TF 603 0 0
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GCTTCGCCTTTTCTTATCTTCTTCCTGCCCTAGGAGTAGAAGTAGCACAAAAAAAGAGGG
ATTAGCATTATTGACCCAATGATAAACCACTAACACCTTCCTCGTTGGGGCCCCGCGCAC
TGGGAAAACGCCGACGCTACGGGAAACCGGCCACTAGTTACAAAGCTCCAATAAGGCGTT
CCTCGAGAGGGCTATCACAGTCAGGTGCGGAGCAATTACCCCTATTTGAAAAGTACCCTT
CTTCCTATTTAGGGGGTTGAGGCGAGAAATGGCTTGATGAATCGTTCCGTTCGCCATGCA
CCGGCCCCATTCACTTGATTCTCGTAGAGGCTGTAAGTACACAGTGCCCCACAACTATCA
ATA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4EH80JQ 669 0 0
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TTGGGTTGTTGGATACGGGATCCTCGTAGTAGGCTGGACCAACATCCAGCCGAGAGAGGG
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AF74TF U 1
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DS 

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TCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GA89TF U 1
AF RR4GA89JQ C 197
BS 1 640 RR4GA89TF
BS 641 641 RR4GA89JQ
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BS 725 725 RR4GA89JQ
BS 726 744 RR4GA89TF
BS 745 948 RR4GA89JQ

RD RR4GA89TF 750 0 0
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AACTCTCTTCGCAGTCTCAACTCCAAGAAGTACCCTGCCCTAGTCCCGACAACCATCGAC
CACCACCTCCTCTTCACCGTCGGTCTCGGGCTAAACCCTTGCCCCACTTGTAAGGCCGGG
AACGGAAGCCGTGTTGTGGCCAGCATCAACAATGTAACATTCACTATGCCCAAAACCGCT
TTGCTTCCAGCTCATTACTTTAATATTAGCGGAGTTTTCACAACGGATTTTCCCAAGAAC
CCACCCCACGTTTTCAACTACAGCGGAGGATCAGTCACGAACATGGCCACGGAAACAGGG
ACGAGGCTTTACAAGCTACCTTACAACGCCACGGTGCAGCTTGTTCTCCAAGATACTGGC
ATCATAGCCCCGGAGAACCATCCTATTCATCTTCATGGCTTCAACTTCTTCGAAGTTGGT
CGAGGATTAGGTAACTTCGACCCCAAGAAAGATCCAAACAACTTTAACTTAGTTGATCCG
GTTGAGAGGAACACAATCGGAGTTCCATCTGGTGGGGTGGGTTGTCATCAGATTCAGAGC
GGATAATCCCGGGGTTTGGTTCATGCATTGTCACTTGGAG*TACACACGACGTGGGGATT
AAAGATGGCTTTCTTGGTGGAGAACGGCAAAG*ACCCAATCAGTCGATTT*GCC*CCGCC
TAAG*ATCTTCCCAAGTGTTAGAT
CTCACT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4GA89JQ 752 0 0
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ACTTTAATATTAGCGGAGTTTTCACAACGGATTTTCCCAAGAACCCACCCCACGTTTTCA
ACTACAGCGGAGGATCAGTCACGAACATGGCCACGGAAACAGGGACGAGGCTTTACAAGC
TACCTTACAACGCCACGGTGCAGCTTGTTCTCCAAGATACTGGCATCATAGCCCCGGAGA
ACCATCCTATTCATCTTCATGGCTTCAACTTCTTCGAAGTTGGTCGAGGATTAGGTAACT
TCGACCCCAAGAAAGATCCAAACAACTTTAACTTAGTTGATCCGGTTGAGAGGAACACAA
TCGGAGTTCCATCTGGTGGG*TGGGTTGTCATCAGATTCAGAGCGGATAATCCCGGGGTT
TGGTTCATGCATTGTCACTTGGAGGTACACACGACGTGGGGATTAAAGATGGCTTTCTTG
GTGGAGAACGGCAAAGGACCCAATCAGTCGATTTTGCCACCGCCTAAGGATCTTCCCAAG
TGTTAGATTCTTCAACTAAAAAAAGCCACGTCCAAGAAGACCAGCGAGTGGTGAATTAAT
GCGTGGATTTGGTTAGCAAATTATATTTTTTTGAGCAAAGCAAAAGGTTCAGTTTTTTTT
GCTCATGTAAAGTTTGAATAAAAAAGGAAGGAAAAGAGCATTGTGTTATAACAATATTTT
TTATCATTATATCAAAGTTCCATTTATACACC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL5213Contig1 1290 2 2 U
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ATCGATCACAGAGAAGTCTACCTTGTAGACCTCTCTCTAAAATTGATTATCATTTATCGT
TACCAACATCAAATATGCATCTCTCTCTTAGTCCTACCCCCTTTGTTCTCCTCTTCCTCG
TTGTTGCACCAGCTGTATTGGCTGATGTAGCTATCTTGAGAACGGATTATTACCAAAAAA
CATGCCCCGACTTCAACAAAATCGTGCGTGAAGCCGTTTTAACTAAGCGATCTCAACAAC
CGACAACTGCTGCCGGAACACTCCGTCTCTTCTTTCACGATTGTTTCCTTGAAGGCTGTG
ATGCGTCTGTTCTGATAGCGACCAATTCGTTTAACAAAGCGGAACGTGACGATGATCTTA
ACGACTCCCTCCCAGGAGATGCTTTCGACATTGTCAATCGCATTAAGACAGCTCTCGAGC
TGTCTTGCCCTGGTGTTGTGTCATGCGCTGATATTTTAGCGCAGGCTACGCGTGACCTTG
TCACGATGGTAGGAGGACCTTACTTCGATGTAAAGCTTGGTCGTAAAGACGGACTCGAAT
CCAAGGCCCATAAAGTCCGAGGAAACGTCCCGATGCCTAACCAGACGGTCCATGACATCC
ACGGGATGTTCAAGAAAAATGGGTTTAGTCTACGTGAGATGGTAGCGTTAAGCGGAGCCC
ACACAATCGGATTTTCTCACTGCAAAGAGTTTGTGACCGGCTTTACGGGTCAAAAGCCGA
TCCAGAAATCAACCCGCGATTCGCAACCGCTTTGAAAGAACTATGCAAAAACCACACCGT
GGATGACACAATCGCGGCGTTTAACGACGTGATGACTCCGGGAAAATTCGACAACATGTA
CTTCAAGAACCTAAAACGAGGACTAGGTCTTTTAGCTTCCGACCACCTCCTTATTAAAGA
CAATAGTACGAAACCGTTTGTCGAGCTTTACGCAACTGACGAGAAAGCATTCTTTGATGA
TTTCGCACGAGCGATGGAGAAACTCGGTACGGTTGGCGTTAAGGGCGATGGAGAAGGAGA
AGTGAGACGTAGGTGCGACCACTTCAACAATCTCAACGTATAAGCAAAGGAAAACACGAA
AACAAAATAATAATATTTACGTTATTTATTTGCCGGGAGAAAGGAGAATTGTGCAGAAGA
AATGTTTCGTTGGTATATATATGTGTTTAAAACTATGTATCGTAAGCAAGTTACTGTAAC
GATTCAATATAAGATGTTTGTTCTTTTTCG


BQ
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AF RR4H008TF U 1
AF RR4H008JQ C 496
BS 1 601 RR4H008TF
BS 602 1290 RR4H008JQ

RD RR4H008TF 601 0 0
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ATCGATCACAGAGAAGTCTACCTTGTAGACCTCTCTCTAAAATTGATTATCATTTATCGT
TACCAACATCAAATATGCATCTCTCTCTTAGTCCTACCCCCTTTGTTCTCCTCTTCCTCG
TTGTTGCACCAGCTGTATTGGCTGATGTAGCTATCTTGAGAACGGATTATTACCAAAAAA
CATGCCCCGACTTCAACAAAATCGTGCGTGAAGCCGTTTTAACTAAGCGATCTCAACAAC
CGACAACTGCTGCCGGAACACTCCGTCTCTTCTTTCACGATTGTTTCCTTGAAGGCTGTG
ATGCGTCTGTTCTGATAGCGACCAATTCGTTTAACAAAGCGGAACGTGACGATGATCTTA
ACGACTCCCTCCCAGGAGATGCTTTCGACATTGTCAATCGCATTAAGACAGCTCTCGAGC
TGTCTTGCCCTGGTGTTGTGTCATGCGCTGATATTTTAGCGCAGGCTACGCGTGACCTTG
TCACGATGGTAGGAGGACCTTACTTCGATGTAAAGCTTGGTCGTAAAGACGGACTCGAAT
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4H008JQ 795 0 0
G
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ACCTTACTTCGATGTAAAGCTTGGTCGTAAAGACGGACTCGAATCCAAGGCCCATAAAGT
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AAATGGGTTTAGTCTACGTGAGATGGTAGCGTTAAGCGGAGCCCACACAATCGGATTTTC
TCACTGCAAAGAGTTTGTGACCGGCTTTACGGGTCAAAAGCCGATCCAGAAATCAACCCG
CGATTCGCAACCGCTTTGAAAGAACTATGCAAAAACCACACCGTGGATGACACAATCGCG
GCGTTTAACGACGTGATGACTCCGGGAAAATTCGACAACATGTACTTCAAGAACCTAAAA
CGAGGACTAGGTCTTTTAGCTTCCGACCACCTCCTTATTAAAGACAATAGTACGAAACCG
TTTGTCGAGCTTTACGCAACTGACGAGAAAGCATTCTTTGATGATTTCGCACGAGCGATG
GAGAAACTCGGTACGGTTGGCGTTAAGGGCGATGGAGAAGGAGAAGTGAGACGTAGGTGC
GACCACTTCAACAATCTCAACGTATAAGCAAAGGAAAACACGAAAACAAAATAATAATAT
TTACGTTATTTATTTGCCGGGAGAAAGGAGAATTGTGCAGAAGAAATGTTTCGTTGGTAT
ATATATGTGTTTAAAACTATGTATCGTAAGCAAGTTACTGTAACGATTCAATATAAGATG
TTTGTTCTTTTTCG

QA 2 795 2 795
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5215Contig1 735 2 1 U
GTCGCTGTCTATGTAGCGCAGGAAGGTGTGATGAAGGACTTAATACGATTAAGAAGATAT
GCAGAGTTGCAAATAAGCCTCTCGTGGTGACTTACACTGGCCTTATCCATGCATGCCTCG
ACGCGGGAAACGTAAAGAACGCAGCTTACATTTTCGATCAGATGAAGGAGGTCTGCAACC
CGAACCTAGTCACTTGCAACATAATGCTAAAAGCTTATCTACAAGAGGGGTTGTTTGAAG
AAGGCAGAGAACTTTTCCAGAAGACGTTGGAAGATGGAAGTAATATAGAAAGCAGCTCAG
ATTTTGAATCAAGAGTGTTGCCGGACACGTACACGTTCAACACAATGCTAGAAGCGTGCG
CTGAACAAAAGAAGTGGGACGATTTTGGTTATGCTTATCAAGAGATGTTGCGTCACGGAT
ACCATTTCAATGCCAAACGCCATCTCAAAATGGTCCTTGAAGCTAGCAGAGCAGGACAGG
AAGAAGTGATGGAAGTGACATGGGAACATCTGAGACGGAGTAATAGGATGCCACCTTCGC
CTCTAATCAAAGAAAGATTCTGCAGGAAGCTCGAGAAAGGCGATCATGCAACGGCCATAT
CGTCTCTTGCTGTCCTTAATGGCAAGATAGAGGAGACTGAGCAACGTTCATTTTCAACGG
ACGCATGGTCCAAGTCTTGTACCGGTTTGAGAAAGATTCAGTTTTGAGTTAATGGACGAT
GTGAACAGACGTGTG


BQ
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AF RR4GF85TF U 1
AF RR4GA11TF U 1
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QA 1 522 1 522
DS 

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GCAGAGTTGCAAATAAGCCTCTCGTGGTGACTTACACTGGCCTTATCCATGCATGCCTCG
ACGCGGGAAACGTAAAGAACGCAGCTTACATTTTCGATCAGATGAAGGAGGTCTGCAACC
CGAACCTAGTCACTTGCAACATAATGCTAAAAGCTTATCTACAAGAGGGGTTGTTTGAAG
AAGGCAGAGAACTTTTCCAGAAGACGTTGGAAGATGGAAGTAATATAGAAAGCAGCTCAG
ATTTTGAATCAAGAGTGTTGCCGGACACGTACACGTTCAACACAATGCTAGAAGCGTGCG
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ACCATTTCAATGCCAAACGCCATCTCAAAATGGTCCTTGAAGCTAGCAGAGCAGGACAGG
AAGAAGTGATGGAAGTGACATGGGAACATCTGAGACGGAGTAATAGGATGCCACCTTCGC
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ACGCATGGTCCAAGTCTTGTACCGGTTTGAGAAAGATTCAGTTTTGAGTTAATGGACGAT
GTGAACAGACGTGTG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

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CGGTATGTCTCTAACTCGTGTTCTTGGGATGATGAGAGGTCTGCAAAAGACCAACGCGAA
AAGCAGTTCGGTGAAGAACAAACTCATGCTGATCCAAACGAACAAAGTTCTCCGCCATTT
CCAGATAACTCTTTTGAAGAAAGGAAGATCCGATTGAAGCGAGAGGGACGCGTCGTACAG
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AGAGGCGTATCCCGTCACTAAAGGAACCACTTTGAAGAACGTCTGGACG


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AF RR4GI48JQ U 1
AF RR4G193JQ U 1
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CTCCGGAATACCCGCCCCTGGTCGAAACTCCGCACGTTGCTCGATCATCACCTTTAAGCA
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DS 

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TACACATCTTGAACCAAAACTACCATATACTATAAGATTTACATTTTACTCAAAGAACTT
TCCGGAGCTAAAGTAAACAGGAAGTGAAAATACCGTTTCAGAGTGAGTGTTAACAGAACA
TGATGTACATCAACTATTACTTCACCATTATCATCATCTACTTTCGGTTGGATACGAAGC
CGGTATGTCTCTAACTCGTGTTCTTGGGATGATGAGAGGTCTGCAAAAGACCAACGCGAA
AAGCAGTTCGGTGAAGAACAAACTCATGCTGATCCAAACGAACAAAGTTCTCCGCCATTT
CCAGATAACTCTTTTGAAGAAAGGAAGATCCGATTGAAGCGAGAGGGACGCGTCGTACAG
CTCCGGAATACCCGCCCCTGGTCGAAACTCCGCACGTTGCTCGATCATCACCTTTAAGCA
AGCGGTGGGGGCGTCCTTTTCCGCAAAGCCTTTCAACTTCAAGGTCAAGGTTTGGATCTC
AGAGGCGTATCCCGTCACTAAAGGAACCACTTTGAAGAACGTCTGGACG

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL5217Contig1 1307 2 6 U
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TACTCCTATTTTAATACGTTTTTAATACATGTGAAAGTTCTAAAACATAACTCTTCTTAA
ATAGAGAGGTAGTAAATTTTTTATTGTGACTATATTTTTTTTTTGACGACAAACGGTTAT
TCTATTACTCAAACTTGAGGTGGTCTGGGTAAACAAACCGGAATAGAACAACCAACAAAA
TGTAACATCCTATGGAAGGATGAAGGATCTAGCTGTCTTAGCTAAAAAGTCTGAGATCTG
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CAAGGCCAATGTTAACGTTCATGCTCTTGTGCGAGCATTTCATCAGCGGATTACTTGGGG
CAAGCTTGATGCAATTTTTCTTTCTGCTTGGACTATCGTACACGTCACCCACTGTTGCGA
TGGCTCTAAATAGCATGTTACCCGCTATTACCTTTGCCCTGGCTCTTATTTTCAGAATAG
AGAATGCACAGAAACTGAAGAGCAGAGCAGGCGTGCTCAAGTTAATAGGAACCCTAATTT
GCATACTTGGAGCAATGTTCTTAACATTCTATAAAGGTCTTCAAGTATCAAATCCTCATA
CTCATCCAGAGGCTATTGACAACAATACATTACATAACAATGGTCACGACCAAGCAAAGA
AATGGCTTCTAGGCTGTGTTTACTTGTTCACTGGGATAGTGTTATTGTCGCTATGGATGT
TGTTTCAAGGGAAATTAAGCATTAAGTATCCGTGTACTAAGTACTCAAGTACTTGCCTCA
TGTCGGTCTTTGCAGCATTTCAATGTGCCATTTTGAGTCTTTATAGGAGTAGAGAAGTCG
AAGATTGGATCATCAAAGACAAACTCGTCATGTTCGTTATCCTTTACGCTGGAATAGTGG
GACAAGCGATGTCGACAGTGGTAACGTCATGGTCAATAAAAAGGACGGGAGCAGTATTCG
TGTCAACATTTAGTCCCGTTTGCCTTGTGTCTGCTACGTTATGCGATTTCCTCATCTTGC
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TATTTCTTTGGGGAAAGAGGAGTGAGACAGATCAGACTGTTTCGAAGACTTTGACCGTTT
CCAAGTCTTGTCAAATGATCGAAAACAAAGACAATATAACAGTAGATGACAACAATACTA
AATTGCCTGTTTGATATATTATAATAATCTATACAAATAAAAGTAGC


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AF RR4E292TF U 1
AF RR4E292JQ C 547
BS 1 732 RR4E292TF
BS 733 733 RR4E292JQ
BS 734 745 RR4E292TF
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BS 747 758 RR4E292TF
BS 759 1307 RR4E292JQ

RD RR4E292TF 758 0 0
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TACTCCTATTTTAATACGTTTTTAATACATGTGAAAGTTCTAAAACATAACTCTTCTTAA
ATAGAGAGGTAGTAAATTTTTTATTGTGACTATATTTTTTTTTTGACGACAAACGGTTAT
TCTATTACTCAAACTTGAGGTGGTCTGGGTAAACAAACCGGAATAGAACAACCAACAAAA
TGTAACATCCTATGGAAGGATGAAGGATCTAGCTGTCTTAGCTAAAAAGTCTGAGATCTG
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CAAGGCCAATGTTAACGTTCATGCTCTTGTGCGAGCATTTCATCAGCGGATTACTTGGGG
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TGGCTCTAAATAGCATGTTACCCGCTATTACCTTTGCCCTGGCTCTTATTTTCAGAATAG
AGAATGCACAGAAACTGAAGAGCAGAGCAGGCGTGCTCAAGTTAATAGGAACCCTAATTT
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CTCATCCAGAGGCTATTGACAACAATACATTACATAACAATGGTCACGACCAAGCAAAGA
AATGGCTTCTAG*CTGTGTTTACTT*TTCACTGGGATA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4E292JQ 761 0 0
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TTTTAGGCTGTGTTTACTTGTTCACTGGGATAGTGTTATTGTCGCTATGGATGTTGTTTC
AAGGGAAATTAAGCATTAAGTATCCGTGTACTAAGTACTCAAGTACTTGCCTCATGTCGG
TCTTTGCAGCATTTCAATGTGCCATTTTGAGTCTTTATAGGAGTAGAGAAGTCGAAGATT
GGATCATCAAAGACAAACTCGTCATGTTCGTTATCCTTTACGCTGGAATAGTGGGACAAG
CGATGTCGACAGTGGTAACGTCATGGTCAATAAAAAGGACGGGAGCAGTATTCGTGTCAA
CATTTAGTCCCGTTTGCCTTGTGTCTGCTACGTTATGCGATTTCCTCATCTTGCGGTCTC
CTTTATACCTCGGCAGTATAATTGGATCAGTAGTGACTATAACGGGCCTCAACGTATTTC
TTTGGGGAAAGAGGAGTGAGACAGATCAGACTGTTTCGAAGACTTTGACCGTTTCCAAGT
CTTGTCAAATGATCGAAAACAAAGACAATATAACAGTAGATGACAACAATACTAAATTGC
CTGTTTGATATATTATAATAATCTATACAAATAAAAGTAGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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GAGATATGTCATCATCAGCGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAGGCACGGGGATATACTATC
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BQ
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AF RR4EO82JQ C 1
AF RR4EO82TF U 1
BS 1 521 RR4EO82TF

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GGGAAAAAGTACTTTACTTTTCTGTACTACCGTATGGTATGTATTAGACATCTTACGTGC
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QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4EO82TF 521 0 0
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TTAGAAAATCGATCCACAAGAAGAGCGCATCTCACGACATAGTGAGGGAGACGGTGAAGA
CGGATGGGGCCGGCTGCGCAGGAGAGGAGATGAAGTCCACGAGAGGTTTCTCCGTAGCCG
GAGATATGTCATCATCAGCGAGTAGTTGGGTCCCACATGAAGGCACGGGGATATACTATC
CAAAAGGACAGGAGACGGTGCTGCAAGATGTGCCTCCTCCTCCAGCTGGCAGCCAAGTGG
ACGAGCTCGTTAATTGGTTCTCTTGATAAAAAAAAATGATCACACTCGACCTCTTGTATC
AATCTCGATCTCATGATCTCAAAAGTTGTTCTCTCTATAAGTCTCTAATTATTGTTGTAA
GGGAAAAAGTACTTTACTTTTCTGTACTACCGTATGGTATGTATTAGACATCTTACGTGC
GTAATAATTATAAGTGAATATATGTATTGTCATGTAATGAG

QA 1 521 1 521
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGTTCCCTCAACGACGTCGCTTCCCGTCAACCATGGCGTCCTCTCGTGCCCAGAAGCTTC
TCCGCCAATGCTAACGAAGATCGATCTTCGCTGGACGATTGGATGTTCAGCGGAAACAGT
GGTGGCAACGATGGAAAAAGCAGTGATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGGCGGAGAAAGAC
AAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTACGGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTAACAGAGACGAG
ACATTCGATCCTTCGTCGGATGGAGTTGATGGTAAACTGAAGGAAGCTGCGTTGATTTAC
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TGGGGAGCTAATCACTTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGATGCAAAGACCTAGA
CAGAACAACAAGGCGGAGATAACCACAGAGGAAGTTCTGAAGAAAGCTGATTTCAGGAAT
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GGCATCAGTGCTAAGGCACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCAAGACTGCCCGTGCATTT
GGTCTGATGCCTTTCACAACGATGGGTACCAAGGCATTCACATTTGGGAAAACCATGGAG
AACAGAGACCAAGATTTCGAGTATGAAGTGGTTGACGATGATGATGAGTATGACAATGCA
ACTGAGTGAGATTTGATCCACTCTCTTCTGCTTTCTAAATCTTTGGCCTAACTAGCTGGT
CTAGTTTTCATTTCTGAGGTTTTGGTCTATCAAGATTTTAAATAATAGGATGTTACCAAA
AGTGGACAATACGTTACTTGAATTCCTCCGATACCAAGGGATTAGGAATTGTATTTTACT
TCTCTTGTTGTGTTACTTTTGAAGATGACAGATTATGGTTCC


BQ
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AF RR4AO30TF U 1
AF RR4AO30JQ C 137
BS 1 833 RR4AO30TF
BS 834 1002 RR4AO30JQ

RD RR4AO30TF 833 0 0
GGAGATCGGAGGAACTGAACCCTAAATCGAAAGACGATGAAACCTGCCCGTTTCGCGATT
CGTTCCCTCAACGACGTCGCTTCCCGTCAACCATGGCGTCCTCTCGTGCCCAGAAGCTTC
TCCGCCAATGCTAACGAAGATCGATCTTCGCTGGACGATTGGATGTTCAGCGGAAACAGT
GGTGGCAACGATGGAAAAAGCAGTGATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGGCGGAGAAAGAC
AAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTACGGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTAACAGAGACGAG
ACATTCGATCCTTCGTCGGATGGAGTTGATGGTAAACTGAAGGAAGCTGCGTTGATTTAC
AACATCGACGACGAAGAAGGCGTCAAGGATAGTTACTCGTTTAGGCCTGATGTCAACAGC
TGGGGAGCTAATCACTTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGATGCAAAGACCTAGA
CAGAACAACAAGGCGGAGATAACCACAGAGGAAGTTCTGAAGAAAGCTGATTTCAGGAAT
GTTCGATTCCTTGCACAGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTGTTAAGAGGAAGCAGACT
GGCATCAGTGCTAAGGCACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCAAGACTGCCCGTGCATTT
GGTCTGATGCCTTTCACAACGATGGGTACCAAGGCATTCACATTTGGGAAAACCATGGAG
AACAGAGACCAAGATTTCGAGTATGAAGTGGTTGACGATGATGATGAGTATGACAATGCA
ACTGAGTGAGATTTGATCCACTCTCTTCTGCTTTCTAAATCTTTGGCCTAACT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4AO30JQ 866 0 0
AAGATCGATCTTCGCTGGACGATTGGATGTTCAGCGGAAACAGTGGTGGCAACGATGGAA
AAAGCAGTGATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGGCGGAGAAAGACAAGCGCGAGTTGGGTA
GATCGTACGGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTAACAGAGACGAGACATTCGATCCTTCGT
CGGATGGAGTTGATGGTAAACTGAAGGAAGCTGCGTTGATTTACAACATCGACGACGAAG
AAGGCGTCAAGGATAGTTACTCGTTTAGGCCTGATGTCAACAGCTGGGGAGCTAATCACT
TCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGATGCAAAGACCTAGACAGAACAACAAGGCGG
AGATAACCACAGAGGAAGTTCTGAAGAAAGCTGATTTCAGGAATGTTCGATTCCTTGCAC
AGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTGTTAAGAGGAAGCAGACTGGCATCAGTGCTAAGG
CACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCAAGACTGCCCGTGCATTTGGTCTGATGCCTTTCA
CAACGATGGGTACCAAGGCATTCACATTTGGGAAAACCATGGAGAACAGAGACCAAGATT
TCGAGTATGAAGTGGTTGACGATGATGATGAGTATGACAATGCAACTGAGTGAGATTTGA
TCCACTCTCTTCTGCTTTCTAAATCTTTGGCCTAACTAGCTGGTCTAGTTTTCATTTCTG
AGGTTTTGGTCTATCAAGATTTTAAATAATAGGATGTTACCAAAAGTGGACAATACGTTA
CTTGAATTCCTCCGATACCAAGGGATTAGGAATTGTATTTTACTTCTCTTGTTGTGTTAC
TTTTGAAGATGACAGATTATGGTTCC

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

CO CL5221Contig1 720 2 3 U
TATCAAAGAGACTCGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGTGAATCTGGTTTCATTCTCGACGGCT
TTCCTCGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTGGTGG
TGAATCTGAAGCTACCAGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGTGTCTAGGCAGGAGAACATGCG
ATCAGTGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAAC
CAGGGATCAGCATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTC
GTGCTGATGATACCGAAGAGGTTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTTACAATGAAACCAG
CCAGCCTCTTGAAGAGTACTACCGTAGCAAGGGAAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGG
AGGCATCCCTGAGTCATGGCCAAGGCTATTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGA
GAAACAATCTGCCGCGGCATAAGTTCACACTTCACCACCGGTATTTATTTATATAATTCT
TTGCATGTGGAAGACATGTGCCTAATCAGTTTTGTGTGTTGGAAATAAAAGAAAAACCTT
AGATTGTTTTTTTTTATTGCCTCGGTTCAGAATAATCATCATCATACACACTTTTGCAAA
CTATAATGATGTATCACGATTGAGTTTGCTAGTTACAGGAATGTATAAACACTTTTTACT


BQ
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AF RR4CT93TF U 281
AF RR4CT93JQ C 1
BS 1 280 RR4CT93JQ
BS 281 396 RR4CT93TF
BS 397 720 RR4CT93JQ

RD RR4CT93TF 125 0 0
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GTATTTTACAATGAAACCAGCCAGCCTCTTGAAGAGTACTACCGTAGCAAGGGAAA
AGCTGATGG

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR4CT93JQ 720 0 0
TATCAAAGAGACTCGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGTGAATCTGGTTTCATTCTCGACGGCT
TTCCTCGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTGGTGG
TGAATCTGAAGCTACCAGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGTGTCTAGGCAGGAGAACATGCG
ATCAGTGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAAC
CAGGGATCAGCATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTC
GTGCTGATGATACCGAAGAGGTT*GTTAAAGCTAGGCTTCGTATTT*ACAATGAAACCAG
CCAGCCTCTTGAAGAGTACTACCGTAGCAAGGGAAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGG
AGGCATCCCTGAGTCATGGCCAAGGCTATTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGA
GAAACAATCTGCCGCGGCATAAGTTCACACTTCACCACCGGTATTTATTTATATAATTCT
TTGCATGTGGAAGACATGTGCCTAATCAGTTTTGTGTGTTGGAAATAAAAGAAAAACCTT
AGATTGTTTTTTTTTATTGCCTCGGTTCAGAATAATCATCATCATACACACTTTTGCAAA
CTATAATGATGTATCACGATTGAGTTTGCTAGTTACAGGAATGTATAAACACTTTTTACT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5222Contig1 867 2 4 U
CAAACTCCTTCATATCTTTCCTTATTCATTTTTTCTTCCAAAAATTTAAAGTACATAAGA
AAATATTAACCACTTTTATTTTTTTTTGTTTTGAAACTAACTTCTTTTAGTTTGTAATGT
GTTTTTTATATATATGTTATTTTAATGTGCAGAAGCTATTACCGTTGCACCACAGTGGGT
TGTGGAGTGAAGAAGAGAGTGGAGAGATCCTCCGATAATCCTTCCATCGTCATGACAACT
TACGAAGGTCAACACACTCATCCTTTCCCCATGACGCCACGTGGACACATCGGAATGCTT
ACGTCACCAATTCTCGACCTTGGTGCAACCACTGCGTCATCATCATCATCATTCTTTATC
CCTCAGCCAAGCTACTTGCTATCTCAGCATCATCAACCTTACAGCAGCATGTATAACAAC
AACTCTCTAAGCATGATCAGTAGAAGCTCATCCTCTGATGGCACTTTCGTAAATCCAGGG
GCATCATCATTCCATGGATTTGCTTATGAGATGTCACAAGCTTCTACATCAACTACTACC
ATTAGGGATCACGGATTACTTCAAGATATTCTTCCTTCGCAGACAGGGGCGGTCCTGTGC
TACTTGGGGCCTTAAACAACAACAAAAAGGGGGCCTTAATGGATCTTGAGAGAAGAAAAA
ATAAGAAGAGGTTGTCCAAAAAGGAAAGAAATAAAGAAAAAGAAACGTTGCAGTAGAAAA
CTAATATTTTTAATTCTTATAATTAGTTGTATTCTTAATTTTTATAATTAGTTGTAAGAC
CCAGTTTATTTACAATATACTACCTACCTTTATTCCCTTTCTTCCAACGGATACTCTTCT
TCTTAAAGCTTAAAAATAAACGTTACG


BQ
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AF RR4GW68TF U 1
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BS 634 660 RR4GW68TF
BS 661 867 RR4GW68JQ

RD RR4GW68TF 660 0 0
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AAATATTAACCACTTTTATTTTTTTTTGTTTTGAAACTAACTTCTTTTAGTTTGTAATGT
GTTTTTTATATATATGTTATTTTAATGTGCAGAAGCTATTACCGTTGCACCACAGTGGGT
TGTGGAGTGAAGAAGAGAGTGGAGAGATCCTCCGATAATCCTTCCATCGTCATGACAACT
TACGAAGGTCAACACACTCATCCTTTCCCCATGACGCCACGTGGACACATCGGAATGCTT
ACGTCACCAATTCTCGACCTTGGTGCAACCACTGCGTCATCATCATCATCATTCTTTATC
CCTCAGCCAAGCTACTTGCTATCTCAGCATCATCAACCTTACAGCAGCATGTATAACAAC
AACTCTCTAAGCATGATCAGTAGAAGCTCATCCTCTGATGGCACTTTCGTAAATCCAGGG
GCATCATCATTCCATGGATTTGCTTATGAGATGTCACAAGCTTCTACATCAACTACTACC
ATTAGGGATCACGGATTACTTCAAGATATTCTTCCTTCGCAGACAGGGGCGGTCCTGTGC
TACTTGGGGCCTTAAACAACAACAAAAAGGGG*CCTTAATGGATCTTGAGAGAAGAAAAA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4GW68JQ 732 0 0
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AGAGTGGAGAGATCCTCCGATAATCCTTCCATCGTCATGACAACTTACGAAGGTCAACAC
ACTCATCCTTTCCCCATGACGCCACGTGGACACATCGGAATGCTTACGTCACCAATTCTC
GACCTTGGTGCAACCACTGCGTCATCATCATCATCATTCTTTATCCCTCAGCCAAGCTAC
TTGCTATCTCAGCATCATCAACCTTACAGCAGCATGTATAACAACAACTCTCTAAGCATG
ATCAGTAGAAGCTCATCCTCTGATGGCACTTTCGTAAATCCAGGGGCATCATCATTCCAT
GGATTTGCTTATGAGATGTCACAAGCTTCTACATCAACTACTACCATTAGGGATCACGGA
TTACTTCAAGATATTCTTCCTTCGCAGACAGGGGCGGTCCTGTGCTACTTGGGGCCTTAA
ACAACAACAAAAAGGGGGCCTTAATGGATCTTGAGAGAAGAAAAAATAAGAAGAGGTTGT
CCAAAAAGGAAAGAAATAAAGAAAAAGAAACGTTGCAGTAGAAAACTAATATTTTTAATT
CTTATAATTAGTTGTATTCTTAATTTTTATAATTAGTTGTAAGACCCAGTTTATTTACAA
TATACTACCTACCTTTATTCCCTTTCTTCCAACGGATACTCTTCTTCTTAAAGCTTAAAA
ATAAACGTTACG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5223Contig1 930 2 6 U
GCATTCTCGATTAACCCAGTGAGAGCACACTACTGTGATGATGGTTGTCCTGACTTAGTC
TTCCTTTATTCCAGAATAGGCCTTCATCGTTACAACTTTCTCCAGGGCAAAAAATTGCAG
CTCAGTAGTGTAAAGAAATACACCAAACCCAGTTGTTCTCATGTTAACACTTACTGCATC
ACTTTGGAAGCCGAGGATCCAGACATCTGCGGTTCTCTCCAAACTTTTCAGACCAAAGTT
AGTGAACAAAGATTCCGCAGATTTGATCTGAAGTGCAGTATTGCTAGACCTCTAGGTGAA
ACAAAGAAGACCATCACAGGTGGCTATAGCTTTGATAAGAGTCCCAAAGTGCTCGAGTTT
CCTCAAGAGAACCCTTTTGTTGAAGATGGCGGCACAAACCGATTTTACTTGCTCAAGGAT
TCAGAGCTTCAAGACAATTATTGGATCCGTTTGTACTTGGAACTTGCAGTTGCTACATCC
AATAAGAAAATTGGCCGTGATACGCACAGCCTGGACAGTTTGAAGATTCTGAAAGTGGCT
ATGGAAAGTACCCAGGGACTTTGCGACTTTGATGCAGTTTTCTACATAAGGTACGAGGAC
TCTTGCGAGGCTCGAGTTGGTAAGGATGTCCATCGCGTTGCTATTGTCAGAAGAATCTTG
GATAAGCAATCGGAACTCTTGAGTCTCTATGGTTATAACCAGAGCATAAACAAAAGTGCT
TCCGTTGAAGCTTGCTCGTCCTCTGCACAAGACTAGATCCATTTGAGTATTTATCTGGAT
CAGAATAATTAACTCCGTCGGTGGAATGCTTTTTATGCAATTTGTGTGTGTCTAAGTGTG
TTGTTCTACATTAATGATATTTCCTTGGTCAAGACTAATTTATTTTTACTGTTTAAGTAA
TTTGCTTTTTTAATTTAGTATTATGCAACG


BQ
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AF RR4EQ29TF U 1
AF RR4EQ29JQ C 216
BS 1 709 RR4EQ29TF
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BS 730 749 RR4EQ29TF
BS 750 930 RR4EQ29JQ

RD RR4EQ29TF 750 0 0
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CCTCAAGAGAACCCTTTTGTTGAAGATGGCGGCACAAACCGATTTTACTTGCTCAAGGAT
TCAGAGCTTCAAGACAATTATTGGATCCGTTTGTACTTGGAACTTGCAGTTGCTACATCC
AATAAGAAAATTGGCCGTGATACGCACAGCCTGGACAGTTTGAAGATTCTGAAAGTGGCT
ATGGAAAGTACCCAGGGACTTTGCGACTTTGATGCAGTTTTCTACATAAGGTACGAGGAC
TCTTGCGAGGCTCGAGTTGGTAAGGATGTCCATCGCGTTGCTATTGTCAGAAGAATCTTG
GATAAGCAATCGGAACTCTTGAGTCTCTATGGTTATAACCAGAGCATAA**CAAAGTGCT
TCCGTTGA*GCTTGCTCGTCCTCTGCACA
G

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4EQ29JQ 715 0 0
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CTTGGAACTTGCAGTTGCTACATCCAATAAGAAAATTGGCCGTGATACGCACAGCCTGGA
CAGTTTGAAGATTCTGAAAGTGGCTATGGAAAGTACCCAGGGACTTTGCGACTTTGATGC
AGTTTTCTACATAAGGTACGAGGACTCTTGCGAGGCTCGAGTTGGTAAGGATGTCCATCG
CGTTGCTATTGTCAGAAGAATCTTGGATAAGCAATCGGAACTCTTGAGTCTCTATGGTTA
TAACCAGAGCATAAACAAAAGTGCTTCCGTTGAAGCTTGCTCGTCCTCTGCACAAGACTA
GATCCATTTGAGTATTTATCTGGATCAGAATAATTAACTCCGTCGGTGGAATGCTTTTTA
TGCAATTTGTGTGTGTCTAAGTGTGTTGTTCTACATTAATGATATTTCCTTGGTCAAGAC
TAATTTATTTTTACTGTTTAAGTAATTTGCTTTTTTAATTTAGTATTATGCAACG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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GGACCACTCCTACGATCCATTCCTCGACGATTTCTTTTTACGATTGCGTCCCAATGACCC
GTCGCTATCCCCTCCGTAAAAGTCTCCGGCGACGAAGGTCGGCACCTCGCCGCAATTTCA
TTTCCTCCGATGTAGAAACGGACTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTTTTCCAATGGGT
TAGCGAAACCCATCTATGTGCAAATCAGCCACGACGAGCTCACAAGCGAGATAGACACCG
ACGCCGCGATTGATTCAACGGAGAAAGACAACGACTTGGTTGTAACCGATTCGGTTCGGG
TTGACCCGGTTCAGGAAACCGAAGAATCCACCGTGAGCGATGCACTATCTCCACCACCAC
CACCACCACCGAAGAAGAAGCTCCAAGAACGTAAATCAACTGACGGGTCTCCGTCTCTCA
TTGGTCTACTCTTCAAATCAATCGTAAAGTCTCCTCCTTTCTTCCTCACCTGGTCCCTCC
TCTTCCCTTTCGACCCCTTCACCACCTTCAAGCTCGCCAGACGACTCTTACTGTCCCAAG
TTTCCCTCTTTACCGAAATTTTATCTCGAACTCTTAAGCTGAGTGGTGGGTTCAAAGATA
CCAAACGTACTGTGAATGTTGCGTGCAAGTTCGGATGGGGTTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI48TF U 1
AF RR4G193TF U 1
BS 1 645 RR4G193TF

RD RR4GI48TF 524 0 0
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GTCGCTATCCCCTCCGTAAAAGTCTCCGGCGACGAAGGTCGGCACCTCGCCGCAATTTCA
TTTCCTCCGATGTAGAAACGGACTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTTTTCCAATGGGT
TAGCGAAACCCATCTATGTGCAAATCAGCCACGACGAGCTCACAAGCGAGATAGACACCG
ACGCCGCGATTGATTCAACGGAGAAAGACAACGACTTGGTTGTAACCGATTCGGTTCGGG
TTGACCCGGTTCAGGAAACCGAAGAATCCACCGTGAGCGATGCACTATCTCCACCACCAC
CACCACCACCGAAGAAGAAGCTCCGAGAACGTAAATCAACTGACGGGTCTCCGTCTCTCA
TTGGTCTACTCTTCAAATCAATCGTAAAGTCTCCTCCTTTCTTCCTCACCTGGTCCCTCC
TCTTCCCTTTCGACCCCTTCACCACCTTCAAGCTCGCCAGACGA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4G193TF 645 0 0
GGACCACTCCTACGATCCATTCCTCGACGATTTCTTTTTACGATTGCGTCCCAATGACCC
GTCGCTATCCCCTCCGTAAAAGTCTCCGGCGACGAAGGTCGGCACCTCGCCGCAATTTCA
TTTCCTCCGATGTAGAAACGGACTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTTTTCCAATGGGT
TAGCGAAACCCATCTATGTGCAAATCAGCCACGACGAGCTCACAAGCGAGATAGACACCG
ACGCCGCGATTGATTCAACGGAGAAAGACAACGACTTGGTTGTAACCGATTCGGTTCGGG
TTGACCCGGTTCAGGAAACCGAAGAATCCACCGTGAGCGATGCACTATCTCCACCACCAC
CACCACCACCGAAGAAGAAGCTCCAAGAACGTAAATCAACTGACGGGTCTCCGTCTCTCA
TTGGTCTACTCTTCAAATCAATCGTAAAGTCTCCTCCTTTCTTCCTCACCTGGTCCCTCC
TCTTCCCTTTCGACCCCTTCACCACCTTCAAGCTCGCCAGACGACTCTTACTGTCCCAAG
TTTCCCTCTTTACCGAAATTTTATCTCGAACTCTTAAGCTGAGTGGTGGGTTCAAAGATA
CCAAACGTACTGTGAATGTTGCGTGCAAGTTCGGATGGGGTTTGT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5225Contig1 863 2 2 U
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GACAGAAAAGATTCGATTGAACAAGTGAAGAAGCTTTACGAACTCTTCCGCAAGAGTGAC
TGCACAATGTTGGAAATCAACCCTCTCGCTGAGACATCCACGAACCAATTGGTAGCTGCT
GATGCTAAGTTGAACTTTGATGATAATGCTGCGTTCCGTCAGAAAGATATTTTTGCCCTT
CGTGATCCAACACAGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTGGACCTGAACTAT
ATCGGTTTAGATGGAGAGATTGGGTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACC
ATGGACATCATTAAACTGCACGGTGGGACTCCCGCAAATTTCCTTGACGTTGGTGGAAAC
GCATCTGAACACCAGGTGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACATCGGACGATAAAGTGAAA
GCAATATTGGTGAACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATT
GTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTGGAAGGAACA
AATGTTGAACAAGGAAAGAGAACTCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAACAGCTGAT
GATTTGGATGACGCAGCAGAGAAAGCTGTGAAGGCATTAGCTAATTAGGCTATAAGGGGT
TGTTTTCATACAAGAAAAAAAGCTATTTGTTGAGATTGTTTTTTTCTATGGTTCTAGGCC
ATTTCTATGTGGTTGAGGCAATTGCATATTGTTGCCGATATAATATGCTGAAACAGATCA
ATAATGTTATTGATGAAATTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DF68TF U 1
AF RR4DF68JQ C 185
BS 1 693 RR4DF68TF
BS 694 863 RR4DF68JQ

RD RR4DF68TF 698 0 0
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GACAGAAAAGATTCGATTGAACAAGTGAAGAAGCTTTACGAACTCTTCCGCAAGAGTGAC
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GATGCTAAGTTGAACTTTGATGATAATGCTGCGTTCCGTCAGAAAGATATTTTTGCCCTT
CGTGATCCAACACAGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTGGACCTGAACTAT
ATCGGTTTAGATGGAGAGATTGGGTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACC
ATGGACATCATTAAACTGCACGGTGGGACTCCCGCAAATTTCCTTGACGTTGGTGGAAAC
GCATCTGAACACCAGGTGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACATCGGACGATAAAGTGAAA
GCAATATTGGTGAACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATT
GTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTGGAAGGAACA
AATGTTGAACAAGGAAAGAGAACTCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAACAGCTGAT
GATTTGGATGACGCAGCAGAGAAAGCTGTGAAG
CATTA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4DF68JQ 679 0 0
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ATCCAACACAGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTGGACCTGAACTATATCG
GTTTAGATGGAGAGATTGGGTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACCATGG
ACATCATTAAACTGCACGGTGGGACTCCCGCAAATTTCCTTGACGTTGGTGGAAACGCAT
CTGAACACCAGGTGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACATCGGACGATAAAGTGAAAGCAA
TATTGGTGAACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGA
ATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTGGAAGGAACAAATG
TTGAACAAGGAAAGAGAACTCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAACAGCTGATGATT
TGGATGACGCAGCAGAGAAAGCTGTGAAGGCATTAGCTAATTAGGCTATAAGGGGTTGTT
TTCATACAAGAAAAAAAGCTATTTGTTGAGATTGTTTTTTTCTATGGTTCTAGGCCATTT
CTATGTGGTTGAGGCAATTGCATATTGTTGCCGATATAATATGCTGAAACAGATCAATAA
TGTTATTGATGAAATTTTA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL5226Contig1 751 2 4 U
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GAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGC
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AE60JQ C 1
AF RR4AE60TF U 1
BS 1 697 RR4AE60TF
BS 698 698 RR4AE60JQ
BS 699 728 RR4AE60TF
BS 729 751 RR4AE60JQ

RD RR4AE60JQ 751 0 0
GGTAGTTACTTTGTCTAATGCTTCCGAGTATAAACGGTATAGCCCGAGGTCTGGAGGCTT
GGTTGACTATGAGGACGATGAAGATGATGAAGACTATAAACCTCCTCCCAGGAAACAGCC
CGAAGTCTCTGAGGAGGAAGAAGGCGAGCTCCTTGGGCTGAAACGCAAATCCCCTTTCCC
AGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGA
AAACGTGTTTGCTGTGCTGTGTTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTCGCAAAGAAAAGTCA
GGGCAGCACTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGAGGAGTCTAGAAG
TAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGT
TTCTAGTTCGGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGT
GGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCTGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACAC
TCTGGACTTGTAGTTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACCC
TTCAAAGTTAAAGACTGAGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAA
GAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGC
AGCCGGTTTTATTTATATATTCATCTTTTGG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4AE60TF 728 0 0
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GGTTGACTATGAGGACGATGAAGATGATGAAGACTATAAACCTCCTCCCAGGAAACAGCC
CGAAGTCTCTGAGGAGGAAGAAGGCGAGCTCCTTGGGCTGAAACGCAAATCCCCTTTCCC
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AAACGTGTTTGCTGTGCTGTGTTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTCGCAAAGAAAAGTCA
GGGCAGCACTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGAGGAGTCTAGAAG
TAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGT
TTCTAGTTCGGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGT
GGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCTGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACAC
TCTGGACTTGTAGTTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACCC
TTCAAAGTTAAAGACTGAGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAA
GAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAG*TTTCTTCTTCCATTGTGTTTGC
AGCCGGTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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TTTCCCGGTTACAGAGAACCGGAGCTCTTTTCCGGTTTTCAAAAACTGAAACCAACTTCA
CCGTCTCCTGCCGAAATAATTGTTTTCAGATGTAATTATGTACATGTTTGCGTTGTTACG
GGTAGTATGTGTGTGCGTAAATCTTGATGTGCCGATGAGCTCCGGCGATTCGGTCGATCA
AAACCGGATCAGCATCGGGAAGCCTAAACCGGGTTGACTCTAATGTATGTATATCAGTCA
GTATTTGGAAGGGACTATGTTCGTTTTTAGTGTATTTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BP29JQ C 1
AF RR4BP29TF U 1
BS 1 520 RR4BP29TF

RD RR4BP29JQ 520 0 0
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AAGAGAGGTTGGGACTGATCATTCCATGTTTTCATCTTCTCTGACTTCCAAAGTCTCACC
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GTATTTGGAAGGGACTATGTTCGTTTTTAGTGTATTTTTG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4BP29TF 520 0 0
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AAGAGAGGTTGGGACTGATCATTCCATGTTTTCATCTTCTCTGACTTCCAAAGTCTCACC
GTTTACTTCCTCTTGTTCTGCTTCTTCCTCCTCTGCTTCATTCAGTTCTGGTCGGACATA
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CCGTCTCCTGCCGAAATAATTGTTTTCAGATGTAATTATGTACATGTTTGCGTTGTTACG
GGTAGTATGTGTGTGCGTAAATCTTGATGTGCCGATGAGCTCCGGCGATTCGGTCGATCA
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GTATTTGGAAGGGACTATGTTCGTTTTTAGTGTATTTTTG

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL5228Contig1 854 2 4 U
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GTGTTGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTCATCGCCGGAGGGAACTTCTTTTTTCTTGCATTA
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GCAGCGGCGAGGTGGGCTCGGTGGAGGAAGGGAACGGAGTCGGATTTTAGGGTTCGTGGG
GTCAGATCTGTTTCCCAGCCTTCGGGATCTGTCCTTGATGGTTGCAAATGGCGGTGGTTT
TGAGCTCGTTCTCAGATCCTGATCTGAGATGAGTAGCGGCAAAGCGAGGTTGCGGTTCGT
GTTCAAGGCGTCTTGATGCGGCGGTCCTCTCCTTTCCCGGTTAAGGGAGTGTCGGAGTAT
CCTTTTCTCGGCGGCGCGTGCAGAGGAGGTGTTCTGTTGTGTGACAGTGGCCTGTTTTCT
GGTGGCCTCGCGTGAAGCTCCGTCCTGCTTCTATATCGATAGGTCGTCTATGGCTTAGTC
GATTGAAGCTCGTCTGGTCTTCCTCTCTTTTTAACGCCACTGCTTGTGCCTGGTTTCCTT
GTCTTCGTTGTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D045TF U 1
AF RR4F159TF U 152
BS 1 607 RR4D045TF
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BS 609 682 RR4D045TF
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RD RR4D045TF 682 0 0
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TAATATAGAGATCCACTGTATATGGTTTTCCAAGTGGACAAAAAGTAACTAAACACAAAA
AGCTTCTCTCTCCTTCTCTAACTTATCTGCTCGCAACCTTTACGGCCGTTGATTGCTCCG
GTGTTGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTCATCGCCGGAGGGAACTTCTTTTTTCTTGCATTA
GCTTCGTCTCTCCTCTTCCCCTCCCATCGATATGCTCGCTGTCTCTGGTTGGTTTACCGA
CGTCGAAGCTCAGTCCCGCTCGAGAGGTGACCAGATCCGGCGGAGTGCGACTGTTCTGGA
GCAGCGGCGAGGTGGGCTCGGTGGAGGAAGGGAACGGAGTCGGATTTTAGGGTTCGTGGG
GTCAGATCTGTTTCCCAGCCTTCGGGATCTGTCCTTGATGGTTGCAAATGGCGGTGGTTT
TGAGCTCGTTCTCAGATCCTGATCTGAGATGAGTAGCGGCAAAGCGAGGTTGCGGTTCGT
GTTCAAG*CGTCTTGATGCGGCGGTCCTCTCCTTTCCCGGTTAAGGGAGTGTCGGAGTAT
CCTTTTCTCGGCGGCGCGTGCA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4F159TF 703 0 0
GG
GTGGACAAAAAGTAACTAAACACAAAAAGCTTCTCTCTCCTTCTCTAACTTATCTGCTCG
CAACCTTTACGGCCGTTGATTGCTCCGGTGTTGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTCATCGCC
GGAGGGAACTTCTTTTTTCTTGCATTAGCTTCGTCTCTCCTCTTCCCCTCCCATCGATAT
GCTCGCTGTCTCTGGTTGGTTTACCGACGTCGAAGCTCAGTCCCGCTCGAGAGGTGACCA
GATCCGGCGGAGTGCGACTGTTCTGGAGCAGCGGCGAGGTGGGCTCGGTGGAGGAAGGGA
ACGGAGTCGGATTTTAGGGTTCGTGGGGTCAGATCTGTTTTCCAGCCTTCGGGATCTGTC
CTTGATGGTTGCAAATGGCGGTGGTTTTGAGCTCGTTCTCAGATCCTGATCTGAGATGAG
TAGCGGCAAAGCGAGGTTGCGGTTCGTGTTCAAGGCGTCTTGATGCGGCGGTCCTCTCCT
TTCCCGGTTAAGGGAGTGTCGGAGTATCCTTTTCTCGGCGGCGCGTGCAGAGGAGGTGTT
CTGTTGTGTGACAGTGGCCTGTTTTCTGGTGGCCTCGCGTGAAGCTCCGTCCTGCTTCTA
TATCGATAGGTCGTCTATGGCTTAGTCGATTGAAGCTCGTCTGGTCTTCCTCTCTTTTTA
ACGCCACTGCTTGTGCCTGGTTTCCTTGTCTTCGTTGTGGA

QA 3 703 3 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAGCTTTTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGAGTCTGGAAACAGCCTCCTTCATTTACAT
TGTTGATGGTGCACTTAGCGCTGTTGCTGCAGAAACTAACCCACAGGATGCACCGGTACC
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TGCGCAACGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGATGTTCGTGTTACTATTGCCGC
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GGTCGAGGATTTATCTGCCAGACAGGTGTATGAGAAGCTTCTTGAGGCCGTTGCACCATA
AACTCTGAGGTCCGTGCATGTTGGTGAAAGACATTAACCGAGAACTCTGCAATCAGTCAA
TCACCCTGTAATTGGTTTATTTCAGAGACGAAAGAGTTTTAATATTTTGCTTGGGAAGAT
ATAGACAAAATTGCTTTCTTATATCTCTGTTTTCATGCTTCCAAACCACTACTTTTTTTA
TACGATCCCCCATTATTATAGTCTCTGTATCTAATACATTCAAAAGTGTCGTCTTTTGAA
CTAGAATTTAAAAATCACATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EJ08TF U 1
AF RR4EJ08JQ C 68
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BS 588 804 RR4EJ08JQ

RD RR4EJ08TF 587 0 0
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TGAGCTTTTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGAGTCTGGAAACAGCCTCCTTCATTTACAT
TGTTGATGGTGCACTTAGCGCTGTTGCTGCAGAAACTAACCCACAGGATGCACCGGTACC
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TGCGCAACGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGATGTTCGTGTTACTATTGCCGC
ACCAGCAGCTCGTGGGGAAGCTAACAACGAGCTTCTGGAATTCATGGGAAGGGTGCTTGG
TTTAAGGTTGAGCCAGATGACTCTCCAAAGAGGCTGGAATAGCAAATCGAAACTCCTCGT
GGTCGAGGATTTATCTGCCAGACAGGTGTATGAGAAGCTTCTTGAGGCCGTTGCACCATA
AACTCTGAGGTCCGTGCATGTTGGTGAAAGACATTAACCGAGAACTC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EJ08JQ 737 0 0
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TTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGAGTCTGGAAACAGCCTCCTTCATTTACATTGTTGAT
GGTGCACTTAGCGCTGTTGCTGCAGAAACTAACCCACAGGATGCACCGGTACCTCCCTGC
ATTTCACAGCTCGACGGTGGGCTTGTTCAGGTTGCTATAGAAGTGGAAGACCGTGCGCAA
CGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGATGTTCGTGTTACTATTGCCGCACCAGCA
GCTCGTGGGGAAGCTAACAACGAGCTTCTGGAATTCATGGGAAGGGTGCTTGGTTTAAGG
TTGAGCCAGATGACTCTCCAAAGAGGCTGGAATAGCAAATCGAAACTCCTCGTGGTCGAG
GATTTATCTGCCAGACAGGTGTATGAGAAGCTTCTTGAGGCCGTTGCACCATAAACTCTG
AGGTCCGTGCATGTTGGTGAAAGACATTAACCGAGAACTCTGCAATCAGTCAATCACCCT
GTAATTGGTTTATTTCAGAGACGAAAGAGTTTTAATATTTTGCTTGGGAAGATATAGACA
AAATTGCTTTCTTATATCTCTGTTTTCATGCTTCCAAACCACTACTTTTTTTATACGATC
CCCCATTATTATAGTCTCTGTATCTAATACATTCAAAAGTGTCGTCTTTTGAACTAGAAT
TTAAAAATCACATCTAC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5231Contig1 720 2 1 U
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CCTAAATCCGTTGGTAAAGGATCAAAGGATCTAACTTTGTGTGGAGTGTTCCGTAAAAGA
ACCTGTTGCTCTCCTGCTCAGACGAACCCTGCTTTCGTAGCTGTCAGAAACTTGGCTACT
TTTGGAGAAGCTAGTCAAGATTGTCTGCATCTGTTCGAGCTGTTGGAGTGTTCGATCTGT
AACCCCAACGTTGGAATTCAACCGGGTCCTCCACGCATTTGCGCTTCCTTCTGTAACAAA
GTCTTCGGAGCTTGCAAAGATGCGTACTTCGCCAGTAATGCACTTACACAGATGATTGGC
CCATGTGGAGTAAACGACATCATCTGCGTTAAAACGTTAAAGTGGGAGTCTAACGGCACA
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TGTTATGGAAGCAAAGCAAGTCTAGAGTCGGTGGTGGAGTCACGGCCGCGGAGAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FL18TF U 1
AF RR4FL18JQ C 20
BS 1 720 RR4FL18TF

RD RR4FL18TF 720 0 0
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CCGATCCTGTTTCTTCATCTCTTGATCTCCTTCTCATCCGGTGCACTGAAACCGGATTCG
AAAGGGGTATGCGTTTCTAAAGGAGGGAGGTTTCCACCATATGAATCAGAAGGAAAGCCT
CCTAAATCCGTTGGTAAAGGATCAAAGGATCTAACTTTGTGTGGAGTGTTCCGTAAAAGA
ACCTGTTGCTCTCCTGCTCAGACGAACCCTGCTTTCGTAGCTGTCAGAAACTTGGCTACT
TTTGGAGAAGCTAGTCAAGATTGTCTGCATCTGTTCGAGCTGTTGGAGTGTTCGATCTGT
AACCCCAACGTTGGAATTCAACCGGGTCCTCCACGCATTTGCGCTTCCTTCTGTAACAAA
GTCTTCGGAGCTTGCAAAGATGCGTACTTCGCCAGTAATGCACTTACACAGATGATTGGC
CCATGTGGAGTAAACGACATCATCTGCGTTAAAACGTTAAAGTGGGAGTCTAACGGCACA
TCGTTCTGCGAAGCAGCTGGTTTCTCTGTTCAAACAAAAGATGATTCTAGAGAAGAACCG
TGTTATGGAAGCAAAGCAAGTCTAGAGTCGGTGGTGGAGTCACGGCCGCGGAGAGTCTCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4FL18JQ 701 0 0
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TGGGAAGATGTTCAACGAAGAAAGTGTTTCTGATCCAGAGTCCGATCCTGTTTCTTCATC
TCTTGATCTCCTTCTCATCCGGTGCACTGAAACCGGATTCGAAAGGGGTATGCGTTTCTA
AAGGAGGGAGGTTTCCACCATATGAATCAGAAGGAAAGCCTCCTAAATCCGTTGGTAAAG
GATCAAAGGATCTAACTTTGTGTGGAGTGTTCCGTAAAAGAACCTGTTGCTCTCCTGTTC
AGACGAACCCTGCTTTCGTAGCTGTCAGAAACTTGGCTACTTTTGGAGAAGCTAGTCAAG
ATTGTCTGCATCTGTTCGAGCTGTTGGAGTGTTCGATCTGTAACCCCAACGTTGGAATTC
AACCGGGTCCTCCACGCATTTGCGCTTCCTTCTGTAACAAAGTCTTCGGAGCTTGCAAAG
ATGCGTACTTCGCCAGTAATGCACTTACACAGATGATTGGCCCATGTGGAGTAAACGACA
TCATCTGCGTTAAAACGTTAAAGTGGGAGTCTAACGGCACATCGTTCTGCGAAGCAGCTG
GTTTCTCTGTTCAAACAAAAGATGATTCTAGAGAAGAACCGTGTTATGGAAGCAAAGCAA
GTCTAGAGTCGGTGGTGGAGTCACGGCCGCGGAGAGTCTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL5232Contig1 520 2 1 U
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GCGTCGTCTCCGTGCGGAGCAGACTCCAGATGAGCTTGATATGGAAGATGGAGATGAGAT
CGATGCAATGCTCCATCAGACCGGTGGTGTTGCAAGTGGAGGCATGTATCTGTTCTGATT
TTAGTTGGTCTTTTATGGTTTTCGATAAGATGTTGTGATATATATTTTAATTGACAGTTT
TCAATAAGACGATGGTGACATTATTATTAGATCCTATGATAACAATACCAATGGAATGGG
CTTTGCTTTATGGATTTTCTATTGATTAAAGTAGTAGCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GA60JQ C 1
AF RR4GA60TF U 1
BS 1 520 RR4GA60TF

RD RR4GA60JQ 520 0 0
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GGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGAACAAGGAGGAGTTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGG
CCAGGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAAGATCAAGAGGAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGAT
GAACGCTTACTGCGACCGTCAATCTGTGGATCTCAACGCAATTGCTTTCTTGTTCGATGG
GCGTCGTCTCCGTGCGGAGCAGACTCCAGATGAGCTTGATATGGAAGATGGAGATGAGAT
CGATGCAATGCTCCATCAGACCGGTGGTGTTGCAAGTGGAGGCATGTATCTGTTCTGATT
TTAGTTGGTCTTTTATGGTTTTCGATAAGATGTTGTGATATATATTTTAATTGACAGTTT
TCAATAAGACGATGGTGACATTATTATTAGATCCTATGATAACAATACCAATGGAATGGG
CTTTGCTTTATGGATTTTCTATTGATTAAAGTAGTAGCTT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4GA60TF 520 0 0
ATCTCTCTCAGGACTTGATCGGAGCGTTTGATCTGATAAAAGGAAGATGTCGGCTACTCA
GGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGAACAAGGAGGAGTTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGG
CCAGGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAAGATCAAGAGGAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGAT
GAACGCTTACTGCGACCGTCAATCTGTGGATCTCAACGCAATTGCTTTCTTGTTCGATGG
GCGTCGTCTCCGTGCGGAGCAGACTCCAGATGAGCTTGATATGGAAGATGGAGATGAGAT
CGATGCAATGCTCCATCAGACCGGTGGTGTTGCAAGTGGAGGCATGTATCTGTTCTGATT
TTAGTTGGTCTTTTATGGTTTTCGATAAGATGTTGTGATATATATTTTAATTGACAGTTT
TCAATAAGACGATGGTGACATTATTATTAGATCCTATGATAACAATACCAATGGAATGGG
CTTTGCTTTATGGATTTTCTATTGATTAAAGTAGTAGCTT

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL5233Contig1 1041 2 10 U
TTTTTTTTCTACCTTCTCTCTAATAAACAGAAACCCTAAGCGCCCCTAAAGAGATCTCCT
TCGCTTCTCCGCCGTCATCTCTGACGGTGTGAGAGGCACTTCGCCTCCACTCCTTTTGCT
CCCCTTTCGTGCTTCATCTGTGGATCGGTGGCCCTCTCAACTTCTCTTAATTTCTTTTTG
TCCGGTGGTGTTGGTGTGGCGACGTTCGAGCAGAGGCGAGGTTCGATGGCTCTCCGGTGG
CTTGAGGACGGCTCTGGTGGTCTCCTCCTCTTCTCTTCTTTTCCTGTCGCATCTGTTTTC
TGGATCTGGTGTTTGATGCTTCGTGTAGCGGTGTTGCGGTGGCCCTGAAGTCGCGCGCGT
GGGACGGTGGCGTGTGGGCTGTGGTGGAAGCTCGCCGGATGTCGTCTCTGAGTCGTCGAT
CTGCTTGGGGACGGTGGATCTGGTACTCCAAGAAGTTTTTCCGGCGTTCTCTCTTCCTCC
GTTGGTCCTCTCTCCCTCGACCTTCGTCTTCACCCGTGTGGAGTAAGTTTGATCTCTTCT
TCTTCTGCCGTGGTCGATTTCTCCGGTATCTAGTATTCAGATCTGGTGTGGTGGTTTGTT
TGGCGGTTCTCTGTGCCGACGCGGCGACTTTTCACACTTCGGTCCCTTCTCATGGTTTCG
GAGTCGAAGAGATGGTCGGTATCACTTCGGTTTTGGGTGGTTTCTTCCTCCCGAAATTTT
CTTGCGGCGGACATCCTTTTCCCCGAAGACGGCGGTGACATGCTTGTTTTAGGGTTAGGG
TTCTCTGGGCCGTTTCTTGCCTATTGGGCCATGCTGTGATTGTTGGGTCTGGTTTGGGGC
TTTAAGATTTAGGTTTGGTTGTTGGGCCATGTATTCAAACCAATTCTGGGATTTTGTAAG
GGTTAAGTTTTTGTGTTTCTAGATTTTGCTGTGTTTTTATTTTTGTATTTTTGTGTTGTA
GTTGTCTTTATTTTTCTGCTACTTGTTTTCATTGTAACTTCTGTCAAAAATTAAAATGGT
ATAAAATTTACCATTCGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS62TF U 1
AF RR4DS62JQ C 177
BS 1 645 RR4DS62TF
BS 646 646 RR4DS62JQ
BS 647 667 RR4DS62TF
BS 668 668 RR4DS62JQ
BS 669 678 RR4DS62TF
BS 679 679 RR4DS62JQ
BS 680 693 RR4DS62TF
BS 694 694 RR4DS62JQ
BS 695 719 RR4DS62TF
BS 720 1041 RR4DS62JQ

RD RR4DS62TF 719 0 0
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CTTGAGGACGGCTCTGGTGGTCTCCTCCTCTTCTCTTCTTTTCCTGTCGCATCTGTTTTC
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GGGACGGTGGCGTGTGGGCTGTGGTGGAAGCTCGCCGGATGTCGTCTCTGAGTCGTCGAT
CTGCTTGGGGACGGTGGATCTGGTACTCCAAGAAGTTTTTCCGGCGTTCTCTCTTCCTCC
GTTGGTCCTCTCTCCCTCGACCTTCGTCTTCACCCGTGTGGAGTAAGTTTGATCTCTTCT
TCTTCTGCCGTGGTCGATTTCTCCGGTATCTAGTATTCAGATCTGGTGTGGTGGTTTGTT
TGGCGGTTCTCTGTGCCGACGCGGCGACTTTTCACACTTCGGTCC*TTCTCATGGTTTCG
GAGTCGA*GAGATGGTCG*TATCACTTCGGTTT*GGGTGGTTTCTTCCTCCCGAAATTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4DS62JQ 865 0 0
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GTGGCTTGAGGACGGCTCTGGTGGTCTCCTCCTCTTCTCTTCTTTTCCTGTCGCATCTGT
TTTCTGGATCTGGTGTTTGATGCTTCGTGTAGCGGTGTTGCGGTGGCCCTGAAGTCGCGC
GCGTGGGACGGTGGCGTGTGGGCTGTGGTGGAAGCTCGCCGGATGTCGTCTCTGAGTCGT
CGATCTGCTTGGGGACGGTGGATCTGGTACTCCAAGAAGTTTTTCCGGCGTTCTCTCTTC
CTCCGTTGGTCCTCTCTCCCTCGACCTTCGTCTTCACCCGTGTGGAGTAAGTTTGATCTC
TTCTTCTTCTGCCGTGGTCGATTTCTCCGGTATCTAGTATTCAGATCTGGTGTGGTGGTT
TGTTTGGCGGTTCTCTGTGCCGACGCGGCGACTTTTCACACTTCGGTCCCTTCTCATGGT
TTCGGAGTCGAAGAGATGGTCGGTATCACTTCGGTTTTGGGTGGTTTCTTCCTCCCGAAA
TTTTCTTGCGGCGGACATCCTTTTCCCCGAAGACGGCGGTGACATGCTTGTTTTAGGGTT
AGGGTTCTCTGGGCCGTTTCTTGCCTATTGGGCCATGCTGTGATTGTTGGGTCTGGTTTG
GGGCTTTAAGATTTAGGTTTGGTTGTTGGGCCATGTATTCAAACCAATTCTGGGATTTTG
TAAGGGTTAAGTTTTTGTGTTTCTAGATTTTGCTGTGTTTTTATTTTTGTATTTTTGTGT
TGTAGTTGTCTTTATTTTTCTGCTACTTGTTTTCATTGTAACTTCTGTCAAAAATTAAAA
TGGTATAAAATTTACCATTCGTACC

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL5234Contig1 549 2 1 U
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TACATACAGAGCTTCACCGATGCTGATGATGCCCTCAAGCTCCACCACGTCGTTCATTGC
TCCCTCGACGTCATCGAAGAGCGAGTGAACAATCCCAAAACCACATTGAACGAGGCTTTT
CTTGGCCTACTCTATCCTACACTCAACTACAAAGTGTATGGTTACTTGACTAATACCAAA
GTGAAATTTATACTTGTCACAACTGATTTGGATGTCAGAGACACCGATGTCAGAAATTTC
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AAGAAGATAACCTCTAGGACCTTTGCTCAAACTGTGAGCAACATTGTCGGATCATACGGT
TTGAACTGACCCCTCGTACTTGCTTTGTGTGCATTGGAGGAACTGCATTTCTTTTTATCA
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TGGATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D695TF U 1
AF RR4D695JQ C 29
BS 1 549 RR4D695TF

RD RR4D695TF 549 0 0
GGAGGGAGAAGAAAGATGATCGTTTGCGTCTCCGTCGTCGGCCACCAGAACAATCCGCTT
TACATACAGAGCTTCACCGATGCTGATGATGCCCTCAAGCTCCACCACGTCGTTCATTGC
TCCCTCGACGTCATCGAAGAGCGAGTGAACAATCCCAAAACCACATTGAACGAGGCTTTT
CTTGGCCTACTCTATCCTACACTCAACTACAAAGTGTATGGTTACTTGACTAATACCAAA
GTGAAATTTATACTTGTCACAACTGATTTGGATGTCAGAGACACCGATGTCAGAAATTTC
TTCAGGAAGTTCCATGCTGCCTATGTAGATGCAGTCTCAAACCCATTCCATGTCCCTGGC
AAGAAGATAACCTCTAGGACCTTTGCTCAAACTGTGAGCAACATTGTCGGATCATACGGT
TTGAACTGACCCCTCGTACTTGCTTTGTGTGCATTGGAGGAACTGCATTTCTTTTTATCA
TTTCTCTTGTTGATATCAACGCTTGGATTGTTGTAAGAAGAATTATTGGGTTCACATGAA
TGGATATTT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4D695JQ 521 0 0
TCTCCGTCGTCGGCCACCAGAACAATCCGCTTTACATACAGAGCTTCACCGATGCTGATG
ATGCCCTCAAGCTCCACCACGTCGTTCATTGCTCCCTCGACGTCATCGAAGAGCGAGTGA
ACAATCCCAAAACCACATTGAACGAGGCTTTTCTTGGCCTACTCTATCCTACACTCAACT
ACAAAGTGTATGGTTACTTGACTAATACCAAAGTGAAATTTATACTTGTCACAACTGATT
TGGATGTCAGAGACACCGATGTCAGAAATTTCTTCAGGAAGTTCCATGCTGCCTATGTAG
ATGCAGTCTCAAACCCATTCCATGTCCCTGGCAAGAAGATAACCTCTAGGACCTTTGCTC
AAACTGTGAGCAACATTGTCGGATCATACGGTTTGAACTGACCCCTCGTACTTGCTTTGT
GTGCATTGGAGGAACTGCATTTCTTTTTATCATTTCTCTTGTTGATATCAACGCTTGGAT
TGTTGTAAGAAGAATTATTGGGTTCACATGAATGGATATTT

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL5235Contig1 1006 2 10 U
GGGTCACAAAAATGGAGAAACTCCTCTCTCCTCTCTTGAGAGTTGAGAGAGAGTTTTCTC
TCGAAACCTTCCTTGTTATCAAACCTATATCTTTCACAAGGGAGGATTCGATTTTGTTTG
ATTGTATAATACTGTCGATCTCTTGATCGATCTTCTCCTTCGCTTTGGCGATTTTCTTTT
TCGGATTAGCCGATTTTGTTTTCGCTTTGGCGATGAATAAACTTTCGTTAGGCGATTTTG
AAGTGTTTCAATCTTAACCAGAGCAGTGTTTCATTCCTATTTTCTCTCTGGTTTTGATTG
AGTTTGAATAAAGTGCTGATCTTTAATTGATCGGGCTTCAAGTTCACCTCTTTCGCATCA
GTCGTTTTCATATCCCGTTAGCTTGAGCTTGGCTCTCTTTCTTCATCAGTTACGCTCTTT
CCTTTTCCGACTGGAATCAGTCTTTACTCTTCCCTGAAGTAGAGCCGTTAGATGGTTCTG
GAGTAAAGCATCTATGGTGGAAAAGAAGATTGAGATGATAGAATTATCTTGGTTGATTTA
TGGGAGATACAGTAGAATTGGCATCTTATTGATGGTCCAGTAAAGTGTCTCAGAAATAAA
CAATCCAAGTTCTGGTTTTAATATCTGATGGTGTTTAGAGGCTAAATCTTAAGCAACGGT
TTTCAGCGGAAGAATGGAGGAGCTAAGGAGTACAGTTTCCATATCAGTGAATGGCGAAGA
AAATTCGAGAGAATCGATTTGGTAAAAGACGGCGGCGATGTTCGACGGCGAAGCATATCA
GAGGCGGAGGAGTTCTACTTCTGCATGATGAACGCGTGGCTATACACGTGTCCCACTGCT
GTCTTTTTGTTGCTTGGATGAAGATTGAAGAACACGTGTTTCTGAAAATCCGAGTCTGAT
CATTATCTCGATTAAGTTTTAAATTATTCTGTTGTTGGGCCTCACTAATATGTTTCTGTA
CCCATGTAATTAGCCCTCTGGGTCTTAATGAAAACCATGTTGACAG


BQ
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AF RR4GT07TF U 1
AF RR4GT07JQ C 232
BS 1 687 RR4GT07TF
BS 688 688 RR4GT07JQ
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BS 748 767 RR4GT07TF
BS 768 1006 RR4GT07JQ

RD RR4GT07TF 776 0 0
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TCGGATTAGCCGATTTTGTTTTCGCTTTGGCGATGAATAAACTTTCGTTAGGCGATTTTG
AAGTGTTTCAATCTTAACCAGAGCAGTGTTTCATTCCTATTTTCTCTCTGGTTTTGATTG
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CAATCCAAGTTCTGGTTTTAATATCTGATGGTGTTTAGAGGCTAAATCTTAAGCAACGGT
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CGAGCATAT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4GT07JQ 775 0 0
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ACGCTCTTTCCTTTTCCGACTGGAATCAGTCTTTACTCTTCCCTGAAGTAGAGCCGTTAG
ATGGTTCTGGAGTAAAGCATCTATGGTGGAAAAGAAGATTGAGATGATAGAATTATCTTG
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AGAAATAAACAATCCAAGTTCTGGTTTTAATATCTGATGGTGTTTAGAGGCTAAATCTTA
AGCAACGGTTTTCAGCGGAAGAATGGAGGAGCTAAGGAGTACAGTTTCCATATCAGTGAA
TGGCGAAGAAAATTCGAGAGAATCGATTTGGTAAAAGACGGCGGCGATGTTCGACGGCGA
AGCATATCAGAGGCGGAGGAGTTCTACTTCTGCATGATGAACGCGTGGCTATACACGTGT
CCCACTGCTGTCTTTTTGTTGCTTGGATGAAGATTGAAGAACACGTGTTTCTGAAAATCC
GAGTCTGATCATTATCTCGATTAAGTTTTAAATTATTCTGTTGTTGGGCCTCACTAATAT
GTTTCTGTACCCATGTAATTAGCCCTCTGGGTCTTAATGAAAACCATGTTGACAG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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GTACTATTTTTTCATAATAGGTGGCGTTCAAGCCGTGAATCTGCTCTATTTTAGGTTTTT
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AF RR4FW52JQ C 1
AF RR4FW52TF U 1
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ATAGTACTCTTTATTTGTTGTTTT

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DS 

RD RR4FW52TF 504 0 0
GGAGTTTCTGACGGTTAAGATGCCTGAGCATATGAGAGCTGTCGCGGGAGCGATCTTCTT
CTTGAGCTCGTCGATTGCGAGTTATATATGCACACTTCTTATTATTGTGATTGATAGCGT
GACACGCAAGGAAGGGCGCTCGTGGTTAGGAGATAAAGACTTTAACAAGAACAGACTTGA
GTACTATTTTTTCATAATAGGTGGCGTTCAAGCCGTGAATCTGCTCTATTTTAGGTTTTT
TGCTTCCAGGTTTATCACTGAGAACAACGAGGATAATGAGATTTTTAGTTAAGTGGTTGA
GATCACCTTTTCATCTTTGTTTTACTGGTTAAAGCCATAGAGGTTACGTTTCTTTTTTTT
CCATAATCTATTTCTTGTGTACTGTGGTTTATTTCCATTTTTAGTAGTATTATCACCCCG
TGTGCTAAGCACAGGTCTATTTCTGCTTAATTGTATTTAAATTCTTACAAAAATAAAACT
ATAGTACTCTTTATTTGTTGTTTT

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5237Contig1 756 2 2 U
GGTTCGATTTACGTGGTACGTTAATTTCATAGCATAAAACTATAGTCTGAAAGAAGATCC
TAACATTGCTAGTAGTACAACATAAAGGAAACAGAGTAGCAGAAGAGTGAACTTAAGACA
AAGGGACTTGGCCCATTTAGTCATACAAGGTTTCCATTTCGATTCAGAAATTGGAGAAGT
TGTTCCGTGATGACTGAACCATCTGCAAGTCCGTCGTCGTTTGGCAAGATGTCTCATCAC
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AATACTCCCCAATGACTAGAAAACAACGTGCAGCTTGACGAACGGTCAAAATCCGACGCA
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TGCGACACAAGTATCTTGATGAGGTCAGATGGACGGAATCCGGCCATCCAGATAAAACAG
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ACAGCTTTTAAACGTAACACCTCATCAAAGTGAGCG


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AF RR4DD68JQ U 1
AF RR4FP47JQ U 49
BS 1 572 RR4DD68JQ
BS 573 756 RR4FP47JQ

RD RR4DD68JQ 572 0 0
GGTTCGATTTACGTGGTACGTTAATTTCATAGCATAAAACTATAGTCTGAAAGAAGATCC
TAACATTGCTAGTAGTACAACATAAAGGAAACAGAGTAGCAGAAGAGTGAACTTAAGACA
AAGGGACTTGGCCCATTTAGTCATACAAGGTTTCCATTTCGATTCAGAAATTGGAGAAGT
TGTTCCGTGATGACTGAACCATCTGCAAGTCCGTCGTCGTTTGGCAAGATGTCTCATCAC
TTATCAGCGTCTCTCGTGGTCGAGACAACCAAAGAGAGCTAAGAGCTCTGAGCCGTCCGT
AATACTCCCCAATGACTAGAAAACAACGTGCAGCTTGACGAACGGTCAAAATCCGACGCA
GCTGGTGAACAGTCTGCTACCTCAGGTTATCAGCCTGGCGGATAAAGCCTTCGAGATTAG
AGATTTTGCCGAGAGCGACAGCCATTTGTTGCATACCGTCCATGACGGGAGAGGCAGCTA
GAGTATCGATGAGAGATTGCTGAAGTTGTTCGAGTCCTTGCGAGAGAGCCTCCTCCGCTT
GTTGCGATGAGTGTTGTAGGCTATATATCCCC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4FP47JQ 708 0 0
GAAAGAAGATCCTAACATTGCTAGTAGTACAACATAAAGGAAACAGAGTAGCAGAAGAGT
GAACTTAAGACAAAGGGACTTGGCCCATTTAGTCATACAAGGTTTCCATTTCGATTCAGA
AATTGGAGAAGTTGTTCCGTGATGACTGAACCATCTGCAAGTCCGTCGTCGTTTGGCAAG
ATGTCTCATCACTTATCAGCGTCTCTCGTGGTCGAGACAACCAAAGAGAGCTAAGAGCTC
TGAGCCGTCCGTAATACTCCCCAATGACTAGAAAACAACGTGCAGCTTGACGAACGGTCA
AAATCCGACGCAGCTGGTGAACAGTCTGCTGCCTCAGGTTATCAGCCTGGCGGATAAAGC
CTTCGAGATTAGAGATTTTGCCGAGAGCGACAGCCATTTGTTGCATACCGTCCATGACGG
GAGAGGCAGCTAGAGTATCGATGAGAGATTGCTGAAGTTGTTCGAGTCCTTGCGAGAGAG
CCTCCTCCGCTTGTTGCGATGAGTGTTGTAGGCTATATATCCCCATCAGTTGTTGCTCCC
AATAGATCCATTTGCGACACAAGTATCTTGATGAGGTCAGATGGACGGAATCCGGCCATC
CAGATAAAACAGCGTTCGGCAGGGGACATCCATGTACCGATGATGAGGTGGAAAACGTCT
GCTTTCGCGGCCACAGCTTTTAAACGTAACACCTCATCAAAGTGAGCG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5238Contig1 1050 2 2 U
TAGAGTTGCTTGTCGTCTTACTACTCACGACTCTCTTCTACCTTTTCTTTTTTTCCTATT
CCCGTCGGTTGAAATCAAACAAAAAAAAGGAAAAAAAGTTGAAGAAGAGCAATCAATCAA
TCAATCAATCGTCTTCTTCGTCTCGATTATACCTAATGGAAATCGAGGTCTCGAGCTCGA
GGACTCACGATACCGTCGATTTGGATAGCATTCGTGTAAAGCGGAAGACGTTGCAGAATC
TGCTCGACGATTGCCAGAGAGCTCTCGAGCTGCTCAATCCCGCCGATACTGCTTCTCCCG
CCGGCGGAGATAAAACCGAAACCGTTGGCTCATCGTCGGAGAGGGAGGAAGAAGAAGAGG
AGGAGCTTCCTTCTTCCGATTCAGGAGATCCCGAAGCCGATAAATTCTATGATCTCATCA
AGTCCAGAGTTGAATGTCATGGCTTTCGGGAGAAGATTGAGCTAGCTCAAGTTTCGCTTC
TCCAAGATCTTGCTGAAGAAGGTAGCTCTTGGGATGTAGTTAGTAAAGATGATTTATGGG
GCGAGGGGAGTTTGGGTCAAACGGAAGATGATGATTATGTTCTTGTTAGGGAAGAGGATA
TAGCTGACGGTATCGCTTGTTTCATGGCTACTTATTTATCTTCCCTTAAGCAGACTAAGG
ATATATCTCCTGATCAGCTTCAGAAAGCACTTAGCACGATGTTTTCAGTGAAGAAGAGAA
AGGGGAAGCTTCGTAAAGCATGGGAAGGAAGTAAAGTTATTTACAACGTTGCATCTTGGA
GCGCAACTGCTATAGGCATATATCAGAACCCGATGATCCTGAGTATTGCATCCAAGGCCT
TCTGGGTGTCTTGCAAGGCCATATCAAAGCTTGTCTGAATTGAAAGATACATCTGACTCA
CATGTTGCTCATAAGTTACAACACAGCCTCGAGACTCAGCAATGTTTCATATATCATTTA
ATTTATATCTGTACATAATGCCATTTGTTAGATCTTTCTTCCCTGGTGATGTTATTACTC
AACATGCAATGTTAAAAGATCAGTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D950TF U 1
AF RR4D950JQ C 170
BS 1 655 RR4D950TF
BS 656 1050 RR4D950JQ

RD RR4D950TF 655 0 0
TAGAGTTGCTTGTCGTCTTACTACTCACGACTCTCTTCTACCTTTTCTTTTTTTCCTATT
CCCGTCGGTTGAAATCAAACAAAAAAAAGGAAAAAAAGTTGAAGAAGAGCAATCAATCAA
TCAATCAATCGTCTTCTTCGTCTCGATTATACCTAATGGAAATCGAGGTCTCGAGCTCGA
GGACTCACGATACCGTCGATTTGGATAGCATTCGTGTAAAGCGGAAGACGTTGCAGAATC
TGCTCGACGATTGCCAGAGAGCTCTCGAGCTGCTCAATCCCGCCGATACTGCTTCTCCCG
CCGGCGGAGATAAAACCGAAACCGTTGGCTCATCGTCGGAGAGGGAGGAAGAAGAAGAGG
AGGAGCTTCCTTCTTCCGATTCAGGAGATCCCGAAGCCGATAAATTCTATGATCTCATCA
AGTCCAGAGTTGAATGTCATGGCTTTCGGGAGAAGATTGAGCTAGCTCAAGTTTCGCTTC
TCCAAGATCTTGCTGAAGAAGGTAGCTCTTGGGATGTAGTTAGTAAAGATGATTTATGGG
GCGAGGGGAGTTTGGGTCAAACGGAAGATGATGATTATGTTCTTGTTAGGGAAGAGGATA
TAGCTGACGGTATCGCTTGTTTCATGGCTACTTATTTATCTTCCCTTAAGCAGAC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4D950JQ 881 0 0
CTCGAGCTCGAGGACTCACGATACCGTCGATTTGGATAGCATTCGTGTAAAGCGGAAGAC
GTTGCAGAATCTGCTCGACGAT*GCCAGAGAGCTCTCGAGCTGCTCAATCCCGCCGATAC
TGCTTCTCCCGCCGGCGGAGATAAAACCGAAACCGTTGGCTCATCGTCGGAGAGGGAGGA
AGAAGAAGAGGAGGAGCTTCCTTCTTCCGATTCAGGAGATCCCGAAGCCGATAAATTCTA
TGATCTCATCAAGTCCAGAGTTGAATGTCATGGCTTTCGGGAGAAGATTGAGCTAGCTCA
AGTTTCGCTTCTCCAAGATCTTGCTGAAGAAGGTAGCTCTTGGGATGTAGTTAGTAAAGA
TGATTTATGGGGCGAGGGGAGTTTGGGTCAAACGGAAGATGATGATTATGTTCTTGTTAG
GGAAGAGGATATAGCTGACGGTATCGCTTGTTTCATGGCTACTTATTTATCTTCCCTTAA
GCAGACTAAGGATATATCTCCTGATCAGCTTCAGAAAGCACTTAGCACGATGTTTTCAGT
GAAGAAGAGAAAGGGGAAGCTTCGTAAAGCATGGGAAGGAAGTAAAGTTATTTACAACGT
TGCATCTTGGAGCGCAACTGCTATAGGCATATATCAGAACCCGATGATCCTGAGTATTGC
ATCCAAGGCCTTCTGGGTGTCTTGCAAGGCCATATCAAAGCTTGTCTGAATTGAAAGATA
CATCTGACTCACATGTTGCTCATAAGTTACAACACAGCCTCGAGACTCAGCAATGTTTCA
TATATCATTTAATTTATATCTGTACATAATGCCATTTGTTAGATCTTTCTTCCCTGGTGA
TGTTATTACTCAACATGCAATGTTAAAAGATCAGTTTGAGC

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 2

CO CL5239Contig1 614 2 3 U
AGGGAGTATAATAGTATTTACTTATCCGTGTTTCCCAAAAACCGGTTAGTTTCAGCTCAA
TTTGGTTTTGGTTTAATTTAGTTTTCCAGGACGTTGCTTGAGATACAGTTTGTCTACTTC
GAGATTTATTACAACATTACACATCAGAAAGTACAACAAACGGAAAGAGAGAAGAGAGAT
AGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAG
TCTCTTCTAGCACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCCTCAGCTGCTGGGCTGTGCTCAGTTG
TGGAAGGGCCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAATATTTATCAGACTCTGGCT
TTATGACATCATCAGGAACTGCACTTGCCTGCAATTCGTCCTCCACGTTCTTGTCATACC
CCGAGGAGTAACTTCTTGAAGTGATGGGAGCAGACGCGGTGGCGCGTGGGACGACGGCGT
CAACGAGGTGCTTCCTAAAGCCGGTGATTAATTGAAAGCTCTTTGATCTGGTTGCCATAC
AACTCAGTTTTTCCAAATCTTAGATGAGAACTTGTCCCTTTTGTGTGTGTCTGTGATAGT
TAGTATGATGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL36JQ U 41
AF RR4BL36TF C 1
BS 1 40 RR4BL36TF
BS 41 560 RR4BL36JQ
BS 561 614 RR4BL36TF

RD RR4BL36JQ 520 0 0
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CGGAAAGAGAGAAGAGAGATAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACT
TGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCTTCTAGCACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCCTCAGC
TGCTGGGCTGTGCTCAGTTGTGGAAGGGCCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCA
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GGCGCGTGGGACGACGGCGTCAACGAGGTGCTTCCTAAAGCCGGTGATTAATTGAAAGCT
CTTTGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTTTCCAAATCT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4BL36TF 614 0 0
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GAGATTTATTACAACATTACACATCAGAAAGTACAACAAACGGAAAGAGAGAAGAGAGAT
AGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAG
TCTCTTCTAGCACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCCTCAGCTGCTGGGCTGTGCTCAGTTG
TGGAAGGGCCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAATATTTATCAGACTCTGGCT
TTATGACATCATCAGGAACTGCACTTGCCTGCAATTCGTCCTCCACGTTCTTGTCATACC
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CAACGAGGTGCTTCCTAAAGCCGGTGATTAATTGAAAGCTCTTTGATCTGGTTGCCATAC
AACTCAGTTTTTCCAAATCTTAGATGAGAACTTGTCCCTTTTGTGTGTGTCTGTGATAGT
TAGTATGATGACCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL5240Contig1 779 2 2 U
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ACCGATACCTAAAGTTCTCGTAAGTTGATTGATTGGTGCTGATGAGGTACAAGTGGAAAC
CGGTAAGGCCACCAACGAACCAGACACAGATGAAAGTATAGATTATCAGCGCGATGGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G687JQ U 1
AF RR4GQ37JQ U 1
BS 1 723 RR4G687JQ
BS 724 779 RR4GQ37JQ

RD RR4G687JQ 723 0 0
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TAGTGTAAACCGGAGACTATAACCGTCCTATACCAGTTCCGGTTCTGCTTCTAACTGTTG
CTGCTGCATCAGATATCTCAACCAGTAAATCTCTGGAAGCATCATTCCCTGAAGAAGACT
CATCATCTCTGGTTCTCAAATCTTCGTTGTTAACACGGCCTGACAACTCCCAGCTACCTC
CTCTCCTTCCCCTGCTAGACTCTCTCGAATGCATAATCCCTCGTCCTTCGGTCTCTTCAG
GTGGAAGCATCCTGCTCAAATCCCTCGATGTAACCGATGCTCCCATCTCCTTGTCCATGA
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TCACCGGCTCCTTTGGTACCTTTGCCCTGAAACTGTTCTTAGATGAAGCAACGCTCGTGC
AGAACACTTGCATGAAGTTACCAATTATCCCTTTGTTGAAAGGGTTCTCGTGTCTATCGT
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CGG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4GQ37JQ 779 0 0
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GTAAACAAACAAACTTGAATGAATCACAATCTTGTTTGATCTTCTTCAACCTTTTTAAAA
TAGTGTAAACCGGAGACTATAACCGTCCTATACCAGTTCCGGTTCTGCTTCTAACTGTTG
CTGCTGCATCAGATATCTCAACCAGTAAATCTCTGGAAGCATCATTCCCTGAAGAAGACT
CATCATCTCTGGTTCTCAAATCTTCGTTGTTAACACGGCCTGACAACTCCCAGCTACCTC
CTCTCCTTCCCCTGCTAGACTCTCTCGAATGCATAATCCCTCGTCCTTCGGTCTCTTCAG
GTGGAAGCATCCTGCTCAAATCCCTCGATGTAACCGATGCTCCCATCTCCTTGTCCATGA
TGTCACCGAGCTCTTCATCTACCGTCTCGTGCCACACCGGTTTTCTCCCCATCTCTATGT
CCTGTGAAACTTTCTGCAAGCTCGGGCTTGACATGGCTCCGTTTACTATCCTCGGCGGGA
TCACCGGCTCCTTTGGTACCTTTGCCCTGAAACTGTTCTTAGATGAAGCAACGCTCGTGC
AGAACACTTGCATGAAGTTACCAATTATCCCTTTGTTGAAAGGGTTCTCGTGTCTATCGT
ACCGATACCTAAAGTTCTCGTAAGTTGATTGATTGGTGCTGATGAGGTACAAGTGGAAAC
CGGTAAGGCCACCAACGAACCAGACACAGATGAAAGTATAGATTATCAGCGCGATGGAG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL5241Contig1 522 2 1 U
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TGTTGGGGCTGACCATGCGGTCTTTGAGCAAGGGGCATCAGCAGGAAACGTGGGGAAAGA
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GTGTCTGGTTTTGTACCTTAAGAGTTTTTACATTCTTTAGACGTAACTCGTCGAAACTCT
CGAATCATATTTTTCTATTCCAAATAATTCATGTTACTACGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GZ36JQ C 1
AF RR4GZ36TF U 1
BS 1 522 RR4GZ36TF

RD RR4GZ36JQ 522 0 0
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GGTCGATGCCGTCATCGCTAATCTCGAGTGACCTTTAAAAAAAGTTACTTGTTCCCTCCA
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GTGTCTGGTTTTGTACCTTAAGAGTTTTTACATTCTTTAGACGTAACTCGTCGAAACTCT
CGAATCATATTTTTCTATTCCAAATAATTCATGTTACTACGT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4GZ36TF 522 0 0
GTTAGTTGCAAACACTGCTGCTGGTATTGCTGGAGGCACCGGAGTCATGCCTGGAGGAAA
TGTTGGGGCTGACCATGCGGTCTTTGAGCAAGGGGCATCAGCAGGAAACGTGGGGAAAGA
CAAGATAGTAAGAGAAAACAAAGCAAATCCAGTGGCGTTGCTTCTCTCGTCAGCCATGAT
GCTGAGACACCTTCAGTTTCCTTCATTTGCTGACCGGCTCGAAACAGCGGTGAAAAGAGT
CATCTCTGAAGGAAAGTGCAGGACTAAAGATCTTGGTGGACAGAGCACTACTCAAGAGGT
GGTCGATGCCGTCATCGCTAATCTCGAGTGACCTTTAAAAAAAGTTACTTGTTCCCTCCA
TCCCTCTCTGCAAAATTCATCAAAAGTTCCTTGGTGCTACTGTTGCCAAAAAGTATATGG
GTGTCTGGTTTTGTACCTTAAGAGTTTTTACATTCTTTAGACGTAACTCGTCGAAACTCT
CGAATCATATTTTTCTATTCCAAATAATTCATGTTACTACGT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL5242Contig1 543 2 2 U
TTTCTTTATCTCAATGAAAATATTAAATTTATATATTTTGTTTCCATTACAAATTCACAA
CATATACAAAAATAAAATGAAAAATTAACAATGTTTTTATGTTTCAAATTCAAACCAAGT
AACTGCCGGCTTCTTACGGCATCACTTGTCAGCCAACGACCACCAGCAAACTCTGTCGGA
CGGCAGGGATAGAACACAGTAACGATCCGAAAATTCCAGTGAGAGCATAAGCAATTGCAC
AAAAGGGAAGGGCCTCTGGCTCCTTAGCCGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCAC
TTGAAGCAGTGGCGATTCCTCGAGCAATAGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGA
CTTGCACAAAGTTAGCTCCAATAAGACCAGTCACAACCACTACAGCTGCTGTAAGCGACG
AATTGGTCCCTTCAAAGAGTGATACAATGCTAAGGGCTAACGCGACCGTGATGCAGCGAG
GTAGGATTGAAACAGTTAAAGATGGTTCCAGACCAACTAAACGTCCAACAAGAGCAGTGG
AGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RR4FJ77TF C 1
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CGGCAGGGATAGAACACAGTAACGATCCGAAGATTCCAGTGAGAGCATAAGCAATTGCAC
AGAAGGGAAGGGCCTCTGGCTCCTTAGCCGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCAC
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CTTGCACAAAGTTAGCTCCAATAAGACCAGTCACAACCACTACAGCTGCTGTAAGCGACG
AATTGGTCCCTTCAAAGAGTGATACAATGCTAAGGGCTAACGCGACCGTGATGCAGCGAG
GTAGGATTGAAACAGTTAAAGATGGTTCCAGACCAACTAAACGTCCAACAAGAGCAGTGG
AGC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4FJ77JQ 536 0 0
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AAAAATAAAATGAAAAATTAACAATGTTTTTATGTTTCAAATTCAAACCAAGTAACTGCC
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GATAGAACACAGTAACGATCCGAAAATTCCAGTGAGAGCATAAGCAATTGCACAAAAGGG
AAGGGCCTCTGGCTCCTTAGCCGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCACTTGAAGC
AGTGGCGATTCCTCGAGCAATAGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGACTTGCAC
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CCCTTCAAAGAGTGATACAATGCTAAGGGCTAACGCGACCGTGATGCAGCGAGGTAGGAT
TGAAACAGTTAAAGATGGTTCCAGACCAACTAAACGTCCAACAAGAGCAGTGGAGC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

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GTTGTAATGGAAGGTTTAGTTGATCCTTGATGGGTTTAAAGATAGCCAACTCTTGTGTTG
TCTGATGGCTCATTCATTGTGTAGTTTTATGTACAAACCAACTTTATATTGTTACAGCTT
TTGGATAAACATGTTGTAATGAACGGTTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FO30TF U 1
AF RR4FO30JQ C 50
BS 1 573 RR4FO30TF

RD RR4FO30TF 573 0 0
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TACGCCATGTCTTCCCACCAACCTGAGATGTTTAGCTCAGATTCGTCCGAGTATAGAGCG
CTGAGGCGCAGCTATTTGCTGCTGGAGGAAGAGAGCTTCGCGTTGGAGAGAGAGTTGAAG
GAAATGGAAGGCGAGGTTAAAGCACTCGAAGATGAGAAAGTTGAGCTTTTGGACAAGCTT
GTTGTAATGGAAGGTTTAGTTGATCCTTGATGGGTTTAAAGATAGCCAACTCTTGTGTTG
TCTGATGGCTCATTCATTGTGTAGTTTTATGTACAAACCAACTTTATATTGTTACAGCTT
TTGGATAAACATGTTGTAATGAACGGTTTAGCT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4FO30JQ 524 0 0
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CGGACCAACTTTACGCCATGTCTTCCCACCAACCTGAGATGTTTAGCTCAGATTCGTCCG
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GAGAGTTGAAGGAAATGGAAGGCGAGGTTAAAGCACTCGAAGATGAGAAAGTTGAGCTTT
TGGACAAGCTTGTTGTAATGGAAGGTTTAGTTGATCCTTGATGGGTTTAAAGATAGCCAA
CTCTTGTGTTGTCTGATGGCTCATTCATTGTGTAGTTTTATGTACAAACCAACTTTATAT
TGTTACAGCTTTTGGATAAACATGTTGTAATGAACGGTTTAGCT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

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TTCTTTTATGAAAAATCCATAGCTCTGTTCTTAATGTTCGTGTGTTTTATATGGTTTTGA
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TAAACTTTTGATTTTTCTTTTATCATTCGATTTTATTTAAATAATTTTACCCTTACAGAA
ACATTAGTAGTTTTAAGTTATAAATTTTGTACTGTGTTTAAAAAAATATCTGAGATGCTC
TTCTTCTACCACTTATAAAATTCAGACTGGTCAGAAATGGCATGTGAAATTAGATATTAA
TTTATACATTTTTGGGCACTAAGGGTGTTTGAAGTTTATATGTCGTTTATAGTTTGGAAA
GTGACTAGTCAATTAGAAGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GM91TF U 1
AF RR4GM91JQ C 116
BS 1 639 RR4GM91TF
BS 640 803 RR4GM91JQ

RD RR4GM91TF 639 0 0
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TTCTCCGGCGACTGTGTCTTCTCATATAAGCAACTACGATTTCAGATACTCCCTCATCGA
TGTTCCACTCATCTCCATCATTAGATCTGTCATAATACTCTGTAAGTAAACCCCACAAGC
TTCTTTTATGAAAAATCCATAGCTCTGTTCTTAATGTTCGTGTGTTTTATATGGTTTTGA
TGGCAGGCGTTTACGGGCTCTGCGACGGACCGAAGCTATCAAAGGGACCATATCTGACAA
TAACTACGATCTGCTCGATTTTGTCATTGTTCTACGTGTCTTTTAAGGCAGCTGTTGTGT
TTGCCGAGCCAGTGATCAGAGACGGCGGAGGCGGAGGAAGGCTCAGAATAGAGGAAGCGG
CTCTGTTGTGTGTTCGTGGGTCTTAGCCATCGGTCATATCGTTGTGGCCTATAGAACGAG
TTGTAGAGAGAGAAGAAAGCTTTTAGGCTTCAAGATCGACATCGAATCCGTATGTTTCTT
TAAACTTTTGATTTTTCTTTTATCATTCGATTTTATTTAAATAATTTTACCCTTACAGAA
ACATTAGTAGTTTTAAGTTATAAATTTTGTACTGTGTTT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4GM91JQ 688 0 0
ATCGATGTTCCACTCATCTCCATCATTAGATCTGTCATAATACTCTGTAAGTAAACCCCA
CAAGCTTCTTTTATGAAAAATCCATAGCTCTGTTCTTAATGTTCGTGTGTTTTATATGGT
TTTGATGGCAGGCGTTTACGGGCTCTGCGACGGACCGAAGCTATCAAAGGGACCATATCT
GACAATAACTACGATCTGCTCGATTTTGTCATTGTTCTACGTGTCTTTTAAGGCAGCTGT
TGTGTTTGCCGAGCCAGTGATCAGAGACGGCGGAGGCGGAGGAAGGCTCAGAATAGAGGA
AGCGGCTCTGTTGTGTGTTCGTGGGTCTTAGCCATCGGTCATATCGTTGTGGCCTATAGA
ACGAGTTGTAGAGAGAGAAGAAAGCTTTTAGGCTTCAAGATCGACATCGAATCCGTATGT
TTCTTTAAACTTTTGATTTTTCTTTTATCATTCGATTTTATTTAAATAATTTTACCCTTA
CAGAAACATTAGTAGTTTTAAGTTATAAATTTTGTACTGTGTTTAAAAAAATATCTGAGA
TGCTCTTCTTCTACCACTTATAAAATTCAGACTGGTCAGAAATGGCATGTGAAATTAGAT
ATTAATTTATACATTTTTGGGCACTAAGGGTGTTTGAAGTTTATATGTCGTTTATAGTTT
GGAAAGTGACTAGTCAATTAGAAGGTTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5246Contig1 714 2 2 U
TGATTTCCATTGATTCAAACATAACTTACACATGAGATGATTCTAAGCTAGCGAGTTACA
AACCCCTAGAGACTAAGCCAGCAGGAGACATACTCTTCCTCTGGAGACAAAGGCCAGCAG
AATATATAAAATTCTCAGGAAACAAACATAAGCACATAGAACAGAGGTTACCAAAGAGAA
CAACACAAATTCTAGATCCATATGAACAAAAAGCCCAAATAGACAAATCCAACGAAGCAA
GAAGGCAGAAATAAGCGCACACCCTTGGACGAACTTATTAGGGAAGAACCTGCATCTCAA
TATACTGCTCCGCAAACAACCTGACGAGCCCTGAGATACCACAGCGAACTATATCCCGGA
GGATGAAGACCCGACTTTTAACTTACATACCTCCACGTCACGGTGCAGAAAGAGCCGAAG
CCCCCAAGTCCTTGAAAACGAGCCGGATGTTCTTTCAACCCGACCACAAAGCAACCCGTC
GCAACGGAGACAAGGAACAAGCACAACCTTCAACCTTCGCTAGATCTGAAACTATAAGCA
ACCAATACGCACCTGCAGCTTTAAGAGGCAGGAGAAGGAGCCTGAGAGGGAAGAGATACA
CCAAATCAGAAACGAGAAACCGCTTCCAGAATAGCCACCACCGAGAACAAACTCCACGCC
AGATTTAAAAAAACAGATCTAGATCTAGATTTTAGTTAGATCTACTTTGAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H176TF C 1
AF RR4H176JQ U 10
BS 1 9 RR4H176TF
BS 10 714 RR4H176JQ

RD RR4H176TF 714 0 0
TGATTTCCATTGATTCAAACATAACTTACACATGAGATGAT*CTAAGCTAGCGAGTTACA
AACCC*TAGAGACTAAGCCAGCAGGAGACATACTCTTCCTCTGGAGACAAAGGCCAGCAG
AATATATAAAATTCTCAGGAAACAAACATAAGCACATAGAACAGAGGTTACCAAAGAGAA
CAACACAAATTCTAGATCCATATGAACAAAAAGCCCAAATAGACAAATCCAACGAAGCAA
GAAGGCAGAAATAAGCGCACACCCTTGGACGAACTTATTAGGGAAGAACCTGCATCTCAA
TATACTGCTCCGCAAACAACCTGACGAGCCCTGAGATACCACAGCGAACTATATCCCGGA
GGATGAAGACCCGACTTTTAACTTACATACCTCCACGTCACGGTGCAGAAAGAGCCGAAG
CCCCCAAGTCCTTGAAAACGAGCCGGATGTTCTTTCAACCCGACCACAAAGCAACCCGTC
GCAACGGAGACAAGGAACAAGCACAACCTTCAACCTTCGCTAGATCTGAAACTATAAGCA
ACCAATACGCACCTGCAGCTTTAAGAGGCAGGAGAAGGAGCCTGAGAGGGAAGAGATACA
CCAAATCAGAAACGAGAAACCGCTTCCAGAATAGCCACCACCGAGAACAAACTCCACGCC
AGATTTAAAAAAACAGATCTAGATCTAGATTTTAGTTAGATCTACTTTGAACTC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4H176JQ 705 0 0
TTGATTCAAACATAACTTACACATGAGATGATTCTAAGCTAGCGAGTTACAAACCCCTAG
AGACTAAGCCAGCAGGAGACATACTCTTCCTCTGGAGACAAAGGCCAGCAGAATATATAA
AATTCTCAGGAAACAAACATAAGCACATAGAACAGAGGTTACCAAAGAGAACAACACAAA
TTCTAGATCCATATGAACAAAAAGCCCAAATAGACAAATCCAACGAAGCAAGAAGGCAGA
AATAAGCGCACACCCTTGGACGAACTTATTAGGGAAGAACCTGCATCTCAATATACTGCT
CCGCAAACAACCTGACGAGCCCTGAGATACCACAGCGAACTATATCCCGGAGGATGAAGA
CCCGACTTTTAACTTACATACCTCCACGTCACGGTGCAGAAAGAGCCGAAGCCCCCAAGT
CCTTGAAAACGAGCCGGATGTTCTTTCAACCCGACCACAAAGCAACCCGTCGCAACGGAG
ACAAGGAACAAGCACAACCTTCAACCTTCGCTAGATCTGAAACTATAAGCAACCAATACG
CACCTGCAGCTTTAAGAGGCAGGAGAAGGAGCCTGAGAGGGAAGAGATACACCAAATCAG
AAACGAGAAACCGCTTCCAGAATAGCCACCACCGAGAACAAACTCCACGCCAGATTTAAA
AAAACAGATCTAGATCTAGATTTTAGTTAGATCTACTTTGAACTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5247Contig1 739 2 2 U
GAAGAGAAGAAGATTGATGAGGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAA
AAGGAGCTATACGAGTTTCTTGATCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATG
AGACACTATGAGGTGGTGTACTTGATTCATGAGAAACATTCAGAGGAGGTTGAAAGCGTC
AATGAGAAAGTTCAAGAGTTCTTGAAGGAGAAGAAGGGGAAAGTGTGGAGGTTTAGTGAC
TGGGGGATGCTTAGACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCGCACTATATACTG
ATGAACTTTGAGATGGAAGCCAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGAT
GAGAGGGTGATTAGGCATCTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCT
CCCCCTCCCGAGTTTCACTCTGTTCGTGCAAGTATGGATGGGATGATGACTTTTATGATG
ATGATGAGGAGGAGGAAGAAGAGTTTGATGAAGAAGAGGAAGAAGGTGATGATGTAGAGT
ATGAAGTAGATGATGATGGTAATGTAGTCATGGTGGTGTATGAAGATGATGAAGAAGAAC
AAGGACAGGACCAGTCAAATAAAGCCATAAGAGAAAAAAAAACGAACGACAGTTAACGTT
TGATGAGGTTTAGAGAGCTGTTTTGTAGACATGGAGTTTGTATAAACAATATCACATCAT
CGAAAGTACTTTTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC96TF U 1
AF RR4DC96JQ C 115
BS 1 638 RR4DC96TF
BS 639 739 RR4DC96JQ

RD RR4DC96TF 638 0 0
GAAGAGAAGAAGATTGATGAGGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAA
AAGGAGCTATACGAGTTTCTTGATCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATG
AGACACTATGAGGTGGTGTACTTGATTCATGAGAAACATTCAGAGGAGGTTGAAAGCGTC
AATGAGAAAGTTCAAGAGTTCTTGAAGGAGAAGAAGGGGAAAGTGTGGAGGTTTAGTGAC
TGGGGGATGCTTAGACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCGCACTATATACTG
ATGAACTTTGAGATGGAAGCCAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGAT
GAGAGGGTGATTAGGCATCTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCT
CCCCCTCCCGAGTTTCACTCTGTTCGTGCAAGTATGGATGGGATGATGACTTTTATGATG
ATGATGAGGAGGAGGAAGAAGAGTTTGATGAAGAAGAGGAAGAAGGTGATGATGTAGAGT
ATGAAGTAGATGATGATGGTAATGTAGTCATGGTGGTGTATGAAGATGATGAAGAAGAAC
AAGGACAGGACCAGTCAAATAAAGCCATAAGAGAAAAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4DC96JQ 625 0 0
AGGATGAGACACTATGAGGTGGTGTACTTGATTCATGAGAAACATTCAGAGGAGGTTGAA
AGCGTCAATGAGAAAGTTCAAGAGTTCTTGAAGGAGAAGAAGGGGAAAGTGTGGAGGTTT
AGTGACTGGGGGATGCTTAGACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCGCACTAT
ATACTGATGAACTTTGAGATGGAAGCCAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGAT
GGTGATGAGAGGGTGATTAGGCATCTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGAC
TGCCCTCCCCCTCCCGAGTTTCACTCTGTTCGTGCAAGTATGGATGGGATGATGACTTTT
ATGATGATGATGAGGAGGAGGAAGAAGAGTTTGATGAAGAAGAGGAAGAAGGTGATGATG
TAGAGTATGAAGTAGATGATGATGGTAATGTAGTCATGGTGGTGTATGAAGATGATGAAG
AAGAACAAGGACAGGACCAGTCAAATAAAGCCATAAGAGAAAAAAAAACGAACGACAGTT
AACGTTTGATGAGGTTTAGAGAGCTGTTTTGTAGACATGGAGTTTGTATAAACAATATCA
CATCATCGAAAGTACTTTTCTTTTT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL5248Contig1 530 2 2 U
GGGAGTCGAGACAATTTAACAATGTCGACAAACAAAATCGTCCGTCTGATTGCACCGAGC
CGATCCGCCTCCTCTAGATTCCTGGAGCCTGTATCCCGATTTCTAAGCTCCGGTACTCCT
CCTCCTCCGCCGCAGTCACCATCCCCGTCTCCGAATCAGGATCAGGTTGTGAAGCCAGAT
GCGAAACTTCAAGAGATGCCCAAGGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGGAGGAGGT
GGAGAGTTTGTTAACGAAGATACGGGTGAGATAGGAGGGCCTAGAGGTCCTGAGCCCACT
CGGTACGGCGATTGGGAACAACGTGGTCGATGCTCCGACTTCTAAGACGTGATCCCAAGT
AAATCTGGCTACCTTATTAGAGTCTCCTTGTTCATCATTTTGATTCCAAAGGAAATAAAT
TCACTTTCTATAAGTTTTTTTTATGTATTCTCAAATAATGGAGACAGTTGGAATTGTGAT
ATGTCTTGGATTCGTTGTGTTGCTTATGAATGTTTTAGCTATTTGATTAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BR60JQ C 1
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DS 

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CGATCCGCCTCCTCTAGATTCCTGGAGCCTGTATCCCGATTTCTAAGCTCCGGTACTCCT
CCTCCTCCGCCGCAGTCACCATCCCCGTCTCCGAATCAGGATCAGGTTGTGAAGCCAGAT
GCGAAACTTCAAGAGATGCCCAAGGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGGAGGAGGT
GGAGAGTTTGTTAACGAAGATACGGGTGAGATAGGAGGGCCTAGAGGTCCTGAGCCCACT
CGGTACGGCGATTGGGAACAACGTGGTCGATGCTCCGACTTCTAAGACGTGATCCCAAGT
AAATCTGGCTACCTTATTAGAGTCTCCTTGTTCATCATTTTGATTCCAAAGGAAATAAAT
TCACTTTCTATAAGTTTTTTTTATGTATTCTCAAATAATGGAGACAGTTGGAATTGTGAT
ATGTCTTGGATTCGTTGTGTTGCTTATGAATGTTTTAGCTATTTGATT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CC35JQ C 1
AF RR4CC35TF U 1
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DS 

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QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AV52TF U 1
AF RR4AV52JQ C 259
BS 1 701 RR4AV52TF
BS 702 702 RR4AV52JQ
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GATGAGTGTCTCTTGTTTGATGTCCTTGGAAGGCTTTCCTTTCAACCGATGAAGGAGAAT
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CATCTTCTAGCTAACATGATCAGCCTCCTCTGTATAGGAATGCGTCTTGAACAAGAATTT
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TGCTTGACAGATTCACGAGGAGAAAGGGTATCAGTAGGAGCATCTGGCGCCTTGTTCGGG
TTACTAGGTGCAATGCTCTCAGAGCTGATCACAAACTGGACAATCTATGAAAATAAGTGT
ACCGCACTTATGACATTGATCCTGATCATTGCACTGAACCTAAGCGTTGGATTCTTTACC
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CCTTCTTCTCCGTCCGCAGTACGGATACGTGAGCCCCAAGCACATTCCTCCTGGTTATGA
CATGAAACACA
GAAA

QA 1 791 1 791
DS 

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TGGCGTCTCATATCTTGCATCTGGCTTCATGGTGGACTGCTTCATCTTCTAGCTAACATG
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GCTTTGTATGTTCTCTCCGGTCTTGGTGGAAGCCTTATGTCTTGCTTGACAGATTCACGA
GGAGAAAGGGTATCAGTAGGAGCATCTGGCGCCTTGTTCGGGTTACTAGGTGCAATGCTC
TCAGAGCTGATCACAAACTGGACAATCTATGAAAATAAGTGTACCGCACTTATGACATTG
ATCCTGATCATTGCACTGAACCTAAGCGTTGGATTCTT*ACCACGTGTAGACAACTCTGC
TCACTGTGGAGGGTTCTTAGCAGGTTTCTTACTGGGGTTTGTCCTTCTTCTCCGTCCGCA
GTACGGATACGTGAGCCCCAAGCACATTCCTCCTGGTTATGACATGAAACACAAGAAATC
GAAACATAAGTGTTATCAACACATCTTCAGGTTTACATCTCTAGCCATCCTTCTTGCGGG
ATTCATTGCGGGATATGCTAAGCTTCTCAGAGAACATACTAGAGGGAGCGATCCATTCAG
GGATGTCAATTAGCATCTTGTAGCCAGCACCACTGATGACACATTCCCTGTAAAAGATCA
TTTCACAAGATCCCAAGATTTTTCCATATTGGATACAAATATCATCATCAGAAAGGTTCA
TATATTTCACGATTCAAAAATATGTATCATACATGTTCAAAGGCTGTTGTAACTATACAA
TCTCTATGAGAAAAGCATATATTAACTGT

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

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GGGTAATTAAATAAATTATCATATATAACACGGAACAAAAAGTACAACTGTAGTGCAATA
TTTGCTGATGATTTAATCTTCTAAGAATATAAATTCGTGTGTAGCACCAGATGGCTACGT
ATATATATATGTATAATATTGTATAATCAAAGGAAGACCAAAACTGAGAAGAAGTAGAAG
AATGAAATAGAGAGCGAGAGAGAATAATAAGAGGAAGACGACGTGCTTGGTCTTTGAGAT
GGTATGTTGGTGGCCTCTGGCTCAAACGAAGAAGCTGGCGGTCTAGCCAATGAAGATGAA
CGGTTCGATGGAAGCGCCCTAGCCGAGGTCTCACCGGTGTAACAATCAGATTCTTTCCAG
CCAAGAATCAGTTTCTCACGATCAAAGACTACACGATAGCCAGTCATGAAGTTCTGTCCG
ATGATGCTAATGTCTTCGATCTTCATGACGCCTAAACAGTAGACATCTGTGTCCTTCATG
GGGATCACTACTAAAGGGTGATAAACAGGATATGAGCCCCCGCCTTTCATTGTCAGATTC
ACAGCTGGATACTGGAAGCTGTCTTTGTCTGGGCTTAATGCATAACAATACTCAAAAGGC
AACTCGGAATCAGTCTGATAACGTTTGTCCAAAGCTAGAGAGTTGAAACTTTCTGAAATA
AGGGTGTAAGCTTCAGAAGTCAGATAAGTGAAGGAGGTTCCAGAGTCGAAAACAGCATCA
AATTCAAGATCGCCGGTGTTCCCTCCGACGCTTATTTGAGTGACGGTGATGTTGTAAGTA
GGATGTGGTTGTCTTATGTTCAATGGTGTTTCTCGTTGGTCAACGCTACCTCTATCCCCA
AAACTGATTCTACCAGCTCCATCGTTTCCAAAACACATTGAGAACGAGTTAGCTGCGATT
CCTTCCTTTGCTAATATGCTTGGAACCGATATGTCTTCTAAGCCAAGCCCGAAAAGACCG
TTTGGAGCTGCACCATCATGGAACACACCGGTCTGAACTTGACCACATCCCAAGGTAACG
CGAGCGGGAATAGCTTTGGAGTTTTTCTCATTAGAAACTAAGTGAATCACATCTTCGACC
AATACTCCAGTAGAAGAAGTGCCGTTTGAAAGATACCGTATCTGGTATGGGCAGTTACTA
TTTGGGAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH89JQ U 1
AF RR4B459TF C 396
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BS 515 515 RR4B459TF
BS 516 643 RR4EH89JQ
BS 644 1151 RR4B459TF

RD RR4EH89JQ 643 0 0
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TTTGCTGATGATTTAATCTTCTAAGAATATAAATTCGTGTGTAGCACCAGATGGCTACGT
ATATATATATGTATAATATTGTATAATCAAAGGAAGACCAAAACTGAGAAGAAGTAGAAG
AATGAAATAGAGAGCGAGAGAGAATAATAAGAGGAAGACGACGTGCTTGGTCTTTGAGAT
GGTATGTTGGTGGCCTCTGGCTCAAACGAAGAAGCTGGCGGTCTAGCCAATGAAGATGAA
CGGTTCGATGGAAGCGCCCTAGCCGAGGTCTCACCGGTGTAACAATCAGATTCTTTCCAG
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AACTCGGAATCAGTCTGATAACGTTTGTCCAAAGCTAGAGAGT

QA 1 643 1 643
DS 

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ACAGTAGACATCTGTGTCCTTCATGGGGATCACTACTAAAGGGTGATAAACAGGATATGA
GCCCCCGCCTTTCATTGTCAGATTCACAGCTGGATACTGGAAGCTGTCTTTGTCTGGGCT
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GGTTCCAGAGTCGAAAACAGCATCAAATTCAAGATCGCCGGTGTTCCCTCCGACGCTTAT
TTGAGTGACGGTGATGTTGTAAGTAGGATGTGGTTGTCTTATGTTCAATGGTGTTTCTCG
TTGGTCAACGCTACCTCTATCCCCAAAACTGATTCTACCAGCTCCATCGTTTCCAAAACA
CATTGAGAACGAGTTAGCTGCGATTCCTTCCTTTGCTAATATGCTTGGAACCGATATGTC
TTCTAAGCCAAGCCCGAAAAGACCGTTTGGAGCTGCACCATCATGGAACACACCGGTCTG
AACTTGACCACATCCCAAGGTAACGCGAGCGGGAATAGCTTTGGAGTTTTTCTCATTAGA
AACTAAGTGAATCACATCTTCGACCAATACTCCAGTAGAAGAAGTGCCGTTTGAAAGATA
CCGTATCTGGTATGGGCAGTTACTATTTGGGAAGCG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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GCTTCTGAAACGAGGACTCAAAGTTGTCGGCGATGGCATGTTGCTTAACATAATCCAATC
TGAAATCCGCCACGAGATCTCCAACCCTCGTTTCCTGGGAGTTGAGACAGGTAAGCTAGG
AGCTTTCAAGTTGGATTGTGATTCTCCGGGAAACAGAGACATTGTCCTGAGGAGGCAGTT
TAATTCAGGAGAAGAGGTTGTTGTCTCAGCTTTACTACAACAGGAGCCCATTGATGATGA
TGCTGATGATGATATAGCGTTTCCAAGGGGAGCTGTGGCCAAAGTGTGTATCAGTAAGCC
TAGACTCAGCTCTGTCCTGCAGTTTGATTGCCGTGTTTCTGAGACGGCTCGTGGAAGTTC
TGATTTCGACATCGAGAGAGCTTATTATATCCGCTCTTTATGTAGCTCTTCTTCGCCTTA
TGGAGGAGACTTTTTCAGGGAATTAGATCCGAGACTGCAGGATGCACTGAAGCAGTACCT
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GGAGCAGGAGCAGTACGTTAGCTGGCTACGCAAGCTTGAATCAACAGTGACTCACTCTCT
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TTGGTGTTTTCTTGCAGTGGTCATTAATGACCTTGAGATTAGCATAATCAGCTTTGCCAT
GGTTTTTGTTTTAGGGAGAGTTTATTGACAAAAATATATGTTTAACTGGTATATTTCCAA
TTAGTGGGACAAAAAGATCTTATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CR13TF U 1
AF RR4CR13JQ C 52
BS 1 597 RR4CR13TF
BS 598 866 RR4CR13JQ

RD RR4CR13TF 597 0 0
GGAGAAGGAAAAGTCTGTGGAGTCGATTCTGGAAAAAGAGATGAGGAATAAGGCGAACTC
GCTTCTGAAACGAGGACTCAAAGTTGTCGGCGATGGCATGTTGCTTAACATAATCCAATC
TGAAATCCGCCACGAGATCTCCAACCCTCGTTTCCTGGGAGTTGAGACAGGTAAGCTAGG
AGCTTTCAAGTTGGATTGTGATTCTCCGGGAAACAGAGACATTGTCCTGAGGAGGCAGTT
TAATTCAGGAGAAGAGGTTGTTGTCTCAGCTTTACTACAACAGGAGCCCATTGATGATGA
TGCTGATGATGATATAGCGTTTCCAAGGGGAGCTGTGGCCAAAGTGTGTATCAGTAAGCC
TAGACTCAGCTCTGTCCTGCAGTTTGATTGCCGTGTTTCTGAGACGGCTCGTGGAAGTTC
TGATTTCGACATCGAGAGAGCTTATTATATCCGCTCTTTATGTAGCTCTTCTTCGCCTTA
TGGAGGAGACTTTTTCAGGGAATTAGATCCGAGACTGCAGGATGCACTGAAGCAGTACCT
AACATCCAAGGGAATCAGTGAAGGACTAACTAATTTCATCTTGTGTCATCTGAACAA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4CR13JQ 815 0 0
GGCGAACTCGCT*CTGAAACGAGGACTCAAAGT*GTCGGCGATGGCATGTTGCTTAACAT
AATCCAATCTGAAATCCGCCACGAGATCTCCAACCCTCGTTTCCTGGGAGTTGAGACAGG
TAAGCTAGGAGCTTTCAAGTTGGATTGTGATTCTCCGGGAAACAGAGACATTGTCCTGAG
GAGGCAGTTTAATTCAGGAGAAGAGGTTGTTGTCTCAGCTTTACTACAACAGGAGCCCAT
TGATGATGATGCTGATGATGATATAGCGTTTCCAAGGGGAGCTGTGGCCAAAGTGTGTAT
CAGTAAGCCTAGACTCAGCTCTGTCCTGCAGTTTGATTGCCGTGTTTTTGAGACGGCTCG
TGGAAGTTCTGATTTCGACATCGAGAGAGCTTATTATATCCGCTCTTTATGTAGCTTTTT
TTCGCCTTATGGAGGAGACTTTTTCAGGGAATTAGATCCGAGACTGCAGGATGCACTGAA
GCAGTACCTAACATCCAAGGGAATCAGTGAAGGACTAACTAATTTCATCTTGTGTCATCT
GAACAAGAAGGAGCAGGAGCAGTACGTTAGCTGGCTACGCAAGCTTGAATCAACAGTGAC
TCACTCTCTGAAGCCGTGAGGTGCTCACTCCATTTGCTCATTTGTTTTTTGTTTTTTGTT
TAATTCTTCTTGGTGTTTTCTTGCAGTGGTCATTAATGACCTTGAGATTAGCATAATCAG
CTTTGCCATGGTTTTTGTTTTAGGGAGAGTTTATTGACAAAAATATATGTTTAACTGGTA
TATTTCCAATTAGTGGGACAAAAAGATCTTATGCG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL5253Contig1 924 2 2 U
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AGAGGCTATACGATTGATAAGAGTGTTTTTGTATCGAAGAAGAAAGAAATATATGGTTGG
AGAGGAAGAAGAGAAAAGGAGATGGTGGTGGTTCGAGAGTCATCACAAGACGACGACGAC
GACCTCTAAGCAATCTCAATGGCTTCATTCCACACTTGGAGAGCTTGATTCAAAGACAAA
TGCCATGCTGTCGCTAATTGAGGAGGGTAACGCAGATTCTTTTGCGCAGCGTGCGGAGAC
TTACTACAAGAAACGTCCCGAGCTTATCTCCTTCGTCCATGATTTCTATCGTGCTCACCG
TTCCTTAGCCCACCGTTCCCATCACCTTAAATCTTCTTCTTCTTCCTCTATCGACCACTC
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TGAGGCTCTGAGAAGACAGCTGTTAGAGAAAGACGAGGAGAAGAGAGAGGTCATTAGGCA
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TTCTTCTTCCCGGTGCGTCTCGCACTCTTTTCCATCTCGACTACAAGTTCCTCGGGAAGC
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TTTTTTTTTTTTTTTGTAAGATTGAAACAGATCTCTAGTTTCTTGCTGTATTGTAACCTG
GATTAGCGTAATTATCCTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FF35TF U 1
AF RR4FF35JQ C 658
BS 1 736 RR4FF35TF
BS 737 924 RR4FF35JQ

RD RR4FF35TF 736 0 0
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AGAGGCTATACGATTGATAAGAGTGTTTTTGTATCGAAGAAGAAAGAAATATATGGTTGG
AGAGGAAGAAGAGAAAAGGAGATGGTGGTGGTTCGAGAGTCATCACAAGACGACGACGAC
GACCTCTAAGCAATCTCAATGGCTTCATTCCACACTTGGAGAGCTTGATTCAAAGACAAA
TGCCATGCTGTCGCTAATTGAGGAGGGTAACGCAGATTCTTTTGCGCAGCGTGCGGAGAC
TTACTACAAGAAACGTCCCGAGCTTATCTCCTTCGTCCATGATTTCTATCGTGCTCACCG
TTCCTTAGCCCACCGTTCCCATCACCTTAAATCTTCTTCTTCTTCCTCTATCGACCACTC
TCTTTCCGAAGAACCCGATTCCGAGATTGAAGACCCTGACGAAGACGAGCAGGACCAGGG
AAACGCCTCCTCCACTTCCAAACTGGAACAAGATAGGTTGACGCTGATCCAAGAGATCAG
TGAGGCTCTGAGAAGACAGCTGTTAGAGAAAGACGAGGAGAAGAGAGAGGTCATTAGGCA
GCTTTCTCTTGCTGTTGAGAGACGAGAACTTGAGCCTCAAGAGACGTCTTCTTCTTCTTC
TTCTTCTTCCCGGTGCGTCTCGCACTCTTTTCCATCTCGACTACAAGTTCCTCGGGAAGC
TGTTCTACACTTGAAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4FF35JQ 267 0 0
TTTTTT
TTCTTCCCGGTGCGTCTCGCACTCTTTTCCATCTCGACTACAAGTTCCTCGGGAAGCTGT
TCTACACTTGAAATGCGCCATCATGGTACTAACAAGGAAACTCTTTCTATGCTCATTACC
TCATGAGCATTGGCTACAATACTTTCTTTCTTTATGTGTTTGATTCACCCACTCTCCTTT
TTTTTTTTTTTTGTAAGATTGAAACAGATCTCTAGTTTCTTGCTGTATTGTAACCTGGAT
TAGCGTAATTATCCTCTTACC

QA 7 267 7 267
DS 



AS 1 2

CO CL5254Contig1 743 2 2 U
TTTGGTACGAACAGAACAAGAACATACTATCAGCATTTCGGGTAACTCACATATAATGGA
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AAAGTAAAAAGAGAGAGGATCTTGTGGCTTTATGTGTGGCTAATTGGCTTTGGAGCTCCT
AAAGCCTTTCTTAAGCTCAGTAACTCTCTTCATACAAGCAGCCTTGGACTTGCCAGGAAC
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GAGCAGTGCAATGTCTTCTCCATTACTCCAACTCTCGTCCCCTCCAACGTCTTCTTCTTC
AGCCAATCTAGGATCCGAAGAAGCTTTCCTGTTCTTCAAAAACTGAGCGTAATCATCACT
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CTTCCCTCCAAACGCAGACGCAACCGCTTCCCACCGCCCAGGCTTCCCCGCCGGATGCTT
CACAAGCTGCTTCTTCAGAATCTCCATCTCCTCTTCACTCCACTCCTTAGTTTCTTTCAC
AGATCCATTTCGATCCGCCACTTTACTCGTTGTCACAACCGGAAGTGGATTTTCCTGCGA
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ATCCGTGGGGGTGTTGTTCGTCC


BQ
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AF RR4GS82TF C 1
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BS 4 743 RR4GS82JQ

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ATCCGT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4GS82JQ 740 0 0
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AGCTGCAACCTTCTCCCATCTCATAGCCGCTTCTTTGGGAAAAGCTTTAAGAGCATTGAG
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GTAGACTTTCTTCTCTCCAATCTCTTTAGCCTTCTTGATCACATTCTCCGTCTTATACTT
CCCTCCAAACGCAGACGCAACCGCTTCCCACCGCCCAGGCTTCCCCGCCGGATGCTTCAC
AAGCTGCTTCTTCAGAATCTCCATCTCCTCTTCACTCCACTCCTTAGTTTCTTTCACAGA
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CGTGGGGGTGTTGTTCGTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

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AAAGAGGAGAAGGCATCCGGTAACAAGGTAGAGAGAGAGAGGAGAGAGCGTGAAAGGGAT
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GGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

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QA 1 796 1 796
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AGAGAGAGAGGAGAGAGCGTGAAAGGGATTTGTAATGGTGTTTGATGGACTCGTTTCATT
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AAAATGATATGAATAGACAAGCCAAAGTTGGTTCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GA26JQ U 8
AF RR4GA26TF C 1
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QA 1 490 1 490
DS 

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CTTCTCCATTAGATTTTTTCTCTTCCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AU44JQ C 1
AF RR4AU44TF U 1
BS 1 838 RR4AU44TF

RD RR4AU44JQ 838 0 0
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QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4AU44TF 838 0 0
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QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL5258Contig1 742 2 4 U
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GACTTCATATCCAACTTCACTC


BQ
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AF RR4G252TF U 1
AF RR4G252JQ C 11
BS 1 691 RR4G252TF
BS 692 692 RR4G252JQ
BS 693 708 RR4G252TF
BS 709 742 RR4G252JQ

RD RR4G252TF 718 0 0
GATCTTAGCTGGGAGAGACACGAGCTCAGTTGCACTAACGTGGTTCTTTTGGGTTATAAC
TAGACATCCAGAAGTTGAAAACAGAATCATCAGCGAGGTCAGAGAGATCTTGAGACAGAG
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ACAAGCAGCACTATCAGAAACCATGAGACTTTACCCTCCAATACCAATGGAGATGAAACA
AGCCATTGAAGACGATGTGTTCCCTGATGGGACGTTTCTAAGTAAAGGTTCAAGGGTTTA
CTTTGCGATATATGCCATGGGAAGGATGGAAACAATCTGGGGGAAAGACTGTGAGGTGTT
TAGACCAGAGAGATGGATACAAGCAGGGAGTTTCGTGAGCGACGACCAGTTTAAATACGT
TGTGTTTAATGCTGGGCCAAGGCTTTGTTTAGGGAAGACATTTGCTTACTTGCAGATGAA
GACAGTGGCTGCTTCAGTCTTGTTGAGGTACTCGGTCAAGGTTGATCCAGATCATGTTGT
TGTCCCTAGAGTAACGACAACTTTGTACATGAAGCATGGTCTCAAGGTGACCATCTCGCC
AAGGTCGCTGGAGGAGAAGACACAGGTTCAATTAGAGAAACGTTAGAAACGGGCTATATC
ATGGAGAAGTTACTAGAGAGTCATGTTCCCA*TATTATATATTTTCAA
TTCATATAAT

QA 1 708 1 708
DS 

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GAAGTTGAAAACAGAATCATCAGCGAGGTCAGAGAGATCTTGAGACAGAGAGGAGGAGAT
CATCAGACTAGTCTCTTCACGGTCAAGGAACTAAACGACATGGTGTATCTACAAGCAGCA
CTATCAGAAACCATGAGACTTTACCCTCCAATACCAATGGAGATGAAACAAGCCATTGAA
GACGATGTGTTCCCTGATGGGACGTTTCTAAGTAAAGGTTCAAGGGTTTACTTTGCGATA
TATGCCATGGGAAGGATGGAAACAATCTGGGGGAAAGACTGTGAGGTGTTTAGACCAGAG
AGATGGATACAAGCAGGGAGTTTCGTGAGCGACGACCAGTTTAAATACGTTGTGTTTAAT
GCTGGGCCAAGGCTTTGTTTAGGGAAGACATTTGCTTACTTGCAGATGAAGACAGTGGCT
GCTTCAGTCTTGTTGAGGTACTCGGTCAAGGTTGATCCAGATCATGTTGTTGTCCCTAGA
GTAACGACAACTTTGTACATGAAGCATGGTCTCAAGGTGACCATCTCGCCAAGGTCGCTG
GAGGAGAAGACACAGGTTCAATTAGAGAAACGTTAGAAACGGGCTATATCATGGAGAAGT
TACTAGAGAGTCATGTTCCCAATATTATATATTTTCAAATTCAATATAATGACTTCATAT
CCAACTTCACTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5259Contig1 1019 2 2 U
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TCGCAGCCGTTATGAACGCCAAGATCATCGGTTCTGGTGAGAGGTCAATGGTCTTGGCAC
ACGGATATGGAGGCGACCAGTCGGTTTGGGATAAGATAATTCCGGTCTTGTCCCAATCTT
TTAAAGTTTTGGTCTTTGACTGGCCTTTTTCTGGAGCCATCGAAGACCAAACTCTTTATG
ACTCATCGAAGTATAACTCCTTTGATGCCTTCTCTGACGATCTTATTGCTCTTATGGAGG
AGTTGAAGTTTGGTCCCGTTGCGTTCATAGGCCATTCCATGTCTGGTATGATCGGTTGTG
CTGCTTCTATAAAGAGACCCGACTTGTTTACAAATCTTGTTCTTATTGCTGCTTCTCCCA
GGTACATTAACAGCGAGGATTACAAAGGAGGTTTTGAGCCAGAAGACATTGACGCGATCA
TCTCCAACATTGCCTCCAACTACGAGGCTTGGGTGGTTGCTTTCGCCCCCACAGTGGTCG
ACTCAAGAGACTCTCTCTCAGTCCAATGGTTGGAGAAGTGTCTTAAGAATATGAAGCCCG
AGACGGCTCTTGCCTTAGGTAAGATAGTGTTTGGCAGCGACGAGAGAGAGCTTTTGGGCA
AAGTGTCAGTTCCTTGCCACATCATACAGTCTGGAAACGACGCCGTAGTTCCAGTCTCCG
TTGCCTACTTCATGCAAGAGAATATCAAAGGGAATTCCGCGGTAGAGATCATTGAGAACT
CGATTGGGCATTTCCCACAAATGACGTCACATCTGGAGCTTCTACGAGTCATGAGACGCT
TCCTCGAGTTTTGAGGCTCGAATATAATAAACAGTTTTACATGCGTCCATATTTTTCTCG
TCTACAATATTCTGCTAAGATAACGAAGTGGGTCATAAGTATCATATATATATTTTTTTT
TAATGTGAATGTGTATTTAATTGGCAGCACAGAGTAATTTAGTTATATTTTAGTTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AR89TF U 1
AF RR4AR89JQ C 211
BS 1 734 RR4AR89TF
BS 735 1019 RR4AR89JQ

RD RR4AR89TF 734 0 0
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AGTTGAAGTTTGGTCCCGTTGCGTTCATAGGCCATTCCATGTCTGGTATGATCGGTTGTG
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GGTACATTAACAGCGAGGATTACAAAGGAGGTTTTGAGCCAGAAGACATTGACGCGATCA
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TTGCCTACTTCATG

QA 1 734 1 734
DS 

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TCTCTGACGATCTTATTGCTCTTATGGAGGAGTTGAAGTTTGGTCCCGTTGCGTTCATAG
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GGGTGGTTGCTTTCGCCCCCACAGTGGTCGACTCAAGAGACTCTCTCTCAGTCCAATGGT
TGGAGAAGTGTCTTAAGAATATGAAGCCCGAGACGGCTCTTGCCTTAGGTAAGATAGTGT
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CTGGAAACGACGCCGTAGTTCCAGTCTCCGTTGCCTACTTCATGCAAGAGAATATCAAAG
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ACAGTTTTACATGCGTCCATATTTTTCTCGTCTACAATATTCTGCTAAGATAACGAAGTG
GGTCATAAGTATCATATATATATTTTTTTTTAATGTGAATGTGTATTTAATTGGCAGCAC
AGAGTAATTTAGTTATATTTTAGTTGAAT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EC05TF U 1
AF RR4EC05JQ C 52
BS 1 587 RR4EC05TF

RD RR4EC05TF 587 0 0
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TTTTCCATTTTCGCTTCGTAAAAGACGATGAGCAGCACCGGCGCAGGAAGCGGCACGACC
AAAGGAGGGAGAGGAAAGCCAAAGGCCACCAAGTCCGTCTCTCGTTCGTCGAAGGCCGGT
CTCCAGTCCCCCGTCGGAAGAATCGCCAGATTCCTCAAGGCAGGGAAATACGCCGAGCGT
GTCGGTGCCGGAGCTCCGGTCTATCTCTCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCTGAGGTG
TTGGAGCTAGCTGGAAACGCGGCGAGGGATAACAAGAAGACGCGTATCGTGCCGAGACAT
ATCCAGCTTGCGGTTAGGAACGATGAGGAGCTGAGTAAGCTTTTGGGAGCTGTTACGATT
GCTAACGGAGGAGTGTTACCGAATATTCATTCGAACCTTTTGCCTTCAAAAGTTGGGAAG
AACAAAGGAGATATCGGATCTGCTTCTCAGGAGTTCTGAGTTCTCTTTTTAGCTCTTTGT
TCTCTGGATGTAACTTAATATGAGTTTTGATTAATCTTTGGGTTTGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EC05JQ 536 0 0
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AAGGCCGGTCTCCAGTCCCCCGTCGGAAGAATCGCCAGATTCCTCAAGGCAGGGAAATAC
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GCTGAGGTGTTGGAGCTAGCTGGAAACGCGGCGAGGGATAACAAGAAGACGCGTATCGTG
CCGAGACATATCCAGCTTGCGGTTAGGAACGATGAGGAGCTGAGTAAGCTTTTGGGAGCT
GTTACGATTGCTAACGGAGGAGTGTTACCGAATATTCATTCGAACCTTTTGCCTTCAAAA
GTTGGGAAGAACAAAGGAGATATCGGATCTGCTTCTCAGGAGTTTTGAGTTCTCTTTTTA
GCTCTTTGTTCTCTGGATGTAACTTAATATGAGTTTTGATTAATCTTTGGGTTTGC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL5261Contig1 908 2 2 U
GGGGAAGAGACACGACTCTCCTCTGAGTAATCAGTTTCAGAACTAACAGATTCATTTCGT
AAAGTTCACTCACAATATTTTCCTTGGTGAGTTATCTTTCATCTATTGTTTCATTTTTCA
TTCCCAGAGCTATTCTGATCGACGAGTTTGTTTGATTGCGAGGGTCCGATTGGTTTCAAA
GTTATAGCGCGAGAATTTTTTTGTTACATACTTGGTCTTGTGAAGTCTAAATATCTAGGA
ACTGATAGCTGCTTTTGAAATTCAGGTCAACGCCGGGAAATTAGAAGATCTGGTCTCAAG
CAAGATAGCTGGTAAAAACATGGACGAAAATACTAAATCAGTATCCGGAAATGGTAGAAC
CGAGCTGGTAAAATTCATTGCTGATAGCCATGCCAAGCTCATGAAGCCAGCTGCTCGTTA
TTACTATACACTTAAAGATTCTATGGTTTGTGGGAAAAGAAGATATACGGCTGTAAAAGA
TGCAGACCACATGGAAACAGGAGTATTTGACAAACCTCTTCCTTGCTTTGGTTGTGGACT
CGGATGGTTCTCCTTTCTTCTGGGGTTTGTGTTCCCACCTTTGTGTACTATGCTACATTT
CTTTATTTCGGGAACTATTACCGTAGAGATCCTAGAGAAAGAGCTGGTCTTGCTGCTTCC
GCAATCACTGCAATGGGATTCTCTCTTGTGTTTCTCGTGATTTTTGCTTTCCGATGGTTT
TAGTATTTGAGTTATTCAAGTAACTATGTAAGTACACATTCCTATAAGTCCCCCTGCTCA
TCAAGCAATAGCAGCCGAACTTGATGTTTCATGTACATTCACATGAAACTATGACTATGA
GTTTACTTCAGTCTTCGTTTCTCAAGTTGTATATCATTTCTTGTTCACAGATTATAAAGT
TTGTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES39TF U 1
AF RR4ES39JQ C 163
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BS 608 908 RR4ES39JQ

RD RR4ES39TF 607 0 0
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AAAGTTCACTCACAATATTTTCCTTGGTGAGTTATCTTTCATCTATTGTTTCATTTTTCA
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CAAGATAGCTGGTAAAAACATGGACGAAAATACTAAATCAGTATCCGGAAATGGTAGAAC
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TTACTATACACTTAAAGATTCTATGGTTTGTGGGAAAAGAAGATATACGGCTGTAAAAGA
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CGGATGGTTCTCCTTTCTTCTGGGGTTTGTGTTCCCACCTTTGTGTACTATGCTACATTT
CTTTATT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4ES39JQ 746 0 0
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AAGTCTAAATATCTAGGAACTGATAGCTGCTTTTGAAATTCAGGTCAACGCCGGGAAATT
AGAAGATCTGGTCTCAAGCAAGATAGCTGGTAAAAACATGGACGAAAATACTAAATCAGT
ATCCGGAAATGGTAGAACCGAGCTGGTAAAATTCATTGCTGATAGCCATGCCAAGCTCAT
GAAGCCAGCTGCTCGTTATTACTATACACTTAAAGATTCTATGGTTTGTGGGAAAAGAAG
ATATACGGCTGTAAAAGATGCAGACCACATGGAAACAGGAGTATTTGACAAACCTCTTCC
TTGCTTTGGTTGTGGACTCGGATGGTTCTCCTTTCTTCTGGGGTTTGTGTTCCCACCTTT
GTGTACTATGCTACATTTCTTTATTTCGGGAACTATTACCGTAGAGATCCTAGAGAAAGA
GCTGGTCTTGCTGCTTCCGCAATCACTGCAATGGGATTCTCTCTTGTGTTTCTCGTGATT
TTTGCTTTCCGATGGTTTTAGTATTTGAGTTATTCAAGTAACTATGTAAGTACACATTCC
TATAAGTCCCCCTGCTCATCAAGCAATAGCAGCCGAACTTGATGTTTCATGTACATTCAC
ATGAAACTATGACTATGAGTTTACTTCAGTCTTCGTTTCTCAAGTTGTATATCATTTCTT
GTTCACAGATTATAAAGTTTGTATAC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL5262Contig1 623 2 3 U
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ATTTCACCTTGACCATGGCTTCGATTGTCTGCTATTACGCTCCATACACGATCCGAGCAT
CTTCCGGATCCGGGTCTATGAAAAACCCGGATCAAAACCGCAAGAAAACTGTTTCTTGGT
GGGCTCCTCTCTTCGGCATATCCTCCGAGCCAGATTACCTCAACATCGAAACCCCCTCCT
CCGTGGCTACGGAACCGAGCGGGTCGGGTCAGGATTCGGGTCAAAAGCTTCGTCGCCGCG
GTTGTCTTACTGAGGAGAAGGCTAGGGAGTTGAGGAAGAAAATCGCAGAAGCTTCCACGT
TCCACGAAGTCATGTATCATTCGGCGATTGCGTCTCGGCTTGCTTCTGACATCTCCGGTC
GGGTTAAGGATTAAAAAACGGACCCGGGTCGCTGTTTTTCAGATCTAGAGATCAATTTGT
CGGATCGAAAATGTTTCCTGTTTTAGTTGTTGTCGTGTTCATGTTTGTTTTCAGACTATC
TTCTGTCGGTGCTTGTTTTTCATTAGAACCGTTGGATTGGGTATTTGTCTCTTTTGTTTG
TTGTAAATGCTTGTTCTCAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GU58JQ C 1
AF RR4GU58TF U 88
BS 1 87 RR4GU58JQ
BS 88 618 RR4GU58TF
BS 619 623 RR4GU58JQ

RD RR4GU58JQ 623 0 0
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ATTTCACCTTGACCATGGCTTCGATTGTCTGCTGTTACGCTCCATACACGATCCGAGCAT
CTTCCGGATCCGGGTCTATGAAAAACCCGGATCAAAACCGCAAGAAAACTGTTTCTTGGT
GGGCTCCTCTTTTCGGCATATCCTCCGAGCCAGATTACCTCAACATCGAAACCCCCTCCT
CCGTGGCTACGGAACCGAGCGGGTCGGGTCAGGATTCGGGTCAAAAGCTTCGTCGCCGCG
GTTGTCTTACTGAGGAGAAGGCTAGGGAGTTGAGGAAGAAAATCGCAGAAGCTTCCACGT
TCCACGAAGTCATGTATCATTCGGCGATTGCGTCTCGGCTTGCTTCTGACATCTCCGGTC
GGGTTAAGGATTAAAAAACGGACCCGGGTCGCTGTTTTTCAGATCTAGAGATCAATTTGT
CGGATCGAAAATGTTTCCTGTTTTAGTTGTTGTCGTGTTCATGTTTGTTTTCAGACTATC
TTCTGTCGGTGCTTGTTTTTCATTAGAACCGTTGGATTGGGTATTTGTCTCTTTTGTTTG
TTGTAAATGCTTGTTCTCAAGAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4GU58TF 531 0 0
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CGGATCAAAACCGCAAGAAAACTGTTTCTTGGTGGGCTCCTCTCTTCGGCATATCCTCCG
AGCCAGATTACCTCAACATCGAAACCCCCTCCTCCGTGGCTACGGAACCGAGCGGGTCGG
GTCAGGATTCGGGTCAAAAGCTTCGTCGCCGCGGTTGTCTTACTGAGGAGAAGGCTAGGG
AGTTGAGGAAGAAAATCGCAGAAGCTTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCATTCGGCGA
TTGCGTCTCGGCTTGCTTCTGACATCTCCGGTCGGGTTAAGGATTAAAAAACGGACCCGG
GTCGCTGTTTTTCAGATCTAGAGATCAATTTGTCGGATCGAAAATGTTTCCTGTTTTAGT
TGTTGTCGTGTTCATGTTTGTTTTCAGACTATCTTCTGTCGGTGCTTGTTTTTCATTAGA
ACCGTTGGATTGGGTATTTGTCTCTTTTGTTTGTTGTAAATGCTTGTTCTC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL5263Contig1 959 2 4 U
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CACTGTTCGAGCCCGGAGAGCTGAGCTCGTGGTCTTTCTGGAGAGCAGGAATCGCCGAGT
TCATAGCTACTTTCCTCTTCCTTTACATCACAGTGTTGACAGTCATGGGAGTGAAGAGAG
CACCAAACATGTGTGCCTCTGTTGGAATCCAAGGCATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGA
TCTTTGCTCTCGTCTACTGTACTGCTGGAATTTCAGGTGGACACATCAACCCAGCGGTTA
CGTTCGGTCTGTTCTTGGCTAGGAAGTTGTCTCTGACCAGGGCTGTTTTCTACATGATTA
TGCAATGTCTCGGAGCCATCTGTGGTGCCGGAGTCGTCAAGGGTTTCCAGCCAACGCCGT
ACCAGACTCTCGGTGGCGGTGCCAACACCGTCGCTCCCGGCTACTCCAGGGATCTGGTCT
CGGCGCTGAGATCATCGGAACCTTCGTTCTCGTCTACACGGTCTTCTCCGCCACCGACTC
CAAAATAAGCGCCCGTGACTCACACGTCCCGATTTTGGCACCACTCCCAATCGGGTTTGC
AGTGTTTTTGGTACACTTGGCGACAATTCCGATAACCGGAACCGGAATCAACCCAGCTAG
AAGTCTTGGAGCTGCCATTATCTACAACAAGGAACACTCCTGGGACGACCAGTGGATTTT
CTGGGTTGGACCATTCATTGGAGCAGCTCTAGCAGCACTCTATCACCAGATTGTCATCAG
AGCCATTCCTTTCAAGAGCAAGAGCTGAAGAACCATATGATGAACTAGAGTTCCGATCTT
TTTATTTACTGTTATGTAATTTCGTTGCTTATCTAGCTTTTATTTTGCAATGCACTACTA
CTCTGTTTGGGATTTTGTGAATTTCTTTGTTTTTGTTTAAGCATTAACTAGTTTGCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GM15TF U 1
AF RR4GM15JQ C 180
BS 1 691 RR4GM15TF
BS 692 692 RR4GM15JQ
BS 693 719 RR4GM15TF
BS 720 959 RR4GM15JQ

RD RR4GM15TF 719 0 0
GGCAGCCCATCTGAACATCAGCTCAGTCCGACAAGGACTACAAAGAGCCACCACCTGCGC
CACTGTTCGAGCCCGGAGAGCTGAGCTCGTGGTCTTTCTGGAGAGCAGGAATCGCCGAGT
TCATAGCTACTTTCCTCTTCCTTTACATCACAGTGTTGACAGTCATGGGAGTGAAGAGAG
CACCAAACATGTGTGCCTCTGTTGGAATCCAAGGCATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGA
TCTTTGCTCTCGTCTACTGTACTGCTGGAATTTCAGGTGGACACATCAACCCAGCGGTTA
CGTTCGGTCTGTTCTTGGCTAGGAAGTTGTCTCTGACCAGGGCTGTTTTCTACATGATTA
TGCAATGTCTCGGAGCCATCTGTGGTGCCGGAGTCGTCAAGGGTTTCCAGCCAACGCCGT
ACCAGACTCTCGGTGGCGGTGCCAACACCGTCGCTCCCGGCTACTCCAGGGATCTGGTCT
CGGCGCTGAGATCATCGGAACCTTCGTTCTCGTCTACACGGTCTTCTCCGCCACCGACTC
CAAAATAAGCGCCCGTGACTCACACGTCCCGATTTTGGCACCACTCCCAATCGGGTTTGC
AGTGTTTTTGGTACACTTGGCGACAATTCCGATAACCGGAACCGGAATCAACCCAGCTAG
AAGTCTTGGAGCTGCCATTATCTACAACAAG*AACACTCCTGGGACGACCAGTGGATTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4GM15JQ 780 0 0
GCACCAAACATGTGTGC*TCTGTTGGAATCCAAGGCATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATG
ATCTTTGCTCTCGTCTACTGTACTGCTGGAATTTCAGGTGGACACATCAACCCAGCGGTT
ACGTTCGGTCTGTTCTTGGCTAGGAAGTTGTCTCTGACCAGGGCTGTTTTCTACATGATT
ATGCAATGTCTCGGAGCCATCTGTGGTGCCGGAGTCGTCAAGGGTTTCCAGCCAACGCCG
TACCAGACTCTCGGTGGCGGTGCCAACACCGTCGCTCCCGGCTACTCCAGGGATCTGGTC
TCGGCGCTGAGATCATCGGAACCTTCGTTTTCGTCTACACGGTCTTTTCCGCCACCGACT
CCAAAATAAGCGCCCGTGACTCACACGTCCCGATTTTGGCACCACTCCCAATCGGGTTTG
CAGTGTTTTTGGTACACTTGGCGACAATTCCGATAACCGGAACCGGAATCAACCCAGCTA
GAAGTCTTGGAGCTGCCATTATCTACAACAAGGAACACTCCTGGGACGACCAGTGGATTT
TCTGGGTTGGACCATTCATTGGAGCAGCTCTAGCAGCACTCTATCACCAGATTGTCATCA
GAGCCATTCCTTTCAAGAGCAAGAGCTGAAGAACCATATGATGAACTAGAGTTCCGATCT
TTTTATTTACTGTTATGTAATTTCGTTGCTTATCTAGCTTTTATTTTGCAATGCACTACT
ACTCTGTTTGGGATTTTGTGAATTTCTTTGTTTTTGTTTAAGCATTAACTAGTTTGCGCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5264Contig1 834 2 14 U
GCTTCAAAACTAGATGTGAAACTTCAAGTGGTGGAACCACTGGACTCTAGTCAAAGACTA
GGGCTACAAGGAGAACACCAATATCTAAACGCTAGTCTTGCGGTTGCGTTGTGTTCTACA
TTTCTTCACAAGATTGGTATTATTGAGGACAAGAATGATACAAATGGTTTACTACCTGAA
AGATTCATATCTGGATTATCAAATGCTTATTTGATGGGACGAGCTATGATCGTGCCTGAC
TCAGAACTTCCTGAAGAGATTGTGTTTTACCTTGATGGAGCTCATAGTCCTGAAAGCATG
GAAGCTTGCGCTACTTGGTTTTCACAACAGGTCAAAGAAAGAAACCAGAAAAGATCAGAG
CAGATACTCTTGTTCAATCGTATGACTGTTCGTGATCCGAGTTTGCTTCTTCCGAGATTA
AGGACTAAATGCATTGATCAAGGAGTTGAATTCAAGAAAGCAGTTTTTGTGCCAAACATG
TCTGTATACAACCAAGTGGGGGGATCTTGGTCAAAGTTTGAGCAACGTGTTGATGATTCA
ACGACGTGGCAGTTGGGTCTGAAGAGTATTTGGGACAATCTAGCACGCGGTGAAGCAAAA
AATAAGTCAAGAAGTGACTCCAAAGAAGAAGAGAAGAGTTTGGTGTTTTCTTCACTTCCT
CTGGCCGTTGACTGGTTCAGGGACAGTGCTCGCCGGAAAAGTAAACAAGTTCGTTTTCAG
GTGTTGGTGACTGATTCATTACATTTGGTGGGTGATCTCTTGAGATTAATTAAGAAATGA
AATGTGTAAACCTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATTTGATGATTTGTACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DE39TF U 1
AF RR4CH71JQ C 89
BS 1 128 RR4DE39TF
BS 129 129 RR4CH71JQ
BS 130 188 RR4DE39TF
BS 189 189 RR4CH71JQ
BS 190 302 RR4DE39TF
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BS 341 341 RR4CH71JQ
BS 342 575 RR4DE39TF
BS 576 576 RR4CH71JQ
BS 577 601 RR4DE39TF
BS 602 602 RR4CH71JQ
BS 603 675 RR4DE39TF
BS 676 834 RR4CH71JQ

RD RR4DE39TF 676 0 0
GCTTCAAAACTAGATGTGAAACTTCAAGTGGTGGAACCACTGGACTCTAGTCAAAGACTA
GGGCTACAAGGAGAACACCAATATCTAAACGCTAGTCTTGCGGTTGCGTTGTGTTCTACA
TTTCTTCAGAAGATTGGTATTATTGAGGACAAGAATGATACAAATGGTTTACTACCTGAA
AGATTCATCTCTGGATTATCAAATGCTTATTTGATGGGACGAGCTATGATCGTGCCTGAC
TCAGAACTTCCTGAAGAGATTGTGTTTTACCTTGATGGAGCTCATAGTCCTGAAAGCATG
GAGGCTTGCGCTACTTGGTTTTCACAACAGGTCAAAGAAATAAACCAGAAAAGATCAGAG
CAGATACTCTTGTTCAATCGTATGACTGTTCGTGATCCGAGTTTGCTTCTTCCGAGATTA
AGGACTAAATGCATTGATCAAGGAGTTGAATTCAAGAAAGCAGTTTTTGTGCCAAACATG
TCTGTATACAACCAAGTGGGGGGATCTTGGTCAAAGTTTGAGCAACGTGTTGATGATTCA
ACGACGTGGCAGTTGGGTCTGAAGAGTATTTGGGATAATCTAGCACGCGGTGAAGCAAAA
ACTAAGTCAAGAAGTGACTCCAAAGAAGAAGAGAAGAGTTTGGTGTTTTCTTCACTTCCT
CTGGCCGTTGACTGG
C

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4CH71JQ 746 0 0
ACGCTAGTCTTGCGGTTGCGTTGTGTTCTACATTTCTTCACAAGATTGGTATTATTGAGG
ACAAGAATGATACAAATGGTTTACTACCTGAAAGATTCATATCTGGATTATCAAATGCTT
ATTTGATGGGACGAGCTATGATCGTGCCTGACTTAGAACTTCCTGAAGAGATTGTGTTTT
ACCTTGATGGAGCTCATAGTCCTGAAAGCATGGAAGCTTGCGCTACTTGGTTTTCACAAC
AGGTCAAAGAAAGAAACCAGAAAATATCAGAGCAGATACTTTTGTTCAATTGTATGACTG
TTCGTGATCCGAGTTTGCTTTTTCCGAGATTAAGGACTAAATGCATTGATCAAGGAGTTG
AATTCAAGAAAGCAGTTTTTGTGCCAAACATGTCTGTATACAACCAAGTGGGGGGATTTT
GGTCAAAGTTTGAGCAACGTGTTGATGATTCAACGACGTGGCAGTTGGGTTTGAAGAGTA
TTTGGGACAATTTAGCACGCGGTGAAGCAAAAAATAAGTCAAGAAGTGACTCCAAAGAAG
AAGAGAAGAGTTTGGTGTTTTTTTCACTTCCTTTGGCCGTTGACTGGTTCAGGGACAGTG
CTCGCCGGAAAAGTAAACAAGTTCGTTTTCAGGTGTTGGTGACTGATTCATTACATTTGG
TGGGTGATCTCTTGAGATTAATTAAGAAATGAAATGTGTAAACCTTGTTTTTTCTTTTTT
TTTTTTAATTTGATGATTTGTACTCG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL5265Contig1 849 2 2 U
GATGATGAAGTCACCCTTGTACAAATCCCTTCCCCCACCTCCGTATGTTAAACCGAGTGG
TAAAGCAAAGATTGAAAAACCTGAAGCTTCAAGTAATCCAAAGGCTCGGTTCGATGGTGA
AGAAGGAAATATTCCAGACGTTGATAAAAAGGTTTCTGAAGCAGGTCAGCTTAAAGTGAA
TGACATAGATGATCAATCTCTGAAGCGGCGATCTAGTAGAAGAAAACACAGTATACAATC
GGGTGATGGTGATGATGATACAAGAAGCAGCAGAAGGAGGGAGCACTCAAGGAAAGGCCT
TCAAGTCTTAATAGATGAAGATGAGAATGACAGTGAGGAAAAGATAATGGATAAACTTCT
GATGCATTACAGTAAAAAGCCTTCGAGTTATGAAAAGATCAAAGAAGAATCTAAAAGCAG
ACGTTCACATCATAGAAAAGACGAAGGTGAAGAGATTCATCATCCCGCTCGGTCACTTAG
TCTCCCCAGTGAGCAATTTGCCGGACCATCTGAACCCGCAAAGACGTTTGCTCGTGCCTC
CTCGTTTCAGCCAGAACGTAGTGAAGCTAAGCACGTTCACCCCAAGTTACCTGACTATGA
GGATTTGGCTGCTAGATTTGCAGAGCTAAAAGGAAAGTAATATGTTTTGAACAGTTTGTG
CCTTAGAGAAATATAGTGCGTCTGTACGAGATTAAAGATTCTATTACCCATTACTCACAT
CTTCCTATTACTTCCCCATTGTTGGTCTGACACATTGTTATGGACCCCCAAAGAGCTATT
GATCATCTGTTTCCGTATGGGTTTCATTTAACATTTTATTAACAAAATTGAAAGGATGTG
TTTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH04TF U 1
AF RR4DH04JQ C 217
BS 1 763 RR4DH04TF
BS 764 849 RR4DH04JQ

RD RR4DH04TF 763 0 0
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TAAAGCAAAGATTGAAAAACCTGAAGCTTCAAGTAATCCAAAGGCTCGGTTCGATGGTGA
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TGACATAGATGATCAATCTCTGAAGCGGCGATCTAGTAGAAGAAAACACAGTATACAATC
GGGTGATGGTGATGATGATACAAGAAGCAGCAGAAGGAGGGAGCACTCAAGGAAAGGCCT
TCAAGTCTTAATAGATGAAGATGAGAATGACAGTGAGGAAAAGATAATGGATAAACTTCT
GATGCATTACAGTAAAAAGCCTTCGAGTTATGAAAAGATCAAAGAAGAATCTAAAAGCAG
ACGTTCACATCATAGAAAAGACGAAGGTGAAGAGATTCATCATCCCGCTCGGTCACTTAG
TCTCCCCAGTGAGCAATTTGCCGGACCATCTGAACCCGCAAAGACGTTTGCTCGTGCCTC
CTCGTTTCAGCCAGAACGTAGTGAAGCTAAGCACGTTCACCCCAAGTTACCTGACTATGA
GGATTTGGCTGCTAGATTTGCAGAGCTAAAAGGAAAGTAATATGTTTTGAACAGTTTGTG
CCTTAGAGAAATATAGTGCGTCTGTACGAGATTAAAGATTCTATTACCCATTACTCACAT
CTTCCTATTACTTCCCCATTGTTGGTCTGACACATTGTTATGG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4DH04JQ 633 0 0
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GAGGGAGCACTCAAGGAAAGGCCTTCAAGTCTTAATAGATGAAGATGAGAATGACAGTGA
GGAAAAGATAATGGATAAACTTTTGATGCATTACAGTAAAAAGCCTTCGAGTTATGAAAA
GATCAAAGAAGAATTTAAAAGCAGACGTTCACATCATAGAAAAGACGAAGGTGAAGAGAT
TCATCATCCCGCTCGGTCACTTAGTCTCCCCAGTGAGCAATTTGCCGGACCATTTGAACC
CGCAAAGACGTTTGCTCGTGCCTCCTCGTTTCAGCCAGAACGTAGTGAAGCTAAGCACGT
TCACCCCAAGTTACCTGACTATGAGGATTTGGCTGCTAGATTTGCAGAGCTAAAAGGAAG
GTAATATGTTTTGAACAGTTTGTGCCTTAGAGAAATATAGTGCGTCTGTACGAGATTAAA
GATTTTATTACCCATTACTCACATCTTCCTATTACTTCCCCATTGTTGGTTTGACACATT
GTTATGGACCCCCAAAGAGCTATTGATCATCTGTTTCCGTATGGGTTTCATTTAACATTT
TATTAACAAAATTGAAAGGATGTGTTTTTGATT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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GGTATTGATCCAACTGGCGGAGACGAGTCTCCAGATCAAGGAAGTCATGGTGGTGTGGAC
GAGATAGACCATGATGCTTGGCTATACGAGACCTGCACGTTAGTACTACAGCTTGTTGTG
GATCTCTTTGTCAAATTCTACACTACAGTCAATCCACTTCTAAAGAAAGTACTAATGCTT
CTTGTGAGCTTCATAAAGAGACCTCACCAGAGCCTTGCAGGGATTGGTATCGCTGCGTTT
GTTCGTCTTATGAGCGACGCTGGTGTCTTGTTTTCTGAAGAGAAATGGTTAGAAGTAGTG
TCGTCTTTGAAAGAATCGGCGAAGACTACGTGTCCAGATTTTTCTTATTTCCTCAGCGAA
GAGTATGTGGAGAGAAGCCAAAGAAATGCAGAGTCTGTGAATCCAGTTGGCTCGGATGGT
AATGAAGAGAGTCAGACAACAGCACTCCGTCTTTACGCCGCTATCTCTGATGCTAAGCGC
CGTGCCGCGGTTCAGCTTCTGTTGATTCAGGCTGTGATGGAGATCTACCACATGTATAGA
CCTCAGCTCTCGGCGAAAAACACGATAGTTCTCTTCGACGCATTGCGCGGTGTAGCGTTA
CATGCTCACAGCGTAAACAGCAACTCGATATTGCGTTCAAGACTACAAGAGCTAGGACCC
ATGACGCAAATGTAAGATCCTCCACTACTTCGTCTCGAGAACGAGTCTTACCAAATCTGC
CTCACGTTCTTACAGAATCTCGTCACAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F828TF U 1
AF RR4F828JQ C 32
BS 1 619 RR4F828TF
BS 620 620 RR4F828JQ
BS 621 719 RR4F828TF
BS 720 720 RR4F828JQ
BS 721 738 RR4F828TF
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RD RR4F828TF 738 0 0
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GGTATTGATCCAACTGGCGGAGACGAGTCTCCAGATCAAGGAAGTCATGGTGGTGTGGAC
GAGATAGACCATGATGCTTGGCTATACGAGACCTGCACGTTAGTACTACAGCTTGTTGTG
GATCTCTTTGTCAAATTCTACACTACAGTCAATCCACTTCTAAAGAAAGTACTAATGCTT
CTTGTGAGCTTCATAAAGAGACCTCACCAGAGCCTTGCAGGGATTGGTATCGCTGCGTTT
GTTCGTCTTATGAGCGACGCTGGTGTCTTGTTTTCTGAAGAGAAATGGTTAGAAGTAGTG
TCGTCTTTGAAAGAATCGGCGAAGACTACGTGTCCAGATTTTTCTTATTTCCTCAGCGAA
GAGTATGTGGAGAGAAGCCAAAGAAATGCAGAGTCTGTGAATCCAGTTGGCTCGGATGGT
AATGAAGAGAGTCAGACAACAGCACTCCGTCTTTACGCCGCTATCTCTGATGCTAAGCGC
CGTGCCGCGGTTCAGCTTCTGTTGATTCAGGCTGTGATGGAGATCTACCACATGTATAGA
CCTCAGCTCTCGGCGAAAA*CACGATAGTTCTCTTCGACGCATTGCGCGGTGTAGCGTTA
CATGCTCACAGCGTAAACAGCAACTCGATATTGCGTTCAAGACTACAAGAGCTAGGACC*
ATGACGCAAATGTAAGAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4F828JQ 780 0 0
TT
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GATCAAGGAAGTCATGGTGGTGTGGACGAGATAGACCATGATGCTTGGCTATACGAGACC
TGCACGTTAGTACTACAGCTTGTTGTGGATCTCTTTGTCAAATTCTACACTACAGTCAAT
CCACTTCTAAAGAAAGTACTAATGCTTCTTGTGAGCTTCATAAAGAGACCTCACCAGAGC
CTTGCAGGGATTGGTATCGCTGCGTTTGTTCGTCTTATGAGCGACGCTGGTGTCTTGTTT
TCTGAAGAGAAATGGTTAGAAGTAGTGTCGTCTTTGAAAGAATCGGCGAAGACTACGTGT
CCAGATTTTTCTTATTTCCTCAGCGAAGAGTATGTGGAGAGAAGCCAAAGAAATGCAGAG
TCTGTGAATCCAGTTGGCTCGGATGGTAATGAAGAGAGTCAGACAACAGCACTCCGTCTT
TACGCCGCTATCTCTGATGCTAAGCGCCGTGCCGCGGTTCAGCTTCTGTTGATTCAGGCT
GTGATGGAGATCTACCACATGTATAGACCTCAGCTCTCGGCGAAAAACACGATAGTTCTC
TTCGACGCATTGCGCGGTGTAGCGTTACATGCTCACAGCGTAAACAGCAACTCGATATTG
CGTTCAAGACTACAAGAGCTAGGACCCATGACGCAAATGTAAGATCCTCCACTACTTCGT
CTCGAGAACGAGTCTTACCAAATCTGCCTCACGTTCTTACAGAATCTCGTCACAGACG

QA 3 780 3 780
DS 



AS 1 2

CO CL5267Contig1 482 2 2 U
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GCTGTGGGAAAAAATCAAAAAGAGTTACAATGAAAAAAAAGATGAGTGTTGGGAAATTAG
AAGCAACCGATCATTACAAGTTAGAATGAATACTATTCTTTATGCTGTTAGAAATTTGAA
GAGCTGCATAAGCCAAGTGGAGAATTTGAATCCAAGTAGTGCATCCGAATTTGACATTAT
GGAAAAAGTCAAGAAATTATTGGTACAAGATCCCAAAACTGAAAAAAGGTTTTAAATTTG
ATCATGTGTGGGCGTTATGAAGGATATCCTAAAATTTACCGATAATGTCAATTTTGGTAT
TCCAAACACTCCTGAGAGCCCCGTCGTCGGTTCTCCAACCTCTCAATTTCAAGGATTTTC
TTCATTTTCAATCAAATTTAAGATTTTCTTCATTTTCAATTAATTTAAATAGTGATGATG
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4B943TF U 1
AF RR4B943JQ C 131
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BS 228 482 RR4B943JQ

RD RR4B943TF 227 0 0
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GCTGTGGGAAAAAATCAAAAAGAGTTACAATGAAAAAAAAGATGAGTGTTGGGAAATTAG
AAGCAACCGATCATTACAAGTTAGAATGAATACTATTCTTTATGCTGTTAGAAATTTGAA
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QA 1 227 1 227
DS 

RD RR4B943JQ 352 0 0
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AGCCAAGTGGAGAATTTGAATCCAAGTAGTGCATCCGAATTTGACATTATGGAAAAAGTC
AAGAAATTATTGGTACAAGATCCCAAAACTGAAAAAAGGTTTTAAATTTGATCATGTGTG
GGCGTTATGAAGGATATCCTAAAATTTACCGATAATGTCAATTTTGGTATTCCAAACACT
CCTGAGAGCCCCGTCGTCGGTTCTCCAACCTCTCAATTTCAAGGATTTTCTTCATTTTCA
ATCAAATTTAAGATTTTCTTCATTTTCAATTAATTTAAATAGTGATGATGGT

QA 1 352 1 352
DS 



AS 1 2

CO CL5268Contig1 637 2 2 U
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AACCAAGAAGCTCTGTGAAGGGACATGCAACTACAACTACTGTCTAAGCTATTTCGACAC
TAAACGCGTCCTTTATTGCTGCATCCCCCTCACAGTGTTTTAGTGGTGGCTCATGGTTTT
ACTCATCAGTGCCGAAGTAACGATCACCAAACTCGCCTAAACCTGGTATAACTCGGAACT
CTTTGTTCAGACACTGGTCTATTTCAGATGTCACAATCTTCAATGCCGGAAACCGTTTGC
AGACACAATGAATTCCTTCTGGCGCCGAAATAAGGTTGAGGAATATAATGTGAGATTCAG
GAACTCCTTTCTGAATGAGTAGTTCAATGGCTTGATTAGCAGAGTTACCTGTAGCTAAAA
CAGGGTCTAGAAGCAGGACATGGCGTTCAGAGATGTCGCGAGGAAGCTTCTCATATATAA
GCTGTTTTCCATCGTCTCCATCACGATGAATAAGAATCTTCCCTAACTTAATCCCTTTGC
AGCAAGCGCGTAATGCATTTTCCACGCTTTCACCACT


BQ
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AF RR4F801JQ U 1
AF RR4GA39JQ U 317
BS 1 620 RR4F801JQ
BS 621 637 RR4GA39JQ

RD RR4F801JQ 620 0 0
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TAAACGCGTCCTTTATTGCTGCATCCCCCTCACAGTGTTTTAGTGGTGGCTCATGGTTTT
ACTCATCAGTGCCGAAGTAACGATCACCAAACTCGCCTAAACCTGGTATAACTCGGAACT
CTTTGTTCAGACACTGGTCTATTTCAGATGTCACAATCTTCAATGCCGGAAACCGTTTGC
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GAACTCCTTTCTGAATGAGTAGTTCAATGGCTTGATTAGCAGAGTTACCTGTAGCTAAAA
CAGGGTCTAGAAGCAGGACATGGCGTTCAGAGATGTCGCGAGGAAGCTTCTCATATATAA
GCTGTTTTCCATCGTCTCCATCACGATGAATAAGAATCTTCCCTAACTTAATCCCTTTGC
AGCAAGCGCGTAATGCATTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4GA39JQ 321 0 0
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TTCTGGCGCCGAGATAAGGTTGAGGAATATAATGTGAGATTCAGGAACTCCTTTCTGAAT
GAGTAGTTCAATGGCTTGATTAGCAGAGTTACCTGTAGCTAAGACAGGGTCTAGAAGCAG
GACATGGCGTTCAGAGATGTCGCGAGGAAGCTTCTCATATATAAGCTGTTTTCCATCGTC
TCCATCACGATGAATAAGAATCTTCCCTAACTTAATCCCTTTGCAGCAAGCGCGTAATGC
ATTTTCCACGCTTTCACCACT

QA 1 321 1 321
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5270Contig1 996 2 2 U
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ATTCACTCAATGACTTTTTAGTTCTGTTATTATTGATTTCAGCAAATCATATGCAAGTAT
TCAGGAACATTGAGGAAACTGCTTGGGAAGTCTACATGTTCTTCCAGTGGTAACCTCAAG
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TACAACAACTGTGAATGGACTACTGTGATGCCTTCAAATGTAGTCTTCTTGCATTGTGCT
GCTAAGTTCATGGAAGTCAATAAAGTCTTGGTACAGACTGAGAAGTGTATGGAGGAGATT
CGGTATTGGGCTTGGCCAGAGGTTCTTCTTGGTTTGAAACAGTGTCAAGTACTTGAAACA
TCCTCTGAGGCTGCTGAGTCTTTAGCCGTTAAGTTGATGGATGCGCTCGTGGAGAAACTG
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TTGTTTCGTTTCTCTTGTGACAGTAAAAGCACGGAGAGTTTCAAGAACAGCTCTTCTCGG
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AAGCTGACGGTGTTGAGGAAATTTGACAATGTTACCATCGCTAGGTTCTTGTTCTATTAC
CAGAAGGTCAAGTTCTGTTCTGCGTCATCATCAAATGAGAAAAGAGAGATTCTTGAAACG
ACCGTTGATACTCTCTACGTGTTGGACCGAAGCTGTGTTCTTACAAGAGTCTTTTCGGTG
TTTTGAGGCTTGCTCTTGGGTTAAACATAAACAAAAGTGGTATGAACAAACTCGAGGTTA
TGATTGGTCAGCAACTGGAACAAGCAACGCTTGACACTCTTCTTGTTCCGTCTCCAGTGA
AGTCTAGTCACTTGTACTATGTGAATCTTGTTCTTA


BQ
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AF RR4ED58TF U 1
AF RR4GL03TF U 408
BS 1 674 RR4ED58TF
BS 675 996 RR4GL03TF

RD RR4ED58TF 674 0 0
GATAAAAACGGTAACATGGCATTAAAGTTAAAACTTTTTTTCATGTGGGGGTCTTTCAAG
ATTCACTCAATGACTTTTTAGTTCTGTTATTATTGATTTCAGCAAATCATATGCAAGTAT
TCAGGAACATTGAGGAAACTGCTTGGGAAGTCTACATGTTCTTCCAGTGGTAACCTCAAG
TTGATCTTCAATGACTTCCCTGGTGGAGCCCAAAGTTTCGAGCTTTTGTCAAGATTCTGC
TACAACAACTGTGAATGGACTACTGTGATGCCTTCAAATGTAGTCTTCTTGCATTGTGCT
GCTAAGTTCATGGAAGTCAATAAAGTCTTGGTACAGACTGAGAAGTGTATGGAGGAGATT
CGGTATTGGGCTTGGCCAGAGGTTCTTCTTGGTTTGAAACAGTGTCAAGTACTTGAAACA
TCCTCTGAGGCTGCTGAGTCTTTAGCCGTTAAGTTGATGGATGCGCTCGTGGAGAAACTG
TGTTTAGCCATTGAAGCGAGTCCCTCTAGTGCTCCTTGCTCGCCTTCACCAGATAGCAGC
TTGTTTCGTTTCTCTTGTGACAGTAAAAGCACGGAGAGTTTCAAGAACAGCTCTTCTCGG
ATAACTTGGTGGTTCGATGAGGTTCTTGTTCTAAGTCCCGGTTTGGTCAAAGCGTTCTTG
AAGCTGACGGTGTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GL03TF 589 0 0
G
GTACTTGAAACATCCTCTGAGGCTGCTGAGTCTTTAGCCGTTAAGTTGATGGATGCGCTC
GTGGAGAAACTGTGTTTAGCCATTGAAGCGAGTCCCTCTAGTGCTCCTTGCTCGCCTTCA
CCAGATAGCAGCTTGTTTCGTTTCTCTTGTGACAGTAAAAGCACGGAGAGTTTCAAGAAC
AGCTCTTCTCGGATAACTTGGTGGTTCGATGAGGTTCTTGTTCTAAGTCCCGGTTTGGTC
AAAGCGTTCTTGAAGCTGATGGTGTTGAGGAAATTTGACAATGTTACCATCGCTAGGTTC
TTGTTCTATTACCAGAAGGTCAAGTTCTGTTCTGCGTCATCATCAAATGAGAAAAGAGAG
ATTCTTGAAACGACCGTTGATACTCTCTACGTGTTGGACCGAAGCTGTGTTCTTACAAGA
GTCTTTTCGGTGTTTTGAGGCTTGCTCTTGGGTTAAACATAAACAAAAGTGGTATGAACA
AACTCGAGGTTATGATTGGTCAGCAACTGGAACAAGCAACGCTTGACACTCTTCTTGTTC
CGTCTCCAGTGAAGTCTAGTCACTTGTACTATGTGAATCTTGTTCTTA

QA 2 589 2 589
DS 



AS 1 2

CO CL5271Contig1 749 2 4 U
GGGTATTTTCTTAATCCGAATTCCCTTCCCCAAGCAAACCAGCTCGGGAGAAGCCCCAGT
CACAACCACAGCCACAAGATGCAGCTTCTCCTATGGCCACTTCATTTTACTCAGAAATGC
TCAGCAGACAAACCAAGTCGCTTTTGGAGGAATATTTCAATGTACGTCTGATGGATGAGG
CATTGCAATGCGTAGAGGAACTTAAATCCCCATCTCACCATCCGGAGCTCGTCAAGGAAG
CTATCTCCCTCGGCTTGGAGAAAAATCCACCGTGCTTTGAACCAGTGGTGAGACTCTTGG
AATATTTGGTCTCTAAGAAGGTTCTAACTCCTAAAGACATAGAGAGTGGTTGTCTGCTTT
ACGGGTCTATCCTCGATGACATTGGAATCGATCTGCCAAAGGCACCAAACAACTTTGGGG
AGATCCTTGGGAGTTTGGTTATGGCCAATGCATCAGATTTTGGGATGGTGGAAGAGATTC
TAATGAAAATGGAGGATGGTCGGTTCAAGAAAGCAGTCTTGGATGCTGTGATGAAGAGTG
TAAGCGAATCTCTGTTGGTCGCGCAAGCTGCCAAAGTCGAGGCTTGCCGTAGTTTGGTGT
AAGCTGTTGTGTGGTTTCATCTCTGTTACAGCAGGATACTTCTGGTTCGACCTGAAAAGC
TTTAATATCTCTATGTTTGAATAAGTTTGGTTATGTATCCTCTTTGTTATATGGACCATT
TGTTAGTGAGTAAATTCACATTTTGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI67TF U 1
AF RR4EI67JQ C 120
BS 1 634 RR4EI67TF
BS 635 635 RR4EI67JQ
BS 636 655 RR4EI67TF
BS 656 749 RR4EI67JQ

RD RR4EI67TF 655 0 0
GGGTATTTTCTTAATCCGAATTCCCTTCCCCAAGCAAACCAGCTCGGGAGAAGCCCCAGT
CACAACCACAGCCACAAGATGCAGCTTCTCCTATGGCCACTTCATTTTACTCAGAAATGC
TCAGCAGACAAACCAAGTCGCTTTTGGAGGAATATTTCAATGTACGTCTGATGGATGAGG
CATTGCAATGCGTAGAGGAACTTAAATCCCCATCTCACCATCCGGAGCTCGTCAAGGAAG
CTATCTCCCTCGGCTTGGAGAAAAATCCACCGTGCTTTGAACCAGTGGTGAGACTCTTGG
AATATTTGGTCTCTAAGAAGGTTCTAACTCCTAAAGACATAGAGAGTGGTTGTCTGCTTT
ACGGGTCTATCCTCGATGACATTGGAATCGATCTGCCAAAGGCACCAAACAACTTTGGGG
AGATCCTTGGGAGTTTGGTTATGGCCAATGCATCAGATTTTGGGATGGTGGAAGAGATTC
TAATGAAAATGGAGGATGGTCGGTTCAAGAAAGCAGTCTTGGATGCTGTGATGAAGAGTG
TAAGCGAATCTCTGTTGGTCGCGCAAGCTGCCAAAGTCGAGGCTTGCCGTAGTTTGGTGT
AAGCTGTTGTGTGGTTTCATCTCTGTTACAGCAG*ATACTTCTGGTTCGACCTGA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4EI67JQ 630 0 0
CTCAGCAGACAAACCAAGTCGCTTTTGGAGGAATATTTCAATGTACGTCTGATGGATGAG
GCATTGCAATGCGTAGAGGAACTTAAATCCCCATCTCACCATCCGGAGCTCGTCAAGGAA
GCTATCTCCCTCGGCTTGGAGAAAAATCCACCGTGCTTTGAACCAGTGGTGAGACTCTTG
GAATATTTGGTCTCTAAGAAGGTTCTAACTCCTAAAGACATAGAGAGTGGTTGTTTGCTT
TACGGGTCTATCCTCGATGACATTGGAATCGATCTGCCAAAGGCACCAAACAACTTTGGG
GAGATCCTTGGGAGTTTGGTTATGGCCAATGCATCAGATTTTGGGATGGTGGAAGAGATT
CTAATGAAAATGGAGGATGGTCGGTTCAAGAAAGCAGTCTTGGATGCTGTGATGAAGAGT
GTAAGCGAATCTCTGTTGGTCGCGCAAGCTGCCAAAGTCGAGGCTTGCCGTAGTTTGGTG
TAAGCTGTTGTGTGGTTTCATCTCTGTTACAGCAGGATACTTTTGGTTCGACCTGAAAAG
CTTTAATATCTCTATGTTTGAATAAGTTTGGTTATGTATCCTCTTTGTTATATGGACCAT
TTGTTAGTGAGTAAATTCACATTTTGAGTT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL5272Contig1 873 2 2 U
GGAGGGTTCCTCGCCGAACACACATCCATCCATCACCTTCCACACTATTTCCGCTAAGTG
TTTCCGAAGAGCCATGGAGACTGGGAAACGAGACAGAGAAGACATGGAAGTGCAACCCTC
CTCTCCGAGGAAGCCACGTGTACTACTCGCTGCAAGCGGAAGCGTCGCCGCCATCAAATT
CGGCAATCTCTGCCACTGTTTCACAGAGTGGGCTGAAGTGAGAGCCGTCGTCACGAAATC
GTCTCTTCATTTCGTCGACAGACTCTCTCTCCCAGGGGAAGTGACGCTGTACACTGATGA
AGATGAGTGGTCGAGCTGGAACAAGATCGGCGATCCTGTGCTTCACATCGAGCTCAGACG
CTGGGCTGATGTTTTGGTCATTGCTCCTTTGTCTGCTAACACATTAGGGAAGATTGCTGG
TGGGCTGTGTGATAATCTTCTGACTTGTATCATTCGAGCTTGGGATTATAGCAAACCGCT
TTTCGTTGCACCTGCGATGAATACTTTGATGTGGAACAATCCTTTTACGGAAAGGCATTT
GTTGTCGCTTGATGAACTTGGAGTCACGCTTATTCCTCCCATCAAGAAGAGATTGGCGTG
TGGGGACTATGGTAACGGCTCAATGGCTGAGCCTTCTCTTATCTATTCCACCGTCAGGCT
CTTCTGGGAGTCGCAGGCTCATCAGCAAAGCGGTGGTACAAGTTAAAACACCGTGGTGGT
GTCCACTTTGCATTGGTTGGTTCTGTTTTCAGTGTCATAGATAAATAGATTATTCAGTCT
GTAATGCTTGTTTTTTTGTACATCTTTAAGACAGCTGTCTGGATTGATGTCTCCACCACT
CATGTTGCTGTAGAAAACTATTTAAGTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H348TF U 1
AF RR4H348JQ C 250
BS 1 671 RR4H348TF
BS 672 873 RR4H348JQ

RD RR4H348TF 671 0 0
GGAGGGTTCCTCGCCGAACACACATCCATCCATCACCTTCCACACTATTTCCGCTAAGTG
TTTCCGAAGAGCCATGGAGACTGGGAAACGAGACAGAGAAGACATGGAAGTGCAACCCTC
CTCTCCGAGGAAGCCACGTGTACTACTCGCTGCAAGCGGAAGCGTCGCCGCCATCAAATT
CGGCAATCTCTGCCACTGTTTCACAGAGTGGGCTGAAGTGAGAGCCGTCGTCACGAAATC
GTCTCTTCATTTCGTCGACAGACTCTCTCTCCCAGGGGAAGTGACGCTGTACACTGATGA
AGATGAGTGGTCGAGCTGGAACAAGATCGGCGATCCTGTGCTTCACATCGAGCTCAGACG
CTGGGCTGATGTTTTGGTCATTGCTCCTTTGTCTGCTAACACATTAGGGAAGATTGCTGG
TGGGCTGTGTGATAATCTTCTGACTTGTATCATTCGAGCTTGGGATTATAGCAAACCGCT
TTTCGTTGCACCTGCGATGAATACTTTGATGTGGAACAATCCTTTTACGGAAAGGCATTT
GTTGTCGCTTGATGAACTTGGAGTCACGCTTATTCCTCCCATCAAGAAGAGATTGGCGTG
TGGGGACTATGGTAACGGCTCAATGGCTGAGCCTTCTCTTATCTATTCCACCGTCAGGCT
CTTCTGGGAGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4H348JQ 624 0 0
TTTCGTCGACAGACTCTCTCTCCCAGGGGAAGTGACGCTGTACACTGATGAAGATGAGTG
GTCGAGCTGGAACAAGATCGGCGATCCTGTGCTTCACATCGAGCTCAGACGCTGGGCTGA
TGTTTTGGTCATTGCTCCTTTGTCTGCTAACACATTAGGGAAGATTGCTGGTGGGCTGTG
TGATAATCTTTTGACTTGTATCATTCGAGCTTGGGATTATAGCAAACCGCTTTTCGTTGC
ACCTGCGATGAATACTTTGATGTGGAACAATCCTTTTACGGAAAGGCATTTGTTGTCGCT
TGATGAACTTGGAGTCACGCTTATTCCTCCCATCAAGAAGAGATTGGCGTGTGGGGACTA
TGGTAACGGCTCAATGGCTGAGCCTTCTTTTATCTATTCCACCGTCAGGCTCTTTTGGGA
GTCGCAGGCTCATCAGCAAAGCGGTGGTACAAGTTAAAACACCGTGGTGGTGTCCACTTT
GCATTGGTTGGTTCTGTTTTCAGTGTCATAGATAAATAGATTATTCAGTCTGTAATGCTT
GTTTTTTTGTACATCTTTAAGACAGCTGTCTGGATTGATGTCTCCACCACTCATGTTGCT
GTAGAAAACTATTTAAGTTCATTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL5273Contig1 825 2 8 U
GTTATGGCCGGGATGCTACTCCGGATCAGATAGAAGAGGCAGCAAAAAAAGCTCGTGCGC
ACACATTTATTAGCTCACTTGACAAAGGATATGAAACTCAGGTTGGGAAGGCTGGTTTAA
CGCTGACGGAGGAGCAGAAAATAAAACTTTCGATTGCTAGAGCTGTACTCTTAGATCCAA
AAATACTGCTGCTTGATGAGGTCACTGGAGGACTAGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCC
AAGAAGCTCTTGATCTTCTGATGTTAGGACGGTCAACCATAATAATAGCACGACGGCTAA
GTCTGATAAGAAATGCGGACTATATTGCTGTAATGGAAGGGGGCCAGCTACTCGAAATGG
GTACACATGATGAATTAATCAACCTTGGTAATTTGTATGCTGAGCTTCTCAAGTGTGAAG
AAGCGACAAAGCTACCCAGACGGATGCCAGTTAGGAACTACAACGATTCTGCTGGGTTCC
AGCCTGAGAGGGATTCTTCAGCTGGTCGTGGCTTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGG
CCAAGTCTCCATCTCTTCAGAGAGGTCACAATGTTTTCCGCCCCCAGGAAATGTACTTTA
ACAGTGAAGGGTCACCCAATGATCATAGCCCTGCTCCAGAGAAAATGGGAGAAAATGGCT
CGTCTTTGGATGTCGCTGATAAGGAACCAACCATTAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGC
GGTTACCAGAACTACCAAAAATTGACATTCAGTGTCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTT
CAGATCCGGAGTCCCCTATATCACCCCTTCTGATATCAGATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DL64TF U 1
AF RR4DL64JQ C 10
BS 1 683 RR4DL64TF
BS 684 684 RR4DL64JQ
BS 685 698 RR4DL64TF
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BS 705 723 RR4DL64TF
BS 724 825 RR4DL64JQ

RD RR4DL64TF 725 0 0
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CGCTGACGGAGGAGCAGAAAATAAAACTTTCGATTGCTAGAGCTGTACTCTTAGATCCAA
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AAGAAGCTCTTGATCTTCTGATGTTAGGACGGTCAACCATAATAATAGCACGACGGCTAA
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CCAAGTCTCCATCTCTTCAGAGAGGTCACAATGTTTTCCGCCCCCAGGAAATGTACTTTA
ACAGTGAAGGGTCACCCAATGATCATAGCCCTGCTCCAGAGAAAATGGGAGAAAATGGCT
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GGT
AC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4DL64JQ 816 0 0
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TTGATCTTCTGATGTTAGGACGGTCAACCATAATAATAGCACGACGGCTAAGTCTGATAA
GAAATGCGGACTATATTGCTGTAATGGAAGGGGGCCAGCTACTCGAAATGGGTACACATG
ATGAATTAATCAACCTTGGTAATTTGTATGCTGAGCTTCTCAAGTGTGAAGAAGCGACAA
AGCTACCCAGACGGATGCCAGTTAGGAACTACAACGATTCTGCTGGGTTCCAGCCTGAGA
GGGATTCTTCAGCTGGTCGTGGCTTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGGCCAAGTCTC
CATCTCTTCAGAGAGGTCACAATGTTTTCCGCCCCCAGGAAATGTACTTTAACAGTGAAG
GGTCACCCAATGATCATAGCCCTGCTCCAGAGAAAATGGGAGAAAATGGCTCGTCTTTGG
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AACTACCAAAAATTGACATTCAGTGTCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGG
AGTCCCCTATATCACCCCTTCTGATATCAGATCCCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5274Contig1 837 2 2 U
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TTTGCACAAATGGACTACGTTAGCAAGCTCAATGACCTTGCCGTGGCATCGCGTTCAATA
TCGACATTAGAGGAAATGATTGACAAAGACATTCAGACAGGCTGTGTAAAGAAATATGGT
AGCCATACAAGAAACCTTTTGAAGGTAAAGCAGGGTCTTGAAATGATCAAGGTTTTTTGC
GAAGAGTTACTGGCTACTGAAGGTGATGACTCTCTAAAGGATGCAGCAATTAAGGCTTAC
AATCAAGTGCTTTTTCCTCACCATCAGTATAATATTCAGAAAGCTTGTGCTACTGGGTTG
AACTCTCTCCCCTCGAAGTCTTTGGTGCTACTCCTGCTCGGTGAAGCTGAGGAAACGATT
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CTCTTCCTCTCCAAGAACCTTGGTATCGATTGGTGAAGAGACTGAAAACTCAAGAAAACT
CGCATGGGCCTGGTTATTTTGCAAGTATTATCACTCTTTAAAGTATCTCTTTTATCAATC
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BQ
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AF RR4GH48TF U 1
AF RR4GH48JQ C 216
BS 1 738 RR4GH48TF
BS 739 837 RR4GH48JQ

RD RR4GH48TF 738 0 0
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GCCTTCAAGGGACTGGCTGCCACCGTGAATTCACGGAATCCGCAGGTGGCTGTGAGTCAG
TTCTCTGACGCATGCTCTCTCTTCTCGGGCCTCTTTGGTATTCTTGATACGTCCTTCAAG
TTTGCACAAATGGACTACGTTAGCAAGCTCAATGACCTTGCCGTGGCATCGCGTTCAATA
TCGACATTAGAGGAAATGATTGACAAAGACATTCAGACAGGCTGTGTAAAGAAATATGGT
AGCCATACAAGAAACCTTTTGAAGGTAAAGCAGGGTCTTGAAATGATCAAGGTTTTTTGC
GAAGAGTTACTGGCTACTGAAGGTGATGACTCTCTAAAGGATGCAGCAATTAAGGCTTAC
AATCAAGTGCTTTTTCCTCACCATCAGTATAATATTCAGAAAGCTTGTGCTACTGGGTTG
AACTCTCTCCCCTCGAAGTCTTTGGTGCTACTCCTGCTCGGTGAAGCTGAGGAAACGATT
AATGTACATCTGCAAAGCTATGTTACTGCATCGACACCAGTAATTGTATATCTTGACAAA
CTCTTCCTCTCCAAGAACCTTGGTATCGATTGGTGAAGAGACTGAAAACTCAAGAAAACT
CGCATGGGCCTGGTTATTTTGCAAGTATTATCACTCTTTAAAGTATCTCTTTTATCAATC
TATGCATGTAATGACATT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4GH48JQ 622 0 0
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GACAGGCTGTGTAAAGAAATATGGTAGCCATACAAGAAACCTTTTGAAGGTAAAGCAGGG
TCTTGAAATGATCAAGGTTTTTTGCGAAGAGTTACTGGCTACTGAAGGTGATGACTCTCT
AAAGGATGCAGCAATTAAGGCTTACAATCAAGTGCTTTTTCCTCACCATCAGTATAATAT
TCAGAAAGCTTGTGCTACTGGGTTGAACTCTCTCCCCTCGAAGTCTTTGGTGCTACTCCT
GCTCGGTGAAGCTGAGGAAACGATTAATGTACATCTGCAAAGCTATGTTACTGCATCGAC
ACCAGTAATTGTATATCTTGACAAACTCTTCCTCTCCAAGAACCTTGGTATCGATTGGTG
AAGAGACTGAAAACTCAAGAAAACTCGCATGGGCCTGGTTATTTTGCAAGTATTATCACT
CTTTAAAGTATCTCTTTTATCAATCTATGCATGTAATGACATTACGGCCTCCAAAAGCTG
GATCATTTCATGAACCGCTTTGGTTATGTCCGAGAAAAACTCAAATAAACCATCTTTATA
TCAAAGGTATGTTTATGAGGTC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5275Contig1 425 2 1 U
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GGGGCATGCTTCTTTTGCTTTTAATAGTTATTACCAAAAGGAAGGGAGGGGTTATGGTTC
TTGTGACTTTAAAGGTGTTGCTATGATCACTACTACAGACCCAAGTCATGGAAGCTGCAT
TTTCCCAGGAAGCAAGAAGGTGGGAAACCGAACACAAACGGTGGTGAATTCAACCCAAGT
CGCCGGGAGTGAAGCCTTCTCAAGGATTCTCTCAAGAGGCTTCTGCGTTAGTATTATGAT
TCTTGTAACTTGTATTTTGATACCTTTCTGGTGATTGTTCATTTTTCCACGGTGAGTGAC
GATTCTCTAGGTTCACAAACATTGTTTTCTATGAAGTTCTAGATTTATAAACATTCTATT
TTACC


BQ
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AF RR4D875JQ C 1
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TTACC

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CGCCGGGAGTGAAGCCTTCTCAAGGATTCTCTCAAGAGGCTTCTGCGTTAGTATTATGAT
TCTTGTAACTTGTATTTTGATACCTTTCTGGTGATTGTTCATTTTTCCACGGTGAGTGAC
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TTACC

QA 1 425 1 425
DS 



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BQ
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AF RR4CE53JQ C 1
AF RR4CE53TF U 1
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QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4EB03TF U 1
AF RR4EB03JQ C 341
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BS 659 659 RR4EB03JQ
BS 660 710 RR4EB03TF
BS 711 711 RR4EB03JQ
BS 712 721 RR4EB03TF
BS 722 1200 RR4EB03JQ

RD RR4EB03TF 721 0 0
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GGTTTTCTCCGATTGATTTGCGGTGGTTCCGGCGGTGGCGTGTCTTCACCGTTGCCGTCG
GAACAGTCTGTCTAGTTTTAATCATTTGTTGTTGTTTCTTTTGGTTTACTCAACCCTTCT
CTTTCCTTTTGTGTGACCCTCTGTAGTTTTTGATAGCTTGGTTTTGCTATTGTTTGCTAC
TGTTAAGGAGCTCTGATGAAAGATCAGCGATTTTATCTCGGGCTTATTATCAAATTCCTG
GTTAGATCTGGGTTTCGTGGTGTTGCAGGTTTGGTTGGTTTTCAGATCTGCTTTTCTCGT
GCTCAGATCCAGTCGGTGTGAATGTCTACGGCGGTAATGAGTTGTTTGGCTCTGGCTTCT
CTGCTCATGCTTTAGTGTCTCCGCAAGGATAACTCTCAAGCTCCGTTTCCGTCGTCCTCC
ATGGTGTGGACTTCCGGCCGAGGGTTTTAATCCGGATAATCTCTCTTGGTTTCTGAGCTT
GTCTTAGTTGGTGCTTGATTCAGCAACGGTGTAGCATTTCGTGGTGATGTGTGGTGAGCA
TATGAGGGTTTTGGTTCTTGAGAAGTAGGTGGTTTCAGATCACTTATTCGTCTCTCAG*T
TTGTTGGAGGCCTTCTCCTGCCTAATGTTTTAGTGTTTATCCTGGTCTTC*TTTGGTCTC
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4EB03JQ 860 0 0
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GTTGTTTGGCTCTGGCTTCTCTGCTCATGCTTTAGTGTCTCCGCAAGGATAACTCTCAAG
CTCCGTTTCCGTCGTCCTCCATGGTGTGGACTTCCGGCCGAGGGTTTTAATCCGGATAAT
CTCTCTTGGTTTCTGAGCTTGTCTTAGTTGGTGCTTGATTCAGCAACGGTGTAGCATTTC
GTGGTGATGTGTGGTGAGCATATGAGGGTTTTGGTTCTTGAGAAGTAGGTGGTTTCAGAT
CACTTATTCGTCTCTCAGGTTTGTTGGAGGCCTTCTCCTGCCTAATGTTTTAGTGTTTAT
CCTGGTCTTCCTTTGGTCTCTGTTTTCCTCGTGGCTTCGTCTGGTTGAGGCAATATAAAG
AGGTTGAGGCGTGGAGGCTTATGGTTTTAAGGTGCGGTTGAGTATGGTGCTCTCGCGGAT
GTTGTTACATCCTGGTTTATGTGTTGAGTTCGTGGCAGTAGTTTGGTGGGTTTCATCGTG
AACAGGTGGTTCAGATGAGGTTTATGCTCTTCATGAAATAGTCATCCGTGGTGCTTGATC
TCTTGCGCAGTTCGTTGCAAGATAACCGGCTAGTTGTAGCGTCCTAAATCATTGTTCTTT
TATCTCTGGTTGATTGTCTCTTGATTTCTTAAAAGGAGAATAGGGGTTTAGTTTAATTTC
TGGAGGTTTGTTTGTAGCCTGTGTGTTTGGGTTCTAGATTCCCGATTTTGGGCTTAGTTT
CCCGGGATATCTTTGTATTCCGCCGGCTTTAGTATCTCAACCTTGTATCTTTCTTATGTT
ATTAATAAAATCAGATGGGG

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL5278Contig1 857 2 2 U
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GCAAAGATGTTTGTAGATTGGCAAAAATGGAGAGCCTCCATGGTTCCTCCAAATGGGATC
CCAGACTCAGAAGTGAGAGATGAGTTGGAGTTCGGAAAGATCTGTCTTCAGGGTCCAACC
AAATCCGGACACCCTTTGGTGCTTGTCTTATGCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGAATGCA
GTTAACTTCAAGAGTAATCACTTTTCACTCTGTTAAAAGACTTTTTTTATATCAGCATTC
ATGTTCTCTTGTTATTGAGTAGTTTCATTTCGAGTCAGTGGATTCTTGAGACTAATCTTT
TCATGTCTTTGGTGTTGCAGAGTTTGTTGTTTATGTACTAGACAAAACAATAGCAAGTGG
CATCAAAGACAAAGAAGTAGGAGATGAGAAGTTAGTAGCCGTTTTCGATCTTGCTAACAT
TACATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGACTAATCACCAGCTTTCAGTTCTTACAATCTTA
CTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACATGCTGCATATGCCTGGATTCTTCGTGTCCGT
TTGGAGATTCGTCTGCCGTTTTCTAGAGAAATCTACTCAAGAAAAGATTGTGATAGTAAC
GGACGGAGAAGAAGAGATAAAGTTCAAGGAGGAGATCGGAGTAGATGCCTTGCCGGAAGA
ATACGGTGGACGATCTAAACTCACACTAATCCAAGATGTTCTTCTTCCTCAGACTGCTCC
ACAAATGTGAAACAAGCAAAACAATAACCATGTTTAATTCTTCTTGAGAGCAATTATAAA
ACACTAAACCCTGCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G456TF U 1
AF RR4G456JQ C 189
BS 1 711 RR4G456TF
BS 712 857 RR4G456JQ

RD RR4G456TF 711 0 0
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GCAAAGATGTTTGTAGATTGGCAAAAATGGAGAGCCTCCATGGTTCCTCCAAATGGGATC
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AAATCCGGACACCCTTTGGTGCTTGTCTTATGCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGAATGCA
GTTAACTTCAAGAGTAATCACTTTTCACTCTGTTAAAAGACTTTTTTTATATCAGCATTC
ATGTTCTCTTGTTATTGAGTAGTTTCATTTCGAGTCAGTGGATTCTTGAGACTAATCTTT
TCATGTCTTTGGTGTTGCAGAGTTTGTTGTTTATGTACTAGACAAAACAATAGCAAGTGG
CATCAAAGACAAAGAAGTAGGAGATGAGAAGTTAGTAGCCGTTTTCGATCTTGCTAACAT
TACATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGACTAATCACCAGCTTTCAGTTCTTACAATCTTA
CTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACATGCTGCATATGCCTGGATTCTTCGTGTCCGT
TTGGAGATTCGTCTGCCGTTTTCTAGAGAAATCTACTCAAGAAAAGATTGTGATAGTAAC
GGACGGAGAAGAAGAGATAAAGTTCAAGGAGGAGATCGGAGTAGATGCCTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4G456JQ 669 0 0
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CAAGAGTAATCACTTTTCACTCTGTTAAAAGACTTTTTTTATATCAGCATTCATGTTCTC
TTGTTATTGAGTAGTTTCATTTCGAGTCAGTGGATTCTTGAGACTAATCTTTTCATGTCT
TTGGTGTTGCAGAGTTTGTTGTTTATGTACTAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATCAAAG
ACAAAGAAGTAGGAGATGAGAAGTTAGTAGCCGTTTTCGATCTTGCTAACATTACATACA
AGAACCTTGATGCTCGTGGACTAATCACCAGCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTACCCGG
AACGCCTTGCAAAATGCTACATGCTGCATATGCCTGGATTCTTCGTGTCCGTTTGGAGAT
TCGTCTGCCGTTTTCTAGAGAAATCTACTCAAGAAAAGATTGTGATAGTAACGGACGGAG
AAGAAGAGATAAAGTTCAAGGAGGAGATCGGAGTAGATGCCTTGCCGGAAGAATACGGTG
GACGATCTAAACTCACACTAATCCAAGATGTTCTTCTTCCTCAGACTGCTCCACAAATGT
GAAACAAGCAAAACAATAACCATGTTTAATTCTTCTTGAGAGCAATTATAAAACACTAAA
CCCTGCTCT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL5279Contig1 527 2 1 U
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CCTTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAAT
CTGCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCAC
TGTCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGT
CCCAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCA
CGGATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTCCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCT
TTCCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGT
CACATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATCATACTCAAAAAGACTGCCAC
AGAGTTCAGTCTGTATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GN24JQ C 1
AF RR4GN24TF U 1
BS 1 527 RR4GN24TF

RD RR4GN24JQ 527 0 0
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CCTTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAAT
CTGCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCAC
TGTCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGT
CCCAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCA
CGGATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTCCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCT
TTCCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGT
CACATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTTTGCATCATACTCAAAAAGACTGCCAC
AGAGTTCAGTCTGTATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAGG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4GN24TF 527 0 0
GGATTCTGAAACGTGTAATTCTCGTGGCTTTGGGGATCATGCAGGATCAAACATGGCTTT
CCTTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAAT
CTGCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCAC
TGTCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGT
CCCAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCA
CGGATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTCCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCT
TTCCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGT
CACATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATCATACTCAAAAAGACTGCCAC
AGAGTTCAGTCTGTATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAGG

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL5280Contig1 1062 2 12 U
AGGGTCCTTCGATAGGCGATGTTGATGGGATGGACATACTGATGTCGTGGTTCCCACAAC
ATCAGGAAACATTTACGTTCTGAGTGGCAAGGATGGTTCGATTGTCCGTCCTTACCCGTA
CAGAACCCATGGAAGAGTGATGAACCAAGTTCTTCTTGTTGATCTGAACAAGCGAGGTGA
CAAAAAGAAGGGACTTACCATTGTTACCACATCCTTTGACGGTTACATGTATCTCATAGA
TGGGCCCACCTCGTGCGCTGACGTTGTCGATATTGGTGAAACTTCATACAGCATGGTCTT
GGCTGATAATGTTGACGGTGGAGATGATCTTGATCTCATCGTCTCAACTATGAACGGGAA
CGTCTTTTGCTTCTCCACGCCTTCTCCTCACCATCCCCTCAAGGCTTGGAGATCGACTGA
TCAAGGGATGAACAATAAGGCTATCCGTTACGATCGTGAAGGCGTTTTTGTCACGCATTC
AACCAGAGGCTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAAACTTCTGGGCTGAGATTGAGATTGTTGA
TAACTACAGATACCCATCTGGTTCACAAGCGCCCTATAACGTTACAACGACGCTGTTGGT
ACCAGGCAATTACCAGGGAGATAGGAGGATAAAGCAGAGCCAGATCTATGACCGACCAGG
AAAATACAGAATAAAACTACCAACCGTTGGAGTGAGGACAACAGGCACTGTAATAGTGGA
GATGGTGGACAAGAATGGACTCCATTTCTCAGACGAATTCTCTCTAACATTCCATATGTA
TTATTACAAGCTTCTGAAGTGGCTGCTTGTCCTCCCGATGCTCGGGATGTTCGGTCTGCT
CGTGATACTACTACCTCAAGAAGCTGTGCCCCTCCCGTCGTTTTCCCGCAACAGAGACTT
ATGATGCTAAGTGCTTGAGCTTTAAGTATCTCCCCTTGAATAGCTCGTCTAAAGTATTAG
ATATCTTTTTTGGTTGTTAAAAATCTTTCGATTATCTTTCTTTGAGTTTATAGAGTTTTA
TGTACTACTTTATTCCTGTAACTTAAAAAAAACTACTCATGC


BQ
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AF RR4BD67TF U 1
AF RR4BD67JQ C 273
BS 1 704 RR4BD67TF
BS 705 705 RR4BD67JQ
BS 706 766 RR4BD67TF
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BS 794 819 RR4BD67TF
BS 820 1062 RR4BD67JQ

RD RR4BD67TF 819 0 0
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CAAAAAGAAGGGACTTACCATTGTTACCACATCCTTTGACGGTTACATGTATCTCATAGA
TGGGCCCACCTCGTGCGCTGACGTTGTCGATATTGGTGAAACTTCATACAGCATGGTCTT
GGCTGATAATGTTGACGGTGGAGATGATCTTGATCTCATCGTCTCAACTATGAACGGGAA
CGTCTTTTGCTTCTCCACGCCTTCTCCTCACCATCCCCTCAAGGCTTGGAGATCGACTGA
TCAAGGGATGAACAATAAGGCTATCCGTTACGATCGTGAAGGCGTTTTTGTCACGCATTC
AACCAGAGGCTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAAACTTCTGGGCTGAGATTGAGATTGTTGA
TAACTACAGATACCCATCTGGTTCACAAGCGCCCTATAACGTTACAACGACGCTGTTGGT
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GATGGTGGACAAGAATGGACTCCATTTCTCAGACGAATTCTCTCTA*CATTCCATATGTA
T*ATTACA*GCT*CTGAAGTGGCTGCTTGTCCTCCCGAT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR4BD67JQ 790 0 0
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ATCCCCTCAAGGCTTGGAGATCGACTGATCAAGGGATGAACAATAAGGCTATCCGTTACG
ATCGTGAAGGCGTTTTTGTCACGCATTCAACCAGAGGCTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAA
ACTTCTGGGCTGAGATTGAGATTGTTGATAACTACAGATACCCATCTGGTTCACAAGCGC
CCTATAACGTTACAACGACGCTGTTGGTACCAGGCAATTACCAGGGAGATAGGAGGATAA
AGCAGAGCCAGATCTATGACCGACCAGGAAAATACAGAATAAAACTACCAACCGTTGGAG
TGAGGACAACAGGCACTGTAATAGTGGAGATGGTGGACAAGAATGGACTCCATTTTTCAG
ACGAATTCTCTCTAACATTCCATATGTATTATTACAAGCTTCTGAAGTGGCTGCTTGTCC
TCCCGATGCTCGGGATGTTCGGTCTGCTCGTGATACTACTACCTCAAGAAGCTGTGCCCC
TCCCGTCGTTTTCCCGCAACAGAGACTTATGATGCTAAGTGCTTGAGCTTTAAGTATCTC
CCCTTGAATAGCTCGTCTAAAGTATTAGATATCTTTTTTGGTTGTTAAAAATCTTTCGAT
TATCTTTCTTTGAGTTTATAGAGTTTTATGTACTACTTTATTCCTGTAACTTAAAAAAAA
CTACTCATGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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CTGAAGTAAACTCAAGCAGCCATCATGAGCTTCGGACCATTGTCCGGCATTCCCATTCCA
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TCGCAGCGTAAACAGTAGAATTGACCCATTCCGGGCAAATCCTCATCAAGCTTCAAAGGC
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GAGAGACGACGATGCGGAAGACC


BQ
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AF RR4FN95JQ U 1
AF RR4H871JQB U 2
BS 1 96 RR4FN95JQ
BS 97 97 RR4H871JQB
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RD RR4FN95JQ 541 0 0
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CTGAAGTAAACTCAAGCAGCCATCATGAGCTTCGGACCATTGTCCGGCATTCCCATTCCA
GCGGCTAAATCTGCATCGAGTTGTGAGTGTGGCGCTGGTCCATTCATTATCTTCACACGC
TTCTTATGCTTCTTCGTCTTGAAATGATCATCTCGCACAGACGCTTTGGAGAAGTACCGA
TCGCAGCGTAAACAGTAGAATTGACCCATTCCGGGCAAATCCTCATCAAGCTTCAAAGGC
TTGACCTCCGCCTCTGGTTTACGCAACTCCGTATACACCAAATCGTCGCCTTTGACTTCG
AATTTGTCACGACGAGCTGTTTTGTGAGACAAACGCCTCTTCTTCACTTTCCTCGTCGGA
CATCTACCCATTGTATTACTCCTCTGCTCTTAGAGAATGAAGCCACACGAGGAGG
AGGTCC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4H871JQB 562 0 0
GG
AGAACAAAAAAAACATATCATTAATTTAGGAATTATATAGTTTAACTACTAAGGACCATC
TACCAACAACAATCTAGGTTCCATAAACTGTTGAAGTGTGAAAGATAATGAAGTAAACTG
AAGTAAACTCAAGCAGCCATCATGAGCTTCGGACCATTGTCCGGCATTCCCATTCCAGCG
GCTAAATCTGCATCGAGTTGTGAGTGTGGCGCTGGTCCATTCATTATCTTCACACGCTTC
TTATGCTTCTTCGTCTTGAAATGATCATCTCGCACAGACGCTTTGGAGAAGTACCGATCG
CAGTGTAAACAGTAGAATTGACCCATTCCGGGCAAATCCTCATCAAGCTTCAAAGGCATG
GCCTCCGCCTCTGGTTTACGCAACTCCGTATACACCAAATCGTCGCCTTTGACTTCGAAT
TTGTCACGACGAGCTGTTTTGTGAGACAAACGCCTCTTCTTCACTTTCCTCGTCGGACAT
CTACCCATTGTATTACTCCTCTGCTCTTAGAGAATGAAGCCACACGAGGAGGTGGTGGAG
AGACGACGATGCGGAAGACC

QA 3 562 3 562
DS 



AS 1 2

CO CL5282Contig1 786 2 17 U
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AGATTAGTATCAGGAATGTCTTCGGTTGTGGAAGGGAATCCTAAGAAAGACGACGACAAG
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AGAGGTTATGCTAAGCTTGCTCGTTTGGATAAACCCATAGGGACTTGGTTGCTTGCCTGG
CCCTGTATGTGGTCAAATTGCGTTGGCTGCTGATCCTGGAAGCCTTCCAAGTTTTAAAAT
GATGGGTTTGTTCGGTTGCGGTGCACTTCTTCTTAGAGGTGCTGGCTGTACTATTAATGA
TCTGCTTGACCGGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACAAGATTAAGACCTATTGCCAG
TGGCCTTCTGACACCATTTCAAGGGCTTCAGTTTCTTGGGCTACAGTTGCTTTTAGGCTT
AGGGATTCTTCTCCAACTGAACAATTACAGCCGTGTTTTAGGGGCTTCATCTTTGTTACT
TGTCTTCTCCTATCCACTTATGAAGAGGTTTACATTTTGGCCTCAAGCATTTTTAGGTTT
GACCATAAACTGGGGAGCACTGTTAGGATGGACTGCAGTGAAAGGAAGCTTAGATCCAAC
TGTTGTACTCCCTCTTTATCTCTCACGAGTCTGCTGGACCCTTGTGTATGATACTATCTA
TGCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN48TF U 164
AF RR4AA39TF U 1
BS 1 215 RR4AA39TF
BS 216 216 RR4FN48TF
BS 217 275 RR4AA39TF
BS 276 276 RR4FN48TF
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BS 318 348 RR4AA39TF
BS 349 349 RR4FN48TF
BS 350 424 RR4AA39TF
BS 425 428 RR4FN48TF
BS 429 489 RR4AA39TF
BS 490 490 RR4FN48TF
BS 491 588 RR4AA39TF
BS 589 589 RR4FN48TF
BS 590 786 RR4AA39TF

RD RR4FN48TF 580 0 0
G
GAAAGACGACGACAAGGAGAAGAGTGGTGGTGTTAAGGAAGCTTCTTGGGTGGATTTGTA
TTTGCCTCAAGGAGCTAGAGGTTATGCTAAGCTTGCTCGTTTGGATAAACCCATCGGGAC
TTGGTTGCTTGCTTGGCCCTGTATGTGGTCAAATTGCGTTGGCTGCTGATCCTGGAAGCC
TTCCAAGTTTTAAAATGATGGGTTTGTTCGGTTGCGGTGCACTTCTTCTTAGAGGTGCTG
GCTGTACTATTAATGATCTGCTTGACCGGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACAAGAT
TAAGACCTATTGCCAGTGGTCTTTTGACACCATTTCAAGGGCTTCAGTTTCTTGGGCTAC
AGTTGCTTTTAGGCTTAGGGATTCTTCTCCAACTGAACAATTACAGCCGTGTTTTAGGGG
CTTCATCTTTGTTACTTGTCTTCTCCTATCCACTTATGAAGAGGTTTACATTTTGGCCTC
AAGCATTTTTAGGTTTGACCATAAACTGGGGAGCACTGTTAGGATGGACTGCAGTGAAAG
GAAGCTTAGATCCAACTGTTGTACTCCCTCTTTATCTCT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR4AA39TF 786 0 0
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TGTAGTAAAGGCACGGACTTTTATCGTGAGGAGAAGCTTCTCGGTGTTGGCTGGAACTAT
AGATTAGTATCAGGAATGTCTTCGGTTGTGGAAGGGAATCCTAAGAAAGACGACGACAAG
GAGAAGAGTGGTGGTGTTAAGGAAGCTTCTTGGGTTGATTTGTATTTGCCTCAAGGAGCT
AGAGGTTATGCTAAGCTTGCTCGTTTGGATAAACCTATAGGGACTTGGTTGCTTGCCTGG
CCTTGTATGTGGTCAA*TTGCGTTGGCTGCTGATCCTGGAAGCCTTCCCAGTTTTAAAAT
GATGGGTTTGTTCGGTTGCGGTGCACTTCTTCTTAGAGGTGCTGGCTGTACTATTAATGA
TCTG****ACCGGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACAAGATTAAGACCTATTGCCAG
TGGCCTTCTTACACCATTTCAAGGGCTTCAGTTTCTTGGGCTACAGTTGCTTTTAGGCTT
AGGGATTCTTCTCCAACTGAACAATTACAGCCGTGTTTTAGGGGCTTCGTCTTTGTTACT
TGTCTTCTCCTATCCACTTATGAAGAGGTTTACATTTTGGCCTCAAGCATTTTTAGGTTT
GACCATAAACTGGGGAGCACTGTTAGGATGGACTGCAGTGAAAGGAAGCTTAGATCCAAC
TGTTGTACTCCCTCTTTATCTCTCACGAGTCTGCTGGACCCTTGTGTATGATACTATCTA
TGCACA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5283Contig1 1069 2 2 U
GAGTCAGAGGTTTGGAGAAATAGCATTTTGTGCAATCACCGCAGATGAACAAGTTAAAGG
TTACGGTACCAGATTGATGAACCACTTGAAAGAACATGCACGCAATGTTGATGGATTGAC
GCATTTTCTTACTTATGCTGACAACAATGCCGTTGGTTATTTTGTCAAGCAGGGTTTCAC
TAAAGAGATTTACTTGGAAAAAGATGTATGGCATGGGTTCATTAAAGATTATGATGGTGG
CCTCCTTATGGAATGCAAAATTGATCCGAAGCTTCCATATACAAATTTGTCAAAGATGAT
TCGTCAGCAAAGAAAAGCAATTGATGAAAGGATAAGAGAGTTATCGAACTGTCAGAAGGT
GTATCAAGTACCTGAATTTCAAAAGAAAGAGGGTGGGAGTCCTAGAAAGATCAGAGTTGA
GGATATTCCTGGCTTAACGGAAGCAGGTTGGACCCCAGATCAGTGGGGGCACACGCGTTA
CAAATTATTCAGTGGTCCTGGAGATAGTGTAACAAAGCAAAAGCAGTTGAACGCACTTAT
TCGCGTACTTCTGAAGACAATGCAAGACCACTCTGATGCTTGGCCTTTTAAAGAACCAGT
TGATCCTCTCGATGTCCCAGATTATTATGAAATCATTAAAGATCCCATTGATCTGAAGAC
AATTGGGAAGAGAGTAGAGTCAGAACAGTACTACGTGACGCTTGACATGTTTGTGGCTGA
TGCGAGACGGATGTTTAACAATTGTAGAACTTACAACTCACCAGATACCATTTACTACAA
ATGTGCAACCAGGTTGGAGACACACTTCCATAGCAAAGTACAAGCAGCTCTCCAGTCTGG
TGCTAAATCTCAATAGAAGATGGTAGAAGTGATTATGTTAATTGTGTTACTGACTCTCGT
TGGGACAGAGATATTTATCTCAAAAACAAGTGTGTTATTAGGTCGACTTGATCGTGTATG
ATGTATGTTTTCCATACGAATATATGTTTAGGAGTAGTAACATAATTAGGACCCTTTTGT
GTATTTAGAACAAGTCTTAGAACACCCACGTCACGTTTCTCATGTTTTC


BQ
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AF RR4CR36TF U 1
AF RR4CR36JQ C 273
BS 1 655 RR4CR36TF
BS 656 1069 RR4CR36JQ

RD RR4CR36TF 655 0 0
GAGTCAGAGGTTTGGAGAAATAGCATTTTGTGCAATCACCGCAGATGAACAAGTTAAAGG
TTACGGTACCAGATTGATGAACCACTTGAAAGAACATGCACGCAATGTTGATGGATTGAC
GCATTTTCTTACTTATGCTGACAACAATGCCGTTGGTTATTTTGTCAAGCAGGGTTTCAC
TAAAGAGATTTACTTGGAAAAAGATGTATGGCATGGGTTCATTAAAGATTATGATGGTGG
CCTCCTTATGGAATGCAAAATTGATCCGAAGCTTCCATATACAAATTTGTCAAAGATGAT
TCGTCAGCAAAGAAAAGCAATTGATGAAAGGATAAGAGAGTTATCGAACTGTCAGAAGGT
GTATCAAGTACCTGAATTTCAAAAGAAAGAGGGTGGGAGTCCTAGAAAGATCAGAGTTGA
GGATATTCCTGGCTTAACGGAAGCAGGTTGGACCCCAGATCAGTGGGGGCACACGCGTTA
CAAATTATTCAGTGGTCCTGGAGATAGTGTAACAAAGCAAAAGCAGTTGAACGCACTTAT
TCGCGTACTTCTGAAGACAATGCAAGACCACTCTGATGCTTGGCCTTTTAAAGAACCAGT
TGATCCTCTCGATGTCCCAGATTATTATGAAATCATTAAAGATCCCATTGATCTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4CR36JQ 797 0 0
TTCCATATACAAATTTGTCAAAGATGATTCGTCAGCAAAGAAAAGCAATTGATGAAAGGA
TAAGAGAGTTATCGAACTGTCAGAAGGTGTATCAAGTACCTGAATTTCAAAAGAAAGAGG
GTGGGAGTCCTAGAAAGATCAGAGTTGAGGATATTCCTGGCTTAACGGAAGCAGGTTGGA
CCCCAGATCAGTGGGGGCACACGCGTTACAAATTATTCAGTGGTCCTGGAGATAGTGTAA
CAAAGCAAAAGCAGTTGAACGCACTTATTCGCGTACTTCTGAAGACAATGCAAGACCACT
CTGATGCTTGGCCTTTTAAAGAACCAGTTGATCCTCTCGATGTCCCAGATTATTATGAAA
TCATTAAAGATCCCATTGATCTGAAGACAATTGGGAAGAGAGTAGAGTCAGAACAGTACT
ACGTGACGCTTGACATGTTTGTGGCTGATGCGAGACGGATGTTTAACAATTGTAGAACTT
ACAACTCACCAGATACCATTTACTACAAATGTGCAACCAGGTTGGAGACACACTTCCATA
GCAAAGTACAAGCAGCTCTCCAGTCTGGTGCTAAATCTCAATAGAAGATGGTAGAAGTGA
TTATGTTAATTGTGTTACTGACTCTCGTTGGGACAGAGATATTTATCTCAAAAACAAGTG
TGTTATTAGGTCGACTTGATCGTGTATGATGTATGTTTTCCATACGAATATATGTTTAGG
AGTAGTAACATAATTAGGACCCTTTTGTGTATTTAGAACAAGTCTTAGAACACCCACGTC
ACGTTTCTCATGTTTTC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL5284Contig1 728 2 2 U
GGAGGCGCTGTCTACGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCCAATCGGGCGGTAAATTC
CGTCCAAGGCTAAATATGGGCGAGAGACCGATAGCGATCAAAGACCTTGAAGTTGGAATT
CTGATAAACAACGTTGGGATAACTTACCCACGAGCCATGTTCTTCCACGAGGTTGACCAA
CTCACATGGACCAAAATCATTAGGGTCAATCTTGAAGCCACCACTTGGGTCACAAGATCT
CTCATCGGACCAATGCTTCACCGCCGTCGAGGAGCTATCATAAATATTAGCTCCGGTGCC
GTCGTTGTTGTCCCTTCTCATCCTCTCTATGCCATCTACGCCGCCACCAAAGCCTATGTT
GATAAACTATCAAGGTCTTTGCATGTGGAATATAAGCATTTTGGTATCCACGTCCAGTGC
CAGGTTCCGTTATACGTGGCAACGAGGATGGTATCAGAAGTAGCAGAAATAGATAAACCA
AGCTTCTTTGTACCATCGCCGGAAGTATATGCAAAAGCGGCGGTGGAGCAGATCGGAATT
GGATCACGATGCTCGCCATTTTGGGCTCATTCCCTTCAGTGGTTTCTCGCTGGTCTTTTG
CCGGAACCTTCTTGATACTTGGCGTCTCTCTATCGGTCTTCGTAGAAGAAGTTTGTCTTA
GTCCCTCGCTTTTTATGTTTGAAGTTATTAAGTTTATATATTTTCCAGTTTACAAAAAAA
AAGTTTAT


BQ
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20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI94JQ C 1
AF RR4DI94TF U 1
BS 1 721 RR4DI94TF
BS 722 728 RR4DI94JQ

RD RR4DI94JQ 728 0 0
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CGTCCAAGGCTAAATATGGGCGAGAGACCGATAGCGATCAAAGACCTTGAAGTTGGAATT
CTGATAAACAACGTTGGGATAACTTACCCACGAGCCATGTTCTTCCACGAGGTTGACCAA
CTCACATGGACCAAAATCATTAGGGTCAATCTTGAAGCCACCACTTGGGTCACAAGATCT
CTCATCGGACCAATGCTTCACCGCCGTCGAGGAGCTATCATAAATATTAGCTCCGGTGCC
GTCGTTGTTGTCCCTTCTCATCCTCTCTATGCCATCTACGCCGCCACCAAAGCCTATGTT
GATAAACTATCAAGGTCTTTGCATGTGGAATATAAGCATTTTGGTATCCACGTCCAGTGC
CAGGTTCCGTTATACGTGGCAACGAGGATGGTATCAGAAGTAGCAGAAATAGATAAACCA
AGCTTCTTTGTACCATCGCCGGAAGTATATGCAAAAGCGGCGGTGGAGCAGATCGGAATT
GGATCACGATGCTCGCCATTTTGGGCTCATTCCCTTCAGTGGTTTCTCGCTGGTCTTTTG
CCGGAACCTTCTTGATACTTGGCGTCTCTCTATCGGTCTTCGTAGAAGAAGTTTGTCTTA
GTCCCTCGCTTTTTATGTTTGAAGTTATTAAGTTTATATATTTTCCAGTTTACAAAAAAA
AAGTTTAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4DI94TF 727 0 0
GGAGGCGCTGTCTACGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCCAATCGGGCGGTAAATTC
CGTCCAAGGCTAAATATGGGCGAGAGACCGATAGCGATCAAAGACCTTGAAGTTGGAATT
CTGATAAACAACGTTGGGATAACTTACCCACGAGCCATGTTCTTCCACGAGGTTGACCAA
CTCACATGGACCAAAATCATTAGGGTCAATCTTGAAGCCACCACTTGGGTCACAAGATCT
CTCATCGGACCAATGCTTCACCGCCGTCGAGGAGCTATCATAAATATTAGCTCCGGTGCC
GTCGTTGTTGTCCCTTCTCATCCTCTCTATGCCATCTACGCCGCCACCAAAGCCTATGTT
GATAAACTATCAAGGTCTTTGCATGTGGAATATAAGCATTTTGGTATCCACGTCCAGTGC
CAGGTTCCGTTATACGTGGCAACGAGGATGGTATCAGAAGTAGCAGAAATAGATAAACCA
AGCTTCTTTGTACCATCGCCGGAAGTATATGCAAAAGCGGCGGTGGAGCAGATCGGAATT
GGATCACGATGCTCGCCATTTTGGGCTCATTCCCTTCAGTGGTTTCTCGCTGGTCTTTTG
CCGGAACCTTCTTGATACTTGGCGTCTCTCTATCGGTCTTCGTAGAAGAAGTTTGTCTTA
GTCCCTCGCTTTTTATGTTTGAAGTTATTAAGTTTATATATTTTCCAGTTTACAAAAAAA
A
GTTTAT

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5285Contig1 832 2 4 U
GGTGACAGATGTAGGGAACCGGAGGAATCTATAAACCATGTGTTTTTGAGTGCCCACCGG
CAGTTCAGATTTGGGCTTTGTCAAAAATCCCTTCAAATCTGAATATTTTCCCGACACAGT
CGCTGTTTACAAACATAGATTATTTATTTTGGAGGATCCCACCAGGATGGAATGACCATC
ATTTTGCGTGGATCTTATGGTACATATGGAAAGCACGAAATAATAAAGTGTTTAGTAATT
TGGATATTGATACTTTAGAGACCCTTAAACTGGCAGAGAAGGAGGCATTATAATGGGACG
AGGCACAAGCGAGTGTGACTCAGGAGTTAGACCGTACTAGCCTGTCTGATCCGGTGATAC
CCAATATACCCGAACGATGGTGCTTTACGGATGGCTCATGGAAAGAACATGACAGATTTT
CAGGCCAAGGATGGTATAGCACACTGGAAGTTTTTGATGGACTTATGGGAGCAAGGAATA
CAAGAGCGGCTAGTTCGGCCCTACACTCAGAAATAGAATCCCTTATTTGGGCAATAGAAT
GTATGCGGAATCTAAGGCAGTTTTCAGATACGTTTGCAACGGACTGTTCTCAGTTGGTGA
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TCCTGAAGAGAAGTTTCAACAGTTCAGAGCTCGTTCATATACCACGAACACAAAATAACA
AGGCGGACAGTCTAGCACGCAGTGTAAGGAAGCAACCGTCTTTTGTCGTTCATATGGATG
CAGAGCTACCAGTTTGGATAACAGAGTCTATATGAGTCTGTTTGTTGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CG86TF U 1
AF RR4CG86JQ C 97
BS 1 613 RR4CG86TF
BS 614 614 RR4CG86JQ
BS 615 713 RR4CG86TF
BS 714 832 RR4CG86JQ

RD RR4CG86TF 713 0 0
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CAGTTCAGATTTGGGCTTTGTCAAAAATCCCTTCAAATCTGAATATTTTCCCGACACAGT
CGCTGTTTACAAACATAGATTATTTATTTTGGAGGATCCCACCAGGATGGAATGACCATC
ATTTTGCGTGGATCTTATGGTACATATGGAAAGCACGAAATAATAAAGTGTTTAGTAATT
TGGATATTGATACTTTAGAGACCCTTAAACTGGCAGAGAAGGAGGCATTATAATGGGACG
AGGCACAAGCGAGTGTGACTCAGGAGTTAGACCGTACTAGCCTGTCTGATCCGGTGATAC
CCAATATACCCGAACGATGGTGCTTTACGGATGGCTCATGGAAAGAACATGACAGATTTT
CAGGCCAAGGATGGTATAGCACACTGGAAGTTTTTGATGGACTTATGGGAGCAAGGAATA
CAAGAGCGGCTAGTTCGGCCCTACACTCAGAAATAGAATCCCTTATTTGGGCAATAGAAT
GTATGCGGAATCTAAGGCAGTTTTCAGATACGTTTGCAACGGACTGTTCTCAGTTGGTGA
AGATGGTTTCGGA*CCAGAAGAGTGGTCAGCCTTTGCAAGTTACCTAGAGGATATCTTCG
TCCTGAAGAGAAGTTTCAACAGTTCAGAGCTCGTTCATATACCACGAACACAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4CG86JQ 736 0 0
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TCCCACCAGGATGGAATGACCATCATTTTGCGTGGATCTTATGGTACATATGGAAAGCAC
GAAATAATAAAGTGTTTAGTAATTTGGATATTGATACTTTAGAGACCCTTAAACTGGCAG
AGAAGGAGGCATTATAATGGGACGAGGCACAAGCGAGTGTGACTCAGGAGTTAGACCGTA
CTAGCCTGTCTGATCCGGTGATACCCAATATACCCGAACGATGGTGCTTTACGGATGGCT
CATGGAAAGAACATGACAGATTTTCAGGCCAAGGATGGTATAGCACACTGGAAGTTTTTG
ATGGACTTATGGGAGCAAGGAATACAAGAGCGGCTAGTTCGGCCCTACACTCAGAAATAG
AATCCCTTATTTGGGCAATAGAATGTATGCGGAATCTAAGGCAGTTTTCAGATACGTTTG
CAACGGACTGTTCTCAGTTGGTGAAGATGGTTTCGGAACCAGAAGAGTGGTCAGCCTTTG
CAAGTTACCTAGAGGATATCTTCGTCCTGAAGAGAAGTTTCAACAGTTCAGAGCTCGTTC
ATATACCACGAACACAAAATAACAAGGCGGACAGTCTAGCACGCAGTGTAAGGAAGCAAC
CGTCTTTTGTCGTTCATATGGATGCAGAGCTACCAGTTTGGATAACAGAGTCTATATGAG
TCTGTTTGTTGCTGTC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL5286Contig1 1136 2 6 U
GGCGTATATCTCGTTTTGTTTGAGGACAGTGAGAATTTTAGTGGCTCAACCTTCAGTGAA
GCCTGGAGAGATTTCTCGAAAGCAAACTTTGTTATCGTTCCCCCTCTTGAAAGAGAAGGC
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TGGACAAGTTCCAGGACTTGTGCGACGGCTCGAATGAGGCATCTGCTGTTTTGGGTCACT
TGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTCTATTAATCGGGGAGAATTGATTGAGGGTG
TCAAAGTGTCCTTTTCAGAAGCAGCACTTCCCAGTATCTCAACTTTAGACTGTGACATTC
TGCACTTGTTAAGAACTACAGAGAAGCTCCAAAATCAGCTTGAAGTCATGGACCAACGCT
GTGAAACGTCAAGGAAATCTGCGTTGGCATCTCTAAAATCTGGACACAAGAAAGTTGCTC
TAAGGCATGCAAGGGAACTGAAGCTGACCACTGAGAGCAGAGAAAAATGCACGTCACTTC
TGAACAGAGTAGAGGAAGTGTTGAACACTATAGCGGATTCCGAATCAACGAAAATGGTCT
CAGAAGCAATTAAAACTGGAGCGAGGGTTATGAAGGACATCAAGATCAGTCCAGATGAAG
TTCATGACTATTTGGAAGAAATTGAAGAAACCATTCAATCGCAGAAGGAAGTGGAAAAAG
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AACTAGAAATGGAGCTTGAAAGTGAAAGTTCCCAGGGCAGACCAACGACTTCAGATACAG
CAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCGGAGCTTAAAATTGGCAACACAAAACAAATATTAG
AGGAGCAAGCTACTGAACCAGTTCTGATGAAAGATGGCGGAAAAAAGATTCTTGAAGCAG
CATAGTTTCACAATGCATCTTCATTTTGGTGCGATCTCTTCTCTACTTGTTGTACAATAT
AATTAGAAAGGAACTTGGTAAAATCCATATCCATAGTATTTGTAAGCAATGCATTTTGTT
GGGATTCAAGAAGCTAAAGCTTCACTCTAATGTATAAATCAGATGTATTTGTCATC


BQ
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AF RR4B576TF U 1
AF RR4B576JQ C 218
BS 1 286 RR4B576TF
BS 287 287 RR4B576JQ
BS 288 297 RR4B576TF
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BS 299 358 RR4B576TF
BS 359 1136 RR4B576JQ

RD RR4B576TF 358 0 0
GGCGTATATCTCGTTTTGTTTGAGGACAGTGAGAATTTTAGTGGCTCAACCTTCAGTGAA
GCCTGGAGAGATTTCTCGAAAGCAAACTTTGTTATCGTTCCCCCTCTTGAAAGAGAAGGC
TGCTGATGTGGTGAGACTTTTATCTGAGGGACACTGGACTTCTACTTTGTGTTGTCACGC
TGGACAAGTTCCAGGACTTGTGCGACGGCTCGAATGAGGCATCTGCTGTTTTGGGTCACT
TGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTCTATTAATCGGGGAGA*TTGATTGAGG*TG
TCAAAGTGTCCTTTTCAGAAGCAGCACTTCCCAGTATCTCAACTTTAGACTGTGACAT

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4B576JQ 919 0 0
GGCATCTGCTGTTTTGGGTCACTTGTCAGGGTGTGGAAAAGCGCATAAAATCTCTATTAA
TCGGGGAGAATTGATTGAGGGTGTCAAAGTGTCCTTTTCAGAAGCAGCACTTCCCAGTAT
CTCAACTTTAGACTGTGACATTCTGCACTTGTTAAGAACTACAGAGAAGCTCCAAAATCA
GCTTGAAGTCATGGACCAACGCTGTGAAACGTCAAGGAAATCTGCGTTGGCATCTCTAAA
ATCTGGACACAAGAAAGTTGCTCTAAGGCATGCAAGGGAACTGAAGCTGACCACTGAGAG
CAGAGAAAAATGCACGTCACTTCTGAACAGAGTAGAGGAAGTGTTGAACACTATAGCGGA
TTCCGAATCAACGAAAATGGTCTCAGAAGCAATTAAAACTGGAGCGAGGGTTATGAAGGA
CATCAAGATCAGTCCAGATGAAGTTCATGACTATTTGGAAGAAATTGAAGAAACCATTCA
ATCGCAGAAGGAAGTGGAAAAAGCTCTCGAATCAGCTCCATATGCAGATATCGATGATGA
AAATATTGAAGAAGAATTCATGAAACTAGAAATGGAGCTTGAAAGTGAAAGTTCCCAGGG
CAGACCAACGACTTCAGATACAGCAGATTCACTGACTGAGATGTTCTCGGAGCTTAAAAT
TGGCAACACAAAACAAATATTAGAGGAGCAAGCTACTGAACCAGTTCTGATGAAAGATGG
CGGAAAAAAGATTCTTGAAGCAGCATAGTTTCACAATGCATCTTCATTTTGGTGCGATCT
CTTCTCTACTTGTTGTACAATATAATTAGAAAGGAACTTGGTAAAATCCATATCCATAGT
ATTTGTAAGCAATGCATTTTGTTGGGATTCAAGAAGCTAAAGCTTCACTCTAATGTATAA
ATCAGATGTATTTGTCATC

QA 1 919 1 919
DS 



AS 1 2

CO CL5287Contig1 945 2 8 U
TCAGAAACAAAAACATTTTACTCCCAGTCTTCGTCTTTATAGCCATCCCTCTCTCTGCCT
TGCATCTCTCCTTAACTCTCACCTCCTTTCGTCTCAAAAACCATGTCTTTCGCTTAGAAG
CCTTAGCCAACGTTGTCCACACACGGTTCGAAGCTAGGCAGGTATGGGAAGAGTCTAGAG
AAGACGCCGTCTCTCTTCTCCGTCTCAAATCTCGGTACTTCGTCCCGTCTTTCATCCTCT
CCTGTATCGTCTCCATAGCCGTCATCACATCAACTTCCTTCTCGCACCAGGGCCTGAACC
CATCTCTGAAGTCGTCGTTTGCTTCGGTGAAGTCCTCGTGGATGCGAGTAACAGCAACTT
CCATTGTTGTCTACGGTCTGCTCTTCCTCTACTCACCAGTTCCCATGTTTCTATCTGCTA
TCTTCGGTTACACACCTACGCTGCGTCACCTCATCACATTCCTGAGTCTCGGCGTTGAGG
TATACATTATGGCTATAACAGGGCTTGGCCTTGTGGTCTCTGTGGTAGAAGAAAGGTACG
GTTTTGATGCGGTTAAGGAAGGAATGGCATTGATGAAAGGGGGAAGGATAACGGGGTTGG
CTTTGGCGGGTGTGTTTGTGTTTTTATCGAGTTTCATTGGTTATGGGATGGAGAAGCTGG
CGAAGGAGCTCGATGTGGATTCCAGCTCAGGGTCGTGGTGGAGGTCTGTGGTTGTGTCTG
GTGGGTGGGATGGGTGGAAACTGGTTTGTATGTATGGGGCAGAGGTGGTGGTGAGTTATG
TTGTAGTCACTGTTTTTTACTGTGAGTGTAGGAAACGTCATGGGAACAGTGATCCAGATG
TTGCTGATGAAGATGGTCTTGCTATTTAAGTTTAGCTGCAACACTTGTCGTTGTTGTTAA
ATTCTATTTGTGAATTGTTGATATATCCCAAATTATGACTTTTTC


BQ
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AF RR4H879TF U 1
AF RR4H879JQB C 182
BS 1 665 RR4H879TF
BS 666 666 RR4H879JQB
BS 667 691 RR4H879TF
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BS 705 717 RR4H879TF
BS 718 945 RR4H879JQB

RD RR4H879TF 717 0 0
TCAGAAACAAAAACATTTTACTCCCAGTCTTCGTCTTTATAGCCATCCCTCTCTCTGCCT
TGCATCTCTCCTTAACTCTCACCTCCTTTCGTCTCAAAAACCATGTCTTTCGCTTAGAAG
CCTTAGCCAACGTTGTCCACACACGGTTCGAAGCTAGGCAGGTATGGGAAGAGTCTAGAG
AAGACGCCGTCTCTCTTCTCCGTCTCAAATCTCGGTACTTCGTCCCGTCTTTCATCCTCT
CCTGTATCGTCTCCATAGCCGTCATCACATCAACTTCCTTCTCGCACCAGGGCCTGAACC
CATCTCTGAAGTCGTCGTTTGCTTCGGTGAAGTCCTCGTGGATGCGAGTAACAGCAACTT
CCATTGTTGTCTACGGTCTGCTCTTCCTCTACTCACCAGTTCCCATGTTTCTATCTGCTA
TCTTCGGTTACACACCTACGCTGCGTCACCTCATCACATTCCTGAGTCTCGGCGTTGAGG
TATACATTATGGCTATAACAGGGCTTGGCCTTGTGGTCTCTGTGGTAGAAGAAAGGTACG
GTTTTGATGCGGTTAAGGAAGGAATGGCATTGATGAAAGGGGGAAGGATAACGGGGTTGG
CTTTGGCGGGTGTGTTTGTGTTTTTATCGAGTTTCATTGGTTATGGGATGGAGAAGCTGG
CGAAG*AGCTCGATGTGGATTCCAGCTCAGG*TCGTGGTGGAG*TCTGTGGTTGTGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4H879JQB 764 0 0
AAGACG
CGTCTCTCTTCTCCGTCTCAAATCTCGGTACTTCGTCCCGTCTTTCATCCTCTCCTGTAT
CGTCTCCATAGCCGTCATCACATCAACTTCCTTCTCGCACCAGGGCCTGAACCCATCTCT
GAAGTCGTCGTTTGCTTCGGTGAAGTCCTCGTGGATGCGAGTAACAGCAACTTCCATTGT
TGTCTACGGTCTGCTCTTCCTCTACTCACCAGTTCCCATGTTTCTATCTGCTATCTTCGG
TTACACACCTACGCTGCGTCACCTCATCCCATTCCTGAGTCTCGGCGTTGAGGTATACAT
TATGGCTATAACAGGGCTTGGCCTTGTGGTCTCTGTGGTAGAAGAAAGGTACGGTTTTGA
TGCGGTTAAGGAAGGAATGGCATTGATGAAAGGGGGAAGGATAACGGGGTTGGCTTTGGC
GGGTGTGTTTGTGTTTTTATCGAGTTTCATTGGTTATGGGATGGAGAAGCTGGCGAAGGA
GCTCGATGTGGATTCCAGCTCAGGGTCGTGGTGGAGGTCTGTGGTTGTGTCTGGTGGGTG
GGATGGGTGGAAACTGGTTTGTATGTATGGGGCAGAGGTGGTGGTGAGTTATGTTGTAGT
CACTGTTTTTTACTGTGAGTGTAGGAAACGTCATGGGAACAGTGATCCAGATGTTGCTGA
TGAAGATGGTCTTGCTATTTAAGTTTAGCTGCAACACTTGTCGTTGTTGTTAAATTCTAT
TTGTGAATTGTTGATATATCCCAAATTATGACTTTTTC

QA 7 764 7 764
DS 



AS 1 2

CO CL5288Contig1 561 2 2 U
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CCGTAGATAAACATAAACAAAACAAAAAGTACCTACGTTTTATGTAAGTAAGCAATCATC
TATAAAGCCCTCATTCTCTTGCATGCTTTTTTGACTCAACTCCAAAAACAAACAAAGAAG
CAAAGAGAGAATGGAGTTATGCAATGAGCAGAGAACTATGTTAATTGTGGTGTTGATTGT
AATAATGTGGAGCTGTTGTTACAGCCACGCCCAGCTGAGCACTGACTTCTACAAGCAAAG
CTGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGACGCGAGGTGCAGCGAGCGGTAACCAGGGAGCG
CCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGTTATTCTTTCACGACTGTTTTGTCAATGTAGGATT
CCATTTTTGTAATGACACAAGCTAAGGAACAGCTCCTTCAATAATACCTCATCATATATC
TTGTTAGTATTTGTAAAATATAAAATTGAAATAGTAACTAAAAGTAAGAGAGAGCATAGA
TACATTTCTTTATATTTTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ12TF U 1
AF RR4GJ12JQ C 24
BS 1 539 RR4GJ12TF
BS 540 561 RR4GJ12JQ

RD RR4GJ12TF 539 0 0
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CCGTAGATAAACATAAACAAAACAAAAAGTACCTACGTTTTATGTAAGTAAGCAATCATC
TATAAAGCCCTCATTCTCTTGCATGCTTTTTTGACTCAACTCCAAAAACAAACAAAGAAG
CAAAGAGAGAATGGAGTTATGCAATGAGCAGAGAACTATGTTAATTGTGGTGTTGATTGT
AATAATGTGGAGCTGTTGTTACAGCCACGCCCAGCTGAGCACTGACTTCTACAAGCAAAG
CTGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGACGCGAGGTGCAGCGAGCGGTAACCAGGGAGCG
CCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGTTATTCTTTCACGACTGTTTTGTCAATGTAGGATT
CCATTTTTGTAATGACACAAGCTAAGGAACAGCTCCTTCAATAATACCTCATCATATATC
TTGTTAGTATTTGTAAAATATAAAATTGAAATAGTAACTAAAAGTAAGAGAGAGCATAG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4GJ12JQ 538 0 0
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AAAAAGTACCTACGTTTTATGTAAGTAAGCAATCATCTATAAAGCCCTCATTCTCTTGCA
TGCTTTTTTGACTCAACTCCAAAAACAAACAAAGAAGCAAAGAGAGAATGGAGTTATGCA
ATGAGCAGAGAACTATGTTAATTGTGGTGTTGATTGTAATAATGTGGAGCTGTTGTTACA
GCCACGCCCAGCTGAGCACTGACTTCTACAAGCAAAGCTGTCCCTCATTGTTTTATGTGG
TGAGACGCGAGGTGCAGCGAGCGGTAACCAGGGAGCGCCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCC
GGTTATTCTTTCACGACTGTTTTGTCAATGTAGGATTCCATTTTTGTAATGACACAAGCT
AAGGAACAGCTCCTTCAATAATACCTCATCATATATCTTGTTAGTATTTGTAAAATATAA
AATTGAAATAGTAACTAAAAGTAAGAGAGAGCATAGATACATTTCTTTATATTTTGAA

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL5289Contig1 835 2 3 U
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TCAGAAGAACAATTGAATTTCCATCTATTGCTCATAGATACATACATACACACAAATATA
TTATTACACATTCAAAACAAAAATAGAATCAAAAAAAAGCCAAATAAAAACAAGTGCTTC
CATCTACTATGCCACTCCTCGCAATCAAACTTCACCAGCAGTTTCAAGTTTTGACGCTTT
GTAAAACGGATATGAGGTTGCTAATGACAGCCATCAAGAGGATGAAGCCTATGATCATGT
TCATGAGATAGATATACGGTGGATTCTTGCGGGTTCTTCTGTCCACTGGTTCCTCCGTAA
TAAACCAGCCCATCTTCTCTGTCTTCAATATAGATAATGATGCTGATGACTTCTTCTCCA
TGGATGCATTAATGACTTTAGGCTTGCCTTCTTTCACCTCTAGTTTTGATGGTATGGTGC
GCCGAGATTTCCGGGTCTTTCCATTAATAGAAGTTTCTGCGGGAAGTTGAATATCTGTGA
CAGAGTCTTTCCTCAAAGATGGAATCTCGTCTGCACTAGAGTGGAACTTCCCACTCAAAC
TATGAAAGCTATCTGGACTTGATGTTCCTTGGTAACTCGTTGCAGATATGGATTCAGCAT
CATCGCTGTCACTGCTACAACCAACAATGATCCCAGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGTGAT
CGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTAGATCACCAAGCACGTCAGTATGATTCCCTC
CGTTAAAACTCAGCAGTTCATTAATATAATCATCATCCCAGGGAGCTTGCGGCTG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4A266JQD U 1
AF RR4A266JQ U 5
BS 1 151 RR4A266JQD
BS 152 152 RR4A266JQ
BS 153 835 RR4A266JQD

RD RR4A266JQD 835 0 0
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TCATGAGATAGATATACGGTGGATTCTTGCGGGTTCTTCTGTCCACTGGTTCCTCCGTAA
TAAACCAGCCCATCTTCTCTGTCTTCAATATAGATAATGATGCTGATGACTTCTTCTCCA
TGGATGCATTAATGACTTTAGGCTTGCCTTCTTTCACCTCTAGTTTTGATGGTATGGTGC
GCCGAGATTTCCGGGTCTTTCCATTAATAGAAGTTTCTGCGGGAAGTTGAATATCTGTGA
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TATGAAAGCTATCTGGACTTGATGTTCCTTGGTAACTCGTTGCAGATATGGATTCAGCAT
CATCGCTGTCACTGCTACAACCAACAATGATCCCAGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGTGAT
CGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTAGATCACCAAGCACGTCAGTATGATTCCCTC
CGTTAAAACTCAGCAGTTCATTAATATAATCATCATCCCAGGGAGCTTGCGGCTG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4A266JQ 830 0 0
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AAGAACAATTGAATTTCCATCTATTGCTCATAGATACATACATACACACAAATATATTAT
TACACATTCAAAACAAAAATAGAATCAAAAAAAAGCCAAATAAAAACAAGTGCTTCCATC
TACTATGCCACTCCTCGCAATCAAACTTCACCAGCAGTTTCAAGTTTTGACGCTTTGTAA
AACGGATATGAGGTTGCTAATGACAGCCATCAAGAGGATGAAGCCTATGATCATGTTCAT
GAGATAGATATACGGTGGATTCTTGCGGGTTCTTCTGTCCACTGGTTCCTCCGTAATAAA
CCAGCCCATCTTCTCTGTCTTCAATATAGATAATGATGCTGATGACTTCTTCTCCATGGA
TGCATTAATGACTTTAGGCTTGCCTTCTTTCACCTCTAGTTTTGATGGTATGGTGCGCCG
AGATTTCCGGGTCTTTCCATTAATAGAAGTTTCTGCGGGAAGTTGAATATCTGTGACAGA
GTCTTTCCTCAAAGATGGAATCTCGTCTGCACTAGAGTGGAACTTCCCACTCAAACTATG
AAAGCTATCTGGACTTGATGTTCCTTGGTAACTCGTTGCAGATATGGATTCAGCATCATC
GCTGTCACTGCTACAACCAACAATGATCCCAGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGTGATCGTT
GCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTAGATCACCAAGCACGTCAGTATGATTCCCTCCGTT
AAAACTCAGCAGTTCATTAATATAATCATCATCCCAGGGAGCTTGCGGCT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

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GTTGGACCACGGAGATGGAGAATACTGATGTACCCAGAAGGAAAGGCAGGAAATTTTTCG
TTGTATTTGTCTGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGACCAACTTTTGCCAAC
TATAAACTGCGAGTGTTGGATCAAGTCAACCGCAATCACCATGAATCTGGGCACCAAGGT
TGGTTTTCCTACGATACATCAGAAACTTCGGGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATG
GAAGAACTCTATGATTCTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAGATATATATTGGTGTT
GAGTTCTTACTTGTCTCAATTACCGAGGATCTCTGAGACGCATGCATTACTGGATTCGAT
CAAGACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTATCTATCATTCCA
CATTTCATATCGATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTATTAAAATAAAGTGACGGGTC
AAATCGGTTGATTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATTCGTTGCAACATTTT
CTCTGGTGGAGAAAACTTGTTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTGTAATAAC
AACAATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTTTTTTCATGGTTGCTGCTGTGT
ACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTTTAATAACAACAATAATGTATGACTGTATGTGT
GTTGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H356TF U 1
AF RR4H356JQ C 49
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RD RR4H356TF 736 0 0
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TGGTTTTCCTACGATACATCAGAAACTTCGGGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATG
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GAGTTCTTACTTGTCTCAATTACCGAGGATCTCTGAGACGCATGCATTACTGGATTCGAT
CAAGACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTATCTATCATTCCA
CATTTCATATCGATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTATTAAAATAAAGTGACGGGTC
AAATCGGTTGATTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATTCGTTGCAACATTTT
CTCTGGTGGAGAAAACTTGTTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTGTAATAAC
AACAATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTTTTT*CATGGTTGCTGCTGTGT
ACATGCATGTTTGTAC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4H356JQ 739 0 0
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GGGCACCAAGGTTGGTTTTCCTACGATACATCAGAAACTTCGGGCAAAGGCACGAGCAAG
TTTATGCCGATGGAAGAACTCTATGATTCTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAGATA
TATATTGGTGTTGAGTTCTTACTTGTCTCAATTACCGAGGATTTCTGAGACGCATGCATT
ACTGGATTCGATCAAGACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTA
TCTATCATTCCACATTTCATATCGATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTATTAAAATA
AAGTGACGGGTCAAATCGGTTGATTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATTCG
TTGCAACATTTTCTCTGGTGGAGAAAACTTGTTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTT
GTTTGTAATAACAACAATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTTTTTTCATGG
TTGCTGCTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTTTAATAACAACAATAATGTAT
GACTGTATGTGTGTTGGGC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL5291Contig1 776 2 8 U
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TAACTATCAGTTGAAGATGAAGGCCTCCAGATCCTTGATAAGCGAGGTTAAAGAGAACTT
CCCCCACATGCCATTCACTTCAAGGTCATTGGAAGAGAAAGGGGCACGACTTGGACTTGT
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BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F906TF U 1
AF RR4F906JQ C 4
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BS 698 700 RR4F906JQ
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BS 711 711 RR4F906JQ
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BS 732 744 RR4F906TF
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RD RR4F906TF 744 0 0
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TGAAGCATGATGTCTTTCTTTTGTTTTCTTTTAAAAGAATTTTTGGAACTTCAGGTCTTT
TGTAGGTTTGAGTTTCAGAGAGTCTCTTAGATAAAAAG**ACAAAGAAAA*CAAATTAAA
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QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4F906JQ 773 0 0
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TGTTGCCCAGATTAAATTCACAGTTCTGCTGATGCCAAATGGATCGGATAGGATCACATC
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AGGAGAGAAAGGAGAGGCCTCAACGGAGGCTGAGCCAATGGAAGCAAGTAGCAATGCTGA
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AGGTTTGAGTTTCAGAGAGTCTCTTAGATAAAAAAGAACAAAGAAAAACAAATTAAATGT
GTCTTTTTGCACAAGTCCTTTTACTGAATGTTCATCATCATTGTTCTGATTTT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL5292Contig1 520 2 1 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H823JQB C 1
AF RR4H823TF U 1
BS 1 520 RR4H823TF

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DS 

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QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

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GCTACAAGTATTATCCAACGGTGCTTGAGCTTGCTGAAAACTCAGACATCTTCGTGGTAG
CATGCCCATTGACTGACCAGACCAGAGGCATTGTCAATCGGCAGGTCATGGATGCATTAG
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TAAAAGCTCTAACAGAAGGCCGCCTAGGTGGGGCTGCGCTGGACGTGTTTGAGCAGGAGC
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TTTGCCGAAGTATTGGAGTAGCATACACGTGTGAGGTTTATGACAATATGCTAAAATCCC
ATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4AI78TF U 1
AF RR4AI78JQ C 326
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BS 889 1144 RR4AI78JQ

RD RR4AI78TF 897 0 0
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QA 1 888 1 888
DS 

RD RR4AI78JQ 819 0 0
G
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GAGCTTGCTGAAAACTCAGACATCTTCGTGGTAGCATGCCCATTGACTGACCAGACCAGA
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CTTCAAAATGTTGTTTTACTTCCTCACGTTGGGAGTAGCACTGTAGAGACAGAGAATGCC
ATGGCAGATCTTGTGGTGAGTAACTTGGAAGCGCACTTCGCTGGGAAATCACTTCTGACT
CCGGCGGTCTGAGTAAAGGGCTCCTTCTATTATCTATGATGATGGAAAGTGTCAATTTCT
CTTCCAAACAACTCGACTTGTCGTATATAAGGTATGTATTTTAAAACAAAAAGACACTAC
TACTCTCTGTTTCCAAGTGTTTTTATCTTTCTTTTTTGCCGAAGTATTGGAGTAGCATAC
ACGTGTGAGGTTTATGACAATATGCTAAAATCCCATCG

QA 2 819 2 819
DS 



AS 1 2

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GTCATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTGGGGAAAACCTCTTTGATGAATCAATATGTTAAC
AAAAAGTTCAGCAACCAGTACAAGGCCACCATTGGAGCTGACTTCTTGACTAAGGAAGTC
CACTTTGAAGATCGTCTTTTCACTTTACAGATATGGGATACAGCTGGACAGGAAAGGTTC
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AACTCCATGAAATCTTTTGAAAACCTCAACAACTGGCGTGAAGAGTTTCTCATCCAGGCT
AGTCCATCTGATCCAGAGAATTTTCCTTTTGTTCTTATCGGAAACAAGGTCGACGTGGAT
GGTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAAAAAGGCTAAAGCTTGGTGTGCTTCGAAGGGA
AACCTACCCTACTTTGAGACCTCTGCTAAGGAAGGCACCAATGTTGAGGAAGCTTTCCAG
TGCATTGCCAGTAACGCGCTCAAGAGCGGCGAAGAGGAAGAGCTATACTTGCCAGACACA
ATCGACGTGGGGACGAGCAACCAACCGAGATCTTCAGGGTGTGAATGCTAAAAGGGTTTG
TATCTTTCCGAGAAGAATGCTTTTGAGTTCAACAATGTGTTTTGGTCTCTCCCATTACCA
GCTATCTCTAAAGTTTTATTACATGCTGTAAAATTTCTTCTTTTGTGTGAAAAATGAATC
CTTCCTTAAAAAACCATTTGATTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DC67TF U 1
AF RR4DC67JQ C 183
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BS 699 699 RR4DC67JQ
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BS 709 868 RR4DC67JQ

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CACTTTGAAGATCGTCTTTTCACTTTACAGATATGGGATACAGCTGGACAGGAAAGGTTC
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AACTCCATGAAATCTTTTGAAAACCTCAACAACTGGCGTGAAGAGTTTCTCATCCAGGCT
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CCTACCCTACTTTGAGACCTCTGCTAAGGAAGGCACCAATGTTGAGGAAGCTTTCCAGTG
CATTGCCAGTAACGCGCTCAAGAGCGGCGAAGAGGAAGAGCTATACTTGCCAGACACAAT
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TCCTTAAAAAACCATTTGATTTGTGC

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4H605TF U 1
AF RR4H605JQB C 1
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BS 517 564 RR4H605JQB

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DS 

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GGAGGCATCGTCAGCAGCAGGAGCAGCAGGGAAGGAAAGTGACAAGGGAGGTGTTGAAGA
TTGTTTGGAGATATCGCCTGGATCAAGTTACAACGAGGATCTGTTTCCTATGGCCTCTTA
ACCCAGGCAAAGCTGTTCTCATTTTCTTGAGGCTTTTTTGGGGGAGATCATGTGTGAGTT
TATTAGTGTTGTAAGATTTTCGTGTTTTTTTTGTTTTGTGAGATTTTTGCAGGCGTGCTC
TGCATAAAAGCTTGTTGTTGATCCAAGGGGGATTGAGTTTTGGTGTGGCCTGATGCCCCC
GGCTCATCCTTTCTTTTGTTTGTACTACTACTACCATTGTATTTGTGACTTTATTATCAT
ATTTGAAGGGAAACCATTTGTACC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL5296Contig1 932 2 2 U
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ATGTTCTACTGGACATCACAGATGATTGCCTCTGTTATGGCTTGCCTTGTCCTTAAAGTA
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ACGAAATGTTGTCGACTTTGATGTTTAATTTC


BQ
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AF RR4GP05TF U 1
AF RR4GP05JQ C 160
BS 1 675 RR4GP05TF
BS 676 932 RR4GP05JQ

RD RR4GP05TF 675 0 0
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CCAACAACGTTTTCAAGTAAGTTTCAAGGAGCAGTGAGTATGAATGCGTTGAGATGTTAC
GTTTCTGAGTTTATCTCAACCTTCTTCTTCGTCCTTGCAGCCGTTGGATCCGTCATGGCT
TCAAGGAAACTGACTGCGGGTGATTTTACGGGTCCGTTTAGTGTATTAATACCGGCGATT
GCAAATGCGTTTGCATTATCATCTTCAGTTTACATCTCTTGGAACGTCTCTGGTGGCCAT
GTGAATCCAGCGGTTACGTTTGGAATGGCGGTTGCTGGTCGGATTAGCGTTCCAACCGCT
ATGTTCTACTGGACATCACAGATGATTGCCTCTGTTATGGCTTGCCTTGTCCTTAAAGTA
ACCGTTGTTGAACAGCACGTACCGATCTATAAGATTGCTGGAGAAATGACGGGATTTGGA
GCATCGGTTCTCGAGGGTGTTCTATCGTTCGTCCTTGTCTACACCGTGTTCACGGCTAAC
GACCCTAGACGTGGCTTACCTTTAGCCGTGGGACCTATATTCATAGGGTTTGTTGCGGGC
GCCAATGTTTTAGCCGCTGGTCCGTTCTCTGGTGGAGCCATGAATCCTGCATGTGCCTTT
GGGTCGGCTATGATT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4GP05JQ 773 0 0
GCCGTTGGATCCGTCATGGCTTCAAGGAAACTGACTGCGGGTGATTTTACGGGTCCGTTT
AGTGTATTAATACCGGCGATTGCAAATGCGTTTGCATTATCATCTTCAGTTTACATCTCT
TGGAACGTCTCTGGTGGCCATGTGAATCCAGCGGTTACGTTTGGAATGGCGGTTGCTGGT
CGGATTAGCGTTCCAACCGCTATGTTCTACTGGACATCACAGATGATTGCCTCTGTTATG
GCTTGCCTTGTCCTTAAAGTAACCGTTGTTGAACAGCACGTACCGATCTATAAGATTGCT
GGAGAAATGACGGGATTTGGAGCATCGGTTCTCGAGGGTGTTCTATCGTTCGTCCTTGTC
TACACCGTGTTCACGGCTAACGACCCTAGACGTGGCTTACCTTTAGCCGTGGGACCTATA
TTCATAGGGTTTGTTGCGGGCGCCAATGTTTTAGCCGCTGGTCCGTTCTCTGGTGGAGCC
ATGAATCCTGCATGTGCCTTTGGGTCGGCTATGATTTACGGAAGCTTCAAGAACCAAGCC
GTCTACTGGGTCGGGCCTTTGCTCGGAGGAGCCACCGCTGCGCTAGTGTATGAAAACATG
GTTGTGGTTCCTGCAGCTGAAGATGACCGTGGTTCATCTACTGGAGATGCCACTGTAGTG
TGATTACTTGTGCGTCTAATGTTTTATATATTTCTACGTTGAAGTAGAGCGTTATTTAGT
TTTTTTTTTCTTTTTCAGTTTACGAAATGTTGTCGACTTTGATGTTTAATTTC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL5297Contig1 807 2 4 U
TTTTTTCTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGATGAGTGA
AGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTT
ATCTAAGAGATCGGTTGCTGCCCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCC
AGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGA
CAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCA
TAACTACGGCTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGT
CATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAAT
GCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCC
GAAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCG
GCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCT
ACCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACAT
TCTTCACACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCCTGCCAAAGAAAGAGAGAATTTGT
CTGATTGATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTCTGTTGTTTGACTTTAAGCT
TGTTTGACTTAAAGCTTTTGTGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF06TF U 1
AF RR4D417TF U 24
BS 1 481 RR4DF06TF
BS 482 482 RR4D417TF
BS 483 555 RR4DF06TF
BS 556 807 RR4D417TF

RD RR4DF06TF 555 0 0
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AGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTT
ATCTAAGAGATCGGTTGCTGCCCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCC
AGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGA
CAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCA
TAACTACGGCTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGT
CATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAAT
GCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCC
GGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCG
GCGATTCTTTGAAGA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4D417TF 784 0 0
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CAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTTATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTC
ATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGGCCTGGAGCTCCAGTGATTTTCAATGTGGTTGTTG
AGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAGAGACAGGACTAATCAAGG
TTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTACGGCTTTATTCCCCGCA
CATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATGCAGGAGCCTGTACTTC
CAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAAA
AAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGAAGTATAAGCATTACACTGACA
TCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGA
AGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTACCGAATGGTCCTGCTGTTGAAG
CCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCACACCTTGAGAAGATAAG
GGAAGGGCCATTCCTGCCAAAGAAAGAGAGAATTTGTCTGATTGATTTTGAATAAAGCAC
GTGTTCATGAAACTGTTCTGTTGTTTGACTTTAAGCTTGTTTGACTTAAAGCTTTTGTGT
GTTT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5299Contig1 854 2 2 U
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CGGATTCTGCTCTCCCTCTACATCTCTGAAAATGGCGGATGCAAATGCCGAACCGGCCGT
TGGTTCTTCGGGATCTAACGAAAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATGCCAACCAT
CGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTAGCTAGTGG
AGTCATGTGAGGAGGGCTTGGGTTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAATCC
TATAACGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATGGG
ACAAAGGAGTTGGAGTTCTTGCAAGACTTTTGCTGTTATGGGTTTGGTTTTCTCTGCTGC
TGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCTGG
ATGTGTGACCGGTGGCTCCATGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGTTG
CGCCGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGTTCTTCGACAGGCATACGTAAAC
CAACAAATATATCTAACAAACGCCATTGCTTCGAATTGCTTAGCTGTTTCTTATTATAGT
TCATCACCTGAGCACAGGGAGAGAGGGAAAACTAGAATTACATTTTCCAACATAGAAGAA
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TTTGGTTACACTCATGCTCCCAATATTACAGTGTTCCTCAGAAAATAAGGGCCTGTCCTG
GCTTGGCTTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH86TF U 1
AF RR4EH86JQ C 255
BS 1 782 RR4EH86TF
BS 783 854 RR4EH86JQ

RD RR4EH86TF 782 0 0
GGGCGAATCGCGAAAGCTCGATCTGTTTCTTCCCTTTTCTTTTTATGACATAAATCCTGT
CGGATTCTGCTCTCCCTCTACATCTCTGAAAATGGCGGATGCAAATGCCGAACCGGCCGT
TGGTTCTTCGGGATCTAACGAAAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATGCCAACCAT
CGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTAGCTAGTGG
AGTCATGTGAGGAGGGCTTGGGTTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAATCC
TATAACGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATGGG
ACAAAGGAGTTGGAGTTCTTGCAAGACTTTTGCTGTTATGGGTTTGGTTTTCTCTGCTGC
TGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCTGG
ATGTGTGACCGGTGGCTCCATGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGTTG
CGCCGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGTTCTTCGACAGGCATACGTAAAC
CAACAAATATATCTAACAAACGCCATTGCTTCGAATTGCTTAGCTGTTTCTTATTATAGT
TCATCACCTGAGCACAGGGAGAGAGGGAAAACTAGAATTACATTTTCCAACATAGAAGAA
GAAACTCAAGCTTGTTTTGATTGAATGTTTGTTCAGTTATTGTCATTATTTATCGTAGAT
TT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4EH86JQ 600 0 0
GGCTTGGGTTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAATCCTATAACGAATGATA
CCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATGGGACAAAGGAGTTGGA
GTTCTTGCAAGACTTTTGCTGTTATGGGTTTGGTTTTTTCTGCTGCTGAATGCATTATCG
AGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCTGGATGTGTGACCGGTG
GCTCCATGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGTTGCGCCGGCTTTGCAA
CTTTTTCTGTACTGATAGAGAAGTTTTTCGACAGGCATACGTAAACCAACAAATATATCT
AACAAACGCCATTGCTTCGAATTGCTTAGCTGTTTCTTATTATAGTTCATCACCTGAGCA
CAGGGAGAGAGGGAAAACTAGAATTACATTTTCCAACATAGAAGAAGAAACTCAAGCTTG
TTTTGATTGAATGTTTGTTCAGTTATTGTCATTATTTATCGTAGATTTTGGTTACACTCA
TGCTCCCAATATTACAGTGTTCCTCAGAAAATAAGGGCCTGTCCTGGCTTGGCTTTGCAC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL5300Contig1 778 2 4 U
ACCCCAACCGTTAGATCTTTCACCTTCACACCACCTCATCGTCGCTCCAATCACACCGTA
ATGTCCGCCGTCCGATCTGAGACCACTTCAACATGTCCTGTTCTGACCAAATTTCAGAAT
GACTGTGCCACCCCTACCCCGTTCTTACGCGAAGTAGCCAACGCCCTTGCTGATGGCATG
CAAGCCGGTCTAGCTGTCCATGGTGGAGGAGATCTCGAGATGATCTTGACTTATGTCGAC
GCTTTGCCTTCGGGGAAGGAGGAAGGTTTGTTCTATGCATTGGATTTAGGGGGAACAAAC
TTTCGGGTGCGTAGCGTACAGTTAGGAGGAGAGGAAGAACGTGTCGTAGCCAAATCTGAA
CAGCTATCTATTCCTCAGGAGCTTCTTGGTGATGACCTTGCAAGGCACGTTCATATTAAA
CATACCAAAGATGTGTCTGGGCTTGGTGCTGCTCTTTTGGCCGCTACTAACTCCATTTAT
TAGTAGTTGCACGTCTACTTCGTGAGTAAAAGACTTGGTGCGATACTGCTGCTCTTCTTT
TTCTTCTCTTTTTACTTCATGAGTTAAACACGCATTATGTTATCTCTAATATATAAGAAT
TGTTAAATTCAAGCTCTGTATACTATGCCACTAAGTAGAGGTGGTTTATTCCACATAAGC
TTTAGCTCATTTTTATATCAAGTGAAAAACATAGTGGTTTTCATCTCTCCTTGTATGCTT
AACTAATTTATGATTCAGCTATTGATTGTGAATTAAATTCAAATCCAGTTATTTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BL67TF U 1
AF RR4BL67JQ C 28
BS 1 307 RR4BL67TF
BS 308 308 RR4BL67JQ
BS 309 330 RR4BL67TF
BS 331 778 RR4BL67JQ

RD RR4BL67TF 334 0 0
ACCCCAACCGTTAGATCTTTCACCTTCACACCACCTCATCGTCGCTCCAATCACACCGTA
ATGTCCGCCGTCCGATCTGAGACCACTTCAACATGTCCTGTTCTGACCAAATTTCAGAAT
GACTGTGCCACCCCTACCCCGTTCTTACGCGAAGTAGCCAACGCCCTTGCTGATGGCATG
CAAGCCGGTCTAGCTGTCCATGGTGGAGGAGATCTCGAGATGATCTTGACTTATGTCGAC
GCTTTGCCTTCGGGGAAGGAGGAAGGTTTGTTCTATGCATTGGATTTAGGGGGAACAAAC
TTTCGGG*GCGTAGCGTACAGTTAGGAGGA
AGGA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4BL67JQ 751 0 0
ACACCACCTCATCGTCGCTCCAATCACACCGTAATGTCCGCCGTCCGATCTGAGACCACT
TCAACATGTCCTGTTCTGACCAAATTTCAGAATGACTGTGCCACCCCTACCCCGTTCTTA
CGCGAAGTAGCCAACGCCCTTGCTGATGGCATGCAAGCCGGTCTAGCTGTCCATGGTGGA
GGAGATCTCGAGATGATCTTGACTTATGTCGACGCTTTGCCTTCGGGGAAGGAGGAAGGT
TTGTTCTATGCATTGGATTTAGGGGGAACAAACTTTCGGGTGCGTAGCGTACAGTTAGGA
GGAGAGGAAGAACGTGTCGTAGCCAAATCTGAACAGCTATCTATTCCTCAGGAGCTTCTT
GGTGATGACCTTGCAAGGCACGTTCATATTAAACATACCAAAGATGTGTCTGGGCTTGGT
GCTGCTCTTTTGGCCGCTACTAACTCCATTTATTAGTAGTTGCACGTCTACTTCGTGAGT
AAAAGACTTGGTGCGATACTGCTGCTCTTCTTTTTCTTCTCTTTTTACTTCATGAGTTAA
ACACGCATTATGTTATCTCTAATATATAAGAATTGTTAAATTCAAGCTCTGTATACTATG
CCACTAAGTAGAGGTGGTTTATTCCACATAAGCTTTAGCTCATTTTTATATCAAGTGAAA
AACATAGTGGTTTTCATCTCTCCTTGTATGCTTAACTAATTTATGATTCAGCTATTGATT
GTGAATTAAATTCAAATCCAGTTATTTGGTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL5301Contig1 978 2 2 U
GACATCATATAATCAGATACATGACCAGACGTTAATGCACTTATTATGATAAAATAAATC
AAAACCTAAAGTTTTTAGACGGAAGTGCTTGTAAATAGGGCTGGATCGGTCAACTTTGAA
GTTCATTCTTTCAAACAAATCCAACTGCAAGATGTAAAAACGTTGATTATGAAAATTACA
TCAATTCACAGATGTGTAAACTAAACTCTATATATATATCAAATAATTTAGTCTTCACCT
GTTTTAAGAAGCCAAGATTGGGTCTAGCGTGAGCACTTTGCTTCAGTGACGCCAACGCAT
CTGTAAAAACATAACAACATATCAATTAAAGGGACTCATGAGAGATCGTTTTAAAAATTA
TCGTGCATACCTTGACAAGAAAGCTTTTCGGTCCTCATTAGATACGCAATGACCATAGAA
GCACTAAAACAAAAACGTAATAGTTATAGTCAAGATCAAGCTTCAAAACGTTAACTGCAC
GTAATAAAAGAAAAAAACAAACAATAACTAAATAATTTTACCTTCGAGATTCTCCTGCAA
AGCAATGAACTAAAACACCTTTCTCTTGGCGGCCACCATCAATAAAATCCAAGCAAATAT
CGAAAAAATCAAGCAGATTCTCCCATTCTTAATCGTAAGCAAAGACAGCCATCCTAGTAA
ATTTGAGATCTTTGCCAGTATGCTCAAGTGAATATAGAAGATTGCCAGATGGCAATGCAC
TCTCTGTCGCAAACTCTTTGCCTTGATCATGATCATCACCAACATACACTTCCTCGATTT
CTTTAGAGTCTAGTTTCACGTTGCGCCATTCCTCGAACACAGATATGGAAGGGCAGTGTA
AAACTGTAAGAACGTGTGAAATATCAGAGCTTCCGTTCTTGAGAATTTCAGAAGCGGCAC
AGATATCACCGAGGTATAGATTTTCCCTAATTAGGTCAAGCTTCTGCATTGTCGATGAGA
AGAACCCTAGACACGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF56TF U 1
AF RR4GF56JQ C 248
BS 1 761 RR4GF56TF
BS 762 978 RR4GF56JQ

RD RR4GF56TF 761 0 0
GACATCATATAATCAGATACATGACCAGACGTTAATGCACTTATTATGATAAAATAAATC
AAAACCTAAAGTTTTTAGACGGAAGTGCTTGTAAATAGGGCTGGATCGGTCAACTTTGAA
GTTCATTCTTTCAAACAAATCCAACTGCAAGATGTAAAAACGTTGATTATGAAAATTACA
TCAATTCACAGATGTGTAAACTAAACTCTATATATATATCAAATAATTTAGTCTTCACCT
GTTTTAAGAAGCCAAGATTGGGTCTAGCGTGAGCACTTTGCTTCAGTGACGCCAACGCAT
CTGTAAAAACATAACAACATATCAATTAAAGGGACTCATGAGAGATCGTTTTAAAAATTA
TCGTGCATACCTTGACAAGAAAGCTTTTCGGTCCTCATTAGATACGCAATGACCATAGAA
GCACTAAAACAAAAACGTAATAGTTATAGTCAAGATCAAGCTTCAAAACGTTAACTGCAC
GTAATAAAAGAAAAAAACAAACAATAACTAAATAATTTTACCTTCGAGATTCTCCTGCAA
AGCAATGAACTAAAACACCTTTCTCTTGGCGGCCACCATCAATAAAATCCAAGCAAATAT
CGAAAAAATCAAGCAGATTCTCCCATTCTTAATCGTAAGCAAAGACAGCCATCCTAGTAA
ATTTGAGATCTTTGCCAGTATGCTCAAGTGAATATAGAAGATTGCCAGATGGCAATGCAC
TCTCTGTCGCAAACTCTTTGCCTTGATCATGATCATCACCA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4GF56JQ 731 0 0
GAAGCCAAGATTGGGTCTAGCGTGAGCACTTTGCTTCAGTGACGCCAACGCATCTGTAAA
AACATAACAACATATCAATTAAAGGGACTCATGAGAGATCGTTTTAAAAATTATCGTGCA
TACCTTGACAAGAAAGCTTTTCGGTCCTCATTAGATACGCAATGACCATAGAAGCACTAA
AACAAAAACGTAATAGTTATAGTCAAGATCAAGCTTCAAAACGTTAACTGCACGTAATAA
AAGAAAAAAACAAACAATAACTAAATAATTTTACCTTCGAGATTCTCCTGCAAAGCAATG
AACTAAAACACCTTTCTCTTGGCGGCCACCATCAATAAAATCCAAGCAAATATCGAAAAA
ATCAAGCAGATTCTCCCATTCTTAATCGTAAGCAAAGACAGCCATCCTAGTAAATTTGAG
ATCTTTGCCAGTATGCTCAAGTGAATATAGAAGATTGCCAGATGGCAATGCACTCTCTGT
CGCAAACTCTTTGCCTTGATCATGATCATCACCAACATACACTTCCTCGATTTCTTTAGA
GTCTAGTTTCACGTTGCGCCATTCCTCGAACACAGATATGGAAGGGCAGTGTAAAACTGT
AAGAACGTGTGAAATATCAGAGCTTCCGTTCTTGAGAATTTCAGAAGCGGCACAGATATC
ACCGAGGTATAGATTTTCCCTAATTAGGTCAAGCTTCTGCATTGTCGATGAGAAGAACCC
TAGACACGTTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5302Contig1 810 2 4 U
GGGTGATTAGAATTTGGTTATGGCGGAGACATCTGCGCTTCTCTTCTCTCACCTCACCAT
CTCTCGCGTATTGGCCACGACTTCTTCTTCTTCTCGATTCTCTCTTCTTTCTCGCGCTCG
GCCTTCTCGTTCGGCTCGTTTTGCAGCTAAGGCATCGCCGCATTACGGTAGCTTCTCCGA
TGACGATGCCTTCTTCCCATGGTCCGATGGAGATAAAGGCATTGAATGGGTTCATGAAGA
AAGAATCACACTTTTCACCTCTGATGGGCTAATTCAGATTGGTGGCAATATGGTTCCTCG
TCGCATCAACTCATCTACTAAGAAACATGGGAAGTCCAAGAAACATCCAAAGTTTCAGGA
AAGTTCTTACATGAATCCTGCTCAAGGTCTATGCCTTGGAGCTCTTTTCGACATCGCAGC
TACAAACGGACTTGATATGGGAAGAAGACTCTGTATCTATGGATTCTGTCGTTCCGTTGA
GATGCTCAGTGATGTTGTTGAAGACACTGTCTTAGAATATGGTGGAGAGGTTGTTGCTGC
AGAGAAAGAGAGCAAAGGGGGTTTACAAGAGAAGTTAAAAATGTCAGTGGCGGTTCCATA
TCTCTGGGGAGTTCCTCCCACTGCAGAGAGGCTTCACCTTGCTGTTCGAACTGGTGGAGG
CATTGTTGACAAAGTCTATTGGCAATGGGATTTCTTGTGAATCATCATGAAACTTCTATA
ATAATGGTGCTCTAACCTCACAAGTCACAAGTGTTTTATAAATCATTCATTGTACAGAAC
TTTACACTTGGTATAAATTCCCTAATTGTA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
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AF RR4H936TF U 1
AF RR4AF62TF U 3
BS 1 675 RR4H936TF
BS 676 676 RR4AF62TF
BS 677 718 RR4H936TF
BS 719 810 RR4AF62TF

RD RR4H936TF 718 0 0
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CTCTCGCGTATTGGCCACGACTTCTTCTTCTTCTCGATTCTCTCTTCTTTCTCGCGCTCG
GCCTTCTCGTTCGGCTCGTTTTGCAGCTAAGGCATCGCCGCATTACGGTAGCTTCTCCGA
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AAGAATCACACTTTTCACCTCTGATGGGCTAATTCAGATTGGTGGCAATATGGTTCCTCG
TCGCATCAACTCATCTACTAAGAAACATGGGAAGTCCAAGAAACATCCAAAGTTTCAGGA
AAGTTCTTACATGAATCCTGCTCAAGGTCTATGCCTTGGAGCTCTTTTCGACATCGCAGC
TACAAACGGACTTGATATGGGAAGAAGACTCTGTATCTATGGATTCTGTCGTTCCGTTGA
GATGCTCAGTGATGTTGTTGAAGACACTGTCTTAGAATATGGTGGAGAGGTTGTTGCTGC
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TCTCTGGGGAGTTCCTCCCACTGCAGAGAGGCTTCACCTTGCTGTTCGAACTGGTGGAGG
CATTGTTGACAAAGTTTATTGGCAATGGGATTTCTTGTGAATCATCATGAAACTTCTA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4AF62TF 808 0 0
GG
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CGCGTATTGGCCACGACTTCTTCTTCTTCTCGATTCTCTCTTCTTTCTCGCGCTCGGCCT
TCTCGTTCGGCTCGTTTTGCAGCTAAGGCATCGCCGCATTACGGTAGCTTCTCCGATGAC
GATGCCTTCTTCCCATGGTCCGATGGAGATAAAGGCATTGAATGGGTTCATGAAGAAAGA
ATCACACTTTTCACCTCTGATGGGCTAATTCAGATTGGTGGCAATATGGTTCCTCGTCGC
ATCAACTCATCTACTAAGAAACATGGGAAGTCCAAGAAACATCCAAAGTTTCAGGAAAGT
TCTTACATGGATCCTGCTCAAGGTCTATGCCTTGGAGCTCTTTTCGACATCGCAGCTACA
AACGGACTTGATATGGGAAGAAGACTCTGTATCTATGGATTCTGTCGTTCCGTTGATATG
CTCAGTGATGTTGTTGAAGACACTGTCTTAGAATATGGTGGAGAGGTTGTTGCTGCAGAG
AAAGAGAGCAAAGGGGGTTTACAAGAGAAGTTAAAAATGTCAGTGGCGGTTCCATATCTC
TGGGGAGTTCCTCCTACTGCAGAGAGGCTTCACCTTGCTGTTCGAACTGGTGGAGGCATT
GTTGACAAAGTCTATTGGCAATGGGATTTCTTGTGAATCATCATGAAACTTCTATAATAA
TGGTGCTCTAACCTCACAAGTCACAAGTGTTTTATAAATCATTCATTGTACAGAACTTTA
CACTTGGTATAAATTCCCTAATTGTA

QA 3 808 3 808
DS 



AS 1 2

CO CL5303Contig1 519 2 1 U
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GAAGCTCAAAGTTCAGTCAAACCAGTGGAGAAAAGCTGCTGAAGCAGCTACGGCCATGCT
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CTCTGAGGATGTTGATGATGATGTGACAAAGAAGAAGAATGGGAATGTGCTCAAGAAGAT
TGGTGTTTTGTGGAAGAAGCCTCAGAAATAGATTGGGGGGAATGACTGATATAATAATCA
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BQ
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AF RR4AI62JQ C 1
AF RR4AI62TF U 1
BS 1 519 RR4AI62TF

RD RR4AI62JQ 519 0 0
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GAAGCTCAAAGTTCAGTCAAACCAGTGGAGAAAAGCTGCTGAAGCAGCTACGGCCATGCT
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CTCTGAGGATGTTGATGATGATGTGACAAAGAAGAAGAATGGGAATGTGCTCAAGAAGAT
TGGTGTTTTGTGGAAGAAGCCTCAGAAATAGATTGGGGGGAATGACTGATATAATAATCA
GGTAACGTTGGTTTGGAGTTGGATTATAAAGACCATCCTGTGGCTCTGGTATTGATGTGT
ATTTAGAAGTTTGGGGGACTATGTTCTGGAAAACATGTTCGAAAAGATTTGAGTTGTAGT
AATTTTATGTTAAACTGTTAAAAGTTGTATCCAGGAGGCAAACTATTAGTTCTGCTACTG
TGTAACGGGCTGTTGACCGTTTGATATGATAGTTTCGCT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4AI62TF 519 0 0
AGGGACTGAGCAGCCTGATGCAACTCAAGCGTCGAACTTGGAGATGGAGATAGAGCTGAG
GAAGCTCAAAGTTCAGTCAAACCAGTGGAGAAAAGCTGCTGAAGCAGCTACGGCCATGCT
ATCTGCTGGAAACAACAACGGGAAGTTTGGTGAGAATTGTGATAAAAAGAACTCTCCTTA
CTCTGAGGATGTTGATGATGATGTGACAAAGAAGAAGAATGGGAATGTGCTCAAGAAGAT
TGGTGTTTTGTGGAAGAAGCCTCAGAAATAGATTGGGGGGAATGACTGATATAATAATCA
GGTAACGTTGGTTTGGAGTTGGATTATAAAGACCATCCTGTGGCTCTGGTATTGATGTGT
ATTTAGAAGTTTGGGGGACTATGTTCTGGAAAACATGTTCGAAAAGATTTGAGTTGTAGT
AATTTTATGTTAAACTGTTAAAAGTTGTATCCAGGAGGCAAACTATTAGTTCTGCTACTG
TGTAACGGGCTGTTGACCGTTTGATATGATAGTTTCGCT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL5304Contig1 553 2 5 U
CAGCTGTTTCCCCCTTCCCACTATCATCATACGAAGTGGGTTTTGCTGGACACAGAACGT
AAACTTTGGTTTTTTATTAAACAAAAATGGATTTCTCCGCCTTGCTTCTCACTCTCTTCA
CCGGAATTATCTTCCTCTACTTTCTCCGGTGCATAGTCTCTCAGCGCCGCCGTGGACCCT
CGAAACTCCCACTCCCGCCGGGAACAATGGGTTGGCCTTACGTCGGCGAGACTTTTCAGC
TCTATTCTCAAGACCCTAACGTCTTTTTCGCATCGAAACAGAAAAGGTACGGATCGATGT
TTAAGACACATGTATTGGGATGTCCATGTGTGATGATCTCGAGTCCCGAAGCTGCCAAGT
TCGTGCTGGTGACCAAGTCTCATCTCTTTAAACCGACTTTTCCAGCGAGTAAAGAGAGGA
TGTTAGGTAAACAAGCCATCTTCTTCCACCAAGGTGATTACCACGCTAAGCTCAGAAAGT
TTGTCCTTCGAGCTTTCATGCCTGAAGCAATCAGAGACATGGTTCCCGACATCGAATCAA
TCGCTCGGGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK82TF U 84
AF RR4E978TF U 1
BS 1 115 RR4E978TF
BS 116 116 RR4CK82TF
BS 117 277 RR4E978TF
BS 278 278 RR4CK82TF
BS 279 553 RR4E978TF

RD RR4CK82TF 207 0 0
AAAATGGATTTCTCCGCCTTGCTTCTCACTCTCTTCACCGGAATTATCTTCCTCTACTTT
CTCCGGTGCATAGTCTCTCAGCGCCGCCGTGGACCCTCGAAACTCCCACTCCCGCCGGGA
ACAATGGGTTGGCCTTACGTCGGCGAGACTTTTCAGCTCTATTCTCAAGACCCTAACGTC
TTTTTCGCATCGAAACAGAAAAGGTAC

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4E978TF 553 0 0
CAGCTGTTTCCCCCTTCCCACTATCATCATACGAAGTGGGTTTTGCTGGACACAGAACGT
AAACTTTGGTTTTTTATTAAACAAAAATGGATTTCTCCGCCTTGCTTCTCACTCT*TTCA
CCGGAATTATCTTCCTCTACTTTCTCCGGTGCATAGTCTCTCAGCGCCGCCGTGGACCCT
CGAAACTCCCACTCCCGCCGGGAACAATGGGTTGGCCTTACGTCGGCGAGACTTTTCAGC
TCTATTCTCAAGACCCTAACGTCTTTTTCGCATCGAAGCAGAAAAGGTACGGATCGATGT
TTAAGACACATGTATTGGGATGTCCATGTGTGATGATCTCGAGTCCCGAAGCTGCCAAGT
TCGTGCTGGTGACCAAGTCTCATCTCTTTAAACCGACTTTTCCAGCGAGTAAAGAGAGGA
TGTTAGGTAAACAAGCCATCTTCTTCCACCAAGGTGATTACCACGCTAAGCTCAGAAAGT
TTGTCCTTCGAGCTTTCATGCCTGAAGCAATCAGAGACATGGTTCCCGACATCGAATCAA
TCGCTCGGGACTC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5306Contig1 694 2 2 U
GGCTCCCTCTCTAAGCTGAATCTTGATTCTTGAATCTGCTTCTGCAGTTGATTCTCTTCC
TTTATTCCAAAGTCTCGTTATTTTTTCAAGAGATTAGTATAAGCAAATGGCTTCATACTA
CGCTGGGTTTTCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAA
ACACCTTCCTCGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAA
TGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAACTTTC
TTCAAGATCTCTCCGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGAC
AGGAACCCTCGTGGTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAACTTTTATTACATAAA
AGCAAATAGCTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGAAACAACCTGAGTA
GATTTGCTCTGTGTCTCTCTATGTATCTGGATCGGAGATGATTAGGGTTCTGGGAAAGCT
GTAAAGATCTGGTTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGGGGAGTGGGAGAAGTGTGGTCT
AGGGTTTAATTGGCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTACAACAAGAAACATAGCATACT
ATGTTCTAATAAATTCAATTTCTTTTTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED94TF U 1
AF RR4ED94JQ C 160
BS 1 685 RR4ED94TF
BS 686 694 RR4ED94JQ

RD RR4ED94TF 685 0 0
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TTTATTCCAAAGTCTCGTTATTTTTTCAAGAGATTAGTATAAGCAAATGGCTTCATACTA
CGCTGGGTTTTCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAA
ACACCTTCCTCGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAA
TGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAACTTTC
TTCAAGATCTCTCCGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGAC
AGGAACCCTCGTGGTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAACTTTTATTACATAAA
AGCAAATAGCTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGAAACAACCTGAGTA
GATTTGCTCTGTGTCTCTCTATGTATCTGGATCGGAGATGATTAGGGTTCTGGGAAAGCT
GTAAAGATCTGGTTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGGGGAGTGGGAGAAGTGTGGTCT
AGGGTTTAATTGGCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTACAACAAGAAACATAGCATACT
ATGTTCTAATAAATTCAATTTCTTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4ED94JQ 535 0 0
ATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACCCCTTCCTCGTAATTCAGACATCTTCATGTACAGAGG
AGACAAGGCGTTTTGTAGCAATGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGTCTGATGAAGCCAA
GGAGAAAAGCTGGAAACTTTCTTCAAGATCTCTCCGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAA
AGATTGCAAAACCGTTCGGACAGGAACCCTCGTGGTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAAGA
AAAGAACTTTTATTACATAAAAGCAAATAGCTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCT
TCTTAAGAAACAACCTGAGTAGATTTGCTCTGTGTCTCTCTATGTATCTGGATCGGAGAT
GATTAGGGTTCTGGGAAAGCTGTAAAGATCTGGTTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGG
GGAGTGGGAGAAGTGTGGTTTAGGGTTTAATTGGCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTA
CAACAAGAAACATAGCATACTATGTTCTAATAAATTCAATTTCTTTTTTTTATCC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL5307Contig1 825 2 2 U
CCACAAACGCTGCAGCCACAAACGCACCATCTTCCTTTGTCTTAGGCGAGGAACTTGGTC
ATGGACCAAACAAACTCTTCTTCTCATCTGGCTCATCACATCATTCATCTCAACATCTCC
ACCTTAACAATCACCAAAGTAGTTCTTCAGACATTAAACAAGAAAGCAACAACAACAACA
AGAGGCCATATGGAGTTCACAGTGGCTTCAGCAATGGAAGATCAGATGATGGTCACATCC
TGAGACCTTTCTTTGATGATTGGCCACGATCAACTGACTCTACCTCAAGTCCAATGAGCT
CATCGACTTGTCATCTTTCCATCTCCATGCCCGGTAACCCTTCCTCAGACGTTTCCTTAA
AGCTTTCCACAGGAAATGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAACATGAGAAACAAAAATGAGAGG
GAGCAACAGCAAAGCATGAATTGGTGGAGCAGTGGAGGGAACCACAACAATATGGGTGGG
CCATTGGCTGAAGCCTTGAGGTCAGCCTCTTCAACGTCAAGTGTTCTTCAACAAATGGGA
ATCTCAACTCAAGTCTTTCACTGAAGAAAGTGTTGAAAAAACAAAAAAAACAAATCAAGT
CCTCTTTTAGCCGCCTTTGCATCTGCACTTTCTGCATTATGGTTCTTCTCTGAATTGTTT
TTGTACCGGTAATGTTGTTAGCCAGGCCTAAGTTGCCTGCTTTGGAACTGTTTTCTTTCT
TTCCTTCCTATGCAGAAATTTATGTCTGAAGTTTAAGTATGTCATAAGTCAGTACCTGAG
AAGTTTCTTGGGTTAGATGTTGGTAATATGTAAGTTGGATTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN01TF U 1
AF RR4DN01JQ C 210
BS 1 723 RR4DN01TF
BS 724 825 RR4DN01JQ

RD RR4DN01TF 723 0 0
CCACAAACGCTGCAGCCACAAACGCACCATCTTCCTTTGTCTTAGGCGAGGAACTTGGTC
ATGGACCAAACAAACTCTTCTTCTCATCTGGCTCATCACATCATTCATCTCAACATCTCC
ACCTTAACAATCACCAAAGTAGTTCTTCAGACATTAAACAAGAAAGCAACAACAACAACA
AGAGGCCATATGGAGTTCACAGTGGCTTCAGCAATGGAAGATCAGATGATGGTCACATCC
TGAGACCTTTCTTTGATGATTGGCCACGATCAACTGACTCTACCTCAAGTCCAATGAGCT
CATCGACTTGTCATCTTTCCATCTCCATGCCCGGTAACCCTTCCTCAGACGTTTCCTTAA
AGCTTTCCACAGGAAATGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAACATGAGAAACAAAAATGAGAGG
GAGCAACAGCAAAGCATGAATTGGTGGAGCAGTGGAGGGAACCACAACAATATGGGTGGG
CCATTGGCTGAAGCCTTGAGGTCAGCCTCTTCAACGTCAAGTGTTCTTCAACAAATGGGA
ATCTCAACTCAAGTCTTTCACTGAAGAAAGTGTTGAAAAAACAAAAAAAACAAATCAAGT
CCTCTTTTAGCCGCCTTTGCATCTGCACTTTCTGCATTATGGTTCTTCTCTGAATTGTTT
TTGTACCGGTAATGTTGTTAGCCAGGCCTAAGTTGCCTGCTTTGGAACTGTTTTCTTTCT
TTC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4DN01JQ 616 0 0
AGCAATGGAAGATCAGATGATGGTCACATCCTGAGACCTTTCTTTGATGATTGGCCACGA
TCAACTGACTCTACCTCAAGTCCAATGAGCTCATCGACTTGTCATCTTTCCATCTCCATG
CCCGGTAACCCTTCCTCAGACGTTTCCTTAAAGCTTTCCACAGGAAATGAAGAAGAAGAA
GAAAGCAAACATGAGAAACAAAAATGAGAGGGAGCAACAGCAAAGCATGAATTGGTGGAG
CAGTGGAGGGAACCACAACAATATGGGTGGGCCATTGGCTGAAGCCTTGAGGTCAGCCTC
TTCAACGTCAAGTGTTCTTCAACAAATGGGAATCTCAACTCAAGTCTTTCACTGAAGAAA
GTGTTGAAAAAACAAAAAAAACAAATCAAGTCCTCTTTTAGCCGCCTTTGCATCTGCACT
TTCTGCATTATGGTTCTTCTCTGAATTGTTTTTGTACCGGTAATGTTGTTAGCCAGGCCT
AAGTTGCCTGCTTTGGAACTGTTTTCTTTCTTTCCTTCCTATGCAGAAATTTATGTCTGA
AGTTTAAGTATGTCATAAGTCAGTACCTGAGAAGTTTCTTGGGTTAGATGTTGGTAATAT
GTAAGTTGGATTAGCT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL5308Contig1 887 2 2 U
GAAGAAGGGATGGAACTGGCTAAGGTGATCAAAGAAGGGTGCAGCAGCAGCAACAGTAGT
AGAGACCAAGAAGCAGCCAACTCTAAAGAGAAAGAAAGCGAGAAAACCAACGGTGAGCGA
GTTTCTGTGTTAGAGAGCACTCAGAAGAAACAGCCATGGAGCAAGGAAGAGATTGACATG
CTGAGAAAAGGAATGATAAAATACCCGAAGGGGACATCTCGTAGATGGGAAGTTATATCA
GAGTACATCGGTACAGGAAGATCCGTGGAAGAGATTCTGAAAGCAACCAAGACGGTTCTT
CTCCAAAAACCAGACTCCGCCAAAGCATTCGACTCGTTCCTCGAGAAGAGGAAACCCACC
GCTACTATCGCTTCCCCTCTCTCCACAAGAGAGGAGCTCGGAGAGTCTCTACCGGCCACA
GCAAAGGTAAAACAACCACCCTCTAAGGAGCCTGTTGCTGGTCAAAGCTCATACAGCAAC
GGTGAAGCAAGCGGAAGTAGTTCAGAGACAACAGATGGTTGGTCTGCTGTTCAAGAAAGA
GCTTTGGTTCAGGCTTTGAAGACATTCCCCAAGGAGACGAGCCAGAGATGGGAGAGAGTA
GCTGCTGCTGTTCCGGGGAGGACGGTGGTTCAGTGCAAGAAGAAGTTTGCAGAGCTTAAG
GAAATCATCAGAAGCAAGAAAACCGGTGTCTAAAATCTTAAACCGGAGCTCCATATGAGA
ATTTTGGGTTGTAATCCTCTTGAGGGCCACACCATTACTTTGCGAGAACAAAGACCTTGA
AACTTTTTTATTATTATATGTAATGATTCATTTGCTTCCGATATCATGAGATGTTAAACC
ACTATCACAAACTTAATACTTTTTACCTAATCTTATGTATTGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EU02TF U 1
AF RR4EU02JQ C 135
BS 1 656 RR4EU02TF
BS 657 887 RR4EU02JQ

RD RR4EU02TF 656 0 0
GAAGAAGGGATGGAACTGGCTAAGGTGATCAAAGAAGGGTGCAGCAGCAGCAACAGTAGT
AGAGACCAAGAAGCAGCCAACTCTAAAGAGAAAGAAAGCGAGAAAACCAACGGTGAGCGA
GTTTCTGTGTTAGAGAGCACTCAGAAGAAACAGCCATGGAGCAAGGAAGAGATTGACATG
CTGAGAAAAGGAATGATAAAATACCCGAAGGGGACATCTCGTAGATGGGAAGTTATATCA
GAGTACATCGGTACAGGAAGATCCGTGGAAGAGATTCTGAAAGCAACCAAGACGGTTCTT
CTCCAAAAACCAGACTCCGCCAAAGCATTCGACTCGTTCCTCGAGAAGAGGAAACCCACC
GCTACTATCGCTTCCCCTCTCTCCACAAGAGAGGAGCTCGGAGAGTCTCTACCGGCCACA
GCAAAGGTAAAACAACCACCCTCTAAGGAGCCTGTTGCTGGTCAAAGCTCATACAGCAAC
GGTGAAGCAAGCGGAAGTAGTTCAGAGACAACAGATGGTTGGTCTGCTGTTCAAGAAAGA
GCTTTGGTTCAGGCTTTGAAGACATTCCCCAAGGAGACGAGCCAGAGATGGGAGAGAGTA
GCTGCTGCTGTTCCGGGGAGGACGGTGGTTCAGTGCAAGAAGAAGTTTGCAGAGCT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4EU02JQ 753 0 0
GAGCACTCAGAAGAAACAGCCATGGAGCAAGGAAGAGATTGACATGCTGAGAAAAGGAAT
GATAAAATACCCGAAGGGGACATCTCGTAGATGGGAAGTTATATCAGAGTACATCGGTAC
AGGAAGATCCGTGGAAGAGATTCTGAAAGCAACCAAGACGGTTCTTCTCCAAAAACCAGA
CTCCGCCAAAGCATTCGACTCGTTCCTCGAGAAGAGGAAACCCACCGCTACTATCGCTTC
CCCTCTCTCCACAAGAGAGGAGCTCGGAGAGTCTCTACCGGCCACAGCAAAGGTAAAACA
ACCACCCTTTAAGGAGCCTGTTGCTGGTCAAAGCTCATACAGCAACGGTGAAGCAAGCGG
AAGTAGTTCAGAGACAACAGATGGTTGGTTTGCTGTTCAAGAAAGAGCTTTGGTTCAGGC
TTTGAAGACATTCCCCAAGGAGACGAGCCAGAGATGGGAGAGAGTAGCTGCTGCTGTTCC
GGGGAGGACGGTGGTTCAGTGCAAGAAGAAGTTTGCAGAGCTTAAGGAAATCATCAGAAG
CAAGAAAACCGGTGTCTAAAATCTTAAACCGGAGCTCCATATGAGAATTTTGGGTTGTAA
TCCTCTTGAGGGCCACACCATTACTTTGCGAGAACAAAGACCTTGAAACTTTTTTATTAT
TATATGTAATGATTCATTTGCTTCCGATATCATGAGATGTTAAACCACTATCACAAACTT
AATACTTTTTACCTAATCTTATGTATTGTTTTG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL5309Contig1 996 2 2 U
GTATTGTTAACTGCGGCGCAGGGCGGGACGCGGTTTACCATTCCAAGCATATATAGAAGT
CAGTATATACAATAATTACTGTTATAAGAACGTTTAGGTACAAGAGAGTAATAACATACA
ACAGTAGCGACAATTTCAGTGTTCGACCTCATAAATTGGCTAAATACTCCTTTTCTATGT
GTTTGGTTGAATGAAAGTCATAAAAGTAATACTAGGGCTAATTACCTCAATGGTACATTC
TCAAAAAAGTTACCACCGACTTGCACGGATTCCCATGCCAGAGTTGAAAAAAGTGGACGA
TATACTCACAAAAGAGAATAAGTACTATAGAATTTAAAGTCTAGTCATGATTTCTAGTTC
AAATACTGCTGTGTTTAAATTTCGTTTGAAAACATCATTGTAATTAGTTCCTCTGATCTT
CAATAACAGAAGCTTCTCAGCATCTGAAATTGTCTCCAAAGCGATAATGGCAGCTCGCGA
ATGGGCCACTAGCCAAGGACTGAAGTCCCAAACGCCAAAACCTATGAACCGTCCTCCTCC
AACGGCTACATCCGATGTCTGTCTGCTCAAATCCGACGCTGCTTGGAATGAAACTCAAAA
GAGTGCAGGTTTTGGCTGGACAATCGAAGATAACAATGGAGTTGTTCCATACTCATCGTC
TCTGCGCCATGTTGCATCGCCTTTAGCGGCGGAAGCTCTTGCTCTCCGTGAAGCCATCCT
CAAATGTAGAGAACGTGGACTGTCAAAAATCAGATGTGAATCGGATTCAGCAATCCTGGT
GAAGGCACTCAATGCTGGAAATTCTCTTGCTGGCCTTTATGGCATCATTTCAGACATTTA
TTTTCTAGCTTCCTCTTTTGAATCTGTTTCATTTAACTGGTTCTCGCGTGAGAGAAATAC
AGTTGCAGATGGTTTGGCAAAACAGAGCCTGGTTGTTGAACTAGCCATTATGGCTTCACC
TAACTTCGGTTAAGGTTTTTAATAGAAATGTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DG12TF U 1
AF RR4DG12JQ C 177
BS 1 691 RR4DG12TF
BS 692 996 RR4DG12JQ

RD RR4DG12TF 691 0 0
GTATTGTTAACTGCGGCGCAGGGCGGGACGCGGTTTACCATTCCAAGCATATATAGAAGT
CAGTATATACAATAATTACTGTTATAAGAACGTTTAGGTACAAGAGAGTAATAACATACA
ACAGTAGCGACAATTTCAGTGTTCGACCTCATAAATTGGCTAAATACTCCTTTTCTATGT
GTTTGGTTGAATGAAAGTCATAAAAGTAATACTAGGGCTAATTACCTCAATGGTACATTC
TCAAAAAAGTTACCACCGACTTGCACGGATTCCCATGCCAGAGTTGAAAAAAGTGGACGA
TATACTCACAAAAGAGAATAAGTACTATAGAATTTAAAGTCTAGTCATGATTTCTAGTTC
AAATACTGCTGTGTTTAAATTTCGTTTGAAAACATCATTGTAATTAGTTCCTCTGATCTT
CAATAACAGAAGCTTCTCAGCATCTGAAATTGTCTCCAAAGCGATAATGGCAGCTCGCGA
ATGGGCCACTAGCCAAGGACTGAAGTCCCAAACGCCAAAACCTATGAACCGTCCTCCTCC
AACGGCTACATCCGATGTCTGTCTGCTCAAATCCGACGCTGCTTGGAATGAAACTCAAAA
GAGTGCAGGTTTTGGCTGGACAATCGAAGATAACAATGGAGTTGTTCCATACTCATCGTC
TCTGCGCCATGTTGCATCGCCTTTAGCGGCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4DG12JQ 820 0 0
ATGTGTTTGGTTGAATGAAAGTCATAAAAGTAATACTAGGGCTAATTACCTCAATGGTAC
ATTCTCAAAAAAGTTACCACCGACTTGCACGGATTCCCATGCCAGAGTTGAAAAAAGTGG
ACGATATACTCACAAAAGAGAATAAGTACTATAGAATTTAAAGTCTAGTCATGATTTCTA
GTTCAAATACTGCTGTGTTTAAATTTCGTTTGAAAACATCATTGTAATTAGTTCCTCTGA
TCTTCAATAACAGAAGCTTCTCAGCATCTGAAATTGTCTCCAAAGCGATAATGGCAGCTC
GCGAATGGGCCACTAGCCAAGGACTGAAGTCCCAAACGCCAAAACCTATGAACCGTCCTC
CTCCAACGGCTACATCCGATGTCTGTCTGCTCAAATCCGACGCTGCTTGGAATGAAACTC
AAAAGAGTGCAGGTTTTGGCTGGACAATCGAAGATAACAATGGAGTTGTTCCATACTCAT
CGTCTCTGCGCCATGTTGCATCGCCTTTAGCGGCGGAAGCTCTTGCTCTCCGTGAAGCCA
TCCTCAAATGTAGAGAACGTGGACTGTCAAAAATCAGATGTGAATCGGATTCAGCAATCC
TGGTGAAGGCACTCAATGCTGGAAATTCTCTTGCTGGCCTTTATGGCATCATTTCAGACA
TTTATTTTCTAGCTTCCTCTTTTGAATCTGTTTCATTTAACTGGTTCTCGCGTGAGAGAA
ATACAGTTGCAGATGGTTTGGCAAAACAGAGCCTGGTTGTTGAACTAGCCATTATGGCTT
CACCTAACTTCGGTTAAGGTTTTTAATAGAAATGTGATTC

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL5310Contig1 699 2 6 U
GGATGGAATTAAATCACCGAAAGGAGGGATTTTAGCCCCCAATCAACAAACCCAGACGCT
TCTAATGTCGAAACGCAACGCGCCGCCGCCAAGACCGCTAATAAAACAGCACTCGTGGTC
GCCGGACGCCGATCGCGAAGAGGCGTGGCTTCGTAGGAAATGCAAACGCCAATCAGATCG
ACTCGGTCGGAGCAAGAGCGTGACGGACGAAGATCTAGAAGAGCTCCGAGGCTGCATCGA
GCTTGGTTTCGGATTCGAGCCTGATTCTCAAGATTTGGATCCGAGGCTCAACGAAACTCT
CCCAGCTCTGGGGTTATACTGCGCGGGGAATAAACAGTATAGTAGTAGTAGGTTGTCACG
GACTTCGTCTCTTTCGTCGATCGCGTCGGAAGGTGACGTAAGCAATTCGAGCACGACAGT
TGTTGATCAAGGTATTGTGATGAAATGTTCTTTTTGTTTGTTAAGAGATATGTGATCTGA
AACTCCTTTTTTTGTTTCGTAGGTGATGATCCGGAGACGATGAAGATAAGGTTGAAGCAG
TGGGCTCAGGGGGTTGCTTGTTCTGTGCGGCAATTCTCCGGCGAACCAAATTGATGTAAT
AAAAATGATTGTTGTCTTAGAAGAATTATTGTTTGTTTGTTTGTTCTGATATGGTTGTAC
AGAGGAATGACATTTTTGTGAAATAGCTGTGATTTTTAG


BQ
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AF RR4EB29TF U 1
AF RR4EB29JQ C 220
BS 1 326 RR4EB29TF
BS 327 327 RR4EB29JQ
BS 328 550 RR4EB29TF
BS 551 551 RR4EB29JQ
BS 552 694 RR4EB29TF
BS 695 699 RR4EB29JQ

RD RR4EB29TF 697 0 0
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TCTAATGTCGAAACGCAACGCGCCGCCGCCAAGACCGCTAATAAAACAGCACTCGTGGTC
GCCGGACGCCGATCGCGAAGAGGCGTGGCTTCGTAGGAAATGCAAACGCCAATCAGATCG
ACTCGGTCGGAGCAAGAGCGTGACGGACGAAGATCTAGAAGAGCTCCGAGGCTGCATCGA
GCTTGGTTTCGGATTCGAGCCTGATTCTCAAGATTTGGATCCGAGGCTCAACGAAACTCT
CCCAGCTCTGGGGTTATACTGCGCGGTGAATAAACAGTATAGTAGTAGTAGGTTGTCACG
GACTTCGTCTCTTTCGTCGATCGCGTCGGAAGGTGACGTAAGCAATTCGAGCACGACAGT
TGTTGATCAAGGTATTGTGATGAAATGTTCTTTTTGTTTGTTAAGAGATATGTGATCTGA
AACTCCTTTTTTTGTTTCGTAGGTGATGATCCGGAGACGATGAAGATAAGGTTGAAGCAG
TGGGCTCAGGTGGTTGCTTGTTCTGTGCGGCAATTCTCCGGCGAACCAAATTGATGTAAT
AAAAATGATTGTTGTCTTAGAAGAATTATTGTTTGTTTGTTTGTTCTGATATGGTTGTAC
AGAGGAATGACATTTTTGTGAAATAGCTGTGATT
CTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4EB29JQ 480 0 0
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TCCGAGGCTCAACGAAACTTTCCCAGCTTTGGGGTTATACTGCGCGGGGAATAAACAGTA
TAGTAGTAGTAGGTTGTCACGGACTTTGTTTCTTTTGTCGATCGCGTCGGAAGGTGACGT
AAGCAATTCGAGCACGACAGTTGTTGATCAAGGTATTGTGATGAAATGTTTTTTTTGTTT
GTTAAGAGATATGTGATTTGAAACTCCTTTTTTTGTTTCGTAGGTGATGATCCGGAGACG
ATGAAGATAAGGTTGAAGCAGTGGGCTCAGGGGGTTGCTTGTTTTGTGCGGCAATTTTCC
GGCGAACCAAATTGATGTAATAAAAATGATTGTTGTTTTAGAAGAATTATTGTTTGTTTG
TTTGTTTTGATATGGTTGTACAGAGGAATGACATTTTTGTGAAATAGCTGTGATTTTTAG

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL5311Contig1 780 2 3 U
GGAAAGGAAGAAAAAAAACAGAGATCATTTCTTCCATCTTCTTCTTCTCTAGAGGGATTA
TTCATTATTACAATGTCGAACCAATCGTACAGATTCGGCTTCTTCCGACGGAAGTATCAT
CACGCAGCTTCGGTGGCACCACCTGAGGTCAAGATCCTTTTCGAGAATTACTCCGAGAAT
GGGGTCATGTCTGTCGATCATCTCCTTAGGTTTCTAACAGATGTTCAGAAACAAGAAAAA
GCCACGAGAGAGGAAGCTCAAGCGATCGTCAATGCCTTATCCTCTCTTCTTCATCGCAAT
TGTATTCACCTTGATGCTTTCTTTAAGTACCTTTTCGGTGTTGACAACTCTCCTCTTGCT
TCTCATGAGGTGCATCAAGACATGAATGATCCATTTGTCACATTATTTCATATTCACAGG
GCATAATTCGTATTTAACGGGTAACCAGCTGAGTAGTGACTGCAGTGAAGTACCTATAAT
AGAAGCATTGCAAAAAGGTGTTAAGGTCATTGAATTGGATCTTTGGCCAAACTCTGATGA
AGACGGTATTGATGTTGTTCATGGAAGGACTCTCACGTCACCTGTGGAGCTGATCAAATG
TCTAAGAGCTATTAAAACGCACGCCTTCGATGTATCTGATTATCCCGTTGTTGTACTCTT
GAAGATCATCTTACTCCACAACTCCAGGCTAAAGTTGCTGAGATGCTTACTGAAACATTT
GGAGACATGCTGTTTGCTCCCCTTCTGGAGATGCTTGAGACTCCATCGCCAGAGTTTTGA


BQ
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AF RR4CS51TF U 62
AF RR4CX15TF U 1
BS 1 395 RR4CX15TF
BS 396 396 RR4CS51TF
BS 397 780 RR4CX15TF

RD RR4CS51TF 435 0 0
TTCA
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GAGAGAGGAAGCTCAAGCGATCGTCAATGCCTTATCCTCTCTTCTTCATCGCAATTGTAT
TCACCTTGATGCTTTCTTTAAGTACCTTTTCGGTGTTGACAACTCTCCTCTTGCTTCTCA
TGAGGTGCATCAAGACATGAATGATCCATTTGTCACATTATTTCATATTCACAGGGCATA
ATTCGTATTTAACGGGTAACCAGCTGAGTAGTGACTGCAGTGAAGTACCTATAATAGAAG
CATTGCAAAAA

QA 5 435 5 435
DS 

RD RR4CX15TF 780 0 0
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TTCATTATTACAATGTCGAACCAATCGTACAGATTCGGCTTCTTCCGACGGAAGTATCAT
CACGCAGCTTCGGTGGCACCACCTGAGGTCAAGATCCTTTTCGAGAATTACTCCGAGAAT
GGGGTCATGTCTGTCGATCATCTCCTTAGGTTTCTAACAGATGTTCAGAAACAAGAAAAA
GCCACGAGAGAGGAAGCTCAAGCGATCGTCAATGCCTTATCCTCTCTTCTTCATCGCAAT
TGTATTCACCTTGATGCTTTCTTTAAGTACCTTTTCGGTGTTGACAACTCTCCTCTTGCT
TCTCATGAGGTGCATCAAGACATGAATGATCCATT*GTCACATTATTTCATATTCACAGG
GCATAATTCGTATTTAACGGGTAACCAGCTGAGTAGTGACTGCAGTGAAGTACCTATAAT
AGAAGCATTGCAAAAAGGTGTTAAGGTCATTGAATTGGATCTTTGGCCAAACTCTGATGA
AGACGGTATTGATGTTGTTCATGGAAGGACTCTCACGTCACCTGTGGAGCTGATCAAATG
TCTAAGAGCTATTAAAACGCACGCCTTCGATGTATCTGATTATCCCGTTGTTGTACTCTT
GAAGATCATCTTACTCCACAACTCCAGGCTAAAGTTGCTGAGATGCTTACTGAAACATTT
GGAGACATGCTGTTTGCTCCCCTTCTGGAGATGCTTGAGACTCCATCGCCAGAGTTTTGA

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5312Contig1 515 2 1 U
GGATTCCAATTAGATGGCAAGAAGCAACTATAAAGTCTTACCAGAAGCGCACACAACAAC
ACAAAATTCCTGAAAGATCTCTAAACCCGGTAGAAGAGCTGGAAGAGATGCAGTTGCCAT
CGCTAAAGCTACAACCCTCACCAAGTTTCTTCTCATCGAGACGAAATCACCAACATGGTG
GATTGAGTTGTCGAGGGATGAACAGGGAAGGAAAAAGCTTCACCGAGAAAAGCGACCTCG
GCAAAAAAGATGGATATGGCCGGAGTGGCAGACGAACTTGCGTGTGAAGAACGATGAAAG
ATAGGATTCATGAGAGAATTTTGAGGGTGCATAAAACACACACACGTTTCTCTTGTCCGC
TATGTCTAATGCTACTGTTTAAATTCTAAGTAAACTTCTCACATGTGAATTATGTCACAC
CGCAAAATCCCATTTCAGTGCGAATCTTTATCATTTGTGACATTTCCATGTGAATCCATT
TCATTTGTGAGAAATAACAAATTATCATTATTCCT


BQ
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AF RR4A275TF U 1
AF RR4A275TFB U 1
BS 1 515 RR4A275TF

RD RR4A275TF 515 0 0
GGATTCCAATTAGATGGCAAGAAGCAACTATAAAGTCTTACCAGAAGCGCACACAACAAC
ACAAAATTCCTGAAAGATCTCTAAACCCGGTAGAAGAGCTGGAAGAGATGCAGTTGCCAT
CGCTAAAGCTACAACCCTCACCAAGTTTCTTCTCATCGAGACGAAATCACCAACATGGTG
GATTGAGTTGTCGAGGGATGAACAGGGAAGGAAAAAGCTTCACCGAGAAAAGCGACCTCG
GCAAAAAAGATGGATATGGCCGGAGTGGCAGACGAACTTGCGTGTGAAGAACGATGAAAG
ATAGGATTCATGAGAGAATTTTGAGGGTGCATAAAACACACACACGTTTCTCTTGTCCGC
TATGTCTAATGCTACTGTTTAAATTCTAAGTAAACTTCTCACATGTGAATTATGTCACAC
CGCAAAATCCCATTTCAGTGCGAATCTTTATCATTTGTGACATTTCCATGTGAATCCATT
TCATTTGTGAGAAATAACAAATTATCATTATTCCT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4A275TFB 515 0 0
GGATTCCAATTAGATGGCAAGAAGCAACTATAAAGTCTTACCAGAAGCGCACACAACAAC
ACAAAATTCCTGAAAGATCTCTAAACCCGGTAGAAGAGCTGGAAGAGATGCAGTTGCCAT
CGCTAAAGCTACAACCCTCACCAAGTTTCTTCTCATCGAGACGAAATCACCAACATGGTG
GATTGAGTTGTCGAGGGATGAACAGGGAAGGAAAAAGCTTCACCGAGAAAAGCGACCTCG
GCAAAAAAGATGGATATGGCCGGAGTGGCAGACGAACTTGCGTGTGAAGAACGATGAAAG
ATAGGATTCATGAGAGAATTTTGAGGGTGCATAAAACACACACACGTTTCTCTTGTCCGC
TATGTCTAATGCTACTGTTTAAATTCTAAGTAAACTTCTCACATGTGAATTATGTCACAC
CGCAAAATCCCATTTCAGTGCGAATCTTTATCATTTGTGACATTTCCATGTGAATCCATT
TCATTTGTGAGAAATAACAAATTATCATTATTCCT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL5313Contig1 881 2 4 U
AACTTAGAAGTGAAGATCTTCAAACCGTGAACCCGACCAAACCGGTAAGAAAGTCCTGAT
CTGGTGATCTGAAGATACGGTGATGGCAGGAGGAGGAACAACGTTCTCAATAGAAAGCGA
TCTACCGGCGACGGAGAAGACCTCCTCCTCCTCCTATTCCGGTGATACGCTAAACGATGA
GGGAAGCGGTTTGAGCCGTGTGGGAAGCGGAGTATGGTCAGGACGGACGGTGGATTACTC
GTCCGAAAGTTCATCATCGATCGGAACTCCGGGAGATAGTGAAGAAGACGAAGATAGCGA
AGAAGACAATGATGAAGAGCTAGGGTTAGCTTCAATGAGCTCTCTTGAAGATTCTCTCCC
AAGCAAAGGTTTATCGAGTCATTACAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGAACTTAGGAGA
GATAGGGAGTGTGAAAGAAGTGCCGAAGCAAGAGAATCCATTGAATAAGAAAAGAAGGTT
ACAGATCTACAACAAGTTGGCAAGAAAGTCGTTCTACTCATGGCAGAACCCTAAGTCTAT
GCCTCTTTTGCCTGTTCATGAAGATGATAATGACGACGATGAGGAAGAGGGAGACGATGG
AGATCTGAGCGATGAAGAGAGAGGAGGAGTTGTTGTTGCAAGGAGACCATCGTTCAAGAA
CAGAGCATTGAAGTCTATGAGTTGTTTTGCTCTCTCAGATCTGCAGGAAGAAGAAGAAGA
TGAAGATGATGAGTGATCAATAATGCATTCATGATTTTTTTTCTTTGTTCATAGCTTATT
ATAACTTTTATTTGGTGGAGCGAATTAATGTTATCTTTTTATTAATTGGGGAAATTAGTT
ATAAATTACGTCGACTGGAGAAAATTAATTAGTGTTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C702TF U 1
AF RR4C702JQ C 61
BS 1 561 RR4C702TF
BS 562 562 RR4C702JQ
BS 563 580 RR4C702TF
BS 581 881 RR4C702JQ

RD RR4C702TF 580 0 0
AACTTAGAAGTGAAGATCTTCAAACCGTGAACCCGACCAAACCGGTAAGAAAGTCCTGAT
CTGGTGATCTGAAGATACGGTGATGGCAGGAGGAGGAACAACGTTCTCAATAGAAAGCGA
TCTACCGGCGACGGAGAAGACCTCCTCCTCCTCCTATTCCGGTGATACGCTAAACGATGA
GGGAAGCGGTTTGAGCCGTGTGGGAAGCGGAGTATGGTCAGGACGGACGGTGGATTACTC
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GATAGGGAGTGTGAAAGAAGTGCCGAAGCAAGAGAATCCATTGAATAAGAAAAGAAGGTT
ACAGATCTACAACAAGTTGGCAAGAAAGTCGTTCTACTCATGGCAGAACCCTAAGTCTAT
GCCTCTTTTGCCTGTTCATGA*GATGATAATGACGACGAT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4C702JQ 821 0 0
CTGGTGATCTGAAGATACGGTGATGGCAGGAGGAGGAACAACGTTCTCAATAGAAAGCGA
TCTACCGGCGACGGAGAAGACCTCCTCCTCCTCCTATTCCGGTGATACGCTAAACGATGA
GGGAAGCGGTTTGAGCCGTGTGGGAAGCGGAGTATGGTCAGGACGGACGGTGGATTACTC
GTCCGAAAGTTCATCATCGATCGGAACTCCGGGAGATAGTGAAGAAGACGAAGATAGCGA
AGAAGACAATGATGAAGAGCTAGGGTTAGCTTCAATGAGCTCTCTTGAAGATTCTCTCCC
AAGCAAAGGTTTATCGAGTCATTACAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGAACTTAGGAGA
GATAGGGAGTGTGAAAGAAGTGCCGAAGCAAGAGAATCCATTGAATAAGAAAAGAAGGTT
ACAGATCTACAACAAGTTGGCAAGAAAGTCGTTCTACTCATGGCAGAACCCTAAGTCTAT
GCCTCTTTTGCCTGTTCATGAAGATGATAATGACGACGATGAGGAAGAGGGAGACGATGG
AGATCTGAGCGATGAAGAGAGAGGAGGAGTTGTTGTTGCAAGGAGACCATCGTTCAAGAA
CAGAGCATTGAAGTCTATGAGTTGTTTTGCTCTCTCAGATCTGCAGGAAGAAGAAGAAGA
TGAAGATGATGAGTGATCAATAATGCATTCATGATTTTTTTTCTTTGTTCATAGCTTATT
ATAACTTTTATTTGGTGGAGCGAATTAATGTTATCTTTTTATTAATTGGGGAAATTAGTT
ATAAATTACGTCGACTGGAGAAAATTAATTAGTGTTTGTGC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5315Contig1 858 2 2 U
GCAACGATGGGTTCAATCCCACAGATCTCTTGGAGTGGTTTTTCAAATCTTAATAATGGG
CTTATGGCTCAGCTTAGGTTCTGTTGAGAGCAACAGGTCTCAATACGGTAATATTGGAGT
CCTAGTTCTCACCATGGCCACAGCTTCCATCCACCCGTTAAGTTTCATCAAGAGCATTTC
ATCGCCTCCAACCCGTGCAACGACTCTGACCCTAAGGTTACACTGGATCTTTATCTCTAA
ATCTAGGCGTTTCAGGTCTGTTTTGCTTTCCGATTTATTCGAGATTCACATAGTCTCGTC
GGGGAGTCTCTTTAGTGGCTCGGAAAGTCTCCTTAGTGGTTCAAATTGCAGGCGCATAAG
ACCTATATACCACGGTTATGTCCGACAACTTTCTCCGAGTTTGTCAACTATTATGGTCGT
TTCACGGTCAAATTCACCAATGGAATCGGAGATGAAAAGAGTTTCAACCATCTCACCATG
TCGCTTACCGATCTTCTTGTCATCCGGATCTCTTGAGATTCACCTAGTCTCCCGGGGCAG
TGTAGACGGTTATAGAGCTTTTCTCTTCTATTTGACGGAGTTGCTAGCTTCAATCGGGTT
CCCGACCCTCTTCAAATCCCTTTCATTAGGGTATTTCAACGTCTCTTCAGACTATTTGAA
GCTCGAAAGAGCTGTGGTTTCAAGGATTCAAGTAAAGATTATCTGCGGATCTCTCTACTT
CGAGCTAGCCTCTCCTTTTAACACTTCTATCCTATGCTGTATTGTTATTCTGTTATTGTT
GTTTTTCTTACCGTCGAGCTTACCTCCGGTTGTAATCGTTGAAACGCCTTAGATTTGAAT
TAATGAAATTTGTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F424TF U 1
AF RR4F424JQ C 216
BS 1 730 RR4F424TF
BS 731 858 RR4F424JQ

RD RR4F424TF 730 0 0
GCAACGATGGGTTCAATCCCACAGATCTCTTGGAGTGGTTTTTCAAATCTTAATAATGGG
CTTATGGCTCAGCTTAGGTTCTGTTGAGAGCAACAGGTCTCAATACGGTAATATTGGAGT
CCTAGTTCTCACCATGGCCACAGCTTCCATCCACCCGTTAAGTTTCATCAAGAGCATTTC
ATCGCCTCCAACCCGTGCAACGACTCTGACCCTAAGGTTACACTGGATCTTTATCTCTAA
ATCTAGGCGTTTCAGGTCTGTTTTGCTTTCCGATTTATTCGAGATTCACATAGTCTCGTC
GGGGAGTCTCTTTAGTGGCTCGGAAAGTCTCCTTAGTGGTTCAAATTGCAGGCGCATAAG
ACCTATATACCACGGTTATGTCCGACAACTTTCTCCGAGTTTGTCAACTATTATGGTCGT
TTCACGGTCAAATTCACCAATGGAATCGGAGATGAAAAGAGTTTCAACCATCTCACCATG
TCGCTTACCGATCTTCTTGTCATCCGGATCTCTTGAGATTCACCTAGTCTCCCGGGGCAG
TGTAGACGGTTATAGAGCTTTTCTCTTCTATTTGACGGAGTTGCTAGCTTCAATCGGGTT
CCCGACCCTCTTCAAATCCCTTTCATTAGGGTATTTCAACGTCTCTTCAGACTATTTGAA
GCTCGAAAGAGCTGTGGTTTCAAGGATTCAAGTAAAGATTATCTGCGGATCTCTCTACTT
CGAGCTAGCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4F424JQ 643 0 0
GGTTACACTGGATCTTTATCTCTAAATCTAGGCGTTTCAGGTCTGTTTTGCTTTCCGATT
TATTCGAGATTCACATAGTCTCGTCGGGGAGTCTCTTTAGTGGCTCGGAAAGTCTCCTTA
GTGGTTCAAATTGCAGGCGCATAAGACCTATATACCACGGTTATGTCCGACAACTTTCTC
CGAGTTTGTCAACTATTATGGTCGTTTCACGGTCAAATTCACCAATGGAATCGGAGATGA
AAAGAGTTTCAACCATCTCACCATGTCGCTTACCGATCTTCTTGTCATCCGGATCTCTTG
AGATTCACCTAGTCTCCCGGGGCAGTGTAGACGGTTATAGAGCTTTTCTCTTCTATTTGA
CGGAGTTGCTAGCTTCAATCGGGTTCCCGACCCTCTTCAAATCCCTTTCATTAGGGTATT
TCAACGTCTCTTCAGACTATTTGAAGCTCGAAAGAGCTGTGGTTTCAAGGATTCAAGTAA
AGATTATCTGCGGATCTCTCTACTTCGAGCTAGCCTCTCCTTTTAACACTTCTATCCTAT
GCTGTATTGTTATTCTGTTATTGTTGTTTTTCTTACCGTCGAGCTTACCTCCGGTTGTAA
TCGTTGAAACGCCTTAGATTTGAATTAATGAAATTTGTGTTAC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5316Contig1 698 2 1 U
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AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TGATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTG
GCTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAA
TTGTATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCT
AACATTTGGTTAATTAGTTATCAACACATTATAATAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DR28JQ C 1
AF RR4DR28TF U 1
BS 1 698 RR4DR28TF

RD RR4DR28JQ 698 0 0
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QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4DR28TF 698 0 0
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AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TGATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTG
GCTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAA
TTGTATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCT
AACATTTGGTTAATTAGTTATCAACACATTATAATAGC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL5317Contig1 1136 2 10 U
GGACCGACGAACCGAACTGTTTATCTCCTTTCCCTTCAGGATTCAATCTCTCTCAGACTA
ATGGAAGAGCATACGAGTCACTCTTCTTTCGATGAACATTGTTTCTTCTGACTATTTCAA
AGAGCTTTATGGTCTCAAGGCTTATCATTGATGAAATCGTTAGCCGTGGATGGGTGGAAA
CTGCCGTGGTCCCTCCACAGCGTATTGTCTCCTCTAAAATTCAACTCACACTGATTCTCC
TTATATCAGAGCGGTCTGATTCCTATATTTAAGATATGCAAAGACGCTGTGGACATGATA
TCAAGCTCTCAAGAAATATGCCTGCCGTAAAGCATTTGCCTGTTCATACATATCTGGATT
CTTGTAGAGTTTCTGTGATCAAATGGAAGGACGACGACCATGGGGTGTTTACGTACGTGA
TCTGCTGCTTAGACTGTATTACTTTGATACGTTGTTGTTTCCACGTATTCCGGTGGTTCC
TGTGAGAAGATGAATTTACCAACAAAACCATCCTGGTTCAACCGAGACATGTCACGTGGC
TCTGAAGACACTGCCCGTCGTCCACCATCAGTAAAAGCATCCCTCTCTGTTTCATTTGGG
CAGCCTGCACCTCACCGTGCTTCCACCAGAGCCCAGACTATTATTCGAACAGAGACAGGG
AGAGGGAGAGAGACCGGGGAAAGGGAAAGGGAGAGTGGATTATGATAATGATAGGAGATC
AAGGCGTGACTATGAAAGTAGTAGAAGCAGACGCAGTGATTACGAGGACGATAGAAGCAG
AAGCAGGAGTGTGCAAATTGAGCGTGAGCCAACTCCTAAAAGAGACTATGGAAACAAGGA
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GAAGAAGTGATCAATCAAGCAAACTTGGAGGTGAAACTAAAATAAACTCTGGACTTGAAA
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ACAGAATTGATCTTTATCTTGAATTGTTCCGACTTTATATTACTTGTTGTTTGCTC


BQ
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AF RR4AK45TF U 1
AF RR4AK45JQ C 365
BS 1 786 RR4AK45TF
BS 787 787 RR4AK45JQ
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RD RR4AK45TF 910 0 0
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AGAGCTTTATGGTCTCAAGGCTTATCATTGATGAAATCGTTAGCCGTGGATGGGTGGAAA
CTGCCGTGGTCCCTCCACAGCGTATTGTCTCCTCTAAAATTCAACTCACACTGATTCTCC
TTATATCAGAGCGGTCTGATTCCTATATTTAAGATATGCAAAGACGCTGTGGACATGATA
TCAAGCTCTCAAGAAATATGCCTGCCGTAAAGCATTTGCCTGTTCATACATATCTGGATT
CTTGTAGAGTTTCTGTGATCAAATGGAAGGACGACGACCATGGGGTGTTTACGTACGTGA
TCTGCTGCTTAGACTGTATTACTTTGATACGTTGTTGTTTCCACGTATTCCGGTGGTTCC
TGTGAGAAGATGAATTTACCAACAAAACCATCCTGGTTCAACCGAGACATGTCACGTGGC
TCTGAAGACACTGCCCGTCGTCCACCATCAGTAAAAGCATCCCTCTCTGTTTCATTTGGG
CAGCCTGCACCTCACCGTGCTTCCACCAGAGCCCAGACTATTATTCGAACAGAGACAGGG
AGAGGGAGAGAGACCGGGGAAAGGGAAAGGGAGAGTGGATTATGATAATGATAGGAGATC
AAGGCGTGACTATGAAAGTAGTAGAAGCAGACGCAGTGATTACGAGGACGATAGAAGCAG
AAGCAG*AGTGTGCAAATTGAGCGTGAGCCAACTCCTAAAAGAGACTATGGAAACA*GGA
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TGCTAGTAGA

QA 1 910 1 910
DS 

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CTGCTTAGACTGTATTACTTTGATACGTTGTTGTTTCCACGTATTCCGGTGGTTCCTGTG
AGAAGATGAATTTACCAACAAAACCATCCTGGTTCAACCGAGACATGTCACGTGGCTCTG
AAGACACTGCCCGTCGTCCACCATCAGTAAAAGCATCCCTTTTTGTTTCATTTGGGCAGC
CTGCACCTCACCGTGCTTCCACCAGAGCCCAGACTATTATTCGAACAGAGACAGGGAGAG
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AGGAGTGTGCAAATTGAGCGTGAGCCAACTCCTAAAAGAGACTATGGAAACAAGGATAAA
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AGTAGATTCAGAAAGGCGGGGATGAAGGATATGGAACAAGGAGGGATTCAAGTTCAGAAG
AAGTGATCAATCAAGCAAACTTGGAGGTGAAACTAAAATAAACTCTGGACTTGAAATGCT
TCGTCTTGGATGATGCATGTTGTTTTACTTTACTGTTTGTCAGCAAACTATTTGTTACAG
AATTGATCTTTATCTTGAATTGTTCCGACTTTATATTACTTGTTGTTTGCTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5318Contig1 515 2 1 U
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ACGAGGCTCAGAGCTAGAAACGAGACAGAGGAAGACTGGTTCATACGTAACCAAGCAGAT
ACTGAAAGAGATGTCAAAACATTTGTAGTAGGAGACGATTTGCACGTGACTAAGGGGGTG
TTGAGAGAGATGTCCTGACTGATGACTCGTTCATGATCCATTCTCGTGTTGAGAACCAAG
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AACAAGAAAACTCCTCCTCAGCACCTGAGATCAAACAACAAGAGCCGGATGATCTTTTCA
TGGTTCTTGGACGTGAACAAGATGTTGTTACACCTACAATGGCATCGTGGACTCCTGAGA
TTGACTTCGAGACGAACAACACTTTGGCTCAAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EF56JQ C 1
AF RR4EF56TF U 1
BS 1 515 RR4EF56TF

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QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4EF56TF 515 0 0
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TTGAGAGAGATGTCCTGACTGATGACTCGTTCATGATCCATTCTCGTGTTGAGAACCAAG
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AACAAGAAAACTCCTCCTCAGCACCTGAGATCAAACAACAAGAGCCGGATGATCTTTTCA
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QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

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TCCTCTTTCACTAGTGTTTAATATAATAATGGGTGATGATCATCATCATCATCATCATCA
TGCTTGAATGTTATATGTTTGTTTCTGTCTTGTAAAACAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C973JQ C 1
AF RR4C973TF U 1
BS 1 521 RR4C973TF

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QA 1 521 1 521
DS 

RD RR4C973TF 521 0 0
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CAGAAGCCATGCCTTTGTGGGTACATGAGGAACCCTAGCCTCCGCCAATACGTTAGCTCC
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TTAATAAGTGACAAGTTTACCTGATTATGAGTGTTAAGTTACAAGTAAAAGTGGGTCTTG
TCCTCTTTCACTAGTGTTTAATATAATAATGGGTGATGATCATCATCATCATCATCATCA
TGCTTGAATGTTATATGTTTGTTTCTGTCTTGTAAAACAGG

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL5320Contig1 649 2 3 U
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CGTTTACTCTTGCAGAAGAAGATCACACTCTTGCTAACGCCGTTCGTTTCATGTTAAATC
AAGATCCGAGAGTAACATTGGCTGGGTACAGCATCCCACATCCTTCCCTTGAATGTGTCA
ATGTCCGTGTCCAGACCACTGGCGATCCGGCGAGGGAGGTACTGAAAGATGCATGTCAAG
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AGGTTAAACAAGCGCGTTTGGCTACTGAGGAAGAGAAGAATAAGAAGGCCGAAGAAGAAG
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GGGGGAAACAAAACATTTGTATTCTCTCTATAGCGTTTTTTTTTATTATCCTGATTTGTA
TTCTCTACATTTGTCAGACGACTCCTACCTAATTGACTAAATATTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CT72TF U 1
AF RR4BP54TF U 92
BS 1 491 RR4CT72TF
BS 492 492 RR4BP54TF
BS 493 649 RR4CT72TF

RD RR4CT72TF 649 0 0
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CTATCTTCTTTTGTGTGTTTGTTTCTATAGTTTGATTTGGGTTTTCAGGGAACTCTGTAG
CAGAAGCAGAAGTAGAAACAGAGATGGAGCACGGTTCGTTCACGAATGATAGTCATGCTT
CGTTTACTCTTGCAGAAGAAGATCACACTCTTGCTAACGCCGTTCGTTTCATGTTAAATC
AAGATCCGAGAGTAACATTGGCTGGGTACAGCATCCCACATCCTTCCCTTGAATGTGTCA
ATGTCCGTGTCCAGACCACTGGCGATCCGGCGAGGGAGGTACTGAAAGATGCATGTCAAG
AGCTCATGCTCATGAACAGACATGTGAGGAGTGTCTTTGACAAGGCGGTTTCAGAGTTTA
AGGTTAAACAAGCGCGTTTGGCTACTGAGGAAGAGAAGAATAAGAAGGCCGAAGAAGAAG
AGCTTAAGAAGTAGAGGGATCTACTCGCTTCCATGGATATTGAAAGCGATTGATTTTGTG
GGGGGAAACAAAACATTTGTATTCTCTCTATAGCGTTTTTTTTTATTATCCTGATTTGTA
TTCTCTACATTTGTCAGACGACTCCTACCTAATTGACTAAATATTATTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4BP54TF 557 0 0
GGGCTCGCACAACTTT
GGGAACTCTGTAGCAGAAGCAGAAGTAGAAACAGAGATGGAGCACGGTTCGTTCACGAAT
GATAGTCATGCTTCGTTTACTCTTGCAGAAGAAGATCACACTCTTGCTAACGCCGTTCGT
TTCATGTTAAATCAAGATCCGAGAGTAACATTGGCTGGGTACAGCATCCCACATCCTTCC
CTTGAATGTGTCAATGTCCGTGTCCAGACCACTGGCGATCCGGCGAGGGAGGTACTGAAA
GATGCATGTCAAGAGCTCATGCTCATGAACAGACATGTGAGGAGTGTCTTTGACAAGGCG
GTTTCAGAGTTTAAGGTTAAACAAGCGCGTTTGGCTACTGAGGAAGAGAAGAATAAGAAG
GCCGAAGAAGAAGAGCTTAAGAAGCAGAGGGATCTACTCGCTTCCATGGATATTGAAAGC
GATTGATTTTGTGGGGG*AAACAAAACATTTGTATTCTCTCTATAGCGTTTTTTT**ATT
ATCTTGATTTGTATTCTCTACATTTGTCAGACGACTCCTACCTAATTGACTAAATATTAT
T

QA 17 557 17 557
DS 



AS 1 2

CO CL5321Contig1 846 2 2 U
GCACGCCTACTAGGACCAGGAACATCAAGTGTTTCAAGTGCCATGGTTTTGGGCATTATG
CCAATGAGTGTACCAACAAGAAGGTGATGAGATCCTAGCCATTGATGCGCTTAGGAAGGA
GCGTGCACTTACTGTTGGAAGAGATAGAACCATGCTATTACACAAGATGCCTGAGGCAAG
CCGTACGATCTACCGTGCACCTGCATCGTCTCTTGAGAGCTGCTGTTTCATCAGCGATAC
TGAGTACCTGTCTGGTTCGGACAACGGAACTGTTGCACTTTGGGGCATGCTAAAAAAGAA
ACCGGTGTTTCTCCTCAAGAATGCACATTCCGTTATTGCGGATGGAATCGCCACTAATGA
AAATGGTGAGCATGATAATGTGGAGTATAATAACTCTTCCACGAGTTCTTGGGTCAGTTC
AGTTGCTGTTTGCAGAGGTAGTGACCTTGCTGCATCTGGAGCTGGTAATGGTTTTGTGCA
TTTGATGGCTGTTGAACCAAGTGCCATTCGACCTTTATTCAAGCTTCCACTGACTGGATT
TGTGAACTCTATGGCTTTTGCAAAATCCGGTAAATTTCTGGTTGCTGGTGTTGGACAAGA
GACGAGATTTGGAAGGTGGGGATGCATAAAGTCTGCGCAAAATGGTGTAGCAATACATCC
CTTAAGGCTGTCACAAGGATTTCATTGGGGGTTGGTTTAAACAAGAGTTGGTACTTATAT
TTTTGAATCTCAAGTTTATGTAATGGGCTACTACAAGTCTTCTCAGCTCTTAAAGTTTTT
GCTCCCTTTTTGTTTGTTTTATTGTACCCAATTTTTCTAATACAAGAGAGAGAAGAACTT
TAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF55TF U 1
AF RR4AF55JQ C 318
BS 1 808 RR4AF55TF
BS 809 846 RR4AF55JQ

RD RR4AF55TF 808 0 0
GCACGCCTACTAGGACCAGGAACATCAAGTGTTTCAAGTGCCATGGTTTTGGGCATTATG
CCAATGAGTGTACCAACAAGAAGGTGATGAGATCCTAGCCATTGATGCGCTTAGGAAGGA
GCGTGCACTTACTGTTGGAAGAGATAGAACCATGCTATTACACAAGATGCCTGAGGCAAG
CCGTACGATCTACCGTGCACCTGCATCGTCTCTTGAGAGCTGCTGTTTCATCAGCGATAC
TGAGTACCTGTCTGGTTCGGACAACGGAACTGTTGCACTTTGGGGCATGCTAAAAAAGAA
ACCGGTGTTTCTCCTCAAGAATGCACATTCCGTTATTGCGGATGGAATCGCCACTAATGA
AAATGGTGAGCATGATAATGTGGAGTATAATAACTCTTCCACGAGTTCTTGGGTCAGTTC
AGTTGCTGTTTGCAGAGGTAGTGACCTTGCTGCATCTGGAGCTGGTAATGGTTTTGTGCA
TTTGATGGCTGTTGAACCAAGTGCCATTCGACCTTTATTCAAGCTTCCACTGACTGGATT
TGTGAACTCTATGGCTTTTGCAAAATCCGGTAAATTTCTGGTTGCTGGTGTTGGACAAGA
GACGAGATTTGGAAGGTGGGGATGCATAAAGTCTGCGCAAAATGGTGTAGCAATACATCC
CTTAAGGCTGTCACAAGGATTTCATTGGGGGTTGGTTTAAACAAGAGTTGGTACTTATAT
TTTTGAATCTCAAGTTTATGTAATGGGCTACTACAAGTCTTCTCAGCTCTTAAAGTTTTT
GCTCCCTTTTTGTTTGTTTTATTGTACC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4AF55JQ 529 0 0
AGAATGCACATTCCGTTATTGCGGATGGAATCGCCACTAATGAAAATGGTGAGCATGATA
ATGTGGAGTATAATAACTCTTCCACGAGTTCTTGGGTCAGTTCAGTTGCTGTTTGCAGAG
GTAGTGACCTTGCTGCATCTGGAGCTGGTAATGGTTTTGTGCATTTGATGGCTGTTGAAC
CAAGTGCCATTCGACCTTTATTCAAGCTTCCACTGACTGGATTTGTGAACTCTATGGCTT
TTGCAAAATCCGGTAAATTTCTGGTTGCTGGTGTTGGACAAGAGACGAGATTTGGAAGGT
GGGGATGCATAAAGTCTGCGCAAAATGGTGTAGCAATACATCCCTTAAGGCTGTCACAAG
GATTTCATTGGGGGTTGGTTTAAACAAGAGTTGGTACTTATATTTTTGAATCTCAAGTTT
ATGTAATGGGCTACTACAAGTCTTCTCAGCTCTTAAAGTTTTTGCTCCCTTTTTGTTTGT
TTTATTGTACCCAATTTTTCTAATACAAGAGAGAGAAGAACTTTAACGC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL5322Contig1 702 2 2 U
GGGCGACTCGTTTCGGGGGACGCGGGAAAATGCAGGAGGAGGAAGCCAAGATCTTGCTGG
GCTTTCCTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTACCGGAAGAAGG
TATGGGAATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCATGCCGAGTCTAAGT
TCAAATCTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACT
ATTCCAGATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCGCGGACATATGCAT
ATGCCAAAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCCTGGAA
CCATCGGTCTTGGTGGAATCAAAGCTAACAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCC
CCTCTCATAATCCCTTCCTTCCTTGATTCAGAGTGTCCCTCTCTTTGAATCTGAGTGAGA
GCTGCCAACAGTGAGATATATTTACTTCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAG
TAACTCTTTTAAGATTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGGTTATCTGCTTGGTGATTCCTCT
ACTTGTTGTAATTTGAATAGCAATACATACACAAGGACTCGGCTTCTGTACTTTGTATTT
GTATTATTATACTTGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGTGAGG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4E064TF U 1
AF RR4E064JQ C 5
BS 1 701 RR4E064TF
BS 702 702 RR4E064JQ

RD RR4E064TF 701 0 0
GGGCGACTCGTTTCGGGGGACGCGGGAAAATGCAGGAGGAGGAAGCCAAGATCTTGCTGG
GCTTTCCTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTACCGGAAGAAGG
TATGGGAATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCATGCCGAGTCTAAGT
TCAAATCTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACT
ATTCCAGATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCGCGGACATATGCAT
ATGCCAAAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCCTGGAA
CCATCGGTCTTGGTGGAATCAAAGCTAACAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCC
CCTCTCATAATCCCTTCCTTCCTTGATTCAGAGTGTCCCTCTCTTTGAATCTGAGTGAGA
GCTGCCAACAGTGAGATATATTTACTTCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAG
TAACTCTTTTAAGATTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGGTTATCTGCTTGGTGATTCCTCT
ACTTGTTGTAATTTGAATAGCAATACATACACAAGGACTCGGCTTCTGTACTTTGTATTT
GTATTATTATACTTGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGTGAG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4E064JQ 698 0 0
GACTCGTTTCGGGGGACGCGGGAAAATGCAGGAGGAGGAAGCCAAGATCTTGCTGGGCTT
TCCTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTACCGGAAGAAGGTATG
GGAATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCATGCCGAGTCTAAGTTCAA
ATCTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACTATTC
CAGATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCGCGGACATATGCATATGC
CAAAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCCTGGAACCAT
CGGTCTTGGTGGAATCAAAGCTAACAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCCCCTC
TCATAATCCCTTCCTTCCTTGATTCAGAGTGTCCCTCTCTTTGAATCTGAGTGAGAGCTG
CCAACAGTGAGATATATTTACTTCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAGTAAC
TCTTTTAAGATTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGGTTATCTGCTTGGTGATTCCTCTACTT
GTTGTAATTTGAATAGCAATACATACACAAGGACTCGGCTTCTGTACTTTGTATTTGTAT
TATTATACTTGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGTGAGG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL5323Contig1 771 2 3 U
GGAAAACTTAAAGTTGGTGTGTGTGATGGGGAAAAGAAGAGCACCATGCTGTGACAATAG
CGAAGAACTGAAGAGAGGGCCATGGAGTGATGAAGAAAGTAAAAGACTCAAAGCTTTTAT
TCTAAAAAGTGGTCATCACAACTGGAGATCTCTTCCTAAACTAGCTGGATTGATGAGATG
CGGAAAGAGTTGCCGTTTAAGATGGATAAACTATCTGAGACCAGGTCTCAAACGAGGCGA
CTTCACCAAAGAGGAGGTAGAAACTATTATACACCTTCACCAAGTTCTTGGAAACAAGTG
GTCAAAGATAGCATCACACTTGCCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAGAATGTGTGGAA
CACTCATCTCAAGAAACGATCGGTGAAGAGCAACTCATCAGCATCAGATGTTACTAACCA
AGCCTCTTCCTCCTCATCAGTCTCTAATGACGTTATTAACAGCGATATGCATAATCAAGA
AGAGGAGTTGGAGATCTTGGTGGAGCATATGCCATGTGGATTTGAGGTGAATGTACCACA
ATCACTAGAATATCTTTTTGAAGATCGCCAAATCCCTCCTCCCCCTATATCTAAACCGGA
CTCTCTAGAAATCCATAGGCAATCACATGATGAGTTGTGTAGCCCAAATGGTTGAACCAG
GGTTAGATGTTTACGATGAGTGCTCAACTATTTTGATAGTCAAACTTTGTAGAACACGAT
GATTTGATCCACAATGTTTATTTTTATTGCATTGACCTTGTCTTGTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GV49TF U 1
AF RR4GA46TF U 30
BS 1 644 RR4GV49TF
BS 645 645 RR4GA46TF
BS 646 771 RR4GV49TF

RD RR4GV49TF 771 0 0
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TCTAAAAAGTGGTCATCACAACTGGAGATCTCTTCCTAAACTAGCTGGATTGATGAGATG
CGGAAAGAGTTGCCGTTTAAGATGGATAAACTATCTGAGACCAGGTCTCAAACGAGGCGA
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GTCAAAGATAGCATCACACTTGCCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAGAATGTGTGGAA
CACTCATCTCAAGAAACGATCGGTGAAGAGCAACTCATCAGCATCAGATGTTACTAACCA
AGCCTCTTCCTCCTCATCAGTCTCTAATGACGTTATTAACAGCGATATGCATAATCAAGA
AGAGGAGTTGGAGATCTTGGTGGAGCATATGCCATGTGGATTTGAGGTGAATGTACCACA
ATCACTAGAATATCTTTTTGAAGATCGCCAAATCCCTCCTCCCCCTATATCTAAACCGGA
CTCTCTAGAAATCCATAGGCAATCACATGATGAGTTGTGTAGCC*AAATGGTTGAACCAG
GGTTAGATGTTTACGATGAGTGCTCAACTATTTTGATAGTCAAACTTTGTAGAACACGAT
GATTTGATCCACAATGTTTATTTTTATTGCATTGACCTTGTCTTGTTTCTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4GA46TF 702 0 0
GGAAAAGAAGAGCACCATGCTGTGACAATAGCGAAGAACTGAAGAGAGGGCCATGGAGTG
ATGAAGAAAGTAAAAGACTCAAAGCTTTTATTCTAAAAAGTGGTCATCACAACTGGAGAT
CTCTTCCTAAACTAGCTGGATTGATGAGATGCGGAAAGAGTTGCCGTTTAAGATGGATAA
ACTATCTGAGACCAGGTCTCAAACGAGGCGACTTCACCAAAGAGGAGGTAGAAACTATTA
TACACCTTCACCAAGTTCTTGGAAACAAGTGGTCAAAGATAGCATCACACTTGCCAGGAA
GAACAGACAACGAGATCAAGAATGTGTGGAACACTCATCTCAAGAAACGATCGGTGAAGA
GCAACTCATCAGCATCAGATGTTACTAACCAAGCCTCTTCCTCCTCATCAGTCTCTAATG
ACGTTATTAACAGCGATATGCATAATCAAGAAGAGGAGTTGGAGATCTTGGTGGAGCATA
TGCCATGTGGATTTGAGGTGAATGTACCACAATCACTAGAATATCTTTTTGAAGATCGCC
AAATCCCTCCTCCCCCTATATCTAAACCGGACTCTCTAGAAATCCATAGGCAATCACATG
ATGAGTTGTGTAGCCCAAATGGTTGAACCAGGGTTAGATGTTTACGATGAGTGCTCAACT
ATTTTGATAGTCAAACTTTGTAGAACACGATGATTTGATCCA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5324Contig1 541 2 2 U
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TGAGTGCGACGATGGTGGGAGCTCTACTGGGACTCGGCACCCAGATGTACTCCAACGCTC
TCCGCAAGCTTCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTG
CTGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTA
TGCTCGATAAGGCTAGAGCTGCCAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATCGGGATTAGT
TATGAAGTCATCTTCGACGTCTTCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGCCATCTCAAG
TGCTTGTTTTCTTTGATCTTCCATGTAAAAGCTTTTCTATTTTTTCTTAGAGCTGGATCT
CCTTTTGCTTTGGTATTGGAGCTCTTTCCGTTCACTGTTTTTGGTTAATGAACCTAAAGA
TGATTTGTGTTTTCATCTCACCGTCTGAATCTGTTAGTACCTGGATAATAATTTCGAATG
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RR4B028JQ C 1
AF RR4B028TF U 23
BS 1 22 RR4B028JQ
BS 23 541 RR4B028TF

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TGAGTGCGACGATGGTGGGAGCTCTACTGGGACTCGGCACCCAGATGTACTCCAACGCTC
TCCGCAAGCTTCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTG
CTGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTA
TGCTCGATAAGGCTAGAGCTGCCAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATCGGGATTAGT
TATGAAGTCATCTTCGACGTCTTCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGCCATCTCAAG
TGCTTGTTTTCTTTGATCTTCCATGTAAAAGCTTTTCTATTTTTTCTTAGAGCTGGATCT
CCTTTTGCTTTGGTATTGGAGCTCTTTCCGTTCACTGTTTTTGGTTAATGAACCTAAAGA
TGATTTGTGTTTTCATCTCACCGTCTGAATCTGTTAGTACCTGGATAATAATTTCGAATG
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4B028TF 519 0 0
GAAAAGAAGAAGAAAGAAGAAGATCGAAACGATGCCTCTGAGTGCGACGATGGTGGGAGC
TCTACTGGGACTCGGCACCCAGATGTACTCCAACGCTCTCCGCAAGCTTCCTTACATGCG
CCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGTTCGCGAACCAGCTCGT
GAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTATGCTCGATAAGGCTAGAGCTGC
CAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATCGGGATTAGTTATGAAGTCATCTTCGACGTCT
TCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGCCATCTCAAGTGCTTGTTTTCTTTGATCTTCC
ATGTAAAAGCTTTTCTATTTTTTCTTAGAGCTGGATCTCCTTTTGCTTTGGTATTGGAGC
TCTTTCCGTTCACTGTTTTTGGTTAATGAACCTAAAGATGATTTGTGTTTTCATCTCACC
GTCTGAATCTGTTAGTACCTGGATAATAATTTCGAATGA

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL5325Contig1 759 2 2 U
TTTTATTTCAATCAATTTATATAGTCTGAGATAATGTTATTACAATGGAACCTCTTATGC
AATCTTGGAAGCATCAGACCTAAAAACTCATGAATCTTTCAAATACAAACATCTGGCTTC
TCCTCACCTAGCTAGGTAGTCACATAGCATAAACGAGATGGTCGCTGCGGAAGATGTAAC
CAGAATCACATCACTCCGTATCAGTCGGACAGGTCGACAAGATAGCTATTGCTGGGATTT
TACAAAATCAGGATTATCCACAGTTAAGTCGGGCTACAAGGTCGCTCATGATCTACACTC
TGCGATATTCCCCTCCACTGTAGCAGAACCAAGTACAACAGGCCTTAAGAAAGCAATTTG
GAAGATCAAAGCACTAAGAAAACTCAAACACTTCCTATAGCAAGCAACATCAGGATATCT
AGCAACGGCGAAGCAACTAAAAGATCGGCATTATGCGAGGGAAAGTACTTGTGTTCGATG
TGGTACAGACTAAGAATCCATCAACCACATGCTTTGAAGATAAGAGAAGATGAGTATGTC
TTGTTTGCGATCAAAATCTCGTTCTTATGATTAAATTAAAACTGATTCGGATTCAAATCA
CAGAGGATAATAGAGAGTCACCTCATCCTCACTGCTCACGCATTCGCTTTCACTATATGA
CATATCCTACTTGATTGGAATTTCAATGATTAACTCCGTGACACAAGCACAACACAAGAG
TTTGGTCGGAACAAGAATGATTTGTAATGAGTTGACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AAAAGATCGGCATTATGCGAGGGAAAGTACTTGTGTTCGATGTGGTACAGACTAAGAATC
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AS 0 0

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4H059TF U 1
AF RR4H059JQ C 206
BS 1 678 RR4H059TF
BS 679 679 RR4H059JQ
BS 680 729 RR4H059TF
BS 730 827 RR4H059JQ

RD RR4H059TF 729 0 0
GGGTAGTCTAAATCACACTTCACAAAGAGGCCGATAGAAAAACGCTCCTAGACACTAAAA
TCGAGGCAAACCTCAGATCTGTATTTTTCGACGCCGGTGACGGGTTTTTCCGCCGGCGTC
GGGACTGTTCATCGTCTCCTTTTGTCTATTTTACTTTCATGTTTTTCTTCTACCGTTATG
CTGTCTGTTCATGCATCCTGGTTTCAACGTTTGGCGAAACCACTGTCTGTGAAGATCTTC
GTAGACTCAGAGCCTTGGTCTGAACCTACGGAACCAATACATTTTTACCGGGGGCTCCCG
GAAAGCCGAGTCAATTAGTGGGGTTCCACTTTTGATCCGATGGCCTGTTCTGAAAGCAAG
AGGCACGATGAGGTTGTGCTCTCCTCTTCACGCTCTCAAAATCATCACTCCGGCAGGCGT
CTGCCATGACCGTTACTCCGGCGAGAAATTCTGTACTATCATAGGCTACGTCTCTTCTCC
GATCTGTCGTGCCGTGCAATCTGTCCACTCCGATGTGACCAGTTTCAGATCCGCCGCGTC
CTTCATCTCCTCTTCACGTAGGTTTGGCGGCGTACAGTTTGGTGACCCGAACCCTAGCAG
CATGACTATCTGGGCCTGGCCCATTAAGGGTTATAAAGAGGTCAGCCCATTTCTTAGTTG
CCCAATTTCTAAAGAAAA*GTTTCAAAGCCCACATTTATGTGGGGGAGTGTGACCATTTT
AGCCAACTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4H059JQ 622 0 0
AACGTTTGGCGAAACCACTGTCTGTGAAGATCTTCGTAGACTCAGAGCCTTGGTCTGAAC
CTACGGAACCAATACATTTTTACCGGGGGCTCCCGGAAAGCCGAGTCAATTAGTGGGGTT
CCACTTTTGATCCGATGGCCTGTTCTGAAAGCAAGAGGCACGATGAGGTTGTGCTCTCCT
CTTCACGCTCTCAAAATCATCACTCCGGCAGGCGTCTGCCATGACCGTTACTCCGGCGAG
AAATTCTGTACTATCATAGGCTACGTCTCTTCTCCGATCTGTCGTGCCGTGCAATCTGTC
CACTCCGATGTGACCAGTTTCAGATCCGCCGCGTCCTTCATCTCCTCTTCACGTAGGTTT
GGCGGCGTACAGTTTGGTGACCCGAACCCTAGCAGCATGACTATCTGGGCCTGGCCCATT
AAGGGTTATAAAGAGGTCAGCCCATTTCTTAGTTGCCCAATTTCTAAAGAAAAAGTTTCA
AAGCCCACATTTATGTGGGGGAGTGTGACCATTTTAGCCAACTTGCTAATAGTTTTCGAT
GGGTTCATTGAGACTATTACCGAAACTCATAAGCACTCAGTGCCTTATTTCTCTTATACG
AAGAGTTCTCATAGTTTCCGTT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5331Contig1 779 2 2 U
GGAACAAACCGGTCAGGATCCTTGTCAAGCGTGACGAGCTGACACTCGAAGGTATCAAGC
AGTTCTACGTGAACGTTGACAAGGAAGAGTGGAAGCTCGAGACGCTTTGCGATCTCTACG
AGACGCTGGCCATCACTCAGAGCGTCATCTTTGTGAACACTAGGCGTAAGGTTGATTGGT
TGACCGATAAAATGAGGAGCCGTGACCATACTGTGTCGGCCACGCACGGGGACATGGACC
AGAACACGAGGGACATCATCATGCGCGAGTTCAGGTCTGGTTCTTCGCGTGTGCTCATAA
CCACTGACCTCCTTGCACGTGGTATCGATGTTCAGCAGGTGTCTCTGGTCATTAACTTTG
ACCTGCCGACGCAGCCTGAGAACTACCTTCACCGTATTGGAAGAAGTGGGAGGTTTGGGA
GGAAGGGAGTGGCGATCAACTTCATGACAAGTGATGATGAGAGGATGATGTCTGATATTC
AGAAGTTTTACAATGTGGTCGTTGAAGAGTTGCCAAACAATGTTGCTGATCTTTTCTGAG
TCCTCCTGTTGTGGCAGCATGGTAACTTCTTTCTTTCTTTTTTTACCGAGAAACTGCTGA
ATTTTACTACGTTTTGTTTCCAGTTTACTTTAGAGTTTTTGGCAAAATGAGAAGAGAACT
CATCTCATGGCTTTATTGTTTTGTTGGCATTATGTTATAACTTTCTTGTTACGTGACTCT
CAAGTTTCTATTTCTCTAAAACAATGTTTTATTTAATTTACTTGGTGGAGTTTGGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO36TF U 1
AF RR4BO36JQ C 72
BS 1 441 RR4BO36TF
BS 442 779 RR4BO36JQ

RD RR4BO36TF 441 0 0
GGAACAAACCGGTCAGGATCCTTGTCAAGCGTGACGAGCTGACACTCGAAGGTATCAAGC
AGTTCTACGTGAACGTTGACAAGGAAGAGTGGAAGCTCGAGACGCTTTGCGATCTCTACG
AGACGCTGGCCATCACTCAGAGCGTCATCTTTGTGAACACTAGGCGTAAGGTTGATTGGT
TGACCGATAAAATGAGGAGCCGTGACCATACTGTGTCGGCCACGCACGGGGACATGGACC
AGAACACGAGGGACATCATCATGCGCGAGTTCAGGTCTGGTTCTTCGCGTGTGCTCATAA
CCACTGACCTCCTTGCACGTGGTATCGATGTTCAGCAGGTGTCTCTGGTCATTAACTTTG
ACCTGCCGACGCAGCCTGAGAACTACCTTCACCGTATTGGAAGAAGTGGGAGGTTTGGGA
GGAAGGGAGTGGCGATCAACT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4BO36JQ 708 0 0
AACGTTGACAAGGAAGAGTGGAAGCTCGAGACGCTTTGCGATCTCTACGAGACGCTGGCC
ATCACTCAGAGCGTCATCTTTGTGAACACTAGGCGTAAGGTTGATTGGTTGACCGATAAA
ATGAGGAGCCGTGACCATACTGTGTCGGCCACGCACGGGGACATGGACCAGAACACGAGG
GACATCATCATGCGCGAGTTCAGGTCTGGTTCTTCGCGTGTGCTCATAACCACTGACCTC
CTTGCACGTGGTATCGATGTTCAGCAGGTGTCTCTGGTCATTAACTTTGACCTGCCGACG
CAGCCTGAGAACTACCTTCACCGTATTGGAAGAAGTGGGAGGTTTGGGAGGAAGGGAGTG
GCGATCAACTTCATGACAAGTGATGATGAGAGGATGATGTCTGATATTCAGAAGTTTTAC
AATGTGGTCGTTGAAGAGTTGCCAAACAATGTTGCTGATCTTTTCTGAGTCCTCCTGTTG
TGGCAGCATGGTAACTTCTTTCTTTCTTTTTTTACCGAGAAACTGCTGAATTTTACTACG
TTTTGTTTCCAGTTTACTTTAGAGTTTTTGGCAAAATGAGAAGAGAACTCATCTCATGGC
TTTATTGTTTTGTTGGCATTATGTTATAACTTTCTTGTTACGTGACTCTCAAGTTTCTAT
TTCTCTAAAACAATGTTTTATTTAATTTACTTGGTGGAGTTTGGGTGC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5332Contig1 917 2 2 U
GGGGAACTAATAAAAAAAAAAAGCTTGACTGCTTTGAGAGAGCCCCTCCCCCTTTGGAGT
CTCACCGTGTGAGCTTAGCTTCTTTCATTTTGATCTTGGCCCGTGATTGAATCTAACCAG
CTTTCTTCTGAATTCGCATCCTTTTGTGAATCTGGTCTTGTAGATCTGCTTAGCACTGAA
TTAGCGATGGGGGAGGAAGATACTAAGGTCACCGTGGAGCCAACAGCGAATGGGACTAGT
TCTCTTCAAAAGCCATCAGATTCAGTCGCTGAAAAACAGCCTGGTGAGAATGCTAGCGGC
AAAGAAACGGAGGTAAACAAGAAAGATGAGGATGCTGGTCCTGAGAAAATGGAGATAGAT
GATAAGATCAAACAAGATGAAGAAAAAATTGAGACGGAAGGTAAAGAGGCAGAGGTTGCA
GAAAAGGAAAAGGAAGCTGAGACTGAGAGACCAGAAGAGAAAGATGTCAAGGAAGACAAG
GAACAAGCAGAGATTGCTAAAACGGAGGAAGAGAATGGAAAACCAGAAGCTGATGATAAA
ATGGATGAAGACACAGATGGCAAGAAGCTGGAAGCTGATGATGGTGTTTCTGGAGCTGCT
ACGGAGGAAGATACCGTGATGAAGGAAGCCGTGGAGTCTGAAGATAATAAAGACATAAAG
GGTGCTGAAAATGGAGGGGTCGACAATATAGTAGATGCTACTAAAGGAAGCCAAGATAAA
GCTGAGGAAGATTAAGAGGAGGAGCCACAGCCACTAGCCAAGGTCCCGGAGGTAACTTTA
TTGTTGATGAGCTTTGTGGTGGAGCGGCGTGAGATGGAAGAAGAAGCTAACCTTGAGGAG
GCTTTTTAATGCGTTTTTTTTTTAACGTTTAACACATTTTGTATAATTATTGTGCAATAA
AATCATGTTCATTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A858TF U 1
AF RR4A858JQ C 136
BS 1 766 RR4A858TF
BS 767 917 RR4A858JQ

RD RR4A858TF 766 0 0
GGGGAACTAATAAAAAAAAAAAGCTTGACTGCTTTGAGAGAGCCCCTCCCCCTTTGGAGT
CTCACCGTGTGAGCTTAGCTTCTTTCATTTTGATCTTGGCCCGTGATTGAATCTAACCAG
CTTTCTTCTGAATTCGCATCCTTTTGTGAATCTGGTCTTGTAGATCTGCTTAGCACTGAA
TTAGCGATGGGGGAGGAAGATACTAAGGTCACCGTGGAGCCAACAGCGAATGGGACTAGT
TCTCTTCAAAAGCCATCAGATTCAGTCGCTGAAAAACAGCCTGGTGAGAATGCTAGCGGC
AAAGAAACGGAGGTAAACAAGAAAGATGAGGATGCTGGTCCTGAGAAAATGGAGATAGAT
GATAAGATCAAACAAGATGAAGAAAAAATTGAGACGGAAGGTAAAGAGGCAGAGGTTGCA
GAAAAGGAAAAGGAAGCTGAGACTGAGAGACCAGAAGAGAAAGATGTCAAGGAAGACAAG
GAACAAGCAGAGATTGCTAAAACGGAGGAAGAGAATGGAAAACCAGAAGCTGATGATAAA
ATGGATGAAGACACAGATGGCAAGAAGCTGGAAGCTGATGATGGTGTTTCTGGAGCTGCT
ACGGAGGAAGATACCGTGATGAAGGAAGCCGTGGAGTCTGAAGATAATAAAGACATAAAG
GGTGCTGAAAATGGAGGGGTCGACAATATAGTAGATGCTACTAAAGGAAGCCAAGATAAA
GCTGAGGAAGATTAAGAGGAGGAGCCACAGCCACTAGCCAAGGTCC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4A858JQ 782 0 0
GCATCCTTTTGTGAATCTGGTCTTGTAGATCTGCTTAGCACTGAATTAGCGATGGGGGAG
GAAGATACTAAGGTCACCGTGGAGCCAACAGCGAATGGGACTAGTTCTCTTCAAAAGCCA
TCAGATTCAGTCGCTGAAAAACAGCCTGGTGAGAATGCTAGCGGCAAAGAAACGGAGGTA
AACAAGAAAGATGAGGATGCTGGTCCTGAGAAAATGGAGATAGATGATAAGATCAAACAA
GATGAAGAAAAAATTGAGACGGAAGGTAAAGAGGCAGAGGTTGCAGAAAAGGAAAAGGAA
GCTGAGACTGAGAGACCAGAAGAGAAAGATGTCAAGGAAGACAAGGAACAAGCAGAGATT
GCTAAAACGGAGGAAGAGAATGGAAAACCAGAAGCTGATGATAAAATGGATGAAGACACA
GATGGCAAGAAGCTGGAAGCTGATGATGGTGTTTCTGGAGCTGCTACGGAGGAAGATACC
GTGATGAAGGAAGCCGTGGAGTCTGAAGATAATAAAGACATAAAGGGTGCTGAAAATGGA
GGGGTCGACAATATAGTAGATGCTACTAAAGGAAGCCAAGATAAAGCTGAGGAAGATTAA
GAGGAGGAGCCACAGCCACTAGCCAAGGTCCCGGAGGTAACTTTATTGTTGATGAGCTTT
GTGGTGGAGCGGCGTGAGATGGAAGAAGAAGCTAACCTTGAGGAGGCTTTTTAATGCGTT
TTTTTTTTAACGTTTAACACATTTTGTATAATTATTGTGCAATAAAATCATGTTCATTAG
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5333Contig1 1009 2 4 U
GGGAGAGAGTTAGTTCATGTCTTATGTGTTTTATCATTCGCCAATTAGTTTGTCTGTGTT
CTGATTGATAATTTGTATTTTTTTTGTCTCCAGTATTCCTCTGCCTCAGTGGGTTGTTGA
AGAGGTTGATAAGGATCCAGATCTTGCATACACTGATCAGTGGGGAAGAAGGAACCACGA
GTATATATCACTTGGCGCTGATACACTCCCTGTTCTCAAAGGTAGAACACCCGTCCAATG
CTATTCCGATTTCATGCGTGCTTTCAGAGACAACTTCAAGCATCTTCTCGGAGACACCAT
TGTGGAAATCCAAGGAATGGGACCCGCAGGAGAGCTGCGTTATCCTTCATATCCCGAGCA
AGATGGAACATGGAGGTTCCCGGGGATTGGAGCCTTCCAGTGCTATGACAAGTACTCGTT
AAGCAGCTTGAAAGCAGCAGCTGAAGCTTATGGAAAGCCAGAGTGGGGCGGTACTGGCCC
AACTGATGCTGGTCACTACAATAACTGGCCAGAAGACACTCAGTTCTTCAAAAAAGAAGA
CGGTGGTTGGAACACAGAGTACGGAGAGTTCTTCCTCACGTGGTACTCCCAGATGTTGCT
GGATCACGGCGAGCGTATCCTTTCCTCAGCCAAATCGATATTCCAAGACACAACGCCATA
TTCAACTTCACGTGCATCGAGATGAGAGACTCTGATAGGTGTCGGGAAGAAGTGGAGCGT
GAAGCTGAGCATTTTGTGCATGTTACTCAGCCTCTGGTTCAAGAAGCTGCAGTGGCTCTC
ACTCACTAGAAAGAGAGATTGTGGCATGGTTCGACCCAATGGTTTATGTTTGTATGCGAT
GTGATGAAATGATTACTATGATGATGCCGAAAAGATGTTTAGGCTAAGGTTGTGTATGTA
TCGGCGGTATAAAAAATGATTATGGGCCATAGCTGTGGTTTTTTGGCTCAGGGTTGTGGC
GTTTGTACTATTTCTGATACATACTAGAATAATATGTATATGTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G474TF U 1
AF RR4G474JQ C 238
BS 1 698 RR4G474TF
BS 699 699 RR4G474JQ
BS 700 761 RR4G474TF
BS 762 1009 RR4G474JQ

RD RR4G474TF 763 0 0
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CTGATTGATAATTTGTATTTTTTTTGTCTCCAGTATTCCTCTGCCTCAGTGGGTTGTTGA
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GTATATATCACTTGGCGCTGATACACTCCCTGTTCTCAAAGGTAGAACACCCGTCCAATG
CTATTCCGATTTCATGCGTGCTTTCAGAGACAACTTCAAGCATCTTCTCGGAGACACCAT
TGTGGAAATCCAAGGAATGGGACCCGCAGGAGAGCTGCGTTATCCTTCATATCCCGAGCA
AGATGGAACATGGAGGTTCCCGGGGATTGGAGCCTTCCAGTGCTATGACAAGTACTCGTT
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AACTGATGCTGGTCACTACAATAACTGGCCAGAAGACACTCAGTTCTTCAAAAAAGAAGA
CGGTGGTTGGAACACAGAGTACGGAGAGTTCTTCCTCACGTGGTACTCCCAGATGTTGCT
GGATCACGGCGAGCGTATCCTTTCCTCAGCCAAATCGATATTCCAAGACACAACGCCATA
TTCAACTTCACGTGCATCGAGATGAGAGACTCTGATAG*TGTCGGGAAGAAGTGGAGCGT
GAAGCTGAGCATTTTGTGCATGTTACTCAGCCTCTGGTTCA
GA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4G474JQ 772 0 0
ATGCTATTCCGATTTCATGCGTGCTTTCAGAGACAACTTCAAGCATCTTCTCGGAGACAC
CATTGTGGAAATCCAAGGAATGGGACCCGCAGGAGAGCTGCGTTATCCTTCATATCCCGA
GCAAGATGGAACATGGAGGTTCCCGGGGATTGGAGCCTTCCAGTGCTATGACAAGTACTC
GTTAAGCAGCTTGAAAGCAGCAGCTGAAGCTTATGGAAAGCCAGAGTGGGGCGGTACTGG
CCCAACTGATGCTGGTCACTACAATAACTGGCCAGAAGACACTCAGTTCTTCAAAAAAGA
AGACGGTGGTTGGAACACAGAGTACGGAGAGTTCTTCCTCACGTGGTACTCCCAGATGTT
GCTGGATCACGGCGAGCGTATCCTTTCCTCAGCCAAATCGATATTCCAAGACACAACGCC
ATATTCAACTTCACGTGCATCGAGATGAGAGACTCTGATAGGTGTCGGGAAGAAGTGGAG
CGTGAAGCTGAGCATTTTGTGCATGTTACTCAGCCTCTGGTTCAAGAAGCTGCAGTGGCT
CTCACTCACTAGAAAGAGAGATTGTGGCATGGTTCGACCCAATGGTTTATGTTTGTATGC
GATGTGATGAAATGATTACTATGATGATGCCGAAAAGATGTTTAGGCTAAGGTTGTGTAT
GTATCGGCGGTATAAAAAATGATTATGGGCCATAGCTGTGGTTTTTTGGCTCAGGGTTGT
GGCGTTTGTACTATTTCTGATACATACTAGAATAATATGTATATGTTTTCCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5334Contig1 872 2 4 U
GGCAGCGTGGCCCAACATGTGGCCAGAAAGGCTTGAGACTGCGCCTGAGTGGTTGGACTC
GCAGGAAGGTGTTTATGGGAAACCTGCACCAGAGGATTTCACAGCGGACCAAGAGAAGTG
GAAGACTGTTGTCTCAAAGTCATACATTGATGGCATGGGAATAGATTGGTCTAACGTGAG
AAACGTGATGGACATGAGGGCAGTGTATGGAGGATTCGCTGCCGCGTTGAAGGATCTGAA
GCTGTGGGTGATGAACGTGGTTCCTGTGGACGCGCCTGATACGCTCCCAGTCATATATGA
ACGTGGTTTGTTTGGAATCTATCATGACTGGTGTGAGTCGTTCAACGCTTATCCAAGGAC
TTATGACCTTCTCCATGCTGATCATCTTTTCTCCACCCTGAGGAAGAGGTGCAAGTTGGA
GTCAGTAATGGCTGAAGTTGATCGGATTCTGAGGCCAGAGGGAACATTCATCATAAGAGA
CGACATGGAAACGATAGGGGAAGTTGAGAAAATGGTGAAATCCATGAAATGGGAGGTGAA
AACTACGCAGTCTAAAGACAATGAAGGCTTGCTTTCGATTAAGAAGTCATGGTGGCGTCC
TACACAAGCTGAGACAATCAAATCGGCCATAGCTTAAGGACAAGTCAGAAAAGCATATCA
CACTTGAGTATAGTTTCTTCATTAAGTTGGTTCTTTCAAGGCTTTGCTTATCAAATTGAA
TTATTAGTTTAATATGTGTATTCCTTTGCACCGAAAAAATTGTATACGTAAACTCTTGAA
CACTTTTTGAAATCATTTGCGGTCACATGTTTGATTGGTGATTAACATATATGAATTTGG
TGTATGTATAATTTTATATACATTTGCATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO47TF U 1
AF RR4EO47JQ C 191
BS 1 700 RR4EO47TF
BS 701 701 RR4EO47JQ
BS 702 726 RR4EO47TF
BS 727 872 RR4EO47JQ

RD RR4EO47TF 726 0 0
GGCAGCGTGGCCCAACATGTGGCCAGAAAGGCTTGAGACTGCGCCTGAGTGGTTGGACTC
GCAGGAAGGTGTTTATGGGAAACCTGCACCAGAGGATTTCACAGCGGACCAAGAGAAGTG
GAAGACTGTTGTCTCAAAGTCATACATTGATGGCATGGGAATAGATTGGTCTAACGTGAG
AAACGTGATGGACATGAGGGCAGTGTATGGAGGATTCGCTGCCGCGTTGAAGGATCTGAA
GCTGTGGGTGATGAACGTGGTTCCTGTGGACGCGCCTGATACGCTCCCAGTCATATATGA
ACGTGGTTTGTTTGGAATCTATCATGACTGGTGTGAGTCGTTCAACGCTTATCCAAGGAC
TTATGACCTTCTCCATGCTGATCATCTTTTCTCCACCCTGAGGAAGAGGTGCAAGTTGGA
GTCAGTAATGGCTGAAGTTGATCGGATTCTGAGGCCAGAGGGAACATTCATCATAAGAGA
CGACATGGAAACGATAGGGGAAGTTGAGAAAATGGTGAAATCCATGAAATGGGAGGTGAA
AACTACGCAGTCTAAAGACAATGAAGGCTTGCTTTCGATTAAGAAGTCATGGTGGCGTCC
TACACAAGCTGAGACAATCAAATCGGCCATAGCTTAAGGACAAGTCAGAAAAGCATATCA
CACTTGAGTATAGTTTCTTCATTAAGTTGGTTCTTTCAAG*CTTTGCTTATCAAATTGAA
TTATTA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4EO47JQ 682 0 0
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ATGAACGTGGTTCCTGTGGACGCGCCTGATACGCTCCCAGTCATATATGAACGTGGTTTG
TTTGGAATCTATCATGACTGGTGTGAGTCGTTCAACGCTTATCCAAGGACTTATGACCTT
CTCCATGCTGATCATCTTTTCTCCACCCTGAGGAAGAGGTGCAAGTTGGAGTCAGTAATG
GCTGAAGTTGATCGGATTTTGAGGCCAGAGGGAACATTCATCATAAGAGACGACATGGAA
ACGATAGGGGAAGTTGAGAAAATGGTGAAATCCATGAAATGGGAGGTGAAAACTACGCAG
TTTAAAGACAATGAAGGCTTGCTTTCGATTAAGAAGTCATGGTGGCGTCCTACACAAGCT
GAGACAATCAAATCGGCCATAGCTTAAGGACAAGTCAGAAAAGCATATCACACTTGAGTA
TAGTTTTTTCATTAAGTTGGTTCTTTCAAGGCTTTGCTTATCAAATTGAATTATTAGTTT
AATATGTGTATTCCTTTGCACCGAAAAAATTGTATACGTAAACTCTTGAACACTTTTTGA
AATCATTTGCGGTCACATGTTTGATTGGTGATTAACATATATGAATTTGGTGTATGTATA
ATTTTATATACATTTGCATTAT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL5335Contig1 698 2 2 U
GGGGAAGCAACGGTATGCGGTGAATGGAGTCTCGTATGTTAACTCGGAGACGCCTCTTAA
ACTCGCTGATCACTTCAACATCCCCGGAGTTTTCAGCACAAGCGTTCCTTCTAATGCTCC
TGCAAATGTTGCTACGTCAGTTGTTCGAGCATCACTCCATGATTTCCTCGAAGTTGTGTT
TCAGAACAATGAGGAATCAATGCAGTCTTGGCACCTTGACGGTTATGACTTCTGGGTCGT
TGGATTTGGTTCTGGACAATGGACACCTGAGCAGAGACCTCTTTACAATCTTGTTGACGC
TCTTACCAGACACACAACGCAGGTGTACCCGAAGTCTTGGACAGCAATCTTGGTGTCGTT
GGACAATCAAGGGATGTGGAATATGAGACCGGCTATATGGGAAAGACAGTATTTGGGACA
ACAGTTTTATCTAAAAGTGTGGGATCCAGTGCAGAGTCTTGCCAATGAATATAATCCTCC
TGATAATCTTCTTCTTTGTGGCAAAGCTATTGGAAGACGAGTTTAGAAAGATCATCTTTA
TAGTGTTCATCTGGTCTTTTTATTTGAGTTCATTTGTTTTGAGGGTTTTTCGATTCAGTT
TGATTTGTGGTTTTGTCCAATCTGGTCATGAGAGGTATGGCTGGTGACATTTGTAGTAAG
TAACAACACATGGAAGAGAAGAAAAGTTGTACGTCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E806JQ C 1
AF RR4E806TF U 1
BS 1 697 RR4E806TF
BS 698 698 RR4E806JQ

RD RR4E806JQ 698 0 0
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TGGATTTGGTTCTGGACAATGGACACCTGAGCAGAGACCTCTTTACAATCTTGTTGACGC
TCTTACCAGACACACAACGCAGGTGTACCCGAAGTCTTGGACAGCAATCTTGGTGTCGTT
GGACAATCAAGGGATGTGGAATATGAGACCGGCTATATGGGAAAGACAGTATTTGGGACA
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TGATAATCTTCTTCTTTGTGGCAAAGCTATTGGAAGACGAGTTTAGAAAGATCATCTTTA
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TGATTTGTGGTTTTGTCCAATCTGGTCATGAGAGGTATGGCTGGTGACATTTGTAGTAAG
TAACAACACATGGAAGAGAAGAAAAGTTGTACGTCTTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4E806TF 697 0 0
GGGGAAGCAACGGTATGCGGTGAATGGAGTCTCGTATGTTAACTCGGAGACGCCTCTTAA
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TGCAAATGTTGCTACGTCAGTTGTTCGAGCATCACTCCATGATTTCCTCGAAGTTGTGTT
TCAGAACAATGAGGAATCAATGCAGTCTTGGCACCTTGACGGTTATGACTTCTGGGTCGT
TGGATTTGGTTCTGGACAATGGACACCTGAGCAGAGACCTCTTTACAATCTTGTTGACGC
TCTTACCAGACACACAACGCAGGTGTACCCGAAGTCTTGGACAGCAATCTTGGTGTCGTT
GGACAATCAAGGGATGTGGAATATGAGACCGGCTATATGGGAAAGACAGTATTTGGGACA
ACAGTTTTATCTAAAAGTGTGGGATCCAGTGCAGAGTCTTGCCAATGAATATAATCCTCC
TGATAATCTTCTTCTTTGTGGCAAAGCTATTGGAAGACGAGTTTAGAAAGATCATCTTTA
TAGTGTTCATCTGGTCTTTTTATTTGAGTTCATTTGTTTTGAGGGTTTTTCGATTCAGTT
TGATTTGTGGTTTTGTCCAATCTGGTCATGAGAGGTATGGCTGGTGACATTTGTAGTAAG
TAACAACACATGGAAGAGAAGAAAAGTTGTACGTCTT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL5336Contig1 519 2 1 U
GGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGGTATATCAGTCGTCAAGTT
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CGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACATCACGTCAGTTGAAGGCAC
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TAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAATTGAAGCTGGGACACCCTTCGAACTCAAAGAGGA
AGGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCATGGAAAAGTCAGTGAGCTGCTTCATCAGTTTGGAGT
CCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCTTTCATTCCCTTCCATTAA
GTTTCCTACCTTTTCTGTTCTGTTTGTTTATGTTTCCAGTGTGTTATTGTCTCCTTTTTG
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BQ
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AF RR4G140JQ C 1
AF RR4G140TF U 1
BS 1 519 RR4G140TF

RD RR4G140JQ 519 0 0
GGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGGTATATCAGTCGTCAAGTT
TGTGTACGACAAGGGGGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACATGGAAATAGTACTTTACT
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ATATGATAAGATATTTGGGAGTGACTCTGAGGTCGTTACCATGCTTAGGTTCAAGACCAA
TAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAATTGAAGCTGGGACACCCTTCGAACTCAAAGAGGA
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CCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCTTTCATTCCCTTCCATTAA
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ATGTTGTCATGTGTTTGATGCTATATATCTATCTGCTTT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR4G140TF 519 0 0
GGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGGTATATCAGTCGTCAAGTT
TGTGTACGACAAGGGGGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACATGGAAATAGTACTTTACT
CGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACATCACGTCAGTTGAAGGCAC
ATATGATAAGATATTTGGGAGTGACTCTGAGGTCGTTACCATGCTTAGGTTCAAGACCAA
TAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAATTGAAGCTGGGACACCCTTCGAACTCAAAGAGGA
AGGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCATGGAAAAGTCAGTGAGCTGCTTCATCAGTTTGGAGT
CCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCTTTCATTCCCTTCCATTAA
GTTTCCTACCTTTTCTGTTCTGTTTGTTTATGTTTCCAGTGTGTTATTGTCTCCTTTTTG
ATGTTGTCATGTGTTTGATGCTATATATCTATCTGCTTT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL5337Contig1 1000 2 2 U
GGAGGGTTATTCGCCTCTTCACCATGGACGCGTACGACATTCTGAGATCCGAGAGGTTAG
AGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGAGAAAGCCTTTGCCGACAGGATCAGTGGCAAGCCCCGAG
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TGATTGAACTCTTCAGTTCATGTGGCGACGTTACAAGGGTTATTGTTCCCAAAGACCCTG
ATCATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTAGTTATTCTTTTCGGGGATGGGGCAGAAG
AGAAGGCCTTGCAACTTAATGGAACTGACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAGGTTG
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TGAATGACCCAAAATTTTGGTATGGCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTTCCCTCCCTG
TAGACCAAGTCGAGAGGGCTTTGAAGGAACATTTCTCTGATTGTGGGGAGATAACTCATG
TTTTTGTCGATACTCTCGACAAGCTGGCTAATGTCTATTTTTCCCTACAAGAAGGAGAAG
CTAGGGCGCTGGCTCGTGATGGAATTAGAATGGGAGAATTCGAATTAGATATTTCTGGCG
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AGAACAAGGTCATTGCTTTCAAGAAGCAGAGGAGGCTTATCTAGAAATTTCTCTTTCTCT
CAAGAAGCTCTATCTTTGGTGTTTAATAATAATAAATCGTGTGAATGATAATACAATGCA
ACCTTGGGGCTTTCTTACTTGCGTTTAATCTCAAAGCTCACATTATGTATGTACGATGAG
CCATTTGTGCTTTCTTACTTTATGTTTAATCTCAAAGCCC


BQ
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AF RR4A868TF U 1
AF RR4A868JQ C 243
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BS 762 1000 RR4A868JQ

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AGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGAGAAAGCCTTTGCCGACAGGATCAGTGGCAAGCCCCGAG
CTTTGATTTCTGTGACGGGATACAACCCTAATCTGCCTGAGGATGATGTCAAGAAGGAAC
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ATCATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTAGTTATTCTTTTCGGGGATGGGGCAGAAG
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TGAATGACCCAAAATTTTGGTATGGCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTTCCCTCCCTG
TAGACCAAGTCGAGAGGGCTTTGAAGGAACATTTCTCTGATTGTGGGGAGATAACTCATG
TTTTTGTCGATACTCTCGACAAGCTGGCTAATGTCTATTTTTCCCTACAAGAAGGAGAAG
CTAGGGCGCTGGCTCGTGATGGAATTAGAATGGGAGAATTCGAATTAGATATTTCTGGCG
TACCTTCAGTCCTAAGTAACCGTCCCAATCCCTTTGGCAACGGTGAAATTGAAATTGGTT
TGGGCTATACTGTCCCAGCTCATATGATTGAGTTTGCCAAC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4A868JQ 758 0 0
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AAGGCCTTGCAACTTAATGGAACTGACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAGGTTGAA
TCGGATGAAGAAGATGAGGAGGCAGCACGCTATAGATCCTCTCTGATTAACGAACTAATG
AATGACCCAAAATTTTGGTATGGCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTTCCCTCCCTGTA
GACCAAGTCGAGAGGGCTTTGAAGGAACATTTCTCTGATTGTGGGGAGATAACTCATGTT
TTTGTCGATACTCTCGACAAGCTGGCTAATGTCTATTTTTCCCTACAAGAAGGAGAAGCT
AGGGCGCTGGCTCGTGATGGAATTAGAATGGGAGAATTCGAATTAGATATTTCTGGCGTA
CCTTCAGTCCTAAGTAACCGTCCCAATCCCTTTGGCAACGGTGAAATTGAAATTGGTTTG
GGCTATACTGTCCCAGCTCATATGATTGAGTTTGCCAACAAGGACGACGACGAGATCGAG
AACAAGGTCATTGCTTTCAAGAAGCAGAGGAGGCTTATCTAGAAATTTCTCTTTCTCTCA
AGAAGCTCTATCTTTGGTGTTTAATAATAATAAATCGTGTGAATGATAATACAATGCAAC
CTTGGGGCTTTCTTACTTGCGTTTAATCTCAAAGCTCACATTATGTATGTACGATGAGCC
ATTTGTGCTTTCTTACTTTATGTTTAATCTCAAAGCCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL5338Contig1 1192 2 4 U
GGTGCAGGAGTCTGACCTCACCAACACCTCAGCCACGGGCAGAGTTGTTGTCCGTTTCCT
AATTGAACCGACTGTAACCGTTTACCTATCTCTGTGGGATGAGGCGGCATCAGCCTTCCG
AGGCCTTCTGGAAGCAGGTGATAAATCAAAGTCCGTGATGTTGGTCACTTCCGTCAATCC
TAAGCTGTTTGGAGGAAACCTGTATTTGAACTCCGCCCAAGGAACTAGGTTCTTCTTTGA
CACCAGCGTCCCTGAAGCGGCAGAGTTTGTTAACAGTGTTGGGGCAACTGCGGCTAAGGG
TTTTACCTGTGTTGACACTCTCCAAGGAATCAAGAGAAAGGAACTTGTCTCGATAGGGGA
TCTTAACACCTTCATCTCCAACTCCAATGAGCAGACCCAGGAGGCTGATTTCCTCTGCAA
GGCCCGGATTGTTTGTGTCAATCAAGAAAATGGGTGGTCCTTTGTGTCGTGCACTGGTTG
CCACAAAAAATTGGAGAGACATGGAACTTCCCTGAACTGCACCAGATGTGTGACTTCCGA
CGTCACTGGTGTCGTCAGGTTCCGTGTTGAGCTATGTGTCGATGATGGCAAAGATAGCGC
TACATTTGTTGTCTTTGACAAAGAGATGTCAAAACTAACCAAGCAGGAAGCTGCTGTCCT
TGCTCTCGATGTGGTGCATGAGGGTGGAGAGGAGCGTCTCCCAGGCTGCCTTGAAGAGCT
AGAAGGGAAGGATTTTATGTTTCAGATCCGCGTCACACCTTTCAATTTCACCCCACACCA
CCGTACCTTCACAGTCTCCACCATCGCTGAAGATACCCCCATGTCGACCCATGTCAAGGA
ACATGTTGAAATCATTTCCACAACCAATGAGAGTAACATCGGCCTGGCAGGTTCGTCTTC
TGGACCCCCCAACTTAGGAGGCAAGTTTGGGACAGAATGTGCTCTGGCAAATCCTCCTGA
GATTGCAGAGGCTCAGAAGAAACGCAAGCGTGGCAGTGAGTAGTTGGGAGAAAACGTTCC
TGTGACCCCGTCAACGCCCCTATCTATTTTTCTAAAAAGCTTCTAATAGCTCTGTTTCTC
TTTGCAATTTTGGTTTTTTTCCTTCTCTTTTTTTTGCGCTTCCTTTCTACGGATATTTAT
CTATGTTTTGGATTATTAAATCAATGAATCGTTGACGGGTTAAACTTGATTC


BQ
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AF RR4BX08TF U 1
AF RR4BX08JQ C 520
BS 1 646 RR4BX08TF
BS 647 647 RR4BX08JQ
BS 648 656 RR4BX08TF
BS 657 1192 RR4BX08JQ

RD RR4BX08TF 656 0 0
GGTGCAGGAGTCTGACCTCACCAACACCTCAGCCACGGGCAGAGTTGTTGTCCGTTTCCT
AATTGAACCGACTGTAACCGTTTACCTATCTCTGTGGGATGAGGCGGCATCAGCCTTCCG
AGGCCTTCTGGAAGCAGGTGATAAATCAAAGTCCGTGATGTTGGTCACTTCCGTCAATCC
TAAGCTGTTTGGAGGAAACCTGTATTTGAACTCCGCCCAAGGAACTAGGTTCTTCTTTGA
CACCAGCGTCCCTGAAGCGGCAGAGTTTGTTAACAGTGTTGGGGCAACTGCGGCTAAGGG
TTTTACCTGTGTTGACACTCTCCAAGGAATCAAGAGAAAGGAACTTGTCTCGATAGGGGA
TCTTAACACCTTCATCTCCAACTCCAATGAGCAGACCCAGGAGGCTGATTTCCTCTGCAA
GGCCCGGATTGTTTGTGTCAATCAAGAAAATGGGTGGTCCTTTGTGTCGTGCACTGGTTG
CCACAAAAAATTGGAGAGACATGGAACTTCCCTGAACTGCACCAGATGTGTGACTTCCGA
CGTCACTGGTGTCGTCAGGTTCCGTGTTGAGCTATGTGTCGATGATGGCAAAGATAGCGC
TACATTTGTTGTCTTTGACAAAGAGATGTCAAAACTAACCAAGCAG*AAGCTGCTG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4BX08JQ 673 0 0
CACCAGATGTGTGACTTCCGACGTCACTGGTGTCGTCAGGTTCCGTGTTGAGCTATGTGT
CGATGATGGCAAAGATAGCGCTACATTTGTTGTCTTTGACAAGGAGATGTCAAAACTAAC
CAAGCAGGAAGCTGCTGTCCTTGCTCTCGATGTGGTGCATGAGGGTGGAGAGGAGCGTCT
CCCAGGCTGCCTTGAAGAGCTAGAAGGGAAGGATTTTATGTTTCAGATCCGCGTCACACC
TTTCAATTTCACCCCACACCACCGTACCTTCACAGTCTCCACCATCGCTGAAGATACCCC
CATGTCGACCCATGTCAAGGAACATGTTGAAATCATTTCCACAACCAATGAGAGTAACAT
CGGCCTGGCAGGTTCGTCTTCTGGACCCCCCAACTTAGGAGGCAAGTTTGGGACAGAATG
TGCTCTGGCAAATCCTCCTGAGATTGCAGAGGCTCAGAAGAAACGCAAGCGTGGCAGTGA
GTAGTTGGGAGAAAACGTTCCTGTGACCCCGTCAACGCCCCTATCTATTTTTCTAAAAAG
CTTCTAATAGCTCTGTTTCTCTTTGCAATTTTGGTTTTTTTCCTTCTCTTTTTTTTGCGC
TTCCTTTCTACGGATATTTATCTATGTTTTGGATTATTAAATCAATGAATCGTTGACGGG
TTAAACTTGATTC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL5339Contig1 677 2 3 U
GGAGTAAAAGGTTTGCCTCATCAGGTTTAGTTTAACACAATGTGTTTTAAAGCATACATA
CAAAAACTAACTTTGAAATGTTTTGTATTATTAGAGTACCATAACTGATCCATAAGTTAG
AATTTATCAACGATAACACCAGGCCGTATAACCTCATAAGCATCTCTGCTCCTGCTTTTC
TTCATCCCTGCCGTGAAATACACCTTTGATGGGTCTGCTGAGACACAAGTCACTTTCACC
CAAATCATCACTTTAGTTTTCAAGCCTTCCACTTCAGCTAGCTTCCCTTTCTCCAGGTAA
CCCGTCACCGTTGTCGAAAACCGCAGGACCGATGAATCCCTGTAACCAACCTCGCAGGTC
TCGGGGATGAAGACAGTCAGCTTACCCGTCTCTTCGTTGAACTCGTAGTTCGTGGCGTCC
TGTGGAAAGATCCCAACAGGTAAACCAAATTCCTTTAGCAGATCAGGCAATGGCTTCTGC
ATTTTTCCTTTGAGTTTGTTGACCAACCACTTGGTACCTCCTTCAATGCTGCTAGACAAT
GAATTGAAATCGTCGCCGACGGAGTTGAACTCTTTGTTTGCCTTTTGTCCTAACCAATAC
GAGCCAACCTTGTTCAGTATCTGATCCATCTCTCCTCTGTAATAATTCGCACGAAGAGAG
AGAGAGAAGTACCACCC


BQ
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4H133TF U 1
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DS 



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BQ
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AF RR4B111JQ C 1
AF RR4B111TF U 1
BS 1 521 RR4B111TF

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TTAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTGTCT

QA 1 521 1 521
DS 



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ACGGTAACCTCTGCCATTTCCTTACTCTCAGAGGTCAAGCTAAGGTCAATCCTCGATAAC
GCACGCCAGGTGCGCAAGACCATAGCTGAATATGGATCATTTAAGAAGTACATGTGGAAC
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ACATCAAAGGCCGAGTTTATAAGCAAAGATCTTGTACGCAGAGGCTTTCGCAGCGTGAGT
CCAACGGTTATTTACTCCTTCATGCAAGCAGCTGGTCTTACAAACGACCACCTCATAGGC
TGCTTCAGACACCAAGACTGTTGCGTGGTTGCAGAGACAACGACAACCAAGGCCAAGAAG
ACTGAACGAGAGTGATAAATAAGTTTTTAAGTGCAAATTCTGAAAGCTAATTGACGTGTT
TGAGTAGTTCAATGTATTTGCTTGCAAAGTTGTTTGACGCAATGAGATTTTGCTACCGTA
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C


BQ
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10 

AF RR4F158TF U 1
AF RR4F158JQ C 641
BS 1 711 RR4F158TF
BS 712 1321 RR4F158JQ

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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4F158JQ 681 0 0
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ACATTCTCTCCAGAAGGCAATTACTCAGGGAAGTTTTCATGGACTTCGATCCAGTTGCTG
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TAAGGTCAATCCTCGATAACGCACGCCAGGTGCGCAAGACCATAGCTGAATATGGATCAT
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CAAACGACCACCTCATAGGCTGCTTCAGACACCAAGACTGTTGCGTGGTTGCAGAGACAA
CGACAACCAAGGCCAAGAAGACTGAACGAGAGTGATAAATAAGTTTTTAAGTGCAAATTC
TGAAAGCTAATTGACGTGTTTGAGTAGTTCAATGTATTTGCTTGCAAAGTTGTTTGACGC
AATGAGATTTTGCTACCGTACCGTGATGTGTTCTTGTGTTAGCGTTGTATAGATGTTTTT
GGTTATTGGTTTATGCTTAGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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GGACGACTACACAGAACAAACAGTAGTTCTCTCTCCCCGCACCTCTCCTCTCTCTCCTCT
TATTCAAAACTAGGGTTCTTGAGTTGTCCATGGAGAGAGAAGAATGCAGCAGCAGCGAAT
CCGGTTGGACCACGTATATTTCTTCGCCTATGGAGGAAGACGAGGAGGAGGTAACTGATG
AGGTATTATGAAGGGCATAGCATCGAAAAAGATCGAAGAAAATATGCCAACGAGTACGAA
AGCAACAAAGACAGCGACGATTCTATGGCTTCCGATGCTTCTTCCGGGCCAAGTTATCAC
CAAACGAGCAACAGAGGGAGAAGGAGAGAAGGTCTCGTTTTAAGAAACGGGAAAAGTGAA
AGTAATAGTAAAAGTAATGATGTTTATGATTATAAACATGATGATAAGAATAGTGGTAAT
CATAAATGTAGGACAAAAGAGAAGAAAAAGGGTGAAAACAAGACTAGATCTTCTAAAAAA
AAGTAAACTTTCTTCTTCTTGAAGTTGTTTGTATGTAAATTGGGATTGGATTATTGATTT
CCTTATTTTTGTGTTGGGGGTTTTTGATACCTCACGCAAAGGGTGTTTGATTATTTATAT
TTTTTTCAGTTGATATTTGTATTCTCTTATGCCCCTCTTGTCTCTTGATTATTATTATTA
ATTTTACTCCTCATATTAATGCAACATGATGATTATC


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AF RR4H647JQB C 1
AF RR4H647TF U 1
BS 1 697 RR4H647TF

RD RR4H647JQB 697 0 0
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AGCAACAAAGACAGCGACGATTCTATGGCTTCCGATGCTTCTTCCGGGCCAAGTTATCAC
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AGTAATAGTAAAAGTAATGATGTTTATGATTATAAACATGATGATAAGAATAGTGGTAAT
CATAAATGTAGGACAAAAGAGAAGAAAAAGGGTGAAAACAAGACTAGATCTTCTAAAAAA
AAGTAAACTTTCTTCTTCTTGAAGTTGTTTGTATGTAAATTGGGATTGGATTATTGATTT
CCTTATTTTTGTGTTGGGGGTTTTTGATACCTCACGCAAAGGGTGTTTGATTATTTATAT
TTTTTTCAGTTGATATTTGTATTCTCTTATGCCCCTCTTGTCTCTTGATTATTATTATTA
ATTTTACTCCTCATATTAATGCAACATGATGATTATC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4H647TF 697 0 0
GGACGACTACACAGAACAAACAGTAGTTCTCTCTCCCCGCACCTCTCCTCTCTCTCCTCT
TATTCAAAACTAGGGTTCTTGAGTTGTCCATGGAGAGAGAAGAATGCAGCAGCAGCGAAT
CCGGTTGGACCACGTATATTTCTTCGCCTATGGAGGAAGACGAGGAGGAGGTAACTGATG
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CAAACGAGCAACAGAGGGAGAAGGAGAGAAGGTCTCGTTTTAAGAAACGGGAAAAGTGAA
AGTAATAGTAAAAGTAATGATGTTTATGATTATAAACATGATGATAAGAATAGTGGTAAT
CATAAATGTAGGACAAAAGAGAAGAAAAAGGGTGAAAACAAGACTAGATCTTCTAAAAAA
AAGTAAACTTTCTTCTTCTTGAAGTTGTTTGTATGTAAATTGGGATTGGATTATTGATTT
CCTTATTTTTGTGTTGGGGGTTTTTGATACCTCACGCAAAGGGTGTTTGATTATTTATAT
TTTTTTCAGTTGATATTTGTATTCTCTTATGCCCCTCTTGTCTCTTGATTATTATTATTA
ATTTTACTCCTCATATTAATGCAACATGATGATTATC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL5344Contig1 607 2 3 U
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CTTTTTCCTCAAGTGATACTGTCATCTTACAAAACCCTAATTAACCGATACAGAGACGGC
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GGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX82JQ U 14
AF RR4AX82TF C 1
BS 1 13 RR4AX82TF
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BS 457 607 RR4AX82TF

RD RR4AX82JQ 443 0 0
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QA 1 443 1 443
DS 

RD RR4AX82TF 607 0 0
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GGAACCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL5345Contig1 936 2 8 U
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TATGGTTTGAGAGTTTTCATTATATTTTGCAGACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BY55TF U 1
AF RR4BY55JQ C 206
BS 1 674 RR4BY55TF
BS 675 675 RR4BY55JQ
BS 676 681 RR4BY55TF
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BS 683 690 RR4BY55TF
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BS 737 936 RR4BY55JQ

RD RR4BY55TF 736 0 0
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CCAAACGTTAGCGGTCGCATTCCTCTGCGTCAGTAATAAGGCAGCTGATAGGCCTATGAT
GAAAGATATTGTGGCAATGCTTAAAGAGATTAGGCAGCTTGACGTGGGACGATCTGACAA
CGATATGTTAAAAG*CGGAAA*TGTGAAAA*TGGCAGCCACAGCCGCTACCGCCGGAGAA
GTTTGTCACTCCTCGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4BY55JQ 731 0 0
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AAATCAAGTAACCGGCCTCCGTTGGCTGGCTCGTACGGTTACATGGCTCCAGAACATGCA
TCGATGCAACGTATAACTGAAAAGAGCGATGTGTATAGTTTTGGAGTGGTACTATTGGAA
GTGCTAACCGGAAAGCATCCATTGGATCCGGATCTACCAGGAGGTGCACATTTGGTTCAA
TGGGTAAGAGATCATCTAGCCAAGAAAAAGGCTCCGGGAGAAATCCTCGACCCAAGGCTC
CGTGGACGAGCCGATCCAATAATGCATGAGATGCTCCAAACGTTAGCGGTCGCATTCCTC
TGCGTCAGTAATAAGGCAGCTGATAGGCCTATGATGAAAGATATTGTGGCAATGCTTAAA
GAGATTAGGCAGCTTGACGTGGGACGATCTGACAACGATATGTTAAAAGGCGGAAAATGT
GAAAAATGGCAGCCACAGCCGCTACCGCCGGAGAAGTTTGTCACTCCTCGTGGTTCATCT
AATTGTTCGTTTGCGTTTTCGGATGAATCCGTATAGAAACCCATATAGAACTACAATTAC
TGTGACTACATTTATAAATTGAAAGGGTGTGTGAATATTTGTAGCCAATGATTTGTTAGA
AGAATCGGAAAGAAATAATATCTTGGTGTATTTTTTATGGTTTGAGAGTTTTCATTATAT
TTTGCAGACGG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5346Contig1 622 2 2 U
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AACTCTACTATGGACGAAGAATCAAGAGATAAACTGCTTTCTTTATTTGCTGGACTAGTG
AAGTCAATCAGCAAACATCAGGATAGTTATGGAATCCAAAAGCTAAACGAAGCTGCTCAA
AAGATGGATTTCTGCAATAGGTTCCCAGTTCCTTTATACCCAGAGCTGATTCACCAGAGA
GTAGAGAATCAGTACTACAGAAGTATGGGATCGTTTAAGCACGACATGGATGTAATGCTG
TCAAACGCTGAATCTTATTTTGGTGCAAACGCACATATGCGTTCTAAGATAAAGCGACTC
CGAGATAAAATCACAAAAACGTTAAGGAAGGTTTCACAAAGTTGTTGATGATGCTGATAT
GGTATGTTTGTTTTCTAGACTCTCTAGGCTGTGGCCATTTTTTCTATAAGAATATTATAT
AGCGAAGAAGAATATGTAAGAGTTTTCACTCTAGGAAACAAAAGAGAAAGGTCTCGGTTT
TCTTTGGGTGAGTCAGTCACACCAGGCACAAGGTTCAATCAATTCTATAGATCCGGTCGC
TTTAGTTCCACGAGACTAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E441TF U 1
AF RR4E441JQ C 73
BS 1 601 RR4E441TF
BS 602 622 RR4E441JQ

RD RR4E441TF 601 0 0
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AAGATGGATTTCTGCAATAGGTTCCCAGTTCCTTTATACCCAGAGCTGATTCACCAGAGA
GTAGAGAATCAGTACTACAGAAGTATGGGATCGTTTAAGCACGACATGGATGTAATGCTG
TCAAACGCTGAATCTTATTTTGGTGCAAACGCACATATGCGTTCTAAGATAAAGCGACTC
CGAGATAAAATCACAAAAACGTTAAGGAAGGTTTCACAAAGTTGTTGATGATGCTGATAT
GGTATGTTTGTTTTCTAGACTCTCTAGGCTGTGGCCATTTTTTCTATAAGAATATTATAT
AGCGAAGAAGAATATGTAAGAGTTTTCACTCTAGGAAACAAAAGAGAAAGGTCTCGGTTT
TCTTTGGGTGAGTCAGTCACACCAGGCACAAGGTTCAATCAATTCTATAGATCCGGTCGC
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4E441JQ 550 0 0
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TACTACAGAAGTATGGGATCGTTTAAGCACGACATGGATGTAATGCTGTCAAACGCTGAA
TCTTATTTTGGTGCAAACGCACATATGCGTTTTAAGATAAAGCGACTCCGAGATAAAATC
ACAAAAACGTTAAGGAAGGTTTCACAAAGTTGTTGATGATGCTGATATGGTATGTTTGTT
TTCTAGACTCTTTAGGCTGTGGCCATTTTTTCTATAAGAATATTATATAGCGAAGAAGAA
TATGTAAGAGTTTTCACTCTAGGAAACAAAAGAGAAAGGTTTCGGTTTTCTTTGGGTGAG
TCAGTCACACCAGGCACAAGGTTCAATCAATTCTATAGATCCGGTCGCTTTAGTTCCACG
AGACTAACAT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL5347Contig1 853 2 2 U
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TTTAAAAAAAATCGCATTATTAGTAAACCTAGAAGCTCATCTTTCTATAATGGGTAATAG
TTTGGGAAGCAAGAAATCTGCTAAAATCATGAAGATCAATGGCGAGAGTTTCAAGCTGAA
GACTCCTGTGAGAGCTGATACGGTTGTTAAAGACTTTCCCGGCCACGTTCTCTTGGAATC
TGAATCCGTGAAGCATTTTGGAATCAGAGCAAAGCCTTTGGGTCCTAACCAGAACTTGGA
ATCCAAAAGGCTTTATTTCATGGTGGAGCTTCCTAGAACATGGAAGGAGAGGGCCCCGAG
AAGGGTTCGGTCTGGAATCCAAATGAGTGCTAAGGAGAGGCTAGAGAATCTGAAGCTGTC
TCGTAGATCATCTTCTGATCTCTCGGTAATGAAGAAGGAGGTTGATGAAGAAGAGAGAGA
AGTGATGACTAGTGTCAAGTTGAGGTTACCAAAGTGGAAAGTGGAGAAACTGAGGAAAGA
GAGTGAGAGTGGCTCTGATTTCTCCGACAAGATCACAGCTCTCTGTCTCCTCAACATTCA
GAGACAACGTTTGCTTCATAATGGAGGAAGAAGCTTTGGGATTGGAGATGAAGAAGGTGT
TGTCAAAGCACAAGAGGTGATCAATTCTTTTTAGGGTTTTGTTTCTTTCTTTCTTGTTAG
AAGAAGAAACACCGATCCGTTTCTCAAGCCACGTTTCTTGCATCCTCTAATTACTAAAAT
TGCCACTAGGAAACGGATGTGCTCCAACTTGTGTGTAACAAACTTCTAGTATTTTCCTAA
TATAAACAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E205TF U 1
AF RR4E205JQ C 130
BS 1 650 RR4E205TF
BS 651 853 RR4E205JQ

RD RR4E205TF 650 0 0
GGAACACATCACCCACCTTGAGCTACTGAGTTTCTTAAATAGATATATCTCTTTTGTGGA
TTTAAAAAAAATCGCATTATTAGTAAACCTAGAAGCTCATCTTTCTATAATGGGTAATAG
TTTGGGAAGCAAGAAATCTGCTAAAATCATGAAGATCAATGGCGAGAGTTTCAAGCTGAA
GACTCCTGTGAGAGCTGATACGGTTGTTAAAGACTTTCCCGGCCACGTTCTCTTGGAATC
TGAATCCGTGAAGCATTTTGGAATCAGAGCAAAGCCTTTGGGTCCTAACCAGAACTTGGA
ATCCAAAAGGCTTTATTTCATGGTGGAGCTTCCTAGAACATGGAAGGAGAGGGCCCCGAG
AAGGGTTCGGTCTGGAATCCAAATGAGTGCTAAGGAGAGGCTAGAGAATCTGAAGCTGTC
TCGTAGATCATCTTCTGATCTCTCGGTAATGAAGAAGGAGGTTGATGAAGAAGAGAGAGA
AGTGATGACTAGTGTCAAGTTGAGGTTACCAAAGTGGAAAGTGGAGAAACTGAGGAAAGA
GAGTGAGAGTGGCTCTGATTTCTCCGACAAGATCACAGCTCTCTGTCTCCTCAACATTCA
GAGACAACGTTTGCTTCATAATGGAGGAAGAAGCTTTGGGATTGGAGATG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4E205JQ 724 0 0
CAAGAAATCTGCTAAAATCATGAAGATCAATGGCGAGAGTTTCAAGCTGAAGACTCCTGT
GAGAGCTGATACGGTTGTTAAAGACTTTCCCGGCCACGTTCTCTTGGAATCTGAATCCGT
GAAGCATTTTGGAATCAGAGCAAAGCCTTTGGGTCCTAACCAGAACTTGGAATCCAAAAG
GCTTTATTTCATGGTGGAGCTTCCTAGAACATGGAAGGAGAGGGCCCCGAGAAGGGTTCG
GTCTGGAATCCAAATGAGTGCTAAGGAGAGGCTAGAGAATCTGAAGCTGTCTCGTAGATC
ATCTTCTGATCTCTCGGTAATGAAGAAGGAGGTTGATGAAGAAGAGAGAGAAGTGATGAC
TAGTGTCAAGTTGAGGTTACCAAAGTGGAAAGTGGAGAAACTGAGGAAAGAGAGTGAGAG
TGGCTCTGATTTTTCCGACAAGATCACAGCTCTCTGTCTCCTCAACATTCAGAGACAACG
TTTGCTTCATAATGGAGGAAGAAGCTTTGGGATTGGAGATGAAGAAGGTGTTGTCAAAGC
ACAAGAGGTGATCAATTCTTTTTAGGGTTTTGTTTCTTTCTTTCTTGTTAGAAGAAGAAA
CACCGATCCGTTTCTCAAGCCACGTTTCTTGCATCCTCTAATTACTAAAATTGCCACTAG
GAAACGGATGTGCTCCAACTTGTGTGTAACAAACTTCTAGTATTTTCCTAATATAAACAA
TGCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5348Contig1 967 2 6 U
GGATCTAAATCCCTCGGTGTCTCTCACACCATCAATCCCAACAAAAACCATCCAAAACAA
TGTACTCAGCATCGTCTGTAATAAAACGCCTCATTTTGATCCACGTATTTGCCATACAAC
TACTTTTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAAT
GCTTGGTTAATCAAGGAAAATACAGGCCGGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAA
CCATGAAAATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGATGGGATCGGCGATCCCACTT
TTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTG
CCACTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGAGGATAATATGGTA
TGATCAGTGTCTTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAGATCGATTACGACAA
TAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGTGGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGC
TTGGAATAATCTTATTCAATATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACT
GTACTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTAC
GAAAGGCTTATCGCCAAAAGCTTGTGAGGAGTGTGTGTCGTTTAATAGCTTGCATTTTCA
AGATTGCCTGAATACTAGACGAGGAGGGAGAGTTGTAGGTTTGAGCTGTAATTTTAGGCT
TGAGTTTTACCCGTTTATTGCCGAGCCCGTCCGGAATATTTAATGAGCTAAAGAAATATT
TAACTCTTTGCTTTCTTTTTTTTTTCAATCAAAAGTTTATGTAAAATCGAGTGCTACTTT
ACTCTTTTGAATGAATGTTTAAAGAATAAAACAACAAATTAGTGACAAATAAAAGAATAG
TTTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI60TF U 1
AF RR4GI60JQ C 211
BS 1 665 RR4GI60TF
BS 666 666 RR4GI60JQ
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BS 737 967 RR4GI60JQ

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TACTTTTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAAT
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CCACTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGAGGATAATATGGTA
TGATCAGTGTCTTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAGATCGATTACGACAA
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TTGGAATAATCTTATTCAATATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACT
GTACTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTAC
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AGATTGCCTGAATACT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4GI60JQ 757 0 0
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CCTACGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCACTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGAT
GTCCTTGGTACAAGGGAGGATAATATGGTATGATCAGTGTCTTCTCGCGATTTCAACCTT
CAATACTATTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGT
GGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGCTTGGAATAATCTTATTCAATATCTGACGAC
TTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACTGTACTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGG
TGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTACGAAAGGCTTATCGCCAAAAGCTTGTGAGGA
GTGTGTGTCGTTTAATAGCTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATACTAGACGAGGAGGGAG
AGTTGTAGGTTTGAGCTGTAATTTTAGGCTTGAGTTTTACCCGTTTATTGCCGAGCCCGT
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AAAAGTTTATGTAAAATCGAGTGCTACTTTACTCTTTTGAATGAATGTTTAAAGAATAAA
ACAACAAATTAGTGACAAATAAAAGAATAGTTTCCCG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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TAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTAT
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TCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGGGATGGAGGCAGTGTTAA
GGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACC
ATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAG
TTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAGCGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGT
TTTGGTTTTGTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGGT
TCTCGACTTAATAATAATGCACTATTTGGGTGTCGCTTACAATCG


BQ
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AF RR4ED15TF U 1
AF RR4ED15JQ C 128
BS 1 645 RR4ED15TF

RD RR4ED15TF 645 0 0
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CATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCAACACCAACCGCAGCTGGTGTCCTGATTGCGT
TAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTAT
TCGGGCTTACGCCGGAGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATGCATCCGTGGAGAGTCGA
TCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGGGATGGAGGCAGTGTTAA
GGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACC
ATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAG
TTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAGCGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGT
TTTGGTTTTGTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGGT
TCTCGACTTAATAATAATGCACTATTTGGGTGTCGCTTACAATCG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4ED15JQ 518 0 0
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GAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTATTCGGGCT
TACGCCGGAGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATGCATCCGTGGAGAGTCGATCCTCGA
TTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGGGATGGAGGCAGTGTTAAGGGTCGT
CTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACT
TAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTG
TTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAGCGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTTTGGTT
TTGTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGGTTCTCGAC
TTAATAATAATGCACTATTTGGGTGTCGCTTACAATCG

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL5350Contig1 838 2 13 U
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GAAAACGAGACCAGTAATAAATATTTGAGAGAATTAAATCCCAAAAAGAAAAAAAATCTT
TTGGCCTTAAACTTGTTTTACATCTCATTCGCAATTTCTAGGCGAGACTCAAAAGATGAA
GTAGTAGCAGATGCAGATGGAGGTTCTTTGTACCATTCATCAGCCTCTCGAGTCATAAAG
TTTGCTTCAGACAAGAAGACATTCTTGTATTCTTCATCGTCATATATAAATTGCGGAGGA
TCTGGCGAACCAATACCAACTATGGTGCTTCCACTCCCAGACATAAAGACAGCATCATAT
TCCCCGCGCCCAGAAGCTATTACACGTTGCTTCAAGCGTTTAAGAGATAGAAGAACTTGA
AATGCTGGCAGTTCCAAATCGTTTACGCAAATGCTTTGAGATACACCGTTGCTAGTGACA
TTCTCCAGTAATCTTAAGGGATCAACGCTACTTGTCTGATCCAGACGGAGACGTTTGTAA
ACTTCAGCAGTGGAGCATGCTTCTCGGGGCTTTATAAGCACCATCGGAAGATCAAAAGGA
AAAGGAGAAGCAAGGTCTTGGACAATCTCACCTCTCCCGGTACAAAAGGCAGCACCACGC
GAGAAGAAGAAAGGAATGTCAGAACCTATTTCACTAGACCAATCTTGGAGTTCCTTCTCA
GAGACAAGACCTCCATTGAGCTGATTCGCCGCCCAGAGTGCAGTTGCAGCATTACTGCTT
CCACCACCGAGTCCAGCTCCAGTAGCACCTTCTTATCTAGATGATCCAGAAGACTTGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C143JQ U 123
AF RR4BP76JQ U 1
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DS 

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TTTGCTTCAGACAAGAAGACATTCTTGTATTCTTCATCGTCATATATAAATTGCGGAGGA
TCTGGCGAACCAATACCAACTATGGTGCTTCCACTCCCAGACATAAAGACAGCATCATAT
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AATGCTGGCAGTTCCAAATCGTTTACGCAAATGCTTTGAGATACACCGTTGCTAGTGACA
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QA 1 838 1 838
DS 



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BQ
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AGTCTGTTTAACCTGTTTATCAATCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGC
TGAACTCAGAAATGACTAAGGTGGATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAA
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QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DP26TF C 1
AF RR4DP26JQ U 5
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BS 5 522 RR4DP26JQ

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TTGCCCATGTTGAAGACTATACATTCTTCTATCAAATGATGCACCAAATGGATGTAAGAT
GCTTGTGAGCTGCTATGATCACCCATGATATGATAGTGATTTAAGGAGTAGTTTGGTATG
TAGAGAAGCAAATAGAGAGATGATGAAGAAAGGGAGAAAAAA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4DP26JQ 518 0 0
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ACATAATCATCACTTCCATATTGACTATATTATAGAATTCGGTTTATTCATACACACATA
CACACATGAATATATGTGTATGCATAAGTAAGTAGGTGTTGTGATCTTAGATTGTAGTTC
GTGAAAGCAAATCTCGGATTCTTCGAGCGGTCTCTTTCTCGGTCAGTATTTCTTCTCTTC
TTCTCTCGTATGCCTCGAAGAACTCTTTGTTCTCTTTCTCTAGCTCCTTCCACACCGTGG
AAGTGATGATAGGGTTGATATTAGCATGCTTGAACAGAGCATCCATACACTCTTCTTTGC
CCATGTTGAAGACTATACATTCTTCTATCAAATGATGCACCAAATGGATGTAAGATGCTT
GTGAGCTGCTATGATCACCCATGATATGATAGTGATTTAAGGAGTAGTTTGGTATGTAGA
GAAGCAAATAGAGAGATGATGAAGAAAGGGAGAAAAAA

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL5353Contig1 1196 2 4 U
GGATATACGTGCGAACCTCTTCTCGCAGAAAAAAACCCTAAATTTATTTGATCTATCCCA
ACATGGAAATTACTTTTTGCTTTAATGAAAACGACAGAGCCGCCGTTACAATTAACATTC
CGTCTGGTGGTGGATTCACAGTTAACTTTAACCCCGTTGCCCGACGCGTTCCACCTTCTG
GGGGCCGATTAAACGACAATGGATCCCATGTTCATCCACAGGCTTCTAGTGGGTTCACAA
TTAACGTTAACCCTAATGGCCTACCCGTACCACCTGCGAATGGTGGATTAAACGTCAACG
GAACCCATGTTCATCCTGAAAACCCTAAACTCTCTGATCCATCTATGAAAATGGCTAACC
CTAGGGTTTTCTTTGATATGACCGTGGGCGGCAAACCAGCTGGTCGGATCGTGATGGAAC
TCTTTGCCGATACGATACCACGGACGGCAGAGAACTTCCGTGCCCTCTGTACGGGGGAGA
AAGGCATTGGCAAGTTTGGTAAGCCACTCCACTACAAGGGAACAATCTTCCACAAGGTAT
TTCCCAATTATACCTTGTGTGGAGGAAATATCATTGGTGGCCGGGAGGAACCAGGAGGCG
AATGTATCTACGGAAGTAGGTTTTTTGACGACGAGAACTTCATCAAGACGCACAGCGGTC
CAGGTATCCTCACCATGTGGAATTGTAGAGAAAACACCAACGGTTCTGAGTTCATGATCT
GCTTGAGGAGGATCGAGGAATTCGACGGCGGGTGCGTCGTGTTTGGCCAAGTGGTTGAGG
GAATGGATGTGATTCAGAACATTGAGAAAGAGGCCGGCCGACCTGATCATAGCGGCGTGC
CTAAAAAGCTCGTGGTGATCGCCGACTGCGGTCAAATTTCCTAGGTCTCGGAGATTTTTA
TCCTTTTGTTTTCATGTTTTGTGTGTCTTCGTTCTTGGTGTGTTTCACTCTAGTTTGGAT
TAGCTACCATCGAATAAGAATAAGGAATGATACCACCATAAATCGTTAGCTATTATTGCT
ACTACTAGAACAAACTTCCAAAGGATGTTTTGAGCGTTGTTATAATCACAAGTGTTTTTA
ATGATGGTTCTTATTAGAGTCACATCTTTAGCTTTAGGCCGACATGAAAATTCTGGCGGC
TTTAAGCTGTTAAAATATAAAGTTAAGTATTGGTTATAAGATGATTGTTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EV82TF U 1
AF RR4EV82JQ C 411
BS 1 619 RR4EV82TF
BS 620 620 RR4EV82JQ
BS 621 693 RR4EV82TF
BS 694 1196 RR4EV82JQ

RD RR4EV82TF 697 0 0
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ACATGGAAATTACTTTTTGCTTTAATGAAAACGACAGAGCCGCCGTTACAATTAACATTC
CGTCTGGTGGTGGATTCACAGTTAACTTTAACCCCGTTGCCCGACGCGTTCCACCTTCTG
GGGGCCGATTAAACGACAATGGATCCCATGTTCATCCACAGGCTTCTAGTGGGTTCACAA
TTAACGTTAACCCTAATGGCCTACCCGTACCACCTGCGAATGGTGGATTAAACGTCAACG
GAACCCATGTTCATCCTGAAAACCCTAAACTCTCTGATCCATCTATGAAAATGGCTAACC
CTAGGGTTTTCTTTGATATGACCGTGGGCGGCAAACCAGCTGGTCGGATCGTGATGGAAC
TCTTTGCCGATACGATACCACGGACGGCAGAGAACTTCCGTGCCCTCTGTACGGGGGAGA
AAGGCATTGGCAAGTTTGGTAAGCCACTCCACTACAAGGGAACAATCTTCCACAAGGTAT
TTCCCAATTATACCTTGTGTGGAGGAAATATCATTGGTGGCCGGGAGGAACCAGGAGGCG
AATGTATCTACGGAAGTAG*TTTTTTGACGACGAGAACTTCATCAAGACGCACAGCGGTC
CAGGTATCCTCACCATGTGGAATTGTAGAGAAA
CACC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4EV82JQ 786 0 0
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ACGGGGGAGAAAGGCATTGGCAAGTTTGGTAAGCCACTCCACTACAAGGGAACAATCTTC
CACAAGGTATTTCCCAATTATACCTTGTGTGGAGGAAATATCATTGGTGGCCGGGAGGAA
CCAGGAGGCGAATGTATCTACGGAAGTAGGTTTTTTGACGACGAGAACTTCATCAAGACG
CACAGCGGTCCAGGTATCCTCACCATGTGGAATTGTAGAGAAAACACCAACGGTTCTGAG
TTCATGATCTGCTTGAGGAGGATCGAGGAATTCGACGGCGGGTGCGTCGTGTTTGGCCAA
GTGGTTGAGGGAATGGATGTGATTCAGAACATTGAGAAAGAGGCCGGCCGACCTGATCAT
AGCGGCGTGCCTAAAAAGCTCGTGGTGATCGCCGACTGCGGTCAAATTTCCTAGGTCTCG
GAGATTTTTATCCTTTTGTTTTCATGTTTTGTGTGTCTTCGTTCTTGGTGTGTTTCACTC
TAGTTTGGATTAGCTACCATCGAATAAGAATAAGGAATGATACCACCATAAATCGTTAGC
TATTATTGCTACTACTAGAACAAACTTCCAAAGGATGTTTTGAGCGTTGTTATAATCACA
AGTGTTTTTAATGATGGTTCTTATTAGAGTCACATCTTTAGCTTTAGGCCGACATGAAAA
TTCTGGCGGCTTTAAGCTGTTAAAATATAAAGTTAAGTATTGGTTATAAGATGATTGTTT
CTTTCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5354Contig1 539 2 1 U
GGACAATTCCCGAACCCTCTCATCTCCGAAGATACTCAGTATGGCTTCATCAACAGCTCT
GGTTTGTGAGACCCAGGCTTGGAAGGATTTGAAGGGTCATGTTGAAGATGTTAACAAGAC
TCATTTGCGTGATTTGATGAGTGATGCACACAGATGCGAGTCCATGATGTTGGAATTTGA
GGGGCTGCTGTTGGATTATTCTCGACAGCGTGCAACTGTGGAGACAATGGACAAGCTTCT
GAACTTGGCTAAGGCTGCACGGTTGTCAGAGAAGATTAGCCGCATGTTCAACGGGGAGCA
TATTAACAGTACGGAGAACAGGTCAGTGCTTCATGTTGCACTCCGTGCTCCAAAGGATGC
AGTTATCAAGGCCGATGGGAAGAATGTAGTCCCAGAGGTGTGGAGCGTTTTAGACAAGAT
CAAGGATTTTTCTGAGAAGATTCGCTCTGGTTCATGGGTTGGAGCCACTGGGAAACCGCT
GAAAGATGTCATTGCAATTGGTATTGGTGGAAGCTTCTTAGGTCCACTTTTTGTGCACA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ83TF U 1
AF RR4GK73TF U 1
BS 1 539 RR4GJ83TF

RD RR4GJ83TF 539 0 0
GGACAATTCCCGAACCCTCTCATCTCCGAAGATACTCAGTATGGCTTCATCAACAGCTCT
GGTTTGTGAGACCCAGGCTTGGAAGGATTTGAAGGGTCATGTTGAAGATGTTAACAAGAC
TCATTTGCGTGATTTGATGAGTGATGCACACAGATGCGAGTCCATGATGTTGGAATTTGA
GGGGCTGCTGTTGGATTATTCTCGACAGCGTGCAACTGTGGAGACAATGGACAAGCTTCT
GAACTTGGCTAAGGCTGCACGGTTGTCAGAGAAGATTAGCCGCATGTTCAACGGGGAGCA
TATTAACAGTACGGAGAACAGGTCAGTGCTTCATGTTGCACTCCGTGCTCCAAAGGATGC
AGTTATCAAGGCCGATGGGAAGAATGTAGTCCCAGAGGTGTGGAGCGTTTTAGACAAGAT
CAAGGATTTTTCTGAGAAGATTCGCTCTGGTTCATGGGTTGGAGCCACTGGGAAACCGCT
GAAAGATGTCATTGCAATTGGTATTGGTGGAAGCTTCTTAGGTCCACTTTTTGTGCACA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR4GK73TF 517 0 0
GGACAATTCCCGAACCCTCTCATCTCCGAAGATACTCAGTATGGCTTCATCAACAGCTCT
GGTTTGTGAGACCCAGGCTTGGAAGGATTTGAAGGGTCATGTTGAAGATGTTAACAAGAC
TCATTTGCGTGATTTGATGAGTGATGCACACAGATGCGAGTCCATGATGTTGGAATTTGA
GGGGCTGCTGTTGGATTATTCTCGACAGCGTGCAACTGTGGAGACAATGGACAAGCTTCT
GAACTTGGCTAAGGCTGCACGGTTGTCAGAGAAGATTAGCCGCATGTTCAACGGGGAGCA
TATTAACAGTACGGAGAACAGGTCAGTGCTTCATGTTGCACTCCGTGCTCCAAAGGATGC
AGTTATCAAGGCCGATGGGAAGAATGTAGTCCCAGAGGTGTGGAGCGTTTTAGACAAGAT
CAAGGATTTTTCTGAGAAGATTCGCTCTGGTTCATGGGTTGGAGCCACTGGGAAACCGCT
GAAAGATGTCATTGCAATTGGTATTGGTGGAAGCTTC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL5355Contig1 1062 2 2 U
GCTACTACCCTCCTCACTAGGTTTGCTTGTCGTGTCGCTCACCTGTTTTGGTGGCGGAGG
AGCTCCTCTTCTCGATCCCCTCGCCTGAGTAAATCCTTCATCACCCTCTAGTACTCGTTG
TTTTGACACTAACTCAGCAGGTACAGACACCTCCTTCTGTATTGTTAGAGCCGCAACTTG
CTCTGCAATTATCCTTGGACATTTATGTACCAAATGTCCATAGATACCACACTTCGAGCA
GATCTCCGATAACCCTTCATACGCCACAAAGTATCTTTCGCCGTTAATCAACACCGTCCC
TTTCAAAGGCTTAGCCAGATTAACCTCCACACAAATTCTCGCAAAGCGAGCTCTTTCATA
ACTCAGTGTTGTCTGGTCCACCCTTATCGGTGTGCCCAATCCCTTAGCGATTCCCATGAG
AATCGATCGATGATAGAAGTTTACTGGGATATTCGTCAACCTGATCCAAACCGGTGTTGT
AATGATATCATCTTTTAGCGGATCAAACTCCGGCGACCAGGCCCTGACCATGAGATAACT
TCCAAACGCTCTCCATGGTCCTCCTGACAACGCCTTCAGATACTCATCTTCTTTCTCAAA
ACGGACCATGAAGAATTGTCGAGGGAGATCCATCACGTACATCGCTCCCTTCGGACTCCA
TAACTCCCTTAACTTCCTGCTCAAGGCAGAGATCGGAACATTCCTTCCCAAAACCCTAAC
AATCATACACTGCTTCCACATCCCATTCATCGCTTCAAGTACCTCGTTCTCAATCGTGAT
CGATGGTTCTCCGTCCTCCCCATTCGGAAATTCTACTCTGAGCCTTCTCGACACAAAACC
ATCATCAATCAAAGTCTCAGGAACCGGCATCCCTCCTGACGTCGTACCCGCCGTCTTTGA
TGCCCACGTGATCCCCTTATCTGGTGGTTCTCCCGGTGGTCTTGATTTCTCCCCCACATC
CATCATGGTTGCGTCGTGGTTCTCGGAATTCAAAACCCTAGTTTCGTCGCCAGTCGCCGT
ATATTTATAACGCATCTTAAAACTACTGAAGGTGCAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AN82TF U 1
AF RR4AN82JQ C 590
BS 1 685 RR4AN82TF
BS 686 1062 RR4AN82JQ

RD RR4AN82TF 690 0 0
GCTACTACCCTCCTCACTAGGTTTGCTTGTCGTGTCGCTCACCTGTTTTGGTGGCGGAGG
AGCTCCTCTTCTCGATCCCCTCGCCTGAGTAAATCCTTCATCACCCTCTAGTACTCGTTG
TTTTGACACTAACTCAGCAGGTACAGACACCTCCTTCTGTATTGTTAGAGCCGCAACTTG
CTCTGCAATTATCCTTGGACATTTATGTACCAAATGTCCATAGATACCACACTTCGAGCA
GATCTCCGATAACCCTTCATACGCCACAAAGTATCTTTCGCCGTTAATCAACACCGTCCC
TTTCAAAGGCTTAGCCAGATTAACCTCCACACAAATTCTCGCAAAGCGAGCTCTTTCATA
ACTCAGTGTTGTCTGGTCCACCCTTATCGGTGTGCCCAATCCCTTAGCGATTCCCATGAG
AATCGATCGATGATAGAAGTTTACTGGGATATTCGTCAACCTGATCCAAACCGGTGTTGT
AATGATATCATCTTTTAGCGGATCAAACTCCGGCGACCAGGCCCTGACCATGAGATAACT
TCCAAACGCTCTCCATGGTCCTCCTGACAACGCCTTCAGATACTCATCTTCTTTCTCAAA
ACGGACCATGAAGAATTGTCGAGGGAGATCCATCACGTACATCGCTCCCTTCGGACTCCA
TAACTCCCTTAACTTCCTGCTCAAG
CAGAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4AN82JQ 473 0 0
TCTTTCTCAAAACGGACCATGAAGAATTGTCGAGGGAGATCCATCACGTACATCGCTCCC
TTCGGACTCCATAACTCCCTTAACTTCCTGCTCAAGGCAGAGATCGGAACATTCCTTCCC
AAAACCCTAACAATCATACACTGCTTCCACATCCCATTCATCGCTTCAAGTACCTCGTTC
TCAATCGTGATCGATGGTTCTCCGTCCTCCCCATTCGGAAATTCTACTCTGAGCCTTCTC
GACACAAAACCATCATCAATCAAAGTCTCAGGAACCGGCATCCCTCCTGACGTCGTACCC
GCCGTCTTTGATGCCCACGTGATCCCCTTATCTGGTGGTTCTCCCGGTGGTCTTGATTTC
TCCCCCACATCCATCATGGTTGCGTCGTGGTTCTCGGAATTCAAAACCCTAGTTTCGTCG
CCAGTCGCCGTATATTTATAACGCATCTTAAAACTACTGAAGGTGCAGTTTCC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL5356Contig1 868 2 6 U
GAGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATGTCTTTATCCAATTCTCTGCCCATAAC
GCGACTTCCTCTGATTACATCACTCAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTTCGTCCTTCTC
ACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTTGTCGCTCCAATTTTTCACAGAGAATTGCTGCATCTGC
CGTCTTCTCAGCTCCTGCCGGCGTCAATGACTCCCTTCCGGCAAGAAACGAGGGCTACAC
TGTTGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCCTCAACAACGGT
AGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACTGGATTGCCTGTAATTGATGA
CGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCATTTC
TGGCCGCTGCCAAAATGAAACCAGCTTGTTTCCTAACGTCGACAGTACCTGGAAAACGTT
CAATGAACTCCAGAATCTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGATGAC
GCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGTTGCTTCT
GGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTTGTGGATTCAGATGGAAAACTGATTGGAATCCT
TACAAGGGGGAACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGTGAAACAGAGAACTGTGA
AACATAGCTAGATAATCCCTTTCAATCTGCCATAGTTAAATAGAAAAATCTGTTGCAAAT
CTGTTCATTCCATTCATGGAAGTATATATAAATGTAAACCCAAACTGGGAATTCAAGACG
TTATTGTGTCGGGTAAAGTCTATTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CH89TF U 1
AF RR4CH89JQ C 119
BS 1 604 RR4CH89TF
BS 605 605 RR4CH89JQ
BS 606 634 RR4CH89TF
BS 635 635 RR4CH89JQ
BS 636 645 RR4CH89TF
BS 646 868 RR4CH89JQ

RD RR4CH89TF 649 0 0
GAGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATGTCTTTATCCAATTCTCTGCCCATAAC
GCGACTTCCTCTGATTACATCACTCAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTTCGTCCTTCTC
ACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTTGTCGCTCCAATTTTTCACAGAGAATTGCTGCATCTGC
CGTCTTCTCAGCTCCTGCCGGCGTCAATGACTCCCTTCCGGCAAGAAACGAGGGCTACAC
TGTTGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCCTCAACAACGGT
AGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACTGGATTGCCTGTAATTGATGA
CGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCATTTC
TGGCCGCTGCCAAAATGAAACCAGCTTGTTTCCTAACGTCGACAGTACCTGGAAAACGTT
CAATGAACTCCAGAATCTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGATGAC
GCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGTTGCTTCT
GGAA*CAAAGTTCCGAAGATTACCAGTTGTGGAT*CAGATGGAAA
CTGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4CH89JQ 750 0 0
TCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTTGTCGCTCCAATTTTTCACAGAGAATTGCTGCATCT
GCCGTCTTCTCAGCTCCTGCCGGCGTCAATGACTCCCTTCCGGCAAGAAACGAGGGCTAC
ACTGTTGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCCTCAACAACG
GTAGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACTGGATTGCCTGTAATTGAT
GACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCATT
TCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACCAGCTTGTTTCCTAACGTCGACAGTACCTGGAAAACG
TTCAATGAACTCCAGAATCTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGATG
ACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGTTGCTT
CTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTTGTGGATTCAGATGGAAAACTGATTGGAATC
CTTACAAGGGGGAACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGTGAAACAGAGAACTGT
GAAACATAGCTAGATAATCCCTTTCAATCTGCCATAGTTAAATAGAAAAATCTGTTGCAA
ATCTGTTCATTCCATTCATGGAAGTATATATAAATGTAAACCCAAACTGGGAATTCAAGA
CGTTATTGTGTCGGGTAAAGTCTATTCTCG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL5357Contig1 1474 2 4 U
GGATCAAAATCAAATTCAATTTGAAAAAACAAAAAGAAAACAAAACAGAGCTTCATAAAG
ATATAAAAGATGGTTGATATGGATTGGAAGAGGAAAATGGTATCATCGGAGCTTGGTTCC
AAGCTCCACGTCACTATTCCGTCCCCGTTCAAGGTCCCTGTATCCTCTCCCATCTCATGC
TCCGATCCATCAGCTTGCTCCGCCTACGAGCTTTACCTCCGTCTCCCCGAGCTGAGAAAG
CTCTGGTCATCACGTGATTTTCCTCGGTGGAACGACGAACCGATTCTCAAACCGGCTCTC
CAAGCTCTGGAGATCACGTTCAGGTTGATCTCAGCCGTTTGTTCCGATACAAGACCGTAC
AACAACAAACGAGAGTGGAGCCGACGGTTGGATTCTCTCGTCACGAATCAGATCCTGCTC
ATAGCAGCCATCTGCGAAGAAGAGGAGGTTGGAGAAGACGATCGAACACCTCCACTCGGA
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TTAGGGAGGAAGATCTTATCCACGATCGATAACGAGATGCGTCGGTGCAAGTACACGCTC
GGACTCGGCGAACAGAACATCGCAGGGAAACCGAATCTCCGGTACGACGCCGTTTGCAGA
CCTAAAGAGATCTACAGCCTCAAGGATAATCCGTACGCGGATCATATAGATAACGAGGAG
AATCAGACTCTCTACGTCATCCACCAGATCCTCGAGTCGTGGATCCACGTTTCCGGAAAC
CTCTTGACACGCGTCGACGCGAGGATCGACGAAGGGAGATTCGGAGACGCGTCGGGGGAC
GTGTTCTTGGTGGAGAGGATCTGGAAGCTGATGGCGGAGATCGAGGATCTTCATATCCTG
ATGGATCCCGAGGATTTTCTGAAGCTGAAGAAGCAGTTACAGATCAAATCCAACGGTCGA
AACGACGCGTTTTGCTTTAGGTCGAGAGGATTAGTGGAGATGATGAGGATGACGAAGGAT
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GTGATCAGACATTCAGACATTGTATGTTACCGTTGACAAAAAAAGAGAAGACATTGTATG
TTACTGAAAATTTTGAAACATTTGATAGTTTATA


BQ
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AF RR4B920TF U 1
AF RR4B920JQ C 641
BS 1 684 RR4B920TF
BS 685 685 RR4B920JQ
BS 686 811 RR4B920TF
BS 812 1474 RR4B920JQ

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ATATAAAAGATGGTTGATATGGATTGGAAGAGGAAAATGGTATCATCGGAGCTTGGTTCC
AAGCTCCACGTCACTATTCCGTCCCCGTTCAAGGTCCCTGTATCCTCTCCCATCTCATGC
TCCGATCCATCAGCTTGCTCCGCCTACGAGCTTTACCTCCGTCTCCCCGAGCTGAGAAAG
CTCTGGTCATCACGTGATTTTCCTCGGTGGAACGACGAACCGATTCTCAAACCGGCTCTC
CAAGCTCTGGAGATCACGTTCAGGTTGATCTCAGCCGTTTGTTCCGATACAAGACCGTAC
AACAACAAACGAGAGTGGAGCCGACGGTTGGATTCTCTCGTCACGAATCAGATCCTGCTC
ATAGCAGCCATCTGCGAAGAAGAGGAGGTTGGAGAAGACGATCGAACACCTCCACTCGGA
GATGGACGTAGTTCTCTAAGTTTACTACCTCACCTAGCCACGTGGCGCAAATCGGAAGCG
TTAGGGAGGAAGATCTTATCCACGATCGATAACGAGATGCGTCGGTGCAAGTACACGCTC
GGACTCGGCGAACAGAACATCGCAGGGAAACCGAATCTCCGGTACGACGCCGTTTGCAGA
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AATCAGACTCTCTACGTCATCCACCAGATCCTCGAGTCGTGGATCCACGTTTCCGGAAAC
CTCTTGACACGCGTCGACGCGAGGATCGACG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4B920JQ 834 0 0
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GGATCCACGTTTCCGGAAACCTCTTGACACGCGTCGACGCGAGGATCGACGAAGGGAGAT
TCGGAGACGCGTCGGGGGACGTGTTCTTGGTGGAGAGGATCTGGAAGCTGATGGCGGAGA
TCGAGGATCTTCATATCCTGATGGATCCCGAGGATTTTCTGAAGCTGAAGAAGCAGTTAC
AGATCAAATCCAACGGTCGAAACGACGCGTTTTGCTTTAGGTCGAGAGGATTAGTGGAGA
TGATGAGGATGACGAAGGATCTGAGGGAGAAGGTTCCCGCGGTGGTTGGTGTTGAGGTGG
ACCCCACGGGAGGTCCGAGGTTGCAGGAGGCGGTTATGAGGCTGTACGCGACGAAGGGAG
AGTGCGATAAGATTCATCTGCTTCAAGGGATGCAGGCAGTGGAGGCGGCTGCTAAGAGGT
TCTTCTTTGCGTATAGGCAGTTGGTGGCGGTGGTGATGGGGAGCGCGGAGACGAGTCAAG
AGTCGTGTGACTCGCTGAGTCAGATATTCATGGAGCCGACGTATTTCCCTAGTCTTGACG
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TTTATTTAAATTAATTTTGTGTGATCAGACATTCAGACATTGTATGTTACCGTTGACAAA
AAAAGAGAAGACATTGTATGTTACTGAAAATTTTGAAACATTTGATAGTTTATA

QA 1 834 1 834
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5359Contig1 719 2 3 U
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CTACTGGTTTCACGGCCCACCGCCGCACCAGTTCTTGATGCGCACACTCACCGGAGTCTC
TCCACCGTTTGATTTCTTGCCTCTCTCCGTCGTCTCATTCGGATCCACCGTCATCGCCGA
GGGCTGCGACGTTGCTAGCTCCATCTCCTGGATTCACGCTTGGACCGTATCGCATGGGAT
AATCACTCAGGTGAGGGAGTACTCCAACACTTCTCTGACGGTTACACGGGTCGGTGACGT
TGTTGCTGGACGGTCTGCGGAGATTGCGCCGTCGCACTGTCCATCAGTGTGGGAAAGTCA
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TTACGTGTTGTTTTCTGGTTGGTTTGTTGTTTATGGGTTGAAGGATTTGTGTGGTTGAAA
CGCGGTGGGGGGTAACGACTTCCTTTTGGCTGTCGCTGGTTCTTCTTTTGTTGGATATTT
GTGCTTAATCGTGAGTTTTGTGTTTTAGTGGGTCAAGCATGGGGAAACTCAACTTGACTT
GTGCGGTTGTGTCGGATGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATGTGCTGTTGGGATATT


BQ
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AF RR4AS05TF U 1
AF RR4AS05JQ C 19
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BS 548 548 RR4AS05JQ
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RD RR4AS05TF 719 0 0
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CTACTGGTTTCACGGCCCACCGCCGCACCAGTTCTTGATGCGCACACTCACCGGAGTCTC
TCCACCGTTTGATTTCTTGCCTCTCTCCGTCGTCTCATTCGGATCCACCGTCATCGCCGA
GGGCTGCGACGTTGCTAGCTCCATCTCCTGGATTCACGCTTGGACCGTATCGCATGGGAT
AATCACTCAGGTGAGGGAGTACTCCAACACTTCTCTGACGGTTACACGGGTCGGTGACGT
TGTTGCTGGACGGTCTGCGGAGATTGCGCCGTCGCACTGTCCATCAGTGTGGGAAAGTCA
GTTCTCGGGTCGGGCTGGAAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCTGGCGATTTGAGGATTTGG
TTGGTATGTTGGTTAAGTAACAGTCACGTCAGGGAATAATAATAACTAAATAAAGGCTGC
TTACGTGTTGTTTTCTGGTTGGTTTGTTGTTTATGGGTTGAAGGATTTGTGTGGTTGAAA
CGCGGTGTGGGGTAACGACTTCCTTTTGGCTGTCGCTGGTTCTTCTTTTGTTGGATATTT
GTGCTTAATCGTGAGTTTTGTGTTTTAGTGGGTCAAGCATGGGGAAACTCAACTTGACTT
GTGCGGTTGTGTCGGATGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATGTGCTGTTGGGATATT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4AS05JQ 701 0 0
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ACCGCCGCACCAGTTCTTGATGCGCACACTCACCGGAGTCTCTCCACCGTTTGATTTCTT
GCCTCTCTCCGTCGTCTCATTCGGATCCACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGTTGCTAG
CTCCATCTCCTGGATTCACGCTTGGACCGTATCGCATGGGATAATCACTCAGGTGAGGGA
GTACTCCAACACTTTTCTGACGGTTACACGGGTCGGTGACGTTGTTGCTGGACGGTTTGC
GGAGATTGCGCCGTCGCACTGTCCATCAGTGTGGGAAAGTCAGTTCTCGGGTCGGGCTGG
AAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCTGGCGATTTGAGGATTTGGTTGGTATGTTGGTTAAGT
AACAGTCACGTCAGGGAATAATAATAACTAAATAAAGGCTGCTTACGTGTTGTTTTCTGG
TTGGTTTGTTGTTTATGGGTTGAAGGATTTGTGTGGTTGAAACGCGGTGGGGGGTAACGA
CTTCCTTTTGGCTGTCGCTGGTTCTTCTTTTGTTGGATATTTGTGCTTAATCGTGAGTTT
TGTGTTTTAGTGGGTCAAGCATGGGGAAACTCAACTTGACTTGTGCGGTTGTGTCGGATG
GTTATGTTATAATTGAAATAAAAATGTGCTGTTGGGATATT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL5360Contig1 755 2 6 U
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CGACATGACAGGATTAAATCTTTTCTTCAAATTACCAATCTGCTCAAGACTCAACCCAAA
AGCTTTCACAAGCAACTCCTCATTGATCCCTGACCCAAAAACCACCGACGGTATCTTCTG
AATCCCGGGGCTTTGGCTATTAAGTCCGCCTAGAATCGTGGCCGTAACATATCCCACGTT
CATCTGAAAATGCACAAGCCCTTTTGGGTACACCATCATCTCTCCTTCTTCCATAACTTT
AGCGTAGACTTTATTGTTAGAGTCCAAAAAACCGGAGTAAACCCGTCCTTTAACCACGTG
GGCTACTTCAGTGGCTCTTGGATGATAATGTGGAGGGTTTATAGCTCCGGGTTTGAGATC
AGCCCGGACAAACGACAAGCCCAAAGTGTTAAGGCCCGGGAAGGTTGTCGGGTTTACGGG
GACTGTGGCTAGACCGGTCTCAGAGAAGTTTCCTGCTTTTTGTAAACCGGAAAAGATGAA
ATCTTTGGTGGTTAGTTCGGAGGAGTTTTTGCATGGGAGGTTTGTGTAGAAGGGATGGTG
ATGAGGAGATGTGATTTGTTTTGGTATACAGAAGTCTTGGATTGGGTCGGGGTCTAAAGC
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TGCTTCCATCTTCTTACTTTGGTTTTGAGGCGTCC


BQ
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AF RR4EB96JQ U 1
AF RR4DQ03TF C 168
BS 1 326 RR4EB96JQ
BS 327 327 RR4DQ03TF
BS 328 655 RR4EB96JQ
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BS 657 665 RR4EB96JQ
BS 666 755 RR4DQ03TF

RD RR4EB96JQ 665 0 0
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CGACATGACAGGATTAAATCTTTTCTTCAAATTACCAATCTGCTCAAGACTCAACCCAAA
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AATCCCGGGGCTTTGGCTATTAAGTCCGCCTAGAATCGTGGCCGTAACATATCCCACGTT
CATCTGAAAATGCACAAGCCCTTTTGGGTACACCATCATCTCTCCTTCTTCCATAACTTT
AGCGTAGACTTTATTGTTAGAGTCCACAAAACCGGAGTAAACCCGTCCTTTAACCACGTG
GGCTACTTCAGTGGCTCTTGGATGATAATGTGGAGGGTTTATAGCTCCGGGTTTGAGATC
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GACTGTGGCTAGACCGGTCTCAGAGAAGTTTCCTGCTTTTTGTAAACCGGAAAAGATGAA
ATCTTTGGTGGTTAGTTCGGAGGAGTTTTTGCATGGGAGGTTTGTGTAGAAGGGATGGTG
ATGAGGAGATGTGATTTGTTTTGGTATACAGAAGTCTTGGATTGGGTCGGGGTCTGAAGC
TAATG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4DQ03TF 588 0 0
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CATATCCCACGTTCATCTGAAAATGCACAAGCCCTTTTGGGTACACCATCATCTCTCCTT
CTTCCATAACTTTAGCGTAGACTTTATTGTTAGAGTCCAAAAAACCGGAGTAAACCCGTC
CTTTAACCACGTGGGCTACTTCAGTGGCTCTTGGATGATAATGTGGAGGGTTTATAGCTC
CGGGTTTGAGATCAGCCCGGACAAACGACAAGTCCAAAGTGTTAAGGCCCGGGAAGGTTG
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CGGAAAAGATGAAATCTTTG*TGGTTAGTTCGGAGGAGTTTTTGCATGGGAGGTTTGTGT
AGAAGGGATGGTGATGAGGAGATGTGATTTGTTTTGGTATACAGAAGTCTTGGATTGGGT
CGGGGTCTAAAGCTAATGTGAAGCAGACTTTGAAACATACAAGAAGTAAAGCTTTTATTA
GAAACATAGTGTTTGCTTCCATCTTCTTACTTTGGTTTTGAGGCGTCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL5361Contig1 960 2 2 U
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CGAGGGATACTGTATCTTCATCACGATTCACGTCTGAAAATCATACATCGTGACCTCAAA
GCGAGTAACATCCTCTTAGATGCTGACATGAACCCAAAAATTGCTGATTTTGGAATGGCA
AGGATATTTGGAATGGACCAAACTGTGGCCAATACAGCAAGAGTAGTTGGGACCTTCGGT
TACATGGCTCCTGAATATGTGACACATGGTCAATTCTCGACGAAATCAGATGTCTACAGC
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GATGTTTTAGTTAACAATTTAGTCACATATGTGTGGAGACTATGGGAGAGAAAATCATTG
CTTGAGGTCATAGATCCTTGTATTAGAGAAGACTGTAAAAGTGATGAAGTAACTAGATAC
ATCCATATTGGGCTATTATGTGTTCAAGAAAATCCAGCAAAACGTCCAACAATGTCAATG
ATTCATCAAATGCTCACAACTAGCTCGATTGCATTACCTGCCCCTCTGCCACCTGGTTTT
TTTTTCAGGAATGAACCAAGATCAAACCCATCAACCCAGGGATTAATGACTGGTCAAACA
AGCAGCAAGTGTATTACTTGTTCAGTAGATGAAGCAACAATCACTGATGTTAATCCTCGT
TGAATACTTAACATTTCCTGTTTGGTTTATGTTGTTAATTTCCACAAATTGTTGTCTTGT
CACTAATTTTGTGTATACATACATGAAAAGTATTAAGAGTCATTTTCAGATTGAAGGAAT
ATTTAGTACAGAAACTTCATGCTTTTTGAAAGACTTGCAATAAATACATAAATTTGGTGC


BQ
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AF RR4F116TF U 1
AF RR4F116JQ C 464
BS 1 662 RR4F116TF
BS 663 960 RR4F116JQ

RD RR4F116TF 664 0 0
GAGAAGTTACTAGTCTATGAGTTTGTTCCTAACAAAAGCCTCGATTATTTCCTTTTCGAC
CCTAAAAAGAGAATTCAGTTGGATTGGGGAGTGCGGCACAACATCATTCTTGGGATTACA
CGAGGGATACTGTATCTTCATCACGATTCACGTCTGAAAATCATACATCGTGACCTCAAA
GCGAGTAACATCCTCTTAGATGCTGACATGAACCCAAAAATTGCTGATTTTGGAATGGCA
AGGATATTTGGAATGGACCAAACTGTGGCCAATACAGCAAGAGTAGTTGGGACCTTCGGT
TACATGGCTCCTGAATATGTGACACATGGTCAATTCTCGACGAAATCAGATGTCTACAGC
TTTGGAGTATTGATGCTTGAGATCATCAGTGGCAAAAAGAATAGCAGCTTCTGCCATATG
GATGTTTTAGTTAACAATTTAGTCACATATGTGTGGAGACTATGGGAGAGAAAATCATTG
CTTGAGGTCATAGATCCTTGTATTAGAGAAGACTGTAAAAGTGATGAAGTAACTAGATAC
ATCCATATTGGGCTATTATGTGTTCAAGAAAATCCAGCAAAACGTCCAACAATGTCAATG
ATTCATCAAATGCTCACAACTAGCTCGATTGCATTACCTGCCCCTCTGCCACCTGGTTTT
TT
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4F116JQ 497 0 0
GGGAGAGAAAATCATTGCTTGAGGTCATAGATCCTTGTATTAGAGAAGACTGTAAAAGTG
ATGAAGTAACTAGATACATCCATATTGGGCTATTATGTGTTCAAGAAAATCCAGCAAAAC
GTCCAACAATGTCAATGATTCATCAAATGCTCACAACTAGCTCGATTGCATTACCTGCCC
CTTTGCCACCTGGTTTTTTTTTCAGGAATGAACCAAGATCAAACCCATCAACCCAGGGAT
TAATGACTGGTCAAACAAGCAGCAAGTGTATTACTTGTTCAGTAGATGAAGCAACAATCA
CTGATGTTAATCCTCGTTGAATACTTAACATTTCCTGTTTGGTTTATGTTGTTAATTTCC
ACAAATTGTTGTCTTGTCACTAATTTTGTGTATACATACATGAAAAGTATTAAGAGTCAT
TTTCAGATTGAAGGAATATTTAGTACAGAAACTTCATGCTTTTTGAAAGACTTGCAATAA
ATACATAAATTTGGTGC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5363Contig1 1088 2 2 U
ATATGATCTTCTGCGGTGTATTTGACGGCCACGGCCCGATGGGTCACAAGATCTCTCGTC
ACATATGTGATAGTCTACCTTCAAGGGTCCATTCGAGAATCAGATCTGGCGGCAATGATA
ATAATAATAATTCAAAGAGTCAGGAGGGTCTGTTGGAGGAAGTGCTAGTGACATTCTTCA
AGCAAATAGACAGCGAACTTGGTCTTGACTCTCCTTATGATAGTTTTTGCAGCGGCACAA
CTGCTGTTACCGTCCTTAAACAGGGTGACTGCTTGGTGATCGCCAACTTGGGAGATTCAC
GAGCAGTTCTAGGCACCCGTGGAAGCAAGAACAATCTCAAAGCTGTCCAACTCACGGTTG
ATCTGAAACCCTGTGTCCAACGCGAAGCAGAGAGAATAGTAGCATGCAAAGGAAGGGTGT
TTGCGATGGAAGAGGAACCTGATGTGTATAGAGTCTGGATGCCTGATGATGATTGCCCTG
GACTCGCAATGTCAAGGGCTTTTGGTGATTTCTGCCTCAAAGACTATGGACTTCTCTGCG
TTCCTGAGGTCTATTTCAGAAATGTCAGTAGAGAAGACGAGTTTGTGGTTCTAGCCACCG
ATGGGGTAATAACAACACTTCGAACGAGTTTTCAGTTTTTTCTTTTTCCAATCAATGAAA
GCAAGACTCTCTTCTATTCTTCGGTGAACAGATTTGGGATGTTTTGTCAAACGAAGAAGT
GGTGAAGATTGTGGGTTCCTGCAAGGACAGGTCAGTGGCAGCAGAGACGTTGGTTCAGAG
AGCAGCTCGGACATGGAGAACGAAGTTTCCAACTTCTAAAGCTGATGACTGCGCCGTGGT
GGTGCTTTACCTGAACCACCGGCCATATCCAAGAGAAGGGAACGTGAGCAGAGCGGTATC
GACTATATCTTGGAGATCAGGTAAGAGCAATAAAGAGTGAGTGTTATGGAGTCGCACCTT
TGTCGCCACAGCAGAGTCTACCGCAAAAGTAGGATATGATGGTTTGAACCTGTTGAGTGT
CGATGCTACTCAACTTGGCTTTTATTTGTGTATAAAATAACTTTTTTTCTTCTGTATCTT
GACTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A863TF U 1
AF RR4A863JQ C 261
BS 1 741 RR4A863TF
BS 742 1088 RR4A863JQ

RD RR4A863TF 741 0 0
ATATGATCTTCTGCGGTGTATTTGACGGCCACGGCCCGATGGGTCACAAGATCTCTCGTC
ACATATGTGATAGTCTACCTTCAAGGGTCCATTCGAGAATCAGATCTGGCGGCAATGATA
ATAATAATAATTCAAAGAGTCAGGAGGGTCTGTTGGAGGAAGTGCTAGTGACATTCTTCA
AGCAAATAGACAGCGAACTTGGTCTTGACTCTCCTTATGATAGTTTTTGCAGCGGCACAA
CTGCTGTTACCGTCCTTAAACAGGGTGACTGCTTGGTGATCGCCAACTTGGGAGATTCAC
GAGCAGTTCTAGGCACCCGTGGAAGCAAGAACAATCTCAAAGCTGTCCAACTCACGGTTG
ATCTGAAACCCTGTGTCCAACGCGAAGCAGAGAGAATAGTAGCATGCAAAGGAAGGGTGT
TTGCGATGGAAGAGGAACCTGATGTGTATAGAGTCTGGATGCCTGATGATGATTGCCCTG
GACTCGCAATGTCAAGGGCTTTTGGTGATTTCTGCCTCAAAGACTATGGACTTCTCTGCG
TTCCTGAGGTCTATTTCAGAAATGTCAGTAGAGAAGACGAGTTTGTGGTTCTAGCCACCG
ATGGGGTAATAACAACACTTCGAACGAGTTTTCAGTTTTTTCTTTTTCCAATCAATGAAA
GCAAGACTCTCTTCTATTCTTCGGTGAACAGATTTGGGATGTTTTGTCAAACGAAGAAGT
GGTGAAGATTGTGGGTTCCTG

QA 1 741 1 741
DS 

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GGAAGCAAGAACAATCTCAAAGCTGTCCAACTCACGGTTGATCTGAAACCCTGTGTCCAA
CGCGAAGCAGAGAGAATAGTAGCATGCAAAGGAAGGGTGTTTGCGATGGAAGAGGAACCT
GATGTGTATAGAGTCTGGATGCCTGATGATGATTGCCCTGGACTCGCAATGTCAAGGGCT
TTTGGTGATTTCTGCCTCAAAGACTATGGACTTCTCTGCGTTCCTGAGGTCTATTTCAGA
AATGTCAGTAGAGAAGACGAGTTTGTGGTTCTAGCCACCGATGGGGTAATAACAACACTT
CGAACGAGTTTTCAGTTTTTTCTTTTTCCAATCAATGAAAGCAAGACTCTCTTCTATTCT
TCGGTGAACAGATTTGGGATGTTTTGTCAAACGAAGAAGTGGTGAAGATTGTGGGTTCCT
GCAAGGACAGGTCAGTGGCAGCAGAGACGTTGGTTCAGAGAGCAGCTCGGACATGGAGAA
CGAAGTTTCCAACTTCTAAAGCTGATGACTGCGCCGTGGTGGTGCTTTACCTGAACCACC
GGCCATATCCAAGAGAAGGGAACGTGAGCAGAGCGGTATCGACTATATCTTGGAGATCAG
GTAAGAGCAATAAAGAGTGAGTGTTATGGAGTCGCACCTTTGTCGCCACAGCAGAGTCTA
CCGCAAAAGTAGGATATGATGGTTTGAACCTGTTGAGTGTCGATGCTACTCAACTTGGCT
TTTATTTGTGTATAAAATAACTTTTTTTCTTCTGTATCTTGACTCCTT

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL5364Contig1 1068 2 16 U
GGGGTCGTGCTGCTTCCCACATTACCCTTGAGTGTGCTTTACAAACTCACCCAAACATAA
CCATTATTGGAGAGGAGGTGTCTGCTCAGAAGCAGACTTTGAAGAACGTCACGGATTACA
TGGTTGATGTTATCTGCAAGCGTGCTGACCTTGGTTACAACTACGGTGTTATTCTAATTC
CAGAAGGTCTGATCGATTTCATTCCCGAGGTTCAGGAGCTGATCGCAGAACTGAACGAAA
TTCTGGCAAATGAGGTGGTTGATGAAAGTGGAGAGTGGAAGAAGAAGCTCACCGAGCAAT
CCCTGAAGCTGTTTGATCTTCTGCCTGAAGCGATTCAGGAACAGCTGATGCTCGAGAGAG
ACCCACACGGAAATGTCCAGGTGGCCAAGATTGAGACTGAGAAGATGCTTATTCAAATGG
TTGAAACTGAATTGGAGAAAAGAAAGGAAGCTGGTTCATACAAGGGACAATTCATGGGCC
AGTCTCATTTCTTTGGGTATGAAGGAAGATGCGGTTTGCCTACAAACTTTGACGCCACCT
ACTGTTATGCACTTGGTTATGGCGCTGGAATGCTCCTCAACAGTGGGAAGACCGGACTGA
TTTCTTCGGTGGGGAACTTGGCTGCTCCTGTGGAAGAATGGACTGTAGGTGGAACTGCTC
TCACAGCCTTGATGGATGTCGAGAGGAGACACGGTAAGTTCAAGCCTGTGATCAAGAAAG
CAATGGTGGAACTTGAAGGTGCACCGTTTAAGAAATTCGCATCGCTGCGTGAGGAATGGG
CTTTGAAGAACCGATACATCAGCCCTGGTCCAATCCAATTCACGGGACCTGGTTCAGATG
CTCTCAGCCACACACTACTCCTTGAACTCGGGGCTCAATAACCTCTCGAGCAACCGGCTT
TCCTTTCATTCTACATCTCGATTTTCTGCTTTCCTTGGGACTTCTCTTTTTTTTCTTTTA
TCTTGAAACCTACATGTCTCCATCTTACCGTTAAGCTTTCGTCACTCTAAATGTTTTTTC
CTTCTGTTGTGTTTTCACATATATATCATAATATGGAGCCTACATCTG


BQ
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AF RR4AL81TF U 1
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RD RR4AL81TF 940 0 0
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TTGAAACTGAATTGGAGAAAAGAAAGGAAGCTGGTTCATACAAGGGACAATTCATGGGCC
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TCACAGCCTTGATGGATGTCGAGAGGAGACACGGTAAGTTCAAGCCTGTGATCAAGAAAG
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QA 1 940 1 940
DS 

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TTATGCACTTGGTTATGGCGCTGGAATGCTCCTCAACAGTGGGAAGACCGGACTGATTTC
TTCGGTGGGGAACTTGGCTGCTCCTGTGGAAGAATGGACTGTAGGTGGAACTGCTCTCAC
AGCCTTGATGGATGTCGAGAGGAGACACGGTAAGTTCAAGCCTGTGATCAAGAAAGCAAT
GGTGGAACTTGAAGGTGCACCGTTTAAGAAATTCGCATCGCTGCGTGAGGAATGGGCTTT
GAAGAACCGATACATCAGCCCTGGTCCAATCCAATTCACGGGACCTGGTTCAGATGCTCT
CAGCCACACACTACTCCTTGAACTCGGGGCTCAATAACCTCTCGAGCAACCGGCTTTCCT
TTCATTCTACATCTCGATTTTCTGCTTTCCTTGGGACTTCTCTTTTTTTTCTTTTATCTT
GAAACCTACATGTCTCCATCTTACCGTTAAGCTTTCGTCACTCTAAATGTTTTTTCCTTC
TGTTGTGTTTTCACATATATATCATAATATGGAGCCTACATCTG

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL5365Contig1 1075 2 4 U
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TGTAGGGCCAAAGGATCTTCCGATAATCTCAAGAGCAGGAGGAAGATTGTTCGGACGAGC
GATTGGTTACATCCAAATGGCTCGTGGCCACATAGACGGTGTCATGAAACAACCTCAAAT
GCAGCAGATTTCGAAAGAAGTTCAAGATTTGCGAGCACAAGTTGATGCTATTAGCCATGG
AGCAAGTTTCTCTCTCTTTAACTCCAATCCTTTGACTCGAAGAGTGGACAACCATTCTCC
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CAAGGTTGCAGATCATTGGACAAAGGCTCAAGAGTTTAGTGGTTCGTCAACGGCTTCAGT
TAATCCACGCCCAAGCAACAGCGTTTGAACGTTTATCTGAGTCTGTAAGTGGCAGAACTC
ACACTATAACTAGTGATTCACCTGTTCTTCCAGTTTCTGCTCAGATGGCAAAGTTGCTCC
CTCATCGCAAAGAGAGTGCAAAAGGATCTGATTTAATGCTGGAGGCTGTTCTTGAAGCTG
AAGTAGCACACAAAGCCAAACACTTTTTTGCACAAGCCGAAAAGGAAACTCCAGCTTTAA
AAGGGAAGTTTGTTGTTGAAGAGAAAGGAGAAACTTGAAGTCAAGTTTTATGGATCATTG
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CTAACTGGGCCAGAGTCCTGAAATCGGTTTCTGCTCCGGCAACAAGTGAGTTAAACCTGG
CAGAGATAAGTCAGTGATTGATCTTGTAATTTTGGTAAACGATCTTGATTCCTATAATTT
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CGATTATGTATCGACTTCTATTTTCAAGCTTAAAAAGGGGAATGTTCTATTGCCG


BQ
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AF RR4DA81TF U 1
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GCAGCAGATTTCGAAAGAAGTTCAAGATTTGCGAGCACAAGTTGATGCTATTAGCCATGG
AGCAAGTTTCTCTCTCTTTAACTCCAATCCTTTGACTCGAAGAGTGGACAACCATTCTCC
AGAATCTTCTAATACAACCACCAATGGGACTGTTACATCTCCCATTGTTGAGGAAAGACA
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ACACTATAACTAGTGATTCACCTGTTCTTCCAGTTTCTGCTCAGATGGCAAAGTTGCTCC
CTCATCGCAAAGAGAGTGCAAAAGGATCTGATTTAATGCTGGAGGCTGTTCTTGAAGCTG
AAGTAGCACACAAAGCCAAACACTTTTTTGCACAAGCCGAAAAGGAA*CTCCAGCTTTAA
AAGG
AAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4DA81JQ 847 0 0
AACAA
CTCAAATGCAGCAGATT*CGAAAGAAGTTCAAGATTTGCGAGCACAAGTTGATGCTAT*A
GCCATGGAGCAAGTTTCTCTCTCTTTAACTCCAATCCTTTGACTCGAAGAGTGGACAACC
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AAAGACACAAGGTTGCAGATCATTGGACAAAGGCTCAAGAGTTTAGTGGTTCGTCAACGG
CTTCAGTTAATCCACGCCCAAGCAACAGCGTTTGAACGTTTATCTGAGTCTGTAAGTGGC
AGAACTCACACTATAACTAGTGATTCACCTGTTCTTCCAGTTTCTGCTCAGATGGCAAAG
TTGCTCCCTCATCGCAAAGAGAGTGCAAAAGGATCTGATTTAATGCTGGAGGCTGTTCTT
GAAGCTGAAGTAGCACACAAAGCCAAACACTTTTTTGCACAAGCCGAAAAGGAAACTCCA
GCTTTAAAAGGGAAGTTTGTTGTTGAAGAGAAAGGAGAAACTTGAAGTCAAGTTTTATGG
ATCATTGATCAACAAGTCACAAGAAGACACCGGCATAGTCTTTGTTTGTACTTGTAGCCT
GAGAATACTAACTGGGCCAGAGTCCTGAAATCGGTTTCTGCTCCGGCAACAAGTGAGTTA
AACCTGGCAGAGATAAGTCAGTGATTGATCTTGTAATTTTGGTAAACGATCTTGATTCCT
ATAATTTATTCTGCGGCTTTGTAAGTTCTTAGGAATATGAATAAATGTGTGTGATTTAGT
TCTCAGTCGATTATGTATCGACTTCTATTTTCAAGCTTAAAAAGGGGAATGTTCTATTGC
CG

QA 6 847 6 847
DS 



AS 1 2

CO CL5366Contig1 878 2 2 U
TTTTTTTCAGACAAAGACTATTGTTTGTCTGTGTGTAAGGGATGAAGCAATCGTCATGGG
GCTGCACAATCTTCATCCAATTATCGCTCTGTCTCATCGTCTATGTGTCTCTGCATTTGG
GTCACCAATCTTTGTCATCAAACAACAACGGTGACAATGCGGGAGCTCTAGATGTCCATT
TCATCTCCGTCTCCGGTGGATTCAGGCCTCTTCACCGTCAAACTCGTCTTCTCCGATTGA
TGGAGAGAGTTGCGGAAACTTACAAGGCTAAATTTGTGGTGAGGACAAGTGAGCATGGAG
AAGGAGATCTACTATTGCTAAATGATACTCGAGTCTCCTCTTCACTGAAACTTCCATGGT
ACACTATGAAGAAAGGATCTGGGAGTTTCAGAGAGCACATCGAAATGCCTTTTGGTGGAT
CCTTGGATGTTGTTTTCCTAGACCCTTTATTCGCCCATACACTAAGTAATGGTCCGGAGG
AAGCCAAGAGAGTTTCAAAGACATTTCAACAAATCACCATCAAACATGGAGTGAACATGT
ATATAAGCGAAAAGGGCTGTACCATCGGAGCCAACGAAGATAGCTTCACTTGCATTATGG
TTCCCAATACATCAGAGAACCAAGGTTCAACTAATGATAGTAAGAGGGAAGTGGAAGATG
GGTTTTTTCTCCACAGAGTTAGCTTCTCAGAGTTTGTTACTTATACTATCAACTTATCAG
GACAAGTCATAGACACAAGAATCATTAAGCAGAAGGGCAAAGAGTCCATTTAAGATTCTT
TTCATATTCTTATGTGTTTTACTCTCTTCATTGTTGTAAACTCTGTAAAGCACCAACATT
CTTTATTCTTCCTCTAGTGACTGGAATACCCTTTCACC


BQ
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DS 

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AAGCACCAACATTCTTTATTCTTCCTCTAGTGACTGGAATACCCTTTCACC

QA 1 651 1 651
DS 



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TATGCTTGTGTTTTTGATTCAAAACGTTACATTTAGCCGTCAATCAGTGGTTTATTCGAG


BQ
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AF RR4D380TF U 1
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DS 

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GACTGTGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCCTACACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACC
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TATGCTTGTGTTTTTGATTCAAAACGTTACATTTAGCCGTCAATCAGTGGTTTATTCGAG

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

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TGTGTTTTCTTTTTGTTGTTTCCTTCAATGTTATCCTTTTTTTTTTTCCACTTTAGACCT
TAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTG
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CTTGAATTCTTTTTTTCATCACCTCG


BQ
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AF RR4EO16TF U 1
AF RR4EO16JQ C 443
BS 1 671 RR4EO16TF
BS 672 866 RR4EO16JQ

RD RR4EO16TF 671 0 0
CGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAAACG
TTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGC
CAAGACTACTAATGTCCCATGGTTTGCTGTGAGTTTTATTTTCACAATATCCTCTCCTTA
TGTGTTTTCTTTTTGTTGTTTCCTTCAATGTTATCCTTTTTTTTTTTCCACTTTAGACCT
TAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTGTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTG
TTGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAG
TTGTAAAGCATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCACTGATT
GGGCTCTCCAAAAGACTAATCTTCATACCAGGTTTGCTACTACTTACTAAACCGTTTAGC
TAATAAAAAACCTTTGATTATGTAAACTCTTTCTTTCTATGTCTGTCTTGAAGCAGTTTA
AAACAAGAAGAATTCATGGTGGGAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGGTTTCAG
TTTTTCATTGTATCTTCTCAGATCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCGT
GTTGCAAAGGG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4EO16JQ 424 0 0
TCATACCAGGTTTGCTACTACTTACTAAACCGTTTAGCTAATAAAAAACCTTTGATTATG
TAAACTCTTTCTTTCTATGTCTGTCTTGAAGCAGTTTAAAACAAGAAGAATTCATGGTGG
GAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGGTTTCAGTTTTTCATTGTATCTTCTCAGA
TCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGG
TTCAGGAGATCGAGGAGGTTGAGACAGATGAACATCATCAACCAAAAGCACCTATAGAGA
TCATGTCCGTCACTTTGCTTCAAGACATGTGAAAGCTTTATTACTTCTTGTATTGAAAAA
TGCTCCCAAGTGATTCTTGATGTATTAATGGTTTGTAACTTGAATTCTTTTTTTCATCAC
CTCG

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 2

CO CL5369Contig1 482 2 1 U
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TTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTT
CCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTA
CAATTGGAGTGTGAAGGCCATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCT
CCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAGGCTAAGCCAAG
GAACAAGGGAGCGGCTTCATCAGCTTAAACTGTTGTTTGAGTATTCGCAGGGAAAAGAGT
TAAACTTAGTTTTTGGCTTCTGAGTTTGTTCGCAGTACTACAACTATTATTGATCATTTG
ATTAGTAATATCTTTCGTTGTGTTGTTTACTTATTATAAAAAAGTTTTGAACTTGGATGA
AA


BQ
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20 20 

AF RR4AG24JQ C 1
AF RR4AG24TF U 1
BS 1 482 RR4AG24TF

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TTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTT
CCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTA
CAATTGGAGTGTGAAGGCCATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCT
CCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAGGCTAAGCCAAG
GAACAAGGGAGCGGCTTCATCAGCTTAAACTGTTGTTTGAGTATTCGCAGGGAAAAGAGT
TAAACTTAGTTTTTGGCTTCTGAGTTTGTTCGCAGTACTACAACTATTATTGATCATTTG
ATTAGTAATATCTTTCGTTGTGTTGTTTACTTATTATAAAAAAGTTTTGAACTTGGATGA
AA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4AG24TF 482 0 0
GGGACTTCTCAGAGACCTAAGTTATTTCGCATCCTCTGCAATGACGAAGGGAACGGGGAG
TTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTT
CCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTA
CAATTGGAGTGTGAAGGCCATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCT
CCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAGGCTAAGCCAAG
GAACAAGGGAGCGGCTTCATCAGCTTAAACTGTTGTTTGAGTATTCGCAGGGAAAAGAGT
TAAACTTAGTTTTTGGCTTCTGAGTTTGTTCGCAGTACTACAACTATTATTGATCATTTG
ATTAGTAATATCTTTCGTTGTGTTGTTTACTTATTATAAAAAAGTTTTGAACTTGGATGA
AA

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL5370Contig1 1165 2 4 U
GGGTTCGACGCGCACTGTCACCTTCAAGACCCCAGGATCATCAGCAAAGCTCCTCAGCTC
ATCTCCTCCGCTGTAGCTTCCGGCGTCTCTGCCTTCGCCGTCAATGGAGTCTCCGAGAAA
GATTGAAACTTGGTCAAAGAGATGGGTGCGAAATACCCTTCTGTTGTTCCCTGCTTTGGT
ATCCATCCATGAGAGAAGTCCTCAATGGTTTGAGACGTTGAAGAGCTTGTTTGAGACCAC
TCCTAGTGCTGCTGTTGGAGAAATTGGTTTGGACAAAGGGTCTAAAGGAAGGGAGATTGA
TTTCTCAGACCAGGTTGGAGTGTTTCGTCAACAGCTCGAACTTGCAAAGGAATTGAATAA
ACCTGCGTCGATCCACTGTGTCCGTGCGTTCGGTGATCTACTTGAGATAACAAAATCTGT
GGGGCCTTTTCCTGCTGGACTCATCCTTCACTCCTACTTGGGCTCAGCTGAGATGGTTCC
TGAGTTTGCAAAGCTCGGTGCATACTTCTCCTTCTCTGGCTTTCTCATGTCCATGAGTGA
GAAGAAAGCCAAGAAGATGTTGAAAGCTGTTCCTTCTGATAGGATCTTATTAGAGACTGA
TTCGCCCGATGCGTTACCAAAGTCAGAGTCAGGGACTCTCTACTTTGTAGAAAGAGATCC
TTCTCTGCCGGAAGAAGGAAACTCATCTCAGGATGTCGAGTCTAATGCTTCCACTGGTGG
TGGCTCCATGAAGTTGCCGAAGGAAACACTTAATCACCCTGCTAATATTCACACCGTACT
CGAGTATGTAGCAAAGTTGTTGGACGTGAAGAACGAAGAACTCGCGGAACTAAGCTATGG
AAACGCTGTTCGGTTGTTCTCTTACTCAGGTTCGAAGCTGCTTCTTGAGACAGGTGCTGC
TGATGTCTCCCTTCACACTCAAAACCATTCCACAACACCGTCATGAGTTCTTAAGTCATT
GTAGTCATGTTTTTCATTACTCTGTTACAAGTCTTTGAAGTTTGAATAGTGTTGTAGACT
CACACTTCTCTTCGTATAAGACCTTTTATAACTATGTGAAAATTGAAATTTGACTTCATA
TATGTAAAAAATGTATTTTGTTACCGCACCTGTGTGGATTCGTTTGATGATGTTATTTGT
GTCATTATTTTTGTTTTTTGTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ95TF U 1
AF RR4DJ95JQ C 303
BS 1 633 RR4DJ95TF
BS 634 634 RR4DJ95JQ
BS 635 670 RR4DJ95TF
BS 671 1165 RR4DJ95JQ

RD RR4DJ95TF 670 0 0
GGGTTCGACGCGCACTGTCACCTTCAAGACCCCAGGATCATCAGCAAAGCTCCTCAGCTC
ATCTCCTCCGCTGTAGCTTCCGGCGTCTCTGCCTTCGCCGTCAATGGAGTCTCCGAGAAA
GATTGAAACTTGGTCAAAGAGATGGGTGCGAAATACCCTTCTGTTGTTCCCTGCTTTGGT
ATCCATCCATGAGAGAAGTCCTCAATGGTTTGAGACGTTGAAGAGCTTGTTTGAGACCAC
TCCTAGTGCTGCTGTTGGAGAAATTGGTTTGGACAAAGGGTCTAAAGGAAGGGAGATTGA
TTTCTCAGACCAGGTTGGAGTGTTTCGTCAACAGCTCGAACTTGCAAAGGAATTGAATAA
ACCTGCGTCGATCCACTGTGTCCGTGCGTTCGGTGATCTACTTGAGATAACAAAATCTGT
GGGGCCTTTTCCTGCTGGACTCATCCTTCACTCCTACTTGGGCTCAGCTGAGATGGTTCC
TGAGTTTGCAAAGCTCGGTGCATACTTCTCCTTCTCTGGCTTTCTCATGTCCATGAGTGA
GAAGAAAGCCAAGAAGATGTTGAAAGCTGTTCCTTCTGATAGGATCTTATTAGAGACTGA
TTCGCCCGATGCGTTACCAAAGTCAGAGTCAGG*ACTCTCTACTTTGTAGAAAGAGATCC
TTCTCTGCCG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4DJ95JQ 863 0 0
TCTCAGACCAGGTTGGAGTGTTTCGTCAACAGCTCGAACTTGCAAAGGAATTGAATAAAC
*TGCGTCGATCCACTGTGTCCGTGCGTTCGGTGATCTACTTGAGATAACAAAATCTGTGG
GGCCTTTTCC*GCTGGACTCATCCTTCACTCCTACTTGGGCTCAGCTGAGATGGTTCCTG
AGTTTGCAAAGCTCGGTGCATACTTCTCCTTCTCTGGCTTTCTCATGTCCATGAGTGAGA
AGAAAGCCAAGAAGATGTTGAAAGCTGTTCCTTCTGATAGGATCTTATTAGAGACTGATT
CGCCCGATGCGTTACCAAAGTCAGAGTCAGGGACTCTCTACTTTGTAGAAGGAGATCCTT
CTCTGCCGGAAGAAGGAAACTCATCTCAGGATGTCGAGTCTAATGCTTCCACTGGTGGTG
GCTCCATGAAGTTGCCGAAGGAAACACTTAATCACCCTGCTAATATTCACACCGTACTCG
AGTATGTAGCAAAGTTGTTGGACGTGAAGAACGAAGAACTCGCGGAACTAAGCTATGGAA
ACGCTGTTCGGTTGTTCTCTTACTCAGGTTCGAAGCTGCTTCTTGAGACAGGTGCTGCTG
ATGTCTCCCTTCACACTCAAAACCATTCCACAACACCGTCATGAGTTCTTAAGTCATTGT
AGTCATGTTTTTCATTACTCTGTTACAAGTCTTTGAAGTTTGAATAGTGTTGTAGACTCA
CACTTCTCTTCGTATAAGACCTTTTATAACTATGTGAAAATTGAAATTTGACTTCATATA
TGTAAAAAATGTATTTTGTTACCGCACCTGTGTGGATTCGTTTGATGATGTTATTTGTGT
CATTATTTTTGTTTTTTGTTTTT

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 2

CO CL5371Contig1 372 2 1 U
GCCATCAGAATCCATGGGAACACTTCAGAAGTTGTGTGAGAAACATGGGACCTGTTGGAG
TTTGTCGTGGGCAGATGGCGTTCAGTTTCTACACTAGGAGGTTTCAAGTCAGTGACTATT
GTTGCAATATTGTCGTCAACGTGAAAAATGAATGCGAAGATGCCATTTGGGGATATTTCA
CCGATCCTTACTTTGTTGCTCTAGTTCGTTTCACTTGTCACATCGCCTACTAGTTCGTTT
TCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTCTTTAGTGGGTTTCTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTT
AGTTCATGCAATATTGTTGTCGTCCTCTTTCGTTATACGTTTTAATTAATGAATAAATAT
GGCTTTCTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D157JQ C 1
AF RR4D157TF U 1
BS 1 372 RR4D157TF

RD RR4D157JQ 372 0 0
GCCATCAGAATCCATGGGAACACTTCAGAAGTTGTGTGAGAAACATGGGACCTGTTGGAG
TTTGTCGTGGGCAGATGGCGTTCAGTTTCTACACTAGGAGGTTTCAAGTCAGTGACTATT
GTTGCAATATTGTCGTCAACGTGAAAAATGAATGCGAAGATGCCATTTGGGGATATTTCA
CCGATCCTTACTTTGTTGCTCTAGTTCGTTTCACTTGTCACATCGCCTACTAGTTCGTTT
TCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTCTTTAGTGGGTTTCTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTT
AGTTCATGCAATATTGTTGTCGTCCTCTTTCGTTATACGTTTTAATTAATGAATAAATAT
GGCTTTCTTTCT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR4D157TF 372 0 0
GCCATCAGAATCCATGGGAACACTTCAGAAGTTGTGTGAGAAACATGGGACCTGTTGGAG
TTTGTCGTGGGCAGATGGCGTTCAGTTTCTACACTAGGAGGTTTCAAGTCAGTGACTATT
GTTGCAATATTGTCGTCAACGTGAAAAATGAATGCGAAGATGCCATTTGGGGATATTTCA
CCGATCCTTACTTTGTTGCTCTAGTTCGTTTCACTTGTCACATCGCCTACTAGTTCGTTT
TCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTCTTTAGTGGGTTTCTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTT
AGTTCATGCAATATTGTTGTCGTCCTCTTTCGTTATACGTTTTAATTAATGAATAAATAT
GGCTTTCTTTCT

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 2

CO CL5372Contig1 492 2 1 U
GGCCTAAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACACTCACCTCCGAGAGAAATGATGAAGCGT
CTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTGATCCAGCCTGCCAAAACCGAA
AGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTG
GGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAGGAAGGCGAC
ACCGTTCTTCTTCCAGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCAT
CTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAAGGCTAAACTCA
ACTACGAGCGTTCCTTTCGTCTTGTGGGTGAAAAAAGAGTCATTTTTCTTTTTATCTTTT
TATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCATTGAAATTTAGACATCAATCTTAAACGATGC
ATCTTCTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CG93TF U 1
AF RR4DP67TF U 4
BS 1 492 RR4CG93TF

RD RR4CG93TF 492 0 0
GGCCTAAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACACTCACCTCCGAGAGAAATGATGAAGCGT
CTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTGATCCAGCCTGCCAAAACCGAA
AGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTG
GGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAGGAAGGCGAC
ACCGTTCTTCTTCCAGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCAT
CTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAAGGCTAAACTCA
ACTACGAGCGTTCCTTTCGTCTTGTGGGTGAAAAAAGAGTCATTTTTCTTTTTATCTTTT
TATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCATTGAAATTTAGACATCAATCTTAAACGATGC
ATCTTCTGATTC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4DP67TF 488 0 0
GG
AAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACACTCACCTCCGAGAGAAATGATGAAGCGTCTGGT
GCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTGATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGG
CATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACC
TGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAGGAAGGCGACACCGT
TCTTCTTCCAGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTT
CCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAAGGCTAAACTCAACTAC
GAGCGTTCCTTTCGTCTTGTGGGTGAAAAAGGAGTCATTTTTCTTTTTATCTTTTTATAT
GAGGTTGGACTTTGTTGATTATCATTGAAATTTAGACATCAATCTTAAACGATGCATCTT
CTGATT

QA 3 488 3 488
DS 



AS 1 2

CO CL5373Contig1 1091 2 2 U
CGCGGCCGCTAAGAAGAAAACAGCCGTCTCTTACACGTCCGTTCTTACCGCTAGAAGCAA
GGCTGCTGGTGGTTTCCAGAAGAAACAAAAAGAAAAGATTGTTGATATCGACTCTGCTGA
TGCTAAGAACGACCTTGCAGCTGTTGAATATGTGGAAGATATCTACAGCTTCTACAAGTC
TGTTGAGAGTGAATGGCGTCCAACTGATTACATGAGGTCGCAGCCTGAGATTAACGAGAA
GATGAGATTCATTCTGGTTGAATGGTTGGTAGATGTATGTGTCAGATTCGAGCTAAACCC
TGAGACGTTTTACCTCACCGTCAACATCATGGATCGGTTCTTGTCTGCTAAGCCAGTACC
TAGAAAAGAACTGCAGCTGGTTGGTCTCAGTGCTCTTCTCATGTCATCCAAATACGAAGA
GATCTGGCCACCACAGGTGGATGATCTAGTTGACATTGCAGACCATGCATACAGTCACAA
GCAAGTACTGGTGATGGAAAAGACAATACTGTCTACACTCGAGTGGTACTTGACAGTTCC
GACACATTATGTCTTCCTCGCACGTTTCATCAAAGCTTCCATTGCAGACCAACGAATGGA
GAGCATGGTGCACTATCTGGCGGAGTTAGGTGTAATGCATTACGACACAACCATAATGTT
CAGCCCATCAATGGTTGCTGCAGCTGCAATCTACGCAGCGAGATCAGCTCTTCACCAAGT
TCCCGTTTGGACCGACACCCTCAAGCATCACACCGGCTATTCCGAAACTCAGCTCATGGA
TTGTGCAAAGCTATTGGCGTTTCAGCAGTGGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAAGA
AGGGAGTGAGGGTAGTAAGAAGGGAGCCTTACTAAAGAAGTACTCCAAGGAGGAAAGGTT
CGCTGTGGCTATGATCCCTCCGGCCAAATCTTTGTTGACTGGAACCGACTCTGCTTAGGA
GTTATAAGACCACCACCATGAAGAAGCTACTACTAGATATGGCTTTTCATTAGATTTAAA
GTTTTGTATAAGTCTAATGAGTTACTTTGAAAACATAATTCTCTATTGAATGAATCCAAA
TGCTTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP71TF U 1
AF RR4AP71JQ C 323
BS 1 804 RR4AP71TF
BS 805 1091 RR4AP71JQ

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GGCTGCTGGTGGTTTCCAGAAGAAACAAAAAGAAAAGATTGTTGATATCGACTCTGCTGA
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TGTTGAGAGTGAATGGCGTCCAACTGATTACATGAGGTCGCAGCCTGAGATTAACGAGAA
GATGAGATTCATTCTGGTTGAATGGTTGGTAGATGTATGTGTCAGATTCGAGCTAAACCC
TGAGACGTTTTACCTCACCGTCAACATCATGGATCGGTTCTTGTCTGCTAAGCCAGTACC
TAGAAAAGAACTGCAGCTGGTTGGTCTCAGTGCTCTTCTCATGTCATCCAAATACGAAGA
GATCTGGCCACCACAGGTGGATGATCTAGTTGACATTGCAGACCATGCATACAGTCACAA
GCAAGTACTGGTGATGGAAAAGACAATACTGTCTACACTCGAGTGGTACTTGACAGTTCC
GACACATTATGTCTTCCTCGCACGTTTCATCAAAGCTTCCATTGCAGACCAACGAATGGA
GAGCATGGTGCACTATCTGGCGGAGTTAGGTGTAATGCATTACGACACAACCATAATGTT
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TTGTGCAAAGCTATTGGCGTTTCA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AP71JQ 769 0 0
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GGTCTCAGTGCTCTTCTCATGTCATCCAAATACGAAGAGATCTGGCCACCACAGGTGGAT
GATCTAGTTGACATTGCAGACCATGCATACAGTCACAAGCAAGTACTGGTGATGGAAAAG
ACAATACTGTCTACACTCGAGTGGTACTTGACAGTTCCGACACATTATGTCTTCCTCGCA
CGTTTCATCAAAGCTTCCATTGCAGACCAACGAATGGAGAGCATGGTGCACTATCTGGCG
GAGTTAGGTGTAATGCATTACGACACAACCATAATGTTCAGCCCATCAATGGTTGCTGCA
GCTGCAATCTACGCAGCGAGATCAGCTCTTCACCAAGTTCCCGTTTGGACCGACACCCTC
AAGCATCACACCGGCTATTCCGAAACTCAGCTCATGGATTGTGCAAAGCTATTGGCGTTT
CAGCAGTGGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAAGAAGGGAGTGAGGGTAGTAAGAAG
GGAGCCTTACTAAAGAAGTACTCCAAGGAGGAAAGGTTCGCTGTGGCTATGATCCCTCCG
GCCAAATCTTTGTTGACTGGAACCGACTCTGCTTAGGAGTTATAAGACCACCACCATGAA
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TACTTTGAAAACATAATTCTCTATTGAATGAATCCAAATGCTTCTTACC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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GCGGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATCTTCGGATCC
AAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTCGAGAAATCTGCTAATTCTTATAAGCTCGCCAAA
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ATCGACCAGGCTATTTCCTACTTTGAAAAGGCAGCTGAGTTCTTTCAAAACGAAGAAGTG
ACCACCTCTGCAAACCAGTGCAATCTCAAGGTGGCACAATATGCTGCACAGTTGGAGCAA
TATGACAAGGCAATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCACTCAACAATAACTTG
CTTAAGTATGGAGTTAAAGGCCATCTTCTCAATGCTGGCATGCGCCACCTTTGCAAAGCT
GATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAAATATCAGGATCTTGATCCAACTTTTACA
GGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTCTGCAATCGATGAAGAAGACATA
GCAAAGTTCACAGATGTTGTCAAGGAGTTTGATAGCATGACTCCTCTGGATTCATGGAAG
ACGACTATGTTGTTGAGGGTGAAAGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGAGGAAGATGAT
CTTACCTAAGCATATCTCTCTCTATCTAACCCAAGCTTTCCCTTATTAATTACTGCTGGT
TCGTATCATCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCATGTTTGGTTTTATTGTGTGAGG
TTATCAGCTTCTAAGGTTGCCTGTGAGGTTTGATAAAATTGGTTTGTTTGATATCAAAAG
ACTACATTTGCTGTCTCAAC


BQ
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AF RR4AN15TF U 1
AF RR4AN15JQ C 279
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GCGGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATCTTCGGATCC
AAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTCGAGAAATCTGCTAATTCTTATAAGCTCGCCAAA
TCATGGGATCTTGCTGGAAAGGCTTATCTTAAACTTGCTGATTGTCACTTAAAGTCCGAC
AGCAAACATGATGCTGCTAATGCTTACGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGAC
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CTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTACTATGAAGCTGACCAGAAG
ATCGACCAGGCTATTTCCTACTTTGAAAAGGCAGCTGAGTTCTTTCAAAACGAAGAAGTG
ACCACCTCTGCAAACCAGTGCAATCTCAAGGTGGCACAATATGCTGCACAGTTGGAGCAA
TATGACAAGGCAATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCACTCAACAATAACTTG
CTTAAGTATGGAGTTAAAGGCCATCTTCTCAATGCTGGCATGCGCCACCTTTGCAAAGCT
GATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAAATATCATGATCTTGATCCAACTTTTACA
GGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTCTGCAAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4AN15JQ 822 0 0
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ATATGCTGCACAGTTGGAGCAATATGACAAGGCAATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATG
CCAATCACTCAACAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAAGGCCATCTTCTCAATGCTGG
CATGCGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAAATATCA
GGATCTTGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTC
TGCAATCGATGAAGAAGACATAGCAAAGTTCACAGATGTTGTCAAGGAGTTTGATAGCAT
GACTCCTCTGGATTCATGGAAGACGACTATGTTGTTGAGGGTGAAAGAGAAGCTGAAGGC
AAAGGAGCTTGAGGAAGATGATCTTACCTAAGCATATCTCTCTCTATCTAACCCAAGCTT
TCCCTTATTAATTACTGCTGGTTCGTATCATCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCA
TGTTTGGTTTTATTGTGTGAGGTTATCAGCTTCTAAGGTTGCCTGTGAGGTTTGATAAAA
TTGGTTTGTTTGATATCAAAAGACTACATTTGCTGTCTCAAC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5375Contig1 481 2 1 U
GCTCCGCAAGCCGCTAGTCAGCCCTCGGGGCGTGGGTTTGTCTCTGTTTGTCGTGGGTTT
TTTGGTGTCAGCGGTTCTGTCTCTCGGAATGGCGGTTCCCGGTGATACTTCTCTCGTCGG
TCCAGAATCCTCACTTCTATGCTCGTGGAGGAGAGATGCGCGAATCCTCGGATCTGGGAA
GCGAAGAACGTCTTTTGCAGTCGCGGTGGTTTCATCTTCTGTGGGTAACGGCGACGGATC
TAAGCCTAGGATTGGACAACCTGGGTTTGTGAAGAGTCGGAGATCTGATGGCCACCGTTG
TCCAGCCGGATTGGGAAGCTTGTCTTCTATTGTCTTTTCACCCATGAATTTACCCTCTGT
TGTTGTTTTGTGTTGGATTGTTTTTAAGTTTCACTTGTAACCTAGGTTTGCCGTTTTCCG
GTACACTGGAATTGTAATATTCCGATGTGCGTTTGGGTCGAATCAATATATATAATTATG
C


BQ
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20 

AF RR4CS50JQ C 1
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C

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C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4DW10TF U 1
AF RR4EA81TF U 1
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BQ
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AF RR4CM96TF U 1
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RD RR4CM96TF 635 0 0
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TGGGTAAGTGAATTGTCCAACTTGATGGTGATCTCACGAAACGGTATGGAGTTTGCTTCT
GCTCTCGCGCCTTTCAAAAAGACCGGTCACAACATTTTCTTTGCTAATCCTCTACACGGT
CCCAGAATTTGCGAGTGCAAATACGAATTTAAGTCGTACGACCTTACCACCGAGATATGG
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DS 

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ATCATGGCGTTTGGGGACAGGAACCAGATCCCTGGTTACTACGAATCTGCTGGAATCGAA
ATATTTCCCAAAGGAGATAAGCATGCGAGACTTCTGGAGATGATAATACGTTTTACGATG
TGGGTAAGTGAATTGTCCAACTTGATGGTGATCTCACGAAACGGTATGGAGTTTGCTTCT
GCTCTCGCGCCTTTCAAAAAGACCGGTCACAACATTTTCTTTGCTAATCCTCTACACGGT
CCCAGAATTTGCGAGTGCAAATACGAATTTAAGTCGTACGACCTTACCACCGAGATATGG
GTTTGGGAGACCCTAGCTGCTGGTGGAGACCCTCTCCTCAAAACCAAAAGAGCTGCAGTG
ATGAGCAACAAGGAGGAGGAGGATGTTAACGACTCTGTTTACTAGAAAGAACTTGCTAAG
TAGTTGATGTTTATAAGTTGCTGCATATTTTCCTAGTAGGGAATGTGTGGAAGTAGCTAT
GTATTTGCTTGATAGTTAATGTTTATAAGAAGCTACATATTAGTGTTAAGTAATTGATGT
TTCAAGTTGCTACTTACGCTAGTGACTACTGATTAGTGAAGTGGGAACCAAACAAATTCT
TAGTTACTTGTGTTAGTTAAATCATTTATTCATCCG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

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GAATCTCAACACCTTAAGCTTCGAAGAATCACTTTCTCCTCTCTTTGGCGATGGCAATCT
CGTCCGTTCACCTGACGATCTCTCCGTGCGCCTCCTCCTGGATAAATACACCGGTTCTGG
TTTCATATCATCGAATATGTATCAACATGGATTTTACAGCTCTATGATCAAGCTTCCCGC
CGATTATACTGCCGGCGTCGCCGTCGCCTTTTATACATCAAACGGAGACGTGTTCGAGAA
AACACATGACGAATTAGACATAGAGTTTCTAGGGAACATAAAAGGGAAACCATGGAGGTT
TCAGACAAACCTTTACGGAAATGGAAGTACACATAGAGGTCGTGAAGAAAGATATCGTCT
ATGGTTTGATCCTTCTAAAGAATTTCATCGTTACAGCATCCTCTGGACTCCTCACAAGAT
CATATTTTGGGTAGACGATGTTCCAATAAGAGAAGTGATAAGAAGTGAAGCAATGGGAGC
AGATTATCCAGCGAAGCCAATGTCTCTCTATGCCACCATTTGGGATGCTTCTGACTGGGC
TACTTCTGGCGGAAAATACAAAGCTAATTACAAGTATGCTCCTTTCGTCGCCGAGTTCAA
ACCCTTCTCCCTTGATGGCTGCTCCGTTGATCCCATCCAAGAAGTCCCCACCGATTGCTC
TGACTCCGTTGACTTCCTCGAATCACAAGACTACTTCTCCATCAACTCACGTCAACATGC
TGCCATGAGAAGATTCCGACAACGGTTTATGTACTATTCATATTGTTATGATACTGTTAG
GTATCCAGAACCACTGCCTGAGTGTGTGATTGTTCCAGCGGAAAAGGATAGGTTTAAGGA
GACAGGGAGGTTGAAGTTTGGTGGTACAGAAGCACGTGGACGGCGTAGGAGTCGTCGTCA
ACAAAGGTCGGAGATTGAGAGTGACCCTGACGAAAGAAGACGATTTTAAACATAAAATTT
CTGTCATTTTTTCATTTGTTATATTCGTTTGTGAGTAAAAGAGAAAAATAAAAATAAGGA
TTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4EZ26TF U 1
AF RR4EZ26JQ C 319
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BS 721 721 RR4EZ26JQ
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BS 826 834 RR4EZ26TF
BS 835 1144 RR4EZ26JQ

RD RR4EZ26TF 851 0 0
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CGTCCGTTCACCTGACGATCTCTCCGTGCGCCTCCTCCTGGATAAATACACCGGTTCTGG
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TCAGACAAACCTTTACGGAAATGGAAGTACACATAGAGGTCGTGAAGAAAGATATCGTCT
ATGGTTTGATCCTTCTAAAGAATTTCATCGTTACAGCATCCTCTGGACTCCTCACAAGAT
CATATTTTGGGTAGACGATGTTCCAATAAGAGAAGTGATAAGAAGTGAAGCAATGGGAGC
AGATTATCCAGCGAAGCCAATGTCTCTCTATGCCACCATTTGGGATGCTTCTGACTGGGC
TACTTCTGGCGGAAAATACAAAGCTAATTACAAGTATGCTCCTTTCGTCGCCGAGTTCAA
*CCCTTCTCC*TTGATGGCTGCTCCGTTGATCCCATCCAAGA*GTCCC*ACCGAT*GCTC
TGACTCCGTTGACTTCCTCGA*TCACA*GACTACTTCTCCATCA*CTCACGTCA
CATGCTGCATGAGAGAT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4EZ26JQ 826 0 0
TCGCTGTCG
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TCTAGGGAACATAAAAGGGAAACCATGGAGGTTTCAGACAAACCTTTACGGAAATGGAAG
TACACATAGAGGTCGTGAAGAAAGATATCGTCTATGGTTTGATCCTTCTAAAGAATTTCA
TCGTTACAGCATCCTCTGGACTCCTCACAAGATCATATTTTGGGTAGACGATGTTCCAAT
AAGAGAAGTGATAAGAAGTGAAGCAATGGGAGCAGATTATCCAGCGAAGCCAATGTCTCT
CTATGCCACCATTTGGGATGCTTCTGACTGGGCTACTTCTGGCGGAAAATACAAAGCTAA
TTACAAGTATGCTCCTTTCGTCGCCGAGTTCAAACCCTTCTCCCTTGATGGCTGCTCCGT
TGATCCCATCCAAGAAGTCCCCACCGATTGCTCTGACTCCGTTGACTTCCTCGAATCACA
AGACTACTTCTCCATCAACTCACGTCAACATGCTGCCATGAGAAGATTCCGACAACGGTT
TATGTACTATTCATATTGTTATGATACTGTTAGGTATCCAGAACCACTGCCTGAGTGTGT
GATTGTTCCAGCGGAAAAGGATAGGTTTAAGGAGACAGGGAGGTTGAAGTTTGGTGGTAC
AGAAGCACGTGGACGGCGTAGGAGTCGTCGTCAACAAAGGTCGGAGATTGAGAGTGACCC
TGACGAAAGAAGACGATTTTAAACATAAAATTTCTGTCATTTTTTCATTTGTTATATTCG
TTTGTGAGTAAAAGAGAAAAATAAAAATAAGGATTTG

QA 10 826 10 826
DS 



AS 1 2

CO CL5380Contig1 694 2 2 U
GGATTGCCAAACCTTCATTTTCTACTTCTCTTCTTCGCCTGAGTTCACTCCTTACGTACA
GACGAAATCGGACAGAGCTCGGGATAACACGGAGTCGTACGAATTACTTCGTCGGCCGCA
TGTTTCATGCAGAGAATCATAAGACGAGAAGATTCCCAGAGAGAGAGGTTCTTTTACAAC
GTATGTGAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTGTAAACCCTAACCGCAAGAACGATGCCAGGTCC
CCGAAACGAGCTCTCGATCTCGTCTCCCCTGTCCATGGCCAATTCCCTCCTATCCTACTG
ATTCTGAAGCATTGCATTCCAAGGTGGACGAGGACGAGAAGAATCTCGTTACCAAACCCG
CCGTCTTCAAGGGCGTTCTCCTTCAGCAGACTCTTCAGGCCATCGTCTCCGTTATTCTCT
TCAAGAGAGCAGAAAAGAAAAGCAGCAGTTTTAATGGAGAGGAGGACTTCAGGAGGAGTA
ACCAGTGCTCCTTGAGTTATCGTGAGTTTCACTTCTTGTTCTTAGGAACCTCGTTTTTGC
TCCGAAAGTTACACACCCTTTGTTGTTTAGGATGATAGGTCTGAAAACTTCAGATAAACT
CTTGAGTAGGAAATTATAAATTTCATACAGGAACAGATAAATATTGTTTCATTACATTTG
CTTACAGCTTGAGAAGCATGAATCATTTTTAAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BB84TF U 1
AF RR4BC12TF U 1
BS 1 690 RR4BB84TF
BS 691 694 RR4BC12TF

RD RR4BB84TF 690 0 0
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GACGAAATCGGACAGAGCTCGGGATAACACGGAGTCGTACGAATTACTTCGTCGGCCGCA
TGTTTCATGCAGAGAATCATAAGACGAGAAGATTCCCAGAGAGAGAGGTTCTTTTACAAC
GTATGTGAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTGTAAACCCTAACCGCAAGAACGATGCCAGGTCC
CCGAAACGAGCTCTCGATCTCGTCTCCCCTGTCCATGGCCAATTCCCTCCTATCCTACTG
ATTCTGAAGCATTGCATTCCAAGGTGGACGAGGACGAGAAGAATCTCGTTACCAAACCCG
CCGTCTTCAAGGGCGTTCTCCTTCAGCAGACTCTTCAGGCCATCGTCTCCGTTATTCTCT
TCAAGAGAGCAGAAAAGAAAAGCAGCAGTTTTAATGGAGAGGAGGACTTCAGGAGGAGTA
ACCAGTGCTCCTTGAGTTATCGTGAGTTTCACTTCTTGTTCTTAGGAACCTCGTTTTTGC
TCCGAAAGTTACACACCCTTTGTTGTTTAGGATGATAGGTCTGAAAACTTCAGATAAACT
CTTGAGTAGGAAATTATAAATTTCATACAGGAACAGATAAATATTGTTTCATTACATTTG
CTTACAGCTTGAGAAGCATGAATCATTTTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4BC12TF 694 0 0
GGATTGCCAAACCTTCATTTTCTACTTCTCTTCTTCGCCTGAGTTCACTCCTTACGTACA
GACGAAATCGGACAGAGCTCGGGATAACACGGAGTCGTACGAATTACTTCGTCGGCCGCA
TGTTTCATGCAGAGAATCATAAGACGAGAAGATTCCCAGAGAGAGAGGTTCTTTTACAAC
GTATGTGAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTGTAAACCCTAACCGCAAGAACGATGCCAGGTCC
CCGAAACGAGCTCTCGATCTCGTCTCCCCTGTCCATGGCCAATTCCCTCCTATCCTACTG
ATTCTGAAGCATTGCATTCCAAGGTGGACGAGGACGAGAAGAATCTCGTTACCAAACCCG
CCGTCTTCAAGGGCGTTCTCCTTCAGCAGACTCTTCAGGCCATCGTCTCCGTTATTCTCT
TCAAGAGAGCAGAAAAGAAAAGCAGCAGTTTTAATGGAGAGGAGGACTTCAGGAGGAGTA
ACCAGTGCTCCTTGAGTTATCGTGAGTTTCACTTCTTGTTCTTAGGAACCTCGTTTTTGC
TCCGAAAGTTACACACCCTTTGTTGTTTAGGATGATAGGTCTGAAAACTTCAGATAAACT
CTTGAGTAGGAAATTATAAATTTCATACAGGAACAGATAAATATTGTTTCATTACATTTG
CTTACAGCTTGAGAAGCATGAATCATTTTTAAGA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5381Contig1 581 2 1 U
GAAACGGTGACTTCGAACTAGGTCCACGCCACACTGACATGAAAGGGACACAAGTCATGA
ACAAAACAGCAATCCCGAGCTGGGAACTCTCAGGCTTCGTCGAGTACATTCCCTCAGGAC
ACAAACAAGGCGACATGGTCCTTGTCGTGCCTAAAGGCGCTTTCGCGGTGCGTCTAGGCA
ACGAAGCTTCCATCAAACAAAAGATCAACGTTAAAAAAGGCTCTTACTATTCCATAACGT
TCAGTGCAGCTCGAACGTGCGCACAGGACGAGCAGTTAAACGTTTCTGTGGCGCCTCACC
ACGGAGTAATGCCCATTCAAACAGTATACAGTAGCTCGGGCTGGGACTTGTATTCGTGGG
CGTTCAAGGCGCAGAGCGATTATGCAGAGATTGTGATACATAATCCAGGTGTTGAGGAAG
ATCCTGCTTGTGGACCACTCATTGATGGTGTTGCTATGAGAGCTCTTTTTCCTCCTCGTC
CCACCAACAGTAAGTGTTTTGAACGCTAACTATTGTCATCAGCAATGTTGAAAAAATCGC
TAGATAGTAACTAAATATATAAAAGATTATCGTTTACACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FI77TF U 1
AF RR4FI77JQ C 103
BS 1 581 RR4FI77TF

RD RR4FI77TF 581 0 0
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ACAAAACAGCAATCCCGAGCTGGGAACTCTCAGGCTTCGTCGAGTACATTCCCTCAGGAC
ACAAACAAGGCGACATGGTCCTTGTCGTGCCTAAAGGCGCTTTCGCGGTGCGTCTAGGCA
ACGAAGCTTCCATCAAACAAAAGATCAACGTTAAAAAAGGCTCTTACTATTCCATAACGT
TCAGTGCAGCTCGAACGTGCGCACAGGACGAGCAGTTAAACGTTTCTGTGGCGCCTCACC
ACGGAGTAATGCCCATTCAAACAGTATACAGTAGCTCGGGCTGGGACTTGTATTCGTGGG
CGTTCAAGGCGCAGAGCGATTATGCAGAGATTGTGATACATAATCCAGGTGTTGAGGAAG
ATCCTGCTTGTGGACCACTCATTGATGGTGTTGCTATGAGAGCTCTTTTTCCTCCTCGTC
CCACCAACAGTAAGTGTTTTGAACGCTAACTATTGTCATCAGCAATGTTGAAAAAATCGC
TAGATAGTAACTAAATATATAAAAGATTATCGTTTACACCG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4FI77JQ 479 0 0
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TCGCGGTGCGTCTAGGCAACGAAGCTTCCATCAAACAAAAGATCAACGTTAAAAAAGGCT
CTTACTATTCCATAACGTTCAGTGCAGCTCGAACGTGCGCACAGGACGAGCAGTTAAACG
TTTCTGTGGCGCCTCACCACGGAGTAATGCCCATTCAAACAGTATACAGTAGCTCGGGCT
GGGACTTGTATTCGTGGGCGTTCAAGGCGCAGAGCGATTATGCAGAGATTGTGATACATA
ATCCAGGTGTTGAGGAAGATCCTGCTTGTGGACCACTCATTGATGGTGTTGCTATGAGAG
CTCTTTTTCCTCCTCGTCCCACCAACAGTAAGTGTTTTGAACGCTAACTATTGTCATCAG
CAATGTTGAAAAAATCGCTAGATAGTAACTAAATATATAAAAGATTATCGTTTACACCG

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL5382Contig1 479 2 1 U
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GGAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAAT
GCCAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCG
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GCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATTAAGACCAGTTTTTTT
TTGTTTTTTTTTGATGTTATGTTGCATTCCTGTTCTGAAAAGCAACTCGTTGGAGTTTAG
AGGAAGAAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGCTTTGGTTATTACCATTTTAAAGTTC


BQ
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AF RR4F778JQ C 1
AF RR4F778TF U 1
BS 1 479 RR4F778TF

RD RR4F778JQ 479 0 0
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CGAAGATGGTTCTTCAAAACGATATCGATCTTCTTAACCCACCAGCTGAGCTTGAGAAGA
GGAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAAT
GCCAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCG
GAAACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACGGAAGGAT
GCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATTAAGACCAGTTTTTTT
TTGTTTTTTTTTGATGTTATGTTGCATTCCTGTTCTGAAAAGCAACTCGTTGGAGTTTAG
AGGAAGAAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGCTTTGGTTATTACCATTTTAAAGTTC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4F778TF 479 0 0
GGCTCTCTCGCTTATTTGTTGTCGTTGCCTGCTATCTTCCTCCGTCTCTTGAGATTCTTG
CGAAGATGGTTCTTCAAAACGATATCGATCTTCTTAACCCACCAGCTGAGCTTGAGAAGA
GGAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAAT
GCCAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCG
GAAACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACGGAAGGAT
GCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATTAAGACCAGTTTTTTT
TTGTTTTTTTTTGATGTTATGTTGCATTCCTGTTCTGAAAAGCAACTCGTTGGAGTTTAG
AGGAAGAAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGCTTTGGTTATTACCATTTTAAAGTTC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL5383Contig1 527 2 1 U
GCACATCTACAGGAGCAGCCAAAGCAGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAAC
TCAACGGAATAGCTCTCCGTGTGCCGACACCAAATGTCTCAGTGGTTGATCTCGTTGTGC
AGGTCTCCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGA
AAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTCTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGAT
GCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCACTTACCATGGTGATGGGAGATGATATGG
TTAAGGTGATTGCTTGGTATGACAATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTTGATTTGG
CTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTCTCCCTTT
TTCTACATTCTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGT
GGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTAAACTTGTTTACATTTGT


BQ
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AF RR4CZ45JQ C 1
AF RR4CZ45TF U 1
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QA 1 527 1 527
DS 

RD RR4CZ45TF 527 0 0
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AAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTCTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGAT
GCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCACTTACCATGGTGATGGGAGATGATATGG
TTAAGGTGATTGCTTGGTATGACAATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTTGATTTGG
CTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTCTCCCTTT
TTCTACATTCTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGT
GGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTAAACTTGTTTACATTTGT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

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CGGTCGACCGACACTCCGACAGCACCGTCGACCGATACCGTTCACCGATCTACATCGATC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RR4B615TF U 1
AF RR4B615JQ C 120
BS 1 817 RR4B615TF
BS 818 821 RR4B615JQ

RD RR4B615TF 817 0 0
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CTTATTTAAATTTTTCTTTCTTGTCTTTTCAGGTACATGCCCAGCAGTACCAGAAGTAAC
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CGGTCGACCGACACTCCGACAGCACCGTCGACCGATACCGTTCACCGATCTACATCGATC
GATACTTCTAACCGTATACCGATCGACACTACTCCGCGAAGCATGGTCGCGATAGTCATT
CTCACGCAGGGCGAGAATGGAAACCTGTATGACCAAGATGGTCATCTGCGTAATGCAACA
GGTCAGAAACTAGATGCACAGGGAAACATAATCCCTGAAACTGAAGCTGAGGCTACAGGA
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QA 1 817 1 817
DS 

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CTCTCTCGTGTTTCAGATACCTTATTATGGGCAATCACACGAGCATCCTATGGACCATCT
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ACCTACAGGATCACTGACATCCTGGGCCGACATCAAAAACGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5385Contig1 946 2 2 U
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GGCTTATTTATTCAAAGTCATTCGAACGTTGAAAGATTTCTTTAGGTCGATTCAATGTCC
TTGTCATGTATTTCTGTTGATTACATAAATTTATCAATGTTCTTGC


BQ
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AF RR4EH71TF U 1
AF RR4EH71JQ C 254
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BS 534 946 RR4EH71JQ

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GAAGCCGTAAATCTCGTTAAGGGTTTTAAAACTTTTTTAAAAAAAAAACAAGCATTCTGA
TCTGTCTTTTCTTTTTTTTTTTTGCTTAATCGACATCCAATGGTTGGTTACAGAGCAGAT
GATGAATACGATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTGATTCTGGTGTGGGAAAGTCT
AATCTGCTTTCGCGATTCACCAAGAACGAGTTTAGCCTCGAGTCTAAATCCACGATCGGA
GTCGAGTTCGCGACTAGGAGTTTGAATGTTGATGATAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGG
GATACTGCTGGTCAAGAAAGGTACCGAGCCATCACTAGCGCGTATTACCGAGGCGCCGTT
GGAGCGCTTCTTGTCTACGACGTAACCCGACACTCCACCTTCGAAAACGTGGAGACGTGG
CTGAAAGAACTCAGAAACCATACTGATCCAAACATCGTAGTCATGCTCGTGGG

QA 1 533 1 533
DS 

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CTAGGAGTTTGAATGTTGATGATAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACTGCTGGTC
AAGAAAGGTACCGAGCCATCACTAGCGCGTATTACCGAGGCGCCGTTGGAGCGCTTCTTG
TCTACGACGTAACCCGACACTCCACCTTCGAAAACGTGGAGACGTGGCTGAAAGAACTCA
GAAACCATACTGATCCAAACATCGTAGTCATGCTCGTGGGCAACAAATCTGATCTCCGCC
ACCTCGTGGCTGTTCAGACAGACGACGCCAAGTCATTCGCTGAGAAAGAATCTCTTTGCT
TCATGGAAACCTCTGCCCTCGAGTCCACGAATGTCGAGGACGCTTTCGCGCAAGTCCTCA
CTCAGATCCACAGCATTGTGAGCAAAAAGGCAATGGAAGCAGCGAGCGAATCAGCTAACG
CTCCGTCAAAAGGAGACAAGATCGAGATCGGTAAAGATGTTTCTGCTGTCAAGAAAGCTG
GATGTTGTTCAAACTAGTAAGAGAGTGGTTATTGGTTTTTTGTTAACGGCTTATTTATTC
AAAGTCATTCGAACGTTGAAAGATTTCTTTAGGTCGATTCAATGTCCTTGTCATGTATTT
CTGTTGATTACATAAATTTATCAATGTTCTTGC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL5386Contig1 1061 2 2 U
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GATTCAGAAGCGAACACATTGTCGAATGCTTAAAAGAGAACAATGTGATCGGTAAAGGAG
GAGCAGGGGTTGTCTACAAAGGCTTAATGCCAAACGGAGAAGAAGTCGCGGTCAAGAAAC
TCTTAACCATAAGGAAAGGATCATCTCACGACAACGGTTTATCCGCAGAGATTCAGACAC
TAGGTGAATCAGACACAGAAACATCGTGAGATTACTCGCGTTTTGTTCAAACAAAGACGT
TAATCTCCTTGTTTACGAGTATATGCCTAACGGTAGCCTCGGAGAAGCCTTGCACGGGAA
AGCTGGAGTGTTTTTGAAATGGGAAACGCGGTTGCAGATTGCGTTGGAAGCGGCCAAGGG
TTTGTGTTATCTTCACCATGATTGTCCGCCGCTTATAATCCACCGGGATGTGAAATCAAA
CAATATATTGTTGGGTCCTGACTTTGAAGCCCATGTAGCTGATTTTGGGCTTGCTAAGTT
TATGATGCAAGACGATGGAGCTTCTCAGTGTATGTCATCGGTCGCTGGCTCGTATGGATA
CATCGCTCCAGAATATGCATATACACTGAGAATAGACGAGAAGAGCGATGTGTACAGTTT
TGGAGTAGTTCTGTTGGAGCTAATAACGGGTCGAAAACCAATAGATAAATTTGGAGAAGA
AGGGATAGACATTGTGCAATGGTCAAAGATTCAGACAAATTGTAACAGGCAAGGTGTGGT
AAAGATCATTGACCAGAGATTGAGCAATGTGCCACTGGGAGAAGCCATGGAGCTATTCTT
TGTGGCAATGCTATGTGTTCAAGAACATAGTGTTGAGAGACCGACCATGAGAGAAGTTGT
CCAGATGATTTCTCAAGCTAAACACCCCAGTACTAATTTCTAAATCCAGTATGAGTTAAT
ATATATAAGTAAAATAGTTTTTTTGTTATGGTGTATGTGTAATGTGGTTATAGAGTTTTT
TGGAAATGTAATGAAGATTTAGTGGTAATATGAGTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ70TF U 1
AF RR4BJ70JQ C 227
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BS 706 1061 RR4BJ70JQ

RD RR4BJ70TF 705 0 0
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GAGCAGGGGTTGTCTACAAAGGCTTAATGCCAAACGGAGAAGAAGTCGCGGTCAAGAAAC
TCTTAACCATAAGGAAAGGATCATCTCACGACAACGGTTTATCCGCAGAGATTCAGACAC
TAGGTGAATCAGACACAGAAACATCGTGAGATTACTCGCGTTTTGTTCAAACAAAGACGT
TAATCTCCTTGTTTACGAGTATATGCCTAACGGTAGCCTCGGAGAAGCCTTGCACGGGAA
AGCTGGAGTGTTTTTGAAATGGGAAACGCGGTTGCAGATTGCGTTGGAAGCGGCCAAGGG
TTTGTGTTATCTTCACCATGATTGTCCGCCGCTTATAATCCACCGGGATGTGAAATCAAA
CAATATATTGTTGGGTCCTGACTTTGAAGCCCATGTAGCTGATTTTGGGCTTGCTAAGTT
TATGATGCAAGACGATGGAGCTTCTCAGTGTATGTCATCGGTCGCTGGCTCGTATGGATA
CATCGCTCCAGAATATGCATATACACTGAGAATAGACGAGAAGAGCGATGTGTACAGTTT
TGGAGTAGTTCTGTTGGAGCTAATAACGGGTCGAAAACCAATAGA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4BJ70JQ 835 0 0
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GAAGCGGCCAAGGGTTTGTGTTATCTTCACCATGATTGTCCGCCGCTTATAATCCACCGG
GATGTGAAATCAAACAATATATTGTTGGGTCCTGACTTTGAAGCCCATGTAGCTGATTTT
GGGCTTGCTAAGTTTATGATGCAAGACGATGGAGCTTCTCAGTGTATGTCATCGGTCGCT
GGCTCGTATGGATACATCGCTCCAGAATATGCATATACACTGAGAATAGACGAGAAGAGC
GATGTGTACAGTTTTGGAGTAGTTCTGTTGGAGCTAATAACGGGTCGAAAACCAATAGAT
AAATTTGGAGAAGAAGGGATAGACATTGTGCAATGGTCAAAGATTCAGACAAATTGTAAC
AGGCAAGGTGTGGTAAAGATCATTGACCAGAGATTGAGCAATGTGCCACTGGGAGAAGCC
ATGGAGCTATTCTTTGTGGCAATGCTATGTGTTCAAGAACATAGTGTTGAGAGACCGACC
ATGAGAGAAGTTGTCCAGATGATTTCTCAAGCTAAACACCCCAGTACTAATTTCTAAATC
CAGTATGAGTTAATATATATAAGTAAAATAGTTTTTTTGTTATGGTGTATGTGTAATGTG
GTTATAGAGTTTTTTGGAAATGTAATGAAGATTTAGTGGTAATATGAGTTTATAC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL5387Contig1 775 2 2 U
GAACAACAACTTTGGGTTGTAGACTTCTTCTAATTGTTACAGCTAAGCAGAACACTGAGA
TAGCAAGCTTAATGGAACACCTCAGTTGGAGAGATGGGCACATCATGATCCTCAGCCTTA
GTTGTTGGAGTCAGTATATTAGCTGGAAGCTTCTGGTTTTTTACCAATCCTGAAAAAGTT
CAGTAATCAGTTTATCAAATGATCTTCTGAGAGATGTATTTAAAAGAAGAAGATAGCTTT
TATCCAAAGGCAACAAAAATAAACTGTACCATCTGAGAGCTCATTTCCACAATAGTTCCT
AACACCTTTCTTGTATACCGTCCATAAAGATGTGTCGGTACTTCCAGTCACATATCCTCT
AACTACAAACAACAAGAAGAAAAAAAAAAAACAGTTGAGAAGTAAAGCAAAGGAAGGCTG
CATAGAGAAGCATATACTAACCCACAAACTCAATTGGGAAAACGGAGCATTTCTTTGCAA
TAACAACATTTCTATCAGGAGATGAAACGATTGCATTTGGAGTTATGTGCTGTGTGTTAT
TGAACCACCACAAACTGGTCTCGTTATGAACCTGAAAGTTAAAAAGCAGAAGCAGATGCA
CAAACTTATTATCTTTCTGCTAACACATTGAGCTATATCCAACTTGAATTTTACAGCGGA
GAAAAAAAACACAAAACCTGGCCTTTGAAGGGAATCGAAGCAAGGTTTCTGTCAAAGGCA
CTCAACTCGATCAGTTGTTATAAGAACCAGATAATCACCAGCATCATATATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG58TF U 1
AF RR4AG58JQ C 276
BS 1 745 RR4AG58TF
BS 746 775 RR4AG58JQ

RD RR4AG58TF 745 0 0
GAACAACAACTTTGGGTTGTAGACTTCTTCTAATTGTTACAGCTAAGCAGAACACTGAGA
TAGCAAGCTTAATGGAACACCTCAGTTGGAGAGATGGGCACATCATGATCCTCAGCCTTA
GTTGTTGGAGTCAGTATATTAGCTGGAAGCTTCTGGTTTTTTACCAATCCTGAAAAAGTT
CAGTAATCAGTTTATCAAATGATCTTCTGAGAGATGTATTTAAAAGAAGAAGATAGCTTT
TATCCAAAGGCAACAAAAATAAACTGTACCATCTGAGAGCTCATTTCCACAATAGTTCCT
AACACCTTTCTTGTATACCGTCCATAAAGATGTGTCGGTACTTCCAGTCACATATCCTCT
AACTACAAACAACAAGAAGAAAAAAAAAAAACAGTTGAGAAGTAAAGCAAAGGAAGGCTG
CATAGAGAAGCATATACTAACCCACAAACTCAATTGGGAAAACGGAGCATTTCTTTGCAA
TAACAACATTTCTATCAGGAGATGAAACGATTGCATTTGGAGTTATGTGCTGTGTGTTAT
TGAACCACCACAAACTGGTCTCGTTATGAACCTGAAAGTTAAAAAGCAGAAGCAGATGCA
CAAACTTATTATCTTTCTGCTAACACATTGAGCTATATCCAACTTGAATTTTACAGCGGA
GAAAAAAAACACAAAACCTGGCCTTTGAAGGGAATCGAAGCAAGGTTTCTGTCAAAGGCA
CTCAACTCGATCAGTTGTTATAAGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4AG58JQ 500 0 0
AGAGCTCATTTCCACAATAGTTCCTAACACCTTTTTTGTATACCGTCCATAAAGATGTGT
CGGTACTTCCAGTCACATATCCTCTAACTACAAACAACAAGAAGAAAAAAAAAAAACAGT
TGAGAAGTAAAGCAAAGGAAGGCTGCATAGAGAAGCATATACTAACCCACAAACTCAATT
GGGAAAACGGAGCATTTTTTTGCAATAACAACATTTTTATCAGGAGATGAAACGATTGCA
TTTGGAGTTATGTGCTGTGTGTTATTGAACCACCACAAACTGGTCTCGTTATGAACCTGA
AAGTTAAAAAGCAGAAGCAGATGCACAAACTTATTATCTTTCTGCTAACACATTGAGCTA
TATCCAACTTGAATTTTACAGCGGAGAAAAAAAACACAAAACCTGGCCTTTGAAGGGAAT
GGAAGCAAGGTTTCTGTCAAAGGCACTCAAC*CGATCAGTTGTTATAAGAACCAGATAAT
CACCAGCATCATATATATTT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL5388Contig1 724 2 2 U
GAAAATTAAAACCATTATGAACAAGTTTATGCTGATCTGTGTAATGTGTTGATGTGAAAA
AATTATCATCATAAATACGGAAGTGTACTTCACTATTTTTGTTATGAAATAAAGCTCTAA
AGAACTCAGTACATGTCCTAACGACACGACAACAAGTTTGCTAGCTTCTTCTTTAGATCT
GCTGCAATCTCAGGACTTGATAGAAACATATCCAGCGACTGAACAACTCCCTTTCTCTCA
ATCTCTCTAAAAGCTGATGCCACGCCTCTCATGATCATATCTCGGCGGGTTATGTCGTAA
GTGTCTACAAGACGAAGCAAAAACTCAAGTAAAGAGTTAGTGATGTGTGGATACTGAGGT
ATTGACCATAGCATCAAGAGAGCAGCAGGTTCAACATTCATAATGCTATCTACTTTTTCG
TCAAAGAAGAGCCAGTCATAGAACAGAGCCGGCTTAACCCTTTGTTCGACCTGAGGATTC
TGCTTGCAGAGTTCTAGAAACCAACCTATAAGAGCCCACCTTGGCATGATCTCTGACCTG
ATGATCTCGTTAGTTGGGTGAACGACACAGCAGATGAACCGGACTATGTCTATCAAAAGT
GTTTCTTTTTCAGGACCCAAGAGAAACTTCTTCAAGAACCACATCTGATGCCGCTTATGG
CTTCCAAGCTTCACATTCCCAAGCAAAAACCTTAACTGGGTTTCCATCTCAGGAGAGATC
CGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FH20JQ U 1
AF RR4FM82JQ U 1
BS 1 689 RR4FH20JQ
BS 690 724 RR4FM82JQ

RD RR4FH20JQ 689 0 0
GAAAATTAAAACCATTATGAACAAGTTTATGCTGATCTGTGTAATGTGTTGATGTGAAAA
AATTATCATCATAAATACGGAAGTGTACTTCACTATTTTTGTTATGAAATAAAGCTCTAA
AGAACTCAGTACATGTCCTAACGACACGACAACAAGTTTGCTAGCTTCTTCTTTAGATCT
GCTGCAATCTCAGGACTTGATAGAAACATATCCAGCGACTGAACAACTCCCTTTCTCTCA
ATCTCTCTAAAAGCTGATGCCACGCCTCTCATGATCATATCTCGGCGGGTTATGTCGTAA
GTGTCTACAAGACGAAGCAAAAACTCAAGTAAAGAGTTAGTGATGTGTGGATACTGAGGT
ATTGACCATAGCATCAAGAGAGCAGCAGGTTCAACATTCATAATGCTATCTACTTTTTCG
TCAAAGAAGAGCCAGTCATAGAACAGAGCCGGCTTAACCCTTTGTTCGACCTGAGGATTC
TGCTTGCAGAGTTCTAGAAACCAACCTATAAGAGCCCACCTTGGCATGATCTCTGACCTG
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GTTTCTTTTTCAGGACCCAAGAGAAACTTCTTCAAGAACCACATCTGATGCCGCTTATGG
CTTCCAAGCTTCACATTCCCAAGCAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4FM82JQ 724 0 0
GAAAATTAAAACCATTATGAACAAGTTTATGCTGATCTGTGTAATGTGTTGATGTGAAAA
AATTATCATCATAAATACGGAAGTGTACTTCACTATTTTTGTTATGAAATAAAGCTCTAA
AGAACTCAGTACATGTCCTAACGACACGACAACAAGTTTGCTAGCTTCTTCTTTAGATCT
GCTGCAATCTCAGGACTTGATAGAAACATATCCAGCGACTGAACAACTCCCTTTCTCTCA
ATCTCTCTAAAAGCTGATGCCACGCCTCTCATGATCATATCTCGGCGGGTTATGTCGTAA
GTGTCTACAAGACGAAGCAAAAACTCAAGTAAAGAGTTAGTGATGTGTGGATACTGAGGT
ATTGACCATAGCATCAAGAGAGCAGCAGGTTCAACATTCATAATGCTATCTACTTTTTCG
TCAAAGAAGAGCCAGTCATAGAACAGAGCCGGCTTAACCCTTTGTTCGACCTGAGGATTC
TGCTTGCAGAGTTCTAGAAACCAACCTATAAGAGCCCACCTTGGCATGATCTCTGACCTG
ATGATCTCGTTAGTTGGGTGAACGACACAGCAGATGAACCGGACTATGTCTATCAAAAGT
GTTTCTTTTTCAGGACCCAAGAGAAACTTCTTCAAGAACCACATCTGATGCCGCTTATGG
CTTCCAAGCTTCACATTCCCAAGCAAAAACCTTAACTGGGTTTCCATCTCAGGAGAGATC
CGGA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5389Contig1 759 2 3 U
GGATTCTCAATCTTAACGTACAGGTTGGAGAAGGAGAAGTAGATCGTTGTGATTCTGGCT
TCTTGGGTGTTTCTGGGTATTGATTGATTAATTATAGAAAGTGTCAAACTTTCCTGGAAA
CTGGATCTGGGTTTTACGTTTTTTTTCTGAGAAGCAAAAGAAGAATAAGCGATGAATCTT
TATCCAAACCTAAGAAGAGGGATACTACTCTCTGTGCTCTTCTTCGACGTCGTTTTGCTG
TGCAACTCTTCCACTTCGCCTTCTTCATCTGAATCGATCACAATAAAGCCAAGACATTTG
TCTTTGCTAAAGAGTGCTTTACAACGGCCAAGTGGGGAGCAGTCTGATCTATGGAAGCCA
ATGGCTGATCAAGGATGGAGTCCATGTATCGATCTCGAAGATCCCCCTTCATTGCCGGAT
AAAACCGAAGGCTATATCCAAGTGTTTCTCGATGGAGGACTTAACCAACAACGAATGGGG
ATATGCGATGCGGTTGCAGTCGCTAAGATCTTAAACGCAACGCTCGTGATCCCTTTTCTT
GAAGTCAATCCCGTTTGGCAAGACTCGAGTTCCTTTGTTGATATATTTGACGTGGATCAT
TTTATCAATGCGTTAAAGGATGACATAAGAGTAGTTAAAGAGCTTCCTGATGAATACTCG
TGGAGCACAAGAGAGTACTACGCAACGGCGGTCCGTGAAACCCGAGTTAAAACTGCGCCT
GTTCATGCTTCTGCGCATGGTATATTGAGAATGTCTCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP34TF U 1
AF RR4DU37TF U 1
BS 1 711 RR4DP34TF
BS 712 712 RR4DU37TF
BS 713 759 RR4DP34TF

RD RR4DP34TF 759 0 0
GGATTCTCAATCTTAACGTACAGGTTGGAGAAGGAGAAGTAGATCGTTGTGATTCTGGCT
TCTTGGGTGTTTCTGGGTATTGATTGATTAATTATAGAAAGTGTCAAACTTTCCTGGAAA
CTGGATCTGGGTTTTACGTTTTTTTTCTGAGAAGCAAAAGAAGAATAAGCGATGAATCTT
TATCCAAACCTAAGAAGAGGGATACTACTCTCTGTGCTCTTCTTCGACGTCGTTTTGCTG
TGCAACTCTTCCACTTCGCCTTCTTCATCTGAATCGATCACAATAAAGCCAAGACATTTG
TCTTTGCTAAAGAGTGCTTTACAACGGCCAAGTGGGGAGCAGTCTGATCTATGGAAGCCA
ATGGCTGATCAAGGATGGAGTCCATGTATCGATCTCGAAGATCCCCCTTCATTGCCGGAT
AAAACCGAAGGCTATATCCAAGTGTTTCTCGATGGAGGACTTAACCAACAACGAATGGGG
ATATGCGATGCGGTTGCAGTCGCTAAGATCTTAAACGCAACGCTCGTGATCCCTTTTCTT
GAAGTCAATCCCGTTTGGCAAGACTCGAGTTCCTTTGTTGATATATTTGACGTGGATCAT
TTTATCAATGCGTTAAAGGATGACATAAGAGTAGTTAAAGAGCTTCCTGATGAATACTCG
TGGAGCACAAGAGAGTACTACGCAACGGCGGTCCGTGAAACCCGAGTTAAA*CTGCGCCT
GTTCATGCTTCTGCGCATGGTATATTGAGAATGTCTCAC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4DU37TF 724 0 0
GGATTCTCAATCTTAACGTACAGGTTGGAGAAGGAGAAGTAGATCGTTGTGATTCTGGCT
TCTTGGGTGTTTCTGGGTATTGATTGATTAATTATAGAAAGTGTCAAACTTTCCTGGAAA
CTGGATCTGGGTTTTACGTTTTTTTTCTGAGAAGCAAAAGAAGAATAAGCGATGAATCTT
TATCCAAACCTAAGAAGAGGGATACTACTCTCTGTGCTCTTCTTCGACGTCGTTTTGCTG
TGCAACTCTTCCACTTCGCCTTCTTCATCTGAATCGATCACAATAAAGCCAAGACATTTG
TCTTTGCTAAAGAGTGCTTTACAACGGCCAAGTGGGGAGCAGTCTGATCTATGGAAGCCA
ATGGCTGATCAAGGATGGAGTCCATGTATCGATCTCGAAGATCCCCCTTCATTGCCGGAT
AAAACCGAAGGCTATATCCAAGTGTTTCTCGATGGAGGACTTAACCAACAACGAATGGGG
ATATGCGATGCGGTTGCAGTCGCTAAGATCTTAAACGCAACGCTCGTGATCCCTTTTCTT
GAAGTCAATCCCGTTTGGCAAGACTCGAGTTCCTTTGTTGATATATTTGACGTGGATCAT
TTTATCAATGCGTTAAAGGATGACATAAGAGTAGTTAAAGAGCTTCCTGATGAATACTCG
TGGAGCACAAGAGAGTACTACGCAACGGCGGTCCGTGAAACCCGAGTTAAAACTGCGCCT
GTTC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5390Contig1 735 2 2 U
GGATCCCAAAGCTCGAGATAAACATAAGAAAATTATCTTAAAAAAACTCCAAAGAAATCA
AAGTAGAAGAGATGATGAAGTTTAAGTCCAAGAGGTTTGGGATTCGATTTGGTTTTGGTA
AAAGAACCAACAACAAAGGCACACAACAAGATCAACAACAAAAGGTATCTAGTAATAACA
ACAGTATTAGCTGCTGCAATAATGAGATTAAATGGGAACTTAGGCCAGGAGGCATGCTTG
TTCAGAAAAGACAAGAGAGCATTGGTGAAGACTTGATCTCCATTAGAGTCTCTACTTTTG
CTAATTTTCATGATCTCTCCATTGAAGCTACCTCCACTTTTGGAGAACTTAAGATGGTAC
TATCACTGCTTACCGGTTTAGAGCCAAAACAGCAACGTCTACTATTCAAAGGGAAAGAGA
GAGAGGATGATGAATATCTACACATGGTTGGTGTTGGAGAAAAAGACAAAGTGTTGTTAC
TAGAAGATCCTGCATTCAGAGAGAAAAAGCTTCTTGATCTTAACAACATTTCCGCTTCTT
GTCCCACTATAATCGTATAAACAGCTAAACCAGTTTCTTAAATTAGTTGCGTGTTAACTT
CTTGGTAAAGTATAAGATCAGCCAAGAATAGTATAGGATTGTCATGCATGATGCATACAG
ATTATATAAATCTCATGTAGTCGTCACTCTGTTTCAAAGTTGTAAAATTAATGTTTACAT
TTGTAATATAATTTT


BQ
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AF RR4HA51TF U 1
AF RR4HA51JQB C 197
BS 1 728 RR4HA51TF
BS 729 735 RR4HA51JQB

RD RR4HA51TF 728 0 0
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AAGTAGAAGAGATGATGAAGTTTAAGTCCAAGAGGTTTGGGATTCGATTTGGTTTTGGTA
AAAGAACCAACAACAAAGGCACACAACAAGATCAACAACAAAAGGTATCTAGTAATAACA
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TTCAGAAAAGACAAGAGAGCATTGGTGAAGACTTGATCTCCATTAGAGTCTCTACTTTTG
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TATCACTGCTTACCGGTTTAGAGCCAAAACAGCAACGTCTACTATTCAAAGGGAAAGAGA
GAGAGGATGATGAATATCTACACATGGTTGGTGTTGGAGAAAAAGACAAAGTGTTGTTAC
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GTCCCACTATAATCGTATAAACAGCTAAACCAGTTTCTTAAATTAGTTGCGTGTTAACTT
CTTGGTAAAGTATAAGATCAGCCAAGAATAGTATAGGATTGTCATGCATGATGCATACAG
ATTATATAAATCTCATGTAGTCGTCACTCTGTTTCAAAGTTGTAAAATTAATGTTTACAT
TTGTAATA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4HA51JQB 539 0 0
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TTCCATTGAAGCTACCTCCACTTTTGGAGAACTTAAGATGGTACTATCACTGCTTACCGG
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TTTACACATGGTTGGTGTTGGAGAAAAAGACAAAGTGTTGTTACTAGAAGATCCTGCATT
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ATAAACAGCTAAACCAGTTTTTTAAATTAGTTGCGTGTTAACTTTTTGGTAAAGTATAAG
ATCAGCCAAGAATAGTATAGGATTGTCATGCATGATGCATACAGATTATATAAATTTCAT
GTAGTCGTCACTTTGTTTCAAAGTTGTAAAATTAATGTTTACATTTGTAATATAATTTT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

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CTTTGCCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCGGTCAC
TTTTGGTCTGTTCTTAGCCAGGAAGCTGTCACTCACCAGAGCTTTGTACTACATAGTGAT
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TGGTGCTGAAATCATCGGTACATTCGTCCTCGTTTACACAGTTTTCTCAGCCACTGACGC
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TTGGGTTGGACCCTTCATTGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCATGTGATTGTCATCAG
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GAACATCTCAAAAGTTCAACATAAATCATTCTTG


BQ
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AF RR4F428TF U 1
AF RR4F428JQ C 74
BS 1 624 RR4F428TF
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BS 626 748 RR4F428TF
BS 749 814 RR4F428JQ

RD RR4F428TF 748 0 0
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CTTTGCCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCGGTCAC
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GCAGTGCTTGGGAGCCATATGCGGAGCTGGTGTGGTTAAAGGTTTCCAGCCTAATCAATA
CCAGGCTCTAGGAGGAGGAGCCAACACTGTGGCTCATGGATACACCAAAGGTAGTGGTCT
TGGTGCTGAAATCATCGGTACATTCGTCCTCGTTTACACAGTTTTCTCAGCCACTGACGC
CAAGAGAAACGCCCGTGACTCTCATGTCCCTATTCTTGCACCACTCCCAATCGGGTTTGC
GGTTTTCTTGGTTCGCTTAGCAACCATCCCAATCACTGGCACAGGCATCAACCCAGCTAG
AAGTCTTGGAGCTGCAATCATCTACAACAAAGACCATTCCTGGGACGACCACTGGGTGTT
TTGGGTTGGACCCTTCATTGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCATGTGATTGTCATCAG
AGCAATCCCCTTCAAGTCCAGAAACTAAGTTAAAACAAAACATCAAGTCCTCTGGTTCTG
GTCCAGTGTCCTAAGTTGCTTCTATTGTTATTCCATATGTGTAAAATGTGTGTATGTATG
AACGTATGTGCGTGCCCTCTCCTTTGCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4F428JQ 741 0 0
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TTAGCCAGGAAGCTGTCACTCACCAGAGCTTTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGA
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GGAGGAGCCAACACTGTGGCTCATGGATACACCAAAGGTAGTGGTCTTGGTGCTGAAATC
ATCGGTACATTCGTCCTCGTTTACACAGTTTTCTCAGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCC
CGTGACTCTCATGTCCCTATTCTTGCACCACTCCCAATCGGGTTTGCGGTTTTCTTGGTT
CGCTTAGCAACCATCCCAATCACTGGCACAGGCATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAGCT
GCAATCATTTACAACAAAGACCATTCCTGGGACGACCACTGGGTGTTTTGGGTTGGACCC
TTCATTGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCATGTGATTGTCATCAGAGCAATCCCCTTC
AAGTCCAGAAAATAAGTTAAAACAAAACATCAAGTCCTCTGGTTTTGGTCCAGTGTCCTA
AGTTGCTTCTATTGTTATTCCATATGTGTAAAATGTGTGTATGTATGAACGTATGTGCGT
GCCCTCTCCTTTGCTTAAGGCAATAAATGTAGCTTGTAAACAAAGAAGAACATCTCAAAA
GTTCAACATAAATCATTCTTG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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TTTCTTCTTCCCTCTTGCCGGCAGTGTACTGCAGAGCCGATGATATTATACTACTCTTTT
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CCATTTTTCAAGTTAACAATTTGTTTTTGTAGATAAGATTGCCTGTCATGATATTTTCTT
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AGACATGTGTATCTAGTAGGCTTATCCATTTGGACACCAGATATGTGACGAACACTCTGC
CACTTCACAAGACAGAATCTAAAACCAACCAATGACAACGCGTCTCTCCAGATAAGTCCT
TTCTATGGAGTTTGCTCTTATAACCATTCATTGCTCTATCTCTTTCTCTAGCCTCACTCA
TAAAACTCACAAGTCGCACACTCCTCACTTACCAAAGGATAACCCACC


BQ
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AF RR4B692TF U 1
AF RR4B692JQ C 189
BS 1 655 RR4B692TF
BS 656 888 RR4B692JQ

RD RR4B692TF 655 0 0
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CTGCATCCTAACGAAAGGATGAATAAGGTAAGAGTCTGTGATTCTGTCGTATGATTCTTT
TTTCTTCTTCCCTCTTGCCGGCAGTGTACTGCAGAGCCGATGATATTATACTACTCTTTT
CTCCTCTCCGGCCTACTTGCTGTGACCTCTGATTCCCTGAGATCGTCTTTTTACCTTCAA
CCATTTTTCAAGTTAACAATTTGTTTTTGTAGATAAGATTGCCTGTCATGATATTTTCTT
TTAAAATATTGTATATAAACTTTGGATTACTTTTGTCAAAAAATAAAATAAAACTTTGGA
TTACAGAAAGGGTTTAAAAAAATCGAAAAACTAGTGTTTCAAAAAAAAAAAAATCGAAAA
ACTAAATAACTATCACTAACTTGAATAAGAAGTAACTTCTATTTTCAGCTATGAATCAAC
TTCTAAACGCTGTAAAAAATAACTAACATCCAAAAAGTACTTTTACTTAAATTTGGTTTA
ATTTATTTTTAGTTATTACTTTTTGTATCCGTAAACTAAACTAAACATTCTTGAAAACAA
ATAATTATTTGAAAGAATAAAAAAATATAAGAGAATATTCAGGACACGTACAAAC

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DS 

RD RR4B692JQ 700 0 0
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ACTATCACTAACTTGAATAAGAAGTAACTTCTATTTTCAGCTATGAATCAACTTCTAAAC
GCTGTAAAAAATAACTAACATCCAAAAAGTACTTTTACTTAAATTTGGTTTAATTTATTT
TTAGTTATTACTTTTTGTATCCGTAAACTAAACTAAACATTCTTGAAAACAAATAATTAT
TTGAAAGAATAAAAAAATATAAGAGAATATTCAGGACACGTACAAACAAAAAAGACATGT
GTATCTAGTAGGCTTATCCATTTGGACACCAGATATGTGACGAACACTCTGCCACTTCAC
AAGACAGAATCTAAAACCAACCAATGACAACGCGTCTCTCCAGATAAGTCCTTTCTATGG
AGTTTGCTCTTATAACCATTCATTGCTCTATCTCTTTCTCTAGCCTCACTCATAAAACTC
ACAAGTCGCACACTCCTCACTTACCAAAGGATAACCCACC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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CACTACACCTCCTATGAAAGACCTGACGATGGACTTGA


BQ
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AF RR4G412TF U 1
AF RR4G520TF U 1
BS 1 719 RR4G412TF
BS 720 758 RR4G520TF

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GGCGGTTAGAGCTCCCAGAGAATCTGAAGCTAAAGTTGCGAATGCGATCGCGTCGACTTC
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CAAGAGGCGTTCAGTGGTTGAACTGACGGAGAGCAAGAACAAAGCTGAGTTGTTTCTCCG
TCTTCCTCAATACGAGCGCGGCAATCAGCTTCCCAATCTGAGCTCCAATATATTCACACT
CGATACCATACACCATGCCGTCTATAAGGTAGGTTTGCGACATTTGGCTGGAGATTTATC
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QA 1 719 1 719
DS 

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CATCCAAGAGGCCCAACGGGCAGCAAAAGCTGCTGCAAAAGGGGAAGGAAGCAAACGTGC
AGGTGAATCTAGTAGAGCCAAGCCTAGCAAGACTGCCAAACAGACTCAACCGAAGAAAGA
CGTACCTCAGGTCACATCATCTTTTTCTGAAAAAAGAACTGTATCAGTAGAAAAAGAGAG
GAGAATGGATGTCCCTCAGGCACAAATGCAGTATGACGACAAAAGCCGAGTCGATAAAGC
CAAGAGGCGTTCAGTGGTTGAACTGACGGAGAGCAAGAACAAAGCTGAGTTGTTTCTCCG
TCTTCCTCAATACGAGCGCGGCAATCAGCTTCCCAATCTGAGCTCCAATATATTCACACT
CGATACCATACACCATGCCGTCTATAAGGTAGGTTTGCGACATTTGGCTGGAGATTTATC
TGGTGACAATGCGCGATGTATTGCCATGCTCCATGCATTTCGAGAAGCTATAAACGATTA
CACTACACCTCCTATGAAAGACCTGACGATGGACTTGA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL5394Contig1 909 2 2 U
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CTATCACACACAGTCACACACACATGGCGACTTCCTTTTCCGTCTCCAGACTCCTCTCTT
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CCGTCTCCTCCGCCAGATCCTCCTCAACAACAACAACCATCTCCGCCTCCATCTCCGTCG
GAGTCAAACTCCCCGACTCCACCCTCTCCTACCTCGACCCCGCCACCGGCGACGTCAAAA
CGGTCACCGTCTCCTCCCTAACCGCCGGCAAAAAAAACCATCCTCTTCGCCGTCCCGGGC
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CTCAGATCCAAAGGCGTCGACGTCATCGCGTGCGTCTACGTGAACGACGCGTTCATGATG
GAGGCGTGGAGGAAGGATCTCGGGATTAGTGATGATGAGGTGATGCTGCTGTCCGACGGG
AACGGAGAGTTCACGGGGAAGCTTGGCGTGGAGCTGGATTTGAGGGATAAGCCCGTGGGG
CTCGGGGTTAGGTCGAGGAGGTACGCGATTTTGGCGGAGGATGGGGTTGTGAAGGTGCTG
AATCTCGAGGAAGGAGGCGCTTTCACTAACTCTAGTGCTGAGGATATGCTTAAAGCTTTT
GATGATTCCGATTCTGTTTTCTCTTTGTGTGTTTTTTTTTGAATTTTCCTGAAGCTTTTC
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TTGTTTGAC


BQ
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GAGTCAAACTCCCCGACTCCACCCTCTCCTACCTCGACCCCGCCACCGGCGACGTCAAAA
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CTCCCAACCTCTCCCTCAAACTCCACACCCGCCGCACCTCCGTCTCTTCCGCCAGATCCT
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CTTGGCGTGGAGCTGGATTTGAGGGATAAGCCCGTGGGGCTCGGGGTTAGGTCGAGGAGG
TACGCGATTTTGGCGGAGGATGGGGTTGTGAAGGTGCTGAATCTCGAGGAAGGAGGCGCT
TTCACTAACTCTAGTGCTGAGGATATGCTTAAAGCTTTTGATGATTCCGATTCTGTTTTC
TCTTTGTGTGTTTTTTTTTGAATTTTCCTGAAGCTTTTCAGATTCTATGTATCCATCCAT
CATCGGATCTGTAACGGAATAAAACATCGGGAATCGTTTTTGTTTGAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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AAGGGATTGCATTTCTCAAGCTTCTATTCACTAATTAATTAAGTAACCCACTCACACTTT
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TTT


BQ
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20 20 20 

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AF RR4FO40TF U 1
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AAGGGATTGCATTTCTCAAGCTTCTATTCACTAATTAATTAAGTAACCCACTCACACTTT
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TTT

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DS 

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GAAGAAAAACAAGAAGAAGGATAAGCACCACAAGGGCCATGACTAAAACCCCTTCTTTCT
AAGGGATTGCATTTCTCAAGCTTCTATTCACTAATTAATTAAGTAACCCACTCACACTTT
TCTCTAAGTTTATGTCAGTTGTTGCTTTGTTTTGTTTTTGCTTCCCATTTGTGCCATCTT
CTATAAGACTTCAACGTATCATGAAACTAGCATTATAAGTTTTCAAGTAAAATGTTTTGC
TTT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL5396Contig1 886 2 2 U
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TTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGCCACGACGCTAAGTCCAAAGT
TGATTCTCCTGCGGAGAAGCCCCCGAAGTCCTATCCTGCTGAAGACGTCAAGAAACCTCT
CGCCAACAGACGCAAGCCAAAGCCTGCCAAGCTCAGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGT
GCTTATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTCGTCTTCTTGAAGCAGCTTAC
TTCTGGTTTACTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTTTTCCTCTGATACGTGT
TAACCAGTCCTATGTGATTGGTACTTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAGCGTCGA
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AGAGTTCTTTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGA
CCAGAAGGTCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCTATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGAC
TTACTTGGGCGCAAGGTTCTCATTGAAACAGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTTCTA
AATTTCATAACCTTTTTTTGCTGAGGTTTCTAGAGTGTCTATCACCTTTAGTTTCATCAC
CTTTAGTTTTATCCTATGAACGGTTGGTCTTGTTCACCGGTCAATTACAATTTTTGGCAT
CTTGTTTTTGAGAGTGAGTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTC


BQ
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AF RR4E046TF U 1
AF RR4E046JQ C 193
BS 1 671 RR4E046TF
BS 672 886 RR4E046JQ

RD RR4E046TF 671 0 0
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TTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGCCACGACGCTAAGTCCAAAGT
TGATTCTCCTGCGGAGAAGCCCCCGAAGTCCTATCCTGCTGAAGACGTCAAGAAACCTCT
CGCCAACAGACGCAAGCCAAAGCCTGCCAAGCTCAGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGT
GCTTATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTCGTCTTCTTGAAGCAGCTTAC
TTCTGGTTTACTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTTTTCCTCTGATACGTGT
TAACCAGTCCTATGTGATTGGTACTTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAGCGTCGA
TAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAACAAGATGGGAGAAGG
AGAGTTCTTTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGA
CCAGAAGGTCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCTATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGAC
TTACTTGGGCG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4E046JQ 694 0 0
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CAAGCCAAAGCCTGCCAAGCTCAGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTTATCATCCT
TGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTCGTCTTCTTGAAGCAGCTTACTTCTGGTTTACT
TCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTTTTCCTCTGATACGTGTTAACCAGTCCTA
TGTGATTGGTACTTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAGCGTCGATAAATTCGATGA
TAAGTATTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAACAAGATGGGAGAAGGAGAGTTCTTTGA
GGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGGTCGT
TGATGCAGCTTTGATCAAAGCTATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGGGCGC
AAGGTTCTCATTGAAACAGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTTCTAAATTTCATAACC
TTTTTTTGCTGAGGTTTCTAGAGTGTCTATCACCTTTAGTTTCATCACCTTTAGTTTTAT
CCTATGAACGGTTGGTCTTGTTCACCGGTCAATTACAATTTTTGGCATCTTGTTTTTGAG
AGTGAGTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5397Contig1 490 2 1 U
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TTACTGTGGTAAGTGTGGGCTTACTTATGTTTACCAGAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATC
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GGTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGGACATGTTTTGTTTCTGGATTTCTTATCTGGATTG
ATGAAAGTTATTACATTTTTTACTTATGTTGGTACTTTGATTAGTCTCAATAATCGATTA
TGTTTGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EV69JQ C 1
AF RR4EV69TF U 1
BS 1 490 RR4EV69TF

RD RR4EV69JQ 490 0 0
GAACATCCAGAAGGAGTGGACGCTTCACCTGGTTCTCCGTCTGAGAGGAGGAGTGAAGAA
GAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCGAAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAA
GCTCGCGGTGCTCCAGTTCTACAAGGTCGACGGTTCCGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAA
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TTACTGTGGTAAGTGTGGGCTTACTTATGTTTACCAGAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATC
ACTGTTTCTTTTCTCTATCTTTATGAACTGGTTTTTGTTTTGGTATGGTAATTTCATAAA
GGTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGGACATGTTTTGTTTCTGGATTTCTTATCTGGATTG
ATGAAAGTTATTACATTTTTTACTTATGTTGGTACTTTGATTAGTCTCAATAATCGATTA
TGTTTGAACC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4EV69TF 490 0 0
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GAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCGAAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAA
GCTCGCGGTGCTCCAGTTCTACAAGGTCGACGGTTCCGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAA
GGAGTGCCCTAACGCGACTTGCGGTGCTGGCACTTTCATGGCGAGTCATTTTGATCGTCA
TTACTGTGGTAAGTGTGGGCTTACTTATGTTTACCAGAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATC
ACTGTCTCTTTTCTCTATCTTTATGAACTGGTTTTTGTTTTGGTATGGTAATTTCATAAA
GGTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGGACATGTTTTGTTTCTGGATTTCTTATCTGGATTG
ATGAAAGTTATTACATTTTTTACTTATGTTGGTACTTTGATTAGTCTCAATAATCGATTA
TGTTTGAACC

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL5398Contig1 860 2 8 U
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AGATCACGAAGCCACTGATAAGTCATGCGAATCTTTGCTGCTCGCCTCGCTAATCATTTT
CGCAGAGGGAGAAATGGGTATCCTCCATCTCGAAACTTCTCCTCGTTGACCAAGAAAGAT
GACCTTACATTGGAGGAAGAAGCTGAGAGGAAAATAGGATGGATGCTGAAGCTTTTCTTT
GCTGGGACAGCAACTTATGTTGGATACCAGTTCTTCCCTTATATGGGTGATACTTTGATT
CAGCAATCAGTCTCGCTTTTACATGTGAAGGATCCCTTGTTTAAGAGAATTGGAGCTTCT
AGGCTTTCCCGTTTCGCCATTGATGATGAAAGGAGGATGAAGGTTGTAGAGTTGGGTGGG
GCTCAAGAGCTTCTTCACATGCTGGGTGCTGCTAAAGATGACAAGACAAGGAAAGAAGCT
CTAAAAGCTCTTGCCGCTCTCTCTAAATCAGATGAAGCTGCCAACTTCCTGGGATCTAAA
GGAGCACTCTCTATCGTCAAATCGACTCCAGATTCCTCTGAAGATTCAGACATTTCAACT
TACAAGTCAAACATACTCAAAAAGCTAGATGACAAAGACCTACCTCTTTCTTCCAACTGA
ATTTTGTCTTTTCATAGGTCCCAGGAATGATAAAGTGTAGGTGTTATCTCTACAATCCTA
AGCATGTCTTTCCTCCTATTCCAAGATAGAACTCTTGAATTTTTTTTGCCAAAGGAAGTC
TGATTCTCTAGCTTCTATTCTTAATGCTGAATACTGTTTTGATTCCAATGTTCTTTGTTC
AAATAAATAATGGTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E614TF U 1
AF RR4E614JQ C 248
BS 1 677 RR4E614TF
BS 678 678 RR4E614JQ
BS 679 700 RR4E614TF
BS 701 701 RR4E614JQ
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RD RR4E614TF 760 0 0
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AGATCACGAAGCCACTGATAAGTCATGCGAATCTTTGCTGCTCGCCTCGCTAATCATTTT
CGCAGAGGGAGAAATGGGTATCCTCCATCTCGAAACTTCTCCTCGTTGACCAAGAAAGAT
GACCTTACATTGGAGGAAGAAGCTGAGAGGAAAATAGGATGGATGCTGAAGCTTTTCTTT
GCTGGGACAGCAACTTATGTTGGATACCAGTTCTTCCCTTATATGGGTGATACTTTGATT
CAGCAATCAGTCTCGCTTTTACATGTGAAGGATCCCTTGTTTAAGAGAATTGGAGCTTCT
AGGCTTTCCCGTTTCGCCATTGATGATGAAAGGAGGATGAAGGTTGTAGAGTTGGGTGGG
GCTCAAGAGCTTCTTCACATGCTGGGTGCTGCTAAAGATGACAAGACAAGGAAAGAAGCT
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GGAGCACTCTCTATCGTCAAATCGACTCCAGATTCCTCTGAAGATTCAGACATTTCAACT
TACAAGTCAAACATACTCAAAAAGCTAGATGACAAAGACCTACCTCTTTCTTCCAACTGA
ATTTTGTCTTTTCATAG*TCCCAGGAATGATAAAGTGTAG*TGTTATCTCTACA*TCCTA
AGCATGTCTTTCCTCCTATTC
AAGATAGACTCTTGATTTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4E614JQ 613 0 0
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CAGTCTCGCTTTTACATGTGAAGGATCCCTTGTTTAAGAGAATTGGAGCTTCTAGGCTTT
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AGCTTCTTCACATGCTGGGTGCTGCTAAAGATGACAAGACAAGGAAAGAAGCTCTAAAAG
CTCTTGCCGCTCTCTCTAAATCAGATGAAGCTGCCAACTTCCTGGGATCTAAAGGAGCAC
TCTCTATCGTCAAATCGACTCCAGATTCCTCTGAAGATTCAGACATTTCAACTTACAAGT
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CTTTTCATAGGTCCCAGGAATGATTAAGTGTAGGTGTTATCTCTACAATCCTAAGCATGT
CTTTCCTCCTATTCCAAGATAGAACTCTTGAATTTTTTTTGCCAAAGGAAGTCTGATTCT
CTAGCTTCTATTCTTAATGCTGAATACTGTTTTGATTCCAATGTTCTTTGTTCAAATAAA
TAATGGTTTAAGG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5400Contig1 749 2 2 U
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CGTCGTGGTGAATCCGGCTGCCCTCCTCCTCGCAACTTTGCTAAAGACACATGTACCATC
GAGTTTGACGGTGCTTCAAAAGGAAACCCTGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTTCTCCGT
GCTCCAGATAATACTGTGATCTTCTCTTGTCGCGAGGGTTTAGGCTCTGCTACAAACAAC
GTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTGTGCTCTTAACAACGGCTTTAAA
AATGTGCACGTCCAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAAGCAGGTTCAAGGTGCATGGGCA
ACCAAAAACCCGAACATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAAGAGCTTATGAGTCAGTTT
GACTCATGTGATATTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCTGATGCTCAAGCT
AGCCTTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAAACTCATGAAGAGAGTGCAGGCGGCTATGGA
AGAAGGGGATACTAATATCTAAGTGGAGTAATATGCATATTATGTTTTCTTGTTTTTGGG
ATCATGTCTTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATGAACACGATGATCTTC
TGTCTCTTTTGCTTTGTCCCACGGCATGTTGACTTCCCAAGAACATGTCTATGTCGTCTA
CTACTTATTCTATTAAATAAGTTTTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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ATCATGTCTTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATGAACACGATGATCTTC
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CTACTTATTCT

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TCAGTTTGACTCATGTGATATTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCTGATGC
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DS 



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BQ
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TATTTTATTAAATTGTTTTTGATAAATAATATTAAATAATTTTGAAAAAAACTTGTATAT
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QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

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GATCGTCCTTAAAGTCGTATTTGTTCATTTGTTTCTTTTTGTAGTATATATGGATGGAAG
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GTAAACCCTTTTAAATTGGCAGTGTGTAGGGCCAGTGCCGGTCCTGAGATATTCGGGGTC
CAATACGAAATTAAAAACCGAGGCCTTTAAATACT


BQ
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AF RR4GI45TF U 1
AF RR4GI45JQ C 115
BS 1 597 RR4GI45TF
BS 598 875 RR4GI45JQ

RD RR4GI45TF 603 0 0
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TTCTTGAGCTCGATATCCTCCAGTTCATAGACGACGCCGAATCGAGGAAGAAAAGAAGAC
GGAGGCATAAAAAGGAGCAGAATCTGTACATGCAACTAAGCGAGGCAATGGAGTGTATAG
AGCATATATGCACCCAAGGTTGTACGTTGGTCGGTCCAACAAACATAGTAGACGATAACA
AGTCATCGACAGTTCCGTTTGGGGCGAAGTCAAATCCTTGTAAGGCATTTTCCACGTGTT
ACGGCCTCCAGCTTTCGATACGTCATTTTGCCGTATGCAAGAAGAGGAGTAACGAGAAAG
GTTGTCTTCGTTGCAAGCGGATGCTTCAACTTCTAAGACTCCATTCTTCTATATGTGATC
AGCCAGAATCTTGTCGCGTCCCTCTTTGCAGGCACTTTAAGAAAAGGGTAGAACAAGATA
AAAGGATGGGTGAAGACACCAAGTGGAAGCTTTTGGTGAGAAGGGTGGTGTCTGCAAAAG
CCATGTCTTCATTGTGTCAGTCGTCAAAGAAGAACAAATGCGATGGAGAAGCAGAAG
ATTAGT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4GI45JQ 761 0 0
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GTATAGAGCATATATGCACCCAAGGTTGTACGTTGGTCGGTCCAACAAACATAGTAGACG
ATAACAAGTCATCGACAGTTCCGTTTGGGGCGAAGTCAAATCCTTGTAAGGCATTTTCCA
CGTGTTACGGCCTCCAGCTTTCGATACGTCATTTTGCCGTATGCAAGAAGAGGAGTAACG
AGAAAGGTTGTCTTCGTTGCAAGCGGATGCTTCAACTTCTAAGACTCCATTCTTCTATAT
GTGATCAGCCAGAATCTTGTCGCGTCCCTCTTTGCAGGCACTTTAAGAAAAGGGTAGAAC
AAGATAAAAGGATGGGTGAAGACACCAAGTGGAAGCTTTTGGTGAGAAGGGTGGTGTCTG
CAAAAGCCATGTCTTCATTGTGTCAGTCGTCAAAGAAGAACAAATGCGATGGAGAAGCAG
AAGGATTAGTCAGGAACAGAACAGGAAGGAGTTGGGGTTTGTAGATAATAATGAAGATTA
GTTAAAGATCGTCCTTAAAGTCGTATTTGTTCATTTGTTTCTTTTTGTAGTATATATGGA
TGGAAGTCTCAAGGGTATACAATCATGTATCATTTGATCGGTGTAGAGGGTTTATTTTGT
AGATGAGTAAACCCTTTTAAATTGGCAGTGTGTAGGGCCAGTGCCGGTCCTGAGATATTC
GGGGTCCAATACGAAATTAAAAACCGAGGCCTTTAAATACT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL5403Contig1 675 2 1 U
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TATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACTACTAGGGTCAAGTTGCCATCTGGTTC
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CTCATGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTGGAGCATCCCCATGGAGGAGG
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GGTTGGTCTTATTGCTGCTAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTTCTGC
TGCCAAGGCCTAGGTTTCATAAGATATTTTTGTTTGCGTTTTGCTGTCTTTCCTTTCGGA
CCTTGTTGTGTTCTGAAATCTCAAAAATATTTTGTTATAATCTTGTCCTTCTCTGTCGAA
GTTATTATTATGTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EF69TF U 1
AF RR4EQ80TF U 1
BS 1 675 RR4EF69TF

RD RR4EF69TF 675 0 0
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GTTATTATTATGTCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EQ80TF 675 0 0
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TAACGTCGAGCATCATGTCGGTGATCGTGGTGTCCTCGCTAGAGCTTCTGGTGATTACGC
TATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACTACTAGGGTCAAGTTGCCATCTGGTTC
GAAGAAGATTGTTCCGAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCAGGTGGTGGAAG
GACCGAGAAGCCGATGCTCAAGGCAGGAAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGGAA
CTCATGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTGGAGCATCCCCATGGAGGAGG
TAACCATCAGCACATTGGTCACGCCAGTACTGTTAGACGTGATGCACCTCCTGGACAGAA
GGTTGGTCTTATTGCTGCTAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTTCTGC
TGCCAAGGCCTAGGTTTCATAAGATATTTTTGTTTGCGTTTTGCTGTCTTTCCTTTCGGA
CCTTGTTGTGTTCTGAAATCTCAAAAATATTTTGTTATAATCTTGTCCTTCTCTGTCGAA
GTTATTATTATGTCT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL5404Contig1 767 2 2 U
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TTAACGGTAAGATCTCAAAAGATGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAATTTA
TCAGCTTTGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCATCA
ATGGAGATGATATCATTTGGGCCATTACCACTCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCCAT
TAAAGATCTATCTCGGGAAATACCGAGAAACTGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAAAC
AAAGACATCAACAACAACAACCGCAGGATAATCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGACC
ATAACAACTTTTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCAACCTTCTCCATTTTTGCCCG
CAGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCTCCTAAATCATTGCAAACACAGTTCC
CGCAACAGCATGATAACACTGATTCCGTTGGACAGTGGTCAGTGTAAAACTTTTTTTTAA
TAAATTCTTTTTTTTTTGTTTTATATATTACTATATTTTATTGTTTCCGGTACATCTTAT
ATTGTTGCAATAACACATTAGATACGTACACGGTACATCTTGACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F448TF U 1
AF RR4F448JQ C 92
BS 1 575 RR4F448TF
BS 576 767 RR4F448JQ

RD RR4F448TF 575 0 0
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AAGGAGCTGAAACAAATCCAGAAAACCCTTCTTTGAAGAACAACAGCATCAACAATAAAG
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TCAGCTTTGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCATCA
ATGGAGATGATATCATTTGGGCCATTACCACTCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCCAT
TAAAGATCTATCTCGGGAAATACCGAGAAACTGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAAAC
AAAGACATCAACAACAACAACCGCAGGATAATCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGACC
ATAACAACTTTTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCAACCTTCTCCATTTTTGCCCG
CAGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4F448JQ 676 0 0
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GTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCATCAATGGAGATGATATCATTTGGGCCATTACCAC
TCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCCATTAAAGATCTATCTCGGGAAATACCGAGAAAC
TGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAAACAAAGACATCAACAACAACAACCGCAGGATAA
TCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGACCATAACAACTTTTCATGTACTAGTTACATCTC
TCATCATCAACCTTCTCCATTTTTGCCCGCAGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTT
CTCTCCTAAATCATTGCAAACACAGTTCCCGCAACAGCATGATAACACTGATTCCGTTGG
ACAGTGGTCAGTGTAAAACTTTTTTTTAATAAATTCTTTTTTTTTTGTTTTATATATTAC
TATATTTTATTGTTTCCGGTACATCTTATATTGTTGCAATAACACATTAGATACGTACAC
GGTACATCTTGACATT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5405Contig1 779 2 2 U
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GCTTCCCTGACTATCCTCTGAAGAAGAGTTTGGTCTGGTCTTTCAATGGGTCGCCGCCGC
CGCCGAAGGAAGAGCTCACCACCGCCGGGAAATCACCGTCTACCGCCGCCGTCAATAGTG
TTTCTGATGAAGCTGGAAGAACAATGAGTGATGATAATGTGTTAGAAGAGCGAGACCCCA
AGTACGATACAATGTTGAATCAAATGGTGGGGAGAATAAAGGCTAAACCAGGTGGCAAAG
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ACACAACTCCTGAATCAACAAGGTATGAGGAGAAACCGGCGCCTCAAGGAACGTTGAACG
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CGATGAGTGTGGATGAGATAGCTAAAAACTACAGGATTGACGTCTCTCAGGTCCAGAAAA
TCACTCAGTTCCTCTCTTTGCCTCCAGAGGTTACTGATAAGCAGAAGAAACGATATGAAT
AAAGGTAAAAAAGACTCTATTTGGTTTTGCCCGTCTATGTGTAACACAGAACCAGAGATG
ACAATGACTTTGAATTATTATTTTCTTCTTTCTGTGGGCAATAATGTAAAAACAGTGTAG
CTAAGAATACAAAGCTTTGTTTTTCAGTTAAGACATGATTCTTTGAAATTAGCAGTTAC


BQ
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AF RR4FR50TF U 1
AF RR4FR50JQ C 132
BS 1 612 RR4FR50TF
BS 613 779 RR4FR50JQ

RD RR4FR50TF 612 0 0
GGGAACACGTTCCTTCCATCTGAACTAGTCCTCCTTAACATGAAGAACGCAACAGAAGCT
GCTTCCCTGACTATCCTCTGAAGAAGAGTTTGGTCTGGTCTTTCAATGGGTCGCCGCCGC
CGCCGAAGGAAGAGCTCACCACCGCCGGGAAATCACCGTCTACCGCCGCCGTCAATAGTG
TTTCTGATGAAGCTGGAAGAACAATGAGTGATGATAATGTGTTAGAAGAGCGAGACCCCA
AGTACGATACAATGTTGAATCAAATGGTGGGGAGAATAAAGGCTAAACCAGGTGGCAAAG
CTGAGATGGGAGAGGCATTGGTAGTGGAGACGTCGAAGAGGCCGCTGCCAAAGCTCCGGA
ACACAACTCCTGAATCAACAAGGTATGAGGAGAAACCGGCGCCTCAAGGAACGTTGAACG
TGGCACAAGTCAGACACATCATGCTTCTATATCAGGGAAAATCTCAGGATCACAACGGTC
CGATGAGTGTGGATGAGATAGCTAAAAACTACAGGATTGACGTCTCTCAGGTCCAGAAAA
TCACTCAGTTCCTCTCTTTGCCTCCAGAGGTTACTGATAAGCAGAAGAAACGATATGAAT
AAAGGTAAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4FR50JQ 648 0 0
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GCTGGAAGAACAATGAGTGATGATAATGTGTTAGAAGAGCGAGACCCCAAGTACGATACA
ATGTTGAATCAAATGGTGGGGAGAATAAAGGCTAAACCAGGTGGCAAAGCTGAGATGGGA
GAGGCATTGGTAGTGGAGACGTCGAAGAGGCCGCTGCCAAAGCTCCGGAACACAACTCCT
GAATCAACAAGGTATGAGGAGAAACCGGCGCCTCAAGGAACGTTGAACGTGGCACAAGTC
AGACACATCATGCTTCTATATCAGGGAAAATTTCAGGATCACAACGGTCCGATGAGTGTG
GATGAGATAGCTAAAAACTACAGGATTGACGTCTCTCAGGTCCAGAAAATCACTCAGTTC
CTCTCTTTGCCTCCAGAGGTTACTGATAAGCAGAAGAAACGATATGAATAAAGGTAAAAA
AGACTCTATTTGGTTTTGCCCGTCTATGTGTAACACAGAACCAGAGATGACAATGACTTT
GAATTATTATTTTCTTCTTTCTGTGGGCAATAATGTAAAAACAGTGTAGCTAAGAATACA
AAGCTTTGTTTTTCAGTTAAGACATGATTCTTTGAAATTAGCAGTTAC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5406Contig1 814 2 3 U
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CGACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAGATATGTTTTTCCTTCTCTCATACTTAGT
TCACAACACTAAACCTGTGGGCCACCAGGATATGGTTGGCTTAGTTATATCGATGATACT
TCTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACGCTGCTTAGTTATATTCGATTTCTTTGGTG
GATGTACTTTTGGCTTTGTCTATATTACCTCTCGGCTTGCTTTTGCCATTCCCCGCTGGG
ATCAATGCCTTATTCAGTCACGGACCCAGACGCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCT
TTGTGGAACTTCATGTCATTGGTTAATGTGTTTGTTGCTTTCCTCTGCGGATATGTTCAT
TATAACAGCGAGTCATCAGCAAGCAAGAAAATCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATG
GGTGAAAGTGAATGGTGGATATTTCCAGCGGGACTGGTCGTGTGTAAGATAATGCAGTCA
CAGCTCATAAATCGGCATGTAGCAAACCTGGAGATACAAGACCGCTCGTTGTACAGTAAG
GATTATCAGCTGTTTTGGCAGTCGTGACCAAAGTCTTGCCAGTGGATGGTCGTATTGGTG
AAGATCTTTGTTAAGGTTTGCATGTAAATAAGTGAGAAGAAACCAAAGATCAAACTACTC
TTGGGGCTGTGTTTATTATATCTGCCTCAATTCGCCTCTTGACTTCAGTTGTTTTGGTGT
ATATCTTGACAGAAATGAATTTGGTTGTCTTAAT


BQ
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AF RR4AB90TF U 2
AF RR4AB90JQ C 1
BS 1 1 RR4AB90JQ
BS 2 504 RR4AB90TF
BS 505 814 RR4AB90JQ

RD RR4AB90TF 505 0 0
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GACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAGATATGTTTTTCCTTCTCTCATACTTAGTT
CACAACACTAAACCTGTGGGCCACCAGGATATGGTTGGCTTAGTTATATCGATGATACTT
CTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACGCTGCTTAGTTATATTCGATTTCTTTGGTGG
ATGTACTTTTGGCTTTGTCTATATTACCTCTCGGCTTGCTTTTGCCATTCCCCGCTGGGA
TCAATGCCTTATTCAGTCACGGACCCAGACGCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCTT
TGTGGAACTTCATGTCATTGGTTAATGTGTTTGTTGCTTTCCTCTGCGGATATGTTCATT
ATAACAGCGAGTCATCAGCAAGCAAGAAAATCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATGG
GTGAAAGTGAATGGTGGATATTT
TC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4AB90JQ 814 0 0
GCACACAAACGCCGAGGATAGCACAACCCGCAGAAAGAACTATGGAGGGATAATCGACCT
TGACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAGATATGTTTTTCCTTCTCTCATTCTTAGT
TCACAACACTAAACCTGTGGGCCACCAGGATATGGTTGGCTTAGTTATATCGATGATACT
TCTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACGCTGCTTAGTTATATTCGATTTCTTTGGTG
GATGTACTTTTGGCTTTGTCTATATTACCTCTCGGCTTGCTTTTGCCATTCCCCGCTGGG
ATCAATGCCTTATTCAGTCACGGACCCAGACGCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCT
TTGTGGAACTTCATGTCATTGGTTAATGTGTTTGTTGCTTTCCTCTGCGGATATGTTCAT
TATAACAGCGAGTCATCAGCAAGCAAGAAAATCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATG
GGTGAAAGTGAATGGTGGATATTTCCAGCGGGACTGGTCGTGTGTAAGATAATGCAGTCA
CAGCTCATAAATCGGCATGTAGCAAACCTGGAGATACAAGACCGCTCGTTGTACAGTAAG
GATTATCAGCTGTTTTGGCAGTCGTGACCAAAGTCTTGCCAGTGGATGGTCGTATTGGTG
AAGATCTTTGTTAAGGTTTGCATGTAAATAAGTGAGAAGAAACCAAAGATCAAACTACTC
TTGGGGCTGTGTTTATTATATCTGCCTCAATTCGCCTCTTGACTTCAGTTGTTTTGGTGT
ATATCTTGACAGAAATGAATTTGGTTGTCTTAAT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL5407Contig1 963 2 2 U
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ACCCTGATCCGCCGCTTCTTCGCCGCGGAAGCGGCGCTCGCGACGAAGACCGAGGCGCCG
AAGCCAAAACCGACGCCGTCTCCGTCGCCTGATCGTGCGAAATGGGACTACAGGGGACAG
AGACAGATCATCCCTTTAGGACAGTGGCTCCCGAAGGTAGCCGTCGATGCCTACGTGGCA
CCCAACGTCGTGTTGGCCGGCCAGGTCACGGTCTGGGACGGCTCTTCCGTCTGGAACGGC
GCCGTTTTGCGCGGGGATCTCAACAAGATCACTTTGGGATTCTGCTCGAATGTTCAGGAG
CGGTGTGTTGTACATGCCGCGTGGTCTTCCCCAACAGGATTACCAGCAGAGACGTTGATT
GACCGGTACGTGACAGTTGGTGCATACAGTCTTCTAAGATCATGTACCATCGAACCAGAG
TGCATAATCGGGCAACACTCGATACTAATGGAAGGTTCTTTGGTCGAGACCCGGTCAATC
CTGGAAGCTGGTTCGGTTGTGCCACCAGGAAGAAGGATCCCGTCAGGTGAGCTATGGGGA
GGCAATCCAGCAAGGTTTATAAGAACGCTAACCAACGAAGAAACCTTAGAGATCCCGAAA
CTCGCTGTAGCCATCAACCATTTAAGTGGAGATTACTTCTCTGAGTTCTTGCCTTACTCC
ACTGTCTACTTAGAGGTAGAGAAGTTCAAGAAGTCCCTTGGAATCGCTGTTTAGAAGAAG
CTTCGTTTTCTTTCTTCAAAGCTTCTCTTATGGGTTTCGTGTGCTTATGTCTCTCTATTC
ATATTGCAATAAGTAGCTGAAGAACATGAACACATTCAAATGTTTGTCTTGTTTTTTTGG
TTTCTTTGTAAACTGATTTTGGCTGGATAAGGCCAGAGTGATAATGGCGATGACTTCTTG
TTC


BQ
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10 10 10 

AF RR4EK09TF U 1
AF RR4EK09JQ C 295
BS 1 718 RR4EK09TF
BS 719 963 RR4EK09JQ

RD RR4EK09TF 718 0 0
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ACCCTGATCCGCCGCTTCTTCGCCGCGGAAGCGGCGCTCGCGACGAAGACCGAGGCGCCG
AAGCCAAAACCGACGCCGTCTCCGTCGCCTGATCGTGCGAAATGGGACTACAGGGGACAG
AGACAGATCATCCCTTTAGGACAGTGGCTCCCGAAGGTAGCCGTCGATGCCTACGTGGCA
CCCAACGTCGTGTTGGCCGGCCAGGTCACGGTCTGGGACGGCTCTTCCGTCTGGAACGGC
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GGCAATCCAGCAAGGTTTATAAGAACGCTAACCAACGAAGAAACCTTAGAGATCCCGAAA
CTCGCTGTAGCCATCAACCATTTAAGTGGAGATTACTTCTCTGAGTTCTTGCCTTACT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EK09JQ 669 0 0
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CAGGAGCGGTGTGTTGTACATGCCGCGTGGTCTTCCCCAACAGGATTACCAGCAGAGACG
TTGATTGACCGGTACGTGACAGTTGGTGCATACAGTCTTCTAAGATCATGTACCATCGAA
CCAGAGTGCATAATCGGGCAACACTCGATACTAATGGAAGGTTCTTTGGTCGAGACCCGG
TCAATCCTGGAAGCTGGTTCGGTTGTGCCACCAGGAAGAAGGATCCCGTCAGGTGAGCTA
TGGGGAGGCAATCCAGCAAGGTTTATAAGAACGCTAACCAACGAAGAAACCTTAGAGATC
CCGAAACTCGCTGTAGCCATCAACCATTTAAGTGGAGATTACTTCTCTGAGTTCTTGCCT
TACTCCACTGTCTACTTAGAGGTAGAGAAGTTCAAGAAGTCCCTTGGAATCGCTGTTTAG
AAGAAGCTTCGTTTTCTTTCTTCAAAGCTTCTCTTATGGGTTTCGTGTGCTTATGTCTCT
CTATTCATATTGCAATAAGTAGCTGAAGAACATGAACACATTCAAATGTTTGTCTTGTTT
TTTTGGTTTCTTTGTAAACTGATTTTGGCTGGATAAGGCCAGAGTGATAATGGCGATGAC
TTCTTGTTC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

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AACAAAAAAAAACATTGACAAGGCTAAGATCATTAAAGCAGCCATAGCTACAGAACGAAA
CCCTAAATCGCTAAAAAGAAAAGAAGAGACCTTAATCAAATCCAGGAATTGAAGGGGGGG
GGGGGGGGTGAAAGTAAACATACCCAG


BQ
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AF RR4GD80TF U 1
AF RR4G222TF U 1
BS 1 627 RR4G222TF

RD RR4GD80TF 599 0 0
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CCCTAAATCGCTAAAAAGAAAAGAAGAGACCTTAATCAAATCCAGGAATTGA
GAGGGGG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4G222TF 627 0 0
GAGAGAGCTACACGTTTGCAATACTTGTCACGAGAGAAATTGAAATTTACACTATGTGAT
CGTAAAAACAGTTCTTCCATGAGAAATAACGTAAACACCACTAGTGAGGAAAAACAAGGC
GTAGTACCTCGTTGTAAGTAGTCCTTCCTTTGCTTTCCACTTTTTCACAAACTGAGAGGA
AGCCGAGGAGAAACAACATCAGTTCAATTTAACAAATAAAATTAAAGAGGCATCATCCAT
AACTCATAGCTATAAACTTTATGGAAAAATCATTTAGATGAACCTTTCATGCTAAATTGA
CGTAGGCCCCTTCCAGTTTTATCTGGACCAGTAGCACGCTGTCTACTCTTCTTCTTCTTA
CCACTGCTGATACAAAAGATATTTTTAACAACTTTCACTGGAGACAGTAACCTAAACAGG
TCCCTATGTAAAAGTACGATCCACACACCATAGTTACACATCTAATTGAAGTCTATGCCA
AACAAAAAAAAACATTGACAAGGCTAAGATCATTAAAGCAGCCATAGCTACAGAACGAAA
CCCTAAATCGCTAAAAAGAAAAGAAGAGACCTTAATCAAATCCAGGAATTGAAGGGGGGG
GGGGGGGGTGAAAGTAAACATACCCAG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5409Contig1 995 2 8 U
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CGTACGGTGAAGGAATCGACGGACTCCGCCATTCGCTCTGCTCGTTTTCTCCGTGAAAAC
TCCACCTCTCAGTTCCGCTCTATACAGGATTTCATTCCACATGCTTTGACTCAGTATAAG
ACCTATGAGAATGCTTTCTTCAGCAAAGTAACTGAAGAATTAATAAACGCAAAGGAGCAT
CCAGCTGCTGCTGCTGGGATTGGTCTCGCTGCTGGTCTTGTTCTTATGCGAGGCCCTCGA
AGATTCTTGTTTCGTCGTACACTCGGCCGGTTTCAGAGCGAAGAGGCTCAGTTCTGGAGA
GCTGAGAAGCATGTCCAGGAGCTGAACATGTCTGTAGACTTGATGAAAAAGGAGAGCAGT
AAATTACTAGAGAGGTCGGCTTTAGCAGAGAAGGATATGAAGCGCGGTCTTTCTGAACTC
ATGGACTCTGGAAACAATATACATCGTCTTGCTAAGTCCGTTCACAAGGTCGAATGCCAA
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GCCGAAGTGGCTTCTATGACTTCGCTCTTGAGACTGAAGAGGATTGCATTGAACAAAAGA
ATCATGGGGATGTCTGAGCTAGGAGTTCCCGTTTGATATACAACACAAGTCTTGATTTTT
TTCCCAAGGTATTTCAAGCAAGATTTCTCGTCAATAAACATCTAACTCTGTCTAAATCCA
AATCTTTATTTTGAGATAGTGTTTCTTTTCCTGATATTTGAGACCATTAGCTTATTTGCT
CGGTGATTTATGAGAAAACATATATAAAGTTACTG


BQ
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AF RR4GA28TF U 1
AF RR4GA28JQ C 213
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GCTAGAG

QA 1 712 1 712
DS 

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TGAAGAATTAATAAACGCAAAGGAGCATCCAGCTGCTGCTGCTGGGATTGGTCTCGCTGC
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TCAGAGCGAAGAGGCTCAGTTCTGGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGGAGCTGAACATGTC
TGTAGACTTGATGAAAAAGGAGAGCAGTAAATTACTAGAGAGGTCGGCTTTAGCAGAGAA
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CTG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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TAATTAG


BQ
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AF RR4G080JQ C 1
AF RR4G080TF U 1
BS 1 487 RR4G080TF

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TAATTAG

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR4G080TF 487 0 0
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CTAGATTTCAAGATCGATGGGGATGGTGGTGGTCATATCTCTTCCTCTAATTTTCTTCTG
CCTTCTTCTCGGATTCGGCTGCTACTTCCTTGGCAAATCTCGTGGCCGTCGTGAGATCCA
TACAAATCCTCAAGTGTATGGAGCTCCTGCTCCGCCTCCCGGTGCAATCATCTCCGCAGC
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GCATTTGATGTCATTAGAAAGTTCAAGGAGTGGTATGGAGTCTATGAACCCTATGGTTTC
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TAATTAG

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL5411Contig1 1088 2 2 U
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GTCCTTCAAACTCGGTTTTGAGGTTAATGGGAAAAGACTTTATGGTCATGAACCAGGGAG
AAGCAGACAACAAGGATGAAGCATCTCGGATTAGCTTAAAACCAACCCCTCAGTTCCATG
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TATGCAGTTTAAGAAGAAACTGAGAAGTGGGTTCTCATGGAGCATGGGTGCACTGGGGGG
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TGTAGAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ51TF U 1
AF RR4AQ51JQ C 287
BS 1 773 RR4AQ51TF
BS 774 1088 RR4AQ51JQ

RD RR4AQ51TF 773 0 0
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GAGGAAAAGGAAGCTTGTTTGTAGAGGTTGATACCATTCCCATTCCAGGCCCTCCAGGCT
CCTTTCTACCGAGTCCCCGGGGTATGTGTTTTGATGAGAATCTTGGAAACTCGTCTGTTG
TTACAAGCCAGTTCCAATCTTCCATGGAACAGCTTGACAGAAACTCATCTGAATCACCTG
TTTCTGCGGTTTCAAACTTTCCAGCTGGCAGATTCAACTTTCCTTCTTCTTTGGACATTC
CTTCAATGAGCTTTTGTGTTCCATCTCATCATGGGACTATCCCTGAGGCTGAGCCGATGA
GTGTTGACAAGGAAACACCTTGGAGATATAGAAACAACGGTCATGATGAGCCCTGTTGTT
GCCAAAGAAAAGACGGAATCTCCTTGAATCATGAAGCATCTCATCTACTGCAGCGAAGAG
CCATGAACTTAACCAAATCTCCTCCAAATCATGCGTTTGAGCAGTCACAGGCACAGCACA
TGATCCAGCAAGAGTTTAATCTTCATAGTAAATTCTCCAGCAGTGCTGTTGTGCCTCCGA
GTCCTTCAAACTCGGTTTTGAGGTTAATGGGAAAAGACTTTATGGTCATGAACCAGGGAG
AAGCAGACAACAAGGATGAAGCATCTCGGATTAGCTTAAAACCAACCCCTCAGTTCCATG
ATCATCCTCAGCCTTGCGCTGGAACGGGGTTATACTTCAACACAAGTCTCTGT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4AQ51JQ 802 0 0
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GGCTGAGCCGATGAGTGTTGACAAGGAAACACCTTGGAGATATAGAAACAACGGTCATGA
TGAGCCCTGTTGTTGCCAAAGAAAAGACGGAATCTCCTTGAATCATGAAGCATCTCATCT
ACTGCAGCGAAGAGCCATGAACTTAACCAAATCTCCTCCAAATCATGCGTTTGAGCAGTC
ACAGGCACAGCACATGATCCAGCAAGAGTTTAATCTTCATAGTAAATTCTCCAGCAGTGC
TGTTGTGCCTCCGAGTCCTTCAAACTCGGTTTTGAGGTTAATGGGAAAAGACTTTATGGT
CATGAACCAGGGAGAAGCAGACAACAAGGATGAAGCATCTCGGATTAGCTTAAAACCAAC
CCCTCAGTTCCATGATCATCCTCAGCCTTGCGCTGGAACGGGGTTATACTTCAACACAAG
TCTCTGTTTAAGGAACAGTTTCGAGTCATCACATCAGCAACCGCAGCAGCAAACACAAGC
TTCACCATTCAGAAACATTTTTGATCACGTGAGGCACTTTTTTCCGAGCTAGCCAACGCA
AAAGATTGGACCTTTATGCAGTTTAAGAAGAAACTGAGAAGTGGGTTCTCATGGAGCATG
GGTGCACTGGGGGGTTTTAAGGTTACATTTGGTATGTTTTACTGCATTTTCCATGCTTTA
TCTCTTTCTGTAGAGACTGTGTAGTTACGGTTTACAAAAAAAAAGAAGCAAACACTTGAA
AATAACAAACATTCTGTAGAGG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL5412Contig1 927 2 2 U
GGGAGAAAAGGAAGTCAAAAAAGAATCTATTTGAGAGAGTTCAGAGGAGTGGATGGGGGA
CACGAAGGTGGAGACAATCTCGAGATTAGCTCAATGGCGGATTGAAAATTTTGGACCTTG
CTCTTTCAAAAAGTCTGATCCTTTCAAAGTTGGAATCTGGAATTGGCATCTGTCTATAGA
GAGGAATCGTTTCCTATCTGTTAGGCTCTTCCCAGAACTCTCTCGTGTATCCAAGGAACA
ACCTCCTATTGCTAAATTTGTTCTTCGTGTCTCCAACGTTGGCCCTAACCGTAAACTATA
CATCTCTCCTGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACAACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGA
TTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGACGTTGAGTTTCTTGATCTCAAACGTCTTCA
GAAGCATGTTCCATCACGACCTCAAGGAGAAAGAGTCATCCACCATCCACATCGACGACA
TGTCTAGAGAATCCTGCATGGCGCTCCTTAGCTACCTCCACGGAAGCATAACGCAGGAAG
ATATAAACTCCGGGAACGTGCTGGAGAGGCTGCAGGAGGCTTGGCTTCATCAGCTGGAGA
AACTGAAGAAAGGGTGTTTGATGTATTTGTTTGATTTCGGAAAGATTTATGATGTCAGGG
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AGGTTTTGTCGGTGTGGAAACCGGTTTGAGAAATAATATTATACTTTTGAAACATTGGTT
TTCAAAATGTTTCAGTTTGATTGTGTTCTGTGTCTATAATCATATGATATCTTGCTTTCT
TGTGTTGTGTGTCTGTAAACATTTCTCTATTGTTCTCTCTATTTACGGTGGGTTTAGCTC
TTCTTTGCTTTTACTGTTAGTTCTCAT


BQ
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AF RR4DV45TF U 1
AF RR4DV45JQ C 150
BS 1 635 RR4DV45TF
BS 636 927 RR4DV45JQ

RD RR4DV45TF 635 0 0
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CACGAAGGTGGAGACAATCTCGAGATTAGCTCAATGGCGGATTGAAAATTTTGGACCTTG
CTCTTTCAAAAAGTCTGATCCTTTCAAAGTTGGAATCTGGAATTGGCATCTGTCTATAGA
GAGGAATCGTTTCCTATCTGTTAGGCTCTTCCCAGAACTCTCTCGTGTATCCAAGGAACA
ACCTCCTATTGCTAAATTTGTTCTTCGTGTCTCCAACGTTGGCCCTAACCGTAAACTATA
CATCTCTCCTGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACAACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGA
TTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGACGTTGAGTTTCTTGATCTCAAACGTCTTCA
GAAGCATGTTCCATCACGACCTCAAGGAGAAAGAGTCATCCACCATCCACATCGACGACA
TGTCTAGAGAATCCTGCATGGCGCTCCTTAGCTACCTCCACGGAAGCATAACGCAGGAAG
ATATAAACTCCGGGAACGTGCTGGAGAGGCTGCAGGAGGCTTGGCTTCATCAGCTGGAGA
AACTGAAGAAAGGGTGTTTGATGTATTTGTTTGAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4DV45JQ 778 0 0
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TCCCAGAACTCTCTCGTGTATCCAAGGAACAACCTCCTATTGCTAAATTTGTTCTTCGTG
TCTCCAACGTTGGCCCTAACCGTAAACTATACATCTCTCCTGTGTATGAGAAACTGCTGC
GTACAACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGATTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTG
ACGTTGAGTTTCTTGATCTCAAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCATCACGACCTCAAGGAG
AAAGAGTCATCCACCATCCACATCGACGACATGTCTAGAGAATCCTGCATGGCGCTCCTT
AGCTACCTCCACGGAAGCATAACGCAGGAAGATATAAACTCCGGGAACGTGCTGGAGAGG
CTGCAGGAGGCTTGGCTTCATCAGCTGGAGAAACTGAAGAAAGGGTGTTTGATGTATTTG
TTTGATTTCGGAAAGATTTATGATGTCAGGGAGGAGATCAGCGGTTTCTTCAGGCAGGCT
GATCGTGAGCTGATGCTGGAGATGTTCCAGGAGGTTTTGTCGGTGTGGAAACCGGTTTGA
GAAATAATATTATACTTTTGAAACATTGGTTTTCAAAATGTTTCAGTTTGATTGTGTTCT
GTGTCTATAATCATATGATATCTTGCTTTCTTGTGTTGTGTGTCTGTAAACATTTCTCTA
TTGTTCTCTCTATTTACGGTGGGTTTAGCTCTTCTTTGCTTTTACTGTTAGTTCTCAT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5413Contig1 1006 2 2 U
GGAACGCTAGCTTATCAAAAGCTGACGAGGTGGTAGGTCTTCAAATAAGAGTGTTCAGCA
CGCCAGGTGGATATTTCCAGCACGTGATGGACCAAGTCGTGTCATGCACACAAAGAGAGA
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TGTTTTCAGAGCGACCTAGCTCAACAGGGGAGGTCATTGAAGTGTATCAGCCAAGTGGAG
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TTCTGAGTTTAACTGATAAGCTTGTAACAAGCACAAGGTCTACCTTTGGATATGCAGCTC
CCGGCACACCGTGTGTTAGAGCCATGTCGATGGAGCCTTGTTTTATTAGAGCTCCTCTCC
ATGGCTGTCAATCGAAGGCAATTAAAACCGCACCTTTTTTAAGACGTTGTGAGGATTGGA
ATCTAGGGATTAAGCTAGTTGATGCTCCAGATAAATTTTGGTGGTGGTGGTAACCATTAC
ATGTGGTGGTAACTATTTATTTGTATACTTAACTAGAACAATGTTCTAGAGACAGATTTT
GGCTTGAATAGGCGTGGGTGTTCAGCATCCACAAACTCACTTGGAGGTTCAACAACTCTA
TCCGTTGGTGCTAGCAGGAAACATGAGATTATAATCCTCGTTTTCGCTTCGTTGCATTGC
ACTCTATGCTTCACATTGCACAACCTCCCATTGCTCCATATCTATCAAGAAAGACATCAT
GTTTAGCAACGACCCATTTTTCAAAGTTTTGAAAACTATATTAGTGACAAAGGCGGACCT
ACATGAACACAAGGGGGTGCAAATGACACACCATTAATTTTGATTTTCTTCTTATAGCTC
ATAGGTGTTTTTAATTTTGAACCAGCATATATTCACGTTTGACACC


BQ
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AF RR4B622TF U 1
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BS 734 1006 RR4B622JQ

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ATGTGGTGGTAACTATTTATTTGTATACTTAACTAGAACAATGTTCTAGAGACAGATTTT
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TCCGTTGGTGCTA

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DS 

RD RR4B622JQ 759 0 0
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TTTAACTGATAAGCTTGTAACAAGCACAAGGTCTACCTTTGGATATGCAGCTCCCGGCAC
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TCAATCGAAGGCAATTAAAACCGCACCTTTTTTAAGACGTTGTGAGGATTGGAATCTAGG
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GGTAACTATTTATTTGTATACTTAACTAGAACAATGTTCTAGAGACAGATTTTGGCTTGA
ATAGGCGTGGGTGTTCAGCATCCACAAACTCACTTGGAGGTTCAACAACTCTATCCGTTG
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TTTTTAATTTTGAACCAGCATATATTCACGTTTGACACC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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ACAAAACATCCACGAGATCTCAATCTCTTTCAACGTCTTGAGAGAGCTAGCTCCGGCCAA
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CAAAACCATATTCCTCGAAGAAGATCTTGAGTGGTTTCAGAAAGTGACCAAAGACTCTCC
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GCGTTCTTACAAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCGGCGAAAGCGTATCTCAGAGGAAACGA
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GATCATGCTCGATGCTCCTAAAGGTTACTCCGCCGAAGCTCCGGGAAGAATGGCGGCGAT
TTACTCGGCGGCGGTTATGGCTAGGAACCGGAAGAAACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTT
GCACGACGTTAACCGGAGAGTTGAGAAGACTTTCGCGGAGGAGTTTCTATGCGCAAAATA
CAGAGTTCATGCCGCCGGGAGGTTATGGCATTTCGCGATTCCTCCGGTGGCTTCAAACGC
TACAATCGACGGTGGCGATTACAGGTTTTGTTAAGGATTGTGACACGTCACACAGCTTTT
GTCATTTCCACTTTTGCCCCTTTTTACTTTTCGGATCTTATTACATAGGGTTCACTTATT
ATCTGATTTAATGCCGACAGTTTTGGATTTCATCTCGTGTTTCGGATCTACTACATCTCG
GTATTGTCTTAGTTACGTGGACTTTCCTTATCTTGCATAGGTCATTTTTACGGAATACTT
TCGTCATTTATGAATTATGATAATTTGACACTTATATCTTAAGTGGAAGCCG


BQ
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AF RR4DD09TF U 1
AF RR4DD09JQ C 541
BS 1 618 RR4DD09TF
BS 619 1192 RR4DD09JQ

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CAGGATGAGCAACATAATCCCATCGGAGAAACGATCGATCGTCACCTTCGTTTTACTTGC
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CAAAACCATATTCCTCGAAGAAGATCTTGAGTGGTTTCAGAAAGTGACCAAAGACTCTCC
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QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4DD09JQ 652 0 0
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TTACTCGGCGGCGGTTATGGCTAGGAACCGGAAGAAACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTT
GCACGACGTTAACCGGAGAGTTGAGAAGACTTTCGCGGAGGAGTTTCTATGCGCAAAATA
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TACAATCGACGGTGGCGATTACAGGTTTTGTTAAGGATTGTGACACGTCACACAGCTTTT
GTCATTTCCACTTTTGCCCCTTTTTACTTTTCGGATCTTATTACATAGGGTTCACTTATT
ATCTGATTTAATGCCGACAGTTTTGGATTTCATCTCGTGTTTCGGATCTACTACATCTCG
GTATTGTCTTAGTTACGTGGACTTTCCTTATCTTGCATAGGTCATTTTTACGGAATACTT
TCGTCATTTATGAATTATGATAATTTGACACTTATATCTTAAGTGGAAGCCG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5415Contig1 735 2 5 U
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TTAAAGATATTTTGCGAAAGTAATCCACCTGGTTTAAAGCAGTGTTGAATATTAACTCCT
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TAGAAAAAGCGGGAGCAGGAGGTATAGTCAGCATCTTCACCGATATTTTCCGGAGGTAAT
CAGTCTGATTAACAGCACTGCTGAAAACTTTCTCCTCGAATCTGGCAGCAATTCCCTTGA
GCTCGTTAATCCCTTCTGGTCCAGAATGTGTAACGTGCTTCATTAGTATACCCATTATCT
TGTTGACGATCCTATGACGTGAATCCGGTGGCACTTGAGCTCTCCAGTCACCTGAGTTTA
TGGCAGGTTCTTCGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4C269JQ U 1
AF RR4CT53JQ U 4
BS 1 405 RR4C269JQ
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BS 487 735 RR4C269JQ

RD RR4C269JQ 735 0 0
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TGGCAGGTTCTTCGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4CT53JQ 732 0 0
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CTCTCTGTTCTTAATATCATCAATACATATAAATATGGAATCGCCTAAAAGTTCCAAACG
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AAGATATTTTGCGAAAGTAATCCACCTGGTTTAAAGCAGTGTTGAATATTAACTCCTCGA
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TTCTCCAGTCACCTGAGTTCACGGAAGGTTCTTCTTTCGGCAAAAAAGGCACTGAATTGT
CATTGAACATAAAATTGCTCAGTTCATCCAAAGCTAGTTTGTTACTCTCAGCAGGGATAG
AAAAAGCGGGAGCAGGAGGTATAGTCAGCATCTTCACCGATATTTTCCGGAGGTAATCAG
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CGTTAATCCCTTCTGGTCCAGAATGTGTAACGTGCTTCATTAGTATACCCATTATCTTGT
TGACGATCCTATGACGTGAATCCGGTGGCACTTGAGCTCTCCAGTCACCTGAGTTTATGG
CAGGTTCTTCGT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGAAGAGGCTATTCCTCTCGATGCTTGGGTCCCTGCTGATGATGTTGTTCCACTTTGCAA
AGCTGTTCTTGAGACCTTCAGAGATCTTGGAAACAGAGGAAACCGACAGAAGATAAGAAT
GATGTACCTCATCGACGAACTTGGTATTGAAGGATTTAGAGCTGAAGTAGAGAAGAGAAT
GCCAAGTGGGAAACTGGAGAGAGAGTCGCCGGAGGATCTTGTGAACAAGAAATGGGAGAG
GAGAGACTATTTCGGAGTCCACCCTCAGAAACAAGAAGGTCTTAGCTACATTGGCCTTCA
CGTTCCTGTAGGTAGGCTACAAGCAGATGACATGGACGAGCTTGCTCGATTAGTTGACAC
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TACTTCCAAAACCGAAGCTCTGCTTCAAGAACCGTTCCTCAAGAACCGGTTCTCACCCGA
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TAAGAAAGGTGTTCCTATTACGGATTTGGTTCCGTTGGTGGCTGAGATTCTAGTCAAAAA
GTTTGGTGCTGTGCCTAGAGTGAGAGAAGAGAATGAAGATTGATTGTATCAGAGCTTTCG
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BQ
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AF RR4G980TF U 1
AF RR4G980JQ C 221
BS 1 684 RR4G980TF
BS 685 1011 RR4G980JQ

RD RR4G980TF 684 0 0
GAAGGATGGTCGGTTTGGATTCAATTTGCTTGTGGGAGGTTTCTTTAGTGCCAAAAGATG
CGAAGAGGCTATTCCTCTCGATGCTTGGGTCCCTGCTGATGATGTTGTTCCACTTTGCAA
AGCTGTTCTTGAGACCTTCAGAGATCTTGGAAACAGAGGAAACCGACAGAAGATAAGAAT
GATGTACCTCATCGACGAACTTGGTATTGAAGGATTTAGAGCTGAAGTAGAGAAGAGAAT
GCCAAGTGGGAAACTGGAGAGAGAGTCGCCGGAGGATCTTGTGAACAAGAAATGGGAGAG
GAGAGACTATTTCGGAGTCCACCCTCAGAAACAAGAAGGTCTTAGCTACATTGGCCTTCA
CGTTCCTGTAGGTAGGCTACAAGCAGATGACATGGACGAGCTTGCTCGATTAGTTGACAC
CTACGGTTCGGGCGAGCTCAGACTCACGGTAGAGCAAAACATCATCATCCCAAATATAGA
TACTTCCAAAACCGAAGCTCTGCTTCAAGAACCGTTCCTCAAGAACCGGTTCTCACCCGA
GCCATCGATCTTGATGAAAGGTCTGGTTGCTTGCACCGGAAGCCAGTTCTGCGGACAAGC
GATAATCGAGACAAAGATAAATGCCTTGAAAGTGACGGAAGAAGTTGAGAGACTCGTAGC
TGTGCCCAAGCCTGTGAGGATGCA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4G980JQ 791 0 0
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GTGAACAAGAAATGGGAGAGGAGAGACTATTTCGGAGTCCACCCTCAGAAACAAGAAGGT
CTTAGCTACATTGGCCTTCACGTTCCTGTAGGTAGGCTACAAGCAGATGACATGGACGAG
CTTGCTCGATTAGTTGACACCTACGGTTCGGGCGAGCTCAGACTCACGGTAGAGCAAAAC
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AAGAACCGGTTCTCACCCGAGCCATCGATCTTGATGAAAGGTCTGGTTGCTTGCACCGGA
AGCCAGTTCTGCGGACAAGCGATAATCGAGACAAAGATAAATGCCTTGAAAGTGACGGAA
GAAGTTGAGAGACTCGTAGCTGTGCCCAAGCCTGTGAGGATGCATTGGACAGGGTGTCCC
AACACTTGCGGACAAGTCCAAGTGGCGGATATCGGATTCATGGGATGCTTGACACGTGGC
GAGAATGGTAAGCCTGTGGAGGGTGCTGACGTTTACGTTGGAGGACGAATAGGAAGCGAC
TCTCATATTGGAGAGATTTATAAGAAAGGTGTTCCTATTACGGATTTGGTTCCGTTGGTG
GCTGAGATTCTAGTCAAAAAGTTTGGTGCTGTGCCTAGAGTGAGAGAAGAGAATGAAGAT
TGATTGTATCAGAGCTTTCGGAATTCATTAAGTTGAAAAGTTATAAAAAAATTCTTGATT
CAACTTAAAGC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5419Contig1 705 2 3 U
TTTTTTTGTGGTCTCGTTGTATCGCTGTCTCCACCTCGATTAGGGTTAAGGATTTGAGGC
GAAATTCATCTTCAACCATACAACCAATCTTCAATCATGGATATGCTGAAGAAGCGAAGG
CTCGACGAGAACGGCAACGGGATCCTCAACGACGTCTCTTCCCGATTGACTCCACACGAC
GCTCGGAAGCTCATCGAGCGATTCTCCACCGATCAGCTCCTCGACATCCTACAAAATGCC
GTCGCGCGACACCCCGACGTCCTCGAGCTCGTCCGATCGACAGCCGACTCGGACATCACG
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CTCTTCTCCGCTTACGGAGATCTCGACGAGGCGATCGTGATCCTCGACAAGGTGACCGCG
AAGTCGAAGGGGTACGGTTTCGTGACGTTCAAGCACGTGGACGGAGCGCTCCTCGCGTTG
AAGGATCCGTCTAAGAAGATCGACGGGCGCGTGACGGTCACGCAGCTCGCTGCCGCTGGG
AATCAAGGTGGTTCTGCTGGTGTGGCGTCGGCGGCGAATGTTTCGGATGTGTCGATGAGG
AAGATTTATGTGGCGAATGTGCCGGTTGATATGCCTGCGGATAGGTTGTTGGATCTGTTT
TTGGCTTATGGGGAGATTGAGGAAGTCCGTTGGGGTTTGATAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FT23TF U 1
AF RR4EN43TF U 1
BS 1 278 RR4EN43TF
BS 279 279 RR4FT23TF
BS 280 705 RR4EN43TF

RD RR4FT23TF 421 0 0
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CTCGACGAGAACGGCAACGGGATCCTCAACGACGTCTCTTCCCGATTGACTCCACACGAC
GCTCGGAAGCTCATCGAGCGATTCTCCACCGATCAGCTCCTCGACATCCTACAAAATGCC
GTCGCGCGACACCCCGACGTCCTCGAGCTCGTCCGATCGACGGCCGACTCGGACATCACG
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CTCTTCTCCGCTTACGGAGATCTCGACGAGGCGATCGTGATCCTCGACAAGGTGACCGCG
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4EN43TF 705 0 0
TTTTTTTGTGGTCTCGTTGTATCGCTGTCTCCACCTCGATTAGGGTTAAGGATTTGAGGC
GAAATTCATCTTCAACCATACAACCAATCTTCAATCATGGATATGCTGAAGAAGCGAAGG
CTCGACGAGAACGGCAACGGGATCCTCAACGACGTCTCTTCCCGATTGACTCCACACGAC
GCTCGGAAGCTCATCGAGCGATTCTCCACCGATCAGCTCCTCGACATCCTACAAAATGCC
GTCGCGCGACACCCCGACGTCCTCGAGCTCGTCCGATCTACAGCCGACTCGGACATCACG
CAGAGGAAGCTCTTCATCCGCGGCCTCGCGGCGGAGACGACGACGGAAGGTCTCCGATCG
CTCTTCTCCGCTTACGGAGATCTCGACGAGGCGATCGTGATCCTCGACAAGGTGACCGCG
AAGTCGAAGGGGTACGGTTTCGTGACGTTCAAGCACGTGGACGGAGCGCTCCTCGCGTTG
AAGGATCCGTCTAAGAAGATCGACGGGCGCGTGACGGTCACGCAGCTCGCTGCCGCTGGG
AATCAAGGTGGTTCTGCTGGTGTGGCGTCGGCGGCGAATGTTTCGGATGTGTCGATGAGG
AAGATTTATGTGGCGAATGTGCCGGTTGATATGCCTGCGGATAGGTTGTTGGATCTGTTT
TTGGCTTATGGGGAGATTGAGGAAGTCCGTTGGGGTTTGATAAGT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5420Contig1 945 2 2 U
GGGCCGTCTTGTTCTCTCATAAAAACTCTTGGACTCGCTTCTTCTCGATCTCCGCAGCTT
CGGTTTCGTCAATGGCTTTACCCAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCG
TCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGAAAAACCACCTTTGTCAAGAGACATCTCACCGGAG
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CAAACTGTGGCAAGATCCGGTTCTACTGTTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTG
GGTTAAGGGATGGATACTACATCCACGGTCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAG
CACGTCTGACATACAAGAATGTTCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAA
ACATCCCGACTGTACTCTGCGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGA
AGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAATACTACGAGATATCTGCCAAGAGTA
ACTACAACTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACC
TTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCCCCAGAAGTACAGATTGACATGGCTGCTC
AGCATCAGCACGAGGTGGAGCTCGCAGCCGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATG
ATGACACGTTCGAGTAGAGAGAGAGAGAGACACTATTATCATTTCTTGTTTTTTTTTTTT
TTTTTCTCTAGTGGAGCTATTTCTATTTGTGTTTGTATTCTTCAAGATATGAAGTTTGAA
AATCTGAGGTTTGCGATGGCACTAGTCATTTTTCCATTCGGAGTCTTTCTGATACTAGTT
GAAGCAAAAGCCAAGCTTTCTTATAAAAAAGCACCTTTTTTGGTG


BQ
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AF RR4A609TF U 1
AF RR4A609JQ C 267
BS 1 765 RR4A609TF
BS 766 945 RR4A609JQ

RD RR4A609TF 765 0 0
GGGCCGTCTTGTTCTCTCATAAAAACTCTTGGACTCGCTTCTTCTCGATCTCCGCAGCTT
CGGTTTCGTCAATGGCTTTACCCAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCG
TCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGAAAAACCACCTTTGTCAAGAGACATCTCACCGGAG
AGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGATTTTTTCA
CAAACTGTGGCAAGATCCGGTTCTACTGTTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTG
GGTTAAGGGATGGATACTACATCCACGGTCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAG
CACGTCTGACATACAAGAATGTTCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAA
ACATCCCGACTGTACTCTGCGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGA
AGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAATACTACGAGATATCTGCCAAGAGTA
ACTACAACTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACC
TTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCCCCAGAAGTACAGATTGACATGGCTGCTC
AGCATCAGCACGAGGTGGAGCTCGCAGCCGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATG
ATGACACGTTCGAGTAGAGAGAGAGAGAGACACTATTATCATTTC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4A609JQ 679 0 0
TGTTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGGTTAAGGGATGGATACTACATCCAC
GGTCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTTCCA
ACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGACTGTACTTTGCGGGAAC
AAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAG
AATTTCCAATACTACGAGATATTTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCATTTTTG
TACCTTGCTAGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTT
GCTCCCCCAGAAGTACAGATTGACATGGCTGCTCAGCATCAGCACGAGGTGGAGCTCGCA
GCCGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACGTTCGAGTAGAGAGAGAGA
GAGACACTATTATCATTTCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTAGTGGAGCTATTTCTAT
TTGTGTTTGTATTCTTCAAGATATGAAGTTTGAAAATCTGAGGTTTGCGATGGCACTAGT
CATTTTTCCATTCGGAGTCTTTCTGATACTAGTTGAAGCAAAAGCCAAGCTTTCTTATAA
AAAAGCACCTTTTTTGGTG

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL5421Contig1 787 2 4 U
CGCAGTACATAAAATCTTAAAACATTCAGTGGTCTAAAATGGTTGGGTTACTTCTCCTAT
CATGGGAAAAGAGATACACAAATAGGATATTACATATTGGTACACACAAAATTACATATA
TCTAAAGCTTTTTTTCTGCTTCCTTTTATGTTATCATCTTTATTATTTCCTCTTCTTCTT
CTTCAGACAACAGACTAGTCGATCGTCATTGGCTGCGTCATGCAACATCTGAAACGGGCT
TTTCTCACTGTCGTCATAACCTCGGTTTCAGCAGCCTCAAGAAGATTGACAACCTCTGCA
AAACAAGGACGGACTTCAGGGTTCGCATCCCAGCAACGTGTCATGATCTCCCCAAGCACA
GGGAGGCAATCAGCTGGGACAGTTGAACGAACTCCTCGGTTTACCACAGCAAACGCAGCT
TGAACCGCCGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTATCAGCTCCCACAGCACGATT
CCAAAACTATAGACGTCCACTTTTTGAGTGTAGGGTCTATGCTGGATCATCTCTGGAGCC
ATCCATCTGTAAGTCCCGGTCTCTGGTGTCATCCCTTCAGTCTGAACTTCAATTCTCGCA
ACGCCAAAATCAGCAATCTTGATGGACCGGTCAGCCGATATGAGGAGGTTATCCGACTTC
AAATCCCGGTGTATAAAGTTGCGCTCATGGACGTAAGCCATACCTCCAGCAACATCCAAC
GCCTGTTTAACAGCTAACTTAAAGGCACAGCCCTGTTCTGTCTCTTCGTCAAAACTGCCT
CACGGAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT19JQ U 1
AF RR4BX68JQ U 1
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RD RR4BT19JQ 693 0 0
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TCTAAAGCTTTTTTTCTGCTTCCTTTTATGTTATCATCTTTATTATTTCCTCTTCTTCTT
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AAATCCCGGTGTATAAAGTTGCGCTCATGGACG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4BX68JQ 787 0 0
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CATGGGAAAAGAGATACACAAATAGGATATTACATATTGGTACACACAAAATTACATATA
TCTAAAGCTTTTTTTCTGCTTCCTTTTATGTTATCATCTTTATTATTTCCTCTTCTTCTT
CTTCAGACAACAGACTAGTCGATCGTCATTGGCTGCGTCATGCAACATCTGAAACGGGCT
TTTCTCACTGTCGTCATAACCTCGGTTTCAGCAGCCTCAAGAAGATTGACAACCTCTGCA
AAACAAGGACGGACTTCAGGGTTCGCATCCCAGCAACGTGTCATGATCTCCCCAAGCACA
GGGAGGCAATCAGCTGGGACAGTTGAACGAACTCCTCGGTTTACCACAGCAAACGCAGCT
TGAACCGCCGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTATCAGCTCCCACAGCACGATT
CCAAAACTATAGACGTCCACTTTTTGAGTGTAGGGTCTATGCTGGATCATCTCTGGAGCC
ATCCATCTGTAAGTCCCGGTCTCTGGTGTCATCCCTTCAGTCTGAACTTCAATTCTCGCA
ACGCCAAAATCAGCAATCTTGATGGACCGGTCAGCCGATATGAGGAGGTTATCCGACTTC
AAATCCCGGTGTATAAAGTTGCGCTCATGGACGTAAGCCATACCTCCAGCAACATCCAAC
GCCTGTTTAACAGCTAACTTAAAGGCACAGCCCTGTTCTGTCTCTTCGTCAAAACTGCCT
CACGGAG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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CTGTGAAGCAGACACTGCTTTCCTCTGTAGGAAATGCGATCGGTGGGTCCACTCTGCGAA
TTTTCTTGCTCGGAGACATCTCCGGCGCGTGATCTGTACAACTTGCCGGAGATTAACTCG
TCGTTGTCTTTTCGGAGATAATTTCAGTGTCGTCTTACCAGAGTCCAGAGATAAAAGTAC
GAGTTGAAGAAGATCGTAGAGTCATTACAAAGTCACCTTTGTCTTTCTGTGTTCTAATTT
TTTTTGTTTCCTTATCAGATGTTGTTAGTTTTTGTGTTTTTATTTCCTTTCTAAAGAAGT
AAAGATTTTATAAAACGGCATGCGATTACGTTTCAGAAGCATGATCCTGATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GL29JQ C 1
AF RR4GL29TF U 1
BS 1 473 RR4GL29TF

RD RR4GL29JQ 473 0 0
GGGGAGTATAAACATGTGTAGAGGTTTTCAGGAACAAGAGAGAAGAAGAGACGACGGAGG
ATGCCGGAGCATCAGGGCTCCAGTAAGCTGCGATCTCTGCGGTGAGAACGCAGCCGTGTA
CTGTGAAGCAGACACTGCTTTCCTCTGTAGGAAATGCGATCGGTGGGTCCACTCTGCGAA
TTTTCTTGCTCGGAGACATCTCCGGCGCGTGATCTGTACAACTTGCCGGAGATTAACTCG
TCGTTGTCTTTTCGGAGATAATTTCAGTGTCGTCTTACCAGAGTCCAGAGATAAAAGTAC
GAGTTGAAGAAGATCGTAGAGTCATTACAAAGTCACCTTTGTCTTTCTGTGTTCTAATTT
TTTTTGTTTCCTTATCAGATGTTGTTAGTTTTTGTGTTTTTATTTCCTTTCTAAAGAAGT
AAAGATTTTATAAAACGGCATGCGATTACGTTTCAGAAGCATGATCCTGATTC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR4GL29TF 473 0 0
GGGGAGTATAAACATGTGTAGAGGTTTTCAGGAACAAGAGAGAAGAAGAGACGACGGAGG
ATGCCGGAGCATCAGGGCTCCAGTAAGCTGCGATCTCTGCGGTGAGAACGCAGCCGTGTA
CTGTGAAGCAGACACTGCTTTCCTCTGTAGGAAATGCGATCGGTGGGTCCACTCTGCGAA
TTTTCTTGCTCGGAGACATCTCCGGCGCGTGATCTGTACAACTTGCCGGAGATTAACTCG
TCGTTGTCTTTTCGGAGATAATTTCAGTGTCGTCTTACCAGAGTCCAGAGATAAAAGTAC
GAGTTGAAGAAGATCGTAGAGTCATTACAAAGTCACCTTTGTCTTTCTGTGTTCTAATTT
TTTTTGTTTCCTTATCAGATGTTGTTAGTTTTTGTGTTTTTATTTCCTTTCTAAAGAAGT
AAAGATTTTATAAAACGGCATGCGATTACGTTTCAGAAGCATGATCCTGATTC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL5423Contig1 699 2 2 U
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CGGAACTCACACATCCCAACATTTCCTCTTTTCTCCCACAGTCTCTCACCGAACCTACGG
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GGCAACCTCTCGTAGTGCTCGACTTTGATCCCTTCCAGCTAGTCAAGCCTCACGAGCCCG
CTTTCTGAAACCGCGTAAAGCTCGCCGCGGATCCGTTGACCCGACCCGGATCTGTTGATC
AAGTAAGGGATCCCGTAAAGGCCCGTGACGAGCGGGAACGGTAACCGGGTCGTGCGTTGG
CCGACGTAAACGGCGTCGTTCTTGGAGATGAGGTCTTCTATGAGGAAATGGTTTGGATGG
TTTCTTTTCAGCGTTCCGTACACGAAGATGTGGTTCGCGAGTGCTCCTCCTCCTCCTCTC
CTCCCATGGTTTGGCGCGACGCGAGGCTCGGGCTTCCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4CB76TF C 1
AF RR4CB76JQ U 4
BS 1 3 RR4CB76TF
BS 4 699 RR4CB76JQ

RD RR4CB76TF 697 0 0
TTTAGCTACACACATTATTAAC*TTATAATCACAATCACAGAAAGAAACCAATTATTACA
ACATAGACATTTTTATTCCAAAAGTAGCAGCAAAGAAAGAACTTTGAGCTATACACAACC
TTTGAATAAATGCGTCTTCAATCAGTAGTAGAAGAAGACACAAACGCTTCAATCTCATCA
ATAACAGAGCTAAACCTGGGCCTATCCTTAGGCCTAACGTACAAAACGCCGTCGTTTTGA
CGGAACTCACACATCCCAACATTTCCTCTTTTCTCCCACAGTCTCTCACCGAACCTACGG
TGAGCAAAGTACACCTCCGCCAAAACGACCCCGTTGGACTCCTCCTCAACCACTTCCACT
GGCAACCTCTCGTAGTGCTCGACTTTGATCCCTTCCAGCTAGTCAAGCCTCACGAGCCCG
CTTTCTGAAACCGCGTAAAGCTCGCCGCGGATCCGTTGACCCGACCCGGATCTGTTGATC
AAGTAAGGGATCCCGTAAAGGCCCGTGACGAGCGGGAACGGTAACCGGGTCGTGCGTTGG
CCGACGTAAACGGCGTCGTTCTTGGAGATGAGGTCTTCTATGAGGAAATGGTTTGGATGG
TTTCTTTTCAGCGTTCCGTACACGAAGATGTGGTTCGCGAGTGCTCCTCCTCCTCCTCTC
CTCCCATGGTTTGGCGCGACGCGAGGCTCGGGCTTCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4CB76JQ 696 0 0
AGCTACACACATTATTAACCTTATAATCACAATCACAGAAAGAAACCAATTATTACAACA
TAGACATTTTTATTCCAAAAGTAGCAGCAAAGAAAGAACTTTGAGCTATACACAACCTTT
GAATAAATGCGTCTTCAATCAGTAGTAGAAGAAGACACAAACGCTTCAATCTCATCAATA
ACAGAGCTAAACCTGGGCCTATCCTTAGGCCTAACGTACAAAACGCCGTCGTTTTGACGG
AACTCACACATCCCAACATTTCCTCTTTTCTCCCACAGTCTCTCACCGAACCTACGGTGA
GCAAAGTACACCTCCGCCAAAACGACCCCGTTGGACTCCTCCTCAACCACTTCCACTGGC
AACCTCTCGTAGTGCTCGACTTTGATCCCTTCCAGCTAGTCAAGCCTCACGAGCCCGCTT
TCTGAAACCGCGTAAAGCTCGCCGCGGATCCGTTGACCCGACCCGGATCTGTTGATCAAG
TAAGGGATCCCGTAAAGGCCCGTGACGAGCGGGAACGGTAACCGGGTCGTGCGTTGGCCG
ACGTAAACGGCGTCGTTCTTGGAGATGAGGTCTTCTATGAGGAAATGGTTTGGATGGTTT
CTTTTCAGCGTTCCGTACACGAAGATGTGGTTCGCGAGTGCTCCTCCTCCTCCTCTCCTC
CCATGGTTTGGCGCGACGCGAGGCTCGGGCTTCCCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5424Contig1 839 2 8 U
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AATGCTCACACACACCCTTACACCATTCCATAATCATAGGAGATAAAAACCAACCTAAAG
TCAAAACAGAAAAGAAACTGCAAAACTTTGGCATAAGTGTGTGATCGGATCCAACGACCA
CCATAACAACAGCTTCAAAGAAACAAGTGAGCCTTGTGGACTTTTCAAGATATGTTGCTC
CCATATTTGCGAGCGACATTAGCGTCCAATAGTGTATCCCAAACATGTAGCTCTCCCTTT
GAACCACCAATAGCAAGCAAGAAAGGATTGTCCGCTGAAAAGGAAAATGGAGAATACAGC
TCCAGCTTTTGGTTTGTGTGAAGTAATGCATGAAGGCTCATTGTTTGACAGATCCCAAAG
TTTTACCGTTTTATCCATAGACCCCGTAGCCAAAAGATTGGGTGCAGAAGTGTTGTATGA
GATGGAGGAGACTCCTTTGTCTTGGCCATGCGCTTGGATAGTGAAGCTTGGTTTTAAATC
AGAATCTGACCCTGACTGTGCGGCGCGTATATCAAAACCTTTCACAGTTCCATCCTCAAG
ACTTACCACAAAGGAGTGGTCACTGTGGGGATTCCAGGCTAAGCTTTCGACATCAGACAT
GACAGACCATTTGAAACCCGAGTGCGAAGGTTGTCTTCCGTCTTTCAAAACAACAGTTTG
ATCAAAGGACCCACTGAGAAGCACTTCTGGAGCATAATGATTCCAAGCAACCGCTTGAAC
CTCCTTTGTGTGATGCTCCATAGTAATCTTACATTGTCCAGTAGCTACATCCCACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN14JQ U 1
AF RR4EL78TF C 228
BS 1 346 RR4EN14JQ
BS 347 347 RR4EL78TF
BS 348 505 RR4EN14JQ
BS 506 506 RR4EL78TF
BS 507 510 RR4EN14JQ
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BS 512 766 RR4EN14JQ
BS 767 839 RR4EL78TF

RD RR4EN14JQ 766 0 0
ACTTAATAAGAGCTTGATAAGTTTTAAGAAGACAGGCAATCTTAAGAGTTCGACAAACAT
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AGAATCTGACCCTGACTGTGCGGCGCGTATATCAAAACCTTTCACAGTTCCATCCTCAAG
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GACAGACCATTTGAAACCCGAGTGCGAAGGTTGTCTTCCGTCTTTCAAAACAACAGTTTG
ATCAAAGGACCCACTGAGAAGCACTTCTGGAGCATAATGATTCCAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4EL78TF 612 0 0
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TAGCTCTCCCTTTGAACCACCAATAGCAAGCAAGAAAGGATTGTCCGCTGAGAAGGAAAA
TGGAGAATACAGCTCCAGCTTTTGGTTTGTGTGAAGTAATGCATGAAGGCTCATTGTTTG
ACAGATCCCAAAGTTTTACCGTTTTATCCATAGACCCCGTAGCCAAAAGATTGGGTGCAG
AAGTGTTGTATGAGATGGAGGAGACTCCTTTGTCTTGGCCATGCGCTTGGATAGTGAAGC
TTGGTTTTAAATCAGAATCTGACCCTGACTGTGCGGCGCGTATATCAAAACCTTTCACAG
TTCCATCCTCAAGACTTACCACAAAGGAGTGTTCACTGTGGGGATTCCAGGCTAAGCTTT
CGACATCAGACATGACAGACCATTTGAAACCCGAGTGCGAAGGTTGTCTTCCGTCTTTCA
AAACAACAGTTTGATCAAAGGACCCACTGAGAAGCACTTCTGGAGCATAATGATTCCAAG
CAACCGCTTGAACCTCCTTTGTGTGATGCTCCATAGTAATCTTACATTGTCCAGTAGCTA
CATCCCACACCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL5425Contig1 737 2 2 U
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AAGCATATGTATCGATCTGTTCAGATGACTTATCAGTTGATTCTGATGATCGATTTGTCC
AATATGTTCGAAGAGCTATTTTAAACAACAGAAGAATCTATGAAGGAAATAACTTTTGAT
AGGGTCAGAGTTGTTCAAGAACAACAAAGAGAAAAGAAGTTTATCTTCTTCTATATAATA
TTTGTTCATCAAGCTTCTTTTCATATAACCCTAACCATCTAGAAAAAAGAGAAAGAGCTA
TCATATCAACTCCAAGGAATCAAAATGCAGGACGTCGTGAACGCAAGTGTTTTGGAAAGA
TAGAAGCAGAGAGAGATGGGAGTTGCAAACGAAGGGTTCCTGTTCTGTTCGGACAGAGAC
ATTTACGGTGATGCTAACTTTGCAGGAACATCTTAGGCCTTGTGACATTTCATTTGTATT
TAGGTTACAGAGCTGAAGGTAAAATCTTCAAAGAGTTCGAAGACTATGTGAATCAATCAA
AGACTATGAACTTCATTCTTCTATGAAGGAAAACATCTTTAATATAAAAGATAAGTTTTT
TCAGAAAATTTGTCTTTTATCTAATGTATCTGCCATCAGTAGAAGACGATGTGAATCAAT
AAAGATGTCTTTTATGGTTTCCAAGAATGTAGAACCTTAACATGAACCATCTTAGTGGTG
TGCTTAGGCTTCAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G659TF U 1
AF RR4G659JQ C 39
BS 1 727 RR4G659TF
BS 728 737 RR4G659JQ

RD RR4G659TF 727 0 0
GGATACTATCATTTACTCTATGAGAAGTCATCAACCGATTCATCTTCTTCAAACAGAGAG
AAGCATATGTATCGATCTGTTCAGATGACTTATCAGTTGATTCTGATGATCGATTTGTCC
AATATGTTCGAAGAGCTATTTTAAACAACAGAAGAATCTATGAAGGAAATAACTTTTGAT
AGGGTCAGAGTTGTTCAAGAACAACAAAGAGAAAAGAAGTTTATCTTCTTCTATATAATA
TTTGTTCATCAAGCTTCTTTTCATATAACCCTAACCATCTAGAAAAAAGAGAAAGAGCTA
TCATATCAACTCCAAGGAATCAAAATGCAGGACGTCGTGAACGCAAGTGTTTTGGAAAGA
TAGAAGCAGAGAGAGATGGGAGTTGCAAACGAAGGGTTCCTGTTCTGTTCGGACAGAGAC
ATTTACGGTGATGCTAACTTTGCAGGAACATCTTAGGCCTTGTGACATTTCATTTGTATT
TAGGTTACAGAGCTGAAGGTAAAATCTTCAAAGAGTTCGAAGACTATGTGAATCAATCAA
AGACTATGAACTTCATTCTTCTATGAAGGAAAACATCTTTAATATAAAAGATAAGTTTTT
TCAGAAAATTTGTCTTTTATCTAATGTATCTGCCATCAGTAGAAGACGATGTGAATCAAT
AAAGATGTCTTTTATGGTTTCCAAGAATGTAGAACCTTAACATGAACCATCTTAGTGGTG
TGCTTAG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4G659JQ 699 0 0
TTCATCTTCTTCAAACAGAGAGAAGCATATGTATCGATCTGTTCAGATGACTTATCAGTT
GATTCTGATGATCGATTTGTCCAATATGTTCGAAGAGCTATTTTAAACAACAGAAGAATC
TATGAAGGAAATAACTTTTGATAGGGTCAGAGTTGTTCAAGAACAACAAAGAGAAAAGAA
GTTTATCTTCTTCTATATAATATTTGTTCATCAAGCTTCTTTTCATATAACCCTAACCAT
CTAGAAAAAAGAGAAAGAGCTATCATATCAACTCCAAGGAATCAAAATGCAGGACGTCGT
GAACGCAAGTGTTTTGGAAAGATAGAAGCAGAGAGAGATGGGAGTTGCAAACGAAGGGTT
CCTGTTCTGTTCGGACAGAGACATTTACGGTGATGCTAACTTTGCAGGAACATCTTAGGC
CTTGTGACATTTCATTTGTATTTAGGTTACAGAGCTGAAGGTAAAATCTTCAAAGAGTTC
GAAGACTATGTGAATCAATCAAAGACTATGAACTTCATTCTTCTATGAAGGAAAACATCT
TTAATATAAAAGATAAGTTTTTTCAGAAAATTTGTCTTTTATCTAATGTATCTGCCATCA
GTAGAAGACGATGTGAATCAATAAAGATGTCTTTTATGGTTTCCAAGAATGTAGAACCTT
AACATGAACCATCTTAGTGGTGTGCTTAGGCTTCAACTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5426Contig1 727 2 9 U
CTCCTGAATATTAACTTTTTAGGAATCAAAGCATCAAAAATAAAAGGAAAAAACATCAAA
ATACAACATAAAAGATTAAAAACATAAAAATATTTAAAAGCAGCAAGCTTTAAAACAAGA
CACATGACTCTTTTCACTCTTTTACCCATTTCTTCTCAGACAAGTTTTGGTCGAAGAATA
TATATATAACTATTACATGCTTTCAAGTTCCTCTTGTCCTTCTTAATTAACGCACAGCTC
TTTATGCTCAACAGCAACCGCTTCAGACACCTCAATGGACTCGTCTCTGTCTTCATCCAT
CTTTGGAAAAACAATCTCATGCGAGTCTTCTCCATCAGCATTGGGTGATGCAGTCACTTG
TGCTACCACTTCTATGGGATTTGAAGTCTGGTTTTGGGTTCCTGCTTCTTTTTCAAGTTT
CTTTCTTTCAGGTTTCACCTTTGCTTCCGAGGTTGGGGCGGGGGCTTTTGCTGGGCAAGG
TTTTCCATCAGGGAGAGCTGTTTTCTGAGATGGCAATCTTGGAAGTGACTTGCGCAACGG
CTGCTTCTTGGGATCAACTGTTGCCACAGTTCCCTTAGAAGCTGGGTTATCCCTAGAGGC
TTTCTCATCTAGGCTCAGTCTACCGAGGCGAGGGGTTTGAGTTTCTTCAGAATCAGTCTT
CTTTCGTCCTAGTTTTGGAGATTTGGGTCTTGTTGGTGGTATCTTCTTTAACTCTGTTTT
AGGCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H149JQ U 21
AF RR4AK09JQ U 1
BS 1 86 RR4AK09JQ
BS 87 87 RR4H149JQ
BS 88 112 RR4AK09JQ
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RD RR4H149JQ 493 0 0
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AACATAAAAATATTTAAA*GCAGCAAGCTTTAAAACAAGACACATGACTCTTTTCACTCT
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TTTCAAGTTCCTCTTGTCCTTCTTAATTAACGCACAGCTCTTTATGCTCAACAGCAACCG
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TTTTCTGAGATGG

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4AK09JQ 727 0 0
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ATACAACATAAAAGATTAAAAACATAGAAATATTTAAAAGCAGCAAGCTTTAGAACAAGA
CACATGGCTCTTTTCACTCTTTTACCCATTTCTTCTCAGACAAGTTTTGGTCGAAGAATA
TATATATAACTATTACATGCTTTCAAGTTCCTCTTGTCCTTCTTAATTAACGCACAGCTC
TTTATGCTCAACAGCAACCGCTTCAGACACCTCAATGGACTCGTCTCTGTCTTCATCCAT
CTTTGGAGAAACAATCTCATGCGAGTCTTCTCCATCAGCATTGGGTGATGCAGTCACTTG
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CTTTCTTTCAGGTTTCACCTTTGCTTCCGAGGTTGGGGCGGGGGCTTTTGCTGGGCAAGG
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CTGCTTCTTGGGATCAACTGTTGCCACAGTTCCCTTAGAAGCTGGGTTATCCCTAGAGGC
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CTTTCGTCCTAGTTTTGGAGATTTGGGTCTTGTTGGTGGTATCTTCTTTAACTCTGTTTT
AGGCGGC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AH52JQ C 1
AF RR4AH52TF U 15
BS 1 14 RR4AH52JQ
BS 15 712 RR4AH52TF

RD RR4AH52JQ 712 0 0
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GAGTAGATATGGAAGTGGTTGCCGCTAGGTCAATGGAGGAGACGCAGAGACAGCAGACAT
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TCCTCGCGGCGGAATCTTTGCTGATTGGGTTGATTGCTGAAGATCAGATGGCAGCGACTC
TGATGATAACGATGACGACGACGATGAAGACGCTGACGCTGATGATGATGACGACGACGA
TGATGCTAATGATGAAAATTTCTCTGGGGATGAAGGGGAGGAGGAAGCTGATCCAGAGGA
TGACCCAGCGCCCAATGGTGGAGCAGGAAGCGATGATGATGAAGATGATGATGGTGATGA
TGAGAGCGATAGTGATGATGATGATGACGACGAGGATGAGGAGGACGAAGATGATGAGGA
GGAGGAAGATGACGAAGATGTTCGCCAGCCACCTGCTAAGAAGAGGAAATGAAACATGGG
ATTAAGTGGGG*AGTGTTTTTTATGTGTGGGTGGTTAAAGACTTGAAGAGGATCTCGTAT
GTGTTATGGTTTTAAGTAGTTCAGTGAAAACCTCCTCTTTATTCAGTTTCATCTTGTTGT
GTTACTACCATTTGTTGTTATCTCAGACTTTTCGACCTTGG*ATTTTAGTTC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4AH52TF 698 0 0
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GTGGTTGCCGCTAGGTCAATGGAGGAGACGCAGAGACAGCAGACATGGGCTTGTTCTGCC
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TCTTTGCTGATTGGGTTGATTGCTGAAGATCAGATGGCAGCGACTCTGATGATAACGATG
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AAAATTTCTCTGGGGATGAAGGGGAGGAGGAAGCTGATCCAGAGGATGACCCAGCGCCCA
ATGGTGGAGCAGGAAGCGATGATGATGAAGATGATGATGGTGATGATGAGAGCGATAGTG
ATGATGATGATGACGACGAGGATGAGGAGGACGAAGATGATGAGGAGGAGGAAGATGACG
AAGATGTTCGCCAGCCACCTGCTAAGAAGAGGAAATGAAACATGGGATTAAGTGGGGGAG
TGTTTTTTATGTGTGGGTGGTTAAAGACTTGAAGAGGATCTCGTATGTGTTATGGTTTTA
AGTAGTTCAGTGAAAACCTCCTCTTTATTCAGTTTCATCTTGTTGTGTTACTACCATTTG
TTGTTATCTCAGACTTTTCGACCTTGGGATTTTAGTTC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5429Contig1 917 2 8 U
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TATATTGCATCATCTCTCCTTAAGAATTCATGATGCCTTCATCCCATCAGAGCCACACCA
CCAGCTTCAAACCACTGAGGATCAAGAAGCCACCACATCAGATCAGTCGCATGGGACCAT
CTCCGGCGGCGCAGCCGGTACTTAAGTGTCCGAGGTGTGATTCCGTCAACACCAAGTTCT
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ACTGGACACGTGGCGGAGCCCTACGTAACGTCCCCATCGGTGGCTCAACCAGAAACAAGA
ACAAGCCTTCTAGCCTCCAAGTCATGTCTTCTCCCCCTCCGATTGTGGCGCCATTGTCGT
CTCACGAGCTTGCTGATGGGTTTCGTATGAACAGAGCACATATAGACCCTCCTGCAATGG
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CTTCTTCTATCGAGTCTTTTAGTTCTTTAAACCAAGACTTGCACCAGAAGCTTCAGCAAC
AGAGGCTCATCGCTTCCATGTTTCAACAAGATTCTCCACCGGTTATGTTTCATAACGCTG
AGCTACTTACTCCTTCGACGGCGACAACGGAGTGGGCTTTCGATAGATCCGCCATGGGAG
GAGCAGCAGCATGTGGCATCAATGAAAACAATGATGATCGTGAGGGTAATTTGGGAAGTT
GGTACCATAATCCTAATAATTCTATGCCCTAACTCATTCAATTCTCAATGTCATTACCAT
TGCTAGTCTCTAATATTGTAGCTAGCTTTCAGAAGCTATGGATGAATTTTACAATTTAGT
AATATTAAGTTTCCCCT


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH80TF U 1
AF RR4FH80JQ C 268
BS 1 680 RR4FH80TF
BS 681 681 RR4FH80JQ
BS 682 720 RR4FH80TF
BS 721 721 RR4FH80JQ
BS 722 747 RR4FH80TF
BS 748 748 RR4FH80JQ
BS 749 765 RR4FH80TF
BS 766 917 RR4FH80JQ

RD RR4FH80TF 765 0 0
GGATACACATGAAGATTCATAAAAATCACAAGAGCCGAGTCTCTCTCTCACTCTTGCCCC
TATATTGCATCATCTCTCCTTAAGAATTCATGATGCCTTCATCCCATCAGAGCCACACCA
CCAGCTTCAAACCACTGAGGATCAAGAAGCCACCACATCAGATCAGTCGCATGGGACCAT
CTCCGGCGGCGCAGCCGGTACTTAAGTGTCCGAGGTGTGATTCCGTCAACACCAAGTTCT
GTTACTACAACAACTACAGCTTATCTCAGCCACGTCACTACTGCAAAAACTGTCGCCGTT
ACTGGACACGTGGCGGAGCCCTACGTAACGTCCCCATCGGTGGCTCAACCAGAAACAAGA
ACAAGCCTTCTAGCCTCCAAGTCATGTCTTCTCCCCCTCCGATTGTGGCGCCATTGTCGT
CTCACGAGCTTGCTGATGGGTTTCGTATGAACAGAGCACATATAGACCCTCCTGCAATGG
CGTTTTCAGGTGGATTCTCCGGCTACATGTTTCCGTTAGATCCTAACTACAATCTTGCAT
CTTCTTCTATCGAGTCTTTTAGTTCTTTAAACCAAGACTTGCACCAGAAGCTTCAGCAAC
AGAGGCTCATCGCTTCCATGTTTCAACAAGATTCTCCACCGGTTATGTTTCATAACGCTG
AGCTACTTACTCCTTCGACG*CGACAACGGAGTGGGCTTTCGATAGATCCGCCATGGGAG
*AGCAGCAGCATGTGGCATCAATGAAA*CAATGATGATCGTGAGG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4FH80JQ 650 0 0
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ACGTCCCCATCGGTGGCTCAACCAGAAACAAGAACAAGCCTTCTAGCCTCCAAGTCATGT
CTTCTCCCCCTCCGATTGTGGCGCCATTGTCGTCTCACGAGCTTGCTGATGGGTTTCGTA
TGAACAGAGCACATATAGACCCTCCTGCAATGGCGTTTTCAGGTGGATTCTCCGGCTACA
TGTTTCCGTTAGATCCTAACTACAATCTTGCATCTTCTTCTATCGAGTCTTTTAGTTCTT
TAAACCAAGACTTGCACCAGAAGCTTCAGCAACAGAGGCTCATCGCTTCCATGTTTCAAC
AAGATTCTCCACCGGTTATGTTTCATAACGCTGAGCTACTTACTCCTTCGACGGCGACAA
CGGAGTGGGCTTTCGATAGATCCGCCATGGGAGGAGCAGCAGCATGTGGCATCAATGAAA
ACAATGATGATCGTGAGGGTAATTTGGGAAGTTGGTACCATAATCCTAATAATTCTATGC
CCTAACTCATTCAATTCTCAATGTCATTACCATTGCTAGTCTCTAATATTGTAGCTAGCT
TTCAGAAGCTATGGATGAATTTTACAATTTAGTAATATTAAGTTTCCCCT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5431Contig1 780 2 2 U
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TTCTGGGATTATGTGGTAGAAGCTTTCAAGAATGGTACACCCAAAACTTCGAGTGAACGT
TCAAAAAATCTCTTCAGTGTCGATTTCAAACGATCGAAAGAGCAACAAAAAAACTACATG
CATGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCAAATGGTGTTTCAAATGTTAATATTTGCA
ATCAAGCTAAAGAAATGCTAATGGAAGATCCAAAATTCAAATCTGGTTGGAAATTTGATC
ATGTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAGTTTAAAGATGGTGTTACTTATGCTAAAA
ATGTATCAGATTCTTGCGGTTTCGAGACTACATATTCAGATTCAGAGAATCCAACAACTA
ATTCTGAGATACAAGCATTTCCAAGCGTACCTTCATTTTCTATTAACGTAGGTGGCAAAG
CTGATTCTATTGGTGGATCACTATCTCAACAACAAATTGGTGGATCTTTTTCTCAACGAT
CAATTGGAGTAAGAAAAGCTACGCTAAAAAGAAAAAGCAATGATCGAACATCGGCTGTAA
TCAAGATTTTAAAAGAAAGAAACAGACAACTTCTGCAACATTTAATGGAGACAAGTGCGC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FN43TF U 1
AF RR4FN43JQ C 153
BS 1 636 RR4FN43TF
BS 637 780 RR4FN43JQ

RD RR4FN43TF 636 0 0
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CAAATTTATATGAAAGTTTCTCAAAATCCAATCACAGATTTTTATCAAACAGCAGATCAA
TTCTGGGATTATGTGGTAGAAGCTTTCAAGAATGGTACACCCAAAACTTCGAGTGAACGT
TCAAAAAATCTCTTCAGTGTCGATTTCAAACGATCGAAAGAGCAACAAAAAAACTACATG
CATGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCAAATGGTGTTTCAAATGTTAATATTTGCA
ATCAAGCTAAAGAAATGCTAATGGAAGATCCAAAATTCAAATCTGGTTGGAAATTTGATC
ATGTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAGTTTAAAGATGGTGTTACTTATGCTAAAA
ATGTATCAGATTCTTGCGGTTTCGAGACTACATATTCAGATTCAGAGAATCCAACAACTA
ATTCTGAGATACAAGCATTTCCAAGCGTACCTTCATTTTCTATTAACGTAGGTGGCAAAG
CTGATTCTATTGGTGGATCACTATCTCAACAACAAATTGGTGGATCTTTTTCTCAACGAT
CAATTGGAGTAAGAAAAGCTACGCTAAAAAGAAAAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FN43JQ 628 0 0
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ATCGAAAGAGCAACAAAAAAACTACATGCATGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCA
AATGGTGTTTCAAATGTTAATATTTGCAATCAAGCTAAAGAAATGCTAATGGAAGATCCA
AAATTCAAATCTGGTTGGAAATTTGATCATGTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAG
TTTAAAGATGGTGTTACTTATGCTAAAAATGTATCAGATTCTTGCGGTTTCGAGACTACA
TATTCAGATTCAGAGAATCCAACAACTAATTCTGAGATACAAGCATTTCCAAGCGTACCT
TCATTTTCTATTAACGTAGGTGGCAAAGCTGATTCTATTGGTGGATCACTATCTCAACAA
CAAATTGGTGGATCTTTTTCTCAACGATCAATTGGAGTAAGAAAAGCTACGCTAAAAAGA
AAAAGCAATGATCGAACATCGGCTGTAATCAAGATTTTAAAAGAAAGAAACAGACAACTT
CTGCAACATTTAATGGAGACAAGTGCGCACATACAACACTATATGGAGATTCAAAGTAAG
AATTATGCATTAAAAAAAATTAAGGAAG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL5432Contig1 807 2 2 U
GCATATCAATATTGCTGATGGTAAGAAAAGTTCTGTAATCTTGGCATCTGAAGCTGCAAA
GATGGACCAAGTGAATCGAGCACAGGGTGAGGCTGAAGCAATACTGGCTAGAGCACAAGC
AACTGCTAGAGGCCTTGCCATGTTATCTCAGTCTCTCAAAGAAACTGGGGGAGTAGAGGC
TGCGAGTTTGAGAGTTGCAGAGCAATACATTCAAGCGTTCAGTAACATTGCCAAGGAGGG
TACGACAATGTTGCTACCAAGTACGGCTTCAAATCCTGCTAGCATGATTGCTCAAGCTTT
AACAATGTACAAAAGCCTTGTGAACCAAGGTCCAAAGAGCGATGACCAAGAAACATCAGC
AGTGGAAGGTGACTGGGAAGACATAGGTGAGAAAGATATATCAGAAGGCTCTAAAAACCG
ATCAGGCTCGACATCATTCGAAACAGAGAAACCAGGTCACACCGGTGAACCAGTATTTTC
TCTTCAGAGTCGCAACAAGGAGTCATAGTAGCCCAGCCAAACCAAGAATGAGATAATTGT
ATGTGCCTGAGAGAACAGAAAATCCATCTTTTCCAGTTTTCAAAAAAATGAGACGTCTTC
CCTGTTTGAGCGGTGGCATGAATATCATATGCCATTTGGCAAATAGAAAACATATCTGAA
CATCTATTCTCTGAAAGTGTTTTTCCCAAATGATTTGGTCTGAACATTTTCCCTACGAAA
GTGTGGTTATCTGTGACTCATTATTTGTTCAAAAAAAAATAAAATCTGTGACTCATTACT
TTGTTAAGTTTGGAAATTTCCAGCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EC38TF U 1
AF RR4EC38JQ C 189
BS 1 683 RR4EC38TF
BS 684 807 RR4EC38JQ

RD RR4EC38TF 683 0 0
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GATGGACCAAGTGAATCGAGCACAGGGTGAGGCTGAAGCAATACTGGCTAGAGCACAAGC
AACTGCTAGAGGCCTTGCCATGTTATCTCAGTCTCTCAAAGAAACTGGGGGAGTAGAGGC
TGCGAGTTTGAGAGTTGCAGAGCAATACATTCAAGCGTTCAGTAACATTGCCAAGGAGGG
TACGACAATGTTGCTACCAAGTACGGCTTCAAATCCTGCTAGCATGATTGCTCAAGCTTT
AACAATGTACAAAAGCCTTGTGAACCAAGGTCCAAAGAGCGATGACCAAGAAACATCAGC
AGTGGAAGGTGACTGGGAAGACATAGGTGAGAAAGATATATCAGAAGGCTCTAAAAACCG
ATCAGGCTCGACATCATTCGAAACAGAGAAACCAGGTCACACCGGTGAACCAGTATTTTC
TCTTCAGAGTCGCAACAAGGAGTCATAGTAGCCCAGCCAAACCAAGAATGAGATAATTGT
ATGTGCCTGAGAGAACAGAAAATCCATCTTTTCCAGTTTTCAAAAAAATGAGACGTCTTC
CCTGTTTGAGCGGTGGCATGAATATCATATGCCATTTGGCAAATAGAAAACATATCTGAA
CATCTATTCTCTGAAAGTGTTTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4EC38JQ 619 0 0
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TGTTGCTACCAAGTACGGCTTCAAATCCTGCTAGCATGATTGCTCAAGCTTTAACAATGT
ACAAAAGCCTTGTGAACCAAGGTCCAAAGAGCGATGACCAAGAAACATCAGCAGTGGAAG
GTGACTGGGAAGACATAGGTGAGAAAGATATATCAGAAGGCTCTAAAAACCGATCAGGCT
CGACATCATTCGAAACAGAGAAACCAGGTCACACCGGTGAACCAGTATTTTCTCTTCAGA
GTCGCAACAAGGAGTCATAGTAGCCCAGCCAAACCAAGAATGAGATAATTGTATGTGCCT
GAGAGAACAGAAAATCCATCTTTTCCAGTTTTCAAAAAAATGAGACGTCTTCCCTGTTTG
AGCGGTGGCATGAATATCATATGCCATTTGGCAAATAGAAAACATATTTGAACATCTATT
CTCTGAAAGTGTTTTTCCCAAATGATTTGGTCTGAACATTTTCCCTACGAAAGTGTGGTT
ATCTGTGACTCATTATTTGTTCAAAAAAAAATAAAATCTGTGACTCATTACTTTGTTAAG
TTTGGAAATTTCCAGCGGG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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GGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCAGGCTACATGCTCAGGCGCTGACATTA
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CGCTACCCCAAATTTCTCAAGCCTGACAACTTGACCAAAGACTAGAAAAGCAAAACTCTT
TTATCATTGATACATGCCTATTCTCTTATTCTAGGCTATGTTATAGCTACTATTGACATT
TTTTCATGTTTTTTTTATATATCCTTCTTTTACTGCTTTGAATGAAATGAATTCATTCTG
GTT


BQ
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20 20 20 

AF RR4BU43JQ C 1
AF RR4BU43TF U 1
BS 1 483 RR4BU43TF

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GAATCAAAGACAAAAATAGCAGAAATAAGGGAATGGATTGTAGAACACAAGCTTCGTACC
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GGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCAGGCTACATGCTCAGGCGCTGACATTA
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TTATCATTGATACATGCCTATTCTCTTATTCTAGGCTATGTTATAGCTACTATTGACATT
TTTTCATGTTTTTTTTATATATCCTTCTTTTACTGCTTTGAATGAAATGAATTCATTCTG
GTT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4BU43TF 483 0 0
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GAATCAAAGACAAAAATAGCAGAAATAAGGGAATGGATTGTAGAACACAAGCTTCGTACC
GTTGGTTGTTTATGGCTGAGTGGGATCTCTGGTTCAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCT
GGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCAGGCTACATGCTCAGGCGCTGACATTA
GCCGCTCTAGCCGGAGCAGCTGCAGTGGAGTACTACGATCACAAAACTGGAGCCACCGAT
CGCTACCCCAAATTTCTCAAGCCTGACAACTTGACCAAAGACTAGAAAAGCAAAACTCTT
TTATCATTGATACATGCCTATTCTCTTATTCTAGGCTATGTTATAGCTACTATTGACATT
TTTTCATGTTTTTTTTATATATCCTTCTTTTACTGCTTTGAATGAAATGAATTCATTCTG
GTT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

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GGGAAGAGAAGAGGAGATGGGGAAGCAGCCGGTGAAGTTGAAGGCGGTGGTTTACGCGCT
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CCACAAGGTCTCGGAGAACTGGATCATCGCCACTCTCCTCCTCACTCCTGTCCTCGGTAC
CTACTGGTATGCTCAGCACTTTCAGGAACAGGAGAAACTCGAGCACAGGTTCTAAGCCAA
TCAAGTTTGGATGCCAGTTTTCTTTATAGAATCTTCCGAGTCAGTGATTTTTCTGAAACT
CTTTATTGCCAAAATAAATTTTTGATCAATGACAATCACTGTTGGTGTGCATCTTTCTTG
ATATGATATGGAATCGTATTCTCTAATGTTCCTTTAGACATAAAAGCAGTTGAAACTCCA
ACTAGTAC


BQ
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AF RR4BB95JQ C 1
AF RR4BB95TF U 1
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CTACTGGTATGCTCAGCACTTTCAGGAACAGGAGAAACTCGAGCACAGGTTTTAAGCCAA
TCAAGTTTGGATGCCAGTTTTCTTTATAGAATCTTCCGAGTCAGTGATTTTTCTGAAACT
CTTTATTGCCAAAATAAATTTTTGATCAATGACAATCACTGTTGGTGTGCATCTTTCTTG
ATATGATATGGAATCGTATTCTCTAATGTTCCTTTAGACATAAAAGCAGTTGAAACTCCA
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QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4BB95TF 488 0 0
GGATATGTGCGCTGCGCTTCGTTGAGATTTGTTTAATTTTTAGGTCAGTTCAGGTGTTGT
GGGAAGAGAAGAGGAGATGGGGAAGCAGCCGGTGAAGTTGAAGGCGGTGGTTTACGCGCT
ATCGCCGTTTCAGCAGAAGATAATGACGGGACTCTGGAAGGATCTCCCGGAGAAAATCCA
CCACAAGGTCTCGGAGAACTGGATCATCGCCACTCTCCTCCTCACTCCTGTCCTCGGTAC
CTACTGGTATGCTCAGCACTTTCAGGAACAGGAGAAACTCGAGCACAGGTTCTAAGCCAA
TCAAGTTTGGATGCCAGTTTTCTTTATAGAATCTTCCGAGTCAGTGATTTTTCTGAAACT
CTTTATTGCCAAAATAAATTTTTGATCAATGACAATCACTGTTGGTGTGCATCTTTCTTG
ATATGATATGGAATCGTATTCTCTAATGTTCCTTTAGACATAAAAGCAGTTGAAACTCCA
ACTAGTAC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL5435Contig1 955 2 4 U
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ATAAAGAGAGGATGCTGAGGAGGTTCAAGAAAGGACAGGTTTGGGCGATATACGACGGCG
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TCTCTTGGATGATGAAGAACAGCTCTTGTGGGAGGTTCCGTGTTTCAGAAGAGAAAGCTT
TGATCGAGCATGTGAAACTCTTCTCTCATCTTGTCAACTGCGAGAGGGTTGCAAAGGAAG
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TCAAGAGACGGGATTACGGGTGTAATCCGGTCAGGTGGGTTGACAAGGAAGATGTTGCGG
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TGAGAGAGTCTTGGATGCTTGATCTTGCTTCTCTGCCTCCTGATTTGGTTTCTTCCACTT
AGTAAAAACATACATGGTTCTTCTTTTCTTTTGGATAAAAAGTAACAAAGCACCTCATGT
CAAACTTTTTTTTTATCACCAAAGATTATTTAATTGTATATTTTCATATATGCCG


BQ
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AF RR4ER09TF U 1
AF RR4ER09JQ C 239
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TGATCGAGCATGTGAAACTCTTCTCTCATCTTGTCAACTGCGAGAGGGTTGCAAAGGAAG
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TC

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DS 

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QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

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CGCTATGTCATCATGAATCATCTTGACCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CQ74TF U 1
AF RR4CQ74JQ C 49
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TGGTAATTATTATTACAGATTTAATTGCGCTGTCACAAAGGTCGTTTGTTCTTGCTTACT
TTTACTTTGTATGTTTTAATATGAATGAGTCTCTTACTCTGTATAAAGACAGACTTTTAG
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GTGGAGTACGGTGAAAACAGCTTTGTGATACTAAGCATAATGTTCGAGTTTTGTTGGAAC
AAGGGAATGTGTTGAGTGTATTGATCCTACAGTGGAGGAAGAATAGTCTGAGGATGGGCT
TTCTTCTTTTCTGAAACTTGCTCTTGTCTGTACTTCTCAGATTCCTTCAAATCGGCCTAC
AATTGCAGAGATTGTTCAGATCTTGGAGGTCATCAGTTCTCCTGTTCCTCAGCGGATGCT
CGATAGTTTCTGAAAAA*CTGTATTAAATTGATTTTCCATTATGCAATATTTTCTTTCTT
TTTTT
GCAATTTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4CQ74JQ 763 0 0
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TTCTTGCTTACTTTTACTTTGTATGTTTTAATATGAATGAGTCTCTTACTCTGTATAAAG
ACAGACTTTTAGGTCACTATATGTGCAGTCACAACAGCCGATAAGGCACAATACGTGACT
GGTCGGAGACCCGTGGAGTACGGTGAAAACAGCTTTGTGATACTAAGCATAATGTTCGAG
TTTTGTTGGAACAAGGGAATGTGTTGAGTGTATTGATCCTACAGTGGAGGAAGAATAGTC
TGAGGATGGGCTTTCTTCTTTTCTGAAACTTGCTCTTGTCTGTACTTTTCAGATTCCTTC
AAATCGGCCTACAATTGCAGAGATTGTTCAGATCTTGGAGGTCATCAGTTCTCCTGTTCC
TCAGCGGATGCTCGATAGTTTCTGAAAAAACTGTATTAAATTGATTTTCCATTATGCAAT
ATTTTCTTTCTTTTTTTTGCAATTTTTTTTGTATAGATTGCTTTCTTTCACAATGGTACG
TCGTATCTTTCTCGCTATGTCATCATGAATCATCTTGACCACC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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TGAAGAATTAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAACAACTTCTTCAGCCAACACCAATGCCTTC
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AGAGTCAAAATCAAACTGGACCGGAACTTTAAGAATCATCATCGCCGTGAATGTTATCAA
CATTTGACTTGCTCACATATTTTTATATTTTATCGTTTTGTAATATTTGAATCGTTTGTG
ACACGTTGTTTTTTCTGTAGTTTGTGACATGCATCGTTATACTCAATTCAAATCCTCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H496TF U 1
AF RR4H496JQB C 1
BS 1 472 RR4H496TF
BS 473 659 RR4H496JQB

RD RR4H496TF 472 0 0
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GTTGAGGAGTGGAGCTTCTGCTATGAAAGCTATGCAGAAAGCTACGAACATAGATGATGT
AGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGC
TTTGTCTACTCCAATCGGTGCGGCTGCTGACTTCGATGAGGATGAGCTCGAAGCTGAGCT
TGAAGAATTAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAACAACTTCTTCAGCCAACACCAATGCCTTC
TGTTCCAGGGCGTCAACCAGTCCGTCCTGTTGCTCCTAAACGGACAGCCGAGGAAGAAGA
ACTCGCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAAGGTTATTGACTTGGTTTGAGCAGAT
CTGTGTATGCATTGATGATAAACAAGAACATGTGATGTATATTATATAAAAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR4H496JQB 659 0 0
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GTTGAGGAGTGGAGCTTCTGCTATGAAAGCTATGCAGAAAGCTACGAACATAGATGATGT
AGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGC
TTTGTCTACTCCAATCGGTGCGGCTGCTGACTTCGATGAGGATGAGCTCGAAGCTGAGCT
TGAAGAATTAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAACAACTTCTTCAGCCAACACCAATGCCTTC
TGTTCCAGGGCGTCAACCAGTCCGTCCTGTTGCTCCTAAACGGACAGCCGAGGAAGAAGA
ACTCGCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAAGGTTATTGACTTGGTTTGAGCAGAT
CTGTGTATGCATTGATGATAAACAAGAACATGTGATGTATATTATATAAAAAGGATCACC
AGAGTCAAAATCAAACTGGACCGGAACTTTAAGAATCATCATCGCCGTGAATGTTATCAA
CATTTGACTTGCTCACATATTTTTATATTTTATCGTTTTGTAATATTTGAATCGTTTGTG
ACACGTTGTTTTTTCTGTAGTTTGTGACATGCATCGTTATACTCAATTCAAATCCTCAC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5438Contig1 756 2 2 U
GGAGTGTCGGAACGAGATAGAGAGAAGGACAATGGCGGCGACGCTTATGAACAGAGCAAT
CTCCAGAACCGAAACAACCGGTGCTTTCAGACTCTCGCTCAACCTCCTGAGAAACTTCTC
AGCTGCTCCGGCGGCGGCGGCGGCATCTCCGTCATCTGAAAACCCTAGTTCCGATCCGAT
TAAACCTAGACGAAGGAAGAAGAAGAACCTAATCGAGGTCGCTCAGTTTTTACCTAACTG
GGGAATCGGGTACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAGCCTCTTATGAGATCACTAAGATCA
ATCTCTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGGTATTGTTCACAAAGATGGGTTGC
GAGCTGCGGATGCTCCAAAGAAGCTAAGCGGAGTTCACAAACGCTGCTGGAAGTATATCC
CTAACCTGTCCAAGACCACACCTACAACAACAAACTCTGCACCCGCTGCTGAAGTTCAAG
CTGCTTGATGATCTGTTTGCTTCCATTGTTTGTGTGGGTACTTCTCAGGATATATCTGTT
TGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCTTTTGTTACTTGATGAGTCACTTTTGA
ATTCCGTGGTAGCTTTGTAGGAAAATATTGGCTTTTCGGTCCATCTTTTAAAGACTTGTA
CGCTTCTTGACATGGATTGTGATTGGCTTTTTGTGTCAACTTGTGTTGTAGGTGATCTTC
TGGTGTTAAAACATCTAATAAAATACATCATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET27TF U 1
AF RR4ET27JQ C 159
BS 1 634 RR4ET27TF
BS 635 756 RR4ET27JQ

RD RR4ET27TF 634 0 0
GGAGTGTCGGAACGAGATAGAGAGAAGGACAATGGCGGCGACGCTTATGAACAGAGCAAT
CTCCAGAACCGAAACAACCGGTGCTTTCAGACTCTCGCTCAACCTCCTGAGAAACTTCTC
AGCTGCTCCGGCGGCGGCGGCGGCATCTCCGTCATCTGAAAACCCTAGTTCCGATCCGAT
TAAACCTAGACGAAGGAAGAAGAAGAACCTAATCGAGGTCGCTCAGTTTTTACCTAACTG
GGGAATCGGGTACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAGCCTCTTATGAGATCACTAAGATCA
ATCTCTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGGTATTGTTCACAAAGATGGGTTGC
GAGCTGCGGATGCTCCAAAGAAGCTAAGCGGAGTTCACAAACGCTGCTGGAAGTATATCC
CTAACCTGTCCAAGACCACACCTACAACAACAAACTCTGCACCCGCTGCTGAAGTTCAAG
CTGCTTGATGATCTGTTTGCTTCCATTGTTTGTGTGGGTACTTCTCAGGATATATCTGTT
TGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCTTTTGTTACTTGATGAGTCACTTTTGA
ATTCCGTGGTAGCTTTGTAGGAAAATATTGGCTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4ET27JQ 598 0 0
AAAACCCTAGTTCCGATCCGATTAAACCTAGACGAAGGAAGAAGAAGAACCTAATCGAGG
TCGCTCAGTTTTTACCTAACTGGGGAATCGGGTACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAGCC
TTTTATGAGATCACTAAGATCAATCTCTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGGT
ATTGTTCACAAAGATGGGTTGCGAGCTGCGGATGCTCCAAAGAAGCTAAGCGGAGTTCAC
AAACGCTGCTGGAAGTATATCCCTAACCTGTCCAAGACCACACCTACAACAACAAACTCT
GCACCCGCTGCTGAAGTTCAAGCTGCTTGATGATCTGTTTGCTTCCATTGTTTGTGTGGG
TACTTCTCAGGATATATCTGTTTGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCTTTTG
TTACTTGATGAGTCACTTTTGAATTCCGTGGTAGCTTTGTAGGAAAATATTGGCTTTTCG
GTCCATCTTTTAAAGACTTGTACGCTTCTTGACATGGATTGTGATTGGCTTTTTGTGTCA
ACTTGTGTTGTAGGTGATCTTCTGGTGTTAAAACATCTAATAAAATACATCATTTACC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5440Contig1 360 2 6 U
CATGGAATTGGCAACACCAGATTGCTCCAAGGGCAAGTTAGACTCATACTCCAATGTCTT
TGATTCACCTGGAATCGCCTGTGTTAGCTTCAGTGGCTTCTTCCTCTCTGATTCCTCAAG
CTGAAAATAACAGAACGACCAGAGAAGCTGAATTGAGTCCGTTTTGAGGAAGTTCCTCTG
GACTCTCTGTCCGTTTGGTAAACGTATCCCGACTCTGCACTGAACGCTGCGGTCGCCTCC
CTTTGGTTCTTCCGGCAGAAGTGGGAATGTTGGCAGCACCGTTGTTGTAACAGCTTCTTC
AACCGCTACTACTTCTTCAGGGGTTATTGCTGATTTATTATCATCTGAAGATTCTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E942JQ U 1
AF RR4E201JQ U 108
BS 1 129 RR4E942JQ
BS 130 130 RR4E201JQ
BS 131 159 RR4E942JQ
BS 160 160 RR4E201JQ
BS 161 252 RR4E942JQ
BS 253 360 RR4E201JQ

RD RR4E942JQ 252 0 0
CATGGAATTGGCAACACCAGATTGCTCCAAGGGCAAGTTAGACTCATACTCCAATGTCTT
TGATTCACCTGGAATCGCCTGTGTTAGCTTCAGTGGCTTCTTCCTCTCTGATTCCTCAAG
CTGAAAATAGCAGAACGACCAGAGAAGCTGAATTGAGTCGGTTTTGAGGAAGTTCCTCTG
GACTCTCTGTCCGTTTGGTAAACGTATCCCGACTCTGCACTGAACGCTGCGGTCGCCTCC
CTTTGGTTCTTC

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4E201JQ 253 0 0
CTGATTCCTCAAGCTGAAAATAACAGAACGACCAGAGAAGCTGAATTGAGTCCGTTTTGA
GGAAGTTCCTCTGGACTCTCTGTCCGTTTGGTAAACGTATCCCGACTCTGCACTGAACGC
TGCGGTCGCCTCCCTTTGGTTCTTCCGGCAGAAGTGGGAATGTTGGCAGCACCGTTGTTG
TAACAGCTTCTTCAACCGCTACTACTTCTTCAGGGGTTATTGCTGATTTATTATCATCTG
AAGATTCTTTCAT

QA 1 253 1 253
DS 



AS 1 2

CO CL5441Contig1 1153 2 10 U
GGGGTTGCTGAAAGCTTCGGCTGAGGTTCTCGGGAAGGGGACGGTTGGGTCTTCGTATAA
GGCGAGCTTTGAGCATGGGTTGGTGGTGGCTGTGAAACGGTTACGCGACGTTGTTGTGCC
TGAGAAAGATTTCAGAGAGAGGCTGCAGAGTTTGGGGTCGATGAGTCATCCCAATCTCGT
GACTCTGATCGCTTATTACTTCAGCCGAGACGAGAAGCTTCTTGTCTCTGAGTACATGTC
TAGAGGAAGCTTGTCTGCGCTATTGCACGGGAACAAAGGAAACGGGAGGACTCCGTTGAA
CTGGGAAACTAGAGCCGGTATAGCATTGGGAGCTGCAAGAGCGATTAGTTATCTACATTC
GCATGATTCGACTACTTCTCATTGAAACATCAAGTCTTCAAACATACTCTTGTCTAATTC
ATATGAAGCTAAGGTTTCTGATTACGGTCTAGCGCCTATCATTAGCTCCACATCTGCGCC
TAACCGTATCGATGGCTACCGTGCCCCTGAAGTCACCGATGCTCGCAAAATCTCTCAAAA
AGCTGACGTTTACAGCTTCGGTGTCCTAATCCTTGAACTCCTCACAGGGAAGTCACCAAC
ACATCAGCAACTGAACGAAGAAGGTGTGGATTTGCCAAGATGGGTCCAATCTATTACCGA
TCAACAATCACCGGCTGTTGTGTTTGATCCAGAGCTCACAAGGTACCAAACCGAGGGCAA
TGAGAACATTATCCGGCTCTTGAAGATTGGTATGAGCTGTACGGCTCAGTACCCTGATAG
TCGTCCCACCATGGCCGATGTCACCAGACTCATCGAGGAGGTTTCTCATTCATCATCAGG
CTCCCCAAATCCGGTATCTGACTGAGTGTTTCTGTTGGGGGTCTTAATTGATCGATTTTC
AAAAATTGTTTGGGGTTGAAATAGCTTTTTACGTCTTCCCCGCCCTTTTTTCTACTTCTT
TGTTTGTGCCCCTAGTTTGTTCGTTAATTCTTGAGCCTCAAATTGAGATGAAACTTTGAA
GATTTTTATCTTTCTATTCTTCTTAATTCGAAATTTCTGAAAATGTTTATAAACATATAT
TGTTTCTGCTAATTTTTTTGTATAATATTATATTATTGGTTGTGTGTGAATAATTTAGTT
CGTTTTCTTCTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH13TF U 1
AF RR4EH13JQ C 300
BS 1 702 RR4EH13TF
BS 703 703 RR4EH13JQ
BS 704 735 RR4EH13TF
BS 736 736 RR4EH13JQ
BS 737 747 RR4EH13TF
BS 748 748 RR4EH13JQ
BS 749 763 RR4EH13TF
BS 764 764 RR4EH13JQ
BS 765 802 RR4EH13TF
BS 803 1153 RR4EH13JQ

RD RR4EH13TF 802 0 0
GGGGTTGCTGAAAGCTTCGGCTGAGGTTCTCGGGAAGGGGACGGTTGGGTCTTCGTATAA
GGCGAGCTTTGAGCATGGGTTGGTGGTGGCTGTGAAACGGTTACGCGACGTTGTTGTGCC
TGAGAAAGATTTCAGAGAGAGGCTGCAGAGTTTGGGGTCGATGAGTCATCCCAATCTCGT
GACTCTGATCGCTTATTACTTCAGCCGAGACGAGAAGCTTCTTGTCTCTGAGTACATGTC
TAGAGGAAGCTTGTCTGCGCTATTGCACGGGAACAAAGGAAACGGGAGGACTCCGTTGAA
CTGGGAAACTAGAGCCGGTATAGCATTGGGAGCTGCAAGAGCGATTAGTTATCTACATTC
GCATGATTCGACTACTTCTCATTGAAACATCAAGTCTTCAAACATACTCTTGTCTAATTC
ATATGAAGCTAAGGTTTCTGATTACGGTCTAGCGCCTATCATTAGCTCCACATCTGCGCC
TAACCGTATCGATGGCTACCGTGCCCCTGAAGTCACCGATGCTCGCAAAATCTCTCAAAA
AGCTGACGTTTACAGCTTCGGTGTCCTAATCCTTGAACTCCTCACAGGGAAGTCACCAAC
ACATCAGCAACTGAACGAAGAAGGTGTGGATTTGCCAAGATGGGTCCAATCTATTACCGA
TCAACAATCACCGGCTGTTGTGTTTGATCCAGAGCTCACAAG*TACCAAACCGAGGGCAA
TGAGAACATTATCCG*CTCTTGAAGAT*GGTATGAGCTGTACG*CTCAGTACCCTGATAG
TCGTCCCACCATGGCCGATGTC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4EH13JQ 854 0 0
AACT
GGAAACTAGAGCCGGTATAGCAT**GGAGCTGCAAGAGCGATTAGTTATCTACATTCGCA
TGATTCGACTACTTCTCATTGAAACATCAAGTCTTCAAACATACTCTTGTCTAATTCATA
TGAAGCTAAGGTTTCTGATTACGGTCTAGCGCCTATCATTAGCTCCACATCTGCGCCTAA
CCGTATCGATGGCTACCGTGCCCCTGAAGTCACCGATGCTCGCAAAATCTCTCAAAAAGC
TGACGTTTACAGCTTCGGTGTCCTAATCCTTGAACTCCTCACAGGGAAGTCACCAACACA
TCAGCAACTGAACGAAGAAGGTGTGGATTTGCCAAGATGGGTCCAATCTATTACCGATCA
ACAATCACCGGCTGTTGTGTTTGATCCAGAGCTCACAAGGTACCAAACCGAGGGCAATGA
GAACATTATCCGGCTCTTGAAGATTGGTATGAGCTGTACGGCTCAGTACCCTGATAGTCG
TCCCACCATGGCCGATGTCACCAGACTCATCGAGGAGGTTTCTCATTCATCATCAGGCTC
CCCAAATCCGGTATCTGACTGAGTGTTTCTGTTGGGGGTCTTAATTGATCGATTTTCAAA
AATTGTTTGGGGTTGAAATAGCTTTTTACGTCTTCCCCGCCCTTTTTTCTACTTCTTTGT
TTGTGCCCCTAGTTTGTTCGTTAATTCTTGAGCCTCAAATTGAGATGAAACTTTGAAGAT
TTTTATCTTTCTATTCTTCTTAATTCGAAATTTCTGAAAATGTTTATAAACATATATTGT
TTCTGCTAATTTTTTTGTATAATATTATATTATTGGTTGTGTGTGAATAATTTAGTTCGT
TTTCTTCTCT

QA 5 854 5 854
DS 



AS 1 2

CO CL5442Contig1 756 2 3 U
GGAGGCTTATGCAAAGGGTATCCGATTAGCAAAGGAGTGGAGCAGAGCGAAAGGAAACAA
GGAGAAACCAAAGATTTTACTTCCGACAGGAAGAACTCCCAATCCACCAGAAGACGCAGT
GCGCCCTGTGGCATCAACAATGGTCTGCACGACAGATGCGGCCTGGAGTAAGGATCATCA
AATGGCGGGACTCGCTTGGATCTTCACGGGACCTTCACCGGCTTCTCAGAGACAGGAATC
GAGCTGCATGCACTATGTGGGCTCTCCTCTTATCGCAGAAGCACTTGCGTTAAGATCAGC
CCTTGAGAGGGCTCAAATTCTCGGAATCTCAGACCTCAAAGTCTTCTCCGACAACCAGAC
GCTCGTCAGAGCTATCTCCGGCACAACTCAGTCTAAAGAAATCATCGGAATCGTAGCAGA
TATCCGATTGATCTCCTCTGCGTTTGCCTCTCTATCAGTTTCTCACCTTTCTCGATCTTT
GAATGTCGCTTCAGATCGTTTAGCGAAGGAGGCTCTTCAAGTCTCTATTTCTTCTTTGTA
ATGGACCTCATGATTGGGCCTGTCTGGGCCTGGTCTTTTCTCTTTTAAATGAGTTATCTA
GTGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTAGGCTTATGATTGTTATGAAAGATATACAGAA
ACACACACTTATATAAAGTATTAAAACACACAATTTTACTGATTTATGATAACATACTGA
TCGGAATACTTTGGTAATATACATATCTCCAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FM02TF U 1
AF RR4FM02JQ C 232
BS 1 736 RR4FM02TF
BS 737 737 RR4FM02JQ
BS 738 756 RR4FM02TF

RD RR4FM02TF 756 0 0
GGAGGCTTATGCAAAGGGTATCCGATTAGCAAAGGAGTGGAGCAGAGCGAAAGGAAACAA
GGAGAAACCAAAGATTTTACTTCCGACAGGAAGAACTCCCAATCCACCAGAAGACGCAGT
GCGCCCTGTGGCATCAACAATGGTCTGCACGACAGATGCGGCCTGGAGTAAGGATCATCA
AATGGCGGGACTCGCTTGGATCTTCACGGGACCTTCACCGGCTTCTCAGAGACAGGAATC
GAGCTGCATGCACTATGTGGGCTCTCCTCTTATCGCAGAAGCACTTGCGTTAAGATCAGC
CCTTGAGAGGGCTCAAATTCTCGGAATCTCAGACCTCAAAGTCTTCTCCGACAACCAGAC
GCTCGTCAGAGCTATCTCCGGCACAACTCAGTCTAAAGAAATCATCGGAATCGTAGCAGA
TATCCGATTGATCTCCTCTGCGTTTGCCTCTCTATCAGTTTCTCACCTTTCTCGATCTTT
GAATGTCGCTTCAGATCGTTTAGCGAAGGAGGCTCTTCAAGTCTCTATTTCTTCTTTGTA
ATGGACCTCATGATTGGGCCTGTCTGGGCCTGGTCTTTTCTCTTTTAAATGAGTTATCTA
GTGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTAGGCTTATGATTGTTATGAAAGATATACAGAA
ACACACACTTATATAAAGTATTAAAACACACAATTTTACTGATTTATGATAACATACTGA
TCGGAATACTTTGGTA*TATACATATCTCCAATACC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4FM02JQ 525 0 0
ACAGGAATCGAGCTGCATGCACTATGTGGGCTCTCCTCTTATCGCAGAAGCACTTGCGTT
AAGATCAGCCCTTGAGAGGGCTCAAATTTTCGGAATTTCAGACCTCAAAGTTTTTTCCGA
CAACCAGACGCTCGTCAGAGCTATTTCCGGCACAACTCAGTTTAAAGAAATCATCGGAAT
CGTAGCAGATATCCGATTGATTTCCTCTGCGTTTGCCTCTCTATCAGTTTCTCCCCTTTC
TCGATCTTTGAATGTCGCTTCAGATCGTTTAGCGAAGGAGGCTCTTCAAGTCTTTATTTT
TTCTTTGTAATGGACCTCATGATTGGGCCTGTCTGGGCCTGGTCTTTTTTCTTTTAAATG
AGTTATTTAGTGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTAGGCTTATGATTGTTATGAAAGA
TATACAGAAACACACACTTATATAAAGTATTAAAACACACAATTTTACTGATTTATGATA
ACATACTGATCGGAATACTTTGGTAATATACATATCTCCAATACC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL5443Contig1 898 2 2 U
GCGGAGCTCCACGAGAAGTTCGTCGAGGCCGTCGCGGAACTCGGTGGTCCCGAAAAAGCG
ACACCCAAAACTCTAATGAGGACAATGGGAGTGAAAGGTCTCACACTCTACCACCTCAAA
TCTCATCTTCAGAAATTTCGGCAAGGGAGGCAAGCTTGTAAAGAATCAACTGACAACTCC
AACAAGGATGCTTCTTGTGTTGGGGAGAGTCAGGACACAGGTTCATCGTCACCTTCATCA
TTGAAACTGGCTGCGCAGGAACAGAACGAGAGTTACCAAGTGACTGAAGCTCTACGCGCT
CAGATGGAAGTCCAAAGAAGACTACACGAGCAGTTGGAGGTGCAACGGAGACTCCAGGTA
AGGATAGAGGCACAAGGGAAGTACCTACAGTCGATTCTTGAGAAAGCTTGTAAGGCCTTT
GAGGAGCAAGCTGCTATGTATACTGGGCTTGAGACAGCTAGGGAATAGTTATCGGAGCTA
GCCATAAAAGTCTCTAACAGCTCTCAAGGAGCAACAGTCCCCCCGTACTTTGTTGATGCG
ACAAAGATGATGATGCCGTCTTTGTCCGAGCTTGAAGTAGTAGGAATAGACCACAAAAGC
AACATCACGACCAACTGTTCAGTAGAAAGCTCTCTGACTTCCAACACCAATGGGAGCTCG
GTTTCGGCTGCGTCGATGAAGAAGAGGCATCGTGGAGACAATGTCGGTGGTGCCGGGTGT
GAAGGGAGCCGGACTGTGCCTAGTAGTACCATTGGATAAAGTCTAGGTTACGAAGAAATC
AATTTGAGATAAGATTCAACAACTCTTGTTTAATTGCTTTGGGGAGATTGTATTGTATGA
TTCGATGCAGAACCTGTCGTTGTATATATTTTGATGTTGAAGCTTTAATTAGTGTTTC


BQ
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AF RR4FO12TF U 1
AF RR4FO12JQ C 206
BS 1 537 RR4FO12TF
BS 538 898 RR4FO12JQ

RD RR4FO12TF 537 0 0
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ACACCCAAAACTCTAATGAGGACAATGGGAGTGAAAGGTCTCACACTCTACCACCTCAAA
TCTCATCTTCAGAAATTTCGGCAAGGGAGGCAAGCTTGTAAAGAATCAACTGACAACTCC
AACAAGGATGCTTCTTGTGTTGGGGAGAGTCAGGACACAGGTTCATCGTCACCTTCATCA
TTGAAACTGGCTGCGCAGGAACAGAACGAGAGTTACCAAGTGACTGAAGCTCTACGCGCT
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GCCATAAAAGTCTCTAACAGCTCTCAAGGAGCAACAGTCCCCCCGTACTTTGTTGAT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4FO12JQ 693 0 0
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ACGAGAGTTACCAAGTGACTGAAGCTCTACGCGCTCAGATGGAAGTCCAAAGAAGACTAC
ACGAGCAGTTGGAGGTGCAACGGAGACTCCAGGTAAGGATAGAGGCACAAGGGAAGTACC
TACAGTCGATTCTTGAGAAAGCTTGTAAGGCCTTTGAGGAGCAAGCTGCTATGTATACTG
GGCTTGAGACAGCTAGGGAATAGTTATCGGAGCTAGCCATAAAAGTCTCTAACAGCTCTC
AAGGAGCAACAGTCCCCCCGTACTTTGTTGATGCGACAAAGATGATGATGCCGTCTTTGT
CCGAGCTTGAAGTAGTAGGAATAGACCACAAAAGCAACATCACGACCAACTGTTCAGTAG
AAAGCTCTCTGACTTCCAACACCAATGGGAGCTCGGTTTCGGCTGCGTCGATGAAGAAGA
GGCATCGTGGAGACAATGTCGGTGGTGCCGGGTGTGAAGGGAGCCGGACTGTGCCTAGTA
GTACCATTGGATAAAGTCTAGGTTACGAAGAAATCAATTTGAGATAAGATTCAACAACTC
TTGTTTAATTGCTTTGGGGAGATTGTATTGTATGATTCGATGCAGAACCTGTCGTTGTAT
ATATTTTGATGTTGAAGCTTTAATTAGTGTTTC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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CTCCTCGCGGCTTACACTCTAGTGAGAGCACGAGCCACCACCGGGAAACAGCTCCTCGAC
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AGCATTTTGAAAAGTTTTTGTGTAAGGGTCACAACAGAAAGTCTTATAATTGCAATAGAT
TTATTTCTGTAAATCTTAATTATCAAGTAATGTAATCAAGCATAAATTAAGC


BQ
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AF RR4CA05JQ C 1
AF RR4CA05TF U 1
BS 1 472 RR4CA05TF

RD RR4CA05JQ 472 0 0
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CTCCTCGCGGCTTACACTCTAGTGAGAGCACGAGCCACCACCGGGAAACAGCTCCTCGAC
GAAGAAATCGACTCATGGGACGTGACGCTTTACCAAAAACTCGATAAGATAAAAGATGGT
GGTAGTTGCGGAAGCAAAGAGCCGCAGGTGATAACGCATGAGAAAATCATCATCTCTCAC
GGTTCATCTAATTGTTCATTTGCCTTCTCGGATGACTCTGTTTGAAACATACTAACGGTG
AAAGGTGTGAATTGTGTGTGTATTTACAAAGTTGTGTGAATAAATTTTGTTGGAATTTTA
AGCATTTTGAAAAGTTTTTGTGTAAGGGTCACAACAGAAAGTCTTATAATTGCAATAGAT
TTATTTCTGTAAATCTTAATTATCAAGTAATGTAATCAAGCATAAATTAAGC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR4CA05TF 472 0 0
GATAGCTCCGCGGTTAAGCTAGGCATTTCAGTCCTCATCGCTGTCACGACCGTCTTAATT
CTCCTCGCGGCTTACACTCTAGTGAGAGCACGAGCCACCACCGGGAAACAGCTCCTCGAC
GAAGAAATCGACTCATGGGACGTGACGCTTTACCAAAAACTCGATAAGATAAAAGATGGT
GGTAGTTGCGGAAGCAAAGAGCCGCAGGTGATAACGCATGAGAAAATCATCATCTCTCAC
GGTTCATCTAATTGTTCATTTGCCTTCTCGGATGACTCTGTTTGAAACATACTAACGGTG
AAAGGTGTGAATTGTGTGTGTATTTACAAAGTTGTGTGAATAAATTTTGTTGGAATTTTA
AGCATTTTGAAAAGTTTTTGTGTAAGGGTCACAACAGAAAGTCTTATAATTGCAATAGAT
TTATTTCTGTAAATCTTAATTATCAAGTAATGTAATCAAGCATAAATTAAGC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL5445Contig1 683 2 1 U
GGGGATCTGTTGATGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGATGGCTCGAGCGTGGACGAAGATGGTGGTGATGATTATGATGTTGACATCGACGATC
TCAGGGAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGTTTCACCGGTCTCGCT
CTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGATCAAGAGTTGGTATCTGAT
TGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACTTACTCAGGC
GCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCGGAGATTGTTGGTTTTATT
GAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGTGTTAACGTTCAGTACATTTTCAACTCACCTCCC
AAGTTGATCATGTTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACGATCAGAATCGACAACTGG
AAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCAGCAAGTTAG
TGAATATGTGGTGCTGAGTACCTTTGTCAAACAATTCATCTTATGGTTAAACAACACATT
GTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTAGCA
ATCTCATAATTAATGACTTCTAG


BQ
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AF RR4F130TF U 1
AF RR4F130JQ C 184
BS 1 683 RR4F130TF

RD RR4F130TF 683 0 0
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GAGATGGCTCGAGCGTGGACGAAGATGGTGGTGATGATTATGATGTTGACATCGACGATC
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CTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGATCAAGAGTTGGTATCTGAT
TGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACTTACTCAGGC
GCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCGGAGATTGTTGGTTTTATT
GAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGTGTTAACGTTCAGTACATTTTCAACTCACCTCCC
AAGTTGATCATGTTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACGATCAGAATCGACAACTGG
AAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCAGCAAGTTAG
TGAATATGTGGTGCTGAGTACCTTTGTCAAACAATTCATCTTATGGTTAAACAACACATT
GTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTAGCA
ATCTCATAATTAATGACTTCTAG

QA 1 683 1 683
DS 

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TTGAAATGTTGCGCTGATGATTTTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACTTACTCAGGCGCT
ATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTTTACCCGGAGATTGTTGGTTTTATTGAA
GAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGTGTTAACGTTCAGTACATTTTCAACTCACCTCCCAAG
TTGATCATGTTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACGATCAGAATCGACAACTGGAAA
CGTGAACATTTTTTGCAGTACATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCAGCAAGTTAGTGA
ATATGTGGTGCTGAGTACCTTTGTCAAACAATTCATTTTATGGTTAAACAACACATTGTG
GTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCATCAGTAGTCTGTATGTTTTGAACCTTAGCAATT
TCATAATTAATGACTTCTAG

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL5446Contig1 706 2 1 U
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CTCTGGTGTGGCGCTGGCTGCTAAGTCAATCAAGCCGAGCATCCGGATTATAGCAGCTGA
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BQ
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AF RR4BZ38JQ C 1
AF RR4BZ38TF U 1
BS 1 706 RR4BZ38TF

RD RR4BZ38JQ 706 0 0
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GTTAGAGCAAATCCAAGAGATTGACACTATAATTGTGCCGATAAGCGGGGGTGGTCTGAT
CTCTGGTGTGGCGCTGGCTGCTAAGTCAATCAAGCCGAGCATCCGGATTATAGCAGCTGA
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TGTGACTAATACCGTAGCTGATGGCCTTCGTGCTTCCCTAGGAGACTTAACATGGCCGGT
AGTGAGAGATCTCGTCGATGATGTTGTAGTTGTTGAGGATGGGGAGATTATCGAAGCCAT
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AGCAGCTTTATCGACTAGTTTCCGTAGGAATCCTTGTTGGAAAGATTGCAAAAACATAGG
GATTGTTCTCTCAGGAGGTAATGTCGATTTGGGTGTTCTGTGGGATTCATTAAAGAGTTC
AAAGTAATTAAAAATCTTGGTTTACTGCATTTGTTTTCACTACTTCTTAGATAATGTGAG
AATTGTCTGTAAAATTTGAACAAAAGGGATTCACTTTCTTGCAAGAAACTCTGCCTTAGT
ACAGAGTCCAAGAGAAGAAAGCAATGTGATGTAATGTTTATTGTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4BZ38TF 706 0 0
GATCCACCCATATAATGATGGACGCATTCTAAGTGGTCAGGGTACCATTGCGTTGGAACT
GTTAGAGCAAATCCAAGAGATTGACACTATAATTGTGCCGATAAGCGGGGGTGGTCTGAT
CTCTGGTGTGGCGCTGGCTGCTAAGTCAATCAAGCCGAGCATCCGGATTATAGCAGCTGA
ACCGAGAGGAGCTGATGATGCAGCTCAGTCTAAGGTTGCTGGTAGAATCATCACTTTACC
TGTGACTAATACCGTAGCTGATGGCCTTCGTGCTTCCCTAGGAGACTTAACATGGCCGGT
AGTGAGAGATCTCGTCGATGATGTTGTAGTTGTTGAGGATGGGGAGATTATCGAAGCCAT
GAGAATGTGCTATGAGATGCTGAAAGTCTCTGTGGAACCAAGTGGTGCCATTGGCCTAGC
AGCAGCTTTATCGACTAGTTTCCGTAGGAATCCTTGTTGGAAAGATTGCAAAAACATAGG
GATTGTTCTCTCAGGAGGTAATGTCGATTTGGGTGTTCTGTGGGATTCATTAAAGAGTTC
AAAGTAATTAAAAATCTTGGTTTACTGCATTTGTTTTCACTACTTCTTAGATAATGTGAG
AATTGTCTGTAAAATTTGAACAAAAGGGATTCACTTTCTTGCAAGAAACTCTGCCTTAGT
ACAGAGTCCAAGAGAAGAAAGCAATGTGATGTAATGTTTATTGTTT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5447Contig1 659 2 3 U
AATCAATTTTGGCTTTCAGAAGTCAGAAACTTGGTTTTTCGAAGCACAAAGCGAATTAAT
CAAGAAGCTGGTTGCACCCCGTTCCATGCACGGGGGTCATCAGCAAGTTCATTGATCCGG
TTGTTGAGGCTTTCTTGTACGTATGCTACACCAGCCCAAAGTCCTCGTATTAGTAGAATG
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AAAAATGCAAGTATAAGTACACCGTTCACTGAGAATCCCACCAGCTTGGTGGAGATGGAA
ACAGGCAAAACAGATCGGACGGCTTTCCTAGCTCTCTTGGAGACTTTTCTGAAGACATTC
TCGACGAACCTAAGCAAAAGATCCAAGCTTCTGTCTTCTTCCTCTTCATCCTCCTCCTGC
TCGTCTTCGTCTTCTCCATAATCCTCATCGATCCCATACTCCGGTCTGATCTTCCGGTTC
CAGCTCCGATCACCGTCCACGAAACCATCCCTCCTCCCGTTGATGAAGTCGCGGGGTCGC
CGGGAAGCAAAAAGAGAAGTAGAAGGAGGAGGATCAGGGGTTCTGGAGATGATTAGGGTT
CCGGGAGTGGAGATGAAGAAGGAGAGAGGCGATCGTGATCGGGTTGAGAGAAGAACGAC


BQ
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AF RR4C786JQ U 45
AF RR4C786TF C 1
BS 1 44 RR4C786TF
BS 45 152 RR4C786JQ
BS 153 659 RR4C786TF

RD RR4C786JQ 108 0 0
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QA 1 108 1 108
DS 

RD RR4C786TF 659 0 0
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CAAGAAGCTGGTTGCACCCCGTTCCATGCACGGGGGTCATCAGCAAGTTCATTGATCCGG
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AAAAATGCAAGTATAAGTACACCGTTCACTGAGAATCCCACCAGCTTGGTGGAGATGGAA
ACAGGCAAAACAGATCGGACGGCTTTCCTAGCTCTCTTGGAGACTTTTCTGAAGACATTC
TCGACGAACCTAAGCAAAAGATCCAAGCTTCTGTCTTCTTCCTCTTCATCCTCCTCCTGC
TCGTCTTCGTCTTCTCCATAATCCTCATCGATCCCATACTCCGGTCTGATCTTCCGGTTC
CAGCTCCGATCACCGTCCACGAAACCATCCCTCCTCCCGTTGATGAAGTCGCGGGGTCGC
CGGGAAGCAAAAAGAGAAGTAGAAGGAGGAGGATCAGGGGTTCTGGAGATGATTAGGGTT
CCGGGAGTGGAGATGAAGAAGGAGAGAGGCGATCGTGATCGGGTTGAGAGAAGAACGAC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5448Contig1 691 2 2 U
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AGATCAAAGGCATCTGGAGAATGGTGAATATGAGAAGGCGAACTTAGAGAAACAACGTTT
AGAAAGAAGGCAAAGAATGTCGAGGCAACTTCAGGAGAGCGGGTGGAGACCGAGATGGTT
CGATAAACAAGGAGAGAATGAAACGTTCAAGTACACGGGCGGTTACTGGGAATCAAGAGG
ACACAGGAACTGGGATGATTGTCCAGACATCTTTGGCGAGTTTACGGAAGAGCAGCTAGC
TGATTCTGCTTAAAAAGAGGCCCTTTTAAGTTTCATGTTCAGTCTGCTTAAGAGAAAATT
TGCATCGGACAGCATTGGAGTTATTTTACACAGAAGAACATGGGAAGAATCAAAAGCCAA
CTTCTTTGGTTTCAATTTTCTGTTTGAAAGAAGGGCATAGAAGAGGAGGATATCAGAAAG
GCTTTTGGTTATATAATACTTTCTTTTTGGTGAGGATGTGTAATGTTTTAGAGTGTCTCT
CTATCTCTCTGTCTCTTTCATTCCGCATCTCTCTCGTTAAATAGTTTGAGATTAATGTTT
AGTTTGTTGGTCCATTTGTATTTAGTTAACA


BQ
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AF RR4F643JQ C 1
AF RR4F643TF U 1
BS 1 690 RR4F643TF
BS 691 691 RR4F643JQ

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AGAAAGAAGGCAAAGAATGTCGAGGCAACTTCAGGAGAGCGGGTGGAGACCGAGATGGTT
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ACACAGGAACTGGGATGATTGTCCAGACATCTTTGGCGAGTTTACGGAAGAGCAGCTAGC
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TGCATCGGACAGCATTGGAGTTATTTTACACAGAAGAACATGGGAAGAATCAAAAGCCAA
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CTATCTCTCTGTCTCTTTCATTCCGCATCTCTCTCGTTAAATAGTTTGAGATTAATGTTT
AGTTTGTTGGTCCATTTGTATTTAGTTAACA

QA 1 691 1 691
DS 

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AGATCAAAGGCATCTGGAGAATGGTGAATATGAGAAGGCGAACTTAGAGAAACAACGTTT
AGAAAGAAGGCAAAGAATGTCGAGGCAACTTCAGGAGAGCGGGTGGAGACCGAGATGGTT
CGATAAACAAGGAGAGAATGAAACGTTCAAGTACACGGGCGGTTACTGGGAATCAAGAGG
ACACAGGAACTGGGATGATTGTCCAGACATCTTTGGCGAGTTTACGGAAGAGCAGCTAGC
TGATTCTGCTTAAAAAGAGGCCCTTTTAAGTTTCATGTTCAGTCTGCTTAAGAGAAAATT
TGCATCGGACAGCATTGGAGTTATTTTACACAGAAGAACATGGGAAGAATCAAAAGCCAA
CTTCTTTGGTTTCAATTTTCTGTTTGAAAGAAGGGCATAGAAGAGGAGGATATCAGAAAG
GCTTTTGGTTATATAATACTTTCTTTTTGGTGAGGATGTGTAATGTTTTAGAGTGTCTCT
CTATCTCTCTGTCTCTTTCATTCCGCATCTCTCTCGTTAAATAGTTTGAGATTAATGTTT
AGTTTGTTGGTCCATTTGTATTTAGTTAAC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

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AGAGATCATCATTAGCGTCTTCATCGTCTTCATCGTCATCCTCATCCTATGAGAAGATAG
AGAAGAGTGACAGTATGAGATTTGAGTTAAGAAGCAGAAAGGCACACAAAATTATCCAGC
AAACTCTTCAAATTGCCGACTCTCCGACCTCAAGAACTTATGCTTTCTGATGCCATCTTT
TACCATCCAAAACATATTCATACATACATATGGGCTTGCGTGTACACATCTGTTTATACA
TATCTAATATATTGTACGTGTATGTATGTGCG


BQ
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AF RR4AN30JQ C 1
AF RR4AN30TF U 1
BS 1 392 RR4AN30TF

RD RR4AN30JQ 392 0 0
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AGAGATCATCATTAGCGTCTTCATCGTCTTCATCGTCATCCTCATCCTATGAGAAGATAG
AGAAGAGTGACAGTATGAGATTTGAGTTAAGAAGCAGAAAGGCACACAAAATTATCCAGC
AAACTCTTCAAATTGCCGACTCTCCGACCTCAAGAACTTATGCTTTCTGATGCCATCTTT
TACCATCCAAAACATATTCATACATACATATGGGCTTGCGTGTACACATCTGTTTATACA
TATCTAATATATTGTACGTGTATGTATGTGCG

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR4AN30TF 392 0 0
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GATTGGGTAAGATTGTGGAAGGCTTGAAGTTGAAAATAAAGACAAGTCTAAGGATGAGGA
AGAGATCATCATTAGCGTCTTCATCGTCTTCATCGTCATCCTCATCCTATGAGAAGATAG
AGAAGAGTGACAGTATGAGATTTGAGTTAAGAAGCAGAAAGGCACACAAAATTATCCAGC
AAACTCTTCAAATTGCCGACTCTCCGACCTCAAGAACTTATGCTTTCTGATGCCATCTTT
TACCATCCAAAACATATTCATACATACATATGGGCTTGCGTGTACACATCTGTTTATACA
TATCTAATATATTGTACGTGTATGTATGTGCG

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 2

CO CL5450Contig1 1035 2 2 U
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TTTCTCACGACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGATGTTCATGTCAGCTGTAGATTCAA
AGCGAGCTCACCAAAGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGAACAACAAACAG
AAGCGGCGTTTACAAGATCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAAT
CGCCATAGCTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGTCCTTCCGACATCAACATCGGCTG
CAACATCCCTGTTTTCCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGACCG
TGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACACCACACT
TTGCAGCGGCGGAAAGAGACAACATCACGGGCGAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAGGTGGA
GAAGAAGTTTAGAGACTCCAAGTTCTTCTGGCCTTATCTGCCACCGTACTGGTTCCCTTG
GCCGTACTCCACTCTCCCGCCGTTGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCCC
TTTTCTTCCTTTAGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCCGCGTTTGACTGGAAAGATCCCAC
CACTTGGATACCTTATCTTCCACGTTTCCCTCCCAGTGATCACAATCCTTAGGGATCACT
TTACCTCCACATTTGGCTTTCTTCTTCTCTCTGTTTTGGCTTTCTGCTTCTCTATGTTTT
TTTTTTGTTTGATCTCTTTTGCCTGTGTTTGTGTGTGATTGATTTACTTATTAATATGTA
AATTACTCTTCCACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C345TF U 1
AF RR4C345JQ C 220
BS 1 637 RR4C345TF
BS 638 1035 RR4C345JQ

RD RR4C345TF 637 0 0
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AAAGAGATAGGGCACAATGTATTTTCGACTTCTCTGTCTTCTCCTCCTCCTAGCTTCTTG
CTTGACACATCAAGCTTTTGGCCGTGGTCGTAACCGGCCACCTAGGGAAGTAAGCTCGTA
TCCTTCATCTAGCATCACAGTCGTCGGAGTTGTTTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACAC
TTTCTCACGACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGATGTTCATGTCAGCTGTAGATTCAA
AGCGAGCTCACCAAAGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGAACAACAAACAG
AAGCGGCGTTTACAAGATCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAAT
CGCCATAGCTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGTCCTTCCGACATCAACATCGGCTG
CAACATCCCTGTTTTCCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGACCG
TGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACACCACACT
TTGCAGCGGCGGAAAGAGACAACATCACGGGCGAGAG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4C345JQ 816 0 0
TGTGACACTG
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TGTAGATTCAAAGCGAGCTCACCAAAGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGA
ACAACAAACAGAAGCGGCGTTTACAAGATCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGC
GTGGACGGAATCGCCATAGCTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGTCCTTCCGACATC
AACATCGGCTGCAACATCCCTGTTTTCCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCA
AAGCAAGACCGTGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAA
AACACCACACTTTGCAGCGGCGGAAAGAGACAACATCACGGGCGAGAGAAGGAGGAGGAA
GAGAAGGTGGAGAAGAAGTTTAGAGACTCCAAGTTCTTCTGGCCTTATCTGCCACCGTAC
TGGTTCCCTTGGCCGTACTCCACTCTCCCGCCGTTGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCC
TTTCCTTTCCCTTTTCTTCCTTTAGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCCGCGTTTGACTGG
AAAGATCCCACCACTTGGATACCTTATCTTCCACGTTTCCCTCCCAGTGATCACAATCCT
TAGGGATCACTTTACCTCCACATTTGGCTTTCTTCTTCTCTCTGTTTTGGCTTTCTGCTT
CTCTATGTTTTTTTTTTGTTTGATCTCTTTTGCCTGTGTTTGTGTGTGATTGATTTACTT
ATTAATATGTAAATTACTCTTCCACT

QA 11 816 11 816
DS 



AS 1 2

CO CL5451Contig1 1012 2 2 U
GAACGCATCAGATCACCCTTTCTTCTTCTTTAGATTGGATCTGCCGAGTACGGTGGTGCA
ATGTCTAGCTACCAGTCTCCTTCCTTTGACGACGGCGGGGAGGTTAATCCTTTTGCGAAT
CCTTCAACTGTTCCTGCTGCGTATGAGCACACCACTGATATTCCTCTAGACTCTCGGAAG
GATCTGAAAGCTAAGGAGAAGGAACTCCAGGCAAAAGAAGCTGATTTGAAGAGGCGAGAG
CAGGAACTCAAGCGGAAAGAGGATGCTATAGCACAGGCCGGGATTGTGATAGAAGACAAA
AACTGGCCACCGTTTCTTCCTCTCATCCATCATGACATTTCGAATGAGATTCCCATCCAT
CTCCAGAGAATCCAATATGTTGCATTCACATCGTTTCTGGGTCTTGTGGTGTGCCTGTTA
TGGAACATTGTTGCAGTCACCACCGCGTGGATTAAGGGAGAAGGTCCAACCATATGGTTT
CTAGCTATTATCTATTTCATATCGGGGGTTCCTGGAGCGTATGTTATGTGGTATAGACCT
CTTTATCGTGCCATGAGGACTGATAGTGCTCTCAAGTTTGGGTGGTTTTTCTTAACATAT
CTGTTTCACATAGGGTTTTGTGTATTCGCGGCGGTGGCTCCTCCAATTATCTTCAAGGGG
AAGTCGCTGACGGGAATATTACCGGCGATTGACGTGTTGAGCGGGAACATATTAGTTGGG
ATATTCTACTTCATTGGGTTTGGATTCTTTTGCCTGGAGTCACTCGTGAGCATCTGGGTT
ATTCAGCAAGTATACATGTACTTCAGAGGGAGCGGTAAAGCAGCAGAGATGAAGCAGGAG
GCAACAAGACGAGCAATGATGGCAGCTCTCTGACCACACACCCTTGAGTCTTAACCATGA
AGATACCATACAGACAGATCCTCTCCTTTTCACTCTTCTTTTGCTTCATTTAACTAAATG
TAACCAAAACTTCTTGATTTCTTTTTAACCATCATCTTTGAAAGGAGCCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BW73TF U 1
AF RR4BW73JQ C 190
BS 1 659 RR4BW73TF
BS 660 1012 RR4BW73JQ

RD RR4BW73TF 667 0 0
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GATCTGAAAGCTAAGGAGAAGGAACTCCAGGCAAAAGAAGCTGATTTGAAGAGGCGAGAG
CAGGAACTCAAGCGGAAAGAGGATGCTATAGCACAGGCCGGGATTGTGATAGAAGACAAA
AACTGGCCACCGTTTCTTCCTCTCATCCATCATGACATTTCGAATGAGATTCCCATCCAT
CTCCAGAGAATCCAATATGTTGCATTCACATCGTTTCTGGGTCTTGTGGTGTGCCTGTTA
TGGAACATTGTTGCAGTCACCACCGCGTGGATTAAGGGAGAAGGTCCAACCATATGGTTT
CTAGCTATTATCTATTTCATATCGGGGGTTCCTGGAGCGTATGTTATGTGGTATAGACCT
CTTTATCGTGCCATGAGGACTGATAGTGCTCTCAAGTTTGGGTGGTTTTTCTTAACATAT
CTGTTTCACATAGGGTTTTGTGTATTCGCGGCGGTGGCTCCTCCAATTATCTTCAAGGG
AAGTCGCT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4BW73JQ 823 0 0
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AAGCGGAAAGAGGATGCTATAGCACAGGCCGGGATTGTGATAGAAGACAAAAACTGGCCA
CCGTTTCTTCCTCTCATCCATCATGACATTTCGAATGAGATTCCCATCCATCTCCAGAGA
ATCCAATATGTTGCATTCACATCGTTTCTGGGTCTTGTGGTGTGCCTGTTATGGAACATT
GTTGCAGTCACCACCGCGTGGATTAAGGGAGAAGGTCCAACCATATGGTTTCTAGCTATT
ATCTATTTCATATCGGGGGTTCCTGGAGCGTATGTTATGTGGTATAGACCTCTTTATCGT
GCCATGAGGACTGATAGTGCTCTCAAGTTTGGGTGGTTTTTCTTAACATATCTGTTTCAC
ATAGGGTTTTGTGTATTCGCGGCGGTGGCTCCTCCAATTATCTTCAAGGGGAAGTCGCTG
ACGGGAATATTACCGGCGATTGACGTGTTGAGCGGGAACATATTAGTTGGGATATTCTAC
TTCATTGGGTTTGGATTCTTTTGCCTGGAGTCACTCGTGAGCATCTGGGTTATTCAGCAA
GTATACATGTACTTCAGAGGGAGCGGTAAAGCAGCAGAGATGAAGCAGGAGGCAACAAGA
CGAGCAATGATGGCAGCTCTCTGACCACACACCCTTGAGTCTTAACCATGAAGATACCAT
ACAGACAGATCCTCTCCTTTTCACTCTTCTTTTGCTTCATTTAACTAAATGTAACCAAAA
CTTCTTGATTTCTTTTTAACCATCATCTTTGAAAGGAGCCCCG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL5452Contig1 717 2 1 U
CAGACAAGAAGAAACTCATCGCCATGGGACAAGTCTTCGACAAGCTCCGAGGCAAGCAGT
GGAGGCAAAAACAGGTACAGGCGATATGTGATCGGGTTTTCGATCGGTTCAAGCTTGAAA
CCGGAAGAGCCAATCTTAGTTTTGAAGAGCTATACATTGCCGTGCTTCTCGTCTACAATG
ACATAAACAAGCGATTGCCTGGTCCTCATTTCGATCCGCCTTCTAAGGATCTTGTCCGAA
GCATTATGACGGAGTGTGATATGAACTTGGATGGAGAAATTGACCGGGAGGAGTTTGTGA
AGTTTATTGAGCTGCTCACGACTGACACATTTGCGGTTGTGAGTCAGGGTTTGATCATAT
CGTTGATTGTGGCTCCCACCGTGGCTATTGCTACAAAGAAGGCCGCGGAAGGTGTCCCAG
GTGTTGGGAAAGTGGTGCATAAGCTGCCTACTTCAGTGTATGCTTCTCTTGTGACCCTCG
CAGTGGTGTGGGTGAATTCCTCCGAATAACTTAGTTGAGGAGTTGCAAAAAAGCTTGCTA
CAAAATAAATGTCATTTCCTTTTTAGTCTTACTATTTATTACAAGAACTTGTTCTTTTAT
CACGCAAATATAGAATAACGCAAGCAAGGGTCGAGTGAAAACAGTTTTATTATCCTTTGT
ATGTGTTGTGGGTCTTGGTTTCCCTTTGTATATCCCTGTCCTCTCTTTCAAGGACCT


BQ
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AF RR4BG12TF U 1
AF RR4BG12JQ C 12
BS 1 717 RR4BG12TF

RD RR4BG12TF 717 0 0
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CGTTGATTGTGGCTCCCACCGTGGCTATTGCTACAAAGAAGGCCGCGGAAGGTGTCCCAG
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CAGTGGTGTGGGTGAATTCCTCCGAATAACTTAGTTGAGGAGTTGCAAAAAAGCTTGCTA
CAAAATAAATGTCATTTCCTTTTTAGTCTTACTATTTATTACAAGAACTTGTTCTTTTAT
CACGCAAATATAGAATAACGCAAGCAAGGGTCGAGTGAAAACAGTTTTATTATCCTTTGT
ATGTGTTGTGGGTCTTGGTTTCCCTTTGTATATCCCTGTCCTCTCTTTCAAGGACCT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4BG12JQ 706 0 0
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CAGGTACAGGCGATATGTGATCGGGTTTTCGATCGGTTCAAGCTTGAAACCGGAAGAGCC
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CGATTGCCTGGTCCTCATTTCGATCCGCCTTCTAAGGATCTTGTCCGAAGCATTATGACG
GAGTGTGATATGAACTTGGATGGAGAAATTGACCGGGAGGAGTTTGTGAAGTTTATTGAG
CTGCTCACGACTGACACATTTGCGGTTGTGAGTCAGGGTTTGATCATATCGTTGATTGTG
GCTCCCACCGTGGCTATTGCTACAAAGAAGGCCGCGGAAGGTGTCCCAGGTGTTGGGAAA
GTGGTGCATAAGCTGCCTACTTCAGTGTATGCTTCTCTTGTGACCCTCGCAGTGGTGTGG
GTGAATTCCTCCGAATAACTTAGTTGAGGAGTTGCAAAAAAGCTTGCTACAAAATAAATG
TCATTTCCTTTTTAGTCTTACTATTTATTACAAGAACTTGTTCTTTTATCACGCAAATAT
AGAATAACGCAAGCAAGGGTCGAGTGAAAACAGTTTTATTATCCTTTGTATGTGTTGTGG
GTCTTGGTTTCCCTTTGTATATCCCTGTCCTCTCTTTCAAGGACCT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5453Contig1 859 2 2 U
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TATTGGAGCACCAACTGTCATAAAATTGGCTATGCACCAAGGCGATACAAGCCTGTAAAC
GGATATAATCACAGAGACACATCACCAGAGAATGATCCTGAGGGATTTTCTCCATCAGGC
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CAATGGTGTGTCAGGGAAAGATAGTTCAATGGTAAACACTCCCAACCAAAACTCTCAAAA
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CGAACACGATAGAAGAGTTGTTGAATAAGATCAGAAAGCTGGAGGACTCCAAAGGCTCGA
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TATCTCTAATTTGATTTGTGGCTCCATCATCTGCATGGGGGTTGGATGCATGTTGTAGAT
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TCTGAGTTCATTTGCGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GR73TF U 1
AF RR4GR73JQ C 71
BS 1 714 RR4GR73TF
BS 715 859 RR4GR73JQ

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CAAGGGAAAAAATAGAAGAGATGAGCAAAGAGCAAGAGAATCTAATTGAGATATTCACAG
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GCTGGAGACGTTAGGCATTGAACTTGAATATATGATTGGAGGTTTAACTTATGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GR73JQ 789 0 0
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TCAGGGAAAGATAGTTCAATGGTAAACACTCCCAACCAAAACTCTCAAAAGCTTTCCGTT
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AATAGAAGAGATGAGCAAAGAGCAAGAGAATCTAATTGAGATATTCACAGAGGAAAGAGA
TAGGCGTGATGGAGAGGAAGAAAGTCTGAGAAGGAAGCTAGAGGAGGCGTCGAACACGAT
AGAAGAGTTGTTGAATAAGATCAGAAAGCTGGAGGACTCCAAAGGCTCGAGCTGGAGACG
TTAGGCATTGAACTTGAATATATGATTGGAGGTTTAACTTATGAAAAGGGTATCTCTAAT
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GTTGTAATTGGTTTTAATCTCCGGTTGGAGTTACTCTAATAAATGCAAAATCTGAGTTCA
TTTGCGGCT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL5454Contig1 474 2 1 U
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TGAGAATGCTCTCTGTATTGGAACTTAATGAATCGAGGATCTTGAAGAAGTTTTCTACGA
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BQ
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AF RR4DD72JQ C 1
AF RR4DD72TF U 1
BS 1 474 RR4DD72TF

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TACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTTAATGCCAACAGAATGGTAGTTGGAACTCTC
CGTGGGTTTGACCAGTTCATGAACCTTGTTGTCGATAACACTGTTGAGGTCAATGGTGAT
GACAAAACTGACATCGGCATGGTGGTGATAAGGGGAAACAGCATTGTCACTGTTGAAGCT
CTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCCTACTTTGCACCACTGGTGTCTGTATTTTGACTTT
TGAGAATGCTCTCTGTATTGGAACTTAATGAATCGAGGATCTTGAAGAAGTTTTCTACGA
TTAATTTTTCCTTTTCTTTGTTTTGAATATTTCTATTAAGAATAGTTATGAGCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4DD72TF 474 0 0
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TCCATCTTCTCCGATTCTGCAAGTATGAGTCGATCAGGCCAGCCCCCGGATCTCAAGAAG
TACATGGACAAGAAGCTCCAAATTAAGCTTAATGCCAACAGAATGGTAGTTGGAACTCTC
CGTGGGTTTGACCAGTTCATGAACCTTGTTGTCGATAACACTGTTGAGGTCAATGGTGAT
GACAAAACTGACATCGGCATGGTGGTGATAAGGGGAAACAGCATTGTCACTGTTGAAGCT
CTTGAACCAGTTGGAAGATCTTAGCCTACTTTGCACCACTGGTGTCTGTATTTTGACTTT
TGAGAATGCTCTCTGTATTGGAACTTAATGAATCGAGGATCTTGAAGAAGTTTTCTACGA
TTAATTTTTCCTTTTCTTTGTTTTGAATATTTCTATTAAGAATAGTTATGAGCC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL5455Contig1 689 2 4 U
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AAGACACATCACCTAATTGTTATTTATTTTAAGCAAACACATAAATTAATGAAAGCTTAG
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TGAGCATTTGGACCGGTTATCCAACCGGTTCATTCGGGAACCACTTCTAGTTTCTTGTTG
CTCCATTTGTCCAACCTTTTAGAAGCCTCTTCCACTTCTTTTGTCCAGTCTGTTCGAAAC
GTTACCCATGCTAAAATAACTGTTTGTATAAGAGTTCCACATATCATTCCCGTCCATATA
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TAGTAACATCCAACGTTAACTTTTGCCACAAACGATTGCCAACCGCATCCAACCGCCACA
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TCAGAAACAGCGGCCGAAACTTCTTCACCCTCGGTGAAAGCATAGCTCAAGACGTCACGA
AATGCCAAAATCACAATGGCTAAGATCACACATGTGATTAACGAATAAATGTTGACGATG
ATAACAGAAAACGATGCTGATTTAGGGGT


BQ
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AF RR4G782TF C 1
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C

QA 1 330 1 330
DS 

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GCATTTGGACCGGTTATCCAACCGGTTCATTCGGGAACCACTTCTAGTTTCTTGTTGCTC
CATTTGTCCAACCTTTTAGAAGCCTCTTCCACTTCTTTTGTCCAGTCTGTTCGAAACGTT
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TTGGCATCGAACTTAAAGTAAAACCCAAAGAGAGCCCCAAGAGGAATTCCGATAATGTAG
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QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CU60JQ C 1
AF RR4CU60TF U 1
BS 1 706 RR4CU60TF

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CCAGAATCAAAACCAACATGGTCTACTTCCAAACCAACTACACCATCGTAGTCCTCTTCT
CGCTGTTCCTCAGTCTGATCTGGAAACCCTTCGCCCTCCTTATCCTACTGGCCCTTATCG
GTGCGTGGCTCTTCCTATACTTCCTCCGCGACGAACCGCTTACTGTATTTGACCGCGAGA
TCGACCACCGTGTTGTCCTTATCGTCATGTCTGTTCTCACTCTCTCGGTCCTTTTCTTAA
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ATGCAGCTGTTAGGAAAACCGAAGACATGTGCCCAAACGGTGATGAAACCAGTCCTTTAC
TTCCCCAGGTATAAAATGATCTTCGTTTGCTATAAGACTATATCACATATGGTTACGATA
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QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4CU60TF 706 0 0
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ATGACAACAATATACGGTACAAATCCGACAGCAGCTAACGACCTAGCCCCAAAACTGGAA
TACATCACACGCACCAACAACAACCACCACGTAAGACCCGGCCTGGCCACGCGCCGCCCA
TGGAAGCAGATGCTCGACCTACGCTCCTTCCACTTCCCGCGTAAACACCCTCAGTGATCA
CCAGAATCAAAACCAACATGGTCTACTTCCAAACCAACTACACCATCGTAGTCCTCTTCT
CGCTGTTCCTCAGTCTGATCTGGAAACCCTTCGCCCTCCTTATCCTACTGGCCCTTATCG
GTGCGTGGCTCTTCCTATACTTCCTCCGCGACGAACCGCTTACTGTATTTGACCGCGAGA
TCGACCACCGTGTTGTCCTTATCGTCATGTCTGTTCTCACTCTCTCGGTCCTTTTCTTAA
CCGATGCAAAGCTCAATATTGCCGTGGCCGTTGTGGTAGGCGTGGTGGTTGTATTGTTAC
ATGCAGCTGTTAGGAAAACCGAAGACATGTGCCCAAACGGTGATGAAACCAGTCCTTTAC
TTCCCCAGGTATAAAATGATCTTCGTTTGCTATAAGACTATATCACATATGGTTACGATA
GTTTATTTGCATTACGTATTTTTCAAATCTATCGTCACTAGAATCT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

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TTGTTGTATCCGGGCCCGGGTTGATTGAGTTATCCATCTAACCCTAATTCTGCGATGACG
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GACGTTCCTGTCATCAAGAGCATCTTGACTTTTTTATCCCTCTCACCGTCTCACGATTTC
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ACCCTTCCCTGCTGAACAATACCTGTAACCAATTTCAGATCCACACTCCGTCGACGCCAT
ATCATACCGGGCTCATCCTGAGAATCACGTGCAGCAACGTTACCAAAAGATAAGGCACGG
TATGAGTGACCGAAAAACTGACGACACAGCACATATGAGAAGGATACACCGGTAGAACGG
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TTCCAATCTTCGCCTACATTTTAGCTGTTTATAAGTCAATGAAAATATCAACTTGATGCT
CTGTTATACCTCTGCTTATAAGTTATGGTTTTAT


BQ
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AF RR4CR54TF U 1
AF RR4CR54JQ C 227
BS 1 651 RR4CR54TF
BS 652 652 RR4CR54JQ
BS 653 678 RR4CR54TF
BS 679 679 RR4CR54JQ
BS 680 713 RR4CR54TF
BS 714 994 RR4CR54JQ

RD RR4CR54TF 713 0 0
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TAAGAGGTCTTCAATGCGTCGATCTTGGGTATGAGGCGGTGTGCAATCTGTATAAATATG
ATTTTCTTCTCCGATCTGAAGACCGGCAAGAGCTCCGGCGCCGTGGAAACTCAGCTTTTG
CGGTTCTGGGAGGCGAGGAATGTGAAGCGCACCGTGAGCTAATGTGGGTGGACATGCTTC
TGATTGATGTTAATGTGAGTTCATCTTTTTATGTTCTTAGATTTCAGTTCATGATCTTTC
GGATCCATGTCGGATGTGTTTGTTTTAAACGTTTCATGTTTTCACGGCGATTTTGTCGTT
TTGTTGTATCCGGGCCCGGGTTGATTGAGTTATCCATCTAACCCTAATTCTGCGATGACG
AGGTGAGGCTAATTATCTCTGGATCTTCGAGTCAGAAGAACGTGACGTTTGGAGTAAATT
GACGTTCCTGTCATCAAGAGCATCTTGACTTTTTTATCCCTCTCACCGTCTCACGATTTC
CCATTCAATTAAATGCATCTCCTTTCACTTTGAGTTGGTGAATCTCCATGTATAAAAGCC
GTCATCAGTAAACCAGACGAGAGGCAGCCCCTAAAGAACCGTCCGTAGAAC*ACCACAAA
ACCCTTCCCTGCTGAACA*TACCTGTAACCAATTTCAGATCCACACTCCGTCG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4CR54JQ 768 0 0
GGG
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CATGATCTTTCGGATCCATGTCGGATGTGTTTGTTTTAAACGTTTCATGTTT*CACGGCG
ATTTTGTCGTTTTGTTGTATCCGGGCCCGGGTTGATTGAGTTATCCATCTAACCCTAATT
CTGCGATGACGAGGTGAGGCTAATTATCTCTGGATCTTCGAGTCAGAAGAACGTGACGTT
TGGAGTAAATTGACGTTCCTGTCATCAAGAGCATCTTGACTTTTTTATCCCTCTCACCGT
CTCACGATTTCCCATTCAATTAAATGCATCTCCTTTCACTTTGAGTTGGTGAATCTCCAT
GTATAAAAGCCGTCATCAGTAAACCAGACGAGAGGCAGCCCCTAAAGAACCGTCCGTAGA
ACCACCACAAAACCCTTCCCTGCTGAACAATACCTGTAACCAATTTCAGATCCACACTCC
GTCGACGCCATATCATACCGGGCTCATCCTGAGAATCACGTGCAGCAACGTTACCAAAAG
ATAAGGCACGGTATGAGTGACCGAAAAACTGACGACACAGCACATATGAGAAGGATACAC
CGGTAGAACGGGTAGAAGATAGATCTTATCGGCTTTAGAATAACACTCTAGAAGAAACTA
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AACTTGATGCTCTGTTATACCTCTGCTTATAAGTTATGGTTTTAT

QA 4 768 4 768
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4DT44TF U 1
AF RR4DT44JQ C 1
BS 1 612 RR4DT44TF
BS 613 746 RR4DT44JQ

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QA 1 612 1 612
DS 

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TTTTAATAACATCAACTTATGTCCATATAAATTGTGGAAGCAAGTTTGCAGAGTATGCAT
CACATTTGTCTACAAAGTGTCCCCGTATCTTGCCTTAGGCCAGATGGAATCAACAGCCAA
GGAAGCAAATTTTACCGAACGAAAGTTCTTGGTGTGAAAGATTGTCAGAGCATGTTAAAC
GAGCCGTACGATCTGCCCATACTGAGGTTTTGCAGCATAAGAAACCAACCTCAAATGCTA
AGGATGATATAACAGGTGTATGAATATTGACTTCTCATGCTGTTCTGAGGCACATCTAAA
AATTACACCTTCAAAACAAGTATGGTCACTTAGTTTTATTGTTTAGTGTTGCCTTCCGTT
TTACTTATAAAGAAACTTATTTAACC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

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GGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTGAAGAACGAAAGTTCAT
AAATCTCAACATTAAATATGTTGTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGATAACACTAGTTG
GGGTTTGGCAATACCTTATGAAGTGATTGAACCTT


BQ
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AF RR4AG47TF U 1
AF RR4AN09TF U 210
BS 1 419 RR4AG47TF
BS 420 420 RR4AN09TF
BS 421 695 RR4AG47TF

RD RR4AG47TF 695 0 0
GGACAGACTCGTTCGAGAAGACGAGACTTTCAATCTGCAAAAAGGATTTGGAGTGAAGAG
ATGGCAGGAAAGGTGCCAAACCCGAAGGTCTTCTTTGACATCTTGGTAGGAAAGAGCAAA
GCGGGTCGTGTTGTGATGAGCTATTCGCTGACGTGACGCCGAAAACCGCTGAAAACTTCC
GTGCTCTATGCACAGGAGAGAAGGGTGTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAG
GCTCTGCCTTTCACCGTATCATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGCGGAGATTTCACCCGTG
GGAATGGAACCGGAGGGGAATCGATCTACGGGGCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGC
TGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCAATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATGGTT
CTCAGTTCTTTATCTGCACTGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTG
GGAAGGTGGTTGATGGGTACAATGTGGTGGAGAAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGG
GGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTGAAGAACGAAAGTTCAT
AAATCTCAACATTAAATATGTTGTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGATAACACTAGTTG
GGGTTTGGCAATACCTTATGAAGTGATTGAACCTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4AN09TF 479 0 0
GGGGCAGCAGGGAAGGTGTTGCACTACAAAGGCTCTGCCTTTCACCGTATCATCCCGGGG
TTCATGTGCCAAGGCGGAGATTTCACCCGTGGGAATGGAACCGGAGGGGAATCGATCTAC
GGGGCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCA
ATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATGGTCCTCAGTTCTTTATCTGCACTGCGAAGACG
CCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTGGTTGATGGGTACAATGTGGTG
GAGAAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAG
GATTGTGGTGAGCTGAAGAATGAAAGTTCATAAATCTCAACATTAAATATGTTGTGAAGT
GTTTATGTTTTGAGATCGATAACACTAGTTGGGGTTTGGCAATACCTTATGAAGTGATT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL5462Contig1 952 2 4 U
GCAAGTCGAGTTCGTCAAGAGCAGCGCTCGTGCTCGAGACTGTCCTAAAGACGACCTCCC
CGAGATCGCCATCTTGGGCCGCTCCAATGTCGGAAAGTCGTCGCTTATCAACTGTTTGGT
CCGTAAAAAAGAAGTCGCTCTCACTTCCAAGAAACCTGGTCTGGTTCTTGATTCTTGATT
CTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCAAGACTCAAT
CTTTATCTTGAAAGTTTTGATTTTTATTTATTTTTAATTTGGGGGGATAAACAGGAAAGA
CTCAGCTTATCAATCATTTCTTGGTGAATAAGAGTTGGTACATTGTGGATTTGCCTGGTT
ACGGGTTTGCTAAAGTGTCAGATGCTGCCAAGACGGATTGGTCCGCGTTTACGAAAGGTT
ACTTCTTGAATAGAGACACACTTGTTTGTGTGCTTCTTCTGATCGATGCAAGTGTTCCTC
CTCAGAAGATTGATCTTGATTGTGCCAATTGGCTCGGTCGCAACAATGTATGTTGAAAAC
TCTCAGTACTATATGTGTTTTTTTTTCTTGAGGAGTTTCTCTTTGATTGTTTGTAGTTGT
GAATTGTGATGATCAGGTACCGATGACCTTTGTGTTTACTAAGTGTGATAAGATGAAAGC
GGCCAAAGGGAAGAGACCTGATGAGAACATTAAAGCTTTCCAACAGATCATCAGAGAGAA
TTTTAAACAACACCCTCCTTGGATTTTGACTATTAGTGTGTCTGGTTTGGGCAGAGATGA
GCTTCTCCTTCACATGTCGCAGCTGAGAAACTATTGGGATCAGTAGAGAGCGTACGTGGA
ACATAAGATAGATGTTTGGTAATGTTATCAGTTAACAAGTTTGTGTTCTCTCTCTTTGTA
TACATACCTCATTCTAGAGATAAAATTTCAAGAAATGCAATCGAACGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GO31TF U 1
AF RR4GO31JQ C 187
BS 1 602 RR4GO31TF
BS 603 603 RR4GO31JQ
BS 604 660 RR4GO31TF
BS 661 952 RR4GO31JQ

RD RR4GO31TF 660 0 0
GCAAGTCGAGTTCGTCAAGAGCAGCGCTCGTGCTCGAGACTGTCCTAAAGACGACCTCCC
CGAGATCGCCATCTTGGGCCGCTCCAATGTCGGAAAGTCGTCGCTTATCAACTGTTTGGT
CCGTAAAAAAGAAGTCGCTCTCACTTCCAAGAAACCTGGTCTGGTTCTTGATTCTTGATT
CTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCAAGACTCAAT
CTTTATCTTGAAAGTTTTGATTTTTATTTATTTTTAATTTGGGGGGATAAACAGGAAAGA
CTCAGCTTATCAATCATTTCTTGGTGAATAAGAGTTGGTACATTGTGGATTTGCCTGGTT
ACGGGTTTGCTAAAGTGTCAGATGCTGCCAAGACGGATTGGTCCGCGTTTACGAAAGGTT
ACTTCTTGAATAGAGACACACTTGTTTGTGTGCTTCTTCTGATCGATGCAAGTGTTCCTC
CTCAGAAGATTGATCTTGATTGTGCCAATTGGCTCGGTCGCAACAATGTATGTTGAAAAC
TCTCAGTACTATATGTGTTTTTTTTTCTTGAGGAGTTTCTCTTTGATTGTTTGTAGTTGT
GA*TTGTGATGATCAGGTACCGATGACCTTTGTGTTTACTAAGTGTGATAAGATGAAAGC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4GO31JQ 766 0 0
TCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCTTGATTCAAGACTCAATCTTTAT
CTTGAAAGTTTTGATTTTTATTTATTTTTAATTTGGGGGGATAAACAGGAAAGACTCAGC
TTATCAATCATTTCTTGGTGAATAAGAGTTGGTACATTGTGGATTTGCCTGGTTACGGGT
TTGCTAAAGTGTCAGATGCTGCCAAGACGGATTGGTCCGCGTTTACGAAAGGTTACTTCT
TGAATAGAGACACACTTGTTTGTGTGCTTCTTCTGATCGATGCAAGTGTTCCTCCTCAGA
AGATTGATCTTGATTGTGCCAATTGGCTCGGTCGCAACAATGTATGTTGAAAACTCTCAG
TACTATATGTGTTTTTTTTTCTTGAGGAGTTTCTCTTTGATTGTTTGTAGTTGTGAATTG
TGATGATCAGGTACCGATGACCTTTGTGTTTACTAAGTGTGATAAGATGAAAGCGGCCAA
AGGGAAGAGACCTGATGAGAACATTAAAGCTTTCCAACAGATCATCAGAGAGAATTTTAA
ACAACACCCTCCTTGGATTTTGACTATTAGTGTGTCTGGTTTGGGCAGAGATGAGCTTCT
CCTTCACATGTCGCAGCTGAGAAACTATTGGGATCAGTAGAGAGCGTACGTGGAACATAA
GATAGATGTTTGGTAATGTTATCAGTTAACAAGTTTGTGTTCTCTCTCTTTGTATACATA
CCTCATTCTAGAGATAAAATTTCAAGAAATGCAATCGAACGAAGCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL5463Contig1 1134 2 8 U
GATCATCACCGCGGACGAGGTTCTGCTGCTGAACTCTTTGGATAGCTACGTGCTTAGGTA
CGTGGTCGAGCTCCAGCAGAGGCTCAAGGCGAGTGCTGTAGGCGAGGTTTGGAGTCAGGA
CAGCAACGAACTCGTCAGGAGGAGGAATAGAGACAGCAATAACAATGTCTTGTTTCAAAA
CTCGTCTCCTGATTATTTGCCTTTCGAGTTTAGGGCTCTTGAGATCGCCCTCGAAGCTGC
TTGTACCTTCCTTGACTCCCAAGCTTCGGAGCTGGAGATCGAGGCGTACCCTTTGTTGGC
GAGCTTACCTCGAAGATCAGTACTCTGAACTTGGAGCGTGTGCGTAGGCTTAAGAGCAGG
CTTGTGGCGTTGACGAGAAGAGTTCAGAAGGTGAGGGATGAGATTGAACAGTTGATGGAT
GATGATGGTGATATGGCTGAGATGTATCTAACGGAGAAGAAGAAGAGGATGGAAGGTTCC
TTGTATGGTGATCAGTCTTTACCAAACGATGGTCTCTCTTTCTCTGCTCCGGTCTCTCCT
GTTTCCTCTCCTCCTAGTTCCCGGAGACTTGAAAAGCTTGAGCATTGCGAGGAGTAGGCA
TGACAGTGCAAAAAGCAGCTCGGAGAGCGCAACTGAGATAGAAGAGCTGGAGATGTTGCT
TGAAGCATACTTTGTCGTCATCGACAGCACTCTCAACTAGCTAACCTCGTTGAAGGAGTA
CATTGATGATACTGAAGACTTCATCAACATTCAATTGGATAACGTGAGGAGTCAGCTGAT
ACAGTTTGAGCTGCTGCTGACTACAGCGACGTTTGTTGTGGCCATCTTTGGGGTTGTGGC
AGGGGTATTTGGGATGAATTTTGAGATAGATTTCTTTGAACAGCCTGGTGCGTTCAAATG
GGTTTTGACCATTACTGGAGTCTGTGGGGTTCTTGTATTTTTGGCGTTCCTATGGTTTTA
CAAACGTAGAAGGCTCATGCCTCTGTGAGTGACATAACTGTCCCAGATAAGTAGGAGATT
TCTATTACTGTTTATGTTGTTTTTTTTTAAATTCATCTGTGACCTTCCCAAGATGGAAAC
AGTGTTCTAGAGGAGATATTTATGAGAATGAAGCTTTAACTATGTGTTTGAGAG


BQ
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AF RR4EU82TF U 1
AF RR4EU82JQ C 334
BS 1 715 RR4EU82TF
BS 716 716 RR4EU82JQ
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BS 736 736 RR4EU82JQ
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BS 821 1134 RR4EU82JQ

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GTTTCCTCTCCTCCTAGTTCCCGGAGACTTGAAAAGCTTGAGCATTGCGAGGAGTAGGCA
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TGAAGCATACTTTGTCGTCATCGACAGCACTCTCAACTAGCTAACCTCGTTGAAG*AGTA
CATTGATGATACTGA*GACTTCATCAACATTCAATTGGATA*CGTGAGGAGTCAGCTGAT
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DS 

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CTCTCTTTCTCTGCTCCGGTCTCTCCTGTTTCCTCTCCTCCTAGTTCCCGGAGACTTGAA
AAGCTTGAGCATTGCGAGGAGTAGGCATGACAGTGCAAAAAGCAGCTCGGAGAGCGCAAC
TGAGATAGAAGAGCTGGAGATGTTGCTTGAAGCATACTTTGTCGTCATCGACAGCACTCT
CAACTAGCTAACCTCGTTGAAGGAGTACATTGATGATACTGAAGACTTCATCAACATTCA
ATTGGATAACGTGAGGAGTCAGCTGATACAGTTTGAGCTGCTGCTGACTACAGCGACGTT
TGTTGTGGCCATCTTTGGGGTTGTGGCAGGGGTATTTGGGATGAATTTTGAGATAGATTT
CTTTGAACAGCCTGGTGCGTTCAAATGGGTTTTGACCATTACTGGAGTCTGTGGGGTTCT
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ATAACTGTCCCAGATAAGTAGGAGATTTCTATTACTGTTTATGTTGTTTTTTTTTAAATT
CATCTGTGACCTTCCCAAGATGGAAACAGTGTTCTAGAGGAGATATTTATGAGAATGAAG
CTTTAACTATGTGTTTGAGAG

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DS 



AS 1 2

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TAACTTACGAATCTGCAGAAACAGAGACGAATCATTTCTCCAGTGTTCAAAAACAAAGGA
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TGAAGCTGGCCACTGTTGTTGGTCCAAGGCTTGATTGGAATTTTTCTGGTGTGGATAAGA
AAGAAGATGGTTAATGCCACTGAGACTGTGAATACTCCAACAACTATGCCCACGATCATA
GAAACATGAGTCTTTTTAGTTTTTGGAGGCGGACGTGGAGGTGGAGACAGAAGTTGGGGA
GGAGGAACAGAAGGTGGGTTTGGGGTTTGTGCTGTCCTAACACTACTAGGAGGAGGGCTC
GTGGTTCCATCTCCACCTACTGGTGTTTGAGTTTCTGGTGCTGGAACCGGTTTTGTGGAG
CCTGCAAGCGCTAGATCAGGAGATGGAGGGGAGGCACCCACAGCAGGACCTTTTCCCGGA
AGAGGTGGTGTCTCTACCAAGCTGCGACGGTTCCAAGAAGCTTCAGATTGGATGAATAAG
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ACACACACAAAAGATTGTAGAGAGAGATGAGGATGGAATAAAGTACCTTGAGTTTTGAGA
TTCAGAGGAAGAAAGGTGAGGAAGATGATGGAGAATGCTGTTCGGAGATTGATTTTCCGC
CATCCATGAGAACTCATAGGAGGTTTCATTTAGCTTCTGTGCGCTCTTTCTTCCTGAAAG
GAGAAGGAACAAGAGGGGGAGCAGTTGAAGATTGAAGTCGTCTCTCAGGGACAAGGAAGA
CTAATCAAAGGTTGCTACTCTTTCAACCTTTTTCTTAATTTTAAATCTCTTATTTATTCC
AATCATACAACTTGTTGACTTGTATGGTTTTTATGTCGTGTACCTCTATTTAGTCTATGT
CGTAAATGTATCTAGGTTTCCTTTCACTGGATATTTAGTCTCTTTTTTGTTAAATCTTGT
TGCTGTGGCTAAATCAAGTTGAGGGGTTTTGTGGTATGACTTGTACTGGGGGATATTTTA
AGAGTATGGCTAGTTGTGACC


BQ
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AF RR4F921TF U 1
AF RR4F921JQ C 681
BS 1 739 RR4F921TF
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BS 741 766 RR4F921TF
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TAACTTACGAATCTGCAGAAACAGAGACGAATCATTTCTCCAGTGTTCAAAAACAAAGGA
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TTTATAGATGGTACCGTCTGAGAAAGAGCCAATGATGTTGCTGAAATCTTCACATGCTGC
TTGTAGCTCTGACAGCTGCAGCCTAGGAACATCTGCGGAAGTGCAAAACTATAGAGTCAG
AGAATGAAGAGAGAAGAATGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTTGCCTGTGATAAGAGCATCT
TGAAGCTGGCCACTGTTGTTGGTCCAAGGCTTGATTGGAATTTTTCTGGTGTGGATAAGA
AAGAAGATGGTTAATGCCACTGAGACTGTGAATACTCCAACAACTATGCCCACGATCATA
GAAACATGAGTCTTTTTAGTTTTTGGAGGCGGACGTGGAGGTGGAGACAGAAGTTGGGGA
GGAGGAACAGAAGGTGGGTTTGGGGTTTGTGCTGTCCTAACACTACTAGGAGGAGGGCTC
GTGGTTCCATCTCCACCTACTGGTGTTTGAGTTTCTGGTGCTGGAACCGGTTTTGTGGAG
CCTGCAAGCGCTAGATCAG*AGATGGAGGGGAGGCACCCACAGCAG
ACT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4F921JQ 721 0 0
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AGATGGAGGGGAGGCACCCACAGCAGGACCTTTTCCCGGAAGAGGTGGTGTCTCTACCAA
GCTGCGACGGTTCCAAGAAGCTTCAGATTGGATGAATAAGTGATCTTGAGAAGGATCAAA
GACTTCTGCAATTTTAGAAATGAGCTATCATAATCCAAAGACACACACAAAAGATTGTAG
AGAGAGATGAGGATGGAATAAAGTACCTTGAGTTTTGAGATTCAGAGGAAGAAAGGTGAG
GAAGATGATGGAGAATGCTGTTCGGAGATTGATTTTCCGCCATCCATGAGAACTCATAGG
AGGTTTCATTTAGCTTCTGTGCGCTCTTTCTTCCTGAAAGGAGAAGGAACAAGAGGGGGA
GCAGTTGAAGATTGAAGTCGTCTCTCAGGGACAAGGAAGACTAATCAAAGGTTGCTACTC
TTTCAACCTTTTTCTTAATTTTAAATCTCTTATTTATTCCAATCATACAACTTGTTGACT
TGTATGGTTTTTATGTCGTGTACCTCTATTTAGTCTATGTCGTAAATGTATCTAGGTTTC
CTTTCACTGGATATTTAGTCTCTTTTTTGTTAAATCTTGTTGCTGTGGCTAAATCAAGTT
GAGGGGTTTTGTGGTATGACTTGTACTGGGGGATATTTTAAGAGTATGGCTAGTTGTGAC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5465Contig1 806 2 11 U
CGTCAATAAATCATATACTATTATGCCATTATTTAATGTATTGATACATAGTGAACAATT
ATTCTAGAGATGTTCTATTTTACTATGATGAAATAACTTTTTGATTAAAAAAAAAAAAGA
AAAAAAGAAAACAAACAACCAATTTGGCAATTTGCGATTAATGTGGCATGTTTGAGTATA
AAAAAGCAAAAAAGAGTTGAACTTCAGGCAAATCTCGGATGCGTTGCAAGAACCGGTTCT
TGTCCGGTACAGCTGAAATCTCCGGCACCGTCTTCTCAATCTGTGGTAAGAGCTTCGCCA
ATTGTATCCCTGTGGCCATACCGGGCTGTGTTTCCATCTCCTCTGCTAACGCTACGGTAC
AAGACTTGAGTGCGATCTCTGCCACATTTGTAAACTCAGTGCTTGTGAGTACTTCACGTG
TCTCGGTAACGAGTAAATGAAACTTGGTGACAGTTGCATCTGAAGAGGAAACATCAGTGG
TGGTGTCATGGGCCATCATTAAATAATCTATCCAGTGGTGTGGACTTCCAGTGCTCATAA
ACACATCAAGAATCCGGATCACAGTTTCTTCAAGAGTTCTTGTGGTTAGCACATCTTTTA
ACTGCTTTCTTTTAAGAACTTCTTTCACTGCACTCTTCATATGGAAAATCAAACTCGGCA
TGCTATTGGTTGCAAGATAATCAGCACTTGTCAAAAACTTTTGTTCATCCTCTCTATCTA
TGAGATCTAACTCTTCAAGTAAATGGGAGCTGGCAAGACCTCTAGCAGTGTCGATATATA
AGTGTCTGCCCAAAATGTTGACTTGA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ63JQ U 3
AF RR4CK85JQ U 1
BS 1 50 RR4CK85JQ
BS 51 51 RR4CZ63JQ
BS 52 53 RR4CK85JQ
BS 54 54 RR4CZ63JQ
BS 55 183 RR4CK85JQ
BS 184 184 RR4CZ63JQ
BS 185 248 RR4CK85JQ
BS 249 249 RR4CZ63JQ
BS 250 382 RR4CK85JQ
BS 383 383 RR4CZ63JQ
BS 384 806 RR4CK85JQ

RD RR4CZ63JQ 774 0 0
G
CAATAAATCATATACTCTTATGCCATTATTTTATGTATTGATACATAGTGAACAATTATT
CTAGAGATGTTCTATTTTACTATGTTGAAATAACTTTT*GATTAAAAAAAAAGAATAAGA
AAA***AACAAACAACCAATTTGGCAATTTGCGATTAATGTGGCATGTTTGAGTATAAGA
AAGCAAAAAAGAGTTGAACTTCAGGCAAATCTCGGATGCGTTGCAAGAACCGGTTCTTGT
CCGGTACAGCTGAAATCTCCGGCACCGTCTTCTCAATCTGTGGTAAGAGCTTCGCCAATT
GTATCCCTGTGGCCATACCGGGCTGTGTTTCCATCTCCTCTGCTAACGCTACGGTACAAG
ACTTGAGTGCGATCTCTGCCACATTTGTAAACTCAGTGCTTGTGAGTACTTCACGTGTCT
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TGTCATGGGCCATCATTAAATAATCTATCCAGTGGTGTGGACTTCCAGTGCTCATAAACA
CATCAAGAATCCGGATCACAGTTTCTTCAAGAGTTCTTGTGGTTAGCACATCTTTTAACT
GCTTTCTTTTAAGAACTTCTTTCACTGCACTCTTCATATGGAAAATCAAACTCGGCATGC
TATTGGTTGCAAGATAATCAGCACTTGTCAAAAACTTTTGTTCATCCTCTCTATCTATGA
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QA 2 774 2 774
DS 

RD RR4CK85JQ 806 0 0
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AAAAAAGAAAACAAACAACCAATTTGGCAATTTGCGATTAATGTGGCATGTTTGAGTATA
AAAGAGCAAAAAAGAGTTGAACTTCAGGCAAATCTCGGATGCGTTGCAAGAACCGGTTCT
TGTCCGGTCCAGCTGAAATCTCCGGCACCGTCTTCTCAATCTGTGGTAAGAGCTTCGCCA
ATTGTATCCCTGTGGCCATACCGGGCTGTGTTTCCATCTCCTCTGCTAACGCTACGGTAC
AAGACTTGAGTGCGATCTCTGCTACATTTGTAAACTCAGTGCTTGTGAGTACTTCACGTG
TCTCGGTAACGAGTAAATGAAACTTGGTGACAGTTGCATCTGAAGAGGAAACATCAGTGG
TGGTGTCATGGGCCATCATTAAATAATCTATCCAGTGGTGTGGACTTCCAGTGCTCATAA
ACACATCAAGAATCCGGATCACAGTTTCTTCAAGAGTTCTTGTGGTTAGCACATCTTTTA
ACTGCTTTCTTTTAAGAACTTCTTTCACTGCACTCTTCATATGGAAAATCAAACTCGGCA
TGCTATTGGTTGCAAGATAATCAGCACTTGTCAAAAACTTTTGTTCATCCTCTCTATCTA
TGAGATCTAACTCTTCAAGTAAATGGGAGCTGGCAAGACCTCTAGCAGTGTCGATATATA
AGTGTCTGCCCAAAATGTTGACTTGA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL5466Contig1 862 2 12 U
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TGTAGAGCCTTAATTCTAATAGTGAGAGAAAATTAAGAATCTTACAGCTAGTTAAGGTGT
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GGTATGAGTAATAAATCCTACCGAGAATAAAATATTTTTCTTGTCTTGGTAGACAGCATT
TGTTGTTGAAGTACATTCAACATCTTTCTCCACAGAACAGCTTTCACCTGCAATTTCCGG
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TACATGAAAAAAAAGTATCACTGTTGTTGAACTTAATAGTGTTATTAGATAATGCATATT
CAGTAGTCGGTGGAGAAAAGGGTTGACAATAAGTTGTACTAATCACCTACTCGCATATAT
AGTTCTTGCGGCTACGCAATTAAGGAGTTATGAATAACACGATGATAATATACCAGTCAG
AATTGCTTGATCCACTCGAAACTCATTGCTCGACATCTCAATCATTCTAAGGTCAGCTGG
AATCTTACAGCCCACTGTTCAGCATGCAAACGTCAAGAAAAGCAGCGTTTAAGAGTTTAA
CGAGATTCTGAACCATTGCCAAAAACTGCATCCAGGTGAGATACAACACACATACCAGTC
ACTTCAACAATGTCCCCTGGCACCAGCTCTGATGCTGGTAGTATAGAGAAGCACCCTGCA
ATTGTATACATGTTAATGCGGAATGCCATCAGAGACAAAAACTTGCAGATATTCAAAACC
TGGAACAACGTCCCAATCCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY63TF U 1
AF RR4CY63JQ C 75
BS 1 684 RR4CY63TF
BS 685 685 RR4CY63JQ
BS 686 729 RR4CY63TF
BS 730 730 RR4CY63JQ
BS 731 736 RR4CY63TF
BS 737 737 RR4CY63JQ
BS 738 769 RR4CY63TF
BS 770 770 RR4CY63JQ
BS 771 780 RR4CY63TF
BS 781 781 RR4CY63JQ
BS 782 800 RR4CY63TF
BS 801 862 RR4CY63JQ

RD RR4CY63TF 819 0 0
GTTCTACTAAATTAAAACACACACAAAGAGATATAAAATAAATAGGTGATTACAACAGAT
TGTAGAGCCTTAATTCTAATAGTGAGAGAAAATTAAGAATCTTACAGCTAGTTAAGGTGT
ACGCAAGAAAATTGCACTAGATCTCAATATCACTAAATCAAAAGCCAGTAAGCTAATGCA
GGTATGAGTAATAAATCCTACCGAGAATAAAATATTTTTCTTGTCTTGGTAGACAGCATT
TGTTGTTGAAGTACATTCAACATCTTTCTCCACAGAACAGCTTTCACCTGCAATTTCCGG
GAAACATTTGATAGTGAGTATGAAAATAGTGAACTGAAAGTGATCACTTGGACTATAATC
TACATGAAAAAAAAGTATCACTGTTGTTGAACTTAATAGTGTTATTAGATAATGCATATT
CAGTAGTCGGTGGAGAAAAGGGTTGACAATAAGTTGTACTAATCACCTACTCGCATATAT
AGTTCTTGCGGCTACGCAATTAAGGAGTTATGAATAACACGATGATAATATACCAGTCAG
AATTGCTTGATCCACTCGAAACTCATTGCTCGACATCTCAATCATTCTAAGGTCAGCTGG
AATCTTACAGCCCACTGTTCAGCATGCAAACGTCAAGAAAAGCAGCGTTTAAGAGTTTAA
CGAGATTCTGAACCATTGCCAAAA*CTGCATCCAGGTGAGATACAACACACATACCAGTC
ACTTCAACA*TGTCCC*TGGCACCAGCTCTGATGCTGGTAGTATAGAGA*GCACCCTGCA
*TTGTATACATGTTAATGCG
ATGCATCAGAGACAAAACT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4CY63JQ 788 0 0
TCTAATAGTGAGAGAAAATTAAGAATCTTACAGCTAGTTAAGGTGTACGCAAGAAAATTG
CACTAGATCTCAATATCACTAAATCAAAAGCCAGTAAGCTAATGCAGGTATGAGTAATAA
ATCCTACCGAGAATAAAATATTTTTCTTGTCTTGGTAGACAGCATTTGTTGTTGAAGTAC
ATTCAACATCTTTCTCCACAGAACAGCTTTCACCTGCAATTTCCGGGAAACATTTGATAG
TGAGTATGAAAATAGTGAACTGAAAGTGATCACTTGGACTATAATCTACATGAAAAAAAA
GTATCACTGTTGTTGAACTTAATAGTGTTATTAGATAATGCATATTCAGTAGTCGGTGGA
GAAAAGGGTTGACAATAAGTTGTACTAATCACCTACTCGCATATATAGTTCTTGCGGCTA
CGCAATTAAGGAGTTATGAATAACACGATGATAATATACCAGTCAGAATTGCTTGATCCA
CTCGAAACTCATTGCTCGACATCTCAATCATTCTAAGGTCAGCTGGAATCTTACAGCCCA
CTGTTCAGCATGCAAACGTCAAGAAAAGCAGCGTTTAAGAGTTTAACGAGATTTTGAACC
ATTGCCAAAAACTGCATCCAGGTGAGATACAACACACATACCAGTCACTTCAACAATGTC
CCCTGGCACCAGCTCTGATGCTGGTAGTATAGAGAAGCACCCTGCAATTGTATACATGTT
AATGCGGAATGCCATCAGAGACAAAAACTTGCAGATATTCAAAACCTGGAACAACGTCCC
AATCCAAA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5467Contig1 1066 2 2 U
GGGGCTTCCGCATGGTGCACCCTTCAACAATTATTATTGCCAAGACAATGTTCAGAACAA
TATGATGGGAGGCATTGAAACCATGTATTTGACGGAGTCATCTCAAGCTGAAGAAAATGG
CATCTTTAAGCCTGTGAGGATCAGTGTTAGAGGACAGCACATTGATGGACTTGCCGGAAT
TGGATGTGAAGCCACATTTGTACCACCACCTGCTTGGCCTCCTACACCTTTTGTGTACTC
TCGTGTCCCCATTAACAGAAATGGTCAGCCACCTCTAGCTAGTGATGGTTCTGAAGGTAG
AATTGGTCAAAGTGAAGAAATTTTAAAAGATGGCTTGACAGCTCTAGTTGGGCTGAGCCA
AGGGACAAGCGGTGTTGGTAATTATACTCGTGGAGATCAAAACGAGGGAGGGCACAGCAG
TGGAGCGACTGTTGGAATGTCAGAACCAAAGGAACATTCAGTCGGGACTGAGCGGGGAAC
GCGAGTTGTACCATATCACTTGATACAAGGACACCTTTGTGTCACTTTCCTCCTTTCCGT
TTTGGAGTTGAATTTGAGGATGTCCATAGACTAGCTAATGGTCATGTAGAGCATTCTCCT
GAATTCTTCTATGCTGGTTCTCTGTGGAAGATTAGCATTCAGGCGTTTAATGATGAAGAC
CCTCAAGGACGCCGAACTGTTGGTTTGTTTCTTCACCGTCGTAAAGCAGAGATAGTGGAC
TCACTAAGGAAGGTCCACGTTTACATAGATCCTCGTGACAAAGTGACTGCACGTTACCAG
CTGGTCTGCCCATCGAAAAGAGAAGTGATGTTGTTTGGGGATTTCAAGCAGAGAGGAACT
TTGTTGCCCAAAGCTCCCAAAGGTTGGGGATGGCGTACTGCACTGCCCTTCGATGAGCTC
TTTGAGCTTCTCCAAAATGGGACTCTGAGAGTTGCAGCTGTGGTTCAGCTCGTCTAGAGA
GAAACTCATATTGTGTGTAGAACAAAAATTCATATGTTGTAGAACAAAAATCTTTATTTT
GGAAGTTATTTAGCAGCTCTCTTAATAATGATATATTACTTAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AF79TF U 1
AF RR4AF79JQ C 233
BS 1 639 RR4AF79TF
BS 640 1066 RR4AF79JQ

RD RR4AF79TF 639 0 0
GGGGCTTCCGCATGGTGCACCCTTCAACAATTATTATTGCCAAGACAATGTTCAGAACAA
TATGATGGGAGGCATTGAAACCATGTATTTGACGGAGTCATCTCAAGCTGAAGAAAATGG
CATCTTTAAGCCTGTGAGGATCAGTGTTAGAGGACAGCACATTGATGGACTTGCCGGAAT
TGGATGTGAAGCCACATTTGTACCACCACCTGCTTGGCCTCCTACACCTTTTGTGTACTC
TCGTGTCCCCATTAACAGAAATGGTCAGCCACCTCTAGCTAGTGATGGTTCTGAAGGTAG
AATTGGTCAAAGTGAAGAAATTTTAAAAGATGGCTTGACAGCTCTAGTTGGGCTGAGCCA
AGGGACAAGCGGTGTTGGTAATTATACTCGTGGAGATCAAAACGAGGGAGGGCACAGCAG
TGGAGCGACTGTTGGAATGTCAGAACCAAAGGAACATTCAGTCGGGACTGAGCGGGGAAC
GCGAGTTGTACCATATCACTTGATACAAGGACACCTTTGTGTCACTTTCCTCCTTTCCGT
TTTGGAGTTGAATTTGAGGATGTCCATAGACTAGCTAATGGTCATGTAGAGCATTCTCCT
GAATTCTTCTATGCTGGTTCTCTGTGGAAGATTAGCATT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AF79JQ 834 0 0
GTGTACTCTCGTGTCCCCATTAACAGAAATGGTCAGCCACCTCTAGCTAGTGATGGTTCT
GAAGGTAGAATTGGTCAAAGTGAAGAAATTTTAAAAGATGGCTTGACAGCTCTAGTTGGG
CTGAGCCAAGGGACAAGCGGTGTTGGTAATTATACTCGTGGAGATCAAAACGAGGGAGGG
CACAGCAGTGGAGCGACTGTTGGAATGTCAGAACCAAAGGAACATTCAGTCGGGACTGAG
CGGGGAACGCGAGTTGTACCATATCACTTGATACAAGGACACCTTTGTGTCACTTTCCTC
CTTTCCGTTTTGGAGTTGAATTTGAGGATGTCCATAGACTAGCTAATGGTCATGTAGAGC
ATTCTCCTGAATTCTTCTATGCTGGTTCTCTGTGGAAGATTAGCATTCAGGCGTTTAATG
ATGAAGACCCTCAAGGACGCCGAACTGTTGGTTTGTTTCTTCACCGTCGTAAAGCAGAGA
TAGTGGACTCACTAAGGAAGGTCCACGTTTACATAGATCCTCGTGACAAAGTGACTGCAC
GTTACCAGCTGGTCTGCCCATCGAAAAGAGAAGTGATGTTGTTTGGGGATTTCAAGCAGA
GAGGAACTTTGTTGCCCAAAGCTCCCAAAGGTTGGGGATGGCGTACTGCACTGCCCTTCG
ATGAGCTCTTTGAGCTTCTCCAAAATGGGACTCTGAGAGTTGCAGCTGTGGTTCAGCTCG
TCTAGAGAGAAACTCATATTGTGTGTAGAACAAAAATTCATATGTTGTAGAACAAAAATC
TTTATTTTGGAAGTTATTTAGCAGCTCTCTTAATAATGATATATTACTTAGTCG

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL5468Contig1 824 2 4 U
GGGATAAAATTTCTCTGAGAGAATTACATTTTATTTGTTTATAATTTTGATCAATAGATC
GAATCTTTTGTTCGCTTGGACGATTATATATGTTTCGCAGTGGCGATTTTCCTCCGGTTT
GTGGATATTAAACTTTTGTTTTAATCACCCTTCCTTTTCGAAAATCATCCTCCAAATCCC
TTTCGATCTTAAAAGGTTTGATGGTTGTAGTCGGTTAAGCTCCGATCTTAATTATAACGG
AAGACAATATTTGCTTCGTTATGATAAGAGCAGAGTTTTCCAGAGGGGATTAAGCTATGA
GTTAATTGATTAAACTTTGTTTTTTTTGTTCAGAATCAGTAGTGTTGAAGCTTCCTTTAT
AAGTGAGAAGTGTTTCAACGAAGAGTCTGTAATAGGTTTACTAAAGTTTTCTCTTCGATT
ACCACCTCCGGCTATTTGGCTACCGGTGTTAAGGTCCTTTAACCATTGACGGTGAAATAG
AGGAAAGAGCATGAAAGTGGTACTAAGATCTAAGGATGGTGGTTTCTCGCCTTTCTTAAC
GATTCTCTCTTTGCCCACACTGCGAAATAACAGTCCGGCGAGATCCCAGGTGAAGCTTTC
GGTGATGCACTCAACAACACATGAACAAGACGCGTGGACAAGAACAAACGCGTGCTTAGG
TTTAGTTGTTGATTTTGGGACTTTAAATATGGGCTTTCTGTAATGGATAAAAACTTTACC
AAACCACTTCTGTTACAAAGCCGAGTGACCTAAAATCTCTTGGTTTGTTAACAAATATGC
ATTGAGTTAATTTGGTCTGCAGAAATGAATGAAAGAATTACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC69TF U 1
AF RR4GC69JQ C 139
BS 1 601 RR4GC69TF
BS 602 602 RR4GC69JQ
BS 603 636 RR4GC69TF
BS 637 824 RR4GC69JQ

RD RR4GC69TF 636 0 0
GGGATAAAATTTCTCTGAGAGAATTACATTTTATTTGTTTATAATTTTGATCAATAGATC
GAATCTTTTGTTCGCTTGGACGATTATATATGTTTCGCAGTGGCGATTTTCCTCCGGTTT
GTGGATATTAAACTTTTGTTTTAATCACCCTTCCTTTTCGAAAATCATCCTCCAAATCCC
TTTCGATCTTAAAAGGTTTGATGGTTGTAGTCGGTTAAGCTCCGATCTTAATTATAACGG
AAGACAATATTTGCTTCGTTATGATAAGAGCAGAGTTTTCCAGAGGGGATTAAGCTATGA
GTTAATTGATTAAACTTTGTTTTTTTTGTTCAGAATCAGTAGTGTTGAAGCTTCCTTTAT
AAGTGAGAAGTGTTTCAACGAAGAGTCTGTAATAGGTTTACTAAAGTTTTCTCTTCGATT
ACCACCTCCGGCTATTTGGCTACCGGTGTTAAGGTCCTTTAACCATTGACGGTGAAATAG
AGGAAAGAGCATGAAAGTGGTACTAAGATCTAAGGATGGTGGTTTCTCGCCTTTCTTAAC
GATTCTCTCTTTGCCCACACTGCGAAATAACAGTCCGGCGAGATCCCAGGTGAAGCTTTC
G*TGATGCACTCAACAACACATGAACAAGACGCGTG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4GC69JQ 686 0 0
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TGATGGTTGTAGTCGGTTAAGCTCCGATCTTAATTATAACGGAAGACAATATTTGCTTCG
TTATGATAAGAGCAGAGTTTTCCAGAGGGGATTAAGCTATGAGTTAATTGATTAAACTTT
GTTTTTTTTGTTCAGAATCAGTAGTGTTGAAGCTTCCTTTATAAGTGAGAAGTGTTTCAA
CGAAGAGTCTGTAATAGGTTTACTAAAGTTTTCTCTTCGATTACCACCTCCGGCTATTTG
GCTACCGGTGTTAAGGTCCTTTAACCATTGACGGTGAAATAGAGGAAAGAGCATGAAAGT
GGTACTAAGATCTAAGGATGGTGGTTTCTCGCCTTTCTTAACGATTCTCTCTTTGCCCAC
ACTGCGAAATAACAGTCCGGCGAGATCCCAGGTGAAGCTTTCGGTGATGCACTCAACAAC
ACATGAACAAGACGCGTGGACAAGAACAAACGCGTGCTTAGGTTTAGTTGTTGATTTTGG
GACTTTAAATATGGGCTTTCTGTAATGGATAAAAACTTTACCAAACCACTTCTGTTACAA
AGCCGAGTGACCTAAAATCTCTTGGTTTGTTAACAAATATGCATTGAGTTAATTTGGTCT
GCAGAAATGAATGAAAGAATTACACT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL5469Contig1 1016 2 2 U
GGCCACGGAGTTGCTGCGGCGAGGATGGATGCAATGTTGAACATTGCTGGATGGATGTCT
GAACAAATGGGTGGTCTCAGTTATCTTGAATTCTTACGCACCCTTGAAAAGAAAGTGGAT
GAAGACTGGGAAGGGATATCATCTTCCCTTGAGGAGATCAGGAGATCTCTCCTCGCCAAG
AATGGTTGCATAGTTAACATGACTGCAGATGGCAAGTCTCTCACTAGCATCGAAAAATCT
CTTGAGAAGTTCCTAGATTTACTCCCTGAAAACCCATCTGGTGGCCTCGTCACTTGGGAT
GGTAGACTCCCTCTGAGAAACGAAGCCATTGTGATACCAACCCAGGTAAACTATGTTGGC
AAAGCTGGTAACGTATACAGCACAGGGTATGAGCTTGATGGCAGTGCGTATGTTATCTCA
AAGCATATTAGTACTACTTGGTTATGGGATCGTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGA
GGTTTCTGTGATTTCGATTCGCATTCAGGAGTGTTCTCGTTCTTGTCGTACCGTGATCCA
AACTTGTTGAAGACACTTGACATATATGATGGAACTGGAGATTTCCTGCGTGGTCTTGAT
ATGGATCAAGAGACGCTCACTAAAGCTATCATTGGAACCATTGGTGATGTTGATTCATAC
CAGTTACCTGATTCCGAAGGTTATAGCAGTTTGATGAGGCATTTACTTGGAGTAACCGAT
GAAGAACGGCAAAGAAAGCGTGAGGAGATATTAACAACAAGTTTGAAGGACTTCAAGGAT
TTCGCAGAGGCAATAGATGTGGTTAGAGACGAAGGTGTGTCGGTGGCTGTGGCATCTGCA
GAAGACATTGATGCTGCTAACAATGCACGCTCCAACTTTTTCGAGGTCAAGAAAGCTCTC
TAAAGTGAGAAGTTCCTCACTAATAAGACTGAGAATCTCATTACATTTTTGTCTTGATTT
CTCTACTGGAGTGAATGTCTTTGGCAAAGCTTAAATATTAAATGAGTTTTCACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP33TF U 1
AF RR4AP33JQ C 235
BS 1 676 RR4AP33TF
BS 677 1016 RR4AP33JQ

RD RR4AP33TF 676 0 0
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GAACAAATGGGTGGTCTCAGTTATCTTGAATTCTTACGCACCCTTGAAAAGAAAGTGGAT
GAAGACTGGGAAGGGATATCATCTTCCCTTGAGGAGATCAGGAGATCTCTCCTCGCCAAG
AATGGTTGCATAGTTAACATGACTGCAGATGGCAAGTCTCTCACTAGCATCGAAAAATCT
CTTGAGAAGTTCCTAGATTTACTCCCTGAAAACCCATCTGGTGGCCTCGTCACTTGGGAT
GGTAGACTCCCTCTGAGAAACGAAGCCATTGTGATACCAACCCAGGTAAACTATGTTGGC
AAAGCTGGTAACGTATACAGCACAGGGTATGAGCTTGATGGCAGTGCGTATGTTATCTCA
AAGCATATTAGTACTACTTGGTTATGGGATCGTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGA
GGTTTCTGTGATTTCGATTCGCATTCAGGAGTGTTCTCGTTCTTGTCGTACCGTGATCCA
AACTTGTTGAAGACACTTGACATATATGATGGAACTGGAGATTTCCTGCGTGGTCTTGAT
ATGGATCAAGAGACGCTCACTAAAGCTATCATTGGAACCATTGGTGATGTTGATTCATAC
CAGTTACCTGATTCCG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AP33JQ 782 0 0
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TGGGATGGTAGACTCCCTCTGAGAAACGAAGCCATTGTGATACCAACCCAGGTAAACTAT
GTTGGCAAAGCTGGTAACGTATACAGCACAGGGTATGAGCTTGATGGCAGTGCGTATGTT
ATCTCAAAGCATATTAGTACTACTTGGTTATGGGATCGTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCA
TATGGAGGTTTCTGTGATTTCGATTCGCATTCAGGAGTGTTCTCGTTCTTGTCGTACCGT
GATCCAAACTTGTTGAAGACACTTGACATATATGATGGAACTGGAGATTTCCTGCGTGGT
CTTGATATGGATCAAGAGACGCTCACTAAAGCTATCATTGGAACCATTGGTGATGTTGAT
TCATACCAGTTACCTGATTCCGAAGGTTATAGCAGTTTGATGAGGCATTTACTTGGAGTA
ACCGATGAAGAACGGCAAAGAAAGCGTGAGGAGATATTAACAACAAGTTTGAAGGACTTC
AAGGATTTCGCAGAGGCAATAGATGTGGTTAGAGACGAAGGTGTGTCGGTGGCTGTGGCA
TCTGCAGAAGACATTGATGCTGCTAACAATGCACGCTCCAACTTTTTCGAGGTCAAGAAA
GCTCTCTAAAGTGAGAAGTTCCTCACTAATAAGACTGAGAATCTCATTACATTTTTGTCT
TGATTTCTCTACTGGAGTGAATGTCTTTGGCAAAGCTTAAATATTAAATGAGTTTTCACA
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5470Contig1 502 2 2 U
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TTCCTGGTTCTCTTAGAAGAAATGATGTTCCTCAACTCCCTATCTAAGCTCCTGAAAACA
CTAGAAAATGGCAGATTAGCATTGTTGTGAATCAGATTATTTCTTTGTTTCCAGATGTGA
AAAATCAGCGCTTGAGTTGCTAGCTTTCGTAAGAGGATCCTCTTCCTCGTGCTCGCTCCT
CGTATCCAAGATAAGAGCTCAGACCAGTCAGCAAACATCTGCGACGGAGGATTGCATCTT
GCGAAGACTTGAGCCCAAACATCATTGGTGTATTGGCATGAAAGAAACAGATGGTCTCTG
GTTTCTGGGAATGCTGAACAGAGCGGGCATGTCACCGGTACCGCCAGCCCCCACGATGAC
AGTCTGGTCCTTGTTGGCAGCCTGTCGTAGTTGGTCACCCACATCATGAAAGCATGTTTA
GGTACTGCCCCTTTGAACCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GV56TF C 1
AF RR4GV56JQ U 264
BS 1 263 RR4GV56TF
BS 264 502 RR4GV56JQ

RD RR4GV56TF 383 0 0
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TTCCTGGTTCTCTTAGAAGAAATGATGTTCCTCAACTCCCTATCTAAGCTCCTGAAAACA
CTAGAAAATGGCAGATTAGCATTGTTGTGAATCAGATTATTTCTTTGTTTCCAGATGTGA
AAAATCAGCGCTTGAGTTGCTAGCTTTCGTAAGAGGATCCTCTTCCTCGTGCTCGCTCCT
CGTATCCAAGATAAGAGCTCAGACCAGTCAGCAAACATCTGCGACGGAGGATTGCATCTT
GCGAAGACTTGAGCCCAAACATCATTGGTGTATTGGCATGAAAGAAACAGATGGTCTCTG
GTTTCTGGGAATGCTGAACAGAG

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR4GV56JQ 239 0 0
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ATTGGTGTATTGGCATGAAAGAAACAGATGGTCTCTGGTTTCTGGGAATGCTGAACAGAG
CGGGCATGTCACCGGTACCGCCAGCCCCCACGATGACAGTCTGGTCCTTGTTGGCAGCCT
GTCGTAGTTGGTCACCCACATCATGAAAGCATGTTTAGGTACTGCCCCTTTGAACCAGA

QA 1 239 1 239
DS 



AS 1 2

CO CL5471Contig1 875 2 2 U
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AACCAAACCCTTAAGCCTCTCTGCTTCTTCACCATCCTCCTCTGAAAACCTCCTTCCCAT
GCTCATCCTACACATGATGTTGTTAACAAGCTTCAATGCTTCCTTACCCACCTCAACACT
CTCCTTCTTCCTCGCCTTATCAAGCAACTTCCTGTAAAAACGGTTTATCTCATCTGCACG
GATGCCTCGCGACTGCTCTTGCGCTTGTGGTCCGAGAAGCTTTGTGACCATTAGCTTCTT
CATGAACTTCCAGTAATCGTCACAAGGAGCGTTGATCACGCCAGATGATCCAAACAAGAG
GGACTCATCGATGGCAGGAACACCCCGAGAGGAGACGTTCACGTCATGGGCTCTGAATAT
CTCGTAGGCCACAGAGGCTGAGGAGACGAGAATGATGGGTGTATTAAAGATCCGGAGGTG
GAGGAAAGATCCATAGCTGGAAGATATTTTGTGTAAAGACTTGTGAACTAGGGTAGAGAG
AAGAAGGTGAAGATGACCAATGACTGGAAGAGAGGGAGGGCTCGGAGGCAGATCACAACC
AACTCGTGAGTCCTTTGTTTTCTTAAAGAAAAGAGAATAACAAAAGAGTGAAAAGAAGCA
GAGGAGAATGAAGATGAAACAGTCAAGAAAGTCACCGCTGATCATCGCTGCCATTGTTGC
TCAAAAGCGTATGAGGCATGTCTTCTTAAAGAGTATGAAGATAAAACAATCTCGTGATCA
GTTTAATAAAGGTATTATTTTCATCCAATAAAGTGACAGCTATGAGTCATTAACCTCGAC
AATAACGTGTCTAGAACACCTCCATTACTTTGTCC


BQ
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AF RR4FA12TF U 1
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BS 716 875 RR4FA12JQ

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GAGGAGAATGAAGATGAAACAGTCAAGAAAGTCACCGCTGATCATCGCTGCCATT

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DS 

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QA 1 630 1 630
DS 



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BQ
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AF RR4BD22JQ C 1
AF RR4BD22TF U 1
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DS 

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TATGGGAGAAACGATAGACCTAGAACCGAATGAGCCAGAGGCAGAGCAAACTGATCAAAC
CAAAACCGTTGAAAAGCTTCTTGTAGAATCAGTTGAGAAGATGCAGACTTCATCTCTTGA
GTTTCCTTATGATGTATCAGAGGAAAAAACCACAACCGTTGATGACAAGATGGAAGAAGT
AACACTGCGGCAAGAAAAATCTGATGAAGTTATAAAAGTTTCATCTGTATCACCATCAGA
GGAACAGGAAGGTGAGATCATTGTTGAAGACAAAACTGAGGAAGAACAAGTAGTAGAAAA
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GCAAGAACACAAAACCATTTCCGAGAAGACAGAAGATGAAAAAGTCAAGG

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL5473Contig1 901 2 2 U
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TCTAGTTTTCATTTTAAAAAAAAACGGAGTCTTGTTCGAGCTACTTACTACCTAGAGTAA
TCAACACAGTCCAAGCCCTAACCAGAGACAACTGGATCTACTGCTGTAGTTACTCAGCCT
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AGACTTCAACGCTCCTTACTGGGCCAGACAAATCCCGTTATCAGCCTAGGTGCAGGTCTG
GGGCAAAAGAGAAGAACGCTCCTGCTGTGTCTTCATCAGCATAAATCTTTTGGTATTTTA
TAAATGGTTTAGGGTTATAGGCTTCCATTCTGGAAAGATAACGATTAGGCTGGATTGGGT
TTGCTAGGATGTATGGCTACGAGTTCCTGGTTTAATGGAATGATGAAGAGAATAGCTGGT
TTTAGAATGCAGAGTTTTGGTAGCATATGGATTGGGAATAGAGAGTTGAGATTTTGGTTG
TTGTAGGATGGATATTCTTTTTGGCTGTGAGATAGTTTAGTCCAGATAAGAGGATAAAAA
AAATCCCCAACTTGTTGTGTGACAAATAGGTCAAAAGAACCATGTTCTCACACTTTTGTC
TATTCTCCAAGCTGAATAGAGTTATCTACCTACTGCCCATGAATTTTCAACTATTTGTGC
T


BQ
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10 

AF RR4FK19TF U 1
AF RR4FK19JQ C 253
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BS 723 901 RR4FK19JQ

RD RR4FK19TF 722 0 0
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TGTTCTTGGTGACAACTCTCGATTCTTCTCTCTTTTAGTTTATTTGTTTATGAATAAAGC
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TCTAGTTTTCATTTTAAAAAAAAACGGAGTCTTGTTCGAGCTACTTACTACCTAGAGTAA
TCAACACAGTCCAAGCCCTAACCAGAGACAACTGGATCTACTGCTGTAGTTACTCAGCCT
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AGACTTCAACGCTCCTTACTGGGCCAGACAAATCCCGTTATCAGCCTAGGTGCAGGTCTG
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TAAATGGTTTAGGGTTATAGGCTTCCATTCTGGAAAGATAACGATTAGGCTGGATTGGGT
TTGCTAGGATGTATGGCTACGAGTTCCTGGTTTAATGGAATGATGAAGAGAATAGCTGGT
TTTAGAATGCAGAGTTTTGGTAGCATATGGATTGGGAATAGAGAGTTGAGATTTTGGTTG
TT

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DS 

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AAGCCCTAACCAGAGACAACTGGATCTACTGCTGTAGTTACTCAGCCTTAGAGAGCCACA
ATGAAGTTCTCTTTGAAGCAAGCAGATGATGCCTCAAGATAAAGCTGAAGACTTCAACGC
TCCTTACTGGGCCAGACAAATCCCGTTATCAGCCTAGGTGCAGGTCTGGGGCAAAAGAGA
AGAACGCTCCTGCTGTGTCTTCATCAGCATAAATCTTTTGGTATTTTATAAATGGTTTAG
GGTTATAGGCTTCCATTCTGGAAAGATAACGATTAGGCTGGATTGGGTTTGCTAGGATGT
ATGGCTACGAGTTCCTGGTTTAATGGAATGATGAAGAGAATAGCTGGTTTTAGAATGCAG
AGTTTTGGTAGCATATGGATTGGGAATAGAGAGTTGAGATTTTGGTTGTTGTAGGATGGA
TATTCTTTTTGGCTGTGAGATAGTTTAGTCCAGATAAGAGGATAAAAAAAATCCCCAACT
TGTTGTGTGACAAATAGGTCAAAAGAACCATGTTCTCACACTTTTGTCTATTCTCCAAGC
TGAATAGAGTTATCTACCTACTGCCCATGAATTTTCAACTATTTGTGCT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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AAGTGATGACGGGACTGAACTGGTACGGTTAGCTTCTAGATGCTTACAGTATGAGCCTCG
AGAACGGCCTAACCCAAAATCTCTAGTCACTGCAATGATCCCTCTTCAGAAGGATCTTGA
GACTCCTTCACATCGACTGATGGGCATACCAAGCAGTGCCTCAACAACGCCTCTTTCACC
ACTCGGAGAAGCATGCCTAAGAACTGACCTAACTGCCATACATGAGATTGTTGAAAAACT
TGGTTATAAAGATGATGAGGGAGCAGCCACAGAGCTTTCGTTCCAGATGTGGACCAACCA
GATGCAGGACTCGCTGAACTTCAAGAAAAAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTT
TGCAAATGCTGCTGAATGTTATTCTCAGTTTATAGAGGGTGGGACAATGGTTTCACCAAC
TGTTTATGCAAGGAGAAGTCTGTGTCACCTGATGAATGAGATGCCTCAAGAGGCGTTGAA
TGATGCAATGCAAGCCCAAGTGATATCTCCCGCTTGGCATATCGCATCTTATCTTCAAGC
TGTAGCTCTCACAGCTCTAGGACAAGAGAACGAAGCACACGCTGCTCTTAAAGACGGATC
AATGCTCGAAAGCAAAAGAAACGCTCTATGATTATGATAACAAAAAAAAAAGAGGAAAAC
AAGAGAAAAAACAGCTCGTAGGCTTTGCAGAATATGATCAAAACCCACCACCATCTTCCT
CATAAGTAGATAGGAGCCACTACACGGCTCTCATATTGTGTGCATCCTCATCACTGGTCA
GTTTCGTAGTTCCCTCTTTTTTTTTCAAATACTGGATGATGCATTCATTTGCAAATTGGA
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AAAAGTTGCCTACTTTGATTATGGACTGGGAATGGTGTGATTGTGGATTTTCTTTGGTGG
GTTCCGTGCTTTGTAATCAATGTTTTGTAATAACAAATAACATGTATGTAAACTTTGTAT
TTTGGCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA50TF U 1
AF RR4AA50JQ C 269
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GACTCCTTCACATCGACTGATGGGCATACCAAGCAGTGCCTCAACAACGCCTCTTTCACC
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AATGCTCGAAAGCAAAAGAAACGCTCTATGATTATGATAACAAAAAAAAAAGAGGAAAAC
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QA 1 858 1 858
DS 

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AAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTTTGCAAATGCTGCTGAATGTTATTCTCAG
TTTATAGAGGGTGGGACAATGGTTTCACCAACTGTTTATGCAAGGAGAAGTCTGTGTCAC
CTGATGAATGAGATGCCTCAAGAGGCGTTGAATGATGCAATGCAAGCCCAAGTGATATCT
CCCGCTTGGCATATCGCATTTTATCTTCAAGCTGTAGCTCTCACAGCTTTAGGACAAGAG
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TGATTATGATAACAAAAAAAAAAGAGGAAAACAAGAGAAAAAACAGCTCGTAGGCTTTGC
AGAATATGATCAAAACCCACCACCATCTTCCTCATAAGTAGATAGGAGCCACTACACGGC
TCTCATATTGTGTGCATCCTCATCACTGGTCAGTTTCGTAGTTCCCTCTTTTTTTTTCAA
ATACTGGATGATGCATTCATTTGCAAATTGGACTCTCTTTTTTTTGTGTGTTTTCTGTTA
CTGGCATTAACATTTCCCTATTATACAGAAGAAAAAGTTGCCTACTTTGATTATGGACTG
GGAATGGTGTGATTGTGGATTTTCTTTGGTGGGTTCCGTGCTTTGTAATCAATGTTTTGT
AATAACAAATAACATGTATGTAAACTTTGTATTTTGGCTT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

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AGATTTCCAGAAGTTTGCTCTTGAGGATGCAGCTGGCAATTACAACTATGGGTTGGAGTG
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GCATCTGAGACCAACCAAGTGAAGCCATCACTCTGAATTTCAAGGATATTTGTTCTAAG


BQ
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AF RR4AT85JQ C 1
AF RR4AT85TF U 1
BS 1 719 RR4AT85TF

RD RR4AT85JQ 719 0 0
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QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4AT85TF 719 0 0
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TGCAGAAAGAACATTCTGAAGAAACCAGTATATTTACCTCGGTGAAAAGTACTTGAAGTA
TCGCAAGCGGTGCTTAAACGAAAGAAAGAAGCTGGGAAGCGGATGCAGTGAGGAAATGAA
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CTTTGAGCAGCTAACGGTTGACTTCTACCGCAAGGGAAATCTGTATGGGTTGGAGAAGTA
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GAAGCTACTGAAGGAAGAATACCGCAGCTTAGACGATTTCCGAGCGAAGGATCCAATCAC
CAGCCAGAAAGTAAACAAGTCTCATTGATGACTTGAAGAGACAGAAGAGTAGAGACATCA
TAATAGGCTGCTGCTTACCACTAAGCAAATGATCCTTAAACCTTGACCTGAAATTTTTGT
GCATCTGAGACCAACCAAGTGAAGCCATCACTCTGAATTTCAAGGATATTTGTTCTAAG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GZ93TF U 1
AF RR4GY33TF U 1
BS 1 798 RR4GY33TF

RD RR4GZ93TF 476 0 0
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QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4GY33TF 798 0 0
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TCTTCTCTACTCTCCGAACCTCCACCCTCTCTACACTTCAAATCGTCTACCCGAGACCTC
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GTCTTCCTTCTTCTGGGGTTACCTTCTCACTCAAATAGCAGGAGGGATATGGGCAGACAC
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TACTCCTATCGCAGCTAAACTCGGTCTCCCCTTCTTGCTCGTTGTTCGTGCTTTCATGGG
AGTTGGCGAGGGTGTTGCGATGCCTGCTATGAACAATATATTGTCCAAGTGGGTGCCTGT
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TAGCCTTTCGCCTTCTGA

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL5477Contig1 850 2 18 U
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TTCTTTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ90TF U 1
AF RR4CZ90JQ C 3
BS 1 653 RR4CZ90TF
BS 654 654 RR4CZ90JQ
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BS 732 737 RR4CZ90TF
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BS 748 748 RR4CZ90JQ
BS 749 767 RR4CZ90TF
BS 768 850 RR4CZ90JQ

RD RR4CZ90TF 769 0 0
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CAAACACGGTGATTACACCATTATCACCAACTCGTCCTCAGCAGACGTGTGACAAGCAGC
ACAAGCCGGCGCTTCTCAACGTCATCATAGCCTGACGAACACACAAGCCAACAATTTGCT
CGGTACACACGATCTCAACACGAGACTTCGGGTCGGCAATAGTTCGGTAAACATGTATTC
TAGGCACAAGTTTAAATTGAACTTGCTTTTTATTAGGCACGAGTTTACGGTCGACTCGCT
TATTGTTAGATACGAGTTTACAAAAACTCGTCTTTGGCTAGGCATGAATTTACAGAAACT
CTCCTTCTACTAGGCACGAGTTCTCAGTAAATTCGCCTCTGTCTCAGCGTGAGTCCAGTA
AACTCGTCTTTCATTAAGCACGAGTTTAAAGTAAACTCGCCTTCTACTAAGCACAAGTTC
AAACTAAATTTGCCTAAGTCGTCGCAGGCATGAATGTGTCTAGCTAATTGTCTAATAAAC
CCTATTCGTGAAATTCACGGAGATCGACTTCATCTCTCTCTACGAACTTGGGGGGACTTA
CTGTTGGGGGTGGATTTACATCCTCTCTCAAGGCCCATTAGACAATAAGCTAG*CCCATT
TGACTAGAAAGTCCTAG*CTCCATCTTTCTATAAATAAG*AGCTTCCTCT**CTTAGAAA
G*ATCTTCTC*TCTTTT*AGATCTAGA*CACTTCTTTATGGAGATTT
AT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4CZ90JQ 848 0 0
GCATG
TCAAAGTCGTCGGTCACGTTACCATGACGTGTTCTCATACCATGACGTGTTCCCAAACAC
GGTGATTACACCATTATCACCAACTCGTCCTCAGCAGACGTGTGACAAGCAGCACAAGCC
GGCGCTTCTCAACGTCATCATAGCCTGACGAACACACAAGCCAACAATTTGCTCGGTACA
CACGATCTCAACACGAGACTTCGGGTCGGCAATAGTTCGGTAAACATGTATTCTAGGCAC
AAGTTTAAATTGAACTTGCTTTTTATTAGGCACGAGTTTACGGTCGACTCGCTTATTGTT
AGATACGAGTTTACAAAAACTCGTCTTTGGCTAGGCATGAATTTACAGAAACTCTCCTTC
TACTAGGCACGAGTTCTCAGTAAATTCGCCTCTGTCTCAGCGTGAGTCCAGTAAACTCGT
CTTTCATTAAGCACGAGTTTAAAGTAAACTCGCCTTCTACTAAGCACAAGTTCAAACTAA
ATTTGCCTAAGTCGTCGCAGGCATGAATGTGTCTAGCTAATTGTCTAATAAACCCTATTC
GTGAAATTCACGGAGATCGACTTCATCTCTCTCTACGAACTTGGGGGGACTTACTGTTGG
GGGTGGATTTACATCCTCTCTCAAGGCCCATTAGACAATAAGCTAGGCCCATTTGACTAG
AAAGTCCTAGGCTCCATCTTTCTATAAATAAGGAGCTTCCTCCTCCTTAGAAAGGATCTT
CTCCTCTTTTTAGATCTAGAACACTTCTTTATGGAGATTTTATAGATTCTTAGATTCATT
TTGCTTCAAATCATTTTGTAATGCAATCTTTGATCAGTAAAATCTCTTGGATGTTCTTTT
CTC

QA 6 848 6 848
DS 



AS 1 2

CO CL5478Contig1 1199 2 2 U
GGATACGAGCATTCTCTCTCTCTCTCTCGTCCTGATTTGTATAAACCCTAACGACTACTA
GATTTACGGCTCCTTTAATCGGAGAAATTGTATCATGAGTCGTTACGATAGCCGGACCGG
TGACTCCACCTCCTACCGTGACCGTCGAAGTGACTCAGGGTTTGGTGGAGCTTCAGCGTA
CGGAAGCTCAGCTAGTAGTAAAAGGGAGACTAGTGTTGGTGGGGATGAGTCTCCAAAGAA
GCAGCCAGATTTGGATGGTTTGACTCCTTTTGAGAAGAATTTCTATGTTGAGTCTCCCTC
TGTCGCAGCTATGACGGAGGCTGAAGTGGAGGAGTATCGAAGGATGAGGGAGATCACTGT
TGAGGGTCGTGATATTCCTAAACCTGTCAAAAGCTTTCGTGATGTTGGCTTTCCTGATTA
TGTTTTGGAAGAGGTTAAGAAGGCTGGTTTTACTGAACCTACCCCCATACAATCTCAGGG
GTGGCCAATGGCGTTGAAGGGACGTGATCTCATTGGCATTGCTGAAACTGGCTCTGGGAA
GACTCTTTCTTACTTGCTACCTGCCATAGTCCATGTGAATGCTCAACCAATTTTAGCTCC
TGGGGATGGTCCAATCGTCTTGGTTCTTGCTCCGAGAGAGATTGGGTACTCTCGGAGTTT
CGATCAGGCAAAAGCCCTATAATGACTGCTACAGACGTCGCAGCTCGTGGATTAGATGTT
AAGGATGTGAAGTATGTGATAAACTATGACTTCCCTGGATCACTGGAGGATTATGTTCAC
AGGATTGGTCGAACTGGTAGAGCCGGGGCCAAAGGAACAGCTTACAGTTTCTTCACAGCT
GCAAATGCGAGGTTCGCCAAAGAGCTTATCAGCATACTAGAAGAAGCTGGACAGAAAGTG
AGCCACGAATTAGCATCAATGGGTCGCAGCACAGCTCCTCCTCCTCCAGGGCTTGGAGGA
TTTAGAGACCGTGGAAGCAGAAGAGCTTGAGTTGATATCTGTTTTATGTGTATGTGTTAT
TGGCTTTTAGGGCTCAGTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTCCATTTACTCTTTTATTTGA
TGCCTCACTCTCTTTCCTAAAACATTTGACATTGGCATCAAAACGTTAAACATGTAAGAT
AACATTTGATCCGATGGTATGATTTGGTTTTAAGTACAAAACCAAAGATGTCGTAATCC


BQ
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AF RR4EV78TF U 1
AF RR4EV78JQ C 608
BS 1 660 RR4EV78TF
BS 661 1199 RR4EV78JQ

RD RR4EV78TF 660 0 0
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GATTTACGGCTCCTTTAATCGGAGAAATTGTATCATGAGTCGTTACGATAGCCGGACCGG
TGACTCCACCTCCTACCGTGACCGTCGAAGTGACTCAGGGTTTGGTGGAGCTTCAGCGTA
CGGAAGCTCAGCTAGTAGTAAAAGGGAGACTAGTGTTGGTGGGGATGAGTCTCCAAAGAA
GCAGCCAGATTTGGATGGTTTGACTCCTTTTGAGAAGAATTTCTATGTTGAGTCTCCCTC
TGTCGCAGCTATGACGGAGGCTGAAGTGGAGGAGTATCGAAGGATGAGGGAGATCACTGT
TGAGGGTCGTGATATTCCTAAACCTGTCAAAAGCTTTCGTGATGTTGGCTTTCCTGATTA
TGTTTTGGAAGAGGTTAAGAAGGCTGGTTTTACTGAACCTACCCCCATACAATCTCAGGG
GTGGCCAATGGCGTTGAAGGGACGTGATCTCATTGGCATTGCTGAAACTGGCTCTGGGAA
GACTCTTTCTTACTTGCTACCTGCCATAGTCCATGTGAATGCTCAACCAATTTTAGCTCC
TGGGGATGGTCCAATCGTCTTGGTTCTTGCTCCGAGAGAGATTGGGTACTCTCGGAGTTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4EV78JQ 592 0 0
GGTCCAATCGTCTTGGTTCTTGCTCCGAGAGAGATTGGGTACTCTCGGAGTTTCGATCAG
GCAAAAGCCCTATAATGACTGCTACAGACGTCGCAGCTCGTGGATTAGATGTTAAGGATG
TGAAGTATGTGATAAACTATGACTTCCCTGGATCACTGGAGGATTATGTTCACAGGATTG
GTCGAACTGGTAGAGCCGGGGCCAAAGGAACAGCTTACAGTTTCTTCACAGCTGCAAATG
CGAGGTTCGCCAAAGAGCTTATCAGCATACTAGAAGAAGCTGGACAGAAAGTGAGCCACG
AATTAGCATCAATGGGTCGCAGCACAGCTCCTCCTCCTCCAGGGCTTGGAGGATTTAGAG
ACCGTGGAAGCAGAAGAGCTTGAGTTGATATCTGTTTTATGTGTATGTGTTATTGGCTTT
TAGGGCTCAGTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTCCATTTACTCTTTTATTTGATGCCTCA
CTCTCTTTCCTAAAACATTTGACATTGGCATCAAAACGTTAAACATGTAAGATAACATTT
GATCCGATGGTATGATTTGGTTTTAAGTACAAAACCAAAGATGTCGTAATCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5480Contig1 818 2 4 U
GCAAGAACGAGGATTTGCTTTCAAGATTCATCAACATCGAGGAGATGAGTTCACCAGAGC
TGCTTCGTGATATTGTCATTAGTTTCATACTCGCGGGACGAGACACCACATCCTCTGCGT
TGAGCTGGTTCTTTTGGTTGCTCTCTATGCATCCAGAAGTTGAGAACAAAATCAGACAAG
AGCTGACCTCGATTAGGGCACGAACAGGGAAGCGAATCGGTGAAGTTTACGGGTTTGAGG
ATCTTAAACTGATGAACTATCTGCACGCAGCGATAACTGAATCTCTTAGGTTATATCCCC
CTGTGCCAGTGGACGCAATGAGCTGTGTTGAGGACAATGTACTGCCTGATGGGACATTTG
TAGGGAAAGCTTGGGGGATAAGTTACAACGCGTACGCGATGGGGAGGATGGAGAGTATTT
GGGGGAAGGGCTGTGATAGGTTTGATCCAGAGAGGTGGATTGATGAAACAAATGGTGGGT
TTAGAGGTGAGAATCCTTACAAGTTTCCGGTGTTTCATGCAGGACCAAGGATGTGTTTAG
GGAAAGAGATGGCTTATATTCAGATGAAATCGATAGTTGCTGCTGTGCTGGACAGGTTTG
TTTTTGAGGTTCCGGGGAAGAAGGAGCGTCCTGAGATTTTGTTGTCTGTGACACTTAGAA
TCAAAGGTGGTTTGTTTGTGAGGATACATGAAAGAACCTGAGTTACTTGTTGGTCAAGTT
TTCTTTGGTTTACACTTTTATAATGTGTTATGTTTTATTTACCTTTTCGCTAAGTTTCCG
GCAAATATTGGTTACAATCACACGGAAGAATAAACTAC


BQ
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AF RR4BZ95TF U 1
AF RR4BZ95JQ C 89
BS 1 521 RR4BZ95TF
BS 522 522 RR4BZ95JQ
BS 523 568 RR4BZ95TF
BS 569 818 RR4BZ95JQ

RD RR4BZ95TF 568 0 0
GCAAGAACGAGGATTTGCTTTCAAGATTCATCAACATCGAGGAGATGAGTTCACCAGAGC
TGCTTCGTGATATTGTCATTAGTTTCATACTCGCGGGACGAGACACCACATCCTCTGCGT
TGAGCTGGTTCTTTTGGTTGCTCTCTATGCATCCAGAAGTTGAGAACAAAATCAGACAAG
AGCTGACCTCGATTAGGGCACGAACAGGGAAGCGAATCGGTGAAGTTTACGGGTTTGAGG
ATCTTAAACTGATGAACTATCTGCACGCAGCGATAACTGAATCTCTTAGGTTATATCCCC
CTGTGCCAGTGGACGCAATGAGCTGTGTTGAGGACAATGTACTGCCTGATGGGACATTTG
TAGGGAAAGCTTGGGGGATAAGTTACAACGCGTACGCGATGGGGAGGATGGAGAGTATTT
GGGGGAAGGGCTGTGATAGGTTTGATCCAGAGAGGTGGATTGATGAAACAAATGGTGGGT
TTAGAGGTGAGAATCCTTACAAGTTTCCGGTGTTTCATGCATGACCAAGGATGTGTTTAG
GGAAAGAGATGGCTTATATTCAGATGAA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4BZ95JQ 730 0 0
ACTCGCGGGACGAGACACCACATCCTCTGCGTTGAGCTGGTTCTTTTGGTTGCTCTCTAT
GCATCCAGAAGTTGAGAACAAAATCAGACAAGAGCTGACCTCGATTAGGGCACGAACAGG
GAAGCGAATCGGTGAAGTTTACGGGTTTGAGGATCTTAAACTGATGAACTATCTGCACGC
AGCGATAACTGAATCTCTTAGGTTATATCCCCCTGTGCCAGTGGACGCAATGAGCTGTGT
TGAGGACAATGTACTGCCTGATGGGACATTTGTAGGGAAAGCTTGGGGGATAAGTTACAA
CGCGTACGCGATGGGGAGGATGGAGAGTATTTGGGGGAAGGGCTGTGATAGGTTTGATCC
AGAGAGGTGGATTGATGAAACAAATGGTGGGTTTAGAGGTGAGAATCCTTACAAGTTTCC
GGTGTTTCATGCAGGACCAAGGATGTGTTTAGGGAAAGAGATGGCTTATATTCAGATGAA
ATCGATAGTTGCTGCTGTGCTGGACAGGTTTGTTTTTGAGGTTCCGGGGAAGAAGGAGCG
TCCTGAGATTTTGTTGTCTGTGACACTTAGAATCAAAGGTGGTTTGTTTGTGAGGATACA
TGAAAGAACCTGAGTTACTTGTTGGTCAAGTTTTCTTTGGTTTACACTTTTATAATGTGT
TATGTTTTATTTACCTTTTCGCTAAGTTTCCGGCAAATATTGGTTACAATCACACGGAAG
AATAAACTAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL5481Contig1 934 2 4 U
GGGCTCAAAGATCCAGCAGAACCCTTATCCCCTCCCGAAAGCACATCGAGAAAGAGAGAG
ATAGAGAGAGAGAGAGCCATGTCTGCCTCCGCTTCTTCCGTTTCCCTCTCTTCCTTCAAT
CCCAAATCCCTTCACTCTCCTTCAAACTCCCCTCCCTCTCTCTCTTCGCTTCCTCCGCCC
TCAAATCCTCCTCCTCACCCGCCCAGTACACATCTCTCTTCGTCACACACGTCGCCGTAT
CCTCTGATTTCGAGGTTGAGGAAGACGACATGTTCGCTGACAACGATTCTCCGCTGGCCC
TCCTCCACCTAAGAGGGAGGAATCATTCTCCATAGGACCAAGGAGTGGTGGTTACGGTTC
TGAGCGTTCCGGTTACGGTTCTGAACGTTCTGGTTACGGGTCTCAACGTTCAGGACGTTC
TGGCTACGGTTCTGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGGGTCAGGGTCGGGCTCGGGCTCATC
AGACCGTGTTTATGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACATGGTTCTTGAGAGCTT
GTTTAGTGAGCAAGGAAAGGTTGTAGAGGCCAGGGTCATTTACGACAGGGAAACTGGTCG
ATCCAAGGGTTTTGGGTTCGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGTCACAAGAGCCATCAG
TTCTTTGAATGGAGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCTCGGAGGCGGAGGCTGG
ACCACCAAGGCGCCAATTTTGAGTTACCACGCAACTCCTGGAATCTATGAGGTTTAGCTC
ATCTTGACTGGAGATGAGTTATTTATGTTTTGGGCTTATGTTTCTTTATTTTACTTTAAT
TCGTTTTACGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTTTGTAGACTAGGAGTTTGGACCTTGTT
TTCTTTTTGTATACTAGTACTCCCTTTCTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GG05TF U 1
AF RR4GG05JQ C 225
BS 1 680 RR4GG05TF
BS 681 681 RR4GG05JQ
BS 682 705 RR4GG05TF
BS 706 934 RR4GG05JQ

RD RR4GG05TF 705 0 0
GGGCTCAAAGATCCAGCAGAACCCTTATCCCCTCCCGAAAGCACATCGAGAAAGAGAGAG
ATAGAGAGAGAGAGAGCCATGTCTGCCTCCGCTTCTTCCGTTTCCCTCTCTTCCTTCAAT
CCCAAATCCCTTCACTCTCCTTCAAACTCCCCTCCCTCTCTCTCTTCGCTTCCTCCGCCC
TCAAATCCTCCTCCTCACCCGCCCAGTACACATCTCTCTTCGTCACACACGTCGCCGTAT
CCTCTGATTTCGAGGTTGAGGAAGACGACATGTTCGCTGACAACGATTCTCCGCTGGCCC
TCCTCCACCTAAGAGGGAGGAATCATTCTCCATAGGACCAAGGAGTGGTGGTTACGGTTC
TGAGCGTTCCGGTTACGGTTCTGAACGTTCTGGTTACGGGTCTCAACGTTCAGGACGTTC
TGGCTACGGTTCTGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGGGTCAGGGTCGGGCTCGGGCTCATC
AGACCGTGTTTATGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACATGGTTCTTGAGAGCTT
GTTTAGTGAGCAAGGAAAGGTTGTAGAGGCCAGGGTCATTTACGACAGGGAAACTGGTCG
ATCCAAGGGTTTTGGGTTCGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGTCACAAGAGCCATCAG
TTCTTTGAATGGAGCTGATT*GGATGGAAGACAGATTAGAGTCTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GG05JQ 710 0 0
ACACACGTCGCCGTATCCTCTGATTTCGAGGTTGAGGAAGACGACATGTTCGCTGACAAC
GATTCTCCGCTGGCCCTCCTCCACCTAAGAGGGAGGAATCATTCTCCATAGGACCAAGGA
GTGGTGGTTACGGTTCTGAGCGTTCCGGTTACGGTTCTGAACGTTCTGGTTACGGGTCTC
AACGTTCAGGACGTTCTGGCTACGGTTCTGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGGGTCAGGGT
CGGGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTATGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACA
TGGTTCTTGAGAGCTTGTTTAGTGAGCAAGGAAAGGTTGTAGAGGCCAGGGTCATTTACG
ACAGGGAAACTGGTCGATCCAAGGGTTTTGGGTTCGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGG
TCACAAGAGCCATCAGTTCTTTGAATGGAGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCT
CGGAGGCGGAGGCTGGACCACCAAGGCGCCAATTTTGAGTTACCACGCAACTCCTGGAAT
CTATGAGGTTTAGCTCATCTTGACTGGAGATGAGTTATTTATGTTTTGGGCTTATGTTTC
TTTATTTTACTTTAATTCGTTTTACGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTTTGTAGACTAG
GAGTTTGGACCTTGTTTTCTTTTTGTATACTAGTACTCCCTTTCTTTCCT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5482Contig1 1043 2 2 U
CTTCCAAAAAAACAAAACAGAACATAACCTCTATCAGTTCTTTTTTTTTTGATCAAAAGC
CTCTATCAGTTCTGATCTTTTGATTTTGCACTATTACTTACCTTTAAAAAAATAAGAAAA
TAGAATAAACAATTCTTTATTGGTTTCTCGGGGGATGGAGAACTCGTACGAGTCAGCAGT
CAAGTGGTCTGATTCCAACAGTCCATATAATATGCTCTCATGTTCACTATTACAATCTGA
TTCTGATCTTAGCCGCTTTAATCTCGGCTTCTCTTCTTCTGCCTCCTCCGGCAACTTCCA
GGCGGATGAGTTTGTCGGTGGGATAGAGAAAGGTGAGTTAGTTTCAAGAAGCCACCGTCT
GGCGGAGAAGAGACGCCGTGATCGGATTAATTCTCACCTCTCTGCTCTCCGGAAACTTGT
CCCTAATTCCGACAAGTTGGACAAAGCAGCACTCTTAGCGACAGTGATAGAACAAGTGAA
AGAACTCAAACAAACAGCAACACAGTCTCCAACCTTCAAAGATCTTCCAACAGAAGCGGA
TGAGGTAATTGTTCAGCCAGAAACCATCTCCAATGACTTTGAACCAGATACCATCATCTT
CAAAGCTTCCTTTTGCTGCGAAGATCAACCGGAGGCAATCTCGGAGATCATTAGGGTTCT
CACAAAGTTTCAACTCGAGACATTACAAGCTGAGATAATCTGCGTTGGTGGAAGAATGAG
AATCAACTTCGTCTTAAAAGATAGCAACTGCAAAGAGACAACGACAAGCATGGCTGCATC
TGCAAAATCTTTGAGGCAAGCTCTTTGCGCTGCTTTAAACCGTATCGCGTCTTCTTCTTC
TTCCTCGTCTACTTCTTCGGTTTGTAGGATTAGAAGTAAAAGACAGAGATGGTTCCTCTC
TTCTCACTACTCACAACAATGACGTTTTTACTAATACCATCTTAATACACAGATCGCGTT
ATTTGTTTCACAAGTGTTACGTGTAGGTTACGTTTTCTTCCTAAACAAAACAAGGTTTGT
ATATTTATATTCTAAGATTATAG


BQ
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AF RR4E421TF U 1
AF RR4E421JQ C 170
BS 1 650 RR4E421TF
BS 651 1043 RR4E421JQ

RD RR4E421TF 650 0 0
CTTCCAAAAAAACAAAACAGAACATAACCTCTATCAGTTCTTTTTTTTTTGATCAAAAGC
CTCTATCAGTTCTGATCTTTTGATTTTGCACTATTACTTACCTTTAAAAAAATAAGAAAA
TAGAATAAACAATTCTTTATTGGTTTCTCGGGGGATGGAGAACTCGTACGAGTCAGCAGT
CAAGTGGTCTGATTCCAACAGTCCATATAATATGCTCTCATGTTCACTATTACAATCTGA
TTCTGATCTTAGCCGCTTTAATCTCGGCTTCTCTTCTTCTGCCTCCTCCGGCAACTTCCA
GGCGGATGAGTTTGTCGGTGGGATAGAGAAAGGTGAGTTAGTTTCAAGAAGCCACCGTCT
GGCGGAGAAGAGACGCCGTGATCGGATTAATTCTCACCTCTCTGCTCTCCGGAAACTTGT
CCCTAATTCCGACAAGTTGGACAAAGCAGCACTCTTAGCGACAGTGATAGAACAAGTGAA
AGAACTCAAACAAACAGCAACACAGTCTCCAACCTTCAAAGATCTTCCAACAGAAGCGGA
TGAGGTAATTGTTCAGCCAGAAACCATCTCCAATGACTTTGAACCAGATACCATCATCTT
CAAAGCTTCCTTTTGCTGCGAAGATCAACCGGAGGCAATCTCGGAGATCA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4E421JQ 874 0 0
GAGTCAGCAGTCAAGTGGTCTGATTCCAACAGTCCATATAATATGCTCTCATGTTCACTA
TTACAATCTGATTCTGATCTTAGCCGCTTTA*TCTCGGCTTCTCTTCTTCTGCCTCCTCC
GGCAACTTCCAGGCGGATGAGTTTGTCGGTGGGATAGAGAAAGGTGAGTTAGTTTCAAGA
AGCCACCGTCTGGCGGAGAAGAGACGCCGTGATCGGATTAATTCTCACCTCTCTGCTCTC
CGGAAACTTGTCCCTAATTCCGACAAGTTGGACAAAGCAGCACTCTTAGCGACAGTGATA
GAACAAGTGAAAGAACTCAAACAAACAGCAACACAGTCTCCAACCTTCAAAGATCTTCCA
ACAGAAGCGGATGAGGTAATTGTTCAGCCAGAAACCATCTCCAATGACTTTGAACCAGAT
ACCATCATCTTCAAAGCTTCCTTTTGCTGCGAAGATCAACCGGAGGCAATCTCGGAGATC
ATTAGGGTTCTCACAAAGTTTCAACTCGAGACATTACAAGCTGAGATAATCTGCGTTGGT
GGAAGAATGAGAATCAACTTCGTCTTAAAAGATAGCAACTGCAAAGAGACAACGACAAGC
ATGGCTGCATCTGCAAAATCTTTGAGGCAAGCTCTTTGCGCTGCTTTAAACCGTATCGCG
TCTTCTTCTTCTTCCTCGTCTACTTCTTCGGTTTGTAGGATTAGAAGTAAAAGACAGAGA
TGGTTCCTCTCTTCTCACTACTCACAACAATGACGTTTTTACTAATACCATCTTAATACA
CAGATCGCGTTATTTGTTTCACAAGTGTTACGTGTAGGTTACGTTTTCTTCCTAAACAAA
ACAAGGTTTGTATATTTATATTCTAAGATTATAG

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 2

CO CL5483Contig1 1052 2 4 U
GACAACCAAAGATGTCTTCTGTAAACTTAGCCTTCATCGCTTGCAAAGACTTTCTCAGCT
GCCAGAAACTTCTTGTTGAAGCAAAGAGAAATCTTGGAGAGATACTATCTGCTTTCGAGT
TTCTTGATAACAACTCCATGGATTTGGTACTGAACCACCTAGACGGTGTCCGTAACCCAG
TTTCCTCTTCAGAGAACTTCTACATTTTGATAGAGACAACAGGAAGTGGTGAAACTTATG
ACAGGGAGAAGCTTGAAGCGTTCCTTTTAAAGTCACTGGAACAAGGTTTAGTCTCTGATG
GTGTAATAGCTCAAGACATAAACCAAGCATCTTCTTTTTGGCGCATACGAGAGGGTATAA
CAGAGGCGTTACAGAAAGCAGGAGCTTGTTAAAGTATGACTTATCCTTACCTGTTGAAGA
GATTTACAATATTGTCAACGACCTTAGAGGGAGACTAGATGGCTTAGCGAATGTCATGGG
ATATGGTCATCTTGGAGACGGTAATCTTCATTTAAACATCTCAGCCGCGGAATATAACGA
TAAGCTTTTAGGTTTGATAGAACCATATGTTTATGAGTGGACATCAAAGCACCGTGGAAG
CATCAGTGCAGAACATGGATTAGGTGTAATGAAAGCTAATGAAATCTTCTACAGCAAATC
ACCTGAAACCGTTGCATTAATGGTATCCATCAAAAAGATGTTGGACCCTAAGGGGATTCT
CAATCCTTACAAAGTTCTTCCTCACTCTTTCTTCTCTCCCTAAGGTGGGGATGAGATGAT
TCTTCAAAAAGAAGAAAATGGGAATATGATGAGGAGCAAAGAAAGTATGATTGATGCAAA
GGAACAAATAAGCAAGTGTTGATTAAAAAGTCACTTAAACTCACTAAAGTGTATATGCTT
CTTCCATGTTGTTGTCATTGTGTCTTAATATCTTATTATCATGGATAAGAAAGAATAATA
AAAACCTGTGGAGCTTACGTGTATTACAAGTTTGCAGTGTACTTAGACTGAAAACTCAGA
AAGAGAAGAATCTACCATCTATTTATAATAGC


BQ
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AF RR4DS83TF U 1
AF RR4DS83JQ C 264
BS 1 714 RR4DS83TF
BS 715 715 RR4DS83JQ
BS 716 748 RR4DS83TF
BS 749 1052 RR4DS83JQ

RD RR4DS83TF 748 0 0
GACAACCAAAGATGTCTTCTGTAAACTTAGCCTTCATCGCTTGCAAAGACTTTCTCAGCT
GCCAGAAACTTCTTGTTGAAGCAAAGAGAAATCTTGGAGAGATACTATCTGCTTTCGAGT
TTCTTGATAACAACTCCATGGATTTGGTACTGAACCACCTAGACGGTGTCCGTAACCCAG
TTTCCTCTTCAGAGAACTTCTACATTTTGATAGAGACAACAGGAAGTGGTGAAACTTATG
ACAGGGAGAAGCTTGAAGCGTTCCTTTTAAAGTCACTGGAACAAGGTTTAGTCTCTGATG
GTGTAATAGCTCAAGACATAAACCAAGCATCTTCTTTTTGGCGCATACGAGAGGGTATAA
CAGAGGCGTTACAGAAAGCAGGAGCTTGTTAAAGTATGACTTATCCTTACCTGTTGAAGA
GATTTACAATATTGTCAACGACCTTAGAGGGAGACTAGATGGCTTAGCGAATGTCATGGG
ATATGGTCATCTTGGAGACGGTAATCTTCATTTAAACATCTCAGCCGCGGAATATAACGA
TAAGCTTTTAGGTTTGATAGAACCATATGTTTATGAGTGGACATCAAAGCACCGTGGAAG
CATCAGTGCAGAACATGGATTAGGTGTAATGAAAGCTAATGAAATCTTCTACAGCAAATC
ACCTGAAACCGTTGCATTAATGGTATCCATCAAAAAGATGTTGGACCCTAAGGG*ATTCT
CAATCCTTACAAAGTTCTTCCTCACTCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DS83JQ 789 0 0
CTTTTAAAGTCACTGGAACAAGGTTTAGTCTCTGATGGTGTAATAGCTCAAGACATAAAC
CAAGCATCTTCTTTTTGGCGCATACGAGAGGGTATAACAGAGGCGTTACAGAAAGCAGGA
GCTTGTTAAAGTATGACTTATCCTTACCTGTTGAAGAGATTTACAATATTGTCAACGACC
TTAGAGGGAGACTAGATGGCTTAGCGAATGTCATGGGATATGGTCATCTTGGAGACGGTA
ATCTTCATTTAAACATTTCAGCCGCGGAATATAACGATAAGCTTTTAGGTTTGATAGAAC
CATATGTTTATGAGTGGACATCAAAGCACCGTGGAAGCATCAGTGCAGAACATGGATTAG
GTGTAATGAAAGCTAATGAAATCTTCTACAGCAAATCACCTGAAACCGTTGCATTAATGG
TATCCATCAAAAAGATGTTGGACCCTAAGGGGATTCTCAATCCTTACAAAGTTCTTCCTC
ACTCTTTCTTCTCTCCCTAAGGTGGGGATGAGATGATTCTTCAAAAAGAAGAAAATGGGA
ATATGATGAGGAGCAAAGAAAGTATGATTGATGCAAAGGAACAAATAAGCAAGTGTTGAT
TAAAAAGTCACTTAAACTCACTAAAGTGTATATGCTTCTTCCATGTTGTTGTCATTGTGT
CTTAATATCTTATTATCATGGATAAGAAAGAATAATAAAAACCTGTGGAGCTTACGTGTA
TTACAAGTTTGCAGTGTACTTAGACTGAAAACTCAGAAAGAGAAGAATCTACCATCTATT
TATAATAGC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL5484Contig1 932 2 4 U
GATCTGATTATGCAAAAAGAGTCTACACCTCTCAGATGCAGCATCTAAAGGACATTGCTG
GTACTTTGGCTTCGGAAGAAGCAGAAGATGCTGGTCAAGTAGCAAAGCTTCGATCAGCTC
TCGAGTCTGTTGACCACAAAAGAAGAAAGATTTTGCAACAAATGAGAAGTGATGCAGCTT
TGTTTACCTTGGAGGAAGGCACTTCTCCCGTTCAGAATCCTTCCACAGCAGCCGAAGACG
CGAGATTAGCTCTCTCATTTCTCTAGATGCCATACTGAAGCAAGTCAAGGAGATAACAAG
ACATTGCTACGGCTCACCAGTTGGTGGAGACAATCCCAGAACAAGAGGACAATCTTCAAG
AAGAAAAGAGATCTTCATTAGATTCCATGTCCTCAACGGAAACCGATGTGTCTCAATGGA
ACGTTCTGCAGTTCAACACGGGAGGCTCTTCAGCTCCATTCATCATAAAATGCGGAGCTA
ACTCCAACTCAGAGCTCGTGATCAAAGCGGATGCACGGATTCAAGAACCTAAAGGAGGAG
AAATCGTGAGAGTTGTGCCAAGACCTTCCGTTCTAGAAAACATGAGCTTGGAGGAAATGA
AACAAGTGTTTGGTCCGTTGCCAGAAGCACTAAGTTCACTGGCCTTAGCAAGAACAGCTG
ATGGCACAAGGGCTAGATATTCCAGACTCTACAGAACTCTAGCCATGAAGGTTCCCTCTC
TTAGGGACCTCGTTGGAGAGCTTGAGAAAGGAGGTGTCTTAAAAGATACCACCAAATCGA
CATGAAAAATGGTTCTGTTTTATGTAAGTATTCTTTGTTTTTTTTTTGTACTGTGAGGCT
TAATATACTTTTGGATTTCTTTGTATTTGTGTGTACTTTGTAGTATTTTGAGACCACTAA
TGATGTTATTGTGTTTAAGAACAGTTTCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL22TF U 1
AF RR4EL22JQ C 266
BS 1 710 RR4EL22TF
BS 711 711 RR4EL22JQ
BS 712 746 RR4EL22TF
BS 747 932 RR4EL22JQ

RD RR4EL22TF 746 0 0
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AAGAAAAGAGATCTTCATTAGATTCCATGTCCTCAACGGAAACCGATGTGTCTCAATGGA
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AAATCGTGAGAGTTGTGCCAAGACCTTCCGTTCTAGAAAACATGAGCTTGGAGGAAATGA
AACAAGTGTTTGGTCCGTTGCCAGAAGCACTAAGTTCACTGGCCTTAGCAAGAACAGCTG
ATGGCACAAGGGCTAGATATTCCAGACTCTACAGAACTCTAGCCATGAAG*TTCCCTCTC
TTAGGGACCTCGTTGGAGAGCTTGAG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4EL22JQ 667 0 0
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GGAGACAATCCCAGAACAAGAGGACAATCTTCAAGAAGAAAAGAGATCTTCATTAGATTC
CATGTCCTCAACGGAAACCGATGTGTCTCAATGGAACGTTCTGCAGTTCAACACGGGAGG
CTCTTCAGCTCCATTCATCATAAAATGCGGAGCTAACTCCAACTCAGAGCTCGTGATCAA
AGCGGATGCACGGATTCAAGAACCTAAAGGAGGAGAAATCGTGAGAGTTGTGCCAAGACC
TTCCGTTCTAGAAAACATGAGCTTGGAGGAAATGAAACAAGTGTTTGGTCCGTTGCCAGA
AGCACTAAGTTCACTGGCCTTAGCAAGAACAGCTGATGGCACAAGGGCTAGATATTCCAG
ACTCTACAGAACTCTAGCCATGAAGGTTCCCTCTCTTAGGGACCTCGTTGGAGAGCTTGA
GAAAGGAGGTGTCTTAAAAGATACCACCAAATCGACATGAAAAATGGTTCTGTTTTATGT
AAGTATTCTTTGTTTTTTTTTTGTACTGTGAGGCTTAATATACTTTTGGATTTCTTTGTA
TTTGTGTGTACTTTGTAGTATTTTGAGACCACTAATGATGTTATTGTGTTTAAGAACAGT
TTCAGCT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL5485Contig1 1072 2 2 U
GTGGATAATGGCGAACGCAATCAGATTCTTTGAGCTAAACACCGGCGCTAAGATCCCCTC
GGTGGGACTCGGAACCTGGCAAGCCTCTCCAGGCCTTGTCGGCGAGGCTGTGACTGCCGC
TGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCTATGGCAACGAGAAAGAGAT
AGGGGCAGTTTTGAAAAAGTTGTTTGAAGACAATGTAGTGAAGCGCGAGGAGTTGTTCAT
CACTTCCAAACTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTAAATAG
AACTCTACAGGATCTACAGTTTGACTATGTGATCTCTATCTGATGCATTGGCCTGTAAGG
ATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTTAAGCCAGAGAACCTTTTACCTGTCGATATTCCTAGC
ACATGGAAAGCAATGGAAGCACTCCACGATTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGTGTAAGC
AACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTGATCTTTTGGAGTTAGCCCGTGTTCCTCCTGCCGTT
GTTCAAGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCGACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCC
AAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCGCCCTTGGGCTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAG
AGCGATGTGCTGAAGAACCTCATACTAAACACTGTTGCTGAGAAACTTGGAAAGTCTCCT
GCGCAAGTTGCGCTTCGCTGGGGACTCCAAATGGGTAACAGCGTACTTCCCAAGAGTACT
AATGAAGGAAGAATTAGAGAGAACTTTGAAGTTTTCGACTGGTCAATACCCGATGACTTG
TTCGCCAAGTTTTCTGATATTGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTCCGTTCTTTGTTCAT
GAGACACTGAGCCCTTATAAGTCTTTTGAAGAGTTATGGGATGGCGAGATATGATATTTC
AACTAATCTATTTGTTTTGTCAATAATGGGAGGTTACTCTATCTATTGAACTTGCCAGTT
TATGTATAAAATGATGCCACTCAAATAATTTATAATCATGTTTGCTGTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 784 1072 RR4B336JQ

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TGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCTATGGCAACGAGAAAGAGAT
AGGGGCAGTTTTGAAAAAGTTGTTTGAAGACAATGTAGTGAAGCGCGAGGAGTTGTTCAT
CACTTCCAAACTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTAAATAG
AACTCTACAGGATCTACAGTTTGACTATGTGATCTCTATCTGATGCATTGGCCTGTAAGG
ATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTTAAGCCAGAGAACCTTTTACCTGTCGATATTCCTAGC
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AACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTGATCTTTTGGAGTTAGCCCGTGTTCCTCCTGCCGTT
GTTCAAGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCGACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCC
AAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCGCCCTTGGGCTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAG
AGCGATGTGCTGAAGAACCTCATACTAAACACTGTTGCTGAGAAACTTGGAAAGTCTCCT
GCGCAAGTTGCGCTTCGCTGGGGACTCCAAATGGGTAACAGCGTACTTCCCAAGAGTACT
AAT

QA 1 783 1 783
DS 

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AAAGGTTCTGTTGGAGTTAAGCCAGAGAACCTTTTACCTGTCGATATTCCTAGCACATGG
AAAGCAATGGAAGCACTCCACGATTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGTGTAAGCAACTTC
TCCACCAAGAAGCTAGCTGATCTTTTGGAGTTAGCCCGTGTTCCTCCTGCCGTTGTTCAA
GTCGAATGTCATCCTTCTTGGCGACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGA
GTTCACCTCACCGCATACTCGCCCTTGGGCTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAGAGCGAT
GTGCTGAAGAACCTCATACTAAACACTGTTGCTGAGAAACTTGGAAAGTCTCCTGCGCAA
GTTGCGCTTCGCTGGGGACTCCAAATGGGTAACAGCGTACTTCCCAAGAGTACTAATGAA
GGAAGAATTAGAGAGAACTTTGAAGTTTTCGACTGGTCAATACCCGATGACTTGTTCGCC
AAGTTTTCTGATATTGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTCCGTTCTTTGTTCATGAGACA
CTGAGCCCTTATAAGTCTTTTGAAGAGTTATGGGATGGCGAGATATGATATTTCAACTAA
TCTATTTGTTTTGTCAATAATGGGAGGTTACTCTATCTATTGAACTTGCCAGTTTATGTA
TAAAATGATGCCACTCAAATAATTTATAATCATGTTTGCTGTTAAT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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GTGCTTTGGAGTTGGGAGGCCTAAAGGTCGTAACTTGTGAGGGTGAGGAAGTGGTAGAGG
CCTGACCCGAACCGGTTTATCCGGTTTCTGAGGAATCCTTTGCTGGAAAAGAGATGAGAT
CGCCTCGATTTCGTTTGCCTCCCAGACATCAGGTTCTTGATCTTCTTGATCTTCTTCTTC
TTGGAGTGGTGGCAATAACGGTTGTGTGATGGGTTTCCTTAGAAACAAGTTGACACCGAA
GTGAGGAGGGAGCTTGGTGCGTCGCGGGTTACGGAGATTCTTTGTGAGTTTCTTCTTCTT
TGCGTAGAGTTTTGTTGTTGCTCTCATACTGCTGCTCGGTTGAAGATTCAGGTGGAAGAA
TATAAGTGACGGAGAGATGATTGGACAATGCGTCATCATTCCGATAGTGAAACGAACTTA
GGGTTTTCTAAATTCACAGTGAATCGAACTCGAATCTAGCTCAATTGAATCGGGAGAAGC
TAGGGTTTTGAGATCGAATCGAACACGAACCTTAGTAAAGGAGTGAGCTTTAGGTTTAGA
AATGATCCCACATGGTGAGTTTACGGATGTTCTCTATCTATCGAGTTTGAGATAGAGAGG
ACACGAGGAAGAAGAAGAAGTTTTTTCTCTTCTTTTTTGGTTAATTATTTTACCCGACCC
GACCCGACCCATATTTACACGACTCGAACTCACCCGATCAGACCGATCTGGCCTGACCCG
AATCGAAAAGGCAAGAGAGAGAAAATAGTTTCGAGGATAAGAACTAGCTGCGTGGCAAGA
CCTTTGGAAGCATGTAGAGAGTTCCCAGCGGGGAAATAGCTGGCAGGACAAAAGCATAGG
CATCTAAAACAATTAAACTACACAATGAGAACTGAGTATCTCTTTAGAGATGGTCCCCTA
GAACTCGACACTGGTAAATGAGCTAATCCAGAATTCTTTTTGTTTTTAAAAGATTTTAGA
ATGATTTATAAATCCCAACAAAACAGGAAAATTATAAGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DR94TF U 1
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ACACGAGGAAGAAGAAGAAGTTTTTTCTCTTCTTTTT*GGTTAATTATTTTACCCGACCC
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DS 

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CGACCCGACCCGACCCATATTTACACGACTCGAACTCACCCGATCAGACCGATCTGGCCT
GACCCGAATCGAAAAGGCAAGAGAGAGAAAATAGTTTCGAGGATAAGAACTAGCTGCGTG
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CCCCTAGAACTCGACACTGGTAAATGAGCTAATCCAGAATTCTTTTTGTTTTTAAAAGAT
TTTAGAATGATTTATAAATCCCAACAAAACAGGAAAATTATAAGGTTTC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL5487Contig1 824 2 2 U
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TATTCAACAACAAATATCATCAGTTGAGGGTTTGGCTTATGGGTTTGGTTTAAACGACAT
GGGCTTGAAGATTTACTAAAAATGTGTTCATGATCATGCTTCAGTCCAAAGAAGAAGGGC
CCAACAGGAAAATAGAAGCTATGGCGGAATAATATATCAATCTGACGGTAATTCAAAGAC
CGACGACCATGCAAAAGGGCGTGACCAGCCGAAGAGTTTTGCGATCACAACTTTCGAAAT
TCAGTCAAGAGTCTTGGTCTTTGGTCAAGTCAATATTCCTAGTCAAGTTTTCATGGTTTT
AAGAGCTTTATAGTTTCTAGGATTGACTAGAGTATTTATTTCTATCTACAGCCTATTATA
TAAAGGCTTGCTATTGTATTGTTTTATTCATTCAACCTTTTTAATAAAAATTACTTTTAG
ATTTGTTGAATCCTTTGTTCTTCGGAACATCGTAATGCTAGGGGAGGAATTCCCGAAAGC
AAACCGTCTAGTGATCACGTCTGAGCGGTGACCTGCTCGATCATAAACACTTCTACACAA
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ATCATCCATTCCACCTTCCTTTGGTCGTTTTCTCGATCAAAGTCTATCCATCACCAACCT
TCGAGTGTAATTCTTGGGAGAGTTTTTATTATTTGGTATCAGAGCCACTTGAGGGTTTGG
TTTTCGTTTCTGTCATCCATCATTCTCATCTTTCCATCTTCTAC


BQ
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AF RR4CH06TF U 1
AF RR4CH06JQ C 47
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BS 742 824 RR4CH06JQ

RD RR4CH06TF 741 0 0
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TATTCAACAACAAATATCATCAGTTGAGGGTTTGGCTTATGGGTTTGGTTTAAACGACAT
GGGCTTGAAGATTTACTAAAAATGTGTTCATGATCATGCTTCAGTCCAAAGAAGAAGGGC
CCAACAGGAAAATAGAAGCTATGGCGGAATAATATATCAATCTGACGGTAATTCAAAGAC
CGACGACCATGCAAAAGGGCGTGACCAGCCGAAGAGTTTTGCGATCACAACTTTCGAAAT
TCAGTCAAGAGTCTTGGTCTTTGGTCAAGTCAATATTCCTAGTCAAGTTTTCATGGTTTT
AAGAGCTTTATAGTTTCTAGGATTGACTAGAGTATTTATTTCTATCTACAGCCTATTATA
TAAAGGCTTGCTATTGTATTGTTTTATTCATTCAACCTTTTTAATAAAAATTACTTTTAG
ATTTGTTGAATCCTTTGTTCTTCGGAACATCGTAATGCTAGGGGAGGAATTCCCGAAAGC
AAACCGTCTAGTGATCACGTCTGAGCGGTGACCTGCTCGATCATAAACACTTCTACACAA
GGGATTGATTCATTCGCAAATCGGTCTCTGAAGTTCATCTTCCATCTTCGACTTCAATCC
ATCATCCATTCCACCTTCCTTTGGTCGTTTTCTCGATCAAAGTCTATCCATCACCAACCT
TCGAGTGTAATTCTTGGGAGA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4CH06JQ 778 0 0
GGATGATGTAACC*TATTCAACAACAAATATCATCAGTTGAGGGTTTGGCTTATGGGTTT
GGTTTAAACGACATGGGCTTGAAGATTTACTAAAAATGTGTTCATGATCATGCTTCAGTC
CAAAGAAGAAGGGCCCAACAGGAAAATAGAAGCTATGGCGGAATAATATATCAATCTGAC
GGTAATTCAAAGACCGACGACCATGCAAAAGGGCGTGACCAGCCGAAGAGTTTTGCGATC
ACAACTTTCGAAATTCAGTCAAGAGTCTTGGTCTTTGGTCAAGTCAATATTCCTAGTCAA
GTTTTCATGGTTTTAAGAGCTTTATAGTTTCTAGGATTGACTAGAGTATTTATTTCTATC
TACAGCCTATTATATAAAGGCTTGCTATTGTATTGTTTTATTCATTCAACCTTTTTAATA
AAAATTACTTTTAGATTTGTTGAATCCTTTGTTCTTCGGAACATCGTAATGCTAGGGGAG
GAATTCCCGAAAGCAAACCGTCTAGTGATCACGTCTGAGCGGTGACCTGCTCGATCATAA
ACACTTCTACACAAGGGATTGATTCATTCGCAAATCGGTCTCTGAAGTTCATCTTCCATC
TTCGACTTCAATCCATCATCCATTCCACCTTCCTTTGGTCGTTTTCTCGATCAAAGTCTA
TCCATCACCAACCTTCGAGTGTAATTCTTGGGAGAGTTTTTATTATTTGGTATCAGAGCC
ACTTGAGGGTTTGGTTTTCGTTTCTGTCATCCATCATTCTCATCTTTCCATCTTCTAC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5488Contig1 852 2 2 U
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CGTTTGCTACTACCGCAACTATGGGAAGACGTTCAAGGGCCCGCGACGTCCTTTCGAGAA
GGAGCGTCTGGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTACGCAACAAGCGTGA
GCTCTGGAGAGTCCAGTACTCGCTGAGCCGGATCCGTAACGCCGCCAGGGATCTCCTGAC
CCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGCAAGGCGCTTGAGGAAGATGAATC
GCTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTTACCGTGG
AGAGCTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGA
TCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGA
ACATTCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTCTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCA
GTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCA
AGAAAGCCTCAGGTGGCGATGCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTTTCTCTTACCGG
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TTCTTTTTATCTTTCTTAAAGAGTTTGCGAACGTTTTGCTTATTTACTACATTTGCCTAA
ATCCAGACTTTTTTCTGCTCCCCTTATAAGTTGTCTTATTTCTAGATTACGGTTTAGAGA
ATAAGTTAATAC


BQ
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AF RR4AV23TF U 1
AF RR4AV23JQ C 207
BS 1 756 RR4AV23TF
BS 757 852 RR4AV23JQ

RD RR4AV23TF 756 0 0
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CGTTTGCTACTACCGCAACTATGGGAAGACGTTCAAGGGCCCGCGACGTCCTTTCGAGAA
GGAGCGTCTGGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTACGCAACAAGCGTGA
GCTCTGGAGAGTCCAGTACTCGCTGAGCCGGATCCGTAACGCCGCCAGGGATCTCCTGAC
CCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGCAAGGCGCTTGAGGAAGATGAATC
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AGAGCTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGA
TCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGA
ACATTCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTCTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCA
GTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCA
AGAAAGCCTCAGGTGGCGATGCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTTTCTCTTACCGG
GGTTTTAGCTATGCGGTTTTGGCTATTTTGTACTTCGTTTGTTGAGGATTGTTTAATGCC
TTCTTTTTATCTTTCTTAAAGAGTTTGCGAACGTTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4AV23JQ 646 0 0
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TCTTCGAAGGCAAGGCGCTTGAGGAAGATGAATCGCTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAG
AACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTTACCGTGGAGAGCTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAG
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CAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAGACTT
GACTTTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGA
AGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCAGGTGGCGATGCTGAC
GGTGATGATGAAGAGTAAATCTTTCTCTTACCGGGGTTTTAGCTATGCGGTTTTGGCTAT
TTTGTACTTCGTTTGTTGAGGATTGTTTAATGCCTTCTTTTTATCTTTCTTAAAGAGTTT
GCGAACGTTTTGCTTATTTACTACATTTGCCTAAATCCAGACTTTTTTCTGCTCCCCTTA
TAAGTTGTCTTATTTCTAGATTACGGTTTAGAGAATAAGTTAATAC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL5489Contig1 770 2 6 U
GGACGCGTCACTCTCTCTGTTCTTTCTTGCGTTTCTCTCTCCCTCTTGCTCACAATCATC
GCGACAAACTGAGTAAATTCAAGCAGATGCTTTGTGAATCGAAATCGAAAGGCGCTGACT
TTGTTTCTCTCGGTTCTCTATCTCTCTCTCTCGCTCTCGTGAGAGCAGATAGTGAAGAAG
AAGCCAAAAAAAAAGGAAAACGATGCCGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTT
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ATTAACTGACAAGCCAACCCCTGAGCTGACAAGGACACCTAACCGAGTTGCAGGAATGTT
CTCTGGAACGCAAGATAAATGTGCCACTTGCAGTCCTGCTTCAAGTGTTCGCACGGAGGC
TGTCCTATCTCTCCTTCCAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCTTGTACTGCAGACACCGT
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GTACTGCCGCCGTAGAAGCCGTCCCTGAATCTTAAGTTTGAAAAAGGTGTTACTACCAAA
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ATTTGTTCTTGTTGTGATTTTGAAAAGTCCTACCAATAATCTATATTTTTAAGATTGTCC
TTAGCAAAGTCTCTTAAGCACAAATTAATAATAAAATATCTTAAGAACTC


BQ
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AF RR4BK07TF U 1
AF RR4BK07JQ C 47
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RD RR4BK07TF 749 0 0
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ATTTGTTCTTGTTGTGATTTTGAAAAGTCCTACCAATAATCTATATTTTTA*GATTGTCC
TTAGCAAAGTCTCTTA*GCACAAATTAAT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4BK07JQ 724 0 0
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TCACCTGCAAAGCCATTAACTGACAAGCCAACCCCTGAGCTGACAAGGACACCTAACCGA
GTTGCAGGAATGTTTTCTGGAACGCAAGATAAATGTGCCACTTGCAGTCCTGCTTCAAGT
GTTCGCACGGAGGCTGTCCTATCTCTCCTTCCAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCTTGT
ACTGCAGACACCGTTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAAAGAAGTTACAATCAACGCAGCT
CTTGAAGGAATCTTGTACTGCCGCCGTAGAAGCCGTCCCTGAATCTTAAGTTTGAAAAAG
GTGTTACTACCAAAACTGGTTTCAGATTGTTTTTTTTCCTTTGTTTATGTGATTGTGTCA
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TTTTAAGATTGTCCTTAGCAAAGTCTCTTAAGCACAAATTAATAATAAAATATCTTAAGA
ACTC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5490Contig1 719 2 1 U
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BQ
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AF RR4BG01JQ C 1
AF RR4BG01TF U 1
BS 1 719 RR4BG01TF

RD RR4BG01JQ 719 0 0
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GCAATAGTTTTACTTTGGTTGTACTTTTAAAAATGTAATAAATTCTTAACTATGTGTAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4BG01TF 719 0 0
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ACCCGCGTGCTGGAAGATGTCGACGCCGATCGCGACGGCTTCATCGACGTGGACGAGTTC
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GCCGACAGCAACAACGGATCCACTGCTGCGGCAAACAGTAGTTCGACCTAAGGCTAGGGT
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GCAATAGTTTTACTTTGGTTGTACTTTTAAAAATGTAATAAATTCTTAACTATGTGTAC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL5491Contig1 828 2 1 U
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TCTACAAGAGCAGGACCCATCTCTAAAATGATGAAACCTCTTTGAATCTCTACAGATAAT
CTCTCTCTTTATAACACTTGACACGATCTTGATCCAACTGTGACAATCGACACAAACTCT
AAGGTTCTTTAGAATCCTTATACTTCCCCCAACGTTTCTCCAAACTGCAAAAGCTATGGC
CAGTTTCTCGCTATGTTGATGCAAAGATCTCTCTTTTGCACTCTCCTCCATGTCTTGAAA
CACACAGCTTTTGTCTTCAACATACCCAAGATCTTTAGCTTTCTTGATCAGCTCTTCAAG
AGTTTAAAGAATCTGCTCCGAGTTTGGATGTGAAAACAAATCTCCAGCCATGAATGTATG
CGTTTCTCTATCGACTTCAACCCAACTCATCGCTGGACTCTTCTTCAGCTTCATCCCCCT
CATATCACTCTTCATCTCAATCACTCTGTTCCATTTCCCCGTGGAGGCGTAGAGATTTGA
CATTAGGATGAGAGTTCCTTCATCTCCAGGTGCTATCTCAAGGATCTTTCTCTTTAACCG
CTCTGCCATCTCAACATTTCTATGGATTTTACAGGCACTGAGCAGCGTCCTCCACAGAAC
CAAATCAGGGTTTACCACCTCGTTTATAAGCATCTCCGCCTCGTCCAATCTCCCTGCTCG
TCCAAGCATGTCTACCATACAAGCGTATGATCATTCGTTACACGACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CC45JQ U 332
AF RR4CD13JQ U 1
BS 1 828 RR4CD13JQ

RD RR4CC45JQ 394 0 0
TCTTTTGCACTCTCCTCCATGTCTTGAAACACACAGCTTTTGTCTTCAACATACCCAAGA
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GAAAACAAATCTCCAGCCATGAATGTATGCGTTTCTCTATCGACTTCAACCCAACTCATC
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CATTTCCCCGTGGAGGCGTAGAGATTTGACATTAGGATGAGAGTTCCTTCATCTCCAGGT
GCTATCTCAAGGATCTTTCTCTTTAACCGCTCTGCCATCTCAACATTTCTATGGATTTTA
CAGGCACTGAGCAGCGTCCTCCACAGAACCAAAT

QA 1 394 1 394
DS 

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ACTCATATGAAATGGCCTTGGGCCTAATTCAAACACAGTCTCATTCATTTACCAATAATC
TCTACAAGAGCAGGACCCATCTCTAAAATGATGAAACCTCTTTGAATCTCTACAGATAAT
CTCTCTCTTTATAACACTTGACACGATCTTGATCCAACTGTGACAATCGACACAAACTCT
AAGGTTCTTTAGAATCCTTATACTTCCCCCAACGTTTCTCCAAACTGCAAAAGCTATGGC
CAGTTTCTCGCTATGTTGATGCAAAGATCTCTCTTTTGCACTCTCCTCCATGTCTTGAAA
CACACAGCTTTTGTCTTCAACATACCCAAGATCTTTAGCTTTCTTGATCAGCTCTTCAAG
AGTTTAAAGAATCTGCTCCGAGTTTGGATGTGAAAACAAATCTCCAGCCATGAATGTATG
CGTTTCTCTATCGACTTCAACCCAACTCATCGCTGGACTCTTCTTCAGCTTCATCCCCCT
CATATCACTCTTCATCTCAATCACTCTGTTCCATTTCCCCGTGGAGGCGTAGAGATTTGA
CATTAGGATGAGAGTTCCTTCATCTCCAGGTGCTATCTCAAGGATCTTTCTCTTTAACCG
CTCTGCCATCTCAACATTTCTATGGATTTTACAGGCACTGAGCAGCGTCCTCCACAGAAC
CAAATCAGGGTTTACCACCTCGTTTATAAGCATCTCCGCCTCGTCCAATCTCCCTGCTCG
TCCAAGCATGTCTACCATACAAGCGTATGATCATTCGTTACACGACCT

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL5492Contig1 481 2 1 U
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CTACGGCAGTCAAGGAAGTTGGCGAAGCTGTGGCTAAGTGTAGCACATTTGTCTCTTCGG
GGAAACTACAAGTTCTGGAACACATAACCAATTCAATGTCATCGAAAGGGAAGAAACCAC
ACGTTTTGGAACGCATAGCCAATTCAATGTCATCGAAAGGAAAGAAGAAATAAACTCTCC
AATGCCTAGAAAACCTTTGGTAACTCCACGGTTATCAAGGAACTATCCAAAATATTTATA
CTTTTATATTAATGTTTGAAGTGTGCGAAACTTATTTTTTATGTCCTAGTCGTGAAGCTT
ATTGGCAGTGTCTCATTTTTTTACGTCTCATTGTCCTTTCAGTTTGTCATGTTCGGCCAT
ATCCATCATATACGATAGGATTGGTTTATGTAATTTTAAATATATCAATACTGTTTTATA
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4EF57JQ C 1
AF RR4EF57TF U 1
BS 1 481 RR4EF57TF

RD RR4EF57JQ 481 0 0
GGGAAGAGGAGGCCGTAAACCCTGCGATGGAAGCAATCCGTGACGAAGTGGATACGTTTG
CTACGGCAGTCAAGGAAGTTGGCGAAGCTGTGGCTAAGTGTAGCACATTTGTCTCTTCGG
GGAAACTACAAGTTCTGGAACACATAACCAATTCAATGTCATCGAAAGGGAAGAAACCAC
ACGTTTTGGAACGCATAGCCAATTCAATGTCATCGAAAGGAAAGAAGAAATAAACTCTCC
AATGCCTAGAAAACCTTTGGTAACTCCACGGTTATCAAGGAACTATCCAAAATATTTATA
CTTTTATATTAATGTTTGAAGTGTGCGAAACTTATTTTTTATGTCCTAGTCGTGAAGCTT
ATTGGCAGTGTCTCATTTTTTTACGTCTCATTGTCCTTTCAGTTTGTCATGTTCGGCCAT
ATCCATCATATACGATAGGATTGGTTTATGTAATTTTAAATATATCAATACTGTTTTATA
C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR4EF57TF 481 0 0
GGGAAGAGGAGGCCGTAAAACCTGCGATGGAAGCAATCCGTGACGAAGTGGATACGTTTG
CTACGGCAGTCAAGGAAGTTGGCGAAGCTGTGGCTAAGTGTAGCACATTTGTCTCTTCGG
GGAAACTACAAGTTCTGGAACACATAACCAATTCAATGTCATCGAAAGGGAAGAAACCAC
ACGTTTTGGAACGCATAGCCAATTCAATGTCATCGAAAGGAAAGAAGAAATAAACTCTCC
AATGCCTAGAAAACCTTTGGTAACTCCACGGTTATCAAGGAACTATCCAAAATATTTATA
CTTTTATATTAATGTTTGAAGTGTGCGAAACTTATTTTTTATGTCCTAGTCGTGAAGCTT
ATTGGCAGTGTCTCATTTTTTTACGTCTCATTGTCCTTTCAGTTTGTCATGTTCGGCCAT
ATCCATCATATACGATAGGATTGGTTTATGTAATTTTAAATATATCAATACTGTTTTATA
C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 2

CO CL5493Contig1 683 2 16 U
GGGGAAGTGAATTCGATTTACACTTTTCTTCTTTTATTTTCTAACAAAAACACAAGTTCA
ACAACCCCCATGTCGTGGTTTCTTATAGCGGCGGCGATTGTAGCTGCCGTCGTCTCATAC
AACCTTATCCAACGTCTGAGATTCAAGCACCCACCAGGACCACGACCAAAGCCTATCGTC
GGTAACCTCTACGACATAAAACCTGTCCGGTTCAGATGCTACTATGAATGGGCTCAAACA
TACGGACCAATCATATCGGTCTGGATCGGCTCTATCTTAAACGTGGTAGTATCAAGCGCC
GAGCTAGCCAAAGAAGTCCTCAAAGAACACGACCAGAAACTAGCCGACCGTCACCGAAAC
AGATCCACAGAAGCATTCAGCCGCAACGGTCAGGATCTGATATGGGCAGATTATGGTCCA
CACTACGTGAAGGTGAGAAAAGTTTGCACGCTTGAGCTCTTCACACCAAAAAGACTCGAG
TCTCTTAGACCTATCCGTGAAGATGAGGTCACTGCCATGGTCGAGTCCGTCTTCAGAGAC
TGTAACCTTCCTGAAAACAGAGTGAAAGGATTACAACTGAGGAAGTACTTAGGAGCGGTT
GCGTTCAACAACATAACGCGGCAAGCGTTTGGGAAGCGTTTTGTGAACGCGGAAAGTGTG
ATGGACGAGCAAGGACTTGAGTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H511TF U 1
AF RR4C692TF U 2
BS 1 47 RR4H511TF
BS 48 48 RR4C692TF
BS 49 128 RR4H511TF
BS 129 129 RR4C692TF
BS 130 148 RR4H511TF
BS 149 149 RR4C692TF
BS 150 287 RR4H511TF
BS 288 288 RR4C692TF
BS 289 356 RR4H511TF
BS 357 357 RR4C692TF
BS 358 592 RR4H511TF
BS 593 593 RR4C692TF
BS 594 622 RR4H511TF
BS 623 623 RR4C692TF
BS 624 648 RR4H511TF
BS 649 683 RR4C692TF

RD RR4H511TF 648 0 0
GGGGAAGTGAATTCGATTTACACTTTTCTTCTTTTATTTTCTAACAATAACACAAGTTCA
ACAACCCCCATGTCGTGGTTTCTTATAGCGGCGGCGATTGTAGCTGCCGTCGTCTCATAC
AACCTTATTCAACGTCTGAGATTCAAGCTCCCACCAGGACCACGACCAAAGCCTATCGTC
GGTAACCTCTACGACATAAAACCTGTCCGGTTCAGATGCTACTATGAATGGGCTCAAACA
TACGGACCAATCATATCGGTCTGGATCGGCTCTATCTTAAACGTGGTCGTATCAAGCGCC
GAGCTAGCCAAAGAAGTCCTCAAAGAACACGACCAGAAACTAGCCGACCGTCACCGGAAC
AGATCCACAGAAGCATTCAGCCGCAACGGTCAGGATCTGATATGGGCAGATTATGGTCCA
CACTACGTGAAGGTGAGAAAAGTTTGCACGCTTGAGCTCTTCACACCAAAAAGACTCGAG
TCTCTTAGACCTATCCGTGAAGATGAGGTCACTGCCATGGTCGAGTCCGTCTTCAGAGAC
TGTAACCTTCCTGAAAACAGAGTGAAAGGATTACAACTGAGGAAGTACTTAG*AGCGGTT
GCGTTCAACAACATAACGCGGCTAGCGTTTGGGAAGCGTTTTGTGAAC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4C692TF 682 0 0
TA
GAAGTGAATTCGATTTACACTTTTCTTCTTTTATTTTCTAACAAAAACACAAGTTCAACA
ACCCCCATGTCGTGGTTTCTTATAGCGGCGGCGATTGTAGCTGCCGTCGTCTCATACAAC
CTTATCCAACGTCTGAGATTCAAGCACCCACCAGGACCACGACCAAAGCCTATCGTCGGT
AACCTCTACGACATAAAACCTGTCCGGTTCAGATGCTACTATGAATGGGCTCAAACATAC
GGACCAATCATATCGGTCTGGATCGGCTCTATCTTAAACGTGGTAGTATCAAGCGCCGAG
CTAGCCAAAGAAGTCCTCAAAGAGCACGACCAGAAGCTAGCCGACCGTCACCGAAACAGA
TCCACAGAAGCATTCAGCCGCAACGGTCAGGATCTGATATGGGCAGATTATGGTCCACAC
TACGTGAAGGTGAGAAAAGTTTGCACGCTTGAGCTCTTCACACCAAAAAGACTCGAGTCT
CTTAGACCTATCCGTGAAGATGAGGTCACTGCCATGGTCGAGTCCGTCTTCAGAGACTGT
AACCTTCCTGAAAACAGAGTGAAAGGATTACAACTGAGGAAGTACTTAGGAGCGGTTGCG
TTCAACAACATAACGCGGCAAGCGTTTGGGAAGCGTTTTGTGAACGCGGAAAGTGTGATG
GACGAGCAAGGACTTGAGTT

QA 3 682 3 682
DS 



AS 1 2

CO CL5494Contig1 851 2 2 U
GGAAAAGTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGACCAAAGTATAT
ATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAACTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGA
GCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGGCGCTTCCAGAA
GAAGCACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAAC
GACCTAACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCT
GCTCAGTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCC
GGTAAACCAGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACC
GCATTGACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTAC
ACATTTGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCT
GGAACATTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTT
CACCAAGGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGC
TTTCTAATGATTCGGTATCGATAAGAACAAAAAACCATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTTT
TAATAATATATAAGTTCTTTCACTTTAATATTATTTCACAGCAATAATTATTCTCTTTGT
TTTTACTTATAGATATGTAATGATTTGTGCTTGTGTTTCACCTCAAACATGAATGAGATT
TTTTTATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN81TF U 1
AF RR4FN81JQ C 129
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BS 606 851 RR4FN81JQ

RD RR4FN81TF 605 0 0
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ATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAACTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGA
GCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGGCGCTTCCAGAA
GAAGCACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAAC
GACCTAACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCT
GCTCAGTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCC
GGTAAACCAGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACC
GCATTGACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTAC
ACATTTGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCT
GGAACATTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTT
CACCA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4FN81JQ 723 0 0
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CCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAACGACCTAAC
TGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAGTT
CAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAAACC
AGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACCGCATTGAC
GGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTACACATTTGG
TGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACATT
CGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAAGG
CAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCTAAT
GATTCGGTATCGATAAGAACAAAAAACCATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTTTTAATAATA
TATAAGTTCTTTCACTTTAATATTATTTCACAGCAATAATTATTCTCTTTGTTTTTACTT
ATAGATATGTAATGATTTGTGCTTGTGTTTCACCTCAAACATGAATGAGATTTTTTTATT
GCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5496Contig1 683 2 1 U
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GTCTTTTTCGCTCTGTTAATTTTCTGGAGAAGTTTTTCTAGATTGATAAGTTCTGGTATC
CGAATCATGGAGGGAATTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAAGCCGAGTTCGATGTT
GAGGAGATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCTCAAGGTTTCCGATCGAATCGCCCACCTCGT
CCCCTCCGATCCGGTTCACAAGCGTGACCATTAAGAACTCGCCATCGATAATGCTGAAAG
GAATGGAGGGAAGCACCTTAGGAGTTTGGGCGGCTCTTGGAGAAGGACGGGCTTATTTCT
CGGACGAAGGAGTCTTGGACCACATGCTTCACTCAGATTTGGCTCCGTTGAGATACTGTG
ACGATGATGGGAGCGTGACTGAAGCATACCCTTTTAATCCCAATGGCTCACCGTTGGGAA
TAGCGGCTATATGTTCACCTGGCGGAAGACATCTTGCGATGATGCCTCATCTTGATCATC
ATCTCGAGTTCTTCTCTTCTCTGTTCGGTCCTCTCATTCCATGGATGACATGGACACCGT
CTATAAGCAATTGGGTATCTCTCTTTCTGTCTCTCGTCTTCCGTCAACTTGCTGTCTCAT
TTTTTAATCAAAGACACTCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4E891TF U 1
AF RR4E629TF U 204
BS 1 683 RR4E891TF

RD RR4E891TF 683 0 0
GGGTGGCATGTTGCCATTGAATGAGGGAGAGAGAATATTGTTTCGTTTTCTATCTCTTTC
GTCTTTTTCGCTCTGTTAATTTTCTGGAGAAGTTTTTCTAGATTGATAAGTTCTGGTATC
CGAATCATGGAGGGAATTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAAGCCGAGTTCGATGTT
GAGGAGATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCTCAAGGTTTCCGATCGAATCGCCCACCTCGT
CCCCTCCGATCCGGTTCACAAGCGTGACCATTAAGAACTCGCCATCGATAATGCTGAAAG
GAATGGAGGGAAGCACCTTAGGAGTTTGGGCGGCTCTTGGAGAAGGACGGGCTTATTTCT
CGGACGAAGGAGTCTTGGACCACATGCTTCACTCAGATTTGGCTCCGTTGAGATACTGTG
ACGATGATGGGAGCGTGACTGAAGCATACCCTTTTAATCCCAATGGCTCACCGTTGGGAA
TAGCGGCTATATGTTCACCTGGCGGAAGACATCTTGCGATGATGCCTCATCTTGATCATC
ATCTCGAGTTCTTCTCTTCTCTGTTCGGTCCTCTCATTCCATGGATGACATGGACACCGT
CTATAAGCAATTGGGTATCTCTCTTTCTGTCTCTCGTCTTCCGTCAACTTGCTGTCTCAT
TTTTTAATCAAAGACACTCATGG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4E629TF 480 0 0
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GTGACCATTAAGAACTCGCCATCGATAATGCTGAAAGGAATGGAGGGAAGCACCTTAGGA
GTTTGGGCGGCTCTTGGAGAAGGACGGGCTTATTTCTCGGACGAAGGAGTCTTGGACCAC
ATGCTTCACTCAGATTTGGCTCCGTTGAGATACTGTGACGATGATGGGAGCGTGACTGAA
GCATACCCTTTTAATCCCAATGGCTCACCGTTGGGAATAGCGGCTATATGTTCACCTGGC
GGAAGACATCTTGCGATGATGCCTCATCTTGATCATCATCTCGAGTTCTTCTCTTCTCTG
TTCGGTCCTCTCATTCCATGGATGACATGGACACCGTCTATAAGCAATTGGGTATCTCTC
TTTCTGTCTCTCGTCTTCCGTCAACTTGCTGTCTCATTTTT*AATCAAAGACACTCATGG

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL5497Contig1 694 2 4 U
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TTTGAAAATTCCCCCAATTTTTTTTTTTCTCCAATTCGCGTTCAGATCTGTTCCTTCTTC
CTCATCGATCTTCAAATCAATTGTTAAAATAACATGGGTTATAAGCGAACTTTTGACGCT
GAGGATATGCAAGAGCTCAACGTGAATCATGCAAGACAGATTGGTTATTACAACAAGCTG
GCCAAACTAGATGAAGGAGTTCCATATCATGTTTCTTTGGAGAAGCCAGGTGTTGTCATA
GGAGACGATCTGAGTGATCTCTATGGGTTTAAAAGTGAGGATAACCTTGAGAAGGGGTTT
GAGAGTGATGCACCTTTCTCTTGGATGACCTCTTTTGAGGAGGATTCTCAATCTGGTGGG
ACGACGACTCAGTCTACTCTCTCTGATGAGTCTCCCGAGTCAGATTTCCTCTGGAGACCA
GTTTGCCTTGAAGAAGATGTCGAGTGGTGTCAGAGTTCTCCTGATAAACAAGTTCCAATC
GGATCAGATCACCAGGCCGACATTCCTGAATGTGTCAAGGATAAAGTCCGTGATGCTGTC
GATGACAATGAAGAACAAGTGATGATGATGGGGAAGTGCGTCATTCCAATGCCTGACAGT
GAAACTGACGAAATTGGTAAAGGAAGAAAGGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FH36TF U 1
AF RR4AC39TF U 89
BS 1 463 RR4FH36TF
BS 464 464 RR4AC39TF
BS 465 573 RR4FH36TF
BS 574 694 RR4AC39TF

RD RR4FH36TF 573 0 0
GGATCCGAATTAAGCCCGGGTTTCAAAATCGGGTATTCCCATTATTCAATCCTAGCCGCT
TTTGAAAATTCCCCCAATTTTTTTTTTTCTCCAATTCGCGTTCAGATCTGTTCCTTCTTC
CTCATCGATCTTCAAATCAATTGTTAAAATAACATGGGTTATAAGCGAACTTTTGACGCT
GAGGATATGCAAGAGCTCAACGTGAATCATGCAAGACAGATTGGTTATTACAACAAGCTG
GCCAAACTAGATGAAGGAGTTCCATATCATGTTTCTTTGGAGAAGCCAGGTGTTGTCATA
GGAGACGATCTGAGTGATCTCTATGGGTTTAAAAGTGAGGATAACCTTGAGAAGGGGTTT
GAGAGTGATGCACCTTTCTCTTGGATGACCTCTTTTGAGGAGGATTCTCAATCTGGTGGG
ACGACGACTCAGTCTACTCTCTCTGATGAGTCTCCCGAGTCAGGTTTCCTCTGGAGACCA
GTTTGCCTTGAAGAAGATGTCGAGTGGTGTCAGAGTTCTCCTGATAAACAAGTTCCAATC
GGATCAGATCACCAGGCCGACATTCCTGAATGT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4AC39TF 606 0 0
CTCCAATTCGCGTTCAGATCTGTTCCTTCTTCCTCATTGATCTTCAAATCAATTGTTAAA
ATAACATGGGTTATAAGCGAACTTTTGACGCTGAGGATATGCAAGAGCTCAACGTGAATC
ATGCAAGACAGATTGGTTATTACAACAAGCTGGCCAAACTAGATGAAGGAGTTCCATATC
ATGTTTCTTTGGAGAAGCCAGGTGTTGTCATAGGAGACGATCTGAGTGATCTCTATGGGT
TTAAAAGTGAGGATAACCTTGAGGAGGGGTTTGAGAGTGATGCATCTTTCTCTTGGATGA
CCTCTTTTGAGGAGGATTCTCAATCTGGTGGGACGACGACTCAGTCTACTCTCTCTGATG
AGTCTCCCGAGTCAGATTTCCTCTGGAGACCAGTTTGCCTTGAAGAAGATGTCGAGTGGT
GTCCGAGTTCTCCTGATAAACAAGTTCCAATCGGATCAGATCACCAGGCCGACATTCCTG
AATGTGTCAAGGATAAAGTCCGTGATGCTGTCGATGACAATGAAGAACAAGTGATGATGA
TGGGGAAGTGCGTCATTCCAATGCCTGACAGTGAAACTGACGAAATTGGTAAAGGAAGAA
AGGAAT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL5498Contig1 923 2 6 U
GGATTCACTAATAATGTGGAATGGTCATCTCTGGGATCGCCGTATCCCAAATAGTTGCAA
ACGGTTTGATCAGTTTACTGATTATGGCGGTGGTGGTTTTCATCCTTCTCGAAACGAGGT
GATCATAAACTCGGAGGTCTGGGACTTGAGGAATATGAATACGAGGCTTATTCGGAGTGT
ACCATCACTGGACCAGACAGCTATTACGTTCAACTCCAGGGGAGATGTTATATACGCAAT
GCTGAGGAGAAATATTGAGGACGTGATGTCTGCTGTCAACACACGTCGTACGAAGCATCC
GTTGTTTGCTGCTTTCCGCACTCTCGATGCGGTAAACTATTCAGACATTGCCACTATACC
GGTGGACCGATGTCTTCTAGACTTCGCCACGGAACCAACAGATTCCTTCCTCGGCCTGAT
CACAATGAAAGATCAAGATGATATGTTTGCCTCAGCCAGGATGTATGAGATTGGCAGACG
GAGACCGACAGATGATGACTCGGATCCCGATGATGATGGTGAGACAGAGGATGAAGATGA
AGATGATGAAGACGACGAAGATGACCTGGACCGGATTCTTGGACTAGCTGGAGGCGATAG
CGACAGTGGAGATGATGACATGAGCAGCGATGACAATGAAGATAACAGTGCGAGTGATTT
TGATGATGATGATGGAGGTATGTTCTTTGATGGTGGGATTATGGAGATTGTAAGTGACGA
CGGTGATGATGAAGAAGGTAATGGTGATGATGAAGACAGCGATGATGACGGTGATTCCAT
GAGCAGTGGCGGAGAGGAGTTTCTGGACAGCATTATTTAAAATGTTTTTTATCTTGTGTT
CTTTTGAGCTACAGATTCTATAAGACGGATCCACTATCCAAAGTTTTGATAAGTAATGTT
TACATCATAGATTATTAAGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F107TF U 1
AF RR4F107JQ C 415
BS 1 427 RR4F107TF
BS 428 428 RR4F107JQ
BS 429 699 RR4F107TF
BS 700 700 RR4F107JQ
BS 701 718 RR4F107TF
BS 719 923 RR4F107JQ

RD RR4F107TF 718 0 0
GGATTCACTAATAATGTGGAATGGTCATCTCTGGGATCGCCGTATCCCAAATAGTTGCAA
ACGGTTTGATCAGTTTACTGATTATGGCGGTGGTGGTTTTCATCCTTCTCGAAACGAGGT
GATCATAAACTCGGAGGTCTGGGACTTGAGGAATATGAATACGAGGCTTATTCGGAGTGT
ACCATCACTGGACCAGACAGCTATTACGTTCAACTCCAGGGGAGATGTTATATACGCAAT
GCTGAGGAGAAATATTGAGGACGTGATGTCTGCTGTCAACACACGTCGTACGAAGCATCC
GTTGTTTGCTGCTTTCCGCACTCTCGATGCGGTAAACTATTCAGACATTGCCACTATACC
GGTGGACCGATGTCTTCTAGACTTCGCCACGGAACCAACAGATTCCTTCCTCGGCCTGAT
CACAATGGAAGATCAAGATGATATGTTTGCCTCAGCCAGGATGTATGAGATTGGCAGACG
GAGACCGACAGATGATGACTCGGATCCCGATGATGATGGTGAGACAGAGGATGAAGATGA
AGATGATGAAGACGACGAAGATGACCTGGACCGGATTCTTGGACTAGCTGGAGGCGATAG
CGACAGTGGAGATGATGACATGAGCAGCGATGACAATGAAGATAACAGTGCGAGTGATTT
TGATGATGATGATGGAGGTATGTTCTTTGATGGTGGGAT*ATGGAGATTGTAAGTGAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4F107JQ 509 0 0
CCTGATCACAATGAAAGATCAAGATGATATGTTTGCTTCAGCCAGGATGTATGAGATTGG
CAGACGGAGACCGACAGATGATGACTCGGATCCCGATGATGATGGTGAGACAGAGGATGA
AGATGAAGATGATGAAGACGACGAAGATGACCTGGACCGGATTCTTGGACTAGCTGGAGG
CGATAGCGACAGTGGAGATGATGACATGAGCAGCGATGACAATGAAGATAACAGTGCGAG
TGATTTTGATGATGATGATGGAGGTATGTTCTTTGATGGTGGGATTATGGAGATTGTAAG
TGACGACGGTGATGATGAAGAAGGTAATGGTGATGATGAAGACAGCGATGATGACGGTGA
TTCCATGAGCAGTGGCGGAGAGGAGTTTCTGGACAGCATTATTTAAAATGTTTTTTATCT
TGTGTTCTTTTGAGCTACAGATTCTATAAGACGGATCCACTATCCAAAGTTTTGATAAGT
AATGTTTACATCATAGATTATTAAGGTGC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL5499Contig1 1022 2 2 U
GGACCTCCAAAAAAATGTCGGCTCTACTTGGTATCGTCTTCCCGGTGACCTTCACCGGCC
ACGGCCAGCTCCCGGCGAAACTCCATTCTTCGCGACGGAGATTGGTGGTTAAGTCTTCGA
ACTCATCCAGCGAACGTCAGACTCTATTCAACCGCATTGCTCCTGTTTACGATAACCTGA
ATGATCTCTTAAGCTTAGGACAACATCGTATCTGGAAGAGCATGGCTGTTTCCTGGAGCG
GAGCGAGAACAGGAGATAAAGTTCTTGACTTGTGTTGTGGAAGTTGATTTAGCCTTTCTC
TTGTCTGAGAAAGTTGGTCCAACTGGAAAGGTGATGGGTTTGGATTTCTCTTCTGAACAA
CTAGCTGTTGCAGCTTCTAGACAGAAGCTTAGAGGGAGGTCTTGCTACAAGTGTATAGAG
TGGATTGAAGGTGATGCTACTGATTTGCCATTTGATGACTGTGAGTTCGATGCGATAACG
ATGGGTTATGGTCTTAGAAACGTTGTTGATAGGCATAGAGCCATGAGGGAGATGTATCGG
GTTCTGAAACCAGGTTCGAGAGTGTCCATACTTGATTTCAATAAGAGCAATCAGTCAGTT
ACGACGTTTATGCAGGATTGGATGATTGACAATGTAGTTGTCCCTGTGGCTACTCTTTAT
GATCTTGCAAAGGAGTATGAATATCTAAAGTATTCAATCAGTGAGTACCTTACAGGAGAA
GAGCTGGAGACTCTTGCTCTAGAAGCTGGATTCTCAAGTGCACGCCATTATGAGATTGGT
GGTGGTTTCATGGGGAATTTGGTCGCCTTGAGGTAAACAGAACAGCATTCAACCACCAAC
ACAACTTCATTGTTGAGAAAAAGAAAAGATTTGTTTTAAAATGTTGAAGATTGATCTAAA
ATTGTTATCTATCCTTCTTCGATGTATTGAGACTTCTAATCAGATGTATTAGTTATACCA
TTGCACATCTTCATATGATAAACAAGCTATCCAAAATAATGTAAATCAGACGTTTCTGGA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4AF15TF U 1
AF RR4AF15JQ C 318
BS 1 792 RR4AF15TF
BS 793 1022 RR4AF15JQ

RD RR4AF15TF 792 0 0
GGACCTCCAAAAAAATGTCGGCTCTACTTGGTATCGTCTTCCCGGTGACCTTCACCGGCC
ACGGCCAGCTCCCGGCGAAACTCCATTCTTCGCGACGGAGATTGGTGGTTAAGTCTTCGA
ACTCATCCAGCGAACGTCAGACTCTATTCAACCGCATTGCTCCTGTTTACGATAACCTGA
ATGATCTCTTAAGCTTAGGACAACATCGTATCTGGAAGAGCATGGCTGTTTCCTGGAGCG
GAGCGAGAACAGGAGATAAAGTTCTTGACTTGTGTTGTGGAAGTTGATTTAGCCTTTCTC
TTGTCTGAGAAAGTTGGTCCAACTGGAAAGGTGATGGGTTTGGATTTCTCTTCTGAACAA
CTAGCTGTTGCAGCTTCTAGACAGAAGCTTAGAGGGAGGTCTTGCTACAAGTGTATAGAG
TGGATTGAAGGTGATGCTACTGATTTGCCATTTGATGACTGTGAGTTCGATGCGATAACG
ATGGGTTATGGTCTTAGAAACGTTGTTGATAGGCATAGAGCCATGAGGGAGATGTATCGG
GTTCTGAAACCAGGTTCGAGAGTGTCCATACTTGATTTCAATAAGAGCAATCAGTCAGTT
ACGACGTTTATGCAGGATTGGATGATTGACAATGTAGTTGTCCCTGTGGCTACTCTTTAT
GATCTTGCAAAGGAGTATGAATATCTAAAGTATTCAATCAGTGAGTACCTTACAGGAGAA
GAGCTGGAGACTCTTGCTCTAGAAGCTGGATTCTCAAGTGCACGCCATTATGAGATTGGT
GGTGGTTTCATG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4AF15JQ 705 0 0
TCCAACTGGAAAGGTGATGGGTTTGGATTTCTCTTCTGAACAACTAGCTGTTGCAGCTTC
TAGACAGAAGCTTAGAGGGAGGTCTTGCTACAAGTGTATAGAGTGGATTGAAGGTGATGC
TACTGATTTGCCATTTGATGACTGTGAGTTCGATGCGATAACGATGGGTTATGGTCTTAG
AAACGTTGTTGATAGGCATAGAGCCATGAGGGAGATGTATCGGGTTCTGAAACCAGGTTC
GAGAGTGTCCATACTTGATTTCAATAAGAGCAATCAGTCAGTTACGACGTTTATGCAGGA
TTGGATGATTGACAATGTAGTTGTCCCTGTGGCTACTCTTTATGATCTTGCAAAGGAGTA
TGAATATCTAAAGTATTCAATCAGTGAGTACCTTACAGGAGAAGAGCTGGAGACTCTTGC
TCTAGAAGCTGGATTCTCAAGTGCACGCCATTATGAGATTGGTGGTGGTTTCATGGGGAA
TTTGGTCGCCTTGAGGTAAACAGAACAGCATTCAACCACCAACACAACTTCATTGTTGAG
AAAAAGAAAAGATTTGTTTTAAAATGTTGAAGATTGATCTAAAATTGTTATCTATCCTTC
TTCGATGTATTGAGACTTCTAATCAGATGTATTAGTTATACCATTGCACATCTTCATATG
ATAAACAAGCTATCCAAAATAATGTAAATCAGACGTTTCTGGAAG

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5500Contig1 843 2 2 U
GGATGGTTGAACATGTTTTCAGTCTCTTATTTCCCAGGACCATCCACTAAACTTCCTGTT
CGGCTGGTTTCGCCTGTTTTGTCACTACTTAAATGGACACAAGAAAAGGAAGGCACTGGA
AATTATTATGACACAGCTCATCAGTTTGCTCTCTTAGCTTCCTCAACGAGAACTTTTAAC
TGCAATGCTGCTAAGAAGCATCTCGGTTACACACCAGTTGTGTCACTTGAAGATGGTATT
GCATCAACGGTTCAGTGGTTCTCTCGTGATCTTGAGAAATCTGATGATACGGCCATCTTG
CTGTGGAGAAATGAGAAGAATACATTTGTTTCTTTTGTTGTCCTCAACTTGTTATACTAC
TGGTTCTTCTCTTCTGGAAGCACATTTACTTCGTCTGCAGCTCAACTTCTGTTTATACTA
CTTGTTGCTCTCTATGGACTTGCTTTTGTGCCGTCAAAGATCTTTGGGTTTCTTCAAGTC
AAGAAAATACCTCCATGGAGATTCGAGATCTCGGAGTCTGCAGTGAGAGATCTTAGCAGG
GATATCGTAGTTGTATGGAACCATGGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTACCACATAGCCCG
GATCTTCATCGAATGCTTAGCAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAATCTGCCTCTACC
TGATGGTTCATCTAAACCAATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGGAAACAATTTCAG
AGACTATCAGCAGTTATTAAATGTCTATGTAACTGGCAAAGATGCTATTAAAAAGTCCTT
ATTTTCAGACTGTAATCCTGGTGACATGAACAATATCTCTTACTGAGACAATTTCGTGGT
GTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CJ37TF U 1
AF RR4CJ37JQ C 168
BS 1 641 RR4CJ37TF
BS 642 843 RR4CJ37JQ

RD RR4CJ37TF 641 0 0
GGATGGTTGAACATGTTTTCAGTCTCTTATTTCCCAGGACCATCCACTAAACTTCCTGTT
CGGCTGGTTTCGCCTGTTTTGTCACTACTTAAATGGACACAAGAAAAGGAAGGCACTGGA
AATTATTATGACACAGCTCATCAGTTTGCTCTCTTAGCTTCCTCAACGAGAACTTTTAAC
TGCAATGCTGCTAAGAAGCATCTCGGTTACACACCAGTTGTGTCACTTGAAGATGGTATT
GCATCAACGGTTCAGTGGTTCTCTCGTGATCTTGAGAAATCTGATGATACGGCCATCTTG
CTGTGGAGAAATGAGAAGAATACATTTGTTTCTTTTGTTGTCCTCAACTTGTTATACTAC
TGGTTCTTCTCTTCTGGAAGCACATTTACTTCGTCTGCAGCTCAACTTCTGTTTATACTA
CTTGTTGCTCTCTATGGACTTGCTTTTGTGCCGTCAAAGATCTTTGGGTTTCTTCAAGTC
AAGAAAATACCTCCATGGAGATTCGAGATCTCGGAGTCTGCAGTGAGAGATCTTAGCAGG
GATATCGTAGTTGTATGGAACCATGGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTACCACATAGCCCG
GATCTTCATCGAATGCTTAGCAGTTGTTAAAGAAGTGGTGC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4CJ37JQ 676 0 0
GAGAACTTTTAACTGCAATGCTGCTAAGAAGCATCTCGGTTACACACCAGTTGTGTCACT
TGAAGATGGTATTGCATCAACGGTTCAGTGGTTCTCTCGTGATCTTGAGAAATCTGATGA
TACGGCCATCTTGCTGTGGAGAAATGAGAAGAATACATTTGTTTCTTTTGTTGTCCTCAA
CTTGTTATACTACTGGTTCTTCTCTTCTGGAAGCACATTTACTTCGTCTGCAGCTCAACT
TCTGTTTATACTACTTGTTGCTCTCTATGGACTTGCTTTTGTGCCGTCAAAGATCTTTGG
GTTTCTTCAAGTCAAGAAAATACCTCCATGGAGATTCGAGATCTCGGAGTCTGCAGTGAG
AGATCTTAGCAGGGATATCGTAGTTGTATGGAACCATGGAGCAATACGAGCTTGAGCTGT
ACCACATAGCCCGGATCTTCATCGAATGCTTAGCAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGA
ATCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCAATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAG
GAAACAATTTCAGAGACTATCAGCAGTTATTAAATGTCTATGTAACTGGCAAAGATGCTA
TTAAAAAGTCCTTATTTTCAGACTGTAATCCTGGTGACATGAACAATATCTCTTACTGAG
ACAATTTCGTGGTGTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5501Contig1 700 2 2 U
GAAACACAGAGAGAGAGAGAAAAAGGAGAGAGATGGAAGACGGTAAATGCAACGGAGGCG
CGACGGCGGTGTTACCGGAGATCAAATTCACCAAGCTTTTCATCAACGGCCAGTTCCTCG
ATGCTGCTTCAGGTAAAACATTTGAAACCATAGACCCAAGGAACGGTGAAGTGATCGCGA
AAATAGCAGCAGGAGACAAAGAAGAGTTGACTTGGCCGTTAACGCTGCACGTCACGCCTT
CGATCATGGTCCTTGGCCTCGCATGACTGGCTTCGAGAGGGCAAGGATTATCAACAAATA
TACCGACTTAATAGAGCAAAACATTGAAGAATTGGCTGCTCTTGATTCGGTCGACGGCGG
AAAGTTGTTCCATGCGGGGGAAATGAATGATATTCCTGCCGCAGCCGGACATTTCCGGTA
CTATGCGGGTGCGGCGGATAAAATACACGGCGAGACACTTAGAATGACACGTCCGTCTTT
GTTCGGATACACACTTAAAGAACCTATTGGAGTGGTCGGTCACATCATCCCTTGGAATTT
TCCTAGCACTATGTTTGCCATGAAAGTGGCTCCGGCTTTAGCTGCTGGTTGCACCATGGT
GGTCAAGCCAGCAGAGCAAACTCCACTCTCTGCTTTGTTCTATGCGCATCTCTCGAAAGA
AGCGGGATTTCCTGATGGCGTGATCAACGTGGTGACTGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4EC04TF U 1
AF RR4F144TF U 1
BS 1 695 RR4EC04TF
BS 696 700 RR4F144TF

RD RR4EC04TF 695 0 0
GAAACACAGAGAGAGAGAGAAAAAGGAGAGAGATGGAAGACGGTAAATGCAACGGAGGCG
CGACGGCGGTGTTACCGGAGATCAAATTCACCAAGCTTTTCATCAACGGCCAGTTCCTCG
ATGCTGCTTCAGGTAAAACATTTGAAACCATAGACCCAAGGAACGGTGAAGTGATCGCGA
AAATAGCAGCAGGAGACAAAGAAGAGTTGACTTGGCCGTTAACGCTGCACGTCACGCCTT
CGATCATGGTCCTTGGCCTCGCATGACTGGCTTCGAGAGGGCAAGGATTATCAACAAATA
TACCGACTTAATAGAGCAAAACATTGAAGAATTGGCTGCTCTTGATTCGGTCGACGGCGG
AAAGTTGTTCCATGCGGGGGAAATGAATGATATTCCTGCCGCAGCCGGACATTTCCGGTA
CTATGCGGGTGCGGCGGATAAAATACACGGCGAGACACTTAGAATGACACGTCCGTCTTT
GTTCGGATACACACTTAAAGAACCTATTGGAGTGGTCGGTCACATCATCCCTTGGAATTT
TCCTAGCACTATGTTTGCCATGAAAGTGGCTCCGGCTTTAGCTGCTGGTTGCACCATGGT
GGTCAAGCCAGCAGAGCAAACTCCACTCTCTGCTTTGTTCTATGCGCATCTCTCGAAAGA
AGCGGGATTTCCTGATGGCGTGATCAACGTGGTGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4F144TF 700 0 0
GAAACACAGAGAGAGAGAGAAAAAGGAGAGAGATGGAAGACGGTAAATGCAACGGAGGCG
CGACGGCGGTGTTACCGGAGATCAAATTCACCAAGCTTTTCATCAACGGCCAGTTCCTCG
ATGCTGCTTCAGGTAAAACATTTGAAACCATAGACCCAAGGAACGGTGAAGTGATCGCGA
AAATAGCAGCAGGAGACAAAGAAGAGTTGACTTGGCCGTTAACGCTGCACGTCACGCCTT
CGATCATGGTCCTTGGCCTCGCATGACTGGCTTCGAGAGGGCAAGGATTATCAACAAATA
TACCGACTTAATAGAGCAAAACATTGAAGAATTGGCTGCTCTTGATTCGGTCGACGGCGG
AAAGTTGTTCCATGCGGGGGAAATGAATGATATTCCTGCCGCAGCCGGACATTTCCGGTA
CTATGCGGGTGCGGCGGATAAAATACACGGCGAGACACTTAGAATGACACGTCCGTCTTT
GTTCGGATACACACTTAAAGAACCTATTGGAGTGGTCGGTCACATCATCCCTTGGAATTT
TCCTAGCACTATGTTTGCCATGAAAGTGGCTCCGGCTTTAGCTGCTGGTTGCACCATGGT
GGTCAAGCCAGCAGAGCAAACTCCACTCTCTGCTTTGTTCTATGCGCATCTCTCGAAAGA
AGCGGGATT*CCTGATGGCGTGATCAACGTGGTGACTGGA

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5502Contig1 617 2 2 U
GGAGGAGGAAAAGAAAGGGTCAATGACTTTTGTTGATGATTTGTATGGTTTTGTGGAGGG
TGTTGACTGCTTTGCTCAGATGGAAGATGAATACTTTCGTGAGATCATGGGGAACCATCT
GTTGGATAGTCCTTATAATCAGCATGATGAGGATTCCTCTTCATCAGAATCAGAGCCAAA
GAGACGAAAGGTTGACGAGTCAGCTTGTGTTATAGAGGATTCCTCAACGATCAAGGTGTC
GGTTCCAACCGTGGATGGAAGGAAAGTCATTGAAATAGCAGTGGAGTCGTTGTCGGAAAA
GGTGTGGAGTTTGAAGGAGAAAATTGCCAATGTGATTCAAATGCCGGCAAAGGATCTGAA
GTTACGAGGAAAAGAAGGGGTATTGAAGGGGGACAAGTCACTGGCACAAAACGATGTTGA
AACCGGAGAAATCCTCACCCTGACTTGGCGCATTTCAAGGTGGGATTAGGGAAATGCAAG
TCTCGTCTATTTACTAAAATATGTTTAAAACTCGTTTTCGATTGGCAAGCAACGTTTTGT
CTCTGGTATCTCTGTTTTGTCTTATGATGTTTACTACTTTTGTCTCTGCTATCTTTAAAA
TATTTACTACTTATGAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CO35JQ C 1
AF RR4CO35TF U 70
BS 1 69 RR4CO35JQ
BS 70 617 RR4CO35TF

RD RR4CO35JQ 617 0 0
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GAGACGAAAGGTTGACGAGTCAGCTTGTGTTATAGAGGATTCCTCAACGATCAAGGTGTC
GGTTCCAACCGTGGATGGAAGGAAAGTCATTGAAATAGCAGTGGAGTCGTTGTCGGAAAA
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TCTCGTCTATTTACTAAAATATGTTTAAAACTCGTTTTCGATTGGCAAGCAACGTTTTGT
CTCTGGTATCTCTGTTTTGTCTTATGATGTTTACTACTTTTGTCTCTGCTATCTTTAAAA
TATTTACTACTTATGAT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4CO35TF 548 0 0
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TCCTTATAATCAGCATGATGAGGATTCCTCTTCATCAGAATCAGAGCCAAAGAGACGAAA
GGTTGACGAGTCAGCTTGTGTTATAGAGGATTCCTCAACGATCAAGGTGTCGGTTCCAAC
CGTGGATGGAAGGAAAGTCATTGAAATAGCAGTGGAGTCGTTGTCGGAAAAGGTGTGGAG
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AAAAGAAGGGGTATTGAAGGGGGACAAGTCACTGGCACAAAACGATGTTGAAACCGGAGA
AATCCTCACCCTGACTTGGCGCATTTCAAGGTGGGATTAGGGAAATGCAAGTCTCGTCTA
TTTACTAAAATATGTTTAAAACTCGTTTTCGATTGGCAAGCAACGTTTTGTCTCTGGTAT
CTCTGTTTTGTCTTATGATGTTTACTACTTTTGTCTCTGCTATCTTTAAAATATTTACTA
CTTATGAT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL5503Contig1 483 2 1 U
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AGC


BQ
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20 20 20 

AF RR4CB17JQ C 1
AF RR4CB17TF U 1
BS 1 483 RR4CB17TF

RD RR4CB17JQ 483 0 0
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AGC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4CB17TF 483 0 0
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GGACATGGTCACAAAGAAGAAGAGTCATGTCTGAGAATAATAATCTCGACAAACATATCT
TAGAGAGGATTACTACACATTGCAATTGCCATTGCAGACATCTCGAGGCTGTCCTATGGT
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AAAAAAAAAAAGTTGTTGTTATTATTTCTTAGTTGTTTCGTCTGTCTTTTACTTCCGAGT
TTTGCAAAGGTTGTTCAATGCATAACTGTTGCCTACTCTTGAAAAAGCATTGGATTTCTA
AGC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL5504Contig1 600 2 5 U
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AGTCACACTCTTTCGTACTTGTAGTAAATACGTGAGAGGTGATCCCTCAAGAGTTTTAGC
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GTTTCATTGCAATCTCCTTTGAACTGTCCATCCCAAACTGTGCCCTCACTAACACTTTCA
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CCAAACTCTCTCTTTGCCCGAGGCCATATTCGTCCACATGCTCATCTTCTTCATTCATGC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DV22JQ U 27
AF RR4DV22TF C 1
BS 1 26 RR4DV22TF
BS 27 228 RR4DV22JQ
BS 229 229 RR4DV22TF
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RD RR4DV22JQ 483 0 0
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AGAAAACTCTTTGTTTATTTAGTCTTGTACTTATAGTCACACTCTTTCGTACTTGTAGTA
AATACGTGAGAGGTGATCCCTCCAGAGTTTTAGCCATTGGCAACAATCTCGTGAATGGCC
TCAGCGACAGAGACATCCTCTGCTCTAACCGCCAGTTTCATTGCAATCTCCTTTGAACTG
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AAACAAGTGTGCGACCTTGCATTGCTCGGAACTGTTTCCGTCCCCTCACAAGACTGCATG
CCAAGAAGATCGATGACAGCCTTTATAGCTTCTCCCAAACTCTCTCTTTGCCCGAGGCCA
TAT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4DV22TF 600 0 0
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AATGTAGAAAAAAAGAAGTCAGTATACTATTTAAAAGAAAAGATTGTACTATAAGGTTGG
GTAAGTGAGGATCTTTAGCAACATGAAGAAAACTCTTTGTTTATTTAGTCTTGTACTTAT
AGTCACACTCTTTCGTACTTGTAGTAGATACGTGAGAGGTGATCCCTCAAGAGTTTTAGC
CATTGGCAACAATCTCGTGAATGGCCTCAGCGACAGAGACATCCTCTGCTCTAACCGCCA
GTTTCATTGCAATCTCCTTTGAACTGTCCATCCCAAACTGTGCCCTCACTAACACTTTCA
CGTTCCCTATGTACACACCTGACAGTAAACAAGTGTGCGACCTTGCATTGCTCGGAACTG
TTTCCGTCCCCTCACAAGACTGCATGCCAAGAAGATCGATGACAGCCTTTATAGCTTCTC
CCAAACTCTCTCTTTGCCCGAGGCCATATTCGTCCACATGCTCATCTTCTTCATTCATGC
TTTCCTATGCATTCCTGAAATTGGAGACGCTCACTTTCAATATGTAATCTGCAGATACAC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL5505Contig1 552 2 6 U
GCCAAAATGGTTTCTTTTATGGAAAATGAAAAGAGTCACAAGGATGCTCGAATTTATTTG
CAAAATCTCATTTTCAAGAGATAACAAACTTGAGAGAACCTGATACAAACAAAACAAAAA
GAGAGATACCACAAGAGATCCCAGCACAGGATTTTAACTAGACATAGGATGGTTGAAAAC
GTATTCAATGGCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAG
CTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACCGTGTCCAAACTATCTAATCCCAA
ATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTT
GACAACATCGAGAACTCTGTCGACGACATCCTGCCTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGA
GAAAGCACGGATCGAACCAAGGAACCCAATTTGAGGCTGGTTCGATCCCGTCACGGGAAC
CCTAAGGTGACGAAGGACTGCAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTTAG
GGATTTGGATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV21TF C 1
AF RR4BV21JQ U 16
BS 1 15 RR4BV21TF
BS 16 43 RR4BV21JQ
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BS 47 47 RR4BV21TF
BS 48 552 RR4BV21JQ

RD RR4BV21TF 499 0 0
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CAAAATCTCATTTTCAAGAGATAACAAACTTGAGAGAACCTGATACAAACAAAACAAAAA
GAGAGATACCACAAGAGATCCCAGCACAGGATTTTAACTAGACATAGGATGGTTGAAAAC
GTATTCAATGGCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAG
CTTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACCGTGTCCAAACTATCTAATCCCAA
ATCCTTTTGGAAATGAACATCAGGTGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTT
GACAACATCGAGAACTCTGTCGACGACATCCTGCCTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGA
GAAAGCACGGATCGAACCAAGGAACCCAATTTGAGGCTGGTTCGATCCCGTCACGGGAAC
CCTAAGGTGACGAAGGACT

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DS 

RD RR4BV21JQ 537 0 0
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AAGAGATAACAAACTTGAGAGAACCTGATACAAACAAAACAAAAAGAGAGATACCACAAG
AGATCCCAGCACAGGATTTTAACTAGACATAGGATGGTTGAAAACGTATTCAATGGCAAG
AGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGCTTGAACTCCTCTTC
AATAGCCATCACTATCTCCACCGTGTCCAAACTATCTAATCCCAAATCCTTTTGGAAATG
AACATCAGGTGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTTGACAACATCGAGAAC
TCTGTCGACGACATCCTGCCTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGAGAAAGCACGGATCGA
ACCAAGGAACCCAATTTGAGGCTGGTTCGATCCCGTCACGGGAACCCTAAGGTGACGAAG
GACTGCAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTTAGGGATTTGGATCC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL5506Contig1 1101 2 2 U
GTAGCTCAGCCTACCATAGTTCCGCTGCTGAAGAACCATTCAAAAGATGATCTCATGATA
TTTTCTGATTTTGATCTGACTTGCACCGTTGTTGATTCTTCTGCTATTTTAGCCGAAATT
GCAATCGTAACTGCCCCGAAAGATGACCAGGGTCAACAAATGAATCGGATGCTCTCGGCT
GACCTGAAGCACACCTGGAGTCTACTTTCTAAACAGTATACAGAGCATTATGAAGAGTGC
ATAGAGAGTATTCTGAATAAGGAAAAAGCGGACAAGTTTGACTACGAGGGTTTATGTGAA
GCACTAGAGCAGCTGTCAGAGTTTGAGAAAAAGGCAAACGATCGAGTGATCGAGTCTGGT
GTACTCAAGGGCCTGAATCTCGATGACATCAAGCGAGTTGGGGAAAGGTTAATTCTTCAA
GATGGCTGCATCAATGTCTTCCAGAAAATTTTGAAGACTCAGGATGTGAATGCAAAACTC
CACGTGCTTTCGTATTGTTGGTGTGGTGACCTCATCAGAGCAGCCTTTTCTGCACGGGGA
GTAGATGCAGTGGAAGTACATGCAAATGAATTCACGTTCGAGGAATCTATCTCTACTGGA
GAAATTGAACGAAAAGTGGAATCCCCAATCGACAAGGCTCAGCAGTTTAAGGGCATTCTA
GAAAACAGAAAGAAGGAGGATAAAGGCATCCTTACTGTTTACATTGGAGATTCAGTAGGT
GACTTGCTCTGTCTCCTGGAAGCAAACATAGGAATAGTGGTTGCCTCTAGCTCGAGCCTC
AGGAGAGGGGGAAGCCATTTCGGGGTCTCATTTGTGCCTTTGTTCTCTGGAATTGTGCAA
AAACAGAAACAAGAAGAAACCTGGAAGGGACTCTCTGGCACACTTTACACGGTATCAAGC
TGGGCTGAAATACATTCCTTCGCTCTTGGATGGGAGTAAACGGCAGAAGAAATATATGAT
TGAAGTTTGTATATACTGCCGGGGGTGGCTAGTTTTTATCAAGGGCCACGTATAAGTTTC
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TGAGCTTCTGTTGCTTTGTTG


BQ
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AF RR4B824TF U 1
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BS 674 1101 RR4B824JQ

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GTAGCTCAGCCTACCATAGTTCCGCTGCTGAAGAACCATTCAAAAGATGATCTCATGATA
TTTTCTGATTTTGATCTGACTTGCACCGTTGTTGATTCTTCTGCTATTTTAGCCGAAATT
GCAATCGTAACTGCCCCGAAAGATGACCAGGGTCAACAAATGAATCGGATGCTCTCGGCT
GACCTGAAGCACACCTGGAGTCTACTTTCTAAACAGTATACAGAGCATTATGAAGAGTGC
ATAGAGAGTATTCTGAATAAGGAAAAAGCGGACAAGTTTGACTACGAGGGTTTATGTGAA
GCACTAGAGCAGCTGTCAGAGTTTGAGAAAAAGGCAAACGATCGAGTGATCGAGTCTGGT
GTACTCAAGGGCCTGAATCTCGATGACATCAAGCGAGTTGGGGAAAGGTTAATTCTTCAA
GATGGCTGCATCAATGTCTTCCAGAAAATTTTGAAGACTCAGGATGTGAATGCAAAACTC
CACGTGCTTTCGTATTGTTGGTGTGGTGACCTCATCAGAGCAGCCTTTTCTGCACGGGGA
GTAGATGCAGTGGAAGTACATGCAAATGAATTCACGTTCGAGGAATCTATCTCTACTGGA
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GAAAACAGAAAGA

QA 1 673 1 673
DS 

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CCCAATCGACAAGGCTCAGCAGTTTAAGGGCATTCTAGAAAACAGAAAGAAGGAGGATAA
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AAACATAGGAATAGTGGTTGCCTCTAGCTCGAGCCTCAGGAGAGGGGGAAGCCATTTCGG
GGTCTCATTTGTGCCTTTGTTCTCTGGAATTGTGCAAAAACAGAAACAAGAAGAAACCTG
GAAGGGACTCTCTGGCACACTTTACACGGTATCAAGCTGGGCTGAAATACATTCCTTCGC
TCTTGGATGGGAGTAAACGGCAGAAGAAATATATGATTGAAGTTTGTATATACTGCCGGG
GGTGGCTAGTTTTTATCAAGGGCCACGTATAAGTTTCAGTCTTTCCCTTTGAAAGTTGTG
ACATGATGAACTTTGGTAAGTCTCGTCTTAGAATCTATGAGCTTCTGTTGCTTTGTTG

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL5507Contig1 792 2 2 U
GGTGCGATGCAATGCATAAGGAGATGGTGGGACGAATCAAACACCGATCACTTAGTCAAC
ATGGGGAAATACGTTTCGGCGATGGTTGCTGCCGGAGTCCGCATAACCTACGCAAGAGAA
AACACCACCCCGTGGTTAGCCGTCCTGCTGGTGAGCTCGGTCGTGGCCACGCTTTACCAG
TTATACTGGGACTTTGTCAAAGATTGGGGTCTTCTGAACCCTAAATCCAAAAACGCATGG
CTAAGGGACGATCTAGTTCTCAAGAACAAGAGCTACTACTATTTCTCCATTGTGTTGAAT
TTGTTAATGCGAGTTGCTTGGATCGAGACGATAGTAAGATTCAGAGTCAACCCTGTTCAG
TCTCATTTGGTAGATTTCTTATTGGCATCAGTTGAAGTCATTCGTCGAGGCCATTGGAAC
TTCTACAGAGTGGAGAATGAGCATTTGAACAACGTAGGCCACTTTAGGGCAGTGAAGACC
GTACCATTACCATTCCGTGACATGTATTCAGACGATTAAAGAAAGATAATAAAATGGAGA
GTCTAGTCTCGAACCAGGTTCCAGGAAGCATCTCGGAGAAACCTCTGGGGAAAAAATTGC
TTAACCATTTATCCTTAAAACAAACAGAAGAGGGGACTACTGGATTTTTGATTTTATTAA
ACTTTGAAAGTGCAAAGACAATTTAACTTGCCAGTTCATAATATTAATTTTCTGTAAATT
TTGATTTGAGGTTTATGTTCAACTTTTCTTTTCTTTTTTAATAAAACTGTCGCTATATTT
TTTATGCTTAGG


BQ
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AF RR4E301TF U 1
AF RR4E301JQ C 113
BS 1 596 RR4E301TF
BS 597 792 RR4E301JQ

RD RR4E301TF 596 0 0
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ATGGGGAAATACGTTTCGGCGATGGTTGCTGCCGGAGTCCGCATAACCTACGCAAGAGAA
AACACCACCCCGTGGTTAGCCGTCCTGCTGGTGAGCTCGGTCGTGGCCACGCTTTACCAG
TTATACTGGGACTTTGTCAAAGATTGGGGTCTTCTGAACCCTAAATCCAAAAACGCATGG
CTAAGGGACGATCTAGTTCTCAAGAACAAGAGCTACTACTATTTCTCCATTGTGTTGAAT
TTGTTAATGCGAGTTGCTTGGATCGAGACGATAGTAAGATTCAGAGTCAACCCTGTTCAG
TCTCATTTGGTAGATTTCTTATTGGCATCAGTTGAAGTCATTCGTCGAGGCCATTGGAAC
TTCTACAGAGTGGAGAATGAGCATTTGAACAACGTAGGCCACTTTAGGGCAGTGAAGACC
GTACCATTACCATTCCGTGACATGTATTCAGACGATTAAAGAAAGATAATAAAATGGAGA
GTCTAGTCTCGAACCAGGTTCCAGGAAGCATCTCGGAGAAACCTCTGGGGAAAAAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4E301JQ 680 0 0
CAAGAGAAAACACCACCCCGTGGTTAGCCGTCCTGCTGGTGAGCTCGGTCGTGGCCACGC
TTTACCAGTTATACTGGGACTTTGTCAAAGATTGGGGTCTTCTGAACCCTAAATCCAAAA
ACGCATGGCTAAGGGACGATCTAGTTCTCAAGAACAAGAGCTACTACTATTTCTCCATTG
TGTTGAATTTGTTAATGCGAGTTGCTTGGATCGAGACGATAGTAAGATTCAGAGTCAACC
CTGTTCAGTCTCATTTGGTAGATTTCTTATTGGCATCAGTTGAAGTCATTTGTCGAGGCC
ATTGGAACTTTTACAGAGTGGAGAATGAGCATTTGAACAACGTAGGCCACTTTAGGGCAG
TGAAGACCGTACCATTACCATTCCGTGACATGTATTCAGACGATTAAAGAAAGATAATAA
AATGGAGAGTCTAGTCTCGAACCAGGTTCCAGGAAGCATCTCGGAGAAACCTCTGGGGAA
AAAATTGCTTAACCATTTATCCTTAAAACAAACAGAAGAGGGGACTACTGGATTTTTGAT
TTTATTAAACTTTGAAAGTGCAAAGACAATTTAACTTGCCAGTTCATAATATTAATTTTC
TGTAAATTTTGATTTGAGGTTTATGTTCAACTTTTCTTTTCTTTTTTAATAAAACTGTCG
CTATATTTTTTATGCTTAGG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL5508Contig1 974 2 6 U
GGGACGTCTGTGATTGATTGTTATGTTCAAAACGAGGAGCTTGTGAGCGCGTTTGATCTG
TTCCGACAGCTTTTCTTGTCCTGTTTAAGACCAGAAGAGTATACAGTCTCGCTTATGATG
AGTGCTTGTGCTGATTTCGCTGCGTTGAGCTCAGGGGAGCAGGTTCAAGGGTATGCTATA
AAGAGTGGAATCGATGCTTTCACCAGCGTCAAGACCTCAAGCATCTCTATGTACGCAAAG
TCAGGTAACATGACGCTCGCGAGTAATATATTCACCGAGGTAGAACATCCAGACGTTGCA
ACATACTCAGCTATGATCTCGTGTCTTGCGCAGCACGGTTTCGCTAGCGACGCCCTAGAC
CTCTTCGAGACGATGAAAAACCGTGGGTTCAAACCGAGCCAGCAGGCGTTTCTCGCTGTT
CTAATAGCTTGCTGCCACGGAGGGTTAGTCACACAAGGACTAAACTACTTCCAAACCATG
TGGGACGAGTACAGGATTAGCCCTAACGAGAAGCATTTCACTTGCCTCGTCGACCTCTTA
GGTAGAACAGGGAGGTTATCAGAGGCCGAGAGGCTGATTCTGAGCTCAGGGTTTCAAGAC
CATCCGGCGATGTGGAAAGCGTTGCTGAGCTCTTGCAGGGTTTAAAAGGACAGCGTGTTG
GGGAGACGCGTCGCGGAGAGGTTGATGGAGCTCGAACCAGAAGCCTCTGGCTCGTATGTT
TTGCTGCACAACATCTACAACGAGTCCGGAGTTAATTTTTGTGGTGAAGAGGTGAGAGAG
CTGATGAGAGATCGTGGGGTTAAGAAAGAACCGGCTTTGAGCTGTATTGTGATTGGTAGA
CAAGCTCATTGGTTTGCGGTTGCTGATTCTTCTCACTCGTCGAGCCAGATGATTTATGCG
ATGCTGCAACAGCAGTTGGATACTATGAACCGTGTAGACCATGAGACTCTTGTTAATGCT
TGTTCTGTTACGTG


BQ
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AF RR4FX57TF U 1
AF RR4FX57JQ C 208
BS 1 639 RR4FX57TF
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TTCCGACAGCTTTTCTTGTCCTGTTTAAGACCAGAAGAGTATACAGTCTCGCTTATGATG
AGTGCTTGTGCTGATTTCGCTGCGTTGAGCTCAGGGGAGCAGGTTCAAGGGTATGCTATA
AAGAGTGGAATCGATGCTTTCACCAGCGTCAAGACCTCAAGCATCTCTATGTACGCAAAG
TCAGGTAACATGACGCTCGCGAGTAATATATTCACCGAGGTAGAACATCCAGACGTTGCA
ACATACTCAGCTATGATCTCGTGTCTTGCGCAGCACGGTTTCGCTAGCGACGCCCTAGAC
CTCTTCGAGACGATGAAAAACCGTGGGTTCAAACCGAGCCAGCAGGCGTTTCTCGCTGTT
CTAATAGCTTGCTGCCACGGAGGGTTAGTCACACAAGGACTAAACTACTTCCAAACCATG
TGGGACGAGTACAGGATTAGCCCTAACGAGAAGCATTTCACTTGCCTCGTCGACCTCTTA
GGTAGAACAGGGAGGTTATCAGAGGCCGAGAGGCTGATTCTGAGCTCAGGGTTTCAAGAC
CATCCGGCGATGTGGAAAGCGTTGCTGAGCTCTTGCAGG*TTTAAAAG*ACAGCGTGTTG
GGGAGACGCGTCGCGGAGAGGTTGATGGAGCTCGAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FX57JQ 767 0 0
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ATATTCACCGAGGTAGAACATCCAGACGTTGCAACATACTCAGCTATGATCTCGTGTCTT
GCGCAGCACGGTTTCGCTAGCGACGCCCTAGACCTCTTCGAGACGATGAAAAACCGTGGG
TTCAAACCGAGCCAGCAGGCGTTTCTCGCTGTTCTAATAGCTTGCTGCCACGGAGGGTTA
GTCACACAAGGACTAAACTACTTCCAAACCATGTGGGACGAGTACAGGATTAGCCCTAAC
GAGAAGCATTTCACTTGCCTCGTCGACCTCTTAGGTAGAACAGGGAGGTTATCAGAGGCC
GAGAGGCTGATTCTGAGCTCAGGGTTTCAAGACCATCCGGCGATGTGGAAAGCGTTGCTG
AGCTCTTGCAGGGTTTACAAGGACAGCGTGTTGGGGAGACGCGTCGCGGAGAGGTTGATG
GAGCTCGAACCAGAAGCCTCTGGCTCGTATGTTTTGCTGCACAACATCTACAACGAGTCC
GGAGTTAATTTTTGTGGTGAAGAGGTGAGAGAGCTGATGAGAGATCGTGGGGTTAAGAAA
GAACCGGCTTTGAGCTGTATTGTGATTGGTAGACAAGCTCATTGGTTTGCGGTTGCTGAT
TCTTCTCACTCGTCGAGCCAGATGATTTATGCGATGCTGCAACAGCAGTTGGATACTATG
AACCGTGTAGACCATGAGACTCTTGTTAATGCTTGTTCTGTTACGTG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5509Contig1 779 2 2 U
GGAAGGCCAAGGACAGTATCGGGATTAGGTCTGGTGTCGGTAAGATGAGGAACCGTCGTT
ACGTTTGTCGGAAAGGTCCTCTTGTTGTGTACGGAACCGAGGGAGCTAAGATTGTGAAAG
CGTTTAGGAACATTACTGGTGTTGAGCTTTGTCATGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGT
TAGCTCCTGGTGGTCATCTCGGGAGGTTTGTGATCTGGACTAAGTCTGCTTTTGAGAAGC
TCGAGTCTATCTATGGATCGTTTGAGAAGCCATCTGAGATGAAGAAGGGTTATGTTTTGC
CTCGTGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGGCTAGGATTACTAACTCTGATGAGGTTCAGA
GTGTGGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCGAAGAGAGCTGTGCTTAAGAAGAACCCGTTGA
AGAACCTTAACGTGATGCTTAAGTTGAATCCGTATTCTAAGACGGCAAAGAGGATGTCTC
TGTTGGCTGAAGCGCAGAGGGTTAAATCGAAGAAGGAGAAGCTCGAGAAGAAGAGGAAAC
CCGTCACGAAGGAGGAGTCACAAGCTATTAAAGCTGCAGGCAAGGCGTGGTACAAGACTA
TGATCTCAGACAGTGATTACACAGAGTTTGATAACTTCACCAAGTGGCTTGGAGCCAGTC
AGTAGTTCTATCCGGTTTAGGCAAAGATTTTTGGTTATTACTTTATGTTATTCATTTTTC
TTGGATTTCATCTCTGGAGTTGTTATTTCTTTGAATTTAAAGAGTATGAGCATGTTTTT


BQ
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AF RR4C370TF U 1
AF RR4C370JQ C 9
BS 1 483 RR4C370TF
BS 484 779 RR4C370JQ

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ACGTTTGTCGGAAAGGTCCTCTTGTTGTGTACGGAACCGAGGGAGCTAAGATTGTGAAAG
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TCGAGTCTATCTATGGATCGTTTGAGAAGCCATCTGAGATGAAGAAGGGTTATGTTTTGC
CTCGTGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGGCTAGGATTACTAACTCTGATGAGGTTCAGA
GTGTGGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCGAAGAGAGCTGTGCTTAAGAAGAACCCGTTGA
AGAACCTTAACGTGATGCTTAAGTTGAATCCGTATTCTAAGACGGCAAAGAGGATGTCTC
TGT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4C370JQ 771 0 0
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CGGAAAGGTCCTCTTGTTGTGTACGGAACCGAGGGAGCTAAGATTGTGAAAGCGTTTAGG
AACATTACTGGTGTTGAGCTTTGTCATGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGTTAGCTCCT
GGTGGTCATCTCGGGAGGTTTGTGATCTGGACTAAGTCTGCTTTTGAGAAGCTCGAGTCT
ATCTATGGATCGTTTGAGAAGCCATCTGAGATGAAGAAGGGTTATGTTTTGCCTCGTGCG
AAGATGGTGAACGCTGATTTGGCTAGGATTACTAACTCTGATGAGGTTCAGAGTGTGGTG
AAGCCGATTAAGAAGGATGCGAAGAGAGCTGTGCTTAAGAAGAACCCGTTGAAGAACCTT
AACGTGATGCTTAAGTTGAATCCGTATTCTAAGACGGCAAAGAGGATGTCTCTGTTGGCT
GAAGCGCAGAGGGTTAAATCGAAGAAGGAGAAGCTCGAGAAGAAGAGGAAACCCGTCACG
AAGGAGGAGTCACAAGCTATTAAAGCTGCAGGCAAGGCGTGGTACAAGACTATGATCTCA
GACAGTGATTACACAGAGTTTGATAACTTCACCAAGTGGCTTGGAGCCAGTCAGTAGTTC
TATCCGGTTTAGGCAAAGATTTTTGGTTATTACTTTATGTTATTCATTTTTCTTGGATTT
CATCTCTGGAGTTGTTATTTCTTTGAATTTAAAGAGTATGAGCATGTTTTT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL5510Contig1 791 2 2 U
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AAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAAGCTACAGCTGGAAAATAAGGACTTGGTA
TCAAAGACCGTCCAAAGAAGATAGCTGGTGTACGTTACCAAGGGAAGAAAACATCTTTTG
ATAACAGTGATGATGATGATGATGATAATGATGATGATGAAGAGGAAGAAGAAGAGAGTG
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AAGAGAGTGAAGAAGAAGACGACAAGGACTCTGTTACTGAAAACTCTCTCCCAGCAAAAA
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TTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATGAAGCTCAAACAGCTTAAATCTATGATTG
ACGAACAAGCACCATCAATTCTCTCAGAGTTCTCTTCAAGGAAAGATGCTATTACTTACT
TGAAACTTAAGCTGGAGCTAAGTGACAAGTTTATTGTGGAGGGAAAAAAAATCAGTCTCG
TATCAAAAAAGAAGTGAGTGAGGACAAATATCATTATACCTGCCTGCGTTGGAAAGTGGA
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CAAGATGTGTTTTATAATCTATTCATACATTATATGAGAGTTACGCATAAAACTCCACAA
TAATCTCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB35TF U 1
AF RR4EB35JQ C 188
BS 1 662 RR4EB35TF
BS 663 791 RR4EB35JQ

RD RR4EB35TF 662 0 0
GGTCCGGCAAAAAGAAATCATCCAAGTCTAAGGAGAGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATT
AAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAAGCTACAGCTGGAAAATAAGGACTTGGTA
TCAAAGACCGTCCAAAGAAGATAGCTGGTGTACGTTACCAAGGGAAGAAAACATCTTTTG
ATAACAGTGATGATGATGATGATGATAATGATGATGATGAAGAGGAAGAAGAAGAGAGTG
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AAGAGAGTGAAGAAGAAGACGACAAGGACTCTGTTACTGAAAACTCTCTCCCAGCAAAAA
GGAAGCGTGATGAAATCGTTGAACCCAAAATCAAGTTGAAGAACCTATGCAAGCAGATTC
TTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATGAAGCTCAAACAGCTTAAATCTATGATTG
ACGAACAAGCACCATCAATTCTCTCAGAGTTCTCTTCAAGGAAAGATGCTATTACTTACT
TGAAACTTAAGCTGGAGCTAAGTGACAAGTTTATTGTGGAGGGAAAAAAAATCAGTCTCG
TATCAAAAAAGAAGTGAGTGAGGACAAATATCATTATACCTGCCTGCGTTGGAAAGTGGA
GA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4EB35JQ 604 0 0
TGATGATGATGATGATGATAATGATGATGATGAAGAGGAAGAAGAAGAGAGTGACGAGGA
TGATGACAAGGACTCTGTCATCGAAAATTCTCTCCAAGCAAAAAGGAAGCGAGAAGAGAG
TGAAGAAGAAGACGACAAGGACTCTGTTACTGAAAACTCTCTCCCAGCAAAAAGGAAGCG
TGATGAAATCGTTGAACCCAAAATCAAGTTGAAGAACCTATGCAAGCAGATTCTTAAAAA
GGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATGAAGCTCAAACAGCTTAAATCTATGATTGACGAACA
AGCACCATCAATTCTCTCAGAGTTCTCTTCAAGGAAAGATGCTATTACTTACTTGAAACT
TAAGCTGGAGCTAAGTGACAAGTTTATTGTGGAGGGAAAAAAAATCAGTCTCGTATCAAA
AAAGAAGTGAGTGAGGACAAATATCATTATACCTGCCTGCGTTGGAAAGTGGAGATTAGG
GCAAGTTTTGTTACTAATCAACATCAGTATGTATAACAAGTAGCATCCTTTTTCAAGATG
TGTTTTATAATCTATTCATACATTATATGAGAGTTACGCATAAAACTCCACAATAATCTC
TTCT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL5511Contig1 901 2 4 U
GGGTATTGTCTTTATCAACCTACCCCTGAAACGTCCCTCTGCCTTCTGCTTCTCTCTCAT
ATTGTCAGCCCATAAATCTTTTTTAGTCGTTGTCGTCGCTTCAAATCTCTCTTTTATCTT
TTCATAAAGATTTGCATCTTCAAGTAACTTCTTTTGCAGAAATGAAGTCCGTTGGAAACT
GCTCAGGTACTCATGTATATGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGA
TGGCTTTTGCTCAAGAATTATCATCTCAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGT
TCAAAGAACAGGAAGAGTGCGAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTAT
GTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACCCATCGCAAGAATGATCGAGTTTGTGTTCAACA
AGAGCGGAGATTCCTCAGAATCTGACTCAAGTCCTCAAGGTTATAATGGCAATAGAACTT
ATATGTATCGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCTC
AAGAATCATCATCTCAGGTAACGGTGGAGAACTCACAAGATAACGATTTCAAACAGATCG
ATGACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAGGATGATATTGGAGAGGTGTGTTGTGTTTGTG
GACTCATCAAGAGACACATCGCAAGAATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGGACGACATGT
TATTGCTTTAGACAAGCCGAAGTGGAGTGGCTAGGGTTATTTGGTAATCTAGCATCATAT
GTGTTAATCTCTAGTATCTTCTGCGTAGGATTAGACATGATAATGGTTTCTTCTTCCTCC
TCTCTTAAAGATCATGAAACGCTTTGTTCTGCCACACAAGAATAATATCATTTCCTCGCG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DO56TF U 1
AF RR4DO56JQ C 158
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BS 631 641 RR4DO56TF
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RD RR4DO56TF 641 0 0
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TGGCTTTTGCTCAAGAATTATCATCTCAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGT
TCAAAGAACAGGAAGAGTGCGAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTAT
GTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACCCATCGCAAGAATGATCGAGTTTGTGTTCAACA
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ATATGTATCGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCTC
AAGAATCATCATCTCAGGTAACGGTGGAGAACTCACAAGATAACGATTTCAAACAGATCG
ATGACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAG*ATGATATTGGA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4DO56JQ 744 0 0
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AGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTTGCTCAAGAATTATCATCTCAGGTGACGGT
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CAGGGATGATACTGGAGAAGTATGTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACCCATCGCAAG
AATGATCGAGTTTGTGTTCAACAGGAGCGGAGATTCCTCAGAATCTGACTCAAGTCCTCA
AGGTTATAATGGCAATAGAACTTATATGTATCGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACT
TTGGAGGGAGATGGCTTTCGCTCAAGAATCATCATCTCAGGTAACGGTGGAGAACTCACA
AGATAACGATTTCAAACAGATCGATGACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAGGATGATAT
TGGAGAGGTGTGTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACACATCGCAAGAATGATCGAGTT
TGTGTTCAACAAGGACGACATGTTATTGCTTTAGACAAGCCGAAGTGGAGTGGCTAGGGT
TATTTGGTAATCTAGCATCATATGTGTTAATCTCTAGTATCTTCTGCGTAGGATTAGACA
TGATAATGGTTTCTTCTTCCTCCTCTCTTAAAGATCATGAAACGCTTTGTTCTGCCACAC
AAGAATAATATCATTTCCTCGCGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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TCGCCAGCTTTCAGTCTGACATTTGCTCACTTCTTTGCCTTTGACTAAAACAACAGCTAT
CTCGAGCATATGTTTTATTTTCTACTCAATACTCGGCCTACACAGACTCATGCTTCTCCT
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CGTGTGATAAGCTTGGTATTTTTTTTTGATCATGTTCAGTTCATAATCTT


BQ
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AF RR4DR46JQ U 1
AF RR4DO79JQ U 1
BS 1 530 RR4DO79JQ

RD RR4DR46JQ 477 0 0
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AA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4DO79JQ 530 0 0
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TGGGTTGGATCGCCCGGATAATAGCTTTTGACAGTTTCGTCTTAACCAATACTTCATCTA
TGAAGTCTCTTCATTATCTTAGGAAGACTGGCTAGATTCACCTGACCTTCTCAACCAGAA
TTCATCTCCACATGGAGACAATATGTTGGATGTCGGATTCAGTGGCAATAGGTCCTTCTT
TCGCCAGCTTTCAGTCTGACATTTGCTCACTTCTTTGCCTTTGACTAAAACAACAGCTAT
CTCGAGCATATGTTTTATTTTCTACTCAATACTCGGCCTACACAGACTCATGCTTCTCCT
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CGTGTGATAAGCTTGGTATTTTTTTTTGATCATGTTCAGTTCATAATCTT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL5513Contig1 772 2 5 U
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TGGTCATAATGTTCCTGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGACCATGACGGACGTGCCAT
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TCGCCAGTAACGACAGCGACGTGAAGCCGGCGAAGAAGAAAGCTCATGGTTCAACGTCCT
CTTACAGATACTATGACTACGTTTCTGGTTTTCTTCACCACGCCACTATCAAAGGACTCG
AGTATGATACTAAGTACATCTATGAGGTTGGTACCCATAAATCCGTTAGACAGTTTCACT
TTACGACTCCTCCCAAGAGTTGGACCTGATGTTCCCTACACATTCGGGATTATTGGTGAT
CTTGGACAAACATATGCTTCTAACGAGACATTGTACCATTACATGTCGAACCCTAAAGGC
CAAGCCGTTCTCTTTGCCGGAGACTTGTCTTACGCAGACGACCATCCAAACCATGACCAG
AGAAAGTGGGATACATGGGGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTACCAGCCATTTATC
TATGCCGCTGGGAATCACGAGATAGATTTCGCTCCGGAGATTGATGAGACTC


BQ
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AF RR4GU32TF U 186
AF RR4AH01TF U 1
BS 1 275 RR4AH01TF
BS 276 276 RR4GU32TF
BS 277 497 RR4AH01TF
BS 498 498 RR4GU32TF
BS 499 772 RR4AH01TF

RD RR4GU32TF 484 0 0
ATAATGTTCCTGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGACCATGACGGACGTGCCATGATCG
TCTCGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGAGTTCCAACGTCGTTACTTACTGGATCGCC
AGTAACGACAGCGACGTGAAGCCGGCGAAGAAGAAAGCTCATGGTTCAACGTCCTCTTAC
AGATACTATGACTACGTTTCTGGTTTTCTTCACCACGCCACTATCAAAGGACTCGAGTAT
GATACTAAGTACATCTATGAGGTTGGTACCCATAAATCCGTTAGACAGTTTCACTTTACG
ACTCCTCCCAAGAGTTGGACCTGATGTTCCCTACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGG
ACAAACATATGCTTCTAACGAGACATTGTACCATTACATGTCGAACCCTAAAGGCCAAGC
CGTTCTCTTTGCCGGAGACTTGTCTTACGCAGACGACCATCCAAACCATGACCAGAGAAA
GTGG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4AH01TF 772 0 0
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CCTACTCTCCCTCTTTCTCCTGAGCATCAGCACCTTAATCAATGCTGGATTAACCAGCAA
ATACGTACGTCAAGCGCTACCATCGATTGAAATGTCTCTTGAAACGTTTCCTTCACCTTC
TGGTCATAATGTTCCTGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGACCATGACGGACGTGCCAT
GATCGTCTCGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTG*GTTCCAACGTCGTTACTTACTGGA
TCGCCAGTAACGACAGCGACGTGAAGCCGGCGAAGAAGAAAGCTCATGGTTCAACGTCCT
CTTACAGATACTATGACTACGTTTCTGGTTTTCTTCACCACGCCACTATCAAAGGACTCG
AGTATGATACTAAGTACATCTATGAGGTTGGTACCCATAAATCCGTTAGACAGTTTCACT
TTACGACTCCTCCCAAG*GTTGGACCTGATGTTCCCTACACATTCGGGATTATTGGTGAT
CTTGGACAAACATATGCTTCTAACGAGACATTGTACCATTACATGTCGAACCCTAAAGGC
CAAGCCGTTCTCTTTGCCGGAGACTTGTCTTACGCAGACGACCATCCAAACCATGACCAG
AGAAAGTGGGATACATGGGGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTACCAGCCATTTATC
TATGCCGCTGGGAATCACGAGATAGATTTCGCTCCGGAGATTGATGAGACTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5514Contig1 982 2 4 U
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CTTCTTGCTGAACACGATTAGATGATCTGCTGGCTGTTCTATGTTAATCCTCCTTCTCAA
AGTTTTAATCTTTTCCCGAGAAAATTCGAATTCTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACGC
CGCCACTGAGTAGGAGGGATTAAAGCTCAAACCTTTATGGTGGATTTGGATTGTATTTGA
CATGAATTAGGAAAGAAAAAGGAAGAATCTATTTTTATTGGATTTTGGGGGATATACTAC
TTTCCATATCTTTGTTGTTTCTGATGGATACGATTCGTGGAGAGGCCAATGGATGTAGTA
ATAATAAGGCTCTTGTTGTTAGTCTAAAGAGCAGTGAGAATGAGGATCAGGTTTCTGAGG
AAGAAAGTGAGTCACAGTGTTTATTGCCGCCTCCTAATCCTAGGAAAGGAGGGATGTCTA
GAAGTAATGACAAGATTAAGAGGACTGTCCAGTGGAATGACAACAAAGGTGACAATCTCG
CTCAGGTTTTGGTTTATGAACCAAGTGAAGTAAGCGATACAGATGACGATGATTCAGATT
CCTGCATCTGCACTATTATGTAGCCCCCTCTCAACCAACCAACCACCATTTAACATTGGA
GTTTAACAATGAGCTCGTCTTTGTTATCTGGCTTCTTTTCAGCAAGACGAACCAACTTAA
GCGACTGGACATCAATCACCAATCAGGCAGCTTTCTGATTTTGTTTTCAGAATGAGGGAT
GTAGTAGACTCATAAAAGCTTATACCAGATCATCACATTTCAGTTACAGGAGTGAGAGTA
TATAGATTATAGATTACTGCTGTATTTTCCAATAGAGTGCTGTTTGATTTTGATGACAGG
TTTTGACAGTAAACTATGTATGTCTTTTACTGCAACAACACAAGCTAAATTCAATTGTAA
ACAATGTGCAGCCATTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G734TF U 1
AF RR4G734JQ C 272
BS 1 746 RR4G734TF
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BS 762 982 RR4G734JQ

RD RR4G734TF 766 0 0
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GTTTT

QA 1 761 1 761
DS 

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ATAGAGTGCTGTTTGATTTTGATGACAGGTTTTGACAGTAAACTATGTATGTCTTTTACT
GCAACAACACAAGCTAAATTCAATTGTAAACAATGTGCAGCCATTATATAC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

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TGTATGTGCGCTTTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AQ41JQ C 1
AF RR4AQ41TF U 1
BS 1 496 RR4AQ41TF

RD RR4AQ41JQ 496 0 0
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CTGAGGAAAAAAGTGAAAAGAAGTATCCAAAGTATGTGTTTGGAGATTATATGGATGTCT
ATGCAAACCAGAAGTTCATGCCTAAAGAACCTCGTTTTCTAGCTGTAAAGACTCTCTAAA
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GCCGAGTTTAATAATTGATAATTTGGCATCTGCTTTTCTGGTTTTCATTTTTTCTTCTCT
TTTTTTTTATTGTAATTTTGAATCTTTGTTGTTACTTGTGATCCAGTTTTTGAATATAAA
TGTATGTGCGCTTTTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4AQ41TF 496 0 0
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CTGAGGAAAAAAGTGAAAAGAAGTATCCAAAGTATGTGTTTGGAGATTATATGGATGTCT
ATGCAAACCAGAAGTTCATGCCTAAAGAACCTCGTTTTCTAGCTGTAAAGACTCTCTAAA
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GCCGAGTTTAATAATTGATAATTTGGCATCTGCTTTTCTGGTTTTCATTTTTTCTTCTCT
TTTTTTTTATTGTAATTTTGAATCTTTGTTGTTACTTGTGATCCAGTTTTTGAATATAAA
TGTATGTGCGCTTTTC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL5516Contig1 915 2 2 U
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AACATGTCGAGAAACAATATTAAGCTGCTGCAATGCGTGTCGTCTTTTTTATTCGCCGTC
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TTCGAGTCAGATATAATCAGATGCAAAGATGGCTCCAAATGGTTCCCTAGAGAACGTCTC
AACGACAACTTCTGCGACTGTCTCGACGGTACCGATGAGCCTGGAACTTCGGCTTGTCCG
AACGGCAAATTCTACTGTCGGAATACAGGAAGTTCTCCAAAGTTTGTTTACTCTTCTCGT
GTGAACGATCGAATCTGTGATTGTTGCGATGGAAGTGTCGAGTACGAGAGTAGCATTACT
TGTCCCAACACGTGTATAATGGGCGGTAACGTTAACTACGTCTACAAACCTAGAACCGAC
CGTAAATCTATCGACAGGCAACTCGGTTCTGCGACAACCGATCCAAACAGATCAGTAACC
ATAGCGAATCTTCAAGACATTGTCAAGAATCTCCAAGGTATGAAACTTGTTTTCGCAGTT
CAGATGGTTTTGATCGGTTTCTTGGTGATCTTGTGGATGCTTAGGCGTCGTGCTCGGTCT
TTTAAGAGAAGACGTTATCTGTTGAAGAGTGTTCATCTCAATAGATCAGGGTAACTAACT
CTAGGGAACTCTTTGATCCATACATAAGTCAGTTTCTTGAGTCTTTTACGCAAATTTTAA
TCACTGCTTTCATTTGTTGTTCGGACAAGAAAATACATGTTTAAAATTAGAATCATGGAG
CGGACAAAAACTTGTGTGATCGCGTATATTATTGTACACACGTAAAACAATGTACGAAAT
AAGGAAGGTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H689TF U 1
AF RR4H689JQB C 231
BS 1 555 RR4H689TF
BS 556 915 RR4H689JQB

RD RR4H689TF 555 0 0
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GTCTCCGTCAATTCCTCAACCACTCCCCTCGTCGGAGTTCATCCATTAGATGAGAAATAC
TTCGAGTCAGATATAATCAGATGCAAAGATGGCTCCAAATGGTTCCCTAGAGAACGTCTC
AACGACAACTTCTGCGACTGTCTCGACGGTACCGATGAGCCTGGAACTTCGGCTTGTCCG
AACGGCAAATTCTACTGTCGGAATACAGGAAGTTCTCCAAAGTTTGTTTACTCTTCTCGT
GTGAACGATCGAATCTGTGATTGTTGCGATGGAAGTGTCGAGTACGAGAGTAGCATTACT
TGTCCCAACACGTGTATAATGGGCGGTAACGTTAACTACGTCTACAAACCTAGAACCGAC
CGTAAATCTATCGACAGGCAACTCGGTTCTGCGACAACCGATCCAAACAGATCAGTAACC
ATAGCGAATCTTCAA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4H689JQB 685 0 0
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GGCTTGTCCGAACGGCAAATTCTACTGTCGGAATACAGGAAGTTCTCCAAAGTTTGTTTA
CTCTTCTCGTGTGAACGATCGAATCTGTGATTGTTGCGATGGAAGTGTCGAGTACGAGAG
TAGCATTACTTGTCCCAACACGTGTATAATGGGCGGTAACGTTAACTACGTCTACAAACC
TAGAACCGACCGTAAATCTATCGACAGGCAACTCGGTTTTGCGACAACCGATCCAAACAG
ATCAGTAACCATAGCGAATCTTCAAGACATTGTCAAGAATCTCCAAGGTATGAAACTTGT
TTTCGCAGTTCAGATGGTTTTGATCGGTTTCTTGGTGATCTTGTGGATGCTTAGGCGTCG
TGCTCGGTCTTTTAAGAGAAGACGTTATCTGTTGAAGAGTGTTCATCTCAATAGATCAGG
GTAACTAACTCTAGGGAACTCTTTGATCCATACATAAGTCAGTTTCTTGAGTCTTTTACG
CAAATTTTAATCACTGCTTTCATTTGTTGTTCGGACAAGAAAATACATGTTTAAAATTAG
AATCATGGAGCGGACAAAAACTTGTGTGATCGCGTATATTATTGTACACACGTAAAACAA
TGTACGAAATAAGGAAGGTTTTTGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5518Contig1 1019 2 8 U
GGAATATCAACTCACCACACTTATTTTCTCACTCTTTCTTTTATATTCATCTCTCTCTAG
CTAAAATTATATAAATCTCGAACGTGTGGATATATAAATAATAACAAAATGGAAAAAATA
GGAGGAATAAGTAGTGGAGGTACGGGATCATCAGGGAAGCAGAGGTGCGAAAAGGACCGT
GGACGATGGAAGAAGATCTTATTCTTATCAATTATATTGCCAACCACGGCGATGGCGTTT
GGAACACTCTCGCCAAATCTGCAGGTCTCAAACGCACCGGAAAAAGTTGCCGGCTCCGGT
GGCTCAACTATCTCCGCCCTGACGTACGACGTGGAAACATCACGCCGGAGGAACAGCTCA
CCATCATGGAACTTCATGCTAAGTGGGGAAACAGGTGGTCGAAAATCGCTAAACACCTTC
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AACAAACCGATGTGACAGCAACAACAACGTCCTCCGTTGGATCTCATCACAGCTCAGAAA
TCAACGATCAAGCTGCAAGTACGTCGAACCATAATGTTTTTTTGTACACAAGATCAAGCG
ATGGAGACATATTCTCCTTCAACTATGTCCTATCAACATACCAACATGGATTTCAACTAT
AGTAACTACTCTGCGTCTGCGGTTACTGGGACTGCGACTGCAACGGCAGATTATTCAATT
CCAATGACTGTTGATGATCAAACCGGTGAAAACTATTGGGGCATGGATGATATTTGGTCA
TCAATGCATTTGCTCAATGGTAATTGATTAGTCAAGATGGATCAGAAATATGGAATATTA
CTTTGAGATTTGTGATTTTTAGGATTACTGTAATTAGTAAGTGACATGTATATGGTTTTT
GCCTCGTTGCTTAGAGGTTTGGGGATATAATTTATATGTAATATTAATGATCTAAATCCT
TGATATATATTTGAACTCCGTTTGATGTTATACATAAATAAAACTGGAAGGGGTCATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GE51TF U 1
AF RR4GE51JQ C 260
BS 1 681 RR4GE51TF
BS 682 682 RR4GE51JQ
BS 683 741 RR4GE51TF
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RD RR4GE51TF 769 0 0
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CTAAAATTATATAAATCTCGAACGTGTGGATATATAAATAATAACAAAATGGAAAAAATA
GGAGGAATAAGTAGTGGAGGTACGGGATCATCAGGGAAGCAGAGGTGCGAAAAGGACCGT
GGACGATGGAAGAAGATCTTATTCTTATCAATTATATTGCCAACCACGGCGATGGCGTTT
GGAACACTCTCGCCAAATCTGCAGGTCTCAAACGCACCGGAAAAAGTTGCCGGCTCCGGT
GGCTCAACTATCTCCGCCCTGACGTACGACGTGGAAACATCACGCCGGAGGAACAGCTCA
CCATCATGGAACTTCATGCTAAGTGGGGAAACAGGTGGTCGAAAATCGCTAAACACCTTC
CAGGAAGAACCGACAACGAAATCAAGAATTTCTGGAGGACAAGAATCCAAAAATACATTA
AACAAACCGATGTGACAGCAACAACAACGTCCTCCGTTGGATCTCATCACAGCTCAGAAA
TCAACGATCAAGCTGCAAGTACGTCGAACCATAATGTTTTTTTGTACACAAGATCAAGCG
ATGGAGACATATTCTCCTTCAACTATGTCCTATCAACATACCAACATGGATTTCAACTAT
AGTAACTACTCTGCGTCTGCG*TTACTGGGACTGCGACTGCAACGGCAGATTATTCAATT
CCAATGACTGTTGATGATCAA*CCGGTGAAA*CTATTGGGGCATGGATG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4GE51JQ 760 0 0
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TGACGTACGACGTGGAAACATCACGCCGGAGGAACAGCTCACCATCATGGAACTTCATGC
TAAGTGGGGAAACAGGTGGTCGAAAATCGCTAAACACCTTCCAGGAAGAACCGACAACGA
AATCAAGAATTTCTGGAGGACAAGAATCCAAAAATACATTAAACAAACCGATGTGACAGC
AACAACAACGTCCTCCGTTGGATCTCATCACAGCTCAGAAATCAACGATCAAGCTGCAAG
TACGTCGAACCATAATGTTTTTTTGTACACAAGATCAAGCGATGGAGACATATTCTCCTT
CAACTATGTCCTATCAACATACCAACATGGATTTCAACTATAGTAACTACTCTGCGTCTG
CGGTTACTGGGACTGCGACTGCAACGGCAGATTATTCAATTCCAATGACTGTTGATGATC
AAACCGGTGAAAACTATTGGGGCATGGATGATATTTGGTCATCAATGCATTTGCTCAATG
GTAATTGATTAGTCAAGATGGATCAGAAATATGGAATATTACTTTGAGATTTGTGATTTT
TAGGATTACTGTAATTAGTAAGTGACATGTATATGGTTTTTGCCTCGTTGCTTAGAGGTT
TGGGGATATAATTTATATGTAATATTAATGATCTAAATCCTTGATATATATTTGAACTCC
GTTTGATGTTATACATAAATAAAACTGGAAGGGGTCATCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL5519Contig1 917 2 2 U
GCACACCTCCTCCTCCTCACTTCACAGCCGCAGACCCTTGGAAGGATTTTCCGGCTGTCC
TTCCGTGACCGAGCTTCTGGCGGTCGTGGGCCTCGATGACCTCACTGACAAAGCTCTGTT
CCTTCCCCATCCCGGTGGATCGGATCAGACCCCTCCGCAGATCGTTTGCCTTAACGACCT
GGTTGCTTCGGACGGGTCAAGTCACAATTACCGGGCCATGGATGTTCCTCCTCTTCCTAA
GAATCGCCATGCCACATGCGGGAGACACAAAGAGGAGATGATCAGACAACTCCGTGAACT
TTCAAGATCCGAACCTAGTTGTATGAAATACGAGACCCTAGATGCTGAACTCGACACCTC
CGGATCCCTATTTCTAGAACCGGGAAACGATCTGTTTTCTTCTACATTTGAATCTCAGGT
GAGTGGACTGAAATGGTTAGAGGATCAACAAGCAGACTATTATCTGTATTCAGATGATAA
TAATGTGAACCGGGGAGGCTGCACTCAACAACAACAAGAACAAGCGTCATCGCCGGTGAT
GGTTCCGGTTTCCACTAGTACTGCAACAAGGTCGACACATGAGATCAATAGTCTCGAGAG
AAACTCTGCTCTCTCTCGCTACAAAGCCAAGAAGAAATCTCGAAGGTACGAGAAGCACAT
CAGATATGAATCGCGGAAAGTTCGTGCAGAAAGTAGGACAAGAATCAGAGGACGTTTCGC
TAAGTCAGATCCATAATATAGATAGTTGAGTATGATAGCGAGTTTGTGAGAGTGGGTTTG
CTTAGTTTCGTATCAGGTATTTGATTGTAATGTCTCATACAGAAACCAATCATGGTCTTG
TATAAATCGAAGCACTATAATGAATATATATGTCTACTATGATTATAATTGAGTCAATTT
TAACCTAGGAGCCACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DX01TF U 1
AF RR4DX01JQ C 139
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BS 635 917 RR4DX01JQ

RD RR4DX01TF 634 0 0
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TTCCGTGACCGAGCTTCTGGCGGTCGTGGGCCTCGATGACCTCACTGACAAAGCTCTGTT
CCTTCCCCATCCCGGTGGATCGGATCAGACCCCTCCGCAGATCGTTTGCCTTAACGACCT
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TTCAAGATCCGAACCTAGTTGTATGAAATACGAGACCCTAGATGCTGAACTCGACACCTC
CGGATCCCTATTTCTAGAACCGGGAAACGATCTGTTTTCTTCTACATTTGAATCTCAGGT
GAGTGGACTGAAATGGTTAGAGGATCAACAAGCAGACTATTATCTGTATTCAGATGATAA
TAATGTGAACCGGGGAGGCTGCACTCAACAACAACAAGAACAAGCGTCATCGCCGGTGAT
GGTTCCGGTTTCCACTAGTACTGCAACAAGGTCGACACATGAGATCAATAGTCTCGAGAG
AAACTCTGCTCTCTCTCGCTACAAAGCCAAGAAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4DX01JQ 779 0 0
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AAGTCACAATTACCGGGCCATGGATGTTCCTCCTCTTCCTAAGAATCGCCATGCCACATG
CGGGAGACACAAAGAGGAGATGATCAGACAACTCCGTGAACTTTCAAGATCCGAACCTAG
TTGTATGAAATACGAGACCCTAGATGCTGAACTCGACACCTCCGGATCCCTATTTCTAGA
ACCGGGAAACGATCTGTTTTCTTCTACATTTGAATCTCAGGTGAGTGGACTGAAATGGTT
AGAGGATCAACAAGCAGACTATTATCTGTATTCAGATGATAATAATGTGAACCGGGGAGG
CTGCACTCAACAACAACAAGAACAAGCGTCATCGCCGGTGATGGTTCCGGTTTCCACTAG
TACTGCAACAAGGTCGACACATGAGATCAATAGTCTCGAGAGAAACTCTGCTCTCTCTCG
CTACAAAGCCAAGAAGAAATCTCGAAGGTACGAGAAGCACATCAGATATGAATCGCGGAA
AGTTCGTGCAGAAAGTAGGACAAGAATCAGAGGACGTTTCGCTAAGTCAGATCCATAATA
TAGATAGTTGAGTATGATAGCGAGTTTGTGAGAGTGGGTTTGCTTAGTTTCGTATCAGGT
ATTTGATTGTAATGTCTCATACAGAAACCAATCATGGTCTTGTATAAATCGAAGCACTAT
AATGAATATATATGTCTACTATGATTATAATTGAGTCAATTTTAACCTAGGAGCCACAC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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TAAAAGCGACTTTGGATGATTATGCAGTGAAGATCAAGTCGAGAGGGGACAAGGAGTTTA
GTCCAGTGTATCCACTAATGCTTCAAATTGGTTCTTCTTTGACAGAAGGAAACTTATAAG
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AAATCGAGATTCAGACATCATGACATGGCTTGTGCCTTCTTCT


BQ
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AF RR4G268JQ C 1
AF RR4G268TF U 1
BS 1 463 RR4G268TF

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ATCATCTCTACACGAGAGGGCCAGACGAGTTAGAATCACCGATGCAGAAGAACAGACTGA
ATCCAAAGCAGTACTCACTGTGGCTTGATAACCAAAAAGAGGATCAGATCTGGAAGGGGA
TAAAAGCGACTTTGGATGATTATGCAGTGAAGATCAAGTCGAGAGGGGACAAGGAGTTTA
GTCCAGTGTATCCACTAATGCTTCAAATTGGTTCTTCTTTGACAGAAGGAAACTTATAAG
CTCCATATGTGTGCTTTGTTTCATCTTTTCAAGGCTTTTAAGAGTTCTTCGAATCAATAA
CATGTTTTGTTGTCTCAAGGAGTTTTCTTACAGTCATAGTGACAATACCTCGTGTCATGT
AAATCGAGATTCAGACATCATGACATGGCTTGTGCCTTCTTCT

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR4G268TF 463 0 0
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ATCATCTCTACACGAGAGGGCCAGACGAGTTAGAATCACCGATGCAGAAGAACAGACTGA
ATCCAAAGCAGTACTCACTGTGGCTTGATAACCAAAAAGAGGATCAGATCTGGAAGGGGA
TAAAAGCGACTTTGGATGATTATGCAGTGAAGATCAAGTCGAGAGGGGACAAGGAGTTTA
GTCCAGTGTATCCACTAATGCTTCAAATTGGTTCTTCTTTGACAGAAGGAAACTTATAAG
CTCCATATGTGTGCTTTGTTTCATCTTTTCAAGGCTTTTAAGAGTTCTTCGAATCAATAA
CATGTTTTGTTGTCTCAAGGAGTTTTCTTACAGTCATAGTGACAATACCTCGTGTCATGT
AAATCGAGATTCAGACATCATGACATGGCTTGTGCCTTCTTCT

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL5521Contig1 1024 2 4 U
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AAGAGCAAAGAAGGAAGAAGAAGAATAGTAGAAGGAAGGAAAGAAGGAGGAGGGATTGTT
AACCAGTGAGGAGTCATGGACTGGCCGCAAGTTTCCTCTAGATCAAGCTCTCTTACCGTT
GGAGAGCAACTCTGCGCCGTATTCATACCTCTCTTTGCCATTTTTGATTTCCTTTTCTCC
ACCGTGGGACAATGCTTCGATTGCCGCAGCAGCCGCCGATCGCCTCAGATATGCCAGCAG
GCGAATCTGGCTCTTCTTGCCCTTGACTCTCCATTTTCAGTCAATGAAGTTGAAGCATTG
TATGAGTTATTCAAGAAACTTAGCTGTTCAATCATTGATGATGGCTTGATTCACAAGGAA
GAGCTTCAGCTGGCGCTTTTTCAAGCTCCATATGGTGAGAACCTCTTTCTTGATAAGGTT
TTTGATTTGTTCGATGAAAAGAAGAATGGAGTTATTGAGTTTGAGGAATTTATACATGCT
TTGAGTGTGTTTCATCCCTACGCACCAATTGATGAGAAGATCGACTTTGCGTTTAGGCTC
TATGATCTAAGACAAACCGGATTTATAGAGCGAGAAGAGGTGCATCAAATGGTGGCTGCT
CTTCTGATGGAATCCGAAATGATTCTATCCGATGAACTTCTGACCATGATCATTGATAAA
ACATTTGCTGATGCAGATTCTGACAAAGACGGTAAAATAGGCAAGGAGGTATGGAAAGTG
TATGTGCTTAAGCATCCAACCTTGTTGAAGAACATGACTCTTCCTTACCTAAAGGATGTG
ACGACTGCATTCCCAAGTTTTGTATTCAACACCGAGGTTGAAGACTGAGACGACAACCGC
ACCGGTTATCTCTTTCTTCTTGACTTTTTTTACGTACAGAAAAACAGTTGTAAATGTGAG
GTTGATGATATCGTCATTGTAGACTGTTCCATTGAAAGTAATAAAAAAATTATTTCTTCT
GTCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4EF85TF U 1
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BS 747 747 RR4EF85JQ
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AACCAGTGAGGAGTCATGGACTGGCCGCAAGTTTCCTCTAGATCAAGCTCTCTTACCGTT
GGAGAGCAACTCTGCGCCGTATTCATACCTCTCTTTGCCATTTTTGATTTCCTTTTCTCC
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TTTGATTTGTTCGATGAAAAGAAGAATGGAGTTATTGAGTTTGAGGAATTTATACATGCT
TTGAGTGTGTTTCATCCCTACGCACCAATTGATGAGAAGATCGACTTTGCGTTTAGGCTC
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CTTCTGATGGAATCCGAAATGATTCTATCCGATGAACTTCTGACCATGATCATTGATAAA
ACATTTGCTGATGCAGATTCTGACAA*GACGGTAAA

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DS 

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GAGCTTCAGCTGGCGCTTTTTCAAGCTCCATATGGTGAGAACCTCTTTCTTGATAAGGTT
TTTGATTTGTTCGATGAAAAGAAGAATGGAGTTATTGAGTTTGAGGAATTTATACATGCT
TTGAGTGTGTTTCATCCCTACGCACCAATTGATGAGAAGATCGACTTTGCGTTTAGGCTC
TATGATCTAAGACAAACCGGATTTATAGAGCGAGAAGAGGTGCATCAAATGGTGGCTGCT
CTTCTGATGGAATCCGAAATGATTCTATCCGATGAACTTCTGACCATGATCATTGATAAA
ACATTTGCTGATGCAGATTCTGACAAAGACGGTAAAATAGGCAAGGAGGTATGGAAAGTG
TATGTGCTTAAGCATCCAACCTTGTTGAAGAACATGACTCTTCCTTACCTAAAGGATGTG
ACGACTGCATTCCCAAGTTTTGTATTCAACACCGAGGTTGAAGACTGAGACGACAACCGC
ACCGGTTATCTCTTTCTTCTTGACTTTTTTTACGTACAGAAAAACAGTTGTAAATGTGAG
GTTGATGATATCGTCATTGTAGACTGTTCCATTGAAAGTAATAAAAAAATTATTTCTTCT
GTCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5522Contig1 1399 2 2 U
GGCCTCTTCTTCTAGTTTCTTTGGTGGTGTTTTCTCTTGGAAAAAAAATGGTTAATTCTT
GTGAGAACAACATCGTCGTTGGACAACACACTACGACGACGATTCTTCAAGATGAAACGA
GAAGTAGAAAGTTGGGACAAGAGACGAAGAGAAGAGTGTTGGGTGTGATTAATCAGAATC
TGGTTGGTGGTGGAAGACGCTATCCTTGTGTTGTCAACAAGAGAGGAAACTTATCCAAGA
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TTCCAATCGCAAACGAAGAAGAAGCTACATTGGACCAACCAATGCCAATGTCTCTGGAGA
AGCCTTACACTGAAGCTGATGATCCAATGGAGGAAGTTGAGATGGAGGATGTAATAGTGG
AAGAACCAATCTTGGACATCGATGTCTCAGATTCCAAGAACTCACTCGCAGCTGTTGAGT
ATGTCCAGGATCTATACGCATTTCACCGAGAAATGGAGAGGTTTAGCTGTGTTCCAGTAG
ATTACATGATGCAGCAGATCGACTTAAACGAGAAGATGAGAGCTATACTAATCGACTGGT
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TGATAGATAGATTCTTGTCCAAGAAAGCTGTGTTGAGAAAGAAGCTTCAGCTTGTAGGGC
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TAGTGCTCATTTCAGACAGAGCTTATACCAGGACTGATGTTCTACACATGGAGAAAATGA
TGTTGAGCACTTTGCAATTCAATGTCTCGTTGCCTACACAATACCCTTTCTTGAGAAGAT
TCCTCAAGGCAGCTCAAGCAGACAAGAAGTGTGAGGTTTTGGCGTCCTTCTTGATCGAGC
TTGCCCTTGTGGAGTACGAGATGCTTCGGTTTCCACCTTCATTACTAGCTGCCACAGCGG
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ACTGTCACTACTCTGAAGATCAGCTCATAGAATGTTGTAGGAAGATGGTGAGTCTTCATC
AGAGGGCGGCCACTGGGAAATTGACAGGAGTATATAGGAAGTACAGCACATTCAAGTTTG
GGTACATAGCCAAGTGTGAAGCTGCACACTTTATTGTTTCTTAGTCTCATCATCCTTAAA
GGCTGCAAAAGGCAGTTATATTTTTTGTACAGTTCTCTTGACAAAGTTCCTCTGTTTCCT
CTGAAGCACAAATAAATAA


BQ
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AF RR4AY89TF U 1
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BS 739 1399 RR4AY89JQ

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GTGAGAACAACATCGTCGTTGGACAACACACTACGACGACGATTCTTCAAGATGAAACGA
GAAGTAGAAAGTTGGGACAAGAGACGAAGAGAAGAGTGTTGGGTGTGATTAATCAGAATC
TGGTTGGTGGTGGAAGACGCTATCCTTGTGTTGTCAACAAGAGAGGAAACTTATCCAAGA
AAGAAGAAGCAGAAGGATGTCAAAAGAAGAAGCTTGATCATCCTCTGAGATCCTCAGTTA
CAAGATCTCGAGAGCCCTTGTGTCAAGATGAGGAGGAGAAGAAGAAGCTGAAGCCAACAG
TTCCAATCGCAAACGAAGAAGAAGCTACATTGGACCAACCAATGCCAATGTCTCTGGAGA
AGCCTTACACTGAAGCTGATGATCCAATGGAGGAAGTTGAGATGGAGGATGTAATAGTGG
AAGAACCAATCTTGGACATCGATGTCTCAGATTCCAAGAACTCACTCGCAGCTGTTGAGT
ATGTCCAGGATCTATACGCATTTCACCGAGAAATGGAGAGGTTTAGCTGTGTTCCAGTAG
ATTACATGATGCAGCAGATCGACTTAAACGAGAAGATGAGAGCTATACTAATCGACTGGT
TGATCGAGGTACATGACAAGTTTGATCTGATGAACGAGACACTGTTCCTCACAGTGAATC
TGATAGATAGATTCTTGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4AY89JQ 823 0 0
AGAGGTTTAGCTGTGTTCCAGTAGATTACATGATGCAGCAGATCGACTTAAACGAGA*GA
TGAGAGCTATACTAATCGACTGGTTGATCGAGGTACATGACAAGTTTGATCTGATGAACG
AGACACTGTTCCTCACAGTGAATCTGATAGATAGATTCTTGTCCAAGAAAGCTGTGTTGA
GAAAGAAGCTTCAGCTTGTAGGGCTGGTGGCTTTGTTTTTAGCTTGCAAGTACGAAGAGG
TTTCAGTTCCTCTTGTTGAAGATTTAGTGCTCATTTCAGACAGAGCTTATACCAGGACTG
ATGTTCTACACATGGAGAAAATGATGTTGAGCACTTTGCAATTCAATGTCTCGTTGCCTA
CACAATACCCTTTCTTGAGAAGATTCCTCAAGGCAGCTCAAGCAGACAAGAAGTGTGAGG
TTTTGGCGTCCTTCTTGATCGAGCTTGCCCTTGTGGAGTACGAGATGCTTCGGTTTCCAC
CTTCATTACTAGCTGCCACAGCGGTGTACACTGCTCAGTGTACACTTGATGGATTCAGGA
AATGGAACCGTACATGTGAATTCCACTGTCACTACTCTGAAGATCAGCTCATAGAATGTT
GTAGGAAGATGGTGAGTCTTCATCAGAGGGCGGCCACTGGGAAATTGACAGGAGTATATA
GGAAGTACAGCACATTCAAGTTTGGGTACATAGCCAAGTGTGAAGCTGCACACTTTATTG
TTTCTTAGTCTCATCATCCTTAAAGGCTGCAAAAGGCAGTTATATTTTTTGTACAGTTCT
CTTGACAAAGTTCCTCTGTTTCCTCTGAAGCACAAATAAATAA

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL5523Contig1 790 2 6 U
GGAAAGACAACAATGGCGTCGTCCTCCTCTCACCTCCTCCTCCTCGTCGCGATCACCGTC
TCTTCCCTTTCAATCTCCCCCACCTCCGCACGTCCCTGCAAAACCTTCCTCATCTCCTCA
TACTCCCTCTCAATAACCCCAGAAAATCCCACCCTCGATCCCCAATCCGATCTCTCCTCC
ACCCGATTCGTCACCGTCTTCACCATCCGCCGCCTCAACCCCAACCCGATCGTCCCTTTC
TTCGTCAACCGCCACGGATTCGAGAAGAAGCAGCAGCCTCATCAGATCCAGCAGGAGGAG
GAGAATCGTCCTTCTCATCAGCTGTCTTTCCCTTTCGTCTCGGAGAACGTCAAGGATCGC
ACGAGGGACATCCTCAGCGTCGTGATGGCTCTCCTGTTCGGTGTCGGATGCGGGGCCTTG
ACCGCCGCGACTATGTACCTCGTGTGGGCTCTGGTTGTGAATCGCCGCGGGTACAGTTTC
GAGGAAGAGGAAGATGATTACGAGAACGAGGAGTCGGATGCAGCTAGCTTGAAGAAGCTG
GGATACGTCAAGATCCCTGAACCTGTCAAGGAAGCTGCTTAAATTGGAGTTATCCTATTT
ACCCCAAACAGACACTTCTGCATATTATTAAGTTATTGTCTATCTATCTATTTGCGTTGC
TTATCAGTCATTCGAATGTTTGTATGGATTTATCTATAGCTTAATATATAATAATGATGA
GATATTATCAGTGCTTTACAATTTGTGTTGTGGATGTAATGTTTATAATGTAAAGTGTGA
TTATGATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK49TF U 1
AF RR4CK49JQ C 53
BS 1 740 RR4CK49TF
BS 741 741 RR4CK49JQ
BS 742 758 RR4CK49TF
BS 759 759 RR4CK49JQ
BS 760 781 RR4CK49TF
BS 782 790 RR4CK49JQ

RD RR4CK49TF 789 0 0
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TCTTCCCTTTCAATCTCCCCCACCTCCGCACGTCCCTGCAAAACCTTCCTCATCTCCTCA
TACTCCCTCTCAATAACCCCAGAAAATCCCACCCTCGATCCCCAATCCGATCTCTCCTCC
ACCCGATTCGTCACCGTCTTCACCATCCGCCGCCTCAACCCCAACCCGATCGTCCCTTTC
TTCGTCAACCGCCACGGATTCGAGAAGAAGCAGCAGCCTCATCAGATCCAGCAGGAGGAG
GAGAATCGTCCTTCTCATCAGCTGTCTTTCCCTTTCGTCTCGGAGAACGTCAAGGATCGC
ACGAGGGACATCCTCAGCGTCGTGATGGCTCTCCTGTTCGGTGTCGGATGCGGGGCCTTG
ACCGCCGCGACTATGTACCTCGTGTGGGCTCTGGTTGTGAATCGCCGCGGGTACAGTTTC
GAGGAAGAGGAAGATGATTACGAGAACGAGGAGTCGGATGCAGCTAGCTTGAAGAAGCTG
GGATACGTCAAGATCCCTGAACCTGTCAAGGAAGCTGCTTAAATTGGAGTTATCCTATTT
ACCCCAAACAGACACTTCTGCATATTATTAAGTTATTGTCTATCTATCTATTTGCGTTGC
TTATCAGTCATTCGAATGTTTGTATGGATTTATCTATAGCTTAATATATAATAATGATGA
GATATTATCAGTGCTTTACA*TTTGTGTTGTGGATGTA*TGTTTATAATGTAAAGTGTGA
T
ATGATGTC

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4CK49JQ 738 0 0
ATCA
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CTCATACTCCCTCTCAATAACCCCAGAAAATCCCACCCTCGATCCCCAATCCGATCTCTC
CTCCACCCGATTCGTCACCGTCTTCACCATCCGCCGCCTCAACCCCAACCCGATCGTCCC
TTTCTTCGTCAACCGCCACGGATTCGAGAAGAAGCAGCAGCCTCATCAGATCCAGCAGGA
GGAGGAGAATCGTCCTTCTCATCAGCTGTCTTTCCCTTTCGTCTCGGAGAACGTCAAGGA
TCGCACGAGGGACATCCTCAGCGTCGTGATGGCTCTCCTGTTCGGTGTCGGATGCGGGGC
CTTGACCGCCGCGACTATGTACCTCGTGTGGGCTCTGGTTGTGAATCGCCGCGGGTACAG
TTTCGAGGAAGAGGAAGATGATTACGAGAACGAGGAGTCGGATGCAGCTAGCTTGAAGAA
GCTGGGATACGTCAAGATCCCTGAACCTGTCAAGGAAGCTGCTTAAATTGGAGTTATCCT
ATTTACCCCAAACAGACACTTCTGCATATTATTAAGTTATTGTCTATCTATCTATTTGCG
TTGCTTATCAGTCATTCGAATGTTTGTATGGATTTATCTATAGCTTAATATATAATAATG
ATGAGATATTATCAGTGCTTTACAATTTGTGTTGTGGATGTAATGTTTATAATGTAAAGT
GTGATTATGATGTC

QA 5 738 5 738
DS 



AS 1 2

CO CL5524Contig1 496 2 1 U
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ATGCTTTCCATACTCCGCCGCAACCTCCAAAACCTTCGTAAGAGCCAACGCGTAGCTGAC
GAGACTGAGATAGCTTCGACAACACAAGGAGCAGGAATAGTAGCTCATAACGAAAGACGA
GACGGGACTAGTGCCGTTATGATGCGATTCCCTTTCTCGATCATCTCGTGCTTTGCCGTG
CCACGTGTCAGCGGGACAGATAGACTATGGATTTCTGGAGATTATGCCAGCGTATCAGAG
GTTAACCATCTCATGGTTAGTGATGGCATGAGATACGCCATTTTAATGTAATAACCCCAA
GTCCAAACATGTTCGTAGAGTTTCGTTTTTTTTTATGTTAACAATACACTTATTTATCTT
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TAGATAGATATTGATG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H518JQB C 1
AF RR4H518TF U 1
BS 1 496 RR4H518TF

RD RR4H518JQB 496 0 0
GGCTATCTCATCAACTCAAAAGAGAGAGAACAAACTAAAACGAGATCAGAGATGACGCAG
ATGCTTTCCATACTCCGCCGCAACCTCCAAAACCTTCGTAAGAGCCAACGCGTAGCTGAC
GAGACTGAGATAGCTTCGACAACACAAGGAGCAGGAATAGTAGCTCATAACGAAAGACGA
GACGGGACTAGTGCCGTTATGATGCGATTCCCTTTCTCGATCATCTCGTGCTTTGCCGTG
CCACGTGTCAGCGGGACAGATAGACTATGGATTTCTGGAGATTATGCCAGCGTATCAGAG
GTTAACCATCTCATGGTTAGTGATGGCATGAGATACGCCATTTTAATGTAATAACCCCAA
GTCCAAACATGTTCGTAGAGTTTCGTTTTTTTTTATGTTAACAATACACTTATTTATCTT
CTCGACATCTATGTGTACAGTGTTAAATCTATGAGATGTAGAACACGTTTTGTTCTTGTA
TAGATAGATATTGATG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4H518TF 496 0 0
GGCTATCTCATCAACTCAAAAGAGAGAGAACAAACTAAAACGAGATCAGAGATGACGCAG
ATGCTTTCCATACTCCGCCGCAACCTCCAAAACCTTCGTAAGAGCCAACGCGTAGCTGAC
GAGACTGAGATAGCTTCGACAACACAAGGAGCAGGAATAGTAGCTCATAACGAAAGACGA
GACGGGACTAGTGCCGTTATGATGCGATTCCCTTTCTCGATCATCTCGTGCTTTGCCGTG
CCACGTGTCAGCGGGACAGATAGACTATGGATTTCTGGAGATTATGCCAGCGTATCAGAG
GTTAACCATCTCATGGTTAGTGATGGCATGAGATACGCCATTTTAATGTAATAACCCCAA
GTCCAAACATGTTCGTAGAGTTTCGTTTTTTTTTATGTTAACAATACACTTATTTATCTT
CTCGACATCTATGTGTACAGTGTTAAATCTATGAGATGTAGAACACGTTTTGTTCTTGTA
TAGATAGATATTGATG

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL5525Contig1 501 2 1 U
GGAGGAAGAAACTCGTCTCTCCAGGATCTGAAAAGCCAGAGAATAACTTGAGGATCAGAG
ATTTTTAATTACAGTGAAGCTGTGGCAGATGAACAGAGTGATTAGTCAGTTTCCGGCAAG
TTAATGAAGGATAAGTGTGTTACCGGAAGTGGCGGCGGTGCGGTCAAAGAAACGGCGTCG
CCGCAGAGTCCAGTCGCGTCATCTTCTTCAGTGAGGAGGCTGAGCGGCGATCTGGAGTCG
AACCGATTTGGCGGGGCGGCTAGCGAGAGACTGAGGCAGGCGGAGGAATCTCTGAGGACG
GTTATGTTTCTGAGCTGCTGGGGAGCTTGTTAGATCTGGCGGTGTAAATCAAAACACGTT
CCTCTTTTGTGCTTTGATTTTGAGCCTTTTCTTTTCTTTTGTTTATTTTGAAGTTGTTTT
AGCTGTCAATATTTTTTTCATCTTTTGTGTAGCTGTTTGAGTTTTCTGTAAATCAATGTA
CAAAAATGTTAAGTGGTGTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EL27JQ C 1
AF RR4EL27TF U 1
BS 1 501 RR4EL27TF

RD RR4EL27JQ 501 0 0
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CCGCAGAGTCCAGTCGCGTCATCTTCTTCAGTGAGGAGGCTGAGCGGCGATCTGGAGTCG
AACCGATTTGGCGGGGCGGCTAGCGAGAGACTGAGGCAGGCGGAGGAATCTCTGAGGACG
GTTATGTTTTTGAGCTGCTGGGGAGCTTGTTAGATCTGGCGGTGTAAATCAAAACACGTT
CCTCTTTTGTGCTTTGATTTTGAGCCTTTTCTTTTCTTTTGTTTATTTTGAAGTTGTTTT
AGCTGTCAATATTTTTTTCATCTTTTGTGTAGCTGTTTGAGTTTTCTGTAAATCAATGTA
CAAAAATGTTAAGTGGTGTTG

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4EL27TF 501 0 0
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TTAATGAAGGATAAGTGTGTTACCGGAAGTGGCGGCGGTGCGGTCAAAGAAACGGCGTCG
CCGCAGAGTCCAGTCGCGTCATCTTCTTCAGTGAGGAGGCTGAGCGGCGATCTGGAGTCG
AACCGATTTGGCGGGGCGGCTAGCGAGAGACTGAGGCAGGCGGAGGAATCTCTGAGGACG
GTTATGTTTCTGAGCTGCTGGGGAGCTTGTTAGATCTGGCGGTGTAAATCAAAACACGTT
CCTCTTTTGTGCTTTGATTTTGAGCCTTTTCTTTTCTTTTGTTTATTTTGAAGTTGTTTT
AGCTGTCAATATTTTTTTCATCTTTTGTGTAGCTGTTTGAGTTTTCTGTAAATCAATGTA
CAAAAATGTTAAGTGGTGTTG

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL5526Contig1 1047 2 6 U
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CCTCGATCGTATTCGATCCTTATACGGAGCGCAAAGCTTTCGACGAGACCAAAGAAGGAG
TAAAAGGGATGGTCGACGCTAACATCACAGAAGTCCCTCGTATCTTCCATGCCCCTAAAG
ATCTCTCAACCGATAAGAAACCTTCTGTCTCTCTTTCAAAACTAGAGATCCCTACCATCG
ACTTTGCAAGCGTTCACGTGGACAAAGTCTCACGTGAAGCCGTCATAGAGAAAGTCAAAT
ACGCGGTGGAGAAGTGGGGGTTCTTCCAGGTGATCAACCATGGTGTTCCTTTGAACGTTC
TTGAAGTGATTCAAGATGGAGTTCGTAGGTTTCACGAGGAAGATCCTGAGGTCAAGAAAC
GATACTTTACCCGTGATAACGCCAACAAAAAGTTTGTCTACAATAGTAACTTCGATCTAT
ACAGTTCCTCGCCATCTGTTAACTGGAGAGATACTTTCACTTGTTACGTAGCTCCAGATC
CTCCAACTCCTGAGGATCTACCAGTGATTTGCAGGGATGCTGTGTTCGAATACTCAAAAC
ATGTGATGAGTTTAGGCGGTTTACTCTTTGAGCTTCTCTCAGAAGCACTGGGTTTGGAAT
CTGAGATCCTTAAGAGCAAGGGGTGCTTGAAGGGTTTGAGTATGCTCTGCCATTACTACC
CACCTTGTCCACAGTTTATGGACCAATGAAAGAGCTTGTATCTGAAGAAAACCCTCCAAA
ATACAGAGACATTACCATAAAAGAATACACGGAAGGATACTTCAAGAAGGGTCTGGATGG
AACGTCACATCTCTTGAATTTCAGGATTTGAAAACAAAACCACAGGAAAAGAATTTTGTG
GTGTTTCTTAGCATCAATCTCTCTGTTCTTGGATCTGCAATAACTTAATCAGTATATGTA
TGTGTTGCGCTTCTCTATGTTCGGATATTTCTATCTTAGTTATATGTATCAGATTATAGT
AGTGAAATGCATTGCACTTAATTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C865TF U 1
AF RR4C865JQ C 211
BS 1 682 RR4C865TF
BS 683 683 RR4C865JQ
BS 684 745 RR4C865TF
BS 746 746 RR4C865JQ
BS 747 764 RR4C865TF
BS 765 1047 RR4C865JQ

RD RR4C865TF 764 0 0
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TAAAAGGGATGGTCGACGCTAACATCACAGAAGTCCCTCGTATCTTCCATGCCCCTAAAG
ATCTCTCAACCGATAAGAAACCTTCTGTCTCTCTTTCAAAACTAGAGATCCCTACCATCG
ACTTTGCAAGCGTTCACGTGGACAAAGTCTCACGTGAAGCCGTCATAGAGAAAGTCAAAT
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TTGAAGTGATTCAAGATGGAGTTCGTAGGTTTCACGAGGAAGATCCTGAGGTCAAGAAAC
GATACTTTACCCGTGATAACGCCAACAAAAAGTTTGTCTACAATAGTAACTTCGATCTAT
ACAGTTCCTCGCCATCTGTTAACTGGAGAGATACTTTCACTTGTTACGTAGCTCCAGATC
CTCCAACTCCTGAGGATCTACCAGTGATTTGCAGGGATGCTGTGTTCGAATACTCAAAAC
ATGTGATGAGTTTAGGCGGTTTACTCTTTGAGCTTCTCTCAGAAGCACTGGGTTTGGAAT
CTGAGATCCTTAAGAGCAAGGG*TGCTTGAAGGGTTTGAGTATGCTCTGCCATTACTACC
CACCTTGTCCACAGTTTATGGACCA*TGAAAGAGCTTGTATCTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4C865JQ 837 0 0
CTCTCTTC
AAACTAGAGATCCCTACCATCGACTT*GCAAGCGT*CACGTGGACAAAGTCTCACGTGAA
GCCGTCATAGAGAAAGTCAAATACGCGGTGGAGAAGTGGGGGTTCTTCCAGGTGATCAAC
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GAAGATCCTGAGGTCAAGAAACGATACTTTACCCGTGATAACGCCAACAAAAAGTTTGTC
TACAATAGTAACTTCGATCTATACAGTTCCTCGCCATCTGTTAACTGGAGAGATACTTTC
ACTTGTTACGTAGCTCCAGATCCTCCAACTCCTGAGGATCTACCAGTGATTTGCAGGGAT
GCTGTGTTCGAATACTCAAAACATGTGATGAGTTTAGGCGGTTTACTCTTTGAGCTTCTC
TCAGAAGCACTGGGTTTGGAATCTGAGATCCTTAAGAGCAAGGGGTGCTTGAAGGGTTTG
AGTATGCTCTGCCATTACTACCCACCTTGTCCACAGTTTATGGACCAATGAAAGAGCTTG
TATCTGAAGAAAACCCTCCAAAATACAGAGACATTACCATAAAAGAATACACGGAAGGAT
ACTTCAAGAAGGGTCTGGATGGAACGTCACATCTCTTGAATTTCAGGATTTGAAAACAAA
ACCACAGGAAAAGAATTTTGTGGTGTTTCTTAGCATCAATCTCTCTGTTCTTGGATCTGC
AATAACTTAATCAGTATATGTATGTGTTGCGCTTCTCTATGTTCGGATATTTCTATCTTA
GTTATATGTATCAGATTATAGTAGTGAAATGCATTGCACTTAATTAGTC

QA 9 837 9 837
DS 



AS 1 2

CO CL5527Contig1 709 2 3 U
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TTTCCATTGACGATGCACTTTAGCGAGGACTATCCCAGCAAGCCTCCCAAATGCAAATTC
CCACAAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCATCGGGGACTGTCTGTCTCTCCATCCTT
AACGAGGATTCGGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAGATTCTTGTCGGTATCCAG
GATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACTGATGGTTATCATCTCTTC
ATCCATGATGCAGTTGAGTACAAGAAACGGGTTAAGCTACAGTCCAAGCAGTATCCTCCC
ATTGTCTAAAAACATCAGAACGGAACACACCGAAACTGATGACAAACCTCTGAATCTTTT
GTGGTCTTTTGTGATTGTGTTTAAATGTAATCGGGTGATTAAAAAAAAACTCCTCATTTT
GGCACCTTTGAGACACTTACTAGAATCTCTTTTATTTCCAGAAAACAAA


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G390TF U 1
AF RR4G390JQ C 4
BS 1 648 RR4G390TF
BS 649 649 RR4G390JQ
BS 650 709 RR4G390TF

RD RR4G390TF 709 0 0
GGATAGAGAGAGACGAAGACAGAGAGTGAAAAGCACAACAGAGATTGTCTTAAGAGAGAG
AGAGAGATGGCTAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCTGAGGAGAGAAAGTCGTGGAGG
AAGAATCATCCTCATGGTTTTGTGGCGAAGCCGGAGACTGGGGCTGATGGTTCTGTGAAT
CTAATAGTGTGGCATTGCACTATTCCTGGTAAAGCCGGTACTGATTGGGAAGGTGGATTC
TTTCCATTGACGATGCACTTTAGCGAGGACTATCCCAGCAAGCCTCCCAAATGCAAATTC
CCACAAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCATCGGGGACTGTCTGTCTCTCCATCCTT
AACGAGGATTCGGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAGATTCTTGTCGGTATCCAG
GATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACTGATGGTTATCATCTCTTC
ATCCATGATGCAGTTGAGTACAAGAAACGGGTTAAGCTACAGTCCAAGCAGTATCCTCCC
ATTGTCTAAAAACATCAGAACGGAACACACCGAAACTGATGACAAACCTCTGAATCTTTT
GTGGTCTTTTGTGATTGTGTTTAAATGTAATCGGGTGATTAAAAAAAA*CTCCTCATTTT
GGCACCTTTGAGACACTTACTAGAATCTCTTTTATTTCCAGAAAACAAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4G390JQ 706 0 0
TAGAGAGAGACGAAGACAGAGAGTGAAAAGCACAACAGAGATTGTCTTAAGAGAGAGAGA
GAGATGGCTAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCTGAGGAGAGAAAGTCGTGGAGGAAG
AATCATCCTCATGGTTTTGTGGCGAAGCCGGAGACTGGGGCTGATGGTTCTGTGAATCTA
ATAGTGTGGCATTGCACTATTCCTGGTAAAGCCGGTACTGATTGGGAAGGTGGATTCTTT
CCATTGACGATGCACTTTAGCGAGGACTATCCCAGCAAGCCTCCCAAATGCAAATTCCCA
CAAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCATCGGGGACTGTCTGTCTCTCCATCCTTAAC
GAGGATTCGGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAGATTCTTGTCGGTATCCAGGAT
TTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACTGATGGTTATCATCTCTTCATC
CATGATGCAGTTGAGTACAAGAAACGGGTTAAGCTACAGTCCAAGCAGTATCCTCCCATT
GTCTAAAAACATCAGAACGGAACACACCGAAACTGATGACAAACCTCTGAATCTTTTGTG
GTCTTTTGTGATTGTGTTTAAATGTAATCGGGTGATTAAAAAAAAACTCCTCATTTTGGC
ACCTTTGAGACACTTACTAGAATCTCTTTTATTTCCAGAAAACAAA

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5528Contig1 840 2 10 U
GGATCTTAAAACAGAGAGATCTTAGAAGAAGACAAAATCTTTACCACCAGATCCTCTTCT
TCTTCTCTCTTACATGTTACCACATCACCACAACTTTCTGGGAATAAAAAAGACTTGGTT
TCTTCTCCTCCGATGAGGTGTAAAAGACACACCGCGGATCTCACGAGTACCGTCGTTTTG
CGCGAATAGATCGAAGAAGCTCGCGGATTTAGGTAGAGGGAATCACCGCCGTTGAGTTTT
TGGTCCGTTTGATCATTGGCTGGCTACAAGGTTCGTGTGTTTTCCGGCGATAAATGGTTT
CCCGGTGACTAAGCTTCTCTTTGGAGTAACCAGCAGAGAAGACGCTCTCTTGTTTCGAAT
CTGAGTCTACTGTTGGTGTTGAGTTAGCTACCAAGACACTCAAAAGTCGTCAGAGCTCAG
ATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGCACTTTCAAGTTTCAAGGAAGAGTGAAGTTATG
TTCTGTGGATGCGAAACAAGTTGGACACTCCCTTGAGAGATGCATATTATCTTGCTCCCT
GAAGATGTTCTAATGCAGCATCTTGTCCTTACTTCGGAACAAAGCTGGCTGTTTCAATAT
CTCTTCTCTTAAAAATGTGGATGTATCTGTTTGCATTCGTGCACGACGTCGATTTTGGAT
TTGTATGTCTTGCCGCAACCAGAAGAGGCTAAAGAAGAGAGTAATGTGAACCGGGAGAGC
TCCAGGAAATGTTGTTTGGATTCTATACATCATTGACATTGTATATACTCACTCATTCAA
ATTTGTTTGGGTCTTATAATGGGCCTTGTAATAGACCATTGATATATATCATTTGTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4BY14TF U 1
AF RR4BY14JQ C 109
BS 1 741 RR4BY14TF
BS 742 742 RR4BY14JQ
BS 743 780 RR4BY14TF
BS 781 781 RR4BY14JQ
BS 782 810 RR4BY14TF
BS 811 811 RR4BY14JQ
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BS 817 817 RR4BY14JQ
BS 818 835 RR4BY14TF
BS 836 840 RR4BY14JQ

RD RR4BY14TF 835 0 0
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TCTTCTCTCTTACATGTTACCACATCACCACAACTTTCTGGGAATAAAAAAGACTTGGTT
TCTTCTCCTCCGATGAGGTGTAAAAGACACACCGCGGATCTCACGAGTACCGTCGTTTTG
CGCGAATAGATCGAAGAAGCTCGCGGATTTAGGTAGAGGGAATCACCGCCGTTGAGTTTT
TGGTCCGTTTGATCATTGGCTGGCTACAAGGTTCGTGTGTTTTCCGGCGATAAATGGTTT
CCCGGTGACTAAGCTTCTCTTTGGAGTAACCAGCAGAGAAGACGCTCTCTTGTTTCGAAT
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ATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGCACTTTCAAGTTTCAAGGAAGAGTGAAGTTATG
TTCTGTGGATGCGAAACAAGTTGGACACTCCCTTGAGAGATGCATATTATCTTGCTCCCT
GAAGATGTTCTAATGCAGCATCTTGTCCTTACTTCGGAACAAAGCTGGCTGTTTCAATAT
CTCTTCTCTTAAAAATGTGGATGTATCTGTTTGCATTCGTGCACGACGTCGATTTTGGAT
TTGTATGTCTTGCCGCAACCAGAAGAGGCTAAAGAAGAGAGTAATGTGAACCGGGAGAGC
TCCAGGAAATGTTGTTTGGAT*CTATACATCATTGACATTGTATATACTCACTCATTCAA
*TTTGTTTGGGTCTTATAATGGGCCTTGTA*TAGAC*ATTGATATATATCATTTG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4BY14JQ 732 0 0
AAAGACTTGGTTTCTTCTCCTCCGATGAGGTGTAAAAGACACACCGCGGATCTCACGAGT
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CCGTTGAGTTTTTGGTCCGTTTGATCATTGGCTGGCTACAAGGTTCGTGTGTTTTCCGGC
GATAAATGGTTTCCCGGTGACTAAGCTTCTCTTTGGAGTAACCAGCAGAGAAGACGCTCT
CTTGTTTCGAATTTGAGTCTACTGTTGGTGTTGAGTTAGCTACCAAGACACTCAAAAGTC
GTCAGAGCTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGCACTTTCAAGTTTCAAGGAAG
AGTGAAGTTATGTTCTGTGGATGCGAAACAAGTTGGACACTCCCTTGAGAGATGCATATT
ATCTTGCTCCCTGAAGATGTTTTAATGCAGCATCTTGTCCTTACTTCGGAACAAAGCTGG
CTGTTTCAATATCTCTTCTCTTAAAAATGTGGATGTATCTGTTTGCATTCGTGCACGACG
TCGATTTTGGATTTGTATGTCTTGCCGCAACCAGAAGAGGCTAAAGAAGAGAGTAATGTG
AACCGGGAGAGCTCCAGGAAATGTTGTTTGGATTCTATACATCATTGACATTGTATATAC
TCACTCATTCAAATTTGTTTGGGTCTTATAATGGGCCTTGTAATAGACCATTGATATATA
TCATTTGTGATG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5529Contig1 841 2 4 U
GAATCCAGCACCTCCTTCCCGACCAAAGTTGTCAGATGCTGCTCCCAACACCCTCGGCGC
CGCTTGCTTAGCGTTACACTACGCTAATGTCATCATCGTGATAGAGAGATTCGTTGCGTC
TCCTCACTTGATAGGCGACGATGCAAGAGACGACCTTTACAACATGTTACCTGCGAGCGT
GAGAAAATCGCTGAGAGAGAGGCTAAAGCCCTACTCGAAAAACTTGAGTTCTTCCGCGGT
TTATGATCCAGGGCTAGCGAAAGAGTGGACAGACGCAATGGCGGGTATCTTGGAATGGTT
GGGTCCGTTAGCTCACAACATGATAAAATGGCAGTCCAAGAGGAGTTACGAGAACCAAAG
CTTGGTGTCGAGGACGCACATAGTTCTTGCGCAAACTCTTTTCTTTGCAAACCAGCAGAA
AACAGAAACCATCATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCAACTATGTCTGGAGATATGGAAG
AGAACTTAACGCCAAGGCTCTTCAAGAGTGTACCAGTAGTCAAACCCTTGAGAAATGTTT
AGACACAGATAACTAGTGAAGAAGCTCTCCAAGACACTACATTTTTTAACTGCTTCTTTG
ACCTAAACTGGCACTGGAACTCCTCACCCCCGGGGAAAATCCAAACCGTGCAGCTTGGAC
CAAACCCGAGGAGGACGAAAAGCTGTTTCATTGCTTGATTACCACGAGAGGTATTATAAT
GTGAGCATCTCTTTTATCTTCTTCTCTCTCCTTTCTTATTTTGACCTGTAGTAGAATGTG
ATGATGCGTTGTATATTGTTTCTACGATTTTATTGTGGTTGAGATACATACTACTACTAC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EG66TF U 1
AF RR4EG66JQ C 27
BS 1 630 RR4EG66TF
BS 631 631 RR4EG66JQ
BS 632 655 RR4EG66TF
BS 656 841 RR4EG66JQ

RD RR4EG66TF 655 0 0
GAATCCAGCACCTCCTTCCCGACCAAAGTTGTCAGATGCTGCTCCCAACACCCTCGGCGC
CGCTTGCTTAGCGTTACACTACGCTAATGTCATCATCGTGATAGAGAGATTCGTTGCGTC
TCCTCACTTGATAGGCGACGATGCAAGAGACGACCTTTACAACATGTTACCTGCGAGCGT
GAGAAAATCGCTGAGAGAGAGGCTAAAGCCCTACTCGAAAAACTTGAGTTCTTCCGCGGT
TTATGATCCAGGGCTAGCGAAAGAGTGGACAGACGCAATGGCGGGTATCTTGGAATGGTT
GGGTCCGTTAGCTCACAACATGATAAAATGGCAGTCCAAGAGGAGTTACGAGAACCAAAG
CTTGGTGTCGAGGACGCACATAGTTCTTGCGCAAACTCTTTTCTTTGCAAACCAGCAGAA
AACAGAAACCATCATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCAACTATGTCTGGAGATATGGAAG
AGAACTTAACGCCAAGGCTCTTCAAGAGTGTACCAGTAGTCAAACCCTTGAGAAATGTTT
AGACACAGATAACTAGTGAAGAAGCTCTCCAAGACACTACATTTTTTAACTGCTTCTTTG
ACCTAAACTGGCACTGGAACTCCTCACCCC*GGGGAAAATCCAAACCGTGCAGCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4EG66JQ 815 0 0
AAG
TGTCAGATGCTGCTCCCAACACCCTCGGCGCCGCTTGCTTAGCGTTACACTACGCTAATG
TCATCATCGTGATAGAGAGATTCGTTGCGTCTCCTCACTTGATAGGCGACGATGCAAGAG
ACGACCTTTACAACATGTTACCTGCGAGCGTGAGAAAATCGCTGAGAGAGAGGCTAAAGC
CCTACTCGAAAAACTTGAGTTCTTCCGCGGTTTATGATCCAGGGCTAGCGAAAGAGTGGA
CAGACGCAATGGCGGGTATCTTGGAATGGTTGGGTCCGTTAGCTCACAACATGATAAAAT
GGCAGTCCAAGAGGAGTTACGAGAACCAAAGCTTGGTGTCGAGGACGCACATAGTTCTTG
CGCAAACTCTTTTCTTTGCAAACCAGCAGAAAACAGAAACCATCATCACGGAGCTTCTTG
TTGGGCTCAACTATGTCTGGAGATATGGAAGAGAACTTAACGCCAAGGCTCTTCAAGAGT
GTACCAGTAGTCAAACCCTTGAGAAATGTTTAGACACAGATAACTAGTGAAGAAGCTCTC
CAAGACACTACATTTTTTAACTGCTTCTTTGACCTAAACTGGCACTGGAACTCCTCACCC
CCGGGGAAAATCCAAACCGTGCAGCTTGGACCAAACCCGAGGAGGACGAAAAGCTGTTTC
ATTGCTTGATTACCACGAGAGGTATTATAATGTGAGCATCTCTTTTATCTTCTTCTCTCT
CCTTTCTTATTTTGACCTGTAGTAGAATGTGATGATGCGTTGTATATTGTTTCTACGATT
TTATTGTGGTTGAGATACATACTACTACTACG

QA 4 815 4 815
DS 



AS 1 2

CO CL5530Contig1 497 2 1 U
GGAAAAACAAAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGATTCATCAG
TTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAGACTTGCAG
ACAGGAAGATTGAGAGGTTTGACAAGAACATTACTAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCA
CCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATTCTCCTCGGCTTCTTTGTCTTCG
TCGTCATTGGTTCATCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCAAAGGCATGGCAT
AAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATCTCTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTG
TTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTATAAATTATCCAATCTTT
GAAATCTTGTCTTGAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BH11JQ C 1
AF RR4BH11TF U 1
BS 1 497 RR4BH11TF

RD RR4BH11JQ 497 0 0
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TTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAGACTTGCAG
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CCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATTCTCCTCGGCTTCTTTGTCTTCG
TCGTCATTGGTTCATCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCAAAGGCATGGCAT
AAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATCTCTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTG
TTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTATAAATTATCCAATCTTT
GAAATCTTGTCTTGAAC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4BH11TF 497 0 0
GGAAAAACAAAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGATTCATCAG
TTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAGACTTGCAG
ACAGGAAGATTGAGAGGTTTGACAAGAACATTACTAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCA
CCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATTCTCCTCGGCTTCTTTGTCTTCG
TCGTCATTGGTTCATCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCAAAGGCATGGCAT
AAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATCTCTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTG
TTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTATAAATTATCCAATCTTT
GAAATCTTGTCTTGAAC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL5531Contig1 554 2 2 U
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TTCCATATGAGATGCCTCTACTTCCTCAGCATGTTCCTATTGGAGCTTTGGCTACTTCCC
TTGCCAATGCTTCTCCAGAACACCAAAGGACGATGCTGGGTGAGAATCTGTATCCGCTTG
TGGAGCAGCTAGAGGCAGAGTCTGCAGCCAAAGTGACTGGGATGCTTTTGGAGATGGATC
AGACTGAAGTGCTTCATCTCTTGGAGTCACCTGAAGCTCTCAAGGCTAAAGTAGCCGAGG
CTATGGACGTTCTCAGAAGTGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTTGCCTCCTTGA
ACCTCAACGACAACCTTGTCTCTTAAATGTTCTTTTGCCTTTCTGTTTGATTTGAAAAAA
AACTACAAATATTTAAAGTGTGGCTTGTCTTCTCCATACACAATTGGAGACCCTTTCTTT
CTTTTTCTGTAGGATTGTTTGACTTGGTTTGTGGCCACACCCTTCAAACTTAATATGATT
TGTTTGAAAACTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR4BR56JQ C 1
AF RR4BR56TF U 1
BS 1 549 RR4BR56TF
BS 550 554 RR4BR56JQ

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TTGCCAATGCTTTTCCAGAACACCAAAGGACGATGCTGGGTGAGAATCTGTATCCGCTTG
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AGACTGAAGTGCTTCATTTTTTGGAGTCACCTGAAGCTTTCAAGGCTAAAGTAGCCGAGG
CTATGGACGTTTTCAGAAGTGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTTGCCTCCTTGA
ACCTCAACGACAACCTTGTTTTTTAAATGTTTTTTTGCCTTTTTGTTTGATTTGAAAAAA
AACTACAAATATTTAAAGTGTGGCTTGTTTTCTCCATACACAATTGGAGACCCTTTCTTT
CTTTTTTTGTAGGATTGTTTGACTTGGTTTGTGGCCACACCCTTCAAACTTAATATGATT
TGTTTGAAAACTTG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4BR56TF 553 0 0
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TTCCATATGAGATGCCTCTACTTCCTCAGCATGTTCCTATTGGAGCTTTGGCTACTTCCC
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AGACTGAAGTGCTTCATCTCTTGGAGTCACCTGAAGCTCTCAAGGCTAAAGTAGCCGAGG
CTATGGACGTTCTCAGAAGTGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTTGCCTCCTTGA
ACCTCAACGACAACCTTGTCTCTTAAATGTTCTTTTGCCTTTCTGTTTGATTTGAAAAAA
AACTACAAATATTTAAAGTGTGGCTTGTCTTCTCCATACACAATTGGAGACCCTTTCTTT
CTTTTTCTGTAGGATTGTTTGACTTGGTTTGTGGCCACACCCTTCAAACTTAATATGATT
TGTTTGAAA
CTTG

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL5532Contig1 804 2 1 U
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TCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCCACCCACCTTCAAGGTGGACAGAGCTGTG
AACACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCTTCTGGTAACGTTTCACGTCTTCATCGCATTCCA
ATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCTCACTGTAGTGGAGATCCACGAC
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CAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTTGGTTCGTTTCCGACAAAGGATTTTCATTTC
CCTCACGATGGGAATCTGCTTAGAACTGAGCCTAGAGACTCCGAGAACCATTTCTCTCTT
GTTGGATGCACCTGCGCTCCTGGTTTCCAGTTTGAGGACTTTGAGCTTGCGAAACGCTCT
CACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTCGCTTATCACAATGCTCTCTTATCCTGAG
TGAAGGAGGTTAATGATAATAAAAAGAATGACAACTCAGTTCACTATGTTGTTTTGTTTC
TTTCAACACCTTACTTATGAACCATGCGAGGTTGTAATTGTACTCTTTTGATTTTACTTT
TGAACTATCTTTCTTTGTGTTTTTTTTCAAGTTGTGGATTGATCAAATCATGTTCAGCAA
AGAGAAAAGCTTTAGTTTCGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AB50TF U 1
AF RR4AB50JQ C 103
BS 1 804 RR4AB50TF

RD RR4AB50TF 804 0 0
GGGAGAGAGAGTCTGTCGGTGAATATCGGGGGGAAGATGGTGAAGTCTTCAGAGATCGTG
AAGAAGCTCAATCTCAGGTCTCACCAAGAAGGTGGTTTCTTCTATGAAACGTTCAGAGAT
TCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCCACCCACCTTCAAGGTGGACAGAGCTGTG
AACACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCTTCTGGTAACGTTTCACGTCTTCATCGCATTCCA
ATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCTCACTGTAGTGGAGATCCACGAC
GATGGGAAGTTGAAATTCACGTGTCTTGGTCCTGACTTGATTGAAGGCGACCAGAAGCCT
CAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTTGGTTCGTTTCCGACAAAGGATTTTCATTTC
CCTCACGATGGGAATCTGCTTAGAACTGAGCCTAGAGACTCCGAGAACCATTTCTCTCTT
GTTGGATGCACCTGCGCTCCTGGTTTCCAGTTTGAGGACTTTGAGCTTGCGAAACGCTCT
CACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTCGCTTATCACAATGCTCTCTTATCCTGAG
TGAAGGAGGTTAATGATAATAAAAAGAATGACAACTCAGTTCACTATGTTGTTTTGTTTC
TTTCAACACCTTACTTATGAACCATGCGAGGTTGTAATTGTACTCTTTTGATTTTACTTT
TGAACTATCTTTCTTTGTGTTTTTTTTCAAGTTGTGGATTGATCAAATCATGTTCAGCAA
AGAGAAAAGCTTTAGTTTCGAACC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AB50JQ 702 0 0
TATGAAACGTTCAGAGATTCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCCACCCACCTTC
AAGGTGGACAGAGCTGTGAACACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCTTCTGGTAACGTTTCA
CGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCTCACT
GTAGTGGAGATCCACGACGATGGGAAGTTGAAATTCACGTGTCTTGGTCCTGACTTGATT
GAAGGCGACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTTGGTTCGTTTCCG
ACAAAGGATTTTCATTTCCCTCACGATGGGAATCTGCTTAGAACTGAGCCTAGAGACTCC
GAGAACCATTTCTCTCTTGTTGGATGCACCTGCGCTCCTGGTTTCCAGTTTGAGGACTTT
GAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTCGCTTATCACA
ATGCTCTCTTATCCTGAGTGAAGGAGGTTAATGATAATAAAAAGAATGACAACTCAGTTC
ACTATGTTGTTTTGTTTCTTTCAACACCTTACTTATGAACCATGCGAGGTTGTAATTGTA
CTCTTTTGATTTTACTTTTGAACTATCTTTCTTTGTGTTTTTTTTCAAGTTGTGGATTGA
TCAAATCATGTTCAGCAAAGAGAAAAGCTTTAGTTTCGAACC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5533Contig1 497 2 1 U
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GATCGGAATCGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGGTTCCTCCT
CTTCCAAGATGGAGCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCG
CGACTCACTACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGC
CACATCTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGAATGATCCCTCTATTTCATCACCATCATC
GTCAAAACCAGATCAGTCAATCGTTTCCGAATGTTTCTCTGGTTCGGCTCTATATCTTTA
CGCGTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTGTGTTCTAG
AATGCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGAATCAATTAGATTTATGATAATGTG
ATATCGAATTCACGCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F953JQ C 1
AF RR4F953TF U 1
BS 1 497 RR4F953TF

RD RR4F953JQ 497 0 0
GGAAAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCAGA
GATCGGAATCGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGGTTCCTCCT
CTTCCAAGATGGAGCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCG
CGACTCACTACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGC
CACATCTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGAATGATCCCTCTATTTCATCACCATCATC
GTCAAAACCAGATCAGTCAATCGTTTCCGAATGTTTCTCTGGTTCGGCTCTATATCTTTA
CGCGTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTGTGTTCTAG
AATGCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGAATCAATTAGATTTATGATAATGTG
ATATCGAATTCACGCTT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4F953TF 497 0 0
GGAAAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCAGA
GATCGGAATCGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGGTTCCTCCT
CTTCCAAGATGGAGCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCG
CGACTCACTACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGC
CACATCTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGAATGATCCCTCTATTTCATCACCATCATC
GTCAAAACCAGATCAGTCAATCGTTTCCGAATGTTTCTCTGGTTCGGCTCTATATCTTTA
CGCGTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTGTGTTCTAG
AATGCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGAATCAATTAGATTTATGATAATGTG
ATATCGAATTCACGCTT

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL5534Contig1 878 2 2 U
GGAAACCGGGAGAGGAGGGGAGAAACAGAAACGGAGAAGCAGTTCAGTTTGGTGATGAGG
CCGCAGATAGCTCTGTTCGGCGATTCAATAACTGCGCAGTCGTTCAGATCCGGCGGATGG
GGATCTGCTCTCGCCGACGCCTACTCTCGCAAAGCTGATGTCGTTGTGCGTGGCTACGGA
GGCTACAATACCCGATGGGCTCTCTTCTTGCTTCACCACATTTTCCCTCTCGGATCTTTG
ACTCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGG
ACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTT
CAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATT
GATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCATAATCAATCTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAG
CCTGAGAGAACAAACGAAACCACTGGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAG
GAACTCGGTCTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAG
AAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCACCTCACGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAA
GAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTC
CCTCACCATTCTCAGATCGACGGTGATAACCCATCCAAAGCTTTCCAAGAGCGTTGCTTA
TAAGAGATTTGATCGATTACAGCTCTTCTTTTGAGTTTTCATGCCATGTTTTATTACACC
GACCCATTTATAACTCTGTTAATAAATTCTCCTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B994TF U 1
AF RR4B994JQ C 231
BS 1 737 RR4B994TF
BS 738 878 RR4B994JQ

RD RR4B994TF 737 0 0
GGAAACCGGGAGAGGAGGGGAGAAACAGAAACGGAGAAGCAGTTCAGTTTGGTGATGAGG
CCGCAGATAGCTCTGTTCGGCGATTCAATAACTGCGCAGTCGTTCAGATCCGGCGGATGG
GGATCTGCTCTCGCCGACGCCTACTCTCGCAAAGCTGATGTCGTTGTGCGTGGCTACGGA
GGCTACAATACCCGATGGGCTCTCTTCTTGCTTCACCACATTTTCCCTCTCGGATCTTTG
ACTCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGG
ACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTT
CAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATT
GATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCATAATCAATCTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAG
CCTGAGAGAACAAACGAAACCACTGGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAG
GAACTCGGTCTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAG
AAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCACCTCACGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAA
GAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTC
CCTCACCATTCTCAGAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4B994JQ 648 0 0
CGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCT
CAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATCAG
AACAATGGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCC
ACCACCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCATAATCAATTTATGGTGAGAAAGC
TATGAAGGAGCCTGAGAGAACAAACGAAACCACTGGTATTTACGCACAACATTGTGTTGC
ATTAGCAGAGGAACTCGGTTTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGA
TGATTGGCAGAAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCACCTCACGCCTGAAGGCAATGGAGT
TGTTTATGAAGAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCC
TTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACGGTGATAACCCATCCAAAGCTTTCCAAGA
GCGTTGCTTATAAGAGATTTGATCGATTACAGCTCTTCTTTTGAGTTTTCATGCCATGTT
TTATTACACCGACCCATTTATAACTCTGTTAATAAATTCTCCTATTTC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5535Contig1 1026 2 2 U
GGAAAAACGGCAATTGGGTTTAAATAACGGGTCGTGTTCTTTATTCGGGTCAAAATTATG
GATCGGGCGTTTGTCTTCTTATTGTCTCTCTGCCTATTGTTGCAAACGTCTCTCTCGATC
GAGAATTTTCACCAGGCGTTTCCTATAGTGGAGCCTGATCCGAATCATACAAAGCTTCGG
CTTAGTAGAGAAGGTTTGGAAGCGATTAGTAGAATCACTACTCCTATTGCTGCTGTTGCG
GTATGTATGTCAAAAGTGTGATGTTTGACTCTGCTGCTTATCTACTATTAACTTTTTGGT
GTCTTCCTTATTATTATTTTTTATCTGAACCTGATCTGTTTTTTTTTTTTAACATTAGGT
AATTGGTCCATACCGTTCTGGAAAATCTTTTCTACTCAATCAGCTTCTTTCCCTTTCTTG
TTATGAAGTTAACTCACATTGCTTTCAAATACATTAGGTTTTGGTGTTGGACACATGCGT
GATACCAAAACAAAAGGTATCTGGGTGTGGGGAACACCACTAGAGCTAGAGATTGACGGA
GTTAAAACTTCCATTATTTACCTCGACACTGAAGGATTTGAAAGTGTTGGAAAGTTTAAT
GTTTATGACGACCGGTACCCATACATTTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAGACGTTTT
GTTTGATGAAGCTCTGAATATTTAATCAATTTTTTTTTTTAATGCTGGTTTTCAGAATAT
TTGCTCTGGCAACAGTTATGAGCTCTGTGCTTATCTATAATCTGCCTTAAACCATCCGCG
AAGCTGATATTTCTCGGCTCTCCTTTGCTGTTGAGTTAGCAGAAGAATTTTATGGAAGGT
TTGTTTCATAGTACTCAGCACTTGCTCTTTTTTTTGTTTTGTTAATAATATGCCTTTATT
TATGGATACTGACTAGCTTTCTATTTTGCATTGGCTCATGCCACTCGATTGATTAGAGTA
AAGGGACAAGACGTAGCTTTTGAACCGTCAAAGCTTCTGTGGCTTATCCAGCGTGATTTT
CTGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB92TF U 1
AF RR4DB92JQ C 351
BS 1 572 RR4DB92TF
BS 573 1026 RR4DB92JQ

RD RR4DB92TF 572 0 0
GGAAAAACGGCAATTGGGTTTAAATAACGGGTCGTGTTCTTTATTCGGGTCAAAATTATG
GATCGGGCGTTTGTCTTCTTATTGTCTCTCTGCCTATTGTTGCAAACGTCTCTCTCGATC
GAGAATTTTCACCAGGCGTTTCCTATAGTGGAGCCTGATCCGAATCATACAAAGCTTCGG
CTTAGTAGAGAAGGTTTGGAAGCGATTAGTAGAATCACTACTCCTATTGCTGCTGTTGCG
GTATGTATGTCAAAAGTGTGATGTTTGACTCTGCTGCTTATCTACTATTAACTTTTTGGT
GTCTTCCTTATTATTATTTTTTATCTGAACCTGATCTGTTTTTTTTTTTTAACATTAGGT
AATTGGTCCATACCGTTCTGGAAAATCTTTTCTACTCAATCAGCTTCTTTCCCTTTCTTG
TTATGAAGTTAACTCACATTGCTTTCAAATACATTAGGTTTTGGTGTTGGACACATGCGT
GATACCAAAACAAAAGGTATCTGGGTGTGGGGAACACCACTAGAGCTAGAGATTGACGGA
GTTAAAACTTCCATTATTTACCTCGACACTGA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4DB92JQ 676 0 0
AACATTAGGTAATTGGTCCATACCGTTCTGGAAAATCTTTTCTACTCAATCAGCTTCTTT
CCCTTTCTTGTTATGAAGTTAACTCACATTGCTTTCAAATACATTAGGTTTTGGTGTTGG
ACACATGCGTGATACCAAAACAAAAGGTATCTGGGTGTGGGGAACACCACTAGAGCTAGA
GATTGACGGAGTTAAAACTTCCATTATTTACCTCGACACTGAAGGATTTGAAAGTGTTGG
AAAGTTTAATGTTTATGACGACCGGTACCCATACATTTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA
TAGACGTTTTGTTTGATGAAGCTCTGAATATTTAATCAATTTTTTTTTTTAATGCTGGTT
TTCAGAATATTTGCTCTGGCAACAGTTATGAGCTCTGTGCTTATCTATAATCTGCCTTAA
ACCATCCGCGAAGCTGATATTTCTCGGCTCTCCTTTGCTGTTGAGTTAGCAGAAGAATTT
TATGGAAGGTTTGTTTCATAGTACTCAGCACTTGCTCTTTTTTTTGTTTTGTTAATAATA
TGCCTTTATTTATGGATACTGACTAGCTTTCTATTTTGCATTGGCTCATGCCACTCGATT
GATTAGAGTAAAGGGACAAGACGTAGCTTTTGAACCGTCAAAGCTTCTGTGGCTTATCCA
GCGTGATTTTCTGCGT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5536Contig1 844 2 2 U
GGGGTCCGTGCCCAATCTTCTTCATCATCATCTTCGTCTCCCCTTCAGCGACATCTTCAT
TAGTGTTATCGATTCATTCAACAACAGACCCACATCATCTGATTCACCAGGTCTAGTCTC
TCTCGTTGAGGCTTTGGTTCGTGAAGGACTCTGCAGTCTACAATGTCCACGTCTGTGCTC
CTCAAACGGACTCCTGTGGACTGCATCTCGTTAGGATTATCTGGAGCGAAGCTTTTCGCT
TGGTCGAAACCAACACTGGTGACTAGTGGAATCAATCAGAGATCAAGCTGTGGTTATCAA
ATGTTCTACTCCGGTGCAGTAGCTGGAGCTAGGGAGGGAAGCCTTGATTTCTGGAGTACC
CTCTTTGTCAATATCACTCAACTGGAAGAAAGATGAGAGCCAAGAAAATGACTTTAAAGA
TGCTGTTGGTGTCTGTTTACCTTTGATAAACGCACTAATCAGAGACATCGAGAAAGGGAT
TTTTCCCAAAAGATTGCTCTCTCAACGTAGAAATTCCAACATCACCCTCATCAAACAAGG
GTTTTTTAAGGTAACAAAGCAAAGCATGTGGAGGCAGTGTCCTAGCTGGCAAGCTGTTTC
AGCTAACTGTCACCCTGGTGCTGGGAATTTCATGTCCAACCAGCAAAGCCTAGGAGCTCA
ACTCGCCCAGCTTGGTAGAGATGCTTCATGCTTCATCTGCTGTGAGTGACAGACGAAGAC
GATAACGATTCGAATAGTCCGTAGGACTTAACTTATGTTCTAAAGCACGATCGCTTCTTT
AAGACCGTGTTCATATCGTTCTTTTTACTTGCTCTTTTGGGACCTTTTTTTTTGTTTAAA
GAGC


BQ
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AF RR4C219TF U 1
AF RR4C219JQ C 26
BS 1 538 RR4C219TF
BS 539 844 RR4C219JQ

RD RR4C219TF 547 0 0
GGGGTCCGTGCCCAATCTTCTTCATCATCATCTTCGTCTCCCCTTCAGCGACATCTTCAT
TAGTGTTATCGATTCATTCAACAACAGACCCACATCATCTGATTCACCAGGTCTAGTCTC
TCTCGTTGAGGCTTTGGTTCGTGAAGGACTCTGCAGTCTACAATGTCCACGTCTGTGCTC
CTCAAACGGACTCCTGTGGACTGCATCTCGTTAGGATTATCTGGAGCGAAGCTTTTCGCT
TGGTCGAAACCAACACTGGTGACTAGTGGAATCAATCAGAGATCAAGCTGTGGTTATCAA
ATGTTCTACTCCGGTGCAGTAGCTGGAGCTAGGGAGGGAAGCCTTGATTTCTGGAGTACC
CTCTTTGTCAATATCACTCAACTGGAAGAAAGATGAGAGCCAAGAAAATGACTTTAAAGA
TGCTGTTGGTGTCTGTTTACCTTTGATAAACGCACTAATCAGAGACATCGAGAAAGGGAT
TTTTCCCAAAAGATTGCTCTCTCAACGTAGAAATTCCAACATCACCCTCATCAAACAA
AGGGTTTTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4C219JQ 819 0 0
CATCATCTTCGTCTCCC*TTCAGCGACATCTTCATTAGTGT*ATCGAT*CAT*CAACAAC
AGACCCACATCATCTGAT*CACCAGGTCTAGTCTCTCTCGTTGAGGCTTTGGTTCGTGAA
GGACTCTGCAGTCTACAATGTCCACGTCTGTGCTCCTCAAACGGACTCCTGTGGACTGCA
TCTCGTTAGGATTATCTGGAGCGAAGCTTTTCGCTTGGTCGAAACCAACACTGGTGACTA
GTGGAATCAATCAGAGATCAAGCTGTGGTTATCAAATGTTCTACTCCGGTGCAGTAGCTG
GAGCTAGGGAGGGAAGCCTTGATTTCTGGAGTACCCTCTTTGTCAATATCACTCAACTGG
AAGAAAGATGAGAGCCAAGAAAATGACTTTAAAGATGCTGTTGGTGTCTGTTTACCTTTG
ATAAACGCACTAATCAGAGACATCGAGAAAGGGATTTTTCCCAAAAGATTGCTCTCTCAA
CGTAGAAATTCCAACATCACCCTCATCAAACAAGGGTTTTTTAAGGTAACAAAGCAAAGC
ATGTGGAGGCAGTGTCCTAGCTGGCAAGCTGTTTCAGCTAACTGTCACCCTGGTGCTGGG
AATTTCATGTCCAACCAGCAAAGCCTAGGAGCTCAACTCGCCCAGCTTGGTAGAGATGCT
TCATGCTTCATCTGCTGTGAGTGACAGACGAAGACGATAACGATTCGAATAGTCCGTAGG
ACTTAACTTATGTTCTAAAGCACGATCGCTTCTTTAAGACCGTGTTCATATCGTTCTTTT
TACTTGCTCTTTTGGGACCTTTTTTTTTGTTTAAAGAGC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL5537Contig1 630 2 1 U
TTTTTGAGAGTAATATAACAAAAGTTGCAAGGGTTTTCTGCTAAAGTCATTGCGCGATGG
ATAGAGTTGAATCTTATATGTTTAATTTCAACGGTGATCAGTCTTCTTCTGAGTCTTTCT
CTTCTTCTTCGGCATCTTCTTCAATTGGGAGGAACAGCGACGAGGAAGAAGAGTTTCACG
GCGACGGAGAAGAGAACAACGAAGCTGAGTCTTCCTACAAAGGTCCTCTTGATTTGATGG
AATCTCTCGAAGAAGTCTTGCCCGTTAGGAAAGGGATATCGAACTATTACAGCGGGAAGT
CGAAGTCTTTCACGAACTTAGCGGCGGCTGCGTCGGCGTTGAGTTCCTCCTCGTCGATGA
AAGACTTGGCGAAGCCGGAGAATCCATACAGCCGTCGTCGGAGGAATCTCCTCTGCCATC
AGATCTGGGAGATCGTACTCGGTGGCGGATATTCCGAGGTGTTTTCCGGCGACGGCTAGT
GGTATTGGGTCCAGCGACTCGTAGGGATGTTAACAGTTGTTTTATTAATCAAATCTTATG
TTTTAAAGTTTAACCCTTTTTAGTTTTTTTTTCTTTTGGAGTAACGTCCGGAGAATGTAT
ATACGAGTTTCAATCAAATCTTTGAAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DM49TF U 1
AF RR4DM49JQ C 136
BS 1 630 RR4DM49TF

RD RR4DM49TF 630 0 0
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ATACGAGTTTCAATCAAATCTTTGAAATGG

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DS 

RD RR4DM49JQ 495 0 0
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TACTCGGTGGCGGATATTCCGAGGTGTTTTCCGGCGACGGCTAGTGGTATTGGGTCCAGC
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CTTTTTAGTTTTTTTTTCTTTTGGAGTAACGTCCGGAGAATGTATATACGAGTTTCAATC
AAATCTTTGAAATGG

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 2

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GCCTTAGGCCGAAACCTAACGACCCTGGAGACGCTCTGGTTCGAATACTCCGCCACGAAG
TCAGATTACTACCTCTACTGCCACAACATCCTCTTCCTCTTCCTCATCTTCTCCCTCGTC
CCTCTCCCTCTCGTCTTCCTCGAACTGGCTCGATCCGCCTGGTTCGATCGGTACAAGATC
CAGCCCAAGGTCAAGAACTCCTTCTCCGACATGTTCCGTTGCTACCGAGACGTCATGAAG
ATGTTCCTCCTCGTCGTCGGCCCTCTCCAGCTCGTCTCTTATCCTTTCCATCCAGATGAT
TGAGATTCGAAGTGGGTTGCCGTTACCGTCTTTCGGGGAGATTGCGGCGCAGTTAGTGGT
TTACTTTTTGGTAGAGGATTATACGAACTATTGGGTTCATAGATTCTTTCATAGCAAGTG
GGGTTATGAGAAGATTCATCATATCCATCATGAGTACACTGCTCCTATTGGGTATGCTGC
TCCTTATGCCCATTGGGCTGAGGTTTTGCTTCTTGGGGTTCCGACTTTTCTTGGTCCTGC
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CATTGAGACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGACTCTGACGAAATTCATTCCGTTCTA
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GTAGTTTAGTTTTCTTCTCTTTTCTGCTATGTGTTGTCACATGGAAATGCTCCTTCGTTT
TCCATCGGTGTGCGTCTTTTTCGTATTGTTTTTCTTTGTTTAAACTCTTTTTAAGTAAGG
CATTTATGATTTTGTATGGTG


BQ
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AF RR4AC42TF U 1
AF RR4AC42JQ C 323
BS 1 406 RR4AC42TF
BS 407 407 RR4AC42JQ
BS 408 822 RR4AC42TF
BS 823 1221 RR4AC42JQ

RD RR4AC42TF 822 0 0
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CCTCTCCCTCTCGTCTTCCTCGAACTGGCTCGATCCGCCTGGTTCGATCGGTACAAGATC
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ATGTTCCTCCTCGTCGTCGGCCCTCTCCAGCTCGTCTCTTATCCTT*CCATCCAGATGAT
TGAGATTCGAAGTGGGTTGCCGTTACCGTCTTTCGGGGAGATTGCGGCGCAGTTAGTGGT
TTACTTTTTGGTAGAGGATTATACGAACTATTGGGTTCATAGATTCTTTCATAGCAAGTG
GGGTTATGAGAAGATTCATCATATCCATCATGAGTACACTGCTCCTATTGGGTATGCTGC
TCCTTATGCCCATTGGGCTGAGGTTTTGCTTCTTGGGGTTCCGACTTTTCTTGGTCCTGC
TATTGCTCCTGGTCACATGATTACCTTCTGGTTGTGGATTGCTTTACGTCAGATTGAAGC
CATTGAGACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGACTCTGACGAAATTCATTCCGTTCTA
TGGTGGAGCTGAGTATCATGATTACCATCATTACGTTGGAGG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AC42JQ 899 0 0
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ATCCATCATGAGTACACTGCTCCTATTGGGTATGCTGCTCCTTATGCCCATTGGGCTGAG
GTTTTGCTTCTTGGGGTTCCGACTTTTCTTGGTCCTGCTATTGCTCCTGGTCACATGATT
ACCTTCTGGTTGTGGATTGCTTTACGTCAGATTGAAGCCATTGAGACTCACAGCGGATAT
GATTTTCCATGGACTCTGACGAAATTCATTCCGTTCTATGGTGGAGCTGAGTATCATGAT
TACCATCATTACGTTGGAGGACAAAGCCAAAGCAACTTTGCTTCAGTTTTCACTTACTGC
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CCTGAAATTTGTTACGGAGGGTTGAGTTTACTTGTCATAAAGATAAGTTTATAAGCAGTC
TGCTAATCTAATCAAAGTCAAGAGTCGCGAAAGAAAGTGTAGTTTAGTTTTCTTCTCTTT
TCTGCTATGTGTTGTCACATGGAAATGCTCCTTCGTTTTCCATCGGTGTGCGTCTTTTTC
GTATTGTTTTTCTTTGTTTAAACTCTTTTTAAGTAAGGCATTTATGATTTTGTATGGTG

QA 1 899 1 899
DS 



AS 1 2

CO CL5539Contig1 793 2 3 U
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GGACTACATTCTTCCCATCGGCCTTGATAACTGCATCCTTTGGAGCACGGAGTGCAACAT
GAAGCACTGACCTGTTCTCCGTACTGTTAATCTGAGGAAGCCATTACAAAAAAAGTTACA
CAAACACTAGAGAACGATACAAGAGAGATGAGAAACGGGAAAAGGTCTACATGTCACTGC
AATCATTGTTTCATATACACTCTCTGGCAGAGTCTAGCTAGCATATAAAATTGTCTAAGT
TTATATCGATAAGATCAAAACAAAGTGAGATTAACAGAGCTTTAAGTTAGAGGATAGGAT
ACACTTACATGCTCCCCGTTGAACATGCGGCTAATCTTCTCTGACAACCGTGCAGCCTGC
ATATATAAAAACAAATGATTAGAAATCTCGACATAAAATAAATCTACCAATAAAAAACAC
CTCTCATCCTCACACCTTAGCCAAGTTCAGAAGCTTGTCCATTTGTCTCCACAGTTGCAC
GCTGTCGAGAATAATCCAACAGCAGCCCCTCAAATTCCCTGATTAAAAGGCATACCAAGA
AAGCAACGGTAAACAAGTTTTTCTTTCAAAAAAATACCAAGACTCAAAACAAAAGCATCC
ACATTCTCATTATCTTAAAATATTGAATTAAAAAAAAAGAAGACATACAACATCATGGAC
TCGCATCTGTGTGCATCACTCATCAAATCACGCAAATGAGTCTTGTTAACATCTTCAACA
TGACCCTGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS91TF U 36
AF RR4AS91JQ C 1
BS 1 35 RR4AS91JQ
BS 36 746 RR4AS91TF
BS 747 793 RR4AS91JQ

RD RR4AS91TF 715 0 0
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CGGGAAAAGGTCTACATGTCACTGCAATCATTGTTTCATATACACTCTCTGGCAGAGTCT
AGCTAGCATATAAAATTGTCTAAGTTTATATCGATAAGATCAAAACAAAGTGAGATTAAC
AGAGCTTTAAGTTAGAGGATAGGATACACTTACATGCTCCCCGTTGAACATGCGGCTAAT
CTTCTCTGACAACCGTGCAGCCTGCATATATAAAAACAAATGATTAGAAATCTCGACATA
AAATAAATCTACCAATAAAAAACACCTCTCATCCTCACACCTTAGCCAAGTTCAGAAGCT
TGTCCATTTGTCTCCACAGTTGCACGCTGTCGAGAATAATCCAACAGCAGCCCCTCAAAT
TCCCTGATTAAAAGGCATACCAAGAAAGCAACGGTAAACAAGTTTTTCTTTCAAAAAAAT
ACCAAGACTCAAAACAAAAGCATCCACATTCTCATTATCTTAAAATATTGAATTAAAAAA
AAAGAAGACATACAACATCATGGACTCGCATCTGTGTGCATCACTCATCAA
TCAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4AS91JQ 793 0 0
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GGACTACATTCTTCCCATCGGCCTTGATAACTGCATCCTTTGGAGCACGGAGTGCAACAT
GAAGCACTGACCTGTTCTCCGTACTGTTAATCTGAGGAAGCCATTACAAAAAAAGTTACA
CAAACACTAGAGAACGATACAAGAGAGATGAGAAACGGGAAAAGGTCTACATGTCACTGC
AATCATTGTTTCATATACACTCTCTGGCAGAGTCTAGCTAGCATATAAAATTGTCTAAGT
TTATATCGATAAGATCAAAACAAAGTGAGATTAACAGAGCTTTAAGTTAGAGGATAGGAT
ACACTTACATGCTCCCCGTTGAACATGCGGCTAATCTTTTCTGACAACCGTGCAGCCTGC
ATATATAAAAACAAATGATTAGAAATCTCGACATAAAATAAATCTACCAATAAAAAACAC
CTCTCATCCTCACACCTTAGCCAAGTTCAGAAGCTTGTCCATT*GTCTCCACAGTTGCAC
GCTGTCGAGAATAATCCAACAGCAGCCCCTCAAATTCCCTGATTAAAAGGCATACCAAGA
AAGCAACGGTAAACAAGTTTTTCTTTCAAAAAAATACCAAGACTCAAAACAAAAGCATCC
ACATTCTCATTATCTTAAAATATTGAATTAAAAAAAAAGAAGACATACAACATCATGGAC
TCGCATCTGTGTGCATCACTCATCAAATCACGCAAATGAGTCTTGTTAACATCTTCAACA
TGACCCTGCAACC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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GGATGATGCCATTGACTTAAAAAGTTTGCCTTTGTTCATTCCACATGATTGTGGAAGATC
TGGGAGCCATCTTCTCCATATGCGGCGCAAAGGTATGGAGAACAAAAACCGTGGAGATTC
ATCAGCTATGTAATGGCACTAAACCACGAGGATCTCAAGCATCTGAGACACTCCTTTCGA
GATTTTGATTGAATAGAGTTACTTTCGTTTGGCATGTGTGTGTGACTATAAAATATACTC
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GAAGAATTTGTGTGTGGGGAGTCCATGGTACAGTTACATAGATACATCTAGTTATGTTAC
ACATCAGGCTTATGCTTCAAGCACTTCATCCTCTTCACTCATGTATATCATTATAAGTTT
TCTTTTAGCTCAATGACTAGGAGGTTTTGAATCCGTAGCTCAGCACATAGCAAGACACAG
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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4HA05TF U 1
AF RR4HA05JQB C 3
BS 1 496 RR4HA05TF
BS 497 579 RR4HA05JQB

RD RR4HA05TF 496 0 0
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GGATGATGCCATTGACTTAAAAAGTTTGCCTTTGTTCATTCCACATGATTGTGGAAGATC
TGGGAGCCATCTTCTCCATATGCGGCGCAAAGGTATGGAGAACAAAAACCGTGGAGATTC
ATCAGCTATGTAATGGCACTAAACCACGAGGATCTCAAGCATCTGAGACACTCCTTTCGA
GATTTTGATTGAATAGAGTTACTTTCGTTTGGCATGTGTGTGTGACTATAAAATATACTC
AGCACAAATCAGAACCTGTTTCCTATCTTGTTTGGAGGGTACACACTATGAAACAATCCT
GAAGAATTTGTGTGTGGGGAGTCCATGGTACAGTTACATAGATACATCTAGTTATGTTAC
ACATCAGGCTTATGCTTCAAGCACTTCATCCTCTTCACTCATGTATATCATTATAAGTTT
TCTTTTAGCTCAATGA

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4HA05JQB 577 0 0
GGTTGCAGAGGCAAGTGGGCGAGATGTGTTCTGGTTTTAGCAAGAAGCCGCCTCGCTTGG
ATGATGCCATTGACTTAAAAAGTTTGCCTTTGTTCATTCCACATGATTGTGGAAGATCTG
GGAGCCATCTTCTCCATATGCGGCGCAAAGGTATGGAGAACAAAAACCGTGGAGATTCAT
CAGCTATGTAATGGCACTAAACCACGAGGATCTCAAGCATCTGAGACACTCCTTTCGAGA
TTTTGATTGAATAGAGTTACTTTCGTTTGGCATGTGTGTGTGACTATAAAATATACTCAG
CACAAATCAGAACCTGTTTCCTATCTTGTTTGGAGGGTACACACTATGAAACAATCCTGA
AGAATTTGTGTGTGGGGAGTCCATGGTACAGTTACATAGATACATCTAGTTATGTTACAC
ATCAGGCTTATGCTTCAAGCACTTCATCCTCTTCACTCATGTATATCATTATAAGTTTTC
TTTTAGCTCAATGACTAGGAGGTTTTGAATCCGTAGCTCAGCACATAGCAAGACACAGAA
CCATGTAATATCTTTCCAATTTTTTTTTTCTGTTTAT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL5541Contig1 822 2 1 U
GGCTAAGAAAGTTTTATCAGTATAAAAACTCTAGTCCTTTTCCACTTATCATTTTAATTT
AAAATTCTTCTCTGCTTGGTTTCTTAATCACCAAACTCTGAGGCTCAGCTCTTTTCGAAA
AATAGAACTTAAAATAGATTTGCAAGTAAAGAAAGTTTGCAACGATGAACACAAGTTTTG
CTTCTCTGCGTTTGCATCTTCACCTGGTGACTCTAAAAGCCTTGACCTGTTCCAGTAGAT
TTTTGGCACGCTCGTTGGTTTTGAAGTGATCACGAACAGGTTGCAGCATTATATTCAATG
CTTTCACCAAGGCTTTCTTCAGATCTTCAGGAGCCAACTCGCCGCTCTCGTAGTCAGCAC
AAATATCTTCAAAGCTGTTGAAGGTCTTGTTACCGCCATCAAATTCAACCTTGAACTCAT
TGAATCGAGGTAGAACTAAGTATTTGACGTATTCAAGACATGGATTGCCTTCCACAGTTC
TTGGTGGGCAATAAGCTTGGCTGATCTTCTCACTAACATCAGCCTCCTCATCTTCCATAA
ATATGGCAGATGATGGATTACTTTTGGACATCTTCTCTTGTCCTTGTTGAAGACCAGGAA
GCATATGGTGGGACAAGATGATGGGTTTGTTCTTTCTCTTAATGTCATCACAGTATTCTC
TTGCTAACATGTTTACTTTCCTCTGATCCATCCCCAGCTGGCAAATATCAGCCTCCAGTA
AGAAAATATCCGCACACTGCATACAAGGGTAAAGAATTTGCGCTGCACTCAGCACCTCTG
TCTCACTACGTCCCATGATCTGCCCACACCTCAAGATTCGAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK90JQ U 1
AF RR4AL17JQ U 1
BS 1 822 RR4AK90JQ

RD RR4AK90JQ 822 0 0
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AAAATTCTTCTCTGCTTGGTTTCTTAATCACCAAACTCTGAGGCTCAGCTCTTTTCGAAA
AATAGAACTTAAAATAGATTTGCAAGTAAAGAAAGTTTGCAACGATGAACACAAGTTTTG
CTTCTCTGCGTTTGCATCTTCACCTGGTGACTCTAAAAGCCTTGACCTGTTCCAGTAGAT
TTTTGGCACGCTCGTTGGTTTTGAAGTGATCACGAACAGGTTGCAGCATTATATTCAATG
CTTTCACCAAGGCTTTCTTCAGATCTTCAGGAGCCAACTCGCCGCTCTCGTAGTCAGCAC
AAATATCTTCAAAGCTGTTGAAGGTCTTGTTACCGCCATCAAATTCAACCTTGAACTCAT
TGAATCGAGGTAGAACTAAGTATTTGACGTATTCAAGACATGGATTGCCTTCCACAGTTC
TTGGTGGGCAATAAGCTTGGCTGATCTTCTCACTAACATCAGCCTCCTCATCTTCCATAA
ATATGGCAGATGATGGATTACTTTTGGACATCTTCTCTTGTCCTTGTTGAAGACCAGGAA
GCATATGGTGGGACAAGATGATGGGTTTGTTCTTTCTCTTAATGTCATCACAGTATTCTC
TTGCTAACATGTTTACTTTCCTCTGATCCATCCCCAGCTGGCAAATATCAGCCTCCAGTA
AGAAAATATCCGCACACTGCATACAAGGGTAAAGAATTTGCGCTGCACTCAGCACCTCTG
TCTCACTACGTCCCATGATCTGCCCACACCTCAAGATTCGAC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AL17JQ 816 0 0
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AAAATTCTTCTCTGCTTGGTTTCTTAATCACCAAACTCTGAGGCTCAGCTCTTTTCGAAA
AATAGAACTTAAAATAGATTTGCAAGTAAAGAAAGTTTGCAACGATGAACACAAGTTTTG
CTTCTCTGCGTTTGCATCTTCACCTGGTGACTCTAAAAGCCTTGACCTGTTCCAGTAGAT
TTTTGGCACGCTCGTTGGTTTTGAAGTGATCACGAACAGGTTGCAGCATTATATTCAATG
CTTTCACCAAGGCTTTCTTCAGATCTTCAGGAGCCAACTCGCCGCTCTCGTAGTCAGCAC
AAATATCTTCAAAGCTGTTGAAGGTCTTGTTACCGCCATCAAATTCAACCTTGAACTCAT
TGAATCGAGGTAGAACTAAGTATTTGACGTATTCAAGACATGGATTGCCTTCCACAGTTC
TTGGTGGGCAATAAGCTTGGCTGATCTTCTCACTAACATCAGCCTCCTCATCTTCCATAA
ATATGGCAGATGATGGATTACTTTTGGACATCTTCTCTTGTCCTTGTTGAAGACCAGGAA
GCATATGGTGGGACAAGATGATGGGTTTGTTCTTTCTCTTAATGTCATCACAGTATTCTC
TTGCTAACATGTTTACTTTCCTCTGATCCATCCCCAGCTGGCAAATATCAGCCTCCAGTA
AGAAAATATCCGCACACTGCATACAAGGGTAAAGAATTTGCGCTGCACTCAGCACCTCTG
TCTCACTACGTCCCATGATCTGCCCACACCTCAAGA

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5542Contig1 499 2 1 U
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AGAAAATGGGTGGAGAGGAGGAATAACATACAAGGGAGTCACCGTACACACTCCGAAGAC
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AGCAAAGCAAGACGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGTCACCCCTGGGATGGCCATGGTGA
TCATGGTCACGGTGACCATCACTAGGTCTCCTTGAACCTTTTGAAGATCATGACGAGAAA
ATGGATCCTCTCTGTTTTATTTTCAGCTTCGTATGTCGAAATAAAGAGAACGTGAAGAAG
ACGTGATATTGTTTTTCTACACACCTTTGTAAGACTTGCTGCTTCTGTTTTTATCTGCTA
CTTCGGTTGGTGTTACTGATGATATTTGTTGTTTTGATTGTCTACAAACAAATGAGCTTT
AAAATATAATCGATTGCCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D202JQ C 1
AF RR4D202TF U 1
BS 1 499 RR4D202TF

RD RR4D202JQ 499 0 0
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AGCAAAGCAAGACGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGTCACCCCTGGGATGGCCATGGTGA
TCATGGTCACGGTGACCATCACTAGGTCTCCTTGAACCTTTTGAAGATCATGACGAGAAA
ATGGATCCTCTCTGTTTTATTTTCAGCTTCGTATGTCGAAATAAAGAGAACGTGAAGAAG
ACGTGATATTGTTTTTTTACACACCTTTGTAAGACTTGCTGCTTCTGTTTTTATCTGCTA
CTTCGGTTGGTGTTACTGATGATATTTGTTGTTTTGATTGTCTACAAACAAATGAGCTTT
AAAATATAATCGATTGCCT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4D202TF 499 0 0
GGATGGTGGTTGCATCGAAATCTCAGGTAGGAAAGAGTTGAAATTGCAATAGCGAATTTG
AGAAAATGGGTGGAGAGGAGGAATAACATACAAGGGAGTCACCGTACACACTCCGAAGAC
GTGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTCATGTGGTGCTGGATTCTGTACAG
AGCAAAGCAAGACGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGTCACCCCTGGGATGGCCATGGTGA
TCATGGTCACGGTGACCATCACTAGGTCTCCTTGAACCTTTTGAAGATCATGACGAGAAA
ATGGATCCTCTCTGTTTTATTTTCAGCTTCGTATGTCGAAATAAAGAGAACGTGAAGAAG
ACGTGATATTGTTTTTCTACACACCTTTGTAAGACTTGCTGCTTCTGTTTTTATCTGCTA
CTTCGGTTGGTGTTACTGATGATATTTGTTGTTTTGATTGTCTACAAACAAATGAGCTTT
AAAATATAATCGATTGCCT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL5543Contig1 645 2 4 U
GGAACGTTGGAGAGGGTGGTAGGCCATGGTGGTGAGGAACAGAGAATACAGAAAGAGATT
AAGAAATGGAAAGGAAAATGGTTCGGTCCAGGCGAAGATAACAGTGTTTACCAAAGCGAC
GCTAGCAACGAAAGCTTACAGGTTAGTCTTGGGCGTATTTTTGAAGCTATGGAGAGGTTT
TCAGCGGAATCTATGAGAGCTTATGATGATCTCTTGGAACGTGCTGCTGAAAAAGATAGC
AGCTCTCAAGAATCAGAGGGAGACTAACCAAAACGATGATTGTACACTTGTGGTGGAGAT
GATCATTCTTATGCCTGGCCATGGTTGCATGATCCGCCCTGACTTGGCTCTGTGGAGGTC
TATGGACCGGAGCACCAGACCTGAACCACTATGGTTGTAACTTAAAAGTTAACATATCAT
CTTTCTCAGACTCAGGCCAGAACCGGTTGATGAGACATGGGAGATGGGTCGATGCCCGAG
TGCTTGTACTAGTTAGGATGGTTGGCTACATGCCATGCTTGATGACTTGCCACAGATGTG
AAGGAGGGATGTATAACTTCTTCTGTGTTCATATTTCCTAACGGTTTGTTGATATTATTA
GTTGCACATATAATAACAGAAAATACTTTGGAAATTTTATGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FF24TF U 1
AF RR4FF24JQ C 229
BS 1 475 RR4FF24TF
BS 476 477 RR4FF24JQ
BS 478 612 RR4FF24TF
BS 613 645 RR4FF24JQ

RD RR4FF24TF 612 0 0
GGAACGTTGGAGAGGGTGGTAGGCCATGGTGGTGAGGAACAGAGAATACAGAAAGAGATT
AAGAAATGGAAAGGAAAATGGTTCGGTCCAGGCGAAGATAACAGTGTTTACCAAAGCGAC
GCTAGCAACGAAAGCTTACAGGTTAGTCTTGGGCGTATTTTTGAAGCTATGGAGAGGTTT
TCAGCGGAATCTATGAGAGCTTATGATGATCTCTTGGAACGTGCTGCTGAAAAAGATAGC
AGCTCTCAAGAATCAGAGGGAGACTAACCAAAACGATGATTGTACACTTGTGGTGGAGAT
GATCATTCTTATGCCTGGCCATGGTTGCATGATCCGCCCTGACTTGGCTCTGTGGAGGTC
TATGGACCGGAGCACCAGACCTGAACCACTATGGTTGTAACTTAAAAGTTAACATATCAT
CTTTCTCAGACTCAGGCCAGAACCGGTTGATGAGACATGGGAGATGGGTCGATGCTTGAG
TGCTTGTACTAGTTAGGATGGTTGGCTACATGCCATGCTTGATGACTTGCCACAGATGTG
AAGGAGGGATGTATAACTTCTTCTGTGTTCATATTTCCTAACGGTTTGTTGATATTATTA
GTTGCACATATA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4FF24JQ 417 0 0
GAAAAAGATAGCAGCTTTCAAGAATCAGAGGGAGACTAACCAAAACGATGATTGTACACT
TGTGGTGGAGATGATCATTCTTATGCCTGGCCATGGTTGCATGATCCGCCCTGACTTGGC
TCTGTGGAGGTCTATGGACCGGAGCACCAGACCTGAACCACTATGGTTGTAACTTAAAAG
TTAACATATCATCTTTTTCAGACTCAGGCCAGAACCGGTTGATGAGACATGGGAGATGGG
TCGATGCCCGAGTGCTTGTACTAGTTAGGATGGTTGGCTACATGCCATGCTTGATGACTT
GCCACAGATGTGAAGGAGGGATGTATAACTTTTTCTGTGTTCATATTTCCTAACGGTTTG
TTGATATTATTAGTTGCACATATAATAACAGAAAATACTTTGGAAATTTTATGAGGG

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL5544Contig1 891 2 2 U
GCCAGGATTCTCTAACCGGATCTCCAACGGAGAACCGGTCGAATTGGCTATCCGCAGCGG
CGTAGAAGAAGAAGACAACAAAAGCTTGGTAATTTCGTCGAACATGTGGTGGGCAGATCT
GAAAGCGGCTCTTGGGCAACGAATCAACGTAGAGGGCATCGTCTCTTCCGTCTCCGTGAT
CGTGAAAGATCGTCATTTGGTTCTCCCCCATGTTTCCGTCAGAGATTTACGCTACATTGA
CTGGGGAGAGCTGAGGCGAAAGGGGTTCAAGGGTGTAGTCTTCGATAAAGATAATACTCT
CACTGCTCCTTACTCTCTAGCGATCTGGCCACCCCTCAGGCCTTCTATTGAGCAGTGTAA
AGCCGTGTTTGGTCATGACATCGCCGTGTTTAGCAACTCCGCAGGGCTTACGGAGTATGA
TCACGATGATTCGAAAGCTAAAGCATTGGAGGCTGAAACAGGGATTAGAGTGTTGAGACA
TAAGACAAAGAAGCCTGCGGGAACTGCTGAAGAAGTTGAGAAACACTTTGGTTGCGCTTC
TTCAGAGCTAATCATGGTGGGTGATCGACCTTTCACGGATATTGTCTACGGGAACAGAAA
CGGGTTTCTAACTGTGTTAACTGAACCGTTGAGTCGAGCTGAGGAGCCTTTCATTGTTAG
ACAGGTGAGGAGATTAGAGTTGGCCTTGTTGAAACGTTGGTTGAGAAAAGGTTTGAAGCC
TGTGGATCACATTTTGGTATCAGATGTAACACCATTTGTTAAGGATCCTTCAGATTTATA
AGAAGGGTTCTCAGTTTGCTCAAGCAAAAACTCTGTTCCTTTTCTTTTTGGTGTAATGGA
AATTTTGACTTTTGGCTAAATGAGAAATGGTAATTCAAAGTTCGGGTTTCG


BQ
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AF RR4BB13TF U 1
AF RR4BB13JQ C 56
BS 1 758 RR4BB13TF
BS 759 891 RR4BB13JQ

RD RR4BB13TF 758 0 0
GCCAGGATTCTCTAACCGGATCTCCAACGGAGAACCGGTCGAATTGGCTATCCGCAGCGG
CGTAGAAGAAGAAGACAACAAAAGCTTGGTAATTTCGTCGAACATGTGGTGGGCAGATCT
GAAAGCGGCTCTTGGGCAACGAATCAACGTAGAGGGCATCGTCTCTTCCGTCTCCGTGAT
CGTGAAAGATCGTCATTTGGTTCTCCCCCATGTTTCCGTCAGAGATTTACGCTACATTGA
CTGGGGAGAGCTGAGGCGAAAGGGGTTCAAGGGTGTAGTCTTCGATAAAGATAATACTCT
CACTGCTCCTTACTCTCTAGCGATCTGGCCACCCCTCAGGCCTTCTATTGAGCAGTGTAA
AGCCGTGTTTGGTCATGACATCGCCGTGTTTAGCAACTCCGCAGGGCTTACGGAGTATGA
TCACGATGATTCGAAAGCTAAAGCATTGGAGGCTGAAACAGGGATTAGAGTGTTGAGACA
TAAGACAAAGAAGCCTGCGGGAACTGCTGAAGAAGTTGAGAAACACTTTGGTTGCGCTTC
TTCAGAGCTAATCATGGTGGGTGATCGACCTTTCACGGATATTGTCTACGGGAACAGAAA
CGGGTTTCTAACTGTGTTAACTGAACCGTTGAGTCGAGCTGAGGAGCCTTTCATTGTTAG
ACAGGTGAGGAGATTAGAGTTGGCCTTGTTGAAACGTTGGTTGAGAAAAGGTTTGAAGCC
TGTGGATCACATTTTGGTATCAGATGTAACACCATTTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4BB13JQ 836 0 0
AGCGGCGTAGAAGAAGAAGACAACAAAAGCTTGGTAATTTCGTCGAACATGTGGTGGGCA
GATCTGAAAGCGGCTCTTGGGCAACGAATCAACGTAGAGGGCATCGTCTCTTCCGTCTCC
GTGATCGTGAAAGATCGTCATTTGGTTCTCCCCCATGTTTCCGTCAGAGATTTACGCTAC
ATTGACTGGGGAGAGCTGAGGCGAAAGGGGTTCAAGGGTGTAGTCTTCGATAAAGATAAT
ACTCTCACTGCTCCTTACTCTCTAGCGATCTGGCCACCCCTCAGGCCTTCTATTGAGCAG
TGTAAAGCCGTGTTTGGTCATGACATCGCCGTGTTTAGCAACTCCGCAGGGCTTACGGAG
TATGATCACGATGATTCGAAAGCTAAAGCATTGGAGGCTGAAACAGGGATTAGAGTGTTG
AGACATAAGACAAAGAAGCCTGCGGGAACTGCTGAAGAAGTTGAGAAACACTTTGGTTGC
GCTTCTTCAGAGCTAATCATGGTGGGTGATCGACCTTTCACGGATATTGTCTACGGGAAC
AGAAACGGGTTTCTAACTGTGTTAACTGAACCGTTGAGTCGAGCTGAGGAGCCTTTCATT
GTTAGACAGGTGAGGAGATTAGAGTTGGCCTTGTTGAAACGTTGGTTGAGAAAAGGTTTG
AAGCCTGTGGATCACATTTTGGTATCAGATGTAACACCATTTGTTAAGGATCCTTCAGAT
TTATAAGAAGGGTTCTCAGTTTGCTCAAGCAAAAACTCTGTTCCTTTTCTTTTTGGTGTA
ATGGAAATTTTGACTTTTGGCTAAATGAGAAATGGTAATTCAAAGTTCGGGTTTCG

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL5545Contig1 783 2 14 U
ACATTGCAAGATCTTAATGATGCTCTCCTGCCATATCGAGAAGCAATGTCTGAAGACTCT
GGAAAATCTGAACAGACTGCAGAAGCCAAAGACATCATCAACAAGCTCAAAAGTGAGTTT
GAAGGAAAGATGTTAGACGATTTGAACACTGCCCATATACTCACGGGTGCTTACCAAGAT
GCATTGAAGTTCATCAATGCTTCCATCGGCAAGCTCAAGAAAATGCAGAAGAAACAGAGG
ATGTCACTGCTTGTGTCACTCATTGAGATTGAGAAAGCAGCAAGGGAAGTTCTGGATGTG
CTTGGTTTGCTCACTACCCTGAGCTATGCCGAGATTTTGAAAGAAATGAAACAGAAAACA
CTAACAAGGGCAGGATTGAGCGAAGAAGACATTTCACAAAAGATAGAAGAAAGGATAATG
GCGAGGAAGAACAAAGAGTTTGAGAAAAGTGATCAGATTAGAGCAGAACTGACAGTTAAA
GGAATAGCATTAATGGATATTGGCAAAGAAACTGTGTGGAGGCCATGCTTCCCTCTTCAG
GCCAATTCCAGCGATTAAGCAAAAGAAAAGTGAGATGGAGCACAGTCAACACTTTCTTCA
TCTCTCTCATTCTTCTTCTTTAGCCTTTTTTTAAGACTCCCTCTTTACTACTCTGTTTTT
AGAGTTGTCACAATGACTCCTAATAGACCGCTTGTTTCTGTTTTGTTCGTATCTGAATAT
TTACAATGACAATTATATCAATTGTGACTAAGTGTTACTTTGGTTATTACATGTTCTAGT
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RR4GS77JQ C 1
AF RR4AM66TF U 36
BS 1 36 RR4GS77JQ
BS 37 98 RR4AM66TF
BS 99 99 RR4GS77JQ
BS 100 100 RR4AM66TF
BS 101 101 RR4GS77JQ
BS 102 261 RR4AM66TF
BS 262 262 RR4GS77JQ
BS 263 339 RR4AM66TF
BS 340 340 RR4GS77JQ
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BS 540 542 RR4AM66TF
BS 543 543 RR4GS77JQ
BS 544 783 RR4AM66TF

RD RR4GS77JQ 580 0 0
ACATTGCAAGATCTTAATGATGCTCTCCTGCCATATCGAGAAGCAATGTCTGAAGACTCT
GGAAAATCTGAACAGACTGCAGAAGCCAAAGAGATCATCAACAAGCTCAAAAGTGAGTTT
GGAGGAAAGATGTTAGACGATTTGAATACTGCCCATATACTCACGGGTGCTTACCAAGAT
GCATTGAAGTTCATCAATGCTTCCATCGGCAAGCTCAAGAAAATGCAGAAGAAACAGAGG
ATGTCACTGCTTGTGTCACTCATTGAGATTGAGAAAGCAGCAAGGGAAGTTCTGGATGTG
CTTGGTTTGCTCACTACCCTGAGCTATGCCGAGATTTTGAAAGAAATGAAACAGAAAACA
CTAACAAGGGCAGGATTGAGCGAAGAAGACATTTCACAAAAGATAGAAGAAAGGATAATG
GCGAGGAAGAGCAAAGAGTTTGAGAAAAGTGATCAGATTAGAGCAGAACTGACAGTTAAA
GGAATAGCATTAATGGATATTGGCAAAGAAACTGTGTGGAGGCCATGCTTCCCTCTTCAG
GCCAATTCCAGTGATTAAGCAAAAGAACAGTGAGATGGAG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4AM66TF 748 0 0
G
CGAGAAGCAATGTCTGAAGACTCTGGAAAATCTGAACAGACTGCAGAAGCCAAAGACATC
ATTAGCAAGCTCAAAAGTGAGTTTGAAGGAAAGATGTTAGACGATTTGAACACTGCCCAT
ATACTCACGGGTGCTTACCAAGATGCATTGAAGTTCATCAATGCTTCCATCGGCAAGCTC
AAGAAAATGCAGAAGAAACAGAGGATGTCACTGCTTGTGTCACTCGTTGAGATTGAGAAA
GCAGCAAGGGAAGTTCTGGATGTGCTTGGTTTGCTCACTACCCTGAGCTATGCCGAGATT
TTGGAAGAAATGAAACAGAAAACACTAACAAGGGCAGGATTGAGCGAAGAAGACATTTCA
CAAAAGATAGAAGAAAGGATAATGGCGAGGAAGAACAAAGAGTTTGAGAAAAGTGATCAG
ATTAGAGCAGAACTGACAGTTAAAGGAATAGCATTAATGGATATTGGCAAAGAAACTGTG
TGGAGGCCATGCTTCCCTCTTCGGGCTAATTCCAGCGATTAAGCAAAAGAAAAGTGAGAT
GGAGCACAGTCAACACTTTCTTCATCTCTCTCATTCTTCTTCTTTAGCCTTTTTTTAAGA
CTCCCTCTTTACTACTCTGTTTTTAGAGTTGTCACAATGACTCCTAATAGACCGCTTGTT
TCTGTTTTGTTCGTATCTGAATATTTACAATGACAATTATATCAATTGTGACTAAGTGTT
ACTTTGGTTATTACATGTTCTAGTTTG

QA 2 748 2 748
DS 



AS 1 2

CO CL5546Contig1 818 2 2 U
GGGATTGGTCTCTAAAACACACTCACCATCCTGAAACCAACTATTTTTCTGAGCCATTGT
CGCTTGGACAAGCCTACGGTAGAGCAAGCCCATCTCTGGAACCTCCTCCAAGTACCCAAA
ACCTCTCTCTATTTGGTGGTGATTCAGACTCTGGACTTTTCCTCCCAACCACGGTTCCTC
GTTTTGGTAATTTTTCAGCAGATGCTACTGCTGATACCTCCTCAATGCCACTGACAGATT
CTGGATTTCAGAACACTACTTTGCAAGGAACTACCGAGTTAGCAGCACATGGGGTTGTTG
AACACAAAGAGAACTTTGTTAAGGTTTATAAATCTGGATCGGTGGGGAGATCACTGGACA
TATCACGGTTCAGCAGCTATCAAGAGCTGATAGAAGAGTTGGGTAAAATGTTTGACATCA
AAGGGTTGTTGGAAGACGCCTTTAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTCGTGGACAAGGAGG
ATGATATTCTTCTTCTCGGCGATGATCCTTGGGAGTCATTTGTGAACAGCGTTTGGTACA
TAAAGATACTGTCGCCGGATGATGTGCACAAAATGGGTGAACATGGGGAAGGCTCCTCCT
TCCCACAGAACCTGACCCATTTCTAGACAGTTGATAGATCTATCCTTGGGCATAGTTCTC
ATCATCACATGTTTCCCTTACTTATCTATTTGAATGCCTGTATGAACGTATCATTTCGCA
AGTTGAGTCTTAGAAACTTAAAAACACTTGTCTGGAACTGTCATAAAACATATGTTAGCA
ACGTTAACTCGTCTTGCTGTAAGACTTTCTGTTATCGT


BQ
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AF RR4H226TF U 1
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BS 1 577 RR4H226TF
BS 578 818 RR4H226JQ

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GTTTTGGTAATTTTTCAGCAGATGCTACTGCTGATACCTCCTCAATGCCACTGACAGATT
CTGGATTTCAGAACACTACTTTGCAAGGAACTACCGAGTTAGCAGCACATGGGGTTGTTG
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TATCACGGTTCAGCAGCTATCAAGAGCTGATAGAAGAGTTGGGTAAAATGTTTGACATCA
AAGGGTTGTTGGAAGACGCCTTTAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTCGTGGACAAGGAGG
ATGATATTCTTCTTCTCGGCGATGATCCTTGGGAGTCATTTGTGAACAGCGTTTGGTACA
TAAAGATACTGTCGCCGGATGATGTGCACAAAATGGG

QA 1 577 1 577
DS 

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GGTGATTCAGACTCTGGACTTTTCCTCCCAACCACGGTTCCTCGTTTTGGTAATTTTTCA
GCAGATGCTACTGCTGATACCTCCTCAATGCCACTGACAGATTCTGGATTTCAGAACACT
ACTTTGCAAGGAACTACCGAGTTAGCAGCACATGGGGTTGTTGAACACAAAGAGAACTTT
GTTAAGGTTTATAAATCTGGATCGGTGGGGAGATCACTGGACATATCACGGTTCAGCAGC
TATCAAGAGCTGATAGAAGAGTTGGGTAAAATGTTTGACATCAAAGGGTTGTTGGAAGAC
GCCTTTAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTCGTGGACAAGGAGGATGATATTCTTCTTTTC
GGCGATGATCCTTGGGAGTCATTTGTGAACAGCGTTTGGTACATAAAGATACTGTCGCCG
GATGATGTGCACAAAATGGGTGAACATGGGGAAGGCTCCTCCTTCCCACAGAACCTGACC
CATTTCTAGACAGTTGATAGATCTATCCTTGGGCATAGTTCTCATCATCACATGTTTCCC
TTACTTATCTATTTGAATGCCTGTATGAACGTATCATTTCGCAAGTTGAGTCTTAGAAAC
TTAAAAACACTTGTCTGGAACTGTCATAAAACATATGTTAGCAACGTTAACTCGTCTTGC
TGTAAGACTTTCTGTTATCGT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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ATGGTGGAGATGGCTGGCTACGGTGAACAGAAACTCTCTTCCGTAATCATCACTGGATCT
CTTCTCTGCGACACTTCACGTCCTCACCTTCCCTCTATAGCTATTCCGGGAGCAACGGTT
GCTATAAAGTGCCAAACTGGATACAAAAGGAGATCCAAATGGATTAAAGCTGTTACTGAT
GATTTGGGAGAGTTTGAAATCGATCTCCCTTCGCAACTCCACGCAATCCCCGACATGGAA
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ACCAATGCACAAAAACGTATCAAGCTTGTTTCCTCTACCAACGGCTTCCGAGTCTACACC
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CATTTTCAAACTAAAGATTTAAACATTTAAACAGTAAAATTTAATGTTTAGCTGGCGCTT
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TGATTTTTATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC85TF U 1
AF RR4EC85JQ C 180
BS 1 679 RR4EC85TF
BS 680 732 RR4EC85JQ

RD RR4EC85TF 679 0 0
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TTCTTGTTCTTGTTTGAAGGAGCGTTTGCAGCTGCAGGGAAGATATGGAGCAGAACAGAG
ATGGTGGAGATGGCTGGCTACGGTGAACAGAAACTCTCTTCCGTAATCATCACTGGATCT
CTTCTCTGCGACACTTCACGTCCTCACCTTCCCTCTATAGCTATTCCGGGAGCAACGGTT
GCTATAAAGTGCCAAACTGGATACAAAAGGAGATCCAAATGGATTAAAGCTGTTACTGAT
GATTTGGGAGAGTTTGAAATCGATCTCCCTTCGCAACTCCACGCAATCCCCGACATGGAA
AACACGTGCGTCGTTAAGCCAGTGCATGTGCCTAAGCTATATAGATGTAATCACAGATCA
ACCAATGCACAAAAACGTATCAAGCTTGTTTCCTCTACCAACGGCTTCCGAGTCTACACC
TCAGGGAAGATCAAGTTACAGGGGCACAGTTCAAGATCATAGTAAGCTGCATGGTGTCAA
CATTTTCAAACTAAAGATTTAAACATTTAAACAGTAAAATTTAATGTTTAGCTGGCGCTT
CAGTCACAGAACCGAGTCAGAGTCTCTCTACATTGATATCATGCTTCTACATTGTTTTTG
ATGTTTCCCACTATGTAAT

QA 1 679 1 679
DS 

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TGCTATAAAGTGCCAAACTGGATACAAAAGGAGATCCAAATGGATTAAAGCTGTTACTGA
TGATTTGGGAGAGTTTGAAATCGATCTCCCTTCGCAACTCCACGCAATCCCCGACATGGA
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AACCAATGCACAAAAACGTATCAAGCTTGTTTCCTCTACCAACGGCTTCCGAGTCTACAC
CTCAGGGAAGATCAAGTTACAGGGGCACAGTTCAAGATCATAGTAAGCTGCATGGTGTCA
ACATTTTCAAACTAAAGATTTAAACATTTAAACAGTAAAATTTAATGTTTAGCTGGCGCT
TCAGTCACAGAACCGAGTCAGAGTCTCTCTACATTGATATCATGCTTCTACATTGTTTTT
GATGTTTCCCACTATGTAATTAAGAAGGATGGTTGCATCATATGTGTAAAAAAGGTTCAC
ATGATTTTTATGC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL5548Contig1 760 2 7 U
GTTTATAATGATAGATAATTTCATAAATATTTGATCATCCGAATTTACATAGGCATAGGC
CAGACACACTTGCTGGTTTAAGGAGGATAACAACACAAACATATGAGAGACATGCATCAT
TCGAAAATAAGTAAACAAAACAAATAAAAGCTTTAATTAGGTTCCCTCTTCCTTCTCATC
CTCGCTAGTGCAGCTACTGTTGCTGCTCCACTCACACTTCAACGTAGATCTCGGAGAACC
ACAACACATTCCCAGCTTCTCAAACCTCTGATACATCACTATCCCTCTCTCTTCACCTAG
GGACTCCATAGTTGACTCTCTACATCCATAACCGTCTAGGTCTACTACACATAGACCTTT
GTAGTAACTCGTCTTTGCGATGCTAGAGTGTATGGCTACTGAGAATTGCTTTGGCTCAAA
ACACGTTAGAACCTTTGAGACAAGATAGCTCAAGTCCATGGTTTCGAAATCGTACCCCAC
TGCCTCAAAGCTAGCGTAGCTGAACCCGTCTTCAGGGGTTACGTGGATGGGGGGAGATGG
CCTCACCTTCCACGCTGTTAATAGAGTAACCGCATGGCTCGAACTCAAAGTCGCAGATTT
GGGATTGAGGAAGTATCTTTCTGATACCAGAGGTATCAGTCATGGAACTTGATTCGTTCT
TGTAGAACATAGATGCCTTGTCCTTGTCCAGACCAGTCATGCACATCTCTAACGTGTATA
CATTCTTGTTGTTTGAGCTCTTGGCAGGAGAAGAAGCTGA


BQ
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AF RR4B057JQ U 1
AF RR4BZ68JQ U 231
BS 1 530 RR4B057JQ
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BS 560 560 RR4BZ68JQ
BS 561 760 RR4B057JQ

RD RR4B057JQ 760 0 0
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TCGAAAATAAGTAAACAAAACAAATAAAAGCTTTAATTAGGTTCCCTCTTCCTTCTCATC
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GGACTCCATAGTTGACTCTCTACATCCATAACCGTCTAGGTCTACTACACATAGACCTTT
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CATTCTTGTTGTTTGAGCTCTTGGCAGGAGAAGAAGCTGA

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DS 

RD RR4BZ68JQ 513 0 0
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CGTACCCCACTGCCTCAAAGCTAGCGTAGCTGAACCCGTCTTCAGGGGTTACGTGGATGG
GGGGAGATGGCCTCACCTTCCACGCTGTTAATAGAGTAACCGCATGGCTCGAACTCAAAG
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AACGTGTATACATTCTTGTTGTTTGAGCTCTTG

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A462JQ C 1
AF RR4A462TF U 1
BS 1 711 RR4A462TF

RD RR4A462JQ 711 0 0
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TATGCTTTGACGAAATTATAGATGGCGGTATTGTCCTGGAGACGGATGCAAATGTGATAG
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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4A462TF 711 0 0
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CCCCAAAAGTGAAGAACATTTTGCTTCTTGATTCTGAAGGAAAGCGCATAGCGGCTAAGT
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CAAAGACTCAGAAAACAAATGCTCGCACCGAAGATATTCATTTCTTTGTTACGGGAGGTG
AAGAAGAAAACGAGCATATCTTAGCCAGTGTCCTTCAGGGTCTCTTCGATGCAGTGAATC
TCCTCCTCAGAGGCAATGTTGATAAGAGAGAGGCATTGGACAATCTTGATCTCATCTTTC
TATGCTTTGACGAAATTATAGATGGCGGTATTGTCCTGGAGACGGATGCAAATGTGATAG
CAGAAAAGGCAGGAATCAATAGCATTGACCCTAACGCTCTTCTGTCCTAGCAGACGATAA
GTCAGGCACTGGCGACTGCAAGAGAGCATTTGGCAAGGTCACTTCTGAAATGATGTGCGT
GTGTTACTTTCTGGTTGATGTTGGTTCGTTGTTATATAAGTATGAACTGAAAAACATGAC
TGTGTGCAAGTTTGTTTGTCTCTGTTGGTTCACTCTTAGTTACAACGAATTAGATTAAAA
AATAAATCGAAGTTTATATTTGTTTGTTTTATACAAAAGTAAATTACAAAT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL5550Contig1 1107 2 2 U
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TCTCCGCCTCATCGATGATCTCCCTCGCCGGAGGAGTTTTAATTATAACCAGACGCCCGA
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TGGAGATCATAGATTGCTTAACGAGGCTGACTACCTCATCGAGTTCGGCATCAAAGACGG
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CAGAGCTTTTAACAACCTCATCGCAAAGTTCCGTTTCAGGTGTTACTCGGACAAGGATGT
CTGGAACAGGAAAAAACTCATCTCTGAAAACATGAAATAAGACTCATTACTATCTCTGTC
TGCTAAACATTCTTCTCCTTTGGTTCTTTTGTAGAGATTTTTATTTCCCAATCTTCATGT
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GTTTTTAATAAAGATGATGTTTATATG


BQ
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AF RR4AD27TF U 1
AF RR4AD27JQ C 310
BS 1 804 RR4AD27TF
BS 805 1107 RR4AD27JQ

RD RR4AD27TF 804 0 0
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CTGTTTCCCTTCAAAGTATCTCCACTATCTCTCTCATCTTCTCCCACTCTGACACTCAAC
TTCCACGCTTTTGTCTTTCTTTAGTCAGGTAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAACCAGTTTC
TTGTTCTTGATTTTCTCCGATGGAAGTTCCACGCCGCTCTTTGGCTGCTTCTATCTCTCC
TCTCCGCCTCATCGATGATCTCCCTCGCCGGAGGAGTTTTAATTATAACCAGACGCCCGA
GGAGCCTATCAAACTCACTGTTCTCAAACTTGATGGATCTTCCTTTGATATTCAAGTGAT
GAAGACAGCTACAGTAGGGGAGCTCAAGATGGCTGTAGAAGCTGCCTTCTCGCACTTGCC
CATCACTGGCGTTGGCAAAGTCTCTTGGCCGCATGTTTGGGCACAGTTCTGCTTATCCTA
TGGAGATCATAGATTGCTTAACGAGGCTGACTACCTCATCGAGTTCGGCATCAAAGACGG
AGACCAGCTTCGGTTCATCCGCCATATATCGAACTACTGCACCATGATGGTGAACCATAA
TAGCAAGACACCACATGTTTCTTCTTTGAAACAACTCAAACTACCATCTAGATTCTCATT
CAAAACCGAAACCTGGAAAAAGAAAGCAACACAAGGACAAGAAGACGGTGGTGAATCCAT
CCCTAAGACACAACCAAGCTTTCTGTCGACTGTATTAGGAGGTTGGCTCTCTTACAAGTC
AACACCAAGTCAACGAGGGACTAA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AD27JQ 798 0 0
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CGTTGGCAAAGTCTCTTGGCCGCATGTTTGGGCACAGTTCTGCTTATCCTATGGAGATCA
TAGATTGCTTAACGAGGCTGACTACCTCATCGAGTTCGGCATCAAAGACGGAGACCAGCT
TCGGTTCATCCGCCATATATCGAACTACTGCACCATGATGGTGAACCATAATAGCAAGAC
ACCACATGTTTCTTCTTTGAAACAACTCAAACTACCATCTAGATTCTCATTCAAAACCGA
AACCTGGAAAAAGAAAGCAACACAAGGACAAGAAGACGGTGGTGAATCCATCCCTAAGAC
ACAACCAAGCTTTCTGTCGACTGTATTAGGAGGTTGGCTCTCTTACAAGTCAACACCAAG
TCAACGAGGGACTAAACACAGAAACGCGACTGCTTTTACGTCGAGTCACCTCAGAGCTTT
TAACAACCTCATCGCAAAGTTCCGTTTCAGGTGTTACTCGGACAAGGATGTCTGGAACAG
GAAAAAACTCATCTCTGAAAACATGAAATAAGACTCATTACTATCTCTGTCTGCTAAACA
TTCTTCTCCTTTGGTTCTTTTGTAGAGATTTTTATTTCCCAATCTTCATGTTTATATGTT
TGGAGGCATGAACAGCAATTTGTAAGAAACGAATGATAAGACGAATCTTTGGTTTTTAAT
AAAGATGATGTTTATATG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

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GATGCGGAGGGGCAAGATGGAGAGGGAGGAGGAAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAG
AAGAGCCGCAAAGCCATGCTCAAGCTCGGTATGAAACCCATCACCGGTGTCAGCCGTGTC
ACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTCTTCAAGAGC
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BQ
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AF RR4EO65TF U 1
AF RR4EO65JQ C 123
BS 1 621 RR4EO65TF
BS 622 837 RR4EO65JQ

RD RR4EO65TF 621 0 0
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GATGCGGAGGGGCAAGATGGAGAGGGAGGAGGAAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAG
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RD RR4EO65JQ 715 0 0
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TGCGGAGGGGCAAGATGGAGAGGGAGGAGGAAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAA
GAGCCGCAAAGCCATGCTCAAGCTCGGTATGAAACCCATCACCGGTGTCAGCCGTGTCAC
CGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTCATATCAAAACCTGATGTCTTCAAGAGCCC
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ATCGTCGTCGTCCAGCGCTGCTGCGGTGGTGCAGGATGACGATGATGAGGAAGTCGACGA
GGAAGGTGTTGAGCCAAAGGATATTGAGTTGGTGATGACACAAGCAGGTGTGCCCAGGCC
AAGGGCCGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATCGTCTCTGCCATCATGGAGCT
TACCACCTAAAACCAAAAACCTTTTCCAACTTTAGATGTGGTTTTAACTTGGGTTATATG
TGCCCCAGAGATTTTCAAGTTTTTGTTTCTATCTTGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAG
TATTACAGTTTGGTTTGTTATTCAATTATCAAGCGTCAGTGGTGAGTTTCAGACG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL5552Contig1 800 2 2 U
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AAGCAGAAGAAGAGAACAAGGTTTTGTCTCAACTTATCGAAACCCTCACACAAGAGCTTG
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AAGATGACCTCAAATTTATAGAGCAATCCAGGGTTATTGAACCGGATAGAATAACCGAGA
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AGAAGAAGAAGAACCAAGTTATGGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTG
CTTGGCTCTTCGCAAGAAAATTGGTCTAGTTGACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGT
TTATATGCCTTACATATTCTGAATAATAATCCCAAAACTGAAATAGTTCTTATTTTGGGG
ATTCATGCAACTTAAATTTGTAACAGTTTTCTTGTCGATTTGTAAGCAACTACATAGACA
AACTGGATCGTGTCAAATGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD79TF U 1
AF RR4BI66TF U 13
BS 1 733 RR4FD79TF
BS 734 800 RR4BI66TF

RD RR4FD79TF 733 0 0
GGGACCACAAACTTATACAACTAAAGCAAACAAAACAACCCTTAATCAGCTGCATTCTTG
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CTCTCTTCGGCGAGAGAATTCTTCTCGGAGATAATTACATCAACAAGTCTCTAGAGATAA
ACGGAATTAGAAGCAAAAGCATAGAAGCTGAGCTTGATGAAGTAAAGGAGAATCTTAGGA
AAGCAGAAGAAGAGAACAAGGTTTTGTCTCAACTTATCGAAACCCTCACACAAGAGCTTG
AAACGGCTAAGGAAAAGCTAAGGCACTCGGTCAGAAAATCCCCTGAACACCCTCAAGTTG
AAGATGACCTCAAATTTATAGAGCAATCCAGGGTTATTGAACCGGATAGAATAACCGAGA
TCAAGGTGAACCGGTTTGACGAAAATGAGGTGTGTGATGAGGATCGTTTTGAGAGGAGAC
GTTCGGTGAAGTTTGCGAATCCACCATTGTTAACGAAAGTCATCGAGAACAAAGAGGAGA
AGAAGAAGAAGAACCAAGTTATGGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTG
CTTGGCTCTTCGCAAGAAAATTGGTCTAGTTGACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGT
TTATATGCCTTACATATTCTGAATAATAATCCCAAAACTGAAATAGTTCTTATTTTGGGG
ATTCATGCAACTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4BI66TF 788 0 0
GG
ATACAACTAAAGCAAACAAAACAACCCTTAATCAGCTGCATTCTTGCAATGGTTCGCGCA
GAGATCGACACTGGAGCTCCTTTCCGGTTTGTTAAAGAAGCCGTCACTCTCTTCGGCGAG
AGAATTCTTCTCGGAGATAATTACATCAACAAGTCTCTAGAGATAAACGGAATTAGAAGC
AAAAGCATAGAAGCTTAGCTTGATGAAGTAAAGGAGAATCTTAGGAAAGCAGAAGAAGAG
AACAAGGTTTTGTCTCAACTTATCGAAACCCTCACACAAGAGCTTGAAACGGCTAAGGAA
AAGCTAAGGCACTCGGTCAGAAAATCCCCTGAACACCCTCAAGTTGAAGATGACCTCAAA
TTTATAGAGCAATCCAGGGTTATTGAACCGGATAGAATAACCGAGATCAAGGTGAACCGG
TTTGACGAAAATGAGGTGTGTGATGAGGATCGTTTTGAGAGGAGACGTTCGGTGAAGTTT
GCGAATCCACCATTGTTAACGAAAGTCATCGAGAGCAAAGAGGAGAAGAATAAGAAGAAC
CAAGTTATGGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTGCTTGGCTCTTCGCA
AGAAAATTGGTCTAGTTGACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGTTTATATGCCTTACA
TATTCTGAATAATAATCCCAAAACTGAAATAGTTCTTATTTTGGGGATTCATGCAACTTA
AATTTGTAACAGTTTTCTTGTCGATTTGTAAGCAACTACATAGACAAACTGGATCGTGTC
AAATGT

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 2

CO CL5553Contig1 677 2 1 U
GGAGATCATCGAGCACATCGTCCTTTTCAAGGTCAAAGACGACGTCGACTCCGACAAGAT
CGACGCCATGGTCGACGGCCTCAACAGCCTCGCCAGCATCGACCAAGTTCTTTACATCTC
CGCCGCTCCTATCCACAGTCTAAGATCCGCGTCCGCCTTCACTCACGTCCTCCACAGCCG
GTACAGGTCCAAGGAAGATCTCAGCGCGTACGTCGCACATCCCGACCACGTTCGCGTCGT
AGAGGCAACCATGCCGATATGGGGAGACATCATGTCCGTTGACTGGATCGCCGATCAAGC
CCCCGGAATCTTGAAACCCCCTGCAGGTTCTGTTGGGAAAGTGACGTTGCTGAAGGTGAA
AGAGAACGTCACCGAGGAGGCCAAGAAGGAGATTATGGAAGTGGTTAAGGAGAAGTCTCA
TGAGATTAGTGTGGGAGAAAACTTCTCTCCGGCGAGAGCAAAGGGTTTCTCGATTGCATC
GGTTGCGTATTTTGAGGATCTTGGAGAAGTTGAGGTGAACGAGGAGTTGGTGAAGGAGAA
GATTGGTGGTTACGTGGAAGATACCATTGTTGTTGAGTTCGTGGTTCCTACTTCTTAGTA
GCTTTTGTAAAAGGATCAGATTTTAAATTTCTTGAAGACTCTGTTATTGTATTTTTGTAA
TCCAAGAATGTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL84TF U 1
AF RR4GL84JQ C 149
BS 1 677 RR4GL84TF

RD RR4GL84TF 677 0 0
GGAGATCATCGAGCACATCGTCCTTTTCAAGGTCAAAGACGACGTCGACTCCGACAAGAT
CGACGCCATGGTCGACGGCCTCAACAGCCTCGCCAGCATCGACCAAGTTCTTTACATCTC
CGCCGCTCCTATCCACAGTCTAAGATCCGCGTCCGCCTTCACTCACGTCCTCCACAGCCG
GTACAGGTCCAAGGAAGATCTCAGCGCGTACGTCGCACATCCCGACCACGTTCGCGTCGT
AGAGGCAACCATGCCGATATGGGGAGACATCATGTCCGTTGACTGGATCGCCGATCAAGC
CCCCGGAATCTTGAAACCCCCTGCAGGTTCTGTTGGGAAAGTGACGTTGCTGAAGGTGAA
AGAGAACGTCACCGAGGAGGCCAAGAAGGAGATTATGGAAGTGGTTAAGGAGAAGTCTCA
TGAGATTAGTGTGGGAGAAAACTTCTCTCCGGCGAGAGCAAAGGGTTTCTCGATTGCATC
GGTTGCGTATTTTGAGGATCTTGGAGAAGTTGAGGTGAACGAGGAGTTGGTGAAGGAGAA
GATTGGTGGTTACGTGGAAGATACCATTGTTGTTGAGTTCGTGGTTCCTACTTCTTAGTA
GCTTTTGTAAAAGGATCAGATTTTAAATTTCTTGAAGACTCTGTTATTGTATTTTTGTAA
TCCAAGAATGTTTTACC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GL84JQ 529 0 0
GCGTCCGCCTTCACTCACGTCCTCCACAGCCGGTACAGGTCCAAGGAAGATTTCAGGGCG
TACGTCGCACATCCCGACCACGTTCGCGTCGTAGAGGCAACCATGCCGATATGGGGAGAC
ATCATGTCCGTTGACTGGATCGCCGATCAAGCCCCCGGAATCTTGAAACCCCCTGCAGGT
TTTGTTGGGAAAGTGACGTTGCTGAAGGTGAAAGAGAACGTCACCGAGGAGGCCAAGAAG
GAGATTATGGAAGTGGTTAAGGAGAAGTCTCATGAGATTAGTGTGGGAGAAAACTTTTTT
CCGGGGAGAGCAAAGGGTTTTTCGATTGCATCGGTTGCGTATTTTGAGGATCTTGGAGAA
GTTGAGGTGAACGAGGAGTTGGTGAAGGAGAAGATTGGTGGTTACGTGGAAGATACCATT
GTTGTTGAGTTCGTGGTTCCTACTTTTTAGTAGCTTTTGTAAAAGGATCAGATTTTAAAT
TTCTTGAAGACTCTGTTATTGTATTTTTGTAATCCAAGAATGTTTTACC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL5554Contig1 531 2 2 U
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AAACGCCGTTAGCAGACTGAGACTTGACGGATGACAACATGGTGTTTGCTATATCCAGAA
ACGCCTCTGCATCTGCAATTTGCTCCCTAGGCTTCTGAACTTTCTGGTGGAGGTTCTCAA
ATTCACTGAAAATTCTAGAGAATTTGTCAAAATCAACACTCGTCATATCATCTTTAGAAT
CGCTGATTTTGTTGATTAGAGCGAGATACTGAGATCTGAGAACCCTCCGATCAGATACTC
CCTGTTCATGTTCTTCTTCTTCTTCTCCCTGAGTCGGCTGCTCGTCGTTTCGCACGGAGG
TTGTAGCTACGCCTTTGTTCTTCTCCCTTTTCACAGACCTAAACCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A404TF C 1
AF RR4A404JQ U 28
BS 1 27 RR4A404TF
BS 28 531 RR4A404JQ

RD RR4A404TF 531 0 0
CAGTGTCCATAGGTCCCAACATAGTGGAACAGCCACACGAGACCAAAACAGTAGAACAGA
CAGCAAGCCCAAGATCATTCCATTTGATAGATACAGAGGCCGCAGTTTCATCAGCATCAT
CGATCCCTAGAGGAGCCTGACCAAACCCATTCACCAAAGCATTCACAAACTCAGCGGGAG
AAACGCCGTTAGCAGACTGAGACTTGACGGATGACAACATGGTGTTTGCTATATCCAGAA
ACGCCTCTGCATCTGCAATTTGCTCCCTAGGCTTCTGAACTTTCTGGTGGAGGTTCTCAA
ATTCACTGAAAATTCTAGAGAATTTGTCAGAATCAACACTCGTCATATCATCTTTAGAAT
CGCTGATTTTGTTGATTAGAGCGAGATACTGAGATCTGAGAACCCTCCGATCAGATACTC
CCTGTTCATGTTCTTCTTCTTCTTCTCCCTGAGTCGGCTGCTCGTCGTTTCGCACGGAGG
TTGTAGCTACGCCTTTGTTCTTCTCCCTTTTCACAGACCTAAACCTCTCCC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4A404JQ 504 0 0
AACAGCCACACGAGACCAAAACAGTAGAACAGACAGCAAGCCCAAGATCATTCCATTTGA
TAGATACAGAGGCCGCAGTTTCATCAGCATCATCGATCCCTAGAGGAGCCTGACCAAACC
CATTCACCAAAGCATTCACAAACTCAGCGGGAGAAACGCCGTTAGCAGACTGAGACTTGA
CGGATGACAACATGGTGTTTGCTATATCCAGAAACGCCTCTGCATCTGCAATTTGCTCCC
TAGGCTTCTGAACTTTCTGGTGGAGGTTCTCAAATTCACTGAAAATTCTAGAGAATTTGT
CAAAATCAACACTCGTCATATCATCTTTAGAATCGCTGATTTTGTTGATTAGAGCGAGAT
ACTGAGATCTGAGAACCCTCCGATCAGATACTCCCTGTTCATGTTCTTCTTCTTCTTCTC
CCTGAGTCGGCTGCTCGTCGTTTCGCACGGAGGTTGTAGCTACGCCTTTGTTCTTCTCCC
TTTTCACAGACCTAAACCTCTCCC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5555Contig1 736 2 2 U
GGAAAAGTGAAGGGGAGAAGGGAAGATTTCGTCCTAAAACCCTAGAAACTTGTAAATCCA
ATCCCAGTGAAAGAAAGGAGTCTCCGAGGATGAAAGGGAAGAGGAAGGAGATGAGTTCCA
TCTTCGATAACTGCCACGAAACCGCTTCTCAGGAGATTTTTCTACGGAGCTGCGGCTTCG
CTCAACGAGGCGTTATTCCAGATTCCGACCCCTCCCTCCTCCTCCTCGGAGCCTCCTCGC
CTTTAAATGAAATCGCATCTCGCCGTGATTCCCAGACGGATAGTGTAATCAATTCGGGTT
ACCAAGAGGAATTGGTGGAGAGCCATGCGGTTCGATTCGTCTCTCCCCCCGAAAGCCCTA
CTAATACCCTTGATTCAGAGGAGGATCATACGGTTCCTGTTCAATCAGCTAATCTGTTGT
CATCATCTCCAGCCAAGAAGAGGCTTAAAGTTCCTTTGAGGGATGTTGTGAAAGCCATCG
TTATGAACTCGAGGAGCACAGAGGAGGACGAAGACAGAGGGATTGAGAAGAACAAGAAGA
GGAGCTGTGTTCAGATCCTTATCGAAAAGGGATTCAATTTCCCTTGAGGGATGCCAAACA
TGGAGAATTGAGTGAGAATATATAAGTAATATATGAGTGTATGGTAATCCTCTTCACGTA
GCTTTTGGATGTGAATTACATATGTTCATTGATATGCTATTGGTGTTGGTAATGAGAATG
TCAAAACTCTTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4G590TF U 1
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BS 733 736 RR4G590JQ

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CTTTAAATGAAATCGCATCTCGCCGTGATTCCCAGACGGATAGTGTAATCAATTCGGGTT
ACCAAGAGGAATTGGTGGAGAGCCATGCGGTTCGATTCGTCTCTCCCCCCGAAAGCCCTA
CTAATACCCTTGATTCAGAGGAGGATCATACGGTTCCTGTTCAATCAGCTAATCTGTTGT
CATCATCTCCAGCCAAGAAGAGGCTTAAAGTTCCTTTGAGGGATGTTGTGAAAGCCATCG
TTATGAACTCGAGGAGCACAGAGGAGGACGAAGACAGAGGGATTGAGAAGAACAAGAAGA
GGAGCTGTGTTCAGATCCTTATCGAAAAGGGATTCAATTTCCCTTGAGGGATGCCAAACA
TGGAGAATTGAGTGAGAATATATAAGTAATATATGAGTGTATGGTAATCCTCTTCACGTA
GCTTTTGGATGTGAATTACATATGTTCATTGATATGCTATTGGTGTTGGTAATGAGAATG
TCAAAACTCTTG

QA 1 732 1 732
DS 

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TCAATTCGGGTTACCAAGAGGAATTGGTGGAGAGCCATGCGGTTCGATTCGTCTCTCCCC
CCGAAAGCCCTACTAATACCCTTGATTCAGAGGAGGATCATACGGTTCCTGTTCAATCAG
CTAATCTGTTGTCATCATCTCCAGCCAAGAAGAGGCTTAAAGTTCCTTTGAGGGATGTTG
TGAAAGCCATCGTTATGAACTCGAGGAGCACAGAGGAGGACGAAGACAGAGGGATTGAGA
AGAACAAGAAGAGGAGCTGTGTTCAGATCCTTATCGAAAAGGGATTCAATTTCCCTTGAG
GGATGCCAAACATGGAGAATTGAGTGAGAATATATAAGTAATATATGAGTGTATGGTAAT
CCTCTTCAGGTAGCTTTTGGATGTGAATTACATATGTTCATTGATATGCTATTGGTGTTG
GTAATGAGAATGTCAAAACTCTTGCTTC

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL5556Contig1 504 2 1 U
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ATAAGAATGTTGCTGGTGACGGTATTGGCCGAGATGTTGAAGGACTACACGGTGGTACTC
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ATATTATATTCTCTTCCTTTCCATCGCTCCAGTTCCTCTAACCCTCTTCTCCCTCCTCCT
CCTCCTCCTTACGCTCCTACTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGACTTTATGATTTT
TCTTTGAGTTGAGTCGTGTAATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATATTTCCTAATAAT
GCATCCTTTTGTTGAAAACACAAAAGAAACAAGTTACAGAGCTTTGTTTGTATCTCCTTT
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AAGAAGACTGTTTTTTTTTTTGAC


BQ
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AF RR4FF20JQ C 1
AF RR4FF20TF U 1
BS 1 504 RR4FF20TF

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ATAAGAATGTTGCTGGTGACGGTATTGGCCGAGATGTTGAAGGACTACACGGTGGTACTC
GCCGGAGCTTTGGAGTATCTCTTCTTTCAGGCGCCTTTTCCGAGGAGAATTCGACTTCAT
ATATTATATTCTCTTCCTTTCCATCGCTCCAGTTCCTCTAACCCTCTTCTCCCTCCTCCT
CCTCCTCCTTACGCTCCTACTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGACTTTATGATTTT
TCTTTGAGTTGAGTCGTGTAATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATATTTCCTAATAAT
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QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4FF20TF 504 0 0
GGAGTAAAAGAAACACACAGAGAACGAGAAAGAACAAGAAGATTCGATATAGAAAAAGTA
ATAAGAATGTTGCTGGTGACGGTATTGGCCGAGATGTTGAAGGACTACACGGTGGTACTC
GCCGGAGCTTTGGAGTATCTCTTCTCTCAGGCGCCTTTTCCGAGGAGAATTCGACTTCAT
ATATTATATTCTCTTCCTTTCCATCGCTCCAGTTCCTCTAACCCTCTTCTCCCTCCTCCT
CCTCCTCCTTACGCTCCTACTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGACTTTATGATTTT
TCTTTGAGTTGAGTCGTGTAATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATATTTCCTAATAAT
GCATCCTTTTGTTGAAAACACAAAAGAAACAAGTTACAGAGCTTTGTTTGTATCTCCTTT
TGTTATATTTTTCTTGAATCGATCTGTTAAAGAAGATTTTTGTATTGAAACCAATATGAG
AAGAAGACTGTTTTTTTTTTTGAC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5557Contig1 737 2 2 U
GGGGCAGGACCTACTTACTCCAACTCTCCTCCGCCCACTTCTGTTCCCATTCCCAAGTTC
TCTCTCCGGCAAAAGAGGACGGTATCTCTGACCTTTCCAGCTCCTGACCCTGATGTTGAT
CTTCCTGAAGTTGCCAAGTCTGCTCCGGTCTCTCCAACCTCGTCTGGTGTCAACCCGTTT
CACAGTACTGTCTCTGCAACTATGACACTGCGTCGCATGCTCAACCTTGAGACTGCGGAT
GAATGAAGATCAGGAGTCTTTAGGGGAACAAGCGGTTAACGTTTTCTATGTGAGAGATGC
TTCAGGAAATCCAGTGGACGTGAAGACGATAGATGCGTTACGTGGAGAGATCGGACACAG
TATGATGGTTAACGTGAAGAACAAGGTACCAAGCAGAAGAAGGAAAGAAGAAGGCCAAGC
TGGAACAGGAGGAAGATGGGCCAAAACCAGTTTCTTCTTTGGGAATTTGCTGGAAAAGTT
CTTGCCTTGAGAGACAAGGTAACTTATATATAAATGTTATAAAATTTGTGTGGATAAAAT
GTATTGTAAACTGTGTATTATGTATGATCTAGAACGTTTAGTAGAGTGTCTTGACTTGGT
CAGGATTTTGGTTTTACTTAGTCATATATTATGACCGTGAAGTGCACCGTTTGAAGTTTG
AACATGTCTATAGTAGAATAATATGGAACTTTTCCTTGGAAGATTTGCTTTTGTATATGA
AACTGTCCTTCTGACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4EK78TF U 1
AF RR4EK78JQ C 33
BS 1 733 RR4EK78TF
BS 734 737 RR4EK78JQ

RD RR4EK78TF 733 0 0
GGGGCAGGACCTACTTACTCCAACTCTCCTCCGCCCACTTCTGTTCCCATTCCCAAGTTC
TCTCTCCGGCAAAAGAGGACGGTATCTCTGACCTTTCCAGCTCCTGACCCTGATGTTGAT
CTTCCTGAAGTTGCCAAGTCTGCTCCGGTCTCTCCAACCTCGTCTGGTGTCAACCCGTTT
CACAGTACTGTCTCTGCAACTATGACACTGCGTCGCATGCTCAACCTTGAGACTGCGGAT
GAATGAAGATCAGGAGTCTTTAGGGGAACAAGCGGTTAACGTTTTCTATGTGAGAGATGC
TTCAGGAAATCCAGTGGACGTGAAGACGATAGATGCGTTACGTGGAGAGATCGGACACAG
TATGATGGTTAACGTGAAGAACAAGGTACCAAGCAGAAGAAGGAAAGAAGAAGGCCAAGC
TGGAACAGGAGGAAGATGGGCCAAAACCAGTTTCTTCTTTGGGAATTTGCTGGAAAAGTT
CTTGCCTTGAGAGACAAGGTAACTTATATATAAATGTTATAAAATTTGTGTGGATAAAAT
GTATTGTAAACTGTGTATTATGTATGATCTAGAACGTTTAGTAGAGTGTCTTGACTTGGT
CAGGATTTTGGTTTTACTTAGTCATATATTATGACCGTGAAGTGCACCGTTTGAAGTTTG
AACATGTCTATAGTAGAATAATATGGAACTTTTCCTTGGAAGATTTGCTTTTGTATATGA
AACTGTCCTTCTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4EK78JQ 705 0 0
GCCCACTTCTGTTCCCATTCCCAAGTTCTCTCTCCGGCAAAAGAGGACGGTATCTCTGAC
CTTTCCAGCTCCTGACCCTGATGTTGATCTTCCTGAAGTTGCCAAGTCTGCTCCGGTCTC
TCCAACCTCGTCTGGTGTCAACCCGTTTCACAGTACTGTCTCTGCAACTATGACACTGCG
TCGCATGCTCAACCTTGAGACTGCGGATGAATGAAGATCAGGAGTCTTTAGGGGAACAAG
CGGTTAACGTTTTCTATGTGAGAGATGCTTCAGGAAATCCAGTGGACGTGAAGACGATAG
ATGCGTTACGTGGAGAGATCGGACACAGTATGATGGTTAACGTGAAGAACAAGGTACCAA
GCAGAAGAAGGAAAGAAGAAGGCCAAGCTGGAACAGGAGGAAGATGGGCCAAAACCAGTT
TCTTCTTTGGGAATTTGCTGGAAAAGTTCTTGCCTTGAGAGACAAGGTAACTTATATATA
AATGTTATAAAATTTGTGTGGATAAAATGTATTGTAAACTGTGTATTATGTATGATCTAG
AACGTTTAGTAGAGTGTCTTGACTTGGTCAGGATTTTGGTTTTACTTAGTCATATATTAT
GACCGTGAAGTGCACCGTTTGAAGTTTGAACATGTCTATAGTAGAATAATATGGAACTTT
TCCTTGGAAGATTTGCTTTTGTATATGAAACTGTCCTTCTGACCT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5558Contig1 628 2 3 U
TTAAGCAAACTAATCAATCTCGGTGGAATTGCATTCCTAGACACCAAGTTAACGAACAAA
GTTATAGCCACCACGTCCGAAACCACCACGTCCAAACCCACCTCGACCAAATCCACCACG
GCCACCACCATACCCTCCCCTTCTTCCAAAACCACCTCCACCCCCTCCTGAATCAGCCGG
GTTCACTCCAATTATTCCCCCATCAAGTTCCTGATCATTCATCTGTTGCATTGCCTTATT
AGCAGCATCGATGGAATCATATGTTACAAAACCAAACCCCTTCAATACACCAGTTTCACG
GTCCGAAACCACTACCACATCAACGATTTTGCCAAATTTGTCAAAAACTTGTTTCAAGAT
ATCTACATCAGTAGTTGGTGAAAAACCTCCAACAAAAAGTTTGGATGGAGTCAAAAAAAG
ATTGCCCTGTAACATAGCGTTGGTGGCTTGCATAGCTCTAGGCTGCCTGAATATGTTTCC
AGCTTTACTAAACAAACCCATGTAATGCATCTTCTTCCAATTTTTTGAGTTTCTCTCTGT
GGATGATGATAATCTCTGGAACCGTCGCTCACTCGCCGTCTAGTGCAAAAACCTCCCCCA
AAGTCTTTCAGTTCTAAGCTCAACGGTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU70JQ U 3
AF RR4FU70TF C 1
BS 1 2 RR4FU70TF
BS 3 542 RR4FU70JQ
BS 543 628 RR4FU70TF

RD RR4FU70JQ 540 0 0
AAGCAAACTAATCAATCTCGGTGGAATTGCATTCCTAGACACCAAGTTAACGAACAAAGT
TATAGCCACCACGTCCGAAACCACCACGTCCAAACCCACCTCGACCAAATCCACCACGGC
CACCACCATACCCTCCCCTTCTTCCAAAACCACCTCCACCCCCTCCTGAATCAGCCGGGT
TCACTCCAATTATTCCCCCATCAAGTTCCTGATCATTCATCTGTTGCATTGCCTTATTAG
CAGCATCGATGGAATCATATGTTACAAAACCAAACCCCTTCAATACACCAGTTTCACGGT
CCGAAACCACTACCACATCAACGATTTTGCCAAATTTGTCAAAAACTTGTTTCAAGATAT
CTACATCAGTAGTTGGTGAAAAACCTCCAACAAAAAGTTTGGATGGAGTCAAAAAAAGAT
TGCCCTGTAACATAGCGTTGGTGGCTTGCATAGCTCTAGGCTGCCTGAATATGTTTCCAG
CTTTACTAAACAAACCCATGTAATGCATCTTCTTCCAATTTTTTGAGTTTCTCTCTGTGG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4FU70TF 628 0 0
TTAAGCAGACTAATCAATCTCGGTGGAATTGCATTCCTAGACACCAAGTTAACGAACAAA
GTTATAGCCACCACGTCCGAAACCACCACGTCCAAACCCACCTCGACCAAATCCACCACG
GCCACCACCATAGCCTCCCCTTCTTCCAAAACCACCTCCACCGCCTCCTGAATCAGCCGG
GTTCACTCCAATTATTCGCCCATCAAGTTCCTGATCATTCATCTGTTGCATTGCCTTATT
AGCAGCATCGATGGAATCATATGTTACGAAACCAAACCCCTTCGATACACCAGTTTCACG
GTCCGAAACCACTACCACATCAACGATTTTGCCAAATTTGTCAAAAACTTGTTTCAAGAT
ATCTACATCAGTAGTTGGTGAGAGACCTCCAACAAAGAGTTTGGATGGAGTCAAAGAAAG
ATTGCCCTGTAACATAGCGTTGGTGGCTTGCATAGCTCTAGGCTGCCTGAATATGTTTCC
AGCTTTACTAAACAAACCCATGTAATGCATCTTCTTCCAATTTTTTGAGTTTCTCTCTGT
GGATGATGATAATCTCTGGAACCGTCGCTCACTCGCCGTCTAGTGCAAAAACCTCCCCCA
AAGTCTTTCAGTTCTAAGCTCAACGGTC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL5559Contig1 1019 2 2 U
GGACTTTTGCTCTAATCAGTTTTAGTAGGCTAAACTTTCGAATATTAAATGGGTGTGTTC
ACTGGATTTGGTAGCTGGATCAATTTGAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGCCGAGTCCCAG
AGATCTGAAAATGGCGAATCTAAGTCGGAGTCAGAGAAAGACACTACTAAGAAGAAGGAG
GAGGAGGAGGTGGTGTATTATGATGAAAAAGAGGACACGAGACAAGAGGGACTTTGGCAT
GAAGCAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATACACCTCCCAAGATCAAGATGACAAATAAG
AAGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACGACTCCTAATATTGTCTAC
TACGTGATGACTGAAAGCGATCCGTTTTTCGATAGGGAGAAGTGGCGTTTCCTAATGAAA
AACACATCAAGAAAGGTTCTGAAGGAGAATGGTCCGAAGCGGGTCGTCATGGTAGAGAAA
GCTATGGCTTATAACTTCCTTTCGCTGACGACTATATCTATCCCGATACATCTAACTATG
GAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGATCAAGAACGGTTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAGA
GTCCAGAAGAATACAAAAAATGTAGCGGTGGCCAAGGAAGGATTGGGTCAAAACTTATAA
TAAACCAATACTTCCAGCCATATCCTCCATTTAATCTACCTCCGCTTTCTTGGTTCATCC
GTGGTTTCACCATCAAAACCTCCAAAAAAATGCTCAACTTGCTTCAGGACATGGCTTTTT
CTTTACGACAGGCAGGGCCTCCCTCAGAATAAGCCATCAAAGCGAGAGAGAACTATGTTG
TTGAATACATAATTTTTAGAAAATATAGAAGATTGTTAGTAAACATACAAAAAAAACTGT
TTATCGCGTATGATTATTTTGGTATCGACTACCGCAGCTGAAAATTGTTTTGTTTTTTTG
AAGTTGAAACTCCTAAAAGTTATTTGTGCTTTTAACATATCATAAGATTGAATGTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX74TF U 1
AF RR4CX74JQ C 233
BS 1 732 RR4CX74TF
BS 733 1019 RR4CX74JQ

RD RR4CX74TF 732 0 0
GGACTTTTGCTCTAATCAGTTTTAGTAGGCTAAACTTTCGAATATTAAATGGGTGTGTTC
ACTGGATTTGGTAGCTGGATCAATTTGAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGCCGAGTCCCAG
AGATCTGAAAATGGCGAATCTAAGTCGGAGTCAGAGAAAGACACTACTAAGAAGAAGGAG
GAGGAGGAGGTGGTGTATTATGATGAAAAAGAGGACACGAGACAAGAGGGACTTTGGCAT
GAAGCAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATACACCTCCCAAGATCAAGATGACAAATAAG
AAGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACGACTCCTAATATTGTCTAC
TACGTGATGACTGAAAGCGATCCGTTTTTCGATAGGGAGAAGTGGCGTTTCCTAATGAAA
AACACATCAAGAAAGGTTCTGAAGGAGAATGGTCCGAAGCGGGTCGTCATGGTAGAGAAA
GCTATGGCTTATAACTTCCTTTCGCTGACGACTATATCTATCCCGATACATCTAACTATG
GAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGATCAAGAACGGTTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAGA
GTCCAGAAGAATACAAAAAATGTAGCGGTGGCCAAGGAAGGATTGGGTCAAAACTTATAA
TAAACCAATACTTCCAGCCATATCCTCCATTTAATCTACCTCCGCTTTCTTGGTTCATCC
GTGGTTTCACCA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4CX74JQ 787 0 0
TTTGGCATGAAGCAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATACACCTCCCAAGATCAAGATGA
CAAATAAGAAGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACGACTCCTAATA
TTGTCTACTACGTGATGACTGAAAGCGATCCGTTTTTCGATAGGGAGAAGTGGCGTTTCC
TAATGAAAAACACATCAAGAAAGGTTCTGAAGGAGAATGGTCCGAAGCGGGTCGTCATGG
TAGAGAAAGCTATGGCTTATAACTTCCTTTCGCTGACGACTATATCTATCCCGATACATC
TAACTATGGAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGATCAAGAACGGTTGTGCAAAAAGAGGTT
ACCAAAGAGTCCAGAAGAATACAAAAAATGTAGCGGTGGCCAAGGAAGGATTGGGTCAAA
ACTTATAATAAACCAATACTTCCAGCCATATCCTCCATTTAATCTACCTCCGCTTTCTTG
GTTCATCCGTGGTTTCACCATCAAAACCTCCAAAAAAATGCTCAACTTGCTTCAGGACAT
GGCTTTTTCTTTACGACAGGCAGGGCCTCCCTCAGAATAAGCCATCAAAGCGAGAGAGAA
CTATGTTGTTGAATACATAATTTTTAGAAAATATAGAAGATTGTTAGTAAACATACAAAA
AAAACTGTTTATCGCGTATGATTATTTTGGTATCGACTACCGCAGCTGAAAATTGTTTTG
TTTTTTTGAAGTTGAAACTCCTAAAAGTTATTTGTGCTTTTAACATATCATAAGATTGAA
TGTTCGC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5560Contig1 909 2 2 U
GCTACGTCTCCTGCTTCAGTTCGTCCTGGACAGGTTCCACGTGGAGCAGCAGCTCCGATT
TGTTTCAAGACTGGTCTTGCTCATCTTGAACAAAACCAGCTTCCAGATGCACTGTCTTGC
TTCGACGAAGCATTCTTGGCTCTTGCTAAGGATCAATCACGTGGGGCTGATATCAAAGCT
CAAGCCACAATCTGTGCTCAGTACAAGATAGCCGTTACTCTCCTCCGGGAAATCTTGAGG
CTACAAAGAGTCCAAGGCGCGAGTGCATTAAGCGCAAAGGACGAAATGGCAAGACTCTCA
AGGCATCTAGCTTCACTGCCACTACTTGCAAAGCACCGCATAAACTGCATACGCACTGCA
ATCAAACGAAACATGGAAGTTCAAAACTATGGCTACTCCAAGCAGATGTTGGAACTGCTT
CTCTCAAAGGCACCAGCGAACAAGCAAGAAGAATTGAGAGGACTAGTTGATCTCTGTGTC
CAAAGAGGCACATCGAACAAATCCATCGACCCGCTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCA
GCTACACTCAGCAGGTTGTCGACCATTGGGTACGATGTTTGCGATCTCTGTGGCGCAAAG
TTCGCTGCTCTTTCATCGCCGGGCTGTATCATTTGTGGTATGGGAAGTATTAAACGTTCT
GATGCACTCGCTGGACCTGCACCTGTATCCACACCGTTTGGCTAAATGTTATGGACGTGA
ATGATTTATGGTTGGTTTTAATTAATATTGTTTAAGTTTCAAACTGGTTATATGCAACAA
CATTCGATTTTGTGGGTTTAATTTCGTTTTGTTTGTCTGTATATTGATTTGATTTGATTT
GTATCACTTCTTTTTTTCTTGTACACTTTTTTAACGTTACTATTAATTTGTCCACCAGGC
ATTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD58TF U 1
AF RR4DD58JQ C 306
BS 1 809 RR4DD58TF
BS 810 909 RR4DD58JQ

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CAAAGAGGCACATCGAACAAATCCATCGACCCGCTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCA
GCTACACTCAGCAGGTTGTCGACCATTGGGTACGATGTTTGCGATCTCTGTGGCGCAAAG
TTCGCTGCTCTTTCATCGCCGGGCTGTATCATTTGTGGTATGGGAAGTATTAAACGTTCT
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ATGATTTATGGTTGGTTTTAATTAATATTGTTTAAGTTTCAAACTGGTTATATGCAACAA
CATTCGATTTTGTGGGTTTAATTTCGTTT
GTT

QA 1 809 1 809
DS 

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ACGAAACATGGAAGTTCAAAACTATGGCTACTCCAAGCAGATGTTGGAACTGCTTCTCTC
AAAGGCACCAGCGAACAAGCAAGAAGAATTGAGAGGACTAGTTGATCTCTGTGTCCAAAG
AGGCACATCGAACAAATCCATCGACCCGCTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCAGCTAC
ACTCAGCAGGTTGTCGACCATTGGGTACGATGTTTGCGATCTCTGTGGCGCAAAGTTCGC
TGCTCTTTCATCGCCGGGCTGTATCATTTGTGGTATGGGAAGTATTAAACGTTTTGATGC
ACTCGCTGGACCTGCACCTGTATCCACACCGTTTGGCTAAATGTTATGGACGTGAATGAT
TTATGGTTGGTTTTAATTAATATTGTTTAAGTTTCAAACTGGTTATATGCAACAACATTC
GATTTTGTGGGTTTAATTTCGTTTTGTTTGTCTGTATATTGATTTGATTTGATTTGTATC
ACTTCTTTTTTTCTTGTACACTTTTTTAACGTTACTATTAATTTGTCCACCAGGCATTTT
TATT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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TGTGGGCTCAAGGGCATGGAGAAAGGAATTGATGACATTATGGTCTCATTAGCTGCTAAT
GACGGTATTGATTGGTTTGATTATAAGAAGCAGTTGAAGAAGGCAGAGCAATGGAACGTT
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ATCTAAGTTTGTGTAACCTGAAGATAAGCTATGTTTTTTTGATATATACTATACTATCAT
TTTCATCATTCATTGCCATT


BQ
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AF RR4FN28JQ C 1
AF RR4FN28TF U 1
BS 1 500 RR4FN28TF

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AAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGTAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCG
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TGTGGGCTCAAGGGCATGGAGAAAGGAATTGATGACATTATGGTCTCATTAGCTGCTAAT
GACGGTATTGATTGGTTTGATTATAAGAAGCAGTTGAAGAAGGCAGAGCAATGGAACGTT
GAAGTCTACTGATTTAACATTCGGTGGCAAGTATAGTGGAACAGCAAGTGTAATTTTCAC
ATCTAAGTTTGTGTAACCTGAAGATAAGCTATGTTTTTTTGATATATACTATACTATCAT
TTTCATCATTCATTGCCATT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4FN28TF 500 0 0
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CTAATCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGGAAG
AAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGTAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCG
GCGCAGTACGCACCTGAGTTATGGGAGTTGTTGAAGAAAGACAACACGTTTGTCTACATG
TGTGGGCTCAAGGGCATGGAGAAAGGAATTGATGACATTATGGTCTCATTAGCTGCTAAT
GACGGTATTGATTGGTTTGATTATAAGAAGCAGTTGAAGAAGGCAGAGCAATGGAACGTT
GAAGTCTACTGATTTAACATTCGGTGGCAAGTATAGTGGAACAGCAAGTGTAATTTTCAC
ATCTAAGTTTGTGTAACCTGAAGATAAGCTATGTTTTTTTGATATATACTATACTATCAT
TTTCATCATTCATTGCCATT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL5562Contig1 696 2 1 U
GGCATTTCATTTCTAGTACTAATCACATAAACTAGAAAAAAAACATAACAAAATGGCGTC
AGTTACATCAGCTACCGTCTTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCGTCAACTCCAA
ACCCACGACGGTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTATC
CGTGAAGTCGTCTCTGAAAGATTTCGGCGTTATGGCCGTCGCAGCTGCAGCGTCCATCGC
TTTGGCCGGGAATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGT
TTTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTTTTCAAGAACAACGC
AGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCA
AGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACAC
TGACGGAGCCTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCG
GGAAACTTACTGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAAT
TGTAATCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTA
CTGGTTTAATGGTAATAGCATTGGTTCTTCGGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 500 1 500
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4D676TF U 1
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BS 786 975 RR4D676JQ

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CTGTA

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QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BC90JQ C 1
AF RR4BC90TF U 1
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GCTTCCACATGATCTGCCTCCGTCCATTGAGGATACCTCTGATCAGAAAAATAAAAGAGG
CGGTCCAGTGGAAGATGAAGATCTAGAAGCTTGAATTGAGCTCCGCTAATACAAAGAACA
TATAAAATAAGACTTGGTCTTAGAAGCTTTCAAAGCCCAATGTATGAGGGTTCTGAAGCA
GAAGAAAAGAGTTGTGGACTTTTCGTCTCTGAATTTTCAGCATATTTGATTGAGGCGTAT
GTTTTTTTTTATATCACACACC

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4BC90TF 502 0 0
GGACCTTCATCCTTCTTAACTTCTTTGCATTTAATTATTTTCAATACTCACTGAAACTTG
AAAACGTTAACCTTTCGACTCCCGATTGTTTCTCTATCTCTTTTTAAATAAACTTTTTCA
CCAAATCTTAGCTACGACAACGTGCCAAAAGCAATTTTTCGAGAAAACCTTCAGACCCAG
AAAGTCTCACAGGCGCAATTTTCCGGCGACATCCACCAGGCCTAGCGGAGTCGGAGTTGA
GCTTCCACATGATCTGCCTCCGTCCATTGAGGATACCTCTGATCAGAAAAATAAAAGAGG
CGGTCCAGTGGAAGATGAAGATCTAGAAGCTTGAATTGAGCTCCGCTAATACAAAGAACA
TATAAAATAAGACTTGGTCTTAGAAGCTTTCAAAGCCCAATGTATGAGGGTTCTGAAGCA
GAAGAAAAGAGTTGTGGACTTTTCGTCTCTGAATTTTCAGCATATTTGATTGAGGCGTAT
GTTTTTTTTTATATCACACACC

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL5566Contig1 921 2 12 U
TTGGTGCTCGGACGGCTAAAGGAAGAGACGACTTTCGCAAGTATCTTGCTTCTGCCATCG
ATGTTCCCGGCCCTGAAGTGGAACGTTTGGCGGAGATGGCTAGGAAGTACAAAGTGTTCT
TGGTCATGGGTGTGATCGAGAGGGAAGGCTATACTCTATACTGTTCTGTCCTTTTCTTTG
ACTCGCAAGGTCAGTTCTTGGGTAAGCACAGGAAACTCATGCCTACGGCTCTTGAACGTT
GCATCTGGGGGTTCGGAGATGGATCAACCATCCCTGTTTTCGATACTCCTATTGGTAAAA
TCGGTGCTGCTATTTGTTGGGAGAATAGGATGCCCTCTTTAAGAACCGCAATGTATGCCA
AAGGGATTGAGATATATTGTGCACCTACTGCTGACGCTAGAGAAACTTGGCTAGCGTCGA
TGACTCACATCGCTCTCGAAGGTGGATGTTTTGTTTTATCATCTAACCAGTTCTGTCGCC
GGAAAGACTATCCTCCTCCACCGGAATACACGTTTTCCGGTTCAGAAGAGACCCTTACAC
CTGATTCTATTGTCTGTGCCGGCGGAAGCTCAATCATTTCCCCTTTAGGGATTGTTCTAG
CTGGACCAAACTATGAAGGAGAGGCTCTTATCTCAGCTGATCTAGATCTTGGGGACATAG
CACGAGCTAAGTTCGACTTCGATGTGGTGGGTCATTACTCGAGGCCTGAAGTGTTTAGCT
TGAACATAAAGGGAGCATCCGAGAAAAGCGGTCAGTTTCACGTCCGAGGCAACCAAAGAT
GAGACCGTCAAAAAGTGAGAGAGACCAACGTTCGACGTCAAAAGACTTATTGGAGTTTAT
GTATAATATTTAATAACACTACTTACGTCAAGACTTGTAACTTGAAATCATTATCAAATC
CAAAAGCGTTCTGTTACAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A470TF U 1
AF RR4A470JQ C 309
BS 1 531 RR4A470TF
BS 532 532 RR4A470JQ
BS 533 580 RR4A470TF
BS 581 581 RR4A470JQ
BS 582 793 RR4A470TF
BS 794 794 RR4A470JQ
BS 795 822 RR4A470TF
BS 823 823 RR4A470JQ
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BS 847 868 RR4A470TF
BS 869 921 RR4A470JQ

RD RR4A470TF 868 0 0
TTGGTGCTCGGACGGCTAAAGGAAGAGACGACTTTCGCAAGTATCTTGCTTCTGCCATCG
ATGTTCCCGGCCCTGAAGTGGAACGTTTGGCGGAGATGGCTAGGAAGTACAAAGTGTTCT
TGGTCATGGGTGTGATCGAGAGGGAAGGCTATACTCTATACTGTTCTGTCCTTTTCTTTG
ACTCGCAAGGTCAGTTCTTGGGTAAGCACAGGAAACTCATGCCTACGGCTCTTGAACGTT
GCATCTGGGGGTTCGGAGATGGATCAACCATCCCTGTTTTCGATACTCCTATTGGTAAAA
TCGGTGCTGCTATTTGTTGGGAGAATAGGATGCCCTCTTTAAGAACCGCAATGTATGCCA
AAGGGATTGAGATATATTGTGCACCTACTGCTGACGCTAGAGAAACTTGGCTAGCGTCGA
TGACTCACATCGCTCTCGAAGGTGGATGTTTTGTTTTATCATCTAACCAGTTCTGTCGCC
GGAAAGACTATCCTCCTCCACCGGAATACACGTTTTCCGGTTCAGAAGAGAGCCTTACAC
CTGATTCTATTGTCTGTGCCGGCGGAAGCTCAATCATTTCGCCTTTAGGGATTGTTCTAG
CTGGACCAAACTATGAAGGAGAGGCTCTTATCTCAGCTGATCTAGATCTTGGGGACATAG
CACGAGCTAAGTTCGACTTCGATGTGGTGGGTCATTACTCGAGGCCTGAAGTGTTTAGCT
TGAACATAAAGGGAGCATCCGAGAAAAGCGGTCAGTTTCACGTCCGAGGCAACCAAAGAT
GAGACCGTCAAAA*GTGAGAGAGACCAACGTTCGACGTCAAA*GACTTATTGGAGTTTAT
GTATA*TATTTAATAACACTACTTACGT

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR4A470JQ 613 0 0
GCTATTTGTTGGGAGAATAGGATGCCCTCTTTAAGAACCGCAATGTATGCCAAAGGGATT
GAGATATATTGTGCACCTACTGCTGACGCTAGAGAAACTTGGCTAGCGTCGATGACTCAC
ATCGCTCTCGAAGGTGGATGTTTTGTTTTATCATCTAACCAGTTCTGTCGCCGGAAAGAC
TATCCTCCTCCCCCGGAATACACGTTTTCCGGTTCAGAAGAGACCCTTACCCCTGATTTT
ATTGTTTGTGCCGGCGGAAGCTCAATCATTTCCCCTTTAGGGATTGTTCTAGCTGGACCA
AACTATGAAGGAGAGGCTTTTATTTCAGCTGATTTAGATCTTGGGGACATAGCCCGAGCT
AAGTTCGACTTCGATGTGGTGGGTCATTACTCGAGGCCTGAAGTGTTTAGCTTGAACATA
A*GGGAGCATCCGAGAAAAGCGGTCAGTTTCACGTCCGAGGCAACCAAAGATGAGACCGT
CAAAAAGTGAGAGAGACCAACGTTCGACGTCAAAAGACTTATTGGAGTTTATGTATAATA
TTTAATAACACTACTTACGTCAAGACTTGTAACTTGAAATCATTATCAAATCCAAAAGCG
TTCTGTTACAGAT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL5567Contig1 1094 2 4 U
TACCTGGATTCAGATTTCACCCAACAGATGAAGAACTCATAAGCCACTACCTGAGACCGA
AGGTTCTAAACACCCTCTTCTCCGCTATAGCCATTGGCGAAGTCGATCTCAACAAGGTTG
AGCCTTGGGACTTGCCATGGAAGGCTAAGATTGGCGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCG
TGAGAGATCGGAAATACCCAACCGGTTTAAGGACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGTTATT
GGAAAGCTACAGGGAAAGACAAAGAGATCTTCAAAGAAAAAGCTCTTGTTGGTATGAAGA
AAACTTTGGTTTTCTACGAAGGAAGAGCTCCTAAAGGAGCAAAAACAAACTGGGTCATGC
ACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTATATTCAACCGACAATCTTCCTAAAACCGCTAAGAACG
AGTGGGTTATTAGTAGGGTTTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACC
AGGGGCTCTGTTCAGGGATTAACCAAGTCGAACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACT
CTTTCGCTGGATCGTTGTCTAACGTGACCTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACA
AGAGCCACATCTCCGAGTTAAAAGATGAATGTAACGTTACTATGCTCGGTTCATCATCGA
CTCATTTAATACCGAACATTGGTTCTCTGCTATACTCCGATCCTCTGTTTATGCAAGATA
ATTCTTCGATAGTGAAGATGTTGCTTGACGGTGAAGAAACCAAGTTTAAGAAGAGTATCC
AGGATTTCGGTACTGTTGAAAACGCATAACCACAAGTTCTTGGGACTGTGACGGTCTGGC
TGGTTCGGCCGGTTCGGTGGAGGTCGATTGCTATTGGAACTTCTGAATGTGGAAACAGGA
ACTAATCGAAAATTGGGGTATATATGGGGACAGCAAACAATTAGGAGGTATTTTATGGTT
TATAGTTGTTATGTGTGTTGCTCTAGATTCTAGACTCTAGGACTATTGGATTTACAAGGA
TATTTGAACATTTGTAAAATTTTGTAAAAAAATGATCAACTTGTGAAAATCGATTATCAT
ACCATTTGTAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH41TF U 1
AF RR4AH41JQ C 203
BS 1 697 RR4AH41TF
BS 698 698 RR4AH41JQ
BS 699 709 RR4AH41TF
BS 710 1094 RR4AH41JQ

RD RR4AH41TF 712 0 0
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AGCCTTGGGACTTGCCATGGAAGGCTAAGATTGGCGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCG
TGAGAGATCGGAAATACCCAACCGGTTTAAGGACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGTTATT
GGAAAGCTACAGGGAAAGACAAAGAGATCTTCAAAGAAAAAGCTCTTGTTGGTATGAAGA
AAACTTTGGTTTTCTACGAAGGAAGAGCTCCTAAAGGAGCAAAAACAAACTGGGTCATGC
ACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTATATTCAACCGACAATCTTCCTAAAACCGCTAAGAACG
AGTGGGTTATTAGTAGGGTTTTTCAGAAAGGTGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACC
AGGGGCTCTGTTCAGGGATTAACCAAGTCGAACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACT
CTTTCGCTGGATCGTTGTCTAACGTGACCTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACA
AGAGCCACATCTCCGAGTTAAAAGATGAATGTAACGTTACTATGCTCGGTTCATCATCGA
CTCATTTAATACCGAACATTGGTTCTCTGCTATACTC*GATCCTCTGTT
ATG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4AH41JQ 892 0 0
CGGTTTAAGGACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGGAAAGACAA
AGAGATCTTCAAAGAAAAAGCTCTTGTTGGTATGAAGAAAACTTTGGTTTTCTACGAAGG
AAGAGCTCCTAAAGGAGCAAAAACAAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCTTAGAAGGCGT
ATATTCAACCGACAATCTTCCTAAAACCGCTAAGAACGAGTGGGTTATTAGTAGGGTTTT
TCAGAAAGGTGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCTGTTCAGGGATTAA
CCAAGTCGAACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTTCGCTGGATCGTTGTCTAA
CGTGACCTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGCCACATCTCCGAGTTAAA
AGATGAATGTAACGTTACTATGCTCGGTTCATCATCGACTCATTTAATACCGAACATTGG
TTCTCTGCTATACTCCGATCCTCTGTTTATGCAAGATAATTCTTCGATAGTGAAGATGTT
GCTTGACGGTGAAGAAACCAAGTTTAAGAAGAGTATCCAGGATTTCGGTACTGTTGAAAA
CGCATAACCACAAGTTCTTGGGACTGTGACGGTCTGGCTGGTTCGGCCGGTTCGGTGGAG
GTCGATTGCTATTGGAACTTCTGAATGTGGAAACAGGAACTAATCGAAAATTGGGGTATA
TATGGGGACAGCAAACAATTAGGAGGTATTTTATGGTTTATAGTTGTTATGTGTGTTGCT
CTAGATTCTAGACTCTAGGACTATTGGATTTACAAGGATATTTGAACATTTGTAAAATTT
TGTAAAAAAATGATCAACTTGTGAAAATCGATTATCATACCATTTGTAATTC

QA 1 892 1 892
DS 



AS 1 2

CO CL5568Contig1 865 2 16 U
GGATCCAATAGCTAACTCCCTTCAACAGAAAAGAAAAATCTCCAAAGCTAAAACAATATC
AATGGCTGATCAGTCAGAGCCATTGTTGTTGTCTGCCGATGATTCCTACGTCGACCACCA
AACCAGACCAGAGGCTTTAACTTTCGACAACATTGTCGAACAGAGTCTATCAGATTTTGG
GTTCTGGCAACTCTTCCAGGTACTCCTCGTTGGACTCGCTTTGTTCTTCGATGCTCATCA
GATATTTATCACTGTCTACACAGACGCATACCCCACGTGGCACTGTCTAAACCACACAAT
CTGCGATCTTGCCACTTCCGACATCTGCAAGCTCCCAAGATCAGCCTGGGACTGGGACGG
TGGCTCCATGGGCAGATCCGTCATTTCAGAATTCGGACTCGAGTGCTCGAGCTCTTTACT
CAGAGGTATGCCTAGCTCTGCTTTCTACATCGGTGCCATTGTTGGAGGGTTCTTTCTAGC
GTTAATCCCAGACGATTCTTTGGGCCGCAAGAAACTAGTTTTGCTCTCAACCTTTGCAAT
GTCAGTCACTTCAATCTCTGTTATGTTCTCAACCAACGTATGGATCTACACAACCCTAAA
GTTTGTCATCGGATTCACGAGACCACAGACTTGGTCGTATGCGCTGGTTCTCATCAGTGA
GCGAGTCTCCACCAGATGGAGAACGAGAGCTACGATGATTCCATTTACCCTTTTCGTTTT
AGGGTTTATGTCATTGTCTGGAATAGCTTACCTTGCTCAACACTCTTCATGGAGATATCT
CTATCTATACACAGCCGTTCCCGCAACATTCTATTGTATCTTCCTCTACATCTTCGCACT
CGAATCACCTAGGTGGCTTCACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FX22TF U 1
AF RR4ET14TF U 246
BS 1 492 RR4FX22TF
BS 493 493 RR4ET14TF
BS 494 576 RR4FX22TF
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BS 578 585 RR4FX22TF
BS 586 586 RR4ET14TF
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BS 624 682 RR4FX22TF
BS 683 683 RR4ET14TF
BS 684 723 RR4FX22TF
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BS 725 759 RR4FX22TF
BS 760 760 RR4ET14TF
BS 761 796 RR4FX22TF
BS 797 865 RR4ET14TF

RD RR4FX22TF 796 0 0
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AATGGCTGATCAGTCAGAGCCATTGTTGTTGTCTGCCGATGATTCCTACGTCGACCACCA
AACCAGACCAGAGGCTTTAACTTTCGACAACATTGTCGAACAGAGTCTATCAGATTTTGG
GTTCTGGCAACTCTTCCAGGTACTCCTCGTTGGACTCGCTTTGTTCTTCGATGCTCATCA
GATATTTATCACTGTCTACACAGACGCATACCCCACGTGGCACTGTCTAAACCACACAAT
CTGCGATCTTGCCACTTCCGACATCTGCAAGCTCCCAAGATCAGCCTGGGACTGGGACGG
TGGCTCCATGGGCAGATCCGTCATTTCAGAATTCGGACTCGAGTGCTCGAGCTCTTTACT
CAGAGGTATGCCTAGCTCTGCTTTCTACATCGGTGCCATTGTTGGAGGGTTCTTTCTAGC
GTTAATCCCAGATGATTCTTTGGGCCGCAAGAAACTAGTTTTGCTCTCAACCTTTGCAAT
GTCAGTCACTTCAATCTCTGTTATGTTCTCAACCAATGTATGGATTTACACAACCCTAAA
GTTTGTCATCGGATTCACGAGATCACAGACTTGGTCGTATGCGCTGGTTCTCATCAGTGA
GCGAGTCTCCACCAGATGGAGACCGAGAGCTACGATGATTCCATTTACCCTTTTCGTTTT
AGG*TTTATGTCATTGTCTGGAATAGCTTACCTTGCTCA*CACTCTTCATGGAGATATCT
CTATCTATACACAGCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4ET14TF 620 0 0
G
TATCACTGTCTACACAGACGCATACCCCACGTGGCACTGTCTTAACCACACAATCTGCGA
TCTTGCCACTTCCGACATCTGCAAGCTCCCAAGATCAGCCTGGGACTGGGACGGTGGCTC
CATGGGCAGATCCGTCATTTCAGAATTCGGACTCGAGTGCTCGAGCTCTTTACTCAGAGG
TATGCCTAGCTCTGCTTTCTACATCGGTGCCATTGTTGGAGGGTTCTTTCTAGCGTTAAT
CCCAGACGATTCTTTGGGCCGCAAGAAACTAGTTTTGCTCTCAACTTTTGCAATGTCAGT
CACTTCAATCTCTGTTATGTTCTCAACCAACGTATGGATCTACACAACCCTAAAGTTTGT
CATCGGATTCACGAGACCACAGACTTGGTCGTATGCGCTGGTTCTCATCAGTGAGCGAGT
CTCCACCAGATGGAGAACGAGAGCTACGATGATTCCGTTTACCCTTTTCGTTTTAGGGTT
TATGTCCTTGTCTGGAATCGCTTACCTTGCTCAACACTCTTCATGGAGATATCTCTATCT
ATACACAGCCGTTCCCGCAACATTCTATTGTATCTTCCTCTACATCTTCGCACTCGAATC
ACCTAGGTGGCTTCACTTG

QA 2 620 2 620
DS 



AS 1 2

CO CL5569Contig1 965 2 4 U
TTTAAAGTTCAAGATAGAGAACAAATAAAAGAAAGTGTTCGATCTTCTGGTCTCATTCAC
CATTTTTTATTTCTTTAAACTTGAGTTTGAATCTATATATCTTCCCAGTTTAGATTCACA
GTTTCTGTCTTCGGTTTCACTCTTTTGTGTAAAGGTTGTGATGGAAGAAGTGAAGGGACA
GAGAGGAAATGGAACCACTGAGGCTGATTTTGTGTTGCAATGGGGGGAGAGGAAAAGAGT
TAGGTGCATGAAAGTTAAGAAAGATCAAAGCTGCAAGTCAACTGATTGTTTGTCTAATAA
GCGCAAACTCATGTCGCGGGCTGTGTCTTCTGAGAGAGGCTCTCCTTCTCGCCATCTTAA
CCGTCCAAACAAGATGGTAGATTCTCCAGGTGGTAATGTTAGGAGATCGTTTGTGGCATC
CCCTGAGAAGGAAGATAGATACTACACAACTAGGGGTTCTATGGGTACAGATGAGAGTGG
CAAAATTATAAAGGAAACTGTGAAGGAAACCAAGAAGCATGTGTGGCCAAAGTTGTTTAT
AACTTTGTCAAATAAGGAGAAGAAGAAGATTTCTTGGCTATGAAAGGGTGCAAGCTTCCT
CAAAGACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGAAGACATTGCTTCTGGTGAGTCCAGGT
ACTTGGTTATCAGATCTGTGCAAAGAGAGGTATGAAGTAAGAGAGAAGAAGACTTCGAAA
AAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAAAGCGATTCAGAGTGAAGAAAA
AGAAGAGGACTTGAGAAACATTCCAGAATTTGGTGAAGGCTAGAAAAGGAAGTAGACAAC
GAACAAGAATCTATTTTGTTTCTTTCATTACATTTTGAGATGTCTCTTTTCCTCTTCTTT
ACAGGTCAAACAAACTATGAGTCACTTGCATTTTTGCTTTCGAAGCTAATCTATTAGTCT
TCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4C493TF U 1
AF RR4C493JQ C 175
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BS 636 683 RR4C493TF
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RD RR4C493TF 686 0 0
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CATTTTTTATTTCTTTAAACTTGAGTTTGAATCTATATATCTTCCCAGTTTAGATTCACA
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GAGAGGAAATGGAACCACTGAGGCTGATTTTGTGTTGCAATGGGGGGAGAGGAAAAGAGT
TAGGTGCATGAAAGTTAAGAAAGATCAAAGCTGCAAGTCAACTGATTGTTTGTCTAATAA
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CCCTGAGAAGGAAGATAGATACTACACAACTAGGGGTTCTATGGGTACAGATGAGAGTGG
CAAAATTATAAAGGAAACTGTGAAGGAAACCAAGAAGCATGTGTGGCCAAAGTTGTTTAT
AACTTTGTCAAATAAGGAGAAGAAGAAGATTTCTTGGCTATGAAAGGGTGCAAGCTTCCT
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GAG

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DS 

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GTTTATAACTTTGTCAAATAAGGAGAAGAAGAAGATTTCTTGGCTATGAAAGGGTGCAAG
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CCAGGTACTTGGTTATCAGATCTGTGCAAAGAGAGGTATGAAGTAAGAGAGAAGAAGACT
TCGAAAAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAAAGCGATTCAGAGTGA
AGAAAAAGAAGAGGACTTGAGAAACATTCCAGAATTTGGTGAAGGCTAGAAAAGGAAGTA
GACAACGAACAAGAATCTATTTTGTTTCTTTCATTACATTTTGAGATGTCTCTTTTCCTC
TTCTTTACAGGTCAAACAAACTATGAGTCACTTGCATTTTTGCTTTCGAAGCTAATCTAT
TAGTCTTCATC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BQ31TF U 1
AF RR4BQ31JQ C 1
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T*GTTAAGACTTCAAGATTTTAGTAAAGAGAGTTCGTCTCTGTTCA

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DS 

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AAGGAAAAGGTATATCGAGAGAGGATAAAGGTAAAGGGAAACTGATCGAAGTTGAGGAAA
GTAGTGACGATTCTGATGATGATGAAGACGACGAAGATGGTGATGAATACGACGAAAGCG
ATTTGTCAGACGATCCTTTGGCGGAGGTGGATTTGGATAATATCCTTCCGTCGAGGACTA
GGAGACGATCGATCCAGCCTGGAGTCTACATCTCCAATGACCGTACTGGTGGAGTTAACG
AGGATGGCGATAGCAGCGACCATAGTGACGCTTAAACCTTTAGCTATGATGACGGTTTTT
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GTGTTTCGAACTCGTGTGCTATATATATCTACGATGTTATTGCAGTTC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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ATGCTTAATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTGTACGTATTGTCT
TAATCTCTCTATTGAATTTTTCTCTCTATATAGATCTAAGACTTGATGGTAATTTTGGAT
TTTTTAAAAAAAAATTCAGTAAGAGGTTTAGGCTCAAAGGACGCTTGTATCCATGTGTTA
TACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGGTTTGATTTTTTGTTAATTATTTTTGTG
AAATTCAGCTGCTATATTCTTGTAGGTTTTTCTTTTTGTGTTTGTTTAGATCGTAATTGA
TGATGTTTAAGGGTTTTAAATTTTGACAAGTGATATTTTGGTGCAGTTACTAATGGGATT
AACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTAATCAATATGAGAGAGTGAC
AGTTGGTGTTGTACGAGAGGTAAGTCTGAAGATTCTCATCTCCATGAAACAATATTTTGA
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TGACTGTGAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGG
ATTTTGAGGTGTTTGACCCCTTTCTTGTTGACTCATACTCAGTAAGAAATGAAATTCGAT
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AGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATTTTGTGGATTGTATTA
TTTTGTGCTTATATGGGATTTTGGTATCT


BQ
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AF RR4B814TF U 1
AF RR4B814JQ C 308
BS 1 808 RR4B814TF
BS 809 1109 RR4B814JQ

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TAATCTCTCTATTGAATTTTTCTCTCTATATAGATCTAAGACTTGATGGTAATTTTGGAT
TTTTTAAAAAAAAATTCAGTAAGAGGTTTAGGCTCAAAGGACGCTTGTATCCATGTGTTA
TACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGGTTTGATTTTTTGTTAATTATTTTTGTG
AAATTCAGCTGCTATATTCTTGTAGGTTTTTCTTTTTGTGTTTGTTTAGATCGTAATTGA
TGATGTTTAAGGGTTTTAAATTTTGACAAGTGATATTTTGGTGCAGTTACTAATGGGATT
AACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTAATCAATATGAGAGAGTGAC
AGTTGGTGTTGTACGAGAGGTAAGTCTGAAGATTCTCATCTCCATGAAACAATATTTTGA
TGAGATTAATTATATTGTTTTTTCTTTCTTATTTGCATTTACAGGACAATTCTGAGAAGA
TGACTGTGAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGG
ATTTTGAGGTGTTTGACCCCTTTCTTGTTGACTCATACTCAGTAAGAAATGAAATTCGAT
TTGGATGTTGTTTTTCTTTTCTTTTTGG

QA 1 808 1 808
DS 

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GCTGCTATATTCTTGTAGGTTTTTCTTTTTGTGTTTGTTTAGATCGTAATTGATGATGTT
TAAGGGTTTTAAATTTTGACAAGTGATATTTTGGTGCAGTTACTAATGGGATTAACGGAT
GAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTAATCAATATGAGAGAGTGACAGTTGGT
GTTGTACGAGAGGTAAGTCTGAAGATTCTCATCTCCATGAAACAATATTTTGATGAGATT
AATTATATTGTTTTTTCTTTCTTATTTGCATTTACAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGT
GAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGA
GGTGTTTGACCCCTTTCTTGTTGACTCATACTCAGTAAGAAATGAAATTCGATTTGGATG
TTGTTTTTCTTTTCTTTTTGGTTAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGA
GACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAAGAATCCTCAAGGAAAAGGAAGGGACGAGTT
CAACAATGCCCTACGCAATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAAGAGTATTTT
TCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTG
TGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATTTTGTGGATTGTATTATTTTGTG
CTTATATGGGATTTTGGTATCT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL5572Contig1 1000 2 2 U
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TACTTGCCTTCGTAATATCTTGGACAATATTCCACGTCACCAACAAGATGAATAAGGCGA
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TACATGTGATAGAAAGAGACATGAGAGAGCCAGTGAGAATGATGGGTGAGTTCATGCAGC
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CGCCATGTTGTATCAAGTCAGCAGCACCGACGTTCGTTGTAATTTTGAGCTTCTCTCCAA
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AAAAATTACACAAGCAAAACGCATGCCAGCTACTTTGAGC


BQ
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AF RR4AN22TF U 1
AF RR4AN22JQ C 337
BS 1 837 RR4AN22TF
BS 838 1000 RR4AN22JQ

RD RR4AN22TF 837 0 0
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CGAAGTGTGCGAATGTGGCAGCGGAGGAGAGAAGAGACGGTGGCCCTGATGTCATCATAG
TCGGAGCTGGTGTGGGTGGTTCAGCTCTCGCCTATGCACTTGCCAAGGACGGGCGTCGAG
TACATGTGATAGAAAGAGACATGAGAGAGCCAGTGAGAATGATGGGTGAGTTCATGCAGC
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CACAGAAATCTACCGGCATAGCAATTTTTAAGGACGGAAAAGAAACAGTCGCATCTTTTC
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CCAGAGACTGCGCCAAAAGGCCTCTTCTCTTCCCAATGTACGGCTGGAAGAAGGGACGGT
GAGATCTTTGATCGAAGAAAAAGGAGTGGTCAAAGGAGTGACATACAAGAACAGTTCAGG
GGAAGAAACCACAGCATCTGCACGTCTCACTGTTGTATGCGATGGTTGCCACTCGAACCT
TCGTCGCTCTCTAAATGACAACAATGCGGAGGTTACGGCGTATGAAATTGGTTACATCTC
GAGGAATTGTCGCCTTGAACAGCCCGACAAGTTACACTTGATAATGGCTAAACCGTCCTT
CGCCATGTTGTATCAAGTCAGCAGCACCGACGTTCGTTGTAATTTTGAGCTTCTCTC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4AN22JQ 664 0 0
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TTTTTTTCACAATGGCCGTTTTGTCCAGAGACTGCGCCAAAAGGCCTCTTCTCTTCCCAA
TGTACGGCTGGAAGAAGGGACGGTGAGATCTTTGATCGAAGAAAAAGGAGTGGTCAAAGG
AGTGACATACAAGAACAGTTCAGGGGAAGAAACCACAGCATCTGCACGTCTCACTGTTGT
ATGCGATGGTTGCCACTCGAACCTTCGTCGCTCTCTAAATGACAACAATGCGGAGGTTAC
GGCGTATGAAATTGGTTACATCTCGAGGAATTGTCGCCTTGAACAGCCCGACAAGTTACA
CTTGATAATGGCTAAACCGTCCTTCGCCATGTTGTATCAAGTCAGCAGCACCGACGTTCG
TTGTAATTTTGAGCTTCTCTCCAATAATCTTCCTTCCGTTTCAAATGGTGAAATGGCGTC
CTTCGTGAAGAACTCTATTGCTCCCCAGGTACCTCTAAAATTCCGCAAAACATTTTTGAA
AGGACTCGATGAGGGATCACATATAAAAATTACACAAGCAAAACGCATGCCAGCTACTTT
GAGC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

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ACATTCTTTATCTGGACGCTGTCAAGAAGAAGTATCTTGAGGAGGCTTCTTCTTGCAACG
TCTTTGTTGTAAAGGTAAATAATAATATTACATATACTGCGAACTCTATTTAGCTTAATC
TTCCTAATATGACTAGTTCAGGGTCGGACAATCTCAACTCCTGCTACTAGTGGAACAATC
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GGAACCATTGAAGATACCAAGGGATGGATTACATGCATCAACTGAGAAACCAGTACTTAT
CAAACCTTATACCACAGAGAGATTCACTCTGCATTTTATCAAAGCTGTGTATACACAAAA
ATGAAGAAGTCTGTGTAAATCTATAATAAAATAAAATATATTCTCATATTCACTTGGATA
ATGTAAAAATAAAATGTATTCTGATTCCATATTTTAATAAATGCATTCTTGGTTGAGAAA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EM90TF U 1
AF RR4BE05TF U 579
BS 1 668 RR4EM90TF
BS 669 669 RR4BE05TF
BS 670 689 RR4EM90TF
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ATGTAAAA*TAAAATGTATTCTGATTCCA

QA 1 689 1 689
DS 

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QA 1 143 1 143
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AO23JQ C 1
AF RR4AO23TF U 1
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DS 

RD RR4AO23TF 502 0 0
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GGATTCTGCTTTTGTGATTTCA

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

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TTTATTCAGATCACTAGTGTTTATGTGAACTGAATACAGACCATGTGCGTTTAATAGAGA
AGCTTGTAAATG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F846TF U 1
AF RR4F846JQ C 38
BS 1 703 RR4F846TF
BS 704 704 RR4F846JQ
BS 705 748 RR4F846TF
BS 749 749 RR4F846JQ
BS 750 753 RR4F846TF
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BS 774 774 RR4F846JQ
BS 775 792 RR4F846TF

RD RR4F846TF 792 0 0
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TAACTTGAGGTTGCTAATGATGGTGTTTTGTTAGTGCATCATTTGGGTTTGGACTGTTGT
TAGATGTGACACTCAAGCTGACCTTTAAATCTGCTTTTTTTTCTTACTCTTTCTTGTTAA
ACGTTTTGCTTCCCTTCTACTTCTTTGGTTTGGAATGTTTCAAGTGAGTATATTGCATTC
ATCCTCTTGATATAATGTGGCAACTATGTTTACTATCTTGAAG*AACTACACGAATTGGA
TTTATTCAGATCACTAGTGTTTATGTGA*CTGA*TACAGACCATGTGCGTTTA*TAGAGA
AGCTTGTAAATG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4F846JQ 755 0 0
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ACAGAAACCAGGAGGAGTCTTACCGAGCTGGTTTTGGAGCCTCTACGGGCAGACCAATAC
TATGAGATGCGTGAACCTTTCAATGTAATGGCAATTTTGAAAAGTCCAATGGGTCTTATG
GTGGGATTCATGGTTGTTGTTGTGTTCTTAATGCCCAAGTTGATGGAGAACATAGATCCA
GAGGAAATGAAGAGAACACAAGAGGAGCTGAGAAACCAAGGAGTGCCTTCACTCTCTAGC
TTGTTGCCCGCTAGCCGCTAAGGAGATCTCCTCAGCACAAATCAAAAGTCCCAAGACCCA
GAACTTTTTGCATGTACCGGCATAACACTTTTGACGAGCATTTGGAAGAAATCAACGTCA
GGAAATTCCTTAAGCGATCTAACTAACTTGAGGTTGCTAATGATGGTGTTTTGTTAGTGC
ATCATTTGGGTTTGGACTGTTGTTAGATGTGACACTCAAGCTGACCTTTAAATTTGCTTT
TTTTTCTTACTCTTTCTTGTTAAACGTTTTGCTTCCCTTTTACTTCTTTGGTTTGGAATG
TTTCAAGTGAGTATATTGCATTCATCCTCTTGATATAATGTGGCAACTATGTTTACTATC
TTGAAGGAACTACACGAATTGGATTTATTCAGATCACTAGTGTTTATGTGAACTGAATAC
AGACCATGTGCGTTTAATAGAGAAGCTTGTAAATG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL5576Contig1 775 2 6 U
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CGTTATCTCGGCCATTCATTGATTATTGTATTTGGGGTTGGGATAATCTACCTCGTACTG
TGTTAATGTACTACTCTAATTTTCTCTCTTCTCCGGAAGGATATTTTCACACCGTTCTCT
GCAACGCTGAGGAATTCAGAAACACAACTGTAAACAGCGACTTGCACTTCATAACGTGGG
ACAATCCGCCTAAGCAGCATCCGCACCATCTCAATCTTGCAGACATGGATAGAATGGTCA
ATAGCAATGCCCCCTTTGCTAGAAAGTTCAGAAGAGAAGATCCTGTTCTTGACAAGATTG
ATGAGGAGCTTCTTAACCGAGGTTTTGGGATGCCTACACCTGGTGGGTGGTGCATTGGGA
GCCATGAAAACGGGACTGACCCTTGTGCTGTTATTGGCGATACTGATGTTATCAGTCTGG
TCCAGGTGCTAGACGGCTGGAGAGTCTTGTTACTTCGCTGTTATCTGCTGAAAATTTTCG
ACCAAAACAATGCAGGTAAATCACATTGCAGAACATCACAGAGATTGATGTAGCAGCTTT
TTGGGAGTAGATGTGATTTAGGATCTGATTGAATCTCTCTTTTAGTCAAAGAGTACAAGT
GAGGACACTGAACAGTTTAGGCTTTGGCTCTTGGGAAGCATATTATAACAGATTAATGTA
TTGTTGTAGTTATCACATTTTCACCCATTTTTCATATTGCAATTTTGAGATTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR04TF U 1
AF RR4GR04JQ C 1
BS 1 680 RR4GR04TF
BS 681 681 RR4GR04JQ
BS 682 696 RR4GR04TF
BS 697 697 RR4GR04JQ
BS 698 710 RR4GR04TF
BS 711 775 RR4GR04JQ

RD RR4GR04TF 710 0 0
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GAGGACACTGAACAGTTTAG*CTTTGGCTCTTGGGA*GCATATTATAACA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4GR04JQ 775 0 0
GTACCCAAAGACGAAGCATCCCAACTGCATTTAAGCTCTTCACAGGCTCGGCTTGGATGG
CGTTATCTCGGCCATTCATTGATTATTGTATTTGGGGTTGGGATAATCTACCTCGTACTG
TGTTAATGTACTACTCTAATTTTCTCTCTTCTCCGGAAGGATATTTTCACACCGTTCTCT
GCAACGCTGAGGAATTCAGAAACACAACTGTAAACAGCGACTTGCACTTCATAACGTGGG
ACAATCCGCCTAAGCAGCATCCGCACCATCTCAATCTTGCAGACATGGATAGAATGGTCA
ATAGCAATGCCCCCTTTGCTAGAAAGTTCAGAAGAGAAGATCCTGTTCTTGACAAGATTG
ATGAGGAGCTTCTTAACCGAGGTTTTGGGATGCCTACACCTGGTGGGTGGTGCATTGGGA
GCCATGAAAACGGGACTGACCCTTGTGCTGTTATTGGCGATACTGATGTTATCAGTCTGG
TCCAGGTGCTAGACGGCTGGAGAGTCTTGTTACTTCGCTGTTATCTGCTGAAAATTTTCG
ACCAAAACAATGCAGGTAAATCACATTGCAGAACATCACAGAGATTGATGTAGCAGCTTT
TTGGGAGTAGATGTGATTTAGGATCTGATTGAATCTCTCTTTTAGTCAAAGAGTACAAGT
GAGGACACTGAACAGTTTAGGCTTTGGCTCTTGGGAAGCATATTATAACAGATTAATGTA
TTGTTGTAGTTATCACATTTTCACCCATTTTTCATATTGCAATTTTGAGATTTCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL5577Contig1 664 2 2 U
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AAGGAATGGGAAAAGTATCTACCTCTCTTCTGGCAACTGGTTCCACCGAGCGAGGAAGAC
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AAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RR4CG71TF U 1
AF RR4CG71JQ C 1
BS 1 657 RR4CG71TF
BS 658 664 RR4CG71JQ

RD RR4CG71TF 657 0 0
GGGTTTGCAGTTAGAAACTCACTTGCTGAAGCAGTAGTTGAAGGCACTGGTGACCATTGC
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AAGAGCTTAATCGAAGCCCATGTGGAAAAAACCGGAAGCAGCAAAGGAGAGACGATCTTG
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ACTCCTGAGGCTTCTGCTGCTTATGTAAGAACAGCCACCGGTGAAGTCACATTTCAATCG
GCATAGAGGAGATGTTGCAGTCGAAACAGAAGGATTGATACATCAATGGTGGGCTACGGA
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TAACAGTCCCATGATTGCTATAAGATGTACAGTTATTCAGTTAAATAACTGCATTCAACT
GCCATGAAGATTCCATAAAATTTGCAATATTATCTTTCATTGAATAAAAGTTTGTAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4CG71JQ 664 0 0
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TGTGAGTACATGACTGGAGGCTGTGTTGTCGTGCTTGGAAAGGTGGGGAGAAACGTAGCT
ACAGGTATGACAGGAGGGTTAGCTTATTTTTTTGATGAAGACAACAGTTTTTTTCCCAAG
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AAGAGCTTAATCGAAGCCCATGTGGAAAAAACCGGAAGCAGCAAAGGAGAGACGATCTTG
AAGGAATGGGAAAAGTATTTACCTTTTTTTTGGCAACTGGTTCCACCGAGCGAGGAAGAC
ACTCCTGAGGCTTTTGCTGCTTATGTAAGAACAGCCACCGGTGAAGTCACATTTCAATCG
GCATAGAGGAGATGTTGCAGTCGAAACAGAAGGATTGATACATCAATGGTGGGGTACGGA
GGGAAAATAGATCATTCACAGATCAATGTGTGTGACAATATTTTTATTGTCCTGTGATTT
TAACAGTCCCATGATTGCTATAAGATGTACAGTTATTCAGTTAAATAACTGCATTCAACT
GCCATGAAGATTCCATAAAATTTGCAATATTATCTTTCATTGAATAAAAGTTTGTAGGAA
AAAA

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5578Contig1 1336 2 2 U
GGCCTCTCATTTCGATTTCCTCTCACTCGAAGCAAGATACAGGAAAAGGCGTAAAATCCA
TCAAATTAAGGGTTAGGGGCTGCCCTCAATCAATCTGGGAAACCTTTGATCTGTTTTCCC
GATCCGACTAGAGGAATAAGACAACGAAGAAGACGCAGTAATGGGCGCGAATTCGATTCC
GACGGACGCAACACTCGATTTAGATGAGCAGATCTCTCAGCTCATGCAGTGCAAGCCCCT
CTCCGAGCAACAGGTTAGATCGTTATGCGAAAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGAAAG
CAACGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGTGACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAGTTCCA
TGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATCGGAGGAATGTGCCCTGATACCAACTATCTATTTAT
GGGAGACTATGTGGACCGTGGATATTATTCTGTCGAAACTGTTACGCTGTTAGTTGGCTT
GAAAGTACGGTATCCTCAGCGAATCACTATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAGAT
TACTCAAGTTTATGGATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTATGGAAACGCAAATGTTTG
GAAGATATTCACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTGGAGTCTGAAAT
ATTCTGCCTTCACGGTGGATTGTCGCCGTCTATCGAGACCCTCGACAACATTAGGAACTT
CGATCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGGCCGATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCC
TGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACATTTGGGTCAGG
ACATTTCCGAACAATTCAACCACTCTAACAGCCTAAAACTGATAGCTCGAGCGCATCAGC
TGGTTATGGAGGGATTCAACTGGGCGCACGAGCAAAAGGTAGTTACTATTTTCAGTGCAC
CAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCCATTCTCGAGGTCGATGACTGCAGGA
ACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCGGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGATGTGACCCGAA
GGACACCTGACTACTTCCTTTAAACACATATCACCTCCCCTAAGCTGCAAAGTCCTGTTG
GTTTTTGAAGATCTATGCTTATTATGTTTGGTAAAACGCATTTTGTTATTTAGCCCCTCT
CGCTTGGATAGTGTAATGTAGGAAACGAGGTCAATGAACTCTTAAATCCCAATGAATGTT
TGTGTTTGGCTGAAATTGTTTAGCTCCCTTCTGTATCAGAATCTTTTTCAATTGAGATTA
TTTTCTCGTAGTTCGT


BQ
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AF RR4AI46TF U 1
AF RR4AI46JQ C 578
BS 1 847 RR4AI46TF
BS 848 1336 RR4AI46JQ

RD RR4AI46TF 847 0 0
GGCCTCTCATTTCGATTTCCTCTCACTCGAAGCAAGATACAGGAAAAGGCGTAAAATCCA
TCAAATTAAGGGTTAGGGGCTGCCCTCAATCAATCTGGGAAACCTTTGATCTGTTTTCCC
GATCCGACTAGAGGAATAAGACAACGAAGAAGACGCAGTAATGGGCGCGAATTCGATTCC
GACGGACGCAACACTCGATTTAGATGAGCAGATCTCTCAGCTCATGCAGTGCAAGCCCCT
CTCCGAGCAACAGGTTAGATCGTTATGCGAAAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGAAAG
CAACGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGTGACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAGTTCCA
TGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATCGGAGGAATGTGCCCTGATACCAACTATCTATTTAT
GGGAGACTATGTGGACCGTGGATATTATTCTGTCGAAACTGTTACGCTGTTAGTTGGCTT
GAAAGTACGGTATCCTCAGCGAATCACTATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAGAT
TACTCAAGTTTATGGATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTATGGAAACGCAAATGTTTG
GAAGATATTCACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTGGAGTCTGAAAT
ATTCTGCCTTCACGGTGGATTGTCGCCGTCTATCGAGACCCTCGACAACATTAGGAACTT
CGATCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGGCCGATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCC
TGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACATTTGGGTCAGG
ACATTTC

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR4AI46JQ 759 0 0
AAGTATGGAAACGCAAATGTTTGGAAGATATTCACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTG
ACAGCCTTGGTGGAGTCTGAAATATTCTGCCTTCACGGTGGATTGTCGCCGTCTATCGAG
ACCCTCGACAACATTAGGAACTTCGATCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGGCCGATG
TGTGACTTATTATGGTCTGATCCTGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTGGT
GCCGGATATACATTTGG*TCAGGACATTTCCGAACAATTCAACCACTCTAACAGCCTAAA
ACTGATAGCTCGAGCGCATCAGCTGGTTATGGAGGGATTCAACTGGGCGCACGAGCAAAA
GGTAGTTACTATTTTCAGTGCACCAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCCAT
TCTCGAGGTCGATGACTGCAGGAACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCGGCCCCAAGGAG
AGGAGAACCAGATGTGACCCGAAGGACACCTGACTACTTCCTTTAAACACATATCACCTC
CCCTAAGCTGCAAAGTCCTGTTGGTTTTTGAAGATCTATGCTTATTATGTTTGGTAAAAC
GCATTTTGTTATTTAGCCCCTCTCGCTTGGATAGTGTAATGTAGGAAACGAGGTCAATGA
ACTCTTAAATCCCAATGAATGTTTGTGTTTGGCTGAAATTGTTTAGCTCCCTTCTGTATC
AGAATCTTTTTCAATTGAGATTATTTTCTCGTAGTTCGT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL5579Contig1 741 2 2 U
GGCAGCAGCAGAACTCATGGAAGGAGCTCACGCAATGCTGTTGCACCTCCTCCACGACGC
AGAGAAGAGCCACCCCGCAGAGAAGAACCACCCCGTGATCTATATCTCACCGAAAGCGAG
TACAGAACATACGGCTTGAGAAGAGCAGAACCAGCTCAGCATTATCCAGTTCCGCCACCT
GAGTCTTCTTACCGTCTGGTAGACTCTTACCGTCCATCTGTGGTGGACCATGAGCGGCTT
TTGAGACAAGCAGAGATTGAGAGGCATCATGAGCGTAGTAGAGAAGTTCTTTTGCCTGAG
AGAAGCTACCACCCGTCGTATGATCACCTAAGCTCTAGGCGCCTGGCGCCTGAGCCACCT
GTGGAGTCTTACAGGAGAGACCCGTATCATAGAGTCGAGTACCGTAGTCCCGAAAGACTA
CATAGGACGTACCTGCCTTCTTCAGGAAGAGAAGATGATGACTTGTATTCCCGATATGTT
ACACCGGACTCATTGGCTGAGTACTACCGATCATCATCATCATCTCGCAGATATCCTCCA
AGCATTGCTGAATCTGAGTTTCCGGCTTCATCATTAACGTCCCGATATGCTTACTCAGGG
TCTTTACCTTATTCTCACCGCTGATTTCTACTTTATAGCTCTTTCCTTTGAAATGTATTT
GCTGTTTAATGTATGTTTGGATTTGTACATGCTTTCGTTGGTTCCACCCGAACTTGGATT
GTACTTTGGTTTTTATATTTT


BQ
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AF RR4H333TF U 1
AF RR4H333JQ C 178
BS 1 702 RR4H333TF
BS 703 741 RR4H333JQ

RD RR4H333TF 702 0 0
GGCAGCAGCAGAACTCATGGAAGGAGCTCACGCAATGCTGTTGCACCTCCTCCACGACGC
AGAGAAGAGCCACCCCGCAGAGAAGAACCACCCCGTGATCTATATCTCACCGAAAGCGAG
TACAGAACATACGGCTTGAGAAGAGCAGAACCAGCTCAGCATTATCCAGTTCCGCCACCT
GAGTCTTCTTACCGTCTGGTAGACTCTTACCGTCCATCTGTGGTGGACCATGAGCGGCTT
TTGAGACAAGCAGAGATTGAGAGGCATCATGAGCGTAGTAGAGAAGTTCTTTTGCCTGAG
AGAAGCTACCACCCGTCGTATGATCACCTAAGCTCTAGGCGCCTGGCGCCTGAGCCACCT
GTGGAGTCTTACAGGAGAGACCCGTATCATAGAGTCGAGTACCGTAGTCCCGAAAGACTA
CATAGGACGTACCTGCCTTCTTCAGGAAGAGAAGATGATGACTTGTATTCCCGATATGTT
ACACCGGACTCATTGGCTGAGTACTACCGATCATCATCATCATCTCGCAGATATCCTCCA
AGCATTGCTGAATCTGAGTTTCCGGCTTCATCATTAACGTCCCGATATGCTTACTCAGGG
TCTTTACCTTATTCTCACCGCTGATTTCTACTTTATAGCTCTTTCCTTTGAAATGTATTT
GCTGTTTAATGTATGTTTGGATTTGTACATGCTTTCGTTGGT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4H333JQ 564 0 0
CCTGAGTCTTCTTACCGTCTGGTAGACTCTTACCGTCCATCTGTGGTGGACCATGAGCGG
CTTTTGAGACAAGCAGAGATTGAGAGGCATCATGAGCGTAGTAGAGAAGTTCTTTTGCCT
GAGAGAAGCTACCACCCGTCGTATGATCACCTAAGCTTTAGGCGCCTGGCGCCTGAGCCA
CCTGTGGAGTTTTACAGGAGAGACCCGTATCATAGAGTCGAGTACCGTAGTCCCGAAAGA
CTACATAGGACGTACCTGCCTTTTTCAGGAAGAGAAGATGATGACTTGTATTCCCGATAT
GTTACACCGGACTCATTGGCTGAGTACTACCGATCATCATCATCATTTCGCAGATATCCT
CCAAGCATTGCTGAATTTGAGTTTCCGGCTTCATCATTAACGTCCCGATATGCTTACTCA
GGGTCTTTACCTTATTTTCACCGCTGATTTTTACTTTATAGCTCTTTCCTTTGAAATGTA
TTTGCTGTTTAATGTATGTTTGGATTTGTACATGCTTTCGTTGGTTCCACCCGAACTTGG
ATTGTACTTTGGTTTTTATATTTT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL5580Contig1 823 2 4 U
GGGCAATACATTGGTTGTCTTCTTCTCTCTGTTTCCTAAACACAACAGTGTCCTCCTCTC
CATCTCCACACAAGATTAATTTCCTTTCAATCTCCATAAAACAAAGACAGACGAAGTAAG
TAGAAGAGGAAGAAGCTTCCTCTAGTTTCATTGTGTTATCTTTTGCTCTGTGAAACACAC
CAAACAAACAAGAAATGTTGCTGTCGTTGCTACTCATTTGGGTTCTCGGTGTCTCCTTCT
TCTCGGTCGCTTCTCCCCAAGGAGAAATCCCAAGTTCTCAGACTTCTTCGCCTCGAACGG
GAGCTCAATCCCCAGGGCCTCCGATTGTTCAAGTGGTGCTTCGTGAGGATTTGAACAAGA
AGTTGAAGCTTAATGGAACTTTAGGAAACAGAGCTTCGGAGTGTCTTCTTCTTGATGGGA
AAGTAACAGACAAGAATGATGTATACTCATTTGGGGTGATTCTGCTCGAACTTCTCCTGG
GGAAGAGATCAGTGGAGAAACCATCAGCTGAAGCAGAATCCATTGTGAGTTGGGTACCAA
AGCTGAGTGACAGAGCAAATCTGCCAAACATATTGGATCCGGCAATAAAAGGAAGCATGG
ATTTGAAGCATCTATATCACGTAGCAGCGGTGGCAGTGTTGTGTGTGCAGGAAGAGCCAA
GTTACAGACCACTTATAACCGATGTCTTGCACTCACTCATCCCTCTTCTACCACTAGATC
TCGGCGGATCTTTGCGGATTTTATAAAAACAAAATTTCATTTCCTTATTGTGTAATTTTT
ACATTTTGAATGTTTGTTGCTTCTTTGCAAAGTTCCCACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF09TF U 1
AF RR4FF09JQ C 243
BS 1 650 RR4FF09TF
BS 651 651 RR4FF09JQ
BS 652 749 RR4FF09TF
BS 750 823 RR4FF09JQ

RD RR4FF09TF 749 0 0
GGGCAATACATTGGTTGTCTTCTTCTCTCTGTTTCCTAAACACAACAGTGTCCTCCTCTC
CATCTCCACACAAGATTAATTTCCTTTCAATCTCCATAAAACAAAGACAGACGAAGTAAG
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CAAACAAACAAGAAATGTTGCTGTCGTTGCTACTCATTTGGGTTCTCGGTGTCTCCTTCT
TCTCGGTCGCTTCTCCCCAAGGAGAAATCCCAAGTTCTCAGACTTCTTCGCCTCGAACGG
GAGCTCAATCCCCAGGGCCTCCGATTGTTCAAGTGGTGCTTCGTGAGGATTTGAACAAGA
AGTTGAAGCTTAATGGAACTTTAGGAAACAGAGCTTCGGAGTGTCTTCTTCTTGATGGGA
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GGAAGAGATCAGTGGAGAAACCATCAGCTGAAGCAGAATCCATTGTGAGTTGGGTACCAA
AGCTGAGTGACAGAGCAAATCTGCCAAACATATTGGATCCGGCAATAAAAGGAAGCATGG
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TCGGCGGATCTTTGCGGATTTTATAAAAA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4FF09JQ 581 0 0
TCGGTCGCTTCTCCCCAAGGAGAAATCCCAAGTTCTCAGACTTCTTCGCCTCGAACGGGA
GCTCAATCCCCAGGGCCTCCGATTGTTCAAGTGGTGCTTCGTGAGGATTTGAACAAGAAG
TTGAAGCTTAATGGAACTTTAGGAAACAGAGCTTCGGAGTGTCTTCTTCTTGATGGGAAA
GTAACAGACAAGAATGATGTATACTCATTTGGGGTGATTCTGCTCGAACTTCTCCTGGGG
AAGAGATCAGTGGAGAAACCATCAGCTGAAGCAGAATCCATTGTGAGTTGGGTACCAAAG
CTGAGTGACAGAGCAAATCTGCCAAACATATTGGATCCGGCAATAAAAGGAAGCATGGAT
TTGAAGCATCTATATCAGGTAGCAGCGGTGGCAGTGTTGTGTGTGCAGGAAGAGCCAAGT
TACAGACCACTTATAACCGATGTCTTGCACTCACTCATCCCTCTTCTACCACTAGATCTC
GGCGGATCTTTGCGGATTTTATAAAAACAAAATTTCATTTCCTTATTGTGTAATTTTTAC
ATTTTGAATGTTTGTTGCTTCTTTGCAAAGTTCCCACTTAT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL5581Contig1 746 2 4 U
GGGTCCTACCAAAACATTCACAGTTTATATATTACATATGTTTCGCGTCAGAGCTCCATT
GCTCACCAAACCTCCCCTTTTGCTTCTCCTCTCTCAAGATACATAAGATGGCTCAAGAAG
GTCGAAACATCATCGATGAGCAGGTTGTTGTTGGAGAGGAGAAAGGTTCGGTGAGATTGG
CTACACTAAACCGCCCTCGTCAGCTAAATGTCATCTCTTCTCAAGTGGTCCTCAAGCTTG
CAGAATATCTTGAAACCTGGGAGAAGGATGACAAAACAAAGCTTATATTGATCAAGGGTG
CAGGGAGAGCTTTCTCAGCCGGCGGTGATCTAAAGATGTTTTATGACGGCCGTGAATCAA
AGGATTCTTGCCTTGAGGTTGTTTACCGAATGTACTGGCTTTGCTACCATATCCACACAT
ACAAGAAGACACAGGTTTCTCTTGTAAATGGGATATCGATGGGTGGAGGTGCATCATTGA
TGGTCCCAATGAAGTTCTCTGTTGTGACAGAGAAAACTGTTCTTGCAACTCCAGAAGCAA
GCATTGGGTTTCACACCGATTGTGGGTTCTCTTACATTCATTCACGTCTTCCTGGTCATC
TAGGAGAATTCTTGGCTTTAACTGGGGCAAGATTGAATGGCAAAGAACTTGTAGCAATTG
GCATGGCAACACATTTTGTTCCTTCTGCTAAACTGGCTGATCTGGAGGCAGTCAATAATT
GATGAGTGTTTCTCAAAAGAAAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET21TF U 1
AF RR4CF83TF U 87
BS 1 304 RR4ET21TF
BS 305 305 RR4CF83TF
BS 306 600 RR4ET21TF
BS 601 746 RR4CF83TF

RD RR4ET21TF 600 0 0
GGGTCCTACCAAAACATTCACAGTTTATATATTACATATGTTTCGCGTCAGAGCTCCATT
GCTCACCAAACCTCCCCTTTTGCTTCTCCTCTCTCAAGATACATAAGATGGCTCAAGAAG
GTCGAAACATCATCGATGAGCAGGTTGTTGTTGGAGAGGAGAAAGGTTCGGTGAGATTGG
CTACACTAAACCGCCCTCGTCAGCTAAATGTCATCTCTTCTCAAGTGGTCCTCAAGCTTG
CAGAATATCTTGAAACCTGGGAGAAGGATGACAAAACAAAGCTTATATTGATCAAGGGTG
CAGGTAGAGCTTTCTCAGCCGGCGGTGATCTAAAGATGTTTTATGACGGCCGTGAATCAA
AGGATTCTTGCCTTGAGGTTGTTTACCGAATGTACTGGCTTTGCTACCATATCCACACAT
ACAAGAAGACACAGGTTTCTCTTGTAAATGGGATATCGATGGGTGGAGGTGCATCATTGA
TGGTCCCAATGAAGTTCTCTGTTGTGACAGAGAAAACTGTTCTTGCAACTCCAGAAGCAA
GCATTGGGTTTCACACCGATTGTGGGTTCTCTTACATTCATTCACGTCTTCCTGGTCATC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4CF83TF 660 0 0
TCCTCTTTCAAGATATATAAGATGGCTCAAGAAGGTCGAAACATCATCGATGAGCAGGTT
GTTGTTGGAGAGGAGAAAGGTTCGGTGAGATTGGCTACACTAAACCGCCCTCGTCAGCTA
AATGTCATCTCTTCTCAAGTGGTCCTCAAGCTTGCAGAATATCTTGAAACCTGGGAGAAG
GATGACAAAACAAAGCTTATATTGATCAAGGGTGCAGGGAGAGCTTTCTCAGCCGGCGGT
GATCTAAAGATGTTTTATGACGGCCGTGAATCAAAGGATTCTTGCCTTGAGGTTGTTTAC
CGAATGTACTGGCTTTGCTACCATATCCACACATACAAGAAGACACAGGTTTCTCTTGTA
AATGGGATATCGATGGGTGGAGGTGCATCATTGATGGTCCCAATGAAGTTCTCTGTTGTG
ACAGAGAAAACTGTTTTTGCAACTCCAGAAGCAAGCATTGGGTTTCACACCGATTGTGGG
TTCTCTTACATTCATTCACGTCTTCCTGGTCATCTAGGAGAATTCTTGGCTTTAACTGGG
GCAAGATTGAATGGCAAAGAACTTGTAGCAATTGGCATGGCAACACATTTTGTTCCTTCT
GCTAAACTGGCTGATCTGGAGGCAGTCAATAATTGATGAGTGTTTCTCAAAAGAAAGTGT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL5582Contig1 498 2 1 U
GCCGAACTTTTTTCGCCGGTTAAAGACTTGAGAGAGGAAACAGAACGAGGAGCGAGCGAG
CGAGCGGCGGAGATCTGTTATCAAACCCGGCGGGAGGATTGGTTAAGGATGTTTGGGCGT
CGTGCTGGAACGAATCGAGCCGGTATGAGGAGGGACGACTCCATTCTGACTCGGCTCGTT
GACTCAGTGTTTTCTCTATTCCGATTAGCTGAGTTCGAGATCCTGTTTGTGCTATTCTTC
GTCATAGCCTACCTCATCTTCAAGGATCTGACGGCGAGGTCGGAGTACAATCGGACTCTT
GTTGAGAAACCCGGTGGATCTGACATCTGGCCGTTCTAGTTGGATACAGCTCATACATGT
TTGTTTAGTACGTATATGCTTGTACACGTTAATGAACTGCTTAGCGTTCTTCTCTCGTAG
TAAATGTTGTCGTCACTTTGTTCAATTGCTCAATGTAATTCTCCTTCCTTGATTTTAATT
TAATGCTTTGGTTTCGCT


BQ
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AF RR4GI13JQ C 1
AF RR4GI13TF U 1
BS 1 498 RR4GI13TF

RD RR4GI13JQ 498 0 0
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CGAGCGGCGGAGATCTGTTATCAAACCCGGCGGGAGGATTGGTTAAGGATGTTTGGGCGT
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GTCATAGCCTACCTCATCTTCAAGGATCTGACGGCGAGGTCGGAGTACAATCGGACTCTT
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TAATGCTTTGGTTTCGCT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4GI13TF 498 0 0
GCCGAACTTTTTTCGCCGGTTAAAGACTTGAGAGAGGAAACAGAACGAGGAGCGAGCGAG
CGAGCGGCGGAGATCTGTTATCAAACCCGGCGGGAGGATTGGTTAAGGATGTTTGGGCGT
CGTGCTGGAACGAATCGAGCCGGTATGAGGAGGGACGACTCCATTCTGACTCGGCTCGTT
GACTCAGTGTTTTCTCTATTCCGATTAGCTGAGTTCGAGATCCTGTTTGTGCTATTCTTC
GTCATAGCCTACCTCATCTTCAAGGATCTGACGGCGAGGTCGGAGTACAATCGGACTCTT
GTTGAGAAACCCGGTGGATCTGACATCTGGCCGTTCTAGTTGGATACAGCTCATACATGT
TTGTTTAGTACGTATATGCTTGTACACGTTAATGAACTGCTTAGCGTTCTTCTCTCGTAG
TAAATGTTGTCGTCACTTTGTTCAATTGCTCAATGTAATTCTCCTTCCTTGATTTTAATT
TAATGCTTTGGTTTCGCT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL5583Contig1 964 2 2 U
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CTCCGCCGAGCCGATCAAACGTACCGGCCATTGAGCTTGATCTGTGAGGAGAGGATTCAT
TGGTGTCACGTTTAAGGTTTCGAAGATTGGTAGAAAGTTTGGGCAGAGGGTTTCTACTAA
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GTCTTCTAGGTTAGCATCTAAGCCACTTTCGCTGAGCATAATATGAATGGGTACTCTTTA
GGAAAAACCTCAGAGGTATGTGGTAGGACTTCGTGTCCTGAGATATATCAGGTATAGTAG
TGTGTTTGTCTTCTAGATCGAGCCTCGGATGACTGCAACAACAACATCAGATGTTTTTAT
GCCGGAGATCCTGAAGCTTCTTTGTAGTTTCTGTGGAAGGATCTTACAGAGACCTGGTGA
TGGGAAGCTTAGATACATTGGAGGTGAGATTCATATCATCTTCATATGAAAACATGTTGG
ATTAAACGAATTGATGCACAAGACTAATGATCTGTGCAACCATCCGTATACAATCAAGTA
TCAGTTACCGGAGAAGATATTGATGCGCTTATATCTGTTTGATCGGATGAGGATCTTCTT
CATATGGTTGAAGAGGATCAAGAAGCTAAAAAAAAAAGAACAAGAATTGATAAATTATGT
TATTCGATTCACACAGTTTTTTCTGCAAGTATCTGGTTTTGGTTTTCTTCAATTTCAACA
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CATACTTAGTCTTTATGAAAATAAAAATCTTTTTGCTAATAAAAACAAACTACATCATTT
AGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RR4DV27TF U 1
AF RR4DV27JQ C 133
BS 1 193 RR4DV27TF
BS 194 964 RR4DV27JQ

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TGGTGTCACGTTT

QA 1 193 1 193
DS 

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TTATGAAAATAAAAATCTTTTTGCTAATAAAAACAAACTACATCATTTAGTC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

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AGATCTGATGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FY05TF U 1
AF RR4FY05JQ C 88
BS 1 551 RR4FY05TF

RD RR4FY05TF 551 0 0
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CTCTCTCGTTCTCCTTCCTCTCTACGCTTCTGCGTCGCCGTTTGTCGGTGGATGGCGTCC
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CAACAAGCAGAGCAAATCGGGACTCAAGTTCGTGTCGGTTGCTAGCGGCGACTCTCAGGT
AGTTGCCGGTACAAATTACCGGCTTATCGTGGCGGTTAATGATGGCGTAAAGATAGCCAA
TGCTGGTGCGAGCAAGAACTACGAAGCGATTGTATGGGAGCAGCCTTGGTTACATTCAAA
GAATCTCACCTCTTTCAAGCCAACCATGAACTAATGGCTGTTTCCTCTTAAGTTCTCCAT
ATGTAATGATCTGATAAAATACAGTAAAAAAAGTTAAATAAACAAAGAAGGAATTGAATT
AATGTTGATTCCTGTATTTCTTTCTGATTTTCAAAATTTATGTTGTTGGGCGTAAACCCT
AGATCTGATGC

QA 1 551 1 551
DS 

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TTT
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AGAGATCGGCGAATTCGCGGTCTCTGAGTACAACAAGCAGAGCAAATCGGGACTCAAGTT
CGTGTCGGTTGCTAGCGGCGACTCTCAGGTAGTTGCCGGTACAAATTACCGGCTTATCGT
GGCGGTTAATGATGGCGTAAAGATAGCCAATGCTGGTGCGAGCAAGAACTACGAAGCGAT
TGTATGGGAGCAGCCTTGGTTACATTCAAAGAATCTCACCTCTTTCAAGCCAACCATGAA
CTAATGGCTGTTTCCTCTTAAGTTCTCCATATGTAATGATCTGATAAAATACAGTAAAAA
AAGTTAAATAAACAAAGAAGGAATTGAATTAATGTTGATTCCTGTATTTCTTTCTGATTT
TCAAAATTTATGTTGTTGGGCGTAAACCCTAGATCTGATGC

QA 4 464 4 464
DS 



AS 1 2

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GGACAAAGGTTAACTTTACAATTTTACGTAAGGACTTCAAACATTTCGATTACATCGTTC
TTTGAATAATTTTACAATGAATTACAAAATACAATGTTTTTTGTCTTCATGGATTCATAC
AATGATACAAGCAATTTCTAAGAGCAAAACGAAACTAAGTCTATTGATTTGTTAGAGTTG
ATATTCTACTCTACAGAAATCATCTGTCAAAAATATACTTTTATTAATAACATGACAAAT
AAATAGTAGTCAAATAACCACGAGTCAGGCAATGCTGATTTTGATCTGTAAATCTAAATG
TGAGGTGAAGCGATGACCACCACAAGACGATAAAAGCTTATGTACCAAGAAAATATACTT
ATATATGGGCTATTGATAAAATTTGAACCCTAACTAAAGCAAGAAAACAAAAAGAATCAT
GTTAGTCCCACCCCATATGGAAAACAAACCCTAATAATTACACATATAAGAATTATTTTC
TTATATCCCCATAAAAAGATATTGTATACAAATATGCATATATATCCACATAAATGTATA
TAAAGGTTCATCCACTTTAAATTTAGCCATCTTCATTCTCACACTCAACCTTCTCCTCTC
TTCCTTCATTTTCTTTGTTTTTTCCTTGATCTGATTCCTCTACTAGATTTTGTTCCCATA
TCACACACCGAGAAAAAGAGAAGAGAAAAGAATAGATACAACTTTACTTCTAAAATTCTG
AAGAATAAAATTAGAAAAGAGTATACCATGGTTTTCTCCTCCATCCAAGCTTATCTTGAT
TCATCCAACTGGCAACAAGTAAGTTCTTTAGTATCTATATATATACAAGCTTCTTAAATA
GGAGAAAGAATATTATTATTGCTTATCAATTACATGTTGTAATTTCGGAATCAAACTAAC
AAAAATAATTCTTAATTCAAAGCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX43TF U 1
AF RR4CX43JQ C 231
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RD RR4CX43TF 703 0 0
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TTCCTTCATTTTCTTTGTTTTT*CCTTGATCTGATTCCTCTAC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4CX43JQ 757 0 0
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GTCCCACCCCATATGGAAAACAAACCCTAATAATTACACATATAAGAATTATTTTCTTAT
ATCCCCATAAAAAGATATTGTATACAAATATGCATATATATCCACATAAATGTATATAAA
GGTTCATCCACTTTAAATTTAGCCATCTTCATTCTCACACTCAACCTTCTCCTCTCTTCC
TTCATTTTCTTTGTTTTTTCCTTGATCTGATTCCTCTACTAGATTTTGTTCCCATATCAC
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ATAATTCTTAATTCAAAGCAAGC

QA 15 757 15 757
DS 



AS 1 2

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ATCATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY54JQ U 1
AF RR4DK27JQ U 32
BS 1 538 RR4BY54JQ
BS 539 539 RR4DK27JQ
BS 540 758 RR4BY54JQ
BS 759 759 RR4DK27JQ
BS 760 769 RR4BY54JQ
BS 770 846 RR4DK27JQ

RD RR4BY54JQ 769 0 0
AAAAATATTGGCTTGCTTTATTTTTATTTTTAATCGATTTTATTATATAACAATTTGCTT
AGAAAAAATCCATTATTTTACACCCTATGACATTACCACACGACATGAATTACTCTTTGA
ATCCATTCTCCTCGTGTCACTGCAACTTCAACCTGCAATATACGCTTTGTTTTCTTCCTA
TATTCATCGCCTTTCACGACATTTAACTTGAGAATCTATGGCCCTTAGCTTACTTCCGCC
GTAAGTAAGCTGGATAAACTCTGGCAAAACTCCATGTATAGCCTTAACTCGCCCGCGGAC
TTTGATATTTCTATTACACAATTGGTTGGCGTCACCTCAATCACCTCTGCTGATAATAAG
TCAAAAGAAGATCTTGATCTTATCTCTTTTGGTAGAATATTAACCTTGAAATGCTTTATT
CTTTCAACTGATAAACTAGCATAAGTTGCTGCAGCTTCAATCTTCTTGATTGTCTCTTGT
GCTGTGTTCTTGGACCCAATTTTTGTTTTATAAATTTTATCATCCTGCTCTTCTAAGAGA
CCTGACAAATCTAGATCACTAGACATTGCTATTATCTGAAAAGCGTTTATGAAATTTGAA
GACGCGGTTGCTGCATTTATCTCAGCAACACTTTCCTTGATTGAGTCTGGAACTTGATGA
TAAGCTGGTATATAACCTAACTTGAACCAAGAATCTTGGATGATTATCTCAACTAGTTTC
ATACGCCTTTGAGGATTTGGGTCAAGAATGTTAAAGAT*AGCTTCTTCT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4DK27JQ 815 0 0
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ATTACCACACGACATGAATTACTCTTTGAATCCATTCTCCTCGTGTCACTGCAACTTCAA
CCTGCAATATACGCTTTGTTTTCTTCCTATATTCATCGCCTTTCACGACATTTAACTTGA
GAATCTATGGCCCTTAGCTTACTTCCGCCGTAAGTAAGCTGGATAAACTCTGGCAAAACT
CCATGTATAGTCTTAACTCGCCCGCGGACTTTGATATTTCTATTACACAATTGGTTGGCG
TCACCTCAATCACCTCTGCTGATAATAAGTCAAAAGAAGATCTTGATCTTATCTCTTTTG
GTAGAATATTAACCTTGAAATGCTTTATTCTTTCAACTGATAAACTAGCATAAGTTGCTG
CAGCTTCAATCTTCTTGATTGTCTCTTGTGCTGTGTTCTTGGACCCAATTTTTGTTTTAT
AAATTTTATCATCCTGCTCTTCTAAGAAACCTGACAAATCTAGATCACTAGACATTGCTA
TTATCTGAAAAGCGTTTATGAAATTTGAAGACGCGGTTGCTGCATTTATCTCAGCAACAC
TTTCCTTGATTGAGTCTGGAACTTGATGATAAGCTGGTATATAACCTAACTTGAACCAAG
AATCTTGGATGATTATCTCAGCTAGTTTCATACGCCTTTGAGGATTTGGGTCAAGAATGT
TAAAGATTAGCTTCTTCTGTGCTCCAGTGAATGCTGGTGGAAATGTGTAATCTGCTCTGA
GTATCTTCTATACAAACCACAAGTGTATGATCATC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CCAGAGGTGGGTGATTTTCCCACAACCACCCTTGTATCTCTAAACTTTTATTAATCTGTT
GATGATCAACAAGACTCGGAACTTTTTTTCTTTTTTCATGTAATGGCTTGATGTTGAATG
AATCTAGTTCCATTCTCT


BQ
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AF RR4AJ14JQ C 1
AF RR4AJ14TF U 1
BS 1 498 RR4AJ14TF

RD RR4AJ14JQ 498 0 0
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QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4AJ14TF 498 0 0
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TTTGGTAGGACAAGAAGTGACGGTTGAGCTGAAGAACGATTTAGCAATCAGAGGGGCACT
TCATTCAGTTGATCAGTACCTTAATATCAAGCTCGAGAACACTCGTGTTGTTGATCAGGA
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GATGATCAACAAGACTCGGAACTTTTTTTCTTTTTTCATGTAATGGCTTGATGTTGAATG
AATCTAGTTCCATTCTCT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL5589Contig1 753 2 2 U
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GTTCCCTGTGCTCTATCCGGCTTACTTCTCACCGTTCTACTCATTCCCCTTTCCGGTTTG
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GACAGCTGTGCACTCAAAAGCCGCTCCGATTAATATTGATCAACTTCTTGGTATGTCTAA
GCTCAGCCTCGGAGAGTTTAGCCAAAGTGGTGTATTGGAACAGTTTCTTTCGTTGAAACT
AGTTGGAGGTTCGGCTTCAAGGCAATCAGCCTTTCATCCAAATCCAGCCAATGGTGGTGG
TGTACCGGACATGAACACCGTGATTCATGCTGTCTAAAGATCTACCTGATGTGACGGTGG
TCTCTCAGATTTGTGGCCGTAGCCAAGTGATTTATTGTCATTAACATGACTTATACAACA
ACAGCGATTTGCAGACAGGTCCCAAGGCTGGGCTCTCGGATTAGTTATTGGTTATAGTAT
ACTATTGTTTTAGTTAGGTTTGATTGGATTTGCTTAGTGCAGCTTTGTTTATTAGGGTGG
AAAAGAAAGAAAGATAAAAGTTACCGGCCTTTGCCTTTGTTTTGGTTTAGCATAACCCTT
AATTTCGTTCAATGATGTATTAAAAGTTTAAAACTGCTTAGCGTTCTAGGATTTATTACA
ATAAGTTTCTTATGAAGATGTCTACTTGTGTCG


BQ
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AF RR4BQ56TF U 1
AF RR4BQ56JQ C 1
BS 1 555 RR4BQ56TF
BS 556 753 RR4BQ56JQ

RD RR4BQ56TF 555 0 0
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ACTATTGTTTTAGTT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4BQ56JQ 753 0 0
GCCTCCGACTGCTTCTTTAGACACCATCCAAACTCAGCTACAACCACCACCGCCTGGTTC
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GACTGCTGCGTATGTTACCGGGCCATCGACAAAGGAAGAGACTCACGAGATTCTCAGGCC
GACAGCTGTGCACTCAAAAGCCGCTCCGATTAATATTGATCAACTTCTTGGTATGTCTAA
GCTCAGCCTCGGAGAGTTTAGCCAAAGTGGTGTATTGGAACAGTTTCTTTCGTTGAAACT
AGTTGGAGGTTCGGCTTCAAGGCAATCAGCCTTTCATCCAAATCCAGCCAATGGTGGTGG
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TCTCTCAGATTTGTGGCCGTAGCCAAGTGATTTATTGTCATTAACATGACTTATACAACA
ACAGCGATTTGCAGACAGGTCCCAAGGCTGGGCTCTCGGATTAGTTATTGGTTATAGTAT
ACTATTGTTTTAGTTAGGTTTGATTGGATTTGCTTAGTGCAGCTTTGTTTATTAGGGTGG
AAAAGAAAGAAAGATAAAAGTTACCGGCCTTTGCCTTTGTTTTGGTTTAGCATAACCCTT
AATTTCGTTCAATGATGTATTAAAAGTTTAAAACTGCTTAGCGTTCTAGGATTTATTACA
ATAAGTTTCTTATGAAGATGTCTACTTGTGTCG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL5590Contig1 773 2 2 U
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GAATGCGAATATGGTAGTGGAAGAGATAAAGGTTGGACTAAGAGTTGAGACCCAATATGG
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TGTTTATGATTTGTTTTGGTTTACTAGAACCTTTTCATTTTACCTGGAGACATCAGGAAA
ATGTGTACCAAAAGCCAAAATTTGTTTAAGCGAGGAAAGAAGATTGGCGACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FL82TF U 1
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BS 584 773 RR4FL82JQ

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ATTCAAAGATAGAATAAGAAAGACTGGGATGATAGTGAGAGATTGGGTGGACCAGTGGGA
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GAATGCGAATATGGTAGTGGAAGAGATAAAGGTTGGACTAAGAGTTGAGACCCAATATGG
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AGCGTTGATCCAAGAGACTGGTTCATCTTGGAAGAACTTAAATTTGCTTCTTGAAAAGTT
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QA 1 583 1 583
DS 

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TGGGATGATAGTGAGAGATTGGGTGGACCAGTGGGAGATATTGTCACATGAAAGTGTCAA
AGGTTTCTTGAACCATTGTGGATGGAATTCAGCACTAGAGAGTATATGCGTTGGGGTCCT
GTTGTTGGCTTGGCCGATGATGGCTGAGCAACCACTGAATGCGAATATGGTAGTGGAAGA
GATAAAGGTTGGACTAAGAGTTGAGACCCAATATGGTAGTGTGCGAGGATTCGTAACAAA
AGAGGAACTAAGCCAAAAGGTTCAAGAACTAATGGAAGGAGAAAAAGGGAAAACAGCAAG
AAAGAATGTAAAAGAATACTCAAAAATGGCAAAAGCAGCGTTGATCCAAGAGACTGGTTC
ATCTTGGAAGAACTTAAATTTGCTTCTTGAAAAGTTATGTAAGAGTGGAGAGACAAGCGA
GGGCAATAACTAGCAAGTATGAAGACTGAGGACTGGTTAACTTGATTAACCAGTTTAGAG
CGGTTGGTATAATCAAATCAATATATCCAAAATATATGTTTATGATTTGTTTTGGTTTAC
TAGAACCTTTTCATTTTACCTGGAGACATCAGGAAAATGTGTACCAAAAGCCAAAATTTG
TTTAAGCGAGGAAAGAAGATTGGCGACCT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

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CTCCGATGGTTTACACAGCATCGGAGCCGGATTTCTAGTTTTCTCTTGTACTTTGGTCTG
TCTTCTCTTGTATTTTGGTCTGTTTTATCTCTTTTCATCATCAACTCCTCTTTATTTTAG
CGGATTTGGTTTTTTAGGGTTTTGATTTTCTTTAGATCCGTAGATCTGAAGTTGTCAATC
TCTTACAATCCGGTTCAGATGTTGTTGTTCTGGGTTAGCCTTGTCTAATAGTTTCAGCTT
GGTCTGTGTTTCATCATTTATCCCATCTGAGATCTGTTTTTTGTCAGAGTGAACGAATCT
GAGACGTCTTTGGTGGGTTCTAGTGTTTGTCCTCTGTCTAGGTGCCACTTCGGTGTAAGT
GGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGGTGAGCAGTTCAGGCCTATTGTGCTTCAGAAT
TCAAGTTTCCTATCACCTCTCTATCTCTCAGTCTTGAAGGAGTTCTTCTCGCGACTTTTA
ATAAGTGTCTGTTCCGGTTGTTTTGATTCCCTTGTTCCTCGGTGGCTTCTGGTGAGGCAG
TATAAGGAGGTTGGGGTTTTAGGCTTCCGAAGAAGGTTTTGCTGGAGAAGGGGGCTTTAG
TTTCAGGTGTTGGTTACTTCACTTTGTGGAGTTTAGGTGTTTTGGTTCTGGCTTGGTACC
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ACTCTCTCTTGGGCTTGGTCGGTTCTTGGCAAGAGTGCCGGCAGTTCTAGGATTGGTTGA
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TATGGGTTATGGTTCCGGGGATGGTAATATGTATCCTCTGGTTGTTGAATATCCTTGTAT
GTCTTTTAGTTTCATCAATCAAATTTAGACGG


BQ
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AF RR4B376TF U 1
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BS 734 1052 RR4B376JQ

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CGGATTTGGTTTTTTAGGGTTTTGATTTTCTTTAGATCCGTAGATCTGAAGTTGTCAATC
TCTTACAATCCGGTTCAGATGTTGTTGTTCTGGGTTAGCCTTGTCTAATAGTTTCAGCTT
GGTCTGTGTTTCATCATTTATCCCATCTGAGATCTGTTTTTTGTCAGAGTGAACGAATCT
GAGACGTCTTTGGTGGGTTCTAGTGTTTGTCCTCTGTCTAGGTGCCACTTCGGTGTAAGT
GGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGGTGAGCAGTTCAGGCCTATTGTGCTTCAGAAT
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ATAAGTGTCTGTTCCGGTTGTTTTGATTCCCTTGTTCCTCGGTGGCTTCTGGTGAGGCAG
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GTGAACGGTGGAT

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DS 

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AGCTTGGTCTGTGTTTCATCATTTATCCCATCTGAGATCTGTTTTTTGTCAGAGTGAACG
AATCTGAGACGTCTTTGGTGGGTTCTAGTGTTTGTCCTCTGTCTAGGTGCCACTTCGGTG
TAAGTGGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGGTGAGCAGTTCAGGCCTATTGTGCTTC
AGAATTCAAGTTTCCTATCACCTCTCTATCTCTCAGTCTTGAAGGAGTTCTTCTCGCGAC
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GGCAGTATAAGGAGGTTGGGGTTTTAGGCTTCCGAAGAAGGTTTTGCTGGAGAAGGGGGC
TTTAGTTTCAGGTGTTGGTTACTTCACTTTGTGGAGTTTAGGTGTTTTGGTTCTGGCTTG
GTACCGTGAACGGTGGATTCAGGTATGTTTGGACTTGTGTTGTTGTGTTGGCCACTGCAT
TGCTTACTCTCTCTTGGGCTTGGTCGGTTCTTGGCAAGAGTGCCGGCAGTTCTAGGATTG
GTTGACTTACTCTTATCTTCCCCAAGGAGTGATTTCAGTTTCAGATGTATGAATGTAAGG
TTTATTTAAGTGATTGTGCTAGTTGTTGTATGTGTTGCCTTCTGTTTGGGCTCGAGATTT
CCGTGTATGGGTTATGGTTCCGGGGATGGTAATATGTATCCTCTGGTTGTTGAATATCCT
TGTATGTCTTTTAGTTTCATCAATCAAATTTAGACGG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

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TAGATAATCATCACTATACCATTTCTAAATAATCTCTACTCATTATTTTGTATGGATGAT
CGTAAAAATGTTTGGGTATCAAACTCTTACCAAGCGTTTGTAGGAGAGGAAGTATAGGTG
AGAAAAGATTAGGGTCAGTCACAGATTATGCGGAAAATTTGAGAACCATGAGAGCATGAT
AAAATAAACGAAGCCAGAAATAGAAACCATTCCCTTCAATTAAGCAAACGTCTTCTCTTT
GTCTCTTTCATTTTCCTTCGGTAAGCTTATATAAATAGATAGACAAAGGAGCCAAAGTTT
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AAGTGAGCTGGTCGCTTTTGACATGGGAGGGCTAAGAAACAACCTTCCCAAAAAGAGAGG
ATTGTCAAGGTTCTACTCGGGTAAAGCAAGATCATATGTTTGTATCTCAGATGTTAAATG
CCTTGAAGATCTCAAGAAACCAACACATCCTCTTGACGAGGACGACGTTGATGATGCCTC
CAAGAAGAGGAAGAAGAAGAATAGGCAATCATCTTCATCTTCGTTTTCTGCAGCAGTTAA
CAGCAACGTTAATTATCAAAACTACCCGTGTCGTAGAGTCTCTAGTAGCACCCATTGTTC
CACACCTTGTGTTGGTGCTTAGTTTTTCGTTTTGCTCTTTTTCAAAACAGTTTCTTAATT
TACCACACCTTTCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E533TF U 1
AF RR4E533JQ C 112
BS 1 605 RR4E533TF
BS 606 795 RR4E533JQ

RD RR4E533TF 605 0 0
TTTTGTGTGTATCATTAACTATTTGGATTTAAGCTTTGGTGTTTGATCTAGAACCTATGT
TAGATAATCATCACTATACCATTTCTAAATAATCTCTACTCATTATTTTGTATGGATGAT
CGTAAAAATGTTTGGGTATCAAACTCTTACCAAGCGTTTGTAGGAGAGGAAGTATAGGTG
AGAAAAGATTAGGGTCAGTCACAGATTATGCGGAAAATTTGAGAACCATGAGAGCATGAT
AAAATAAACGAAGCCAGAAATAGAAACCATTCCCTTCAATTAAGCAAACGTCTTCTCTTT
GTCTCTTTCATTTTCCTTCGGTAAGCTTATATAAATAGATAGACAAAGGAGCCAAAGTTT
TTCTTGTTTTTGTTCTTGTTCTCTCTCTCTATATATATATCTATGAACTATGGAAAACAT
AAGTGAGCTGGTCGCTTTTGACATGGGAGGGCTAAGAAACAACCTTCCCAAAAAGAGAGG
ATTGTCAAGGTTCTACTCGGGTAAAGCAAGATCATATGTTTGTATCTCAGATGTTAAATG
CCTTGAAGATCTCAAGAAACCAACACATCCTCTTGACGAGGACGACGTTGATGATGCCTC
CAAGA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4E533JQ 684 0 0
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GTATAGGTGAGAAAAGATTAGGGTCAGTCACAGATTATGCGGAAAATTTGAGAACCATGA
GAGCATGATAAAATAAACGAAGCCAGAAATAGAAACCATTCCCTTCAATTAAGCAAACGT
CTTCTCTTTGTCTCTTTCATTTTCCTTCGGTAAGCTTATATAAATAGATAGACAAAGGAG
CCAAAGTTTTTCTTGTTTTTGTTCTTGTTCTCTCTCTCTATATATATATCTATGAACTAT
GGAAAACATAAGTGAGCTGGTCGCTTTTGACATGGGAGGGCTAAGAAACAACCTTCCCAA
AAAGAGAGGATTGTCAAGGTTCTACTCGGGTAAAGCAAGATCATATGTTTGTATCTCAGA
TGTTAAATGCCTTGAAGATCTCAAGAAACCAACACATCCTCTTGACGAGGACGACGTTGA
TGATGCCTCCAAGAAGAGGAAGAAGAAGAATAGGCAATCATCTTCATCTTCGTTTTCTGC
AGCAGTTAACAGCAACGTTAATTATCAAAACTACCCGTGTCGTAGAGTCTCTAGTAGCAC
CCATTGTTCCACACCTTGTGTTGGTGCTTAGTTTTTCGTTTTGCTCTTTTTCAAAACAGT
TTCTTAATTTACCACACCTTTCAC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5593Contig1 1190 2 2 U
GAAACGAAGTAGTTGTACTGGGTGAGAAGTATTCGGAGAAAAAACTGGTCAAGAAACTCA
TCAGGTGTTTTCTTAAGCGTTTTGAAGCTTATAAATCAAGACTACTATGAACTCAGATAA
AATCAAGTTCACAACTGGTTGGATTACTCATGTCATATGAGCTGGAACGAACGGAATATC
TACCACTTCCAGTAGAAGGGATTGCTTTCGCAGCTAATGCAGATGATGAGAGAGTTAAGA
AGTTAGAAGCCGATGTCAGTCTGATGGCAAAAAGCTTCAACAATATGGTGAAAAGACCTG
ACAAAGGAGTGTCTAGAACCTTTGGTCGTTCCAACAGAGGTGGTTACCAGCGGAATTCAA
GATCAAATGAAGACCGACATGATTGAAAGAAAGATGCTCAGTGTCATGAATATGAGGGGT
ATGGTCATATTCAACGTGAATGTCCCTTGTTTAACAGGAAGGAAATAAAATGCACTGAAT
GTAAAAGGAGAGGACATCTGAAAGAAGAATGTCCAAATAATCAAAAGAGTGTTGAAAAAT
CACTGATTTACTTCAGTGACACTGAATCTGAAGAAGAAGATGATCTCAAAGACTTGTTGT
TAAACTTCGTGGCACTGGTATGATCAGAAAGAGATGAGATTGATGTCAGGAAAGAGTACC
ATGAGCTGATAAAGAATACGGCTATGCTGAGGGCTCAGGTTAATATTCTGACTATTGATT
CTAACGATCCCGAATAAAAGGAGAACATCATGCTGAAGTCGGAAAATATCGTGAGAAATG
TGAAAGACATCGAACGAAAACTAATGGATGAAAAACAGAAGAATCAGGTTTTGGAAGACC
GTGTAGCCAAGATGTGACAAGCCTTTACTGAAGAGCAGGGCAAAGCTCATGGGATGGAGC
AGGATTTAACCAAGAATCACAAGAAGATTCAAATGCTGAGCCGAGGAACCAAAGATCTCG
ATCAGCTTTTAACCATTGGACAACCTCCAAAGCTAATCGGAGCTTAGGATACAATGGGAA
AAGGTCTACTTCAATAGTTTTTGTGCATGCAACAAAACCATTGGAGGACCAAGTTATCAC
AACTGAAAAATGCACATGTTTTGGGTTAGAGAATAAAAAGGAGAAGCAAGTCACAGTAGC
AGAGGTGAGAGTCAAATCAACTGACAACGGAAAGTCAATGATGTGTGCTG


BQ
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AF RR4CM62TF U 1
AF RR4CM62JQ C 449
BS 1 647 RR4CM62TF
BS 648 1190 RR4CM62JQ

RD RR4CM62TF 647 0 0
GAAACGAAGTAGTTGTACTGGGTGAGAAGTATTCGGAGAAAAAACTGGTCAAGAAACTCA
TCAGGTGTTTTCTTAAGCGTTTTGAAGCTTATAAATCAAGACTACTATGAACTCAGATAA
AATCAAGTTCACAACTGGTTGGATTACTCATGTCATATGAGCTGGAACGAACGGAATATC
TACCACTTCCAGTAGAAGGGATTGCTTTCGCAGCTAATGCAGATGATGAGAGAGTTAAGA
AGTTAGAAGCCGATGTCAGTCTGATGGCAAAAAGCTTCAACAATATGGTGAAAAGACCTG
ACAAAGGAGTGTCTAGAACCTTTGGTCGTTCCAACAGAGGTGGTTACCAGCGGAATTCAA
GATCAAATGAAGACCGACATGATTGAAAGAAAGATGCTCAGTGTCATGAATATGAGGGGT
ATGGTCATATTCAACGTGAATGTCCCTTGTTTAACAGGAAGGAAATAAAATGCACTGAAT
GTAAAAGGAGAGGACATCTGAAAGAAGAATGTCCAAATAATCAAAAGAGTGTTGAAAAAT
CACTGATTTACTTCAGTGACACTGAATCTGAAGAAGAAGATGATCTCAAAGACTTGTTGT
TAAACTTCGTGGCACTGGTATGATCAGAAAGAGATGAGATTGATGTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CM62JQ 742 0 0
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ATGTCCAAATAATCAAAAGAGTGTTGAAAAATCACTGATTTACTTCAGTGACACTGAATC
TGAAGAAGAAGATGATCTCAAAGACTTGTTGTTAAACTTCGTGGCACTGGTATGATCAGA
AGGAGATGAGATTGATGTCAGGAAAGAGTACCATGAGCTGATAAAGAATACGGCTATGCT
GAGGGCTCAGGTTAATATTCTGACTATTGATTCTAACGATCCCGAATAAAAGGAGAACAT
CATGCTGAAGTCGGAAAATATCGTGAGAAATGTGAAAGACATCGAACGAAAACTAATGGA
TGAAAAACAGAAGAATCAGGTTTTGGAAGACCGTGTAGCCAAGATGTGACAAGCCTTTAC
TGAAGAGCAGGGCAAAGCTCATGGGATGGAGCAGGATTTAACCAAGAATCACAAGAAGAT
TCAAATGCTGAGCCGAGGAACCAAAGATCTCGATCAGCTTTTAACCATTGGACAACCTCC
AAAGCTAATCGGAGCTTAGGATACAATGGGAAAAGGTCTACTTCAATAGTTTTTGTGCAT
GCAACAAAACCATTGGAGGACCAAGTTATCACAACTGAAAAATGCACATGTTTTGGGTTA
GAGAATAAAAAGGAGAAGCAAGTCACAGTAGCAGAGGTGAGAGTCAAATCAACTGACAAC
GGAAAGTCAATGATGTGTGCTG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL5594Contig1 772 2 6 U
GGATAACCGGTTCCAATCAGAGCTTGTAGATCAAACCGGGCATGACGACGAGTCCCGATA
ACCAGAAACCGGTCTAACCTTCCGACATCGAGGCGGCACCGGCGACTGAAACGTCGACGT
TTTCCGCGATCACTCAGAGATGGAAAAGAGAGGACACGATAAAGAAAGCATCCCCGATCA
GTAGAGGGATAGCTCTTATCTTCTCCCTCCTCGCCTTCTTAATCATGGTCTGTAACAAAC
ACGGACCCGGCAGAAACTTCGACGAGTACGAAGAGTACAGATATGTAGTGGCGATCGCGA
TCACCGCAACGTTGTACACTGCGTGGCAAACGTTCGTACATCTCTCCAAAAGAGACTTCT
TTGATCGCCGGACTTCCGTTTTCGTCGATTTCTCCGGCGACCAGATAGTAGCGTATCTTC
TCATATCAGCTGCTTCCTCAGCGATTCCGTTGACCAATAGGTTCAGAGAAGGTCAAGATA
ACATTTTTACTGACTCTGCTGCTTCGGCTATCACAATGGCTGTACTCGCCTTTGTTTCTT
TAGCTCTCTCTGCTCTCTTCTCCGGTTACAAACTCTCTACTTCTCATTCTTTTGTCTGAA
TGAATCTCCTGCTTTAAGCCCCTCCTCTCTGTTTGTATATTTATACGAGTTAATGTCATT
AGTGTGCTACTGATGAAAAACATCATCTTACTTCTGTTAATAGTCTCTGTGTATGTTATT
CTTTGATACATTTGTAAAAGTGAAAACATGATGTGTGGAAGTGATTGCTTTT


BQ
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AF RR4F577TF U 1
AF RR4F577JQ C 214
BS 1 564 RR4F577TF
BS 565 565 RR4F577JQ
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BS 700 716 RR4F577TF
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RD RR4F577TF 721 0 0
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GTAGAGGGATAGCTCTTATCTTCTCCCTCCTCGCCTTCTTAATCATGGTCTGTAACAAAC
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TTGATCGCCGGACTTCCGTTTTCGTCGATTTCTCCGGCGACCAGATAGTAGCGTATCTTC
TCATATCAGCTGCTTCCTCAGCGATTCCGTTGACCAATAGGTTCAGAGAAGGTCAAGATA
ACATTTTTACTGACTCTGCTGCTTCGGCTATCACAATGGCTGTACTCGCCTTTGTTTCTT
TAGCTCTCTCTGCTCTCTTCTCCG*TTACAAACTCTCTACTTCTCATTCTTTTGTCTGAA
TGAATCTCCTGCTTTAAGCCCCTCCTCTCTGTTTGTATATTTATACGAGTTAATGTCATT
AGTGTGCTACTGATGAAAAACATCATCTTACTTCTGT**ATAGTCTCTGTGTATGT
ATCTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4F577JQ 559 0 0
CCTTCTTAATCATGGTCTGTAACAAACACGGACCCGGCAGAAACTTCGACGAGTACGAAG
AGTACAGATATGTAGTGGCGATCGCGATCACCGCAACGTTGTACACTGCGTGGCAAACGT
TCGTACATCTCTCCAAAAGAGACTTCTTTGATCGCCGGACTTCCGTTTTCGTCGATTTCT
CCGGCGACCAGATAGTAGCGTATCTTCTCATATCAGCTGCTTCCTCAGCGATTCCGTTGA
CCAATAGGTTCAGAGAAGGTCAAGATAACATTTTTACTGACTCTGCTGCTTCGGCTATCA
CAATGGCTGTACTCGCCTTTGTTTCTTTAGCTCTCTCTGCTCTCTTCTCCGGTTACAAAC
TCTCTACTTCTCATTCTTTTGTCTGAATGAATCTCCTGCTTTAAGCCCCTCCTCTCTGTT
TGTATATTTATACGAGTTAATGTCATTAGTGTGCTACTGATGAAAAACATCATCTTACTT
CTGTTATTAGTCTCTGTGTATGTTATTCTTTGATACATTTGTAAAAGTGAAAACATGATG
TGTGGAAGTGATTGCTTTT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

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AACTAATAAAGACAACATAACATACTCCAGAAAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGAAAGC
CGTATCAAGAAAAGTTATACCAGAGAAGAACGACGGTGATCAAGGGACTACGTTCGACGT
GGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACG
TCTAGATGTCCTCGAAGACCCAAAAGAACTTTATGCACACTACCTGAAACAGCAAAATGG
AATAAGGTTAATGGAAAATTTCGAGGGTAGGTATACAGTGGAGCCAGTGTATGTTGATGC
AGAACGCTTGTGCAAGCACATGAAGCCAAAGAGTCAAGAACAATACAGAAAATGTAGTGG
TGGAAAAGGATTAATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGTACCAGACATTTAGGCCTGCTTCTCC
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ACAAACCC


BQ
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AF RR4EI17TF U 1
AF RR4EI17JQ C 152
BS 1 625 RR4EI17TF
BS 626 626 RR4EI17JQ
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BS 646 848 RR4EI17JQ

RD RR4EI17TF 645 0 0
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TTCCAATATGGAAATGGAATTTACATTAGGATTGCCACCTCGAGCAGCTTACGACATTTT
AACTAATAAAGACAACATAACATACTCCAGAAAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGAAAGC
CGTATCAAGAAAAGTTATACCAGAGAAGAACGACGGTGATCAAGGGACTACGTTCGACGT
GGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACG
TCTAGATGTCCTCGAAGACCCAAAAGAACTTTATGCACACTACCTGAAACAGCAAAATGG
AATAAGGTTAATGGAAAATTTCGAGGGTAGGTATACAGTGGAGCCAGTGTATGTTGATGC
AGAACGCTTGTGCAAGCACATGAAGCCAAAGAGTCAAGAACAATACAGAAAATGTAGTGG
TGGAAAAGGATTAATTGCGTCCAAG*TTAAAGTGTACCAGACATT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4EI17JQ 697 0 0
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GACGGTGATCAAGGGACTACGTTCGACGTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTC
CTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAGATGTCCTCGAAGACCCAAAAGAACTT
TATGCACACTACCTGAAACAGCAAAATGGAATAAGGTTAATGGAAAATTTCGAGGGTAGG
TATACAGTGGAGCCAGTGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACATGAAGCCAAAG
AGTCAAGAACAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTAATTGCGTCCAAGGTTAAA
GTGTACCAGACATTTAGGCCTGCTTCTCCTTGGGATCTGCCGCTGCTGTCTTCGTACGTT
CGCCGGTTCACTGTCGAGACCACTAAGAAAGTCGCTGAAGATCTTCAAATGCAGGCTGGC
GATCTAGTCTCAGAACTTGTAACAAGACACAAGAAAGAAACTCTTCTTTATTAACCCTCT
TAAGGAAAGATTCAAAACCCTTAAGCTCCACAAACCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL5596Contig1 704 2 1 U
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AACTATCCGGCTTCTATCTCCGCGTCGCACTGTTCCTTGTGTTGACGGCGGCTAATTCCC
GGAGTCACCCGCTTGGTTGGTGGCTCTGTTACTTTGGGGTGTGTTCGGCGTTGGCCGAAT
GAAGGTTGAGTTGGAGAACGGATGAAGATGGAAAGAGAAGATGAATAGTGCTAAGCTTCT
CTTTAGGGATGATCGATGGTGGAGATCTATGATCGGTTTCTGGTTTCCGGCTTTGGTTCT
GGTGAAACGTCGATTAGGTCTCCGGAATGGACCTACGTTTAGGTCAAGATGTGGGGGCCA
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TCGACGCGTGGTTTCGTTGGCGCCTCCTTGTTTTAAGGGTTGCAGTTTCCTGAGTTTATG
GGCCTTGTGGCTTTAGTTTGCCCTCTGTTTGTGGGCTTCTTGTTTATGTGTATATGTTTG
GGTTATGTTCTTTGGGTTTTAGCCTTTAATAAAAATTAGATGAC


BQ
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AF RR4AU59JQ C 1
AF RR4AU59TF U 1
BS 1 704 RR4AU59TF

RD RR4AU59JQ 704 0 0
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CTTTAGGGATGATCGATGGTGGAGATCTATGATCGGTTTCTGGTTTCCGGCTTTGGTTCT
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GGCCTTGTGGCTTTAGTTTGCCCTCTGTTTGTGGGCTTCTTGTTTATGTGTATATGTTTG
GGTTATGTTCTTTGGGTTTTAGCCTTTAATAAAAATTAGATGAC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4AU59TF 704 0 0
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TTGAGTGAAACTTTGATTCCGTCGCTGATTATCGTTCGGTGACTGGACTCCGGTATACTG
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AACTATCCGGCTTCTATCTCCGCGTCGCACTGTTCCTTGTGTTGACGGCGGCTAATTCCC
GGAGTCACCCGCTTGGTTGGTGGCTCTGTTACTTTGGGGTGTGTTCGGCGTTGGCCGAAT
GAAGGTTGAGTTGGAGAACGGATGAAGATGGAAAGAGAAGATGAATAGTGCTAAGCTTCT
CTTTAGGGATGATCGATGGTGGAGATCTATGATCGGTTTCTGGTTTCCGGCTTTGGTTCT
GGTGAAACGTCGATTAGGTCTCCGGAATGGACCTACGTTTAGGTCAAGATGTGGGGGCCA
TGTGACGCGTGTTTCCTCGTAGTTGAGGATTCCAACACGTGTACCGGCCATGTTTACTCC
TCGACGCGTGGTTTCGTTGGCGCCTCCTTGTTTTAAGGGTTGCAGTTTCCTGAGTTTATG
GGCCTTGTGGCTTTAGTTTGCCCTCTGTTTGTGGGCTTCTTGTTTATGTGTATATGTTTG
GGTTATGTTCTTTGGGTTTTAGCCTTTAATAAAAATTAGATGAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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AACTGGGGTGGTTTTTTTGTTTGCTCAAGCTTTGCCATTGGATGCAGCAGCTGGTGGGTT
AAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCATGTTACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGG
GTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTTGACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAAC
AGTTGTTGCTTCTTTAGATAGTTTTACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCCTCCTGCCA
GAAGATTCCCTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH70JQ U 1
AF RR4BR25TF C 10
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AACTGGGGTGGTTTTTTT
TTTGGTTT

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR4BR25TF 425 0 0
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CTTGC

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 2

CO CL5598Contig1 918 2 2 U
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TGAACTTGTTATCACCATTATCAATAATTGCAAGGAGTTGCTACATTTGATTTTGGTCTT
ATTATTCAGACTTTATGTAATATCCGAAGCATCAAACCATTTGATTTGGCATCATTTACG
ACCTACCGTTCATGTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK65TF U 1
AF RR4AK65JQ C 265
BS 1 757 RR4AK65TF
BS 758 918 RR4AK65JQ

RD RR4AK65TF 757 0 0
GGACAAACCCTAGAACGGCGATGTCTTTGTTTTGTCAAGTTTCAGTGGCCACTCTTCCTT
TCCGTGTGGCTAGATCTCCGCCGGCGAGGCTCCATCCTGGTGCCCAGAGAGTGACTTTTG
GTGGTAGCCATCAGTTCAGCAGCCTGATTTCATTCTCGAGCACTTGGGCGCTAAGTGCTA
TCACCCCTTCCTCGAATCTGGTTAGCCTCCTCGAATCTGAGATCCAAAGCTCCATTGTTA
ACGTAGACGCTCCTAACAATGACGAGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATC
TTCCAACTGAACGAGTTGTGCGTCTGACTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCG
TAGTTGACCCTTCTACGCATGAACAACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTAGTAT
TTGGGATCCCCATGGGTGTCAATGTATCCAAAGATGATGACGGTCTCTGTCTAGAGTTTG
GAGTCAACGCTTTCGCTGATGAGATTGTCATTGACAGTGTAGTTGTCAAACAACCCCGAG
AATCTAAGTATGCCTACCAAGGACCTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAAAAAG
CTTTCTACAAGTTTTTGGAGATCAGAGGGATCAATCCCACCATCACTGACTTTTTGGCAG
ATTATTTGGCCAACAAAGACAAGAGAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTT
TTGTTGACATCTGAAAACTCTCAAATAAGAGTGAAAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4AK65JQ 654 0 0
AGTTGCCCGAATGGTTTCCTTTCCAAATGATTGATCTTCCAACTGAACGAGTTGTGCGTC
TGACTAGGAAGTTTGGTGATGAAACCATTCTTGTCGTAGTTGACCCTTCTACGCATGAAC
AACCAAAAGTTCTTCAAGATGATGAAGAACTAGTATTTGGGATCCCCATGGGTGTCAATG
TATCCAAAGATGATGACGGTCTCTGTCTAGAGTTTGGAGTCAACGCTTTCGCTGATGAGA
TTGTCATTGACAGTGTAGTTGTCAAACAACCCCGAGAATTTAAGTATGCCTACCAAGGAC
CTGACTTTGATGACTTGGATGAGAATTTGCAAAAAGCTTTCTACAAGTTTTTGGAGATCA
GAGGGATCAATCCCACCATCACTGACTTTTTGGCAGATTATTTGGCCAACAAAGACAAGA
GAGAGCATCTTCGATGGCTCAAGGATGTCAAGTCTTTTGTTGACATCTGAAAACTCTCAA
ATAAGAGTGAAACTTTTAGGTGAGTTTTATGTTTAATGAACTTGTTATCACCATTATCAA
TAATTGCAAGGAGTTGCTACATTTGATTTTGGTCTTATTATTCAGACTTTATGTAATATC
CGAAGCATCAAACCATTTGATTTGGCATCATTTACGACCTACCGTTCATGTACC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL5599Contig1 218 2 4 U
CCCTTCATGGACAGGTAAATCATGCGGGTAGAAAAGTCAACCTCTTCCACTCTGGCTTCA
ACCACCCTCTCAGGCATGAAATACTTCTTTTTCATGTAGGGGAAACTGGCGTCTCTGATT
AGGGCAAAAACTCCCCCTGGTAACTGGCAAAAAATGCCAAATCCAGGTTCTATGCTCTTG
ATGAGGCACTCCCCCAAGTCCCCTACATGGAGTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV56JQ U 1
AF RR4AT63JQ U 93
BS 1 103 RR4AV56JQ
BS 104 104 RR4AT63JQ
BS 105 203 RR4AV56JQ
BS 204 218 RR4AT63JQ

RD RR4AV56JQ 203 0 0
CCCTTCATGGACAGGTAAATCATGCGGGTAGAAAAGTCAACCTCTTCCACTCTGGCTTCA
ACCACCCTCTCAGGCATGAAATACTTCTTTTTCATGTAGGGGATACTGGCGTCTCTGATT
AGGGCAAAAACTCCCCCTGGTAACTGGCAAAAAATGCCAAATCCAGGTTCTATGCTCTTG
ATGAGGCACTCCCCCAAGTCCCC

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR4AT63JQ 126 0 0
CATGTAGGGGAAACTGGCGTCTCTGATTAGGGCAAAAACTCCCCCTGGTAACTGGCAAAA
AATGCCAAATCCAGGTTCTATGCTCTTGATGAGGCACTCCCCCAAGTCCCCTACATGGAG
TGTTTC

QA 1 126 1 126
DS 



AS 1 2

CO CL5600Contig1 791 2 8 U
GATTCTTTTGATTACTTTTAAGAAAGAGAGCAAGAATATGGGAAGTGTACAGTTGAATGG
TTCAGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTCAAAATCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAG
TAACCCCAAGTCGTCCTTCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCG
AGCCATAAGCACCGCACCAGCAAGCCAGCCTCCAGTCGTAGATGAGCCGAGTGATGAACC
TCCTGCTGTCGATTTTGCATTCGTCCATTCGGTGTTGCTACCGGACGGAACACCGGACGT
GCATTGGAGAAGAGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACAT
CGAACTCTATGGTCCTTATAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGC
TACTTGCATGGTCGAGATTGTAAATGGAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGA
AAAGGAGAAACTCAAAAGGAAACCAAAAAACTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGG
AAATCCAGATTCAACCGGATTGGTCGTCATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGA
ATGGAACATCCCTAAGAATTTACCTATTGATGATCCCGAAAGTTCTACGTGAAAGTACGA
CCCAGTTGTTATTGTCTACATCATGAAACAATAACGATCGAGTTCATTTTAATCGTTGTC
GATATTAACCATATATACAACTGGCTATTTAGATAAACCTAAATGATTATATATGAAGGT
TATTAATAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU26TF U 1
AF RR4FU26JQ C 4
BS 1 687 RR4FU26TF
BS 688 688 RR4FU26JQ
BS 689 703 RR4FU26TF
BS 704 704 RR4FU26JQ
BS 705 739 RR4FU26TF
BS 740 740 RR4FU26JQ
BS 741 750 RR4FU26TF
BS 751 791 RR4FU26JQ

RD RR4FU26TF 750 0 0
GATTCTTTTGATTACTTTTAAGAAAGAGAGCAAGAATATGGGAAGTGTACAGTTGAATGG
TTCAGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTCAAAATCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAG
TAACCCCAAGTCGTCCTTCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCG
AGCCATAAGCACCGCACCAGCAAGCCAGCCTCCAGTCGTAGATGAGCCGAGTGATGAACC
TCCTGCTGTCGATTTTGCATTCGTCCATTCGGTGTTGCTACCGGACGGAACACCGGACGT
GCATTGGAGAAGAGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACAT
CGAACTCTATGGTCCTTATAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGC
TACTTGCATGGTCGAGATTGTAAATGGAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGA
AAAGGAGAAACTCAAAAGGAAACCAAAAAACTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGG
AAATCCAGATTCAACCGGATTGGTCGTCATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGA
ATGGAACATCCCTAAGAATTTACCTATTGATGATCCCGAAAGTTCTACGTGAAAGTACGA
CCCAGTTGTTATTGTCTACATCATGAA*CAATAACGATCGAGT*CATTTTAATCGTTGTC
GATATTAACCATATATACA*CTGGCTATTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4FU26JQ 788 0 0
GATCTTTTGATAC
TTTAAGAAAGAGAGCAAGAATATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCT
TCTCTATCTCAAAATCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCCAAGTCGTCC
TTCTTACGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCGAGCCATAAGCACCGCA
CCAGCAAGCCAGCCTCCAGTCGTAGATGAGCCGAGTGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTT
GCATTCGTCCATTCGGTGTTGCTACCGGACGGAACACCGGACGTGCATTGGAGAAGAGCG
TGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCT
TATAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGCTACTTGCATGGTCGAG
ATTGTAAATGGAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGAAACTCAAA
AGGAAACCAAAAAACTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAGATTCAACC
GGATTGGTCGTCATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAAG
AATTTACCTATTGATGATCCCGAAAGTTTTACGTGAAAGTACGACCCAGTTGTTATTGTC
TACATCATGAAACAATAACGATCGAGTTCATTTTAATCGTTGTCGATATTAACCATATAT
ACAACTGGCTATTTAGATAAACCTAAATGATTATATATGAAGGTTATTAATAATG

QA 14 788 14 788
DS 



AS 1 2

CO CL5601Contig1 652 2 1 U
GAGGACCAACCGCTTTGGATCATATTTAGCCGTGACATGACGATCCAACTAAAAGAAGAA
CTCATAATGAACTCTTTCAAAACCCTAGACGGACGAGGTGCTTCCGTACACATCTCTGGT
GGACCGTGCATAACCATACAATATGTGACCAATTATAATCCATGGTTTAAACATACATGA
CTGTAAGCGAGGTGGGAACACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGGAGGAC
TATATCGGATGGTGATGGTGTGTCCATCTTCGGCGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTG
CTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCTATAAC
TATCTCTAATAATTACTTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACAC
GTATGTGCAAGACAAGAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCT
CGTCCAAAGAATGCCAAGGTAAACAATTTGTTAGTTTATTACTTATCAAAACAACCTATG
TGTGGCTATATGTAGGTATTTAGCACAAATTATAAAGGTCAAGCATATCACTATACTATA
TTGTCGGTGGACATTCTTTTATATGAAAATAGCAAAGCCAACACAACTACTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GM93JQ C 1
AF RR4GM93TF U 1
BS 1 652 RR4GM93TF

RD RR4GM93JQ 652 0 0
GAGGACCAACCGCTTTGGATCATATTTAGCCGTGACATGACGATCCAACTAAAAGAAGAA
CTCATAATGAACTCTTTCAAAACCCTAGACGGACGAGGTGCTTCCGTACACATCTCTGGT
GGACCGTGCATAACCATACAATATGTGACCAATTATAATCCATGGTTTAAACATACATGA
CTGTAAGCGAGGTGGGAACACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGGAGGAC
TATATCGGATGGTGATGGTGTGTCCATCTTCGGCGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTG
CTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCTATAAC
TATCTCTAATAATTACTTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACAC
GTATGTGCAAGACAAGAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCT
CGTCCAAAGAATGCCAAGGTAAACAATTTGTTAGTTTATTACTTATCAAAACAACCTATG
TGTGGCTATATGTAGGTATTTAGCACAAATTATAAAGGTCAAGCATATCACTATACTATA
TTGTCGGTGGACATTCTTTTATATGAAAATAGCAAAGCCAACACAACTACTG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4GM93TF 652 0 0
GAGGACCAACCGCTTTGGATCATATTTAGCCGTGACATGACGATCCAACTAAAAGAAGAA
CTCATAATGAACTCTTTCAAAACCCTAGACGGACGAGGTGCTTCCGTACACATCTCTGGT
GGACCGTGCATAACCATACAATATGTGACCAATTATAATCCATGGTTTAAACATACATGA
CTGTAAGCGAGGTGGGAACACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGGAGGAC
TATATCGGATGGTGATGGTGTGTCCATCTTCGGCGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTG
CTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCTATAAC
TATCTCTAATAATTACTTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACAC
GTATGTGCAAGACAAGAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCT
CGTCCAAAGAATGCCAAGGTAAACAATTTGTTAGTTTATTACTTATCAAAACAACCTATG
TGTGGCTATATGTAGGTATTTAGCACAAATTATAAAGGTCAAGCATATCACTATACTATA
TTGTCGGTGGACATTCTTTTATATGAAAATAGCAAAGCCAACACAACTACTG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5602Contig1 1109 2 2 U
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CGCCGGGAAAAAGCACAGACTTTAACTCCGACCCACTTCCCTAATCCAAATGGGTTTCCA
TCTCCGTGGAGAAAGTCTCGACCTTCCGCTCCCAAACTCTCCCAATCCCTCAATTTCGCT
TCTCCCTCTTCACACCTCCCTCTCGTACGCTCCTCGCCGTCTCCTCCTTCTTCCAAGGGT
TTCCTCCAGACCCTAGCGAGAAAAGCCGCGGTTTTGCTCGTCGGGTCGTTTGTCCTCCTG
CTAGGGTTCTCTTCTTCGAGACCTGCTTTAGCGCTGCCCACTGCGAGTACCGCGAGCTCT
CAATCGGAGGAAGAAGAAATGTTGGAGAAGGTTCTGGAAAGCGAGCCGGAGAACATGGAG
GCGATGAAGGCTGTTTTATATAAGAAGATGAGGAGAGGGAAGACGGAAGACGCTGTCAAG
TACGTCGAGAAGCTGATTAAGTTAGAGCCTCGTGAAGTTGAGTGGAAGCTTCTCGAAGCG
CTTTGCTACGAGACGATGGGACAGTTGAGCAAAGCCAAGAGATTCAAGTCTTGATCGGCC
AAATGCATATTGTCAAGGGTCAATTTGAAGAAGGTTTAAAGATATTTCAAGAGATGGTGA
ATGATAACCCTCGAGATTTTAGACCCTATCTTTGCCAGGGAATAGTGTATAGCTTGATGG
ATAAGAAGGAGGAAGCAGATCAGCAGTTTGAGATATATTGGAGTCTTGTACCTGAAGAAT
TCCCACAAAAGGGGTTTCTTGATGATGTTGCGTTGGCTGCTCAAGCCAAATCCCGGGAAC
GACTCCAAAACACTTTCAAAGCTAAATTTACTCAAGGGAAGTAGTGAATCAACCGCTGGT
TTATCTTTCTTAAAAGCTTCATCAGTTAAAATTTTGTTCCTGGAGTAACATGTGTCGTTT
TAAAGACAAAACCGCTCTCAGAGCAGACAGCGTATGGAACCGTGGAGAAGGCAGTTTTTG
GTTTTTTGTGTGCGATTGTTGTTGATTCATCTCTTGGACTCTTCCACCATTATCAGCTTT
TTGGTACTAATTTAAAGCAATCTTCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DE01TF U 1
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BS 635 1109 RR4DE01JQ

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CGCCGGGAAAAAGCACAGACTTTAACTCCGACCCACTTCCCTAATCCAAATGGGTTTCCA
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TCTCCCTCTTCACACCTCCCTCTCGTACGCTCCTCGCCGTCTCCTCCTTCTTCCAAGGGT
TTCCTCCAGACCCTAGCGAGAAAAGCCGCGGTTTTGCTCGTCGGGTCGTTTGTCCTCCTG
CTAGGGTTCTCTTCTTCGAGACCTGCTTTAGCGCTGCCCACTGCGAGTACCGCGAGCTCT
CAATCGGAGGAAGAAGAAATGTTGGAGAAGGTTCTGGAAAGCGAGCCGGAGAACATGGAG
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CTTTGCTACGAGACGATGGGACAGTTGAGCAAAGCCAAGAGATTCAAGTCTTGATCGGCC
AAATGCATATTGTCAAGGGTCAATTTGAAGAAGG

QA 1 634 1 634
DS 

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AAAGGGGTTTCTTGATGATGTTGCGTTGGCTGCTCAAGCCAAATCCCGGGAACGACTCCA
AAACACTTTCAAAGCTAAATTTACTCAAGGGAAGTAGTGAATCAACCGCTGGTTTATCTT
TCTTAAAAGCTTCATCAGTTAAAATTTTGTTCCTGGAGTAACATGTGTCGTTTTAAAGAC
AAAACCGCTCTCAGAGCAGACAGCGTATGGAACCGTGGAGAAGGCAGTTTTTGGTTTTTT
GTGTGCGATTGTTGTTGATTCATCTCTTGGACTCTTCCACCATTATCAGCTTTTTGGTAC
TAATTTAAAGCAATCTTCCACC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

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GGGAGGCGGCGGAAGCGGCGGTGCTGTGTTGCGCCGATGAAGCCGCGTTGTGTTTGGCTT
GCGATGAGAAAGTTCACGCCGCTAATAAACTCGCAGGTAAACACCAGAGAGTCCCTCTCT
CTGTCTCTTCCCCTTCCATCCCCAAATGCGACATTTGTCAGGTCTGATTCTTCTCTCTTT
GATCTCAAAGTTTCAATCTTTTTATTTTTAGGTATGAGAAAAGCCTTGTAATGATTCAAT
GATTGTATTCTCTTTGAAAAGTCTGAACCTTTTTAGAGAGGCCATGGACCAGTTTCTTAG
TTTATTTGTATTTGACAGGAAGCTACTGGATTCTTCTTCTGTCTGCAAGATAGAGCTTTG
CTGTGTAGGAAATGTGATGTTTCAATCCACACTGTGAATCCTTATGTTTCAGCTCACCAG
CGGTTTCTTCTGACTGGAATCAGAGTTGGTCTTGAATCTGCTACGGACACAGGTCCTTCA
ACACCATCCAATGATGATAAAACAAACGAGATGAAACCATGTATCCTGCCTACATCTGAG
CCTCAGAAGATGGACGTTGATCATCATAATCATCAGGTGGGTTTACCGGAAACTAAAGTG
AGTGATCACATTTCGACAAAGCTTCCTATTGCAAGCAGTGGATCAGCTACTGGAAGCATT
CCTCAGTGGCAAATAGATGAGATTTTCGGATTAACCGACTTTGATCAGAGCTATGAATAC
ATGGAGAATCACGGATCATCTAAAGGGGGATACTAGTAGACGAGGAGACTCAGACAGTTC
TTCCATGATGCGGTCTGGAGACGAAGATGGAGAAGATAACAACAACAACAACTGCTTGGG
AGGAGGAGGTGAGACATCATGGGCGGTTCCACAGATTCATTCTCCACCAACAGCTTCTGG
TCTAAACTGGCCTAGACAGTTTAACCGCCACTCAGTGTTTGTTCCGGACATATCTTCTTC
AACTCCTTATACCGGTTCATCTCCTAACCAGAGGGTTGGGAAAAGGCAGCGGAGACGGTT
CTAACAACTGCAACTTACATCACAGTCGATACTTATGATTTATTTCTCTCTAGACTCCTA
CATTAAAACTAGTCACCAAAAACATTTATGTAATGCAAAAACATTACAGAAAAAAACAGA
GACAAGAAGGAATGTTTTTGAGAGAATCACTGTCAACAAACTCTTGTTATTTTGTTGTTT
GTCTTTTGTCACAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A906TF U 1
AF RR4A906JQ C 344
BS 1 830 RR4A906TF
BS 831 831 RR4A906JQ
BS 832 846 RR4A906TF
BS 847 1214 RR4A906JQ

RD RR4A906TF 846 0 0
GGGAGGCGGCGGAAGCGGCGGTGCTGTGTTGCGCCGATGAAGCCGCGTTGTGTTTGGCTT
GCGATGAGAAAGTTCACGCCGCTAATAAACTCGCAGGTAAACACCAGAGAGTCCCTCTCT
CTGTCTCTTCCCCTTCCATCCCCAAATGCGACATTTGTCAGGTCTGATTCTTCTCTCTTT
GATCTCAAAGTTTCAATCTTTTTATTTTTAGGTATGAGAAAAGCCTTGTAATGATTCAAT
GATTGTATTCTCTTTGAAAAGTCTGAACCTTTTTAGAGAGGCCATGGACCAGTTTCTTAG
TTTATTTGTATTTGACAGGAAGCTACTGGATTCTTCTTCTGTCTGCAAGATAGAGCTTTG
CTGTGTAGGAAATGTGATGTTTCAATCCACACTGTGAATCCTTATGTTTCAGCTCACCAG
CGGTTTCTTCTGACTGGAATCAGAGTTGGTCTTGAATCTGCTACGGACACAGGTCCTTCA
ACACCATCCAATGATGATAAAACAAACGAGATGAAACCATGTATCCTGCCTACATCTGAG
CCTCAGAAGATGGACGTTGATCATCATAATCATCAGGTGGGTTTACCGGAAACTAAAGTG
AGTGATCACATTTCGACAAAGCTTCCTATTGCAAGCAGTGGATCAGCTACTGGAAGCATT
CCTCAGTGGCAAATAGATGAGATTTTCGGATTAACCGACTTTGATCAGAGCTATGAATAC
ATGGAGAATCACGGATCATCTAAAGGGGGATACTAGTAGACGAGGAGACTCAGACAGTTC
TTCCATGATGCGGTCTGGAGACGAAGATGGAGAAGATAACAACAACAACA*CTGCTTGGG
AGGAGG

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR4A906JQ 871 0 0
TGCAAGATAGAGCTTTGCTGTGTAGGAAATGTGATGTTTCAATCCACACTGTGAATCTTT
ATGTTTCAGCTCACCAGCGGTTTCTTCTGACTGGAATCAGAGTTGGTCTTGAATCTGCTA
CGGACACAGGTCCTTCAACACCATCCAATGATGATAAAACAAACGAGATGAAACCATGTA
TCCTGCCTACATCTGAGCCTCAGAAGATGGACGTTGATCATCATAATCATCAGGTGGGTT
TACCGGAAACTAAAGTGAGTGATCACATTTCGACAAAGCTTCCTATTGCAAGCAGTGGAT
CAGCTACTGGAAGCATTCCTCAGTGGCAAATAGATGAGATTTTCGGATTAACCGACTTTG
ATCAGAGCTATGAATACATGGAGAATCACGGATCATCTAA*GGGGGATACTAGTAGACGA
GGAGACTCAGACAGTTCTTCCATGATGCGGTCTGGAGACGAAGATGGAGAAGATAACAAC
AACAACAACTGCTTGGGAGGAGGAGGTGAGACATCATGGGCGGTTCCACAGATTCATTCT
CCACCAACAGCTTCTGGTCTAAACTGGCCTAGACAGTTTAACCGCCACTCAGTGTTTGTT
CCGGACATATCTTCTTCAACTCCTTATACCGGTTCATCTCCTAACCAGAGGGTTGGGAAA
AGGCAGCGGAGACGGTTCTAACAACTGCAACTTACATCACAGTCGATACTTATGATTTAT
TTCTCTCTAGACTCCTACATTAAAACTAGTCACCAAAAACATTTATGTAATGCAAAAACA
TTACAGAAAAAAACAGAGACAAGAAGGAATGTTTTTGAGAGAATCACTGTCAACAAACTC
TTGTTATTTTGTTGTTTGTCTTTTGTCACAG

QA 1 871 1 871
DS 



AS 1 2

CO CL5604Contig1 1044 2 2 U
GGATTGAGGGAGCAGTGTAAGGAGGGGGAAGAAAAACAATCTGACTGTCTTTTCTCTCTC
TCTCATAGAAAGTGGTGGAAGAGAAGATGCCGAGGCCAGGGCCAAGACCGTACGACTGTA
TCAGAAGAGCTTGGCATAGTGACACACACCAACCCATGAGGGGTTTGCTCATCCAAGAGA
TTTTCAGGATTGTTTGTGAGATTCACAGCCAATCCACCAAGAAGAACAATGAATGGCAAG
AGAAACTCCCTGTGGTTGTCTTGAGAGCTGAAGAAATCATGTATTCCAAAGCCAATTCTG
AGGCTGAGTATATGGACATGAATACACTTTTGGACCGTGCGAACGACGCCATTAACACCA
TAATCCGACTCGATGAAACCACTGAAACTGGGGAGTTTCTTCAGCCTTGTATTGAAGCTG
CATTGCATTTGGGTTGCACGCCAAGAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGGAACATAAACCCGA
GATGTTATCTTAGCCAAGACTCAACTAAGTTGAACAGCATTATGTCGCCGCAATACCAAG
TCCTCCTGAAACAGAACAACTTTGCTTCAAAGACTCTTCCAGTTAAGAACTTTCACAACG
ATGTTCAGATCAAGAAATACCCTGTCTCCAAACACTCAAGCTACCCTTTGTGCTATTCAC
TCAGAGTTCCTTCTTTGCCAGTCTATAACAATGTCACTGACTCGTGCAAGTCCGACAAGA
ACAGGAGAGAGGTGAGTGTGAAAGATGCAAGTAATGGCATTACCTTTGGTGGTTGTGATC
TATCTCTGCGCTTAGGCCCTCTTGGAGATGATATCAGTTCTCCTACTCAAAAACGGAGTA
AGATAAGCAGCAACAACAACAAAGGCTAAAAATCAGAACAGAACTGTGTGTTTGATTAGC
TAGTCTTGTGTTATAGAATGCGTTTTAGTTAGCTCTTTTTAGTTCCTCTGTACTTTTTAG
AGTTCTTTACATGTAAATAGAGAGAGAGGGCATGATGAACTGTCTTGCATTAATCTCGAA
TCTTCAAAATTCATGTATTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AD11TF U 1
AF RR4AD11JQ C 259
BS 1 748 RR4AD11TF
BS 749 1044 RR4AD11JQ

RD RR4AD11TF 748 0 0
GGATTGAGGGAGCAGTGTAAGGAGGGGGAAGAAAAACAATCTGACTGTCTTTTCTCTCTC
TCTCATAGAAAGTGGTGGAAGAGAAGATGCCGAGGCCAGGGCCAAGACCGTACGACTGTA
TCAGAAGAGCTTGGCATAGTGACACACACCAACCCATGAGGGGTTTGCTCATCCAAGAGA
TTTTCAGGATTGTTTGTGAGATTCACAGCCAATCCACCAAGAAGAACAATGAATGGCAAG
AGAAACTCCCTGTGGTTGTCTTGAGAGCTGAAGAAATCATGTATTCCAAAGCCAATTCTG
AGGCTGAGTATATGGACATGAATACACTTTTGGACCGTGCGAACGACGCCATTAACACCA
TAATCCGACTCGATGAAACCACTGAAACTGGGGAGTTTCTTCAGCCTTGTATTGAAGCTG
CATTGCATTTGGGTTGCACGCCAAGAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGGAACATAAACCCGA
GATGTTATCTTAGCCAAGACTCAACTAAGTTGAACAGCATTATGTCGCCGCAATACCAAG
TCCTCCTGAAACAGAACAACTTTGCTTCAAAGACTCTTCCAGTTAAGAACTTTCACAACG
ATGTTCAGATCAAGAAATACCCTGTCTCCAAACACTCAAGCTACCCTTTGTGCTATTCAC
TCAGAGTTCCTTCTTTGCCAGTCTATAACAATGTCACTGACTCGTGCAAGTCCGACAAGA
ACAGGAGAGAGGTGAGTGTGAAAGATGC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4AD11JQ 786 0 0
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TGAATACACTTTTGGACCGTGCGAACGACGCCATTAACACCATAATCCGACTCGATGAAA
CCACTGAAACTGGGGAGTTTCTTCAGCCTTGTATTGAAGCTGCATTGCATTTGGGTTGCA
CGCCAAGAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGGAACATAAACCCGAGATGTTATCTTAGCCAAG
ACTCAACTAAGTTGAACAGCATTATGTCGCCGCAATACCAAGTCCTCCTGAAACAGAACA
ACTTTGCTTCAAAGACTCTTCCAGTTAAGAACTTTCACAACGATGTTCAGATCAAGAAAT
ACCCTGTCTCCAAACACTCAAGCTACCCTTTGTGCTATTCACTCAGAGTTCCTTCTTTGC
CAGTCTATAACAATGTCACTGACTCGTGCAAGTCCGACAAGAACAGGAGAGAGGTGAGTG
TGAAAGATGCAAGTAATGGCATTACCTTTGGTGGTTGTGATCTATCTCTGCGCTTAGGCC
CTCTTGGAGATGATATCAGTTCTCCTACTCAAAAACGGAGTAAGATAAGCAGCAACAACA
ACAAAGGCTAAAAATCAGAACAGAACTGTGTGTTTGATTAGCTAGTCTTGTGTTATAGAA
TGCGTTTTAGTTAGCTCTTTTTAGTTCCTCTGTACTTTTTAGAGTTCTTTACATGTAAAT
AGAGAGAGAGGGCATGATGAACTGTCTTGCATTAATCTCGAATCTTCAAAATTCATGTAT
TTTTAC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5605Contig1 950 2 2 U
GGGGCTCCGGTCGACACCTTCAACGGCGGCAATGCGGGGGAGCAGATTGCTCCTCCACTT
CAGCCTCCAGGCACGGATATGACTGGTATATGCTTCAGGGATCAGCTATGGATCAACTCG
TACCCCTAGACCGTAACTACGTCTTCGACTACTTCGCTTTGTCTCCTTTCTACGACATCA
CCTGCAACAACGAGGTTCTTCGCCGGAGATCCGTTCATCCTCTCGATCACTCTCAACTCT
CGAAGATGACAGGGTTAGGGTATGTGATCAGTGATGCTACGGAGCCGAACCTGTTCGTGT
TTCGTAAGCAGAAGAGAGATGGTCCCGAGAAAGTCACACCTATGCTAACGTATTATATCT
TGGACGGTACTATCTACCAAGCTCCTCAGCTTTGTAGTGTCTTTGCAGCCCGAGTTGGTC
GGGCTGTTTATCACATTTCCAACGCTTTCTCTGTTGCTGCATCCAAGTTGGAGACCATTA
AGCAGGTTGATGCTAAAAGCCAGAATGAGGCTTCTGAGACAAAGCCTGCTAGTGAGACTG
TTGATCTCAAGGAAGTGAAGCGAGTCGATTTGATTCTTAAGTCGTTATATAGCAAGTTAC
CCCCAGCACCTCCACCACCACCCTTCCCTGAAGGCTATGTTAGCCAGGAAGCACTAGGAG
AAAATGAAGAAGAGCTTGGAACACAGGGAGGAGAGTCGCAGCAGCCTCAAATTGATCCTA
TTATCGATCAAGGTCCTGCTAAGAGAATGAAGTTTTAATGCTCAATCAAGATTTCCTTCT
TCAACTTTACATGTCAGATAAATAGAATCTTAGGTACTAGCAAACACTCTTCTACTTCTT
TTAATTTGAACTCGCCATAGGCTATTGTTTACCTCATCACTTCTCAAATTTTATCAGAAA
TTAAGTCATCTCACGGCAACCACTTCAAGGTCAACTAATGTGTATTTGGC


BQ
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AF RR4H648TF U 1
AF RR4H648JQB C 361
BS 1 602 RR4H648TF
BS 603 950 RR4H648JQB

RD RR4H648TF 602 0 0
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CCTGCAACAACGAGGTTCTTCGCCGGAGATCCGTTCATCCTCTCGATCACTCTCAACTCT
CGAAGATGACAGGGTTAGGGTATGTGATCAGTGATGCTACGGAGCCGAACCTGTTCGTGT
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CC

QA 1 602 1 602
DS 

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GGGCTGTTTATCACATTTCCAACGCTTTCTCTGTTGCTGCATCCAAGTTGGAGACCATTA
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CCCCAGCACCTCCACCACCACCCTTCCCTGAAGGCTATGTTAGCCAGGAAGCACTAGGAG
AAAATGAAGAAGAGCTTGGAACACAGGGAGGAGAGTCGCAGCAGCCTCAAATTGATCCTA
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TCAACTTTACATGTCAGATAAATAGAATCTTAGGTACTAGCAAACACTCTTCTACTTCTT
TTAATTTGAACTCGCCATAGGCTATTGTTTACCTCATCACTTCTCAAATTTTATCAGAAA
TTAAGTCATCTCACGGCAACCACTTCAAGGTCAACTAATGTGTATTTGGC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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CTAGTTTTATGAGATATGGTATTACTGTGTTTGCTCC


BQ
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AF RR4F042TF U 1
AF RR4F042JQ C 227
BS 1 716 RR4F042TF
BS 717 757 RR4F042JQ

RD RR4F042TF 716 0 0
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AGAAAACCCTAACGTTCGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAGATGAAAGGTGGTGAAAC
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GAAAGTGAAGGATCCAAACAAGCCAAAGAGGCCGCCAAGTGCTTTCTTCGTCTTCCTGGA
GGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTAGCTAACCCTAACAACAAATCCGTCGGAGCTGTTGG
TAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAATCCATGACTGCTGATGATAAAGCGCCTTATGTAGA
AAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAAAAATACAACATGAAATT
GGCTAATGGAACGAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGAAGTCAA
CGATGAGAATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGATTAAGAGATGGATCAGCA
GCTGTTTGTTTAATGGAGTATCTTCTCTTCTTATGTGTTAGCTCTACTAGTTTTAGGGAG
AAGAATAGTTTTACTCTATTGCTATGTTTTCCCTTGTTTTATGTTGTTAACTGGGATTTA
ATTCACATCTCTTACTTCAACTCCTCATCATAACTTTGGATTTAGCTTTGAACTTT

QA 1 716 1 716
DS 

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TACAACATGAAATTGGCTAATGGAACGAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCC
AAGTCTGAAGTCAACGATGAGAATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGATTAA
GAGATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTATCTTCTCTTCTTATGTGTTAGCTCTA
CTAGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTTTACTCTATTGCTATGTTTTCCCTTGTTTTATGTTG
TTAACTGGGATTTAATTCACATCTCTTACTTCAACTCCTCATCATAACTTTGGATTTAGC
TTTGAACTTTGTTTCTAGTTTTATGAGATATGGTATTACTGTGTTTGCTCC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL5607Contig1 1044 2 6 U
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TTTCTCTACGTGAATAAGAATCTGAAGAGCCATTTCTCTAGGATGGTGAGGCTGAAGCAA
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ACATATCTTGAATCTGCTGTGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCG
TACCATTTCGATAAAGGATCTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATACGAGGGAG
GAGGATGGTGCACGGATATAGCTACATGCGTAAAACGTAAAACTACGATGAAGGGTTCGT
CTAAGTTTATGAACAAAGACTTTGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCA
ATCCAGACTTCTATAACTGGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCA
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CAAGGCCCACAAGTCGGCAATACGAAAATGGCAAAAGCAGTTGGAGACTGGTTTTATGAG
CGGAGTACATTTCAGAACATAGATTGCCCATCCTTGAATTGCAACCCTACTTGTCCTGCA
GTATCTACTGAAGAATAAAATGTATTGATGTTTTAAAATTCCAAAAAAAAAAAATTCTTT
GAATATGTTGTTTAAATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAAAACATG
AATAATAATAATCATTTCCACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F168TF U 1
AF RR4F168JQ C 402
BS 1 718 RR4F168TF
BS 719 719 RR4F168JQ
BS 720 751 RR4F168TF
BS 752 752 RR4F168JQ
BS 753 772 RR4F168TF
BS 773 1044 RR4F168JQ

RD RR4F168TF 772 0 0
GGGGGCAATGGCTTTCTATGAACTTGTAAACCTTACTCTTGAAGACTCCTCTTTTACACA
TTTCTCTACGTGAATAAGAATCTGAAGAGCCATTTCTCTAGGATGGTGAGGCTGAAGCAA
GTATGGTCAAGTCTCCTGGTCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATC
ACATATCTTGAATCTGCTGTGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCG
TACCATTTCGATAAAGGATCTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATACGAGGGAG
GAGGATGGTGCACGGATATAGCTACATGCGTAAAACGTAAAACTACGATGAAGGGTTCGT
CTAAGTTTATGAACAAAGACTTTGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCA
ATCCAGACTTCTATAACTGGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCA
CCGGTGATATAGAAGCCGTTGATCCGACAAACACCACTTTTCGTAATCAATGCCGCCTTC
GATTCTTGGCAGATCAAGAATGTTTTGGCTCCAACCTCTGTTGATAAACGCAAAGAGTGG
AAGGATTGTAAGCTTGATCTTAAGAAGTGTACAGCCGCTCAGCTTCAAACCGTTCAAGGG
TATAGAGACCAAATGTTGGCTGCGTTGGCACCTGTTCTAGCAACGACGACTAGCGGAT*A
TTCCTAGATTCATGCCACGCTCATTGCCAAG*TGGAAGTGCAGCCACTTGGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4F168JQ 643 0 0
GGGGGCAAGCAAAGCACCAATCCAGACTTCTATAACTGGAATAGAATCAAAGTTCGATAT
TGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAAGCCGTTGATCCGACAAACACCACTTTT
CGTAATCAATGCCGCCTTCGATTCTTGGCAGATCAAGAATGTTTTGGCTCCAACCTCTGT
TGATAAACGCAAAGAGTGGAAGGATTGTAAGCTTGATCTTAAGAAGTGTACAGCCGCTCA
GCTTCAAACCGTTCAAGGGTATAGAGACCAAATGTTGGCTGCGTTGGCACCTGTTCTAGC
AACGACGACTAGCGGATTATTCCTAGATTCATGCCACGCTCATTGCCAAGGTGGAAGTGC
AGCCACTTGGTCCGGTGCTCAAGGCCCACAAGTCGGCAATACGAAAATGGCAAAAGCAGT
TGGAGACTGGTTTTATGAGCGGAGTACATTTCAGAACATAGATTGCCCATCCTTGAATTG
CAACCCTACTTGTCCTGCAGTATCTACTGAAGAATAAAATGTATTGATGTTTTAAAATTC
CAAAAAAAAAAAATTCTTTGAATATGTTGTTTAAATTTTTAATATGATGCATAACTGATG
CAATTATTTTAAAAACATGAATAATAATAATCATTTCCACTTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5608Contig1 729 2 2 U
GGAATCTTCCCGCGTCTTTCACACACTTCAGTCTCGCCGCCGGCGGAAACTTTCGCTTCC
TCCCTTCCCTCCGTCAATCTAGATCTCATATCCGTAGTATCGAAACTTTTCAAATTCGTC
CTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTAAGACATTGAAGTCGGAAGAAG
CTCGAATTGGTGAACTTTTGAGCTCTGAAGGAAGTGAATTATGAGCAGCAGCTCCAGAGA
GGGATCTCCCGATTGGCTTCGATCTTTCCAGGCACCCACCACCACTTCATTGTTATCGCT
ATCATCTTCAGATGATAGTCCTTGCAGGGAATCTGAAACCATTTCGTCTCTTCCTGTGAC
TGGTGACGGTGATGCCGTCGTTACTATTGTGGACAAAGAGTCCTCGGAGTCTCTGTCTAA
GAAGGATTCGAAAACGAAGTTGGTGACGAAGCAAGTGAGTATCGAGCAGGTGTTCTCTAG
GAGGAAGAAGAAAGTAGATGCTAGTCTTGACCTTGAAGAGAAAGAGAATGGAAATAAAGT
TGATGGTGAAGAGAACTCTAGCAAGCAGAAGGACGCTAAAGAAGGAGATGATTATGTATG
GTTTGTCTCATCTGATTCTGAACCACCCTCTACTGAACCAATGAGTCAGCAAGTGACTAT
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GAAGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H639TF U 1
AF RR4H639JQB C 74
BS 1 566 RR4H639TF
BS 567 729 RR4H639JQB

RD RR4H639TF 566 0 0
GGAATCTTCCCGCGTCTTTCACACACTTCAGTCTCGCCGCCGGCGGAAACTTTCGCTTCC
TCCCTTCCCTCCGTCAATCTAGATCTCATATCCGTAGTATCGAAACTTTTCAAATTCGTC
CTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTAAGACATTGAAGTCGGAAGAAG
CTCGAATTGGTGAACTTTTGAGCTCTGAAGGAAGTGAATTATGAGCAGCAGCTCCAGAGA
GGGATCTCCCGATTGGCTTCGATCTTTCCAGGCACCCACCACCACTTCATTGTTATCGCT
ATCATCTTCAGATGATAGTCCTTGCAGGGAATCTGAAACCATTTCGTCTCTTCCTGTGAC
TGGTGACGGTGATGCCGTCGTTACTATTGTGGACAAAGAGTCCTCGGAGTCTCTGTCTAA
GAAGGATTCGAAAACGAAGTTGGTGACGAAGCAAGTGAGTATCGAGCAGGTGTTCTCTAG
GAGGAAGAAGAAAGTAGATGCTAGTCTTGACCTTGAAGAGAAAGAGAATGGAAATAAAGT
TGATGGTGAAGAGAACTCTAGCAAGC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4H639JQB 656 0 0
TCAATCTAGATCTCATATCCGTAGTATCGAAACTTTTCAAATTCGTCCTCTTGTTCTTCT
TCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTAAGACATTGAAGTCGGAAGAAGCTCGAATTGGTGA
ACTTTTGAGCTCTGAAGGAAGTGAATTATGAGCAGCAGCTCCAGAGAGGGATCTCCCGAT
TGGCTTCGATCTTTCCAGGCACCCACCACCACTTCATTGTTATCGCTATCATCTTCAGAT
GATAGTCCTTGCAGGGAATCTGAAACCATTTCGTCTCTTCCTGTGACTGGTGACGGTGAT
GCCGTCGTTACTATTGTGGACAAAGAGTCCTCGGAGTCTCTGTCTAAGAAGGATTCGAAA
ACGAAGTTGGTGACGAAGCAAGTGAGTATCGAGCAGGTGTTCTCTAGGAGGAAGAAGAAA
GTAGATGCTAGTCTTGACCTTGAAGAGAAGGAGAATGGAAATAAAGTTGATGGTGAAGAG
AACTCTAGCAAGCAGAAGGACGCTAAAGAAGGAGATGATTATGTATGGTTTGTCTCATCT
GATTCTGAACCACCCTCTACTGAACCAATGAGTCAGCAAGTGACTATGGCAACTGAAAAA
GATGAGGATATTATTATTCAAGCCAAAGAGAAAGAACCTGCGGTTAAGAAGGCTCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL5609Contig1 988 2 16 U
GGAAGTGTTGTACACAAGTGCAATGTTGTAACGCAACAGAATGTGAAAGTTATTCCTATA
CCTGTTGTAAGAGAAGTGTGTGGGTATGGGGATGATGATTCTCCCTCGTTCCCTATGCCG
GTTGCATATATCTCTGTGAAAGAAGATGAGGTTTCAAGGGCCATGGCTCGAAGCAGTGCG
ACCTATGACATGGATTCTGGAGATGAAGAGTGGCTGAGGAAGCAGAACGTGGAAGTGTTT
GGTAAAGAAGATCAACCTCTTCAGCAAGATACTTTTGAGTTGATGATTGATGGGTTTGAA
AAGCGGCATTTCCAGAGCCTTGCCGATGATCTCTTGTATGAGAAAGCGACCGTTGTTGCT
AGTCTTTTGTATCTGGGTAGGCAAGAGGTGCTCGAAGCAGTGCATGATTACTGGTTGAGG
AAAAGGAAGAAGCGAAAAGCACCACTCCTTAGAGTTTTCCAGGGGCATCATCGAGCGAAG
AAAACTCCCCTACCTTCCAAAACTGTGTTTCGCAAGAGAAGATCCTTCAAAAGGCAGGGG
AAATCCAAACAGCGATATCTCGGGCCTGTAAAGACGGCTGAAGAAGAAGCTCTAGAGGAA
CAAAACGCTATTCGTAGAGCTGAAGAAGCCAAGGCCTATGCTGATACAACCATGGAGATA
GCCATTGCTAGAAGAAGAAGAGCGCAAGTTCTTGGAGAGTATGCAGATTTGGCTGTTTAC
AGAGCCACGATGGCTCTTAAGATTGCAGAAACCAAGAAAGCAGCTGAACCGAACGAGATG
GCCAGAAAACTATTCTTGAACTGATGGTGATATTAGCAAAGAAAAATACAAAGCTTGCTA
CGCAAACTACTGGAACTGAATAGGAATTTGGGGTTTTAGGGGGCATTTTTTTGCAAAGAG
GATGATGATATGAGAGTATAGTCTCTGTATAGACTCTTTGTTAACGTGTATAGTTTTTTT
ACGTTGATATTGTAAATAGGTTTAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL02TF U 1
AF RR4FL02JQ C 294
BS 1 633 RR4FL02TF
BS 634 634 RR4FL02JQ
BS 635 717 RR4FL02TF
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BS 790 799 RR4FL02TF
BS 800 800 RR4FL02JQ
BS 801 818 RR4FL02TF
BS 819 988 RR4FL02JQ

RD RR4FL02TF 818 0 0
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CCTGTTGTAAGAGAAGTGTGTGGGTATGGGGATGATGATTCTCCCTCGTTCCCTATGCCG
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GGTAAAGAAGATCAACCTCTTCAGCAAGATACTTTTGAGTTGATGATTGATGGGTTTGAA
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AGTCTTTTGTATCTGGGTAGGCAAGAGGTGCTCGAAGCAGTGCATGATTACTGGTTGAGG
AAAAGGAAGAAGCGAAAAGCACCACTCCTTAGAGTTTTCCAGGGGCATCATCGAGCGAAG
AAAACTCCCCTACCTTCCAAAACTGTGTTTCGCAAGAGAAGATCCTTCAAAAGGCAGGGG
AAATCCAAACAGCGATATCTCGGGCCTGTAAAGACGGCTGAAGAAGAAGCTCTAGAGGAA
CAAAACGCTATTCGTAGAGCTGAAGAAGCCAAG*CCTATGCTGATACAACCATGGAGATA
GCCATTGCTAGAAGAAGAAGAGCGCAAGTTCTTGGAGAGTATGCAGATTTGGCTGTT*AC
AGAGCCACGATGGCTCTTAAGATTGCAGAA*CCAAGAA*GCAGCTGAACCGAACGAGATG
GC*AGAAA*CTATTCTTGA*CTGATGGTGATATTAGCA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4FL02JQ 695 0 0
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TGTTGCTAGTCTTTTGTATCTGGGTAGGCAAGAGGTGCTCGAAGCAGTGCATGATTACTG
GTTGAGGAAAAGGAAGAAGCGAAAAGCACCACTCCTTAGAGTTTTCCAGGGGCATCATCG
AGCGAAGAAAACTCCCCTACCTTCCAAAACTGTGTTTCGCAAGAGAAGATCCTTCAAAAG
GCAGGGGAAATCCAAACAGCGATATTTCGGGCCTGTAAAGACGGCTGAAGAAGAAGCTCT
AGAGGAACAAAACGCTATTCGTAGAGCTGAAGAAGCCAAGGCCTATGCTGATACAACCAT
GGAGATAGCCATTGCTAGAAGAAGAAGAGCGCAAGTTCTTGGAGAGTATGCAGATTTGGC
TGTTTACAGAGCCACGATGGCTCTTAAGATTGCAGAAACCAAGAAAGCAGCTGAACCGAA
CGAGATGGCCAGAAAACTATTCTTGAACTGATGGTGATATTAGCAAAGAAAAATACAAAG
CTTGCTACGCAAACTACTGGAACTGAATAGGAATTTGGGGTTTTAGGGGGCATTTTTTTG
CAAAGAGGATGATGATATGAGAGTATAGTCTCTGTATAGACTCTTTGTTAACGTGTATAG
TTTTTTTACGTTGATATTGTAAATAGGTTTAGATT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL5610Contig1 1085 2 8 U
TCTTCAAAAAAAAAACAGAACTCCATGTATATGGTTACTTGCAATGTACTCCCAAAGGTC
ACATCACCACGACGACAACCACTCATCAGAGCAACAATGGAGTCTTCTGCTAATTCCGAT
GGCTACCAAAACATCTTGATGATGCGTCACGGTGACCGCATTGACCAAGTCAACCCACTC
TGGCTCGATACAGCTGCGAGACCTTGGGACCCTCCGCTCGTTCACGACGGTATGGTACGC
TCGTTTCGAACTGGTCAACGTATTCGATCTCAGATACGGTTTCCCATCCACAGGGTCTTC
GTCTCTCCCTTCATCCGCTGCGTCCAGACTGCTTCAGAAGTGGTCAACGCTCTCACTGCC
ATCGATCTTGACCCTAACGCTACGTCGTCTAAAGACGTCCTCTCCATCGACAAATCCAAG
CTCAAGGTTTCTATTGAGTTTGGATTAAGCGAGATGCTTAACACAATATCTATTAAGCCT
GAGATTGCCCCTAGAGATAGAAAATTCGAGTTCTTGATTTCTGATCTTGAAGCTATGTTT
CCTGAGGGAATGGTGGATCATAATGCGGTTCCTGCTTATAAAGAGATGCCACAATGGGGA
GAGACCGTACAAGAATGCACTGTTCGATTTCTTAATGTTGCTAACACACTTGCTAATAGG
TATCCTTCAGAGAACTTGCTCTTAGTCACTCACGGGGAAGGAGTAAAGACTACATTTGCA
ACCTATAAAGAGGTTGATGTATACGACATTGAGTACTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGG
CAGATCTCGAGTCAAGGCGGGTCTACAAAAGCTGGACACTTTGAGGTCATAACAAGTCTT
GGTCAATCTGGAATCAAGTATCATTAACCACCACAGCAGAGCAATGATCATGTCCTTGGA
CAAACTCAGGTTTAGTCAAATGTCTTCGAAAGATCATCATGCCATTGGGGAACCAAACCG
GATTCTGGATATCTAGAATTTTCCGGTTAACCTGCCTTGCACTTCATTACAGAAGGAAAT
ATATAACGAGAACAACATTGTAGTCAATCCAAGAAAATTAATAAAAGATATTTTAACTGC
CCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4AP78TF U 1
AF RR4AP78JQ C 314
BS 1 779 RR4AP78TF
BS 780 780 RR4AP78JQ
BS 781 796 RR4AP78TF
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BS 811 821 RR4AP78TF
BS 822 1085 RR4AP78JQ

RD RR4AP78TF 821 0 0
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TGGCTCGATACAGCTGCGAGACCTTGGGACCCTCCGCTCGTTCACGACGGTATGGTACGC
TCGTTTCGAACTGGTCAACGTATTCGATCTCAGATACGGTTTCCCATCCACAGGGTCTTC
GTCTCTCCCTTCATCCGCTGCGTCCAGACTGCTTCAGAAGTGGTCAACGCTCTCACTGCC
ATCGATCTTGACCCTAACGCTACGTCGTCTAAAGACGTCCTCTCCATCGACAAATCCAAG
CTCAAGGTTTCTATTGAGTTTGGATTAAGCGAGATGCTTAACACAATATCTATTAAGCCT
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CCTGAGGGAATGGTGGATCATAATGCGGTTCCTGCTTATAAAGAGATGCCACAATGGGGA
GAGACCGTACAAGAATGCACTGTTCGATTTCTTAATGTTGCTAACACACTTGCTAATAGG
TATCCTTCAGAGAACTTGCTCTTAGTCACTCACGGGGAAGGAGTAAAGACTACATTTGCA
ACCTATAAAGAGGTTGATGTATACGACATTGAGTACTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAG*
CAGATCTCGAGTCAAG*CGGGTCTACAAA*GCTGGACACTT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4AP78JQ 772 0 0
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CTAACGCTACGTCGTCTAAAGACGTCCTCTCCATCGACAAATCCAAGCTCAAGGTTTCTA
TTGAGTTTGGATTAAGCGAGATGCTTAACACAATATCTATTAAGCCTGAGATTGCCCCTA
GAGATAGAAAATTCGAGTTCTTGATTTCTGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGG
TGGATCATAATGCGGTTCCTGCTTATAAAGAGATGCCACAATGGGGAGAGACCGTACAAG
AATGCACTGTTCGATTTCTTAATGTTGCTAACACACTTGCTAATAGGTATCCTTCAGAGA
ACTTGCTCTTAGTCACTCACGGGGAAGGAGTAAGGACTACATTTGCAACCTATAAAGAGG
TTGATGTATACGACATTGAGTACTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGGCAGATCTCGAGTC
AAGGCGGGTCTACAAAAGCTGGACACTTTGAGGTCATAACAAGTCTTGGTCAATCTGGAA
TCAAGTATCATTAACCACCACAGCAGAGCAATGATCATGTCCTTGGACAAACTCAGGTTT
AGTCAAATGTCTTCGAAAGATCATCATGCCATTGGGGAACCAAACCGGATTCTGGATATC
TAGAATTTTCCGGTTAACCTGCCTTGCACTTCATTACAGAAGGAAATATATAACGAGAAC
AACATTGTAGTCAATCCAAGAAAATTAATAAAAGATATTTTAACTGCCCTTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5612Contig1 480 2 1 U
GGGATCAACGTGGTGACTGGATTTGGAACAACTGCTGGAGCTGCTATTTCCTCCCATATG
GACATTGACAAAGTCAGCTGTCTAGAGAAGGTTGCAAAGTAATTTGGATTTTACGACATT
GGAGCTCCTTGACAAGGAGAACATTATTCGTGAAGAAGAAGCTTTTTTGGTCATCGAGTT
CTCTAGCCAACTCTTTTAATTATTTATGTCGCGTGAGATGTCATTACCATCGTTCATACT
GTTTAATCGTGTAACCTACATGACCAAATTCCGATGAAAGGTTTTTAACTATATTTGGGC
AGTGAATTTTGCGAGAGTTCCAAAACTGAAGGTTTTCAATTCTTCTTCCCTTTTTTGTTC
GTTGTAGTGTTTGCTGTATACGCTTCCAGTATCGCATTTTCGTGCTTGAATAAGTGAAAC
AGTTTCATATGTCGAGTGATGATTAAAAATTTGAGTTCTTAGCCAACGTTTTTTTCTTAC


BQ
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AF RR4CH21JQ C 1
AF RR4CH21TF U 1
BS 1 480 RR4CH21TF

RD RR4CH21JQ 480 0 0
GGGATCAACGTGGTGACTGGATTTGGAACAACTGCTGGAGCTGCTATTTCCTCCCATATG
GACATTGACAAAGTCAGCTGTCTAGAGAAGGTTGCAAAGTAATTTGGATTTTACGACATT
GGAGCTCCTTGACAAGGAGAACATTATTCGTGAAGAAGAAGCTTTTTTGGTCATCGAGTT
CTCTAGCCAACTCTTTTAATTATTTATGTCGCGTGAGATGTCATTACCATCGTTCATACT
GTTTAATCGTGTAACCTACATGACCAAATTCCGATGAAAGGTTTTTAACTATATTTGGGC
AGTGAATTTTGCGAGAGTTCCAAAACTGAAGGTTTTCAATTCTTCTTCCCTTTTTTGTTC
GTTGTAGTGTTTGCTGTATACGCTTCCAGTATCGCATTTTCGTGCTTGAATAAGTGAAAC
AGTTTCATATGTCGAGTGATGATTAAAAATTTGAGTTCTTAGCCAACGTTTTTTTCTTAC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4CH21TF 480 0 0
GGGATCAACGTGGTGACTGGATTTGGAACAACTGCTGGAGCTGCTATTTCCTCCCATATG
GACATTGACAAAGTCAGCTGTCTAGAGAAGGTTGCAAAGTAATTTGGATTTTACGACATT
GGAGCTCCTTGACAAGGAGAACATTATTCGTGAAGAAGAAGCTTTTTTGGTCATCGAGTT
CTCTAGCCAACTCTTTTAATTATTTATGTCGCGTGAGATGTCATTACCATCGTTCATACT
GTTTAATCGTGTAACCTACATGACCAAATTCCGATGAAAGGTTTTTAACTATATTTGGGC
AGTGAATTTTGCGAGAGTTCCAAAACTGAAGGTTTTCAATTCTTCTTCCCTTTTTTGTTC
GTTGTAGTGTTTGCTGTATACGCTTCCAGTATCGCATTTTCGTGCTTGAATAAGTGAAAC
AGTTTCATATGTCGAGTGATGATTAAAAATTTGAGTTCTTAGCCAACGTTTTTTTCTTAC

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL5613Contig1 909 2 10 U
GGATACTCATAGCACCCAAAGATCCTCTCAAACCCAAACAGTTCCACAACCAAAGCAACA
TCCTATGGATTTCACATCATCTTCGTTGTTCACAGCAGATTTTGCCTTAGAAAATGAATT
AGATCTATCGAGTTTGATAACTCCTTCAACGTTTATACCTTTCCAAGAACCTACTCCATC
TACTCCGATCATTCACTGCGCCGGTGCTGAAAACGATGGAAGACAGAGAATCCGTGAGAC
GACCATAACCGATGAAATCACAAACGAAGATGTTGAGCCGAAGAACAAGAAAGCGAAACA
TAGAGAGATTGAGAGGCAAAGAAGACAAGAAGTCACGTCTCTTTTTAAGAATCTAAGATA
TATATTGCCATCTCAATACATTAAGGGTAAGCGTTCTTCATCGGATCACGTTCAAGAAGC
TGTGAATTACATCAAAGACTTAGAAAAAAAGATTACAGAGATCAGCGAGAAAAGAGATCG
AATAAAGAGATCTATTTCTCATTCATCTTCAACAGGAGAATGTTCTATTAGATCATTAGA
ATCATCATATTGTTCTTGTGATGGAGACACACATATAGATGTTAAGGTCAGGACTTGTTT
GGTCGGTATCGAGATCGTAGCAAGTTGCTGTTTCAGACAAGAATCTTGTCTTTCAAGTAT
TCTTCAGCTTCTGGTTCAACAACAATGCCTTGATGTTGTTAGTTGCATCTCATCTAGGCT
GCACCCAAGATTCATACACACCATTGTTTGCAAGGTGGAGAATGGAATAGAGGTTAACTT
CTTAGAACTTCAAGAAAAGATGATCAAAATGGCAAAACTATGTTCATATGGATACTATTA
ATGTACTATTTGCATGTTCGTATTTTTTGTGAAACTTTATTTATATAATTTTTCTAATAA
TGTTAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ71TF U 1
AF RR4GZ71JQ C 218
BS 1 678 RR4GZ71TF
BS 679 681 RR4GZ71JQ
BS 682 696 RR4GZ71TF
BS 697 697 RR4GZ71JQ
BS 698 717 RR4GZ71TF
BS 718 718 RR4GZ71JQ
BS 719 727 RR4GZ71TF
BS 728 728 RR4GZ71JQ
BS 729 740 RR4GZ71TF
BS 741 909 RR4GZ71JQ

RD RR4GZ71TF 740 0 0
GGATACTCATAGCACCCAAAGATCCTCTCAAACCCAAACAGTTCCACAACCAAAGCAACA
TCCTATGGATTTCACATCATCTTCGTTGTTCACAGCAGATTTTGCCTTAGAAAATGAATT
AGATCTATCGAGTTTGATAACTCCTTCAACGTTTATACCTTTCCAAGAACCTACTCCATC
TACTCCGATCATTCACTGCGCCGGTGCTGAAAACGATGGAAGACAGAGAATCCGTGAGAC
GACCATAACCGATGAAATCACAAACGAAGATGTTGAGCCGAAGAACAAGAAAGCGAAACA
TAGAGAGATTGAGAGGCAAAGAAGACAAGAAGTCACGTCTCTTTTTAAGAATCTAAGATA
TATATTGCCATCTCAATACATTAAGGGTAAGCGTTCTTCATCGGATCACGTTCAAGAAGC
TGTGAATTACATCAAAGACTTAGAAAAAAAGATTACAGAGATCAGCGAGAAAAGAGATCG
AATAAAGAGATCTATTTCTCATTCATCTTCAACAGGAGAATGTTCTATTAGATCATTAGA
ATCATCATATTGTTCTTGTGATGGAGACACACATATAGATGTTAAGGTCAGGACTTGTTT
GGTCGGTATCGAGATCGTAGCAAGTTGCTGTTTCAGACAAGAATCTTGTCTTTCAAGTAT
TCTTCAGCTTCTGGTTCAC**ACAATGCCTTGATGT*GTTAGTTGCATCTCATCTAG*CT
GCACCCA*GATTCATACACA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4GZ71JQ 692 0 0
GGAAGACAGAGAATCCGTGAGACGACCATAACCGATGAAATCACAAACGAAGATGTTGAG
CCGAAGAACAAGAAAGCGAAACATAGAGAGATTGAGAGGCAAAGAAGACAAGAAGTCACG
TCTCTTTTTAAGAATCTAAGATATATATTGCCATCTCAATACATTAAGGGTAAGCGTTCT
TCATCGGATCACGTTCAAGAAGCTGTGAATTACATCAAAGACTTAGAAAAAAAGATTACA
GAGATCAGCGAGAAAAGAGATCGAATAAAGAGATCTATTTCTCATTCATCTTCAACAGGA
GAATGTTCTATTAGATCATTAGAATCATCATATTGTTCTTGTGATGGAGACACACATATA
GATGTTAAGGTCAGGACTTGTTTGGTCGGTATCGAGATCGTAGCAAGTTGCTGTTTCAGA
CAAGAATCTTGTCTTTCAAGTATTCTTCAGCTTCTGGTTCAACAACAATGCCTTGATGTT
GTTAGTTGCATCTCATCTAGGCTGCACCCAAGATTCATACACACCATTGTTTGCAAGGTG
GAGAATGGAATAGAGGTTAACTTCTTAGAACTTCAAGAAAAGATGATCAAAATGGCAAAA
CTATGTTCATATGGATACTATTAATGTACTATTTGCATGTTCGTATTTTTTGTGAAACTT
TATTTATATAATTTTTCTAATAATGTTAACGT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL5614Contig1 684 2 1 U
GGATCAACGAAAACAAAAAGCAAGAAACAAAGAAGTTATCAAGAAAGCAACACGAGAAGG
TCTAACAATGGAATTTGTAAGGTTTCCGATTGTCTCAATCCTCGAAGACATGCTCGAAGT
CCCCGAGGATCACAACGAGAAGAGCCTCAACAACCCTTCAAGATCTTACATGCGTGACGC
GAAGGCGATGGCTGCTACGCCAGCCGACGTGATCGAGCACCCGAACGCGTACGTTTTCGT
GGTGAACATGCCTGGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTTCAGGTGGAGAACGAGAACGT
GCTCGTGGTGAGTGGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGT
GAGGATGGAGAGGAGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAACGCTGA
TTTGGAGAAGATCTCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAGGTGACTGTTCAGAAGCT
TCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGG
ATTTTGTCCTTTTTATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTG
TGAGAGACTGTGTGATGACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTTGTTCAAAAAAAAAGTG
AAATAAAAGTTGTTTCTCTGTTCT


BQ
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AF RR4BF72TF U 1
AF RR4BF72JQ C 197
BS 1 684 RR4BF72TF

RD RR4BF72TF 684 0 0
GGATCAACGAAAACAAAAAGCAAGAAACAAAGAAGTTATCAAGAAAGCAACACGAGAAGG
TCTAACAATGGAATTTGTAAGGTTTCCGATTGTCTCAATCCTCGAAGACATGCTCGAAGT
CCCCGAGGATCACAACGAGAAGAGCCTCAACAACCCTTCAAGATCTTACATGCGTGACGC
GAAGGCGATGGCTGCTACGCCAGCCGACGTGATCGAGCACCCGAACGCGTACGTTTTCGT
GGTGAACATGCCTGGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTTCAGGTGGAGAACGAGAACGT
GCTCGTGGTGAGTGGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGT
GAGGATGGAGAGGAGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAACGCTGA
TTTGGAGAAGATCTCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAGGTGACTGTTCAGAAGCT
TCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGG
ATTTTGTCCTTTTTATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTG
TGAGAGACTGTGTGATGACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTTGTTCAAAAAAAAAGTG
AAATAAAAGTTGTTTCTCTGTTCT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BF72JQ 488 0 0
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ATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTTCAGGTGGAGAACGAGAACGTGCTCGTGGTGAGTGGG
GAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGA
ATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAACGCTGATTTGGAGAAGATCTCT
GCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAGGTGACTGTTCAGAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCT
AAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGGATTTTGTCCTTTTTAT
GCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTGTGAGAGACTGTGTGAT
GACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTTGTTCAAAAAAAAAGTGAAATAAAAGTTGTTTC
TCTGTTCT

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL5615Contig1 891 2 2 U
GGGCGTGAAACAACAAAAACCAAATTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAGAGAA
TTGTTCTCATCCGTCCGAGAAACCGATCACAGTACGAAGGATTACTCAAAGATCGGCGGT
AATGCAGAGAACAAGAAGACGATGCGAAGGCACCGCCATGGGCGCCACCGTCTTCGATCT
CCGTCCCGGCGTCGGCATCGGACCTTTCTCTATCGGAATGCCAATTTGTGATGCGTTTGC
GCAAATAGAGCAGCAGCCTAACATATATGATGTTGTTCATGTTAAATACCACGACGAGGA
TCCTCTGAAGCTCGATATTGTTATTAGCTTTCCCGATCATGGTTTTCATCTTCGCTTTGA
TCCATGGTCTCAGAGGTTACGCCTTGTTGAGATATATGATGTCAAGCGGCTTCAGATGCG
TTACGCCACTTCTACCATTGGAGGTCCATCAACTCTGGCGACGTTTGTGGCTGTTTATGC
ACTTTTTGGACCCACCTTTCCTGGGATTTATGATAAAGAAAGAGGGGTTTATTCTCTCTT
CTACCCGGGGCTATCCTTTCAGTTTCCAATTCCTAACCAGTACACGGACTGCTGCCATGA
TGGAGAAGCGGCGCTACCATTGGAGTTTCCAGATGGCACCACGCCAGTAGCATGCCGGGT
CTCTATCTATGACAACTCAAGCGACAAAAAAGTTGGTGTAGGAAAGCTGATGGATAGAGC
TTCTGTCCCTCCTTTGCTTCCTGGCAGCCTTTATATGGAGGAGGTTCATGTCAAGCTTGG
CAAGGGGTTATACTTTACTGTCGGAGGCCAGCATATGCCTTTTGGTGCATCGCCACAGGA
TGTATGGACCGACTTAGGACGACCATGTGGGATACACCCAAAGCAGGCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GJ51TF U 1
AF RR4GJ51JQ C 186
BS 1 685 RR4GJ51TF
BS 686 891 RR4GJ51JQ

RD RR4GJ51TF 685 0 0
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AATGCAGAGAACAAGAAGACGATGCGAAGGCACCGCCATGGGCGCCACCGTCTTCGATCT
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GCAAATAGAGCAGCAGCCTAACATATATGATGTTGTTCATGTTAAATACCACGACGAGGA
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TCCATGGTCTCAGAGGTTACGCCTTGTTGAGATATATGATGTCAAGCGGCTTCAGATGCG
TTACGCCACTTCTACCATTGGAGGTCCATCAACTCTGGCGACGTTTGTGGCTGTTTATGC
ACTTTTTGGACCCACCTTTCCTGGGATTTATGATAAAGAAAGAGGGGTTTATTCTCTCTT
CTACCCGGGGCTATCCTTTCAGTTTCCAATTCCTAACCAGTACACGGACTGCTGCCATGA
TGGAGAAGCGGCGCTACCATTGGAGTTTCCAGATGGCACCACGCCAGTAGCATGCCGGGT
CTCTATCTATGACAACTCAAGCGAC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4GJ51JQ 706 0 0
CCGGCGTCGGCATCGGACCTTTCTCTATCGGAATGCCAATTTGTGATGCGTTTGCGCAAA
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TGAAGCTCGATATTGTTATTAGCTTTCCCGATCATGGTTTTCATCTTCGCTTTGATCCAT
GGTCTCAGAGGTTACGCCTTGTTGAGATATATGATGTCAAGCGGCTTCAGATGCGTTACG
CCACTTCTACCATTGGAGGTCCATCAACTCTGGCGACGTTTGTGGCTGTTTATGCACTTT
TTGGACCCACCTTTCCTGGGATTTATGATAAAGAAAGAGGGGTTTATTCTTTTTTCTACC
CGGGGCTATCCTTTCAGTTTCCAATTCCTAACCAGTACACGGACTGCTGCCATGATGGAG
AAGCGGCGCTACCATTGGAGTTTCCAGATGGCACCACGCCAGTAGCATGCCGGGTCTCTA
TTTATGACAACTCAAGCGACAAAAAAGTTGGTGTAGGAAAGCTGATGGATAGAGCTTCTG
TCCCTCCTTTGCTTCCTGGCAGCCTTTATATGGAGGAGGTTCATGTCAAGCTTGGCAAGG
GGTTATACTTTACTGTCGGAGGCCAGCATATGCCTTTTGGTGCATCGCCACAGGATGTAT
GGACCGACTTAGGACGACCATGTGGGATACACCCAAAGCAGGCGTG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5616Contig1 1132 2 2 U
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTCGGCAATCTTATCGGAAGAGTAAGATTC
GAGTTCGTGAATCTAGGGATCTGCAACCAACAATGAACCGCCACCACGATCCCAACCCTT
TCGATGAGGAGGAAGAAGAAATCGTCAATCCCTTCTCTAAAGGCGGTGGACGGGTACCTG
CTGCATCTAGGCCAGCTGGATTTGGTCAAAGCCTCGATGCTACTGTTGATATTCCCTTGG
ATAACACGAATGACTCTTCACAGAAACAGAGAAAGCTTGCTGACTGGGAAGCTGAGCTTA
GGAAGAAAGAAATGGATATTAAACGGAGAGAGGATGCTATTGCTAAATCTGGTGTTCAGA
TAGATGAGAAGAACTGGCCCTCGTTTTTTCCAATCATACACCATGACATTGCTAATGAGA
TACCAGTTCATGCTCAAAAGCTCCAGTACCTGGCCTTTGCTAGTTGGTTAGGTATCGTTT
TGTGTCTGGTATTCAATGTGATTGCAACCATGGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTGA
AGATCTTTTTCCTTGCCACGATATATGCGCTGATGGGGTGTCCACTTTCTTATGTTGTAT
GGTACAGGCCTCTCTACCGAGCCATGAGGACTGACAGCGCTTTGAAGTTTGGTTGGTTTT
TCTTCACCTACTTGATTCACATTGGCTTCTGCATCGTTGCCGCCATTGCCCCGCCAATCT
TTTTCCATGGAAAATCATTAACGGGTGTGCTTGCAGCAATTGATGTCATCTCAGACAGTG
TATTAGCCGGGATCTTCTACTTTATCGGCTTTGGTCTCTTCTGCTTGGAGTCACTTCTGA
GTCTATGGGTTCTTCAGAAAATTTACCTCTACTTTAGGGGAAACAAGTAAAAAGAGAAGG
AAGAGAGGATGGTGGTAATTTTCCCTTTCGGGTAAAAGGTTTGAAGTATGTGCATCTCGT
ATGGATATAATTACATATTACCATTGTGTTGAGGTAAATTGTTTAGTTACTATAGTTGCA
AGAGGGGTTGTTCAGCTATTTCTTTAGTTTTTTTTTCTGCAATACCTTTACTACCAGTGT
CGTTCTCTGAACGTTTGGAATTTTTTCTTGACTAAGTGAACTTTTGAAAGAC


BQ
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AF RR4AH45TF U 1
AF RR4AH45JQ C 306
BS 1 785 RR4AH45TF
BS 786 1132 RR4AH45JQ

RD RR4AH45TF 785 0 0
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTCGGCAATCTTATCGGAAGAGTAAGATTC
GAGTTCGTGAATCTAGGGATCTGCAACCAACAATGAACCGCCACCACGATCCCAACCCTT
TCGATGAGGAGGAAGAAGAAATCGTCAATCCCTTCTCTAAAGGCGGTGGACGGGTACCTG
CTGCATCTAGGCCAGCTGGATTTGGTCAAAGCCTCGATGCTACTGTTGATATTCCCTTGG
ATAACACGAATGACTCTTCACAGAAACAGAGAAAGCTTGCTGACTGGGAAGCTGAGCTTA
GGAAGAAAGAAATGGATATTAAACGGAGAGAGGATGCTATTGCTAAATCTGGTGTTCAGA
TAGATGAGAAGAACTGGCCCTCGTTTTTTCCAATCATACACCATGACATTGCTAATGAGA
TACCAGTTCATGCTCAAAAGCTCCAGTACCTGGCCTTTGCTAGTTGGTTAGGTATCGTTT
TGTGTCTGGTATTCAATGTGATTGCAACCATGGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTGA
AGATCTTTTTCCTTGCCACGATATATGCGCTGATGGGGTGTCCACTTTCTTATGTTGTAT
GGTACAGGCCTCTCTACCGAGCCATGAGGACTGACAGCGCTTTGAAGTTTGGTTGGTTTT
TCTTCACCTACTTGATTCACATTGGCTTCTGCATCGTTGCCGCCATTGCCCCGCCAATCT
TTTTCCATGGAAAATCATTAACGGGTGTGCTTGCAGCAATTGATGTCATCTCAGACAGTG
TATTA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4AH45JQ 827 0 0
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GAGAAGAACTGGCCCTCGTTTTTTCCAATCATACACCATGACATTGCTAATGAGATACCA
GTTCATGCTCAAAAGCTCCAGTACCTGGCCTTTGCTAGTTGGTTAGGTATCGTTTTGTGT
CTGGTATTCAATGTGATTGCAACCATGGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTGAAGATC
TTTTTCCTTGCCACGATATATGCGCTGATGGGGTGTCCACTTTCTTATGTTGTATGGTAC
AGGCCTCTCTACCGAGCCATGAGGACTGACAGCGCTTTGAAGTTTGGTTGGTTTTTCTTC
ACCTACTTGATTCACATTGGCTTCTGCATCGTTGCCGCCATTGCCCCGCCAATCTTTTTC
CATGGAAAATCATTAACGGGTGTGCTTGCAGCAATTGATGTCATCTCAGACAGTGTATTA
GCCGGGATCTTCTACTTTATCGGCTTTGGTCTCTTCTGCTTGGAGTCACTTCTGAGTCTA
TGGGTTCTTCAGAAAATTTACCTCTACTTTAGGGGAAACAAGTAAAAAGAGAAGGAAGAG
AGGATGGTGGTAATTTTCCCTTTCGGGTAAAAGGTTTGAAGTATGTGCATCTCGTATGGA
TATAATTACATATTACCATTGTGTTGAGGTAAATTGTTTAGTTACTATAGTTGCAAGAGG
GGTTGTTCAGCTATTTCTTTAGTTTTTTTTTCTGCAATACCTTTACTACCAGTGTCGTTC
TCTGAACGTTTGGAATTTTTTCTTGACTAAGTGAACTTTTGAAAGAC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL5617Contig1 775 2 3 U
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GTAGTTGCACTGAACCAGATAGTCACATACTCTGCTTTTCACACCTCCTACAAGTCTTCC
GCATCTCTCAAATGGCAACAACACTGAACAATGCACCATATTTTTTTTTTTTTTACAGCT
AGGTTGTACCGTGGAGCCCCTTGAAATAAGTTTTCTTGAAGCTATCGTAAATCATCATCA
AACTCCGTAAAGTCTAAGGGATGTTTTGATGAACGAGTAAGCTAATGCACCGGTGAAAAT
GTAACTATCAACCCTGTCCAATATCCCACCATGTCCAGGGATAAGTGAACCAGAGTCTTT
GACCCCGGCATCACGTTTGATCATTGATTCAGTAAGATCACCAAAGACTGACCCAAAGAA
GTTAATAAACCCAAAAGCAATAGAGCTGAACAGAGACTGAGGCCAAGACAGAGACTTAGA
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TGTGTCTGTGGCAATTACACCACTGAGTGAGATCAACGTTGCCACGAGTCCAACTGTCCA
CTGAGGTGGACCACCAAGAAAAATTGGCCAAGTCCATGCAATACCAGTGTTGAGA


BQ
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AF RR4A078JQ U 97
AF RR4A078JQD U 1
BS 1 289 RR4A078JQD
BS 290 290 RR4A078JQ
BS 291 775 RR4A078JQD

RD RR4A078JQ 492 0 0
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TTTCACACCTCCTACAAGTCTTCCGCATCTCTCAAATGGCAACAACACTGAACAATGCAC
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TGAAGCTATCGTAAATCATCATCAAACTCCGTAAAGTCTAAGGGATGTTTTGATGAACGA
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AGCAAAAGTCCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4A078JQD 775 0 0
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GCATCTCTCAAATGGCAACAACACTGAACAATGCACCATATTTTTTTTTTTTTTACAGCT
AGGTTGTACCGTGGAGCCCCTTGAAATAAGTTTTCTTGAAGCTATCGTAGATCATCATCA
AACTCCGTAAAGTCTAAGGGATGTTTTGATGAACGAGTAAGCTAATGCACCGGTGAAAAT
GTAACTATCAACCCTGTCCAATATCCCACCATGTCCAGGGATAAGTGAACCAGAGTCTTT
GACCCCGGCATCACGTTTGATCATTGATTCAGTAAGATCACCAAAGACTGACCCAAAGAA
GTTAATAAACCCAAAAGCAATAGAGCTGAACAGAGACTGAGGCCAAGACAGAGACTTAGA
GAGTAGAAGGGTAATGACTATACAACCAACAAGTCCAGCAAAAGTCCCTTCCCATGTCTT
TTTGGGACTAATACTAGTCAGAGGTGTCCTACCAAACGCCTTGCCACCGAGAAAAGCAAA
TGTGTCTGTGGCAATTACACCACTGAGTGAGATCAACGTTGCCACGAGTCCAACTGTCCA
CTGAGGTGGACCACCAAGAAAAATTGGCCAAGTCCATGCAATACCAGTGTTGAGA

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL5618Contig1 562 2 1 U
GGAGATTCTTCACGGTTTACGGGCCGTGGGGTAGACCGGACATGGCTTACTTCTCCTTCA
CGAGGAATATTCTTCAAGGTAAACCGATCACGATATACCGGGGGAAGAACCGGGTCGATT
TGGCGAGGGATTTCACTTACATCGACGATATAGTCAAAGGCTGTTTAGGATCTCTCGATT
CGTCGGGTAAGAGTACCGGTTCGGGTGGGAAGAAACGTGGATCCGCACCGTACCGGATCT
TCAACCTGGGGAACACGTCGCCGGTTACGGTTCCGATCCTGGTGGATATTTTGGAGAAGA
ATCTCAAGGTGAAAGCGAAGAGGAACTTCGTGGAGATGCCTGGAAACGGCGACGTTCCGT
TCACGCACGCGAATATTAGCTCCGCCCGAAATGAATTCGGGTATAAACCGACAACCGATT
TGGAAACCGGGTTGAAAAAGTTCGTTAGTTGGTATCTTTCTTATTACGGATACAACAGTA
AAGCCAAGCTTGTACATTAACGGTGAATTTTTTTTCTTTTTTGTACGAATTGTTTTTAAT
ATACCAAACATTAATTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FQ19TF U 1
AF RR4FQ19JQ C 76
BS 1 562 RR4FQ19TF

RD RR4FQ19TF 562 0 0
GGAGATTCTTCACGGTTTACGGGCCGTGGGGTAGACCGGACATGGCTTACTTCTCCTTCA
CGAGGAATATTCTTCAAGGTAAACCGATCACGATATACCGGGGGAAGAACCGGGTCGATT
TGGCGAGGGATTTCACTTACATCGACGATATAGTCAAAGGCTGTTTAGGATCTCTCGATT
CGTCGGGTAAGAGTACCGGTTCGGGTGGGAAGAAACGTGGATCCGCACCGTACCGGATCT
TCAACCTGGGGAACACGTCGCCGGTTACGGTTCCGATCCTGGTGGATATTTTGGAGAAGA
ATCTCAAGGTGAAAGCGAAGAGGAACTTCGTGGAGATGCCTGGAAACGGCGACGTTCCGT
TCACGCACGCGAATATTAGCTCCGCCCGAAATGAATTCGGGTATAAACCGACAACCGATT
TGGAAACCGGGTTGAAAAAGTTCGTTAGTTGGTATCTTTCTTATTACGGATACAACAGTA
AAGCCAAGCTTGTACATTAACGGTGAATTTTTTTTCTTTTTTGTACGAATTGTTTTTAAT
ATACCAAACATTAATTATTATT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4FQ19JQ 487 0 0
AAGGTAAACCGATCACGATATACCGGGGGAAGAACCGGGTCGATTTGGCGAGGGATTTCA
CTTACATCGACGATATAGTCAAAGGCTGTTTAGGATCTCTCGATTCGTCGGGTAAGAGTA
CCGGTTCGGGTGGGAAGAAACGTGGATCCGCACCGTACCGGATCTTCAACCTGGGGAACA
CGTCGCCGGTTACGGTTCCGATCCTGGTGGATATTTTGGAGAAGAATCTCAAGGTGAAAG
CGAAGAGGAACTTCGTGGAGATGCCTGGAAACGGCGACGTTCCGTTCACGCACGCGAATA
TTAGCTCCGCCCGAAATGAATTCGGGTATAAACCGACAACCGATTTGGAAACCGGGTTGA
AAAAGTTCGTTAGTTGGTATCTTTCTTATTACGGATACAACAGTAAAGCCAAGCTTGTAC
ATTAACGGTGAATTTTTTTTCTTTTTTGTACGAATTGTTTTTAATATACCAAACATTAAT
TATTATT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL5619Contig1 850 2 2 U
GGAAGGAGATGGCAAGCCATGCAGTATGCATTCAACGCGTGGCACCACCGTGTCTCGGAG
CCTCGCAAGTGAATAGGAGCAAAACAGTTAGTCCCTTCTCTGTGAGTATTATTACTAGAA
GGAAGAGAAGAAGCAGTGGCGTGAGATGCAGCCTCGTTGACTTCATCGGAGGAGACCTGG
TGAAGCCAGACATCGGTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAAAGCACAAGTCAATAGCCATCT
ACACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTAGGTATCTTAACCGTCTCAAAGAACAGGGCT
ACTACTTTCTTGACATCTCAGCTCGAGGACTTGGTGATCCAGAGACCACACTCCTTAACC
CTTATCCTGTTTGCCCTGCCCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGTGGTACTATCCAC
CAGAAGTTGACTACAGACTCTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGACTTGTCGTCTGGG
TCATTGAAGCAAAGGTTTTGTGTTGTTACTCTCTCATATCTGATTTAATCTGTGCTGTTA
CATCTTCTTACATTCCGTATATCATCAAACAACAACAGGTCCTCTCAAAGTCTGAACTCC
AGTTTCTCGCTCTGCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCA
ACTGGAGAAAGTTCATGTGGAAGCCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGT
AACTTAATGAACTCATGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATTATCA
TCTCCTGCAAGTGTAGTTAATATTCATCGCATTGTAAAATTTGAAATTTGTGCAATGTCA
TAAGACCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H442TF U 1
AF RR4H442JQB C 66
BS 1 636 RR4H442TF
BS 637 850 RR4H442JQB

RD RR4H442TF 636 0 0
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CCTCGCAAGTGAATAGGAGCAAAACAGTTAGTCCCTTCTCTGTGAGTATTATTACTAGAA
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TGAAGCCAGACATCGGTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAAAGCACAAGTCAATAGCCATCT
ACACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTAGGTATCTTAACCGTCTCAAAGAACAGGGCT
ACTACTTTCTTGACATCTCAGCTCGAGGACTTGGTGATCCAGAGACCACACTCCTTAACC
CTTATCCTGTTTGCCCTGCCCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGTGGTACTATCCAC
CAGAAGTTGACTACAGACTCTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGACTTGTCGTCTGGG
TCATTGAAGCAAAGGTTTTGTGTTGTTACTCTCTCATATCTGATTTAATCTGTGCTGTTA
CATCTTCTTACATTCCGTATATCATCAAACAACAACAGGTCCTCTCAAAGTCTGAACTCC
AGTTTCTCGCTCTGCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4H442JQB 785 0 0
CAAGTGAATAGGAGCAAAACAGTTAGTCCCTTCTCTGTGAGTATTATTACTAGAAGGAAG
AGAAGAAGCAGTGGCGTGAGATGCAGCCTCGTTGACTTCATCGGAGGAGACCTGGTGAAG
CCAGACATCGGTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAAAGCACAAGTCAATAGCCATCTACACT
CCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTAGGTATCTTAACCGTCTCAAAGAACAGGGCTACTAC
TTTCTTGACATCTCAGCTCGAGGACTTGGTGATCCAGAGACCACACTCCTTAACCCTTAT
CCTGTTTGCCCTGCCCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGTGGTACTATCCACCAGAA
GTTGACTACAGACTTTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGACTTGTCGTTTGGGTCATT
GAAGCAAAGGTTTTGTGTTGTTACTCTCTCATATCTGATTTAATCTGTGCTGTTACATCT
TCTTACATTCCGTATATCATCAAACAACAACAGGTCCTCTCAAAGTCTGAACTCCAGTTT
CTCGCTCTGCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAACTGG
AGAAAGTTCATGTGGAAGCCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTAACTT
AATGAACTCATGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATTATCATCTCC
TGCAAGTGTAGTTAATATTCATCGCATTGTAAAATTTGAAATTTGTGCAATGTCATAAGA
CCCGT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5620Contig1 1003 2 2 U
TATTCTCTAGTATGAACTGTCTTTGTGACTCTTTAAAAACTCCAACAGCCACTAGAGAGA
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TGCGGTATGGATGGACTTCTCTGTTGGTGATTAGTTTGATGGGCTTGACAAAGATCTTTA
TTTCTTTTTGGTGTGTGGTGCTGGTTGAAGCCGCCTTCATCAGATTTGGTCAATCCGATG
TCTTTTTAGTCGTTTGTGGTTTGTGATTTGGTCCTTCCTGCTCATCTCTTCCCTGATTTC
CGGCTTTCAAAGGACGTCTGCTTTTGTCTTGTCAGTTTTATCCTTCTCATGTATTACTTT
CTCCGCTTTCTTTGTGTTTAGTGGATCTATAGATGCGATTCGTTCTGTCTTGGATTGTGT
GGCATGCTTGTTCGTATTTCTTTGAAACGATGGTGGTTGCCGTTCTGATTTACTTTCGTT
AGCAACATGTATTTGCTCAAGGCTTGACCCAATGGTTTTTGTTGTATATCTCCGCCGTTT
CTTTCAATATCCAGTCTCCACTCTGTCAATTAGGAGTCTTTTTTCTCTCACGGTGGTTTC
GTGTCTCCGATATCCTGTCGATGCCTCGTTCTTAGTGGTGAAGAGGTTTTATGCGATGAG
GATATGTTTCTTTAGTTTGGGTCTGGTTCAAGAAAGTGGTTCTTGTCATCTCCATGAGGT
TTAGTGTTCTTGTTATGGTTTCAGTCAAGCTGCGAATTAGTTTGGGTTTGGATGGGTTTT
TGATATTATTCTTATGTTTTTGATGCTTGCTTCTGGCTTCATTTGGCGTTTTCAAATAGT
GTCTTTAAGGCTCTTGGCTCTTCCAGCGGTTATGTTGATGCTATTTGTATAATTATGATT
TTGATGGAAAGATTTGTATGGAGATGTTTAATTTTTAGCTAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI09TF U 1
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BS 1 756 RR4AI09TF
BS 757 1003 RR4AI09JQ

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GAAAACAAAAAGATCAGTGTGTCCAGCGAGCATTAATTTTCGGCGCCGGAAGAAGACCGG
TAGTGTAGTTCCTTAGGAGTTAGAAGTGTTGAGGAGATCCTTCGATAGTCTGGAAGATAT
TGCGGTATGGATGGACTTCTCTGTTGGTGATTAGTTTGATGGGCTTGACAAAGATCTTTA
TTTCTTTTTGGTGTGTGGTGCTGGTTGAAGCCGCCTTCATCAGATTTGGTCAATCCGATG
TCTTTTTAGTCGTTTGTGGTTTGTGATTTGGTCCTTCCTGCTCATCTCTTCCCTGATTTC
CGGCTTTCAAAGGACGTCTGCTTTTGTCTTGTCAGTTTTATCCTTCTCATGTATTACTTT
CTCCGCTTTCTTTGTGTTTAGTGGATCTATAGATGCGATTCGTTCTGTCTTGGATTGTGT
GGCATGCTTGTTCGTATTTCTTTGAAACGATGGTGGTTGCCGTTCTGATTTACTTTCGTT
AGCAACATGTATTTGCTCAAGGCTTGACCCAATGGTTTTTGTTGTATATCTCCGCCGTTT
CTTTCAATATCCAGTCTCCACTCTGTCAATTAGGAGTCTTTTTTCTCTCACGGTGGTTTC
GTGTCTCCGATATCCTGTCGATGCCTCGTTCTTAGTGGTGAAGAGGTTTTATGCGATGAG
GATATGTTTCTTTAGTTTGGGTCTGGTTCAAGAAAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4AI09JQ 735 0 0
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TGGTCCTTCCTGCTCATCTCTTCCCTGATTTCCGGCTTTCAAAGGACGTCTGCTTTTGTC
TTGTCAGTTTTATCCTTCTCATGTATTACTTTCTCCGCTTTCTTTGTGTTTAGTGGATCT
ATAGATGCGATTCGTTCTGTCTTGGATTGTGTGGCATGCTTGTTCGTATTTCTTTGAAAC
GATGGTGGTTGCCGTTCTGATTTACTTTCGTTAGCAACATGTATTTGCTCAAGGCTTGAC
CCAATGGTTTTTGTTGTATATCTCCGCCGTTTCTTTCAATATCCAGTCTCCACTCTGTCA
ATTAGGAGTCTTTTTTCTCTCACGGTGGTTTCGTGTCTCCGATATCCTGTCGATGCCTCG
TTCTTAGTGGTGAAGAGGTTTTATGCGATGAGGATATGTTTCTTTAGTTTGGGTCTGGTT
CAAGAAAGTGGTTCTTGTCATCTCCATGAGGTTTAGTGTTCTTGTTATGGTTTCAGTCAA
GCTGCGAATTAGTTTGGGTTTGGATGGGTTTTTGATATTATTCTTATGTTTTTGATGCTT
GCTTCTGGCTTCATTTGGCGTTTTCAAATAGTGTCTTTAAGGCTCTTGGCTCTTCCAGCG
GTTATGTTGATGCTATTTGTATAATTATGATTTTGATGGAAAGATTTGTATGGAGATGTT
TAATTTTTAGCTAAG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

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GGGTCTCTCTTTTGTTTTCATCGTCTCCGTCTCCCTATCTCTCTATCTTCTTCTTCTTCC
ACGCAGGTTTGTAATCTGCTGATCTCCTCTGAAAATTCATCTTTCAATGGCTTCTTCGTC
TTCTTCCTCTTCTTCACAATCGTCTCTCTCTCTCCCACTGATGAAATCCCCCACAAAGTC
AGGTCTTTCCACAAGAACGATCCCAGCATCGGTACGGGACTCGTCGGAGCTCCAGCCTGC
GGTGATGTGATGAAGCTCGCTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCTGCTATCGTCTCTTCAT
CTGTTGCTGCTTGCCTAATGATTTGGTGGGAGTTGTTAGGCAATCAGGTGAAGCAAGTGC
CTCTAAGAAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATAAGAATAACAAGGAGAGAAA
GGGGATCGTGGATGCCATTGGAATACTCCTCTCATTCTTATCAGTAGCCTCTTCGACACT
ACTGGCTGTGAGAGTGTCTAGCTCTTTTGGACGCACAAGTTGCAGCCGTTCTACTGAGCA
TTTCCAAGCTTGTCTGCAAGTCAGACTGTCAAGAACCCATTTGCCTCCTTTTAGAGAGTT
GGTCTTTTGGTGTTCTTTGGATCTTATTAGCTATTCGATCCCTTATCCTTCTTGTGTTTT
GTTGTGCTTGTAATATGGTTACTCCCTTGGCTAGTAATGCCTTTCTATCTTGTATGTCCT
CCTTGAATGGAGTTTGAACTCTTATAATTAATGAAGTTTGGTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F520TF U 1
AF RR4F520JQ C 133
BS 1 620 RR4F520TF
BS 621 768 RR4F520JQ

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CTCTAAGAAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATAAGAATAACAAGGAGAGAAA
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TTTCCAAGCTTGTCTGCAAGTCAGACTGTCAAGAACCCATTTGCCTCCTTTTAGAGAGTT
GGTCTTTTGGTGTTCTTTGG

QA 1 620 1 620
DS 

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GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATAAGAATAACAAGGAGAGAAAGGGGATCGTGGA
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TCTGCAAGTCAGACTGTCAAGAACCCATTTGCCTCCTTTTAGAGAGTTGGTCTTTTGGTG
TTCTTTGGATCTTATTAGCTATTCGATCCCTTATCCTTCTTGTGTTTTGTTGTGCTTGTA
ATATGGTTACTCCCTTGGCTAGTAATGCCTTTCTATCTTGTATGTCCTCCTTGAATGGAG
TTTGAACTCTTATAATTAATGAAGTTTGGTTTGACC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL5622Contig1 973 2 2 U
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AGGTTAAAGACGGTCAGCATCTCTCAGAGGACGAGCTTCAGCTTCTTTGCGAATACGGAT
ACAGGTGAACGGGAAGGTTTCGAAGCCGGTTTTGAAAGAAAGGTTCAAGGTGTTCAATAC
TATGTTTGATGAGATACACAAGACGCAGAGTACTTGGATTGTGAGTGATGAGCAGATGCA
GTCGGAGCTAAGGGTTTCTATCGCGGCGTTCGTGATTCCGGCTTATAGGTCTTTCTTTGG
GAGGTATAAGCAGCATATTGACTCTGGGAGGCATAGTGATAAGTATGTTAAGTATCAGCC
TGAAGATATTGAGACTTACATTGATGACTTGTTTGATGGGAATCCACCTTCTATGGCACG
TAAGAGGACTTGAGAAAAAAAAACTATGAGTGTGTGACATAAGATCTGGTTCCCTTTTGC
TTTTTGATAAATTTTTTAATTTTTTTTTTGATAAAATCTGGTTCCCTTTTGCTTCTTCTT
ATTTTTCTTCTATGATTATTTTTCATTACGTTTCATGTTTATAGAACTGTTTCTTGATCT
GAGACTACCATGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP89TF U 1
AF RR4AP89JQ C 79
BS 1 782 RR4AP89TF
BS 783 973 RR4AP89JQ

RD RR4AP89TF 782 0 0
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ACGGGTTGTTGGATATGTTAAACAGTAGGGAAAATAATTGGTTTATGCTGAGCCGAACCG
GTCTGGTGGAGGTCGTACCTAAGAGGCACAACAAGTTCTTGGCCAATATGGTTGGGGTTC
ACGAAGAGGTAGTGTTGTTACTTCTCTTTATCCACTTGGATTCGCCATTGAAATCAACGG
AGGAGAAAGTGGTGGAACACATAGATAGGGAGATAATGGATTTGGATCAATGGATATCAA
AGGTTAAAGACGGTCAGCATCTCTCAGAGGACGAGCTTCAGCTTCTTTGCGAATACGGAT
ACAGGTGAACGGGAAGGTTTCGAAGCCGGTTTTGAAAGAAAGGTTCAAGGTGTTCAATAC
TATGTTTGATGAGATACACAAGACGCAGAGTACTTGGATTGTGAGTGATGAGCAGATGCA
GTCGGAGCTAAGGGTTTCTATCGCGGCGTTCGTGATTCCGGCTTATAGGTCTTTCTTTGG
GAGGTATAAGCAGCATATTGACTCTGGGAGGCATAGTGATAAGTATGTTAAGTATCAGCC
TGAAGATATTGAGACTTACATTGATGACTTGTTTGATGGGAATCCACCTTCTATGGCACG
TA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AP89JQ 895 0 0
CGCGGCAAGCAGTCATAACAGTAGAAGCGATGGTGGAGGACCGCCATTTATCAGGACGAG
GGATGAAAGGCGAAGCATGGGGGGAGATGGGAGCTAGAGTAAACGGGTTGTTGGATATGT
TAAACAGTAGGGAAAATAATTGGTTTATGCTGAGCCGAACCGGTCTGGTGGAGGTCGTAC
CTAAGAGGCACAACAAGTTCTTGGCCAATATGGTTGGGGTTCACGAAGAGGTAGTGTTGT
TACTTCTCTTTATCCACTTGGATTCGCCATTGAAATCAACGGAGGAGAAAGTGGTGGAAC
ACATAGATAGGGAGATAATGGATTTGGATCAATGGATATCAAAGGTTAAAGACGGTCAGC
ATCTCTCAGAGGACGAGCTTCAGCTTCTTTGCGAATACGGATACAGGTGAACGGGAAGGT
TTCGAAGCCGGTTTTGAAAGAAAGGTTCAAGGTGTTCAATACTATGTTTGATGAGATACA
CAAGACGCAGAGTACTTGGATTGTGAGTGATGAGCAGATGCAGTCGGAGCTAAGGGTTTC
TATCGCGGCGTTCGTGATTCCGGCTTATAGGTCTTTCTTTGGGAGGTATAAGCAGCATAT
TGACTCTGGGAGGCATAGTGATAAGTATGTTAAGTATCAGCCTGAAGATATTGAGACTTA
CATTGATGACTTGTTTGATGGGAATCCACCTTCTATGGCACGTAAGAGGACTTGAGAAAA
AAAAACTATGAGTGTGTGACATAAGATCTGGTTCCCTTTTGCTTTTTGATAAATTTTTTA
ATTTTTTTTTTGATAAAATCTGGTTCCCTTTTGCTTCTTCTTATTTTTCTTCTATGATTA
TTTTTCATTACGTTTCATGTTTATAGAACTGTTTCTTGATCTGAGACTACCATGA

QA 1 895 1 895
DS 



AS 1 2

CO CL5623Contig1 989 2 4 U
GGAAATGGAAAATATATTAAAAACCTACAAATACAAAGTTAATTGCGGTGAGCGTTTGAT
CGAACACGCGACCTTCAGATCTTCAGTCTGACGCTCTCCCAACTGAGCTATCCCCGCAAC
TTGTTATATTTTTATTATTCTTCTATGATTTACCTTCAGAGACAATCTATTCCTTTATCA
TACCAAGTGAACAATTGGCTTGCCATTCATAAAGAACTCACCAGTCAGCTTGAACCATCG
GAAGCACAAATCCACCTATCCAAATCTCTATTCTTCGTGGTAATAGGCAGCAATGATATT
TTTGACTATTTTGGATCGTTCAAACTTCGACAAAAGACCAATCCTCAACAATATACACAA
TCAATGGCTGATAAACTCAAAGAGCAATTGAAGAGACTTCACGATACTGGAGCACGGAGA
TTCCTAATTATAGGTGTAGCACAGATCGGTTGCACACCTGGACAACGTGCGGAAAACTCA
ATGCATGAATGCGACCAAGAGGCAAATGCATGGGCTTCTTTGTACAACGAAGCTCTAGTA
AAGATGCTACAACAATTCAAAAAAGAGTTGGGAAGCTCAATGATTTATTCTTACTTTGAT
AACTTCAAGTCCGTCCATGACATCGTCACCAACCCTGCCCGTTACGGTTTTGCTGATGTG
ACATCGGCGTGCTGTGGAACTGGGGAATTAAACGCGGAGTTACCTTGTTTGCTTGTGTCA
AACTTATGTTCAGACAGAACCAAATATCTCTTCTGGGATCGCTACGGTCATCCCACCGAA
GCTGCTGCTCGAACCATCGTCGATCTTATGTTATCTGATGATTCGCAATACTCGTCTCCT
TTAACTCTCACTCAACTGGTCTCTTCATGATCAATAAGAATTCGTTTTGGAATATTAGAT
CATCTAATATAAATGGATTTGGGAGACCTGACTTGTAATAAAAGTAAACAGGATAAATTT
GTCAGAAATAAAATAAACTTTATTAATTT


BQ
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AF RR4EU39TF U 1
AF RR4EU39JQ C 242
BS 1 646 RR4EU39TF
BS 647 647 RR4EU39JQ
BS 648 719 RR4EU39TF
BS 720 989 RR4EU39JQ

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CGAACACGCGACCTTCAGATCTTCAGTCTGACGCTCTCCCAACTGAGCTATCCCCGCAAC
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TACCAAGTGAACAATTGGCTTGCCATTCATAAAGAACTCACCAGTCAGCTTGAACCATCG
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TTTGACTATTTTGGATCGTTCAAACTTCGACAAAAGACCAATCCTCAACAATATACACAA
TCAATGGCTGATAAACTCAAAGAGCAATTGAAGAGACTTCACGATACTGGAGCACGGAGA
TTCCTAATTATAGGTGTAGCACAGATCGGTTGCACACCTGGACAACGTGCGGAAAACTCA
ATGCATGAATGCGACCAAGAGGCAAATGCATGGGCTTCTTTGTACAACGAAGCTCTAGTA
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AACTTCAAGTCCGTCCATGACATCGTCACCAACCCTGCCCGTTACG*TTTTGCTGATGTG
ACATCGGCGTGCTGTGGAACTGGGGAATTAAACGCGGAGTTACCTTGTTTGCTTGTGTC

QA 1 719 1 719
DS 

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TTGACTATTTTGGATCGTTCAAACTTCGACAAAAGACCAATCCTCAACAATATACACAAT
CAATGGCTGATAAACTCAAAGAGCAATTGAAGAGACTTCACGATACTGGAGCACGGAGAT
TCCTAATTATAGGTGTAGCACAGATCGGTTGCACACCTGGACAACGTGCGGAAAACTCAA
TGCATGAATGCGACCAAGAGGCAAATGCATGGGCTTCTTTGTACAACGAAGCTCTAGTAA
AGATGCTACAACAATTCAAAAAAGAGTTGGGAAGCTCAATGATTTATTCTTACTTTGATA
ACTTCAAGTCCGTCCATGACATCGTCACCAACCCTGCCCGTTACGGTTTTGCTGATGTGA
CATCGGCGTGCTGTGGAACTGGGGAATTAAACGCGGAGTTACCTTGTTTGCTTGTGTCAA
ACTTATGTTCAGACAGAACCAAATATCTCTTCTGGGATCGCTACGGTCATCCCACCGAAG
CTGCTGCTCGAACCATCGTCGATCTTATGTTATCTGATGATTCGCAATACTCGTCTCCTT
TAACTCTCACTCAACTGGTCTCTTCATGATCAATAAGAATTCGTTTTGGAATATTAGATC
ATCTAATATAAATGGATTTGGGAGACCTGACTTGTAATAAAAGTAAACAGGATAAATTTG
TCAGAAATAAAATAAACTTTATTAATTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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GAGGAAACCATGCGTCGTCACTCAGCAATCGCTCTCCGAAATCTATTCACCAGAACCTCT
CCACGATTCTCTCGGAATCTAAGCACTACCTCTTCTCCAGCTGCCGTAAACTCGCTCGAC
GGCGTCTCCGGCCGTATCTGGTCTCCTTCGCCGTGTCGGATCCCCAACGCGTCATCAAAT
GTCTCCCACGAGAAAAATCAGAGGAGATTCAGCAGCGATGGCTCGCCTCCGCCAGATGTG
AACAAGGTGGTGGACGAGATCAATCTCAAGTTCGCGGAGGCGCGCGAGGAGATCGAGATG
GCGATGGACGCAAAGGAGACGGTTTACTTCAACGAGGAGGCGGAGTGCGCGAGAGCAGCC
GTGGCGGAGGTTATGGAGATGTTCGAGGGTTTGCTCGGGAAGGTAACGGAGAAAGAGAAA
TCGTCTCTGCAGAGGTCCATGGGGTTGAAGATGGAACAGCTGAAAGCTGAGCTTCAACAG
CTTAACGAATGATTGATTGGTTGATGAGGTTTGATTCTTTGAAGAACGAAAGAGGGTTAG
TAATATCATCTTCGTTTTTTGTTACCGAGCCATTGTTGTTCTTGTCTGATTCAATAAATG
TACTCTTTGGATTAGAGAAACAAAACGTGAAAACAGATTCAGTTGTGC


BQ
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AF RR4FQ33TF U 1
AF RR4FQ33JQ C 246
BS 1 684 RR4FQ33TF
BS 685 685 RR4FQ33JQ
BS 686 692 RR4FQ33TF
BS 693 693 RR4FQ33JQ
BS 694 708 RR4FQ33TF

RD RR4FQ33TF 708 0 0
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GAGGAAACCATGCGTCGTCACTCAGCAATCGCTCTCCGAAATCTATTCACCAGAACCTCT
CCACGATTCTCTCGGAATCTAAGCACTACCTCTTCTCCAGCTGCCGTAAACTCGCTCGAC
GGCGTCTCCGGCCGTATCTGGTCTCCTTCGCCGTGTCGGATCCCCAACGCGTCATCAAAT
GTCTCCCACGAGAAAAATCAGAGGAGATTCAGCAGCGATGGCTCGCCTCCGCCAGATGTG
AACAAGGTGGTGGACGAGATCAATCTCAAGTTCGCGGAGGCGCGCGAGGAGATCGAGATG
GCGATGGACGCAAAGGAGACGGTTTACTTCAACGAGGAGGCGGAGTGCGCGAGAGCAGCC
GTGGCGGAGGTTATGGAGATGTTCGAGGGTTTGCTCGGGAAGGTAACGGAGAAAGAGAAA
TCGTCTCTGCAGAGGTCCATGGGGTTGAAGATGGAACAGCTGAAAGCTGAGCTTCAACAG
CTTAACGAATGATTGATTGGTTGATGAGGTTTGATTCTTTGAAGAACGAAAGAGGGTTAG
TAATATCATCTTCGTTTTTTGTTACCGAGCCATTGTTGTTCTTGTCTGATTCAATAAATG
TACTCTTTGGATTAGAGAAACAAA*CGTGAAA*CAGATTCAGTTGTGC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4FQ33JQ 463 0 0
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GGACGCAAAGGAGACGGTTTACTTCAACGAGGAGGCGGAGTGCGCGAGAGCAGCCGTGGC
GGAGGTTATGGAGATGTTCGAGGGTTTGCTCGGGAAGGTAACGGAGAAAGAGAAATCGTC
TCTGCAGAGGTCCATGGGGTTGAAGATGGAACAGCTGAAAGCTGAGCTTCAACAGCTTAA
CGAATGATTGATTGGTTGATGAGGTTTGATTCTTTGAAGAACGAAAGAGGGTTAGTAATA
TCATCTTCGTTTTTTGTTACCGAGCCATTGTTGTTCTTGTCTGATTCAATAAATGTACTC
TTTGGATTAGAGAAACAAAACGTGAAAACAGATTCAGTTGTGC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL5625Contig1 768 2 2 U
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CTGCCCGGAAAACCATAAGAAGAGTTGCGAGACAGGAGAAGGCAGTGAAGATCTTCCCTC
GTCCCACCTCTGGGCCTCTCCGTTCTGTTGTTCACGCACAGACTCTTAAGTACAACATGA
AAGTCAGAGCCGGTAAAGGCTTCTCTCTCGAGGAGCTTAAGGCTGCTGGTATCGCAAAGA
AGTTGGCTCCAACGATTGGAATCTCAATTGATCACCGTCGTAAGAACCGTTCCTTGGAGA
GTCTTCAATCCAATGTTCAAAGGTTAAAGACCTACAAGGCCAAGTTGGTTGTCTTCCCTC
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AACTCCAAGGAGATTACATGCCTATCTCTAGAGAGAAGGTTGCGATGGAGCTTGTGAAAG
TGACTGCTGATATGAAGACATTCAAGGCTTATGACAAGATCCGTCTTGAGCGCACTAACA
AACGCCATGCTGGTGTCAGAGCCAAGAGAGCCGCCGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAAT
AAGTTATTGATTAAGCTTTAAGACTTTCAATCCATTTTTGAATCCTGCTTCTTGATTTTG
TTTAAGACTCTTGTTTTCATGGGATTTTATCAAGCCTTAAATCTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GD11TF U 1
AF RR4GD11JQ C 84
BS 1 560 RR4GD11TF
BS 561 768 RR4GD11JQ

RD RR4GD11TF 560 0 0
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GTCCCACCTCTGGGCCTCTCCGTTCTGTTGTTCACGCACAGACTCTTAAGTACAACATGA
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AGTTGGCTCCAACGATTGGAATCTCAATTGATCACCGTCGTAAGAACCGTTCCTTGGAGA
GTCTTCAATCCAATGTTCAAAGGTTAAAGACCTACAAGGCCAAGTTGGTTGTCTTCCCTC
GCCGATCCCGTGTAGTCAAGGCTGATGATTCTACTCCTGAGGAGCTTGCTAATGCAACTC
AACTCCAAGGAGATTACATGCCTATCTCTAGAGAGAAGGTTGCGATGGAGCTTGTGAAAG
TGACTGCTGATATGAAGACA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4GD11JQ 685 0 0
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TCTGTTGTTCACGCACAGACTCTTAAGTACAACATGAAAGTCAGAGCCGGTAAAGGCTTC
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TTAAAGACCTACAAGGCCAAGTTGGTTGTCTTCCCTCGCCGATCCCGTGTAGTCAAGGCT
GATGATTCTACTCCTGAGGAGCTTGCTAATGCAACTCAACTCCAAGGAGATTACATGCCT
ATCTCTAGAGAGAAGGTTGCGATGGAGCTTGTGAAAGTGACTGCTGATATGAAGACATTC
AAGGCTTATGACAAGATCCGTCTTGAGCGCACTAACAAACGCCATGCTGGTGTCAGAGCC
AAGAGAGCCGCCGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAATAAGTTATTGATTAAGCTTTAAGA
CTTTCAATCCATTTTTGAATCCTGCTTCTTGATTTTGTTTAAGACTCTTGTTTTCATGGG
ATTTTATCAAGCCTTAAATCTGTGG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL5626Contig1 887 2 8 U
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GAGAACGGAGAAGGAAGAGACGGAGTTCAAGGTCCTCGAAACCTTGACCCCGACGCTCTG
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CAACCTCCGATCCACCACGCCAGCAAAAGCCGTGATTCGTCGTCCCAGGGAGACCGACCC
GGTCAAGAGGGATCAACAGCAACAGACGATGATAAACCGGTGTTCCGGCTGTCGGAAGAA
GGTCGGTCTGACCGGGTTCAGGTGCCGGTGCGGGGACCTTTTCTGCGCCGAGCACCGTTA
CACGGATCGCCACGATTGCAGCTACGACTACAAAACCGCCGGCCGCGAGGCGATCGCTAG
AGAGAATCCTGTCGTCAAGGCGGCGAAGATGGTCAAAGTTTAAATTCGAATCGATTCGAT
CGTGAAAAAAAAAAACTCGTGGTGGTTCAGTTCAAGGTTTCGGTCTGTAAAGATCGGACA
ATCGTTTAACAGAGAGAGATGCTCGGAGACATTATTGATTTGATGATGTCTGTTTGTAAT
GAAAAAAGATCATAGAGATTCCTCTGCTCGATTTCAGTCTGAAGCTAAAATTTATTTTTC
TTTTACTTTTCTTTCTAGTTATTGTTTGGCTTTACGAATTCAAGACAAAGTTGTCGAGTG
GCATGTGTATGTAGATTCGGTAGAAATGAAGGGTGCTTTTGGTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ52TF U 1
AF RR4AJ52JQ C 14
BS 1 819 RR4AJ52TF
BS 820 820 RR4AJ52JQ
BS 821 828 RR4AJ52TF
BS 829 829 RR4AJ52JQ
BS 830 840 RR4AJ52TF
BS 841 841 RR4AJ52JQ
BS 842 855 RR4AJ52TF
BS 856 887 RR4AJ52JQ

RD RR4AJ52TF 855 0 0
GGATATTCCATTCATTTCCTCTCTCTCTCTCTCATCTCTCTACGTTTCTCTCTCTCTATA
TTCTCAACTCGAATCGTAAAGCTAGCCGGAGAAGGTGAAAATTCAATACAACATGGCGCA
GAGAACGGAGAAGGAAGAGACGGAGTTCAAGGTCCTCGAAACCTTGACCCCGACGCTCTG
CTCAAACAACTGCGGCGTCACAGCGAATCCAGCGACCAACAACATGTGTCAGAAATGTTT
CAACGCCTCCGTCGCAGGCGTAGACTCCACCTCGACGTTGAAGAGATCGGCCAGATCCGT
CAACCTCCGATCCACCACGCCAGCAAAAGCCGTGATTCGTCGTCCCAGGGAGACCGACCC
GGTCAAGAGGGATCAACAGCAACAGACGATGATAAACCGGTGTTCCGGCTGTCGGAAGAA
GGTCGGTCTGACCGGGTTCAGGTGCCGGTGCGGGGACCTTTTCTGCGCCGAGCACCGTTA
CACGGATCGCCACGATTGCAGCTACGACTACAAAACCGCCGGCCGCGAGGCGATCGCTAG
AGAGAATCCTGTCGTCAAGGCGGCGAAGATGGTCAAAGTTTAAATTCGAATCGATTCGAT
CGTGAAAAAAAAAAACTCGTGGTGGTTCAGTTCAAGGTTTCGGTCTGTAAAGATCGGACA
ATCGTTTAACAGAGAGAGATGCTCGGAGACATTATTGATTTGATGATGTCTGTTTGTAAT
GAAAAAAGATCATAGAGATTCCTCTGCTCGATTTCAGTCTGAAGCTAAAATTTATTTTTC
TTTTACTTTTCTTTCTAGTTATTGTTTGGCTTTACGAAT*CAAGACAA*GTTGTCGAGTG
*CATGTGTATGTAGA

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4AJ52JQ 874 0 0
ATTTCCTCTCTCTCTCTCTCATCTCTCTACGTTTCTCTCTCTCTATATTCTCAACTCGAA
TCGTAAAGCTAGCCGGAGAAGGTGAAAATTCAATACAACATGGCGCAGAGAACGGAGAAG
GAAGAGACGGAGTTCAAGGTCCTCGAAACCTTGACCCCGACGCTCTGCTCAAACAACTGC
GGCGTCACAGCGAATCCAGCGACCAACAACATGTGTCAGAAATGTTTCAACGCCTCCGTC
GCAGGCGTAGACTCCACCTCGACGTTGAAGAGATCGGCCAGATCCGTCAACCTCCGATCC
ACCACGCCAGCAAAAGCCGTGATTCGTCGTCCCAGGGAGACCGACCCGGTCAAGAGGGAT
CAACAGCAACAGACGATGATAAACCGGTGTTCCGGCTGTCGGAAGAAGGTCGGTCTGACC
GGGTTCAGGTGCCGGTGCGGGGACCTTTTTTGCGCCGAGCACCGTTACACGGATCGCCAC
GATTGCAGCTACGACTACAAAACCGCCGGCCGCGAGGCGATCGCTAGAGAGAATCCTGTC
GTCAAGGCGGCGAAGATGGTCAAAGTTTAAATTCGAATCGATTCGATCGTGAAAAAAAAA
AACTCGTGGTGGTTCAGTTCAAGGTTTCGGTCTGTAAGGATCGGACAATCGTTTAACAGA
GAGAGATGCTCGGAGACATTATTGATTTGATGATGTCTGTTTGTAATGAAAAAAGATCAT
AGAGATTCCTCTGCTCGATTTCAGTCTGAAGCTAAAATTTATTTTTCTTTTACTTTTCTT
TCTAGTTATTGTTTGGCTTTACGAATTCAAGACAAAGTTGTCGAGTGGCATGTGTATGTA
GATTCGGTAGAAATGAAGGGTGCTTTTGGTAAGC

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 2

CO CL5627Contig1 964 2 4 U
GGACTCTCCATCACGAAAAAAAAAAAAATCTCGAAGGCGAAAGGCGATTTGGCTCTGACA
AAAGAGACCAAAACCCTAATCTATGCAGGAGGATGATGAATTTGGGCAGGAAGAATCGAA
TATATGTTTCAAGAACCAAGAGATTCTGGTGGCCACGATCTGGATTCAAGCTTTCACCGG
TACCAATTTCGATTTCTCCACGTACTCCTCGGATTTGAAATCGTTTCTGTAAACGACGTA
ATGGTCTCATGGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCGATTCTCTGTGGATCCTCCGTAGTGTCCT
CTGTAGCTGTCCTCATCGTTTCCTTAACCGGCGATTATGGGATTGTTAGTTTGTGTTTCA
CCATTTACTTGACTTTGTCCTGACTTGTAAAACAGAGGAAAGAGCAGTTACAAGATTCTC
TCGCCTGACATCATGGTGTGGACAATGATTCTGTTAAGCCATCACCAAGACTGGCAAGAA
AGGGCGAGAGAGGAAGTGAGGCATGTATTCGGTTTAGAGTTTTTAGATACTGGTTTGTTT
GTTTGTTTGTTTCAGCTCGAAACTGATATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGAC
TGAGGAACATATTTGGAAGCATATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGCTAGAGGAGAA
AGAAAGAGAGAAAGAGTCTGGTGCTATTCCAGAGGAAGGTGGAGAAATTGTGGTGAAGGA
AGAAAAGAAGAAGAATAAAAAGAAGGAGAAGAAGACTAAGAAGGAGAAGAAGAAAAACAA
GACGTCAGATCACATTCCATGGCGGTTTGTTCTTCCATCTTTGTTTTTATTCTTATAGTA
TCTTATGCGGGAATGATTTTGCCGTAGTTCTTCCGGAATTTGAATTATATCCGCTTGCCG
ACGAGTTTGATTTGTTGCTACTTGCTAATTCATTGTTTCTGTTTCTGGAATCGATTTTTG
AGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4HB87TF U 1
AF RR4HB87JQB C 166
BS 1 672 RR4HB87TF
BS 673 673 RR4HB87JQB
BS 674 690 RR4HB87TF
BS 691 964 RR4HB87JQB

RD RR4HB87TF 690 0 0
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AAAGAGACCAAAACCCTAATCTATGCAGGAGGATGATGAATTTGGGCAGGAAGAATCGAA
TATATGTTTCAAGAACCAAGAGATTCTGGTGGCCACGATCTGGATTCAAGCTTTCACCGG
TACCAATTTCGATTTCTCCACGTACTCCTCGGATTTGAAATCGTTTCTGTAAACGACGTA
ATGGTCTCATGGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCGATTCTCTGTGGATCCTCCGTAGTGTCCT
CTGTAGCTGTCCTCATCGTTTCCTTAACCGGCGATTATGGGATTGTTAGTTTGTGTTTCA
CCATTTACTTGACTTTGTCCTGACTTGTAAAACAGAGGAAAGAGCAGTTACAAGATTCTC
TCGCCTGACATCATGGTGTGGACAATGATTCTGTTAAGCCATCACCAAGACTGGCAAGAA
AGGGCGAGAGAGGAAGTGAGGCATGTATTCGGTTTAGAGTTTTTAGATACTGGTTTGTTT
GTTTGTTTGTTTCAGCTCGAAACTGATATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGAC
TGAGGAACATATTTGGAAGCATATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGCTAGAGGAGAA
AGAAAGAGAGAA*GAGTCTGGTGCTATTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4HB87JQB 799 0 0
TCAAGCTTTCACCGGTACCAATTTCGATTTCTCCACGTACTCCTCGGATTTGAAATCGTT
TCTGTAAACGACGTAATGGTCTCATGGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCGATTCTCTGTGGAT
CCTCCGTAGTGTCCTCTGTAGCTGTCCTCATCGTTTCCTTAACCGGCGATTATGGGATTG
TTAGTTTGTGTTTCACCATTTACTTGACTTTGTCCTGACTTGTAAAACAGAGGAAAGAGC
AGTTACAAGATTCTCTCGCCTGACATCATGGTGTGGACAATGATTCTGTTAAGCCATCAC
CAAGACTGGCAAGAAAGGGCGAGAGAGGAAGTGAGGCATGTATTCGGTTTAGAGTTTTTA
GATACTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTCAGCTCGAAACTGATATGTAAGCTAACGGGTGA
TACGGTGAACAAGACTGAGGAACATATTTGGAAGCATATCAATGGACGACGCTTCCTCAA
CAAGCTAGAGGAGAAAGAAAGAGAGAAAGAGTCTGGTGCTATTCCAGAGGAAGGTGGAGA
AATTGTGGTGAAGGAAGAAAAGAAGAAGAATAAAAAGAAGGAGAAGAAGACTAAGAAGGA
GAAGAAGAAAAACAAGACGTCAGATCACATTCCATGGCGGTTTGTTCTTCCATCTTTGTT
TTTATTCTTATAGTATCTTATGCGGGAATGATTTTGCCGTAGTTCTTCCGGAATTTGAAT
TATATCCGCTTGCCGACGAGTTTGATTTGTTGCTACTTGCTAATTCATTGTTTCTGTTTC
TGGAATCGATTTTTGAGAC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL5628Contig1 696 2 2 U
GACTCTAACCAAAACGGTCATAATCTCGCGTCTTAGTCGTAGCAATAAGGAAGATGTGTC
AGACCGGCTCATGTAGTACCGGTTCTCGTGTCCACCATAATATCTTCACCAACATTGACA
AAGAGGGGTACATGACAACTGCACCCAGTCTCGAGGGTGGCAGGTTTTGTTCCACCTTGT
GCAGTGTCACCTCGGAGACCAGGATCAACGTCAACAATTTTAAGCTGAACTGTAATGGGA
AGTTCAAAATCGATGACCTTGTCCTTCCAGTAGAGTAAATTGCAGTCCATTCCCTCTTTA
AGCCATTTGGTCTTGTCGCCCATATCAGCCTCGTTTAAACGTGTTTCCTCATAACTGCTC
AAGTCCATGAAAACAAACTGAGAGCCGTCTTTATAAGTGAATTGCTTGGTCTCCTTGAAG
ACATTTGCCTCTTCCATAGTAATTCCGGCACGAAAGGTTCTCTCGACGGTGCTACCATTG
ACGTAATTCCTGATTTTGGTTCTGACAAAAGCAGCACCTTTGCCTGGCTTCACATGAAGA
AACTCCAGAACACGCCACGGAGCACTATCGACTTCTATGTTTGTCCCGACTTTGATGTCG
TTGCTAGACAACGCATATATCCTGGGAAATCTGTTCGTTGGGGAGCACTGTTTGCCTCCG
GAAAGACAGACCGCTCAACGATGAGTATGAGGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU41TF C 1
AF RR4GU41JQ U 161
BS 1 160 RR4GU41TF
BS 161 696 RR4GU41JQ

RD RR4GU41TF 653 0 0
GACTCTAACCAAAACGGTCATAATCTCGCGTCTTAGTCGTAGCAATAAGGAAGATGTGTC
AGACCGGCTCATGTAGTACCGGTTCTCGTGTCCACCATAATATCTTCACCAACATTGACA
AAGAGGGGTACATGACAACTGCACCCAGTCTCGAGGGTGGCAGGTTTTGTTCCACCTTGT
GCAGTGTCACCTCGGAGACCAGGATCAACGTCAACAATTTTAAGCTGAACTGTAATGGGA
AGTTCAAAATCGATGACCTTGTCCTTCCAGTAGAGTAAATTGCAGTCCATTCCCTCTTTA
AGCCATTTGGTCTTGTCGCCCATATCAGCCTCGTTTAAACGTGTTTCCTCATAACTGCTC
AAGTCCATGAAAACAAACTGAGAGCCGTCTTTATAAGTGAATTGCTTGGTCTCCTTGAAG
ACATTTGCCTCTTCCATAGTAATTCCGGCACGAAAGGTTCTCTCGACGGTGCTACCATTG
ACGTAATTCCTGATTTTGGTTCTGACAAAAGCAGCACCTTTGCCTGGCTTCACATGAAGA
AACTCCAGAACACGCCACGGAGCACTATCGACTTCTATGTTTGTCCCGACTTTGATGTCG
TTGCTAGACAACGCATATATCCTGGGAAATCTGTTCGTTGGG*AGCACTGTTT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4GU41JQ 536 0 0
CAGGTTTTGTTCCACCTTGTGCAGTGTCACCTCGGAGACCAGGATCAACGTCAACAATTT
TAAGCTGAACTGTAATGGGAAGTTCAAAATCGATGACCTTGTCCTTCCAGTAGAGTAAAT
TGCAGTCCATTCCCTCTTTAAGCCATTTGGTCTTGTCGCCCATATCAGCCTCGTTTAAAC
GTGTTTCCTCATAACTGCTCAAGTCCATGAAAACAAACTGAGAGCCGTCTTTATAAGTGA
ATTGCTTGGTCTCCTTGAAGACATTTGCCTCTTCCATAGTAATTCCGGCACGAAAGGTTC
TCTCGACGGTGCTACCATTGACGTAATTCCTGATTTTGGTTCTGACAAAAGCAGCACCTT
TGCCTGGCTTCACATGAAGAAACTCCAGAACACGCCACGGAGCACTATCGACTTCTATGT
TTGTCCCGACTTTGATGTCGTTGCTAGACAACGCATATATCCTGGGAAATCTGTTCGTTG
GGGAGCACTGTTTGCCTCCGGAAAGACAGACCGCTCAACGATGAGTATGAGGGTTT

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL5629Contig1 894 2 2 U
CAAACAACATTCTACTTCATATGTGCTCTGGGTTGAAATAAATTATGAAAAGAGAGTGAT
TTTTAATACAGCTTAATTCATGGAAAATATGGAAAAATGATCAATTAAAGATATAATAGC
AGAGACTATTAAAGATATAGAAAACTAAAATGTGATAAAAAAAAATAAAAAGCAAGAGTT
GAATGAAGCTCTTCTGATACTCCTACACAATCATCAGTGACTTGTAGAGTCTTCCATCTT
TCTCCATTTCACCAAAGTCTTGAGAAACTTCTTCACCTCTGAGGGGTCTCTAAAAGAGTA
AAACGCATTGCTTTCTTTTGGTACAGAGGATACCAAGATTCCAAATCCTTGCTTCTTCTC
CCTTAGTACCTTAAACGCATCCTCATCAGTCTTGTCATCTCCTATGAAGATTGGGAGAAA
ATCATCGTTGTTGCTTAATCCGAGTGATTCCAACAGAAACTCAACTGCTTTTCCTTTGTT
CCATTCGATCACAGGACGAACCTCTAAAACCTTTCTGCCGTGAGTTAGACGCAAACGAGG
GTATTGTTTCAGGTGGTCATGAACACGTTGAGCAACTAGTGGCCAGTCTTTCTCATCAAC
GTTGCGGTAATGCACAGAAGCGCAGAACTTGTGGTTCTCCACTTTTGCACCTTTGATGCC
TTTAGTTAGCTCCACGAGGGATTTATAAACCTCTTCGATGACTGGTATGAACTCTTTAGC
AGGCTGAAAGAGGTTTACCTCTTCACCCTGTTGGTCAGAGTTGGTGTCTTCAGGGGAGGA
GCCATTAGCATTTGCGGGAGTCATGATGTCCATCCCATGACTACCGGCGTAGTAGAGTTC
GGTTAGTCCAACCAATTCGTAAACCTTGTCACGGATCTACCACTAATAATTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CV80JQ U 1
AF RR4CM84JQ U 25
BS 1 769 RR4CV80JQ
BS 770 894 RR4CM84JQ

RD RR4CV80JQ 769 0 0
CAAACAACATTCTACTTCATATGTGCTCTGGGTTGAAATAAATTATGAAAAGAGAGTGAT
TTTTAATACAGCTTAATTCATGGAAAATATGGAAAAATGATCAATTAAAGATATAATAGC
AGAGACTATTAAAGATATAGAAAACTAAAATGTGATAAAAAAAAATAAAAAGCAAGAGTT
GAATGAAGCTCTTCTGATACTCCTACACAATCATCAGTGACTTGTAGAGTCTTCCATCTT
TCTCCATTTCACCAAAGTCTTGAGAAACTTCTTCACCTCTGAGGGGTCTCTAAAAGAGTA
AAACGCATTGCTTTCTTTTGGTACAGAGGATACCAAGATTCCAAATCCTTGCTTCTTCTC
CCTTAGTACCTTAAACGCATCCTCATCAGTCTTGTCATCTCCTATGAAGATTGGGAGAAA
ATCATCGTTGTTGCTTAATCCGAGTGATTCCAACAGAAACTCAACTGCTTTTCCTTTGTT
CCATTCGATCACAGGACGAACCTCTAAAACCTTTCTGCCGTGAGTTAGACGCAAACGAGG
GTATTGTTTCAGGTGGTCATGAACACGTTGAGCAACTAGTGGCCAGTCTTTCTCATCAAC
GTTGCGGTAATGCACAGAAGCGCAGAACTTGTGGTTCTCCACTTTTGCACCTTTGATGCC
TTTAGTTAGCTCCACGAGGGATTTATAAACCTCTTCGATGACTGGTATGAACTCTTTAGC
AGGCTGAAAGAGGTTTACCTCTTCACCCTGTTGGTCAGAGTTGGTGTCT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4CM84JQ 870 0 0
GCTCTGGGTTGAAATAAATTATGAAAAGAGAGTGATTTTTAGTACAGCTTAATTCATGGA
AAATATGGAAAAATGATCAATTAAAGATATAATAGCAGAGACTATTAAAGATATAGAAAA
CTAAAATGTGATAAAAAAAA*TAGAAAGCAAGAGTTGAATGAAGCTCTTCTGATACTCCT
ACACAATCATCAGTGACTTGTAGAGTCTTCCATCTTTCTCCATTTCACCAAAGTCTTGAG
AAACTTCT******CTGAGGGGTCTCTAAGAGAGTAGAACGCATTGCTTTCTTTTGGTAC
AGAGGATACCAAGATTTCAAATCCTTGCTTCTTCTCCCTTAGTACCTTAAACGCATCCTC
ATCAGTCTTGTCATCTCCTATGAAGATTGGGAGAAAATCATCGTTGTTGCTTAATCCGAG
TGATTCCAACAGAAACTCAACTGCTTTTCCTTTGTTCCATTCGATCACAGGACGAACCTC
TAAAACCTTTCTGCCGTGAGTTAGACGCAGACGAGGGTATTGTTTCAGGTGGTCATGAAC
ACGTTGAGCAACTAGTGGCCAGTCTTTCTCATCAACGTTGCGGTAATGCACAGAAGCGCA
GAACTTGTGGTTCTCCACTTTTGCACCTTTGATGCCTTTAGTTAGCTCCACGAGGGATTT
ATAAACCTCTTCGATGACTGGTATGAACTCTTTAGCAGGCTGAAAGAGGTTTACCTCTTC
ACCCTGTTGGTCAGAGTTGGTGTCTTCAGGGGAGGAGCCATTAGCATTTGCGGGAGTCAT
GATGTCCATCCCATGACTACCGGCGTAGTAGAGTTCGGTTAGTCCAACCAATTCGTAAAC
CTTGTCACGGATCTACCACTAATAATTGCT

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 2

CO CL5630Contig1 514 2 3 U
AGTAAAACGGTGCATTTTGATAACTCACTAAAATTAAGAACTATCTCTTAGACGTGAGCC
CTATTTCCCATAACCAACTAAATCCTAAAAAATTTAAGTGATTACAGAGAAAAAAAGGTG
AAGATCTTGGGGACTTGAAAATATTGTTGATGTAGAGGAATAAGCTTGTAACGAGACGAG
CTAAAACGCACCGTGGACATGATCAAAGAAGCGTGAGCATGAGCAAGAGCTTTATTCATC
ATGTTGTGCTGCGTGAGAAGAACATGCGTATATTTCAGAAAACGTCAACAACCGAAGCCG
GGGTTACTGCTCGTGTCCATCCTTTGGTTCGTGATCGTCTCATCTCCATTCCGCCATCTT
CGCAAACATCCCCTTCTTTGCTGCAGGTTTTCTATCGCCTCCCACCTCCTGTTCCATAAA
AGTTTTCTCTATTTTGTTATTGCTTGCTCTGTTTCCATTTCTTTCTTGATGTAATAAGTG
GATGTGAAAGACAAGAGAGTTACTTAAAGAATCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BO37TF C 1
AF RR4BO37JQ U 4
BS 1 3 RR4BO37TF
BS 4 496 RR4BO37JQ
BS 497 514 RR4BO37TF

RD RR4BO37TF 514 0 0
AGTAAAACGGTGCATTTTGATAACTCACTAAAATTAAGAACTATCTCTTAGACGTGAGCC
CTATTTCCCATAACCAACTAAATCCTAAAAAATTTAAGTGATTACAGAGAAAAAAAGGTG
AAGATCTTGGGGACTTGAAAATATTGTTGATGTAGAGGAATAAGCTTGTAACGAGACGAG
CTAAAACGCACCGTGGACATGATCAAAGAAGCGTGAGCATGAGCAAGAGCTTTATTCATC
ATGTTGTGCTGCGTGAGAAGAACATGCGTATATTTCAGAAAACGTCAACAACCGAAGCCG
GGGTTACTGCTCGTGTCGATCCTTTGGTTCGTGATCGTCTCATCTCCATTCCGCCATCTT
CGCAAACATCCCCTTCTTTGCTGCAGGTTTTCTATCGCCTCCCACCTCCTGTTCCATAAA
AGTTTTCTCTATTTTGTTATTGCTTGCTCTGTTTCCATTTCTTTCTTGATGTAATAAGTG
GATGTGAAAGACAAGAGAGTTACTTAAAGAATCC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4BO37JQ 493 0 0
AAAACGGTGCATTTTGATAACTCACTAAAATTAAGAACTATCTCTTAGACGTGAGCCCTA
TTTCCCATAACCAACTAAATCCTAAAAAATTTAAGTGATTACAGAGAAAAAAAGGTGAAG
ATCTTGGGGACTTGAAAATATTGTTGATGTAGAGGAATAAGCTTGTAACGAGACGAGCTA
AAACGCACCGTGGACATGATCAAAGAAGCGTGAGCATGAGCAAGAGCTTTATTCATCATG
TTGTGCTGCGTGAGAAGAACATGCGTATATTTCAGAAAACGTCAACAACCGAAGCCGGGG
TTACTGCTCGTGTCCATCCTTTGGTTCGTGATCGTCTCATCTCCATTCCGCCATCTTCGC
AAACATCCCCTTCTTTGCTGCAGGTTTTCTATCGCCTCCCACCTCCTGTTCCATAAAAGT
TTTCTCTATTTTGTTATTGCTTGCTCTGTTTCCATTTCTTTCTTGATGTAATAAGTGGAT
GTGAAAGACAAGA

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL5631Contig1 503 2 1 U
GCTACCATAATCCTCTGCGCACTGGGAAATGGGCTGTGACATATGAGGAATGGCCAGAAG
AGTATTATCCACCATATGCAAATGGTCCGGGTTATCTTGTCATATGATATAGCTAAGTTC
ATCGTTGATGATTTTGAACAGCAGAGATTAAGATTATTCAAGATGGAAGATGTGAGCATG
GGAATGTGGGTGGAGAACTTCAACGAGACTAGACCGGTGGAGGTGGTTCACAGCCTGAGG
TTCTGCCAGTTTGGATGCATAGAAGACTACTTCACTGCTCATTACCAGTCGCCACGGCAG
ATGATTTGCATGTGGGATAAGCTGCAGAGACTCGGGAAGCCCAGTTGCTGCAACATGAGA
TGACATAACATTGTTTTTTGGCCTGATTCTGGAATTTTGGAAGAAGCAGAGGAGAGTTTA
TGGAGCTAACTGTATTAGATCTTTGTTTATGTATAGAACAATCTATAATGTATCTATATA
TAATATCCAATGAAAGGCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GH24TF U 1
AF RR4GH24JQ C 14
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RD RR4GH24TF 503 0 0
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GGAATGTGGGTGGAGAACTTCAACGAGACTAGACCGGTGGAGGTGGTTCACAGCCTGAGG
TTCTGCCAGTTTGGATGCATAGAAGACTACTTCACTGCTCATTACCAGTCGCCACGGCAG
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TGGAGCTAACTGTATTAGATCTTTGTTTATGTATAGAACAATCTATAATGTATCTATATA
TAATATCCAATGAAAGGCTCTCC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4GH24JQ 490 0 0
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ATATGCAAATGGTCCGGGTTATCTTGTCATATGATATAGCTAAGTTCATCGTTGATGATT
TTGAACAGCAGAGATTAAGATTATTCAAGATGGAAGATGTGAGCATGGGAATGTGGGTGG
AGAACTTCAACGAGACTAGACCGGTGGAGGTGGTTCACAGCCTGAGGTTCTGCCAGTTTG
GATGCATAGAAGACTACTTCACTGCTCATTACCAGTCGCCACGGCAGATGATTTGCATGT
GGGATAAGCTGCAGAGACTCGGGAAGCCCAGTTGCTGCAACATGAGATGACATAACATTG
TTTTTTGGCCTGATTCTGGAATTTTGGAAGAAGCAGAGGAGAGTTTATGGAGCTAACTGT
ATTAGATCTTTGTTTATGTATAGAACAATCTATAATGTATCTATATATAATATCCAATGA
AAGGCTCTCC

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL5632Contig1 760 2 2 U
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TCGATTCTTGATGATACAATTGGATATCTTCAAGAACTAGAGAAACGGGTTCAAGAACTA
GAATCATGCAGAGAATCGACCGATACAGAAACCCGTGGGACAACAACAATGAAGAGGAAG
AAACCTTATGATGCAGGCGAAAGAACATCAGCTAATTGCACAAACAATGAAATCGGCTAC
GGGAAAAGAACTCATGTTGGACAAGCCGAACCAGCAGAAACTGGTTTAACCGATAATTTA
AGGATCAGTCCGTTTGGTAACGAGGTGGTTATTGAGATGAGAGATGTTTGGAGAGAAGGA
GTTTTGCTTGAGATAATGGATGTGATTAGTAATCTCAACTTGGATTCGCATTCTGTACAA
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ATAGCAACACCAGGAATGATCAAAGAGGCACTTAAAAAGGTTGCATGGATATGCTGAAGA
CATTTTAGCTTTCCCGCTTAGGTTTTGTAATCTTTGGCATTCTTCTAATTTTAGGAATTC
TTGAAAAACAAATATTTTATTTCTTCTATTTGTTGTTAGTTAATGTAGGCGAAGAACTAA
AAAGGGAACTTGAGATTTTCTTTGAAGGTAGATTGTTTTC


BQ
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AF RR4CB37TF U 1
AF RR4CB37JQ C 3
BS 1 495 RR4CB37TF
BS 496 760 RR4CB37JQ

RD RR4CB37TF 495 0 0
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GAATCATGCAGAGAATCGACCGATACAGAAACCCGTGGGACAACAACAATGAAGAGGAAG
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TCCTCGACCGGAGAC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4CB37JQ 758 0 0
GGGCTGGGGATGAAACTGCGAACCACGCGGTTTTAGAGAAGAAACGGCGGGAGAAACTGA
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ATCATGCAGAGAATCGACCGATACAGAAACCCGTGGGACAACAACAATGAAGAGGAAGAA
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GAAAAGAACTCATGTTGGACAAGCCGAACCAGCAGAAACTGGTTTAACCGATAATTTAAG
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TTTGCTTGAGATAATGGATGTGATTAGTAATCTCAACTTGGATTCGCATTCTGTACAATC
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AGCAACACCAGGAATGATCAAAGAGGCACTTAAAAAGGTTGCATGGATATGCTGAAGACA
TTTTAGCTTTCCCGCTTAGGTTTTGTAATCTTTGGCATTCTTCTAATTTTAGGAATTCTT
GAAAAACAAATATTTTATTTCTTCTATTTGTTGTTAGTTAATGTAGGCGAAGAACTAAAA
AGGGAACTTGAGATTTTCTTTGAAGGTAGATTGTTTTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL5633Contig1 1002 2 6 U
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AGCTTCATGGCTTTCCTGCACTTTTTGCTACTCATTTGGTTGATTCTCTACACAGCAAAC
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ATGACAGAGGAGGGTCTACTGAAAGAAGAAAGGTATGGTGGGGAAAACAGGTGGAGAAAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DL25TF U 1
AF RR4DL25JQ C 262
BS 1 713 RR4DL25TF
BS 714 714 RR4DL25JQ
BS 715 752 RR4DL25TF
BS 753 753 RR4DL25JQ
BS 754 764 RR4DL25TF
BS 765 1002 RR4DL25JQ

RD RR4DL25TF 764 0 0
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ACTCATAGGTTCTCCAAGAACATTTTCAGAACAAAGGAGCTGTTTGCTTGCAGGACGGTT
CAGATGCTAGGTTCAGGGATTGTTCTAGGTCTGATTTTCCATAATCTCAAGGATGATTTG
AAAGGTGCAAGAGAAAGAGTCGGACTCTTTGCGTTCATATTGACCTTCCTGCTAACTTCA
ACGATAGAGGCACTCCCTATCTTTCTGCAAGAAAGAGAGATTCTCATGAAGGAGACCTCA
AGTGGAAGCTACAGAGTTTCTTCATACGCCGTCGCTAATGGACTTGTTTACTTGCCGTTT
CTGCTCATTCTAGCGATTCTGTTCTCCATCCCGGTGTACTGGCTGGTGGGGCTGAACCCT
AGCTTCATGGCTTTCCTGCACTTTTTGCTACTCATTTGGTTGATTCTCTACACAGCAAAC
TCAGTGGTTGTGTGCTTTAGTGCACTGGTTCCCAACTTCATCGTTGGGAACTCGGTGATT
TCCGGTGTGATGGGTTCCTTCTTTCTCTTCTCAGGCTACTTCATATCGAAGAATGAGATC
CCTGGTTACTGGATTTTCATGCACTACATCTCTCTGTTTAAGTACCCTTTTGAAGGGTTC
TTGATAAACGAGTTCTCTAAGTCGAGCAAGTGTTTGGAGTATGGTTTGGGAAA*TGTTTG
ATGACAGAGGAGGGTCTACTGAAAGAAGAAAG*TATGGTGGGGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4DL25JQ 741 0 0
C
TTCTGCAAGAAAGAGAGATTCTCATGAAGGAGACCTCAAGTGGAAGCTACAGAGTTTCTT
CATACGCCGTCGCTAATGGACTTGTTTACTTGCCGTTTCTGCTCATTCTAGCGATTCTGT
TCTCCATCCCGGTGTACTGGCTGGTGGGGCTGAACCCTAGCTTCATGGCTTTCCTGCACT
TTTTGCTACTCATTTGGTTGATTCTCTACACAGCAAACTCAGTGGTTGTGTGCTTTAGTG
CACTGGTTCCCAACTTCATCGTTGGGAACTCGGTGATTTCCGGTGTGATGGGTTCCTTCT
TTCTCTTCTCAGGCTACTTCATATCGAAGAATGAGATCCCTGGTTACTGGATTTTCATGC
ACTACATCTCTCTGTTTAAGTACCCTTTTGAAGGGTTCTTGATAAACGAGTTCTCTAAGT
CGAGCAAGTGTTTGGAGTATGGTTTGGGAAAATGTTTGATGACAGAGGAGGGTCTACTGA
AAGAAGAAAGGTATGGTGGGGAAAACAGGTGGAGAAATGTTGTGATCATGCTATGTTTTG
TCTTGCTCTACAGGTTCGTTTCCTATGTGATTCTGAGGTGTAGATGTTCACAAAGAAGTT
TCAAAACTACTCTTGTTTAGATGTGGTTACAATAATGTCTTTTTTTTCTGCAAAACGTTG
GGTTATAAGTTTGTTCAAATGTTTAATTTACTTAAAAAGTGTAAAAGAAAGTGTATTAAT
GCAACCATTTGATTCTATCG

QA 2 741 2 741
DS 



AS 1 2

CO CL5634Contig1 493 2 1 U
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CATCTTTTTTTCTTTCAGTTTCTTAAACTTTCTTTATCAATTTAAAATATGTCTAACTGT
TTCTTCTTCTGAAGAATTTCAAAGGAAACTGGATTTTTCTAATCAGTGGGATCTGATAGA
AAATTTTCAGAGGGTGGAGAGCATCTAGAAATGTAGATGGAGATGACGTTGATCTAAAAA
TGGAAGAAACATAGAAGTCTCAAGGAACATCAATTGAAGGAGGATTCTACAATGAACAAG
AAGAAACAAGGAAGAACTGAAGAAAAAAAAAAAACTGAAGAATCTCAATATTTTTAACTT
TCATGGCAAATTTTGTTTATCCATTTTAATTATTTTCTATTTTAAATTCATCTTCGTTTT
TCCTTTTAGGCATGTATTTTTTTCTTGTTAGTTAATTGTTAATAAAAATATGTTCTTCGA
TTTATATATTGCA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DM02JQ C 1
AF RR4DM02TF U 1
BS 1 493 RR4DM02TF

RD RR4DM02JQ 493 0 0
GGAAATTCCTCGGCTTTAACCTCAACAAACGCTGTTCTCTTCTCTCAAATTCCTCATCTT
CATCTTTTTTTCTTTCAGTTTCTTAAACTTTCTTTATCAATTTAAAATATGTCTAACTGT
TTCTTCTTCTGAAGAATTTCAAAGGAAACTGGATTTTTCTAATCAGTGGGATCTGATAGA
AAATTTTCAGAGGGTGGAGAGCATCTAGAAATGTAGATGGAGATGACGTTGATCTAAAAA
TGGAAGAAACATAGAAGTCTCAAGGAACATCAATTGAAGGAGGATTCTACAATGAACAAG
AAGAAACAAGGAAGAACTGAAGAAAAAAAAAAAACTGAAGAATCTCAATATTTTTAACTT
TCATGGCAAATTTTGTTTATCCATTTTAATTATTTTCTATTTTAAATTCATCTTCGTTTT
TCCTTTTAGGCATGTATTTTTTTCTTGTTAGTTAATTGTTAATAAAAATATGTTCTTCGA
TTTATATATTGCA

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR4DM02TF 493 0 0
GGAAATTCCTCGGCTTTAACCTCAACAAACGCTGTTCTCTTCTCTCAAATTCCTCATCTT
CATCTTTTTTTCTTTCAGTTTCTTAAACTTTCTTTATCAATTTAAAATATGTCTAACTGT
TTCTTCTTCTGAAGAATTTCAAAGGAAACTGGATTTTTCTAATCAGTGGGATCTGATAGA
AAATTTTCAGAGGGTGGAGAGCATCTAGAAATGTAGATGGAGATGACGTTGATCTAAAAA
TGGAAGAAACATAGAAGTCTCAAGGAACATCAATTGAAGGAGGATTCTACAATGAACAAG
AAGAAACAAGGAAGAACTGAAGAAAAAAAAAAAACTGAAGAATCTCAATATTTTTAACTT
TCATGGCAAATTTTGTTTATCCATTTTAATTATTTTCTATTTTAAATTCATCTTCGTTTT
TCCTTTTAGGCATGTATTTTTTTCTTGTTAGTTAATTGTTAATAAAAATATGTTCTTCGA
TTTATATATTGCA

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL5635Contig1 838 2 2 U
GGACAGAATATCACTCTTTACAACCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGCTACCGAAA
TTGCAAAGAAGATGGAGGAAAACGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCCACCAACTAAAGCGG
TGGAGGCTGCAAGGGCGGAAGAAGCTGAGACCAAGGTGACGGTGATACCTCCTAAAACGG
TCGAGGCTACAAACAAACCGGCGGAACAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTGG
TGGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGT
TCACCGGCAAACCACACCATGTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATC
TGCACGAAGGCGATTGGGGCAAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATG
GAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCA
CGTTCAGGGTTATTGAAGGTGATCTGATGAAAGAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTAC
GAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTC
TCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGGCCGATGAATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTG
CCTTAAGTTACGTACTTTTACTAAGACAAAATAAAGGACTATGGAGCCCTGTCCGAGTTT
GTGAGAGATAAATTATGAGTGTGCCATGATTATGTGTGTGTATGGCAAGATCGTTTTACG
TTGTGAGTTGTAACTGTGAGAAGCGACGTGTACTAGCTATGATGAGCAGTGCCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BP36TF U 1
AF RR4BP36JQ C 191
BS 1 683 RR4BP36TF
BS 684 838 RR4BP36JQ

RD RR4BP36TF 683 0 0
GGACAGAATATCACTCTTTACAACCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGCTACCGAAA
TTGCAAAGAAGATGGAGGAAAACGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCCACCAACTAAAGCGG
TGGAGGCTGCAAGGGCGGAAGAAGCTGAGACCAAGGTGACGGTGATACCTCCTAAAACGG
TCGAGGCTACAAACAAACCGGCGGAACAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTGG
TGGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGT
TCACCGGCAAACCACACCATGTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATC
TGCACGAAGGCGATTGGGGCAAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATG
GAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCA
CGTTCAGGGTTATTGAAGGTGATCTGATGAAAGAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTAC
GAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTC
TCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGGCCGATGAATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTG
CCTTAAGTTACGTACTTTTACTA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4BP36JQ 648 0 0
AAACAAACCGGCGGAACAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTGGTGGGGAAGCT
TGAGACAGACGTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAA
ACCACACCATGTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATCTGCACGAAGG
CGATTGGGGCAAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAA
GGTGGCAAAGGAGAGGATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGT
TATTGAAGGTGATCTGATGAAAGAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGAAGATTA
GCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTCTCCAAAGAGA
TCGACGAACATCTCTTGGCCGATGAATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTGCCTTAAGTTA
CGTACTTTTACTAAGACAAAATAAAGGACTATGGAGCCCTGTCCGAGTTTGTGAGAGATA
AATTATGAGTGTGCCATGATTATGTGTGTGTATGGCAAGATCGTTTTACGTTGTGAGTTG
TAACTGTGAGAAGCGACGTGTACTAGCTATGATGAGCAGTGCCGTCCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5637Contig1 799 2 12 U
GGAAACAAAGCTTCGATTCAAAACAAGAAAAATGGCGAATGCATCTGGTTTCTTCACTCA
TCCTTCCCTTTCCTCAATGCGAACCAGAACCCACCTCCCGATCACAGTTTCCGGATCTGG
GTTTCGCGTTTCCAAACGATTCTCCAAAAGGGTCCTCTGCTCTACCCTCAGCTCCCTCGA
TAACAATGCTTCTCCTTCTCCCTCCCAGTATCGCCCTCCCAGGCTAGTGCCGAGTGGATG
CAAACTGATTGGATCTGGTTCAGCTGTCCCGAGTCTTCTGGTTTCTAACGATGATCTCGC
GAAGATTGTCGATACCAATGACGAATGGATAGCTACTCGCACTGGTATCCGCAACCGTCG
AGTTGTCGTGTCAGGCAAAGATAGCTTGGTCGGGTTAGCAGTTGAAGCAGCTACCAAAGC
CCTTGAAATGACGGAGGTTGCTCCTGATGATATCGACTTAGTCCTCATGTGTACTTCCAC
TCCTGATGATCTCTTCGGTGCTGCTCCACAGATTCAGAAGGCACTTGGTTGCACTAAGAA
CCCTTTGGCGTATGATATCACAGCTGCTTGTAGTGGATTTGTTTTGGGTCTTGTCTCAGC
TGCTTGTCATATTAGAGGAGGTGGTTTTAAGAATGTTTTAGTGATTGGAGCTGATTCTTT
GTCTCGGTTCGTTGATTGGACTGATAGAGGAACTTGCATCCTCTTTGGAGATGCTGCTGG
TGCTGTTGATGTTCAGGCTTGTGACATTGAGGATGATGGGTTATACAGTTTTGATGTGCA
CAATGATGGAGACGGTCGT


BQ
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CAGTGATGGA

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DS 

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G
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GATATCGACTTAGTCCTCATGTGTACTTCCACTCCTGATGATCTCTTCGGTGCTGCTCCA
CAGATTCAGAAGGCACTTGGTTGCACTAAGAACCCTTTGGCGTGTGATATCACAGCTGCT
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GAGGATGATGGGTTATACAGTTTTGATGTGCACAATGATGGAGACGGTCGT

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DS 



AS 1 2

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AAACAGGGACATGGGTCGTCGACTCTCATTAACCAGTTCGATTCAGCGAGTCGGCTTCCT
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TCATTATCTTTCGTCTTTAGCTGAAGCTTCAGACTGTGAGCTTGATGAATCTCCAGATGA
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TCTTTCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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TGACGCCAGGGAATAAGAAATCTGAATTGGGGATTCACTTTGGTCGTGGCTTCTACGTGG
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ATTTGATTGAAGGCGAGGTTGTTGATGGCAAAGACGCAGCTGAAAAGTACCTGCTGGAAA
ATAAGGAGGTTCTTGGTACCGTCATTAATACCCTGAGGAAGCAGCTCTTCTAGATGTCCA
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GTTATAACCAATCTTTCAG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BJ49TF U 1
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DS 

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QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FJ75TF U 1
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BS 708 884 RR4FJ75JQ

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AGAAAATAAAGATCAAGCCAAATGTTGCTGTTGCTCTTCCTCCTCCAAGTCATCATCTTC
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ATGGTAGAAGATGGTGATAAGAAGAGGAAAATGTTTCAAGGAGCGTACGATAAACTGACG
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ACCAATGGCCTTCAGTGTTAATACCTGTCATTAATTTCCCCCAACTAATTTAAAATTTAA
AGCATACAAAATTAGATGGGGTATAGTAATTAAAGACTACTAAAAATACCGTCAAAATCG
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QA 1 707 1 707
DS 

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TGGGGTATAGTAATTAAAGACTACTAAAAATACCGTCAAAATCGTGAAGGGATATTCGTC
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GAAGAAATATAAAAAAATAATTCCAATAGAATAAACAGGACGGATTTAGGTAGCATAAGA
ATGAAGATATGTTATGAATCTTATGATACAATATTTAGTCGAAATAAAATTGGCCAGGTT
CAATTTGGGCATAGCTTTAACAAATATGGGTTAAAGGCTTAAAGCTATAAAACGACACGA
CACATGGGCAACGTGATCCACTAACAACATTGAACCATAGCAGATTCTTTGGGTTCTAAA
GAAAAAAAAACCATTTTTGTTGGTAGGTAAGACCAAAGGGTTCTCTTGTTGAAGGCTTAG
GCTCTTGGTCGACCAAACAAACTAACCC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

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TAATGTTTCAATATTTACTGTAGGATCACTTTCTTTCATTTGTTCCCGCAAGGAGACAAC
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BQ
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AF RR4AA26JQ C 1
AF RR4AA26TF U 1
BS 1 703 RR4AA26TF

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TAATGTTTCAATATTTACTGTAGGATCACTTTCTTTCATTTGTTCCCGCAAGGAGACAAC
GTAGTAAATTACAAAAAGTATAATTTAATATATTTCCGTTGCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4AA26TF 703 0 0
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TAATGTTTCAATATTTACTGTAGGATCACTTTCTTTCATTTGTTCCCGCAAGGAGACAAC
GTAGTAAATTACAAAAAGTATAATTTAATATATTTCCGTTGCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

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GTTGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL25TF U 1
AF RR4EL25JQ C 286
BS 1 727 RR4EL25TF
BS 728 728 RR4EL25JQ
BS 729 784 RR4EL25TF
BS 785 966 RR4EL25JQ

RD RR4EL25TF 784 0 0
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CGGAGACTCAGATCGAGCTGTAGACCTGCAATTAAAGCTGTTGTTCAATTCCACGGAAGA
AGAAGACTCAGAATGGATACTTTCAGCGCGGAGGATCTATCGACAATAGGGGGAATCGCG
ACAGTATCTCTCCTTCATTCCTTCATTCCCACGCATTGGTTACCTTTCTCCATCGTTGGA
CGCGCTCAGAAATGGACTCTTTCCCGAACCCTCTTCGTCACTGCGTTTGGAGCAGTCCTG
CATGTCATATCCACTGCCCTTCTTGGTATAACAGCCATCGCAATGGCCAACACCATCGCC
GGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTGGCTTCCCTTTTGCTTGTGTTTCTCGGCGGGAGCTAT
ATCCTGCTGTTTTTGGCTGGTAAAGGAGGACACACCCATTCTCATAACCAACCCATGGAG
AAAATGGCTGTTGCCGGGCTTGTCCTTGTTCCCGCGTTATCTCCTTGTGCTACCACCCTC
CCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAACTCAAAGCCCACGATGGTTCTCGCCACCATAGTTCTG
CTGATCAGCACCATTTTGGTGATGACATCGCTGGTAGCGCTATCGTTCTATGGTGCAAGC
CAACTGAAGTTTCACTGGGTGGAAAGATACGACAAACTACTGGTTGGTTCTGTCCTGTGT
CTGGTAG*TGTCTTAACTCTTAACCCTTCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGTGGTCA
TGAA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4EL25JQ 681 0 0
TTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTGCCCTTCTTGGTATAACAGCCATCGCAATG
GCCAACACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTGGCTTCCCTTTTGCTTGTGTTT
CTCGGCGGGAGCTATATCCTGCTGTTTTTGGCTGGTAAAGGAGGACACACCCATTCTCAT
AACCAACCCATGGAGAAAATGGCTGTTGCCGGGCTTGTCCTTGTTCCCGCGTTATCTCCT
TGTGCTACCACCCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAACTCAAAGCCCACGATGGTTCTC
GCCACCATAGTTCTGCTGATCAGCACCATTTTGGTGATGACATCGCTGGTAGCGCTATCG
TTCTATGGTGCAAGCCAACTGAAGTTTCACTGGGTGGAAAGATACGACAAACTACTGGTT
GGTTCTGTCCTGTGTCTGGTAGGTGTCTTAACTCTTAACCCTTCTCTTCCATGATCATGA
CCACCATGGTGGTCATGAAACACATCAGTTCCACAGGAAAATCATTACTCTCTAGAGGCC
ACTTCTGTTTTGCTGTGTTTTTGTCTGTTTGTTGTAGAGCGGCCTTGATGTCTTCTCACC
TTGTATGTCTATAACTAGTTGTAACGCACTCTGTTTCACGTGCAGTGTTAAATTCCTATT
AACATAATAACATTAGTTGCG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL5643Contig1 1016 2 2 U
GGAATCAAATCCACCATTGTTGACCAAAACAAATCTGTGTTCTCTGTTTTTATTTTGATA
CAAATCTATTAGCGGGCGAGACTATTCCAAACCCTAGATCTAACCCTAGCCGTCAGATTA
GATCAAATGGGGAGATCTCTTCTGAACCGTTGGAATCTTAGGAGACAGCAATGGTGGACG
TAGGCGAGTCGCATTTGTGAAAGATTATTCTCTCAACTCGATGGCCAACAATTCGAATTT
CCTCTAAGCTATTTTCTTGTGATCTCCGTGGTGATGTGTGATTTGGTCGCGCGTACGGGT
CGGCTCCAGCAACGGTACGCTGATGGCTCGCGTCTCGTAGCCGGGTGTATTCCGTTTAGG
TATCTAAATTCTGAATCTGGGAAAGTGGTTCAAGTGTTGATGATCAGCTCATCTAGTGGA
CCTGGACTTTTGTTTCCCAAGGGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGTCAGGGAAGCTGCA
GTAAGGGAAGCAGTGGAAGAAGCAGGAGTCCGTGGGATTTTAATGGACTTCTTGGGAGAT
TATGAGTTCAAAAGCAAAACACACCAAGATGAGTTTAGCCCAGAAAGTTTATGTAAAGCG
GCAATGTACGCCTTGTATGTGAAGGAAGAGCTGGAGACGTGGCCGGAACAGAAGACTAGA
ACAAGGACATGGCTGACGATCGAAGAAGCTGTAGAGAGTTGCAGTCACGCTTGGATGAAG
GATGCGTTGGTTGAAGGGTTCTGTAAATGGCATAAGGAGAATATGGGGAAAGGAGAGGAG
ATAGCAGATGGAGATTGAAGTTTTTAAGTGTTCATAAAAACTCTGAAGTTGGTTTCATTC
CCTTTCGATTTTGTTTTTACTTCTTTTTTCTTAGTTTATATGCATGGAGAAGCTTGTGAC
TGCGAAACATAGGAGTTTCAAAGTTTCTCTTCATCAATTTTAATAAGAAAAGAAAGACAG
CTCATAACAATTGTGTTGAGTATCATTCATAATGAAAAAAGTTGTTTGCTGTTGGC


BQ
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AF RR4BM36TF U 1
AF RR4BM36JQ C 418
BS 1 661 RR4BM36TF
BS 662 1016 RR4BM36JQ

RD RR4BM36TF 661 0 0
GGAATCAAATCCACCATTGTTGACCAAAACAAATCTGTGTTCTCTGTTTTTATTTTGATA
CAAATCTATTAGCGGGCGAGACTATTCCAAACCCTAGATCTAACCCTAGCCGTCAGATTA
GATCAAATGGGGAGATCTCTTCTGAACCGTTGGAATCTTAGGAGACAGCAATGGTGGACG
TAGGCGAGTCGCATTTGTGAAAGATTATTCTCTCAACTCGATGGCCAACAATTCGAATTT
CCTCTAAGCTATTTTCTTGTGATCTCCGTGGTGATGTGTGATTTGGTCGCGCGTACGGGT
CGGCTCCAGCAACGGTACGCTGATGGCTCGCGTCTCGTAGCCGGGTGTATTCCGTTTAGG
TATCTAAATTCTGAATCTGGGAAAGTGGTTCAAGTGTTGATGATCAGCTCATCTAGTGGA
CCTGGACTTTTGTTTCCCAAGGGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGTCAGGGAAGCTGCA
GTAAGGGAAGCAGTGGAAGAAGCAGGAGTCCGTGGGATTTTAATGGACTTCTTGGGAGAT
TATGAGTTCAAAAGCAAAACACACCAAGATGAGTTTAGCCCAGAAAGTTTATGTAAAGCG
GCAATGTACGCCTTGTATGTGAAGGAAGAGCTGGAGACGTGGCCGGAACAGAAGACTAGA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4BM36JQ 599 0 0
GGACCTGGACTTTTGTTTCCCAAGGGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGTCAGGGAAGCT
GCAGTAAGGGAAGCAGTGGAAGAAGCAGGAGTCCGTGGGATTTTAATGGACTTCTTGGGA
GATTATGAGTTCAAAAGCAAAACACACCAAGATGAGTTTAGCCCAGAAGGTTTATGTAAA
GCGGCAATGTACGCCTTGTATGTGAAGGAAGAGCTGGAGACGTGGCCGGAACAGAAGACT
AGAACAAGGACATGGCTGACGATCGAAGAAGCTGTAGAGAGTTGCAGTCACGCTTGGATG
AAGGATGCGTTGGTTGAAGGGTTCTGTAAATGGCATAAGGAGAATATGGGGAAAGGAGAG
GAGATAGCAGATGGAGATTGAAGTTTTTAAGTGTTCATAAAAACTCTGAAGTTGGTTTCA
TTCCCTTTCGATTTTGTTTTTACTTCTTTTTTCTTAGTTTATATGCATGGAGAAGCTTGT
GACTGCGAAACATAGGAGTTTCAAAGTTTCTCTTCATCAATTTTAATAAGAAAAGAAAGA
CAGCTCATAACAATTGTGTTGAGTATCATTCATAATGAAAAAAGTTGTTTGCTGTTGGC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL5644Contig1 757 2 2 U
GGAAAAACTAAATTGTTTCAACTTTCTCAAGGCTAATTGATTATCATAAAGAGCTACTAA
TTGATCAAAAAAATGAAGACCATTCAATTAATATGCATCGTCTTCGTCATACTCTTGTCA
TCATTACCGGCTACAATCAAGTAAGAGTTTAGCAGATACTTGCTTTGAAAGTCTTGATTA
CTGCATGCGCCTTATTACTAGAGATAAAAAGTACTGGGAAAAGGGCTGTTGTAACGTTCG
TGCAAAGCGAGATCAAGCGGCGACAAAACAATGTGCATGTATAATAGCGAAAGATTATAA
GAAATATGTTGATCTCGTCAAACTTTTCAAAGCCTGTGGATTAGGCAATGTAGGTGATTA
TCACCAACAAACTTGTAAATGATACGAGCCGAACATAGTCAACCAACCCAAGCGCCAAGG
ATCGTCAAACCAAATTGGAGATATTTATTTATAGGCAATCATAGGTTATTTCCTAATATA
TTTTGATCACTTTAATTAAGTTCATGTTTGATAAATAGAGAGTAATATATGATCCGCGCA
AGTTAGTTTTTTCAACTATAATGCATTTAAATATTATAAACAATATTTATTTTGTTATCG
ATAATTTTTTTTACATTAAAAATGGGCATTCGGCTATCATTTTATTCGTTTTGGTCGATT
CAATTCAGATTTTTACGGATTCCGTTTGGTTCAGGTTTTTGTGGGTTCGGTTTGGGTTCT
AACCCATTTAATTTAAAATAAAAAATAAAGTTCATAT


BQ
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AF RR4AT05TF U 1
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QA 1 703 1 703
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TGCAAAGCGAGATCAAGCGGCGACAAAACAATGTGCATGTATAATAGCGAAAGATTATAA
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ATCGTCAAACCAAATTGGAGATATTTATTTATAGGCAATCATAGGTTATTTCCTAATATA
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CAATTCAGATTTTTACGGATTCCGTTTGGTTCAGGTTTTTGTGGGTTCGGTTTGGGTTCT
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QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AI36TF U 1
AF RR4AI36JQ C 303
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BS 797 952 RR4AI36JQ

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QA 1 796 1 796
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AAGTGGGACAAGGTTAAACCGATCACTGTCTTGGCTTGCTTTTGAAGGCGGTGATGATGA
TCACAAGGAACAAGAGATGGTAACAAAAGTATGCATGAAATGCCACATGCTGGTTATGCT
ATGCACATCAACTCCTGTTTGTCCTAACTGCAAATTCATGCACCCACATGATCACAGCTC
TACAAAACTGTTTAAACCATCAAATTTGCTGAGGCTTCTGTGCTAGGCTCTTCAGTGGGT
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AAACATTTTTACTATCATGCTTCGTATGAAGGATATTAAATCTCTTTGTT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL13JQ C 1
AF RR4GL13TF U 1
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CTTTTATAGAGACT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4GL13TF 494 0 0
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TGTATATAGTCATTTATGTAGATCAAAACTTACCTGTTTCCCCACTTAGCATGAAGTTCC
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TTCAGCCACCGGAGCCGGCAACTTTTCCCGATTTGGCGAGAGTGTTCCAAACGCCATCCC
CGTGGTTGGCGATATAGTTGATAAGAATAAGATCTTCTTCCATCGTCCATGGTCCTTTTC
TCACCTCTGTTTCTCCTGATGATCCCGAACCTCCACTACATATTCCTCCTCTTTTGTCCA
TTTTATTCTTATTTATTTATAACTCTTATAGCTAGAGGGAGAGGAATTTAAAAGAGAGAG
ACAAGTAAGAGAGAAGGTTGTGATGAGTTGATATTGAAGGTTGTGGAAGGTGAGCAACTG
CTTTTATAGAGACT

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

CO CL5647Contig1 764 2 4 U
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AAAGAAACATATCCTTTGTAGAAAGGAAACATAGAAAAATGTTTGGGTTTTGGCATGTCG
TGGGGTACTTAGGTACTGTAAGAACATCGGGCCACTGAAGCGATAAAATCAAACCCCAAT
CGCTCTCTAGTTTCACCCTTCAAACTTCAGTGAAAGAAGAAAGAAAGTAAAGTTGAGATC
ATCCAATAATGAGCATGGAGATGGCAAAAGAAAAGGCTGATGAGAATCAAACTTGGAGAG
ACCTTCCCTCGGAGCTTCTCATCTCAGTAATGACTAATCTTGAAATCGAAGACAACGTAC
GAGCTTCTGCCGTATGCAAACCTTGGTACGAGGCAGCAGTGTCCGTTAGAATCGTAGACC
AGCCTCCTTGGCTCATGTACTTCCCAAAATCAAGAAACTCTTACGAGCTTTACAATCCAT
CAAACGGCAAGAGACATGCAAAGGAGCTGCAGCCTGAATCACTAGCTGGCTCTAAAGTCC
GTTACTCTAAAGACGGATGGCTGCTCATGTGCAAAAGCTTTTCAACAGATTTCGTCTTGT
TCAATCCATTTACTATGGATCTTGTGGTCTTGCCTGATCTTGAGCTGTGGAGTGGCTACC
AGTTAGTGGGATTCTCTTGCGCTCCTACGTCAAGCGATTGTGTGGTGTTAACAATCAAAG
ACTATGATCCTGGCCATGTTACAATCCGTACATGGAGTCCGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EL12TF U 1
AF RR4FE31TF U 70
BS 1 225 RR4EL12TF
BS 226 226 RR4FE31TF
BS 227 578 RR4EL12TF
BS 579 764 RR4FE31TF

RD RR4EL12TF 578 0 0
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ATCCAATAATGAGCATGGAGATGGCAAAAGAAAAGGCTGATGAGAATCAAACTTGGAGAG
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GAGCTTCTGCCGTATGCAAACCTTGGTACGAGGCAGCAGTGTCCGTTAGAATCGTAGACC
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GTTACTCTAAAGACGGATGGCTGCTCATGTGCAAAAGC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4FE31TF 695 0 0
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CTGGCCATGTTACAATCCGTACATGGAGTCCGGTG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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TGGTTTGGTCGAATGAGAATGAAGTGGAAGAGTTTTTAGATTCCTAGGATGAAGATGAAG
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TGGTGGGTTTGTTCCTATTTGTCGCTTTTGTACAAAGAATGAAGAAGGAATCTCTGTTCG
TTTT


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4FT81TF U 1
AF RR4FT81JQ C 1
BS 1 617 RR4FT81TF
BS 618 664 RR4FT81JQ

RD RR4FT81TF 617 0 0
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GTGGGTCTAGTTCTTCTGGAAGCTCTAGTTCTAGTGGCGGTTCTTCCTCTAGTGGTAATG
ATCTCTACTTTTTCATATGTTCAAATGTGATCTTTTTCTTAATTAAAAAAATGTTTTAAA
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TGGTTTGGTCGAATGAGAATGAAGTGGAAGAGTTTTTAGATTCCTAGGATGAAGATGAAG
TGGAATAGTTTTCTTTTTTTTTTCTATTTCAAGTTAAGGTTCTTTAGTTCTTTTAGATTA
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TGGTGGGTTTGTTCCTA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4FT81JQ 664 0 0
GGTCGACTCCGACAAGAAATATGCCTCCGGTGATGGAAATGGGAAGTGCTGAGAAGAGAG
TGAGGAAAGGAGGAGATGGAGGAGAAGAGGATGTAGACATTGGGGAAGATATACCAATTG
AGGATTATCCATCAGTGGAGATTGAAAGGGATGGTACAGCCGCTGCTGCTGCTGCAAGTG
GTGGGTCTAGTTCTTCTGGAAGCTCTAGTTCTAGTGGCGGTTCTTCCTCTAGTGGTAATG
ATCTCTACTTTTTCATATGTTCAAATGTGATCTTTTTCTTAATTAAAAAAATGTTTTAAA
CTTTCATCTTGTGTGCCTCTGTTAATGTAGATTCAGAGTCAGGGAGTTCATCAGGAAGTG
ATTCAGATGCTGATAGTGTGCAATCGCCATTTGTGGAAGCAAAAGAAGGACAGTGATAAG
TGGTTTGGTCGAATGAGAATGAAGTGGAAGAGTTTTTAGATTCCTAGGATGAAGATGAAG
TGGAATAGTTTTCTTTTTTTTTTCTATTTCAAGTTAAGGTTCTTTAGTTCTTTTAGATTA
TTGGTGACACGATGGACAGAGGTTGAGAGTGACCTAGCAAAGATGAAGAGAATCACTTGG
TGGTGGGTTTGTTCCTATTTGTCGCTTTTGTACAAAGAATGAAGAAGGAATCTCTGTTCG
TTTT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5649Contig1 761 2 2 U
GGATCTCCCGATCATCATCGGAACAAGATGCAGAAGCTGAACGAGTTCTTGTCTGGCGAA
CAGACAAACGATAGCTTCCTTGAAGATGGATCGGAGGGTCTCTGTTCTCTCTCCACAACT
CAGAGAATGTACGGATTCGCCGCGTCTTTGGCCGCTGGTTTGCTTCTCATGTTTCTGTCC
ATGATCGTGTTTGCAATCCCCATCAAGTTTGCACTGCTCTTCACATTCGGAAATGTTCTC
GCTATTGGAAGCACAGCCTTCCTCATGGGACCTGAGCAACAGATAAACATGATGTTGGAC
CCTGTTCGTTTCTACGCTACCTCTATCTATGGTGGATGCGTCCTCCTTGCTCTCTTTTGC
GCTCTCTTGATCCACAGCAAAATTTTGACAGTGATTGCGATTCTATGCGAGACTTGTGCA
CTTATTTGGTACAGCCTCAGTTATATCCCGTTTGCACGAAGAATGGTCTCTGAAATCATG
ATCCGTCTCTGCGACACCGAGCTATAAGTCAATCTGAATGGTTTTAGATATGATTCTTCT
TCTTCAACACTTCTTGATTTTTTTTTTTGTTTGTTTGACCTGATCCGGTGGTTTGCGCAT
GAATCACAAGCAATGCAAATTGAGTTTCTTTTGTTGCTATCTTGAAGCTCTTGTGTGTGT
ATGTGTGTGTGTGTGTATTTTTTGTTGCTTCAAGCCCTTTCTCAGCTTCTGACTTAACAG
TCGTTTGATATTGGGAAATGTAAAAACTTGAGTTATGAGCG


BQ
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AF RR4F892JQ C 1
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TCGTTTGATATT

QA 1 732 1 732
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BQ
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AF RR4EW90JQ C 1
AF RR4EW90TF U 1
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RD RR4EW90TF 498 0 0
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QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FP73TF U 1
AF RR4FP73JQ C 22
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RD RR4FP73TF 768 0 0
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QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4FP73JQ 778 0 0
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TGGCTGGAGCTCGGCTGAGGATGAAGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGGTGAAGGTTT
GGAAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCAGTGAACACAGAAGAGTGCATTACAATGAGTTCCA
CAAGGTGAAGGAACTTAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGATGAAGAAGAGGACGA
GGATGATGATGGCTCGAAAGCAGAGACAACAACCTCACCACCACACAGTAAAGACGTTAA
CAAAGAGGTAGACGCAGCTGGAAAGTCATCTTCATCCTCCAATTGATGATATGATATGAT
ACCACTGTGTTCAATCAAAATGTGTACTCTTGTCCAGGTCTTATAGATCTCTCTCTCTAT
CTTTAAACTTTTTTGAAAGGAAGAGGAAACTATGTTATGTTGTTACAGCATTTTAATGCA
ATTGCTTACAATCACTATTCTATTCAGCAGTAACGAACGAAAAAAAAGAGATTTATCT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5652Contig1 759 2 2 U
GGACTTCACCGGATCCAAGCTATTCAGGTATGGAAGTGGTTGCCCTCAGGTCAATGGAGA
CGCAGAGACAACAGTCATGGACTGAGACGCTTCTCTTCCTCGTTGGAAGGAATCTGGCTT
GTCTGCTCCTCGCGGCAGAATCTTTGCTGATAGGGTTGATTACTGAAGATCAGAGGCTTT
CTGTGAAGGAGGGCTACAAAAAAGGACGCCGAGATGAGGAAAACAAAGATGCCAGTGACT
CTGATGATGATGACGATGATGATGAAGACAACGTTGATGAAGACGATGATGATGATGATG
ATGCTAATGATGAAGATTTTTCAGGGGATGAAGGAGAGGAAGGTGATCCGGAGGATGACC
CCGTGACCAATGGTGGAGGAGGTAAGGATGATAATGACGATGATGATAACGACGGTGATG
AGAGTGAAGATGACGATGAAGATGATGATGATGGAGATGAGGACGACGAAGATGAGGATG
AGGATGATGAGGATGAAGATGTCCGCCAGCCGCCTGCTAAGAAGAGAAAATGAAACATGA
GAAAGAGGAGAGTGTTAAAGACTTGAAGAGGACCATACGTGTGTGTTTAAGTAGTGTAGG
GAAACTTATGCTTCATGTTGTGTACTATCTGTTGTCGGGTGTGACTTTTCAACTTGGATT
TAGTTATCTTCTCTGTGTAGACTGTTGGTCTCTTCTTTTTGTTTTTGCGTCTACCTATGA
CTATGATTCGCCGTGCTTAACATTTTCTTTGTTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EU63TF U 1
AF RR4EU63JQ C 16
BS 1 506 RR4EU63TF
BS 507 759 RR4EU63JQ

RD RR4EU63TF 506 0 0
GGACTTCACCGGATCCAAGCTATTCAGGTATGGAAGTGGTTGCCCTCAGGTCAATGGAGA
CGCAGAGACAACAGTCATGGACTGAGACGCTTCTCTTCCTCGTTGGAAGGAATCTGGCTT
GTCTGCTCCTCGCGGCAGAATCTTTGCTGATAGGGTTGATTACTGAAGATCAGAGGCTTT
CTGTGAAGGAGGGCTACAAAAAAGGACGCCGAGATGAGGAAAACAAAGATGCCAGTGACT
CTGATGATGATGACGATGATGATGAAGACAACGTTGATGAAGACGATGATGATGATGATG
ATGCTAATGATGAAGATTTTTCAGGGGATGAAGGAGAGGAAGGTGATCCGGAGGATGACC
CCGTGACCAATGGTGGAGGAGGTAAGGATGATAATGACGATGATGATAACGACGGTGATG
AGAGTGAAGATGACGATGAAGATGATGATGATGGAGATGAGGACGACGAAGATGAGGATG
AGGATGATGAGGATGAAGATGTCCGC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4EU63JQ 744 0 0
CAAGCTATTCAGGTATGGAAGTGGTTGCCCTCAGGTCAATGGAGACGCAGAGACAACAGT
CATGGACTGAGACGCTTCTCTTCCTCGTTGGAAGGAATCTGGCTTGTCTGCTCCTCGCGG
CAGAATCTTTGCTGATAGGGTTGATTACTGAAGATCAGAGGCTTTCTGTGAAGGAGGGCT
ACAAAAAAGGACGCCGAGATGAGGAAAACAAAGATGCCAGTGACTCTGATGATGATGACG
ATGATGATGAAGACAACGTTGATGAAGACGATGATGATGATGATGATGCTAATGATGAAG
ATTTTTCAGGGGATGAAGGAGAGGAAGGTGATCCGGAGGATGACCCCGTGACCAATGGTG
GAGGAGGTAAGGATGATAATGACGATGATGATAACGACGGTGATGAGAGTGAAGATGACG
ATGAAGATGATGATGATGGAGATGAGGACGACGAAGATGAGGATGAGGATGATGAGGATG
AAGATGTCCGCCAGCCGCCTGCTAAGAAGAGAAAATGAAACATGAGAAAGAGGAGAGTGT
TAAAGACTTGAAGAGGACCATACGTGTGTGTTTAAGTAGTGTAGGGAAACTTATGCTTCA
TGTTGTGTACTATCTGTTGTCGGGTGTGACTTTTCAACTTGGATTTAGTTATCTTCTCTG
TGTAGACTGTTGGTCTCTTCTTTTTGTTTTTGCGTCTACCTATGACTATGATTCGCCGTG
CTTAACATTTTCTTTGTTGTTTTT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL5653Contig1 492 2 1 U
GGCCCACACTTTGTCTTCAAAATCTCAAGTAGTTTAAGAAAGAACAAAGACACCAATATG
AGCTTTCATGCAAAAAGGTTAGTAATTTTCATTGTTCTTATTTTGGCTATTACCTCCGCT
GATTTTTCAGACGCTACCCTTCGTCATATCATGAACCTCAGATTGAATAAGGAGAGGGAG
CTTGTGGAGTTTCACCTTGACTACGCAAGAACTGGAGCCAATCAAGATCACGAACCAGGG
AGAGGAAAACCTTAATCCAACTTAATTATTCATAACTAAAATAATGAGTTTCGTTAACTC
TGCTACTCTCACAAATAAGCGTATTTACGTGTAAAGTATCTATATATACATAATACTGTA
TGATGTAATATAATAGCCTAATAGGCCAAGCTTTTGGCAAGGTTAAAGTTGCATGTAAGA
AGACATGTGTATCAGTGTATGCATCCATGCATACAAATCAAAGTTTTACTATGTGATATT
ATTTTAATTGCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GJ68JQ C 1
AF RR4GJ68TF U 1
BS 1 492 RR4GJ68TF

RD RR4GJ68JQ 492 0 0
GGCCCACACTTTGTCTTCAAAATCTCAAGTAGTTTAAGAAAGAACAAAGACACCAATATG
AGCTTTCATGCAAAAAGGTTAGTAATTTTCATTGTTCTTATTTTGGCTATTACCTCCGCT
GATTTTTCAGACGCTACCCTTCGTCATATCATGAACCTCAGATTGAATAAGGAGAGGGAG
CTTGTGGAGTTTCACCTTGACTACGCAAGAACTGGAGCCAATCAAGATCACGAACCAGGG
AGAGGAAAACCTTAATCCAACTTAATTATTCATAACTAAAATAATGAGTTTCGTTAACTC
TGCTACTCTCACAAATAAGCGTATTTACGTGTAAAGTATCTATATATACATAATACTGTA
TGATGTAATATAATAGCCTAATAGGCCAAGCTTTTGGCAAGGTTAAAGTTGCATGTAAGA
AGACATGTGTATCAGTGTATGCATCCATGCATACAAATCAAAGTTTTACTATGTGATATT
ATTTTAATTGCG

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4GJ68TF 492 0 0
GGCCCACACTTTGTCTTCAAAATCTCAAGTAGTTTAAGAAAGAACAAAGACACCAATATG
AGCTTTCATGCAAAAAGGTTAGTAATTTTCATTGTTCTTATTTTGGCTATTACCTCCGCT
GATTTTTCAGACGCTACCCTTCGTCATATCATGAACCTCAGATTGAATAAGGAGAGGGAG
CTTGTGGAGTTTCACCTTGACTACGCAAGAACTGGAGCCAATCAAGATCACGAACCAGGG
AGAGGAAAACCTTAATCCAACTTAATTATTCATAACTAAAATAATGAGTTTCGTTAACTC
TGCTACTCTCACAAATAAGCGTATTTACGTGTAAAGTATCTATATATACATAATACTGTA
TGATGTAATATAATAGCCTAATAGGCCAAGCTTTTGGCAAGGTTAAAGTTGCATGTAAGA
AGACATGTGTATCAGTGTATGCATCCATGCATACAAATCAAAGTTTTACTATGTGATATT
ATTTTAATTGCG

QA 1 492 1 492
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5655Contig1 909 2 2 U
AGATCGCTCGCTCATCAGAATTTCCATCTTCCTCCGATATCGAGAGAGAAACCACACAAA
AAAAAAAAATGAGACACAACTGCTGCCATCTCTCCTTCGCTTCCGTCCTGAAGATCCTCA
ATTTCCTCCAAGCCCTCCTTCTCAGCCTCCCTCGGCTTCTTATCCCTTCTCCGAGATTCG
GGTTTCCACCTCCGTTCCCTAGATCTTCCTGCTCCCTGGTTTATCTACTCTTTCATGGCG
ATTGGGATCTTGGTCTGTATTGTCACTGTCATCGGTTTCATTGCAGCTGAAGCTATCAAT
GGCTGCTGCTTGTGTTTCTATTCAATCCTCAAAACTCTTGTCATCATACTTGAAGCAGCT
CTCGTTGGATTCATTGCCATTGACCGTCACTGGGAGAAGGATCTTCCTTATGATCCAACT
GGAGAACTCACTAGCCTTCGAGCTTTCATTGAAGCAAACATCGATATTTGCAAATGGGTT
GGGGTTGGCGTGGTAGCTATCCAGCTACTGTCTTTGCTACTGGCTATGGTTCTAAGAGCT
ATGGTTTCTCCTAGGCAATCAGAGCTTGACGACGAAGATGATTATGAGAATCCGATTAAC
AGAGCGCGGGAGAATCTTCTTGCTCCACAGACTAACCAGACATCTTCTGGATCAAGCAAT
ATTGACAACTGGAGGTCCAGAATCAGAGAGAAGTACGGATTGAACAACGGCCAGAGCCAG
AGTCCCTCAGTCTAACTCAAAAGATTTGAGTTCGTGTGTGTGTGTTTGGTATCACTACTT
CCGTTTTGTTCCTCTCTTGCTACCTTTGTAACTTTCAGAGTGTGCATAAGTATTACACAA
CTTTTTAGATTGGAACATTGGTTTCTCTCTGGTGTGTTTGCACAAAAAGCGTAACGAGAT
TTGTGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU28TF U 1
AF RR4CU28JQ C 181
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BS 672 909 RR4CU28JQ

RD RR4CU28TF 671 0 0
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AAAAAAAAATGAGACACAACTGCTGCCATCTCTCCTTCGCTTCCGTCCTGAAGATCCTCA
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DS 

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ATTGGGATCTTGGTCTGTATTGTCACTGTCATCGGTTTCATTGCAGCTGAAGCTATCAAT
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ATGGTTTCTCCTAGGCAATCAGAGCTTGACGACGAAGATGATTATGAGAATCCGATTAAC
AGAGCGCGGGAGAATCTTCTTGCTCCACAGACTAACCAGACATCTTCTGGATCAAGCAAT
ATTGACAACTGGAGGTCCAGAATCAGAGAGAAGTACGGATTGAACAACGGCCAGAGCCAG
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CCGTTTTGTTCCTCTCTTGCTACCTTTGTAACTTTCAGAGTGTGCATAAGTATTACACAA
CTTTTTAGATTGGAACATTGGTTTCTCTCTGGTGTGTTTGCACAAAAAGCGTAACGAGAT
TTGTGTTTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GR30JQ U 1
AF RR4GQ05JQ U 1
BS 1 755 RR4GQ05JQ

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QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4GQ05JQ 755 0 0
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GATTTTACAACGAGAACCTTTAAGCTTTCGTCCACCTGAAGCACGTCGCTAACAGATCCA
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CTAAGGTAATGCTTCTCCCAGGCTGTTTTTTCACTCAGTATCAAGTCGTTTTTGTCTTCA
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QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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AATTCCATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DM23JQ C 1
AF RR4DM23TF U 1
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DS 

RD RR4DM23TF 490 0 0
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ACTTTTTCATTTAGATCGATTCTTGACCATCATCATCTCATATGTTTGTATCATCATTCA
CGTGTGCGTACGAGATCCGAAAGGGGAATCAAGCGTCTCGGTCCGATCCTTCGCTCCTTC
AAAGCGATCTCACTCAAAAATCCATAAAATCAAGTGTGTCTTTGTTACCTATTTCTTCTC
CTTATGTGTGTTTTCTTTTGAATTCCTTTTGTTTTTTTTTTTATGTTAAGACTACCTTTG
TTCTTCTATCTGCTCTCTTCTAGATTTCTCTCTTTTCCGATTGGTGTTTTCGTTTGGCTT
ATTTAAATTTTATAAATCTATGTGTATCACTATGTCCTTCAAATTCTACTAATGAAATTA
AATTCCATAC

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL5658Contig1 492 2 1 U
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GGACGGGGCAGTTGAGTCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAAGACTACCGATCAAAC
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AAGTTGGTATCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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CGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGATATGATCAGTTGCTCAACCTTGTTCT
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AAGTTGGTATC
G

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DS 



AS 1 2

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TTATGCCCACGCTGAAACCCAAAACAATTTCGGCTTCTTCATGCTGAGGTGACGTGTGGC
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GTGGTGGAAAACAGAGGAGAGAACAGGGATTACACTCATTTGCTTAGTGAAATGAGTTAT
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TATCAATGTTGCTTTTGATAGAAAGTCGATTATAAATCCCAGCCTGAGGATTCCAAGAGA
GGCTTGAAAGAGAACAGCAAAGAAGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AP30TF C 1
AF RR4AP30JQ U 2
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BS 2 686 RR4AP30JQ

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DS 

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ATCAATGTTGCTTTTGATAGAAAGTCGATTATAAATCCCAGCCTGAGGATTCCAAGAGAG
GCTTGAAAGAGAACAGCAAAGAAGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

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TCATGTACACATTTATATGATCTCTTCTCCCTTCCTCAATGTTTGTCTTGGGCTTTGCTA
TAATAATGACTTGTATATGCGTGTTTTTTTTTACAGACTCATCCTTCTCAGG


BQ
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AF RR4GC77TF U 1
AF RR4GU69TF U 1
BS 1 712 RR4GC77TF

RD RR4GC77TF 712 0 0
GGAGCGAGCGAGCGAGCGAACTTCATCATCTCCCTCGATGCTTTCTCTGCTTCGATGGTA
ACGGTGTCGTTTCCATCTGCTTCGCTCTCTTTCGTAGAGAGCGGGACGACGTGTAAATCG
CCTCAAGTATCTCGGGTTCTGTTCTCTGGTCCTGATGATGAGCTTCACGGAGAGTCGTCT
CAACCCAAGAAGATACTCAGAGATGTTCATATATCAGAGAGGTTGATGGAGGATTTCACT
GAGCTTGCGAGAGAGAACACTGAGAAAGACCTCGAGACTTGTGGAACTCTCGCTGCCTTC
CTCGTAACATTACGTCTTAGTGACTCTCAATCTAAAGTTCCAAGTGATGATATTTTTTTA
ATAAAGTTCATGATTAATGGTTTAGGAAAGCGGAGTTTTTTATGTGACCACTCTGATAAT
ACCTAAGCAAGAATCAACTGCTAACTCTGTGAGTGTATCTTAGATTAGAGACTTTCTTGA
TCATTTTTTGTGGTGGCTTAAGTACTAATAAATAATGGGGAGGGGGCAGTGTCAAGCAAT
GAATGAAGTGGATGTGTTTTCCATACAAAACGAAAGAGAGCTTTATCCCGTTGGATGGAT
TCATGTACACATTTATATGATCTCTTCTCCCTTCCTCAATGTTTGTCTTGGGCTTTGCTA
TAATAATGACTTGTATATGCGTGTTTTTTTTTACAGACTCATCCTTCTCAGG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4GU69TF 703 0 0
GGAGCGAGCGAGCGAGCGAACTTCATCATCTCCCTCGATGCTTTCTCTGCTTCGATGGTA
ACGGTGTCGTTTCCATCTGCTTCGCTCTCTTTCGTAGAGAGCGGGACGACGTGTAAATCG
CCTCAAGTATCTCGGGTTCTGTTCTCTGGTCCTGATGATGAGCTTCACGGAGAGTCGTCT
CAACCCAAGAAGATACTCAGAGATGTTCATATATCAGAGAGGTTGATGGAGGATTTCACT
GAGCTTGCGAGAGAGAACACTGAGAAAGACCTCGAGACTTGTGGAACTCTCGCTGCCTTC
CTCGTAACATTACGTCTTAGTGACTCTCAATCTAAAGTTCCAAGTGATGATATTTTTTTA
ATAAAGTTCATGATTAATGGTTTAGGAAAGCGGAGTTTTTTATGTGACCACTCTGATAAT
ACCTAAGCAAGAATCAACTGCTAACTCTGTGAGTGTATCTTAGATTAGAGACTTTCTTGA
TCATTTTTTGTGGTGGCTTAAGTACTAATAAATAATGGGGAGGGGGCAGTGTCAAGCAAT
GAATGAAGTGGATGTGTTTTCCATACAAAACGAAAGAGAGCTTTATCCCGTTGGATGGAT
TCATGTACACATTTATATGATCTCTTCTCCCTTCCTCAATGTTTGTCTTGGGCTTTGCTA
TAATAATGACTTGTATATGCGTGTTTTTTTTTACAGACTCATC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL5661Contig1 678 2 3 U
TTTTTGTTTTCTCAACGTTACCGTTTTCCTGAACATCATCAGCCTGCTGCTTAACAGGCG
TTTCTTCCACTGCATTCTCTTCCTTCTTCCTCCGTTTTGATCCCTCATCATCATCCTCCT
CCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTCCTTTTCTTGGAGGATTTCT
CCTTATCCTCATCTTCAACCAAAAACTCAAACTTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTT
TCTCTTTCAGTCCGTCTTCAATCTCAGCATCAGTCTCTTTGACCTTCTCCTCCTCCTCCT
CCTTAGTTACCTCCAGTTCTGGTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTATCTTTCTTCCCGT
CCTTTTGGTGATCAACAAATGCATTCTCATCTACACTTGCTGCCTTCTTCTTCTTCCCAT
CCTCATTATCATCACCAAATTCTTCAACATGGCTCTTGTTAAAAAAATCGCAAAAAACTT
CCTCTAAATCCGGTAAGCTACTGTTCAACTCCTTCTTCTCGATTTCAGCTTCGGAGAGAA
GCTTCTTGAAGCATTTAGAAAACCCACATCGCTCCAAGTACTGAGCGACCGAACGGAGAA
CAATAACTTTCTGCTCTGCTTTCAAGCTCGAGGCTTTGCTGCTCTCTTTCCCCATAACTC
GTCTAAAGATCAACACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK70JQ U 11
AF RR4DK70TF C 1
BS 1 10 RR4DK70TF
BS 11 535 RR4DK70JQ
BS 536 678 RR4DK70TF

RD RR4DK70JQ 525 0 0
CTCAACGTTACCGTTTTCCTGAACATCATCAGCCTGCTGCTTAACAGGCGTTTCTTCCAC
TGCATTCTCTTCCTTCTTCCTCCGTTTTGATCCCTCATCATCATCCTCCTCCTCGGTCTC
TTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTCCTTTTCTTGGAGGATTTCTCCTTATCCTC
ATCTTCAACCAAAAACTCAAACTTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCAG
TCCGTCTTCAATCTCAGCATCAGTCTCTTTGACCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTTAGTTAC
CTCCAGTTCTGGTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTATCTTTCTTCCCGTCCTTTTGGTG
ATCAACAAATGCATTCTCATCTACACTTGCTGCCTTCTTCTTCTTCCCATCCTCATTATC
ATCACCAAATTCTTCAACATGGCTCTTGTTAAAAAAATCGCAAAAAACTTCCTCTAAATC
CGGTAAGCTACTGTTCAACTCCTTCTTCTCGATTTCAGCTTCGGA

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4DK70TF 678 0 0
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TTTCTTCCACTGCATTCTCTTCCTTCTTCCTCCGTTTTGATCCCTCATCATCATCCTCCT
CCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTCCTTTTCTTGGAGGATTTCT
CCTTATCCTCATCTTCAACCAAAGACTCAGACTTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTT
TCTCTTTCAGTCCGTCTTCAATCTCAGCATCAGTCTCTTTGACCTTCTCCTCCTCCTCCT
CCTTAGTTACCTCCAGTTCTGGTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTATCTTTCTTCTCGT
CCTTTTGGTGATCAACAGATGCATTCTCATCTACACTTGCTGCCTTCTTCTTCTTCCCAT
CCTCATTATCATCACCAGATTCTTCAACATGGCTCTTGTTAAAAAAATCGCAGAAAACTT
CCTCTAAATCCGGTAAGCTACTGTTCAACTCCTTCTTCTCGATTTCAGCTTCGGAGAGAA
GCTTCTTGAAGCATTTAGAAAACCCACATCGCTCCAAGTACTGAGCGACCGAACGGAGAA
CAATAACTTTCTGCTCTGCTTTCAAGCTCGAGGCTTTGCTGCTCTCTTTCCCCATAACTC
GTCTAAAGATCAACACTT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5662Contig1 891 2 2 U
TTTTTGACGAAAGAAGCTTCTTCGCTCTTCTCCTCTCGTCCTTTTAGAACTTTTCGTCGT
CTTTCGATCGTCAACGCGTTTCTTCTCATCTGCGATTTCCTCGAAGCTTCAGATCAACGA
TCATGGCCACCTCTGGAAACAAGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGAGATGTTG
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AATCAACCATAGGTGCAGCTTTTTTCTCTCAGACATTGGCTGTGAATGACGCTACTGTCA
AGTTTGAAATATGGGATACAGCTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGGCTCCAATGTACT
ACAGGGGTGCAGCTGCCGCCATTATTGTCTTTGACATTACTAATCAAGCCTCTTTTGAGA
GGGCGAAGAAATGGGTTCAGGAACTGCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTC
TTGCTGGAAACAAAGCTGATTTATTAGATGCAAGGAAAGTGTCTCCAGAGGAGGCAGAGA
CATATGCACAAGAGAACAGCCTTTTCTTCATGGAAACCTCAGCGAAGACTGCAACTAATG
ACAAAGACATCTTTTACGAAATCGCAAAAAGGCTACCACGTGTGCAGCCAGCAGAGAACC
CAACAGGAATGGTTATCCCAAACGGTCCCGGAGCTACGGCAGCAAGCGCATCATGTTGTG
CTTAGTCAGCAGTAGATCTCTCTCTTCTTCTTATCTGGACATTGTCGCTTTGAATTGCAT
TGACAAGAAAAGTGTATAAAGCCAATGATATTTTCCAACTATGGTGAATCTTAAAGATAT
TTGTATTTGAACGACGGTTTGGATCTCATTTGTAATTAGATTTCATAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CC21TF U 1
AF RR4CC21JQ C 47
BS 1 451 RR4CC21TF
BS 452 891 RR4CC21JQ

RD RR4CC21TF 451 0 0
TTTTTGACGAAAGAAGCTTCTTCGCTCTTCTCCTCTCGTCCTTTTAGAACTTTTCGTCGT
CTTTCGATCGTCAACGCGTTTCTTCTCATCTGCGATTTCCTCGAAGCTTCAGATCAACGA
TCATGGCCACCTCTGGAAACAAGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGAGATGTTG
GTGCTGGAAAGTCAAGTCTTGTGCTTCGGTTTGTTAAAGATCAGTTTGTTGAGTTCCAGG
AATCAACCATAGGTGCAGCTTTTTTCTCTCAGACATTGGCTGTGAATGACGCTACTGTCA
AGTTTGAAATATGGGATACAGCTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGGCTCCAATGTACT
ACAGGGGTGCAGCTGCCGCCATTATTGTCTTTGACATTACTAATCAAGCCTCTTTTGAGA
GGGCGAAGAAATGGGTTCAGGAACTGCAGGC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR4CC21JQ 845 0 0
AGAAC
TTTCGTCGTCTTTCGATCGTCAACGCGTT*CTTCTCATCTGCGATTTCCTCGAAGCTTCA
GATCAACGATCATGGCCACCTCTGGAAACAAGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTG
GAGATGTTGGTGCTGGAAAGTCAAGTCTTGTGCTTCGGTTTGTTAAAGATCAGTTTGTTG
AGTTCCAGGAATCAACCATAGGTGCAGCTTTTTTCTCTCAGACATTGGCTGTGAATGACG
CTACTGTCAAGTTTGAAATATGGGATACAGCTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGGCTC
CAATGTACTACAGGGGTGCAGCTGCCGCCATTATTGTCTTTGACATTACTAATCAAGCCT
CTTTTGAGAGGGCGAAGAAATGGGTTCAGGAACTGCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGG
TGATGGCTCTTGCTGGAAACAAAGCTGATTTATTAGATGCAAGGAAAGTGTCTCCAGAGG
AGGCAGAGACATATGCACAAGAGAACAGCCTTTTCTTCATGGAAACCTCAGCGAAGACTG
CAACTAATGACAAAGACATCTTTTACGAAATCGCAAAAAGGCTACCACGTGTGCAGCCAG
CAGAGAACCCAACAGGAATGGTTATCCCAAACGGTCCCGGAGCTACGGCAGCAAGCGCAT
CATGTTGTGCTTAGTCAGCAGTAGATCTCTCTCTTCTTCTTATCTGGACATTGTCGCTTT
GAATTGCATTGACAAGAAAAGTGTATAAAGCCAATGATATTTTCCAACTATGGTGAATCT
TAAAGATATTTGTATTTGAACGACGGTTTGGATCTCATTTGTAATTAGATTTCATAACTT

QA 6 845 6 845
DS 



AS 1 2

CO CL5663Contig1 501 2 1 U
GGGCTCTCTACGTGGACGGCGGCTAGGTTCAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAA
TCCACGAGATCAAGGACTTTCTTCTGACAGCTAGAAGAAAGGATGCTCGGTCTGTGAAGA
TCAAAAGAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTACACGC
TCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGA
GTGTGCAAGACCTTTGAAGATGATGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGC
TATTGTTCAAACTTTTTCGAGTATGACTATGTTTTCTAAATTTTTCTCTCTCTATTGATT
CTGTTTTTTTTCTATTACGTATCGATTTAATGCCTCTACGGTTAATTACAATCCTTAGAT
GTTAATTACAATCTCAACATCTCTCTGAACTTTACCATCGTGTTCATTTTCTTTGAGTAA
TAGTCAGAGAATAATATCATT


BQ
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AF RR4F586JQ C 1
AF RR4F586TF U 1
BS 1 501 RR4F586TF

RD RR4F586JQ 501 0 0
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TTTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGA
GTGTGCAAGACCTTTGAAGATGATGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGC
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CTGTTTTTTTTCTATTACGTATCGATTTAATGCCTCTACGGTTAATTACAATCCTTAGAT
GTTAATTACAATCTCAACATCTCTTTGAACTTTACCATCGTGTTCATTTTCTTTGAGTAA
TAGTCAGAGAATAATATCATT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR4F586TF 501 0 0
GGGCTCTCTACGTGGACGGCGGCTAGGTTCAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAA
TCCACGAGATCAAGGACTTTCTTCTGACAGCTAGAAGAAAGGATGCTCGGTCTGTGAAGA
TCAAAAGAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTACACGC
TCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGA
GTGTGCAAGACCTTTGAAGATGATGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGC
TATTGTTCAAACTTTTTCGAGTATGACTATGTTTTCTAAATTTTTCTCTCTCTATTGATT
CTGTTTTTTTTCTATTACGTATCGATTTAATGCCTCTACGGTTAATTACAATCCTTAGAT
GTTAATTACAATCTCAACATCTCTCTGAACTTTACCATCGTGTTCATTTTCTTTGAGTAA
TAGTCAGAGAATAATATCATT

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL5664Contig1 906 2 2 U
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CTCCTCAGGCATTGCATATGATACGGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTCGCCGT
TTCTATCATGCGCACCTTCGATGAATCCCATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTCAGTC
ACTCCGTCTCGAAATCTAGCTTCTCGCTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTAGTTA
GAGCAGAAGATAACCCTGAAGCTGTTGATGCTAACACTGCTACGGAGGATAATGTAGTAG
AAGCTGATGAAGCCAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGAA
TACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGA
CTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCCGAGAACAGACGTAGGTTGTCTATCT
ACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAAAACGCTGGCATACACACTACCATTCGTATTCGCA
GGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCCTTATACTCTCCCAACATCAAAG
AGATAAAAGTTGTGAGCCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACA
AGCTTCCCCGTCTCTCCACATTCAAGTGAACACCACCCCCACTGTGCTGTGTTTGACCTA
CCAACCAAGGTAGTAATCTTCCCTTGTGTTCTCTGTTCTTGTAAGAATTTTTTTTTTTCT
ATTTTTCTTTTGTAAGTCATGGCATGCACATTCTTCTGAGAAAGTAAATCAAGTTTAGTC
GAGATTCCGTTTGGTTGAATGTAGACCTGGTTCTTGTTTGATAATGAAATGATATATGAC
CCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP93TF U 1
AF RR4GP93JQ C 142
BS 1 634 RR4GP93TF
BS 635 906 RR4GP93JQ

RD RR4GP93TF 634 0 0
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CTCCTCAGGCATTGCATATGATACGGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTCGCCGT
TTCTATCATGCGCACCTTCGATGAATCCCATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTCAGTC
ACTCCGTCTCGAAATCTAGCTTCTCGCTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTAGTTA
GAGCAGAAGATAACCCTGAAGCTGTTGATGCTAACACTGCTACGGAGGATAATGTAGTAG
AAGCTGATGAAGCCAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGAA
TACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGA
CTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCCGAGAACAGACGTAGGTTGTCTATCT
ACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAAAACGCTGGCATACACACTACCATTCGTATTCGCA
GGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCCTTATACTCTCCCAACATCAAAG
AGATAAAAGTTGTGAGCCACAGAAAAGTGAGAAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GP93JQ 765 0 0
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TCTCGCTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTAGTTAGAGCAGAAGATAACCCTGAAG
CTGTTGATGCTAACACTGCTACGGAGGATAATGTAGTAGAAGCTGATGAAGCCAAAGCTC
CAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGAATACTGAACCAGAAAGCAATTG
AGGTATCAGAGAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCA
AACTGGAAGTTCCCGAGAACAGACGTAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTA
GACAAAACGCTGGCATACACACTACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTG
TTGAAATCGTGTTTCCCTTATACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTTGTGAGCCACA
GAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACAT
TCAAGTGAACACCACCCCCACTGTGCTGTGTTTGACCTACCAACCAAGGTAGTAATCTTC
CCTTGTGTTCTCTGTTCTTGTAAGAATTTTTTTTTTTCTATTTTTCTTTTGTAAGTCATG
GCATGCACATTCTTCTGAGAAAGTAAATCAAGTTTAGTCGAGATTCCGTTTGGTTGAATG
TAGACCTGGTTCTTGTTTGATAATGAAATGATATATGACCCCTTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL5665Contig1 1214 2 4 U
GAAGAATGGTAGCGATTAGGAAACGTGTTATGAAGAAGAAACCAAAGAGTGAGTCCAATC
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ATGATTCCTCTAGCGACGAGGACGAAGAGATGAACCCTAGGCCTCGTCCCGTGAAACGCA
TTGTCCGTGAGATTAACTTTCCACCTCGTGATGACGAGCCTTCTTCTCTGTGTTCTTCAG
GGGTTACTACCAAAACCTCCACCGGCAAGAGAGCGTCGTCGTCCGCGGCGGCTAGGCTGG
CTGCTTCTCGTGCTAGGTTGGTTAACAAGCCCGTTGGCGTTAGGCTGAGGAAGTGGGGGA
AGTGGGCCGCTGAGATAAGACATCCTATCCTCAAAACGAGGAGATGGTTGGGTACTTTTC
TTACTCAAGAAGATGCTCATCAGGCTTATAAAAAGAAGAGGAGAGAGTATGATGAACTTC
TCGGCATCGTTGTTGATCCCGTCCCTGCTGTGTCCGTGGAAGATGCTAAACCTGATGATG
GCTCTTCAACTACGGAGCAAGACACTCCCGCTTCACCTCTTAAAGAAGAGATCAAGATCT
CTACAAATGATGGTGTTGATGATTTGAGCAAAGAATTGTTGCTTGATTTCAACTTTGCTG
ATCTACAGATTCCTGATCTTGGGTTCTGTAATGATGGTGGAGGACCAATGGGTGGTGGTG
GGAATGAGCTTGGTTTAGACTTTGATTGTTTCTTCACTGATGATCAGCTTGATGATTTTG
GTTTGCTTGATGATATTGGATTTGAAGACAGTGGTCCGAGTGCGTTGCCCGATTTCGACT
TTGCAGATGTTGAGCTTGACCTGTCTGGCTCGAGTTTCCTGGATCATTCCTCGCCACTCA
ACATCACTTGCCCCATGAAAAGTTTTGCGACTTAGAATAATAGTTTTTTTCTTTGGGTAT
TTTATAAGGAGTTAAGACATACAAAGAAGATAAGTGTATGTTCCGGAGAGGGTAAGATCG
TAAGACAATAAGTAGCCGGGTTTTGCATTTAGGAGTTTTTATTTATTTAATTTTTGTTCT
AGAGGTGAAGATAATAAAAGTATTGAATGGTTAAAGGCTTTAATGATTCAGAACTGTTTT
TACTTTTTACTTCTATAAGTTTTGGTTTTGAAATTGTGCTTTTTTTAAGAGCTGTCGAAA
GTTTTTGAGAATAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A476TF U 1
AF RR4A476JQ C 369
BS 1 850 RR4A476TF
BS 851 851 RR4A476JQ
BS 852 865 RR4A476TF
BS 866 1214 RR4A476JQ

RD RR4A476TF 865 0 0
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CTACAAATGATGGTGTTGATGATTTGAGCAAAGAATTGTTGCTTGATTTCAACTTTGCTG
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GTTTGCTTGATGATATTGGATTTGAAGACAGTGGTCCGAGTGCGTTGCCCGATTTCGACT
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DS 

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GTTGTTGATCCCGTCCCTGCTGTGTCCGTGGAAGATGCTAAACCTGATGATGGCTCTTCA
ACTACGGAGCAAGACACTCCCGCTTCACCTCTTAAAGAAGAGATCAAGATCTCTACAAAT
GATGGTGTTGATGATTTGAGCAAAGAATTGTTGCTTGATTTCAACTTTGCTGATCTACAG
ATTCCTGATCTTGGGTTCTGTAATGATGGTGGAGGACCAATGGGTGGTGGTGGGAATGAG
CTTGGTTTAGACTTTGATTGTTTCTTCACTGATGATCAGCTTGATGATTTTGGTTTGCTT
GATGATATTGGATTTGAAGACAGTGGTCCGAGTGCGTTGCCCGATTTCGACTTTGCAGAT
GTTGAGCTTGACCTGTCTGGCTCGAGTTTCCTGGATCATTCCTCGCCACTCAACATCACT
TGCCCCATGAAAAGTTTTGCGACTTAGAATAATAGTTTTTTTCTTTGGGTATTTTATAAG
GAGTTAAGACATACAAAGAAGATAAGTGTATGTTCCGGAGAGGGTAAGATCGTAAGACAA
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AGATAATAAAAGTATTGAATGGTTAAAGGCTTTAATGATTCAGAACTGTTTTTACTTTTT
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GAATAT

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

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TT


BQ
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15 15 

AF RR4E237JQ U 1
AF RR4GY60JQ U 7
BS 1 450 RR4E237JQ
BS 451 451 RR4GY60JQ
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RD RR4E237JQ 722 0 0
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TTATAGCCAGTACCAAACTCAAGTACTGTTTGTATTTCATGCATCCTCGTGTCCCGGTAA
CCAAACAACTCACTGAAAACAAAAGCCAAAAGGGCGTATAATGCCTTCTGGTTGCTCCAA
ATACCCCGATACTCTAGAGAGTTTATACAGAAGCAAAAAAGAAGAAAGAAACAGATAAGC
AAGCGCTTTAGGCATCCAACGCCATGAAGAAGTTCTGCTTACGGGCATGCTCTGGTACAA
GCCGGTTCACGATTTCAGAAGGGATGCCAGATAGCTCTTGAGGTTTGAAGTTGAAAAGCG
GAGGAAGTGGCCGGCCATTGGGAAGACGAGTGTTGGGGTCCCTTAGCTCATCAAATAACG
GATGAATACAAGCTTCCAAAGCTGTGCATCTCAAATTAGGGGAATATTGGAAGAACCTAC
ATAGAAGATCAACCGCTTCCGGCGGTAAACGTTTTTGGAAGACCTTGTGCCATGGATGAG
GTTTTATCTGGGGAAATTTAAATTCTGTATAGTTTGGATTCATGCACTTGATTTCCTCCC
TCGTTGGTGTTCCTAAAACCTTGATGATTTCAACAAGCTGATCGACTCCGCTTTCACCAG
GAAACAGAGGCTGTCCAAGAAGCAATTCAGCCATCACACAACCAGTGGACCATATATCAA
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4GY60JQ 716 0 0
C
TAGAATTATCATATGTATATAATATAAACTGGTTGTGAAACAAACAAGTGGTCTTATAGC
CAGTACCAAACTCAAGTACTGTTTGTATTTCATGCATCCTCGTGTCCCGGTAACCAAACA
ACTCACTGAAAACAAAAGCCAAAAGGGCGTATAATGCCTTCTGGTTGCTCCAAATACCCC
GATACTCTAGAGAGTTTATACAGAAGCAAAAAAGAAGAAAGAAACAGATAAGCAAGCGCT
TTAGGCATCCAACGCCATGAAGAAGTTCTGCTTACGGGCATGCTCTGGTACAAGCCGGTT
CACGATTTCAGAAGGGATGCCAGATAGCTCTTGAGGTTTGAAGTTGAAAAGCGGAGGAAG
TGGCCGGCTATTGGGAAGACGAGTGTTGGGGTCCCTTAGCTCATCAAATAACGGATGAAT
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ATCAACCGCTTCCGGTGGTAAACGTTTTTGGAAGACCTTGTGCCATGGATGAGGTTTTAT
CTGGGGAAATTTAAATTCTGTATAGTTTGGATTCATGCACTTGATTTCCTCCCTCGTTGG
TGTTCCTAAAACCTTGATGATTTCAACAAGCTGATCGACTCCGCTTTCACCAGGAAACAG
AGGCTGTCCAAGAAGCAATTCAGCCATCACACAACCAGTGGACCATATATCAATT

QA 2 716 2 716
DS 



AS 1 2

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AAGGTATGGTATCCATAGCCTACCTTCAATCCTGATGGTAAATCAATCTTCAAAAGCGCG
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CAAACCTGTCCAGTATGTGGCTGAAGTGGAACCAACAACCAGCTTAGACGCTAGAGATGG
TAACCTGATCACATGGTTACGCAAAGGGACTTCTATTAGTGAAGTATACAAACAAGATCC
ATTCTTGGTGCTAAGTCTGCTGTTTATCTGTGTACAAATTGCAATCCATGTCTTTCCCAT
GGCAGAACCTCGTTTGAAAGCGTTGTGGGCTTCTTATGTTCCCAATCTGAACCTGGAAAG
ATTTGGAGAGGTAAGCCAAGTGTTCAGCCGCGCTATTCACATGGTGGACGTGAGGAGGCT
GTGGTTGAAACTAACACTCGTCAAAACAAGGAGCTTCCATGAAAGGGCAAAGAACGCTCG
AGCATGGGCTTCATCTCTCGCATCTGTCTCTCTAGGCCAGACTTCATCAAGCCAGTCCTC
TTGATCCCTAAGGGTGAAAAAACAAATCCCCTTGAGTGTGTGTTCTGGGAGTTCTTAGAG
TTCCCTCTAATGAAAGGTTTGTGGGACTTTTGAGTTTAGTTTGTATGCATCAAAAGCATG
TAAATCCAGGAACAGCTTGGCTTACTTTTGTGAATATCTTTCTCTCTTTTTGGTTTTATA
AAAGTTGAGATGTCTGTTTTTGACCTCATTTCTTTTACTGAATAATTTGGTTAAAATTTG
TCTGAATCTTACAGGGAAACTTTGAATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E580TF U 1
AF RR4E580JQ C 429
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BS 569 636 RR4E580TF
BS 637 1050 RR4E580JQ

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ACTTGACAGGTTAATGGCTTTGAATCATGATGGAAATGCTTATGTGTCTGTGCTCTTCTA
TGCTTCCTGGTGCCCCTTCTCACGTGCTCTGCGCCCTAAGTTTGATACGTTGAGTTCCAT
GTTCCCTCAGATACAACACCTAGCTGTGGACCATTCTCAAGCACTACCATCTGTCTTTTC
AAGGTATGGTATCCATAGCCTACCTTCAATCCTGATGGTAAATCAATCTTCAAAAGCGCG
GTATCATGGTAGAAAGGATCTTACATCCCTGATTGAGTTTTATGAGGAATCAACAGGTCT
CAAACCTGTCCAGTATGTGGCTGAAGTGGAACCAACAACCAGCTTAGACGCTAGAGATGG
TAACCTGATCACATGGTTACGCAAAGGGACTTCTATTAGTGAAGTATACAAACAAGATCC
ATTCTTGGTGCTAAGTCTGCTGTTTATCTGTGTACAAATTGCAATCCATGTCTTTCCCAT
GGCAGAACCTCGTTTGAAAGCGTTGTGTGCTTCTTATGTTCCCAATCTGAACCTGGAAAG
ATTTGGAGAGGTAAGCCAAGTGTTCAGCCGCGCTAT

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DS 

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TGCTAAGTCTGCTGTTTATCTGTGTACAAATTGCAATCCATGTCTTTCCCATGGCAGAAC
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AGGTAAGCCAAGTGTTCAGCCGCGCTATTCACATGGTGGACGTGAGGAGGCTGTGGTTGA
AACTAACACTCGTCAAAACAAGGAGCTTCCATGAAAGGGCAAAGAACGCTCGAGCATGGG
CTTCATCTCTCGCATCTGTCTCTCTAGGCCAGACTTCATCAAGCCAGTCCTCTTGATCCC
TAAGGGTGAAAAAACAAATCCCCTTGAGTGTGTGTTCTGGGAGTTCTTAGAGTTCCCTCT
AATGAAAGGTTTGTGGGACTTTTGAGTTTAGTTTGTATGCATCAAAAGCATGTAAATCCA
GGAACAGCTTGGCTTACTTTTGTGAATATCTTTCTCTCTTTTTGGTTTTATAAAAGTTGA
GATGTCTGTTTTTGACCTCATTTCTTTTACTGAATAATTTGGTTAAAATTTGTCTGAATC
TTACAGGGAAACTTTGAATTGT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5668Contig1 1080 2 2 U
GGAACTTTCCCAGGAAAATTCGTTAGAAGGTAAACCTCAAGAAAACTCGCTTGTTATCTC
TCGATTCAAGTGACAGCGTGAATGGCGGATCGTGCGGCGGAGACGATCTCCGACAAGAAT
CAGGAGCTAACGAGGGAGAATCTGGAGATGAAGGAGAGGTTAAAGAAGCTAACGGGAGAA
ATGGAGGAGATGAAACACGTGGAAGCGGAGATGAATCAGAGCATGGGAGAAATGGAGAAA
GAGATGGAGGAGTACGAGGAAGAGAAGAAGGCTTAAGAGGGTGGAAGAGGTGGTTGAGCT
GAAGAAAGAGTTGGCTGAGAAGGGAGAGAGCTTGGAAGGGCGTGAGAAGGAAGCTGAGGG
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GGTTTTTGAAGTGAGGGTAGTGGAGGAGAAGAGCTAGAAGGTTAGATTAGAAGAAGAGAT
GAGGGAGAAAGGGGATGCGAAAGAGAAGGAGATCAAGGATTTGCAGAAGAAAGTTGGGGA
CTTGAATCTGGAGCTGGTGAAGAATGGAGAGGAGTTGAAGAAATGTAAGTCTGAGGAGAA
AGGGACAGTGAGTGGAGCTGAGGAAAAAGAGAAGGAGATGGAGATGAAGAAGGAAGAGTT
GATGAAGAAAGTTGAGGAAGCGCAGGGGATGATAGTTGAGTTGAAAAAAAGAGCCATGAA
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GGTTGGTGCTGGTTTGGTTGCAGCGACCGCCTTTGTCTGCTATTCCAAGCTAAGGTGATT
TTTTTTTATTGATGTGTAAGGGATGAGGAATAATAACTGATGACCAAGTTCTTAAGATTG
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TTGAGTTTGTGATTTTTTTGTTGTTCATGCCACGAATGAATTTCGCAACTGTGCTTTTAT
CACTTGTCTTTTTCTTTTATATTTTACCTGATTTCAAAGAGAAGCATGTTTTGCTTAACC


BQ
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AF RR4AM28TF U 1
AF RR4AM28JQ C 294
BS 1 789 RR4AM28TF
BS 790 1080 RR4AM28JQ

RD RR4AM28TF 789 0 0
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TCGATTCAAGTGACAGCGTGAATGGCGGATCGTGCGGCGGAGACGATCTCCGACAAGAAT
CAGGAGCTAACGAGGGAGAATCTGGAGATGAAGGAGAGGTTAAAGAAGCTAACGGGAGAA
ATGGAGGAGATGAAACACGTGGAAGCGGAGATGAATCAGAGCATGGGAGAAATGGAGAAA
GAGATGGAGGAGTACGAGGAAGAGAAGAAGGCTTAAGAGGGTGGAAGAGGTGGTTGAGCT
GAAGAAAGAGTTGGCTGAGAAGGGAGAGAGCTTGGAAGGGCGTGAGAAGGAAGCTGAGGG
GTTAAGGAAAGATAGAGCTGATGTTGAGAGGAAGGTTAGAGAGTTGGAGAGGAAGATTGG
GGTTTTTGAAGTGAGGGTAGTGGAGGAGAAGAGCTAGAAGGTTAGATTAGAAGAAGAGAT
GAGGGAGAAAGGGGATGCGAAAGAGAAGGAGATCAAGGATTTGCAGAAGAAAGTTGGGGA
CTTGAATCTGGAGCTGGTGAAGAATGGAGAGGAGTTGAAGAAATGTAAGTCTGAGGAGAA
AGGGACAGTGAGTGGAGCTGAGGAAAAAGAGAAGGAGATGGAGATGAAGAAGGAAGAGTT
GATGAAGAAAGTTGAGGAAGCGCAGGGGATGATAGTTGAGTTGAAAAAAAGAGCCATGAA
GCCTGGTATCAGAGAGAGAAACACAAAAGATGACATGTAAGTAGAGTTGTGGTGGCGAGT
GGTTGGTGC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4AM28JQ 787 0 0
TTGAGCTGAAGAAAGAGTTGGCTGAGAAGGGAGAGAGCTTGGAAGGGCGTGAGAAGGAAG
CTGAGGGGTTAAGGAAAGATAGAGCTGATGTTGAGAGGAAGGTTAGAGAGTTGGAGAGGA
AGATTGGGGTTTTTGAAGTGAGGGTAGTGGAGGAGAAGAGCTAGAAGGTTAGATTAGAAG
AAGAGATGAGGGAGAAAGGGGATGCGAAAGAGAAGGAGATCAAGGATTTGCAGAAGAAAG
TTGGGGACTTGAATCTGGAGCTGGTGAAGAATGGAGAGGAGTTGAAGAAATGTAAGTCTG
AGGAGAAAGGGACAGTGAGTGGAGCTGAGGAAAAAGAGAAGGAGATGGAGATGAAGAAGG
AAGAGTTGATGAAGAAGGTTGAGGAAGCGCAGGGGATGATAGTTGAGTTGAAAAAAAGAG
CCATGAAGCCTGGTATCAGAGAGAGAAACACAAAAGATGACATGTAAGTAGAGTTGTGGT
GGCGAGTGGTTGGTGCTGGTTTGGTTGCAGCGACCGCCTTTGTCTGCTATTCCAAGCTAA
GGTGATTTTTTTTTATTGATGTGTAAGGGATGAGGAATAATAACTGATGACCAAGTTCTT
AAGATTGATATCAAGAAATTGATGATTGATTATACAGGTTGGCTAGAACTTTGTTTTGGG
TTTGGATTTGAGTTTGTGATTTTTTTGTTGTTCATGCCACGAATGAATTTCGCAACTGTG
CTTTTATCACTTGTCTTTTTCTTTTATATTTTACCTGATTTCAAAGAGAAGCATGTTTTG
CTTAACC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5669Contig1 1091 2 12 U
GGGCTTTCCGACAAATGGCGGCTACTACTACATTGTACAAGTCTTCTTCATGTCTCAAGT
CCGGTTCCACCACCAGTCGCTTAAACCCATCTTCTCTCGTCAAGCCCTGTCCAAATCCGA
CCAGAGTTTCGGTTCTGGGGAAGAGTCGGAGACATGTGGTTAGGAAAGCTTCGATCGAAA
TGTCGCAATCGAACTCGACACCTTCCTCGGTTGTTGCTGTCAATTCATCAAGTAAGCAAA
AGGGTCCCATCATCGTGATTGATAACTACGACAGCTTCACCTACAATCTCTGCCAGTATA
TGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAATGATGAACTTACAGTAGAGGAGC
TCAAAAGCAAAAATCCAAGAGGGGTTCTGATTTCTCCTGGGCCTGGAACCCCACAAGACT
CTGGGATTTCCTTGCAAACTGTTTTGGAACTCGGTCCACATGTTCCTTTGTTTGGAGTAT
GTATGGGTTTGCAGTGTATAGGAGAAGCATTTGGAGGAAAGATCGTGCGGTCACCATATG
GTGTAATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGATGAGAAAGGAGAAGATGGCTTAT
TCTCTGGATTGTCCAACCCTTTCCTTGTAGGTAGATATCACAGCCTCGTCATTGAGAAAG
ATACGTTTCCAAGTGATGAACTCGAGGTTACTGCCTGGACAGAAGATGGTTTGGTTATGG
CGGCAAGACACAGGAAGCACAAGCATATACAGGGAGTTCAATTCCATCCGGAGAGTATTA
TAACGACTGAAGGCAAGACAATTGTCCGCAATTTCATCAAACTTGTAGAGAAGAAAGAGG
CTGAGAAGTTGACTTAAGGCTTTCCTCAATCAGAAAACATTAAGTTGTGTTCCTTTAATA
AAGTTTGCCAATGCAAAATGTGCCTTGTCATCTTCACATTGTTTCTATCATAGAGTTTCG
ATTGATTCAACAGAAAACTGATGCCACTTCTTTAGCAAAATTTGTCTTACAATAGTTAAG
TTGAACACATGGATTAAGACTACTGTGTATTGAATATCTACAATGTTAATTTGAGATGTG
CCAAGTCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU46TF U 1
AF RR4DU46JQ C 224
BS 1 630 RR4DU46TF
BS 631 631 RR4DU46JQ
BS 632 688 RR4DU46TF
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BS 690 703 RR4DU46TF
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BS 735 748 RR4DU46TF
BS 749 1091 RR4DU46JQ

RD RR4DU46TF 748 0 0
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CCGGTTCCACCACCAGTCGCTTAAACCCATCTTCTCTCGTCAAGCCCTGTCCAAATCCGA
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TGTCGCAATCGAACTCGACACCTTCCTCGGTTGTTGCTGTCAATTCATCAAGTAAGCAAA
AGGGTCCCATCATCGTGATTGATAACTACGACAGCTTCACCTACAATCTCTGCCAGTATA
TGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAATGATGAACTTACAGTAGAGGAGC
TCAAAAGCAAAAATCCAAGAGGGGTTCTGATTTCTCCTGGGCCTGGAACCCCACAAGACT
CTGGGATTTCCTTGCAAACTGTTTTGGAACTCGGTCCACATGTTCCTTTGTTTGGAGTAT
GTATGGGTTTGCAGTGTATAGGAGAAGCATTTGGAGGAAAGATCGTGCGGTCACCATATG
GTGTAATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGATGAGAAAGGAGAAGATGGCTTAT
TCTCTGGATTGTCCAACCCTTTCCTTGTAG*TAGATATCACAGCCTCGTCATTGAGAAAG
ATACGTTTCCAAGTGATGAACTCGAGGT*ACTGCCTGGACAGA*GATGGTTTGGTTATGG
CGGCA*GACACAG*AAGCACAAGCATAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DU46JQ 868 0 0
A
TCATCAAGTAAGCAAAAGGGTCCCATCATCGTGATTGATAACTACGACAGCTTCAC*TAC
AATCTCTGCCAGTATATGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTT*ACCGCAATGATGAA
CTTACAGTAGAGGAGCTCAAAAGCAAAAATCCAAGAGGGGTTCTGATTTCTCCTGGGCCT
GGAACCCCACAAGACTCTGGGATTTCCTTGCAAACTGTTTTGGAACTCGGTCCACATGTT
CCTTTGTTTGGAGTATGTATGGGTTTGCAGTGTATAGGAGAAGCATTTGGAGGAAAGATC
GTGCGGTCACCATATGGTGTAATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGATGAGAAA
GGAGAAGATGGCTTATTCTCTGGATTGTCCAACCCTTTCCTTGTAGGTAGATATCACAGC
CTCGTCATTGAGAAAGATACGTTTCCAAGTGATGAACTCGAGGTTACTGCCTGGACAGAA
GATGGTTTGGTTATGGCGGCAAGACACAGGAAGCACAAGCATATACAGGGAGTTCAATTC
CATCCGGAGAGTATTATAACGACTGAAGGCAAGACAATTGTCCGCAATTTCATCAAACTT
GTAGAGAAGAAAGAGGCTGAGAAGTTGACTTAAGGCTTTCCTCAATCAGAAAACATTAAG
TTGTGTTCCTTTAATAAAGTTTGCCAATGCAAAATGTGCCTTGTCATCTTCACATTGTTT
CTATCATAGAGTTTCGATTGATTCAACAGAAAACTGATGCCACTTCTTTAGCAAAATTTG
TCTTACAATAGTTAAGTTGAACACATGGATTAAGACTACTGTGTATTGAATATCTACAAT
GTTAATTTGAGATGTGCCAAGTCCTCT

QA 2 868 2 868
DS 



AS 1 2

CO CL5670Contig1 710 2 3 U
GGGCATCTCTGATCTCTCTGACTCGTTGTCTAAAAAAAAAAAGATCTCTCTGACTCTTGT
GAGAGAAAATGGGAGCTCTTGATTCTCTCTCTGAATACATCTCCGACTACTTCCACGTCT
CCCGAAAAAGAAAGAAGCGTAAAGTCAATCAGACGGTGAATATAAAGGTGAAGATGGACT
GCGACGGCTGCGAACGCAGAGTCAAGAACGCTGTTTCCTCCATGAAAGGCGTGGAAACGG
TGGAGCTGAACATGAAGATACACAAAGTGACGGTGAGTGGGTACGTGGAACCGAAGAAGT
GTTGAAGAGAGTCGAAAGGACAGGGAAAAAGGCGGAGATATGGCCGTACGTTCCTTACAA
CGTGGTGGCATATCCATATGCAGTCGGAGCTTACGACAAGAAAGCTCCGGCCGGTTATGT
GAGGAGGTCTGACCAGTCACAGCCACTACCCGGAGCTCCAGACGACGTGATCATGTCGCT
TTTTAGCGACGAGAACCCCAACGCTTGCACCGTTATGTAATAAATAAAGTATCATTGTAA
TATTAATATCCACCGCACATACTTAACGTTTTACTTTTTTTATTTGTGGTATAATAATAT
GCATAGAGGAAGAAGCAAGTAGTATTTTCATTTTTGTTATCAATCGTGTTGTATCATTAG
CTAGGGCTTTGGTTTGCCTTAATTTGTGCCATCGTTAGGTTGTTTTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO86TF U 61
AF RR4CO86JQ C 1
BS 1 60 RR4CO86JQ
BS 61 299 RR4CO86TF
BS 300 710 RR4CO86JQ

RD RR4CO86TF 239 0 0
GAGAGAAAATGGGAGCTCTTGATTCTCTCTCTGAATACATCTCCGACTACTTCCACGTCT
CCCGAAAAAGAAAGAAGCGTAAAGTCAATCAGACGGTGAATATAAAGGTGAAGATGGACT
GCGACGGCTGCGAACGCAGAGTCAAGAACGCTGTTTCCTCCATGAAAGGCGTGGAAACGG
TGGAGCTGAACATGAAGATACACAAAGTGACGGTGAGTGGGTACGTGGAACCGAAGAAG

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR4CO86JQ 710 0 0
GGGCATCTCTGATCTCTCTGACTCGTTGTCTAAAAAAAAAAAGATCTCTCTGACTCTTGT
GAGAGAAAATGGGAGCTCTTGATTCTCTCTCTGAATACATCTCCGACTACTTCCACGTCT
CCCGAAAAAGAAAGAAGCGTAAAGTCAATCAGACGGTGAATATAAAGGTGAAGATGGACT
GCGACGGCTGCGAACGCAGAGTCAAGAACGCTGTTTCCTCCATGAAAGGCGTGGAAACGG
TGGAGCTGAACATGAAGATACACAAAGTGACGGTGAGTGGGTACGTGGAACCGAAGAAGT
GTTGAAGAGAGTCGAAAGGACAGGGAAAAAGGCGGAGATATGGCCGTACGTTCCTTACAA
CGTGGTGGCATATCCATATGCAGTCGGAGCTTACGACAAGAAAGCTCCGGCCGGTTATGT
GAGGAGGTCTGACCAGTCACAGCCACTACCCGGAGCTCCAGACGACGTGATCATGTCGCT
TTTTAGCGACGAGAACCCCAACGCTTGCACCGTTATGTAATAAATAAAGTATCATTGTAA
TATTAATATCCACCGCACATACTTAACGTTTTACTTTTTTTATTTGTGGTATAATAATAT
GCATAGAGGAAGAAGCAAGTAGTATTTTCATTTTTGTTATCAATCGTGTTGTATCATTAG
CTAGGGCTTTGGTTTGCCTTAATTTGTGCCATCGTTAGGTTGTTTTACCG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5671Contig1 1117 2 2 U
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GTGAACGAACACTGTCCCTTTCCATCTTCGTGCGCTACGCTGGCTTCCTTTCTAGACATC
GATCCTTGTCTTTTTCTCCGATCACGCAACCATACGAATCTCCACTTCCTCTGCGGCGGA
GGAGTATTCATGTGGAAGGAGGAATGGCTGGATGTAATACTTGTCCCCGCGGGTCTCGCC
GTGATGGTCGCATACCACGTCTGGCTCGGCTACGCTATAATCCACCGTCCCAAGCTCACT
GTTATCTCCCTCAACGCTGAATCTCGACGACAATGGGTCTTCTCTATGATGACCGAGCCG
CTGAAGAATGGTACTTTAGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGGCATCAACCCTT
TTAGCCACGACAGCAATCACTCTCTGTTCCATCATCGGCGTCTTCGTAAACAACAACACC
TCTGCTTCCAAATCCACAGCCTCCTCGTCTATCATATACGGAAACAAAAGCCCTCTCCTT
TCGACCATCAAGAACTTCGCGATCCTCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCTCTGCAACGTC
CAGTCCATCAGGTACTACGCTCATGTGAGTTTCCTCATCACGGTTCCCGTCTCGAGAGGG
AAGAGGGAGCACTGCGAGTACGTGTCTAGAAACCTGAACCGGGCTAGCTACTTCTGGTCT
CTCGGACTTCGAGCTTTCTACTTCTCCTTCCCGCTCTTCCTGTGGAACTTCGGTCCCATC
CCCATGTTTGTGTGTTGCTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATTTCTTGGATACCACCACT
AGCTTCACTAGGCATCTCCATAGCGAGTCGTTCAGAGAGATAGCTGAGTCTATGGACGGT
GAAATCGAATCGGCCGTTCATTCTCTGTAGAATCCTCTCTGTTTTTCTTTTCTTGTGTGT
TCGTTGAGTTTCAAGAGTTGTACTATTAGCGGAGTTTGTATGTAATGTGATGAAACAACC
TTGGCTGCGTCTGTGAGCGCAAACGTTTATGTAAACCGCAAATAAACTGTCCAAATAACA
TGTTATATAGAATGTAGACTATGTAATCTCTTGCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BR59TF U 1
AF RR4BR59JQ C 422
BS 1 607 RR4BR59TF
BS 608 1117 RR4BR59JQ

RD RR4BR59TF 607 0 0
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GGAGTATTCATGTGGAAGGAGGAATGGCTGGATGTAATACTTGTCCCCGCGGGTCTCGCC
GTGATGGTCGCATACCACGTCTGGCTCGGCTACGCTATAATCCACCGTCCCAAGCTCACT
GTTATCTCCCTCAACGCTGAATCTCGACGACAATGGGTCTTCTCTATGATGACCGAGCCG
CTGAAGAATGGTACTTTAGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGGCATCAACCCTT
TTAGCCACGACAGCAATCACTCTCTGTTCCATCATCGGCGTCTTCGTAAACAACAACACC
TCTGCTTCCAAATCCACAGCCTCCTCGTCTATCATATACGGAAACAAAAGCCCTCTCCTT
TCGACCATCAAGAACTTCGCGATCCTCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCTCTGCAACGTC
CAGTCCA

QA 1 607 1 607
DS 

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CTGCTTCCAAATCCACAGCCTCCTCGTCTATCATATACGGAAACAAAAGCCCTCTCCTTT
CGACCATCAAGAACTTCGCGATCCTCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCTCTGCAACGTCC
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AGAGGGAGCACTGCGAGTACGTGTCTAGAAACCTGAACCGGGCTAGCTACTTCTGGTCTC
TCGGACTTCGAGCTTTCTACTTCTCCTTCCCGCTCTTCCTGTGGAACTTCGGTCCCATCC
CCATGTTTGTGTGTTGCTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATTTCTTGGATACCACCACTA
GCTTCACTAGGCATCTCCATAGCGAGTCGTTCAGAGAGATAGCTGAGTCTATGGACGGTG
AAATCGAATCGGCCGTTCATTCTCTGTAGAATCCTCTCTGTTTTTCTTTTCTTGTGTGTT
CGTTGAGTTTCAAGAGTTGTACTATTAGCGGAGTTTGTATGTAATGTGATGAAACAACCT
TGGCTGCGTCTGTGAGCGCAAACGTTTATGTAAACCGCAAATAAACTGTCCAAATAACAT
GTTATATAGAATGTAGACTATGTAATCTCTTGCACA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5672Contig1 1214 2 4 U
GGTAATAAAATTTGTATAGTTATAAAAATATAATTAAATAATATTTCGAAATTAGCAATG
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AAAAAATGATATAATACTGATAATTTTGAAAAAGTATAGCTAAACAATATTTATAAAATT
TGTAAATATATAAGAAATTAATGATTTTAGGTTTATTTTTTTATAAATTTTTAAAAAATT
CTATAAAATTTCGAAAATTTAAAGTAATAAAATTGTATAGTTATAAAAATATAATTAAAT
AAGATTTCGAAATTAGTAATGTTCATATTTGAATATTTTATTTTAATGAGGATCTATGAA
TTATTACCATATTCTAAAAAGTTTACCAAAAATATAAATCAACATAAATGTAATATATGA
GTTATTACTATATTCTAAAAAATGTACTAAAAATATAAATTTACATTAAATATAGTTGTC
CATGTCATATTTTTCATATGCCATGTCATCAAATTTAGTAGACATGTCACATTTTTTTTT
TGCGAAACTGATTCTGAAGATTTTTTTTTTTGCGAAACTGATCCTGAAGAGGACATGTGG
CAAAATCACTTCGCAAATATAGTCTAGGGGATAGCAAACCCAAATGACGTAATCACTTTT
TTATAGGAAAATAAAATTTAAATCTAATGGTTGAGTTTATCAATACTTTGTAATCTAACG
GATAAGATCATCTCTCAATTACGAAATCTGACGTCATCAGACTCTTATTCTCTTTTAGCA
ACAGACGTCTTCAACCAAAGGTTCTCTGAACAACGCATCCCTTCTGCATCCGCCTCTTCG
CAAAGGATATCACATTTGCTTCCTTTCGGATTCAATGCGTCTGAGCAATTACACCTTTTG
GAGTCTGCCCTATAGTCCATCTATATATATAAGTTTCAGATTTCTCTTCTGTTTACGTAT
TCTATCGTTAGTCTTATCCCTTTATTTATTCCATCATTGTTATCCAGTATTTAGATGTAT
GAATTTTCTTCTTGTACAGTTCATCACCATCGTTGTTCTTCTTTCGTGCATGTATTGTCT
TTTGAATTTTTATCCGATTTCACAAATTGTTTCATTTATTATAGGGAATTAATCAATCCA
GTGTTTGTTGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI74TF U 1
AF RR4DI74JQ C 488
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BS 690 690 RR4DI74JQ
BS 691 730 RR4DI74TF
BS 731 1214 RR4DI74JQ

RD RR4DI74TF 735 0 0
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TTCATATTTGAATATTTTTATTTTAATGAGGATCTTTGAGTTATTACCATATTCTAATTT
TTTTACCAAAAATATAAATCAACATAAATGTAATATATGAGTTACTACTACATAATTAAT
AAAAAATGATATAATACTGATAATTTTGAAAAAGTATAGCTAAACAATATTTATAAAATT
TGTAAATATATAAGAAATTAATGATTTTAGGTTTATTTTTTTATAAATTTTTAAAAAATT
CTATAAAATTTCGAAAATTTAAAGTAATAAAATTGTATAGTTATAAAAATATAATTAAAT
AAGATTTCGAAATTAGTAATGTTCATATTTGAATATTTTATTTTAATGAGGATCTATGAA
TTATTACCATATTCTAAAAAGTTTACCAAAAATATAAATCAACATAAATGTAATATATGA
GTTATTACTATATTCTAAAAAATGTACTAAAAATATAAATTTACATTAAATATAGTTGTC
CATGTCATATTTTTCATATGCCATGTCATCAAATTTAGTAGACATGTCACATTTTTTTTT
TGCGAAACTGATTCTGAAGATTTTTTTTTTTGCGAAACTGATCCTGAAGAGGACATGTGG
CAAAATCACTTCGCAAATATAGTCTAGGG*ATAGCAAACCCAAATGACGTAATCACTTTT
TTATAGGAAA
TAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4DI74JQ 727 0 0
CTATATTCTAAAAAATGTACTAAAAATATAAATTTACATTAAATATAGTTGTCCATGTCA
TATTTTTCATATGCCATGTCATCAAATTTAGTAGACATGTCACATTTTTTTTTTGCGAAA
CTGATTCTGAAGATTTTTTTTTTTGCGAAACTGATCCTGAAGAGGACATGTGGCAAAATC
ACTTCGCAAATATAGTCTAGGGGATAGCAAACCCAAATGACGTAATCACTTTTTTATAGG
AAAATAAAATTTAAATCTAATGGTTGAGTTTATCAATACTTTGTAATCTAACGGATAAGA
TCATCTCTCAATTACGAAATCTGACGTCATCAGACTCTTATTCTCTTTTAGCAACAGACG
TCTTCAACCAAAGGTTCTCTGAACAACGCATCCCTTCTGCATCCGCCTCTTCGCAAAGGA
TATCACATTTGCTTCCTTTCGGATTCAATGCGTCTGAGCAATTACACCTTTTGGAGTCTG
CCCTATAGTCCATCTATATATATAAGTTTCAGATTTCTCTTCTGTTTACGTATTCTATCG
TTAGTCTTATCCCTTTATTTATTCCATCATTGTTATCCAGTATTTAGATGTATGAATTTT
CTTCTTGTACAGTTCATCACCATCGTTGTTCTTCTTTCGTGCATGTATTGTCTTTTGAAT
TTTTATCCGATTTCACAAATTGTTTCATTTATTATAGGGAATTAATCAATCCAGTGTTTG
TTGTTTT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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TGGACGCTATTGGAGTTTACTTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACA
AGCTGGAAGCTCAAGGTGGTACAGAGGGGCGTGTTTGGGATGATGGTTTTTACGATGGTG
TTAAAACCATGCGGTTTGGTCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACG
TGAAAGGTGGGAAATTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGA
TTGTGCTTGTCCCGGGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAGACAAGCTT
CTTTCGCAACACGGTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGTTT
CTTTGGGTATAAGACGGGTAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGG
ATTCCATGGAAGAGAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATTCC
TACTCCTGTTCCTGTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGGAGGAGT
TGCATGGGATGATGGTGTCTACGATGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGGTAATGA
TGGTGTGTCCTTTGTTAAGTTTGAGTACGTTAAAGGGACAAACTTGGTATCTGGAGATGA
CCATGGGAAGAAGACAATACTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGAATACCT
CACGGTTTTGGAAGGCTACTACGATAAGATCTTTGGAGTGCAGGAACCGGTGATTATCTC
TCTTAAGTTCAAGACAAACAAAAGGGATTCAATTCCGTTTGGAATGAATTCCGGTGAGAA
GTTCTCACTCGGGGAGAAAGGCCACAAGATCGTCGGGTTCCATGGGCAAGCTAGTGATGT
TCTTCACAGTGTTGGAGTTACTGTTGTTCCCATCACCCCTACCAAGTGAAACATGCATCT
ATTGTATGAATAATACTGAATGAACTTTTAATCAGATTGTCCTTTTAATGGTATTTACTT
TGAATAATAAAGTCTATCGGTTCTTTAC


BQ
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AF RR4DB45TF U 1
AF RR4DB45JQ C 385
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BS 586 629 RR4DB45TF
BS 630 1108 RR4DB45JQ

RD RR4DB45TF 629 0 0
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TGGACGCTATTGGAGTTTACTTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACA
AGCTGGAAGCTCAAGGTGGTACAGAGGGGCGTGTTTGGGATGATGGTTTTTACGATGGTG
TTAAAACCATGCGGTTTGGTCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACG
TGAAAGGTGGGAAATTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGA
TTGTGCTTGTCCCGGGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAGACAAGCTT
CTTTCGCAACACGGTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGTTT
CTTTGGGTATAAGACGGGTAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGG
ATTCCATGGAAGAGAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATTCC
TACTCCTGTTCCTGTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAG*TGGAAAGGGAGGAGT
TGCATGGGATGATGGTGTCTACGATGGTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4DB45JQ 724 0 0
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GTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGGATTCCATGGAAGAGAAGGCGACGC
TATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATTCCTACTCCTGTTCCTGTGATTCCAGC
CACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGGAGGAGTTGCATGGGATGATGGTGTCTACGA
TGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGGTAATGATGGTGTGTCCTTTGTTAAGTTTGA
GTACGTTAAAGGGACAAACTTGGTATCTGGAGATGACCATGGGAAGAAGACAATACTCGG
AGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGAATACCTCACGGTTTTGGAAGGCTACTACGA
TAAGATCTTTGGAGTGCAGGAACCGGTGATTATCTCTCTTAAGTTCAAGACAAACAAAAG
GGATTCAATTCCGTTTGGAATGAATTCCGGTGAGAAGTTCTCACTCGGGGAGAAAGGCCA
CAAGATCGTCGGGTTCCATGGGCAAGCTAGTGATGTTCTTCACAGTGTTGGAGTTACTGT
TGTTCCCATCACCCCTACCAAGTGAAACATGCATCTATTGTATGAATAATACTGAATGAA
CTTTTAATCAGATTGTCCTTTTAATGGTATTTACTTTGAATAATAAAGTCTATCGGTTCT
TTAC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5674Contig1 1090 2 4 U
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CTGACCCCCAAAACAATGACAGAGAAAGAGGTGGCGATGGAGATGGAAGCCGTAGAAGCA
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AAGCCCCGTACCGCCGAGATCTCTTCTCAGCAGTTTGTGGAAGCTGTTGTGAGAATACAA
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GATGAGCAAAGACAAAAGCTTTTGATTGGGTTTGTGCAAGAGAAAGCTTCTGAGCTATCA
TCTTCTCTGATGCTAGTTGCACTTTGTGAGGAAGCAGTTGAGAGGCTGACGATAATGAAC
CATCCGGATGGAGATTGTCCACTTTGTTTGTATCCCTTATTCCCTGAGGATGGCGAGAGT
AATCCAATGCCCTTTATGAAGCTCATGTCTTGCTTCCACTGTTTCCACTGTGAGTGCATC
ATTAGGTGGTGGAACTGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAAAACGGATTCTGT
TTTAGTACAAGGTGAGGACAAAGAAGACCCACTGCTCCAGTCAGAGTCAGAGAACATGAG
AAGAGAGCGGTTTGAGGCGATTTTAAAGACTCAGGAAGAAAAGGGAGGTCTGGTTCAACC
AAAGAAAAACATATCGGTTGTGCCCGGTATGTATCTTCCTCCTCCACCAGCTCCTGCATC
ATTTTCATCGAACCAAGAAGAAGCTCAAGAGCAAGGACAACAAGTGGAACACAAAGAAGG
TGAATCAGAGACAAACTCTAGCAGCTCCAACAACAGGAGAGGGAGAGGCAGAGGCCGAGG
AGGGCGGGGACATAGTAATGTCAACAGAAGGAAGCAGACCTCGCAAGATCCAAGAAAACC
TACGAAGCAGTGGGTGCAGAGGAGTTGACAAAACTCATGTATTATTTATATATATCGAGA
GAGAGAGAGAGAGATATCAAACTCAACTCAAAAACAGACTACAAATACAAAAAAATAAAT
CCTCCGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD73TF U 1
AF RR4FD73JQ C 431
BS 1 610 RR4FD73TF
BS 611 611 RR4FD73JQ
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CTGACCCCCAAAACAATGACAGAGAAAGAGGTGGCGATGGAGATGGAAGCCGTAGAAGCA
GTTTACGGAGACGAAGCCGTCATAGTGGATTCATATCCTCCTCATCTTCACCTCCACATC
AAGCCCCGTACCGCCGAGATCTCTTCTCAGCAGTTTGTGGAAGCTGTTGTGAGAATACAA
GCAGGTTCTAAGTATCCAGAAGAGCCGCCGGAGATTAGCCTGATTGAATCCAAGGGTCTT
GATGAGCAAAGACAAAAGCTTTTGATTGGGTTTGTGCAAGAGAAAGCTTCTGAGCTATCA
TCTTCTCTGATGCTAGTTGCACTTTGTGAGGAAGCAGTTGAGAGGCTGACGATAATGAAC
CATCCGGATGGAGATTGTCCACTTTGTTTGTATCCCTTATTCCCTGAGGATGGCGAGAGT
AATCCAATGCCCTTTATGAAGCTCATGTCTTGCTTCCACTGTTTCCACTGTGAGTGCATC
ATTAGGTGGTGGAACTGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAAAACGGATTCTGT
TTTAGTACAATGTGAGGACAAAGAAGACCCACTGCTCCAGTCAGAGTCAGAGAACATGAG
AAGAGAGCGGTTT

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DS 

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CCTTTATGAAGCTCATGTCTTGCTTCCACTGTTTCCACTGTGAGTGCATCATTAGGTGGT
GGAACTGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAAAACGGATTCTGTTTTAGTACAA
GGTGAGGACAAAGAAGACCCACTGCTCCAGTCAGAGTCAGAGAACATGAGAAGAGAGCGG
TTTGAGGCGATTTTAAAGACTCAGGAAGAAAAGGGAGGTCTGGTTCAACCAAAGAAAAAC
ATATCGGTTGTGCCCGGTATGTATCTTCCTCCTCCACCAGCTCCTGCATCATTTTCATCG
AACCAAGAAGAAGCTCAAGAGCAAGGACAACAAGTGGAACACAAAGAAGGTGAATCAGAG
ACAAACTCTAGCAGCTCCAACAACAGGAGAGGGAGAGGCAGAGGCCGAGGAGGGCGGGGA
CATAGTAATGTCAACAGAAGGAAGCAGACCTCGCAAGATCCAAGAAAACCTACGAAGCAG
TGGGTGCAGAGGAGTTGACAAAACTCATGTATTATTTATATATATCGAGAGAGAGAGAGA
GAGATATCAAACTCAACTCAAAAACAGACTACAAATACAAAAAAATAAATCCTCCGTTTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL5675Contig1 1245 2 2 U
GGGATGGCAGTTGCCCATCTGGCGTGATGGATATAGTGCAGTACACACAGAGTTTAAAAC
AAGAACTCAGTACATACAAGTCCCAGCAAGAGGATATAGATGAGCGTCTAAAATGTTTGG
TTGCTGAACAAGAACAGGCCGACCAAGAGTTGATTACTTTGCAAGCTTCTCTGGATTCTA
TCCGTGAGGCGCTCCCGGAATGCCTATCTACCAGAGAGTCAATGATGAAACACATTGAAG
AGGAGCATCAGGACACTGCAGCATCGGTGTTTTGTTCTTTGACCAAAGATGTTATGCCTC
CGCGGTCTTTGAATCTGTCAAACAGAGGAGTGTTTGGCATTGTAGCCCTTCTTGGTTCAG
TTGCCTCCACCTCACTAAGCAGGGTATTATCTGCATATTTGGGGAAAGACACAATGCTTG
CGCTGGTATGCAAATCATCAGAATATAGTCCAAGCTTTGATGAGTACCTAAATCTTCAAG
CTGAAGCAGCTAGGCTCCGACGTCCCATAACCAATCCTTTGCAAGTTATTTGTCTTGATG
CAACCAGAACTTGGAGAAGTGGACTTGTGGAAGATGATCCTCAGAGGAGACTAGCGATGG
TTAACCCTTCCCTACGCAATGGAGATCCCATACCAGGTTTCAAAGGTTACGCTGTGAACA
TGATCGAGCTGGCTTTAGGGGACCTGGATATAGGGACAAAGTCGGGTCACGGGCTTAGAG
AGACACTCTTCTATGAACTTTTTGGAGACCTGCAAGTGTACGAGACAGGAAAGGATCTCG
AAGCAGCCCTTCCTTACCTCGTTGGTGTAGATGCTGTGTCTCTAGATGGTGTGATCAAAA
CAAGAAAAGGATTTTTATTCTCTGGATCCTGCATTCCGGAAGTTCATTTCCCAATAACAG
TACCAGAGAACCACGAGAAGACGTTATTGAAGCTGGAAATAACGAGGGAAAGGAAGAGAA
AGCGTGAGGAGGAGATACGTGAGGAGAAAGGTTTGTTGAAGAAGATAGGGAAGAAGCTGA
AGAAGGCAACGCAGAAGTACAAACGTTGCACAGCCATGTCTGAGTCTCAGGACTTGTAAA
TGTCTGTTGGAGACTTTAATAAAAAGCATTTTGGTGTTAGTTTTAGTTCATGAAAACTTG
GAACTTGTTTATTGTGTCGGTTAGGGCTGATCTTTTGTGGATATGATCGTCGCTGGTTGT
TTACTGCTTCACTCTATGTTCTCAATGTTTATAGAAGCTTTTCGT


BQ
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AF RR4BI55TF U 1
AF RR4BI55JQ C 522
BS 1 764 RR4BI55TF
BS 765 1245 RR4BI55JQ

RD RR4BI55TF 764 0 0
GGGATGGCAGTTGCCCATCTGGCGTGATGGATATAGTGCAGTACACACAGAGTTTAAAAC
AAGAACTCAGTACATACAAGTCCCAGCAAGAGGATATAGATGAGCGTCTAAAATGTTTGG
TTGCTGAACAAGAACAGGCCGACCAAGAGTTGATTACTTTGCAAGCTTCTCTGGATTCTA
TCCGTGAGGCGCTCCCGGAATGCCTATCTACCAGAGAGTCAATGATGAAACACATTGAAG
AGGAGCATCAGGACACTGCAGCATCGGTGTTTTGTTCTTTGACCAAAGATGTTATGCCTC
CGCGGTCTTTGAATCTGTCAAACAGAGGAGTGTTTGGCATTGTAGCCCTTCTTGGTTCAG
TTGCCTCCACCTCACTAAGCAGGGTATTATCTGCATATTTGGGGAAAGACACAATGCTTG
CGCTGGTATGCAAATCATCAGAATATAGTCCAAGCTTTGATGAGTACCTAAATCTTCAAG
CTGAAGCAGCTAGGCTCCGACGTCCCATAACCAATCCTTTGCAAGTTATTTGTCTTGATG
CAACCAGAACTTGGAGAAGTGGACTTGTGGAAGATGATCCTCAGAGGAGACTAGCGATGG
TTAACCCTTCCCTACGCAATGGAGATCCCATACCAGGTTTCAAAGGTTACGCTGTGAACA
TGATCGAGCTGGCTTTAGGGGACCTGGATATAGGGACAAAGTCGGGTCACGGGCTTAGAG
AGACACTCTTCTATGAACTTTTTGGAGACCTGCAAGTGTACGAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4BI55JQ 724 0 0
CAAGTTATTTGTCTTGATGCAACCAGAACTTGGAGAAGTGGACTTGTGGAAGATGATCCT
CAGAGGAGACTAGCGATGGTTAACCCTTCCCTACGCAATGGAGATCCCATACCAGGTTTC
AAAGGTTACGCTGTGAACATGATCGAGCTGGCTTTAGGGGACCTGGATATAGGGACAAAG
TCGGGTCACGGGCTTAGAGAGACACTCTTTTATGAACTTTTTGGAGACCTGCAAGTGTAC
GAGACAGGAAAGGATCTCGAAGCAGCCCTTCCTTACCTCGTTGGTGTAGATGCTGTGTCT
CTAGATGGTGTGATCAAAACAAGAAAAGGATTTTTATTCTCTGGATCCTGCATTCCGGAA
GTTCATTTCCCAATAACAGTACCAGAGAACCACGAGAAGACGTTATTGAAGCTGGAAATA
ACGAGGGAAAGGAAGAGAAAGCGTGAGGAGGAGATACGTGAGGAGAAAGGTTTGTTGAAG
AAGATAGGGAAGAAGCTGAAGAAGGCAACGCAGAAGTACAAACGTTGCACAGCCATGTCT
GAGTCTCAGGACTTGTAAATGTCTGTTGGAGACTTTAATAAAAAGCATTTTGGTGTTAGT
TTTAGTTCATGAAAACTTGGAACTTGTTTATTGTGTCGGTTAGGGCTGATCTTTTGTGGA
TATGATCGTCGCTGGTTGTTTACTGCTTCACTCTATGTTCTCAATGTTTATAGAAGCTTT
TCGT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5676Contig1 1233 2 8 U
GATGGAGCAACAGACTGTAACAATCGCCAAAGCCTGTATCCATGCATCACTAAATGCTAG
GTGCAGTGTGGCTGCAGCAGCAAATCCCATCTATGGAACCTATGACAGATCATTGACTCC
AACAAAGAACATTGGACTTCCAGACTCGCTGCTCTCTCGTTTTGATCTGCTGTTTATCGT
GTTGGACCAAATGGATGCTGGTATGGATAGCATGATATCAGAACACGTTTTGCGCATGCA
TCGTTACCAAAACGGTAGAGGGGAGGCAGGGCCAGATGGGAACTTGCCTTATGGGAGAGA
GGAAGATGGTGAAAGTGAAGTGTTTGTTAAGTATAACCGAATGTTGCATGGGAAGAATAA
GAAAAGAGGCCAAACAAATGAGAAAACTCTTACGATTAAGTTCCTGAAGAAGTACATTCA
CTATGCCAAACATCGAATTCAACCAGAGCTTACTGATGAAGCATCTGAACGTATTGCAGA
AGCATATGCAGATCTCAGAAATGCAGGTTCTGATACCAAGACTGGAGGTACGCTTCCGAT
AACAGCAAGAACTCTAGAGACAATAATACGTCTTGCTACGGCACATGCCAAACTGAAGTT
GAGCAGAAAGGTTACTAAAGTCGACGCAGAGGCTGCCTTGAAGCTGATGAACTTTGCAAT
ATATCATCAAGAACTGACAGAGATGGATGAGCGGGAACAAGAAGAACGTCAAAGTGAACA
ATCAGAACAAGAAAGAACACCAAGTGGTAACAGAGGCAATCAAGAGAATGTCTCTGCAAA
CGTCGAAAGCGAAGCAGCAGATCCAATGGACGTCGATGAACCTCCCTCGGAGCAATTTAG
TGGGACTGTCTCTGCAGCAAGGATTGAAACGTTTGAGCGAGTGTTTGGGCAGCACATGAG
GACAAACAGGCTGGACGACATTTCTATTGCAGATATAGAGACAGTAGTCAACAACAATGG
AGTTGGAGCTTCTCGTTACTCGGCAGATGAGATTATGGCTCTATTAGAGAAACTGCAAGA
TGATAACAAAGTGATGATCAGCGACGGAAAAGTCCATATCATTTGATCCTTCATGAAGAC
ATGCACCTAAAGAAGTAGTTTCCTCTTATTAGAGAACTCAAAAGTAGTGTAGTACTGGGA
GAAGAGAAGCTATTGGGGACCAAAGTATCTTTTCTTTTTAATTCGTCTTTGCAATCTATT
ATTAAAGTAAGAAACACAAATCTATTGCTAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F088TF U 1
AF RR4F088JQ C 499
BS 1 610 RR4F088TF
BS 611 611 RR4F088JQ
BS 612 631 RR4F088TF
BS 632 632 RR4F088JQ
BS 633 736 RR4F088TF
BS 737 737 RR4F088JQ
BS 738 750 RR4F088TF
BS 751 1233 RR4F088JQ

RD RR4F088TF 750 0 0
GATGGAGCAACAGACTGTAACAATCGCCAAAGCCTGTATCCATGCATCACTAAATGCTAG
GTGCAGTGTGGCTGCAGCAGCAAATCCCATCTATGGAACCTATGACAGATCATTGACTCC
AACAAAGAACATTGGACTTCCAGACTCGCTGCTCTCTCGTTTTGATCTGCTGTTTATCGT
GTTGGACCAAATGGATGCTGGTATGGATAGCATGATATCAGAACACGTTTTGCGCATGCA
TCGTTACCAAAACGGTAGAGGGGAGGCAGGGCCAGATGGGAACTTGCCTTATGGGAGAGA
GGAAGATGGTGAAAGTGAAGTGTTTGTTAAGTATAACCGAATGTTGCATGGGAAGAATAA
GAAAAGAGGCCAAACAAATGAGAAAACTCTTACGATTAAGTTCCTGAAGAAGTACATTCA
CTATGCCAAACATCGAATTCAACCAGAGCTTACTGATGAAGCATCTGAACGTATTGCAGA
AGCATATGCAGATCTCAGAAATGCAGGTTCTGATACCAAGACTGGAGGTACGCTTCCGAT
AACAGCAAGAACTCTAGAGACAATAATACGTCTTGCTACGGCACATGCCAAACTGAAGTT
GAGCAGAAAG*TTACTAAAGTCGACGCAGAG*CTGCCTTGAAGCTGATGAACTTTGCAAT
ATATCATCAAGAACTGACAGAGATGGATGAGCGGGAACAAGAAGAACGTCAAAGTGAACA
ATCAGAACAAGAAAGA*CACCAAGTGGTAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4F088JQ 735 0 0
AAATGCAGGTTCTGATACCAAGACTGGAGGTACGCTTCCGATAACAGCAAGAACTCTAGA
GACAATAATACGTCTTGCTACGGCACATGCCAAACTGAAGTTGAGCAGAAAGGTTACTAA
AGTCGACGCAGAGGCTGCCTTGAAGCTGATGAACTTTGCAATATATCATCAAGAACTGAC
AGAGATGGATGAGCGGGAACAAGAAGAACGTCAAAGTGAACAATCAGAACAAGAAAGAAC
ACCAAGTGGTAACAGAGGCAATCAAGAGAATGTCTCTGCAAACGTCGAAAGCGAAGCAGC
AGATCCAATGGACGTCGATGAACCTCCCTCGGAGCAATTTAGTGGGACTGTCTCTGCAGC
AAGGATTGAAACGTTTGAGCGAGTGTTTGGGCAGCACATGAGGACAAACAGGCTGGACGA
CATTTCTATTGCAGATATAGAGACAGTAGTCAACAACAATGGAGTTGGAGCTTCTCGTTA
CTCGGCAGATGAGATTATGGCTCTATTAGAGAAACTGCAAGATGATAACAAAGTGATGAT
CAGCGACGGAAAAGTCCATATCATTTGATCCTTCATGAAGACATGCACCTAAAGAAGTAG
TTTCCTCTTATTAGAGAACTCAAAAGTAGTGTAGTACTGGGAGAAGAGAAGCTATTGGGG
ACCAAAGTATCTTTTCTTTTTAATTCGTCTTTGCAATCTATTATTAAAGTAAGAAACACA
AATCTATTGCTAGCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5677Contig1 239 2 1 U
GAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTTCTGGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAG
GCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTCGGATTCACATACCGCTCCTACCTATGCGTCT
GGTTAGAGAAATATATTACAGTGTTTGTATTTTGTTAATTTGCTTTCTTTTGTATGTGTG
TGGTAGGTTTCTGCTGCCGATTTTTTCTATATATGGTATGTTTATGTGAGTTTGATACC


BQ
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AF RR4C150JQ C 1
AF RR4C150TF U 1
BS 1 239 RR4C150TF

RD RR4C150JQ 239 0 0
GAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTTCTGGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAG
GCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTCGGATTCACATACCGCTCCTACCTATGCGTCT
GGTTAGAGAAATATATTACAGTGTTTGTATTTTGTTAATTTGCTTTCTTTTGTATGTGTG
TGGTAGGTTTCTGCTGCCGATTTTTTCTATATATGGTATGTTTATGTGAGTTTGATACC

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR4C150TF 239 0 0
GAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTTCTGGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAG
GCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTCGGATTCACATACCGCTCCTACCTATGCGTCT
GGTTAGAGAAATATATTACAGTGTTTGTATTTTGTTAATTTGCTTTCTTTTGTATGTGTG
TGGTAGGTTTCTGCTGCCGATTTTTTCTATATATGGTATGTTTATGTGAGTTTGATACC

QA 1 239 1 239
DS 



AS 1 2

CO CL5678Contig1 793 2 2 U
GGATTTCAAACAAACAAAACAAAACCATTCTCCAAAACAGAGCATGAGAAACGGAGGACA
AAGCCAGAACAAGTTCTTGAGGATCATCTCAACACCTTTCAGAGCTTTAGGCAAAGCTTA
CGTGAGAAGCATCACCGGCTGTGCCTCTCGGACTCAGTATCCCTCCTCCTCCTCTTCCGT
CTCCACTGCTTTTCCTAGAAGCAAGAGCTCATCCTCTGCCGCCTTCTCCTCATCCGCATC
TACACGCAGAACAACTGATTTTGGGATTGATGACGACTACAGCGAGCTAGTGAGAGCAGC
GTCGGTTAGGAGTTTAGGACACAAGAATGAGATAGACATGTTTATACATGAGAAGGTGAA
ACAAGAGAAGCTGCAGCAGGAGATGCAGAATAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGAATAG
CACGAGCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTGTGAA
ACCGAAGACGACTAAGAAAGTCTCTGAGCTTTTGTATCCTCGTAGCAAATCATATGCTGT
TACTGGTAGCCCTAAGTTTTAGTGTTTTTGTTTCTCTCTCTCTTTTTAATAGTAATTTGT
GGATTGATTTTTGATATTTTTTAGTTTTGATTTTTCTGCAACAAGGAAATAATGATAGAA
TTCGATAAACTGCTCTCGATTCAAACCCAAGTTTGGTTGATATTTGAAGTTCAGTACGTG
TATATACGACCCATGTGTTTCAATGATTTTGCATTTTTTATGTTAAGTTTTGAAGTAATT
TATAATTTGTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY41TF U 1
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TATATACGACCCATGTGTTTCAATGATTTTGCATTTTTTATGTTAAGTTTTGAAGTAATT
TATAATTTGTATT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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TTTGATTTGTCTCTCTTGAG


BQ
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AF RR4GI46TF U 1
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BS 1 694 RR4GI46TF
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AAAAGATGCTGATGATAAGAAGACCAAGAAGGTGAACTCGATGGAGAAGCAGCTTAGGGA
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CTCAAAAGCTGAGAGTAGAACAGAGACAGTTGAG*AGCAGTGCATTGTGCTATCTACAAC
GAACTCTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4GI46JQ 797 0 0
AGATGCTGATGATAAGAAGACCAAGAAGGTGAACTCGATGGAGAAGCAGCTTAGGGAATT
AGAGTTTCAACTACAAAACTCCAAGGTATCATCTGAAGCATTTCAAGAACAGCAGAACAT
GTTGTACTCAGCAATATGGGACATGGAGACCTTGATTGAAGATCTTAAATCTAAAGCCTC
AAAAGCTGAGAGTAGAACAGAGACAGTTGAGGAGCAGTGCATTGTGCTATCTACAACGAA
CTCTGTACTTAACAAAGAAGTGACGTCTCTGAGGCAAAGAGCCAAATCCTTGGAAGCATC
ATTGGATCTAATTAACAAAGAAAAAGAGAAATATGCGCAAGAAATAGCTACGAGAAACAA
GCTTCTTATGGATATGGTGATGCAGTTATCCAGTGAAAGGGAACGTATAAAAGAACAGCT
ATATTCTTTGGCAAAGGAAAATGAAAAACTGAGAGTGAACCAGTGCTCAGAGGGAAGTAA
ATGCCAAAGAAATGGAACTTATGATGGGGACAAAGAGCTGCCTTCTACCACAGATGGTGG
AGGAATAGAGGGACTTGCTGAAAGTCTGCAGGCAGGAGGGTGAGACAACAAGGGAAGAAC
CACAAAATAATGTTGAACCAGAGGTTCCTTCTGCCTCTGAATATAGTAGTATGAACACAG
AGATCAGGAGGGCAAGCAAGTTAAGACACATACCAGTTTTTGCAGTAGCTTTTGTGCTGT
TTCTTTCGTTCTTTGCTTTGGCTTTTGTTAAAGGAAAAACAAGTTCAATTTGAAAAATTT
GATTTGTCTCTCTTGAG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL5680Contig1 241 2 1 U
GGGCTATAGACAAGTTTGAAGACAAGAAACAGGTCGAGACCAACCCCAAGGTTCCATCGA
ATGTTTGATCTTCACTGGCTTTGATATGTCCAATAAAACCTGTTGTTTATCTGTCTTCCA
AGTTTTTACTTTACGAGTTTGGCTTTGTTTCTGACATCAATTGGCATATATGTTTTTGAG
TCTCAAGTCCAAATCCTTTGTACGACGGTTAAACAATTCTGATAGGACTTCTTATTGATG
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4AV67JQ C 1
AF RR4AV67TF U 1
BS 1 241 RR4AV67TF

RD RR4AV67JQ 241 0 0
GGGCTATAGACAAGTTTGAAGACAAGAAACAGGTCGAGACCAACCCCAAGGTTCCATCGA
ATGTTTGATCTTCACTGGCTTTGATATGTCCAATAAAACCTGTTGTTTATCTGTCTTCCA
AGTTTTTACTTTACGAGTTTGGCTTTGTTTCTGACATCAATTGGCATATATGTTTTTGAG
TCTCAAGTCCAAATCCTTTGTACGACGGTTAAACAATTCTGATAGGACTTCTTATTGATG
T

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4AV67TF 241 0 0
GGGCTATAGACAAGTTTGAAGACAAGAAACAGGTCGAGACCAACCCCAAGGTTCCATCGA
ATGTTTGATCTTCACTGGCTTTGATATGTCCAATAAAACCTGTTGTTTATCTGTCTTCCA
AGTTTTTACTTTACGAGTTTGGCTTTGTTTCTGACATCAATTGGCATATATGTTTTTGAG
TCTCAAGTCCAAATCCTTTGTACGACGGTTAAACAATTCTGATAGGACTTCTTATTGATG
T

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 2

CO CL5681Contig1 800 2 2 U
AGGGCTAATGGGTTTCGTCTTCAAGCTGTGGATGGAGTGGAGGATAGCGAGTCCGAGTCC
GGGGAGGAGATTGATGAGGAGGAAGTTGGGGATGATGATGTGGTTGAGGTTCATGAGATT
GAGGATAGTGATAATGAGGAAGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATGAAGAGGAGGAGGAG
GAGGATGAAGTGGATAATGTCGATCGTGGTCTTGGTGGCTCAGGGAGTAGTACTGGACGG
TTGATGAATGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGAT
GGTGAGACTGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGATGATGGTGAGTTTGGTGATGATGAT
GATGATGATGATGGTGATGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGGTATCTTGTTCATCCA
GTCTCTCAAGTGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGAC
AACGATCCAGATGAAGAAGAGGAAGTGGAAGATGATCTCCCAATGCCTGACCAGTCCTTG
CCATCATCATCTCGTCCAAAGAGAAAACGTGATGGTGATGAAGATGATGATGTCGATGAT
GATGATGACGATGATGATGATGACGATGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATTAGATGTGT
ACACACAAACCGTTGCTACTTGTGGAATAGGGCGGCAATGTTCAAAATAGTCAGTTATGG
TGAGGCTGGTGGATTTTCAAATGACGGTTACTCAAGTTGGATTTACCGCCCTTTTAGAAA
ACCCCCAACGTTATGGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C871TF U 1
AF RR4C871JQ C 166
BS 1 566 RR4C871TF
BS 567 800 RR4C871JQ

RD RR4C871TF 566 0 0
AGGGCTAATGGGTTTCGTCTTCAAGCTGTGGATGGAGTGGAGGATAGCGAGTCCGAGTCC
GGGGAGGAGATTGATGAGGAGGAAGTTGGGGATGATGATGTGGTTGAGGTTCATGAGATT
GAGGATAGTGATAATGAGGAAGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATGAAGAGGAGGAGGAG
GAGGATGAAGTGGATAATGTCGATCGTGGTCTTGGTGGCTCAGGGAGTAGTACTGGACGG
TTGATGAATGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGAT
GGTGAGACTGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGATGATGGTGAGTTTGGTGATGATGAT
GATGATGATGATGGTGATGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGGTATCTTGTTCATCCA
GTCTCTCAAGTGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGAC
AACGATCCAGATGAAGAAGAGGAAGTGGAAGATGATCTCCCAATGCCTGACCAGTCCTTG
CCATCATCATCTCGTCCAAAGAGAAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4C871JQ 635 0 0
GAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGAAGTGGATAATGTCGATCGTGGTCTTGGTGGCTCAGGG
AGTAGTACTGGACGGTTGATGAATGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGAT
GATGAGGATAATGATGGTGAGACTGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGATGATGGTGAG
TTTGGTGATGATGATGATGATGATGATGGTGATGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGG
TATCTTGTTCATCCAGTCTCTCAAGTGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAA
CCCATTAACGAGGACAACGATCCAGATGAAGAAGAGGAAGTGGAAGATGATCTCCCAATG
CCTGACCAGTCCTTGCCATCATCATTTCGTCCAAAGAGAAAACGTGATGGTGATGAAGAT
GATGATGTCGATGATGATGATGACGATGATGATGATGACGATGATGGGGTTGATGATGAG
GAAGATTAGATGTGTACACACAAACCGTTGCTACTTGTGGAATAGGGCGGCAATGTTCAA
AATAGTCAGTTATGGTGAGGCTGGTGGATTTTCAAATGACGGTTACTCAAGTTGGATTTA
CCGCCCTTTTAGAAAACCCCCAACGTTATGGAGGG

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL5682Contig1 241 2 1 U
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CAATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTCTTTAA
ATATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTAAACGT
TTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTTGTCCAGTGAAAAATATTATTGCTTTTGTTCTTTTA
G


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RR4E674JQ C 1
AF RR4E674TF U 1
BS 1 241 RR4E674TF

RD RR4E674JQ 241 0 0
GGTGAAGAGGGGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGTTGGT
CAATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTCTTTAA
ATATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTAAACGT
TTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTTGTCCAGTGAAAAATATTATTGCTTTTGTTCTTTTA
G

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4E674TF 241 0 0
GGTGAAGAGGGGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGTTGGT
CAATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTCTTTAA
ATATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTAAACGT
TTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTTGTCCAGTGAAAAATATTATTGCTTTTGTTCTTTTA
G

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 2

CO CL5683Contig1 816 2 2 U
GGACGTCCTTACGCCGAGCGAGATCTACACAATCTCCGATCCCCAAAATGGCGACGAGAA
GACGTACTTTGCTCAAGGTCATTGTCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGTAAGACTTCCTTGA
TGAATCAATATGTGCATAACAAGTTTAGTCAACAGTATAAAGCGACTATTGGTGCTGATT
TCGTGACCAAGGAGCTTCAGATTGGGGATAAGCTTGTTACTCTCCAGATTTGGGATACTG
CTGGACAAGAGAGGTTCCAGAGTCTTGGTGCTGCGTTTTACAGAGGTGCAGATTGTTGCG
CTTTGGTTTATGATGTCAACGTGGCCAAGTCCTTTGACTCCCTCGAAACTTGGCATGAGG
AGTTTCTTAAACAGGCAAGTCCAGCGGATCCAAAGACATTTCCGTTTATAGTGCTTGGAA
ACAAGGTTGACATAGGTGGAGGGAGCACTAGAGTGGTCTCTGAGACGAAAGCAGCTGACC
ATTGCCAAAACCGCTCTTGCCAACGAGAATGATCAGGACATATACTTCCAAGGCATACCA
GTTGCAGTGACTGAAAACGAGCCAAAAGGGGGTGGTTGCGCTTGCTGAACTGTGGATTTG
AACATTCTTTTGCGTTCGTTTTTGATACATTTGCTCGTTATTCATTGAAAGTTGGTGTAC
TCTTTGAGGATTTCAGAACGATAAGCTTGTAGAATCAATCTTTTCAGCTATTCCATCATG
TATTAATTTGATTGGAGGAGTCTGTATGATCAAAATCGATTCTGCTGGATACATTTTGTT
ATTTTCGGAAGAACAGTTATTTGCTCTTATTACCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F122TF U 1
AF RR4F122JQ C 462
BS 1 706 RR4F122TF
BS 707 816 RR4F122JQ

RD RR4F122TF 706 0 0
GGACGTCCTTACGCCGAGCGAGATCTACACAATCTCCGATCCCCAAAATGGCGACGAGAA
GACGTACTTTGCTCAAGGTCATTGTCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGTAAGACTTCCTTGA
TGAATCAATATGTGCATAACAAGTTTAGTCAACAGTATAAAGCGACTATTGGTGCTGATT
TCGTGACCAAGGAGCTTCAGATTGGGGATAAGCTTGTTACTCTCCAGATTTGGGATACTG
CTGGACAAGAGAGGTTCCAGAGTCTTGGTGCTGCGTTTTACAGAGGTGCAGATTGTTGCG
CTTTGGTTTATGATGTCAACGTGGCCAAGTCCTTTGACTCCCTCGAAACTTGGCATGAGG
AGTTTCTTAAACAGGCAAGTCCAGCGGATCCAAAGACATTTCCGTTTATAGTGCTTGGAA
ACAAGGTTGACATAGGTGGAGGGAGCACTAGAGTGGTCTCTGAGACGAAAGCAGCTGACC
ATTGCCAAAACCGCTCTTGCCAACGAGAATGATCAGGACATATACTTCCAAGGCATACCA
GTTGCAGTGACTGAAAACGAGCCAAAAGGGGGTGGTTGCGCTTGCTGAACTGTGGATTTG
AACATTCTTTTGCGTTCGTTTTTGATACATTTGCTCGTTATTCATTGAAAGTTGGTGTAC
TCTTTGAGGATTTCAGAACGATAAGCTTGTAGAATCAATCTTTTCA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4F122JQ 355 0 0
GAGACGAAAGCAGCTGACCATTGCCAAAACCGCTCTTGCCAACGAGAATGATCAGGACAT
ATACTTCCAAGGCATACCAGTTGCAGTGACTGAAAACGAGCCAAAAGGGGGTGGTTGCGC
TTGCTGAACTGTGGATTTGAACATTCTTTTGCGTTCGTTTTTGATACATTTGCTCGTTAT
TCATTGAAGGTTGGTGTACTCTTTGAGGATTTCAGAACGATAAGCTTGTAGAATCAATCT
TTTCAGCTATTCCATCATGTATTAATTTGATTGGAGGAGTCTGTATGATCAAAATCGATT
CTGCTGGATACATTTTGTTATTTTCGGAAGAACAGTTATTTGCTCTTATTACCAG

QA 1 355 1 355
DS 



AS 1 2

CO CL5684Contig1 1009 2 2 U
GGTCTCTAATCTAATCTCCTCCGTCGTGAACTCTGATTCCTCCCAAGACAATGTCGTCGA
ACAGCAGAGAAGCGAGGAGGCGGAAGATCTTAGAAAGAGGATCCGATCGTCTGGCCTTTA
TCACTGGTCAGATCAACGGCGTTCCTCCTCCTTCTTCCGATCCCACTTCCCTTACTCAAT
CTCATCCCCGCACTAGTGATTCCTCACCGGAGACGACTCCGCCTCCCGATCAGATACCTA
CGAATCGAGAAACAGCTTTCACCACTCATCAGGAAAACATCTCCGAGCCTGAAAATATGG
ATCGTATCATCCATCCAAGCGGTGCAGACTCTCTTCAGCCTCTCAACTATACAGAAACGT
TGGCTGAAGCCTCCGCTTCAGACACCAGAGAGACAAGGGTACAACAGCCTCTTGCAACCC
CATCAGTGACAGATTTGGGTGCTTCTCAAGCTTTTACTCCTCTGGTTAGTTTTGTGAACA
CCATCACTCCAAAACACATTGGAGCCGCCATTGATGCTTCCGAATACGCACGGATGTTCT
CATCTCTTTTGATCGCCCTTCTTGTCCTACTATCTCATCTCGGGTTCTCTTCCCTAGGCA
GCATTGTAAGCTTCAGGCCTGTCTTCTTGCTTCTCTTGACCGATGCCACCATTGTGCTGG
GACGTGTTCTACTGACCCATCATCATGGAGAACCTTCCTCGGCTTCAAGGCGAGAAAACT
CAGTAATGAATGGACAACAAGGCATAGCGGAGCAAGTGGGCAACGCCCTGGAGATGGTCT
TGACGATGAAGAAGATAATGAACGCTGTTTCTATGGATTTTAGCTTGTACGCTGTGTTTC
TCATATGCGGCCTCTTGTTCACATAAACCATCTTTGCTTAGGTCCTCCTTGTAGGTTTCT
GTTTTCTTATTTATTTCTGTTGCTTTTTCTTATAGATTACACTTGTGTGTCCGACATATT
TAATCCAGTATTTGGTTTGTTTGATAATAAGGAGGAGCTTTTGTGTCTT


BQ
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AF RR4F274TF U 1
AF RR4F274JQ C 372
BS 1 612 RR4F274TF
BS 613 1009 RR4F274JQ

RD RR4F274TF 612 0 0
GGTCTCTAATCTAATCTCCTCCGTCGTGAACTCTGATTCCTCCCAAGACAATGTCGTCGA
ACAGCAGAGAAGCGAGGAGGCGGAAGATCTTAGAAAGAGGATCCGATCGTCTGGCCTTTA
TCACTGGTCAGATCAACGGCGTTCCTCCTCCTTCTTCCGATCCCACTTCCCTTACTCAAT
CTCATCCCCGCACTAGTGATTCCTCACCGGAGACGACTCCGCCTCCCGATCAGATACCTA
CGAATCGAGAAACAGCTTTCACCACTCATCAGGAAAACATCTCCGAGCCTGAAAATATGG
ATCGTATCATCCATCCAAGCGGTGCAGACTCTCTTCAGCCTCTCAACTATACAGAAACGT
TGGCTGAAGCCTCCGCTTCAGACACCAGAGAGACAAGGGTACAACAGCCTCTTGCAACCC
CATCAGTGACAGATTTGGGTGCTTCTCAAGCTTTTACTCCTCTGGTTAGTTTTGTGAACA
CCATCACTCCAAAACACATTGGAGCCGCCATTGATGCTTCCGAATACGCACGGATGTTCT
CATCTCTTTTGATCGCCCTTCTTGTCCTACTATCTCATCTCGGGTTCTCTTCCCTAGGCA
GCATTGTAAGCT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4F274JQ 638 0 0
TCCGCTTCAGACACCAGAGAGACAAGGGTACAACAGCCTCTTGCAACCCCATCAGTGACA
GATTTGGGTGCTTCTCAAGCTTTTACTCCTCTGGTTAGTTTTGTGAACACCATCACTCCA
AAACACATTGGAGCCGCCATTGATGCTTCCGAATACGCACGGATGTTCTCATCTCTTTTG
ATCGCCCTTCTTGTCCTACTATCTCATCTCGGGTTCTCTTCCCTAGGCAGCATTGTAAGC
TTCAGGCCTGTCTTCTTGCTTCTCTTGACCGATGCCACCATTGTGCTGGGACGTGTTCTA
CTGACCCATCATCATGGAGAACCTTCCTCGGCTTCAAGGCGAGAAAACTCAGTAATGAAT
GGACAACAAGGCATAGCGGAGCAAGTGGGCAACGCCCTGGAGATGGTCTTGACGATGAAG
AAGATAATGAACGCTGTTTCTATGGATTTTAGCTTGTACGCTGTGTTTCTCATATGCGGC
CTCTTGTTCACATAAACCATCTTTGCTTAGGTCCTCCTTGTAGGTTTCTGTTTTCTTATT
TATTTCTGTTGCTTTTTCTTATAGATTACACTTGTGTGTCCGACATATTTAATCCAGTAT
TTGGTTTGTTTGATAATAAGGAGGAGCTTTTGTGTCTT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL5685Contig1 1172 2 8 U
GGGGAAGAAAAATTTATCAGCCCTTCATGGATCTCACTTTCACTCACAGATTCGTGAAGG
TCAACGGAATCAACATGCACTTCGCCGAGAAAACTCCCTCCGTCGCCTTCGCCGGAACTT
CACCTCCTCCGGCGATACTCTTCCTCCACGGATTCCCGGAGCTCTGGTACACGTGGCGGC
ACCAGATGGCGGCTCTCTCTTCCCTAGGCTACCGCACGATCGCCCCCGACCTGCGCGGAT
ACGGAGACACGGAGGCGCCGGAGAGCGCGGACGCGTACACGAGCCTCCACGTGGTCGGAG
ATCTGATCGGACTGATCGACGCGGTGGTCGGAGGAGATCAGGAGAAAGTGTTCGTGGTGG
GACACGACTGGGGAGCGATCATCGCGTGGCATCTCTGTCTCCTCAGACCGGACAGGGTTA
AGGCTCTGGTGAACATGAGCGTGGTGTTCGAGCCTTGGAGCCTCAAGAGGAAACCGATCC
CAATGTTTAAGTCGTTCTACGGAGATGACTACTATATCTGCAGGTTTCAGGAGTATGGGG
AAATAGAGGCGGAGTTCGCTAAAGTTGGCACGGAACGGGCGCTTATGGAGTTTTTAACGT
ATAGTGATACTGGTCCTATACTCTTACCTAAAGGGAAAAGCTGTGATGATTATGATGATC
CTGTTTCACTCCCCTCTTGGCTAACAGAGTATGATGTTAAGTATTACGTTTCCAAGTACG
AGAAGAGTGGCTTCACTGGACCTGTTAACTACTACCGAAACATGGACCGCACGTGGGAGA
TGATGGGGACATTCTCAAACGCTCAGGTGAAAGTTCCGGTTAAGTTTATAATCGGAGACC
AAGATTTGACGTATCACATTCCAGGGACCAAGAAGTACATCCACGATGTCCGGTTTAAGA
GCCACGTACCGTTGTTAGACGAAGTTGTGGTAATTAAAGGCGTTGGCCATTTTCTCCATG
AGGAAAGGCCTGAGGAGATAAGTAAACACATCCACGACTATTTCCGCACTTTTTAGACCC
AAATTGTAATTTAGGTATTACACAAAGATAAAGAAAATGCTCTTCGAATTTCATAAATGA
AATTTGCATAAACGTTGTTACCTCTGTTATGTAATGTTTTTGTAGATGCATGACATGTAC
CTGGAAGACACTTTAAGCCAAGGTTTATTACC


BQ
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AF RR4D592TF U 1
AF RR4D592JQ C 479
BS 1 683 RR4D592TF
BS 684 684 RR4D592JQ
BS 685 714 RR4D592TF
BS 715 715 RR4D592JQ
BS 716 723 RR4D592TF
BS 724 724 RR4D592JQ
BS 725 733 RR4D592TF
BS 734 1172 RR4D592JQ

RD RR4D592TF 733 0 0
GGGGAAGAAAAATTTATCAGCCCTTCATGGATCTCACTTTCACTCACAGATTCGTGAAGG
TCAACGGAATCAACATGCACTTCGCCGAGAAAACTCCCTCCGTCGCCTTCGCCGGAACTT
CACCTCCTCCGGCGATACTCTTCCTCCACGGATTCCCGGAGCTCTGGTACACGTGGCGGC
ACCAGATGGCGGCTCTCTCTTCCCTAGGCTACCGCACGATCGCCCCCGACCTGCGCGGAT
ACGGAGACACGGAGGCGCCGGAGAGCGCGGACGCGTACACGAGCCTCCACGTGGTCGGAG
ATCTGATCGGACTGATCGACGCGGTGGTCGGAGGAGATCAGGAGAAAGTGTTCGTGGTGG
GACACGACTGGGGAGCGATCATCGCGTGGCATCTCTGTCTCCTCAGACCGGACAGGGTTA
AGGCTCTGGTGAACATGAGCGTGGTGTTCGAGCCTTGGAGCCTCAAGAGGAAACCGATCC
CAATGTTTAAGTCGTTCTACGGAGATGACTACTATATCTGCAGGTTTCAGGAGTATGGGG
AAATAGAGGCGGAGTTCGCTAAAGTTGGCACGGAACGGGCGCTTATGGAGTTTTTAACGT
ATAGTGATACTGGTCCTATACTCTTACCTAAAGGGAAAAGCTGTGATGATTATGATGATC
CTGTTTCACTCCCCTCTTGGCTA*CAGAGTATGATGTTAAGTATTACGTTTCCA*GTACG
AGA*GAGTGGCTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4D592JQ 694 0 0
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GGAAATAGAGGCGGAGTTCGCTAAAGTTGGCACGGAACGGGCGCTTATGGAGTTTTTAAC
GTATAGTGATACTGGTCCTATACTCTTACCTAAAGGGAAAAGCTGTGATGATTATGATGA
TCCTGTTTCACTCCCCTCTTGGCTAACAGAGTATGATGTTAAGTATTACGTTTCCAAGTA
CGAGAAGAGTGGCTTCACTGGACCTGTTAACTACTACCGAAACATGGACCGCACGTGGGA
GATGATGGGGACATTCTCAAACGCTCAGGTGAAAGTTCCGGTTAAGTTTATAATCGGAGA
CCAAGATTTGACGTATCACATTCCAGGGACCAAGAAGTACATCCACGATGTCCGGTTTAA
GAGCCACGTACCGTTGTTAGACGAAGTTGTGGTAATTAAAGGCGTTGGCCATTTTCTCCA
TGAGGAAAGGCCTGAGGAGATAAGTAAACACATCCACGACTATTTCCGCACTTTTTAGAC
CCAAATTGTAATTTAGGTATTACACAAAGATAAAGAAAATGCTCTTCGAATTTCATAAAT
GAAATTTGCATAAACGTTGTTACCTCTGTTATGTAATGTTTTTGTAGATGCATGACATGT
ACCTGGAAGACACTTTAAGCCAAGGTTTATTACC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5686Contig1 241 2 1 U
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GCAGCTTCACGAGAAGCAATCCCAAGAAGAACAGGAAACGCGAAGATGTTACTCTCTTTC
AGCGATTTCAATAGCAAAACGCTGAGTTTTAGTGACAACCCGTTTCGTCTCAGGCCCATG
TTCATCGGAAAAGTCACAGAACAGAGCTCTGCTTCCTCCTCAAACGAACAACAAGTAGAT
G


BQ
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20 

AF RR4AD51JQ C 1
AF RR4AD51TF U 1
BS 1 241 RR4AD51TF

RD RR4AD51JQ 241 0 0
GGGCCGACTTTGTGACATCTGGCAATGTCGAGTAAGCTTATCCAGCCACCACCACCAATG
GCAGCTTCACGAGAAGCAATCCCAAGAAGAACAGGAAACGCGAAGATGTTACTCTCTTTC
AGCGATTTCAATAGCAAAACGCTGAGTTTTAGTGACAACCCGTTTCGTCTCAGGCCCATG
TTCATCGGAAAAGTCACAGAACAGAGCTCTGCTTCCTCCTCAAACGAACAACAAGTAGAT
G

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4AD51TF 241 0 0
GGGCCGACTTTGTGACATCTGGCAATGTCGAGTAAGCTTATCCAGCCACCACCACCAATG
GCAGCTTCACGAGAAGCAATCCCAAGAAGAACAGGAAACGCGAAGATGTTACTCTCTTTC
AGCGATTTCAATAGCAAAACGCTGAGTTTTAGTGACAACCCGTTTCGTCTCAGGCCCATG
TTCATCGGAAAAGTCACAGAACAGAGCTCTGCTTCCTCCTCAAACGAACAACAAGTAGAT
G

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 2

CO CL5687Contig1 1261 2 2 U
AAGCAAAGAAAATATGAGTAGCAGCAGCCGATGGAATCGTACGATCTACGTTGGGAACTT
ACCTGGTGATATTCGCATGAGAGAGGTTGAAGATCTCTTCTACAAGTATGGACCCATTGT
GGACATTGATTTGAAGATTCCACCTAGGCCTCCCGGTTATGCATTCGTCGAGTTTGAAGA
TCCTCGTGATGCAGACGATGCTATTTATGGACGGGATGGGTATGACTTTGATGGATGTCG
ACTTCGGGTTGAGATTGCACATGGTGGTCGTAGAGGTTCTACATCATCGGTGGATAGGTA
CAGCAGCAGCTACAGTGGGAGCCGTGCACCTTCTAGGCGTTCCGACTATCGTGTGCTTGT
CACGGGATTGCCGTCGTCTGCTTCCTGGCAGGACCTTAAGGACCACATGCGCAAAGCTGG
AGATGTCTGCTTTTCTGAAGTTTTTCGTGACCGTGGAGGCATGTCTGGGGGTTGTGGACT
ATAGCAACTATGATGATATGAAGTAAAGAAGCTTGATGATTCTGAGTTTCGAAATGCTTT
CTCTAGAGCTTATATACGGGTAAGAGAATATGAGTCGAGGAGTGTGAGTCGCAGCCCGTA
CTATTCTAGAAGAAGCAGGAGTCGAAGCTATAGTTATAGTAGCAGAAGTGTGTCGCCTGC
TAGATCGAGATCTGTCCGTTCTCCAACTCCTCTTTCTCGTTCTCCAACACCGCGTAGCTC
AGTCTCAAGATCTGGCTCACTGCGGCGAGCTGGGGACTGGATCTTAGGGACTTGATGGAT
CATCTATAGATGGGTTCTAGGGACTTACTGCTCTGATACTCAGCTCAGATCCTCGCAACA
TTTGGGATTAACAGTCCTTTTGATTCTCTTAACGTTTTCTTTTTGTTGTCTATGCTGGAA
TCCATGTTTTGTTCTTTTCCAGACCAACAACACTCTAAATTCCGGACGCCACAGTAAACA
TTTGTTGTCTTTGCTGCAGGTCCCGATCGAGATCGATATCAGATTCTCCAGTTTCACCCG
TGCGATCTGACTGAAAAGGAGAACTGGTGACCAGGAATAGAGGACCGCCGTATCCAAATT
GATTCATGCTTCTCATGGTCCACTCGTAGTATAATAATCTGATTTGGATTTGAGTTACTA
TATCTCGGATGACGGTTGATAATAATGTCTTTCTTTTCAAACTTATAGTTGGCCTGTTAT
TGTCTTTTTGCAATGAACCGAACCTCTACAAATAAGTCTATTTATAGATTGTGGTTGCTC
G


BQ
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10 

AF RR4EZ70TF U 1
AF RR4EZ70JQ C 426
BS 1 675 RR4EZ70TF
BS 676 1261 RR4EZ70JQ

RD RR4EZ70TF 675 0 0
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ACCTGGTGATATTCGCATGAGAGAGGTTGAAGATCTCTTCTACAAGTATGGACCCATTGT
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TCCTCGTGATGCAGACGATGCTATTTATGGACGGGATGGGTATGACTTTGATGGATGTCG
ACTTCGGGTTGAGATTGCACATGGTGGTCGTAGAGGTTCTACATCATCGGTGGATAGGTA
CAGCAGCAGCTACAGTGGGAGCCGTGCACCTTCTAGGCGTTCCGACTATCGTGTGCTTGT
CACGGGATTGCCGTCGTCTGCTTCCTGGCAGGACCTTAAGGACCACATGCGCAAAGCTGG
AGATGTCTGCTTTTCTGAAGTTTTTCGTGACCGTGGAGGCATGTCTGGGGGTTGTGGACT
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CTCTAGAGCTTATATACGGGTAAGAGAATATGAGTCGAGGAGTGTGAGTCGCAGCCCGTA
CTATTCTAGAAGAAGCAGGAGTCGAAGCTATAGTTATAGTAGCAGAAGTGTGTCGCCTGC
TAGATCGAGATCTGT

QA 1 675 1 675
DS 

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AACTATGATGATATGAAGTAAAGAAGCTTGATGATTCTGAGTTTCGAAATGCTTTCTCTA
GAGCTTATATACGGGTAAGAGAATATGAGTCGAGGAGTGTGAGTCGCAGCCCGTACTATT
CTAGAAGAAGCAGGAGTCGAAGCTATAGTTATAGTAGCAGAAGTGTGTCGCCTGCTAGAT
CGAGATCTGTCCGTTCTCCAACTCCTCTTTCTCGTTCTCCAACACCGCGTAGCTCAGTCT
CAAGATCTGGCTCACTGCGGCGAGCTGGGGACTGGATCTTAGGGACTTGATGGATCATCT
ATAGATGGGTTCTAGGGACTTACTGCTCTGATACTCAGCTCAGATCCTCGCAACATTTGG
GATTAACAGTCCTTTTGATTCTCTTAACGTTTTCTTTTTGTTGTCTATGCTGGAATCCAT
GTTTTGTTCTTTTCCAGACCAACAACACTCTAAATTCCGGACGCCACAGTAAACATTTGT
TGTCTTTGCTGCAGGTCCCGATCGAGATCGATATCAGATTCTCCAGTTTCACCCGTGCGA
TCTGACTGAAAAGGAGAACTGGTGACCAGGAATAGAGGACCGCCGTATCCAAATTGATTC
ATGCTTCTCATGGTCCACTCGTAGTATAATAATCTGATTTGGATTTGAGTTACTATATCT
CGGATGACGGTTGATAATAATGTCTTTCTTTTCAAACTTATAGTTGGCCTGTTATTGTCT
TTTTGCAATGAACCGAACCTCTACAAATAAGTCTATTTATAGATTGTGGTTGCTCG

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL5688Contig1 1170 2 2 U
GCTTTTATCTTTCCGCAGTGTATCTGATCTCCCAAACTCAACAGTAATGATGTTCATTAC
TCCTTCATTTTGGGATCAACAAATAATATTTCTTCTTTAATCTTTGTTACAAGTTATTAA
AGTTCGCAACTAAGTTTGCTCAATGGACGATATATACACATACACACACACCACGTTGGC
ATGGTCCATCTTCAGCTAAATCGGTTAAACAATAATATCATGTTTCATCACGGTTTGGTT
TAAAAAACTTTTTGCCACTCTGCTTCAATCAGCACTCATGAATACCAAAATAATACTAAC
CAATTTGTAACGATATTCGTAGGTCACAACGGTATACAAAAGAGACGAAACATCTATCAC
AGAGGATCCGACATGTCATTCATATCTTTTATCCAATGGTTATCCGAAAAGATCTTAGAG
ATAGTCCTATTAATTGCTAAACGATATTCTTTTTTTTGATCAAAGTAGTCAGAGAGAATA
ACTCAGCAGAGGTAAAAAAGATATATCTCATGGTGAAAAATATAAAAACTCGAGTAGATT
TGCATAATAATTGATCAAATGTTTCTGGATTTGTACGGTACGGATCCAACCGGTGATCAG
AGGTCAGAAGTGAAGGTCTTTTCTACTTTTTATCTTCTTCTTTTATTGTATTTGGAGGTC
CCATTAAAGAAAAACGAAAGTGTTGTCTGAGTCATAAGGAAGAAAAAGGGGTCGAAAACG
AAAATAGAGTAAATTTAGGGTACACAAAAGTGTCAGATAGGAGAGAAAATACAGAGGTGT
GGACCTCTCCGCAAAGAAAAAGTGTGTGAGTTATTAAATGCAACTTGTCAATTTCTACTT
ATCATATATGGCTCGATGCATCTTGTGAATTATACACTGACACTTTTCGCTTGTTGTCCT
CGTGTTTATACATTCCTGTTGTTGCAACTTAGAATTGTTATTTTCAGAGTTTACAGATCA
ATATCTTAATAATATATTTCAAATATTTGATTTGATTGATTATTGAAACTACAAATATAA
CATGATTACTGGTAGTAGGACTAATGGAAAACTCTAGTAAAATTCTTTTTACTTTTTTTT
TTGGATCAAAATTCTTTTTACATTTCTTTATGTAACTTTCTGGTTGTAAGTATTGTTTTA
TGTTGACAAAACAAGTACTGTTTTGTTTGC


BQ
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AF RR4EX09TF U 1
AF RR4EX09JQ C 458
BS 1 700 RR4EX09TF
BS 701 1170 RR4EX09JQ

RD RR4EX09TF 706 0 0
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TCCTTCATTTTGGGATCAACAAATAATATTTCTTCTTTAATCTTTGTTACAAGTTATTAA
AGTTCGCAACTAAGTTTGCTCAATGGACGATATATACACATACACACACACCACGTTGGC
ATGGTCCATCTTCAGCTAAATCGGTTAAACAATAATATCATGTTTCATCACGGTTTGGTT
TAAAAAACTTTTTGCCACTCTGCTTCAATCAGCACTCATGAATACCAAAATAATACTAAC
CAATTTGTAACGATATTCGTAGGTCACAACGGTATACAAAAGAGACGAAACATCTATCAC
AGAGGATCCGACATGTCATTCATATCTTTTATCCAATGGTTATCCGAAAAGATCTTAGAG
ATAGTCCTATTAATTGCTAAACGATATTCTTTTTTTTGATCAAAGTAGTCAGAGAGAATA
ACTCAGCAGAGGTAAAAAAGATATATCTCATGGTGAAAAATATAAAAACTCGAGTAGATT
TGCATAATAATTGATCAAATGTTTCTGGATTTGTACGGTACGGATCCAACCGGTGATCAG
AGGTCAGAAGTGAAGGTCTTTTCTACTTTTTATCTTCTTCTTTTATTGTATTTGGAGGTC
CCATTAAAGAAAAACGAAAGTGTTGTCTGAGTCATAAGGA
GAAAAA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4EX09JQ 713 0 0
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AAATATAAAAACTCGAGTAGATTTGCATAATAATTGATCAAATGTTTCTGGATTTGTACG
GTACGGATCCAACCGGTGATCAGAGGTCAGAAGTGAAGGTCTTTTCTACTTTTTATCTTC
TTCTTTTATTGTATTTGGAGGTCCCATTAAAGAAAAACGAAGGTGTTGTCTGAGTCATAA
GGAAGAAAAAGGGGTCGAAAACGAAAATAGAGTAAATTTAGGGTACACAAAAGTGTCAGA
TAGGAGAGAAAATACAGAGGTGTGGACCTCTCCGCAAAGAAAAAGTGTGTGAGTTATTAA
ATGCAACTTGTCAATTTCTACTTATCATATATGGCTCGATGCATCTTGTGAATTATACAC
TGACACTTTTCGCTTGTTGTCCTCGTGTTTATACATTCCTGTTGTTGCAACTTAGAATTG
TTATTTTCAGAGTTTACAGATCAATATCTTAATAATATATTTCAAATATTTGATTTGATT
GATTATTGAAACTACAAATATAACATGATTACTGGTAGTAGGACTAATGGAAAACTCTAG
TAAAATTCTTTTTACTTTTTTTTTTGGATCAAAATTCTTTTTACATTTCTTTATGTAACT
TTCTGGTTGTAAGTATTGTTTTATGTTGACAAAACAAGTACTGTTTTGTTTGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL5689Contig1 238 2 1 U
GGGGGAGCACGTTTTGCGGGAGACATAGGTACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCGATT
TCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCCGATAAAG
TCCAGAGGATTTGATTGTGATGTGATGTGTCTATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGTTGC
TGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAAAATTGCTAC


BQ
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AF RR4D195JQ C 1
AF RR4D195TF U 1
BS 1 238 RR4D195TF

RD RR4D195JQ 238 0 0
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TGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAAAATTGCTAC

QA 1 238 1 238
DS 

RD RR4D195TF 238 0 0
GGGGGAGCACGTTTTGCGGGAGACATAGGTACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCGATT
TCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCCGATAAAG
TCCAGAGGATTTGATTGTGATGTGATGTGTCTATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGTTGC
TGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAAAATTGCTAC

QA 1 238 1 238
DS 



AS 1 2

CO CL5690Contig1 919 2 4 U
TTTTTCATCAATGTGAAGGTTTCTAATCTGATGAGCAAGTGGTTCGGTGATGCACAGAAG
CTTGTGGCTGCTGTGTTTAGCTTGGCGGAGAAACTCCAACCTGCCATTATTTTTATAGAC
GAGGTGGATAGTTTTCTTGGACAGCGGCGTGCGACGGATAACGAAGCGATGGCGAATATG
AAGACTGAGTTTATGGCTCTCTGGGATGGGTTTACTACAGACCAGAACGCGAGGGTGATG
GTTCTTGCTGCAACGAACAGACCTTCTGAGCTTGATGAAGTTATACTGAGACGGTTTCCT
CAGGCGTTTGAGATCGGTATGCCTGACCTCAAGGAGAGAGCTCAGATATTGGAAGTTGTT
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GACTATACCGGTTCGGATATCTTTGAGCTCTGCAAGAAAGCAGCTTACTTCCCAATCAGA
GAAATCTTAGAGGAAGAGAAAAAGGGCAGAGAAGTTTCAACGCCTAGGCCATTGACACAG
TTGGACTTGGAGAAGGTTCTTGCTACTTTTAAGAAGACACAGGTTGCTGCAAGTGAGTAT
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GCAGCTATAAATGGCATTTCAAAGCTCTTTGTCCCTCGGATTGTAAACCATCAGTCGGAT
TCCCAGGATTTAAGTCAGCGTGATCCAGAAGGAGATTCAGAATAGAAGATTTTTTTTTGG
GGTTTGTTGTGTATAACCACCAAAGTATACTAGAAAATTCACACTTTTTTCAGATGTTTG
AATCATGGGCATTTTTTTTATACATCATTTGTGATTTTTTGGGCTGTTTTTAGGAAATTT
AATTACTTGCTTTTCATTT


BQ
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AF RR4C382TF U 1
AF RR4C382JQ C 301
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BS 529 551 RR4C382TF
BS 552 919 RR4C382JQ

RD RR4C382TF 551 0 0
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TTGGACTTGGA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4C382JQ 619 0 0
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TCCCAGGATTTAAGTCAGCGTGATCCAGAAGGAGATTCAGAATAGAAGATTTTTTTTTGG
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AATCATGGGCATTTTTTTTATACATCATTTGTGATTTTTTGGGCTGTTTTTAGGAAATTT
AATTACTTGCTTTTCATTT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL5691Contig1 1200 2 2 U
GGAAACAACAATCATGGAGTCTCTGGGAAGATTAAAGATTCACCGCCAGCCATTCTTCAC
TCACACCTCTTCATCCTCCTTCCTTGAACAATCTTCCACCTTCAGACCATTTATCCGCCC
AAACTCCTCTTTCAGATACCCTTCAATCAAAGCTTCTTCCTCTTCCAAATCTCAAAACTT
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AACAACCGCCGCTGCTCTCCTTTCCCTCAACCTCCAGCTCAAACCACCGGCCATCGCAGC
TCCCCTCACACCTCCTTCGTCAACGGACAGCGACAAACACGTCACCTACGAAGAGCAAGA
GAGAGCCCTCGAAGAGCATTTAGCAACTCACCCAACCGACGTGGACTCTCTTCGCTCCTT
GGTGGAGGTAAAATTCGGATCTTATAAGCTCCCAGAAGCTATACAAGTACTCGACCGTCT
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TTTTTGCCAAGGAGCGATATACACTTTGCTGAAGGAGGAAGACAAGGCGGAGGAACAGTA
TCTCAAGTTTAAGAGACTTGTACCGGAGAATTATAATTATATGGAGGATTTCTTGGTTAA
TAATTTGTTTGCAGGAGAGCTTTTCTAAGGTTAGAGGATCAGGAGAGTTGTATGGTGGAT
TGTGTTTGAATGGTGGGATGGTCTGTAACGTTTTAGCTATTTGTATTGAGATAAAAATAA
TGCTTGAGTTAACTATGATGATTTGATTTGAATGATGGATTTGATTTGGATGATGGCTTT
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BQ
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AF RR4CU48TF U 1
AF RR4CU48JQ C 424
BS 1 657 RR4CU48TF
BS 658 1200 RR4CU48JQ

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TCACACCTCTTCATCCTCCTTCCTTGAACAATCTTCCACCTTCAGACCATTTATCCGCCC
AAACTCCTCTTTCAGATACCCTTCAATCAAAGCTTCTTCCTCTTCCAAATCTCAAAACTT
GATCATCCATCTTCAAAAGTCCGCACTTTTCCGCGTCCTCAAGTCCACCTGCATCACTAT
AACAACCGCCGCTGCTCTCCTTTCCCTCAACCTCCAGCTCAAACCACCGGCCATCGCAGC
TCCCCTCACACCTCCTTCGTCAACGGACAGCGACAAACACGTCACCTACGAAGAGCAAGA
GAGAGCCCTCGAAGAGCATTTAGCAACTCACCCAACCGACGTGGACTCTCTTCGCTCCTT
GGTGGAGGTAAAATTCGGATCTTATAAGCTCCCAGAAGCTATACAAGTACTCGACCGTCT
GATAAAACTGGAACCGGACGAACCGAAATGGCCGGTTCAGAAAGCCAGATACTTTACTTG
CGATGGATATACACAATCAGCTAAAACCGTACTGGAAGAGGTTCTAGCTAAACACCCTCT
TCGCGCTGAAGCTTATCACGGCTTGGTCGTGGCTTACTCCAATGCAGGTCTTGATTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4CU48JQ 777 0 0
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AAAACTGGAACCGGACGAACCGAAATGGCCGGTTCAGAAAGCCAGATACTTTACTTGCGA
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CGCTGAAGCTTATCACGGCTTGGTCGTGGCTTACTCCAATGCAGGTCTTGATTGGAGAAA
GGTGGAGAGGAGAATCGAGGAAGCGATGTTGAGATGCGAGAGGGAGGACAAGCGCAAGGA
GTATCGTGAGTTTAAGCATCTCGTGGCTCAGATTCGTGTGGTTAGAGGGAAACACAGCGA
AGCACTGAAGCTTTATGAAGAGCTTGTCGAAGATGAACCAAGTGATTTCTGGCCGTATTT
TTGCCAAGGAGCGATATACACTTTGCTGAAGGAGGAAGACAAGGCGGAGGAACAGTATCT
CAAGTTTAAGAGACTTGTACCGGAGAATTATAATTATATGGAGGATTTCTTGGTTAATAA
TTTGTTTGCAGGAGAGCTTTTCTAAGGTTAGAGGATCAGGAGAGTTGTATGGTGGATTGT
GTTTGAATGGTGGGATGGTCTGTAACGTTTTAGCTATTTGTATTGAGATAAAAATAATGC
TTGAGTTAACTATGATGATTTGATTTGAATGATGGATTTGATTTGGATGATGGCTTTGTA
TTGATTCGTGAGTTATGTTCATCCCGGTTTTGTTTTTCTAAGCAGTTTTAAATAACC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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TGCATTTCAAGCAGCAGCTTGCAGCATATGTTGAAAAGATTCTTGGGATTATCTGGGATA
AACTGAAAAAAGAGTTGAACACTTCCCTTACTCTCTGCATCCAGGCACCAAAAACGTTCA
AGGGGACTGCGCTAATGTCTGATAGCACTGCTAAATACTGGCAGGGGATTATTGAAGGAC
TAGATGCACTGCTAAGCACACTTAAAGAGAACTTCGTTCCTCTGGTTCTTATCCACAAGA
TATTGTCTCAGGCTTTCTCACTCATCAATGTCCAACTGTGGAACAGCGTTATGACGCGAC
CAGATAACTGTTCGTTCATCAATGGAGAATATGTAAAATCTGGTTTAGAAAAGTTAGAGG
TTTGGTGCTTGGAAACAAATGAAGAGTATGCTGGCTCATCCTGGGATGAACTCAAACATA
CCAGACAGGCTGTTGGATTCTTGCTCTTCCATAATAAGTACAAAATCTCATACGATGAGA
TTGCAAAAAAATTGTGTCCAATCCTTAGAATACAGCAGCATTTCAGATTATGTACTCTGT
ATAAAGATGAAATCTACAACACAAAAAGTGTTTCTCAAGAGGTCATAGAGAACATGGCAG
GAGTTATGACAGATAGCAGCGACTTCTTGTTAAAAGATGATTCTAGCAACAGCATATCTC
TCTTGATCGATGACTTATCTAGTTCAATGCAAGATAAGGACTTTGCACAAGTGAAACCTG
CTGAGGAACTAGTGGAGAATCCAGCTTTCAGTTTCTTGCAATAGTGTAACTCAGTGAAAC
CAAAAAACAAGAACACCATTCAAAAAGAAAAAAAAAACAGGATGAAGAATCTCTCTTAGA
TGAAAGGGCTTATTGGATTTGTTTATTTGTCTCATTGGATTTATCTCTCTAATTACCAAG
AGATATTATTTTGCTGGGAGAGAGAGTACAAAAGACATCCGGTTATTATTTATGGGTCAC
TTCTTTTGTTGGTGGAAACAAGGATATATAGTTTGTACAGAAGACAATATATATTTAGTA
TAAAAGAGAAAAAAATTGTTCTTAGGATAAGAAAGC


BQ
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AF RR4D912TF U 1
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BS 1 613 RR4D912TF
BS 614 1116 RR4D912JQ

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AACTGAAAAAAGAGTTGAACACTTCCCTTACTCTCTGCATCCAGGCACCAAAAACGTTCA
AGGGGACTGCGCTAATGTCTGATAGCACTGCTAAATACTGGCAGGGGATTATTGAAGGAC
TAGATGCACTGCTAAGCACACTTAAAGAGAACTTCGTTCCTCTGGTTCTTATCCACAAGA
TATTGTCTCAGGCTTTCTCACTCATCAATGTCCAACTGTGGAACAGCGTTATGACGCGAC
CAGATAACTGTTCGTTCATCAATGGAGAATATGTAAAATCTGGTTTAGAAAAGTTAGAGG
TTTGGTGCTTGGAAACAAATGAAGAGTATGCTGGCTCATCCTGGGATGAACTCAAACATA
CCAGACAGGCTGTTGGATTCTTGCTCTTCCATAATAAGTACAAAATCTCATACGATGAGA
TTGCAAAAAAATTGTGTCCAATCCTTAGAATACAGCAGCATTTCAGATTATGTACTCTGT
ATAAAGATGAAAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4D912JQ 741 0 0
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CAAATGAAGAGTATGCTGGCTCATCCTGGGATGAACTCAAACATACCAGACAGGCTGTTG
GATTCTTGCTCTTCCATAATAAGTACAAAATCTCATACGATGAGATTGCAAAAAAATTGT
GTCCAATCCTTAGAATACAGCAGCATTTCAGATTATGTACTCTGTATAAGGATGAAATCT
ACAACACAAAAAGTGTTTCTCAAGAGGTCATAGAGAACATGGCAGGAGTTATGACAGATA
GCAGCGACTTCTTGTTAAAAGATGATTCTAGCAACAGCATATCTCTCTTGATCGATGACT
TATCTAGTTCAATGCAAGATAAGGACTTTGCACAAGTGAAACCTGCTGAGGAACTAGTGG
AGAATCCAGCTTTCAGTTTCTTGCAATAGTGTAACTCAGTGAAACCAAAAAACAAGAACA
CCATTCAAAAAGAAAAAAAAAACAGGATGAAGAATCTCTCTTAGATGAAAGGGCTTATTG
GATTTGTTTATTTGTCTCATTGGATTTATCTCTCTAATTACCAAGAGATATTATTTTGCT
GGGAGAGAGAGTACAAAAGACATCCGGTTATTATTTATGGGTCACTTCTTTTGTTGGTGG
AAACAAGGATATATAGTTTGTACAGAAGACAATATATATTTAGTATAAAAGAGAAAAAAA
TTGTTCTTAGGATAAGAAAGC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL5693Contig1 611 2 5 U
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TCTCTGTCGTTAACTCTTCTTCTTCTTCGCGTTCGAAAGATGTGAATAGAGAGCCAAAAA
AGAAAGTGAAACTACGACAAGACTGGAGGGAAAAGTCCAAACCTATACCACCCGGAGGCA
CCTATCCAGCAAAAGATCATTGCAGTCGATGTGGGCTATGCGACACCTACTACATTGCCC
ATGTGAAGGATGCATGTGCTTTTCTTGGAGATGGAATGTCAAGGATTGAGAGCTTGGAAC
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ATCAAGAGCAGCTCTATGCTCGTAAGCTCAAGCCTGTTGAAGGAGCACAGTGGACTGGAA
TTGTCACAACCATTGCCATTGAGATGCTGAAATCTAACATGGTTGAGGCTGTTGTTTGTG
TGCAGAGTGACCCTGAAGATAGATTGTCTCCAAGACCAGTATTAGCCAGAACACCTGAAG
AAGTTTTCGCAGCAAGAGGCGTCAAACCAACTCTGTCTCCTAATCTGAATACTCTTGAAC
TAATCGAGTCT


BQ
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AF RR4C747TF U 65
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AG

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DS 

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TCTCTGTCGTTAACTCTTCTTCTTCTTCGCGTTCGAAAGATGTGAATAGAGAGCCAAAAA
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CCTATCCAGCAAAAGATCATTGCAGTCGATGTGGGCTATGCGACACCTACTACATTGCCC
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CTGTTGTGCATGGTAGAGGAAGGAAAGCAGATTCCTTAGAAGATACATACTTTGGGGTCC
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QA 1 611 1 611
DS 



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TCCTGTCCTTTTTATCACATTCCTTGACCATATCGTCATCTTCTACTACCTTTTCAACCC
TGAAATGTCTGCAAACCACTTTCCCCGCATATAACCACTTTCCTTAAACTGGTCACCAGT
TACTTACTTACTTCCATGTAAACCGGTTCAAACTGGTTGTCTTTCTCCGCAAGAAAGATT
TGGAAGCCCATGTTCACAGAGTTAGCTAATAGTTGAATCAAACCAACACCCTACAGGCGA
ACAGATACGTTAAAAAGTAACTAAAAGATATAACAGTATTTAGTCTAGTCTCAGTTAAAA
GTGATATTAACACCATATAAGAATCCGTTTAGACGGTGCTCTCAGGAACCTATAGTCCAA
TAAGTGAAGAGTTTTGTGTTATTATCAACATATATATCCAGACATAGTGGATGAGGGAAT
TGATGGGATTAATCACGGACTCTTAACTCCGGCCGTTTTGATGAGTGAAAGCGGAAACGA
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GCTTAGCGCCTCTTCTGTCTCGGGCCGTCTACGGACCAAACGATGACACTCCAAAGCGCA
GTCCGAGAATACACTCAAGAAGCCCATTACGCGGAGGTTTTAATGAAACGCAGCATACAG
GACACGTGGCGCCGCGACATCTCTCGACTTTCCAGCCTGTATGTCGACGTGTCTTTCTTA
GGAAAAAGAGAGAACATTTTTTTATATATAAAGATTTGAAAGCGTAGAGTAAAATTCGGA
CTTTTACTAACAAAAAATAAAAATTCGATTCGGAGAAAACCAAATCGGTCATTACTAAAT
TTACCACGCTGCAACTGAGGGTAGATTCTAAACACCACGTCAGTTTACCCAAAAGTAAAG
TATATGCAATCAACAGACAACATGACAATATTGTCCAATTCAGTTTCGCCTCGTGGCAAA
TCCACGTAGACGTCGCGAAACTTCCAGTGAACGCGCAAGGATGCAAAGATTATAAATCGT
CTTGACCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU67TF U 1
AF RR4EU67JQ C 551
BS 1 685 RR4EU67TF
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TCCTGTCCTTTTTATCACATTCCTTGACCATATCGTCATCTTCTACTACCTTTTCAACCC
TGAAATGTCTGCAAACCACTTTCCCCGCATATAACCACTTTCCTTAAACTGGTCACCAGT
TACTTACTTACTTCCATGTAAACCGGTTCAAACTGGTTGTCTTTCTCCGCAAGAAAGATT
TGGAAGCCCATGTTCACAGAGTTAGCTAATAGTTGAATCAAACCAACACCCTACAGGCGA
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TAAGTGAAGAGTTTTGTGTTATTATCAACATATATATCCAGACATAGTGGATGAGGGAAT
TGATGGGATTAATCACGGACTCTTAACTCCGGCCGTTTTGATGAGTGAAAGCGGAAACGA
CACAGACTCGCCGTCGAAGGATGGGGAGACGCTACTTCCGTTTCTTCTCTGAAGGTGTTT
AGGGTCACCGAGGCGCCACTGTTCTATCGGGCCGGTTACTTACAAATCCAACATGCCAAA
GCTCAGTCACATAACACCCTTAAAA*GCCCACTAAGCCGATGTCTTAAATGAAACGCAGC
GCTTAGCGCCTCTTCTGTCTCGGGCCGTCTACGGAC*AAACGATGACACTCCAAAGCGCA
GTCCGAGAA
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QA 1 789 1 789
DS 

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AGGCGCCACTGTTCTATCGGGCCGGTTACTTACAAATCCAACATGCCAAAGCTCAGTCAC
ATAACACCCTTAAAAAGCCCACTAAGCCGATGTCTTAAATGAAACGCAGCGCTTAGCGCC
TCTTCTGTCTCGGGCCGTCTACGGACCAAACGATGACACTCCAAAGCGCAGTCCGAGAAT
ACACTCAAGAAGCCCATTACGCGGAGGTTTTAATGAAACGCAGCATACAGGACACGTGGC
GCCGCGACATCTCTCGACTTTCCAGCCTGTATGTCGACGTGTCTTTCTTAGGAAAAAGAG
AGAACATTTTTTTATATATAAAGATTTGAAAGCGTAGAGTAAAATTCGGACTTTTACTAA
CAAAAAATAAAAATTCGATTCGGAGAAAACCAAATCGGTCATTACTAAATTTACCACGCT
GCAACTGAGGGTAGATTCTAAACACCACGTCAGTTTACCCAAAAGTAAAGTATATGCAAT
CAACAGACAACATGACAATATTGTCCAATTCAGTTTCGCCTCGTGGCAAATCCACGTAGA
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QA 1 659 1 659
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACACTGTTTAAGACGTTCGTTCGATTGTTTTAATACAAGTTGGTATCATACATATACAGA
GTAAAACGTAAATATATGTCATATCTCACAAAAACAAAAGCGCAACACAAAAAAAAAAAC
TCTTGGTAAGCTAACCACAAACGGACGGTTTATATCCAGCAAAAGGCAAATAAAATCCTT
AATAATTGATTATGGTTGACTTGTGTGTGTGTGTTAGCGGGCACCACCTTGATTCTTCAG
CTCTAATAACCAAATCCTTACCTCATTTATTTTCTGGTAACAGGCATAATCACACAGGTT
TTAGGTTTCTCAGGGTTTCCATGGTGCTGGTGGCGGCGGGGGAGTAGGGAACAATGGAGG
AACCGCTGAGAATATAGTGTTTTTGTCTATAGTACCAGATGCCTCCTCTTCACCCGACAA
TGCCACGAGAGCTGCGACAAGACCAGCATTCCCTGCAAGAGTCGGTTCAGTGTAGTTGTA
GTTGGTCCGTACATCGCGGAACCCATCGCGCTTGTCAGGACCAGCAACCATGGCTCCTTC
AATCGTGTTCGGATTCGGTTTCTTGCTGTCTCTCCATTTCCATCCTCCTTTGCAGTTGTA
TTTGACTTTGTTCTTGGGAATCGAAGCTCCTCTGTGATGCACGTGTTTCGGGTATTTTGA
GCCAAAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D228JQ U 10
AF RR4E889JQ U 1
BS 1 70 RR4E889JQ
BS 71 71 RR4D228JQ
BS 72 91 RR4E889JQ
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BS 141 181 RR4E889JQ
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BS 185 185 RR4D228JQ
BS 186 668 RR4E889JQ

RD RR4D228JQ 268 0 0
AAA
ACGTTCGTTCGATTGTTTTAATACAAGTTGGTATCATACATATACAGAGTAAAACGTAAA
TATATGTCATATCTCACAAAAACAAAAGCGCAACACAAAAAAAAAAACTCTTGGTAAGCT
AACCACAAACGGACGGTTTATATCCAGCAAAAGGCAAATAAAATCCTTAATAATTGATTA
TGGTTGACTTGTGTGTGTGTGTTAGCGGGCACCACCTTGATTCTTCAGCTCTAATAACCA
AATCCTTACCTCATTTATTTTCTGG

QA 4 268 4 268
DS 

RD RR4E889JQ 668 0 0
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GTAAAACGTAGATATATGTCATATCTCACAAGAACAAAAGCGCAACACAAAAAGGAAAAC
TCTTGGTAAGCTAGCCACAGACGGACGGTTTATATCCAGCAAAAGGCAAATAAAATCCTT
AGTAGTTGATTATGGTTGACTTGTGTGTGTGTGTTAGCGGGCACCACCTTGATTCTTCAG
CTCTAATAACCAAATCCTTACCTCATTTATTTTCTGGTAACAGGCATAATCACACAGGTT
TTAGGTTTCTCAGGGTTTCCATGGTGCTGGTGGCGGCGGGGGAGTAGGGAACAATGGAGG
AACCGCTGAGAATATAGTGTTTTTGTCTATAGTACCAGATGCCTCCTCTTCACCCGACAA
TGCCACGAGAGCTGCGACAAGACCAGCATTCCCTGCAAGAGTCGGTTCAGTGTAGTTGTA
GTTGGTCCGTACATCGCGGAACCCATCGCGCTTGTCAGGACCAGCAACCATGGCTCCTTC
AATCGTGTTCGGATTCGGTTTCTTGCTGTCTCTCCATTTCCATCCTCCTTTGCAGTTGTA
TTTGACTTTGTTCTTGGGAATCGAAGCTCCTCTGTGATGCACGTGTTTCGGGTATTTTGA
GCCAAAAC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL5697Contig1 751 2 2 U
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ACGTCGGTCTCTTATTCATTACACGCACAAACAATACGTACAAACACACAAAACACAATG
ACAACAAAGACAGATCATTGTTAAGGGTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGT
GGCTGCACCATCGGATGGAGTTTGGCTCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGG
GGGACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCATATCTCGATCGTGAAGCCATCTGGATCGTGG
AAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATC
TCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGG
TTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTTTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAG
AGATGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAACCAAGCGCCTTCAAAATTTAAAGATTCAGGT
CTTCGAATAGGGAAGAACCCTAACACCATTCGGTAAAAATTCATGGATTCTTCGATTGAT
CGGCACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGACGTGAGATGGAGAGGGTTTCTTGCGTTCTCC
TTCATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAAATAACAATGGCGTCGACGTCGTACGTTGGT
ATAGTCGAGGTTGATTAGATGAGACGATTCC


BQ
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AF RR4D885TF C 1
AF RR4D885JQ U 4
BS 1 3 RR4D885TF
BS 4 751 RR4D885JQ

RD RR4D885TF 751 0 0
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ACAACAAAGACAGATCATTGTTAAGGGTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGT
GGCTGCACCATCGGATGGAGTTTGGCTCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGG
GGGACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCATATCTCGATCGTGAAGCCATCTGGATCGTGG
AAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATC
TCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGG
TTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTTTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAG
AGATGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAACCAAGCGCCTTCAAAATTTAAAGATTCAGGT
CTTCGAATAGGGAAGAACCCTAACACCATTCGGTAAAAATTCATGGATTCTTCGATTGAT
CGGCACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGACGTGAGATGGAGAGGGTTTCTTGCGTTCTCC
TTCATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAAATAACAATGGCGTCGACGTCGTACGTTGGT
ATAGTCGAGGTTGATTAGATGAGACGATTCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4D885JQ 748 0 0
AGTAAGAAGAGCAAGGAGAATGATCATTTCCTCGAGTGGAATCACATCCACTGATTCACG
TCGGTCTCTTATTCATTACACGCACAAACAATACGTACAAACACACAAAACACAATGACA
ACAAAGACAGATCATTGTTAAGGGTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGC
TGCACCATCGGATGGAGTTTGGCTCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGG
ACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCATATCTCGATCGTGAAGCCATCTGGATCGTGGAAG
AAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATCTCC
ATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTG
TCTTTGGGATTGATTTCGGTTTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGA
TGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAACCAAGCGCCTTCAAAATTTAAAGATTCAGGTCTT
CGAATAGGGAAGAACCCTAACACCATTCGGTAAAAATTCATGGATTCTTCGATTGATCGG
CACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGACGTGAGATGGAGAGGGTTTCTTGCGTTCTCCTTC
ATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAAATAACAATGGCGTCGACGTCGTACGTTGGTATA
GTCGAGGTTGATTAGATGAGACGATTCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL5698Contig1 847 2 8 U
GAAAATATGTAAATAAGAAGAACCATATTCGTCAAAGAATTAACCGTCAATTGCACTGCG
TCGGAACTACTTATTCGTGTGGAAAGTAAACCCACGGATCCTGCCGTAGAATTCAACAAA
TGAGAGAATAGAAGAATGGTACGGAGACTCATCTCATGTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGT
TCTCTCAAGGTTTGAGAGCAAGTGAAAGACCAAACCTTGGATGCTTGTCTAAGGCCCTAG
TGTCGATCTCACTGGAAACAGTCACTAGCGATTTGGGCAAGACCTCGTGCTGAAGAAGAG
CACCGAGTGTGCCACGGCTGTTGAATTTAGCTTTCACTGAAGTCAAGGGATCAATCGCGT
ATGACCCACCAACAGTTATCGTGTTCTCATTAGTCGAGAATTTCCTGTAAACCTCACCAA
CTGCAGCACTTCTCTTGGATTCGTCGAGGTGATGAAGGTAAGATGCTTTGATTGAGTCTC
CTTTGTCTCCCAATATAATGGAAGCGGAAGCATCTGGTTTGGTCACACTGATTCCAGCAT
TGTACTTGGTGAATGTTTAGGAGGAGGTGTCGTATCCAGCTTCGGCACCAAATGAGATGA
CTGGTGTGCCTAGAGTGGCGTGGTCGTGGAAGTACTGGACCTCGAGCTTGCCAGAACTGT
TGTCAGGGACTTTGAAGGAGACGATGGCTTTGGTCGAAGGGAGGATCTCAGTGAAAGTGA
CAGTTGTCAAAATAGTAGAATCAGTGTCGACTTTGACATCGAAGACAGCATTCTTGTATT
TGTATTGAGTGGAAACATCAGCAGCATGCACGCCTCCTTTCCTGAGAGCAGTAGACGTAA
GTGCCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D431JQ U 1
AF RR4ES16JQ U 29
BS 1 52 RR4D431JQ
BS 53 53 RR4ES16JQ
BS 54 199 RR4D431JQ
BS 200 200 RR4ES16JQ
BS 201 292 RR4D431JQ
BS 293 293 RR4ES16JQ
BS 294 297 RR4D431JQ
BS 298 847 RR4ES16JQ

RD RR4D431JQ 297 0 0
GAAAATATGTAAATAAGAAGAACCATATTCGTCAAAGAATTAACCGTCAATTTCACTGCG
TCGGAACTACTTATTCGTGTGGAAAGTAAACCCACGGATCCTGCCGTAGAATTCAACAAA
TGAGAGAATAGAAGAATGGTACGGAGACTCATCTCATGTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGT
TCTCTCAAGGTTTGAGAGCGAGTGAAAGACCAAACCTTGGATGCTTGTCTAAGGCCCTAG
TGTCGATCTCACTGGAAACAGTCACTAGCGATTTGGGCAAGACCTCGTGCTGCAGAA

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR4ES16JQ 819 0 0
CGTAAAATAGTTAAT
CCGTCAATTGCACTGCGTCGGAACTACTTATTCGTGTGGAAAGTAAACCCACGGATCCTG
CCGTAGAATTCAACAAATGAGAGAATAGAAGAATGGTACGGAGACTCATCTCATGTGTTG
CGTGTGTGTGTGTGT**TCTCTCAAGGTTTGAGAGCAAGTGAAAGACCAAACCTTGGATG
CTTGTCTAAGGCCCTAGTGTCGATCTCACTGGAAACAGTCACTAGCGATTTGGGCAAGAC
CTCGTGCTGAAGAAGAGCACCGAGTGTGCCACGGCTGTTGAATTTAGCTTTCACTGAAGT
CAAGGGATCAATCGCGTATGACCCACCAACAGTTATCGTGTTCTCATTAGTCGAGAATTT
CCTGTAAACCTCACCAACTGCAGCACTTCTCTTGGATTCGTCGAGGTGATGAAGGTAAGA
TGCTTTGATTGAGTCTCCTTTGTCTCCCAATATAATGGAAGCGGAAGCATCTGGTTTGGT
CACACTGATTCCAGCATTGTACTTGGTGAATGTTTAGGAGGAGGTGTCGTATCCAGCTTC
GGCACCAAATGAGATGACTGGTGTGCCTAGAGTGGCGTGGTCGTGGAAGTACTGGACCTC
GAGCTTGCCAGAACTGTTGTCAGGGACTTTGAAGGAGACGATGGCTTTGGTCGAAGGGAG
GATCTCAGTGAAAGTGACAGTTGTCAAAATAGTAGAATCAGTGTCGACTTTGACATCGAA
GACAGCATTCTTGTATTTGTATTGAGTGGAAACATCAGCAGCATGCACGCCTCCTTTCCT
GAGAGCAGTAGACGTAAGTGCCAC

QA 16 819 16 819
DS 



AS 1 2

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CGGTGCAGCTGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTAACTTGTTTTATTACCAGTTTG
GTCTTTTGCTTTTTATGTCTCTCCCCCATACAATCACAGTTTGAAGTTGTTTCGTTGCTT
TCCCTATAACTGCTTTTGTGTGTGTTTTAAACTTTATTTAAGAATTTTAAACTT


BQ
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AF RR4FX45JQ C 1
AF RR4FX45TF U 1
BS 1 234 RR4FX45TF

RD RR4FX45JQ 234 0 0
GGAAGCTCTGGAGGCGAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGTTCTTAGGAGCGTTGCTGCTGG
CGGTGCAGCTGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTAACTTGTTTTATTACCAGTTTG
GTCTTTTGCTTTTTATGTCTCTCCCCCATACAATCACAGTTTGAAGTTGTTTCGTTGCTT
TCCCTATAACTGCTTTTGTGTGTGTTTTAAACTTTATTTAAGAATTTTAAACTT

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR4FX45TF 234 0 0
GGAAGCTCTGGAGGCGAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGTTCTTAGGAGCGTTGCTGCTGG
CGGTGCAGCTGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTAACTTGTTTTATTACCAGTTTG
GTCTTTTGCTTTTTATGTCTCTCCCCCATACAATCACAGTTTGAAGTTGTTTCGTTGCTT
TCCCTATAACTGCTTTTGTGTGTGTTTTAAACTTTATTTAAGAATTTTAAACTT

QA 1 234 1 234
DS 



AS 1 2

CO CL5700Contig1 1227 2 2 U
GAGGAAGGATGAACTCAGAAGACCACACCATCTTTCTTCAAGTGCAGATTTCAGATGGCA
ATGGTTACATGAGGAACATTCACTTCCCTTTCAGCATTGTAAGCGACACACCGCTTGAAG
TAGCTTTGGAGATGGTGAAAGAGCTTGAGATCACTGATTGGGATCCTTTGGTGATCGCTG
CAATGATAGAAAATGAGATATCTTTGCTTGTACCAAACTGGAGTGCACATGGGGACCCTT
CTCTCCTGCACCACAGCTTTGGTCATGAAGATGATGACGACGACAATGGCGAGGGAGGTG
GACGAAGAACAACACGCCCTTTCTACTCTGCTGCTTGCTCTCTTGTAGCAGTTAACACTG
CCCATGAGGAGGACCCTTCTCTCCCGCACGACAGCTTTGGTCATGAAGTTGATGACGACA
ATGGCGAGGGAAGAGGACGAACAACACCCACTTTCTACTCTGCTTATTGCTCTCCCGATC
CTACTGTAGAAGTTGAGGACGACGACAAGGCCCATGAGGACCCTTCTCTCCAGCACCAAA
GCTTTGGTCATGAAGATGATGATGACGACAATGTCCAGGGAGGAGTACAAAGAACACTCC
CTTTCTCCTCTGCTTCTTCCTCTTACGACTCTCCTGTAGCAGTTACAGACAACGCCAACA
CCCATGAGGAGGAGGACCCTTCTCTCCCGCACAACAGCTTTGGTCATGAAGATAATGACG
ACAATGGCAGAAGAGTAAGAGAAAGAACACACCCTTACTCATCTCCTTCCTCCTCTCACG
GCTCTCTTGTAGCAGCAGTTAAAGACAACAACAACAACAACAACGATGGTTCAAGTAACG
ATGGTGCTGGCAGTGGCAGAGGCTCTAGCACTTTGTTGAGTTTTTCGACGTACCAACACT
CTCCTCCCGCCGATGATGATGATCAAAGTCCGCATCAACGGAGGAGAAGGTTAAGGTTAC
ATAAGATGAGATCGCTTGTGGATACGAGAACGCAGGTGCTGCACCGATCGCTCATGGAGT
TGATCAACAGGCACACCAGGCGCGGGCGTGGCTCTAATACGAACTTGAACGAGTTACAAC
ATAAATCGGTTGCTGACTTGTTGAGACGATCTTGAGAAATGGGTGTGAGCCTTTGTGGCT
TTTTGATTTATAAAAATAGATATTCAATGGTACATTAGCATTTTACTTTGATTGATGGGT
ATTATATTAAATAAAAATTTTAGTGTC


BQ
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AF RR4EG05TF U 1
AF RR4EG05JQ C 527
BS 1 763 RR4EG05TF
BS 764 1227 RR4EG05JQ

RD RR4EG05TF 763 0 0
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ATGGTTACATGAGGAACATTCACTTCCCTTTCAGCATTGTAAGCGACACACCGCTTGAAG
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CAATGATAGAAAATGAGATATCTTTGCTTGTACCAAACTGGAGTGCACATGGGGACCCTT
CTCTCCTGCACCACAGCTTTGGTCATGAAGATGATGACGACGACAATGGCGAGGGAGGTG
GACGAAGAACAACACGCCCTTTCTACTCTGCTGCTTGCTCTCTTGTAGCAGTTAACACTG
CCCATGAGGAGGACCCTTCTCTCCCGCACGACAGCTTTGGTCATGAAGTTGATGACGACA
ATGGCGAGGGAAGAGGACGAACAACACCCACTTTCTACTCTGCTTATTGCTCTCCCGATC
CTACTGTAGAAGTTGAGGACGACGACAAGGCCCATGAGGACCCTTCTCTCCAGCACCAAA
GCTTTGGTCATGAAGATGATGATGACGACAATGTCCAGGGAGGAGTACAAAGAACACTCC
CTTTCTCCTCTGCTTCTTCCTCTTACGACTCTCCTGTAGCAGTTACAGACAACGCCAACA
CCCATGAGGAGGAGGACCCTTCTCTCCCGCACAACAGCTTTGGTCATGAAGATAATGACG
ACAATGGCAGAAGAGTAAGAGAAAGAACACACCCTTACTCATC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4EG05JQ 701 0 0
TCTCCAGCACCAAAGCTTTGGTCATGAAGATGATGATGACGACAATGTCCAGGGAGGAGT
ACAAAGAACACTCCCTTTCTCCTCTGCTTCTTCCTCTTACGACTCTCCTGTAGCAGTTAC
AGACAACGCCAACACCCATGAGGAGGAGGACCCTTCTCTCCCGCACAACAGCTTTGGTCA
TGAAGATAATGACGACAATGGCAGAAGAGTAAGAGAAAGAACACACCCTTACTCATCTCC
TTCCTCCTCTCACGGCTCTCTTGTAGCAGCAGTTAAAGACAACAACAACAACAACAACGA
TGGTTCAAGTAACGATGGTGCTGGCAGTGGCAGAGGCTCTAGCACTTTGTTGAGTTTTTC
GACGTACCAACACTCTCCTCCCGCCGATGATGATGATCAAAGTCCGCATCAACGGAGGAG
AAGGTTAAGGTTACATAAGATGAGATCGCTTGTGGATACGAGAACGCAGGTGCTGCACCG
ATCGCTCATGGAGTTGATCAACAGGCACACCAGGCGCGGGCGTGGCTCTAATACGAACTT
GAACGAGTTACAACATAAATCGGTTGCTGACTTGTTGAGACGATCTTGAGAAATGGGTGT
GAGCCTTTGTGGCTTTTTGATTTATAAAAATAGATATTCAATGGTACATTAGCATTTTAC
TTTGATTGATGGGTATTATATTAAATAAAAATTTTAGTGTC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL5701Contig1 1231 2 2 U
CGCTTGAACACAGACTAAGTATTGTCTTTGTTTACGTTAGATACCCTAAGGATTCGGACA
AGCACATGCTAGCTAAGCAAACAGGACTCACTCGGAGCCAGGTACGTATGGTGCAAATTA
GTTGATTTTGTCTTATTGTGTCAAATAACGAAACATATTGCTGTCAACAAATACGAAAAT
ACTTGTTTTAGCTAGGATTTGTATATTTGATTATTTGAATAAATAATTTACAACCCATTA
GATCCTTATTTATATAAATTCAAAATCTGGTTCCTTTTTCTTTTAAAAGAACTTTTTTAT
TGTTGTCCAAAAAAAGAACTTTTTATTTACCTAATGAATTTCTCTTAACCACATTCGTTG
GATAGGACGACGAAATCACTCTAGAATTAACACATATTTATATGTGGATTTGCTTTGTTT
CTTATAGGTGTCAAACTGGTTTATAAACGTGAGAGTTCGGCTATGGAAACCGATGGTGGA
AGAGATGTACATGGAGGAGATGAAGGAGCAGGGAAAGAACATAATGGAGAAGGAATCTAA
TCTTGATAATAATAACGAAGATTCTGCTTCTAAATCAACAAGTAACTAAGAGAAAAGCCC
CATGAAAGGAGGAGGAGGCGCCGACAATTACCATCCGAAGCCCAATCACAGCGGTGACTT
AGAAGGCGTCACGGGAATGCAAGGAAGTCCAAAAAGGCTAAGAACAAACGAAGAGACAAT
GATGCAGCCTAGTAATGTAGATTTCACCTCCAACGAGAAGCTCACAATGAAAATTCTAGA
AGAACGGCAAGGGATAAGATCAGACGGTGGATACCCTTTCATGGGGAGTTTCGGACAATA
CCAAATGGATGAGATGTCAAGATTCGATGTAGCTGTCTCGGGCCAGGAGCTCTTAGCGCA
AAGGTACTCAGGAAACAACAATGGCATGTCACTCACGTTAGGTTTACCTCACTGTGATAG
CTTGTCGTCCACGCATCATCAGGGTTCCATGCAGACCCATCATGCGATCCCGATAGAGAG
AAGAGTGAAAATAGGGGAGACAGAGGAGTATGGAGCCGCCACCATCTCGGCTGCAACAGT
GCATTCATCAGCCGCTGCTTACAGTGGGATGAACATGCAAAACCAGAAGCGATATGTGGC
TCAGTTATTGCCTGACTTCGTTGCTTAAAACCAGAAGCAACCAATAAAGCTTACTTTTAC
ATTAGTATATAGTTTTTTATACTACTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AE21TF U 1
AF RR4AE21JQ C 425
BS 1 661 RR4AE21TF
BS 662 1231 RR4AE21JQ

RD RR4AE21TF 661 0 0
CGCTTGAACACAGACTAAGTATTGTCTTTGTTTACGTTAGATACCCTAAGGATTCGGACA
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GTTGATTTTGTCTTATTGTGTCAAATAACGAAACATATTGCTGTCAACAAATACGAAAAT
ACTTGTTTTAGCTAGGATTTGTATATTTGATTATTTGAATAAATAATTTACAACCCATTA
GATCCTTATTTATATAAATTCAAAATCTGGTTCCTTTTTCTTTTAAAAGAACTTTTTTAT
TGTTGTCCAAAAAAAGAACTTTTTATTTACCTAATGAATTTCTCTTAACCACATTCGTTG
GATAGGACGACGAAATCACTCTAGAATTAACACATATTTATATGTGGATTTGCTTTGTTT
CTTATAGGTGTCAAACTGGTTTATAAACGTGAGAGTTCGGCTATGGAAACCGATGGTGGA
AGAGATGTACATGGAGGAGATGAAGGAGCAGGGAAAGAACATAATGGAGAAGGAATCTAA
TCTTGATAATAATAACGAAGATTCTGCTTCTAAATCAACAAGTAACTAAGAGAAAAGCCC
CATGAAAGGAGGAGGAGGCGCCGACAATTACCATCCGAAGCCCAATCACAGCGGTGACTT
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4AE21JQ 807 0 0
TAGGTGTCAAACTGGTTTATAAACGTGAGAGTTCGGCTATGGAAACCGATGGTGGAAGAG
ATGTACATGGAGGAGATGAAGGAGCAGGGAAAGAACATAATGGAGAAGGAATCTAATCTT
GATAATAATAACGAAGATTCTGCTTCTAAATCAACAAGTAACTAAGAGAAAAGCCCCATG
AAAGGAGGAGGAGGCGCCGACAATTACCATCCGAAGCCCAATCACAGCGGTGACTTAGAA
GGCGTCACGGGAATGCAAGGAAGTCCAAAAAGGCTAAGAACAAACGAAGAGACAATGATG
CAGCCTAGTAATGTAGATTTCACCTCCAACGAGAAGCTCACAATGAAAATTCTAGAAGAA
CGGCAAGGGATAAGATCAGACGGTGGATACCCTTTCATGGGGAGTTTCGGACAATACCAA
ATGGATGAGATGTCAAGATTCGATGTAGCTGTCTCGGGCCAGGAGCTCTTAGCGCAAAGG
TACTCAGGAAACAACAATGGCATGTCACTCACGTTAGGTTTACCTCACTGTGATAGCTTG
TCGTCCACGCATCATCAGGGTTCCATGCAGACCCATCATGCGATCCCGATAGAGAGAAGA
GTGAAAATAGGGGAGACAGAGGAGTATGGAGCCGCCACCATCTCGGCTGCAACAGTGCAT
TCATCAGCCGCTGCTTACAGTGGGATGAACATGCAAAACCAGAAGCGATATGTGGCTCAG
TTATTGCCTGACTTCGTTGCTTAAAACCAGAAGCAACCAATAAAGCTTACTTTTACATTA
GTATATAGTTTTTTATACTACTAAACC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL5702Contig1 700 2 1 U
GGAAAAATCGAATCGAAAGAAGAAGGAAGGATGTGGGTGGAGATAATCTGCGCTCTAGCG
ATCTACAAACTCGTTCGCCTTTTCTTCTCCAACGACGACTTCTCCGACGTAGAAACATCA
GACTCCACTGCTCTCTTCTCCGTTGCTCACAGACTGGAGAAGGTATACGGGGGAAAAGCA
TATGTAGGGCTTCGAATTCCAGATGCAGACACTTCTTCTAGACGGGACATCGATCTTGTC
CTCGTCACTAATGGACAAGTTGAGGTGATCGGTGTTAAGAATCTACATGGAATTGTTACG
GTAACGAGGGATGGAAGCTGGGTTTGTGAAGGTGGCAAGCATCATCATTCTACTCAGACT
TACCCTGATCCTCTGGCCGAAGTGAAGAAACAAGCTTCAGTTCTTGAGTCATATCTTGAA
CAGAGAGGCGTTACTTTACCTGAAGGAAGTATCTCTTGCAAAGTTGTCATTCCCAATCCA
AATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCGAGTGAGGTAATTACCTACGAAGAGTGGCAACAT
CTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTTTCTGGTTGGGTCAAAGGCGCCTTCAGCAGCACA
GGAAAAGAGATGCAAGACTCTCCGCATCAAAAACTTAACTTCGTCCTTGGCTCTGCACCA
GTCTGGGATAGGGTGGAGCTTAAAACAGCAAGATTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E678TF U 222
AF RR4CY18TF U 1
BS 1 700 RR4CY18TF

RD RR4E678TF 249 0 0
ACA
GGACATCGATCTTGTCCTCGTCACTAATGGACAAGTTGAGGTGATCGGTGTTAAGAATCT
ACATGGAATTGTTACGGTAACGAGGGATGGAAGCTGGGTTTGTGAAGGTGGCAAGCATCA
TCATTCTACTCAGACTTACCCTGATCCTCTGGCTGAAGTGAAGAAACAAGCTTCAGTTCT
TGAGTCATATCTTGAACAGAGAGGCGTTACTTTACCTGAAGGAAGTATCTCTTGCGAAGT
TGTCAT

QA 4 249 4 249
DS 

RD RR4CY18TF 700 0 0
GGAAAAATCGAATCGAAAGAAGAAGGAAGGATGTGGGTGGAGATAATCTGCGCTCTAGCG
ATCTACAAACTCGTTCGCCTTTTCTTCTCCAACGACGACTTCTCCGACGTAGAAACATCA
GACTCCACTGCTCTCTTCTCCGTTGCTCACAGACTGGAGAAGGTATACGGGGGAAAAGCA
TATGTAGGGCTTCGAATTCCAGATGCAGACACTTCTTCTAGACGGGACATCGATCTTGTC
CTCGTCACTAATGGACAAGTTGAGGTGATCGGTGTTAAGAATCTACATGGAATTGTTACG
GTAACGAGGGATGGAAGCTGGGTTTGTGAAGGTGGCAAGCATCATCATTCTACTCAGACT
TACCCTGATCCTCTGGCCGAAGTGAAGAAACAAGCTTCAGTTCTTGAGTCATATCTTGAA
CAGAGAGGCGTTACTTTACCTGAAGGAAGTATCTCTTGCAAAGTTGTCATTCCCAATCCA
AATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCGAGTGAGGTAATTACCTACGAAGAGTGGCAACAT
CTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTTTCTGGTTGGGTCAAAGGCGCCTTCAGCAGCACA
GGAAAAGAGATGCAAGACTCTCCGCATCAAAAACTTAACTTCGTCCTTGGCTCTGCACCA
GTCTGGGATAGGGTGGAGCTTAAAACAGCAAGATTGTGTT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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ACCCCTTCTTCTTCCTCTTCATCATCTCTCCGCCGTCTCTCCTCCCTTCCCGTCTCTACC
TTCCCTCGCCACTCTAACCGGAGGCCACAGATACAATAAGATCAGTTGCAGAAAGCTCCT
TACCCGGTTACGAGGAAGCTACCCCTATGGTGTTCTGTGGCCTGTTCCCAGTTGACGCTG
ACCAGTTTCCTGATCTTCGAGATGCGTTGGAAAAACTGCAACTCAATGATGCCGCTTTGA
AGTTTGAGCCTGAGACTTCAAGTGCCATGGGTTTTGGCTTTAGATGTGGTTTCTTGGGTC
TTCTCCACATGGAAATTGTGCAGGAAAGACTAGAGAGAGAATACAACTTGAATCTCATTA
CCACTGCTCCAAGTGTTGTATATAAAGTGCACACTGTAAATGGTGATACTACTATGTGCT
CAAACCCATCTCTCCTTCCACAACCTGGGCTAAGGAAAGCAGTCGAAGAACCATACGTGA
AGATTGAGTTGCTTACATCGAAAGACTACATCGGTGCACTTATGGAGCTCGCTCAAGATA
GGAGAGGGGAGTTCAAAGAAATGAAGTATATAGCTGAGAACAGAGCTTCTCTCCTCTATG
AGTTACCTCTTGCAGAGATGGTGGGAGATTTCTTTGATCAGTTGAAGTCCAGGACCAAGG
GATATGCTAGCATGGAATACTCAGTTATTGGGTGCAGGGAGAGCGATCTGATAAAACTAG
ATATTCTGATTAATGCTGAATTGGTGGAGCCTTTATCAACCATTGTACACAGAGACAAGG
CATATTCTGTTGGAAGAGCTTTGACTCAAAAACTCAAAGAGCTTATTCCGAGACAAATGT
TTAAAGTGCCCATCCAGGCTTGTATAGGATCAAAAGTGATTGCTAGTGAAGCGCTCTCAG
CAATCAGAAAGGATGTTTTGGCCAAATGTTACGGTGGAGATATTTCTCGGAAGAAGAAGC
TTCTTAAGAAACAGGCGGCAGGTAAGAAGAGAATGAAAGCTATAGGTAGAGTTGATGTAC
CTCAAGAAGCTTTCATGGCCGTCCTCAAACTTGAAAAGGAGGTTTTGTAACACCACTCGA
TAAAAAGACCCATTACATTATATATTTCATTTGATCCCTTTTGTAATAAACTATTTTCAC
ACCTAATGCAATCTTTCTTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ER44TF U 1
AF RR4ER44JQ C 526
BS 1 690 RR4ER44TF
BS 691 691 RR4ER44JQ
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RD RR4ER44TF 787 0 0
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*ATATGCTAGCATGGAATACTCAGTTAT*GGGTGCAGG*AGAGCGATCTGATAAA
CTAGATATCTGA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4ER44JQ 701 0 0
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TACACAGAGACAAGGCATATTCTGTTGGAAGAGCTTTGACTCAAAAACTCAAAGAGCTTA
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TGTAACACCACTCGATAAAAAGACCCATTACATTATATATTTCATTTGATCCCTTTTGTA
ATAAACTATTTTCACACCTAATGCAATCTTTCTTTCTTTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

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ACGGATATAACACTAACGCCGTTGCCTTTAACGGAACCGTCGAGTCAATATGTACTAGCC
AAATGGAGGACATCGTTACAGTAACCGACGACGGCTACGCCAACCCCAACGGAGGAGGAG
GGAGAAGCAAGGCGTCGTTTATGATGTGGAGGATGTGCAATCCTGTCCACGTGCTGAGAG
TCCATTGGATACCGTGTTTGTTAGCGCTAGGAGTTCTGTTCTTCACGGGCGTAGAGGAGT
ACATGATCCAGATGATTCCTCCGAGTTCTGAACCGTTCGATATTGGTTTTGTGGCGACGC
GCTCCCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTTTTAGCCGCTCTAA
ACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACTACATATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAC
GACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGCATTCTTGGTTACT
CTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTTCTAGGATCAGGGGTAGATTTTCCGGTAGGAA
ACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAGGCCATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGG
ACATGAGGAGAATGAAGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTTGACATCCTCAATGTATTAC
AATCGATCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTG
GCGCTGGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACAAGAGATGATGAGCAAGAGACA
CAATGTAGGCAATAGTTCTAGTTTGATTTCGGATCGCTAGTTATTAATTTTTTTTTCTAA
AAGTTTTTAGCCTGGACATATTTAATGTAGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTTACTTTCT
TTCAAATTGCTCTAATTAAAATATGAACAATACTAAATTCACCACTTTCCTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FU21TF U 1
AF RR4FU21JQ C 324
BS 1 560 RR4FU21TF
BS 561 1013 RR4FU21JQ

RD RR4FU21TF 560 0 0
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ACGGATATAACACTAACGCCGTTGCCTTTAACGGAACCGTCGAGTCAATATGTACTAGCC
AAATGGAGGACATCGTTACAGTAACCGACGACGGCTACGCCAACCCCAACGGAGGAGGAG
GGAGAAGCAAGGCGTCGTTTATGATGTGGAGGATGTGCAATCCTGTCCACGTGCTGAGAG
TCCATTGGATACCGTGTTTGTTAGCGCTAGGAGTTCTGTTCTTCACGGGCGTAGAGGAGT
ACATGATCCAGATGATTCCTCCGAGTTCTGAACCGTTCGATATTGGTTTTGTGGCGACGC
GCTCCCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTTTTAGCCGCTCTAA
ACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACTACATATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAC
GACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGCATTCTTGGTTACT
CTACTCAGCTCCCTCTTCCT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4FU21JQ 690 0 0
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TCTTCACCTGATCTAAATACCGTTTTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAA
ACTACATATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCT
TGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAG
GATTTTCTAGGATCAGGGGTAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTAC
TCAGGCCATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGAAGAGGTTG
AGACTAGCCTTGCTTTTTGACATCCTCAATGTATTACAATCGATCAGGCTTCTCGGGACG
AGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCTGGGGTTCTCTTTGACTCA
CTGGCTGGAAAATACAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATGTAGGCAATAGTTCTAGTT
TGATTTCGGATCGCTAGTTATTAATTTTTTTTTCTAAAAGTTTTTAGCCTGGACATATTT
AATGTAGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTTACTTTCTTTCAAATTGCTCTAATTAAAATA
TGAACAATACTAAATTCACCACTTTCCTTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL5705Contig1 607 2 1 U
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AATGGATCCTCTTTTTTGTTTGATGTTATCGACCCCACAAACCAATCGGTTCTGTTTTTT
TTTCTGACATTAAATCTAATCTCCGTCTTGCAGTTTACGGGTTCCGACAGACTTTACGAC
ATGGCAGAAGATGAAGTTGTTGATCCCAAGAAGTACCTTGAGGAATCTTGCAATCCAAAA
TGTGTCAAGCCACTAATCGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCT
GGCCAAAAGCATTGCACTGGGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTT
GCACCCAAGCTATTTACAAAACTGAAGTGAAACAAGGCGAAGCTGGAGTTGACATTGTCT
TTCAGTTGAAGGAATGTATAAAACGCAGTTGATGTTGAACTTTTTTTTTTCAACTGCAAC
CCTGAATAATGCAAAATGGCTCTGCTTCTCGTTTTTATTATATTTTTTTGCTCAAGACAT
TGTTTATTGTTGCTTCTTTTGAAGTAATGGTATGCATAATAAGTAATAACAAGAATTTGT
TACATCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BA45JQ C 1
AF RR4BA45TF U 1
BS 1 607 RR4BA45TF

RD RR4BA45JQ 607 0 0
GGGAGTCTAGATCCTCTTTCCTCTCAATTAGGTATCAACACTCCCGTTTCTTTTTAATTC
AATGGATCCTCTTTTTTGTTTGATGTTATCGACCCCACAAACCAATCGGTTCTGTTTTTT
TTTCTGACATTAAATCTAATCTCCGTCTTGCAGTTTACGGGTTCCGACAGACTTTACGAC
ATGGCAGAAGATGAAGTTGTTGATCCCAAGAAGTACCTTGAGGAATCTTGCAATCCAAAA
TGTGTCAAGCCACTAATCGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCT
GGCCAAAAGCATTGCACTGGGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTT
GCACCCAAGCTATTTACAAAACTGAAGTGAAACAAGGCGAAGCTGGAGTTGACATTGTCT
TTCAGTTGAAGGAATGTATAAAACGCAGTTGATGTTGAACTTTTTTTTTTCAACTGCAAC
CCTGAATAATGCAAAATGGCTCTGCTTCTCGTTTTTATTATATTTTTTTGCTCAAGACAT
TGTTTATTGTTGCTTCTTTTGAAGTAATGGTATGCATAATAAGTAATAACAAGAATTTGT
TACATCT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4BA45TF 607 0 0
GGGAGTCTAGATCCTCTTTCCTCTCAATTAGGTATCAACACTCCCGTTTCTTTTTAATTC
AATGGATCCTCTTTTTTGTTTGATGTTATCGACCCCACAAACCAATCGGTTCTGTTTTTT
TTTCTGACATTAAATCTAATCTCCGTCTTGCAGTTTACGGGTTCCGACAGACTTTACGAC
ATGGCAGAAGATGAAGTTGTTGATCCCAAGAAGTACCTTGAGGAATCTTGCAATCCAAAA
TGTGTCAAGCCACTAATCGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCT
GGCCAAAAGCATTGCACTGGGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTT
GCACCCAAGCTATTTACAAAACTGAAGTGAAACAAGGCGAAGCTGGAGTTGACATTGTCT
TTCAGTTGAAGGAATGTATAAAACGCAGTTGATGTTGAACTTTTTTTTTTCAACTGCAAC
CCTGAATAATGCAAAATGGCTCTGCTTCTCGTTTTTATTATATTTTTTTGCTCAAGACAT
TGTTTATTGTTGCTTCTTTTGAAGTAATGGTATGCATAATAAGTAATAACAAGAATTTGT
TACATCT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL5706Contig1 710 2 7 U
TTTTTAGGGTTGAGGGAAATAAATAGAAAGAATCGGTCACTAGGATATAGTCAAAATTTG
GAAAAGGTTTTCGATTGGTTCATAGGATTAGGTTGATACGATATGGGATCCGATTCTACT
ATACAAAGATGAAACGAGACTCGACAGAGGATACAATATGTTTTTTTTAAAGACAGTCTG
TGTTTGTTTTGGCTTCTGTTCTGGGTTTAGTAGTAATACTCTTAAAACTAACGTTAAAGG
CTGATAATATTCATTCGCTTAAGTAATTTAGGTCTACTATGGTGATTGGTTTTCAGAGTT
ATATCACTGGTGTTAGCTACGCTAAATTTAGCATATATTATGAAAGGAGGGTGGTAATTG
AGTTTGAGGTTATCTACTAAGGTATGGCCTTGCGTTTTTTTTTCTGGTTTTGGCATTGGC
TCTTGAACATCTCATCTACTCTACTGAAAAGTTGTAGATACAGGGGAAGCCATTACTCTT
TATTATTGGATTTCTTATTCTTTTTTATCTTATTACTATATTTCACTGTCTGACTTTCAG
GTTACATTATGTCATGTGGTATATCAAATGGTTTCAGGTTGGTTTTACGGTATTATTGGT
GGTCAGGAAACTCAGCTTTCTCATGAGGTTATCAAATTTCGGTCTCACGGACAAAGTGGC
CAGCTATATCCGACAAATAAGTGCCAAATATGCTCATTACCGGATTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO62TF U 79
AF RR4CO62JQ C 1
BS 1 78 RR4CO62JQ
BS 79 271 RR4CO62TF
BS 272 272 RR4CO62JQ
BS 273 299 RR4CO62TF
BS 300 300 RR4CO62JQ
BS 301 325 RR4CO62TF
BS 326 710 RR4CO62JQ

RD RR4CO62TF 264 0 0
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TTCTGGGTTTAGTAGTAATACTCTTAAAACTAACGTTAAAGGCTGATAATATTCATTCGC
TTAAGTAATTTAG*TCTACTATGGTGATTGGTTTTCAGAGT*ATATCACTGGTGTTAGCT
ACGCTAA
TTAGCATATATATGAAA

QA 1 247 1 247
DS 

RD RR4CO62JQ 710 0 0
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GAAAAGGTTTTCGATTGGTTCATAGGATTAGGTTGATACGATATGGGATCCGAT*CTACT
ATACAAAGATGAAACGAGACTCGACAGAGGATACAATATGTTTTTTT*AAAGACAGTCTG
TGTTTGTTTTGGCTTCTGTTCTGGGTTTAGTAGTAATACTCTTAAAACTAACGTTAAAGG
CTGATAATATTCATTCGCTTAAGTAATTTAGGTCTACTATGGTGATTGGTTTTCAGAGTT
ATATCACTGGTGTTAGCTACGCTAAATTTAGCATATATTATGAAAGGAGGGTGGTAATTG
AGTTTGAGGTTATCTACTAAGGTATGGCCTTGCGTTTTTTTTTCTGGTTTTGGCATTGGC
TCTTGAACATCTCATCTACTCTACTGAAAAGTTGTAGATACAGGGGAAGCCATTACTCTT
TATTATTGGATTTCTTATTCTTTTTTATCTTATTACTATATTTCACTGTCTGACTTTCAG
GTTACATTATGTCATGTGGTATATCAAATGGTTTCAGGTTGGTTTTACGGTATTATTGGT
GGTCAGGAAACTCAGCTTTCTCATGAGGTTATCAAATTTCGGTCTCACGGACAAAGTGGC
CAGCTATATCCGACAAATAAGTGCCAAATATGCTCATTACCGGATTGACC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5707Contig1 979 2 4 U
GGATTACTAAAGTGAATAGATAAAATCAGCATGAAAGATCAGAAGATGAAGCTCCACTGT
GGTCTTACCGCTGAAAATTTGACAGCTAAGTTTGGCCTCCATGAAAAAGGGCTTGACTTC
GAACTTGTCTTCGTAGATTGGGTTGCTGGTGAATCCAAAACAAAAACCTTTCTTACTAAT
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AAGGTGATCACGCGATACCTAGCCGAACAATACAAAGACGTTGGAACAGACCTATTACCA
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BQ
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CTA

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DS 



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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4CQ68JQ U 1
AF RR4AY26TF C 479
BS 1 615 RR4CQ68JQ
BS 616 616 RR4AY26TF
BS 617 742 RR4CQ68JQ
BS 743 1265 RR4AY26TF

RD RR4CQ68JQ 742 0 0
CATGAAAGTCTTAAATTATTCTCAAAAACCCTCGATGAGAGAATTGAACTAAATTAAAGA
TAACAAACAACACAAGACATCCGGCTTTCGGATAGAGCTTGGCAACGTCTATCTCACAAC
AAAACCCAACCAATTAAAACAAATAAAACCCCCAATTTACATACACTTAGAGACACCAAA
CCAAATGCTGAGTTGGACTTGAGTGGGTACACAGGCCGTATTACGACTCCACAATTTCCT
GTTGAGTTGTGGAAGTTACGTTGAAGCTTAATGTATCCACTTTCACCCCAGTTTGCTCCC
CATGAGTTACGAATAATCCAGTAGTCTTCACCTTTTTCTGTCGTTCCATACCCCACGACT
ACCACATTGTGGTTTCCATACCAATGATCACATGGTCCTGTAAACACACCAGATTTGTAG
AGTTTCATATTTTCGGCTTCAATCATAACACTAATAGGTTGATGTGCAACAGCCTTCTTC
AAAGACATCTCATCGTTATGTGGAGCATCCTCATAACTATCAATGGTAACATACCGAGTG
GTAACCATCTCAATGGCCTTGCACGCGGCGGTATCATTCTCAGTATAAGGGTAAACTTTA
TCCGTTACAATACCATCGTTATCCACAATGAACTCAAAAGCATCGGCTGCGTTACCTCCT
AAACATCCAAAGTTTCCCGAATCTTCCCCTCTGTCGCAATCCAAGAGTTCTTGTTCCGAC
AAAGATACTAACTCTCCTGTCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4AY26TF 787 0 0
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TGGTAACCATCTCAATGGC*TTGCACGCGGCGGTATCATTCTCAGTATAAGGGTAAACTT
TATCCGTTACAATACCACTGTTTTCGATAATGAACTCAAAAGCGTCGGCTGCGTTACCTC
CTAAACATCCAAAGTTTCCCGAATCTTCCCCTCTGTCGCAATCCAAGAGTTCTTGTTCCG
ACAAAGATACTAACTCTCCTGTCTTGATCTTGTTTAAACCCTCCACCGCTCCAACCGCCG
CGAACGCCCAACAACCTCCACAGTCTCCTTGGTTTTTGACCGGAACAACTGCACCTTTCT
CTCTCCAGTCAACTTCCTCGGGCAAAACGTCTCCTTCTTTGTACAAGTACCTATCTCCTA
TCACTGGATCGCTTGTCCTTACCATCTTCCCCCTTAAGTGAATAGCTCGAAACTCATCGT
CGGTTAGATCTGCAAACCGGGTCAATCCGAGTTCGTAAGTCCGGTCCGGGACCGAGTTGT
GTGCTTCTATCAACTTCAAGTTGTCTTTGAAGATATTGAAACGTCTCTCTTTCTCTCCAA
GAGCGTTATAGTTCTTCCGGTTCTCCACAAGCCACAGCTCGTACGTCCGGCGCACTTCCG
CCTCACTGCCTTTCGTCTCCGTCGCTGTAACGCCGCCGAGAGACGAGGAAAGTAGTAACG
CGGAGAGGATCACGAGAGCTATAGTTAAAAATCTTATAGGAATAGCCATTTTTTTTTGCT
TCTTTCT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5709Contig1 242 2 1 U
TTTTTAACCGACGTCACAACTCCTCCATACCAAAAAAATCTCTCAGAATCCCTAAAAATC
CACTTGAAAAAATGGCAGAAACCTCAAAAGCTCCTGAGTCGGAGAAGAGTGAGGCGTAAC
TACTATAATCTACCTATTAGGGTTTCGCTAGATTCGTAAGAGATTCTCAGAGTTTATTAT
GACCGACAGATCTGGTCTTGTAATGACTTTGTGTGGATTTGGTATTTGCTTCCTTCTTCC
TT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 

AF RR4EG83TF U 1
AF RR4ET77TF U 1
BS 1 242 RR4EG83TF

RD RR4EG83TF 242 0 0
TTTTTAACCGACGTCACAACTCCTCCATACCAAAAAAATCTCTCAGAATCCCTAAAAATC
CACTTGAAAAAATGGCAGAAACCTCAAAAGCTCCTGAGTCGGAGAAGAGTGAGGCGTAAC
TACTATAATCTACCTATTAGGGTTTCGCTAGATTCGTAAGAGATTCTCAGAGTTTATTAT
GACCGACAGATCTGGTCTTGTAATGACTTTGTGTGGATTTGGTATTTGCTTCCTTCTTCC
TT

QA 1 242 1 242
DS 

RD RR4ET77TF 241 0 0
TTTTTAACCGACGTCACAACTCCTCCATACCAAAAAAATCTCTCAGAATCCCTAAAAATC
CACTTGAAAAAATGGCAGAAACCTCAAAAGCTCCTGAGTCGGAGAAGAGTGAGGCGTAAC
TACTATAATCTACCTATTAGGGTTTCGCTAGATTCGTAAGAGATTCTCAGAGTTTATTAT
GACCGACAGATCTGGTCTTGTAATGACTTTGTGTGGATTTGGTATTTGCTTCCTTCTTCC
T

QA 1 241 1 241
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5711Contig1 627 2 2 U
GCGCCTCTACAATATATATTTGAAACAATTGTACCTACTAGGAGCGAGGAATGTGGCTTT
GTTTGGAATCGGTAAGATTGGGTGTATACCACGTATTGTTGCTACCCTTGGTGGTGGCGT
TGGCTGCGCAGAAGAAGTGAACCAAGCCGTGGATCTCTTCAACAATAAACTCAAAGCCCT
AGTAACAGACTTCAACAACAAACTCTCTAGTGCTAAGTTCACTTACGTTGACCTCTTCTT
CTGGAAATGCTGAAGATTTCGCCGCTCTTGGGGTTACTGTTGGTGATAGGAGTTGTTGTA
CGGTTAACCCAGGTGAAGAGCTTTGTGCGCAGAACAGACCGATTTGTCCTGACCGAACAA
AATACATATTTTGGGATAACGTGCATACCACGGATATTATTAATACAGTGATAGCTATCG
CATCGTTTAACGGAAACATAACTTCTCCCTTCAGCATATCTCAGCTTGTGAATTAGCTTA
TAATATGGACATGACTTTACTAGTTTAAGCTTTAAACTGGATGGGTCATGGAAACCGTAT
AATATTCATATACTATCAAATGAATAATGAATAAATGGATTGTAATAGTTTCCAAATAAC
AAAAATAATAATAATAATTACAAACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX43TF U 1
AF RR4BX43JQ C 1
BS 1 253 RR4BX43TF
BS 254 627 RR4BX43JQ

RD RR4BX43TF 253 0 0
GCGCCTCTACAATATATATTTGAAACAATTGTACCTACTAGGAGCGAGGAATGTGGCTTT
GTTTGGAATCGGTAAGATTGGGTGTATACCACGTATTGTTGCTACCCTTGGTGGTGGCGT
TGGCTGCGCAGAAGAAGTGAACCAAGCCGTGGATCTCTTCAACAATAAACTCAAAGCCCT
AGTAACAGACTTCAACAACAAACTCTCTAGTGCTAAGTTCACTTACGTTGACCTCTTCTT
CTGGAAATGCTGA

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR4BX43JQ 627 0 0
GCGCCTCTACAATATATATTTGAAACAATTGTACCTACTAGGAGCGAGGAATGTGGCTTT
GTTTGGAATCGGTAAGATTGGGTGTATACCACGTATTGTTGCTACCCTTGGTGGTGGCGT
TGGCTGCGCAGAAGAAGTGAACCAAGCCGTGGATCTCTTCAACAATAAACTCAAAGCCCT
AGTAACAGACTTCAACAACAAACTCTCTAGTGCTAAGTTCACTTACGTTGACCTCTTCT*
CTGGAAATGCTGAAGATTTCGCCGCTCTTGGGGTTACTGTTGGTGATAGGAGTTGTTGTA
CGGTTAACCCAGGTGAAGAGCTTTGTGCGCAGAACAGACCGATTTGTCCTGACCGAACAA
AATACATATTTTGGGATAACGTGCATACCACGGATATTATTAATACAGTGATAGCTATCG
CATCGTTTAACGGAAACATAACTTCTCCCTTCAGCATATCTCAGCTTGTGAATTAGCTTA
TAATATGGACATGACTTTACTAGTTTAAGCTTTAAACTGGATGGGTCATGGAAACCGTAT
AATATTCATATACTATCAAATGAATAATGAATAAATGGATTGTAATAGTTTCCAAATAAC
AAAAATAATAATAATAATTACAAACCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5712Contig1 517 2 3 U
ATGGGAAAACAGGGTAGAATATCAATGGAAACAACATCTCATTACATTGGACAGAAGAGT
GTTTGACTAAGCAGTAAGATAAAGAAAAAAAAAAGAGGAATCAAAACTTCATGGTGATCT
CAGGTGGGAACAAACGGCCACGGTGATTGAATATCATGAAATCCGAGTTATCTGGTAAAG
ACACCGCCCTGTTTTCATCGGAGTCGGGGTGAATGGAAAAAAACTTGCCAGGGAAAGTCA
AAGCAGCCCACATACAGAGAGCTAGTCCCACGATCAACTCCAAAACAACATTCAACGGAG
GTCCGGGGAACTCTTCCTCCGTGATCTTCAACAATCCTCTATATTGGATTGTTGAATAGG
CGGCGTGGGAAAAAATCAGGACGCCGAAAACTCCAATTACGAAACCTAAATTCATGTTTT
GCGTATAAAGTTGTTCTCTTTCCCTTCTCGATCTGCTGGGTTTTGTCTCGTCGAGTATTC
TCCGCCTGGACTTCGAAAGTAGGATTGAAGACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CT63JQ U 185
AF RR4CT63TF C 1
BS 1 186 RR4CT63TF
BS 187 466 RR4CT63JQ
BS 467 517 RR4CT63TF

RD RR4CT63JQ 282 0 0
CC
CCCTGTTTTCATCGGAGTCGGGGTGAATGGAAAAAAACTTGCCAGGGAAAGTCAAAGCAG
CCCACATACAGAGAGCTAGTCCCACGATCAACTCCAAAACAACATTCAACGGAGGTCCGG
GGAACTCTTCCTCCGTGATCTTCAACAATCCTCTATATTGGATTGTTGAATAGGCGGCGT
GGGAAAAAATCAGGACGCCGAAAACTCCAATTACGAAACCTAAATTCATGTTTTGCGTAT
AAAGTTGTTCTCTTTCCCTTCTCGATCTGCTGGGTTTTGT

QA 3 282 3 282
DS 

RD RR4CT63TF 517 0 0
ATGGGAAAACAGGGTAGAATATCAATGGAAACAACATCTCATTACATTGGACAGAAGAGT
GTTTGACTAAGCAGTAAGATAAAGAAAAAAAAAAGAGGAATCAAAACTTCATGGTGATCT
CAGGTGGGAACAAACGGCCACGGTGATTGAATATCATGAAATCCGAGTTATCTGGTAAAG
ACACCGCCCTGTTTTCATCGGAGTCGGGGTGAATGGAGAGAAACTTGCCAGGGAAAGTCA
AAGCAGCCCACATACAGAGAGCTAGTCCCACGATCAACTCCAGAACAACATTCAACGGAG
GTCCGGTGAACTCTTCCTCCGTGATCTTCAACAATCCTCTATATTGGATTGTTGAATAGG
CGGCGTGGGAAAGAATCAGGACGCCGAGAACTCCAATTACGAAACCTAGATTCATGTTTT
GCGTATAAAGTTGTTCTCTTTCCCTTCTCGATCTGCTGGGTTTTGTCTCGTCGAGTATTC
TCCGCCTGGACTTCGAAAGTAGGATTGAAGACGATCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL5713Contig1 279 2 2 U
AGTGAGAAATTGGATTGTAAAGCCAAATGCTTTTTGGACTGATCATTCAATAAACAGATA
ACATAAACATACTTTTAAAAGAAAAAAAGTCAAGAAATAATCTCTTCTTATTTGTCTTAA
ACATTTAGCTTCTCAATCCCTCTCCTCAAAGCATTAGCTCTAAACACACTCCCAATGGTG
TTCACAGCCAACTTCAAATCCTCCAAAGGATTACCCGGAGCAACCTTCTTGTACAGATAG
CTATCGAATGTCATCTTCTGAACATACTCATCGCTACAC


BQ
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DS 



AS 1 2

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CTATACCGTGTCTAAATTCTTGTGTACATGTCTTAATACTTCTTTATCATGTTATGGAAC
CATGGGTTTTCTAT


BQ
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T

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BQ
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AF RR4EV31TF U 1
AF RR4EV31JQ C 332
BS 1 544 RR4EV31TF
BS 545 545 RR4EV31JQ
BS 546 582 RR4EV31TF
BS 583 1101 RR4EV31JQ

RD RR4EV31TF 585 0 0
GATCGGGAGATCATCAAACCGAGACCCCACCCCCAAGATGAAGAACAAGTAGAAGAACCC
TTTCCACAAGGCTCAACCTTCTTCTTCATCAAATCAAATCAAATCAATCGCATCCGCTTT
TTCCTGATTCTCCGTCGACGAAATACGATTCCGTTGTTGATCGATGAACTTGTCAAGGCG
ACTGGCTCTGCTAGGAGCTCAATCCGCGCTCTCAATCGCCAGAACCCGAGGTCTGGGCTC
CTCCTCCTCCTCCTACGGCTTAATTGATCGGCGTCCCTTTCAGTTCCGTCAAATCTCGGA
GCTCACCAAAGTCAATGGGAAGCGTGCTTTTCTCGTCGATACTTTGGCTCTGGTGAGGAG
TCTTGAAGCACAAGGTGTACCATCGAAACAAGCTGAGGCCATTGCTTCTGCCATCACTGA
GGTTTTGAATGATAGCTTGGAGAATGTCTCTGAGTCCTTTGTTTCCAAGGCTGAGATGCA
GAAGATTGAAATGCTCCAAGATTCTAATCTCTCCAAATTTAAATCTGAAGTCAAAAGCTC
TCAG*AGCATCATTTTACTGTTTTACAACGCGAGACAGAAAA
CTA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4EV31JQ 770 0 0
CTCGTCGATACTTTGGCTCTGGTGAGGAGTCTTGAAGCACAAGGTGTACCATCGAAACAA
GCTGAGGCCATTGCTTCTGCCATCACTGAGGTTTTGAATGATAGCTTGGAGAATGTCTCT
GAGTCCTTTGTTTCCAAGGCTGAGATGCAGAAGATTGAAATGCTCCAAGATTCTAATCTC
TCCAAATTTAAATCTGAAGTCAAAAGCTCTCAGGAGCATCATTTTACTGTTTTACAACGC
GAGACAGAAAAACTAAGAGGGGATATAGAGAAGATGAGAAGCGAGCTAAGGTATGAAATT
GATAAGGTCACAGCTGGACAACGCTTGGATTTGAATCTTGAAAGAGGCCGGATACGTGAT
GAGCTAGCTAATCAGAATTCAGAAACAACAAACCTCACAAACAAGCTTGACAGAGAAATT
CATGCATTGAGAGCTCAACTAGAAGCGGCCAAATACGAAGTAATCAAATACTGCATCGGT
ACACTGGTCTCCATTTCAGCAGTTGGACTCGCAGTCCTTCGCATAATGATGTAGTTGAAT
CTAACCCTCAAGACATATATGCTCAAAACAAAAGTTGGTAGATTTTCTTTTTTTTTTTAC
TTGAAACCTCAACGCCATATTCTTTTTTTCTTTTCTGGCGTGGAAAAGAGAGAGGAAAAA
AACAATGTTATTGTAATCGTGATCTCTTGGGCTAATCATCCTTGCTAGAACAGGTTTTGA
ATTTGCCCCGAGTATTATATTCAATCCAAGAAACGTTGGTTTTTTATTAC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL5716Contig1 1007 2 2 U
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CATCACAAGATCGGGGATAGAACAAGTGCCTCCCTCGATCGTGTCATGGCCTCGTCTTGA
AGAGTTGAAGATGTCATACTTTGAAAACCTCAAGGAATTCCCTCATGCTCTTGAAAGAAT
CACATGGCTGAGTTTGACCAACAGAGAGATACAAGAGGTTCCTCCGTGTGTCACGAAAAT
GTCTGGTCTGAAATCATTTGTGCTCGATGGATGCCGAAAGTTGGTATCACCCCCACCGAT
TTCGGATTCCATCAGTTTCATGGGTGCAAGAGACTGCAAGTCCCTGGTGTTAATAGAGTG
CTCCTTTCGCAATCCACGCGCTCATTACTACTTTGAGAACTGCTTCAAACTGAATCAAGA
CGCTAGAGACCTCATCATCCAGAATAGTAGTCCAGGTGGACAAGTGCCTCCACACTTCAC
TCACCGAGCTACTGGTGGAGGTCCATTGACTATTAAGTTGACTGAAAAGCCTCTTCCAAA
ATCCACGAGATTTAAAGCTTGCATCTTGCTGCTTAATAATGGTGACCATGACGCTTGCTC
TGAAAAGAACTCGACAGGAGTGGACGTGATGTATAAAAATGGCAGTAGAAATTTGTGGCC
AGCTTTAGCAGGGCATCTGTACACATTCCAAGTTAAAGCGAAGGTGACTTGCAGCGAGCT
TCTCTTTGAGTTCAAGCTGGAAAGGGATGACGTTTGGAAGATAGGAGAATGCGGGCTAGT
CCAAGACTTGAGGGTCCCTTGATATTGATGAACACCATGAGATCTTGAGAGGTGATCGCC
AAACATACTCTAAAGTTAAATTGGTCTCTCTGTTTATTGTTCTCTATTGTATTTCTCTGT
TTTCTTTTTAGTACGTTTAGGGTTTCTTTTGATTATTTTTAATATAACACTATTGAGTAT
TGTCCCTCTTCAAGAATTTTTTAAGGCTTAATGGCATGGAAATTTCG


BQ
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AF RR4EC27TF U 1
AF RR4EC27JQ C 394
BS 1 639 RR4EC27TF
BS 640 1007 RR4EC27JQ

RD RR4EC27TF 639 0 0
GAGTTATTGCTCCATATTGAAGTGTTTTCCTCAGATCTCCACAAATATTAGAGTTCTCGA
CATCACAAGATCGGGGATAGAACAAGTGCCTCCCTCGATCGTGTCATGGCCTCGTCTTGA
AGAGTTGAAGATGTCATACTTTGAAAACCTCAAGGAATTCCCTCATGCTCTTGAAAGAAT
CACATGGCTGAGTTTGACCAACAGAGAGATACAAGAGGTTCCTCCGTGTGTCACGAAAAT
GTCTGGTCTGAAATCATTTGTGCTCGATGGATGCCGAAAGTTGGTATCACCCCCACCGAT
TTCGGATTCCATCAGTTTCATGGGTGCAAGAGACTGCAAGTCCCTGGTGTTAATAGAGTG
CTCCTTTCGCAATCCACGCGCTCATTACTACTTTGAGAACTGCTTCAAACTGAATCAAGA
CGCTAGAGACCTCATCATCCAGAATAGTAGTCCAGGTGGACAAGTGCCTCCACACTTCAC
TCACCGAGCTACTGGTGGAGGTCCATTGACTATTAAGTTGACTGAAAAGCCTCTTCCAAA
ATCCACGAGATTTAAAGCTTGCATCTTGCTGCTTAATAATGGTGACCATGACGCTTGCTC
TGAAAAGAACTCGACAGGAGTGGACGTGATGTATAAAAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4EC27JQ 614 0 0
TGAGAACTGCTTCAAACTGAATCAAGACGCTAGAGACCTCATCATCCAGAATAGTAGTCC
AGGTGGACAAGTGCCTCCACACTTCACTCACCGAGCTACTGGTGGAGGTCCATTGACTAT
TAAGTTGACTGAAAAGCCTCTTCCAAAATCCACGAGATTTAAAGCTTGCATCTTGCTGCT
TAATAATGGTGACCATGACGCTTGCTCTGAAAAGAACTCGACAGGAGTGGACGTGATGTA
TAAAAATGGCAGTAGAAATTTGTGGCCAGCTTTAGCAGGGCATCTGTACACATTCCAAGT
TAAAGCGAAGGTGACTTGCAGCGAGCTTCTCTTTGAGTTCAAGCTGGAAAGGGATGACGT
TTGGAAGATAGGAGAATGCGGGCTAGTCCAAGACTTGAGGGTCCCTTGATATTGATGAAC
ACCATGAGATCTTGAGAGGTGATCGCCAAACATACTCTAAAGTTAAATTGGTCTCTCTGT
TTATTGTTCTCTATTGTATTTCTCTGTTTTCTTTTTAGTACGTTTAGGGTTTCTTTTGAT
TATTTTTAATATAACACTATTGAGTATTGTCCCTCTTCAAGAATTTTTTAAGGCTTAATG
GCATGGAAATTTCG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5718Contig1 877 2 2 U
GCCATGGAGGTTGGGGCGCCATTCTCTCCGAGGTCTATGCTCGTAAGGCCGACATCATTC
TGCGAGGATATTATGGGTGGAACTCAACTCGTGCTTTGGAAGTTGTGGACCAAGTGTTTC
CCAAGGATGCTGAGGTACAACCTTCTCTGGTAGTTGTCTATTTTGGAGGAAACGACTCAA
TGGCGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACGTTCCACTTACCGAATACGTTGACAACA
TGAAGAACATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTTCGGACTCGACTCGTATCATATTTCTAA
GCTGCCCTCCAGTGGACGAGGGCAAACTTCGTCAGAACCAAAGCCCATACTTGAGCGAGG
TGACCCGCACAAACGAGCTCTGCAAGACTTATTCAGACGCTTGTGTTGAGCTGTGCCAAG
AGCTAGGTTTACAAGTAGTTGATCTCTTCTCTACTCTTCAGAAATCAGATGACTGGGAAA
CCGTTTGCTTCACAGATGGGATACATTTGTCAGCGCAAGGAAGCAAACTGGTGGCTGCGG
AGATACTGAGAGTGGTGAAAGAAGCGGAATGGACACCGTCGCTTCACTGGAAATCGATGC
CAACTGAATTCTTTGAGGACTCACGTTATGATCTTGTTTCAGCTGATGGCAAAAACACTG
TCAACTTTTCGGAGTGGACCTACTTCTGGGAACAACAATGGGACTAAACATTACAACAAC
AAGACCTTTATAGAATGTGTTGTTGTTACCTTGGCTATTTTCGATTCTGAAAAAATGTCG
TACCATCGTTGCTTTGTTTTTGTTTTTTGAAACGTTATTATCTTTTTTTTTTTCTCCAAG
AATTACTGATAGGAATCAAAGACTCCATTGAGTTGCT


BQ
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AF RR4CR18TF U 1
AF RR4CR18JQ C 173
BS 1 423 RR4CR18TF
BS 424 877 RR4CR18JQ

RD RR4CR18TF 423 0 0
GCCATGGAGGTTGGGGCGCCATTCTCTCCGAGGTCTATGCTCGTAAGGCCGACATCATTC
TGCGAGGATATTATGGGTGGAACTCAACTCGTGCTTTGGAAGTTGTGGACCAAGTGTTTC
CCAAGGATGCTGAGGTACAACCTTCTCTGGTAGTTGTCTATTTTGGAGGAAACGACTCAA
TGGCGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACGTTCCACTTACCGAATACGTTGACAACA
TGAAGAACATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTTCGGACTCGACTCGTATCATATTTCTAA
GCTGCCCTCCAGTGGACGAGGGCAAACTTCGTCAGAACCAAAGCCCATACTTGAGCGAGG
TGACCCGCACAAACGAGCTCTGCAAGACTTATTCAGACGCTTGTGTTGAGCTGTGCCAAG
AGC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR4CR18JQ 705 0 0
CGACTCAATGGCGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACGTTCCACTTACCGAATACGT
TGACAACATGAAGAACATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTTCGGACTCGACTCGTATCAT
ATTTCTAAGCTGCCCTCCAGTGGACGAGGGCAAACTTCGTCAGAACCAAAGCCCATACTT
GAGCGAGGTGATCCGCACAAACGAGCTCTGCAAGACTTATTCAGACGCTTGTGTTGAGCT
GTGCCAAGAGCTAGGTTTACAAGTAGTTGATCTCTTCTCTACTCTTCAGAAATCAGATGA
CTGGGAAACCGTTTGCTTCACAGATGGGATACATTTGTCAGCGCAAGGAAGCAAACTGGT
GGCTGCGGAGATACTGAGAGTGGTGAAAGAAGCGGAATGGACACCGTCGCTTCACTGGAA
ATCGATGCCAACTGAATTCTTTGAGGACTCACGTTATGATCTTGTTTCAGCTGATGGCAA
AAACACTGTCAACTTTTCGGAGTGGACCTACTTCTGGGAACAACAATGGGACTAAACATT
ACAACAACAAGACCTTTATAGAATGTGTTGTTGTTACCTTGGCTATTTTCGATTCTGAAA
AAATGTCGTACCATCGTTGCTTTGTTTTTGTTTTTTGAAACGTTATTATCTTTTTTTTTT
TCTCCAAGAATTACTGATAGGAATCAAAGACTCCATTGAGTTGCT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5719Contig1 742 2 3 U
TTGTAAGCTTTCGACATAAATATTGGAGAAGACAGACAAAACAAAACGCGACGAAGACTA
CAAGGAGAAAGATTCATACACTCAACTCAGTCATCTTCATCCGAAGACTCATACGCTAAT
CCCAACAAGCCTTTCAAAGCATTTTGACCTTGCCCATTGCTTTCTGCTGCTTTGCCTCCG
GGTTGCTCCTCAGGTCTGTCCAGTTTATCTCTTTGAACCTTTGCTTCTGTTGGAACAATA
TCCCTCCTTTTAGGAGGTGACAAGCTTGTAAAAACCTTTGGTCGCTTCGGTTTAACCTCC
ACAACCTTTCTCAATAAATCTTGCTGCCTGATACCACTCTTAGGCTTGGGCTCAACACGA
AGCGGCAAAGGAATAAATGCTGGAAATGAATCAGCTTGGGTTGCAGCTTTTTTAAAGGCA
GCAAAAGCCCGTTTCTCAGTTCGTCTGAGAAGGCGCTCTGCATCCTGCTCTGCTTCCATC
TGCTCTTTAAGATAAAGCAAATCGTCGCTGTCCAAAGCGCCACGTCCATGAAGATAGCCT
CCACGCTCACCAGCAACATCTTGCATCTTTGCAACCATACGTTGAAAGGTGACGTCCTCA
TCATCTATCTTACCCTTCCCTTGTTTCTTATCTTTAGGGTCGGAGAGATTCGTGTATTCT
TTAACTTCCCTCCCTGACATATCGTCTCCGCTTAAAGAAAAACTCTCACAAGATTAGGGT
TCCTACGTTTTCACAAGGCTCC


BQ
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AF RR4EW74JQ U 111
AF RR4EW74TF C 1
BS 1 110 RR4EW74TF
BS 111 390 RR4EW74JQ
BS 391 742 RR4EW74TF

RD RR4EW74JQ 280 0 0
ATACGCTAATCCCAACAAGCCTTTCAAAGCATTTTGACCTTGCCCATTGCTTTCTGCTGC
TTTGCCTCCGGGTTGCTCCTCAGGTCTGTCCAGTTTATCTCTTTGAACCTTTGCTTCTGT
TGGAACAATATCCCTCCTTTTAGGAGGTGACAAGCTTGTAAAAACCTTTGGTCGCTTCGG
TTTAACCTCCACAACCTTTCTCAATAAATCTTGCTGCCTGATACCACTCTTAGGCTTGGG
CTCAACACGAAGCGGCAAAGGAATAAATGCTGGAAATGAA

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR4EW74TF 742 0 0
TTGTAAGCTTTCGACATAAATATTGGAGAAGACAGACAAAACAAAACGCGACGAAGACTA
CAAGGAGAAAGATTCATACACTCAACTCAGTCATCTTCATCCGAAGACTCATACGCTAAT
CCCAACAAGCCTTTCAAAGCATTTTGACCTTGCCCATTGCTTTCTGCTGCTTTGCCTCCG
GGTTGCTCCTCAGGTCTGTCCAGTTTATCTCTTTGAACCTTTGCTTCTGTTGGAACAATA
TCGCTCCTTTTAGGAGGTGACAAGCTTGTAGAGACCTTTGGTCGCTTCGGTTTAACCTCG
ACAACCTTTCTCAGTAAATCTTGCTGCCTGATACCACTCTTAGGCTTGGGCTCAACACGA
AGCGGCAAAGGAATAGATGCTGGAGATGAATCAGCTTGGGTTGCAGCTTTTTTAAAGGCA
GCAAAAGCCCGTTTCTCAGTTCGTCTGAGAAGGCGCTCTGCATCCTGCTCTGCTTCCATC
TGCTCTTTAAGATAAAGCAAATCGTCGCTGTCCAAAGCGCCACGTCCATGAAGATAGCCT
CCACGCTCACCAGCAACATCTTGCATCTTTGCAACCATACGTTGAAAGGTGACGTCCTCA
TCATCTATCTTACCCTTCCCTTGTTTCTTATCTTTAGGGTCGGAGAGATTCGTGTATTCT
TTAACTTCCCTCCCTGACATATCGTCTCCGCTTAAAGAAAAACTCTCACAAGATTAGGGT
TCCTACGTTTTCACAAGGCTCC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL5720Contig1 701 2 4 U
GTAGTTTGAAGAAAGAAACTTTATATTTCATTACACTGTCTGCTACACACATAATCATTT
CTTTTTCTTCTTTAGAAACATTGTCAATGTTTCATCAAGTGAAACAAAATAAATAATTTT
TTTAAAACAATTTGTCTTTACACACTTTTAGGTGCAAAGTATCACACAGTGACACAAATA
TCTTTATTACCTTTCCCTCAAGATGGACAACTCTTTATCTCATATTCTAAATTTAGACAA
ATGTGATTTTCCATTGAAGCCGCCCGCGAGGTATCCTGCAGTGTACTCTGGTATGGTCAT
ATCTCTGTACTTAGCAGGGTTTTCATCAAACAGAAGCTCTTTGATCGGTTCATAAACCGT
GGAATTCGGAAACAGGTTCGAGCTAAAGAAGCACGCAACTGAAATCCTCGGACCATCTCT
GTTTGCCCGTACCCTATGCTCGACGCTCAAGAACTTGTCATTAGTTATCAGCTGCATGAA
ATCACCGATGTTGATGACAAGAGCTCCATGAATAGGTGTTACATCGACCCAATAATCTTT
ATGAAGAACTTGAAGACCACCGATTTGGTCTTGAAGAAGAAGTGTAAGAAAAGAATTATC
GGTGTGCTTGCTTATGCCCAAAGTTAGGTCAGGTTGTGGGCAAGGTGGGAAGTAATGGCA
AAGCATAGACAAACCTTTAAGACAATCTATCTTCCTAAGGA


BQ
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AF RR4C275JQ U 1
AF RR4FF11JQ U 331
BS 1 565 RR4C275JQ
BS 566 566 RR4FF11JQ
BS 567 587 RR4C275JQ
BS 588 701 RR4FF11JQ

RD RR4C275JQ 587 0 0
GTAGTTTGAAGAAAGAAACTTTATATTTCATTACACTGTCTGCTACACACATAATCATTT
CTTTTTCTTCTTTAGAAACATTGTCAATGTTTCATCAAGTGAAACAAAATAAATAATTTT
TTTAAAACAATTTGTCTTTACACACTTTTAGGTGCAAAGTATCACACAGTGACACAAATA
TCTTTATTACCTTTCCCTCAAGATGGACAACTCTTTATCTCATATTCTAAATTTAGACAA
ATGTGATTTTCCATTGAAGCCGCCCGCGAGGTATCCTGCAGTGTACTCTGGTATGGTCAT
ATCTCTGTACTTAGCAGGGTTTTCATCAAACAGAAGCTCTTTGATCGGTTCATAAACCGT
GGAATTCGGAAACAGGTTCGAGCTAAAGAAGCACGCAACTGAAATCCTCGGACCATCTCT
GTTTGCCCGTACCCTATGCTCGACGCTCAAGAACTTGTCATTAGTTATCAGCTGCATGAA
ATCACCGATGTTGATGACAAGAGCTCCATGAATAGGTGTTACATCGACCCAATAATCTTT
ATGAAGAACTTGAAGACCACCGATT*GGTCTTGAAGAAGAAGTGTAA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4FF11JQ 371 0 0
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GCACGCAACTGAAATCCTCGGACCATCTCTGTTTGCCCGTACCCTATGCTCGACGCTCAA
GAACTTGTCATTAGTTATCAGCTGCATGAAATCACCGATGTTGATGACAAGAGCTCCATG
AATAGGTGTTACATCGACCCAATAATCTTTATGAAGAACTTGAAGACCACCGATTTGGTC
TTGAAGAAGAAGTGTAAGAAAAGAATTATCGGTGTGCTTGCTTATGCCCAAAGTTAGGTC
AGGTTGTGGGCAAGGTGGGAAGTAATGGCAAAGCATAGACAAACCTTTAAGACAATCTAT
CTTCCTAAGGA

QA 1 371 1 371
DS 



AS 1 2

CO CL5721Contig1 1006 2 2 U
GGAGAGGAGAGAGAGTACTTTAAAACAATTTATTAAAAAATATTCTCTCTCTAGACACTC
TAACTTCTTTCTAGGAACTTCTAAAATAAAGTTGCGATCGGTGGCCGGCAGGTTCTCTTG
CCATCGGTCGCCACCCCCTTTTTATTTTGTTTCTTTTGTTGTAATATAAAGATCTATGTT
TTTCGGTAAGCCGAATCTTCCTTCCGTTGCGGATATATTATCTTCGCTGTGGCGATGTTT
TCTTTTTGTTGTGTTTGTTTTTCATGTTCTTTATCGAAACTGGTTTTTAATCATCTCTTT
TTTCTTCGATAAAGAACCCTCAAATAACTTTCCACTTGATCTTATTTAAATCCCGTAGGC
TACTAAATAGGTTTCTATGTTTCCCCGCTCACCTAAATTCCTCCTCCTAAGAGATTAAGT
CTTTCTATCTAAGTAGCCGATATGGCGTGAAGAAAGCTTCTCTGACTGAGGATGAATAAG
GTTTGGTGGATCCTTGAAATCAAGTATGGAATAGATCAAGAAGAGTCGGCGCTTTTTGCG
GTCCGATAAATGTTCTTCTTTCTTTTGACTAACGGTTTCCTCTGCTTTAAATTTTCCGGT
GAAACATAGTTTTCTGGTTAGTCAGTTACGGTTTATGGTGGAAGGTTTATACAAATGAAG
ATTAACAAGCCCAGAAGTGTAGCTAGAGAAAAATCAGAGACGTAATGGATGTGCTACGAC
ATAAACTCCACCTTCCTTGCGGTGGCGCGTTCGTCGCGCGTTACTCGATGTGCGTGACTC
AGTGTCAAGACCCAAGTACAAGAATTGAATGGCGCGTGTATTTACTGTCTTGATCTTTGA
CGCGTGGCAAGTTGAAAGAAACCTCGAAACGGTTGATCTATACTATTATTGTAGGTTTCG
TATGTGTTAATGTGTATACCGGTCTTGTAAACAAAAACATTTGGGCTGTTAATACGCTTG
TAAGTTTGCCCCTTTGGACTTTCATGAAATGAAAAGTCGACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GM84TF U 1
AF RR4GM84JQ C 389
BS 1 640 RR4GM84TF
BS 641 1006 RR4GM84JQ

RD RR4GM84TF 640 0 0
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TAACTTCTTTCTAGGAACTTCTAAAATAAAGTTGCGATCGGTGGCCGGCAGGTTCTCTTG
CCATCGGTCGCCACCCCCTTTTTATTTTGTTTCTTTTGTTGTAATATAAAGATCTATGTT
TTTCGGTAAGCCGAATCTTCCTTCCGTTGCGGATATATTATCTTCGCTGTGGCGATGTTT
TCTTTTTGTTGTGTTTGTTTTTCATGTTCTTTATCGAAACTGGTTTTTAATCATCTCTTT
TTTCTTCGATAAAGAACCCTCAAATAACTTTCCACTTGATCTTATTTAAATCCCGTAGGC
TACTAAATAGGTTTCTATGTTTCCCCGCTCACCTAAATTCCTCCTCCTAAGAGATTAAGT
CTTTCTATCTAAGTAGCCGATATGGCGTGAAGAAAGCTTCTCTGACTGAGGATGAATAAG
GTTTGGTGGATCCTTGAAATCAAGTATGGAATAGATCAAGAAGAGTCGGCGCTTTTTGCG
GTCCGATAAATGTTCTTCTTTCTTTTGACTAACGGTTTCCTCTGCTTTAAATTTTCCGGT
GAAACATAGTTTTCTGGTTAGTCAGTTACGGTTTATGGTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4GM84JQ 618 0 0
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GAAGAAAGCTTCTCTGACTGAGGATGAATAAGGTTTGGTGGATCCTTGAAATCAAGTATG
GAATAGATCAAGAAGAGTCGGCGCTTTTTGCGGTCCGATAAATGTTCTTCTTTCTTTTGA
CTAACGGTTTCCTCTGCTTTAAATTTTCCGGTGAAACATAGTTTTCTGGTTAGTCAGTTA
CGGTTTATGGTGGAAGGTTTATACAAATGAAGATTAACAAGCCCAGAAGTGTAGCTAGAG
AAAAATCAGAGACGTAATGGATGTGCTACGACATAAACTCCACCTTCCTTGCGGTGGCGC
GTTCGTCGCGCGTTACTCGATGTGCGTGACTCAGTGTCAAGACCCAAGTACAAGAATTGA
ATGGCGCGTGTATTTACTGTCTTGATCTTTGACGCGTGGCAAGTTGAAAGAAACCTCGAA
ACGGTTGATCTATACTATTATTGTAGGTTTCGTATGTGTTAATGTGTATACCGGTCTTGT
AAACAAAAACATTTGGGCTGTTAATACGCTTGTAAGTTTGCCCCTTTGGACTTTCATGAA
ATGAAAAGTCGACAAAAA

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

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GCTTACCAAAGCGTTGAGGAGAAGGTGCGCAGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATG
CATATAGACCAGAGGAACAACGAGATCAGCAGTTACTGGCTGGGGTTAAACGAGTTTGCA
GATTTGACCCATGAAGAGTTCAAAAGGAAGTATCTCGGACTTGCAAAGCCTCCGCAGTTC
TCTAGAAAGAGGCAGCCCTCCTCTGCTAACTTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCT
AAATCCGTTGACTGGAGGAAGAAAGGCGCTGTGACTCCTGTAAAGAACCAGGGTTCATGT
GGTAGTTGTTGGGCGTTTTCGACCGTTGCAGCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACA
GGGAACCTGAGTTCGCTTTCGGAGCAAGAACTCATAGACTGTGACACAACTTACAACAAC
GGTTGCGATGGAGGTCTAATGGACTACGCATTCCAGTACATCATTTCCACAGGTGGTCTC
CACAAAGAAGACGATTATCCTTACCTCATGGAGGAAGGCATTTGCCAAGAGCAGAAGGAG
GATGTAGAAGTTGTGACAATCAGCGGCTACGAAGATGTCCCACAAAACAGTGATGAAAGC
CTGGTGAAGGCTTTAGCTCACCAGCCAGTCAGTGTGGCTATTGAGGCTTCAGGAAGAGAC
TTCCAGTTCTACAAAGGGGGAGTGTTCAATGGGAAGTGTGGAACAGAGCTAGACCATGGT
GTAGCTGCAGTTGGGTACGGTTCATCAAAGGGATCTGACTATGTTATTGTGAAGAACTCA
TGGGGACCAAGATGGGGAGAGAAAGGGTTTATTAGGATGAAGAGAAACACTGGTAAACCA
GAGGGAATCTGCGGAATCAACAAGATGGCTTCATATCCTACCAAGACCAACTAAGACAGA
CTCACATCTATCTTCTCATTCTGCTACTGCTTCCTACGTTTTTCTTTTCTTTCCAATGCA
TTTTCTATTCTACCTGTTTTCAAGCATATTATATTGTATTTGATGAATTTGAGATTTTAA
AATAATATTCTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G772TF U 1
AF RR4G772JQ C 342
BS 1 593 RR4G772TF
BS 594 1093 RR4G772JQ

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GCTTACCAAAGCGTTGAGGAGAAGGTGCGCAGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATG
CATATAGACCAGAGGAACAACGAGATCAGCAGTTACTGGCTGGGGTTAAACGAGTTTGCA
GATTTGACCCATGAAGAGTTCAAAAGGAAGTATCTCGGACTTGCAAAGCCTCCGCAGTTC
TCTAGAAAGAGGCAGCCCTCCTCTGCTAACTTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCT
AAATCCGTTGACTGGAGGAAGAAAGGCGCTGTGACTCCTGTAAAGAACCAGGGTTCATGT
GGTAGTTGTTGGGCGTTTTCGACCGTTGCAGCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACA
GGGAACCTGAGTTCGCTTTCGGAGCAAGAACTCATAGACTGTGACACAACTTACAACAAC
GGTTGCGATGGAGGTCTAATGGACTACGCATTCCAGTACATCATTTCCACAGGTGGTCTC
CACAAAGAAGACGATTATCCTTACCTCATGGAGGAAGGCATTTGCCAAGAGCA

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DS 

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GATCCACCAGATCACAACAGGGAACCTGAGTTCGCTTTCGGAGCAAGAACTCATAGACTG
TGACACAACTTACAACAACGGTTGCGATGGAGGTCTAATGGACTACGCATTCCAGTACAT
CATTTCCACAGGTGGTCTCCACAAAGAAGACGATTATCCTTACCTCATGGAGGAAGGCAT
TTGCCAAGAGCAGAAGGAGGATGTAGAAGTTGTGACAATCAGCGGCTACGAAGATGTCCC
ACAAAACAGTGATGAAAGCCTGGTGAAGGCTTTAGCTCACCAGCCAGTCAGTGTGGCTAT
TGAGGCTTCAGGAAGAGACTTCCAGTTCTACAAAGGGGGAGTGTTCAATGGGAAGTGTGG
AACAGAGCTAGACCATGGTGTAGCTGCAGTTGGGTACGGTTCATCAAAGGGATCTGACTA
TGTTATTGTGAAGAACTCATGGGGACCAAGATGGGGAGAGAAAGGGTTTATTAGGATGAA
GAGAAACACTGGTAAACCAGAGGGAATCTGCGGAATCAACAAGATGGCTTCATATCCTAC
CAAGACCAACTAAGACAGACTCACATCTATCTTCTCATTCTGCTACTGCTTCCTACGTTT
TTCTTTTCTTTCCAATGCATTTTCTATTCTACCTGTTTTCAAGCATATTATATTGTATTT
GATGAATTTGAGATTTTAAAATAATATTCTCT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTGAGTAATATTGGCCACATCGAACTTGACCTACCAGAACGTCCAGAGAAGGCGGCTCTT
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GCTGTTCTGCTTCTCTACGTGCTTTTCTGGTTAAAGTTGGATCTGTTCACGACGCTTAAG
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TAATTTTTATAGATTAAGGTGATAGACAAGTGCAAAGTATTTTCAGAGTTTACCAACTAT
CAGTTTAGTCTTAAAAAGTTATCACC


BQ
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AF RR4BC45TF U 388
AF RR4BC45JQ C 1
BS 1 391 RR4BC45JQ
BS 392 420 RR4BC45TF
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TGGG
TAAAGTTGGATCTGTTCACGACGCTTAAG*CACTATCTTTGTTGGGAGTGTTTCTGCTGT
TCGTTGGACACAGAACACTCTCTGGCCTCGCAGCAGCATCGAACAAG

QA 5 111 5 111
DS 

RD RR4BC45JQ 686 0 0
CTTTCTGGTAAATATGAAATCCAGCTAACTATTGGAGATTCTTCTATGGAGAACTCTGTA
TTGAGTAATATTGGCCACATCGAACTTGACCTACCAGAACGTCCAGAGAAGGCGGCTCTT
CCTCCTCTACAACCTACTGACCCTTACTCAAGATATGGGCCAAAAGCTGAGATATCACAC
ATCTTCCGTGTTCCTGAAAAGCTACCCGCGAAGCAGCTTTCACTAGTTTTCTTGGGTCTT
ATAGTCCTCCCATTTATCGCTTTCCTGATCGGGCTGACACGGTTGGGAGTGAACATAAAG
AGCTTCCCATCATCGGTTGGAGCTGCAACATCCGCTTTGCTTTTCCATGGCGGCATCGGA
GCTGTTCTGCTTCTCTACGTGCTTTTCTGGTTAAAGTTGGATCTGTTCACGACGCTTAAG
GCACTATCTTTGTTGGGAGTGTTTCTGCTGTTCGTTGGACACAGAACACTCTCTGGCCTC
GCAGCAGCATCGAACAAGTTGAAATCTGCTTGAAGAATGTATTCGCTATGATGAATCTTC
TGTGTGTTCCATGGACCAGTTTTTTTTTTCTTTTATTTGCAGTTTTGTAGTATTACTTTT
TAATTTTTATAGATTAAGGTGATAGACAAGTGCAAAGTATTTTCAGAGTTTACCAACTAT
CAGTTTAGTCTTAAAAAGTTATCACC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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CAAGAAAAAGTACGACGAAGATGAGCCGACACAAACCTACGAGAGCGTCGCACTCATCAT
CGGCGTCACGGGCATCGTCGGGAACAGCCTAGCGGAGATCCTTCCTCTCTCCGACACTCC
GGGAGGTCCGTGGAAAGTCTACGGCGTCGCTCGCCGTCCTCGTCCCACCTGGAACGCCGA
TCATCCCATCGATTACATCCAGTGCGATGTCTCCGACGAAGAAGACGCGAGATCCAAGCT
TTCGCCTCTGAGAGACGTCACGCACTTCTTCTACGTCACGTGGAGCAACCGATCTGTGGA
GGTGGACAACTGTAAGGTTAACGGCTCTATGCTCCGTAACGTCCTCCGCGCGGTTGTACC
CAACGCGCCGAATCTCCGGCACGTTTGTCTCCAGACGGGGACGAAGCATTACCTTGGCCC
TTTTCGATAGTCTTGGTAAAGATGTTCAACGTCACGAGCCGCCTTTCACGGAGGACATGC
CGAGGTTGCGGGTCGAGAACTTTTACTACACTCTTGAGGATGTTCTGTCTGAAGAGATTA
AGACGAGAGAGAGTGCGACTTGGTCTGTGCATAGACCCAATCTCATCTTTGGATTCTCTC
CTTATAGCTTGATGAACATTGTGGGGACTCTCTGCGTCTACGCAGCCATCTGCAAGCACG
AAGGGTCTAAGTTGGTTTTCCCGGGGAGAAAGGAGGCGTGGGAAGGTTTCACGACAGGGT
CAGACGCTGATCTGGTCGCTGAGCAGCAGATTTGGGCTGCCGTTGATCCTTACGCCAAGA
ACGAGGCGTTTAACTGCAGCAACGCCGATGTTTTCAAGTGGAAGCACCTGTGGAAGATAC
TCGCTGAGCAGTTTGGGATCGAGGAGTATGGGTTCGAAGAAGGGAAGAATGTGGGGTTGA
GATGATGAAAGGGAAAGAAGGAGTGTGGGAGGAGATGGTGAAGGAGAATCAGCTGCAGGA
GAAGAAGCTTGATGAGGTTGGTCTGTGGTGGTTTGCTGATCTTGTGCTTGGTGTTGATGG
TATGCTTGATAGTATGAACAAGAGCAAAGAGTATGGCTTTCTTGGTTTCAGAACTCCAAC
AACTCGTTTATCTCTTGGATTGACAAGTACAAGCTTTCAAGATTGTGCCTTGATTCATCT
TGTACACAAAATACAGTTGGATG


BQ
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AF RR4CD91TF U 1
AF RR4DJ37TF U 457
BS 1 483 RR4CD91TF
BS 484 484 RR4DJ37TF
BS 485 615 RR4CD91TF
BS 616 616 RR4DJ37TF
BS 617 717 RR4CD91TF
BS 718 1223 RR4DJ37TF

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CAAGAAAAAGTACGACGAAGATGAGCCGACACAAACCTACGAGAGCGTCGCACTCATCAT
CGGCGTCACGGGCATCGTCGGGAACAGCCTAGCGGAGATCCTTCCTCTCTCCGACACTCC
GGGAGGTCCGTGGAAAGTCTACGGCGTCGCTCGCCGTCCTCGTCCCACCTGGAACGCCGA
TCATCCCATCGATTACATCCAGTGCGATGTCTCCGACGAAGAAGACGCGAGATCCAAGCT
TTCGCCTCTGAGAGACGTCACGCACTTCTTCTACGTCACGTGGAGCAACCGATCTGTGGA
GGTGGACAACTGTAAGGTTAACGGCTCTATGCTCCGTAACGTCCTCCGCGCGGTTGTACC
CAACGCGCCGAATCTCCGGCACGTTTGTCTCCAGACGGGGACGAAGCATTACCTTGGCCC
TTT*CGATAGTCTTGGTAAAGATGTTCAACGTCACGAGCCGCCTTTCACGGAGGACATGC
CGAGGTTGCGGGTCGAGAACTTTTACTACACTCTTGAGGATGTTCTGTCTGAAGAGATTA
AGACGAGAGAGAGTGTGACTTGGTCTGTGCATAGACCCAATCTCATCTTTGGATTCTCTC
CTTATAGCTTGATGAACATTGTGGGGACTCTCTGCGTCTACGCAGCCATCTGCAAGC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4DJ37TF 767 0 0
GGGGACGAAGCATTACCTTGGCCCTTTTCGATAGTCTTGGTAAAGATGTTCAACGTCACG
AGCCGCCTTTCACGGAGGACATGCCGAGGTTGCGGGTCGAGAACTTTTACTACACTCTTG
AGGATGTTCTGTCTGAAGAGATTAAGACGAGAGAGAGTGCGACTTGGTCTGTGCATAGAC
CCAATCTCATCTTTGGATTCTCTCCTTATAGCTTGATGAACATTGTGGGGACTCTCTGCG
TCTACGCAGCCATCTGCAAGCACGAAGGGTCTAAGTTGGTTTTCCCGGGGAGAAAGGAGG
CGTGGGAAGGTTTCACGACAGGGTCAGACGCTGATCTGGTCGCTGAGCAGCAGATTTGGG
CTGCCGTTGATCCTTACGCCAAGAACGAGGCGTTTAACTGCAGCAACGCCGATGTTTTCA
AGTGGAAGCACCTGTGGAAGATACTCGCTGAGCAGTTTGGGATCGAGGAGTATGGGTTCG
AAGAAGGGAAGAATGTGGGGTTGAGATGATGAAAGGGAAAGAAGGAGTGTGGGAGGAGAT
GGTGAAGGAGAATCAGCTGCAGGAGAAGAAGCTTGATGAGGTTGGTCTGTGGTGGTTTGC
TGATCTTGTGCTTGGTGTTGATGGTATGCTTGATAGTATGAACAAGAGCAAAGAGTATGG
CTTTCTTGGTTTCAGAACTCCAACAACTCGTTTATCTCTTGGATTGACAAGTACAAGCTT
TCAAGATTGTGCCTTGATTCATCTTGTACACAAAATACAGTTGGATG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5726Contig1 1427 2 12 U
GGGTGGCCGGCCTGAGAGGATTCGAAGCTTGACGATTGTATAAACCATGGCGACGGCTTC
AGTTGCTTTTAAGTCTAGGGAAGACCATAGGAAGCAAATTGAACTAGAGGAAGCTCGTAA
AGCGGGGCTTGCACCAGCTGAGCTAGATGAGGATGGAAAGGAGATCAATCCTCACATTCC
TCAGTATATGTCTTCTGCTCCTTGGTATCTCAACTCTGAAAAGCCCAGTCTTAAGCATCA
ACGGAATTGGAAGAGTGATCCCAATTACACTAAGTCATGGTATGACAGAGGTGCTAAGAT
CTACCAAGCTGAAAAATACCGCAAGGGAGCTTGTCAAAATTGTGGTGCAATGACGCATAC
TGCAAAGGCGTGTATGGATAGACCTCGCCAGATTGGAGCAAAGTACACGAACAAGAACAT
TGCACCTGATGAGAAAATCGAGAGCTTTGAACTCGACTATGATGGCAAGAGGGACCGATG
GAATGGGTACGATCCTTCAACCTATCATCGTGTGGTAGACCTTTATGAAGCTAAAGAGGA
TGCACGAAAGAAGTATCTCAAGGAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGAGAAGAACAATAA
CCAGGAAGGTGATGATGCTGCAACCAGTGATGGGGACGAAGAAGATGATGATGACTTGAG
GGTCGATGAAGCAAAGGTTGATGAGAGCAGGCAGATGGACTTTGCAAAGGTTGAAAAACG
TGTTCGAACTACTGGTGGTGGTAGTACAGGAACTGTGAGAAATCTGCGTATTAGAGAAGA
CACAGCGAAATACCTGTTGAACCTTGATATCAATTCGGCTCATTATGACCCTAAAACACG
ATCCATGCGTGAAGACCCACTTCCAGATGCAGATCCGAATGATAAATTTTATTCGGGAGA
TAATCAATATAGAGACAGTGGCCAAGCTGCAGAGTTCAAACAGATGAACATGCACTCATC
GGCAACATTTGACAAGGGACAGGACATGCATATGCAAGCGGCTCCATCCCAAGCTGAGTT
GCTGTACAAGAATTTCAAGGTTGCTAAGGACAAACTGAAGACTCAGACAAAGGACACAAT
CATGGAGAAGTACGGGAATGCTTTTACAGAAGATGAAATTCCAATGGAGCTTTTGCTTGG
ACAGAGCGAAAGACAAGTTGAGTATGACCGAGCAGGGAGGATTGTAAAAGGACAGGAGGT
TATACTGCCGAAGAGCAAATACGAAGAAGATGTTCTTGCTAACAATCACACAAGTGTTTG
GGGCTCATGGTGGAAAGACCATCAATGGGGATATAGATGTTGCCAGCGGACGATTCGCAA
TAGTTACTGCACAGGCTTTGCTGGTATTGAGGCCGCAGAGGCTTCCCTTGATTTGATGAA
GGCTAACATTGCTCGCAAAGAAGCCTGTGAAGAGAGCCCAAAGAAGG


BQ
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AF RR4EZ77TF U 1
AF RR4EZ77JQ C 548
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RD RR4EZ77TF 776 0 0
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AGTTGCTTTTAAGTCTAGGGAAGACCATAGGAAGCAAATTGAACTAGAGGAAGCTCGTAA
AGCGGGGCTTGCACCAGCTGAGCTAGATGAGGATGGAAAGGAGATCAATCCTCACATTCC
TCAGTATATGTCTTCTGCTCCTTGGTATCTCAACTCTGAAAAGCCCAGTCTTAAGCATCA
ACGGAATTGGAAGAGTGATCCCAATTACACTAAGTCATGGTATGACAGAGGTGCTAAGAT
CTACCAAGCTGAAAAATACCGCAAGGGAGCTTGTCAAAATTGTGGTGCAATGACGCATAC
TGCAAAGGCGTGTATGGATAGACCTCGCCAGATTGGAGCAAAGTACACGAACAAGAACAT
TGCACCTGATGAGAAAATCGAGAGCTTTGAACTCGACTATGATGGCAAGAGGGACCGATG
GAATGGGTACGATCCTTCAACCTATCATCGTGTGGTAGACCTTTATGAAGCTAAAGAGGA
TGCACGAAAGAAGTATCTCAAGGAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGAGAAGAACAATAA
CCAGGAAGGTGATGATGCTGCAACCAGTGATGGGGACGAAGAAGATGATGATGACTTGAG
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QA 1 776 1 776
DS 

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GAAGCAAAGGTTGATGAGAGCAGGCAGATGGACTTTGCAAAGGTTGAAAAACGTGTTCGA
ACTACTGGTGGTGGTAGTACAGGAACTGTGAGAAATCTGCGTATTAGAGAAGACACAGCG
AAATACCTGTTGAACCTTGATATCAATTCGGCTCATTATGACCCTAAAACACGATCCATG
CGTGAAGACCCACTTCCAGATGCAGATCCGAATGATAAATTTTATTCGGGAGATAATCAA
TATAGAGACAGTGGCCAAGCTGCAGAGTTCAAACAGATGAACATGCACTCATCGGCAACA
TTTGACAAGGGACAGGACATGCATATGCAAGCGGCTCCATCCCAAGCTGAGTTGCTGTAC
AAGAATTTCAAGGTTGCTAAGGACAAACTGAAGACTCAGACAAAGGACACAATCATGGAG
AAGTACGGGAATGCTTTTACAGAAGATGAAATTCCAATGGAGCTTTTGCTTGGACAGAGC
GAAAGACAAGTTGAGTATGACCGAGCAGGGAGGATTGTAAAAGGACAGGAGGTTATACTG
CCGAAGAGCAAATACGAAGAAGATGTTCTTGCTAACAATCACACAAGTGTTTGGGGCTCA
TGGTGGAAAGACCATCAATGGGGATATAGATGTTGCCAGCGGACGATTCGCAATAGTTAC
TGCACAGGCTTTGCTGGTATTGAGGCCGCAGAGGCTTCCCTTGATTTGATGAAGGCTAAC
ATTGCTCGCAAAGAAGCCTGTGAAGAGAGCCCAAAGAAGG

QA 1 880 1 880
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGTTTCTCGTAAAGGAGGACATCCTGGGCAAGGCCGAGGAAGTGCAAAGGCCATGTCTCG
TGGTGGTCCTACAAGCAACGCCGGTGGTAGAGGTAGGGGAAGCATGAAGACACATCAACA
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AATGTGAATCGATGAGGGAGATTTAGACACTTGTATGGATAAAAGAAACTGTATTTTGTT
TAGGGAGATGGTTTATAAATGATTTTTGTGTGGTCACATAACTGGATTTGGAAATTAGGG
TCTTAAACAACGACTTTGTGTATAAATGTAGAATGTTTCAC


BQ
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AF RR4GY12TF U 1
AF RR4GY12JQ C 1
BS 1 537 RR4GY12TF
BS 538 641 RR4GY12JQ

RD RR4GY12TF 537 0 0
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GGTTTCTCGTAAAGGAGGACATCCTGGGCAAGGCCGAGGAAGTGCAAAGGCCATGTCTCG
TGGTGGTCCTACAAGCAACGCCGGTGGTAGAGGTAGGGGAAGCATGAAGACACATCAACA
CAAAGCGCAGAATGGCATCGGGAAGAAAACTTTAGGTGATATCGAAATACTCCACACTGA
TACACTAATAAAAGAGGTAGAAAAGGTTTTTGGATCAGTTAACCCAAATCCAGCAGAGGT
AGAGAAGGCAAAGAGAGTGCTAAGAGATCATGAGCAAGCACTTGTGGATGCAATTGCAAG
GCTTGAAGAACTATCAGACGGCGAAAGCGGTAATATTTGAATAGGAGGCCGTTCTAACTT
CCTCCTCAGATGATGTAGTCAGGGCATTGGACTTGGCTCAAATGTGTAGATGGTGGTGTT
AATGTGAATCGATGAGGGAGATTTAGACACTTGTATGGATAAAAGAAACTGTATTTT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4GY12JQ 641 0 0
GTGGGTAAATCTTAAAGAGATATCTCCGGGAGATATCAGATGGGAAGGTGAGGATGGTGG
GGTTTCTCGTAAAGGAGGACATCCTGGGCAAGGCCGAGGAAGTGCAAAGGCCATGTCTCG
TGGTGGTCCTACAAGCAACGCCGGTGGTAGAGGTAGGGGAAGCATGAAGACACATCAACA
CAAAGCGCAGAATGGCATCGGGAAGAAAACTTTAGGTGATATCGAAATACTCCACACTGA
TACACTAATAAAAGAGGTAGAAAAGGTTTTTGGATCAGTTAACCCAAATCCAGCAGAGGT
AGAGAAGGCAAAGAGAGTGCTAAGAGATCATGAGCAAGCACTTGTGGATGCAATTGCAAG
GCTTGAAGAACTATCAGACGGCGAAAGCGGTAATATTTGAATAGGAGGCCGTTCTAACTT
CCTCCTCAGATGATGTAGTCAGGGCATTGGACTTGGCTCAAATGTGTAGATGGTGGTGTT
AATGTGAATCGATGAGGGAGATTTAGACACTTGTATGGATAAAAGAAACTGTATTTTGTT
TAGGGAGATGGTTTATAAATGATTTTTGTGTGGTCACATAACTGGATTTGGAAATTAGGG
TCTTAAACAACGACTTTGTGTATAAATGTAGAATGTTTCAC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL5729Contig1 1219 2 2 U
GGCTTCAGGTTGCAGAGAAGTGTCAGAGCACGATTGATCAGAGTGGGCCAGATGGGATCC
ATCAGCAGGATTTGCAAGCAAATAGCAACATGGTCATGGCTGCTGGACGTCAACTAGCGA
AAAGCTTGGAGTCACATTCTCTTAATGACTTAGGCTTCTCCGAACGCTATGTTCGGTGTT
TGCAGATCTCTGAGGTTGTAAGCAGCATGAAAGATGTGATTGACTTCTGCCGTGACCAAA
AAGTTGGTCCAATAGAGGCTTTGAAGAGTTATCCTTATCGAATGAGGGCAGGGAAGATGC
AGATGCAGCAGGAGATGGAGCAAGCAGGTAATGATGCTAGAGGACTTCCACCTGATAGGA
ACAGTCTCAACAAGCTAATGGCCTTGCGCAATAACAACAACATGAACAACGGTCAGGGAT
CTCTTCCAGGCTCTGGGCAAGCCGCCGCGGCCTTTGCTCTTACCAACTACCAGACCATGC
TAATGAAACAGAACGCGGAGCAAACCAACGCCACGCTCCAGCAAGAATCATCAAGAAACA
TGAGCCCATCACCGAGCTATAATGGAGCAGCTGGTACTTTGTTAACTGGTTTTGCGCAGA
GCCCATCGATCAGCGGTGTTTCTTCTCCTCAGAGGCAAATGCCAAGCTCTAGTTATAACA
GCTCAGCTCATCAGCAATACCAACAACAGCAGCAACAGCCTTCCTGTAGTGGCAGTAACC
AAGCGATGGAACAACAACAGCTGATTCACCAGATATGGCAACAGATGGCGAACAGCAACG
GAGGCTCCGGGCAGCAGCAGTCGCTCTCTGGTCAGAACATGGGAAGAAACAGAACAGATT
ATGTGCCCACAGCGGAAACACCAAGCAGTCCCAACAGGTTCAGAGGCATGAAAGGGCTAG
ACCAGAGCCAGATCCAGAACCAGGAAGCTATGGTCTCTTCTAACAACACATCATCACTCA
ACTTTGGTGATAACAACGGTTTCTTTAGCAATGGGGTTGATGAAAGCATGGAGTATCCTT
GGAAGGCATGATGAGGAGGAGAAGTTGGTAGTTTAGTCTATGTATGTCTTTTTGTAAAGA
ACTGAGAGTACTAAAAGACTTAGAGACCATCTTTAGGTTATGTGAATCTCTTGAGGAGAG
TTCTCATCAAATGTTAACTTTGTCCACCTGGTGGTGTTGCTGAACTCTTAGAGAAAAGCT
TCTGTTTTTATGAGGTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK90TF U 1
AF RR4GK90JQ C 456
BS 1 701 RR4GK90TF
BS 702 1219 RR4GK90JQ

RD RR4GK90TF 701 0 0
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ATCAGCAGGATTTGCAAGCAAATAGCAACATGGTCATGGCTGCTGGACGTCAACTAGCGA
AAAGCTTGGAGTCACATTCTCTTAATGACTTAGGCTTCTCCGAACGCTATGTTCGGTGTT
TGCAGATCTCTGAGGTTGTAAGCAGCATGAAAGATGTGATTGACTTCTGCCGTGACCAAA
AAGTTGGTCCAATAGAGGCTTTGAAGAGTTATCCTTATCGAATGAGGGCAGGGAAGATGC
AGATGCAGCAGGAGATGGAGCAAGCAGGTAATGATGCTAGAGGACTTCCACCTGATAGGA
ACAGTCTCAACAAGCTAATGGCCTTGCGCAATAACAACAACATGAACAACGGTCAGGGAT
CTCTTCCAGGCTCTGGGCAAGCCGCCGCGGCCTTTGCTCTTACCAACTACCAGACCATGC
TAATGAAACAGAACGCGGAGCAAACCAACGCCACGCTCCAGCAAGAATCATCAAGAAACA
TGAGCCCATCACCGAGCTATAATGGAGCAGCTGGTACTTTGTTAACTGGTTTTGCGCAGA
GCCCATCGATCAGCGGTGTTTCTTCTCCTCAGAGGCAAATGCCAAGCTCTAGTTATAACA
GCTCAGCTCATCAGCAATACCAACAACAGCAGCAACAGCCT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4GK90JQ 764 0 0
GCTCTTACCAACTACCAGACCATGCTAATGAAACAGAACGCGGAGCAAACCAACGCCACG
CTCCAGCAAGAATCATCAAGAAACATGAGCCCATCACCGAGCTATAATGGAGCAGCTGGT
ACTTTGTTAACTGGTTTTGCGCAGAGCCCATCGATCAGCGGTGTTTCTTCTCCTCAGAGG
CAAATGCCAAGCTCTAGTTATAACAGCTCAGCTCATCAGCAATACCAACAACAGCAGCAA
CAGCCTTCCTGTAGTGGCAGTAACCAAGCGATGGAACAACAACAGCTGATTCACCAGATA
TGGCAACAGATGGCGAACAGCAACGGAGGCTCCGGGCAGCAGCAGTCGCTCTCTGGTCAG
AACATGGGAAGAAACAGAACAGATTATGTGCCCACAGCGGAAACACCAAGCAGTCCCAAC
AGGTTCAGAGGCATGAAAGGGCTAGACCAGAGCCAGATCCAGAACCAGGAAGCTATGGTC
TCTTCTAACAACACATCATCACTCAACTTTGGTGATAACAACGGTTTCTTTAGCAATGGG
GTTGATGAAAGCATGGAGTATCCTTGGAAGGCATGATGAGGAGGAGAAGTTGGTAGTTTA
GTCTATGTATGTCTTTTTGTAAAGAACTGAGAGTACTAAAAGACTTAGAGACCATCTTTA
GGTTATGTGAATCTCTTGAGGAGAGTTCTCATCAAATGTTAACTTTGTCCACCTGGTGGT
GTTGCTGAACTCTTAGAGAAAAGCTTCTGTTTTTATGAGGTTCG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5730Contig1 436 2 3 U
CATATGGAAGATAGAAACTTAAGAAGAGAGGGTGATGCAAAAAGGGACAATAGTGACAGA
CTCAAAACATCAAAGCAAAGACGCAACGTACTTAAAAAAAAGAGTAGCAAATAGTGTACT
TCTTCTTCTTTCAGTTTCTTCTCTTTATCTTTCTTCTTTCCCTCCTTCTGATCTTCTTTC
TTCTCCCCTTCCTCTTCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCTTCTTTTCT
TTCTTATCCTTTGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTTGTCTTTTCCGTCTGCACCTGATTCA
TCCTTATCTTTCTTCTTCTTTTTATTACTTTCTTCTTCTTCTAAATCCTCTTTTTGTTGT
GATACATCCTCATCTTTCTTCTCCTTACCTTTCTTTTTCTTCTTGTGTTCCTTCTCTGTT
TCTTCATCTTTTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA51JQ U 16
AF RR4FA51TF C 1
BS 1 15 RR4FA51TF
BS 16 261 RR4FA51JQ
BS 262 436 RR4FA51TF

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CAAAGACGCAACGTACTTAAAAAAAAGAGTAGCAAATAGTGTACTTCTTCTTCTTTCAGT
TTCTTCTCTTTATCTTTCTTCTTTCCCTCCTTCTGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTCCTCT
TCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATCCTTTGAT
TCTTCT

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR4FA51TF 436 0 0
CATATGGAAGATAGAAACTTAAGAAGAGAGGGTGATGCAAAAAGGGACAATAGTGACAGA
CTCAGAACATCAAAGCAAAGACGCAACGTACTTAAAAAAAAGAGTAGCAAATAGTGTACT
TCTTCTTCTTTCAGTTTCTTCTCTTTATCTTTCTTCTTTCCCTCCTTCTGATCTTCTTTC
TTCTCCCCTTCCTCTTCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCTTCTTTTCT
TTCTTATCCTTTGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTTGTCTTTTCCGTCTGCACCTGATTCA
TCCTTATCTTTCTTCTTCTTTTTATTACTTTCTTCTTCTTCTAAATCCTCTTTTTGTTGT
GATACATCCTCATCTTTCTTCTCCTTACCTTTCTTTTTCTTCTTGTGTTCCTTCTCTGTT
TCTTCATCTTTTACAC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCTGTTCATCGCCAC
ATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGAGAAGTTCAACGCCAACCAAGATGTGGAG
GATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCATGGTGAAGCTGAGTACGACAAATGGCGG
CACCCTGATCCTTATATCGCTCCATGGGCTCCTGGTGGCTCCAAGTTCTGTAGAAACCCC
ACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAC
TTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAGATGTTTTGTTT
TAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCGTGGTTTACATTTGTTCATCTAAAACATGTCATCAT
GAATCAAGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAAACAAACAAAAGTGTGTTCCGTC


BQ
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AF RR4F147TF U 1
AF RR4F147JQ C 340
BS 1 597 RR4F147TF

RD RR4F147TF 597 0 0
GGACTGTTGAAAGAGTGACATCTAGAAGGAGAGAGTTGAATTCAATCGGAAGCAGGAGGA
GGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCGGCGTATTTCGCGCGGCGAGCGGCGCAGAAGGAGAGG
GTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCTGTTCATCGCCAC
ATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGAGAAGTTCAACGCCAACCAAGATGTGGAG
GATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCATGGTGAAGCTGAGTACGACAAATGGCGG
CACCCTGATCCTTATATCGCTCCATGGGCTCCTGGTGGCTCCAAGTTCTGTAGAAACCCC
ACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAC
TTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAGATGTTTTGTTT
TAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCGTGGTTTACATTTGTTCATCTAAAACATGTCATCAT
GAATCAAGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAAACAAACAAAAGTGTGTTCCGTC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4F147JQ 258 0 0
TCCAAGTTTTGTAGAAACCCCACTCCCCCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGT
CAAGAAGACAACCCATAAAACTTAATTTTCCTGTGGTTATGGTTCAGAAAATAAATTTTT
ACTTTCAAAGATGTTTTGTTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCGTGGTTTACATTTGT
TCATTTAAAACATGTCATCATGAATCAAGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAAACAA
ACAAAAGTGTGTTCCGTC

QA 1 258 1 258
DS 



AS 1 2

CO CL5733Contig1 838 2 7 U
GGAAGACATATCAAACAAAACTTGAAGATCAAGAATCATATACAAAAACCAAAGTTCCAA
GGTCCTAAATAAATATGAAATGACCCAATAAACAAAGAAAAGCAAACAGCTTTTGGAACA
AGTATCAGTCAAGTTTCGTAACATTCTTTCTATCAGAGGACACGTGCTGTCCGAAGAGAG
GAGAGAATCGATGTCGCTGTATGATCTTGAGAAGGACAAATGTGTTCGCAGCCAGAAACA
CCAAACTCACCATCCACAGCTGTAGAAAGACGTTCACGCCCTTGAACTCGAGCATGTATC
CCCATAACAGCCAATGCGTCTGAGCTCCAATCCACAGAACCATGCATAAGATGCCTTCCC
ACTTCAGCTTCATACGGCTCCACGGTAGAATCAGAGGTAGCAGGCAATAGAACCACACAA
AGTACTGTGCAGTTATCACCTTATTGAAAGCCACGAACGCGACGGTTTGGAGAAACATAC
AGAACACTAGATCCTGAGAGAAGCAAAAGACTAAAGCAAGCTGTACAGTGAACTGAGGTA
AGAAAGAGATAAGCTTCTCCACAGCTGAAAACTGGCGCTCGTAGTGAAGATAAATATGGT
AAAAGTAAATGGAGAAGTTGTGCCTCGGATCCGTGCGTGTGAGGTGATACAAGAGAGCCT
CGTGGAGGAACTCGTGTCCATAAAAGTAGAAAGAAACAGCATTGCAAAGTAGAAAAACTC
CCCCGGATATCAAACCAAACATGATTCTCTCCCTCGAAAACAAACTACTAACACTGAAGC
TGAATGTTCTCTTCTCAGTGCTGCTAGTACGTGTCCAGCCCTCAAGAGGGGGCTTGTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4GX33JQ U 1
AF RR4B471JQ U 1
BS 1 226 RR4B471JQ
BS 227 227 RR4GX33JQ
BS 228 248 RR4B471JQ
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BS 250 607 RR4B471JQ
BS 608 608 RR4GX33JQ
BS 609 838 RR4B471JQ

RD RR4GX33JQ 755 0 0
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GGTCCTAAATAAATATGAAATGACCCAATAAACAAAGAAAAGCAAACAGCTTTTGGAACA
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CGTGGAGGAACTCGTGTCCATAAAAGTAGAAAGAAACAGCATTGCAAAGTAGAAAAACTC
CCCCGGATATCAAACCAAACATGATTCTCTCCCTC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4B471JQ 838 0 0
GGAAGACATATCAAACAAAACTTGAAGATCAAGAATCATATACAAAAACCAAAGTTCCAA
GGTCCTAAATAAATATGAAATGACCCAATAAACAAAGAAAAGCAAACAGCTTTTGGAACA
AGTATCAGTCAAGTTTCGTAACATTCTTTCTATCAGAGGACACGTGCTGTCCGAAGAGAG
GAGAGAATCGATGTCGCTGTATGATCTTGAGAAGGACAAATGTGTTTGCAGCCAGAAACA
CCAAACTCGCCATCCACAGCTGTAGAAAGACGTTCACGCCCTTGAACTCGAGCATGTATC
CCCATAACAGCCAATGCGTCTGAGCTCCAATCCACAGAACCATGCATAAGATGCCTTCCC
ACTTCAGCTTCATACGGCTCCACGGTAGAATCAGAGGTAGCAGGCAATAGAACCACACAA
AGTACTGTGCAGTTATCACCTTATTGAAAGCCACGAACGCGACGGTTTGGAGAAACATAC
AGAACACTAGATCCTGAGAGAAGCAAAAGACTAAAGCAAGCTGTACAGTGAACTGAGGTA
AGAAAGAGATAAGCTTCTCCACAGCTGAAAACTGGCGCTCGTAGTGAAGATAAATATGGT
AAAAGTAGATGGAGAAGTTGTGCCTCGGATCCGTGCGTGTGAGGTGATACAAGAGAGCCT
CGTGGAGGAACTCGTGTCCATAAAAGTAGAAAGAAACAGCATTGCAAAGTAGAAAAACTC
CCCCGGATATCAAACCAAACATGATTCTCTCCCTCGAAAACAAACTACTAACACTGAAGC
TGAATGTTCTCTTCTCAGTGCTGCTAGTACGTGTCCAGCCCTCAAGAGGGGGCTTGTG

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

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TATGATTCATACATAGCAGAGAAAGAGGGAATCCTCTCGTCTTTAGCAAAACGTGCAAAG
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ATGTATCTATTCCCTTGCATCAACCTTCCCCAAAAGGCGATTGCAGCTGCAGAAGCTGCA
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GTCCCCGGTTCTGGCTTTAGACAGGTACCTGGCACATGGCATTTCAGGTGCACTATACTT
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ATGGATGAGTTCCGCGACTAAGGGATTCTGATTCTTAAGACCTCTCAAAGATATGATAAT
AAGCAAAGGAGACGCATGCAGTTTCTTTTCCGTAGACATTGTGCTTACTAAG


BQ
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AF RR4G433TF U 1
AF RR4G433JQ C 343
BS 1 584 RR4G433TF
BS 585 772 RR4G433JQ

RD RR4G433TF 584 0 0
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AAAGTAGCCCGGTCCATGGGCTACGGTGAGAAGGATATCTGCTTAGTCTCGTTCCAGTCT
ATCTCCAAAGGTTACTACGGAGAGTGTGGGAAGAGAGGTGGTTACATGGAGGTGACGGGA
TTCACCTCTGATGTAAGAGAACAGATATACAAACTGGCTTCTGTGAATCTTTGCTCCAAC
ATCTCTGGTCAAATTCTGGCCAGCCTAGTCATGAGCCCTCCCAAGCCTGGTGACGACTCC
TATGATTCATACATAGCAGAGAAAGAGGGAATCCTCTCGTCTTTAGCAAAACGTGCAAAG
ACCCTTGAAGAAGCTCTGAACAAGTTGGAGGGTGTGACATGCAACAGGGCAGAAGGAGCT
ATGTATCTATTCCCTTGCATCAACCTTCCCCAAAAGGCGATTGCAGCTGCAGAAGCTGCA
AAGACAGCACCAGACGCTTTCTACTGCAATCGCCTTTTAAACGCTACTGGAATAGTTGTA
GTCCCCGGTTCTGGCTTTAGACAGGTACCTGGCACATGGCATTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4G433JQ 430 0 0
TTAGCAAAACGTGCAAAGACCCTTGAAGAAGCTCTGAACAAGTTGGAGGGTGTGACATGC
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GCTACTGGAATAGTTGTAGTCCCCGGTTCTGGCTTTAGACAGGTACCTGGCACATGGCAT
TTCAGGTGCACTATACTTCCTCAAGAAGATAAGATTCCTGCAATCGTAAACCGTCTCACT
GAGTTCCTCGAGAGCTTCATGGATGAGTTCCGCGACTAAGGGATTCTGATTCTTAAGACC
TCTCAAAGATATGATAATAAGCAAAGGAGACGCATGCAGTTTCTTTTCCGTAGACATTGT
GCTTACTAAG

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

CO CL5735Contig1 1169 2 2 U
GGAGACGGTTTTGGAAATTCCGATACCGGAGGAGTTGTTCTCCGGTATGGGAAATAGCGT
TGCGCTGAGGTGTCAGAATATGATGACGTGGATGAAAGCTCAGACGTCTGATAAACTGTC
GCAACCGCTAATCGCAGCTCGTATCAACGAGCTTCGTTTTCTTCTCTATCTCCTTGGATC
GCCTCTTATACCACTCCAGGTTCAAGTTGGTCACTCTGTTCATAAGCCTGTCAAAGATTC
CTCCATTCAAGCCTCGACGGCGAAATACATAGTGCAACAATACATAGCGGCGACGGGAGG
ACCGGCGGCGTTAAACGCCGTGAACAGTATGTGCGTGATTGGACAAGTGAAGATGACGGC
GTCAGATTTTCATCAAGGAGATGATTCAACGGTGAATCTTAAAAACAAGGATGAAATGGG
TGGCTTCATATTGTGGCAGAAGGATCCAGACCTGTGGTGTTTGGAGCTCGTTGTGTCTGG
ATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTTCGTGGCGACATTCTTCTAACCAGCA
AACACCTTCGTCTACCGGTACACCGAGACCTCTCCGCCGATTTTTACAGGGTTTAGATCC
TCGTTCGACCGCGAATATGTTCCTCGACGCGACATGCATTGGAGAGAAGATTATCAACGG
CGAAGATTGCTTTATACTGAAACTTGAGACGAGTCCGGCGGTTAGAGAGGCTCAGAGCGG
TCCAGATTTCGAGATCATTCATCATACGATATGGGGTTATTTTAGCCAGAGATCGGGACT
GTTGATACAGTTCGAGGACTCGAGGCTTCTGAGTATGAGGACCAAGGAAGGGGATGTATT
TTGGGAGACGAGCGCAGAATCGGTGATGGATGATTATAGGTACGTGGATGATGTGAACAT
CGCTCACGGTGGAAAAACGTCGGTTACGGTTTTCAGGTATGGTGAAGCGTCGGCGAACCA
TCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGAGGATCGAAGAAGTTGATTTTAACATTTGGGGTCT
CTCTGTCGATCATTTTCGTCCTCCCGCCAATCTGCACATCGGGAACTGATTCTTTTCAAT
CCATTTCTTTTAATTTGTTACTAGGTTTTATAAGTATCAACCAGCGAGCCGGTGAAATAA
TTTAATAATAATATTGAGCTTGAGGACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FF94TF U 1
AF RR4FF94JQ C 456
BS 1 696 RR4FF94TF
BS 697 1169 RR4FF94JQ

RD RR4FF94TF 696 0 0
GGAGACGGTTTTGGAAATTCCGATACCGGAGGAGTTGTTCTCCGGTATGGGAAATAGCGT
TGCGCTGAGGTGTCAGAATATGATGACGTGGATGAAAGCTCAGACGTCTGATAAACTGTC
GCAACCGCTAATCGCAGCTCGTATCAACGAGCTTCGTTTTCTTCTCTATCTCCTTGGATC
GCCTCTTATACCACTCCAGGTTCAAGTTGGTCACTCTGTTCATAAGCCTGTCAAAGATTC
CTCCATTCAAGCCTCGACGGCGAAATACATAGTGCAACAATACATAGCGGCGACGGGAGG
ACCGGCGGCGTTAAACGCCGTGAACAGTATGTGCGTGATTGGACAAGTGAAGATGACGGC
GTCAGATTTTCATCAAGGAGATGATTCAACGGTGAATCTTAAAAACAAGGATGAAATGGG
TGGCTTCATATTGTGGCAGAAGGATCCAGACCTGTGGTGTTTGGAGCTCGTTGTGTCTGG
ATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTTCGTGGCGACATTCTTCTAACCAGCA
AACACCTTCGTCTACCGGTACACCGAGACCTCTCCGCCGATTTTTACAGGGTTTAGATCC
TCGTTCGACCGCGAATATGTTCCTCGACGCGACATGCATTGGAGAGAAGATTATCAACGG
CGAAGATTGCTTTATACTGAAACTTGAGACGAGTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FF94JQ 714 0 0
GGTGTTTGGAGCTCGTTGTGTCTGGATGTAAAGTCATATGCGGTAGTAACGGTCGGCTTT
CGTGGCGACATTCTTCTAACCAGCAAACACCTTCGTCTACCGGTACACCGAGACCTCTCC
GCCGATTTTTACAGGGTTTAGATCCTCGTTCGACCGCGAATATGTTCCTCGACGCGACAT
GCATTGGAGAGAAGATTATCAACGGCGAAGATTGCTTTATACTGAAACTTGAGACGAGTC
CGGCGGTTAGAGAGGCTCAGAGCGGTCCAGATTTCGAGATCATTCATCATACGATATGGG
GTTATTTTAGCCAGAGATCGGGACTGTTGATACAGTTCGAGGACTCGAGGCTTCTGAGTA
TGAGGACCAAGGAAGGGGATGTATTTTGGGAGACGAGCGCAGAATCGGTGATGGATGATT
ATAGGTACGTGGATGATGTGAACATCGCTCACGGTGGAAAAACGTCGGTTACGGTTTTCA
GGTATGGTGAAGCGTCGGCGAACCATCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGAGGATCGAAG
AAGTTGATTTTAACATTTGGGGTCTCTCTGTCGATCATTTTCGTCCTCCCGCCAATCTGC
ACATCGGGAACTGATTCTTTTCAATCCATTTCTTTTAATTTGTTACTAGGTTTTATAAGT
ATCAACCAGCGAGCCGGTGAAATAATTTAATAATAATATTGAGCTTGAGGACTG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL5736Contig1 1026 2 2 U
GGGGGTTGCATGCTTAGAAGCGGCCAGATGCTCTTTGCACAGGCATTGCTATTTCAAAGG
TTGGGAAGGTCTTGGAGGAAAAAAGAATCTGAGCCGCCTGAAGAGGAATACTTAGAGATC
TTAGAACTTTTTGGTGATTCTGAGGCTTCAGCGTTTTCGATACATAATCTTATACTAGCT
GGAGAATCATATGGCCTGGCTGCTGGGTCATGGGTAGGACCATATGCAGTTTGTCGGTCA
TGGGAGTCATTAGCTCGGAAGAAAAGAGAAGAAGCTGAGGTCAAAGACCGCTCGTGTTCC
ATGGCTGTTCATATCGTTTCTGGTAGTGAAGATGGGGAGAGAGGTGGAGCTCCAATTCTC
TGTATAGAAGATGTCACCAAAACTTGTTTGGAATATTCAGAAGGAGAAACTGAGTGGACT
TCAGTTCTTCTCTTGGTCCCACTGGTTCTTGGACTTGACAAAGTGAACCCAAGGTACATT
CCGTCTCTGATAGCCACTTTCAGTTTCCCTCAAAGCCTTGGGATTTTGGGTGGCAAACCA
GGTGCATCAACTTACATAGTTGGAGTTCAAGAAGACAAAGGTTTCTACCTTGACCCACAC
GATGTTCAACAGGTAGTGACAGTGAACAAAAAAACTCAGGATGTTGACACTTCGTCTTAC
CATTGCAATACACTTCGTTATGTTCCGTTGGAGTCACTAGACCCATCGCTAGCTCTTGGA
TTCTATTGCCGGGACAAAGATGATTTTGATGATTTCTGTATCCGAGCAACGAAGCTAGCA
GAAGACTCCAACGGCGCTCCGTTGTTCACGGTGACTCAATCTCACAGAGGTGGTGAGCGT
GGAATTGCAGAAACCAGCGCTGTGGCATCATCTACAGAGATATCTGGTGAGGAGCATGAA
GATGATTGGCAATTACTTTGACCAGTTTCACTAAGACATCATTCTTCTTCGTTTTGTAAC
TTTGTCCGAATTGTCACAGTTTACGTCTCAAGACACCATTCTTTCTTCATCGATGCAAAG
ATTTGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA62TF U 1
AF RR4EA62JQ C 393
BS 1 633 RR4EA62TF
BS 634 1026 RR4EA62JQ

RD RR4EA62TF 633 0 0
GGGGGTTGCATGCTTAGAAGCGGCCAGATGCTCTTTGCACAGGCATTGCTATTTCAAAGG
TTGGGAAGGTCTTGGAGGAAAAAAGAATCTGAGCCGCCTGAAGAGGAATACTTAGAGATC
TTAGAACTTTTTGGTGATTCTGAGGCTTCAGCGTTTTCGATACATAATCTTATACTAGCT
GGAGAATCATATGGCCTGGCTGCTGGGTCATGGGTAGGACCATATGCAGTTTGTCGGTCA
TGGGAGTCATTAGCTCGGAAGAAAAGAGAAGAAGCTGAGGTCAAAGACCGCTCGTGTTCC
ATGGCTGTTCATATCGTTTCTGGTAGTGAAGATGGGGAGAGAGGTGGAGCTCCAATTCTC
TGTATAGAAGATGTCACCAAAACTTGTTTGGAATATTCAGAAGGAGAAACTGAGTGGACT
TCAGTTCTTCTCTTGGTCCCACTGGTTCTTGGACTTGACAAAGTGAACCCAAGGTACATT
CCGTCTCTGATAGCCACTTTCAGTTTCCCTCAAAGCCTTGGGATTTTGGGTGGCAAACCA
GGTGCATCAACTTACATAGTTGGAGTTCAAGAAGACAAAGGTTTCTACCTTGACCCACAC
GATGTTCAACAGGTAGTGACAGTGAACAAAAAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EA62JQ 634 0 0
ATATTCAGAAGGAGAAACTGAGTGGACTTCAGTTCTTCTCTTGGTCCCACTGGTTCTTGG
ACTTGACAAAGTGAACCCAAGGTACATTCCGTCTCTGATAGCCACTTTCAGTTTCCCTCA
AAGCCTTGGGATTTTGGGTGGCAAACCAGGTGCATCAACTTACATAGTTGGAGTTCAAGA
AGACAAAGGTTTCTACCTTGACCCACACGATGTTCAACAGGTAGTGACAGTGAACAAAAA
AACTCAGGATGTTGACACTTCGTCTTACCATTGCAATACACTTCGTTATGTTCCGTTGGA
GTCACTAGACCCATCGCTAGCTCTTGGATTCTATTGCCGGGACAAAGATGATTTTGATGA
TTTCTGTATCCGAGCAACGAAGCTAGCAGAAGACTCCAACGGCGCTCCGTTGTTCACGGT
GACTCAATCTCACAGAGGTGGTGAGCGTGGAATTGCAGAAACCAGCGCTGTGGCATCATC
TACAGAGATATCTGGTGAGGAGCATGAAGATGATTGGCAATTACTTTGACCAGTTTCACT
AAGACATCATTCTTCTTCGTTTTGTAACTTTGTCCGAATTGTCACAGTTTACGTCTCAAG
ACACCATTCTTTCTTCATCGATGCAAAGATTTGA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5738Contig1 803 2 2 U
GCCAGAGCAGATTCTTAATCTTTGCAACACAAGAGCTTACCTGAGGAAGAGAGACCACTT
GGCAATCGATAAGTACGCTCTGCCTGGACTGAGGTCATTAGCTGTTGTCGCAGCACAACG
GATAGCTAAAAAAACAAAAAAATGCTCTGGTGGTCCATGGGAATTCGTTGGTGGGTTGCC
TTTGTTTGATCCTCCACGACATGATAGTGCATACACCATTAGAAGAGCTTCATACCTCGG
TGTCAACATCAGTGATCACTGGTGGTCAATTTGCTATTACCAAAGAGACTCGACGTATGG
GATCAAACATGTATCCATAGCATCAAAGCCATCCGAGGGAGTTTAGGCAACCAAGTGACA
TTTTATAATCTCTTGATTCCAAACTCTGAGATATAACATTCATCAAGAATACAGAGAAGT
TCTAGAGAGGCGTGTGTTTACAGGTTTTGAATAGGGAATCTGTCTAACTACTCAACTATT
CCCAATAATAAATATTGGACACACTAGCTGAAATTGAGGAATAGCATGGCACTGTCAGAG
GCTTAGAGAAGAAACTCCTCCACATGTTAGGTTATAATAAAAATGACGAATCGGAAGGTG
TCAAACAAGATACTGAACTAATGAATGCTTCTGAAATCGTTAAGAGTCCAGTTGCTACAA
ACCGGGAAGAGGTGGAAGAGTTTCAAAGCCAGACGAAATGTAACTCTGTCTATATATGTG
TTCTTACAAACCTTGAACCGTTCGCATGGAGTGATATTGTTCAATGAACATTAGTATCTA
AAGATTTCTTTTGGCACATTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D260TF U 1
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BS 541 803 RR4D260JQ

RD RR4D260TF 540 0 0
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GGCAATCGATAAGTACGCTCTGCCTGGACTGAGGTCATTAGCTGTTGTCGCAGCACAACG
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TTTGTTTGATCCTCCACGACATGATAGTGCATACACCATTAGAAGAGCTTCATACCTCGG
TGTCAACATCAGTGATCACTGGTGGTCAATTTGCTATTACCAAAGAGACTCGACGTATGG
GATCAAACATGTATCCATAGCATCAAAGCCATCCGAGGGAGTTTAGGCAACCAAGTGACA
TTTTATAATCTCTTGATTCCAAACTCTGAGATATAACATTCATCAAGAATACAGAGAAGT
TCTAGAGAGGCGTGTGTTTACAGGTTTTGAATAGGGAATCTGTCTAACTACTCAACTATT
CCCAATAATAAATATTGGACACACTAGCTGAAATTGAGGAATAGCATGGCACTGTCAGAG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4D260JQ 504 0 0
GGATCAAACATGTATCCATAGCATCAAAGCCATCCGAGGGAGTTTAGGCAACCAAGTGAC
ATTTTATAATCTCTTGATTCCAAACTCTGAGATATAACATTCATCAAGAATACAGAGAAG
TTCTAGAGAGGCGTGTGTTTACAGGTTTTGAATAGGGAATCTGTCTAACTACTCAACTAT
TCCCAATAATAAATATTGGACACACTAGCTGAAATTGAGGAATAGCATGGCACTGTCAGA
GGCTTAGAGAAGAAACTCCTCCACATGTTAGGTTATAATAAAAATGACGAATCGGAAGGT
GTCAAACAAGATACTGAACTAATGAATGCTTCTGAAATCGTTAAGAGTCCAGTTGCTACA
AACCGGGAAGAGGTGGAAGAGTTTCAAAGCCAGACGAAATGTAACTCTGTCTATATATGT
GTTCTTACAAACCTTGAACCGTTCGCATGGAGTGATATTGTTCAATGAACATTAGTATCT
AAAGATTTCTTTTGGCACATTTAT

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5739Contig1 1048 2 4 U
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AAGAAGCTGTCGCACGCCAGTCGACGACGATATCACATCCCCTCGACGATTATTTCGCCG
ACACCAGCATTTGAGTTCCTGCTCCCGAACGTCTCCGGCAACATCCGATCAGCTTAGTGA
TCGAGTACTGCTAGAAGCACCCCGACGTTGGCTCCTTTTAAGTGAGCGTATAAATTAGCC
CAATAAGGTGTCTTGGTTAGATATATCTATCGTTTTCTGCTTATTGAGGGTAATGAAACC
AGTTGTTGATCAGATGACTATGAATATTCAATAAATCTCTGTGAACTGGGTTCTATATAA
ATCGATATATAGGGGATTGCTTCGAGCTTGTGTTCACTACACATTGCTTACTGGACTTTC
TGATGGGCTTAGATGAGGCCCAAGTCTACGTTACCTCCTATTTGCTATTCTCATTTACTT
CTTATAAAAACAAGTTTAGTCTTTGTAATAAGAGAATTGTTCCCAAAAGAAAAAAGTCTT
TGTAATGAACAAAATCTAGGTTTCATCCTTTTAATTTCTTTCTCATCTTTTCTCTTCTTC
AATCTCCCTCCATTTCGACAAGCTTATCACATTATATTACCAAGCCCGGCCCATGATAAG
ATATCGGCAAGGCCCAATAAGGATGGCGAACTGTGTTGACATAATACATAGTAATAGGTT
GTTATTATAAATAATAAGAGTGTAATTGTGCAAATACCCAAAACTCAGGGTTTCCAGAAA
CAAAAGACGTAAAAAAAGTGTCGGAGGCAACAGAGTAAAAGGGAAGAGACTTGTTTTTAC
CTCTTCGAATACAAGAAGCTTTCTCCGATCCTCTTATTCGTTGTACGATCGATTAATGTG
ACAGAATAAGTCACATATTATACTATGGTTATCTAATTGTTAGTTTTCCATATTCTTGGA
TTTATCTTTTCCTAGTTAGTTTAATATTTCCTTTGATTTTACTATATATTGTAGCCTGGC
AAAGCTTTAAATCAATCATAATATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FL79TF U 1
AF RR4FL79JQ C 458
BS 1 681 RR4FL79TF
BS 682 682 RR4FL79JQ
BS 683 705 RR4FL79TF
BS 706 1048 RR4FL79JQ

RD RR4FL79TF 705 0 0
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AAGAAGCTGTCGCACGCCAGTCGACGACGATATCACATCCCCTCGACGATTATTTCGCCG
ACACCAGCATTTGAGTTCCTGCTCCCGAACGTCTCCGGCAACATCCGATCAGCTTAGTGA
TCGAGTACTGCTAGAAGCACCCCGACGTTGGCTCCTTTTAAGTGAGCGTATAAATTAGCC
CAATAAGGTGTCTTGGTTAGATATATCTATCGTTTTCTGCTTATTGAGGGTAATGAAACC
AGTTGTTGATCAGATGACTATGAATATTCAATAAATCTCTGTGAACTGGGTTCTATATAA
ATCGATATATAGGGGATTGCTTCGAGCTTGTGTTCACTACACATTGCTTACTGGACTTTC
TGATGGGCTTAGATGAGGCCCAAGTCTACGTTACCTCCTATTTGCTATTCTCATTTACTT
CTTATAAAAACAAGTTTAGTCTTTGTAATAAGAGAATTGTTCCCAAAAGAAAAAAGTCTT
TGTAATGAACAAAATCTAGGTTTCATCCTTTTAATTTCTTTCTCATCTTTTCTCTTCTTC
AATCTCCCTCCATTTCGACAAGCTTATCACATTATATTACCAAGCCCGGCCCATGATAAG
ATATCGGCAAGGCCCAATAAG*ATGGCGAACTGTGTTGACATAAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4FL79JQ 591 0 0
CTATTTGCTATTCTCATTTACTTCTTATAAAAACAAGTTTAGTCTTTGTAATAAGAGAAT
TGTTCCCAAAAGAAAAAAGTCTTTGTAATGAACAAAATCTAGGTTTCATCCTTTTAATTT
CTTTCTCATCTTTTCTCTTCTTCAATCTCCCTCCATTTCGACAAGCTTATCACATTATAT
TACCAAGCCCGGCCCATGATAAGATATCGGCAAGGCCCAATAAGGATGGCGAACTGTGTT
GACATAATACATAGTAATAGGTTGTTATTATAAATAATAAGAGTGTAATTGTGCAAATAC
CCAAAACTCAGGGTTTCCAGAAACAAAAGACGTAAAAAAAGTGTCGGAGGCAACAGAGTA
AAAGGGAAGAGACTTGTTTTTACCTCTTCGAATACAAGAAGCTTTCTCCGATCCTCTTAT
TCGTTGTACGATCGATTAATGTGACAGAATAAGTCACATATTATACTATGGTTATCTAAT
TGTTAGTTTTCCATATTCTTGGATTTATCTTTTCCTAGTTAGTTTAATATTTCCTTTGAT
TTTACTATATATTGTAGCCTGGCAAAGCTTTAAATCAATCATAATATTATT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL5740Contig1 1183 2 2 U
GGGACTCAAAAGTCAACAGCGAGAAGTAAAAAGTAGTGAGAGGAGGAGGAAGGGAGGAAG
GAAGGAAGGAAGTATATCTACAGGTAAAGTCTTTCTGCAAAATCTCTCGGGGGACTTATG
GCAAGAGTCGTCGAGTCTGACACGGTTCCTGGAGGTTCCGATGTACTACAGCTAAGTCTT
GACTCGATCAGGGAATCGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCTTCAGCTTGATCGAG
AGAGCTAAGTTTCCACTCAATTCAGCTGAAAACTCCTCTTCTCTGACTGAGTTCTTTGTC
AGAGAGATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGAAAACCCGGAAGAGAATCCT
TTCTTCCTTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACACCCAAATATCCACCGGTTCTG
TATCCTAAGGCCTCATCTGTTAACATAAACAAAAGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGAA
CTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTATGCATCAACTGCTGCTTCT
GATCTCGCTTGTTTACAAGTAGGTACATCTTATTTGGATTCACAAATTCATGTCTACGTC
TTGTTTATGCCTGATAGTTTGTTGATCTTGTTTAAGGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTAT
GGTAAGTTTGTTGCTGAGGTCAAATTCAGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATT
CGCTCTAAGGTAAGTTACCAAAACTAGTGTTTTAACAAAATGTGGATTTTGGTTTTTCTA
TTAAAACGACGAGACGTTTTCTTTAGGATACAGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTTG
AGAAAGTAGAAGAAATGGTTAAGAAGAGAGTCGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGG
AGGTGAAGTGCGTCTCTGGTGGTGCTGATGAGAGGGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATC
CATATCTAGTCTCTCGCATCTATGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGG
TTGAGTATCTTCTACGTCGTCTCGATTGAATCTCGAGTCATCATTAAACAAGATGATGAG
TCCATCGTCTTTTTCCACAAACTCTTGCAAGATTTGTTTTTTCATTACAGACTATCATCA
ATCAAACACTTGTCCAATATGAATAAACCAAACCGATTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AX23TF U 1
AF RR4AX23JQ C 429
BS 1 674 RR4AX23TF
BS 675 1183 RR4AX23JQ

RD RR4AX23TF 674 0 0
GGGACTCAAAAGTCAACAGCGAGAAGTAAAAAGTAGTGAGAGGAGGAGGAAGGGAGGAAG
GAAGGAAGGAAGTATATCTACAGGTAAAGTCTTTCTGCAAAATCTCTCGGGGGACTTATG
GCAAGAGTCGTCGAGTCTGACACGGTTCCTGGAGGTTCCGATGTACTACAGCTAAGTCTT
GACTCGATCAGGGAATCGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCTTCAGCTTGATCGAG
AGAGCTAAGTTTCCACTCAATTCAGCTGAAAACTCCTCTTCTCTGACTGAGTTCTTTGTC
AGAGAGATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGAAAACCCGGAAGAGAATCCT
TTCTTCCTTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACACCCAAATATCCACCGGTTCTG
TATCCTAAGGCCTCATCTGTTAACATAAACAAAAGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGAA
CTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTATGCATCAACTGCTGCTTCT
GATCTCGCTTGTTTACAAGTAGGTACATCTTATTTGGATTCACAAATTCATGTCTACGTC
TTGTTTATGCCTGATAGTTTGTTGATCTTGTTTAAGGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTAT
GGTAAGTTTGTTGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4AX23JQ 755 0 0
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TTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTATGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGC
TTGTTTACAAGTAGGTACATCTTATTTGGATTCACAAATTCATGTCTACGTCTTGTTTAT
GCCTGATAGTTTGTTGATCTTGTTTAAGGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTT
TGTTGCTGAGGTCAAATTCAGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATTCGCTCTAA
GGTAAGTTACCAAAACTAGTGTTTTAACAAAATGTGGATTTTGGTTTTTCTATTAAAACG
ACGAGACGTTTTCTTTAGGATACAGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTTGAGAAAGTA
GAAGAAATGGTTAAGAAGAGAGTCGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTGAAG
TGCGTCTCTGGTGGTGCTGATGAGAGGGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATCCATATCTA
GTCTCTCGCATCTATGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGAGTAT
CTTCTACGTCGTCTCGATTGAATCTCGAGTCATCATTAAACAAGATGATGAGTCCATCGT
CTTTTTCCACAAACTCTTGCAAGATTTGTTTTTTCATTACAGACTATCATCAATCAAACA
CTTGTCCAATATGAATAAACCAAACCGATTTGACC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL5741Contig1 899 2 4 U
GACACTAATGATTGGTTCTTTGCCAACCATGACAGCTCTCATATGGCTGACCAACAAGTT
CTCCTCTGGAGTTCTTGACCGTCCTAAATGCTCTCAGAGCAGCTCTGCTCCCGAAGGACC
TCGTTCCGAAACCGACAGTATATTTGATTTGGGCATGGAAGCTATCAAGCTTGGATGGAA
AGAATACATTCAGCAGCCGGTTCTTCCAGCTAGCCTTGCATATGTCCTTCTCTGCTTCAA
CATCGTCCTCACCCCTGGCAGTTTGATGACCGCATTTCTAACACAACGATGTGTGAATCC
ATCAGTTATTGGGGGTTTCAGTGGACTATGTGCTGTGATGGGAGTCGCTGTAACTTTCTT
ATCAGCAAACTTGGTCAAACGATTTGGCATTCTAAAGGCGGGTGCAGTAGGATTGTTTTT
CCAAGCTTCACTCCTCGGTGTAGCCGTTGCTGTGTACTGGAGCTCTTCTCTATCCCAAAA
GAGCCCACTCTTCTTCTTGTCCATGATCGTACTATCAAGGCTAGGCCACATGTCTTACGG
CGTTGTGGGAGCACAGATTCTTCAAACCGGCATCCCATCGTCCAAAGCTAACCTCATCGG
TGCAACTGAGATATCAGTGGCTAGCCTAGCTGTGTCACTGATGCTGGGAGTAGCCATTGC
GGCTAACGATGCTTCTCATTTCGGGTTTCTTGCGGTTCTGTCTCTTTTATCAGTTGTTGC
GGCCTCTTTGATATTCTGTAGGTTGCTGAGGAATCCTACTGATGAACAAAGACGGCTCTT
CTCCTTGATCCTCTTGCGATTTGAAAATTATACATTGAAATGTTTTGTATAGTTAGCTTC
ACTATCATTGTATAAATTCTTCATTTTATTTTGAAGTTGGAAGAAAATATGAGTTATAT


BQ
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AF RR4G055TF U 1
AF RR4G055JQ C 495
BS 1 723 RR4G055TF
BS 724 724 RR4G055JQ
BS 725 749 RR4G055TF
BS 750 899 RR4G055JQ

RD RR4G055TF 749 0 0
GACACTAATGATTGGTTCTTTGCCAACCATGACAGCTCTCATATGGCTGACCAACAAGTT
CTCCTCTGGAGTTCTTGACCGTCCTAAATGCTCTCAGAGCAGCTCTGCTCCCGAAGGACC
TCGTTCCGAAACCGACAGTATATTTGATTTGGGCATGGAAGCTATCAAGCTTGGATGGAA
AGAATACATTCAGCAGCCGGTTCTTCCAGCTAGCCTTGCATATGTCCTTCTCTGCTTCAA
CATCGTCCTCACCCCTGGCAGTTTGATGACCGCATTTCTAACACAACGATGTGTGAATCC
ATCAGTTATTGGGGGTTTCAGTGGACTATGTGCTGTGATGGGAGTCGCTGTAACTTTCTT
ATCAGCAAACTTGGTCAAACGATTTGGCATTCTAAAGGCGGGTGCAGTAGGATTGTTTTT
CCAAGCTTCACTCCTCGGTGTAGCCGTTGCTGTGTACTGGAGCTCTTCTCTATCCCAAAA
GAGCCCACTCTTCTTCTTGTCCATGATCGTACTATCAAGGCTAGGCCACATGTCTTACGG
CGTTGTGGGAGCACAGATTCTTCAAACCGGCATCCCATCGTCCAAAGCTAACCTCATCGG
TGCAACTGAGATATCAGTGGCTAGCCTAGCTGTGTCACTGATGCTGGGAGTAGCCATTGC
GGCTAACGATGCTTCTCATTTCGGGTTTCTTGCGGTTCTGTCTCTTTTATCAGTTGTTGC
GGC*TCTTTGATATTCTGTAGGTTGCTGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4G055JQ 405 0 0
TCTTGTCCATGATCGTACTATCAAGGCTAGGCCACATGTCTTACGGCGTTGTGGGAGCAC
AGATTTTTCAAACCGGCATCCCATCGTCCAAAGCTAACCTCATCGGTGCAACTGAGATAT
CAGTGGCTAGCCTAGCTGTGTCACTGATGCTGGGAGTAGCCATTGCGGCTAACGATGCTT
CTCATTTCGGGTTTCTTGCGGTTCTGTCTCTTTTATCAGTTGTTGCGGCCTCTTTGATAT
TCTGTAGGTTGCTGAGGAATCCTACTGATGAACAAAGACGGCTCTTCTCCTTGATCCTCT
TGCGATTTGAAAATTATACATTGAAATGTTTTGTATAGTTAGCTTCACTATCATTGTATA
AATTCTTCATTTTATTTTGAAGTTGGAAGAAAATATGAGTTATAT

QA 1 405 1 405
DS 



AS 1 2

CO CL5742Contig1 500 2 2 U
TTGGGATTAAATGTGTGTTTGTGTTGGGAGTACATCCCTAATCAGGACCAAGCGCACATG
AGAAATATAACATAGTTGAATTTACTTTTGGATCACACATACTAAACACAAAACTGCTAA
GCGATGTCAAATAAAAAGTGAAAAACAAAATAAAAACACTATCGGCGTGAATGCTGATGG
TAAGGTGAAGTGGCTTGAATTCGCATCCGCCGTTTCTGAAGAAAACTTTGGAGAGATCTT
TTCATTGAAGCCTTTGGATTCGGAAGCTGATGATGATGTAATCGGGTCAACCTGTTCCGA
GGATCCGACCCGTTTGAGGATGACCTTTCTTCCATTTCTCTACTCGCGATCGATATTATA
GATTTAGCCTGAAAATTGGTAACATTCGAAAAAACACACATTTTTCCATTGTAAAAAATT
GTAATCCTCTGAAATTCTTCTTCCTTTGGTAGTGAATTTCCAGAGCTTCTTGATTCTACC
ACAGAGGTGTCTGAATCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DX59TF C 1
AF RR4DX59JQ U 237
BS 1 238 RR4DX59TF
BS 239 500 RR4DX59JQ

RD RR4DX59TF 500 0 0
TTGGGATTAAATGTGTGTTTGTGTTGGGAGTACATCCCTAATCAGGACCAAGCGCACATG
AGAAATATAACATAGTTGAATTTACTTTTGGATCACACATACTAAACACAAAACTGCTAA
GCGATGTCAAATAAAAAGTGAAAAACAAAATAAAAACACTATCGGCGTGAATGCTGATGG
TAAGGTGAAGTGGCTTGAATTCGCATCCGCCGTTTCTGAAGAAAACTTTGGAGAGATCTT
TTCATTGAAGCCTTTGGATTCGGAAGCTGATGATGATGTAATCGGGTCAACCTGTTCCGA
GGATCCGACCCGTTTGAGGATGACCTTTCTTCCATTTCTCTACTCGCGATCGATATTATA
GATTTAGCCTGAAGATTGGTAACATTCGAAGAAACACACATTTTTCCATTGTAGAAAATT
GTAATCCTCTGAGATTCTTCTTCCTTTGGTAGTGAATTTCCAGAGCTTCTTGATTCTACC
ACAGAGGTGTCTGAATCGGC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4DX59JQ 264 0 0
TT
TTTTCATTGAAGCCTTTGGATTCGGAAGCTGATGATGATGTAATCGGGTCAACCTGTTCC
GAGGATCCGACCCGTTTGAGGATGACCTTTCTTCCATTTCTCTACTCGCGATCGATATTA
TAGATTTAGCCTGAAAATTGGTAACATTCGAAAAAACACACATTTTTCCATTGTAAAAAA
TTGTAATCCTCTGAAATTCTTCTTCCTTTGGTAGTGAATTTCCAGAGCTTCTTGATTCTA
CCACAGAGGTGTCTGAATCGGC

QA 3 264 3 264
DS 



AS 1 2

CO CL5743Contig1 784 2 3 U
ATTCATGTTCATGGAGAGGTGAGAGTACTCTCAAGCAATTCTCTCAAATTACTTGTAACC
AGTTCTATTATCAATATATTCGTATTTCATCTTGTTCATCTCTGTGTTACAAGTTCCGAT
ACGTAAATCGTATCAAGTGGTATCAGAGCTCAGTTACGAGCCATGGGGACGATGGAGATT
CCGATCTTCTACAGTGAAGAACCGGAGGAGTGGGTTTCATGGATGGATGCGTTTATTGCT
GATCAAAGTCTTTCAGAGTTTGAGACAAGGCAGTTTACGTATGGTTTCATTGACGGTGAA
GCACACACATGGTACTGCTATGAGTTGTCGAAATCTGGGTTTGATAGCTGGGAAGATCTG
AAACCTAGACTGATCCGACGGTTCAGCACGAGAGTGGTGGAAGCGAAGCAGCCTAGCTTG
ATGGACCATATCAAACAAATGAGGATTCTTCTGGATGGTCCTCAACAAAAGTGGAAAGAA
AAAGATGAGGCGAAGAAACAATGGGGAGAAGAGATGAAGGCCGCTGGAGGATCGAAACTG
ACCCTGAGCTAAAGCTGTCAAATGGGCCGGCCAGAGCCCATATGGGCGAAACCAATTGGA
CCATTTCGGGGTTTGGTCTTTAATGGGTGGTCTATATTAGACATGGTCCATAAAAACGCC
CAAAACCAATAAAACCCATGTCCAAATGGACAGCCCATGGACACCCAACATTTTCATTTA
TATTCATATTTACTCACAATCTGTAATTATTTATTTGTAAAATCTGTAATTATTTAATTG
TACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4B015TF U 1
AF RR4B015JQ C 58
BS 1 761 RR4B015TF
BS 762 762 RR4B015JQ
BS 763 784 RR4B015TF

RD RR4B015TF 784 0 0
ATTCATGTTCATGGAGAGGTGAGAGTACTCTCAAGCAATTCTCTCAAATTACTTGTAACC
AGTTCTATTATCAATATATTCGTATTTCATCTTGTTCATCTCTGTGTTACAAGTTCCGAT
ACGTAAATCGTATCAAGTGGTATCAGAGCTCAGTTACGAGCCATGGGGACGATGGAGATT
CCGATCTTCTACAGTGAAGAACCGGAGGAGTGGGTTTCATGGATGGATGCGTTTATTGCT
GATCAAAGTCTTTCAGAGTTTGAGACAAGGCAGTTTACGTATGGTTTCATTGACGGTGAA
GCACACACATGGTACTGCTATGAGTTGTCGAAATCTGGGTTTGATAGCTGGGAAGATCTG
AAACCTAGACTGATCCGACGGTTCAGCACGAGAGTGGTGGAAGCGAAGCAGCCTAGCTTG
ATGGACCATATCAAACAAATGAGGATTCTTCTGGATGGTCCTCAACAAAAGTGGAAAGAA
AAAGATGAGGCGAAGAAACAATGGGGAGAAGAGATGAAGGCCGCTGGAGGATCGAAACTG
ACCCTGAGCTAAAGCTGTCAAATGGGCCGGCCAGAGCCCATATGGGCGAAACCAATTGGA
CCATTTCGGGGTTTGGTCTTTAATGGGTGGTCTATATTAGACATGGTCCATAAAAACGCC
CAAAACCAATAAAACCCATGTCCAAATGGACAGCCCATGGACACCCAACATTTTCATTTA
TATTCATATTTACTCACAATCTGTAATTATTTATTTGTAAA*TCTGTAATTATTTAATTG
TACT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4B015JQ 727 0 0
ACCAGTTCTATTATCAATATATTCGTATTTCATCTTGTTCATCTCTGTGTTACAAGTTCC
GATACGTAAATCGTATCAAGTGGTATCAGAGCTCAGTTACGAGCCATGGGGACGATGGAG
ATTCCGATCTTCTACAGTGAAGAACCGGAGGAGTGGGTTTCATGGATGGATGCGTTTATT
GCTGATCAAAGTCTTTCAGAGTTTGAGACAAGGCAGTTTACGTATGGTTTCATTGACGGT
GAAGCACACACATGGTACTGCTATGAGTTGTCGAAATCTGGGTTTGATAGCTGGGAAGAT
CTGAAACCTAGACTGATCCGACGGTTCAGCACGAGAGTGGTGGAAGCGAAGCAGCCTAGC
TTGATGGACCATATCAAACAAATGAGGATTCTTCTGGATGGTCTTCAACAAAAGTGGAAA
GAAAAAGATGAGGCGAAGAAACAATGGGGAGAAGAGATGAAGGCCGCTGGAGGATCGAAA
CTGACCCTGAGCTAAAGCTGTCAAATGGGCCGGCCAGAGCCCATATGGGCGAAACCAATT
GGACCATTTCGGG*TTTGGTCTTTAATGGGTGGTCTATATTAGACATGGTCCATAAAAAC
GCCCAAAACCAATAAAACCCATGTCCAAATGGACAGCCCATGGACACCCAACATTTTCAT
TTATATTCATATTTACTCACAATCTGTAATTATTTATTTGTAAAATCTGTAATTATTTAA
TTGTACT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5745Contig1 651 2 2 U
GGACTAGAGCTATTCATCATCACACCACTTTCTCTCAAACCTCTTTTTCTCTCTAAAAAA
AAGCAATGATGGAAACTCTCCAGATTCGCAAACAAGTTTCTCTCCCCGTTTCTCAGCAGC
GTCCTACTTCCTCCTCCACCACCACCGATGATAATAAGCCTGGTATCATCCGACGTAGCC
TTTCTTCACTCTCACTCAATCTCTCAAACAAACCAAAGGAGATTGGAAAACAAGCAAGAA
CCTGGTGGGAATGGATCCTTCCCAAGAATCTTGACCAGTCGGTTCACAAAGCAGAGGAAG
TAGTATAATGCACGTCTTCTTCAAACTCCGATCTCAGATCCCCAATCTCGTGGGCTCTCT
TTTTCTTCTGATACCATATGCAAATATAAACGTCAACGATAATCAGGATTGTTCGCTCTA
TTGTGTCATAAACGGTTAAGTTTTTTTTTTTGTAATTTGTCTCTTAAAAGTTATGATCTT
CATATCAATCAATTGGATTATAGTCAACCATAAGGGAAGTGGTTTGGTGTTGTATTTTGC
TGCTATAGTTAATTTTCCTGTCAAATTATTCATCATTCATGTGATTTGTGTTATATTTTT
GTATTTAATAACCATGAAATTTATATAGAATCATGTTATTCTGTTTCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RR4GF86TF U 1
AF RR4GF86JQ C 360
BS 1 602 RR4GF86TF
BS 603 651 RR4GF86JQ

RD RR4GF86TF 602 0 0
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AAGCAATGATGGAAACTCTCCAGATTCGCAAACAAGTTTCTCTCCCCGTTTCTCAGCAGC
GTCCTACTTCCTCCTCCACCACCACCGATGATAATAAGCCTGGTATCATCCGACGTAGCC
TTTCTTCACTCTCACTCAATCTCTCAAACAAACCAAAGGAGATTGGAAAACAAGCAAGAA
CCTGGTGGGAATGGATCCTTCCCAAGAATCTTGACCAGTCGGTTCACAAAGCAGAGGAAG
TAGTATAATGCACGTCTTCTTCAAACTCCGATCTCAGATCCCCAATCTCGTGGGCTCTCT
TTTTCTTCTGATACCATATGCAAATATAAACGTCAACGATAATCAGGATTGTTCGCTCTA
TTGTGTCATAAACGGTTAAGTTTTTTTTTTTGTAATTTGTCTCTTAAAAGTTATGATCTT
CATATCAATCAATTGGATTATAGTCAACCATAAGGGAAGTGGTTTGGTGTTGTATTTTGC
TGCTATAGTTAATTTTCCTGTCAAATTATTCATCATTCATGTGATTTGTGTTATATTTTT
GT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4GF86JQ 292 0 0
TTTTTCTTCTGATACCATATGCAAATATAAACGTCAACGATAATCAGGATTGTTCGCTCT
ATTGTGTCATAAACGGTTAAGTTTTTTTTTTTGTAATTTGTCTCTTAAAAGTTATGATCT
TCATATCAATCAATTGGATTATAGTCAACCATAAGGGAAGTGGTTTGGTGTTGTATTTTG
CTGCTATAGTTAATTTTCCTGTCAAATTATTCATCATTCATGTGATTTGTGTTATATTTT
TGTATTTAATAACCATGAAATTTATATAGAATCATGTTATTCTGTTTCAGTC

QA 1 292 1 292
DS 



AS 1 2

CO CL5746Contig1 1173 2 2 U
GAGAAGTTCTTACAGCGTTATCAGCAAGTACAACAAGGCCATGGGAACCTCCTAGGCATG
CCTTCTCTATCTGGAGGAAACGAGAAGCAGTTCTCTTCACAACAGCAAAATCCTCTTTTG
CAGCAGAGTTCTGCCATGTCTCCTCATGGTAACATGGGAATTCAGGCACCAGGTTTTAGT
GTCATGAGTTCTGCTTCCTTACAGCAGCCATCAAATGCCATGGCTCAACAACTGGGTCAG
CAGCCTTCTGCTGCAGATGTAGATCATGGAAGAAATGATGATCAGCTGCAACAAAACTTA
CCTGATGATTCAACTTCCATAGCAGCTTCTAAAACCATTCCAAATGAGGATGATTCTAAA
GGTCTATTTGATACTCCGTCGGGAATGCCGAGCTACATGTTGGACCCAGTACAGGTAACT
AGGGACGGCCCTGATTTCTCTCCTGGGCAGCCCATACAACCCGGCCAACCTTCAAGCAGC
CTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGTAACTCTGAATTAGGAGCCATTGGTGACCCTTCAGCT
TTAGGGGCAATGCATGATCAGATGCACAATCTCCAGATGCTTGAAGCAGCGTACTATAGA
CTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAACGTCCTAGACCCTATACTCCGAGGAACCCTGCAATC
ACACCTCAAACATTTCCCCAAACACAAGCGCCAATCGTAAACAACCCTTTGTTCTGGGAA
CGTTTAGGCAGCGATGCTTATGGAACCGATACTTTGTTCTTTGCATTTTATTATCAGCAG
AACTCATATCAGCAGTATCTGGCGGCAAAAGAGCTGAAGAAACAGTCATGGAGATACCAC
AGAAAGTTCAACACATGGTTTCAGAGACACAAGGAGCCAAAGATTGCAACGGATGAGTAT
GAACAAGGAGCCTATGTTTACTTTGATTTCCAAACCCCCAAAGACGAGAGCCAAGAAGGA
GGATGGTGTCAAAGGATCAAAAACGAGTTCACGTTTGAATACAGTTATCTTGAAGATGAA
CTCGCCTTGTAGAAAAAGATAAAGAGAGATATATGTTTCATAATGTATATACTCTTCAGC
AGTGTTTTCTTTCTTTCAATAAACAAATTACTTTTCCGTTTCAAACTTTCAGATAGTAAT
ATTCTCTTGGTTCTATGCAATCCAGATATAATT


BQ
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AF RR4BO18TF U 1
AF RR4BO18JQ C 476
BS 1 718 RR4BO18TF
BS 719 1173 RR4BO18JQ

RD RR4BO18TF 718 0 0
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CAGCAGAGTTCTGCCATGTCTCCTCATGGTAACATGGGAATTCAGGCACCAGGTTTTAGT
GTCATGAGTTCTGCTTCCTTACAGCAGCCATCAAATGCCATGGCTCAACAACTGGGTCAG
CAGCCTTCTGCTGCAGATGTAGATCATGGAAGAAATGATGATCAGCTGCAACAAAACTTA
CCTGATGATTCAACTTCCATAGCAGCTTCTAAAACCATTCCAAATGAGGATGATTCTAAA
GGTCTATTTGATACTCCGTCGGGAATGCCGAGCTACATGTTGGACCCAGTACAGGTAACT
AGGGACGGCCCTGATTTCTCTCCTGGGCAGCCCATACAACCCGGCCAACCTTCAAGCAGC
CTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGTAACTCTGAATTAGGAGCCATTGGTGACCCTTCAGCT
TTAGGGGCAATGCATGATCAGATGCACAATCTCCAGATGCTTGAAGCAGCGTACTATAGA
CTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAACGTCCTAGACCCTATACTCCGAGGAACCCTGCAATC
ACACCTCAAACATTTCCCCAAACACAAGCGCCAATCGTAAACAACCCTTTGTTCTGGG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4BO18JQ 698 0 0
GCAGCCTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGTAACTCTGAATTAGGAGCCATTGGTGACCCTT
CAGCTTTAGGGGCAATGCATGATCAGATGCACAATCTCCAGATGCTTGAAGCAGCGTACT
ATAGACTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAACGTCCTAGACCCTATACTCCGAGGAACCCTG
CAATCACACCTCAAACATTTCCCCAAACACAAGCGCCAATCGTAAACAACCCTTTGTTCT
GGGAACGTTTAGGCAGCGATGCTTATGGAACCGATACTTTGTTCTTTGCATTTTATTATC
AGCAGAACTCATATCAGCAGTATCTGGCGGCAAAAGAGCTGAAGAAACAGTCATGGAGAT
ACCACAGAAAGTTCAACACATGGTTTCAGAGACACAAGGAGCCAAAGATTGCAACGGATG
AGTATGAACAAGGAGCCTATGTTTACTTTGATTTCCAAACCCCCAAAGACGAGAGCCAAG
AAGGAGGATGGTGTCAAAGGATCAAAAACGAGTTCACGTTTGAATACAGTTATCTTGAAG
ATGAACTCGCCTTGTAGAAAAAGATAAAGAGAGATATATGTTTCATAATGTATATACTCT
TCAGCAGTGTTTTCTTTCTTTCAATAAACAAATTACTTTTCCGTTTCAAACTTTCAGATA
GTAATATTCTCTTGGTTCTATGCAATCCAGATATAATT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL5747Contig1 1304 2 2 U
GGAGAGACCTCCCGATCTCTCTCCTCCGTTCACAGACCATCTCCACGAGAGTTTCTCCGA
GCGCTCTCTCTCCGGGGTCTTCTCCGAGCGCTCTCTCTCCGGGGTCTTCTCCGAGCGCTC
ACTCTCCGGTTTCTTTTCCCAGCGCTCTCTCTCCGAGGTCTCAGCTCTCTCCCATCAAAC
CCTCTCCAAACAACAACCCCCTCTCAATTATGACTGGAATCCAGAAAGCTCTTTGCTACA
TTAGTGTAGAGTCGGCACCAGTGATTGAGCTTGCAGTTGACCTTTACGTTAGAACTTTCA
AGGCTCAGATAATCAGAAGCTATGATGATGGAAGTCAAGAGCTGGATATTTATGGTTCCA
GTGTTCTTATTACAACCACCACTCCTCCTTTCAGGTCTATAGTTGAACTTCTAACTGACC
GCTCCACCGTCTCTATGGTTAAAAACGACCCTTCGTTTGTTGAGTTTGATTTTGAGTTTG
ATTTTAAAATAAATCCCTCGGACCAAGTTGTCTTGAAAGTCAGAGACCCCTTCGACATCA
TTTGGCTCATAAGAGAGAAGACATTTTCTGATGGTTCTCGTTTCCTCCCTTGTTGTAGTC
GTTGCAATTACCCAGCCCAACATCGTCCAGCACTCTGTTCAGAGATGAAAAGATGGGATG
TCTTGATCCGTGAATCACTTTTGCGTCCGCCAAATTTAAGTTCGATTCAGGACTTGCAAG
AGGACCTGGTACGGATTAGAGAATATAGGGTTTTCTACGAGGTTCTTGATGTCAAAACCT
TTGCAGGGGACTTGTCTGACGCACTTGACGAGCTGGAATCTTTTAACACCCTGATGCAAG
GGATAATTGTTACAAGCTCTCTGAACCCTACGTACCTTAATGCTCGCAACTTTAGAGAAA
TGTTAAACTCTGGTAGACAAAGGTATGACCAGCTTCTGCAAGCCATTACTCCTATGGGAA
TGCATAGTGAAGGTAATCTGCCTGACCCTCGTCGACTTCGGGCATCCACAGCTGATATGT
GGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAGAGTGCTAGAACCGTTATGAATTTGAAGATTAATA
GCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAATACTGGATGCTAGTTGACCTGTACAATGAAGTGC
CGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGACTCAGAATGTTCGTCTGTTTTAACCAATGTTCTT
TTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAAACTGCCTCTAGTTTTGCTTCTTGTTTGGTTGGAA
TTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTTGTTGAAGTCTTATCCTTAA


BQ
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AACTGCCTCTAGTTTTGCTTCTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTT
GTTGAAGTCTTATCCTTAA

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DS 



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ACCATAATGCTCTCCCATACTGGTTGTGGAACGTGGACCAAGAGTTTACAAGTATCAGGT
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CAAGAGAGCCAACCCTGGGAATCACTTCCCTTGTCTAGTCTGTTCGACGTAAAGACAGAT
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TTTATACGATTTTTACACACTAAAAATGTGATTATAACCG


BQ
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BS 697 1300 RR4DW85JQ

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CCTCCCCGCAGACGATACTTCATCGTAAGGGCTAATCTCCCGTTTCCGAAGCATCAAGCT
AAGTACCACAAAGGGCTCGAAGCCGCCATCGATGCTGTTGACAGAGCTTGTCGCCTCTGT
GTCGATGTAGAGAGATCGCTTTTCTCTTCTAAAGACAAGATCCTCCAGAAGAATGACCAA
ACACCAGTTACCATCGCAGACTTCGGAGTGCAAGCTTTAGTCAGCTTAGGGCTATCGAAA
TTTTTTCCTTCGATACCTTTGGTCGCTGAAGAAGATTCTCTTTTCTTGCGTGAGAACAAT
CTCGTGAGCTCTGTGGTGAGTGAAGTCATCGCAAAAGCTAGCGTTGGAGATGATGATCGC
TTGTCTGATGTTGATGTACTTGAAGCTATTGATATAGGTGGCAAAGATGCTTATACTTTT
TGCAACAAACCAGCTACTTACTGGGTTTTGGATCCAATAGATGGCACAAGAGGGTTCCTT
AAAGGAGATGATGCTTTATATGTGGTAGGATTGGCCCTTGTTGTAGATAATGAAATTGTG
CTAGGGGTCATGGGATGTCCAAACTGGCCTGGAGAT

QA 1 696 1 696
DS 

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TATTGATATAGGTGGCAAAGATGCTTATACTTTT*GCAACAAACCAGCTACTTACTGGGT
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GCCTGGAGATTCTTTTTCAGACGAATCCAACGGGACCATAATGCTCTCCCATACTGGTTG
TGGAACGTGGACCAAGAGTTTACAAGTATCAGGTGATTGGACAAGGCGTTTTGTTGATGC
ATGTGGTTTAGTGAACAAGGCTCGGTTTTGTATTCAAGAGAGCCAACCCTGGGAATCACT
TCCCTTGTCTAGTCTGTTCGACGTAAAGACAGATTCAGGTGCTTGCATGGTAATGAGATT
CGTCTTTTGCCCACATGTTGTGGAAGTTTGTGCAAGTACTTGATGGTAGCTTCTGGTAGA
GCATCGGTCTTCCTTCTCCGAGCCAGAACTGAGCGAACTATAAAGTCTTGGGATCATGCC
GTTGGGATCATATGCGTTCATGAAGCTGGAGGAAAGGTAACAGATTGGGAAGGAGTTGAT
ATCAATCTGGAGGAAGATCAATCGGAAAGGAGGATCATCTTTCCGGCGGGTGGTGTTGTG
GTTAGCAACGGAAGTTTACATCCGCAGCTTCTTGAGATGATATCTTCTACTTCCTCAACT
CTTTGATTTATTTGACGACTACTCTCCTTAAAAGTTTATACGATTTTTACACACTAAAAA
TGTGATTATAACCG

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

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GATGCTAATTTCTCAAAAAACTTTCCTGTATGCTTTTATTTTCTTAGTATTATTCAATTT
ATTTTTGAAGAATCTGCTCGCAGCTTCCGTTTCATAAACAAAAAAAAAAAGAAAATCAAA
AGAAGAATCTTTGAAATTGTGGAATTAGGGTTTTTGGGAGAATCCGTCTCTGCATAAGCT
GAAAAGGTCTCCAACAAGATATGTCTGCCTCCGGTGAGCCGGAATGAATCAAAAGAGTCA
AATCAGAAGGAGCTGTTCCGTGTCGTAGTCCAGACAGCAAGGACTCCAGAAACAGTTGGA
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AAGTACCTGCTGATAACTTCCTTCTAAAGCCTCTTGGTTTCGACTGGGTCAAAGGCCCCA
CCAAGCTCTCTGACATCCTAACCTATCCAAACAGCCGAATCAGGAAAGCCATAGACGAGC
AGTTTCAAACAGAGTATGATACTACCACTACTAAGCCTTTTGTATGGGCGTTCAATCTCC
AGCTCCCTCACAAAGACAACTACAGCGCCGTGGCCTACTTTGTTTCCACAGAGCCTATCC
CACAAGGCTCCCTCATGGACCAGTTTCTGAAAGGAGACGATGCGTTCAAGAAGTCGAGGC
TAAAACTGATTGCAAACATCGTCAAAGGGCCCTGGATCGTGAGGAAAGCTGTCGGAGAGC
AAGCTATATGCGTCATCGGACGTGCGCTCTCTTGCAAATACGTCTCTGGAGAGAGCTTCG
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CTAGGTTTATGGAACTGTCTTCCAGCAGCAGTAATGAGCGGTCTAGCTGGTGGAAGTCGA
TTGGGAATGGATTAACTAATCTGCTTAATCAAGACACAGCCAACACGAACAATAATACAT
CATCTCCTGGGAGTAACCACAAGGATGAAAATGTGATAAAGACGCAGTAATTGATTTGAT
TTAATTCTTTAAATTTCTTTGATTTCATTACACAACTAAAACCTTATCATTTCTTATTAC
ATTGCAAATGTATAGATTGTTTTTTTTTTACTAATATGGATTTGATATCCAACAACCATG
TGAGAACATATCGAAAAGAATATATCATATACCTT


BQ
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AF RR4FY87TF U 1
AF RR4FY87JQ C 579
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RD RR4FY87TF 807 0 0
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AGAAGAATCTTTGAAATTGTGGAATTAGGGTTTTTGGGAGAATCCGTCTCTGCATAAGCT
GAAAAGGTCTCCAACAAGATATGTCTGCCTCCGGTGAGCCGGAATGAATCAAAAGAGTCA
AATCAGAAGGAGCTGTTCCGTGTCGTAGTCCAGACAGCAAGGACTCCAGAAACAGTTGGA
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AAGTACCTGCTGATAACTTCCTTCTAAAGCCTCTTGGTTTCGACTGGGTCAAAGGCCCCA
CCAAGCTCTCTGACATCCTAACCTATCCAAACAGCCGAATCAGGAAAGCCATAGACGAGC
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AGCTCCCTCACAAAGACAACTACAGCGCCGTGGCCTACTTTGTTTCCACAGAGCCTATCC
CACAAGGCTCCCTCATGGACCAGTTTCTGAAAGGAGACGATGCGTTCAAGAAGTCGAGGC
TAAAACTGATTGCAAACATCGTCAAAGGGCCCTGGATCGTGAGGAAAGCTGTCGGAGAGC
AAGCTATATGCGTCATCGGACGTGCGCTCTCTTGCAA*TACGTCTCTGGAGAGAGCTTCG
TGGAG*TTGATGTGGATATCGGGTCTT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4FY87JQ 717 0 0
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TACGTCTCTGGAGAGAGCTTCGTGGAGGTTGATGTGGATATCGGGTCTTCGATGGTCGCT
AGCGCCATTGTCCACCTCGCGTTTGGTTACATCACGACGCTGACTGTTGATCTCGTGTTC
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TCCGAGCTGCAGACTGACTCGGCTAGGTTTATGGAACTGTCTTCCAGCAGCAGTAATGAG
CGGTCTAGCTGGTGGAAGTCGATTGGGAATGGATTAACTAATCTGCTTAATCAAGACACA
GCCAACACGAACAATAATACATCATCTCCTGGGAGTAACCACAAGGATGAAAATGTGATA
AAGACGCAGTAATTGATTTGATTTAATTCTTTAAATTTCTTTGATTTCATTACACAACTA
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GATTTGATATCCAACAACCATGTGAGAACATATCGAAAAGAATATATCATATACCTT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGTCAAAGGAAATGGCTTCCTTGCTCTTAAGAAAGAGAGCAAAGTAGCAGAAACACCAAG
TTTTGCTGACCTTCCATTATGTCTCCTGGAAGTAATAATATCTCAACTTGATTTAAAAGA
TAGCATACGCGCCTCTGCTGCCTGCAAAACATGGCGTGAAGCCGGTCTATATGTCCGGTT
GGTAGACAAGCCTCCTTGGCTTATGCACTTACCTAAACGTGGCAGCTCTTTTGAAATGTA
CGATCCATTGCAAAAGAAGATGTACACACTGAATCTACCTGAGCTATCAAAATCCACTGT
GTGTTACTCAAGAGATGGATGGTTACTTATGCGCAAGACCACTTCTCACCAGTTATACTT
CTTCAATCCGTTTACTCGTACTTGTGTTGTGTTAGCGTTTAAGACTGTTGAGTATGGTAC
CGTCACTACGAGCACTTGCCATCCCGAAGCAACAGAGTGGATTACGGAGGATATACATTT
CTATCTGAGATATGAAAGTGATTCACATAAGCACAGCAATGTAATCTATGCAAACCGTCG
CTTCTATTGTATTGGCGATACCGGAGGCTTACATTACTTTGAACCGTCTTCTCGAGAATG
GCGTACCATCTACACGTATACATCGCCATGTCCTTTCTCAGGTATGTATAGATACCAGTA
TGAGCGAAAGAAGAAGAGAGTTTTCTTGGTGGTGCGTAAAGGAGTGTTGTTTAAGTGTAC
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ATTAATAGCACTACGCTTGATGGGTTGACAATCTTTACGAGTCTTTATTCTTATGAGATG
AGAGTTAATCTCCCATGGATGAGGCATAGTGTTTATTTCCCGAAGCTTCGTTTAAGTTTC
AAGTGTTGTGTATCGTACTCGTTTGATGAAGAGAGGTATTTTCCGCGTAAGCAGTGGCAA
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GACTACATGTGAAGCTAGAACAATTAATGGTGGCAATGGTGTATGTTAAAGACATAATTC
TCTCTTCTTTTTCTTCCATTAGACCAGTTGACATACTTGCATTATTTGTTATGTTTATCT
ACTTTGATTTATCGAATTCTGTTTCTTTC


BQ
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AF RR4G962TF U 1
AF RR4G962JQ C 550
BS 1 686 RR4G962TF
BS 687 687 RR4G962JQ
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BS 777 787 RR4G962TF
BS 788 1289 RR4G962JQ

RD RR4G962TF 787 0 0
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TTTTGCTGACCTTCCATTATGTCTCCTGGAAGTAATAATATCTCAACTTGATTTAAAAGA
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CGATCCATTGCAAAAGAAGATGTACACACTGAATCTACCTGAGCTATCAAAATCCACTGT
GTGTTACTCAAGAGATGGATGGTTACTTATGCGCAAGACCACTTCTCACCAGTTATACTT
CTTCAATCCGTTTACTCGTACTTGTGTTGTGTTAGCGTTTAAGACTGTTGAGTATGGTAC
CGTCACTACGAGCACTTGCCATCCCGAAGCAACAGAGTGGATTACGGAGGATATACATTT
CTATCTGAGATATGAAAGTGATTCACATAAGCACAGCAATGTAATCTATGCAAACCGTCG
CTTCTATTGTATTGGCGATACCGGAG*CTTACATTACTTTGAACCGTCTTCTCGAGAATG
GCGTACCATCTACACGTATACATCGCCATGTCCTTTCTCAG*TATGTATAGATAC*AGTA
TGAGCGA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4G962JQ 740 0 0
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ATATGAAAGTGATTCACATAAGCACAGCAATGTAATCTATGCAAACCGTCGCTTCTATTG
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CTACACGTATACATCGCCATGTCCTTTTTCAGGTATGTATAGATACCAGTATGAGCGAAA
GAAGAAGAGAGTTTTCTTGGTGGTGCGTAAAGGAGTGTTGTTTAAGTGTACACATGCGGA
GGTGAGAAGCCTGTTGTGTATAAGCTAGATGAGTCGTACGATTGGGTGGAGATTAATAGC
ACTACGCTTGATGGGTTGACAATCTTTACGAGTCTTTATTCTTATGAGATGAGAGTTAAT
CTCCCATGGATGAGGCATAGTGTTTATTTCCCGAAGCTTCGTTTAAGTTTCAAGTGTTGT
GTATCGTACTCGTTTGATGAAGAGAGGTATTTTCCGCGTAAGCAGTGGCAAGAACAGGAG
GATTTGTGCCCTGTTGAGAGTCTTTGGATTAGGCCACCTAAGAAAGCTATAGACTACATG
TGAAGCTAGAACAATTAATGGTGGCAATGGTGTATGTTAAAGACATAATTCTCTCTTCTT
TTTCTTCCATTAGACCAGTTGACATACTTGCATTATTTGTTATGTTTATCTACTTTGATT
TATCGAATTCTGTTTCTTTC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL5752Contig1 1240 2 10 U
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AGATCGATTAACAATGGCGATCAATAGAAAACTCGTATCTCTTCTCTTCCTCTTAGCAAC
CGTATCATCATTCGCATCAGCATCCTTCTCCGATCCAGATTCCGACTCCGATCTCGTCAA
CGAACTCGTTTCCCTCAGATCAAACTCAGAATCAGGCGTAATCCATCTCGACGACAATGG
AATCTCCAAATTCCTCATCTCCTCACCCACACCACGACCTTACTCCATCCTCGTCTTCTT
CGACGCCACTCAGCTCCACAGCAAAACCGAGCTCCGTCTCCAAGAGCTCCGCCGCGAGTT
CGGCCTCGTCTCCGCTACCTTCCTCGCTAACAACAACGGATCCGATCTAAACAAGCTTTT
CTTCTGCGAGATCGAGTTCTCCCGATCCCAAGCTTCCTTCCAGCGATTCGGCGTTAACGC
TCTCCCTCACATCCGTCTTGTATCCGGTTCAACATCAAAACTAAGCGACGAATCTGGTCA
AATGGACCAATCTGATTTCTCTCGTTTAGCTGAATCCATGGCTGAGTTCGTCGAGCAAAG
AACCAAGCTCACCGTCGGTCCGATCCAACGGCCGCCGTTTCTCTCCAAGGCGCAGATCAG
CGTCATCGTTGCTTTGATCGTTATCGCCACTCCCTTTGTCATCAAACGGATTCTGAAAGG
AGAAACTCTTCTTCATGACCGTAGGCTTTGGTTATCAGGTGCTATCTTTATCTACTTCTT
CAGCGTCGCGGGAACAATGCACAACATCATCAGGAAGATGCCTATGTTTCTTCAGGATCG
TAACGATCCCAACAAGCTAGTTTTCTTCTACCAAGGATCTGGAATGCAGCTTGGAGCTGA
GGGATTCGCTGTGGGGTTCTTGTACACTGTTGTTGGCTTGCTCTTGGCGTTTGTTACTAA
TGTGCTTGTTCGAGTAAGGAATCTTAATGTTCAGAGATTGGTGATGCTTGTGGCTCTCTT
TGTATCCTTCTGGGCTGTCAAGAAAGTTGTTTTCTTGGATAATTGGAAGACTGGCTATGG
GATTCATCCCTACTGGCCATCAAGTTGGCGTTGATTTCTCAACCTCTTTTGAGGTGATGA
GTTTAATTTTCAAGACATTTCTGGGACATTTTGTATGCTTAATGTGGTACTTTGAATCAG
TCTAGTACAATTTCAGATGGTTTAAACTCATCACTACTTC


BQ
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AF RR4C355TF U 1
AF RR4C355JQ C 503
BS 1 649 RR4C355TF
BS 650 650 RR4C355JQ
BS 651 705 RR4C355TF
BS 706 706 RR4C355JQ
BS 707 719 RR4C355TF
BS 720 720 RR4C355JQ
BS 721 724 RR4C355TF
BS 725 725 RR4C355JQ
BS 726 740 RR4C355TF
BS 741 1240 RR4C355JQ

RD RR4C355TF 740 0 0
GGGGCAATACCTTTCTCTTCTCTTTCCGAATCTGAGCTCACCCCCCCCCTCTTTGGAGAG
AGATCGATTAACAATGGCGATCAATAGAAAACTCGTATCTCTTCTCTTCCTCTTAGCAAC
CGTATCATCATTCGCATCAGCATCCTTCTCCGATCCAGATTCCGACTCCGATCTCGTCAA
CGAACTCGTTTCCCTCAGATCAAACTCAGAATCAGGCGTAATCCATCTCGACGACAATGG
AATCTCCAAATTCCTCATCTCCTCACCCACACCACGACCTTACTCCATCCTCGTCTTCTT
CGACGCCACTCAGCTCCACAGCAAAACCGAGCTCCGTCTCCAAGAGCTCCGCCGCGAGTT
CGGCCTCGTCTCCGCTACCTTCCTCGCTAACAACAACGGATCCGATCTAAACAAGCTTTT
CTTCTGCGAGATCGAGTTCTCCCGATCCCAAGCTTCCTTCCAGCGATTCGGCGTTAACGC
TCTCCCTCACATCCGTCTTGTATCCGGTTCAACATCAAAACTAAGCGACGAATCTGGTCA
AATGGACCAATCTGATTTCTCTCGTTTAGCTGAATCCATGGCTGAGTTCGTCGAGCAAAG
AACCAAGCTCACCGTCGGTCCGATCCAACGGCCGCCGTTTCTCTCCAAG*CGCAGATCAG
CGTCATCGTTGCTTTGATCGTTATCGCCACTCCCTTTGTCATCAA*CGGATTCTGAAAG*
AGAA*CTCTTCTTCATGACC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4C355JQ 738 0 0
TCCGGTTCAACATCAAAACTAAGCGACGAATCTGGTCAAATGGACCAATCTGATTTCTCT
CGTTTAGCTGAATCCATGGCTGAGTTCGTCGAGCAAAGAACCAAGCTCACCGTCGGTCCG
ATCCAACGGCCGCCGTTTCTCTCCAAGGCGCAGATCAGCGTCATCGTTGCTTTGATCGTT
ATCGCCACTCCCTTTGTCATCAAACGGATTCTGAAAGGAGAAACTCTTCTTCATGACCGT
AGGCTTTGGTTATCAGGTGCTATCTTTATCTACTTCTTCAGCGTCGCGGGAACAATGCAC
AACATCATCAGGAAGATGCCTATGTTTCTTCAGGATCGTAACGATCCCAACAAGCTAGTT
TTCTTCTACCAAGGATCTGGAATGCAGCTTGGAGCTGAGGGATTCGCTGTGGGGTTCTTG
TACACTGTTGTTGGCTTGCTCTTGGCGTTTGTTACTAATGTGCTTGTTCGAGTAAGGAAT
CTTAATGTTCAGAGATTGGTGATGCTTGTGGCTCTCTTTGTATCCTTCTGGGCTGTCAAG
AAAGTTGTTTTCTTGGATAATTGGAAGACTGGCTATGGGATTCATCCCTACTGGCCATCA
AGTTGGCGTTGATTTCTCAACCTCTTTTGAGGTGATGAGTTTAATTTTCAAGACATTTCT
GGGACATTTTGTATGCTTAATGTGGTACTTTGAATCAGTCTAGTACAATTTCAGATGGTT
TAAACTCATCACTACTTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL5753Contig1 365 2 5 U
AAGCTCCAGAAACATAGTTAGAGATTCTGGATTATTGATAAAACAGAAAGACATACAGAC
AGCATCAAACCAAAGAAACAAAAACAAGAAACAAAGAAAACAAAGGCAAGAAGCTCTTCA
ATCTTCTCAGGCTGTTGGAGGTTGAGTAGTTCCATTCTCTTCTGCAGTAGTGGTGTTGTC
TGAGCCGGGGATAAAACCGTTCTGCTCAGTGTTTTCATCGTCAAGAAACACGGGAAGAAG
CGTGGCCAATAGTCTAACAGCTAGAGGAAGACCACGAGACTTGTTCATAAGCTCTTCAAT
GCATTTCTTGTCGTTCCTAGGAGGATCATCTTCCCCGTTCTCTATCCGTGCTTCATCATA
TATCT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4CG08JQ U 37
AF RR4GZ87JQ U 1
BS 1 47 RR4GZ87JQ
BS 48 48 RR4CG08JQ
BS 49 193 RR4GZ87JQ
BS 194 194 RR4CG08JQ
BS 195 365 RR4GZ87JQ

RD RR4CG08JQ 232 0 0
GATAAAACAGAAAGACATACAGACAGCATCAAACCAAAGAAACAAAAACAAGAAACAAAG
AAAACAAAGGCAAGAAGCTCTTCAATCTTCTCAGGCTGTTGGAGGTTGAGTAGTTTCATT
CTCTTCTGCAGTAGTGGTGTTGTCTGAGCCGGGGATAAAACCGTTCTGCTCAGTGTTTTC
ATCGTCAAGAAACACGGGAAGAAGCGTGGCCAATAGTCTAACAGCTAGAGGA

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR4GZ87JQ 365 0 0
AAGCTCCAGAAACATAGTTAGAGATTCTGGATTATTGATAAAACAGAGAGACATACAGAC
AGCATCAAACCAAAGAAACAAAAACAAGAAACAAAGAAAACAAAGGCAAGAAGCTCTTCA
ATCTTCTCAGGCTGTTGGAGGTTGAGTAGTTCCATTCTCTTCTGCAGTAGTGGTGTTGTC
TGAGCCGGGGATAGAACCGTTCTGCTCAGTGTTTTCATCGTCAAGAAACACGGGAAGAAG
CGTGGCCAATAGTCTAACAGCTAGAGGAAGACCACGAGACTTGTTCATAAGCTCTTCAAT
GCATTTCTTGTCGTTCCTAGGAGGATCATCTTCCCCGTTCTCTATCCGTGCTTCATCATA
TATCT

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 2

CO CL5754Contig1 1196 2 8 U
GAGCTTACATTTCATAGGCAATAACCCCAACCCTTACGAACAAGCCATAACTATAATAGG
AAGAACATTAGCCGCCTTTGACGAGGACAACTTGATTCCATGTTACGGTTTTGGAGACGC
GTCAACACATGATCAAGATGTGTTTAGTTTCAACCCGGAAGATAGGTTCTGTAATGGGTT
TGAGGAAGTGCTTGGTCGGTATAAAGAGATCGTGCCTCAGCTTAAGCTCGCGGGGCCGAC
GTCGTTTGCTCCCATCATCGATATGGCAATGACCATTGTTGAGCAGAGTGGTGGACAGTA
TCACGTTTTAGTGATAATAGCAGATGGGCAGGTTACAAGAAGCGTTGACACTGAAAATGG
ACAGTTAAGTCCGCAAGAACAGAAGACTGTGGAGGCTATTGTGCAAGCGAGTAAGCTGCC
TCTATCAATAGTCTTAGTGGGGGTTGGGGATGGACCATGGGATATGATGAGAGAGTTTGA
CGATAATATTCCATCCCAGAGCTTTTGATAACTTCCCAATTTGTCAACTTCACAGAGATC
ATGTCAAAGAACAAAGCTCAGTCCTTAAAGGAAACAGAGTTTGCCCTCTCTGCTCTCATG
GAAATTCCTCAACAATACAAGGCCACATTAGAGCTTAACCTTTTAGGAAGAAGAAATGGG
AATATCCAGGAACGTTTCCCTCTTCCACCTCCAATGCATGGTGGATCGTCATCATACAAC
AACAAACCAAAAGCTAACCGTGTTCCAAGTTTCAAACCGAGCGTACCTCCTCATCCCACC
GAAAGATCTAGTCCTGCAACGCCCGCTACCACCTCTGCTTTCGATAACCAGCTATGTCCG
ATATGTCTGAGCAACCCTAAAGACATGGCCTTTGGTTGTGGCCATCAGACTTGTTGCGAG
TTTGGACCGGATCTTGAAATGTGTCCGATTTGCCGTGCACCGATCCAGACAAGAATAAAG
CTCTACTAACTAGCAGGCGGCCAAGATCGACTACACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTG
TGTTAGTTTTGTTCGTTGGTTCACTTTTCTAACTTGGATCTTTTGTCTTCGTTCTTTCCT
TATTTGCTTGGAATTAAAATGTTGCTATCAATGCGTGAATCCTTACTCCATTTTTCTTCT
CTTTTGATGGTTTTTTTCTTCTTTTTTGGACAACTATAAGCTACACTAAGATTTGC


BQ
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AF RR4FY31TF U 1
AF RR4FY31JQ C 444
BS 1 496 RR4FY31TF
BS 497 497 RR4FY31JQ
BS 498 516 RR4FY31TF
BS 517 517 RR4FY31JQ
BS 518 646 RR4FY31TF
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BS 648 676 RR4FY31TF
BS 677 1196 RR4FY31JQ

RD RR4FY31TF 676 0 0
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AAGAACATTAGCCGCCTTTGACGAGGACAACTTGATTCCATGTTACGGTTTTGGAGACGC
GTCAACACATGATCAAGATGTGTTTAGTTTCAACCCGGAAGATAGGTTCTGTAATGGGTT
TGAGGAAGTGCTTGGTCGGTATAAAGAGATCGTGCCTCAGCTTAAGCTCGCGGGGCCGAC
GTCGTTTGCTCCCATCATCGATATGGCAATGACCATTGTTGAGCAGAGTGGTGGACAGTA
TCACGTTTTAGTGATAATAGCAGATGGGCAGGTTACAAGAAGCGTTGACACTGAAAATGG
ACAGTTAAGTCCGCAAGAACAGAAGACTGTGGAGGCTATTGTGCAAGCGAGTAAGCTGCC
TCTATCAATAGTCTTAGTGGGGGTTGGGGATGGACCATGGGATATGATGAGAGAGTTTGA
CGATAATATTCCATCC*AGAGCTTTTGATAACTTCC*AATTTGTCAACTTCACAGAGATC
ATGTCAAAGAACAAAGCTCAGTCCTTAAAGGAAACAGAGTTTGCCCTCTCTGCTCTCATG
GAAATTCCTCAACAATACAAGGCCACATTAGAGCTTAACCTTTTAG*AAGAAGAAATGGG
AATATCCAGGAACGTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4FY31JQ 753 0 0
TTGGGGATGGACCATGGGATATGATGAGAGAGTTTGACGATAATATTCCATCCCAGAGCT
TTTGATAACTTCCCAATTTGTCAACTTCACAGAGATCATGTCAAAGAACAAAGCTCAGTC
CTTAAAGGAAACAGAGTTTGCCCTCTCTGCTCTCATGGAAATTCCTCAACAATACAAGGC
CACATTAGAGCTTAACCTTTTAGGAAGAAGAAATGGGAATATCCAGGAACGTTTCCCTCT
TCCACCTCCAATGCATGGTGGATCGTCATCATACAACAACAAACCAAAAGCTAACCGTGT
TCCAAGTTTCAAACCGAGCGTACCTCCTCATCCCACCGAAAGATCTAGTCCTGCAACGCC
CGCTACCACCTCTGCTTTCGATAACCAGCTATGTCCGATATGTCTGAGCAACCCTAAAGA
CATGGCCTTTGGTTGTGGCCATCAGACTTGTTGCGAGTTTGGACCGGATCTTGAAATGTG
TCCGATTTGCCGTGCACCGATCCAGACAAGAATAAAGCTCTACTAACTAGCAGGCGGCCA
AGATCGACTACACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTGTTAGTTTTGTTCGTTGGTTCA
CTTTTCTAACTTGGATCTTTTGTCTTCGTTCTTTCCTTATTTGCTTGGAATTAAAATGTT
GCTATCAATGCGTGAATCCTTACTCCATTTTTCTTCTCTTTTGATGGTTTTTTTCTTCTT
TTTTGGACAACTATAAGCTACACTAAGATTTGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL5755Contig1 1105 2 2 U
GAACAGAGCTTCGTCTTTACGAGAACAACTTCTCAGGTCCTCTTCCAGTCAACGTAAACG
TCTTGATGCCAAGGATGGAAAGGCTATACCTCTTTCACAACAGCTTCACCGGAGAGATCC
CACCGTCTCTATGTGAAGTCTCCGGACTGCAGATTCTCTCCCTAAGAAACAACCGTTTCT
CCGGTAGCTTCCCAAACTGCTGGCATCGTTCCTTCATGCTTTACGGAATCGACGCCTCTG
AGAACAGCTTATCTGGCGAGATACCTCCCTCTCTCGGCACGTTACCTTCTCTCAGCGTCT
TGCTTCTGAACCAGAACGCATTACGAGGTAAAATCCCAGACACGCTTCAGAACTGCTCTG
GTCTCACGAACATTGATCTCGGAGGAAACAAGCTGACTGGGACACTTCCATCGTGGCTAA
GTAAGCTCTCTTCTCTGTTCATGCTTCGTCTGCAAAGTAACTCCTTCGATGGTCAAATCC
CAGATGGTCTCTGCAGCGTTCACAATCTACACATTCTTGATCTCTCGGGAAACAAAATAT
CAGGACCGGTTCCAAAATGCATCAGCAACCTCACAGCCATTGCTCGTGGAACAACAAACT
TCGAGGTGTTCCAGAATCTTGTCTTCGTCGTTACAAGAGCTCGTAAATACCAAGATATAG
TCAACAGCATCAATCTATCTGGAAACAACATAAACGGAGAGATCCCAGCGGAGATCTTGG
ACCTCTCTTACCATCGAATCCTGAACTTATCAAGAAACTCGATAGCAGGAAGCATCCCCG
GGGAGATTTCCAAACTTGGTCGCTTGGAGACGCTTGATCTGTCAAGAAACATGTTGTCTG
GTGCCATTCCTGAGAGCTTGGCAGTGATATCTTCTCTGCAGAAGCTGAACCTTTCGTTCA
ATAAACTGGAAGGGCGCATACCAAAGCTGCCGAAGTTTCAAGATCCGTCCATTTACATAG
GAAACGAGTTGCTCTGTGGGAAACCACTTCCTAAAAAATGTCCTCAAGACGTTAATAGGA
GATTGTTATAGTAACAACATACGGTACTACATTAATGTACCTTACAAAAAATAATGTACC
TGATCATTCCCAAATAAATAATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GT61TF U 1
AF RR4GT61JQ C 469
BS 1 684 RR4GT61TF
BS 685 1105 RR4GT61JQ

RD RR4GT61TF 691 0 0
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TCTTGATGCCAAGGATGGAAAGGCTATACCTCTTTCACAACAGCTTCACCGGAGAGATCC
CACCGTCTCTATGTGAAGTCTCCGGACTGCAGATTCTCTCCCTAAGAAACAACCGTTTCT
CCGGTAGCTTCCCAAACTGCTGGCATCGTTCCTTCATGCTTTACGGAATCGACGCCTCTG
AGAACAGCTTATCTGGCGAGATACCTCCCTCTCTCGGCACGTTACCTTCTCTCAGCGTCT
TGCTTCTGAACCAGAACGCATTACGAGGTAAAATCCCAGACACGCTTCAGAACTGCTCTG
GTCTCACGAACATTGATCTCGGAGGAAACAAGCTGACTGGGACACTTCCATCGTGGCTAA
GTAAGCTCTCTTCTCTGTTCATGCTTCGTCTGCAAAGTAACTCCTTCGATGGTCAAATCC
CAGATGGTCTCTGCAGCGTTCACAATCTACACATTCTTGATCTCTCGGGAAACAAAATAT
CAGGACCGGTTCCAAAATGCATCAGCAACCTCACAGCCATTGCTCGTGGAACAACAAACT
TCGAGGTGTTCCAGAATCTTGTCTTCGTCGTTACAAGAGCTCGTAAATACCAAGATATAG
TCAACAGCATCAATCTATCTGGAA
CAACATA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4GT61JQ 637 0 0
ATGGTCAAATCCCAGATGGTCTCTGCAGCGTTCACAATCTACACATTCTTGATCTCTCGG
GAAACAAAATATCAGGACCGGTTCCAAAATGCATCAGCAACCTCACAGCCATTGCTCGTG
GAACAACAAACTTCGAGGTGTTCCAGAATCTTGTCTTCGTCGTTACAAGAGCTCGTAAAT
ACCAAGATATAGTCAACAGCATCAATCTATCTGGAAACAACATAAACGGAGAGATCCCAG
CGGAGATCTTGGACCTCTCTTACCATCGAATCCTGAACTTATCAAGAAACTCGATAGCAG
GAAGCATCCCCGGGGAGATTTCCAAACTTGGTCGCTTGGAGACGCTTGATCTGTCAAGAA
ACATGTTGTCTGGTGCCATTCCTGAGAGCTTGGCAGTGATATCTTCTCTGCAGAAGCTGA
ACCTTTCGTTCAATAAACTGGAAGGGCGCATACCAAAGCTGCCGAAGTTTCAAGATCCGT
CCATTTACATAGGAAACGAGTTGCTCTGTGGGAAACCACTTCCTAAAAAATGTCCTCAAG
ACGTTAATAGGAGATTGTTATAGTAACAACATACGGTACTACATTAATGTACCTTACAAA
AAATAATGTACCTGATCATTCCCAAATAAATAATAAA

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL5756Contig1 1337 2 2 U
GAGGTCGAAAAGCTTGGGAAAGCTCCATTGATAAACTGTGCTAAAACCAGCATGTCCTCC
AAACTAATCTCTGGTGACAGTGACTTCTTTGCCAATTTGGTTGTGGATGCAGTTCTGTCA
GTTAAGATGACAAATCAGCGGGGGGAGATTAAATACCCTATCAAGGGGATTAATATTCTA
AAAGCTCACGGACAAAGTGCAAAAGACAGCTATTTGTTGAATGGATATGCACTCAACACT
GGCCGTGCTGCCCAGGGGATGCCATTGCAAGTTTCTCCAGCGAAGATTGCTTGCCTCGAC
TTCAATCTTCAGAAGACGAAAATGCAGCTGGGTGTCCAAGTTGTTGTTAACGATCCACGA
GAACTTGAAAAAATCCGTCAAAGAGAAGCTGACATGACCAAAGAGCGGATAGAGAAACTT
CTTAAAGCTGGGGCCAATGTCATTTTGACCACGATGGGAATTGACGACATGGCACTTAAA
TACTTTGTAGAGGCTGGAGCTATTGCTGTTAGGCGTGTCCGCAAAGAAGACATGCGCCAT
GTTGCCAAAGCAACTGGAGCAACCCTGGTCACCACTTTTGCTGACATGGAGGGTGAAGAA
ACATTTGATCCGGCACACCTTGGAACTGCAGAAGAAGTTGTGGAGGAGAGAATCGCAGAT
GATGATGTTGTATTGATAAAGGGAACCAAAACTAGCAGTGCGGTCTCCTTGATCTTGAGA
GGTGCAAATGACTACATGCTTGATGAAATGGAGAGAGCACTGCACGATTCGTTATGTATT
GTCAAGAGGACCCTCGAGTCCAACACGGTGGTTGCTGGTGGAGGTGCAGTTGAATCAGCG
TTGTCTGTCTATCTGGAGCACCTTGCTACAACCTTGGGCTTTCGTGAACAATTGGCAATT
GCTGAATTTGCAGATGCACTATTGATTATACCAAAGGTGCTTGCAGTAAACGCTGCTAAG
GATGCAACCGAGTTGGTAGCTAAACTGAGAGCATACCACCACACCGCACAAACCAAGGCT
GATAAGAAGCACTATTCAAGCATGGGACTTGACCTTGTTAATGGAACCATCCGTAACAAT
TTGGAAGCTGGAGTGATCGAACCAGCGATGAGCATAGTGAAAATTATTCAGTTTTCAACC
GAGGCAGCCATTACCATTCTGCGAATTGATGACATGATCAAACTGGTGAAGGAAGACGGT
CAAGGCGATGAGTAACCAATCCTTTAAGCTTCTCTTTGTTTGTCATATCTTTAGTATGCG
TTTCTGTCGGCTTCTTTTTCTAGCTGTAACAATGACATCCTCTGAAACAGCAGTTTATGT
TTTTCGCTTTTTACTCC


BQ
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AF RR4AZ76TF U 1
AF RR4AZ76JQ C 584
BS 1 803 RR4AZ76TF
BS 804 1337 RR4AZ76JQ

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AAAGCTCACGGACAAAGTGCAAAAGACAGCTATTTGTTGAATGGATATGCACTCAACACT
GGCCGTGCTGCCCAGGGGATGCCATTGCAAGTTTCTCCAGCGAAGATTGCTTGCCTCGAC
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GAACTTGAAAAAATCCGTCAAAGAGAAGCTGACATGACCAAAGAGCGGATAGAGAAACTT
CTTAAAGCTGGGGCCAATGTCATTTTGACCACGATGGGAATTGACGACATGGCACTTAAA
TACTTTGTAGAGGCTGGAGCTATTGCTGTTAGGCGTGTCCGCAAAGAAGACATGCGCCAT
GTTGCCAAAGCAACTGGAGCAACCCTGGTCACCACTTTTGCTGACATGGAGGGTGAAGAA
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GATGATGTTGTATTGATAAAGGGAACCAAAACTAGCAGTGCGGTCTCCTTGATCTTGAGA
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GTCAAGAGGACCCTCGAGTCCAA

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DS 

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ACGATTCGTTATGTATTGTCAAGAGGACCCTCGAGTCCAACACGGTGGTTGCTGGTGGAG
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CCGCACAAACCAAGGCTGATAAGAAGCACTATTCAAGCATGGGACTTGACCTTGTTAATG
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CATATCTTTAGTATGCGTTTCTGTCGGCTTCTTTTTCTAGCTGTAACAATGACATCCTCT
GAAACAGCAGTTTATGTTTTTCGCTTTTTACTCC

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DS 



AS 1 2

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GTGGAGGCAAAGTTGCCCCCAGGATTCAGGTTTCACCCAAAGGATGACGAGCTTGTCTGC
GATTACTTGATGGCACGATCGCTTGGTCACAATATAAATCAAACTCCTCCTCCTCTCCTC
TTGATCCAAGTCGATCTCAACAAGTGCGAGCCTTGGGACATCCCGAAAACGGCATGCGTG
GGAGGCAAAGATTGGTATTTCTACAGCCAAAGAGATAGGAAATACGCGACGGGGCTGAGA
ACAAACAGAGCAACGGCCACCGGATATTGGAAAGCCACAGGGAAAGACAGAGCCATTCTA
AGAAAGAGTAAGCTTGTTGGGATGAGGAAGACATTGGTGTTCTATCAAGGTCGAGCTCCC
CGTGGTCGTAAAACTGATTGGGTCATGCACGAGCTTCGTCTCCAGGGTTCCTTTGATCCT
CCTACTCTGAACTCTCCAGAGGTACAGGAAGACTGGGTCTTGTGTGGAGTGTTCCACAAG
AACACAGAAGGAGTTTTAAGTAGAGACAACGTGGGAAGCTGTTTTGACGAGACAGCCTCC
GCTTCTCTTCCTCCACTGATGGATTCTTACATCAACTTTGACCAAGAGCCCTCTTCTTAC
CTCGGTGATGATCAGCACTTCATCACCAATGAGCAAGTGCCCTGCTTCTCCAATTTGTCA
AGGAACCAAACCCTAACCAACTCAGTTTTTGAACTCAAGAAGAACCCTATCCCCTTGTTC
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ATGGTTCTCAGAGCTCTGCTCAGCCAGCTCACTAAGATAAATGGAGGCATTGAGGTTAAA
GAATCACAGATTTATGGGGAAGGTAGCTCCGAGAGCTTCTTGACCGACATTGGCGTACCA
AGCACTGCGTGGAATTGATGATGGTCGAGTGTAGTAGTGCGAGTCGTTATTGCTATATTC
ATATTCATGATTGGAACCATTCTTCAAGGGGTGAGGAGGAGTAAGGTGTGTGTGTCTGAT
TGTACAAACATTTCCCTCACTCTTGTACAACTCATGTAAAATACCACTTAAGACATTACA
ATACATATGAATTTCATCATAGCTCCATCTGTTTTGGTGTAATAATTAATCAAGAATACT
ATATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4BR71TF U 1
AF RR4BR71JQ C 486
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BS 696 696 RR4BR71JQ
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TTGATCCAAGTCGATCTCAACAAGTGCGAGCCTTGGGACATCCCGAAAACGGCATGCGTG
GGAGGCAAAGATTGGTATTTCTACAGCCAAAGAGATAGGAAATACGCGACGGGGCTGAGA
ACAAACAGAGCAACGGCCACCGGATATTGGAAAGCCACAGGGAAAGACAGAGCCATTCTA
AGAAAGAGTAAGCTTGTTGGGATGAGGAAGACATTGGTGTTCTATCAAGGTCGAGCTCCC
CGTGGTCGTAAAACTGATTGGGTCATGCACGAGCTTCGTCTCCAGGGTTCCTTTGATCCT
CCTACTCTGAACTCTCCAGAGGTACAGGAAGACTGGGTCTTGTGTGGAGTGTTCCACAAG
AACACAGAAGGAGTTTTAAGTAGAGACAACGTGGGAAGCTGTTTTGACGAGACAGCCTCC
GCTTCTCTTCCTCCACTGATGGATTCTTACATCAACTTTGACCAAGAGCCCTCTTCTTAC
CTCGGTGATGATCAGCACTTCATCACCAATGAGCA*GTGCCCTGCTTCTC
ATTT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4BR71JQ 720 0 0
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AGAAGGAGTTTTAAGTAGAGACAACGTGGGAAGCTGTTTTGACGAGACAGCCTCCGCTTC
TCTTCCTCCACTGATGGATTCTTACATCAACTTTGACCAAGAGCCCTCTTCTTACCTCGG
TGATGATCAGCACTTCATCACCAATGAGCAAGTGCCCTGCTTCTCCAATTTGTCAAGGAA
CCAAACCCTAACCAACTCAGTTTTTGAACTCAAGAAGAACCCTATCCCCTTGTTCACCGG
TGGTTCAGCCCCCACCACGCTCCCAGGGTTAGACTCGTTCTGTTCTTCAGATCAGATGGT
TCTCAGAGCTCTGCTCAGCCAGCTCACTAAGATAAATGGAGGCATTGAGGTTAAAGAATC
ACAGATTTATGGGGAAGGTAGCTCCGAGAGCTTCTTGACCGACATTGGCGTACCAAGCAC
TGCGTGGAATTGATGATGGTCGAGTGTAGTAGTGCGAGTCGTTATTGCTATATTCATATT
CATGATTGGAACCATTCTTCAAGGGGTGAGGAGGAGTAAGGTGTGTGTGTCTGATTGTAC
AAACATTTCCCTCACTCTTGTACAACTCATGTAAAATACCACTTAAGACATTACAATACA
TATGAATTTCATCATAGCTCCATCTGTTTTGGTGTAATAATTAATCAAGAATACTATATG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5758Contig1 670 2 6 U
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CACGTTTATTCCAATTAATTCCATCACCACTACGAATCTTCAATGCGTCGTTCCTAACTC
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AAATTCCGACCAAGACTTGCTGCCAGGTCGATTTATTCAATCTCTATATTTGACGTGGCT
CGGTGTGCTCAGAACTTCAGGCTTACCGATTCCTCTTTACTGATCGTGTCATGGCTACAA
TCAAACTGGAAAATGATGTCTCTGTTACACTGAATCTATTCGACTCTCAAGTTGTTTTCG
TTCCATAAAAGCTTGAAGGCTTGCGTGATGATCCAAAGGTGATAGTTGCCACAAACATAA
ATCCGAAGACGGTTGGAGGTCGTTTGTTTCTCAACGCAATGTCTGGCACTCATATTTACT
TGGACAGCTGCAGGGGAATCTTGCTTCTACAAATTGGTAGCTAGGGACACTGGTCTTCCA
TCTGCAGCACCACTGCTAAGGGGATATGCAAAGGTTGAGCCTGTGACAATTCGTGAGCTC
AATGATTTTATCATCACTGCCATGTCACAGCTATCGTGTTGAGATGGTTATAGAGGATGA
TACTGCTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW42TF U 1
AF RR4C636TF U 403
BS 1 562 RR4BW42TF
BS 563 563 RR4C636TF
BS 564 571 RR4BW42TF
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BS 573 635 RR4BW42TF
BS 636 670 RR4C636TF

RD RR4BW42TF 635 0 0
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AAATTCCGACCAAGACTTGCTGCCAGGTCGATTTATTCAATCTCTATATTTGACGTGGCT
CGGTGTGCTCAGAACTTCAGGCTTACCGATTCCTCTTTACTGATCGTGTCATGGCTACAA
TCAAACTGGAAAATGATGTCTCTGTTACACTGAATCTATTCGACTCTCAAGTTGTTTTCG
TTCCATAAAAGCTTGAAGGCTTGCGTGATGATCCAAAGGTGATAGTTGCCACAAACATAA
ATCCGAAGACGGTTGGAGGTCGTTTGTTTCTCAACGCAATGTCTGGCACTCATATTTACT
TGGACAGCTGCAGGGGAATCTTGCTTCTACAAATTGGTAGCTAGGGACACTGGTCTTCCA
TCTGCAGCACCACTGCTAAGGG*ATATGCAA*GGTTGAGCCTGTGACAATTCGTGAGCTC
AATGATTTTATCATCACTGCCATGTCACAGCTATC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4C636TF 268 0 0
AGT
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GCACTCATATTTACTTGGACAGCTGCAGGGGAATCTTGCTTCTACAAATTGGTAGCTAGG
GACACTGGTCTTCCATCTGCAGCACCACTGCTAAGGGGATATGCAAAGGTTGAGCCTGTG
ACAATTCGTGAGCTCAATGATTTTATCATCACTGCCATGTCACAGCTATCGTGTTGAGAT
GGTTATAGAGGATGATACTGCTGAA

QA 4 268 4 268
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5760Contig1 796 2 4 U
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AATGGAGAGTTTGGAGATGCTTTTGTCATTCTGTATATGCAGATGGGAAGCAACAGATGG
ATTTTGTGTGGAACAGATTTGCACTCCTCCATCCAAGAAGTGAAGAAAAGTTTCTATGGC
CAAATCCAAAGCCTGTACCATCAAGAGGGTTATTGCAGGAACCTGCAAAGACCGAGATGC
CCAATAAGCTATTCACCGAGCAATGTGGATTTGGATTGTTGGACCCCAAAACGAAAGCCA
CGAGAGCTGAGTTATTCAGTAAAGATTTTTTAGAAAAGGTCACAATCTCTTCACACATGG
GTACTTCTCAAGATCTTGATGGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATTCAACACCATTCCACA
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TGCAGCCGGATCCACCAGCTGTTGAGGGCTCAACCGCGTTGCCCAGGAACGGGGAAGGCC
AGTATAATGAGAACTACAGCTTGAATCAGTTTTATAACTGAAAGTGTATTGCCTTAAATC
ATAATAAGATATTTTGTGTGAGGATCAGGCGAGCCTAGTAGTAACGTTAAGATAGGAGCT
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TACAGACTCATGTAGATTATGTTAACCAAAATGGAGAATTTGTATCCATGTGGACGACAT
AAGACGATTGTTTTCG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK70TF U 1
AF RR4EK70JQ C 5
BS 1 706 RR4EK70TF
BS 707 707 RR4EK70JQ
BS 708 722 RR4EK70TF
BS 723 796 RR4EK70JQ

RD RR4EK70TF 722 0 0
ATTTAGCTACAATTAATTTAGTTATAAGATTAGTAGTTTGGAGTTCACAACAATCACATT
AATGGAGAGTTTGGAGATGCTTTTGTCATTCTGTATATGCAGATGGGAAGCAACAGATGG
ATTTTGTGTGGAACAGATTTGCACTCCTCCATCCAAGAAGTGAAGAAAAGTTTCTATGGC
CAAATCCAAAGCCTGTACCATCAAGAGGGTTATTGCAGGAACCTGCAAAGACCGAGATGC
CCAATAAGCTATTCACCGAGCAATGTGGATTTGGATTGTTGGACCCCAAAACGAAAGCCA
CGAGAGCTGAGTTATTCAGTAAAGATTTTTTAGAAAAGGTCACAATCTCTTCACACATGG
GTACTTCTCAAGATCTTGATGGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATTCAACACCATTCCACA
AGCAACCTCCAACCTGTGGTTCACGGGTCTGTGAATCAACTCAATTCAGTCTCCAGCTAT
TGCAGCCGGATCCACCAGCTGTTGAGGGCTCAACCGCGTTGCCCAGGAACGGGGAAGGCC
AGTATAATGAGAACTACAGCTTGAATCAGTTTTATAACTGAAAGTGTATTGCCTTAAATC
ATAATAAGATATTTTGTGTGAGGATCAGGCGAGCCTAGTAGTAACGTTAAGATAGGAGCT
GTGAAACTTGTTTTCTGTGGAACTTGCTAATCAATTCCCTTTTTTT*GTGTCAGCAATAA
TA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4EK70JQ 792 0 0
AGCTACAATTAATTTAGTTATAAGATTAGTAGTTTGGAGTTCACAACAATCACATTAATG
GAGAGTTTGGAGATGCTTTTGTCATTCTGTATATGCAGATGGGAAGCAACAGATGGATTT
TGTGTGGAACAGATTTGCACTCCTCCATCCAAGAAGTGAAGAAAAGTTTCTATGGCCAAA
TCCAAAGCCTGTACCATCAAGAGGGTTATTGCAGGAACCTGCAAAGACCGAGATGCCCAA
TAAGCTATTCACCGAGCAATGTGGATTTGGATTGTTGGACCCCAAAACGAAAGCCACGAG
AGCTGAGTTATTCAGTAAAGATTTTTTAGAAAAGGTCACAATCTCTTCACACATGGGTAC
TTCTCAAGATCTTGATGGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATTCAACACCATTCCACAAGCA
ACCTCCAACCTGTGGTTCACGGGTCTGTGAATCAACTCAATTCAGTCTCCAGCTATTGCA
GCCGGATCCACCAGCTGTTGAGGGCTCAACCGCGTTGCCCAGGAACGGGGAAGGCCAGTA
TAATGAGAACTACAGCTTGAATCAGTTTTATAACTGAAAGTGTATTGCCTTAAATCATAA
TAAGATATTTTGTGTGAGGATCAGGCGAGCCTAGTAGTAACGTTAAGATAGGAGCTGTGA
AACTTGTTTTCTGTGGAACTTGCTAATCAATTCCCTTTTTTTTGTGTCAGCAATAATACA
GACTCATGTAGATTATGTTAACCAAAATGGAGAATTTGTATCCATGTGGACGACATAAGA
CGATTGTTTTCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5762Contig1 959 2 8 U
GACTATCGGTAACTTTCATCTCCTCTCTCTCTCTCTTTTCTGTTCTTTCCTGTTTTGTTT
TCTCCGACCCAGTCGAATCAAAAGGATAAGCTTGTGTGTTTGTTTTATTTTGTTTATTCG
TATGCAGATATGGTGAAGTTTCACCAAACGTGCGATCCTGAGAAGGAGAACTTGTCTCTG
TATGGACTTCCAAATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGCAGAGGAAGTTCCTCCTGAG
CTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGGACTGG
GTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACTTTGGT
GCACGTTTCGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACGATCTC
CCAACCATTTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATCCAAAGATCATTCTGGTACC
AATAACAACAATAGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGAAGGTTTCGAAGATGTCATCTCCA
TTGCCTAAAGAAGAAGATGAGAGTGAAGACGAGGAAGAACAAGGTGCGGTTTGTGGCGCT
TGTGGAGACAACTACGGTACAGATGAGTTTTGGATATGCTGTGACGCGTGTCAGAAATGG
TTCCATGGAAAATGTGTCCAGATTACACCTGCAAAAGCAGAGCACATCAAGCACTACAAG
TGCCCAAGTTGCACTAACAAGAGAGCCAGACCTTGATGTTACTTAAACAACCAGAAGAAA
AAGAAAGAAAAGGTTAAAAGTCGGATGAATTTTCTTCTTGTTAATGTCAATACTACAAAT
ACTAATGTGCATGTTTGAGGTTATTTTAGTCCTTTTCGTCTACACTAATTGTTGTTTTTG
GTCATATGCTTTTACGTTTTTTATTAGTTAACACAGTCTAAAGTTGAAAGATTCTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CZ82TF U 1
AF RR4CZ82JQ C 510
BS 1 671 RR4CZ82TF
BS 672 672 RR4CZ82JQ
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TCTCCGACCCAGTCGAATCAAAAGGATAAGCTTGTGTGTTTGTTTTATTTTGTTTATTCG
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TATGGACTTCCAAATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGCAGAGGAAGTTCCTCCTGAG
CTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGGACTGG
GTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACTTTGGT
GCACGTTTCGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACGATCTC
CCAACCATTTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATCCAAAGATCATTCTGGTACC
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TGCCCAAGTTGCACTAACAAGAGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4CZ82JQ 450 0 0
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CGAGGAAGAACAAGGTGCGGTTTGTGGCGCTTGTGGAGACAACTACGGTACAGATGAGTT
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TGCAAAAGCAGAGCACATCAAGCACTACAAGTGCCCAAGTTGCACTAACAAGAGAGCCAG
ACCTTGATGTTACTTAAACAACCAGAAGAAAAAGAAAGAAAAGGTTAAAAGTCGGATGAA
TTTTCTTCTTGTTAATGTCAATACTACAAATACTAATGTGCATGTTTGAGGTTATTTTAG
TCCTTTTCGTCTACACTAATTGTTGTTTTTGGTCATATGCTTTTACGTTTTTTATTAGTT
AACACAGTCTAAAGTTGAAAGATTCTGGAC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL5763Contig1 1261 2 2 U
GGATGGACTCTCTGGTAGCGAGCTACGCTTCGTCGGACGAAGAAGAAGAACCCCAACTAC
CTACCCAATCTCTCACCGTAAAATCATCCTCCTCCTCCTTGTTCTCAGCTATTCCTCAAC
CTAACCAATCCAGATCCGAGGCTTTTGATTCATCTTCATCCTCTACTCGAGGAAAGTCTT
CTTCTTCGTCTTTCCTCTCCTCTCTCCCTCCTCCCAAATCCCGCCAACAAAACCCATCTC
CCTCCTTACCCAAACGCGTCGTTCAGATCAAGCTTCCCGTAAACCCTAATCTCGATGACG
ACGAAGACGACGAAGAAGAAGAGGAGAAAGCGAGGAAGAAGCGCAGACAGATGGAAGCCG
CTGCTGCGGCATCGAACAATTCGTCGGTGAAATCGTTCTTATCCGCCATGCCTGCTCCAA
AGAGCTCTCAAGCACTCGGGGCTCTTCCTTCGTTAGGATCAGGATCAGGAACGGGCCGAA
GATCGATTCTTGAAACAGAGACGCCTGCGATTACTCAAAGTACTGATCAAACGCAGTCGT
TTAGTAGTAGCGAGACGGAACAAGTAGATAACTATTATGCTGGTTACGGTGGATACGAGC
AAAACCCTAGTGCAAATGTAGAGGCTTTTGGTTATGAGCAGAACCCTAGTGGAAGTGGAG
ATATGTCTGGTTATGGTGGGTATGAGCAGAACCCTAGTGGAAGTGGAGATGTGTCTGGTT
ATGTGGGGTATGATGGTGGAGGTGGTGGTAATGCTTGGAACGGTGGTGGTGGGTTTGAGG
GGACGAGGGGAGTGCCTGAGGCGTTTATAGCGATGGATAGTGGGGCGAGGAGAGGGAGGA
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CTGCGTTATTCATGGACATGAAGCACAAGGAGTCGGAGCTAGCAGAGAGACGTTCTAAAG
GACTGCTCACTAAAGCTGAGACGCAAGCTAAATATGGATGGTGATTTGCTCTTTGTTTCT
CTCAATCTTGTGAGGTTGGCAACAGATTTTCTGTAACTTTTTTTTTTTACTTTACCATCT
TCCAAAGTCCAAGCTTTGAATGTGATACTCATTTTACTTATATGAATGAATCTGTACTCA
G


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4AI61TF U 1
AF RR4AI61JQ C 633
BS 1 759 RR4AI61TF
BS 760 1261 RR4AI61JQ

RD RR4AI61TF 759 0 0
GGATGGACTCTCTGGTAGCGAGCTACGCTTCGTCGGACGAAGAAGAAGAACCCCAACTAC
CTACCCAATCTCTCACCGTAAAATCATCCTCCTCCTCCTTGTTCTCAGCTATTCCTCAAC
CTAACCAATCCAGATCCGAGGCTTTTGATTCATCTTCATCCTCTACTCGAGGAAAGTCTT
CTTCTTCGTCTTTCCTCTCCTCTCTCCCTCCTCCCAAATCCCGCCAACAAAACCCATCTC
CCTCCTTACCCAAACGCGTCGTTCAGATCAAGCTTCCCGTAAACCCTAATCTCGATGACG
ACGAAGACGACGAAGAAGAAGAGGAGAAAGCGAGGAAGAAGCGCAGACAGATGGAAGCCG
CTGCTGCGGCATCGAACAATTCGTCGGTGAAATCGTTCTTATCCGCCATGCCTGCTCCAA
AGAGCTCTCAAGCACTCGGGGCTCTTCCTTCGTTAGGATCAGGATCAGGAACGGGCCGAA
GATCGATTCTTGAAACAGAGACGCCTGCGATTACTCAAAGTACTGATCAAACGCAGTCGT
TTAGTAGTAGCGAGACGGAACAAGTAGATAACTATTATGCTGGTTACGGTGGATACGAGC
AAAACCCTAGTGCAAATGTAGAGGCTTTTGGTTATGAGCAGAACCCTAGTGGAAGTGGAG
ATATGTCTGGTTATGGTGGGTATGAGCAGAACCCTAGTGGAAGTGGAGATGTGTCTGGTT
ATGTGGGGTATGATGGTGGAGGTGGTGGTAATGCTTGGA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4AI61JQ 629 0 0
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CCTAGTGGAAGTGGAGATGTGTCTGGTTATGTGGGGTATGATGGTGGAGGTGGTGGTAAT
GCTTGGAACGGTGGTGGTGGGTTTGAGGGGACGAGGGGAGTGCCTGAGGCGTTTATAGCG
ATGGATAGTGGGGCGAGGAGAGGGAGGAGAGGGAGGAATGATTTTCCGACGGAGATTGTT
GAGGTTAAGCAGGATGAGCTCATGAAGAATAGGCCGAGAGTTGATCAGGTTAAATCTACT
GGGATTGCCTTCGGTCCTACGTATCAGCCTGAGTCGTCTTCATCTAAGGGGAAAGTGTCA
AAGCTTCACAAGAGAAAGCATCAGATCACTGCGTTATTCATGGACATGAAGCACAAGGAG
TCGGAGCTAGCAGAGAGACGTTCTAAAGGACTGCTCACTAAAGCTGAGACGCAAGCTAAA
TATGGATGGTGATTTGCTCTTTGTTTCTCTCAATCTTGTGAGGTTGGCAACAGATTTTCT
GTAACTTTTTTTTTTTACTTTACCATCTTCCAAAGTCCAAGCTTTGAATGTGATACTCAT
TTTACTTATATGAATGAATCTGTACTCAG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL5764Contig1 765 2 2 U
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CTCTAAGTTCATAAGAAAATGGAAGGAAGACAATATTACCCTCCAAGAGAAAACGTCGAC
GGGAACAGAACAGCCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACCTGTTCCTTATCTT
TTTGGTGGTTTGGCAGCGATGCTTGGTCTCATAGCTTTCGCTCTTCTGATCCTCGCCTGC
TCTTACTGGCGTCTCTCCGGTTATCTCGACGGTGAGGAGGAGCAGAGCAGAGAGAGAGAT
CTTGAAGCTGGATATGTGAAACCCGATAAAGCGGTGAAGGCTGTACCTTTGCCGGAGAAG
TTCTTGGTGATTATGGCCGGAGACGTCAAACCCACTTACTTGGCGACGCCGGCTGAAAAG
AGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGATGGTGATGATGACGTGAAGGATGGTGATCAGGCG
GTGCGTCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACATTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAA
CAGAGGCTCGTCTTAGGTGAACAGTTCATGATAACTGTTTGCATCTAACCCGGTTGCTTC
TGGTATTCGGATCGGGTCTGGTCAGAGCTCTACATGATGAGATTTATAGGCTATATAGTC
AAAACTAGAAAAAAGGGAATTGGTTCTGATTAATGTTATTTAATCTCAGCTTTTTGCATT
AATTTACTTAGGCTTTTTAAGTTGTAAGTTTGTAATTCATCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DO62TF U 1
AF RR4DO62JQ C 440
BS 1 660 RR4DO62TF
BS 661 765 RR4DO62JQ

RD RR4DO62TF 660 0 0
GGACCAAAAACATTTTCTATTTAGAAAAAGAAAACTCAAAACCACTTTTTTTTTCTCTCT
CTCTAAGTTCATAAGAAAATGGAAGGAAGACAATATTACCCTCCAAGAGAAAACGTCGAC
GGGAACAGAACAGCCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACCTGTTCCTTATCTT
TTTGGTGGTTTGGCAGCGATGCTTGGTCTCATAGCTTTCGCTCTTCTGATCCTCGCCTGC
TCTTACTGGCGTCTCTCCGGTTATCTCGACGGTGAGGAGGAGCAGAGCAGAGAGAGAGAT
CTTGAAGCTGGATATGTGAAACCCGATAAAGCGGTGAAGGCTGTACCTTTGCCGGAGAAG
TTCTTGGTGATTATGGCCGGAGACGTCAAACCCACTTACTTGGCGACGCCGGCTGAAAAG
AGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGATGGTGATGATGACGTGAAGGATGGTGATCAGGCG
GTGCGTCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACATTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAA
CAGAGGCTCGTCTTAGGTGAACAGTTCATGATAACTGTTTGCATCTAACCCGGTTGCTTC
TGGTATTCGGATCGGGTCTGGTCAGAGCTCTACATGATGAGATTTATAGGCTATATAGTC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4DO62JQ 326 0 0
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GTAACGGTGCGACACATTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAACAGAGGCTCGTCTTAGGTG
AACAGTTCATGATAACTGTTTGCATCTAACCCGGTTGCTTCTGGTATTCGGATCGGGTCT
GGTCAGAGCTCTACATGATGAGATTTATAGGCTATATAGTCAAAACTAGAAAAAAGGGAA
TTGGTTCTGATTAATGTTATTTAATCTCAGCTTTTTGCATTAATTTACTTAGGCTTTTTA
AGTTGTAAGTTTGTAATTCATCAGTC

QA 1 326 1 326
DS 



AS 1 2

CO CL5765Contig1 612 2 1 U
AAAGAAAGGCTCTGCTGCTTCTTCTCAGTTTCTATCTTTCAGGGCATCTCAAGATGACAG
ACATAGAAAGCCTGGAAACTATCATCCTCTCCCACACTCTGGTTCCTTCATGCCATCATC
AGTAGCAGCAGATGTATACGATTCTAACCGGAACACTCCTTACAGTTCTGTACAGGGAGC
CCAGGATGTTCCCTAATTTGTAATCAACAGCAAATCTATCTCAGTTTTCCATGGCCAGGC
CGGGTCTCCAGTCTCATTATGCACCAGGAGGAAAAAGCTTCATGAGCAATGGCATAAACT
CACAACCTTATGCAGTAGTTCCTATCATGGCACCTCCAATCTCAGTCCTTCCTGCTCCAG
GTTCCATTTGTAGGGACAACTGATATTAGATCTTCTTCCAAGCCATTAGGATCACCAACT
CAGTTGACCATCTTTTTATGCCGGTTCAGTTTGTGTTTATGATGACATATCTCCTGACAA
GGCCAAGGCGATAATGTTGCTTGCTGGAAACGGTTCCTCTATGCCTCAAGCCTTCTCACC
ACCTCAAACGCATCATCAACAAGTCATCCACCATCATGCTCGTGCCTCTGTTGATTCTTC
TTCAGCTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A126TFB U 249
AF RR4A126TF U 1
BS 1 612 RR4A126TF

RD RR4A126TFB 230 0 0
CAGTCTCATTATGCACCAGGAGGAAAAAGCTTCATGAGCAATGGCATAAACTCACAACCT
TATGCAGTAGTTCCTATCATGGCACCTCCAATCTCAGTCCTTCCTGCTCCAGGTTCCATT
*GTAGGGACAACTGATATTAGATCTTCTTCCAAGCCATTAGGATCACCAACTCAGTTGAC
CATCTTTT*ATGCCGGTTCAGTTTGTGTTTATGATGACATATCTCCTGAC

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR4A126TF 612 0 0
AAAGAAAGGCTCTGCTGCTTCTTCTCAGTTTCTATCTTTCAGGGCATCTCAAGATGACAG
ACATAGAAAGCCTGGAAACTATCATCCTCTCCCACACTCTGGTTCCTTCATGCCATCATC
AGTAGCAGCAGATGTATACGATTCTAACCGGAACACTCCTTACAGTTCTGTACAGGGAGC
CCAGGATGTTCCCTAATTTGTAATCAACAGCAAATCTATCTCAGTTTTCCATGGCCAGGC
CGGGTCTCCAGTCTCATTATGCACCAGGAGGAAAAAGCTTCATGAGCAATGGCATAAACT
CACAACCTTATGCAGTAGTTCCTATCATGGCACCTCCAATCTCAGTCCTTCCTGCTCCAG
GTTCCATTTGTAGGGACAACTGATATTAGATCTTCTTCCAAGCCATTAGGATCACCAACT
CAGTTGACCATCTTTTTATGCCGGTTCAGTTTGTGTTTATGATGACATATCTCCTGACAA
GGCCAAGGCGATAATGTTGCTTGCTGGAAACGGTTCCTCTATGCCTCAAGCCTTCTCACC
ACCTCAAACGCATCATCAACAAGTCATCCACCATCATGCTCGTGCCTCTGTTGATTCTTC
TTCAGCTATGCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL5766Contig1 1433 2 2 U
GGGGACCCTCTTGGAAGTTGTCCAATTCCTCACTGATATGAATCTTGTCATCAAGAAAGC
TTACATCTCTTCTGATGGCGGTTGGTTCATGGACGTCTTCAAAGTCATCCACCAAGATGG
CAACAAGATCACTGACACTCAACTCCTTGACTTTATCCAAATGGTACCTACTCACATACT
TAGCTTCTCTTCGGTGGTGTATGTATGTATGTATGTATGTGTAAAAAAAGGTTGTTGGAA
CAATAATCAGAGGATAGAGCGCAACGCTGGCTGGTTTATTCCACCTTTAAGAAGCTCAGT
TGGTGTCATGCCCTCTGACGAATACACCACCATTGAGCTCGCTGGAACCGATAGACCCGG
TCTCTTGTCTGAAGTATCTGCTGTTCTCACAGACCTTCACTGCAACGTTGTCAACGCTGA
GATATGGACTCACAACACCAGAGCTGCTGCGGTTCACGTCACCGACAATACTACTACTTC
AGCTATTACGGACCCAATCCGCCTTTCCACCATCAAACATCTGCTGTGCAATGTATTTAG
GACCAACAGCGGCTCCAGGGCTGCAAAAACCGTCTTTTCTTCTTCTGATACACACAGGGA
GAGGCGCTTGCATCAGATCATGTTTGATGACAGGGATTACGAGGGAGTCAAAAGACCAAG
GACATCAAGGCCCTGTGTCACACTAACAAACATTGACAAGGATTATACCGTTGTTACCAT
GAGGTCCAAAGATAGACCAAAGCTTGTGTTTGACGTTGTCTGTACCTTGACTGATATGCA
GTATGTGGTGTTCCATGGCATGGTCAGCACAGAACCACTAGAGGCTTATCAGGAGTTTTA
CATCCGTCATGTAGATGGACTTCCCATAAACTCAGAAGCCGAGCAAGACCGTGTTATCCA
ATGTCTTGAAGCAGCCATTGAGAGAAGAACCTCCGAGGGTTTAGAGCTGGAATTATCAGC
AGAAGACAGAGTTGGTCTTCTCTCAGACATAACCAGAACATTCCGAGAGAACAGCTTAAC
TATTGTGAGAGCAGAGATTTCAACGCGAGAGGGTAAGGCTAAAGATACCTTTTACGTTAC
AGACGTAACAGGAAACGCTGTTGAATCAAAAATCGTGGAGTCAATAAGGAAAGAGATAGG
AGTAAGCAAGCTGAAGGCGAAGGTGAAGCAGACCGAGGAATGCTCTGTTCTTGGTACAAG
CAGGGCTTCGCAAGAAACAACAATGGGGTATTTGCTTAGCAACATCTTCAAATCTAAGCC
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AAAGTAGCCCGTCTTCTGAAACAAATGTGGAGAAATCCTCTTTTTTTTTGGGT


BQ
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BS 792 1433 RR4B063JQ

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CAATAATCAGAGGATAGAGCGCAACGCTGGCTGGTTTATTCCACCTTTAAGAAGCTCAGT
TGGTGTCATGCCCTCTGACGAATACACCACCATTGAGCTCGCTGGAACCGATAGACCCGG
TCTCTTGTCTGAAGTATCTGCTGTTCTCACAGACCTTCACTGCAACGTTGTCAACGCTGA
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AGCTATTACGGACCCAATCCGCCTTTCCACCATCAAACATCTGCTGTGCAATGTATTTAG
GACCAACAGCGGCTCCAGGGCTGCAAAAACCGTCTTTTCTTCTTCTGATACACACAGGGA
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GACATCAAGGCCCTGTGTCACACTAACAAACATTGACAAGGATTATACCGTTGTTACCAT
GAGGTCCAAAGATAGACCAAAGCTTGTGTTTGACGTTGTCTGTACCTTGACTGATATGCA
GTATGTGGTGT

QA 1 791 1 791
DS 

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GATTACGAGGGAGTCAAAAGACCAAGGACATCAAGGCCCTGTGTCACACTAACAAACATT
GACAAGGATTATACCGTTGTTACCATGAGGTCCAAAGATAGACCAAAGCTTGTGTTTGAC
GTTGTCTGTACCTTGACTGATATGCAGTATGTGGTGTTCCATGGCATGGTCAGCACAGAA
CCACTAGAGGCTTATCAGGAGTTTTACATCCGTCATGTAGATGGACTTCCCATAAACTCA
GAAGCCGAGCAAGACCGTGTTATCCAATGTCTTGAAGCAGCCATTGAGAGAAGAACCTCC
GAGGGTTTAGAGCTGGAATTATCAGCAGAAGACAGAGTTGGTCTTCTCTCAGACATAACC
AGAACATTCCGAGAGAACAGCTTAACTATTGTGAGAGCAGAGATTTCAACGCGAGAGGGT
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GTGGAGTCAATAAGGAAAGAGATAGGAGTAAGCAAGCTGAAGGCGAAGGTGAAGCAGACC
GAGGAATGCTCTGTTCTTGGTACAAGCAGGGCTTCGCAAGAAACAACAATGGGGTATTTG
CTTAGCAACATCTTCAAATCTAAGCCTAGTCTCCGGTAACTTCCAGCTCACTCATAATTG
TCTCATGGAGTATGTGCTCTTGTATAGATAACAAAACTATTATTAGACAGGATTAGGTAA
GGCATCATAAGCTAAGCTGGTTGCAAAAAGTAGCCCGTCTTCTGAAACAAATGTGGAGAA
ATCCTCTTTTTTTTTGGGT

QA 1 859 1 859
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTCAAGTTCTAGGATGCGTCCAAGTCGATCAGTCCACTGTTGCAATCAAAGAGACGTTCG
GGAAGTTCGACGACGTTCTCGAGCCAGGTTGTCACTGTTTGCCCTGGTGCATAGGGAGTC
AAGTCGCTGGTCACCTTTCCCTGCGTGTTCAACAGCTCGATGTTCGCTGCGAGACCAAAA
CTAAAGATAATGTGTTTGTCACCGTCGTTGCTTCCATTCAGTACCGTGCTTTAGCTGAGA
GTGCTCAAGATGCTTTTTACAAGCTCAGCAACACCAGGAATCAGATTCAAGCTTATGTCT
TTGACGTGATCCTAGCAAGTGTGCCTAAGCTGGATCTAGACTCAACCTTTGAGCAGAAGA
ACGACATTGCCAAAACCGTTGAGAGTGAGCTCGAAAAGGCTATGTCGCATTACGGGTATG
AGATAGTCCAGACGCTTATTGTGGACATCGAGCCTGATGTGCATGTCAAGAGAGCTATGA
ATGAGATCAACGCTGCTTCGAGAATGAGAGAGGCAGCTAGTGAGAAAGCAGAAGCAGAGA
AGATACTTCAGATCAAGAGAGCCGAAGGAGAAGCTGAGTCCAAGTACCTTTCGGGTCTCG
GTATAGCACGTCAGAGACAAGCCATCGTGGACGGTCTGAGGAACAGCGTGCTGGCCTTCT
CCGAGTCTGTTCCAGGGACGTCTTCCAAGGACGTCATGGACATGGTTCTGGTCACTCAGT
ACTTTGATACTTTGAAGGAGATTGGTGCGTCTTCGAAGTCGAACTCGGTGTTCATACCGC
ACGGTCCGGGTGCTGTTAAGGACATTGCTTCGCAGATCAGGGATGGTCTTCTTCAGGGAA
ACGCTGCTGCTGAGTGATTATGAGTGAGTGATGAGAGATTTTAATAAGTACAAAAGCCTT
TTCTTCTGGGTGGTTTAGTTGGTGTTGCTACTTATTTATTTTTCTTTTAGCGGTTGGGCT
TTTCTAGTATTGAAGTCCTTATGGATTGCTTATCGTTGGTAGACTGGATCATGTTTATGG
TTTTGGGCTTTGATAGTATATGACGCAATTTGGGTCG


BQ
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BS 694 1117 RR4DF13JQ

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GGAAGTTCGACGACGTTCTCGAGCCAGGTTGTCACTGTTTGCCCTGGTGCATAGGGAGTC
AAGTCGCTGGTCACCTTTCCCTGCGTGTTCAACAGCTCGATGTTCGCTGCGAGACCAAAA
CTAAAGATAATGTGTTTGTCACCGTCGTTGCTTCCATTCAGTACCGTGCTTTAGCTGAGA
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TTGACGTGATCCTAGCAAGTGTGCCTAAGCTGGATCTAGACTCAACCTTTGAGCAGAAGA
ACGACATTGCCAAAACCGTTGAGAGTGAGCTCGAAAAGGCTATGTCGCATTACGGGTATG
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GTATAGCACGTCAGAGACAAGCCATCGTGGACG
TCTG

QA 1 693 1 693
DS 

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CTCAGTACTTTGATACTTTGAAGGAGATTGGTGCGTCTTCGAAGTCGAACTCGGTGTTCA
TACCGCACGGTCCGGGTGCTGTTAAGGACATTGCTTCGCAGATCAGGGATGGTCTTCTTC
AGGGAAACGCTGCTGCTGAGTGATTATGAGTGAGTGATGAGAGATTTTAATAAGTACAAA
AGCCTTTTCTTCTGGGTGGTTTAGTTGGTGTTGCTACTTATTTATTTTTCTTTTAGCGGT
TGGGCTTTTCTAGTATTGAAGTCCTTATGGATTGCTTATCGTTGGTAGACTGGATCATGT
TTATGGTTTTGGGCTTTGATAGTATATGACGCAATTTGGGTCG

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5769Contig1 1217 2 4 U
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GCGTGTGCCTGCGGTTTATGGAGTGGGTTTGCGGTTAACACCAGGGAGAGTAAGTGTGTT
GAGCGATGGTTCAGTAGTTGTTGAGGTTCCAGGGATTGAGATAGGACAAGGGCTATGGAC
GAAGGTGAAACAGATGGCCGCATTCTCACTTGGGCTGATCCAGTGTAGTACTACAAGCGA
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GGTAACTGGTGGTAGCACCAGCTCTGAAGCTAGTAGTGAAGCTGTGAGGATTTGCTGCGG
TGGCTTAGTTGAGAGGCTGTTACCTGTCAAGACTGCTTTGGAGGAGAAAACAGGAGGACC
TGTGACTTGGGATAGTCTCATCAGTCAGGCTTATATGCAATCGGTGAACATGTCAGTTAG
TAACACTTACTCGCCAGACTTCGGCACTCAGTACCTTAACTATGGAGTTGCAGCGAGCGA
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TTGCGGGAAAAGTCTCAACCCTGCTGTGGATTTAGGACAGATTGAAGGAGCATTTGTTCA
AGGACTTGGGTTCTTCATGCTTGAAGAGTACCTAATGAACTCAGACGGTCTCATAGTAAC
AGACAGCACATGGACTTACAAGATCCCAACGGTCGACACAATCCCAAGACAGTTTAATGT
CGAGATTCTCAACAGTGGACACCACAAGAACCGTGTTCTTTCATCCAAAGCTTCTGGTGA
ACCGCCATTGCTTTTAGCGTCTTCTGTTCACTGTGCTGTCCGAGCAGCTGTTAAAGAAGC
TAAGAAACAGACTGTGACATGGAGTGATGATAACCAAGAAGGGGTTGTTGATCTGAGCTT
TGAATTGCCTGTTCCAGCAACAATGCCTGTTGTGAAGGAGCTTTGTGGACTCAATGTTGT
TGAGAAATACTTGGACTGGAAAATCAAGCAGAGGAAGAACATTTGATAGCTTGTGTGTTG
TGTTTCTGTTGTGAATGTAATTGCTCTGTTTATTTGAAGTGCTTGCAACAGTTGTTATGT
TTGCATAATGATGTTCTTGATTATGTGATCAAAACCGGTTTTTGTAATAAGCTGCAACTT
AAAAAACCTCTTCAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB69TF U 1
AF RR4CB69JQ C 424
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RD RR4CB69TF 642 0 0
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GCGTGTGCCTGCGGTTTATGGAGTGGGTTTGCGGTTAACACCAGGGAGAGTAAGTGTGTT
GAGCGATGGTTCAGTAGTTGTTGAGGTTCCAGGGATTGAGATAGGACAAGGGCTATGGAC
GAAGGTGAAACAGATGGCCGCATTCTCACTTGGGCTGATCCAGTGTAGTACTACAAGCGA
TGAGCTTCTCGAGAAGATACGTGTCATCCAAGCTGATACATTGAGTATGGTGCAAGGCTC
GGTAACTGGTGGTAGCACCAGCTCTGAAGCTAGTAGTGAAGCTGTGAGGATTTGCTGCGG
TGGCTTAGTTGAGAGGCTGTTACCTGTCAAGACTGCTTTGGAGGAGAAAACAGGAGGACC
TGTGACTTGGGATAGTCTCATCAGTCAGGCTTATATGCAATCGGTGAACATGTCAGTTAG
TAACACTTACTCGCCAGACTTCGGCACTCAGTACCTTAACTATGGAGTTGCAGCGAGCGA
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TTGCGGGAAA*GTCTCAACCCTGCTGTGGATTTAGGACAGAT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4CB69JQ 794 0 0
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CACTTACTCGCCAGACTTCGGCACTCAGTACCTTAACTATGGAGTTGCAGCGAGCGAGGT
TGAAGTAAACATTTTGACTGGTGAAACAACGGTTCTGCGCACGGATATTATCTATGATTG
CGGGAAAAGTCTCAACCCTGCTGTGGATTTAGGACAGATTGAAGGAGCATTTGTTCAAGG
ACTTGGGTTCTTCATGCTTGAAGAGTACCTAATGAACTCAGACGGTCTCATAGTAACAGA
CAGCACATGGACTTACAAGATCCCAACGGTCGACACAATCCCAAGACAGTTTAATGTCGA
GATTCTCAACAGTGGACACCACAAGAACCGTGTTCTTTCATCCAAAGCTTCTGGTGAACC
GCCATTGCTTTTAGCGTCTTCTGTTCACTGTGCTGTCCGAGCAGCTGTTAAAGAAGCTAA
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ATTGCCTGTTCCAGCAACAATGCCTGTTGTGAAGGAGCTTTGTGGACTCAATGTTGTTGA
GAAATACTTGGACTGGAAAATCAAGCAGAGGAAGAACATTTGATAGCTTGTGTGTTGTGT
TTCTGTTGTGAATGTAATTGCTCTGTTTATTTGAAGTGCTTGCAACAGTTGTTATGTTTG
CATAATGATGTTCTTGATTATGTGATCAAAACCGGTTTTTGTAATAAGCTGCAACTTAAA
AAACCTCTTCAACC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL5770Contig1 1126 2 6 U
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GCAAATTAGGGTAAAAAAAAGTGGGAATGGTGGCGGACAACAAGAGCAAGAAGGCGAAGA
CTGATGAGGAGAACGCCGAGCAAATCGACGGAGAGCTTCTCCTTTCTATCGGAAAGCTTC
AGTCCATTCAAGACGACCTCGAGAAGATAAACGAGAAGGCTAGCGATGAAGTGTTGGAAG
TGGAGCAGAAGTACAACTGTATAAGGAAGCCTGTCTATGACAAGCGTGCCGATATCATCA
AAGCCATCCCTGATTTCTGGCTCACTTCTTTCTTGAGCCACCCTGCTCTCGGTGATCTTT
TGACTGAAGAAGACCAAAAGATATTCAAATATCTAAGCTCTCTGGATGTTGAGGATGCCA
AAGATGTGAAGTCTGGATACTCTATCACTTTTAACTTCAATGCCAACCCTTATTTTGAGG
ATGGGAAACTAACCAAGACCTTTACCTTCCTCGACGAAGGGACAACCAAAATCACAGCCA
CACCTATCAAGTGGAAAGAGGGCAAGGGCTTGCCAAATGGTGTGGACCACGAGAAGAATG
GAAACAAACGTGCATTGCCTGAAGAGAGTTTCTTTACCTGGTTTAGCGATGGTCAACACA
AGGAAGAAGACGTTGAAGTTGAGATTCACGACGAGGTTGCGGATATCATCAAGGAAGATT
TATGGGCCAACCCTCTCACCTACTTCAACAATGAGGCTGATGAAGAGGATTTTGATGATG
AAGATGATGAGGGGGAAGGTGATTTTGATGAAGACGATGAAGGAGAAGGCGAAGATGGTG
AGGAATGATGGGAGAGGCTTCCCCCGGAAACCACATTTGCTTACATGTCTTCTTTTATAA
CAGAGTGTGTTGAAAGTTTTTTAATTTTAATCAAAATGGCTCATGACAATAACATACAAG
ACTTAGCTTTTTCAATGCTTCGAGAAAAAGATACATTTTTAGCTATTTTAATCCTTTGTT
TCTAGGAGTACCATTTTCAATCTTTTGTTTGCAGAGTCCTGCTTAAATTGTTTTTATCGT
CTTTTACTGTTCTTATATAATAGTATCTCCTCTCTTCTCTGTGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EM67TF U 1
AF RR4EM67JQ C 513
BS 1 667 RR4EM67TF
BS 668 668 RR4EM67JQ
BS 669 713 RR4EM67TF
BS 714 715 RR4EM67JQ
BS 716 739 RR4EM67TF
BS 740 1126 RR4EM67JQ

RD RR4EM67TF 739 0 0
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GCAAATTAGGGTAAAAAAAAGTGGGAATGGTGGCGGACAACAAGAGCAAGAAGGCGAAGA
CTGATGAGGAGAACGCCGAGCAAATCGACGGAGAGCTTCTCCTTTCTATCGGAAAGCTTC
AGTCCATTCAAGACGACCTCGAGAAGATAAACGAGAAGGCTAGCGATGAAGTGTTGGAAG
TGGAGCAGAAGTACAACTGTATAAGGAAGCCTGTCTATGACAAGCGTGCCGATATCATCA
AAGCCATCCCTGATTTCTGGCTCACTTCTTTCTTGAGCCACCCTGCTCTCGGTGATCTTT
TGACTGAAGAAGACCAAAAGATATTCAAATATCTAAGCTCTCTGGATGTTGAGGATGCCA
AAGATGTGAAGTCTGGATACTCTATCACTTTTAACTTCAATGCCAACCCTTATTTTGAGG
ATGGGAAACTAACCAAGACCTTTACCTTCCTCGACGAAGGGACAACCAAAATCACAGCCA
CACCTATCAAGTGGAAAGAGGGCAAGGGCTTGCCAAATGGTGTGGACCACGAGAAGAATG
GAAACAAACGTGCATTGCCTGAAGAGAGTTTCTTTACCTGGTTTAGCGATGGTCAACACA
AGGAAGA*GACGTTGAAGTTGAGATTCACGACGAGGTTGCGGATATCATCAAG**AGATT
TATGGGCCAACCCTCTCAC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4EM67JQ 614 0 0
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CCAAATGGTGTGGACCACGAGAAGAATGGAAACAAACGTGCATTGCCTGAAGAGAGTTTC
TTTACCTGGTTTAGCGATGGTCAACACAAGGAAGAAGACGTTGAAGTTGAGATTCACGAC
GAGGTTGCGGATATCATCAAGGAAGATTTATGGGCCAACCCTCTCACCTACTTCAACAAT
GAGGCTGATGAAGAGGATTTTGATGATGAAGATGATGAGGGGGAAGGTGATTTTGATGAA
GACGATGAAGGAGAAGGCGAAGATGGTGAGGAATGATGGGAGAGGCTTCCCCCGGAAACC
ACATTTGCTTACATGTCTTCTTTTATAACAGAGTGTGTTGAAAGTTTTTTAATTTTAATC
AAAATGGCTCATGACAATAACATACAAGACTTAGCTTTTTCAATGCTTCGAGAAAAAGAT
ACATTTTTAGCTATTTTAATCCTTTGTTTCTAGGAGTACCATTTTCAATCTTTTGTTTGC
AGAGTCCTGCTTAAATTGTTTTTATCGTCTTTTACTGTTCTTATATAATAGTATCTCCTC
TCTTCTCTGTGTTT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL5771Contig1 808 2 1 U
GGAGACAAATCGGCAAAACATTAATTGCGGTCAACGGGGGGTCTTCTGATTGTACCGACG
CCGGTACACGCCACGAGAGCCATAAGGTTCCTAATTTCTCCTCCGTGCAACGATGTCGGA
GACTCGCCGGAGTCAATCTAACCATGAACGAATCGACAACTCCGAGAATCAACACGGAAG
AGTTGTAATAGAGAACAGTGATGGTGAGAAACTCGTTGGAGTTTTGCAAGATACCGGCTC
AACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGATTCCAATCATCGAAGGATCGTATCCCCATGAG
GACAATAGCTAATGTTTTTGAAAGAGCAAAGATCACTACTTTCCGGTTTGATTTCGCTGG
CAACGGGGAAAGCCAAGGATCATTTCAGTATGGTAACTATCGCCGCGAAGCTGAAGATCT
GCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGGGAAAACCGTGTGATTTCTGCAATTATCGGACA
TAGTAAAGGTGGGAATGTGGTGCTTTTGTATGCAGCAAAGTACAAGGATGTGGATATTGT
TGTGAACATCTCAGGACGGTTTTTTCTAGAGAGGGGAATAGAAGGGCGGCTTGGTAAGGA
CTACATTAAGAGAATCAAAGAGAATGGGTTCATCGATGTTAGGAACAGAAAGGGAAAGTT
TGAATATAGAGTAACCAAAGAGAGTCTAGTGGACCGTCTCACAACCAATACTCATGAAGC
ATGTCTCTCAATTCATGAAAACTGCAGGTGTTAACAGTTCATGGGTTAAACGATAAAATC
GTGTCTGTGACAGAAGCATCTGAATTCG


BQ
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AF RR4A159TFB U 1
AF RR4A159TF U 1
BS 1 808 RR4A159TF

RD RR4A159TFB 744 0 0
GGAGACAAATCGGCAAAACATTAATTGCGGTCAACGGGGGGTCTTCTGATTGTACCGACG
CCGGTACACGCCACGAGAGCCATAAGGTTCCTAATTTCTCCTCCGTGCAACGATGTCGGA
GACTCGCCGGAGTCAATCTAACCATGAACGAATCGACAACTCCGAGAATCAACACGGAAG
AGTTGTAATAGAGAACAGTGATGGTGAGAAACTCGTTGGAGTTTTGCAAGATACCGGCTC
AACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGATTCCAATCATCGAAGGATCGTATCCCCATGAG
GACAATAGCTAATGTTTTTGAAAGAGCAAAGATCACTACTTTCCGGTTTGATTTCGCTGG
CAACGGGGAAAGCCAAGGATCATTTCAGTATGGTAACTATCGCCGCGAAGCTGAAGATCT
GCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGGGAAAACCGTGTGATTTCTGCAATTATCGGACA
TAGTAAAGGTGGGAATGTGGTGCTTTTGTATGCAGCAAAGTACAAGGATGTGGATATTGT
TGTGAACATCTCAGGACGGTTTTTTCTAGAGAGGGGAATAGAAGGGCGGCTTGGTAAGGA
CTACATTAAGAGAATCAAAGAGAATGGGTTCATCGATGTTAGGAACAGAAAGGGAAAGTT
TGAATATAGAGTAACCAAAGAGAGTCTAGTGGACCGTCTCACAACCAATACTCATGAAGC
ATGTCTCTCAATTCATGAAAACTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4A159TF 808 0 0
GGAGACAAATCGGCAAAACATTAATTGCGGTCAACGGGGGGTCTTCTGATTGTACCGACG
CCGGTACACGCCACGAGAGCCATAAGGTTCCTAATTTCTCCTCCGTGCAACGATGTCGGA
GACTCGCCGGAGTCAATCTAACCATGAACGAATCGACAACTCCGAGAATCAACACGGAAG
AGTTGTAATAGAGAACAGTGATGGTGAGAAACTCGTTGGAGTTTTGCAAGATACCGGCTC
AACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGATTCCAATCATCGAAGGATCGTATCCCCATGAG
GACAATAGCTAATGTTTTTGAAAGAGCAAAGATCACTACTTTCCGGTTTGATTTCGCTGG
CAACGGGGAAAGCCAAGGATCATTTCAGTATGGTAACTATCGCCGCGAAGCTGAAGATCT
GCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGGGAAAACCGTGTGATTTCTGCAATTATCGGACA
TAGTAAAGGTGGGAATGTGGTGCTTTTGTATGCAGCAAAGTACAAGGATGTGGATATTGT
TGTGAACATCTCAGGACGGTTTTTTCTAGAGAGGGGAATAGAAGGGCGGCTTGGTAAGGA
CTACATTAAGAGAATCAAAGAGAATGGGTTCATCGATGTTAGGAACAGAAAGGGAAAGTT
TGAATATAGAGTAACCAAAGAGAGTCTAGTGGACCGTCTCACAACCAATACTCATGAAGC
ATGTCTCTCAATTCATGAAAACTGCAGGTGTTAACAGTTCATGGGTTAAACGATAAAATC
GTGTCTGTGACAGAAGCATCTGAATTCG

QA 1 808 1 808
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5773Contig1 661 2 2 U
GTCATGGCCCATAATCAAGTCGAAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTA
GCATTTTATGTATGTAATCGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGC
AAAATCGTTCCTGAGACGATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCT
GGTAATACTGTCAATGTATACTGCAAGCTGGGTTGTGTATCCTCTGTGTGCAGTGACTTA
GCCACTCTCCAGGACTTCGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGTGCGGTCGCACAATGCACC
AACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAA
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TGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGATCCCT
AAATTGATGGTTCCTTAAGGCCACGACAGATTCGACAGTAGTTTGAAGTTGGTTTTTTAA
TAAAATTGGGAGGCTTTCTCCCCTTTGCCCACCAAAAAAAAAAAAGAGGGTCATCGATCC
CTAAATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RR4B029TF U 1
AF RR4B029JQ C 467
BS 1 626 RR4B029TF
BS 627 661 RR4B029JQ

RD RR4B029TF 626 0 0
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GCATTTTATGTATGTAATCGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGC
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GGTAATACTGTCAATGTATACTGCAAGCTGGGTTGTGTATCCTCTGTGTGCAGTGACTTA
GCCACTCTCCAGGACTTCGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGTGCGGTCGCACAATGCACC
AACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAA
GCATATCCACGATCTATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCG
TGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGATCCCT
AAATTGATGGTTCCTTAAGGCCACGACAGATTCGACAGTAGTTTGAAGTTGGTTTTTTAA
TAAAATTGGGAGGCTTTCTCCCCTTTGCCCACCAAAAAAAAAAAAGAGGGTCATCGATCC
CTAAATTGTTAATCCCTTCTACTTGT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4B029JQ 195 0 0
ATGG
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GGTTTTTTAATAAAATTGGGGGGCTTTCTCCCCTTTGCCCCCCAAAAAAAAAAAAGGGGG
TCATCGATCCCTAAATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATATATCTAAATAAAGAAT
AATGTTTCCTT

QA 5 195 5 195
DS 



AS 1 2

CO CL5774Contig1 924 2 12 U
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AGATTTTCATGGAAAAACATATGTCTTCCTATAAGCTGCATCAACAACACAAACCAGAAG
ACTAAAACAATAAGCCCATCAAAGGAAAAACCTCTTCAGCTATCCAGACAAACCTCTGTT
CGAAGCAGAGTATCCTTGTCTGATTTCAGTAGTTCAAACATCTCACTCAACGACTTCTCA
AACTCTTTTCTCATAGACATTCACATCTTCACCTACGAAGAGCTCAAAACGATCACACAA
GGCTTCTCAAAGCATAACTATCTCGGTGAAGGAGGATTTGGTGAAGTCTACAAAGGTTTC
GTTGATGATAGCCTCAAGCCTGGTTTAAAATCTCAGCCTGTTGCTGTCAAGGCCTTGAAA
CAAGAAGGTGGACAAGGCCATAGGGAGTGGCTGGCTGAAGTTATAATCCTTGGTCAGTTG
AAGTATCCACATCTTGTGAACTTGATTGGATACTGCTGTGAGGATGATCACAGGCTTCTA
GTTTATGAATACATGGAACGAGGCAATCTGGAAGACCATCTATTTCAGAAGTATGGTGGA
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GATTATAAGATGTTGTAGCGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G367TF U 1
AF RR4G367JQ C 542
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BS 650 650 RR4G367JQ
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BS 670 670 RR4G367JQ
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BS 777 924 RR4G367JQ

RD RR4G367TF 776 0 0
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AGATTTTCATGGAAAAACATATGTCTTCCTATAAGCTGCATCAACAACACAAACCAGAAG
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AACTCTTTTCTCATAGACATTCACATCTTCACCTACGAAGAGCTCAAAACGATCACACAA
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DS 

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ATTATAAGATGTTGTAGCGGTTT

QA 1 383 1 383
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTGACGATATCATCGATGAATACATGAAGAAGAAAGAGGATCAAAACACAGCTGATGATG
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AACTAGTGAGCGAGGCAACATAACTTCAGAACTCCATTAAACTTACCCGTGACAATATCA
AAGCAATCATCATGGACGTTATGTTTGGAGGAACGGAAACGGTAGCGTCAGCGATAGAGT
GGGCATTAACTGAGTTATTACGGAGCCCCGAGGATCTAAAACGAGTTCAACAAGAACTCG
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AAACCGCAGAGGACACTGAGATCGACGGTTACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGA
TCAACGCGTTTGCGATTGGACGCGACAAGAACTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGAC
CATCTAGGTTTTTGGAACCGGGCGTACCAGATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATAC
CATTCGGATCGGGTCGTAGATCATGCCCGGGTATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAAC
TAGCCGTGGCCCATATATTACATTGCTTCACGTGGAAATTACCTGATGGCATGAAACCAA
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TGAAGATTTGTGGATGTTATATAATACTATATGTTTATGTATTTGTGTACTAATGAATTA
AAGTTATGTATCACGTGTGTTCTGGATGAAACATAAAGTGGCTCTTTGTTTCGTTTTTCA
TTTTCTTTTGGGAAATCTTTTCCTTGCATGAAATGTAAACACTGAAAAATAAGATTTTTT
ACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI84TF U 1
AF RR4EI84JQ C 505
BS 1 690 RR4EI84TF
BS 691 691 RR4EI84JQ
BS 692 722 RR4EI84TF
BS 723 1146 RR4EI84JQ

RD RR4EI84TF 722 0 0
GTGATCCACAAGGAATAAACAAGCGGCTCGTGAAGGCCCGTAATGACCTAGACGGGTTTA
TTGACGATATCATCGATGAATACATGAAGAAGAAAGAGGATCAAAACACAGCTGATGATG
GAGAAGTTGTTGATACCGATATGGTTGATGATCTTCTTGCTTTTTACAGTGAAGAGGCGA
AACTAGTGAGCGAGGCAACATAACTTCAGAACTCCATTAAACTTACCCGTGACAATATCA
AAGCAATCATCATGGACGTTATGTTTGGAGGAACGGAAACGGTAGCGTCAGCGATAGAGT
GGGCATTAACTGAGTTATTACGGAGCCCCGAGGATCTAAAACGAGTTCAACAAGAACTCG
CTGAAGTAGTCGGACTTGACAGACATGTGGAAGAATCAGACATCGAGAAGTTGACTTTTC
TGAAATGCACACTCAAAGAAACCCTAAGGCTACACCCACCGATCCCACTCCTCCTCCACG
AAACCGCAGAGGACACTGAGATCGACGGTTACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGA
TCAACGCGTTTGCGATTGGACGCGACAAGAACTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGAC
CATCTAGGTTTTTGGAACCGGGCGTACCAGATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATAC
CATTCGGATCGGGTCGTAGATCATGCCCGG*TATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAAC
TA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4EI84JQ 642 0 0
ACGGTTACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGATCAACGCGTTTGCGATTGGACGCG
ACAAGAACTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGACCATCTAGGTTTTTGGAACCGGGCG
TACCAGATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATACCATTCGGATCGGGTCGTAGATCAT
GCCCGGGTATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAACTAGCCGTGGCCCATATATTACATT
GCTTCACGTGGAAATTACCTGATGGCATGAAACCAAGCGAGCTTGATATGAGCGACGTGT
TTGGTCTGACGGCTCCTAAAGCCACGCGTCTTTACGCTGTCCCGAGCACGCGCCTTATTT
GTGCTGTTTAAAGTTATGGTTCGAAGCACGTGGACGGTGAAAGGAAAGGTGGTTGGTATG
GTTCTTGGAAGTGGTGTGAGAACTCAAAAGAAGCCCTGAAGATTTGTGGATGTTATATAA
TACTATATGTTTATGTATTTGTGTACTAATGAATTAAAGTTATGTATCACGTGTGTTCTG
GATGAAACATAAAGTGGCTCTTTGTTTCGTTTTTCATTTTCTTTTGGGAAATCTTTTCCT
TGCATGAAATGTAAACACTGAAAAATAAGATTTTTTACAACT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL5777Contig1 213 2 1 U
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AGGATGATAAATGATTTAATCAATGGTGAGGAGGACAAGAAAACATCATGTTGTTGTTGT
TTTTTTCTTTGCTTTGGATTTGCTGAGGCATTACAGAGACCTTGAAGTTGTAGGCGTCTT
TTGTAAAAGATGGTACTTGTTCAAGGAGGAACC


BQ
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AF RR4CA49JQ C 1
AF RR4CA49TF U 1
BS 1 213 RR4CA49TF

RD RR4CA49JQ 213 0 0
GAAGGGAGTTGAAGAAGAATTTGGGCCTTCGCGATGAGGACGAAGAGGAGGAGGAGAATG
AGGATGATAAATGATTTAATCAATGGTGAGGAGGACAAGAAAACATCATGTTGTTGTTGT
TTTTTTCTTTGCTTTGGATTTGCTGAGGCATTACAGAGACCTTGAAGTTGTAGGCGTCTT
TTGTAAAAGATGGTACTTGTTCAAGGAGGAACC

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR4CA49TF 213 0 0
GAAGGGAGTTGAAGAAGAATTTGGGCCTTCGCGATGAGGACGAAGAGGAGGAGGAGAATG
AGGATGATAAATGATTTAATCAATGGTGAGGAGGACAAGAAAACATCATGTTGTTGTTGT
TTTTTTCTTTGCTTTGGATTTGCTGAGGCATTACAGAGACCTTGAAGTTGTAGGCGTCTT
TTGTAAAAGATGGTACTTGTTCAAGGAGGAACC

QA 1 213 1 213
DS 



AS 1 2

CO CL5778Contig1 701 2 3 U
AGGGTGTACCAGAAAGGAAGAAAGGCGATTCCAACTCTTTCTTTGTATTTTTATTGTTTT
CAGATCGAATCCAAGAAATGGGTAACGCTATTAGGTTACTCTACCGGAAATGTTGCAGCC
CCACGACGGACGATAAGCCTCACGGAGTCTCAGCACTTTCACGTGATCTCTTTAGCTTCG
AGACCACATCTCAGGTTCCTGAAAGGCTCGGAAGTTATGTTGTGTCTTCTACAAAGGCTC
AAGCAAACTGGTATGGAAAGATACTTGAGACATGGAAGCAAGCTAAACCTCGGCCTCAGA
CCGATGAGGAAGCTGCAAGGCTTGTTATCACCACTCTAAAGGGGCATAAGAAAGCTGATG
TTGAGGGACTTTTGTCTTTCTATAGACTCCCGTCACCTGGTAAGCCTGATGAGGTCTCCA
GTGAATCCCCTGCGCCTGTACTTGAAGGCCTTAAATTTGAGCTCCTAACGCTTCCGGTGG
ATGAAAAATCTGTGGCAGATGGGGATACAGTTAATGTGTATGTCAGTAGCACAGATCCTA
TTGTGTCATCTACACTTCCTAAGGAAGTGAGTCTTGCTGCGGCAAAAAGAGCTAAGGCCC
GTGAGAGTAAGAATTACACAGAAGCAGATGCACTTCACAAGAAGATCATAGCTTCTGGTT
ACAGGATGATAAATGTTCAGAACAAAGAAGTGCTTGCTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C626TF U 48
AF RR4G014TF U 1
BS 1 254 RR4G014TF
BS 255 255 RR4C626TF
BS 256 701 RR4G014TF

RD RR4C626TF 218 0 0
TTTTTATTGTTTTCAGATCGAATCCAAGAAATGGGTAACGCTATTAGGTTACTCTACCGG
AAATGTTGCAGCCCCACGACGGACGATAAGCCTCACGGAGTCTCAGCACTTTCACGTGAT
CTCTTTAGCTTCGAGACCACATCTCAGGTTCCTGAAAGGCTCGGAAGTTATGTTGTGTCT
TCTACAAAGGCTCAAGCAAACTGGTATGGAAAGATACT

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR4G014TF 701 0 0
AGGGTGTACCAGAAAGGAAGAAAGGCGATTCCAACTCTTTCTTTGTATTTTTATTGTTTT
CAGATCGAATCCAAGAAATGGGTAACGCTATTAGGTTACTCTACCGGAAATGTTGCAGCC
CCACGACGGACGATAAGCCTCACGGAGTCTCAGCACTTTCACGTGATCTCTTTAGCTTCG
AGACCACATCTCAGGTTCCTGAAAGGCTCGGAAGTTATGTTGTGTCTTCTACAAAGGCTC
AAGCAAACTGGTATTGAAAGATACTTGAGACATGGAAGCAAGCTAAACCTCGGCCTCAGA
CCGATGAGGAAGCTGCAAGGCTTGTTATCACCACTCTAAAGGGGCATAAGAAAGCTGATG
TTGAGGGACTTTTGTCTTTCTATAGACTCCCGTCACCTGGTAAGCCTGATGAGGTCTCCA
GTGAATCCCCTGCGCCTGTACTTGAAGGCCTTAAATTTGAGCTCCTAACGCTTCCGGTGG
ATGAAAAATCTGTGGCAGATGGGGATACAGTTAATGTGTATGTCAGTAGCACAGATCCTA
TTGTGTCATCTACACTTCCTAAGGAAGTGAGTCTTGCTGCGGCAAAAAGAGCTAAGGCCC
GTGAGAGTAAGAATTACACAGAAGCAGATGCACTTCACAAGAAGATCATAGCTTCTGGTT
ACAGGATGATAAATGTTCAGAACAAAGAAGTGCTTGCTAAA

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL5779Contig1 427 2 4 U
GGAAGGACGATCCTCCTTCTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCCCAAAAATTGG
ATACGATCTCTCAGCTCTATAATCTCATCAAATTCTCTATATAGAGATCTATGGGATGTG
CTGCTTCTCTTCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTAAAACGGTCTTACCAGCTCGGAGAATG
CAGCTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCTTGAAGATCATGGTGTCGCGTCAAAAGTTGG
GAAGACTACTACAAACAACATGGATGTGGGTATGAGTGGACAGAGGCATGTTTATTGCTT
GCGCTGAAATTTTTTTCCATATGTAAAACAAAGAAAATTTAACAAATATGTACATTGATG
TAGTGATATCCACATGTACAATCCATGTATACGTTCTCGCTCTTTGCGTTACTTCTATAG
TTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA12TF U 1
AF RR4HA12JQB C 17
BS 1 187 RR4HA12TF
BS 188 188 RR4HA12JQB
BS 189 252 RR4HA12TF
BS 253 427 RR4HA12JQB

RD RR4HA12TF 252 0 0
GGAAGGACGATCCTCCTTCTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCCCAAAAATTGG
ATACGATCTCTCAGCTCTATAATCTCATCAAATTCTCTATATAGAGATCTATGGGATGTG
CTGCTTCTCTTCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTAAAACGGTCTTACCAGCTCGGAGAATG
CAGCTCCCGCAGATGCTAAGAATCTACGCTTGAAGATCATGGTGTCGCGTCAAAAGTTGG
GAAGACTACTAC

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4HA12JQB 411 0 0
TTT
TTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCCCAAAAATTGGATACGATCTTTCAGCTCTA
TAATCTCATCAAATTCTCTATATAGAGATCTATGGGATGTGCTGCTTCTCTTCCAGATAG
GAACTCTGGAGCTTAAAACGGTCTTACCAGCTCGGAGAATGCAGCTCCAGCAGATGTTAA
GAATTTACGCTTGAAGATCATGGTGTCGCGTCAAAAGTTGGGAAGACTACTACAAACAAC
ATGGATGTGGGTATGAGTGGACAGAGGCATGTTTATTGCTTGCGCTGAAATTTTTTTCCA
TATGTAAAACAAAGAAAATTTAACAAATATGTACATTGATGTAGTGATATCCACATGTAC
AATCCATGTATACGTTCTCGCTCTTTGCGTTACTTCTATAGTTCTTCC

QA 4 411 4 411
DS 



AS 1 2

CO CL5780Contig1 680 2 3 U
TTTAGAATGTGAAGAAAACTTGTAGCAAAAGCATGACAATTTCCCAAGGAGAAGGAATCT
ACCGTACAGCATAGTACAAATTGAGATAACAAGAGCGCAGTTGACCAACACATGTGAACC
AAAGAGAACAAGAGGACAAGGATAATCAAGGAGAACAAAACAGGAACAAGGATAACACGA
GGACAAGAGGGCTAGCCATGACCGTCGATCGAACAGATCCGGACCTCCATCATCACACCA
GAGGGGATCTGGTCATAATAAGAAGAAACAGCCTCATCCGCTTGAAAGACGCTTACAACA
ACTTTTACCAGACATAGCAGCTCGCAGAGCTTGTAAAACAAAGTAGTCTGGAGATCAGAA
TCATCTGTGAGTGTGAGCTGATGAATAACCTGTTCACTCTTTATATTCTTTGGGAGCTAA
AGTCCAGAGTTAAACAAGGATTCTGAACTGTATAGATAACCCAAGTGTGGACCCGAAAGC
GAGAGATATGTGTGTAGATACTTCCTGTATGGCTCCATCAAACTATCAGCTAATGCAGTT
CTGATGATGACATTGTCGATTGAATGTCCAACAAAACTCAGCTTAACGTTTTTAAAACAA
CCATATCTCGCATGTTTCTTCTGGAAGAAAGATATAACTTCCTGTGCAAGTCTCTGTCCC
ATTCCCCTGAAATCTCCATG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG34JQ U 4
AF RR4GG34TF C 1
BS 1 3 RR4GG34TF
BS 4 224 RR4GG34JQ
BS 225 680 RR4GG34TF

RD RR4GG34JQ 221 0 0
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GAGAACAAGAGGACAAGGATAATCAAGGAGAACAAAACAGGAACAAGGATAACACGAGGA
CAAGAGGGCTAGCCATGACCGTCGATCGAACAGATCCGGAC

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR4GG34TF 680 0 0
TTTAGAATGTGAAGAAAACTTGTAGCAGAAGCATGACAATTTCCCAAGGAGAAGGAATCT
ACCGTACAGCATAGTACAAATTGAGATAACAAGAGCGCAGTTGACCAACACATGTGAACC
AAAGAGAACAAGAGGACAAGGATAATCAAGGAGAACAAAACAGGAACAAGGATAACACGA
GGACAAGAGGGCTAGCCATGACCGTCGATCGAACAGATCCGGACCTCCATCATCACACCA
GAGGGGATCTGGTCATAATAAGAAGAAACAGCCTCATCCGCTTGAAAGACGCTTACAACA
ACTTTTACCAGACATAGCAGCTCGCAGAGCTTGTAAAACAAAGTAGTCTGGAGATCAGAA
TCATCTGTGAGTGTGAGCTGATGAATAACCTGTTCACTCTTTATATTCTTTGGGAGCTAA
AGTCCAGAGTTAAACAAGGATTCTGAACTGTATAGATAACCCAAGTGTGGACCCGAAAGC
GAGAGATATGTGTGTAGATACTTCCTGTATGGCTCCATCAAACTATCAGCTAATGCAGTT
CTGATGATGACATTGTCGATTGAATGTCCAACAAAACTCAGCTTAACGTTTTTAAAACAA
CCATATCTCGCATGTTTCTTCTGGAAGAAAGATATAACTTCCTGTGCAAGTCTCTGTCCC
ATTCCCCTGAAATCTCCATG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL5781Contig1 504 2 1 U
GCAAGGCCCACTTCACAGCCTCGTCGAGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCT
CCACCGACCTTCGCGCCAAGTACAACGTCAGATCCATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGG
TCCAGATCGTCCGCGGGACCTACAAGGGCCGCGAGGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTC
GCAAGTGGGTCATCCACATCGAGAGGATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGGACCACTGTGA
ACGTCGGTGTTCAGCCGTCGAAGGTTGTGATAACGAAGCTGAGGTTGGACAAGGACAGGA
AGTCGCTTTTGGAGAGGAAGGCCAAGGGACGTGCCGCGGCGGATAAGGACAAGGGGACAA
AGTTTACCGCTGAGGATGTTATGCAGAACGTTGATTAAACAAAAAGGTTTTTAATCTTTT
AGTTTTAATCGTTAAGAGTACTGTTTTGTCTTTGGTCGAATGTTTTATTTATGTTGCGGA
CATGAGAAGTATCATTTCAATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CB89TF U 1
AF RR4CB89JQ C 283
BS 1 504 RR4CB89TF

RD RR4CB89TF 504 0 0
GCAAGGCCCACTTCACAGCCTCGTCGAGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCT
CCACCGACCTTCGCGCCAAGTACAACGTCAGATCCATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGG
TCCAGATCGTCCGCGGGACCTACAAGGGCCGCGAGGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTC
GCAAGTGGGTCATCCACATCGAGAGGATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGGACCACTGTGA
ACGTCGGTGTTCAGCCGTCGAAGGTTGTGATAACGAAGCTGAGGTTGGACAAGGACAGGA
AGTCGCTTTTGGAGAGGAAGGCCAAGGGACGTGCCGCGGCGGATAAGGACAAGGGGACAA
AGTTTACCGCTGAGGATGTTATGCAGAACGTTGATTAAACAAAAAGGTTTTTAATCTTTT
AGTTTTAATCGTTAAGAGTACTGTTTTGTCTTTGGTCGAATGTTTTATTTATGTTGCGGA
CATGAGAAGTATCATTTCAATTTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4CB89JQ 222 0 0
GGTTGGACAAGGACAGGAAGTCGCTTTTGGAGAGGAAGGCCAAGGGACGTGCCGCGGCGG
ATAAGGACAAGGGGACAAAGTTTACCGCTGAGGATGTTATGCAGAACGTTGATTAAACAA
AAAGGTTTTTAATTTTTTAGTTTTAATCGTTAAGAGTACTGTTTTGTCTTTGGTCGAATG
TTTTATTTATGTTGCGGACATGAGAAGTATCATTTCAATTTC

QA 1 222 1 222
DS 



AS 1 2

CO CL5782Contig1 560 2 3 U
GGCTCACAGAGTTCAGCCAATGTCACTTGAGCAAGTAATGTCTGATCGAGATAGCGAAGA
TGAAGTGGATGATGACGTTGCAGATCTGGAAGATCGCCAGATGCTTGATGATTTTGTGGA
TGTGAATAAGAACGAAAAGAGATTCATGCATCTTTGGAACTCTTTTGTAAGAAAACAGAG
GGTTGTGGCGGATGGTCATATATCATGGGCATGTGAAGCATTTTCGAAGTTTCACAAGGA
AGAGTTGCTCCATTCTTCACCACTCTTCTGGTGCTGGAGATTATTTATGATAAAACTATG
GAACATTGGACTTGTAGACTCGGCCACCATCAATAACTGCAATGTCATCCTCGAGAATTG
CGATAGTAACTCAGACAAGAACAACAAGAAGAGTGTGGATGTTGGTATTGACATTAACAG
TAACGCCATGGATGTTGACGAGGATGTCAATAACAGCAAAGCCAAGTAATAGGCTGAATT
AGAGAACCCCCTCTGGCTGCAACATTCATCTGTTTTATTAGTTTGCAAACTGATTTCATT
TTTTCTTTTTTTTTTGGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CF88TF U 30
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BS 1 29 RR4CF88JQ
BS 30 247 RR4CF88TF
BS 248 560 RR4CF88JQ

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AAGATCGCCAGATGCTTGATGATTTTGTGGATGTGAATAAGAACGAAAAGAGATTCATGC
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QA 1 218 1 218
DS 

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QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

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TGATTGACAAAACC


BQ
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AF RR4B623TF U 1
AF RR4B623JQ C 604
BS 1 819 RR4B623TF
BS 820 1334 RR4B623JQ

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GA

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DS 

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TCTGTTTGTAATCTTGTAGTAACCTCTGAAGAGTTTTATCACTGTAACTTCATTTTTCTT
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TTGACAAAACC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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CGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAGGAGTATGTTCTACTTCTATGTATCATTTTTCTCCAG
ATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATAT
AGTGCCATTTGTTATCTTGTAGATTGTATTATTTTGTGCTTATATGGGATTTTGGTATCT
ATAGTTTGTATGGTTTGCTTGATGCC


BQ
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AF RR4E865TF U 1
AF RR4E865JQ C 514
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GTGCGCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGTCAAGG
TCATGCTTGATCGTACTCCTGAACCCATCTTTGCAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTA
GGCTTAATGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAA
AGTTATTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGTCGAGGGTAATG
AATATGAGAGGGTGACAGTTGGTGTTGTACCAGAGGACAATTTTGAGAAGATGACTGTGG
AAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGG
AATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACGTTCAAAAAAATCATGGAATGGA
AGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGTCTTCAACAATGCCCTACGCGATGCTCCTT
CGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAGGAGTATGTTCTACTTCTATGTATCATTTTTCTCCAG
ATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATAT
AGTGCCATTTGTTATCTTGTAGATTGTATTATTTTGTGCTTATATGGGATTT*GGTATCT
ATAGTTTGTATGGTTTGCTTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4E865JQ 233 0 0
TCAACAATGCCTTACGGGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAGGAGTATGTT
CTACTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAG
TATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATTTGTTATCTTGTAGATTGTATTATT
TTGTGCTTATATGGGATTTTGGTATCTATAGTTTGTATGGTTTGCTTGATGCC

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 2

CO CL5785Contig1 528 2 4 U
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TGAGTGGGATAGAACCAGACATGGAAGATCTGTTCCAGGAGAAGAAGCGTGTCAGGAACC
CTCTCGTTCCTCTCGGTGCGTTTGCGACGGCGGGAGTGCTAACGGCTGGGCTGATTAGTT
TCAGAAGAGGGAACTCTCAGTTGGGTCAGGTTTTGATGAGAGCTAGAGTGGTCGTCCAAG
GTGCCACTGTCGCTCATATGGTTGGAACCGCTTACTACTACGGTGATAATCCCTGGAAGA
AATGAGCTGCTTTGCTACTTGTGAGATGACACACGCAGGGGTCAGAAGAAGAGGTATGTG
CTGTTCTCTTTGAGCGTCAGAAAAGTCTTCCGTCTTGTTAGGATTTATTACTTTGCAAGG
GTACTACACATCAAATGATTCTTGAATAATCAAGAAGAACTAAAAAAAAAGTTGTTCTGT
TTCTTAATCAATTTGATTATTTTGATTCAAGGGAATTTTCAGAACCCC


BQ
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AF RR4FJ38TF U 1
AF RR4FJ38JQ C 346
BS 1 485 RR4FJ38TF
BS 486 486 RR4FJ38JQ
BS 487 524 RR4FJ38TF
BS 525 528 RR4FJ38JQ

RD RR4FJ38TF 528 0 0
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TGAGTGGGATAGAACCAGACATGGAAGATCTGTTCCAGGAGAAGAAGCGTGTCAGGAACC
CTCTCGTTCCTCTCGGTGCGTTTGCGACGGCGGGAGTGCTAACGGCTGGGCTGATTAGTT
TCAGAAGAGGGAACTCTCAGTTGGGTCAGGTTTTGATGAGAGCTAGAGTGGTCGTCCAAG
GTGCCACTGTCGCTCATATGGTTGGAACCGCTTACTACTACGGTGATAATCCCTGGAAGA
AATGAGCTGCTTTGCTACTTGTGAGATGACACACGCAGGGGTCAGAAGAAGAGGTATGTG
CTGTTCTCTTTGAGCGTCAGAAAAGTCTTCCGTCTTGTTAGGATTTATTACTTTGCAAGG
GTACTACACATCAAATGATTCTTGAATAATCAAGAAGAACTAAAAAAAAAGTTGTTCTGT
TTCTTGATCAATTTGATTATTTTGATTCAAGGGAATTTTCAGAA
ACCC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4FJ38JQ 183 0 0
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TATTACTTTGCAAGGGTACTACACATCAAATGATTCTTGAATAATCAAGAAGAACTAAAA
AAAAAGTTGTTCTGTTTCTTAATCAATTTGATTATTTTGATTCAAGGGAATTTTCAGAAC
CCC

QA 1 183 1 183
DS 



AS 1 2

CO CL5786Contig1 1284 2 4 U
GGAAGACTCTCTTTAGCAGCGATGGCTATGTACTCTCACCGTCTCAGACGAGCCTTGCTC
ACCACCACTTCATTTCTTAACCGATCAATCTCACTCTCTCCCGCTTCTTCAGTTGCTCCA
CCCGCCGTTACCCCATCTGTGTCGACGGTGCTACAGAGATCCGTTTTAGGGCGTTTCACC
GAAGCGACTCGAGCTCCGGTGAGGCTGTTCTCGACGAGGCAGTACAAGCTTTACAAAGAA
TGCGATGAGATCACGGAGAACACTGTGTTGTTTGAAGGTTGTGATTACAATCACTGGCTC
ATCACCATGGATTTCCCCAAGGACAATCCTTTGTCCCCTGAGGAAATGGTCTCTACCTAT
GAGAAGACTTGCGCCGCAGGTCTTGGTATCAGCTTGGAAGAAGCCAAGAAGAAGATATAT
GCTTGTAGCACAACTACTTACCAAGGCTTTCAAGCGATCATGACTGAGGAAGAATCAGAG
AAGTTCAAGGATTTACCTGGAGTGGTGTTTATTTTACCAGATTCCTACATCGATCCTCAG
AACAAGGAGTATGGTGGAGATAAGTATGAGAACGGAGTGATCACACACAGGCCATCACCA
TATCAGTTTAACAGAAGACAACCCCGTGATAAGTTCAATCAAAGACCTGACCGTCAAGGC
GGTCCTCAAAACTTCCAGAGAAACCCACAGTTTGGTCAGCAACCACCACCTCCGTACCAG
CCGGGATACAATCAAGGCCAGGGATTTCCTGTGCCTCCGTACCAAGGGCCACCAGGTGGT
TTCGGACAAGGCGGACCTGGGAACTATAACCAAGGGCCACAAGGAGGTTACAACCAAGGA
GGGCCTAGGAATTACGGTCCCCAGGGGACTGGAAACTATGGTCCTCCACCTGGAGCTGGA
GTTCCCAATCCCGGATTTGGTCAGGGGTATTGTGGACCTGAACAAGAGCAGAATCAAGCA
TTTCCACAGGGAGATCAGAGGAATGCAGCTGGAGACTGGAACAACAATAATCCAGCAGGC
CAATCCGGACCTGACCAAGGAAGAAGATACTAGACAGAGAGATATGATGGATGGATTCTT
GCTGCTGTGAAATGAGCTTGAATAAGGAGAGAAGCATCGAAGGCCCCTTTTATTAAGTTT
TTAGAGTACATAGTTTTGTTAGTCATGCTCCTCTTTCTACTTTTATTAGAACAAGAATCA
TCTCCTTTTCTCCTAAGTTGAGCTTGTTCAACGTCTGCTTGTTGCCTCTGTTACTTGAAA
CACTTTTTCAAAACGTTGTTTGCC


BQ
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AF RR4E680TF U 1
AF RR4E680JQ C 492
BS 1 658 RR4E680TF
BS 659 659 RR4E680JQ
BS 660 719 RR4E680TF
BS 720 1284 RR4E680JQ

RD RR4E680TF 719 0 0
GGAAGACTCTCTTTAGCAGCGATGGCTATGTACTCTCACCGTCTCAGACGAGCCTTGCTC
ACCACCACTTCATTTCTTAACCGATCAATCTCACTCTCTCCCGCTTCTTCAGTTGCTCCA
CCCGCCGTTACCCCATCTGTGTCGACGGTGCTACAGAGATCCGTTTTAGGGCGTTTCACC
GAAGCGACTCGAGCTCCGGTGAGGCTGTTCTCGACGAGGCAGTACAAGCTTTACAAAGAA
TGCGATGAGATCACGGAGAACACTGTGTTGTTTGAAGGTTGTGATTACAATCACTGGCTC
ATCACCATGGATTTCCCCAAGGACAATCCTTTGTCCCCTGAGGAAATGGTCTCTACCTAT
GAGAAGACTTGCGCCGCAGGTCTTGGTATCAGCTTGGAAGAAGCCAAGAAGAAGATATAT
GCTTGTAGCACAACTACTTACCAAGGCTTTCAAGCGATCATGACTGAGGAAGAATCAGAG
AAGTTCAAGGATTTACCTGGAGTGGTGTTTATTTTACCAGATTCCTACATCGATCCTCAG
AACAAGGAGTATGGTGGAGATAAGTATGAGAACGGAGTGATCACACACAGGCCATCACCA
TATCAGTTTAACAGAAGACAACCCCGTGATAAGTTCAATCAAAGACCTGACCGTCAAG*C
GGTCCTCAAAACTTCCAGAGAAACCCACAGTTTGGTCAGCAACCACCACCTCCGTACCA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4E680JQ 793 0 0
ATTTA
CTGGAGTGGTGTTTATTTTACCAGATTCTTACATCGATCCTCAGAACAAGGAGTATGGTG
GAGATAAGTATGAGAACGGAGTGATCACACACAGGCCATCACCATATCAGTTTAACAGAA
GACAACCCCGTGATAAGTTCAATCAAAGACCTGACCGTCAAGGCGGTCCTCAAAACTTCC
AGAGAAACCCACAGTTTGGTCAGCAACCACCACCTCCGTACCAGCCGGGATACAATCAAG
GCCAGGGATTTCCTGTGCCTCCGTACCAAGGGCCACCAGGTGGTTTCGGACAAGGCGGAC
CTGGGAACTATAACCAAGGGCCACAAGGAGGTTACAACCAAGGAGGGCCTAGGAATTACG
GTCCCCAGGGGACTGGAAACTATGGTCCTCCACCTGGAGCTGGAGTTCCCAATCCCGGAT
TTGGTCAGGGGTATTGTGGACCTGAACAAGAGCAGAATCAAGCATTTCCACAGGGAGATC
AGAGGAATGCAGCTGGAGACTGGAACAACAATAATCCAGCAGGCCAATCCGGACCTGACC
AAGGAAGAAGATACTAGACAGAGAGATATGATGGATGGATTCTTGCTGCTGTGAAATGAG
CTTGAATAAGGAGAGAAGCATCGAAGGCCCCTTTTATTAAGTTTTTAGAGTACATAGTTT
TGTTAGTCATGCTCCTCTTTCTACTTTTATTAGAACAAGAATCATCTCCTTTTCTCCTAA
GTTGAGCTTGTTCAACGTCTGCTTGTTGCCTCTGTTACTTGAAACACTTTTTCAAAACGT
TGTTTGCC

QA 6 793 6 793
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5788Contig1 761 2 4 U
GAGCACAAGGAAACATGGTAGCTAGAGGCTAATTGAGTTCTGTGACGATGCTCCCCCTGT
CTTCAACAATGTGTCCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATCTCCATCATTCCCCCGTGTCC
TGTGGGAGCTAGTTATCCACTTTGCCAGCTGCACGAAACAGAGGTTTACACCGACTCTGC
TCAAGATCATATTGCTCCATGTGGATATATTAAACTCGCTACAGAAATACCAGAGTATAT
GGAACACTGCAAGTTTCTACCAAAGCTCAACAATGAGAGACCAAACGAGAGGAACTCCAC
TTATAAGGAACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGGTCCTTGTCATGTTCGAGGGTGATAC
AATAGTGGTTCCCAAAGAAACTTGTTGGTTCGGATTTTACCCTGATGGAGCTACAGCACC
TCTTTTGCCTCCTCAACAGACAAAGCTATATACTGAGGACTGGATTGGTCTGAAAACATT
GGATGATGCTGGAAAAGTGAAGTTTGTCGGTGTCCCTGGAGATCACCTCGAAATGGCGCA
TGATGACGTTGTGAAATACGTCGTGCCTTACCTGCGAAACCAGCTTGTGTTTTTTTCTTG
ATGCATACTCGAACGCAATGCAATGGAAAAGAGATTGTAATCTTGATGCAGTCATATCAA
CCTGAATTCATGTATAAGGCCTCAAGCTTTATTAATCTTGATGCAGATCAACCTAATTAC
ATGAATAAATAAATGGAATAAAGAGAGAGTAATCTTGATAC


BQ
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AF RR4CX33TF U 1
AF RR4CX33JQ C 111
BS 1 314 RR4CX33TF
BS 315 315 RR4CX33JQ
BS 316 334 RR4CX33TF
BS 335 761 RR4CX33JQ

RD RR4CX33TF 342 0 0
GAGCACAAGGAAACATGGTAGCTAGAGGCTAATTGAGTTCTGTGACGATGCTCCCCCTGT
CTTCAACAATGTGTCCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATCTCCATCATTCCCCCGTGTCC
TGTGGGAGCTAGTTATCCACTTTGCCAGCTGCACGAAACAGAGGTTTACACCGACTCTGC
TCAAGATCATATTGCTCCATGTGGATATATTAAACTCGCTACAGAAATACCAGAGTATAT
GGAACACTGCAAGTTTCTACCAAAGCTCAACAATGAGAGACCAAACGAGAGGAACTCCAC
TTATAAGGAACGTT*CACCAGCTTGCACAACTTG
TCCTTGCA

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4CX33JQ 651 0 0
CCCCGTGTCCTGTGGGAGCTAGTTATCCACTTTGCCAGCTGCACGAAACAGAGGTTTACA
CCGACTCTGCTCAAGATCATATTGCTCCATGTGGATATATTAAACTCGCTACAGAAATAC
CAGAGTATATGGAACACTGCAAGTTTCTACCAAAGCTCAACAATGAGAGACCAAACGAGA
GGAACTCCACTTATAAGGAACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGGTCCTTGTCATGTTCG
AGGGTGATACAATAGTGGTTCCCAAAGAAACTTGTTGGTTCGGATTTTACCCTGATGGAG
CTACAGCACCTCTTTTGCCTCCTCAACAGACAAAGCTATATACTGAGGACTGGATTGGTC
TGAAAACATTGGATGATGCTGGAAAAGTGAAGTTTGTCGGTGTCCCTGGAGATCACCTCG
AAATGGCGCATGATGACGTTGTGAAATACGTCGTGCCTTACCTGCGAAACCAGCTTGTGT
TTTTTTCTTGATGCATACTCGAACGCAATGCAATGGAAAAGAGATTGTAATCTTGATGCA
GTCATATCAACCTGAATTCATGTATAAGGCCTCAAGCTTTATTAATCTTGATGCAGATCA
ACCTAATTACATGAATAAATAAATGGAATAAAGAGAGAGTAATCTTGATAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL5789Contig1 1044 2 2 U
GATGATATCTTTAAAAAAAGATTAGACTCTCACGGCAACGTCATCGAGGCAAAACAAGGT
GGAATTGGTCATACTAAGATTGAAAAGCCTTTACAGAAACATGGTGGAAGGTTGGAGGAC
AATGAAAAGTATTGCGGTTCCTGTTTTGGAGCTGAAGACACGGATGATGCTTGCTGTAAC
TCATGCGAGGAAGTTCGTGAAGCTTACCGAAAGAAAGGTTGGGGTCTCTCTGACCCTGAA
TCAATCGACCAGTGTAAAAGAGAAGGCTATGTGCAAAAGGTGAAAGACGAAGAAGGTGAA
GGTCGTAATGTTCACGGTTTCGTTGAAGTTAACAAAGTCGCTGGGAATTTTCATTTCGTT
CCAGGACAAAGCTTTCATCAATCAGGTTTTCAGTTTCATGATATGATAATGTTCCAGCAA
GGCAACTACAACATTAGCCACAAGGTCAACCGGTTAGCCTTTGGGGACTTTTTCCCCGGT
GTAGTCAACCCTCTAGATGGTGTGCAGTGGAATCAGGATAAACAGAATGGCGTGTACCAA
TATTTCATCAAGGTGGTACCAACCGTATACACTGATGTTCACGAGAAAACTATTCAGTCA
AACCAATTCTCTGTGACAGAACATTTCCAGAATGCGGAAGCAGGTCGTATGCAGTCCCCA
CCTGGTGTTTTCTTCTACTATGATCTGTCTCCAATCAAGGTGATATTTGAGGAGCAGCAT
GTGGAGTTCTTGCACTTCCTAACAAATGTTTGTGCTATAGTAGGAGGTATCTTCACGGTA
TCAGGAATCGTGGATTCCTTCATTACCATGGACAACGAGCAATTAAGAAGAAAATGGAGA
TTGGTAAATTCAACTGAGTTTTGTTTTATATTATACTATATTATTCTCCACACCTTGTTG
GTCAAAAGACTGGAGAATCTCAGAATGGGTTTTTACAGTTAGACATTAGGTTTGAGAATG
TTGCCACAACTTTGTACTCTTTTGACTTTCAATTATGTAATCTCTCTTCCTCTGGCACAA
GGTAAAATGATCTTGTGTTCTTCC


BQ
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DS 



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BQ
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AF RR4CW50TF U 1
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ATATGGCTTGATGCGAAGCTTCAGCTTGTTGTAGATCCTTACCAAATACTTGAAAG*TTC
TTGTGGAGAACGAACTCTAGTATCGCAATCTCGAGACACTACAGACGTTTTGATGTGTTT
GTGGAGGCTGAG*CGAACAAAGCCGCGAGAAA*TACGACAATGCATCGATTGAT*ACCAA
GTAGAGT*CTACAAGGGG
TA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4CW50JQ 772 0 0
CTTCTATTGCATAGATTATTCCCAAATGTTAGGTACTCTATATGGCTTGATGCGAAGCTT
CAGCTTGTTGTAGATCCTTACCAAATACTTGAAAGGTTCTTGTGGAGAACGAACTCTAGT
ATCGCAATCTCGAGACACTACAGACGTTTTGATGTGTTTGTGGAGGCTGAGGCGAACAAA
GCCGCGAGAAAATACGACAATGCATCGATTGATTACCAAGTAGAGTTCTACAAGGGGGTA
GGCTTGACGCCTTATAATGATGCTAAGCTTCCTATAACAAGTGATGTTCCTGAAGGTTGT
ACAATCATAAGAGAACACATACCGATCACAAACCTCTTCACGTGTGTTTGGTTTAACGAA
GTAGACCGGTTTACCTCAAGAGATCAGTTAAGTTTTGCGATTGCTAGAGACAAGATAAGA
GAGAAGGTGGATTGGAGTATTAATATGTTCTTGGACTGTGAAAGACGAAACTTTGTAAAA
CAGGTTTATCATAGAGACGTTTTGATGAGCATGAAACCTCCTCGAGCTTCTTCTTCTTCT
AGGGTTCTTCCCGAGCCACTGCCTTTGCCACGTGGTAAAGCAGTCGGTGGTAGAGCCAAT
ACAGGGAAGAAGATTCCGGGACAACGTGGAAAAAGGCGTCACCGGAAAGTTTCAGCTGGT
GGAAGAAACATGAGATAACAGAGATTTTTCCACCTTTAATTTTGTAAGATTTTATTTATT
TTAATGCAATTTTTTGTTATTATTTTGGGAATTACAGTTGAAGTATAGTTTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5791Contig1 750 2 1 U
GGGAAGCAAAATCGGTTCCGCCACTTCTCCTCTTCTCCTCCCTCCATGTCCTCCGCCATC
GCGGCCGCTTCCTCTTTAGTCTCCGCCGACGAAAGTCTCCTCTCATCGAATCCTCTCTTG
CAGGATTTCGATTTCCCTCCGTTTGATTCCGTCGATGCTGAGCATGTTCGTCCCTGGATT
CGTGCTCTGCTGCAGCGCCTCGAAGGTGAATTGGAGCAGTTAGAGAAATCTGTGGAGCCA
TCATGGCCAAGACTGGTTGAAGCGTTAGAGAAGCTCGTTGATCGGTTAAGTGTTGTTTGG
GGAGTGATCAATCACCTTAAAGTTATCAAGGACACACCTGAGCTTCGTGCTGCTATTGAA
GACGTTCAGCCGGAGAAAGTAAAGTTTCAGCTTAGGTTGGGGCAAAGCAAGCCTATCTAC
AATGCCTTTAAAGCTATTCGTCAATCTCCTGATTGGTCATCGATCATGCTTGTGTTTCTT
CTGGTAGAGGTGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTTGTGAACTTCGTCTTCACA
AAGGTATCTATATATATATACTAGGAGGGCGGGATGTTAGAGTCGAACAAACTTTAGGAC
GGTTTCCGGGGTGGTTGTGTTGTCGGAATAGAAAAAGTGACTTCTGTATCAATTATCAGT
ACCATATTTGATTTCTATAGAAGATCGCTGGTTCATAAAACTGAAATGTGCAATATAATT
GAATTAAATTGTTATCTAAGTAACTGACTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A246TF U 1
AF RR4A246TFB U 1
BS 1 750 RR4A246TF

RD RR4A246TF 750 0 0
GGGAAGCAAAATCGGTTCCGCCACTTCTCCTCTTCTCCTCCCTCCATGTCCTCCGCCATC
GCGGCCGCTTCCTCTTTAGTCTCCGCCGACGAAAGTCTCCTCTCATCGAATCCTCTCTTG
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CGTGCTCTGCTGCAGCGCCTCGAAGGTGAATTGGAGCAGTTAGAGAAATCTGTGGAGCCA
TCATGGCCAAGACTGGTTGAAGCGTTAGAGAAGCTCGTTGATCGGTTAAGTGTTGTTTGG
GGAGTGATCAATCACCTTAAAGTTATCAAGGACACACCTGAGCTTCGTGCTGCTATTGAA
GACGTTCAGCCGGAGAAAGTAAAGTTTCAGCTTAGGTTGGGGCAAAGCAAGCCTATCTAC
AATGCCTTTAAAGCTATTCGTCAATCTCCTGATTGGTCATCGATCATGCTTGTGTTTCTT
CTGGTAGAGGTGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTTGTGAACTTCGTCTTCACA
AAGGTATCTATATATATATACTAGGAGGGCGGGATGTTAGAGTCGAACAAACTTTAGGAC
GGTTTCCGGGGTGGTTGTGTTGTCGGAATAGAAAAAGTGACTTCTGTATCAATTATCAGT
ACCATATTTGATTTCTATAGAAGATCGCTGGTTCATAAAACTGAAATGTGCAATATAATT
GAATTAAATTGTTATCTAAGTAACTGACTG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4A246TFB 748 0 0
GGGAAGCAAAATCGGTTCCGCCACTTCTCCTCTTCTCCTCCCTCCATGTCCTCCGCCATC
GCGGCCGCTTCCTCTTTAGTCTCCGCCGACGAAAGTCTCCTCTCATCGAATCCTCTCTTG
CAGGATTTCGATTTCCCTCCGTTTGATTCCGTCGATGCTGAGCATGTTCGTCCCTGGATT
CGTGCTCTGCTGCAGCGCCTCGAAGGTGAATTGGAGCAGTTAGAGAAATCTGTGGAGCCA
TCATGGCCAAGACTGGTTGAAGCGTTAGAGAAGCTCGTTGATCGGTTAAGTGTTGTTTGG
GGAGTGATCAATCACCTTAAAGTTATCAAGGACACACCTGAGCTTCGTGCTGCTATTGAA
GACGTTCAGCCGGAGAAAGTAAAGTTTCAGCTTAGGTTGGGGCAAAGCAAGCCTATCTAC
AATGCCTTTAAAGCTATTCGTCAATCTCCTGATTGGTCATCGATCATGCTTGTGTTTCTT
CTGGTAGAGGTGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTTGTGAACTTCGTCTTCACA
AAGGTATCTATATATATATACTAGGAGGGCGGGATGTTAGAGTCGAACAAACTTTAGGAC
GGTTTCCGGG*TGGTTGTGTTGTCGGAATAGAAAAAGTGACTTCTGTATCAATTATCAGT
ACCATATTTGATTTCTATAGAAGATCGCTGGTTCATAAAACTGAAATGTGCAATATAATT
GAATTAAATTGTTATCTAAGTAACTGAC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL5792Contig1 1217 2 2 U
GCAGGAAGATCATATGCAGTGCAATCTCCAACACCGGATCGCTTTTTGGTTATTCTGACC
AAATTGGCCTCAGTCTGTTTGAGTTAAAGAAGAATGAAATTGCAAAGAGCCCGTGGAGTG
TCAGTAGAAGACGACTTCCCACACTTCCATTTGCGCATTCCATGATTTTCAGTTCAGACT
GCTCTCGACTGATATTAGCAGGACATGATAGAAGGATATATGCTATTGACGTTAGTAATT
TGGAATTAGTATATACCTTTACACCATGCCGGGAGGAGCAGGAAGGTGAATCTCCACCTA
TGGAGCCTCCTATAACAAAACTGTATACTAGCTCAGATGATCAGTGGCTAGCCGCTATCA
ATTGCTTTGGGGACATATATGTATTCAACCTTGAAACACAAAGGCAACACTGGTTCGTAT
CAAGGCTTGATGGTGCATCTGTTGCAGCTGCTGGTTTCCATCCTTGGAATAACAATGCGC
TTGTGATCTCCACCTCGTCGAACCAGGTCTTTGCTTTTGATGTAGAGGCTAGACAGTTGG
GCAAGTGGTCGCTGCTACACACAAACGTTCTGCCAAAGAGGTACCAGGAGTTTCCTGGGG
AGGTCATTGGACTCTCATTCTCCCCCTCTCCAAATTCATCGTCTGTAATAGTTTACAGTT
CCAGGGCGAAGTGTTTAATCGACTTTGGGAAGCCAGTAGAAGAAGATGAAGAAAATGATT
TACCAAACGGCAATCTATCTAAAAGTCTAGAAGGTAAACTTGTCAACATGGGCTTGAAAT
TGGGGAAAGGTTCAAACCGAAAACGTCGGTTAGAAGAGTATCAGTTAGAGGGTAAGAGTA
AAGAGAGAAAGAACTTTGAAATCTTACCCTCCAAGCACCCAGTTTTGTTTGTGGGTCACC
TCTCTAAAAACTCAATCATGGTGATAGAAAAACCATGGATTGAAGTTGTCAAGAGTTTGG
ACACTCAACCAGTGGACAGACATATTTTTGGGACTTGAATGAGAAAAGGGGTTGTTTTGT
CTGAAGAAGATGGTCTCTTTTTTTTTGTCGGGTGAAGAAGTAGAAAGGGCTAATAGAAAT
GTTGAGAGTGGCGAAGTAAACTGTTTACATCTCTTTTTTTTTTCGTCGTCTTTTTAAGTA
TTGATGAATCCATATGTTTTGTAATCTTGCCACAGAACATGAATTTTTGTTCAACTTAAG
TTTGACTTTCTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ02TF U 1
AF RR4BQ02JQ C 475
BS 1 703 RR4BQ02TF
BS 704 1217 RR4BQ02JQ

RD RR4BQ02TF 705 0 0
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AAATTGGCCTCAGTCTGTTTGAGTTAAAGAAGAATGAAATTGCAAAGAGCCCGTGGAGTG
TCAGTAGAAGACGACTTCCCACACTTCCATTTGCGCATTCCATGATTTTCAGTTCAGACT
GCTCTCGACTGATATTAGCAGGACATGATAGAAGGATATATGCTATTGACGTTAGTAATT
TGGAATTAGTATATACCTTTACACCATGCCGGGAGGAGCAGGAAGGTGAATCTCCACCTA
TGGAGCCTCCTATAACAAAACTGTATACTAGCTCAGATGATCAGTGGCTAGCCGCTATCA
ATTGCTTTGGGGACATATATGTATTCAACCTTGAAACACAAAGGCAACACTGGTTCGTAT
CAAGGCTTGATGGTGCATCTGTTGCAGCTGCTGGTTTCCATCCTTGGAATAACAATGCGC
TTGTGATCTCCACCTCGTCGAACCAGGTCTTTGCTTTTGATGTAGAGGCTAGACAGTTGG
GCAAGTGGTCGCTGCTACACACAAACGTTCTGCCAAAGAGGTACCAGGAGTTTCCTGGGG
AGGTCATTGGACTCTCATTCTCCCCCTCTCCAAATTCATCGTCTGTAATAGTTTACAGTT
CCAGGGCGAAGTGTTTAATCGACTTTGGGAAGCCAGTAGAAGA
GA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4BQ02JQ 743 0 0
ATGCGCTTGTGATCTCCACCTCGTCGAACCAGGTCTTTGCTTTTGATGTAGAGGCTAGAC
AGTTGGGCAAGTGGTCGCTGCTACACACAAACGTTCTGCCAAAGAGGTACCAGGAGTTTC
CTGGGGAGGTCATTGGACTCTCATTCTCCCCCTCTCCAAATTCATCGTCTGTAATAGTTT
ACAGTTCCAGGGCGAAGTGTTTAATCGACTTTGGGAAGCCAGTAGAAGAAGATGAAGAAA
ATGATTTACCAAACGGCAATCTATCTAAAAGTCTAGAAGGTAAACTTGTCAACATGGGCT
TGAAATTGGGGAAAGGTTCAAACCGAAAACGTCGGTTAGAAGAGTATCAGTTAGAGGGTA
AGAGTAAAGAGAGAAAGAACTTTGAAATCTTACCCTCCAAGCACCCAGTTTTGTTTGTGG
GTCACCTCTCTAAAAACTCAATCATGGTGATAGAAAAACCATGGATTGAAGTTGTCAAGA
GTTTGGACACTCAACCAGTGGACAGACATATTTTTGGGACTTGAATGAGAAAAGGGGTTG
TTTTGTCTGAAGAAGATGGTCTCTTTTTTTTTGTCGGGTGAAGAAGTAGAAAGGGCTAAT
AGAAATGTTGAGAGTGGCGAAGTAAACTGTTTACATCTCTTTTTTTTTTCGTCGTCTTTT
TAAGTATTGATGAATCCATATGTTTTGTAATCTTGCCACAGAACATGAATTTTTGTTCAA
CTTAAGTTTGACTTTCTTTTGAC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL5793Contig1 848 2 8 U
CGGCATCTTCCCCATCCTCAGATCCTCTTCTCTGCCGTATCAGCTCACGGCTCCTGCTTT
AGCTCTGCTTCTCGTGTTCCGCACGGAAGCTTCGTATTCTAGGTATGAAGAAGGGAGGAA
AGCTTGGGTTGGGATCATTGCTGGCACTGATGATTTAGCTAGGCAGGTGATATGTTCGGT
TGATGGCTCTGGTGATGAGTTGGTTATTAAAAATTTGCTTCTTCGTTACGTTGCAGCTTT
CCCTGTGGCTCTTAAGTGTCATGTTACTTATGGTTCAGATGTCGCGAGAGATCTCCAGAG
CTTGGTTGAAGCTGATGATTTGTCTCTGATTCTTGAATCTAAGCATCGTCCACGTTGTGT
GATAGAGTTCATTTCTCAGAGCCTGGCTGCTTAAACTGGAGGATACAAAGAGAGATCTGT
GGAATCAAAGATGCTACACTTACACGAAGGCATTGGTGTGTGTGAACAGCTAATGGGCAT
ACCTATTCCTCTCGCTTACACACGCTTAACCCCCGAGGTTTTTAGTCTTTTGGCATCTAA
CTCTACCAATCATTCTCTGGGATGAATGCCATTGGATTGTTGTTCCTGCTACTTTCATCA
GTGCTGCTTCTCTCTTCTGCATTGAAGAAGTGGGTGTTCTTATAGAAGAGCCATTCCCTA
TGCTGGCCTTAGACGAGCTCTGTGATCTTGTGCATAGTAACATCCAAGAAGCTGTTAAAT
CTGAGACTATCATACGCAACCGGATCGTTGAAAAGATAAAGCTTCATGAATTCAAGCACT
CACCAAATGGTCGGTATAGATCTTAGTTTAGCTTTGACGTTTATACAATGTATAGAAACA
ACACTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV18TF U 1
AF RR4BV18JQ C 39
BS 1 565 RR4BV18TF
BS 566 566 RR4BV18JQ
BS 567 615 RR4BV18TF
BS 616 616 RR4BV18JQ
BS 617 626 RR4BV18TF
BS 627 627 RR4BV18JQ
BS 628 650 RR4BV18TF
BS 651 848 RR4BV18JQ

RD RR4BV18TF 650 0 0
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AGCTCTGCTTCTCGTGTTCCGCACGGAAGCTTCGTATTCTAGGTATGAAGAAGGGAGGAA
AGCTTGGGTTGGGATCATTGCTGGCACTGATGATTTAGCTAGGCAGGTGATATGTTCGGT
TGATGGCTCTGGTGATGAGTTGGTTATTAAAAATTTGCTTCTTCGTTACGTTGCAGCTTT
CCCTGTGGCTCTTAAGTGTCATGTTACTTATGGTTCAGATGTCGCGAGAGATCTCCAGAG
CTTGGTTGAAGCTGATGATTTGTCTCTGATTCTTGAATCTAAGCATCGTCCACGTTGTGT
GATAGAGTTCATTTCTCAGAGCCTGGCTGCTTAAACTGGAGGATACAAAGAGAGATCTGT
GGAATCAAAGATGCTACACTTACACGAAGGCATTGGTGTGTGTGAACAGCTAATGGGCAT
ACCTATTCCTCTCGCTTACACACGCTTAACCCCCGAGGTTTTTAGTCTTTTGGCATCTAA
CTCTACCAATCATTCTCTGGGATGA*TGCCATTGGATTGTTGTTCCTGCTACTTTCATCA
GTGCTGCTTCTCTCT*CTGCATTGAA*AAGTGGGTGTTCTTATAGAAGAG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4BV18JQ 810 0 0
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CTAGGTATGAAGAAGGGAGGAAAGCTTGGGTTGGGATCATTGCTGGCACTGATGATTTAG
CTAGGCAGGTGATATGTTCGGTTGATGGCTCTGGTGATGAGTTGGTTATTAAAAATTTGC
TTCTTCGTTACGTTGCAGCTTTCCCTGTGGCTCTTAAGTGTCATGTTACTTATGGTTCAG
ATGTCGCGAGAGATCTCCAGAGCTTGGTTGAAGCTGATGATTTGTCTCTGATTCTTGAAT
CTAAGCATCGTCCACGTTGTGTGATAGAGTTCATTTCTCAGAGCCTGGCTGCTTAAACTG
GAGGATACAAAGAGAGATCTGTGGAATCAAAGATGCTACACTTACACGAAGGCATTGGTG
TGTGTGAACAGCTAATGGGCATACCTATTCCTCTCGCTTACACACGCTTAACCCC*GAGG
TTTTTAGTCTTTTGGCATCTAACTCTACCAATCATTCTCTGGGATGAATGCCATTGGATT
GTTGTTCCTGCTACTTTCATCAGTGCTGCTTCTCTCTTCTGCATTGAAGAAGTGGGTGTT
CTTATAGAAGAGCCATTCCCTATGCTGGCCTTAGACGAGCTCTGTGATCTTGTGCATAGT
AACATCCAAGAAGCTGTTAAATCTGAGACTATCATACGCAACCGGATCGTTGAAAAGATA
AAGCTTCATGAATTCAAGCACTCACCAAATGGTCGGTATAGATCTTAGTTTAGCTTTGAC
GTTTATACAATGTATAGAAACAACACTTTA

QA 1 810 1 810
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5796Contig1 1273 2 2 U
GCGGGCTAAACAGAACCTCTTGTGGAATCCACCTTCAAGAGAGTATATGAGCAAAGCAAT
GGCATGCCAGATGTGCCAAGGAACCATTAACGAAGTAGAGACACTGCTGATTTGTGATGC
CTGTGAAAAGGGATATCACTTGAAATGTCTACAAGCTAACAATATAAAAGGTGTCCCCAA
ATCTGAATGGCACTGCTCAAGATGTGTGCAGTTGTACAGCGGCAAGTCTTTTCCTCCTAA
ATATGGTCGTGTAATGAGAAGCGCAACTACAGCGAAAATGTCTTCTACTACAGGTGAAGT
TCAGTCACCCGCGGAGAAGGTGGTTGGTAAAATCGACCTAAAGGTTAATAAAGAGGCAAT
GCCACGTCCTGAGACGGCAAAACCAACTTTAGTTTCAGCTACGGATCGAACAGTTGAAGC
TGAAGGTGCAACAGCTGTAAGTCAAACAGTTAAAGCTGAAAATGCAGCAGCTGTAAGTCA
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ACCTGTAAGTCAAACGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCAGCTATAAGTGAAAGGGTTGAAGC
TGAAGATGCAGCACCTGTAAGTCAAACGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCAGCTATAAGTGA
AAGGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCACCTGTAAGTCAAACGGTTGAAGCTGAAGATGCAGC
AGCTATAAGTGAATGGGTCGAAGCTGAAGATGCATCTATGAATCAAGGAGTTGATACTAA
TGATGAACCACAAGGTTCTGTAGGAAACGAAGTTGAGGGTGATGATCCTTCAGAACAGGT
ACCTCAATCAGAGACTCCTACTAATCCTCCAAAACAAGAGAACAAAGAATATCCAAGCAA
AGATGTTGCTGAAGGATCCGTGTCAGCGAGTGGCCAAGATAAAGACCTGAAGATCACCGT
GGAACCATCATCACAAGAGGAGAATTCAGCATTTCAACCAGACAACTCATCATCCTAGCC
TCCTTTGCTGTGAATGGTTGAGACAAAAGTTTCAAAGATGAGCATCCACTCTGTCCAGGT
AGCCTCTTTGTTCTTCTAGTGTATTATTGTAAGTTATCATCATGCTGATGTCTTTAATCT
ACCGTTAGGGTTGATTACTAGATCTTTGTTCCATGTTGTTTCAAACTTTTTGAGCTAAAT
TAGTTATTGAATTAGGTATAATTTTGTAATTTAGCTTGAACATTTTTATAAGTACTTTAT
TTTAGTTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH33TF U 1
AF RR4DH33JQ C 466
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BS 694 1273 RR4DH33JQ

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GGCATGCCAGATGTGCCAAGGAACCATTAACGAAGTAGAGACACTGCTGATTTGTGATGC
CTGTGAAAAGGGATATCACTTGAAATGTCTACAAGCTAACAATATAAAAGGTGTCCCCAA
ATCTGAATGGCACTGCTCAAGATGTGTGCAGTTGTACAGCGGCAAGTCTTTTCCTCCTAA
ATATGGTCGTGTAATGAGAAGCGCAACTACAGCGAAAATGTCTTCTACTACAGGTGAAGT
TCAGTCACCCGCGGAGAAGGTGGTTGGTAAAATCGACCTAAAGGTTAATAAAGAGGCAAT
GCCACGTCCTGAGACGGCAAAACCAACTTTAGTTTCAGCTACGGATCGAACAGTTGAAGC
TGAAGGTGCAACAGCTGTAAGTCAAACAGTTAAAGCTGAAAATGCAGCAGCTGTAAGTCA
AACGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCAGCTATAAGTGAAAGGGCTGAAGCTGAAGATGCAGC
ACCTGTAAGTCAAACGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCAGCTATAAGTGAAAGGGTTGAAGC
TGAAGATGCAGCACCTGTAAGTCAAACGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCAGCTATAAGTGA
AAGGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCACCTGTAAG

QA 1 693 1 693
DS 

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TGAAAGGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCACCTGTAAGTCAAACGGTTGAAGCTGAAGATGC
AGCAGCTATAAGTGAAAGGGTTGAAGCTGAAGATGCAGCACCTGTAAGTCAAACGGTTGA
AGCTGAAGATGCAGCAGCTATAAGTGAATGGGTCGAAGCTGAAGATGCATCTATGAATCA
AGGAGTTGATACTAATGATGAACCACAAGGTTCTGTAGGAAACGAAGTTGAGGGTGATGA
TCCTTCAGAACAGGTACCTCAATCAGAGACTCCTACTAATCCTCCAAAACAAGAGAACAA
AGAATATCCAAGCAAAGATGTTGCTGAAGGATCCGTGTCAGCGAGTGGCCAAGATAAAGA
CCTGAAGATCACCGTGGAACCATCATCACAAGAGGAGAATTCAGCATTTCAACCAGACAA
CTCATCATCCTAGCCTCCTTTGCTGTGAATGGTTGAGACAAAAGTTTCAAAGATGAGCAT
CCACTCTGTCCAGGTAGCCTCTTTGTTCTTCTAGTGTATTATTGTAAGTTATCATCATGC
TGATGTCTTTAATCTACCGTTAGGGTTGATTACTAGATCTTTGTTCCATGTTGTTTCAAA
CTTTTTGAGCTAAATTAGTTATTGAATTAGGTATAATTTTGTAATTTAGCTTGAACATTT
TTATAAGTACTTTATTTTAGTTTGAACC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL5797Contig1 1164 2 4 U
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GCGATTGTTTGCGGTAGCAAGAGATCTCTGTTCGAGGATTTGTCCGCCGCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCGCCTCCCGTCTCCAAGAAACTCCGTTGCTTTTCTTCCTCTTCTCCCCCT
CGTTTCCCCCCTCCTCCTGCCTCCTCCTCCTCGCTCCTTCTCAATCATCTCGCTGCGATT
TTCCCCGATATGGATCATCAGATTCTTGAGAGGGCAATTGAGGAATGTGGAGATGATATT
GATTCTGCGATTAGATGTTTGAATCAGCTTCGTTTAGAATCAACCAATAAGAACTCAGAA
TCATCTATCCAGGGGGAAGCAAAAGTGGAAGCTCCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG
CAAGGGGAGGAGGAAGTCTTGAACATGGATGGCGCTGAGTGGGTTGACCTCTTCGTCAGG
GAGATGATGAATGCTTCAGACATGAAAGACGCGAAAGACCGCGCTGCAAGAGCGTTAGAA
GCTTTGGAGAAGTCGATCAAGGCACGTGCTGGTGGTGCCGACGCAGCGGCGGCGGCGGCG
GCGCAGAGCAGCAGTCTCCAGCAGGAGAACTCGATGCTGAGGCAGCAGTTGGAAGCTATC
GTCCAGGAGAACAGTTTGCTGAAACGAGCGGTGGTGACGCAGCAGAAGCGGCAGAGAGAG
AGTGAAGATCAAAGCCAGGAGCTGCAGCATCTGAGGCAGATGGTCACTCAGTACCAGGAG
CAGCTGAGGACTCTCGAGGTGAATAACTATGCTCTCACGCTTCATCTGAAACAAGCGCAG
CAGAACAACGGTTCGATCCCGGGACGGTTTCATCCTGACGTGTTCTAATGCGGCTTTTGT
CGCTCAAGAGGAATGCTCAGTCAAGACGTATATCTAATTTCAGTTTCCAGTGTTTGTTGT
ATGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCGTTGGCTTGTGACTTATCTTTATTATACATGA
ATTATGGGATGATTGATGAATCTGTCCGAAGCAGCTGTATTTTCAGACAAGACTTTGAGA
CATACTTGTTTTGTAAAGTTACAAATGTACATATATGTATCATTTAATCTACTAGTATGA
GTATATAAAAGTTGAGTTGGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GQ47TF U 1
AF RR4GQ47JQ C 443
BS 1 624 RR4GQ47TF
BS 625 625 RR4GQ47JQ
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BS 671 1164 RR4GQ47JQ

RD RR4GQ47TF 678 0 0
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GCGATTGTTTGCGGTAGCAAGAGATCTCTGTTCGAGGATTTGTCCGCCGCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCGCCTCCCGTCTCCAAGAAACTCCGTTGCTTTTCTTCCTCTTCTCCCCCT
CGTTTCCCCCCTCCTCCTGCCTCCTCCTCCTCGCTCCTTCTCAATCATCTCGCTGCGATT
TTCCCCGATATGGATCATCAGATTCTTGAGAGGGCAATTGAGGAATGTGGAGATGATATT
GATTCTGCGATTAGATGTTTGAATCAGCTTCGTTTAGAATCAACCAATAAGAACTCAGAA
TCATCTATCCAGGGGGAAGCAAAAGTGGAAGCTCCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG
CAAGGGGAGGAGGAAGTCTTGAACATGGATGGCGCTGAGTGGGTTGACCTCTTCGTCAGG
GAGATGATGAATGCTTCAGACATGAAAGACGCGAAAGACCGCGCTGCAAGAGCGTTAGAA
GCTTTGGAGAAGTCGATCAAGGCACGTGCTGGTGGTGCCGACGCAGCGGCGGCGGCGGCG
GCGCAGAGCAGCAGTCTCCAGCAG*AGAACTCGATGCTGAGGCAGCAGTTGGAAGCTATC
GTCCAGGAGA
CAGTTTGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4GQ47JQ 722 0 0
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CACGTGCTGGTGGTGCCGACGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCGCAGAGCAGCAGTCTCCAGC
AGGAGAACTCGATGCTGAGGCAGCAGTTGGAAGCTATCGTCCAGGAGAACAGTTTGCTGA
AACGAGCGGTGGTGACGCAGCAGAAGCGGCAGAGAGAGAGTGAAGATCAAAGCCAGGAGC
TGCAGCATCTGAGGCAGATGGTCACTCAGTACCAGGAGCAGCTGAGGACTCTCGAGGTGA
ATAACTATGCTCTCACGCTTCATCTGAAACAAGCGCAGCAGAACAACGGTTCGATCCCGG
GACGGTTTCATCCTGACGTGTTCTAATGCGGCTTTTGTCGCTCAAGAGGAATGCTCAGTC
AAGACGTATATCTAATTTCAGTTTCCAGTGTTTGTTGTATGTTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCTCCGTTGGCTTGTGACTTATCTTTATTATACATGAATTATGGGATGATTGATGAATC
TGTCCGAAGCAGCTGTATTTTCAGACAAGACTTTGAGACATACTTGTTTTGTAAAGTTAC
AAATGTACATATATGTATCATTTAATCTACTAGTATGAGTATATAAAAGTTGAGTTGGAT
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL5798Contig1 864 2 3 U
AAAAGATGCAGAAAAAATCTGAGAAGAGAAGAGAAATGAAAAGAAAGAGAAAGAAAGATG
AAAGAGAAGTAGGTCTACTAATTATGATATAATTTTGTTTTAGTTAGGAAGTAATGGAAA
AAGTTAAAGAAAGTGTGTTGGTAGTATAAAGTGATCTAAAATGATATTAGAATTCATAAA
GTGACCTACCATGTAAATCTCTCATGACTTTTCTCTATGGAAATTTCGTGATCAAAAGGC
ATATGCATAAGCGTTGTCGTCGGCCAGATTTGAAACGGTTGGTTAAGGTCTAACTTGGTA
TTATCAGGTGCCTAAATGAATAGAAAATATTAGATGTAGTTTTACCAGAAAAGAATATTG
GATGTAGAATTGTCAATTTTCTTGATTTTAATAAAGTGAAATGTAAGAATAACGCTCACT
ATTTGTTGGTAAAATTATTCGAGGTAATCTCTACCAACCAATACAAAATAAAAATCAAGC
CAAAAACTAATAACAATAATCATGCATTTTTATAGTTACATTTTCACATTATTTTTCTAT
GATTTTTTCAATCGTCTATATTCCACAGTTGTGGTTTAAAACATCAGTGGGTATCAGGGC
CGGCCCTAAGCTATGCGTAGTGAAGCATTTGCAACAGGTCCCCGAAATTTTTGAAGAAAA
CCACATAGACACAAGCCCCCAAAATATATTTTTAGGCCCCCAAATTTTTTTTTTACATAG
ACGTTGTAACAGACCCCCAAAATCTCAGGGCCGGCACTGATGGGTATAAAACTAAATAAA
TTGGAAGCAAACAAACATGTCAGGTAATAAATAAAAAAAAGTTAGAGCAGGGTGAACTGG
AACAAGATTGTCAAAGATTTTAGC


BQ
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AF RR4CV08TF U 396
AF RR4CV08JQ C 1
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BS 635 864 RR4CV08JQ

RD RR4CV08TF 239 0 0
GTGAAATGTAAGAATAACGCTCACTATTTGTTGGTAAAATTATTCGAGGTAATCTCTACC
AACCAATACAAAATAAAAATCAAGCCAAAAACTAATAACAATAATCATGCATTTTTATAG
TTACATTTTCACATTATTTTTCTATGATTTTTTCAATCGTCTATATTCCACAGTTGTGGT
TTAAAACATCAGTGGGTATCAGGGCCGGCCCTAAGCTATGCGTAGTGAAGCATTTGCAA

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR4CV08JQ 864 0 0
AAAAGATGCAGAAAAAATCTGAGAAGAGAAGAGAAATGAAAAGAAAGAGAAAGAAAGATG
AAAGAGAAGTAGGTCTACTAATTATGATATAATTTTGTTTTAGTTAGGAAGTAATGGAAA
AAGTTAAAGAAAGTGTGTTGGTAGTATAAAGTGATCTAAAATGATATTAGAATTCATAAA
GTGACCTACCATGTAAATCTCTCATGACTTTTCTCTATGGAAATTTCGTGATCAAAAGGC
ATATGCATAAGCGTTGTCGTCGGCCAGATTTGAAACGGTTGGTTAAGGTCTAACTTGGTA
TTATCAGGTGCCTAAATGAATAGAAAATATTAGATGTAGTTTTACCAGAAAAGAATATTG
GATGTAGAATTGTCAATTTTCTTGATTTTAATAAAGTGAAATGTAAGAATAACGCTCACT
ATTTGTTGGTAAAATTATTCGAGGTAATCTCTACCAACCAATACAAAATAAAAATCAAGC
CAAAAACTAATAACAATAATCATGCATTTT*ATAGTTACATTTTCACATTATTTT*CTAT
GATTTTTTCAATCGTCTATATTCCACAGTTGTGGTTTAAAACATCAGTGGGTATCAGGGC
CGGCCCTAAGCTATGCGTAGTGAAGCATTTGCAACAGGTCCCCGAAATTTTTGAAGAAAA
CCACATAGACACAAGCCCCCAAAATATATTTTTAGGCCCCCAAATTTTTTTTTTACATAG
ACGTTGTAACAGACCCCCAAAATCTCAGGGCCGGCACTGATGGGTATAAAACTAAATAAA
TTGGAAGCAAACAAACATGTCAGGTAATAAATAAAAAAAAGTTAGAGCAGGGTGAACTGG
AACAAGATTGTCAAAGATTTTAGC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL5799Contig1 1002 2 2 U
GTGATGGAACCACTGTGTCTGAACTTCTGATTCCCATATCATAGCTCGTGCCTTCCCACA
TACCTTAGGCCAGCCTTTGGCTCACTTCCTCCGGGAAACCGCCAAAGTTCCTGATGCTCA
GATTATCACTCAGCTTCCATCTATCAGAGTTGGAATCGTGTTTTGTGGAAGACAAGCTCC
GGGTGGACACAATGTAATCTGGGGTCTTCACGAGGCTTTTAAGATGCACAACGCAAAAAG
CACCTTGCTTGGCTTTTTGGGTGGTTCGGAAGGTCTGTTTGCGCAAAAGACTCTGGAGAT
CACAGATGATATACTCCAGACCTACAAAAACCAAGGTGGCTATGATTTGCTGGGAAGAAC
CAAGGATCAGATCAGAACCACTGAGCAGGTGAACGCTGCACTCAAAGCTTGCACTGATTT
GAAGCTAGATGGCCTTGTTATCATTGGAGGTGTAACATCAAACACAGATGCCGCTCATCT
TGCTGAGTTTTTCGCTGAAGCAAAATGCTCTACAAAGGTGGTGGGTGTTCCAGTTACTAC
AAATGGCGATCTCAAGAATCAGTTTGTGGAGGCAAACGTTGGTTTTGACACCATTTGCAA
GGTGAATTCCCAGCTCATTAGCAATGCCTGCACTGATGCTCTCTCTGCAGAGAAGTACTA
TTATTTCATCCGTCTAATGGGTCGGAAGCATTCTCATGTTGCCCTTGAGTGCACCCTCCA
GTCTCATCCAAACATGGTGATACTGGGCGAGGAGGTTGCAGCATCTAAGCTCACCATTTT
TGACATTTCTAAGCAGATCTGTGATGCAGTTCAAGCAAGAGCAGGACAAGACAAGAATCA
TGGAGTCATCCTCATTCCCGAAGGGATCATAGAGAGTATTCCTGAAGTATATGCTCTGTT
AAAGGAAATTCACGGGCTACTTAGGGAGGGTGTAGCTGCAGATAATATCTCTACTCAGCT
CTCACCTTGGTCATCTGCTTTGTTTGAATTTCTTCCTCCATT


BQ
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AF RR4E564TF U 1
AF RR4FP79TF U 359
BS 1 595 RR4E564TF
BS 596 1002 RR4FP79TF

RD RR4E564TF 595 0 0
GTGATGGAACCACTGTGTCTGAACTTCTGATTCCCATATCATAGCTCGTGCCTTCCCACA
TACCTTAGGCCAGCCTTTGGCTCACTTCCTCCGGGAAACCGCCAAAGTTCCTGATGCTCA
GATTATCACTCAGCTTCCATCTATCAGAGTTGGAATCGTGTTTTGTGGAAGACAAGCTCC
GGGTGGACACAATGTAATCTGGGGTCTTCACGAGGCTTTTAAGATGCACAACGCAAAAAG
CACCTTGCTTGGCTTTTTGGGTGGTTCGGAAGGTCTGTTTGCGCAAAAGACTCTGGAGAT
CACAGATGATATACTCCAGACCTACAAAAACCAAGGTGGCTATGATTTGCTGGGAAGAAC
CAAGGATCAGATCAGAACCACTGAGCAGGTGAACGCTGCACTCAAAGCTTGCACTGATTT
GAAGCTAGATGGCCTTGTTATCATTGGAGGTGTAACATCAAACACAGATGCCGCTCATCT
TGCTGAGTTTTTCGCTGAAGCAAAATGCTCTACAAAGGTGGTGGGTGTTCCAGTTACTAC
AAATGGCGATCTCAAGAATCAGTTTGTGGAGGCAAACGTTGGTTTTGACACCATT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4FP79TF 644 0 0
G
CCAAGGATCAGATCAGAACCACTGAGCAGGTGAACGCTGCACTCAAAGCTTGCATTGATT
TGAAGCTAGATGGCCTTGTTATCATTGGAGGTGTAACATCAAACACAGATGCCGCTCATC
TTGCTGAGTTTTTCGCTGAAGCAAAATGCTCTACAAAGGTGGTGGGTGTTCCAGTTACTA
CAAATGGCGATCTCAAGAATCAGTTTGTGGAGGCAAACGTTGGTTTTGACACCATTTGCA
AGGTGAATTCCCAGCTCATTAGCAATGCCTGCACTGATGCTCTCTCTGCAGAGAAGTACT
ATTATTTCATCCGTCTAATGGGTCGGAAGCATTCTCATGTTGCCCTTGAGTGCACCCTCC
AGTCTCATCCAAACATGGTGATACTGGGCGAGGAGGTTGCAGCATCTAAGCTCACCATTT
TTGACATTTCTAAGCAGATCTGTGATGCAGTTCAAGCAAGAGCAGGACAAGACAAGAATC
ATGGAGTCATCCTCATTCCCGAAGGGATCATAGAGAGTATTCCTGAAGTATATGCTCTGT
TAAAGGAAATTCACGGGCTACTTAGGGAGGGTGTAGCTGCAGATAATATCTCTACTCAGC
TCTCACCTTGGTCATCTGCTTTGTTTGAATTTCTTCCTCCATT

QA 2 644 2 644
DS 



AS 1 2

CO CL5800Contig1 503 2 7 U
GGAGAAGAGGGGTGCGGAAACCCTAGATCTATCTATCGGAGTAACAAGGAATCAATGTCG
GATCCTTACGAGAGGGTTAACGGTGGAAGGTTAGCCTTCAAAGGAGGTGATCTAGCCACG
AGGAAGTCCATCGAAAAGAAGAAGAAGAAACAAAAGAAGAACAAGCAAAAGCTCGACGGC
GCTGACATTGAAAAGCTGGCTCCTAACTCTTCAGCGAATTCCTCCAACAACGCAGATGTT
AAAGACGACATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAAGAAGTACGACGATCTGTTCCCC
GTCGAGGCAAAGAAATTCGGTTACATTCCCAAATCGAACTTCGAATCAGTAGCAGAGGCT
CTTGACGATCGAGTCACGAAGAAAGCTGATCGCTACTGTAAATAGAATGTTTTTACCATC
CCAACTTGTATGCGTTATTGCATTGGTGTTTGTAGAATCTAATGACTTTATTTTGATAAG
AGTTAAATCTATTTGAAGCAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4GE31TF U 1
AF RR4CI84TF U 246
BS 1 279 RR4GE31TF
BS 280 282 RR4CI84TF
BS 283 337 RR4GE31TF
BS 338 338 RR4CI84TF
BS 339 413 RR4GE31TF
BS 414 414 RR4CI84TF
BS 415 503 RR4GE31TF

RD RR4GE31TF 503 0 0
GGAGAAGAGGGGTGCGGAAACCCTAGATCTATCTATCGGAGTAACAAGGAATCAATGTCG
GATCCTTACGAGAGGGTTAACGGTGGAAGGTTAGCCTTCAAAGGAGGTGATCTAGCCACG
AGGAAGTCCATCGAAAAGAAGAAGAAGAAACAAAAGAAGAACAAGCAAAAGCTCGACGGC
GCTGACATTGAAAAGCTGGCTCCTAACTCTTCAGCGAATTCCTCCAACAACGCAGATGTT
AAAGACGACATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAAG***TACGACGATCTGTTCCCC
GTCGAGGCAAAGAAATTCGGTTACATTCCCAAATCGAGCTTCGAATCAGTAGCAGAGGCT
CTTGACGATCGAGTCACGAAGAAAGCTGATCGCTACTGTAAATAGAATGTTTT*ACCATC
CCAACTTGTATGCGTTATTGCATTGGTGTTTGTAGAATCTAATGACTTTATTTTGATAAG
AGTTAAATCTATTTGAAGCAGTT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4CI84TF 258 0 0
G
GACATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAAGAAGTACGACGATCTGTTCCCCGTCGAG
GCAAAGAAATTCGGTTACATTCCCAAATCGAACTTCGAATCAGTAGCAGAGGCTCTTGAC
GATCGAGTCACGAAGAAAGCTGATCGCTACTGTAAATAGAATGTTTTTACCATCCCAACT
TGTATGCGTTATTGCATTGGTGTTTGTTGAATCTAATGACTTTATTTTGATAAGAGTTAA
ATCTATTTGAAGCAGTT

QA 2 258 2 258
DS 



AS 1 2

CO CL5801Contig1 600 2 3 U
TTTTTATTATTATTGTAAGAGACAAATAAGAGAGATAAAATGAGCTCTACTAGGAACGTA
CTGAATATCATAATAATCATTTGTGTACGTCTCAGTCTGGGTTGTACTGATGGAGCTCAA
AAACGAGAGAGTGGAGAGATTGATTCTCATACTATTCAACTCAGCTCTCTCTTCCCTTCA
TCATCATCACCTTGTGTTCTTTCTAGCAGAGGTATTCTCTTAGTTTATTTCCTATGATTC
ATTGTGTTTTAGCTATACACATACTCTGTTATTAGTATGTCCTTTTGTATATTGTTGTCC
TTATAATGTAAAGATCATATGGAGGTATAGTTTAATATCAATTAACTTACAATTAGGACA
AATTACTGCCAGTCAGGCTAAGGCACATGATATTAGAAAGCGATAGTTAGATGTTCCTTG
ATTGAAAATATGAATATTTTGCTAGCTAGTTAAAGTTAATTAATATGAATACAACTATGT
TTTGACTCCAGTAGTTGATATCACAATGAAATTTTATATTTTATTTTGTTAGATAATTTA
TGAACAATACATCAACGACCACCATAATACTAATGTTTTATTTTTGGAGAATCTGTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CM65TF U 145
AF RR4CM65JQ C 1
BS 1 144 RR4CM65JQ
BS 145 381 RR4CM65TF
BS 382 600 RR4CM65JQ

RD RR4CM65TF 237 0 0
TCTCATACTATTCAACTCAGCTCTCTCTTCCCTTCATCATCATCACCTTGTGTTCTTTCT
AGCAGAGGTATTCTCTTAGTTTATTTCCTATGATTCATTGTGTTTTAGCTATACACATAC
TCTGTTATTAGTATGTCCTTTTGTATATTGTTGTCCTTATAATGTAAAGATCATATGGAG
GTATAGTTTAATATCAATTAACTTACAATTAGGACAAATTACTGCCAGTCAGGCTAA

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR4CM65JQ 600 0 0
TTTTTATTATTATTGTAAGAGACAAATAAGAGAGATAAAATGAGCTCTACTAGGAACGTA
CTGAATATCATAATAATCATTTGTGTACGTCTCAGTCTGGGTTGTACTGATGGAGCTCAA
AAACGAGAGAGTGGAGAGATTGATTCTCATACTATTCAACTCAGCTCTTTCTTCCCTTCA
TCATCATCACCTTGTGTTCTTTCTAGCAGAGGTATTCTCTTAGTTTATTTCCTATGATTC
ATTGTGTTTTAGCTATACACATACTCTGTTATTAGTATGTCCTTTTGTATATTGTTGTCC
TTATAATGTAAAGATCATATGGAGGTATAGTTTAATATCAATTAACTTACAATTAGGACA
AATTACTGCCAGTCAGGCTAAGGCACATGATATTAGAAAGCGATAGTTAGATGTTCCTTG
ATTGAAAATATGAATATTTTGCTAGCTAGTTAAAGTTAATTAATATGAATACAACTATGT
TTTGACTCCAGTAGTTGATATCACAATGAAATTTTATATTTTATTTTGTTAGATAATTTA
TGAACAATACATCAACGACCACCATAATACTAATGTTTTATTTTTGGAGAATCTGTGAGC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL5802Contig1 257 2 3 U
GCTTCCATTTATATAAAAAAGAAAAACCTATATTATATAACATACTCCACATGCAAAGAT
TATCAAAATGTGAGTTATTAAAAAAATCAAACAAAATACAATATTGTAACGTTCACATAT
AGTAAACCCTCTTGTTCTGCAACAAAATATATCTAAAAAATGAAACAAAACCATTTTTTA
AAGAAAAAAAAACAATAATCACCTTTCCTTCTTTGTCTTCACACTCCTCTAATCGATCTT
AACAGAGGAATAGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A471TF C 1
AF RR4A471JQ U 10
BS 1 9 RR4A471TF
BS 10 249 RR4A471JQ
BS 250 257 RR4A471TF

RD RR4A471TF 257 0 0
GCTTCCATTTATATAAAAAAGAAAAACCTATATTATATAACATACTCCACATGCAAAGAT
TATCAAAATGTGAGTTATTAGAAAAATCAAACAAAATACAATATTGTAACGTTCACATAT
AGTAAACCCTCTTGTTCTGCAACAAAATATATCTAAAAAATGAAACAAAACCATTTTTTA
AAGAAGATAAAACAATAATCACCTTTCCTTCTTTGTCTTCACACTCCTCTAATCGATCTT
AACAGAGGAATAGATGC

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR4A471JQ 240 0 0
TATATAAAAAAGAAAAACCTATATTATATAACATACTCCACATGCAAAGATTATCAAAAT
GTGAGTTATTAAAAAAATCAAACAAAATACAATATTGTAACGTTCACATATAGTAAACCC
TCTTGTTCTGCAACAAAATATATCTAAAAAATGAAACAAAACCATTTTTTAAAGAAAAAA
AAACAATAATCACCTTTCCTTCTTTGTCTTCACACTCCTCTAATCGATCTTAACAGAGGA

QA 1 240 1 240
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5804Contig1 1279 2 2 U
GGGGCTCTCTTCTCTCCTCTTCTCCTCCTTGTTCTCAAGAATCTACCGCCACCCATCCGC
CGCCGTATGATCTGTTTCGTGGCAGCGGTTAAATCATCTTTTTGTTATTTGTATTGATAT
GGGTTGTGGTGGTTCAAGGCTAGGAGGTGTGGCGGCGGCAAGAGCGGATGAGGGAGGCGT
TGTGCCACTTCCGGCGGGAATACGTCCGCTTCTCCGGCGTAGATTAGACGAGATGAAGAA
ACGGAGCCATGCAAACGTCTTTAAAGGGAACAATACGCTATCCAAGACGGAGCTTCTAAG
GCACAATTCCTCCGAGGACGGAGATGAGAAGGAGGAGAACGTCGAAAGCTTGAAGTTATC
GTCTAAGGTGGCTCATGCGCCTGAACATCACGTGGAAGAGAAAAAGAGGTTATTTATGAG
AAGGTTTCGTCCATAGATGAGGTTAAAGAGGAGGAAGAGGTTGTGAAGAAACAAGATGAG
AAAAATGATGATGCCGTCAATGTTAAGAAAGAAGGAAATGATGGTATAAATCATGATGAG
ATCATCATTGCTAAGAAGGAAGGAGGTGATGGTGTTGCTCAAGATGGTCGTATAAATCTT
GATGAGGTCATCATTGCTAAGAAGAAAGGATATAATGGTGTTGATCATGATGAAGGGAGG
ATGAGCAATTTAGATGAGAGGATGATATGTCCTGGATCTCCAAGCTTTCGGGTTTATTGT
ATCGATGTTGCTTCTGATGATGACGAAGAAGAAAAATATGGTGAAGTTGCGAGAAAGTCG
ATGGAAACCGAAAGCGTCAGTATAGAGCCAAAAGAGGACGAAAGCATCGTGAAAAAGGAG
AAAAGAGAAAGAAAAGGAAATAGATTCGGAATAGCATTGCCAAGGAAGTATTTAGCTAAT
GTGACTGCACAGTGCTATGCCAATGCAGGATGCATGGGCAATAACACTCACACTCGACGT
GTGCAAGAGAAATCGAGCCAGTGAGTATTATGATTGCCATCTTTAAATTGATTTGTTCAA
AGAAGAATGATGTATGGTGTAATGGTGTACGAGGCTATAATGAGTATTCAAAAACCACCC
CAACATGCAAAACACTAATACCCTTTTAATTAGACTTTTATTTTTTTTGAGAGACGCTTG
TTTCAGAATTTGTACACCTCTTCGTCTCTTTGCTTTCTCTCAGGATAAGTTAGTGTTTGA
CGAATTTTACCTTTTTTACTTTCACGTGGAAAATATGTAAGTAATTGAACTTGCGCAATG
AGAAGATGTTTTTACTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN59TF U 1
AF RR4GN59JQ C 534
BS 1 707 RR4GN59TF
BS 708 1279 RR4GN59JQ

RD RR4GN59TF 707 0 0
GGGGCTCTCTTCTCTCCTCTTCTCCTCCTTGTTCTCAAGAATCTACCGCCACCCATCCGC
CGCCGTATGATCTGTTTCGTGGCAGCGGTTAAATCATCTTTTTGTTATTTGTATTGATAT
GGGTTGTGGTGGTTCAAGGCTAGGAGGTGTGGCGGCGGCAAGAGCGGATGAGGGAGGCGT
TGTGCCACTTCCGGCGGGAATACGTCCGCTTCTCCGGCGTAGATTAGACGAGATGAAGAA
ACGGAGCCATGCAAACGTCTTTAAAGGGAACAATACGCTATCCAAGACGGAGCTTCTAAG
GCACAATTCCTCCGAGGACGGAGATGAGAAGGAGGAGAACGTCGAAAGCTTGAAGTTATC
GTCTAAGGTGGCTCATGCGCCTGAACATCACGTGGAAGAGAAAAAGAGGTTATTTATGAG
AAGGTTTCGTCCATAGATGAGGTTAAAGAGGAGGAAGAGGTTGTGAAGAAACAAGATGAG
AAAAATGATGATGCCGTCAATGTTAAGAAAGAAGGAAATGATGGTATAAATCATGATGAG
ATCATCATTGCTAAGAAGGAAGGAGGTGATGGTGTTGCTCAAGATGGTCGTATAAATCTT
GATGAGGTCATCATTGCTAAGAAGAAAGGATATAATGGTGTTGATCATGATGAAGGGAGG
ATGAGCAATTTAGATGAGAGGATGATATGTCCTGGATCTCCAAGCTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4GN59JQ 746 0 0
TGATGAGATCATCATTGCTAAGAAGGAAGGAGGTGATGGTGTTGCTCAAGATGGTCGTAT
AAATCTTGATGAGGTCATCATTGCTAAGAAGAAAGGATATAATGGTGTTGATCATGATGA
AGGGAGGATGAGCAATTTAGATGAGAGGATGATATGTCCTGGATCTCCAAGCTTTCGGGT
TTATTGTATCGATGTTGCTTCTGATGATGACGAAGAAGAAAAATATGGTGAAGTTGCGAG
AAAGTCGATGGAAACCGAAAGCGTCAGTATAGAGCCAAAAGAGGACGAAAGCATCGTGAA
AAAGGAGAAAAGAGAAAGAAAAGGAAATAGATTCGGAATAGCATTGCCAAGGAAGTATTT
AGCTAATGTGACTGCACAGTGCTATGCCAATGCAGGATGCATGGGCAATAACACTCACAC
TCGACGTGTGCAAGAGAAATCGAGCCAGTGAGTATTATGATTGCCATCTTTAAATTGATT
TGTTCAAAGAAGAATGATGTATGGTGTAATGGTGTACGAGGCTATAATGAGTATTCAAAA
ACCACCCCAACATGCAAAACACTAATACCCTTTTAATTAGACTTTTATTTTTTTTGAGAG
ACGCTTGTTTCAGAATTTGTACACCTCTTCGTCTCTTTGCTTTCTCTCAGGATAAGTTAG
TGTTTGACGAATTTTACCTTTTTTACTTTCACGTGGAAAATATGTAAGTAATTGAACTTG
CGCAATGAGAAGATGTTTTTACTTGG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL5805Contig1 906 2 2 U
GGCCTCGTTTCAAAATGGTATTTGATTCACACATCAGCAGTCTGCGAGATCAAACGTAAA
GACATTATGGGAAGACGATGTTCATCCTCACTATGTCATGAGACGTTATGCTGAATTCAC
AGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGAATATGGGGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGA
GCGATTAAGAATGGCTGTAGATGTCTTGATCCTCAAGCTTGCAAAGTTGTTTCCAAGGCC
AAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAACAACTATGATATGACAATTGCTGTACTGAAGGA
AGCTGGACCAGAAGGTGGTAAAATCCAAATGCATTTTGAGGAATTACTGAAGAGCAACAC
TTCATTATTCGTGGAAGAATTGCTGGTGGAGCATTTCAGTGATTTAATCAAATTTGTGAA
ATCTCGTGCTTCTGAGGATTCAAGCTCAAATCCAGAGAGATCAATCACAGTTGCTGAGGT
AGATCCGCTGGTGAAAGACTTTGGAGGCAGATGGAAGACAGCGATAGAGTTGATGCACAA
AGATATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCCTGTGTGGTATGGAGATCCTGAGAGCTGCATT
GACACAACTGCTGCTCTACTACACACGGCTTACAGATTGCATCAAGAAGATACCTGGTGG
GTCTGGTTTGAACAAGGATCTTGTCTCCATTCAGTCTATAATGTTCGAGATCAGGAAGTA
CTTTAAGACTTTTTAAAAGATAAGATACGTTAGCTGCTTATGAAGAGTATGTAAGACAGG
GAAAGCTTTCAAAGTGAATCTACTAAAGCCATTGTTATGCGTTAAATGATGTATTCTTGA
GACGTCTTTTTTTTGCTACTGTAATCAAATAATTCTCTATTGCTAAAGATTTGAAATGAA
AATTCG


BQ
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AF RR4ED75TF U 1
AF RR4ED75JQ C 430
BS 1 667 RR4ED75TF
BS 668 906 RR4ED75JQ

RD RR4ED75TF 669 0 0
GGCCTCGTTTCAAAATGGTATTTGATTCACACATCAGCAGTCTGCGAGATCAAACGTAAA
GACATTATGGGAAGACGATGTTCATCCTCACTATGTCATGAGACGTTATGCTGAATTCAC
AGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGAATATGGGGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGA
GCGATTAAGAATGGCTGTAGATGTCTTGATCCTCAAGCTTGCAAAGTTGTTTCCAAGGCC
AAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAACAACTATGATATGACAATTGCTGTACTGAAGGA
AGCTGGACCAGAAGGTGGTAAAATCCAAATGCATTTTGAGGAATTACTGAAGAGCAACAC
TTCATTATTCGTGGAAGAATTGCTGGTGGAGCATTTCAGTGATTTAATCAAATTTGTGAA
ATCTCGTGCTTCTGAGGATTCAAGCTCAAATCCAGAGAGATCAATCACAGTTGCTGAGGT
AGATCCGCTGGTGAAAGACTTTGGAGGCAGATGGAAGACAGCGATAGAGTTGATGCACAA
AGATATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCCTGTGTGGTATGGAGATCCTGAGAGCTGCATT
GACACAACTGCTGCTCTACTACACACGGCTTACAGATTGCATCAAGAAGATACCTGGTGG
GTCTGGT
CT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4ED75JQ 477 0 0
TTCTGAGGATTCAAGCTCAAATCCAGAGAGATCAATCACAGTTGCTGAGGTAGATCCGCT
GGTGAAAGACTTTGGAGGCAGATGGAAGACAGCGATAGAGTTGATGCACAAAGATATCAT
AACTTCCTTCAGTAACTTCCTGTGTGGTATGGAGATCCTGAGAGCTGCATTGACACAACT
GCTGCTTTACTACACACGGCTTACAGATTGCATCAAGAAGATACCTGGTGGGTTTGGTTT
GAACAAGGATCTTGTCTCCATTCAGTCTATAATGTTCGAGATCAGGAAGTACTTTAAGAC
TTTTTAAAAGATAAGATACGTTAGCTGCTTATGAAGAGTATGTAAGACAGGGAAAGCTTT
CAAAGTGAATCTACTAAAGCCATTGTTATGCGTTAAATGATGTATTCTTGAGACGTCTTT
TTTTTGCTACTGTAATCAAATAATTCTCTATTGCTAAAGATTTGAAATGAAAATTCG

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL5806Contig1 495 2 1 U
GACATCAGATATAGAGGAGAAATCTGTGATCATTGGTGAGAGAAACAAAGCAGCGACAGA
AGCTTTGAAAAGAGCAATAGAGCAAGGACACAAGAGAGTTGCGATTCTTTACGGAGGAGG
CCACATGCCTGACCTGGGAAGACGGCTTAGAGAAGAGTTTGATCTTGTTCCTTCTGAGGT
GAGATGGGTAACAGCTTGGTCTATCAGTAACCCAGGGGACATGGAGACGACTTCGTTTCC
GTTTCTGAGGACATTGGCCGATGCTCTGCGTTGGCCGCTGAACCGGTACCAAACCCTGGC
GTTGCTAATATTTTCATCGGTTCTTGCGGTGGATCTCTGCTTTTGGGAGCTGTTCTTGGA
TTCGACCATTGACTGGGGTTCACAGATAGCTGCAGAGGTGTACCGGTTTGTAGATAATAC
AAAACTTGTGTAATTTACACAACGATGTACAAAACAGTATTCTAATAGTATTTAAAAGTA
GCTAAGTCTACTGTT


BQ
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AF RR4BW50JQ C 1
AF RR4BW50TF U 1
BS 1 495 RR4BW50TF

RD RR4BW50JQ 495 0 0
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GAGATGGGTAACAGCTTGGTCTATCAGTAACCCAGGGGACATGGAGACGACTTCGTTTCC
GTTTCTGAGGACATTGGCCGATGCTCTGCGTTGGCCGCTGAACCGGTACCAAACCCTGGC
GTTGCTAATATTTTCATCGGTTCTTGCGGTGGATCTCTGCTTTTGGGAGCTGTTCTTGGA
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AAAACTTGTGTAATTTACACAACGATGTACAAAACAGTATTCTAATAGTATTTAAAAGTA
GCTAAGTCTACTGTT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4BW50TF 495 0 0
GACATCAGATATAGAGGAGAAATCTGTGATCATTGGTGAGAGAAACAAAGCAGCGACAGA
AGCTTTGAAAAGAGCAATAGAGCAAGGACACAAGAGAGTTGCGATTCTTTACGGAGGAGG
CCACATGCCTGACCTGGGAAGACGGCTTAGAGAAGAGTTTGATCTTGTTCCTTCTGAGGT
GAGATGGGTAACAGCTTGGTCTATCAGTAACCCAGGGGACATGGAGACGACTTCGTTTCC
GTTTCTGAGGACATTGGCCGATGCTCTGCGTTGGCCGCTGAACCGGTACCAAACCCTGGC
GTTGCTAATATTTTCATCGGTTCTTGCGGTGGATCTCTGCTTTTGGGAGCTGTTCTTGGA
TTCGACCATTGACTGGGGTTCACAGATAGCTGCAGAGGTGTACCGGTTTGTAGATAATAC
AAAACTTGTGTAATTTACACAACGATGTACAAAACAGTATTCTAATAGTATTTAAAAGTA
GCTAAGTCTACTGTT

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 2

CO CL5807Contig1 1217 2 4 U
GCCTAATGATTACCTAGATGTCTTTCATAAGCTGAAGACTGAACTATCCTACCTTGCTCT
AACCCATCTTGAGACTTTAAAGGAAGCTCGTGACTTGGCTGCTAATTCTGATGAAGTCGC
TGAGGCTCAAAAATATGAAGATGAAATACAGGATCTGCAAAACATGCTGAAAAATGATGT
TTTGATCGGTGAGGTCAACGCAGAGAGTCTCCAAGTTAGATCATCTGGCACTACTGAACT
TTACAAAGTTCTCCAAGAGCCAAAGTTTCGTACAGTTGATTCAGAAGATCTCCTGTCAGA
GAGATTGTTACTAGCAGAGAAGGACTTGAAATCAACGATTGAACTTCTCAAACACGCCAC
GTTGACCCTGAAGGTTCTAAACTTGGGTTCACATGAGCAGCAGTCGAAATATGCTTCAAC
TTGGTTAGTCATTGCTAGGACCTGCGCTCAAGAACTGCGGCATGCTGCATCTATTTGGAA
ACAGGCGATTCAAAATGATGTTCAAGAGGAAATCCTATCTAAACCTCAAGGGAAGAGCTT
TGTTCAGTCAGTGGGAGAAATTTACAGAGTAGTGAAAATCCTAAGAGCTTCGACGAGACT
ATATAAACCGTGGATTTTATTACACCCGACATCATCTACTGTGTTGGCTGTTTTGGACGA
GTGTGTGGAGTTGTGGCTAAGCTCTGGATTAGAAGAAGCTCTTCGGAATAATAATATCAC
CCGTCTCCAAGGACTTGACAGTGACTATTCTGCTGATCAGCTTCTAGAATCAATCAGATG
TATAGACGAAGTTGACGCCTTCACACTTCACGCCTGCATCACCTCAGATACATCACCTAC
CTGCTGCATTTCTGCCCTAAATAATGAAATAGTACCAGGAATTAAGATGGTGGAGTGGAA
CGGAGAGCATTACTTGGTGTCTCTTGCTAATCTATGGGCTAATCTGATCAGCCGCGACTC
ACCTGACCTTGCCAGCCCCAGTCTTTTTGCCCGGTCTTAGAAAAAACGTACACAACGATT
CATTACTCGCCAGGCATACAAATCCATTTTCTACTAAAATATAGATCCGTCCATATATAT
ACACTTATTTGTTTATAATATTTGAAGATGGTTTGGGTCATTTTATTGTATGCCATATAT
CGAATGGGTTTTGGTAGTTTCATTACTTGAGCATTTCCTAAGCTTTACAGAAGATTTGTT
TTGTCCGAACAAAGCAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B205TF U 1
AF RR4B205JQ C 627
BS 1 822 RR4B205TF
BS 823 823 RR4B205JQ
BS 824 862 RR4B205TF
BS 863 1217 RR4B205JQ

RD RR4B205TF 862 0 0
GCCTAATGATTACCTAGATGTCTTTCATAAGCTGAAGACTGAACTATCCTACCTTGCTCT
AACCCATCTTGAGACTTTAAAGGAAGCTCGTGACTTGGCTGCTAATTCTGATGAAGTCGC
TGAGGCTCAAAAATATGAAGATGAAATACAGGATCTGCAAAACATGCTGAAAAATGATGT
TTTGATCGGTGAGGTCAACGCAGAGAGTCTCCAAGTTAGATCATCTGGCACTACTGAACT
TTACAAAGTTCTCCAAGAGCCAAAGTTTCGTACAGTTGATTCAGAAGATCTCCTGTCAGA
GAGATTGTTACTAGCAGAGAAGGACTTGAAATCAACGATTGAACTTCTCAAACACGCCAC
GTTGACCCTGAAGGTTCTAAACTTGGGTTCACATGAGCAGCAGTCGAAATATGCTTCAAC
TTGGTTAGTCATTGCTAGGACCTGCGCTCAAGAACTGCGGCATGCTGCATCTATTTGGAA
ACAGGCGATTCAAAATGATGTTCAAGAGGAAATCCTATCTAAACCTCAAGGGAAGAGCTT
TGTTCAGTCAGTGGGAGAAATTTACAGAGTAGTGAAAATCCTAAGAGCTTCGACGAGACT
ATATAAACCGTGGATTTTATTACACCCGACATCATCTACTGTGTTGGCTGTTTTGGACGA
GTGTGTGGAGTTGTGGCTAAGCTCTGGATTAGAAGAAGCTCTTCGGAATAATAATATCAC
CCGTCTCCAAGGACTTGACAGTGACTATTCTGCTGATCAGCTTCTAGAATCAATCAGATG
TATAGACGAAGTTGACGCCTTCACACTTCACGCCTGCATCAC*TCAGATACATCACCTAC
CTGCTGCATTTCTGCCCTAAAT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4B205JQ 591 0 0
CGACATCATCTACTGTGTTGGCTGTTTTGGACGAGTGTGTGGAGTTGTGGCTAAGCTCTG
GATTAGAAGAAGCTCTTCGGAATAATAATATCACCCGTCTCCAAGGACTTGACAGTGACT
ATTCTGCTGATCAGCTTCTAGAATCAATCAGATGTATAGACGAAGTTGACGCCTTCACAC
TTCACGCCTGCATCACCTCAGATACATCACCTACCTGCTGCATTTCTGCCCTAAATAATG
AAATAGTACCAGGAATTAAGATGGTGGAGTGGAACGGAGAGCATTACTTGGTGTCTCTTG
CTAATCTATGGGCTAATCTGATCAGCCGCGACTCACCTGACCTTGCCAGCCCCAGTCTTT
TTGCCCGGTCTTAGAAAAAACGTACACAACGATTCATTACTCGCCAGGCATACAAATCCA
TTTTCTACTAAAATATAGATCCGTCCATATATATACACTTATTTGTTTATAATATTTGAA
GATGGTTTGGGTCATTTTATTGTATGCCATATATCGAATGGGTTTTGGTAGTTTCATTAC
TTGAGCATTTCCTAAGCTTTACAGAAGATTTGTTTTGTCCGAACAAAGCAA

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL5808Contig1 992 2 12 U
GCTTTCCTCTTTAATAATAATACTCAATCTCCTCCCAAAACCGAACCTTACAACGCAAGG
AGCAGACACAGGTTGATGCTTCTGTCTCTCAAGATCAGTTTGGTCCTAATCGTGATCCTC
GCTCTAGCCGGTTCCTTCTGGTGGACGGTCTCCATCTCCACCCTCCTCGAGAGGCCACGT
GTTTCACAACTACAGGAGGTTACCGGAGCAGCTCGTTTCAGACTTGTTGGATATTGGAGA
GATCTCTGCTGGTCCTAGTAAATGGAAAGAGTTGGAGTATTGTAATAGTATAGAAGAGTC
TGAGAACTATGTTCCTTGCTTTAATCTCTCTGAGAGTCTTGATCGGTTCTGTGGGTCGAG
ACAGGAGTGTTTGGTCTCACCTCCTGTGGATTACAAGGTTCCTCTTAGGTGGCCTACCGG
TAAAGATGTGATATGGTATCATAATGTGAAGATCACTGCTGATGAGGTGTTGACCTCTGG
TAGCATCAACAAGAGGATGATGATGATGGATGATGATCAGATCTCTTTCCGTTCCGCGTC
TCCTATGTTTGATGAGGTTGAAGATTACTCTCATCAGATTGCTCAGATGATTGGGATTAA
GAATGATAACTTCATTGAAGCTGGTGTAAGTCACACACACACACACTCAGTTTTGGACGA
GCTTCGTTCTATGACAGTGAAATCTCAAGGACAGAGCGACGGCCTGACAGAAACTACAAG
CCGAGAGATTGTTAAAACCAACAATGTACACGAAAAATCCAGTCAGAAACTGAGTGGTGA
CTCCTTTCGTGTTGAACGTACAAAGGAATGGTTAGAGAAGACAACATCTCATGTGAATAA
GCTGTTGTGTGAGACATTTCCTCATGTATGCTATTTTCTCCCTTGCTTAGTTCATCACTT
TTATCTCATATCCTTCTGAGTGGTGAATCTTAATTGATTTCAGATTCTTAGGCCCTGTTT
GTTTTTCTATTTCTAATCTCCATTCAGCTGTC


BQ
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AF RR4AB40TF U 1
AF RR4AB40JQ C 145
BS 1 162 RR4AB40TF
BS 163 163 RR4AB40JQ
BS 164 397 RR4AB40TF
BS 398 398 RR4AB40JQ
BS 399 408 RR4AB40TF
BS 409 409 RR4AB40JQ
BS 410 449 RR4AB40TF
BS 450 450 RR4AB40JQ
BS 451 466 RR4AB40TF
BS 467 467 RR4AB40JQ
BS 468 488 RR4AB40TF
BS 489 992 RR4AB40JQ

RD RR4AB40TF 488 0 0
GCTTTCCTCTTTAATAATAATACTCAATCTCCTCCCAAAACCGAACCTTACAACGCAAGG
AGCAGACACAGGTTGATGCTTCTGTCTCTCAAGATCAGTTTGGTCCTAATCGTGATCCTC
GCTCTAGCCGGTTCCTTCTGGTGGACGGTCTCCATCTCCACC*TCCTCGAGAGGCCACGT
GTTTCACAACTACAGGAGGTTACCGGAGCAGCTCGTTTCAGACTTGTTGGATATTGGAGA
GATCTCTGCTGGTCCTAGTAAATGGAAAGAGTTGGAGTATTGTAATAGTATAGAAGAGTC
TGAGAACTATGTTCCTTGCTTTAATCTCTCTGAGAGTCTTGATCGGTTCTGTGGGTCGAG
ACAGGAGTGTTTGGTCTCACCTCCTGTGGATTACAAG*TTCCTCTTAG*TGGCCTACCGG
TAAAGATGTGATATGGTATCATAATGTGA*GATCACTGCTGATGAG*TGTTGACCTCTGG
TAGCATCA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4AB40JQ 848 0 0
ACGGTCTCCATCTCCCCCCTCCTCGAGAGGCCACGTGTTTCACAACTACAGGAGGTTACC
GGAGCAGCTCGTTTCAGACTTGTTGGATATTGGAGAGATCTCTGCTGGTCCTAGTAAATG
GAAAGAGTTGGAGTATTGTAATAGTATAGAAGAGTCTGAGAACTATGTTCCTTGCTTTAA
TCTCTCTGAGAGTCTTGATCGGTTCTGTGGGTCGAGACAGGAGTGTTTGGTCTCACCTCC
TGTGGATTACAAGGTTCCTCTTAGGTGGCCTACCGGTAAAGATGTGATATGGTATCATAA
TGTGAAGATCACTGCTGATGAGGTGTTGACCTCTGGTAGCATCAACAAGAGGATGATGAT
GATGGATGATGATCAGATCTCTTTCCGTTCCGCGTCTCCTATGTTTGATGAGGTTGAAGA
TTACTCTCATCAGATTGCTCAGATGATTGGGATTAAGAATGATAACTTCATTGAAGCTGG
TGTAAGTCACACACACACACACTCAGTTTTGGACGAGCTTCGTTCTATGACAGTGAAATC
TCAAGGACAGAGCGACGGCCTGACAGAAACTACAAGCCGAGAGATTGTTAAAACCAACAA
TGTACACGAAAAATCCAGTCAGAAACTGAGTGGTGACTCCTTTCGTGTTGAACGTACAAA
GGAATGGTTAGAGAAGACAACATCTCATGTGAATAAGCTGTTGTGTGAGACATTTCCTCA
TGTATGCTATTTTCTCCCTTGCTTAGTTCATCACTTTTATCTCATATCCTTCTGAGTGGT
GAATCTTAATTGATTTCAGATTCTTAGGCCCTGTTTGTTTTTCTATTTCTAATCTCCATT
CAGCTGTC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5810Contig1 415 2 2 U
GAAGTCAAAACACTCATATAGTGACCATATCAATATGAGCAGAAAAGATGACAAGGATGA
GAGTTCGACATTTTACGATAACGCAACGAAAGTCATAGGTGTGGTTGGAGCCATTGGAGC
GGCCGTGAGTCTATTCTCGTGGATGACCTCAGGCTCGGAAGAGAACGGTCCAAAAGAGAA
GATGATGAAGGCTCCTGGTGGGAATGGTTCTATTATTCCTAGGGCACCTTTCGAAGCCAA
CCCAAGAGACCACTTCAAGAACCAGCGTCAGCTTAATAAGAAATGAAAAAAATGAGTATG
TGGAGATATTTATAATTTCCCACTTAGTATTCTATAACCGAATAATAAACCGTTGCATGT
GACAGATATATGTCTTATATGCAGCATGTTATATATATATATGTATTGCAACTTT


BQ
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AF RR4BL89JQ C 1
AF RR4BL89TF U 193
BS 1 192 RR4BL89JQ
BS 193 415 RR4BL89TF

RD RR4BL89JQ 415 0 0
GAAGTCAAAACACTCATATAGTGACCATATCAATATGAGCAGAAAAGATGACAAGGATGA
GAGTTCGACATTTTACGATAACGCAACGAAAGTCATAGGTGTGGTTGGAGCCATTGGAGC
GGCCGTGAGTCTATTCTCGTGGATGACCTCAGGCTCGGAAGAGAACGGTCCAAAAGAGAA
GATGATGAAGGCTCCTGGTGGGAATGGTTCTATTATTCCTAGGGCACCTTTCGAAGCCAA
CCCAAGAGACCACTTCAAGAACCAGCGTCAGCTTAATAAGAAATGAAAAAAATGAGTATG
TGGAGATATTTATAATTTCCCACTTAGTATTCTATAACCGAATAATAAACCGTTGCATGT
GACAGATATATGTCTTATATGCAGCATGTTATATATATATATGTATTGCAACTTT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4BL89TF 223 0 0
TCCTGGTGGGAATGGTTCTATTATTCCTAGGGCACCTTTCGAAGCCAACCCAAGAGACCA
CTTCAAGAACCAGCGTCAGCTTAATAAGAAATGAAAAAAATGAGTATGTGGAGATATTTA
TAATTTCCCACTTAGTATTCTATAACCGAATAATAAACCGTTGCATGTGACAGATATATG
TCTTATATGCAGCATGTTATATATATATATGTATTGCAACTTT

QA 1 223 1 223
DS 



AS 1 2

CO CL5811Contig1 1216 2 2 U
GAACCTCTGCATGTGTGTGATCTGCAGCAAGTTCGACTTTGCTGTCGACACGTGCCGCTG
GATCGGCTGCGACGTGTGTTCTCACTGGACTCATACTGATTGTGCCATCAGGGAGGGAGA
GATCTCGATGGGAGTCTCGGCTAAGAGCGTGTCTGGTATGGGAGAGATGCTGTTCAAGTG
CCGAGCTTGCAACCGTACTTCCTAGCTGCTCGGTTGGGTTAAAGACGTGTTTCACCACTG
TGTGCCGAACTGGGACAGGGAAGCTTTGGTGAAGGAGCTTGATTTCTTGAGGAGGATATT
CCGTGGGAGTGAAGATACGAGAGGCAGGAAGCTGTTCTGGAAGTGTGAGGAGATTATTGA
TAAGATTAAAGGTGGTTTGGCTGAAGCAACAGCTGCCAAGTTGATACTCATGTTCTTCCA
AGAAATTGAGTTGGACTCGCCAAAGAGCCTTGAGAACGGAGAAGGTGGAGGGATGATAGC
ACCGCAAGACGCGTGCAACCGCATTGCCGAAGTTGTGAAGGAGACACTGAGGAAGATGGA
GATAGTGGGCGAGGAGAAGACGAGGATGTACAAGAAAGCGAGGATGGGGCTAGAGGAATG
CGAGAGGGAGATGGAGGAGAAAGCTAAAGAAGTAGCGGAGCTGAAGATGGAGAGGCAGAA
GAAGAAACAGCAGATAGAGGAAGTGGAGAGGATCGTGAGGCTGAAACAAGCGGAGGCGGA
GATGTTTCAGTTGAAAGCGAACGAGGCGAAAATGGAAGCGGAGAGGCTGGAGAGGATCGT
GAAGGCGAAGAAGGAGAGGACTGAGGAAGAGTATGCTAGTAACTACTTGAAACAGAGGCT
GAGCGAGGCAGAGGCAGAGAAAGAGTATCTGTTTCAGAAGCTGAAAGAGCAAAAAAAAAG
TGGTGGAAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAGGCGTCACAGTCAGTGATGTACTCAAA
TATCAGAGAGATGCTGAGTGGATACAGTGCACCGTCGCCAAGAGTTGATCCAAGATCAAA
CCAGAGAAACCATTTTGGATCCAATCCTTGAAGTGTTTGTATTCATGTTCCAGCTTTGAA
TCAATTACTGTTGGATTCGCTTTGTTAACTGTGAAGTCTTGTAGTCGTTGTAATTGCATT
AATGTTTAATACCTGGTAACTTTTGTTAACTACATTGACTCCCTCTGTTTTTCTATTATT
TGTCAAGACTCCCTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK35TF U 1
AF RR4EK35JQ C 486
BS 1 708 RR4EK35TF
BS 709 1216 RR4EK35JQ

RD RR4EK35TF 708 0 0
GAACCTCTGCATGTGTGTGATCTGCAGCAAGTTCGACTTTGCTGTCGACACGTGCCGCTG
GATCGGCTGCGACGTGTGTTCTCACTGGACTCATACTGATTGTGCCATCAGGGAGGGAGA
GATCTCGATGGGAGTCTCGGCTAAGAGCGTGTCTGGTATGGGAGAGATGCTGTTCAAGTG
CCGAGCTTGCAACCGTACTTCCTAGCTGCTCGGTTGGGTTAAAGACGTGTTTCACCACTG
TGTGCCGAACTGGGACAGGGAAGCTTTGGTGAAGGAGCTTGATTTCTTGAGGAGGATATT
CCGTGGGAGTGAAGATACGAGAGGCAGGAAGCTGTTCTGGAAGTGTGAGGAGATTATTGA
TAAGATTAAAGGTGGTTTGGCTGAAGCAACAGCTGCCAAGTTGATACTCATGTTCTTCCA
AGAAATTGAGTTGGACTCGCCAAAGAGCCTTGAGAACGGAGAAGGTGGAGGGATGATAGC
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GATAGTGGGCGAGGAGAAGACGAGGATGTACAAGAAAGCGAGGATGGGGCTAGAGGAATG
CGAGAGGGAGATGGAGGAGAAAGCTAAAGAAGTAGCGGAGCTGAAGATGGAGAGGCAGAA
GAAGAAACAGCAGATAGAGGAAGTGGAGAGGATCGTGAGGCTGAAACA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4EK35JQ 731 0 0
AAGACGCGTGCAACCGCATTGCCGAAGTTGTGAAGGAGACACTGAGGAAGATGGAGATAG
TGGGCGAGGAGAAGACGAGGATGTACAAGAAAGCGAGGATGGGGCTAGAGGAATGCGAGA
GGGAGATGGAGGAGAAAGCTAAAGAAGTAGCGGAGCTGAAGATGGAGAGGCAGAAGAAGA
AACAGCAGATAGAGGAAGTGGAGAGGATCGTGAGGCTGAAACAAGCGGAGGCGGAGATGT
TTCAGTTGAAAGCGAACGAGGCGAAAATGGAAGCGGAGAGGCTGGAGAGGATCGTGAAGG
CGAAGAAGGAGAGGACTGAGGAAGAGTATGCTAGTAACTACTTGAAACAGAGGCTGAGCG
AGGCAGAGGCAGAGAAAGAGTATCTGTTTCAGAAGCTGAAAGAGCAAAAAAAAAGTGGTG
GAAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAGGCGTCACAGTCAGTGATGTACTCAAATATCA
GAGAGATGCTGAGTGGATACAGTGCACCGTCGCCAAGAGTTGATCCAAGATCAAACCAGA
GAAACCATTTTGGATCCAATCCTTGAAGTGTTTGTATTCATGTTCCAGCTTTGAATCAAT
TACTGTTGGATTCGCTTTGTTAACTGTGAAGTCTTGTAGTCGTTGTAATTGCATTAATGT
TTAATACCTGGTAACTTTTGTTAACTACATTGACTCCCTCTGTTTTTCTATTATTTGTCA
AGACTCCCTCT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5812Contig1 1236 2 2 U
GGAAGACTAATGGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTATGATAACAAGCTTGTGGCATTGTAATT
TAGATATGACTGATTCAGTTATTTCTTTGTTTTGATATTTTTGGCAGGAGCATCATGTCA
AAACATGCCACGGTTTAGTTTCAGTTGTAGTCTATGGAGACCAAGAGAAACCAGCATTGA
TCACTTATCCAGATGTAGCATTAAATTACTTGTCTTGCTTCCAAGGACTGTTTCTCTGCC
CTGAAGCGGTGTCCTTACTCCTCCATAACTTCTGCATCTACCATATTAGCCCCCCTGGAC
ATGAGAGTTTTTGTAGTTCGGAGCTGCTCCAGTTTGTTCCAATGATCCTTCGCCTTCTGT
TGAAGACCTCGCCGACCAGATTCTTGAAGTATTGAACTTCTTTAGCCTGGAGTCAGTGAT
TTGCATGGGGATCACAGCTGGTGCCTACATCCTCTCCTTATTTGCTATAAAACATAAAGA
TCGAGTTTTGGGTCTGATTCTGATATCGCCTCTATGCAAAGCACCCTCATGGTCCGAATG
GTTTTATTACAAGGTAGTGTCAAACTTGTTGTACTATTATGGCATGTCTGGATTGTTAAA
AGATCGTTTCCTTCAGAGGTACTTCAGTAAGGAAGCTCGTGGGAGCTCTGATGTTCCGGA
GCGTGATGTAGTACATGAATGCAGAAGGCTGCTTGGCGAAAGACACGGTATTAGCCTGCG
GAGGTTTCTGGAAGCAATCAACAGGAGACATGACATAACAGATGGGTTGAGGAGTTTGAA
ATGTCGTACACTCATATTTGTTGGTGACCAATCTCCTTTCCACTCTGAGACTCTTCACAT
GGTGGCTGCATTAGACAGAAAATACAGCGCCTTGGTTGAGGTGCAAGCTTGTGGATCAAT
GATGACAGAAGAGCAACCACATGCGATGTTGATACCAATGGAGTTCTTTTTCATGGGCTT
TGGGTTGCATCGGCCTGGTCGGGTTAGTGATAGCCCTACGAGTCCACTCAGTCCGTCGTG
AATTTCCCCAGAGCTTCTGTCTCCGGAGAGTCTTGGTTTGAAGCTGAAGCCAATAAAGAC
TCGGGTTCCCACCACGAAATGTTAAACCAAACATTGATTCATTTTTTTTTCTCATATTCT
TTGATTAAATTGTATTTGTTGTTGTACTCTCTTATATGTAGTCGGATTAAACTCAAAAAA
CACTTTTATGTAGTAAGAGATGGTAGTTTTATGGAC


BQ
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AF RR4E379TF U 1
AF RR4E379JQ C 452
BS 1 681 RR4E379TF
BS 682 1236 RR4E379JQ

RD RR4E379TF 681 0 0
GGAAGACTAATGGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTATGATAACAAGCTTGTGGCATTGTAATT
TAGATATGACTGATTCAGTTATTTCTTTGTTTTGATATTTTTGGCAGGAGCATCATGTCA
AAACATGCCACGGTTTAGTTTCAGTTGTAGTCTATGGAGACCAAGAGAAACCAGCATTGA
TCACTTATCCAGATGTAGCATTAAATTACTTGTCTTGCTTCCAAGGACTGTTTCTCTGCC
CTGAAGCGGTGTCCTTACTCCTCCATAACTTCTGCATCTACCATATTAGCCCCCCTGGAC
ATGAGAGTTTTTGTAGTTCGGAGCTGCTCCAGTTTGTTCCAATGATCCTTCGCCTTCTGT
TGAAGACCTCGCCGACCAGATTCTTGAAGTATTGAACTTCTTTAGCCTGGAGTCAGTGAT
TTGCATGGGGATCACAGCTGGTGCCTACATCCTCTCCTTATTTGCTATAAAACATAAAGA
TCGAGTTTTGGGTCTGATTCTGATATCGCCTCTATGCAAAGCACCCTCATGGTCCGAATG
GTTTTATTACAAGGTAGTGTCAAACTTGTTGTACTATTATGGCATGTCTGGATTGTTAAA
AGATCGTTTCCTTCAGAGGTACTTCAGTAAGGAAGCTCGTGGGAGCTCTGATGTTCCGGA
GCGTGATGTAGTACATGAATG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4E379JQ 785 0 0
TCCTCTCTTA
TTGCTATAAAACATAAAGATCGAGTTTTGGGTCTGATTCTGATATCGCCTCTATGCAAAG
CACCCTCATGGTCCGAATGGTTTTATTACAAGGTAGTGTCAAACTTGTTGTACTATTATG
GCATGTCTGGATTGTTAAAAGATCGTTTCCTTCAGAGGTACTTCAGTAAGGAAGCTCGTG
GGAGCTCTGATGTTCCGGAGCGTGATGTAGTACATGAATGCAGAAGGCTGCTTGGCGAAA
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ATGGGTTGAGGAGTTTGAAATGTCGTACACTCATATTTGTTGGTGACCAATCTCCTTTCC
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AGCTGAAGCCAATAAAGACTCGGGTTCCCACCACGAAATGTTAAACCAAACATTGATTCA
TTTTTTTTTCTCATATTCTTTGATTAAATTGTATTTGTTGTTGTACTCTCTTATATGTAG
TCGGATTAAACTCAAAAAACACTTTTATGTAGTAAGAGATGGTAGTTTTATGGAC

QA 11 785 11 785
DS 



AS 1 2

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AGGCCCATGCTTATGGCTCTCGCACTCTCTTCCAATTTCTTTGACAATCTCCCCAAAGCT
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TGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAGCATCTGCTGCTTATCTTGTTACTCTCTGCTTCTCATC
TTGTTGATCTTGGCTGAGCTTGGAGCTGCAGCTTTTATTTTCTTCGACAACAGCTGGAGA
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AACTGGAATATTGTCAGATGGGTTGCTCTAGGAGCCGTTGTTTTCGAGGCTTTGCTTTTC
TTGCTTGCCCTTATGGTCAGGGCAGCTAACACACCAGATGAGTATTACAGTGATGATGAG
TTTATTGCTCCTCCTAGGCAAATCAGGCAGCCATTCATCAACCGCCAACCCGCCCCTGTT
ACGGGTGTCCCTGTTGCTCCTACTTTGGACCAACGCCCGAGCCGCAGTGACCCTTGGAGC
GCACGTATGAGGGAGAAGTATGGGCTAGACACATCTGAGTTCACATACAATCCCTCAGAG
TCACACCGGTTCCAGCAAATGCCGACGCAACCAAATGAAGAAAAGGGACGATGTACCATC
ATGTGAGTCCCATGTTATAACGGCTCAAATCAAAAGTTCAGTCAATTCTCTTTTCTTGTT
ATCTTTTCTGTGTGTGTGTGTGTAACAATCAAGAGTGTCAGTGATATTATTAGAGGTATG
CTTCTATGGAAACTCTTTTTGTTGCGTCTGTGTAGTCTTTTTTGTAAGTACTTTACCATC
ATGAATATTCATCTTGGTTGTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAGCATCTGCTGCTTATCTTGTTACTCTCTGCTTCTCATC
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DS 

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TTATTGCTCCTCCTAGGCAAATCAGGCAGCCATTCATCAACCGCCAACCCGCCCCTGTTA
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TGTGAGTCCCATGTTATAACGGCTCAAATCAAAAGTTCAGTCAATTCTCTTTTCTTGTTA
TCTTTTCTGTGTGTGTGTGTGTAACAATCAAGAGTGTCAGTGATATTATTAGAGGTATGC
TTCTATGGAAACTCTTTTTGTTGCGTCTGTGTAGTCTTTTTTGTAAGTACTTTACCATCA
TGAATATTCATCTTGGTTGTCAG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GM65JQ C 1
AF RR4GM65TF U 1
BS 1 222 RR4GM65TF

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QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4GM65TF 222 0 0
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QA 1 222 1 222
DS 



AS 1 2

CO CL5815Contig1 1158 2 4 U
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TTCCTCACTCTTCAAGCTCTTACTTCTCCTGTAGATCACATACTTCCTTGGAAGCTAAGA
TCCTTCGTAACTCACCAAGAAACTCTGTTCACGTGATAGAGAGCAAAAGAAAGACTGTTT
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TCAACTTTCTTGTGAACCAAGATTCTTCTTCCTCTGCTTCTTCCAAAGTCATCGACATGA
ATAGCAGAGAATTCAAGAAGAGAATGTTCAAAGAGCTGAAGGTGTTTGACACAACGGATA
AAGCTTGTCCTGTAAGTAACCGAACCAAGGCATCGCGTAATCCCCATCATCTATCAGTGA
AGGTCAACAATAAAGAAGATGCACGTAGAAACCAAAAGAAACATCAGAGAACATCAGGAA
GAAGATCAGCATCAAACTCTCCTCGGATAAAAATCAAAGTGAGTTCTCCTAGAGTGCAAG
TCTCAGCGCGTAGAAGCAAATCGAGATCGCAGAGCAAACAAGTTCTTGAAAGTTTTGCAG
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AAGAGAACAACATCAGAGCTTCACAAGACTTTAGGGAACTGCTAGCATGTTACCTTTCAT
TGAATCCTATGGAGTATCATGATCTTATCCTTAAAGTTTTCGTTCAAGTTTGGCTTGAAG
TCATAAACTCCAAAGTTGCGTCCAAGTAAAAACATGTATCTGTTGTTAGCTATAAATAAT
TATCTGTTAAAAATAGTTGGTTCTTATTAAAGAGTGTTTTATCTTGTGTGGACATTTATC
TTTGCAAGACCAGTTTTTGTGTTTTGCCTGTTTAATGTAAAGACTAGACCGATCGCTCGC
TTTCTTGTCTATGGTTGTGATGTGATGTGTGAGCATAATGAACATACACATTCAATAATT
GAGCATTTTAACCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G

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DS 

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AGTGAGTTCTCCTAGAGTGCAAGTCTCAGCGCGTAGAAGCAAATCGAGATCGCAGAGCAA
ACAAGTTCTTGAAAGTTTTGCAGTGATCAAGAGCTCTCTTGATCCGAAGAAAGATTTTAG
AGAATCAATGGTGGAGATGATAGAAGAGAACAACATCAGAGCTTCACAAGACTTTAGGGA
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ATCTGTTGTTAGCTATAAATAATTATCTGTTAAAAATAGTTGGTTCTTATTAAAGAGTGT
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TAAAGACTAGACCGATCGCTCGCTTTCTTGTCTATGGTTGTGATGTGATGTGTGAGCATA
ATGAACATACACATTCAATAATTGAGCATTTTAACCAAACC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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CAAAAACAAACTTACTCAAGAGGATATGATCGCTCTTTCAGGGGCTCACACCCTCGGGTT
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CCCAAGAATCGCTATTAACATGGACCCAGTCACTCCAAGAACGTTCGACAACGTTTACTA
CAAGAATTTGCAACAAGGCAAAGGACTCTTCACTTCCGACCAAGTTTTTTTCACCGACCG
TCGCTCAAGACCCACCGTTGACGCTTGGGCAAAGAGCTCACCTGCTTTCAACGCCGCGTT
CATAAAAGCTATGACCAAGCTCGGCCGCGTTGGCGTTAAGGTTGGAAGCAACGGTAACAT
CCGTCGTGACTGTGGAGCGTTTAACTAAAGAGGGAAACTGAAAAGTTTATAAATCCTTTT
TCCGAGATTTGATTTACATTTTTATTTTAATTGTTTTTTTGTTTGTTTCTGCTTCTTGTG
TTCTTGAAAAACATTTAAATAA


BQ
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AF RR4BX93TF U 1
AF RR4BX93JQ C 469
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RD RR4BX93TF 713 0 0
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GGCGCGGTTTGGTCTAGTTCTCGCCATGGCTCTTTGCCTCACAGTCTCTGTGTTTCCGGA
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TCTCCGTCTCTTCTTCCATGATTGCTTCGTCAACGGATGTGATGCGTCGGTCATGATTCA
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CAAAGTTTCTTGTGCTGATATCCTAGCCTTAGCCACCCGTGATGTTATTGTCGCGGCTAA
AGGACCGTCGTACACAGTGGAACTCGGTAGGCGTGACGGTTTGGTATCGACCGCTGCTAG
CGTCAACGGAAACTTGCCAGGTCCAAATGACAATGTTGACAAACTCAACAAGCTCTTTGC
CAAAAACAAACTTACTCAAGAGGATATGATCGCTCTTTCAGGG*CTCACACCCTCGGGTT
CGCTCACTGTAGCAA*GTAGCCA*CAGAATCTACAACTTCA*CCGCACACACC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4BX93JQ 694 0 0
TGTCGCGGCTAAAGGACCGTCGTACACAGTGGAACTCGGTAGGCGTGACGGTTTGGTATC
GACCGCTGCTAGCGTCAACGGAAACTTGCCAGGTCCAAATGACAATGTTGACAAACTCAA
CAAGCTCTTTGCCAAAAACAAACTTACTCAAGAGGATATGATCGCTCTTTCAGGGGCTCA
CACCCTCGGGTTCGCTCACTGTAGCAAAGTAGCCAACAGAATTTACAACTTCAACCGCAC
ACACCCTGTTGATCCAACCATAAACAAAGCCTACGTTAAAGAGCTTCAAGCCGCTTGTCC
CAAGAAAGTTGACCCAAGAATCGCTATTAACATGGACCCAGTCACTCCAAGAACGTTCGA
CAACGTTTACTACAAGAATTTGCAACAAGGCAAAGGACTCTTCACTTCCGACCAAGTTTT
TTTCACCGACCGTCGCTCAAGACCCACCGTTGACGCTTGGGCAAAGAGCTCACCTGCTTT
CAACGCCGCGTTCATAAAAGCTATGACCAAGCTCGGCCGCGTTGGCGTTAAGGTTGGAAG
CAACGGTAACATCCGTCGTGACTGTGGAGCGTTTAACTAAAGAGGGAAACTGAAAAGTTT
ATAAATCCTTTTTCCGAGATTTGATTTACATTTTTATTTTAATTGTTTTTTTGTTTGTTT
CTGCTTCTTGTGTTCTTGAAAAACATTTAAATAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5817Contig1 752 2 2 U
ACAAAGGGAGTATTAAACTTTAGAGCAGTTCAACTTTTACAGAAACTGTATATAATAAAT
ACAGTAAAATGAGAAAGAAAACATAGACATCTATATGAAAGGGGTTATATCCAACTTGAT
TAATTTACGAAGATAGACCAGCAATGTATTTGATACCAGTTGCAGGCAGCCATAAGTTCC
CTTTTATGAACTGTGCCACCGTAAAGTTGATAGCTTCTGCCGAATTATTCAACAGATGGT
ACCCTGGCCACTTAACACGACGGTCAAGGCTAGCCCCCGGTACGTTGTTCATATATTCGG
CATAGTACAACGTGTCCAACGCAAAATTGCCGTTCCATTCGAGCCATCCTTCGGGCTTGA
GCACATCACTCATGTAGTTTTGCATGAACACTGTTCTAGAATATAGTTTCCATGGCCGAC
CCAGGTAAGTAGCAGTGGTATTTAAGTTTGGAAGTAGGTCTGTGTCAGCCGTTATGTTAC
TAAATTGGATCATGAATCCGGTTGGCTGGTTAGAATCTTTATGTCCTTGAGCCGTGATGC
TGTTCTTCTGGTTTGGTAAGCCTTGTTTTGCTTTGATTTGACAGTCTTGAAATACAGCTG
TAGCGTCTCCAAACATGAAATCCACGGTGCCCGTTATAATGCATTCTCTAAAGAATTGAC
GCATTGTGTGGGCGTAGAGAGTATCTTGATAACCTCTCATCGCACATCGGTAAAAAACTC
CGAGATCCGAGTCTGACCGGATTGCAACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AC07TF C 1
AF RR4AC07JQ U 9
BS 1 8 RR4AC07TF
BS 9 752 RR4AC07JQ

RD RR4AC07TF 752 0 0
ACAAAGGGAGTATTAAACTTTAGAGCAGTTCAACTTTTACAGAAACTGTATATAATAAAT
ACAGTAAAATGAGAAAGAAAACATAGACATCTATATGAAAGGGGTTATATCCAACTTGAT
TAATTTACGAAGATAGACCAGCAATGTATTTGATACCAGTTGCAGGCAGCCATAAGTTCC
CTTTTATGAACTGTGCCACCGTAAAGTTGATAGCTTCTGCCGAATTATTCAACAGATGGT
ACCCTGGCCACTTAACACGACGGTCAAGGCTAGCCCCCGGTACGTTGTTCATATATTCGG
CATAGTACAACGTGTCCAACGCAAAATTGCCGTTCCATTCGAGCCATCCTTCGGGCTTGA
GCACATCACTCATGTAGTTTTGCATGAACACTGTTCTAGAATATAGTTTCCATGGCCGAC
CCAGGTAAGTAGCAGTGGTATTTAAGTTTGGAAGTAGGTCTGTGTCAGCCGTTATGTTAC
TAAATTGGATCATGAATCCGGTTGGCTGGTTAGAATCTTTATGTCCTTGAGCCGTGATGC
TGTTCTTCTGGTTTGGTAAGCCTTGTTTTGCTTTGATTTGACAGTCTTGAAATACAGCTG
TAGCGTCTCCAAACATGAAATCCACGGTGCCCGTTATAATGCATTCTCTAAAGAATTGAC
GCATTGTGTGGGCGTAGAGAGTATCTTGATAACCTCTCATCGCACATCGGTAAAAAACTC
CGAGATCCGAGTCTGACCGGATTGCAACTGCC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4AC07JQ 744 0 0
AGTATTAAACTTTAGAGCAGTTCAACTTTTACAGAAACTGTATATAATAAATACAGTAAA
ATGAGAAAGAAAACATAGACATCTATATGAAAGGGGTTATATCCAACTTGATTAATTTAC
GAAGATAGACCAGCAATGTATTTGATACCAGTTGCAGGCAGCCATAAGTTCCCTTTTATG
AACTGTGCCACCGTAAAGTTGATAGCTTCTGCCGAATTATTCAACAGATGGTACCCTGGC
CACTTAACACGACGGTCAAGGCTAGCCCCCGGTACGTTGTTCATATATTCGGCATAGTAC
AACGTGTCCAACGCAAAATTGCCGTTCCATTCGAGCCATCCTTCGGGCTTGAGCACATCA
CTCATGTAGTTTTGCATGAACACTGTTCTAGAATATAGTTTCCATGGCCGACCCAGGTAA
GTAGCAGTGGTATTTAAGTTTGGAAGTAGGTCTGTGTCAGCCGTTATGTTACTAAATTGG
ATCATGAATCCGGTTGGCTGGTTAGAATCTTTATGTCCTTGAGCCGTGATGCTGTTCTTC
TGGTTTGGTAAGCCTTGTTTTGCTTTGATTTGACAGTCTTGAAATACAGCTGTAGCGTCT
CCAAACATGAAATCCACGGTGCCCGTTATAATGCATTCTCTAAAGAATTGACGCATTGTG
TGGGCGTAGAGAGTATCTTGATAACCTCTCATCGCACATCGGTAAAAAACTCCGAGATCC
GAGTCTGACCGGATTGCAACTGCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL5818Contig1 1222 2 2 U
GGAAGGGATGGTAGTGAGATGGGAAGGAGGAGTGATGAGATGTCTCGAGGAGTAGGAGAT
GAAGGAGAGGCAACGTTGGAGTGGGGAAGAAGATGCATTGCTACGTTCCTACGTGAGACA
GTTCGGTCCTAGAGAATGGCATCTAGTCTCTGAGCGTATGAACAAGCCTTTGAACCGTGA
CGCTAAGTCTTGTCTAGAGAGATGGAAGAACTATCTTAAGCCAGGGATCAAGAAAGGGTC
GTTGACCGAGGAAGAGCAGAGGCTCGTGATACGTTTGCAGGAGAAACACGGCAACAAGTG
GAAGAAGATAGCTGCTGAGGTTCCAGGGAGGACGGCGAAACGGTTAGGGAAGTGGTGGGA
AGTGTTTAAGGAGAAGCAACAGAGAGAAGAGAAAGAGAGTAACAAGAGAGTTGAGCCTAT
TGACGAGAGTAAGTACGATAGGATTCTCGAGAGTTTCGCTGAGAAGCTTGTCAAAGAGAG
GTCAGCTAACAGCGTTGGCTCTGTTTCTGTCTCTGTTCCTACGGTCATGGCTAGTTCAAA
CGGAGGGTTTCTACATTCTGATCAACAAGTTCCTCCTCCTCCTCCTTCTAATAATCATGT
GCTCCCGCCTTGGTTAGCTACTTCTAACAACGGGAGCAATGTTGTTGCTAGACCTCCCTC
GGTGACTCTTACTCTATCGCCTTCCACCGGGGCTGCAGCTTCTCCACAACAGCCTATCCC
ATGGCTGCAGCAGCAGCCTGAGGCCAGCTCTGGAGGTCTTGTGTTAGGTAGTATGGTGCC
GTCTTGTAGCGGTAGTAATGAGTGTGTTCATGTCAGAGCTTGTGGAGTGTTGTAGGGAGT
TGGAGGGAGGGCACAGAGCTTGGGCAGAGCATAAGAAGGAGGCGGCTTGGAGGCTAAGGA
GATTAGAGCTGCAGCTAGAGTCAGAGAAGACAAGTAGACAAAGGGAGAAGACGGAAGAGA
TTGAAGCAAAGATGAAGGCTCTGAGGGAAGAGCAGAAGATTGCAATGGAGAAGATTGAAG
GAGAGTATAGAGAACAGCTTGTTGGGTTGAGGAGAGACGCCGAGGCCAAGGACCAGAAAC
TTGCTGATCAATGGACCTCTAAGCATAACAGACTCAATAAGTTTCTTGAACAACACATGA
GCTGCAGGCAGAGACTATTATGATCTCTTTCTTGTCCTCTTTCTTTTGTAATGTAATGTA
AATTAAGCTATTTTTTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GAAGGAGAGGCAACGTTGGAGTGGGGAAGAAGATGCATTGCTACGTTCCTACGTGAGACA
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CGCTAAGTCTTGTCTAGAGAGATGGAAGAACTATCTTAAGCCAGGGATCAAGAAAGGGTC
GTTGACCGAGGAAGAGCAGAGGCTCGTGATACGTTTGCAGGAGAAACACGGCAACAAGTG
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TGACGAGAGTAAGTACGATAGGATTCTCGAGAGTTTCGCTGAGAAGCTTGTCAAAGAGAG
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CGGAGGGTTTCTACATTCTGATCAACAAGTTCCTCCTCCTCCTCCTTCTAATAATCATGT
GCTCCCGCCTTGGTTAGCTACTTCTAACAACGGGAGCAATGTTGTTGCTAGACCTCCCTC
GGTGACTCTTACTCTATCGCCTTCCACCGGGGCTGCAGCTTCTCCACAACAGCCTATCCC
ATGGCTGCAGCAGCAGCCTGAGGC
AGCTCTGG

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DS 

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CCCTCGGTGACTCTTACTCTATCGCCTTCCACCGGGGCTGCAGCTTCTCCACAACAGCCT
ATCCCATGGCTGCAGCAGCAGCCTGAGGCCAGCTCTGGAGGTCTTGTGTTAGGTAGTATG
GTGCCGTCTTGTAGCGGTAGTAATGAGTGTGTTCATGTCAGAGCTTGTGGAGTGTTGTAG
GGAGTTGGAGGGAGGGCACAGAGCTTGGGCAGAGCATAAGAAGGAGGCGGCTTGGAGGCT
AAGGAGATTAGAGCTGCAGCTAGAGTCAGAGAAGACAAGTAGACAAAGGGAGAAGACGGA
AGAGATTGAAGCAAAGATGAAGGCTCTGAGGGAAGAGCAGAAGATTGCAATGGAGAAGAT
TGAAGGAGAGTATAGAGAACAGCTTGTTGGGTTGAGGAGAGACGCCGAGGCCAAGGACCA
GAAACTTGCTGATCAATGGACCTCTAAGCATAACAGACTCAATAAGTTTCTTGAACAACA
CATGAGCTGCAGGCAGAGACTATTATGATCTCTTTCTTGTCCTCTTTCTTTTGTAATGTA
ATGTAAATTAAGCTATTTTTTTTCATC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5819Contig1 1192 2 4 U
GAGCATACTATGAGCTTTGGTTTAGGCATCTCAATCAGCAACCGGTTTACTGTTTTAATT
TTAATTTTATTTTGGTTAAGACTTTGGGCGATTGTCAGCCTTTTATCTTTTGTGAAAGTT
GGCCCTTTGTCTAGGCCTTTTAAGACTTTGTTGAGTCCACAAAGGGATGGCTTTATAACC
CCTTGTGGCTGACGAAATTTGGCACTTTAGTCTTGAATAAAATTTGTTTTGCCTTTGCAA
AGAAAACCCTAAGTCCTTCTAGTGTGAGAAGCAAGAGAGAGCAGCCTGAATCTTATCAAG
CTCCAACCATCAAGCTTGTGGCGATTCTTCATCCCATCAATCCCCCCAACGATTTGCCTT
GAGGGTGATACACATCCAGCAAGGCCAATCCCATCTTCTACTCATCATCCATCCACTGAT
CTGTTGAGAGAGACACACATCCAGCAACAGATTCCATCACCATCTCTATCCTTTTTATTT
CTCTTGTTTTTATTTCTGTTTGCATCTTTTGTTTGATTCATTTTTATAAATCTAAAATCC
ATAAAAATCATCTCTGTTTCTGTTCTTGTTTTATTTTCATAGTTTGGCTTCTGTTCTTCA
TTTTTATAAATCCATAAAACTCATAAAAAGTTTTTTTTGTTTCAGGTACAGTTTTGGCCG
ATTTGATCCAAGCATCAAGTTCTTTCAAAACCAGTACCAAAATCGACCAGGATCATATTT
TCCAAGCCACTAGTTTGCAGCCCGGTTCCCAGCCTGTAACATTTGGTATCAGAGCCAAAG
GCTCCAAAAGATTTGGTTATTTCAATCCTTTAGTTCATTTTGTTGTCTGTTTTGCATTTG
CATCTTTAAAAAAAAAAAAAAAATTTGTTCTTGCTGTTCTTGCTTGTTCTTGCTTTTCAT
CATAGTGTTCATCATAGGCTTGCTAGATCATTTCGTGGGTTGCATCATTTAGTTAACCTG
TTTGTGCATCTTGGTCGATTTTGCTTTCCATATTTTGTATTAATTGATCATTCTTGCATT
TATTTGTTTGCATTTGCATTCCATATTTAGTAGATTGATTAGTTTGCATTTAATCCTGAT
TAGAATCTCATTTAGTTTGCATTTATTCTTGTCAATCATCATTTAATTTTGATTTGCATT
TAAAGTTTGATTTTCTTTCTCTTTTTAAATTTTTTCGATTTTAATTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GI68TF U 1
AF RR4GI68JQ C 402
BS 1 585 RR4GI68TF
BS 586 586 RR4GI68JQ
BS 587 629 RR4GI68TF
BS 630 1192 RR4GI68JQ

RD RR4GI68TF 629 0 0
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TTAATTTTATTTTGGTTAAGACTTTGGGCGATTGTCAGCCTTTTATCTTTTGTGAAAGTT
GGCCCTTTGTCTAGGCCTTTTAAGACTTTGTTGAGTCCACAAAGGGATGGCTTTATAACC
CCTTGTGGCTGACGAAATTTGGCACTTTAGTCTTGAATAAAATTTGTTTTGCCTTTGCAA
AGAAAACCCTAAGTCCTTCTAGTGTGAGAAGCAAGAGAGAGCAGCCTGAATCTTATCAAG
CTCCAACCATCAAGCTTGTGGCGATTCTTCATCCCATCAATCCCCCCAACGATTTGCCTT
GAGGGTGATACACATCCAGCAAGGCCAATCCCATCTTCTACTCATCATCCATCCACTGAT
CTGTTGAGAGAGACACACATCCAGCAACAGATTCCATCACCATCTCTATCCTTTTTATTT
CTCTTGTTTTTATTTCTGTTTGCATCTTTTGTTTGATTCATTTTTATAAATCTAAAATCC
ATAAAAATCATCTCTGTTTCTGTTCTTGTTTTATTTTCATAGTTTTGCTTCTGTTCTTCA
TTTTTATAAATCCATAAAACTCATAAAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4GI68JQ 791 0 0
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TTTTATAAATCTAAAATCCATAAAAATCATCTCTGTTTCTGTTCTTGTTTTATTTTCATA
GTTTGGCTTCTGTTCTTCATTTTTATAAATCCATAAAACTCATAAAAAGTTTTTTTTGTT
TCAGGTACAGTTTTGGCCGATTTGATCCAAGCATCAAGTTCTTTCAAAACCAGTACCAAA
ATCGACCAGGATCATATTTTCCAAGCCACTAGTTTGCAGCCCGGTTCCCAGCCTGTAACA
TTTGGTATCAGAGCCAAAGGCTCCAAAAGATTTGGTTATTTCAATCCTTTAGTTCATTTT
GTTGTCTGTTTTGCATTTGCATCTTTAAAAAAAAAAAAAAAATTTGTTCTTGCTGTTCTT
GCTTGTTCTTGCTTTTCATCATAGTGTTCATCATAGGCTTGCTAGATCATTTCGTGGGTT
GCATCATTTAGTTAACCTGTTTGTGCATCTTGGTCGATTTTGCTTTCCATATTTTGTATT
AATTGATCATTCTTGCATTTATTTGTTTGCATTTGCATTCCATATTTAGTAGATTGATTA
GTTTGCATTTAATCCTGATTAGAATCTCATTTAGTTTGCATTTATTCTTGTCAATCATCA
TTTAATTTTGATTTGCATTTAAAGTTTGATTTTCTTTCTCTTTTTAAATTTTTTCGATTT
TAATTCTTTCC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL5820Contig1 1142 2 2 U
GGGGAGGGGTATGGCGCAAGGAAGCATGGACCCTGATGCTCTGGACGATATCATTCGGCG
TTTGCTTGATTACAGAAACACAAAGCCAGCAGGGCCGAAGCAGTCTATGATGCTCAACGA
CTCTGAGATCCGACAGCTTTGCGTTGTCTCCAAACAGATATTCCTTCAGCAGCCCAGTCT
CCTTGAGCTCGATGCCCCCGTCAAGATCTGTGGTGATATTCACGGTCAATACTCAGATTT
ACTGCGACTTTTCGAGTACGGTGGATTCCCACCTGCAGCAAACTACTTGTTCTTAGGAGA
TTACGTAGACCGTGGGAAGCAGAGTTTGGAGTCTATCTGTCTTCTCCTTGCCTACAAGAT
CAAATACCCCGAGAACTTCTTCCTCTTGAGAGGAAACCACGAGTGCGCATCCATCAACAG
AATCTACGGTTTCTACGACGAGTGTAAACGGAGGTTCAGCGTCAAGCTCTGGAAAGTGTT
TACCGACTGTTTCAACTGTCTCCCTTTGGCTGCTGTCATAGACGAGAAGATACTTTGTAT
GCACGGCGGTCTCTCTCCTGATCTCACCAGCGTCGAGCAGATTAAGAACATCGAGCGTCC
GACTGATATTCCGGACTCTGGTTTGCTCTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCTAGTAAAGG
CGTCAAGGGGTGGGGGATGAATGACCGTGGCGTCTCCTACACTTTTGGTGCTGACAAAGT
CGCCGAGTTTCTAATTAAAAACGATATGGATTTAGTCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTAGA
GGATGGGTATGAGTTCATTGCTGATAGACAGCTTGTGACTATATTCTCTGCTCCAAACTA
CTGTGGTGAGTTCGATAATGCGGGCGCTATGATGAGCGTCGATGAAAGTTTGATGTGCTC
TTTCCAAATTCTTAAGCCTGCCGATCGAAAGCCAAGGTTCTTCTGAAACACACATACGAA
ACCGTTGGACTTCCCACTTGCTACCTTGGTTTCATCTGAAATACTAAAAAAAGTTATCTC
ATCTCAGACTAAGTCCATGACTAAGCTTTGATCGCATCTGTAAGAGTTTGGATTTTACCA
ATAGTGACTCGTTTGATGTACAGAGATACCTTTTTTAAAGAGTTTGTAACAAAATTTTTT
CC


BQ
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10 10 

AF RR4CG87TF U 1
AF RR4CG87JQ C 426
BS 1 649 RR4CG87TF
BS 650 1142 RR4CG87JQ

RD RR4CG87TF 649 0 0
GGGGAGGGGTATGGCGCAAGGAAGCATGGACCCTGATGCTCTGGACGATATCATTCGGCG
TTTGCTTGATTACAGAAACACAAAGCCAGCAGGGCCGAAGCAGTCTATGATGCTCAACGA
CTCTGAGATCCGACAGCTTTGCGTTGTCTCCAAACAGATATTCCTTCAGCAGCCCAGTCT
CCTTGAGCTCGATGCCCCCGTCAAGATCTGTGGTGATATTCACGGTCAATACTCAGATTT
ACTGCGACTTTTCGAGTACGGTGGATTCCCACCTGCAGCAAACTACTTGTTCTTAGGAGA
TTACGTAGACCGTGGGAAGCAGAGTTTGGAGTCTATCTGTCTTCTCCTTGCCTACAAGAT
CAAATACCCCGAGAACTTCTTCCTCTTGAGAGGAAACCACGAGTGCGCATCCATCAACAG
AATCTACGGTTTCTACGACGAGTGTAAACGGAGGTTCAGCGTCAAGCTCTGGAAAGTGTT
TACCGACTGTTTCAACTGTCTCCCTTTGGCTGCTGTCATAGACGAGAAGATACTTTGTAT
GCACGGCGGTCTCTCTCCTGATCTCACCAGCGTCGAGCAGATTAAGAACATCGAGCGTCC
GACTGATATTCCGGACTCTGGTTTGCTCTGTGACCTTCTTTGGTCTGAT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4CG87JQ 717 0 0
ACGGTTTCTACGACGAGTGTAAACGGAGGTTCAGCGTCAAGCTCTGGAAAGTGTTTACCG
ACTGTTTCAACTGTCTCCCTTTGGCTGCTGTCATAGACGAGAAGATACTTTGTATGCACG
GCGGTCTCTCTCCTGATCTCACCAGCGTCGAGCAGATTAAGAACATCGAGCGTCCGACTG
ATATTCCGGACTCTGGTTTGCTCTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCTAGTAAAGGCGTCA
AGGGGTGGGGGATGAATGACCGTGGCGTCTCCTACACTTTTGGTGCTGACAAAGTCGCCG
AGTTTCTAATTAAAAACGATATGGATTTAGTCTGCCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATG
GGTATGAGTTCATTGCTGATAGACAGCTTGTGACTATATTCTCTGCTCCAAACTACTGTG
GTGAGTTCGATAATGCGGGCGCTATGATGAGCGTCGATGAAAGTTTGATGTGCTCTTTCC
AAATTCTTAAGCCTGCCGATCGAAAGCCAAGGTTCTTCTGAAACACACATACGAAACCGT
TGGACTTCCCACTTGCTACCTTGGTTTCATCTGAAATACTAAAAAAAGTTATCTCATCTC
AGACTAAGTCCATGACTAAGCTTTGATCGCATCTGTAAGAGTTTGGATTTTACCAATAGT
GACTCGTTTGATGTACAGAGATACCTTTTTTAAAGAGTTTGTAACAAAATTTTTTCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5821Contig1 885 2 4 U
TTCATCATTGGTGCTTCTTGTCCTAAAGATGGTTGTGTTTGTATGTAATGGGATAAACTA
GTTAAGGTGGCTTTGGTTGGTTCTTGTCTGCTTCAGGTGTCTATCGAGTTTGGTCTGAGT
GAGATGATGAACAGTATGGCTATTAGGTCTGAGATTGCTCCAAAAGATGGAAAATTCGAA
TTCAAGATTTCAGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGGTGGATCATAATATTGAT
CCTGTTTATAAAGAGATGCCACAATGGGAAGAGACTGTGGAAGAATGCACAGAACGGTTT
CTTAGTTTGGTGAAGACTCTTGCTGATAAGTACCCTTCAGAGAACTTGCTCTTAGTCACT
CACGGTAAAGCAAAACAATATTTTTGGTTATGTGGAACGTGTACTCACACTCTATCCAGT
AGCAAAAGAGTCTATGATAATCCCTTTCGTTAATCATATGTTAAAAATGTGTGTTGACTT
GTAAGAACTTGTATGTGCAGGGGAAGGAGTAAGGACTACATTTGCAACCTTTAAAGACGT
AGATGTGTATGAGGTAGAGTATTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGACAGGTCTCGTGTCA
AGAAGGGTTTGCTAAAGCTGGAGACTTTGAAGTGATTACAAGTCTTGGTCAAGCTGGAAT
CAAGTACCATTCCTTGAAAACCACACCAGTACCAAGTGTGAAGTGGTTTTAAGTCATGGT
CAAGCTGGAACCAGATTTAGTCATAAGCCGAACACCGGTTTATTGAACTGCCTTTAGTTC
CTCTGTTTATGTACTATCTGGTTGTATTTGAGTTGCTTTTGCATGAATTATGAAATATAT
TTTCGAAGTTTGATTCAGTCAAATAAGATAATTACATTTCTGGCG


BQ
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AF RR4HA41TF U 1
AF RR4HA41JQB C 109
BS 1 284 RR4HA41TF
BS 285 285 RR4HA41JQB
BS 286 337 RR4HA41TF
BS 338 885 RR4HA41JQB

RD RR4HA41TF 337 0 0
TTCATCATTGGTGCTTCTTGTCCTAAAGATGGTTGTGTTTGTATGTAATGGGATAAACTA
GTTAAGGTGGCTTTGGTTGGTTCTTGTCTGCTTCAGGTGTCTATCGAGTTTGGTCTGAGT
GAGATGATGAACAGTATGGCTATTAGGTCTGAGATTGCTCCAAAAGATGGAAAATTCGAA
TTCAAGATTTCAGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGGTGGATCATAATATTGAT
CCTGTTTATAAAGAGATGCCACAATGGGAAGAGACTGTGGAAGA*TGCACAGAACGGTTT
CTTAGTTTGGTGAAGACTCTTGCTGATAAGTACCCTT

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR4HA41JQB 777 0 0
TTTGGTCTGAGTGAGATGATGAACAGTATGGCTATTAGGTCTGAGATTGCTCCAAAAGAT
GGAAAATTCGAATTCAAGATTTCAGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGGTGGAT
CATAATATTGATCCTGTTTATAAAGAGATGCCACAATGGGAAGAGACTGTGGAAGAATGC
ACAGAACGGTTTCTTAGTTTGGTGAAGACTCTTGCTGATAAGTACCCTTCAGAGAACTTG
CTCTTAGTCACTCACGGTAAAGCAAAACAATATTTTTGGTTATGTGGAACGTGTACTCAC
ACTCTATCCAGTAGCAAAAGAGTCTATGATAATCCCTTTCGTTAATCATATGTTAAAAAT
GTGTGTTGACTTGTAAGAACTTGTATGTGCAGGGGAAGGAGTAAGGACTACATTTGCAAC
CTTTAAAGACGTAGATGTGTATGAGGTAGAGTATTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGACA
GGTCTCGTGTCAAGAAGGGTTTGCTAAAGCTGGAGACTTTGAAGTGATTACAAGTCTTGG
TCAAGCTGGAATCAAGTACCATTCCTTGAAAACCACACCAGTACCAAGTGTGAAGTGGTT
TTAAGTCATGGTCAAGCTGGAACCAGATTTAGTCATAAGCCGAACACCGGTTTATTGAAC
TGCCTTTAGTTCCTCTGTTTATGTACTATCTGGTTGTATTTGAGTTGCTTTTGCATGAAT
TATGAAATATATTTTCGAAGTTTGATTCAGTCAAATAAGATAATTACATTTCTGGCG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL5822Contig1 1267 2 4 U
GGGCGGCATTCGTCTTTGGGTTCTCTCTTTCTACAAGCTTCTCTGCAATCTGACATTCCT
AATGGCGAATAATGAAGAACACTTCGAAGATTCAAACTCCATTGGAGGAGATACGTTTGG
CGCAGTAAAACAACGTTTCAAGGATCGATCAAAGAAAGTTATTCATACCAGAGAGTTATT
ATCTAAACAAGCGGTGCAGACGCGCGAGATCTTATCCAAACAGGCCGTTAAGATCGCCAA
ACAAGCCGAAGAACACGAAAGATTCATCAACAAGGTTACACATCTTGTTGGGGTGCTCGG
ATTTGGAGGTTTTTGTTTCCTACTTGGAGCAAGGCCACAGGACATTCCTCTCGTTTACTG
CCTCTTCTATGTCATCTTTGTTCCTCTCCGATGGATATATTACCGGTTTAAGAAGTGGCA
TTATTATCTTCTGGACTTTTGCTACTACGCCAACACAATCTTCTTGGTTGATCTTCTTTT
GTATCCTAAAAATGAAAAGCTTTTCATGGTTTGCTTCACGATTAGGTGGTGGAACCCAGC
GACATTTGCAGCTATGCGCCCTATGGGCACCGATCGCAGGGTTTCATGGCCTTGCGTAGA
AGACAAATCTTACCTTTTCACATGGCTGTTTCTCATCCCCCTTGGTGGTTTATACTCTTT
GGCAAGTGCTCTATTTTCTTATCGTCAATGTCCTGCGTAGGCAGAGACTCCTGAGAGATC
CTGAAGTTATGACTTCATACAGAGAATTGTCCAAGAAAGCTCAGAAGGCAAACAATAAGT
TATGGCAGCTCAGCGGTGTACTAGGCGATCAGAACCGTATGTGGATGTACATCCTCTTCC
AGGCCATCTTCACGGTGGCGACTATGGCACTGACCGTACCCATCTTCTTATCGTATAGAC
TTCACGTGATCTTTCAGATCTTAAAGATTTCAGCGGCAGTGTGGAACGGAGGGAGCTTTT
TACTTGAGGTAATGCCACGGCAAGTGATTCAGAAAGAGAAGAAGAAGAAAACAGAGATGC
AGCCGATAGAGGAGCAGCCTCCGTCGCAACATGAACCAACAGGTGTTACCTCCAACTCAG
AGTGAGCCAAAATCTACTACTGAAACATGATGGTACATATTAAAATAATGTTTCCCAATG
CATGCCAGAATCATGGTTGTTGTTTCTTTTTTCCTCTGAAACGGTTTTTTCATATGGTCG
GTTACATCATTCTAAAATGTTACATTGAATTATCTTTCTATATCAGTTGGGTTTGCTTCT
CTTTACT


BQ
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AF RR4FW24TF U 1
AF RR4FW24JQ C 594
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BS 641 641 RR4FW24JQ
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BS 694 1267 RR4FW24JQ

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ATTTGGAGGTTTTTGTTTCCTACTTGGAGCAAGGCCACAGGACATTCCTCTCGTTTACTG
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TTATTATCTTCTGGACTTTTGCTACTACGCCAACACAATCTTCTTGGTTGATCTTCTTTT
GTATCCTAAAAATGAAAAGCTTTTCATGGTTTGCTTCACGATTAGGTGGTGGAACCCAGC
GACATTTGCAGCTATGCGCCCTATGGGCACCGATCGCAGGGTTTCATGGCCTTGCGTAGA
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GGCAAGTGCTCTATTTTCTTATCGTCAATGTCC

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DS 

RD RR4FW24JQ 674 0 0
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ACTCTTTGGCAAGTGCTCTATTTTCTTATCGTCAATGTCCTGCGTAGGCAGAGACTCCTG
AGAGATCCTGAAGTTATGACTTCATACAGAGAATTGTCCAAGAAAGCTCAGAAGGCAAAC
AATAAGTTATGGCAGCTCAGCGGTGTACTAGGCGATCAGAACCGTATGTGGATGTACATC
CTCTTCCAGGCCATCTTCACGGTGGCGACTATGGCACTGACCGTACCCATCTTCTTATCG
TATAGACTTCACGTGATCTTTCAGATCTTAAAGATTTCAGCGGCAGTGTGGAACGGAGGG
AGCTTTTTACTTGAGGTAATGCCACGGCAAGTGATTCAGAAAGAGAAGAAGAAGAAAACA
GAGATGCAGCCGATAGAGGAGCAGCCTCCGTCGCAACATGAACCAACAGGTGTTACCTCC
AACTCAGAGTGAGCCAAAATCTACTACTGAAACATGATGGTACATATTAAAATAATGTTT
CCCAATGCATGCCAGAATCATGGTTGTTGTTTCTTTTTTCCTCTGAAACGGTTTTTTCAT
ATGGTCGGTTACATCATTCTAAAATGTTACATTGAATTATCTTTCTATATCAGTTGGGTT
TGCTTCTCTTTACT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL5823Contig1 1154 2 2 U
GGGGATGGATCAACTCACGGGCTCCGGATACAAGCTCTCTTACATAACGACCACGACCAG
ACACCAAGTGAAGGTGAAGATAATCTTGCCGAGAAAAGTAGTGAATTTAACTTCTTTCCT
GGGGATATCTTCTCTTTGTCACAGGAAAAGCTTGAGAGTGTAATCGATGTGGAGACATCT
CTTGCAGTTCCTCAGGGTGCAGGGGGAAACCGAGCTGGGCTATTTAGAACTCCTATATCT
GGTGGAGTTCAGAATGCTACATCAGCTCATGCCTTACCTCGTCCTGCGTTAGCTGTACGC
AACTTGCTGGAGCTGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAATGATGTCTAAAATGCACCAC
CGTAGAGAAGGGTACCCATTTGGCTCTTTGGTTGATTTTGCACCTGATCCTATGGGCCAT
CCAATATTCTTACTTTCACCGTTGGCCATCCACACACGAAACCTCTTGGCTGAACCTAGA
TGCAGTCTCGTTGTTCAGATGCCTGGATGGAGTTGCTTATCAAATGCAAGAGTGACATTA
TTTGGTGATGTGTACCCATTGTCCGATGATGAACAGGAGTGGGCTCATAAGCAATACATT
GCAAAGCACCAACACGGAACTTCCGAGCAGTGGGGAAACTTTCACTATTTTAGAATGCAC
AACATAAGTGATATATATTTCATTGGAGGGTTTGGAACGGTCGCATGGGTTGATGTCAAA
GAGTATGAGGCCTTACAGCCAGACAAAATCGCTGTTGATGGTGGTGAGCAGAACCTCAAG
GAACTAAATGCCATCTTTTCAAAGCCGCTTAGAGAGCTACTGTCTTTTGCTGAATCAGAG
GTAGGCGACGCTGCTCTCATTTCTATTGATAGCAAAGGGATAGATGTACGGGTTCGTCAA
GGTGCTCAGTTCAACATACAAAGGTTAGCATTTGAAGAAGGGCATGGTGTTGAAACGCTA
GAAGAAGCTAAAGCTGCACTATGGAAAGTGATAGAGAAGGTCAAACTGAACTATTTGCCG
AAATGACCAAGAACCTTAGAGTTTGCAGAAATAACCAAACCTCCTTTTCTCTATGTTTTT
TGTTTGGCCAAAATGTATGTCAATCTGGAACTACGGGATTGAGATCTGAGTTTAATAATA
TTTGGGGTTTTATT


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AF RR4CG61TF U 1
AF RR4CG61JQ C 413
BS 1 636 RR4CG61TF
BS 637 1154 RR4CG61JQ

RD RR4CG61TF 636 0 0
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ACACCAAGTGAAGGTGAAGATAATCTTGCCGAGAAAAGTAGTGAATTTAACTTCTTTCCT
GGGGATATCTTCTCTTTGTCACAGGAAAAGCTTGAGAGTGTAATCGATGTGGAGACATCT
CTTGCAGTTCCTCAGGGTGCAGGGGGAAACCGAGCTGGGCTATTTAGAACTCCTATATCT
GGTGGAGTTCAGAATGCTACATCAGCTCATGCCTTACCTCGTCCTGCGTTAGCTGTACGC
AACTTGCTGGAGCTGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAATGATGTCTAAAATGCACCAC
CGTAGAGAAGGGTACCCATTTGGCTCTTTGGTTGATTTTGCACCTGATCCTATGGGCCAT
CCAATATTCTTACTTTCACCGTTGGCCATCCACACACGAAACCTCTTGGCTGAACCTAGA
TGCAGTCTCGTTGTTCAGATGCCTGGATGGAGTTGCTTATCAAATGCAAGAGTGACATTA
TTTGGTGATGTGTACCCATTGTCCGATGATGAACAGGAGTGGGCTCATAAGCAATACATT
GCAAAGCACCAACACGGAACTTCCGAGCAGTGGGGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4CG61JQ 742 0 0
TGGGCCATCCAATATTCTTACTTTCACCGTTGGCCATCCACACACGAAACCTCTTGGCTG
AACCTAGATGCAGTCTCGTTGTTCAGATGCCTGGATGGAGTTGCTTATCAAATGCAAGAG
TGACATTATTTGGTGATGTGTACCCATTGTCCGATGATGAACAGGAGTGGGCTCATAAGC
AATACATTGCAAAGCACCAACACGGAACTTCCGAGCAGTGGGGAAACTTTCACTATTTTA
GAATGCACAACATAAGTGATATATATTTCATTGGAGGGTTTGGAACGGTCGCATGGGTTG
ATGTCAAAGAGTATGAGGCCTTACAGCCAGACAAAATCGCTGTTGATGGTGGTGAGCAGA
ACCTCAAGGAACTAAATGCCATCTTTTCAAAGCCGCTTAGAGAGCTACTGTCTTTTGCTG
AATCAGAGGTAGGCGACGCTGCTCTCATTTCTATTGATAGCAAAGGGATAGATGTACGGG
TTCGTCAAGGTGCTCAGTTCAACATACAAAGGTTAGCATTTGAAGAAGGGCATGGTGTTG
AAACGCTAGAAGAAGCTAAAGCTGCACTATGGAAAGTGATAGAGAAGGTCAAACTGAACT
ATTTGCCGAAATGACCAAGAACCTTAGAGTTTGCAGAAATAACCAAACCTCCTTTTCTCT
ATGTTTTTTGTTTGGCCAAAATGTATGTCAATCTGGAACTACGGGATTGAGATCTGAGTT
TAATAATATTTGGGGTTTTATT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL5824Contig1 732 2 3 U
CGCAAAGAAAGTATACTGTAAAGCTTCCTCGCTGTTCTGTGTATTGATGACAGTTAAGGA
TGTGCAACTTAGCTTCTTATACTCCCTCAGTAGTTGGCAGATTGTTGTTTTGCCTTCCCC
AGTTTCACCAACAAGAAGAACAGGCTCACGCAGTTTATAAGAACGTTCAATGAGAAAAAA
TAGTCTCCACATACTTCGAGTCCAGGTGACTATTTTGTTTTCCCAGACTTGGGAGTGATC
CAAGAGCATCTTCTACGGCCATCAGAGAAGCAATCACTCGCCTCTTCATCTCTCTCCCCT
TTCAGATTCCTTCTCAAAGAAGATGAAGAGTTTGACCCGCCACGCCACAGAGCCCTCTTC
CCGCTCGAAGAAGAAGAAGACGCAATACTCAACGGCTACGACTCGCACGAGGAAGAAGAA
GAAGAAGACGCAATACTTCAAAATAGTTCCCCACCAATGGCAAAAAGCTTTAGACTAAGG
GATCGTTAAGTGTAGAGAGAAACCCAGATGGAGGAGAGGCAAAAAATCAAAACTTTATGA
AAATTAAAGAGTAAGAAGATGGTACCACAGTGAGAAGGAGAAGAGGGAAGAGAGACAATG
GGCTGGGTGTTTTGATTCGCGGAAAAGCTGTTCTTCGCTTTGCCCATTTGATTCAGAAAG
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ATGGCAACATCC


BQ
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AF RR4GO78JQ U 61
AF RR4GO78TF C 1
BS 1 67 RR4GO78TF
BS 68 285 RR4GO78JQ
BS 286 732 RR4GO78TF

RD RR4GO78JQ 231 0 0
GTGCAAC
CTTAGCTTCTTATACTCCCTCAGTAGTTGGCAGATTGTTGTTTTGCCTTCCCCAGTTTCA
CCAACAAGAAGAACAGGCTCACGCAGTTTATAAGAACGTTCAATGAGAAAAAATAGTCTC
CACATACTTCGAGTCCAGGTGACTATTTTGTTTTCCCAGACTTGGGAGTGATCCAAGAGC
ATCTTCTACGGCCATCAGAGAAGCAATCACTCGCCTCT
CATCTC

QA 8 225 8 225
DS 

RD RR4GO78TF 732 0 0
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TGTGCAACTTAGCTTCTTATACTCCCTCAGTAGTTGGCAGATTGTTGTTTTGCCTTCCCC
AGTTTCACCAACAAGAAGAACAGGCTCACGCAGTTTATAAGAACGTTCAATGAGAAAAAA
TAGTCTCCACATACTTCGAGTCCAGGTGACTATTTTGTTTTCCCAGACTTGGGAGTGATC
CAAGAGCATCTTCTACGGCCATCAGAGAAGCAATCACTCGCCTCTTCATCTCTCTCCCCT
TTCAGATTCCTTCTCAAAGAAGATGAAGAGTTTGACCCGCCACGCCACAGAGCCCTCTTC
CCGCTCGAAGAAGAAGAAGACGCAATACTCAACGGCTACGACTCGCACGAGGAAGAAGAA
GAAGAAGACGCAATACTTCAAAATAGTTCCCCACCAATGGCAAAAAGCTTTAGACTAAGG
GATCGTTAAGTGTAGAGAGAAACCCAGATGGAGGAGAGGCAAAAAATCAAAACTTTATGA
AAATTAAAGAGTAAGAAGATGGTACCACAGTGAGAAGGAGAAGAGGGAAGAGAGACAATG
GGCTGGGTGTTTTGATTCGCGGAAAAGCTGTTCTTCGCTTTGCCCATTTGATTCAGAAAG
TTTGACTGTGAAATCGGCAGAGAAGAAGATGAAGAAGAGAGAGAAATAGAAGAAGACTCA
ATGGCAACATCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5825Contig1 1163 2 2 U
GGTATACAGGTAACCGTATCACCTCCAAGTGGTTTACAAATTGACAGAGAAGGAAGAGAA
CGTGACGTGGCTGGATAAACAAGAAACAATGTTTTTTTATTTATTTTCAAGGCCAAAACT
TCTGAGAGAACGGCAGGCGAGTTTGTTAAAAATAAATAAAAAAGAAACACTCACACCGGA
TATTGTATCCCATGCCACACTGAAACGCTCGTAGGGGTATTTTAAAATAACAGGAAGAAT
AGGAGTTCCTGCCAAAAATGCACCTGTCTTGAATGTCAGCAAGTAGTCTCCGTTGGTGGT
TGTTCCTTCTGCAGCGAGACCAACCCACAGTTTATTTTAAAGGATAAGTGATGGATTGGT
TGCTAAATCAGTATGAAAGAGTAATAATGAACCTGGAAAAAGCATAATAGTTGGAGCAGA
TTTATTCTTATGAGCTTCTCTAACTCTCTCATTTACTGTGCCTGTAAAGATAATTGAAAA
CATCAGTTAAATGCATAGTATGATGACTATATTGAGTAGCATTAGATATTAAACTAGACA
AGCATACACTAGTTACTGTACTGAGAAAGGTGAAAAGAAACTTCTCTTGAAAAGTTCACA
TACCAGATACACCCTTGAAATCAGGTGATTTTGCTTCTCGTTGGACATAGACACAACCAA
GGCATTTGCTGCCATAGAAAAGAAACAAGATTTTGTATAACCAAGTTTGAGATAGATGCA
TACACACAAATAAAAGAAACAAGGGCATTTGATATGTTGATGAGCTACAAAGAATGTATT
CATAACTAACCTGATGAGGCCAACAAGAGGAAGTTTGCCCACTGATCTCTTCATAAGCAA
AAATAAATAAATGCAAATGTCATTGCCAGAAAAAAAAAGATAATTAAAAATGTGAACTTT
GGAAAGTAACTTAACAGAAGCAGTACTATATATAGCAAGATTCTACCAACTAACCTTGGC
AACAAAGCTTGGGAAAGAAGCAGACATATGATACAAAATGTCAAGGTAGGAAACGTGATT
AGACACAATGACTCCAGGTCTTTCAGGTTCCTCCTTATCATCTTCCTGTAAAATCCATAG
CAAATGACAGAACAAAATTAAGAGAAGGAAAAAAAACAAACGCCAAACCATCAGTGAAAA
CAAAACCATGAATCAATTTCAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ41TF U 1
AF RR4FZ41JQ C 398
BS 1 620 RR4FZ41TF
BS 621 1163 RR4FZ41JQ

RD RR4FZ41TF 620 0 0
GGTATACAGGTAACCGTATCACCTCCAAGTGGTTTACAAATTGACAGAGAAGGAAGAGAA
CGTGACGTGGCTGGATAAACAAGAAACAATGTTTTTTTATTTATTTTCAAGGCCAAAACT
TCTGAGAGAACGGCAGGCGAGTTTGTTAAAAATAAATAAAAAAGAAACACTCACACCGGA
TATTGTATCCCATGCCACACTGAAACGCTCGTAGGGGTATTTTAAAATAACAGGAAGAAT
AGGAGTTCCTGCCAAAAATGCACCTGTCTTGAATGTCAGCAAGTAGTCTCCGTTGGTGGT
TGTTCCTTCTGCAGCGAGACCAACCCACAGTTTATTTTAAAGGATAAGTGATGGATTGGT
TGCTAAATCAGTATGAAAGAGTAATAATGAACCTGGAAAAAGCATAATAGTTGGAGCAGA
TTTATTCTTATGAGCTTCTCTAACTCTCTCATTTACTGTGCCTGTAAAGATAATTGAAAA
CATCAGTTAAATGCATAGTATGATGACTATATTGAGTAGCATTAGATATTAAACTAGACA
AGCATACACTAGTTACTGTACTGAGAAAGGTGAAAAGAAACTTCTCTTGAAAAGTTCACA
TACCAGATACACCCTTGAAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4FZ41JQ 766 0 0
AAAAGCATAATAGTTGGAGCAGATTTATTCTTATGAGCTTCTCTAACTCTCTCATTTACT
GTGCCTGTAAAGATAATTGAAAACATCAGTTAAATGCATAGTATGATGACTATATTGAGT
AGCATTAGATATTAAACTAGACAAGCATACACTAGTTACTGTACTGAGAAAGGTGAAAAG
AAACTTCTCTTGAAAAGTTCACATACCAGATACACCCTTGAAATCAGGTGATTTTGCTTC
TCGTTGGACATAGACACAACCAAGGCATTTGCTGCCATAGAAAAGAAACAAGATTTTGTA
TAACCAAGTTTGAGATAGATGCATACACACAAATAAAAGAAACAAGGGCATTTGATATGT
TGATGAGCTACAAAGAATGTATTCATAACTAACCTGATGAGGCCAACAAGAGGAAGTTTG
CCCACTGATCTCTTCATAAGCAAAAATAAATAAATGCAAATGTCATTGCCAGAAAAAAAA
AGATAATTAAAAATGTGAACTTTGGAAAGTAACTTAACAGAAGCAGTACTATATATAGCA
AGATTCTACCAACTAACCTTGGCAACAAAGCTTGGGAAAGAAGCAGACATATGATACAAA
ATGTCAAGGTAGGAAACGTGATTAGACACAATGACTCCAGGTCTTTCAGGTTCCTCCTTA
TCATCTTCCTGTAAAATCCATAGCAAATGACAGAACAAAATTAAGAGAAGGAAAAAAAAC
AAACGCCAAACCATCAGTGAAAACAAAACCATGAATCAATTTCAGC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CATTGGCACGCACCTTCAGAGCATTTACTCAATGGAGAAAGGTTTGCCATGGAACTTCAC
ATGGTACATAAAAGTGAAGAAGGACACTTAGCAGTTATAGGAGTTCTCTTCCGAAAAGGA
GAGCCGAATGCTTTCATTTCAAGGATAATGGAAAAGATCAATTCGATCGCAAACATCCAA
GATGGAGAGGCCACCATAGGAAGGCTACATCCAAAAGACTTCGGATGGGATCTTACAAAA
TTCTACGAATATAGTGGATCTCTCACTACTCCTCCTTGCACGGAAGATGTCATCTGGACC
ATCATCAACAAGGTGGGGACTGTTTCACATGAGCAAATTAAAGTATTAGTCGATGCTCGC
CGCGGTGGTTACGAGGATAACGCAAGACCCGCTCAACCGCTGAATGACCGTGTGGTTTAT
CTAAACGAACAGCATACCAGATCAACTCCAAGCTCCCAAGGACAAATTGATATAAATTAA
TTTTGAAGATGTTTGTGGATTGGCTGCTCCTCCATTACTAATTATATTTTACAACATGAA
TTTACAAATTTATATATTTTCCAGTTAAAAAACATGTAAATATGTTTTTTTGCTTAAAAG
TTAAAAACAAAGCAAAGTGCTATATGCATAATATATATGTATTGTAACAAACAAGATGTA
ACATTAATCAACCATAACATGAGTTGTTTGATTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AA38TF U 1
AF RR4AA77TF U 10
BS 1 650 RR4AA38TF
BS 651 651 RR4AA77TF
BS 652 758 RR4AA38TF

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GAGCCGAATGCTTTCATTTCAAGGATAATGGAAAAGATCAATTCGATCGCAAACATCCAA
GATGGAGAGGCCACCATAGGAAGGCTACATCCAAAAGACTTCGGATGGGATCTTACAAAA
TTCTACGAATATAGTGGATCTCTCACTACTCCTCCTTGCACGGAAGATGTCATCTGGACC
ATCATCAACAAGGTGGGGACTGTTTCACATGAGCAAATTAAAGTATTAGTCGATGCTCGC
CGCGGTGGTTACGAGGATAACGCAAGACCCGCTCAACCGCTGAATGACCGTGTGGTTTAT
CTAAACGAACAGCATACCAGATCAACTCCAAGCTCCCAAGGACAAATTGATATAAATTAA
TTTTGAAGATGTTTGTGGATTGGCTGCTCCTCCATTACTAATTATATTTTACAACATGAA
TTTACAAATTTATATATTTTCCAGTTAAAAAACATGTAAATATGTTTTTT*GCTTAAAAG
TTAAAAACAAAGCAAAGTGCTATATGCATAATATATATGTATTGTAACAAACAAGATGTA
ACATTAATCAACCATAACATGAGTTGTTTGATTCTTTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4AA77TF 749 0 0
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GCACCTTCAGAGCATTTACTCAATGGAGAAAGGTTTGCCATGGAACTTCACATGGTACAT
AAAAGTGAAGAAGGACACTTAGCAGTTATAGGAGTTCTCTTCCGAAAAGGAGAGCCGAAT
GCTTTCATTTCAAGGATAATGGAAAAGATCAATTCGATCGCAAACATCCAAGATGGAGAG
GCCACCATAGGAAGGCTACATCCAAAAGACTTCGGATGGGATCTTACAAAATTCTACGAA
TATAGTGGATCTCTCACTACTCCTCCTTGCACGGAAGATGTCATCTGGACCATCATCAAC
AAGGTGGGGACTGTTTCACATGAGCAAATTAAAGTATTAGTCGATGCTCGCCGCGGTGGT
TACGAGGATAACGCAAGACCCGCTCAACCGCTGAATGACCGTGTGGTTTATCTAAACGAA
CAGCATACCAGATCAACTCCAAGCTCCCAAGGACAAATTGATATAAATTAATTTTGAAGA
TGTTTGTGGATTGGCTGCTCCTCCATTACTAATTATATTTTACAACATGAATTTACAAAT
TTATATATTTTCCAGTTAAAAAACATGTAAATATGTTTTTTTGCTTAAAAGTTAAAAACA
AAGCAAAGTGCTATATGCATAATATATATGTATTGTAACAAACAAGATGTAACATTAATC
AACCATAACATGAGTTGTTTGATTCTTTT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5828Contig1 1071 2 2 U
GGATAACCCAGAATTCGAGAACGAGGCTGAGAAGAAAATCATCAATCAAACCAACACAGG
ATGGCGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCG
TGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACAGCGACGAAGGCGAGAATCAC
GACGAGTCAACAAATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAATCTCTTCGCCAA
GAGAATCTCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTCTCGCT
GAATCCGCTGCTTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTTGTATCGATG
GTTACATCGAGAGATTTCTTGGCCCGATTAGAGAGTCTGAGGCAAGCTTTATCTAATGGA
ACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTA
CTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATC
CCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAG
GAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAA
GCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCTTGCACAAGAAGTTAGTGCTCTG
AGCAAGGTAGGGAGGGTAGTGGATATATGGCACGCTGGGAAAATGTTCTACACGTTTTCC
ACATGGGGACTTGCTTTTGGAGGGTTATATCAAGCTCGTGGTGCGTTGAAGATAGCTGCT
AAGGGCGTTCATGCAACAAGCAAAGTTGTTTTGAGGGCTCTCTGAAAGTTGTAAAAGGGG
TCCACTGTGATGAAAGCAGAGATGATTCTCCACTTCCTCATGGTTTGTGTTTCTGTGTTG
TGTTGGAATGACTTTTACTTTAGCTACTACTATCATTGGGTCATTGCTTGTGTAAATAGT
GTAAAATCTGTGTGATCAGAATTGTACTTTAATTTACTTGAATTCTTCAGG


BQ
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AF RR4AW88TF U 1
AF RR4AW88JQ C 255
BS 1 722 RR4AW88TF
BS 723 1071 RR4AW88JQ

RD RR4AW88TF 722 0 0
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ATGGCGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCG
TGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACAGCGACGAAGGCGAGAATCAC
GACGAGTCAACAAATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAATCTCTTCGCCAA
GAGAATCTCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTCTCGCT
GAATCCGCTGCTTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTTGTATCGATG
GTTACATCGAGAGATTTCTTGGCCCGATTAGAGAGTCTGAGGCAAGCTTTATCTAATGGA
ACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTA
CTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATC
CCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAG
GAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAA
GCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCTTGCACAAGAAGTTAGTGCTCTG
AG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4AW88JQ 817 0 0
TCAGGA
CTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTCTCGCTGAATCCGCTGCTTTATCTCA
CGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTTGTATCGATGGTTACATCGAGAGATTTCTT
GGCCCGATTAGAGAGTCTGAGGCAAGCTTTATCTAATGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTT
CAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCA
AGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAA
AAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGT
TGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGA
AGAGCTTCAGAAGATTCTTGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGGGTAGT
GGATATATGGCACGCTGGGAAAATGTTCTACACGTTTTCCACATGGGGACTTGCTTTTGG
AGGGTTATATCAAGCTCGTGGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCAACAAG
CAAAGTTGTTTTGAGGGCTCTCTGAAAGTTGTAAAAGGGGTCCACTGTGATGAAAGCAGA
GATGATTCTCCACTTCCTCATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTTTACTT
TAGCTACTACTATCATTGGGTCATTGCTTGTGTAAATAGTGTAAAATCTGTGTGATCAGA
ATTGTACTTTAATTTACTTGAATTCTTCAGG

QA 7 817 7 817
DS 



AS 1 2

CO CL5829Contig1 670 2 2 U
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TTGGAGGAAAACGACGACAGTGAAGCGCATGAGCAGCGGCAAAGGTGGATGCACAGCAGA
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GCAGTAGTGATGAAACAGGAAAGATAAGTAGTTTCGCAAATTTACAACGAACCAGTATCC
GTCGCAAATTTGCAACGAACCAGTTTCTAGCGCAAATTTGCAACGAACGTTTTTTATTTG
TGAATAAAAATTTGCGATTCGTAATTCCTTAGCAAATTGCGATTTGCAACGGAATTGCGA
AGATTTTTTTCCCTTGCAACATACATGTTTTTTATAGTGATAAGAATCTTTATTTTTTCA
CGAATCATATGTGAAACACCATCTTTCTTGAGTTACTGGAAAGTTCATGAACTCTGTTTG
TACTGCCGCTCTAAGTTTAGCTCTTGTGCCTCACCCCAAAATATAGATTATGTTTCTACT
AATTTGAGCATATTTCTAGAATCAATGTTTAAATTACTAAATATTTTGTTATTTTCTTTT
TCAAATGTACCATAAAATCTATGTAAAATAAAATAAAAATTGGTATTGGTATAATTCATA
TTTTTTAAGG


BQ
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AF RR4FI09TF U 1
AF RR4FI09JQ C 1
BS 1 281 RR4FI09TF
BS 282 670 RR4FI09JQ

RD RR4FI09TF 281 0 0
GGAATCTCTGGACGAAATTGGAAGCTTGGGTGGAAGAAGGACAAAAACGAAGTTAATGGC
TTGGAGGAAAACGACGACAGTGAAGCGCATGAGCAGCGGCAAAGGTGGATGCACAGCAGA
CTCGTCTCGGTCGAGCTCTCTGTTGGCTTCACCTACTCACCACCATCAAAGATCTGAGAA
GCAGTAGTGATGAAACAGGAAAGATAAGTAGTTTCGCAAATTTACAACGAACCAGTATCC
GTCGCAAATTTGCAACGAACCAGTTTCTAGCGCAAATTTGC

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4FI09JQ 670 0 0
GGAATCTCTGGACGAAATTGGAAGCTTGGGTGGAAGAAGGACAAAAACGAAGTTAATGGC
TTGGAGGAAAACGACGACAGTGAAGCGCATGAGCAGCGGCAAAGGTGGATGCACAGCAGA
CTCGTCTCGGTCGAGCTCTCTGTTGGCTTCACCTACTCACCACCATCAAAGATCTGAGAA
GCAGTAGTGATGAAACAGGAAAGATAAGTAGTTTCGCAAATTTACAACGAACCAGTATCC
GTCGCAAATTTGCAACGAACCAGTTTCTAGCGCAAATTTGCAACGAACGTTTTTTATTTG
TGAATAAAAATTTGCGATTCGTAATTCCTTAGCAAATTGCGATTTGCAACGGAATTGCGA
AGATTTTTTTCCCTTGCAACATACATGTTTTTTATAGTGATAAGAATCTTTATTTTTTCA
CGAATCATATGTGAAACACCATCTTTCTTGAGTTACTGGAAAGTTCATGAACTCTGTTTG
TACTGCCGCTCTAAGTTTAGCTCTTGTGCCTCACCCCAAAATATAGATTATGTTTCTACT
AATTTGAGCATATTTCTAGAATCAATGTTTAAATTACTAAATATTTTGTTATTTTCTTTT
TCAAATGTACCATAAAATCTATGTAAAATAAAATAAAAATTGGTATTGGTATAATTCATA
TTTTTTAAGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5830Contig1 1077 2 2 U
GGGCGAGCATATAGCGCTGTAGATTACGTCTCTCTCTCTCTCTATTGCTTGGTGAAGAAG
AGGGTCTTTTGATTGGTTTTTTCTTTCTCTACGGTAGCTAATCGAATCAAAAAGATTTTT
GGCCTTTCGTCGTCTCTGTTTGCAACCCTAAACTCTCTCTCCGACACGTTTGTTTTCGGT
AATAATGCGACCGTTTATGTCAGGCTCGAGAGCTTTGTTCAGCTTAATTTCATGTCGAAA
CGCAATCAGGAGCCCGATTAATCGCTCCGGGATCGTTCAGAGCAGTTTTAAATGGAATCG
ATTTCGCCGATTTGGTTCTCTTTCGGGGGTAGATAGATGCTCTTCTCACGGGTTGATGTC
CGATAATGATGGTAGAAGAGCCTCTTTCGGTACTGGGAGCTTAAATCAAAGACGGCATTT
TCTGGGTTGTGGAGATGGGGAAGAAGGTGGTGGTGAATTATCAAAGATCTACGAAGAGAG
ACGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTAGTTCTAGCTGTAGACTTGTA
CCACGGCTTTGTTCCTTGGTGTCAACGCTCCGAGGTTCTTAAAGAATACTCTGATGGCTC
TTTCGACGCTGAGCTCGAGATTGGTTTCAAGTTTCTTGTTGAGAGTTACATCTCCCATAT
TGAGTTCGAAAGACCCAAATGGATTAAGACAACAGTGAGAGACACCGGCCTGTTTGACCA
TTTGATCAACCTCTGGCAGTTCAAACCAGGTCCCATTCCAGGAACCTGCGAGCTTTCTAT
TCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCACCTCTCTATCGCCAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAA
GGAGGTAGCAACAAGGCTCATTGGGGCGTTTAGTGACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCC
TGGAATTCCTGTGGATGCAAACTCATATGAACAAAAAGCTTGATACATATAATCCTATTA
AATGAAACTAACAATTATCAGGTTAGTTTGCATGTTGTTTGCTAGAAAGAGCGATTACCC
CATAGCTTTTTGTTGCAATTTTTTTCCATATATGAATTGCTTTTGCATTATCAACAC


BQ
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AF RR4GE61TF U 1
AF RR4GE61JQ C 383
BS 1 663 RR4GE61TF
BS 664 1077 RR4GE61JQ

RD RR4GE61TF 663 0 0
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AGGGTCTTTTGATTGGTTTTTTCTTTCTCTACGGTAGCTAATCGAATCAAAAAGATTTTT
GGCCTTTCGTCGTCTCTGTTTGCAACCCTAAACTCTCTCTCCGACACGTTTGTTTTCGGT
AATAATGCGACCGTTTATGTCAGGCTCGAGAGCTTTGTTCAGCTTAATTTCATGTCGAAA
CGCAATCAGGAGCCCGATTAATCGCTCCGGGATCGTTCAGAGCAGTTTTAAATGGAATCG
ATTTCGCCGATTTGGTTCTCTTTCGGGGGTAGATAGATGCTCTTCTCACGGGTTGATGTC
CGATAATGATGGTAGAAGAGCCTCTTTCGGTACTGGGAGCTTAAATCAAAGACGGCATTT
TCTGGGTTGTGGAGATGGGGAAGAAGGTGGTGGTGAATTATCAAAGATCTACGAAGAGAG
ACGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTAGTTCTAGCTGTAGACTTGTA
CCACGGCTTTGTTCCTTGGTGTCAACGCTCCGAGGTTCTTAAAGAATACTCTGATGGCTC
TTTCGACGCTGAGCTCGAGATTGGTTTCAAGTTTCTTGTTGAGAGTTACATCTCCCATAT
TGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4GE61JQ 695 0 0
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GAAGGTGGTGGTGAATTATCAAAGATCTACGAAGAGAGACGTGTCTTGGGGTATTCTCAG
GAGCAATTGTTTAATGTAGTTCTAGCTGTAGACTTGTACCACGGCTTTGTTCCTTGGTGT
CAACGCTCCGAGGTTCTTAAAGAATACTCTGATGGCTCTTTCGACGCTGAGCTCGAGATT
GGTTTCAAGTTTCTTGTTGAGAGTTACATCTCCCATATTGAGTTCGAAAGACCCAAATGG
ATTAAGACAACAGTGAGAGACACCGGCCTGTTTGACCATTTGATCAACCTCTGGCAGTTC
AAACCAGGTCCCATTCCAGGAACCTGCGAGCTTTCTATTCTTGTCGATTTCAAATTCAAC
TCACCTCTCTATCGCCAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGGCTCATT
GGGGCGTTTAGTGACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAATTCCTGTGGATGCAAAC
TCATATGAACAAAAAGCTTGATACATATAATCCTATTAAATGAAACTAACAATTATCAGG
TTAGTTTGCATGTTGTTTGCTAGAAAGAGCGATTACCCCATAGCTTTTTGTTGCAATTTT
TTTCCATATATGAATTGCTTTTGCATTATCAACAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL5831Contig1 1262 2 2 U
GGGTCTTCCCTCAGCGCTGCGTTCTTAATCTCTCTTTCGCAAGCAAAGCAAGAGCTTCTT
GGATCTTCCATAGCACAAGTTTCATCTCTAAAGTTTGTAAAGAAGATTGTTGGGGGAAAA
TGGACACAAAAGCTATGGCGAAATCAAAGAGAGCTCACACTCAACACCACAGCAAGAAAC
CACATAAGCCCAAAGCTCCTGAGAAGCTGCAAGGAAACCAAACCAAAACTCCGGTTCAAT
CTCGGCTCTCGTCGAATTGGGATCGGTACGATGACGAACTCAATCCCGGTTTGGAAAATG
CGCCTGGGGATGCAATAGTGCCGAAGAGCAAAGGAGCAGATTATCTGCATCTGATATCCG
AAGCTCAAGCTGAGTCTCACATCATCAACTCAGATTCTCTAGATGATCTTTTGCACGATG
AGTTTAGTCGCGTGGTTGGATCTATGATCTCGGCAAGAGGGGAAGGTATAGTTTCGTGGA
TGGAAGATGATAACTTTTGTTGTGGAAGAAGAAGAAGAGGGATCAGCTTCACATCATGAG
CCTGGATTCCTATCTTTGGATTTGAATGCACTGGAGAAAATGCTAGAGAAAGTGGATGTG
CATGAGAGACTTTACATTGACGCTGACCTTTTGCCTCCCCAGCTGTGTACAATTCAATCA
AAAAGGGAGCGGAGATAAAGAACCTTGTCGTTCACACACATCACAAGACGTGCAAGCTGT
GACAACAAGGCTTAGTGAGATAGTAGTTCAACAAGAATCAAGTGGAAACATGGACTCTGC
TGTTGAATCACCGGCTGAGTCTCTGTATCAAGTCAAGCACATACCAATGCTAACAGAGAA
GTCTTCAGCAGTTGAAGCTGATCTTGATTTGCTTCTCAATTCCTTTAGTGGAGACTCTAA
CCCAGTGGCCAGTGCCTTCAGTCAGAAGCCTCCTTCAGCTTTTGAAACTGAGCTGGACTC
TCTTCTCAACTCTCATGCTGGTGCAGAAGAACCATTCAACAGACCAGAGAACCCATCTAA
TCAAAAGCTTAATACGACGGGTTTTGGTGACGTGCTTGATGATTTGCTCGAGAGTACTTC
ATTACCAATCAAACCACAGGGGATCCAGACCTCTTCGTCTTCGACAGTTGGAAAATCCAA
AGTTTTGGATGAGTTTGATTCTTGGTTGGATACGATTTGAGTTTTTTTGTTAGCTTAATA
CTTTTTTTTGTATTACCTATGTAAACGAGAACATTCTATTAGAAAAAAAACTATTCAGAG
CG


BQ
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10 10 

AF RR4AK40TF U 1
AF RR4AK40JQ C 445
BS 1 725 RR4AK40TF
BS 726 1262 RR4AK40JQ

RD RR4AK40TF 725 0 0
GGGTCTTCCCTCAGCGCTGCGTTCTTAATCTCTCTTTCGCAAGCAAAGCAAGAGCTTCTT
GGATCTTCCATAGCACAAGTTTCATCTCTAAAGTTTGTAAAGAAGATTGTTGGGGGAAAA
TGGACACAAAAGCTATGGCGAAATCAAAGAGAGCTCACACTCAACACCACAGCAAGAAAC
CACATAAGCCCAAAGCTCCTGAGAAGCTGCAAGGAAACCAAACCAAAACTCCGGTTCAAT
CTCGGCTCTCGTCGAATTGGGATCGGTACGATGACGAACTCAATCCCGGTTTGGAAAATG
CGCCTGGGGATGCAATAGTGCCGAAGAGCAAAGGAGCAGATTATCTGCATCTGATATCCG
AAGCTCAAGCTGAGTCTCACATCATCAACTCAGATTCTCTAGATGATCTTTTGCACGATG
AGTTTAGTCGCGTGGTTGGATCTATGATCTCGGCAAGAGGGGAAGGTATAGTTTCGTGGA
TGGAAGATGATAACTTTTGTTGTGGAAGAAGAAGAAGAGGGATCAGCTTCACATCATGAG
CCTGGATTCCTATCTTTGGATTTGAATGCACTGGAGAAAATGCTAGAGAAAGTGGATGTG
CATGAGAGACTTTACATTGACGCTGACCTTTTGCCTCCCCAGCTGTGTACAATTCAATCA
AAAAGGGAGCGGAGATAAAGAACCTTGTCGTTCACACACATCACAAGACGTGCAAGCTGT
GACAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4AK40JQ 818 0 0
TGATCTCGGCAAGAGGGGAAGGTATAGTTTCGTGGATGGAAGATGATAACTTTTGTTGTG
GAAGAAGAAGAAGAGGGATCAGCTTCACATCATGAGCCTGGATTCCTATCTTTGGATTTG
AATGCACTGGAGAAAATGCTAGAGAAAGTGGATGTGCATGAGAGACTTTACATTGACGCT
GACCTTTTGCCTCCCCAGCTGTGTACAATTCAATCAAAA*GGGAGCGGAGATAAAGAACC
TTGTCGTTCACACACATCACAAGACGTGCAAGCTGTGACAACAAGGCTTAGTGAGATAGT
AGTTCAACAAGAATCAAGTGGAAACATGGACTCTGCTGTTGAATCACCGGCTGAGTCTCT
GTATCAAGTCAAGCACATACCAATGCTAACAGAGAAGTCTTCAGCAGTTGAAGCTGATCT
TGATTTGCTTCTCAATTCCTTTAGTGGAGACTCTAACCCAGTGGCCAGTGCCTTCAGTCA
GAAGCCTCCTTCAGCTTTTGAAACTGAGCTGGACTCTCTTCTCAACTCTCATGCTGGTGC
AGAAGAACCATTCAACAGACCAGAGAACCCATCTAATCAAAAGCTTAATACGACGGGTTT
TGGTGACGTGCTTGATGATTTGCTCGAGAGTACTTCATTACCAATCAAACCACAGGGGAT
CCAGACCTCTTCGTCTTCGACAGTTGGAAAATCCAAAGTTTTGGATGAGTTTGATTCTTG
GTTGGATACGATTTGAGTTTTTTTGTTAGCTTAATACTTTTTTTTGTATTACCTATGTAA
ACGAGAACATTCTATTAGAAAAAAAACTATTCAGAGCG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL5832Contig1 1063 2 2 U
GGTCAACACATTTTGGTTTCATTTTCTTCATGTGATGTGAGAATTTTGGGTTAGAAAGAT
GAAGACTATAAGTGGGTTAGGGATAGGGCTGAGTTTGGTGTTTGTGTTCCTTCTCTTAGC
ACTTGTTGCAGAAATCTATTACCTTCTGAGATGGAAGAAGCACACGAAGCGCATCATAAG
CGAAGAGAGCCAAGAAGAAGAAGAACAACAAGCTGGGTACGCTAAGGAACTTATCCAGCT
CTTCTGCTTCAAAAACCATCACTCTTTACATGCCAACAGTGGCGGAAGAGAGGCGGAAAT
CTCGAGGACTCAAGATTTAGAGTTAGGGTTGATGAAACACGTGGGTGGTGTAGGAGAAGT
AGGGTTTGAAGCAGAGCTCATGAAGCTTCATAACCAGAGGTTTCTCTTCACAATCATAGA
AGAGACAAAAGCAGATTTGGAATCTGATGATGAGACATCAAGAAGACTGAGTGATGTTCC
GGTTGGAGTAAATGACTGTATTACCCCTGGTTTCACTCCTCTGGCTTCTCCTTGTACACT
GAAGTCATCATCTCCTTTGGAGTCTTACTCACACCATGGATTCAATCCTCTGTTCGAGAC
AGAGGAAGAGCTTGAGTTTAACAAGTTCTTCAGGTCGTCTTCTTCTTCGCCTCCTCCGAA
GTTTAAGTTCTTGAGGGATGCTGAAGAGAAGCTGAGGAGGAGAATGGTTGAAGAAGCTAA
AAGGAGAGAGGAGACAGAGGGTTCGTTTCTGATGTTCTTGAAACCTGAGATGATGAACAG
AGTGAAGAAACAGAGTAGTCAAGAATCTGATGAGACGGTGTCGTTTTCTATTTCTTCTTC
ATCAGGGACAAAGCTCATAACGCTAGACCAGAGATCCACACTGGTTGTTTAGTGTTAGAT
CTCTCATGCTCTGCTCCATAATTTTTATTTTTTTGGTTGAAATTTTGTAAAAAGAATTTC
AATTTTAATTGTGTGAATTATCTTTGTGTTTTCTCTCATTCTGATTCTTTTGGGATCAAT
TTCTTCTGTATATATCGATCTGAAAAATGTTTGCAGATGCTCC


BQ
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DS 

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GACGGTGTCGTTTTCTATTTCTTCTTCATCAGGGACAAAGCTCATAACGCTAGACCAGAG
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TGGTTGAAATTTTGTAAAAAGAATTTCAATTTTAATTGTGTGAATTATCTTTGTGTTTTC
TCTCATTCTGATTCTTTTGGGATCAATTTCTTCTGTATATATCGATCTGAAAAATGTTTG
CAGATGCTCC

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DS 



AS 1 2

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GAACATGCTTATTCTTTTGTTGGAATGCATTGCATCTTCGACCAATGCAAATCTTCTGTC
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TCAAAAGATGTCACAGATTTTGACTTCTCGTCAAACAATCAGTACATTGCGTCTTCATCA
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GGAAATGCAAACAAGGAAGTCACGGTGTTCAATTTCAGCACTGGGAGAACTATTAAAACA
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TGTGGTGATGGACAGGGAACTGTATATTCAGTGAGCATGGATTCTCATACGGGTTCATTA
TCCCGGTCTCATCGCCATCGTACTAATCACAAATCCCCGGTCACAACTGTGAAGTATCGA
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TTGGCCCCGAGGATACACAGAATCCAGGCATCGTTTTGCCCGCTTTTATCCCTAGAGAAA
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TGGAACCATGGAGAGAACTTGTTGGCCTCGTCTGATTTCTACGGTGTTGTTATTGTATGG
AAAAGAGCAAAGACAAGCTCATGAGGTTTGTCTATAATCCATTATAAACGAATCGAAATC
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CTTAACCGTGTGAATTTTCGTTTATAAGTTCTAATTGTGAAAACTTCGAAGTGGATTCTG
GATTGATTGGATCATCTATAGACACATTCAGG


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AF RR4A562TF U 1
AF RR4A562JQ C 520
BS 1 800 RR4A562TF
BS 801 1352 RR4A562JQ

RD RR4A562TF 800 0 0
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GCTGAGAGCTTCAGTTCTAGTAGAGATTTACGGAGTGCTAATCAGGTTTCGAGCCGGAGG
TTGAGTTTTAGCTCGAGTTTGAGTGATGGTGATCATTCCTTTCGTCGCGGTGGTGGTTTT
GAACATGCTTATTCTTTTGTTGGAATGCATTGCATCTTCGACCAATGCAAATCTTCTGTC
ACTGTTCTGAAGTTTGGCCATATGAGTTCTGATCTACTTGCATATGGAGCATCAGATGGA
ACCTTAACTGTTTGTACTCTCTCCGAAGAGCCTTCTGTCCTCAAGCAGTTGACAGGCCAC
TCAAAAGATGTCACAGATTTTGACTTCTCGTCAAACAATCAGTACATTGCGTCTTCATCA
CTTGATAAGACAATACGAGTCTGGGAGTTGTCAAGAGGTGTTTGTATTAGAGTTATATAT
GGAGTCTCTGCACAGTTTTGTATACGTTTTCACCCTGTTAATAACAATTTCCTTTCTGCT
GGAAATGCAAACAAGGAAGTCACGGTGTTCAATTTCAGCACTGGGAGAACTATTAAAACA
CTGTCGTTCGAGGGTGAGGTGACAGCTATGGACCATGACCACACTGGCCAAATCATTTTC
TGTGGTGATGGACAGGGAACTGTATATTCAGTGAGCATGGATTCTCATACGGGTTCATTA
TCCCGGTCTCATCGCCATCGTACTAATCACAAATCCCCGGTCACAACTGTGAAGTATCGA
AGCTTCTCCCTCCTGGCATC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4A562JQ 833 0 0
AATAACAATTTCCTTTCTGCTGGAAATGCAAACAAGGAAGTCACGGTGTTCAATTTCAGC
ACTGGGAGAACTATTAAAACACTGTCGTTCGAGGGTGAGGTGACAGCTATGGACCATGAC
CACACTGGCCAAATCATTTTCTGTGGTGATGGACAGGGAACTGTATATTCAGTGAGCATG
GATTCTCATACGGGTTCATTATCCCGGTCTCATCGCCATCGTACTAATCACAAATCCCCG
GTCACAACTGTGAAGTATCGAAGCTTCTCCCTCCTGGCATCAGGTCCTGTACTTCTCACA
TGTACTCAGGATGGAAACTTATGTTTCTTCAGTGTTGCGCTTCAGATAAAAGGCTACCTG
ACATTACGTTGCTCCCTCAAATTGGCCCCGAGGATACACAGAATCCAGGCATCGTTTTGC
CCGCTTTTATCCCTAGAGAAAGGAGAGTACATAGTTGCTGGGAGCGAAGACTCGAATGTC
TACTTCTATGATCTAACCAAACCGAAACACACATGTGTAAACAAGCTACAGGGTCACAGG
TTTCCAGTAATGTGCGTTGCGTGGAACCATGGAGAGAACTTGTTGGCCTCGTCTGATTTC
TACGGTGTTGTTATTGTATGGAAAAGAGCAAAGACAAGCTCATGAGGTTTGTCTATAATC
CATTATAAACGAATCGAAATCCGCCAGCCAGTTTTGCCAGTAAAGGATTTTGGTTTCTTG
CTTCATCTCTGTATTGCTAATCTTAACCGTGTGAATTTTCGTTTATAAGTTCTAATTGTG
AAAACTTCGAAGTGGATTCTGGATTGATTGGATCATCTATAGACACATTCAGG

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL5834Contig1 1006 2 2 U
GGCTGATGGGTGACTTCATGGATTCTGGACCAACTGAAACATCTTCCACCAACAACAATA
ACAACGCCAAGTTCCAAGAGGCGGACTTGTTTGCTGATGCAACTTTTGTATCAGCACCTC
CTCAGGGAACAGAATTTGGGTCGCAAACACAGAAAGAAGTTGATCTTTTCTCTGTGTCTG
AGCCTTCTGTCACGCTTGCTTCACCTCCTCCGACGGTTGACCTTTTTGCGTCCACTGAAC
CTGTTGCACCCCCAGAAGCCAAGATTCCTAAACCTGAGTCTATGACCACTCCCAACATTG
TTGACCCATTTGCTGCAGTTCCTATGCAAAGTTTTGATGGATCTGATCCTTTTGGTGCCT
TCACTTCTGGTCCACAGGCCCCAGTTGTAACAAACACAACATCCCCTGTATCTTTGGCAG
ACTCGAAACCACAACAGTTGCAAAAGAAAGATCCTTTCCAGGTGAAATCGGGAATATGGG
CAGATTCTCTGAGCCGTGGACTAATTGATCTCAATATAACTGCTCCCAAAAAAAGCTTCC
CTTGCTGATGTGGGGGTCGTGGGTGGTCTGAGCAACGATGAAGGGAACAAGGCATCTGCT
GCTGCGTACTACTCAGGATGGTCCATGGGCGCAGGATCCGGGCTCGGTAAAACCGGACTA
TACAGTGCACAGCAGCAGCAACAACCACAACAACAAACACCTGAGATTTCAGATGATTTT
TTCTCCAGCCTCAGTCACCAAAGGTACTAAACTGGAGGCTTTAAGCAGTGACTTTGTCTG
GGGTTATCACGTTTGATTCTACATTCATACTGGAAGTCAATGTTTTTATTCTCAATGGGA
GTTTGTTGTTCTTGCTCTTGATTGATGGGACAATCTGATCTGTGGCTTGCGTTTTAAATA
AGAGAATTGTTTTTGGGGAAGAGAGTATTATTTGTTGGTTTGAATTTTCTATTTGTTCAT
AGAACAACAAATCATATGTATTTCATTTGACTCTTTGGATAATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F861TF U 1
AF RR4F861JQ C 346
BS 1 630 RR4F861TF
BS 631 1006 RR4F861JQ

RD RR4F861TF 630 0 0
GGCTGATGGGTGACTTCATGGATTCTGGACCAACTGAAACATCTTCCACCAACAACAATA
ACAACGCCAAGTTCCAAGAGGCGGACTTGTTTGCTGATGCAACTTTTGTATCAGCACCTC
CTCAGGGAACAGAATTTGGGTCGCAAACACAGAAAGAAGTTGATCTTTTCTCTGTGTCTG
AGCCTTCTGTCACGCTTGCTTCACCTCCTCCGACGGTTGACCTTTTTGCGTCCACTGAAC
CTGTTGCACCCCCAGAAGCCAAGATTCCTAAACCTGAGTCTATGACCACTCCCAACATTG
TTGACCCATTTGCTGCAGTTCCTATGCAAAGTTTTGATGGATCTGATCCTTTTGGTGCCT
TCACTTCTGGTCCACAGGCCCCAGTTGTAACAAACACAACATCCCCTGTATCTTTGGCAG
ACTCGAAACCACAACAGTTGCAAAAGAAAGATCCTTTCCAGGTGAAATCGGGAATATGGG
CAGATTCTCTGAGCCGTGGACTAATTGATCTCAATATAACTGCTCCCAAAAAAAGCTTCC
CTTGCTGATGTGGGGGTCGTGGGTGGTCTGAGCAACGATGAAGGGAACAAGGCATCTGCT
GCTGCGTACTACTCAGGATGGTCCATGGGC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4F861JQ 661 0 0
ATCCTTTTGGTGCCTTCACTTCTGGTCCACAGGCCCCAGTTGTAACAAACACAACATCCC
CTGTATCTTTGGCAGACTCGAAACCACAACAGTTGCAAAAGAAAGATCCTTTCCAGGTGA
AATCGGGAATATGGGCAGATTCTCTGAGCCGTGGACTAATTGATCTCAATATAACTGCTC
CCAAAAAAAGCTTCCCTTGCTGATGTGGGGGTCGTGGGTGGTCTGAGCAACGATGAAGGG
AACAAGGCATTTGCTGCTGCGTACTACTCAGGATGGTCCATGGGCGCAGGATCCGGGCTC
GGTAAAACCGGACTATACAGTGCACAGCAGCAGCAACAACCACAACAACAAACACCTGAG
ATTTCAGATGATTTTTTCTCCAGCCTCAGTCACCAAAGGTACTAAACTGGAGGCTTTAAG
CAGTGACTTTGTCTGGGGTTATCACGTTTGATTCTACATTCATACTGGAAGTCAATGTTT
TTATTCTCAATGGGAGTTTGTTGTTCTTGCTCTTGATTGATGGGACAATCTGATCTGTGG
CTTGCGTTTTAAATAAGAGAATTGTTTTTGGGGAAGAGAGTATTATTTGTTGGTTTGAAT
TTTCTATTTGTTCATAGAACAACAAATCATATGTATTTCATTTGACTCTTTGGATAATAC
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL5835Contig1 1114 2 4 U
GTATACAATTTCTTACATCCTTCATATGTCCAATGATTTTGATTATCATATAAGAAAAAT
AATAGTTATTATGATATAAGTTTTGTTTTCTTCTTTCATGGAGTCCGATCCAAACCCTAA
TGCTCTAAATCAATACATAAATCCAAGAGATTGTACTCAAGGCTTTTGTTCCACGTTTTG
TCCTCAGTGGTGTAGTTACATCAAGTTATCTCCACCACCACTTTCCTATGAACTCCTAAA
CGATGGTGTTTCATCAAACCCTAGTGTTTCACCTCTTCTCATTGCCATCATTGGTATCCT
TGGAAGTGCATTTCTTTTAGCAACTTACTACACTCTTGTCTCAAAGCATTGCGCCACCGA
CACAAACGATGGAGCTGCCTCAGACACGGGTAGATCTGATCTCATTATCGATGTTAACTC
GCTAGAAAGTCAAGATCATGACAACCCTTTTGCTCATGAGTCTTCAAATGCCGGTTGGAC
GACGCCATGATAAAGAAGATTGGTTTCTTCAAGTTGAAGAAGCATCAAAACGGGCTCAAG
ATCAACGTTACAGATTGTTCGATATGTCTTGGAGAGTTTAACGAAGACGAGAGCTTAAGG
TTATTGCCTAATTGTAACCACATTTTCCACGTGGTTTGTATTGATCGGTGGCTCACCTCT
CACTCAAATTGTCCCCTTTGCCGGGGTAAGATCATCGTCCCTACCACTCAAGAAACCGAT
CATGTCTTTGTGGTGATGAATCTTGATCGGTTTACTAGCAGTTCTGGACCAGTAGAAGGA
AATGTGATGGTTCTTGATCCTCGTGAAGAGGTTAGTGTTTCGGTTAGTTCTCATCATCCA
CGACGGTTTTCGGCCGCAGATATTGTTATGTGGATGAGCAGAGACGGAGAAGAGGAGGAG
AGAAGTTATGATCTTGAAAATGGAAACAGAGTGAAGCTTGTAGACTACTTTAAAAGATCA
CTCTCAAGTGGTGGATTGGTTCTTGGGGCTCAAGGACGGACTAGGAGATCCTAAACCTAC
TTCCTTGACTCCATATTAGTTTCTTAAATATATTTTATTGTACTTACACTTTGAGAAATT
GATACAGATACATATAATGGATGCATTTTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GH16TF U 1
AF RR4GH16JQ C 395
BS 1 667 RR4GH16TF
BS 668 668 RR4GH16JQ
BS 669 679 RR4GH16TF
BS 680 1114 RR4GH16JQ

RD RR4GH16TF 679 0 0
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AATAGTTATTATGATATAAGTTTTGTTTTCTTCTTTCATGGAGTCCGATCCAAACCCTAA
TGCTCTAAATCAATACATAAATCCAAGAGATTGTACTCAAGGCTTTTGTTCCACGTTTTG
TCCTCAGTGGTGTAGTTACATCAAGTTATCTCCACCACCACTTTCCTATGAACTCCTAAA
CGATGGTGTTTCATCAAACCCTAGTGTTTCACCTCTTCTCATTGCCATCATTGGTATCCT
TGGAAGTGCATTTCTTTTAGCAACTTACTACACTCTTGTCTCAAAGCATTGCGCCACCGA
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CACTCAA*TTGTCCCCTTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4GH16JQ 720 0 0
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CATGAGTCTTCAAATGCCGGTTGGACGACGCCATGATAAAGAAGATTGGTTTCTTCAAGT
TGAAGAAGCATCAAAACGGGCTCAAGATCAACGTTACAGATTGTTCGATATGTCTTGGAG
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TTTGTATTGATCGGTGGCTCACCTCTCACTCAAATTGTCCCCTTTGCCGGGGTAAGATCA
TCGTCCCTACCACTCAAGAAACCGATCATGTCTTTGTGGTGATGAATCTTGATCGGTTTA
CTAGCAGTTCTGGACCAGTAGAAGGAAATGTGATGGTTCTTGATCCTCGTGAAGAGGTTA
GTGTTTCGGTTAGTTCTCATCATCCACGACGGTTTTCGGCCGCAGATATTGTTATGTGGA
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AGCTTGTAGACTACTTTAAAAGATCACTCTCAAGTGGTGGATTGGTTCTTGGGGCTCAAG
GACGGACTAGGAGATCCTAAACCTACTTCCTTGACTCCATATTAGTTTCTTAAATATATT
TTATTGTACTTACACTTTGAGAAATTGATACAGATACATATAATGGATGCATTTTTCACC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5836Contig1 731 2 1 U
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TTTCGTCAAGT


BQ
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AF RR4B983JQ C 1
AF RR4B983TF U 1
BS 1 731 RR4B983TF

RD RR4B983JQ 731 0 0
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GACGTCGAGAGGTTCGCAGCAGTACAGTGCTTTGAGTGTCCCTGAGCTGACCCAGCAGAT
GTGGGACGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGCCACGGACGTTACTTAACCGC
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AGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGCGGATCCCGAACAACGTCAAGTCCAGCGTCT
GTGACATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACTCCACCTCGA
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TCCTTCATTGGTACACGGGAGAAGGCATGGACGAGATGGAGTTCACCGAGGCGGAGAGTA
ACATGAATGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCGACAGCCGGTGAGGAGG
AGTATGAGGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTCGTCAGTGGCTTCGTCT
GATTCATAAAGCTTAAAGACTCTCCTTTTGTTTTGCTTTTTTCAGTTTGTGTGCTTTTGT
TCGTGAAACCCAAATTCGTTCTGGATTGTTAAAACGTTTGCGTGTGTATTGGTTTATTGT
TTTCGTCAAGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4B983TF 731 0 0
GGCTGTGAACTTGATCCCTTTCCCGAGGCTCCACTTCTTCATGGTTGGTTTCGCTCCATT
GACGTCGAGAGGTTCGCAGCAGTACAGTGCTTTGAGTGTCCCTGAGCTGACCCAGCAGAT
GTGGGACGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGCCACGGACGTTACTTAACCGC
ATCCGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGTTAAGGAGGTGGATGAGCAGATGATGAACATCC
AGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGCGGATCCCGAACAACGTCAAGTCCAGCGTCT
GTGACATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACTCCACCTCGA
TCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAGCAGTTCACAGCTATGTTCAGGAGGAAGGCTT
TCCTTCATTGGTACACGGGAGAAGGCATGGACGAGATGGAGTTCACCGAGGCGGAGAGTA
ACATGAATGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCGACAGCCGGTGAGGAGG
AGTATGAGGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTCGTCAGTGGCTTCGTCT
GATTCATAAAGCTTAAAGACTCTCCTTTTGTTTTGCTTTTTTCAGTTTGTGTGCTTTTGT
TCGTGAAACCCAAATTCGTTCTGGATTGTTAAAACGTTTGCGTGTGTATTGGTTTATTGT
TTTCGTCAAGT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5837Contig1 1107 2 10 U
GCATCCTCCACCGTATATACGGCAAGTTCATGGTGCATCGTCCTTTCATAAGGAAAGCCA
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AGCTTTTCTTGGTCAGGGCTTTGATGCCGCTGCACAGGCCTAAGTGCGCCGCTGCGTATC
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TTCTTGGGGAGTTCGAAGAAGTCTTGGAAGCTACTCAAGGAGATGAGTTTCGACGGTGTA
TGGTTCCTTTGTTCCGTCGAATCGCTAGATGTCTCAACAGCTCACATTTTCAGGTGGCTG
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CGGCGAGGCAGTGATGATGGTTACAAGGTTTTCATCTTCGGTTACTATTACCACCACCTC
AGGGAAAGCTTCTGGTAGTTGAACACTCTTTCTTGCTTCTTTGTTTTATCAATCAACAAT
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GTCAGGTCTTAGAGTATGAAAGAACGATGTCTTGTAAGAAATATGGTTCTATAGATTATA
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TTTGGTGAGAAAACAGATGAATCGTAC


BQ
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AF RR4GZ15TF U 1
AF RR4GZ15JQ C 452
BS 1 650 RR4GZ15TF
BS 651 651 RR4GZ15JQ
BS 652 690 RR4GZ15TF
BS 691 691 RR4GZ15JQ
BS 692 712 RR4GZ15TF
BS 713 713 RR4GZ15JQ
BS 714 723 RR4GZ15TF
BS 724 724 RR4GZ15JQ
BS 725 750 RR4GZ15TF
BS 751 1107 RR4GZ15JQ

RD RR4GZ15TF 750 0 0
GCATCCTCCACCGTATATACGGCAAGTTCATGGTGCATCGTCCTTTCATAAGGAAAGCCA
TCAACAACATCTTCTACAGGTTCGTTTTCGAGACCGAGAGGCACAACGGCGTCGCTGAGC
TGCTCGAGATTCTGGGAAGTATAATCAACGGTTTCGCGTTGCCGCTGAAAGAGGAGCACA
AGCTTTTCTTGGTCAGGGCTTTGATGCCGCTGCACAGGCCTAAGTGCGCCGCTGCGTATC
ATCAGCAGCTTTGTTATTGCGTTGTTCAGTTCGTTGAGAAAGACTCGAAGCTCGCTGATA
CGGTCGTTAGAGGGCTTTTGAAGTATTGGCCTGTGACCAATAGTTCTAAGGAGGTTATGT
TTCTTGGGGAGTTCGAAGAAGTCTTGGAAGCTACTCAAGGAGATGAGTTTCGACGGTGTA
TGGTTCCTTTGTTCCGTCGAATCGCTAGATGTCTCAACAGCTCACATTTTCAGGTGGCTG
AGAGAGCTTTGTTTCTATGGAACAACGATCACATAAGGAACCTGATTACTCAAAACCATA
AAGTGATAATGCCAATCGTGTTCCCGGCCATGGAGAGGAACATGTGTGGCCATTGGAACC
AGTCGGTGAAGAATCTGACTTTGAATGTGAGGAAAGTGTTGGCGGAGACG*ACAGGCTCT
GTTTGATGAGTGCTTAGCCAAGTTTCAAGA*GATGAAGCGAGTAGAGCAGAG*TTCTAGT
CAA*CGAGAAGCAACGTGGAAGCTTTTGGA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4GZ15JQ 656 0 0
TCTCAACAGCTCACATTTTCAGGTGGCTGAGAGAGCTTTGTTTCTATGGAACAACGATCA
CATAAGGAACCTGATTACTCAAAACCATAAAGTGATAATGCCAATCGTGTTCCCGGCCAT
GGAGAGGAACATGTGTGGCCATTGGAACCAGTCGGTGAAGAATCTGACTTTGAATGTGAG
GAAAGTGTTGGCGGAGACGGACAGGCTCTGTTTGATGAGTGCTTAGCCAAGTTTCAAGAA
GATGAAGCGAGTAGAGCAGAGGTTCTAGTCAAACGAGAAGCAACGTGGAAGCTTTTGGAA
GATTTGGCGGCTTCCAAATCGGTAAGCGGCGGCGAGGCAGTGATGATGGTTACAAGGTTT
TCATCTTCGGTTACTATTACCACCACCTCAGGGAAAGCTTCTGGTAGTTGAACACTCTTT
CTTGCTTCTTTGTTTTATCAATCAACAATGCTTTCAAAAGATCAAGTAGAGTTGTTAAAT
TTTTTATTGATCCTGATCTCTTTTATGTTGTCAGGTCTTAGAGTATGAAAGAACGATGTC
TTGTAAGAAATATGGTTCTATAGATTATAGTTCTTGAGAGGAATGTTATTTGTAATGTAT
TGTGGAATGAAAGTGATCTATAAGTCTGTTTTGGTGAGAAAACAGATGAATCGTAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL5838Contig1 1049 2 4 U
GACAAAAGGAAGGGGATGATCCGACTATCCAGCGGACTCAGACTTTTGGCCAGAGATTCA
TGGACAATCTCTTTCTCAGAAATCTCACATCTCAACCAAAGAGCGCTGCTGCAGAGGTGT
CTGTACCCTCTTCTCCACATAAGGTGGGTCCTGCAGAGCCCGACAACAGAGAAGAAGAGA
GCCCAGCTCTTGGAACTATTAGAGGCAAATGCATCACACAATTACTACTACTTGGTGCTA
TCAACAGTATCCAGAAAAAATACTGGAGTAATTTGAAAACAACACAGAAGATAGCGATCA
TGGACATCTTATTCTCTTTCATAGAATTCGCTGCTTCCTACAATTCATATTCTAACCTCA
GAACACGAATGAATCACATTTCCGCGGAAAGGCCACCTCTAAACCTTCTCCGACAAGAGC
TAGAAGGAACCAACATATATATGGATGTCTTACATAAGACAACAACTGGGCTTGGGGATG
CTGCATCCGATGACACGGAAGATAAACTCGAAGGTGCAGCTGAAGAAAAGCTGGTGTCCT
TCTGTGAACAAGTGCTGAAAGAAACATCTGATCTCCAGTCCTCTTTGGGGGAGTCTACCA
ACATGGATGTTCACCGGGTACTTGAGCTACGTTCTCCCGTGATTGTCAAGGTTCTGGAAG
GAATGTGCTTCATGAACAACAAAATATTCAGGAAACACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGC
TCACGAGGCCTGTCTGCTGTGAACAGATGGACATACGAGGTGCATTAGCCAACCTTTTCA
CAGCACAATTGAAGCCTCTTTTGCAACAGTAAATGATCGAAGCCTATAAAATTGTGACAA
AGCATACTTTTGCTTCCCACAGTTTGGGTTATTGTTTTTTTTTTCTCTTTTTTCTACATT
GGAGTGGTTCTTCTCTTTATTAGAGATGATGCTTGTTCCTGACATGTCGATTAATCTGTA
CTTAGACCGTATCAGCTGTTTTTGAGATTCTTATTCACGTCAAACTTAAAAACCTTTGAG
AACTTTTATGATATTTTGGGTTCACTCTC


BQ
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AF RR4BR41TF U 1
AF RR4BR41JQ C 393
BS 1 662 RR4BR41TF
BS 663 663 RR4BR41JQ
BS 664 679 RR4BR41TF
BS 680 1049 RR4BR41JQ

RD RR4BR41TF 679 0 0
GACAAAAGGAAGGGGATGATCCGACTATCCAGCGGACTCAGACTTTTGGCCAGAGATTCA
TGGACAATCTCTTTCTCAGAAATCTCACATCTCAACCAAAGAGCGCTGCTGCAGAGGTGT
CTGTACCCTCTTCTCCACATAAGGTGGGTCCTGCAGAGCCCGACAACAGAGAAGAAGAGA
GCCCAGCTCTTGGAACTATTAGAGGCAAATGCATCACACAATTACTACTACTTGGTGCTA
TCAACAGTATCCAGAAAAAATACTGGAGTAATTTGAAAACAACACAGAAGATAGCGATCA
TGGACATCTTATTCTCTTTCATAGAATTCGCTGCTTCCTACAATTCATATTCTAACCTCA
GAACACGAATGAATCACATTTCCGCGGAAAGGCCACCTCTAAACCTTCTCCGACAAGAGC
TAGAAGGAACCAACATATATATGGATGTCTTACATAAGACAACAACTGGGCTTGGGGATG
CTGCATCCGATGACACGGAAGATAAACTCGAAGGTGCAGCTGAAGAAAAGCTGGTGTCCT
TCTGTGAACAAGTGCTGAAAGAAACATCTGATCTCCAGTCCTCTTTGGGGGAGTCTACCA
ACATGGATGTTCACCGGGTACTTGAGCTACGTTCTCCCGTGATTGTCAAGGTTCTGGAAG
GA*TGTGCTTCATGAACAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4BR41JQ 657 0 0
CCACCTCTAAACCTTCTCCGACAAGAGCTAGAAGGAACCAACATATATATGGATGTCTTA
CATAAGACAACAACTGGGCTTGGGGATGCTGCATCCGATGACACGGAAGATAAACTCGAA
GGTGCAGCTGAAGAAAAGCTGGTGTCCTTCTGTGAACAAGTGCTGAAAGAAACATCTGAT
CTCCAGTCCTCTTTGGGGGAGTCTACCAACATGGATGTTCACCGGGTACTTGAGCTACGT
TCTCCCGTGATTGTCAAGGTTCTGGAAGGAATGTGCTTCATGAACAACAAAATATTCAGG
AAACACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACGAGGCCTGTCTGCTGTGAACAGATGGAC
ATACGAGGTGCATTAGCCAACCTTTTCACAGCACAATTGAAGCCTCTTTTGCAACAGTAA
ATGATCGAAGCCTATAAAATTGTGACAAAGCATACTTTTGCTTCCCACAGTTTGGGTTAT
TGTTTTTTTTTTCTCTTTTTTCTACATTGGAGTGGTTCTTCTCTTTATTAGAGATGATGC
TTGTTCCTGACATGTCGATTAATCTGTACTTAGACCGTATCAGCTGTTTTTGAGATTCTT
ATTCACGTCAAACTTAAAAACCTTTGAGAACTTTTATGATATTTTGGGTTCACTCTC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5839Contig1 1086 2 2 U
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AAATCTTCTTCTTCTTCAAGACATCAGCAACTAACCAATAGGAACAGAGAATCAAAAGAC
AAATAAAATTATTCAGACAAAAGATGAGTTGCAATGGTTGCCGTGTGCTCCGAAAAGGTT
GCAGCGAGAACTGCATACTCCGGCCATGTATTCAATGGATAGAAAGCGCCGACGCTCAGG
GCCACGCCACCGTATTCGTCGCTAAATTCTTCGGTCGAGCCGGTCTAATGTCTTTCATCT
CCGCCGTACCGGAATCTCAACGTCCCGCTCTGTTTCAGTCTCTGCTCTACGAAGCTTGCG
GAAGAACCGTGAATCCAGTCAACGGAGCGATAGGAATGCTGTGGACGGGGAACTGGAACG
TCTGCCAAGCTGCTGTCGAGACGGTGCTTCGCGGCGGTTCTCTGAGACCCATCCCCGAGC
TTCTCGCTCACGGCGGCGGCGGATTCGCCGGGTTTCCAACGGCTACTTCCGAAGAAGTAT
CTGAGATCTGCACCGAAATGTTGAGTCTCCAGCACAACGATGGTTCTTCCGACGATCGTA
ACATGTACCATCATTCGAGATTTTCGAGCTCTAGATCGAGATCCAGACAAGATTCTTCTC
CGACCAAACGTAAGCGAGTAGAGCAACAACCATCTTCCGAGCTCGATCTGTCCCTGATCC
CTAATTTCCCTGTAAAAACAACGCCTTGCCCCACACGGCAGCGATCGAGAACACCCTCGA
TGAACTCCGAGGAATCAGTGACGACGACTACTACTACTACACCGACGTCGTTTTGGGATA
ACACTGCAGCTGGTGGTGATCTGTATGGGAACGGAAGCAAGCTGCTTAACCTGTTTGTTT
AAGGAAACTTTGTCGTTTTTCTTCCCTCTGATTTTAGCTAGGGTTCAGAATTGTAATTTC
TTCCCATTTTTCGTGGATACAGAATATTTGGGACCAGGTTTTGTTCTCTCGGTTCAGAAG
TTATATTCACCAATGTTAAACTTAATATTAAGAGATGAATTTCTAAAATTTCTACCTTGT
TAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB85TF U 1
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GAAGAACCGTGAATCCAGTCAACGGAGCGATAGGAATGCTGTGGACGGGGAACTGGAACG
TCTGCCAAGCTGCTGTCGAGACGGTGCTTCGCGGCGGTTCTCTGAGACCCATCCCCGAGC
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CTGAGATCTGCACCGAAATGTTGAGTCTCCAGCACAACGATGGTTCTTCCGACGATCGTA
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CTAATTTCCCTGTA

QA 1 734 1 734
DS 

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GCACAACGATGGTTCTTCCGACGATCGTAACATGTACCATCATTCGAGATTTTCGAGCTC
TAGATCGAGATCCAGACAAGATTCTTCTCCGACCAAACGTAAGCGAGTAGAGCAACAACC
ATCTTCCGAGCTCGATCTGTCCCTGATCCCTAATTTCCCTGTAAAAACAACGCCTTGCCC
CACACGGCAGCGATCGAGAACACCCTCGATGAACTCCGAGGAATCAGTGACGACGACTAC
TACTACTACACCGACGTCGTTTTGGGATAACACTGCAGCTGGTGGTGATCTGTATGGGAA
CGGAAGCAAGCTGCTTAACCTGTTTGTTTAAGGAAACTTTGTCGTTTTTCTTCCCTCTGA
TTTTAGCTAGGGTTCAGAATTGTAATTTCTTCCCATTTTTCGTGGATACAGAATATTTGG
GACCAGGTTTTGTTCTCTCGGTTCAGAAGTTATATTCACCAATGTTAAACTTAATATTAA
GAGATGAATTTCTAAAATTTCTACCTTGTTAAATT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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GTCGGATTTGTACGGATCCTTCATAAATGTTAAACCTTTATCTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DA82JQ C 1
AF RR4DA82TF U 1
BS 1 287 RR4DA82TF

RD RR4DA82JQ 287 0 0
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GAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGCTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAG
ACAGCGATCTAAGTAGAGAGAAAGTCTTCGCCTTTCAATCTGCATTTCTGTTTCTGTTAC
CTTCCCTAAGTACTTTTGTTTGATCTTGTTTCAGTTTTTTGTTTTGTTGGCTACGTTCTT
GTCGGATTTGTACGGATCCTTCATAAATGTTAAACCTTTATCTATCC

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR4DA82TF 287 0 0
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GAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGCTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAG
ACAGCGATCTAAGTAGAGAGAAAGTCTTCGCCTTTCAATCTGCATTTCTGTTTCTGTTAC
CTTCCCTAAGTACTTTTGTTTGATCTTGTTTCAGTTTTTTGTTTTGTTGGCTACGTTCTT
GTCGGATTTGTACGGATCCTTCATAAATGTTAAACCTTTATCTATCC

QA 1 287 1 287
DS 



AS 1 2

CO CL5841Contig1 1220 2 2 U
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AACGGAGTAGGAGAGAGAAAGCTGGGAGATGAAACGCCGTCATCTTTCTTGGACGGTACG
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CTTCAACGTGGCTACTCAGTTCGAGCCACCGTTCGAGCTAACACAGAAAAGACTAAAAGA
GATATAAGCTACTTAACCGAGCTTCCATTTGCTTCGGAGAGGCTTAAAATATTCACCGCC
GATCTCAACGAACCGGAGAGCTTTAAACCGGCTATCGAAGGATGCAAAGCAGTGTTTCAC
GTGGCACATCCCATGGACCCGACCAGCAACGAGACCGAAGAGACCGTGACAAAACGCACC
GTGCAAGGTCTTATGGGGATACTGAAATCATGTCTGGATGCTAAAACCGTGAAACGCTTT
TTCTACACATCAAGCGCCGTAACCGTTTTCTACGGCGTCGGAAGCGGTGCTGGAGGAAAC
GGAGGAGTAGTAGATGAGAACGTTTGGAGCGACGTGGAAGTGTTTAGGAATCAGAAGGAG
AAGAGAGTAAGTAGCTCTTATGTTGTGTCGAAAATGGCGGCCGAGACGGCAGCGCTTGAG
TTCGGCGGGAAGAATGGATTGGAGGTTGTGACGCTTGTGATCCCTCTCGTCGTCGGACCT
TTTATATCTCCGTCGTTGCCTTCATCCGTCTTCATCTCTCTCGCCATGATCTTTGGAAAT
TACAAGGAGAAGTATTTGTTCGATACTTACAACATGGTACATATTGACGATGTAGCAAGG
GCGATGATATTTCTATTGGAAAAGCCAGTAGCGAAAGGGAGATATATATGTTCGTCTGTG
GAGATGAAGATCGACGAGGTCTTTGAGTTTTTGTCTACGAGGTTTCCTCAGTTTCAGCTA
CCTTCAATTGATTTGAAGAGTTACACAGTAGAGAAGCGGATGAGTCTGTCGTCGAAGAAG
CTGAGGAGTGCAGGGTTCGAGTTTAAGTATGGAGCTGATGATATATTCACCGGAGCTATA
AAGAGCTGCCAAGCGAGAGGCTTTCTTTAAAGTCTTAAGGGTTTTTGATTTTAAATTTGT
ATATGAATTGAAAATATCATTTCTTTTTATTCCGTTTTGTAAGATGTTCCACTTGTTGAC
GAAAGAAACAAATTGTTTCT


BQ
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CTTCAACGTGGCTACTCAGTTCGAGCCACCGTTCGAGCTAACACAGAAAAGACTAAAAGA
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GATCTCAACGAACCGGAGAGCTTTAAACCGGCTATCGAAGGATGCAAAGCAGTGTTTCAC
GTGGCACATCCCATGGACCCGACCAGCAACGAGACCGAAGAGACCGTGACAAAACGCACC
GTGCAAGGTCTTATGGGGATACTGAAATCATGTCTGGATGCTAAAACCGTGAAACGCTTT
TTCTACACATCAAGCGCCGTAACCGTTTTCTACGGCGTCGGAAGCGGTGCTGGAGGAAAC
GGAGGAGTAGTAGATGAGAACGTTTGGAGCGACGTGGAAGTGTTTAG
AATCA

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DS 

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AAGCGCCGTAACCGTTTTCTACGGCGTCGGAAGCGGTGCTGGAGGAAACGGAGGAGTAGT
AGATGAGAACGTTTGGAGCGACGTGGAAGTGTTTAGGAATCAGAAGGAGAAGAGAGTAAG
TAGCTCTTATGTTGTGTCGAAAATGGCGGCCGAGACGGCAGCGCTTGAGTTCGGCGGGAA
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GTCGTTGCCTTCATCCGTCTTCATCTCTCTCGCCATGATCTTTGGAAATTACAAGGAGAA
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TCTATTGGAAAAGCCAGTAGCGAAAGGGAGATATATATGTTCGTCTGTGGAGATGAAGAT
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AAATATCATTTCTTTTTATTCCGTTTTGTAAGATGTTCCACTTGTTGACGAAAGAAACAA
ATTGTTTCT

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DS 



AS 1 2

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CTTGTCTTCTTCTCTCCTCTCTCTCGCTCCTTTTGTATTGTATCTGATTCCCTTTTTTCT
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GATCTGATTGCTAAACCACAGGGCGAATCAAAATCTTGCAGAGCAGAGGGCAATAAAACC
GATAGCTCGGAAAATAAGGACAGCTTCTTCTTCCTCCCTGATTTGAACATGGTACCAACC
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ACGAAAATTGTGTTAATGACAACTAATAGACTTTAATCTTTTCAAACCTGTCC


BQ
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BS 704 1193 RR4G350JQ

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GTAGAGCTTCTAATACGACTAAAGCACGCGGGGACGGTTGTTTCGGAAGATCCAGCGACG
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GGCGGCGGCGTTGCCGTTTCGTTGAAAAAGGATGTGTATTCCGCTAGAGGCAGTCCGAAG
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TCGGCCGATGGATTCGAGGACACCAGTCTCCTAGCTAGCTGCTCCACGTCTACAGTATCC
GGATCTAAGGATTTTCCCACAAACGAAATCACCAATTCTTTCTCCAAGAGATTGAAGATA
AAGAAGTCTTCTGAGCTTAAATACCAAGATAAGTTAAAGTTGAAGGAAAGAGTCGACCTT
GAAAATGATATTGCAAGTCTCCGAGCAAGTTTCGACGAACAAA
CGTTAGAACACAGTTGAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4G350JQ 769 0 0
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CCGATGGATTCGAGGACACCAGTCTCCTAGCTAGCTGCTCCACGTCTACAGTATCCGGAT
CTAAGGATTTTCCCACAAACGAAATCACCAATTCTTTCTCCAAGAGATTGAAGATAAAGA
AGTCTTCTGAGCTTAAATACCAAGATAAGTTAAAGTTGAAGGAAAGAGTCGACCTTGAAA
ATGATATTGCAAGTCTCCGAGCAAGTTTCGACGAACAAAACGTTAGGAACCACAGGTTGA
AGAGGATCAAGCTTGATTTGAGTTCAGGCCGTGTCAAGAACGAGACTCCTCAGGTTGATC
TGATTGCTAAACCACAGGGCGAATCAAAATCTTGCAGAGCAGAGGGCAATAAAACCGATA
GCTCGGAAAATAAGGACAGCTTCTTCTTCCTCCCTGATTTGAACATGGTACCAACCGAGG
ACGAGATATTGTATGGAACTAGCTAAGAGGCTTATCTGAAGACTTTCGATCTCGATCTGA
TTACAATCATGAAAGGAGCCAGAGAGACTTGATGAACGTAATAAGAGGTTTCATTCATTG
TTTTCTGTCTCCTTCCTTCTCGTGGGTGGAAATTTTAGGTTCTTTAATTTTTTTTCTCTC
TTTTGTCCCTATTCGTTGTAGTTAAAGCTGTGTTTGAAATTGTGTTTTTTCTGTCAACGA
AAATTGTGTTAATGACAACTAATAGACTTTAATCTTTTCAAACCTGTCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL5843Contig1 566 2 2 U
TTGTTTGGTATTCCAATACAATCTATAACTATTAACACGTATTTACAATCTTTGATGCAT
AGAGACTCTAAAATACAAGCAATTGTTGTTCTAAAGAACTGTGTAAAGAAGAGCATCTAG
CACTGGATATTGATATTAACAGAGCCTGTTCTGTATCTCCATCCATTCTTCGCTCGACCA
ACTTAATGAGATACTCCACAAAAATAGAATCGAATGGCAATGTAATTGGTCCACCAGCAG
AGAGGCCAAACGCTTCTTCAGAGATCTTCAAGAACTCTTGGAAAATAGAGTTGTTAAGGT
ACCTTAATGGAAAAGCAAAACGCATTTTATCTGCCGTGTAAACCACGAAACAACCCTTCT
CCACAGCGGTGGAGCTTCTACTACTTGTTCTATGGAATGAGATTCTTCTCCTGTGGAGGG
CTGCTCTTTGTTGCCATTTCTTGGCTATCTTGAGGAGCTTCTTTGTGTTCATCATGGTTT
TGACTTTGAGGACTAGTATATTTGAAAAAGAAAAGATTTGTATGTTCTGTTTGAAGAGCT
CTCTAAATGAAAGTTGTGAATGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GJ67TF C 1
AF RR4GJ67JQ U 281
BS 1 280 RR4GJ67TF
BS 281 566 RR4GJ67JQ

RD RR4GJ67TF 566 0 0
TTGTTTGGTATTCCAATACAATCTATAACTATTAACACGTATTTACAATCTTTGATGCAT
AGAGACTCTAAAATACAAGCAATTGTTGTTCTAAAGAACTGTGTAAAGAAGAGCATCTAG
CACTGGATATTGATATTAACAGAGCCTGTTCTGTATCTCCATCCATTCTTCGCTCGACCA
ACTTAATGAGATACTCCACAAAAATAGAATCGAATGGCAATGTAATTGGTCCACCAGCAG
AGAGGCCAAACGCTTCTTCAGAGATCTTCAAGAACTCTTGGAAAATAGAGTTGTTAAGGT
ACCTTAATGGAAAAGCAAAACGCATTTTATCTGCCGTGTAAACCACGAAACAACCCTTCT
CCACAGCGGTGGAGCTTCTACTACTTGTTCTATGGAATGAGATTCTTCTCCTGTGGAGGG
CTGCTCTTTGTTGCCATTTCTTGGCTATCTTGAGGAGCTTCTTTGTGTTCATCATGGTTT
TGACTTTGAGGACTAGTATATTTGAGAAAGAAAAGATTTGTATGTTCTGTTTGAAGAGCT
CTCTAAATGAAAGTTGTGAATGATCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4GJ67JQ 286 0 0
GAAAATAGAGTTGTTAAGGTACCTTAATGGAAAAGCAAAACGCATTTTATCTGCCGTGTA
AACCACGAAACAACCCTTCTCCACAGCGGTGGAGCTTCTACTACTTGTTCTATGGAATGA
GATTCTTCTCCTGTGGAGGGCTGCTCTTTGTTGCCATTTCTTGGCTATCTTGAGGAGCTT
CTTTGTGTTCATCATGGTTTTGACTTTGAGGACTAGTATATTTGAAAAAGAAAAGATTTG
TATGTTCTGTTTGAAGAGCTCTCTAAATGAAAGTTGTGAATGATCC

QA 1 286 1 286
DS 



AS 1 2

CO CL5844Contig1 1026 2 2 U
GGATGGCGAAACAGAGTTACTTCTTCTTGTTTCTTTCTCTCGTCTCACTCTGTTCCTCAA
CAACTACAACTCATGATGTCTTTGACTCACCAACGGTCTTCCCAACAAACCCTACAACTA
CACCACCGGTTACTACATTTCCTCCTGTGACCATAACACCAACAAACCCTACCACAACTC
TTACCCCTCCGGTCACAACAGTCCCTGCTACACTCACACCACCAGTGACCAACCCAGTGA
CTCAATATCCTCCAACACAACCCTCAGGGACGGTACCGGTTCCTGTCATTCCACCGCCTT
TCACCTCAAACTCTCCTTCGGTTTCAGGTCAAAGCTGGTGCGTGGCAAAGCCCGGAGCCT
CACAAACCTCACTCCAACTGGCTCTTGACTATGCGTGCGGGTTAGGTGGAGCTGATTGTT
CTCAGATACAGCAAGGAGGCAACTGTTATTCGCCAATCAGTCTCCAGAACCATGCCTCGT
TTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAATCCATCTCCACAAAGCTGTGATTTTGGCGGTG
CAGCCTCCATTGTAAACACCAACCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGCTCAT
CAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACATCAACACCAATAA
TACCAACAGGAGGTGGGATAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCAGTTTTTAACCCGGCGA
ATCCTTTACCAAACACTATGAACAATCCATTATCAGGAGGTCCTCCCGCGGTTTACGGGT
TTGATGGTTCGCCTAGTGGGAACAATCCAACATTATCAGACTCTACCTACTTGCAGCTTC
ACTTTGGTCACACTGTGGTGGTGACAATGATTCTTCACGCAGTGCTGTTTCATTAGAAAG
TAGAATTATATAGGAGTTGAATTAGTTTTATGAGATAGTGTTCAACAAGCTTAAGCTTTT
AGAGTATGTTACGAAGAAGCTAGGGATATAAGACATTATAAATTTGTTTGATTCAACGCT
CATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ33TF U 1
AF RR4EQ33JQ C 391
BS 1 672 RR4EQ33TF
BS 673 1026 RR4EQ33JQ

RD RR4EQ33TF 673 0 0
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CAACTACAACTCATGATGTCTTTGACTCACCAACGGTCTTCCCAACAAACCCTACAACTA
CACCACCGGTTACTACATTTCCTCCTGTGACCATAACACCAACAAACCCTACCACAACTC
TTACCCCTCCGGTCACAACAGTCCCTGCTACACTCACACCACCAGTGACCAACCCAGTGA
CTCAATATCCTCCAACACAACCCTCAGGGACGGTACCGGTTCCTGTCATTCCACCGCCTT
TCACCTCAAACTCTCCTTCGGTTTCAGGTCAAAGCTGGTGCGTGGCAAAGCCCGGAGCCT
CACAAACCTCACTCCAACTGGCTCTTGACTATGCGTGCGGGTTAGGTGGAGCTGATTGTT
CTCAGATACAGCAAGGAGGCAACTGTTATTCGCCAATCAGTCTCCAGAACCATGCCTCGT
TTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAATCCATCTCCACAAAGCTGTGATTTTGGCGGTG
CAGCCTCCATTGTAAACACCAACCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGCTCAT
CAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACATCAACACCAATAA
TACCAACAGGAG
T

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4EQ33JQ 636 0 0
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CGCCAATCAGTCTCCAGAACCATGCCTCGTTTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAATC
CATCTCCACAAAGCTGTGATTTTGGCGGTGCAGCCTCCATTGTAAACACCAACCCAAGCA
CTGGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGCTCATCAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGA
ACCAGCCTCCTGTCACATCAACACCAATAATACCAACAGGAGGTGGGATAATCGGGGTTG
GAACTCCACCAGCAGTTTTTAACCCGGCGAATCCTTTACCAAACACTATGAACAATCCAT
TATCAGGAGGTCCTCCCGCGGTTTACGGGTTTGATGGTTCGCCTAGTGGGAACAATCCAA
CATTATCAGACTCTACCTACTTGCAGCTTCACTTTGGTCACACTGTGGTGGTGACAATGA
TTCTTCACGCAGTGCTGTTTCATTAGAAAGTAGAATTATATAGGAGTTGAATTAGTTTTA
TGAGATAGTGTTCAACAAGCTTAAGCTTTTAGAGTATGTTACGAAGAAGCTAGGGATATA
AGACATTATAAATTTGTTTGATTCAACGCTCATGTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL5845Contig1 1219 2 2 U
GGATACACAAAACGCTTAGAGAGGTAAGAAAAATAAAAGAAATAAAAAGGAGAGATAGTT
ATTGAATACAAGCAATTTATTTTAGAAGTCGATTAATTATCAAGAATGGGTTACTGCGAT
GGTACTCGATGGTGGTGTTAATCATATGGTTATAGCAACATACCGGCTCGCTATTTCCAC
CTTGTTTTTGGCACCAATAGCATTTTTCTGGGAACGGACAACAAGACCAAAACTTACGCT
CAACATCTTGGTTCAGCTTTTCTTCAGTGCTCTTGTTGGGGCAAGTTTGACTCAGTATTT
CTTCCTACTGGGACTATCGTACACATCTGCTACGTTAGCATGTGCTTTTATTAGCATGAC
ACCTGCGGTTACGTTCGTTTTATCTTTAGTATTCAGGGTAGAGAAACTAAACATGAAAAG
CAAAGCAGGTATAGGGATGGTGATGGGCACTTTGATATGCATTGGAGGAGCTTTATTACT
AACAATGTACAAAGGTGTTCCCTTGACAAAATTTCACAAACTAGAAACCCATCCATCGAC
CGACAATAAACCCGCATTGAAACCTGAGAATTGGATCATTGGATGCGTGCTTCTCTTTGC
GGGTAGTAGCTGTTTCGGGTCGTGGATGCTAATACAATCCAAAGTGAACGACAAATACCC
TTGTCAATACTCAAGCACCGTCATACTATCTTTTTTCGGAACCATCCAATGCGCACTACT
AAGCCTCATCAAATCAAGAGATATCACGACTTGGATCCTCACAGATAAACTCGATATCAT
GACCGTTGTTTATGCAGGAGCGGTAGCACAAGGAATATGTACAGTGGGAACATCTTGGTG
CATCAGAAAGAGAGGACCGATCTTTACTTCAATATTTACTCCGGTGGGGCTTGTCTTTGC
AACCCTATTTGATTTCTCGATCCTTCATCGTCAAATTTGTATGGGAAGTGTTATCGGATC
TGGGATTGTTATCTTCGGACTATACATATTCTTGTTGGGAAAGGTAAGGCAAATGAAAGA
AGAGTGTGCAAAGAAGTTGCCTTCTCATTTTGGTGAAGAAGAAACCAAAGACGATGAACA
ATACAAAAAGGGTCATCTTATGGTTGTTCCAATGACTCCTTGATATGCTCAGACTTCTCC
TTTTCTTCTTCGCTTTGTACATTATCTTGGAAGTAATAATTTCAAACATAAAAGCCAACC
AAGGCTTTTATCAATTTGG


BQ
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CAAAGCAGGTATAGGGATGGTGATGGGCACTTTGATATGCATTGGAGGAGCTTTATTACT
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ATCATGACCGTTGTTTATGCAGGAGCGGTAGCACAAGGAATATGTACAGTGGGAACATCT
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GGATCTGGGATTGTTATCTTCGGACTATACATATTCTTGTTGGGAAAGGTAAGGCAAATG
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GAACAATACAAAAAGGGTCATCTTATGGTTGTTCCAATGACTCCTTGATATGCTCAGACT
TCTCCTTTTCTTCTTCGCTTTGTACATTATCTTGGAAGTAATAATTTCAAACATAAAAGC
CAACCAAGGCTTTTATCAATTTGG

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DS 



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AF RR4EU19TF U 1
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BS 612 1067 RR4EU19JQ

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ATTATATTGGAGTCTATACTCTACACTATCTTAGGATTACAGTTGTTTCAATTTGTTTTT
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TGGTTAGAAAG

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DS 

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CTTAGGATTACAGTTGTTTCAATTTGTTTTTGATTTTTCAAAGTTTCTTCCTTTGATTGT
GTATTGTGCTTTGCTTGTTACTTGAGGCAATTAGTTATGCTTAATCACTCTTTTGATTCA
AATGGGTCTGCTTTACTTTTTTTTTTAGTTATGGTTAGAAAGTAGAATTCATTTGAAGTA
TGATTTTTAGTTGCGATTACTATAACATTAACTGAATAGTAATTGCTACTAGTTTTGATA
ATAATGTGAGCACTGGCACTGTCTTATTGCCACCAGTTTGGTTCAATCTGTCCTTGACCT
TTCTGCAAAAACTTTACATTGTATATGAATGTGTTGTTAAAGCCTATCACTTCATGGTTT
GACACAATGATAAATTTTTCAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGACAGGCCGC
TCGCCCTGCTGGTGGTGCCCCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAA
CTCAAAAATCTTTATATTCTAGTTTCAGTCTCAGGGTTGTCTAGAATTTTTGAAGATGCT
TTCTACATTTGGTTTAAAGATAATTTCGTCATGTCTACCTTTGAATGCTTGGAGACTATT
TATCAGTTTGTTTTGACT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5848Contig1 1180 2 4 U
GGCATGGGAGATATGTGGTTGATCCGGTTACTTCCATGAAAAAAGGGCCTCCACTGCCTA
TTCATCGATCACGCTCCGTTCCAGCGTTCAACAAAGATGGTAGTCTAAGACAAGCAGGTG
TTTTCAGGGTGATTCCTACTCCGAACATGACGCCAGCAAGAAATAATAATATTAAACTTA
ACGACACGGATGTTGATGGAGGAGAAGATGTTCCTGAAGAAGAAGCTGTGTGCAGAATCT
GCATGGTGGAAATGGGGGAAGACTCGGATGCCTTCAAGATGGAATGTATGTGTAGAGGTG
AATTAGCTCTAGCACACAAGAATGTACAATCAAATGGTTCACCATTAAAAAACAGAACGT
GTGATGTGTGCAAGCAAGAGGTTCAGAACCTCCCTGTGACCCTTCTTCGCATGCAGAACT
CCCACGGGAATTTTGGAGATGCTGATACCGAGGCTTCTCACTTCAGTGTGTGGAAGGATG
TTCCAGTACTTGTCATTGTAAGCATGCTTGCATACTTCTGTTTCCTCGAGCAGCTTCTGC
TTACGAAAATGAAATCCGGAGCCATTGCAATATCTTTACCATTCTCTTGCGTTCTTGGTC
TTCTTGCCTCTATGACGACAACAACAATGGTGAAGAAGCAATATATCTGGATTTACGCCA
CAGTTCAGTTCGCTCTTGTAGTTTTTTTCTCTCACATTTTCTTCACATTGGTTCACATGA
AGCCGGTTGTGTCCATTCTCTTAGCCACATTGGTCGGGTTTGGGCTCACCATGAGCGGGC
AAACGGGTCTAGCCGAGTTTTCAAAATGGAGGAGAGTCCAGAGAGCAGATGAACCTCCAA
GCAGTAGTAGTCAGGTGGATCAACCACCAGCTCAGACAGCAGGTTAGAGCAATCTGTGGA
TCATGAAACTCAAGCCAGAGCTCCTGAATGCTGGTCACATGTTCCCACTAGCGGTTTATG
GTATAAAATCAAAACCATTTTGGGTCGTGACATCTTGGATGGAGAGATCCATCTATTTAG
AGATGTGAGAACATATTGGTCATGTCACATGTAGTGATGGTTACCTGGAAGAGTTCAAAA
ATTATTTCTGGGTGGTCAGTTAGTGAATGTGTGTTAAGCTTATTTTTGGTACTTTATTGT
ACAAAAATATAAGTAAAAATAGGAATATATATATTCGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E179TF U 1
AF RR4E179JQ C 420
BS 1 687 RR4E179TF
BS 688 688 RR4E179JQ
BS 689 704 RR4E179TF
BS 705 1180 RR4E179JQ

RD RR4E179TF 704 0 0
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TTCATCGATCACGCTCCGTTCCAGCGTTCAACAAAGATGGTAGTCTAAGACAAGCAGGTG
TTTTCAGGGTGATTCCTACTCCGAACATGACGCCAGCAAGAAATAATAATATTAAACTTA
ACGACACGGATGTTGATGGAGGAGAAGATGTTCCTGAAGAAGAAGCTGTGTGCAGAATCT
GCATGGTGGAAATGGGGGAAGACTCGGATGCCTTCAAGATGGAATGTATGTGTAGAGGTG
AATTAGCTCTAGCACACAAGAATGTACAATCAAATGGTTCACCATTAAAAAACAGAACGT
GTGATGTGTGCAAGCAAGAGGTTCAGAACCTCCCTGTGACCCTTCTTCGCATGCAGAACT
CCCACGGGAATTTTGGAGATGCTGATACCGAGGCTTCTCACTTCAGTGTGTGGAAGGATG
TTCCAGTACTTGTCATTGTAAGCATGCTTGCATACTTCTGTTTCCTCGAGCAGCTTCTGC
TTACGAAAATGAAATCCGGAGCCATTGCAATATCTTTACCATTCTCTTGCGTTCTTGGTC
TTCTTGCCTCTATGACGACAACAACAATGGTGAAGAAGCAATATATCTGGATTTACGCCA
CAGTTCAGTTCGCTCTTGTAGTTTTTT*CTCTCACATTTTCTTC

QA 1 704 1 704
DS 

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CTTACGAAAATGAAATCCGGAGCCATTGCAATATCTTTACCATTCTCTTGCGTTCTTGGT
CTTCTTGCCTCTATGACGACAACAACAATGGTGAAGAAGCAATATATCTGGATTTACGCC
ACAGTTCAGTTCGCTCTTGTAGTTTTTTTCTCTCACATTTTCTTCACATTGGTTCACATG
AAGCCGGTTGTGTCCATTCTCTTAGCCACATTGGTCGGGTTTGGGCTCACCATGAGCGGG
CAAACGGGTCTAGCCGAGTTTTCAAAATGGAGGAGAGTCCAGAGAGCAGATGAACCTCCA
AGCAGTAGTAGTCAGGTGGATCAACCACCAGCTCAGACAGCAGGTTAGAGCAATCTGTGG
ATCATGAAACTCAAGCCAGAGCTCCTGAATGCTGGTCACATGTTCCCACTAGCGGTTTAT
GGTATAAAATCAAAACCATTTTGGGTCGTGACATCTTGGATGGAGAGATCCATCTATTTA
GAGATGTGAGAACATATTGGTCATGTCACATGTAGTGATGGTTACCTGGAAGAGTTCAAA
AATTATTTCTGGGTGGTCAGTTAGTGAATGTGTGTTAAGCTTATTTTTGGTACTTTATTG
TACAAAAATATAAGTAAAAATAGGAATATATATATTCGTCG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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AATGGAGATGATGAGTCTAGCTTCGAGCAGTGTTACCGTTGTTACCCTGTCACATTCATT
GAAAAGGCACATCTTGACAAGGGGGACAAAATTATAATGCCTCCTTCCGCTCTCAACCGT
CTTGCTTCTTTGCATATTGAGTACCCAATGCTGTTTCAACTGAGTAATGAATCTGTTGGC
AAGATCACACATTGTGGTGTACTCGAGTTCACCGCAGACGAAGGCCTTGTTTACTTTCCT
TATTGGATGATGCAAAACATGTCTCTTCAAGAGGGAGACATTGTGAGAATCAAGAATATG
AGTTTGGTGAAAGGGACTTACATCAAGCTTCAGCCACACACTCAAGATTTCTTGGACATT
ACCAGCCCAAGTTCACGCCATTCACTGGGTCCGGAAAGCGTTTGGATGGGAAGACACAAA
CAGAATCAACTGAACAAGAAGAGAAGCCAACTGAGAAGGGCAAGGATGATGATTAGAAGC
TGTCAAGCATAACGCCGCCGCAAAAATCAGGGAAGCTTGTCTTTGGCTCAAACAGCAAAC
AAACTTCAAAAGCAAATGTGAAAGTTGATCCAAAGAACGTGGAGCAAGAAAGTTCGACAA
AGTCTGATGAAGCTAAGTTTAAAGTGTTTACTGGGAAGAAATACTCACTCAAGGGTTAAG
AAAACACAGGTTTTTTTTTAAGTTTAATCATCTGCCGATGAATATTAATGTGTTTATTTT
TAAATTATTTCTATCACAATTTATCTGTTTAAGCATTTACATATTCATAGATTCTCTCAC
CAATTTATGGGAATAGCTTCAGTGGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH42TF U 241
AF RR4AH42JQ C 1
BS 1 240 RR4AH42JQ
BS 241 501 RR4AH42TF
BS 502 810 RR4AH42JQ

RD RR4AH42TF 261 0 0
TATTGGATGATGCAAAACATGTCTCTTCAAGAGGGAGACATTGTGAGAATCAAGAATATG
AGTTTGGTGAAAGGGACTTACATCAAGCTTCAGCCACACACTCAAGATTTCTTGGACATT
ACCAGCCCAAGTTCACGCCATTCACTGGGTCCGGAAAGCGTTTGGATGGGAAGACACAAA
CAGAATCAACTGAACAAGAAGAGAAGCCAACTGAGAAGGGCAAGGATGATGATTAGAAGC
TGTCAAGCATAACGCCGCCGC

QA 1 261 1 261
DS 

RD RR4AH42JQ 810 0 0
AATGGAGATGATGAGTCTAGCTTCGAGCAGTGTTACCGTTGTTACCCTGTCACATTCATT
GAAAAGGCACATCTTGACAAGGGGGACAAAATTATAATGCCTCCTTCCGCTCTCAACCGT
CTTGCTTCTTTGCATATTGAGTACCCAATGCTGTTTCAACTGAGTAATGAATCTGTTGGC
AAGATCACACATTGTGGTGTACTCGAGTTCACCGCAGACGAAGGCCTTGTTTACTTTCCT
TATTGGATGATGCAAAACATGTCTCTTCAAGAGGGAGACATTGTGAGAATCAAGAATATG
AGTTTGGTGAAAGGGACTTACATCAAGCTTCAGCCACACACTCAAGATTTCTTGGACATT
ACCAGCCCAAGTTCACGCCATTCACTGGGTCCGGAAAGCGTTTGGATGGGAAGACACAAA
CAGAATCAACTGAACAAGAAGAGAAGCCAACTGAGAAGGGCAAGGATGATGATTAGAAGC
TGTCAAGCATAACGCCGCCGCAAAAATCAGGGAAGCTTGTCTTTGGCTCAAACAGCAAAC
AAACTTCAAAAGCAAATGTGAAAGTTGATCCAAAGAACGTGGAGCAAGAAAGTTCGACAA
AGTCTGATGAAGCTAAGTTTAAAGTGTTTACTGGGAAGAAATACTCACTCAAGGGTTAAG
AAAACACAGGTTTTTTTTTAAGTTTAATCATCTGCCGATGAATATTAATGTGTTTATTTT
TAAATTATTTCTATCACAATTTATCTGTTTAAGCATTTACATATTCATAGATTCTCTCAC
CAATTTATGGGAATAGCTTCAGTGGAACCC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL5850Contig1 604 2 2 U
GCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCTCACTCGAGTAACCGTGGAGTTCTCATG
ACCATGTCTACGTCCACCGTAGTGGCTAGAGGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATAGA
AAAAAACTACTCCTGGTCGTGAATCCGAATTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGCTC
CACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGG
TGTTGATGAAGGTCATACCAGGCATGACGGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAG
CCCACATCAACGGTCTAGCAGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCAGAGCAACACT
GTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGGTGGTGGAGGCTGCT
GAAACAAAACAAAAAAACAAAACTAGTTTAAATTTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTCA
GGACACTCTATTTAGTAAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAATT
TGGTACTAAGACTGTTACTGTATGCAGTGAACCTTTTGCCTTTTTATAGATCTTTCGTTG
GGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 

AF RR4BM56JQ C 1
AF RR4BM56TF U 99
BS 1 98 RR4BM56JQ
BS 99 604 RR4BM56TF

RD RR4BM56JQ 604 0 0
GCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCTCACTCGAGTAACCGTGGAGTTCTCATG
ACCATGTCTACGTCCACCGTAGTGGCTAGAGGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATAGA
AAAAAACTACTCCTGGTCGTGAATCCGAATTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGCTC
CACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGG
TGTTGATGAAGGTCATACCAGGCATGACGGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAG
CCCACATCAACGGTCTAGCAGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCAGAGCAACACT
GTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTTTCAGTTCTGTTGAACCTGGTGGTGGAGGCTGCT
GAAACAAAACAAAAAAACAAAACTAGTTTAAATTT*CGTATAGGTTTTTCACACCTCTCA
GGACACTCTATTTAGTAAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAATT
TGGTACTAAGACTGTTACTGTATGCAGTGAACCTTTTGCCTTTTTATAGATCTTTCGTTG
GGTT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4BM56TF 506 0 0
TGTTGGACAAACCAATTATAGAAAAAAACTACTCCTGGTCGTGAATCCGAATTTGATTTG
AGGAAATCAAAGAAGATGGCTCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAAC
AAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTGTTGATGAAGGTCATACCAGGCATGACGGTAGACAAC
GCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCACATCAACGGTCTAGCAGTTGTCATCGTCTGTGCT
CAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTT
GAACCTGGTGGTGGAGGCTGCTGAAACAAAACAAAAAAACAAAACTAGTTTAAATTTTCG
TATAGGTTTTTCACACCTCTCAGGACACTCTATTTAGTAAAAAAAGAAAATGTCCTTTGG
TGTATATAAATATCAGAAAATTTGGTACTAAGACTGTTACTGTATGCAGTGAACCTTTTG
CCTTTTTATAGATCTTTCGTTGGGTT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5852Contig1 753 2 2 U
TTTTTCTTCGATGAGAACCCTTACTTCAAGAACACTGTCTTGACCAAGACATATCACATG
ATTGATGAAGATGAGCCTATCCTCGAGAAGGCTATCGGGACGGAGATGGAGTGGTATCCT
GGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTTAAAAAGAAGCCAAAGAAGGGATTCAAAAACACA
AAGCCGATCACCAAGACTGAGGACTGTGAGAGTTTCTTCAATTTCTTCAATCCACCTCAA
GTTCCTGAGGACGAAGATGATCTTGATGATGAATTGGCTGAAGAACTACAAGGTCAAGTG
GAACACGACTACGATATTGGATCAACAATTAAAGAGAAATTCATCTCGCATGCTGTGTCA
TGGTTCACTGGTGAAGCTGTAGACGAAGATGACCTTGAGATGGAGGATGATGATGATGAG
ATTGATGAAGATGATGATGAGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGAAGAGGACGAGGAT
GATGAGGACGAAGAGGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCGGAAAGAAGTCATCAGCTGGGCAC
AAGAAGTCTGGAAGAAGTCAACTGGCAGAAGGTCAACAAGGTGAGAGGCCACCGGAATGC
AAGCAGCAGTGAGTAAACAAACCTCATCTCAGGTGAAGAAGATTTGGCTTATTGATGAAG
AAGAAGAAGAAAGAGGTCTCTGTGTTTCTTAATTTGCTGTGGTTTGTATGATTATAAATC
AAGTTTTGGGTGGTGGTTTGCTAAAAACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F357TF U 1
AF RR4F357JQ C 292
BS 1 571 RR4F357TF
BS 572 753 RR4F357JQ

RD RR4F357TF 576 0 0
TTTTTCTTCGATGAGAACCCTTACTTCAAGAACACTGTCTTGACCAAGACATATCACATG
ATTGATGAAGATGAGCCTATCCTCGAGAAGGCTATCGGGACGGAGATGGAGTGGTATCCT
GGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTTAAAAAGAAGCCAAAGAAGGGATTCAAAAACACA
AAGCCGATCACCAAGACTGAGGACTGTGAGAGTTTCTTCAATTTCTTCAATCCACCTCAA
GTTCCTGAGGACGAAGATGATCTTGATGATGAATTGGCTGAAGAACTACAAGGTCAAGTG
GAACACGACTACGATATTGGATCAACAATTAAAGAGAAATTCATCTCGCATGCTGTGTCA
TGGTTCACTGGTGAAGCTGTAGACGAAGATGACCTTGAGATGGAGGATGATGATGATGAG
ATTGATGAAGATGATGATGAGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGAAGAGGACGAGGAT
GATGAGGACGAAGAGGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCGGAAAGAAGTCATCAGCTGGGCAC
AAGAAGTCTGGAAGAAGTCAACTGGCAGAAG
TCAAC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4F357JQ 462 0 0
GGTCAAGTGGAACACGACTACGATATTGGATCAACAATTAAAGAGAAATTCATCTCGCAT
GCTGTGTCATGGTTCACTGGTGAAGCTGTAGACGAAGATGCCCTTGAGATGGAGGATGAT
GATGATGAGATTGATGAAGATGATGATGAGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGAAGAG
GACGAGGATGATGAGGACGAAGAGGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCGGAAAGAAGTCATCA
GCTGGGCACAAGAAGTCTGGAAGAAGTCAACTGGCAGAAGGTCAACAAGGTGAGAGGCCA
CCGGAATGCAAGCAGCAGTGAGTAAACAAACCTCATCTCAGGTGAAGAAGATTTGGCTTA
TTGATGAAGAAGAAGAAGAAAGAGGTCTCTGTGTTTCTTAATTTGCTGTGGTTTGTATGA
TTATAAATCAAGTTTTGGGTGGTGGTTTGCTAAAAACAAAAA

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

CO CL5853Contig1 1279 2 8 U
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AAATTGAACCACCACCACCGAGAAACCCTACGACTGCTCTGCCCCCAATGGATATAGCTC
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BQ
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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AF RR4EY81TF U 1
AF RR4EY81JQ C 296
BS 1 549 RR4EY81TF
BS 550 550 RR4EY81JQ
BS 551 582 RR4EY81TF
BS 583 1018 RR4EY81JQ

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TTATCCCAAAGGATACGGTATTGAAGATCACTTGTCTACGTTCCTCTGTGTTGCAAACCC
TGAATCATTGCTACTTGGATGGAAAAGAAGAGCTATTCTTTCATTAGTGCTATCAAACGA
ATCCGGCAAAAGACTGTACGGAACATTTAGAAATGGACCACCGTGCAAGGCTTTCTGCGC
TCAGTTTCCAGCATGGGGTTGGGCAAATGCCATACCTCTTGTTGATGAAGCAGAAAGTTA
CTGATAAGGAGACATTAGATGTCAACGGTTTCCAAGTTCTTTATTGTGAGGTTGGTCAAG
TGACTAATATTTTCGCAAAGCATCCGGACATTTGCCTTGAATTTCATACCAAAGAGCCTT
TGGTGAAAACAACATACATGCATCTCCTCATGGGTCTCATCGAGAAACTGAACAAGCCTC
CACGTAGCTTCACCAAGAACGAATTAAGCGACACTCGCATGGAATTGACAGATCTAACAA
AAGCAGGGT*CAAGCTAGACTGGTTGAAAGAAAAGCTTGATG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4EY81JQ 723 0 0
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TCAAGTGACTAATATTTTCGCAAAGCATCCGGACATT*GCCTTGAATTTCATACCAAAGA
GCCTTTGGTGAAAACAACATACATGCATCTCCTCATGGGTCTCATCGAGAAACTGAACAA
GCCTCCACGTAGCTTCACCAAGAACGAATTAAGCGACACTCGCATGGAATTGACAGATCT
AACAAAAGCAGGGTTCAAGCTAGACTGGTTGAAGGAAAAGCTTGATGAGATTTCCTTGGA
GTTGAAGAAATCAAATGATGATGGTTCCGTGAGTTCTTATAGTTCTCGAGCCCAACAAAT
GGAGGAAGAGCTCCAAGAACTCGAGAAACAAGTCAAGAATCTCAACCTTGAACTGGACAC
AGAAAAGGTCAAGTCTGCCGCTGAAGTTTTGTTGTTGGAACAGACGGTGTCGGATCTCAG
AGATGAGCTGAGCATGATAAAACCAAGATCAACTCCTAAAGACGTACTTGAGGGAGTTGT
TCTCTCTTGGGAAGTATTGGATTACCCGGATCTCAGTAATGAAGAAGTAGAATAAGTAAT
GACATTTTGTTACTGTTTTCCTGTTTTCTTTTATAAATTCTAAATTTCTTAGTTATGTTC
TTCTATATTTGCATTAATTGGAACTACATACATAATAATAATGATTAAGGTTATGTTCGT
TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5857Contig1 1184 2 4 U
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TCTTCCTTCAATCCCAAATCCCTTCTTCCTCTCTGCGTTTCCCGCTCCGCCTCCGTCTTA
CCTCCTTCACTCTCCTTCAAACTCCCCTCCCTCTCTCTCTTCACTTCCTCCGCCCTCAAA
TCCTCCTCCTCACCCGCCCAGTACACATCTCTCTTCGTCACACACGTCGCCGTATCCTCT
GATTTCGAGGTTGAGGAAGACGACATGTTCGCTGATGACGATTCTCCGCCGCCGCAGGAG
CGCAGCTCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTTTCCTTCGATGTCGAT
AGCGCTCAGCTCGCTCAACTGTTCGAGAGCGCCGGTAACGTTGAGATGGTTGAGGTTATC
TATGACAAAGTGACTGGCCGAAGCAGGGGTTTTGGGTTTGTGACTATGTCCTCTGCAGCT
GAAGCTGAGGCTGCTGCTCAACAGTTTAATGGCTATGAATTTGAAGGTAGACCCTTGAGG
GTTAACGCTGGCCCTCCTCCACCTAAGAGGGAGGAATCATTCTCCAGAGGACCAAAGAGT
GGTGGTTATGGTTCTGAACGTTCCGGTTACGGTTCTGAACGTTCCGGTTACGGGTCTCAA
CGTTCAGGACGTTCTGGTTACGGTTCTGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGGGTCAGGGTCG
GGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTATGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACATG
GCTCTTGAGAGCTTGTTTAGTGAGCAAGGAAAGGTTGTAGAGGCCAGGGTCATTTACGAC
AGGGAAACTGGTCGATCCAAGGGTTTTGGGTTCGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGTC
ACAAGAGCCATCAGTTCTTTGAATGGAGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCTCG
GAGGCGAGGCTAGACCACCAAGGCGCCAATTTTGAGTTACCACGCAACTCCTGGAATCTA
TGAGGTTTAGCTCATCTTGACTGGAGATGAGTTATTTATGTTTTGGGCTTATGTTTCTTT
ATTTCACTTTAATTCGTTTTACGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTTTGTAGACTAGGAG
TTTGGACCTTGTTTTCTTTTTATATACTAGTACTCCCTTTCTTC


BQ
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AF RR4EV54TF U 1
AF RR4EV54JQ C 360
BS 1 631 RR4EV54TF
BS 632 632 RR4EV54JQ
BS 633 643 RR4EV54TF
BS 644 1184 RR4EV54JQ

RD RR4EV54TF 643 0 0
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TCTTCCTTCAATCCCAAATCCCTTCTTCCTCTCTGCGTTTCCCGCTCCGCCTCCGTCTTA
CCTCCTTCACTCTCCTTCAAACTCCCCTCCCTCTCTCTCTTCACTTCCTCCGCCCTCAAA
TCCTCCTCCTCACCCGCCCAGTACACATCTCTCTTCGTCACACACGTCGCCGTATCCTCT
GATTTCGAGGTTGAGGAAGACGACATGTTCGCTGATGACGATTCTCCGCCGCCGCAGGAG
CGCAGCTCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTCGTCGGTAACCTTTCCTTCGATGTCGAT
AGCGCTCAGCTCGCTCAACTGTTCGAGAGCGCCGGTAACGTTGAGATGGTTGAGGTTATC
TATGACAAAGTGACTGGCCGAAGCAGGGGTTTTGGGTTTGTGACTATGTCCTCTGCAGCT
GAAGCTGAGGCTGCTGCTCAACAGTTTAATGGCTATGAATTTGAAGGTAGACCCTTGAGG
GTTAACGCTGGCCCTCCTCCACCTAAGAGGGAGGAATCATTCTCCAGAGGACCAAAGAGT
GGTGGTTATGGTTCTGAACGTTCCGGTTACG*TTCTGAACGTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4EV54JQ 825 0 0
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CTATGACAAAGTGACTGGCCGAAGCAGGGGTTTTGGGTTTGTGACTATGTCCTCTGCAGC
TGAAGCTGAGGCTGCTGCTCAACAGTTTAATGGCTATGAATTTGAAGGTAGACCCTTGAG
GGTTAACGCTGGCCCTCCTCCACCTAAGAGGGAGGAATCATTCTCCAGAGGACCAAGGAG
TGGTGGTTATGGTTCTGAACGTTCCGGTTACGGTTCTGAACGTTCCGGTTACGGGTCTCA
ACGTTCAGGACGTTCTGGTTACGGTTCTGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGGGTCAGGGTC
GGGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTATGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACAT
GGCTCTTGAGAGCTTGTTTAGTGAGCAAGGAAAGGTTGTAGAGGCCAGGGTCATTTACGA
CAGGGAAACTGGTCGATCCAAGGGTTTTGGGTTCGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGT
CACAAGAGCCATCAGTTCTTTGAATGGAGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCTC
GGAGGCGAGGCTAGACCACCAAGGCGCCAATTTTGAGTTACCACGCAACTCCTGGAATCT
ATGAGGTTTAGCTCATCTTGACTGGAGATGAGTTATTTATGTTTTGGGCTTATGTTTCTT
TATTTCACTTTAATTCGTTTTACGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTTTGTAGACTAGGA
GTTTGGACCTTGTTTTCTTTTTATATACTAGTACTCCCTTTCTTC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL5858Contig1 1018 2 4 U
GTTACAAATCATGAGTGAATTGTTTACCAAGTTTCTGTTCCCTGATAGAGATTTTTTCTG
ATACTTTTATTCCAATTTAATTTCTTGTTAAATTCAATTTTATATAACCACTGATTTCGT
TTGGGTGTAACCGTGTAATAAATTTGTTTCCTTTGTGTGATTCTTGTAAAAAAAAAAAAA
TTATTATTATCATAGTGATCGCAAACTGTTCGACAAAAAGCCTCAACGAATGTTTTTGAT
TTATTCTAGATTACTCCAGTGTCTGCCATGGGATACAGTTCAGATGACGACAAGATCCTC
AGCTACAACGATGTCGTCCTCAGGAGATCAGATTTGGACATCCTCAACGGACCCAATTTT
CTGAACGACCGTATCATCGAGTTCTACCTAAGCTACCTATCCACGGTCCACACTTCCTCT
GCCATCTCACTCATCCCTCCCTCCATTGCCTTCTGGATCTCAAACTGCCCCGACACCGAA
TCACTCAAAGACTTCATCAAACCCCTTAGGTTGCTCGAAAGCGACCTCCTGATATTTCCT
GTAAACGACAATACCAATGTCGAGCTAGCAGAAGGAGGGTTACACTGGAGCTTACTCGTG
TACCACAGAGAAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGACAGCTTGATGGGACTGAATAAATGG
AGTGCAAAACAGCTCTTCGAGGCGGTTTCTCCGTTTGTGTCTGATGGTGATGCGATGTAC
AGAGAGTGCAGTGATACACCTCAGCAGAAGAATGGGTACGATTGTGGTGTTTACCTTCTT
GCAATTGCCCAGGTTATATGCGAATGGTTTAGCTCTGGAGGAGTGAAGAACCGGGATGAG
TTGTGGTTTACTGATGTGAAGGAGAGTTTACCGGATCTGGTTAACCATTTGAGAGAAGAG
ATGTCAGGGCTGATCAGAAGGTTGATCTCTGAGAAGAGTGCGACTGTGTGAGTAAATGAA
ATGGTTTAGTGAATGATTAGATTACTTTTGATATTTCATTCTTTTTTCTCGAACAATT


BQ
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AF RR4FB53TF U 1
AF RR4FB53JQ C 392
BS 1 656 RR4FB53TF
BS 657 657 RR4FB53JQ
BS 658 668 RR4FB53TF
BS 669 1018 RR4FB53JQ

RD RR4FB53TF 676 0 0
GTTACAAATCATGAGTGAATTGTTTACCAAGTTTCTGTTCCCTGATAGAGATTTTTTCTG
ATACTTTTATTCCAATTTAATTTCTTGTTAAATTCAATTTTATATAACCACTGATTTCGT
TTGGGTGTAACCGTGTAATAAATTTGTTTCCTTTGTGTGATTCTTGTAAAAAAAAAAAAA
TTATTATTATCATAGTGATCGCAAACTGTTCGACAAAAAGCCTCAACGAATGTTTTTGAT
TTATTCTAGATTACTCCAGTGTCTGCCATGGGATACAGTTCAGATGACGACAAGATCCTC
AGCTACAACGATGTCGTCCTCAGGAGATCAGATTTGGACATCCTCAACGGACCCAATTTT
CTGAACGACCGTATCATCGAGTTCTACCTAAGCTACCTATCCACGGTCCACACTTCCTCT
GCCATCTCACTCATCCCTCCCTCCATTGCCTTCTGGATCTCAAACTGCCCCGACACCGAA
TCACTCAAAGACTTCATCAAACCCCTTAGGTTGCTCGAAAGCGACCTCCTGATATTTCCT
GTAAACGACAATACCAATGTCGAGCTAGCAGAAGGAGGGTTACACTGGAGCTTACTCGTG
TACCACAGAGAAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGACAGCTTGATGGGACTGAATAA*TGG
AGTGCAAA
CAGCTCTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4FB53JQ 627 0 0
GCTACCTATCCACGGTCCACACTTCCTCTGCCATCTCACTCATCCCTCCCTCCATTGCCT
TCTGGATCTCAAACTGCCCCGACACCGAATCACTCAAAGACTTCATCAAACCCCTTAGGT
TGCTCGAAAGCGACCTCCTGATATTTCCTGTAAACGACAATACCAATGTCGAGCTAGCAG
AAGGAGGGTTACACTGGAGCTTACTCGTGTACCACAGAGAAGCCAACTCGTTTTTCCATC
ACGACAGCTTGATGGGACTGAATAAATGGAGTGCAAAACAGCTCTTCGAGGCGGTTTCTC
CGTTTGTGTCTGATGGTGATGCGATGTACAGAGAGTGCAGTGATACACCTCAGCAGAAGA
ATGGGTACGATTGTGGTGTTTACCTTCTTGCAATTGCCCAGGTTATATGCGAATGGTTTA
GCTCTGGAGGAGTGAAGAACCGGGATGAGTTGTGGTTTACTGATGTGAAGGAGAGTTTAC
CGGATCTGGTTAACCATTTGAGAGAAGAGATGTCAGGGCTGATCAGAAGGTTGATCTCTG
AGAAGAGTGCGACTGTGTGAGTAAATGAAATGGTTTAGTGAATGATTAGATTACTTTTGA
TATTTCATTCTTTTTTCTCGAACAATT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5859Contig1 1024 2 2 U
AGCTCTCCTTCCGGTTCTTGGTGGCACATCTGGTGTCCTTCAAGGAATGTTGTCCATGGC
TAAATCGTTGGCTATTTTGATTGCGTTTTTGGCTGCTTTGTTTGTATTGTCACGTACCTG
GGTACCTTGGTTTCTAAAGCTTATGACAAGCCTTTCTTCTCAGACTAACGAGCTCTACCA
GTTGGCCGCTGTACATTTTGTTTGCTTGTCGCTTGGTGTAGCGACAAGCTCGGTCTAAGT
CTTGAGTTGGGTTCCTTTGCGGCAGGAGTGATGATATCAACAACTGATCTCGCCCAGCAT
ACTCTTGAACAAGTGGAACCCATCCGCAACTTTTTTTGCAGCGCTGTTCCTCGCTAGTAT
TGGAATGCTGATACATATGCACTTCTTGTGGAACCATGTTGACATTCTGGTAGCAGCCGT
GTTACTGGTGATAGTGATAAAGACTGTGGTCGTTGCAATCGTTGTTAAAGTCTTTGGATA
CAATAACAAAACTGCAGTGCTTGTTGGAATGTCGCTTGCTCAGATTGGGGAGTTTGCTTT
TGTTCTGCTAAGTCGAGCATCCAATCTTCACCTAATTGAGAGCAAACTGTACCTCCTGCT
TCTGGGAACAACTGCTCTAAGCCTGGTAACAACACCATTTCTATTCAAGTTGATACCGGC
CGTTGTACATTTAGGAGTGCTCTTACGGTGGTTCTCCCCGATAGCTCAACTGAGATTGGT
TTCAAAGGAGGTTTGTATCGTTCAGAGAGTGCAAAGCTTATATCACAAATGATCCAAGGT
TCTCTTCACGATTCTTGATGTTGATTCAATAGAAGACACGACACAAAACATCAAAGCCCC
ATTTGATCTCAAGCTAGGCAAAGACAATGAACGGAGAACCGTCGATTGTGTTCCGGATGT
ATAGATGTTTCAGAGAGATGAGAAGATGACCGAAGAGGAAACTGTATAAAATCTCTTACA
CAAAGATAACCACTAAACAAACTTGTAACTTTGATTCATTCTTCTCTATAAAGTTTTTGA
GATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4E593TF U 1
AF RR4E593JQ C 338
BS 1 623 RR4E593TF
BS 624 1024 RR4E593JQ

RD RR4E593TF 623 0 0
AGCTCTCCTTCCGGTTCTTGGTGGCACATCTGGTGTCCTTCAAGGAATGTTGTCCATGGC
TAAATCGTTGGCTATTTTGATTGCGTTTTTGGCTGCTTTGTTTGTATTGTCACGTACCTG
GGTACCTTGGTTTCTAAAGCTTATGACAAGCCTTTCTTCTCAGACTAACGAGCTCTACCA
GTTGGCCGCTGTACATTTTGTTTGCTTGTCGCTTGGTGTAGCGACAAGCTCGGTCTAAGT
CTTGAGTTGGGTTCCTTTGCGGCAGGAGTGATGATATCAACAACTGATCTCGCCCAGCAT
ACTCTTGAACAAGTGGAACCCATCCGCAACTTTTTTTGCAGCGCTGTTCCTCGCTAGTAT
TGGAATGCTGATACATATGCACTTCTTGTGGAACCATGTTGACATTCTGGTAGCAGCCGT
GTTACTGGTGATAGTGATAAAGACTGTGGTCGTTGCAATCGTTGTTAAAGTCTTTGGATA
CAATAACAAAACTGCAGTGCTTGTTGGAATGTCGCTTGCTCAGATTGGGGAGTTTGCTTT
TGTTCTGCTAAGTCGAGCATCCAATCTTCACCTAATTGAGAGCAAACTGTACCTCCTGCT
TCTGGGAACAACTGCTCTAAGCC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4E593JQ 687 0 0
GCAGCGCTGTTCCTCGCTAGTATTGGAATGCTGATACATATGCACTTCTTGTGGAACCAT
GTTGACATTCTGGTAGCAGCCGTGTTACTGGTGATAGTGATAAAGACTGTGGTCGTTGCA
ATCGTTGTTAAAGTCTTTGGATACAATAACAAAACTGCAGTGCTTGTTGGAATGTCGCTT
GCTCAGATTGGGGAGTTTGCTTTTGTTCTGCTAAGTCGAGCATCCAATTTTCACCTAATT
GAGAGCAAACTGTACCTCCTGCTTCTGGGAACAACTGCTTTAAGCCTGGTAACAACACCA
TTTCTATTCAAGTTGATACCGGCCGTTGTACATTTAGGAGTGCTCTTACGGTGGTTCTCC
CCGATAGCTCAACTGAGATTGGTTTCAAAGGAGGTTTGTATCGTTCAGAGAGTGCAAAGC
TTATATCACAAATGATCCAAGGTTCTCTTCACGATTCTTGATGTTGATTCAATAGAAGAC
ACGACACAAAACATCAAAGCCCCATTTGATCTCAAGCTAGGCAAAGACAATGAACGGAGA
ACCGTCGATTGTGTTCCGGATGTATAGATGTTTCAGAGAGATGAGAAGATGACCGAAGAG
GAAACTGTATAAAATCTCTTACACAAAGATAACCACTAAACAAACTTGTAACTTTGATTC
ATTCTTCTCTATAAAGTTTTTGAGATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL5860Contig1 278 2 1 U
TTTTTTTTATTCGGAAATCTGTCGATATCTCTTATTTAATCTTCTTGTTTCTATATTTCA
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BQ
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AF RR4F542TF U 1
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AF RR4FG84TF U 1
AF RR4FG84JQ C 406
BS 1 619 RR4FG84TF
BS 620 810 RR4FG84JQ

RD RR4FG84TF 619 0 0
GGACCACAAGTAGAAAATATTTCAATACACAAACAACAAACACACTTCTTCTTTCTTTAA
ATCCCAACTGCAAGAGATAATGGCGAAAGAGTCCACCACCATTGACATCGGCGAGCCGAG
TACCGTTACCAAAAGTACAAGCCATGCCGTAGTGGACGAGAAGAAGAAGAGTTTTGTGAC
AGCCGCCGCAGGAGGCGGCTACAAGAGAGGTTTGGCCATATTCGATTTCCTCCTCCGTTT
GGCGGCCATTGGAATCACCATCGGGGCTTCCTCTGTCATGTTCACCGCCGAGGAGACACT
TCCGTTCTTTACTCAGTTCTTACAGTTCCAAGCAGGTTACGATGACTTCCCCACGTTTCA
GTTCTTTGTGATAGCCATAGCCATAGTCGCCAGCTATCTCGTACTTTCACTTCCCTTTTC
CATCGTCACTATTGTCCGACCACTAGCGGTTGCGCCCCGGCTCATCCTCCTCATCTCCGA
CACTGTAATCTTGACGCTTACCACAGCAGCATCTGCTGCGGCAGCATCAATTGTCTACCT
AGCACATAACGGTAATTCAAACACCAATTGGCTCCCCATTTGTCAGCAGTTTGGAGACTT
CTGCCAAACCGCAAGTACT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4FG84JQ 405 0 0
TTCACTTCCCTTTTCCATCGTCACTATTGTCCGACCACTAGCGGTTGCGCCCCGGCTCAT
CCTCCTCATCTCCGACACTGTAATCTTGACGCTTACCACAGCAGCATCTGCTGCGGCAGC
ATCAATTGTCTACCTAGCACATAACGGTAATTCAAACACCAATTGGCTCCCCATTTGTCA
GCAGTTTGGAGACTTCTGCCAAACCGCAAGTACTGCAGTTGTAGCTGCATCTATCTCGGT
TGTCTTCTTTATCCTTCTCATTGTCATCTCAGCCATTGCCCTAAAAAGGCATTGATCTGA
AATTTTATGCATGTATATGTTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTGCTTTGTGTAGGATGAGAT
GATAGATATATGGTTTTGTAAAGGTGTGGTCCGTGTGTAAAATGT

QA 1 405 1 405
DS 



AS 1 2

CO CL5863Contig1 933 2 8 U
GGATAGATAAAAATGTACCTATCTAAGCATCAGGTTCTCGTTTTGAAAAGTAGAGAGTTT
CTCTTCAAGTTCAGAGTTTCTGTTCTCCAAGTCTTTTACTCTGTTTTCCAACTCACCCAA
GTAAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTTGCTGTGCTGAAACTCTGTTCCTCAGCAACC
TTTTGTTTGCACCAAAAAAGCCACATCACGCAACTAAACGGTAATGGTAAAAAAAGGTAA
AAAGAAATGGGTACCTCTTTAGCCGCTTGGTCTCTTTCTCAGCCGGAGTCCTCTCTCTTT
TCCTTTGACCCTCTCCTCCGACAATTATCTGTGTCTGGTCCTGACCGATTCCCGTCCGAA
GATTTCCTTTCCGACATCTTCTCCTCCAAACTTCGAAACTCTCCGTATCAGATGGGATAA
TCCATGAAAAGATACAACCTTTACTTCAAGCCCTAGCTTTATACTGATGAAACATGCAAT
CTACGAAACTCTGAGATCGGAAGAAGAGGAATTTCCCAAATCGGAAATCAGTCAAATTCA
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ACACCAAAAACAGAAAAAAACTAACCAATTGGGCGTTGATGTTCTTGTTTCCAGCAGTGG
CCATGATTGTTGATCTGAAGCTCGGGAAATCCTCTGATCAACAAGATGGGATGTGAGAAA
CGCGTTGATAATCGAAAGAGGGAGAAGATAGAGCTAAAACGATTTCACCCTGACGCATGG
CTGAAGACCGTCTCTTCTGGTCTCTAATTAAGAGACGTAGTTTATGTTTATTGGTATTTT
CCATTTTCTTTTAATTCCAATTAAACTAAAAGACCCTCTTTAGAACCCCGGATAATGATA
CTCTTACAGCTTCTATGCTGCAGATTAGATGTA


BQ
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AF RR4GO07TF U 1
AF RR4GO07JQ C 422
BS 1 619 RR4GO07TF
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BS 718 933 RR4GO07JQ

RD RR4GO07TF 717 0 0
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GTAAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTTGCTGTGCTGAAACTCTGTTCCTCAGCAACC
TTTTGTTTGCACCAAAAAAGCCACATCACGCAACTAAACGGTAATGGTAAAAAAAGGTAA
AAAGAAATGGGTACCTCTTTAGCCGCTTGGTCTCTTTCTCAGCCGGAGTCCTCTCTCTTT
TCCTTTGACCCTCTCCTCCGACAATTATCTGTGTCTGGTCCTGACCGATTCCCGTCCGAA
GATTTCCTTTCCGACATCTTCTCCTCCAAACTTCGAAACTCTCCGTATCAGATGGGATAA
TCCATGAAAAGATACAACCTTTACTTCAAGCCCTAGCTTTATACTGATGAAACATGCAAT
CTACGAAACTCTGAGATCGGAAGAAGAGGAATTTCCCAAATCGGAAATCAGTCAAATTCA
GGATCCGAGGATAAACAAAAGGATCCCAGAAAGAATCTATAGCTTAATAAAAGAATCAGC
ACACCAAAAACAGAAAAAA*CTAACCAATTGGGCGTTGATGTTCTTGTTTCCAGCAGTGG
CCATGATTGTTGATCTGAAGCTCGGGAA*TCCTCTGATCA*CAAGATGGGATGTGAG

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DS 

RD RR4GO07JQ 512 0 0
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GATCCGAGGATAAACAAAAGGATCCCAGAAAGAATCTATAGCTTAATAAAAGAATCAGCA
CACCAAAAACAGAAAAAAACTAACCAATTTGGCGTTGATGTTCTTGTTTCCAGCAGTGGC
CATGATTGTTGATCTGAAGCTCGGGAAATCCTCTGATCAACAAGATGGGATGTGAGAAAC
GCGTTGATAATCGAAAGAGGGAGAAGATAGAGCTAAAACGATTTCACCCTGACGCATGGC
TGAAGACCGTCTCTTCTGGTCTCTAATTAAGAGACGTAGTTTATGTTTATTGGTATTTTC
CATTTTCTTTTAATTCCAATTAAACTAAAAGACCCTCTTTAGAACCCCGGATAATGATAC
TCTTACAGCTTCTATGCTGCAGATTAGATGTA

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

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GGATCAAAAACTCAAAAAAGAAAGAAAAAACATTTATACTACAAAAAAAAGGAAAAAGAA
ATAAGCAAAAAAATGGCTAATAATAAAAGCGTACTAGCATTATGTCTGCTGTTTCTAGTG
GCATCAAGTGTGATCTACGAGGCGCAAGGAACGTTCTTGTTAAAGATGTACTTGAGCAGG
AAGTTTTTTAAAAAGGCAATGCAGTTTACACCTTTCGCATGCAAAGGTATGATATTTATG
TTGCACAGGCTTAAAGGTGGATGTCCCGCGACTAAGGGGTTCAAGACTTTCTTTTCACTG
TTCATATCTTACGTGAACTTTATCAAAAAGGCAGAACTCAACACCTTCTTCCAGAAACTC
AAGTCTTCCATGTCTGCCACATCAAAGATCGCTACCACGGACGAAAAAACCTTCGAATCT
GGGGTGAAAACTGCTGCTGGAACACTAAATGAAGCGGCAGAATCTGTTACTGAAAAATTA
GGCACAGCAGAGACCAAGCAGAAGATAGAATCTTCCCAACAACAGTTGATGCAGACATTC
GAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTCC
TCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAG
TTTGTGGAGACTGCTGCTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTTCCACTCAGTCTCAG
AAATCTCAGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGCCCCAACAGTCTCAGCAGTCTCTGCAGTCA
GTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCATGAAGGCTCAGACTCAGACCAATTGAGATACACTA
ATGCGCCGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTGGTACCGCCAAATATGATAATTAGTAGCT
AAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGTC
TACCTTTAGACCGACGTATGC


BQ
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AF RR4FA84TF U 1
AF RR4AD20TF U 480
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AAGTTTTTTAAAAAGGCAATGCAGTTTACACCTTTCGCATGCAAAGGTATGATATTTATG
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TTCATATCTTACGTGAACTTTATCAAAAAGGCAGAACTCAACACCTTCTTCCAGAAACTC
AAGTCTTCCATGTCTGCCACATCAAAGATCGCTACCACGGACGAAAAAACCTTCGAATCT
GGGGTGAAAACTGCTGCTGGAACACTAAATGAAGCGGCAGAATCTGTTACTGAAAAATTA
GGCACAGCAGAGACCAAGCAGAAGATAGAATCTTCCCAACAACAGTTGATGCAGACATTC
GAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTCC
TCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAG
TTTGTGGAGACTGCTGCTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTTCCACTCAGTCTCAG
AAATCTCAGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGTCCCAACAGTCT

QA 1 762 1 762
DS 

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G
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TCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAG
TTTGTGGAGACTGCTGCTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTTCCACTCAGTCTCAG
AAATCTCAGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGCCCCAACAGTCTCAGCAGTCTCTGCAGTCA
GTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCATGAAGGCTCAGACTCAGACCAATTGAGATACACTA
ATGCGCCGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTGGTACCGCCAAATATGATAATTAGTAGCT
AAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGTC
TACCTTTAGACCGACGTATGC

QA 2 502 2 502
DS 



AS 1 2

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GGATGTTCTTATATGTGACAACTAACATTTTATTTCTTGATCAAAATTGATCTGTGAGAT
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GAGAGCAAGCTTGTGATT


BQ
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AF RR4CW21JQ C 1
AF RR4CW21TF U 1
BS 1 498 RR4CW21TF

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GAGTCGACTTGATTCGATTCAGTCTAAGTGGGATGAAGCTGGGGGTAATGATCGGCTCGA
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GGATGTTCTTATATGTGACAACTAACATTTTATTTCTTGATCAAAATTGATCTGTGAGAT
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GAGAGCAAGCTTGTGATT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4CW21TF 498 0 0
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GTTCGTCACATTCGTCGGCGTCCAGGTCCAAGAAGACCTTGTTCTGCTCAAAGAGAATCA
CGGGATTGTGATCAGAAGCTCTCTGGAGATTGGGAAGTTGGCTGCTGTGGCTAGAGGAAC
TCCTATCGTTGAGTTTCTTGGGGCTAGAGAGTTGGCTCATAAAATACTTTCGTGCGATAT
GAGTCGACTTGATTCGATTCAGTCTAAGTGGGATGAAGCTGGGGGTAATGATCGGCTCGA
AGCTGCAGCTATTGAAGGTTGGCTTGTTTACAATGTCTATGATCAGTTGCAGCAGTGAAA
GGATGTTCTTATATGTGACAACTAACATTTTATTTCTTGATCAAAATTGATCTGTGAGAT
TGTGCATTTTGATCTGTTTGTTGTTGCTATGAGTGAACAAAAATCATGTTTGAATAAAAA
GAGAGCAAGCTTGTGATT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL5866Contig1 964 2 6 U
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GTTTGGTTAGAAGATGTCTCGAAGATATGATAGCCGCACCACAATCTTCTCCCCAGAAGG
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CCAGACCTCAACCTCCTCCGAGAAAATGTACAAGATCGACGACCACGTCGCCTGTGCCGT
CGCTGGCATCATGTCCGACGCCAACATCCTCATCAACACTGCTAGAGTCCAGGCCCAGCG
CTACACCTTCATGTACCAGGAGCCCATGCCTGTTGAGCAGCTTGTTCAGTCTCTCTGTGA
TACTAAACAAGGGTACACGCAGTTCGGTGGTCTTCGTCCCTTTGGTGTGTCGTTTCTTTT
TGCAGGGTGGGACAAGAACCATGGGTTTCAGCTGTATATGAGTGACCCGAGTGGGAACTA
CGGTGGTTGGAAAGCCGCGGCTGTGGGAGCTAACAACCAGGCGGCTCAGTCTATTCTGAA
ACAGGACTACAAGGATGATGCGACTAGAGAAGAGGCAGTGGAGCTTGCCTTGAAGGTTCT
GAGCAAGACGATGGACAGCACTAGCTTGACGTCTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGGTGTT
TTTGACTCCTTCCGGGAGTGTTAAGTACCATGTTCACTCTCCTGACTCGCTTACTAAGCT
GTTGGTGAAGCATGGTGTGACTCAACCCGCTTTTGAATCATCCTGAGCGCAAAACTAATC
GCTAGAGTCTTGATCTTTGCTTGGTGATGTGTCTCCTTTTATCTATCTTGTTAGTTCTCT
GTTTTACATTTAGACTTTATGGCGATGAAACTTGAATTTCACAATGTTATGAGAATTTTA
TTCG


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4FP01TF U 1
AF RR4FP01JQ C 416
BS 1 634 RR4FP01TF
BS 635 635 RR4FP01JQ
BS 636 655 RR4FP01TF
BS 656 656 RR4FP01JQ
BS 657 715 RR4FP01TF
BS 716 964 RR4FP01JQ

RD RR4FP01TF 726 0 0
GGAAACAAGAATCAAAGCAGAGGCGATCAGAGATCGAAATCAATTCCTTCCTCCTCTCAG
GTTTGGTTAGAAGATGTCTCGAAGATATGATAGCCGCACCACAATCTTCTCCCCAGAAGG
CCGTCTCTACCAAGTCGAGTACGCAATGGAAGCCATCGGCAACGCCGGTTCCGCCATCGG
GATCTTATCCAAAGACGGCGTCGTATTGATCGGCGAGAAGAAAGTCACCTCAAAGCTTCT
CCAGACCTCAACCTCCTCCGAGAAAATGTACAAGATCGACGACCACGTCGCCTGTGCCGT
CGCTGGCATCATGTCCGACGCCAACATCCTCATCAACACTGCTAGAGTCCAGGCCCAGCG
CTACACCTTCATGTACCAGGAGCCCATGCCTGTTGAGCAGCTTGTTCAGTCTCTCTGTGA
TACTAAACAAGGGTACACGCAGTTCGGTGGTCTTCGTCCCTTTGGTGTGTCGTTTCTTTT
TGCAGGGTGGGACAAGAACCATGGGTTTCAGCTGTATATGAGTGACCCGAGTGGGAACTA
CGGTGGTTGGAAAGCCGCGGCTGTGGGAGCTAACAACCAGGCGGCTCAGTCTATTCTGAA
ACAGGACTACAAGGATGATGCGACTAGAGAAGAG*CAGTGGAGCTTGCCTTGAAG*TTCT
GAGCAAGACGATGGACAGCACTAGCTTGACGTCTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAG
TGTTTCTGACT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4FP01JQ 549 0 0
TGTGATACTAAACAAGGGTACACGCAGTTCGGTGGTCTTCGTCCCTTTGGTGTGTCGTTT
CTTTTTGCAGGGTGGGACAAGAACCATGGGTTTCAGCTGTATATGAGTGACCCGAGTGGG
AACTACGGTGGTTGGAAAGCCGCGGCTGTGGGAGCTAACAACCAGGCGGCTCAGTTTATT
TTGAAACAGGACTACAAGGATGATGCGACTAGAGAAGAGGCAGTGGAGCTTGCCTTGAAG
GTTTTGAGCAAGACGATGGACAGCACTAGCTTGACGTTTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAG
GTGTTTTTGACTCCTTCCGGGAGTGTTAAGTACCATGTTCACTCTCCTGACTCGCTTACT
AAGCTGTTGGTGAAGCATGGTGTGACTCAACCCGCTTTTGAATCATCCTGAGCGCAAAAC
TAATCGCTAGAGTCTTGATCTTTGCTTGGTGATGTGTCTCCTTTTATCTATCTTGTTAGT
TCTCTGTTTTACATTTAGACTTTATGGCGATGAAACTTGAATTTCACAATGTTATGAGAA
TTTTATTCG

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL5867Contig1 792 2 2 U
GGGGTTGAATGAATATTTGGTCCTATGTTCAGCGTCTCAGATGCTACTGTTATCAAAAGT
ACGTTCTCATTATCCTTCTCCTTGCACGTCATTAGCACCAAACTCTTCTTGCCTTCACGC
AGGTACCTACCTGAAACCAGTGGAGATTCTCTTAAAAGCAGATAGCTAACGTAAAGCGTT
CATTGTGTAGCAAAGTTGTCAAGGAGATTCCAGATCTCTCAGCCAAGTGTTCTACTATTT
GTAAAACCATTACATCTGTTGTCCTTTGCATTGAAAATAAATTAGCTTTTGATAAAAAAG
ACCAATTATAGAGACATTTAAGCATATGTAAAAGAATGGTGAAGAGCACTTATATGTCAT
ATTACTCTCCAAGTTATATGTCATATCACAGGAGGAGCTGCTACTTCTTTTTCCACATTC
AAGTCCAACCTGTAATCTCCATTTCTGCAAAAAGAGCCCTGCTTCTCATTTGCTCTTCAC
GTTTTGAATCCATACCAACCTGAGGATGCAAGGGCGTGGATACAGTGATCTCACTCACAC
AGTATCCAGTATTCCCGTGGATTAGGATAGCGTCCAAAGAGTTTTCAGAAGTTTGACAAA
CCAATGTGATGTGATGCCAGACGCCTGAAGGAGAAGACGAATTTAGGGAACGGTTTGTGA
TGTGCGTCTTTCTTCTTCTATGCTTGAATTGGCGCAGACAACACAAAGATTACTGATCGT
TATGCCTTTTTGTTATAAAGGATAAAATAAGTACATTAAGCAGATCAACTCATAATGGAA
GAATTGTTTAGC


BQ
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AF RR4BQ20TF U 1
AF RR4BQ20JQ C 116
BS 1 638 RR4BQ20TF
BS 639 792 RR4BQ20JQ

RD RR4BQ20TF 638 0 0
GGGGTTGAATGAATATTTGGTCCTATGTTCAGCGTCTCAGATGCTACTGTTATCAAAAGT
ACGTTCTCATTATCCTTCTCCTTGCACGTCATTAGCACCAAACTCTTCTTGCCTTCACGC
AGGTACCTACCTGAAACCAGTGGAGATTCTCTTAAAAGCAGATAGCTAACGTAAAGCGTT
CATTGTGTAGCAAAGTTGTCAAGGAGATTCCAGATCTCTCAGCCAAGTGTTCTACTATTT
GTAAAACCATTACATCTGTTGTCCTTTGCATTGAAAATAAATTAGCTTTTGATAAAAAAG
ACCAATTATAGAGACATTTAAGCATATGTAAAAGAATGGTGAAGAGCACTTATATGTCAT
ATTACTCTCCAAGTTATATGTCATATCACAGGAGGAGCTGCTACTTCTTTTTCCACATTC
AAGTCCAACCTGTAATCTCCATTTCTGCAAAAAGAGCCCTGCTTCTCATTTGCTCTTCAC
GTTTTGAATCCATACCAACCTGAGGATGCAAGGGCGTGGATACAGTGATCTCACTCACAC
AGTATCCAGTATTCCCGTGGATTAGGATAGCGTCCAAAGAGTTTTCAGAAGTTTGACAAA
CCAATGTGATGTGATGCCAGACGCCTGAAGGAGAAGAC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4BQ20JQ 677 0 0
CACGCAGGTACCTACCTGAAACCAGTGGAGATTCTCTTAAAAGCAGATAGCTAACGTAAA
GCGTTCATTGTGTAGCAAAGTTGTCAAGGAGATTCCAGATCTCTCAGCCAAGTGTTCTAC
TATTTGTAAAACCATTACATCTGTTGTCCTTTGCATTGAAAATAAATTAGCTTTTGATAA
AAAAGACCAATTATAGAGACATTTAAGCATATGTAAAAGAATGGTGAAGAGCACTTATAT
GTCATATTACTCTCCAAGTTATATGTCATATCACAGGAGGAGCTGCTACTTCTTTTTCCA
CATTCAAGTCCAACCTGTAATCTCCATTTCTGCAAAAAGAGCCCTGCTTCTCATTTGCTC
TTCACGTTTTGAATCCATACCAACCTGAGGATGCAAGGGCGTGGATACAGTGATCTCACT
CACACAGTATCCAGTATTCCCGTGGATTAGGATAGCGTCCAAAGAGTTTTCAGAAGTTTG
ACAAACCAATGTGATGTGATGCCAGACGCCTGAAGGAGAAGACGAATTTAGGGAACGGTT
TGTGATGTGCGTCTTTCTTCTTCTATGCTTGAATTGGCGCAGACAACACAAAGATTACTG
ATCGTTATGCCTTTTTGTTATAAAGGATAAAATAAGTACATTAAGCAGATCAACTCATAA
TGGAAGAATTGTTTAGC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL5868Contig1 1180 2 2 U
GCGAGGCAGTAGAGCAACAAGTCAGAATCGCTGCAGAGAGACAACACATCGACTATGAGC
TCTCTGATAAAGAGAACGAAATGGATTGTAGTGAGGATGACGATGAGGATGACCGACATG
TTAACAGAGATGGAGAACTCAGTTTTGACTACATAACAAGTGAGCAGAGAGTAGAAGCTC
CACTACCTACACCACAAGGAGCATTGAATGTAAATGCAGATCATAGAGAAGAGAACCCAA
GAAGGAGCAGTCATTCAGCTCCGTTGTTCCCACAGAAGAAGTCTGATTTATCGACAAATG
CTTACGTATTACCAACTCCTGTCGATTCAAAGTCCTCATCCATCTTCACGCAAGCAAACC
ACAGTGCACACTTATGGCATTCGTCTCCTCTTGAACCCATAAAAACCGTTCATAAAGATG
CAGAAAGCAACCTCTATTCCCGTCTTCCTCGTCCTACAGAAGCTGCACCACGACACGCAT
TTTCTGGACCGGTCAAACCATCCTCAACCCGTCTTCCAGTTCCTGTGCAGGCTCACTCAA
CTTCTCCAAGGATGTTGTCTCCTGCTGCTTCACCTCCGCTCGCTTCTTCTCCACGGATCA
CCGAGCTCCATGAGCTTCCAAGACCACCTGGTCAATTTGCTCCTCCACGACGCTCTAAAT
CTCCTGTTCTGACTGGTCACTCAGCTCCTGTTACTGCTTGGAGTCAAGAAAGAAGCAATG
TTGCTGTGTCCAAGAACATTGTGGCATCACCTCTTCCGGTTCCTCCTTTGGTTGTACCAA
GAAGCTACTCCATACCTTCGAGAAACCAGAGTGAACAACCCTCCATGCCTCAAACGAACC
AAATCAGAGTAGTGTCTCCACCGCCTCTGCCTCTTACTCCAGCGTCTCTGATGAATCTCA
GATCGTTGTCTAGGTCTCGGGTTGGGGAATCTGCTCAGAGCGGTCAAAAAAGAAGAGGAG
TACAAGTGATTGGACGATGAAGCTATTAGTAGCTAACGTGACGTTTGATGAAAGCGTTGG
TTGTAGAAAGTAAATATACATGTCAGATATTTTTCTAGTTCTTTAGTTTTAACCCTCTAT
ACTGTTTTTTTTTCTTCCCTTATTTATCCTTTTTGTCACTTTGAAAAGAATTAGTTGTTG
TTTTCTGAAAATTAGGAGAAGGAAAATGAGAAATTAGGGC


BQ
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AF RR4EK17TF U 1
AF RR4EK17JQ C 446
BS 1 732 RR4EK17TF
BS 733 1180 RR4EK17JQ

RD RR4EK17TF 732 0 0
GCGAGGCAGTAGAGCAACAAGTCAGAATCGCTGCAGAGAGACAACACATCGACTATGAGC
TCTCTGATAAAGAGAACGAAATGGATTGTAGTGAGGATGACGATGAGGATGACCGACATG
TTAACAGAGATGGAGAACTCAGTTTTGACTACATAACAAGTGAGCAGAGAGTAGAAGCTC
CACTACCTACACCACAAGGAGCATTGAATGTAAATGCAGATCATAGAGAAGAGAACCCAA
GAAGGAGCAGTCATTCAGCTCCGTTGTTCCCACAGAAGAAGTCTGATTTATCGACAAATG
CTTACGTATTACCAACTCCTGTCGATTCAAAGTCCTCATCCATCTTCACGCAAGCAAACC
ACAGTGCACACTTATGGCATTCGTCTCCTCTTGAACCCATAAAAACCGTTCATAAAGATG
CAGAAAGCAACCTCTATTCCCGTCTTCCTCGTCCTACAGAAGCTGCACCACGACACGCAT
TTTCTGGACCGGTCAAACCATCCTCAACCCGTCTTCCAGTTCCTGTGCAGGCTCACTCAA
CTTCTCCAAGGATGTTGTCTCCTGCTGCTTCACCTCCGCTCGCTTCTTCTCCACGGATCA
CCGAGCTCCATGAGCTTCCAAGACCACCTGGTCAATTTGCTCCTCCACGACGCTCTAAAT
CTCCTGTTCTGACTGGTCACTCAGCTCCTGTTACTGCTTGGAGTCAAGAAAGAAGCAATG
TTGCTGTGTCCA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4EK17JQ 735 0 0
TTCCTCGT
CTACAGAAGCTGCACCACGACACGCATTTTCTGGACCGGTCAAACCATCCTCAACCCGTC
TTCCAGTTCCTGTGCAGGCTCACTCAACTTCTCCAAGGATGTTGTCTCCTGCTGCTTCAC
CTCCGCTCGCTTCTTCTCCACGGATCACCGAGCTCCATGAGCTTCCAAGACCACCTGGTC
AATTTGCTCCTCCACGACGCTCTAAATCTCCTGTTCTGACTGGTCACTCAGCTCCTGTTA
CTGCTTGGAGTCAAGAAAGAAGCAATGTTGCTGTGTCCAAGAACATTGTGGCATCACCTC
TTCCGGTTCCTCCTTTGGTTGTACCAAGAAGCTACTCCATACCTTCGAGAAACCAGAGTG
AACAACCCTCCATGCCTCAAACGAACCAAATCAGAGTAGTGTCTCCACCGCCTCTGCCTC
TTACTCCAGCGTCTCTGATGAATCTCAGATCGTTGTCTAGGTCTCGGGTTGGGGAATCTG
CTCAGAGCGGTCAAAAAAGAAGAGGAGTACAAGTGATTGGACGATGAAGCTATTAGTAGC
TAACGTGACGTTTGATGAAAGCGTTGGTTGTAGAAAGTAAATATACATGTCAGATATTTT
TCTAGTTCTTTAGTTTTAACCCTCTATACTGTTTTTTTTTCTTCCCTTATTTATCCTTTT
TGTCACTTTGAAAAGAATTAGTTGTTGTTTTCTGAAAATTAGGAGAAGGAAAATGAGAAA
TTAGGGC

QA 9 735 9 735
DS 



AS 1 2

CO CL5869Contig1 880 2 2 U
CTTTAGAAGTTATTGACAAAGTGTTCCCCAAGGATTCCTTGGTACAGCCTTCTCTGGTAG
TTGTCTATTTTGGAGGAAACGACTCAATGGGGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACG
TCCCACTATCTGAATACGTCCAAAACATGAAGAAGATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTT
CAGACTCTACTCGTATCATATTCCTTAGTTGCCCTCCAGTGGACGAAGCCAAAGTTCGTC
AAAACCAGAGGTAACTTCTCTGAAAATATCTCTCTCTGTTGCTTGCTCCAGACTTAATGT
TATTTTTTTTTGGTCGCACAAGCCCATACTTGAGCGAGGTAATCCGCACAAACGAGCTAT
GCAAGACGTATTCAGACGCTTGTGTGGAGCTGTGCAAAGAGCTCGGCTTACAAGTAGTTG
ATCTCTACTCTGCTTTTCAGAAAGCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCACAGATGGGA
TTCATTTGTCGGCACAAGGAAGCAAACTTGTAGCTGCAGAGATACTGAGAGTGGTTAAAG
AAGCGGAGTGGAGACCTTCGCTTCACTGGAAATCGATGCCGACAGAATTCTCTGGGGACT
CTCCTTATGATCTTGTTGCAGCAGATGGCAAAACGACGTTGAACTCTTCCGAGTGGACGT
ACTTCTGGGGAGAACAATGGGAGTAACAGCACACACAACAACGAATATAAAACCTTTATA
TAATATATAGTTCTCTTGTTTTAGACTGGTTTATGAGTCTATTTTCTGAAACGTTATTAT
TTCTTCATGCTTGAGTAGTTTCTTGAATCTATCTTCTTTTCTGAACCTGTAGTTTCTTAA
AATAAATAGTACTAATATAATATCTATCTATTTACTTTCC


BQ
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AF RR4FC63TF U 1
AF RR4FC63JQ C 443
BS 1 730 RR4FC63TF
BS 731 880 RR4FC63JQ

RD RR4FC63TF 730 0 0
CTTTAGAAGTTATTGACAAAGTGTTCCCCAAGGATTCCTTGGTACAGCCTTCTCTGGTAG
TTGTCTATTTTGGAGGAAACGACTCAATGGGGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACG
TCCCACTATCTGAATACGTCCAAAACATGAAGAAGATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTT
CAGACTCTACTCGTATCATATTCCTTAGTTGCCCTCCAGTGGACGAAGCCAAAGTTCGTC
AAAACCAGAGGTAACTTCTCTGAAAATATCTCTCTCTGTTGCTTGCTCCAGACTTAATGT
TATTTTTTTTTGGTCGCACAAGCCCATACTTGAGCGAGGTAATCCGCACAAACGAGCTAT
GCAAGACGTATTCAGACGCTTGTGTGGAGCTGTGCAAAGAGCTCGGCTTACAAGTAGTTG
ATCTCTACTCTGCTTTTCAGAAAGCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCACAGATGGGA
TTCATTTGTCGGCACAAGGAAGCAAACTTGTAGCTGCAGAGATACTGAGAGTGGTTAAAG
AAGCGGAGTGGAGACCTTCGCTTCACTGGAAATCGATGCCGACAGAATTCTCTGGGGACT
CTCCTTATGATCTTGTTGCAGCAGATGGCAAAACGACGTTGAACTCTTCCGAGTGGACGT
ACTTCTGGGGAGAACAATGGGAGTAACAGCACACACAACAACGAATATAAAACCTTTATA
TAATATATAG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4FC63JQ 438 0 0
AGCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCACAGATGGGATTCATTTGTCGGCACAAGGAAG
CAAACTTGTAGCTGCAGAGATACTGAGAGTGGTTAAAGAAGCGGAGTGGAGACCTTCGCT
TCACTGGAAATCGATGCCGACAGAATTCTCTGGGGACTCTCCTTATGATCTTGTTGCAGC
AGATGGCAAAACGACGTTGAACTCTTCCGAGTGGACGTACTTCTGGGGAGAACAATGGGA
GTAACAGCACACACAACAACGAATATAAAACCTTTATATAATATATAGTTCTCTTGTTTT
AGACTGGTTTATGAGTCTATTTTCTGAAACGTTATTATTTCTTCATGCTTGAGTAGTTTC
TTGAATCTATCTTCTTTTCTGAACCTGTAGTTTCTTAAAATAAATAGTACTAATATAATA
TCTATCTATTTACTTTCC

QA 1 438 1 438
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5871Contig1 1137 2 2 U
CTACGATCCCAAATATGCGTTGCGCTTGTGTCTCAAGGAAAAGAGAAGTCGTGCTTGTGT
CCATATATACAGCATGATGTCTATGCATGAAGAGGCAGTAGCCCTTGCTCTTCAGATTGA
CCCAGAGCTTGCTATGGCGGAAGCTGATAAGGTTGAAGACGATGAAGACTTGAGAAAGAA
GCTGTGGCTGATGGTTGCAAAGCATGTCGTCAAGCAGGAAAAGGGAGTCAAAAGGGAAAA
CATAAGGAAAGCTATTGCCTTTCTCAAGGAAACTGATGGCCTTCTAAAGATTGAAGATAT
TTTGCCATTCTTTCCGGACTTTGCCTTAATTGATGACTTCAAGGTTAGTTCTTTTTACCA
GGAGGCACACAAACGCTCTGTCTTGTGCTTTTGTTATTTTCTTCAATACCGTTGTGCAGG
AAGCTATTTGCTCGTCTCTGGAGGATTACAACAAGCAAATAGAACAACTGAAAGAGGAGA
TGAATGATGCCACACGTGGTGCAGATAATATTAGAAATGATATCAGTGCCTTGACACAAA
GATATGCTGTGATCGACCGTGAAGAGGAATGCGGGGTTTGTAAACGTAAAATCTTGACGA
CGACCGGGGATTTCAGACTGGCACAGGGATATTTTTCAGCTGGACCACTGGCTCCTTTCT
ATGTATTTCCTTGTGGACACTCTTTCCACGCACAGTGCCTGATCACACACGTCACTAGCT
GTGCACATGAAGAGCAAGCGGAGAGTATACTCGATCTGCAGAAGCAGCTGACATTGCTCG
GTAGCGAAACACGGAGGGATATGAATGGTAATCGATCTGATGAACCCGTAACTAGCACAA
CTACTGCAGACAAGCTTCGATCAGAGTTAGATGATGCTATCGCCAGTGAATGCCCATTCT
GTGGAGAACTAATGATCAATGAGATCACTCTGCCTTTTATTAAACCTGAGGAAACACAAC
ATTTTGCCTCGTGGGACCTCCGACCTCCGACCAACTTAGCTAACCAGAGGACCATTTCTT
TGCCTGTTTGATTTGTGTAACACCGTGATTTCCTTTTCATGTAATTTCTTCTTCAGCTGC
CTTGGATTGTGGATGTGATTTTGAGTGTGAGTTAATATTATTATTAAGCTTCTTGAG


BQ
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AF RR4AR29TF U 1
AF RR4AR29JQ C 436
BS 1 728 RR4AR29TF
BS 729 1137 RR4AR29JQ

RD RR4AR29TF 728 0 0
CTACGATCCCAAATATGCGTTGCGCTTGTGTCTCAAGGAAAAGAGAAGTCGTGCTTGTGT
CCATATATACAGCATGATGTCTATGCATGAAGAGGCAGTAGCCCTTGCTCTTCAGATTGA
CCCAGAGCTTGCTATGGCGGAAGCTGATAAGGTTGAAGACGATGAAGACTTGAGAAAGAA
GCTGTGGCTGATGGTTGCAAAGCATGTCGTCAAGCAGGAAAAGGGAGTCAAAAGGGAAAA
CATAAGGAAAGCTATTGCCTTTCTCAAGGAAACTGATGGCCTTCTAAAGATTGAAGATAT
TTTGCCATTCTTTCCGGACTTTGCCTTAATTGATGACTTCAAGGTTAGTTCTTTTTACCA
GGAGGCACACAAACGCTCTGTCTTGTGCTTTTGTTATTTTCTTCAATACCGTTGTGCAGG
AAGCTATTTGCTCGTCTCTGGAGGATTACAACAAGCAAATAGAACAACTGAAAGAGGAGA
TGAATGATGCCACACGTGGTGCAGATAATATTAGAAATGATATCAGTGCCTTGACACAAA
GATATGCTGTGATCGACCGTGAAGAGGAATGCGGGGTTTGTAAACGTAAAATCTTGACGA
CGACCGGGGATTTCAGACTGGCACAGGGATATTTTTCAGCTGGACCACTGGCTCCTTTCT
ATGTATTTCCTTGTGGACACTCTTTCCACGCACAGTGCCTGATCACACACGTCACTAGCT
GTGCACAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4AR29JQ 702 0 0
CTCTGGAGGATTACAACAAGCAAATAGAACAACTGAAAGAGGAGATGAATGATGCCACAC
GTGGTGCAGATAATATTAGAAATGATATCAGTGCCTTGACACAAAGATATGCTGTGATCG
ACCGTGAAGAGGAATGCGGGGTTTGTAAACGTAAAATCTTGACGACGACCGGGGATTTCA
GACTGGCACAGGGATATTTTTCAGCTGGACCACTGGCTCCTTTTTATGTATTTCCTTGTG
GACACTCTTTCCACGCACAGTGCCTGATCACACACGTCACTAGCTGTGCACATGAAGAGC
AAGCGGAGAGTATACTCGATCTGCAGAAGCAGCTGACATTGCTCGGTAGCGAAACACGGA
GGGATATGAATGGTAATCGATCTGATGAACCCGTAACTAGCACAACTACTGCAGACAAGC
TTCGATCAGAGTTAGATGATGCTATCGCCAGTGAATGCCCATTCTGTGGAGAACTAATGA
TCAATGAGATCACTCTGCCTTTTATTAAACCTGAGGAAACACAACATTTTGCCTCGTGGG
ACCTCCGACCTCCGACCAACTTAGCTAACCAGAGGACCATTTCTTTGCCTGTTTGATTTG
TGTAACACCGTGATTTCCTTTTCATGTAATTTCTTCTTCAGCTGCCTTGGATTGTGGATG
TGATTTTGAGTGTGAGTTAATATTATTATTAAGCTTCTTGAG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5873Contig1 1049 2 2 U
GGTCAGAGAAGTGATTCTGGTCAACAACAACAACAACCTCCACAGAATTTCTTCAATGAT
CTCTCCAAGGCTCCTCCTACCTCTGACGCTGAAGCTTCCACGAAACCTCTGTGGGTGGAG
GATGAGACAACACGACAAGGAGCAGGAAACAAAAGAAAGTTTGGGTTCCAGGGGATGAAC
GATGAGAAGAAGAAAGAGATAGACTCCTCCTCACGTGTTGTTGATCCGCACGAGAAGAAG
ACAAAAGCATCCCATGTTTCAAACTCTACTGATGAAGGATCAACGGCTGAAAACGAAGAT
GTTGCAGAATCTGAAGTAGGCGGTGGCGGTTCTTCTTCCAATCTAGCTAAGGAGGTGGTT
CGTCCTAACGCTGATACAAACGTCGTGGACAACTTAGCTGGTCAAAGGAAGAACGGCCAT
GGCGCTGAAGAGTTTACTACAATGCGCAACATGAGTTACAACACCGTACCTTTCACTGTT
CATCCACAGAAAGCCGTCACTGGTTTACCTTACTCGGCATTGCTGGCCTTTCTCAATCTC
CATTCGCTGCAAGAGGCCCATCAAACTCAGCTACGGCGAAAGGCGAGGGAAAACAGCCTG
TTGCAGAAGAAGGCTCATCAGAGGATGCATCAGAACGACCATCAGGAGACAACAACAACA
ACAGTACTGCTTTTTCTTTCGGCTTTTCTGCCATAAAACCTGGAATGGCAGCGGATGTGA
AGTTTGGAGGATCTGGTGCACGTCCTAACCTGCCCTGGGTCTCAACCACTGGTTCAGGCC
CGCACGGTCGAACAATCTCGGGTGTTACATACCGGTACAATGCAAACCAGATCAAAATCG
TTTGCGCTTGTCACGGCTCACACATGTCGCCCGAGGAGTTTGTCAGGCATGCAAGCGAGG
AGTATGTTAGCCCTGAGTCTTCTGTAGGAATGACGGCTGCCTCGGCTCATACCTGAAAAG
TCGCCGGAGAAGTGTCTTATATCGTTGTAAACAAATGGAACAAGTGGTTTGTAATGAGTT
TCTTATGGGAAGGTGTACTCTTTAAGGCC


BQ
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AF RR4D093TF U 1
AF RR4D093JQ C 350
BS 1 641 RR4D093TF
BS 642 1049 RR4D093JQ

RD RR4D093TF 641 0 0
GGTCAGAGAAGTGATTCTGGTCAACAACAACAACAACCTCCACAGAATTTCTTCAATGAT
CTCTCCAAGGCTCCTCCTACCTCTGACGCTGAAGCTTCCACGAAACCTCTGTGGGTGGAG
GATGAGACAACACGACAAGGAGCAGGAAACAAAAGAAAGTTTGGGTTCCAGGGGATGAAC
GATGAGAAGAAGAAAGAGATAGACTCCTCCTCACGTGTTGTTGATCCGCACGAGAAGAAG
ACAAAAGCATCCCATGTTTCAAACTCTACTGATGAAGGATCAACGGCTGAAAACGAAGAT
GTTGCAGAATCTGAAGTAGGCGGTGGCGGTTCTTCTTCCAATCTAGCTAAGGAGGTGGTT
CGTCCTAACGCTGATACAAACGTCGTGGACAACTTAGCTGGTCAAAGGAAGAACGGCCAT
GGCGCTGAAGAGTTTACTACAATGCGCAACATGAGTTACAACACCGTACCTTTCACTGTT
CATCCACAGAAAGCCGTCACTGGTTTACCTTACTCGGCATTGCTGGCCTTTCTCAATCTC
CATTCGCTGCAAGAGGCCCATCAAACTCAGCTACGGCGAAAGGCGAGGGAAAACAGCCTG
TTGCAGAAGAAGGCTCATCAGAGGATGCATCAGAACGACCA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4D093JQ 700 0 0
AGGAGGTGGTTCGTCCTAACGCTGATACAAACGTCGTGGACAACTTAGCTGGTCAAAGGA
AGAACGGCCATGGCGCTGAAGAGTTTACTACAATGCGCAACATGAGTTACAACACCGTAC
CTTTCACTGTTCATCCACAGAAAGCCGTCACTGGTTTACCTTACTCGGCATTGCTGGCCT
TTCTCAATCTCCATTCGCTGCAAGAGGCCCATCAAATTCAGCTACGGCGAAAGGCGAGGG
AAAACAGCCTGTTGCAGAAGAAGGCTCATCAGAGGATGCATCAGAACGACCATCAGGAGA
CAACAACAACAACAGTACTGCTTTTTCTTTCGGCTTTTCTGCCATAAAACCTGGAATGGC
AGCGGATGTGAAGTTTGGAGGATCTGGTGCACGTCCTAACCTGCCCTGGGTCTCAACCAC
TGGTTCAGGCCCGCACGGTCGAACAATCTCGGGTGTTACATACCGGTACAATGCAAACCA
GATCAAAATCGTTTGCGCTTGTCACGGCTCACACATGTCGCCCGAGGAGTTTGTCAGGCA
TGCAAGCGAGGAGTATGTTAGCCCTGAGTCTTCTGTAGGAATGACGGCTGCCTCGGCTCA
TACCTGAAAAGTCGCCGGAGAAGTGTCTTATATCGTTGTAAACAAATGGAACAAGTGGTT
TGTAATGAGTTTCTTATGGGAAGGTGTACTCTTTAAGGCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5874Contig1 1163 2 2 U
GAAGTGTTTCCAAGTTACATGAGAAGCGAGATTCAGTAAAGCTAAGCATCAAGTCCTTTA
GGATTCCAGAGCTTTTTATTGAAGTTCCAGAAACTGCAACTGTAGGATCACTGAAGAGGA
CCGTGATGGAGGCTGTCAGTGTTTTACTCAGCGGTGGGATACGTGTTGGGGTATTGGTTC
ATGGGAAGAAGGTCAGAGATGACAAGAGAACTCTTTCACAGACTGGGATCTCATGTGAAG
AGAATCTAACCAACCTTGGGTTCACCTTGTAGCCTGGTCCCAGCAAAGTTCCCATACCTT
TGTGTTCCGAAGATCCTGTGGTGGTTGTGCCACCAACCGAGCCGACAAGTTTATGTGAAC
GGTCTGCGGCTTCTCCCACGTTAGATTCTGGAGTTCCTCATGCAGATGATGTGATTAACT
CAGGAAGTATTGTGGACAACAATCTCGAGTTAGTTCCATACAAGAGTGAGATATCTTTTG
ATGAACCTTCATCAGATTCAAGAGCGCTTGTTTCACTCCCAGCCTTGGAGGAAGTTAAGA
CGCTTGCCATAGTTCCGTTAAACCAGAAACCTAAGCGTACAGAGCTTGCCCAGCGCAGAA
CCAGGAGACCTTTCTCTGTGACCGAGGTAGAAGCTCTCGTACAAGCAGTTGAGGAACTCG
GGACTGGAAGATGACGTGATGTGAAATTGCGTGCTTTTGAGAATGCAGATCATCGGACCT
ACGTGGACTTGAAGGATAAATGGAAGACGCTGGTTCACACAGCAAGTATATCACCGCAGC
AAAGAAGAGGAGAGCCGGTGCCACAAGAACTGCTAGACAGAGTGTTGAAGGCATACGGGT
ATTGGTCGCAGCACCAAGGGAAACATCATGCGAGAGGAGCACCCAAAGATGCAGACACGA
ACAGAGGTGGAGCTCTTGAATCAGGTGTTTCAGTGTAAAAAGGAGGCAAGTATTGGTAGG
TGTACAGATGAAAACAAGAATAATAATTGTAAACTCGGTTTCTGCATAGATTAATTGTCT
TTCTACTAAAATACAATTTATTTTTCTGGTTTGGCATTTTGTAAATGACTCCACAAAGTT
TAGCTTTTCTGTACTTGTTTAATCTCAAACTGATTATGTTGTGTAATATGGTCGGTCCGG
AATGTAATTCTAGACATTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GO49TF U 1
AF RR4GO49JQ C 444
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BS 731 1163 RR4GO49JQ

RD RR4GO49TF 730 0 0
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ATGGGAAGAAGGTCAGAGATGACAAGAGAACTCTTTCACAGACTGGGATCTCATGTGAAG
AGAATCTAACCAACCTTGGGTTCACCTTGTAGCCTGGTCCCAGCAAAGTTCCCATACCTT
TGTGTTCCGAAGATCCTGTGGTGGTTGTGCCACCAACCGAGCCGACAAGTTTATGTGAAC
GGTCTGCGGCTTCTCCCACGTTAGATTCTGGAGTTCCTCATGCAGATGATGTGATTAACT
CAGGAAGTATTGTGGACAACAATCTCGAGTTAGTTCCATACAAGAGTGAGATATCTTTTG
ATGAACCTTCATCAGATTCAAGAGCGCTTGTTTCACTCCCAGCCTTGGAGGAAGTTAAGA
CGCTTGCCATAGTTCCGTTAAACCAGAAACCTAAGCGTACAGAGCTTGCCCAGCGCAGAA
CCAGGAGACCTTTCTCTGTGACCGAGGTAGAAGCTCTCGTACAAGCAGTTGAGGAACTCG
GGACTGGAAGATGACGTGATGTGAAATTGCGTGCTTTTGAGAATGCAGATCATCGGACCT
ACGTGGACTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4GO49JQ 720 0 0
CTCGAGTTAGTTCCATACAAGAGTGAGATATCTTTTGATGAACCTTCATCAGATTCAAGA
GCGCTTGTTTCACTCCCAGCCTTGGAGGAAGTTAAGACGCTTGCCATAGTTCCGTTAAAC
CAGAAACCTAAGCGTACAGAGCTTGCCCAGCGCAGAACCAGGAGACCTTTCTCTGTGACC
GAGGTAGAAGCTCTCGTACAAGCAGTTGAGGAACTCGGGACTGGAAGATGACGTGATGTG
AAATTGCGTGCTTTTGAGAATGCAGATCATCGGACCTACGTGGACTTGAAGGATAAATGG
AAGACGCTGGTTCACACAGCAAGTATATCACCGCAGCAAAGAAGAGGAGAGCCGGTGCCA
CAAGAACTGCTAGACAGAGTGTTGAAGGCATACGGGTATTGGTCGCAGCACCAAGGGAAA
CATCATGCGAGAGGAGCACCCAAAGATGCAGACACGAACAGAGGTGGAGCTCTTGAATCA
GGTGTTTCAGTGTAAAAAGGAGGCAAGTATTGGTAGGTGTACAGATGAAAACAAGAATAA
TAATTGTAAACTCGGTTTCTGCATAGATTAATTGTCTTTCTACTAAAATACAATTTATTT
TTCTGGTTTGGCATTTTGTAAATGACTCCACAAAGTTTAGCTTTTCTGTACTTGTTTAAT
CTCAAACTGATTATGTTGTGTAATATGGTCGGTCCGGAATGTAATTCTAGACATTCTTTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5875Contig1 496 2 2 U
CAAATTCCATAGTTCCATGGCTACGTTGGAAAGATTCAAGTTCCTACCGACGCAGTGTGA
AGTTCAACAGAGCCCGACACTAAGTCCAAGCCCTAGGACAAGTCCTTTGGTACAGTTTCG
TCGTAAGAAGACCACCTTAAAGATGCTTCTGAGTCTTATACCGCCGAGCCGTCGAGAGCA
GCCGCTGACTCATCAGGCTCGTTCACTAGCAGCTGATAAAGACGTAGCTGGACGCAAACT
GAGAGACTTATTCGTTTCTTCGTCTCCTGTAGAGGAAGAAGAAGTGAAGGAGAGGCCGAA
GGGGAAAACAAAAGAAGAAGTTCTTGCTGCCAATGCAGCTAAGTTGAACGCAGCTGCTAC
TTCACAACCGGTTTGGTTGGGAATCAGCAAGCGGCTTCTCCAGCGAGCTTGGCGTCCTAT
GCTTGGTACCATTTTTGAGTAATGTATAACCCAATTTTTTTTTGTCTTTTTTATGTGACA
ATGGAAACCAATTTGG


BQ
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AF RR4AK04TF U 1
AF RR4AK04JQ C 1
BS 1 291 RR4AK04TF
BS 292 496 RR4AK04JQ

RD RR4AK04TF 291 0 0
CAAATTCCATAGTTCCATGGCTACGTTGGAAAGATTCAAGTTCCTACCGACGCAGTGTGA
AGTTCAACAGAGCCCGACACTAAGTCCAAGCCCTAGGACAAGTCCTTTGGTACAGTTTCG
TCGTAAGAAGACCACCTTAAAGATGCTTCTGAGTCTTATACCGCCGAGCCGTCGAGAGCA
GCCGCTGACTCATCAGGCTCGTTCACTAGCAGCTGATAAAGACGTAGCTGGACGCAAACT
GAGAGACTTATTCGTTTCTTCGTCTCCTGTAGAGGAAGAAGAAGTGAAGGA

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR4AK04JQ 496 0 0
CAAATTCCATAGTTCCATGGCTACGTTGGAAAGATTCAAGTTCCTACCGACGCAGTGTGA
AGTTCAACAGAGCCCGACACTAAGTCCAAGCCCTAGGACAAGTCCTTTGGTACAGTTTCG
TCGTAAGAAGACCACCTTAAAGATGCTTTTGAGTCTTATACCGCCGAGCCGTCGAGAGCA
GCCGCTGACTCATCAGGCTCGTTCACTAGCAGCTGATAAAGACGTAGCTGGACGCAAACT
GAGAGACTTATTCGTTTCTTCGTCTCCTGTAGAGGAAGAAGAAGTGAAGGAGAGGCCGAA
GGGGAAAACAAAAGAAGAAGTTCTTGCTGCCAATGCAGCTAAGTTGAACGCAGCTGCTAC
TTCACAACCGGTTTGGTTGGGAATCAGCAAGCGGCTTCTCCAGCGAGCTTGGCGTCCTAT
GCTTGGTACCATTTTTGAGTAATGTATAACCCAATTTTTTTTTGTCTTTTTTATGTGACA
ATGGAAACCAATTTGG

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL5876Contig1 706 2 2 U
CTGATCTTCTTGTTGGAGTTGTGGTCAACGTTGCTCTCGTCGGTATGTTGGCTCCTTTTG
TCCGTTTTGGCCAACCGTCGTCTGCATCTAGTGGCTTCTTAGGACGCATGCTTAATGCTT
ATAATGCGCTTCCCAGCAGCGTGTTTGAAGCTGAGAGACCAGGATGTAGTTTCTCTGCTC
AACAGAGACTTGCTACCTACTTCTACAAGGGTATAATGTATGGTGCAGTTGGGTTTGGAT
GTGGCATTGTAGGTCAAGGCATTGCTAATCTCATCATGACTGCTAAACGGAGCATAAATA
AATCAAAGAAGACATCCCGGTACCACCTCTCATCAAGAGTGCAGCTCTCTGGGGGTGTAT
TCTTGAGTGTTTCTTCGAATACTCGTTATCAGATCATCAATGGTCTGGAGAGAGTGGTTG
AAGCATCGCCTTTCGCCAAGAAAGTGCCTCCTGTGGCTTTGGCGTTTACCGTTGGTGTAC
GTTTTGCTAATAACATTTATGGTGGGATGCAGTTTGTGGATTGGGCGAGATTGAGCGGTT
GTCAGTGATTAAAAAAAAAGACCAAAAGCAAAACTCAGTTTCTTTATGAATGCATGTCTA
ATCTTAATGAACCTACTATTGTTGTAGCCCGCTCGGTTTGATTCCTATATATGTTTACAG
AACTCGCTAGAGCGGTAGTTGAGCTGTAATGGTAATGAATAAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G942TF U 1
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BS 1 487 RR4G942TF
BS 488 706 RR4G942JQ

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ATAATGCGCTTCCCAGCAGCGTGTTTGAAGCTGAGAGACCAGGATGTAGTTTCTCTGCTC
AACAGAGACTTGCTACCTACTTCTACAAGGGTATAATGTATGGTGCAGTTGGGTTTGGAT
GTGGCATTGTAGGTCAAGGCATTGCTAATCTCATCATGACTGCTAAACGGAGCATAAATA
AATCAAAGAAGACATCCCGGTACCACCTCTCATCAAGAGTGCAGCTCTCTGGGGGTGTAT
TCTTGAGTGTTTCTTCGAATACTCGTTATCAGATCATCAATGGTCTGGAGAGAGTGGTTG
AAGCATCGCCTTTCGCCAAGAAAGTGCCTCCTGTGGCTTTGGCGTTTACCGTTGGTGTAC
GTTTTGC

QA 1 487 1 487
DS 

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ATGTGGCATTGTAGGTCAAGGCATTGCTAATCTCATCATGACTGCTAAACGGAGCATAAA
TAAATCAAAGAAGACATCCCGGTACCACCTCTCATCAAGAGTGCAGCTTTTTGGGG*TGT
ATTCTTGAGTGTTTTTTCGAATACTCGTTATCAGATCATCAATGGTCTGGAGAGAGTGGT
TGAAGCATCGCCTTTCGCCAAGAAAGTGCCTCCTGTGGCTTTGGCGTTTACCGTTGGTGT
ACGTTTTGCTAATAACATTTATGGTGGGATGCAGTTTGTGGATTGGGCGAGATTGAGCGG
TTGTCAGTGATTAAAAAAAAAGACCAAAAGCAAAACTCAGTTTCTTTATGAATGCATGTC
TAATCTTAATGAACCTACTATTGTTGTAGCCCGCTCGGTTTGATTCCTATATATGTTTAC
AGAACTCGCTAGAGCGGTAGTTGAGCTGTAATGGTAATGAATAAAATG

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

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AACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAG
AGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTGGAGGAGGAAGATGATAAGAAGAGTCACTAGCTT
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TTTCCATGGGGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCA
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CGATCGTGAATTCTTAT


BQ
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AF RR4FL75TF U 1
AF RR4FL75JQ C 8
BS 1 737 RR4FL75TF

RD RR4FL75TF 737 0 0
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GTTCATTTCGCAAATCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCAC
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TCACTCTACGGATTCGAGGTGGAAAAGGTGAACACTTTAAACATGGACGGGAAGAAGAAG
AAGCGCGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCTGACTACAAGAAGGCATACGTGACGCTCAAA
AACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAG
AGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTGGAGGAGGAAGATGATAAGAAGAGTCACTAGCTT
GATCAGAAGGAGAAGAGGGAGGTCGGTGGCTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGT
GGCGGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCTGCTTCCGGGGCTAAG
TTTCCATGGGGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCA
GTAGGGTTTATGGCCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCGTTTTAGCTGTCGGA
TTGTTATGGATTTTATTTCTGTTTCTTTCGTGACTTTTCTGTCTTAAAAGGAGACGAGCT
CGATCGTGAATTCTTAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FL75JQ 730 0 0
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CGCTGAAAACGATACCTTCAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTGGAGTCACTCT
ACGGATTCGAGGTGGAAAAGGTGAACACTTTAAACATGGACGGGAAGAAGAAGAAGCGCG
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TGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAGAGTAAAG
TGAAAGGATCTAGCTTTGTGGAGGAGGAAGATGATAAGAAGAGTCACTAGCTTGATCAGA
AGGAGAAGAGGGAGGTCGGTGGCTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGTGGCGGTG
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GGGGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCAGTAGGGT
TTATGGCCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCGTTTTAGCTGTCGGATTGTTAT
GGATTTTATTTCTGTTTCTTTCGTGACTTTTCTGTCTTAAAAGGAGACGAGCTCGATCGT
GAATTCTTAT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5879Contig1 1180 2 2 U
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GCGGAGGTACAGTGGCTATTGGTAGTTCACGGAGTGATGACGTTAACGGTGATCAAAGGC
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TTTGTGGGAATGGTGTTTGGTTCCAAGGGTACGGACATTGTCTTAACGGTTGAGCAGTTC
TGTTGCCACCGTCCTAATCCCACATTGCAAATCATATACATAGCTATTATTGGATCAGTA
TACTTTGTGATTGCAAAGTCTTCCTTCATCTATATACCTGGATACTATATTGGCCATGTT
CACAAGTACACGAGCTTTGTGGCTGTTGTTATGGGTGTCATACTTTTCTTATTAACGAGC
TTTTCTGATCCAGGTACCGTGAACGCTTCCAATGTTTCACACTACATTTCTGCTTACCCT
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AGATCCAAGCATTGCAGCATATGCAACCGCTGTGTAGCTCGGTTTGACCATCACTGTGGC
TGGATGAATAACTGCATTGGAGAAAGGAATACTAGATATTTCATAGCTTTTCTCTTTTGT
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TGCTGGGCGAGTTAAAGAACTCCGTGTTGTACATATCTTAACAGTCTATTATGGTGTAGA
GAATTCTTTCCGCAACTTAGCTCCTCGAGTTTTACAGTGGCTGGTTGGTACATACAACAC
CCAAATACTTGTGATGGTGTTTCTCGCCGTTGTTTCTCTCCTCCTCGCTGGCTTCTTTGC
TTACCACTTAAACCTCTGCTTAACCAACACAACAACTAATGAGACATTTAAATGGAGAGA
ATACATAAGGTGGAGGAAGAAACTCAGTGAATCAAAGGCAAGAACATCCTCTGCCCATGA
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CCAGAACGTTTCTGAGATTGTTTTTCCTTTATCGTCAAGACCACTTACTTCTTGCATACC
AAAACCCAAGTCGGAATAGTTAAAAGTTACGTTTAGTCAA


BQ
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AF RR4FS62TF U 1
AF RR4FS62JQ C 381
BS 1 670 RR4FS62TF
BS 671 1180 RR4FS62JQ

RD RR4FS62TF 670 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGGACTTTCAGCGGAGGATCCTCTCAGAGACGACAATG
GCGGAGGTACAGTGGCTATTGGTAGTTCACGGAGTGATGACGTTAACGGTGATCAAAGGC
ACACCTTTCCAATGGATTCACTACTTCATTACTCGCGGAGCCTACGCTTACTTGCTGAGG
TTTGTGGGAATGGTGTTTGGTTCCAAGGGTACGGACATTGTCTTAACGGTTGAGCAGTTC
TGTTGCCACCGTCCTAATCCCACATTGCAAATCATATACATAGCTATTATTGGATCAGTA
TACTTTGTGATTGCAAAGTCTTCCTTCATCTATATACCTGGATACTATATTGGCCATGTT
CACAAGTACACGAGCTTTGTGGCTGTTGTTATGGGTGTCATACTTTTCTTATTAACGAGC
TTTTCTGATCCAGGTACCGTGAACGCTTCCAATGTTTCACACTACATTTCTGCTTACCCT
TATGATGATATCATTTACTCTGAGAACGAATGTTCGACGTGTAGAATCCCAAAGCCTGCT
AGATCCAAGCATTGCAGCATATGCAACCGCTGTGTAGCTCGGTTTGACCATCACTGTGGC
TGGATGAATAACTGCATTGGAGAAAGGAATACTAGATATTTCATAGCTTTTCTCTTTTGT
GATTTTTTGT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4FS62JQ 800 0 0
GGCTGTTGTTATGGGTGTCATACTTTTCTTATTAACGAGCTTTTCTGATCCAGGTACCGT
GAACGCTTCCAATGTTTCACACTACATTTCTGCTTACCCTTATGATGATATCATTTACTC
TGAGAACGAATGTTCGACGTGTAGAATCCCAAAGCCTGCTAGATCCAAGCATTGCAGCAT
ATGCAACCGCTGTGTAGCTCGGTTTGACCATCACTGTGGCTGGATGAATAACTGCATTGG
AGAAAGGAATACTAGATATTTCATAGCTTTTCTCTTTTGTGATTTTTTGTAGGCATTTCC
TTCTTTGCTTGTACGGAGCAATAACCATTGGGTTTATTCTTGCTGGGCGAGTTAAAGAAC
TCCGTGTTGTACATATCTTAACAGTCTATTATGGTGTAGAGAATTCTTTCCGCAACTTAG
CTCCTCGAGTTTTACAGTGGCTGGTTGGTACATACAACACCCAAATACTTGTGATGGTGT
TTCTCGCCGTTGTTTCTCTCCTCCTCGCTGGCTTCTTTGCTTACCACTTAAACCTCTGCT
TAACCAACACAACAACTAATGAGACATTTAAATGGAGAGAATACATAAGGTGGAGGAAGA
AACTCAGTGAATCAAAGGCAAGAACATCCTCTGCCCATGACCATGATGATGAAGCAGAGG
AAGCTATAGTGAAACGGAATGTGTATGATAGAGGAGGTTTCCAGAACGTTTCTGAGATTG
TTTTTCCTTTATCGTCAAGACCACTTACTTCTTGCATACCAAAACCCAAGTCGGAATAGT
TAAAAGTTACGTTTAGTCAA

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL5880Contig1 1068 2 2 U
GGGAATGGAGAAAGTCACAAATCCGGAAACCTCCGCCGGAGGAAAGAAGCGTCGGCGAGA
GGAGGATGAAGTTGGTTGCAGTCACGTTGCTAATGGAGATCAATGTTTTTCTCTCCAGGA
TGAACTTACCTTTAGCGATACTTCTGTGGCGCTTCGGATGATGCGGTCTCAGTTTCCTCG
CATTGACCAGGCTTCGGTCCCGCCATTCATATTACAGTCGCAATTGTACAGTAGCGTCAA
CGATAGAACCCAGGTCGATAGAGAACTTGAGCTTCTACGAAGGGATAAAGTTGTTCGTGT
TTTCAAACTCAACACTGGACAAGATGATCATGCAATCATCTTTCTGGATGACTATCTTAA
CCAGGTTGCCTGTGCTTTCCCTCCCTTCCCTTCCTTCCTTGTCGCCTATTCTACATAATC
CATCCAATATGTTTTAAGGTTGATCGAATAGCAAAGAGGATGGAAGATAAGAATCAGAGT
GATACTGCAACTATTTTCAAGTGGTTCAAAGAACATGTCCTTGATTCTAAAATTGAGCCC
AATATTTCACATCATGAGCTTTGTACGCTCTTGTCATTGGGAGGAAAGGTGAAGGATGCG
CACATCACTCTCTTAATCAACGCTGGCCTTCTCACACGCCAACTTATCGATCCAGACATG
TACTGGTTTACCATTCCCAGTATTGGCAAACTGTTGAAGGCTCTGCGGCAGGGAAGGAAG
GAGCTACTCTCGTTGCTAAAGCGCAAGCGTCACAAAGAGATGTTCTTGGCCCAGCTTGAA
AAGAAACGACTCCGCTACTCTCCTCTTGATATGAGATTTCACATTCGAGATCTCATTGGC
TCTCGTCACCTCAAAACTTTCCAAACCACTTCTGGTTTGCTTCTTCGCCTTTCAACCGAC
TAACAACCTCTTTTCTCGTATACACATCCACTTAATCTTGTCAATTCATCCGATTTAGCT
CATCCTCATCATCATCTTGTTAAGTGAATATATATTTGTTCAAAAGGAGAATGTATTACA
CGATTGTTTTTTCTTTTATTTGTCTTTCACAATAGTTGAAATTGGCCC


BQ
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AF RR4DD90TF U 1
AF RR4DD90JQ C 413
BS 1 699 RR4DD90TF
BS 700 1068 RR4DD90JQ

RD RR4DD90TF 706 0 0
GGGAATGGAGAAAGTCACAAATCCGGAAACCTCCGCCGGAGGAAAGAAGCGTCGGCGAGA
GGAGGATGAAGTTGGTTGCAGTCACGTTGCTAATGGAGATCAATGTTTTTCTCTCCAGGA
TGAACTTACCTTTAGCGATACTTCTGTGGCGCTTCGGATGATGCGGTCTCAGTTTCCTCG
CATTGACCAGGCTTCGGTCCCGCCATTCATATTACAGTCGCAATTGTACAGTAGCGTCAA
CGATAGAACCCAGGTCGATAGAGAACTTGAGCTTCTACGAAGGGATAAAGTTGTTCGTGT
TTTCAAACTCAACACTGGACAAGATGATCATGCAATCATCTTTCTGGATGACTATCTTAA
CCAGGTTGCCTGTGCTTTCCCTCCCTTCCCTTCCTTCCTTGTCGCCTATTCTACATAATC
CATCCAATATGTTTTAAGGTTGATCGAATAGCAAAGAGGATGGAAGATAAGAATCAGAGT
GATACTGCAACTATTTTCAAGTGGTTCAAAGAACATGTCCTTGATTCTAAAATTGAGCCC
AATATTTCACATCATGAGCTTTGTACGCTCTTGTCATTGGGAGGAAAGGTGAAGGATGCG
CACATCACTCTCTTAATCAACGCTGGCCTTCTCACACGCCAACTTATCGATCCAGACATG
TACTGGTTTACCATTCCCAGTATTGGCAAACTGTTGAAG
CTCTGCG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4DD90JQ 656 0 0
ACATAATCCATCCAATATGTTTTAAGGTTGATCGAATAGCAAAGAGGATGGAAGATAAGA
ATCAGAGTGATACTGCAACTATTTTCAAGTGGTTCAAAGAACATGTCCTTGATTCTAAAA
TTGAGCCCAATATTTCACATCATGAGCTTTGTACGCTCTTGTCATTGGGAGGAAAGGTGA
AGGATGCGCACATCACTCTCTTAATCAACGCTGGCCTTCTCACACGCCAACTTATCGATC
CAGACATGTACTGGTTTACCATTCCCAGTATTGGCAAACTGTTGAAGGCTCTGCGGCAGG
GAAGGAAGGAGCTACTCTCGTTGCTAAAGCGCAAGCGTCACAAAGAGATGTTCTTGGCCC
AGCTTGAAAAGAAACGACTCCGCTACTCTCCTCTTGATATGAGATTTCACATTCGAGATC
TCATTGGCTCTCGTCACCTCAAAACTTTCCAAACCACTTCTGGTTTGCTTCTTCGCCTTT
CAACCGACTAACAACCTCTTTTCTCGTATACACATCCACTTAATCTTGTCAATTCATCCG
ATTTAGCTCATCCTCATCATCATCTTGTTAAGTGAATATATATTTGTTCAAAAGGAGAAT
GTATTACACGATTGTTTTTTCTTTTATTTGTCTTTCACAATAGTTGAAATTGGCCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL5881Contig1 632 2 1 U
GCAGGAGGTTGGAGCCAACTGCGACAATGCACGCAAGTACAATGGAAACCTGATCAAGAT
GATGATGAGCAAGAAGATGAGGACTCCCATTAGACCAGACTGCGATCTCACCATCTTCGT
CTTCGCTCTCTTCAATGAGAACATGAAGCCTGGCCCCACTTCCGAGAGGAACTACGGCCT
CTTCAACCCTGACGGAACTCCCGTTTACTCCCTCGGGATCAAGACCTCCTCCTCCTCGGG
TGGTAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAAAACTCCACCGGTGGTGGTAGTAGCAGCAGTGGAGG
TAGCACTGGTGGATCACCCGGTGGCGGCGGCGGCGGCATCTACACGCCAGAGAACCCTTC
ACTGGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAAAAGGCAGATTCGTTGAGTGCGTGTT
CTTCTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGCTGTAAAAGCTCTCACCCCACTAGAT
CTCGGCTTTGTACCTCTAATTGGGTTGATGACGTGAAATTATCCCCAAATTTTATTTTAT
TTAATTAGTTTGTTATGTTGGTGTTTGGTCGGAAACCTATTTTCTGAATGGACCGTGGAT
TTAGAAAACTTGCCATCTTTGTTGTGCCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DB49TF U 1
AF RR4DB49JQ C 124
BS 1 632 RR4DB49TF

RD RR4DB49TF 632 0 0
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GATGATGAGCAAGAAGATGAGGACTCCCATTAGACCAGACTGCGATCTCACCATCTTCGT
CTTCGCTCTCTTCAATGAGAACATGAAGCCTGGCCCCACTTCCGAGAGGAACTACGGCCT
CTTCAACCCTGACGGAACTCCCGTTTACTCCCTCGGGATCAAGACCTCCTCCTCCTCGGG
TGGTAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAAAACTCCACCGGTGGTGGTAGTAGCAGCAGTGGAGG
TAGCACTGGTGGATCACCCGGTGGCGGCGGCGGCGGCATCTACACGCCAGAGAACCCTTC
ACTGGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAAAAGGCAGATTCGTTGAGTGCGTGTT
CTTCTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGCTGTAAAAGCTCTCACCCCACTAGAT
CTCGGCTTTGTACCTCTAATTGGGTTGATGACGTGAAATTATCCCCAAATTTTATTTTAT
TTAATTAGTTTGTTATGTTGGTGTTTGGTCGGAAACCTATTTTCTGAATGGACCGTGGAT
TTAGAAAACTTGCCATCTTTGTTGTGCCTACC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4DB49JQ 509 0 0
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CAACCCTGACGGAACTCCCGTTTACTCCCTCGGGATCAAGACCTCCTCCTCCTCGGGTGG
TAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAAAACTCCACCGGTGGTGGTAGTAGCAGCAGTGGAGGTAG
CACTGGTGGATCACCCGGTGGCGGCGGCGGCGGCATCTACACGCCAGAGAACCCTTCACT
GGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAAAAGGCAGATTCGTTGAGTGCGTGTTCTT
CTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGCTGTAAAAGCTCTCACCCCACTAGATCTC
GGCTTTGTACCTCTAATTGGGTTGATGACGTGAAATTATCCCCAAATTTTATTTTATTTA
ATTAGTTTGTTATGTTGGTGTTTGGTCGGAAACCTATTTTCTGAATGGACCGTGGATTTA
GAAAACTTGCCATCTTTGTTGTGCCTACC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL5882Contig1 900 2 6 U
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TGGAGGAAACTGAAGCGACCTCCTTATGTGACCGATTTAGGAAGACAGTCCGTGTGTGCG
AATGGATCGATCTACTGGTTCTTTTCGGATGCTGCGGGCATCGGGTCTCGTTACCGTTTA
CTAGCCTTGGATCTTCACAAGGAAGAGTTCCATAAGGTCTCTGTTCCTGAAACTTTGGTC
AAGCGAGACACTCTGATTGTTAACCTTGAGGACCGTCTAGCTATATCCAACACCCGGGCT
GATGGGATACTAGAGATATATAGCATGAACGCAGAAGAAGAAGTGTGGAGCAAGACTTAT
TCCATAACTCTACCGGAGACAATGTGTTGCATGCCGGTTTCGGTTTCTAAGCAAGGGAAT
CTCGTCTTTTCGAACAATGAGAAGAGAAGTTTGTTCAAATATTATCCAGAGACGGGTGAG
ATTTGCTGTCTCTCCTTGGATATGTGTGTTATATCTCCTTACCTCGAGAATTTGGCTCCG
CTCCGGTCCCAAGCAGGACATTATCCTGGTCATAAAATCAGGTCATTTAGATGCAGATTG
GTTTGGACGCCGAGAAAGGTCAAATTTGGGATCCTTGTGTTATTCGCTCTAGTTGTTTAC
AGTTTGATGAGCTTATTCACTCTTGAGGAATTAAGGACGACGACACACGAGTGGTGGATA
GGAAAAAAACAAGTAGACTTATCAAAAGTAACCGGAGGTAGTCTGCTTGGACTGGTTCTC
GTTTCGTTATGGTATTGTTATATTTTCTCGATAAGAGAATTTGTTAGCTCCTTTTCTTGT
GCTCTTGTGTATATCTGGTTATTTTACATATGAGAATTGGTCTTCCTCGTTTGTAAGTGA


BQ
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AF RR4EA53TF U 1
AF RR4EA53JQ C 426
BS 1 687 RR4EA53TF
BS 688 688 RR4EA53JQ
BS 689 695 RR4EA53TF
BS 696 696 RR4EA53JQ
BS 697 728 RR4EA53TF
BS 729 900 RR4EA53JQ

RD RR4EA53TF 728 0 0
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TGGAGGAAACTGAAGCGACCTCCTTATGTGACCGATTTAGGAAGACAGTCCGTGTGTGCG
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CTAGCCTTGGATCTTCACAAGGAAGAGTTCCATAAGGTCTCTGTTCCTGAAACTTTGGTC
AAGCGAGACACTCTGATTGTTAACCTTGAGGACCGTCTAGCTATATCCAACACCCGGGCT
GATGGGATACTAGAGATATATAGCATGAACGCAGAAGAAGAAGTGTGGAGCAAGACTTAT
TCCATAACTCTACCGGAGACAATGTGTTGCATGCCGGTTTCGGTTTCTAAGCAAGGGAAT
CTCGTCTTTTCGAACAATGAGAAGAGAAGTTTGTTCAAATATTATCCAGAGACGGGTGAG
ATTTGCTGTCTCTCCTTGGATATGTGTGTTATATCTCCTTACCTCGAGAATTTGGCTCCG
CTCCGGTCCCAAGCAGGACATTATCCTGGTCATAAAATCAGGTCATTTAGATGCAGATTG
GTTTGGACGCCGAGAAAGGTCAAATTTGGGATCCTTGTGTTATTCGCTCTAGTTGTTTAC
AGTTTGATGAGCTTATTCACTCTTGAG*AATTAAG*ACGACGACACACGAGTGGTGGATA
GGAAAAAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4EA53JQ 475 0 0
CTTTTCGAACAATGAGAAGAGAAGTTTGTTCAAATATTATCCAGAGACGGGTGAGATTTG
CTGTCTCTCCTTGGATATGTGTGTTATATCTCCTTACCTCGAGAATTTGGCTCCGCTCCG
GTCCCAAGCAGGACATTATCCTGGTCATAAAATCAGGTCATTTAGATGCAGATTGGTTTG
GACGCCGAGAAGGGTCAAATTTGGGATCCTTGTGTTATTCGCTCTAGTTGTTTACAGTTT
GATGAGCTTATTCACTCTTGAGGAATTAAGGACGACGACACACGAGTGGTGGATAGGAAA
AAAACAAGTAGACTTATCAAAAGTAACCGGAGGTAGTCTGCTTGGACTGGTTCTCGTTTC
GTTATGGTATTGTTATATTTTCTCGATAAGAGAATTTGTTAGCTCCTTTTCTTGTGCTCT
TGTGTATATCTGGTTATTTTACATATGAGAATTGGTCTTCCTCGTTTGTAAGTGA

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL5883Contig1 831 2 2 U
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TCCTATTCTTGTCCACCATAAACTCCCATTTCCCATCGGAACCACAAACCCATGCTCCAC
AAACAACCAGACACATCTCATCCATCTGCAAGCGACCACGAAAATAACCTAACCATCATT
TTTCAAGTTTTTCTCAGTTTAACCTATAACAGAAGAATAACGCGAGCAAAACTATAAAAC
AAGATATACAAACAGGAAGAAGGTACCTTCGACAAGAAGATCCCAGACGGAAGAGCGGAG
AACCACAAAACTATCGCCTTATCTCTCAACACTTCAAAGAAGGAAAATTAGTGTTTACTT
TGCTTTTCCTACGAGAAACCTCCCATGCTTACTCTCTCCACTTAATTGCACCATCCACCT
AAAACAATCGTAGGATATTCTCCACCGTTAGATCTTGTACTTTACATTACATCCAACAGT
TCACAATTACTCTCTTTATTTCATATACCTACTAATTTAAAATGATTTTAAAAGTATTTA
TTACTTTTTTCTAGCTACCTCGTTAACTACTATTTTTTTAAATTATATAAATGAGCATCA
TTTATGGTAAGCAGAAAGAAGGAAAAGAAACCTAGTCACAAAAGTAAACTGGTTTGGTTG
ATTCTCTTAAAGCAGACAACAAATTACATATCTCCTCATTGGGGATATTTTCGTCACCTA
TGATTCACAGCAAGAATGAAAGTGTGCTCAGGAAACAAAGTGTTCTTTTGTGAGAAAAAA
AAGACGAAGTATCTCTGAACATAACGTTCTCATTAAACAAATGTTTATTCG


BQ
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AF RR4ED40TF U 1
AF RR4ED40JQ C 329
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BS 619 831 RR4ED40JQ

RD RR4ED40TF 618 0 0
GAACCCTACGTTCAAGCTCTCTCATGGTTATTCCTTCATCCACCGGTATCATCCTAGCCA
TCCTATTCTTGTCCACCATAAACTCCCATTTCCCATCGGAACCACAAACCCATGCTCCAC
AAACAACCAGACACATCTCATCCATCTGCAAGCGACCACGAAAATAACCTAACCATCATT
TTTCAAGTTTTTCTCAGTTTAACCTATAACAGAAGAATAACGCGAGCAAAACTATAAAAC
AAGATATACAAACAGGAAGAAGGTACCTTCGACAAGAAGATCCCAGACGGAAGAGCGGAG
AACCACAAAACTATCGCCTTATCTCTCAACACTTCAAAGAAGGAAAATTAGTGTTTACTT
TGCTTTTCCTACGAGAAACCTCCCATGCTTACTCTCTCCACTTAATTGCACCATCCACCT
AAAACAATCGTAGGATATTCTCCACCGTTAGATCTTGTACTTTACATTACATCCAACAGT
TCACAATTACTCTCTTTATTTCATATACCTACTAATTTAAAATGATTTTAAAAGTATTTA
TTACTTTTTTCTAGCTACCTCGTTAACTACTATTTTTTTAAATTATATAAATGAGCATCA
TTTATGGTAAGCAGAAAG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4ED40JQ 503 0 0
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TTACTCTCTCCACTTAATTGCACCATCCACCTAAAACAATCGTAGGATATTCTCCACCGT
TAGATCTTGTACTTTACATTACATCCAACAGTTCACAATTACTCTCTTTATTTCATATAC
CTACTAATTTAAAATGATTTTAAAAGTATTTATTACTTTTTTCTAGCTACCTCGTTAACT
ACTATTTTTTTAAATTATATAAATGAGCATCATTTATGGTAAGCAGAAAGAAGGAAAAGA
AACCTAGTCACAAAAGTAAACTGGTTTGGTTGATTCTCTTAAAGCAGACAACAAATTACA
TATCTCCTCATTGGGGATATTTTCGTCACCTATGATTCACAGCAAGAATGAAAGTGTGCT
CAGGAAACAAAGTGTTCTTTTGTGAGAAAAAAAAGACGAAGTATCTCTGAACATAACGTT
CTCATTAAACAAATGTTTATTCG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL5884Contig1 1008 2 2 U
GGGGACTCGCGAACCTCTGCAACCTTTGATTTGATGATAACTTGTCTTTCATTTGATTTG
ATGATAACTTGACTCGCGAATCCCACTACTGAAACTTTTGATTTGATGATAACTTGTCTT
TCATTAGGGAGAAGAAGTATGAGTTAGGTTTAAGGTTGCTTGTCGATGGAGAAACCACGG
GTCGCCTTCGAGATGCGATCATAGAGAGAGACGAGTCTCTGGCCAACTCAATGGAGAAAC
TTATTTGATACTTTTGTTTCTTGTTTCCCAAGCCTCATGAACACCAGCATTCCAACACTT
CCAGGCACTTGGCTGAAGGAGCTTTTGTGCAAGGATTGTTTTCATCTTCCAGCCAAACTC
AAAATTGATCTTTTACTTTCCTATGACCATTTTTCTAAAGACCTCTCCCTCATTCTATTG
ATGATGAAACTTGAATGAACAAACACATGTGATCCACAGGTTTCTGAAGCATCCCACGCT
CGCCGCCGTGGGAAACGGCTCGTCAAGGAGATAGGGGATATCAAAGAGAAAGGTTGCCTA
AGTAACGGTTGTAACCAACTTGGAGCCAAAGGGTGTGTCATGTATGCAGAGAGAGGAAGT
GGTCAAGCTTGGATGCAACGCTTCCTAAGGTTTCAGCACTGGATGATCCGGTTCTAGCTA
CGGTTTGTGAGCCGGTAGAGAGAGCAAACTCAAACCACTTGTTCACTGCAGGACTTGCCG
ACAGCATGGGAGTTAGGTAACTTGTTTAATGACTCATTTGTTATAGGTGCTGTCTATGCT
AGTTGGGAGTCTTCCAGCCTCTGAATAGCCTTTAGCCACAAGCTTCCTTTGCTGCAGCAT
CACTGACAGTGTAGTTAGCAATATTGTTGGGTGAACTTATTTTCTGATGAACTTAATATT
GAATGCAGTTCTGGTTAGACTTCTCATGAGCTTAGTAGATCATTGTAACAAAAAAAAATT
ATTTTTTTCTCCTAAGGATCCTAAAAAGAATCCACCATTGGACTGTTT


BQ
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AF RR4FR38TF U 1
AF RR4FR38JQ C 336
BS 1 624 RR4FR38TF
BS 625 1008 RR4FR38JQ

RD RR4FR38TF 624 0 0
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ATGATAACTTGACTCGCGAATCCCACTACTGAAACTTTTGATTTGATGATAACTTGTCTT
TCATTAGGGAGAAGAAGTATGAGTTAGGTTTAAGGTTGCTTGTCGATGGAGAAACCACGG
GTCGCCTTCGAGATGCGATCATAGAGAGAGACGAGTCTCTGGCCAACTCAATGGAGAAAC
TTATTTGATACTTTTGTTTCTTGTTTCCCAAGCCTCATGAACACCAGCATTCCAACACTT
CCAGGCACTTGGCTGAAGGAGCTTTTGTGCAAGGATTGTTTTCATCTTCCAGCCAAACTC
AAAATTGATCTTTTACTTTCCTATGACCATTTTTCTAAAGACCTCTCCCTCATTCTATTG
ATGATGAAACTTGAATGAACAAACACATGTGATCCACAGGTTTCTGAAGCATCCCACGCT
CGCCGCCGTGGGAAACGGCTCGTCAAGGAGATAGGGGATATCAAAGAGAAAGGTTGCCTA
AGTAACGGTTGTAACCAACTTGGAGCCAAAGGGTGTGTCATGTATGCAGAGAGAGGAAGT
GGTCAAGCTTGGATGCAACGCTTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4FR38JQ 673 0 0
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TAAAGACCTCTCCCTCATTCTATTGATGATGAAACTTGAATGAACAAACACATGTGATCC
ACAGGTTTCTGAAGCATCCCACGCTCGCCGCCGTGGGAAACGGCTCGTCAAGGAGATAGG
GGATATCAAAGAGAAAGGTTGCCTAAGTAACGGTTGTAACCAACTTGGAGCCAAAGGGTG
TGTCATGTATGCAGAGAGAGGAAGTGGTCAAGCTTGGATGCAACGCTTCCTAAGGTTTCA
GCACTGGATGATCCGGTTCTAGCTACGGTTTGTGAGCCGGTAGAGAGAGCAAACTCAAAC
CACTTGTTCACTGCAGGACTTGCCGACAGCATGGGAGTTAGGTAACTTGTTTAATGACTC
ATTTGTTATAGGTGCTGTCTATGCTAGTTGGGAGTCTTCCAGCCTCTGAATAGCCTTTAG
CCACAAGCTTCCTTTGCTGCAGCATCACTGACAGTGTAGTTAGCAATATTGTTGGGTGAA
CTTATTTTCTGATGAACTTAATATTGAATGCAGTTCTGGTTAGACTTCTCATGAGCTTAG
TAGATCATTGTAACAAAAAAAAATTATTTTTTTCTCCTAAGGATCCTAAAAAGAATCCAC
CATTGGACTGTTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL5885Contig1 1257 2 2 U
GGAGTGAGTTTGGAATGGGAACACGTCTGTCGTTTCATCTCCACAGGAGAATGGAGTCTG
CCTTGGCGACATCGAGTTTCATGGGTACCAAAGTGATGGTTCCCGCCACTCTGTTTTGCA
GACGAGCTCGAGTAGCGTCTCTCACCGTCACGGCAAGTAGCACTACTAAGATTACACGAG
GCTCGACTCTTGTCTCGTGATTCCTCCTCCCCCCATTTTCAAGAAACCGCGTGCCATTAT
CAAGTTCTTGGGAGGCGCCTTCGTCGGAGCTGTCCCTGAACTCACCTACAGTTACCTAAA
GGAGCTACTGGCTAAAGAAGGGTATTTGATTGTATCTGTGCCGTACAACGTCACTTTTGA
TCACGAACAAGCTGCCAAGCAGGTTTACCAGAGGTTCAACTCCTGCTTGGACACCATTGT
CTTATCTGGAGTTCCAAATGCCGATTTTAACCCTCGAGATCTAGCTAACCTTCCTGTTTT
CTCTGTTGGTCACAGTAATGGTGCGCTGCTCCAAGTTTTGACCGGAAGTTATTTCTCTGA
CAAGATACCAAAGGTTAATGCCATCATTTCATTCAACAACAAATCAGCCACAGAGGCAGT
TCCATATTTTGAGCAGCTTGGTCCTCTCATCCAGCAGATGATGCCAGTCGTGGAAGCTTC
TCCGTTATATGAAATAGCTCGAAATGCTTCAGGTGATGCGTTGAAAGTACTACTGGATGC
CGCTGGGACAACGATTCTGAACAATGATCAAGAAGCTCTTAAGTCGTTTTCTAATTTGGT
TGATCAGTTGCCCTCAGTATTTGGCGAGGTTGGACAAGGGGTGTCGGAATTCAGACCATC
ACCACTTGAGAATCGTACTTGCTTCAAATGCTCCTACAGCGTTCCACACACTTTACTGGT
ACAATTCAACTCTGATGCAATCGACGAGACTGATTTACTGGAAGAAACCCTAAGGCCTCG
GATAGAATCTTTTGGTGGTTCACTTGAAAAGGTTCGGCTGAACGGAAACCATCTCACACC
TTGCGTACAGGACCCGAAGTGGCAAATTGGGTCTGTCTACACGCCAGCAGACGCTGTGGC
TCAGGCGCTGAAGACAATACCTCTGAGGGACACCCGTGTTCTTTCAAGGACAATCGTCGA
TTGGTTTACAAGGTTTGAGAATTGAGCCAATCGTGCTCGTGGTGTATTGTTAAAGAAATG
GTCAAATATGTATGTATATACATGGTTCATGGTATTTGAAATAAAATATTTATGTGT


BQ
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AF RR4DT82TF U 1
AF RR4DT82JQ C 474
BS 1 689 RR4DT82TF
BS 690 1257 RR4DT82JQ

RD RR4DT82TF 689 0 0
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CCTTGGCGACATCGAGTTTCATGGGTACCAAAGTGATGGTTCCCGCCACTCTGTTTTGCA
GACGAGCTCGAGTAGCGTCTCTCACCGTCACGGCAAGTAGCACTACTAAGATTACACGAG
GCTCGACTCTTGTCTCGTGATTCCTCCTCCCCCCATTTTCAAGAAACCGCGTGCCATTAT
CAAGTTCTTGGGAGGCGCCTTCGTCGGAGCTGTCCCTGAACTCACCTACAGTTACCTAAA
GGAGCTACTGGCTAAAGAAGGGTATTTGATTGTATCTGTGCCGTACAACGTCACTTTTGA
TCACGAACAAGCTGCCAAGCAGGTTTACCAGAGGTTCAACTCCTGCTTGGACACCATTGT
CTTATCTGGAGTTCCAAATGCCGATTTTAACCCTCGAGATCTAGCTAACCTTCCTGTTTT
CTCTGTTGGTCACAGTAATGGTGCGCTGCTCCAAGTTTTGACCGGAAGTTATTTCTCTGA
CAAGATACCAAAGGTTAATGCCATCATTTCATTCAACAACAAATCAGCCACAGAGGCAGT
TCCATATTTTGAGCAGCTTGGTCCTCTCATCCAGCAGATGATGCCAGTCGTGGAAGCTTC
TCCGTTATATGAAATAGCTCGAAATGCTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DT82JQ 784 0 0
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TCTCTGACAAGATACCAAAGGTTAATGCCATCATTTCATTCAACAACAAATCAGCCACAG
AGGCAGTTCCATATTTTGAGCAGCTTGGTCCTCTCATCCAGCAGATGATGCCAGTCGTGG
AAGCTTCTCCGTTATATGAAATAGCTCGAAATGCTTCAGGTGATGCGTTGAAAGTACTAC
TGGATGCCGCTGGGACAACGATTCTGAACAATGATCAAGAAGCTCTTAAGTCGTTTTCTA
ATTTGGTTGATCAGTTGCCCTCAGTATTTGGCGAGGTTGGACAAGGGGTGTCGGAATTCA
GACCATCACCACTTGAGAATCGTACTTGCTTCAAATGCTCCTACAGCGTTCCACACACTT
TACTGGTACAATTCAACTCTGATGCAATCGACGAGACTGATTTACTGGAAGAAACCCTAA
GGCCTCGGATAGAATCTTTTGGTGGTTCACTTGAAAAGGTTCGGCTGAACGGAAACCATC
TCACACCTTGCGTACAGGACCCGAAGTGGCAAATTGGGTCTGTCTACACGCCAGCAGACG
CTGTGGCTCAGGCGCTGAAGACAATACCTCTGAGGGACACCCGTGTTCTTTCAAGGACAA
TCGTCGATTGGTTTACAAGGTTTGAGAATTGAGCCAATCGTGCTCGTGGTGTATTGTTAA
AGAAATGGTCAAATATGTATGTATATACATGGTTCATGGTATTTGAAATAAAATATTTAT
GTGT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL5886Contig1 1190 2 2 U
GGTACCAGTTCGCAGACATGAGTCTTCTAGCCAACGAGTCCATCTCAAAGCACATGAACA
AAGACCCTGAGGGTTATGTGCCAATATCTTACATTGCTTCGACCAAGAAGATTAAGGCTT
TAACGAGTAACCACCACTTAGTTTCATTGGCTCTGCGCTCCTCCTCTAAGCTTGTTGTGA
GTGAAGACAACAAGAAAGTTAAGTGTAAAGTTCCATTTACTGAGAGAGACAGAGAAGATT
TGCAGGGCCGGACTGTTGTTGCAGAGAATTTGCCTGATGATCACTCTTACCAGAACCTTG
AGAAGATCTTTGGAGTTGTTGGAAACGTTAAAGCGATTCGAATCTGTCATCCTCCTGAAT
CAAACTCCTCTCGTCCAAAAGGAGATTTCTTGATGAGCAACAAAATTCACGCACTTATCG
AGTATGACCACACTGTTGTTGCGGATAAAGCTGTGGATAAGCTGAACGATGAAAGAAACT
GGAGGAAAGGACTTCGTGTGAGGCTGCTTCTTAGATGCTCGCCCAAATCAGTGCTCAAGC
ACAGAAGAAACTTTGATGGCATCCTCATAGATGATGAAAGTCCTTATGAATCTGGAGAAG
AATCTCCACGTATCCATTTAACCGAGCATCAGCTTGATAACGAGGGTGATGACAACAATC
TTGGAGGACTATGGGGAAAAGGGAGAGGAAAAGGAAGAGGACGATCTCCAAGAACCTATG
TGGTAGGAGGAGGAGGAGGAGAACGTAGCTTCGGGATCGGGCTCGGACTCAGCCTCGGCC
CTATGTCACCAAGCCTAGGCCTACACGGATCTTCGTCTCCAAAAACAGCAACAAAGGGAC
CAAGGATGCCTGATGGGACAAGAGGCTTCACTATGGGACGTGGCAAACCTGTCAATCTCA
GTCTTATCTAACAATCTCTAAGTAAAAGAGGTAAAAGCTATAGAATTAACCAAATAATAC
ATGTTGGCTGTTGTTTTTTTGAGATATGGGTTCACAGAAGCAAGGACATGGGTTTGGGAT
GAGGTATGGTGAAGTTTTTTGAGTGTTTTTTCTTTCTTCTTTTTGCATTTCTTTTATTCT
CTAATTTGGGCAATTTCTTTTGTATGTTTTGATTTGTTTATTTTTGCGTGAGACTAACTG
AATAATAAAGGGTTTATAGCACAAGGACTGCAACCCTGTCGTGTATCAAT


BQ
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AF RR4DB62TF U 1
AF RR4DB62JQ C 405
BS 1 694 RR4DB62TF
BS 695 1190 RR4DB62JQ

RD RR4DB62TF 694 0 0
GGTACCAGTTCGCAGACATGAGTCTTCTAGCCAACGAGTCCATCTCAAAGCACATGAACA
AAGACCCTGAGGGTTATGTGCCAATATCTTACATTGCTTCGACCAAGAAGATTAAGGCTT
TAACGAGTAACCACCACTTAGTTTCATTGGCTCTGCGCTCCTCCTCTAAGCTTGTTGTGA
GTGAAGACAACAAGAAAGTTAAGTGTAAAGTTCCATTTACTGAGAGAGACAGAGAAGATT
TGCAGGGCCGGACTGTTGTTGCAGAGAATTTGCCTGATGATCACTCTTACCAGAACCTTG
AGAAGATCTTTGGAGTTGTTGGAAACGTTAAAGCGATTCGAATCTGTCATCCTCCTGAAT
CAAACTCCTCTCGTCCAAAAGGAGATTTCTTGATGAGCAACAAAATTCACGCACTTATCG
AGTATGACCACACTGTTGTTGCGGATAAAGCTGTGGATAAGCTGAACGATGAAAGAAACT
GGAGGAAAGGACTTCGTGTGAGGCTGCTTCTTAGATGCTCGCCCAAATCAGTGCTCAAGC
ACAGAAGAAACTTTGATGGCATCCTCATAGATGATGAAAGTCCTTATGAATCTGGAGAAG
AATCTCCACGTATCCATTTAACCGAGCATCAGCTTGATAACGAGGGTGATGACAACAATC
TTGGAGGACTATGGGGAAAAGGGAGAGGAAAAGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4DB62JQ 786 0 0
ATTCACGCACTTATCGAGTATGACCACACTGTTGTTGCGGATAAAGCTGTGGATAAGCTG
AACGATGAAAGAAACTGGAGGAAAGGACTTCGTGTGAGGCTGCTTCTTAGATGCTCGCCC
AAATCAGTGCTCAAGCACAGAAGAAACTTTGATGGCATCCTCATAGATGATGAAAGTCCT
TATGAATCTGGAGAAGAATCTCCACGTATCCATTTAACCGAGCATCAGCTTGATAACGAG
GGTGATGACAACAATCTTGGAGGACTATGGGGAAAAGGGAGAGGAAAAGGAAGAGGACGA
TCTCCAAGAACCTATGTGGTAGGAGGAGGAGGAGGAGAACGTAGCTTCGGGATCGGGCTC
GGACTCAGCCTCGGCCCTATGTCACCAAGCCTAGGCCTACACGGATCTTCGTCTCCAAAA
ACAGCAACAAAGGGACCAAGGATGCCTGATGGGACAAGAGGCTTCACTATGGGACGTGGC
AAACCTGTCAATCTCAGTCTTATCTAACAATCTCTAAGTAAAAGAGGTAAAAGCTATAGA
ATTAACCAAATAATACATGTTGGCTGTTGTTTTTTTGAGATATGGGTTCACAGAAGCAAG
GACATGGGTTTGGGATGAGGTATGGTGAAGTTTTTTGAGTGTTTTTTCTTTCTTCTTTTT
GCATTTCTTTTATTCTCTAATTTGGGCAATTTCTTTTGTATGTTTTGATTTGTTTATTTT
TGCGTGAGACTAACTGAATAATAAAGGGTTTATAGCACAAGGACTGCAACCCTGTCGTGT
ATCAAT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5887Contig1 337 2 2 U
GCTCCATATCTCCTTGCTTCCTCTTAATCTTTGCTTTCATTCTCTTCTCCCTCCTCTTTT
CCTTCTCCACTTTCTTGTCCTCATGATCCACTTTCCTCAGTTGCTCTCCCAATTTCTTAT
AGTAATCATTCCTTGCCTCTGCATCAAGAGCAACTTCAGTCTCAGTTTCGGAAGCAGCTA
CTATTGCTAAAGGAGCCACTGGATTGCCTTCCTCATCAAACTTAACCCTGGTCCCACTTG
GTCTGTGCTGGCTGATCTTCAGCTTCTTGTTTTTCGAAACACGAGTTCCTGGCATGGGAA
CTCCTTCGTCCTTGTTTGATTTGTCTCCACCCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ40TF C 1
AF RR4GQ40JQ U 42
BS 1 41 RR4GQ40TF
BS 42 337 RR4GQ40JQ

RD RR4GQ40TF 330 0 0
GCTCCATATCTCCTTGCTTCCTCTTAATCTTTGCTTTCATTCTCTTCTCCCTCCTCTTTT
CCTTCTCCACTTTCTTGTCCTCATGATCCACTTTCCTCAGTTGCTCTCCCAATTTCTTAT
AGTAATCATTCCTTGCCTCTGCATCAAGAGCAACTTCAGTCTCAGTTTCGGAAGCAGCTA
CTATTGCTAAAGGAGCCACTGGATTGCCTTCCTCATCAAACTTAACCCTGGTCCCACTTG
GTCTGTGCTGGCTGATCTTCAGCTTCTTGTTTTTCGAAACACGAGTTCCTGGCATGGGAA
CTCCTTCGTCCTTGTTTGATTTGTCTCCAC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4GQ40JQ 296 0 0
CTCTTCTCCCTCCTCTTTTCCTTCTCCACTTTCTTGTCCTCATGATCCACTTTCCTCAGT
TGCTCTCCCAATTTCTTATAGTAATCATTCCTTGCCTCTGCATCAAGAGCAACTTCAGTC
TCAGTTTCGGAAGCAGCTACTATTGCTAAAGGAGCCACTGGATTGCCTTCCTCATCAAAC
TTAACCCTGGTCCCACTTGGTCTGTGCTGGCTGATCTTCAGCTTCTTGTTTTTCGAAACA
CGAGTTCCTGGCATGGGAACTCCTTCGTCCTTGTTTGATTTGTCTCCACCCTTGCC

QA 1 296 1 296
DS 



AS 1 2

CO CL5888Contig1 742 2 3 U
ATATCATCAGCCTAGCCCTGCAGTCTCTGCTCATATGACCCACTTGCCGGCAGTTCCTGC
AAACCACCTCCTCCTCCCTGATATGGGATCTGATCCCTCGTGGTAACACATGGGTTTTAG
GGCATTTGATAGCAAGGTGACCAAACAGGTTACAGTGATTGCACACGGGATCGTCTCTGC
AGTCACGAGCAAAATGACCGGTCTTCCTGCAGTTGTTGCAGGCTTTCTCGTTAGTGCAGT
CAGCAAAAAAGTGACCTTGCTTGTAACAGTTGTTGCAAAGTCTGAGGTCTCCAGGAGGGA
GGTGGCGACCTGTGCAGTCTTTAGCTTGGTGTCCGGCAATACCGCAGCTGTGACAAATGC
CTTCGTTGGTGCAGCTATTAGACATGTGACCTGGTTCACGGCAGTTCCAACACAGCGACT
TCGCGGAGCATTCTGATAAAATGTGCCCAGGAAGGCCACAGTTGTGGCAGATAGAGACAT
TGGGACACTCTCGAGCAAAATGACCAGGTTGCTTACAATTCTTGCACATATTACTTTGGC
TGAAAGTCCGACGAGAATCTCTCCGGTAAGGATCATCACGGTAAGAAAAACGATCAGAAC
CAATCTTTCTGTCCATCGGATTCCTACTCCTCTCCAAACTCATTATCTCCTTCCTTCACG
TCGACGACAACCAATATTTTGACGACAACCAATTTTCCGACAAGTAAACTATCAGCAGTT
CGACAAATCTGGCGTGCGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A821JQ U 77
AF RR4A821TF C 1
BS 1 76 RR4A821TF
BS 77 379 RR4A821JQ
BS 380 742 RR4A821TF

RD RR4A821JQ 303 0 0
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GTGACCAAACAGGTTACAGTGATTGCACACGGGATCGTCTCTGCAGTCACGAGCAAAATG
ACCGGTCTTCCTGCAGTTGTTGCAGGCTTTCTCGTTAGTGCAGTCAGCAAAAAAGTGACC
TTGCTTGTAACAGTTGTTGCAAAGTCTGAGGTCTCCAGGAGGGAGGTGGCGACCTGTGCA
GTCTTTAGCTTGGTGTCCGGCAATACCGCAGCTGTGACAAATGCCTTCGTTGGTGCAGCT
ATT

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR4A821TF 742 0 0
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AAACCACCTCCTCCTCCCTGATATGGGATCTGATCCCTCGTGGTAACACATGGGTTTTAG
GGCATTTGATAGCAAGGTGACCAGACAGGTTACAGTGATTGCACACGGGATCGTCTCTGC
AGTCACGAGCAAAATGACCGGTCTTCCTGCAGTTGTTGCAGGCTTTCTCGTTAGTGCAGT
CAGCAGAGAAGTGACCTTGCTTGTAACAGTTGTTGCAGAGTCTGAGGTCTCCAGGAGGGA
GGTGGCGACCTGTGCAGTCTTTAGCTTGGTGTCCGGCAATACCGCAGCTGTGACAAATGC
CTTCGTTGGTGCAGCTATTAGACATGTGACCTGGTTCACGGCAGTTCCAACACAGCGACT
TCGCGGAGCATTCTGATAAAATGTGCCCAGGAAGGCCACAGTTGTGGCAGATAGAGACAT
TGGGACACTCTCGAGCAAAATGACCAGGTTGCTTACAATTCTTGCACATATTACTTTGGC
TGAAAGTCCGACGAGAATCTCTCCGGTAAGGATCATCACGGTAAGAAAAACGATCAGAAC
CAATCTTTCTGTCCATCGGATTCCTACTCCTCTCCAAACTCATTATCTCCTTCCTTCACG
TCGACGACAACCAATATTTTGACGACAACCAATTTTCCGACAAGTAAACTATCAGCAGTT
CGACAAATCTGGCGTGCGGCCC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL5889Contig1 500 2 2 U
GTAATAACCATCAGGTCTATTCAATGTCACATGTTTGAAACACTAGAGGCAGATACAAGA
GGATGAAATGTTAATCCAACTCAATACAAACCGTTTTGCTCTATAGTTTTTAAGAGTCAT
AACAATAATTTACAGCTGAAAAGAATCAAGAATGACTTGAAGAGTCTTCTGTGAGCTCTG
CCATTGCTTCTCAGTAGCACTCACCACAAACAGAACCACCGTGTTCCCCTTTGCCGTCGC
TTTCCCAAGGTTATGACTTCCCGTTAGCGCAAATGGCGTCTCCAATACATACTTATAGTA
CGTTTGGTCACCGATCTTTTCGATCGATGTATTCACAAGCTCATCAGAATCATAAGAGTT
TCCAGTGACAAAGGGACCAAGAAAAGCGATCACTCTCTCAGGCTCACCGAGATGGAAGAT
GTTTGATGTCGGGACGAGAGATGCGGAAGCCATTTTTTTTTTTGGTTATGAAAGGTTGAA
AGTTTTCAGGGGTTTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H896TF C 1
AF RR4H896JQB U 241
BS 1 240 RR4H896TF
BS 241 500 RR4H896JQB

RD RR4H896TF 500 0 0
GTAATAACCATCAGGTCTATTCAATGTCACATGTTTGAAACACTAGAGGCAGATACAAGA
GGATGAAATGTTAATCCAACTCAATACAAACCGTTTTGCTCTATAGTTTTTAAGAGTCAT
AACAATAATTTACAGCTGAAAAGAATCAAGAATGACTTGAAGAGTCTTCTGTGAGCTCTG
CCATTGCTTCTCAGTAGCACTCACCACAAACAGAACCACCGTGTTCCCCTTTGCCGTCGC
TTTCGCAAGGTTATGACTTCCCGTTAGCGCAAATGGCGTCTCCAATACATACTTATAGTA
CGTTTGGTCACCGATCTTTTCGATCGATGTATTCACAAGCTCATCAGAATCATAAGAGTT
TCCAGTGACAAAGGGACCAAGAGAAGCGATCACTCTCTCAGGCTCACCGAGATGGAAGAT
GTTTGATGTCGGGACGAGAGATGCGGAAGCCATTTTTTTTTTTGGTTATGAGAGGTTGAA
AGTTTTCAGGGGTTTGTGCC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4H896JQB 260 0 0
TTTCCCAAGGTTATGACTTCCCGTTAGCGCAAATGGCGTCTCCAATACATACTTATAGTA
CGTTTGGTCACCGATCTTTTCGATCGATGTATTCACAAGCTCATCAGAATCATAAGAGTT
TCCAGTGACAAAGGGACCAAGAAAAGCGATCACTCTCTCAGGCTCACCGAGATGGAAGAT
GTTTGATGTCGGGACGAGAGATGCGGAAGCCATTTTTTTTTTTGGTTATGAAAGGTTGAA
AGTTTTCAGGGGTTTGTGCC

QA 1 260 1 260
DS 



AS 1 2

CO CL5890Contig1 1093 2 6 U
GGGTAGAGCCACCCCCTTCTTCTAAGTCTAACCTAGTCCGGTCAAATTCTCTAAAGTCCT
CAAGAAGTGAAGCATGCTCTTGTTTTGCTTTAAGACTTGAGCGGTGACGATAAAACTCCT
GCCACTTTGAATTAACTAGTCATTCATACACAGGGAACAAAGACTGATTAACTAATTACA
ACATAGGTTGTCATAAACTAGTCCAAAAAAAAAAGATAATACCTGAGTGAGATCTTGAAG
GATCTCCTGATGTCGAGTTAAAGTATGAGAGACCATTTCTGAACCACCAGAAGAAACCCA
AGCTTGCATCTGCGCGTTAACTTGTTGAAGTTGACTTAGAAGTAAATCAATCCCAGCTTC
AAGATCACTGTCAGCACCATCTGACTTGGTTAAAGCCTTGTTAGTTGAAACAAGTCTGCG
GTATGAATGCATCTGCTCGTCAAGCTGAGCTTCAATCTTTCTAGCCTGCTCAAAAATCCA
ACAATAAAATCATCTTCATTTATGTACCAAAAGCATCTCTTAATATTACAAATGGATTCA
AATCCAGAAGAATGATATCGAATCAGTTCACCAAAACCCAATTCAAACATCTCATACGCA
ATTCTATCCAGTAGCTTCTTTACAGAAAGTTACCTGTTTGCGTAAAGCATCCCAAGAGCT
CGGAACGTCCATGGCGTCTAATGAATCCGTCAAAATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT
TTTTGAATACGTATCGTCTCTTTTTTAAATCTGATGAGAAACTTTTTTACCCCAGATCAA
AGTAACTAAACCTTCGCCAAACCCGAAAGAAGCGATCCAATTGGTTCGAAAAGGAGAGAA
GTAGTAGTAATTACGGATCAGATCGAGAGAAGGAGAAGAAGAGAGTTGGTTTGGAGACGC
AGACAGGTTTTTTTTTTCTGCGTGCCCCTTCAACGGCAATTTGGTTCCTTTTTGCGGTCG
TAATCAAAACTAATTAATTCGAGAATGACGAAGATTATATGATCCTGTGCTTCTCACCCA
CCTTAAGGTTATATAGACGCTAGAAAGTTGACACGTGATTTACATAGAATCAAACGCTCA
GGTACTCCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL26TF U 1
AF RR4GL26JQ C 465
BS 1 723 RR4GL26TF
BS 724 726 RR4GL26JQ
BS 727 745 RR4GL26TF
BS 746 747 RR4GL26JQ
BS 748 766 RR4GL26TF
BS 767 1093 RR4GL26JQ

RD RR4GL26TF 766 0 0
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CAAGAAGTGAAGCATGCTCTTGTTTTGCTTTAAGACTTGAGCGGTGACGATAAAACTCCT
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ACATAGGTTGTCATAAACTAGTCCAAAAAAAAAAGATAATACCTGAGTGAGATCTTGAAG
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AGCTTGCATCTGCGCGTTAACTTGTTGAAGTTGACTTAGAAGTAAATCAATCCCAGCTTC
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GTATGAATGCATCTGCTCGTCAAGCTGAGCTTCAATCTTTCTAGCCTGCTCAAAAATCCA
ACAATAAAATCATCTTCATTTATGTACCAAAAGCATCTCTTAATATTACAAATGGATTCA
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ATTCTATCCAGTAGCTTCTTTACAGAAAGTTACCTGTTTGCGTAAAGCATCCCAAGAGCT
CGGAACGTCCATGGCGTCTAATGAATCCGTCAAAATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT
TTT**GATACGTATCGTCTCTTTTT**AATCTGATGAGAAACTTTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4GL26JQ 629 0 0
CCTGCTCAAAAATCCAACAATAAAATCATCTTCATTTATGTACCAAAAGCATCTCTTAAT
ATTACAAATGGATTCAAATCCAGAAGAATGATATCGAATCAGTTCACCAAAACCCAATTC
AAACATCTCATACGCAATTCTATCCAGTAGCTTCTTTACAGAAAGTTACCTGTTTGCGTA
AAGCATCCCAAGAGCTCGGAACGTCCATGGCGTCTAATGAATCCGTCAAAATCTCCTCTC
TCTCTCTCTCTCTTTTTTTTGAATACGTATCGTCTCTTTTTTAAATCTGATGAGAAACTT
TTTTACCCCAGATCAAAGTAACTAAACCTTCGCCAAACCCGAAAGAAGCGATCCAATTGG
TTCGAAAAGGAGAGAAGTAGTAGTAATTACGGATCAGATCGAGAGAAGGAGAAGAAGAGA
GTTGGTTTGGAGACGCAGACAGGTTTTTTTTTTCTGCGTGCCCCTTCAACGGCAATTTGG
TTCCTTTTTGCGGTCGTAATCAAAACTAATTAATTCGAGAATGACGAAGATTATATGATC
CTGTGCTTCTCACCCACCTTAAGGTTATATAGACGCTAGAAAGTTGACACGTGATTTACA
TAGAATCAAACGCTCAGGTACTCCTGCCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL5891Contig1 860 2 2 U
GGATCTTCTTCTTAAAGGCATTGAAACCTAGAGAGAAAGCAAACAAATAACAAAAATAAT
GAGTGTTTTTGGGGCGAACCAAAATAGAACGGATTTGTCGGATTTAGAATACAGCGATGC
GGGAGAATCAGGTTGGACAATGTACTTAGACCATTCTTCTTCTGTTTCATTGCATCATTT
TGATGATGACAATGGAGTGACAAAACAAGAACATGATGAAGATTCTTCAATGGTGTCGGA
TGCATCATCCGGGCCTCCTTATTACTCTGAAGAGGCAGTCCCTGAGGATCCCTTCCAACA
AAACACACAATATTGGTGTAAGAGCAAAATCAAGAACAAGAAGAAAGTTCATGGAGAACA
AGGATATACTGAACGATTTAATTCTTGCCTTGATGACACAGCTTCTTCATTGGCGACTGG
AAAAGAAGTATCAGCACATAAGCAACATCGAGATCAATACCAAAAATTAGATTATTTCTC
CCAAAGCTACTCCACAAGAAGAATAATTAAGGGAAAATATGAATCAGGTTTCCTACAACA
AGCTTTCCCGGTTGAAAAATTTGCATCGGATCATCAAGGTTATGGTGCCAGTAACCAGAT
AAAGAGAAGAGGATAAAAGATGGTATTGGATATTAAGTATTTTATCAGAGAACACCCTTC
CTTGAGCATGTTGGCTATATGTCTTTAAGAAAACCATGTGGGTTTCTCCTTCATTTTTTC
TTGATAATGCCTTACTATGTTGTTGTTTATTTTTACTTTTCTCGATATTGCAACTATCAA
GTTATTTTCCATAATAAATATAAAAAAAATGTAAGTAACGTTTGGAACCAAAAATCGTTG
AATGCAAAAAGATTGGACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H385TF U 1
AF RR4H385JQ C 417
BS 1 704 RR4H385TF
BS 705 860 RR4H385JQ

RD RR4H385TF 704 0 0
GGATCTTCTTCTTAAAGGCATTGAAACCTAGAGAGAAAGCAAACAAATAACAAAAATAAT
GAGTGTTTTTGGGGCGAACCAAAATAGAACGGATTTGTCGGATTTAGAATACAGCGATGC
GGGAGAATCAGGTTGGACAATGTACTTAGACCATTCTTCTTCTGTTTCATTGCATCATTT
TGATGATGACAATGGAGTGACAAAACAAGAACATGATGAAGATTCTTCAATGGTGTCGGA
TGCATCATCCGGGCCTCCTTATTACTCTGAAGAGGCAGTCCCTGAGGATCCCTTCCAACA
AAACACACAATATTGGTGTAAGAGCAAAATCAAGAACAAGAAGAAAGTTCATGGAGAACA
AGGATATACTGAACGATTTAATTCTTGCCTTGATGACACAGCTTCTTCATTGGCGACTGG
AAAAGAAGTATCAGCACATAAGCAACATCGAGATCAATACCAAAAATTAGATTATTTCTC
CCAAAGCTACTCCACAAGAAGAATAATTAAGGGAAAATATGAATCAGGTTTCCTACAACA
AGCTTTCCCGGTTGAAAAATTTGCATCGGATCATCAAGGTTATGGTGCCAGTAACCAGAT
AAAGAGAAGAGGATAAAAGATGGTATTGGATATTAAGTATTTTATCAGAGAACACCCTTC
CTTGAGCATGTTGGCTATATGTCTTTAAGAAAACCATGTGGGTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4H385JQ 444 0 0
CTGGAAAAGAAGTATCAGCACATAAGCAACATTGAGATCAATACCAAAAATTAGATTATT
TCTCCCAAAGCTACTCCACAAGAAGAATAATTAAGGGAAAATATGAATCAGGTTTCCTAC
AACAAGCTTTCCCGGTTGAAAAATTTGCATCGGATCATCAAGGTTATGGTGCCAGTAACC
AGATAAAGAGAAGAGGATAAAAGATGGTATTGGATATTAAGTATTTTATCAGAGAACACC
CTTCCTTGAGCATGTTGGCTATATGTCTTTAAGAAAACCATGTGGGTTTCTCCTTCATTT
TTTCTTGATAATGCCTTACTATGTTGTTGTTTATTTTTACTTTTCTCGATATTGCAACTA
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DS 



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ATTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 720 1 720
DS 

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QA 1 831 1 831
DS 



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BQ
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AF RR4G655TF C 1
AF RR4G655JQ U 35
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RD RR4G655TF 326 0 0
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QA 1 326 1 326
DS 

RD RR4G655JQ 292 0 0
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CGGTTGCGTACTCCGAAGCAAGGGAATCGTAATGACTGACTGACTGCCCACG

QA 1 292 1 292
DS 



AS 1 2

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CAACATCGTACTTCGTACAGCATGCTGTTCCGTGGGCATCGGGTTGCCTGTATACTCCAC
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AGCTTATGGTTCTTTCAGCCTTGTTGAAGTGTTCACGGACAAACTCATCTCTTGGTTTCC
GCTTTACTATCATGTGAAGTTTGCGTTCCTCGTCTGGCTTCAACTTCCCACCGTTGATGG
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AGAGATACGTTTTGTGCGATCAATGATTGTCAAACTCTTGGGATCAGTCAATGAAGTTGC
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BQ
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AF RR4AK30JQ C 1
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QA 1 714 1 714
DS 



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BQ
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A

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DS 



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BQ
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AF RR4AA55JQ C 1
AF RR4AA55TF U 1
BS 1 714 RR4AA55TF

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TTACATTTACATACGTTTTTTGTTTTCTCATTTCATTGAATGTGTTATTTTTAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AA55TF 714 0 0
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DS 



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AGTATGTGGTGACCATCACCAAGCCCCAGGTCGATATGCCAAGGTGAAAGCTGAAAGCAA
TCATCATCAGAACGACTTTAAACACTTTGAAGAAGACTCTGTTTCGTTCCCTTTACCAAG
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TCCTTTAAAGCAGCCTCTTAAACGACCTAAAAACTCAGATCCTTTCCAAGAAGCCATGTT
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CAACACAGAGGAACAGCTTGAAGCAGTGATGGAGATTGATGGATTGGAAGAAGCCAAGCA
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TAATACTAGGATGAGGAAGTTGTTTTTGTTTCGACAGTTTTGGTGGTGGAAGTAAAAACA
ATGTGTGGATTTGCTTTGCTTCGCTTCTCTATGAACCAGTAGCAGAATTTTATTTCTAGG
TAATTTAAAGTCTGGAGTTTGTATTTGGTGCTTGTTGTCTATGGTAAAATGATTTAATCC
CAAGTACCACTACAAAACCAATGTTTAGGTTTGTAGTCAGTAAATGTTTAACTCATAGTA
GATTAATTGGTCCGACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AH15TF U 1
AF RR4AH15JQ C 565
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DS 



AS 0 0

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TTTGCTCCTAACTCTTTCTTCAACCCCCCTTGCCTTCAACAATGAGGAATCAAATTTCAA
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TGACTCACCAGAAGCAAAAGGGTCAAGTGGGCAAAAGATATAGATTTCAGCGAGCTGGAG
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AATGAAATATTGTGATCTAGTTTTTAGGGGCATCCCTGATAGGTGGAGACACTAAACAAT
TTAGCATGGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB74TF U 1
AF RR4DB74JQ C 155
BS 1 247 RR4DB74TF
BS 248 248 RR4DB74JQ
BS 249 418 RR4DB74TF
BS 419 910 RR4DB74JQ

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AAAAGTAACAAAAGCACAATATGTCACAAGTTTCATATGCACCATTGGTGCTTCTGCTGG
GTACGGTCTAAGCTTATCCTTACAACAGCTAGCCTTCAGTAAAGTCCTAAAAAGACAAAC
GTTCTCATAAGTCATGGATTTGATTATCTACGTGAGTGTTGTGGCCAGTTGTGTTAGCGT
GGTGGGGCTTTTTGCTAGTGGAGAGTGGGTAACTTTGAGCAGTGAAATGGATAGTTACAA
GCTTGGAAAGGTATCTTACGTAATGAACCTAGTGTGGACAGCTATTACCTGGCAGGTA

QA 1 418 1 418
DS 

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TTGAGCAGTGAAATGGATAGTTACAAGCTTGGAAAGGTATCTTACGTAATGAACCTAGTG
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TCCTCTCTATTCTCAAATGCTATTGGCGTTTTGGGACTGCCTGTGGTTCCTGTACTGGCT
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TGGGGTTTCATGTCCTATGTCTACCAACACTATCTTGATGATAAAAACTTGAAGAAAAGT
CTTGGAATCCCAGCGACCGGATCCTCTGACTCACCAGAAGCAAAAGGGTCAAGTGGGCAA
AAGATATAGATTTCAGCGAGCTGGAGGCAGCCTACAATGAAGAATAAACATAATATATTT
GTGATGCAATTCAAGTGAAGTCTGAGGGTGATCTTTTTTTCCTATTTGCATCACTGTAAC
AGTTAGTAGATTTGGCTTAAACAAATAATGAAATATTGTGATCTAGTTTTTAGGGGCATC
CCTGATAGGTGGAGACACTAAACAATTTAGCATGGT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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AAATTGAGATCTGAAAAGAGAATCTTAAGAGAGGAGAAAATTTTGAAAAAAAATGGGAGC
TGCGAAGAATAATAATAACTGGGCAATATTGGAAGATGAAGGTAGTGGCAACGACGCCTC
CTCCTCCTCCCGGATCCCGTATTCTTCCTTAATCGTAGACACATCTTTGCCTCTCCCCCT
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CGATTCACTCTTCTCCGTCGAGAGAGTGTCTGGAGGCATCACCAACCTATTGCTGAAGGT
TTCTGTGAAAGAAGAAGAAGACAAAGAAGTCTCAATAACGGTGCGGCTGTATGGGCCTAA
CACTGACTATGTTATCAATCGTCAGAGAGAGCTACAGGCTATCAAATATCTCTCTGCTGC
CGGGTTTGGGGCCAAGTTGCTTGGTGGATTTGGAAATGGGATGGTGCAATCATTTATCAA
TGCAAGAACCTTAGCGCCATCAGACATGAGGCAGCCAAAGATTGCTGCTGAAATTGCCAA
AGAGCTTGGAAAGTTTCATAAAGTTAACATACCTGGTCCCAAAGAACCTCAGCTCTGGGT
TGATATCTTGAAGTTCTTTGAAAAAGCCTCTACTCTTGCGTTCGAGGAACCTGATAAGCA
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CCTGATGCTAAATGAGGAAGAAGAGAAACTGTACTTGATTGATTTCGAGTATGGATCGTA
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GTATAAATTAGCGTCTCATTTGTACTGGGCGGTATGGGCAATCATACAGGCAAGGATGTC
TCCAATTGAGTTTGATTATTTGGGTTACTTCTTTTTGCGGTACAATGAATACAAGAAGCA
GAAGCCTCTTACCTTTTCACTTGTTACATCTTACCTGTCCGCGTCTGTGTAGCTTGCTTG
ACCAAAATGGAAATTTGATTGTTTTTTTTGTCGTGATCAATTCTTGTAAAAGTTGTTACG
TGTTGCTTTGTATGAATGAACTTGTTTTAAGG


BQ
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AF RR4GE53TF U 1
AF RR4GE53JQ C 620
BS 1 684 RR4GE53TF
BS 685 685 RR4GE53JQ
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BS 748 750 RR4GE53JQ
BS 751 771 RR4GE53TF
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RD RR4GE53TF 771 0 0
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AAATTGAGATCTGAAAAGAGAATCTTAAGAGAGGAGAAAATTTTGAAAAAAAATGGGAGC
TGCGAAGAATAATAATAACTGGGCAATATTGGAAGATGAAGGTAGTGGCAACGACGCCTC
CTCCTCCTCCCGGATCCCGTATTCTTCCTTAATCGTAGACACATCTTTGCCTCTCCCCCT
CATGATTCCTCGCATCATAGAGTTATGTAAAGATCTGTTCGACAATTGGAGAGAGCTTGA
CGATTCACTCTTCTCCGTCGAGAGAGTGTCTGGAGGCATCACCAACCTATTGCTGAAGGT
TTCTGTGAAAGAAGAAGAAGACAAAGAAGTCTCAATAACGGTGCGGCTGTATGGGCCTAA
CACTGACTATGTTATCAATCGTCAGAGAGAGCTACAGGCTATCAAATATCTCTCTGCTGC
CGGGTTTGGGGCCAAGTTGCTTGGTGGATTTGGAAATGGGATGGTGCAATCATTTATCAA
TGCAAGAACCTTAGCGCCATCAGACATGAGGCAGCCAAAGATTGCTGCTGAAATTGCCAA
AGAGCTTGGAAAGTTTCATAAAGTTAACATACCTGGTCCCAAAGAACCTCAGCTCTGGGT
TGATATCTTGAAGTTCTTTGAAAA*GCCTCTACTCTTGCGTTCGAG*AACCTGATAAGCA
GA*GCTCTTCGAGACTATTTCGTTTGAG**ACTGTATAAAGAAATTGTTGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4GE53JQ 733 0 0
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GAAAAAGCCTCTACTCTTGCGTTCGAGGAACCTGATAAGCAGAAGCTCTTCGAGACTATT
TCGTTTGAAGAACTGTATAAAGAAATTGTTGAGCTAAGGGAATTCACAAGCTTACTTAAC
GCACCTGTGGTGTTTGCTCATAATGATTTACTCTCTGGAAACCTGATGCTAAATGAGGAA
GAAGAGAAACTGTACTTGATTGATTTCGAGTATGGATCGTACAACTACAGAGGCTTCGAC
ATTGGAAATCACTTCAATGAATACGCAGGATACGACTGTGATTACAGCTTGTACCCAACT
AAAGAAGAACAATATCATTTCATCAAGCATTACTTACAGCCAGATAAACCAGACGAGGTC
AGCAATGGTGAAGTGGAGTCAGTCTTCATAGAGACAGACGCGTATAAATTAGCGTCTCAT
TTGTACTGGGCGGTATGGGCAATCATACAGGCAAGGATGTCTCCAATTGAGTTTGATTAT
TTGGGTTACTTCTTTTTGCGGTACAATGAATACAAGAAGCAGAAGCCTCTTACCTTTTCA
CTTGTTACATCTTACCTGTCCGCGTCTGTGTAGCTTGCTTGACCAAAATGGAAATTTGAT
TGTTTTTTTTGTCGTGATCAATTCTTGTAAAAGTTGTTACGTGTTGCTTTGTATGAATGA
ACTTGTTTTAAGG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL5901Contig1 919 2 2 U
GGAATCTCATCTATCTATCATCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTCTTCGTATTCTTCAC
TAACACTCTTCTTCTTCTTATTCGCTTCTGTCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCA
ACATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAGATGCTCTCCC
AGACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCA
ACGACGCAATGTCCTTTTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCC
TCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAG
CGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAA
ACGTAACCGTTAACAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCC
TTGACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATA
TTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATCATCTT
CACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTGTTGACAACGATGAGAAA
ACAGTGTGCAAGAATGAAAAAGATCAGATGAGCTTTTTGAGACAGAGAAAATAAAAGAAG
ATTGGCAGGGAAAAAGAGTAAGTTTTTTCACCCATAACACTAAAGAACGAGCAAACTTGG
ATCCCAAGAAGAAATAATGTGAATGCAATAAGTATGGAGAAAGTTGTAAAACTCATAAAC
TCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGAAACGATCTTTATTAAGTTGTGAAAGATAATAACTGG
TGCTTGGGCTTTTCTGACC


BQ
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TAACACTCTTCTTCTTCTTATTCGCTTCTGTCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCA
ACATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAGATGCTCTCCC
AGACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCA
ACGACGCAATGTCCTTTTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCC
TCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAG
CGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAA
ACGTAACCGTTAACAATAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCC
TTGACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATA
TTAGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATCATCTT
CACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTGTTGACAACGATGAGAAA
ACAGTGTGCAAGA

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GCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTAGCACTTCTATACCTATAATGGAT
CCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATCATCTTCACCACTTCCTGCACAAGCTCCTAAC
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GATGAGCTTTTTGAGACAGAGAAAATAAAAGAAGATTGGCAGGGAAAAAGAGTAAGTTTT
TTCACCCATAACACTAAAGAACGAGCAAACTTGGATCCCAAGAAGAAATAATGTGAATGC
AATAAGTATGGAGAAAGTTGTAAAACTCATAAACTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGAAA
CGATCTTTATTAAGTTGTGAAAGATAATAACTGGTGCTTGGGCTTTTCTGACC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

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CTATTATAATGGGAGCGAGTCGGAAACTACAAGGCGAGATAGATCGGGTGCTGAAGAAGG
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AC


BQ
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20 20 

AF RR4AV17JQ C 1
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TCTGAAAGTGAAAACCCTAACTCTTTTCACCAATCAAATCAGAGGAAACCTCTGGCTGAG
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AC

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QA 1 287 1 287
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTCAACGAAGATGAGTTGAGAGATGCAGTGCTTCTGGTCTTTGCTAACAAGCAAGATCTT
CCAAACGCCATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAACTTGGCCTTCACTCTCTCCGTCAA
CGTCACTGGTACATACAGAGCACATGTGCTACCTCAGGAGAAGGGCTCTATGAAGGACTT
GATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGGCTTAGGAGAGCAATTTGTGGGAGAGTCTT
GTCTTCTTGGTCTCTGTTTAGTTCTTTCAGTCTCAACACTTTTTTATCATTTCGTACTCT
GTTCTTCGCTCTCTTAAGTTTTTTTTTCTCTCTCTTAGCAAAGTATTTGATTGTTTTTTT
ATCATTTTGTCTTGATGTGTCTTTTTTAACTTTTTTTATCTAATAAATACTACATTTCG


BQ
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AF RR4FV22TF U 1
AF RR4FV22JQ C 180
BS 1 462 RR4FV22TF
BS 463 539 RR4FV22JQ

RD RR4FV22TF 462 0 0
GAGGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACGCAAGGGCTCATCTTC
GTGGTGGACAGCAATGACCGTGACCGTGTTGTCGAAGCTAGAGACGAGCTTCACAGAATG
CTCAACGAAGATGAGTTGAGAGATGCAGTGCTTCTGGTCTTTGCTAACAAGCAAGATCTT
CCAAACGCCATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAACTTGGCCTTCACTCTCTCCGTCAA
CGTCACTGGTACATACAGAGCACATGTGCTACCTCAGGAGAAGGGCTCTATGAAGGACTT
GATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGGCTTAGGAGAGCAATTTGTGGGAGAGTCTT
GTCTTCTTGGTCTCTGTTTAGTTCTTTCAGTCTCAACACTTTTTTATCATTTCGTACTCT
GTTCTTCGCTCTCTTAAGTTTTTTTTTCTCTCTCTTAGCAAA

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4FV22JQ 360 0 0
TCCAAACGCCATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAACTTGGCCTTCACTCTTTCCGTCA
ACGTCACTGGTACATACAGAGCACATGTGCTACCTCAGGAGAAGGGCTCTATGAAGGACT
TGATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGGCTTAGGAGAGCAATTTGTGGGAGAGTCT
TGTCTTCTTGGTCTCTGTTTAGTTCTTTCAGTCTCAACACTTTTTTATCATTTCGTACTC
TGTTCTTCGCTCTCTTAAGTTTTTTTTTCTCTCTCTTAGCAAAGTATTTGATTGTTTTTT
TATCATTTTGTCTTGATGTGTCTTTTTTAACTTTTTTTATCTAATAAATACTACATTTCG

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 2

CO CL5905Contig1 439 2 2 U
GTTATCAAGGCCAGGAAGCTGTCTAGTGCACTCTCTGCAGCTAGCTCAGCTTGTGACCAT
ATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCCGAGGGCACATTTGTTTCAATGGGTGTGTACTCA
GACGGATCATACAACGTTCCATTGGACTTATCTATTCTTTCCCTGTAACCTGCCGTAACG
GAGAGTGGTCTATTGTCCAAGGTTTACCGATCGATGAAGTGTCGAGGAAGAAGATGGATT
TGACAGCAGAGGAGTTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCATGCCTCTCTTAGACCG
GTTTTTATCCCTGAAAGATGATAACGGAGCTTTGTTTATTAAAAAAAAATACTTTGAATA
ACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTACTTGTGTTTTCCAGTATTTTGAATCTTTGATCTCTTT
CAGTCTGGGCTTTTGGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AU61JQ C 1
AF RR4AU61TF U 228
BS 1 227 RR4AU61JQ
BS 228 439 RR4AU61TF

RD RR4AU61JQ 439 0 0
GTTATCAAGGCCAGGAAGCTGTCTAGTGCACTCTCTGCAGCTAGCTCAGCTTGTGACCAT
ATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCCGAGGGCACATTTGTTTCAATGGGTGTGTACTCA
GACGGATCATACAACGTTCCATTGGACTTATCTATTCTTTCCCTGTAACCTGCCGTAACG
GAGAGTGGTCTATTGTCCAAGGTTTACCGATCGATGAAGTGTCGAGGAAGAAGATGGATT
TGACAGCAGAGGAGTTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCATGCCTCTCTTAGACCG
GTTTTTATCCCTGAAAGATGATAACGGAGCTTTGTTTATTAAAAAAAAATACTTTGAATA
ACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTACTTGTGTTTTCCAGTATTTTGAATCTTTGATCTCTTT
CAGTCTGGGCTTTTGGCCG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4AU61TF 212 0 0
AAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAGTTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCATGC
CTCTCTTAGACCGGTTTTTATCCCTGAAAGATGATAACGGAGCTTTGTTTATTAAAAAAA
AATACTTTGAATAACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTACTTGTGTTTTCCAGTATTTTGAAT
CTTTGATCTCTTTCAGTCTGGGCTTTTGGCCG

QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 2

CO CL5906Contig1 1258 2 12 U
TGGGGAACGCCTCCACAAATGCTAACGCCATTGATGGAAGGACCAGATCCAGACATGCAA
GATGAAAGAGCCAAAAAGGAGAGCTCATGGGAAGCCATCAGAGAATGGTTTAAGGTTCAC
AAAGGTATTTCTGGCAACATGTCTTCTCCCTCCGTACAACCACATTGCAACAGTTATGAC
GTCGCGGCCAAGGGACAAGATGTGAGGCTCTTGCTCGGCGTCTTAGGCTGTCCTCTTGCT
CCAATCTCCGTTGTCGGCTCCGATCTACTACCCGATGACACTCTTCTTGGCTCTTTCCAA
ATCAAGAATGTCCCATTTGAGACGTCGACGGCGCATTACATAATACAACAATACTTAGCG
GCAACGGGATGTCTAAAGCGAGCTAAGGCGGCCAAAAACATGTACGCAACGGGGATAATG
AAAATGAGTTGCTGCGAGACGGAGATCGCCGCTGGAAAAAGTGTTAAGACACTCGGTGGC
GGCGGAAATGGTCGGAGCGGAGACAGTGGTTGCTTTGTACTGTGGCAGATGCACCCTGGG
ATGTGGTCTCTGGAGCTTGTTCTCGGTGGAACTAAACTCATATCCGGCTCCGATGGTAAA
ACCGTGTGGCGCCATACGCCATGGCTAGGTACTCACGCCGCTAAAGGCCCTCAACGTCCA
CTTCGTCGACTCATCCAGGGTTTGGATCCAAAAACAACAGCAGGCCTATTCGCAAAGGCC
CAATGCTTAGGCGAGAGAAGGATCGGAGACGACGACTGTTTCGTACTCAAAGTATCCGCC
GATCGCGACTCACTGATCGAGCGCAACGACGCCGGAGCTCCGGCGGAGGTTATACGCCAC
GCGCTGTACGGATACTTCTGCCAGAAGAGCGGTCTGCTGATCTATCTGGAGGATTCGCAC
CTCACCAGAGTCACGACGATCTCGCCGGAAGACGAGGCGGTTTACTGGGAGACGACGATC
GGAAGCAGCATCGGAGATTACCGCGACGTCGACGGAGTCGCCGTGGCTCACTTCGGACGT
GCCGTCGCGACGGTGTTTAGATTCGGAGAGACGTCGTTGCAGTATAGTAGGACGAGGATG
GAGGAGGTGTGGAGGATAGACGACGTCGTATTCGATGTGCCTGGACTTTCGTTGGATTCG
TTTATTCCTCGCCGATATATTTGAAGATGATAACAATAATTCTCCTGTTTACAGTAATGT
GAATTCCCGATAAAATGTGAGACTAATTTAATAACTAAAGACTATTTATTGGCGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY91TF U 1
AF RR4EY91JQ C 435
BS 1 646 RR4EY91TF
BS 647 647 RR4EY91JQ
BS 648 693 RR4EY91TF
BS 694 694 RR4EY91JQ
BS 695 703 RR4EY91TF
BS 704 704 RR4EY91JQ
BS 705 717 RR4EY91TF
BS 718 718 RR4EY91JQ
BS 719 730 RR4EY91TF
BS 731 731 RR4EY91JQ
BS 732 742 RR4EY91TF
BS 743 1258 RR4EY91JQ

RD RR4EY91TF 742 0 0
TGGGGAACGCCTCCACAAATGCTAACGCCATTGATGGAAGGACCAGATCCAGACATGCAA
GATGAAAGAGCCAAAAAGGAGAGCTCATGGGAAGCCATCAGAGAATGGTTTAAGGTTCAC
AAAGGTATTTCTGGCAACATGTCTTCTCCCTCCGTACAACCACATTGCAACAGTTATGAC
GTCGCGGCCAAGGGACAAGATGTGAGGCTCTTGCTCGGCGTCTTAGGCTGTCCTCTTGCT
CCAATCTCCGTTGTCGGCTCCGATCTACTACCCGATGACACTCTTCTTGGCTCTTTCCAA
ATCAAGAATGTCCCATTTGAGACGTCGACGGCGCATTACATAATACAACAATACTTAGCG
GCAACGGGATGTCTAAAGCGAGCTAAGGCGGCCAAAAACATGTACGCAACGGGGATAATG
AAAATGAGTTGCTGCGAGACGGAGATCGCCGCTGGAAAAAGTGTTAAGACACTCGGTGGC
GGCGGAAATGGTCGGAGCGGAGACAGTGGTTGCTTTGTACTGTGGCAGATGCACCCTGGG
ATGTGGTCTCTGGAGCTTGTTCTCGGTGGAACTAAACTCATATCCGGCTCCGATGGTAAA
ACCGTGTGGCGCCATACGCCATGGCTAGGTACTCACGCCGCTAAAG*CCCTCAACGTCCA
CTTCGTCGACTCATCCAGGGTTTGGATCCAAAA*CAACAGCAG*CCTATTCGCAAAG*CC
CAATGCTTAG*CGAGAGAAGGA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4EY91JQ 824 0 0
CGAGACGGAGATCGCCGCTGGAAAAAGTGTTAAGACACTCGGTGGCGGCGGAAATGGTCG
GAGCGGAGACAGTGGTTGCTTTGTACTGTGGCAGATGCACCCTGGGATGTGGTCTCTGGA
GCTTGTTCTCGGTGGAACTAAACTCATATCCGGCTCCGATGGTAAAACCGTGTGGCGCCA
TACGCCATGGCTAGGTACTCACGCCGCTAAAGGCCCTCAACGTCCACTTCGTCGACTCAT
CCAGGGTTTGGATCCAAAAACAACAGCAGGCCTATTCGCAAAGGCCCAATGCTTAGGCGA
GAGAAGGATCGGAGACGACGACTGTTTCGTACTCAAAGTATCCGCCGATCGCGACTCACT
GATCGAGCGCAACGACGCCGGAGCTCCGGCGGAGGTTATACGCCACGCGCTGTACGGATA
CTTCTGCCAGAAGAGCGGTCTGCTGATCTATCTGGAGGATTCGCACCTCACCAGAGTCAC
GACGATCTCGCCGGAAGACGAGGCGGTTTACTGGGAGACGACGATCGGAAGCAGCATCGG
AGATTACCGCGACGTCGACGGAGTCGCCGTGGCTCACTTCGGACGTGCCGTCGCGACGGT
GTTTAGATTCGGAGAGACGTCGTTGCAGTATAGTAGGACGAGGATGGAGGAGGTGTGGAG
GATAGACGACGTCGTATTCGATGTGCCTGGACTTTCGTTGGATTCGTTTATTCCTCGCCG
ATATATTTGAAGATGATAACAATAATTCTCCTGTTTACAGTAATGTGAATTCCCGATAAA
ATGTGAGACTAATTTAATAACTAAAGACTATTTATTGGCGGGTT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL5907Contig1 793 2 2 U
GAGTGAGCCGGGGAACCGACTCGACCGGTTCGTTGGTTTTCGGGCGTGAGGCTTTGCCAG
TTGGTGCCTCGTGGGTCCCGCTCGTCCGTAACCCGCGCGCGCCGAGCTTCTACTACGTTG
GTCTCAAGGGCCTCGAAGTCGGCGGCGTCAGAATCCCTCTACCGGACGATGTTTTCGACT
TAACCGAAACCGGCGACGGCGGGGTGGTTATGGACACCGGAACCGCTGTGACTAGACTCC
CCACGGCGGCTTACGCCGCTTTCCGGGACGGGTTCAAGTCGCAGACGGCGAACTTGCCGC
GAGCTTCCGGCGTATCGATATTCGACACGTGTTACGACCTGTCCGGGTTTGTTTCGGTCC
GAGTCCCGACCGTGTCGTTCTATTTCACGGAAGGTCCGGTTTTGACTCTACCGGCGAGGA
ATTTCTTGATGCCGGTGGATGATTCGGGGACGTACTGTTTCGCGTTCGCGGCGTCTCCGA
CGGGTTTGTCGATAATAGGGAACATACAACAAGAAGGGATCCAAGTATCTTTCGACGGAG
CCAATGGCTTTGTTGGGTTTGGTCCCAATGTTTGCTAGCGTTTAACAAAAAAATAAAAGA
TATTTACGTTTTTTGTTTGCTAGTAAGTAAAAAACTTTTGTCTCAATATGTATCTGTCTT
TTATTTATTAGCTTTGGTTTTGAGTATTTAATAAGTGGTAATTAGTATAGAGAGTACTGA
AATGTATATGATTTGACCAAAATTGTCTTTTGGATTTTTGATTGAGGAATCTTTAATGAT
ATGAGTTTTACCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A782TF U 1
AF RR4A782JQ C 33
BS 1 762 RR4A782TF
BS 763 793 RR4A782JQ

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TTGGTGCCTCGTGGGTCCCGCTCGTCCGTAACCCGCGCGCGCCGAGCTTCTACTACGTTG
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CCACGGCGGCTTACGCCGCTTTCCGGGACGGGTTCAAGTCGCAGACGGCGAACTTGCCGC
GAGCTTCCGGCGTATCGATATTCGACACGTGTTACGACCTGTCCGGGTTTGTTTCGGTCC
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CGGGTTTGTCGATAATAGGGAACATACAACAAGAAGGGATCCAAGTATCTTTCGACGGAG
CCAATGGCTTTGTTGGGTTTGGTCCCAATGTTTGCTAGCGTTTAACAAAAAAATAAAAGA
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TTATTTATTAGCTTTGGTTTTGAGTATTTAATAAGTGGTAATTAGTATAGAGAGTACTGA
AATGTATATGATTTGACCAAAATTGTCTTTTGGATTTTTGAT

QA 1 762 1 762
DS 

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CCGCGCGCGCCGAGCTTCTACTACGTTGGTCTCAAGGGCCTCGAAGTCGGCGGCGTCAGA
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GACACCGGAACCGCTGTGACTAGACTCCCCACGGCGGCTTACGCCGCTTTCCGGGACGGG
TTCAAGTCGCAGACGGCGAACTTGCCGCGAGCTTCCGGCGTATCGATATTCGACACGTGT
TACGACCTGTCCGGGTTTGTTTCGGTCCGAGTCCCGACCGTGTCGTTCTATTTCACGGAA
GGTCCGGTTTTGACTCTACCGGCGAGGAATTTCTTGATGCCGGTGGATGATTCGGGGACG
TACTGTTTCGCGTTCGCGGCGTCTCCGACGGGTTTGTCGATAATAGGGAACATACAACAA
GAAGGGATCCAAGTATCTTTCGACGGAGCCAATGGCTTTGTTGGGTTTGGTCCCAATGTT
TGCTAGCGTTTAACAAAAAAATAAAAGATATTTACGTTTTTTGTTTGCTAGTAAGTAAAA
AACTTTTGTCTCAATATGTATCTGTCTTTTATTTATTAGCTTTGGTTTTGAGTATTTAAT
AAGTGGTAATTAGTATAGAGAGTACTGAAATGTATATGATTTGACCAAAATTGTCTTTTG
GATTTTTGATTGAGGAATCTTTAATGATATGAGTTTTACCG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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GGTGGTTTTCTCTTCCCTTCTTCCTCTTCCGGCAGAGACCTCACCGACGATATTCCATAG
AAAGTAAACGCCTTTCATATCTGTAACGTCTCACCAATCATTTAATTCGTTCTTTATTTT
GAGTTTACCCTTAATTAATCCACTCTGCTCACTTAAAGATTTCTATCTACCTCTTCGTTT
CCACTATAACCGCCTGGAGCTCCAGCTATTAATATCGGACCTTCCTAGCATGCACAGTCC
AAATCAAACGATATCCAGAAGCATACAATTTCCTAGCAGCAACAGATTCCGGTGGCAAAT
TCATGCACTCTCCTTGCCGATTTGAGAGCCGGCCGATGAAATATTCTGGTCCTCCAATTG
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CTTCTTCGGTTAATGGGATTTTATGATACTGATTCACTTATTAGATGGAGTTAGAGATTT
ACAACAAAATTATTGATTCCATAGCTTTTGGCTATTTCTGCCCCGTTCAACTACCTAAGT
TATTTATGCATACAAGTGCTCTGATGGATTGAGATTTATTACAGGAAAAATGAGGAATTT
AATTACATGACACGGCATACAAATAAGGCATTATTGAAGTGGGGACAATCATTGCAAGCT
ACACGATGAAGCGAAAAGCAAGCCCTTTGAATAGGAGATGCGCATGATATGTGAGGAGTC
AAATGGGAGGACGAAGGGTGGTTAAAGAAATGATGTGCTAAGGTTCCCGTAAACCTTAAA
ATTGATATTATAGCCAAGGTTGATGCAACATACTTACTTGGCTATAATATAGCAACCTCG
AGATTGCTCTATGGAAGAATTTGAGGTTTCCAAGTTCTTGAGATGTTAAAATCCATTATG
TATTACAATCCATGTAGCAATATTAGCAGCCAAGTGGTCCCTTCAAGTCCTTAGTAACAA
TGCATGGCTCTTCGCTCGCAAATGCCCTCAAGATGTAGAAAAAGACTAGCCTTTTCTTAT
GGGAAGAGAACAGTTCGAGTCTGTGATGTGTACGATCATGGAAGGCAAAGAGAGGGTCGA
TGACTTTCGATCGTGCCTCTCTGCACGTGTCGCTCCACATTATTTTTTTTTGTATGGTTT
GCATCATGTGAAATGGGCCATGTGTTGGTGTCTGAATATCTATTGAGCTCTTAGGTTCTT
TTGCTTAAAGATCCAGATGTTAATAGGGTTTCTGCTATTTTGATATTGGAAATACCAAGC
AGAAAACAAACGTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU93TF U 1
AF RR4DU93JQ C 491
BS 1 694 RR4DU93TF
BS 695 695 RR4DU93JQ
BS 696 715 RR4DU93TF
BS 716 716 RR4DU93JQ
BS 717 737 RR4DU93TF
BS 738 738 RR4DU93JQ
BS 739 762 RR4DU93TF
BS 763 763 RR4DU93JQ
BS 764 776 RR4DU93TF
BS 777 1276 RR4DU93JQ

RD RR4DU93TF 776 0 0
GGTGGTTTTCTCTTCCCTTCTTCCTCTTCCGGCAGAGACCTCACCGACGATATTCCATAG
AAAGTAAACGCCTTTCATATCTGTAACGTCTCACCAATCATTTAATTCGTTCTTTATTTT
GAGTTTACCCTTAATTAATCCACTCTGCTCACTTAAAGATTTCTATCTACCTCTTCGTTT
CCACTATAACCGCCTGGAGCTCCAGCTATTAATATCGGACCTTCCTAGCATGCACAGTCC
AAATCAAACGATATCCAGAAGCATACAATTTCCTAGCAGCAACAGATTCCGGTGGCAAAT
TCATGCACTCTCCTTGCCGATTTGAGAGCCGGCCGATGAAATATTCTGGTCCTCCAATTG
GCGCAGACAATTGTAGTATGCTTTATGCGTATAGTCTGAAACTAAGAAACTGCGACGGAG
CTTCTTCGGTTAATGGGATTTTATGATACTGATTCACTTATTAGATGGAGTTAGAGATTT
ACAACAAAATTATTGATTCCATAGCTTTTGGCTATTTCTGCCCCGTTCAACTACCTAAGT
TATTTATGCATACAAGTGCTCTGATGGATTGAGATTTATTACAGGAAAAATGAGGAATTT
AATTACATGACACGGCATACAAATAAGGCATTATTGAAGTGGGGACAATCATTGCAAGCT
ACACGATGAAGCGAAAAGCAAGCCCTTTGAATAG*AGATGCGCATGATATGTGAG*AGTC
AAATGGGAGGACGAAGG*TGGTTAAAGAAATGATGTGCTAAG*TTCCCGTAAACCT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4DU93JQ 786 0 0
TATTGATTCCATAGCTTTTGGCTATTTCTGCCCCGTTCAACTAC*TAAGTTATTTATGCA
TACAAGTGCTCTGATGGATTGAGATTTATTACAGGAAAAATGAGGAATTTAATTACATGA
CACGGCATACAAATAAGGCATTATTGAAGTGGGGACAATCATTGCAAGCTACACGATGAA
GCGAAAAGCAAGCCCTTTGAATAGGAGATGCGCATGATATGTGAGGAGTCAAATGGGAGG
ACGAAGGGTGGTTAAAGAAATGATGTGCTAAGGTTCCCGTAAACCTTAAAATTGATATTA
TAGCCAAGGTTGATGCAACATACTTACTTGGCTATAATATAGCAACCTCGAGATTGCTCT
ATGGAAGAATTTGAGGTTTCCAAGTTCTTGAGATGTTAAAATCCATTATGTATTACAATC
CATGTAGCAATATTAGCAGCCAAGTGGTCCCTTCAAGTCCTTAGTAACAATGCATGGCTC
TTCGCTCGCAAATGCCCTCAAGATGTAGAAAAAGACTAGCCTTTTCTTATGGGAAGAGAA
CAGTTCGAGTCTGTGATGTGTACGATCATGGAAGGCAAAGAGAGGGTCGATGACTTTCGA
TCGTGCCTCTCTGCACGTGTCGCTCCACATTATTTTTTTTTGTATGGTTTGCATCATGTG
AAATGGGCCATGTGTTGGTGTCTGAATATCTATTGAGCTCTTAGGTTCTTTTGCTTAAAG
ATCCAGATGTTAATAGGGTTTCTGCTATTTTGATATTGGAAATACCAAGCAGAAAACAAA
CGTACC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5910Contig1 948 2 10 U
GAGGGATGATATTGGCAATATCTCCACGTCTCAGATGAAAAGTGATTCGAAAAAGACAGA
GCTACTTATTGAGCCTCGGTTTCCATTGTTTGGTGGGTGGAAAACGTTTTTCACGATAGG
TTATGGTTTGCCACTTAGTGACTTTTTGTTTGCATCGGAAGGGAAACGTTTCCTCGACAT
CCCTTTGGCTCCCCTATGCTTGACCTTGTCACTGAAAAACTTATTGTACAGGTTGTCTTA
CCTGAGGGTTCAAAAGATATATCAGTTACCACTCCATTCGCTGTCAAGCAGTCTCACGAG
ATCAAATATTCACACTTAGATATAGCTGGTAGACCAGTTGTTGTGCTCGAAAAGAACAAC
GTTGTCCCAGATCACAATCAGAATATCCAGGTCTACTATAAGTTCAGCAACATCAATCTG
CTGAGTGAGCCATTGATGTTAATCACTGGATTTTTTGTTTTGTTCATCACTTGCATTATT
TACACGCGGGCTGACTTCTCCATCTCTAAGTCCTCTGCTGCATATTTGGCGAAACTTCAA
TGGGATGAGGTCCTAGCAACAGTCCAGGAAGTTCAAAACATCATCCAAAAATGCTTAGCT
GCACATGATAAGCTGTAAGCATCGCTGCGTGATCTATCAAGAACCGGTGACATTCAAACC
TGCAAAGCAGCTCGCAAATCCACCGACAGTTCGCTGAAAGATCTCTCGAAAGAACTGAGA
CCTCTTCTGGCTTCCTTACAATCTTTCCCATCAGCCTCTCAAATATCTCCAAAGGTTGAA
GAGCTAGTTGCGAAAGAGAGAGAACTTCAAGAGAAGTTGATGGCCAAACACACCACTGTT
GTTGAAGGGTACGAGAAGAAATCCTCAGGCCGTGATATCGAAAACCGAATCGCTTCCCAG
CAGCAAAAGATCATAGCATTGAGGCAAGAAGTTGAAGATCTTCTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE92TF U 1
AF RR4DE92JQ C 554
BS 1 713 RR4DE92TF
BS 714 714 RR4DE92JQ
BS 715 740 RR4DE92TF
BS 741 741 RR4DE92JQ
BS 742 774 RR4DE92TF
BS 775 775 RR4DE92JQ
BS 776 779 RR4DE92TF
BS 780 780 RR4DE92JQ
BS 781 793 RR4DE92TF
BS 794 948 RR4DE92JQ

RD RR4DE92TF 793 0 0
GAGGGATGATATTGGCAATATCTCCACGTCTCAGATGAAAAGTGATTCGAAAAAGACAGA
GCTACTTATTGAGCCTCGGTTTCCATTGTTTGGTGGGTGGAAAACGTTTTTCACGATAGG
TTATGGTTTGCCACTTAGTGACTTTTTGTTTGCATCGGAAGGGAAACGTTTCCTCGACAT
CCCTTTGGCTCCCCTATGCTTGACCTTGTCACTGAAAAACTTATTGTACAGGTTGTCTTA
CCTGAGGGTTCAAAAGATATATCAGTTACCACTCCATTCGCTGTCAAGCAGTCTCACGAG
ATCAAATATTCACACTTAGATATAGCTGGTAGACCAGTTGTTGTGCTCGAAAAGAACAAC
GTTGTCCCAGATCACAATCAGAATATCCAGGTCTACTATAAGTTCAGCAACATCAATCTG
CTGAGTGAGCCATTGATGTTAATCACTGGATTTTTTGTTTTGTTCATCACTTGCATTATT
TACACGCGGGCTGACTTCTCCATCTCTAAGTCCTCTGCTGCATATTTGGCGAAACTTCAA
TGGGATGAGGTCCTAGCAACAGTCCAGGAAGTTCAAAACATCATCCAAAAATGCTTAGCT
GCACATGATAAGCTGTAAGCATCGCTGCGTGATCTATCAAGAACCGGTGACATTCAAACC
TGCAAAGCAGCTCGCAAATCCACCGACAGTTCGCTGAAAGATCTCTCGAAAGA*CTGAGA
CCTCTTCTGGCTTCCTTACA*TCTTTCCCATCAGCCTCTCAAATATCTCCAAAG*TTGA*
GAGCTAGTTGCGA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4DE92JQ 395 0 0
TAGCAACAGTCCAGGAAGTTCAAAACATCATCCAAAAATGCTTAGCTGCACATGATAAGC
TGTAAGCATCGCTGCGTGATCTATCAAGAACCGGTGACATTCAAACCTGCAAAGCAGCTC
GCAAATCCACCGACAGTTCGCTGAAAGATCTCTCGAAAGAACTGAGACCTCTTCTGGCTT
CCTTACAATCTTTCCCATCAGCCTCTCAAATATCTCCAAAGGTTGAAGAGCTAGTTGCGA
AAGAGAGAGAACTTCAAGAGAAGTTGATGGCCAAACACACCACTGTTGTTGAAGGGTACG
AGAAGAAATCCTCAGGCCGTGATATCGAAAACCGAATCGCTTCCCAGCAGCAAAAGATCA
TAGCATTGAGGCAAGAAGTTGAAGATCTTCTAGAG

QA 1 395 1 395
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5912Contig1 609 2 1 U
GAGATGGTGTAATGCTGGAAGCACCTGATCAAGACTTCGAGTTCCTTAGGAACACTTCTT
TCAACTTGTTACAAGGCTGCAGGATGCGTAACACCAAGACGGAATATGTGTCGTGTCCGT
CTTGTGGAAGAACTCTGTTTGACTTGCAAGAAATCAGTGCTGAGATCAGAGAAAAGACTT
CACATTTGCCTGGCGTTTCGATTGCAATAATGGGTTGCATTGTGAATGGACCTGGAGAAA
TGGCTGATGCTGATTTCGGTTATGTAGGCGGTTCTCCCGGGAAAATCGATCTTTACGTTG
GAAAGACGGTGGTGAAGCGTGGGATTGCCATGTCGGGGGCAACTGATGCTCTGATCGGTC
TGATCAAAGAACATGGTCGTTGGGTGGACCCACCTGTGGCTGATGAGTAGATTTATTGTT
GGCAAAGATGGATAAAAATGGATTTACTTTCTGAAATTTGAGAGGGAGAGAAGAAGATGA
TATGTGTATGTATGTATGTATATATACATATACCTATTTATTGTGCAATGCGTCATATTC
AACAATGTCCAAATCTCTAAACTGATAATAGTTCTGAGTTTTTAAATAATACAACAGAAG
CAAGTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D221TF U 1
AF RR4D221JQ C 347
BS 1 609 RR4D221TF

RD RR4D221TF 609 0 0
GAGATGGTGTAATGCTGGAAGCACCTGATCAAGACTTCGAGTTCCTTAGGAACACTTCTT
TCAACTTGTTACAAGGCTGCAGGATGCGTAACACCAAGACGGAATATGTGTCGTGTCCGT
CTTGTGGAAGAACTCTGTTTGACTTGCAAGAAATCAGTGCTGAGATCAGAGAAAAGACTT
CACATTTGCCTGGCGTTTCGATTGCAATAATGGGTTGCATTGTGAATGGACCTGGAGAAA
TGGCTGATGCTGATTTCGGTTATGTAGGCGGTTCTCCCGGGAAAATCGATCTTTACGTTG
GAAAGACGGTGGTGAAGCGTGGGATTGCCATGTCGGGGGCAACTGATGCTCTGATCGGTC
TGATCAAAGAACATGGTCGTTGGGTGGACCCACCTGTGGCTGATGAGTAGATTTATTGTT
GGCAAAGATGGATAAAAATGGATTTACTTTCTGAAATTTGAGAGGGAGAGAAGAAGATGA
TATGTGTATGTATGTATGTATATATACATATACCTATTTATTGTGCAATGCGTCATATTC
AACAATGTCCAAATCTCTAAACTGATAATAGTTCTGAGTTTTTAAATAATACAACAGAAG
CAAGTTAGC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4D221JQ 263 0 0
TGCTCTGATCGGTCTGATCAAAGAACATGGTCGTTGGGTGGACCCACCTGTGGCTGATGA
GTAGATTTATTGTTGGCAAAGATGGATAAAAATGGATTTACTTTCTGAAATTTGAGAGGG
AGAGAAGAAGATGATATGTGTATGTATGTATGTATATATACATATACCTATTTATTGTGC
AATGCGTCATATTCAACAATGTCCAAATCTCTAAACTGATAATAGTTCTGAGTTTTTAAA
TAATACAACAGAAGCAAGTTAGC

QA 1 263 1 263
DS 



AS 1 2

CO CL5913Contig1 990 2 4 U
GGACACACAGAGAACGAAACAATGAAGAACTACGCTAAAACCACATCACGAAATTACAAG
TTTGCTATTTTAGTCACAACTCTTTTTTTCCTGATCCTAACCGTGTCCAAACCTGTCGCC
TCTCAGAACTGCGGCTGCGCCTCTGGCTTATGCTGCAGCAGAGCTGGTTACTTTGGAACA
ACCGATGATTACTGCGGGGAGGGCTGCAGAGAAGGACCTTGCAAGAACAGCGGTCCCGGA
GATCCAACTGTTTCACTTGAAGAAACTGTGACACCTGAGTTCTTTAACTCTATACTAAGC
CAAGCAACAGAGAGTAACTGCCAAGGTAGAGGATTCTACACCCACGAAACCTTTATGGCT
GCAGCTAATGCCTATCAAGCTTCGGTGCTTCCATCTCGAAACGTGAAATCGCTGCCTTCT
TTGCTCACGTCGCTCAGGAAACGGGGTTCCTGTGCCACATTGAGGAAGTCGATGGACCAG
CGAAAGCCGCACGTGGAGAATACTGTGACGCATCAAAGACAGAGTTCCCATGTGCACAAG
GAAAGGGTTACTATGGTCGTGGTGCGATCCAGCTCTCTTGGAACTACAACTATGGTCCCT
GTGGCAGAGACCTGAACGAGGGAGACTTATTGGCTACACCTGAGAAAGTGGCTCAAGACC
AGGTTCTTGCCTTCAAAGCCTCTTTCTGGTACTGGACTACTAATGTCCGCTCGAGTTTTA
AATCGGGCTTTGGCGCGACCATCAGGGCTGTGAATAGTAGGGAGTGTAGCGGAGGAGATT
CTACAGAGAAAGCTGTCAACAGGGTTAGGTACTTCCAAGACTATTGTCGCAAGCTTGGAG
TTGAACCTGGAGAAAACCTTTCTTGTTAAGGTTTCTCTCTATATATCCATCTGGAACAGC
CAAGGTTGGCAATATAAGAATAAGAGACCACAGAGGATAAAAGTAACATACTAGTAGTAT
ATATAGCAATGTGTTTTTTTGGTAAAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H017TF U 1
AF RR4H017JQ C 279
BS 1 437 RR4H017TF
BS 438 438 RR4H017JQ
BS 439 540 RR4H017TF
BS 541 990 RR4H017JQ

RD RR4H017TF 545 0 0
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TCTCAGAACTGCGGCTGCGCCTCTGGCTTATGCTGCAGCAGAGCTGGTTACTTTGGAACA
ACCGATGATTACTGCGGGGAGGGCTGCAGAGAAGGACCTTGCAAGAACAGCGGTCCCGGA
GATCCAACTGTTTCACTTGAAGAAACTGTGACACCTGAGTTCTTTAACTCTATACTAAGC
CAAGCAACAGAGAGTAACTGCCAAGGTAGAGGATTCTACACCCACGAAACCTTTATGGCT
GCAGCTAATGCCTATCAAGCTTCGGTGCTTCCATCTCGAAACGTGAAATCGCTGCCTTCT
TTGCTCACGTCGCTCAG*AAACGGGGTTCCTGTGCCACATTGAGGAAGTCGATGGACCAG
CGAAAGCCGCACGTGGAGAATACTGTGACGCATCAAAGACAGAGTTCCCATGTGCACAAG
AAAGG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4H017JQ 712 0 0
GTTCTTTAACTCTATACTAAGCCAAGCAACAGAGAGTAACTGCCAAGGTAGAGGATTCTA
CACCCACGAAACCTTTATGGCTGCAGCTAATGCCTATCAAGCTTCGGTGCTTCCATCTCG
AAACGTGAAATCGCTGCCTTCTTTGCTCACGTCGCTCAGGAAACGGGGTTCCTGTGCCAC
ATTGAGGAAGTCGATGGACCAGCGAAAGCCGCACGTGGAGAATACTGTGACGCATCAAAG
ACAGAGTTCCCATGTGCACAAGGAAAGGGTTACTATGGTCGTGGTGCGATCCAGCTCTCT
TGGAACTACAACTATGGTCCCTGTGGCAGAGACCTGAACGAGGGAGACTTATTGGCTACA
CCTGAGAAAGTGGCTCAAGACCAGGTTCTTGCCTTCAAAGCCTCTTTCTGGTACTGGACT
ACTAATGTCCGCTCGAGTTTTAAATCGGGCTTTGGCGCGACCATCAGGGCTGTGAATAGT
AGGGAGTGTAGCGGAGGAGATTCTACAGAGAAAGCTGTCAACAGGGTTAGGTACTTCCAA
GACTATTGTCGCAAGCTTGGAGTTGAACCTGGAGAAAACCTTTCTTGTTAAGGTTTCTCT
CTATATATCCATCTGGAACAGCCAAGGTTGGCAATATAAGAATAAGAGACCACAGAGGAT
AAAAGTAACATACTAGTAGTATATATAGCAATGTGTTTTTTTGGTAAAACAG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL5914Contig1 1354 2 2 U
GGAACAGACACAACAAGAGAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACAGAGTTGT
GTTCAGAGAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCGACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTCC
CCCACCAGCTAGTGTTGCAAGAGTACTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTG
ACGACCCCGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAA
GGTACGTTGTAATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAG
GATCCACCGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGTAGTGG
AAGCTTCAAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTG
TCTATGTCTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGTGACTTGTACTTAGCCAAAGGGC
TTGGTCTTAGCCCTGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGCG
TTGCTGGTCTCCGTGTAGCCAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGC
TTGCCACGTCAGAGACGACCATCATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTACG
ATCTTGTTGGGGTCGCTTTATTTGGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCGGGTCTGATC
CGGACCCGGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGAGCTTCACACCGCAATTCAAAATTTCCTGC
CAGACACGGAGAAGACAATAGATGGGAGGCTAACAGAAGCAGGAATAAACTTCACGCTGT
CAAGAGAGCTTCCACAGATAATAGAAGACAATGTGGAGAGTTTCTGCAAGAAGTTGATAG
GAAAAGCAGGACTGGTTCATAAAGACTATAACCAGATGTTTTGGGCGGTTCATCCAGGTG
GACCAGCGATATTGAACCGAATGGAGAAGCGGCTTAACCTGTCGCCGGAGAAGCTGAGTC
CAAGCAGAAGAGCTCTCATGGACTATGGCAACGCAAGTAGCAACTCGATTGTTTATGTGT
TGGAGTATATGTTGGAGGAGAGCAGGAAAGCAAGGAACATGAGTGGAAGTGAAAATGAGT
GGGGTCTGATTCTGGCTTTTGGACCTGGTGTTACATTTGAAGGCATCGTTGCAAGGAACC
TTGATGTTTGAGCTAAAAGTGGGGGTTTTGGTTGTACCTTGAGACTCAAGAAACAATCAC
CTGTTGCTCTCTATAGTTATTTCAAATTTTAAGCAGAGATAAATGCATATAATAAGATAT
GAATCTAAAAGAGATGAATTTTATTTGCGATGCC


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AF RR4AE37TF U 1
AF RR4AE37JQ C 512
BS 1 770 RR4AE37TF
BS 771 1354 RR4AE37JQ

RD RR4AE37TF 770 0 0
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GTTCAGAGAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCGACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTCC
CCCACCAGCTAGTGTTGCAAGAGTACTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTG
ACGACCCCGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAA
GGTACGTTGTAATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAG
GATCCACCGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGTAGTGG
AAGCTTCAAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTG
TCTATGTCTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGTGACTTGTACTTAGCCAAAGGGC
TTGGTCTTAGCCCTGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGCG
TTGCTGGTCTCCGTGTAGCCAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGC
TTGCCACGTCAGAGACGACCATCATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTACG
ATCTTGTTGGGGTCGCTTTATTTGGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCGGGTCTGATC
CGGACCCGGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGAGCTTCACACCGCAATTCAA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4AE37JQ 843 0 0
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CGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCTTGCCACGTCAGAGACGACCATCATTGGTTT
CAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTACGATCTTGTTGGGGTCGCTTTATTTGGTGATGG
AGCCGGAGCTATGATCATCGGGTCTGATCCGGACCCGGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGA
GCTTCACACCGCAATTCAAAATTTCCTGCCAGACACGGAGAAGACAATAGATGGGAGGCT
AACAGAAGCAGGAATAAACTTCACGCTGTCAAGAGAGCTTCCACAGATAATAGAAGACAA
TGTGGAGAGTTTCTGCAAGAAGTTGATAGGAAAAGCAGGACTGGTTCATAAAGACTATAA
CCAGATGTTTTGGGCGGTTCATCCAGGTGGACCAGCGATATTGAACCGAATGGAGAAGCG
GCTTAACCTGTCGCCGGAGAAGCTGAGTCCAAGCAGAAGAGCTCTCATGGACTATGGCAA
CGCAAGTAGCAACTCGATTGTTTATGTGTTGGAGTATATGTTGGAGGAGAGCAGGAAAGC
AAGGAACATGAGTGGAAGTGAAAATGAGTGGGGTCTGATTCTGGCTTTTGGACCTGGTGT
TACATTTGAAGGCATCGTTGCAAGGAACCTTGATGTTTGAGCTAAAAGTGGGGGTTTTGG
TTGTACCTTGAGACTCAAGAAACAATCACCTGTTGCTCTCTATAGTTATTTCAAATTTTA
AGCAGAGATAAATGCATATAATAAGATATGAATCTAAAAGAGATGAATTTTATTTGCGAT
GCC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5916Contig1 740 2 2 U
GGACACAGACTTTCAAAATTCATGAAGACGAATCAGCGATCTGATTTGGATTTTTGTTGT
TGAGCAAATCCGTCGAATAGATGTCCTGAAACCTAGTTTGGACCCCAGCAGCTCAAGCAC
ATGACAGTCCTGAGCGATTCCTCAGCCTTCTTGGTATTACCGGAGGATGAGGATACGGTG
GAGGCTGAGGATGAAAGATTTTTGGTCTGAGAAATGGATCTGATGTTATTCCGGAGATGT
TGATTCATCGAACGGAGAACGTAGTTCCACCGGCAAACGCCTAACTGATCTTTTAGTGTC
TCCACAACTCCAATACTTGCTGCCACCGTCCATGTCTTGCTTGTAGAATTCATCTCGAGA
TCGACTGAATGATTCAGGAGAAGACTTCCTCTTTTCTTTTTGAATGCTTTGTTTTGAGTT
TTTGGATTTAGCTATGAAGTTTGTGAATTTGCAGATGAAAGTTTGTGAGTGACGGAATGG
TTGATTATAAAGAAGAAATAAAACACAAACAAAACTGCCGCTAAAGCTGAGTGATGATAA
AAACCAGATGCGTTAAGCTGCTGGAGTTGCGACAAATTGGATAAGGGGCAAACTTGAAAG
TTTCCCACGGTTTCAGCGTTTTTCCGCAACTGGTTTTGGAGTTGGAACCACGAGTGCTTG
CCCACATTCAAACTCAATCAGCTGTTTCTTTTTAGGAAAAGCAAATAAACTAAAATATTC
GAAGAAAATGAAATACGTAT


BQ
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AF RR4C291TF U 1
AF RR4C291JQ C 20
BS 1 284 RR4C291TF
BS 285 740 RR4C291JQ

RD RR4C291TF 284 0 0
GGACACAGACTTTCAAAATTCATGAAGACGAATCAGCGATCTGATTTGGATTTTTGTTGT
TGAGCAAATCCGTCGAATAGATGTCCTGAAACCTAGTTTGGACCCCAGCAGCTCAAGCAC
ATGACAGTCCTGAGCGATTCCTCAGCCTTCTTGGTATTACCGGAGGATGAGGATACGGTG
GAGGCTGAGGATGAAAGATTTTTGGTCTGAGAAATGGATCTGATGTTATTCCGGAGATGT
TGATTCATCGAACGGAGAACGTAGTTCCACCGGCAAACGCCTAA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4C291JQ 721 0 0
TCATGAAGACGAATCAGCGATCTGATTTGGATTTTTGTTGTTGAGCAAATCCGTCGAATA
GATGTC*TGAAACCTAGTTTGGACCCCAGCAGCTCAAGCACATGACAGTCCTGAGCGATT
CCTCAGCCTTCTTGGTATTACCGGAGGATGAGGATACGGTGGAGGCTGAGGATGAAAGAT
TTTTGGTCTGAGAAATGGATCTGATGTTATTCCGGAGATGTTGATTCATCGAACGGAGAA
CGTAGTTCCACCGGCAAACGCCTAACTGATCTTTTAGTGTCTCCACAACTCCAATACTTG
CTGCCACCGTCCATGTCTTGCTTGTAGAATTCATCTCGAGATCGACTGAATGATTCAGGA
GAAGACTTCCTCTTTTCTTTTTGAATGCTTTGTTTTGAGTTTTTGGATTTAGCTATGAAG
TTTGTGAATTTGCAGATGAAAGTTTGTGAGTGACGGAATGGTTGATTATAAAGAAGAAAT
AAAACACAAACAAAACTGCCGCTAAAGCTGAGTGATGATAAAAACCAGATGCGTTAAGCT
GCTGGAGTTGCGACAAATTGGATAAGGGGCAAACTTGAAAGTTTCCCACGGTTTCAGCGT
TTTTCCGCAACTGGTTTTGGAGTTGGAACCACGAGTGCTTGCCCACATTCAAACTCAATC
AGCTGTTTCTTTTTAGGAAAAGCAAATAAACTAAAATATTCGAAGAAAATGAAATACGTA
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5917Contig1 1324 2 2 U
GGGTTGGAAGGTCTTGTCTATCCAGAAAGCTTGTCCTTAAGCTACGCGGACATGTCTGTA
CCTGAAAGGCTTAAAGGGATGCAACAGAATCAGCAAATAGAAGTTTTGTCTCAGAGCAGT
AATGATTCACCCGAACTTCTTCAGATACTTCAGTTCCATGGAAGCAACAATGACGAGTTG
TTGCAGAGTACCTTCAGCCATTTTCAAATGCTTGAATCTGGTTTTGGAACAAAATATAAC
ATGGATTTTGGTCCTTCACATGAAGCTATGGATGGCTGCATTTCAAGAACAAGTAGTTGC
CAGATAGACCCAGCGGATACAATGGGGGTTATTTTGAAGAACAGTGTAGAAAGCAGAGCT
ATTTTCTTGAAAAACAAGAGAAAATCAGAGGTCAAGACAAGGGAAGAGGAAAAGACAGAG
AAGAAGATCAAAGTAGAGGCTGAGACAGAGTCAAACATAAATAACAAGGAAGCATCTTCA
GACACTTCAAAGGAGACATCAAAGGGAGCTTCAGGGATCCAGAAATTGGATTATATCCAC
GTGAGAGCTCGTCGAGGACAAGCCACAGACAGACACAGTTTATCAGAAAGGGCAAGAAGA
GAAAAGATCAGCAAGAAGATGAAATATTTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACACAATC
ACTGGAAAAGCTTGTGTGCTTGATGAGATCATCAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGACAA
GTTGAGTTCTTGTCGATGAAACTTGCAGTCCTAAACCCAGAACACGAGCTTGCTGTGGAA
GATTTATCTGTAAATCAGTTTCAGGCTTACTTTACAAATTTTCCAGTAGTAATTGCTTCA
AAACCATCAGTAATGGTTGATTTACCATTGTTTCCACTAGACCAGCAAGGATCTCTAGAT
CTATCAGTGATAAATCCGAACCAAACATCTATTGACGCTCCATGTGCAAGCTGGGAAACT
CAGTCACATAGTCTCTTTGCTTCAGTACTAAGATAAGATCTATTGAAGCAACCAAGTTGA
CATCATCAAAATCAGAACAATATATGTCCACTATATATGCTGATCAAAGTGACAATTTCG
CTGAGAACAAAAATTCAGCTTCTGCATTATCCTTTGATCCTTTTTCTGATATTTAAACCA
GAAGAACTTGAGTATCAATTTAATGATCATGTATCCATCACTCTTTGTATATAGATCATA
TTCTGTTTTAATGTGTAAGATAAGATATAGAGAGAAAGAGGGTAAATAAATACTATGTTT
TAAAGTTTTTATAGATGTGTGATATGTCATGTGTAGAAGAAGAAAAAGAAAAGTCTTGTG
ATGC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4DT11TF U 1
AF RR4DT11JQ C 484
BS 1 746 RR4DT11TF
BS 747 1324 RR4DT11JQ

RD RR4DT11TF 746 0 0
GGGTTGGAAGGTCTTGTCTATCCAGAAAGCTTGTCCTTAAGCTACGCGGACATGTCTGTA
CCTGAAAGGCTTAAAGGGATGCAACAGAATCAGCAAATAGAAGTTTTGTCTCAGAGCAGT
AATGATTCACCCGAACTTCTTCAGATACTTCAGTTCCATGGAAGCAACAATGACGAGTTG
TTGCAGAGTACCTTCAGCCATTTTCAAATGCTTGAATCTGGTTTTGGAACAAAATATAAC
ATGGATTTTGGTCCTTCACATGAAGCTATGGATGGCTGCATTTCAAGAACAAGTAGTTGC
CAGATAGACCCAGCGGATACAATGGGGGTTATTTTGAAGAACAGTGTAGAAAGCAGAGCT
ATTTTCTTGAAAAACAAGAGAAAATCAGAGGTCAAGACAAGGGAAGAGGAAAAGACAGAG
AAGAAGATCAAAGTAGAGGCTGAGACAGAGTCAAACATAAATAACAAGGAAGCATCTTCA
GACACTTCAAAGGAGACATCAAAGGGAGCTTCAGGGATCCAGAAATTGGATTATATCCAC
GTGAGAGCTCGTCGAGGACAAGCCACAGACAGACACAGTTTATCAGAAAGGGCAAGAAGA
GAAAAGATCAGCAAGAAGATGAAATATTTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACACAATC
ACTGGAAAAGCTTGTGTGCTTGATGAGATCATCAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGACAA
GTTGAGTTCTTGTCGATGAAACTTGC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4DT11JQ 841 0 0
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AGAGCTCGTCGAGGACAAGCCACAGACAGACACAGTTTATCAGAAAGGGCAAGAAGAGAA
AAGATCAGCAAGAAGATGAAATATTTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACACAATCACT
GGAAAAGCTTGTGTGCTTGATGAGATCATCAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGACAAGTT
GAGTTCTTGTCGATGAAACTTGCAGTCCTAAACCCAGAACACGAGCTTGCTGTGGAAGAT
TTATCTGTAAATCAGTTTCAGGCTTACTTTACAAATTTTCCAGTAGTAATTGCTTCAAAA
CCATCAGTAATGGTTGATTTACCATTGTTTCCACTAGACCAGCAAGGATCTCTAGATCTA
TCAGTGATAAATCCGAACCAAACATCTATTGACGCTCCATGTGCAAGCTGGGAAACTCAG
TCACATAGTCTCTTTGCTTCAGTACTAAGATAAGATCTATTGAAGCAACCAAGTTGACAT
CATCAAAATCAGAACAATATATGTCCACTATATATGCTGATCAAAGTGACAATTTCGCTG
AGAACAAAAATTCAGCTTCTGCATTATCCTTTGATCCTTTTTCTGATATTTAAACCAGAA
GAACTTGAGTATCAATTTAATGATCATGTATCCATCACTCTTTGTATATAGATCATATTC
TGTTTTAATGTGTAAGATAAGATATAGAGAGAAAGAGGGTAAATAAATACTATGTTTTAA
AGTTTTTATAGATGTGTGATATGTCATGTGTAGAAGAAGAAAAAGAAAAGTCTTGTGATG
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL5918Contig1 1074 2 2 U
CAACGAATGCTTGCAGATCTCCGGAAATCTTTTGGACGAAGGGAAAATTAGATCCATAGT
TGATGAGGTAAAGCAAGTTATGACAGCTAGCTCTAGCAGGAAGCGAGAGAGGGGAGAGAG
AGCCGATGCTGAAGACTTTGACGCTGAAGAGGGAGAGCTTATTAAAGAAGAAAATGAGTA
AGAGGAAGAAATTTTTGATCAGTCGGTGAAATATTGGGAACACTGGTTAAGACATTCAAG
GCCTCGTTTCTACCTTTCTTCGGTGAGTTATCCTCTTACTTAACTCCTATGTGGGGAAGG
GATAAAACCGCTGAAGAGAGAAGGATTGCGATATGCATTTTTGATGATGTTGCAGAGCAA
TGCCGTGATGCTGCCTTCAAATATTATGATACTTATCTTCCATTCGTACTGGAAGCTTGC
AATGACGAGAGCCCAGAAGTTCGACAGGCTGCCGTTTATGGGCTTGGTGTTTGTGCTGAG
TTTGGCATATGATAACGCTGTATCAGCTGTGGGAAAGATCTGCCTATTTCACCGGGACAG
TATCGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTTTAAGTAATGATGT
TATTGAAGCGAAAGTAGTTCATGATCAGCTCTGTTCAATGGTTGAGAGGCAAGATGTGGA
CCTTTTAGGCCCCAATAACCACTATCTTCCTAAAATCATAACAGTTTTCGCTGAGGTCCT
TACAGGGAAAGATGTGGTGACACAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATACTAAGGCA
ACTTCAGCAAACACTGCCACCATCGGCATTGGGGTCAATATGGTCAACACTGAAGCCCGA
GCAGCAGCACGCTCTCCAATCCATGCTTTCCTCCTAAGAGGCACACCAGTCTGGTCTCTC
TGTTCATCTACACTGTTCTTGTGAGCTTTATTTTTCCACCACAAAAGCGTCGTCAGTTTT
GCATTCATGTGTCTTGCATTATTTTTTGGTTTGCTTTATTCACCATTTGTTGTTGGGAGG
GATGATGAGTGGGTCTAAATCCTTCATAAGTAATGAAAATGAAATTTCTATCTC


BQ
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AF RR4EJ19TF U 1
AF RR4EJ19JQ C 388
BS 1 651 RR4EJ19TF
BS 652 1074 RR4EJ19JQ

RD RR4EJ19TF 651 0 0
CAACGAATGCTTGCAGATCTCCGGAAATCTTTTGGACGAAGGGAAAATTAGATCCATAGT
TGATGAGGTAAAGCAAGTTATGACAGCTAGCTCTAGCAGGAAGCGAGAGAGGGGAGAGAG
AGCCGATGCTGAAGACTTTGACGCTGAAGAGGGAGAGCTTATTAAAGAAGAAAATGAGTA
AGAGGAAGAAATTTTTGATCAGTCGGTGAAATATTGGGAACACTGGTTAAGACATTCAAG
GCCTCGTTTCTACCTTTCTTCGGTGAGTTATCCTCTTACTTAACTCCTATGTGGGGAAGG
GATAAAACCGCTGAAGAGAGAAGGATTGCGATATGCATTTTTGATGATGTTGCAGAGCAA
TGCCGTGATGCTGCCTTCAAATATTATGATACTTATCTTCCATTCGTACTGGAAGCTTGC
AATGACGAGAGCCCAGAAGTTCGACAGGCTGCCGTTTATGGGCTTGGTGTTTGTGCTGAG
TTTGGCATATGATAACGCTGTATCAGCTGTGGGAAAGATCTGCCTATTTCACCGGGACAG
TATCGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTTTAAGTAATGATGT
TATTGAAGCGAAAGTAGTTCATGATCAGCTCTGTTCAATGGTTGAGAGGCA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4EJ19JQ 687 0 0
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GCTGCCGTTTATGGGCTTGGTGTTTGTGCTGAGTTTGGCATATGATAACGCTGTATCAGC
TGTGGGAAAGATCTGCCTATTTCACCGGGACAGTATCGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGC
GTGGTTGAACTGTTTGCCTTTAAGTAATGATGTTATTGAAGCGAAAGTAGTTCATGATCA
GCTCTGTTCAATGGTTGAGAGGCAAGATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCACTATCT
TCCTAAAATCATAACAGTTTTCGCTGAGGTCCTTACAGGGAAAGATGTGGTGACACAAGA
GACGGCAGGTCGTATGGTTAATATACTAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACCATCGGC
ATTGGGGTCAATATGGTCAACACTGAAGCCCGAGCAGCAGCACGCTCTCCAATCCATGCT
TTCCTCCTAAGAGGCACACCAGTCTGGTCTCTCTGTTCATCTACACTGTTCTTGTGAGCT
TTATTTTTCCACCACAAAAGCGTCGTCAGTTTTGCATTCATGTGTCTTGCATTATTTTTT
GGTTTGCTTTATTCACCATTTGTTGTTGGGAGGGATGATGAGTGGGTCTAAATCCTTCAT
AAGTAATGAAAATGAAATTTCTATCTC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL5919Contig1 920 2 2 U
GGGGGTTCGTAAATAAACACAGGAATCTTCCAAGAAAGCGACGAAACGATAGAGAGAAAG
AGTATAGAGAAGCAAACAATGGAGGTGATAACCGACGAGGTAAACGCCACGCCGACGGAA
ACTCTTGGTCGAAACGATCCGGAGGAGGAGGCGCTCGTGACCGCAGAGGAGATGAAGATT
GAAAGGGATAACAATGGTGGAGAGAGGAAGAGGGAGAGCGAGACGCCTCCAGAGGATGAT
TGTTGCCCGATCTGCTTCGGCTCCTTTAACGTTCCGTGTCGAGGGGATTGTGGCCATTGG
TATTGCGGAAGTTGCATCTTGCAGTACTGGAACTACGCTGCAGTATCTACGCCTTGCAAG
TGTCCCATGTGTGTTCGTCACATCACTAAGCTGACACCGGAAGCGTCCTTGCTACAGCGC
CAAGAGCCGGAGGTGAAGGAGGTTCTTGCTAAGATCCGTAGGTATAACCGTCTCTTTGTT
GGAGGTTTTACTGTTTTTGTTCAGAGGGTGAAGGAGCTGCCTTTGCTAATGAAGAGAATG
GTATGGCACATAATGGATCCGGATACGAACAGCCTGTATTTTAGCGAAGTTCGCATCTTT
GCAATGCTGATGAGTACCCTTTACACTGCCTCCGAGTTTAACTTCATCCCAACGGGAGGG
TTCAGAATAGTAACTGTGTTCGAGTACGGTGCTATAGCAATGATCTTGATTTTGCGCTTG
GTGGGGGTATACAGGAGGAGACGTCTTGCTCAGCGGGTTAGGCATGTTGCAGCTGCAGAA
GTTGAACCAGAATAAAGAACATACGAACGAATGTATAAACATGTGAAGAAGCAAACGTTT
GTTCATTGTGGATAGGTTTGGTAGATCATAGAAAACCATGAGTCTTGTGTAGTTTTACTG
TCCATATGCAAATCATATTT


BQ
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AF RR4FP11TF U 1
AF RR4FP11JQ C 391
BS 1 658 RR4FP11TF
BS 659 920 RR4FP11JQ

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AGTATAGAGAAGCAAACAATGGAGGTGATAACCGACGAGGTAAACGCCACGCCGACGGAA
ACTCTTGGTCGAAACGATCCGGAGGAGGAGGCGCTCGTGACCGCAGAGGAGATGAAGATT
GAAAGGGATAACAATGGTGGAGAGAGGAAGAGGGAGAGCGAGACGCCTCCAGAGGATGAT
TGTTGCCCGATCTGCTTCGGCTCCTTTAACGTTCCGTGTCGAGGGGATTGTGGCCATTGG
TATTGCGGAAGTTGCATCTTGCAGTACTGGAACTACGCTGCAGTATCTACGCCTTGCAAG
TGTCCCATGTGTGTTCGTCACATCACTAAGCTGACACCGGAAGCGTCCTTGCTACAGCGC
CAAGAGCCGGAGGTGAAGGAGGTTCTTGCTAAGATCCGTAGGTATAACCGTCTCTTTGTT
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GTATGGCACATAATGGATCCGGATACGAACAGCCTGTATTTTAGCGAAGTTCGCATCTTT
GCAATGCTGATGAGTACCCTTTACACTGCCTCCGAGTTTAACTTCATCCCAACGGGAG

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DS 

RD RR4FP11JQ 530 0 0
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AAGATCCGTAGGTATAACCGTCTCTTTGTTGGAGGTTTTACTGTTTTTGTTCAGAGGGTG
AAGGAGCTGCCTTTGCTAATGAAGAGAATGGTATGGCACATAATGGATCCGGATACGAAC
AGCCTGTATTTTAGCGAAGTTCGCATTTTTGCAATGCTGATGAGTACCCTTTACACTGCC
TCCGAGTTTAACTTCATCCCAACGGGAGGGTTCAGAATAGTAACTGTGTTCGAGTACGGT
GCTATAGCAATGATCTTGATTTTGCGCTTGGTGGGGGTATACAGGAGGAGACGTCTTGCT
CAGCGGGTTAGGCATGTTGCAGCTGCAGAAGTTGAACCAGAATAAAGAACATACGAACGA
ATGTATAAACATGTGAAGAAGCAAACGTTTGTTCATTGTGGATAGGTTTGGTAGATCATA
GAAAACCATGAGTCTTGTGTAGTTTTACTGTCCATATGCAAATCATATTT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL5920Contig1 1176 2 2 U
GGACTGTTTTCTCTGTGTGTTCTTGGGTTAGGTCATAAACCCATAGTGGAGCGTTCTCTC
AATCTTTGTGCAAGAAAATCTTGATAAAATTGGCGTTTTAACATACTAGGAGGGTGCCAA
TAAATCACTGGACTTGGTCTTGTGTCTTTTTCATCTTCAAGACGACTATGGGTTTAGATA
TGGAAGATGATGGTGGTAGCGATGGGGGAGAAGGAAATGGTGGGTTTTCACCTAATTCTA
GCTTTGGGGCATTCCCTGAGACGGCCATGGATTTGGATTTCATGGATGAGCTCTTGTTTG
ATGGATGTTGGCTAGAGACAACAGATGGTAAGAGCTTGAAGCAGACAGAAGAAGCTGCTT
CAGCTTCTACCGCCATGAATGACAATAGCCCTTTCCTCTGCTTTGGAGAGAACCCATCTC
AAGATGATGAAACAGAGAGAATGAATCAAGAACCTTTTAACCAGGTTGCAACAGGTTCTG
ATCAAGCTGAAAAGTTTCTACTAGATGAAGCTGAGGTGGGAAGGAGTTGGTGGATTGCCC
CAAGAACAAGTGAAGACCCTTCTTCATCAGTGAAGGAGAGGCTATTAAGAGCTATAAGCG
GTCTTGAGGAGGCGGTGCCTGATAAAGACTTCTTGGTGCAGATATGGGTGCCATTTCAGC
AGGAAGGGAAGAACTTTCTAACCATTTTGGCGCAACCACATTTATTCAACCAAAAATACT
CAAGCCTTGCAAAATACGGACATGTTTCAGAGACTTACAACTTCCCAGCTGATGAGGGTT
CCACAGAAGGAGGTCTTCCCGGTCGTGTTTTCCTGCAGAAGTTTCCTGAGTGGACTCCTG
ATGTACGTTTCTTTAGAAGTGATGAATATCCGCGCATCAAAGAAGCACAAAAGTGTGATG
TTCGTGGCTCGCTTGCCCTTCCTGTGTTTGAAAGATGTAGTGGGACTTGTTTGGGTGTTG
TTGAGGTCGTCACAACAACTCAGAAGATGAATTACCGGCCAGAACTTGAGAATATCTGTA
AAGCTCTTGAGGTTTTACTCTTCCTCATAATTAAACATTGTCTTGAATGTCTATTTCACC
GGAGGGATTTCTCTTTGTGCGCTTCTTCTATCTTTCTGCATTTTCTTTGGTTCTAATTCT
ATATGACAAGAGTGAGAAGCTCACAGATGTTGCTAT


BQ
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AF RR4DX20TF U 1
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AATCTTTGTGCAAGAAAATCTTGATAAAATTGGCGTTTTAACATACTAGGAGGGTGCCAA
TAAATCACTGGACTTGGTCTTGTGTCTTTTTCATCTTCAAGACGACTATGGGTTTAGATA
TGGAAGATGATGGTGGTAGCGATGGGGGAGAAGGAAATGGTGGGTTTTCACCTAATTCTA
GCTTTGGGGCATTCCCTGAGACGGCCATGGATTTGGATTTCATGGATGAGCTCTTGTTTG
ATGGATGTTGGCTAGAGACAACAGATGGTAAGAGCTTGAAGCAGACAGAAGAAGCTGCTT
CAGCTTCTACCGCCATGAATGACAATAGCCCTTTCCTCTGCTTTGGAGAGAACCCATCTC
AAGATGATGAAACAGAGAGAATGAATCAAGAACCTTTTAACCAGGTTGCAACAGGTTCTG
ATCAAGCTGAAAAGTTTCTACTAGATGAAGCTGAGGTGGGAAGGAGTTGGTGGATTGCCC
CAAGAACAAGTGAAGACCCTTCTTCATCAGTGAAGGAGAGGCTATTAAGAGCTATAAGCG
GTCTTGAGGAGGCGGTGCCTGATAAAGACTTCTTGGTGCAGATATGGGTGCCATTTCAGC
AG
AAG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DX20JQ 782 0 0
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TTTTAACCAGGTTGCAACAGGTTCTGATCAAGCTGAAAAGTTTCTACTAGATGAAGCTGA
GGTGGGAAGGAGTTGGTGGATTGCCCCAAGAACAAGTGAAGACCCTTCTTCATCAGTGAA
GGAGAGGCTATTAAGAGCTATAAGCGGTCTTGAGGAGGCGGTGCCTGATAAGGACTTCTT
GGTGCAGATATGGGTGCCATTTCAGCAGGAAGGGAAGAACTTTCTAACCATTTTGGCGCA
ACCACATTTATTCAACCAAAAATACTCAAGCCTTGCAAAATACGGACATGTTTCAGAGAC
TTACAACTTCCCAGCTGATGAGGGTTCCACAGAAGGAGGTCTTCCCGGTCGTGTTTTCCT
GCAGAAGTTTCCTGAGTGGACTCCTGATGTACGTTTCTTTAGAAGTGATGAATATCCGCG
CATCAAAGAAGCACAAAAGTGTGATGTTCGTGGCTCGCTTGCCCTTCCTGTGTTTGAAAG
ATGTAGTGGGACTTGTTTGGGTGTTGTTGAGGTCGTCACAACAACTCAGAAGATGAATTA
CCGGCCAGAACTTGAGAATATCTGTAAAGCTCTTGAGGTTTTACTCTTCCTCATAATTAA
ACATTGTCTTGAATGTCTATTTCACCGGAGGGATTTCTCTTTGTGCGCTTCTTCTATCTT
TCTGCATTTTCTTTGGTTCTAATTCTATATGACAAGAGTGAGAAGCTCACAGATGTTGCT
AT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5921Contig1 1216 2 2 U
GGGCAGATCTTGGGGAGGGGATTGTGGCATCATCTTCGTGGCTGCGTGTGACGACGTTGC
CACGAAGAAGATGGATTACCGGAACAAGCTTGTTCTTGCTCCCATGGTCCGTGTGGGAAC
GCTCTCTTTCCGAATGTTGGCGGCGGAGTACGGCGCAGATATTACATACGGAGAAGAGAT
TATCGATCATAAGCTTCTCAAATGCCAACGCCGTTTCAACATTGCTTCTGGAACAACAGA
GTTTGTGGAGAAAGGGAGTGAGAATGTTGTCTTTAGCACATGTGCTGAAGAAAGAGAAAG
GGTTGTTTTTCAAATGGGGACTTCTGATGCTGTTAGGGCTCTCAAAGCTGCTGAGATTGT
GTGCAATGATGTTGCAGCTGTTGATATTAATATGGGTTGCCCCAAGGCTTTCTCTATTCA
AGGAGGAATGGGTGCTGCTCTCTTAAGTAAACCCGAGCTCATTCACGATATTCTGGCAAC
ACTTAAGAGGAACTTAGACGTCCCCGTTACTTGCAAGATTCGTCTATTGAAATCACCTGC
AGATACTGTTGAATTGGCTAGGAGGATCGAGAAGCTTGGCGTACCAGCCCTTGCTGTACA
TGGGAGGAAAGTTGCAGACAGGCCAAGAGATCCTGCTAAATGGGACGAGATCGCAGATGT
AGTTGCTGCATTGTCCATTCCCGTTATTGCAAATGGAGATGTTTTAGAATACGATGATTT
CTCTCGCATTAAAACTGCAACGGGCGCTGCATCCGTGATGGTTGCAAGAGGAGCTATGTG
GAATGCTTCAATTTTCTCTCCAAAAGGAAAGTCTCACTGGGAAGATGTGAAAAAGAAATA
CATTAGAAAGAGCATCTTGTGGAACAACGATGTTAAAAGCACGAAATACACGATAAAGGA
GATGATAGCGCATCATTCTTGTCTTGAATTAGCCGAAGGAAAGTCTCTCAACAAAGCTGA
CACTTTGGAAGATATAGCGAATCTTTACGAGGTGGAAGAGTACTATTGGAAAGTAAAGAA
CATTCGTCCCCTGACACATGACTTGGACTACGTTTTGTGATACTCAGACAAAATGCCACT
TTATTTCGAGTCTTAGTGTAATCTCGTTTTTATGTTTTATATATAGAGGGATCCCATTGG
TTTTACTTAACCGAAATTCGAATCTATTGTTGTACTGGAAGTAACTACACTATTATTAAT
CATGCATTCTCTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN09TF U 1
AF RR4EN09JQ C 637
BS 1 768 RR4EN09TF
BS 769 1216 RR4EN09JQ

RD RR4EN09TF 768 0 0
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GCTCTCTTTCCGAATGTTGGCGGCGGAGTACGGCGCAGATATTACATACGGAGAAGAGAT
TATCGATCATAAGCTTCTCAAATGCCAACGCCGTTTCAACATTGCTTCTGGAACAACAGA
GTTTGTGGAGAAAGGGAGTGAGAATGTTGTCTTTAGCACATGTGCTGAAGAAAGAGAAAG
GGTTGTTTTTCAAATGGGGACTTCTGATGCTGTTAGGGCTCTCAAAGCTGCTGAGATTGT
GTGCAATGATGTTGCAGCTGTTGATATTAATATGGGTTGCCCCAAGGCTTTCTCTATTCA
AGGAGGAATGGGTGCTGCTCTCTTAAGTAAACCCGAGCTCATTCACGATATTCTGGCAAC
ACTTAAGAGGAACTTAGACGTCCCCGTTACTTGCAAGATTCGTCTATTGAAATCACCTGC
AGATACTGTTGAATTGGCTAGGAGGATCGAGAAGCTTGGCGTACCAGCCCTTGCTGTACA
TGGGAGGAAAGTTGCAGACAGGCCAAGAGATCCTGCTAAATGGGACGAGATCGCAGATGT
AGTTGCTGCATTGTCCATTCCCGTTATTGCAAATGGAGATGTTTTAGAATACGATGATTT
CTCTCGCATTAAAACTGCAACGGGCGCTGCATCCGTGATGGTTGCAAG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4EN09JQ 580 0 0
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AGATGTTTTAGAATACGATGATTTCTCTCGCATTAAAACTGCAACGGGCGCTGCATCCGT
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CTGGGAAGATGTGAAAAAGAAATACATTAGAAAGAGCATCTTGTGGAACAACGATGTTAA
AAGCACGAAATACACGATAAAGGAGATGATAGCGCATCATTCTTGTCTTGAATTAGCCGA
AGGAAAGTCTCTCAACAAAGCTGACACTTTGGAAGATATAGCGAATCTTTACGAGGTGGA
AGAGTACTATTGGAAAGTAAAGAACATTCGTCCCCTGACACATGACTTGGACTACGTTTT
GTGATACTCAGACAAAATGCCACTTTATTTCGAGTCTTAGTGTAATCTCGTTTTTATGTT
TTATATATAGAGGGATCCCATTGGTTTTACTTAACCGAAATTCGAATCTATTGTTGTACT
GGAAGTAACTACACTATTATTAATCATGCATTCTCTTGGT

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

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GGTTGCGGATCAGTGAAACTATTTGCGATTCCTTCAATGTTTCCTCCACCTCCGATTGTG
ATGTAAATTGGAGCATTAGGATCTTTCACTGGAGTGCTCAAGCCATTGGTGATATTATAC
TTAATATTGGAAACACGTTCGGATCTCTCATACGCATGGACATGACCAGCCAAGACCAAA
TCAACCTTGCTGTTAGCAAACCACGACTCGAACATCACCCTCATGCTCTCACCTTCCATG
TAATGGTAGTTGACACTATTGTACCACGGAGAGTGAACCATAACAATCAACCATGGAGTC
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CCGTAGCCAGAGTAAGAGGAGAGGACGATGATGTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GE35JQ U 105
AF RR4C733JQ U 1
BS 1 695 RR4C733JQ

RD RR4GE35JQ 175 0 0
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GTTATACATCATAACAGAATCAGCTGCTATGGCTTCATTGTCTTGGTTCCTATGCCATGT
GTACTGTGCGTGAGTCTTGTTCTTAATCTCGAGAAGAGCATGACCAAAACTCGAT

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR4C733JQ 695 0 0
TAAAGATTTAAACTGAATATCCGAAATAACAATGCAATCTAAATTGAAAAATCCATAACC
TAAACATAAAACCAAAGAAAAAAAACAAACTAAAAAAACCCTCCTTTTTCAAATCAGCAA
ATGAAACAGTCACGCGCTGTCTCCTCCTTTGGAAAGAAATATCTGTTATACATCATAACA
GAATCAGCTGCTATGGCTTCATTGTCTTGGTTCCTATGCCATGTGTACTGTGCGTGAGTC
TTGTTCTTAATCTCGAGAAAAGCATGACCAAAACTCGATTCCCTATAAGCTGAGTAACTC
GGTTGCGGATCAGTGAAACTATTTGCGATTCCTTCAATGTTTCCTCCACCTCCGATTGTG
ATGTAAATTGGAGCATTAGGATCTTTCACTGGAGTGCTCAAGCCATTGGTGATATTATAC
TTAATATTGGAAACACGTTCGGATCTCTCATACGCATGGACATGACCAGCCAAGACCAAA
TCAACCTTGCTGTTAGCAAACCACGACTCGAACATCACCCTCATGCTCTCACCTTCCATG
TAATGGTAGTTGACACTATTGTACCACGGAGAGTGAACCATAACAATCAACCATGGAGTC
TCCTCTCTGTTCACTTTCTTCAGCTCTTGCTCAAGCCACACGTATTGCGGTGTGTATTTG
CCGTAGCCAGAGTAAGAGGAGAGGACGATGATGTG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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AAGCTCCTCCAAAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGGTATAGCTGTGTAGGGGGTTG
ATGGCGGAGGAAGTGGAATTGTCGCCGTTGGTTCCACCGACGCCGGCGATGGATCCATCC
GAGATCGATCTCGAAGCTGGACATGGCGAACAAATTCAGTGTCGAATCTGCCTTGAATCT
GACGGTAGAGATTTCATTGCGCCTTGCAAATGCAAAGGAACATCAAAGTATGTACATCGT
GATTGCTTGGATCACTGGAGAGCTATCAAGGAAGGTTTTACGTTTGCGCACTGCACAACT
TGCAAGGCTCCGTATTATCTTCGAGTACACGGTGCTGGTGATAGGAAATGGAGGACCTTG
AAGTTTCGCTTCTTTGTTACTCGTGACATCTTATCCATCTTTCTTGCTGTTCAGCTTGTG
ATTGCTGCGTTGGCATACATGGTCTATTTCATAGATAGCTACCAGCAGTCATGGCTTCGT
CATATTTGGGGTTTTGACAGTCAGGTCACCTTTTATTACATGTCTGGAGCTTTACTATTC
TTTGCTCTGCTGGGTCTATCTGGATGCTTCATAACTTGCTACGACCGCAGAGTTCGCAAT
GACCTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATTGTGTCTCTGTTGCTGTCAGCCTGGGATATGCACA
GACTGCCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTACTGAAAGT
TGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAGGTGCAGGGGAAGCCGGATTG
CCATTGCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGGAATATTC
TACAGCGTACTGGTTGCAACCATGGTTGGACAACGTATTTGGCAGCGCCATTATCACATT
CTCGCTAAAAGAATGCTAACAAAGGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATG
GGATCTGAATGGTCGCCACCCGCTTTGCCGTCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTT
GGCCTTCTGTGAAAACTATACTGGCTTGTGATTGAATGCTATGGAAAGATTTTTCAACTG
CTTACAGGGGAATTCATCTGATCAAGATGTGAGAGATAAGACAAAAGTTTGGAGATTATG
AATGTTAGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTTGTAAAGAACGATCCCAACTTTAGTCAGAG
TCCTCCTCCCGTTGACGAATTGAGTTTTCATGTCGAGTGTTTAATCTTAACGGTTTGTTA
TATAGGTATGCACAAGCGTTGTTTTCTTGTGGATACTTTTTGCCACAACCAATCACCCCC
AATATGTCTTCTAGACAGCCAAAATTTAATTTA


BQ
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AF RR4AA67TF U 1
AF RR4AA67JQ C 574
BS 1 820 RR4AA67TF
BS 821 821 RR4AA67JQ
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RD RR4AA67TF 864 0 0
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AAGCTCCTCCAAAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGGTATAGCTGTGTAGGGGGTTG
ATGGCGGAGGAAGTGGAATTGTCGCCGTTGGTTCCACCGACGCCGGCGATGGATCCATCC
GAGATCGATCTCGAAGCTGGACATGGCGAACAAATTCAGTGTCGAATCTGCCTTGAATCT
GACGGTAGAGATTTCATTGCGCCTTGCAAATGCAAAGGAACATCAAAGTATGTACATCGT
GATTGCTTGGATCACTGGAGAGCTATCAAGGAAGGTTTTACGTTTGCGCACTGCACAACT
TGCAAGGCTCCGTATTATCTTCGAGTACACGGTGCTGGTGATAGGAAATGGAGGACCTTG
AAGTTTCGCTTCTTTGTTACTCGTGACATCTTATCCATCTTTCTTGCTGTTCAGCTTGTG
ATTGCTGCGTTGGCATACATGGTCTATTTCATAGATAGCTACCAGCAGTCATGGCTTCGT
CATATTTGGGGTTTTGACAGTCAGGTCACCTTTTATTACATGTCTGGAGCTTTACTATTC
TTTGCTCTGCTGGGTCTATCTGGATGCTTCATAACTTGCTACGACCGCAGAGTTCGCAAT
GACCTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATTGTGTCTCTGTTGCTGTCAGCCTGGGATATGCACA
GACTGCCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTACTGAAAGT
TGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAG*TGCAGGG*AAGCCGGAT*G
CCATTGCTCT
CATATGGCATAGTA

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4AA67JQ 840 0 0
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TGTTGCTGTCAGCCTGGGATATGCACAGACTGCCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGG
GCAGATTGCACAGCATGTACTGAAGGTTGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGC
CTTGGAGGTGCAGGGGAAGCCGGATTGCCATTGCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTT
GGTTTGTTTACGGTTATAGGAATATTCTACAGCGTACTGGTTGCAACCATGGTTGGACAA
CGTATTTGGCAGCGCCATTATCACATTCTCGCTAAAAGAATGCTAACAAAGGAGTATGTG
GTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATGGGATCTGAATGGTCGCCACCCGCTTTGCCGTCT
GAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTTGGCCTTCTGTGAAAACTATACTGGCTTGTGATT
GAATGCTATGGAAAGATTTTTCAACTGCTTACAGGGGAATTCATCTGATCAAGATGTGAG
AGATAAGACAAAAGTTTGGAGATTATGAATGTTAGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTTGT
AAAGAACGATCCCAACTTTAGTCAGAGTCCTCCTCCCGTTGACGAATTGAGTTTTCATGT
CGAGTGTTTAATCTTAACGGTTTGTTATATAGGTATGCACAAGCGTTGTTTTCTTGTGGA
TACTTTTTGCCACAACCAATCACCCCCAATATGTCTTCTAGACAGCCAAAATTTAATTTA

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL5924Contig1 965 2 2 U
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GTTTATAACTTGGATGATGCTGAATTTTTGGCAAGGTTTAATTCTAACGAGACAGAGAAC
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AATAATCCTAGAAACGAGCTCAAATCTCTGGTGAAAGGTATTCTTTGCAAAAGTTCAGTG
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CATGAGGAAGCGTCGCCAATGGTGAGGTACGAATTAAGCAGAGTAACAGGGTTAATGTTT
ATTGCAATCGGGAAAAGGAGAGTGCAGTGCGGAGGAGAAGCAAGAGCGGGGCTTGTAGAT
ATGTGGTTCACGCCAATGTTGCTAGATTTCGGGTGGCTGCAAAGGTGCAAGAAGGGATTA
GACATGAGGGAAGTGGAAGAAGGGATGGGGCAGACGCTTTTAACACTGCCATCCAAGCTT
CAGTATCAAGTGTTCATGGAATGGTTCAGGTGGTTCTCTAAGCACGGGACTGAGTGTCCT
AATCTCAGTAAATCATTTCAGATTTGGTGGCGTAGGTCTTTCCTTAGAGGTGTTGATTCT
TTTTCTACTTGTAGGTGAGACAAAAGTGTTTAAGAGACACTGTTAGGGTGATAGCTTATG
TAACTTTTTTCTCCTCTTGTATGTTGTTTCCACTTTGCTATGTTTGCATCGAAGCTAGTT
TAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4G027TF U 1
AF RR4G027JQ C 378
BS 1 644 RR4G027TF
BS 645 965 RR4G027JQ

RD RR4G027TF 648 0 0
GATCTCCGAGCTGTTCCGTGGACAGAGGACGAAGAGGAAAGACTGAGGAGAGTTCTTGCA
GTTTATAACTTGGATGATGCTGAATTTTTGGCAAGGTTTAATTCTAACGAGACAGAGAAC
AACACACAGGAAAGCTTATCCAAGCAGCTTGTTTGGTCAATAACCTCTTGCAGCCATACA
AATAATCCTAGAAACGAGCTCAAATCTCTGGTGAAAGGTATTCTTTGCAAAAGTTCAGTG
TACGAAAAAGAACAGCCTGAAATCAACAAGGAAGACATATATAAAGCAGGCAAGTACTGT
GTGGATTCACTTGTTAAACTGTTTGGAAAGGGAAGTAGTAACAAGAGCGGAAAGCCATTG
ATTGAAGGTATATCGAGGGAAGTGGAGAACATTAATTGGCTGTTGGAAATCATGATAGAC
CGGGAGATAGCAGAGGAATTCGTGGAGATATGGGGGAAGCAAAGAACGCTAGTGGAGATG
CATGAGGAAGCGTCGCCAATGGTGAGGTACGAATTAAGCAGAGTAACAGGGTTAATGTTT
ATTGCAATCGGGAAAAGGAGAGTGCAGTGCGGAGGAGAAGCAAGAGCGGGGCTTGTAGAT
ATGTGGTTCACGCCAATGTTGCTAGATTTCGGGTGGCTGCAAAG
TGCA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4G027JQ 588 0 0
GGAAGTGGAGAACATTAATTGGCTGTTGGAAATCATGATAGACCGGGAGATAGCAGAGGA
ATTCGTGGAGATATGGGGGAAGCAAAGAACGCTAGTGGAGATGCATGAGGAAGCGTCGCC
AATGGTGAGGTACGAATTAAGCAGAGTAACAGGGTTAATGTTTATTGCAATCGGGAAAAG
GAGAGTGCAGTGCGGAGGAGAAGCAAGAGCGGGGCTTGTAGATATGTGGTTCAGGCCAAT
GTTGCTAGATTTCGGGTGGCTGCAAAGGTGCAAGAAGGGATTAGACATGAGGGAAGTGGA
AGAAGGGATGGGGCAGACGCTTTTAACACTGCCATCCAAGCTTCAGTATCAAGTGTTCAT
GGAATGGTTCAGGTGGTTCTCTAAGCACGGGACTGAGTGTCCTAATCTCAGTAAATCATT
TCAGATTTGGTGGCGTAGGTCTTTCCTTAGAGGTGTTGATTCTTTTTCTACTTGTAGGTG
AGACAAAAGTGTTTAAGAGACACTGTTAGGGTGATAGCTTATGTAACTTTTTTCTCCTCT
TGTATGTTGTTTCCACTTTGCTATGTTTGCATCGAAGCTAGTTTAAGT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL5925Contig1 890 2 4 U
GGAATCTCAAGTCTCGAAGACAATCATCTGCGTTCGAAGCCGATAGTGACTCCTGATCTT
CTTCACGATTTATGAAACGGAACACGTTATGGTTTTTTCGTGATAATTCCTATTAATTCG
GACGTCCACTACGAGTTCTTCAATGCGTTGTTGCGTCGGTGGGGTTGTGGGATATCAGTC
CGGCGAGTGTTCATCCTTTGATTAGCCGGAGAGAAGCTTACAAGTGAGGAGAGTAATAAG
GATTCTGCTCCGGTCGATACTAAGCCTCCTACCGCAGCCTCTGTGAACGTTCTTCTGAGA
CAGGCATTGCATGGTGATTGCTAACTCGGTTGCTAAGTTGAATTCGGCAGAAGTTCTCAA
GCTTCTTAATTCCCCTCTACCAATACTACAATCTATGGGTGCGTTTTTAGTTACTTACTC
ATTCCAATGGGATTACGTCCCAAGAGTCGTCCTTGCTCGCTTTGAACTCCATGTATCAGC
TCATCGGGCATCAACCCTTCACACTGCCGTAGAAGTTTCAAGCTGCTTAGACTTGCTTGT
GCACAATTTAGATTAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGGTCTTGTGATCTATGAGGACAAGGA
CACTGATGATGAAGTAGGAGAAGGACCAAATGAAGCAATGGAAAAAGATGAAGAAGGTGC
AGGCGAATCAGAGTATGAAGCAGCTGATGGTGTCAATGAATTTGAAGATTTTGACATGAT
CGATTAAGAAGACTTCCTGAAAACGGAAATGGAGTTTTGATCTGTGTGAGGCTGTTTGGT
TGGTTAGATGTTTAATGTCTCATCACGGAATCTCTAATACGTAATGGTTGTATTTATTTG
TAGTACTGAAATTAAGAGTTTTATTTTGACATACGAAAAAGAGTTGACGC


BQ
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AF RR4BZ41TF U 1
AF RR4BZ41JQ C 347
BS 1 598 RR4BZ41TF
BS 599 599 RR4BZ41JQ
BS 600 615 RR4BZ41TF
BS 616 890 RR4BZ41JQ

RD RR4BZ41TF 615 0 0
GGAATCTCAAGTCTCGAAGACAATCATCTGCGTTCGAAGCCGATAGTGACTCCTGATCTT
CTTCACGATTTATGAAACGGAACACGTTATGGTTTTTTCGTGATAATTCCTATTAATTCG
GACGTCCACTACGAGTTCTTCAATGCGTTGTTGCGTCGGTGGGGTTGTGGGATATCAGTC
CGGCGAGTGTTCATCCTTTGATTAGCCGGAGAGAAGCTTACAAGTGAGGAGAGTAATAAG
GATTCTGCTCCGGTCGATACTAAGCCTCCTACCGCAGCCTCTGTGAACGTTCTTCTGAGA
CAGGCATTGCATGGTGATTGCTAACTCGGTTGCTAAGTTGAATTCGGCAGAAGTTCTCAA
GCTTCTTAATTCCCCTCTACCAATACTACAATCTATGGGTGCGTTTTTAGTTACTTACTC
ATTCCAATGGGATTACGTCCCAAGAGTCGTCCTTGCTCGCTTTGAACTCCATGTATCAGC
TCATCGGGCATCAACCCTTCACACTGCCGTAGAAGTTTCAAGCTGCTTAGACTTGCTTGT
GCACAATTTAGATTAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGGTCTTGTGATCTATGAGGACAAG*A
CACTGATGATGAAGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4BZ41JQ 544 0 0
GCAGAAGTTCTCAAGCTTCTTAATTCCCTTCTACCAATACTACAATCTATGGGTGCGTTT
TTAGTTACTTACTCATTCCAATGGGATTACGTCCCAAGAGTCGTCCTTGCTCGCTTTGAA
CTCCATGTATCAGCTCATCGGGCATCAACCCTTCACACTGCCGTAGAAGTTTCAAGCTGC
TTAGACTTGCTTGTGCACAATTTAGATTAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGGTCTTGTGATC
TATGAGGACAAGGACACTGATGATGAAGTAGGAGAAGGACCAAATGAAGCAATGGAAAAA
GATGAAGAAGGTGCAGGCGAATCAGAGTATGAAGCAGCTGATGGTGTCAATGAATTTGAA
GATTTTGACATGATCGATTAAGAAGACTTCCTGAAAACGGAAATGGAGTTTTGATCTGTG
TGAGGCTGTTTGGTTGGTTAGATGTTTAATGTCTCATCACGGAATCTCTAATACGTAATG
GTTGTATTTATTTGTAGTACTGAAATTAAGAGTTTTATTTTGACATACGAAAAAGAGTTG
ACGC

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL5926Contig1 619 2 2 U
GGGTCTCAGACTGTTTGTCTTAGAGACGACAAGTAGATTCCTTTTCTTTTTTCATTTTAC
TCTCCCAGCATCCAATAATTGTTATATAATTTTCTCAAGACAGAAATAAGATTCTTTGGT
TTTTATTTCCCGAGAAAATACAATCTTGATTTCATCTGTTACCAGAGCTTCTTCTTTCTG
CTTTTGAAGGAACAAGAACAAATCAAAAGATTTGAGCTTTTAATGGAATCAAGGATGGAA
GGAGATGTGTTTTCTGGATTTGGAGAGAGATATCAGATGGATGGCAAAGTGTTGCAGAGT
TTCCAGAAGAGCTTCGTTCAGGTTCAGGATATTTTGGATCAAAACCGGCTTCTCATCAAC
GAGATCAATCAGAACCATGAGTCCAAACAAGCAGATCACTTGGGAAGAAACGTTGGTTTG
ATAAGAGAGCTCAACAACAATATCAGAACTGTGGCTAGTCTTTATGGTGATCTCTCTCAT
TCTTTTGCCAAATCCATCGATGCTTCATCGGAAGGAGAATCCACTGGGACCAACAACCAA
AAGAGATTTAGATCCGGGTAAAATATTATTTACCAAAAAAGAAGAAGATCAATCTCTCTG
TGTTCTGTAGATTCAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A745TF U 1
AF RR4A745JQ C 250
BS 1 517 RR4A745TF
BS 518 619 RR4A745JQ

RD RR4A745TF 517 0 0
GGGTCTCAGACTGTTTGTCTTAGAGACGACAAGTAGATTCCTTTTCTTTTTTCATTTTAC
TCTCCCAGCATCCAATAATTGTTATATAATTTTCTCAAGACAGAAATAAGATTCTTTGGT
TTTTATTTCCCGAGAAAATACAATCTTGATTTCATCTGTTACCAGAGCTTCTTCTTTCTG
CTTTTGAAGGAACAAGAACAAATCAAAAGATTTGAGCTTTTAATGGAATCAAGGATGGAA
GGAGATGTGTTTTCTGGATTTGGAGAGAGATATCAGATGGATGGCAAAGTGTTGCAGAGT
TTCCAGAAGAGCTTCGTTCAGGTTCAGGATATTTTGGATCAAAACCGGCTTCTCATCAAC
GAGATCAATCAGAACCATGAGTCCAAACAAGCAGATCACTTGGGAAGAAACGTTGGTTTG
ATAAGAGAGCTCAACAACAATATCAGAACTGTGGCTAGTCTTTATGGTGATCTCTCTCAT
TCTTTTGCCAAATCCATCGATGCTTCATCGGAAGGAG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR4A745JQ 370 0 0
TTTTCTGGATTTGGAGAGAGATATCAGATGGATGGCAAAGTGTTGCAGAGTTTCCAGAAG
AGCTTCGTTCAGGTTCAGGATATTTTGGATCAAAACCGGCTTTTCATCAACGAGATCAAT
CAGAACCATGAGTCCAAACAAGCAGATCACTTGGGAAGAAACGTTGGTTTGATAAGAGAG
CTCAACAACAATATCAGAACTGTGGCTAGTCTTTATGGTGATCTCTCTCATTCTTTTGCC
AAATCCATCGATGCTTCATCGGAAGGAGAATCCACTGGGACCAACAACCAAAAGAGATTT
AGATCCGGGTAAAATATTATTTACCAAAAAAGAAGAAGATCAATCTCTCTGTGTTCTGTA
GATTCAAATG

QA 1 370 1 370
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5928Contig1 965 2 6 U
GATAAAGGATGGATGGGGTTAACATCCGTGCAGGATCCTCCTCCAACTAGAAGTTCATGG
GGAAACACCGGTGCTCACGACAGAGAAGATATTTCATCTACTGTATCCGACCCGGGTCCG
ATCTGGGATACGGGACCCAAATGGGGCAGCGAACATCTGCTTGGGATGTAGAGAACTCGA
TCGAGCTGCCAGGTCCTCCGGAGGATATAGAGACAGGACTGCGGAATCAAAGCATGACAC
CGAGATTCGAAAATAAATGGGTTGCTAGAAAAGGACATTTCCTTGGGATCATGGTGTGTA
ACCACGCTTGTCGGACCGTGCAAAGCTCCCAAGTCGTGGCTCCCAATTCAGAACATGACG
ATGGTACAATGGACATGCTATTGGTTCACGGGGTGTGGAAGACTGAGGTTAATTAGGTTT
TTTATCCTTCTGCAAACCGGTCGACACCTTTCGCTTCCATACGTCGAGTGTGTAAAGGTG
AAGTCGGTGAAGATAAAGGCGGGAAAACAGACGCATGACAGTTGTGGTATAGACGGAGAG
CTGTTTGCGTTGAATGGAGAAGTGATATCGACGATGCTACCGGAACAATGTAGATTGATC
GGTAATGCTCCTGAACGACATTAGTAGTTATGTTAAAACCTCATCAAATTATGTGGATGG
AAAGAGAAGAGTCCAGGTGGTTGTCTATAGGTTTCTTTTTTTGATATGGGGTGTGGTTTT
TGATCTGGTCGGCGGCGTCAATAGCTCTGTGGCAAGAGGAATAAGATATTGTGATCACCA
TGAGACACCATCCTTCCCTTTTGTAACCCATAAGTTCCCTAATACCCTAAACCTTTTGTA
TATTCTTTTACCCTTTTTTTCATGTGTGTTTTGAAATATATATAGATATGTACCATAAAA
CATGGGTTATCCGACAATGGTTCGTGTGTTTCACTTGAATTTGTCAACCGGTTTGGTTAT
CATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4E082TF U 1
AF RR4E082JQ C 207
BS 1 407 RR4E082TF
BS 408 408 RR4E082JQ
BS 409 415 RR4E082TF
BS 416 416 RR4E082JQ
BS 417 473 RR4E082TF
BS 474 965 RR4E082JQ

RD RR4E082TF 473 0 0
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GGAAACACCGGTGCTCACGACAGAGAAGATATTTCATCTACTGTATCCGACCCGGGTCCG
ATCTGGGATACGGGACCCAAATGGGGCAGCGAACATCTGCTTGGGATGTAGAGAACTCGA
TCGAGCTGCCAGGTCCTCCGGAGGATATAGAGACAGGACTGCGGAATCAAAGCATGACAC
CGAGATTCGAAAATAAATGGGTTGCTAGAAAAGGACATTTCCTTGGGATCATGGTGTGTA
ACCACGCTTGTCGGACCGTGCAAAGCTCCCAAGTCGTGGCTCCCAATTCAGAACATGACG
ATGGTACAATGGACATGCTATTGGTTCACGGGGTGTGGAAGACTGAG*TTAATTATGTTT
TTTATCCTTCTGCAAACCGGTCGACACCTTTCGCTTCCATACGTCGAGTGTGT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR4E082JQ 759 0 0
ATAGAGACAGGACTGCGGAATCAAAGCATGACACCGAGATTCGAAAATAAATGGGTTGCT
AGAAAAGGACATTTCCTTGGGATCATGGTGTGTAACCACGCTTGTCGGACCGTGCAAAGC
TCCCAAGTCGTGGCTCCCAATTCAGAACATGACGATGGTACAATGGACATGCTATTGGTT
CACGGG*TGTGGAAGACTGAGGTTAATTAGGTTTTTTATCCTTCTGCAAACCGGTCGACA
CCTTTCGCTTCCATACGTCGAGTGTGTAAAGGTGAAGTCGGTGAAGATAAAGGCGGGAAA
ACAGACGCATGACAGTTGTGGTATAGACGGAGAGCTGTTTGCGTTGAATGGAGAAGTGAT
ATCGACGATGCTACCGGAACAATGTAGATTGATCGGTAATGCTCCTGAACGACATTAGTA
GTTATGTTAAAACCTCATCAAATTATGTGGATGGAAAGAGAAGAGTCCAGGTGGTTGTCT
ATAGGTTTCTTTTTTTGATATGGGGTGTGGTTTTTGATCTGGTCGGCGGCGTCAATAGCT
CTGTGGCAAGAGGAATAAGATATTGTGATCACCATGAGACACCATCCTTCCCTTTTGTAA
CCCATAAGTTCCCTAATACCCTAAACCTTTTGTATATTCTTTTACCCTTTTTTTCATGTG
TGTTTTGAAATATATATAGATATGTACCATAAAACATGGGTTATCCGACAATGGTTCGTG
TGTTTCACTTGAATTTGTCAACCGGTTTGGTTATCATGC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL5929Contig1 1445 2 2 U
GAAGTTGATTAGTGGTGTAGTGGAATCCATTACACGACATTATTTTATTTGAGTTTATTC
TTCTTGGTTACTGCTGTACTCCATTTGATAATATTGTTAATCACCTGTTTAGTCATAGTC
GCCACTCACCACGTAATTAAACAAGAATAAACGAATATTCTTTATTTTATATAATCATAT
ATTGAATTAATCAACGGTACTCATTTGTTATAAACGAAAAGTTTGTGGAAAATACCATCA
TGGTCCTATCTTCTATAAAAAATTGAAATACGAAACAAGGTTATGGTAATAATTCTGTTT
AATAATGTAACTTGTTTAATGGTTAAAATGATTGTTTGCGTAAGTTGAAATCCGGTAGAA
AACGAAAGATTTGATTCGAACCTCGTATATAACTCAAACAAAAAATAATTTAACTTTCAA
CTTTAAAAATATATAGTTATTGTAAATTATTTTGTACGTTTTCACTATTTGACCGTACAA
CACATATCTTCCCTGTCTTCCATAATGTTCATATCGATAAAATATACATAATATCAGAAA
TATATACATATTGCTTTCTTTTGCCTTTGGGTGGAGCCTAATCAAGAGCATTTTGGGGGT
AAAAGCTTCACGAACCCGTAGCATAGGTCTTGTTAGACAATAAACAATGTAAACTATATA
GCATATATTATTCCGCACTCATGTTGTACCTCTATTAACATGTCTTCCAAGTATCTGTAT
TGATATTAGTAGTCTTTTTAAAAAAAATCATCCATTTTAAGTTGTACCAAAAATGACTCT
TCCCTTCTCTCAAAGGGTAAGAAGCAGGACCGGTCCGGATTAATATGGCGCCTAAAGCAA
ATCTAAAACATAATGCCCCATAAATATAACTACAATTTTTTTACTACTTTTAATATATAA
TCAAAATATATGTTACTAAAGCTTCATCTGTTTTAGACGAAAAAAAAAATTTCTCGCAAA
ACCATTGATCAATTTTGAATAACCATTAGTTTCAATTTTTTTTTGAATAACCACATTTTA
GATGGTTTGCATTCCACTGATAATTCATTTGATTGATTCTTAATTGTATTTTAATTTCCT
TTAAAAATAACATAAATTTTCTAATATTGCAATACATATGATAAAAGTTGAACATTAACA
CTTATTTCACTTTGAGAAATATATCAAAGAATATTAGAACCCAGTTTAGGATATTTTGTA
TTCTCATATTATATAATTTTTCATTAAATATAAAAATTTACAAAAAATGGAGACCCAAAA
AGAAAAATATCTCCTTTAAAAATAATCAGGATTTAATTAGTTTTGATCAAAAAAGATTTA
ATTAGTTAAATAGTTTATTAATGATATATATCATTTAATATAGTGTGGTAATAAAAGAAA
CTAAGTTGTTAGAAAAGGTAACCAAATTGTTCATGTCAAATCGGTATCAATTACTATACT
TATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TATATACATATTGCTTTCTTTTGCCTTTGGGTGGAGCCTAATCAAGAGCATTTTGGGGGT
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TTTTTTTTGAATAACCACATTTTAGATGGTTTGCATTCCACTGATAATTCATTTGATTGA
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TTAGTTTTGATCAAAAAAGATTTAATTAGTTAAATAGTTTATTAATGATATATATCATTT
AATATAGTGTGGTAATAAAAGAAACTAAGTTGTTAGAAAAGGTAACCAAATTGTTCATGT
CAAATCGGTATCAATTACTATACTTATCC

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DS 



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TC


BQ
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10 10 

AF RR4FB85TF U 1
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TATAGAGTCATTTCTTAGAGTTGTGGCATGTTGTCATGTTCTACAGGGATATGGTCTAAC
TGAGAGCTGTGCTGGAACATTTGTCACGTTCCCAGACGACCTGGATGCTTGGAACAGTTG
GTCCACCTGTACCAAACGTCGATATACGCCTGGAATCTGTTCCGGACATGGAATATGATG
CTCTTGGAAGTACCCCGCGTGGAGAAATCTGCATCCGCGGAAAA*CCCTGTTTTCTGGGT
ACCACAAACGTGA
GACCTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FB85JQ 501 0 0
CCGGACATGGAATATGATGCTCTTGGAAGTACCCCGCGTGGAGAAATCTGCATCCGCGGA
AAAACCCTGTTTTCTGGGTACCACAAACGTGAAGACCTCACAAAAGAGGTTCTTGTTGAT
GGATGGTTTCACACAGGTGATGTTGGTGAGTGGCAACCAGATGGAGACTTCAACTCTATC
TGTCAAAATGAAAAAGCAAAAGCATTCATACTTGGAGAACTTGTTAAGACTGGCAGAGAG
AGAAAGTTGAAAGGTTTTGAGATCATTAGAGCTGTTCATTTGGAACCGGTCGCTTTCGAT
ATTGAAAGAGATCTTCTTACTCCTACCTACAAAAAGAAGAGGCCTCAATTGCTCAAATAC
TATCAAAATGTAATTGATGAGATGTACAAGGCTGCAAAGGAAGGTCAAGGTTCAGGACAA
TAGATTTCTTCTACTATATATTTTCAATATTCTATATTCTTTCTCTTCCATGATCAGGCA
TGCCTTTCTTCATTAAAGTTC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL5931Contig1 1083 2 2 U
GGGGAGTTCATTATATTCATCGGCCTGGACCAACGCTCCAAGATCTCGGATACATTGCTC
TTCCGGAGCTTGGTCAAGATAAAAGCTACATAAGTGAAACTGTGTTCACTTGTGTATTTC
TTTCGTTTTTACTGTGGACTTTCCATCCATTCATCATGAAAAGCAAGAAGATATACACGG
TGTTGATATGGTGCAGGGTTCTCGCTTTCTTAGTTGCTTGTCAGTTTCTCCGAGTAATAA
CATTCTATGCTACTCAGCTTCCTGGCCCTAACTATCACTGTCGAGAGGGTTCTGAGCTTG
CCACGTTGCCACGCCCACATAGCGTTCTTGAGGTGCTCTTGATTAACTTTCCACGTGGGG
TGATATACGGATGTGGAGATTTGATTTTCTCATCTCATATGATATTCACACTTGTCTTTG
TCCTCACTTACCAGAAATACGGTTCTAAAAGGTTTATAAAGCTGTTAGGTTGGGTCATTG
CCATCTTGCAAAGCCTCTTGATTATTGCGTCCCGTAAACATTACACAGTGGATGTTGTCG
TTGCGTGGTATACAGTCAACTTGGTTGTTTTCTTCCTCGACAAGAAACTTCCAGAGTTGC
CTGATCGGACCACGGTGTTACTCCCTTTGAGCTCCAAAGACAGAACCAAGGAAGAGAATC
ACAAACTCTTGAACGGGAACGGTGTTGATCCTACTGCAGATAGGAGACCAAGGGCTCAAG
TGAATGGGAAGATTTATGAAGACAGCAATGGAGTTCATAACGATAACGCTACCAATGGCG
CCTGAGGACTTGGCTCGAGTTTAGTTTCTTGCTCCTCAAGTATTTTAGGGTAACACGAAA
CGTTCTCTTTATACATCTTAACCAGCCACCTTTTCTTTCTTTGCGTGCTGTGTTCATAAG
TCTTCTTTAACACCATCTTACAACTTACAACTGTTTCTTAAAACTTCAGTTTAGGTTATT
AATTTTGCCATTTACCAACAGCAAAGAAAATCGCAAGATTGTAGAGCATTTTACTAAATA
GTAAATGACGTTTGAGAAACTTTTATATACTTATAAACATCTAGTTATATTAAACTTTGT
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4E314TF U 1
AF RR4E314JQ C 272
BS 1 525 RR4E314TF
BS 526 1083 RR4E314JQ

RD RR4E314TF 525 0 0
GGGGAGTTCATTATATTCATCGGCCTGGACCAACGCTCCAAGATCTCGGATACATTGCTC
TTCCGGAGCTTGGTCAAGATAAAAGCTACATAAGTGAAACTGTGTTCACTTGTGTATTTC
TTTCGTTTTTACTGTGGACTTTCCATCCATTCATCATGAAAAGCAAGAAGATATACACGG
TGTTGATATGGTGCAGGGTTCTCGCTTTCTTAGTTGCTTGTCAGTTTCTCCGAGTAATAA
CATTCTATGCTACTCAGCTTCCTGGCCCTAACTATCACTGTCGAGAGGGTTCTGAGCTTG
CCACGTTGCCACGCCCACATAGCGTTCTTGAGGTGCTCTTGATTAACTTTCCACGTGGGG
TGATATACGGATGTGGAGATTTGATTTTCTCATCTCATATGATATTCACACTTGTCTTTG
TCCTCACTTACCAGAAATACGGTTCTAAAAGGTTTATAAAGCTGTTAGGTTGGGTCATTG
CCATCTTGCAAAGCCTCTTGATTATTGCGTCCCGTAAACATTACA

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4E314JQ 812 0 0
CTATCACTGTCGAGAGGGTTCTGAGCTTGCCACGTTGCCACGCCCACATAGCGTTCTTGA
GGTGCTCTTGATTAACTTTCCACGTGGGGTGATATACGGATGTGGAGATTTGATTTTCTC
ATCTCATATGATATTCACACTTGTCTTTGTCCTCACTTACCAGAAATACGGTTCTAAAAG
GTTTATAAAGCTGTTAGGTTGGGTCATTGCCATCTTGCAAAGCCTCTTGATTATTGCGTC
CCGTAAACATTACACAGTGGATGTTGTCGTTGCGTGGTATACAGTCAACTTGGTTGTTTT
CTTCCTCGACAAGAAACTTCCAGAGTTGCCTGATCGGACCACGGTGTTACTCCCTTTGAG
CTCCAAAGACAGAACCAAGGAAGAGAATCACAAACTCTTGAACGGGAACGGTGTTGATCC
TACTGCAGATAGGAGACCAAGGGCTCAAGTGAATGGGAAGATTTATGAAGACAGCAATGG
AGTTCATAACGATAACGCTACCAATGGCGCCTGAGGACTTGGCTCGAGTTTAGTTTCTTG
CTCCTCAAGTATTTTAGGGTAACACGAAACGTTCTCTTTATACATCTTAACCAGCCACCT
TTTCTTTCTTTGCGTGCTGTGTTCATAAGTCTTCTTTAACACCATCTTACAACTTACAAC
TGTTTCTTAAAACTTCAGTTTAGGTTATTAATTTTGCCATTTACCAACAGCAAAGAAAAT
CGCAAGATTGTAGAGCATTTTACTAAATAGTAAATGACGTTTGAGAAACTTTTATATACT
TATAAACATCTAGTTATATTAAACTTTGTATT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL5932Contig1 633 2 5 U
TTTTTCTAGTTATAAGTAGATTGATCTTATCCTTGTATATATTAGTTAATTATTTTTCTA
ATTTCCGATGTGAGATCATTAGTATATGATATACTAATTTGTTGTATATGGCTTTTTTCT
CTCAGGTATCGCATAATACTCGCCCCACTGAAACTATCAACTGTAAGTGTACCTTTAAGG
AAAATGGAAGGCTAAGTATGTACAAGGCCGAGCTTGACGTTGTAAGGCATTTGGTTGTTG
ATATGTCATGCATTGATAAGAGTGTCGACATGAGGCTGATGCTAGCTGCCAAAAGGAAAA
TGACTGCTCTCACCGTGAGTTGAGTTTGATATATACTTTTTCTGGATAGCCTCTCTTGAA
CTCATGATGTGTGATCTTTCTATGGTTGGTATAGGAGAAAGAGATAAGTGACATTAAAGA
GCTACTGGATTCAGCAACTGTTGATCCAAATGTGAAAGGCGGTTTAAGGTGGCCGTTTGG
TAAATCTTCATCTGGAGATGGATACAGAATATTTGAAGTTTGTAACGTTAGAGCTACTAT
CTACAAGAACCAGACTCTCAGGCTTAGGGTTAGAGAGACCGATAGATTCAATGAGTGGAC
TGGAACAGGAGCAGTCAAGAGGGAGGTGACTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN85JQ U 6
AF RR4GN85TF C 1
BS 1 5 RR4GN85TF
BS 6 38 RR4GN85JQ
BS 39 39 RR4GN85TF
BS 40 264 RR4GN85JQ
BS 265 633 RR4GN85TF

RD RR4GN85JQ 259 0 0
CTAGTTATAAGTAGATTGATCTTATCCTTGTATTTATTAGTTAATTATTTTTCTAATTTC
CGATGTGAGATCATTAGTATATGATATACTAATTTGTTGTATATGGCTTTTTTCTCTCAG
GTATCGCATAATACTCGCCCCACTGAAACTATCAACTGTAAGTGTACCTTTAAGGAAAAT
GGAAGGCTAAGTATGTACAAGGCCGAGCTTGACGTTGTAAGGCATTTGGTTGTTGATATG
TCATGCATTGATAAGAGTG

QA 1 259 1 259
DS 

RD RR4GN85TF 633 0 0
TTTTTCTAGTTATAAGTAGATTGATCTTATCTTTGTATATATTAGTTAATTATTTTTCTA
ATTTCCGATGTGAGATCATTAGTATATGATATACTAATTTGTTGTATATGGCTTTTTTCT
CTCAGGTATCGCATAATACTCGCCCCACTGAAACTATCAACTGTAAGTGTACCTTTAAGG
AAAATGGAAGGCTAAGTATGTACAAGGCCGAGCTTGACGTTGTAAGGCATTTGGTTGTTG
ATATGTCATGCATTGATAAGAGTGTCGACATGAGGCTGATGCTAGCTGCCAAAAGGAAAA
TGACTGCTCTCACCGTGAGTTGAGTTTGATATATACTTTTTCTGGATAGCCTCTCTTGAA
CTCATGATGTGTGATCTTTCTATGGTTGGTATAGGAGAAAGAGATAAGTGACATTAAAGA
GCTACTGGATTCAGCAACTGTTGATCCAAATGTGAAAGGCGGTTTAAGGTGGCCGTTTGG
TAAATCTTCATCTGGAGATGGATACAGAATATTTGAAGTTTGTAACGTTAGAGCTACTAT
CTACAAGAACCAGACTCTCAGGCTTAGGGTTAGAGAGACCGATAGATTCAATGAGTGGAC
TGGAACAGGAGCAGTCAAGAGGGAGGTGACTCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL5933Contig1 966 2 2 U
GTCAACTCACCGTTTCGACTTGCCGAGTCAAGTTGAAAACACACAGATTTGACTCGCTCG
AGCTTTATTACTAGGGTCAAGTTGTGTTTTTTTTTTCCTTCTCTCTTCAAAACCAGAGAG
AGAGTGAAAAAGACCCTCTGACCAAAGTCAAAACTTCTTAAACTTGGTTTCAGATCTGAA
AAGGGCTTCATCGAACCCTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCCCTTCTTCTTCTTCTT
CGTTATCTCTTTACTTAGGTAACTGTTGCTGACTATCTTAACAATAACATGTCTGCCAGG
CCAAGTAATTGCTCTCGTCTCTCAAAGAGTTTTCTTCTTTTCTGCATTTGACTTGTGAAA
GCTTTTGAAGAATCTGTTGTTGGGTTACTCGATTATGTTGAAAAGTTTGTTCTTTTGTGA
TTTATGTACTGAAAATTGAGTGAAAAGTGTCTCCCTTTTTGGGTTTATGTTCTAATGTCT
AAAAGTCTACAAGAGACTGTTTTTATGTTTTTATGTTTAGTCTTGGGTTAGTGATTTATG
TTTCTCTAACAGTGAAAGGAGTGGACTTTAAGTTGTTTGAAGCAGTCTGACATCTGAACT
TTCTAGTTGACTTTGGTCTTAGTATGTAATGCATAATGAGTTTGGGATCTATAGTCTGTT
TTTATGTTTTTTGTTTAGTCTTTTTGTTTGTGATTTATGTTTCTCTGATAGCGAAATGAG
AAGTTGTTTGAAGCAATTTGACATGTGATACTGCTAAGATTGTGTTTTGGGTGTCAGTAT
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TTAGCTTTGAGACTGTGGCTAATTAGTTGACTTGAATGATGGTTTTTTTACAAGGCGGAA
CTCTCT


BQ
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DS 



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BQ
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ATCAGTTTGTTTC

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RD RR4B512TF 253 0 0
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CTTTATTATTGCTTTCCTAATTATATTTTGTTAATTTGAGTTGAACAAAAAAAAATATCT
ATCAGTTTGTTTC

QA 1 253 1 253
DS 



AS 1 2

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BQ
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TTCCTTTCTTTATCTTCTGGGCTTTATTGTTTGTGTTTTCGTTGAGATTTGGGTTGATTT
TCGTGCTGGTTCATGAGCTTAGTGAGCTCTGTCTTTTCTCTATGATTTTCGTCATGCTTA
TGTTGGAACCGTGTTTCATCGAGTTAGTAGATGCAGATGTGGCTGTGGTCGGTTGGGGCA
GCACATTTCGTGTTTCAGATCTAGAAGTGGAAGTGCATTGGTTTGTGAGCCTTGCTCGTT
TTAGTCTCTCCCGTTCTCTTTTCAGTAGAGTGGTGTAAAGGTTTGGTCGGTTTGTTGCCT
CTTTGCTTGGAGTGTATCTCTTGTCTTAGTAGTTTTTTGTTGGGGTTTAGTGTTGGTGGT
TGCTTGTCGTCTGTTTTCCTCTCTTGTGTGTGTTTCCAGAGAGGTTAATTTGGCAAGGTT
TCATCTTCAGTGTGTGTGCGTGTGATGGAG

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DS 

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CTTTTCAGTAGAGTGGTGTAAAGGTTTGGTCGGTTTGTTGCCTCTTTGCTTGGAGTGTAT
CTCTTGTCTTAGTAGTTTTTTGTTGGGGTTTAGTGTTGGTGGTTGCTTGTCGTCTGTTTT
CCTCTCTTGTGTGTGTTTCCAGAGAGGTTAATTTGGCAAGGTTTCATCTTCAGTGTGTGT
GCGTGTGATGGAGGAGTTTCTTTTTAAGTTATTTGAACGTTTAGTTATCCAAGGTGCGTG
GACCAAGCAGCGGTTCCCCTTGTCGATTTATGAAGTCTCCGGTTATTGGTCTTATCGATT
GGCGGGCGAGGCAGCAGCGATAAGGGTGGTTTGGGTGTAGAAGCGGAGGTTCCCGGGTGG
CGGGCTACGGGCAGCAGCGGTATCTCCCTATCACTGGCTTCTCTTCAGTTTAAAGGCTAC
TAAGCTCTTTGTTTTTGCTCCTGCATAGATGGTAACTGTGTATTTGGTTCTGTGTTTTTA
AGTCATCCGTGTGTGAATTCAAGTCGCCCCAGTGTGGGTTTTAGTGTGCCGCTTTCTATG
GGCTCTTGGTCCTGGGGCTATTTCGTTTTGCCGCCAGTTTATGTATGAATATTGCTATTT
TGATTATGAATGTATTTCAATTTGGTAC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCATACAACTCTTTAACCAACCAAACAATGGTGGTTCCTAGAAACAGAGTTTGGCTGTCG
TAGAACAAGTTCATGTCCTCTTGTTTGTCATGCACCTTCATGTCTGAGCAAAACAATACT
TAGAGAATATCCAGCAGTCCAAATTCTATGCACAATCAGACCAATATCAAAGCAGCTAAA
CGTAACGGTGGGGGAAGTAGACGAAGCACCCAAAAACTCATTTTTAGCATTGGAAGTCAG
ATGCAATAAAGAAGGTATCATCCAATAATCTTCTTCTCTGCCTTCCATTTGCTTGAAATC
GTCTCTCACTCAGAATCTTGGAGGAAAACAGATTTTATTTTACCAAATTTTTATAAAAGA
TGATAACTTTCATGCTTGACAGGAATTCTGCAAACCTTGAAAAGCTAAGAAAAGCTATTA
GTGCCGTGTTTCCATTAAGTCCTTCTCTGTGGGCTAGAATGAGGGAATGAAGCATCTCTA
GCCTCTAGGTGAATTAGTATTTGCTCTTCTTTGGTATAATGCTCATATTGAATTAGGTGT
TTGCTCTTATTACTGTAAATGAATCTGGAAAATTTCCTAGTTTCCGTATGATCATGCTTA
GATGAAATCCTGTGAGGGAAGAGATAATGATAAAAGTATATTTTTCCATCTGCATTGATT
GGTAAGTCTGTTCATCATAGATATCAATTATGCATACTGCCAATGACTATCTGCTGCTAT
TTTATGTCTTAGTGAAGCATGCCAGTATGGTGGATTAATATTCTTGTGTCTCCCAGGGAC
TGGCATATGTTGACTTTGTGGATGATGAGGACCTTGCAACAGCTATAGCAAAGAACAAAA
AGATGTTTCTCGGTAAGAAGATCAGTATAGAACGGTCAAAATCCAAAGAAGGGTAAAATA
CGGATTTCGCTCGCGTGGAAATGGCGGGAATCTATATCTCTTTCTGGTTGTCCTAGTTCA
TACTACATCTTGTCCAAAGAATTCTAACCTGGTATGATTGCTTTCATAGAAGGTTCGGGG
AATTCAAAGGACACATCTCACTCAGGGTTTTGAGAAGGCGAAAGCACCTTGGTCCCTTCT
CTTCTCATTCCCTGGATATATAGCTTTTCTTTTTCTACTTTTTAACGCAAATCTTATCCT
GTAGACTGACAATATCGCATCTGCGACTCTCTCTTTTGTGACAAGCAAATGAAACACACA
TTTGAGTTATTGC


BQ
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AF RR4C559TF U 1
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BS 1 700 RR4C559TF
BS 701 1213 RR4C559JQ

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TAGAACAAGTTCATGTCCTCTTGTTTGTCATGCACCTTCATGTCTGAGCAAAACAATACT
TAGAGAATATCCAGCAGTCCAAATTCTATGCACAATCAGACCAATATCAAAGCAGCTAAA
CGTAACGGTGGGGGAAGTAGACGAAGCACCCAAAAACTCATTTTTAGCATTGGAAGTCAG
ATGCAATAAAGAAGGTATCATCCAATAATCTTCTTCTCTGCCTTCCATTTGCTTGAAATC
GTCTCTCACTCAGAATCTTGGAGGAAAACAGATTTTATTTTACCAAATTTTTATAAAAGA
TGATAACTTTCATGCTTGACAGGAATTCTGCAAACCTTGAAAAGCTAAGAAAAGCTATTA
GTGCCGTGTTTCCATTAAGTCCTTCTCTGTGGGCTAGAATGAGGGAATGAAGCATCTCTA
GCCTCTAGGTGAATTAGTATTTGCTCTTCTTTGGTATAATGCTCATATTGAATTAGGTGT
TTGCTCTTATTACTGTAAATGAATCTGGAAAATTTCCTAGTTTCCGTATGATCATGCTTA
GATGAAATCCTGTGAGGGAAGAGATAATGATAAAAGTATATTTTTCCATCTGCATTGATT
GGTAAGTCTGTTCATCATAGATATCAATTATGCATACTGC

QA 1 700 1 700
DS 

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CTTCTTTGGTATAATGCTCATATTGAATTAGGTGTTTGCTCTTATTACTGTAAATGAATC
TGGAAAATTTCCTAGTTTCCGTATGATCATGCTTAGATGAAATCCTGTGAGGGAAGAGAT
AATGATAAAAGTATATTTTTCCATCTGCATTGATTGGTAAGTCTGTTCATCATAGATATC
AATTATGCATACTGCCAATGACTATCTGCTGCTATTTTATGTCTTAGTGAAGCATGCCAG
TATGGTGGATTAATATTCTTGTGTCTCCCAGGGACTGGCATATGTTGACTTTGTGGATGA
TGAGGACCTTGCAACAGCTATAGCAAAGAACAAAAAGATGTTTCTCGGTAAGAAGATCAG
TATAGAACGGTCAAAATCCAAAGAAGGGTAAAATACGGATTTCGCTCGCGTGGAAATGGC
GGGAATCTATATCTCTTTCTGGTTGTCCTAGTTCATACTACATCTTGTCCAAAGAATTCT
AACCTGGTATGATTGCTTTCATAGAAGGTTCGGGGAATTCAAAGGACACATCTCACTCAG
GGTTTTGAGAAGGCGAAAGCACCTTGGTCCCTTCTCTTCTCATTCCCTGGATATATAGCT
TTTCTTTTTCTACTTTTTAACGCAAATCTTATCCTGTAGACTGACAATATCGCATCTGCG
ACTCTCTCTTTTGTGACAAGCAAATGAAACACACATTTGAGTTATTGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGAAAGACAGGATCTTTCGAGCAGATAAGATTGATTTCAATAGTTTAGATAAACAGCTT
GAGAAACATCTGAGTAGGGTTTGGTCGAGGAACCTTGAGATAACTCATAAAGCTAAGGAA
AGAGTGGGAGATTAATTTGGCTAAGTTGGAAACAAGGAATGTTATTGCTCGTGGTACTTT
TGGGACGGTCTATAAAGGCATATATGATGGTGAAGATGTTGCAGTGAAGGTGCTTGATTG
GGAAGATGATGGTAAAGAAAGTACAACAAATCGGGCTTTATTTCGTCAAGAGGTCACTGT
TTGGCACAAACTAGACCACCCAAATGTCACAAAGTTTGTTGGAGCATCAATGGGAACAAC
GAATCTGAAAATACCAATACCTGACTCAGAAAACTCATTACCTCAACGAGCTTGTTGTGT
AGTTGTGGAATATGTCTCTGGTGGAACGTTGAAGCAGTACTTGATCCTTAATAGACGCAA
GAAACTCGCGTTTAAAGTTGTTATCAAACTCGCTCTTGACTCTCCCGAGGGCTAAGCTAT
CTGCACTCAGAGAAGATAGTGCACCGTGATGTGAAAACAGAGAATATGCTTTTGGATGTT
CAAAGTAATCTGAAAATAGCAGATTTTGGAGTAGCGAGAGTGGAAGCTCTGAATCCAAAG
GACATGACTGGAGAAACGGGTACTCTTGGATACATGTCTCCTGAGGTTATCGATAGTAAG
CCATACAACAGAAGGTGTGATGTTTATAGCTTTGGGATATGTTTATGGGAAATCTACTGC
TGTGACATGCCTTATCCTGATTTTAGCTTTGTCGATGTTTCTTCAGCTGTTGTCTTACAT
AATCTGAGACCGGAGATTCCTAGATGCTGTCCGACAGTATTGGCGAATATAATGAAGAAA
TGTTGGGATGGGAATCCGCAGAGACGACCGGGGATGGTGGACGTGGTGAAGATGCTTGAA
GGAATTGATACCAGTAAAGGTGGCGGTATGATACCTGAAGATCAGAGTCCCGGCGGCTGC
TTTTGCTTTGCTCCAGCTCGTGGCCCCTAAACTCCCTTCTCTCTCTTTTTTAATCGTGTT
GTTTTCAGTCATTTTTCCTTCACATTGAATGATATTTGTTTCTTTTTTTTTGGAATGAAT
GTTAAATTTTATTCATCAAAAAGCCTTTTTACG


BQ
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AF RR4H013TF U 1
AF RR4H013JQ C 446
BS 1 681 RR4H013TF
BS 682 682 RR4H013JQ
BS 683 709 RR4H013TF
BS 710 1233 RR4H013JQ

RD RR4H013TF 709 0 0
GATTTGATTTGAATTCAAGACATGGAGAAAAGATCAGGAGAAGAAGAAGGGAGTGTTGGG
AAGAAAGACAGGATCTTTCGAGCAGATAAGATTGATTTCAATAGTTTAGATAAACAGCTT
GAGAAACATCTGAGTAGGGTTTGGTCGAGGAACCTTGAGATAACTCATAAAGCTAAGGAA
AGAGTGGGAGATTAATTTGGCTAAGTTGGAAACAAGGAATGTTATTGCTCGTGGTACTTT
TGGGACGGTCTATAAAGGCATATATGATGGTGAAGATGTTGCAGTGAAGGTGCTTGATTG
GGAAGATGATGGTAAAGAAAGTACAACAAATCGGGCTTTATTTCGTCAAGAGGTCACTGT
TTGGCACAAACTAGACCACCCAAATGTCACAAAGTTTGTTGGAGCATCAATGGGAACAAC
GAATCTGAAAATACCAATACCTGACTCAGAAAACTCATTACCTCAACGAGCTTGTTGTGT
AGTTGTGGAATATGTCTCTGGTGGAACGTTGAAGCAGTACTTGATCCTTAATAGACGCAA
GAAACTCGCGTTTAAAGTTGTTATCAAACTCGCTCTTGACTCTCCCGAGGGCTAAGCTAT
CTGCACTCAGAGAAGATAGTGCACCGTGATGTGAAAACAGAGAATATGCTTTTGGATGTT
CAAAGTAATCTGAAAATAGCATATTTTGGAGTAGCGAGAGTGGAAGCTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4H013JQ 788 0 0
CTCAG
AAACTCATTACCTCAACGAGCTTGTTGTGTAGTTGTGGAATATGTCTCTGGTGGAACGTT
GAAGCAGTACTTGATCCTTAATAGACGCAAGAAACTCGCGTTTAAAGTTGTTATCAAACT
CGCTCTTGACTCTCCCGAGGGCTAAGCTATCTGCACTCAGAGAAGATAGTGCACCGTGAT
GTGAAAACAGAGAATATGCTTTTGGATGTTCAAAGTAATCTGAAAATAGCAGATTTTGGA
GTAGCGAGAGTGGAAGCTCTGAATCCAAAGGACATGACTGGAGAAACGGGTACTCTTGGA
TACATGTCTCCTGAGGTTATCGATAGTAAGCCATACAACAGAAGGTGTGATGTTTATAGC
TTTGGGATATGTTTATGGGAAATCTACTGCTGTGACATGCCTTATCCTGATTTTAGCTTT
GTCGATGTTTCTTCAGCTGTTGTCTTACATAATCTGAGACCGGAGATTCCTAGATGCTGT
CCGACAGTATTGGCGAATATAATGAAGAAATGTTGGGATGGGAATCCGCAGAGACGACCG
GGGATGGTGGACGTGGTGAAGATGCTTGAAGGAATTGATACCAGTAAAGGTGGCGGTATG
ATACCTGAAGATCAGAGTCCCGGCGGCTGCTTTTGCTTTGCTCCAGCTCGTGGCCCCTAA
ACTCCCTTCTCTCTCTTTTTTAATCGTGTTGTTTTCAGTCATTTTTCCTTCACATTGAAT
GATATTTGTTTCTTTTTTTTTGGAATGAATGTTAAATTTTATTCATCAAAAAGCCTTTTT
ACG

QA 6 788 6 788
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5941Contig1 915 2 2 U
GGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACACAGGTCTCCGCAAAGT
CGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAGGTCAAGGAAGTTGGTG
ACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGTGGCCGTAACAATAACG
GTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCGCACGAAAGGCGTAACGA
TCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAGTAGACATGTCTGTGAAGATGCGGACT
ACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCCCTGGGATTGGCTTTGGG
CTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCTCCTTCCGGGGGGGCCCGAGCC
ATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTGTGTCAGTACCTACGGGC
CAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCCTCCCAAAAGGTAACGGA
GGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCGAGTGCAAAGGCAGAAGG
GAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTCGGCCTTAGTGATCCGAC
GGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACTCTAGGGATAACAGGCTG
ATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCTTCGCC
ACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCATTAAAGCGGTACGTGAG
CTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCATATCCGGTGTGGGCGTTAGAGCATTG
AGAGGACCTTTCCCT


BQ
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AF RR4C248TF U 1
AF RR4D960TF U 301
BS 1 374 RR4C248TF
BS 375 915 RR4D960TF

RD RR4C248TF 374 0 0
GGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACACAGGTCTCCGCAAAGT
CGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAGGTCAAGGAAGTTGGTG
ACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGTGGCCGTAACAATAACG
GTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCGCACGAAAGGCGTAACGA
TCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAGTAGACATGTCTGTGAAGATGCGGACT
ACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCCCTGGGATTGGCTTTGGG
CTTTTCCTGCGCAG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4D960TF 615 0 0
ACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCCCTGGGATTGGCTTTGGG
CTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCTCCTTCCGGGGGGGCCCGAGCC
ATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTGTGTCAGTACCTACGGGC
CAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCCTCCCAAAAGGTAACGGA
GGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCGAGTGCAAAGGCAGAAGG
GAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTCGGCCTTAGTGATCCGAC
GGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACTCTAGGGATAACAGGCTG
ATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCTTCGCC
ACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCATTAAAGCGGTACGTGAG
CTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCATATCCGGTGTGGGCGTTAGAGCATTG
AGAGGACCTTTCCCT

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL5942Contig1 1276 2 2 U
GATCTACTACAGGCGCGTTGAGGAAGCCGTTGCCGCCAAGGAGGCTCTTCAAGGCGCCGA
TTTGAACGGGAGTCACATTAAGATCGAATTCGCTCGACCGGCAAAACCTTGCAAGAGTCT
TTGGGTTGGTGGAATCAGTTCGAGTGTCCCTAAAGATGTACTCGAGGCAGAGTTCAGGAA
ATTTGGGGAAATCGAAAGTTTCAGGTTTCTTAAGGATCGCAAGACTGCTTTTATTGACTT
CTTTGACGTGGACGATGCTATTCAGGCAAAGACCATGAACGGGAAGCGACTAGGTGGTAG
CTTTTTGCGAGTTGATTTTCTTCGCTCACAAGGGCCAAGGAAAGAATCACGGCTTGGCTC
CGAAGATGGCAGGGATGGTAGTTTGAGTGCTAAGCACCAGTATACTCACTCATCTGGAGA
TGGTCAAGCAAGTAACGTTCTGTGGATTGGGTACCCTCCTTCTGTTCAGATAGACGAACG
TCTGCTGCACAATTCCATGATTCTCTTTGGTGAGATTGAGAGATGTATTAGCTATCCATC
AAGGCATTTCTCACTTGTAGAATTTAGAAGCATTGAGGAAGCTCGCTGTGCTAAGGAAGG
ACTACAGGGAAGGTTATTCAACGATCCGAGAATCACAATCATGTACCAAAACGATAACAT
TCCCCCTGGACGGGGAGATGATACCTTTTTTATTCTGGTGTCAAACGAGCAAAGCCCGAG
ATGTTTATCAATGATCCTCCATACATATCGTCACCACATTCCAGTGTGGTTCTTGACCCT
GTTAGGCCTTTCCGAGGTAGCATGGAACGTTCACATATTGGTCCAGAATATGGCGATGTA
GCTGGCAACGAAGGAAGCTGGAGAAGGCCATCTCCTACAGGAGCTGGAATACTCCCGTCT
CCCGCACCAAGTACAAGGCTACCCGTTAGGTCAAACCGTGGTTCTTGGGAAGGATATGAT
CCTGCTCAGTTGGATAGAGAACCTAAAAGAACTCGTAGAGATGGATCAGTAGATGCTTTC
CCGTCGATGAGTGTAGATGATCGTATCACTGGATTGGATAGTAGTTCATATAGACGTGGA
TCAGTTACATCGAGACCACGCCGTGGTTTCCCTGATACTGATTTCATTTGGAGGGGGGTC
ATAGCCAAAGGTGGAACTCCTGTTTGTCATGCTCGTTGTGTACCTATTGGAAAGGGGATT
GAATCTGAACTGTGAGTACTATTTTCACGCACTTTAGCCTTTTCTGCCTTAACTTAATAG
TTCAGTGATTATAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B411TF U 1
AF RR4B411JQ C 522
BS 1 781 RR4B411TF
BS 782 1276 RR4B411JQ

RD RR4B411TF 781 0 0
GATCTACTACAGGCGCGTTGAGGAAGCCGTTGCCGCCAAGGAGGCTCTTCAAGGCGCCGA
TTTGAACGGGAGTCACATTAAGATCGAATTCGCTCGACCGGCAAAACCTTGCAAGAGTCT
TTGGGTTGGTGGAATCAGTTCGAGTGTCCCTAAAGATGTACTCGAGGCAGAGTTCAGGAA
ATTTGGGGAAATCGAAAGTTTCAGGTTTCTTAAGGATCGCAAGACTGCTTTTATTGACTT
CTTTGACGTGGACGATGCTATTCAGGCAAAGACCATGAACGGGAAGCGACTAGGTGGTAG
CTTTTTGCGAGTTGATTTTCTTCGCTCACAAGGGCCAAGGAAAGAATCACGGCTTGGCTC
CGAAGATGGCAGGGATGGTAGTTTGAGTGCTAAGCACCAGTATACTCACTCATCTGGAGA
TGGTCAAGCAAGTAACGTTCTGTGGATTGGGTACCCTCCTTCTGTTCAGATAGACGAACG
TCTGCTGCACAATTCCATGATTCTCTTTGGTGAGATTGAGAGATGTATTAGCTATCCATC
AAGGCATTTCTCACTTGTAGAATTTAGAAGCATTGAGGAAGCTCGCTGTGCTAAGGAAGG
ACTACAGGGAAGGTTATTCAACGATCCGAGAATCACAATCATGTACCAAAACGATAACAT
TCCCCCTGGACGGGGAGATGATACCTTTTTTATTCTGGTGTCAAACGAGCAAAGCCCGAG
ATGTTTATCAATGATCCTCCATACATATCGTCACCACATTCCAGTGTGGTTCTTGACCCT
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4B411JQ 755 0 0
GATGTATTAGCTATCCATCAAGGCATTTCTCACTTGTAGAATTTAGAAGCATTGAGGAAG
CTCGCTGTGCTAAGGAAGGACTACAGGGAAGGTTATTCAACGATCCGAGAATCACAATCA
TGTACCAAAACGATAACATTCCCCCTGGACGGGGAGATGATACCTTTTTTATTCTGGTGT
CAAACGAGCAAGGCCCGAGATGTTTATCAATGATCCTCCATACATATCGTCACCACATTC
CAGTGTGGTTCTTGACCCTGTTAGGCCTTTCCGAGGTAGCATGGAACGTTCACATATTGG
TCCAGAATATGGCGATGTAGCTGGCAACGAAGGAAGCTGGAGAAGGCCATCTCCTACAGG
AGCTGGAATACTCCCGTCTCCCGCACCAAGTACAAGGCTACCCGTTAGGTCAAACCGTGG
TTCTTGGGAAGGATATGATCCTGCTCAGTTGGATAGAGAACCTAAAAGAACTCGTAGAGA
TGGATCAGTAGATGCTTTCCCGTCGATGAGTGTAGATGATCGTATCACTGGATTGGATAG
TAGTTCATATAGACGTGGATCAGTTACATCGAGACCACGCCGTGGTTTCCCTGATACTGA
TTTCATTTGGAGGGGGGTCATAGCCAAAGGTGGAACTCCTGTTTGTCATGCTCGTTGTGT
ACCTATTGGAAAGGGGATTGAATCTGAACTGTGAGTACTATTTTCACGCACTTTAGCCTT
TTCTGCCTTAACTTAATAGTTCAGTGATTATAAGC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL5943Contig1 1127 2 2 U
TTTTTGCTCCTGAGTTGGATAAACATGGGTATCAAGCTCTCTACAAGAGGAAGACTAATG
AGGTTCTCAGCGGAAGTACAACAAGTGCAATTGACGGATGTGCAACATTTTTCAGAAGGG
ATAGATTTGCACATGTCAAGAAATATGATGTTGAGTTCAATAAGGCTGCTCAGTCTTTGA
CTGAGGCTATCATCCCTCCTGCTCAGAAGAGAAGTGCTTTAAACCGACTTGTGAAGGATA
ACATTGCGTTAATAGTTGTTCTTGAAGCCAAGTTTGGTAATCAACCTGCTGATCTCTCTG
GGAAGCGCCAGCTTATCTGTGTGGCGAATACACATGTTAATGTTCAACAAGAACTGAAGG
ATGTGAAGCTCTGGCAGGTTCATACTTTACTAAAAGGACTGGAGAAAATAGCTGCTAGTG
CCGATATTCCTATGCTTGTATGTGGAGACTTCAATACACTTCCCGGGAGTGCTCCTCATT
CACTTCTTGTATATGGAAAGGTTGATCCACAACATCCAGATCTATTAGTTGATCCACTTG
GGATCCTGCGTCCTCAAACCAAACTGACTCATCAATTGCCTCTGGTGAGTGCGTACTCAT
CGTTTGTGAGATCAGTAACGGGTCTTGGATTGGAACAACACAGAAGGAAAATGGATCTTA
ATACAAACGAGCCGTTGTTTACCAATTGTACAAGGGACTTCATTGGCACTCATGACTATA
TATTTTATACAGCGGATACGTTAATGGTGGAGTCTTTATTGGAGTTGCTAGATGAAGATG
GTTTGAGAAAGGATACAGCTCTTCCTTCACCTGAATGGTCGTCTAGTCACATTGCACTAT
TAGCTGAGTTCCGTTGCATGCCTAGGACCAGACGCTAACCGGTGTTCCCCCTTCTTTTCA
CCATGGCAAATCGCTTACAGATAGTTTTCTTTTTTTTGTTTTCATGTTTTTATAATCAGA
TTATGACAGAGATGACACAAAAGTTCGAAAGTGATTCTGATCCAAAGTAAAAGGCAGAGA
TCACTTTCTGAAGTTGGTCATTCTTTATAATGACCTCTTGTGTTTCTTTCTTTGTCTAAC
CTTTCGCATTTTGATCGTCAATATTAAGAGATACCCCTTTGCTTTTT


BQ
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AF RR4FL05TF U 1
AF RR4FL05JQ C 385
BS 1 639 RR4FL05TF
BS 640 1127 RR4FL05JQ

RD RR4FL05TF 639 0 0
TTTTTGCTCCTGAGTTGGATAAACATGGGTATCAAGCTCTCTACAAGAGGAAGACTAATG
AGGTTCTCAGCGGAAGTACAACAAGTGCAATTGACGGATGTGCAACATTTTTCAGAAGGG
ATAGATTTGCACATGTCAAGAAATATGATGTTGAGTTCAATAAGGCTGCTCAGTCTTTGA
CTGAGGCTATCATCCCTCCTGCTCAGAAGAGAAGTGCTTTAAACCGACTTGTGAAGGATA
ACATTGCGTTAATAGTTGTTCTTGAAGCCAAGTTTGGTAATCAACCTGCTGATCTCTCTG
GGAAGCGCCAGCTTATCTGTGTGGCGAATACACATGTTAATGTTCAACAAGAACTGAAGG
ATGTGAAGCTCTGGCAGGTTCATACTTTACTAAAAGGACTGGAGAAAATAGCTGCTAGTG
CCGATATTCCTATGCTTGTATGTGGAGACTTCAATACACTTCCCGGGAGTGCTCCTCATT
CACTTCTTGTATATGGAAAGGTTGATCCACAACATCCAGATCTATTAGTTGATCCACTTG
GGATCCTGCGTCCTCAAACCAAACTGACTCATCAATTGCCTCTGGTGAGTGCGTACTCAT
CGTTTGTGAGATCAGTAACGGGTCTTGGATTGGAACAAC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4FL05JQ 743 0 0
CTTTACTAAAAGGACTGGAGAAAATAGCTGCTAGTGCCGATATTCCTATGCTTGTATGTG
GAGACTTCAATACACTTCCCGGGAGTGCTCCTCATTCACTTCTTGTATATGGAAAGGTTG
ATCCACAACATCCAGATCTATTAGTTGATCCACTTGGGATCCTGCGTCCTCAAACCAAAC
TGACTCATCAATTGCCTCTGGTGAGTGCGTACTCATCGTTTGTGAGATCAGTAACGGGTC
TTGGATTGGAACAACACAGAAGGAAAATGGATCTTAATACAAACGAGCCGTTGTTTACCA
ATTGTACAAGGGACTTCATTGGCACTCATGACTATATATTTTATACAGCGGATACGTTAA
TGGTGGAGTCTTTATTGGAGTTGCTAGATGAAGATGGTTTGAGAAAGGATACAGCTCTTC
CTTCACCTGAATGGTCGTCTAGTCACATTGCACTATTAGCTGAGTTCCGTTGCATGCCTA
GGACCAGACGCTAACCGGTGTTCCCCCTTCTTTTCACCATGGCAAATCGCTTACAGATAG
TTTTCTTTTTTTTGTTTTCATGTTTTTATAATCAGATTATGACAGAGATGACACAAAAGT
TCGAAAGTGATTCTGATCCAAAGTAAAAGGCAGAGATCACTTTCTGAAGTTGGTCATTCT
TTATAATGACCTCTTGTGTTTCTTTCTTTGTCTAACCTTTCGCATTTTGATCGTCAATAT
TAAGAGATACCCCTTTGCTTTTT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL5944Contig1 886 2 2 U
GGCCCGAGAAAGATCTTCGAGCCAGCCAGCGCTACAGTGTTTGTTAACAATCAGTAATCG
AATCCTCATCTTCACTGAGAAAAGCAATGTCTAACGATCACAAGAAAAGACTTGCGTCTA
GATTAGAGTGGGAAGGTTTCATCGAGACGAAGATCAAAAGTGATGGAAATTGCCAGTTTA
GCTCTTTAGCGGATCAGCTCTTCAGGTGTCCGGAGTATCATGAGAAAGTTCGAGAGAGAA
TAGTTAAACAGCTTAAAACTTGTCCAAAATTTACAGAGAGTTTGTTGAGATGGACTCGAG
TAAAAAAAGAAGCAACGATCTTCCCAAGGATTACTCCGAGTATGTCAAGAACATGTCGAA
CAACGGTGTGTGGGGTGATAGCGTCACGTTGCAGGCAGCTGCTGACACGTTTGGGGTAAA
GATAGTAGTCATTACATCGGAGAAAGAAGTAGATTCCATGGAGATTGTTCCCAAGTCTTT
GACACTCGAGAGAGTTGTTTACTTGAGCTATTTGGCTGGGGTCCATTACAACTCCATCTA
CTTAAAAGGTTCAGAGACGGATACTGCTCCGATGGAGCTTCCGGGGAAGACTAAGAACAA
GAATACGAATAAGAGTGATAATAGCAAAGACATGGAGCCACAAGGGAGGAATGAGAATGA
CAAGAACAAGGAGAAGATGAAGAAGAACAAGGACGGAAACAAAAGGAAGAATAAATAGCT
ACAAGATACCTTACCTTTTTCATGATTTGTTTTTCCAAACGCAAATATGTACGTAGAGGT
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TTTCTGCTTTGACAGTTGAGATGAGAGCATAATGAGTTATGCAACG


BQ
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AF RR4EG61TF U 1
AF RR4EG61JQ C 120
BS 1 378 RR4EG61TF
BS 379 886 RR4EG61JQ

RD RR4EG61TF 378 0 0
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AATCCTCATCTTCACTGAGAAAAGCAATGTCTAACGATCACAAGAAAAGACTTGCGTCTA
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GCTCTTTAGCGGATCAGCTCTTCAGGTGTCCGGAGTATCATGAGAAAGTTCGAGAGAGAA
TAGTTAAACAGCTTAAAACTTGTCCAAAATTTACAGAGAGTTTGTTGAGATGGACTCGAG
TAAAAAAAGAAGCAACGATCTTCCCAAGGATTACTCCGAGTATGTCAAGAACATGTCGAA
CAACGGTGTGTGGGGTGA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4EG61JQ 767 0 0
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AGCTCTTTAGCGGATCAGCTCTTCAGGTGTCCGGAGTATCATGAGAAAGTTCGAGAGAGA
ATAGTTAAACAGCTTAAAACTTGTCCAAAATTTACAGAGAGTTTGTTGAGATGGACTCGA
GTAAAAAAAGAAGCAACGATCTTCCCAAGGATTACTCCGAGTATGTCAAGAACATGTCGA
AGAACGGTGTGTGGGGTGATAGCGTCACGTTGCAGGCAGCTGCTGACACGTTTGGGGTAA
AGATAGTAGTCATTACATCGGAGAAAGAAGTAGATTCCATGGAGATTGTTCCCAAGTCTT
TGACACTCGAGAGAGTTGTTTACTTGAGCTATTTGGCTGGGGTCCATTACAACTCCATCT
ACTTAAAAGGTTCAGAGACGGATACTGCTCCGATGGAGCTTCCGGGGAAGACTAAGAACA
AGAATACGAATAAGAGTGATAATAGCAAAGACATGGAGCCACAAGGGAGGAATGAGAATG
ACAAGAACAAGGAGAAGATGAAGAAGAACAAGGACGGAAACAAAAGGAAGAATAAATAGC
TACAAGATACCTTACCTTTTTCATGATTTGTTTTTCCAAACGCAAATATGTACGTAGAGG
TTGTTTTTCATTTGGGAAACAAAATGTAAACGTGACAAAAAGGGTTGTTTAGAGCCTAAC
TTTTCTGCTTTGACAGTTGAGATGAGAGCATAATGAGTTATGCAACG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5946Contig1 766 2 9 U
TTTTTTTTTGCATAGATACACATCTTCTGTGAATGAAGAACTTGAAATAATTTACTCATA
GTAACATATAACAATCGCAAAATTCAAATACAGTCATTGTACAACATGTTGCAATTATGT
TCACCGGCTCTCGAACTTGAACCACTTCCAGTTAGCATAGATCTCTTAGTCCTTGCCCTG
AGGGAAGCTGCTTGTGATCGGAGGAGGAGGATCAGTAGTAATCTCGCTTCTTGTTGTTAT
CGTAGGCATCTTTTCTCTGTACTTCTTTGCCATTTCTTCAGCCTCCATAAACACTTTCTC
TCTATTTGTGATGAACAACCCCGGCTCGCTTTCAAGATCTGCAATGCTTAAAGATATCTT
GTCTGGAAATAGAGACTTCACAACCAGAACTTTTAAGCTTTCGTCCACCTGAAGCACGTC
GCTAACAGATCCAATTCTTCTGCGGGTTATGTTTGAAATGTGCAGCAATCCACTTCTACT
ACTATCCCCGAGTTTGACCTGGGCTCCATACGGTAAGATTTTGGCAACTGTTCCTTCTAA
GAGTGTTCCTTCTCTAAGGTACTGCTTCTCCCAGGCTGTTTTTTCACTCAGTATCAAGTC
GTTTTTGTCTTCATTCAATCGCGTTATCTGCACAACCAGTCTACGACCCACATTTTCCTT
CAACTCAGTGAAGCTATTCACTCTCTTTACCAGCTCCTGCTTTGGAATAAACCCTCTCAA
ACCCTCAATTCTTGTGAGAAGCCCACCAGTATTCCACTCAGTTATC


BQ
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AF RR4D218JQ U 10
AF RR4D218TF C 1
BS 1 9 RR4D218TF
BS 10 183 RR4D218JQ
BS 184 184 RR4D218TF
BS 185 238 RR4D218JQ
BS 239 239 RR4D218TF
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BS 272 282 RR4D218JQ
BS 283 766 RR4D218TF

RD RR4D218JQ 273 0 0
GCATAGATACACATCTTCTGTGAATGAAGAACTTGAAATAATTTACTCATAGTAACATAT
AACAATCGCAAAATTCAAATACAGTCATTGTACAACATGTTGCAATTATGTTCACCGGCT
CTCGAACTTGAACCACTTCCAGTTAGCATAGATCTCTTAGTCCTTGCCCTGAGG*AAGCT
GCTTGTGATCGGAGGAGGAGGATCAGTAGTAATCTCGCTTCTTGTTGTT*TCGTAGGCAT
CTTTTCTCTGTACTTCTTTGC*ATTTCTTCAGC

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR4D218TF 766 0 0
TTTTTTTTTGCATAGATACACATCTTCTGTGAATGAAGAACTTGAAATAATT*ACTCATA
GTAACATATAACAATCGCAAAATTCAAATACAGTCATTGTACAACATGTTGCAATTATGT
TCACCGGCTCTCGAACTTGAACCACTTCCAGTTAGCATAGATCTCTTAGTCCTTGCCCTG
AGGGAAGCTGCTTGTGATCGGAGGAGGAGGATCAGTAGTAATCTCGCTTCTTGTTGTTAT
CGTAGGCATCTTTTCTCTGTACTTCTTTGCCATTTCTTCAGCCTCCATAAACACTTTCTC
TCTATTTGTGATGAACAACCCCGGCTCGCTTTCAAGATCTGCAATGCTTAAAGATATCTT
GTCTGGAAATAGAGACTTCACAACCAGAACTTTTAAGCTTTCGTCCACCTGAAGCACGTC
GCTAACAGATCCAATTCTTCTGCGGGTTATGTTTGAAATGTGCAGCAATCCACTTCTACT
ACTATCCCCGAGTTTGACCTGGGCTCCATACGGTAAGATTTTGGCAACTGTTCCTTCTAA
GAGTGTTCCTTCTCTAAGGTACTGCTTCTCCCAGGCTGTTTTTTCACTCAGTATCAAGTC
GTTTTTGTCTTCATTCAATCGCGTTATCTGCACAACCAGTCTACGACCCACATTTTCCTT
CAACTCAGTGAAGCTATTCACTCTCTTTACCAGCTCCTGCTTTGGAATAAACCCTCTCAA
ACCCTCAATTCTTGTGAGAAGCCCACCAGTATTCCACTCAGTTATC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL5947Contig1 1112 2 2 U
GGACAACCAAAAACATAAACACAAACGCCAATCGAAACTCTCGCGTTTGCTATGGAGAAG
AAGTGTTTTGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCGTGTCTCTGTATCG
GTTCCCTTTATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAAC
TTCACACAGCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAAT
GGAGAACTCGATTCATGGTTCATGCCACTTTCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAA
GTGAAGCAAATGAAAGAGTTACGTCAAGGATACAACATTGTTGGAAGATCTCAGGGGAAT
CTAGTGGCTAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTA
TCTTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCTCCTCTGTTCCGATGTGTGGTTCTGGATTATGG
TGTGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTTATTCAAGATCAT
CTTGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCC
AAGTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAA
CGTTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTT
CCAAAAGATTCATCTTGGTTCGGGTTTTACCCTGATGGTGATTTCGGACCTTTTTTTACC
GTTCGAGAGACAAAACTCTTTAAAGAGGACTGGATCGGTTTGAAACCATTGACTGATACA
GGGAAAGTGGAGTTTGTGAGTGTAGATGGCGCACACTTAAGAATGTCAAATATGGATATC
GTCAAATATGTTGTACCTTATCTCCAAAACCAACCTTTTTCCGAGCAAAAAAGATTCAAT
CGCAAAACGAAAGAGCCTTTGCGCCCTTGAAAGAGCAAATATTTCACGTTTCATATGCTT
ATTTTATGTAATAGTGAAAAAAAACTTAGTGATGGATGTGTAGAACAAAAATCATTATTC
ATATAGATATAAATAATATACACTAGACCTCG


BQ
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AF RR4FC71TF U 1
AF RR4FC71JQ C 475
BS 1 738 RR4FC71TF
BS 739 1112 RR4FC71JQ

RD RR4FC71TF 738 0 0
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AAGTGTTTTGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCGTGTCTCTGTATCG
GTTCCCTTTATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAAC
TTCACACAGCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAAT
GGAGAACTCGATTCATGGTTCATGCCACTTTCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAA
GTGAAGCAAATGAAAGAGTTACGTCAAGGATACAACATTGTTGGAAGATCTCAGGGGAAT
CTAGTGGCTAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTA
TCTTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCTCCTCTGTTCCGATGTGTGGTTCTGGATTATGG
TGTGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTTATTCAAGATCAT
CTTGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCC
AAGTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAA
CGTTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTT
CCAAAAGATTCATCTTGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4FC71JQ 638 0 0
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GATCATCTTGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAA
AGTTCCAAGTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTAC
AAAGAACGTTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACGATAAGGTC
ATTGTTCCAAAAGATTCATCTTGGTTCGGGTTTTACCCTGATGGTGATTTCGGACCTTTT
TTTACCGTTCGAGAGACAAAACTCTTTAAAGAGGACTGGATCGGTTTGAAACCATTGACT
GATACAGGGAAAGTGGAGTTTGTGAGTGTAGATGGCGCACACTTAAGAATGTCAAATATG
GATATCGTCAAATATGTTGTACCTTATCTCCAAAACCAACCTTTTTCCGAGCAAAAAAGA
TTCAATCGCAAAACGAAAGAGCCTTTGCGCCCTTGAAAGAGCAAATATTTCACGTTTCAT
ATGCTTATTTTATGTAATAGTGAAAAAAAACTTAGTGATGGATGTGTAGAACAAAAATCA
TTATTCATATAGATATAAATAATATACACTAGACCTCG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL5948Contig1 1106 2 4 U
GCAACTCAATCCGGGCCTGTTACTCTGCAAGGGAACAACAATTTCATGGGAGACATGTTT
ACACAAGCTGGACCAACAAGCTCAGTGGCATCATCGCCATCCCATTCAGATCTAACACCT
ATAACAGGAGCGATTGAGATCGTTCCTCCGCCTCAGAAAAAGTTCGAGCCAAAATCATCA
GTCTGGGCAGACACATTGAGCAGGGGGCTTGTTAACTTCAACATATCTGGACCTAAAACA
AATCCATTGTCAGACATAGGAGTTGACTTTGATGCGATCAACAGGAGAGAGAAACGGTTT
GAGAAACCGACAAACGCACCACCAGCAACATCGACTATCAACATGGGTAAAGCAATGGGA
TCAGGCACTGGCTTAGGGCGTGCCGGTGCAACTGCTATGAGACCTCCTCCAAATCCAATG
GTAGGCTCTGGCATGCCCATGGGTGCTGGTGGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACAC
ATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCCAAATCAACCAATGGGTATGGGAATGGGA
CCAGGCATGAACCAAAACCAACCTATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAAC
CAACCTCTGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGT
TATCCGATGCAACCACAAAACCAAGGAATGGTCCCTGGTCCGAACATGCCAGGAAACAAC
AACAACTATAATCCAATGATGGGTCAAGGCGGTTATAACCCTCAACAATCCTATGGTGGT
GGATACAGGTAAGATCAAGCCGACTATCCACTTGTAAAATCAAGAACAGAACACTCTGGT
TCCATACCTTTCCGTGCTTTTTTGCATTTTTACCTGGGACATGTAATATCAGGGGATAAA
ATAGTGGGATTGGTCAGCCGCTTCACGGAAGTACTCAGGTTACATTAATCATGCCAGCAT
CAGGATTTTTTACAGTTTTTTTTACCTTTGCTATATCGGGTATAAATTGATATATACTAC
ACAGATTTTATTTTTGAGGATTTCACGTATTGAATGTGTAAACATTTTTCATACACGGAA
CAAATAAGATATGTTTTTTTTTTTTT


BQ
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AF RR4FU17TF U 1
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BS 1 658 RR4FU17TF
BS 659 659 RR4FU17JQ
BS 660 674 RR4FU17TF
BS 675 1106 RR4FU17JQ

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GCAACTCAATCCGGGCCTGTTACTCTGCAAGGGAACAACAATTTCATGGGAGACATGTTT
ACACAAGCTGGACCAACAAGCTCAGTGGCATCATCGCCATCCCATTCAGATCTAACACCT
ATAACAGGAGCGATTGAGATCGTTCCTCCGCCTCAGAAAAAGTTCGAGCCAAAATCATCA
GTCTGGGCAGACACATTGAGCAGGGGGCTTGTTAACTTCAACATATCTGGACCTAAAACA
AATCCATTGTCAGACATAGGAGTTGACTTTGATGCGATCAACAGGAGAGAGAAACGGTTT
GAGAAACCGACAAACGCACCACCAGCAACATCGACTATCAACATGGGTAAAGCAATGGGA
TCAGGCACTGGCTTAGGGCGTGCCGGTGCAACTGCTATGAGACCTCCTCCAAATCCAATG
GTAGGCTCTGGCATGCCCATGGGTGCTGGTGGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACAC
ATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCCAAATCAACCAATGGGTATGGGAATGGGA
CCAGGCATGAACCAAAACCAACCTATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAAC
CAACCTCTGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAG*T
TATCCGATGCAACC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4FU17JQ 657 0 0
TGGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACACATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAA
CCCAAATCAACCAATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCTATGGG
TATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCTCTGGGTATGGGAATGGGACCAGG
CATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGTTATCCGATGCAACCACAAAACCAAGGAAT
GGTCCCTGGTCCGAACATGCCAGGAAACAACAACAACTATAATCCAATGATGGGTCAAGG
CGGTTATAACCCTCAACAATCCTATGGTGGTGGATACAGGTAAGATCAAGCCGACTATCC
ACTTGTAAAATCAAGAACAGAACACTCTGGTTCCATACCTTTCCGTGCTTTTTTGCATTT
TTACCTGGGACATGTAATATCAGGGGATAAAATAGTGGGATTGGTCAGCCGCTTCACGGA
AGTACTCAGGTTACATTAATCATGCCAGCATCAGGATTTTTTACAGTTTTTTTTACCTTT
GCTATATCGGGTATAAATTGATATATACTACACAGATTTTATTTTTGAGGATTTCACGTA
TTGAATGTGTAAACATTTTTCATACACGGAACAAATAAGATATGTTTTTTTTTTTTT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5949Contig1 1504 2 4 U
GCGTGTAAAGTCCAAAAAACAGAGTGAACTCTCACAGTGGCACTTACCCGATGGTAGCCT
TTGCCCCTCTGCTGATGAGGTCAAGCGGAAGATGGAAACGTTGATTCCGGTTAAACAAGA
AGGTTTCTCAGATGGTCCAACTCCTCTGAAACTTGGCATAAGGAAGAATCATAATGGCGT
TTGGGAAGTTAGGAAGCCTACTCCAAATGGACTTTCTTCCAGTAATAAGGTTGGGTATCA
GGACAAGAATGTTATACCAATGAGTAGTAGCGCTACTGGAAGTGGTCGTGATGGTGGTGG
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CGAACTTGATTCCATTTCAATGAATGTCGATTCAGGCTATAACATTCCTGACGGAAACCA
AGCTGGGGAGGATATAAACAATGAAGTTATTGTTCTAAGTGATTCTGATGAAGATAACGA
TGCAGTAATCACTTCTGGACCTGGATACAGTGGTGGGGTAAACTTTCCGTTGAACCCTTC
TGGTATCATTAACTCATATAATGAGGACACGCACACCATGGCTGGTGGGGGGAAGTTCAC
GCTTAGGTGTTTCCAACGATGATGATGATTTTGTGACGCCATGGTGGTCACTTCCTCCTG
ATACTCCAGAAGCCCCTGGGTTCCCTCTATTTGCATCTGATGCTGACGTTTCAGAAGGTT
TACTTGGTTTGCATCATCATGGCCCTCCACTAAACTGTGCTCCTGAAATGAATGGAGACT
ACACCATGGCTCCTGAGACATCTGAAGTAGGTGCGAACGATGGCGGCCTAGTTGACAATC
CTCTTGCATTTGGTAGAGACGATCCTTCACTTCAAATATTTTTGCCAACGAAACCAGATG
CTTCAGCTCAGACGGGTTTTTTAAACCAAGCTGATATGTCAAATGGTATCCGCAGTGATA
CTGGATCTCGCTTAGGCTAGGCGATAGCGCTGGTGGTGGGAATCATGGAGAGGCTACTTC
TGCAAATGGCCTCAACTCAAATCAGCAGATGTTGACAACGACAGATACTGCGTCGTTGCT
TTTGGGTATGAATGACGACAAGGCGAAGAGACAAAGATCAGACAATCCATTTTCATTTCC
TCGGCAGAAGCGTTCTAACAATCAACAGGAATATCAGACAGCAGGAGTTAGCCTTGATTC
GGTGTGCAGACAAGACTCGAATTGGTAGTAACTATTTATTTCTTTATATTGCTGAGTCTC
CTCAGTATCGGTTGGCCCTTGTCTGGTACACACTGCAGGGGACCAAAGCAAAGCACAGAG
GGTGATTTAGTTTACTTAATAGGCAGGGCATAGAGGTGGTTCCGGGTTAATTGGTAACTT
GTATACTCGAATAGCTTTTTTTCTTTTATGGAAGATTATTAAAATTACTTGGGTGCCAGA
AGCATGGAACGTTGTAAATTATGGCTCCCTATTTTTTATCTATTATAAAAATCATCTCTT
ATGC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4B688TF U 1
AF RR4B688JQ C 665
BS 1 717 RR4B688TF
BS 718 718 RR4B688JQ
BS 719 786 RR4B688TF
BS 787 1504 RR4B688JQ

RD RR4B688TF 786 0 0
GCGTGTAAAGTCCAAAAAACAGAGTGAACTCTCACAGTGGCACTTACCCGATGGTAGCCT
TTGCCCCTCTGCTGATGAGGTCAAGCGGAAGATGGAAACGTTGATTCCGGTTAAACAAGA
AGGTTTCTCAGATGGTCCAACTCCTCTGAAACTTGGCATAAGGAAGAATCATAATGGCGT
TTGGGAAGTTAGGAAGCCTACTCCAAATGGACTTTCTTCCAGTAATAAGGTTGGGTATCA
GGACAAGAATGTTATACCAATGAGTAGTAGCGCTACTGGAAGTGGTCGTGATGGTGGTGG
TGATGATGCAAGCGTAAGCCAGGATGCGCTTGGATCCTTTGACTTTGGAGCCAATGGCAT
CGAACTTGATTCCATTTCAATGAATGTCGATTCAGGCTATAACATTCCTGACGGAAACCA
AGCTGGGGAGGATATAAACAATGAAGTTATTGTTCTAAGTGATTCTGATGAAGATAACGA
TGCAGTAATCACTTCTGGACCTGGATACAGTGGTGGGGTAAACTTTCCGTTGAACCCTTC
TGGTATCATTAACTCATATAATGAGGACACGCACACCATGGCTGGTGGGGGGAAGTTCAC
GCTTAGGTGTTTCCAACGATGATGATGATTTTGTGACGCCATGGTGGTCACTTCCTCCTG
ATACTCCAGAAGCCCCTGGGTTCCCTCTATTTGCATCTGATGCTGACGTTTCAGAAG*TT
TACTTGGTTTGCATCATCATGGCCCTCCACTAAACTGTGCTCCTGAAATGAATGGAGACT
ACACCA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4B688JQ 840 0 0
TCCAGAAGCCCCTGGGTTCCCTCTATTTGCATCTGATGCTGACGTTTCAGAAGGTTTACT
TGGTTTGCATCATCATGGCCCTCCACTAAACTGTGCTCCTGAAATGAATGGAGACTACAC
CATGGCTCCTGAGACATCTGAAGTAGGTGCGAACGATGGCGGCCTAGTTGACAATCCTCT
TGCATTTGGTAGAGACGATCCTTCACTTCAAATATTTTTGCCAACGAAACCAGATGCTTC
AGCTCAGACGGGTTTTTTAAACCAAGCTGATATGTCAAATGGTATCCGCAGTGATACTGG
ATCTCGCTTAGGCTAGGCGATAGCGCTGGTGGTGGGAATCATGGAGAGGCTACTTCTGCA
AATGGCCTCAACTCAAATCAGCAGATGTTGACAACGACAGATACTGCGTCGTTGCTTTTG
GGTATGAATGACGACAAGGCGAAGAGACAAAGATCAGACAATCCATTTTCATTTCCTCGG
CAGAAGCGTTCTAACAATCAACAGGAATATCAGACAGCAGGAGTTAGCCTTGATTCGGTG
TGCAGACAAGACTCGAATTGGTAGTAACTATTTATTTCTTTATATTGCTGAGTCTCCTCA
GTATCGGTTGGCCCTTGTCTGGTACACACTGCAGGGGACCAAAGCAAAGCACAGAGGGTG
ATTTAGTTTACTTAATAGGCAGGGCATAGAGGTGGTTCCGGGTTAATTGGTAACTTGTAT
ACTCGAATAGCTTTTTTTCTTTTATGGAAGATTATTAAAATTACTTGGGTGCCAGAAGCA
TGGAACGTTGTAAATTATGGCTCCCTATTTTTTATCTATTATAAAAATCATCTCTTATGC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL5950Contig1 973 2 2 U
TTTTTTTATTGATTCAATATAATAGGGGAAAAGATCGTACAGTTCCCTACCGAGACAAGA
GAAACTCTTAACAGATCCTCCGCGCGCTGGGCATACCTCTTCCGTGCGTCTTTCTCGTGG
CAGGAACAGAACAACAGGGAAAGACCCGGCCGACCTGCCCAGGGCTCGAGGGCGAGCTTA
AGAGAGAATGGGGAGCGAATCGAAAGGCTTCCGTTTTCGTTCTTGGTTTGGTTCGGGCTC
CTCTCGATCTTTTTCGTAGTAGGGAAGGGGGAAGGAGTCTAAATCTATGGACATTAATGA
ACCATCATTGATGGACGTTGCACATGACACGATCAATTCGACTCAAGGTCCGGCGCTAAT
AGAGGTTGCTTACTTTCCTAGTAGCGAAGGAAAAGGGCAGGGCTTTTTTCGTGGTAATAG
TGGGCGGGTCTCCTTTCGAAGTAAAGGCCTTCGCATTCCTAATCCGCCCCACCAACCACG
AACGGCTTAGTTTGCCCCAGCTTGGTGAATCCCCGCGCAACGACATAGTTTGTGCGCCCT
TTACCGTTCTCGCTCAGTGTTTGCAACGGCTGGGGAGGCAGTCGTAGAAGCGAAGTTTAT
GCCACGCCAACCATCAAATACGAGATTGGGGGCCCCTTTTCAACGATTTGATGGAATGGC
CCACCCAATAGCGCTTATGTCATATGGGAACTCATGGCTGGAAACAATCCTTATGGTTTT
GATATCCGGTAGGAATAATAAGAATCAAAGTCCAGGTAGGTTGGTGAGCCTAGTGATAGG
AGACTATCTAGCTTGGTTCGGAGAGCACTTGTTGGGTTAAAGACTTTTTTTGTTGCTAAA
TGTTACAGCCTAAATGCTAACTATTGACTCTACTCGTTCGGATGGGTGTTTACCCCAAAG
TGTTCCCGGACTGCATGCATACATCCTTAAGTAACTTAGTGCAACATGGCAAATTTCATT
GAGAGGAATCAGC


BQ
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AF RR4E447TF U 1
AF RR4E447JQ C 289
BS 1 561 RR4E447TF
BS 562 973 RR4E447JQ

RD RR4E447TF 561 0 0
TTTTTTTATTGATTCAATATAATAGGGGAAAAGATCGTACAGTTCCCTACCGAGACAAGA
GAAACTCTTAACAGATCCTCCGCGCGCTGGGCATACCTCTTCCGTGCGTCTTTCTCGTGG
CAGGAACAGAACAACAGGGAAAGACCCGGCCGACCTGCCCAGGGCTCGAGGGCGAGCTTA
AGAGAGAATGGGGAGCGAATCGAAAGGCTTCCGTTTTCGTTCTTGGTTTGGTTCGGGCTC
CTCTCGATCTTTTTCGTAGTAGGGAAGGGGGAAGGAGTCTAAATCTATGGACATTAATGA
ACCATCATTGATGGACGTTGCACATGACACGATCAATTCGACTCAAGGTCCGGCGCTAAT
AGAGGTTGCTTACTTTCCTAGTAGCGAAGGAAAAGGGCAGGGCTTTTTTCGTGGTAATAG
TGGGCGGGTCTCCTTTCGAAGTAAAGGCCTTCGCATTCCTAATCCGCCCCACCAACCACG
AACGGCTTAGTTTGCCCCAGCTTGGTGAATCCCCGCGCAACGACATAGTTTGTGCGCCCT
TTACCGTTCTCGCTCAGTGTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4E447JQ 685 0 0
GGACATTAATGAACCATCATTGATGGACGTTGCACATGACACGATCAATTCGACTCAAGG
TCCGGCGCTAATAGAGGTTGCTTACTTTCCTAGTAGCGAAGGAAAAGGGCAGGGCTTTTT
TCGTGGTAATAGTGGGCGGGTCTCCTTTCGAAGTAAAGGCCTTCGCATTCCTAATCCGCC
CCACCAACCACGAACGGCTTAGTTTGCCCCAGCTTGGTGAATCCCCGCGCAACGACATAG
TTTGTGCGCCCTTTACCGTTCTCGCTCAGTGTTTGCAACGGCTGGGGAGGCAGTCGTAGA
AGCGAAGTTTATGCCACGCCAACCATCAAATACGAGATTGGGGGCCCCTTTTCAACGATT
TGATGGAATGGCCCACCCAATAGCGCTTATGTCATATGGGAACTCATGGCTGGAAACAAT
CCTTATGGTTTTGATATCCGGTAGGAATAATAAGAATCAAAGTCCAGGTAGGTTGGTGAG
CCTAGTGATAGGAGACTATCTAGCTTGGTTCGGAGAGCACTTGTTGGGTTAAAGACTTTT
TTTGTTGCTAAATGTTACAGCCTAAATGCTAACTATTGACTCTACTCGTTCGGATGGGTG
TTTACCCCAAAGTGTTCCCGGACTGCATGCATACATCCTTAAGTAACTTAGTGCAACATG
GCAAATTTCATTGAGAGGAATCAGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL5951Contig1 879 2 2 U
GGAGGATGGACAGCAACCATATTCTTCACATCATTCCAGATTCGAGACAAGTGAAGGCAG
AAGAGTTGCAAGCAGGAGCGTGCTACCTGCAGATTACTGCGGTTGATGCGGTCATGGAAG
ATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGGATATTCTCTCTTTCAACCGGAAGTGTTCGAG
CACGAGTCTTTGACCGGTTCTTGTTTGATACACCTTTTACAAAGAACGGGAAGACGCAAG
GTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGACGAACAGTGCTGCAGACAGAGGGATCATTCCCTG
CTCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAATCCGAATCCCTTGAATTCTCGCCGGTGGAAA
ATGCAATTGGAATGATTGAAACCAGAACAACCGCACTGAGAAACGAGCTAGAGGAGCCTC
GTAGCTCGGACGGGGATCACCTACCACGGCTCCAGAGTCTGCAGAGGATTCTTCAAGGAA
GTGTTGCAGTGCAGGTCAACAGTGGGGTGTTGAGCGTTTGCACAGCCTTCTTATCAGGTG
AGCCTGCAGCGAGATTGCGTTCGCAAGAACTGCAGCAACTTATCGCAGCACTTCTTGAAT
TCATGGCGGTTTGCAAGCGAGCCATAAGGGTTCACTTCAGATTAATCGGAGAAGAAGACC
AGGAGTTCCATACTCAGCTCGTCAATGGATTTCAGTCTCTTACCGCAGAGCTCTCACATT
ACATTCCTGCTATCTTGTCTGAACTTTAGTGTTAATCCTTGTAATTTTTGTCAGTGTTTA
CTTCGAGTTTGTGTGTTTTACTTCCACTGTTTGGCTTTGTTTAACTGCATTTGGATAGCT
TTGTTTGTCTAGTTAAAGAAAAAAACTTACACGCTTCAG


BQ
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AF RR4FR20TF U 1
AF RR4FR20JQ C 218
BS 1 490 RR4FR20TF
BS 491 879 RR4FR20JQ

RD RR4FR20TF 490 0 0
GGAGGATGGACAGCAACCATATTCTTCACATCATTCCAGATTCGAGACAAGTGAAGGCAG
AAGAGTTGCAAGCAGGAGCGTGCTACCTGCAGATTACTGCGGTTGATGCGGTCATGGAAG
ATGAGGATCTTGGGAGCAGAAGAGAGAGGATATTCTCTCTTTCAACCGGAAGTGTTCGAG
CACGAGTCTTTGACCGGTTCTTGTTTGATACACCTTTTACAAAGAACGGGAAGACGCAAG
GTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGACGAACAGTGCTGCAGACAGAGGGATCATTCCCTG
CTCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAATCCGAATCCCTTGAATTCTCGCCGGTGGAAA
ATGCAATTGGAATGATTGAAACCAGAACAACCGCACTGAGAAACGAGCTAGAGGAGCCTC
GTAGCTCGGACGGGGATCACCTACCACGGCTCCAGAGTCTGCAGAGGATTCTTCAAGGAA
GTGTTGCAGT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR4FR20JQ 662 0 0
TACAAAGAACGGGAAGACGCAAGGTGGATTAGAAGATCAATGGAAGAGACGAACAGTGCT
GCAGACAGAGGGATCATTCCCTGCTCTTGTGAATAGGCTGTTGGTTACCAAATCCGAATC
CCTTGAATTCTCGCCGGTGGAAAATGCAATTGGAATGATTGAAACCAGAACAACCGCACT
GAGAAACGAGCTAGAGGAGCCTCGTAGCTCGGACGGGGATCACCTACCACGGCTCCAGAG
TCTGCAGAGGATTCTTCAAGGAAGTGTTGCAGTGCAGGTCAACAGTGGGGTGTTGAGCGT
TTGCACAGCCTTCTTATCAGGTGAGCCTGCAGCGAGATTGCGTTCGCAAGAACTGCAGCA
ACTTATCGCAGCACTTCTTGAATTCATGGCGGTTTGCAAGCGAGCCATAAGGGTTCACTT
CAGATTAATCGGAGAAGAAGACCAGGAGTTCCATACTCAGCTCGTCAATGGATTTCAGTC
TCTTACCGCAGAGCTCTCACATTACATTCCTGCTATCTTGTCTGAACTTTAGTGTTAATC
CTTGTAATTTTTGTCAGTGTTTACTTCGAGTTTGTGTGTTTTACTTCCACTGTTTGGCTT
TGTTTAACTGCATTTGGATAGCTTTGTTTGTCTAGTTAAAGAAAAAAACTTACACGCTTC
AG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL5952Contig1 1028 2 2 U
GCAAGAACAAGACTGCTCGTATCGATAGGTTTATTTGTTACTTCTCGTCGCCGCAGCCCT
GTTACGTGGACGAGGAGCATGTTGATAAGCTCAAGGGGTTGTTGGGGGTTACTATTGGTG
GTGGTGGGAAGCTTGAGTCTCCTTGGAGCGAGGATATAAAGAAGCCGAGCAAGAGAAGTT
TCGGAGAGGTGGTGGAGAAGTTTAAGTCTGAGGAGGGTGTGATTGCGATTGGGGATGTTT
TCTATGCTGATTTGGAGAGGGATTGGGTGATGCAGCCTGGTGGACCTATTAACCACAAAT
GCAAGACGCTGATTGAACCGAGTAGGCTTATTCTGTTGACGGCGCAGCGGTTCATCCAGA
CGTTCTTGGGGAAGAATTTTATTGCTCTGCATCTCCGTAGACATGGGTTCCTCAAGTTCT
GCAATGCGAAATCGCCAAGTTGCTTTTATCCGATACCACAAGCTGCAGACTGCATCAGTC
GGATAGTGGAAAGAGCCAATGCTCCAGTAATCTACCTTTCAATAGATGCTGCTGAGAGTG
AAACCGGTCTGCTTCAGTCGCTAGTAGTCGTTGATGGAAAAATCGTTCCGCTTGTCAAAC
GTCCACCTCGCAACTCAGCGGAAAAGTGGGACTCGTTGTTGTATAGACATGGTATAGAGG
ATGACTCTCAGGTGGATGCTATGTTGGATAAGACGATATGTGCAATGTCGAGTGTCTTCA
TCGGAGCATCGGGTTCTACTTTTACAGAGGATATTTTGCGTCTAAGGAAAGACTGGGGAA
CTTCATCTACGTGCGATGAGTATCTCTGTCGAGGTGAAGAACCAAACTTCATAGCAGAAG
ATGAATAAAAAAAAAGTAAACACATTCGTTTAACTTTTTTTTTCTTTTTTTCTGTTCTGA
ATCCACTGTTCTTATTTTTTTTACATGTATTATAATAGTTCCTTTAGTGTCAGATTCTTT
TGATTATTTTCGACATAAATTGCATAGATTGTGTACATAAAACTGAATTACAAAGGGGTA
TGTTTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A788TF U 1
AF RR4A788JQ C 396
BS 1 668 RR4A788TF
BS 669 1028 RR4A788JQ

RD RR4A788TF 668 0 0
GCAAGAACAAGACTGCTCGTATCGATAGGTTTATTTGTTACTTCTCGTCGCCGCAGCCCT
GTTACGTGGACGAGGAGCATGTTGATAAGCTCAAGGGGTTGTTGGGGGTTACTATTGGTG
GTGGTGGGAAGCTTGAGTCTCCTTGGAGCGAGGATATAAAGAAGCCGAGCAAGAGAAGTT
TCGGAGAGGTGGTGGAGAAGTTTAAGTCTGAGGAGGGTGTGATTGCGATTGGGGATGTTT
TCTATGCTGATTTGGAGAGGGATTGGGTGATGCAGCCTGGTGGACCTATTAACCACAAAT
GCAAGACGCTGATTGAACCGAGTAGGCTTATTCTGTTGACGGCGCAGCGGTTCATCCAGA
CGTTCTTGGGGAAGAATTTTATTGCTCTGCATCTCCGTAGACATGGGTTCCTCAAGTTCT
GCAATGCGAAATCGCCAAGTTGCTTTTATCCGATACCACAAGCTGCAGACTGCATCAGTC
GGATAGTGGAAAGAGCCAATGCTCCAGTAATCTACCTTTCAATAGATGCTGCTGAGAGTG
AAACCGGTCTGCTTCAGTCGCTAGTAGTCGTTGATGGAAAAATCGTTCCGCTTGTCAAAC
GTCCACCTCGCAACTCAGCGGAAAAGTGGGACTCGTTGTTGTATAGACATGGTATAGAGG
ATGACTCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4A788JQ 633 0 0
CGTAGACATGGGTTCCTCAAGTTCTGCAATGCGAAATCGCCAAGTTGCTTTTATCCGATA
CCACAAGCTGCAGACTGCATCAGTCGGATAGTGGAAAGAGCCAATGCTCCAGTAATCTAC
CTTTCAATAGATGCTGCTGAGAGTGAAACCGGTCTGCTTCAGTCGCTAGTAGTCGTTGAT
GGAAAAATCGTTCCGCTTGTCAAACGTCCACCTCGCAACTCAGCGGAAAAGTGGGACTCG
TTGTTGTATAGACATGGTATAGAGGATGACTCTCAGGTGGATGCTATGTTGGATAAGACG
ATATGTGCAATGTCGAGTGTCTTCATCGGAGCATCGGGTTCTACTTTTACAGAGGATATT
TTGCGTCTAAGGAAAGACTGGGGAACTTCATCTACGTGCGATGAGTATCTCTGTCGAGGT
GAAGAACCAAACTTCATAGCAGAAGATGAATAAAAAAAAAGTAAACACATTCGTTTAACT
TTTTTTTTCTTTTTTTCTGTTCTGAATCCACTGTTCTTATTTTTTTTACATGTATTATAA
TAGTTCCTTTAGTGTCAGATTCTTTTGATTATTTTCGACATAAATTGCATAGATTGTGTA
CATAAAACTGAATTACAAAGGGGTATGTTTGAG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL5953Contig1 572 2 4 U
GCTAGCCAGGAGGATTTCGACGCCTTCACTTCCTCCAAAGTGGCGGATCTGGCGAGGCCC
TTGAAGGAGAGCGGGTTCCCTTACAAGATCCATATAGTGAAGGATCACGATATGAGGGAG
AGGCTGTGCCTTGAGATCGAGAGGCTTGGCTTGAGCGCTGTGATTATGGGGAGTAGAGGT
TTCGGTGCTGAGAAGAAGAGTGGGAGTGATGATGATGATGATGATGGGAGGTTGGGGTCT
GTTAGTGATTACTGTGTTCATCACTGTGTTTGTCCTGTTGTTGTCGTTAGATTCCCTGAT
GATGATCGTGTTGGGCCTGGGCCTCTTGTTACTACCGTCAAGACTGGTGGGGATGGTGAT
GATCATCGTGAACACATCAAAGAAGAGTAACGCCTGTTGGGATCTTGGTCAAGTTCGCAC
TCTTTACAGCATCCGGGTACACAACAATTCAAGTAGGAGTTTTAGCGCAGTGGTCAGAGG
AATTTGTGTTCTATGTTTATCTATCATGAGGAATTTCGGATGGTTTCTGAAGTAAACATA
AAGAAGTTTGTATGAATACCTAAACCCTTTGG


BQ
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AF RR4E866TF U 1
AF RR4E866JQ C 1
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BS 234 277 RR4E866TF
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AGGCTGTGCCTTGAGATCGAGAGGCTTGGCTTGAGCGCTGTGATTATGGGGAGTAGAGGT
TTCGGTGCTGAGAAGAAGAGTGGGAGTGATGATGATGATGATGATGGGAGGT*GGGGTCT
GTTAGTGATTACTGTGTTCATCACTGTGTTTGTCCTG

QA 1 277 1 277
DS 

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TTCGGTGCTGAGAAGAAGAGTGGGAGTGATGATGATGATGATGATGGGAGGTTGGGGTCT
GTTAGTGATTACTGTGTTCATCACTGTGTTTGTCCTGTTGTTGTCGTTAGATTCCCTGAT
GATGATCGTGTTGGGCCTGGGCCTCTTGTTACTACCGTCAAGACTGGTGGGGATGGTGAT
GATCATCGTGAACACATCAAAGAAGAGTAACGCCTGTTGGGATCTTGGTCAAGTTCGCAC
TCTTTACAGCATCCGGGTACACAACAATTCAAGTAGGAGTTTTAGCGCAGTGGTCAGAGG
AATTTGTGTTCTATGTTTATCTATCATGAGGAATTTCGGATGGTTTCTGAAGTAAACATA
AAGAAGTTTGTATGAATACCTAAACCCTTTGG

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL5954Contig1 1123 2 2 U
GATCGCATCATCAAACGCAGGTTCTTCTTGTCTTGTGCTAAAGTTGTTGTGGTGATCGAG
TCTCTTTGCCTCATGATCTCTCCCAAGAAGCTCCATTCGCTGGAGGAGCTTATCACAAAA
AGGAGATGAATCTCCTCCATCCAACAACCCAGTTTCAAGACTCATTTCTTCATCTTTCAA
GAACATCTCATCAGCTACATCTTTGTCGGCGTAGAGGTTCACACGAGAATCTTTCTTGGG
AGAGTTTAAGGCTACCGTTTCTAGCTTCTCGTTTAGATTTTTTCGAGCTCTCTCGGTTCT
AGTTCCTCCATTTACTTGAGGAACCGTACGTGCCTAAATACCCAAAAAAATCAAATCACA
CAATCATCACTCAAAAGACATTTTATTAAGCTCTCTTGAAGTTGAAAAGCAAATAAAGAC
AGAACATGAGTTATAAAACGACAAAAACATTTGAAGCAAACTTGGCTACTTCTGCAAGAG
TTTTTTTTTTATTTACCTGTGGTTTGATGTTTCTTCTAGAAGAAACTTGAAGTGTTTCTG
CTGCAGATTCTATTTTCTTCTTCGATCGCCACTGGCTTGCATCCATTCTCTCTGTAAGAT
TTTGGGATAGAGCATAAACTTAAACATCAAACTCTGCATTGAACTGAGAATAATCAAAGA
ACAAGACCCAAGAAAATGTAAATGATCAAAGGAAGGTTTGGATGCAACTTCTTACATAGT
TTTATGTTAGTTCCCAGCTTGAACAAGTGTGTGACTAGTATCTGCAACAACAAAATAAAA
AGAGGAGAGATGAATCTCTTCACAAGGAAATAAGGTAGAGAGAAGCATCAAAGTGACTAT
ATGACTCTGATATTAATTGTTTACGTTACAAATCATAAACAAGTATTAAAGGGGTCAAAT
ATTATAGGCTTTATTCAATTGTTTTTATTCTGAAGTTATAGTACAATGTTTTATTTATGA
AGAAACTGTTTAAAAACCTTGTCTTTCATAAATTTTACTAAATAAACAATCATAAGAAAA
TACAATTCACCTATTAATAATACCATTTCAACACTTGACAATCATTTTCTTTTACATTAG
GCTATTAATATGATAATACCTACCCTTAAATGAAAGAGAGGGC


BQ
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AF RR4BQ17TF U 1
AF RR4BQ17JQ C 401
BS 1 671 RR4BQ17TF
BS 672 1123 RR4BQ17JQ

RD RR4BQ17TF 671 0 0
GATCGCATCATCAAACGCAGGTTCTTCTTGTCTTGTGCTAAAGTTGTTGTGGTGATCGAG
TCTCTTTGCCTCATGATCTCTCCCAAGAAGCTCCATTCGCTGGAGGAGCTTATCACAAAA
AGGAGATGAATCTCCTCCATCCAACAACCCAGTTTCAAGACTCATTTCTTCATCTTTCAA
GAACATCTCATCAGCTACATCTTTGTCGGCGTAGAGGTTCACACGAGAATCTTTCTTGGG
AGAGTTTAAGGCTACCGTTTCTAGCTTCTCGTTTAGATTTTTTCGAGCTCTCTCGGTTCT
AGTTCCTCCATTTACTTGAGGAACCGTACGTGCCTAAATACCCAAAAAAATCAAATCACA
CAATCATCACTCAAAAGACATTTTATTAAGCTCTCTTGAAGTTGAAAAGCAAATAAAGAC
AGAACATGAGTTATAAAACGACAAAAACATTTGAAGCAAACTTGGCTACTTCTGCAAGAG
TTTTTTTTTTATTTACCTGTGGTTTGATGTTTCTTCTAGAAGAAACTTGAAGTGTTTCTG
CTGCAGATTCTATTTTCTTCTTCGATCGCCACTGGCTTGCATCCATTCTCTCTGTAAGAT
TTTGGGATAGAGCATAAACTTAAACATCAAACTCTGCATTGAACTGAGAATAATCAAAGA
ACAAGACCCAA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4BQ17JQ 723 0 0
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AGAAACTTGAAGTGTTTCTGCTGCAGATTCTATTTTCTTCTTCGATCGCCACTGGCTTGC
ATCCATTCTCTCTGTAAGATTTTGGGATAGAGCATAAACTTAAACATCAAACTCTGCATT
GAACTGAGAATAATCAAAGAACAAGACCCAAGAAAATGTAAATGATCAAAGGAAGGTTTG
GATGCAACTTCTTACATAGTTTTATGTTAGTTCCCAGCTTGAACAAGTGTGTGACTAGTA
TCTGCAACAACAAAATAAAAAGAGGAGAGATGAATCTCTTCACAAGGAAATAAGGTAGAG
AGAAGCATCAAAGTGACTATATGACTCTGATATTAATTGTTTACGTTACAAATCATAAAC
AAGTATTAAAGGGGTCAAATATTATAGGCTTTATTCAATTGTTTTTATTCTGAAGTTATA
GTACAATGTTTTATTTATGAAGAAACTGTTTAAAAACCTTGTCTTTCATAAATTTTACTA
AATAAACAATCATAAGAAAATACAATTCACCTATTAATAATACCATTTCAACACTTGACA
ATCATTTTCTTTTACATTAGGCTATTAATATGATAATACCTACCCTTAAATGAAAGAGAG
GGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL5955Contig1 1026 2 2 U
GGGATTCTCGTCCCACCGTTAAAGATGACGACGACGACTACCTCTCTGTTTTCTCGGTGC
CACTTTTCTCCTTCTTTAAACTTCAAATGCGAACTCGAATCTCCCGCTAAAACGCGACTC
TTCTCTCCTGCGAGAGGGAAACATGTTGTCACATCGTTAAAAGCATGTCGTATCCGTTGC
TCCTCCCACGATCCTGGTTCGCGTCATGTATACGTGTCCAGTAGAAGAAACATGGTTGTC
ATGTTGTCCACTGTGCAGCTTCTGTCTCATTTGCTTCCTTCAAGTGCTTCGTTTAGTGTT
TCATGATGCTGGAACCTTTGAGATGGATGATAACACAGGTGGCATCAACGGGTCTATTGC
TAAAGAACTCGAGAGACCTGAAAACGCAGGTTTGAAGAGATCCTTAAAGGTTCTAGAGAA
AGCAAAGCTTAAGGTTGATGAGATACAACCAGTGTCTTGGGCGGATATGATCGCTGTTGG
TGGGTCAGAAGCAGTCTCAATGTGTGGAGGCCCAACAATTCCAGTAGTTTTGGGAAGACT
TGATTCAACGCAACCTGATCCAGAAGACAAGTTACCTCCAGAATCCCTCAATGCCTCGGG
TTTGAAAGAATGTTTCCAAAGAAAAGGATTCTCGACCCAAGAACTTGTTGCCTTGTCTGG
TGCACATACGATCGGGAGCAAAGGCTTTGGAGATCCATTTACTTTTGACAATGCTTACTA
CAAAATCCTTCTTGAAAAGCCTTGGAGTTCAACGACATCCAAAATGACGAGTATGGTCGG
GCTTCCTTCGGATCATGCCCTCGTGGAGGATGATGAGTGTTTAAGGTGGGTGAAGCAGTA
TGCGGAAGATCAAGACAAGTTCTTCAGAGACTTCACTAGTGCTTATATCAAACTAGTTAA
CTCTGGGGCCAAATGGAAAACATTGTGATGTCTAATTTGATCTTATGTTAGTTCATACTT
CATTAATAAACATGTCCTAAATAATTTTGGTTGTAATATGCTTATTTAATTATTTTTACC
TTTTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4D947TF U 1
AF RR4D947JQ C 336
BS 1 608 RR4D947TF
BS 609 1026 RR4D947JQ

RD RR4D947TF 608 0 0
GGGATTCTCGTCCCACCGTTAAAGATGACGACGACGACTACCTCTCTGTTTTCTCGGTGC
CACTTTTCTCCTTCTTTAAACTTCAAATGCGAACTCGAATCTCCCGCTAAAACGCGACTC
TTCTCTCCTGCGAGAGGGAAACATGTTGTCACATCGTTAAAAGCATGTCGTATCCGTTGC
TCCTCCCACGATCCTGGTTCGCGTCATGTATACGTGTCCAGTAGAAGAAACATGGTTGTC
ATGTTGTCCACTGTGCAGCTTCTGTCTCATTTGCTTCCTTCAAGTGCTTCGTTTAGTGTT
TCATGATGCTGGAACCTTTGAGATGGATGATAACACAGGTGGCATCAACGGGTCTATTGC
TAAAGAACTCGAGAGACCTGAAAACGCAGGTTTGAAGAGATCCTTAAAGGTTCTAGAGAA
AGCAAAGCTTAAGGTTGATGAGATACAACCAGTGTCTTGGGCGGATATGATCGCTGTTGG
TGGGTCAGAAGCAGTCTCAATGTGTGGAGGCCCAACAATTCCAGTAGTTTTGGGAAGACT
TGATTCAACGCAACCTGATCCAGAAGACAAGTTACCTCCAGAATCCCTCAATGCCTCGGG
TTTGAAAG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4D947JQ 691 0 0
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AGAGATCCTTAAAGGTTCTAGAGAAAGCAAAGCTTAAGGTTGATGAGATACAACCAGTGT
CTTGGGCGGATATGATCGCTGTTGGTGGGTCAGAAGCAGTCTCAATGTGTGGAGGCCCAA
CAATTCCAGTAGTTTTGGGAAGACTTGATTCAACGCAACCTGATCCAGAAGACAAGTTAC
CTCCAGAATCCCTCAATGCCTCGGGTTTGAAAGAATGTTTCCAAAGAAAAGGATTCTCGA
CCCAAGAACTTGTTGCCTTGTCTGGTGCACATACGATCGGGAGCAAAGGCTTTGGAGATC
CATTTACTTTTGACAATGCTTACTACAAAATCCTTCTTGAAAAGCCTTGGAGTTCAACGA
CATCCAAAATGACGAGTATGGTCGGGCTTCCTTCGGATCATGCCCTCGTGGAGGATGATG
AGTGTTTAAGGTGGGTGAAGCAGTATGCGGAAGATCAAGACAAGTTCTTCAGAGACTTCA
CTAGTGCTTATATCAAACTAGTTAACTCTGGGGCCAAATGGAAAACATTGTGATGTCTAA
TTTGATCTTATGTTAGTTCATACTTCATTAATAAACATGTCCTAAATAATTTTGGTTGTA
ATATGCTTATTTAATTATTTTTACCTTTTCT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL5956Contig1 1071 2 6 U
GGCCCCTTCTCTCTTCTCCCTCGTTCAAAGATTTGGCCTTCCTTCTTCCTGTTTAGTTCT
TTTGAATTATATCACCCAAACACATTAGAACAAAACCATTGATGCTTAATCAGCAGTTCT
TGGTCATAGAGACACATGTCTCCGATCATACTCAGTGAGATCTTCCTCTCTGGGTTTATG
CTAAACTCCACCATCAGGCGCAGGACCCATCTCGTTCAATCTTTCTCTGTTGTCTTCCTT
TACTGGCTTTACTACGTCTCTTAGTTTCTCATAATTAATCTCCAGTTTTTTCTTCTTCCG
TTATATATATTATATTCTCGTAATCAAAACCCTAGTTTTTAAACTCTTTCTTTTGTTTCT
TGCTCGTTACGTCATCGATCTGGGTCCTGTCCTGTTTTATCTCTCTTCTCGTAAGGCAAA
AGAGCTTCTTTGTTTGTTTGTTTGTACGTTTACTAAATGGAACCGTCGTCGTCGGGAACA
ACTTCGCCGTCGGGATCGGAAGAGAGTCTCATGGAGCAGAGGAAGCGGAAGAGGATGCTC
TCAAACCGTGAATCAGCGAGGAGATCGAGGATGAAGAAACAGAAGCTCCTGGACGATCTA
ACGGCTCAGGTTAACCAGCTCAAAGAACAGAACAACGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATC
ACGACGCAGCACTACTTAACCGCTGAAGCAGAGAACTCTGTTCTCAGAGCTCAGCTTGAT
GAACTCAGCCACAGGCTCGAATCTCTCAATGACATCATCGAGTTACTCGACAATACCAAC
GGGATTTGTCCGAGCCTTCTGACTGGTCCAGAGCCTGATGATTTTCTCGTGAACCAGATG
AATACGAACATGTTTTGTATGAACCCGCCTCTCATGGCATCTTCTGATGCGTTACTGTAT
TAGAAACGTGGTCCAGAAAACCTCGAAATTACAAAATGGGGCCGTTTCTTTTGTCTGATT
TTAAGATATGTCCAAAGAGAGATATATGAAAAAAAAAATCTATCAGTGGGGTATGCTGTT
TGATTGTGCTTTGTTCCGTCTTTGGCTCTATGTATTAAAAGCATCGTTGTT


BQ
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AF RR4EJ74TF U 1
AF RR4EJ74JQ C 406
BS 1 578 RR4EJ74TF
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BS 611 686 RR4EJ74TF
BS 687 1071 RR4EJ74JQ

RD RR4EJ74TF 686 0 0
GGCCCCTTCTCTCTTCTCCCTCGTTCAAAGATTTGGCCTTCCTTCTTCCTGTTTAGTTCT
TTTGAATTATATCACCCAAACACATTAGAACAAAACCATTGATGCTTAATCAGCAGTTCT
TGGTCATAGAGACACATGTCTCCGATCATACTCAGTGAGATCTTCCTCTCTGGGTTTATG
CTAAACTCCACCATCAGGCGCAGGACCCATCTCGTTCAATCTTTCTCTGTTGTCTTCCTT
TACTGGCTTTACTACGTCTCTTAGTTTCTCATAATTAATCTCCAGTTTTTTCTTCTTCCG
TTATATATATTATATTCTCGTAATCAAAACCCTAGTTTTTAAACTCTTTCTTTTGTTTCT
TGCTCGTTACGTCATCGATCTGGGTCCTGTCCTGTTTTATCTCTCTTCTCGTAAGGCAAA
AGAGCTTCTTTGTTTGTTTGTTTGTACGTTTACTAAATGGAACCGTCGTCGTCGGGAACA
ACTTCGCCGTCGGGATCGGAAGAGAGTCTCATGGAGCAGAGGAAGCGGAAGAGGATGCTC
TCAAACCGTGAATCAGCGAGGAGATCGAGGATGAAGAA*CAGAAGCTCCTGGACGATCTA
ACGGCTCAG*TTAACCAGCTCAAAGAACAGAACAACGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATC
ACGACGCAGCACTACTTAACCGCTGA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4EJ74JQ 666 0 0
TTCTCGTAAGGCAAAAGAGCTTCTTTGTTTGTTTGTTTGTACGTTTACTAAATGGAACCG
TCGTCGTCGGGAACAACTTCGCCGTCGGGATCGGAAGAGAGTCTCATGGAGCAGAGGAAG
CGGAAGAGGATGCTCTCAAACCGTGAATCAGCGAGGAGATCGAGGATGAAGAAACAGAAG
CTCCTGGACGATCTAACGGCTCAGGTTAACCAGCTCAAAGAACAGAACAACGAGATCGTG
ACAAGTGTCAGCATCACGACGCAGCACTACTTAACCGCTGAAGCAGAGAACTCTGTTCTC
AGAGCTCAGCTTGATGAACTCAGCCACAGGCTCGAATCTCTCAATGACATCATCGAGTTA
CTCGACAATACCAACGGGATTTGTCCGAGCCTTCTGACTGGTCCAGAGCCTGATGATTTT
CTCGTGAACCAGATGAATACGAACATGTTTTGTATGAACCCGCCTCTCATGGCATCTTCT
GATGCGTTACTGTATTAGAAACGTGGTCCAGAAAACCTCGAAATTACAAAATGGGGCCGT
TTCTTTTGTCTGATTTTAAGATATGTCCAAAGAGAGATATATGAAAAAAAAAATCTATCA
GTGGGGTATGCTGTTTGATTGTGCTTTGTTCCGTCTTTGGCTCTATGTATTAAAAGCATC
GTTGTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL5957Contig1 1209 2 2 U
GGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACTTCAACCATCGGACCG
CAGTGACATCAAGTTTGGTACAGGGAGTCTACTCAATGCAACGGGATAGGATGAAGAAAC
GGAAACCACTATCCAACCCCTGGTGGGAATCCTTTGGTTTCTCTTTAGACAAGCCCTTGA
TCAACGAAGATGATAACTCCATATACGGTGCCGTTTTCGAGTATAAAAACAACCAGAATA
TACCTCATTCGGGATCGGGAGTGCCTCCGAGTTACGTGATTGCCTTTCGCGGCACGATGC
TGAAATTCAAAACTTGGCGTAAGGATTTGGAAGAAGACCTTCGATGCTTGTTCAACAACC
TTAGCAACGGAACTAGGTTCAAACATGCCATACAAACAATCGAAACTGTGCTGGAGAAAC
ACAGTACCAAGAAAACTTCTGTCTGGCTCACTGGACACTCTCTCGGAGCAGGTATAGCGT
TGTTGGCTGGGAAGACCATGACGAAACGTGGATTCCCTCTCGAGACTTACGTATTCAGCC
CGCCCATCTCGTCTATTCCTCTAGATAGTCTATCTGGTCTTGATGTGGTTAAAGACATCT
TTCGATTCGCCGAGTGTATCTTCAAAGTGACCTTATCCGTGCTCTTTGATCTCAAGACTA
AAGCAGACGATCCAAGAATAGCAAAGTGGATACCTTACGTATATGTGAACCCATCAGATA
TAGTCTGTGCAGAATACATTGGTCTTTTGAAACACAAAAACGTCATGGCTGATTTCGGAT
TAAGCGAATTTGAGATTCTTGGTGCTGGAGTCTCTATCAGGAGTCTTGTTTTCGGAGATG
AAATAGGAGAACCTATTCAACTTCTTTCGTCAGCCGATATGATAGTAAACAAGAATAAAC
CTAATGTTGAGACAAATAATATGCTTAAGAAATGGTGGTATAAGTTTAAGAAGGCTCATG
CTCTTGCTCAATGGTGGGATCCAAACCCAGATCTTCGGGTAAATTGGGAAACCCACAGCA
TTAGGCCATCTACACCATGTCTGGATATGGAGCCAACATCCTCCTCTTGACCCCTTTTCT
AAGGATTTTCCTTAGTATATGCTTGGGAACCATCTATCATCCATCTACCCTTTTTCGGTT
TCTTCAACTTTTCCTTTTGTTGTTGTTTTCCATGTGTTTGAAACGCTTGTTACGTTGTAA
AAGCTCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL42TF U 1
AF RR4EL42JQ C 494
BS 1 740 RR4EL42TF
BS 741 1209 RR4EL42JQ

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CAGTGACATCAAGTTTGGTACAGGGAGTCTACTCAATGCAACGGGATAGGATGAAGAAAC
GGAAACCACTATCCAACCCCTGGTGGGAATCCTTTGGTTTCTCTTTAGACAAGCCCTTGA
TCAACGAAGATGATAACTCCATATACGGTGCCGTTTTCGAGTATAAAAACAACCAGAATA
TACCTCATTCGGGATCGGGAGTGCCTCCGAGTTACGTGATTGCCTTTCGCGGCACGATGC
TGAAATTCAAAACTTGGCGTAAGGATTTGGAAGAAGACCTTCGATGCTTGTTCAACAACC
TTAGCAACGGAACTAGGTTCAAACATGCCATACAAACAATCGAAACTGTGCTGGAGAAAC
ACAGTACCAAGAAAACTTCTGTCTGGCTCACTGGACACTCTCTCGGAGCAGGTATAGCGT
TGTTGGCTGGGAAGACCATGACGAAACGTGGATTCCCTCTCGAGACTTACGTATTCAGCC
CGCCCATCTCGTCTATTCCTCTAGATAGTCTATCTGGTCTTGATGTGGTTAAAGACATCT
TTCGATTCGCCGAGTGTATCTTCAAAGTGACCTTATCCGTGCTCTTTGATCTCAAGACTA
AAGCAGACGATCCAAGAATAGCAAAGTGGATACCTTACGTATATGTGAACCCATCAGATA
TAGTCTGTGCAGAATACATT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4EL42JQ 716 0 0
GACCATGACGAAACGTGGATTCCCTCTCGAGACTTACGTATTCAGCCCGCCCATCTCGTC
TATTCCTCTAGATAGTCTATCTGGTCTTGATGTGGTTAAAGACATCTTTCGATTCGCCGA
GTGTATCTTCAAAGTGACCTTATCCGTGCTCTTTGATCTCAAGACTAAAGCAGACGATCC
AAGAATAGCAAAGTGGATACCTTACGTATATGTGAACCCATCAGATATAGTCTGTGCAGA
ATACATTGGTCTTTTGAAACACAAAAACGTCATGGCTGATTTCGGATTAAGCGAATTTGA
GATTCTTGGTGCTGGAGTCTCTATCAGGAGTCTTGTTTTCGGAGATGAAATAGGAGAACC
TATTCAACTTCTTTCGTCAGCCGATATGATAGTAAACAAGAATAAACCTAATGTTGAGAC
AAATAATATGCTTAAGAAATGGTGGTATAAGTTTAAGAAGGCTCATGCTCTTGCTCAATG
GTGGGATCCAAACCCAGATCTTCGGGTAAATTGGGAAACCCACAGCATTAGGCCATCTAC
ACCATGTCTGGATATGGAGCCAACATCCTCCTCTTGACCCCTTTTCTAAGGATTTTCCTT
AGTATATGCTTGGGAACCATCTATCATCCATCTACCCTTTTTCGGTTTCTTCAACTTTTC
CTTTTGTTGTTGTTTTCCATGTGTTTGAAACGCTTGTTACGTTGTAAAAGCTCTTT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5959Contig1 1128 2 2 U
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GGAGGAAGATGTGTCCAACTACTTCAGTACATTTGGACCAGTTCAAGATGTGAGGATACC
ATATCAGCAAAAGAGAATGTTTGGGTTTGTGACTTTTTTGTACCCTGAGACTGTCAAGAG
CATTCTTGCCAAAGGGAACCCTCACTTTGTGTGTGATTCAAGGGTTCTTGTTAAGCCTTA
CAAGGAGAAAGGCAAAGTCACTGATAAATACAGAACTAACCAGCCAACAGAGCTAGAATT
GTCCCCAACAGACCTTGCTTCTAGCCCCAGGGATGCTATAGGAGGGAGAGGGTTTTATAA
CACCCCACAAGATGTTTTATGGGAGAGTAAGTTTTAAGAAGAGATTCTTGAGCTTCAGAG
CAGAAGGCTTATGAACATGCAGCTTCTTGACGTCAAGAAGCATTTCCAAGTCAATTCCCC
TACACACATTCATTCCCCAAACCCTTTTAGCCAAGCACTTGTGTCTCCACGCCCATTGCC
GGTTAAAGCAGGAGAATATGTAGGAAGAGATGTAGGGAAAGGAAGTTCCAAAGAAGGATC
TGATGATGACACAATGAATCTACCAGAGAGGTTGGAGGATAGCTTGCCTGATAGTCCATT
TGCGTCGTCTGCACATCATTTGGTTATGTTTGGTGAATCTATAGACAACAACGGATCGGA
TTTGTGGTCGCCTTCTTCGGACAATGATGATAATTCTACTCCGTCTACACTCTCTGACTC
CAACTCTTTCAACTGCCAAATGCCAAGGTTACTGCCTATTGGGATGTTACCCGGTGGGGG
TGGACCGGCCTGTCGTGTGGGAATATAAGCAGGAAGAGAGGTAACAAAGAAAGAAAAAAC
TGATAATATAGAGACCTTAAGTAACCAAAGATGCAGAGGTGTAAAATATAAAGCAGGAAA
GTTGATGTAAGAGATAGAGAAGAGAAAGAAGGAAGATTGTTTTACCATTTCTCTAGTATT
AATGTGTAATGTGATGGACCACAGAAGATGATGTAATATGATATGATATAAATATATATA
GGACAAGAAGTATAATCTCTCTAAAGATTTACAAAAGAAAGAGATTAC


BQ
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AF RR4EG13TF U 1
AF RR4EG13JQ C 471
BS 1 743 RR4EG13TF
BS 744 1128 RR4EG13JQ

RD RR4EG13TF 743 0 0
GATGGCTTGTCCAGCTTCGAGACAGATCTATCTTACATTTCCTGCCGACAGTAGGTTCAG
GGAGGAAGATGTGTCCAACTACTTCAGTACATTTGGACCAGTTCAAGATGTGAGGATACC
ATATCAGCAAAAGAGAATGTTTGGGTTTGTGACTTTTTTGTACCCTGAGACTGTCAAGAG
CATTCTTGCCAAAGGGAACCCTCACTTTGTGTGTGATTCAAGGGTTCTTGTTAAGCCTTA
CAAGGAGAAAGGCAAAGTCACTGATAAATACAGAACTAACCAGCCAACAGAGCTAGAATT
GTCCCCAACAGACCTTGCTTCTAGCCCCAGGGATGCTATAGGAGGGAGAGGGTTTTATAA
CACCCCACAAGATGTTTTATGGGAGAGTAAGTTTTAAGAAGAGATTCTTGAGCTTCAGAG
CAGAAGGCTTATGAACATGCAGCTTCTTGACGTCAAGAAGCATTTCCAAGTCAATTCCCC
TACACACATTCATTCCCCAAACCCTTTTAGCCAAGCACTTGTGTCTCCACGCCCATTGCC
GGTTAAAGCAGGAGAATATGTAGGAAGAGATGTAGGGAAAGGAAGTTCCAAAGAAGGATC
TGATGATGACACAATGAATCTACCAGAGAGGTTGGAGGATAGCTTGCCTGATAGTCCATT
TGCGTCGTCTGCACATCATTTGGTTATGTTTGGTGAATCTATAGACAACAACGGATCGGA
TTTGTGGTCGCCTTCTTCGGACA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4EG13JQ 658 0 0
TCAATTCCCCTACACACATTCATTCCCCAAACCCTTTTAGCCAAGCACTTGTGTCTCCAC
GCCCATTGCCGGTTAAAGCAGGAGAATATGTAGGAAGAGATGTAGGGAAAGGAAGTTCCA
AAGAAGGATCTGATGATGACACAATGAATCTACCAGAGAGGTTGGAGGATAGCTTGCCTG
ATAGTCCATTTGCGTCGTCTGCACATCATTTGGTTATGTTTGGTGAATCTATAGACAACA
ACGGATCGGATTTGTGGTCGCCTTCTTCGGACAATGATGATAATTCTACTCCGTCTACAC
TCTCTGACTCCAACTCTTTCAACTGCCAAATGCCAAGGTTACTGCCTATTGGGATGTTAC
CCGGTGGGGGTGGACCGGCCTGTCGTGTGGGAATATAAGCAGGAAGAGAGGTAACAAAGA
AAGAAAAAACTGATAATATAGAGACCTTAAGTAACCAAAGATGCAGAGGTGTAAAATATA
AAGCAGGAAAGTTGATGTAAGAGATAGAGAAGAGAAAGAAGGAAGATTGTTTTACCATTT
CTCTAGTATTAATGTGTAATGTGATGGACCACAGAAGATGATGTAATATGATATGATATA
AATATATATAGGACAAGAAGTATAATCTCTCTAAAGATTTACAAAAGAAAGAGATTAC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL5960Contig1 927 2 2 U
GACCGAATGCGAATACGTTTAATATCTTTATTCATGGTTGGTGTAAGGCTAATAGAGTAG
AGGAAGCTCTCTGGACTATACAAGAGATGAAAGGTTATGGTTTCCGTCCTTGTGTGATTA
GCTACACGACGATTATTAGATGCTATTGTTTGCAGTGTAACTTTATTAAAGTCTATGAGA
TGTTGAGTGAGATGGAAGCTAACGGGTGTCCACCGAACTCTGTGACTTACACGACGATTA
TGTCTTGTCTTAACGCGCAGAAAGAGTTTGAGGAGTCTTTAAGGGTGGCCACGAGGATGA
AGAGGTCGGGTTGCGATGCGGATACTCTTTTCTACAACTGTTTGATTCACACGCTCGCTC
GAGCTGGGAGGTTAGAGGAAGCTGAGCGTGTTTTCAGAGATGAGATGCGATCCGTTAACA
CGTCTACTTATAACTCGATGATTGCTATGTATTGTCACCACGATGAAGAGGACAAGGCCG
TTGAGCTTCTCAGGGAGATGGAGAGTTGGGAGGTTGTTGAAAGAAATGGTGACTAAGCAT
CATCTCAGCTTGGATGAATCTACTTATACTTTTCTGATACAGAGGTTTTGCAGAGCTGAT
ATGTGTGAGTGGGCGTATTGCTTGTTTGAAGAGATGATGAGCCAAGATATCGCGCCGAGG
CATAGGACTTGTTTGTTGCTCTTGGATGAGGTTAAGAAGAAGAATATGCATGAAGCTGTT
GAGAGGATCGAGTATGTGATGAAGACTGTTAAACTTACTGCTCCTGTAAAGTGAGGTTAT
TATTAGTTACTACAATGCTGAGAAGTGTTCATTGTTTTACTCATTCAACCACACATTGTA
GTGTAGATTTCAAGTTCTTTGGTCATGGATAAGACTTGATGAGATTTGTAACTTAATGGA
GTTGAATGATTCAGACACGGTTTAGGC


BQ
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AF RR4EI90TF U 1
AF RR4EI90JQ C 181
BS 1 454 RR4EI90TF
BS 455 927 RR4EI90JQ

RD RR4EI90TF 454 0 0
GACCGAATGCGAATACGTTTAATATCTTTATTCATGGTTGGTGTAAGGCTAATAGAGTAG
AGGAAGCTCTCTGGACTATACAAGAGATGAAAGGTTATGGTTTCCGTCCTTGTGTGATTA
GCTACACGACGATTATTAGATGCTATTGTTTGCAGTGTAACTTTATTAAAGTCTATGAGA
TGTTGAGTGAGATGGAAGCTAACGGGTGTCCACCGAACTCTGTGACTTACACGACGATTA
TGTCTTGTCTTAACGCGCAGAAAGAGTTTGAGGAGTCTTTAAGGGTGGCCACGAGGATGA
AGAGGTCGGGTTGCGATGCGGATACTCTTTTCTACAACTGTTTGATTCACACGCTCGCTC
GAGCTGGGAGGTTAGAGGAAGCTGAGCGTGTTTTCAGAGATGAGATGCGATCCGTTAACA
CGTCTACTTATAACTCGATGATTGCTATGTATTG

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4EI90JQ 747 0 0
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TGTCTTGTCTTAACGCGCAGAAAGAGTTTGAGGAGTCTTTAAGGGTGGCCACGAGGATGA
AGAGGTCGGGTTGCGATGCGGATACTCTTTTCTACAACTGTTTGATTCACACGCTCGCTC
GAGCTGGGAGGTTAGAGGAAGCTGAGCGTGTTTTCAGAGATGAGATGCGATCCGTTAACA
CGTCTACTTATAACTCGATGATTGCTATGTATTGTCACCACGATGAAGAGGACAAGGCCG
TTGAGCTTCTCAGGGAGATGGAGAGTTGGGAGGTTGTTGAAAGAAATGGTGACTAAGCAT
CATCTCAGCTTGGATGAATCTACTTATACTTTTCTGATACAGAGGTTTTGCAGAGCTGAT
ATGTGTGAGTGGGCGTATTGCTTGTTTGAAGAGATGATGAGCCAAGATATCGCGCCGAGG
CATAGGACTTGTTTGTTGCTCTTGGATGAGGTTAAGAAGAAGAATATGCATGAAGCTGTT
GAGAGGATCGAGTATGTGATGAAGACTGTTAAACTTACTGCTCCTGTAAAGTGAGGTTAT
TATTAGTTACTACAATGCTGAGAAGTGTTCATTGTTTTACTCATTCAACCACACATTGTA
GTGTAGATTTCAAGTTCTTTGGTCATGGATAAGACTTGATGAGATTTGTAACTTAATGGA
GTTGAATGATTCAGACACGGTTTAGGC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5961Contig1 274 2 1 U
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GAAAAACAATTACAGAGAAGAAAAAGTCTGGTAAATTAGAAAAAACTTTGAACGAGAAAG
AGAAGGCGTTTAGATATATTTCTTTCTTGTTAGCTCTCCTATTTTTTTCTCTTGGTGATC
GGAGACGCACTCATCAGATTCGTATCCCACCTACAGAGAGCTTGATTGTAATGTGCTTAG
GGATGCTCATTTAGGCTCGAACAAGGCAAACGCG


BQ
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AF RR4CN55JQ C 1
AF RR4CN55TF U 1
BS 1 274 RR4CN55TF

RD RR4CN55JQ 274 0 0
GGAATATTTTAGGATTTTGACCAATTCACTCAAACAGAAAACAAGGAAAAAAGTGGAAGA
GAAAAACAATTACAGAGAAGAAAAAGTCTGGTAAATTAGAAAAAACTTTGAACGAGAAAG
AGAAGGCGTTTAGATATATTTCTTTCTTGTTAGCTCTCCTATTTTTTTCTCTTGGTGATC
GGAGACGCACTCATCAGATTCGTATCCCACCTACAGAGAGCTTGATTGTAATGTGCTTAG
GGATGCTCATTTAGGCTCGAACAAGGCAAACGCG

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR4CN55TF 274 0 0
GGAATATTTTAGGATTTTGACCAATTCACTCAAACAGAAAACAAGGAAAAAAGTGGAAGA
GAAAAACAATTACAGAGAAGAAAAAGTCTGGTAAATTAGAAAAAACTTTGAACGAGAAAG
AGAAGGCGTTTAGATATATTTCTTTCTTGTTAGCTCTCCTATTTTTTTCTCTTGGTGATC
GGAGACGCACTCATCAGATTCGTATCCCACCTACAGAGAGCTTGATTGTAATGTGCTTAG
GGATGCTCATTTAGGCTCGAACAAGGCAAACGCG

QA 1 274 1 274
DS 



AS 1 2

CO CL5962Contig1 1198 2 8 U
GGACACAGACGTCGAGAAAGTTAGCAGTGATGATTATGACTACAGCGATAGTTTCATTAA
TGATGATGATGATGATGATGATGATGATCCATCTCCCCGCGCTTCTCAGATCTCTACCTC
TGACGATGATGCTAAAACAAAGGCAAAGAAGATAAATAAAAGACTAAGGAAGAAGCTTCA
AGTCTCTGATTCAGACTCCGAGGACTCCGTAGAGATACTTAACAACGATAATGACCACAA
GATCCCAAAGGTAGTTTCTTCAGAGGTTCCTTTGGAGAATTCTGAGAAGGCATCAGAAGC
AACAAATCCTACTCACGTGGCTATGGATAATAAAAAGGAGGATAAGCCATCTGGTGAGGT
CGAACTTGGCTCTGATGTGCTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAACAAGGAATCAGT
TGTTATTAGCACAGACGAAGGAAAGGAGAAAGATATGTCAGGGACTGACAAAGCAATAGA
ATCATCAACTGATGGAACTCTATCAAAGAAAAAGAGGAAGAAAGAGAGGAAAGAGGAGGA
GACTACAGGGAGGAAGAAACAAGCTATCGAAAAGAACATGGAGAAAGAAGCTAGTACTAA
GGAACTACCTGAATCAGAGATTTCTTCAAATGAGGTGACAATTGAAGAGATTGAAAAAGG
AGAGTTAGATGGTAAAGTAGCTGTTCATGGAAAAAGGGTCAGCATACTCTATACTGGGAA
GTTGAAAGACGCTGGGAAAGTGTTTGAATCAAACTTGGAAGAAGCTCCATTAAGATTTCG
CTTAGGTGGAGAAAAGGTCATAAAAGGTCTCAGTAAGGGTGTTGAAGGGATGCGAGCTGG
TGATAAGAGAAGACTCATAATTCCACCATCTCTTGGGTACTCCGAGGAAGGGCTGAAGAA
GGAAGATGTGCCTAAGAATTCGTGGCTTGTCTATGAAGTAGAGGCAGTAAAAGTGAGATG
ATGTCATTAGCTCTTTTGAAACAAGTTTAAGCCTTTTTATTTTTTTTTCTCGAGTCATCT
ATTTGCCTCCAATTTTGTTCGTTTTGGGGAGGGGATTTCTTAGCTGTTCGCATAACTCAG
CCACATGGTTATTTAATTTCATCGGTCAAGAAGATGGAAACTTGTTTTAGTTGAACTTTT
TTCATCGAAGTGTAATATCCTCCGAAACGATTCGTATATAGTCACCCCTCTGTTTCAC


BQ
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AF RR4GN93TF U 1
AF RR4GN93JQ C 479
BS 1 659 RR4GN93TF
BS 660 660 RR4GN93JQ
BS 661 694 RR4GN93TF
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CGAACTTGGCTCTGATGTGCTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAACAAGGAATCAGT
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AGAGTTAGATGGTAAAGTAGCTGTTCATGGAAAA**GGTCAGCATACTCTATACTGGGAA
GTTGAAAGACGCTGGGAAAGTGTTTGA*TCAAACTTGGAAGA
GCTCCATAAGATTCGCTT

QA 1 762 1 762
DS 

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AAGGAACTACCTGAATCAGAGATTTCTTCAAATGAGGTGACAATTGAAGAGATTGAAAAA
GGAGAGTTAGATGGTAAAGTAGCTGTTCATGGAAAAAGGGTCAGCATACTCTATACTGGG
AAGTTGAAAGACGCTGGGAAAGTGTTTGAATCAAACTTGGAAGAAGCTCCATTAAGATTT
CGCTTAGGTGGAGAAAAGGTCATAAAAGGTCTCAGTAAGGGTGTTGAAGGGATGCGAGCT
GGTGATAAGAGAAGACTCATAATTCCACCATCTCTTGGGTACTCCGAGGAAGGGCTGAAG
AAGGAAGATGTGCCTAAGAATTCGTGGCTTGTCTATGAAGTAGAGGCAGTAAAAGTGAGA
TGATGTCATTAGCTCTTTTGAAACAAGTTTAAGCCTTTTTATTTTTTTTTCTCGAGTCAT
CTATTTGCCTCCAATTTTGTTCGTTTTGGGGAGGGGATTTCTTAGCTGTTCGCATAACTC
AGCCACATGGTTATTTAATTTCATCGGTCAAGAAGATGGAAACTTGTTTTAGTTGAACTT
TTTTCATCGAAGTGTAATATCCTCCGAAACGATTCGTATATAGTCACCCCTCTGTTTCAC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5963Contig1 1107 2 4 U
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GAGAGTCTTTCAGGCCCCCAAAGACATGTACAATAGTGTCATGGACTTTCCGAGGTTTCT
ACGAAAAGGCTCTTCTTGAATATGAGCGGCATAAAGTCCTCGTGGGGGAAGTACAGATAC
CCCTTGCTATTGAACCAGAACCAATGAATATTGATAATCAGGCTTCTGGATCTGGTAGAG
CGAGGAGAGACGCAGCGGCACGTGCTATGCAAGGTTGGCATTCACAGCGTCTTAATGGGA
ACGGTGACGTTAATGATGACCCTGCATTTAAGGATAAGAATTTAGTTCTTCACCAGAAGC
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ACCATGTTGCAAAACATGCCATCCAAGTGTCTAATCATCCTATGTTGGATGTGACAGTTG
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CGGCAGGGCGGCTGGTAATAAGTGGTGAACCGGAGAACCCTATGAATCCCTGGGGAGCTA
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TGGTGACCCTGAACGGCCAGTTGTTCGTCCGTGTGCCACTCGAGCAATTTGATTAAAACA
TTTTACAGTTTAACAAAGCCTTGAAGACCCAAGAGAGAAGGGAGAGAAGAATGTTTAGAA
ATAGTTGTGAGCATCTTTTGTCTGTATATTATCATGATTGAGAGCATAATACAACCTGAG
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TAAATTCTTAAAAATCAACATTTATATGTACCACAAGCTCATCAAACATTTTCTATTAAG
AAACACAAATTTACAACTTTTTTTAGT


BQ
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AF RR4F709TF U 1
AF RR4F709JQ C 449
BS 1 667 RR4F709TF
BS 668 668 RR4F709JQ
BS 669 726 RR4F709TF
BS 727 1107 RR4F709JQ

RD RR4F709TF 726 0 0
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CTGTAATTAGATTGGGCGGTTATGACAAGGTTACTGGATTTAAACTATGGCGGCAAGTAG
GAGAGTCTTTCAGGCCCCCAAAGACATGTACAATAGTGTCATGGACTTTCCGAGGTTTCT
ACGAAAAGGCTCTTCTTGAATATGAGCGGCATAAAGTCCTCGTGGGGGAAGTACAGATAC
CCCTTGCTATTGAACCAGAACCAATGAATATTGATAATCAGGCTTCTGGATCTGGTAGAG
CGAGGAGAGACGCAGCGGCACGTGCTATGCAAGGTTGGCATTCACAGCGTCTTAATGGGA
ACGGTGACGTTAATGATGACCCTGCATTTAAGGATAAGAATTTAGTTCTTCACCAGAAGC
GCGAAAAACAGATAGGAACATCCCCTGGGTTGCTTAAACGCAAGAGGCTATCGTCTACTG
ACCATGTTGCAAAACATGCCATCCAAGTGTCTAATCATCCTATGTTGGATGTGACAGTTG
TCGATGTTGGACCACCAGCTGACTGGGTAAAGATTAACGTGCAGAGGACGCAAGATTGCT
TTGAGGTGTATGCATTAGTCCCAGGACTAGTCCGTGAAGAGGTCCGAGTCCAGTCAGATC
CGGCAGG*CGGCTGGTAATAAGTGGTGAACCGGAGAACCCTATGAATCCCTGGGGAGCTA
CTCCTT

QA 1 726 1 726
DS 

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GTCTAATCATCCTATGTTGGATGTGACAGTTGTCGATGTTGGACCACCAGCTGACTGGGT
AAAGATTAACGTGCAGAGGACGCAAGATTGCTTTGAGGTGTATGCATTAGTCCCAGGACT
AGTCCGTGAAGAGGTCCGAGTCCAGTCAGATCCGGCAGGGCGGCTGGTAATAAGTGGTGA
ACCGGAGAACCCTATGAATCCCTGGGGAGCTACTCCTTTCAAGAAGGTCGTAAGTTTACC
TACAAGAATTGATCCTCATCATACATCGGCTGTGGTGACCCTGAACGGCCAGTTGTTCGT
CCGTGTGCCACTCGAGCAATTTGATTAAAACATTTTACAGTTTAACAAAGCCTTGAAGAC
CCAAGAGAGAAGGGAGAGAAGAATGTTTAGAAATAGTTGTGAGCATCTTTTGTCTGTATA
TTATCATGATTGAGAGCATAATACAACCTGAGAACCCACTTTAGGATATCTCTAAGTAGG
CCATTAGTTTATCATCTCTACTCTCCCTTATTTAAATTCTTAAAAATCAACATTTATATG
TACCACAAGCTCATCAAACATTTTCTATTAAGAAACACAAATTTACAACTTTTTTTAGT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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TTCTTCTAGATGGTACTACCAGCGAGAAAAAGGCGGGGCCAAATCTAAGTGTAGATGGGT
ATGCTCTGATAGATACCGTGAAAGATGCGCTCGAAGGAAATTGTACCGGGGTGGTTCCTT
GTGCTGACACCATAGCTCTTTGTTACTAGAGATCTTGTGAATCTTGCAAGCGGAGGAAAA
GCAAGATATGAGATACCAACGGGACGATTTGATGGTAGAGAGTCTCTGGCATCAACAGTA
GATTTGCCTGGTCCTCAAATGAGTGTCTCGGACACCTTTAAGATGTTTGAAAAAAGAAAA
CTTAGCCTTACCGATATGGTTCTACTTTCTTGGTGGACATACAATTGGAGTAACGCATTG
TTCATTCATTATGGACCGGCTATACAATTTTTAAGAATTCACAAAAACCTGATCCAGCTA
TGGATCCCAATTTGGTCAAAGAATTACGACTTAAATGTCCTAAAAAATCACGACAAAATG
GAGCCATCAATCTGGATCAAAATGTTCCGAGTTCGGATATTGTCGATGCATCTTACTACA
AGCAGATAGAATCTCGCCGAGGAATACTTCAAATCGATGACCAACTCGCCACCGATGAAA
TGACGAAACAGATAGTGAAGGATTTAGCCGTCGGTAACGATTTCTTGGTTAGGTTTGGTC
AGGCAATGGTGAAATTGGGATCGTTTGGAGTTAAAGACAAGGACACTGGTGAGATCAGAA
CATCGTGTCGTTCCTGCAAGAATCTGTTTTGCACGGCATAAATCTTCTTCCGTTTTTATT
ATGTTTGGACACTTTCGGTTTTCATTTTGTCATGCATGTTTTTTTTATTACATGTGCTAT
TTTTTGTGTATTGTTATTTCTTGAGAGTTATCTAAAGGAATAACATAACCATGAATACAA
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4AH90TF U 1
AF RR4AH90JQ C 325
BS 1 561 RR4AH90TF
BS 562 562 RR4AH90JQ
BS 563 600 RR4AH90TF
BS 601 601 RR4AH90JQ
BS 602 623 RR4AH90TF
BS 624 962 RR4AH90JQ

RD RR4AH90TF 624 0 0
CACCCCTAATGACCCGCCTTTATTTTCACGATTGTTTTAGCAACGGATGCGATGCGTCCC
TTCTTCTAGATGGTACTACCAGCGAGAAAAAGGCGGGGCCAAATCTAAGTGTAGATGGGT
ATGCTCTGATAGATACCGTGAAAGATGCGCTCGAAGGAAATTGTACCGGGGTGGTTCCTT
GTGCTGACACCATAGCTCTTTGTTACTAGAGATCTTGTGAATCTTGCAAGCGGAGGAAAA
GCAAGATATGAGATACCAACGGGACGATTTGATGGTAGAGAGTCTCTGGCATCAACAGTA
GATTTGCCTGGTCCTCAAATGAGTGTCTCGGACACCTTTAAGATGTTTGAAAAAAGAAAA
CTTAGCCTTACCGATATGGTTCTACTTTCTTGGTGGACATACAATTGGAGTAACGCATTG
TTCATTCATTATGGACCGGCTATACAATTTTTAAGAATTCACAAAAACCTGATCCAGCTA
TGGATCCCAATTTGGTCAAAGAATTACGACTTAAATGTCCTAAAAAATCACGACAAAATG
GAGCCATCAATCTGGATCAAA*TGTTCCGAGTTCGGATATTGTCGATGCATCTTACTACA
*GCAGATAGAATCTCGCCGAGGA
T

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4AH90JQ 638 0 0
GTCTCGGACACCTTTAAGATGTTTGAAAAAAGAAAACTTAGCCTTACCGATATGGTTCTA
CTT*CTTGGTGGACATACAATTGGAGTAACGCATTGTTCATTCATTATGGACCGGCTATA
CAATTTT*AAGAATTCACAAAAACCTGATCCAGCTATGGATCCCAATTTGGTCAAAGAAT
TACGACTTAAATGTCCTAAAAAATCAGGACAAAATGGAGCCATCAATTTGGATCAAAATG
TTCCGAGTTCGGATATTGTCGATGCATCTTACTACAAGCAGATAGAATCTCGCCGAGGAA
TACTTCAAATCGATGACCAACTCGCCACCGATGAAATGACGAAACAGATAGTGAAGGATT
TAGCCGTCGGTAACGATTTCTTGGTTAGGTTTGGTCAGGCAATGGTGAAATTGGGATCGT
TTGGAGTTAAAGACAAGGACACTGGTGAGATCAGAACATCGTGTCGTTCCTGCAAGAATC
TGTTTTGCACGGCATAAATCTTCTTCCGTTTTTATTATGTTTGGACACTTTCGGTTTTCA
TTTTGTCATGCATGTTTTTTTTATTACATGTGCTATTTTTTGTGTATTGTTATTTCTTGA
GAGTTATCTAAAGGAATAACATAACCATGAATACAAGT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL5965Contig1 866 2 4 U
CTCATGGATTTTATTATGGTCGGATCCTACTGAAAAACAACAAATTCGGGACCAGGTCGG
TTACCTGGAAGGTATGTTTTTTCAGACGAAAGGAATAGGGAGTTATCTGATTCAGCCGCT
GACGGTGCTGTTGTGCTGGAAAGCCCCGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATCTGCATAAT
GATATAAGCTCTGAAAATGCAATCAATCCAGGAATTAGGAGAACGAGCAAGGGTGTGGAG
TATCTTGTTGAAGCATCAGCGGCAGAAGCTGAGGCGATCAGTGCTACGTTGGCTGCTGCC
AAGGCACGACAAGTCAATGGTGAAGTTGAGCTCCCAGATAGGGATGGTGGTGGAGAGGCT
TCACCTAGTGGGACACCTACATTTTCGCTAATGAAGCCAGATTCCATGGGATCAATCGGT
ACTCCTGCAGGGATTCGTCTTCACCATAGAGCCGTGGTGGTTGCTGCAGAAACTGGTGGC
GCCTTGGGTGGAATGGCTAGACAGTTTTCTATTGATCAGTTTGAAAATGAGGGACGACGT
GTCAGTTATGGGACACCAGAAAGTGCAACTGCAGCAAGGAAACTACTAGATCGACAAATG
TCAATCAGTAGTGTTCCTAAGAAGGTTATAGCTCATCTTCTAAAGCCTCGTGGGTGGAAG
CCTCCAGTTCGACGCCAGTTTTTCCTAGATTGCAATGAAATAGCTGACCTTTGTGATAGT
GCAGAACGTATCTTCTCAAATGAACCAACTGTATTACAACTTAAAGCTCCTATCAAATAT
TTGGTGATCTGCATGGACAGTTTGGGGACCTCATGCGCCTTTTGATGATATGGTCACCAT
CTACAGTGGTGACATATCATACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4HA09TF U 1
AF RR4E455TF U 139
BS 1 194 RR4HA09TF
BS 195 195 RR4E455TF
BS 196 483 RR4HA09TF
BS 484 866 RR4E455TF

RD RR4HA09TF 483 0 0
CTCATGGATTTTATTATGGTCGGATCCTACTGAAAAACAACAAATTCGGGACCAGGTCGG
TTACCTGGAAGGTATGTTTTTTCAGACGAAAGGAATAGGGAGTTATCTGATTCAGCCGCT
GACGGTGCTGTTGTGCTGGAAAGCCCCGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATCTGCATAAT
GATATAAGCTCTGAGAATGCAATCAATCCAGGAATTAGGAGAACGAGCAAGGGTGTGGAG
TATCTTGTTGAAGCATCAGCGGCAGAAGCTGAGGCGATCAGTGCTACGTTGGCTGCTGCC
AAGGCACGACAAGTCAATGGTGAAGTTGAGCTCCCAGATAGGGATGGTGGTGGAGAGGCT
TCACCTAGTGGGACACCTACATTTTCGCTAATGAAGCCAGATTCCATGGGATCAATCGGT
ACTCCTGCAGGGATTCGTCTTCACCATAGAGCCGTGGTGGTTGCTGCAGAAACTGGTGGC
GCC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4E455TF 728 0 0
GAAAGCTCCGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATCTGCATAATGATATAAGCTCTGAAAAT
GCAATCAATCCAGGAATTAGGAGAACGAGCAAGGGTGTGGAGTATCTTGTTGAAGCATCA
GCGGCAGAAGCTGAGGCGATCAGTGCTACGTTGGCTGCTGCCAAGGCACGACAAGTCAAT
GGTGAAGTTGAGCTCCCAGATAGGGATGGTGGTGGAGAGGCTTCACCTAGTGGGACACCT
ACATTTTCGCTAATGAAGCCAGATTCCATGGGATCAATCGGTACTCCTGCAGGGATTCGT
CTTCACCATAGAGCCGTGGTGGTTGCTGCAGAAACTGGTGGCGCCTTGGGTGGAATGGCT
AGACAGTTTTCTATTGATCAGTTTGAAAATGAGGGACGACGTGTCAGTTATGGGACACCA
GAAAGTGCAACTGCAGCAAGGAAACTACTAGATCGACAAATGTCAATCAGTAGTGTTCCT
AAGAAGGTTATAGCTCATCTTCTAAAGCCTCGTGGGTGGAAGCCTCCAGTTCGACGCCAG
TTTTTCCTAGATTGCAATGAAATAGCTGACCTTTGTGATAGTGCAGAACGTATCTTCTCA
AATGAACCAACTGTATTACAACTTAAAGCTCCTATCAAATATTTGGTGATCTGCATGGAC
AGTTTGGGGACCTCATGCGCCTTTTGATGATATGGTCACCATCTACAGTGGTGACATATC
ATACATCG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5966Contig1 455 2 6 U
GGACCCTAAAGAAAGTTTTAACCTAGCGTCGTCCTCGTCGCCTCCAGCAGCAGAGCCAGA
GAAGCAAAGAAGATTCTCTGTAATCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTGCCG
GGAAGGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAATCCTCGTG
GCCGCGCTCACAAGCGATTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACTGCAGTTGTTGGCTTTG
GCAAAAAGAGAGGACCAAACTCATCAGAGAAGTAGAGACAAAACCAAGACTTCTGGTGTG
GTTTTCCCTCGGATTATTTTGATGTTTTGATAATGCGTTTTAGTTTCCGGTATGGTAATG
AGTCGATGTTTGCTGTCAATTTTATTCGTGTTTCTCCTTGGATTATTTTTATTATATTAA
AGAAACTCAAACTCCATTATAGGAGGAGAAAGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4CP43TF U 1
AF RR4GS39TF U 306
BS 1 345 RR4CP43TF
BS 346 346 RR4GS39TF
BS 347 386 RR4CP43TF
BS 387 387 RR4GS39TF
BS 388 453 RR4CP43TF
BS 454 455 RR4GS39TF

RD RR4CP43TF 453 0 0
GGACCCTAAAGAAAGTTTTAACCTAGCGTCGTCCTCGTCGCCTCCAGCAGCAGAGCCAGA
GAAGCAAAGAAGATTCTCTGTAATCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCTGCCG
GGAAGGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAATCCTCGTG
GCCGCGCTCACAAGCGATTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACTGCAGTTGTTGGCTTTG
GCAAAAAGAGAGGACCAAACTCATCAGAGAAGTAGAGACAAAACCAAGACTTCTGGTGTG
GTTTTCCCTCGGATTATTTTGATGTTTTGATAATGCGTTTTAGTT*CCGGTATGGTAATG
AGTCGATGTTTGCTGTCAATTTTATTGGTGTTTCTCCTTGGATTATTTTTATTATATTAA
AGAAACTCAAACTCCATTATAGGAGGAGAAAGT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4GS39TF 150 0 0
CCCTCGGATTATTTTGATGTTTTGATAATGCGTTTTAGTTTCCGGTATGGTAATGAGTCG
ATGTTTGTTGTCAATTTTATTCGTGTTTCTCCTTGGATTATTTTTATTATATTAAAGAAA
CTCAAACTCCATTATAGGAGGAGAAAGTAC

QA 1 150 1 150
DS 



AS 1 2

CO CL5967Contig1 1039 2 2 U
GGATGGTTTGTAGAGTTTGCAAAAACTCACACATGGAGTCCTACACTAACCGGTTTAGTT
CAGAAGAAGTTTGAGAAGATAGGTCAGCTCCGTCTCAAAGGTATTGTTAGCACTTGTAGG
ACTACTCGAAAGAGACCAAACTGGATTAAGAAAACTTTGTGGAGAAAAATGTGTGCTTTT
TGGGACACTGATAAAGCCAAAGAAAAGAGTTTGACGGCTTCAGTTGCTCGGATGTCTGAC
CGTAATGGTCTTGGTCCTCACAAGCACAACTCTGGGCAGAAGTCTTTCAAACAAATCGAG
CAAGAATTGGTAGAGGAATTGGGCAGACCGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCATTAAGACT
CATACAAAAAAGGATGGGACCTTTGTGGATATGAAAGCACAGGAGTTGCTGAGGTGTATC
GGCGGAACAAACAGTCAAGGTTGGAGGACCTTGAGGCTGAAAATGCAGACCCTTCAGAGT
CTAGTTCACAAGCTCCAGAGCTCTCTATAGATGAGGATAATGAGATATTCCTCCTGTCTA
CTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATTATGGAATTGGAAGCCTCAAGGGTACTCTCGTCA
ATGGAAAGCGGAAGTACAGTGCATCCTCTTCAATCCTGGACCTGCAAACACAGCTTGATG
AAGCTCACCGCAAGATCGAGGAGCAGGCTGCCCAGAATGCAATTGCTCTCCGCAAAATCG
AGGAGCAGGCTGCCCAAAATGCAAACAATCTCCGCATCATCGAAGAGCAGGCTGCCCAAA
ATGCAGAGCAGGGAGCACAGCTCAAGGAGTTATCGGTAATGAACAAGTTTATGATTGCAA
CAAATCCTCAGTACGTTGAATTCATTGCAGCTAACAAGTCTGGTGATTAAGTTCTCTTTT
TCTTAGAATTTAAGTTCTTTCTTTTGTGTACTTTCAAACTTATGATCAGGTGTTAAAGTA
TTTTCAGCTTGTTAAACTCCTAAATAAGGAGTTCTTTTGTATCAAAACATAATCTTGTTA
AAATTTCCAGTTTCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A893TF U 1
AF RR4A893JQ C 412
BS 1 682 RR4A893TF
BS 683 1039 RR4A893JQ

RD RR4A893TF 682 0 0
GGATGGTTTGTAGAGTTTGCAAAAACTCACACATGGAGTCCTACACTAACCGGTTTAGTT
CAGAAGAAGTTTGAGAAGATAGGTCAGCTCCGTCTCAAAGGTATTGTTAGCACTTGTAGG
ACTACTCGAAAGAGACCAAACTGGATTAAGAAAACTTTGTGGAGAAAAATGTGTGCTTTT
TGGGACACTGATAAAGCCAAAGAAAAGAGTTTGACGGCTTCAGTTGCTCGGATGTCTGAC
CGTAATGGTCTTGGTCCTCACAAGCACAACTCTGGGCAGAAGTCTTTCAAACAAATCGAG
CAAGAATTGGTAGAGGAATTGGGCAGACCGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCATTAAGACT
CATACAAAAAAGGATGGGACCTTTGTGGATATGAAAGCACAGGAGTTGCTGAGGTGTATC
GGCGGAACAAACAGTCAAGGTTGGAGGACCTTGAGGCTGAAAATGCAGACCCTTCAGAGT
CTAGTTCACAAGCTCCAGAGCTCTCTATAGATGAGGATAATGAGATATTCCTCCTGTCTA
CTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATTATGGAATTGGAAGCCTCAAGGGTACTCTCGTCA
ATGGAAAGCGGAAGTACAGTGCATCCTCTTCAATCCTGGACCTGCAAACACAGCTTGATG
AAGCTCACCGCAAGATCGAGGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4A893JQ 628 0 0
AGGTGTATCGGCGGAACAAACAGTCAAGGTTGGAGGACCTTGAGGCTGAAAATGCAGACC
CTTCAGAGTCTAGTTCACAAGCTCCAGAGCTCTCTATAGATGAGGATAATGAGATATTCC
TCCTGTCTACTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATTATGGAATTGGAAGCCTCAAGGGTA
CTCTCGTCAATGGAAAGCGGAAGTACAGTGCATCCTCTTCAATCCTGGACCTGCAAACAC
AGCTTGATGAAGCTCACCGCAAGATCGAGGAGCAGGCTGCCCAGAATGCAATTGCTCTCC
GCAAAATCGAGGAGCAGGCTGCCCAAAATGCAAACAATCTCCGCATCATCGAAGAGCAGG
CTGCCCAAAATGCAGAGCAGGGAGCACAGCTCAAGGAGTTATCGGTAATGAACAAGTTTA
TGATTGCAACAAATCCTCAGTACGTTGAATTCATTGCAGCTAACAAGTCTGGTGATTAAG
TTCTCTTTTTCTTAGAATTTAAGTTCTTTCTTTTGTGTACTTTCAAACTTATGATCAGGT
GTTAAAGTATTTTCAGCTTGTTAAACTCCTAAATAAGGAGTTCTTTTGTATCAAAACATA
ATCTTGTTAAAATTTCCAGTTTCTTATT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5969Contig1 690 2 4 U
GCACTTAAAATGGAGATCATTCCTAACCCAAAGGAAGTCGATGGAGTGAAAGTTCTTCAA
CTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCAATAAGGTTCTTTGACAATGCTATCGGTGTTAATGTA
CCTCGCTCACGGTTCTTGCCAGTGAAGGCAACATCAGACTTGCTGCTGGTCCAGTCTGAT
CTCTACACCCTAGTTGATGGCTTTGTCACCCGAAACCCTGCTAGAACTAACCCCTCAAAC
CCATCAGTTGAATTGGGACCCGAATTCAAGAAGGTGGCTAATTTCTTGAGCCGGTTCAAG
TCCATCCCTAATATTGTCGAGCTCGACAGCCTTAAGGTGTCTGGTGATGTCTATTTTGGC
TCTTCCGTTGTTCTCAAGGGCAAGGTGACTGTAACCGCAAAATCTGGGACGAAGGTGGAA
ATCCCCGATGGTGCTGTGATCGAGAACAAGGACATCAATGGTCCGGAGGACCTCTGAATA
AGAAGAATCCTAAGTCTTCTTCCCTTTCTCATGGAAGCCACATCTTGTTCTTCGGTATAA
AGAGTCAACCAGATCGTTTGTGAAAGAATAATAAATGCTTTTTGCAGTTTAGCAAAGTCT
TTTCCACCATGGACTTTCATTACTTCTGCTTTTTAAATTTTCCCGAACATAATTACAATC
AAGTATGAGTGTTATTCTGGTTCTTTCTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C263TF U 1
AF RR4C263JQ C 1
BS 1 246 RR4C263TF
BS 247 247 RR4C263JQ
BS 248 270 RR4C263TF
BS 271 690 RR4C263JQ

RD RR4C263TF 270 0 0
GCACTTAAAATGGAGATCATTCCTAACCCAAAGGAAGTCGATGGAGTGAAAGTTCTTCAA
CTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCAATAAGGTTCTTTGACAATGCTATCGGTGTTAATGTA
CCTCGCTCACGGTTCTTGCCAGTGAAGGCAACATCAGACTTGCTGCTGGTCCAGTCTGAT
CTCTACACCCTAGTTGATGGCTTTGTCACCCGAAACCCTGCTAGAACTAACCCCTCAAAC
CCATCA*TTGAATTGGGACCCGAATTCAAG

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR4C263JQ 690 0 0
GCACTTAAAATGGAGATCATTCCTAACCCAAAGGAAGTCGATGGAGTGAAAGTTCTTCAA
CTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCAATAAGGTTCTTTGACAATGCTATCGGTGTTAATGTA
CCTCGCTCACGGTTCTTGCCAGTGAAGGCAACATCAGACTTGCTGCTGGTCCAGTCTGAT
CTCTACACCCTAGTTGATGGCTTTGTCACCCGAAACCCTGCTAGAACTAACCCCTCAAAC
CCATCAGTTGAATTGGGACCCGAATTCAAGAAGGTGGCTAATTTCTTGAGCCGGTTCAAG
TCCATCCCTAATATTGTCGAGCTCGACAGCCTTAAGGTGTCTGGTGATGTCTATTTTGGC
TCTTCCGTTGTTCTCAAGGGCAAGGTGACTGTAACCGCAAAATCTGGGACGAAGGTGGAA
ATCCCCGATGGTGCTGTGATCGAGAACAAGGACATCAATGGTCCGGAGGACCTCTGAATA
AGAAGAATCCTAAGTCTTCTTCCCTTTCTCATGGAAGCCACATCTTGTTCTTCGGTATAA
AGAGTCAACCAGATCGTTTGTGAAAGAATAATAAATGCTTTTTGCAGTTTAGCAAAGTCT
TTTCCACCATGGACTTTCATTACTTCTGCTTTTTAAATTTTCCCGAACATAATTACAATC
AAGTATGAGTGTTATTCTGGTTCTTTCTGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL5970Contig1 1094 2 6 U
GGAAAGAGAAACACATAACAAAATGGGGTCCCCAATGGCCTCTTTGGCAGCAACTTTGCT
TATCTTAGCACTCTCTCTTGGCTTTGTATCTGAAACCACCGCAAATTACTACTACTCTTC
TCCTCCTCCACCGGTCAAACACTACACTCCTCCAGTGTACAAGTCACCTCCACCACCTGT
TAAGCATTACTCTCCTCCGGTGTACAAATCCCCACCTCCACCAAAGAAGGATTACGAGTA
CAAATCCCCTCCACCACCGGTTAAGCATTATTCTCCTCCTCCAGTTTACAAGTCTCCACC
TCCTCCCAAGAAACATTACGAGTACAAGTCGCCTCCTCCACCGGTTTACAAGTCTCCTCC
TCCTCCCGTATACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAACACTACGAGTACAAATCACCTCC
TCCACCAGTTTACAAGTCTCCTCCTCCTCCGGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAA
ACATTACGAGTACAAATCACCACCACCACCGGTTTACAAGTCTCCCCCTCCTCCGGTTTA
CCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGCACTACGAGTACAAATCTCCTCCTCCTCCAGTTTA
CCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGCATTACGAGTACAAATCTCCTCCTCCTCCAGTTTA
CCAGTCTCCTCCCCCTCCGGTTTACTACTCTCCCCCACCACCAAAGAAACACTACGAATA
CAAATCGCCTCCACCTCCCGTGTATTCTCCTCCTCACCACCCGTACCTTTACAAATCTCC
ACCTCCTCCATACCACTACTAGATAAGCTGATCGTCAGACTCATGGAGTTGACGACATTA
CACAAGAAAAACAAATAATCTTTTGGTCATATAATAAAGGATACAAGATCATTAAGAGAG
AACCGAAACGGATATATGTTTTAAGAGAAGTTTCCCATTTGATGTGTTTTATTTTTCTTC
CATAAATAAGTTGTTGTAATAAACTTCAAACATGTTTGATGATTGGTCCCTTCCTGCATG
CAAACTGGCCATGTGTTTGTAATTTCGAGTCCTGTTTTCCAAATTCTTCAATTTCAAAGT
TTGCTTGTTAACTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM92TF U 1
AF RR4DM92JQ C 451
BS 1 695 RR4DM92TF
BS 696 696 RR4DM92JQ
BS 697 708 RR4DM92TF
BS 709 709 RR4DM92JQ
BS 710 727 RR4DM92TF
BS 728 1094 RR4DM92JQ

RD RR4DM92TF 727 0 0
GGAAAGAGAAACACATAACAAAATGGGGTCCCCAATGGCCTCTTTGGCAGCAACTTTGCT
TATCTTAGCACTCTCTCTTGGCTTTGTATCTGAAACCACCGCAAATTACTACTACTCTTC
TCCTCCTCCACCGGTCAAACACTACACTCCTCCAGTGTACAAGTCACCTCCACCACCTGT
TAAGCATTACTCTCCTCCGGTGTACAAATCCCCACCTCCACCAAAGAAGGATTACGAGTA
CAAATCCCCTCCACCACCGGTTAAGCATTATTCTCCTCCTCCAGTTTACAAGTCTCCACC
TCCTCCCAAGAAACATTACGAGTACAAGTCGCCTCCTCCACCGGTTTACAAGTCTCCTCC
TCCTCCCGTATACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAACACTACGAGTACAAATCACCTCC
TCCACCAGTTTACAAGTCTCCTCCTCCTCCGGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAA
ACATTACGAGTACAAATCACCACCACCACCGGTTTACAAGTCTCCCCCTCCTCCGGTTTA
CCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGCACTACGAGTACAAATCTCCTCCTCCTCCAGTTTA
CCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGCATTACGAGTACAAATCTCCTCCTCCTCCAGTTTA
CCAGTCTCCTCCCCCTCCGGTTTACTACTCTCCCC*ACCACCAAAGAA*CACTACGAATA
CAAATCG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4DM92JQ 644 0 0
GGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAACATTACGAGTACAAATCACCACCACCACC
GGTTTACAAGTCTCCCCCTCCTCCGGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGCACTA
CGAGTACAAATCTCCTCCTCCTCCAGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGCATTA
CGAGTACAAATCTCCTCCTCCTCCAGTTTACCAGTCTCCTCCCCCTCCGGTTTACTACTC
TCCCCCACCACCAAAGAAACACTACGAATACAAATCGCCTCCACCTCCCGTGTATTCTCC
TCCTCACCACCCGTACCTTTACAAATCTCCACCTCCTCCATACCACTACTAGATAAGCTG
ATCGTCAGACTCATGGAGTTGACGACATTACACAAGAAAAACAAATAATCTTTTGGTCAT
ATAATAAAGGATACAAGATCATTAAGAGAGAACCGAAACGGATATATGTTTTAAGAGAAG
TTTCCCATTTGATGTGTTTTATTTTTCTTCCATAAATAAGTTGTTGTAATAAACTTCAAA
CATGTTTGATGATTGGTCCCTTCCTGCATGCAAACTGGCCATGTGTTTGTAATTTCGAGT
CCTGTTTTCCAAATTCTTCAATTTCAAAGTTTGCTTGTTAACTC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL5971Contig1 605 2 2 U
GGAAACCATACTTGTTTCCACCATCTTTTCTTTCACTCAGCCGCTACTTAAACATGGGAA
GCGATACAGAAGCAGAGAAGTCCATTCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTC
CTATAGCTAAACCTCTTGCCGGCAAAAAGCTCCAAAAGAGGACATTCAAACTCATTCAAA
AAGCTGCTGGAAATAAATGTTTGAAGAGAGGTGTAAAGGAAGTGGTTAAGAGCATAAGAC
GTGGCCAAAAAGGAATATGTGTGATAGCTGGAAACATATCCCCCATTGATGTGATTACCC
ATCTTCCAATCTTGTGCGAGGAAGCTGGTGTTCCTTACGTCTATGTTCCTTCCAAAGAGG
ATCTTGCGCAAGCTGGTTCTACAAAACGACCAACTTGTTGTGTATTGGTCATGCTTAAAC
CGGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAAGATCTTGAAAAGCTAAAGACAGACTACGAACAAG
TCTCTGACGATGTTAAAGAGCTTACCTCTGATGTAATCTGATTAGAAACTAGTATCAAAG
AACAAAATTAACATTTGTTTCTGTTTTGCTTAATGAAAATGATGAGGTTAATCAGAGTTT
GTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 

AF RR4AC77JQ C 1
AF RR4AC77TF U 120
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AAGCTGCTGGAAATAAATGTTTGAAGAGAGGTGTAAAGGAAGTGGTTAAGAGCATAAGAC
GTGGCCAAAAAGGAATATGTGTGATAGCTGGAAACATATCCCCCATTGATGTGATTACCC
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ATCTTGCGCAAGCTGGTTCTACAAAACGACCAACTTGTTGTGTATTGGTCATGCTTAAAC
CGGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAAGATCTTGAAAAGCTAAAGACAGACTACGAACAAG
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GTACC

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GAACAAAATTAACATTTGTTTCTGTTTTGCTTAATGAAAATGATGAGGTTAATCAGAGTT
TGTACC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

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TTTTTACGTTTAAGTTGCAAACAATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTTTTAAT
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BQ
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AF RR4DJ40JQ C 1
AF RR4DJ40TF U 1
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TTTTTACGTTTAAGTTGCAAACAATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTTTTAAT
ATCTACTACAAGCAGAGATTTATCC

QA 1 265 1 265
DS 

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TGCCTATCTATAAATCTCTGTGTTTCCTTTCTTGTTTCTTGAACCAGTTATGTTTTTAAT
TTTTTACGTTTAAGTTGCAAACAATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTTTTAAT
ATCTACTACAAGCAGAGATTTATCC

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 2

CO CL5973Contig1 1121 2 2 U
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GATGTTGTATATAAACAAGAAGCATCTCTTGATTACTAGACACTGAAAGAAGTCAAAAAT
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GAAAAAACAAAAAAAACAAAAAGGAGAGTTGTGGAGTGAGATCACTGCAGAAAGAAAAAA
AATGGGATCTTCTTCAGGACAAAGTGGATATGATCTGTCTTTCAAGATCTTGTTGATTGG
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AATTTATATAAAGACGAAGCTTGGCTTCTCTGTAAATCTCCTTATCAGTTCCTTAGATTG
TTCTTCTTTTTTTTTGCCTCGACTGAGATTGTGTAATAATAAGTTAATAACCTCACTACA
CAGAAGAAAAGGAAAGCAAGACCAGCGTGTATCTTGTGTTT


BQ
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AF RR4D044TF U 1
AF RR4D044JQ C 441
BS 1 705 RR4D044TF
BS 706 1121 RR4D044JQ

RD RR4D044TF 705 0 0
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CTCCTGAGTTTTTGTCGGTTGGGTTCTTTGTTTTATTTCTACAGTATTAGATCGACAAAA
GAAAAAACAAAAAAAACAAAAAGGAGAGTTGTGGAGTGAGATCACTGCAGAAAGAAAAAA
AATGGGATCTTCTTCAGGACAAAGTGGATATGATCTGTCTTTCAAGATCTTGTTGATTGG
AGATTCTGGTGTTGGTAAAAGCAGCTTGCTTCTCAGTTTCATTTCCAGCTCTGTCCATGA
TCTTGCTCCCACCATAGGTGTTGATTTTAAGATCAAACAGCTGAAAGTAAGAGGAAAAAG
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TCTGAACTTGGCAGATGTTTGGGCCAAAGAGATTGAGCTTTACTCCACTAACCATGACTG
CATTAAGATGCTCGTTGGCAACAAAGTCGACAGAGAATCAGAGAG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4D044JQ 681 0 0
TTGATTTTAAGATCAAACAGCTGAAAGTAAGAGGAAAAAGGGTAAAGCTTACAATCTGGG
ACACAGCTGGACAAGAAAAGTTCAGGACGTTGACAAGTTCTTATTTCAGAGGCTCCCAAG
GGATCATTCTCGTTTATGATGTGACGAAAAGAGAGACGTTTCTGAACTTGGCAGATGTTT
GGGCCAAAGAGATTGAGCTTTACTCCACTAACCATGACTGCATTAAGATGCTCGTTGGCA
ACAAAGTCGACAGAGAATCAGAGAGGAAGGTAAGCCGAGAAGAAGGAACGGCTCTAGCCA
AAAAACTCAAGTTTCTGTTTCATGAATGTTGCGCAAGAACCAGAGAAAACGTGAAGCAAT
GCTTTGAAGAGCTTGCTCTCAAGATAATGGATGTACCTAGTCTTTTGCAAGAAGGATCAA
GCTCTCTGAAGAGAAAACCGGATTTCAGAACTCATCAGAGCCGGTGCTGCTCGTGAGCTG
TGTTTGATCATTGAAACCCGCCTAGGTTCTTTTGTGTGTAAATTTATATAAAGACGAAGC
TTGGCTTCTCTGTAAATCTCCTTATCAGTTCCTTAGATTGTTCTTCTTTTTTTTTGCCTC
GACTGAGATTGTGTAATAATAAGTTAATAACCTCACTACACAGAAGAAAAGGAAAGCAAG
ACCAGCGTGTATCTTGTGTTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL5974Contig1 1107 2 4 U
GGAAGAAAGAGAGTCAGCGAGAATGGAGCTTTGCGTTATCAGCTCGACGACGACGATCAA
TCCTTTTCATTCATGTCGTCTTGGTGCTTCTCGTCGTCTCTTCCAATCCGATAGCTTGTT
CCTCTCTCGTGATGGTTGCTCATTCAACGGCAGGCTTCTGAAGAAACCAATCAAGAAGCC
CTTGGAGCTATCCTGCGCCGCCAAGAAAATTGGCGGCGGTGGAGTAGCCCGGCGAGCAGC
GGCTTCAACCAAGGCCCCTCCGGCGGTTGAACCAAGCGTAAAGGACGACAAGCTCCCCGC
TGAACTTCAGGTCGTTGAGACTAAAGCCCCCAATTCAAGTGTGAAACTGAGTGTGGAAGT
TCCAGCAATTGTCTGTGAAGATTGTTACCAGAGAGTCCTGACCGAGTTCATGAAAATGGC
AAAGGTTCCTGGGTTCCGGCCTGGAAAGAGAGTTCCAGAGAATATTATTGTTGGTTTCGT
TGGGAGGCCATACGTTTTGAGAGCTACTGTTGAATCTATCTTGAAAAGAACACTTCCCCA
CGCCATGGAGTCTGTGACTGGAAAGGCTTTAAAAGACTCTATACAGATTGTAAGCAGCTT
TCCGGAGATGGAGAAGGCTTATTCTCAGCTCAAGACTCTTAGTTACGAGGTGGTTGTTGA
TGTGGTGCCTGAGCTGAAATGGAGTACTGAGAATGGGTATAAAGATATGAAGGTCGTTGT
TGAACTAGTAGATGAGATAGACGCTAAGAAAGCTTCCGAAAGACAACTAAGACAGAAGTA
CAAGTCCCTTGGTGCTTTGAAGATTGTCACTGACCGAGGTCTACAGGTGGGAGATCTTGC
AGTCATTGATATATCTGCTACAACCATAGACGAGGAAGGGACAACTGGTGAATCCATTCC
AGATGCTGAAAGCAAAGGTCTTCATTTTGACACAGAAGAAGGGAACAGATTGCTTCCTGG
ATTCCTTGATTCAATCTTAGGAATCCGGGCTGGCGAGTCAAAGTCATTCTCGCTTGTGTT
TCCTGATTCATGGAAGCAGAAAGTCTCCGTGGCCACGTGCTCAGTTCACTGTTGATTGTA
AGAACTATTCTACAGAGATTACAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY93TF U 1
AF RR4GQ02TF U 336
BS 1 392 RR4DY93TF
BS 393 393 RR4GQ02TF
BS 394 604 RR4DY93TF
BS 605 1107 RR4GQ02TF

RD RR4DY93TF 604 0 0
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TCCTTTTCATTCATGTCGTCTTGGTGCTTCTCGTCGTCTCTTCCAATCCGATAGCTTGTT
CCTCTCTCGTGATGGTTGCTCATTCAACGGCAGGCTTCTGAAGAAACCAATCAAGAAGCC
CTTGGAGCTATCCTGCGCCGCCAAGAAAATTGGCGGCGGTGGAGTAGCCCGGCGAGCAGC
GGCTTCAACCAAGGCCCCTCCGGCGGTTGAACCAAGCGTAAAGGACGACAAGCTCCCCGC
TGAACTTCAGGTCGTTGAGACTAAAGCCCCCAATTCAAGTGTGAAACTGAGTGTGGAAGT
TCCAGCAATTGTCTGTGAAGATTGTTACCAGATAGTCCTGACCGAGTTCATGAAAATGGC
AAAGGTTCCTGGGTTCCGGCCTGGAAAGAGAGTTCCAGAGAATATTATTGTTGGTTTCGT
TGGGAGGCCATACGTTTTGAGAGCTACTGTTGAATCTATCTTGAAAAGAACACTTCCCCA
CGCCATGGAGTCTGTGACTGGAAAGGCTTTAAAAGACTCTATACAGATTGTAAGCAGCTT
TCCG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4GQ02TF 772 0 0
G
AAGTGTGAAACTGAGTGTGGAAGTTCCAGCAATTGTCTGTGAAGATTGTTACCAGAGAGT
CCTGACCGAGTTCATGAAAATGGCAAAGGTTCCTGGGTTCCGGCCTGGAAAGAGAGTTCC
AGAGAATATTATTGTTGGTTTCGTTGGGAGGCCATACGTTTTGAGAGCTACTGTTGAATC
TATCTTGAAAAGAACACTTCCCCACGCCATGGAGTCTGTGACTGGAAAGGCTTTAAAAGA
CTCTATACAGATTGTAAGCAGCTTTCCGGAGATGGAGAAGGCTTATTCTCAGCTCAAGAC
TCTTAGTTACGAGGTGGTTGTTGATGTGGTGCCTGAGCTGAAATGGAGTACTGAGAATGG
GTATAAAGATATGAAGGTCGTTGTTGAACTAGTAGATGAGATAGACGCTAAGAAAGCTTC
CGAAAGACAACTAAGACAGAAGTACAAGTCCCTTGGTGCTTTGAAGATTGTCACTGACCG
AGGTCTACAGGTGGGAGATCTTGCAGTCATTGATATATCTGCTACAACCATAGACGAGGA
AGGGACAACTGGTGAATCCATTCCAGATGCTGAAAGCAAAGGTCTTCATTTTGACACAGA
AGAAGGGAACAGATTGCTTCCTGGATTCCTTGATTCAATCTTAGGAATCCGGGCTGGCGA
GTCAAAGTCATTCTCGCTTGTGTTTCCTGATTCATGGAAGCAGAAAGTCTCCGTGGCCAC
GTGCTCAGTTCACTGTTGATTGTAAGAACTATTCTACAGAGATTACAACTT

QA 2 772 2 772
DS 



AS 1 2

CO CL5975Contig1 1078 2 2 U
GACGTAATCGAAGCTCCGACTCGGATCATCGAGGCGAAACCCGGAGAGATGTCCCGGAGC
TCCAAAAGGACAGGGATCATCGCCGTCAAGTGTGGGATGACTGCTCTCTGGGACAAATGG
GGAGCTAGGGTTCCGGTGTCTATCCTCTGGGTCGATGACAACATCGTCTCTCAGGTCAAA
ACCGTTGAGAAAGAAGGCATCTTTGCGCTGCAGATTGGATGTGGGCATAAGAAACCGAAG
CATTTGACGATGCCTGAGTTGGGTCATTTCAGAGCTCAAGGTGTGCCGTTGAAGAGGAAG
CTGAGAGAGTTTCCTGTGACGGAAGACGCTCTGCTTCCTGTTGGGACTGAGCTCGGTGTG
CGTCATTTTGTTCCTGGGCAGTATGTTGATGTCACTGGGATCACTCGTGGGAAAGGTTTT
CAGGGAGTAATGAAAATATTTAAGTTCAAAGGAGGGCCGAAATCACATGGTTGTTCAAAG
GCACATCGGAAAGGTGGTTCCACTGGTCAAAGAGATGATCCGGGAAAGGTGTTCAAGGGA
AGAAAGGTGCCTGGGAGAATGGGTGCAGAGCAGAGGACTGTAAAGAACGTTTGGGTTTAC
AAGATTGATCCCGCCAGGAACCTCATCTGGGTTAGAGGACAAGTTCCTGGTGCGGAAGGA
AACTTTGTGTTCATAAGAGATGCTCACTACAAGAAACCGGACATCTCAAAGCTTCCATTT
CCAACCTACTTAGCCCCAGAAGACGAGGACCCATCAGAGTTAGAACCGTTGGTCGCAGAT
CTAGGAGAAGTCGACCCATTTATGCTAGCAGAGTGATGTTAAAGACATGATCCTCATCTT
GATTTTGACCTTTTTCATTTTTTACGTTCGTGGAAGACGAGAAGCTGATGAGGTGGAGGC
ACAGAGCTCTAAAGCTTTTGCTGAAGAAAGATTGTCTTTTCCTATTTATTAGTTGTATGA
AACTGAAAACGATGGTTAGAGAGGAATTTAGTCTTTGCATTTGTTGAATTTGCAATAAGC
AATGAAGTAACAGTATTCTTGTCTTATCTTCTAAATATATGGTTACTTTTGTACGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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ACCGTTGAGAAAGAAGGCATCTTTGCGCTGCAGATTGGATGTGGGCATAAGAAACCGAAG
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CGTCATTTTGTTCCTGGGCAGTATGTTGATGTCACTGGGATCACTCGTGGGAAAGGTTTT
CAGGGAGTAATGAAAATATTTAAGTTCAAAGGAGGGCCGAAATCACATGGTTGTTCAAAG
GCACATCGGAAAGGTGGTTCCACTGGTCAAAGAGATGATCCGGGAAAGGTGTTCAAGGGA
AGAAAGGTGCCTGGGAGAATGGGTGCAGAGCAGAGGACTGTAAAGAACGTTTGGGTTTAC
AAGATTGATCCCGCCAGGAACCTCATCTGGGTTAGAGGACAAGTTCCTGGTGCGGA

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DS 

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GAGATGATCCGGGAAAGGTGTTCAAGGGAAGAAAGGTGCCTGGGAGAATGGGTGCAGAGC
AGAGGACTGTAAAGAACGTTTGGGTTTACAAGATTGATCCCGCCAGGAACCTCATCTGGG
TTAGAGGACAAGTTCCTGGTGCGGAAGGAAACTTTGTGTTCATAAGAGATGCTCACTACA
AGAAACCGGACATCTCAAAGCTTCCATTTCCAACCTACTTAGCCCCAGAAGACGAGGACC
CATCAGAGTTAGAACCGTTGGTCGCAGATCTAGGAGAAGTCGACCCATTTATGCTAGCAG
AGTGATGTTAAAGACATGATCCTCATCTTGATTTTGACCTTTTTCATTTTTTACGTTCGT
GGAAGACGAGAAGCTGATGAGGTGGAGGCACAGAGCTCTAAAGCTTTTGCTGAAGAAAGA
TTGTCTTTTCCTATTTATTAGTTGTATGAAACTGAAAACGATGGTTAGAGAGGAATTTAG
TCTTTGCATTTGTTGAATTTGCAATAAGCAATGAAGTAACAGTATTCTTGTCTTATCTTC
TAAATATATGGTTACTTTTGTACGTTT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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CTCGCCAAAACAATCTTGTTGTGGAGCAGATCGTCGACTTATACGACCAAATTTCAAAGC
TCGAGTGTTTGAAACCTTCAAAAAATGTCGACACTTTGTTCGGACAACTCGTGTCCACGT
GCTTACCCACGGACACAAACATCGATGTCACAAAGATGAGTGACGAAGTCAAAGACATGA
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AATCTTGGGGTCTTTACCAGAAGTCCAAAACCCACTTGACCATTTAAACATCTTTCCTTA
CTACAACAACTACCTCAAGCTAGTCAAGCTCGAGTTCGATCTCTTGAGTCAACACTCGAG
CCATGTTCCATCCAAGATGCCTCTCACATCCATCGTCTTGGCTAAGTTCCACCTACCCAA
CACGACGTTCCATAACTTTGACATCGACTCACACGCAAACGCACTCGCTTCAAGCCTTTG
TCTCTCGCGACCCCGACCTCTCAAAACGCATGATCTTTCCACACAACGGACGTGCTAAAC
GCTACGGAAGGGCTAGACCAATACGACGTAGTTTTCTTGGCGGCTCTCGTTGGGATGGAC
AAAGAGGCAAAGGTCAAAGCCATCGAGCACTTGGAGAAACACATGGCTCCTGGAGCTACC
CTCATGCTAAGGAGTGCTCATGCTCTTAGAGCTTTCTTGTATCCGATCGTTGACTCTTCT
GATCTCAAAGGCTTCCAGCTCTTGACCATCTATCATCCCACCGATGACGTGGTTAACTCG
GTTGTCATCGCACGCAAGCTTGGTGGTTCGACCATGACTGGAGTCAATGGTACTCGTGGC
TGCATGTTCATGCCTTGTAACTGTTCTAAGGTCCACGCCATTATGAACAACCGTTGCAAG
AAGATGATGATCGAGGAGTTTAGCGCCATCGAGTAACCAAAAGCAAGTAATTACTGAACA
CATCTCATATCTCTTGAGACTATGTGTTAATGTTTTTCTCTTATATTAATTGCTATTTTC
ACTTCATGTGATCTTGTGTGTTTTTTTTTTCTGACGTGTGTGGCTAGTATAAGCTGGTGA
ATTTTGATTTCTTTGATCTTCGCTATGAATTGTGAAGATACAGAAGAACCCTTTCTCTGT
TCCCTTTTCATCATCAATAAAAATAATATAAGATAATGTT


BQ
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AF RR4AV38TF U 1
AF RR4AV38JQ C 381
BS 1 648 RR4AV38TF
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TCGAGTGTTTGAAACCTTCAAAAAATGTCGACACTTTGTTCGGACAACTCGTGTCCACGT
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GATCTAACCTCATCAAGCTATGTGGTGAAGCCGAAGGCTATTTAGAGCAACACTCTCCAC
AATCTTGGGGTCTTTACCAGAAGTCCAAAACCCACTTGACCATTTAAACATCTTTCCTTA
CTACAACAACTACCTCAAGCTAGTCAAGCTCGAGTTCGATCTCTTGAGTCAACACTCGAG
CCATGTTCCATCCAAGATGCCTCTCACATCCATCGTCTTGGCTAAGTTCCACCTACCCAA
CACGACGTTCCATAACTTTGACATCGACTCACACGCAAACGCACTCGCTTCAAGCCTTTG
TCTCTCGCGACCCCGACCTCTCAAAACGCATGATCTTTCCACACAACGGACGTGCTAAAC
GCTACGGAAGGGCTAGACCAATACGACGTAGTTTTCTTGGCGGCTCTCGTTGGGATGGAC
AAAGAGGCAAAGGTCAAAGCCATCGAGCACTTGGAGAAACACATGGCTTCTGGAGCTA

QA 1 658 1 658
DS 

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ACATCGACTCACACGCAAACGCACTCGCTTCAAGCCTT*GTCTCTCGCGACCCCGACCTC
TCAAAACGCATGATCTT*CCACACAACGGACGTGCTAAACGCTACGGAAGGGCTAGACCA
ATACGACGTAGTTTTCTTGGCGGCTCTCGTTGGGATGGACAAAGAGGCAAAGGTCAAAGC
CATCGAGCACTTGGAGAAACACATGGCTCCTGGAGCTACCCTCATGCTAAGGAGTGCTCA
TGCTCTTAGAGCTTTCTTGTATCCGATCGTTGACTCTTCTGATCTCAAAGGCTTCCAGCT
CTTGACCATCTATCATCCCACCGATGACGTGGTTAACTCGGTTGTCATCGCACGCAAGCT
TGGTGGTTCGACCATGACTGGAGTCAATGGTACTCGTGGCTGCATGTTCATGCCTTGTAA
CTGTTCTAAGGTCCACGCCATTATGAACAACCGTTGCAAGAAGATGATGATCGAGGAGTT
TAGCGCCATCGAGTAACCAAAAGCAAGTAATTACTGAACACATCTCATATCTCTTGAGAC
TATGTGTTAATGTTTTTCTCTTATATTAATTGCTATTTTCACTTCATGTGATCTTGTGTG
TTTTTTTTTTCTGACGTGTGTGGCTAGTATAAGCTGGTGAATTTTGATTTCTTTGATCTT
CGCTATGAATTGTGAAGATACAGAAGAACCCTTTCTCTGTTCCCTTTTCATCATCAATAA
AAATAATATAAGATAATGTT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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GCCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCAATGGCAGATGGGTACTGGAACCAGCCTCCGATGTC
GTCGATCCCACACGGAGGTCCTCTGAAACGTCACCGTTCTGACTTCGACCATGATTACGT
GTCACGGGATGAGGATCGAGGTATACTTCGTTCAGTAAGAGACACGAGAACTATTGGCTC
AGCTTATGATCGCTACCTTCAGAGTGCGCAAACGTCTTCTAGGCCATCTGAAGAATCTGG
TCGGTTTCATGGTGTCGGCAGAGGAGGTGACATGGGTGAGCTTATGTCTGGGCGTGGTGG
AGTTCCGCATCCAGATTTTGGGCCTCCAAATGGTCGAGATTTGGGTTTTGGTCAACAAGA
TTTAGTTGGTAGACCTGGAAGGGAACTGCTTCGTCTGCCTCCAGATGCATCCAACACTCT
ATTTGTCGAAGGACTTCCTTCTAATTGCTCCAGGAGGGAAGTATCTCGTATCCTTTCTTT
ATGGCTCGTTTTCAATACTTCTTACACCATTTATCACTCAAGAATGTTTTTGTGCTGTCA
GTCTCCTTAACTGTATGTCTTTTAGATATATTTCGACCACTTTTGGGATATAAAGAAGCG
AGACTTGTGACCAAAGATACAAAGCAAAGGAATGGAGATCCTGTTGTTCTATGTTTTTTT
GATTTTGAAAGCCCTGCATGTGCAGCAACTGCTCGTACCGCCCTGCAAGGCTATAGAATG
GATGAAAATGAACCGGACTCCAAAAATTTGCGGATCCAGTTTTCAAGAAACCCAGGTCGA
AGAGCAGGACAACGCGGAGGAAGGAGGTGATGATGAGTGAGTGGGAGACATTTGGGAGGC
GGCATCAGTCAAATGGTTATAGCTTATTGTTACTCTAGAACACAAACACACTTGATCACG
TATTCAGATCCTTAGGAAGACTCTCACCCAAAGCAATAGAGATGTATGGATATACACAAG
AGACTAGGAGATGAGTTGATTGTAATTTACAGCATCTCACCCTAGCTCTTTCTGTTTCCT
TTTCTCATATTATGATAGATTTATAATTAAATGTATGCTTTTATTAATGATATTTATCAA
AGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4AR92TF U 1
AF RR4AR92JQ C 532
BS 1 801 RR4AR92TF
BS 802 1145 RR4AR92JQ

RD RR4AR92TF 801 0 0
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GCCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCAATGGCAGATGGGTACTGGAACCAGCCTCCGATGTC
GTCGATCCCACACGGAGGTCCTCTGAAACGTCACCGTTCTGACTTCGACCATGATTACGT
GTCACGGGATGAGGATCGAGGTATACTTCGTTCAGTAAGAGACACGAGAACTATTGGCTC
AGCTTATGATCGCTACCTTCAGAGTGCGCAAACGTCTTCTAGGCCATCTGAAGAATCTGG
TCGGTTTCATGGTGTCGGCAGAGGAGGTGACATGGGTGAGCTTATGTCTGGGCGTGGTGG
AGTTCCGCATCCAGATTTTGGGCCTCCAAATGGTCGAGATTTGGGTTTTGGTCAACAAGA
TTTAGTTGGTAGACCTGGAAGGGAACTGCTTCGTCTGCCTCCAGATGCATCCAACACTCT
ATTTGTCGAAGGACTTCCTTCTAATTGCTCCAGGAGGGAAGTATCTCGTATCCTTTCTTT
ATGGCTCGTTTTCAATACTTCTTACACCATTTATCACTCAAGAATGTTTTTGTGCTGTCA
GTCTCCTTAACTGTATGTCTTTTAGATATATTTCGACCACTTTTGGGATATAAAGAAGCG
AGACTTGTGACCAAAGATACAAAGCAAAGGAATGGAGATCCTGTTGTTCTATGTTTTTTT
GATTTTGAAAGCCCTGCATGTGCAGCAACTGCTCGTACCGCCCTGCAAGGCTATAGAATG
GATGAAAATGAACCGGACTCC

QA 1 801 1 801
DS 

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GTGCTGTCAGTCTCCTTAACTGTATGTCTTTTAGATATATTTCGACCACTTTTGGGATAT
AAAGAAGCGAGACTTGTGACCAAAGATACAAAGCAAAGGAATGGAGATCCTGTTGTTTTA
TGTTTTTTTGATTTTGAAAGCCCTGCATGTGCAGCAACTGCTCGTACCGCCCTGCAAGGC
TATAGAATGGATGAAAATGAACCGGACTCCAAAAATTTGCGGATCCAGTTTTCAAGAAAC
CCAGGTCGAAGAGCAGGACAACGCGGAGGAAGGAGGTGATGATGAGTGAGTGGGAGACAT
TTGGGAGGCGGCATCAGTCAAATGGTTATAGCTTATTGTTACTCTAGAACACAAACACAC
TTGATCACGTATTCAGATCCTTAGGAAGACTCTCACCCAAAGCAATAGAGATGTATGGAT
ATACACAAGAGACTAGGAGATGAGTTGATTGTAATTTACAGCATCTCACCCTAGCTCTTT
CTGTTTCCTTTTCTCATATTATGATAGATTTATAATTAAATGTATGCTTTTATTAATGAT
ATTTATCAAAGCCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL5978Contig1 1204 2 4 U
GGCTGGTGGCTAAAGGCGTCACGGAACAGAACAATCGAGAAGAGCCAGCCGGCCTCTGAA
GTCTCTTACCTTGAATCGGAATCCATGGCTGTTCAAGCCGGCGTTCAGACCTCCAAAGTT
CTCATCTTGCTCGGCGCAGGGGTCTCTGGTTCGATTGTACTGAGACATGGGAGGTTGTCT
GACCTAATAGCGCAGCTTCAAGAATTACTCAAAGGGGCTGAAGGAGTTGAAAGCACACCT
TTTAGTTACAAGTATGATAGTGCCGCCCTCGCTGCTCAGATTCGACAGCTCGCAAATGAA
ATCAAAGAACTAAGTACGATAAATCCAGTTACCATATTTAACGGAGATTCAAACAACAGT
GGCTATGCTTCTTACCTGGTTCCAGCGGCCGCTGTTGGAGCTATGGGGTCTGTTACATGT
GGTGGAAGGGTTGGTCATTCTCGGATGCAATGTTTGTGACAAAGAAAAATATGGCTAATG
CAGTTGCATCTTTTTCAAAACAACTAAACGACTTGCAGGAAACACTAGCGTCAACAAAGA
AACATCTTTCAAAGGAGCTATCGAAATTGGATTGGAAGGTGGAAAAGCAGACCGAGATAT
CTAAAATGATTTTAAGTGATGTAACAGATGTGAAATCAAGCATTTCACAACTTGGGTTTG
ACTTTCAACAAATTAATGAAATGATATCCGGAATCGAAAGGAAGATTGACAGTCTTGAAA
GCAAACAAGATGTGACACTCTCAGGATTATGGCATTTATGTCAAATTGCAGGAGTTAAAG
ACAGCCCAGCCACTAAAGTCATTCAGGATGTTGGTGCGAGACTACCTATTGATGCAAAAC
CATCTTCTAACAATTCTCTTTCGGGTCTGCGGTTCCTAACAGAAGGAGAGGAGGGTGTAA
ATGTAATACACAAGCCTGTTTTGGAGAAAGAAAGCCCGGTGGCGATGAAACTAGTGGAGG
AGAAAACAAAGCCAGCTGTGGTGACAAGAACCAGAGTTCACAGAGCGTTTCCCGGTGGAA
TATCTTGGGTACAAGACCTTACCAGATAATCATAAAACACATATTTTTGGTGATTTTCTT
TACAAAGAATTTACTTTATATGGTCCCAACTTGTGATACTGATATTGGGACTGGGGCAAT
TAATTATCTGTAAGTATGCAAACTATACACATATTACATTCATCAACAGTTTGCGTTGTG
TGCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4GS94TF U 1
AF RR4GS94JQ C 473
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GTCTCTTACCTTGAATCGGAATCCATGGCTGTTCAAGCCGGCGTTCAGACCTCCAAAGTT
CTCATCTTGCTCGGCGCAGGGGTCTCTGGTTCGATTGTACTGAGACATGGGAGGTTGTCT
GACCTAATAGCGCAGCTTCAAGAATTACTCAAAGGGGCTGAAGGAGTTGAAAGCACACCT
TTTAGTTACAAGTATGATAGTGCCGCCCTCGCTGCTCAGATTCGACAGCTCGCAAATGAA
ATCAAAGAACTAAGTACGATAAATCCAGTTACCATATTTAACGGAGATTCAAACAACAGT
GGCTATGCTTCTTACCTGGTTCCAGCGGCCGCTGTTGGAGCTATGGGGTCTGTTACATGT
GGTGGAAGGGTTGGTCATTCTCGGATGCAATGTTTGTGACAAAGAAAAATATGGCTAATG
CAGTTGCATCTTTTTCAAAACAACTAAACGACTTGCAGGAAACACTAGCGTCAACAAAGA
AACATCTTTCAAAGGAGCTATCGAAATTGGATTGGAAGGTGGAAAAGCAGACCGAGATAT
CTAAAATGATTTTAAGTGATGTAACAGATGTGAAATCAAGCATTTCACAACTTGGGTTTG
ACTTTCAACAAATTAATGAAATGATATCCGGAATCGAAAGGAAGATTGACAGTCTTGAAA
GCAA*CAAGATGTGACACTCTCAG
ATATGGCATTTATG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4GS94JQ 732 0 0
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AACAAAGAAACATCTTTCAAAGGAGCTATCGAAATTGGATTGGAAGGTGGAAAAGCAGAC
CGAGATATCTAAAATGATTTTAAGTGATGTAACAGATGTGAAATCAAGCATTTCACAACT
TGGGTTTGACTTTCAACAAATTAATGAAATGATATCCGGAATCGAAGGGAAGATTGACAG
TCTTGAAAGCAAACAAGATGTGACACTCTCAGGATTATGGCATTTATGTCAAATTGCAGG
AGTTAAAGACAGCCCAGCCACTAAAGTCATTCAGGATGTTGGTGCGAGACTACCTATTGA
TGCAAAACCATCTTCTAACAATTCTCTTTCGGGTCTGCGGTTCCTAACAGAAGGAGAGGA
GGGTGTAAATGTAATACACAAGCCTGTTTTGGAGAAAGAAAGCCCGGTGGCGATGAAACT
AGTGGAGGAGAAAACAAAGCCAGCTGTGGTGACAAGAACCAGAGTTCACAGAGCGTTTCC
CGGTGGAATATCTTGGGTACAAGACCTTACCAGATAATCATAAAACACATATTTTTGGTG
ATTTTCTTTACAAAGAATTTACTTTATATGGTCCCAACTTGTGATACTGATATTGGGACT
GGGGCAATTAATTATCTGTAAGTATGCAAACTATACACATATTACATTCATCAACAGTTT
GCGTTGTGTGCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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TTAAAAAATTAATACTTATACAAAACAACGTACTATATATATATATACACATTGGTAAGA
GCCTGATCAGTACGGTTTATTCTCCCATGTTTTTGTGTTTCTCTTTATCAGAAGCTGTGT
ATGTACATGGACGAGGGGAGAGGGCTCTATGCAAGCCTCTGTTTTGTTGGCTTGGAGTTG
CGTCTTCTCTGGTTTTGGGCAGAGTTGTCGTGAGTTTTCCC


BQ
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AF RR4GP76TF C 1
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BS 13 281 RR4GP76JQ

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TTAAAAAATTAATACTTATACAAAACAACGTACTATATATATATATACACATTGGTAAGA
GCCTGATCAGTACGGTTTATTCTCCCATGTTTTTGTGTTTCTCTTTATCAGAAGCTGTGT
ATGTACATGGACGAGGGGAGAGGGCTCTATGCAAGCCTCTGTTTTGTTGGCTTGGAGTTG
CGTCTTCTCTGGTTTTGGGCAGAGTTGTCGTGAGTTTTCCC

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR4GP76JQ 269 0 0
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TACTTATACAAAACAACGTACTATATATATATATACACATTGGTAAGAGCCTGATCAGTA
CGGTTTATTCTCCCATGTTTTTGTGTTTCTCTTTATCAGAAGCTGTGTATGTACATGGAC
GAGGGGAGAGGGCTCTATGCAAGCCTCTGTTTTGTTGGCTTGGAGTTGCGTCTTCTCTGG
TTTTGGGCAGAGTTGTCGTGAGTTTTCCC

QA 1 269 1 269
DS 



AS 1 2

CO CL5980Contig1 1378 2 2 U
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GAATCCTCTCTCGTTCTCACCTGAGCTTCCTTTAGCTTCGATTCTCTCGCATTTGCTTAT
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AAAAATTAGGAGAGCGAAGATGAGCGAGGGCCAGAAGTTCCAGCTAGGAACAATCGGCGC
TTTGAGTCTATCCGTTGTGTCGTCTGTGTCGATCGTGATCTGTAACAAGGCGCTTATCAG
CACCCTTGGCTTCACCTTCGCGACTACGTTGACAAGTTGGCATCTATTGGTCACGTTTTG
TTCCCTTCATGTCGCACTATGGATGAAGATGTTTGAACACAAACCTTTTGATCCACGAGC
TGTTATGGGATTTGGCATACTGAATGGGATATCCATTGGACTATTGAACCTCAGCCTGGG
CTTTAATTCCGTTGGTTTTTACCAGATGACAAAACTAGCAATCATCCCCTGTACTGTTCT
CTTGGAGACCCTCTTCTTCAGGAAAAAGTTCAGTCGAAAAATTCAGTTTTCATTAACCAT
CCTTCTCCTTGGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCTTCAGCTTAATATGCTGGGTTC
TGTCTTGTCGCTGCTGGCTGTTATCACAACTTGTGTTGCTCAAATTATGACAAATACCAT
CCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCCACGCAGCTTCTTTATCAGTCTTGCCCTTATCAAGC
AATTACACTTTTCGTCACTGGCCCATTTTTAGATGGGCTCCTAACCAACCAGAACGTGTT
TGCTTTCAAGTACACTTCTCAAGTTGTGTTTTTCATCGTCCTGTCCTGCATGATATCAGT
CTCTGTAAACTTCAGCACTTTTCTGGTCTTTGGGAAAACGTCTCCGGTCACATATCAGGT
TTTGGGACATCTGAAAACATGCCTGGTTCTAGCATTTGGCTATGTGTTGCTGAAGGACCC
ATTCAACTGGCGCAACATTCTTGGTATTATGGTGGCTGTGATTGGAATGGTTGTTTATTC
CTATTTCTGCTCGGTTGAAACTCAGCAGAAGGCAAGTGAAACATCAACCCAGTTGCCTCA
GATGAAAGAAAGCGAGAAGGATCCGCTAATAGCAGCTGAAAATGGAAGCGGAGTGTTATC
AGATGGTGGTGGTGTTGGTGTGGGTGTGCAAAAGACGACAGCTCCTGTATGGAACTCGAA
TAAAGATTTTCAAGCCTAAAAAAACTGAACATTGCTATTTTTTTTTTTCTTATATATATA
AATATCAAACTCTCTTTTGTATCAGATTTGTCAGAAAAGAAAAACTTTTTTTATTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DN31TF U 1
AF RR4DN31JQ C 624
BS 1 725 RR4DN31TF
BS 726 1378 RR4DN31JQ

RD RR4DN31TF 730 0 0
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GAATCCTCTCTCGTTCTCACCTGAGCTTCCTTTAGCTTCGATTCTCTCGCATTTGCTTAT
TAGGTTATATGCACGAATGAGATCGTTGTAGATCGTGACTGAAGCGAGAGAGAGATAAAA
AAAAATTAGGAGAGCGAAGATGAGCGAGGGCCAGAAGTTCCAGCTAGGAACAATCGGCGC
TTTGAGTCTATCCGTTGTGTCGTCTGTGTCGATCGTGATCTGTAACAAGGCGCTTATCAG
CACCCTTGGCTTCACCTTCGCGACTACGTTGACAAGTTGGCATCTATTGGTCACGTTTTG
TTCCCTTCATGTCGCACTATGGATGAAGATGTTTGAACACAAACCTTTTGATCCACGAGC
TGTTATGGGATTTGGCATACTGAATGGGATATCCATTGGACTATTGAACCTCAGCCTGGG
CTTTAATTCCGTTGGTTTTTACCAGATGACAAAACTAGCAATCATCCCCTGTACTGTTCT
CTTGGAGACCCTCTTCTTCAGGAAAAAGTTCAGTCGAAAAATTCAGTTTTCATTAACCAT
CCTTCTCCTTGGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCTTCAGCTTAATATGCTGGGTTC
TGTCTTGTCGCTGCTGGCTGTTATCACAACTTGTGTTGCTCAAATTATGACAAATACCAT
CCAGA
GAAGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4DN31JQ 755 0 0
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TCACAACTTGTGTTGCTCAAATTATGACAAATACCATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCAT
CCACGCAGCTTCTTTATCAGTCTTGCCCTTATCAAGCAATTACACTTTTCGTCACTGGCC
CATTTTTAGATGGGCTCCTAACCAACCAGAACGTGTTTGCTTTCAAGTACACTTCTCAAG
TTGTGTTTTTCATCGTCCTGTCCTGCATGATATCAGTCTCTGTAAACTTCAGCACTTTTC
TGGTCTTTGGGAAAACGTCTCCGGTCACATATCAGGTTTTGGGACATCTGAAAACATGCC
TGGTTCTAGCATTTGGCTATGTGTTGCTGAAGGACCCATTCAACTGGCGCAACATTCTTG
GTATTATGGTGGCTGTGATTGGAATGGTTGTTTATTCCTATTTCTGCTCGGTTGAAACTC
AGCAGAAGGCAAGTGAAACATCAACCCAGTTGCCTCAGATGAAAGAAAGCGAGAAGGATC
CGCTAATAGCAGCTGAAAATGGAAGCGGAGTGTTATCAGATGGTGGTGGTGTTGGTGTGG
GTGTGCAAAAGACGACAGCTCCTGTATGGAACTCGAATAAAGATTTTCAAGCCTAAAAAA
ACTGAACATTGCTATTTTTTTTTTTCTTATATATATAAATATCAAACTCTCTTTTGTATC
AGATTTGTCAGAAAAGAAAAACTTTTTTTATTCCG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL5981Contig1 1180 2 4 U
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TCCTAAAAGCTCGCAAGGTCCCGTGGAGTATCAGCAAGAGGTTGATGTGTTAAGCAAAAT
GAGGCATCCGAATATCATCACGCTGATCGGAGCTTGTCCAGAAGGGTGGAGTCTTGTCTA
TGAGTATCTACCCGATGGAAGCCTTGAAGATAGGCTTACTTGCAAGGACAACTCTCCACC
GTTATCATGGCAAAACCGTGTACGGATCGCCACTGAAGTATGCGCAGCGCTTGTCTTTCT
TCACTCCAACAAAGCTCATAGCTTAGTACACGGTGATCTAAAGCCGGCGAATATCCTCCT
CGACGCTAATCTCGTTAGCAAGTTGAGCGACTTTGGAACATGCTCAGTAGGAAGCAAGAG
TGATGTCACAGGCACAGCTGGTTACTTGGATCCAGAAGCTTCTAGCAGCGGAGAGCTAAC
ACCAAAGTCAGATGATTTACTCGTTTGGGGTAATACTATTACGGTTGTTGACAGGGAGGT
CTGCTTTGCGGATAGCAAACGAAGTGAAGTATGCGCTTGATTCCGGTTCGTTAAACAACG
TTTTGGACCCTTTAGCTGGTGACTGGCCCTTTGTTCAGGCCGAGCAGCTTGCTCGCTTGG
CGTTGAGATGCTGTGAGGCTGTCGGTGAGAATCGTCCGGATCTTGCTACTGAAGTCTGGA
GGGTGCTTGAACCTATGAGAGCTTCTAGCGGAGGATCTTCGTCTTTTCATCCCGGACGTA
ACGAGAAACGCATAGCTCCTCCTTACTTCATTTGTCCCATATTCCAGGAAGTCATGCAGG
ATCCGCACGTAGCTGCAGATGGTTTCACATATGAAGCAGAGGCAATAAGAGCGTGGCTTG
ACAGTGGACACGATACTTCACCGATGACCAATGCCAAGCTTTCACACAATAGTCTAATCT
CTAACCATGCTCTCCGTTCTGCAATTCAGGAGTGGCTTCAACATCATTGTTGAAAATGAA
AATCCTTCAAAACCCTCAAACTCCTGTTTCATGCTTGTAATCTCTCATGAAAAGAAGTTA
TCTTCGTTATCCTTATATGCATACATACAATCTCTCCGTAGATAGCATATATTGCCTACT
TTGTCAAATCATAGTGTAAATCCTCTATATTTGTAAGATG


BQ
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AF RR4DZ51TF U 1
AF RR4DZ51JQ C 372
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TGATGTCACAGGCACAGCTGGTTACTTGGATCCAGAAGCTTCTAGCAGCGGAGAGCTAAC
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DS 

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TGGCCCTTTGTTCAGGCCGAGCAGCTTGCTCGCTTGGCGTTGAGATGCTGTGAGGCTGTC
GGTGAGAATCGTCCGGATCTTGCTACTGAAGTCTGGAGGGTGCTTGAACCTATGAGAGCT
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TACTTCATTTGTCCCATATTCCAGGAAGTCATGCAGGATCCGCACGTAGCTGCAGATGGT
TTCACATATGAAGCAGAGGCAATAAGAGCGTGGCTTGACAGTGGACACGATACTTCACCG
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TCTATATTTGTAAGATG

QA 13 809 13 809
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5983Contig1 1173 2 4 U
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GCTTTATGCATTAGCTTGTAGCCCAACGGATCCTACCCTTGTAGCAACCGGAGGTGGAGA
TGATAAAGCCTTTCTCTTTAAGATTGGCAATGGAGATTGGGCTGCTGAGCTTCCTGGTCA
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GTTTTCTGGTCATAACCAAAGTGTTACTTGCGGTGACTTCACCCCCTGATGGTAAACTGA
TTTGTACTGGCTCTGATGATGCTAGTTTGATTGTATGGAACCCAAAAACTTGTGAAAGCA
TTCATGTGGTTAAAGGTCATCCATATCATACGGAAGGGCTGATATGCTTGGACATCAACT
CGAACTCCAGTCTTGTTATCAGTGGCTCAAAAGACGGTTCTGTTCACATTGTCAACATAG
TCACCGGAAAGGTTGTGAGCTCTCTGGCTTCCCATACAGAGTCAGTTGAATGTGTGAAGT
TTTCACCGAGCTCAGCAACAATCCCCATGGCTGCAACAGGAGGAATGGACAAGAAGCATA
TCATCTGGGATCTGCAACATTCAACTCCCAGGTTCATCTGCGACCACGCGGAAGGTGTGA
CATGCGTGACTTGGATAGGAACTTCCAAGTACTTAGCCACTGGCTGTGCAGATGGTACGG
TGAGAGTTTGGGACAGCTTATTAGGCAACTGCGTTCATACCTTCCATGGCCATCAAGATG
CGGTTCAGGCTATCTCGGTCTCCACCAACACCGACTTTATTGTTTCGGTCTCTGTTGATA
ACACTGCTCGTGTCTTCGAGACATCTGAGTTCCTAAACAAGACGGCATAACACTTGTTAT
ATGGTATTTTATTACCTCTCGTTGTGGGTTCGGATAAGTGATGAAAATCATTCTACTTTT
CAATTTTCTATGCAATGCAATATCAATAGTGCT


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AF RR4FX88TF U 1
AF RR4FX88JQ C 395
BS 1 465 RR4FX88TF
BS 466 466 RR4FX88JQ
BS 467 667 RR4FX88TF
BS 668 1173 RR4FX88JQ

RD RR4FX88TF 667 0 0
GGAAGAAGAGTTTTATGAAAACGATGACTCTGTTCACACATTCACTGGTCACAAAGGTGA
GCTTTATGCATTAGCTTGTAGCCCAACGGATCCTACCCTTGTAGCAACCGGAGGTGGAGA
TGATAAAGCCTTTCTCTTTAAGATTGGCAATGGAGATTGGGCTGCTGAGCTTCCTGGTCA
CAAGGACTCTGTTTCCTCTCTAGCTTTTAGCTACGATGGACAGTTGCTTGCTTCTGGAGG
TTTGGATGGTGTTGTTCAGATCTTTGATGCTTCCTCAGGGACTTTGAAATGTGTTTTAGA
CGGTCCTGGTGGTGGAATCGAGTGGGTGAAGTGGCATCCGAGAGGACACATTGTGTTGGC
TGGATCAGAAGATTGCTCTATGTGGATGTGGAATGCTGATAAAGAGGCTTATCTTAATAT
GTTTTCTGGTCATAACCAAAGTGTTACTTGCGGTGACTTCACCCC*TGATGGTAAACTGA
TTTGTACTGGCTCTGATGATGCTAGTTTGATTGTATGGAACCCAAAAACTTGTGAAAGCA
TTCATGTGGTTAAAGGTCATCCATATCATACGGAAGGGCTGATATGCTTGGACATCAACT
CGAACTCCAGTCTTGTTATCAGTGGCTCAAAAGACGGTTCTGTTCACATTGTCAACATAG
TCACCGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4FX88JQ 779 0 0
GCTGATAAAGAGGCTTATCTTAATATGTTTTCTGGTCATAACCAAAGTGTTACTTGCGGT
GACTTCACCCCCTGATGGTAAACTGATTTGTACTGGCTCTGATGATGCTAGTTTGATTGT
ATGGAACCCAAAAACTTGTGAAAGCATTCATGTGGTTAAAGGTCATCCATATCATACGGA
AGGGCTGATATGCTTGGACATCAACTCGAACTCCAGTCTTGTTATCAGTGGCTCAAAAGA
CGGTTCTGTTCACATTGTCAACATAGTCACCGGAAAGGTTGTGAGCTCTCTGGCTTCCCA
TACAGAGTCAGTTGAATGTGTGAAGTTTTCACCGAGCTCAGCAACAATCCCCATGGCTGC
AACAGGAGGAATGGACAAGAAGCATATCATCTGGGATCTGCAACATTCAACTCCCAGGTT
CATCTGCGACCACGCGGAAGGTGTGACATGCGTGACTTGGATAGGAACTTCCAAGTACTT
AGCCACTGGCTGTGCAGATGGTACGGTGAGAGTTTGGGACAGCTTATTAGGCAACTGCGT
TCATACCTTCCATGGCCATCAAGATGCGGTTCAGGCTATCTCGGTCTCCACCAACACCGA
CTTTATTGTTTCGGTCTCTGTTGATAACACTGCTCGTGTCTTCGAGACATCTGAGTTCCT
AAACAAGACGGCATAACACTTGTTATATGGTATTTTATTACCTCTCGTTGTGGGTTCGGA
TAAGTGATGAAAATCATTCTACTTTTCAATTTTCTATGCAATGCAATATCAATAGTGCT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL5984Contig1 1053 2 4 U
GAAACAGTTCTATCACCGCGAAACACAATCAAACTTCTTGAGAACCGACACGTATATAGG
AGCGATCTCTAGTACATATACGAAACTTTCTAACAAACGTACTTGAAAATTATGAAACAA
GACAAATTTTGTTATAAGAAGATTTAAAGATGTAACAGCATAAATGTCAACTAAAAATGT
CAATAATTGCGACACGTACATTTAGTCTTTTTTTTTTTTACATCAAAAGGCTATTTTAAC
ACGTACATTTAGTCTATTAGATGAGCCACAAAGCGAGATTAAATAAAACTGTACTGCAAA
AGAGAACGGTCGTACATATGATACGTAGTACTGTCACATGTACGATGCAACCAAACCAAA
ACCAAACATCAAACCCAAAGACAGAGGATATCAATATATCATTGGCGTGTGTTTTCCTGA
CTTTCCCTGAAACTTTGAGGTTCTGATTCTATCTATGGTCCACTCTGTTATCTGTAGCTT
CATGTTCAAGTTTTGCTCATCTCTTATTGAGTTTACTTTTGTATATCGATCTATCTATAT
GTTTTATGTCTGTTTATAAGGATATTGATTCGTTTATGGACACCTCTCGATGCGATGTTG
TCTGAAATGTGCAGATTCTACTACAAAAGAAATGGCTGCTTCAAGTGCTGTAACCGCTGA
CTACGTCTTCAAGCCTAATTGAACAAGTCTTATAAGTTATTGCTTAAAAGATTTATAATA
AAGGATATCGTTGAGGAGTTACATTGAATCTCTTATATCTCATATATCATTGTTTAAGTT
TCTACAAATTAAGTGATTTTTTCTTTAGTTGCACAAGCACAATATCGGCAGAGGTATGGA
ATGCACTCATGGACGATGTTCTGCAAGGACAGATGGATCGAAATTTAATTACCACTACCG
GGCTTCGTAGCCTGATGGTAATGGAACCTCGGCTGAGGTGCCCGCCACCCAGCTTCGAAA
CCCGGCCACAGCGATTTAACATCCTTACTGCTGGGGCGCTGGACCCCTTCGGGGGATATT
TGGGAAAGTGGCTGCCCAGACACCAGAGATATC


BQ
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AF RR4DA57TF U 1
AF RR4DA57JQ C 498
BS 1 708 RR4DA57TF
BS 709 709 RR4DA57JQ
BS 710 774 RR4DA57TF
BS 775 1053 RR4DA57JQ

RD RR4DA57TF 781 0 0
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AGCGATCTCTAGTACATATACGAAACTTTCTAACAAACGTACTTGAAAATTATGAAACAA
GACAAATTTTGTTATAAGAAGATTTAAAGATGTAACAGCATAAATGTCAACTAAAAATGT
CAATAATTGCGACACGTACATTTAGTCTTTTTTTTTTTTACATCAAAAGGCTATTTTAAC
ACGTACATTTAGTCTATTAGATGAGCCACAAAGCGAGATTAAATAAAACTGTACTGCAAA
AGAGAACGGTCGTACATATGATACGTAGTACTGTCACATGTACGATGCAACCAAACCAAA
ACCAAACATCAAACCCAAAGACAGAGGATATCAATATATCATTGGCGTGTGTTTTCCTGA
CTTTCCCTGAAACTTTGAGGTTCTGATTCTATCTATGGTCCACTCTGTTATCTGTAGCTT
CATGTTCAAGTTTTGCTCATCTCTTATTGAGTTTACTTTTGTATATCGATCTATCTATAT
GTTTTATGTCTGTTTATAAGGATATTGATTCGTTTATGGACACCTCTCGATGCGATGTTG
TCTGAAATGTGCAGATTCTACTACAAAAGAAATGGCTGCTTCAAGTGCTGTAACCGCTGA
CTACGTCTTCAAGCCTAATTGAACAAGTCTTATAAGTTATTGCTTAAA*GATTTATAATA
AAGGATATCGTTGAGGAGTTACATTGAATCTCTTATATCTCATATATCATTGTT
AAGTTTC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4DA57JQ 556 0 0
CATCTCTTATTGAGTTTACTTTTGTATATCGATCTATCTATATGTTTTATGTCTGTTTAT
AAGGATATTGATTCGTTTATGGACACCTCTCGATGCGATGTTGTCTGAAATGTGCAGATT
CTACTACAAAAGAAATGGCTGCTTCAAGTGCTGTAACCGCTGACTACGTCTTCAAGCCTA
ATTGAACAAGTCTTATAAGTTATTGCTTAAAAGATTTATAATAAAGGATATCGTTGAGGA
GTTACATTGAATTTCTTATATTTCATATATCATTGTTTAAGTTTCTACAAATTAAGTGAT
TTTTTCTTTAGTTGCACAAGCACAATATCGGCAGAGGTATGGAATGCACTCATGGACGAT
GTTCTGCAAGGACAGATGGATCGAAATTTAATTACCACTACCGGGCTTCGTAGCCTGATG
GTAATGGAACCTCGGCTGAGGTGCCCGCCACCCAGCTTCGAAACCCGGCCACAGCGATTT
AACATCCTTACTGCTGGGGCGCTGGACCCCTTCGGGGGATATTTGGGAAAGTGGCTGCCC
AGACACCAGAGATATC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL5985Contig1 1251 2 4 U
GGGGCTCTATTTCACACGGATTCTAGTTGAAAGCCACTACTTCTATCTTGACATTGATAC
TGGAAGTGACTTGACTTGGGTCCAATGTGACGCTCCTTGTCGGAGTTGCGCTAAGGGAGC
AAATCAGCTGTATACGCCAAGAAAAGGTATGTTAGTGAGATCCGCGGAGTCCTTATGTGT
AGAAGTTCAAAAGCATCAAGTGACACAACATTGTGAGAAGAACTGTGAGCAGCAGTGTGA
CTACGAGATTGAGTATGCTGATCTTAGCTCTTCCCTTGGTGTTCTCACCAAAGATGAGTT
TCATATCAATCTCCACAACGGATCAGTTGCCCACTTGGATATTGTTTTCGGGTGTGGATA
TGATCAGCAAGGGCTACTGTTAAACACTCTGGTAAAAACAGACGGGATCCTTGGTCTAAG
CAGAGCTAAAATTAGCTTGCCTTCTCAGCTTGCAAGCCGAGGCATCATCAGCAATGTGGT
TGGCCACTGCCTTCCCCTCTGATCTAAACGGTGAAGGGTATATCATCATGGGAAGTGATT
TGGTTCCCTCACACGGAATCACATGGGTTCCTATGCTTCACCATTTCCACTTGGAATTTT
ATCAGATGCAAGTTTCAAAGATGAGCTACGGGAAAGGTATGCTTAGCTTTGATGGAAGAG
TAGGGAAAGTCTTATTTGACACTGGAAGCTCTTATACATACTTCCCTAACAAGGCTTACT
CCCAGCTGGTCAAATCACTTCAAGAAGTTTCTGGGATAGGATTAACACTTGACGAATCAG
ACAAAACACTGCCTATCTGTCGGCAAACTGACTTCCGGATCAGTTCCTTGTCGGATGTTA
GACGGTTCTTTAGACCAATAACTCTACAAATAGGGAGCAAATGGTGGATCATATCAAGAA
AACTTGTGCTTCAGCCAGAGGATTACTTGATCATAAGCAACAAAGGAAATGTATGTCTTG
GGATACTAGATGGAAGCAGTGTTCATGATGGATCCACCATTATTCTTGGAGACGTGTCGA
TGCGTGGACACCTGATCGTGTACGACAATGTGAAGCGGAGAATCGGAGGGATGAGATCAG
ACTGCGTTCGGCCTCGTGATTCTGATTTCAGTGTACCTTTCGTTCAAGTCTGAGGAAGAT
CCACAAATTCTAACGTCATATCTGTTGTATAAAACCCGACACTATGCGAGTGTTTTTGAT
ATATAGTGTATTTAGTAGGTATAGTTTGACATAAGAAAGAAAAGATTACCC


BQ
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AF RR4BJ93TF U 1
AF RR4BJ93JQ C 438
BS 1 496 RR4BJ93TF
BS 497 497 RR4BJ93JQ
BS 498 710 RR4BJ93TF
BS 711 1251 RR4BJ93JQ

RD RR4BJ93TF 710 0 0
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AGAAGTTCAAAAGCATCAAGTGACACAACATTGTGAGAAGAACTGTGAGCAGCAGTGTGA
CTACGAGATTGAGTATGCTGATCTTAGCTCTTCCCTTGGTGTTCTCACCAAAGATGAGTT
TCATATCAATCTCCACAACGGATCAGTTGCCCACTTGGATATTGTTTTCGGGTGTGGATA
TGATCAGCAAGGGCTACTGTTAAACACTCTGGTAAAAACAGACGGGATCCTTGGTCTAAG
CAGAGCTAAAATTAGCTTGCCTTCTCAGCTTGCAAGCCGAGGCATCATCAGCAATGTGGT
TGGCCACTGCCTTCCC*TCTGATCTAAACGGTGAAGGGTATATCATCATGGGAAGTGATT
TGGTTCCCTCACACGGAATCACATGGGTTCCTATGCTTCACCATTTCCACTTGGAATTTT
ATCAGATGCAAGTTTCAAAGATGAGCTACGGGAAAGGTATGCTTAGCTTTGATGGAAGAG
TAGGGAAAGTCTTATTTGACACTGGAAGCTCTTATACATACTTCCCTAAC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4BJ93JQ 814 0 0
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ATCACATGGGTTCCTATGCTTCACCATTTCCACTTGGAATTTTATCAGATGCAAGTTTCA
AAGATGAGCTACGGGAAAGGTATGCTTAGCTTTGATGGAAGAGTAGGGAAAGTCTTATTT
GACACTGGAAGCTCTTATACATACTTCCCTAACAAGGCTTACTCCCAGCTGGTCAAATCA
CTTCAAGAAGTTTCTGGGATAGGATTAACACTTGACGAATCAGACAAAACACTGCCTATC
TGTCGGCAAACTGACTTCCGGATCAGTTCCTTGTCGGATGTTAGACGGTTCTTTAGACCA
ATAACTCTACAAATAGGGAGCAAATGGTGGATCATATCAAGAAAACTTGTGCTTCAGCCA
GAGGATTACTTGATCATAAGCAACAAAGGAAATGTATGTCTTGGGATACTAGATGGAAGC
AGTGTTCATGATGGATCCACCATTATTCTTGGAGACGTGTCGATGCGTGGACACCTGATC
GTGTACGACAATGTGAAGCGGAGAATCGGAGGGATGAGATCAGACTGCGTTCGGCCTCGT
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ATATCTGTTGTATAAAACCCGACACTATGCGAGTGTTTTTGATATATAGTGTATTTAGTA
GGTATAGTTTGACATAAGAAAGAAAAGATTACCC

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL5986Contig1 810 2 1 U
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CCATACTTTTAGCGATGTTTCGTAGCTTATGTTTAAGAATCTTTCCGTTGCCGTTCTTGG
GTAGTTCTCCCATGAAAACAACCCTCTTCGGACACATAAAATGAGGCAGATTCTCACGGC
AGTACTTAATCAAATCACCTTCTCTTGTCGTGAATTGATCATCACAGTCTCCTTGACTAT
TGTTACGCTTTTCTAGAACAACGAACGCACAAGGGGTTTCACCCCACATAGGGTGAGGCA
TGGCCACAACAGCAGCCTCGAGCACTTTCTTATACTTATAAAGAACATTCTCAACTTCAA
CACTGTTGATGTTTTCGCCTCCCGATATGATAATATCTTTGGACCGATCTTTGATCTGTA
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CTTCAGATGTAGCTTTCGGATTCTTTAGATACCCTTTCATTAAACTGCTTCCTTTGATGA
CAATTTCTCCCATTGTCTTCCCATCGCGTGGGACACTCTCTTGAGTTTTCGTGTTCTTCA
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GTTTCTCTGGAAGTCTGTTCCACTCGTCAC


BQ
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AF RR4AG88JQ U 1
AF RR4AG87JQ U 1
BS 1 810 RR4AG87JQ

RD RR4AG88JQ 732 0 0
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CCATACTTTTAGCGATGTTTCGTAGCTTATGTTTAAGAATCTTTCCGTTGCCGTTCTTGG
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AGTACTTAATCAAATCACCTTCTCTTGTCGTGAATTGATCATCACAGTCTCCTTGACTAT
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CACTGTTGATGTTTTCGCCTCCCGATATGATAATATCTTTGGACCGATCTTTGATCTGTA
TGTGCCCATCCGGATGGATCACACCTATGTCTCCTGTGTTGAGCCATCCGTGCTTAAACG
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CGTCAACGTCAG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4AG87JQ 810 0 0
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TTTATACTAATCGAAACATAAGTATCAGATATCTAATATCTCACATATATTTTCCGTAGG
GATTTTGCCTGAGAGATGATATTTAGTGCTTAATGCCAACAGTATTGTCATTACTAACAA
CCATACTTTTAGCGATGTTTCGTAGCTTATGTTTAAGAATCTTTCCGTTGCCGTTCTTGG
GTAGTTCTCCCATGAAAACAACCCTCTTCGGACACATAAAATGAGGCAGATTCTCACGGC
AGTACTTAATCAAATCACCTTCTCTTGTCGTGAATTGATCATCACAGTCTCCTTGACTAT
TGTTACGCTTTTCTAGAACAACGAACGCACAAGGGGTTTCACCCCACATAGGGTGAGGCA
TGGCCACAACAGCAGCCTCGAGCACTTTCTTATACTTATAAAGAACATTCTCAACTTCAA
CACTGTTGATGTTTTCGCCTCCCGATATGATAATATCTTTGGACCGATCTTTGATCTGTA
TGTGCCCATCCGGATGGATCACACCTATGTCTCCTGTGTTGAGCCATCCGTGCTTAAACG
CTTCAGATGTAGCTTTCGGATTCTTTAGATACCCTTTCATTAAACTGCTTCCTTTGATGA
CAATTTCTCCCATTGTCTTCCCATCGCGTGGGACACTCTCTTGAGTTTTCGTGTTCTTCA
CGTCAACGTCAGCTAGGCCTAAGATGCCAACCCCTTGTCTTGCCTTCATCTCCATCTGTT
GTTTCTCTGGAAGTCTGTTCCACTCGTCAC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL5987Contig1 747 2 4 U
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CTACTGGCTAAAGTGAAGCAGACGACGGGGATCGTCGGCCTCGACGTCGTGCCGAACGCG
AGGGCGGTGCTGATCGATCTCTACAGCAAAACCCTAAAGGAGATCCAAGCCGTGCCGGAG
GACGAAGGATACCGCAAAGCGGTGGAATCGTTCACGCGCCACCGTCTCAGCGTGTGCAAA
GAAGAGGAAGACTGGGAGGCGATCGAGAAGCGTCTCGGCTGCGGTCAAGTCGAGGAGCTC
ATCGAAGAGGCGCAGGACGAGCTCACGCTCATCGGGAAGATGATCGAATGGGACCCTTGG
GGTGTTCCAGATGACTACGAGTGTGAAGTAATTGAGAACAATGCACCGATTCCAAAGCAC
GTTCCTCAACACCGACCTGGTCCACTTCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTG
ATTTCAGAGTCCAAAACAAAAATCCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTACTACCTCCACTGAT
CCGCAGTTGAAGGAGTAACTTCCAGATTTTCACATTGTTTGTTTGTGTACTTGTTTGCTT
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GAAAACTAGAACAATGTCACTCGTTTCATAAATGTTTTTTTATCTTTCTTCTCAAAGAAC
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DS 

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GCTGCTGCTGCTACTACCTCCACTGATCCGCAGTTGAAGGAGTAACTTCCAGATTTTCAC
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GAAATAAACTGGTTTATAATAATCTTTGAAAACTAGAACAATGTCACTCGTTTCATAAAT
GTTTTTTTATCTTTCTTCTCAAAGAACCTATGATAATACAAATGATGTTTCATC

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 2

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TAATCTTCTGTGGTTTATCTTGAAAGAGTTGTGCAAGTTCGTGTAAGAGAGAAGCGTAAT
GAGCTGCTTTGGTTGTTGTGGCGATGATGATTTCCATAGAGTTAACGAAACAGGAACAAA
GACAGCGCATAACATAGCAGGTTACGATGGTCACCATCAAAGGGTTGAACCATTCAAGAA
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GCAACCGGATAACGAATTTCTCTCCCAGGTTTCAATGGTTTCGAGATTGCGAAACGACAA
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TGCTCCTAATGGATCTCTTCATGATATCCTTCATGGTAAAAAAGGTGTGAAAGGAGCACA
GCCAGGTCCTGTTCTGCCATGGCACCAGAGAGTAAAAATTGCGGTTGGTGCGGCTAAAGG
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CAGTGTACTTATGTTTGAAGATGATGTTGCTAAGATTGCTGATTTCGATCTGTCCAATCA
AGCCCCTGACATGGCTGCACGCCTTCACTCAACTCGTGTGCTTGGGACCTTTGGTTATCA
CGCTCCAGAGTATGCAATGACAGGAACGTTGAGCACAAAGAGTGATGTGTATAGTTTTGG
GGTTGTTCTGCTAGAGCTCCTCGCAGGTCGTAAACCAGTTGATCATACTTTACCAAGAGG
ACAGCAGAGTCTCGTGACTTGGGCAACCCCTAAACTGAGTGAAAACAACGTGAAGCAGTG
CGTTGATGCAAGACTAAACGGAGAGTATCTTCCTAAAGCTGCTGCCAAGATGGCAGCTGT
AGCTGCGCTTTGTGTGCAATATGAGGCAGAGTTCAGGCCAAACATGAGCATAGTAGTGAA
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CCCTTATTGATGTCACACTTCATTTGTTTTTGTTTAATTATGAATATGATTGTGTAAATT
CGTGAAATAGCCCTTTATATTTCTCTCGTAAAAGGATATATATATATATACAAGAAACTG
TATCATTTTCTTAC


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TAATCTTCTGTGGTTTATCTTGAAAGAGTTGTGCAAGTTCGTGTAAGAGAGAAGCGTAAT
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GTTTTACGGTGTTCTGAAAAACGGTAAGGCAGCTGCCATTAAGAAACTTGATTCCAGTAA
GCAACCGGATAACGAATTTCTCTCCCAGGTTTCAATGGTTTCGAGATTGCGAAACGACAA
TGTTGTTGCTCTTCTGGGATATTGCGTTGATGGACCACTCCGTGTTCTTGCTTATGAATA
TGCTCCTAATGGATCTCTTCATGATATCCTTCATGGTAAAAAAGGTGTGAAAGGAGCACA
GCCAGGTCCTGTTCTGCCATGGCACCAGAGAGTAAAAATTGCGGTTGGTGCGGCTAAAGG
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CAGTG

QA 1 785 1 785
DS 

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ACCAGTTGATCATACTTTACCAAGAGGACAGCAGAGTCTCGTGACTTGGGCAACCCCTAA
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CAGGCCAAACATGAGCATAGTAGTGAAGGCTCTTCAGCCTCTACTCAATCCTCCTCGCTC
TACTCCTCAGACTCCACAGAGAAATATCCCTTATTGATGTCACACTTCATTTGTTTTTGT
TTAATTATGAATATGATTGTGTAAATTCGTGAAATAGCCCTTTATATTTCTCTCGTAAAA
GGATATATATATATATACAAGAAACTGTATCATTTTCTTAC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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GATGAGACTTCTGAGTCTTGCAAAACGAGTATGACCAAAGCTAGTAATAACTCCTCGGTT
ACCACTCCATCTCACAGTAACAGTAGCCCTCGAGGGATCACACACGTGGTGGGGCCATCA
TCGGTGGTTTACGGGTCTCAGATCAGTTCTTGGGTTGAACAAGCTCACAGCTTAAAGCGT
GAGGAGAGTCCAAGGATGATGGTTAACAAGAATGAAACTACAAAACCGGTTAATAATAAC
CGTAAAAGGCTTAAACCGGGAGAGAATCCAAGACCAAGGCCTAAAGATAGGCAGATGATC
CAAGATCGTGTCAAGGAGTTGCGTGAAATCATACCCAACGGTGCAAAGTGTAGCATAGAT
GCGCTACTAGAACGTACAATCAAACACATGCTCTTCTTGCAAAACGTCTCTAAGCATGCT
GATAAGGTGAAAGAAACTGGGGAATCCAAGATAATAATGAAAGAGGAAGGTGCGTTTGAA
GGAGGAGGAGGAGGAGGAGCAACATGGGCTTTTGAAGTAGGGTCAAAGTCTCTAAGGTGT
CCTATTGTAGTAGAGGATCTAAACCCTCCTCGCATTTTCCTAGTTGAGATGTTATGCGAA
CAACGGGGATTCTTTCTAGAAATTGCTGATTGGATCAGAAGCTTAGGCATGACGATCTTG
AAGGGTGTCATTGAAACTCGAATAAACAAGATTTGGGCTCGCTTCACTGTTGAGGCGAGT
CGTGATGTGACGAGGATGGAGATATTCATGCAGCTAGTGAATATTTTGGAGCAGACGATC
AAGTGTGGAGGAATCTCTGAGACTATGTTGGATGGTATTAAAGCTACAATGCCATTTACC
AACACCTTACCGGTTACTGGTGGCTGTTCAATGTAACACAATCATTGACCGTACCGGTGT
TAATCCGGTTTGGCTAAAGCTGAATTCATATAGAGGTTTCGAGCGGACCGCTCCAGAATT
TAGGCTCGCTATGACTAATTAAAGTCGGTCTGAAAACAGAGCTGATTATTTTTAAGTAGT
TTTTTAAAAAATACTTTTTGTTTGTACATTTTTTTCTATCTGTTGGGAATTTTGCAAATT
TTATTTTGTACTGAACCTCATTTGTGTGGATTTTTCTTTTCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B106TF U 1
AF RR4B106JQ C 648
BS 1 776 RR4B106TF
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BS 778 801 RR4B106TF
BS 802 1363 RR4B106JQ

RD RR4B106TF 801 0 0
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GATAAGGTGAAAGAAACTGGGGAATCCAAGATAATAATGAAAGAGGAAGGTGCGTTTGAA
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QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4B106JQ 716 0 0
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GATGTTATGCGAACAACGGGGATTCTTTCTAGAAATTGCTGATTGGATCAGAAGCTTAGG
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TGTTGAGGCGAGTCGTGATGTGACGAGGATGGAGATATTCATGCAGCTAGTGAATATTTT
GGAGCAGACGATCAAGTGTGGAGGAATCTCTGAGACTATGTTGGATGGTATTAAAGCTAC
AATGCCATTTACCAACACCTTACCGGTTACTGGTGGCTGTTCAATGTAACACAATCATTG
ACCGTACCGGTGTTAATCCGGTTTGGCTAAAGCTGAATTCATATAGAGGTTTCGAGCGGA
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ATTTTTAAGTAGTTTTTTAAAAAATACTTTTTGTTTGTACATTTTTTTCTATCTGTTGGG
AATTTTGCAAATTTTATTTTGTACTGAACCTCATTTGTGTGGATTTTTCTTTTCCT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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TTAAATTAATGAACGTAGATGATAGATCCCGAGACCTAATAACTGTTTTCTTACAAGCAA
ACATAATATAAAGTATTGCTGTTCTGTTTCTTAGTTCCCTTCTTGTCCGATATGTTGCTG
TTCTGTTTCTTCTTGAATCTCCGTGATCTGCAATCTTCCTGATCCATCACCACCAGATTC
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BQ
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AF RR4DR34JQ U 272
AF RR4DR34TF C 1
BS 1 271 RR4DR34TF
BS 272 432 RR4DR34JQ
BS 433 650 RR4DR34TF

RD RR4DR34JQ 161 0 0
CTCACTCCTGACTGGTCATCACTAGCAGCAGCAGCTACTACTTCTTGGTCTATCTTAACT
TGTGGCTTAAGACGGCGAATGGCCTCGGCTGCTTCTCCCATAACAACTGGAGGTGGTTGC
GGAGGAACCCATGATCGCTGCTTCTGGATAGCTGCTGGTTC

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR4DR34TF 650 0 0
AATAAGCCAAGCAATCCAAATGACTGAGCTTAGTTGTGTAACAAGGGTTTGACTTGTTTA
TTAAATTAATGAACGTAGATGATAGATCCCGAGACCTAATAACTGTTTTCTTACAAGCAA
ACATAATATAAAGTATTGCTGTTCTGTTTCTTAGTTCCCTTCTTGTCCGATATGTTGCTG
TTCTGTTTCTTCTTGAATCTCCGTGATCTGCAATCTTCCTGATCCATCACCACCAGATTC
AGAGAACTTAGTGACCTTCTGTAACTCATCGCTCACTCCTGACTGGTCATCACTAGCAGC
AGCAGCTACTACTTCTTGGTCTATCTTAGCTTGTGGCTTAGGACGGCGAATGGCCTCGGC
TGCTTCTCGCATAACAACTGGAGGTGGTTGCGGAGGAACCCATGATCGCTGCTTCTGGAT
AGCTGCTGGTTCCATTGTACTTGTTTCATTTTGGATGCCGATGGAACGCGCCGATGTTGT
CTCATAACCGAAATCCCCGGATCTAGGGTTCTTCTGTTGCCACCATGGACCGTTGGAACT
CTCTTCTTGCGGCGCTTGACCATAGCCCCATGGCTTAGCTTTAGGAGCGATGCGAGGATT
TGGTAGCTGTTGGTTTGGATTGGGTGGCATGTCGTTAATCTCCCGAATGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL5991Contig1 900 2 2 U
CTACTTACTGGGAAAAGCTTAAAGGTCACACGAATAGATATTCGATCCAATCTAGTATAG
AACTATCAATTTATCATCTTCTTCAGTCCCAATGATGTATCTCCCTTCTGAAGACTCCTC
ATCACCAGTTCCCAATGCTTCCTCTATGGCACCAAAGCCGAGGATGATGATACAGAAATG
CGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGATGTGGAAGAAAACAATGACTGCTT
ACAGATGGAGTCAAACATCACACATGCAGAGGAGGCGAATAAGCTTCCTGTAGTGTCTGA
ACCAGAAGCAGAACCTTTGCTGCCTCATGAAACCAAGCCGGAAACTACTGAAGATACTCA
GAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAAGCTATGTGGTGTGAGGCATTGGAAAGCACC
ATTATATAAGTTCTTCAACCAAGATGGCCCTGACAATAAGAAACTATTTAAAGTCGAAGT
CAATGTTGAAGTAAAGGAAGTTTCAGGGATAACGGTTCTGGAGTGTTTTGGAGATCCACA
CAGCAAGAAGAAAATAGCAGCTGAGCAGGCAGCGGAAGTAGCGCTTTGGTTTCTCAAGAA
TGTGGGTCATACCGTCCAGACTGACAATGCTTCTGGTCGTAAGGGAGGACAAAAAAACGC
TTTAGAATCTGTTAATAACATATGACTTAAGTAGGTCTAGTTTTGTTCATGTTAATTGGC
TTTTAGCTGGTTAGCATTTGACAGAATCTCTCTACCTAGAGAGTTCAAAAGTGTGTAAGC
CTCTACCCTCAACATTCTCACATCGTATAAGAGACTATGTTTGATGTCTGTCAAAGTTTG
TGTACAAGGATCATCTTTTCTGTAACGTTAGTAGTAAGTAAAAACTATGAAGTTATGGTT


BQ
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AF RR4C313TF U 1
AF RR4C313JQ C 110
BS 1 257 RR4C313TF
BS 258 900 RR4C313JQ

RD RR4C313TF 257 0 0
CTACTTACTGGGAAAAGCTTAAAGGTCACACGAATAGATATTCGATCCAATCTAGTATAG
AACTATCAATTTATCATCTTCTTCAGTCCCAATGATGTATCTCCCTTCTGAAGACTCCTC
ATCACCAGTTCCCAATGCTTCCTCTATGGCACCAAAGCCGAGGATGATGATACAGAAATG
CGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGATGTGGAAGAAAACAATGACTGCTT
ACAGATGGAGTCAAACA

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR4C313JQ 791 0 0
GAAGACTCCTCATCACCAGTTCCCAATGCTTCCTCTATGGCACCAAAGCCGAGGATGATG
ATACAGAAATGCGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGATGTGGAAGAAAAC
AATGACTGCTTACAGATGGAGTCAAACATCACACATGCAGAGGAGGCGAATAAGCTTCCT
GTAGTGTCTGAACCAGAAGCAGAACCTTTGCTGCCTCATGAAACCAAGCCGGAAACTACT
GAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAAGCTATGTGGTGTGAGGCAT
TGGAAAGCACCATTATATAAGTTCTTCAACCAAGATGGCCCTGACAATAAGAAACTATTT
AAAGTCGAAGTCAATGTTGAAGTAAAGGAAGTTTCAGGGATAACGGTTCTGGAGTGTTTT
GGAGATCCACACAGCAAGAAGAAAATAGCAGCTGAGCAGGCAGCGGAAGTAGCGCTTTGG
TTTCTCAAGAATGTGGGTCATACCGTCCAGACTGACAATGCTTCTGGTCGTAAGGGAGGA
CAAAAAAACGCTTTAGAATCTGTTAATAACATATGACTTAAGTAGGTCTAGTTTTGTTCA
TGTTAATTGGCTTTTAGCTGGTTAGCATTTGACAGAATCTCTCTACCTAGAGAGTTCAAA
AGTGTGTAAGCCTCTACCCTCAACATTCTCACATCGTATAAGAGACTATGTTTGATGTCT
GTCAAAGTTTGTGTACAAGGATCATCTTTTCTGTAACGTTAGTAGTAAGTAAAAACTATG
AAGTTATGGTT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL5992Contig1 1092 2 2 U
GGACGGTAAATCTAGCGGTAAACTTTGATTTGCAGTAACCGAGGGAGTTGTGATCGTCAC
AGACATCGGCCACACCACGAGTAACCCACATCGAAACGTTACTCTTCCACGCGCCCATGT
CGGAGACTCGTTGGAATCAATCTAGACATGAACGTATCGACAACTCCGAGATTCAACAAC
GAAGAGTTGTAATAATAGAGAACAGTCATGGTGAGAAGCTCGTGGGAGTTTTGCATGATA
CCGGCTCGACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGCATTCACTCATCAAAGGATCGGATTC
CAATGGTGGCTATTGCCAATGTCTTTGAAAGAGCTAAGATCAGTTCCTTCCGGTTCGATT
TCGCTGGCAACGGAGAAAGCCAAGGATCATTTCGGTATGGTAACTATCGCCGTGAAGCTG
AAGATCTGCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGTGAAAACCGTGAAATTTCTGCAATCA
TCGGACATAGCAAAGGTGGAAGTGTGGTGCTTTTGTACGCAGCAAAGTACAAGGATGTAC
AGACTGTTGTGAATATCTCTGGTCGGTTTTTTCTAGAGAGAGGAATGGAGCGGCGCCTTG
GGAAGGACTACTTCAATAAAATCAAGGAGAACGGGTTCATTGATGTTAGGAACAGAAAAG
GAAAGTTTGAATATAGAGTTACCGAAGAGAGCCTAATGGACCGTCTCACGACCAATACTC
ATGAAGCATGTCTCTCAATTCATGAAAACTGCAGGGTGTTAACAATTCATGGGACAAACG
ATAGAATAGTCCATGTAACAGAAGCATCAGAATTCGCCAAATACATAAAGAATCACAAAC
TGTGTCTAATTGAAGGAGCTGATCATGAGTTCACATCTCACCAGCATGAGCTGGCTTCTA
CTGTTTTATCCTTCTTCAAATTGGATCTCAAGAAAGATGACGATTCAGTTGATGTCAGTA
CAAGTAACCGAAACCACATGAGATCAGTTGTTGCGATTAAGTCTCGAATTTAAATAGCTT
TGTTCAATACAATCTGCCAGGTTTGACGTTTAAGCACGTCAAAGGTTCTTATGAGTAATA
AACTTTTCGTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC42TF U 1
AF RR4DC42JQ C 476
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BS 622 1092 RR4DC42JQ

RD RR4DC42TF 621 0 0
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AGACATCGGCCACACCACGAGTAACCCACATCGAAACGTTACTCTTCCACGCGCCCATGT
CGGAGACTCGTTGGAATCAATCTAGACATGAACGTATCGACAACTCCGAGATTCAACAAC
GAAGAGTTGTAATAATAGAGAACAGTCATGGTGAGAAGCTCGTGGGAGTTTTGCATGATA
CCGGCTCGACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGCATTCACTCATCAAAGGATCGGATTC
CAATGGTGGCTATTGCCAATGTCTTTGAAAGAGCTAAGATCAGTTCCTTCCGGTTCGATT
TCGCTGGCAACGGAGAAAGCCAAGGATCATTTCGGTATGGTAACTATCGCCGTGAAGCTG
AAGATCTGCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGTGAAAACCGTGAAATTTCTGCAATCA
TCGGACATAGCAAAGGTGGAAGTGTGGTGCTTTTGTACGCAGCAAAGTACAAGGATGTAC
AGACTGTTGTGAATATCTCTGGTCGGTTTTTTCTAGAGAGAGGAATGGAGCGGCGCCTTG
GGAAGGACTACTTCAATAAAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DC42JQ 617 0 0
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TGTACAGACTGTTGTGAATATCTCTGGTCGGTTTTTTCTAGAGAGAGGAATGGAGCGGCG
CCTTGGGAAGGACTACTTCAATAAAATCAAGGAGAACGGGTTCATTGATGTTAGGAACAG
AAAAGGAAAGTTTGAATATAGAGTTACCGAAGAGAGCCTAATGGACCGTCTCACGACCAA
TACTCATGAAGCATGTCTCTCAATTCATGAAAACTGCAGGGTGTTAACAATTCATGGGAC
AAACGATAGAATAGTCCATGTAACAGAAGCATCAGAATTCGCCAAATACATAAAGAATCA
CAAACTGTGTCTAATTGAAGGAGCTGATCATGAGTTCACATCTCACCAGCATGAGCTGGC
TTCTACTGTTTTATCCTTCTTCAAATTGGATCTCAAGAAAGATGACGATTCAGTTGATGT
CAGTACAAGTAACCGAAACCACATGAGATCAGTTGTTGCGATTAAGTCTCGAATTTAAAT
AGCTTTGTTCAATACAATCTGCCAGGTTTGACGTTTAAGCACGTCAAAGGTTCTTATGAG
TAATAAACTTTTCGTGG

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL5993Contig1 992 2 2 U
GGATAGATCTGTAGTAGTTCTAACGCGACATCCCATAAAATCCTCTGTTCAGACGGCTCG
ATCGGATCGAGTCGGATCTAGGGGATTCGAAAAAGATGTCGCAACAGTCGTTGATCTACA
GTTTCGTGGCCAGAGGAACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGATTTCAAAGGCAACTTCA
CAACCATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAGCTCCCCTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACA
ACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACCTACTGTGTTGTTG
CGGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGAGAGAGTAAAGGAGGATT
TTAACAAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAG
AGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTA
GCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACA
TCGAGAAGGTTCTTGACCGCGGCGAGAAAATTGATCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACC
TTCGCTCACAGGCACAAGACTTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAGAAGGAAGATGTGGC
TTCAGAACATGAAGATTAAACTCATAGTTCTCGCCATCATCATCGCACTGATTCTCATAA
TCGTGCTCTCAGTCTGCCATGGCTTCAAGTGCTAAAAGCCCAGGAAAAAAGATTCAAAAC
TCTCTTGAGATCTTTCTCACTCGGTACATCGTGTACTTGCCCTTTTTCCCTTTATTGTCT
GTCCTATCATCAGCATTCTAATGTTTCTGCTTGAATTGGTTTTTGTATAGATAGACATAT
ATGTAAGCTTCACGTTTGCTATATTACTTGTTGCACCTGATGACGTTGATCCCTAAGAGA
TCTAAAACTATTAAATGATTTTGTTGACTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FA43TF U 1
AF RR4FA43JQ C 291
BS 1 646 RR4FA43TF
BS 647 992 RR4FA43JQ

RD RR4FA43TF 646 0 0
GGATAGATCTGTAGTAGTTCTAACGCGACATCCCATAAAATCCTCTGTTCAGACGGCTCG
ATCGGATCGAGTCGGATCTAGGGGATTCGAAAAAGATGTCGCAACAGTCGTTGATCTACA
GTTTCGTGGCCAGAGGAACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGATTTCAAAGGCAACTTCA
CAACCATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAGCTCCCCTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACA
ACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACCTACTGTGTTGTTG
CGGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGAGAGAGTAAAGGAGGATT
TTAACAAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAG
AGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTA
GCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACA
TCGAGAAGGTTCTTGACCGCGGCGAGAAAATTGATCTTCTGGTGGACAAAACTGAGAACC
TTCGCTCACAGGCACAAGACTTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4FA43JQ 702 0 0
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AAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACAGC
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GATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATG
ATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGCGGCGAGAAAATTGATCTTCTGGTGGACAAA
ACTGAGAACCTTCGCTCACAGGCACAAGACTTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAGAAGG
AAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATTAAACTCATAGTTCTCGCCATCATCATCGCACTG
ATTCTCATAATCGTGCTCTCAGTCTGCCATGGCTTCAAGTGCTAAAAGCCCAGGAAAAAA
GATTCAAAACTCTCTTGAGATCTTTCTCACTCGGTACATCGTGTACTTGCCCTTTTTCCC
TTTATTGTCTGTCCTATCATCAGCATTCTAATGTTTCTGCTTGAATTGGTTTTTGTATAG
ATAGACATATATGTAAGCTTCACGTTTGCTATATTACTTGTTGCACCTGATGACGTTGAT
CCCTAAGAGATCTAAAACTATTAAATGATTTTGTTGACTGAT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5995Contig1 380 2 2 U
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TGGACTTATTCATTACATAACACAGAAAAAAAAGTCTCCAAGGACATAACTCCCGAACCC
AAAGGAGTTTGATGTACAAAACATAAACAGACAAGTAAATAACAAGAAGAAAGATTCTAA
TCCTTGTTTCCAGATTCGTCCTTCTTGTCTGCTTCATCAGTTCCCATCTGCGGTAATGTG
AGATCTGGCTTGTATAAGTTGTGTACAACAGAGGCTCCGGCGAGCAATGAAGCTACGACG
ACGACAGTTGACAATGCTGGAGACGGCGTACCCGTCGGTTTCTTCCCCCCAAACTTTTTG
TTCATCATTTTTTTTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GS80TF C 1
AF RR4GS80JQ U 53
BS 1 52 RR4GS80TF
BS 53 380 RR4GS80JQ

RD RR4GS80TF 199 0 0
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TGGACTTATTCATTACATAACACAGAAAAAAAAGTCTCCAAGGACATAACTCCCGAACCC
AAAGGAGTTTGATGTACAAAACATAAACAGACAAGTAAATAACAAGAAGAAAGATTCTAA
TCCTTGTTTCCAGATTCGT

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR4GS80JQ 328 0 0
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CCGAACCCAAAGGAGTTTGATGTACAAAACATAAACAGACAAGTAAATAACAAGAAGAAA
GATTCTAATCCTTGTTTCCAGATTCGTCCTTCTTGTCTGCTTCATCAGTTCCCATCTGCG
GTAATGTGAGATCTGGCTTGTATAAGTTGTGTACAACAGAGGCTCCGGCGAGCAATGAAG
CTACGACGACGACAGTTGACAATGCTGGAGACGGCGTACCCGTCGGTTTCTTCCCCCCAA
ACTTTTTGTTCATCATTTTTTTTGTCCC

QA 1 328 1 328
DS 



AS 1 2

CO CL5996Contig1 998 2 2 U
GGACGGGAGGGTGCAAATATGGAGAGACTTGTAGGTTCAGCCACACTAAACAACAGACTT
CTCTCCCCTCACGCCCATAGCTTAACTTCCTCGGTCTTCCCATCAGACCGGTAAATTACA
ATCAATTTGATTATTTAAACATTTTCTAGCATTCTCTGTCTATAAAACCTCGTAATAGTG
GTGGTAACCAATTGAGCAGGGAGAGAAAGAATGTCCTTTCTACATGCGAAACGGCTCCTG
CAAGTTTGGAGGTGACTGCAAATTTAATCATCCGGATCCTAAGGCTGTTGGAGGTGGAGT
TGATTCTCCTCTCTTCCGTGGTAATAATGGTGGATCATTTCCCCCAAAGGATGCCCCACA
AGCAAGTTCAACTTCTTGGTCCTCATCGAGACACATGAATGGTACTGGTACTGGTGGTAC
TGCTCCTTTTATTCCACTCATGTACTCACAGAATCGTGGAGCTTCTTCACCTCAAACTCC
AGCGTGGAGTGGATATCAGAAAGGAGTGTGCTTCCTCCTTCCACATACTCGGCTGAAACT
AGTTCATTCTCTCAGTTGCCTGCTGAGGAATTCCCAGAGCGTCCGGATCAACCAGAGTGC
AGTTATTATGTTAAAACTGGGGATTGTAAGTTCAAATCTAAATGCAAATACCATCATCCC
AAAAATAGATTGCCGAAGCAATCCCCATCCTCTTTCAATGACAAGGGCTTACCCCTAAGA
CCTGATCAGAGCATGTGCACACACTACAGCCGCTATGGCATCTGCAAATTTGGTCCAGCT
TGTAGATTCGATCACTCTATACCGCCTACATTCTCTTCCAGCAGCTCCCAAACCGTAGAT
ACTCCTCAGCTCGGCGGCAACGCTAATGAAAACGACAGCTGGAATTGACACCACGTGTTC
AGAAGCCTGCGTAAAGGATAGTTTCCGTCTTTTTTTCAGTTCTTAGGAGCAAAACTCTGT
TTCTGGTTTGGAGTTTATAAAGAAAACATATACTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GN01TF U 1
AF RR4GN01JQ C 385
BS 1 658 RR4GN01TF
BS 659 998 RR4GN01JQ

RD RR4GN01TF 658 0 0
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GTGGTAACCAATTGAGCAGGGAGAGAAAGAATGTCCTTTCTACATGCGAAACGGCTCCTG
CAAGTTTGGAGGTGACTGCAAATTTAATCATCCGGATCCTAAGGCTGTTGGAGGTGGAGT
TGATTCTCCTCTCTTCCGTGGTAATAATGGTGGATCATTTCCCCCAAAGGATGCCCCACA
AGCAAGTTCAACTTCTTGGTCCTCATCGAGACACATGAATGGTACTGGTACTGGTGGTAC
TGCTCCTTTTATTCCACTCATGTACTCACAGAATCGTGGAGCTTCTTCACCTCAAACTCC
AGCGTGGAGTGGATATCAGAAAGGAGTGTGCTTCCTCCTTCCACATACTCGGCTGAAACT
AGTTCATTCTCTCAGTTGCCTGCTGAGGAATTCCCAGAGCGTCCGGATCAACCAGAGTGC
AGTTATTATGTTAAAACTGGGGATTGTAAGTTCAAATCTAAATGCAAATACCATCATC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GN01JQ 614 0 0
ATCGAGACACATGAATGGTACTGGTACTGGTGGTACTGCTCCTTTTATTCCACTCATGTA
CTCACAGAATCGTGGAGCTTCTTCACCTCAAACTCCAGCGTGGAGTGGATATCAGAAAGG
AGTGTGCTTCCTCCTTCCACATACTCGGCTGAAACTAGTTCATTCTCTCAGTTGCCTGCT
GAGGAATTCCCAGAGCGTCCGGATCAACCAGAGTGCAGTTATTATGTTAAAACTGGGGAT
TGTAAGTTCAAATCTAAATGCAAATACCATCATCCCAAAAATAGATTGCCGAAGCAATCC
CCATCCTCTTTCAATGACAAGGGCTTACCCCTAAGACCTGATCAGAGCATGTGCACACAC
TACAGCCGCTATGGCATCTGCAAATTTGGTCCAGCTTGTAGATTCGATCACTCTATACCG
CCTACATTCTCTTCCAGCAGCTCCCAAACCGTAGATACTCCTCAGCTCGGCGGCAACGCT
AATGAAAACGACAGCTGGAATTGACACCACGTGTTCAGAAGCCTGCGTAAAGGATAGTTT
CCGTCTTTTTTTCAGTTCTTAGGAGCAAAACTCTGTTTCTGGTTTGGAGTTTATAAAGAA
AACATATACTAGGC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL5997Contig1 1374 2 2 U
GGAAAGTCGACGTGAGGATTCTATTCATTGGGTTTCGATCGTGTTGTTTGATCTTCCAGG
ATGTGTGTAAGTCGAATCGTCATGAGGAATCACTGGTCGATTTTCATTGGCATCGTTTCG
TATGCGATTCTTCCCCTCTAAAACGTTATAACATCCATTAAAATCGCCATCAATAACCAT
CTTTACTTCTTCTAGCACCGCCGGCACGATCAATCATTCACCGCTTATTATCTTATCTTG
AGTCGGTGGATAATACCTATAAAAAGTGCAGCCTTCTTCCATCAACTCATACTCCTCCCC
GATTCTAAGGGCCAGAGCCATAACCATGGACTCTTTCGGATCTTAATCTGTTGGACAGAT
CTTTCGAACATCTCATGGTTTCGGTGATTCTTGCTTGGCTTACCAAGGCAGGAGTGAAGA
TGGGGGTTCTTGCTTGGCTCAAAGGTGAGGATTGGAGCATGGTGAGTCGAGAGTGGTTTG
GACAGGACGACCGGTTCGACTTTAAGCTCCGACCTGTGATCCTTCTGATGTATCTACAGG
TTGAAGATGACATCTCACCTTCGGAAGTGTCCGTCTTGGATTGCGAATTTTGCATCAGTG
GTCCCGGTAGTTATATAGTACATGTTTGTTGATGAGAATGGTATTGGGGTTTGTTGAGCT
TATGGGTTTTTACAGTGAATCATTATGATGTATGCTACGTAAGCCAGTCAGATGTCGACT
GCTACATTACTCCTGAGTCAGCGTTTTATCTCGAATGAAGGTGGACTCTTGAAGTTCATT
GAGACACAGAACAAGTTGATTGGTCACATGGTGATTGTTCTTGATGTAGAGGCAGGGCAG
GAGTTGATGTGCAAAAGCATTGAATCTAACAGACTCCTCTGATAACAATCTTCTTATAGA
TGTCGCTTCTGGATACCACAAAGCATGGTGATGAATCTCAGATACATAGATCATACCTAC
ATGATACGGACTGTTCAAGCAACGCATCAAACAATGTTGACCGTATACTTCTTTCCCATA
GTGTTGTTGTTCATGGTGCATGGCAGGTTACACTAGCTACATCAGTAGTCTTATCAAATG
GACGACAAACATACATTCCTTACAGCAGTATAACATAGAAACAGAACAATATGGTGATTA
CGGATAGGATGTGGACAAGGCTAATGTTTTAGACGAATCAGCCCAGTTTTTAGGCCCAAA
GGATATAATCAAGGAGAAAAAAGAGGTGCCGGAAAAGCTACTTCTTAAGAAAACTGTGAT
AGAGTTTTTGATTTTCCTACGGCTTCTTAAGAAATCGCTAAGTGAAGGTCAGAAAAGCAT
GTATTTTCAAAACATGTGATATTCAGAGTTTCTTTGAAACAATAACGTTTTGGC


BQ
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AF RR4GQ04TF U 1
AF RR4GQ04JQ C 591
BS 1 746 RR4GQ04TF
BS 747 1374 RR4GQ04JQ

RD RR4GQ04TF 746 0 0
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ATGTGTGTAAGTCGAATCGTCATGAGGAATCACTGGTCGATTTTCATTGGCATCGTTTCG
TATGCGATTCTTCCCCTCTAAAACGTTATAACATCCATTAAAATCGCCATCAATAACCAT
CTTTACTTCTTCTAGCACCGCCGGCACGATCAATCATTCACCGCTTATTATCTTATCTTG
AGTCGGTGGATAATACCTATAAAAAGTGCAGCCTTCTTCCATCAACTCATACTCCTCCCC
GATTCTAAGGGCCAGAGCCATAACCATGGACTCTTTCGGATCTTAATCTGTTGGACAGAT
CTTTCGAACATCTCATGGTTTCGGTGATTCTTGCTTGGCTTACCAAGGCAGGAGTGAAGA
TGGGGGTTCTTGCTTGGCTCAAAGGTGAGGATTGGAGCATGGTGAGTCGAGAGTGGTTTG
GACAGGACGACCGGTTCGACTTTAAGCTCCGACCTGTGATCCTTCTGATGTATCTACAGG
TTGAAGATGACATCTCACCTTCGGAAGTGTCCGTCTTGGATTGCGAATTTTGCATCAGTG
GTCCCGGTAGTTATATAGTACATGTTTGTTGATGAGAATGGTATTGGGGTTTGTTGAGCT
TATGGGTTTTTACAGTGAATCATTATGATGTATGCTACGTAAGCCAGTCAGATGTCGACT
GCTACATTACTCCTGAGTCAGCGTTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4GQ04JQ 784 0 0
TGCATCAGTGGTCCCGGTAGTTATATAGTACATGTTTGTTGATGAGAATGGTATTGGG*T
TTGTTGAGCTTATGGGTTTTTACAGTGAATCATTATGATGTATGCTACGTAAGCCAGTCA
GATGTCGACTGCTACATTACTCCTGAGTCAGCGTTTTATCTCGAATGAAGGTGGACTCTT
GAAGTTCATTGAGACACAGAACAAGTTGATTGGTCACATGGTGATTGTTCTTGATGTAGA
GGCAGGGCAGGAGTTGATGTGCAAAAGCATTGAATCTAACAGACTCCTCTGATAACAATC
TTCTTATAGATGTCGCTTCTGGATACCACAAAGCATGGTGATGAATCTCAGATACATAGA
TCATACCTACATGATACGGACTGTTCAAGCAACGCATCAAACAATGTTGACCGTATACTT
CTTTCCCATAGTGTTGTTGTTCATGGTGCATGGCAGGTTACACTAGCTACATCAGTAGTC
TTATCAAATGGACGACAAACATACATTCCTTACAGCAGTATAACATAGAAACAGAACAAT
ATGGTGATTACGGATAGGATGTGGACAAGGCTAATGTTTTAGACGAATCAGCCCAGTTTT
TAGGCCCAAAGGATATAATCAAGGAGAAAAAAGAGGTGCCGGAAAAGCTACTTCTTAAGA
AAACTGTGATAGAGTTTTTGATTTTCCTACGGCTTCTTAAGAAATCGCTAAGTGAAGGTC
AGAAAAGCATGTATTTTCAAAACATGTGATATTCAGAGTTTCTTTGAAACAATAACGTTT
TGGC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL5998Contig1 1307 2 4 U
GAGAGCCTCCACTGAATCATCTTCCTGAGCCTCACCATGAGCCTACGAAAAGAAGCACTA
ATCCAGCGCAATTTTCTTCAGTGCCAAAGAAAAGTAGGTTGAAGATTGGAGAATCCTCGG
CTTTCTTCACATATGTCAAGTCTACTGTCAATGGAAATGGCTCAGTTCATCCAGGTATGG
CTGAGAAGCTTCAAGTGGTGGCAAGTTAGGTGACCAAGAACAACACCAAACAAACAAGAG
GAGGTAAAGAGCTCACTGCTCAAGGAGAGAACTCAGTGAATGGCACGCTTGAGCGGTCAC
GCACGCTTCCAACACCAGTGGAACTTCACAGTAGTAAGAGTTACCAAGAAGTTCCAAATT
CCCTTGAGCGGTCACGCACGCTTCCACCACCAATGGAACTTCATAGTACTAGTAGGAGTT
GTTACCAAGGAGCTATGGATGATACCCGGGTCGCTGCTAAGGATTCATCATCTCAAATTA
ACGCTTCGAGATTCGCTGCACAAAATGCGTATCCTTACTATATGCATGGGGTCATGAACC
AAGTTATGATGCAATCAGCGGCCATGATGCCTCAGTATGGTCATCAACATCCTCATTGCC
CACCTAATCATCTGAATGGAATGACAGGGTTTCCTTATTACCACCACCATCCCATGAACA
CGTCGTTACAGCACAGTCAGATGTCACAGAATGGTCAGGTGCCCTTACAGAATGGTCAGA
TGCCTATGGTCCATCATCATCATCATCATTCTTGGCCACAGACACAGATAGGAAACCACC
CGTCTCCTAACGAGGTGAGAGTGACTAAACTTGACAGAAGAGAGGAAGCGCTGCTTAAAT
TTAGACGCAAAAGAAACCAAAGGTGTTTTGACAAGAAGATTAGGTATGTGAATAGGAAGC
GGCTTGCTGAGAGGAGACCACGTGTTAAGGGTCAGTTTGTTAGGAAAATGAACGGCGTGA
ATGTTGACTTGAACGGGCAGCCTGAGCCTGACTCTGCTGACTATGATGACGAGGATGAGG
AGGATGAAGAGGAAGAGGAGAATCGGGACTCATCTCCTCAGGATGATGCTCTTGGAACTT
GATAAACATGGGAGAGAACTGAAAACCGTGTTTGGTTTTATATCGAGAATGATGCTCTGC
TACAGCCAAAACACTGGATATGTGTACTTCATTTGCAAAGGAGATAATGTGCTCAGCTTT
GGCAGAGCATTGAAAATCACTATGTTTAGTTCGTTGATAAACATAAATGTGCTTTGATCA
TGTTCAGTGAGTTATGTATAAACCTTTTCTTCTCCTTCCAGCAATTT


BQ
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AF RR4FJ54TF U 1
AF RR4FJ54JQ C 601
BS 1 698 RR4FJ54TF
BS 699 699 RR4FJ54JQ
BS 700 756 RR4FJ54TF
BS 757 1307 RR4FJ54JQ

RD RR4FJ54TF 762 0 0
GAGAGCCTCCACTGAATCATCTTCCTGAGCCTCACCATGAGCCTACGAAAAGAAGCACTA
ATCCAGCGCAATTTTCTTCAGTGCCAAAGAAAAGTAGGTTGAAGATTGGAGAATCCTCGG
CTTTCTTCACATATGTCAAGTCTACTGTCAATGGAAATGGCTCAGTTCATCCAGGTATGG
CTGAGAAGCTTCAAGTGGTGGCAAGTTAGGTGACCAAGAACAACACCAAACAAACAAGAG
GAGGTAAAGAGCTCACTGCTCAAGGAGAGAACTCAGTGAATGGCACGCTTGAGCGGTCAC
GCACGCTTCCAACACCAGTGGAACTTCACAGTAGTAAGAGTTACCAAGAAGTTCCAAATT
CCCTTGAGCGGTCACGCACGCTTCCACCACCAATGGAACTTCATAGTACTAGTAGGAGTT
GTTACCAAGGAGCTATGGATGATACCCGGGTCGCTGCTAAGGATTCATCATCTCAAATTA
ACGCTTCGAGATTCGCTGCACAAAATGCGTATCCTTACTATATGCATGGGGTCATGAACC
AAGTTATGATGCAATCAGCGGCCATGATGCCTCAGTATGGTCATCAACATCCTCATTGCC
CACCTAATCATCTGAATGGAATGACAGGGTTTCCTTATTACCACCACCATCCCATGAACA
CGTCGTTACAGCACAGTCAGATGTCACAGAATGGTCAG*TGCCCTTACAGAATGGTCAGA
TGCCTATGGTCCATCATCATCATCATCATTCTTGGC
ACAGAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4FJ54JQ 707 0 0
CCA
CTAATCATCTGAATGGAATGACAGGGTTTCCTTATTACCACCACCATCCCATGAACACGT
CGTTACAGCACAGTCAGATGTCACAGAATGGTCAGGTGCCCTTACAGAATGGTCAGATGC
CTATGGTCCATCATCATCATCATCATTCTTGGCCACAGACACAGATAGGAAACCACCCGT
CTCCTAACGAGGTGAGAGTGACTAAACTTGACAGAAGAGAGGAAGCGCTGCTTAAATTTA
GACGCAAAAGAAACCAAAGGTGTTTTGACAAGAAGATTAGGTATGTGAATAGGAAGCGGC
TTGCTGAGAGGAGACCACGTGTTAAGGGTCAGTTTGTTAGGAAAATGAACGGCGTGAATG
TTGACTTGAACGGGCAGCCTGAGCCTGACTCTGCTGACTATGATGACGAGGATGAGGAGG
ATGAAGAGGAAGAGGAGAATCGGGACTCATCTCCTCAGGATGATGCTCTTGGAACTTGAT
AAACATGGGAGAGAACTGAAAACCGTGTTTGGTTTTATATCGAGAATGATGCTCTGCTAC
AGCCAAAACACTGGATATGTGTACTTCATTTGCAAAGGAGATAATGTGCTCAGCTTTGGC
AGAGCATTGAAAATCACTATGTTTAGTTCGTTGATAAACATAAATGTGCTTTGATCATGT
TCAGTGAGTTATGTATAAACCTTTTCTTCTCCTTCCAGCAATTT

QA 4 707 4 707
DS 



AS 1 2

CO CL5999Contig1 1287 2 4 U
GGGGATCAATGGCACAACAAAGTCTTTGGTGGCGAATCATTTAGCAGAATCAGTAGCAGG
AGCAATAACAATAAGGGCATTTGATGAAGAAGAGAGATTCTTCAAGAAAAGTCTCACACT
CATCGATACAAACGCTAGTCCTTTTCTCCACAGCTTTGCAGCTAACGAATGGCTGATCCA
GCGGCTTGAAACAGTCAGCGCCATTGTACTAGCCTCCACTGCTTTCTGTATGGTTTTGCT
CCCTACAGGAACATTTAGCTCTGGGTTCATTGGTATGGCGCTATCATACGGTTTATCTTT
GAACATGGGACTTGTTTACTCCGTACAGAACCAGTGCTACTTAGCTAACTGGATCATCTC
CGTTGAGAGGCTTAATCAGTACACACATTTAACACCTGAGGCTCCTGAAGTAATTGAAGA
GACTCGACCACCTGTTAACTGGCCGGTCACAGGCCGAGTTGAAATCTCTGATTTGCAGAT
AAATACAGACGAGAGTCCCCATTGGTTTTAAAAGGAATCAGCTGCGTTTTTGAAGGAGGA
CACAAGATTGGTATTGTTGGTAGGACTGGTAGTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCTTTG
TTCAGACTTGTTGAGCCTGTTGGAGGAAAGATTGTTGTTGACGGTGTTGACATCTCCAAG
ATAGGAGTTCATGATCTGAGATCAAGGTTTGGGATTATACCTCAGGATCCAACTCTGTTC
AATGGAACAGTGAGGTATAACTTGGATCCTTTGTGTCAGCATACAGATGCTGAGATTTGG
GAGGTTCTTGGAAAGTGTCAGCTGAAAGATGTGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGTTTAGAT
TCAATAGTTGTGGAGGATGGATCGAACTGGAGCATGGGACAGAGACAGCTGTTTTGTTTA
GGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGTAGAGTATTGGTCTTAGACGAAGCAACTGCCTCTATA
GACAACGCTACAGATTTGATACTTCAGAAAACAATACGGCGAGAGTTTGCTGATTGCACT
GTCATAACCGTCGCTCACCGTATCCCCACCGTCATGGACTGTACAATGGTTCTCTCCATA
AGCGACGGACGCATTGTGGAGTATGATGCGCCAATGGGGTTGATGGAGAATGAGAACTCA
TTGTTTGGTAAGCTTGTGAAAGAGTATTGGTCTCATTACCACTCAGCTGACTCTCACTGA
GAATGTGGTGCTATGATGTCGACATTGTTGTTGTATAACTCAAATCTCTTACACGGTGGA
TGATATATTACAACAATTAATTAACTC


BQ
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AF RR4GQ71TF U 1
AF RR4GQ71JQ C 540
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BS 665 665 RR4GQ71JQ
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BS 696 1287 RR4GQ71JQ

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CATCGATACAAACGCTAGTCCTTTTCTCCACAGCTTTGCAGCTAACGAATGGCTGATCCA
GCGGCTTGAAACAGTCAGCGCCATTGTACTAGCCTCCACTGCTTTCTGTATGGTTTTGCT
CCCTACAGGAACATTTAGCTCTGGGTTCATTGGTATGGCGCTATCATACGGTTTATCTTT
GAACATGGGACTTGTTTACTCCGTACAGAACCAGTGCTACTTAGCTAACTGGATCATCTC
CGTTGAGAGGCTTAATCAGTACACACATTTAACACCTGAGGCTCCTGAAGTAATTGAAGA
GACTCGACCACCTGTTAACTGGCCGGTCACAGGCCGAGTTGAAATCTCTGATTTGCAGAT
AAATACAGACGAGAGTCCCCATTGGTTTTAAAAGGAATCAGCTGCGTTTTTGAAGGAGGA
CACAAGATTGGTATTGTTGGTAGGACTGGTAGTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCTTTG
TTCAGACTTGTTGAGCCTGTTGGAGGAAAGATTGTTGTTGACGGTGTTGACATCTCCAAG
ATAG*AGTTCATGATCTGAGATCAAGGTTTGGGAT

QA 1 695 1 695
DS 

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GTTCAGACTTGTTGAGCCTGTTGGAGGAAAGATTGTTGTTGACGGTGTTGACATCTCCAA
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CAATGGAACAGTGAGGTATAACTTGGATCCTTTGTGTCAGCATACAGATGCTGAGATTTG
GGAGGTTCTTGGAAAGTGTCAGCTGAAAGATGTGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGTTTAGA
TTCAATAGTTGTGGAGGATGGATCGAACTGGAGCATGGGACAGAGACAGCTGTTTTGTTT
AGGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGTAGAGTATTGGTCTTAGACGAAGCAACTGCCTCTAT
AGACAACGCTACAGATTTGATACTTCAGAAAACAATACGGCGAGAGTTTGCTGATTGCAC
TGTCATAACCGTCGCTCACCGTATCCCCACCGTCATGGACTGTACAATGGTTCTCTCCAT
AAGCGACGGACGCATTGTGGAGTATGATGCGCCAATGGGGTTGATGGAGAATGAGAACTC
ATTGTTTGGTAAGCTTGTGAAAGAGTATTGGTCTCATTACCACTCAGCTGACTCTCACTG
AGAATGTGGTGCTATGATGTCGACATTGTTGTTGTATAACTCAAATCTCTTACACGGTGG
ATGATATATTACAACAATTAATTAACTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6000Contig1 1109 2 2 U
GGAAGGCTATGGCTGTCACCAGCTTAGCACCTCCATGGCTCGTTCTGAGACAAGCGTTCC
GTGGAACGGTCGCAGCTTCTTCTTCTTATCTTCACACAACTTACAAACCTCTAATAACAA
ATCACCCTTCGTCTCCACTCCGACACTCAGCTTTGAGAAGATGCCACGTAGCAAAAGCAA
TGAAAGGAGATGTAGAGCTTCTCCTCAAAGGAGTTGTTGGAGACCAAGCTGTTGCTAAGG
AAGTCAAACACATCCTTGAAATGGCAAGACGTGCAACATCAAGAAGAGAAGTTCTTCACA
CAGACTTTCTCACTCCACCTGTTGTTAAGGAATCGGTTTCAGTCTTGGGAAAACTTGCTG
ATGTTGCAGTCGTTGCTCAGGGAGGTTACCCTGAAGCTGAGCGGTGTAGGATCTCGGTTG
GACATCCTGATGCCTTAACCAATGATCCAGATATAGTTGCAGCTTTGAGTATCACAGGGA
ATTTTGGGCTTCAAGCTTGTTCTCATGGCGACTTCCTTGGAGCCATTCTTGGCTCTGGAA
TCACCAGGGACAAGCTGGGGGATATATTAATTCAGGAAGAAAAAGGAGCTCAGGTCCTGA
TAGTTCCTGAACTTGTTGACTTTATTGTTTCCGCTCTCGACAAGGTTGGGAATGTTTCTG
TAACTTGTAGTAAGATACCTTTGCTTGCTTTTCAATACGAACCTCCTAGGACTAATACCT
TCAAAACCATTGAAGCCTCGTTGAGAATTGATGCAGTAGCTAGTGCTGGTTTCAAGATTT
CTCGGTTTAAGCTAGTTGATTTGATTAGTAGTGGGGACGTTCGGGTTAACTGGGCAACTG
TTACCAAGAATGGAACCACGGTAAAGACTGGTGATGTTGTCTCTGTTAGCGGAAAAGGGA
GACTCAAGATTGGAGAGATCAACGAAACGAAGAAAGGGAAATTTGCAGTTGAAATCATCA
GATATCTGTAAGAATGAAGCTGTGACAAGTTTATTTACGGATCTTTTTTTTTTATCATAA
ACTCATACTCACTTTTATCTCTTTTCTTTTATTTGATGACATTTTGTAGAGCAAATTTCA
TACGAATAAAGTTTTTTTTTTTTTTGTGC


BQ
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AF RR4C487TF U 1
AF RR4C487JQ C 430
BS 1 584 RR4C487TF
BS 585 1109 RR4C487JQ

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GTGGAACGGTCGCAGCTTCTTCTTCTTATCTTCACACAACTTACAAACCTCTAATAACAA
ATCACCCTTCGTCTCCACTCCGACACTCAGCTTTGAGAAGATGCCACGTAGCAAAAGCAA
TGAAAGGAGATGTAGAGCTTCTCCTCAAAGGAGTTGTTGGAGACCAAGCTGTTGCTAAGG
AAGTCAAACACATCCTTGAAATGGCAAGACGTGCAACATCAAGAAGAGAAGTTCTTCACA
CAGACTTTCTCACTCCACCTGTTGTTAAGGAATCGGTTTCAGTCTTGGGAAAACTTGCTG
ATGTTGCAGTCGTTGCTCAGGGAGGTTACCCTGAAGCTGAGCGGTGTAGGATCTCGGTTG
GACATCCTGATGCCTTAACCAATGATCCAGATATAGTTGCAGCTTTGAGTATCACAGGGA
ATTTTGGGCTTCAAGCTTGTTCTCATGGCGACTTCCTTGGAGCCATTCTTGGCTCTGGAA
TCACCAGGGACAAGCTGGGGGATATATTAATTCAGGAAGAAAAA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4C487JQ 680 0 0
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TTCAAGCTTGTTCTCATGGCGACTTCCTTGGAGCCATTTTTGGCTCTGGAATCACCAGGG
ACAAGCTGGGGGATATATTAATTCAGGAAGAAAAAGGAGCTCAGGTCCTGATAGTTCCTG
AACTTGTTGACTTTATTGTTTCCGCTCTCGACAAGGTTGGGAATGTTTCTGTAACTTGTA
GTAAGATACCTTTGCTTGCTTTTCAATACGAACCTCCTAGGACTAATACCTTCAAAACCA
TTGAAGCCTCGTTGAGAATTGATGCAGTAGCTAGTGCTGGTTTCAAGATTTCTCGGTTTA
AGCTAGTTGATTTGATTAGTAGTGGGGACGTTCGGGTTAACTGGGCAACTGTTACCAAGA
ATGGAACCACGGTAAAGACTGGTGATGTTGTCTCTGTTAGCGGAAAAGGGAGACTCAAGA
TTGGAGAGATCAACGAAACGAAGAAAGGGAAATTTGCAGTTGAAATCATCAGATATCTGT
AAGAATGAAGCTGTGACAAGTTTATTTACGGATCTTTTTTTTTTATCATAAACTCATACT
CACTTTTATCTCTTTTCTTTTATTTGATGACATTTTGTAGAGCAAATTTCATACGAATAA
AGTTTTTTTTTTTTTTGTGC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6001Contig1 763 2 2 U
GCAACAGGAGACTTGAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTCTTGA
TACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGT
TTTACCTATCAGATTAGAGGAAAACTCAAACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTGGATA
GGCAGAGAGGGAATTAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATATAGAC
TCATGAAAGTGTCGGAATGCTCAAACATTCAATCAATATTAGATTAGATCAAGAATTGCC
TTTCGTTTTACTTCAAATAAAAATAAAAAACGATAAAAGAAAGAAAAAAGATTATTCTTT
CTACATATGAGTCAGATTCCTTGGATACTTCGAAAAGTATCTGTTTACTTGTGTTTACAT
CTTGTCGATTCTACTATAAATTCTATAATTAAGAATAACTCATTATAAGATAAGTGGATT
TTTTAGAGTAGTTCATCAATGGTGACCAAATATCTCTCCCTTTTTTTGACTCTGCACCAG
TGATTTCACTATTATTAGTGAACAATAATGGAAAAGTTTCTTCATATTCATAGAAATAGG
GGACAGAATTCACATGGATATAGTAAGTCTCGCATGGGCTGGTTTAATGGTAGTTTTTAC
ATTTTCCCTCTCTCTCGTAGGGTGGGGAAGAAGTGGACTCTAGAAGTACTCCTAATTGCG
ATAATAATCAAACTCTATCAACCGGTATAAATTGTTTTAGTTT


BQ
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AF RR4E837TF U 1
AF RR4E837JQ C 531
BS 1 680 RR4E837TF
BS 681 763 RR4E837JQ

RD RR4E837TF 684 0 0
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TACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGT
TTTACCTATCAGATTAGAGGAAAACTCAAACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTGGATA
GGCAGAGAGGGAATTAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATATAGAC
TCATGAAAGTGTCGGAATGCTCAAACATTCAATCAATATTAGATTAGATCAAGAATTGCC
TTTCGTTTTACTTCAAATAAAAATAAAAAACGATAAAAGAAAGAAAAAAGATTATTCTTT
CTACATATGAGTCAGATTCCTTGGATACTTCGAAAAGTATCTGTTTACTTGTGTTTACAT
CTTGTCGATTCTACTATAAATTCTATAATTAAGAATAACTCATTATAAGATAAGTGGATT
TTTTAGAGTAGTTCATCAATGGTGACCAAATATCTCTCCCTTTTTTTGACTCTGCACCAG
TGATTTCACTATTATTAGTGAACAATAATGGAAAAGTTTCTTCATATTCATAGAAATAGG
GGACAGAATTCACATGGATATAGTAAGTCTCGCATGGGCTGGTTTAATGGTAGTTTTTAC
ATTTTCCCTCTCTCTCGTAG
TGTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4E837JQ 233 0 0
TCTGCACCAGTGATTTCACTATTATTAGTGAACAATAATGGAAAAGTTTCTTCATTTTCA
TAGAAATAGGGGACAGAATTCACATGGATATAGTAAGTCTCGCATGGGCTGGTTTAATGG
TAGTTTTTACATTTTCCCTCTCTCTCGTAGGGTGGGGAAGAAGTGGACTCTAGAAGTACT
CCTAATTGCGATAATAATCAAACTCTATCAACCGGTATAAATTGTTTTAGTTT

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 2

CO CL6002Contig1 1282 2 2 U
GGGATCCTTCTGATTCTCATCTATTTCTTCTACATCTCGACCCTTTCCGTCCTAAATCAG
ATAAGCCCAGCCATTAGCTCACCAGATACATAGTAGATCTACAAGCTTCTTCTTCTCCTA
ATCCACCAGATCTCAACCTTCCATGGCTCTCAATCTCCGCCAGAAACAAACTGAATGCAT
AATCCGGATGCTGAATCTGAACCAACCTCTGAAACAAAGCGGCACCACCGCGAACGAGGA
AGTCTACAAGATCCTGATCTACGACAAGTACCGCCAAAACATCCTCTCCCCTCTCATCCA
CGTCAAGGATCTCCGCTGAGTTTGATGGGACGGATTTGATTGGGAACACTAAACATCTCA
TGAACGCTGTGAACTCTCTCCCGGAGTTAACCGAGAGGAAGCAGGTGATTGATAAGCACA
CCAACATCGCTACCGCGCTCTTAGGACAGATCAAGGAGAGGTCTATCGATGCTTTCACTA
AGAAAGAGAGTGACATGATGATGAGAGGCGGAATCGATAGAGCTGAGCTCATGGCTGCTT
TAAAGGGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCAGATTCGCAATCATGTACTTGATCTCCA
CGGAAACCATAAACCAATCCGAAGTTGAGTCCGTGGAAGCAGCATTGAACGAAGCTGGGG
CTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATCAAATCCTTGAACGTGTCTCTCGCAG
CTTCGGCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACATTGTAGACTGGGCCGAGAAGCTTTACGGGC
AATCTATAAGCGCGGTCACTGCAGGAGTCAAGAATCTGTTGTCTAGTGATCAACAATTGG
CGGTGACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGAAGGGAAACCGAACCCAGAGTTTGATTCTT
ACCTTTTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCCTGGCTCCGGTGGTGGTAGCCATGTGAAGG
GACCGTTTAGAGAAGCAATGGTGTTCATGATAGGTGGAGGGAACTATGTTGAGTATGGGA
GTTTGCAGGAGCTTACTCAGAGACAGTTGACGGTTAAGAACGTTATTTACGGAGCCACTG
AGATTCTTACAGGAAGTGAGTTGGTGGAACAGCTGGGGCTTTTGGGTAAGAAGATGGGTT
TGGGAGGTCCGGTCGCTTCGTCTTCTTCGTCTGGTCACTGAGCTTGAGAGTTTTTCTTTT
TCTTATGAGAGTTTTCTGGTTTGTTAAATAAATCTCGTGAGTGCTTTTATATTTTAAGTT
TTAATCCGGATCTCGATTCATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR84TF U 1
AF RR4BR84JQ C 546
BS 1 695 RR4BR84TF
BS 696 1282 RR4BR84JQ

RD RR4BR84TF 695 0 0
GGGATCCTTCTGATTCTCATCTATTTCTTCTACATCTCGACCCTTTCCGTCCTAAATCAG
ATAAGCCCAGCCATTAGCTCACCAGATACATAGTAGATCTACAAGCTTCTTCTTCTCCTA
ATCCACCAGATCTCAACCTTCCATGGCTCTCAATCTCCGCCAGAAACAAACTGAATGCAT
AATCCGGATGCTGAATCTGAACCAACCTCTGAAACAAAGCGGCACCACCGCGAACGAGGA
AGTCTACAAGATCCTGATCTACGACAAGTACCGCCAAAACATCCTCTCCCCTCTCATCCA
CGTCAAGGATCTCCGCTGAGTTTGATGGGACGGATTTGATTGGGAACACTAAACATCTCA
TGAACGCTGTGAACTCTCTCCCGGAGTTAACCGAGAGGAAGCAGGTGATTGATAAGCACA
CCAACATCGCTACCGCGCTCTTAGGACAGATCAAGGAGAGGTCTATCGATGCTTTCACTA
AGAAAGAGAGTGACATGATGATGAGAGGCGGAATCGATAGAGCTGAGCTCATGGCTGCTT
TAAAGGGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCAGATTCGCAATCATGTACTTGATCTCCA
CGGAAACCATAAACCAATCCGAAGTTGAGTCCGTGGAAGCAGCATTGAACGAAGCTGGGG
CTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4BR84JQ 737 0 0
GGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCAGATTCGCAATCATGTACTTGATCTCCACGGAA
ACCATAAACCAATCCGAAGTTGAGTCCGTGGAAGCAGCATTGAACGAAGCTGGGGCTGAC
ACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATCAAATCCTTGAACGTGTCTCTCGCAGCTTCG
GCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACATTGTAGACTGGGCCGAGAAGCTTTACGGGCAATCT
ATAAGCGCGGTCACTGCAGGAGTCAAGAATCTGTTGTCTAGTGATCAACAATTGGCGGTG
ACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGAAGGGAAACCGAACCCAGAGTTTGATTCTTACCTT
TTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCCTGGCTCCGGTGGTGGTAGCCATGTGAAGGGACCG
TTTAGAGAAGCAATGGTGTTCATGATAGGTGGAGGGAACTATGTTGAGTATGGGAGTTTG
CAGGAGCTTACTCAGAGACAGTTGACGGTTAAGAACGTTATTTACGGAGCCACTGAGATT
CTTACAGGAAGTGAGTTGGTGGAACAGCTGGGGCTTTTGGGTAAGAAGATGGGTTTGGGA
GGTCCGGTCGCTTCGTCTTCTTCGTCTGGTCACTGAGCTTGAGAGTTTTTCTTTTTCTTA
TGAGAGTTTTCTGGTTTGTTAAATAAATCTCGTGAGTGCTTTTATATTTTAAGTTTTAAT
CCGGATCTCGATTCATC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL6003Contig1 238 2 8 U
GCAACAAGCTGGCTGGGAGATTGGAGAATGTTGTGGGATGGTATCACTCACACCCTGGGT
ATGGATGCTGGCTCTCGGGTATCGATGTCTCAACGCAGATGCTTAACCAGCAGTATCAGG
AGCCTTTCTTGGCTGTTGTGATTGACCCGACAAGGACTGTTTCGGCTGGTAAGGTTGAAA
TTGGGGCGTTCAGGACTTATCCTGAGGGGGCATAAAATCTCTGATGATCATGTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H656TF U 1
AF RR4CC10TF U 57
BS 1 145 RR4H656TF
BS 146 146 RR4CC10TF
BS 147 151 RR4H656TF
BS 152 152 RR4CC10TF
BS 153 211 RR4H656TF
BS 212 212 RR4CC10TF
BS 213 231 RR4H656TF
BS 232 238 RR4CC10TF

RD RR4H656TF 231 0 0
GCAACAAGCTGGCTGGGAGATTGGAGAATGTTGTGGGATGGTATCACTCACACCCTGGGT
ATGGATGCTGGCTCTCGGGTATCGATGTCTCAACGCAGATGCTTAACCAGCAGTATCAGG
AGCCTTTCTTGGCTGTTGTGATTGATCCGACGAGGACTGTTTCGGCTGGTAAGGTTGAAA
TTGGGGCGTTCAGGACTTATCCTGAGGGGGCGTAAAATCTCTGATGATCAT

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR4CC10TF 182 0 0
GGGTATGGATGCTGGCTCTCGGGTATCGATGTCTCAACGCAGATGCTTAACCAGCAGTAT
CAGGAGCCTTTCTTGGCTGTTGTGATTGACCCGACAAGGACTGTTTCGGCTGGTAAGGTT
GAGATTGGGGCGTTCAGGACTTATCCTGAGGGG*CATAAGATCTCTGATGATCATGTTTC
TG

QA 1 182 1 182
DS 



AS 1 2

CO CL6004Contig1 1223 2 2 U
TTCGTACTGTCCTCGTCGCCGACATCCCTAGCCTCCCGGACTCTGTTTACGGATTAGCCG
AAGGTATGAGTCCCTCCGGTTTAGATTTGAGCAAACCGAAACCGTTTAAGATGCCTGGAT
TCTCTGTGATTGGACACAGAGGACATGGTATGAATGTGTTGCAGTCATCTGATCGGAGAA
CCAGAGGGTTTAAAGAAAACTCTATCTTCTCTTTTAATTCTGCAGCCAAGTTTCCCATCG
ATTTCATTGAGTTCGATGTTCAGGTGACAAAAGACGATTGTCCTGTCATTTTCCATGATG
ATTTCATCTACTCTCAAGAGAATGGTGTTGTTAATGAGAGTAGAGTGACTGATCTGAGCC
TTTCTGAGTTCCTCCTCTATGGACCTCAGAAAGAAGCTGAGAAAACAGGGAAGACCCTTA
TGAGGAAATCCAAAGAAGGTCAGGTTTTGAGATGGGACGTTGACTCTGATGATCCCCTTT
GCACGCTACAAGAAGCTTTTGAACGTGTTGAGCAATCTCTAGGGTTCAATATCGAGTTGA
AATTCGATGATCAGGTTGTTTATGAGCGAGAGTTTCTCGTCCATGTCTTGAGAACAGTTC
TGCAGGTGGTGTTTGATTATGCCAAAGACAGACCAGTGATCTTCTCAAGTTTCCAACCAG
ATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAACTACAGAGCACTTACCCTGTTTTCTTTCTGACTAACG
CGGGCAACCAAATGTACAATGACGAGAGAAGAAACTCACTGGAAGAAGCCATTAAAGTTT
GCTTGGAAGGAAAGCTACAAGGTATTGTTTCAGAGGTTAAAGGAGTTTTCAGAAACCCAT
CAGCCATTTCCAAAATCAAAGAGTCCAACCTCTCTCTCCTCACATACGGCAAACTCAACA
ATGTGGGAGAGGCAGTGTACATGCAATATGTGATGGGGATTGAAGGAGTGATTGTAGACT
TTGTTGAGGAGATTTCTGAGTCAGTTACACTCATGATGATAAGATCACCATCACCATCAC
CAGGGTCAAAGGATGATGTTGCTGCCATTACAAGACCTGAGTTTTCACCAAAGGAGATTG
ATTTTCTTCTCAGGCTTCTCTCGCAGTTTTGATACAACATTAATTGATATCATTATTACC
TATGTTTTTTTTCTGATCGAATATCTTTGTATCTTTTGTTTCTTTTATCATGTGGTTTTT
TCTTTAGGATTTGATTTTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT89TF U 1
AF RR4GT89JQ C 444
BS 1 593 RR4GT89TF
BS 594 1223 RR4GT89JQ

RD RR4GT89TF 594 0 0
TTCGTACTGTCCTCGTCGCCGACATCCCTAGCCTCCCGGACTCTGTTTACGGATTAGCCG
AAGGTATGAGTCCCTCCGGTTTAGATTTGAGCAAACCGAAACCGTTTAAGATGCCTGGAT
TCTCTGTGATTGGACACAGAGGACATGGTATGAATGTGTTGCAGTCATCTGATCGGAGAA
CCAGAGGGTTTAAAGAAAACTCTATCTTCTCTTTTAATTCTGCAGCCAAGTTTCCCATCG
ATTTCATTGAGTTCGATGTTCAGGTGACAAAAGACGATTGTCCTGTCATTTTCCATGATG
ATTTCATCTACTCTCAAGAGAATGGTGTTGTTAATGAGAGTAGAGTGACTGATCTGAGCC
TTTCTGAGTTCCTCCTCTATGGACCTCAGAAAGAAGCTGAGAAAACAGGGAAGACCCTTA
TGAGGAAATCCAAAGAAGGTCAGGTTTTGAGATGGGACGTTGACTCTGATGATCCCCTTT
GCACGCTACAAGAAGCTTTTGAACGTGTTGAGCAATCTCTAGGGTTCAATATCGAGTTGA
AATTCGATGATCAGGTTGTTTATGAGCGAGAGTTTCTCGTCCATGTCTTGAGA
C

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4GT89JQ 780 0 0
GTTTTGAGATGGGACGTTGACTCTGATGATCCCCTTTGCACGCTACAAGAAGCTTTTGAA
CGTGTTGAGCAATCTCTAGGGTTCAATATCGAGTTGAAATTCGATGATCAGGTTGTTTAT
GAGCGAGAGTTTCTCGTCCATGTCTTGAGAACAGTTCTGCAGGTGGTGTTTGATTATGCC
AAAGACAGACCAGTGATCTTCTCAAGTTTCCAACCAGATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAA
CTACAGAGCACTTACCCTGTTTTCTTTCTGACTAACGCGGGCAACCAAATGTACAATGAC
GAGAGAAGAAACTCACTGGAAGAAGCCATTAAAGTTTGCTTGGAAGGAAAGCTACAAGGT
ATTGTTTCAGAGGTTAAAGGAGTTTTCAGAAACCCATCAGCCATTTCCAAAATCAAAGAG
TCCAACCTCTCTCTCCTCACATACGGCAAACTCAACAATGTGGGAGAGGCAGTGTACATG
CAATATGTGATGGGGATTGAAGGAGTGATTGTAGACTTTGTTGAGGAGATTTCTGAGTCA
GTTACACTCATGATGATAAGATCACCATCACCATCACCAGGGTCAAAGGATGATGTTGCT
GCCATTACAAGACCTGAGTTTTCACCAAAGGAGATTGATTTTCTTCTCAGGCTTCTCTCG
CAGTTTTGATACAACATTAATTGATATCATTATTACCTATGTTTTTTTTCTGATCGAATA
TCTTTGTATCTTTTGTTTCTTTTATCATGTGGTTTTTTCTTTAGGATTTGATTTTCTTTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6005Contig1 601 2 4 U
GACTCATAAGCCATCTCATCAACAAAGAGAACTCTGAAGGTGTTGTTCTGCTTGGTCATA
GCACTGGCTGCCAGGACATTGTGTATTACATTGGAACCAATTCTGCATGTTCCCGAGCTG
TCCGAGCTACAATTTTGCAGGCACCGGTCAGTGATAGAGAGTACAAAGCAACACTTCCCG
AAACCCCAGCTTTGATAGACTTGGCTGCGAAAATGATAAGCGAAGGCCGAGCAGAGGAGC
TAATGCCTAGAGAAGCTGATCCTTCTGCTCCAATCTCTGCTTATAGATACCACTCCCTCT
GCGCTTACATGGGAGACGACGACATGTTTAGTTCTGACCTAAGTGATGATCAGTTGAAAA
CTAGACTTGGCCATATGGCTAACACGCCTTGTCAGGTGATTTTCTCCATGGGTGAGGAGT
ATGTACCGGATTATGTCGACAAAAAAGTACTGGTTAACAGATTAGGTAGAGCAATGGGAG
GAGCAGAGAAAGTGGAGATAGAGCATGGGAACCACTCTCTATCCAATAGAGTTCATGAAG
CTGTTCAAGCCATTATTGGTTTTGTCAAAAGAGAAGGACCCAGTGGTTGGGATGATCCTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4FV59TF U 1
AF RR4FV59JQ C 342
BS 1 415 RR4FV59TF
BS 416 416 RR4FV59JQ
BS 417 503 RR4FV59TF
BS 504 601 RR4FV59JQ

RD RR4FV59TF 503 0 0
GACTCATAAGCCATCTCATCAACAAAGAGAACTCTGAAGGTGTTGTTCTGCTTGGTCATA
GCACTGGCTGCCAGGACATTGTGTATTACATTGGAACCAATTCTGCATGTTCCCGAGCTG
TCCGAGCTACAATTTTGCAGGCACCGGTCAGTGATAGAGAGTACAAAGCAACACTTCCCG
AAACCCCAGCTTTGATAGACTTGGCTGCGAAAATGATAAGCGAAGGCCGAGCAGAGGAGC
TAATGCCTAGAGAAGCTGATCCTTCTGCTCCAATCTCTGCTTATAGATACCACTCCCTCT
GCGCTTACATGGGAGACGACGACATGTTTAGTTCTGACCTAAGTGATGATCAGTTGAAAA
CTAGACTTGGCCATATGGCTAACACGCCTTGTCAGGTGATTTTCTCCATGGGTGATGAGT
ATGTACCGGATTATGTCGACAAAAAAGTACTGGTTAACAGATTAGGTAGAGCAATGGGAG
GAGCAGAGAAAGTGGAGATAGAG

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4FV59JQ 260 0 0
AGTGATGATCAGTTGAAAACTAGACTTGGCCATATGGCTAACACGCCTTGTCAGGTGATT
TTTTCCATGGGTGAGGAGTATGTACCGGATTATGTGGACAAAAAAGTACTGGTTAACAGA
TTAGGTAGAGCAATGGGAGGAGCAGAGAAAGTGGAGATAGAGCATGGGAACCACTCTCTA
TCCAATAGAGTTCATGAAGCTGTTCAAGCCATTATTGGTTTTGTCAAAAGAGAAGGACCC
AGTGGTTGGGATGATCCTTG

QA 1 260 1 260
DS 



AS 1 2

CO CL6006Contig1 694 2 3 U
GGGTTAGTGAGCGATGGCGACTGCAGGAACTGCGACGGCGAAGAGAAAACCGGTGTTTGT
GAAGGTTGAACAGCTGAAGCCTGGGACGACGGGTCACACGTTGACTGTTAAGGTCGTTGA
TTCCAACCCTGTGGTTCCGACTACCCGTAAGGCTCGTCCGGGGAGTTCTATGAGTCGTCC
GTCTCAGCCTAGTCGAATCGCTGAGTGTCTCATCGGAGACGAGACCGGGTGTATTCTCTT
CACTGCTCGTAACGATCAAGTTGATCTTATGAAGCCGGGAGAAACGGTGATACTGCGCAA
CTCGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACGATGAGGCTAGGGGTTGATAAATGGGGACGCAT
CGAAGCCACTGAACCTGCATCTTTTCACTGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTG
AATATGAACTGATTAACGTTAACGATCAGTGAGATCTTCTTTGGTGTGTGTTTGGGGGAG
TTAAGAAGGTTTATGATTCTTCTTCTACCGTTAAGGTCTTTGATTTAGTTGTTGAAGCTT
TGTATGGACTTGTCCAGAGACGCTTTCTTTTAGGAATGCTTTCTATTTCTTTTTTGTTTT
TTTTTCTGTCTCCATCTACGAAACTCTTGCATCAACTTGTTGGCTACTAACAATTCGTAA
GTAAATCAAATCTATCTACTAGAATTTAGAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CN70TF U 267
AF RR4CN70JQ C 1
BS 1 266 RR4CN70JQ
BS 267 395 RR4CN70TF
BS 396 694 RR4CN70JQ

RD RR4CN70TF 129 0 0
TTATGAAGCCGGGAGAAACGGTGATACTGCGCAACTCGAGGATAGACATGTTCAAGGGCA
CGATGAGGCTAGGGGTTGATAAATGGGGACGCATCGAAGCCACTGAACCTGCATCTTTTC
ACTGTCAAA

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR4CN70JQ 694 0 0
GGGTTAGTGAGCGATGGCGACTGCAGGAACTGCGACGGCGAAGAGAAAACCGGTGTTTGT
GAAGGTTGAACAGCTGAAGCCTGGGACGACGGGTCACACGTTGACTGTTAAGGTCGTTGA
TTCCAACCCTGTGGTTCCGACTACCCGTAAGGCTCGTCCGGGGAGTTCTATGAGTCGTCC
GTCTCAGCCTAGTCGAATCGCTGAGTGTCTCATCGGAGACGAGACCGGGTGTATTCTCTT
CACTGCTCGTAACGATCAAGTTGATCTTATGAAGCCGGGAGAAACGGTGATACTGCGCAA
CTCGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACGATGAGGCTAGGGGTTGATAAATGGGGACGCAT
CGAAGCCACTGAACCTGCATCTTT*CACTGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTG
AATATGAACTGATTAACGTTAACGATCAGTGAGATCTTCTTTGGTGTGTGTTTGGGGGAG
TTAAGAAGGTTTATGATTCTTCTTCTACCGTTAAGGTCTTTGATTTAGTTGTTGAAGCTT
TGTATGGACTTGTCCAGAGACGCTTTCTTTTAGGAATGCTTTCTATTTCTTTTTTGTTTT
TTTTTCTGTCTCCATCTACGAAACTCTTGCATCAACTTGTTGGCTACTAACAATTCGTAA
GTAAATCAAATCTATCTACTAGAATTTAGAAACG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6007Contig1 726 2 1 U
GGCACCGAAACAAAATGATTATGTCAGAGGAAAACCGCAGAGAAATCTGCAAGTACCTTT
TCAAAGAAGGAGTGCTGTTCGCGAAGAAAGACTTCAACCTCGCTAAGCACCCGTTGATTG
AGTCAGTGCCAAACCTGCAAGTGATCAAGCTGATGCAGTCTTTCAAGTCCAAGGAGTATG
TAAGGGAGACGTTCGCGTGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACCAACGAAGGGATTGAGT
TTCTGAGGACTTACCTTAACCTCCCGTCTGATGTTGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCGG
CTAAGCCTATTGGTCGTCCTTTTGGTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCTA
GGTTTGAAGGAGGAGATCGTCCCAGGTATGGTGGGGACCGTGATGGGTACCGTGGAGCTC
CTCGTGGTGGTGGTGAAGGAGAAAGGGGTGGTGCTCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTCC
AAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGTTTTGGCCGAGGTGCTGGAGGTTACAGCTCGGCTGCAC
CATCTGGTTCAGGTCTCCCTTGATAAAGAAATGGTTCTTAGTTACACATGGAGGAGTTCA
TTTCAGCTTTAAATTTTGCTTTCTGTTATTCAACTTCTGGAGTTCTTTATTGTCTTATCT
TGAGTTCAGTTCGTTCGTCGTAGCAGACACGAGAAACCTTGTTACGAGTAAACGTTGTTT
AGTACC


BQ
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AF RR4BV07JQ C 1
AF RR4BV07TF U 1
BS 1 726 RR4BV07TF

RD RR4BV07JQ 726 0 0
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TAAGGGAGACGTTCGCGTGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACCAACGAAGGGATTGAGT
TTCTGAGGACTTACCTTAACCTCCCGTCTGATGTTGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCGG
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CTCGTGGTGGTGGTGAAGGAGAAAGGGGTGGTGCTCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTCC
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AGTACC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4BV07TF 726 0 0
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TCAAAGAAGGAGTGCTGTTCGCGAAGAAAGACTTCAACCTCGCTAAGCACCCGTTGATTG
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TAAGGGAGACGTTCGCGTGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACCAACGAAGGGATTGAGT
TTCTGAGGACTTACCTTAACCTCCCGTCTGATGTTGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCGG
CTAAGCCTATTGGTCGTCCTTTTGGTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCTA
GGTTTGAAGGAGGAGATCGTCCCAGGTATGGTGGGGACCGTGATGGGTACCGTGGAGCTC
CTCGTGGTGGTGGTGAAGGAGAAAGGGGTGGTGCTCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTCC
AAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGTTTTGGCCGAGGTGCTGGAGGTTACAGCTCGGCTGCAC
CATCTGGTTCAGGTCTCCCTTGATAAAGAAATGGTTCTTAGTTACACATGGAGGAGTTCA
TTTCAGCTTTAAATTTTGCTTTCTGTTATTCAACTTCTGGAGTTCTTTATTGTCTTATCT
TGAGTTCAGTTCGTTCGTCGTAGCAGACACGAGAAACCTTGTTACGAGTAAACGTTGTTT
AGTACC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL6008Contig1 1208 2 2 U
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TCCAAGCACCAGAGCATAGATCAAACTCCAACTCCATCCCTAACCAACCGGAAGAAATAC
CCGTGATCGATCTCTCACGTCTCAATGACCCTGAAGATATCCAAAACGTGATCTCTGAGA
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ATGCGAGGAAGCGTGTGGAGGAGACGGTGAAGATATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGAGA
AGATCAAAGTAAAGAGAGACGAGGTGAATCCAGCAGGGTATCATGATGGAGAACACACGA
AGAACGTTAGAGACTGGAAAGAAGTGTTTGATATTTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGC
CTTTTTCCATAGATCCTGAAGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGT
TTCCTTCTGATTTCAGGGAGGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGT
TCAGACTTTTAGAGCTCATCTCATTAAGCTTGGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATT
ACTTCAAAGAACAAATGAGTTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTG
ACCTAGCTCTAGGTGTAGGCCACCACAAAGATGCAGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAG
ACGAAGTTGGAGGGTTGCAAATTAGTCGTAGATCGGACGGTGTTTGGTTTCCTATTAAAC
CTGTCCCTAATGCTCTTGTCATCAATATTGGCAATTGTATGGAGGGATGGACGAATGATA
AGTACTGGAGTGCAGAACATAGAGTGGTGGTGAACTCAACAAGGGAAAGATACTCAATAC
CGTTCTTCTTGTTGCCTTCACATGATGTGGAAGTGAAACCATTGGAAGAGCTTTTGAGTC
CTGAAAACCCTCCAAGATACAAAGGATATAAATATGGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACA
GAAGCGATTTTAAAAAGCTCGAGATCCAAAACATTCAGATCGATGAATTCAAAATTGTAA
CATAGAATTACTGGTACTATGTGTGACTTGGGTTTTTCAAGCTATGATCTCAATGTAAGC
CATTAATGTAATAATGTGTGTGAGACTGAGTCTTTGTCAGAAACAATAAACTTGATAATG
TTTAATGG


BQ
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AF RR4H279TF U 1
AF RR4H279JQ C 488
BS 1 625 RR4H279TF
BS 626 1208 RR4H279JQ

RD RR4H279TF 625 0 0
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TCCAAGCACCAGAGCATAGATCAAACTCCAACTCCATCCCTAACCAACCGGAAGAAATAC
CCGTGATCGATCTCTCACGTCTCAATGACCCTGAAGATATCCAAAACGTGATCTCTGAGA
TAGGTGATGCATGTGAAACATGGGGATTTTTCCAGGTGATCAATCATGGTGTACCTTGCG
ATGCGAGGAAGCGTGTGGAGGAGACGGTGAAGATATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGAGA
AGATCAAAGTAAAGAGAGACGAGGTGAATCCAGCAGGGTATCATGATGGAGAACACACGA
AGAACGTTAGAGACTGGAAAGAAGTGTTTGATATTTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGC
CTTTTTCCATAGATCCTGAAGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGT
TTCCTTCTGATTTCAGGGAGGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGT
TCAGACTTTTAGAGCTCATCTCATTAAGCTTGGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATT
ACTTCAAAGAACAAATGAGTTTTTT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4H279JQ 721 0 0
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AGAACAAATGAGTTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCTAGC
TCTAGGTGTAGGCCACCACAAAGATGCAGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAGACGAAGT
TGGAGGGTTGCAAATTAGTCGTAGATCGGACGGTGTTTGGTTTCCTATTAAACCTGTCCC
TAATGCTCTTGTCATCAATATTGGCAATTGTATGGAGGGATGGACGAATGATAAGTACTG
GAGTGCAGAACATAGAGTGGTGGTGAACTCAACAAGGGAAAGATACTCAATACCGTTCTT
CTTGTTGCCTTCACATGATGTGGAAGTGAAACCATTGGAAGAGCTTTTGAGTCCTGAAAA
CCCTCCAAGATACAAAGGATATAAATATGGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAAGCGA
TTTTAAAAAGCTCGAGATCCAAAACATTCAGATCGATGAATTCAAAATTGTAACATAGAA
TTACTGGTACTATGTGTGACTTGGGTTTTTCAAGCTATGATCTCAATGTAAGCCATTAAT
GTAATAATGTGTGTGAGACTGAGTCTTTGTCAGAAACAATAAACTTGATAATGTTTAATG
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6009Contig1 802 2 2 U
GGGTTTATGACTATCTCAGCGATGGAAGCGTGGCTTCTTTGCTTCACGGTAACCGAGGAG
AGAACCGGGTTCCGTTGGATTGGGAAACGAGGATGAAGATCGCGATTGGTGCAGCGAAAG
GGATCGCTAGAATCCACAGAGAGAACAATGGAAAGCTCGTACATGGCAACGTCAAGTCTT
CGAATGTGTTCTTGAACGCAGAGCGTAACGGCTGCGTGTCAGATCTTGGTTTGACAGCTG
TGATGAGCGCCTTGGCCCCACCTATCTCTAGGCAAGCTGGTTACCGTGCGCCGGAAGTAT
CAGACACAAGGAAGTCTTCTCAGTTATCAGATGTTTACAGCTTCGGCGTCGTTTTGCTCG
AACTGCTCACGGGAAAATCGCCGATTCACACTACCGCAGGAGATGAGATTATACATTTGG
TTCGGTGGGTACATTCTGTTGTGAGAGAGGAATGGACTGCGGAGGTGTTCGACGTGGAGC
TTCTGAGGTATACAAACATAGAGGAAGAGATGGTTGAGATGTTGCAGATTGCTCTGTCGT
GTGTTGTCAAAGCACCCGACCAGAGACCGAAGATGTCTGATTTGGTTAGGCTTATGGAGG
GTGTCGGAAACCGACGAGCCAGTCTTGAGACTAAACCAGAGAAGAAAGCCTCCGAGACTT
CCACGCCGAGTGAAACTTGATGGACTTACAGAAAATTAAGAAACTGTTGATTTATAGTTA
ATATATGAAGTTTGTATAATCTCTTCTGCTCATCCTCTCTTCTTCGGTTAGAACCGGTTT
ACTCAAACACCAATTTCTGGTT


BQ
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AF RR4FL52TF U 1
AF RR4FL52JQ C 465
BS 1 603 RR4FL52TF
BS 604 802 RR4FL52JQ

RD RR4FL52TF 603 0 0
GGGTTTATGACTATCTCAGCGATGGAAGCGTGGCTTCTTTGCTTCACGGTAACCGAGGAG
AGAACCGGGTTCCGTTGGATTGGGAAACGAGGATGAAGATCGCGATTGGTGCAGCGAAAG
GGATCGCTAGAATCCACAGAGAGAACAATGGAAAGCTCGTACATGGCAACGTCAAGTCTT
CGAATGTGTTCTTGAACGCAGAGCGTAACGGCTGCGTGTCAGATCTTGGTTTGACAGCTG
TGATGAGCGCCTTGGCCCCACCTATCTCTAGGCAAGCTGGTTACCGTGCGCCGGAAGTAT
CAGACACAAGGAAGTCTTCTCAGTTATCAGATGTTTACAGCTTCGGCGTCGTTTTGCTCG
AACTGCTCACGGGAAAATCGCCGATTCACACTACCGCAGGAGATGAGATTATACATTTGG
TTCGGTGGGTACATTCTGTTGTGAGAGAGGAATGGACTGCGGAGGTGTTCGACGTGGAGC
TTCTGAGGTATACAAACATAGAGGAAGAGATGGTTGAGATGTTGCAGATTGCTCTGTCGT
GTGTTGTCAAAGCACCCGACCAGAGACCGAAGATGTCTGATTTGGTTAGGCTTATGGAGG
GTG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4FL52JQ 338 0 0
GTGTTCGACGTGGAGCTTCTGAGGTATACAAACATAGAGGAAGAGATGGTTGAGATGTTG
CAGATTGCTCTGTCGTGTGTTGTCAAAGCACCCGACCAGAGACCGAAGATGTCTGATTTG
GTTAGGCTTATGGAGGGTGTCGGAAACCGACGAGCCAGTCTTGAGACTAAACCAGAGAAG
AAAGCCTCCGAGACTTCCACGCCGAGTGAAACTTGATGGACTTACAGAAAATTAAGAAAC
TGTTGATTTATAGTTAATATATGAAGTTTGTATAATCTCTTCTGCTCATCCTCTCTTCTT
CGGTTAGAACCGGTTTACTCAAACACCAATTTCTGGTT

QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 2

CO CL6010Contig1 797 2 8 U
GGAAAACAGTCCCGACTTATTCAGCTCCGTCGCTAACGCCGCCTGTACCGTCGGCATCAC
ATTAACCTTCAAACGCCGTTGGTTTACTCTTCCCCACAGGGATTCTCATCTGAGAGAGAG
AGACTAGGTAGGAGCAATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGACACTGGAAGAT
ACTTCGCGGGGATAATGTAATGATTATCCGCGGGAAAGATAAGGGCGAGACGGGAACAAT
TAAGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGAA
GCATATAAAGGGAGGTCCTGATCATGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCCCTTCA
CGCCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCCTGTCACCGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTGAA
GTACCTAGAGGATGGTACAAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACAGGCACATCTGGTTCCAT
TATTCCTCGCCCAGAGATTCTTAAGATAAGGACAACACCAAGACCCACTACAGCTGGCCC
AAAGGACACACCAATGGAGTTTGTCTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGG
CACGCCTGATCTTTGAGTAAAACCTTCTTCCTAAAATGTTGATGCTCCCAGATGATTCTT
CTTCTTTTTACATCCAGATTACAAGTTTGATTTAGTTCAAAGATTTGAGAAATGAGATGC
TGTTGAACAAGCTTTGATTCTTTTTTCCGTTACTCTTATGAACGTTTTCAAGGTGTCAAA
TAAAAACCTTATGGGAT


BQ
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AF RR4EV55TF U 1
AF RR4EV55JQ C 88
BS 1 113 RR4EV55TF
BS 114 114 RR4EV55JQ
BS 115 156 RR4EV55TF
BS 157 157 RR4EV55JQ
BS 158 167 RR4EV55TF
BS 168 168 RR4EV55JQ
BS 169 240 RR4EV55TF
BS 241 797 RR4EV55JQ

RD RR4EV55TF 240 0 0
GGAAAACAGTCCCGACTTATTCAGCTCCGTCGCTAACGCCGCCTGTACCGTCGGCATCAC
ATTAACCTTCAAACGCCGTTGGTTTACTCTTCCCCACAGGGATTCTCATCTGA*AGAGAG
AGACTAGGTAGGAGCAATGGGTTGGAAAGCTGCTGA*AAACTCATCA*ACACTGGAAGAT
ACTTCGCGGGGATAATGTAATGATTATCCGCGGGAAAGATAAGGGCGAGACGGGAACAAT

QA 1 240 1 240
DS 

RD RR4EV55JQ 710 0 0
TCTTCCCCACAGGGATTCTCATCTGAGAGAGAGAGACTAGGTAGGAGCAATGGGTTGGAA
AGCTGCTGAGAAACTCATCAGACACTGGAAGATACTTCGCGGGGATAATGTAATGATTAT
CCGCGGGAAAGATAAGGGCGAGACGGGAACAATTAAGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCG
TGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGAAGCATATAAAGGGAGGTCCTGATCATGA
AGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCCCTTCACGCCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCC
TGTCACCGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTGAAGTACCTAGAGGATGGTACAAAAGTAAG
AGTGGCCAGAGGCACAGGCACATCTGGTTCCATTATTCCTCGCCCAGAGATTCTTAAGAT
AAGGACAACACCAAGACCCACTACAGCTGGCCCAAAGGACACACCAATGGAGTTTGTCTG
GGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGGCACGCCTGATCTTTGAGTAAAACCTTC
TTCCTAAAATGTTGATGCTCCCAGATGATTCTTCTTCTTTTTACATCCAGATTACAAGTT
TGATTTAGTTCAAAGATTTGAGAAATGAGATGCTGTTGAACAAGCTTTGATTCTTTTTTC
CGTTACTCTTATGAACGTTTTCAAGGTGTCAAATAAAAACCTTATGGGAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6011Contig1 1275 2 4 U
GGCTAGCGATTCTTCTTCTCTCTGGGTTTAGGGTTCCCGGTAGTGTGGCAACGACGTTGA
GCGCTTTGTACCTTTATCGCCCTCATCTGACTTAGAGATGGAGATCATGCCAAGAGAGAA
TGATAACGCTTTGTCAGCTCCTACCCCCATGGAGTTGTCAACAACTTTCCCAGGACCTGG
TCCCTACGGGAAGCAGCGGACATCGAGCTTGGAAGCACCTATCATGCTGCTAACTGGACA
TCCCAGTGCTGTCTACACCATGAAGTTCAACCCATCGGGGACTCTGATTGCATCTGGGTC
ACATGACAGAGAGATCTTTCTCTGGAGGGTTCACGGGGACTGCAAAAACTTCATGGTTCT
GAAAGGTCACAAGAACGCTATCCCCGATCTTCACTGGACCAGCGACGGCTCCATGATTGT
ATCAGCAAGTCCGGATAAAACTGTAGGGCGTGGGATGTTGACACTGGGAAACAAGTCAAG
AAGATGGCTGAGCATTCCTCCTTTGTGAATTCCTGCTGTTCTACGCGTAGAGGACCTCCG
CTTATCGTCAGTGGATCTGATGATGGAACCGCCAAGCTTTGGGACATGCGTCAGAGAGGA
GCCATTCAGACGTTTCCTGATAAATACCAGATCACGGCGGTGAGCTTCTCTGATGCAGGT
GATAAGATTTTCACTGGCGGTGTGGACAACGATGTTAAAGTCCGGGACTTGCGAAAAGGC
GAAACCACCATGACGCTGGAGGGCCATCAGGATACGATCACGGGGATTAGCTTAAGTCCA
GACGGTTCCTACCTTCTCACCAATGGAATGGACAACAAGCTCTGCGTGTGGGACATGCGT
CCTTACGCCCCACAGAACCGGTGTGTGAGGATCTTTGAAGGGCATCAGCACAACTTTGAG
AAGAACCTGCTCAAGTGTTCGTGGTCACCTGATGGTACCAAAGTCACTGCTGGTAGCGCA
GACCGCATGGTTCATATTTGGGACACAACCACTCGGCGCATTCTCTACGAGCTCCCAGGC
CATAAAGGATCGGTCAATGAGTGTGTGTTTCACCCCACTGAGCCTATCATTGGTTCTAGC
AGCAGCGATAAAGATATCTACCTGGGAGAGATCTGAAAGTTTTAAAGCTGTGTGAGACAT
TTGCAAACTAAATTTGAATTTAAAGTCTTTAGATTCAACAATGTGTTTTAAGACATTTTG
CTTATTGAGAGAGATAAACTAAAACACTGCTTTTGCTAAAAGTAATCAAGAACTGTTATC
TCCTGCTATGTCTTC


BQ
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AF RR4F030TF U 1
AF RR4F030JQ C 561
BS 1 658 RR4F030TF
BS 659 659 RR4F030JQ
BS 660 703 RR4F030TF
BS 704 1275 RR4F030JQ

RD RR4F030TF 703 0 0
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GCGCTTTGTACCTTTATCGCCCTCATCTGACTTAGAGATGGAGATCATGCCAAGAGAGAA
TGATAACGCTTTGTCAGCTCCTACCCCCATGGAGTTGTCAACAACTTTCCCAGGACCTGG
TCCCTACGGGAAGCAGCGGACATCGAGCTTGGAAGCACCTATCATGCTGCTAACTGGACA
TCCCAGTGCTGTCTACACCATGAAGTTCAACCCATCGGGGACTCTGATTGCATCTGGGTC
ACATGACAGAGAGATCTTTCTCTGGAGGGTTCACGGGGACTGCAAAAACTTCATGGTTCT
GAAAGGTCACAAGAACGCTATCCCCGATCTTCACTGGACCAGCGACGGCTCCATGATTGT
ATCAGCAAGTCCGGATAAAACTGTAGGGCGTGGGATGTTGACACTGGGAAACAAGTCAAG
AAGATGGCTGAGCATTCCTCCTTTGTGAATTCCTGCTGTTCTACGCGTAGAGGACCTCCG
CTTATCGTCAGTGGATCTGATGATGGAACCGCCAAGCTTTGGGACATGCGTCAGAGAGGA
GCCATTCAGACGTTTCCTGATAAATACCAGATCACGGCGGTGAGCTTCTCTGATGCAG*T
GATAAGATTTTCACTGGCGGTGTGGACAACGATGTTAAAGTCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4F030JQ 715 0 0
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TAAATACCAGATCACGGCGGTGAGCTTCTCTGATGCAGGTGATAAGATTTTCACTGGCGG
TGTGGACAACGATGTTAAAGTCCGGGACTTGCGAAAAGGCGAAACCACCATGACGCTGGA
GGGCCATCAGGATACGATCACGGGGATTAGCTTAAGTCCAGACGGTTCCTACCTTCTCAC
CAATGGAATGGACAACAAGCTCTGCGTGTGGGACATGCGTCCTTACGCCCCACAGAACCG
GTGTGTGAGGATCTTTGAAGGGCATCAGCACAACTTTGAGAAGAACCTGCTCAAGTGTTC
GTGGTCACCTGATGGTACCAAAGTCACTGCTGGTAGCGCAGACCGCATGGTTCATATTTG
GGACACAACCACTCGGCGCATTCTCTACGAGCTCCCAGGCCATAAAGGATCGGTCAATGA
GTGTGTGTTTCACCCCACTGAGCCTATCATTGGTTCTAGCAGCAGCGATAAAGATATCTA
CCTGGGAGAGATCTGAAAGTTTTAAAGCTGTGTGAGACATTTGCAAACTAAATTTGAATT
TAAAGTCTTTAGATTCAACAATGTGTTTTAAGACATTTTGCTTATTGAGAGAGATAAACT
AAAACACTGCTTTTGCTAAAAGTAATCAAGAACTGTTATCTCCTGCTATGTCTTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6012Contig1 773 2 3 U
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ATCTATGCAAACTGTGTATCTACCCACTACTTATATGATGATCGTCGTCAACCTCGTGTA
TCACAATGAGCAATGTCGTGTTGCATCCCAAATAGAACGAATGATTAAATCATTAGAACC
AATAGGGACGTTTTAGTAGAGGCCCTAGATATTAGGGCAAAGTGTGACTAGTTTAGTTAC
TCTTGAAGATCAAACCATCGACTTGAGAACATGTTGTTCTCTTCGTCAAGATCAATCAAA
CCATCTAAATCAAAGTACGTGTTTGTGTTTGAACATGATCCCCATTCTTCCTTCACCACG
TGGCTCCCAATAAAACTGTTGACCGACTCTGCCGTATGTTCTTGGCTGGATTTTTGAAGT
GGAGGCGGTGGCGCAGGAATATTTGTTCTCGCTGTCTTTTTCCTAGAACCCGTTTTGGCG
ATCTCCGGTTTTCCGGTTAGACTTTGGACGAGTGTACGGAAGTTCTTGACGTCAGCATTG
ATAATCTCCGGCGCAAAGATATGGATGATTCGAATCTTAGGCTTGATCTTGGTGATTATT
TGGGATTTCTTGTTCATAGGAACCAAAGTTCTTGAATTATCTCCATAGAAGCTTTGATAA
GGAAGATGATCTAGATCGTACTCACCCTTCATTGAATTTCTCACCATTTAGAAAACAAAG
AATTGGTTTTTGTTTGGATTGTGTTTCTTGTATTGTTTGAAGATATAATATCC


BQ
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AF RR4CE43JQ U 78
AF RR4CE43TF C 1
BS 1 77 RR4CE43TF
BS 78 214 RR4CE43JQ
BS 215 773 RR4CE43TF

RD RR4CE43JQ 137 0 0
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GTGTTGCATCCCAAATAGAACGAATGATTAAATCATTAGAACCAATAGGGACGTTTTAGT
AGAGGCCCTAGATATTA

QA 1 137 1 137
DS 

RD RR4CE43TF 773 0 0
GAGTTATCAAAGTCAGTCTACAAAGTAATCAAAGAGCGCAAATAATCACAACATGTGTAT
ATCTATGCAAACTGTGTATCTACCCACTACTTATATGATGATCGTCGTCAAC*TCGTGTA
TCACAATGAGCAATGTCGTGTTGCATCCCAAATAGAACGAATGATTAAATCATTAGAACC
AATAGGGACGTTTTAGTAGAGGCCCTAGATATTAGGGCAAAGTGTGACTAGTTTAGTTAC
TCTTGAAGATCAAACCATCGACTTGAGAACATGTTGTTCTCTTCGTCAAGATCAATCAAA
CCATCTAAATCAAAGTACGTGTTTGTGTTTGAACATGATCCCCATTCTTCCTTCACCACG
TGGCTCCCAATAAAACTGTTGACCGACTCTGCCGTATGTTCTTGGCTGGATTTTTGAAGT
GGAGGCGGTGGCGCAGGAATATTTGTTCTCGCTGTCTTTTTCCTAGAACCCGTTTTGGCG
ATCTCCGGTTTTCCGGTTAGACTTTGGACGAGTGTACGGAAGTTCTTGACGTCAGCATTG
ATAATCTCCGGCGCAAAGATATGGATGATTCGAATCTTAGGCTTGATCTTGGTGATTATT
TGGGATTTCTTGTTCATAGGAACCAAAGTTCTTGAATTATCTCCATAGAAGCTTTGATAA
GGAAGATGATCTAGATCGTACTCACCCTTCATTGAATTTCTCACCATTTAGAAAACAAAG
AATTGGTTTTTGTTTGGATTGTGTTTCTTGTATTGTTTGAAGATATAATATCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL6013Contig1 1349 2 2 U
TTTTTCTGCTCAGAAACCCTAAAGTATAAAAAGACAGATACAAAATGAGGAACAACGTGA
AACTCTTACTCTTCTTCATCTCCATTTCCCTCCTCCTGATCGCCGTTGCTCACGCCCAAG
ATAGCCATGAGGGCCACTCACATTCCGGGAAGACTAAGTGCGGGTGCTCACACGAGGACG
ACCATGAAAACAAAGCCGGAGCCCGCAAATACAAAATCGCAGCCATTCCTGCCGTTCTAC
TCTCCGGCGTGATCGGAGTTCTTTTCCCTCTCTTAGGCAAAGTCTTCCCTTCTTTGCGTC
CTGAGACTCATTTCTTCTTCATCACGAAAGCTCTCGCTGCCGGAGTCATCCTGTCTACCG
GATTCATGCACGTCTTGCCTGAGGCTTACGAGATGCTTAACTCGCCGTGCCTCACGTCGG
AAGCGTGGGAGTTTCCGTTCACTGGATTCATCGCCATGGTTGCAGCGATCTTGACTCTGT
CCGTTGATACGTTTGCTACCTCGAGTTTCTATAAATCGCACTGCAAAGTGTCCAAAATGA
TCGCTGATGGAGAATCCGGTGAGCCATCGGTTGGATCCGACAAGGTCCAGATTCTCAGGA
CAAGAGTTATTGCACAGGTATTGGAGCTGGGAATATTAGTACATTCAGTGGTAATAGGAA
TATCACTTGGAGCTTCACAGAGTCCAGAAGCCGCAAAAGCTCTCTTCGTTGCCTTAATGT
TTCATCAATGCTTCGAAGGTCTTGGCCTTGGTGGCTGTATTGCTCAGGGAAAATTCAAGT
GTTTGTCAGTAACAATAATGTCGACGTTCTTCGCGGTAACAACACCAATAGGTATCGTTG
TCGGAATGGGAATAGCAAATACGCACGATGAATCTTCTTCAACGGCTCTGATCGTTCAAG
GAGTATTGAACGCTGCATCCGCAGGTATTCTCATTTACATGTCTCTGGTCGACCTTCTCG
CAGCAGACTTTTTGCACCCTAAGATGCAATCCAATACTGGGCTTCAAATTATGGCCCATA
TTGCTCTTCTTCTTGGTGCTGGCCTCATGTCTTTATTGGCTAAATGGGCTTGATGATTCC
TTTTTTCAACGCTCAGGTTTTTCATTCATGGCATTTATGTTGTCGTGGACTCGAATTATT
ATTTGTTTCTTTTATGTTTTTGTTCTCAATTCTATTTCCAATTTTAGTTTTGAGTATCTC
TATTTTCTGGACTACCTCATGTATACATATGCAAAATTCATTTGAGTTATATGTATGTTG
ATTCATGTCCCAGAAAAGTAATGAGCCTTGATTGGTTGCTTGTCCGAGTGTGGTTTGTAA
TAAGCTATATATTATATTTATTTGTGTGT


BQ
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AF RR4GR17TF U 1
AF RR4GR17JQ C 497
BS 1 627 RR4GR17TF
BS 628 1349 RR4GR17JQ

RD RR4GR17TF 627 0 0
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AACTCTTACTCTTCTTCATCTCCATTTCCCTCCTCCTGATCGCCGTTGCTCACGCCCAAG
ATAGCCATGAGGGCCACTCACATTCCGGGAAGACTAAGTGCGGGTGCTCACACGAGGACG
ACCATGAAAACAAAGCCGGAGCCCGCAAATACAAAATCGCAGCCATTCCTGCCGTTCTAC
TCTCCGGCGTGATCGGAGTTCTTTTCCCTCTCTTAGGCAAAGTCTTCCCTTCTTTGCGTC
CTGAGACTCATTTCTTCTTCATCACGAAAGCTCTCGCTGCCGGAGTCATCCTGTCTACCG
GATTCATGCACGTCTTGCCTGAGGCTTACGAGATGCTTAACTCGCCGTGCCTCACGTCGG
AAGCGTGGGAGTTTCCGTTCACTGGATTCATCGCCATGGTTGCAGCGATCTTGACTCTGT
CCGTTGATACGTTTGCTACCTCGAGTTTCTATAAATCGCACTGCAAAGTGTCCAAAATGA
TCGCTGATGGAGAATCCGGTGAGCCATCGGTTGGATCCGACAAGGTCCAGATTCTCAGGA
CAAGAGTTATTGCACAGGTATTGGAGC

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DS 

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CGGTGAGCCATCGGTTGGATCCGACAAGGTCCAGATTCTCAGGACAAGAGTTATTGCACA
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AGGTCTTGGCCTTGGTGGCTGTATTGCTCAGGGAAAATTCAAGTGTTTGTCAGTAACAAT
AATGTCGACGTTCTTCGCGGTAACAACACCAATAGGTATCGTTGTCGGAATGGGAATAGC
AAATACGCACGATGAATCTTCTTCAACGGCTCTGATCGTTCAAGGAGTATTGAACGCTGC
ATCCGCAGGTATTCTCATTTACATGTCTCTGGTCGACCTTCTCGCAGCAGACTTTTTGCA
CCCTAAGATGCAATCCAATACTGGGCTTCAAATTATGGCCCATATTGCTCTTCTTCTTGG
TGCTGGCCTCATGTCTTTATTGGCTAAATGGGCTTGATGATTCCTTTTTTCAACGCTCAG
GTTTTTCATTCATGGCATTTATGTTGTCGTGGACTCGAATTATTATTTGTTTCTTTTATG
TTTTTGTTCTCAATTCTATTTCCAATTTTAGTTTTGAGTATCTCTATTTTCTGGACTACC
TCATGTATACATATGCAAAATTCATTTGAGTTATATGTATGTTGATTCATGTCCCAGAAA
AGTAATGAGCCTTGATTGGTTGCTTGTCCGAGTGTGGTTTGTAATAAGCTATATATTATA
TTTATTTGTGTGT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL6014Contig1 1424 2 2 U
GGATTCGAAACTCATCATTTCTCTATCTACACATAACTCCAAAAAATATCAAACTCTCTC
TCTCCCCCTCTCCCTAAAAACCACAAGGAAAAAAAAAAAGTAGAAAGTCTCAATTTTTTT
TGCTGAGGGTTCTCTTTTGTAGGTATTTTCTGTGAGTTGAACAAAAAAGGGTATTTTCTG
TGCATCAATGGATGAGAAAGGAAGAAACTTGAACAACAACAACATGGAAGATGAAATGGA
CCTGAAGAGAGGTCCATGGACAGCTGAAGAAGATTTTAAGCTCATGAATTACATTGCAAC
TCATGGAGAAGGTCGATGGAACTCTCTTTCTCGTTGTGCAGGACTCCAACGCACCGGTAA
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CCTCGAAGAACAACTCTTGATCCTCGAACTTCATTCCCGCTGGGGCAATCGATGGTCAAA
AATCGCGCAATACCTACCGGGAAGAACAGACAATGAGATCAAAAACTACTGGAGAACCCG
AGTGCAAAAACATGCGAAGCAGCTTAAATGCGACGTGAACAGTCAGCAATTCAAAGACAC
AATGAAGTACTTGTGGATGCCACGGCTCGTCGAGAGGATCCAATCTGCCTCGGCCGCAGC
CACCGTAGCCACGTCCACCAACACCACTACCACGACAGGATCTGCCGCTACATCATCTAG
CAACACAACCTCTAACAATCAATTCATGACGTATGATTACAATAACAACAGCTTGGGACA
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TCCGATATCAGACTTGACGGAGTACTACAGCGCTCCAAACCCGTACCCGGAATACTATTC
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GGATAATTATTATGATTATCCTGGATTATTTGACGAAAATTTACCGGGTATGCAGGAGCA
GAGTAATCTGAACTGGTTTGAAGATTTTAATGGAGTTACTTTTTCTTCGGACAGTTTATG
GAACATTGGAGAAATTAATGAAGACTTATGGTTCTTACAGGCGCAACAACAGTTCAACAA
TAATGGCAACTTCTGATTTCTGAATACAATATAAAAAGTTAGAATCGTAAAGTATTTAAT
TAAACAGGAAGTATACGTGTGAAAGACATTTGTTGAAGGGGAATAATTAAAAGATAAGGA
ATGTGTTTACGATATTATATTAGGATATATGATCAGCTTTTTTGTTGCAAGCTTGATCAT
ATATCATGGCGTTTCAACAAAACGCTCAATTTGATTGGTTTTGCTTTTTGGGATTGTAAT
GATATTTTCTAGATAATCGATAATGGATGACAATTATTTTATAC


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TC

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DS 



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BQ
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AF RR4BA60TF U 1
AF RR4BA60JQ C 632
BS 1 767 RR4BA60TF
BS 768 1456 RR4BA60JQ

RD RR4BA60TF 767 0 0
GTCATCGTTGTAATCGCTTTTTCTTCTTTCTCATCTGGACCCTCGATAATCCCCAAGAAA
GGTCTTGTCTTTTTGGTTTAGATTTGTTCTGCGTTAAACGAAGAAGAAGATAAAAAAATT
TCTCGATTTTTTTTTCCAGATGATGAAGAGAATCTAAGTTGTGGTTGGTGTTAAAGGATG
TGGAAACAGATTCTAAGTAAGCTTCCCAACAACAAAAAGTCTTCAAAGAACGAACATCAT
CATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCGACGCTTTAGACCTCGAGGAGGA
AGAGCCTTCGATGGATCTCGCCTGGCCTCACTTGCAGCTCGTCTACGAGCTTTTCCTGAG
GTTCGTTGCTTCTCCTGAGACTGACACCAAACTGGCCAAAAGATACATAGACCAATCCTT
CGTCCTGAGGCTACTAGACTTGTCCGACTCCGAGGATCCTAGAGAGAGAGACTGCCTCAA
AACAATCCTCCACCGGATCTACGGCAAATTCATGGTCCACCGTCCTTTCATCAGGAAGTC
AATAAACAACATCTTCTACAGGTTTGTCTTCGAGACAGAGAAACACAACGGCATCGCCGA
GTTTCTTGAAATCTTGGGAAGTATAATCAACGGTTTCGCTCTTCCTTTGAAAGAAGAGCA
CAAAGTGTTTCTGGTTCGGGTTTTGATACCGCTCCACAAACCCAAGTGCTTGCAGATGTA
TCACCAGCAACTGTCTTATTGCATCACGCAGTTTGTGGAGAACGATT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BA60JQ 825 0 0
GGTTTCGCTCTTCCTTTGAAAGAAGAGCACAAAGTGTTTCTGGTTCGGGTTTTGATACCG
CTCCACAAACCCAAGTGCTTGCAGATGTATCACCAGCAACTGTCTTATTGCATCACGCAG
TTTGTGGAGAAGGATTGCAAACTCGCTGATACGGTTATAAGAGGGCTGCTCAAGTACTGG
CCCGTGACGAATAGTTCTAAAGAAGTCATGTTTCTGAATGAGTTGGAGGAAGTGCTTGAA
GCGACACAGCCTCCGGAGTTCCAACGGTGTATGGTGCCGCTGTTTCGCCAGATAGCTCGG
TGTTTGAACAGTCTGCATTTTCAGGTTGCAGAGAGAGCTTTATTCTTATGGAACAACAAT
CACATAGAGAATCTGATAATGCAGAGCCGCAAAGTCATTCTCCCAATTATATTCCCTGCG
TTGGAGAGAAACGCACAGAAACATTGGAACCAGGCTGTTCATAGCTTGACGCTAAACGTG
AGGAAGATATTCCAAGACCTGGACCCTGAGCTGTTCAAGGAATGCCTCGCTAAGTTCAAA
GAAGATGAATCAAAGGAAGGTGAGACCAAGGCCAAACGTGAAGCCACTTGGAAACGGTTG
GAAGAAGTTGGAATGCGAAAAGGGTAAATGAGGTCTTAGAGCTATAGAGAAGCATTGAAG
AAAAGTTTCAATATTTGGTCTCTTCTTCTTCCAAGTTCCCATTATTATTATTATTATTAT
TATTTTTTGTTTCCTGTAAAATCTTCTTGTTAATGGTTTTTCTTTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGCTACATTGTTGTCTATGTTCCACGTTCTTGAGACTGTCAT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGAGAAGAGTAACTGTAGTTTTGAAGATATGCAGGGCAAAAAAACATGTCTTCACAGAA
CATACCAACTCATAATAAGAGTTCACACAATAACTTCAAAATAGTTCAGGATCGATGAGA
CAATCATGAACTGTGTCATCATCACCAGAAGCAGAGGAGATAGATAGCTTGACCAAACCC
CTGCCTGATCAAAGGAGCAGCAGCTAATAGAAGTCGAAGGGCATTCAGGAAACAAAGGGG
AATGAGAAAATAGGGAAACAACAAGAAGGGAACCAGAGTTTAGGGTTTTAGATGGAGGAA
AAAACATCATCATAGCAATGTAGCTCAAGGTTTGATGACAAGAAATGTTGCAAAGAGCTT
TGGTAGAACATTTATATGTCGGGTCGTGCTGGTATATATTGATTAACAATTCCTCCAATC
ATCAATCATCGTCATCATCAAACGAGTCGTCATCATCATCATCATCAACTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D674JQ U 115
AF RR4D674TF C 1
BS 1 114 RR4D674TF
BS 115 259 RR4D674JQ
BS 260 476 RR4D674TF

RD RR4D674JQ 145 0 0
ATGAGACAATCATGAACTGTGTCATCATCACCAGAAGCAGAGGAGATAGATAGCTTGACC
AAACCCCTGCCTGATCAAAGGAGCAGCAGCTAATAGAAGTCGAAGGGCATTCAGGAAACA
AAGGGGAATGAGAAAATAGGGAAAC

QA 1 145 1 145
DS 

RD RR4D674TF 476 0 0
GGGAGAAGAGTAACTGTAGTTTTGAAGATATGCAGGGCAAAAAAACATGTCTTCACAGAA
CATACCAACTCATAATAAGAGTTCACACAATAACTTCAAAATAGTTCAGGATCGATGAGA
CAATCATGAACTGTGTCATCATCACCAGAAGCAGAGGAGATAGATAGCTTGACCAAACCC
CTGCCTGATCAAAGGAGCAGCAGCTAATAGAAGTCGAAGGGCATTCAGGAAACAAAGGGG
AATGAGAAAATAGGGAAACAACAAGAAGGGAACCAGAGTTTAGGGTTTTAGATGGAGGAA
AAAACATCATCATAGCAATGTAGCTCAAGGTTTGATGACAAGAAATGTTGCAAAGAGCTT
TGGTAGAACATTTATATGTCGGGTCGTGCTGGTATATATTGATTAACAATTCCTCCAATC
ATCAATCATCGTCATCATCAAACGAGTCGTCATCATCATCATCATCAACTTCATCC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

CO CL6018Contig1 797 2 7 U
CAATGTTTTCGTTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTATCTGCTGGTGGCCAAG
AGTTGGCACAAGAATCCCCCCGGATTTACTGGTTGTCTATCGTTTTTCTTGGTTTCGATG
TGTTCTTCGTTGTCTTCTGTGTTGCCTTGGCCTGCGTTATTGGCATTGCTGTTTGCTGTT
GCCTCCCATGCATCATTGCGGTTTTATACGCTGTTGCGGATCAGGAAGGGGCTTCAAAAG
AAGATATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGTAAAGTTGGTGATGTTAACAAACATG
CTGGTGATGAAGCTCAAGGAAACACCGAGGGAGTAATGACAGAGTGTGGTACAGATTCAC
CCGTTGAACATACTATTCTGCAGGAGGATGCAGAATGCTGCATCTGTCTCTGTGCATATG
AAGACGGAAGCGAACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCACCATTTCCACTGCTCATGTGTAG
ACAAGTGGCTATACATCAACGCTACTTGCCCGCTCTGCAAATACGACATCCTCAAGAGTA
GCAACTTGGATCATGAGGAAGTTTAGAGGAGACTGCTTTTACTTATTCATGACCCCCCCC
CACACAACATTTGACAGGAAACTTGGGGTCCAAAGGAAAAAAACACCAGTGTTTTTTTCT
ATATATATGATGCGTTGTCTGTCATATGATATCTATACAAATTATTATACTTTTGTTTTT
ATTTTTTGGTTTGGAAAGGAATCAGGTCTGTACATGTATATCTATCTTACTTTCATTTGC
AAACACTCTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK39TF U 267
AF RR4BK39JQ C 1
BS 1 266 RR4BK39JQ
BS 267 318 RR4BK39TF
BS 319 319 RR4BK39JQ
BS 320 383 RR4BK39TF
BS 384 384 RR4BK39JQ
BS 385 420 RR4BK39TF
BS 421 797 RR4BK39JQ

RD RR4BK39TF 154 0 0
AAGTTTCGTAAAGTTGGTGATGTTAACAAACATGCTGGTGATGAAGCTCAAG*AAACACC
GAGGGAGTAATGACAGAGTGTGGTACAGATTCACCCGTTGAACATACTATTCTGCAG*AG
GATGCAGAATGCTGCATCTGTCTCTGTGCATATG

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR4BK39JQ 797 0 0
CAATGTTTTCGTTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTATCTGCTGGTGGCCAAG
AGTTGGCACAAGAATCCCCCCGGATTTACTGGTTGTCTATCGTTTTTCTTGGTTTCGATG
TGTTCTTCGTTGTCTTCTGTGTTGCCTTGGCCTGCGTTATTGGCATTGCTGTTTGCTGTT
GCCTCCCATGCATCATTGCGGTTTTATACGCTGTTGCGGATCAGGAAGGGGCTTCAAAAG
AAGATATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGTAAAGTTGGTGATGTTAACAAACATG
CTGGTGATGAAGCTCAAGGAAACACCGAGGGAGTAATGACAGAGTGTGGTACAGATTCAC
CCGTTGAACATACTATTCTGCAGGAGGATGCAGAATGCTGCATCTGTCTCTGTGCATATG
AAGACGGAAGCGAACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCACCATTTCCACTGCTCATGTGTAG
ACAAGTGGCTATACATCAACGCTACTTGCCCGCTCTGCAAATACGACATCCTCAAGAGTA
GCAACTTGGATCATGAGGAAGTTTAGAGGAGACTGCTTTTACTTATTCATGACCCCCCCC
CACACAACATTTGACAGGAAACTTGGGGTCCAAAGGAAAAAAACACCAGTGTTTTTTTCT
ATATATATGATGCGTTGTCTGTCATATGATATCTATACAAATTATTATACTTTTGTTTTT
ATTTTTTGGTTTGGAAAGGAATCAGGTCTGTACATGTATATCTATCTTACTTTCATTTGC
AAACACTCTTTTGTGTT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL6019Contig1 1080 2 2 U
CGAGTGTTGTCGGAGATGAAGATAGGGGCGGTTCGGGAGAGTTGGCTGGTACGGACTCCG
GTAACTCCTCCGGCGGTTCACGCCTTAATTCGCCGGAATGAAAAGCCGCAGCAGCTCGGG
TTTGCTCTCTCGAAGAGGTTGTCTCGTGGTGTGGTTATGGAGGTTCAGGGAGGGAGAGGA
TATGAGTCTCCATGGGATGAGAAACCTTACGAAACTCTTCCCACTGGGAAAAAGGTTTAC
GTTGACGAATCAGATGTTGTCACGTTTCTTGATCCTCCCAAGGAGTTGATTCCATTGGAT
CCTTCTTCATATAACCCAGCTGCTTATCTCTGGAAAAAGATTGAAGATATCCCTGAAGAG
AGGCGCCACCGCTTGCTGCAATTTCTAGAGCCAAGGCTTATATCAAGAGCGTGGGAAATA
GCAGGCTCTCGTTATGAAGATTCGAAATTAGCTAAAATGGCTGCATCAAAGTTGTTCACT
ACTGGAGGAGATGCGGAAGTGTCACTTGAATACTTTAACTGCCGAACAAGTAATGGTCCA
CTAATCATATCCTGGATAAAGTCCTTCAAGATGGCTGTGTTTTCCTCCAACAACGGCCAA
ATCTATGGGCCTGTTTGTGGTGGACCGATAGTCTCAACCCTTGCCAATGCTTTCAGCCCG
TTATACTTTGAGGTCACAGAAGCTATGGAAGTTATGGCCACAGAAGAACCCTGCGACATA
GCCTGCAGATTTGGTGATGGGCTTCTTGATATCGAAGATTACCCACAAGGGTTTCCTCGA
CCAGCCAAGCATCCGTATCCGTTCAACGACAGTGTTGTCATATACATACGACATATAGGT
CCTGGTGTATGCGTAGGACAGGCATGGCAAGAAGGTAAAGAACTGCAACAAGTTCCTCAA
AGATTATGTTCCGACGTTCTTATGGTCAAACAGTACAGTTGAATTTTAAGGAGGCTTCTT
TTTTTGTTAATTTTAGATTGCAAAACTGTTTCATGGTTGCTTGAAGAGCCTCTTTTTATT
TCTGACAAAATAACTTGTATAAGAAGCTTTATCTTTGCGGTATAAAAGCAGAGGATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CB10TF U 1
AF RR4CB10JQ C 387
BS 1 532 RR4CB10TF
BS 533 1080 RR4CB10JQ

RD RR4CB10TF 532 0 0
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GTAACTCCTCCGGCGGTTCACGCCTTAATTCGCCGGAATGAAAAGCCGCAGCAGCTCGGG
TTTGCTCTCTCGAAGAGGTTGTCTCGTGGTGTGGTTATGGAGGTTCAGGGAGGGAGAGGA
TATGAGTCTCCATGGGATGAGAAACCTTACGAAACTCTTCCCACTGGGAAAAAGGTTTAC
GTTGACGAATCAGATGTTGTCACGTTTCTTGATCCTCCCAAGGAGTTGATTCCATTGGAT
CCTTCTTCATATAACCCAGCTGCTTATCTCTGGAAAAAGATTGAAGATATCCCTGAAGAG
AGGCGCCACCGCTTGCTGCAATTTCTAGAGCCAAGGCTTATATCAAGAGCGTGGGAAATA
GCAGGCTCTCGTTATGAAGATTCGAAATTAGCTAAAATGGCTGCATCAAAGTTGTTCACT
ACTGGAGGAGATGCGGAAGTGTCACTTGAATACTTTAACTGCCGAACAAGTA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4CB10JQ 694 0 0
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ATTAGCTAAAATGGCTGCATCAAAGTTGTTCACTACTGGAGGAGATGCGGAAGTGTCACT
TGAATACTTTAACTGCCGAACAAGTAATGGTCCACTAATCATATCCTGGATAAAGTCCTT
CAAGATGGCTGTGTTTTCCTCCAACAACGGCCAAATCTATGGGCCTGTTTGTGGTGGACC
GATAGTCTCAACCCTTGCCAATGCTTTCAGCCCGTTATACTTTGAGGTCACAGAAGCTAT
GGAAGTTATGGCCACAGAAGAACCCTGCGACATAGCCTGCAGATTTGGTGATGGGCTTCT
TGATATCGAAGATTACCCACAAGGGTTTCCTCGACCAGCCAAGCATCCGTATCCGTTCAA
CGACAGTGTTGTCATATACATACGACATATAGGTCCTGGTGTATGCGTAGGACAGGCATG
GCAAGAAGGTAAAGAACTGCAACAAGTTCCTCAAAGATTATGTTCCGACGTTCTTATGGT
CAAACAGTACAGTTGAATTTTAAGGAGGCTTCTTTTTTTGTTAATTTTAGATTGCAAAAC
TGTTTCATGGTTGCTTGAAGAGCCTCTTTTTATTTCTGACAAAATAACTTGTATAAGAAG
CTTTATCTTTGCGGTATAAAAGCAGAGGATTTAC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6020Contig1 1107 2 2 U
GTAATACAGAACTAAAGTTATACTGTTGTCGGTTGCTCAAATAAAAAGAAGAAGTTATAC
TGTCGTCGATTTGTTTAAAAATGCATGGGGGTATGATTCTAAAATCAATTAAAGTTGCAG
CCATTATTTAGATTAGATAGATAAAGATTACGGTGTATATTAGGACACGTGTCGACGCCA
CTCTTAACTTTTTCCCTACTTTTTGCAGCCCAAATGTCTATCGTCCACGATTAGACCTTG
AAGTCGGCTTGATTATAAACATTAGCCAACTTTCTTTTTTTTTTGTGAAAAACATTAGCC
AACATTTCCCTAGTTGCTTTAGTTTAGTTTTGATCTGCTACTAGTCTACTATGTAATTTC
TGTCACAAAAAAAAATTGGTATAAAACTTAACATTTTACCAAATAAATTATTAAAATGTT
TTTAGGTTACATTTGTTATAATTTGTTCCTGTCTTGAATTATGTCATGTGGTCAGTGGTT
ATAATACATAGTTAAGTTTTCGTATGCGTTGAAGTTAGGGAGAAAAAGGCCCTATTATGT
TGCTAGTGCTACATCTGTATAATTTAGCAACGTGCATGAAACAAAACAAACAAAAAAGTT
AATACACAAAGATCAATTGTTTTTCAGAACAAGTACAAATGTAGTTCATACGATCAGCCA
TAATCAACAGAAACATATTACACACAACAACAGTTTGACTACAACTGCTGAGTACTGAAG
AATCTATCCACAAAAAAGTTTATTTGAGTTTTTCTGTAACTTTGTAATTTTATTTCTTTT
GATAAAGACTGTAATTTTATTGGCCGTCTCTTTTGATCTTTTCTCTTTGGAGAAAAGAAA
AGAAAGATAAAAAGTGTAATAAAAATCTGATTTTGATCTTTAGATATTTTAGTTACGAGA
ACTTTTGTACCTTTTGCATGATCTTGTAATTTTATGACAGATGGAAAAACAAGAACTAGA
ATTCAACAATTCGAAAAATTTAGGTTGATGATAAGATGCTTTATTATGCATGATATATTC
ACATATAAGAAATATATAAAAATAAAATATAAGCGAAAGAAAAATCTTAATATTGAATAT
AATGATTGAAACATATTGTCCTTAAAA


BQ
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AF RR4C233TF U 1
AF RR4C233JQ C 563
BS 1 703 RR4C233TF
BS 704 1107 RR4C233JQ

RD RR4C233TF 711 0 0
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CCATTATTTAGATTAGATAGATAAAGATTACGGTGTATATTAGGACACGTGTCGACGCCA
CTCTTAACTTTTTCCCTACTTTTTGCAGCCCAAATGTCTATCGTCCACGATTAGACCTTG
AAGTCGGCTTGATTATAAACATTAGCCAACTTTCTTTTTTTTTTGTGAAAAACATTAGCC
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TGTCACAAAAAAAAATTGGTATAAAACTTAACATTTTACCAAATAAATTATTAAAATGTT
TTTAGGTTACATTTGTTATAATTTGTTCCTGTCTTGAATTATGTCATGTGGTCAGTGGTT
ATAATACATAGTTAAGTTTTCGTATGCGTTGAAGTTAGGGAGAAAAAGGCCCTATTATGT
TGCTAGTGCTACATCTGTATAATTTAGCAACGTGCATGAAACAAAACAAACAAAAAAGTT
AATACACAAAGATCAATTGTTTTTCAGAACAAGTACAAATGTAGTTCATACGATCAGCCA
TAATCAACAGAAACATATTACACACAACAACAGTTTGACTACA
CTGCTGAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4C233JQ 545 0 0
TTTAGCAACGTGCATGAAACAAAACAAACAAAAAAGTTAATACACAAAGATCAATTGTTT
TTCAGAACAAGTACAAATGTAGTTCATACGATCAGCCATAATCAACAGAAACATATTACA
CACAACAACAGTTTGACTACAACTGCTGAGTACTGAAGAATCTATCCACAAAAAAGTTTA
TTTGAGTTTTTCTGTAACTTTGTAATTTTATTTCTTTTGATAAAGACTGTAATTTTATTG
GCCGTCTCTTTTGATCTTTTCTCTTTGGAGAAAAGAAAAGAAAGATAAAAAGTGTAATAA
AAATCTGATTTTGATCTTTAGATATTTTAGTTACGAGAACTTTTGTACCTTTTGCATGAT
CTTGTAATTTTATGACAGATGGAAAAACAAGAACTAGAATTCAACAATTCGAAAAATTTA
GGTTGATGATAAGATGCTTTATTATGCATGATATATTCACATATAAGAAATATATAAAAA
TAAAATATAAGCGAAAGAAAAATCTTAATATTGAATATAATGATTGAAACATATTGTCCT
TAAAA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL6021Contig1 558 2 4 U
GAGGAAGGGATAAGCAACAATGATGGTTCTGATGATCTGATGGCATACCTGAACAACGCC
TTGTGGGAGTCTCCGTTGGAAGTGGAAGCTATGCTTGGCGTAGATGCTGCTGCTGCTGCT
GCTATGACTCAGGAAGAGGCAAACCCAATGGACCTATGGAGCTTAGATGATATCAACTCC
ATGCTGGATGGTGGTGTCTTCTGAAGTGAGTGGTGGGTTGCCTAGTTTGTAAATAAAGCT
GTGTGTTGGGTTTTGCTGTTGGGGGGAATGGTACAAGGCACACCTGGAGCTTTATCGTTG
TCTTATGAGTCTCTTTGCCATAGAGAGTGTCTCTTTTAAATTCCTGAAATAAAAGGGGGT
GTGGAAGTATATAGAGTATATTATTATAATTTCTATCCAATGACTCTCTTCCTTGAGTTT
TTTTTTTTCGTATTTTTATGACAATTTATTAATGTTTTAAAAACTCTTTTTGGATTTTTC
TTTTATAGTGTATCATCATCACCCTCTGAAGTGTTTGTTTTGTACCCCAAAAAACTTATA
TAGAACTGTTTGGAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D011JQ C 1
AF RR4CP15TF U 353
BS 1 362 RR4D011JQ
BS 363 428 RR4CP15TF
BS 429 429 RR4D011JQ
BS 430 558 RR4CP15TF

RD RR4D011JQ 520 0 0
GAGGAAGGGATAAGCAACAATGATGGTTCTGATGATCTGATGGCATACCTGAACAACGCC
TTGTGGGAGTCTCCGTTGGAAGTGGAAGCTATGCTTGGCGTAGATGCTGCTGCTGCTGCT
GCTATGACTCAGGAAGAGGCAAACCCAATGGACCTATGGAGCTTAGATGATATCAACTCC
ATGCTGGATGGTGGTGTCTTCTGAAGTGAGTGGTGGGTTGCCTAGTTTGTAAATAAAGCT
GTGTGTTGGGTTTTGCTGTTGGGGGGAATGGTACAAGGCACACCTGGAGCTTTATCGTTG
TCTTATGAGTCTCTTTGCCATAGAGAGTGTCTCTTTTAAATTCCTGAAATAAAAGGGGGT
GTGGAAGTATATAGAGTATATTATTATAATTTCTATCCAATGACTCT**TCCTTGAGTTT
TTTTTTTTCGTATTTTTATGACAATTTATTAATGTTTTAAAAACTCTTTTTGGATTTTTC
TTTTATAGTGTATCATCATCACCCTCTGAAGTGTTTGTTT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4CP15TF 206 0 0
CAGGAAGTGA
GGAAGTATATAGAGTATATTATTATAATTTCTATCCAATGACTCTCTTCCTTGAGTTTTT
TTTTTTTGTATTTTTATGACAATTTATTAATGTTTTAAAAACTCTTTTTGGATTTTTCTT
TTATAGTGTATCATCATCACCCTCTGAAGTGTTTGTTTTGTACCCCAAAAAACTTATATA
GAACTGTTTGGAACCT

QA 11 206 11 206
DS 



AS 1 2

CO CL6022Contig1 288 2 3 U
CACAATGTCAACAGAAACTCTCATCAAACAAAGTGTACAAAGCATCTTCGAAACTGCTTA
AAATGAGAAATGTCTTAGAGAGTGGGAGCTCTCTCAGCAGTTCCAGCGATGACGGTAAGC
AAATTGTTTCCAAAAGGATCACTTAAATGCTTTGAAAGGTTCTCAACAGGACCTTCTCCG
GTAACATAAGCTTGGATGAAAAAAGCGAACATGGAAAACATGGCTAATCCCCCGTTCTTG
ATCTCCTTAACCTTGAGAAGAGCTGCTTGTTCAGGGTCTTTTGCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B801TF C 1
AF RR4B801JQ U 97
BS 1 97 RR4B801TF
BS 98 255 RR4B801JQ
BS 256 288 RR4B801TF

RD RR4B801TF 288 0 0
CACAATGTCAACAGAAACTCTCATCAAACAAAGTGTACAAAGCATCTTCGAAACTGCTTA
AAATGAGAAATGTCTTAGAGAGTGGGAGCTCTCTCAGCAGTTCCAGCGATGACGGTAAGC
AAATTGTTTCCGAAAGGATCACTTAGATGCTTTGAAAGGTTCTCAACAGGACCTTCTCCG
GTAACATAAGCTTGGATGAAGAAAGCGAACATGGAAAACATGGCTAATCTCCCGTTCTTG
ATCTCCTTAACCTTGAGAAGAGCTGCTTGTTCAGGGTCTTTTGCTTGC

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR4B801JQ 159 0 0
C
CAGTTCCAGCGATGACGGTAAGCAAATTGTTTCCAAAAGGATCACTTAAATGCTTTGAAA
GGTTCTCAACAGGACCTTCTCCGGTAACATAAGCTTGGATGAAAAAAGCGAACATGGAAA
ACATGGCTAATCCCCCGTTCTTGATCTCCTTAACCTTG

QA 2 159 2 159
DS 



AS 1 2

CO CL6023Contig1 1365 2 8 U
GGGAGAAAAGCCAATGCAAAAGGAAGAAGAAGAAGCTAAACCTCTCTCTATCTCTGTTCA
TGGCGCTTTCAGGAACTTTGCAGCTTACTTCTAATTACATTCCTGGTTATGGAGTTTCAG
ACAGCAGCAGGAGCTTCTCTAACTCTGTTGTCTCTAGAAAAACACTTGATGTATTACCTT
TCTCTTCCTGTCTGGTTCGCATCGAGAATGGAGGATATGCCGCCCCTAAGAGAGTTTCTT
TTGTGTGCCGAGCAAGTTCTTCTGGCCATAGGAGAAACAATCCTGATTTCTCAAGAAACA
ATAGGAATGGTTTCAGAGGTAATAGGAACAGGCGGAACGAAGATAGAGACGGTTTAGACG
GTGGTGGTGGTGGTCTTGAAACTCTGAGATGCTGTCTTCCAAGAATGGTCCTGTGTTCTC
CCTATCTAGTTCCCCGAAGTTCCAGGCGACTTCATCACCTGGACCAAGAGAGAAAGAGAT
AGTTGATCTTTTCAGGAAAGTCCAAGCTCAGCTCCGAGCTCGAGCTGCTGCTAAGAAAGA
AGATAAGAAGACTGAAGAAGCTTCTAAAGGACAGGGAGGAAAAGAGACTGAGACTGTGGA
CTCTCTTCTTAAGTTACTGAGGAAGCACTCACGAGAACAGAGCAAGAAGAACGTTAGCAA
CTTTGATTCTGAAAAGCAGCTACAAGGAGATGATCATGATGATGATGATGATGATGCTGA
AAGACAGGTTCACAGTTCCAATCATTTTGATTCGCGAAACAGGGATCATAATGCAACACG
TTTTACCAGGCCAGCCTCAAGCTTCAGGCGCAATTCACCTGTACCGAGACATAAGCCTCA
GTCCAGCTACTCTAGTGAGGCCATTTTTGATGAGGCGTCAAGTTACAGTGTGACTTGGAC
TCAGAAAAAGGATCAAGTGGATTCACGTGATGAACCTGAATACGAGCCCGAGCCTGTTTA
TGAACCTGAATCTGAACCAGGACTTGGCCTTCTCGAATCAGAGCCAGAGCTGAAACCAGA
GTCATTTTACCATGAGGAGGATGAGGATCATGATGTCATTGTAGATGAATTAGCAGTTGA
TGAAGATGATGATGATGCTGAGTCTATCAATGCTGAGGAAGAAACTGAGAAAGATGAAGA
CTTGAGTGCACTGAAGTTGATAGAACTTAGAGCCATAGCAAAATCAAGGGGTCTTAAAGG
GATTTCAAAGATGAAGAAAGCAGAGCTGTTGAATTTGCTGTGTAGTAATAAAGCATGATG
ATAGGAATGAACAAGAACACTGTTTTAGTTTTTCTGATACAGCCAATCAATCTCCAAATA
TTTGTTTCATTCATAATTTTAGTGCATTCTGATTATTTCTCCATC


BQ
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AF RR4FQ54TF U 1
AF RR4FQ54JQ C 553
BS 1 650 RR4FQ54TF
BS 651 651 RR4FQ54JQ
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BS 722 1365 RR4FQ54JQ

RD RR4FQ54TF 722 0 0
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TGGCGCTTTCAGGAACTTTGCAGCTTACTTCTAATTACATTCCTGGTTATGGAGTTTCAG
ACAGCAGCAGGAGCTTCTCTAACTCTGTTGTCTCTAGAAAAACACTTGATGTATTACCTT
TCTCTTCCTGTCTGGTTCGCATCGAGAATGGAGGATATGCCGCCCCTAAGAGAGTTTCTT
TTGTGTGCCGAGCAAGTTCTTCTGGCCATAGGAGAAACAATCCTGATTTCTCAAGAAACA
ATAGGAATGGTTTCAGAGGTAATAGGAACAGGCGGAACGAAGATAGAGACGGTTTAGACG
GTGGTGGTGGTGGTCTTGAAACTCTGAGATGCTGTCTTCCAAGAATGGTCCTGTGTTCTC
CCTATCTAGTTCCCCGAAGTTCCAGGCGACTTCATCACCTGGACCAAGAGAGAAAGAGAT
AGTTGATCTTTTCAGGAAAGTCCAAGCTCAGCTCCGAGCTCGAGCTGCTGCTAAGAAAGA
AGATAAGAAGACTGAAGAAGCTTCTAAAGGACAGGGAGGAAAAGAGACTGAGACTGTGGA
CTCTCTTCTTAAGTTACTGAGGAAGCACTCACGAGAACAGAGCAAGAAGA*CGTTAGCAA
CTTTGATTCTGAAA*GCAGCTACAAG*AGATGATCATGATGATGATGATGATGATGCTGA
A
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FQ54JQ 813 0 0
TGAAGAAGCT*CTAAAGGACAGG*AGGAAAAGAGACTGAGACTGTGGACTCTCTTCTTAA
GTTACTGAGGAAGCACTCAGGAGAACAGAGCAAGAAGAACGTTAGCAACTTTGATTCTGA
AAAGCAGCTACAAGGAGATGATCATGATGATGATGATGATGATGCTGAAAGACAGGTTCA
CAGTTCCAATCATTTTGATTCGCGAAACAGGGATCATAATGCAACACGTTTTACCAGGCC
AGCCTCAAGCTTCAGGCGCAATTCACCTGTACCGAGACATAAGCCTCAGTCCAGCTACTC
TAGTGAGGCCATTTTTGATGAGGCGTCAAGTTACAGTGTGACTTGGACTCAGAAAAAGGA
TCAAGTGGATTCACGTGATGAACCTGAATACGAGCCCGAGCCTGTTTATGAACCTGAATC
TGAACCAGGACTTGGCCTTCTCGAATCAGAGCCAGAGCTGAAACCAGAGTCATTTTACCA
TGAGGAGGATGAGGATCATGATGTCATTGTAGATGAATTAGCAGTTGATGAAGATGATGA
TGATGCTGAGTCTATCAATGCTGAGGAAGAAACTGAGAAAGATGAAGACTTGAGTGCACT
GAAGTTGATAGAACTTAGAGCCATAGCAAAATCAAGGGGTCTTAAAGGGATTTCAAAGAT
GAAGAAAGCAGAGCTGTTGAATTTGCTGTGTAGTAATAAAGCATGATGATAGGAATGAAC
AAGAACACTGTTTTAGTTTTTCTGATACAGCCAATCAATCTCCAAATATTTGTTTCATTC
ATAATTTTAGTGCATTCTGATTATTTCTCCATC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6024Contig1 1319 2 4 U
GGAAGGAGTTCGTCATACCGATAACAGGGCCTCTTATTCGGATCATAGGAGATCGGTTTC
CATGGCAGGTCAAAAGCGCTATCTTGGCTACATTAATCATTCTAATACAAAGGGGTGGCA
TGGCGCTTAAGCCGTTCCTTCCTCAACTTCAAACAACATTCGTCAAGTGTCTACAAGACT
CTACAAGGACCATCCGTTCTAGTGCTGCGCTTGCCTTGGGGAAGCTTAGTGCATTAAGCA
CGAGGATTGACCCATTAGTTGGTGACCTGATGACTAGTTTCCTGGCTGCAGATTCAGGGG
TACGTGAGGCCATTCTATCTGCTATGAGAGGTGTAATAAAACATGCTGGGAAGAGCATTG
GGCCTGCTGTTAGAATACGCATTTTTGATCTCATTAAGGAACTAATGCACAATGATGATG
ACCAAGTTCGAATTTTTGCTACTAGCATTCTGGGTATCTTATCACAGTACCTAGAAGCTG
CACAACTCAGTGTTCTGCTTCAGGAAGTCATTTCTTTATCTGCTTCACAAAAATGGAGCT
CTAGGCATGGCTCAGTTCTCTGTATTGCATCCTTGCTGAAGCACAACCCTTCGACCATTA
TGACATCTTCACTCTTTACCGCATTGTTAAATTCTCTTAAGAGCTCTTTGAAGGACGAGA
AGTTTCCACTACGTGAAACCTCGACAAAGGCCTTGGGAAGGCTTTTACTACATCAACTTG
CAGTGGAGCCTTCCAGCACAGCAAGAGTGGTTATCGATGTCCTTTCATCGATAGTCTCAG
CTTTGCATGATGATTCGAGCGAGGTCCGAAGAAGAGCTCTCTCTTCACTTAAAGCTTTTG
CAAAAAACAACCCGGCAGCAACCAGTGACAATGTAAGTGTTATAGGGCCTCCGCTTGCTG
AATGTTTGAAAGATGGAAGCACACCAGTGAGACTTGCTGCAGAAAGATGTGCTATGCACG
TGTTCCAATTAACAAAGGGCGCAGAAAATGTTCAAGCAGCTCAGAAATATATCACAGGAT
TGGATGCCCGACGGTTATCCAAGTTGCCTGAACAAAGCGATGACGACGATAGTGAAGATG
ATAATGGGCGTGGGTAGGAGGAAACTTGTGTTCTCTCCTCTTCCACTTCTTAGAATAGGT
TCATTGGTTTTCCCTATACACATATTTCTGCAAAAGCATTATCCCGTGAGTTGCGGATGA
TACTTGATCTCGATTCCTTGGCTTGAGACTATAGTACTAGCAGTTACACCAATGATATAG
ACCATACCTTGTTTGGTTATCAATATTTGGGTTTTGGTGGAAATATATATCATTTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CW59TF U 1
AF RR4F629TF U 542
BS 1 617 RR4CW59TF
BS 618 618 RR4F629TF
BS 619 689 RR4CW59TF
BS 690 1319 RR4F629TF

RD RR4CW59TF 694 0 0
GGAAGGAGTTCGTCATACCGATAACAGGGCCTCTTATTCGGATCATAGGAGATCGGTTTC
CATGGCAGGTCAAAAGCGCTATCTTGGCTACATTAATCATTCTAATACAAAGGGGTGGCA
TGGCGCTTAAGCCGTTCCTTCCTCAACTTCAAACAACATTCGTCAAGTGTCTACAAGACT
CTACAAGGACCATCCGTTCTAGTGCTGCGCTTGCCTTGGGGAAGCTTAGTGCATTAAGCA
CGAGGATTGACCCATTAGTTGGTGACCTGATGACTAGTTTCCTGGCTGCAGATTCAGGGG
TACGTGAGGCCATTCTATCTGCTATGAGAGGTGTAATAAAACATGCTGGGAAGAGCATTG
GGCCTGCTGTTAGAATACGCATTTTTGATCTCATTAAGGAACTAATGCACAATGATGATG
ACCAAGTTCGAATTTTTGCTACTAGCATTCTGGGTATCTTATCACAGTACCTAGAAGCTG
CACAACTCAGTGTTCTGCTTCAGGAAGTCATTTCTTTATCTGCTTCACAAAAATGGAGCT
CTAGGCATGGCTCAGTTCTCTGTATTGCATCCTTGCTGAAGCACAACCCTTCGACCATTA
TGACATCTTCACTCTTTTCCGCATTGTTAAATTCTCTTAAGAGCTCTTTGAAGGACGAGA
AGTTTCCACTACGTGAAACCTCGACAAAG
CCTTG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4F629TF 778 0 0
G
AGGCATGGCTCAGTTCTCTGTATTGCATCCTTGCTGAAGCACAACCCTTCGACCATTATG
ACATCTTCACTCTTTACCGCATTGTTAAATTCTCTTAAGAGCTCTTTGAAGGACGAGAAG
TTTCCACTACGTGAAACCTCGACAAAGGCCTTGGGAAGGCTTTTACTACATCAACTTGCA
GTGGAGCCTTCCAGCACAGCAAGAGTGGTTATCGATGTCCTTTCATCGATAGTCTCAGCT
TTGCATGATGATTCGAGCGAGGTCCGAAGAAGAGCTCTCTCTTCACTTAAAGCTTTTGCA
AAAAACAACCCGGCAGCAACCAGTGACAATGTAAGTGTTATAGGGCCTCCGCTTGCTGAA
TGTTTGAAAGATGGAAGCACACCAGTGAGACTTGCTGCAGAAAGATGTGCTATGCACGTG
TTCCAATTAACAAAGGGCGCAGAAAATGTTCAAGCAGCTCAGAAATATATCACAGGATTG
GATGCCCGACGGTTATCCAAGTTGCCTGAACAAAGCGATGACGACGATAGTGAAGATGAT
AATGGGCGTGGGTAGGAGGAAACTTGTGTTCTCTCCTCTTCCACTTCTTAGAATAGGTTC
ATTGGTTTTCCCTATACACATATTTCTGCAAAAGCATTATCCCGTGAGTTGCGGATGATA
CTTGATCTCGATTCCTTGGCTTGAGACTATAGTACTAGCAGTTACACCAATGATATAGAC
CATACCTTGTTTGGTTATCAATATTTGGGTTTTGGTGGAAATATATATCATTTTAGT

QA 2 778 2 778
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6026Contig1 1067 2 2 U
GGGGTTACGCTCATCCTCACGACTCTCTTGTTAGCTGCGACTGCGATGATCAAATTCTCA
ACTTTCGAAATTGCGAAATAATAATCAGAGTGTGACCCTTCACTCCATGACCATGGCGAT
CTCTCTTCTTCCCAGACCCTTCATCTCGCTCCGTACAAGCAAAAGCTTCAACCTTTCACC
CAGGGTTCTCTCCCTTAGGCTATCATGTTCTTCGAATATTCCAGAGAAGAGATCATTCGC
TGTTGCAACCGGTGAGAAGTTCATCGGACTCGCGTCGAGGCTTTTGAAAAGGTCCAATCA
ACGGACGCCTGAGGTCGATGATGATGGAGATAGAATAGGAGGAACAGTAATTGAAGATGA
GGTTGACCCAGCGATGATATGGGAACAAAGGGTTAAAGACGTAGAGGCTGAGAAAGAGAG
GAGGGTCATTACTACAAGCCCTGGTTTTAGCTTCTCTGCCGCTGGTCTCTTGTTCCCTTA
CCATCTTGGTGTTGCTCAGCTTCTCATCGAGAAGGGTTACATCAAGGACACTACTCCTTT
GGCAGGAGCTTCTGCTGGTGCTGTAGTCTGTGCTGTGATAACCTCAGGATCCTCTATGTG
GAAAGCCCTTGAAGCTACCAAGGTTCTTGCTGATGATTGTCGACGCAATGGCACTGCTTT
TCGCCTTGGGGCTGTCCTCAGAGAGTCTATGGAGAAATTACTCCCGGATGATATTCACAC
TAGGTGTAATGGCAGAGTTCGTGTTGCCGTCACACGGGTGTTATGGAGACCTAGAGGTTT
ACTTGTGGATCAATTCGACTCCAAAAGTGACCTTATAAATGCTGTTTTTACATCTTCCTT
TATTCCAGCAGAGGACGAGGTGTTGGATAAGTTGTTTGAGCTAGGATACGCGGATGCAGC
TACGTGGTCTGAGATGAATCCAGTGGAGGAACTGGTCTATGATGATACTCCTGCAGCTCA
AGCGATTCAAGCTAGTTAGTAAATACAAGAACTCAGTACTTAATTTGTTTTAACTAAAAA
CAGTATGTTTATTAATAGTTTTCCCACAAGGAGAGACTTCTGTACTC


BQ
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AF RR4F316TF U 1
AF RR4F316JQ C 435
BS 1 585 RR4F316TF
BS 586 1067 RR4F316JQ

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ACTTTCGAAATTGCGAAATAATAATCAGAGTGTGACCCTTCACTCCATGACCATGGCGAT
CTCTCTTCTTCCCAGACCCTTCATCTCGCTCCGTACAAGCAAAAGCTTCAACCTTTCACC
CAGGGTTCTCTCCCTTAGGCTATCATGTTCTTCGAATATTCCAGAGAAGAGATCATTCGC
TGTTGCAACCGGTGAGAAGTTCATCGGACTCGCGTCGAGGCTTTTGAAAAGGTCCAATCA
ACGGACGCCTGAGGTCGATGATGATGGAGATAGAATAGGAGGAACAGTAATTGAAGATGA
GGTTGACCCAGCGATGATATGGGAACAAAGGGTTAAAGACGTAGAGGCTGAGAAAGAGAG
GAGGGTCATTACTACAAGCCCTGGTTTTAGCTTCTCTGCCGCTGGTCTCTTGTTCCCTTA
CCATCTTGGTGTTGCTCAGCTTCTCATCGAGAAGGGTTACATCAAGGACACTACTCCTTT
GGCAGGAGCTTCTGCTGGTGCTGTAGTCTGTGCTGTGATAACCTC

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DS 

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CTCAGCTTCTCATCGAGAAGGGTTACATCAAGGACACTACTCCTTTGGCAGGAGCTTCTG
CTGGTGCTGTAGTCTGTGCTGTGATAACCTCAGGATCCTCTATGTGGAAAGCCCTTGAAG
CTACCAAGGTTCTTGCTGATGATTGTCGACGCAATGGCACTGCTTTTCGCCTTGGGGCTG
TCCTCAGAGAGTCTATGGAGAAATTACTCCCGGATGATATTCACACTAGGTGTAATGGCA
GAGTTCGTGTTGCCGTCACACGGGTGTTATGGAGACCTAGAGGTTTACTTGTGGATCAAT
TCGACTCCAAAAGTGACCTTATAAATGCTGTTTTTACATCTTCCTTTATTCCAGCAGAGG
ACGAGGTGTTGGATAAGTTGTTTGAGCTAGGATACGCGGATGCAGCTACGTGGTCTGAGA
TGAATCCAGTGGAGGAACTGGTCTATGATGATACTCCTGCAGCTCAAGCGATTCAAGCTA
GTTAGTAAATACAAGAACTCAGTACTTAATTTGTTTTAACTAAAAACAGTATGTTTATTA
ATAGTTTTCCCACAAGGAGAGACTTCTGTACTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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GGGCGTTTCTCTACTTCTGTCGACATTCCCTGTAATCCTCAGATGACAGCTTCAAGTTTC
TGTAACGCTTAGCCTCGAAAGGCTGAGACGTTGTCTTTACTTCTTTTATTAAATCAGTCC
TTCAATCTCTCTCACTACGATGAATTCAATTATCTCCTTCCCATAAATTCCATACGAAAT
CCCTAAAAAACATTCTATAAAATCGTCCAAGAAACCTTCAAATCAAGCAGCTTCAACAAA
ATATAATTTCTTTCTTACTACAGAACAACAACAATGGTCACTGAAGAATCTACTTCTCCC
ACTACGCGACTTAAACCACTCCTCCCACTACGTCACATTCAATTCACCTCTTCTTCTTCC
ATGGTTACTGAGAAATCTACTTCTCTGTATATAAGGATTTTTATTCGGTGCAATTCATCA
CCCTCTCCACCTCATTCCTTATTTCTGATATCAAACCCATGCTCCAACAATGGCAAACTC
CCACCTTCTCCTCTCACCTGAAATCTACTCAGACAGTTGCTGCATGTCTTCTTCGCTTTT
GGTAGGCCATTAATCTGGAGAAATAAGTAAGCTCATGGGAGGTGTACATGCTTCTCCTGG
ATAAAATGCAATTAGGAAGGCAACTGACAATGTGAGATATCAAGACATGGTTTCTCTACA
ATCAGGGCCGAACCGACACTGTCGGTGGAAAAAAGGAGTTCATGTCTAAAGCTAAAGAAT
ATTTCATTATGTTTCATAATCTATATCTTCTCTTTGATCATATTCACAATCAACTAACTT
GAGTATATATGTTCAGAAAACAGTAACAATGAGGAAAAAAGAAGGGCCAGCTGATTTTTA
AAACCCGACCTTCCAAAACTGATACTAGCCCAAGAATACATTAACAGCATCCAAACTTCT
TTGTCAGAGCTTCCTGAAACAAAGTACATGAGGTACGATGCCATGGGTCTAGGCATTCAA
GATGTGATTTTTCCTAACAGATGACACAAGTTGATGTGAAACAACTACTCAAGAATTGGT
GGAGCTGATAGCTGCAATAAAAGATGGAACAACTAACGGAAGATTGGCAAACGGATACTA
TTTGGGCTATTGGCCAAAAGTAGAACTATCCAAGTAACGAGAAAAGAAAACGTCTTGGTT
CAGAATTATTTTGTAGGTACATGTTAGTCACATCTTCACGCTTCATTGTACAATGTAGAT
TTCGGGTCATCTACAACAACAAAAAAATGGGTCCTTTGTATTCACTTTCAGCTTTCTTAT
GTTCTCTGAAACTAACAGTGAAGTCAACT


BQ
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AF RR4GJ08TF U 1
AF RR4GJ08JQ C 495
BS 1 661 RR4GJ08TF
BS 662 1289 RR4GJ08JQ

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CCCTAAAAAACATTCTATAAAATCGTCCAAGAAACCTTCAAATCAAGCAGCTTCAACAAA
ATATAATTTCTTTCTTACTACAGAACAACAACAATGGTCACTGAAGAATCTACTTCTCCC
ACTACGCGACTTAAACCACTCCTCCCACTACGTCACATTCAATTCACCTCTTCTTCTTCC
ATGGTTACTGAGAAATCTACTTCTCTGTATATAAGGATTTTTATTCGGTGCAATTCATCA
CCCTCTCCACCTCATTCCTTATTTCTGATATCAAACCCATGCTCCAACAATGGCAAACTC
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GGTAGGCCATTAATCTGGAGAAATAAGTAAGCTCATGGGAGGTGTACATGCTTCTCCTGG
ATAAAATGCAATTAGGAAGGCAACTGACAATGTGAGATATCAAGACATGGTTTCTCTACA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4GJ08JQ 795 0 0
CTCACTG
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AATAAGTAAGCTCATGGGAGGTGTACATGCTTCTCCTGGATAAAATGCAATTAGGAAGGC
AACTGACAATGTGAGATATCAAGACATGGTTTCTCTACAATCAGGGCCGAACCGACACTG
TCGGTGGAAAAAAGGAGTTCATGTCTAAAGCTAAAGAATATTTCATTATGTTTCATAATC
TATATCTTCTCTTTGATCATATTCACAATCAACTAACTTGAGTATATATGTTCAGAAAAC
AGTAACAATGAGGAAAAAAGAAGGGCCAGCTGATTTTTAAAACCCGACCTTCCAAAACTG
ATACTAGCCCAAGAATACATTAACAGCATCCAAACTTCTTTGTCAGAGCTTCCTGAAACA
AAGTACATGAGGTACGATGCCATGGGTCTAGGCATTCAAGATGTGATTTTTCCTAACAGA
TGACACAAGTTGATGTGAAACAACTACTCAAGAATTGGTGGAGCTGATAGCTGCAATAAA
AGATGGAACAACTAACGGAAGATTGGCAAACGGATACTATTTGGGCTATTGGCCAAAAGT
AGAACTATCCAAGTAACGAGAAAAGAAAACGTCTTGGTTCAGAATTATTTTGTAGGTACA
TGTTAGTCACATCTTCACGCTTCATTGTACAATGTAGATTTCGGGTCATCTACAACAACA
AAAAAATGGGTCCTTTGTATTCACTTTCAGCTTTCTTATGTTCTCTGAAACTAACAGTGA
AGTCAACT

QA 8 795 8 795
DS 



AS 1 2

CO CL6028Contig1 1176 2 4 U
GGAACCACAATCATGGAGTCTCTGGGAAGATTACAGCTCCATCACCAGCCATTTTTTCTT
TCCTTCACTCACACCTCTTCACCGTTCCCGAAACACCCAACATCTTCCCCCTTCAGACCA
CTAATCCGACCAAACTCCTCTTTCAAACAAGTTTCAATCAAAGCTTCCTCCTCCAAACTC
CAAAACCCTATCACCCCTCTCCAAAAGTCAATACCTTTCAGTCTCCTCAAATCCACATGC
ATCACTCTAACAACCGCAGCCGCCCTCCTCCTTGTCAACCTCCAGCTCAAACCTCCAGCG
ATTGCAGCTCCCGTCGCGCCTCCTCCGTCAACGGAAAGACAAGAACACGTCACCCTGGAA
GAAGAAGAGAGAGCCCTCGAAGAGCATCTAGCAACACACCCTCCTGACGTCGACTCTCTT
CGTTCCTTGATGGAGGTAAAGATCAGATCTCGTAAGCTCGAAGAAGCCATAGAAGTAGTC
GACCGTTTGATCAAACTAGAACCCGAGGAACCAGAATGGCCTGGCCTTAAAGCTAACATC
TTTACATACAGTGGAGAGATAGACTCAGCTAAAACTTCATTCGAAGAGATTCTTGCTAAA
GACCCTCTTCGTGTCGAAGCCTATCACGGCTTGGTCATGGCTTATTCAGATGCAGATCTC
GACTTGAGAGAGGTGGAGAGTAGAATCGAAGAAGCGATGCTGAGATGCAAGAAGGAGAAT
AATCACAACGATTTTCGAGACTTTAAGCTTCTTTTGGCGCAGATTCGTGTGATTGAAGGG
AAGCATGGTGAAGCGTTGAAGCTTTATGGAGAGCTTGTGAAAGAAGAGCCAGGAGATTTC
AGACCGTATTTCTGTCAAGGAGTTATATACACGTTGCTGAAGAAGAAAGACAAAGCAGAG
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ATGGATAATATGATTGCTACCAAGCTTTTTTCAGAGAAGACTCAGCGTGAGATGGCTGGA
TCAGAGAGTTGATTTATGTGTGTAATGTTTTGGTAAATCACATTGAGATGAATAATGTTT
AGTTGATTTTGATGTTTTATGTCTGTTTAGTTGGTTTATATATAAGGACACCATTAGTTG
ACATTTGGATTTGATTTATTTTCCGATTTGAATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FG34TF U 1
AF RR4FG34JQ C 619
BS 1 714 RR4FG34TF
BS 715 715 RR4FG34JQ
BS 716 781 RR4FG34TF
BS 782 1176 RR4FG34JQ

RD RR4FG34TF 786 0 0
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TCCTTCACTCACACCTCTTCACCGTTCCCGAAACACCCAACATCTTCCCCCTTCAGACCA
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CAAAACCCTATCACCCCTCTCCAAAAGTCAATACCTTTCAGTCTCCTCAAATCCACATGC
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ATTGCAGCTCCCGTCGCGCCTCCTCCGTCAACGGAAAGACAAGAACACGTCACCCTGGAA
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CGTTCCTTGATGGAGGTAAAGATCAGATCTCGTAAGCTCGAAGAAGCCATAGAAGTAGTC
GACCGTTTGATCAAACTAGAACCCGAGGAACCAGAATGGCCTGGCCTTAAAGCTAACATC
TTTACATACAGTGGAGAGATAGACTCAGCTAAAACTTCATTCGAAGAGATTCTTGCTAAA
GACCCTCTTCGTGTCGAAGCCTATCACGGCTTGGTCATGGCTTATTCAGATGCAGATCTC
GACTTGAGAGAGGTGGAGAGTAGAATCGAAGAAGCGATGCTGAGATGCAAGAAG*AGAAT
AATCACAACGATTTTCGAGACTTTAAGCTTCTTTTGGCGCAGATTCGTGTGATTGAAGGG
A
GCATG

QA 1 781 1 781
DS 

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AGTAGAATCGAAGAAGCGATGCTGAGATGCAAGAAGGAGAATAATCACAACGATTTTCGA
GACTTTAAGCTTCTTTTGGCGCAGATTCGTGTGATTGAAGGGAAGCATGGTGAAGCGTTG
AAGCTTTATGGAGAGCTTGTGAAAGAAGAGCCAGGAGATTTCAGACCGTATTTCTGTCAA
GGAGTTATATACACGTTGCTGAAGAAGAAAGACAAAGCAGAGGAACAGTTCGATAAGTTT
AGAGAACTTGTGCCTGAGAATCATCCTTACAGAGAGTATTTTATGGATAATATGATTGCT
ACCAAGCTTTTTTCAGAGAAGACTCAGCGTGAGATGGCTGGATCAGAGAGTTGATTTATG
TGTGTAATGTTTTGGTAAATCACATTGAGATGAATAATGTTTAGTTGATTTTGATGTTTT
ATGTCTGTTTAGTTGGTTTATATATAAGGACACCATTAGTTGACATTTGGATTTGATTTA
TTTTCCGATTTGAATCAC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6030Contig1 1372 2 2 U
GGAAGAGAGAAGAAGAGAGAGAAAAGGCTATGGAAAGATAGATAAAACTCAGTTTATTTT
GAAAATACACAGAGGAGAGAGATAGAGAGAGAAGGAGATGGGGGATTCAAGCGGTTCTGT
CTCCATTGATATGGAGGCAATGTCTCTTGGAGGACAGGAACACCTTGTGGAGACTACCTA
TGGCCCGGTATGTGTTGCCGTTTGTGGAGATCCTGATAAACCTGCTCTTATCACATATCC
TGATGTTGCTCTTAATTATATGTTTTCTTTTCAAGGGTTGTTGTTTTGTCCAGAAGCTAG
TTCCTTGTTACTCCACAACTTTTGCATTTATCACATCAGTCCTATTGGCCATGAGTTAGG
AGCTCCAGTGATCAGTGTTGATGCTCCTTTGCTCTCAGCTGATGACTTAGCTGACCAGAT
AGTCGAGGTTCTTAACTATTTCGGACTTGGTGCAGTAATGTGTATGGGAGTCACAGCAGG
AGCTTACATTCTGACCTTATTTGCTATGAAGTACAGAGAGTTCTGGGATTAATACTCGTC
TCTCCACTGTGCCAAGCTCCTTCTTGGTCAGAATGGTTGTGCAATAAGGTTATGTCTAAT
CTTCTTTATTACTATGGCATGTGCGGAGTGGTTAAAGAATTGCTACTAAAACGGTACTTC
AGCAAGGAAGTTCGTGGTAATGCTCAAGTTCCAGAATCAGATATTGTTCAAGAATGCAGA
AGATTACTTTGCGAGCGGCAGAGTACAAATGTATGGAGATACCTTGAGGCAATCAACGGG
AGAGTGGACCTTAGCGAAGAGTTAAGGAAACTGCAATGCAGAACTTTAATATTCATCGGC
GAAAATTCAGCTTACCACTCAGAGGCCGTTCACATGACCACAAAACTAGACAGACGATAC
GGCGCACTAGTCGAGGTACAAGGAAGCGGGTCGTTGGTGACAGAATAGCAGCCACAGGCG
ATGGTAATACCGATGGAATACTTTTTGATGGGGTACGGATTGTATCGTCCAGCACAGAGC
GTGAGCCCGAGAAGTCCTTTGAGCCCAACGAGGATCTCGCCTGAGCTTCTCTCCCCTGAA
AACATGGGGTTGAAGCTCAAGCCCATTAAGACAAGACTCGCGCTATGACACACAACTCTG
CCTCCTCCTCTTTGTGCTATAGAAATTATTGCAACATATATATATATTTATATACGTTAC
ATAAAAAAAATCGACATTGGTTTGTGGAGTTTGAGATGCTCTTTTGTGTTATGATTAAAG
CTGTAGATATAGACAGGGACACAGATGTTTTATGTTTTTTGGAAATTTTGTGGTAGCTGT
TATTGTTATGTTTGTACATTTTGTTGAATAAATCATTTAAGGAAAATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AQ45TF U 1
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BS 761 1372 RR4AQ45JQ

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GAAAATACACAGAGGAGAGAGATAGAGAGAGAAGGAGATGGGGGATTCAAGCGGTTCTGT
CTCCATTGATATGGAGGCAATGTCTCTTGGAGGACAGGAACACCTTGTGGAGACTACCTA
TGGCCCGGTATGTGTTGCCGTTTGTGGAGATCCTGATAAACCTGCTCTTATCACATATCC
TGATGTTGCTCTTAATTATATGTTTTCTTTTCAAGGGTTGTTGTTTTGTCCAGAAGCTAG
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AGTCGAGGTTCTTAACTATTTCGGACTTGGTGCAGTAATGTGTATGGGAGTCACAGCAGG
AGCTTACATTCTGACCTTATTTGCTATGAAGTACAGAGAGTTCTGGGATTAATACTCGTC
TCTCCACTGTGCCAAGCTCCTTCTTGGTCAGAATGGTTGTGCAATAAGGTTATGTCTAAT
CTTCTTTATTACTATGGCATGTGCGGAGTGGTTAAAGAATTGCTACTAAAACGGTACTTC
AGCAAGGAAGTTCGTGGTAATGCTCAAGTTCCAGAATCAGATATTGTTCAAGAATGCAGA
AGATTACTTTGCGAGCGGCAGAGTACAAATGTATGGAGAT

QA 1 760 1 760
DS 

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AGATTACTTTGCGAGCGGCAGAGTACAAATGTATGGAGATACCTTGAGGCAATCAACGGG
AGAGTGGACCTTAGCGAAGAGTTAAGGAAACTGCAATGCAGAACTTTAATATTCATCGGC
GAAAATTCAGCTTACCACTCAGAGGCCGTTCACATGACCACAAAACTAGACAGACGATAC
GGCGCACTAGTCGAGGTACAAGGAAGCGGGTCGTTGGTGACAGAATAGCAGCCACAGGCG
ATGGTAATACCGATGGAATACTTTTTGATGGGGTACGGATTGTATCGTCCAGCACAGAGC
GTGAGCCCGAGAAGTCCTTTGAGCCCAACGAGGATCTCGCCTGAGCTTCTCTCCCCTGAA
AACATGGGGTTGAAGCTCAAGCCCATTAAGACAAGACTCGCGCTATGACACACAACTCTG
CCTCCTCCTCTTTGTGCTATAGAAATTATTGCAACATATATATATATTTATATACGTTAC
ATAAAAAAAATCGACATTGGTTTGTGGAGTTTGAGATGCTCTTTTGTGTTATGATTAAAG
CTGTAGATATAGACAGGGACACAGATGTTTTATGTTTTTTGGAAATTTTGTGGTAGCTGT
TATTGTTATGTTTGTACATTTTGTTGAATAAATCATTTAAGGAAAATTTCCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTCATGTTTTAAGAAGTTGATTTTTCTTCAAATGTGC


BQ
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AF RR4GL43JQ C 1
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BS 1 159 RR4GL43TF

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DS 

RD RR4GL43TF 159 0 0
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GCAAACCCCCTGCAAATAGAAGAATCTGCAAAATGGTCAAACGGAACATATGTATCTAAT
TTTTCATGTTTTAAGAAGTTGATTTTTCTTCAAATGTGC

QA 1 159 1 159
DS 



AS 1 2

CO CL6033Contig1 1058 2 2 U
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CGAGGATTCTAGAACTAGGCAACAAGCTAGCTTCCAGAATGCTTAGCGAAGGACAGTATC
TGTCACTTCATCTGAGAATGGAGAAAGACGTTTGGGTTAGAACCGATTGTCTCCCCGGTT
TAACACCCGAGTTCGACGAGATAGTCAACAGCGAGAGAGAACGCCACCCGGAGCTTCTCA
CCGGTCGTTCGAACATGACTTACAACCAGAGGAAACTCGCTGGCCTATGCCCTTTGACAA
CTCTAGAAGTCACGAGGCTGCTTAAAGCTTTAGAAGCACCAAAAGACGCGAGAATCTACT
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TTCACCTCTACAACAAACATGATCTTCATTGCCCGGTGAGCTCGAACCGTTCGCCAAGAA
AGCTTCGGTTATGGCCGCGATAGACTACATCGTCTGCGAGAAGAGCGATGTTTTCATACC
GTCGCACGGTGGGAACATGGGACATGCGTTGCAAGGGCAAAGAGCTTACGCTGGTCACAA
GAAGTACATCACTCCTAATAAGAGACAGATGCTTCCTTACTTCATGAATGCCTCGCTACC
TGAACCGGAGTTCAACAGGATTGTGAAAGATCTTCATCGAGAGTCTTTAGGACAGCCTGA
GTTGAGAACGAGTAAAGGTGGTAAAGATGTTACTAACATCCTGTTCCAGAGTGTATGTGT
TCAGATAGACAGCAACAACAATAACAACGATAAGTCAGAGAGGCTCAAGGTGGTTGGTTC
GTGCAGTATTCTTTTAGTTCATTTTTTTTTGCCTTGATTTGGAGTATATATTACGAGTTG
TGTATTCTTTGAATTGAGGTTTATTTACGTGGGAAGTAGAATAGGAATGAGATATGATAT
GATTCTTTGATTCGATTTATTTGAACTGTAATTATATATTACAGAGTTTGTATACGATTA
TACTTGTACCATATATAAATAAAAAGCAACATTTGACT


BQ
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AF RR4D364TF U 1
AF RR4D364JQ C 516
BS 1 674 RR4D364TF
BS 675 1058 RR4D364JQ

RD RR4D364TF 674 0 0
GCCCTTCTGATCTCCAGAAACTCCGATGCAAGGTAGCTTTCCAAGCTTTGAGATTCTCAC
CGAGGATTCTAGAACTAGGCAACAAGCTAGCTTCCAGAATGCTTAGCGAAGGACAGTATC
TGTCACTTCATCTGAGAATGGAGAAAGACGTTTGGGTTAGAACCGATTGTCTCCCCGGTT
TAACACCCGAGTTCGACGAGATAGTCAACAGCGAGAGAGAACGCCACCCGGAGCTTCTCA
CCGGTCGTTCGAACATGACTTACAACCAGAGGAAACTCGCTGGCCTATGCCCTTTGACAA
CTCTAGAAGTCACGAGGCTGCTTAAAGCTTTAGAAGCACCAAAAGACGCGAGAATCTACT
GGACGGGAGGAGAGCCTCTAGGTGGAAAAGAGGCTTTGGAGCCGTTAACCAAAGAGTTCC
TTCACCTCTACAACAAACATGATCTTCATTGCCCGGTGAGCTCGAACCGTTCGCCAAGAA
AGCTTCGGTTATGGCCGCGATAGACTACATCGTCTGCGAGAAGAGCGATGTTTTCATACC
GTCGCACGGTGGGAACATGGGACATGCGTTGCAAGGGCAAAGAGCTTACGCTGGTCACAA
GAAGTACATCACTCCTAATAAGAGACAGATGCTTCCTTACTTCATGAATGCCTCGCTACC
TGAACCGGAGTTCA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4D364JQ 543 0 0
GCGAGAAGAGCGATGTTTTCATACCGTCGCACGGTGGGAACATGGGACATGCGTTGCAAG
GGCAAAGAGCTTACGCTGGTCACAAGAAGTACATCACTCCTAATAAGAGACAGATGCTTC
CTTACTTCATGAATGCCTCGCTACCTGAACCGGAGTTCAACAGGATTGTGAAAGATCTTC
ATCGAGAGTCTTTAGGACAGCCTGAGTTGAGAACGAGTAAAGGTGGTAAAGATGTTACTA
ACATCCTGTTCCAGAGTGTATGTGTTCAGATAGACAGCAACAACAATAACAACGATAAGT
CAGAGAGGCTCAAGGTGGTTGGTTCGTGCAGTATTCTTTTAGTTCATTTTTTTTTGCCTT
GATTTGGAGTATATATTACGAGTTGTGTATTCTTTGAATTGAGGTTTATTTACGTGGGAA
GTAGAATAGGAATGAGATATGATATGATTCTTTGATTCGATTTATTTGAACTGTAATTAT
ATATTACAGAGTTTGTATACGATTATACTTGTACCATATATAAATAAAAAGCAACATTTG
ACT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL6034Contig1 1274 2 2 U
GACGATTCACTGAATCCAAGGCACACGGTGGCGCGATTGAAATTCAAATCGATACTTTGC
ATCAATCTTTGATTGATTTTGCACCTGTGAGAGCCCAGATCCGAAGTTTCTTTCTTCTCG
AACGAAGAAAATGCAAGCAAGGCATGTGCAATCGTCGTATCGAGATCGGACGGACGAGTT
CTCTGGTATCGTTGAAAGCCATCGGAGATCGATTGCTCCAGCGGCGGCGAATAGTGCGCC
TTATGGTGGTGGGGGAAGAAGAAGAGAGGATCCGAGATCTGCGGCGGCAAATCAATCAGA
GTTCAGTAAGAGAGCTTCTCTGATCGGTTTAGCTATCCACCAGACCTCCCAGAAGCTATC
CAAGCTCGCTCAACTGGCGAAGAGGTCATCAGTGTTTGATGATCCAACGCGGGAGATACA
AGAGCTGACGGTTGTGATCAAACAAGAGATCTCTGGTCTAAACGGCGCTTTCGACCTTCA
AGCTGTACGCAACAACAACTCCCATCATAATGATGATGAAAGGAACAGCATCTCTAGAGA
CACCACTAGTCACTCTGCAACTGTTGTTGACGATCTCAAGAATCGCTTGATGGACACTAC
CAAAGAGTTTAAGGATGTTCTTACTTTGAGAACTGAGAACATGAAGATCCAAGAAGATCG
AATGAAAAAATTCTCGAAAATCTCTTCAAAAGAATCAGCAAATCCGTTTGTTCGCCAGCG
CCCTCTGGCTTCTAAGCCTTCACCTAGTCAACCTACTCCTCTTCCATGGGCTAATGGTTC
TTCTTCTTCATCGTCATCTCAGATAGTCCCAAGGCAGGGAGAGGCCGAATCCTCACCACT
ATTGCAACAGAGTCATAACAACAGATGGTCCCGTTGCAAGACACATATATGCAAAACCGA
GCAGAAGCTCTACACAATGTAGAATCAACAATCCATGAGCTAAGCAATATCTTCACACAA
CTAGCGACCATGGTTTCTCAGCAAGGGGAGATCGCTATCAGGATCGATCAGGACATGGAA
GATACATTGGCGAATGTGGAAGGCGCACAGAGCCAACTGGCTAGGTATCTCAACAGTATA
TCGTCTAACCGGTGGCTCATGATTAAGATTTTCTTCGTACTTATTGCTTTTCTCATGGTT
TCCCTCTTCTTCGTTGCGTGATATTGAAATAGAAAAAGAAAATGATTCTTAACGAGTTAT
AAACATTATTCTCTTTTCTGTCGTATCGTATTGACATGTTAAGACAGCAAAGAAAGAAGA
GTTATTTTTGGGGT


BQ
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AF RR4DY59TF U 1
AF RR4DY59JQ C 436
BS 1 608 RR4DY59TF
BS 609 1274 RR4DY59JQ

RD RR4DY59TF 608 0 0
GACGATTCACTGAATCCAAGGCACACGGTGGCGCGATTGAAATTCAAATCGATACTTTGC
ATCAATCTTTGATTGATTTTGCACCTGTGAGAGCCCAGATCCGAAGTTTCTTTCTTCTCG
AACGAAGAAAATGCAAGCAAGGCATGTGCAATCGTCGTATCGAGATCGGACGGACGAGTT
CTCTGGTATCGTTGAAAGCCATCGGAGATCGATTGCTCCAGCGGCGGCGAATAGTGCGCC
TTATGGTGGTGGGGGAAGAAGAAGAGAGGATCCGAGATCTGCGGCGGCAAATCAATCAGA
GTTCAGTAAGAGAGCTTCTCTGATCGGTTTAGCTATCCACCAGACCTCCCAGAAGCTATC
CAAGCTCGCTCAACTGGCGAAGAGGTCATCAGTGTTTGATGATCCAACGCGGGAGATACA
AGAGCTGACGGTTGTGATCAAACAAGAGATCTCTGGTCTAAACGGCGCTTTCGACCTTCA
AGCTGTACGCAACAACAACTCCCATCATAATGATGATGAAAGGAACAGCATCTCTAGAGA
CACCACTAGTCACTCTGCAACTGTTGTTGACGATCTCAAGAATCGCTTGATGGACACTAC
CAAAGAGT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4DY59JQ 839 0 0
GATCAAACAAGAGATCTCTG*TCTAAACGGCGCTTTCGAC*TTCAAGCTGTACGCAACAA
CAACTCCCATCATAATGATGATGAAAGGAACAGCATCTCTAGAGACACCACTAGTCACTC
TGCAACTGTTGTTGACGATCTCAAGAATCGCTTGATGGACACTACCAAGGAGTTTAAGGA
TGTTCTTACTTTGAGAACTGAGAACATGAAGATCCAAGAAGATCGAATGAAAAAATTCTC
GAAAATCTCTTCAAAAGAATCAGCAAATCCGTTTGTTCGCCAGCGCCCTCTGGCTTCTAA
GCCTTCACCTAGTCAACCTACTCCTCTTCCATGGGCTAATGGTTCTTCTTCTTCATCGTC
ATCTCAGATAGTCCCAAGGCAGGGAGAGGCCGAATCCTCACCACTATTGCAACAGAGTCA
TAACAACAGATGGTCCCGTTGCAAGACACATATATGCAAAACCGAGCAGAAGCTCTACAC
AATGTAGAATCAACAATCCATGAGCTAAGCAATATCTTCACACAACTAGCGACCATGGTT
TCTCAGCAAGGGGAGATCGCTATCAGGATCGATCAGGACATGGAAGATACATTGGCGAAT
GTGGAAGGCGCACAGAGCCAACTGGCTAGGTATCTCAACAGTATATCGTCTAACCGGTGG
CTCATGATTAAGATTTTCTTCGTACTTATTGCTTTTCTCATGGTTTCCCTCTTCTTCGTT
GCGTGATATTGAAATAGAAAAAGAAAATGATTCTTAACGAGTTATAAACATTATTCTCTT
TTCTGTCGTATCGTATTGACATGTTAAGACAGCAAAGAAAGAAGAGTTATTTTTGGGGT

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL6035Contig1 1221 2 2 U
GGAGTCCGAAATCTAGAAATTTGTAACTTGAGGCGAATCGCCGCCATGGCTGCTCACGCC
GACCGAATCTCAAACGCTTCCATGGAAAATCTCACGCGGCAGGTAGAGAAACGGCCGATC
TCAACCATCGTCTTCATCGTCGCTATGCAAAAGGAAGCTCAGCCTCTTATCGAAAGGTTC
CGCCTTGTCAAAGACGTTAACTCCCCGTGAGTTCTTTCATTCATCTCAAATGTGATTTTT
GCTTTCTTGTCCTTTTGAAAAAATGAAACTTTTTTTTTTAATTTAGGTTTCCAAAAAGAG
GTGGCTTGGGTTCTGTTTAAAGGAATATATAAAGAGCTGAACATTAATATAGTGTGCCCA
GGAAAAGATTCAGCTCTTGGTATGTATGTCTGTTATGTAGATATCTAATGTTCATTGTTA
CTACATTTGAATGTTATTTGGGTTTGATTATGTTTAGGAGTTGATAGTGTATGCACGGTT
CCTGCATCTCTCGTGACGTATGCATCTATCCAAGCGTTACAGCCGGATCTAATCATTAAT
GCTGGAACCGCTGGTGGGTTTAAGGCCAAAGGAGCAAGTATTTGCGATGTTTATATTGTC
TCTAGCTCTGCTTTCCATGACAGAAGGATACCTGTTCCTGTCCTTGATCTATATGGTGTT
GGTATGCGGAAAGCCTTCCCTACTCCCAACCTTATTAAGGAGCTGAACCTAAAGGTGGGA
AGATTATCCACTGGTGATTCTATGGATATGTCTCCACATGACAAAGAATCAATCACAGCA
AATGATGCTACAGTTAAAGACATGGAGGGAGCAGCAGTGGCCTACGTGGCTGATATTTTT
AAGGTTCCTACGATTTTAATAAAAGGAGTAACTGATATTGTGGATGGAAATAGACCAACC
TCAGAGGAGTTATTGGAGAACTTAGCTGCAGTCACTGCGAAGCTTGATGAGTCTATTACC
AAAGTGATCGACTTCATCAGTGGCAAGTGTCTTTCAGACCTCTGAAGAGGTTCACGTTTT
TTAATAAAGATTCAAGCAAAAGGGAGATGGGTATAGGCAAGTTGGGCGATAGGTTGGAGC
AGAATGTTCATTTTTTAACTCCACTTTTTCCTCATGAGCTCTCTTTTTATTGGCTCTCTT
TCATATGATGATGGATCATCTTATATGTAGAAACTCAAAAAGTTTTGATACCCAACAACA
TAATAAGATTTGCTTTCATCT


BQ
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AF RR4FF87TF U 1
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BS 700 1221 RR4FF87JQ

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GACCGAATCTCAAACGCTTCCATGGAAAATCTCACGCGGCAGGTAGAGAAACGGCCGATC
TCAACCATCGTCTTCATCGTCGCTATGCAAAAGGAAGCTCAGCCTCTTATCGAAAGGTTC
CGCCTTGTCAAAGACGTTAACTCCCCGTGAGTTCTTTCATTCATCTCAAATGTGATTTTT
GCTTTCTTGTCCTTTTGAAAAAATGAAACTTTTTTTTTTAATTTAGGTTTCCAAAAAGAG
GTGGCTTGGGTTCTGTTTAAAGGAATATATAAAGAGCTGAACATTAATATAGTGTGCCCA
GGAAAAGATTCAGCTCTTGGTATGTATGTCTGTTATGTAGATATCTAATGTTCATTGTTA
CTACATTTGAATGTTATTTGGGTTTGATTATGTTTAGGAGTTGATAGTGTATGCACGGTT
CCTGCATCTCTCGTGACGTATGCATCTATCCAAGCGTTACAGCCGGATCTAATCATTAAT
GCTGGAACCGCTGGTGGGTTTAAGGCCAAAGGAGCAAGTATTTGCGATGTTTATATTGTC
TCTAGCTCTGCTTTCCATGACAGAAGGATACCTGTTCCTGTCCTTGATCTATATGGTGTT
GGTATGCGGAAAGCCTTCCCTACTCCCAACCTTATTAAG
AGCT

QA 1 699 1 699
DS 

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CTCTAGCTCTGCTTTCCATGACAGAAGGATACCTGTTCCTGTCCTTGATCTATATGGTGT
TGGTATGCGGAAAGCCTTCCCTACTCCCAACCTTATTAAGGAGCTGAACCTAAAGGTGGG
AAGATTATCCACTGGTGATTCTATGGATATGTCTCCACATGACAAAGAATCAATCACAGC
AAATGATGCTACAGTTAAAGACATGGAGGGAGCAGCAGTGGCCTACGTGGCTGATATTTT
TAAGGTTCCTACGATTTTAATAAAAGGAGTAACTGATATTGTGGATGGAAATAGACCAAC
CTCAGAGGAGTTATTGGAGAACTTAGCTGCAGTCACTGCGAAGCTTGATGAGTCTATTAC
CAAAGTGATCGACTTCATCAGTGGCAAGTGTCTTTCAGACCTCTGAAGAGGTTCACGTTT
TTTAATAAAGATTCAAGCAAAAGGGAGATGGGTATAGGCAAGTTGGGCGATAGGTTGGAG
CAGAATGTTCATTTTTTAACTCCACTTTTTCCTCATGAGCTCTCTTTTTATTGGCTCTCT
TTCATATGATGATGGATCATCTTATATGTAGAAACTCAAAAAGTTTTGATACCCAACAAC
ATAATAAGATTTGCTTTCATCT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6038Contig1 556 2 1 U
GGATTGCAACCAATACTAAAAAATCCACTAGTAAACCAGAAACACACAAAACCCTTATTT
AAAAATGTCAGTGATGAGTCACAACAAAGCAGAAGGCAGGCTATACGAGTCAACTCAGAC
TCGGCTAGTTCCTTACATACGAACTGTTGGCCAAGAGAGCGGAGGAGACGATGATGACGA
CGACAAAGACGTGGCTCCGACGGCTTGATCATGTGCATTTTACCGCATATATGCTATTTA
TAAACTAAATAGCAACCAGTTAATTCAGTAGTAATTGTGCTTCTTGTCATAGAACCACAC
ACACACATATCTATTTAGCTGAAGCACTAGATGTGCCTGTATATCCATGTCGCAAGTATG
CCTTTATAGTATGTATTACATAAACAACATTTCTGACTCTGCAGTGTTGAGAGGTTTAGC
TAGCTTTAAGTAATAATATAGTGTATCGTGTGTCACTTACTTATGAATGATGAAATAATA
TTACATTATATACACCATATTTGTGTCAATTACATACATACAATGATATATATTTATATG
TAATACAGTTCTTACC


BQ
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BS 1 556 RR4ES61TF

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TCGGCTAGTTCCTTACATACGAACTGTTGGCCAAGAGAGCGGAGGAGACGATGATGACGA
CGACAAAGACGTGGCTCCGACGGCTTGATCATGTGCATTTTACCGCATATATGCTATTTA
TAAACTAAATAGCAACCAGTTAATTCAGTAGTAATTGTGCTTCTTGTCATAGAACCACAC
ACACACATATCTATTTAGCTGAAGCACTAGATGTGCCTGTATATCCATGTCGCAAGTATG
CCTTTATAGTATGTATTACATAAACAACATTTCTGACTCTGCAGTGTTGAGAGGTTTAGC
TAGCTTTAAGTAATAATATAGTGTATCGTGTGTCACTTACTTATGAATGATGAAATAATA
TTACATTATATACACCATATTTGTGTCAATTACATACATACAATGATATATATTTATATG
TAATACAGTTCTTACC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4ES61JQ 162 0 0
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ACTTACTTATGAATGATGAAATAATATTACATTATATACACCATATTTGTGTCAATTACA
TACATACAATGATATATATTTATATGTAATACAGTTCTTACC

QA 1 162 1 162
DS 



AS 1 2

CO CL6039Contig1 1050 2 2 U
GGATCTTAGCCGCAGTTTTGGCTCCTCCAGGCGAAGAAGAAGACACAGTCTCTTTGATGG
ATTTCATCTGTTGTTTCCGACCGCATCACTCTTGTCGGGGGATTTCAGTTTCGTCTGCTT
CCAGCTTAAGTAGCCTTCCCGCCGCCAATCGTTTCCTCCCGACAACGAGTGTCCGAATTA
GAATCCCAACGACGCCGTTTCTTCAGTATCCGAAATTTTCAATAGAGGCTCACGCAAAGA
AGAAGAAAAACACTTCAAAAACGACTATCTTCGAACCTAACCGAACAAAGAAGAAGACGA
ATCACTCTTTGAAGAAAACGAAGAAGAAGATGAGCAAGTCCTTCTCGAAGATGTTCTAGA
CGAGCTACTAACTGATGAAGAAGAAGACGACTTCTACCTCGAAGAAGAAGAGGAGGAGGA
AGAACTCTATGCTGGTGATGGAGGTGGTGGTGGAGGCATCAAGCTTGCCGGAACAACATG
GGACAAAGAAGCATTGTCCTTAGCTGAGAAAGCGTGCGAGTCTTTTAACGGTGAGCTAGG
CATTTACGCGTTCAAGACTCTGCCAAACTCAACCATACAAGTGAGAATCGAACGGCTCAC
TAACAAGTCCGGTTTTCCGACGATGGAAGACATTGAAGCGTATTCAACAACTTACAGAGC
GAAACTGTCTGAAGCTGAACTCGCCAAGACCGTACCAGACAATATCTCCTTAGAGGTGTC
ATCTCCTGGTGTTGAAAGAGTAGTAAGAGTTCCTCAGGATCTTGACCGGTACAAGGACAG
GTCAATGTATGTGAGGTACGTTAACGAGGAAGCTGAAAATGAAGGTGATGGTATCTTTAG
ACTTGTCTCTTTTGATGTGGAAGCCAAAAGCTGCGTTTGGGGGATAGCCGATATTAGAGT
GAACCGTGAGAAGGCAGGCAAAGGCAGACCTTTGAGCAAGAAGCAAAGAGAATGGCGTCT
TGAAACGTCTTTTGAGTCACTACGTTTAGTTCGTTTGCATTCTGAATGTTGAAACACATA
ACATTATTTTTATTGAATGAAAACTATTAC


BQ
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AF RR4GU91TF U 1
AF RR4GU91JQ C 282
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AGAACTCTATGCTGGTGATGGAGGT

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DS 

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CTTTTAACGGTGAGCTAGGCATTTACGCGTTCAAGACTCTGCCAAACTCAACCATACAAG
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AAGGTGATGGTATCTTTAGACTTGTCTCTTTTGATGTGGAAGCCAAAAGCTGCGTTTGGG
GGATAGCCGATATTAGAGTGAACCGTGAGAAGGCAGGCAAAGGCAGACCTTTGAGCAAGA
AGCAAAGAGAATGGCGTCTTGAAACGTCTTTTGAGTCACTACGTTTAGTTCGTTTGCATT
CTGAATGTTGAAACACATAACATTATTTTTATTGAATGAAAACTATTAC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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AATTCTGTTAACAAGCGGGTGCACTTTAGCCCTCTCAGACGAACTGACACAAGACAGAAT
CACTATCAAGATATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCCCCATCATCGAAATCACTTTTT
TGGCATTTAGGCTCAGAGACAAAGTCGACCCTAAAAGGAACAACGACCACTTTTGCACCA
AGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGTAAGACATTTGGAGTGTTCCATCTTTCAGGGGATG
AAGAAAACACAATAAACAAAAAGCCTCTGGTCGGAGGTTCTCAGGTCTCAGGTGTTCGTG
CAACATCGACCATCACAAGGCAGACATACGGTGATGCCCATAAGGCTGTGGAAGTTACCA
AACTTACGACTGCACACAATTCACTTGACAACCCGCGAGGAGAGATCATTCAAGCCCCTG
TACGGACCAAGAGTGTTCTATTTGCGTTCTTTGTCAAACCAAAAACTCCACAGCTTAAAG
CTGGTTAACAACTCTTTTTACTGGAACGACATTTCAAATATCAACCTTTTTTTTTTTTTT
TTATAAAACGTTTATCAATGTAACCAAGTCCAAAATGACATGATTATGGTACGGGATTAG
CAAAACTGTGTAGATAAAGAACAATGTGCTATTTAAAAATGATTTCTGTTTAAGTCG


BQ
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AF RR4G562TF U 1
AF RR4G562JQ C 461
BS 1 624 RR4G562TF
BS 625 1197 RR4G562JQ

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AATTTAAAGGACTACACTGTAAAGGCTCTGGTTAATGCTGTTGATCACTTGGGAACTGTT
GCTTCCAAACTTACTGATCTCTTTGATCACCAAAGTTCAGACATATCAACCATGGAGCTG
AGAGCTTCTTGTGTTAGCCAGCAACTGCTTACAAGCCGGACATATATAGAAAAAGAAGGT
CTTAGACAGCAACAGCTATTAGCAGTTATCCCAATGCATCACAAGCATTACACTCTACCC
AATTCTGTTAACAAGCGGGTGCACTTTAGCCCTCTCAGACGAACTGACACAAGACAGAAT
CACTATCAAGATATATCCCGTCTT

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DS 

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GAACTGACACAAGACAGAATCACTATCAAGATATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCCC
CATCATCGAAATCACTTTTTTGGCATTTAGGCTCAGAGACAAAGTCGACCCTAAAAGGAA
CAACGACCACTTTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGTAAGACATTTGGAGT
GTTCCATCTTTCAGGGGATGAAGAAAACACAATAAACAAAAAGCCTCTGGTCGGAGGTTC
TCAGGTCTCAGGTGTTCGTGCAACATCGACCATCACAAGGCAGACATACGGTGATGCCCA
TAAGGCTGTGGAAGTTACCAAACTTACGACTGCACACAATTCACTTGACAACCCGCGAGG
AGAGATCATTCAAGCCCCTGTACGGACCAAGAGTGTTCTATTTGCGTTCTTTGTCAAACC
AAAAACTCCACAGCTTAAAGCTGGTTAACAACTCTTTTTACTGGAACGACATTTCAAATA
TCAACCTTTTTTTTTTTTTTTTATAAAACGTTTATCAATGTAACCAAGTCCAAAATGACA
TGATTATGGTACGGGATTAGCAAAACTGTGTAGATAAAGAACAATGTGCTATTTAAAAAT
GATTTCTGTTTAAGTCG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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GATCTCATCAATGCTGATGACCATGGTTGACTCTTCTAGATCAGTCCAAAGATCCCGTGA
CAGTGAAGAATCTGAGATCGTACGAAGACACTTGCTCGCTACTGGCCTCTCTAAGCTCGG
TTACAACTATGTTAATATCGATGATTGTTGGGCTGAACTTGCTCGTGACCAAAAGGGCAA
TCTGGTGCCAAAGAAGTCAACGTTCCCTTCTGGTATCAAAGCCCTTGCAGATTATGTTCA
CAGCAAGGGCCTTAAGCTTGGGATTTACTCTGATGCAGGGTATTTAACTTGTAGCAAAAC
AATGCCTGGCTCTCTAGGCCATGAGGAGCAAGATGCCAAGAAATTTGCAGAATGGGGAAT
AGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACACTGATGGCTCTAGACCAACCGTCAGGTATCC
AGTTATGACCCGAGCTCTGATGAAATCTGGCCGTCCCATCTTTCACTCCTTGTGTGAATG
GGGAGATATTCATCCAGCTCTCTGGGGATCTCCACTAGGAAACAGTTGGAGAACCACTAT
TGACATCAATGATAGTTGGCTTAGTATGATTGCAAATGCAGACATGAACGAAATCTATGC
TGAGCATGCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCCTGATATGCTTGAAGTGGGAAATGGAGG
GATGACTAAAGATGAGTACATAGTCCATTTCAGCATATGGGCAATCTCAAAGGCTCCTCT
TCTACTTGGTTGTGACATAAGAAACATGACTAAAGAAACTATGGAGATTGTGGCAAACAA
GGAGGTCATTGCTATCAATCAAGATTCACTTGGTGTTCAGGCCAAGGAAGCTAGAATGGA
AGGTGATATCCAGAGTTGGGCAGGGCCATTGTCAGGTTACAGAGTAGCTTTGCTTCTGTT
GAACCGTGGACCAACACGATTAGCAATCACTGCTTTTTGGGATGATATTGAGATCCCTCC
AAATAGCATCGTTGAAGCCAGAGATCTATGGAAGCACAAGACATTGAAGCAAAAGTTTGT
GGGGAACTTGACAGCAACAGTTGATTCTCATGCGTGTAAGCTGTATGTTCTCAAACCTGT
TGCCTGAGAGATATAGGCTACGATTGTAATATCCAATTTATTATGTAGACACAATGATCG
GTTCCTTAATAAAATTGTTCAACGTTTTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GQ38TF U 1
AF RR4GQ38JQ C 488
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BS 650 1233 RR4GQ38JQ

RD RR4GQ38TF 649 0 0
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GATCTCATCAATGCTGATGACCATGGTTGACTCTTCTAGATCAGTCCAAAGATCCCGTGA
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TCTGGTGCCAAAGAAGTCAACGTTCCCTTCTGGTATCAAAGCCCTTGCAGATTATGTTCA
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AGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACACTGATGGCTCTAGACCAACCGTCAGGTATCC
AGTTATGACCCGAGCTCTGATGAAATCTGGCCGTCCCATCTTTCACTCCTTGTGTGAATG
GGGAGATATTCATCCAGCTCTCTGGGGATCTCCACTAGGAAACAGTTGGAGAACCACTAT
TGACATCAATGATAGTTGGCTTAGTATGATTGCAAATGCAGACATGAAC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4GQ38JQ 746 0 0
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ATTCATCCAGCTCTCTGGGGATCTCCACTAGGAAACAGTTGGAGAACCACTATTGACATC
AATGATAGTTGGCTTAGTATGATTGCAAATGCAGACATGAACGAAATCTATGCTGAGCAT
GCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCCTGATATGCTTGAAGTGGGAAATGGAGGGATGACT
AAAGATGAGTACATAGTCCATTTCAGCATATGGGCAATCTCAAAGGCTCCTCTTCTACTT
GGTTGTGACATAAGAAACATGACTAAAGAAACTATGGAGATTGTGGCAAACAAGGAGGTC
ATTGCTATCAATCAAGATTCACTTGGTGTTCAGGCCAAGGAAGCTAGAATGGAAGGTGAT
ATCCAGAGTTGGGCAGGGCCATTGTCAGGTTACAGAGTAGCTTTGCTTCTGTTGAACCGT
GGACCAACACGATTAGCAATCACTGCTTTTTGGGATGATATTGAGATCCCTCCAAATAGC
ATCGTTGAAGCCAGAGATCTATGGAAGCACAAGACATTGAAGCAAAAGTTTGTGGGGAAC
TTGACAGCAACAGTTGATTCTCATGCGTGTAAGCTGTATGTTCTCAAACCTGTTGCCTGA
GAGATATAGGCTACGATTGTAATATCCAATTTATTATGTAGACACAATGATCGGTTCCTT
AATAAAATTGTTCAACGTTTTGCTCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL6042Contig1 803 2 2 U
ATTCATGTCCTCTACTCTATTCATTTTCTTCCTTGTCATGGCAACAACCAATGGTCAGGC
TCCAGCTCCAACCCCTTCAGGTCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCA
ATTCACAATGTTCATAAGACTCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCA
GCTCAACTCTTCCTCCAGCCAAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAG
CAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTTCAGCTTGTTCA
GTTCCATGTCCTTCCTACGCTCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTT
ACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAAAACGGTAAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGG
TAACCAAGTCAACATCACCACGGGAGTTGTCAGCGCAACGGTAGCTAACTCTGCCTACAG
CGATAAGCAGCTTGCTGTGTATCAAGTGGATCAAGTTTTGCTGCCGTTAGCAATGTTTGG
TTCAAGCTCAGCACCTGCTCCTGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTTTCGAAAGGTTCAGC
TCCAAGTGGTGATGATGGAGGAGATTCTACTGATTCATCAGATACAGAGAGAATCAGATA
TTGGTTCATCTCCACTATGGCAGCCATTGCTGCTTCTTCTATGTGGATATAACACCATAT
TTGATTTTAAGAATAACGAATGAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTGAGTTTTGTGTTATC
GTGTTATTGTTTTGGTTCAAAAA


BQ
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AF RR4GT90TF U 1
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BS 415 803 RR4GT90JQ

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TCCAGCTCCAACCCCTTCAGGTCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCA
ATTCACAATGTTCATAAGACTCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCA
GCTCAACTCTTCCTCCAGCCAAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAG
CAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTTCAGCTTGTTCA
GTTCCATGTCCTTCCTACGCTCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTT
ACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAAAACGGTAAATTCCCTCTTAACATCACTAG

QA 1 414 1 414
DS 

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CCTACGCTCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCT
GGTGATGGCCAAAACGGTAAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAAC
ATCACCACGGGAGTTGTCAGCGCAACGGTAGCTAACTCTGCCTACAGCGATAAGCAGCTT
GCTGTGTATCAAGTGGATCAAGTTTTGCTGCCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCA
CCTGCTCCTGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTTTCGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGAT
GATGGAGGAGATTCTACTGATTCATCAGATACAGAGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCC
ACTATGGCAGCCATTGCTGCTTCTTCTATGTGGATATAACACCATATTTGATTTTAAGAA
TAACGAATGAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTGAGTTTTGTGTTATCGTGTTATTGTTTT
GGTTCAAAAA

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL6043Contig1 1165 2 2 U
TTAGTTGTATTATTACAAGTAGGGCTAGCAGGCATGGACATTCTCACAAAAGCTGTCCTA
AACGAAGGCATGAGCAATTATGTCCTTGTGGTTTACCGTCATGGTGTTGCTGCCATCGTT
ATGGCCCCGTTCGCTTTCTACTTCGACAAGATGGCGAGACCTAAGATGACACGGATGATA
TTTTTCAAGATAACACTCCTTGGCCTATTCGAACCAGTAATAGACCAGAACTTATTTTGT
CTGGGGATGAAATACACAACAGCTACTTTTGCAACCGCCTTGTACAACACGCTACCAGCA
GTCACTTTCATCCTCGCCTTAATAGTTAGGCTGGAAAAAGTTAAGCTTCGAAGTATCAGG
AGCGCCAGTAAGGTACTTGGGACAATGGTTTCAGTGGGAGGAACCATGATTATGACACTT
GTCAAAGGTCCAGCTCTCGACCTCTTTTGGACCAAAGGACCCTCTAAACAGAACACAATC
GGGACCGATATTCACAGTTCTATCAAAGGCGCAGTTTTGGTCACAATTGGTTGTTTCAGC
TATGCATGTTTCTTTATTCTCTATGCGATCACGTTGAAGACTTACCCCACCGAGCTCTCA
CTTACAGCATGGATATGCCTAATGGGGACAATAGAAGGAGCAGCTGTAGCATTAGTCATG
GAGAGAGGAAATCCTGGTGCATGGGCCATTGGGTTGGGATAACAAACTTCTTACCGTCAC
ATATAGTGGGATAGTGTGCTCAGCGCTTGGTTACTACATTGGAGGACTGGTGATGAAAAC
TAGAGGTCCTGTGTTTGTAACAGCTTTTAGTCCTCTTTGTATGATCGTAGTAGCGTTTAT
GTCGAGCATCATTTTTGCTGAACAGATGTATCTTGGAAGGGCTCTTGGTGCGGCGGTTAT
ATGTGCAGGACTGTACCTTGTGATATGGGGTAAAGGAAGAGATTACAAATATGTTTCCAC
GAACCCATCACAAACAAAACTAGAACTAAACGGTAATGGGAAAAAGAATGTTGGTCATGA
AATCATCACTATCAGCAAGGAAGGAGAACAAAGAACAGTTGTAGAAACAGTTTAAAATGT
ATGGAAAATTAAATGAATGAAGAAATCCTTGGATTTATGTAACTCAGAATGACGATTATC
ATTATAGTGTATTGATAACAACAAC


BQ
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AF RR4BF04TF U 1
AF RR4BF04JQ C 557
BS 1 722 RR4BF04TF
BS 723 1165 RR4BF04JQ

RD RR4BF04TF 722 0 0
TTAGTTGTATTATTACAAGTAGGGCTAGCAGGCATGGACATTCTCACAAAAGCTGTCCTA
AACGAAGGCATGAGCAATTATGTCCTTGTGGTTTACCGTCATGGTGTTGCTGCCATCGTT
ATGGCCCCGTTCGCTTTCTACTTCGACAAGATGGCGAGACCTAAGATGACACGGATGATA
TTTTTCAAGATAACACTCCTTGGCCTATTCGAACCAGTAATAGACCAGAACTTATTTTGT
CTGGGGATGAAATACACAACAGCTACTTTTGCAACCGCCTTGTACAACACGCTACCAGCA
GTCACTTTCATCCTCGCCTTAATAGTTAGGCTGGAAAAAGTTAAGCTTCGAAGTATCAGG
AGCGCCAGTAAGGTACTTGGGACAATGGTTTCAGTGGGAGGAACCATGATTATGACACTT
GTCAAAGGTCCAGCTCTCGACCTCTTTTGGACCAAAGGACCCTCTAAACAGAACACAATC
GGGACCGATATTCACAGTTCTATCAAAGGCGCAGTTTTGGTCACAATTGGTTGTTTCAGC
TATGCATGTTTCTTTATTCTCTATGCGATCACGTTGAAGACTTACCCCACCGAGCTCTCA
CTTACAGCATGGATATGCCTAATGGGGACAATAGAAGGAGCAGCTGTAGCATTAGTCATG
GAGAGAGGAAATCCTGGTGCATGGGCCATTGGGTTGGGATAACAAACTTCTTACCGTCAC
AT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4BF04JQ 609 0 0
TTCTCTATGCGATCACGTTGAAGACTTACCCCACCGAGCTCTCACTTACAGCATGGATAT
GCCTAATGGGGACAATAGAAGGAGCAGCTGTAGCATTAGTCATGGAGAGAGGAAATCCTG
GTGCATGGGCCATTGG*TTGGGATAACAAACTTCTTACCGTCACATATAGTGGGATAGTG
TGCTCAGCGCTTGGTTACTACATTGGAGGACTGGTGATGAAAACTAGAGGTCCTGTGTTT
GTAACAGCTTTTAGTCCTCTTTGTATGATCGTAGTAGCGTTTATGTCGAGCATCATTTTT
GCTGAACAGATGTATCTTGGAAGGGCTCTTGGTGCGGCGGTTATATGTGCAGGACTGTAC
CTTGTGATATGGGGTAAAGGAAGAGATTACAAATATGTTTCCACGAACCCATCACAAACA
AAACTAGAACTAAACGGTAATGGGAAAAAGAATGTTGGTCATGAAATCATCACTATCAGC
AAGGAAGGAGAACAAAGAACAGTTGTAGAAACAGTTTAAAATGTATGGAAAATTAAATGA
ATGAAGAAATCCTTGGATTTATGTAACTCAGAATGACGATTATCATTATAGTGTATTGAT
AACAACAAC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6044Contig1 1346 2 4 U
AGGCTCGCTTCCACAGCCAATTCACCCGGCGATCGGAAAGCTACCGGAACAATGAGTAGT
ACGGCAGGGAAGCTCGTGACGTCGAGATCGGAGCTCAACATTGAAGATTATCTTCCTTCC
GGCTCCTCCATCCATGAGCCTCGCGGCAAGCTCCGCCTGATTGATCTGATCGACATCTCA
CCAACTCTCACTGAAGCTGCTGGTGCCATCGTTGATGACTCATTCACAAGATGTTTCAAG
TCGAATCCACCAGAGCCTTGGAACTGGAACATTTACCTGTTTCCACTATGGTGCTTTGGG
GTGGTTGTTAGATACTGCATTCTCTTTCCCTTGAGGTGCCTCACTTTAGCATTTGGGTGG
TTTATTTTCCTTTCAACATTCATTTCCCGTACATTCGCTGCTCAAAGGTCAAGACAGGTT
GAGGAAAAATATAGAGAGGGTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATG
GACAGGAGTTGTCAAATATCATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGT
TGCCAACCATACCTCAATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGT
TATAATGCAGAAGCATCCTGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGT
AGGATGTATCTGGTTCAATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTAGCGAGAAAGTT
AAGAGACCATGTCCAAGGAGCTGACAATAATCCTCTTCTCATATTTCCCGAAGGGACATG
CGTAAATAATAATTATACAGTGATGTTTAAGAAGGGTGCTTTTGAGTTATGCTGCACTGT
TTGTCCAATAGCAATCAAATACAACAAGATTTTTGTTGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAA
ACAATCATTCACGATGCACTTGCTGCAACTCATGACTTCATGGGCAGTTGTGTGTGAAGT
GTGGTACTTGGAACCCCAAACTATAAGGCCTGGTGAAACAGCAATTGAGTTTGCAGAGAG
GGTCAGAGACATGATATCACTTCGGGCAGGCCTCAAAAAGGTCCCTTGGGATGGATACTT
GAAGTATTCAAGACCAAGCTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCGGAGTC
CCTCCTTGCTAGATTGGAAGAGAAGTGAATGTAACGATAAAGCACCTTTCCGTTTAGATA
AAACAAACTCGTGGCTTATTTTGCTTTAGTTTCTCTACGTTTTTTGTGAATCTTTCAATA
TGAATTCTTTTGTAAGACCACAACCGGTCTTATTCACGAGCTCTTCCGAGTTTGGAAAGG
CTAAGAATTTAATACATTCATTAAAG


BQ
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AF RR4AE34TF U 1
AF RR4AE34JQ C 638
BS 1 737 RR4AE34TF
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GTGGTTGTTAGATACTGCATTCTCTTTCCCTTGAGGTGCCTCACTTTAGCATTTGGGTGG
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GAGGAAAAATATAGAGAGGGTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATG
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TGCCAACCATACCTCAATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGT
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CGTAAATAATAATTATACAGTGAT

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DS 

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GACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTCACGATGCACTTGCTGCAACTCATGACT
TCATGGGCAGTTGTGTGTGAAGTGTGGTACTTGGAACCCCAAACTATAAGGCCTGGTGAA
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AAGGTCCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTCAAGACCAAGCTCCAAGCATAGTGAACGC
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GAGCTCTTCCGAGTTTGGAAAGGCTAAGAATTTAATACATTCATTAAAG

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DS 



AS 1 2

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TTCACTACCCTAAGCCCAATCCATTGACGAAGATTGATCAAAATAAAACCAATAATAATA
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GTTGTTAAAAATCACCTTAAAACACACAAGAGAATC


BQ
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AF RR4DF11TF U 1
AF RR4DF11JQ C 482
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BS 643 1116 RR4DF11JQ

RD RR4DF11TF 642 0 0
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AGCCTGAGTTTATGAACCTAAGAGAGTGGGATCGAAGATCTCGGTTCATCCGCGAAAACC
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CTTCTTCAAGAACAAACGTAAACAACATCTCAAGCACTGCCTCATCTCCTGGCTACACTC
TCAAAGAGATTGATCCATCAACATATTCATTCACTAATGCACTCAAGGCGTTACAAGCAA
AGACAATGTATAATAAGATAGAATGGTTAACACAAGAAGGGTTTGCTTTGAATTCAAAGT
GGAACGAAGCAGAGAAATATATATGCAATCCATTGTCTGGAGAAGTTCCAATGGAGTGTT
TGTCTTCTAAAACATTACGTGCAAGATCTTTCAGAAACTTGACCACCATGTCTGCTCCTC
TTCACTACCCTAAGCCCAATCCATTGACGAAGATTGATCAAAATAAAACCAATAATAATA
ATCATAACGTCAGAGTCATTCACGAGGATCTTTATGTTCTTGATCCTGTTCTTGTTCGAG
CTGAAGAGAAAGTTGTGGGGCTAAAACTAGATGTGGGCATTA

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DS 

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TCATAACGTCAGAGTCATTCACGAGGATCTTTATGTTCTTGATCCTGTTCTTGTTCGAGC
TGAAGAGAAAGTTGTGGGGCTAAAACTAGATGTGGGCATTAAGAGTACCTCGGTGGATAG
TAGTTCCGGTAGCCCTAGTCCGGCAGAGACGCCTCCGATCATGGAACGGTCGCTGAAAAG
ATATGCGGAAGCTTATGATTCGCCGGTGGACTTCAATCTCAATATGGAAGGTCAACCAGA
GGATTTAAAGTCGGCAGAGGATGAAAAGGAAGAAGAAAAGCACGAGATGCCTAAAAAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAGAAGCAAGGGATGAGTAAAAAAGAAGAAGAGAA
GCAAGAGATGATAAAAGGAAAAGGAGAAAAAGAGCAAGAGACGAGTGAAGAAGGGGAAAA
ACAAATGGAGAAAAATAAGAAGAGAGGAAGTGGATGCTTCCCATGGATGAGATCAAGACA
AGGACAAGCAAGAAAATCAAAGTACATTTTCCCGATTTGTATTCCTCATCTTGTCAAAGG
TTGTTAAAAATCACCTTAAAACACACAAGAGAATC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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TGGGTCATGTCATTCACATGCTTGAAGCTGAGGACTTAGTGTCTAGAGATGATAGGAGAA
ACTCCGGCGGGGGAGGAGGAGGAGATCCGAGAAGGTCACCGAGGAAGATGAATGTGACTG
AATCAGAGGATGAGAGTGTTAATTCCATTCTGATCAAGAATGACAGTTAGCTTCGGAGAA
GGAGGAAAGTCAGTAAAAGAGTGGGAGCTTTGGCATTATAATTTTTGGTACACTATTTTT
AGAAGTTTTCTTGTGTGTACGTGTAGTCATGTATCTTACAATAATAAAAATGTGGTTTAG
ATTAAAAGAAAAGAAGATGTTTTATATTTATTCTTCACATTAGGTGAGGATTCTGTTGTA
ATATAGTCTAAATGGTGATTTGTGCTATAGATGTGGTACAGTTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D267JQ C 312
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AATCAGAGGATGAGAGTGTTAATTCCATTCTGATCAAGAATGACAGTTAGCTTCGGAGAA
GGAGGAAAGTCAGTAAAAGAGTGGGAGCTTTGGCATTATAATTTTTGGTACACTATTTTT
AGAAGTTTTCTTGTGTGTACGTGTAGTCATGTATCTTACAATAATAAAAATGTGGTTTAG
ATTAAAAGAAAAGAAGATGTTTTATATTTATTCTTCACATTAGGTGAGGATTCTGTTGTA
ATATAGTCTAAATGGTGATTTGTGCTATAGATGTGGTACAGTTTTATTT

QA 1 469 1 469
DS 

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AGAAGATGTTTTATATTTATTCTTCACATTAGGTGAGGATTCTGTTGTAATATAGTCTAA
ATGGTGATTTGTGCTATAGATGTGGTACAGTTTTATTT

QA 1 158 1 158
DS 



AS 1 2

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ATTATTGTATTACCTCAGGTGTTTCGATTGTTTGCATCCATCTACATGGGACACAATCTC
AGTTCACTGAATCTGATGGTACTGCGTGATACCACGTTTTGGTGGAAGCTTCCTTAGGAT
AAAGAGGACCAGAATAGAAGGCAATATCTCCACCAACAGGTAATATATGAAGTTTAGGAT
TGGGTGATCCAAGACATCAAGATCTGCTGCATCGTCGAACGCATTAAAGCACATCATGAT
ACACCTGATGAGGAAACAGGTAAAGCATATGGATGTCACGTAACCGACCTCTTGCAGCTT
CTTGCGCCTCCCTTTGGATTCTACTGGAAACCGTTGCAGCATTAGGAAAAGCCTTCCTCC
GTATAATAAAAATCCAAGGGCTGCGAACAATGACACACCTGCAAAGAACATCTTGGAAAT
GACTACCATAACGTGAACAGGCTTCCACCACAAAACCAACCAAAGAGCAATCTGAACTAC
ATATACAAGAGCATTAATAGTGAAGAAACTTGGCCTCAGTCCATCAGTTGAAACAGCACG
TGCCTGGTAGTATATCTCAGCCCAAAAGAGGACGAGAAGAGCATACGTAGTGAAGAAAAC
AAGACTTGGAATGTCAAGCAACATATGCTGTAGAATCTCTGGCTGCATGTTCTGTGCATC
ACGCCTGAAGACAAACACTAGAGCTCGAACTCCGTTCACGAGGAAATTGAGAAAGTGAAA
GACTTTCTGCGTCGTCCATCCGTACTCTGGAACTCTCAACTGTATTCTCACCAATTGAAT
CACAGCAATGACGGAAACGATTGCGTATAGAACAGCGAGGATGTGGAAGATACGGCCCTG
CCAGACCGGAGATTCGTTCACGTCCCACCACCAATTCGTCGTAGCCTCCTTCAGATTAAG
CGAAGACGACGACGACGACGACGACGGAGAGGACAGAGAGTGCATCAGATACAAGCCGCC
GCCGGTTCTCATCGCTTAGGAATCAATGTAGTTTGGATTCGTTGATGGGTTTAGCTTCGA
TGAACGAAAAGAGAATCGATCGAATCGCTTTATCCTCTCTCTTTCTCCTTCCTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CT89JQ U 1
AF RR4B182TF C 583
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TAAAAAAACAAGAGATTTAACTTTCCACAATTTTCAGCTGTTTGACATGCTCCTATTTAT
ATTATTGTATTACCTCAGGTGTTTCGATTGTTTGCATCCATCTACATGGGACACAATCTC
AGTTCACTGAATCTGATGGTACTGCGTGATACCACGTTTTGGTGGAAGCTTCCTTAGGAT
AAAGAGGACCAGAATAGAAGGCAATATCTCCACCAACAGGTAATATATGAAGTTTAGGAT
TGGGTGATCCAAGACATCAAGATCTGCTGCATCGTCGAACGCATTAAAGCACATCATGAT
ACACCTGATGAGGAAACAGGTAAAGCATATGGATGTCACGTAACCGACCTCTTGCAGCTT
CTTGCGCCTCCCTTTGGATTCTACTGGAAACCGTTGCAGCATTAGGAAAAGCCTTCCTCC
GTATAATAAAAATCCAAGGGCTGCGAACAATGACACACCTGCAAAGAACATCTTGGAAAT
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TGCCTGGTAGTATATCTCAGCCCAAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4B182TF 678 0 0
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AAGAGCAATCTGAACTACATATACAAGAGCATTAATAGTGAAGAAACTTGGCCTCAGTCC
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ATACGTAGTGAAGAAAACAAGACTTGGAATGTCAAGCAACATATGCTGTAGAATCTCTGG
CTGCATGTTCTGTGCATCACGCCTGAAGACAAACACTAGAGCTCGAACTCCGTTCACGAG
GAAATTGAGAAAGTGAAAGACTTTCTGCGTCGTCCATCCGTACTCTGGAACTCTCAACTG
TATTCTCACCAATTGAATCACAGCAATGACGGAAACGATTGCGTATAGAACAGCGAGGAT
GTGGAAGATACGGCCCTGCCAGACCGGAGATTCGTTCACGTCCCACCACCAATTCGTCGT
AGCCTCCTTCAGATTAAGCGAAGACGACGACGACGACGACGACGGAGAGGACAGAGAGTG
CATCAGATACAAGCCGCCGCCGGTTCTCATCGCTTAGGAATCAATGTAGTTTGGATTCGT
TGATGGGTTTAGCTTCGATGAACGAAAAGAGAATCGATCGAATCGCTTTATCCTCTCTCT
TTCTCCTTCCTTGTTTCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6048Contig1 1216 2 8 U
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TTTAGAGAGAAGAGAGAATGATCGCAGACGGATCAGGAGAAGACGAAGAGAAATGGCTCG
CCGCCGGCGCTGCGGCTTTCAAGCAGAACGCATTTTACATGCAACGCGCTATTGATTCGA
ATAATCTGAAAGATGCTCTCAAGTACTCGGCTCAGATGCTTAGCGAGTTGCGGACTTCGA
AGCTTTCGCCTCACAAGTACTATGACCTCTATATGAGAGCTTTTGATGAGTTGAGGAAGC
TTGAGATTTTCTTCATGGAGGAAACTCGGCGTGGCTGCTCCGTCATTGAACTCTATGAGC
TTGTTCAGCATGCTGGTAACATATTACCACGCTTATATCTCCTGTGTACAGCAGGATCCG
TTTATATCAAAACCAAGGAAGCTCCTGCCAAGGAAATTCTTAAAGATCTTGTTGAGATGT
GCCGTGGGATTCAGCATCCTCTACGTGGTCTCTTCTTGAGAAGCTACCTTGCGCAAATTA
GTCGAGATAAATTACCTTACATTGGTTCTGAGTATGAAGGAGATGCTGATACAGTCACGG
ATGCGGTGGAGTTTGTACTACTGAACTTTACCGAGATGAATAAACTTTGGGTCAGAATGC
AACACCAGGGACCTGCTCGGGAAAAGGATAAACGGGAGAAAGAGAGGAGTGAGCTTCGTG
ACCTTGTTGGAAAGAACCTTCATGTGCTGAGCCAGTTAGAAGGTGTAGACCTTGATATGT
ATAGAGATACAGTTCTTCCTAGAGTCTTAGAGCAGATAGTGAACTGCCGAGATGAGATTG
CCCAATATTACCTAATGGACTGTATCATTCAAGTCTTCCCCGACGAGTATCACTTGCAGA
CTCTTGATGTACTTCTTGGGGCTTGTCCACAACTTCAGCCGTCGGTTGACATTATGACAG
TGCTTTCACGTTTAATGGAGAGGCTGTCAAGTTATGCTGCCTTAAATACTGAAGTTTTAC
CTTATTTCCTGCAAGTGGAAGCTTTCTCAAAGTTGAATAATGCAATTGGAAAGGTAATAG
AAGCACAAGAAGACATGCCTATTCTGAGTGCAGTAACCCTGTATTCTTCGCTTCTCAAGT
TTACTCTTCATGTTCACCCTGATCGGCTTGATTATGCGGACCAAGTGTTGGGATCATGTA
TTAAGCAATTGTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH56TF U 1
AF RR4FH56JQ C 560
BS 1 656 RR4FH56TF
BS 657 657 RR4FH56JQ
BS 658 686 RR4FH56TF
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BS 688 706 RR4FH56TF
BS 707 707 RR4FH56JQ
BS 708 725 RR4FH56TF
BS 726 1216 RR4FH56JQ

RD RR4FH56TF 727 0 0
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TTTAGAGAGAAGAGAGAATGATCGCAGACGGATCAGGAGAAGACGAAGAGAAATGGCTCG
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ATAATCTGAAAGATGCTCTCAAGTACTCGGCTCAGATGCTTAGCGAGTTGCGGACTTCGA
AGCTTTCGCCTCACAAGTACTATGACCTCTATATGAGAGCTTTTGATGAGTTGAGGAAGC
TTGAGATTTTCTTCATGGAGGAAACTCGGCGTGGCTGCTCCGTCATTGAACTCTATGAGC
TTGTTCAGCATGCTGGTAACATATTACCACGCTTATATCTCCTGTGTACAGCAGGATCCG
TTTATATCAAAACCAAGGAAGCTCCTGCCAAGGAAATTCTTAAAGATCTTGTTGAGATGT
GCCGTGGGATTCAGCATCCTCTACGTGGTCTCTTCTTGAGAAGCTACCTTGCGCAAATTA
GTCGAGATAAATTACCTTACATTGGTTCTGAGTATGAAGGAGATGCTGATACAGTCACGG
ATGCGGTGGAGTTTGTACTACTGAACTTTACCGAGATGAATAAACTTTGGGTCAGA*TGC
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ACCTT
TT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FH56JQ 657 0 0
CATTGGTTCTGAGTATGAAGGAGATGCTGATACAGTCACGGATGCGGTGGAGTTTGTACT
ACTGAACTTTACCGAGATGAATAAACTTTGGGTCAGAATGCAACACCAGGGACCTGCTCG
GGAAAAGGATAAACGGGAGAAAGAGAGGAGTGAGCTTCGTGACCTTGTTGGAAAGAACCT
TCATGTGCTGAGCCAGTTAGAAGGTGTAGACCTTGATATGTATAGAGATACAGTTCTTCC
TAGAGTCTTAGAGCAGATAGTGAACTGCCGAGATGAGATTGCCCAATATTACCTAATGGA
CTGTATCATTCAAGTCTTCCCCGACGAGTATCACTTGCAGACTCTTGATGTACTTCTTGG
GGCTTGTCCACAACTTCAGCCGTCGGTTGACATTATGACAGTGCTTTCACGTTTAATGGA
GAGGCTGTCAAGTTATGCTGCCTTAAATACTGAAGTTTTACCTTATTTCCTGCAAGTGGA
AGCTTTCTCAAAGTTGAATAATGCAATTGGAAAGGTAATAGAAGCACAAGAAGACATGCC
TATTCTGAGTGCAGTAACCCTGTATTCTTCGCTTCTCAAGTTTACTCTTCATGTTCACCC
TGATCGGCTTGATTATGCGGACCAAGTGTTGGGATCATGTATTAAGCAATTGTCTGC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL6049Contig1 1335 2 2 U
GGAGTTCTGTAATCCCTAAATCCCCAAAATTTCAGACAAGTTTAGATTCTCTTTCCTCCA
TCTCTCTCCTTCGGTTCGCGCTTGTGGAATACGTTCAGAAAGTGGGGTGGACAAAATGAA
TAACGGTGGTCCGTGGTTACCGGAAGAGGACTTTAAGGGTCTCACGGATAACTTCTTTGA
TGATCTCATCAATCATATCGATTTCCCTCTTGAGGACATCGAAACCACCAACGAAGAGGC
AGACTGGGGTGCCGACTTTAAGAACCTCATACCTCCACCATCGGATGTGCTCACAAGTTT
GTCCTCTGAGTTCACTCGTGCTGGCACCAATGGGCAGCTTGTGGAAGGAGCCCACAAGAA
GCCTGTGCCCACTTTGAAGCAGTCGGGAGGAATCTCTTCTACCGTTGATACTTCCCTCCC
TGATGTCAAAGTCTCAAAGCTGTTTCAGTCCTCAAGCCCAGTCTCAGTGCTCGAGAACAA
CGCAGCCAATGGTTCTGCAGCCTCGTTCCAGAACCAAAACAGAGCTCAGAGACTGGCCTT
CCCCGTCAAAGGCATCAGAAGCAAGCGCAAACGCCCCACAATCCCAACATTCTTATCCCG
CCACTCCTTCTTATCTGAAATGCTGGAGAGGAAGTTTGCTCTGGATGATGATTCAGACTC
TGAAGACACTTACCTCTCTTCTGAGAGTTCTGCCAAGAGGAGACGCAAGAAGAAGAACAG
CAACGTCTCTCACAGTCCTGAACCATTCAGCGCAGATGGGACAGTTGTCAGGAAGTGCAC
TCATTGCGAGTCAACCAAGACCCCACAGTGGACGGAAGGTCCCAATGGTCCTAAGACACT
CTGCAACGCTTGTGGAGTTCGGTTCAGATCAGGCCGTCTTCTTCCAGAGTACCGTCCAGC
TTCAAGCCCCACCTTCATCCCAACAGTGCATTCAAATTCTCACAGGAAGATCATAGAGAT
GAGATGGAAAGATGAAGAAGGCCAGTTTGGAACCGGAATGGCCCGTGGCTTTAGATACCG
AGCGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTTTGTAACTTTAGCAGACCGAAGTGAGTTTGGTCT
GTGAAAAAAACAAAAAACAAAACCAAAACAATGAGGATCCCTGGAATGGGGTTTAGCTCT
CTGTAAGACTTGTCTTCTTTAAAACTAGGGCTTAGTATCTGTCTTTTTTTTAAAAGAATC
TGATGCAGAGAGTTTCTTTAGGGTTTGTAGTTGGAAAGTTATAGGGTCTTTTAAAGTGTT
TGTTTGATTATGTTTTATATTTGGCTGACATCTGTTTTATCAAAGTAGTGTAATGCCAGT
TTTCTTTCTTAAACT


BQ
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AF RR4B119TF U 1
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BS 768 1335 RR4B119JQ

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TAACGGTGGTCCGTGGTTACCGGAAGAGGACTTTAAGGGTCTCACGGATAACTTCTTTGA
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AGACTGGGGTGCCGACTTTAAGAACCTCATACCTCCACCATCGGATGTGCTCACAAGTTT
GTCCTCTGAGTTCACTCGTGCTGGCACCAATGGGCAGCTTGTGGAAGGAGCCCACAAGAA
GCCTGTGCCCACTTTGAAGCAGTCGGGAGGAATCTCTTCTACCGTTGATACTTCCCTCCC
TGATGTCAAAGTCTCAAAGCTGTTTCAGTCCTCAAGCCCAGTCTCAGTGCTCGAGAACAA
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CCACTCCTTCTTATCTGAAATGCTGGAGAGGAAGTTTGCTCTGGATGATGATTCAGACTC
TGAAGACACTTACCTCTCTTCTGAGAGTTCTGCCAAGAGGAGACGCAAGAAGAAGAACAG
CAACGTCTCTCACAGTCCTGAACCATTCAGCGCAGATGGGACAGTTG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4B119JQ 721 0 0
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TCTCTTCTGAGAGTTCTGCCAAGAGGAGACGCAAGAAGAAGAACAGCAACGTCTCTCACA
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CCAAGACCCCACAGTGGACGGAAGGTCCCAATGGTCCTAAGACACTCTGCAACGCTTGTG
GAGTTCGGTTCAGATCAGGCCGTCTTCTTCCAGAGTACCGTCCAGCTTCAAGCCCCACCT
TCATCCCAACAGTGCATTCAAATTCTCACAGGAAGATCATAGAGATGAGATGGAAAGATG
AAGAAGGCCAGTTTGGAACCGGAATGGCCCGTGGCTTTAGATACCGAGCGTAGAGAGAGA
GAGAGAGAGACTTTGTAACTTTAGCAGACCGAAGTGAGTTTGGTCTGTGAAAAAAACAAA
AAACAAAACCAAAACAATGAGGATCCCTGGAATGGGGTTTAGCTCTCTGTAAGACTTGTC
TTCTTTAAAACTAGGGCTTAGTATCTGTCTTTTTTTTAAAAGAATCTGATGCAGAGAGTT
TCTTTAGGGTTTGTAGTTGGAAAGTTATAGGGTCTTTTAAAGTGTTTGTTTGATTATGTT
TTATATTTGGCTGACATCTGTTTTATCAAAGTAGTGTAATGCCAGTTTTCTTTCTTAAAC
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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GTTTTTTTTTATCTATCTTCTGTTTATATTTATATATGTATACAAACATAGAGCATACTT
TGATCTCTTCTGTTTCAGGGCTCTCATTAGGTTAGCCTTGTTTCGGAGTACTGGACATAA
GATGCTTCTCCATGGTGGGGAAACACCTAATGATGATGATGACAAAGATCCTAACCAACC
AGAGCTTCAAAATAGAGATAGGAACCATCGTTTTGGAAACCAAAATCCATGGAACTCGGA
AAGACGGGCAATGTCAGCTTTGAGTTCATTCGGTCAGAATGCAAGAACAGGAACAACAAC
AACAACAGCATCTTCTTCCAACTCGGGCTGGTCTCGAAGGATTCAACACCAGCAAGCAGT
TATAGAGCCACCTGTGGTGATGGTCAAGGAGGAACGAACAACAATCTCCGAGCTATTATC
TGAGAAGGGTGTTAAGGGAGCGTTGTTTGTAATGGGTGAGGTTCTTTACATAACCAGACC
GCTCATCTACGTTCTCTTTATAAGAAGATATGGGATCAGGTCTTGGATTCCTTGGGCTAT
TTCACTTTCTGTAGACACACTGGGGATGGGGATTCTTTCAAATCTGAATCTGTGGGGAGA
GGAGAGGAAGCAAATCCATTTCTCTCAACCTGAAAGAGACGAGCTTAGGAGAAGGGAGCT
GCTATGGGCATTGTACCTCATGAGAGATCCATTCTTCACCAAGTACACAAGGCAGAAGCT
GGAAAGCTCTCAGAAGAAGGTGGAACCAGTTCCACTGATAGGCTTCTTTACAGAGAAAAT
TGTGGAGCTTTTAGTGGGAGCTCAGACACGGTACACTTACATATCGGGATCTTGAGTTCA
ACCACTTTGTTGGAGTGTTATCCTGTTGTTCAATCTTGGAAGGCTAATGCAGAGATTAGT
AGGGAATGTTTCAGGCTTTTGTAAGAAAGTGCGTTTATTGTTGCAGTTAGGACATACAGT
CCCATAATAAAGATAGATGATGAGTTTTGCC


BQ
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AF RR4DD78TF U 1
AF RR4DD78JQ C 495
BS 1 647 RR4DD78TF
BS 648 1171 RR4DD78JQ

RD RR4DD78TF 647 0 0
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ATCCCCTACTCATCTCCATCCTCAAGGACTTGGAAACCGTTGTTGAAGTCGCTGCTGAGC
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GTTTTTTTTTATCTATCTTCTGTTTATATTTATATATGTATACAAACATAGAGCATACTT
TGATCTCTTCTGTTTCAGGGCTCTCATTAGGTTAGCCTTGTTTCGGAGTACTGGACATAA
GATGCTTCTCCATGGTGGGGAAACACCTAATGATGATGATGACAAAGATCCTAACCAACC
AGAGCTTCAAAATAGAGATAGGAACCATCGTTTTGGAAACCAAAATCCATGGAACTCGGA
AAGACGGGCAATGTCAGCTTTGAGTTCATTCGGTCAGAATGCAAGAACAGGAACAACAAC
AACAACAGCATCTTCTTCCAACTCGGGCTGGTCTCGAAGGATTCAACACCAGCAAGCAGT
TATAGAGCCACCTGTGGTGATGGTCAAGGAGGAACGAACAACAATCTCCGAGCTATTATC
TGAGAAGGGTGTTAAGGGAGCGTTGTTTGTAATGGGTGAGGTTCTTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4DD78JQ 677 0 0
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AGGGAGCGTTGTTTGTAATGGGTGAGGTTCTTTACATAACCAGACCGCTCATCTACGTTC
TCTTTATAAGAAGATATGGGATCAGGTCTTGGATTCCTTGGGCTATTTCACTTTCTGTAG
ACACACTGGGGATGGGGATTCTTTCAAATCTGAATCTGTGGGGAGAGGAGAGGAAGCAAA
TCCATTTCTCTCAACCTGAAAGAGACGAGCTTAGGAGAAGGGAGCTGCTATGGGCATTGT
ACCTCATGAGAGATCCATTCTTCACCAAGTACACAAGGCAGAAGCTGGAAAGCTCTCAGA
AGAAGGTGGAACCAGTTCCACTGATAGGCTTCTTTACAGAGAAAATTGTGGAGCTTTTAG
TGGGAGCTCAGACACGGTACACTTACATATCGGGATCTTGAGTTCAACCACTTTGTTGGA
GTGTTATCCTGTTGTTCAATCTTGGAAGGCTAATGCAGAGATTAGTAGGGAATGTTTCAG
GCTTTTGTAAGAAAGTGCGTTTATTGTTGCAGTTAGGACATACAGTCCCATAATAAAGAT
AGATGATGAGTTTTGCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6052Contig1 1090 2 4 U
GCAGGAAAACTCGTTGCTGGATAACACGGCGAGAATTGAAGATTGGTTAGCTAGGTTTCC
CATGTACGACTGGGTGGGTGGAAGAACACCAGTTATGTCTGCAGTTGGTCTGCTTCCAGC
TGCACTACAGGGAATTGATATTAGAGAGATGCTTGCTGGTGCTGCAATAATGGATGAGGC
TACCAGGACAACTTCGCTCAAGAATAACCCTGCAGCGCTCTTAGCAATGTGTTGGTACTG
GGCTTCTGATGGCGTTGGTTCCAAAGATATGGTTATACTTCCTTACAAGGATAGCTTACT
GCTATTTAGCCGGTATCTGCAGCAGTTGGTCATGGAATCACTAGGAAAGGAGTTTGATCT
TGACGGTAACACTGTTAATCAAGGGCTAACTGTATATGGAAACAAGGGGAGCACAGATCA
GCACGCCTACATTCAACAACTGAGGGAGGGTGTGCACAACTTCTTTGCAACCTTCATAGA
AGTGCTACGTGACAGACCTCCGGGTCATGATTGGGAGCTTGAGCCAGGTGTCACTTGTGG
TGACTACCTCTTTGGGATGCTTCAGGGAACTAGATCTGCTTTATATGCAAACGGTAGAGA
GTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGACACCAAGATCCGTTGGGGCTATTATAGCACT
TTATGAAAGAGCGGTCGGGTTGTATGCCTCATTTGTCAATATTAATGCTTACCACCAACC
TGGTGTGAAAGCCGGGAAGAAGGCGGCAGCTGAAGTTCTGGCGCTGCAAAAGCGTGTATT
GTCAGTTTTTAACGAAGCCAGTTGTAAAGATCCGGTAGAGCCATTGACACTGGACGAGAT
AGCTGACCGTTGCCATGCTCCTGAAGAAATTGAGATGATATACAAGATCATAGCTCACAT
GTTTGCATACGACAGAGTTTTGATAGCTGAAGGTAGCTGCGGATCGCCAAGGAGTGTTAA
AGTGTACCTGGGAGAGTGCAGTGTGGATGACATGTTCGCATAATAAAACTTTCCTCAAAC
GCACAAATGAGTCTCAATCTCTGTTCTGTTGTTTTTCCTTATTTATTTTTGCCAAACGTC
TATGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR87TF U 1
AF RR4FR87JQ C 581
BS 1 698 RR4FR87TF
BS 699 699 RR4FR87JQ
BS 700 737 RR4FR87TF
BS 738 1090 RR4FR87JQ

RD RR4FR87TF 738 0 0
GCAGGAAAACTCGTTGCTGGATAACACGGCGAGAATTGAAGATTGGTTAGCTAGGTTTCC
CATGTACGACTGGGTGGGTGGAAGAACACCAGTTATGTCTGCAGTTGGTCTGCTTCCAGC
TGCACTACAGGGAATTGATATTAGAGAGATGCTTGCTGGTGCTGCAATAATGGATGAGGC
TACCAGGACAACTTCGCTCAAGAATAACCCTGCAGCGCTCTTAGCAATGTGTTGGTACTG
GGCTTCTGATGGCGTTGGTTCCAAAGATATGGTTATACTTCCTTACAAGGATAGCTTACT
GCTATTTAGCCGGTATCTGCAGCAGTTGGTCATGGAATCACTAGGAAAGGAGTTTGATCT
TGACGGTAACACTGTTAATCAAGGGCTAACTGTATATGGAAACAAGGGGAGCACAGATCA
GCACGCCTACATTCAACAACTGAGGGAGGGTGTGCACAACTTCTTTGCAACCTTCATAGA
AGTGCTACGTGACAGACCTCCGGGTCATGATTGGGAGCTTGAGCCAGGTGTCACTTGTGG
TGACTACCTCTTTGGGATGCTTCAGGGAACTAGATCTGCTTTATATGCAAACGGTAGAGA
GTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGACACCAAGATCCGTTGGGGCTATTATAGCACT
TTATGAAAGAGCGGTCGGGTTGTATGCCTCATTTGTCA*TATTAATGCTTACCACCAACC
TGGTGTGAAAGCCGGGA
G

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FR87JQ 510 0 0
TTATATGCAAACGGTAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGACACCAAGATCC
GTTGGGGCTATTATAGCACTTTATGAAAGAGCGGTCGGGTTGTATGCCTCATTTGTCAAT
ATTAATGCTTACCACCAACCTGGTGTGAAAGCCGGGAAGAAGGCGGCAGCTGAAGTTCTG
GCGCTGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTTTTAACGAAGCCAGTTGTAAAGATCCGGTAGAG
CCATTGACACTGGACGAGATAGCTGACCGTTGCCATGCTCCTGAAGAAATTGAGATGATA
TACAAGATCATAGCTCACATGTTTGCATACGACAGAGTTTTGATAGCTGAAGGTAGCTGC
GGATCGCCAAGGAGTGTTAAAGTGTACCTGGGAGAGTGCAGTGTGGATGACATGTTCGCA
TAATAAAACTTTCCTCAAACGCACAAATGAGTCTCAATCTCTGTTCTGTTGTTTTTCCTT
ATTTATTTTTGCCAAACGTCTATGATTTTG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL6053Contig1 434 2 3 U
GTGCATCACCACAACATCGGATTCGTAGGTATAAATAAGTTAATACCATACCTTACCTTC
CTCATCATAAGGAAGATATAAGGATACGAATACTCAGCATACACACCAACCATGGTTTTA
TAGAAACCTGCGTATACTACCGAACAAACAGTTAAATTGCCAGACACAAATTCTAACTAT
TAGACCAGTCCTAAAAAAAAAACATTGTCTTCTTCAATATCTGGAATGCTATTTTTTACT
TCTTAATCCCAAATATGAACTAACTCAAGTTTGCTGCTCGGTTGAAAAACTAAGCACAAT
GGGTCATAAAGCATATCCTTCATCTCGGCTGATCTTCTGAAATTGGGTTCCTCAGTCGTT
CTCTCTGTCAGCATACAGAACTCTTCACCTTTCAAATGCGTTCAGGGTTTGGAAACATCA
GTTCGGCTTGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E965JQ U 190
AF RR4E965TF C 1
BS 1 189 RR4E965TF
BS 190 352 RR4E965JQ
BS 353 434 RR4E965TF

RD RR4E965JQ 163 0 0
CCTAAAAAAAAAACATTGTCTTCTTCAATATCTGGAATGCTATTTTTTACTTCTTAATCC
CAAATATGAACTAACTCAAGTTTGCTGCTCGGTTGAAAAACTAAGCACAATGGGTCATAA
AGCATATCCTTCATCTCGGCTGATCTTCTGAAATTGGGTTCCT

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR4E965TF 434 0 0
GTGCATCACCACAACATCGGATTCGTAGGTATAAATAAGTTAATACCATACCTTACCTTC
CTCATCATAAGGAAGATATAAGGATACGAATACTCAGCATACACACCAACCATGGTTTTA
TAGAAACCTGCGTATACTACCGAACAAACAGTTAAATTGCCAGACACAAATTCTAACTAT
TAGACCAGTCCTAAAAGAAAAACATTGTCTTCTTCAATATCTGGAATGCTATTTTTTACT
TCTTAATCCCAAATATGAACTAACTCAAGTTTGCTGCTCGGTTGAAAAACTAAGCACAAT
GGGTCATAGAGCATATCCTTCATCTCGGCTGATCTTCTGAGATTGGGTTCCTCAGTCGTT
CTCTCTGTCAGCATACAGAACTCTTCACCTTTCAAATGCGTTCAGGGTTTGGAAACATCA
GTTCGGCTTGAAGC

QA 1 434 1 434
DS 



AS 1 2

CO CL6054Contig1 1237 2 2 U
GGGAAAGCCTTAAGAAGATTATTCTTTTCTTAGCTTCTCTCACTTCTCGCAGGGGGAGAT
TTATAAAGCTTAGGGGGGGAGGGTCCCATGTTGACCTCACCATGCTCGTCTTCGTCTCTA
TTCTGCCATCGTCCAGCTCTCTCCTCCATCTCGCGTTCCAAGTTTAGGCTTCCTCGTCGC
GTCCTAGTCTCCCCTGCTCTCACCCACGTTTCTCCTCTTACCGCCTCCCCTTCCAAGTCC
GCCAAGCACAAATGGAAGATTCAGTGCTTCAGAAATGAGGATTCTGCTCCCGAGAATCCA
GAGCCTGGGGAATTCATTAAGCCAGATCAAGATATTCAGCCATGTACTGATCAAAAAGCT
AATTGGAACACAACTCTTCACAAGGCTGCCGATGCAGTTTTGAAGGGAATTGGTACTCGT
TGGAAGGTACCATGGACTGCTGAGACCATTGTTCAGGTAATGCTATTATGGGTAGCCGCC
TTCTGGTTCATTGGATCTTGGATGATCCCCTTCATGGCTCATATATCAGGTTTCCACAAG
GATTCTCTCACTTTTAGAGGCCAAGCTTTGTTCAGTCTTATAACCGATGTAACAGAAGGA
CTAGCCGGGATTGCTATCCTCCACCGTTGCCTCTCAATGTTCCGTCCACTTGCAAGTGAT
TGGTTCCGCTTTACTCTCAAAGGAAACTGGCAACTAGACGTCATCATAGGCTGTTTCATG
TTCCCTTTCGTTAACCGTCTCTCCCAGTTAAACCTAAACCTCTTGCCACTCCCACCAACC
TCAAGTCCTGTCTCGCTCTCTAGTGTGGAGCAGTCGATAATGGCTAGAGACCCTGTCGCG
ATTGCCCTGTATGCGGTTGTGGTATCGGTTTGTGCACCGGTTTGGGAAGAGATAGTGTTC
AGAGGGTTCTTGCTGCCGTTTCTGACTAGGTACATGCCGGCTTGGTGTGCGATTCTTGTG
AGCTCGGTTGCGTTTGCTTTGGCTCATTTCAATGTGCAGAGGATGTTGCCGCTGGTGTTC
CTTGGAGTGGTTTTGGGTTTGATATTCGCAAGGTCAAGGAACTTGTTGCCTTCGATGCTG
TTGCATAGCTTGTGGAATGGCTTTGTGTTCATGGAACTGATGCGATGATGATGAGGAGGA
GGAGGAATATATCTTATGTAGGGTGTCTGTTTCCTTTTCCCCTTATTCTTGTAATTGATT
CATGTTATGATTCTTATATATTTTTCATTAAATGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F074TF U 1
AF RR4F074JQ C 542
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BS 694 1237 RR4F074JQ

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GAGCCTGGGGAATTCATTAAGCCAGATCAAGATATTCAGCCATGTACTGATCAAAAAGCT
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CTAGCCGGGATTGCTATCCTCCACCGTTGCCTCTCAATGTTCCGTCCACTTGCAAGTGAT
TGGTTCCGCTTTACTCTCAAAGGAAACTGGCAA

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DS 

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TGCATAGCTTGTGGAATGGCTTTGTGTTCATGGAACTGATGCGATGATGATGAGGAGGAG
GAGGAATATATCTTATGTAGGGTGTCTGTTTCCTTTTCCCCTTATTCTTGTAATTGATTC
ATGTTATGATTCTTATATATTTTTCATTAAATGGGC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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AACTCTCCCTCGTCTCAGAAGCGAAAGTCTGCGGTTTACCGGCTTAGTTTCAAGAGGAGA
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CCTTCAACTTTTAAACTCCGTGGGGAAACCTATTTCAAAGACAAAAAGAAATCCCCAGCT
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GATGAAGAAGGCATGAGCATTGTACTTTACTTTAAATTACAGCACTGTTGCTTTCCGTGA
AAGGCTTAAGATCGTGGCTGGACTTGTTAACTCCGAAGATCTAGCTCTAGGCTCGACTGA
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CTTTAAGGGTCCAAACTACTTTGAGATTGATTTGGATGTCCATCGGTTCAGCTACATATC
AAGGAAAGGACTTGAAGCATTCAGAGATCGACTGAAGAATGGAATTCTTGATCTCGGTTT
AGCCATCCAGGCTCAGAAACCAGAAGAGCTGCCGGAACAAGTCTTGTGTTGTCTGAGGCT
GAGCCAGATTGACTTCGTTGACCGTGGTCAAATACCAATGCTACTAATCCCTGATGAAGG
GGAAACTCTGGTGTAAGCATTGCTATCATCTTGTATTACTCAACAACTCCTTTGGATGAA
GAAAACCAAATAATAAAAGTGTGTTAATTCATCAAAATACTGTATATTTCCAAATTATGT
GGACTTCTCTCTATTTCTATTTTATTTATTTATGCTATAACTTATATATGTAAAAACGTT
CATAATGCAAAACTCTTAGAAGTTCATCTTCTGGAGTTTGGCCTTTCTGTTGTAACTTTG
TACTCTGTTACCTCAATGGTATTATTATGATATTATCTGTGTT


BQ
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AF RR4F705TF U 1
AF RR4F705JQ C 519
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BS 680 1243 RR4F705JQ

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ACCCTGAAATCCAGCCTGAGCAGGTTGATGCCGACGGTTAGTTTCAACGACAAGACTCTG
AACTCTCCCTCGTCTCAGAAGCGAAAGTCTGCGGTTTACCGGCTTAGTTTCAAGAGGAGA
TCATGCGATGGTGAGGAAGTTACGGAGCAGCGTAAGTTGCTGTACCGTCCGAAGGCGGGT
ATCACCATTCCTTGCTCTGCCAGAGAGAAGCAGTCCAGTGGAAGCTGGTGTGAGATACCA
CCTTCAACTTTTAAACTCCGTGGGGAAACCTATTTCAAAGACAAAAAGAAATCCCCAGCT
CCAAATCAATGTGCTTACATTCCTATTGGCGTTGATTTGTTTGTCTGTCCAAAGAAGGTT
GATCATATCGCTCAACACATCGAGCTTCCAAACATCAAAACCGAGGCAAAGCTCCCTGCG
CTTCTCGTTGTCAACATTCAGTTACCAACCTATCCTGCTGCAATGTTCCTTGGAGATAGT
GATGAAGAAGGCATGAGCATTGTACTTTACTTTAAATTACAGCACTGTTGCTTTCCGTGA
AAG*CTTAAGATCGTGGCTGGACTTGTTAACTCCGAAGATCTAGCTCTAGGCTCGACTGA
GAAGAAGCTTGTACAGGCT

QA 1 679 1 679
DS 

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TGCAATGTTCCT*GGAGATAGTGATGAAGAAGGCATGAGCATTGTACTTTACTTTAAATT
ACAGCACTGTTGCTTTCCGTGAAAGGCTTAAGATCGTGGCTGGACTTGTTAACTCCGAAG
ATCTAGCTCTAGGCTCGACTGAGAAGAAGCTTGTACAGGCTTACAATGAAAAGCCCGTTC
TCTCTCGTCCTCAACACAACTTCTTTAAGGGTCCAAACTACTTTGAGATTGATTTGGATG
TCCATCGGTTCAGCTACATATCAAGGAAAGGACTTGAAGCATTCAGAGATCGACTGAAGA
ATGGAATTCTTGATCTCGGTTTAGCCATCCAGGCTCAGAAACCAGAAGAGCTGCCGGAAC
AAGTCTTGTGTTGTCTGAGGCTGAGCCAGATTGACTTCGTTGACCGTGGTCAAATACCAA
TGCTACTAATCCCTGATGAAGGGGAAACTCTGGTGTAAGCATTGCTATCATCTTGTATTA
CTCAACAACTCCTTTGGATGAAGAAAACCAAATAATAAAAGTGTGTTAATTCATCAAAAT
ACTGTATATTTCCAAATTATGTGGACTTCTCTCTATTTCTATTTTATTTATTTATGCTAT
AACTTATATATGTAAAAACGTTCATAATGCAAAACTCTTAGAAGTTCATCTTCTGGAGTT
TGGCCTTTCTGTTGTAACTTTGTACTCTGTTACCTCAATGGTATTATTATGATATTATCT
GTGTT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6057Contig1 1077 2 2 U
GGAAACAGAGTCTCGCTATGAATCGTAAGCAACACACTTGAAGAAAATATAGCTGATGGG
TTTCATCTCTCTGCAATCTTGGAGCAGAGGAGCTTCAACTTGTGTTAATCTCCTTCGTCC
CCAGGTAGCTGGTCCGTACCCTAAGCTATACGATGGTGGAGCAGTGCAAGCAGTCAAGTT
TGACGTGAGAGCCTCTTGGAGTCGTAAATCGTTTAAGAAACTCAGAAGAGAGACTCAATT
ACAAGGTAAAGACACAACCACAAAAAATGTTACAGAAGCAGATCAAGAAGAAGAAGAAGT
AATAGCTCGAGTTGATGATGACACTTCGACTTCAAAGGCCTCCTCTATCAATGTTGTTGT
TGCTGCTGCTGCTCCTCGAGACAAAGTGCTTCAAGCCTGCACTTTAACTTCCGGTTTAAT
GGCTGCATTAGGCCTTCTCATCAGGAAGGCCTCTCATGTTGCGTCGACTGAAGGGTTACC
AATCCCAGACTGCTCTTCGGATATACCATTTGGTTTCGAAACTTGGCATCTCGGGTTAAT
CGCTGGAACGGTTGTGTTGATATCGTCAAGCAGGTTCTTGCTACTAAAGTCTTGGCCAGA
TTTTTCTGATTCAAGTGAAGCAGCAAACCAACAGATCCTTACTTCGCTGGAACCGCTAGA
CTACCTCGTTGTTGCTACTTTACCTGGTATTAGTGGGGAGATGCTGTTTAGAGGTGCGTT
GATGCCTTTGTTTGGAACCAGTTGGGGCAGTATTGTGGGAGTTGGACTCGTCTTCGGTTT
ACTTCATCTTGGAAGCGGAAGAAAGTACTCCTTTGCTGTTTGGGCGTCGGCTGTGGGTAT
AGTCTACGGTTACGCAGCGGTTCTGTCGTCGAGTCTTGTCGTTCCGATAGCTTCTCATGC
ACTCAACAATTTGGTCGGAGGTTTGCTGTGGCGTTATAGTAGTAGTAGTACTAGTTCCAA
GCTCAAGTCTTTGGAGTGAGAGTTGTTTACATAATGTTTATAAAATGGGGCTTAATTTGA
AAAGCTTACATTTTTGTGGGTCGTTTTGTGAAATATTTATAGTATTAGGGTGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F128TF U 1
AF RR4F128JQ C 401
BS 1 555 RR4F128TF
BS 556 1077 RR4F128JQ

RD RR4F128TF 555 0 0
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TTTCATCTCTCTGCAATCTTGGAGCAGAGGAGCTTCAACTTGTGTTAATCTCCTTCGTCC
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TGACGTGAGAGCCTCTTGGAGTCGTAAATCGTTTAAGAAACTCAGAAGAGAGACTCAATT
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TGCTGCTGCTGCTCCTCGAGACAAAGTGCTTCAAGCCTGCACTTTAACTTCCGGTTTAAT
GGCTGCATTAGGCCTTCTCATCAGGAAGGCCTCTCATGTTGCGTCGACTGAAGGGTTACC
AATCCCAGACTGCTCTTCGGATATACCATTTGGTTTCGAAACTTGGCATCTCGGGTTAAT
CGCTGGAACGGTTGT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4F128JQ 677 0 0
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GCGTCGACTGAAGGGTTACCAATCCCAGACTGCTCTTCGGATATACCATTTGGTTTCGAA
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CTACTAAAGTCTTGGCCAGATTTTTCTGATTCAAGTGAAGCAGCAAACCAACAGATCCTT
ACTTCGCTGGAACCGCTAGACTACCTCGTTGTTGCTACTTTACCTGGTATTAGTGGGGAG
ATGCTGTTTAGAGGTGCGTTGATGCCTTTGTTTGGAACCAGTTGGGGCAGTATTGTGGGA
GTTGGACTCGTCTTCGGTTTACTTCATCTTGGAAGCGGAAGAAAGTACTCCTTTGCTGTT
TGGGCGTCGGCTGTGGGTATAGTCTACGGTTACGCAGCGGTTCTGTCGTCGAGTCTTGTC
GTTCCGATAGCTTCTCATGCACTCAACAATTTGGTCGGAGGTTTGCTGTGGCGTTATAGT
AGTAGTAGTACTAGTTCCAAGCTCAAGTCTTTGGAGTGAGAGTTGTTTACATAATGTTTA
TAAAATGGGGCTTAATTTGAAAAGCTTACATTTTTGTGGGTCGTTTTGTGAAATATTTAT
AGTATTAGGGTGATTAC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAAGACACCGTTAGAGCAGAGGCAAAGAGCCACAACAACGTTCACTTAATGTTGGTTGAT
GGAATGTCTAAGGTAATGACTCGACAAGTTGAGAATTGTGTGTCATCGGATATCTACGTT
GGTGGTCTAAAATGGAACATCGTTATCTTGACACAGCAGGACTGCCTATACTATGCTCTG
GTTATCACCGACAGCAAGTGTATCGGTTCTAGTTGGAAAGTCAATTGCAACGTCAAACTT
ACCATATACTCAGCTACTTGTTCAATCCTTAACTACAACCGCTGGACGTGGTTTTGTTTC
GACGCAAACAATTCTACATTATTGGTAAGCATCCCACTCAACAACATGAAGGAGTTATAC
ACTGTGAACGACAAATCAGTTTTCTCAGCCGAGATCACTAACGTCAACCCGCAATCCCTC
GACGTTAGCTGCACCCCTCGAACTATAGGGACTGCAGAAAGCATTAAACTGATAGAGGTG
GGGAGAAACAAGTCTAAATTCACTTGGAAGATTACTCACTTCTCCACCTTCGTTGATGAA
CATCATTCCTCGTACCAGTTCACCGTTGGACCACGCAGATGGTACCTACGGATGTACCCG
AAAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTCATTGTCTTTGTATTTGCATGCGTCTGATTAC
GTGACTAGTCCAAATACAAAAACTTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGTTGGACCAATTCA
AACGCAATCACCATGAAATAGGCCAGCACTTCTGGTTTGACTCTGATGGGCAGAAGGGAG
AATCCAAGTTTTTGGCGCTGGAGGAATTGCACAAGGCTTCAAACGGATTTCTGGTGAAAG
ACCAGATATATATTGGTGTTGAGTTCTTCTATATCTCCACTACCCAGAATATGATATTAT
TGTTAATTATCAATGAATTAATTAAGACCACAAGAATAAATAGCTCCTGGAGAGGAACTT
ATCTACCTATTCGAGACAAAAAAAATCTACTTATCCCCTAATTTGCATATCATGGTGTGT
TTAGAAATGCAAAAATAAAACGATCAAATCGGTTGCTTGTACTCTCGGGCATTATAACAT
TCAACCGAATCTGATGCTATGTCTTATGTATCCGATTGCTTTTTTTGTTGGAGTGAAAAC
CTTTCTAGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E669TF U 1
AF RR4E669JQ C 490
BS 1 647 RR4E669TF
BS 648 1210 RR4E669JQ

RD RR4E669TF 647 0 0
AAACGAGAGCTGCAGTGTTTTTAGACGACCAACCTTGAAATGGGTCAAACTTTGTCACTT
GAAGACACCGTTAGAGCAGAGGCAAAGAGCCACAACAACGTTCACTTAATGTTGGTTGAT
GGAATGTCTAAGGTAATGACTCGACAAGTTGAGAATTGTGTGTCATCGGATATCTACGTT
GGTGGTCTAAAATGGAACATCGTTATCTTGACACAGCAGGACTGCCTATACTATGCTCTG
GTTATCACCGACAGCAAGTGTATCGGTTCTAGTTGGAAAGTCAATTGCAACGTCAAACTT
ACCATATACTCAGCTACTTGTTCAATCCTTAACTACAACCGCTGGACGTGGTTTTGTTTC
GACGCAAACAATTCTACATTATTGGTAAGCATCCCACTCAACAACATGAAGGAGTTATAC
ACTGTGAACGACAAATCAGTTTTCTCAGCCGAGATCACTAACGTCAACCCGCAATCCCTC
GACGTTAGCTGCACCCCTCGAACTATAGGGACTGCAGAAAGCATTAAACTGATAGAGGTG
GGGAGAAACAAGTCTAAATTCACTTGGAAGATTACTCACTTCTCCACCTTCGTTGATGAA
CATCATTCCTCGTACCAGTTCACCGTTGGACCACGCAGATGGTACCT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4E669JQ 721 0 0
TGCACCCCTCGAACTATAGGGACTGCAGAAAGCATTAAACTGATAGAGGTGGGGAGAAAC
AAGTCTAAATTCACTTGGAAGATTACTCACTTCTCCACCTTCGTTGATGAACATCATTCC
TCGTACCAGTTCACCGTTGGACCACGCAGATGGTACCTACGGATGTACCCGAAAGGAACC
TTAGAGGGGAAAGGAAATTCATTGTCTTTGTATTTGCATGCGTCTGATTACGTGACTAGT
CCAAATACAAAAACTTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGTTGGACCAATTCAAACGCAATC
ACCATGAAATAGGCCAGCACTTCTGGTTTGACTCTGATGGGCAGAAGGGAGAATCCAAGT
TTTTGGCGCTGGAGGAATTGCACAAGGCTTCAAACGGATTTCTGGTGAAAGACCAGATAT
ATATTGGTGTTGAGTTCTTCTATATCTCCACTACCCAGAATATGATATTATTGTTAATTA
TCAATGAATTAATTAAGACCACAAGAATAAATAGCTCCTGGAGAGGAACTTATCTACCTA
TTCGAGACAAAAAAAATCTACTTATCCCCTAATTTGCATATCATGGTGTGTTTAGAAATG
CAAAAATAAAACGATCAAATCGGTTGCTTGTACTCTCGGGCATTATAACATTCAACCGAA
TCTGATGCTATGTCTTATGTATCCGATTGCTTTTTTTGTTGGAGTGAAAACCTTTCTAGA
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6060Contig1 365 2 2 U
CCTTATCAGAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACTC
GAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTCGACTGCAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTC
GACTGAAAAGGCGTTCCTCGGAGTGACTCGAGCACTTGTCTAGAGAGGTGCTTTAGCAAC
TCGACTGAAAGGAGAGGCCAAGGACGGGGTCGAACCGTCATTCCAGGATTTGCAGTCCAA
TACATTGCCATTATGTTACCTAGCCAAACCCGCCACCTCATGTGCCAAAGTCAAACGGTT
GTTCTTTCTTCCCTCTTTTTTATATATATATGCTGTGGCGGGCGGAGCGGCATAGCGAAA
AAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4GV52TF C 1
AF RR4GV52JQ U 109
BS 1 108 RR4GV52TF
BS 109 365 RR4GV52JQ

RD RR4GV52TF 263 0 0
CCTTATCAGAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACTC
GAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTCGACTGCAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTC
GACTGAAAAGGCGTTCCTCGGAGTGACTCGAGCACTTGTCTAGAGAGGTGCTTTAGCAAC
TCGACTGAAAGGAGAGGCCAAGGACGGGGTCGAACCGTCATTCCAGGATTTGCAGTCCAA
TACATTGCCATTATGTTACCTAG

QA 1 263 1 263
DS 

RD RR4GV52JQ 257 0 0
CTTTAGCAACTCGACTGAAAAGGCGTTCCTCGGAGTGACTCGAGCACTTGTCTAGAGAGG
TGCTTTAGCAACTCGACTGAAAGGAGAGGCCAAGGACGGGGTCGAACCGTCATTCCAGGA
TTTGCAGTCCAATACATTGCCATTATGTTACCTAGCCAAACCCGCCACCTCATGTGCCAA
AGTCAAACGGTTGTTCTTTCTTCCCTCTTTTTTATATATATATGCTGTGGCGGGCGGAGC
GGCATAGCGAAAAAAAA

QA 1 257 1 257
DS 



AS 1 2

CO CL6061Contig1 1024 2 2 U
GGTGGCCACTAATGTAGCAACAAAAAAAAACAGAGCACGTTGGCAGGGAAGAGCCCAGAC
ACGAAGAGAGGGAGAGATCTTATCCATGGCTGCTATTACTAGTCTCCAAGCAATCCATCT
CAAACTCGGGAGACGTGGCAGCATCCGTTGCGGGATCGCGGAGCCGAGCGGAGTACCAGC
TCCGGTAGGGCAGAAGACTAGATACAACGATGGCTTAGCTGAGAGAGTGTTCATGGGGCT
GTTCGCGAGGAAGATGGACAAGTTTGGTGGCTCGAAGAAGAAGAAGAAGGATGAGACGAA
GGAGAAAGAGTTTTGGGAATACGACTACGAGAGCTTCGTTGAGGTTTCAAAGGGAGTGAT
GCAAGGCCGATCAAGGGCACAGCAGCAAGAGGTTGTGAGAGAGGTTCTTCTCTCCATGCT
CCCTCCCGGCGCTCCTGAACAGTTTAGAAAACTCTTCCCACCGACGAAATGGGCAGCAGA
GTTCAATGCAGCTCTTACGGTGCCTTTCTTTCACTGGCTGGTTGGTCCTTCTCAGGTCAT
AGAAGTGGAAGTGAATGGTGTGAAACAGAAAAGTGGCGTTCGTATAAAGAAATGCAGGTA
TCTAGAGAACAGTGGGTGTGTAGGAATGTGTGTGAATATGTGCAAGATCCCAACACAAGA
TTTCTTCACCAATGAGTTTGGTCTCCCACTCACCATGAACCCAAATTTTGAAGATATGAG
TTGCGAGATGATATACGGACAAGTGCCTCCTACATTTGAGGAAGATCCAGCCACCAAACA
ACCTTGTTTAGCAGACATATGTTCTATAGCCAATCCGAGCTCCCCAATCTGCCCTAAACT
ACAAGCATGAACAGCATTGGATCAGCCAGATGTGCAATTTCCAAAGATATACATTTACAT
ACCTTTTCACACACACACACAGAAAAGTCACAATATTGTAGAGATTTGATACTGGTTTGT
ATTATTATGTGTTTCTATTCTGGTTGAGTTGTGAAAGTATGCGATGATACACAGTTGACC
TACT


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4DF32TF U 1
AF RR4DF32JQ C 439
BS 1 593 RR4DF32TF
BS 594 1024 RR4DF32JQ

RD RR4DF32TF 593 0 0
GGTGGCCACTAATGTAGCAACAAAAAAAAACAGAGCACGTTGGCAGGGAAGAGCCCAGAC
ACGAAGAGAGGGAGAGATCTTATCCATGGCTGCTATTACTAGTCTCCAAGCAATCCATCT
CAAACTCGGGAGACGTGGCAGCATCCGTTGCGGGATCGCGGAGCCGAGCGGAGTACCAGC
TCCGGTAGGGCAGAAGACTAGATACAACGATGGCTTAGCTGAGAGAGTGTTCATGGGGCT
GTTCGCGAGGAAGATGGACAAGTTTGGTGGCTCGAAGAAGAAGAAGAAGGATGAGACGAA
GGAGAAAGAGTTTTGGGAATACGACTACGAGAGCTTCGTTGAGGTTTCAAAGGGAGTGAT
GCAAGGCCGATCAAGGGCACAGCAGCAAGAGGTTGTGAGAGAGGTTCTTCTCTCCATGCT
CCCTCCCGGCGCTCCTGAACAGTTTAGAAAACTCTTCCCACCGACGAAATGGGCAGCAGA
GTTCAATGCAGCTCTTACGGTGCCTTTCTTTCACTGGCTGGTTGGTCCTTCTCAGGTCAT
AGAAGTGGAAGTGAATGGTGTGAAACAGAAAAGTGGCGTTCGTATAAAGAAAT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4DF32JQ 586 0 0
ACAGTTTAGAAAACTCTTCCCACCGACGAAATGGGCAGCAGAGTTCAATGCAGCTCTTAC
GGTGCCTTTCTTTCACTGGCTGGTTGGTCCTTCTCAGGTCATAGAAGTGGAAGTGAATGG
TGTGAAACAGAAAAGTGGCGTTCGTATAAAGAAATGCAGGTATCTAGAGAACAGTGGGTG
TGTAGGAATGTGTGTGAATATGTGCAAGATCCCAACACAAGATTTCTTCACCAATGAGTT
TGGTCTCCCACTCACCATGAACCCAAATTTTGAAGATATGAGTTGCGAGATGATATACGG
ACAAGTGCCTCCTACATTTGAGGAAGATCCAGCCACCAAACAACCTTGTTTAGCAGACAT
ATGTTCTATAGCCAATCCGAGCTCCCCAATCTGCCCTAAACTACAAGCATGAACAGCATT
GGATCAGCCAGATGTGCAATTTCCAAAGATATACATTTACATACCTTTTCACACACACAC
ACAGAAAAGTCACAATATTGTAGAGATTTGATACTGGTTTGTATTATTATGTGTTTCTAT
TCTGGTTGAGTTGTGAAAGTATGCGATGATACACAGTTGACCTACT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL6062Contig1 814 2 2 U
GGATACCTTCTTCTTTCTCTGATTCAACATCAAATCTCTCTCGCGAAAACCCTAATTCTC
TCTTTCGATTCTTTCTTTCGATTCTCTCTTACGATTCTCTCGTTCAAGATGCAAATTTTC
GTGAAAACTCTCACCGGCAAGACCATCACTCTCGAAGTCGAGAGCTCCGATACCATCACT
TTGGAGGTGGAGAGCTCTGTACGATCGATAACGTCAAGGCTAAGATTCAGGACAAGGAAG
GGATCCCACCGGACCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGGAAACAGCTTGAGGATAGTCGTA
CGCTTGCAGATTACAATATCCAGAAGGAGTCGACCCTTCACCTTGTGTTGCGTCTCCGTG
GTGGTATGCAAATCTTTGTGAAGACTCTGACAGGCAAGACTATTACCTTGGAAGTTGAGA
GCTCAGACACAATCGACAATGTGAAGGCTAAAATTCAGGACAGGGAAGGGATCCCTCCGG
ACCAACAGAGACTCATCTTCGCTGGTAAGCAGCTTGAGGATGGTCGCACGCTTGCTGACT
ACAATATCCAGAAGGAGTCAACGCTTCACTTGGTTCTTCGTCTTCGTGGTGGACGCTTCT
GAGCGTTGTGATCTGTGTGGTTCTTTGAGGTTCGTTAATGCACTTGGGATGGGATGTGAT
CTCTGTTTTGCTTCTGCAAAACTGGATTATCTGTTTCGTCATGTTTTTCATGTTCTGTTT
TCTTTTTTTTCTTTTCGTTGTGAACCTTTCGGTTGGGCTCTTGATGGCCCCTTTATGTTT
CAAGTTTAAATAATAATCCAAGTGCTTGCGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY94TF U 1
AF RR4GY94JQ C 577
BS 1 729 RR4GY94TF
BS 730 814 RR4GY94JQ

RD RR4GY94TF 736 0 0
GGATACCTTCTTCTTTCTCTGATTCAACATCAAATCTCTCTCGCGAAAACCCTAATTCTC
TCTTTCGATTCTTTCTTTCGATTCTCTCTTACGATTCTCTCGTTCAAGATGCAAATTTTC
GTGAAAACTCTCACCGGCAAGACCATCACTCTCGAAGTCGAGAGCTCCGATACCATCACT
TTGGAGGTGGAGAGCTCTGTACGATCGATAACGTCAAGGCTAAGATTCAGGACAAGGAAG
GGATCCCACCGGACCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGGAAACAGCTTGAGGATAGTCGTA
CGCTTGCAGATTACAATATCCAGAAGGAGTCGACCCTTCACCTTGTGTTGCGTCTCCGTG
GTGGTATGCAAATCTTTGTGAAGACTCTGACAGGCAAGACTATTACCTTGGAAGTTGAGA
GCTCAGACACAATCGACAATGTGAAGGCTAAAATTCAGGACAGGGAAGGGATCCCTCCGG
ACCAACAGAGACTCATCTTCGCTGGTAAGCAGCTTGAGGATGGTCGCACGCTTGCTGACT
ACAATATCCAGAAGGAGTCAACGCTTCACTTGGTTCTTCGTCTTCGTGGTGGACGCTTCT
GAGCGTTGTGATCTGTGTGGTTCTTTGAGGTTCGTTAATGCACTTGGGATGGGATGTGAT
CTCTGTTTTGCTTCTGCAAAACTGGATTATCTGTTTCGTCATGTTTTTCATGTTCTGTTT
TCTTTTTTT
CTTTCGT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4GY94JQ 238 0 0
TTCGTCTTCGTGGTGGACGCTTCTGAGCGTTGTGATCTGTGTGGTTCTTTGAGGTTCGTT
AATGCACTTGGGATGGGATGTGATCTCTGTTTTGCTTCTGCAAAACTGGATTATCTGTTT
CGTCATGTTTTTCATGTTCTGTTTTCTTTTTTTTCTTTTCGTTGTGAACCTTTCGGTTGG
GCTCTTGATGGCCCCTTTATGTTTCAAGTTTAAATAATAATCCAAGTGCTTGCGGACC

QA 1 238 1 238
DS 



AS 1 2

CO CL6063Contig1 606 2 3 U
ACTTATTGTCTTGATTTAAAATTGTAATACAGACGCATTCAGACTAAAAGCTTAAAACCC
AAGATGAACTACATAGATGGAATAATCCTTGATAAATCAAATGAAGCAAGGGCAGAGAAC
CGATTCGTAAGCTCACTAAACGTCCTTTGCTCCTTCTCATCTCCTTCTGCTCTGTTTTTA
ATAAGTAGCTGTTGATGACCAATGTTCTTTGCTCTTGGGCTGGCCTGCTAGCGTATCACC
GAGGACCAAATCATCAACTTGTGGGTCTGAATGAATAAACCCTCTTTTAATTTTCAACCC
ATGCTTTCCCTTCTTTTTTCTTGTAATGGGCGCCTTCTTTGCAATGGACTTTTCATCATC
ACATATTACTTGTTGATTGGGTTTAAGCCTGCAGAAGCTGTGTACAATCTCTCTACAGAA
CACATGAATGACCTTAGCTTGAAACACTTTTGTCTTGTCAAGCGGATCTTTGGCTACAAA
CGTGATGAAGTAGACCTCTCCGCTGTTGGAGTAAATATTTGCTTTCTCAACCTCAACGAA
CTCAAAATCAGTCCCCTCTGTTTTGTTGTAGATCTCAATGGCTTCCGCAGGGAGTCTACC
GAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV50JQ U 233
AF RR4FV50TF C 1
BS 1 232 RR4FV50TF
BS 233 393 RR4FV50JQ
BS 394 606 RR4FV50TF

RD RR4FV50JQ 163 0 0
GTATCACCGAGGACCAAATCATCAACTTGTGGGTCTGAATGAATAAACCCTCTTTTAATT
TTCAACCCATGCTTTCCCTTCTTTTTTCTTGTAATGGGCGCCTTCTTTGCAATGGACTTT
TCATCATCACATATTACTTGTTGATTGGGTTTAAGCCTGCA
AA

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR4FV50TF 606 0 0
ACTTATTGTCTTGATTTAAAATTGTAATACAGACGCATTCAGACTAAAAGCTTAAAACCC
AAGATGAACTACATAGATGGAATAATCCTTGATAAATCAAATGAAGCAAGGGCAGAGAAC
CGATTCGTAAGCTCACTAAACGTCCTTTGCTCCTTCTCATCTCCTTCTGCTCTGTTTTTA
ATAAGTAGCTGTTGATGACCAATGTTCTTTGCTCTTGGGCTGGCCTGCTAGCGTATCACC
GAGGACCAAATCATCAACTTGTGGGTCTGAATGAATAGACCCTCTTTTAATTTTCAACCC
ATGCTTTCTCTTCTTTTTTCTTGTAATGGGCGCCTTCTTTGCAATGGACTTTTCATCATC
ACATATTACTTGTTGATTGGGTTTAAGCCTGCAGAAGCTGTGTACAATCTCTCTACAGAA
CACATGAATGACCTTAGCTTGAAACACTTTTGTCTTGTCAAGCGGATCTTTGGCTACAAA
CGTGATGAAGTAGACCTCTCCGCTGTTGGAGTAAATATTTGCTTTCTCAACCTCAACGAA
CTCAAAATCAGTCCCCTCTGTTTTGTTGTAGATCTCAATGGCTTCCGCAGGGAGTCTACC
GAAAAA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL6064Contig1 1387 2 2 U
GGGTCATTTCCAAAAATACACACAGGACAGAACAGAAGAGAAGAGGAGAGGAGAGAAGAA
ACAAAACCGAACTCTTCAAACTCGAGAGAAAGGTGCAAAACCTACGAGAAAGCGAGAGAG
AACTAAACTAATCGAATCTGGTGGAACAATGGCTAATTTGCCTCCATCTCTCTCCATGGG
CACTCCTTTCGGTGGTCCCAGCACGTCGGTCGGAGCTCCGGCGGCGAACAAAGATCGAAA
CTTGGCATCGGCAGAGCAGTTGGTTCTCGATCTCAGCAATCCTGAACTCAGAGAAAATGC
TCTTCTCGAGCTTTCCAAGAAAAGAGAACTGTTTCAGGATTTGGCGCCTCTCTTGTGGAA
CTCTTTCGGTACCATTGCCGCCTTGTTACAGGAGATGGTGTCAATCTACTCTGTTCTCGC
ACCTCCGAATCTGACTCCTGCTCAGTCCAACCGTGTTTGCAACTCACTCGCCCTTCTTCA
GTGCGTAGCATCTCATTCCGACACGAGGATGTTATTTCTCAAGGCTCACATCCCATTGTA
CCTTTATCCCTTCCTGAATGCAACGAGTAAGTCAAGACCTTTCGAATACTTGCGCCTTAC
TAGCTTAGGTGTCATTGGTGCTCTTGTCAAGGTACAACCCATCCTCTCCCTTTGCTCTAA
AAATTCTTGGTTTCTGAATGAATGGGGTTATCTTTCTTTTAGCTAAGTTAGTGTATGAAA
TAAGGAAAGATCCTTTCACTCTGTTACCCCAGGTTGATGACACAGAGGTCATTAGCTTCC
TTCTTTCAACTGGAATTATTCCTCTGTGCCTCCGCACCATGGAGATGGGGAGTGAGCTGT
CCAAAACTGTTGCGACATTCATAGTTCAAAAGATCTTGTTGGATGACGTGGGGATGGATT
ACATCTGCACTACAGCAGAGCGTTTTTTTGCTGTTGTTAGAGTGTTGGGAAATATGGTTC
AGTCACTCGTTGAGCAGCCTTCTCCACGCCTTTTGAAGCATATCATTCGTTGTTACCTCC
GTTTATCTGACAACCCAAGGGCTTGTGCTGCACTCGGAAGCTGTCTCCCTGACTCGCTAC
GAGATGGGACCTTCAGCAATTGTCTTCGCGAGGATCAAATCGCGAGGAGGTGGCTGCAAC
AGCTGGTTCACAATGTTGGAGTTGGTCGAGTCCCATCACATCAAGGTGGAGGATTTGAGC
ACATGCTCTGAGATGCTGAATTCATCTCAGCCTATCTTTGTATTGCTTTTTTTGTTTGTT
TGTTTGTTTGTTTCTAATTTATTCATGTACTTTTGATGCCTTAACTTGGATGATGTGTGT
TATAGGCTCTTTTAATCTGTTTGAAATTTTCTACTTTTTGTAATTATATAATAAGCTTTA
GAACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GW58TF U 1
AF RR4GW58JQ C 586
BS 1 744 RR4GW58TF
BS 745 1387 RR4GW58JQ

RD RR4GW58TF 744 0 0
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AACTAAACTAATCGAATCTGGTGGAACAATGGCTAATTTGCCTCCATCTCTCTCCATGGG
CACTCCTTTCGGTGGTCCCAGCACGTCGGTCGGAGCTCCGGCGGCGAACAAAGATCGAAA
CTTGGCATCGGCAGAGCAGTTGGTTCTCGATCTCAGCAATCCTGAACTCAGAGAAAATGC
TCTTCTCGAGCTTTCCAAGAAAAGAGAACTGTTTCAGGATTTGGCGCCTCTCTTGTGGAA
CTCTTTCGGTACCATTGCCGCCTTGTTACAGGAGATGGTGTCAATCTACTCTGTTCTCGC
ACCTCCGAATCTGACTCCTGCTCAGTCCAACCGTGTTTGCAACTCACTCGCCCTTCTTCA
GTGCGTAGCATCTCATTCCGACACGAGGATGTTATTTCTCAAGGCTCACATCCCATTGTA
CCTTTATCCCTTCCTGAATGCAACGAGTAAGTCAAGACCTTTCGAATACTTGCGCCTTAC
TAGCTTAGGTGTCATTGGTGCTCTTGTCAAGGTACAACCCATCCTCTCCCTTTGCTCTAA
AAATTCTTGGTTTCTGAATGAATGGGGTTATCTTTCTTTTAGCTAAGTTAGTGTATGAAA
TAAGGAAAGATCCTTTCACTCTGT

QA 1 744 1 744
DS 

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CTCCCTTTGCTCTAAAAATTCTTGGTTTCTGAATGAATGGGGTTATCTTTCTTTTAGCTA
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AGGTCATTAGCTTCCTTCTTTCAACTGGAATTATTCCTCTGTGCCTCCGCACCATGGAGA
TGGGGAGTGAGCTGTCCAAAACTGTTGCGACATTCATAGTTCAAAAGATCTTGTTGGATG
ACGTGGGGATGGATTACATCTGCACTACAGCAGAGCGTTTTTTTGCTGTTGTTAGAGTGT
TGGGAAATATGGTTCAGTCACTCGTTGAGCAGCCTTCTCCACGCCTTTTGAAGCATATCA
TTCGTTGTTACCTCCGTTTATCTGACAACCCAAGGGCTTGTGCTGCACTCGGAAGCTGTC
TCCCTGACTCGCTACGAGATGGGACCTTCAGCAATTGTCTTCGCGAGGATCAAATCGCGA
GGAGGTGGCTGCAACAGCTGGTTCACAATGTTGGAGTTGGTCGAGTCCCATCACATCAAG
GTGGAGGATTTGAGCACATGCTCTGAGATGCTGAATTCATCTCAGCCTATCTTTGTATTG
CTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTCTAATTTATTCATGTACTTTTGATGCCTTAAC
TTGGATGATGTGTGTTATAGGCTCTTTTAATCTGTTTGAAATTTTCTACTTTTTGTAATT
ATATAATAAGCTTTAGAACAGT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL6065Contig1 1350 2 14 U
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GCGACGGATCGATCCGTGGATATGATTCGCTGCATCAACTCTTATCCGCGAATCTGAAGC
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AACAGATTGTTCTGCCAGATTCTGCTAAAGCCCTCTCTTCAACACATGATTTTGATCTCC
AGGCGGTTAGCTTTTCAGCTGATAAAGAGCAAATGAGAAAGCCACGAGTGGTCAGAGTTG
GTCTCATTCAAAACTCCGTTGCTCTTCCAACCACTGCTCCTTTCTCCGACCAGAAAAGAG
GAATCTTCGAGAAGTTGAAGCCAATGATCGACGCTGCAGGTGTTGCTGGTGTTAACATAC
TCTGCTTACAGGAAGCTTGGACTATGCCGTTTGCATTCTGTACAAGGGAGAAGAAATGGT
GTGAGTTTGCAGAACCTATCGATGGGGAGTCAACAAAGTTTCTTCAAGAGCTAGCCAAAA
AGTATAACATGGTGATTGTGAGTCCTATTCTCGAAAGAGATATGGATCACGGTGAAGTAC
TTTGGAACACTGCTGTGATTATAGGGAATAACGGTAACATCATTGGCAAACATCGGAAGA
ACCATATACCGAGGGTAGGAGATTTCAACGAGAGCACGTATTACATGGAAGGAGACACAG
GCCATCCCGTGTTTGAGGCGGTGTTTGGGAAAATAGCAGTCAATATATGTTACGGAAGAC
ATCATCCTCTGAACTGGTTAGCTTTTGGTCTAAACGGTGCGGAGATTGTCTTCAACCCTT
CAGCAACTGTTGGTGAACTCAGTGAACCAATGTGGCCTATTGAGGCAAGAAACGCTGCGA
TAGCAAACAGTTACTTTGTGGGATCCATTAACCGAGTTGGAACCGAAGTGTTCCCAAATG
CTTTCACCTCAGGGGATGGGAAACCGCAGCACAATGACTTTGGCCATTTCTATGGATCGA
GCTATTTCACTGCACCGGATGCTTCTTGCACGCCGTCTCTGTCGCGTCACAGAGACGGGT
TAATGATTTCGGACATGGATCTCAATCTCTGCAGGCAGTACAAAGATAAGTGGGGGTTTA
GAATGACTGCGAGATACGAAGTGTATGCTGATCTTTTGGATAAGTACATAAAGCCAGAGT
TCAAGCCCCAAGTCGTCTCTGACCCGATGCTCCACAAGAATTCTTCTTAAGCAAAAAAAA
AAAGTAACTTTTAAAAATTATCTTTGTAAGTCTGTAACAGTAACAGAATCTGTTTTGTTC
CTCTGTTTTTATGAATAAAGTTGATGATGC


BQ
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AF RR4ER74TF U 1
AF RR4ER74JQ C 613
BS 1 684 RR4ER74TF
BS 685 685 RR4ER74JQ
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BS 777 777 RR4ER74JQ
BS 778 792 RR4ER74TF
BS 793 1350 RR4ER74JQ

RD RR4ER74TF 795 0 0
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GCGACGGATCGATCCGTGGATATGATTCGCTGCATCAACTCTTATCCGCGAATCTGAAGC
CTGAGCTCTATCAGGATGTAAGCCGATTGCTACTTGGAAGCAACTGTGGTAGATCGCTTG
AACAGATTGTTCTGCCAGATTCTGCTAAAGCCCTCTCTTCAACACATGATTTTGATCTCC
AGGCGGTTAGCTTTTCAGCTGATAAAGAGCAAATGAGAAAGCCACGAGTGGTCAGAGTTG
GTCTCATTCAAAACTCCGTTGCTCTTCCAACCACTGCTCCTTTCTCCGACCAGAAAAGAG
GAATCTTCGAGAAGTTGAAGCCAATGATCGACGCTGCAGGTGTTGCTGGTGTTAACATAC
TCTGCTTACAGGAAGCTTGGACTATGCCGTTTGCATTCTGTACAAGGGAGAAGAAATGGT
GTGAGTTTGCAGAACCTATCGATGGGGAGTCAACAAAGTTTCTTCAAGAGCTAGCCAAAA
AGTATAACATGGTGATTGTGAGTCCTATTCTCGAAAGAGATATGGATCACGGTGAAGTAC
TTTGGAACACTGCTGTGATTATAGGGAATAACGGTAACATCATTGGCAAACATCGGAAGA
ACCATATACCGAGGGTAGGAGATT*CAACGAGAGCACGTATTACATGGAAG*AGACACAG
*CCATCCCGTGTTTGAGGCGGTGTTTGGGAAAATAGCAGTCA*TATATGT*ACGGA*GAC
ATCATCCTCTGA
CTG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4ER74JQ 738 0 0
CTGTGATTATAGGGAATAACGGTAACATCATTGGCAAACATCGGAAGAACCATATACCGA
GGGTAGGAGATTTCAACGAGAGCACGTATTACATGGAAGGAGACACAGGCCATCCCGTGT
TTGAGGCGGTGTTTGGGAAAATAGCAGTCAATATATGTTACGGAAGACATCATCCTCTGA
ACTGGTTAGCTTTTGGTCTAAACGGTGCGGAGATTGTCTTCAACCCTTCAGCAACTGTTG
GTGAACTCAGTGAACCAATGTGGCCTATTGAGGCAAGAAACGCTGCGATAGCAAACAGTT
ACTTTGTGGGATCCATTAACCGAGTTGGAACCGAAGTGTTCCCAAATGCTTTCACCTCAG
GGGATGGGAAACCGCAGCACAATGACTTTGGCCATTTCTATGGATCGAGCTATTTCACTG
CACCGGATGCTTCTTGCACGCCGTCTCTGTCGCGTCACAGAGACGGGTTAATGATTTCGG
ACATGGATCTCAATCTCTGCAGGCAGTACAAAGATAAGTGGGGGTTTAGAATGACTGCGA
GATACGAAGTGTATGCTGATCTTTTGGATAAGTACATAAAGCCAGAGTTCAAGCCCCAAG
TCGTCTCTGACCCGATGCTCCACAAGAATTCTTCTTAAGCAAAAAAAAAAAGTAACTTTT
AAAAATTATCTTTGTAAGTCTGTAACAGTAACAGAATCTGTTTTGTTCCTCTGTTTTTAT
GAATAAAGTTGATGATGC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL6066Contig1 1388 2 2 U
GACTTTTCTGGGTATATATGCCCTCGTGTTACCAAAAAACCACCTAGGTCTGTGCCGCGT
GTTGGAGACAGAAGAATCAGGAAGATATTGGCTTCTAGACACTGGAAAGGAGGTTCAAGA
CATTCAGAAGCAAAATCATGGAGAAGTTATTACTTGCACCATCAGAGGAGCTATCCTATC
AAGAAAAGGAAATACTTTGAACACATATCTGATTCTGTGTCTGATGATTATCGTCTGCGC
TCTAAGATGCAAAGAGGCAGCAGAACTGTTGCTACTATGAAAGGTCCAGGTGCATCCTTT
GTCTCAAGCGACTCTCATGTGAGACTGCGAATCAAGTCATTCAGGGTGCCTGAGCTTTTT
GTAGAGATTCCAGAAACCGCTACTGTTGGCTCCTTGAAGAGAATGGTGATGGAAGCAGTG
AGCACTTTATTGAGTGATGGACACAGAGTTGGTCTGATGGTTCAAGGGAAGAAAGTCAGA
GATGATAACAAAACACTTCATCAGACTGGGATCTCTCAGGATAACACCCACTTGGACTCT
CTTGATTTCATCCTTGAACCCAGCTCAGAAGCGCCTCATCTGTTATCTAGTAACCCGTTG
GGACATGTCTGCGAGGAACTGCCTATATGCCATGCTTCTGACATGGACACCGTGTTCAAA
TCTGAGCATGATTTAGCACTGTACCCATCTCACTCGTTTGACAAGGAAACCGCAACAGAT
GTTTCTAAAGCTCTGGTTCCTGCTGCTCCTGCTGCGCTCACCGAACTGTCTCCTCTACCG
CCTCGTCATAAATCTAAGCAGCAGCAGCATCGGAATCAGACTGCACAGCGAAGAATGCGT
CGACCTTTCTCTGTTACTGAAGTAGAAGCACTTGTTCAAGCTGTTGAGAAACTCGGTACT
GGAAGGTGGAGAGATGTTAAGCATAGTGCTTTCGAAGATGCATACCACCGCACTTACGTT
GATCTCAAGGACAAGTGGAAAACGCTGGTCCATACAGCTAAGATATCGCCACAGCAGAGG
AGAGGAGAGCCAGTGCCGCAGGAACTTCTAAACCGTGTCTTGAACGCTCACGGCTACTGG
TCACAGCAACACATGGAGACAACACTGGCTCTTCCTAAACCAGAGTCTGTGCTGCTTCTC
TAATCAAAATGTGCTTTGCAGATCCTCTCTCTCTCTATCTATCTATCTCTCTTCCCCTTT
GTGTATTGTTGTAAGATTCTGACGACATAGATGCACAAATTTAGTCTCTGACTTGTCTCT
TTGGTTTTTATTTCTTTTTTTAACTTTCTCAATGTAAAGTTTTTAATTGGAATAAGGTGG
ATGTTCCTGACCAATTTAGGGCTTTTTTTGTTTTGTACATGGTTTGTTTACATTCTCAGT
TTCTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO21TF U 1
AF RR4AO21JQ C 741
BS 1 825 RR4AO21TF
BS 826 1388 RR4AO21JQ

RD RR4AO21TF 825 0 0
GACTTTTCTGGGTATATATGCCCTCGTGTTACCAAAAAACCACCTAGGTCTGTGCCGCGT
GTTGGAGACAGAAGAATCAGGAAGATATTGGCTTCTAGACACTGGAAAGGAGGTTCAAGA
CATTCAGAAGCAAAATCATGGAGAAGTTATTACTTGCACCATCAGAGGAGCTATCCTATC
AAGAAAAGGAAATACTTTGAACACATATCTGATTCTGTGTCTGATGATTATCGTCTGCGC
TCTAAGATGCAAAGAGGCAGCAGAACTGTTGCTACTATGAAAGGTCCAGGTGCATCCTTT
GTCTCAAGCGACTCTCATGTGAGACTGCGAATCAAGTCATTCAGGGTGCCTGAGCTTTTT
GTAGAGATTCCAGAAACCGCTACTGTTGGCTCCTTGAAGAGAATGGTGATGGAAGCAGTG
AGCACTTTATTGAGTGATGGACACAGAGTTGGTCTGATGGTTCAAGGGAAGAAAGTCAGA
GATGATAACAAAACACTTCATCAGACTGGGATCTCTCAGGATAACACCCACTTGGACTCT
CTTGATTTCATCCTTGAACCCAGCTCAGAAGCGCCTCATCTGTTATCTAGTAACCCGTTG
GGACATGTCTGCGAGGAACTGCCTATATGCCATGCTTCTGACATGGACACCGTGTTCAAA
TCTGAGCATGATTTAGCACTGTACCCATCTCACTCGTTTGACAAGGAAACCGCAACAGAT
GTTTCTAAAGCTCTGGTTCCTGCTGCTCCTGCTGCGCTCACCGAACTGTCTCCTCTACCG
CCTCGTCATAAATCTAAGCAGCAGCAGCATCGGAATCAGACTGCA

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4AO21JQ 648 0 0
TGCTGCTCCTGCTGCGCTCACCGAACTGTCTCCTCTACCGCCTCGTCATAAATCTAAGCA
GCAGCAGCATCGGAATCAGACTGCACAGCGAAGAATGCGTCGACCTTTCTCTGTTACTGA
AGTAGAAGCACTTGTTCAAGCTGTTGAGAAACTCGGTACTGGAAGGTGGAGAGATGTTAA
GCATAGTGCTTTCGAAGATGCATACCACCGCACTTACGTTGATCTCAAGGACAAGTGGAA
AACGCTGGTCCATACAGCTAAGATATCGCCACAGCAGAGGAGAGGAGAGCCAGTGCCGCA
GGAACTTCTAAACCGTGTCTTGAACGCTCACGGCTACTGGTCACAGCAACACATGGAGAC
AACACTGGCTCTTCCTAAACCAGAGTCTGTGCTGCTTCTCTAATCAAAATGTGCTTTGCA
GATCCTCTCTCTCTCTATCTATCTATCTCTCTTCCCCTTTGTGTATTGTTGTAAGATTCT
GACGACATAGATGCACAAATTTAGTCTCTGACTTGTCTCTTTGGTTTTTATTTCTTTTTT
TAACTTTCTCAATGTAAAGTTTTTAATTGGAATAAGGTGGATGTTCCTGACCAATTTAGG
GCTTTTTTTGTTTTGTACATGGTTTGTTTACATTCTCAGTTTCTTTCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL6067Contig1 844 2 3 U
AGCCACAAAGGCTCTCCTCGGAGGGATCTCTGATGTTATCGCTCAGGTGGTGGCTAGTCC
TGCTGATTTGGTGAAAGTGAGAATGCAAGCAGATGGTAGATTGGTGAGCCAAGGTCTGAA
ACCGAGGTACTCTGGACCAGTGGAAGCTTTTCACTAGAATTTATACAATCAGAAGGAGTG
AAAGGGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCGAACATACAGAGAGCGTTTCTAGTGAATATGGGT
GAGCTAGCTTGCTACGATCACGCCAAACACTTTGTGATTGAGAGAAAGATCTCGGGCGGG
GATAACATTTACGCGCACACTCTTGCATCTATCATGTCCGGTCTTGCTTCCACGACTCTG
AGCTGTCCTGCTGATGTGGTGAAGACGAGGATGATGAATCAAGGGGAGAAAGGTGTGTAC
AGAAGTTCGTATGATTGTTTGGTGAAGACGGTTAGGTTTGAAGGTGTAAGAGCTTTGTGG
AAAGGCTTTTTGCCGACATGGGGGAGGCTTGGACCGTGGCAGTTTGTGTTTTGGGTCTCT
TACGAGAAGTTTAGACAGCTTGCTGGCCTCTCTTCCTTCTAGTAAAACTAAATTTTGAGG
CTTTAGGGGGTTCTGAAATATCTTTTAAATGTAACATCTTACTCTTACTTTCAAGTTTGA
GTAAGATTCAATGGTTTCAAGTCTAGTTTTAAAATAAATTGGTTAATTTCCTTGGGGTTT
CGTATCAGTTTTCATCTTTTCCTAACTAAATTGCTTATGAAGTCAAATTCAAGTACTTTT
TTTCTATTGAAATTTGCATATATTTAGTGCAAGAATATTGGTGTATATTATTAATTGAAA
TGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4B676TF U 96
AF RR4B676JQ C 1
BS 1 108 RR4B676JQ
BS 109 195 RR4B676TF
BS 196 844 RR4B676JQ

RD RR4B676TF 107 0 0
AGATTTGGTGAGC
CCAAGGTCTGAAACCGAGGTACTCTGGACCAGTGGAAGCTTTTCACTAGAATTTATACAA
TCAGAAGGAGTGAAAGGGCTATGGAAA
AGGTGTT

QA 14 100 14 100
DS 

RD RR4B676JQ 844 0 0
AGCCACAAAGGCTCTCCTCGGAGGGATCTCTGATGTTATCGCTCAGGTGGTGGCTAGTCC
TGCTGATTTGGTGAAAGTGAGAATGCAAGCAGATGGTAGATTGGTGAGCCAAGGTCTGAA
ACCGAGGTACTCTGGACCAGTGGAAGCTTT*CACTAGAATT*ATACAATCAGAAGGAGTG
AAAGGGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCGAACATACAGAGAGCGTTTCTAGTGAATATGGGT
GAGCTAGCTTGCTACGATCACGCCAAACACTTTGTGATTGAGAGAAAGATCTCGGGCGGG
GATAACATTTACGCGCACACTCTTGCATCTATCATGTCCGGTCTTGCTTCCACGACTCTG
AGCTGTCCTGCTGATGTGGTGAAGACGAGGATGATGAATCAAGGGGAGAAAGGTGTGTAC
AGAAGTTCGTATGATTGTTTGGTGAAGACGGTTAGGTTTGAAGGTGTAAGAGCTTTGTGG
AAAGGCTTTTTGCCGACATGGGGGAGGCTTGGACCGTGGCAGTTTGTGTTTTGGGTCTCT
TACGAGAAGTTTAGACAGCTTGCTGGCCTCTCTTCCTTCTAGTAAAACTAAATTTTGAGG
CTTTAGGGGGTTCTGAAATATCTTTTAAATGTAACATCTTACTCTTACTTTCAAGTTTGA
GTAAGATTCAATGGTTTCAAGTCTAGTTTTAAAATAAATTGGTTAATTTCCTTGGGGTTT
CGTATCAGTTTTCATCTTTTCCTAACTAAATTGCTTATGAAGTCAAATTCAAGTACTTTT
TTTCTATTGAAATTTGCATATATTTAGTGCAAGAATATTGGTGTATATTATTAATTGAAA
TGAA

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL6068Contig1 1288 2 2 U
GACACACACAGTCTCTCTCTCTCTCGCTCATCTACGCCGCCGGGAAAGAAGTGACCACAT
CGTCAGGGTTTCACGGCGAAGATTGTCAGTCCCCTAATCGGCGAAGCGTCATCAATGGCA
ACCATGGCTAGGTCGTTTCTGCAGGCGATATCTAAGGAAGAAGCGGTGGCTCCTCCGCTC
AGAGTTGTTCAGATCGAAGGACTGGCTGCGTTAAAGATAATAAAGCATTGCAAGGAGTTT
GCACCGACTCTTGTCACGGGGCAGCTGCTTGGACTTGATGTTGGTAGTGTTCTTGAAATC
ACCAATTGTTTCCCTTTCCCTGTGAGAGATGAGGATGAAGAGATTGAAGCTGATGGTGCT
AACTATCAGCTTGAGATGATGAGGTGTCTCAGGGAGGTTAATGTTGACAACAACACTGTT
GGCTGGTATCAATCCACAGTTCTTGGATCTTATCAGACTGTTGAGTTGATTGAGACCTTC
ATGAATTACCAGGAGAACATCAAGAGATGCGTGTGCATCATATACGATCCCTCTAAAGCT
GACCTAGGCGTCTTAGCCTTGAAGGCTTTGAAGCTTTCAGATTCCTTTATGGAGTTGTAC
AGGGGGCGGAAACTTTACAGGCGACAAGTTGAGGGAAAAAACTTCTCGTGGATGGATATT
TTTGAGGAAATACCTATCAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTTATGACCGAA
CTGGAGACTGATACACCTGTCTCACAGGGTGATTTTGATCGTCTTCACTCCTCAACCACT
CCTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTTTGATTAAATGCATGGATGATTTATCCATGGAA
CAACAAAAGTTCCAATATTACCACCGGAACCTGTCTCGTCAGCAAGCGCAGCAACAAGCC
TGGCTCCAGAAGAGAAGGACGGAGAACATGGCTCGTAAATCAGCTGGGGAAGAGGCATTA
CCCGAGGAGGATCCTTCAAACCCAATCTTTAAGCCGATCCCTGAACCGTCGAGGCTAGAG
AGCTTCCTCATCACAAACCAAGTCTCAAACTTCTGTGGCCAAATCAACGGAGTGGCTGGC
CAGAACTTCAGCAGGCTCTACCTCACCAAGGCGTTGCACGAATAATTGAGTACGAGGCCA
CCCAGGTTTTTGTTTTTTGAGTTGAGAAAGTGAAAAGATTTGGTGGTAGAACGGATCATG
TATTTGTTTTGCTGGAAGTTTTTTTTTTGCGAAATTAAAAATACAAACCATATGAAAACA
TCTTTCAGCTCGTATGCATGGCTTATCG


BQ
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AF RR4FP06TF U 1
AF RR4FP06JQ C 659
BS 1 743 RR4FP06TF
BS 744 1288 RR4FP06JQ

RD RR4FP06TF 743 0 0
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CGTCAGGGTTTCACGGCGAAGATTGTCAGTCCCCTAATCGGCGAAGCGTCATCAATGGCA
ACCATGGCTAGGTCGTTTCTGCAGGCGATATCTAAGGAAGAAGCGGTGGCTCCTCCGCTC
AGAGTTGTTCAGATCGAAGGACTGGCTGCGTTAAAGATAATAAAGCATTGCAAGGAGTTT
GCACCGACTCTTGTCACGGGGCAGCTGCTTGGACTTGATGTTGGTAGTGTTCTTGAAATC
ACCAATTGTTTCCCTTTCCCTGTGAGAGATGAGGATGAAGAGATTGAAGCTGATGGTGCT
AACTATCAGCTTGAGATGATGAGGTGTCTCAGGGAGGTTAATGTTGACAACAACACTGTT
GGCTGGTATCAATCCACAGTTCTTGGATCTTATCAGACTGTTGAGTTGATTGAGACCTTC
ATGAATTACCAGGAGAACATCAAGAGATGCGTGTGCATCATATACGATCCCTCTAAAGCT
GACCTAGGCGTCTTAGCCTTGAAGGCTTTGAAGCTTTCAGATTCCTTTATGGAGTTGTAC
AGGGGGCGGAAACTTTACAGGCGACAAGTTGAGGGAAAAAACTTCTCGTGGATGGATATT
TTTGAGGAAATACCTATCAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTTATGACCGAA
CTGGAGACTGATACACCTGTCTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4FP06JQ 630 0 0
TTTTTGAGGAAATACCTATCAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTTATGACCG
AACTGGAGACTGATACACCTGTCTCACAGGGTGATTTTGATCGTCTTCACTCCTCAACCA
CTCCTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTTTGATTAAATGCATGGATGATTTATCCATGG
AACAACAAAAGTTCCAATATTACCACCGGAACCTGTCTCGTCAGCAAGCGCAGCAACAAG
CCTGGCTCCAGAAGAGAAGGACGGAGAACATGGCTCGTAAATCAGCTGGGGAAGAGGCAT
TACCCGAGGAGGATCCTTCAAACCCAATCTTTAAGCCGATCCCTGAACCGTCGAGGCTAG
AGAGCTTCCTCATCACAAACCAAGTCTCAAACTTCTGTGGCCAAATCAACGGAGTGGCTG
GCCAGAACTTCAGCAGGCTCTACCTCACCAAGGCGTTGCACGAATAATTGAGTACGAGGC
CACCCAGGTTTTTGTTTTTTGAGTTGAGAAAGTGAAAAGATTTGGTGGTAGAACGGATCA
TGTATTTGTTTTGCTGGAAGTTTTTTTTTTGCGAAATTAAAAATACAAACCATATGAAAA
CATCTTTCAGCTCGTATGCATGGCTTATCG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6069Contig1 1151 2 2 U
TCTAGTCAACATGTCGGAATCTTCTGAATCTCCGCTCGTCCTCGTCCATCGCCCACCTAC
TCTAGCTTACATGGACGACCAACTCAGTCGCAACTTCCGTCTTCTCAAAACTTACGCCTC
ACCGGATCCACTACCGGTCTTCCTCTCCCGCCACGCCGCCTCCGTCACAGCCTTCGTCAA
CATCGGCAGGCTCAAGATAGACGCCGACCTCCTCTCCCACCTCCCTTTCTCTCCAGCTCC
TCGTCTGCACCAGCGTCGGCACCGATCACGTCGACCTCGCCGAATGCAAGCGCCTCGGCA
TCGCCGTCACCAACGCCGGCGACTCCTTCTCCGATGACGTGGCGGATTGCGCCGTCGGGT
TGCTGATAAGCGTCCTCCGTCGCATTTCGGTCGGAGATCGTTACGTCCGGTCTGGTAAAT
GGGCGAAACTTGGGGAGTTCCAACTAGGCACCAAGGTAAGTGGAAAGCGAGTTGGGATCG
TTGGAATGGGGACGATCGGATCACGTATCGCCAAAAGACTCGAACCCTTTGGATGCATCA
TCTCTTACAACGCGAGAACTCAGAAACAGAGCATCCCTTACCGTTACTACTCCGATGTTC
TGTCCTTGGCAGCAGACAACGATGTCCTCGTGCTTTGCTGCTCTCTGACGGATCAGACGA
GGCACGTTGTGAACAGAGAAGTGATGGAGTCGCTTGGGAAGGAAGGGGTTATTATTAATG
TGGGAAGGGGAGGACTGATTGATGAGAAGGAGATGGTGAAGTGTCTTGTGGAAGGCGTGA
TCGGTGGTGCCGGTTTGGATGTGTTTGAGAAAGAACCGCAAGTTCCTCAGGAGTTGTTTG
GTTTGGACAATGTTGTCTTGTCTCCGCATGCTGCTGTGGCCACGCCTGGGGCTTTGGAAA
GTGTTGCCAATGTTGCGATTGCTAACTTGAAGGCGTTTTTCCCGAACCAGCCTTTGGTTT
CCCCGGTTCGATTGGGTTGAGAGGTTGTCCGGTTTGATCCAAGAAGACTCATGATCAAAT
GTATTATTCGTTATTGAACGATATGATTAAGAAAAGGAAAGTGTACTAATATATTGATCA
GTGAATCCCCTATATATTATGGGAATAGTCAAGAAAGAATATCAAAACTAAGATGCTAAT
GTGTAATTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AR48TF U 1
AF RR4AR48JQ C 472
BS 1 556 RR4AR48TF
BS 557 1151 RR4AR48JQ

RD RR4AR48TF 556 0 0
TCTAGTCAACATGTCGGAATCTTCTGAATCTCCGCTCGTCCTCGTCCATCGCCCACCTAC
TCTAGCTTACATGGACGACCAACTCAGTCGCAACTTCCGTCTTCTCAAAACTTACGCCTC
ACCGGATCCACTACCGGTCTTCCTCTCCCGCCACGCCGCCTCCGTCACAGCCTTCGTCAA
CATCGGCAGGCTCAAGATAGACGCCGACCTCCTCTCCCACCTCCCTTTCTCTCCAGCTCC
TCGTCTGCACCAGCGTCGGCACCGATCACGTCGACCTCGCCGAATGCAAGCGCCTCGGCA
TCGCCGTCACCAACGCCGGCGACTCCTTCTCCGATGACGTGGCGGATTGCGCCGTCGGGT
TGCTGATAAGCGTCCTCCGTCGCATTTCGGTCGGAGATCGTTACGTCCGGTCTGGTAAAT
GGGCGAAACTTGGGGAGTTCCAACTAGGCACCAAGGTAAGTGGAAAGCGAGTTGGGATCG
TTGGAATGGGGACGATCGGATCACGTATCGCCAAAAGACTCGAACCCTTTGGATGCATCA
TCTCTTACAACGCGAG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4AR48JQ 680 0 0
TTGGGATCGTTGGAATGGGGACGATCGGATCACGTATCGCCAAAAGACTCGAACCCTTTG
GATGCATCATCTCTTACAACGCGAGAACTCAGAAACAGAGCATCCCTTACCGTTACTACT
CCGATGTTCTGTCCTTGGCAGCAGACAACGATGTCCTCGTGCTTTGCTGCTCTCTGACGG
ATCAGACGAGGCACGTTGTGAACAGAGAAGTGATGGAGTCGCTTGGGAAGGAAGGGGTTA
TTATTAATGTGGGAAGGGGAGGACTGATTGATGAGAAGGAGATGGTGAAGTGTCTTGTGG
AAGGCGTGATCGGTGGTGCCGGTTTGGATGTGTTTGAGAAAGAACCGCAAGTTCCTCAGG
AGTTGTTTGGTTTGGACAATGTTGTCTTGTCTCCGCATGCTGCTGTGGCCACGCCTGGGG
CTTTGGAAAGTGTTGCCAATGTTGCGATTGCTAACTTGAAGGCGTTTTTCCCGAACCAGC
CTTTGGTTTCCCCGGTTCGATTGGGTTGAGAGGTTGTCCGGTTTGATCCAAGAAGACTCA
TGATCAAATGTATTATTCGTTATTGAACGATATGATTAAGAAAAGGAAAGTGTACTAATA
TATTGATCAGTGAATCCCCTATATATTATGGGAATAGTCAAGAAAGAATATCAAAACTAA
GATGCTAATGTGTAATTATG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6070Contig1 1415 2 2 U
CGTACTACAATGACTCGATCTCAAGACGTACACCTTCTTCCTCACAATCGTCCCCATCTT
CATCCTCGGTGTCTACTGGCACGGACAGAAGCTCACCTACTTCCTCAGACCCCTCTGGGA
ATCACCTCCCAAACCGTTCCAAACCCTCCCGCATTACTACCATCCAAACGCCTCCATGGA
GACTCTCTGCAGCCTCCACGGCTGGACACTCCTCGAGTCTCCTCGACGCGTCTTCGATGC
TGTACTCTTCAGCAACGAGGTCGACATGCTCACCATCCTCTGGAAAGAGCTCTATCCATA
CATCACGCAGTTCGTGGTCCTCGAGTCCAACTCGACCTTCACCGGTTTACCTAAACCGCT
GGTTTTCGATGCAAACCGGGAGAAGTTTGAGTTTGTTGAGCCGAGGCTGACTTATGGAAG
CATAGGAGGGAGGTTCAAGAGAGGAGAGAACCCTTTTGTTGAGGAAGCTTACCAGAGGAT
CGCGTTGGACAAGCTTATCACACTCTCGGGGATCGAAGAAGACGATCTTTTGATAATGTC
TGACGTCGACGAGATCCCCAGCGCTCACACCATCGACCTGCTTAGATGGTGCGATGGTTA
CCCTCCGGTTCTCCACCTCCAGCTCAGAAACTACTTGTACTCGTTCGAGTACTTCGTCGA
CAGCAAAAGCTGGAGAGCTTCTATTCACAGTTACAAGCCCGGGAATACACGGTACGCTCA
TTTCCGACGAGGGGACACTCTTTTGGCGGACGCTGGTTGGCACTGCAGCTTCTGTTTCAG
GCGCATCAGCGAGTTTGTGTTCAAGATGAAAGCGTATAGCCACAACGACAGGGGTAGGTT
CTCTCATTATCTGAACCCGGAGAGGATACAGGATGTGATATGCAGAGGGACTGATCTGTT
CGACATGCTTCCCGAAGAGCATACGTTCAGGGAAATCATCGGGAAGATGGGTCCGATCCC
GCGGTCTTACTCGGCTGTTCATCTCCCTGGTCATCTGATTGAAAAAGCTGAGAGTTATAA
GTACTTGTTGCCTGGGAACTGTGTTAGGGACAGTGGCTGATGATGATAAGGGTTTGTGCT
TATCAGACTGTAGTCGTGGGAGAGTCTGAAACAGAGGTTGGTACAGTTTGTTTTGGGAAT
ATTGAGGGAGAGTGATCTGATAAGTAGAGTCTCTGGTTTCAGCAGTATCTCTCGGTGAGG
GTATATAGCCAATACTGACTTTATGTTCCCTTTTGTTGGTTTTTGGGAAGTTTTGCTGGA
ATAGTCTTTCTATCTCTATCTCTTTTTTTCCTTTTTACCTTTAGACTCTTTTTTTTTAGT
CTGTACAATCTATTAATGACTTCTTTACATTATTCCTCAGATTCTTTGTAATCTTTATTC
TTAAAGAATTCTTAATTTGATCTCCTCTTGATCCT


BQ
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TTTCCGACGAGGGGACAC

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DS 

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GGGAATATTGAGGGAGAGTGATCTGATAAGTAGAGTCTCTGGTTTCAGCAGTATCTCTCG
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GCTGGAATAGTCTTTCTATCTCTATCTCTTTTTTTCCTTTTTACCTTTAGACTCTTTTTT
TTTAGTCTGTACAATCTATTAATGACTTCTTTACATTATTCCTCAGATTCTTTGTAATCT
TTATTCTTAAAGAATTCTTAATTTGATCTCCTCTTGATCCT

QA 1 761 1 761
DS 



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AATAAAACCCATAGAGCCAAGGACTTACTCCCTGGAGCTCTGATACCATGATAACAATCT
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ACAAAGATTCTATTAATATCATAAAAGTTTTGAGAGAGTGGCTGCAACAATGGCAGCCTT
CGTTGCCTTCATCAAAACACATTACAGCATATATATAAGAATCTAAAACCCTAGTTACAT
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BQ
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AF RR4FU78TF C 1
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TTGTTGACTCGGTGTTGAAAAGGCCGGATGATGTTATCCTCTTGTGCCATGTAGTAACGT
GTTATAGCTTGAGTGAGGGAGAGCTGCGTGAGTGAGGGTTTGTCAGAAGCGTGGATCTTC
AAAGATGCTGAGCCGAACAGAATAAGTAAAAACCCATGAACCGGTTGTAGAAACGAGTTT
AATAAAACCCATAGAGCCAAGGACTTACTCCCTGGAGCTCTGATACCATGATAACAATCT
CAAACAAAAGAGATTGGATGCTCAAAGAGCTTATTAAGAAAGATAGAAATAGCTTATAAA
AAAGCTTTATTATACAAGAAAGTAAAGAGGAAGGAAAGCTTTAGACTTGTCTTCAATAAC
ACAAAGATTCTATTAATATCATAAAAGTTTTGAGAGAGTGGCTGCAACAATGGCAGCCTT
CGTT
CC

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DS 

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GC
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TGGCAGCCTTCGTTGCCTTCATCAAAACACATTACAGCATATATATAAGAATCTAAAACC
CTAGTTACATGGGCTACAAAAGCTTCAAATGGATAATAAACTTGGGCTTTACTTCGGGCT
TCAATACTCCTCCGCAAACTTAGCGTCGGGTGCAACAGAAAGGCTGAGTTTGAATGCAAA
TGGAGATGGCTTGGAATGAGCATAAGTAGATGAAGTAGGATGCTGTTGATGTATGCAAAT
GGCTCTTCTTCTTCATGGAAAACAAACTAAGTGTGAGATCTATTCAGGCCTATACTTGGA
GAGTATCACATGGCTTCACTCAGAGGTTTCTTTTGAACTTGGAGAGCTTAGTTGATCTCA
CTCAGAGGTATAATTGTGGTCTCTTTGTCTCACTATGAATCTAGGCTTACTTTACCTATT
TCTTATTCTGTCTCATGAAGAAGCAAAACTCTCTTTCCACACTTACTAAACCATCCTATT
AACTCTCTGATGCCTATCAATATACCACCAAAACTCTTCTCTAAACAACTTGACTTTCTC
GTCAGCATTCCAGCGAGCAACTTGTGTGCATTATCATT

QA 3 640 3 640
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTGAGATAAGCCTTCCTGATGAAGCTGGGCGTTTCCAAATTCTTCAGATTCACACAAAC
AAGATGAAGGAAAATTCTTTCCTTGGTCATGATATCAATCTCCAAGAGCTTTCTGCTCGA
ACAAAAAATTACAGTGGTGCGGAGCTTGAAGGTGTTGTTAAAAGTGCTACCTCATATGCG
TTAAACAGACAATTAAGCATGGATGATCTTACAAAGCCAGTGGAAGAAGAGAATATCAAG
ATCACTATGGAGGATTTTCTCCATGCAATCCATGAAGTTCAGCCTGCCTTTGGAGCCTCC
ACAGATGACCTGGAGCGCTGCAGACTTAACGGGATGGTGGATTCTGGTGATCGGCATAAT
CGCATTTACAAAAGAGCGATGCTTCTAGTCGAGCAAGTTAAAGTTAGTAGTAGAAGTCCT
CTTGTCACTTGTCTTCTAGAGGGGCCAAGCGGAAGTGGAAAAACTGCTTTAGCTGCAACT
GTTGGTATCGATAGTGACTTCCCCTATGTTAAGATCGTCTCTGCTGAAACTATGATTGGT
CTTCAGGAGAGCACCAAATGTGCTCACATTGTCAAGGTCTTTGAGGATGCATATAAATCA
CCAATGAGCATCATTATCCTTGATGATATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGT
CCTCGTTTCTCAAACATTATTTCTCAGACGTTGATGGTTCTCCTCAAACGACTTCCTCCG
AAGGGGAAGAAACTTCTCGTGTTTGGGACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTT
GGTATCTGTGATGCCTTCTCTATCACTTACTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCA
AGGAAGGTGCTGAAGCAGCTTAATGTCTTCTCGGAAGATGATATCGATGCAGCTGCCGAG
GCTCTCGATGATATGCCGATCAAGAAGCTGTACATGCTAATTGAGATGGCCGCGCAAGGA
GAAGACGGTGGATCCGCAGAAGCTATCTATGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCAT
TTCTTCGATTGCCTACAAGACGTTGTCCGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTT
TCTTCTTCATAAAGCTTTTGAAACAATTGGTTTGGTTATTAACTCTTTGGATTTTATTTT
ATTTGGTGGATGAATGGAACTGAGAGGGCTTTCTTGTGCTGC


BQ
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AF RR4FA67TF U 1
AF RR4FA67JQ C 568
BS 1 606 RR4FA67TF
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BS 608 632 RR4FA67TF
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RD RR4FA67TF 632 0 0
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AAGATGAAGGAAAATTCTTTCCTTGGTCATGATATCAATCTCCAAGAGCTTTCTGCTCGA
ACAAAAAATTACAGTGGTGCGGAGCTTGAAGGTGTTGTTAAAAGTGCTACCTCATATGCG
TTAAACAGACAATTAAGCATGGATGATCTTACAAAGCCAGTGGAAGAAGAGAATATCAAG
ATCACTATGGAGGATTTTCTCCATGCAATCCATGAAGTTCAGCCTGCCTTTGGAGCCTCC
ACAGATGACCTGGAGCGCTGCAGACTTAACGGGATGGTGGATTCTGGTGATCGGCATAAT
CGCATTTACAAAAGAGCGATGCTTCTAGTCGAGCAAGTTAAAGTTAGTAGTAGAAGTCCT
CTTGTCACTTGTCTTCTAGAGGGGCCAAGCGGAAGTGGAAAAACTGCTTTAGCTGCAACT
GTTGGTATCGATAGTGACTTCCCCTATGTTAAGATCGTCTCTGCTGAAACTATGATTGGT
CTTCAG*AGAGCACCAAATGTGCTCACATTGT

QA 1 632 1 632
DS 

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ATTGTCAAGGTCTTTGAGGATGCATATAAATCACCAATGAGCATCATTATCCTTGATGAT
ATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAACATTATTTCTCAG
ACGTTGATGGTTCTCCTCAAACGACTTCCTCCGAAGGGGAAGAAACTTCTCGTGTTTGGG
ACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGCCTTCTCTATCACT
TACTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAGGAAGGTGCTGAAGCAGCTTAATGTC
TTCTCGGAAGATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCGATGATATGCCGATCAAGAAG
CTGTACATGCTAATTGAGATGGCCGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATCCGCAGAAGCTATC
TATGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCGATTGCCTACAAGACGTTGTC
CGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTTCATAAAGCTTTTGAAACAAT
TGGTTTGGTTATTAACTCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTGGATGAATGGAACTGAGAGG
GCTTTCTTGTGCTGC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6074Contig1 1195 2 2 U
TTTTTCTCTCTTTCCGTTTCAAGAGGGATTTAGATCGTTCCTCACACACGCCTTTCCCTT
TCTCTCTCTCTTTAATTCATTCTTCTCAGCACAACAAGAATGACTAATTGTCTTGGAGAC
TCGAACATGGCTTCTTCTCACTTGGACATTCTCCGTTGCCCATTTTTGAGGAACATCAAT
GACCCCACTAACCTCTCCTTCTCTTCTTCCTCCTTGCCTGTGCGAGGACCAATTTTTGAG
GATGGACCCAATTTTGACACTGCATTCAGGCTTTTCCATGGTCAAGATGGTGTTGTCCCT
CTCTCTGACAGCCCTCGTCCTGGACCAGAGAAGCCTAAGCTTTCCTCTCCTGCATTCAAT
CCACTTGCTGCTAAGGCGGCCACTATCAGTCTCTCCTCCTTTGGACATGGAGGGTCTTTT
GGATTTGATGCGTTTTCGGACTTGTTTAAGAACCAAAAGAGAAACTCAGACTCTTCCAAA
AAGAAAGATTCTTCCTCTAAGGGAGGAAACCACGAGTCTATGAGTGATGACTGGCTTCAA
ACAGGGAACTGCCCAATCGCTAAATCATATCGAGCTGTAAGTGGTGTGGCACCGCTCGTA
GCAAAGATCCTGCAACCCCCTCCCGGAATGCAGTACAAGTGTCCTAAAGCAATAGTAGCA
GCTCGAGCAGCCATATCAAAAACCGCTTTCGCCAAGAACCTCCGGCCACAACCTTTATCA
TCCAAAGTACTAGTCATCGGGATGCTGGGGATGGCCCTGAACGTGCCCCTAGGTGTTTGG
AGAGAGCACACTGAAAAGTTCTCGGCATCTTGGTTTATAGCTCTTCACGCAGCGGTTCCT
TTCATAGGAATACTGAGGAAGTCTGTGTTGATGCCTAAAATGGCGATGGTTTTTACCATA
GCAGCGTCTGTTATGGGACAAGTGATTGGGTCAAGAGCAGAGAGGTATAGGCTTAAGTCG
GTAGCTCAGAAGAGACTCACGTTGACAGGACCTGATAAAGTAGATGGAAGGTGCGGTGTG
ATGAAATGGAATCCCATGCTGCTTGAAGTGGCAAGTCCTGTTTCTACGTGAGCAGCTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGCTTTTGGTTTCTTTTTCGACGAGCTTGATATATGTATAGTTGTTT
CTATTCTTGTTTCGGCCATTGTATTTGAGAAAGTTTATAAATGTTTGAATAAGGC


BQ
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BS 651 1195 RR4F537JQ

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TCTCTCTCTCTTTAATTCATTCTTCTCAGCACAACAAGAATGACTAATTGTCTTGGAGAC
TCGAACATGGCTTCTTCTCACTTGGACATTCTCCGTTGCCCATTTTTGAGGAACATCAAT
GACCCCACTAACCTCTCCTTCTCTTCTTCCTCCTTGCCTGTGCGAGGACCAATTTTTGAG
GATGGACCCAATTTTGACACTGCATTCAGGCTTTTCCATGGTCAAGATGGTGTTGTCCCT
CTCTCTGACAGCCCTCGTCCTGGACCAGAGAAGCCTAAGCTTTCCTCTCCTGCATTCAAT
CCACTTGCTGCTAAGGCGGCCACTATCAGTCTCTCCTCCTTTGGACATGGAGGGTCTTTT
GGATTTGATGCGTTTTCGGACTTGTTTAAGAACCAAAAGAGAAACTCAGACTCTTCCAAA
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ACAGGGAACTGCCCAATCGCTAAATCATATCGAGCTGTAAGTGGTGTGGCACCGCTCGTA
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DS 

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AAGTGTCCTAAAGCAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACCGCTTTCGCCAAG
AACCTCCGGCCACAACCTTTATCATCCAAAGTACTAGTCATCGGGATGCTGGGGATGGCC
CTGAACGTGCCCCTAGGTGTTTGGAGAGAGCACACTGAAAAGTTCTCGGCATCTTGGTTT
ATAGCTCTTCACGCAGCGGTTCCTTTCATAGGAATACTGAGGAAGTCTGTGTTGATGCCT
AAAATGGCGATGGTTTTTACCATAGCAGCGTCTGTTATGGGACAAGTGATTGGGTCAAGA
GCAGAGAGGTATAGGCTTAAGTCGGTAGCTCAGAAGAGACTCACGTTGACAGGACCTGAT
AAAGTAGATGGAAGGTGCGGTGTGATGAAATGGAATCCCATGCTGCTTGAAGTGGCAAGT
CCTGTTTCTACGTGAGCAGCTAGTGTTGTCTGCTAAAAGCTTTTGGTTTCTTTTTCGACG
AGCTTGATATATGTATAGTTGTTTCTATTCTTGTTTCGGCCATTGTATTTGAGAAAGTTT
ATAAATGTTTGAATAAGGC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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ATCCTGCGCATGTGGAGAGTGAAGAGAGTGTCGGTTCGGTGTTGGAGAAGTTTCGTGAGA
TGAACCTTGATGATAATCTTGAATCTGTTGGGGAGGATGATAAGGATGGTGTGATTGTCA
CACTGCTTCATCAGGTCAAGGATCTCGAGAAGAAGTTGAAGGAAAGGAAAGAGTGGGCTC
AGAAGAAGGCGATGCAAGCCGCCCAAAAGGTCAGCGATGAACTGACCGAGCTGAAAAATT
TGAACAGCGAAAGAGAGAGTATCCAAATGTTGAAAAAGGGGAAACAAGCTGTTGACGAAT
CGACCGTGAAGAGATTGTCCGAGCTGGAAAATGCTGTTAGAAAAGCTACTTTGTCAGCGT
GACACAGCAAATGCGATTTGTTAGAACGCTTGAGAATCAAAATGCAGAGATCCGAGCAGA
GAGGGAAGATCTCAAACTAAGTGCATCAGAATCGCTTAAAGCGTGCATGGAAGAATCAAA
GAAGGAAAAAAAATGCTTGAAGAAGCTTTTTGGCATGGGAGAAGCAGAAGCTGAAGTTGC
AGGATGAGATTACAGCTGAGAAAGAGAAGATTAAAGCCCTTTATAAGGCTTTAGCTCAGA
TAACAGATGACGAAAAGGAAATTGAGGCGAAAAGGGTGGAGGAACAGAAAGCAAAGGAGC
AAGCTGTGGCACAAGTGGAGGAAGAACAACGCTCAAAAGAAGCAGCTGAGGCACACAACA
AGAGAAAGCTGGAGACTCTCAGGTTAAAAATCGAACTAGACTTCCAACGACACAAAGACG
ATCACCAAAGACTTGAGCAAGAGCTGTCTCGGCTCAAAGCCTCTTCAGATAACGACTCAA
GCCACTTATCCAACAATGTTTGGGAACCTGCAAAATCTCAAGGAGAAAACATCGCTAAGC
TGCTTGAAGAACTCGATAAGCTTGAAGGGTCTTATGAGAGTGAAGCAAACAGTGATAGAG
AATGCATAGTCTGTATGAAAGATGAAGTCTCGGTGGTGTTTCTTCCTTGTGCGCATCAAG
TAGTGTGTGGTAGTTGCAGCGATAATTTCTTCTCGAGCAACAACAGTGGCGGAGGCAAAG
TCACCTGTCCTTGCTGCAGAGCTGTGGTTCAGCAGCGCATTCATATCTTTGGAGCAACGT
CGTGAAAACTGAGATAGCTTCTCTTTGGGATTCAAAGAGAGCATCACAACTTCAGGTTTT
ACTTTGCAAGTACAAGAAAAATAAATGCTTTAGCTTCTTCGGCAAAGCTTTTTATACTTG
GAATTTTATTTTACAGTATTTGGAAAAAGGTTTTGCACGATGTACAAAAAAATTGCGATC
GTGATGGAAACTTTTTCTACCTG


BQ
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TGAACAGCGAAAGAGAGAGTATCCAAATGTTGAAAAAGGGGAAACAAGCTGTTGACGAAT
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TATA

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DS 

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CTTGAGCAAGAGCTGTCTCGGCTCAAAGCCTCTTCAGATAACGACTCAAGCCACTTATCC
AACAATGTTTGGGAACCTGCAAAATCTCAAGGAGAAAACATCGCTAAGCTGCTTGAAGAA
CTCGATAAGCTTGAAGGGTCTTATGAGAGTGAAGCAAACAGTGATAGAGAATGCATAGTC
TGTATGAAAGATGAAGTCTCGGTGGTGTTTCTTCCTTGTGCGCATCAAGTAGTGTGTGGT
AGTTGCAGCGATAATTTCTTCTCGAGCAACAACAGTGGCGGAGGCAAAGTCACCTGTCCT
TGCTGCAGAGCTGTGGTTCAGCAGCGCATTCATATCTTTGGAGCAACGTCGTGAAAACTG
AGATAGCTTCTCTTTGGGATTCAAAGAGAGCATCACAACTTCAGGTTTTACTTTGCAAGT
ACAAGAAAAATAAATGCTTTAGCTTCTTCGGCAAAGCTTTTTATACTTGGAATTTTATTT
TACAGTATTTGGAAAAAGGTTTTGCACGATGTACAAAAAAATTGCGATCGTGATGGAAAC
TTTTTCTACCTG

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

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TATACCAGTCATCGACATGTCGGACCCGGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATTTGTGA
CGCTGCTGAGAAATGGGGTTTCTTTCAATTGATCAACCATGGAGTTCCTTTGGATGTTCT
TGATAACGTGAAGGCCGCCACTCACAGGTTCTTTAATCTTCCTGTTGAGGAGAAGAGCAA
GTACACAAAGGAGAACTCACTGTCGACCAACGTTAGGTTCGGTACTAGTTTTAGTCCTCG
TGCTGAGAAAGCTCTTGAGTGGAAAGATTACCTCAGTCTCTTCTTTGTGTCCGAAGCTGA
GGCTGAACAGTTTTGGCCTCATGTTTGCAAGAATGAAGCTCTAGAGTACATGAACAAGTC
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AACCGTTGGCGTTGGTCGTCACTCAGACGTCTCTTCCCTCACCATTCTCTTACAAGACCA
AATCGGTGGCCTCCACGTTCGTTCCCTATCTTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCACCGGT
TCCCGGATCCTTTGTGATCAACATCGGAGACGCTATGCAGATCTTGAGCAACGGTCGTTA
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CTTTGTGAATCCAAAACCAGAGTCAGTGATTGGTCCTCTCCCTGAGGTGGTCGCAAAGGG
TGAGGAACCGATTTATAAAGACGTTGTGTACCCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCAAGAA
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AAGAAGACTCTCTTCAATACTATGTTGTATACAGTTTCTCTTTTATAAAACTAAAAGTGT
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4FK70TF U 1
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GGCTCCAACACTCTCCATGGCACAGTTCGCAGACCCAGCTGAAGTAACCGAGTTCGTGGT
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ATATATTCAACCATTCGAAGAGCGTCTCATCAACAAGTTCGTCAACGAGACAGACGAGGC
TATACCAGTCATCGACATGTCGGACCCGGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATTTGTGA
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TGATAACGTGAAGGCCGCCACTCACAGGTTCTTTAATCTTCCTGTTGAGGAGAAGAGCAA
GTACACAAAGGAGAACTCACTGTCGACCAACGTTAGGTTCGGTACTAGTTTTAGTCCTCG
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4CU18JQ 829 0 0
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GGAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAGACGAGACCAAAGAGCCAATTTTCATGGGCTCAG
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GTCGTCACTCAGACGTCTCTTCCCTCACCATTCTCTTACAAGACCAAATCGGTGGCCTCC
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ATAAAGACGTTGTGTACCCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCAAGAAAGCACATGATGGAA
AGAAAACCGTTGACTTCGCCAAGATATGATCATAACCAGACCTCAGAAGAGTTTGGTTTC
TTTTGTTTTGTTTCATGTTTGTGTGTTGCATGCGTGTGAATTAATAAAGAAGACTCTCTT
CAATACTATGTTGTATACAGTTTCTCTTTTATAAAACTAAAAGTGTTGC

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL6077Contig1 1385 2 2 U
GGAAATCGTAAAAAAAAAAGAAAAAAACTCTGAAGAACTCTCAACCTTCGTAAAAGTGTT
TTGATCTCTTCCAAACTTTCGCAGAAACGGATCCAATTCATTTAACATAGTAGCTTCACA
ACGAGAAGAAACAGGGTGATCGAGAGAGATGAGATGGAAGAGCGTAAAGGCAAAACAACA
GCATACATGGGTTTATAGCAGCAGAATGTTTTTGCAGTGACTCCTCCACGTGTGAAACCT
GTCATCATTAAGGTTTGTGCTTTAGGAGGTCTGAGGAGATTGCAAAGATATAATCCTTTT
TTTTTTGTTGAGGATTCTGCCATGACAGGCAATGGAAGCTATATTCAGTCGATGCTTGAG
TTCTGGGCGTGGGGATCAGAGGCGTCTTTCTATATTCAAAGGGAGGCACAAGAATGGATG
GAACAAAGAAGCTAAGTGGAGATCAAACAGAGAGAAGCTCAGATGTGTCTCATTTCCGCC
AGGGGCTGATGCTATTCTTCAGGATTTGTTTACTCACTATCCACACTGCTGCAACCTCAT
TTAACAAGTATGTGGGCCTCTCTGGTAAACAAGGGCAGTGGAGAGATGATTTTTTTCCGG
AAACCACAGATCAGCGGTGAAGATATTGTAGAGAAGGAGTTCTAGGCTAAGGACAGATAA
AGCTCTTCAGGAGGTTAGGAATACTCAGGACATATAGCAGCAAGTGAAATGAATTTTTTT
TTTTCTTTATTGGTTTATATTGCAGATCTCTAAGCTGCGGTCGAAGCTTCCCATTACATC
TTTTAGAGACGCAATTCACATCTATTTGTGCTGCAAACCTCTTGCTGAAAGTTTTCCATT
TCTATCTTGAAGTTTCTGAGAGAATATCCTGCGAAAGAGGTGAAAGCATTGGAGACAACA
AGGTTCGACTGCAGAGCAAAGGTGGAAGGCACTCATCACTTTTTTTTTCTTCTTTGTACT
GAGAGGAGGTGCACACCAACTTCTTTGCGAGGATCAGGAGCTTTCTCTTCTCGCAGTGCG
CAGGAGCAAATGATAAGCACAGTGATTATGGCGGCGATAAGAACACCAGCGGCTACAGCA
AAGATAAGAATACGATTCAGGAACATGTTATTGCTCCTTTGATAGTCTAATGTCAAATCA
AAACGAGTATGGATAACGTCTTACCTGAAATGGAGGGAGACAAAGGTGGCTTCGTTAAGC
CGTCAGGAAGTGCGCCATTACTAGGTTGTGTTGTAATGAGATAAGGATAGTTTCCTATTT
CTAAGGAGCTTAGGTTAAGTAGTTTTCCTATTCTTGATGTAGGTTTAACTTATTCTCCAA
GTTAATGTTGTATATAAACATATGATGGGTGAATGAATGAATAAAGGACGAACAATTCTG
CTTAC


BQ
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AF RR4F815TF U 1
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BS 646 1385 RR4F815JQ

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DS 

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ATGTTGTATATAAACATATGATGGGTGAATGAATGAATAAAGGACGAACAATTCTGCTTA
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

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AAAAACATAAGGAAAAGACCTGCGGCTGATGCTGATGAAGAAGACGACGATGATTCCAAA
AGCGAGACCTCTATACTGAACAACCTCAAGAAAGTTGCTAAACCCGATAACAACAATCTG
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TACACTGGAATTCATGGGTACACGGATCACAAAGCTGGGTTTAGAAGAGAGCAGACCATC
TCCAGCGAGAAAGCTGGAGGCTCACACGGGCCTTTAAGAGCTTCTGCGCACATCAGGGTA
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TCGTCAGACCTGTAATAGTCGTTAAACTGAAATTCT


BQ
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AF RR4G860TF U 1
AF RR4G860JQ C 615
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BS 713 1356 RR4G860JQ

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ACAATGTCAGACACTGTACAAGAGCCTAAAACATCTCAAGATTCTCAACCTGCTGCTGCT
GTCACACAAGAATCTCAATCTCAGCAAGTTTGCACTTTCTTCAAGAAGCCATCTAAAGCT
AAAAACATAAGGAAAAGACCTGCGGCTGATGCTGATGAAGAAGACGACGATGATTCCAAA
AGCGAGACCTCTATACTGAACAACCTCAAGAAAGTTGCTAAACCCGATAACAACAATCTG
TTTTTCTCCTCTGGACCATCCAAGATCTCTGCTACTACGGCTCCTCCTGAGAAAGCCGTC
GTCTTTCACTACGATTCGTCCAAGGAGATCCAGGTTCAAAACGACAGTAGAGCCACTGCC
ACTCTTGAAACCGAGACCGACTTCAACCAGGACGCACGAGCCATCCGTGAGAGAGTCCTT
AAGCGAGCTGACGAAGCCTTGAAAGGGAATAAAAAGAACAAGGCTTCTGATGAGAAGCTC
TACACTGGAATTCATGGGTACACGGATCACAAAGCTGGGTTTAGAAGAGAGCAGACCATC
TCCAGCGAGAAAGCTGGAGGCTCACACGGGCCTTTAAGAGCTTCTGCGCACA

QA 1 712 1 712
DS 

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TGGAGGCTCACACGGGCCTTTAAGAGCTTCTGCGCACATCAGGGTATCCGCTAGGTTCGA
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TGATGAGGCTGACATCGAGGAAGATGAAGATGCATTGCCCTTTGCTTGCTTCATTTGCAG
AGAATCTTTCGTTGATCCAGTTGTGACCAAATGCAAACACTACTTCTGCGAGCATTGTGC
TTTAAAGCATCACACGAAGAACAAGAAGTGCTTTGTGTGTAACCAACCAACGATGGGGAT
TTTCAATGCAGCACATGAGATCAAGAAGAGAATGGCTGAAGAACGGAGTAAAGCTCAAGG
ATTGTGAAGTTTGTTTGTTCTTTCACAGGCCAAAACTTACTTTCTCTTGTTTAAGGAATG
CTTTTTGTCTGTTGTATTCGTCTGCCTATATACTGTAATGGTCCTTTACAGATCAGGCGA
GGAGCTCCTTATGTTTGATACTTATTATTCAGCTTCCTAGTAGTCATCGTCAGACCTGTA
ATAGTCGTTAAACTGAAATTCT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL6079Contig1 1369 2 4 U
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AGTCATCGGAGGGTGTTTCGTCTTCGTCAGTGGCGCCGTTCCTGAGGAAATGCTACGAGA
TGGTCGACGACTCTTCCACTGATTCCATCATCTCGTGGAGTGCTAATGGAGACGACAACA
GCTTCGTTATCTCGGACACGACCCTCTTCTCTGCTCAACTCTTGCCTAAATACTTTAAAC
ACAGCAATCTCTCTAGCTTCGTCCGTCAGCTCAACATCTACGGTTTTAGAAAAGTTGATG
CTGATCATTATGAGTTTACGAACCACTGGTTTGTCAGAGGTCGAAAGGACTTGCTAAAGA
ATGTTATCAGGAGGAAGAATGTTCAGAGTAGTAGTGAGGATCAGCGCAAAAGCGTTTCCG
AAAAACAGGAAAGTACAAGTGAAACTTGTCAGGGTGGTGATCCTGAGAAGAGTGAGCTGT
GGAAAGAAGTTGAAATCTTAAAAGGGGATAAGAAGGCATTGGCGCAGGAGCTTGTCAAAG
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GTCTGTTGGTTCAGTTGCTTCAACCAAAGGAGAAGAATTGGAGAAAAGGTGAAGGAGGAG
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TTCCTGTAGTAACATACCAGCAGAGACCATCAGAGGGAACAGCAAAGTCAAGCTCGAGTG
ACTTGAATGATTTTTTGAGAAACGCGGATATGTTGAAGTTCTGCTTGGATGAGAATCATG
TGCCCTTGATCATACCTGATCTGTATGATGGTGGGGCGTGGGAAAAGCTTTTGTTGTCGA
GCCCTTCAAAGAAGAAGAAGAATGTGAAGAAAGGTAAGGATGATGGGACATTGGAGGAGG
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TGAGTTTTTGAACATATCAAAACTTTTGTTAGGTAGTGAAAACATTATAAGTAGGCTCTG
GAGTATTATTTTTGACCAGAGCTATTCTTAAAGATATGCTTTAGGAGTTTAGGGTCTTGC
TAAAGAAAACCTGGACTTTCTATCTACTGAGAAGTTTACTTTATACTCC


BQ
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AF RR4GO24TF U 1
AF RR4GO24JQ C 591
BS 1 682 RR4GO24TF
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RD RR4GO24TF 692 0 0
GCTTCTTCTTTAATTCAAAATTCAAAAACTTTATCGGAGACTCGAGAGAGGTTATGGTGA
AGTCATCGGAGGGTGTTTCGTCTTCGTCAGTGGCGCCGTTCCTGAGGAAATGCTACGAGA
TGGTCGACGACTCTTCCACTGATTCCATCATCTCGTGGAGTGCTAATGGAGACGACAACA
GCTTCGTTATCTCGGACACGACCCTCTTCTCTGCTCAACTCTTGCCTAAATACTTTAAAC
ACAGCAATCTCTCTAGCTTCGTCCGTCAGCTCAACATCTACGGTTTTAGAAAAGTTGATG
CTGATCATTATGAGTTTACGAACCACTGGTTTGTCAGAGGTCGAAAGGACTTGCTAAAGA
ATGTTATCAGGAGGAAGAATGTTCAGAGTAGTAGTGAGGATCAGCGCAAAAGCGTTTCCG
AAAAACAGGAAAGTACAAGTGAAACTTGTCAGGGTGGTGATCCTGAGAAGAGTGAGCTGT
GGAAAGAAGTTGAAATCTTAAAAGGGGATAAGAAGGCATTGGCGCAGGAGCTTGTCAAAG
TTAGGCAGTACCAGGAGGTTACTGACACGAAGATGCTTCACTTGGAAGACAGAGTTCAAG
GAATGGAAGAGAGTCAGCAGGAGATGCTTTCGTTTCTGGTTATGGTTATGCAGAATCCAA
GTCTGTTGGTTCAGTTGCTTCACCCAA
GGAGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4GO24JQ 779 0 0
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CAGAATCCAAGTCTGTTGGTTCAGTTGCTTCAACCAAAGGAGAAGAATTGGAGAAAAGGT
GAAGGAGGAGGAGGAGGAGCAACGATTCTGGAAGAAGTTACAGAGGAAGGAGAATCAAGC
TCTAATGGTCTTCCTGTAGTAACATACCAGCAGAGACCATCAGAGGGAACAGCAAAGTCA
AGCTCGAGTGACTTGAATGATTTTTTGAGAAACGCGGATATGTTGAAGTTCTGCTTGGAT
GAGAATCATGTGCCCTTGATCATACCTGATCTGTATGATGGTGGGGCGTGGGAAAAGCTT
TTGTTGTCGAGCCCTTCAAAGAAGAAGAAGAATGTGAAGAAAGGTAAGGATGATGGGACA
TTGGAGGAGGAGGAGGAGTGTGAGCCGATGGAGTTAGACAAGAGCGGTACGTTGAAGCTG
ATACAAGAGGAGATGGAGAGAGCAGATGAGTTTGATTCTGGACAGCTTACTCCAGAGAGG
TCTAGGAATCTTGAGATTCTAACACAGCAGATAGCATTGATGGCTTCAAATGAATAGAAA
GAGAAAATGATGAGTTTTTGAACATATCAAAACTTTTGTTAGGTAGTGAAAACATTATAA
GTAGGCTCTGGAGTATTATTTTTGACCAGAGCTATTCTTAAAGATATGCTTTAGGAGTTT
AGGGTCTTGCTAAAGAAAACCTGGACTTTCTATCTACTGAGAAGTTTACTTTATACTCC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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TGAGGTTGTTTGCGTCGATGGAGATTAGAGATGAGTTTACTTACACTTCTGTTGTGCATA
ATCTATGCAAAGATGGGCGGCTTGTGTGCGCTTCGAAGCTGCTGTTGTTGTGTTATAATA
AAGGAATGAAGATTCCTTCGTCGGCGAGACGAGCAGTGTTGTCGGGTTTACGGATGACGG
TATCTTACCAGGCAGCGAGGATGACAGATCACAAAATCAAAGCTGCTATTAAGTGCAATG
CACTAACGGATACTTAAGATACTGAAAGGTATTTATTTAGAGAACAGTTCTTGATCTATA
ATAAGGGCTCTTTTCATACTAGATTCTAGTGGAGAATTGATAAGTCTCTCTTGGAGCTAG
AGTCTTACTTTATCTGCATCAATGGAGTCCTATCTTATCTTCAGACATAAGTCAGTGTAT
ACTATAAACTTCTGATTAATGAGTTTTTTTTCCTATCACCTGTGGAGAAAAGCATGTAAA
ACAATTATTTGTGTCGCCCTTACGTAAAGCTTCTTGTTTTTTCTCTGTGTATATATAGCT
GATGAGATTGATTTTGGCTACAGAGATGTATTATTAGCTTAGGGTTAACTGGATTGTAAC
AGAGAGCTTCTGTACCAGATTCTAGCTATGTTCATAAACGCTATGCAGGTTCAACAACAT
CAATGACTTGAGATCAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E532TF U 1
AF RR4E532JQ C 542
BS 1 638 RR4E532TF
BS 639 738 RR4E532JQ

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TGAGGTTGTTTGCGTCGATGGAGATTAGAGATGAGTTTACTTACACTTCTGTTGTGCATA
ATCTATGCAAAGATGGGCGGCTTGTGTGCGCTTCGAAGCTGCTGTTGTTGTGTTATAATA
AAGGAATGAAGATTCCTTCGTCGGCGAGACGAGCAGTGTTGTCGGGTTTACGGATGACGG
TATCTTACCAGGCAGCGAGGATGACAGATCACAAAATCAAAGCTGCTATTAAGTGCAATG
CACTAACGGATACTTAAGATACTGAAAGGTATTTATTTAGAGAACAGTTCTTGATCTATA
ATAAGGGCTCTTTTCATACTAGATTCTAGTGGAGAATTGATAAGTCTCTCTTGGAGCTAG
AGTCTTACTTTATCTGCATCAATGGAGTCCTATCTTATCTTCAGACATAAGTCAGTGTAT
ACTATAAACTTCTGATTAATGAGTTTTTTTTCCTATCACCTGTGGAGAAAAGCATGTAAA
ACAATTATTTGTGTCGCCCTTACGTAAAGCTTCTTGTTTTTTCTCTGTGTATATATAGCT
GATGAGATTGATTTTGGCTACAGAGATGTATTATTAGC

QA 1 638 1 638
DS 

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ATGAGATTGATTTTGGCTACAGAGATGTATTATTAGCTTAGGGTTAACTGGATTGTAACA
GAGAGCTTCTGTACCAGATTCTAGCTATGTTCATAAACGCTATGCAGGTTCAACAACATC
AATGACTTGAGATCAGT

QA 1 197 1 197
DS 



AS 1 2

CO CL6081Contig1 1253 2 2 U
GGGAGAGAGAGAGACAAAAAAAAAAAAGAGGCGAAGAAGCCAACGATACCATCCTTGCCC
AAAAAAATTCAAAACTCCGATAACCTCACGCGCCTCCCTACCATTTTTTACTGATACGAT
GGAGCCGGCGAAGGTAGATTCCGATGCGAAGACTGTCAAGGATCAGAATCCTCATCCCTC
CTCCTCGAGCGTCGATCCGAAAGCTGCGGATCAAGGACCGACGACGAAGAAGAAGGGAGG
CGGCGAGGACGCGAACACCGAGATCGCCTTGTCCGAGGTCGAAATCGAGACGAAAGGGAT
CGATCCAGCAGCGGCGCAAGGGGAAGCGCAGCCGCCGGCGAGAACGTCGTCTGGATCGAA
GAAATCGGTGCATTGGAGCCCCGAGCTGGTTTCCGGGTCTCAGGAACCGGATCAGAAGTC
CTCCGCCTCGTCGTACCCGGCCGGATCTAACCCGTATATCGCTCGTTCCCCGGCTGAGAC
GTCGGATGCTTCGTTGAAAGATACGATGGAGTCTGTGAAAGGAGCGCTTGGGAGATGGGG
GAAGAGGGTTGCTGAAGCTGCTAAGAAGACTGAGAGCCTTGCCGGCAACACCTGGCAGCA
CCTGAGAACTGCTCCGAGTTTTGCGGATGCCGCTATGGGAAGAATTGCGCAGAGCACTAA
GGTCCTTGCAGAAGGAGGATATGAGAAGATCTTCCGACAAACCTTTGAGACCGTTACAGA
AGAGCAGCTTCTAAATTCTTTTGCATGTTACTTGTCGACCTCAGCTGGGCCAGTTATGGG
AGTTCTATATATATCCTCTGCCAAGCTTGCTTACTGTAGTGACAACCCCCTTTCTTACAA
GAATGGTGGTCAAACTGAATGGAGCTACTACAAGGTAGTGATACCATTACATCAACTCAA
AGCAGTGAATCCATCGACAAGCATAGTGAACCCTGCAGAAAAGTACATACAGGTAATATC
GGTAGACAATCATGAGTTCTGGTTCATGGGTTTCTTAAACTACGAAGGCGCTGTGACATC
TCTGCAAGAAGCTTTGCAAGCCGGTGGTGGTTTACGGTCAGTGTGATTGTTTCACGTTGG
AGGATTCTTTGATGACCATATGAAAAGCTTGTTTGATGAATTCTGAATTATTTTGATCTG
TACTCTTGTTTTTCTTTTTTTTGCTTAGCTATTATCATTTCAGTTAACATTATATGCATA
AATATAATTTAATCATCATTATATGAGAGGACAGCTTATTTGCAATCGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GC15TF U 1
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BS 1 562 RR4GC15TF
BS 563 1253 RR4GC15JQ

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GGGAGAGAGAGAGACAAAAAAAAAAAAGAGGCGAAGAAGCCAACGATACCATCCTTGCCC
AAAAAAATTCAAAACTCCGATAACCTCACGCGCCTCCCTACCATTTTTTACTGATACGAT
GGAGCCGGCGAAGGTAGATTCCGATGCGAAGACTGTCAAGGATCAGAATCCTCATCCCTC
CTCCTCGAGCGTCGATCCGAAAGCTGCGGATCAAGGACCGACGACGAAGAAGAAGGGAGG
CGGCGAGGACGCGAACACCGAGATCGCCTTGTCCGAGGTCGAAATCGAGACGAAAGGGAT
CGATCCAGCAGCGGCGCAAGGGGAAGCGCAGCCGCCGGCGAGAACGTCGTCTGGATCGAA
GAAATCGGTGCATTGGAGCCCCGAGCTGGTTTCCGGGTCTCAGGAACCGGATCAGAAGTC
CTCCGCCTCGTCGTACCCGGCCGGATCTAACCCGTATATCGCTCGTTCCCCGGCTGAGAC
GTCGGATGCTTCGTTGAAAGATACGATGGAGTCTGTGAAAGGAGCGCTTGGGAGATGGGG
GAAGAGGGTTGCTGAAGCTGCT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4GC15JQ 777 0 0
AGACGTCGGATGCTTCGTTGAAAGATACGATGGAGTCTGTGAAAGGAGCGCTTGGGAGAT
GGGGGAAGAGGGTTGCTGAAGCTGCTAAGAAGACTGAGAGCCTTGCCGGCAACACCTGGC
AGCACCTGAGAACTGCTCCGAGTTTTGCGGATGCCGCTATGGGAAGAATTGCGCAGAGCA
CTAAGGTCCTTGCAGAAGGAGGATATGAGAAGATCTTCCGACAAACCTTTGAGACCGTTA
CAGAAGAGCAGCTTCTAAATTCTTTTGCATGTTACTTGTCGACCTCAGCTGGGCCAGTTA
TGGGAGTTCTATATATATCCTCTGCCAAGCTTGCTTACTGTAGTGACAACCCCCTTTCTT
ACAAGAATGGTGGTCAAACTGAATGGAGCTACTACAAGGTAGTGATACCATTACATCAAC
TCAAAGCAGTGAATCCATCGACAAGCATAGTGAACCCTGCAGAAAAGTACATACAGGTAA
TATCGGTAGACAATCATGAGTTCTGGTTCATGGGTTTCTTAAACTACGAAGGCGCTGTGA
CATCTCTGCAAGAAGCTTTGCAAGCCGGTGGTGGTTTACGGTCAGTGTGATTGTTTCACG
TTGGAGGATTCTTTGATGACCATATGAAAAGCTTGTTTGATGAATTCTGAATTATTTTGA
TCTGTACTCTTGTTTTTCTTTTTTTTGCTTAGCTATTATCATTTCAGTTAACATTATATG
CATAAATATAATTTAATCATCATTATATGAGAGGACAGCTTATTTGCAATCGTTTAC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL6082Contig1 1044 2 4 U
GGAAACGAGTCAAAGATCATGCAGGTCACTGTTGATGGTCGAGAAGCATCATATAACGGA
GGAGGGAACATTAGTTTCAGAGGAAAACTAAAGAGAAATGCACATTTCACAGCAAGACTC
TTCAAACCTAACCTTCAGCTTCTTGGTTCCCCTATCTCCGTCTCCTACTCTGTGAAATCA
GATAAAAGCTCTCTGCTAGGCATTCTCCTCCGTTTTTCAACTCCATCACAGGAGACAAAG
TCCTTATCATGGCTCCAAATGAACACATGCACAGATTTGGCGACATGTTCGTGCCATGCC
TAAGAAGGACAACATCTGACTGGACAGTGCACGAAACAAACCTTGTTATGGATGGACATA
CACTGACTGAGATCTCGGCCTTATGCTACGGTCCAGATGATCTTGCTGAAGAGACAAACA
CACAAGGATATTTTGCATTGCTTGGCCACATCTCTATCAAGTCCCAGCAGAAGACCAAAC
TTTTCCCCACAGCTTCATCATGGGTTATCGGCTCATAACGTAGAGATTGTACCTGGTGAT
TCCGGCTCCAGGACCTTAAGCTGTAAGCTAGAATGGAAACTGAAGCACCCTGAGGAGGAT
TCTGTATTCACAAGGTACAATGTGTATGCAGAGAAGCTGATTTCATACAGGACAAGGAAG
GTAATGGAAGAACCAAGAAACGAGAAAGTGTTTCTTGGGACGGCTCATGTTGATGCTTAT
TATGTTTCTGGTATGGTGGTTGGATCAGATGTGAAGAAAGTAAGGTTTGTGATTCAGACC
TGTGGTGAAGATGGTTCGTGGCAGGAGCTGGATGGTTCCCCAAGCATTCTGGTTGAGGCA
GAACAGCTCAGTTCAAAGATTTGTTGTTGTGGGTTGATTTGATCTTTGGTTTCCATTTTG
TGAACTTGTAACTCCTGCGATGATAAAGAGGAGTAATGCTGCATTAAATGTATGGTCTAG
TCACTGGTCAGCATATGATTATATGACAATGATTATGACGAAATAACTGAATGAATGAAA
GCAAATGCATTGTATTACCGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C357TF U 1
AF RR4C357JQ C 310
BS 1 351 RR4C357TF
BS 352 352 RR4C357JQ
BS 353 399 RR4C357TF
BS 400 1044 RR4C357JQ

RD RR4C357TF 403 0 0
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GGAGGGAACATTAGTTTCAGAGGAAAACTAAAGAGAAATGCACATTTCACAGCAAGACTC
TTCAAACCTAACCTTCAGCTTCTTGGTTCCCCTATCTCCGTCTCCTACTCTGTGAAATCA
GATAAAAGCTCTCTGCTAGGCATTCTCCTCCGTTTTTCAACTCCATCACAGGAGACAAAG
TCCTTATCATGGCTCCAAATGAACACATGCACAGATTTGGCGACATGTTCGTGCCATGCC
TAAGAAGGACAACATCTGACTGGACAGTGCACGAAACAAACCTTGTTATGG*TGGACATA
CACTGACTGAGATCTCGGCCTTATGCTACGGTCCAGATG
TCTT

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR4C357JQ 735 0 0
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AGATCTCGGCCTTATGCTACGGTCCAGATGATCTTGCTGAAGAGACAAACACACAAGGAT
ATTTTGCATTGCTTGGCCACATCTCTATCAAGTCCCAGCAGAAGACCAAACTTTTCCCCA
CAGCTTCATCATGGGTTATCGGCTCATAACGTAGAGATTGTACCTGGTGATTCCGGCTCC
AGGACCTTAAGCTGTAAGCTAGAATGGAAACTGAAGCACCCTGAGGAGGATTCTGTATTC
ACAAGGTACAATGTGTATGCAGAGAAGCTGATTTCATACAGGACAAGGAAGGTAATGGAA
GAACCAAGAAACGAGAAAGTGTTTCTTGGGACGGCTCATGTTGATGCTTATTATGTTTCT
GGTATGGTGGTTGGATCAGATGTGAAGAAAGTAAGGTTTGTGATTCAGACCTGTGGTGAA
GATGGTTCGTGGCAGGAGCTGGATGGTTCCCCAAGCATTCTGGTTGAGGCAGAACAGCTC
AGTTCAAAGATTTGTTGTTGTGGGTTGATTTGATCTTTGGTTTCCATTTTGTGAACTTGT
AACTCCTGCGATGATAAAGAGGAGTAATGCTGCATTAAATGTATGGTCTAGTCACTGGTC
AGCATATGATTATATGACAATGATTATGACGAAATAACTGAATGAATGAAAGCAAATGCA
TTGTATTACCGTATC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL6083Contig1 1437 2 4 U
GGAGAACACTCTCTCTCTATGATTTCACTCCTTCAATTGAAGCTAAAACCATCGCAAATG
TCTCTCACTGGTGACCGCCTCTTGATTCTCCCGACTCCTCCACGCTCTTCCTTCATCTCT
GCACCACCTCGCTTCTCCCGCCTCCCGCTGAACCGTCCTCGTACCGGTTGTATCACCTCC
GTCAATCGCTTCCGCGTCTTACCTCTGAGTCGTCAATGGAATCCGATCGTCTCAACTCGC
CGCCGACTCTTCCCCGTTCGTGCAATCGACTCAGACCTCCCACACCAGAACAACAAGGAA
TACGAAGAATGGGACTCATGGACGGCCAAATTCTCCGGCGGAGCCAACCTCCCGTTTCTG
ATGCTGCAGTTGCCACAGATCATCCTCAATTCCCAGAATCTTCTCGCCGGCAACAACACC
GCCCTCTCCGCCGTCCCATGGCTGGGGATGTTGACTGGTTTGTTAGGGAACCTTTCGTTA
CTTTCTTATTTCGCTAAGAAGAGAGAAAAAGAAGCTGCTGTGGTGCAAACGCTCGGAGTC
GTCTCTACCTACGTTGTCCTTGCGCAGCTCACGATGGCTGGAGCCATGCCTGTGAGGTAT
TTTGCTGCTACTTCTTCCGTTGTAGCGGTTGGTCTGGTGTTGAATTGTTTGTTCTGTTTC
GGTAAGATTGGGACAGCTGTGTGGGGATTGTGGGAAGACTTTATCACTGTTGGTGGGCTC
TCTGTTCTTCCTCAAATCATGTGGTCCACTTTTGTCCCTATGGTACCGAACAGTATCTTG
CCGGGAACAACTGCTTTTGTTATTGCTGTAGCGGCTGTGATTATGGCTCGAACCGGGAAA
CTCCCAGAGGAAGGTGTTAGGTTTGTTGGGTCTTTATCTGGATGGACAGCGACACTTATG
TTCATGTGGATGCCAGTTTCCCAAATGTGGACAAACTTTTTAAACCCAGACAACATAAAA
GGCTTATCACCAATCACAATGGTACTTGCGATGATGGGGAACGGGCTTATGATCCCACGA
GCACTATTTATCCGCGATTTGATGTGGTTCACCGGTTCAATATGGGCGACTTTTTTTTAT
GGATATGGAAACATTCTGTGCTTATACATGTTAAACTACACCAGCAAGTCATTTTTTGCG
GCGGCCACGACTGGTTTGATTTCATGGATAGGACTTGCTTTGTGGAGAGATACAATAGCC
TATGGTCACAACTCGCCGTTTAGACCACTAAAGGAGCTGGTGTTTGGGCCATAACTCGAC
AGAGATGAAACGCCGTTTGCTTCAAGCTAGCAAGTACATAGGGATGGGATTACTTGTTTG
TGTCAAGGACCAAGTCCATTACATTATGTCCAAGTTCCTGTATATAAAACGCATACTCAA
TGCTACTACTATTACTTTGATTGAATCATACTACTAGTAATAGTTTCCATTGGTTTT


BQ
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AF RR4B279TF U 1
AF RR4B279JQ C 657
BS 1 735 RR4B279TF
BS 736 736 RR4B279JQ
BS 737 748 RR4B279TF
BS 749 1437 RR4B279JQ

RD RR4B279TF 748 0 0
GGAGAACACTCTCTCTCTATGATTTCACTCCTTCAATTGAAGCTAAAACCATCGCAAATG
TCTCTCACTGGTGACCGCCTCTTGATTCTCCCGACTCCTCCACGCTCTTCCTTCATCTCT
GCACCACCTCGCTTCTCCCGCCTCCCGCTGAACCGTCCTCGTACCGGTTGTATCACCTCC
GTCAATCGCTTCCGCGTCTTACCTCTGAGTCGTCAATGGAATCCGATCGTCTCAACTCGC
CGCCGACTCTTCCCCGTTCGTGCAATCGACTCAGACCTCCCACACCAGAACAACAAGGAA
TACGAAGAATGGGACTCATGGACGGCCAAATTCTCCGGCGGAGCCAACCTCCCGTTTCTG
ATGCTGCAGTTGCCACAGATCATCCTCAATTCCCAGAATCTTCTCGCCGGCAACAACACC
GCCCTCTCCGCCGTCCCATGGCTGGGGATGTTGACTGGTTTGTTAGGGAACCTTTCGTTA
CTTTCTTATTTCGCTAAGAAGAGAGAAAAAGAAGCTGCTGTGGTGCAAACGCTCGGAGTC
GTCTCTACCTACGTTGTCCTTGCGCAGCTCACGATGGCTGGAGCCATGCCTGTGAGGTAT
TTTGCTGCTACTTCTTCCGTTGTAGCGGTTGGTCTGGTGTTGAATTGTTTGTTCTGTTTC
GGTAAGATTGGGACAGCTGTGTGGGGATTGTGGGAAGACTTTATCACTGTTGGTGGGCTC
TCTGTTCTTCCTCAA*TCATGTGGTCCA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4B279JQ 781 0 0
TTTCGGTAAGATTGGGACAGCTGTGTGGGGATTGTGGGAAGACTTTATCACTGTTGGTGG
GCTCTCTGTTCTTCCTCAAATCATGTGGTCCACTTTTGTCCCTATGGTACCGAACAGTAT
CTTGCCGGGAACAACTGCTTTTGTTATTGCTGTAGCGGCTGTGATTATGGCTCGAACCGG
GAAACTCCCAGAGGAAGGTGTTAGGTTTGTTGGGTCTTTATCTGGATGGACAGCGACACT
TATGTTCATGTGGATGCCAGTTTCCCAAATGTGGACAAACTTTTTAAACCCAGACAACAT
AAAAGGCTTATCACCAATCACAATGGTACTTGCGATGATGGGGAACGGGCTTATGATCCC
ACGAGCACTATTTATCCGCGATTTGATGTGGTTCACCGGTTCAATATGGGCGACTTTTTT
TTATGGATATGGAAACATTCTGTGCTTATACATGTTAAACTACACCAGCAAGTCATTTTT
TGCGGCGGCCACGACTGGTTTGATTTCATGGATAGGACTTGCTTTGTGGAGAGATACAAT
AGCCTATGGTCACAACTCGCCGTTTAGACCACTAAAGGAGCTGGTGTTTGGGCCATAACT
CGACAGAGATGAAACGCCGTTTGCTTCAAGCTAGCAAGTACATAGGGATGGGATTACTTG
TTTGTGTCAAGGACCAAGTCCATTACATTATGTCCAAGTTCCTGTATATAAAACGCATAC
TCAATGCTACTACTATTACTTTGATTGAATCATACTACTAGTAATAGTTTCCATTGGTTT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL6084Contig1 746 2 4 U
GTGGTGACACGTCAGCAGCTCTATCCGCTTACTGCGCCTCCGCGGGGATACCTTCGATTG
TCTTCTTGCCTGCGAACAAGATCTCGATGGCTCAGCTTGTTCAGCCGATAGCTAACGGTG
CGTTTGTTCTGAGCATCGACACTGATTTCGACGGCTGTATGAAGCTGATCAGGGAGATAA
CCGCTGAGTTACCTATTTACTTGGCGAACTCGTTGAATAGTTTGAGGTTAGAAGGGCAGA
AGACTGCGGCGATTGAGATTCTTCAGCAGTTTGATTGGCAAGTTCCTGATTGGGTGATTG
TTCCCGGTGGCAATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAGGCTTCAAGATGTGTCAAG
AGCTCGGACTCGTGGACAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTCAAGCGGCTAATGCGAATC
CTCTTTACTTGCATTACAAGTCTGGCTGGAAGGACTTCAAGCCCATGACCGCGAGTACCA
CTTTCGCCTCTGCGATTCAGATCGGTGACCCTGTGTCTATCGATAGAGCCGTGTACGCTC
TCAAGAAGTGTGACGGGATTGTGGAGGAAGCCACGGAGGAAGAGCTGATGGATGCGATGG
CTCAGGCTGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGGGTGTGGCTTTGACTGCTT
TGTTTAAGCGGAGGAACAGAGGAGTGATTGCGCCGACTGATAGGACTGTGGTGGTGAGTA
CTGCTCATGGGTTGAAGTTTACTCAG


BQ
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AF RR4DI34TF U 1
AF RR4DI34JQ C 542
BS 1 605 RR4DI34TF
BS 606 606 RR4DI34JQ
BS 607 641 RR4DI34TF
BS 642 746 RR4DI34JQ

RD RR4DI34TF 641 0 0
GTGGTGACACGTCAGCAGCTCTATCCGCTTACTGCGCCTCCGCGGGGATACCTTCGATTG
TCTTCTTGCCTGCGAACAAGATCTCGATGGCTCAGCTTGTTCAGCCGATAGCTAACGGTG
CGTTTGTTCTGAGCATCGACACTGATTTCGACGGCTGTATGAAGCTGATCAGGGAGATAA
CCGCTGAGTTACCTATTTACTTGGCGAACTCGTTGAATAGTTTGAGGTTAGAAGGGCAGA
AGACTGCGGCGATTGAGATTCTTCAGCAGTTTGATTGGCAAGTTCCTGATTGGGTGATTG
TTCCCGGTGGCAATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAGGCTTCAAGATGTGTCAAG
AGCTCGGACTCGTGGACAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTCAAGCGGCTAATGCGAATC
CTCTTTACTTGCATTACAAGTCTGGCTGGAAGGACTTCAAGCCCATGACCGCGAGTACCA
CTTTCGCCTCTGCGATTCAGATCGGTGACCCTGTGTCTATCGATAGAGCCGTGTACGCTC
TCAAGAAGTGTGACGGGATTGTGGAGGAAGCCACGGAGGAAGAGCTGATGGATGCGATGG
CTCAG*CTGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4DI34JQ 205 0 0
CAAGAAGTGTGACGGGATTGTGGAGGAAGCCCCGGAGGAAGAGTTGATGGATGCGATGGC
TCAGGCTGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGGGTGTGGCTTTGACTGCTTT
GTTTAAGCGGAGGAACAGAGGAGTGATTGCGCCGACTGATAGGACTGTGGTGGTGAGTAC
TGCTCATGGGTTGAAGTTTACTCAG

QA 1 205 1 205
DS 



AS 1 2

CO CL6085Contig1 1458 2 2 U
GAATCCTCTTCCTTGTGTCTGTCTGAATTAGAATCCTGTTCCTTGAGGGTTTCTGTTTTT
TTTGGTTTTTTTTCCTTTTCCTAATTTAATTTGGGTTCTTCAATCTCGTAATCTAATCGT
AATATATATATCAGAGAGGAGAGTCGGAAGAATTAAATCTGTAATCTCAAACGAGGATAA
GAAATTAATGAAGAAGAAGATGTGGGATCTTCCAAGGGATGTGGAGGAAGAGGTGTTGTG
TCGGGTTCCGTTGAAATCTCTGGGACTTGTCCGATCTACTTGCAAAAGGTGGAACATGTT
GTCCAGATGTGATCGCTTATTTGCAAAAAAGCACCTTGCTCATCTAGCAGCAGAAGCAGC
AAAGAAGAAGGACCACCCTCTTGTGGTTATGATGATTGATTATCGGGTTCAGTTGATGAG
ATTGAATCTTTCCCACGAAGACCAAGTTGTTGTTGTAAATCCTGAAGCTAAACTTATTGG
CCTAGATGAAATCGATGTGCGTGAAATCTTTCATTGCGACGGCTTATTGTTATGCATTCC
CAAAGAAGACCGATCCAGGCTATTGGTTTGGAATCCCTATTGGGGGCGGGGGCAACTCAG
GTGGATCTAGCACACACATAATCACCACTTACTGGACCAGCATCTCAATGGTCGTTTGGA
CAGGTACACGTACGGTCTCGGATACAACAAGAGTAGTTCCCAGTACAAAATCCTGAGATT
TATTGATTATCCCCTAAAATTCGTTGAGTTCAAAATCTACGACTTCAACTCTGATTCATG
GAGGATTCTTGATCTCTTTCCTCCAGACAACGACTGGTGTATAAAATTCGATGAACGCGG
CCTATCTTTGAAGGGAAACACCTACTGGTTTGCAGCAGAAGCTATGAATTACGATGCCAT
TAGTTTCTTAGTCTGTTTTGATTTCACAACAGAGACATTCTCCCCGCTTTTGCCTCTCCC
CTTTGAGGCTTTTCCTGAAGATATTTTGAGTCTATCATCATCATCTACTAGTCTTGTGGT
TTTATTCCAGTCCGCGGATACATTGGAGATGGAGATCTGGATTTCCAATACGATTGAGCA
GCCCAATGCCCTGTCCTGGAACACCAAGGTTTTCTTATCGGCGAATATCAAACAACTCAT
TAGCCCCCATTTTAATTTTCCGATATCTGCGTGTTTCTTCATTGACCAGGAGAAAAAAGT
CGCTGTGATTTTTGATAAAAACGCCCCTAATGGTACCTCCAGTCGTGAAATAGCTTACAT
CTTTTTTGGAGGAGGAGTGGATGATGATGTATCATTCTTGAAACAAGAAGTTGTTAAAGA
ATCTGCAGACCCATTTTGTTATTCAAGTGCTTGCTATTATGTTCCAAGCTTAGTGCAACT
CAACTAGTCCGTCCACCTACTATTATTGTTATCTCTGTTTGTTTCCCAAGATTGACTATT
AAGTTTCTTTTTTTTTCG


BQ
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AF RR4AK10TF U 1
AF RR4AK10JQ C 654
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BS 728 1458 RR4AK10JQ

RD RR4AK10TF 727 0 0
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TTTGGTTTTTTTTCCTTTTCCTAATTTAATTTGGGTTCTTCAATCTCGTAATCTAATCGT
AATATATATATCAGAGAGGAGAGTCGGAAGAATTAAATCTGTAATCTCAAACGAGGATAA
GAAATTAATGAAGAAGAAGATGTGGGATCTTCCAAGGGATGTGGAGGAAGAGGTGTTGTG
TCGGGTTCCGTTGAAATCTCTGGGACTTGTCCGATCTACTTGCAAAAGGTGGAACATGTT
GTCCAGATGTGATCGCTTATTTGCAAAAAAGCACCTTGCTCATCTAGCAGCAGAAGCAGC
AAAGAAGAAGGACCACCCTCTTGTGGTTATGATGATTGATTATCGGGTTCAGTTGATGAG
ATTGAATCTTTCCCACGAAGACCAAGTTGTTGTTGTAAATCCTGAAGCTAAACTTATTGG
CCTAGATGAAATCGATGTGCGTGAAATCTTTCATTGCGACGGCTTATTGTTATGCATTCC
CAAAGAAGACCGATCCAGGCTATTGGTTTGGAATCCCTATTGGGGGCGGGGGCAACTCAG
GTGGATCTAGCACACACATAATCACCACTTACTGGACCAGCATCTCAATGGTCGTTTGGA
CAGGTACACGTACGGTCTCGGATACAACAAGAGTAGTTCCCAGTACAAAATCCTGAGATT
TATTGAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4AK10JQ 805 0 0
GTTTGGACAGGTACACGTACGGTCTCGGATACAACAAGAGTAGTTCCCAGTACAAAATCC
TGAGATTTATTGATTATCCCCTAAAATTCGTTGAGTTCAAAATCTACGACTTCAACTCTG
ATTCATGGAGGATTCTTGATCTCTTTCCTCCAGACAACGACTGGTGTATAAAATTCGATG
AACGCGGCCTATCTTTGAAGGGAAACACCTACTGGTTTGCAGCAGAAGCTATGAATTACG
ATGCCATTAGTTTCTTAGTCTGTTTTGATTTCACAACAGAGACATTCTCCCCGCTTTTGC
CTCTCCCCTTTGAGGCTTTTCCTGAAGATATTTTGAGTCTATCATCATCATCTACTAGTC
TTGTGGTTTTATTCCAGTCCGCGGATACATTGGAGATGGAGATCTGGATTTCCAATACGA
TTGAGCAGCCCAATGCCCTGTCCTGGAACACCAAGGTTTTCTTATCGGCGAATATCAAAC
AACTCATTAGCCCCCATTTTAATTTTCCGATATCTGCGTGTTTCTTCATTGACCAGGAGA
AAAAAGTCGCTGTGATTTTTGATAAAAACGCCCCTAATGGTACCTCCAGTCGTGAAATAG
CTTACATCTTTTTTGGAGGAGGAGTGGATGATGATGTATCATTCTTGAAACAAGAAGTTG
TTAAAGAATCTGCAGACCCATTTTGTTATTCAAGTGCTTGCTATTATGTTCCAAGCTTAG
TGCAACTCAACTAGTCCGTCCACCTACTATTATTGTTATCTCTGTTTGTTTCCCAAGATT
GACTATTAAGTTTCTTTTTTTTTCG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

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ACACATGAAGGTGTTCCAGAAGAGTTCTATGGAGCCAAAGTCATTGGATCAAGAAGCTTC
CCTTGCCCTTATTACCAAAAGGTTCCCCTCTCGCTTGCCCTTAGTCCAAGAATTATCTCC
GAAATCGCTCGTTTTAAGCCTGACATTATACACGCTTCTTCTCCTGGGATTATGGTTTTT
GGTGCTCTGGCAATAGCAAAGATGCTATCTGTACCAATAGTAATGTCTTACCACACACGC
GTCCCTGTATACATCCCAAGATACACTTTTAGTTGGTTGGTCCAACCAATGTGGTCAATA
ATCAGATTTCTTCACCGAGCGGCTGATCTTACATTAGTTCCTTCCGCTGCCATTGGAAAA
GATCTTATAGCAGCTGGTGCAACTGCGGCTAATCAACTTCGACTCTGGAATAAGGGTGTG
GATTCAGAAAGCTTCAATCCCCGTTTCCGTTCTCAAGAAATGCGTATAAGACTAAGTAAT
GGTGAGCCAGAAAAGCCTCTTGTGATCCATGTAGGCCGTATTGGCGTAGAAAAGAGTTTG
GAGCTTCTAAAAAGTGTAATGGACAAATTGCCTGGAGCTCGGATTGCTTTCATTGGAGAT
GGGCCATACAGAGAGGATCTTGAGAAGCTGTTCGCCGGAATGCCAGCGGTTTTCACTGGA
ATGCTACAAGGGGAGGAACTCTTGCAAGCTTACGCAAGCGGTGATGTGTTTGTGATGCCA
TCAGAGTCAGAGACGCTTGGTCTCGTGGTTCTTGAGGCAATGGCTTCAGGACTTCCTGTT
GTTGCTGCTCGAGCTGGTGGAATCCCTGATATCATCCCTGAAGAACAGGAGGGAAAGACA
GGGTTTTTGTTCAGCCCTGGAGATGTGGAAGACTGTGTGACGAAGCTGAGAACTCTATTG
CACGACAGTGAAACAAGAGAAATCATTGGAAAGGCGGCAAGAGAAGAGACGGAGAAGTAT
GATTGGAGAGCAGCAACGACGAAGATACGCAATGAACAGTACGGAGCAGCGATATGGTTC
TGGAGGAAGAAGAAAGCTGAGGTTTTGGGACCAATAAATTGGTTGTTTAAACGACTCTTT
CCTGTGCCGCCGGAAGTTAACGCTTAGAAGAAGCAATCAAAGTGAAATTTGGTTGAAATG
TTACTTTTGGTTAATGGTGTTTTATCTTTTGTATACTTGGATTGCTTATGTGCTTATGGA
AAGCTTGATGTTGTAAGATATGTCTTTTATGTCTGGTCTAGTGGACTTTTGCCTTTAGGG
TTTTAATATCTTCAGATCACCTACTTTGTGTGTGTGTTTGTATAAAAAAAATGATTAGCA
AGCTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4E183TF U 1
AF RR4E183JQ C 636
BS 1 691 RR4E183TF
BS 692 1386 RR4E183JQ

RD RR4E183TF 691 0 0
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ACACATGAAGGTGTTCCAGAAGAGTTCTATGGAGCCAAAGTCATTGGATCAAGAAGCTTC
CCTTGCCCTTATTACCAAAAGGTTCCCCTCTCGCTTGCCCTTAGTCCAAGAATTATCTCC
GAAATCGCTCGTTTTAAGCCTGACATTATACACGCTTCTTCTCCTGGGATTATGGTTTTT
GGTGCTCTGGCAATAGCAAAGATGCTATCTGTACCAATAGTAATGTCTTACCACACACGC
GTCCCTGTATACATCCCAAGATACACTTTTAGTTGGTTGGTCCAACCAATGTGGTCAATA
ATCAGATTTCTTCACCGAGCGGCTGATCTTACATTAGTTCCTTCCGCTGCCATTGGAAAA
GATCTTATAGCAGCTGGTGCAACTGCGGCTAATCAACTTCGACTCTGGAATAAGGGTGTG
GATTCAGAAAGCTTCAATCCCCGTTTCCGTTCTCAAGAAATGCGTATAAGACTAAGTAAT
GGTGAGCCAGAAAAGCCTCTTGTGATCCATGTAGGCCGTATTGGCGTAGAAAAGAGTTTG
GAGCTTCTAAAAAGTGTAATGGACAAATTGCCTGGAGCTCGGATTGCTTTCATTGGAGAT
GGGCCATACAGAGAGGATCTTGAGAAGCTGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4E183JQ 751 0 0
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AAGCGGTGATGTGTTTGTGATGCCATCAGAGTCAGAGACGCTTGGTCTCGTGGTTCTTGA
GGCAATGGCTTCAGGACTTCCTGTTGTTGCTGCTCGAGCTGGTGGAATCCCTGATATCAT
CCCTGAAGAACAGGAGGGAAAGACAGGGTTTTTGTTCAGCCCTGGAGATGTGGAAGACTG
TGTGACGAAGCTGAGAACTCTATTGCACGACAGTGAAACAAGAGAAATCATTGGAAAGGC
GGCAAGAGAAGAGACGGAGAAGTATGATTGGAGAGCAGCAACGACGAAGATACGCAATGA
ACAGTACGGAGCAGCGATATGGTTCTGGAGGAAGAAGAAAGCTGAGGTTTTGGGACCAAT
AAATTGGTTGTTTAAACGACTCTTTCCTGTGCCGCCGGAAGTTAACGCTTAGAAGAAGCA
ATCAAAGTGAAATTTGGTTGAAATGTTACTTTTGGTTAATGGTGTTTTATCTTTTGTATA
CTTGGATTGCTTATGTGCTTATGGAAAGCTTGATGTTGTAAGATATGTCTTTTATGTCTG
GTCTAGTGGACTTTTGCCTTTAGGGTTTTAATATCTTCAGATCACCTACTTTGTGTGTGT
GTTTGTATAAAAAAAATGATTAGCAAGCTTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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AAAAAGGTTAGTAGTGTAAGCTAACACATTGTTTAACCACATCCATAAACTAAACAGTCT
ACTTGGTAGTGTAAGCTACATTTATTTTTGGCTACTAAAACTGTCTGTTGTTACCCCCAA
CTTTTATTGCTTCATCAGTCACGTTCCATCCGAGATTTTGACAATCATGCTACATGTCAT
GTCGGGAAATTTGAGGTACATTTTATTTTAACTTCTGGTGTTATTTTCCTTACAAGATTG
GCCTTATCTCTACATCTTTGGGATGATGCTCTTCATAATCAGAGAGCTAAGTTAACTTCT
CTGTTGGTTTAACAAAGTGACAACGATACCGCAGACTGTGGATACGTTTTACCGAAAATC
TAGCAGTACCCAATACGTAGGAAATGTGGCGGTGCCGCTACTCTGTATCAGTGCTCTAGA
TGGTCCCTTATGCACAAAGGAGGCTATTCCTTGGGAAGAATGCCGGGCAAACAAAAACAT
TGTGTTGGCGACAACAAATCACGGAGGACATCTAGCGTTTTTCGAAGGATTAACTGCATC
TAGCTTGTGGTGGGTTCGGGCCACCAACGAGTTTCTTGGCGCCCTTAGCTGCAGTCGTCA
TATGCATATGCAGAAAGTAAGTTTCTGTCTGTTATCTTCAACTGTTTTTGTCTATTGTTT
CACCAGTTCAATCCTGTGCAGATTCAAGAGAGAGGAAGCTCAGGATCAGGAAAGCTGGAG
GAGCCTTCGATAAACCAAGGCCCGTACCTTAACATTGCAGAAGACGGGTTGGTGGCAGCA
GTCAACTTGGAGGAAAACACCACACGGTCAAAAGAAGCAACACAAGTATTGAACCAGAGA
GGACCAAAGGTTAAAGATAAGAGAAGCTTTAACGTGTTGTGCCACCAGACAAAACGGTCC
ATTTGGTTGCTTGGTTACATAGGCATGGTAACAGGTTTCCCTTTAGTTGGGATGCTCATG
AACTACCTCTTTCGTAAGAAGCAACGACCCATAACAGCCTCCAAATCCTGAAGATGCTTT
ATTTTTTCCTCCCTCAGTAACTTCATTCGCAGATTCTTAATTTAATAACTGTCTTCTGAT
TTGTTAGTTATGCGTATGTTAATAACATTATCCTATACACCTTTAATCCTATTCCTCTAC
GCGTACACAGACGAAAGAAGATAATTTATGTAGAGGACGACTCCTACCTTTTTGGTAGTA
CTGTAGAAATAAGTTATCCTCTCTAACTAT


BQ
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AF RR4G146TF U 1
AF RR4G146JQ C 588
BS 1 641 RR4G146TF
BS 642 1350 RR4G146JQ

RD RR4G146TF 641 0 0
GGGTTTATCAGCCGAAAATTCAAACAAAGGTTGTACGACAGAGCTCTAACCATCGGACTT
CAAGGTTATGCCCAATTACATGAACCTCAGTATACACGGCTTGCTAACTGGGAAGGCATA
AAAAAGGTTAGTAGTGTAAGCTAACACATTGTTTAACCACATCCATAAACTAAACAGTCT
ACTTGGTAGTGTAAGCTACATTTATTTTTGGCTACTAAAACTGTCTGTTGTTACCCCCAA
CTTTTATTGCTTCATCAGTCACGTTCCATCCGAGATTTTGACAATCATGCTACATGTCAT
GTCGGGAAATTTGAGGTACATTTTATTTTAACTTCTGGTGTTATTTTCCTTACAAGATTG
GCCTTATCTCTACATCTTTGGGATGATGCTCTTCATAATCAGAGAGCTAAGTTAACTTCT
CTGTTGGTTTAACAAAGTGACAACGATACCGCAGACTGTGGATACGTTTTACCGAAAATC
TAGCAGTACCCAATACGTAGGAAATGTGGCGGTGCCGCTACTCTGTATCAGTGCTCTAGA
TGGTCCCTTATGCACAAAGGAGGCTATTCCTTGGGAAGAATGCCGGGCAAACAAAAACAT
TGTGTTGGCGACAACAAATCACGGAGGACATCTAGCGTTTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4G146JQ 763 0 0
CAAACAAAAACATTGTGTTGGCGACAACAAATCACGGAGGACATCTAGCGTTTTTCGAAG
GATTAACTGCATCTAGCTTGTGGTGGGTTCGGGCCACCAACGAGTTTCTTGGCGCCCTTA
GCTGCAGTCGTCATATGCATATGCAGAAAGTAAGTTTCTGTCTGTTATCTTCAACTGTTT
TTGTCTATTGTTTCACCAGTTCAATCCTGTGCAGATTCAAGAGAGAGGAAGCTCAGGATC
AGGAAAGCTGGAGGAGCCTTCGATAAACCAAGGCCCGTACCTTAACATTGCAGAAGACGG
GTTGGTGGCAGCAGTCAACTTGGAGGAAAACACCACACGGTCAAAAGAAGCAACACAAGT
ATTGAACCAGAGAGGACCAAAGGTTAAAGATAAGAGAAGCTTTAACGTGTTGTGCCACCA
GACAAAACGGTCCATTTGGTTGCTTGGTTACATAGGCATGGTAACAGGTTTCCCTTTAGT
TGGGATGCTCATGAACTACCTCTTTCGTAAGAAGCAACGACCCATAACAGCCTCCAAATC
CTGAAGATGCTTTATTTTTTCCTCCCTCAGTAACTTCATTCGCAGATTCTTAATTTAATA
ACTGTCTTCTGATTTGTTAGTTATGCGTATGTTAATAACATTATCCTATACACCTTTAAT
CCTATTCCTCTACGCGTACACAGACGAAAGAAGATAATTTATGTAGAGGACGACTCCTAC
CTTTTTGGTAGTACTGTAGAAATAAGTTATCCTCTCTAACTAT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL6088Contig1 1323 2 2 U
GGCAAATAATCCATTAGCCTATAAATTTAGCTGGAATCCTGCTGGAGCCATTAGAGCTGG
CCGCAACCCCGCCAAATACAAAAGCAATGGCAACATAATACACGTTGATGGGGAGGATCT
ATATGATTCAGCCACAAGATTCAGAGTACCTAACCTTCCAGCTTTTGCATTGGAGTGTCT
ACCAAACCGAAACTCATTGGTTTACAGTGAACAAATGGGAGAGAAGAACACCACTAACGC
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TGGTTCAGCCATCTGCAAAGCGTATCCATCGCGATGCCTTGTACGAAGATGTCGGATGCG
AAGTCTCTGATGATTTGTCTGACTGTGGACTTATACTCGGAATCAAACAGCCTGAGCTAG
ATATGATTCTTCCGGAGAGAGCATATGCTTTCTTTTCTCACACTCACAAGGCACAGAAAG
AGAACATGCCTTTGTTGGATAAGATTCTATCTGAGAGAGTGACGTTGTATGATTATGAGC
TCATTGTTGGAGATCATGGTAAAAGACCATTAGCATTTGGTCAATATGCAGGAAGAGCTG
GTCTCGTTGACTTCTTGCATGGACTAGGACAGAGGTATCTAGGTTTAGGATACTCAACGC
CTTTCCTCTCGCTTGGACATTCTAAGGAAAGTGCAGCCAAAGCTGCTAAAACAATTGTAT
TCTTGGGGTACAACGAAGAGAGGGAGATTCCTTCATTGTGTAAAAGTGTGTTTGATGCAA
CTTGCTACCTAATGGAGGAGAAACTAGCCTATTCCGGAAATGAGCAGGACATGGTGCTTC
TGCATCACGAAGTAGAAGTGGAGTTCCCTGAAAGCAAACGTACAGAGAAGCACAGTGCAA
CTCTCTTGGAGTTTGGGGAAATCAAGAACGGGCAAATGACGACTGCTATGGCCAAGACCG
TTGGGATCCCTGCAGCTATTGGAGCTCTGTTGCTAATTGAAGACAAGATCAAGACAAGAG
GAGTCTTACGACCTCTTGAGCCAGAAGTCTATTTGCCAGCTTTGGATATATTGCAAGCTT
ATGGTATAAAGCTGATGGAGAAGACAGAATAATTTTTTTCTTTCAAAGAACTCTTTATAC
TGTTTCTCTATAGCTTGAAGACTAAACTGAAGGAGACAATAGAGATAAGCCTCGGAACCT
TGGATCGATAGCGAGAGGAACTTTGCAGATATATGTATTATATGTGTATACGAATGTGTG
TACAAAAGAACTTGTGTCCACAAATCTCAGTGGATGTATAGTACGTAATCATATTATGTG
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4EY61TF U 1
AF RR4EY61JQ C 567
BS 1 623 RR4EY61TF
BS 624 1323 RR4EY61JQ

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TGGTTCAGCCATCTGCAAAGCGTATCCATCGCGATGCCTTGTACGAAGATGTCGGATGCG
AAGTCTCTGATGATTTGTCTGACTGTGGACTTATACTCGGAATCAAACAGCCTGAGCTAG
ATATGATTCTTCCGGAGAGAGCATATGCTTTCTTTTCTCACACTCACAAGGCACAGAAAG
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TCATTGTTGGAGATCATGGTAAAAGACCATTAGCATTTGGTCAATATGCAGGAAGAGCTG
GTCTCGTTGACTTCTTGCATGGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4EY61JQ 757 0 0
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GGACAGAGGTATCTAGGTTTAGGATACTCAACGCCTTTCCTCTCGCTTGGACATTCTAAG
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GCCTATTCCGGAAATGAGCAGGACATGGTGCTTCTGCATCACGAAGTAGAAGTGGAGTTC
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AACGGGCAAATGACGACTGCTATGGCCAAGACCGTTGGGATCCCTGCAGCTATTGGAGCT
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GTCTATTTGCCAGCTTTGGATATATTGCAAGCTTATGGTATAAAGCTGATGGAGAAGACA
GAATAATTTTTTTCTTTCAAAGAACTCTTTATACTGTTTCTCTATAGCTTGAAGACTAAA
CTGAAGGAGACAATAGAGATAAGCCTCGGAACCTTGGATCGATAGCGAGAGGAACTTTGC
AGATATATGTATTATATGTGTATACGAATGTGTGTACAAAAGAACTTGTGTCCACAAATC
TCAGTGGATGTATAGTACGTAATCATATTATGTGTGC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6089Contig1 1111 2 2 U
GAAGAAAGAAGTACAAGGAGTAGTCCTCTCAGATTTGGAAATAGAGATAAAGAGAGAGGA
AGAGATTCGAGTCTCATCACTAAACCAATCTTTTTCTTACCATCGCTTTGAGAAAAAGAA
ATGAGTAAAGAAGAGTCCATGAACATCCAGACTTATGTTCTTAGAGTGAATATACACTGT
GAAGGCTGTAAGCAAAAAGTCAAGAAAATCTTGCAGAAAATCGAAGGTGTTTTCACGACC
AAGATTGATGCAGACCAAGGGAAAGTGACTGTCTCTGTCTCTGGGAGCGTAGATGCTTCA
GTTCTCATCGAGAAGCTCGCCAAATCTGGTAAGCATGCTGAAATCTGGAGTGCTCCAAAG
GGTTATAACAACCCAAATCAGTCTCTTTTGGCGAATCAGCTGAAAGGAATGCAGATTGAC
AACGGAAGAGGCGGTGGTGGTAAGAACAATAACAACGACAAAGGTCCCAAGAATGGTGAA
ACTAATGTGCCAAAGATGGATCAACAACTGAATCCACAACAGATACAGAAGATGAAAGGG
TTTCAAGATCTGAAGCTTGCTCCGGAATTAAAAGACTTGAAGGGCTCTGTTCCTGAGAAC
AAGAACCAAAACCAGCCAGGAGCGAAGTTCAATGTTCCTGAGGAAGAGGACTACGATGAT
TTTAGTGATGACGATGACGAGTTTACTGATGCTGGTGAAGAGGACTCTGATGATGATGAG
TTTGACGATCTCCCTTCTCCTTCTAATAAAATGAAGCCTAACATGATGAAGGCTAATAAT
CAACAGATGATGATGAACGCCAATCTTGGCGGTGGTCCCACCAAATACGGCGGTAAGGGA
TTTTCCGGCGGTAGCAAAGGTGAACCTAACGGTGGTGGCGGTGGAAAAGGTGATTCTGGC
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CATCCACAGAATGGTAAAAATGGCGGTGAAGGTGGTGGTCCAAACGCCGGGAAGAATGTC
ACATGGGAGGTGCAGGACCATCAAACATGACTATGCCAATAGGTGGTCCAATGGGTATGG
GTGGTCTGATGAGAAATATTCCGGCTGTTCA


BQ
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AF RR4BK87TF U 1
AF RR4EX67TF U 580
BS 1 638 RR4BK87TF
BS 639 1111 RR4EX67TF

RD RR4BK87TF 638 0 0
GAAGAAAGAAGTACAAGGAGTAGTCCTCTCAGATTTGGAAATAGAGATAAAGAGAGAGGA
AGAGATTCGAGTCTCATCACTAAACCAATCTTTTTCTTACCATCGCTTTGAGAAAAAGAA
ATGAGTAAAGAAGAGTCCATGAACATCCAGACTTATGTTCTTAGAGTGAATATACACTGT
GAAGGCTGTAAGCAAAAAGTCAAGAAAATCTTGCAGAAAATCGAAGGTGTTTTCACGACC
AAGATTGATGCAGACCAAGGGAAAGTGACTGTCTCTGTCTCTGGGAGCGTAGATGCTTCA
GTTCTCATCGAGAAGCTCGCCAAATCTGGTAAGCATGCTGAAATCTGGAGTGCTCCAAAG
GGTTATAACAACCCAAATCAGTCTCTTTTGGCGAATCAGCTGAAAGGAATGCAGATTGAC
AACGGAAGAGGCGGTGGTGGTAAGAACAATAACAACGACAAAGGTCCCAAGAATGGTGAA
ACTAATGTGCCAAAGATGGATCAACAACTGAATCCACAACAGATACAGAAGATGAAAGGG
TTTCAAGATCTGAAGCTTGCTCCGGAATTAAAAGACTTGAAGGGCTCTGTTCCTGAGAAC
AAGAACCAAAACCAGCCAGGAGCGAAGTTCAATGTTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4EX67TF 532 0 0
GGA
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GAAGAGGACTACGATGATTTTAGTGATGACGATGACGAGTTTACTGATGCTGGTGAAGAG
GACTCTGATGATGATGAGTTTGACGATCTCCCTTCTCCTTCTAATAAAATGAAGCCTAAC
ATGATGAAGGCTAATAATCAACAGATGATGATGAACGCCAATCTTGGCGGTGGTCCCACC
AAATACGGCGGTAAGGGATTTTCCGGCGGTAGCAAAGGTGAACCTAACGGTGGTGGCGGT
GGAAAAGGTGATTCTGGCGGCGCTGGAAATCAAAACCAAGGTGGAGGTAAGAACGGCGGT
CAACATGCTGGTGGTGGACATCCACAGAATGGTAAAAATGGCGGTGAAGGTGGTGGTCCA
AACGCCGGGAAGAATGTCACATGGGAGGTGCAGGACCATCAAACATGACTATGCCAATAG
GTGGTCCAATGGGTATGGGTGGTCTGATGAGAAATATTCCGGCTGTTCA

QA 4 532 4 532
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTTTCCAAACATTTGTCTATCTAAAAAATGAAGATTCACATATACGCTTCATGTGGTT
TGTGGAAATCGTCCGTGAAGAATGGATGGGGGTTTCTTGTTGATGACGTAAAAGGAGGCA
GATTACTTACTTTGGACACAACTTCCACCTTTGATGACCTAAAGGTTATGGTGTGTGAAG
ACTTTGAACTTGATATAAACGTGGTCAAAATGAAGCTGAGTTACTTAGGGTATAGATAGG
CCGAAGATAATGTTTGCTTACTTTACTTTAGGGTATAGATAGGGGTTGAGAACGGTTGCT
TACTTTACTGCAATTTAAGGTATAGATAGGGCTTGACAACGCATATGAGTCTTTTAGGGT
ATAAAAATGGGTTGAGAAACTTAAAGACTCAAATAAAATAGTGAAACAAGGTAGTAACTA
AAAGAGTAAAAAGAGTAACTAAAAGAGTCAAATAACATAGACAAATGACAATTACTTCCT
ACACAAGTTATAAATGAAAGCGCATCATTCAAGTTCCACAAGAGGATTTGTAAATGTCTT
TGGAGGAGTGAATTTGGCCATTCTCGAAATAAGGACAGGATCGTTTGCAGCTTCCCATAG
AGCATAAGCAATCTTGTGCCGCGCTTCACGAATGTTCTCGTCATTAACCACAGAAAAGTC
CAAGCCTAGAAGATGGCATTCAAAAACTCAGTTAGCCATTCCTTTAAGTAACCAGAGATA
AGTAAACTGATAAGCATTTCAGAGTTACTACTTTATTACACAAATCAACTAGAACATGAA
AATCGAGCTCTCACATGTGAAGTATAAACATGAAAATCGACTTCTCACATGTCAAGTTGG
TTAGCCTTTTCAAGTGTTTTAGGAATTTTAAACCTTAGTAAAGACAATATCACAAACAAA
ATACAGCTCAAAATCAACTTGACAACAAGCTACCATCATCTCGAGAACAAGCTACAAGCA
TCTCACAATCAACTCAAGCACAAAGTATAATCAATAACAATAAGTTGAATCGATTTAGGG
TTTGAAAATTTTCATCTCTTTCTAGTACATGC


BQ
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AF RR4FD55TF U 1
AF RR4FD55JQ C 635
BS 1 685 RR4FD55TF
BS 686 1052 RR4FD55JQ

RD RR4FD55TF 688 0 0
TTTTTTCCAAACATTTGTCTATCTAAAAAATGAAGATTCACATATACGCTTCATGTGGTT
TGTGGAAATCGTCCGTGAAGAATGGATGGGGGTTTCTTGTTGATGACGTAAAAGGAGGCA
GATTACTTACTTTGGACACAACTTCCACCTTTGATGACCTAAAGGTTATGGTGTGTGAAG
ACTTTGAACTTGATATAAACGTGGTCAAAATGAAGCTGAGTTACTTAGGGTATAGATAGG
CCGAAGATAATGTTTGCTTACTTTACTTTAGGGTATAGATAGGGGTTGAGAACGGTTGCT
TACTTTACTGCAATTTAAGGTATAGATAGGGCTTGACAACGCATATGAGTCTTTTAGGGT
ATAAAAATGGGTTGAGAAACTTAAAGACTCAAATAAAATAGTGAAACAAGGTAGTAACTA
AAAGAGTAAAAAGAGTAACTAAAAGAGTCAAATAACATAGACAAATGACAATTACTTCCT
ACACAAGTTATAAATGAAAGCGCATCATTCAAGTTCCACAAGAGGATTTGTAAATGTCTT
TGGAGGAGTGAATTTGGCCATTCTCGAAATAAGGACAGGATCGTTTGCAGCTTCCCATAG
AGCATAAGCAATCTTGTGCCGCGCTTCACGAATGTTCTCGTCATTAACCACAGAAAAGTC
CAAGCCTAGAAGATGGCATTCAAAA
CTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FD55JQ 418 0 0
TTCTCGTCATTAACCACAGAAAAGTCCAAGCCTAGAAGATGGCATTCAAAAACTCAGTTA
GCCATTCCTTTAAGTAACCAGAGATAAGTAAACTGATAAGCATTTCAGAGTTACTACTTT
ATTACACAAATCAACTAGAACATGAAAATCGAGCTCTCACATGTGAAGTATAAACATGAA
AATCGACTTCTCACATGTCAAGTTGGTTAGCCTTTTCAAGTGTTTTAGGAATTTTAAACC
TTAGTAAAGACAATATCACAAACAAAATACAGCTCAAAATCAACTTGACAACAAGCTACC
ATCATCTCGAGAACAAGCTACAAGCATCTCACAATCAACTCAAGCACAAAGTATAATCAA
TAACAATAAGTTGAATCGATTTAGGGTTTGAAAATTTTCATCTCTTTCTAGTACATGC

QA 1 418 1 418
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6094Contig1 835 2 2 U
GGGAATGATGATGATCTTAAGAAGAATTGATTTTTAGCTTTGCTGAAACACCCTTGTGTT
CTATATTTATTGTGTCATGAAAATCATATTACATTCTTCTTACTATACAGAGGCTTAACC
AAGGTGGAAACGCAACAAACTTATGAATCTATTGCTTTCTTTTCTTTTTGTATCCAAATG
ATCTTTTTTTTTTTGGAAACACACGCAGAGTATATAACATGGTAGGGTAAACTTGTAATG
ATCTAAGATCCAGTAACCTTCTCCTGCAACATTTGGACAAGCTTCATGAACAGAGCTTGT
TGTTCCTCCAGTGTCAGGCTTGTGATTATCTGGTCTAAGAGCTTATCCACAGAGAGGCTT
TGAGGTACAACAAAGGATTGATGGTATATGTATGCAAAAACAGCCATCACCATCTGACAA
TCCATTCTATCTGTGATTCCACCATGACCGGGAATACTATCACCAAAGTCCTTGACTTTG
AAAGCTCTTTTGAAACCACTGGCAAAGAAGCCACCAAAAGGTGCTATTATAGACGCAAAT
AATCCAAGACATAGAGCATGCCACTGAACTGGTAAAACAGAAATTTCTTTCCAAGGCAAC
TACAAAGTGTAAACGCCTTACTCTTTTTAGAAGTAATGAAAGTTGCTCCCTGTAATTTTT
TCAGTAGTGTACAATGACTAGTCTTATTCAGTTGGAGATCCATCCTGGTAAAGCATGTGT
CTCTTGCTTGAACAAGGGACCCGGATCACATTGGAGCCAGCCCGTGGATAGGTCCTCTCT
GGGACATGTAAGCCACGGGAAGCGTCCCATTATATTTGCAAGCAAGAATGCAGAG


BQ
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AF RR4CO40JQ U 1
AF RR4EL39JQ U 195
BS 1 245 RR4CO40JQ
BS 246 835 RR4EL39JQ

RD RR4CO40JQ 245 0 0
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CTATATTTATTGTGTCATGAAAATCATATTACATTCTTCTTACTATACAGAGGCTTAACC
AAGGTGGAAACGCAACAAACTTATGAATCTATTGCTTTCTTTTCTTTTTGTATCCAAATG
ATCTTTTTTTTTTTGGAAACACACGCAGAGTATATAACATGGTAGGGTAAACTTGTAATG
ATCTA

QA 1 245 1 245
DS 

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AACCTTCTCCTGCAACATTTGGACAAGCTTCATGAACAGAGCTTGTTGTTCCTCCAGTGT
CAGGCTTGTGATTATCTGGTCTAAGAGCTTATCCACAGAGAGGCTTTGAGGTACAACAAA
GGATTGATGGTATATGTATGCAAAAACAGCCATCACCATCTGACAATCCATTCTATCTGT
GATTCCACCATGACCGGGAATACTATCACCAAAGTCCTTGACTTTGAAAGCTCTTTTGAA
ACCACTGGCAAAGAAGCCACCAAAAGGTGCTATTATAGACGCAAATAATCCAAGACATAG
AGCATGCCACTGAACTGGTAAAACAGAAATTTCTTTCCAAGGCAACTACAAAGTGTAAAC
GCCTTACTCTTTTTAGAAGTAATGAAAGTTGCTCCCTGTAATTTTTTCAGTAGTGTACAA
TGACTAGTCTTATTCAGTTGGAGATCCATCCTGGTAAAGCATGTGTCTCTTGCTTGAACA
AGGGACCCGGATCACATTGGAGCCAGCCCGTGGATAGGTCCTCTCTGGGACATGTAAGCC
ACGGGAAGCGTCCCATTATATTTGCAAGCAAGAATGCAGAG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL6095Contig1 1187 2 2 U
GCAGCTCCTAACGGACAGCCTCGACCTAATCGAGGAAAGACGGGACCGAGCCCTGATTCG
CATTCAAAACTATCAGCAAGCAATGGCACGACAGTACAACTCCAAAGTCAGGCTCCGACA
GTTCGCTGTAGGTGACCTAGTACTTAGGAAAGTTTTCGAAGGAACCAAAGAACCAGATGC
TGGAAAGTTAGGAACCAACTGGGAAGGTCCCTATCAGATCATCCACGTGGTACAACCTGG
CGTTTACAAGCTCCAAAAGGTGCGAACCGGGGTACCTGAAATCAGATCGTGGAACGCCAC
AAATCTGAAGAAATACTATCATTGGGTACTTAAATTCCTCGAATTGCGTTAGGCTTGACC
CCTTGACTGGGTACGTAGGCAATTGTGTTATGAGTGTAACCCCAACCTCATTTCAACACT
TCGTTCACCACAATCAAAGGGGGCATATGTCTGATTAAAATCACATAGCCCACGCAGCAA
ATGTATGATCATTATAATACAGCAATTGTATGATTACTATGATACTATGTATCCAATTAT
CAATAAAGAAATTATTCTCGATATCTCAATTCTTTAACAAAACAGGTCCCTGCAAACATG
GACCTAGGGTCCTAAAAACCCTTCGGATTAGTCCAGGTCTCTACAAACCTGGACCTAAGG
TCTTAAAATCCTTAACAACCACAAAAGGTCCTAAAATCCTTCAAGCAATATCAGGTCTCG
ACGAACCTGGACCTAAGGTCTTAAAATCCTTACTAAATCTCCAAGGTCTTAAAATTCTTA
TCAAATCTCCAAGGTCTTAAAATCCTTATCAAATCTCCAAGGTCTTAAAATCCTTATCAA
ATCTCCAAGGTCTTAAAATCCTCATCAAATCACAAAGGTCTTAAAATCCTTATCAAACCT
CAGAAGGTCTTAAAATCCTAAGCAAGTCTCAACGGGTCTTAAAATCCCACAAACGAATTT
AGGTTCCCAAGAACCCCCACCTATGGTGTCCGAGTTGAACTCAGGTTCCTAAAAACCTTA
AGCTAACTTCGATACTTCATGAACCCCTCTTAAGAGGCCAAAAACGATCCAAGTCTCTAA
GACTTACCGCGAAATCAGGGACCTAATTCGGAGGATTCACTAAACCTCTTAATTAGTAAC
CAAGGCACAGTCTCTATCGAAACTCTTAACCAAATTCGAGTTCATCC


BQ
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AF RR4G982TF U 1
AF RR4G982JQ C 554
BS 1 611 RR4G982TF
BS 612 1187 RR4G982JQ

RD RR4G982TF 611 0 0
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CATTCAAAACTATCAGCAAGCAATGGCACGACAGTACAACTCCAAAGTCAGGCTCCGACA
GTTCGCTGTAGGTGACCTAGTACTTAGGAAAGTTTTCGAAGGAACCAAAGAACCAGATGC
TGGAAAGTTAGGAACCAACTGGGAAGGTCCCTATCAGATCATCCACGTGGTACAACCTGG
CGTTTACAAGCTCCAAAAGGTGCGAACCGGGGTACCTGAAATCAGATCGTGGAACGCCAC
AAATCTGAAGAAATACTATCATTGGGTACTTAAATTCCTCGAATTGCGTTAGGCTTGACC
CCTTGACTGGGTACGTAGGCAATTGTGTTATGAGTGTAACCCCAACCTCATTTCAACACT
TCGTTCACCACAATCAAAGGGGGCATATGTCTGATTAAAATCACATAGCCCACGCAGCAA
ATGTATGATCATTATAATACAGCAATTGTATGATTACTATGATACTATGTATCCAATTAT
CAATAAAGAAATTATTCTCGATATCTCAATTCTTTAACAAAACAGGTCCCTGCAAACATG
GACCTAGGGTC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4G982JQ 634 0 0
ATTCTCGATATCTCAATTCTTTAACAAAACAGGTCCCTGCAAACATGGACCTAGGGTCCT
AAAAACCCTTCGGATTAGTCCAGGTCTCTACAAACCTGGACCTAAGGTCTTAAAATCCTT
AACAACCACAAAAGGTCCTAAAATCCTTCAAGCAATATCAGGTCTCGACGAACCTGGACC
TAAGGTCTTAAAATCCTTACTAAATCTCCAAGGTCTTAAAATTCTTATCAAATCTCCAAG
GTCTTAAAATCCTTATCAAATCTCCAAGGTCTTAAAATCCTTATCAAATCTCCAAGGTCT
TAAAATCCTCATCAAATCACAAAGGTCTTAAAATCCTTATCAAACCTCAGAAGGTCTTAA
AATCCTAAGCAAGTCTCAACGGGTCTTAAAATCCCACAAACGAATTTAGGTTCCCAAGAA
CCCCCACCTATGGTGTCCGAGTTGAACTCAGGTTCCTAAAAACCTTAAGCTAACTTCGAT
ACTTCATGAACCCCTCTTAAGAGGCCAAAAACGATCCAAGTCTCTAAGACTTACCGCGAA
ATCAGGGACCTAATTCGGAGGATTCACTAAACCTCTTAATTAGTAACCAAGGCACAGTCT
CTATCGAAACTCTTAACCAAATTCGAGTTCATCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6096Contig1 1170 2 2 U
GATTTCTAGACGAGCCACGTTGTTCGAGATGCTGAAAGATTATGGACAGGCTGCGAGTGA
CATGCATAGATATGTTAATATTCTAACCAAGCAAATGGAAGAGAAGACCTCTGGGATTCA
CGAAAGATTCACTAATTTGGCCAATGACATTAGACAAGCTCGTATGCGACTTTCCGAACT
GGAAGAGAAATCAAGGAAAGAAACTTCTTTGGATATGTACCTCGTCTTGGGTGTAATGCC
ATCATGCTCTGCTTCAGATATCAGAAAGGCATATAGGAAGGCCGCACTTAAGCATCATCC
CGACAAGGCTGGTCAGTCATTGACAAGAAACGAGAGTAAAGATGAGAGGTTATGGAAGGA
GATAGGAGAAGAAGTGCGCAGAGATACTGATAAATTATTTAAAATGATTGGGGAAGCATA
TGCTGTGCTTTCAGATCCTGCAAAGCGTTCGCAGTATGATCTTGAAGAAGAGATGCATAA
TTCACAAAGAAGACGTGATGGAGCCAGCACATCTGGAGCAGAGCCAGATGTTAATTATCC
TTTCAGTAACAGTAGAAGAAACTGGAGAGAAGGATGGAGTTCACGTAGGGAACCATCAGC
TCCGAGGTGGTTTGAACAAAACCGATCAAATAGATACCCGTTGTAACTGCAGAGCGTCTC
CAAGATATCTCTTGATCAAAAATTCATCACCAACAGAAGTTTTTGTGGCCTCCTATGCAA
AATTACCCAGGCTGGTAAGGGTGTGGAGCAGATGCTCATATTCATGGAACACACGATGAT
AAACATGGAAAGGCTTGAGAGATGCAGAGAATTTTAACTCAGGGAGTTAAGAAAAAGGAA
ACTCTCTCTATTTGTATAATCGTTTTGTTCGTGAGGTAGAGACTTCTCCATTGTCCAGTA
CGTTGAAGCAACGTTGTACAGATCACGGGAAACGTGAATTTGAGTGGTTGAAAAGAGACT
TTGCATATAACAGATTTCATGTTATATCTTTTCTTTTATTCTTCTTTGGTGGTGTTCAAA
ATGGTGTGTCACAGTCACAGGGTCGTGAGAAGGACAGCTTGGTCTCTCTCGTTTGCAGTT
CTTGTTGTTTAGTCCTTTTTATTGTAGATTCTTTTAATTCATTGGCTTCTAACAAAAAGT
AACTGATTTGATCTTGCATCAAGTGATTTC


BQ
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AF RR4B682TF U 1
AF RR4B682JQ C 368
BS 1 433 RR4B682TF
BS 434 1170 RR4B682JQ

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CGAAAGATTCACTAATTTGGCCAATGACATTAGACAAGCTCGTATGCGACTTTCCGAACT
GGAAGAGAAATCAAGGAAAGAAACTTCTTTGGATATGTACCTCGTCTTGGGTGTAATGCC
ATCATGCTCTGCTTCAGATATCAGAAAGGCATATAGGAAGGCCGCACTTAAGCATCATCC
CGACAAGGCTGGTCAGTCATTGACAAGAAACGAGAGTAAAGATGAGAGGTTATGGAAGGA
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TGCTGTGCTTTCA

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DS 

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CTTTCAGATCCTGCAAAGCGTTCGCAGTATGATCTTGAAGAAGAGATGCATAATTCACAA
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AACAGTAGAAGAAACTGGAGAGAAGGATGGAGTTCACGTAGGGAACCATCAGCTCCGAGG
TGGTTTGAACAAAACCGATCAAATAGATACCCGTTGTAACTGCAGAGCGTCTCCAAGATA
TCTCTTGATCAAAAATTCATCACCAACAGAAGTTTTTGTGGCCTCCTATGCAAAATTACC
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GAAAGGCTTGAGAGATGCAGAGAATTTTAACTCAGGGAGTTAAGAAAAAGGAAACTCTCT
CTATTTGTATAATCGTTTTGTTCGTGAGGTAGAGACTTCTCCATTGTCCAGTACGTTGAA
GCAACGTTGTACAGATCACGGGAAACGTGAATTTGAGTGGTTGAAAAGAGACTTTGCATA
TAACAGATTTCATGTTATATCTTTTCTTTTATTCTTCTTTGGTGGTGTTCAAAATGGTGT
GTCACAGTCACAGGGTCGTGAGAAGGACAGCTTGGTCTCTCTCGTTTGCAGTTCTTGTTG
TTTAGTCCTTTTTATTGTAGATTCTTTTAATTCATTGGCTTCTAACAAAAAGTAACTGAT
TTGATCTTGCATCAAGTGATTTC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6097Contig1 1284 2 2 U
GGGAGCCCCTCTCCAGCAATCATGATGGTAGCTTTCTTTTGGGCGATGTTCCAAACATTT
CAGACAATGGGAGCTCCACAAACGGAGCATCTGGAGTTACATTAGCAGATGTTTCTTCCA
ATCCTGCAATGACGTATCACGTCCCTTATGAAGCAAACCAAATCCTGGAGGGCAATTTGC
CGTATTCTCAAGTTGATATCTTAGTTCCGAACCAAGGAGCAGCAACTGCAGCTTATGGGA
GCTCAAGTTCTGATATAGTTGGATGCGAGACAGATACTGGAGAGTGTTTGGATCCAATAA
TGGCTGTTCTGGCTGGCTCAATGGCACTAGAATCCAATGCAGTAAATGAGTTGCTTCCTG
AAGTCCAAGATCCATTGTGGGAACAGTTCTTTGGCGAGAGGCCAGTGATTGGCGACACAG
AGGAGCTACTCTCAGGGTCAGTGGACAATGGGTTGATAATGGAGCAGTTGAAATTACAAT
CCAACCTGAGGAATGTGTTGAGCAACACTCAACAAATGAACCATCTTACTGAACAGATGG
GATTTCTCACATCAGATGCGCTCAGGAAGTGAAATAGCCACAAGTTCCATAAACACTCAA
AAGGTAATAATGCATCTTTCTTTGTTGAGGAGTTCATAATATTTACACATTTTTTTTCCC
AGAATATTTTTGCAAAAACACGACTTGTTCTCGCAGATGTAGAAGATGATGGGTTAAGGT
TTTGTGGAGTCGCAGCAACGAAAAGATAATAATGGCCAAAGGAGGTGTTATAATGTATGT
ATGTATCAAACTTGTGTTACTCTCATTCTTGTCAATGTGTGATAAAATAAGAGAAATAAT
AGCCTTAAAATTTTTGCATGGAACTTGGAAAGAAATCTCTACTTGTTATTGAAAGAAAAG
GAACATGTTCCAAATTGTGATATTATTTTGTTCTCTTGTGTCTTTATGATGACATGCTTC
TTTTACGGATCGGTGTTTGCGTTTTTTGTTACATTAGCCCCAAACTTGGCACTATTAGTT
TAGACATTATAACCTGAACCGATAGGCTTGTGTGAGGCGGTAATTTGGGGAGCCAAGGGT
AAGAATCAGGAGGTGGCATCACACAGTTATAAGCTCTATTGAAATAGATTTTTTTAGGGA
CTGCCCAACCTTTTTCTCAAATGTGAAAGCTGATGCTTCTTTCTGGAAAAGTAACTCAGA
TTGTACATTCCCATATGGGCCAGCTTGCATCAACAGACCATTGTAGAACTTCACTCCCCA
CAGAATCCCAGTATCATCTATACG


BQ
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AF RR4GZ84TF U 1
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BS 562 1284 RR4GZ84JQ

RD RR4GZ84TF 561 0 0
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CGTATTCTCAAGTTGATATCTTAGTTCCGAACCAAGGAGCAGCAACTGCAGCTTATGGGA
GCTCAAGTTCTGATATAGTTGGATGCGAGACAGATACTGGAGAGTGTTTGGATCCAATAA
TGGCTGTTCTGGCTGGCTCAATGGCACTAGAATCCAATGCAGTAAATGAGTTGCTTCCTG
AAGTCCAAGATCCATTGTGGGAACAGTTCTTTGGCGAGAGGCCAGTGATTGGCGACACAG
AGGAGCTACTCTCAGGGTCAGTGGACAATGGGTTGATAATGGAGCAGTTGAAATTACAAT
CCAACCTGAGGAATGTGTTGAGCAACACTCAACAAATGAACCATCTTACTGAACAGATGG
GATTTCTCACATCAGATGCGC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR4GZ84JQ 788 0 0
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TGCGCTCAGGAAGTGAAATAGCCACAAGTTCCATAAACACTCAAAAGGTAATAATGCATC
TTTCTTTGTTGAGGAGTTCATAATATTTACACATTTTTTTTCCCAGAATATTTTTGCAAA
AACACGACTTGTTCTCGCAGATGTAGAAGATGATGGGTTAAGGTTTTGTGGAGTCGCAGC
AACGAAAAGATAATAATGGCCAAAGGAGGTGTTATAATGTATGTATGTATCAAACTTGTG
TTACTCTCATTCTTGTCAATGTGTGATAAAATAAGAGAAATAATAGCCTTAAAATTTTTG
CATGGAACTTGGAAAGAAATCTCTACTTGTTATTGAAAGAAAAGGAACATGTTCCAAATT
GTGATATTATTTTGTTCTCTTGTGTCTTTATGATGACATGCTTCTTTTACGGATCGGTGT
TTGCGTTTTTTGTTACATTAGCCCCAAACTTGGCACTATTAGTTTAGACATTATAACCTG
AACCGATAGGCTTGTGTGAGGCGGTAATTTGGGGAGCCAAGGGTAAGAATCAGGAGGTGG
CATCACACAGTTATAAGCTCTATTGAAATAGATTTTTTTAGGGACTGCCCAACCTTTTTC
TCAAATGTGAAAGCTGATGCTTCTTTCTGGAAAAGTAACTCAGATTGTACATTCCCATAT
GGGCCAGCTTGCATCAACAGACCATTGTAGAACTTCACTCCCCACAGAATCCCAGTATCA
TCTATACG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL6098Contig1 1175 2 2 U
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CAAGCAAAACCAGTGGAGAAGTAGAAAGCCAACGTATGACTCATATCGCGGTCGAGAGGA
ACCGTAGAAAGCAAATGAACGAGCATCTTCGTGTTCTCAGGTCTCCTATGCCTGGATCCT
ACGTTCAAAGGGGAGATCAAGCGTCGATCATAGGTGGAGCAATAGAGTTTGTGAGAGAGA
GAGAGAACAAGTCGTGCTTGGCTGATGTGGAGGTGAAGCTGCTAGGGTTTGACGCTATGA
TCAAGATACTTTCAAGAAGAAGACCAGGACGACTGATTAAGACTATTGCTGCTTTGGAGG
ATCTTCATCTCTCCATCCTTCACACTAACATCACTACCATGGAACAAACTGTCCTCTATT
CCTTCAATGTCAAGGCAAGTTTTACTTTCTTACTTTATCATTATAGGAGTTTTATATATA
AGTACATAGTACATATCAAGTTTTTTACCCATATGTTTGGACTGCTTTAATATAAATGTT
AATTTTTTAGTAAGCTATGGGAAAAAGTAGTAGTCTAGTGATTAGCTAGTGCAGTTTCTA
TCATTGGGCGGATGTTTGCTTAGCGGCGATTCCATGGGTTTATTAAATAGGCAATAGCCA
TGTATATATATAAAACTCAATTACAGTTAGATAATATATATAAATTACATATAGCTTTGT
CATTATAAGCATATGCATTATTTAAATGTATGGTATAATTCCAAAGTTTACTAAATAAAA
ATCAGGGCAGTACAAAGTTAAAAGGAAAAAGGTTTACAGCAACACCTAGTTACAGGTTTG
GTTTCCCTCTACACAGAAAAGAGAAAATCATAAAGGATAGTTACAAAGAAGATACATATG
TATTACGAATTGATATTGTTATAGTATCTAGCAACCGCAAAAAGATAACATCAGGTAGGT
ATAACACACGTGCAGATTACAAGTGAGACGAGGTTTACTGCAGAAGACATTGCAAGTTCC
ATCCAAGAGATATTTAGTTTTATTCACGCAAATACCACCATGTAATAATTTTTATATTTC
GCCTGTCATTTCTGTTAAAGGTACTTTTCATAAGTTTATGTTGGCGGCTTATAAAAAAAA
GTCTATGTTTGTTCCATTTTAGATCTTACATGTCC


BQ
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AF RR4EB72TF U 1
AF RR4EB72JQ C 581
BS 1 646 RR4EB72TF
BS 647 1175 RR4EB72JQ

RD RR4EB72TF 646 0 0
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ATCTTCATCTCTCCATCCTTCACACTAACATCACTACCATGGAACAAACTGTCCTCTATT
CCTTCAATGTCAAGGCAAGTTTTACTTTCTTACTTTATCATTATAGGAGTTTTATATATA
AGTACATAGTACATATCAAGTTTTTTACCCATATGTTTGGACTGCTTTAATATAAATGTT
AATTTTTTAGTAAGCTATGGGAAAAAGTAGTAGTCTAGTGATTAGCTAGTGCAGTTTCTA
TCATTGGGCGGATGTTTGCTTAGCGGCGATTCCATGGGTTTATTAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4EB72JQ 595 0 0
ATTAGCTAGTGCAGTTTCTATCATTGGGCGGATGTTTGCTTAGCGGCGATTCCATGGGTT
TATTAAATAGGCAATAGCCATGTATATATATAAAACTCAATTACAGTTAGATAATATATA
TAAATTACATATAGCTTTGTCATTATAAGCATATGCATTATTTAAATGTATGGTATAATT
CCAAAGTTTACTAAATAAAAATCAGGGCAGTACAAAGTTAAAAGGAAAAAGGTTTACAGC
AACACCTAGTTACAGGTTTGGTTTCCCTCTACACAGAAAAGAGAAAATCATAAAGGATAG
TTACAAAGAAGATACATATGTATTACGAATTGATATTGTTATAGTATCTAGCAACCGCAA
AAAGATAACATCAGGTAGGTATAACACACGTGCAGATTACAAGTGAGACGAGGTTTACTG
CAGAAGACATTGCAAGTTCCATCCAAGAGATATTTAGTTTTATTCACGCAAATACCACCA
TGTAATAATTTTTATATTTCGCCTGTCATTTCTGTTAAAGGTACTTTTCATAAGTTTATG
TTGGCGGCTTATAAAAAAAAGTCTATGTTTGTTCCATTTTAGATCTTACATGTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL6099Contig1 1263 2 2 U
GGAAGTTTTAATTGAAGAAGATCGAGGAGAGCGAATCGAAAAGACAGAGAAGAGGAAGAT
TCAATGGGGGTCGATTATTACAAGGTTCTCCAAGTTGATCGAAGCGCAAGAGATGAAGAT
TTGAAGAAAGCTTATCGCAAACTCTCCATGAAGTGGCATCCCGACAAGAACCCTAACAAC
AAAAAAGAAGCAGAAGCCAAATTCAAACAGATCTCCGAAGCTTACGATGTACTGAGCGAT
CCTCAGAAGCGAGCAATCTACGATCAATACGGTGAAGAAGGTCTAAAGAGCCAGGCTCCG
CCTCCGCCTTCCGGTGGTTCAGAAACTTCGTTCAGGTTCAACGGTAGAAGCGCTGATGAC
ATCTTCTCGGAGTTCTTCGGCTTCTCCAAACCCCCTGGTGGTGGGTTCAGGTTCGGTGAA
GACGTTTTCTCGTCTTACAGGTCTTCTCCAGGGGAAACCTCTACTGCTGTTCCACCGAGG
AAAGCTGCTCCTATAGAGAGACAGCTTCCTTGTAGCTTGGAGGATTTGTATAAAGGTATC
ACTAAGAAGATGAAGATCTCTAGGGACGTCCTTGATTCCAGCTGGAGACAAACAACGGTG
GAAGAGATCTTGACGATAGAGATCAAGCCAGGATGGAAGAAAGGGACGAAGATAACTTTC
CCCGAGAAAGGAAACGAGCAGAGAGGAATCATACCTTCAGATCTCGTATTCATAGTTGAC
GAGAAGCCACACGCTGTGTTCAAGAGAGACGGGAACGACCTTGCGATCACGCAGAAGATC
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CTGACGGTTCCTGTCAACAACGTGATCAGCCCTTCTTATGAAGAGGTTGTGAAAGGAGAA
GGCATGCCTATCCCTAAAGACCCGTCGAAGAAGGGAAACTTGAGAATCAAGTTTAATATT
AAGTTCCCGTCGAGGCTAACGACAGAGCAGAAGTCTGGAATCAAACGGATGTTTTCGTCT
TGTTAGATGATTTCGTTTTAAAAACTCTGTTCTCTGTGCTCTTTTTGCTACGTTTGGTTT
CAGGTGTGGTCGTGGGAGTGTTTGTGAGATCATTAATGATGTAGCTTTCACTTTGCAGTT
AGGTTTTCTCAACACAGCTTTTGGTTTTGGGGTTTTAGTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTC
TTTCTTCTAAGTTGTTATTAGATTTGAATAAAAGAAGAACTAAGTAAAGGTTCTTTTCTT
TTG


BQ
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AAAAAAGAAGCAGAAGCCAAATTCAAACAGATCTCCGAAGCTTACGATGTACTGAGCGAT
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CCTCCGCCTTCCGGTGGTTCAGAAACTTCGTTCAGGTTCAACGGTAGAAGCGCTGATGAC
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DS 

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TGTGTTCAAGAGAGACGGGAACGACCTTGCGATCACGCAGAAGATCCCTCTGGTTGAAGC
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TAAAGACCCGTCGAAGAAGGGAAACTTGAGAATCAAGTTTAATATTAAGTTCCCGTCGAG
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GTTTTAAAAACTCTGTTCTCTGTGCTCTTTTTGCTACGTTTGGTTTCAGGTGTGGTCGTG
GGAGTGTTTGTGAGATCATTAATGATGTAGCTTTCACTTTGCAGTTAGGTTTTCTCAACA
CAGCTTTTGGTTTTGGGGTTTTAGTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTCTTTCTTCTAAGTTG
TTATTAGATTTGAATAAAAGAAGAACTAAGTAAAGGTTCTTTTCTTTTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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ACTCTCTACACCAAAAGCCTCAAGCTTTTCTACAACCTATTCTTAAAGACATCACCACAA
ACCTCTACTACTCTCCCTTATCCATAGGCGCCAACGTGCATAACATCAATCTCGCCATCG
ACCTGGATGGCTCCGCGCCATTGTTGCTAACCTGCGCCGCTGCCGCCAAATCCAGCTCTT
ACCACCCTATCAAATGCGGTTCCTCTAGATGCATGCAAGCCAAACCTGACCCTCTCTCCT
GTCCCACGAATACCTCCAAGAAAGCCACATGTCACAAGTCCTTTTCCACTTCCTTCACTG
AGAAACCCCTCAAAGCTCGTCTCCTCCGAGATACCGTGTCTTTGCTTTACACCGACAACG
GCTTCACCTATATGGGCGGTGGTATCGATATGGCTATGACTATAGCTTGCACCGACGTTA
ACGTTGACCCCTTAGTTAAACCCTTCCCGTCGATCGTTGTTGGGACGTTGGGTCTCGCTA
AGACCCATATGGCGCTTCCTTCACAGGTCGTTTCTTTATACAAACTCCCCATGAAGGTGG
CTCTCTGTTTACCTTCACCAAACTCTGGAGAGTCCTCTGGATCTGGTTCTCTTTTCATTG
GTGGTGGTCCTTACTTCATGGCACTTTACCCTGAAGATATCTCAAAGATCTTTGCCTCAA
CACCTCTACTTCCTAGTGACCAGTCTCGTGGTGAGTACTTCATCGATGTGAACTACATCC
AAATCAGTGGAAAGATTGTTCCATTTTCCAAGAAAAGCACAAAGATCTGCACTTTGGCTC
CTTACACGGTCTTGCATAGTTCTATATACAAAGCTCTAGTCTTAGCCTTCGCCGAGAAAG
CCAAGATGACTAAAGTTCCGGCAGTGAAGCCTTTTGGTTCGTGCTTCAGCTCCAAAGGAC
TCGGGAGGTGGATGATGGGAAGTCGTGTTCCTGTGATAGAGCTAGTGCTGCGTGGTGGGG
CTAAGTGGAAGATTTACGGATCCAATTCGCTTGTGAAGATGAGTAAAGATGTGGTTTGCT
TAGGATTTATGGACGGAGGTATGAGTCTGCCGATGGACATGATAATCGGAGGTTATCAGA
TGGAAGATAATTTTGTGGAGTTTGATGTAGAAGCTTCTAAGTTCTCTTTCACTTCTTCTC
TTTTGCTTATTAACTCTTCTTGCTCACAGTCGAGACACTTCTGATTCGAGTCTTGTCTTT
GTTTGGTCTGTAATGTTTGAAGATCTGCAAGATTATCTTTGCTTTTGAAATACGACAGTC
AAACTATCACA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB19TF U 1
AF RR4EB19JQ C 674
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BS 739 1331 RR4EB19JQ

RD RR4EB19TF 738 0 0
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ACCTCTACTACTCTCCCTTATCCATAGGCGCCAACGTGCATAACATCAATCTCGCCATCG
ACCTGGATGGCTCCGCGCCATTGTTGCTAACCTGCGCCGCTGCCGCCAAATCCAGCTCTT
ACCACCCTATCAAATGCGGTTCCTCTAGATGCATGCAAGCCAAACCTGACCCTCTCTCCT
GTCCCACGAATACCTCCAAGAAAGCCACATGTCACAAGTCCTTTTCCACTTCCTTCACTG
AGAAACCCCTCAAAGCTCGTCTCCTCCGAGATACCGTGTCTTTGCTTTACACCGACAACG
GCTTCACCTATATGGGCGGTGGTATCGATATGGCTATGACTATAGCTTGCACCGACGTTA
ACGTTGACCCCTTAGTTAAACCCTTCCCGTCGATCGTTGTTGGGACGTTGGGTCTCGCTA
AGACCCATATGGCGCTTCCTTCACAGGTCGTTTCTTTATACAAACTCCCCATGAAGGTGG
CTCTCTGTTTACCTTCACCAAACTCTGGAGAGTCCTCTGGATCTGGTTCTCTTTTCATTG
GTGGTGGTCCTTACTTCATGGCACTTTACCCTGAAGATATCTCAAAGATCTTTGCCTCAA
CACCTCTACTTCCTAGTG

QA 1 738 1 738
DS 

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GATTGTTCCATTTTCCAAGAAAAGCACAAAGATCTGCACTTTGGCTCCTTACACGGTCTT
GCATAGTTCTATATACAAAGCTCTAGTCTTAGCCTTCGCCGAGAAAGCCAAGATGACTAA
AGTTCCGGCAGTGAAGCCTTTTGGTTCGTGCTTCAGCTCCAAAGGACTCGGGAGGTGGAT
GATGGGAAGTCGTGTTCCTGTGATAGAGCTAGTGCTGCGTGGTGGGGCTAAGTGGAAGAT
TTACGGATCCAATTCGCTTGTGAAGATGAGTAAAGATGTGGTTTGCTTAGGATTTATGGA
CGGAGGTATGAGTCTGCCGATGGACATGATAATCGGAGGTTATCAGATGGAAGATAATTT
TGTGGAGTTTGATGTAGAAGCTTCTAAGTTCTCTTTCACTTCTTCTCTTTTGCTTATTAA
CTCTTCTTGCTCACAGTCGAGACACTTCTGATTCGAGTCTTGTCTTTGTTTGGTCTGTAA
TGTTTGAAGATCTGCAAGATTATCTTTGCTTTTGAAATACGACAGTCAAACTATCACA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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ATAATTACCTTCCATCAAAACTAAAACCTTTAAATCCTAAAAACACACAATCATGACAGA
AATAACAGAAAAAGTCGACCTACCAGCTTCGGTCTCAACGACATCAGGAGTGAAAGGACT
CGTTGATGCCAAAATAACAGAAGTCCCCCGGAGCTTTCATTACCCTTCTTCACTTTTGTC
CAACAAAAGACCTGATATCTCCGGCTTAAACCTCACCGTCCCGATCATCGACCTTGGACG
GATTAACAACACATCAACAAGAACCGACGTCGTTTCAAAGATCAAAGAAGCAGCTGAGAA
TTGGGGTTTTTTCCAAGTGATCAACCATGGTATTCCTTTAACTCTTCTTGAAGATATCAA
GCAAGGAGTACGAAGATTTCACGAGGAAGATCCCGAGGTGAAGAAAAATTACTTTCCCAC
TGATTCCAACAAGAAGTTTGTTTACAGTAACAGCTTTGAGGATCCTTATAAATCATCTAC
TTTGAATTGGAGGGACTCTTTCACTTGTTTCCTTGCTCCAGATCCTCCAAACCCTGAAGA
GATCCCTGTAGCTTGCAGGGATGCTGTGATGGACTATTCCAAGCATGTAATGGAGTTAGG
AACGTTACTCTTCCAACTTCTCTCAGAAGCTTTAGGTTTGGACTCTGATGTACTTAAGAG
GATGGATTGTCTCAAGGGTTTGTTTATGTTCTGCCACTACTACCCACCTTGTCCACAACC
TGACCTAACTTTGGGAATAAATAAACACACCGATAACTCTTTCCTTACGCTTCTTCTTCA
AGACCAAATTGGTGGTCTCCAAGTTCTTCATAAAGATTATTGGGTCGATGTAACCCCTGT
TCATGGAGCTATTGTTGTCAATGTGGGTGATTTCATGCAGCTGATAACGAATGATAAGTT
CTTAAGTGTGGAACATAGGGTACGTGCGAACATAGATGGACCACGGATTTCAGTTGCATG
TTTCTTTAGCTCGAGTCTGTTTCCAAATGCCACGGTTTATGGACCGATCAAAGAGCTTTT
GTCTGATGAAAGTCCTGCAAAGTACATAGGTATCACCATACCAGAGTATACCGCAGGTTA
CCTTGCCAGCGGCTTCGATGGGAGATCACATTTGTCTAAATATAGGATATGAAAAAAAAG
AGACTTTTCCTATTGATGAATATTTATTTGTGAGTACTTTTGCACCTGAAACAATGTTTT
AAGTAAAACGATTCACACATTATTTATTTATTTAGTTCTGC


BQ
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AF RR4H530JQB C 598
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BS 656 1301 RR4H530JQB

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ATAATTACCTTCCATCAAAACTAAAACCTTTAAATCCTAAAAACACACAATCATGACAGA
AATAACAGAAAAAGTCGACCTACCAGCTTCGGTCTCAACGACATCAGGAGTGAAAGGACT
CGTTGATGCCAAAATAACAGAAGTCCCCCGGAGCTTTCATTACCCTTCTTCACTTTTGTC
CAACAAAAGACCTGATATCTCCGGCTTAAACCTCACCGTCCCGATCATCGACCTTGGACG
GATTAACAACACATCAACAAGAACCGACGTCGTTTCAAAGATCAAAGAAGCAGCTGAGAA
TTGGGGTTTTTTCCAAGTGATCAACCATGGTATTCCTTTAACTCTTCTTGAAGATATCAA
GCAAGGAGTACGAAGATTTCACGAGGAAGATCCCGAGGTGAAGAAAAATTACTTTCCCAC
TGATTCCAACAAGAAGTTTGTTTACAGTAACAGCTTTGAGGATCCTTATAAATCATCTAC
TTTGAATTGGAGGGACTCTTTCACTTGTTTCCTTGCTCCAGATCCTCCAAACCCTGAAGA
GATCCCTGTAGCTTGCAGGGATGCTGTGATGGACTATTCCAAGCATGTAATGGAG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4H530JQB 704 0 0
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AGGAACGTTACTCTTCCAACTTCTCTCAGAAGCTTTAGGTTTGGACTCTGATGTACTTAA
GAGGATGGATTGTCTCAAGGGTTTGTTTATGTTCTGCCACTACTACCCACCTTGTCCACA
ACCTGACCTAACTTTGGGAATAAATAAACACACCGATAACTCTTTCCTTACGCTTCTTCT
TCAAGACCAAATTGGTGGTCTCCAAGTTCTTCATAAAGATTATTGGGTCGATGTAACCCC
TGTTCATGGAGCTATTGTTGTCAATGTGGGTGATTTCATGCAGCTGATAACGAATGATAA
GTTCTTAAGTGTGGAACATAGGGTACGTGCGAACATAGATGGACCACGGATTTCAGTTGC
ATGTTTCTTTAGCTCGAGTCTGTTTCCAAATGCCACGGTTTATGGACCGATCAAAGAGCT
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TTACCTTGCCAGCGGCTTCGATGGGAGATCACATTTGTCTAAATATAGGATATGAAAAAA
AAGAGACTTTTCCTATTGATGAATATTTATTTGTGAGTACTTTTGCACCTGAAACAATGT
TTTAAGTAAAACGATTCACACATTATTTATTTATTTAGTTCTGC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6102Contig1 1296 2 4 U
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CAAGTCTTTGATGATAGGATGATCTGGATTGATCTCTAGTATTCTCCTACCTCTCATGAA
CTCCAAGCTTGAAGTGTCTCCAAGCGCTTGGGCCTTCATTAACCTTTTTACCATAAAACA
AACCAGATTTTTTAAGTTTCATTCGGTTTCAATAAAGCTGAGCTGTTTTAAAGGTACTAA
CCTCTCCATATTAGCTGACCAACCAAACTTGCCAGAGACAAGCACACAAGGAGAAGAGCT
CAAACGGTTTGAAACTTGGACTTTGGCAACTTTGTCACCAAGCTGCTGTTTCATCCAATC
ACACAGAAGATTGAATTCTTGCTTAGCTTCTCTTTCCTTCACTTCATCTTCATCACCTGC
CAAAAAAATGGCGCCACGCTTTGTTAGAAACAAAGAAAGGCTTAACTAACACTCATTGCA
GTAAACAATACCAAGTTCCAAATCTTCTTTGCTGATGTCAACGAACTTCCTCTCTTTATA
GGTCTGTAGATTCTGAATCGCAACTTCATCGATTGGTTCAACCAAGTATAGAACCTATAT
AATCAACGAAAATCAAAATCAGAATCAAGAACCAAGGCAGATTCAGGTCCATGAGTTGAA
AAAACTAATCTTGAATCATTCATTATTACCTCAATGTCTTTTTGAATTAGTTTCTCCAAG
AAAGGAGCAGACTTGGCACTTTTCAGACTATCAGTGGCGAGGTAGTAGATAGCCTTTTGG
TTCTCACCCATGTTCTCAATATATTCATCCAAACTCGTCAGCTCCTCTTCGTTCTTGGAG
CTGTAGAATCTAAGCAACGGTGTAATACGCTTGTGGTTACCAGTGTCTTCAATACAACCC
AACTTGAGGAATCTACCAAAGTTCTCCCAGAACTTCTTGTAGTCCTGAAACCAATTCGTA
CCAAACAAAATGAATCTCTCTTCGAATGATCTCAAGAGAACAAAGTAGGTTTAATGTGAA
TGTACATACCTCTTTGTTTTCACTTTCAGAGATTTCTTGTATCATGTCGAAAGTCTTCCT
AATGAGCCTCTTTCTCATGATTCTTACCTGAATGTTGTTACAAAGATTGAGTATGATTCA
TATGAAGAGTTGTATCAGTAACTGTTGGCATCACTTACGATTCTGCTTTCTTGGAGAATT
TCACGTGAAACGTTAAGTGGAAGATCGTTTGAATCCACCACACCCTCCACAAAGCTCAAG
TATCTGGGGAACTGCAGACAGATAATGAACCATGTC


BQ
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AF RR4FG27TF U 1
AF RR4FG27JQ C 636
BS 1 663 RR4FG27TF
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CAAGTCTTTGATGATAGGATGATCTGGATTGATCTCTAGTATTCTCCTACCTCTCATGAA
CTCCAAGCTTGAAGTGTCTCCAAGCGCTTGGGCCTTCATTAACCTTTTTACCATAAAACA
AACCAGATTTTTTAAGTTTCATTCGGTTTCAATAAAGCTGAGCTGTTTTAAAGGTACTAA
CCTCTCCATATTAGCTGACCAACCAAACTTGCCAGAGACAAGCACACAAGGAGAAGAGCT
CAAACGGTTTGAAACTTGGACTTTGGCAACTTTGTCACCAAGCTGCTGTTTCATCCAATC
ACACAGAAGATTGAATTCTTGCTTAGCTTCTCTTTCCTTCACTTCATCTTCATCACCTGC
CAAAAAAATGGCGCCACGCTTTGTTAGAAACAAAGAAAGGCTTAACTAACACTCATTGCA
GTAAACAATACCAAGTTCCAAATCTTCTTTGCTGATGTCAACGAACTTCCTCTCTTTATA
GGTCTGTAGATTCTGAATCGCAACTTCATCGATTGGTTCAACCAAGTATAGAACCTATAT
AATCAACGAAAATCAAAATCAGAATCAAGAACCAAGGCAGATTCAGGTCCATGAGTTGAA
AAA*CTAATCTTGAATCATTCATTATTACCTCAATGTCTTTT
GAAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4FG27JQ 661 0 0
GCAGATTCA
AGGTCCATGAGTTGAAAAAACTAATCTTGAATCATTCATTATTACCTCAATGTCTTTTTG
AATTAGTTTCTCCAAGAAAGGAGCAGACTTGGCACTTTTCAGACTATCAGTGGCGAGGTA
GTAGATAGCCTTTTGGTTCTCACCCATGTTCTCAATATATTCATCCAAACTCGTCAGCTC
CTCTTCGTTCTTGGAGCTGTAGAATCTAAGCAACGGTGTAATACGCTTGTGGTTACCAGT
GTCTTCAATACAACCCAACTTGAGGAATCTACCAAAGTTCTCCCAGAACTTCTTGTAGTC
CTGAAACCAATTCGTACCAAACAAAATGAATCTCTCTTCGAATGATCTCAAGAGAACAAA
GTAGGTTTAATGTGAATGTACATACCTCTTTGTTTTCACTTTCAGAGATTTCTTGTATCA
TGTCGAAAGTCTTCCTAATGAGCCTCTTTCTCATGATTCTTACCTGAATGTTGTTACAAA
GATTGAGTATGATTCATATGAAGAGTTGTATCAGTAACTGTTGGCATCACTTACGATTCT
GCTTTCTTGGAGAATTTCACGTGAAACGTTAAGTGGAAGATCGTTTGAATCCACCACACC
CTCCACAAAGCTCAAGTATCTGGGGAACTGCAGACAGATAATGAACCATGTC

QA 10 661 10 661
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGCCGAACTTCATTCACTTGACAAAATCGCTCGACGACAAAGACGACGAATCCGAGGAA
TCCAGCAACGATCTAGAAACCGCATACCGAGACTAGATTCAGAAACCACAGGCTTGAAAG
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TTCTTCTGCAGCAGCAGCATTGGCAATGGACTCCACCGAGTCATATGCCCCTCCTCCTCA
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CATTCGTTTCCTTGTATCCAATGCGGCAGCTGGCTCCGTCATTGGGAAAGGAGGCTCCAC
CATCACTGAGTTCCAGGCTAAGTCCGGTGCGCGGATCCAGCCCTCTCGTAACCAGGAGTT
TTTCCCTGGGACAACCGATAGGATTATCATGATATCTGGCTCTATTAAAGAAGTTGTCAA
TGGACTTGAACTTATCCTTGATAAATTGCACAGCGAGCTTCATACTGAAGAGGGTAGTGA
TGTTGAGCCTCGGAGACGACTAAGACTTGTGGTTCCTAACAGTTCTTGTGGAGGCATCAT
TGGGAAAGGAGGGGCCACCATCAAGTCATTCATTGAGGAATCTAAAGCTGGTATTAAGAT
ATCCCCTCTGGATAATACCTTCTATGGGGTTGAGTGATAGGCTAGTCACGTTATCTGGAA
CCTTCGAGGAGCAGATGCGGGCTATTGATTTGATTTTGGCTAAGCTTACCGAGGACGATC
ATTACTCCCAGAATGTGCATTCCCCATATTCATATGCAGGTCTTTCCTACTCTGGTTTTC
ATGGTCATCCATATGCGTATGTGCTTCCTTCTGTTGCAACAGCGGGATACAGTTCGGCTA
ACTACGCACACAACGGTTCTGGAGGCAGGTATCAAAACCACCAAAAGGAAGAGGCTGGTA
CGACGGTGACAATTGGTGTGTCGGATGAGCATATAGGACTGGTCCTTGGCCGTGGGGGAA
GAAACATCATGGAAATCACTCAGATGACAGGTGCCCGAATAAAAATATCTGACCGAGGCG
ATTTCATGTCTGGAACCACTGATAGGAAAGTGAGTATCACAGGATCACAGAGAGCAATTC
AGCAAGCTGAGACGATGATAAAACAGAAAGTTGATTCAGCCTCCGAGAGAGACACCGAAT
AAAAGCACCCACCGACGGAAGTGTCCATCTTGGTTCCTTATCTTTGGTCATTTGTTGAGG
CTTAAGCTTTGAGAATGGGATCACAAAATCATCTTGAAGTGAGGCAGAGAGTTGTCTCTA
GGAGAGCTTTGTTTCTTCTTGGTTCATTTTCTTTTGCATGTCTTTTGACTTAATACAATG
TGTTTTTTTTTTGCTTTCTCTTGGGAGAGAAGCAGGATTGGATTTAGAAGTCTTGTTTTC
ACTTTTGTTTTATTAATAACTTTATTGAAGTTTTGTTTCCCTTGAGTTCTTCCTGTCTAT
AACAATGAACACACCCAACCATTACACTAC


BQ
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AF RR4AK23TF U 1
AF RR4AK23JQ C 758
BS 1 816 RR4AK23TF
BS 817 1530 RR4AK23JQ

RD RR4AK23TF 816 0 0
GGGCCGAACTTCATTCACTTGACAAAATCGCTCGACGACAAAGACGACGAATCCGAGGAA
TCCAGCAACGATCTAGAAACCGCATACCGAGACTAGATTCAGAAACCACAGGCTTGAAAG
TGTCGCTGACGCAAGGAGGCTTTGAGAACAGAGATTGCTTGATTCGGATTCTTCTTAATC
TTCTTCTGCAGCAGCAGCATTGGCAATGGACTCCACCGAGTCATATGCCCCTCCTCCTCA
AGAGCTCACCAAGCTTTCCCCTGAACCTTCCGAAGATGATTCTGGTGAGAAGCCAACACA
CATTCGTTTCCTTGTATCCAATGCGGCAGCTGGCTCCGTCATTGGGAAAGGAGGCTCCAC
CATCACTGAGTTCCAGGCTAAGTCCGGTGCGCGGATCCAGCCCTCTCGTAACCAGGAGTT
TTTCCCTGGGACAACCGATAGGATTATCATGATATCTGGCTCTATTAAAGAAGTTGTCAA
TGGACTTGAACTTATCCTTGATAAATTGCACAGCGAGCTTCATACTGAAGAGGGTAGTGA
TGTTGAGCCTCGGAGACGACTAAGACTTGTGGTTCCTAACAGTTCTTGTGGAGGCATCAT
TGGGAAAGGAGGGGCCACCATCAAGTCATTCATTGAGGAATCTAAAGCTGGTATTAAGAT
ATCCCCTCTGGATAATACCTTCTATGGGGTTGAGTGATAGGCTAGTCACGTTATCTGGAA
CCTTCGAGGAGCAGATGCGGGCTATTGATTTGATTTTGGCTAAGCTTACCGAGGACGATC
ATTACTCCCAGAATGTGCATTCCCCATATTCATATG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AK23JQ 773 0 0
GGCTAAGCTTACCGAGGACGATCATTACTCCCAGAATGTGCATTCCCCATATTCATATGC
AGGTCTTTCCTACTCTGGTTTTCATGGTCATCCATATGCGTATGTGCTTCCTTCTGTTGC
AACAGCGGGATACAGTTCGGCTAACTACGCACACAACGGTTCTGGAGGCAGGTATCAAAA
CCACCAAAAGGAAGAGGCTGGTACGACGGTGACAATTGGTGTGTCGGATGAGCATATAGG
ACTGGTCCTTGGCCGTGGGGGAAGAAACATCATGGAAATCACTCAGATGACAGGTGCCCG
AATAAAAATATCTGACCGAGGCGATTTCATGTCTGGAACCACTGATAGGAAAGTGAGTAT
CACAGGATCACAGAGAGCAATTCAGCAAGCTGAGACGATGATAAAACAGAAAGTTGATTC
AGCCTCCGAGAGAGACACCGAATAAAAGCACCCACCGACGGAAGTGTCCATCTTGGTTCC
TTATCTTTGGTCATTTGTTGAGGCTTAAGCTTTGAGAATGGGATCACAAAATCATCTTGA
AGTGAGGCAGAGAGTTGTCTCTAGGAGAGCTTTGTTTCTTCTTGGTTCATTTTCTTTTGC
ATGTCTTTTGACTTAATACAATGTGTTTTTTTTTTGCTTTCTCTTGGGAGAGAAGCAGGA
TTGGATTTAGAAGTCTTGTTTTCACTTTTGTTTTATTAATAACTTTATTGAAGTTTTGTT
TCCCTTGAGTTCTTCCTGTCTATAACAATGAACACACCCAACCATTACACTAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL6105Contig1 741 2 4 U
GTCTTCCTCGTGCTCCTCCGCTTCAACATTTTCCCGAGAATTTTAGCTCGAGAAAATTTG
GAATGGGGGTGAAAATAGCACCATACACTTCTCCCTTCCTTCAATGGGCTGCTCATCTTT
CTTCTTCTTCCCCTTCAAGGGCCATATCATCACGACGACGACACGACGGACGGTTCGTCC
CTCAGAGATTGAACCGTTCCTCTCTCTTCGGTACGCCACTCCATCGCTCCAAATCCTGCG
AACTATCTAAACCGACCAAAACGCAGTCGTTTCGTAGAGTTTCTAGCGCAAGCTTCTCCG
ACGAGGAGTTCTCGAAAAAGATCCAAGAGCTAACTCTCAGATTCAACAACGAGAGAGATG
CGAACTTGTCGAGTATCGAAATGAAAGCAAACAGGGTCTATCTTCCACTCTCGCTTCGGA
TCATAAAGAAGAAACGGCAATGTGAGGAAGGTGTCAAACAAACCGCGCGTGACTCGATGA
GCAAAGCCTTCTCGTCGATGGTGTTCATGATCAAGAGCTCCAAAGCTTCACCTTACACAT
GAGGGAGACTCTCTTCTACGAAGACTTACGAGGGATCTTGGCACGTGTGAGAAAAGAGAT
GCACGCGTCGTTCGTCTGGTTGTTCCGACAGGTTTTCTCCGCGACGCCTACGTTGATGGT
CTACGTCATGATTCTCCTCGCCAACTTCACGGTTTATTCGCTCGGTGCCAACTCTGCTTT
AGCAGCCGCCGCTCCGACGAC


BQ
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AF RR4GV39TF U 1
AF RR4GV39JQ C 578
BS 1 592 RR4GV39TF
BS 593 593 RR4GV39JQ
BS 594 687 RR4GV39TF
BS 688 741 RR4GV39JQ

RD RR4GV39TF 687 0 0
GTCTTCCTCGTGCTCCTCCGCTTCAACATTTTCCCGAGAATTTTAGCTCGAGAAAATTTG
GAATGGGGGTGAAAATAGCACCATACACTTCTCCCTTCCTTCAATGGGCTGCTCATCTTT
CTTCTTCTTCCCCTTCAAGGGCCATATCATCACGACGACGACACGACGGACGGTTCGTCC
CTCAGAGATTGAACCGTTCCTCTCTCTTCGGTACGCCACTCCATCGCTCCAAATCCTGCG
AACTATCTAAACCGACCAAAACGCAGTCGTTTCGTAGAGTTTCTAGCGCAAGCTTCTCCG
ACGAGGAGTTCTCGAAAAAGATCCAAGAGCTAACTCTCAGATTCAACAACGAGAGAGATG
CGAACTTGTCGAGTATCGAAATGAAAGCAAACAGGGTCTATCTTCCACTCTCGCTTCGGA
TCATAAAGAAGAAACGGCAATGTGAGGAAGGTGTCAAACAAACCGCGCGTGACTCGATGA
GCAAAGCCTTCTCGTCGATGGTGTTCATGATCAAGAGCTCCAAAGCTTCACCTTACACAT
GAGGGAGACTCTCTTCTACGAAGACTTACGAGGGATCTTGGCACGTGTGAGAGAAGAGAT
GCACGCGTCGTTCGTCTGGTTGTTCCGACAGGTTTTCTCCGCGACGCCTACGTTGATGGT
CTACGTCATGATTCTCCTCGCCAACTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4GV39JQ 164 0 0
TTGGCACGTGTGAGAAAAGAGATGCACGCGTCGTTCGTCTGGTTGTTCCGACAGGTTTTT
TCCGCGACGCCTACGTTGATGGTTTACGTCATGATTCTCCTCGCCAACTTCACGGTTTAT
TCGCTCGGTGCCAACTCTGCTTTAGCAGCCGCCGCTCCGACGAC

QA 1 164 1 164
DS 



AS 1 2

CO CL6106Contig1 1356 2 2 U
GGAATCTGAAGGATATCTGTTATAGATTCATCCTCTTTAAGCCCTCCATTAATCTATCAC
CCATGATCTATCTTCAATGTGAGCTTTAATTCTGCAAGGCTGTGTATCTGCATGTATAAA
AAGACCGGACGCTCCTCCTCCACCGTTCAAGCGCAGTTGCTCCGGTTCTGGGAGGCCATG
GACATCATCCTCACAAAAGTTTATTGTATTTCTTCCACCGTCTAAGAGCAGAACCGCCTC
TGTTTTCTCTGGGTCGGCCAAGAGGAAGCATATCAGCGTATGAGGGAGAGAAGAAAAACA
GAGGGATGATGAGTGATGCGCGTAAGGGCTACGCCACCGTTGAAGATCTAACGAAAATAC
CCATAGCCGGAGCTTCAAACATTAATGGCTGCAGGAGGAAATCACTTGGAGGCGGAGGGG
AGAGAAAATTACTTGGCGGTGGTGGTGGTCGGAGTTGGTATATCTAACAGGCGCCTCCTT
CTGCCAACTTCTCCATGACACCGTGCGGCTTCAGTTTATCAACAGCTTAAGAAAAGTCCT
CTTGGTGCTCATATCAAACATGTCATTGAACTCTTATTTGAGACAAGGCAATCCTTTACA
CCAGAGCCAATGACGTTTACACCAGAACAAATGAACAGAAGTTGTTATGTTATTATCCTT
TCCAAAAAGGCTGTTTTTGATGGTTAAGGAACTATGCTAGGCGATGTCAAGTATCCTGCT
GGGACTGCAGTTGTTGATCTGAAAGTAGCTTACCTGAATGACAGCAACTATTGATCTGAA
AATAACTTATGGAGGATTTGCAGGTCAAAGTTGATGACAAGTATAAATTTATGCTCCACG
ACAGACATTCCGAGCGACCTGCTTGACGTGTAGAATGAGCTTCTTAAGTTTGGTCTGAAG
CCAGTGATGAATACTACACAAAAGAGAGCTGCTGCACAGATTCAAGGTGCACGTAATAAA
CAATAAAGAAAAAGAAACAAGAGATCAGCAAGACAACAAAACTCACCAACACCCTTCTTC
CCGAGCTCTTACATATCCTCAGTGGCAGCACTTCTCATATCAGATTTTGGGTCAGATATA
TAAGTCTGAAGAAATTTATTTGCGCATCTCTTCATCGCCACACATAGGATCCAACTTAAG
AGGATACCCTTATTGTTTAACTTAACAGAATCTCCTCCTGGATTCTCTCTACTCTCATCT
TGGTTTCAAGTTTTTTAACGACTGGGGCTGTTAGCGTTATTGTTTAACTTTTTGGGTAGT
ATTTAGGCTAACAGGCATTGGGCCTACCGCGTTTAGGGTGCCATCTCTTTTTGTATTGGG
TCAAACCCTTATTTTGGTTAATATAATCTAATCCTC


BQ
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10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CG39TF U 1
AF RR4CG39JQ C 545
BS 1 668 RR4CG39TF
BS 669 1356 RR4CG39JQ

RD RR4CG39TF 668 0 0
GGAATCTGAAGGATATCTGTTATAGATTCATCCTCTTTAAGCCCTCCATTAATCTATCAC
CCATGATCTATCTTCAATGTGAGCTTTAATTCTGCAAGGCTGTGTATCTGCATGTATAAA
AAGACCGGACGCTCCTCCTCCACCGTTCAAGCGCAGTTGCTCCGGTTCTGGGAGGCCATG
GACATCATCCTCACAAAAGTTTATTGTATTTCTTCCACCGTCTAAGAGCAGAACCGCCTC
TGTTTTCTCTGGGTCGGCCAAGAGGAAGCATATCAGCGTATGAGGGAGAGAAGAAAAACA
GAGGGATGATGAGTGATGCGCGTAAGGGCTACGCCACCGTTGAAGATCTAACGAAAATAC
CCATAGCCGGAGCTTCAAACATTAATGGCTGCAGGAGGAAATCACTTGGAGGCGGAGGGG
AGAGAAAATTACTTGGCGGTGGTGGTGGTCGGAGTTGGTATATCTAACAGGCGCCTCCTT
CTGCCAACTTCTCCATGACACCGTGCGGCTTCAGTTTATCAACAGCTTAAGAAAAGTCCT
CTTGGTGCTCATATCAAACATGTCATTGAACTCTTATTTGAGACAAGGCAATCCTTTACA
CCAGAGCCAATGACGTTTACACCAGAACAAATGAACAGAAGTTGTTATGTTATTATCCTT
TCCAAAAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4CG39JQ 812 0 0
GTGCTCATATCAAACATGTCATTGA*CTCTTATTTGAGACAAGGCAATCCTTTACACCAG
AGCCAATGACGTTTACACCAGAACAAATGAACAGAAGTTGTTATGTTATTATCCTTTCCA
AAAAGGCTGTTTTTGATGGTTAAGGAACTATGCTAGGCGATGTCAAGTATCCTGCTGGGA
CTGCAGTTGTTGATCTGAAAGTAGCTTACCTGAATGACAGCAACTATTGATCTGAAAATA
ACTTATGGAGGATTTGCAGGTCAAAGTTGATGACAAGTATAAATTTATGCTCCACGACAG
ACATTCCGAGCGACCTGCTTGACGTGTAGAATGAGCTTCTTAAGTTTGGTCTGAAGCCAG
TGATGAATACTACACAAAAGAGAGCTGCTGCACAGATTCAAGGTGCACGTAATAAACAAT
AAAGAAAAAGAAACAAGAGATCAGCAAGACAACAAAACTCACCAACACCCTTCTTCCCGA
GCTCTTACATATCCTCAGTGGCAGCACTTCTCATATCAGATTTTGGGTCAGATATATAAG
TCTGAAGAAATTTATTTGCGCATCTCTTCATCGCCACACATAGGATCCAACTTAAGAGGA
TACCCTTATTGTTTAACTTAACAGAATCTCCTCCTGGATTCTCTCTACTCTCATCTTGGT
TTCAAGTTTTTTAACGACTGGGGCTGTTAGCGTTATTGTTTAACTTTTTGGGTAGTATTT
AGGCTAACAGGCATTGGGCCTACCGCGTTTAGGGTGCCATCTCTTTTTGTATTGGGTCAA
ACCCTTATTTTGGTTAATATAATCTAATCCTC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL6107Contig1 730 2 2 U
GGGAGAAGAGGAGGAGCTGCTTGTTCCTTTCCGGAGATATATCTGTTCTTCGTTCAAAGG
GGAGCATTTAAGGATTCTTATCGTTCAAGATGGAGCGCAAGACGATTGATTTGGACCAAG
GATGGGACTATATGCAGACTGGTATTACTAAGCTGAAACGGATTCTCGAAGGGCTGCCTG
AGCCGCAGTTTGACTCTGAGCAATACATGATGCTCTATACGACTATCTACAACATGCGCA
CTCAGAAACCGCCTCATGATTACTCTCAGCAGCTTTATGACAAGTATCGTGAAGCATTTG
AGGAGTATATTAACTCCACTGTTTTGCCTGCTTTAATGGAGAAGCACGATGAATACATGC
TGCGGGAGCTGGTTAAAAGGTGGTCTAACCATAAAGTTATGGTTCGATGGCTATCCCGCT
TCTTCTACTATCTTGACCGTTACTTCATTGCTCGGAGATCACTTCCACCCCTCAATGAAG
TTGGCCTGACCTGCTTCCGTGACCGGGTTTATAACGAGTTGCATTCCAAGGTCAAAGATG
CTGTAATAGCACTTATTGATAAAGAACGTGAAGGCGAGCAGATTGATAGGGCTCTACTGA
AAAACTATTTATGGCTTTGTTTTGAATTTTTTTTTCTTTTTTTAACTTGTGTCGTGCCTT
TTTTCCTTGGGATGCAAATTACCTTTTGGATATGGATTGGAGATGGCATAATGAATTGAT
ATCTGCTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET41TF U 1
AF RR4ET41JQ C 221
BS 1 339 RR4ET41TF
BS 340 730 RR4ET41JQ

RD RR4ET41TF 339 0 0
GGGAGAAGAGGAGGAGCTGCTTGTTCCTTTCCGGAGATATATCTGTTCTTCGTTCAAAGG
GGAGCATTTAAGGATTCTTATCGTTCAAGATGGAGCGCAAGACGATTGATTTGGACCAAG
GATGGGACTATATGCAGACTGGTATTACTAAGCTGAAACGGATTCTCGAAGGGCTGCCTG
AGCCGCAGTTTGACTCTGAGCAATACATGATGCTCTATACGACTATCTACAACATGCGCA
CTCAGAAACCGCCTCATGATTACTCTCAGCAGCTTTATGACAAGTATCGTGAAGCATTTG
AGGAGTATATTAACTCCACTGTTTTGCCTGCTTTAATGG

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR4ET41JQ 510 0 0
GACTATCTACAACATGCGCACTCAGAAACCGCCTCATGATTACTCTCAGCAGCTTTATGA
CAAGTATCGTGAAGCATTTGAGGAGTATATTAACTCCACTGTTTTGCCTGCTTTAATGGA
GAAGCACGATGAATACATGCTGCGGGAGCTGGTTAAAAGGTGGTCTAACCATAAAGTTAT
GGTTCGATGGCTATCCCGCTTCTTCTACTATCTTGACCGTTACTTCATTGCTCGGAGATC
ACTTCCACCCCTCAATGAAGTTGGCCTGACCTGCTTCCGTGACCGGGTTTATAACGAGTT
GCATTCCAAGGTCAAAGATGCTGTAATAGCACTTATTGATAAAGAACGTGAAGGCGAGCA
GATTGATAGGGCTCTACTGAAAAACTATTTATGGCTTTGTTTTGAATTTTTTTTTCTTTT
TTTAACTTGTGTCGTGCCTTTTTTCCTTGGGATGCAAATTACCTTTTGGATATGGATTGG
AGATGGCATAATGAATTGATATCTGCTTTT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL6108Contig1 1230 2 4 U
GCAAACCAACTGGATGACATGGAAGCGTTTGGAGATGTGGGAGCCCTAGAAGATAACGTA
GAATCGTTTTTATCCCAAGATGATGGAGATGGAGGAAGCTTGTTTGGCACCCTAAAGCGG
AACCCTTCTGAGCATACCGAAACCTTAAAGGCTTTTAGTTTTAGTGAGGTTGGCTCTATA
AGAAGAAGCGCCAGCAAGGTCATCTGCTGTAATTTCTCATCTGATGGGAAGTTGTTAGCT
AGCGCTGGACATGATAAGAAGGTTTTTTTTTGGAACATGGAAACGCTACACACTGAGATT
CCTCCGGAAGAGCATGGTCATATCATCACAGATATTCGATTCCAACCTAATTCAACTCAA
CTGGCTACGTCTTCGTTCGACAAAACTATCAAAATATGGGATGTTTCTAAGCCTGGTTAC
TTCGTACGAACAATTTCTGGTCACAATGCACCTGTAATGTCCCTTGATTTTCACCCTAAG
AAAACCGATTTGTTCTGCTCTTGTGATACCAATAATGAGATTCGTTTCTGGAGCATCAAC
TCTAATTGCCTTCGTGGCATAAAGGGTGCTAGCACGCAAGTACGGTTCCAGCCAAAACTT
GGACAAATGCTTGCTGCAGCTTCGGAAAATATTGTGTCAATTTTCGATGTTGAACAGTAC
AGAGGGGTCAATTCGTTTAAGGGACATTCCTCAACTGTGCATTCTATTTGTTGGAACCCA
ACCGGAGAGTTGGTAGCTTCTGTTAGCGAAGACAGTGTTAAAGTATGGTCTGTGAACTCA
GGAGAGTGCATCCACGAACTCAGTTCTAGTGGAAACAAATTCCACTCTTGCGTTTATCAC
CCTGCCTATCCCAACCTCTTGGTCATCGGTGGGTACCAGTCAATAGAGTTGTGGGACACA
GGAGAGAACAAATGTATGACATTAGCGGCTCACGAGTGTGTGATCTCTGCCTTAGCTCAG
TCATTTTCGACAGGAATGTTGGCGTCTGCAAGTCATGACAAGTCCGTAAAGATTTGGAAG
TAGAAAAAATATTTTATCTTCTTCTTCAAGAAGAGCTCAGGACTATTTTTGAGTCTAATT
CTTTGTTAAATGTTTGAAATCAATAAGTTGTTTAATGGGTTTGTTAGCGCAAGAGCAAAG
GGACTTGCTTTGTTTTATGATCCGTACTTTCTTTCTTGTTGTGATCTCTAGTGTTTGAAG
TGAGACACAGAGATGTAAGTAATTTCCTCG


BQ
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AF RR4D909TF U 1
AF RR4D909JQ C 554
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BS 667 667 RR4D909JQ
BS 668 678 RR4D909TF
BS 679 1230 RR4D909JQ

RD RR4D909TF 678 0 0
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GAATCGTTTTTATCCCAAGATGATGGAGATGGAGGAAGCTTGTTTGGCACCCTAAAGCGG
AACCCTTCTGAGCATACCGAAACCTTAAAGGCTTTTAGTTTTAGTGAGGTTGGCTCTATA
AGAAGAAGCGCCAGCAAGGTCATCTGCTGTAATTTCTCATCTGATGGGAAGTTGTTAGCT
AGCGCTGGACATGATAAGAAGGTTTTTTTTTGGAACATGGAAACGCTACACACTGAGATT
CCTCCGGAAGAGCATGGTCATATCATCACAGATATTCGATTCCAACCTAATTCAACTCAA
CTGGCTACGTCTTCGTTCGACAAAACTATCAAAATATGGGATGTTTCTAAGCCTGGTTAC
TTCGTACGAACAATTTCTGGTCACAATGCACCTGTAATGTCCCTTGATTTTCACCCTAAG
AAAACCGATTTGTTCTGCTCTTGTGATACCAATAATGAGATTCGTTTCTGGAGCATCAAC
TCTAATTGCCTTCGTGGCATAAAGGGTGCTAGCACGCAAGTACGGTTCCAGCCAAAACTT
GGACAAATGCTTGCTGCAGCTTCGGAAAATATTGTGTCAATTTTCGATGTTGAACAGTAC
AGAGGG*TCAATTCGTTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4D909JQ 677 0 0
GTGGCATAAAGGGTGCTAGCACGCAAGTACGGTTCCAGCCAAAACTTGGACAAATGCTTG
CTGCAGCTTCGGAAAATATTGTGTCAATTTTCGATGTTGAACAGTACAGAGGGGTCAATT
CGTTTAAGGGACATTCCTCAACTGTGCATTCTATTTGTTGGAACCCAACCGGAGAGTTGG
TAGCTTCTGTTAGCGAAGACAGTGTTAAAGTATGGTCTGTGAACTCAGGAGAGTGCATCC
ACGAACTCAGTTCTAGTGGAAACAAATTCCACTCTTGCGTTTATCACCCTGCCTATCCCA
ACCTCTTGGTCATCGGTGGGTACCAGTCAATAGAGTTGTGGGACACAGGAGAGAACAAAT
GTATGACATTAGCGGCTCACGAGTGTGTGATCTCTGCCTTAGCTCAGTCATTTTCGACAG
GAATGTTGGCGTCTGCAAGTCATGACAAGTCCGTAAAGATTTGGAAGTAGAAAAAATATT
TTATCTTCTTCTTCAAGAAGAGCTCAGGACTATTTTTGAGTCTAATTCTTTGTTAAATGT
TTGAAATCAATAAGTTGTTTAATGGGTTTGTTAGCGCAAGAGCAAAGGGACTTGCTTTGT
TTTATGATCCGTACTTTCTTTCTTGTTGTGATCTCTAGTGTTTGAAGTGAGACACAGAGA
TGTAAGTAATTTCCTCG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL6109Contig1 1249 2 2 U
TTTTTAGTTTTTAAAAAATAAAAAATAAAAAATGGGATACATAAATGTGTCCGTATTATT
TGCCCTGGTTGGGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATAATGCACTAATTCC
AGAGGCCAAACCTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAAACCAACGTAGCTCCTTTGTCTTCGCG
TAAAGGTTTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTTCACCACGTACCATCAACGTGAA
TCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACCGACGCACTAAAGAGCATTCCTACAAAGAA
CACAAAGCGTGTGATCATCAAGATGGCTCCTGGTGAATACAAAGAGAAGGTCACTATCGA
CAAAAAGAAACCCTTTATTACATTGATGGGTGATCCCAAGGCCATGCCCGTTCTGACATT
CGACGGTACTGCCGCCCAGTATGGAACCGTAAATAGCGCCTCTCTCATTATCTTATCCGA
TTATTTCATTACCGAAAACATCATCGTTAAGAACTCTGCGCCGGAACCAGATGGTAAGAG
GAAGGGAGCACAGGCCTTAGCTATGAGAATCTCTGGAGACAAGGCGGCTTTCTACAACTG
CAAATTCCACGGTTTCCAAGATACACTTTGTGACGATGCTGGAAACCATTTCTTTAAGGA
TTGTTACATTGAAGGGACATTTGATTTCATCTTCGGAAGTGGAACCTCTATGTATTTGGA
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CGCAGAAGAGAAGAGTGGATACACTTTCGTGCACTGCAAGGTAACTGGAAGTGATGGTGG
TGGAATCTATTTAGGTAGATCATGGAAGGGTCACCCCAAGGTTGTCTACGCCTACACCGA
GATGAGCAGCGTCGTCAACCCAACCGGATGGCAAGCAAACAAGGTGGCCGCACATGACAA
GACCGTGTTCTACGGAGAGTACAAGTGCATAGTACCAGGATCACATGAAGCCAAGAGAGT
TCCATTCACACAAGACATTGACGACAATGAAGCCAAACGTTTCCTTTCCCTCGGCTACAT
CCAAGGATCCTCGTGGCTTCTCCCACCTTCCGGCTTTAAGTCTTAATATTAAGCTATTCA
AAACTGTATGTATAGCGGTGTATTTTCTTTTCCAACAGTCCTCTCTTCTTAGCTGAGAGA
CTTGTGTAATTTTGGTTTCATGACAATAAAAGGGTCCCGATTCTGTACC


BQ
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AF RR4GJ22TF U 1
AF RR4GJ22JQ C 539
BS 1 658 RR4GJ22TF
BS 659 1249 RR4GJ22JQ

RD RR4GJ22TF 661 0 0
TTTTTAGTTTTTAAAAAATAAAAAATAAAAAATGGGATACATAAATGTGTCCGTATTATT
TGCCCTGGTTGGGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATAATGCACTAATTCC
AGAGGCCAAACCTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAAACCAACGTAGCTCCTTTGTCTTCGCG
TAAAGGTTTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTTCACCACGTACCATCAACGTGAA
TCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACCGACGCACTAAAGAGCATTCCTACAAAGAA
CACAAAGCGTGTGATCATCAAGATGGCTCCTGGTGAATACAAAGAGAAGGTCACTATCGA
CAAAAAGAAACCCTTTATTACATTGATGGGTGATCCCAAGGCCATGCCCGTTCTGACATT
CGACGGTACTGCCGCCCAGTATGGAACCGTAAATAGCGCCTCTCTCATTATCTTATCCGA
TTATTTCATTACCGAAAACATCATCGTTAAGAACTCTGCGCCGGAACCAGATGGTAAGAG
GAAGGGAGCACAGGCCTTAGCTATGAGAATCTCTGGAGACAAGGCGGCTTTCTACAACTG
CAAATTCCACGGTTTCCAAGATACACTTTGTGACGATGCTGGAAACCATTTCTTTAAG
ATT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GJ22JQ 711 0 0
AGGAAGGGAGCACAGGCCTTAGCTATGAGAATCTCTGGAGACAAGGCGGCTTTCTACAAC
TGCAAATTCCACGGTTTCCAAGATACACTTTGTGACGATGCTGGAAACCATTTCTTTAAG
GATTGTTACATTGAAGGGACATTTGATTTCATCTTCGGAAGTGGAACCTCTATGTATTTG
GAAACACAATTACACGCGGTGGGAGATGGTATTAAAGTGATTTCAGCGCATGCGGGAAAG
AGCGCAGAAGAGAAGAGTGGATACACTTTCGTGCACTGCAAGGTAACTGGAAGTGATGGT
GGTGGAATCTATTTAGGTAGATCATGGAAGGGTCACCCCAAGGTTGTCTACGCCTACACC
GAGATGAGCAGCGTCGTCAACCCAACCGGATGGCAAGCAAACAAGGTGGCCGCACATGAC
AAGACCGTGTTCTACGGAGAGTACAAGTGCATAGTACCAGGATCACATGAAGCCAAGAGA
GTTCCATTCACACAAGACATTGACGACAATGAAGCCAAACGTTTCCTTTCCCTCGGCTAC
ATCCAAGGATCCTCGTGGCTTCTCCCACCTTCCGGCTTTAAGTCTTAATATTAAGCTATT
CAAAACTGTATGTATAGCGGTGTATTTTCTTTTCCAACAGTCCTCTCTTCTTAGCTGAGA
GACTTGTGTAATTTTGGTTTCATGACAATAAAAGGGTCCCGATTCTGTACC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL6110Contig1 1134 2 2 U
GGGTTCTTCTCCTCACTCGGGCATGAAGTGATATGGCATCATCCATTGATTCTCTCCAGT
CCCATTCCCTCTGCAATCTCCAGTCATCGATTGGAAGATCCAAGCTCCAGATTCCTTCGA
GCCTGCTTGCGTTCAGACGCAGACACATAACTCTGAACTGGATTCAACTCCAAACCAACC
AAAACTTCGTCTGCAAATCGATTGCTGACGATTCCTCGACTCCAGACGATGAAGAAACTC
AGAACGATGATGATAACGAGGAGGAAGAAGAAGAAGACGTTGCCACGACTCCGAGTAACA
ACAACAACACGGCCAGTGAATCCGAGACTCCGATGATTTCGAGATTCCGTACCATGGTTA
CCACCATCGCCAACGATTCCGAGACTTCAATCTCGAGATTTCGTAGTATGGTGACCACTC
TCCCTCCTGTCGTCTTCCTGATGAACAAGTCCTCAGGGAAAAACAGCGTTTGGATAGGTA
TCAGCATCGTAGCTACTCTCCTCCTCGCTTCTCTACGAGCTTACGCAGTAAAAAAATCGA
GAGATAATAATAACCGCCCTCCTGGCTCCGTTGCTGATCTCGTGAGACGTGGCCAGCTGA
GATCCGGTGATAGAAGAGGCATCTCAAAGTCTCTTAACTACGAAGACCCGTTCAACAACC
CTTTCGTTAAACTTGGCAAAGGAAGCTCCACGGTGGATATGTGCGGGAAAGTTTATAAGC
TAGCTCCGGTCACGCTCACCGAGAAAGAACAGAGTGTTCATCAGAAGAGAAGGTCGAGAG
CGTACCAGTGGAAGAGACCAACTGTTTTCCTTAAAGAAGGTGACTCGGTGCCTCCTGATG
TTGATCCTGATACTGACAGATGGATCCCTGCTAATCATCCGTTTGCGACCACGGTCAGCG
ATATCGATCAAGACCTTGCTCAGAACAATGTGTACCAGAAGCAAGGTGTTCCGTTTCGGA
TTCGTGCTGAGCATGAAGCTATGCAGAAAAAGCTTGAAGCTTTACAAAATGAGGAGAAGT
TGAATAATTTGGGTATTGATAGTCAAAACGCCCGAGATTTTCAGAGGCCATACAAGTTTT
CAGGCCAGCTTGAGGAAGACGATAATAATGTCCAGGAGAATCGTACTGGTGATT


BQ
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AF RR4B163TF U 1
AF RR4B163JQ C 645
BS 1 763 RR4B163TF
BS 764 1134 RR4B163JQ

RD RR4B163TF 763 0 0
GGGTTCTTCTCCTCACTCGGGCATGAAGTGATATGGCATCATCCATTGATTCTCTCCAGT
CCCATTCCCTCTGCAATCTCCAGTCATCGATTGGAAGATCCAAGCTCCAGATTCCTTCGA
GCCTGCTTGCGTTCAGACGCAGACACATAACTCTGAACTGGATTCAACTCCAAACCAACC
AAAACTTCGTCTGCAAATCGATTGCTGACGATTCCTCGACTCCAGACGATGAAGAAACTC
AGAACGATGATGATAACGAGGAGGAAGAAGAAGAAGACGTTGCCACGACTCCGAGTAACA
ACAACAACACGGCCAGTGAATCCGAGACTCCGATGATTTCGAGATTCCGTACCATGGTTA
CCACCATCGCCAACGATTCCGAGACTTCAATCTCGAGATTTCGTAGTATGGTGACCACTC
TCCCTCCTGTCGTCTTCCTGATGAACAAGTCCTCAGGGAAAAACAGCGTTTGGATAGGTA
TCAGCATCGTAGCTACTCTCCTCCTCGCTTCTCTACGAGCTTACGCAGTAAAAAAATCGA
GAGATAATAATAACCGCCCTCCTGGCTCCGTTGCTGATCTCGTGAGACGTGGCCAGCTGA
GATCCGGTGATAGAAGAGGCATCTCAAAGTCTCTTAACTACGAAGACCCGTTCAACAACC
CTTTCGTTAAACTTGGCAAAGGAAGCTCCACGGTGGATATGTGCGGGAAAGTTTATAAGC
TAGCTCCGGTCACGCTCACCGAGAAAGAACAGAGTGTTCATCA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4B163JQ 490 0 0
GACCCGTTCAACAACCCTTTCGTTAAACTTGGCAAAGGAAGCTCCACGGTGGATATGTGC
GGGAAAGTTTATAAGCTAGCTCCGGTCACGCTCACCGAGAAAGAACAGAGTGTTCATCAG
AAGAGAAGGTCGAGAGCGTACCAGTGGAAGAGACCAACTGTTTTCCTTAAAGAAGGTGAC
TCGGTGCCTCCTGATGTTGATCCTGATACTGACAGATGGATCCCTGCTAATCATCCGTTT
GCGACCACGGTCAGCGATATCGATCAAGACCTTGCTCAGAACAATGTGTACCAGAAGCAA
GGTGTTCCGTTTCGGATTCGTGCTGAGCATGAAGCTATGCAGAAAAAGCTTGAAGCTTTA
CAAAATGAGGAGAAGTTGAATAATTTGGGTATTGATAGTCAAAACGCCCGAGATTTTCAG
AGGCCATACAAGTTTTCAGGCCAGCTTGAGGAAGACGATAATAATGTCCAGGAGAATCGT
ACTGGTGATT

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL6111Contig1 732 2 3 U
TTTTTTGCTAAACTTGGCATTGGCTAATATAAGAACAATTACACTCAACGAAAATCCACA
AAAGAGCAAGTAGAAAACACAAACAAGAAGATAACAAACTGGAACTGATTTGGATAATTT
TGTACATAGAGAAAAAAGATTTATCATCTTTATTATTTCAGAATCTGCTACGGTGGAGAT
GAGAGATTATTTAGACGTTTGCAGCACTTCTGAAAGATCCGAGAGACTTGGAACCTGAAG
CCCTCAGAACGAACTGATGGTAGAATGCAGCTATCGCAGCTCCAATAAATGGTCCCACCC
AAAATATCCAGTGGTCATCCCAGGGCTTGCTCTCGTTGAAGATGACGGCTGCTCCGAAAC
TCCTTGCCGGGTTAATACCAGTTCCGGTGATGGGAATGGTAGCCAAGTGCACCATGAACA
CCGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACTGGAACGTGGGAGTCTCTGGCACTGCGCT
TAGGGTCAGTGGTGGAGAAGACGGTGTAGACAAGAAGAGGAGAGTAGCAACGAACTCGGC
AATGACTGCTCTGTAAAAAGACCACTTGGTCAGCTCCTCCGGATCAAATAGAGGCGCCGG
GGGTGGATCTTGATAGTCTCTTGTCTGAAAACCTTCTCCGGAAACGGCTTCCACGTCCTT
CGCCATAACTACTTTCTTTGGTTTTTTCTTCTTTCCAACAAATGGTTTTTCTTTTGCTTC
TCTGTTGTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM31JQ U 22
AF RR4DM31TF C 1
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AACAAGAAGATAACAAACTGGAACTGATTTGGATAATTTTGTACATAGAGAAAAAA

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR4DM31TF 732 0 0
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GAGAGATTATTTAGACGTTTGCAGCACTTCTGAAAGATCCGAGAGACTTGGAACCTGAAG
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CGCCATAACTACTTTCTTTGGTTTTTTCTTCTTTCCAACAAATGGTTTTTCTTTTGCTTC
TCTGTTGTGTCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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CGAGCTGTTCTCTGAAGGGAAGCTGCTTCCCTTCTGGCAGGTCAAACACTCGGAGAAGTT
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TAGAGTGGTTAAAGAAGAGATTGTTCACAACAACAGCATCAAGGAGCAGGAGGGTAACAG
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TGTTCTTTGGAAAGAGCTTTTGCGGCTGAAGAAACAGAGGACCACCAATACTACGGCGGC
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TCCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG90TF U 1
AF RR4GG90JQ C 557
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BS 672 787 RR4GG90JQ

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GGTTTTCACGACGGAGGGACCTCGCATTTCTTTCTCCGCCGATCTGTCGTCATCAGACAG
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CGAGCTGTTCTCTGAAGGGAAGCTGCTTCCCTTCTGGCAGGTCAAACACTCGGAGAAGTT
TCAAAACGTTACATTGAAAACAAAAGTTATCGACGTGGAAGAAGAAGTAAAAGAAGATCG
TAGAGTGGTTAAAGAAGAGATTGTTCACAACAACAGCATCAAGGAGCAGGAGGGTAACAG
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TTCAAGCTCCA

QA 1 671 1 671
DS 

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GTGACTATGAGGATAAGACCCATGATTCATGTTCCTGTTTGTACTCCCTCT

QA 1 231 1 231
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6115Contig1 591 2 9 U
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AAAAACCTAACGAAACCATAACTTATTCGAAGACGGAAAAGCTAAAACAATACACATATA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EG37JQ U 32
AF RR4EG37TF C 1
BS 1 31 RR4EG37TF
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BS 81 81 RR4EG37TF
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RD RR4EG37JQ 132 0 0
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CGACCTCTCTACTTTATTACAAAATGAAACGTGGATACCGACATCTCTACTTGAAACAAA
ACTAATCAGATC

QA 1 132 1 132
DS 

RD RR4EG37TF 591 0 0
TTTTTAATAGAAAGATCTACTTTAATAATAAGATAAGAAAATTACAAAGATGAAGAAAAT
ACTTGGAGGAAGATTATTACATGATGGATACCGACATCTCTACTTTATTACAAAATGAAA
CATGGATACCGACATCTCTACTTGAAACAAAACTAATCAGATCATAGTTGTAAAAAGAAA
AAAAACCTAACGAAACCATAACTTATTCGAAGACGGAAAAGCTAAAACAATACACATATA
CTAACGAGACATAAGAAGCGAAACTAAAAGCCTTGTTAAGAAGAAGATATTTCGATCATA
TTCCCCTTGAAAAAATAAGAGAATGATTCGAATTAACGTTTCATAACGGAAGATGTCTTC
TGCAAAGTTCTCGGAGATATTTTTTTTTCTTAATAGAATCATGCGATGTCTAACCGCAAG
ATTCTTCTCAGATCGGTGGTTGCATCGGCTGATTTGAACGAGGAGGAGACGCTTCTCTTC
GCGAAGAACGCCGGTAAGGGAACTTCGCTCGGCGGCGGAGACGTCGATGTGACTGTACCA
GCGTAAAACAAAGCTGGGGGATTCGACCTCCGGTTCTGCGATGGGATCATC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6117Contig1 882 2 2 U
GGGGGGGGAGTTGCAGAACCACCACACACACACAAGTTGCAGGAGAAAAAGAAAAAAAAG
TCGAATAAAGAAGAAAAAAGAAGAAGAAGACGCTCTGTTCTTGAATCTTGAATCAAGCAA
AGCTGCTAAGGGAGGTGGCTGAACAAAACCCTTATCCTAATTTCCCCCGAATATGCCATT
TCTGAGGATAGTGAGACTTCTCTTACCAGGGATCAGAGTGTTGATTAGAAGGTCGTTACT
TTGGTTGCTGTAGATGCATATCCCTTCTTGGATCTACCAGTTACTTGGTTGCATGGGTTG
CAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCAAGGTCGTCTAGTGAAGAAGCCGACGA
GCGTGTCAGACGATTTCTGGAGCACAAGCACCTGCGAGATGGATAACAACAGCACGATGC
AGTCACAGAGAAGCGTTTCTTCTATCAGCTTCACTAACATCACTGCTGCTTCTGCAAGTA
GTAGCAACCCCAATGAATTTGTTAACAATGGATTGGGCCTCTGGTTGCAAACTAGACAAC
AGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGCTAAAGTTCGAGAACCTACAATAA
GCTGGAATGCAACATATGAGAGCTTGTTGGGTATGAACAAGCGGTTCTCTCGTCCAATAC
CTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTGGGAGCAAGAGGGCTTGTATGATT
GATTTATTTGCAACTCAAGAATATACTTAATCTCTTCTCCTTTTTCTTCTTCTTCTTGTG
TGTGTTGTGTGTGTAATCAAACTTGGCTTCCTGAAAAGTATTTAAAATCTCAAGGAACTA
AGATATTTTTACCTTCAAAAAGGAAATACTTATTCATAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AI04TF U 1
AF RR4AI04JQ C 101
BS 1 816 RR4AI04TF
BS 817 882 RR4AI04JQ

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AGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGCTAAAGTTCGAGAACCTACAATAA
GCTGGAATGCAACATATGAGAGCTTGTTGGGTATGAACAAGCGGTTCTCTCGTCCAATAC
CTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTGGGAGCAAGAGGGCTTGTATGATT
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TGTGTTGTGTGTGTAATCAAACTTGGCTTCCTGAAA
GTATT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AI04JQ 782 0 0
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TTGATTAGAAGGTCGTTACTTTGGTTGCTGTAGATGCATATCCCTTCTTGGATCTACCAG
TTACTTGGTTGCATGGGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCAAGGTCG
TCTAGTGAAGAAGCCGACGAGCGTGTCAGACGATTTCTGGAGCACAAGCACCTGCGAGAT
GGATAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTTTCTTCTATCAGCTTCACTAACAT
CACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTTAACAATGGATTGGGCCT
CTGGTTGCAAACTAGACAACAGTGGCTTGCAAATGGATCTTCTTCACAAACAAAGGCTAA
AGTTCGAGAACCTACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAGAGCTTGTTGGGTATGAACAA
GCGGTTCTCTCGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTTTGGTGGATGTGTGGGA
GCAAGAGGGCTTGTATGATTGATTTATTTGCAACTCAAGAATATACTTAATCTCTTCTCC
TTTTTCTTCTTCTTCTTGTGTGTGTTGTGTGTGTAATCAAACTTGGCTTCCTGAAAAGTA
TTTAAAATCTCAAGGAACTAAGATATTTTTACCTTCAAAAAGGAAATACTTATTCATAAA
AG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL6118Contig1 1012 2 2 U
GGATTCACCTGACCGGATCGAGAGCTCAGGGAAGAGAATTTACCAATGGCGGAAGATCTG
GTTCTCGACACGGTGATCAGAGATTGGGTTTTGATCCCTCTCTCAGTAGTGATGGTTCTC
ATTGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGTTCGTCTCCGACTCCTGATGCG
AAGATGGTCAAAGAAGGACAAGTTGTAATTAGGGCACGGAATCTCAAGGCAGGTGCCAAT
TTCATCCCGCCTAAGTCCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAACGGA
TTGTTACATGTTCCTAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCT
AACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACT
TTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCATTTCCGCTT
ACTCAGAGATTCAGGTCAATGTTACAGAACGGTATCGACTTGAGCACTGTTGATGTTAGC
TATGTGAGCAGCCGTTCATGGTACTTTTTGAACTTGTTTGGACTAAGAGGCTTATTCAGC
CTCATTCTTGGAGATGAAAATGCAATTGATGACACGCAAAGAATGATGCAAATGGGTGGA
TTTGGTTTTGATGCATCAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGTCCCGACATTATTCAA
CATGAATGGGCCTTACCACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTTTTGAGAAAACTCGTG
CAGTAGAAACATTCTTGCCTCTGGTCCCCCCTAGTTTTCTGCTGGTATCTAGACTTTTCT
GTGTGTCTAATGTCCTCCATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCATATTTTTTTTCAGTGA
CACCATTTGGTTTAAATCTCTACTGTTATTACATATAGCTGGTGGTTCCAATTTACTTTG
GTCCAAAGCAGAGCTGGTTATATCTGGTGCTTATAAGACTTGCTTTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F057TF U 1
AF RR4F057JQ C 349
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BS 480 1012 RR4F057JQ

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GGATTCACCTGACCGGATCGAGAGCTCAGGGAAGAGAATTTACCAATGGCGGAAGATCTG
GTTCTCGACACGGTGATCAGAGATTGGGTTTTGATCCCTCTCTCAGTAGTGATGGTTCTC
ATTGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGTTCGTCTCCGACTCCTGATGCG
AAGATGGTCAAAGAAGGACAAGTTGTAATTAGGGCACGGAATCTCAAGGCAGGTGCCAAT
TTCATCCCGCCTAAGTCCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAACGGA
TTGTTACATGTTCCTAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCT
AACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACT
TTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCATTTCCGCT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR4F057JQ 664 0 0
TTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTGTCAATGATTATACCA
CAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATA
CCATTTCCGCTTACTCAGAGATTCAGGTCAATGTTACAGAACGGTATCGACTTGAGCACT
GTTGATGTTAGCTATGTGAGCAGCCGTTCATGGTACTTTTTGAACTTGTTTGGACTAAGA
GGCTTATTCAGCCTCATTCTTGGAGATGAAAATGCAATTGATGACACGCAAAGAATGATG
CAAATGGGTGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGTCCC
GACATTATTCAACATGAATGGGCCTTACCACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTTTTG
AGAAAACTCGTGCAGTAGAAACATTCTTGCCTCTGGTCCCCCCTAGTTTTCTGCTGGTAT
CTAGACTTTTCTGTGTGTCTAATGTCCTCCATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCATATT
TTTTTTCAGTGACACCATTTGGTTTAAATCTCTACTGTTATTACATATAGCTGGTGGTTC
CAATTTACTTTGGTCCAAAGCAGAGCTGGTTATATCTGGTGCTTATAAGACTTGCTTTTA
TTTT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6120Contig1 961 2 2 U
GGTTCTTTGCCTTGTTGCCATGGAGAAACCAGTCTCTCTTAAACCTGAGCACATCCGGGA
TGAGAAAGTGAAGGTTCTTCAATCAGTGATGCCTATAAAAGATGAAGAGGTGGTTCTTGG
ACAATATGAAGGTTACAGAGATGATCCAACTGTTCCAAACGACTCAAACACTCCAACCTT
TGCCACAACAATTCTCCGCATAGACAATGAAAGATGGGAAGGTGTTCCATTTATACTGAA
AGCCGGAAAGGCAATGAGTTCAAGGAAGGCAGATATTCGCATTCAGTTTAAGGATGTTCC
TGGCGACATATTCAAATGTCAAAAGCAAGGGAGGAACGAGTTTGTTATACGCTTGCAACC
TTCAGAGGCCATGTACATGAAGCTAACTGTGAAGCAACCGGGTCTTGAGATGCAAACCGT
GCAAAGTGAACTAGACCTATCGTACAAGCAACGTTACCAAGATGTCTCGATCCCAGAGGC
TTACGAGCGCCTAATTCTTGACACAATTAAAGGTGACCAACAACACTTTGTTCGCAGAGA
CGAGCTGAAGGCAGCTTGGGAGATCTTCACTCCACTGCTTCACAGGATAGGAAGGGGAGA
AGTGAAATCTATCCCATACAAACAAGGAAGCCGAGGCCCAGCAGAAGCAGATCAGCTACT
AGAGAAAGCTGGTTATTTGCAGACACATGGCTACATTTGGATCCCACCTACGCTGTAATA
AAACTGTATGAAACAAGGAGATGGTGATAATGAGTAAACCACACAAAATAAGAGCTTCTC
TGTTTTTTTTTGTTTCTTGTTTCATTTCTGAATAAAATCTCTTAAATGAGAGCTTGTAAG
TGAATCTTATGTATACTAGTGAGTGATCTTCACTAGGACATTGCTTGTCTTGTGTTTTTT
CACCCATACTGCAAAGAGGCTTTGTAAGAACACTATTAAATTAAGAGATCTTTTTCTTTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4G612TF U 1
AF RR4G612JQ C 363
BS 1 702 RR4G612TF
BS 703 961 RR4G612JQ

RD RR4G612TF 702 0 0
GGTTCTTTGCCTTGTTGCCATGGAGAAACCAGTCTCTCTTAAACCTGAGCACATCCGGGA
TGAGAAAGTGAAGGTTCTTCAATCAGTGATGCCTATAAAAGATGAAGAGGTGGTTCTTGG
ACAATATGAAGGTTACAGAGATGATCCAACTGTTCCAAACGACTCAAACACTCCAACCTT
TGCCACAACAATTCTCCGCATAGACAATGAAAGATGGGAAGGTGTTCCATTTATACTGAA
AGCCGGAAAGGCAATGAGTTCAAGGAAGGCAGATATTCGCATTCAGTTTAAGGATGTTCC
TGGCGACATATTCAAATGTCAAAAGCAAGGGAGGAACGAGTTTGTTATACGCTTGCAACC
TTCAGAGGCCATGTACATGAAGCTAACTGTGAAGCAACCGGGTCTTGAGATGCAAACCGT
GCAAAGTGAACTAGACCTATCGTACAAGCAACGTTACCAAGATGTCTCGATCCCAGAGGC
TTACGAGCGCCTAATTCTTGACACAATTAAAGGTGACCAACAACACTTTGTTCGCAGAGA
CGAGCTGAAGGCAGCTTGGGAGATCTTCACTCCACTGCTTCACAGGATAGGAAGGGGAGA
AGTGAAATCTATCCCATACAAACAAGGAAGCCGAGGCCCAGCAGAAGCAGATCAGCTACT
AGAGAAAGCTGGTTATTTGCAGACACATGGCTACATTTGGAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4G612JQ 599 0 0
CAGAGGCCATGTACATGAAGCTAACTGTGAAGCAACCGGGTCTTGAGATGCAAACCGTGC
AAAGTGAACTAGACCTATCGTACAAGCAACGTTACCAAGATGTCTCGATCCCAGAGGCTT
ACGAGCGCCTAATTCTTGACACAATTAAAGGTGACCAACAACACTTTGTTCGCAGAGACG
AGCTGAAGGCAGCTTGGGAGATCTTCACTCCACTGCTTCACAGGATAGGAAGGGGAGAAG
TGAAATCTATCCCATACAAACAAGGAAGCCGAGGCCCAGCAGAAGCAGATCAGCTACTAG
AGAAAGCTGGTTATTTGCAGACACATGGCTACATTTGGATCCCACCTACGCTGTAATAAA
ACTGTATGAAACAAGGAGATGGTGATAATGAGTAAACCACACAAAATAAGAGCTTCTCTG
TTTTTTTTTGTTTCTTGTTTCATTTCTGAATAAAATCTCTTAAATGAGAGCTTGTAAGTG
AATCTTATGTATACTAGTGAGTGATCTTCACTAGGACATTGCTTGTCTTGTGTTTTTTCA
CCCATACTGCAAAGAGGCTTTGTAAGAACACTATTAAATTAAGAGATCTTTTTCTTTTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL6121Contig1 1075 2 2 U
GCAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCATTACAACCTGAAAAGGCAGATGACGTTCCCCAAAACG
ATGTCGTTACGCGGGAAGAACCCGACGAGTCCCAAATCGCCTCTTCCGAGAAGGAGACGG
TCGAGCAGCTGGACCACCTCATGGCTCAACCACTCGACAACGTCCTTCAAGCAAGTCGTC
TTCGCCGTGATGATGCAACAGCAGTCTTCTCACCAATCCCCAAGATCCATCTCAAAACCC
CAAACCCCTCCCACCAACACCGACATCGATCGAACCCTCTCCTTACCCGATTCCCTCCTC
CTCAAAATCCTCCACAAGCTCCCCGAATCCCGAAACGACGCCATTGGGCAATGCTGTGAG
TTGCTTGAAGAGCTTAGTGTTTGTGACCATAGGATGGATGATGGTTGGGTGGGTGCGCTT
TCTTGCTTTGAGAGTTTGAAGACGCTGAGGATATCGTCTTGCGGAAAGATGGATGGGAGT
CCTGGACCGGTGGAGTTGCTGGGTTCTTGTCCGGCTCTGGAGAGTTTGCAGCTCGAGAGG
TGTTGTCTGAGTGATAGAGACGGGGTGAGAGCGTTGTTTAAGGTGTGTGATGGAGCAACG
ACTGTTCATATTCAGGATTGCTGGGGACTGGATGATGATTGTTTCAGTTTGGCCAAAGCT
TTCAGGAGGGTTAGGTTTTTGTCTTTGGAAGGATGCTCGGTCCTAACAACAGGCGGTTTA
GAGTCAGTGGTTTTGCGCTGGGAAGAGCTGGAGAGCATGAGAGTAGTGTCGTGTAAGAAC
ATAAAAGACAGCGAGATTTCGCCGGCGCTCTCGTCTTTGTTCTCCCTTTTCAAAGAACTG
ACGTGGAGACCAGACACAAGGTCTCATCTCTCATCGAGACTCCAAGCTGCTGGAATTGGA
AAGAGAGGTAGCAAATTCTTCAAGAAGAGATAATGCCATTGGATGTATCTTTATGTGCCC
CTTAAAGATGTTGATGTAGTAGACAAAACTCTTTATATTCTACTTTGTTGTAATTGATAA
AAACATATTTGTAGAAACTCTTATGTATTTGCAATGTTTTGTTATGTATAATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EX31TF U 1
AF RR4EX31JQ C 541
BS 1 665 RR4EX31TF
BS 666 1075 RR4EX31JQ

RD RR4EX31TF 669 0 0
GCAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCATTACAACCTGAAAAGGCAGATGACGTTCCCCAAAACG
ATGTCGTTACGCGGGAAGAACCCGACGAGTCCCAAATCGCCTCTTCCGAGAAGGAGACGG
TCGAGCAGCTGGACCACCTCATGGCTCAACCACTCGACAACGTCCTTCAAGCAAGTCGTC
TTCGCCGTGATGATGCAACAGCAGTCTTCTCACCAATCCCCAAGATCCATCTCAAAACCC
CAAACCCCTCCCACCAACACCGACATCGATCGAACCCTCTCCTTACCCGATTCCCTCCTC
CTCAAAATCCTCCACAAGCTCCCCGAATCCCGAAACGACGCCATTGGGCAATGCTGTGAG
TTGCTTGAAGAGCTTAGTGTTTGTGACCATAGGATGGATGATGGTTGGGTGGGTGCGCTT
TCTTGCTTTGAGAGTTTGAAGACGCTGAGGATATCGTCTTGCGGAAAGATGGATGGGAGT
CCTGGACCGGTGGAGTTGCTGGGTTCTTGTCCGGCTCTGGAGAGTTTGCAGCTCGAGAGG
TGTTGTCTGAGTGATAGAGACGGGGTGAGAGCGTTGTTTAAGGTGTGTGATGGAGCAACG
ACTGTTCATATTCAGGATTGCTGGGGACTGGATGATGATTGTTTCAGTTTGGCCAAAGCT
TTCAG
AGGG

QA 1 665 1 665
DS 

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ACTGTTCATATTCAGGATTGCTGGGGACTGGATGATGATTGTTTCAGTTTGGCCAAAGCT
TTCAGGAGGGTTAGGTTTTTGTCTTTGGAAGGATGCTCGGTCCTAACAACAGGCGGTTTA
GAGTCAGTGGTTTTGCGCTGGGAAGAGCTGGAGAGCATGAGAGTAGTGTCGTGTAAGAAC
ATAAAAGACAGCGAGATTTCGCCGGCGCTCTCGTCTTTGTTCTCCCTTTTCAAAGAACTG
ACGTGGAGACCAGACACAAGGTCTCATCTCTCATCGAGACTCCAAGCTGCTGGAATTGGA
AAGAGAGGTAGCAAATTCTTCAAGAAGAGATAATGCCATTGGATGTATCTTTATGTGCCC
CTTAAAGATGTTGATGTAGTAGACAAAACTCTTTATATTCTACTTTGTTGTAATTGATAA
AAACATATTTGTAGAAACTCTTATGTATTTGCAATGTTTTGTTATGTATAATTGT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL6122Contig1 551 2 3 U
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TGGAAGCTGGTTGATGTTTTGGTGACAATAGGAGATTCTTTGGTTGAGATGAGGAAGAGC
GGTCCGGGTGCGGTAACGGTTGAGCAAAGTAAGCAACTGACATCGTCCATGTTGAAATGG
GGTCGAGCAGTAGGTGAATTCGTGAAAGCAGCTTCTGCCAAGAAAGGAGTAACTATGGAT
ATATCTTTTGATGCTTCTCCAACTAACGCAGCAGCTGGAAACGGTGGAAGTGTCCCCACA
GGACAATCAGCAAAGACTAAAGCTTAGTGTAACTCTTCAACCAAGGCGATTGAGACTTTT
CATTGTTTTTTTTAATTATTATTTACTCAGACAAGAAAAAAAATTACAGAATGTGAGAGA
TGATTTCAAAGCAATATGCAGTATGTTTCAAACATCTCATCCTAAAATGTTTTAGTGCTA
AAATTATAAAATTTGTAAATTACATTATAACTTCATTTCAACAATTATTATTTTTCCAAG
TGATTAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH65TF U 11
AF RR4EH65JQ C 1
BS 1 10 RR4EH65JQ
BS 11 134 RR4EH65TF
BS 135 551 RR4EH65JQ

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TTGATGTTTTGGTGACAATAGGAGATTCTTTGGTTGAGATGAGGAAGAGCGGTCCGGGTG
CGGT

QA 1 124 1 124
DS 

RD RR4EH65JQ 551 0 0
GTGCACCTCTTCTTAGCTTTGTCTCCATTGGATGGTACCAAAGCTGGAACATCAGATCCG
TGGAAGCTGGTTGATGTTTTGGTGACAATAGGAGATTCTTTGGTTGAGATGAGGAAGAGC
GGTCCGGGTGCGGTAACGGTTGAGCAAAGTAAGCAACTGACATCGTCCATGTTGAAATGG
GGTCGAGCAGTAGGTGAATTCGTGAAAGCAGCTTCTGCCAAGAAAGGAGTAACTATGGAT
ATATCTTTTGATGCTTCTCCAACTAACGCAGCAGCTGGAAACGGTGGAAGTGTCCCCACA
GGACAATCAGCAAAGACTAAAGCTTAGTGTAACTCTTCAACCAAGGCGATTGAGACTTTT
CATTGTTTTTTTTAATTATTATTTACTCAGACAAGAAAAAAAATTACAGAATGTGAGAGA
TGATTTCAAAGCAATATGCAGTATGTTTCAAACATCTCATCCTAAAATGTTTTAGTGCTA
AAATTATAAAATTTGTAAATTACATTATAACTTCATTTCAACAATTATTATTTTTCCAAG
TGATTAGTTGC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6125Contig1 1350 2 4 U
GGATCCATCCACCTCTTTCCTTGAAGCGATTCTTTTCTCATCGAATCGTTCCTCCCACAC
GCCTCTTCCTCTCATCACTTTGTTCCTCCGTCGTCGGCGTCTTCCGTCTCTTATCCATTC
TTCTCCTTTTTTTCCAACACAACAAAGAATGGCTAATTGTTCGGGAGACTCCAACGACAT
GGCGGCTTCTCAGTTTGACATTCTCCGATGCCCTTTCTTGAGGAACATCAATGAGCCCAC
TAATCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTGCCTTTCCCCATCCCTGCACCAGCAGGTCAAGGGCC
TATATTCGAGGATGGACCCAATTTTGATACCGCGTTTAGGCTTTTCCACGGCCAAGATGG
TGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAGCCCGTCCCTCTGTTCAA
TCCACTCGCTGCTAAGGCCGCCACCATCAGTCTCTCATCTTTTGGACCTGGAGGCCCTTT
TGGATTCGATGCGTTTTCTCACATGTTTAAAAACCAAAAGAGAAACTCTGACTCTTCCAA
AAACAACAAGGATTCTTCCAAGGGAGGAAACCACGAATCTATGAGTGACGACTGGCTACA
AACAGGAAACTGCCCCATTGCGAAATCGTACCGAGCTGTAAGCGGTGTGGCGCCGCTCGT
GGCGAAGATCCTGCAGCCACCTCCAGGGATGCATTGCAAGTGCCCTAAAGCAATAGTAGC
AGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACAGCTTTCGCCAAGAACCTCCGCCCGCAGCCTTTATC
ATCCAAAGTTCTTGTGATAGGGATGCTCGGCATGGCGCTAAACGTTCCTCTTGGGGTCTG
GAGAGAGCACACTGAAAAGTTCTCTGCATCTTGGTTTATAGCCCTTCACGCAGCCGTTCC
CTTCATAGGGATACTGAGGAAGTCGGTGTTGATGCCTAAGATGGCGATGGTGTTTACCAT
AGCAGCATCGGTTATGGGACAGGTGATTGGGTCAAGAGCAGAGAGGTATAGGCTCAAGTC
GGCAGCTCAGAAGAAGATGACATCATTGGCTGTACCAAACCCTTCGTCTGTTGAAGCAAC
TCCGATGCAGTTCCCCGGAGTTTCATCATCGGATGGAAGGTGCGGTGACAAAGTGGTGAT
GAAATGGAACCCCATGTTGCTTGAAACAGCAAGTCCTGTCTCTACCGGAGCAACTAATGT
TGTCTGCTAAATATTTTGATTTCTTCAAGAAGATCTCGAATATATATATATATAATTGTT
TTTCTTCTTGTTTTGGAGAGATTGTATTTGTAAAAGTTTCTATATGTTTGAGAAAAACTA
GAATAAATTCATTTCTAAAATGTTGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN51TF U 1
AF RR4EN51JQ C 675
BS 1 756 RR4EN51TF
BS 757 757 RR4EN51JQ
BS 758 794 RR4EN51TF
BS 795 1350 RR4EN51JQ

RD RR4EN51TF 794 0 0
GGATCCATCCACCTCTTTCCTTGAAGCGATTCTTTTCTCATCGAATCGTTCCTCCCACAC
GCCTCTTCCTCTCATCACTTTGTTCCTCCGTCGTCGGCGTCTTCCGTCTCTTATCCATTC
TTCTCCTTTTTTTCCAACACAACAAAGAATGGCTAATTGTTCGGGAGACTCCAACGACAT
GGCGGCTTCTCAGTTTGACATTCTCCGATGCCCTTTCTTGAGGAACATCAATGAGCCCAC
TAATCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTGCCTTTCCCCATCCCTGCACCAGCAGGTCAAGGGCC
TATATTCGAGGATGGACCCAATTTTGATACCGCGTTTAGGCTTTTCCACGGCCAAGATGG
TGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAGCCCGTCCCTCTGTTCAA
TCCACTCGCTGCTAAGGCCGCCACCATCAGTCTCTCATCTTTTGGACCTGGAGGCCCTTT
TGGATTCGATGCGTTTTCTCACATGTTTAAAAACCAAAAGAGAAACTCTGACTCTTCCAA
AAACAACAAGGATTCTTCCAAGGGAGGAAACCACGAATCTATGAGTGACGACTGGCTACA
AACAGGAAACTGCCCCATTGCGAAATCGTACCGAGCTGTAAGCGGTGTGGCGCCGCTCGT
GGCGAAGATCCTGCAGCCACCTCCAGGGATGCATTGCAAGTGCCCTAAAGCAATAGTAGC
AGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACAGCTTTCGCCAA*AACCTCCGCCCGCAGCCTTTATC
ATCCAAAGTTCTTG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4EN51JQ 676 0 0
AGCCACCTCCAGGGATGCATTGCAAGTGCCCTAAAGCAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCA
TATCAAAAACAGCTTTCGCCAAGAACCTCCGCCCGCAGCCTTTATCATCCAAAGTTCTTG
TGATAGGGATGCTCGGCATGGCGCTAAACGTTCCTCTTGGGGTCTGGAGAGAGCACACTG
AAAAGTTCTCTGCATCTTGGTTTATAGCCCTTCACGCAGCCGTTCCCTTCATAGGGATAC
TGAGGAAGTCGGTGTTGATGCCTAAGATGGCGATGGTGTTTACCATAGCAGCATCGGTTA
TGGGACAGGTGATTGGGTCAAGAGCAGAGAGGTATAGGCTCAAGTCGGCAGCTCAGAAGA
AGATGACATCATTGGCTGTACCAAACCCTTCGTCTGTTGAAGCAACTCCGATGCAGTTCC
CCGGAGTTTCATCATCGGATGGAAGGTGCGGTGACAAAGTGGTGATGAAATGGAACCCCA
TGTTGCTTGAAACAGCAAGTCCTGTCTCTACCGGAGCAACTAATGTTGTCTGCTAAATAT
TTTGATTTCTTCAAGAAGATCTCGAATATATATATATATAATTGTTTTTCTTCTTGTTTT
GGAGAGATTGTATTTGTAAAAGTTTCTATATGTTTGAGAAAAACTAGAATAAATTCATTT
CTAAAATGTTGAAACC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6126Contig1 902 2 2 U
GGGAGTAAAATGGTGACGGCAGGATCGATATTGACATACGAACAAGCACATTGACGAAAC
CGATCGTTCTCTTCTCGATCGCACTGTTGAGCACCGTCCTCTTCTTCGCATTCTTCTTCG
AAGACAAGCCTTACTCATCATCATCATCATATCCCTCTTCTTCAGACTCCATGGCTCGAA
GAACCTTCATCTTGTGGCTTCACGGGCTTGGAGATTCCGGACCTGCCAACGAACCCATCA
AGTCACTTTTCAAGTCTCCCGAGTTTACCAACACCAAATGGCTCTTCCCTTCTGCTCCTC
CTAATCCAGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATGCCTTCTTGGTTTGACATCCGTGAGC
TTCCTCTTACCGCGGCCTCTCCGAATGATGAAAGCAGCGTGCTTGAAGCAGTTAAGAACG
TTCATGCTGTTATAGATAAGGAGATTGCAGGAGGAATCAATCCAGAAAACGTGTATATCT
GCGGATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCTAGTGCTCTGCTTTACCCTAAAACTC
TTGGAGGAGGTGCAGTCTTTAGTGGATGGGTTCCATTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGT
TTACCAAAGATGCTATCAAGACACCAATCTTGTGGTCTCATGGGATTGATGACAAGACTG
TATTATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTCCTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTG
AATTTAAGGCGTATCCAGATCTTGGACACTCAATCAGTAATAATGAGCTTCAGTATCTGG
AGTCATGGATCAAACAAAGGATGCTGAGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTAAAAGCTTTTGA
GATCGAGTTTTTTGTCCAACTACTTCAATTTTCTATTTGCTAAATGGATAATCAGAAGAT
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4EC43TF U 1
AF RR4EC43JQ C 485
BS 1 603 RR4EC43TF
BS 604 902 RR4EC43JQ

RD RR4EC43TF 603 0 0
GGGAGTAAAATGGTGACGGCAGGATCGATATTGACATACGAACAAGCACATTGACGAAAC
CGATCGTTCTCTTCTCGATCGCACTGTTGAGCACCGTCCTCTTCTTCGCATTCTTCTTCG
AAGACAAGCCTTACTCATCATCATCATCATATCCCTCTTCTTCAGACTCCATGGCTCGAA
GAACCTTCATCTTGTGGCTTCACGGGCTTGGAGATTCCGGACCTGCCAACGAACCCATCA
AGTCACTTTTCAAGTCTCCCGAGTTTACCAACACCAAATGGCTCTTCCCTTCTGCTCCTC
CTAATCCAGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATGCCTTCTTGGTTTGACATCCGTGAGC
TTCCTCTTACCGCGGCCTCTCCGAATGATGAAAGCAGCGTGCTTGAAGCAGTTAAGAACG
TTCATGCTGTTATAGATAAGGAGATTGCAGGAGGAATCAATCCAGAAAACGTGTATATCT
GCGGATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCTAGTGCTCTGCTTTACCCTAAAACTC
TTGGAGGAGGTGCAGTCTTTAGTGGATGGGTTCCATTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGT
TTA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4EC43JQ 418 0 0
ATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCTAGTGTTCTGCTTTACCCTAAAACTCTTGG
AGGAGGTGCAGTCTTTAGTGGATGGGTTCCATTCAATTTTTCTGTCATCAATCAGTTTAC
CAAAGATGCTATCAAGACACCAATCTTGTGGTCTCATGGGATTGATGACAAGACTGTATT
ATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTCCTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTGAATT
TAAGGCGTATCCAGATCTTGGACACTCAATCAGTAATAATGAGCTTCAGTATCTGGAGTC
ATGGATCAAACAAAGGATGCTGAGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTAAAAGCTTTTGAGATC
GAGTTTTTTGTCCAACTACTTCAATTTTCTATTTGCTAAATGGATAATCAGAAGATTG

QA 1 418 1 418
DS 



AS 1 2

CO CL6127Contig1 1152 2 8 U
GCAGCAGCAGAAGGTCTCGGAAGATGAAGGTGTTACTGGTAATGCAGAGGTAAAGGCTTC
ACCTAGGAGGAAGTCTACTTCCTTCTCGTTTCCTACAGGTGAGCCTACCGAAGAGGATTT
TGATGGTCCTTTTGGGAGTTGGAGTGGAAAGTCGGGTTTGGATAAGGCTGCCAATGGTTT
TGAGCGGGGGAACAATCTTCCGGAGCATGTCACTGCCAAAGCGGAAAAGGAGAGCGACTG
TGAAGATTTCTATGACCCAGGTGAGTCAGCAAGCTTCACAAGTAACACAGAGGTAGAGGG
TGAGGAAGGTTCACAAAGACTTGCTACACCTGTGGGAGAGTTTTATGATGCTTGGGATGA
ACTATCAACCGACAGTGGAATGCAGAGTTCAGCTAACAACATTGAGTCTGGACTAAGGGA
GATAAGGCTGAGTTTAGTAATGGAAATCGAGAAGAGAAAACAGACAGAGGAATCTCTAGA
GCAGATGCAAACACATTGGCTGAAACTCCGTGAGCAGCTGGCCCAGGTCGGTCTATTCAT
TCCTATCAATCCTACCACCTCCACCAGCAACATGAACCTATCGGAAGAACTACATTGCCA
ACTCGAGGTTGCTAGGTTTGTCTCCGACTCTCTAAGCAGAGGTATGGCCAAGGCAGAGGC
AGAGATGGTGATGGAATCTAGGCTCGAAACTAAGAACTTTGAGATTACAAGATTGTCTGA
CCGTGTACACTACTACGAAGCCGTGAACCGAGAAATGTCCCAACGAAACCAAGAGGCCAT
AGAGGTGGCACGACGTAAGAGGCAGAAGAGAAAGAAGAGGCAGAGATGGATATGGGGATC
AATCGCAGCAACCATTACTTTTGGAAGCGCGGCGTTGGCACGGTTTTACATTCCTACTGC
ATCAAAACCTTTTTCCGAAGTATCACAAACTTTTAAGGATGATTGAGTAAGCCTATTGTT
TCCCATAATGGGTGTTTGATATGAGCAAGAGAAATAAGATACAGGACGTTTAGCACACGC
CTTGTGAATAGAAATATATACGTATTTGGTTATTGTTTTAACCGTTCAAGATTGATGTAT
AGCTCCAAGTAGCTGTAATACACATGTTTTTTTTTTTTGCGGTGGCATACTAAAGTGGAA
GCCACATTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL84TF U 1
AF RR4FL84JQ C 634
BS 1 652 RR4FL84TF
BS 653 653 RR4FL84JQ
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BS 758 1152 RR4FL84JQ

RD RR4FL84TF 757 0 0
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ACCTAGGAGGAAGTCTACTTCCTTCTCGTTTCCTACAGGTGAGCCTACCGAAGAGGATTT
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TGAGCGGGGGAACAATCTTCCGGAGCATGTCACTGCCAAAGCGGAAAAGGAGAGCGACTG
TGAAGATTTCTATGACCCAGGTGAGTCAGCAAGCTTCACAAGTAACACAGAGGTAGAGGG
TGAGGAAGGTTCACAAAGACTTGCTACACCTGTGGGAGAGTTTTATGATGCTTGGGATGA
ACTATCAACCGACAGTGGAATGCAGAGTTCAGCTAACAACATTGAGTCTGGACTAAGGGA
GATAAGGCTGAGTTTAGTAATGGAAATCGAGAAGAGAAAACAGACAGAGGAATCTCTAGA
GCAGATGCAAACACATTGGCTGAAACTCCGTGAGCAGCTGGCCCAGGTCGGTCTATTCAT
TCCTATCAATCCTACCACCTCCACCAGCAACATGAACCTATCGGAAGAACTACATTGCCA
ACTCGAGGTTGCTAGGTTTGTCTCCGACTCTCTAAGCAGAGGTATGGCCAAG*CAGAGGC
AGAGATGGTGATGGAATCTAG*CTCGAAACTAAGAACTTTGAGAT*ACAAGATTGTCTGA
CCGTGTACACTACTACGAAGCCGTGAACCGAGAAATG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4FL84JQ 519 0 0
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GAAGAGGCAGAGATGGATATGGGGATCAATCGCAGCAACCATTACTTTTGGAAGCGCGGC
GTTGGCACGGTTTTACATTCCTACTGCATCAAAACCTTTTTCCGAAGTATCACAAACTTT
TAAGGATGATTGAGTAAGCCTATTGTTTCCCATAATGGGTGTTTGATATGAGCAAGAGAA
ATAAGATACAGGACGTTTAGCACACGCCTTGTGAATAGAAATATATACGTATTTGGTTAT
TGTTTTAACCGTTCAAGATTGATGTATAGCTCCAAGTAGCTGTAATACACATGTTTTTTT
TTTTTGCGGTGGCATACTAAAGTGGAAGCCACATTCACT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL6128Contig1 1280 2 2 U
GGATCTTCTCTTTCTTAAAATATTTCTCTTTCTTCCTTCTCTTTCCTCAATCTCTCTCAG
AATTCTCTCTCCTAGGCAAAAAAATTCCCTTAAAGAGCCCCCGTTCGTTTAACCCAATCC
TCATATCTTTGAAATGGATGACGATGGGTTCCGTAACTGGGGTTACTACGAACCAGCAGC
TGCTACGTTCAAAGGTAATCTCGGTTTGCAGCTAATGCCAAGCATTGATCGGAACACTAA
ACCGTTTTTACCCGGTCGAGACCCGAATCTAATGATCGGGCAGCAAAACGGGCCGTACCA
CCACCCTGAGCCTCCTCCTATCAACAACATGAGCTACAATTGGATTAACCAACAGCACAA
GGACAAGTTCTTCAACATGTTGCCTGTAACAACCGATCCTCATTACGGAAACATCCTCCC
CGAAACTTCATCGGCTCCATCAATGCGTCACCATCATCAAACCACCGAGGAATACCCGGT
TAAATCGGAACAAGAAGAGATTGTTCTGACCAACAAGAAGAGAAAGCCTAATTCAAAACC
CGGCGCGGGGACAAAGGCGAAGAAGCCTGGGAAACCAAAAGAGGAGGAGAAGGACAAGAG
CACTAATAACGGTAACGTTTCGCGAGTGAAACCGGCTAAGAAAAGCGTAGACTTCGTTAT
CAACGGAGTGAACATGGACATCTCGGGTCTACCTGTACCGGTCTGCACTTGCACTGGAGC
TCCTCAGCAGTGTTACCGCTGGGGCTGTGGAGGTTGGCAATCTGCGTGTTGCACCACGAA
CATATCGATGTATCCGTTGCCGATGAGCACTAAACGTCGTGGAGCGAGGATCTCGGGTAG
GAAGATGAGTCAAGGAGCGTTCAAGAAGGTGCTTGAGAAACTTGCTTCTGATGGGTTTAA
CTTTGGGAATTCGATTGATCTTAAGACCCATTGGGCTAGACATGGGACTAACAAGTTCGT
CACGATCAGATGATTTAGTTTCTTCCTCTTTATTAGTAAAAAGAAGGAAAAAAAGAGACG
TATCTCTTCCGGGACTGAGGTCTCTCAGTGATCGTGTGTATACTATAACGAATCTGATGT
CTGTGACCTTTTGAGTTCTGTCTACAATCTGAGTTTGCAGGTGACCACCATTTGTTGGAG
TCTGTATGTTTGTCTGAGGGAAGAAGGTGACAGAGAAATGAAGTTTGGTTTTTTCCCTCC
TTTTGTTATCCTTATAAAACATTTTACTGACTTGTAAGTTGTAACAGATATTCTTTTAAT
TAAAATGTTTTTATTTCTCG


BQ
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AF RR4G873TF U 1
AF RR4G873JQ C 549
BS 1 660 RR4G873TF
BS 661 1280 RR4G873JQ

RD RR4G873TF 660 0 0
GGATCTTCTCTTTCTTAAAATATTTCTCTTTCTTCCTTCTCTTTCCTCAATCTCTCTCAG
AATTCTCTCTCCTAGGCAAAAAAATTCCCTTAAAGAGCCCCCGTTCGTTTAACCCAATCC
TCATATCTTTGAAATGGATGACGATGGGTTCCGTAACTGGGGTTACTACGAACCAGCAGC
TGCTACGTTCAAAGGTAATCTCGGTTTGCAGCTAATGCCAAGCATTGATCGGAACACTAA
ACCGTTTTTACCCGGTCGAGACCCGAATCTAATGATCGGGCAGCAAAACGGGCCGTACCA
CCACCCTGAGCCTCCTCCTATCAACAACATGAGCTACAATTGGATTAACCAACAGCACAA
GGACAAGTTCTTCAACATGTTGCCTGTAACAACCGATCCTCATTACGGAAACATCCTCCC
CGAAACTTCATCGGCTCCATCAATGCGTCACCATCATCAAACCACCGAGGAATACCCGGT
TAAATCGGAACAAGAAGAGATTGTTCTGACCAACAAGAAGAGAAAGCCTAATTCAAAACC
CGGCGCGGGGACAAAGGCGAAGAAGCCTGGGAAACCAAAAGAGGAGGAGAAGGACAAGAG
CACTAATAACGGTAACGTTTCGCGAGTGAAACCGGCTAAGAAAAGCGTAGACTTCGTTAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4G873JQ 732 0 0
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ACGGTAACGTTTCGCGAGTGAAACCGGCTAAGAAAAGCGTAGACTTCGTTATCAACGGAG
TGAACATGGACATCTCGGGTCTACCTGTACCGGTCTGCACTTGCACTGGAGCTCCTCAGC
AGTGTTACCGCTGGGGCTGTGGAGGTTGGCAATCTGCGTGTTGCACCACGAACATATCGA
TGTATCCGTTGCCGATGAGCACTAAACGTCGTGGAGCGAGGATCTCGGGTAGGAAGATGA
GTCAAGGAGCGTTCAAGAAGGTGCTTGAGAAACTTGCTTCTGATGGGTTTAACTTTGGGA
ATTCGATTGATCTTAAGACCCATTGGGCTAGACATGGGACTAACAAGTTCGTCACGATCA
GATGATTTAGTTTCTTCCTCTTTATTAGTAAAAAGAAGGAAAAAAAGAGACGTATCTCTT
CCGGGACTGAGGTCTCTCAGTGATCGTGTGTATACTATAACGAATCTGATGTCTGTGACC
TTTTGAGTTCTGTCTACAATCTGAGTTTGCAGGTGACCACCATTTGTTGGAGTCTGTATG
TTTGTCTGAGGGAAGAAGGTGACAGAGAAATGAAGTTTGGTTTTTTCCCTCCTTTTGTTA
TCCTTATAAAACATTTTACTGACTTGTAAGTTGTAACAGATATTCTTTTAATTAAAATGT
TTTTATTTCTCG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6131Contig1 1442 2 2 U
GGAGAACACGTTTCTTCTTCTCCTTCGCAGCGCTTCCTCTCAAACTCGCAGAGTGCAGAT
AGTTAGACCTAGCCAATGCCAATGGGAGGAGGATTCAGAGTTTTGCATCTGGTGAGGCCA
TTCTTGCCTTTTCTCCCAGAGGTGCAGAGTGCAGACAGGAAGATTCCGTTCAGAGAGAAA
GTCATCTACACAGTCATCTCCCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGCCAGCTCCCTCTCTAC
GGTATCCACGCCACCACCGGCGCTGATCCCTTGTACTGGATGCGTGTCATTCTCGCTTCC
AACCGTGGTACCGTCATGGAGCTTGGTATCACTCCCATCGTCACCTCTGGTCTCGTTATG
CAGCTCTTGGCTGGGTCTAAGATCATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGATCGTGCT
CTCTTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCTTGGGATTTTGATTGCTATTGGTGAAGCTGTTGCG
TATGTTCTTTCTGGTATGTACGGTCCTGTTGGCCAGCTTGGCGTTGGGAACTCTATTCTC
ATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCTGGTATCATCGTTATCTGCCTCGACGAGCTTCTTCAG
AAGGGTTATGGGCTTGGCTCTGGGATCTCTCTTTTCATTGCAACCAATATCTGTGAAAGC
ATTATCTGGAAATCATTTAGTCCCACAACGATCAACACTGGCCGTGGAGCTGAGTTCGAA
GGCGCTGTGATCGCCTTGTTCCATATGCTGATTATTAAATCCAATAAGGTTGCTGCGCTC
AGACAAGCTTTCTACAGGCAAAACCTTCCGAACGTTACCAACTTGCTTGCTACAGTCTTG
ATTTTTCTGATCGTTATCTACTTCCAAGGGTTCCGTGTTGTGTTGCCCGTGAGATCAAAG
AGTGCTCGTGGCCAACAGGGTTCTTACCCGATTAAGCTGTTCTACATCTCCAACATGCCG
ATCATTCTCCAGTCTGCTCTCGTCTCAAACCTCTACCTCATGCTCAAAGACGTGGATTGA
AGTCTCCGGGTCTTCTGCTAGAGATGTAGCTAAGCAGCTCAAGGAACAACAAATGGTGAT
GCCGGGACACAGAGAGTCGAACTTGCAGAAGGAGCTGAACCGTTATATCCCAACCGCAGC
TGCTTTTGGAGGAGTTTTGCATCGGTGCACTCACTGTTTTGGCTGATTTCATGGGAGCCA
TTGGGTCGGGGACTGGAATCTTGCTAGCTGTGACAATCATATATCAGTATTTCGAAACCT
TTGAGAAGGAAAAAGCGAGCGAGCTTGGTTTCTTTGGCTTCTAAATGTATCAGTGTCTTA
TAAAAGGGTAAATTTTGATGAGACTAGTCAGGAACTCGTATGTGTCCAACTCTAAAGGTG
CAATAGACGATCAAACTGGTAGATACTTTTTGATTAACCAACAGATTTACCTCCATTAGT
AT


BQ
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AF RR4AG12JQ C 667
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BS 766 1442 RR4AG12JQ

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AGTTAGACCTAGCCAATGCCAATGGGAGGAGGATTCAGAGTTTTGCATCTGGTGAGGCCA
TTCTTGCCTTTTCTCCCAGAGGTGCAGAGTGCAGACAGGAAGATTCCGTTCAGAGAGAAA
GTCATCTACACAGTCATCTCCCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGCCAGCTCCCTCTCTAC
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CTCTTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCTTGGGATTTTGATTGCTATTGGTGAAGCTGTTGCG
TATGTTCTTTCTGGTATGTACGGTCCTGTTGGCCAGCTTGGCGTTGGGAACTCTATTCTC
ATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCTGGTATCATCGTTATCTGCCTCGACGAGCTTCTTCAG
AAGGGTTATGGGCTTGGCTCTGGGATCTCTCTTTTCATTGCAACCAATATCTGTGAAAGC
ATTATCTGGAAATCATTTAGTCCCACAACGATCAACACTGGCCGTGGAGCTGAGTTCGAA
GGCGCTGTGATCGCCTTGTTCCATATGCTGATTATTAAATCCAAT

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DS 

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GTGATCGCCTTGTTCCATATGCTGATTATTAAATCCAATAAGGTTGCTGCGCTCAGACAA
GCTTTCTACAGGCAAAACCTTCCGAACGTTACCAACTTGCTTGCTACAGTCTTGATTTTT
CTGATCGTTATCTACTTCCAAGGGTTCCGTGTTGTGTTGCCCGTGAGATCAAAGAGTGCT
CGTGGCCAACAGGGTTCTTACCCGATTAAGCTGTTCTACATCTCCAACATGCCGATCATT
CTCCAGTCTGCTCTCGTCTCAAACCTCTACCTCATGCTCAAAGACGTGGATTGAAGTCTC
CGGGTCTTCTGCTAGAGATGTAGCTAAGCAGCTCAAGGAACAACAAATGGTGATGCCGGG
ACACAGAGAGTCGAACTTGCAGAAGGAGCTGAACCGTTATATCCCAACCGCAGCTGCTTT
TGGAGGAGTTTTGCATCGGTGCACTCACTGTTTTGGCTGATTTCATGGGAGCCATTGGGT
CGGGGACTGGAATCTTGCTAGCTGTGACAATCATATATCAGTATTTCGAAACCTTTGAGA
AGGAAAAAGCGAGCGAGCTTGGTTTCTTTGGCTTCTAAATGTATCAGTGTCTTATAAAAG
GGTAAATTTTGATGAGACTAGTCAGGAACTCGTATGTGTCCAACTCTAAAGGTGCAATAG
ACGATCAAACTGGTAGATACTTTTTGATTAACCAACAGATTTACCTCCATTAGTAT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GATCGACTGATTCATCTTCCTCCTCCTTGGCATCAATTCTCTCAAAGGTTGTTCTGTCAT
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ACCCTCTGGAGAAGAAGCTCAGAATCTTAGCGAGAAGGATATTTCAAAAGCATACAGGGT
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CGATCTTCTTAGGATCCAGCGCGAGAAACAGCACAAGAAATCGCAGGTGGATTCCAAGAG
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GTCTGCTAGACCTTATGATGAAGAGGAGAGAATCGCAAGGAAGCTTAAGGAGGAGGTGGA
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CGGTGGCGGTGTAGATGGAAAGAGAAGAGAAGAAGATAGAAGTGGAGGTGGAGGAACTAG
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TAGCGCGGGAAGGCTGAGAGAAGTGTTTTCAGAGTTTGGTGAGGTTGAAGATGTTGTTAT
CAGGAGTACCAAGAAGAAAGGCTCCTCCGCTCTCATTGTAATGGCTACTAAAGATGGAGC
TGTAGCAGCGACGAGAACATTGTGTGGGGATCTCTCTAACCCATTGCTAGTTGTACCTCT
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GAGTAACATATTTGGTGCTGGTTACCAAGCTTATGAAGACCAGGTCATGGAAAGACTGAA
AAAGGCGGCTATGAACCAGAAATGATAAAAGGAGTATAATGAAGCCTAGGCGTAATGAAG
CTACATGATGTCAAGAACTAAAAGCTTCTTCAAGACCAAAGTGGACGTCTCCATTTCCAT
ATCACAGACTCTCGTGGTCCTTGCATGTTCTTTTTTCTTGTAATGATATATAGAGTTCAA
CAAGTATTTGTGGACATCCATTGTCATATGACTCATA


BQ
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AF RR4FA91TF U 1
AF RR4FA91JQ C 582
BS 1 682 RR4FA91TF
BS 683 1237 RR4FA91JQ

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GATCGACTGATTCATCTTCCTCCTCCTTGGCATCAATTCTCTCAAAGGTTGTTCTGTCAT
ATTAGACGAAAGGAGTAAGAAAATGGAGGAGTTTGTGGACCATTACTTAGTTCTAGGGCT
ACCCTCTGGAGAAGAAGCTCAGAATCTTAGCGAGAAGGATATTTCAAAAGCATACAGGGT
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CCAGAGGCTCAAGACATCTTACGAGGTTCTCAAAGACGACAAAGCTCGGAAGCTCTTTGA
CGATCTTCTTAGGATCCAGCGCGAGAAACAGCACAAGAAATCGCAGGTGGATTCCAAGAG
GCGCAAGATGATGTCTGATCTGGAGGAAAGGGAGCGTTCCGGTTTTGCACCTAGTCGTGC
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CGGTGGCGGTGTAGATGGAAAGAGAAGAGAAGAAGATAGAAGTGGAGGTGGAGGAACTAG
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QA 1 682 1 682
DS 

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GTGGAGGTGGAGGAACTAGTGTTCAGCTAGATAAAGAGAGAGTTTTGAAGGTTTCTTGGG
AAACGATTGGTGGAGGGTATAGCGCGGGAAGGCTGAGAGAAGTGTTTTCAGAGTTTGGTG
AGGTTGAAGATGTTGTTATCAGGAGTACCAAGAAGAAAGGCTCCTCCGCTCTCATTGTAA
TGGCTACTAAAGATGGAGCTGTAGCAGCGACGAGAACATTGTGTGGGGATCTCTCTAACC
CATTGCTAGTTGTACCTCTTCAAAAAGCAGCACAAACCGATTTTCCAACCGCTAAGAAAT
CTGCAGAAGCAGAACCTCAGAGTAACATATTTGGTGCTGGTTACCAAGCTTATGAAGACC
AGGTCATGGAAAGACTGAAAAAGGCGGCTATGAACCAGAAATGATAAAAGGAGTATAATG
AAGCCTAGGCGTAATGAAGCTACATGATGTCAAGAACTAAAAGCTTCTTCAAGACCAAAG
TGGACGTCTCCATTTCCATATCACAGACTCTCGTGGTCCTTGCATGTTCTTTTTTCTTGT
AATGATATATAGAGTTCAACAAGTATTTGTGGACATCCATTGTCATATGACTCATA

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

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GGGATAAATTGATCTCCAAAAACTACTTCAAAACTCACATTCGAATCCTCGCCGGTGTAA
TAGTCGGAGAAAAACAGGCGATGGAATCTCACGGCACCGGTCTCCGGCGAGTTCTGTTGT
TATCATTCTGCGTCGCCGGGATCTGGGCTGCCTACATTTACCAAGGCGTTCTTCAGGAAA
CCCTGTCCACGAAGAGATTTGGGGAAGATGAGAAGAGATTCGAGCATCTTGCGTTTCTGA
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ATGGAGGTAGTGGTGGAGCTCCATGGTGGACGTACTGGAGTGCTGGCATTACTAATACCA
TTGGTCCTGCCATGGGTATCGAAGCTCTCAAGTATATTAGTTATCCTGCTCAGGTCCTGG
CAAAGTCTTCTAAAATGATTCCAGTCATGTTGATGGGGTCCTTAGTTTATGGCATAAGAT
ACACTTTGCCTGAGTATCTTTGCACCTTTCTTGTTGCCGGAGGAGTGTCCATGTTTGCCC
TTCTTAAGACTAGCCCAAAGACCATCAGCAAGCTAGCAAATCCAAATGCTCCTCTTGGTT
ACGGCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCTTTGACGGGTTCACAAACGCCACCCAAGATTCTA
TTACCGCAAGGTACCCGAAAACCAGCGCGTGGGACATAATGCTGGGAATGAACTTATGGG
GAACCATATACAACATGGTCTACATGTTTGGTCTGCCACACGGGAGCGGATTCGAAGCTG
TGCAGTTCTGCAAGCAACACCCTGAGGCAGCATGGGACATTTTCATGTACTGTCTGTGCG
GTGCGGTGGGACAAAACTTTATCTTCTTGACGATAAGCAGATTCGGGTCTCTAGCTAACA
CGACCATAACGACCACGAGGAAGTTTGTAAGCATCGTGGTGTCTTCAGTTCTGAGCGGGA
ATCCGTTGTCGTCCAAACAGTGGGGATGTGTGTCGATGGTGTTTGGTGGTTTGTCTTACC
AAATTTACTTGAAATGGAGGAAGCTGCAGAGAACGCAGAAGAAGAAAAAGACTTGATTGA
AGCTGAGAATGGGGGCGCAGCAGAATCTATAATTCTTGTTTTTGATTTGGGAAATGTTTT
ACTTTCACCAGATAATGTCTGAAACGTAGATGGAAGAAAAGCTTAGCAAAAATGTAGACT
AATGCACTTAGAAGAAACTTATATATATCAAGCCAAAGTCT


BQ
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AF RR4A736TF U 1
AF RR4A736JQ C 615
BS 1 715 RR4A736TF
BS 716 1241 RR4A736JQ

RD RR4A736TF 715 0 0
GGGATAAATTGATCTCCAAAAACTACTTCAAAACTCACATTCGAATCCTCGCCGGTGTAA
TAGTCGGAGAAAAACAGGCGATGGAATCTCACGGCACCGGTCTCCGGCGAGTTCTGTTGT
TATCATTCTGCGTCGCCGGGATCTGGGCTGCCTACATTTACCAAGGCGTTCTTCAGGAAA
CCCTGTCCACGAAGAGATTTGGGGAAGATGAGAAGAGATTCGAGCATCTTGCGTTTCTGA
ACTTGGCTCAGAATGTGGTCTGCTTGGTTTGGTCTTTTATAATGATTAAGCTGTGGTCCA
ATGGAGGTAGTGGTGGAGCTCCATGGTGGACGTACTGGAGTGCTGGCATTACTAATACCA
TTGGTCCTGCCATGGGTATCGAAGCTCTCAAGTATATTAGTTATCCTGCTCAGGTCCTGG
CAAAGTCTTCTAAAATGATTCCAGTCATGTTGATGGGGTCCTTAGTTTATGGCATAAGAT
ACACTTTGCCTGAGTATCTTTGCACCTTTCTTGTTGCCGGAGGAGTGTCCATGTTTGCCC
TTCTTAAGACTAGCCCAAAGACCATCAGCAAGCTAGCAAATCCAAATGCTCCTCTTGGTT
ACGGCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCTTTGACGGGTTCACAAACGCCACCCAAGATTCTA
TTACCGCAAGGTACCCGAAAACCAGCGCGTGGGACATAATGCTGGGAATGAACTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4A736JQ 627 0 0
TTGAACCTCGCCTTTGACGGGTTCACAAACGCCACCCAAGATTCTATTACCGCAAGGTAC
CCGAAAACCAGCGCGTGGGACATAATGCTGGGAATGAACTTATGGGGAACCATATACAAC
ATGGTCTACATGTTTGGTCTGCCACACGGGAGCGGATTCGAAGCTGTGCAGTTCTGCAAG
CAACACCCTGAGGCAGCATGGGACATTTTCATGTACTGTCTGTGCGGTGCGGTGGGACAA
AACTTTATCTTCTTGACGATAAGCAGATTCGGGTCTCTAGCTAACACGACCATAACGACC
ACGAGGAAGTTTGTAAGCATCGTGGTGTCTTCAGTTCTGAGCGGGAATCCGTTGTCGTCC
AAACAGTGGGGATGTGTGTCGATGGTGTTTGGTGGTTTGTCTTACCAAATTTACTTGAAA
TGGAGGAAGCTGCAGAGAACGCAGAAGAAGAAAAAGACTTGATTGAAGCTGAGAATGGGG
GCGCAGCAGAATCTATAATTCTTGTTTTTGATTTGGGAAATGTTTTACTTTCACCAGATA
ATGTCTGAAACGTAGATGGAAGAAAAGCTTAGCAAAAATGTAGACTAATGCACTTAGAAG
AAACTTATATATATCAAGCCAAAGTCT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6135Contig1 1333 2 6 U
GGTTTTAGACAAAAGTACCCCGGGAAAGTTTATAAGATTATCGTTCCTATGGATCTTTGT
GCGTTGGATGATCTAGCTACGGAGTTGGTTCGTGTTAGAGATGAGATCACTTGGTTAGTT
GCGAAGATGGACTCTAGGCTGTTACCGGATGAGTTTGACAATAGTGGAGATGAAGGGATA
CTGTCTTTTGTGGTTGCTTTGTGGGGTAAGGTGAAGGTTTTGTGGTCTCGGGTTGGGGAG
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GAGTCTCAGTTAGCGTTTTATAAAGAAGGAAGGGCGCAAGGCGCTGGAGTTGCGTTTGTG
GTGTTTAAAGATGTTTACACAGCTAATAAGGCTGTTCAGGATTTCAGAAACGAGAGGTCG
AGGCGGACTGGGAAGTTCTTCTCTGTCACAGAGCTGAGGCTTCAGAGAAACCAGTGGAAA
GTCGAGAGAGCGCCCTTGGCGACTGATATTTACTGGAATCATCTGGGGTTGACGAAGATC
GCGCTTATAGTAAGAAGAGTGATTGTGAATACTATTCTACTGTTGATTCTCGTGTTTTTC
AGCTCCCCATTGGCCTTGATCAGTGCGTTGGTAAGTGCCGGGAGAATCTTTAAAGCAGAA
GTTCGACTTTGCACAATACTATGCCTTCAACCTCACCATCTTTGCCTTGACAATGATATA
CTCTTCGTTCGCTCCACTCGTGGTCCCTGTAGGCGCGGTTTACTTTGGTTACAGATACAT
TGTCGACAAATACAACTTCCTATACGTGTACAGAGTCCGCGGCTTCCCTGCTGGCAACGA
AGGAAAGCTAATGGACACGGTTTTGTGCATCATGCGGTTTTGCATCGACCTGTACATCGT
CTCCATGCTGTTTTTCTTCTCTGTCAAAGGAGATTCGACAAAGCTTCAAGCCATTTTCAC
ACTTGGGTTGCTTGTGATGTACAAGCTTTTGCCTTCGGATACAGAACGGTTTCACCCGGC
TCTTCTCCGGAGTATTCAGACCGTCGATAGCATCGTCGACGGGCCAGTGGATTACGAAGC
TTATTCTCAACCCAACTTTGACTGGGACACTTACAACAGATGATGTTTCTACGACCTTAT
GACTTATTAGTTTTGGTCTTTTGACCATATCGAGTTTTAGAATCTGTCTCTCAACGGGTT
CTCTTTGTAAGTTTGTATATCCCTTTTTTGTGTATAAAATCCACCTTTTGAGAGCATTTA
CGTTTGTTGCAACATCTCTTGCAATTTGTCAACAGGATCTCTTTTATGTATTAATTAATA
TCCCATTCTTTTG


BQ
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AF RR4GO86TF U 1
AF RR4GO86JQ C 621
BS 1 689 RR4GO86TF
BS 690 690 RR4GO86JQ
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GCGAAGATGGACTCTAGGCTGTTACCGGATGAGTTTGACAATAGTGGAGATGAAGGGATA
CTGTCTTTTGTGGTTGCTTTGTGGGGTAAGGTGAAGGTTTTGTGGTCTCGGGTTGGGGAG
AGGTTTGGTTTTACAGATGATGAGAAGCTTAGGTAGCTGCAAGAGCTGAGAGCTGATTTG
GAGTCTCAGTTAGCGTTTTATAAAGAAGGAAGGGCGCAAGGCGCTGGAGTTGCGTTTGTG
GTGTTTAAAGATGTTTACACAGCTAATAAGGCTGTTCAGGATTTCAGAAACGAGAGGTCG
AGGCGGACTGGGAAGTTCTTCTCTGTCACAGAGCTGAGGCTTCAGAGAAACCAGTGGAAA
GTCGAGAGAGCGCCCTTGGCGACTGATATTTACTGGAATCATCTGGGGTTGACGAAGATC
GCGCTTATAGTAAGAAGAGTGATTGTGAATACTATTCTACTGTTGATTCTCGTGTTTTTC
AGCTCCCCATTGGCCTTGATCAGTGCGTTGGTAAGTGCCGGGAGAATCTTTAAAGCAGAA
GTTCGACTTTGCACAATACTATGCCTTCA*CCTCACCATCTTTGCCTTGACAATGATATA
CTCTTCGT*CGCTCCACTCGT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GO86JQ 713 0 0
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ATGCCTTCAACCTCACCATCTTTGCCTTGACAATGATATACTCTTCGTTCGCTCCACTCG
TGGTCCCTGTAGGCGCGGTTTACTTTGGTTACAGATACATTGTCGACAAATACAACTTCC
TATACGTGTACAGAGTCCGCGGCTTCCCTGCTGGCAACGAAGGAAAGCTAATGGACACGG
TTTTGTGCATCATGCGGTTTTGCATCGACCTGTACATCGTCTCCATGCTGTTTTTCTTCT
CTGTCAAAGGAGATTCGACAAAGCTTCAAGCCATTTTCACACTTGGGTTGCTTGTGATGT
ACAAGCTTTTGCCTTCGGATACAGAACGGTTTCACCCGGCTCTTCTCCGGAGTATTCAGA
CCGTCGATAGCATCGTCGACGGGCCAGTGGATTACGAAGCTTATTCTCAACCCAACTTTG
ACTGGGACACTTACAACAGATGATGTTTCTACGACCTTATGACTTATTAGTTTTGGTCTT
TTGACCATATCGAGTTTTAGAATCTGTCTCTCAACGGGTTCTCTTTGTAAGTTTGTATAT
CCCTTTTTTGTGTATAAAATCCACCTTTTGAGAGCATTTACGTTTGTTGCAACATCTCTT
GCAATTTGTCAACAGGATCTCTTTTATGTATTAATTAATATCCCATTCTTTTG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6136Contig1 1410 2 6 U
GAACGGTCAGAACGTTGACCAAATCTCTCTCTCTCCACCCGAATCTCACCGGCGATCGTT
GTTTGCTCACCGACAAATCTGAATCGTACCCAACAGTCACAGTGGAAGAAGAATGGCGAC
TCGGGTTGATCCACCAAACGGAGTTAGCAACCAAGGGAAGCATTACTTCTCAATGTGGCA
AACACTCTTCGAGATCGACACCAAATACGTTCCCATCAAACCCATAGGCCGTGGCGCCTA
CGGTGTCGTCTGCTCTTCCGTCAACAGAGAGACTAACGAGAGAGTAGCCATCAAGAAGAT
CCACAATGTGTTTCAGAACAGGATCGACGCGTTGAGGACACCTCGTGAGCTCAAGCTTCT
ACGTCATCTTCGGCATGAAAATGTGATTGCTCTTAAAGATGTAATGATGGCTAATCATAA
AAGAACCTTTAAGGATGTGTATCTTGTTTACGAGCTCATGGACACTGATCTTCACCAGAT
TATCAAGTCTTCTCAAGTGTTGACTAATGATCATTGCCAATACTTCTTGTTCCAGCTGCT
TCGAGGGCTAAAGTATATACATTCAGCCAACATTCTTCATCGGGATTTGAAACCAGGTAA
CCTCCTTGTGAACGCAAACTGCGACTTAAAGATATGTGACTTTGGTCTAGCGAGGACTAG
CAACACCAAAGGTCAGTTCATGACTGAATACGTTGTGACTCGATGGTACCGAGCACCAGA
GCTTCTCCTCTGTTGTGACAACTACGGAACCTCCATCGATGTCTGGTCGGTAGGATGCAT
ATTCGCCGAGCTTCTCGGAAGAAAACCGATATTCCCGGGGACAGAATGCCTTAACCAGAT
TAAACTCATTATTAACATTTTGGGGAGCCAGAGAGAGGAAGATCTCGAGTTTATCGATAA
CCCGAAAGCCAAAAGATACATAGAGTCACTCCCTTACTCACCGGGGATATCATTCTTTCG
TCTTTACCCGAATGCGCATGCTCTAGCCATCGACCTGCTTCAGAAGATGCTCGTTCTTGA
CCCTTCCAAGAGGATTAGTGTCGCGGAAGCGCTTCAGCATCCTTACATGGCGCCTTTGTA
TGACCCTAACGCGAATCCTCCTGCTCAAGTTCCTACTGATCTTGATGTAGACGAGGATGA
GGATTTGGGGGCGGAGATGATAAGAGAGTTGATGTGGAAAGAAATGGTTCATTATCATCC
AGAGACTGCTACCATGAACAACTCTGAGCTCTAACCACAAGTATTATGAAGGTAATTTTC
AGAGAGATCTTTCAACTACTTTCTAAAAAAAACTTGATTCATGTTTGCTTCTTACAATGT
TGTTAATAATCGTGTGATTTACTTGTGTCATGGAACCTCCTCTGCCTTGTTTTTCTGGTT
ATAAAGTTTAAGTGTCTGTAACGTTTGTAC


BQ
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AF RR4GG45TF U 1
AF RR4GG45JQ C 621
BS 1 671 RR4GG45TF
BS 672 672 RR4GG45JQ
BS 673 716 RR4GG45TF
BS 717 717 RR4GG45JQ
BS 718 740 RR4GG45TF
BS 741 1410 RR4GG45JQ

RD RR4GG45TF 750 0 0
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GTTTGCTCACCGACAAATCTGAATCGTACCCAACAGTCACAGTGGAAGAAGAATGGCGAC
TCGGGTTGATCCACCAAACGGAGTTAGCAACCAAGGGAAGCATTACTTCTCAATGTGGCA
AACACTCTTCGAGATCGACACCAAATACGTTCCCATCAAACCCATAGGCCGTGGCGCCTA
CGGTGTCGTCTGCTCTTCCGTCAACAGAGAGACTAACGAGAGAGTAGCCATCAAGAAGAT
CCACAATGTGTTTCAGAACAGGATCGACGCGTTGAGGACACCTCGTGAGCTCAAGCTTCT
ACGTCATCTTCGGCATGAAAATGTGATTGCTCTTAAAGATGTAATGATGGCTAATCATAA
AAGAACCTTTAAGGATGTGTATCTTGTTTACGAGCTCATGGACACTGATCTTCACCAGAT
TATCAAGTCTTCTCAAGTGTTGACTAATGATCATTGCCAATACTTCTTGTTCCAGCTGCT
TCGAGGGCTAAAGTATATACATTCAGCCAACATTCTTCATCGGGATTTGAAACCAGGTAA
CCTCCTTGTGAACGCAAACTGCGACTTAAAGATATGTGACTTTGGTCTAGCGAGGACTAG
CAACACCAAAG*TCAGTTCATGACTGAATACGTTGTGACTCGATGGTACCGAGCAC*AGA
GCTTCTCCTCTGTTGTGACA
CTACGAACCT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4GG45JQ 790 0 0
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TGACTGAATACGTTGTGACTCGATGGTACCGAGCACCAGAGCTTCTCCTCTGTTGTGACA
ACTACGGAACCTCCATCGATGTCTGGTCGGTAGGATGCATATTCGCCGAGCTTCTCGGAA
GAAAACCGATATTCCCGGGGACAGAATGCCTTAACCAGATTAAACTCATTATTAACATTT
TGGGGAGCCAGAGAGAGGAAGATCTCGAGTTTATCGATAACCCGAAAGCCAAAAGATACA
TAGAGTCACTCCCTTACTCACCGGGGATATCATTCTTTCGTCTTTACCCGAATGCGCATG
CTCTAGCCATCGACCTGCTTCAGAAGATGCTCGTTCTTGACCCTTCCAAGAGGATTAGTG
TCGCGGAAGCGCTTCAGCATCCTTACATGGCGCCTTTGTATGACCCTAACGCGAATCCTC
CTGCTCAAGTTCCTACTGATCTTGATGTAGACGAGGATGAGGATTTGGGGGCGGAGATGA
TAAGAGAGTTGATGTGGAAAGAAATGGTTCATTATCATCCAGAGACTGCTACCATGAACA
ACTCTGAGCTCTAACCACAAGTATTATGAAGGTAATTTTCAGAGAGATCTTTCAACTACT
TTCTAAAAAAAACTTGATTCATGTTTGCTTCTTACAATGTTGTTAATAATCGTGTGATTT
ACTTGTGTCATGGAACCTCCTCTGCCTTGTTTTTCTGGTTATAAAGTTTAAGTGTCTGTA
ACGTTTGTAC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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AATCACAAGCTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTGGACCGATCTTTCTGTCT
TAAATTCCTCAATTCGAAATCCGCATCTCCTAATATTCAAGCCTTGGCAAAAACCACACT
TGATGCCACACAAGCAAGAGCAACACAAACATTCAAAAGACTTCAATCTATTATCGATGG
AGGAGTTGACCCACGATCCAAATTAGCTTACAGATCATGCATGGATGAATACGAGAACAC
CATGGAAAACCTCGATGAAGCTTTTGAGAATTTGGCTTCCGGGGATGGCTTCGGGATGAA
CATCAAAGTTTCAGCTGCATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATAATGTGAAGAGATT
GAGATCTGTAGATACTTCTGTTGTGAATAACAGTAAGGGAATCAAGAAGCTTTGTGGTAT
TGCTCTTGTTATCTCTAACATGTTACCACGTAGATCTTAATTCTGAACAATCATCATGTG
TTTGCACTGATTAAATTATAGTGTTGGTAAGATGACACTTAAATTATTATAATAAAATAT
T


BQ
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10 

AF RR4CU04TF U 128
AF RR4CU04JQ C 1
BS 1 127 RR4CU04JQ
BS 128 241 RR4CU04TF
BS 242 601 RR4CU04JQ

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ACACAAGCAAGAGCAACACAAACATTCAAAAGACTTCAATCTATTATCGATGGA

QA 1 114 1 114
DS 

RD RR4CU04JQ 601 0 0
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AATCACAAGCTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTGGACCGATCTTTCTGTCT
TAAATTCCTCAATTCGAAATCCGCATCTCCTAATATTCAAGCCTTGGCAAAAACCACACT
TGATGCCACACAAGCAAGAGCAACACAAACATTCAAAAGACTTCAATCTATTATCGATGG
AGGAGTTGACCCACGATCCAAATTAGCTTACAGATCATGCATGGATGAATACGAGAACAC
CATGGAAAACCTCGATGAAGCTTTTGAGAATTTGGCTTCCGGGGATGGCTTCGGGATGAA
CATCAAAGTTTCAGCTGCATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATAATGTGAAGAGATT
GAGATCTGTAGATACTTCTGTTGTGAATAACAGTAAGGGAATCAAGAAGCTTTGTGGTAT
TGCTCTTGTTATCTCTAACATGTTACCACGTAGATCTTAATTCTGAACAATCATCATGTG
TTTGCACTGATTAAATTATAGTGTTGGTAAGATGACACTTAAATTATTATAATAAAATAT
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL6138Contig1 776 2 3 U
TTTTAATTATAATTCAGGCTTTTATTAAAATGCATAAGGTTGAAAATAGTGTTTTTTTTT
CAAAACTGAAACCTGCGCTAAGCTGAAGCGGGAACTACATCTGTTTGTCAAGTAGTAGGA
TCTAAACGGTAAACGGTGGTAAGACATAAGCAATAATTATTTTGCTTCAAGTGAAGTGTA
TGAATTGCTCAACTTGCTTGTAATAAAATCAATGCTTGTAAATTTATCCGTGTGGCAACT
TTCGGTGGGCCGATAACGCCTCTTTCTCACAATATAAACATGCGGAGTGAACTTAATTTC
CTGAGGCTGTGCGGGTACAACATACTCGTTAAGCTCTCAACTATAGTGAGTGGTTCCACT
TTTCGAAACTCCGCAATAGGGAGAGAGTAGAGTTGATGTATTCCCGACGACGGTAGCCAC
AAGCCTATTGCAAGCAGGAATGGTGCGGGAAAGTGTTTTTGCCAAATGTTTACATCGATG
ATTGGATCCTGGCCTTTAGGACCAAGCTTGAGACGGTTCTTCTTAATCTCACATACAACA
GAGCGTGCTTTAGTACCAGTAGGGACTGGAATGTTAACAGTGACCTCCTGGAGAGTCTGG
ACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATAACCATTACCATTGTTAGGAGCTCCAACAATATTT
GGCTTTATGCTCACTGCAACAACAATCTCTGGGTCACCCTTTCCACTTTTTTTTGTGGAA
AGAAACAGCAAGAGAGTCGAATCACAGACAGAGGAGAGTCATAGAGTTTGAAATTC


BQ
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AF RR4BB63TF C 1
AF RR4BB63JQ U 5
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BS 5 726 RR4BB63JQ
BS 727 776 RR4BB63TF

RD RR4BB63TF 776 0 0
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TGAATTGCTCAACTTGCTTGTAATAAAATCAATGCTTGTAAATTTATCCGTGTGGCAACT
TTCGGTGGGCCGATAACGCCTCTTTCTCACAATATAGACATGCGGAGTGAACTTAATTTC
CTGAGGCTGTGCGGGTACAACATACTCGTTAAGCTCTCAACTATAGTGAGTGGTTCCACT
TTTCGAAACTCCGCAATAGGGAGAGAGTAGAGTTGATGTATTCCCGACGACGGTAGCCAC
AAGCCTATTGCAAGCAGGAATGGTGCGGGAAAGTGTTTTTGCCAAATGTTTACATCGATG
ATTGGATCCTGGCCTTTAGGACCAAGCTTGAGACGGTTCTTCTTAATCTCACATACAACA
GAGCGTGCTTTAGTACCAGTAGGGACTGGAATGTTAACAGTGACCTCCTGGAGAGTCTGG
ACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATAACCATTACCATTGTTAGGAGCTCCAACAATATTT
GGCTTTATGCTCACTGCAACAACAATCTCTGGGTCACCCTTTCCACTTTTTTTTGTGGAA
AGAAACAGCAAGAGAGTCGAATCACAGACAGAGGAGAGTCATAGAGTTTGAAATTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4BB63JQ 722 0 0
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AACGGTAAACGGTGGTAAGACATAAGCAATAATTATTTTGCTTCAAGTGAAGTGTATGAA
TTGCTCAACTTGCTTGTAATAAAATCAATGCTTGTAAATTTATCCGTGTGGCAACTTTCG
GTGGGCCGATAACGCCTCTTTCTCACAATATAAACATGCGGAGTGAACTTAATTTCCTGA
GGCTGTGCGGGTACAACATACTCGTTAAGCTCTCAACTATAGTGAGTGGTTCCACTTTTC
GAAACTCCGCAATAGGGAGAGAGTAGAGTTGATGTATTCCCGACGACGGTAGCCACAAGC
CTATTGCAAGCAGGAATGGTGCGGGAAAGTGTTTTTGCCAAATGTTTACATCGATGATTG
GATCCTGGCCTTTAGGACCAAGCTTGAGACGGTTCTTCTTAATCTCACATACAACAGAGC
GTGCTTTAGTACCAGTAGGGACTGGAATGTTAACAGTGACCTCCTGGAGAGTCTGGACCC
ATGAGTAGCTCTCAAGATCATAACCATTACCATTGTTAGGAGCTCCAACAATATTTGGCT
TTATGCTCACTGCAACAACAATCTCTGGGTCACCCTTTCCACTTTTTTTTGTGGAAAGAA
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6139Contig1 1107 2 2 U
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GGGTCCGTTGTTGACAGAAGATCTTATTAAAGAAACAGAGGAACTAGTATTGCGGACAGG
GAGCATGGGGGCTGGGTGTTCTCAACTCTTGTCCGACATGCAAGCTTTCAAGTCAGCAAA
TCCTGGCTGTATTTTGGAAGATTTTGTGAGATGGCATTCTCCTCCAGATTGGACTGAAAA
TGATACTTCTTCTGGAGATGACTCTTCTCCTCTAAGAGGTCAATTAAGCATCCGGATGCA
AAAAGAAGGTAATTTATGGCGTGAGCTGTGGGAAACAGCTAAACCACTGCCTGCGGTTAA
GCAAACACCTCTCTATGATGAAGATTTTGCTGTGGAAGGAATCTTGAATTCTTTGGAAGA
CATTCCACCTGCTGAATTTTTCGAGCAGCTGTTTGTTTCTCTTGTTGCCCTGGGATTTGT
AATGGCGGAGCCAGTAGTAGCCACAAACGATGACTTGTCAAAGCTTTTCTTCGAATGCAA
GGATTATGTAGTTGCGACCTGCCAGGGAGACGCATGGACCGATAAGCTTGATGATCTTTG
CCAGGTGTATGAAACAGTGGAAACAATGTTAGTACATCCAGAAAAGGTGTTGAGATCAAT
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AAAGTACGGGACCGAGCCCGCGGCAGTCTTTCTCGAGTCTTTTTGATGGGAAGTCGTCTC
TGTTCGCAAGAAACCACCTAGACCTGCTGAAAATGGGACTCTTGTCTGACTCTTTGCTAT
TTTTTATATTTAATTTGTTTCATCTGTTTTTGAGTTATTTCTCAATATTCTTTTTTTGTG
CTCCGGGTTTAGGTTGTTAAGTTAAATCAGTTGGTTGATAACTGTAAATTTGTATCATTC
ATAACATTTCTCAGGAGGAACTCAAAACTTCTGATGAAATGAAAATGAATAAAGATTGTG
GCCTGTGGAAGCTAGAAAAGTTTTTTT


BQ
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AF RR4D406TF U 1
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BS 1 680 RR4D406TF
BS 681 1107 RR4D406JQ

RD RR4D406TF 696 0 0
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GGGTCCGTTGTTGACAGAAGATCTTATTAAAGAAACAGAGGAACTAGTATTGCGGACAGG
GAGCATGGGGGCTGGGTGTTCTCAACTCTTGTCCGACATGCAAGCTTTCAAGTCAGCAAA
TCCTGGCTGTATTTTGGAAGATTTTGTGAGATGGCATTCTCCTCCAGATTGGACTGAAAA
TGATACTTCTTCTGGAGATGACTCTTCTCCTCTAAGAGGTCAATTAAGCATCCGGATGCA
AAAAGAAGGTAATTTATGGCGTGAGCTGTGGGAAACAGCTAAACCACTGCCTGCGGTTAA
GCAAACACCTCTCTATGATGAAGATTTTGCTGTGGAAGGAATCTTGAATTCTTTGGAAGA
CATTCCACCTGCTGAATTTTTCGAGCAGCTGTTTGTTTCTCTTGTTGCCCTGGGATTTGT
AATGGCGGAGCCAGTAGTAGCCACAAACGATGACTTGTCAAAGCTTTTCTTCGAATGCAA
GGATTATGTAGTTGCGACCTGCCAGGGAGACGCATGGACCGATAAGCTTGATGATCTTTG
CCAGGTGTATGAAACAGTGGAAACAATGTTAGTACATCCAGAAAAGGTGTTGAGATCAAT
GAAGCAAACAGAGGAGTCGC
CGTCAGAGGGAACGAA

QA 1 680 1 680
DS 

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GGAGACGCATG*ACCGATAAGCTTGATGATCTTTGCCAGGTGTATGAAACAGTGGAAACA
ATGTTAGTACATCCAGAAAAGGTGT*GAGATCAATGAAGCAAACAGAGGAGTCGCGTCAG
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AAACAAGAAGAGAGTTCCATCAGAAACTGAACAGAAAAGTACGGGACCGAGCCCGCGGCA
GTCTTTCTCGAGTCTTTTTGATGGGAAGTCGTCTCTGTTCGCAAGAAACCACCTAGACCT
GCTGAAAATGGGACTCTTGTCTGACTCTTTGCTATTTTTTATATTTAATTTGTTTCATCT
GTTTTTGAGTTATTTCTCAATATTCTTTTTTTGTGCTCCGGGTTTAGGTTGTTAAGTTAA
ATCAGTTGGTTGATAACTGTAAATTTGTATCATTCATAACATTTCTCAGGAGGAACTCAA
AACTTCTGATGAAATGAAAATGAATAAAGATTGTGGCCTGTGGAAGCTAGAAAAGTTTTT
TT

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL6140Contig1 713 2 1 U
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TCTTTCTCACTCTCTCTCGAGATGGAAGCTCAACACCTCCATGGCAAGCCTCTAGCTAAA
GGAGAATGGTCCACAGGATTCTGTGTTTGCTTCTCCGACTGCAAAAACTGTTGTATCACA
TGCTGGTGTCCATGTATTACATTTGGCCAAGTCGCTGAGATTGTAGATCAAGGATCAACC
ACGTGTGGCACGGCTGGAGCACTATACGCGTTAATAAACGCAGTAAGGGTTGCGCATGTA
TATACTCGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAATATCGAAGGCAGTGATT
GTGGAGACTGCCTAAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACCCAACAATACCGTG
AACTCAAGAACCGCGGTTTCAATTTGGATCTTGGATGGGCGGGGAACGTACAGAGGCAGC
AAAACCAAGGCACCGAGATGGGTGCTCCTGTCTTTCAAGGTGGCATGAACCGTTAAGACT
AATTCTTTATATGTAATTTATTCGGTCATATAATAAATGAGGTTTAGTCCTCTGTGTGTT
TCTGTAATATGCTTCTGAATTATGAATGAAAGTGATTTTATTTATTGCGTTAATATTCGG
TCAAATATATGACACTTGGACGAGTCAATTGAATACTATTATATACGCGCATG


BQ
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AF RR4A554JQ C 1
AF RR4A554TF U 1
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TCTTTCTCACTCTCTCTCGAGATGGAAGCTCAACACCTCCATGGCAAGCCTCTAGCTAAA
GGAGAATGGTCCACAGGATTCTGTGTTTGCTTCTCCGACTGCAAAAACTGTTGTATCACA
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ACGTGTGGCACGGCTGGAGCACTATACGCGTTAATAAACGCAGTAAGGGTTGCGCATGTA
TATACTCGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAATATCGAAGGCAGTGATT
GTGGAGACTGCCTAAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACCCAACAATACCGTG
AACTCAAGAACCGCGGTTTCAATTTGGATCTTGGATGGGCGGGGAACGTACAGAGGCAGC
AAAACCAAGGCACCGAGATGGGTGCTCCTGTCTTTCAAGGTGGCATGAACCGTTAAGACT
AATTCTTTATATGTAATTTATTCGGTCATATAATAAATGAGGTTTAGTCCTCTGTGTGTT
TCTGTAATATGCTTCTGAATTATGAATGAAAGTGATTTTATTTATTGCGTTAATATTCGG
TCAAATATATGACACTTGGACGAGTCAATTGAATACTATTATATACGCGCATG

QA 1 713 1 713
DS 

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TCTTTCTCACTCTCTCTCGAGATGGAAGCTCAACACCTCCATGGCAAGCCTCTAGCTAAA
GGAGAATGGTCCACAGGATTCTGTGTTTGCTTCTCCGACTGCAAAAACTGTTGTATCACA
TGCTGGTGTCCATGTATTACATTTGGCCAAGTCGCTGAGATTGTAGATCAAGGATCAACC
ACGTGTGGCACGGCTGGAGCACTATACGCGTTAATAAACGCAGTAAGGGTTGCGCATGTA
TATACTCGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAATATCGAAGGCAGTGATT
GTGGAGACTGCCTAAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACCCAACAATACCGTG
AACTCAAGAACCGCGGTTTCAATTTGGATCTTGGATGGGCGGGGAACGTACAGAGGCAGC
AAAACCAAGGCACCGAGATGGGTGCTCCTGTCTTTCAAGGTGGCATGAACCGTTAAGACT
AATTCTTTATATGTAATTTATTCGGTCATATAATAAATGAGGTTTAGTCCTCTGTGTGTT
TCTGTAATATGCTTCTGAATTATGAATGAAAGTGATTTTATTTATTGCGTTAATATTCGG
TCAAATATATGACACTTGGACGAGTCAATTGAATACTATTATATACGCGCATG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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AGAACCCGGAAAGAATCTCCGTCGTTTACCGCACATCTTCAACCGCGTCCTCGAGCTTCC
GCTGCGGTCCGAAGCAGACGTCTCCGTGGAGGAGAAACCCGACTGCTTCAGATTCGTGGC
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TACCGTGTCTTGTGTTGATGGGGCTTTGGTTGTTACGGTTCCTAAGATGGT


BQ
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AF RR4CY23TF U 1
AF RR4CY23JQ C 388
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AGAACCCGGAAAGAATCTCCGTCGTTTACCGCACATCTTCAACCGCGTCCTCGAGCTTCC
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TGAGTTGGAGCTTGATGTCTGGCG

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4CY23JQ 204 0 0
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GGTTGTTACGGTTCCTAAGATGGT

QA 1 204 1 204
DS 



AS 1 2

CO CL6142Contig1 1439 2 2 U
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GATCCACAGCCTCTTCACCATTTCGAGTGGCATCTCTACGAGTACGAGATCAACAAGTGC
GACGCTTGCGCCTTGTACAGGCTCGAGCTCAAGCTCGTCGTCGATGGGAAGAAGAACTCG
AAGGGAAGAGTGTCGACGGACTCGGTGGCTGATCTGCAGAAACAGATGGGGAGACTCACT
GCTGAGTTCCCTCAAGAAAATGTCAACAACAAACGATGCATCAAAGGAAGGCCTAAAGTG
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GGGAATGAGTATGGAGTAGGTGAAGAGTTTAACTATCTTGTCGGAAATCTAACCGACTAT
TATCTTCCCTGAGAAGAAACAAACAAAACACTGTTGCTTACTATTTAAACCAGGCAGCAG
AAGAAGAAGAAGCTTCTACATCTTGTAGGGCAAGTAATGGGTTTTTCTTTTCTTTTTTTT
TTTTTCTTTATATAACTATAATCATCTACTATGTGTATATAACAAGAAAGGGGGTGCAGA
AGAGACTGTCATGGAGTTTGAGAGAGCTTGTTTCTTTCTAACCACAAGTAAAGTTGAGAA
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BQ
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AF RR4AN63TF U 1
AF RR4AN63JQ C 642
BS 1 754 RR4AN63TF
BS 755 1439 RR4AN63JQ

RD RR4AN63TF 754 0 0
GTGAGGAAGATGATGCAACCAGCAAGTTAGCTCCGCCCAAGCCTGAGCCTACTGATCAGA
ATCTCGAAGCTGGAAAAGCTACTGTCTTCCCAAGGGGATACAATTTGGTCCAGGAGAAGC
CAGAGCATGAGTTTCCATTGGCTGACCATTGCAAAGATCCTTCCTTAACCGTTGGCAACA
ACTTCGATCTGGATTACAATCAGTACGATCTTCAACAAGAGTTTGAACCAAACTTCAACG
GTGGCGGTTTCAACGATTGTCCCACTTATGGTCCTTTACACATCTCTGCATTCATCCCAA
CCATCTGTCCTCCACCATCTGCCTTCTTGGGTCCCAAATGTGCTCTTTGGGACTGCCCTA
GGCCTGCTCAAGGATTCGACTGGTTCCAGGATTACTGCAGCAGCTTCCACGCCGCCCTTG
CTTTCAACGAAGGCCCACCGGGGATGAATCCCGTTGTTCGTCCTGGTGGCATTGGCTTGA
AAGACGGTCTGCTTTTTGCAGCTCTGAGCGCAAAAGCTGGAGGGAAAGATGTCGGTATCC
CCGAGTGCGAAGGAGCTGCAACTGCTAAGTCCCCATTGAATGCTCCTGAGCTCTTTGACC
TCACGGTTCTAGAGAGCGAGACACTAAAGGGAGTGGCTGTTCTTCGACAAGCCGAGGAGG
GCGTTTGAGAGCGGGAACAGAAAGCAAAGATCCTTACCGGACTACAACGGACGCGGGTGG
CACGAGTCGCGCAAGCAGATCATGAGCGAGTTCG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4AN63JQ 798 0 0
CTTCGACAAGCCGAGGAGGGCGTTTGAGAGCGGGAACAGAAAGCAAAGATCCTTACCGGA
CTACAACGGACGCGGGTGGCACGAGTCGCGCAAGCAGATCATGAGCGAGTTCGTAGGGCT
GAAGAGGTCTTACTACATGGATCCACAGCCTCTTCACCATTTCGAGTGGCATCTCTACGA
GTACGAGATCAACAAGTGCGACGCTTGCGCCTTGTACAGGCTCGAGCTCAAGCTCGTCGT
CGATGGGAAGAAGAACTCGAAGGGAAGAGTGTCGACGGACTCGGTGGCTGATCTGCAGAA
ACAGATGGGGAGACTCACTGCTGAGTTCCCTCAAGAAAATGTCAACAACAAACGATGCAT
CAAAGGAAGGCCTAAAGTGAACACAAAGGTGGCAGCAGCAGCCAACACTGGGAATGTTGA
GAACACAGGAGTAGAGCAGGGGAATGAGTATGGAGTAGGTGAAGAGTTTAACTATCTTGT
CGGAAATCTAACCGACTATTATCTTCCCTGAGAAGAAACAAACAAAACACTGTTGCTTAC
TATTTAAACCAGGCAGCAGAAGAAGAAGAAGCTTCTACATCTTGTAGGGCAAGTAATGGG
TTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTATATAACTATAATCATCTACTATGTGTATATA
ACAAGAAAGGGGGTGCAGAAGAGACTGTCATGGAGTTTGAGAGAGCTTGTTTCTTTCTAA
CCACAAGTAAAGTTGAGAAAGGAGACTGCTTTTTTATTTTAATTAAAGATTCAGTCTATG
GATGGTGACATTCCGGCC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL6143Contig1 1285 2 4 U
GGACTAGTTTCCTTAACGACACAGATCTCTCATCTCATCATCATCAATGATGATTCTCTC
CTCGCCGACGATGCAGAAAGGAATATTCGTGAGCGTTCCGGTACTTGTCCTCTCCGTTTC
CTTCGCAGCTGCCGTCTTCTTCCTCCTCTCCTCTTCTCTCTCCTCCTCCTCCTGCTCATG
TCCTTCTTCTCCGAACATAGCTTCCCTCGGTGGAAGCGTTAGTGACGTGAGATTACAGGA
GAGGATATCGACGACGCGAGAGGATATAGAGTGGGTTAGAGATCTGATTAGATCCAACGG
TTTGCATATGCAGAAGAATGAGCTTAGGAAAGGCATCAATCCTCGCACTAGAGATCAACA
ACTCGCAGATCTTAAACAGTACAAGGGTATATCTCATTACGAAGGAGACGAAGCAAACAA
CCACACAGCTCTTCCATGCCCTGGTGAGTTACTAGTCGAGCAGCATCACAGCAACTACGG
TGAGCCTTGGGCAGGTGGCCGCGACGTATTCGAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAA
ACCAAACTCTCGCGTCCTCGAGATCGGATGCGGCACCTTACGGGTCGGTTTGCATTTCAT
CCGCTATCTCGATCCAAGACACTTCCACTGCCTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGC
TGCTTTGAGATACGAGCTTCCATCACAAGGTCTTCTACATAAACGGCCTCTTATACTCAG
AGGCGAAGATATGGAGTTCAGCAAGTTTGGCTCGGATGTAAGCTATGATCTTATATACGC
GAGTGCGGTCTTTCTTCACATGCCTGATAAGCTCGTGTGGACTGGACTCGAGAGGCTGGT
GGAGAAGTTAAAGCCTTATGAAGGGAGGATCTTTGTGTCGCATAATGTGAAGTTTTGTTC
AAGGTTAGGTGGAGACGAGTGTGGAAAGAAGCTAGCGAGTTTGGGGCTTGAGTATCTTGG
TAAACAGACACATGATAGCTTGCTGTTTAATCACTACGAGATCTGGTTTGGGTTTAGGCG
GGTGAAACCATAAAAAAAACAAAAATTTGTCGGAAGTAGTTTAAATATGGGTTTGGTGAC
ACGACATCGCTCTCCATTATCTGAGGATTGGATCAGAACTTGAAGGAGAGAAACGTCCAC
AAAAGCTTTGAAGTACACTCACTGAGAGATACGTGTATTGTGCATGTAATAGCCAAATGA
TATAAGATACGAGAGTAGATTCATATTATTCTGTAACCAAAAAATATTGTTTTCATATTT
CAAGAGTTGTTAGCTTTTGTTTGTT


BQ
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AF RR4DC51TF U 1
AF RR4DC51JQ C 583
BS 1 689 RR4DC51TF
BS 690 690 RR4DC51JQ
BS 691 701 RR4DC51TF
BS 702 1285 RR4DC51JQ

RD RR4DC51TF 701 0 0
GGACTAGTTTCCTTAACGACACAGATCTCTCATCTCATCATCATCAATGATGATTCTCTC
CTCGCCGACGATGCAGAAAGGAATATTCGTGAGCGTTCCGGTACTTGTCCTCTCCGTTTC
CTTCGCAGCTGCCGTCTTCTTCCTCCTCTCCTCTTCTCTCTCCTCCTCCTCCTGCTCATG
TCCTTCTTCTCCGAACATAGCTTCCCTCGGTGGAAGCGTTAGTGACGTGAGATTACAGGA
GAGGATATCGACGACGCGAGAGGATATAGAGTGGGTTAGAGATCTGATTAGATCCAACGG
TTTGCATATGCAGAAGAATGAGCTTAGGAAAGGCATCAATCCTCGCACTAGAGATCAACA
ACTCGCAGATCTTAAACAGTACAAGGGTATATCTCATTACGAAGGAGACGAAGCAAACAA
CCACACAGCTCTTCCATGCCCTGGTGAGTTACTAGTCGAGCAGCATCACAGCAACTACGG
TGAGCCTTGGGCAGGTGGCCGCGACGTATTCGAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAA
ACCAAACTCTCGCGTCCTCGAGATCGGATGCGGCACCTTACGGGTCGGTTTGCATTTCAT
CCGCTATCTCGATCCAAGACACTTCCACTGCCTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGC
TGCTTTGAGATACGAGCTTCCATCACAAG*TCTTCTACATA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4DC51JQ 703 0 0
GGTCGGTTTGCATTTCATCCGCTATCTCGATCCAAGACACTTCCACTGCCTTGAAAGAGA
CGAGCTTTCTCTAATGGCTGCTTTGAGATACGAGCTTCCATCACAAGGTCTTCTACATAA
ACGGCCTCTTATACTCAGAGGCGAAGATATGGAGTTCAGCAAGTTTGGCTCGGATGTAAG
CTATGATCTTATATACGCGAGTGCGGTCTTTCTTCACATGCCTGATAAGCTCGTGTGGAC
TGGACTCGAGAGGCTGGTGGAGAAGTTAAAGCCTTATGAAGGGAGGATCTTTGTGTCGCA
TAATGTGAAGTTTTGTTCAAGGTTAGGTGGAGACGAGTGTGGAAAGAAGCTAGCGAGTTT
GGGGCTTGAGTATCTTGGTAAACAGACACATGATAGCTTGCTGTTTAATCACTACGAGAT
CTGGTTTGGGTTTAGGCGGGTGAAACCATAAAAAAAACAAAAATTTGTCGGAAGTAGTTT
AAATATGGGTTTGGTGACACGACATCGCTCTCCATTATCTGAGGATTGGATCAGAACTTG
AAGGAGAGAAACGTCCACAAAAGCTTTGAAGTACACTCACTGAGAGATACGTGTATTGTG
CATGTAATAGCCAAATGATATAAGATACGAGAGTAGATTCATATTATTCTGTAACCAAAA
AATATTGTTTTCATATTTCAAGAGTTGTTAGCTTTTGTTTGTT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL6144Contig1 1044 2 2 U
GGACAGACACGGACTTGGATCCTCCAAATATGAGATATATCATAAGCATCATCCACTTCA
ATCTGAAGGGAATGGCTGGAGAAGAGCAAAGACGAAGATGGAGCCTTAAAGGCAAAACCG
CACTTGTCACCGGTGGAACCAAAGGCATTGGGCATGCTATAGTAGAGGAACTTGCAGGAT
TTGGGGCGATAGTACATACGTGTGCTAGAGATGAAGCACATCTCAACGAGTGTTTGAGCG
ACTGGAAAAATAAAGGGTTTCAAGTCACTGGTTCAGTCTGTGACGCATCGTCCTGGACCG
AAAGAGAGAAGCTGATGCAAACTGTGTCCGCTTTGTTTGATGCCAAGCTCGGTATCCTCG
TAATTTATCTCCATCCTAAATATCATTTGATTGTATTTTCTTTTGTGTTGTGCAAAGACA
GACCAAGAATTAACACTTAAATTCTTGAGATTAGATCAACAATGTTGGCGCAATCCGGTC
AAAGCCAACAATTGAAAACACGGCCGAGGATTTCTCGTTCCACATTTCCACCAACTTGGA
ATCTGCGTACCATTTTAGCCAGCTTGCACATCCTCTGCTCAAGTCTTCAGGGTGTGGTAA
TATCGTGTTCATATCCTCTGTCGCTGGGGTCGTGTCGTTTGGCGTCAGCTCCATCTACTG
TGCAACAAAAGGGGCAATGAATCAGCTAGCAAGGAGTTTGGCATGCGAATGGGCTAGCGA
CGGCATTAGGGCTAATGCTGTAGCTCCTACAGTCATTGCCACTCCTCTCGTTGATGCGTT
TGATGATGAATTCAAGAAAGCAGTGGAATCAACAAATCCCTTGGGGCGCTTAGGGAAGCC
GGAGGAGGTAGCATCGCTTGTGGCATTTCTTTGTATGCCTGCAGCTTCTTATATAACGGG
TCAGACCATCTGTGTCGATGGAGATCTTTCTGTAAATGGCTTCTCGTATCAGCCACATGC
TTAAAACCAAATTGCCAAAACAAATCACAATTTCAAGTTTCTATTTCATATGAATAATCT
ATTTTACTGGAGGTTATTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ES71TF U 1
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CACTTGTCACCGGTGGAACCAAAGGCATTGGGCATGCTATAGTAGAGGAACTTGCAGGAT
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QA 1 445 1 445
DS 

RD RR4ES71JQ 712 0 0
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GTATTTTCTTTTGTGTTGTGCAAAGACAGACCAAGAATTAACACTTAAATTCTTGAGATT
AGATCAACAATGTTGGCGCAATCCGGTCAAAGCCAACAATTGAAAACACGGCCGAGGATT
TCTCGTTCCACATTTCCACCAACTTGGAATCTGCGTACCATTTTAGCCAGCTTGCACATC
CTCTGCTCAAGTCTTCAGGGTGTGGTAATATCGTGTTCATATCCTCTGTCGCTGGGGTCG
TGTCGTTTGGCGTCAGCTCCATCTACTGTGCAACAAAAGGGGCAATGAATCAGCTAGCAA
GGAGTTTGGCATGCGAATGGGCTAGCGACGGCATTAGGGCTAATGCTGTAGCTCCTACAG
TCATTGCCACTCCTCTCGTTGATGCGTTTGATGATGAATTCAAGAAAGCAGTGGAATCAA
CAAATCCCTTGGGGCGCTTAGGGAAGCCGGAGGAGGTAGCATCGCTTGTGGCATTTCTTT
GTATGCCTGCAGCTTCTTATATAACGGGTCAGACCATCTGTGTCGATGGAGATCTTTCTG
TAAATGGCTTCTCGTATCAGCCACATGCTTAAAACCAAATTGCCAAAACAAATCACAATT
TCAAGTTTCTATTTCATATGAATAATCTATTTTACTGGAGGTTATTTTTTTC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AACGGACCTTACGCTCTGATCACCACCGCTGTTTCAGCTGATCTCGGCACGCATAGCTCG
TTGAAAGGAAACTCGAGGACTTTGGCTACCGTAACGGCTATAATCGACGGGACGGGATCC
GTTGGAGCGGCGGTTGGGCCGTTGCTAACGGGTTACATATCGTCGAGGAGTAGCTGGAGT
GCGGTTTTCACCATGTTGATGGGAGCTGCGTTTGTGGCGGGACTGTTGTTGACTAGGCTT
GTGATGGCTGAAGTAGCGGCTAAGATAGCTGAGTTTAGGCCGTCGGAATCAGAGTGTAGA
GCTCCGGTGGAGCATCAGGGTCATGTGCTAGATGTGTGAGCAACTTTGATCCCCATTTTT
AGTTGCTTTCTTTAAGAGGAGCGATTCAGACCGGAGGTTTAGGTCAAGATTTGGTCTGTG
GGGGAAACTTGTAAACATGTAATCTGTATTGTGAATGTACAAAAGTTATAATATATATAA
ATATATCGATCTTTTTGGGTAACTG


BQ
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AF RR4BN12TF U 1
AF RR4BN12JQ C 57
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BS 253 565 RR4BN12JQ

RD RR4BN12TF 252 0 0
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AACGGACCTTACGCTCTGATCACCACCGCTGTTTCAGCTGATCTCGGCACGCATAGCTCG
TTGAAAGGAAACTCGAGGACTTTGGCTACCGTAACGGCTATAATCGACGGGACGGGATCC
GTTGGAGCGGCGGTTGGGCCGTTGCTAACGGGTTACATATCGTCGAGGAGTAGCTGGAGT
GCGGTTTTCACC

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR4BN12JQ 509 0 0
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CTCGTTGAAAGGAAACTCGAGGACTTTGGCTACCGTAACGGCTATAATCGACGGGACGGG
ATCCGTTGGAGCGGCGGTTGGGCCGTTGCTAACGGGTTACATATCGTCGAGGAGTAGCTG
GAGTGCGGTTTTCACCATGTTGATGGGAGCTGCGTTTGTGGCGGGACTGTTGTTGACTAG
GCTTGTGATGGCTGAAGTAGCGGCTAAGATAGCTGAGTTTAGGCCGTCGGAATCAGAGTG
TAGAGCTCCGGTGGAGCATCAGGGTCATGTGCTAGATGTGTGAGCAACTTTGATCCCCAT
TTTTAGTTGCTTTCTTTAAGAGGAGCGATTCAGACCGGAGGTTTAGGTCAAGATTTGGTC
TGTGGGGGAAACTTGTAAACATGTAATCTGTATTGTGAATGTACAAAAGTTATAATATAT
ATAAATATATCGATCTTTTTGGGTAACTG

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

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TTAGCTACACATCCACTCTGTTCCCCACTCGATCGAAAGCTTTCGTGTTCCACGCAGCGA
TCGATGGCGCGTCGTTCCGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCT
GCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAACAAAGGTTTCGTTGGATCT
ACGAGTAGAAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGATTGCCCACCTCCTGTCTCTCTC
CTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGGTTTGATCTTGATCCTGAGC
TTGATTTTGTTTGGCTGATATGCCTGTGTTCTTTCTATGTCAACTTACAAAATTGTTTGA
TAGTTATTGAGGAGCCTTATCTGTTTAGGGAAGTGATTTGAACAAGTGAAAGTTTTGATG
AGTTAGTAGCCATTAGTTCAATTGAGGCTTGGTTGCAGAACAGGCTAGTTACTCTGGTAG
TTATCTGTGATCAGGCTCGGAGACATTACCATTCCCTTTTCCGTATCTTGTTTCATGACG
TTTTTCTTGTGTTTAGCATATAGTTATAGCTCTTGTTTTCTCCTATGTAGACGTTCCTTC
TCGGACTTGTGCTGTGAACAGGCTAGTCACTTTGTTATTGTTACTCTTGATTGCAGAAAA
TGACGTTTTCTGATATCTAACTTATAGTTATAGCTATGAATATTACGCTCCTTCTCTGAC
TTGTGTTTTTGATCAGATTGTGGAGGAGATGATCCAGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAG
CAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTGCAAGAAGCTGTTGCAGATGAGCAT
AGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAG
GAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAA
GCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCTATCA
GGCTGGGGAGGTGAGTAAACTGATTGCATTTCTCATGTCAGAGAAACCAAACTTTCACAA
CTTAGCTCAAGAAAAGGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAATCCTATCTTCCATGTT
TCCTCCATATATTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCGAATGTAGCTAAAGACATGGC
TTTGTATTGACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT69TF U 1
AF RR4DT69JQ C 541
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BS 700 700 RR4DT69JQ
BS 701 741 RR4DT69TF
BS 742 1212 RR4DT69JQ

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CTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGGTTTGATCTTGATCCTGAGC
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AGTTAGTAGCCATTAGTTCAATTGAGGCTTGGTTGCAGAACAGGCTAGTTACTCTGGTAG
TTATCTGTGATCAGGCTCGGAGACATTACCATTCCCTTTTCCGTATCTTGTTTCATGACG
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QA 1 741 1 741
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TGACGTTTTCTGATATCTAACTTATAGTTATAGCTATGAATATTACGCTCCTTCTCTGAC
TTGTGTTTTTGATCAGATTGTGGAGGAGATGATCCAGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAG
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AGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAG
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TCCTCCATATATTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCGAATGTAGCTAAAGACATGGC
TTTGTATTGACT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6148Contig1 948 2 2 U
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GCTCGTTATTCCTCTCCTCATGCTGTGGCCACTGATTGTGTTTGCCAAGAAGCATCCCGT
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CTCTTTTTCAAAAGGGAAGATTGTTCTGGAGGCAGCGATTCTCACAGCTACAATGGTCCT
GGGGTTAACGATATACACTTTCTGGGCAGTAAGGAGAGGCCATGACTTCTCTTTCCTTGA
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BQ
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AF RR4EF14TF U 1
AF RR4EF14JQ C 421
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BS 622 948 RR4EF14JQ

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GCTTTATCCTAAGATGACGGAGAGCCCCGGGCTCCGCTGGGCTTTCATAAGGAAGGTTTA
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GCTCGTTATTCCTCTCCTCATGCTGTGGCCACTGATTGTGTTTGCCAAGAAGCATCCCGT
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TTACATTGTCTACGACACGAA

QA 1 621 1 621
DS 

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ACCATTCCTCTTCGGAGCCCTCCTTATCATCCTTGTCCTCTCTATCATACAGGTACTCCA
TCCTCTGGGGAAGCTATCGTCGATGATATTCAGCTGTTTCGCTTCAGTCGTGTTCTGCGG
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TGCTGCTATTTGTCTTTATCTCGACGTCATCAATCTCTTCCTCCATATCCTTGGTTTTGC
CATCCACACCTAGTGACTTGGTGCATCATGCGCACATCCTATCTGATAATGTCCTCGTCA
TGGGTTACTTAGAACTAGTTCAAGACACAAACTTTAAAAGGCTGGGTTATGCTATTTGCT
CTAAATAATTGTTAAATATTTATTTTGTAAAGATTATGATAACTCTTAAATCTCAAGACT
TTCGGTTTAAGAGGTTCCTTGTTTTGCAAGGAATCTCTAGAAAAAAAA

QA 1 528 1 528
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCGAAACCCACCACAAAGTTTCAATCTTTTACCATTCTTGAAGTCATTCACGGCGAGTTT
GTACTGAGTCACACGTCTCTAACTCGCCCTGGGGAGGCGAAGAAGAAACCCAACAATGAG
GTTTCTCCAGGTGCTTCTCTTTCTCCACCTCTTTCAGAAACTCTCTGCTCAGTCTCCTCC
CACCAATAATGCGACTTCTCTCGACGCCCTTCTCCAAGATTACTCCTTTAGAGCCTTCGT
TCGTCGTCCTCGCACCGGCATTCTCTACAACGCCACCACCGTTCCTTCCGATTTAACCGG
GATCAAACTCTCCGCCGTGAGACTCAGAAGCGGAAGCTTGAGAAAACACGGAGTAACTTC
TCTCAAAGAGTTCTCAATTCCGAAAGGCGTAATCGTGAAGCCGTACGTTACAAGGCTCGT
TCTTGTTTATCAGAACTTAGCTAACTACTCTCGCTTGTATTACCCTCTCTCTGGTTACGA
CTACGTCGCTCCCGTGCTGGGTCTCCTCGCTTACGACGCTAAGAATCTCTCCGCCGTTAA
CTTGCCGGAGCTCGAGTTAACGGCGTCGAATGATCCCATTAGGATTGGTTTCACTGATCT
CGAACGTATCCCGCAAGGGTCTAGCGCTAAGTGCGTTAGTTTTGATTCGCGAGGGAAAGC
GAGTTTTAAGGACTCGGTTCAGCCTGGGAACACGTGTGAGACTGATCGTCAGGGGCATTT
CTCAGTGGTGGTGAAGTCTGTGGCGTCTGCTCCGTCACCAAGCGAGGGAAGGACGAAGAA
GAAGAAGAAGGAGAGCTCTGAGGATAGTTCAAGGACTTGGATCATTGTTGGATCAGTGGT
TGGTGGGCTGATACTTTTGGGGCTGTTGGTGTTTATTGTTTTGAGGTGTCGGAGTTACAA
GAAGGAGGAGAAGATTAGGGAGATGGAGAGAGCTGGAGAGACAGGGGAAGCTCTTAGGAT
GACTCAGGTCGGAGAGACAAGAGCACCGACGGCTACTACTACTCGTACACAACCAATGCT
TGAAACTGAATACGCAGCTTAGATTTGATTGTGTGTTTGTGTACATCATCATTAGCTTCA
GCTTTGATCCATCTGTTACTGGCTTCTGGTAAAGTGTTTTTTTGATTTTTTTTTTTAGTT
GTGGTTAGCAAGTTGATACGCACATTCATCTTGTTTCTCTACGAGAGTGATTTAAGGAAA
TAAGCATTATTGTTTCTTCTCTTTGTCCTCAACTTTGGTGGGAAGATATGGATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CC15TF U 1
AF RR4CC15JQ C 522
BS 1 706 RR4CC15TF
BS 707 707 RR4CC15JQ
BS 708 717 RR4CC15TF
BS 718 1317 RR4CC15JQ

RD RR4CC15TF 727 0 0
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TCTTGTTTATCAGAACTTAGCTAACTACTCTCGCTTGTATTACCCTCTCTCTGGTTACGA
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CGAACGTATCCCGCAAGGGTCTAGCGCTAAGTGCGTTAGTTTTGAT*CGCGAGGGAA
GCGAGTTTAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4CC15JQ 796 0 0
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GGATTGGTTTCACTGATCTCGAACGTATCCCGCAAGGGTCTAGCGCTAAGTGCGTTAGTT
TTGATTCGCGAGGGAAAGCGAGTTTTAAGGACTCGGTTCAGCCTGGGAACACGTGTGAGA
CTGATCGTCAGGGGCATTTCTCAGTGGTGGTGAAGTCTGTGGCGTCTGCTCCGTCACCAA
GCGAGGGAAGGACGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAGCTCTGAGGATAGTTCAAGGACTTGGA
TCATTGTTGGATCAGTGGTTGGTGGGCTGATACTTTTGGGGCTGTTGGTGTTTATTGTTT
TGAGGTGTCGGAGTTACAAGAAGGAGGAGAAGATTAGGGAGATGGAGAGAGCTGGAGAGA
CAGGGGAAGCTCTTAGGATGACTCAGGTCGGAGAGACAAGAGCACCGACGGCTACTACTA
CTCGTACACAACCAATGCTTGAAACTGAATACGCAGCTTAGATTTGATTGTGTGTTTGTG
TACATCATCATTAGCTTCAGCTTTGATCCATCTGTTACTGGCTTCTGGTAAAGTGTTTTT
TTGATTTTTTTTTTTAGTTGTGGTTAGCAAGTTGATACGCACATTCATCTTGTTTCTCTA
CGAGAGTGATTTAAGGAAATAAGCATTATTGTTTCTTCTCTTTGTCCTCAACTTTGGTGG
GAAGATATGGATTGTT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL6151Contig1 483 2 1 U
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TTATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGTTATGTT
TGGTTTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCCTTAATTTTAATATCATGGATTT
TCATTTCTTATAGTTTTGATTTTCTTTATTTGATTGGTTTTGCATAGGTTATCTAGTACT
GAAAAATGAAAGCTTGTAACCATCATATGTAACATTTATCTGAGACAAAATGCTTGTTCT
TCT


BQ
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20 20 20 

AF RR4DU57JQ C 1
AF RR4DU57TF U 1
BS 1 483 RR4DU57TF

RD RR4DU57JQ 483 0 0
GGACCGTGTCGCTTCCCTTTATTCAGAGATGGCCAAATCGAAGAATCACACGGCGCATAA
CCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGGATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCC
CACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGT
CAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTAAGCTTTTTAATTCTCTCTGAGAGGTTT
TTATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGTTATGTT
TGGTTTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCCTTAATTTTAATATCATGGATTT
TCATTTCTTATAGTTTTGATTTTCTTTATTTGATTGGTTTTGCATAGGTTATCTAGTACT
GAAAAATGAAAGCTTGTAACCATCATATGTAACATTTATCTGAGACAAAATGCTTGTTCT
TCT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR4DU57TF 483 0 0
GGACCGTGTCGCTTCCCTTTATTCAGAGATGGCCAAATCGAAGAATCACACGGCGCATAA
CCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGGATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCC
CACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGT
CAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTAAGCTTTTTAATTCTCTCTGAGAGGTTT
TTATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGTTATGTT
TGGTTTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCCTTAATTTTAATATCATGGATTT
TCATTTCTTATAGTTTTGATTTTCTTTATTTGATTGGTTTTGCATAGGTTATCTAGTACT
GAAAAATGAAAGCTTGTAACCATCATATGTAACATTTATCTGAGACAAAATGCTTGTTCT
TCT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL6152Contig1 1366 2 2 U
AAAAAATCGACTACTAAACTTCCTGGAAAACAGAAAAAATCCTCTTTGCCAACACATTTG
TATGTTAATACTACACGTGTTTGCTTACAGACTGTAACAGCTACATATTCCAGAGTGACT
AAGCAAATCGAGATTCAAACATTTTTAAGTGTGAATTAACTGATCATCTTAGTCCGGCTG
AAGCTGTTGGATTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTCTGGGCAAGAGACCCATCGT
AATCCCGTTTCTCAAAGGAACTATCCTGAGAGTCAGCTATCTTGTCTGCGACTCCATAGT
CAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATATTTCGGTCGCTTGATGTCCTCGTTGATCTGCTCTT
TAGTTTTACCTGTTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAATACTCAGTATTTGCATCAAGTT
CCTTGGCCTTTATCCACATGTCTATGGCAGCTCCGCTCGATCTGTTTACTTTTGGCAGAT
ATAGTTTTGTTGATGAATGTGGTTGTACGGCACGATAACCCTTTTTCCCGAAAGAAAGAA
GCATTGCTGCTTGTCCAAAAGCCATGCCACAGTTGATTGTGTATACATCTGATTTGCAAT
AAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCCAACAGTTTCCATCTTCT
CATTCTGAGTCCCAGGTGAGTTTATGTATAGATAGATGGGCTTTGCTGGGTTATCATAGT
CTAACCACATAAACTGTGCAACGAGTAACTCAGTAACTGCAGGTACGATAGGCATGCCAA
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TTGCAGATCCTCCACCGCCGCCTCCTCCACCTCTGTACATTTGGACACTCATGCTATATC
TTCTAGGATCTGCTACATTCATACCAGACATACTCCATGTCCCTCCATTGTCTAAATAAT
TTCTTCTAGACGAGATGCTTTCCTCGGTAACTTTTTCCGCTTGCCTACGGACAGGGCTAT
CCTCGGTCATGAACATATCCATTTGAGCTGGGTTAAGCCCGTAGAAGTATTGCGGTACAT
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BQ
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AF RR4AR43TF C 563
BS 1 757 RR4H843JQB
BS 758 1366 RR4AR43TF

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AAGCTGTTGGATTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTCTGGGCAAGAGACCCATCGT
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CATTCTGAGTCCCAGGTGAGTTTATGTATAGATAGATGGGCTTTGCTGGGTTATCATAGT
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QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4AR43TF 804 0 0
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TATGTATAGATAGATGGGCTTTGCTGGGTTATCATAGTCTAACCACATAAACTGTGCAAC
GAGTAACTCAGTAACTGCAGGTACGATAGGCATGCCAAGATAGCAAATCCTAGCATCCAA
GAGCAAAGAAGGCAAATCTGGAGGAGCAGTTCTTGGTCTTGCAGATCCTCCACCGCCGCC
TCCTCCACCTCTGTACATTTGGACACTCATGCTATATCTTCTAGGATCTGCTACATTCAT
ACCAGACATACTCCATGTCCCTCCATTGTCTAAATAATTTCTTCTAGACGAGATGCTTTC
CTCGGTAACTTTTTCCGCTTGCCTACGGACAGGGCTATCCTCGGTCATGAACATATCCAT
TTGAGCTGGGTTAAGCCCGTAGAAGTATTGCGGTACATTCTTGAAGTTTTGCATCACTCC
GTCTTTGAGATTGTCTCCTTGAAACTGCTTGGGGATGTGGTCAAAGCTCATGTTTTTAGC
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TTTGGCAACCGATGAAGAAGGTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

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CCGATTTGGGTTCGTTTTTAAAGAGACAAATATTGAATCTGTACGTACTGAATCTACGCA
ATTGCAAGTTGTTGGTACACGTTTTTAACATACATTATTGATTGAATGTTAAATTTCGAA
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GAACCTCTAACACACTAGTGATGCGACCAAAGAGGCTTTTATGCATCAGTTCAGTCTCCA
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GAGGGACAATTCAATTCATCTGAACAGCAGAGTCTCTTTTTTTTTGGGCAAAGAACAGCA
GTTTCTTATTACATTGAAAAATCATATGTGAACATCTTGGTTTTAAGACTGAGATTTTTT
TTGCAGGTGATACAAAGGCACCAGTTTCAGCAATGATAGCAGAGTGATAGTGGTTAGCTC
TTCATGAGAGACAAGTCATCTGTTTGAGATTAATCCCGAAAAAGAGGGGCAAGAACAACA
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GGGGTTGAAGAGGAGTTGCATAAGGTGGTGGTGGTTTTGGTTTAGTGTTCTTCACCACAA
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TTTTAAATGTAAATAGCAGTATAGTCTATTTTCTTTACAGATTGGCCCCATTACATTGAT
TCATGAACTGCATATTCTTTGCATGTAAACATAATAAGAAACAAAAAAAAGTTTTTGCC


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AF RR4E820TF U 1
AF RR4E820JQ C 577
BS 1 666 RR4E820TF
BS 667 667 RR4E820JQ
BS 668 750 RR4E820TF
BS 751 751 RR4E820JQ
BS 752 762 RR4E820TF
BS 763 763 RR4E820JQ
BS 764 786 RR4E820TF
BS 787 1079 RR4E820JQ

RD RR4E820TF 786 0 0
GGGGTCTTCTTCTTCCACACCCCCTCGACGAAGCCGTCTGATTCATCTGTTCTTCGAGAA
TCATCTCCGACAACATCTTCTTCGATCTTCTCCGTCGGATTCTTCTCCGTCGAAGACATC
TCCTCTCTAAGTCGCTGTCACCTCCTCCTCAAGTCGCTGTCTTACAAGAAATGCCTAGGG
CCGATTTGGGTTCGTTTTTAAAGAGACAAATATTGAATCTGTACGTACTGAATCTACGCA
ATTGCAAGTTGTTGGTACACGTTTTTAACATACATTATTGATTGAATGTTAAATTTCGAA
AACCCTAAATCCCAATTTCAACATCCTTTGATTTTGTTTCGTTTTTTTTCTCCAGAACTT
TGGTTATGCTAATAGTAAGACTTTTTTCTGTAGAGAAGAAAGTAGCTTGTGAAATGCCAA
GAACCTCTAACACACTAGTGATGCGACCAAAGAGGCTTTTATGCATCAGTTCAGTCTCCA
TCGTGGTTATACTTATGCTGTAAGCAGAGCTCTTCACTTTGATAGTAGTTAGCACTTTAA
GAGGGACAATTCAATTCATCTGAACAGCAGAGTCTCTTTTTTTTTGGGCAAAGAACAGCA
GTTTCTTATTACATTGAAAAATCATATGTGAACATCTTGGTTTTAAGACTGAGATTTTTT
TTGCAG*TGATACAAAGGCACCAGTTTCAGCAATGATAGCAGAGTGATAGTGGTTAGCTC
TTCATGAGAGACAAGTCATCTGTTTGAGAT*AATCCCGAAAA*GAGGGGCAAGAACAACA
GATTTC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4E820JQ 503 0 0
TTTTTTTTTGGGCAAAGAACAGCAGTTTCTTATTACATTGAAAAATCATATGTGAACATC
TTGGTTTTAAGACTGAGATTTTTTTTGCAGGTGATACAAAGGCACCAGTTTCAGCAATGA
TAGCAGAGTGATAGTGGTTAGCTCTTCATGAGAGACAAGTCATCTGTTTGAGATTAATCC
CGAAAAAGAGGGGCAAGAACAACAGATTTCGTAGGAAGAGCCTCTCAAACGATTGAAGCA
AGAACAACAGATTTCGTCCAGTCTGGGGTTGAAGAGGAGTTGCATAAGGTGGTGGTGGTT
TTGGTTTAGTGTTCTTCACCACAAACTCAACTTCAAGTTCAGCAAAACAACTATGGAAAA
TTATGAAAAGAAAATTGACATAGATTTTAAATGTAAATAGCAGTATAGTCTATTTTCTTT
ACAGATTGGCCCCATTACATTGATTCATGAACTGCATATTCTTTGCATGTAAACATAATA
AGAAACAAAAAAAAGTTTTTGCC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL6154Contig1 826 2 5 U
GGATTTGCAAGAGAATCAGCTAGGGAGTTCATGTTTCTTGGAATAAAAGAAAAGACAATG
AAATCAAAAGAGAGGGATAGATGCTCGATGTCCCGGGTGATTCCGTAGAGATCCGTCGGG
TAGTTCTTCGAGGTAATACTAGCAACGAGTGCTTGAAAATCTGATTTGATACAGATTCTT
GAGTAGCCGGCTGTCCGTGCGTGTAAGAGAGCCGATCTTATGGCGAGTCCTTCTGCCATC
TGAGGAGTCGAGGTGTGCTCAAATATGGAGGTTCCTTGGTCTAGTCGTTCCCCTTGAAGT
GTGAAGAAGATCCATCCACACCCTGCGCGCTGGGTTGTAGCTTGCCAAGCTGCATCAATG
AAACAAACAAGGGTATCAGGAGGCAAAGGATCAAGCAAACCATGTGATGGAGGCGGTCGT
TGTTGTGCAATATTTGCTTGCGCCATGGTCCACTCTTGGGCATCTCTGATTGACTTTGTG
ATGAGCTCTGCTGGCGTAGTTACTCTGTTTTCAAAGACAATTAGGTTCCTTGCTATCCAG
AGTCCCCATATTATCCATGGGAATATGTTCCCTGTTACTCCGAGAGGAGGTAAGTTTTTC
AGCTGGATTGTCAAGAGTAAAGCTTCGCCGAAGGAGGCGCAGTCTGATGGCTTGAAGTCC
GTGGTCCATAGATGAATGAGATCCCATACTTGTCTAGCAAAGTTGCAGTGGAGAAAGACG
AGGTTGGCAGTTTCCAATTCTCCGCAGTGCTTACATGTAATGTTGGCAGTGAGGCTTCTT
TTTGCCAGATTTTCCCCTAATGCAAGAGCTCCTTTTATGATCTTCC


BQ
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AF RR4CN86TF U 213
AF RR4CN85JQ C 1
BS 1 212 RR4CN85JQ
BS 213 308 RR4CN86TF
BS 309 309 RR4CN85JQ
BS 310 384 RR4CN86TF
BS 385 826 RR4CN85JQ

RD RR4CN86TF 172 0 0
CGATCTTATGGCGAGTCCTTCTGCCATCTGAGGAGTCGAGGTGTGCTCAAATATGGAGGT
TCCTTGGTCTAGTCGTTCCCCTTGAAGTGTGAAGAATATCCATCCACACCCTGCGCGCTG
GGTTGTAGCTTGCCAAGCTGCATCAATGAAACAAACAAGGGTATCAGGAGGC

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR4CN85JQ 826 0 0
GGATTTGCAAGAGAATCAGCTAGGGAGTTCATGTTTCTTGGAATAAAAGAAAAGACAATG
AAATCAAAAGAGAGGGATAGATGCTCGATGTCCCGGGTGATTCCGTAGAGATCCGTCGGG
TAGTTCTTCGAGGTAATACTAGCAACGAGTGCTTGAAAATCTGATTTGATACAGATTCTT
GAGTAGCCGGCTGTCCGTGCGTGTAAGAGAGCCGATCTTATGGCGAGTCCTTCTGCCATC
TGAGGAGTCGAGGTGTGCTCAAATATGGAGGTTCCTTGGTCTAGTCGTTCCCCTTGAAGT
GTGAAGAAGATCCATCCACACCCTGCGCGCTGGGTTGTAGCTTGCCAAGCTGCATCAATG
AAACAAACAAGGGTATCAGGAGGCAAAGGATCAAGCAAACCATGTGATGGAGGCGGTCGT
TGTTGTGCAATATTTGCTTGCGCCATGGTCCACTCTTGGGCATCTCTGATTGACTTTGTG
ATGAGCTCTGCTGGCGTAGTTACTCTGTTTTCAAAGACAATTAGGTTCCTTGCTATCCAG
AGTCCCCATATTATCCATGGGAATATGTTCCCTGTTACTCCGAGAGGAGGTAAGTTTTTC
AGCTGGATTGTCAAGAGTAAAGCTTCGCCGAAGGAGGCGCAGTCTGATGGCTTGAAGTCC
GTGGTCCATAGATGAATGAGATCCCATACTTGTCTAGCAAAGTTGCAGTGGAGAAAGACG
AGGTTGGCAGTTTCCAATTCTCCGCAGTGCTTACATGTAATGTTGGCAGTGAGGCTTCTT
TTTGCCAGATTTTCCCCTAATGCAAGAGCTCCTTTTATGATCTTCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6155Contig1 1433 2 2 U
GATACCTAAGCCTGTGGAGTTTTCTCAGTCTCTCGGTGATCATTTGCCCAAGACTCTTGT
CGAGCGGTTAACTGCTTTGAGGACGCGGATTGTTGTGATGGCGAACCAAGAAGGACCAAC
CATAACAAGAACTAGGAGGAAGACACAACATTGAGGTTCAACGCTTGCAGATCTCCATCA
AGCTTTGGAAGATTATCTACCTGTTCTATTAGGATTAACTAAAGATGGTAGCCAATTACA
GTTCAAAGTACAGTTTAACTGGATAAATCAGGAGGATGAGGAAGAGGAAACAGCCATGTT
AAGCGTTTGGTATGAAATATTGTCGGTTTTGCATCTAATGGCAATGCTACAAATGTCACA
AGCCAATTTGCTGCTGCTTCCTAGAGGTTCTACTGATGGCTACCATCCAAAAGTATCCGA
AGAAAACAGACGAGCTTCAATTGATATCTTCTTAAAGGCAGCTGGATATCTTGACTGCGC
TGTCAAGCATGTCCTCCCTCAGTTTTCAGCCGAGCAAAGGAGAAGTTTACCTGTTGACCT
AGCAGAAGGAGCTCTACGGGCTCTTTGCCTGCAAGCATTAGGCCAGGGTGTTGATATCCA
ACTTGGTATTGCGATTGATAGCTCAAAAGCCACTCTCGCAGTGAAGCGAAGACTTTCATG
TGAAATGGTGAAATACTGGCAGCAGGCACAGGATAACTGGATGAATCTCCCATTAGCAAA
TGGCTGGGGAGAAAAGCATATGCTCTTTGTCAAGTGGAAACATGTTGAAGCTAAAGCTGC
AGCGTACTACTACCATGGGTTGATTCTTGATGAAGGAAACACAGAGAAATCACATGGCAT
GGCGGTTGCTGCTTTACAAGCTGCAGATGAGTGTTTCAAAGAAAGTAAGAAAGCAAGTGA
GGCATTCAATGCATCTTCACCCACGTCAAGGACTCCACCGCTTTTCGGGACAATGAAGTA
CCTATCAGAGAAAATACCGAAAGAAACTTCAAGTAAAGTCAGGATAAACCGTGATCTATA
CTCATATGAGAAAATCATGGAGACGGCACCAACTCTTCCTGATTTTGCCTTGGCATTGAA
ACCTGATGAGTACCAACTCCCTTCTGTAGATGCATCATGGTCCGAAGACAGGACTAAAAA
CTCATCAAATCACATTACAGGAAACCAAAGATAGAAGCAGTGGATAGAATGAATGTTGCC
TTATAGAGTACAAAGCCACAGTGGCCGCCATATAAATACCAAATGGTATAGCTCTCTCTA
TAAACTACTCTTGTGATTCTCCAAATGTTGATAATATATGTAAGAAAAGCTCCCTTTGTG
TACAAACCTTCCAAATTGGATTTGTATAAGTTTCCAGAAATAAAAAATCAAGGGAACATG
TTGTTTGTATTCTGTATGATTGTTTAGTGCAATAAAATCATATTCTTTCTGGG


BQ
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AF RR4AY73TF U 1
AF RR4AY73JQ C 612
BS 1 813 RR4AY73TF
BS 814 1433 RR4AY73JQ

RD RR4AY73TF 813 0 0
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AGCTTTGGAAGATTATCTACCTGTTCTATTAGGATTAACTAAAGATGGTAGCCAATTACA
GTTCAAAGTACAGTTTAACTGGATAAATCAGGAGGATGAGGAAGAGGAAACAGCCATGTT
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AGCCAATTTGCTGCTGCTTCCTAGAGGTTCTACTGATGGCTACCATCCAAAAGTATCCGA
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AGCGTACTACTACCATGGGTTGATTCTTGATGA

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DS 

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AATACTGGCAGCAGGCACAGGATAACTGGATGAATCTCCCATTAGCAAATGGCTGGGGAG
AAAAGCATATGCTCTTTGTCAAGTGGAAACATGTTGAAGCTAAGGCTGCAGCGTACTACT
ACCATGGGTTGATTCTTGATGAAGGAAACACAGAGAAATCACATGGCATGGCGGTTGCTG
CTTTACAAGCTGCAGATGAGTGTTTCAAAGAAAGTAAGAAAGCAAGTGAGGCATTCAATG
CATCTTCACCCACGTCAAGGACTCCACCGCTTTTCGGGACAATGAAGTACCTATCAGAGA
AAATACCGAAAGAAACTTCAAGTAAAGTCAGGATAAACCGTGATCTATACTCATATGAGA
AAATCATGGAGACGGCACCAACTCTTCCTGATTTTGCCTTGGCATTGAAACCTGATGAGT
ACCAACTCCCTTCTGTAGATGCATCATGGTCCGAAGACAGGACTAAAAACTCATCAAATC
ACATTACAGGAAACCAAAGATAGAAGCAGTGGATAGAATGAATGTTGCCTTATAGAGTAC
AAAGCCACAGTGGCCGCCATATAAATACCAAATGGTATAGCTCTCTCTATAAACTACTCT
TGTGATTCTCCAAATGTTGATAATATATGTAAGAAAAGCTCCCTTTGTGTACAAACCTTC
CAAATTGGATTTGTATAAGTTTCCAGAAATAAAAAATCAAGGGAACATGTTGTTTGTATT
CTGTATGATTGTTTAGTGCAATAAAATCATATTCTTTCTGGG

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

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CTTCTTGGCTTCCATGTATTTCTTCTTTAATCACGGAGAAGGTGGTCCTGGGAGGTGCTT
TGCTTCGGGGAGACACGTGTGGTTATCAGATGCGGTTAACTCCGGTTCTGATTATTGTTT
CAGGTCTTTTATGGTTAAGAGAGCTGGGATCAGGACGGTTGTTATGGTTCCTACTGATGC
TGGTGTTCTCGAGCTTGGCTCTGTTTGGTCTTTGCCTGAGAATGTAGAGTTGGTTAAGTC
TGTTCAAGGTTTGTTCATGAGGAGAGTTAAGCCGCCTCCTTTGGTGGTGGTTCACAAGCT
TTTCGGACAAGAACTGAGTAGCTCGAATCAAGTGCAAGAGAATGTGAACGTGGTTGCTGT
AGAGGATAAGAATCACAAGGTGAAGAAGACTTCTTGTACACAGACAAGACCAGCGAGTTT
ATTAGCAGGAGTAGGAGGAGGAGGAGGAACGGTGTCTGTTGTGGAGGAGAAGCGACCGAG
GAAACGAGGGAGGAAGCCTGCAAACGAAGAGAAGAGGCGTTGAACCACGTGGAAGCTGAG
AGGCAGAGACGTGAGAAGCTTAACCAGAGATTCTACGCTTTAAGAGCTGTTGTGCCTAAC
ATCTCTAAAATGGACAAAGCTTCTCTTCTTGGAGACGCCATCTCTTACATCAAAGAGCTT
CAAGAGAAAGTAAAGATCATTGAAGTCGAAGCAGTTGGAACAGAGACCACTGGGGCAGAA
GAGAGTCAAGAGGTTGTTGACATTCAAGCTGCGGAAGAAGAGGTAGTGGTAAGAGTGATC
TCACCGTTGGAGTCGCATCCAGCTTCGAGAATCATACAGGCAATGAGAAACTCAGAGGTT
ACTGAGTCTAATCTTTCATTAGCTGAAGACACATTGTTTCACACTTTTGTGGTAAAGTCT
AATAATAACGGGTCTGATCCGTTGACGAAAGAGAAGCTTATAGCATCTGCTTACCCGCCA
ACCAGCTTGACACAGCACCTGCTACCACCATCTTTTACTTCACAGGTTTCTGGTGATTTG
TAGCTTTCAAGCTTCTTCTCTTGTGCAGGTATAGGAAGACTTGAGGTTCAAGTAGAAATT
AGATAAAATCCTTTTATTTGTTTTTTCTCTTTCTTAGGTGAAAGTAAATCCAATTTTCAT
ATAGTAATTTTCTAATGTTGTAATCTATTAAAGTGAAAGTAATACAGTCTTCCTGATGCC


BQ
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AF RR4EX92TF U 1
AF RR4EX92JQ C 562
BS 1 669 RR4EX92TF
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CTTCTTGGCTTCCATGTATTTCTTCTTTAATCACGGAGAAGGTGGTCCTGGGAGGTGCTT
TGCTTCGGGGAGACACGTGTGGTTATCAGATGCGGTTAACTCCGGTTCTGATTATTGTTT
CAGGTCTTTTATGGTTAAGAGAGCTGGGATCAGGACGGTTGTTATGGTTCCTACTGATGC
TGGTGTTCTCGAGCTTGGCTCTGTTTGGTCTTTGCCTGAGAATGTAGAGTTGGTTAAGTC
TGTTCAAGGTTTGTTCATGAGGAGAGTTAAGCCGCCTCCTTTGGTGGTGGTTCACAAGCT
TTTCGGACAAGAACTGAGTAGCTCGAATCAAGTGCAAGAGAATGTGAACGTGGTTGCTGT
AGAGGATAAGAATCACAAGGTGAAGAAGACTTCTTGTACACAGACAAGACCAGCGAGTTT
ATTAGCAGGAGTAGGAGGAGGAGGAGGAACGGTGTCTGTTGTGGAGGAGAAGCGACCGAG
GAAACGAGGGAGGAAGCCTGCAAACGAAGAGAAGAGGCGTTGAACCACGTGGAAGCTGAG
AGGCAGAGACGTGAGAAGCTTAACCAGAGATTCTACGCTTTAAGAGCTGTTGTGCCTAAC
ATCTCTAAA*TGGACAAAGCTTCTCTTCTTGGAGACGCCATCTCTTACATCAAAGAGCTT
CAAGAGAAAGTAA*GATCATTGAAGTCGAAGCAGTTGGA*CAGAGACCACTGGGGCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4EX92JQ 699 0 0
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AACCAGAGATTCTACGCTTTAAGAGCTGTTGTGCCTAACATCTCTAAAATGGACAAAGCT
TCTCTTCTTGGAGACGCCATCTCTTACATCAAAGAGCTTCAAGAGAAAGTAAAGATCATT
GAAGTCGAAGCAGTTGGAACAGAGACCACTGGGGCAGAAGAGAGTCAAGAGGTTGTTGAC
ATTCAAGCTGCGGAAGAAGAGGTAGTGGTAAGAGTGATCTCACCGTTGGAGTCGCATCCA
GCTTCGAGAATCATACAGGCAATGAGAAACTCAGAGGTTACTGAGTCTAATCTTTCATTA
GCTGAAGACACATTGTTTCACACTTTTGTGGTAAAGTCTAATAATAACGGGTCTGATCCG
TTGACGAAAGAGAAGCTTATAGCATCTGCTTACCCGCCAACCAGCTTGACACAGCACCTG
CTACCACCATCTTTTACTTCACAGGTTTCTGGTGATTTGTAGCTTTCAAGCTTCTTCTCT
TGTGCAGGTATAGGAAGACTTGAGGTTCAAGTAGAAATTAGATAAAATCCTTTTATTTGT
TTTTTCTCTTTCTTAGGTGAAAGTAAATCCAATTTTCATATAGTAATTTTCTAATGTTGT
AATCTATTAAAGTGAAAGTAATACAGTCTTCCTGATGCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGTTGATGGTGAAGTGGTGCCTGTTATCGTCTTCTTCCACGGTGGAAGCTTTGTGCATTC
TTCTGCGAACAGTGCTATCTACGATACTCTTTGCCGCAGGCTTGTTGGTCTGTGCGGCTC
CGTTGTTATCTCTGTGAACTATCGACGTGCGCCGGAGAATCGTTACCCTTGCGCTTATGA
TGATGGCTGGACTGCTCTCAACTGGGTCAACTCTAGATCTTGGCTTCAAAGCAAGAAAGA
CTCCAAGGTTCATATCTTCTTGGCGGGTGATAGCTCTGGGGGTAACATAGCACATAACGT
GGCGGTGAGAGCGGTTGAGTCGGGGATTGGTGTTCTGGGGAACATTTTGCTTAACCCTAT
GTTTGGAGGAACGGAGAGGACTGAATCTGAGACGCGTCTGGATGGGAAGTACTTTGTGAC
GGTCAGATACCGTGATTGGTATTGGAGAGCGTTTCTTCCGGAGGGAGAAGAGAGAGAGCA
TCCAGCGTGTAGCCCGTTTGGTCCTAGGAGCAAGAGTTTAGAAGGTTTGAGTTTCCCCAA
GAGTCTTGTCGTTGTGGCGGGTTTAGACTTGATTCAAGATTGGCAGCTGAAGTACGCGGA
AGGGCTTAAGAGTGCGGGTCAAGAGGTGAAGCTTGTTTACTTGGAGCAAGCCACCATTGG
GCTTCTACTTATTGCCTAATAACAATCACTTCCATACCGTGATGGAGGAGATAGCTGCGT
TTGTCAACGCGGAATGACAAAAGAAAACGTTCTCATTATCTTGTAGTCTCTTTTCACTAA
CAAACGGGTGAAATAAGGTGAAAAGCCCGAGATTCTCGTTTTTAGAAGCTCCTTGTAGTG
AGTCTTAAAGTGTGGCGTTTAACTACTACCACAACGGTTGGGTTGGCGTCTGCGTTTGTG
AACCGTGCGAAGCTGGATTCTGAGAGCAAAGCAGGAAGAAGAACAGCGAAGGCGGTCATG
TTTGGGTTTTTAGCGTTGTTAGCGTTTAACTAAAAAAACTACAGCTAAAGTTTTTTTTCA
GCTTGCGGTTGATAGTAACTCCGGTTATGTTACTATTATGATACTTTCCAGTATATATAT
CTTTTATCTACATAATGAACAAATATATGCTCATAGGTGGTTGT


BQ
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AF RR4EC37TF U 590
BS 1 799 RR4A072TFB
BS 800 1184 RR4EC37TF

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GGCGGTGAGAGCGGTTGAGTCGGGGATTGGTGTTCTGGGGAACATTTTGCTTAACCCTAT
GTTTGGAGGAACGGAGAGGACTGAATCTGAGACGCGTCTGGATGGGAAGTACTTTGTGAC
GGTCAGATACCGTGATTGGTATTGGAGAGCGTTTCTTCCGGAGGGAGAAGAGAGAGAGCA
TCCAGCGTGTAGCCCGTTTGGTCCTAGGAGCAAGAGTTTAGAAGGTTTGAGTTTCCCCAA
GAGTCTTGTCGTTGTGGCGGGTTTAGACTTGATTCAAGATTGGCAGCTGAAGTACGCGGA
AGGGCTTAAGAGTGCGGGTCAAGAGGTGAAGCTTGTTTACTTGGAGCAAGCCACCATTGG
GCTTCTACTTATTGCCTAATAACAATCACTTCCATACCGTGATGGAGGAGATAGCTGCGT
TTGTCAACGCGGAATGACA

QA 1 799 1 799
DS 

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TT
TTTCCCCAAGAGTCTTGTCGTTGTGGCGGGTTTAGACTTGATTCAAGATTGGCAGCTGAA
GTACGCGGAAGGGCTTAAGAGTGCGGGTCAAGAGGTGAAGCTTGTTTACTTGGAGCAAGC
CACCATTGG*CTTCTACTTATTGCCTAATAACAATCACTTCCATACCGTGATGGAGGAGA
TAGCTGCGTTTGTCAACGCGGAATGACAAAAGAAAACGTTCTCATTATCTTGTAGTCTCT
TTTCACTAACAAACGGGTGAAATAAGGTGAAAAGCCCGAGATTCTCGTTTTTAGAAGCTC
CTTGTAGTGAGTCTTAAAGTGTGGCGTTTAACTACTACCACAACGGTTGGGTTGGCGTCT
GCGTTTGTGAACCGTGCGAAGCTGGATTCTGAGAGCAAAGCAGGAAGAAGAACAGCGAAG
GCGGTCATGTTTGGGTTTTTAGCGTTGTTAGCGTTTAACTAAAAAAACTACAGCTAAAGT
TTTTTTTCAGCTTGCGGTTGATAGTAACTCCGGTTATGTTACTATTATGATACTTTCCAG
TATATATATCTTTTATCTACATAATGAACAAATATATGCTCATAGGTGGTTGT

QA 3 595 3 595
DS 



AS 1 2

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GAGACACATGTGACATGTTCATCTCCCTTAATCTCTGCAACTATCTCAGCCAATCGGCGA
CGGACTCGAAGCGACCGGAGCAAATCTCGAAACAGAATCTCCTCCTAGTAACCGTTCGGA
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CGATCCTTAAGGAGACAGTCACGGTTTCTATTGAGAGAAGGTTTTATTCATGTTTAGTTT
CTGGAAAAAGCGTTTGGGAATAGGTATGGCTGCTGCTGCACATGATTCATCATCAAGAGA
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GTTGGGTACTGTTCTGCTAGATAGGGTCAAATCAGCTGCAGCCAGCTTACACTATTTGAG
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AACTTTTCATAGTCCAGGGGAAGAAGATACGTTTCCTGGAACTAGCGAGAAGAACCAAGA
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TAAAGAGAGGGTGATTATAGGTGAGGAAGAAATTAGAAGGAAGACAGTCGAAATCGAGCA
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CAAAACAATGGAGATAATCAAGACGTTGGTTGAAGCCAGTAGAAGAGATAGGGAGGAAGC
TGTTGAGAAAGAAGAGGAGCTCCGTCGTGTGAAGACGGAGTTTGAATCACTTAGAAATTA
CGTCAATACTTCCACCAATGCTGTTGAGACACTTCGTTCATCGGAAAGGCAATTCAAAAC
TATCGAAGCAATGCTGGTTGCTAAGTCTGCACAGCTGGAAGGCGAGAAAGCGCAGAAAGA
GGTAGAAATTCAAAAGCTGATGGAGGAGAACGTGAAGCTAACCGCTCTTCTTGACAAGAA
AGAAGCTCAGATTCTGGCCTTGAATGAACAATGCAAATTCATGGCTTTGAATGCTTCAAA
CATCTGATCCTCCATCTTTCATCTCTTGGCAAAAAGACAGGATCATTCGACATAGTAGCC
GTACTTAATTTGCTACGGCCTATGTGATTTTTTATGTTTTTTATGTTTTTCAGATTTGAT
ATTCTGGTAACTCTGTAAAAATCATGGCTTTTGAATAAGCAAATAAAGTAGTCTTTGGTA
C


BQ
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10 

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CTGGAAAAAGCGTTTGGGAATAGGTATGGCTGCTGCTGCACATGATTCATCATCAAGAGA
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AACTCTGTAAAAATCATGGCTTTTGAATAAGCAAATAAAGTAGTCTTTGGTAC

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CGGTTTGCTTGAGAGTAGAAAAAAAGAGTGTTGACTGTTGACACG


BQ
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BS 767 945 RR4FH18JQ

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TGGCTCCAATTGGCCAGGGATATGGACTAACAGAGACTTGTGCTGGTGGAACCTTCTCGG
AGTTTGATGATACATCTGTTGGCCGTGTGGGTGCTCCTCTTCCTTGCTCCTTTGTTAAGC
TGATAGACTGGCCGGAAGGCGGGTACTTAATCAGTGATAAGCCAATGCCCCGTGGTGAAA
TTGTAATTGGTGGCTCAAATATTACACTTGGGTATTTCAAGAATGAAGAGAAGACCAAAG
AAGTTTACAAGGTTGATGAAAAGGGGATGAGGTGGTTCTACACAGGAGACATAGGACAGT
TTCACCCTGATGGTTGCCTTGAGATTATAGACAGAAAGAAGGATATTGTTAAACTTCAGC
ATGGGGAATATGTCTCCTTGGGCAAAGTGGAGGCTGCTCTAAGTATAAGCCCATACGTAG
AAAACATAATGGTTCATGCTGATCCGTTTTACAGTTACTGTGTGGCTCTTGTGGTTGCTG
CGCAACAAACGCTTGAAGGTTGGGCGTCAAAGCAAGGAATAGAGTCCACCAACTTCGAAG
AGCTGTGTGCTAAAGAACAGATCGTGAAAGAAGTGTATGCGTCTCTTGTTAAGGCGGCTA
AACAGTCGCGGTTGGAGAAGTTTGAGATACCAGCAAAGATCAAGTTGTTGGCGGCTCCAT
GGACGCCAGAGTCAGGGTTAGTGACAGCAGCACTAAAGCTTAAAAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4FH18JQ 744 0 0
GGTACTTAATCAGTGATAAGCCAATGCCCCGTGGTGAAATTGTAATTGGTGGCTCAAATA
TTACACTTGGGTATTTCAAGAATGAAGAGAAGACCAAAGAAGTTTACAAGGTTGATGAAA
AGGGGATGAGGTGGTTCTACACAGGAGACATAGGACAGTTTCACCCTGATGGTTGCCTTG
AGATTATAGACAGAAAGAAGGATATTGTTAAACTTCAGCATGGGGAATATGTCTCCTTGG
GCAAAGTGGAGGCTGCTCTAAGTATAAGCCCATACGTAGAAAACATAATGGTTCATGCTG
ATCCGTTTTACAGTTACTGTGTGGCTCTTGTGGTTGCTGCGCAACAAACGCTTGAAGGTT
GGGCGTCAAAGCAAGGAATAGAGTCCACCAACTTCGAAGAGCTGTGTGCTAAAGAACAGA
TCGTGAAAGAAGTGTATGCGTCTCTTGTTAAGGCGGCTAAACAGTCGCGGTTGGAGAAGT
TTGAGATACCAGCAAAGATCAAGTTGTTGGCGGCTCCATGGACGCCAGAGTCAGGGTTAG
TGACAGCAGCACTAAAGCTTAAAAGAGATGTAATTAGGAAGGAGTTCTTTGAAGATCTCA
CCAAGCTATATGCTTCCTAATCTTCTTCTTCGTCTTCTACTATCTTTTTTTTGTTAAACT
TTCTATAAACACACAACTTGTCTGTCTTGCTCTTTAGTTCGGTTTGCTTGAGAGTAGAAA
AAAAGAGTGTTGACTGTTGACACG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6161Contig1 821 2 2 U
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AGGAAAGCGAGAGTAACTGGAAGAGCTTCAAAGGCTCAAAGAGAGGATAGTATTAGAAGA
ACTGTATATGTCTCTGACATTGATCAGAGTGTGACTGAGGAAGTCTTAGCTGGTTTGTTC
AGCAGCTATGGACAAGTTGTTGATTGTCGTATCTGTGGAGATCCACATTCAGTTCTTCGC
TTTGCCTTTGTTGAGTTCTCTGATGACCATGGTGCAAGGGCTGCTTTAAGTGTAGGTGGA
ACAATGATCGGTTATTACCCAGTTAGGGTCTTACCTTAAAACTGCTATTCTTCCTGTGAA
TCCCACATCTCTCCCCAGGTCAGAAGATGAGAGGGAGATGTGTAGCAGAACCATCTACTG
CACTAATGTTGACAAGAATGCCACTGAGGATGATGTTAGAACCTTCTTTGAGTCTGCCTG
CGGTGAGGTAGCTCGCATAAGGCTTCTTGGTGACCAGCTGCATTCTACTCGTATAGCTTT
TGTTGAATTTGCCATGGCAGAGAGTGCAGTTGGGGCGCTCAACTGCAGTGGAGTAGTCTT
AGGATCGCAGCCGATAAGGGTAAGCCCTTCAAAGACACCAGTGAGACCAAGATTCAGTCG
ATCACCATCCTCAAACTAGGAGAGAAACAGAACCAACCCCAAAGAGGCTTTGTTGGTGTT
GGAGAGTGATGAAAAACATTTCGTTTTTTTCCTTGAGTAATTTTTCTTTTCAGTTATCTT
TTTTAATTGTTCTCTAATATCTAGAGCAGAGTTATATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C736TF U 1
AF RR4C736JQ C 82
BS 1 279 RR4C736TF
BS 280 821 RR4C736JQ

RD RR4C736TF 279 0 0
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AGGAAAGCGAGAGTAACTGGAAGAGCTTCAAAGGCTCAAAGAGAGGATAGTATTAGAAGA
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TTTGCCTTTGTTGAGTTCTCTGATGACCATGGTGCAAGG

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR4C736JQ 740 0 0
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GATGACCATGGTGCAAGGGCTGCTTTAAGTGTAGGTGGAACAATGATCGGTTATTACCCA
GTTAGGGTCTTACCTTAAAACTGCTATTCTTCCTGTGAATCCCACATCTCTCCCCAGGTC
AGAAGATGAGAGGGAGATGTGTAGCAGAACCATCTACTGCACTAATGTTGACAAGAATGC
CACTGAGGATGATGTTAGAACCTTCTTTGAGTCTGCCTGCGGTGAGGTAGCTCGCATAAG
GCTTCTTGGTGACCAGCTGCATTCTACTCGTATAGCTTTTGTTGAATTTGCCATGGCAGA
GAGTGCAGTTGGGGCGCTCAACTGCAGTGGAGTAGTCTTAGGATCGCAGCCGATAAGGGT
AAGCCCTTCAAAGACACCAGTGAGACCAAGATTCAGTCGATCACCATCCTCAAACTAGGA
GAGAAACAGAACCAACCCCAAAGAGGCTTTGTTGGTGTTGGAGAGTGATGAAAAACATTT
CGTTTTTTTCCTTGAGTAATTTTTCTTTTCAGTTATCTTTTTTAATTGTTCTCTAATATC
TAGAGCAGAGTTATATCTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6162Contig1 1081 2 2 U
GTAATTAGATGGATCGTGGCATTGTTTCTAGTAGCGGAGATGGAGGATCTCAGACAGCTT
TGCCTGATAAGTTGGCATTCAAAAATGTTAATAATCCTATCAAGAAGCAGACCAATGGTT
GTGACACAATCTGTGTTAAACAAGATGATGATCCATGCCATTTCTTGCGTCTCCTTTATG
AGAGTCTAATAGCAGGAGGATTAGCTGGTCTTGTTGTAGAAGCTGCTCTATACCCAATTG
ATACAATCAAAACTCGAGTCCAGGTAGCTCGAGATGGAGGGCAGATTATATGGAAAGGGT
TATACTCTGGTCTTGGTGGCAACCTTGCTGGTGTCTTACCTGCTTCTGCCTTATTTTTCG
GTGTATATGAACCAACCAAACAGAAGCTGCTGAAAGTTGTACCTGAAAAGTTTAGCGCGG
TTGCACATTTGGCTGCAGGTGCTTTAGGAGGTGCTGTTTCATCTATTGTTCGTGTACCAA
CCGAAGTTGTTAAACAGCGGATGCAAACTGGACAATTTGCTTCGGCACCTGATGCTGTTC
GACTTATTATAGCCAAAGAAGGATTCGGAGGCATGTATGCGGGATACGGATCTTTCTTGT
TGCGAGATTTGCCTTTTGACGCGCTTCAGTTTTGTGTATATGAGCAGTTACGGATCGGAT
ACAAGTTGGCTGCGAGAAGAGATCTGAATGATCCAGAGAACGCAATGCTTGGTGCAGTTG
CTGGTGCTGTCACTGGAGTTTTGACCACTCCTCTGGACGTAATCAAAACCAGGTTAATGG
TTCAGGGCGCAGGAAATCAGTATAAAGGGTTCTCGGATTGCGTTAAGACGATATTAAGAG
AAGAAGGGTCATCAGCTTTGTGGAAGGGAATGGGTCCAAGGGTATTGTGGATAGGTATTG
GAGGTTCAATTTTCTTTGGAGTACTGGAGAAGACAAAGCAGATTCTTTCAGATCGGAGCT
GCCAAAAGATTCATAAGGCTTAAACAGTTAGATTCTGAGTGAGATTCTACATCATTGATG
TTCCTGTGGAGATGTTGATTCATTACGTATCTTGCTTGATTTTAAGGCCATGTCTTCTAT
T


BQ
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10 

AF RR4ER52TF U 1
AF RR4ER52JQ C 354
BS 1 551 RR4ER52TF
BS 552 1081 RR4ER52JQ

RD RR4ER52TF 551 0 0
GTAATTAGATGGATCGTGGCATTGTTTCTAGTAGCGGAGATGGAGGATCTCAGACAGCTT
TGCCTGATAAGTTGGCATTCAAAAATGTTAATAATCCTATCAAGAAGCAGACCAATGGTT
GTGACACAATCTGTGTTAAACAAGATGATGATCCATGCCATTTCTTGCGTCTCCTTTATG
AGAGTCTAATAGCAGGAGGATTAGCTGGTCTTGTTGTAGAAGCTGCTCTATACCCAATTG
ATACAATCAAAACTCGAGTCCAGGTAGCTCGAGATGGAGGGCAGATTATATGGAAAGGGT
TATACTCTGGTCTTGGTGGCAACCTTGCTGGTGTCTTACCTGCTTCTGCCTTATTTTTCG
GTGTATATGAACCAACCAAACAGAAGCTGCTGAAAGTTGTACCTGAAAAGTTTAGCGCGG
TTGCACATTTGGCTGCAGGTGCTTTAGGAGGTGCTGTTTCATCTATTGTTCGTGTACCAA
CCGAAGTTGTTAAACAGCGGATGCAAACTGGACAATTTGCTTCGGCACCTGATGCTGTTC
GACTTATTATA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4ER52JQ 728 0 0
TTTTTCGGTGTATATGAACCAACCAAACAGAAGCTGCTGAAAGTTGTACCTGAAAAGTTT
AGCGCGGTTGCACATTTGGCTGCAGGTGCTTTAGGAGGTGCTGTTTCATCTATTGTTCGT
GTACCAACCGAAGTTGTTAAACAGCGGATGCAAACTGGACAATTTGCTTCGGCACCTGAT
GCTGTTCGACTTATTATAGCCAAAGAAGGATTCGGAGGCATGTATGCGGGATACGGATCT
TTCTTGTTGCGAGATTTGCCTTTTGACGCGCTTCAGTTTTGTGTATATGAGCAGTTACGG
ATCGGATACAAGTTGGCTGCGAGAAGAGATCTGAATGATCCAGAGAACGCAATGCTTGGT
GCAGTTGCTGGTGCTGTCACTGGAGTTTTGACCACTCCTCTGGACGTAATCAAAACCAGG
TTAATGGTTCAGGGCGCAGGAAATCAGTATAAAGGGTTCTCGGATTGCGTTAAGACGATA
TTAAGAGAAGAAGGGTCATCAGCTTTGTGGAAGGGAATGGGTCCAAGGGTATTGTGGATA
GGTATTGGAGGTTCAATTTTCTTTGGAGTACTGGAGAAGACAAAGCAGATTCTTTCAGAT
CGGAGCTGCCAAAAGATTCATAAGGCTTAAACAGTTAGATTCTGAGTGAGATTCTACATC
ATTGATGTTCCTGTGGAGATGTTGATTCATTACGTATCTTGCTTGATTTTAAGGCCATGT
CTTCTATT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6163Contig1 686 2 3 U
AATAAAACGAAACTAAAAATATCTCAGTCTCTCTTACCATGAAAAGAAGCAAAGTGGTTA
ATCAAAGCTAAAGCATTACTCGTTAAATGAGCAATAACCAAAATCCTTTCTCTAACAAAA
ACCTTAACCTTCCCATTCATGTCATCTCCTTCAAATCCGTCGGGGCACGTGTTCTCATCG
GTCAAAGCCGCACTAACCCATGTCTGAATATCACTCATGTATACCTCATAGCTCGAGCCA
CTTAGCTGACCCATCTCACCAATTGATTTCCTAAGCTCATCCAACGTGTCACCTAACTCC
TCGACGCAGTCTCTCATGGCCAAAACTTCTCTTGGCTTGAGCCGTCTACTACTCGAGAGA
CGCACCATCATTACTGATGTAGCTTTTGCCGAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGA
GCCATAAGCTTGGGGCTGGTTTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAG
AGTCTTGGATATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT
GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAGAGACGTGAGG
AAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAAAATATATGTTATGAGCTTTA
TGACAATGTTATGATATATGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CS95JQ U 31
AF RR4CS95TF C 1
BS 1 30 RR4CS95TF
BS 31 353 RR4CS95JQ
BS 354 686 RR4CS95TF

RD RR4CS95JQ 323 0 0
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GCAATAACCAAAATCCTTTCTCTAACAAAAACCTTAACCTTCCCATTCATGTCATCTCCT
TCAAATCCGTCGGGGCACGTGTTCTCATCGGTCAAAGCCGCACTAACCCATGTCTGAATA
TCACTCATGTATACCTCATAGCTCGAGCCACTTAGCTGACCCATCTCACCAATTGATTTC
CTAAGCTCATCCAACGTGTCACCTAACTCCTCGACGCAGTCTCTCATGGCCAAAACTTCT
CTTGGCTTGAGCCGTCTACTACT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4CS95TF 686 0 0
AATAAAACGAAACTAAAAATATCTCAGTCTCTCTTACCATGAAGAGAAGCAAAGTGGTTA
ATCAAAGCTAAAGCATTACTCGTTAAATGAGCAATAACCAAAATCCTTTCTCTAACAAAA
ACCTTAACCTTCCCATTCATGTCATCTCCTTCAAATCCGTCGGTGCACGTGTTCTCATCG
GTCAGAGCCGCACTAACCCATGTCTGAATATCACTCATGTATACCTCATAGCTCGAGCCA
CTTAGCTGACCCATCTCACCAATTGATTTCCTAAGCTCATCCAACGTGTCACCTAACTCC
TCGACGCAGTCTCTCATGGCCGAGACTTCTCTTGGCTTGAGCCGTCTACTACTCGAGAGA
CGCACCATCATTACTGATGTAGCTTTTGCCGAGGCTAATGTGATGTTGAGAGCCGCGTGA
GCCATAAGCTTGGGGCTGGTTTGGATGAGACTGGCATGAGTTGAGAGTGAAGTGACACAG
AGTCTTGGATATGTTGTGACTGTGCATGATGATTTTACGAACTCTGTGTTTGTTGCTGTT
GTATGGACCGACTTGAGTGTGGTTATGGTTATGGCTACCGTTATGAGAAGAGACGTGAGG
AAGTGATGAGTAGCTCTAAAAGATTCAGCCATCTCTTTAAAATATATGTTATGAGCTTTA
TGACAATGTTATGATATATGTGTTCC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL6164Contig1 1321 2 4 U
GGACCCCTCGGTTCCATCATGGCCTTGTTCTTCTCCCCTGCTACCTCCGCTCCTTTCTTC
CTCACACTCTCCCTCGCCCTCTACTGCAGCCTCGACCCTTTCAACCACTGCGCCATCTCC
GACTTCCCAAACTTCGTAGCTCACGAGGTTGTCTCTCCACGCCCCGATCAAGTTCCATGG
GAGAGAGACTCACAGAACTCTCTCCAGAGATCCGGGATTCTGTTTCAGAACCAAGTCCAG
GGTCCTGAGAGCGTCGCCTTTGATCCTCTAGGACGCGGTCCATACACCGGCGTTGCTGAT
GGTAGGGTTTTGTTCTGGAATGGCCACAACTGGACTGACTTCTCATACACGTCAAGCAAT
AGGTCTGGGATTTGTGATCCGAAGCCTTCTGCTCTGAGTTACTTGAGGAACGAGCATATA
TGTGGGCGTCCTCTGGGACTCCGTTTCGATAAGAGAACCGGTGAGTTGTACATAGCCGAC
GCTTATATGGGACTTTTGAAAGTAGGTCCTGAAGGTGGCTTAGCAATGCCGCTTGTAACT
GAGGCTGAAGGCGTCCCGTTGGGGTTTACTAACGACCTTGACATTGATGATGATGGAACT
GTTTACTTTACTGATAGCAGTATCAATTACCAGAGAAGGAACTTTTTGCAGCTTGTCTTC
TCTGGAGACAATACTGGGAGGGTTCTTAAGTATGATCCAATAGCAAAGAAAGCTGTTGTT
CTAGTCTCAAATGTTCAGTTTCCGAACGGTGTGTCTATCAGCAAAGACGGTTCTTTCTTT
GTTTTCTGCGAGGGTGATATTGGAAGCCTGCGAAGATACTGGTTAAAAGGAGAGAAAGCT
GGAACATCAGATGTGTTTGCAATGTTACCAGGGCATCCTGATAACGTAAGGACAAACAAA
GAAGGTGAATTTTGGGTGGCGCTTCACTGCAGGCGCAACTACTACTCGTACATAATGGCA
AGATACCCTAAGCTAAGGATGTTCATACTGAGACTCCCAATCACCGCAAGAATACACTAC
ATGTTCCAGATCGGGATGCGGCCTCACGGTTTGGTGGTGAAGTATAGCCCTGAAGGGAAG
CTTGTGAAGGTATTGGAAGATAGCGAAGGAAAAGTTGTGAGATCAGTGAGTGAGGTAGAA
GAAAAAGATGGGAAGCTTTGGTTGGGGAGTGTGTTGATGAATTTTGTTGCTGTCTATGAT
CTTTGATTTTATTAAAACTTACACGTAAACAGCTTCACTGGGGTTTTTAAGTTTTAGTAC
ATCCACAGAACAGAGTTAGGCTTAGTAAGTATAAAGGCAAGTAGAATGCAGTTTTTCTAT
C


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4BC16TF U 1
AF RR4BC16JQ C 655
BS 1 769 RR4BC16TF
BS 770 770 RR4BC16JQ
BS 771 860 RR4BC16TF
BS 861 1321 RR4BC16JQ

RD RR4BC16TF 860 0 0
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CTCACACTCTCCCTCGCCCTCTACTGCAGCCTCGACCCTTTCAACCACTGCGCCATCTCC
GACTTCCCAAACTTCGTAGCTCACGAGGTTGTCTCTCCACGCCCCGATCAAGTTCCATGG
GAGAGAGACTCACAGAACTCTCTCCAGAGATCCGGGATTCTGTTTCAGAACCAAGTCCAG
GGTCCTGAGAGCGTCGCCTTTGATCCTCTAGGACGCGGTCCATACACCGGCGTTGCTGAT
GGTAGGGTTTTGTTCTGGAATGGCCACAACTGGACTGACTTCTCATACACGTCAAGCAAT
AGGTCTGGGATTTGTGATCCGAAGCCTTCTGCTCTGAGTTACTTGAGGAACGAGCATATA
TGTGGGCGTCCTCTGGGACTCCGTTTCGATAAGAGAACCGGTGAGTTGTACATAGCCGAC
GCTTATATGGGACTTTTGAAAGTAGGTCCTGAAGGTGGCTTAGCAATGCCGCTTGTAACT
GAGGCTGAAGGCGTCCCGTTGGGGTTTACTAACGACCTTGACATTGATGATGATGGAACT
GTTTACTTTACTGATAGCAGTATCAATTACCAGAGAAGGAACTTTTTGCAGCTTGTCTTC
TCTGGAGACAATACTGGGAGGGTTCTTAAGTATGATCCAATAGCAAAGAAAGCTGTTGTT
CTAGTCTCAAATGTTCAGTTTCCGAACGGTGTGTCTATCAGCAAAGACG*TTCTTTCTTT
GTTTTCTGCGAGGGTGATATTGGAAGCCTGCGAAGATACTGGTTAAAAGGAGAGAAAGCT
GGAACATCAGATGTGTTTGC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4BC16JQ 667 0 0
GTCTTCTCTGGAGACAATACTGGGAGGGTTCTTAAGTATGATCCAATAGCAAAGAAAGCT
GTTGTTCTAGTCTCAAATGTTCAGTTTCCGAACGGTGTGTCTATCAGCAAAGACGGTTCT
TTCTTTGTTTTCTGCGAGGGTGATATTGGAAGCCTGCGAAGATACTGGTTAAAAGGAGAG
AAAGCTGGAACATCAGATGTGTTTGCAATGTTACCAGGGCATCCTGATAACGTAAGGACA
AACAAAGAAGGTGAATTTTGGGTGGCGCTTCACTGCAGGCGCAACTACTACTCGTACATA
ATGGCAAGATACCCTAAGCTAAGGATGTTCATACTGAGACTCCCAATCACCGCAAGAATA
CACTACATGTTCCAGATCGGGATGCGGCCTCACGGTTTGGTGGTGAAGTATAGCCCTGAA
GGGAAGCTTGTGAAGGTATTGGAAGATAGCGAAGGAAAAGTTGTGAGATCAGTGAGTGAG
GTAGAAGAAAAAGATGGGAAGCTTTGGTTGGGGAGTGTGTTGATGAATTTTGTTGCTGTC
TATGATCTTTGATTTTATTAAAACTTACACGTAAACAGCTTCACTGGGGTTTTTAAGTTT
TAGTACATCCACAGAACAGAGTTAGGCTTAGTAAGTATAAAGGCAAGTAGAATGCAGTTT
TTCTATC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL6165Contig1 754 2 3 U
GGAAAGAAGCTTCTCTTTTGATTCTCTCTGCTTTCTCTTTCTCTCTCATCTCTCATCTCT
CTCTTTCTTCATCGACTCTTGGAGCGATGGTGAAGAACATTCTGGACAATTCATCCCTCG
TTTCGATCCAACGCGTCAAGGAGCTCGCCGGAGATCGTTCAGATAATCTCACATTCCACC
AGGTGGACCTTTGCGATAAACCCGCGCTTGAGAGGCTTTTCTCCCAATCCAAGTTCGATG
CAGTGATGCATTTTGCTGGACTAAAAGCAGTCGGGGAGAGCGTAGCCAAACCTCTTCTCT
ATTATAACAATAACTTGATTGGCACTATTACTCTCTTGGAAGTCATGGCCGCACACGGTT
GTAAAAAACTTGTATTTTCATCATCGGCTACTGTGTACGGCTGGCCAAAGGAGGTTCCTT
GTACTGAAGAGTCCCCTCTCTCCGGAATGAGTCCTTATGCTAGAACTAAGCTCTTCATTG
AGGACATTTGTCGTGATGTACAACGTGGTGATCCTGAATGGAGAATCATTATGCTCAGAT
ACTTTAACCCTGTCGGTGCTCACCCTAGCGGTCGCATTGGTGAGGATCCTTGTGGCACTC
CTAATAACCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTCGTTGTTGGCAGCTTCCTAACCTCAAGAT
TTATGGAACCGACTATACCACTAAAGATGGCACCGGTGTACGAGATTATATTCATGTTGT
TGATCTAGCCGATGGCCATATATCTGCGCTTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DY22TF U 159
AF RR4FF65TF U 1
BS 1 321 RR4FF65TF
BS 322 322 RR4DY22TF
BS 323 754 RR4FF65TF

RD RR4DY22TF 210 0 0
G
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TCTCCCAATCCGAGTTCGATGCAGTGATGCATTTTGCTGGACTAAAAGCAGTCGGGGAGA
GCGTAGCCAAACCTCTTCTCTATTATAACAATAACTTGATTGGCACTATTACTCTCTTGG
AAGTCATGGCCGCACGCGGTTGTAAAAAA

QA 2 210 2 210
DS 

RD RR4FF65TF 754 0 0
GGAAAGAAGCTTCTCTTTTGATTCTCTCTGCTTTCTCTTTCTCTCTCATCTCTCATCTCT
CTCTTTCTTCATCGACTCTTGGAGCGATGGTGAAGAACATTCTGGACAATTCATCCCTCG
TTTCGATCCAACGCGTCAAGGAGCTCGCCGGAGATCGTTCAGATAATCTCACATTCCACC
AGGTGGACCTTTGCGATAAACCCGCGCTTGAGAGGCTTTTCTCCCAATCCAAGTTCGATG
CAGTGATGCATTTTGCTGGACTAAAAGCAGTCGGGGAGAGCGTAGCCAAACCTCTTCTCT
ATTATAACAATAACTTGATTGTCACTATTACTCTCTTGGAAGTCATGGCCGCACACGGTT
GTAAAAAACTTGTATTTTCATCATCGGCTACTGTGTACGGCTGGCCAAAGGAGGTTCCTT
GTACTGAAGAGTCCCCTCTCTCCGGAATGAGTCCTTATGCTAGAACTAAGCTCTTCATTG
AGGACATTTGTCGTGATGTACAACGTGGTGATCCTGAATGGAGAATCATTATGCTCAGAT
ACTTTAACCCTGTCGGTGCTCACCCTAGCGGTCGCATTGGTGAGGATCCTTGTGGCACTC
CTAATAACCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTCGTTGTTGGCAGCTTCCTAACCTCAAGAT
TTATGGAACCGACTATACCACTAAAGATGGCACCGGTGTACGAGATTATATTCATGTTGT
TGATCTAGCCGATGGCCATATATCTGCGCTTCAA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6167Contig1 745 2 1 U
GGAACTTCAAACAATGTGCAGGCAAACGGGACCAACTCCTTCAATCCAGCTCCTCAAAGC
TGGGAGCATATATTGCATAATGCGAACTTGGATGACTTCACAGTGAATGGTTTCGAACCA
TGGGATGTTGATGCTGACCTTATCGATGTTCTGCCACAGGCTGTCAGGCCTGATACCTAC
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TCAGTGCTCAACTCCGAGATGCAAAGGACAGAAAGCTGCATGACCAGAGGTGATCCAGAA
GCTCCAATCAGGACAAAGCTGAGATGCCTCCAGGTCCAAGACCAGATATTGACGACGCAA
ATATTGATTCTCAGGAAACATTGAAAGAGTTGGTGAATTGGAAAGCCAAAGCGGAGCAGC
AGCTAATGGAAATGTCAGACGTTGTCCGTGTCTGCAGGGATAGAGTCAGAAACACACACT
AGGCACATGAATTGATGGATTCACTTACATAGATTCCCTTGGGACTTGTACAGGGTTTCT
GGTTAAAAGAAAAAGGAAAAACAAAGAGAGTAGAGATCAAATAGTCATCTGGAAAGTTTA
TTTAGGAAGAAGAGGTAGAGAAGTGATCCTCTCTACATGAAAAGTGATATTTGAAGGTAG
AGACGCTTTTTTTAAACAGTAGTTGGTTTTGCTGTATATTCTCTCTGACTAACGACTCTC
TTATTCAACAACCAAGTTTTGGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AM87JQ C 1
AF RR4AM87TF U 1
BS 1 745 RR4AM87TF

RD RR4AM87JQ 745 0 0
GGAACTTCAAACAATGTGCAGGCAAACGGGACCAACTCCTTCAATCCAGCTCCTCAAAGC
TGGGAGCATATATTGCATAATGCGAACTTGGATGACTTCACAGTGAATGGTTTCGAACCA
TGGGATGTTGATGCTGACCTTATCGATGTTCTGCCACAGGCTGTCAGGCCTGATACCTAC
TCGCTTCCACCAAATGCTCGCAAAAGCTCTTTCCAAGACCATATGTGGTTTGAGGAGCAG
TCAGTGCTCAACTCCGAGATGCAAAGGACAGAAAGCTGCATGACCAGAGGTGATCCAGAA
GCTCCAATCAGGACAAAGCTGAGATGCCTCCAGGTCCAAGACCAGATATTGACGACGCAA
ATATTGATTCTCAGGAAACATTGAAAGAGTTGGTGAATTGGAAAGCCAAAGCGGAGCAGC
AGCTAATGGAAATGTCAGACGTTGTCCGTGTCTGCAGGGATAGAGTCAGAAACACACACT
AGGCACATGAATTGATGGATTCACTTACATAGATTCCCTTGGGACTTGTACAGGGTTTCT
GGTTAAAAGAAAAAGGAAAAACAAAGAGAGTAGAGATCAAATAGTCATCTGGAAAGTTTA
TTTAGGAAGAAGAGGTAGAGAAGTGATCCTCTCTACATGAAAAGTGATATTTGAAGGTAG
AGACGCTTTTTTTAAACAGTAGTTGGTTTTGCTGTATATTCTCTCTGACTAACGACTCTC
TTATTCAACAACCAAGTTTTGGATT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4AM87TF 745 0 0
GGAACTTCAAACAATGTGCAGGCAAACGGGACCAACTCCTTCAATCCAGCTCCTCAAAGC
TGGGAGCATATATTGCATAATGCGAACTTGGATGACTTCACAGTGAATGGTTTCGAACCA
TGGGATGTTGATGCTGACCTTATCGATGTTCTGCCACAGGCTGTCAGGCCTGATACCTAC
TCGCTTCCACCAAATGCTCGCAAAAGCTCTTTCCAAGACCATATGTGGTTTGAGGAGCAG
TCAGTGCTCAACTCCGAGATGCAAAGGACAGAAAGCTGCATGACCAGAGGTGATCCAGAA
GCTCCAATCAGGACAAAGCTGAGATGCCTCCAGGTCCAAGACCAGATATTGACGACGCAA
ATATTGATTCTCAGGAAACATTGAAAGAGTTGGTGAATTGGAAAGCCAAAGCGGAGCAGC
AGCTAATGGAAATGTCAGACGTTGTCCGTGTCTGCAGGGATAGAGTCAGAAACACACACT
AGGCACATGAATTGATGGATTCACTTACATAGATTCCCTTGGGACTTGTACAGGGTTTCT
GGTTAAAAGAAAAAGGAAAAACAAAGAGAGTAGAGATCAAATAGTCATCTGGAAAGTTTA
TTTAGGAAGAAGAGGTAGAGAAGTGATCCTCTCTACATGAAAAGTGATATTTGAAGGTAG
AGACGCTTTTTTTAAACAGTAGTTGGTTTTGCTGTATATTCTCTCTGACTAACGACTCTC
TTATTCAACAACCAAGTTTTGGATT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATAAAAAAAAAAGAGAAGACTTTTTTTCTGAAGAATGAAAGCAGAGCTAAACTTACCAGC
AGGATTCCGATTCCATCCAACGGACGAAGAGCTTGTGAATTTCTACCTTTGCCGGAAATG
CGCGTCGGAGCAGATCTCAGCTCCGGTTATCGCCGAAATCGATCTCTACAAGTTCAATCC
TTGGGAGCTTCCAGATAAGTCTCTGTACGGAGAGAAAGAGTGGTACTTCTTCTCGCCCCG
AGACAGGAAATACCCAAACGGTTCGCGTCCTAACCGGGCAGCAGGTTCCGGTTATTGGAA
GCCACCGGAGCTGATAAACCGATCGGTAAACCGAAGACGTTGGGTATAAAGAAAGCACCG
TCTTCTACGCTGGGAAAGCTCCGAAAGGGGTTAAAACGAATTGGATTATGCACGAGTATC
GTCTCGCTAATGTCGACAGATCGGCTTCTGTTCACAAAAAGAACAACCTACGACTTGATG
ATTGGGTGTTATGTCGAATATACAACAAGAAAGGAACCATGGAGAAATACTACCCTACGG
ATGAGAAGCCAAGGACTATCACTGATCACTCGTCATCCCCTTTTGATACGTCGGTCTCGA
GTTACCCGACACTGCAAGAGGATGATTCGAGCAGCTCGGGGGGTCGCGTGGTGTCACCGG
ATGCACGGGAGGTTCAGAGCGAGCCTAAGTGGGGAGAGCTTGAGAACGCTTTTGATACTT
CCATGTTTGGTGGTGGTTCCATGGACTTGTTGCAGCAGAGTGAAGCTGCTTTTGTCCCTC
AGTTCTTGTACCAGCCTTTTACTGATTATTTCAACTCCTGGCAGGACACGCAAGAGCAGA
AACCGTTCTTGAATTGGAGTTTTGGTCCACAGGGGTGAAAAAGGAAGAGAGTACAAGGTT
TTTGGTCTGTGTGGTGGTGATGTGTTAGAGAGGAGTTCTCAATCTTCTTTGTTTCTTAGT
AGTGAGAAAAAGATTGTAGAGTGTTAATAGTTTCTTAGCGTCATCAACGTTTCATTGGTA
GGCAAATTCTTGTTATTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F076TF U 1
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ATG

QA 1 723 1 723
DS 

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TTGATACTTCCATGTTTGGTGGTGGTTCCATGGACTTGTTGCAGCAGAGTGAAGCTGCTT
TTGTCCCTCAGTTCTTGTACCAGCCTTTTACTGATTATTTCAACTCCTGGCAGGACACGC
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TCATTGGTAGGCAAATTCTTGTTATTTCA

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

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TCACGGGGAAGAAGAGATGAGAAGCTTTATATTCGATTCAGATACATAACTGAATCGATT
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AGATCGACGGCATGAACCGGCAGAGATACGGCACCGCCTCTTGCATCTCAGTTCTCGATG
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TGTAATAGTATGTCTTTTGGGCTTCGTTTAATCAAACGAAAAGTTGAC


BQ
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BS 561 888 RR4E843JQ

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TCACGGGGAAGAAGAGATGAGAAGCTTTATATTCGATTCAGATACATAACTGAATCGATT
TTTTTTGGTTGTAGATATTTTCGATCTCAGAATCGATTTGTCTTCGCATGGCGATATTTC
TTTTTCGCTTTGGCGATTTCTGGGTTTTCGCTTGGCGATTTTTGTAGTGTTATCAGCTCA
AAATCAAACTTTTCTTCAAGGATGTGTTTTCTTTCTTTGGTTTTGGGTTGAGTTTAATAA
ACATCTGCTCTCTTCCTTCGGTTTTAAACTTGTTTTACCCGTTTTGATCTAGAGGTTTGT
TTTTCTCTTATTGTTAGTAAAGCTTGTCTCTTGATTTTGATTTGAAATCAATCTTCGTTA
TGTCAAGCGAAGTATCCAAGATGGTCAAGGTACGAGATTTGGATAATCCTTTGATGAATC
GACGCAGAGCTTAGAGAAATTGGAGCTACCTATAGGCAGTGTTCCGACAAGGTTCTGTTC
TCGTTTTCTACCGAAGCTTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4E843JQ 520 0 0
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GAAGTATCCAAGATGGTCAAGGTACGAGATTTGGATAATCCTTTGATGAATCGACGCAGA
GCTTAGAGAAATTGGAGCTACCTATAGGCAGTGTTCCGACAAGGTTCTGTTCTCGTTTTC
TACCGAAGCTTTCCCTGGATCAAATTCTACCAATTGGAGAAGGAAACCTTGGTGATTGAC
GGTGATTGGAGGATTGATGAGCAAACAAACAGCTTCAAACGAACGGAGATGGAGATCGAC
GGCATGAACCGGCAGAGATACGGCACCGCCTCTTGCATCTCAGTTCTCGATGTAATAGAA
CCAGGGTTAAACACGTGTTACGCTTTGTGTCACGCTTACAGAGATGTTAATCTCTTTGTC
TTGGGTTCTATTTGGACTTTTTAGAATTTTGTAATCAAAGTTTGGATCTGCTTGTAATAG
TATGTCTTTTGGGCTTCGTTTAATCAAACGAAAAGTTGAC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL6171Contig1 1077 2 4 U
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AATGGCCAAAGCTTTCATTACCACTAGCACGGGTTTGTCTCTCGAATAGCATGTATTTAC
TCAATGTGTCTCTCACTACTGACTCTAAATCTGATCTTGAGTCACCATTATCCGTGATGA
TAAATGAGACCAAGGAGGCATCATGGTCTGATCATGGCGAAACTAATACCAACTCAGAAT
TGAAGGAGGCAAAAGGAGGAATGAACCAGGACATAATTCAAAACTCTCTCTCCGCATACA
AGGATATCCGTAGAAGGGAGAATCATTTGCTCAAACAGGCTCTTCTTGCCAATATGGCTT
ACGTAGAATTGGAGTTGGAGAATCCTATCAAAGCCTTGTCAGCTGCTAATTCACTCCTGC
AACTTCCAGATTGTTCAAAGATATATGTTTTCTTAGGCCATATTTACGCAGCGGAGGCTC
TCTGCTTGCTCAACAGACCCGGTGAAGCTGGTTCGCATTTATCTGCCTATCTACTCGGGC
AGGAAGATTTTAAACTACCATTTGCGCAAGAAGGCTTTGACCCGTGGCGGATGAACATGA
GTTCCGACTGTGAGGAGGCATCGGATTGTTCCACAGGAAATGCCCGGGTTTCACTCAAGC
CAGAAGAAGCTCGTGGAGCACTTTTTGCAAACCTTTCCGCCCTCTTTGCAACACAAGGGC
ATTATGACCAGGCCAAATCTTTCATTCAACACGCTTTAACTGTCTTACCGAACAATGTAC
AAGCTACGATTACAGCGGTCTACATCGATCTCATGGTGGGTAGGTCACAAGATGCCGTTG
CTCGGTTAAAACAGCGTACCCGTGTGAGCTTTGTCCCTGGCAGATTGGGAGTGAGAGCCT
CGTGAATGGTTTGTACTCTGTTCTTTAAAACCAAGCTTCAGAAGTTAGTTCCTTCTATAA
ATATCAGAGAATTACTCCTTTTTTTTATTACTTCCTGTATTGGTGCTGTGAGATGTGTTT
GCATTCTTGACTTAGATTTGGGTTGTAGACTGGGAGAACTAAACACAGGTTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET36TF U 1
AF RR4ET36JQ C 416
BS 1 573 RR4ET36TF
BS 574 574 RR4ET36JQ
BS 575 611 RR4ET36TF
BS 612 1077 RR4ET36JQ

RD RR4ET36TF 611 0 0
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AATGGCCAAAGCTTTCATTACCACTAGCACGGGTTTGTCTCTCGAATAGCATGTATTTAC
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TAAATGAGACCAAGGAGGCATCATGGTCTGATCATGGCGAAACTAATACCAACTCAGAAT
TGAAGGAGGCAAAAGGAGGAATGAACCAGGACATAATTCAAAACTCTCTCTCCGCATACA
AGGATATCCGTAGAAGGGAGAATCATTTGCTCAAACAGGCTCTTCTTGCCAATATGGCTT
ACGTAGAATTGGAGTTGGAGAATCCTATCAAAGCCTTGTCAGCTGCTAATTCACTCCTGC
AACTTCCAGATTGTTCAAAGATATATGTTTTCTTAGGCCATATTTACGCAGCGGAGGCTC
TCTGCTTGCTCAACAGACCCGGTGAAGCTGGTTCGCATTTATCTGCCTATCTACTCGGGC
AGGAAGATTTTAAACTACCATTTGCGCAAGAAG*CTTTGACCCGTGGCGGATGAACATGA
GTTCCGACTGT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4ET36JQ 662 0 0
CCTGCAACTTCCAGATTGTTCAAAGATATATGTTTTCTTAGGCCATATTTACGCAGCGGA
GGCTCTCTGCTTGCTCAACAGACCCGGTGAAGCTGGTTCGCATTTATCTGCCTATCTACT
CGGGCAGGAAGATTTTAAACTACCATTTGCGCAAGAAGGCTTTGACCCGTGGCGGATGAA
CATGAGTTCCGACTGTGAGGAGGCATCGGATTGTTCCACAGGAAATGCCCGGGTTTCACT
CAAGCCAGAAGAAGCTCGTGGAGCACTTTTTGCAAACCTTTCCGCCCTCTTTGCAACACA
AGGGCATTATGACCAGGCCAAATCTTTCATTCAACACGCTTTAACTGTCTTACCGAACAA
TGTACAAGCTACGATTACAGCGGTCTACATCGATCTCATGGTGGGTAGGTCACAAGATGC
CGTTGCTCGGTTAAAACAGCGTACCCGTGTGAGCTTTGTCCCTGGCAGATTGGGAGTGAG
AGCCTCGTGAATGGTTTGTACTCTGTTCTTTAAAACCAAGCTTCAGAAGTTAGTTCCTTC
TATAAATATCAGAGAATTACTCCTTTTTTTTATTACTTCCTGTATTGGTGCTGTGAGATG
TGTTTGCATTCTTGACTTAGATTTGGGTTGTAGACTGGGAGAACTAAACACAGGTTTTTT
GT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6172Contig1 1486 2 2 U
GGAACTCCAATCGATCGAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCCATGTTTTGATTTTG
TCTCTCCTCTCTGGGGCGAATCTGAGAATGTTATTAAGACCGAAGATGATGATAAGCTCC
TGGCTTGGCAAAGATGCGAAGAAGATTCTCAAACGCAAAGACAGCGACGCCGGCGAAAAA
GGGAAAGCACTGAGGAGTTGCGAGCATCGTTGTTCAACAGATTCCGTTCGCCGGAGACTC
CAAAGAGACAGCAGCAACAGCAACAGTCGCAGCACCGTATCTGTGGTCCAACTCTTGCTC
TCACTTTCAACTTCTTCGTTGCTATTAGCATTATCTTCATGAACAAATGGGTGCTTAAGA
ACATAGGGTTTGAGTTCCCAGTGTTCCTCACGTTCATCCACTACATTGTGGCTTATCTAC
TAATGGCTCTTCTCAAATCATTCTCCCTTCTCCCCGCTCCACCTCCTCCTTCCTCCACCA
AGTCATCGTCTCTTTCCCTCTACACTCTCGGCATTGTTATGTCACTCTCTACTGGTCTCG
CTAATGTTAGCCTCAAGTATAATAGTGTTGGATTCTACCAGATGGCGAAAATCGCTGTCA
CGCCTTCGATTGTGTTTGCAGAGTTCTTGTGGTATAGAAAGAGAGTTTCTTTCATGAAGG
TGGTTGCACTTACAGTTGTATCTGTAGGAGTTGCGGTTGCGACTGTAACAGATTTGCAGT
TTAGTCAGTTTGGTGCTTGTGTGGCTTTAGCATGGATCATACCTAGCGCTACCAACAAAA
TCTTATGGTCAAACATGCAACAACGAGAGAACTGGACCGCATTAGCGTTGATGTGGAAGA
CAACTCCAATCACTCTCTTGTTTCTTGTATCAATGATTCCCTTCTTGGATCCACCAGGCG
CTCTTTCCTTCGACTGGAGCCTTCCCAACACATCCGCCATTTTCGTCTCAGCGTTTCTCG
GATTCTTTCTTCAGTGGTCAGGAGCCTTAGCTCTCGGAGCGACTTCTGCGATCACGCACG
TTGTCCTGGGACAGTTCAAGACCTGTGTCCTCCTCCTTGGGAACTTCTACATCTTCGGGT
CGAATAGTGGTGTGGTTAGCGTTTGCGGTGCGATTGTGGCGATTATTGGGACGTCGTTGT
ATACTTACCTTAACACGAGAGGTCAGTCTCTTAAGGCTTCGTCTTCTTCTTCTTCTTTGG
ACAAGAAGTCAAGATTCAGTGAGCTTAAAGATGATGAGAAGAAACTTGAACCTTACGGCT
CTGACGCGGTTTAGTCTTAGTCTTTAACATTTCTTTTCTAGTATAGTTTTAATTGATTTT
TTTCCACGTTCACAACTTATTTAGATTCGAATTTTCAACTTTTTTGGTCTCCTTGTTTTC
TTTTGGTAGCAAGTGTTTCAATTAAAGGTTCTGTTTTCCTTTTTGTTAATTTTTGGAGAT
GTATATGTGCTGTATTCTGAAATTTTAATAATTTTTCAGACAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A849TF U 1
AF RR4A849JQ C 609
BS 1 799 RR4A849TF
BS 800 1486 RR4A849JQ

RD RR4A849TF 799 0 0
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TGGCTTGGCAAAGATGCGAAGAAGATTCTCAAACGCAAAGACAGCGACGCCGGCGAAAAA
GGGAAAGCACTGAGGAGTTGCGAGCATCGTTGTTCAACAGATTCCGTTCGCCGGAGACTC
CAAAGAGACAGCAGCAACAGCAACAGTCGCAGCACCGTATCTGTGGTCCAACTCTTGCTC
TCACTTTCAACTTCTTCGTTGCTATTAGCATTATCTTCATGAACAAATGGGTGCTTAAGA
ACATAGGGTTTGAGTTCCCAGTGTTCCTCACGTTCATCCACTACATTGTGGCTTATCTAC
TAATGGCTCTTCTCAAATCATTCTCCCTTCTCCCCGCTCCACCTCCTCCTTCCTCCACCA
AGTCATCGTCTCTTTCCCTCTACACTCTCGGCATTGTTATGTCACTCTCTACTGGTCTCG
CTAATGTTAGCCTCAAGTATAATAGTGTTGGATTCTACCAGATGGCGAAAATCGCTGTCA
CGCCTTCGATTGTGTTTGCAGAGTTCTTGTGGTATAGAAAGAGAGTTTCTTTCATGAAGG
TGGTTGCACTTACAGTTGTATCTGTAGGAGTTGCGGTTGCGACTGTAACAGATTTGCAGT
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TCTTATGGTCAAACATGCA

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DS 

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CTTACAGTTGTATCTGTAGGAGTTGCGGTTGCGACTGTAACAGATTTGCAGTTTAGTCAG
TTTGGTGCTTGTGTGGCTTTAGCATGGATCATACCTAGCGCTACCAACAAAATCTTATGG
TCAAACATGCAACAACGAGAGAACTGGACCGCATTAGCGTTGATGTGGAAGACAACTCCA
ATCACTCTCTTGTTTCTTGTATCAATGATTCCCTTCTTGGATCCACCAGGCGCTCTTTCC
TTCGACTGGAGCCTTCCCAACACATCCGCCATTTTCGTCTCAGCGTTTCTCGGATTCTTT
CTTCAGTGGTCAGGAGCCTTAGCTCTCGGAGCGACTTCTGCGATCACGCACGTTGTCCTG
GGACAGTTCAAGACCTGTGTCCTCCTCCTTGGGAACTTCTACATCTTCGGGTCGAATAGT
GGTGTGGTTAGCGTTTGCGGTGCGATTGTGGCGATTATTGGGACGTCGTTGTATACTTAC
CTTAACACGAGAGGTCAGTCTCTTAAGGCTTCGTCTTCTTCTTCTTCTTTGGACAAGAAG
TCAAGATTCAGTGAGCTTAAAGATGATGAGAAGAAACTTGAACCTTACGGCTCTGACGCG
GTTTAGTCTTAGTCTTTAACATTTCTTTTCTAGTATAGTTTTAATTGATTTTTTTCCACG
TTCACAACTTATTTAGATTCGAATTTTCAACTTTTTTGGTCTCCTTGTTTTCTTTTGGTA
GCAAGTGTTTCAATTAAAGGTTCTGTTTTCCTTTTTGTTAATTTTTGGAGATGTATATGT
GCTGTATTCTGAAATTTTAATAATTTTTCAGACAGAGG

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 2

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TTTGGGGTTTAGGGTTTCGGGTTTAAAGGTTTTCGACCACCAGGAGTCCGGGTTCTGGAG
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TCTTGATGGTAACGGTGTTATTGATCATAACTTCTTTGGTGGTCTCTGCTCTTTCATTAA
GTTCATCAAAGATATAGTTGAGAGCTCAGAGAATTGCTGTGAAAATGGGCACTAAGGGAC
TTGTGTTTTTTTCTTCAAATAAATGTCCGGTTCTTCCTTCCTTGGGGCTAACTGTGTTTG
GACATAAGACTTGTTGTTGTGTCCCTTTGAATTGTATAATTTGGTTATGCCCTACTAAAC
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BQ
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AF RR4AJ77TF U 318
AF RR4AJ77JQ C 1
BS 1 317 RR4AJ77JQ
BS 318 378 RR4AJ77TF
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BS 484 524 RR4AJ77TF
BS 525 715 RR4AJ77JQ

RD RR4AJ77TF 214 0 0
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G*AGGAGGAGGGCGCGAGTGAAGCTGGTGG*TTTCGCGCATGTTCTTGATGGTAACGGTG
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TTGAGAGCTCAGAGAATTGCTGTGAAA
TGGGCAC

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR4AJ77JQ 715 0 0
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TTTGGGGTTTAGGGTTTCGGGTTTAAAGGTTTTCGACCACCAGGAGTCCGGGTTCTGGAG
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GTTTGTCTCGTCGAACCCGCTTGCTGAGAACTCGGTGGTACCAGACTGTGCATTTGCGTC
AGAGGTTTACGGACGTACTAACGGGATCTTGGCGCAGCTGCTGGAGCTCAAGGCTTGGTT
TGAGACGCAGACGCTTTACCATTTCAACTCTTGCTCGATCTTGATGGTTTACGAGAATGA
ATCGGGTGGCGATGAGAGGAGGAGGAGGGCGCGAGTGAAGCTGGTGGATTTCGCGCATGT
TCTTGATGGTAACGGTGTTATTGATCATAACTTCTTTGGTGGTCTCTGCTCTTTCATTAA
GTTCATCAAAGATATAGTTGAGAGCTCAGAGAATTGCTGTGAAAATGGGCACTAAGGGAC
TTGTGTTTTTTTCTTCAAATAAATGTCCGGTTCTTCCTTCCTTGGGGCTAACTGTGTTTG
GACATAAGACTTGTTGTTGTGTCCCTTTGAATTGTATAATTTGGTTATGCCCTACTAAAC
CAAACCATTGTACTGTACTTCTTCATATGAGTTTTAATGAAGTTTCCATGGAAAC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6174Contig1 1128 2 4 U
GGAATGTTTGCTATCTCTTCGTTCTCTCTCTTCTCTCAAAGCAGGCTCTCTCTCTATCTT
TGGTTCTGGAGATTAAAACTGTTCGGCTACGCAAACATCATTCACGACACGAGAGATAAT
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GGAGAGGGGCTTTACCAGTGGACGAATTGACGTGTGAGGAGGTTTGTTGGTTATGTAAGA
GAAGGCCCAACTTTGACGGGTTTCACGACCCTAAATGTTCTTCTTGCATACTCATAAGCC
AGAACCAGAAGCCCGAAGAGGAAAAGTAGACAGCGATGAAACTTTTCCACCATGAAATAT
GAGGGAGAAGCCGCACTCTTGCCTTCTGATGAGCTTCTAATAATTGCTATTCTCCTCTGG
AAATAACCTGAAAGAGAGCAAGCGAGTAATGTAATATTGGTGTTAGTTCCAGAACAACCT
TTCATGAAGAAGAAGTATGGTCTTAAACAATGGATAAATTGCGTATTTCTATACCAGGAT
CTTCCATGGTGAGGTTCTGAGGCAAATAGAAATACGGACAAGAGCAAGAAAAACCATTTG
CTCCCTCCACAACATTATAGCAATGCTATTCCCACAAGAACTCAAGAGCCTGGAAAGTCT
TTGTAATTTGCTATATCATTAACTCATCACCGAGGGTTTAGATTAAAGTCCCAAAAGGGA
CAACAAAGACACATTGATCAAGTCTTTGCGATACATCAGACGCAAGAGAGACAGAGAAGT
TAAGACATGAGTAAATAGGACAGAAGAGTACCTCCTCTGTTCTCTCGTGGCTTACAAGAT
GACCTCCATGAAGATCAACCATTCTAGCAACAGGATACAGCCTCTGTGCCAGTCTTCTTG
CGTGACACATCTGAGCAATGACATCATGTCTGCATATAAACCCACCACACACTCAAGACC
GAGCACAACAACATGATTCTATTCTAACTTAACTGCATCTTTGTCACATACCTTCCATGA
ATGACTGAGACAAGGAACCCAGCAGAGCGTATCCGTTCAATCTCTGGTTTTGTGATCTTG
TGTAACCAACAAGCGTTGAGTTGTCCATCAAGCCCGTCCTTTGACTGC


BQ
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AF RR4F387TF U 1
AF RR4F387JQ C 561
BS 1 722 RR4F387TF
BS 723 723 RR4F387JQ
BS 724 757 RR4F387TF
BS 758 1128 RR4F387JQ

RD RR4F387TF 757 0 0
GGAATGTTTGCTATCTCTTCGTTCTCTCTCTTCTCTCAAAGCAGGCTCTCTCTCTATCTT
TGGTTCTGGAGATTAAAACTGTTCGGCTACGCAAACATCATTCACGACACGAGAGATAAT
ACTTTGCAGCTTTGGTTTCAGACACAGAAGCATTACCCACAAGGCATTGTTAAGCAGCGA
GGAGAGGGGCTTTACCAGTGGACGAATTGACGTGTGAGGAGGTTTGTTGGTTATGTAAGA
GAAGGCCCAACTTTGACGGGTTTCACGACCCTAAATGTTCTTCTTGCATACTCATAAGCC
AGAACCAGAAGCCCGAAGAGGAAAAGTAGACAGCGATGAAACTTTTCCACCATGAAATAT
GAGGGAGAAGCCGCACTCTTGCCTTCTGATGAGCTTCTAATAATTGCTATTCTCCTCTGG
AAATAACCTGAAAGAGAGCAAGCGAGTAATGTAATATTGGTGTTAGTTCCAGAACAACCT
TTCATGAAGAAGAAGTATGGTCTTAAACAATGGATAAATTGCGTATTTCTATACCAGGAT
CTTCCATGGTGAGGTTCTGAGGCAAATAGAAATACGGACAAGAGCAAGAAAAACCATTTG
CTCCCTCCACAACATTATAGCAATGCTATTCCCACAAGAACTCAAGAGCCTGGAAAGTCT
TTGTAATTTGCTATATCATTAACTCATCACCGAGGGTTTAGATTAAAGTCCCAAAAGGGA
CA*CAAAGACACATTGATCAAGTCTTTGCGATACATC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4F387JQ 568 0 0
GGCAAATAGAAATACGGACAAGAGCAAGAAAAACCATTTGCTCCCTCCACAACATTATAG
CAATGCTATTCCCACAAGAACTCAAGAGCCTGGAAAGTCTTTGTAATTTGCTATATCATT
AACTCATCACCGAGGGTTTAGATTAAAGTCCCAAAAGGGACAACAAAGACACATTGATCA
AGTCTTTGCGATACATCAGACGCAAGAGAGACAGAGAAGTTAAGACATGAGTAAATAGGA
CAGAAGAGTACCTCCTCTGTTCTCTCGTGGCTTACAAGATGACCTCCATGAAGATCAACC
ATTCTAGCAACAGGATACAGCCTCTGTGCCAGTCTTCTTGCGTGACACATCTGAGCAATG
ACATCATGTCTGCATATAAACCCACCACACACTCAAGACCGAGCACAACAACATGATTCT
ATTCTAACTTAACTGCATCTTTGTCACATACCTTCCATGAATGACTGAGACAAGGAACCC
AGCAGAGCGTATCCGTTCAATCTCTGGTTTTGTGATCTTGTGTAACCAACAAGCGTTGAG
TTGTCCATCAAGCCCGTCCTTTGACTGC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL6175Contig1 1030 2 4 U
GTAAGGAAGAAAGGATTGCTAGGACGTGGGGAACTACTTCTCAAGGGTTACCTTACGTGG
AAGAACACATTACTCCGTCGGGGAACTGGTTGATCGGTGGAGATTTAGAAGTTTTCCAGG
CGGTTAAGTACAACGATGGGCTTGATCATTACAGGCTGTCACCTAAACAGCTTAGGAAAG
AGTTCGACAACCGTAAAGCGGATGCTGTCTTTGCCTTCCAGCTGAGGAACCCTGTGCACA
ACGGCCACGCTCTGTTGATGAACGATACGAGGAAAAGACTTTTGGAGATGGGTTACAAGA
ACCCTGTTCTGTTGCTTCATCCTTTAGGAGGTTTCACTAAAGCTGATGATGCTCCTCTTG
ATGTTCGAATGGAACAACATAGCAAGGTTCTTGAAGATGGGGTTCTTGACCCGGAGACTA
CTATTGTCGCGATATTTCCGTCGCCGATGCACTATGCTGGTCCCACTGAAGTTCAGTGGC
ACGCCAAGGCTAGGATCAATGCAGGTGCTAATTTCTACATTGTGGGTCGTGATCCCGCGG
GAATGGGACATCCTAGTGAGAAGAGAGATCTGTATGATCCTGATCATGGAAAGAAAGTCT
TGAGCATGGCTCCTGGACTTGAGAAACTGAATATTCTTCCGTTTAGGGTTGCAGCTTATG
ATACAGTTGAGAAGAAGATGGCGTTTTTCGATCCAACCCGTGCAAAAGAGTTTCTTTTCA
TTTCTGGAACTAAGATGCGAACGTATGCAAGAACAGGGGAGAGTCCACCAGATGGGTTTA
TGTGTCCGAGTGGATGGAATGTTCTTGTCAAATATTATGAGAGCTTGCAAGAAAGTGATG
AATCGTCAAAACAACAAGCAGTTGTTTCAGCCTAAAGAATCAAACTCTTTGAGAATTGAA
GTGTCCGTGATGACTGCCTTTTGTTCCACCATTTACATGTTTTTGTCTTGTGGAAAATCA
CGAGTGTTTTTCAAAACTCAGAACCCAAATAATGTTTTTGCTGATGAGCAGAGACAAGAT
TGTTAATGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE68TF U 1
AF RR4FE68JQ C 512
BS 1 649 RR4FE68TF
BS 650 650 RR4FE68JQ
BS 651 706 RR4FE68TF
BS 707 1030 RR4FE68JQ

RD RR4FE68TF 715 0 0
GTAAGGAAGAAAGGATTGCTAGGACGTGGGGAACTACTTCTCAAGGGTTACCTTACGTGG
AAGAACACATTACTCCGTCGGGGAACTGGTTGATCGGTGGAGATTTAGAAGTTTTCCAGG
CGGTTAAGTACAACGATGGGCTTGATCATTACAGGCTGTCACCTAAACAGCTTAGGAAAG
AGTTCGACAACCGTAAAGCGGATGCTGTCTTTGCCTTCCAGCTGAGGAACCCTGTGCACA
ACGGCCACGCTCTGTTGATGAACGATACGAGGAAAAGACTTTTGGAGATGGGTTACAAGA
ACCCTGTTCTGTTGCTTCATCCTTTAGGAGGTTTCACTAAAGCTGATGATGCTCCTCTTG
ATGTTCGAATGGAACAACATAGCAAGGTTCTTGAAGATGGGGTTCTTGACCCGGAGACTA
CTATTGTCGCGATATTTCCGTCGCCGATGCACTATGCTGGTCCCACTGAAGTTCAGTGGC
ACGCCAAGGCTAGGATCAATGCAGGTGCTAATTTCTACATTGTGGGTCGTGATCCCGCGG
GAATGGGACATCCTAGTGAGAAGAGAGATCTGTATGATCCTGATCATGGAAAGAAAGTCT
TGAGCATGGCTCCTGGACTTGAGAAACTGAATATTCTTCCGTTTAGGGT*GCAGCTTATG
ATACAGTTGAGAAGAAGATGGCGTTTTTCGATCCAACCCGTGCAAA
GAGTTCTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FE68JQ 519 0 0
TTTCTACATTGTGGGTCGTGATCCCGCGGGAATGGGACATCCTAGTGAGAAGAGAGATCT
GTATGATCCTGATCATGGAAAGAAAGTCTTGAGCATGGCTCCTGGACTTGAGAAACTGAA
TATTCTTCCGTTTAGGGTTGCAGCTTATGATACAGTTGAGAAGAAGATGGCGTTTTTCGA
TCCAACCCGTGCAAAAGAGTTTCTTTTCATTTCTGGAACTAAGATGCGAACGTATGCAAG
AACAGGGGAGAGTCCACCAGATGGGTTTATGTGTCCGAGTGGATGGAATGTTCTTGTCAA
ATATTATGAGAGCTTGCAAGAAAGTGATGAATCGTCAAAACAACAAGCAGTTGTTTCAGC
CTAAAGAATCAAACTCTTTGAGAATTGAAGTGTCCGTGATGACTGCCTTTTGTTCCACCA
TTTACATGTTTTTGTCTTGTGGAAAATCACGAGTGTTTTTCAAAACTCAGAACCCAAATA
ATGTTTTTGCTGATGAGCAGAGACAAGATTGTTAATGTT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6177Contig1 976 2 4 U
GCCGGTGTCTTATATACCAAATTCACAAAATAATAGTTTTTGAATATTTCTTACATACGA
CAAGTTGAGATACAGTAGGACCAATGTACATTACCCACTGTAGAATGAGTGCAACATTTG
TAAACTTACATGAGCAACTGCCTTTATTACTGTATGTTCATTTCTTAGAGAGCATTTGAT
CTATTTGGCCGTTTTTGTTGTACATTTCTACTATCTTTTTGGAATATGAAGGCATGTGAC
TGTTGGCTCTTTCTTTTCCCCATTTCCGGTTGACGTGCAAATAGTTTCTGATGGTATGGT
AATCCAATGAGTACCGAGCAAATTCTAGACCCTTAGGACCAACCAAACTTAAGATGAATG
CTATAATGTTTCCAACAAATAGTGGCGCAGGCTGAGCAGGACCTTGGCCAAACTTAGCAG
CATCGTCAGCCTTAACGGTCTCTGTCACAAAAGGTCGCCGATCACCGCTACTGATTGTTG
GAGAGATCTCCAAAAGATTTTTTACTAAGCTTAGCATTTCTTTCCCACGCTCATTCCTCA
CTGTAATATACTGCGGATGGTCAGTCATGTTCACACCTGAATACTTTGGAACACCCATGT
AACCAATAACCAAATCCGCTAATGCATTTGTGTAATCAAAGCAGCTATAACAAGATGGAG
CTATAACATCAACTAAATCGTTTGCTGGTAGAGAGAAATAGGGAACCTCTTCAATGTGTC
CGTCAAGGTGTTTAAGTTGGACCTTGTAATCTTGCATGAACTCATAGTGGAAAACAGTCT
CTGGGTCCTTACTAGCCGCTTTAAAAAACTTGTCAAGTCCTTCCCGTGTTCCATTGTCCA
CACAATTAGTGCCTAAAACATAAAGCTTTTCAAGATTCAAATGCTGCTCCACTGATCTCA
ACGCTTGCACTTGGCAACCCACACCGCAAAAGAAAAAACGTTTCACTCCGGAAGACTCGA
TTAGTTCAAGAGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF17JQ U 1
AF RR4C747JQ U 525
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BS 699 723 RR4DF17JQ
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CTATTTGGCCGTTTTTGTTGTACATTTCTACTATCTTTTTGGAATATGAAGGCATGTGAC
TGTTGGCTCTTTCTTTTCCCCATTTCCGGTTGACGTGCAAATAGTTTCTGATGGTATGGT
AATCCAATGAGTACCGAGCAAATTCTAGACCCTTAGGACCAACCAAACTTAAGATGAATG
CTATAATGTTTCCAACAAATAGTGGCGCAGGCTGAGCAGGACCTTGGCCAAACTTAGCAG
CATCGTCAGCCTTAACGGTCTCTGTCACAAAAGGTCGCCGATCACCGCTACTGATTGTTG
GAGAGATCTCCAAAAGATTTTTTACTAAGCTTAGCATTTCTTTCCCACGCTCATTCCTCA
CTGTAATATACTGCGGATGGTCAGTCATGTTCACACCTGAATACTTTGGAACACCCATGT
AACCAATAACCAAATCCGCTAATGCATTTGTGTAATCAAAGCAGCTATAACAAGATGGAG
CTATAACATCAACTAAATCGTTTGCTGGTAGAGAGAA*TAGGGAACCTCTTCAATGTGTC
CGT

QA 1 723 1 723
DS 

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G
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TTGGAACACCCATGTAACCAATAACCAAATCCGCTAATGCATTTGTGTAATCAAAGCAGC
TATAACAAGATGGAGCTATAACATCAACTAAATCGTTTGCTGGTAGAGAGAAATAGGGAA
CCTCTTCAATGTGTCCGTCAAGGTGTTTAAGTTGGACCTTGTAATCTTGCATGAACTCAT
AGTGGAAAACAGTCTCTGGGTCCTTACTAGCCGCTTTAAAAAACTTGTCAAGTCCTTCCC
GTGTTCCATTGTCCACACAATTAGTGCCTAAAACATAAAGCTTTTCAAGATTCAAATGCT
GCTCCACTGATCTCAACGCTTGCACTTGGCAACCCACACCGCAAAAGAAAAAACGTTTCA
CTCCGGAAGACTCGATTAGTTCAAGAGTATT

QA 2 452 2 452
DS 



AS 1 2

CO CL6178Contig1 1131 2 2 U
GCCTACAGAATATTTTACTACATAAACAGATCTGGAAATGGGCGACTTACATTTAGGGAG
CTCAGAAGAGGAAACTTGATTGATGCAATGATTCATGCTGATCAAGAAGAAGATATCAAC
AAAGTGTTGAGGTACTTCTCATATGAACATTTTTATGTCATATACTGCAAGTTCTGGGAG
CTGGATACGGATCATGATTTCCTTATTGACAAAGAAAACCTTATGAGATATGGCAACCAT
GCTCTTACTTTCCGGATTGTCGACAGAATATTCTCCCAGGTTGCTAGGAAGTTTACTAGC
AAAGTTCAAGGGAAAATGGGGTATGAGGATTTTGTGTATTTCATACTTGCTGAAGAAGAT
AAATCGTCAGAGCCTAGCCTTGAATACTGGTTTAAGTGCATAGACTTGGATGGGAATGGT
ATTATTACGCGAAATGAGATGCTCTTCTTTTATGAGGAGCAGTTGCGTCGAATGGAGTGT
ATGGCGCAAGAGGCTGTTCTCTTTGAGGATATCTTATGCCAGATGATTGATATGATCGGA
CCAGAGAACGAGAGCCATATAACGGTGCATGACCTAAAGGGCTCAAAGCTCTCTGGACAC
GTCTTCAACATCCTGTTTAATCTCAACAAGTTTATGGCATTTGAAACACGGGATCCGTTC
CTCATCCGTCAGGAGCGGGAGAACCCAACATTGACAGAGTGGGACCGTTTTGCACATAGA
GAGTACATAAGGCTATCAATGGAAGAAGATGTTGGAGATGCATCCAATGGAAGTGCTGAG
GCTTGGGATGAGTCCCTGGAGGCTCCCTTCTGAGTTCACAAAAAGAAGAAAAGTCATTGC
ATCATTGGGAAAGAATCTTTGGAGCTTAACCAGAGGAAGGGAAGGGAGAGAGCTCTAATG
CTGAAACTTGAAAACCATACAAAAAGTTTTGGTTTTTCTTCAGTGTTCCTTTTTATTTCA
TATCTAAAACTTTACAGAAATTCTCTATTTATAAAATAGTCATCTAAACTCAATGGCTTG
TAATTTGCATTCACTTTGCTGATGTTTCAAGATGTGGGTTTGTTCAGTACTTTTTCATCA
TTTTTCCAGTTGTTGATACAATGTGGAAACCAATAATGCCATGTTTCCTCC


BQ
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AF RR4D482TF U 1
AF RR4D482JQ C 452
BS 1 646 RR4D482TF
BS 647 1131 RR4D482JQ

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GCCTACAGAATATTTTACTACATAAACAGATCTGGAAATGGGCGACTTACATTTAGGGAG
CTCAGAAGAGGAAACTTGATTGATGCAATGATTCATGCTGATCAAGAAGAAGATATCAAC
AAAGTGTTGAGGTACTTCTCATATGAACATTTTTATGTCATATACTGCAAGTTCTGGGAG
CTGGATACGGATCATGATTTCCTTATTGACAAAGAAAACCTTATGAGATATGGCAACCAT
GCTCTTACTTTCCGGATTGTCGACAGAATATTCTCCCAGGTTGCTAGGAAGTTTACTAGC
AAAGTTCAAGGGAAAATGGGGTATGAGGATTTTGTGTATTTCATACTTGCTGAAGAAGAT
AAATCGTCAGAGCCTAGCCTTGAATACTGGTTTAAGTGCATAGACTTGGATGGGAATGGT
ATTATTACGCGAAATGAGATGCTCTTCTTTTATGAGGAGCAGTTGCGTCGAATGGAGTGT
ATGGCGCAAGAGGCTGTTCTCTTTGAGGATATCTTATGCCAGATGATTGATATGATCGGA
CCAGAGAACGAGAGCCATATAACGGTGCATGACCTAAAGGGCTCAAAGCTCTCTGGACAC
GTCTTCAACATCCTGTTTAATCTCAACAAGTTTATGGCATTTGAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4D482JQ 680 0 0
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TCTTATGCCAGATGATTGATATGATCGGACCAGAGAACGAGAGCCATATAACGGTGCATG
ACCTAAAGGGCTCAAAGCTCTCTGGACACGTCTTCAACATCCTGTTTAATCTCAACAAGT
TTATGGCATTTGAAACACGGGATCCGTTCCTCATCCGTCAGGAGCGGGAGAACCCAACAT
TGACAGAGTGGGACCGTTTTGCACATAGAGAGTACATAAGGCTATCAATGGAAGAAGATG
TTGGAGATGCATCCAATGGAAGTGCTGAGGCTTGGGATGAGTCCCTGGAGGCTCCCTTCT
GAGTTCACAAAAAGAAGAAAAGTCATTGCATCATTGGGAAAGAATCTTTGGAGCTTAACC
AGAGGAAGGGAAGGGAGAGAGCTCTAATGCTGAAACTTGAAAACCATACAAAAAGTTTTG
GTTTTTCTTCAGTGTTCCTTTTTATTTCATATCTAAAACTTTACAGAAATTCTCTATTTA
TAAAATAGTCATCTAAACTCAATGGCTTGTAATTTGCATTCACTTTGCTGATGTTTCAAG
ATGTGGGTTTGTTCAGTACTTTTTCATCATTTTTCCAGTTGTTGATACAATGTGGAAACC
AATAATGCCATGTTTCCTCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6179Contig1 987 2 2 U
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CAACGTCTCCTAGCTATAGCCCAACGTCTCCAAGCTACAGCCCAACGTCTCCAAGTTACA
GCCCAACATCCCCGAGTTACAGTCCAACTTCACCTGCATACAGTCCAACTTCTCCTGCGT
ACAGCCCAACGTCACCTGCATACAGCCCTACCTCTCCATCTTACAGTCCAACTTCACCAT
CTTACAGTCCGACATCGCCTTCTTACAGCCCTACCTCACCCTCCTACAGTCCAACATCTC
CTTTACAGTCCTACTTCACCTGCATACAGCCCAACTTCTCCTGGCTACAGCCCTACTTCA
CCAAGCTACAGTCCAACGTCTCCTAGTTACGGTCCGACGTCTCCAAGCTACAACCCTCAG
TCTGCTAAATACAGTCCATCTCTGGCTTACTCTCCTAGCAATGCAAGACTATCACCAGCT
AGCCCTTACAGTCCTACATCTCCAAACTACAGCCCTACATCACCATCCTACTCACCCACA
TCTCCGTCGTATTCACCTTCAAGTCCAACATACAGTCCCAGCAGCCCATACAGCTCAGGA
GCAAGCCCTGACTACAGCCCAAGCGCAGGGTACTCACCAACACTTCCTGGTTATTCACCC
TCATCCACCGGTCAGTATACACCACATGAGGGAGATAAAAATGACAAGACTGGAAAAGAT
GCCAGCAAGGATGATAAAAGCAACCCTTGAATGGAAATTCGAACTTGTAGAAGGAGCAGT
GGATGATGCTGAGAGAGAAAGAAGAAATCGTTTCAAGTCGTATCTATGTCGTGCTTTGTA
TAAATTGTTCTAAACTTATTCATAAAGCTACCCATCATCGATCCAAAAACAGAACAATTT
GAACATCATAGTCTTTGGGCTTTTTAGTCTGGTTGTTGAGTTCTTTTGTCTTGTTGGATT
TCAGAAACTTAAAACATATTAAACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC18TF U 1
AF RR4FC18JQ C 402
BS 1 596 RR4FC18TF
BS 597 987 RR4FC18JQ

RD RR4FC18TF 596 0 0
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ACAGCCCAACGTCACCTGCATACAGCCCTACCTCTCCATCTTACAGTCCAACTTCACCAT
CTTACAGTCCGACATCGCCTTCTTACAGCCCTACCTCACCCTCCTACAGTCCAACATCTC
CTTTACAGTCCTACTTCACCTGCATACAGCCCAACTTCTCCTGGCTACAGCCCTACTTCA
CCAAGCTACAGTCCAACGTCTCCTAGTTACGGTCCGACGTCTCCAAGCTACAACCCTCAG
TCTGCTAAATACAGTCCATCTCTGGCTTACTCTCCTAGCAATGCAAGACTATCACCAGCT
AGCCCTTACAGTCCTACATCTCCAAACTACAGCCCTACATCACCATCCTACTCACCCACA
TCTCCGTCGTATTCACCTTCAAGTCCAACATACAGTCCCAGCAGCCCATACAGCTC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4FC18JQ 586 0 0
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TGCAAGACTATCACCAGCTAGCCCTTACAGTCCTACATCTCCAAACTACAGCCCTACATC
ACCATCCTACTCACCCACATCTCCGTCGTATTCACCTTCAAGTCCAACATACAGTCCCAG
CAGCCCATACAGCTCAGGAGCAAGCCCTGACTACAGCCCAAGCGCAGGGTACTCACCAAC
ACTTCCTGGTTATTCACCCTCATCCACCGGTCAGTATACACCACATGAGGGAGATAAAAA
TGACAAGACTGGAAAAGATGCCAGCAAGGATGATAAAAGCAACCCTTGAATGGAAATTCG
AACTTGTAGAAGGAGCAGTGGATGATGCTGAGAGAGAAAGAAGAAATCGTTTCAAGTCGT
ATCTATGTCGTGCTTTGTATAAATTGTTCTAAACTTATTCATAAAGCTACCCATCATCGA
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TCTTTTGTCTTGTTGGATTTCAGAAACTTAAAACATATTAAACGGC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

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ATGAACTGATTAGTCGCATACCAGCTTGGAGAGTACCGAGAGTCGATGTAGACAGCATCA
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TGTATATATATGTAGCGGCCGAGGCATGAATCGTGACGGTGGTGGTGATCGGAGACGGAG
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TGGTGTTTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO43TF U 1
AF RR4EO43JQ C 160
BS 1 352 RR4EO43TF
BS 353 611 RR4EO43JQ

RD RR4EO43TF 355 0 0
TTTTTGAGCCATTTGAACATTTCCTTCCCGGCGGCGTCTCTTTCAGCGACGTTACGCCGC
CGAAGATTCCGCCGGAAATCGAGACCAGCGTAGTAAGGTACGTAAAAAGCAGAAGCCAAC
GAAGAGTTTCTCGTCAAGCACTCGTATCTCTTCATCTTCTCGTGGAATATCACTTCAAGC
ATGAACTGATTAGTCGCATACCAGCTTGGAGAGTACCGAGAGTCGATGTAGACAGCATCA
CCGATCATCGGTCCGAATCCGAAGTTGTTGAGGTACTTACACATGCTGATCTTGTCCTTT
GGTCTTGAAATCGAGTCGCAGTCTTGGAGGATGTCGGTGTTGAATCGAGAAG
TAG

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR4EO43JQ 452 0 0
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GAGTCGATGTAGACAGCATCACCGATCATCGGTCCGAATCCGAAGTTGTTGAGGTACTTA
CACATGCTGATCTTGTCCTTTGGTCTTGAAATCGAGTCGCAGTCTTGGAGGATGTCGGTG
TTGAATCGAGAAGCTAGGTTATGTATATATATGTAGCGGCCGAGGCATGAATCGTGACGG
TGGTGGTGATCGGAGACGGAGGTAGTAGTGGTGGTGGTGATGAGGATGATTTTGTTTTGG
GAGAGACGAAGGAGAAGGAGAGAGGTTGTGAGGAGAGAGAAAAGAAGTAAGAGAGTGGTT
TGTTTCTTCTTACATGGATGATTCTTGATGGCACTTGATGAATTGTTGTTTTTCATTGCT
GTTGTTGTGAATGTTGTTGTGTGGTGTTTTTG

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL6181Contig1 994 2 6 U
GATTACTCTTCAGATGAGATGGTTGATCATGTGATAACACTGGTTTCTTTGGATTTTTCA
TCGATGATTGATCTACTCCTGCATAGTCCCGCAAAACCCTTACGGCGTAGCTTCGTAGCA
GAAGTGGTATCTGGAACCTCAATAATCTCATCTCCTGATCGCTTAGAAGGAGTGGCCATC
TTGACAGAGCTTTCATCACTGTATGGAGCACTTTGGCTTCGATCAACCAAGCTGTCTTCC
ATGGTCGAATCTCATCAAGGATGTGTGGAAGAAGACGTTTATATAAGGAGAACAGGCGTT
ACATGTTAGTGCTGCATTTAAGGTGTCCCGCTGTCGTCGAATTTAGGTTGCTCCTTTCTC
GGAGGCCAGAAATGTGAGGCGCTGTGGAGAGCTCATGTAGGTTGATCCTCTCATGGTGGA
TGTAAATGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCATTCAATACCTTATCCTCCATCAATCATC
AATCATCTTCGCACCGTTAGCTTTCAGAAGTATCTTCTGATTAGCCAATCATAGCAGTGG
ATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATACCAATTGAAGTCGGGTTCTTTTGATGGGAAAATCA
GGAACCTAGGAAGAATGAGAAGCTATATTGCCTTATACCAGCACCTAAAGAATATGTTAC
GCCTCTCTCTTGGCCCAAGAGTTTAGATTATGTCCCTTACGCTAATGCCCCGAACAAGGC
TATTCAGAGATGGATTTAGTATGAGAGGGACGCTTTTAGATTCCTTAGTGGTGGAACTCA
TTAAGGTGGTAGGACTGCTCTGGACACTGGTTGTGAGATAATGTCTTATGTTTGCTTCTG
TTTATATTCTTCGAGTCTCATATTCTTCATTAGTGACGTTGTGGGATTATATGTTTGTAG
TTGCTTTATTTCAGTTTTACCACACCTGAATTACCTGCTGAGAAGATGTATACGAAAAAC
AAGAGAGGGTTAACATACATGGTTCATGGGAAGC


BQ
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AF RR4FQ46TF U 1
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ATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATACCAATTGAAGTCGGGTTCTTTTGATGGGAAAATCA
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CAGAGATGGATTTAGTATGAGAGGGACGCTTTTAGATTCCTTAGTGGTGGAACTCATTAA
GGTGGTAGGACTGCTCTGGACACTGGTTGTGAGATAATGTCTTATGTTTGCTTCTGTTTA
TATTCTTCGAGTCTCATATTCTTCATTAGTGACGTTGTGGGATTATATGTTTGTAGTTGC
TTTATTTCAGTTTTACCACACCTGAATTACCTGCTGAGAAGATGTATACGAAAAACAAGA
GAGGGTTAACATACATGGTTCATGGGAAGC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

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CCCTGAACGTGGAATCTATCCACACGAGCTTGGCAAACGTCAACCGCCTTGCGAAATCGC
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TAGTAATGCCATCTTCCACATCAACTTCACCGCCAAGAGCTGTGACTACATATCGGTTGT
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CCCACCAAGCTCCCCGTGAACAGAAACTGTCGCCCAAATTTTTCCTTTTATGATGAACTT
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TGGATGTTTTGATTGCTGC


BQ
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AF RR4ER03TF U 1
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AGAAAAAGAAAAAGAAGTCGATGGATGGACATCATCGGATGAAGAGGAGGAAGTGGACGA
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QA 1 659 1 659
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ATGCTGAGATTCTACGAGGTTCCGGAGCAGGACATATGTGAAAATGATTGGCTTCGTCTG
TATACTGATTTCGCACTTTATTGCTACTGGCGGTATAATGAGGAGGCATTCAAGTCTTGC
TTGCCTGCCGAGATCAACAAAATACTTGTGGAAACCTTTGAAACTCATACAGACCCGTCT
CTGAAGCTCAAGTCTAGTAATGCCATCTTCCACATCAACTTCACCGCCAAGAGCTGTGAC
TACATATCGGTTGTCAGGAGGACAAAGGATGGGAGAACAGGGCATATAATACTCGAAATT
AGTACCTGGACCAACCCACCAAGCTCCCCGTGAACAGAAACTGTCGCCCAAATTTTTCCT
TTTATGATGAACTTTGCTTTGTTTTTATTAACAGTTAAATAATTTTTGTAAATCCTGTTT
ATGTCCTTTATTTATGGATGTTTTGATTGCTGC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL6183Contig1 975 2 8 U
GCCTCCCGGCTCAGATCGCTTGCTTGAACAAGACGACGGTGACCATGCCGAATCTAACAC
TTGTGCTCTTCTTCTTTTCCACTTTATTATTCACATCCTCCTTTGCTTTCCAATCAGACG
AGCTCCTCCTGGATGACGAGGAGTTTGGTCTTGAGGGAGGATCCCATCCTCGCTCGCCGG
AACCGGTTACAACCGATTCACCTCCGAAGCAGGCTCCGAGTACCCGTAGAAGGTACTCGG
ATCCTGATCTGGACTCAAAGATCCAATTCACCCTCGAACATGCCTTCGGAGACTCTGGTA
TCTCCTCCGCCGGTACTTTCTCCGCTCGCCTCAAGACTTGGAGCCATGGTGGTCAGACAT
TAACGAAACTGCGGTTCTCTAGGAATGAGTTTTCTGATGAAGAGAAAGCTGCCTTTCAAA
ATCTGCTGAAAGGAGATGACTTTTATAGAATAAGACTCCCATCTAATGTTGTCACTCCAC
CTGGGAGAGAGTATGTGATTGCATCTGTGAGAGCTAGATGTCTTCCACGGGATGGTTTGG
ATGAGCATATCGTTATACACATGGATGGTGCCAACGTTTTGGCAGTCAGTTACGGCTCTC
CTGGAGCATGCCCGTATCCTCGACAGTTGAAACTTCCAGGAAAATGGACATTTAACTCCC
ACACTATCTTGAAGAGTAGTGAGCAGGCACCAAGAACTCCGATATTCACGGAGGAGATCT
TTGGCAGTAGCGAGAATATAGAAGGTGAAGCAGAAGCGCCAGTAGAGAGATCATTTTGGG
CAAAATATTGGATGTACTTGATACCACTTGGACTTATAGTGATGAATGCTGTGACACAAG
CGAGTAACATGGCTGAAGAACAAACTGCGGGGCCTCAAGGGCAAGCACCAGCTGCCATTC
AGGGGGGTTCCGCACCCAGGAGAAGATGATGATTCCTTTCTCACTTTCTTGTAATCGTGG
TTTTTTCTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CD89TF U 1
AF RR4CD89JQ C 526
BS 1 686 RR4CD89TF
BS 687 687 RR4CD89JQ
BS 688 713 RR4CD89TF
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BS 723 744 RR4CD89TF
BS 745 975 RR4CD89JQ

RD RR4CD89TF 749 0 0
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TTGTGCTCTTCTTCTTTTCCACTTTATTATTCACATCCTCCTTTGCTTTCCAATCAGACG
AGCTCCTCCTGGATGACGAGGAGTTTGGTCTTGAGGGAGGATCCCATCCTCGCTCGCCGG
AACCGGTTACAACCGATTCACCTCCGAAGCAGGCTCCGAGTACCCGTAGAAGGTACTCGG
ATCCTGATCTGGACTCAAAGATCCAATTCACCCTCGAACATGCCTTCGGAGACTCTGGTA
TCTCCTCCGCCGGTACTTTCTCCGCTCGCCTCAAGACTTGGAGCCATGGTGGTCAGACAT
TAACGAAACTGCGGTTCTCTAGGAATGAGTTTTCTGATGAAGAGAAAGCTGCCTTTCAAA
ATCTGCTGAAAGGAGATGACTTTTATAGAATAAGACTCCCATCTAATGTTGTCACTCCAC
CTGGGAGAGAGTATGTGATTGCATCTGTGAGAGCTAGATGTCTTCCACGGGATGGTTTGG
ATGAGCATATCGTTATACACATGGATGGTGCCAACGTTTTGGCAGTCAGTTACGGCTCTC
CTGGAGCATGCCCGTATCCTCGACAGTTGAAACTTCCAGGAAAATGGACATTTAACTCCC
ACACTATCTTGAAGAGTAGTGAGCAG*CACCAAGAACTCCGATATTCACGGAG*AGATCT
T*GGCAGTAGCGAGAATATAGAAG
TGAGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4CD89JQ 450 0 0
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TCAGTTACGGCTTTCCTGGAGCATGCCCGTATCCTCGACAGTTGAAACTTCCAGGAAAAT
GGACATTTAACTCCCACACTATTTTGAAGAGTAGTGAGCAGGCACCAAGAACTCCGATAT
TCACGGAGGAGATTTTTGGCAGTAGCGAGAATATAGAAGGTGAAGCAGAAGCGCCAGTAG
AGAGATCATTTTGGGCAAAATATTGGATGTACTTGATACCACTTGGACTTATAGTGATGA
ATGCTGTGACACAAGCGAGTAACATGGCTGAAGAACAAACTGCGGGGCCTCAAGGGCAAG
CACCAGCTGCCATTCAGGGGGGTTCCGCACCCAGGAGAAGATGATGATTCCTTTCTCACT
TTCTTGTAATCGTGGTTTTTTCTTTTTTTT

QA 1 450 1 450
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6185Contig1 1194 2 2 U
GGAGACAGGAAAGAACTCTTCCCTCACTTTCTTCCCAAGATTAACAAACTAAACCCTCTC
TCTCTCTCTCTCTGTGTGTTTACTAGTAGTATCAAAGAGAGATCATCGGAAAAAATGTCT
CCGGCGAAGAAGAAGAGCCGAAGCTTTCCTCCGATAAGCGAGTGTAAAAGTGGAGAGTAT
GATTCGATCGCAGCAGATCTGGACGGGACTATGCTTCTCTCGAGAAGCTCCTTCCCTTAT
TTCATGCTCGTCGCAATTGAAGCAGGCAGTCTCTTCCGTGGATTGATCCTCCTTCTATCT
CTCCCGATCGTCATCATCGCTTACCTCTTCGTCTCCGAAGCTCTCGGTATCCAAATCCTC
ATCTACATCTCCTTCGCCGGCATCAAAGTCCGCGACATCGAACTCGTCTCTCGCGCCGTT
CTTCCACGGTCTATACTAACAATCTTCACTCATTTTCTGGTTTCCATATATTTTTGGAAT
CTCAATGAGTTTCTTTTTATTAATGAATAAATAAAATAGGTTTTACGCGGCGGATGTGAG
GAAGGACAGTTTCGAGGTGTTTGATAAATGCAAGAGGAAAGTGGTGGTCACTGCTAATCC
CATAGTGATGGTTGAGCCTTTCGTTAAGGATTACTTGGGAGGAGATAAAGTTCTGGGAAC
AGAGATCGAAGTGAATCCCAAAACGATGAAAGCCACTGGGTTTGTGAAGAAGCCTGGTGT
TCTTGTTGGAGACTTGAAGAGATTAGCCATCTTGAAGGAGTTCGGGGAAGAATCACCCCA
TCTTGGCATCGGTGACCGCACCTCCGATCACGATTTCATGTCCATTTGCAAGGTACCTAT
AACATATATATCCTCTTTCTCAAGCTTATTTAAGTTTCTTGAATCTATAAGACCCTCTAT
TAGGTTAGAGCTGAGTGCATAAACGTCTGATACTTGAAACATTTCGTAATCAAAGAACTA
ATAAGTATTAGAAAACTACACATAAATGCAGTAGGACCCCTACTTAATGACGTGTTGCCG
GTTCACATGATCTAGTTGTACAAATTTCCATACATGCCTTCACATGATCTATTCACTTCT
ATGTCCAAATTATTTGTATGTGTATGTATAATAATAAAGACACGCATGAAATATCTAGAT
TAAGTAGTTTTACTATTTGAATTCAAGAAAGGAACGTAATAAGTTTCCAGCGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EJ76TF U 1
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TCTCTCTCTCTCTGTGTGTTTACTAGTAGTATCAAAGAGAGATCATCGGAAAAAATGTCT
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GATTCGATCGCAGCAGATCTGGACGGGACTATGCTTCTCTCGAGAAGCTCCTTCCCTTAT
TTCATGCTCGTCGCAATTGAAGCAGGCAGTCTCTTCCGTGGATTGATCCTCCTTCTATCT
CTCCCGATCGTCATCATCGCTTACCTCTTCGTCTCCGAAGCTCTCGGTATCCAAATCCTC
ATCTACATCTCCTTCGCCGGCATCAAAGTCCGCGACATCGAACTCGTCTCTCGCGCCGTT
CTTCCACGGTCTATACTAACAATCTTCACTCATTTTCTGGTTTCCATATATTTTTGGAAT
CTCAATGAGTTTCTTTTTATTAATGAATAAATAAAATAGGTTTTACGCGGCGGATGTGAG
GAAGGACAGTTTCGAGGTGTTTGATAAATGCAAGAGGAAAGTGGTGGTCACTGCTAATCC
CATAGTGATGGTTGAGCCTTTCGT

QA 1 624 1 624
DS 

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ATAGTGATGGTTGAGCCTTTCGTTAAGGATTACTTGGGAGGAGATAAAGTTCTGGGAACA
GAGATCGAAGTGAATCCCAAAACGATGAAAGCCACTGGGTTTGTGAAGAAGCCTGGTGTT
CTTGTTGGAGACTTGAAGAGATTAGCCATCTTGAAGGAGTTCGGGGAAGAATCACCCCAT
CTTGGCATCGGTGACCGCACCTCCGATCACGATTTCATGTCCATTTGCAAGGTACCTATA
ACATATATATCCTCTTTCTCAAGCTTATTTAAGTTTCTTGAATCTATAAGACCCTCTATT
AGGTTAGAGCTGAGTGCATAAACGTCTGATACTTGAAACATTTCGTAATCAAAGAACTAA
TAAGTATTAGAAAACTACACATAAATGCAGTAGGACCCCTACTTAATGACGTGTTGCCGG
TTCACATGATCTAGTTGTACAAATTTCCATACATGCCTTCACATGATCTATTCACTTCTA
TGTCCAAATTATTTGTATGTGTATGTATAATAATAAAGACACGCATGAAATATCTAGATT
AAGTAGTTTTACTATTTGAATTCAAGAAAGGAACGTAATAAGTTTCCAGCGAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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TGTTTTGTCTTTGAAACCCTGTGTTAAATTGTTGGTGTTGCATGTCGTCTCTGAGCTTCC
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ACCAGGATTAGTGGTAATCGCCGGTCTTTGTATGTTGTTTAATCATAATGAAACTAGTGC


BQ
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AF RR4GF88TF U 1
AF RR4GF88JQ C 403
BS 1 612 RR4GF88TF
BS 613 780 RR4GF88JQ

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TGTTTTGTCTTTGAAACCCTGTGTTAAATTGTTGGTGTTGCATGTCGTCTCTGAGCTTCC
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CTCTTGATCTGG

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DS 

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TCATAATGAAACTAGTGC

QA 1 378 1 378
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTGCTTTTTGTTTTTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E323TF U 1
AF RR4E323JQ C 2
BS 1 714 RR4E323TF
BS 715 799 RR4E323JQ

RD RR4E323TF 714 0 0
GGGTTACCATATCTGGAGGGATTCACAACCATGTCATGAAAGAGATCAAAGAAGTTCTGA
TAGATAAAGAAAGATCCTGGAAGAGATGTGTTGAGAGTGTTTGGTAGATCTTTGAGCCGG
CTATTGAACATTGACACCAAATTGTTTATCTTTGTCACACACCCGCTGCTGTTGTTGCCC
TTTACCATAGATAACTGACTCGGTATGCAACCTAACTGTCCTGATCCAGCTAACACCATC
TTTCTTGCACCTAAGTTGTATAGTCTCTGCGGACAATAAATAGCTGCTGCAGATGCATAA
TTAAGTCCTTTCAAGACGTTTTGCCCAATTGATACAGGAGATAGATATGGTGGCACCAAT
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CTTTTACTAGAGTGGGGATGTAATTGTTGTTTCCACTATCAACTAAGGAGTCTCCGAAGA
TGAAGAAAGCTGGAGCAAGAGGATGATGGTTGCTAGACTGATCATGGCCATAACCAAACA
AGACGAGCTCTAAGAACACAACACAAAACAACAAACTCTTCATGCTTAGTTACTCTCTCA
CTCTCTCTTTCTCCCTCTGTCTGTCCTGGCTTTGGAGAGAAGTTTGTGATATATATTTAT
GGGGATATAGAGGGAAACTTGGTTGTGTGACATATTGAGATAGTGTTTGGTTCA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4E323JQ 798 0 0
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AGATAAAGAAAGATCCTGGAAGAGATGTGTTGAGAGTGTTTGGTAGATCTTTGAGCCGGC
TATTGAACATTGACACCAAATTGTTTATCTTTGTCACACACCCGCTGCTGTTGTTGCCCT
TTACCATAGATAACTGACTCGGTATGCAACCTAACTGTCCTGATCCAGCTAACACCATCT
TTCTTGCACCTAAGTTGTATAGTCTCTGCGGACAATAAATAGCTGCTGCAGATGCATAAT
TAAGTCCTTTCAAGACGTTTTGCCCAATTGATACAGGAGATAGATATGGTGGCACCAATG
GCAAACCGAGAAACGGCCAGTGGGAAAGCCAAAATCAATTCCATATGGGAGATAGTTAGC
TTTTACTAGAGTGGGGATGTAATTGTTGTTTCCACTATCAACTAAGGAGTCTCCGAAGAT
GAAGAAAGCTGGAGCAAGAGGATGATGGTTGCTAGACTGATCATGGCCATAACCAAACAA
GACGAGCTCTAAGAACACAACACAAAACAACAAACTCTTCATGCTTAGTTACTCTCTCAC
TCTCTCTTTCTCCCTCTGTCTGTCCTGGCTTTGGAGAGAAGTTTGTGATATATATTTATG
GGGATATAGAGGGAAACTTGGTTGTGTGACATATTGAGATAGTGTTTGGTTCAGAAGAAC
TGGTCGTGGTAAATGATCTCATGGTGTGTAGTGGTTAACTGTTACAGTTCTGAAAGATTT
TTTGCTTTTTGTTTTTCC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL6189Contig1 1309 2 2 U
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TTGAGTCCACAAATCCACTTTGATGAGAATATCCAGCCGCATGTGTCAACTACTGCCGTA
GCTGATTCGAGAACAGCAGACACACAAGAAAATTACGGTCAGTCACAGTTCAAAGGTGCT
GAAAGCACAGATGCAAATGTGAATACTGGAGTTCCTCTTATTGACCTTGTCGCTGAGGAC
AGTAGCCTCAGGTCTCTGCAGGTCATTAAAAATGACGACTTGGAAGAACTGAAGGAACTA
GGTTCTGGTACCTTCGGAACTGTTTACCATGGAAAATGGAGGGGTACAGATGTTGCTATC
AAGCGAATAAAAAAGAGCTGTTTCATTGGTCGTTCATCTGAACAAGAGAGACTGACCTCG
GAGTTCTGGCATGAAGCTGAAATTCTTTCCAAGCTACATCATCCAAATGTTATGGCATTC
TACGGCGTAGTGAGAGATGGGCCAGGAGGGACTTTAGCTACAGTGACAGAGTACATGGTC
AATGGATCGCTTAGACATGTTCTGCTCAGCAACAGGCAGATTGATCGACGTAAGCGACTC
ATCATTGCAATGGATGCAGCTTTTGGAATGGAGTATTTGCATTCAAAGAACATAGTGCAT
TTCGATTTGAAGTGTGACAACTTGCTTGTCAACTTAAAGGATCCCGCCCGTCCAATATGC
AAGGTTGGTGATTTTGGTTTGTCAAAGATTAAAAGAAACACTCTGGTCAGCGGTGGTGTA
AGAGGAACCCTCCCTTGGATGGCTCCCGAACTACTTAGTGGCAGCAGCAGCAAAGTTTCT
GAAAAGGTCGATGTGTTCTCTTTCGGAATCGTCTTGTGGGAAATTCTTACTGGTGAGGAA
CCCTACGCCAATATGCATTACGGTGCAATCATCGGAGGCATAGTGAACAATACACTGAGA
CCAACCGTGCCAAGCTACTGTGACCCGGAATGGAGGATGCTGATGGAGCAGTGTTGGGCT
CCTGATCCATTTGTTCGACCTTCTTTCCCAGAGATAGCGAGACGTCTCCGTACTATGTCC
TCTGCGGCAAAAGCCCACGCCACCAATCACCAAATCCACAAGTAATCTATATGTTCATAT
TATTACCGGTACGTATTTTGTTTCAGAAAAAGGTTTGTGTATAAAAAAACATCGTTGCGT
CTTCTTTCGGATTTGAGAGTGTTGATTTGTACAAGAAGTCCTAAATACATATTTGTATAG
CCATTATTATTATTGTTGAGTGTAAGTAAATTGGTTTTGGTACAATGAC


BQ
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AF RR4H033TF U 1
AF RR4H033JQ C 484
BS 1 693 RR4H033TF
BS 694 1309 RR4H033JQ

RD RR4H033TF 693 0 0
GGAGTTCCTATTGATTATAGCTACCCACCATTGCAATCTGGGAAAGTTGCTCCAACTCGG
TTGAGTCCACAAATCCACTTTGATGAGAATATCCAGCCGCATGTGTCAACTACTGCCGTA
GCTGATTCGAGAACAGCAGACACACAAGAAAATTACGGTCAGTCACAGTTCAAAGGTGCT
GAAAGCACAGATGCAAATGTGAATACTGGAGTTCCTCTTATTGACCTTGTCGCTGAGGAC
AGTAGCCTCAGGTCTCTGCAGGTCATTAAAAATGACGACTTGGAAGAACTGAAGGAACTA
GGTTCTGGTACCTTCGGAACTGTTTACCATGGAAAATGGAGGGGTACAGATGTTGCTATC
AAGCGAATAAAAAAGAGCTGTTTCATTGGTCGTTCATCTGAACAAGAGAGACTGACCTCG
GAGTTCTGGCATGAAGCTGAAATTCTTTCCAAGCTACATCATCCAAATGTTATGGCATTC
TACGGCGTAGTGAGAGATGGGCCAGGAGGGACTTTAGCTACAGTGACAGAGTACATGGTC
AATGGATCGCTTAGACATGTTCTGCTCAGCAACAGGCAGATTGATCGACGTAAGCGACTC
ATCATTGCAATGGATGCAGCTTTTGGAATGGAGTATTTGCATTCAAAGAACATAGTGCAT
TTCGATTTGAAGTGTGACAACTTGCTTGTCAAC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4H033JQ 826 0 0
GGCGTAGTGAGAGATGGGCCAGGAGGGACTTTAGCTACAGTGACAGAGTACATGGTCAAT
GGATCGCTTAGACATGTTCTGCTCAGCAACAGGCAGATTGATCGACGTAAGCGACTCATC
ATTGCAATGGATGCAGCTTTTGGAATGGAGTATTTGCATTCAAAGAACATAGTGCATTTC
GATTTGAAGTGTGACAACTTGCTTGTCAACTTAAAGGATCCCGCCCGTCCAATATGCAAG
GTTGGTGATTTTGGTTTGTCAAAGATTAAAAGAAACACTCTGGTCAGCGGTGGTGTAAGA
GGAACCCTCCCTTGGATGGCTCCCGAACTACTTAGTGGCAGCAGCAGCAAAGTTTCTGAA
AAGGTCGATGTGTTCTCTTTCGGAATCGTCTTGTGGGAAATTCTTACTGGTGAGGAACCC
TACGCCAATATGCATTACGGTGCAATCATCGGAGGCATAGTGAACAATACACTGAGACCA
ACCGTGCCAAGCTACTGTGACCCGGAATGGAGGATGCTGATGGAGCAGTGTTGGGCTCCT
GATCCATTTGTTCGACCTTCTTTCCCAGAGATAGCGAGACGTCTCCGTACTATGTCCTCT
GCGGCAAAAGCCCACGCCACCAATCACCAAATCCACAAGTAATCTATATGTTCATATTAT
TACCGGTACGTATTTTGTTTCAGAAAAAGGTTTGTGTATAAAAAAACATCGTTGCGTCTT
CTTTCGGATTTGAGAGTGTTGATTTGTACAAGAAGTCCTAAATACATATTTGTATAGCCA
TTATTATTATTGTTGAGTGTAAGTAAATTGGTTTTGGTACAATGAC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6190Contig1 1157 2 8 U
GGGCTTACACTTCAAGCGATCTATCGCATCTGGTGGTATGTGATTGGCTCCAACCAGATA
CCTTACTTTATCAACCCAACGTTGAGCCACGTCTTAGCATGCACACTCTAGCTCTCCTCT
TGGCTATACCGTACATCACTCTTCATCATCGCTTGTCTCGTCTACCAAGTCGTCTGCCAC
CTCCAGATCCTTCGTCTAGAGGAGTTCGCTCGCTGCTTCGCCTCTGAGATCACTGACTTT
AGCGCCACGCTCGCTGAGCATTTGAAGATACATCGTGAACTAAAGATTGTTAGTCACCGT
TTCAGACGGTTCATAGTATTGTCTTTGTTTTTCGTCACTGCCACTCAGTTCATGGCGTTG
CTTACCACCATGAGAGCTAGTGTTCCCTTTCACATCTACGAAGTTGGCGAGCTCGCGTTA
TGTTCCATAAGTTTGGTGTCAGGGCTTTTCATATGCTTGAAAAGCGCAACACAGATGACT
CACAAAGCTCAATCTGTAACCAGCATAGCCACTAAATGGAACGTCTGCGCTAGTCTAGAC
ACCTTTGATGATCTTGACAATGGAGAAACTCCTAAATATCCAACATCCAGACAGCATTTC
CAGATTTTGTCACGTCGTCGTGATGTTAGTCGATCGTCTGATGATGATGAAGATGGAGAT
AGTGATCTTGACAATACCACTATACATCCAATCTATGCGCGAGCCATTTCTTTCCAGAAA
CGTCAAGCTCTAGTGACATATCTAGAGAACAACAAAGCGGGAATCACTGTTTACGGATTC
TTGGTGGATAAAACATGGCTTCGTATGATCTTTAGCATTGAGCTTGCTCTTCTTCTGTGG
CTTCTCAAAAAGACAATCGTGAACATAACATGAAAATGAAACCAGTGTCTTGGTTTCTCA
TACAACACACGACAAGATTAGTGCCAGAGATGATTTTTCCACAATGCGAGTATCACAGCG
TTATTTTGTAGATCGTCTATGGATGGAAATTTATGTATGTTTATCAATATTTGAGTTATA
TTTGACCAAAAAAAAAAAGATCTCTGTGACTGTGAGTTATATATGTATGTATCCAGCTCA
GGTCTATTGTTGTGTAAAACCGATATTCATAAGGACGAATTTTTGGGTGAATGTATGATT
TATGGATTTGCGATCTT


BQ
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AF RR4EM68TF U 1
AF RR4EM68JQ C 527
BS 1 673 RR4EM68TF
BS 674 674 RR4EM68JQ
BS 675 714 RR4EM68TF
BS 715 715 RR4EM68JQ
BS 716 719 RR4EM68TF
BS 720 720 RR4EM68JQ
BS 721 748 RR4EM68TF
BS 749 1157 RR4EM68JQ

RD RR4EM68TF 753 0 0
GGGCTTACACTTCAAGCGATCTATCGCATCTGGTGGTATGTGATTGGCTCCAACCAGATA
CCTTACTTTATCAACCCAACGTTGAGCCACGTCTTAGCATGCACACTCTAGCTCTCCTCT
TGGCTATACCGTACATCACTCTTCATCATCGCTTGTCTCGTCTACCAAGTCGTCTGCCAC
CTCCAGATCCTTCGTCTAGAGGAGTTCGCTCGCTGCTTCGCCTCTGAGATCACTGACTTT
AGCGCCACGCTCGCTGAGCATTTGAAGATACATCGTGAACTAAAGATTGTTAGTCACCGT
TTCAGACGGTTCATAGTATTGTCTTTGTTTTTCGTCACTGCCACTCAGTTCATGGCGTTG
CTTACCACCATGAGAGCTAGTGTTCCCTTTCACATCTACGAAGTTGGCGAGCTCGCGTTA
TGTTCCATAAGTTTGGTGTCAGGGCTTTTCATATGCTTGAAAAGCGCAACACAGATGACT
CACAAAGCTCAATCTGTAACCAGCATAGCCACTAAATGGAACGTCTGCGCTAGTCTAGAC
ACCTTTGATGATCTTGACAATGGAGAAACTCCTAAATATCCAACATCCAGACAGCATTTC
CAGATTTTGTCACGTCGTCGTGATGTTAGTCGATCGTCTGATGATGATGAAGATGGAGAT
AGTGATCTTGACA*TACCACTATACATCCAATCTATGCGCGAGCCATTTCTTTC*AGAA*
CGTCAAGCTCTAGTGACATATCTAGAGA
CACAA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4EM68JQ 631 0 0
GCGCTAGTCTAGACACCTTTGATGATCTTGACAATGGAGAAACTCCTAAATATCCAACAT
CCAGACAGCATTTCCAGATTTTGTCACGTCGTCGTGATGTTAGTCGATCGTCTGATGATG
ATGAAGATGGAGATAGTGATCTTGACAATACCACTATACATCCAATCTATGCGCGAGCCA
TTTCTTTCCAGAAACGTCAAGCTCTAGTGACATATCTAGAGAACAACAAAGCGGGAATCA
CTGTTTACGGATTCTTGGTGGATAAAACATGGCTTCGTATGATCTTTAGCATTGAGCTTG
CTCTTCTTCTGTGGCTTCTCAAAAAGACAATCGTGAACATAACATGAAAATGAAACCAGT
GTCTTGGTTTCTCATACAACACACGACAAGATTAGTGCCAGAGATGATTTTTCCACAATG
CGAGTATCACAGCGTTATTTTGTAGATCGTCTATGGATGGAAATTTATGTATGTTTATCA
ATATTTGAGTTATATTTGACCAAAAAAAAAAAGATCTCTGTGACTGTGAGTTATATATGT
ATGTATCCAGCTCAGGTCTATTGTTGTGTAAAACCGATATTCATAAGGACGAATTTTTGG
GTGAATGTATGATTTATGGATTTGCGATCTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6191Contig1 878 2 2 U
GGAATGGCTACAGACACTATCCAAAGAGACTGAAACAAGATCAACTGGATGGCTATGACC
AGAGAACAAAACAATAAGAATGGATCAAACAGAAATTAAGAACATGGCTACGGACCAGAA
CATTTGCTTATCCCTCTTCCCAGAGATCTTTTACCAGTGAGGCCGCAATAATAGTTCCGG
TGACCAACAATTTCTGAAAAAACCATCCAAACAACAAGAAGCACAAACTTTGGGGGATAA
TCACAGCAGAAAACCGATTTAACAAGCTCAAAACGCCAACCACATAAGACACCGACGGCA
AAGGGGAGGAAACTGAGAGATCTCTCCTCAGAACAGCACAGCCGATTCAAGATAGTGCTT
CCACTGAGAAGAAGAGAGAGGGGAGAACAAAGATTGATCGTGAAGCTGATGATCAGCAAG
TTTTGCAGCTGGAGGAGAAGGATGTTGTGTCATCTGTTGCCACTGTGCTCTTTGATTTGT
GCGGTCCTGGAGATTGGATGCCTATGGAGAAACTTCACTCGGTGATATTAAAGAAGTATG
GAAACATATGGCATCACAGTCGAGTAAGAAGGTATCTGGCACAAGAAGACTGGGCAATCC
CTGAAGCAAACGGTAAACCGTGGTACGGTTTGCTGATGCTGCTGAGAAAATACCCGGAAC
ATTTCGTAATCAACACTAGATCCAAAGGAAGAGTTACGCTAGAATTTGTATCCCTTGTCT
CCCTACTCTCATGAACACTGTAATCTCCAACATGATTGTGCTTGTTTCTGTTTTGCTATG
CGGTGGATTATTGTTATTAAATATCTTTTGATTTCTCCCACGAACTGAGTGTACAAACGG
GGTTGCCTTGAGCTTTTCTATCATATCGTTGATTACGG


BQ
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AF RR4DF50TF U 1
AF RR4DF50JQ C 233
BS 1 441 RR4DF50TF
BS 442 878 RR4DF50JQ

RD RR4DF50TF 441 0 0
GGAATGGCTACAGACACTATCCAAAGAGACTGAAACAAGATCAACTGGATGGCTATGACC
AGAGAACAAAACAATAAGAATGGATCAAACAGAAATTAAGAACATGGCTACGGACCAGAA
CATTTGCTTATCCCTCTTCCCAGAGATCTTTTACCAGTGAGGCCGCAATAATAGTTCCGG
TGACCAACAATTTCTGAAAAAACCATCCAAACAACAAGAAGCACAAACTTTGGGGGATAA
TCACAGCAGAAAACCGATTTAACAAGCTCAAAACGCCAACCACATAAGACACCGACGGCA
AAGGGGAGGAAACTGAGAGATCTCTCCTCAGAACAGCACAGCCGATTCAAGATAGTGCTT
CCACTGAGAAGAAGAGAGAGGGGAGAACAAAGATTGATCGTGAAGCTGATGATCAGCAAG
TTTTGCAGCTGGAGGAGAAGG

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4DF50JQ 646 0 0
GGGGATAATCACAGCAGAAAACCGATTTAACAAGCTCAAAACGCCAACCACATAAGACAC
CGACGGCAAAGGGGAGGAAACTGAGAGATCTCTCCTCAGAACAGCACAGCCGATTCAAGA
TAGTGCTTCCACTGAGAAGAAGAGAGAGGGGAGAACAAAGATTGATCGTGAAGCTGATGA
TCAGCAAGTTTTGCAGCTGGAGGAGAAGGATGTTGTGTCATCTGTTGCCACTGTGCTCTT
TGATTTGTGCGGTCCTGGAGATTGGATGCCTATGGAGAAACTTCACTCGGTGATATTAAA
GAAGTATGGAAACATATGGCATCACAGTCGAGTAAGAAGGTATCTGGCACAAGAAGACTG
GGCAATCCCTGAAGCAAACGGTAAACCGTGGTACGGTTTGCTGATGCTGCTGAGAAAATA
CCCGGAACATTTCGTAATCAACACTAGATCCAAAGGAAGAGTTACGCTAGAATTTGTATC
CCTTGTCTCCCTACTCTCATGAACACTGTAATCTCCAACATGATTGTGCTTGTTTCTGTT
TTGCTATGCGGTGGATTATTGTTATTAAATATCTTTTGATTTCTCCCACGAACTGAGTGT
ACAAACGGGGTTGCCTTGAGCTTTTCTATCATATCGTTGATTACGG

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6192Contig1 1247 2 2 U
GAACACTAGTTCCAACAATGTCAATAAGAGCATTTTTAATGTAAATTTTTCATTTTTTTA
ATAAAATAAGTCTATAATGGAACTTCATCTATTTTAAAATAAAAATGCAATAATAAATCA
ACCGAAAATGAATTAATTCATTTATAGAGTGAATTTATTTTTATTCTATTATAAAAAGAA
AAATGAAATAATTTTTTTTTTCATTCTGAAATGAAAAGTGGAATGAGGCTGACGATGATA
ACAAGTAACAATTTTTTTTCATCGGTTGACGAGAGGGGGAGACAGTTGAGACGGTTACTG
GCGATTGTTATTACGATTGTCTTCTCCTCTCAAATTCTCAAAGATTGGCTCAGATCAAGG
CAGTAAATAGTCATTCCAGTGATGTTTCTTTAATCCAGACGTCCACATGATGATCTCGCC
AAACTCTAAATCTAAGAACAGTTCATACATCATCAACGACAAGTGTAATCCAACATTACT
CGGTACGTAACATATTTTCAGAATCCATTTATGATATCGGTATGGTACTGTTATACGACA
GTTCTACGCTGATACATTCCATCTCCGTGGTGGATAAGATCCACTGCGATGTTATTTTGA
CGACATATTGTCAGTTTCCGATTGTAATGGTGTTTATTCATCGTTATAAATGGTGCATCG
GCAGAAAAGTTTGGGATCCAGGAAAATATCGATATTTGTTCCAATTATGTTATGAGATTA
AGAGGAGACGATCAACTTCAGTAACGGATGAAGAATCGTTTGAAGAGGAAGTCTTTTGGT
TGTATGGCGATGTACTTACAGTCGTTGAAAGTTGGTTATCCCGGTTTTTAGTTTTCATAG
TTGAATCAATATATTGGATTATATACCAGAAAATATCTATAGTCCTAAATTGGGATAAGA
TCAACGTAATACAACAAAAGATACTGGTGTTCTTGATGCGACAGAAGATTTCTAGTTCGC
AAAAAGGTTAATAGAAGTGATCCTCTAGTAACGAAGAGGACCTGGGAAGGAAAAACATCT
CTACAGTATTCTTCAGTTTACATCATTTTATCAATTGTTGTTTTCTTGTTATCTTATGTT
TCATTTGTATTTTTCCTACTTTCAATCTAATTAATAAATACAAGTTGTTAGAAAAAAAAA
GCAAGTAACAACCATTCACCAATGCGATATCTAAAAACATAAACGTGCGGATGTGTGAAT
ATGATCCTTTCGCAGACATACCGATCAACGGTTGGTTACTAACATAG


BQ
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AF RR4G561TF U 1
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AAATGAAATAATTTTTTTTTTCATTCTGAAATGAAAAGTGGAATGAGGCTGACGATGATA
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AAACTCTAAATCTAAGAACAGTTCATACATCATCAACGACAAGTGTAATCCAACATTACT
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CGACATATTGTCAGTTTCCGATTGTAATGGTGTTTATTCATCGTTATAAATGGTGCATCG
GCAGAAAAGTTTGGGATCCAGGAAA
TATCGATA

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DS 

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GTTCTACGCTGATACATTCCATCTCCGTGGTGGATAAGATCCACTGCGATGTTATTTTGA
CGACATATTGTCAGTTTCCGATTGTAATGGTGTTTATTCATCGTTATAAATGGTGCATCG
GCAGAAAAGTTTGGGATCCAGGAAAATATCGATATTTGTTCCAATTATGTTATGAGATTA
AGAGGAGACGATCAACTTCAGTAACGGATGAAGAATCGTTTGAAGAGGAAGTCTTTTGGT
TGTATGGCGATGTACTTACAGTCGTTGAAAGTTGGTTATCCCGGTTTTTAGTTTTCATAG
TTGAATCAATATATTGGATTATATACCAGAAAATATCTATAGTCCTAAATTGGGATAAGA
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AAAAAGGTTAATAGAAGTGATCCTCTAGTAACGAAGAGGACCTGGGAAGGAAAAACATCT
CTACAGTATTCTTCAGTTTACATCATTTTATCAATTGTTGTTTTCTTGTTATCTTATGTT
TCATTTGTATTTTTCCTACTTTCAATCTAATTAATAAATACAAGTTGTTAGAAAAAAAAA
GCAAGTAACAACCATTCACCAATGCGATATCTAAAAACATAAACGTGCGGATGTGTGAAT
ATGATCCTTTCGCAGACATACCGATCAACGGTTGGTTACTAACATAG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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GACACAGTTCGAATTTGATTAATCAAAGCAAAGTCGTGTCTGGTTTTTAGATTTGCTTGA
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ATCTGTTTTTCCTGTGCGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAACAAAAATCTG
AGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAACCAGA
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TTGGATTCTCCGCTGTTGAAACTGTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTCGTCTACTGCA
ATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCTCTTCTCTCT
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TAACCGGTTTTAAATTCTCAGCTTTATACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A553TF U 1
AF RR4A553JQ C 442
BS 1 623 RR4A553TF
BS 624 1110 RR4A553JQ

RD RR4A553TF 623 0 0
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GACACAGTTCGAATTTGATTAATCAAAGCAAAGTCGTGTCTGGTTTTTAGATTTGCTTGA
GAGAGAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGGGAGACAGACAATTACGATGGCGTTACGGT
GACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTTAGCCATAGGCTCAGGGCTTCTCTTTC
CCATTGGAGACAAGGGGAAGGGGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTTTAGCTAACC
TTGTTGAATCTGCAGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAGAGTACTTGA
TGCTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACTATCCCTGCCAATGCTTCTCACATTG
TTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCTACTCGTGAGGTCCTCGTTGTCCAGGAAA
AGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTATCCACGAGG
GTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTATCGCAG
ATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4A553JQ 669 0 0
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AAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTATCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAG
TAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTATCGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCT
TCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAACAGAAAACGGATCTGTTTTTCCTGTGCGTCT
TGGCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAACAAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGA
TGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCA
TGGCTGAAATCTGCGAGAAGAAATGTGATGGACAATACGTTGGATTCTCCGCTGTTGAAA
CTGTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTCGTCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACC
TTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCTCTTCTCTCTGAATCGATTCTCATGGAATCT
CTGCATTTGTCATTATTGTGTGTGTCCTTTGTATTTGTATCTCAAATAAGAAAAACAAAA
CCATCTTTCTGGGACAAATGCTTTCCTTTGGCATTGTCATAACCGGTTTTAAATTCTCAG
CTTTATACT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL6194Contig1 774 2 6 U
GAACCACAAAAGGCACTATCACAACCTTCACATTCCAGGAGTATGGAGTGGAACTGAAGC
TGGACAGGAATGTGTATTTGGTAGATATAGTGAGGGCTAAGATTGGGAGAGTGTTGAAGT
TTGATTCGATTAATGACGGACACAATTGGTCAGAAATGGATACATTGATTTTCAATACTT
GGCATTGGTGGAGTCGTAGAGGCCCTTCACAACCATGGGATTATATTCAACTAGGAAGTA
AGGTTACAAAGGACATGGACCGTGTGACAGCGTTCGAAATCGCACTCGGGACTTGGGGCA
AATGGGTCGATACGGTCGTAGATACTCAGAGAACTAGAGTCTTTTTCCAAGGAATTTCAC
CATCTCATTACAAAGGGGCTTTATGGGGTGAACCAATGGCAAGGAGTTGCGCAAAACAGA
AGGAACCATTTCTGGGGACAAGTTATCCAGGAGGATTGCCAGCTGAAGTAGGAGTTTTGA
AGAGAGCACTTGGGAAAATATCGAAACCGGTTACTTTGCTAGACATTACGATGCTTTCAT
TGCTTCGCAAAGATGGTCACCCTTCGATATACGGTCTAGGAGGCCAAACCGGCAATGACT
GCAGCCACTGGTGTCTCTCTGGGGTACCGGATACTTGGAATGAGATTCTTTACAACTATA
TGGCTTAGTAAGAACATTTTAAACATAGAAAGAGAAAACAAAAATATAGCTTATTTGTTA
ACGTTTGATTCTGCATTTGGATCTTAATAAAAAAGGTACTGATATTAAAAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GC20TF U 1
AF RR4GC20JQ C 392
BS 1 697 RR4GC20TF
BS 698 700 RR4GC20JQ
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BS 731 750 RR4GC20TF
BS 751 774 RR4GC20JQ

RD RR4GC20TF 750 0 0
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TTGATTCGATTAATGACGGACACAATTGGTCAGAAATGGATACATTGATTTTCAATACTT
GGCATTGGTGGAGTCGTAGAGGCCCTTCACAACCATGGGATTATATTCAACTAGGAAGTA
AGGTTACAAAGGACATGGACCGTGTGACAGCGTTCGAAATCGCACTCGGGACTTGGGGCA
AATGGGTCGATACGGTCGTAGATACTCAGAGAACTAGAGTCTTTTTCCAAGGAATTTCAC
CATCTCATTACAAAGGGGCTTTATGGGGTGAACCAATGGCAAGGAGTTGCGCAAAACAGA
AGGAACCATTTCTGGGGACAAGTTATCCAGGAGGATTGCCAGCTGAAGTAGGAGTTTTGA
AGAGAGCACTTGGGAAAATATCGAAACCGGTTACTTTGCTAGACATTACGATGCTTTCAT
TGCTTCGCAAAGATGGTCACCCTTCGATATACGGTCTAGGAGGCCAAACCGGCAATGACT
GCAGCCACTGGTGTCTCTCTGGGGTACCGGATACTTGGAATGAGATTCTTTACAACTATA
TGGCTTAGTAAGAACATTTTAAACATAGAAAGAGAAA**CAAAATATAGCTTATTTGTTA
ACGTTTGAT*CTGCATTTGGATCTTAATAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4GC20JQ 383 0 0
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AGGATTGCCAGCTGAAGTAGGAGTTTTGAAGAGAGCACTTGGGAAAATATCGAAACCGGT
TACTTTGCTAGACATTACGATGCTTTCATTGCTTCGCAAAGATGGTCACCCTTCGATATA
CGGTCTAGGAGGCCAAACCGGCAATGACTGCAGCCACTGGTGTCTCTCTGGGGTACCGGA
TACTTGGAATGAGATTCTTTACAACTATATGGCTTAGTAAGAACATTTTAAACATAGAAA
GAGAAAACAAAAATATAGCTTATTTGTTAACGTTTGATTCTGCATTTGGATCTTAATAAA
AAAGGTACTGATATTAAAAACCT

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 2

CO CL6195Contig1 1316 2 6 U
TTTTTTCTGCTGCTACATTATACACATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTAGCCATG
GCTTCGGCTACTTTCTCTGTGGCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCTCTGACTTCTCAGGA
CTCAGAAACTCCCCTGCTCTTCCCTTGGGCAAGAAAACTTCTTCTGATGAGTTTGTTTCC
TTCGTCAGTTTCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGAGGATACGGGAAAGGAGTGACC
GAGGCCAAGCTAAAGGTAGCCATCAATGGATTCGGTAGGATCGGTAGGAACTTCTTGATG
TCATTGCCATTAACGACACTGGCGGTGTCAAACAAGCGACGCATCTCCTCAAATACGACT
CGACTCTCGGAATCTTCGACGCTGACGTCAAGCCTTCAGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTG
ATGGAAAGATCATCAAGATTGTCTCTGACCGCAACCCATCCAACCTCCCCTGGGGGGAAC
TAGGCATTGACTTGGTCATCGAAGGAACCGGAGTGTTTGTAGACAGAGAAGGTGCTGGTA
AGCACATTCAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTCTCATCACTGCACCTGGTAAAGGTGATATTC
CAACCTATGTGGTTGGTGTCAATGCTGAACTTTACAGCCATGAAGACACAATCATCAGCA
ATGCTTCTTGTACTACCAACTGTCTCGCTCCATTCGTCAAGGTTCTTGACCAGAAGTTCG
GGATCATAAAGGGTACAATGACAACCACTCACTCATACACTGGCGACCAGAGGCTGTTGG
ATGCTAGCCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGCAGCGGCTCCCTAACCTGAAAGGAAAA
CTCAACGGGATCGCGCTGCGTGTGCCGACTCCCAACGTCTCGGTGGTCGACTTGGTCGTG
CAGGTCTCGAAGAAGACTTTCGCTGAGGAAGTCAACGCTGCTTTCAGGGATGCGGCTGAG
AAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTCAGG
TGCTCTGATGTGTCGTCCACCATCGATTCTTCTCTGACCATGGTTATGGGAGATGATATG
GTTAAAGTGATTGCTTGGTATGATAACGAATGGGGTTACTCGCAGAGAGTCGTTGATTTG
GCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAAGATTCAACTGTTTGATGTTGTTCTGC
TCCATTTTTTATTTTACTGTTATTATGGTGATTCGGAATGTATAATTGTAGTTCCTGAGT
TTATTATGTATTTGTGCTCTTCAATTTTAATAGTAATAAACTTTATATTCGAACAC


BQ
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AF RR4E814TF U 1
AF RR4E814JQ C 515
BS 1 703 RR4E814TF
BS 704 704 RR4E814JQ
BS 705 710 RR4E814TF
BS 711 711 RR4E814JQ
BS 712 734 RR4E814TF
BS 735 1316 RR4E814JQ

RD RR4E814TF 734 0 0
TTTTTTCTGCTGCTACATTATACACATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTAGCCATG
GCTTCGGCTACTTTCTCTGTGGCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCTCTGACTTCTCAGGA
CTCAGAAACTCCCCTGCTCTTCCCTTGGGCAAGAAAACTTCTTCTGATGAGTTTGTTTCC
TTCGTCAGTTTCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGAGGATACGGGAAAGGAGTGACC
GAGGCCAAGCTAAAGGTAGCCATCAATGGATTCGGTAGGATCGGTAGGAACTTCTTGATG
TCATTGCCATTAACGACACTGGCGGTGTCAAACAAGCGACGCATCTCCTCAAATACGACT
CGACTCTCGGAATCTTCGACGCTGACGTCAAGCCTTCAGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTG
ATGGAAAGATCATCAAGATTGTCTCTGACCGCAACCCATCCAACCTCCCCTGGGGGGAAC
TAGGCATTGACTTGGTCATCGAAGGAACCGGAGTGTTTGTAGACAGAGAAGGTGCTGGTA
AGCACATTCAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTCTCATCACTGCACCTGGTAAAGGTGATATTC
CAACCTATGTGGTTGGTGTCAATGCTGAACTTTACAGCCATGAAGACACAATCATCAGCA
ATGCTTCTTGTACTACCAACTGTCTCGCTCCATTCGTCAAGGT*CTTGAC*AGAAGTTCG
GGATCATAAAGGGT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4E814JQ 802 0 0
GTTTGTAGACAGAGAAGGTGCTGGTAAGCACATTCAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTCTCAT
CACTGCACCTGGTAAAGGTGATATTCCAACCTATGTGGTTGGTGTCAATGCTGAACTTTA
CAGCCATGAAGACACAATCATCAGCAATGCTTCTTGTACTACCAACTGTCTCGCTCCATT
CGTCAAGGTTCTTGACCAGAAGTTCGGGATCATAAAGGGTACAATGACAACCACTCACTC
ATACACTGGCGACCAGAGGCTGTTGGATGCTAGCCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGC
AGCGGCTCCCTAACCTGAAAGGAAAACTCAACGGGATCGCGCTGCGTGTGCCGACTCCCA
ACGTCTCGGTGGTCGACTTGGTCGTGCAGGTCTCGAAGAAGACTTTCGCTGAGGAAGTCA
ACGCTGCTTTCAGGGATGCGGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATG
AGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTCAGGTGCTCTGATGTGTCGTCCACCATCGATTCTTCTC
TGACCATGGTTATGGGAGATGATATGGTTAAAGTGATTGCTTGGTATGATAACGAATGGG
GTTACTCGCAGAGAGTCGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAA
GATTCAACTGTTTGATGTTGTTCTGCTCCATTTTTTATTTTACTGTTATTATGGTGATTC
GGAATGTATAATTGTAGTTCCTGAGTTTATTATGTATTTGTGCTCTTCAATTTTAATAGT
AATAAACTTTATATTCGAACAC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6197Contig1 1071 2 2 U
GAGGGACAGAGATGGAGAGAGAATCAAGCGACATGATGACAGGGAGGATGATAGAAGAAG
CAGGGATCGAGACCGACATCACAGAAGTCGTCACAGGGATCGCAGTGGCGAAAGAAGAGA
TCGTGTTAGGGGTGATGATGACTACCGTCGTAGTAGTCGTGACCGTGACTTTGACAGGCG
TAGAGATTCTGACAGAGATAGAGGAGGAGATAGACGCCGTCGCCGTTCTCGTTCAAGGGG
TAGATCTGAGCGAAGATCACGTTCTCCATCAAAGACTAAGCGGGTCAGTGGATTCGACAT
GGCACCTCCAGCTGCTGGGATGTTAGATGCTGGTGCTGCTCTTACAGGCCAAGTTCCTGC
TCCAAGCCCAAATCTTCTTCCTGGAAATGGAATGTTTCCTTTACAACCTGGACAGCAATT
CGGAGGAGTCCCTATGATGCCTATTCAGGCAATGACACAACAGGCTACTAGACATGCTCG
GAGGGTCTATGTTGGTGGCCTTTCTCCCTCAGCAAATGAACAGTCTGTTGCGACATTTTT
TAGCCAGGCTATGGCTGCTATTGGCGGAAACAGTGCTGGTCCAGGTGATGCTGTTGTTAA
TGTGTACATCAACTACGAGAAGAAATTTGCATTTGTGGAGATGCGATCCGTTCAAGAAGC
CAGTAATGCAATGACTTTGGATGGAATTATATTTGAGGGAGCTCCAGTAAAGGTGAGGAG
ACCGAGTGACTATAACCCAGCGCTGGCTGCAACCCTTGGTCCAAGCCAGCCCATTCCAAA
TTTAAACTTGGCTGCTGTAGGTCTGACTCCAGGGGGTGCTTTCGCTTGAAGGCCCAGACC
GTCTTTTTGTTGGTGGACTTCCTTACTATATCCCTGAGTCACAAATCAGAGAGTTGTTAG
AGTCCTTAGGAGCCCTGAAAGGTTTTGATCTTGTAAGAGACAGAGAAACTGGAAACTCAA
AAGGATATGCATTCTGTGCGTATCAAGATCCCGCAGCTACAGACATTGCATGCGCTGCCC
TCAATGGAATTACCATGGGAGATAAAACTCTATGTGTAAGCGAGCTAACCA


BQ
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AF RR4FQ85TF U 1
AF RR4A551TF U 284
BS 1 499 RR4FQ85TF
BS 500 1071 RR4A551TF

RD RR4FQ85TF 499 0 0
GAGGGACAGAGATGGAGAGAGAATCAAGCGACATGATGACAGGGAGGATGATAGAAGAAG
CAGGGATCGAGACCGACATCACAGAAGTCGTCACAGGGATCGCAGTGGCGAAAGAAGAGA
TCGTGTTAGGGGTGATGATGACTACCGTCGTAGTAGTCGTGACCGTGACTTTGACAGGCG
TAGAGATTCTGACAGAGATAGAGGAGGAGATAGACGCCGTCGCCGTTCTCGTTCAAGGGG
TAGATCTGAGCGAAGATCACGTTCTCCATCAAAGACTAAGCGGGTCAGTGGATTCGACAT
GGCACCTCCAGCTGCTGGGATGTTAGATGCTGGTGCTGCTCTTACAGGCCAAGTTCCTGC
TCCAAGCCCAAATCTTCTTCCTGGAAATGGAATGTTTCCTTTACAACCTGGACAGCAATT
CGGAGGAGTCCCTATGATGCCTATTCAGGCAATGACACAACAGGCTACTAGACATGCTCG
GAGGGTCTATGTTGGTGGC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4A551TF 788 0 0
GTCAGTGGATTCGACATGGCACCTCCAGCTGCTGGGATGTTAGATGCTGGTGCTGCTCTT
ACAGGCCAAGTTCCTGCTCCAATCCCAAATCTTCTTCCTGGAAATGGAATGTTTCCTTTA
CAACCTGGACAGCAATTCGGAGGAGTCCCTATGATGCCTATTCAGGCAATGACACAACAG
GCTACTAGACATGCTCGGAGGGTCTATGTTGGTGGCCTTTCTCCCTCAGCAAATGAACAG
TCTGTTGCGACATTTTTTAGCCAGGCTATGGCTGCTATTGGCGGAAACAGTGCTGGTCCA
GGTGATGCTGTTGTTAATGTGTACATCAACTACGAGAAGAAATTTGCATTTGTGGAGATG
CGATCCGTTCAAGAAGCCAGTAATGCAATGACTTTGGATGGAATTATATTTGAGGGAGCT
CCAGTAAAGGTGAGGAGACCGAGTGACTATAACCCAGCGCTGGCTGCAACCCTTGGTCCA
AGCCAGCCCATTCCAAATTTAAACTTGGCTGCTGTAGGTCTGACTCCAGGGGGTGCTTTC
GCTTGAAGGCCCAGACCGTCTTTTTGTTGGTGGACTTCCTTACTATATCCCTGAGTCACA
AATCAGAGAGTTGTTAGAGTCCTTAGGAGCCCTGAAAGGTTTTGATCTTGTAAGAGACAG
AGAAACTGGAAACTCAAAAGGATATGCATTCTGTGCGTATCAAGATCCCGCAGCTACAGA
CATTGCATGCGCTGCCCTCAATGGAATTACCATGGGAGATAAAACTCTATGTGTAAGCGA
GCTAACCA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL6198Contig1 212 2 1 U
GGGATGACGTCAAGTCCGCATGGCCCTTATGGGCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCA
ATTACAATGGGAAGCAAGGCTGTAAAGCGGAGCGAATCCGGAAAGATTGCCTCAGTTCGG
ATTGTTCTCTGCAACTCGGGAACATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATG
CCGCGGTGAATATGTACCCGGGCCCTGTACGC


BQ
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AF RR4CB12JQ C 1
AF RR4CB12TF U 1
BS 1 212 RR4CB12TF

RD RR4CB12JQ 212 0 0
GGGATGACGTCAAGTCCGCATGGCCCTTATGGGCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCA
ATTACAATGGGAAGCAAGGCTGTAAAGCGGAGCGAATCCGGAAAGATTGCCTCAGTTCGG
ATTGTTCTCTGCAACTCGGGAACATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATG
CCGCGGTGAATATGTACCCGGGCCCTGTACGC

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR4CB12TF 212 0 0
GGGATGACGTCAAGTCCGCATGGCCCTTATGGGCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCA
ATTACAATGGGAAGCAAGGCTGTAAAGCGGAGCGAATCCGGAAAGATTGCCTCAGTTCGG
ATTGTTCTCTGCAACTCGGGAACATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATG
CCGCGGTGAATATGTACCCGGGCCCTGTACGC

QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 2

CO CL6199Contig1 1166 2 2 U
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TGGCTTCTCCTGCTCAGAATCTAACACTTCAATATAGTCCTGTTCTGCTTCAGCACGGTC
TCTTTATGGCTGGAGATGTGTGGTTCTTGGATTCCACTAAAGAATCATTAGGCTTCGTTC
TTGCTGATTATGGGTTCGATGTTTGGATAGGAAACGTTCGTGGTACGCGTTATAGTTATG
GGCATGTAACTTTGTCTTAAACTGACAAGGAATTTTGGGATTGGAGTTGGCAAGATTTGG
CTATGTACGACTTGGCAGAAATGGTTCAGTATATGTATTCAGTTGCAAACTCCAAAATCT
TCCTTGTTGGACATTCTCAGGGGACTATCATGTCTCTTGCTGCTCTTACTCAGCCACGTG
TTGCGGAAATGGTTGAAGCAGCTGCGTTGCTTTGTCCAATATCGTATTTGGATCATGTCA
CAGCTCCACTTGTAGAAAGAATGGTTTTTATGCATCTCGATCAGATTGTCGTTGCTCTTG
GCCAGCATCAAATAAACTTTCGAAGTGATACATTAGTTAAACTTGTTGACTCATTATGCG
AAGGGCATATGGATTGCACTGATTTCCTCTCATCCATAACAGGGAAGAATTGTTGTTTCA
ATGCCTCGAGGATAGAATACTACTTAGATTACGAGCCTCACCCATCATCTGTGAAGAACT
TGCGACATCTTTTCCAAATGATTCGGAAGGGGAGCTTTGCAAAATTTGACTACGGCTTTC
TTAAAAACATATTGACTTATGGGACATCAAAACCTCCGGAATTCGAACTTGGTCTCATTC
CGGCATCATTACCTATGTGGATGGGGTACGGTGGAAGTGATCTCTTAGCAGACGTGACAG
ATGTGGAACGTACTCTCGCCGAGCTACCTTCCAGACCAGAGGTGCTATATCTTGAGAATT
ATGGTCACATTGATTTTGTACTGAGCACAAGTGCCAAAGAAGATGTGTATATGCACATGA
TTCAATTCTTCAGGGCAAGGAAAAAGTCCAGTAGTTGGTAAACTACTAACTGCAAGGCTG
GACACATTTTCATCTGTTATCTGTCTCCTTACTTGATGTCGTGTGTACATATGTATATTT
ATTTTTCAAACTCAGTTGACTTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E307TF U 1
AF RR4E307JQ C 428
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BS 640 1166 RR4E307JQ

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TGGCTTCTCCTGCTCAGAATCTAACACTTCAATATAGTCCTGTTCTGCTTCAGCACGGTC
TCTTTATGGCTGGAGATGTGTGGTTCTTGGATTCCACTAAAGAATCATTAGGCTTCGTTC
TTGCTGATTATGGGTTCGATGTTTGGATAGGAAACGTTCGTGGTACGCGTTATAGTTATG
GGCATGTAACTTTGTCTTAAACTGACAAGGAATTTTGGGATTGGAGTTGGCAAGATTTGG
CTATGTACGACTTGGCAGAAATGGTTCAGTATATGTATTCAGTTGCAAACTCCAAAATCT
TCCTTGTTGGACATTCTCAGGGGACTATCATGTCTCTTGCTGCTCTTACTCAGCCACGTG
TTGCGGAAATGGTTGAAGCAGCTGCGTTGCTTTGTCCAATATCGTATTTGGATCATGTCA
CAGCTCCACTTGTAGAAAGAATGGTTTTTATGCATCTCGATCAGATTGTCGTTGCTCTTG
GCCAGCATCAAATAAACTTTCGAAGTGATACATTAGTTAAACTTGTTGACTCATTATGCG
AAGGGCATATGGATTGCACTGATTTCCTCTCATCCATAA

QA 1 639 1 639
DS 

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TATGGATTGCACTGATTTCCTCTCATCCATAACAGGGAAGAATTGTTGTTTCAATGCCTC
GAGGATAGAATACTACTTAGATTACGAGCCTCACCCATCATCTGTGAAGAACTTGCGACA
TCTTTTCCAAATGATTCGGAAGGGGAGCTTTGCAAAATTTGACTACGGCTTTCTTAAAAA
CATATTGACTTATGGGACATCAAAACCTCCGGAATTCGAACTTGGTCTCATTCCGGCATC
ATTACCTATGTGGATGGGGTACGGTGGAAGTGATCTCTTAGCAGACGTGACAGATGTGGA
ACGTACTCTCGCCGAGCTACCTTCCAGACCAGAGGTGCTATATCTTGAGAATTATGGTCA
CATTGATTTTGTACTGAGCACAAGTGCCAAAGAAGATGTGTATATGCACATGATTCAATT
CTTCAGGGCAAGGAAAAAGTCCAGTAGTTGGTAAACTACTAACTGCAAGGCTGGACACAT
TTTCATCTGTTATCTGTCTCCTTACTTGATGTCGTGTGTACATATGTATATTTATTTTTC
AAACTCAGTTGACTTCCAT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6200Contig1 1269 2 2 U
GGACCGACGTGTGTGTGCGAGATTCACTTCCTCTCTCATCCTCCTCTGATCCCGCCGCCA
CCAAACACCTCCTAGCTCTCCTCCTATAGCTGTTAACTGTTATAAAGCCCGGTAACAAGC
AGCTGAGGAATAAGAAGACGTCCTGATGATGATGATGACTTCACTCGGTATGGATGGTGG
TGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAGGGAGATTTATGACGTATCCGCCGCCTCTTTCCGTGCC
TCCGTCGGCTCCTCAGTCACCTAACTTCTCTGGTGGTCTCCGATCACAGCCTTCTTTCCT
CGTTGAGCAAGAAAAATATCTTTCTGAATTACTTGCAGAGCGCCACAAGCTTACTCCCTT
CTTGCCTGTGCTCCCACATCTCTTCCGTCTCATGAACCAAGAGATCTCTTTCATCATCTC
CAGCACCAAATTGGCTAAACCCTCCTGGTAGCTCGTCCGGTCTCATTGTAAAGCGATCAA
TCAGAGTGGATATTCCAGTCGACAAGTATCCAAACTACAATTTCGTTGGACGTCTCTTGG
GACTTAGAGGAAACTCCCTAAAACGAGTTGAAGCGAGCTCTGAGTGCCGTGTTCTGATCA
GGGGGAGAGGCAGCATTAAAGACCCAGTCAAGGAGGAAATGATGAGAGGGAAACCAGGGT
ATGAGCACCTGAATGAACAGCTCCACATCTTAGTGGAGGCAGAGTTGCCCATTGAGATAG
TGGATGCACGTCTCATGCAAGCTCGTGAAATCCTAGCCGATCTACTTACTCCAGTGGAGG
AGACGCATGATTTCTACAAGAAACAACAGCTAAGGGAACTGGCGCTTCTCAACGGTAGTC
TTAGAGAAGAAGGTTCTCCATCTCCAATGTCTGGTTCCGTCTCTCCTTACAATAATAGCC
TCGGCATGAAGAGAGCCAAGACAAGGGACTAAATAAAAACAAAACTCATCTCACCTTAAC
CACACTTCCCTTCTTCAAACAAGAAGGCTTTTGAAGGTTCCATCTCCATCTCCATCCCAT
CCCATCCTAGTCCTACTCGGGTGCTACCGGTACCCTTCATTATCATATATGACTGTCTGT
TTATTTATGTGTCCCGGAGAGAGAGAGTTCAGATGACAGAACTACAGGAGTCTGTATCTT
TGTGTATCCGTCTCTATCCGAGTGTTAGTTTTGGCTTTGCTTTTGTTATTTTTGGTTCAG
TGGAGACTAGCTAGTAATAAGCTTTGTTCCTTAATTTTGGGTAAAACATAATGGTTTGTG
TTTGGTAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A489TF U 1
AF RR4A489JQ C 562
BS 1 773 RR4A489TF
BS 774 1269 RR4A489JQ

RD RR4A489TF 773 0 0
GGACCGACGTGTGTGTGCGAGATTCACTTCCTCTCTCATCCTCCTCTGATCCCGCCGCCA
CCAAACACCTCCTAGCTCTCCTCCTATAGCTGTTAACTGTTATAAAGCCCGGTAACAAGC
AGCTGAGGAATAAGAAGACGTCCTGATGATGATGATGACTTCACTCGGTATGGATGGTGG
TGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAGGGAGATTTATGACGTATCCGCCGCCTCTTTCCGTGCC
TCCGTCGGCTCCTCAGTCACCTAACTTCTCTGGTGGTCTCCGATCACAGCCTTCTTTCCT
CGTTGAGCAAGAAAAATATCTTTCTGAATTACTTGCAGAGCGCCACAAGCTTACTCCCTT
CTTGCCTGTGCTCCCACATCTCTTCCGTCTCATGAACCAAGAGATCTCTTTCATCATCTC
CAGCACCAAATTGGCTAAACCCTCCTGGTAGCTCGTCCGGTCTCATTGTAAAGCGATCAA
TCAGAGTGGATATTCCAGTCGACAAGTATCCAAACTACAATTTCGTTGGACGTCTCTTGG
GACTTAGAGGAAACTCCCTAAAACGAGTTGAAGCGAGCTCTGAGTGCCGTGTTCTGATCA
GGGGGAGAGGCAGCATTAAAGACCCAGTCAAGGAGGAAATGATGAGAGGGAAACCAGGGT
ATGAGCACCTGAATGAACAGCTCCACATCTTAGTGGAGGCAGAGTTGCCCATTGAGATAG
TGGATGCACGTCTCATGCAAGCTCGTGAAATCCTAGCCGATCTACTTACTCCA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4A489JQ 708 0 0
AACGAGTTGAAGCGAGCTCTGAGTGCCGTGTTCTGATCAGGGGGAGAGGCAGCATTAAAG
ACCCAGTCAAGGAGGAAATGATGAGAGGGAAACCAGGGTATGAGCACCTGAATGAACAGC
TCCACATCTTAGTGGAGGCAGAGTTGCCCATTGAGATAGTGGATGCACGTCTCATGCAAG
CTCGTGAAATCCTAGCCGATCTACTTACTCCAGTGGAGGAGACGCATGATTTCTACAAGA
AACAACAGCTAAGGGAACTGGCGCTTCTCAACGGTAGTCTTAGAGAAGAAGGTTCTCCAT
CTCCAATGTCTGGTTCCGTCTCTCCTTACAATAATAGCCTCGGCATGAAGAGAGCCAAGA
CAAGGGACTAAATAAAAACAAAACTCATCTCACCTTAACCACACTTCCCTTCTTCAAACA
AGAAGGCTTTTGAAGGTTCCATCTCCATCTCCATCCCATCCCATCCTAGTCCTACTCGGG
TGCTACCGGTACCCTTCATTATCATATATGACTGTCTGTTTATTTATGTGTCCCGGAGAG
AGAGAGTTCAGATGACAGAACTACAGGAGTCTGTATCTTTGTGTATCCGTCTCTATCCGA
GTGTTAGTTTTGGCTTTGCTTTTGTTATTTTTGGTTCAGTGGAGACTAGCTAGTAATAAG
CTTTGTTCCTTAATTTTGGGTAAAACATAATGGTTTGTGTTTGGTAAT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6201Contig1 1104 2 4 U
CCACCCATCCTCCCCTCTTCCTCGGGCAACAAATCACCCTCCCTTGCTGATTCTGAAGAG
GAGATCGAGATCGAAGAGATCTCTAGCCAGCCACGATTTGGGGAGCACATCACCATGCCA
GGCGGCTACTACACCACGTTTCCACCTGACACCGATGAGTACGAGCCATCTGCCTCTACT
CGCTACCGATAGGAGGTACTCTGTCACCTTCTCTTGTATATACTAGCTTTTCTTTGTTTT
TTAGGATTTATTTTCGGTATCCCTCTCAGCTTAATAACACAGAGACTGTGTGACTTAAGT
TTGGGGGAGGTACCAAGTATTTAACCATGTTTGCTTTGATGGTCCTGCATTGAGTCCATG
CATTGTACTTATCTATTTGCATATATAAATAAAAAAAAAATTTGAAAAATCCGATAAAAA
CCAAAAAATTAAGCATGTAGTTGCATCAGCATCCTTTAAGTTTGAGTCTAGAAGCATTCA
TATAGGTTGCATCCATCTGCATAGGGAGCAATGATTTAAAATGCCTTGCAAAGAGCTTGT
TTAGCACTCAAAGTGACACCCTAGTTAAGCATATCAAGTAGCCTAAGCATCTCTTTAAAG
CCTTGCACGCTTCGAGCCTTGAAAACTCTTCTTGAAACTTGTGTGCTTGCTTGTCATTGA
CATTGCTCTGAAAACCAGCTCCAATCTGAACTTAGGCTTAAATGAACTTAATTTCTCTCA
CTTATGGGCATTTGCATACTTGATCATGGTTCTCATACACATTTGGGTTATCTTTGTCCA
TTGTACCACTCTTTGTTAACCCAAATGGAACTCCCTCACCCTTGAGCCCTTACCTTTCTT
TGAAGCCAACATTGATTTGCTTGAGTGAGGCCTTTTCCGATAGCTTGTCATGTGCAAAAT
CTTGAGAGTATTGGAGGTGACATGGATTTGTTCTCATCTCTTGCTAGCATAGGATCATTA
TTTGAGCTAGCTTCTAGGATGATGGTTGGGTGCATGTCCTAAATGAGTTCGTATCTTGGG
TTTGGGTAGTGAGAAACTTGAGAAAGATAAGCCTTAGGGACCTTAGAATGAAAAGAAAAG
AAAGCTCTAGATTGTGCTATTTGA


BQ
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AF RR4FW84TF U 1
AF RR4FW84JQ C 472
BS 1 673 RR4FW84TF
BS 674 674 RR4FW84JQ
BS 675 687 RR4FW84TF
BS 688 1104 RR4FW84JQ

RD RR4FW84TF 687 0 0
CCACCCATCCTCCCCTCTTCCTCGGGCAACAAATCACCCTCCCTTGCTGATTCTGAAGAG
GAGATCGAGATCGAAGAGATCTCTAGCCAGCCACGATTTGGGGAGCACATCACCATGCCA
GGCGGCTACTACACCACGTTTCCACCTGACACCGATGAGTACGAGCCATCTGCCTCTACT
CGCTACCGATAGGAGGTACTCTGTCACCTTCTCTTGTATATACTAGCTTTTCTTTGTTTT
TTAGGATTTATTTTCGGTATCCCTCTCAGCTTAATAACACAGAGACTGTGTGACTTAAGT
TTGGGGGAGGTACCAAGTATTTAACCATGTTTGCTTTGATGGTCCTGCATTGAGTCCATG
CATTGTACTTATCTATTTGCATATATAAATAAAAAAAAAATTTGAAAAATCCGATAAAAA
CCAAAAAATTAAGCATGTAGTTGCATCAGCATCCTTTAAGTTTGAGTCTAGAAGCATTCA
TATAGGTTGCATCCATCTGCATAGGGAGCAATGATTTAAAATGCCTTGCAAAGAGCTTGT
TTAGCACTCAAAGTGACACCCTAGTTAAGCATATCAAGTAGCCTAAGCATCTCTTTAAAG
CCTTGCACGCTTCGAGCCTTGAAAACTCTTCTTGAAACTTGTGTGCTTGCTTGTCATTGA
CATTGCTCTGAAA*CCAGCTCCAATCT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4FW84JQ 633 0 0
AAGCATTCATATAGGTTGCATCCATCTGCATAGGGAGCAATGATTTAAAATGCCTTGCAA
AGAGCTTGTTTAGCACTCAAAGTGACACCCTAGTTAAGCATATCAAGTAGCCTAAGCATC
TCTTTAAAGCCTTGCACGCTTCGAGCCTTGAAAACTCTTCTTGAAACTTGTGTGCTTGCT
TGTCATTGACATTGCTCTGAAAACCAGCTCCAATCTGAACTTAGGCTTAAATGAACTTAA
TTTCTCTCACTTATGGGCATTTGCATACTTGATCATGGTTCTCATACACATTTGGGTTAT
CTTTGTCCATTGTACCACTCTTTGTTAACCCAAATGGAACTCCCTCACCCTTGAGCCCTT
ACCTTTCTTTGAAGCCAACATTGATTTGCTTGAGTGAGGCCTTTTCCGATAGCTTGTCAT
GTGCAAAATCTTGAGAGTATTGGAGGTGACATGGATTTGTTCTCATCTCTTGCTAGCATA
GGATCATTATTTGAGCTAGCTTCTAGGATGATGGTTGGGTGCATGTCCTAAATGAGTTCG
TATCTTGGGTTTGGGTAGTGAGAAACTTGAGAAAGATAAGCCTTAGGGACCTTAGAATGA
AAAGAAAAGAAAGCTCTAGATTGTGCTATTTGA

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL6202Contig1 1080 2 2 U
GTACTTTGGTGATTCGATCATCGACACGGGAAATAATAATAATCTAACAACAGAAATGAA
ATGTAATTTTCGTCCCTATGGCATGAATTTTCCTACGGGAGTTGCCACCGGGAGATTCAG
CGATGGAAAGGTCGCTACTGATTATATATCCGAATATTTAGGACTAAAGCCGATTGTACC
GGCATATTTAGAACCCAACGTACAACTAGAAGAACTTCTCACTGGCGTATCATTTGCTTC
GGGTGGTAGTGGCTATCACTATTTAACATCCAAAATATCAAGGGTGAGGTCACTGTTGGA
GCAGTTGACATATTTTGAACAATACATAGCGAGGGCAACGAGGTTACTAGGGAAAGATAA
GACTAATCACTTATTAGCCAAGGGCTTAGCCATTGTGGTCGCAGGTAACAACGATCTGCT
TATTACATACTATGGTCAAGGTGCTCAATCGCTCATATACAACATTCACAACTTTACATC
AATGATGGCTAAGTCTGCCGCAAGTTTCGTTATGCAATTACATGGATATGAAGCAAGACA
AATAGCAGTGATAGGAACACCACCACTTGGATGTATACCAGCGCAAAGAAGCATAAAGGG
AGGTCCTCATAGAGACTGCGCTCAAGAACTAAACTATGCATTTCAGCTTTTCAATGCCAA
ACTCTTCATCACGTTGGATCAATTGACTCATGCCCTACCAAATTCAAATATCTTCTACAT
TGACATCTACTCTCCTTTCAGTGACATCATAGAAAACTCACAAGATTATGGGTTTGAGGA
AATAAAGAAAGGATGTTGTGGAACTGGACTTTTGGAAGCAGGTATACTCTGCAATCGATT
CACAACCGATGTGTGCTCCAATGTATCTGCTCACTTGTTTTGGGATAGTTTCCATCCTAC
CCAAAGATTCAATAAAATTGTAGCCAAAAAACTAATTAAGAGATACATCCACCATTTGAA
ATAAAATGTAACACTGTATGCTTTTCGTTATGCTAACGCAATAAAGCTAGATGTCTAAAG
TCACTGTAAATCACTCTATTGGTGTAAATTGACTCTATTAAAAATTCCATCACTGTTTAC


BQ
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AF RR4H523JQB C 415
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BS 592 1080 RR4H523JQB

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GGCATATTTAGAACCCAACGTACAACTAGAAGAACTTCTCACTGGCGTATCATTTGCTTC
GGGTGGTAGTGGCTATCACTATTTAACATCCAAAATATCAAGGGTGAGGTCACTGTTGGA
GCAGTTGACATATTTTGAACAATACATAGCGAGGGCAACGAGGTTACTAGGGAAAGATAA
GACTAATCACTTATTAGCCAAGGGCTTAGCCATTGTGGTCGCAGGTAACAACGATCTGCT
TATTACATACTATGGTCAAGGTGCTCAATCGCTCATATACAACATTCACAACTTTACATC
AATGATGGCTAAGTCTGCCGCAAGTTTCGTTATGCAATTACATGGATATGAAGCAAGACA
AATAGCAGTGATAGGAACACCACCACTTGGATGTATACCAGCGCAAAGAAG

QA 1 591 1 591
DS 

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TACATCAATGATGGCTAAGTCTGCCGCAAGTTTCGTTATGCAATTACATGGATATGAAGC
AAGACAAATAGCAGTGATAGGAACACCACCACTTGGATGTATACCAGCGCAAAGAAGCAT
AAAGGGAGGTCCTCATAGAGACTGCGCTCAAGAACTAAACTATGCATTTCAGCTTTTCAA
TGCCAAACTCTTCATCACGTTGGATCAATTGACTCATGCCCTACCAAATTCAAATATCTT
CTACATTGACATCTACTCTCCTTTCAGTGACATCATAGAAAACTCACAAGATTATGGGTT
TGAGGAAATAAAGAAAGGATGTTGTGGAACTGGACTTTTGGAAGCAGGTATACTCTGCAA
TCGATTCACAACCGATGTGTGCTCCAATGTATCTGCTCACTTGTTTTGGGATAGTTTCCA
TCCTACCCAAAGATTCAATAAAATTGTAGCCAAAAAACTAATTAAGAGATACATCCACCA
TTTGAAATAAAATGTAACACTGTATGCTTTTCGTTATGCTAACGCAATAAAGCTAGATGT
CTAAAGTCACTGTAAATCACTCTATTGGTGTAAATTGACTCTATTAAAAATTCCATCACT
GTTTAC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL6203Contig1 1314 2 4 U
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TCCTCCCACTGACTCTTCAATCACCTCTTCTGCTTTGCCCTTTCATGGACACCTCTCTCT
CCCACCAGGGATCCCTCCCTTTCCTCCCGTCGCGCCGCGATTTCCCAAGAACCGGCGGCG
TTTGCGCTCTTCTCCCTTGGCGGCGTCGTAAGGTCCGGTACGATTCGATGGTGGTTGTTG
CTGCGTCTGCGTCCGCGGGAGCTGGAGCTGGAGCTAGCCTCGACGCGCCTCTCGTCCCCC
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TCGCCGTCGCTGATTTGCTCAAGCAGCTCGCCCAAGACAAGGAAGCTGCTTTATCTCGCA
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AGAGCAACTGCCAAACCGCGGTTGAAGACATAATGTACATGTTGATCTTGTACAAATTCT
CAGAGATCAGAGTGCCTCTCCTCCCAAAGCTCTCCACTTGCATCTACAGCGGAAGACTCG
AGATCTGGCCTTCCAAAGACTGGGAGCTCGAATCAATCCATACCTGCGACGTTCTCGAGC
TCATCAAAGAACACAGCAACGCAGTCATCAGTTTGAGAGTTGATTCGACTCTGACCGACG
ATCTGGAGACGACCGAGATCGATAAGCATCATCTCAGCAGAGTGTACACGGCTTCGATCT
TGTACGGTTACTTTCTGAAGTCCGCTTCCCTAAGGCACCAGCTCGAATGCTCGCTGCTGT
CGGAAGGTATCGTCATCACGAAGCAGCTGAGACATTACATCTCCGGGTTCGATCCCAATA
TACTGCAGAGATGCGCAAAGCCGAGGTCGCGTGAGGCCAAGAACCTGATAGAGAAGCAGA
GCTTAGCTCTTTTCGGTCCTGAGGAGGGGAAGGACGAAGAGAGTGTCGTCGTTGCATCGT
TTTCGAGCTTGAAGAGGCTGCTTCTGGAGGCTGTGGCGTTTGGTACGTTTCTGTGGGACA
CGGAGGAGTATGTAGACGGCGCGTTTAAGCTCAAGGAGAATGAGAATGCAGAAGAGAATA
GCAGTGTCTTAAATGAGACCAGTTTGGTATCTTTTTTTGTGTGCACACTGCATATATATA
GAGGGAGCGATGAATGGTTTCTACAGGGCTATGAAAACTATTTGTTTTTTGTCTATAGTT
TGCGTGATTATATGTATAGTGTGTTGTTTATATAGAGAAGACAGTTTGGTTTCG


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AF RR4F413TF U 1
AF RR4F413JQ C 566
BS 1 744 RR4F413TF
BS 745 745 RR4F413JQ
BS 746 780 RR4F413TF
BS 781 1314 RR4F413JQ

RD RR4F413TF 784 0 0
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TCCTCCCACTGACTCTTCAATCACCTCTTCTGCTTTGCCCTTTCATGGACACCTCTCTCT
CCCACCAGGGATCCCTCCCTTTCCTCCCGTCGCGCCGCGATTTCCCAAGAACCGGCGGCG
TTTGCGCTCTTCTCCCTTGGCGGCGTCGTAAGGTCCGGTACGATTCGATGGTGGTTGTTG
CTGCGTCTGCGTCCGCGGGAGCTGGAGCTGGAGCTAGCCTCGACGCGCCTCTCGTCCCCC
GCTCCGCTCAGGGGAAGTTCCTAAGCTGCGTCTTGACGAAAAAGCGGCCTCTTTTTCACT
TCGCCGTCGCTGATTTGCTCAAGCAGCTCGCCCAAGACAAGGAAGCTGCTTTATCTCGCA
TGTTCCTCAGTTCTGGTTCCGATGAAGCTTCTCTCCACAGAAGGATAGCTCAACTCAAGG
AGAGCAACTGCCAAACCGCGGTTGAAGACATAATGTACATGTTGATCTTGTACAAATTCT
CAGAGATCAGAGTGCCTCTCCTCCCAAAGCTCTCCACTTGCATCTACAGCGGAAGACTCG
AGATCTGGCCTTCCAAAGACTGGGAGCTCGAATCAATCCATACCTGCGACGTTCTCGAGC
TCATCAAAGAACACAGCAACGCAGTCATCAGTTTGAGAGTTGATTCGACTCTGACCGACG
ATCTGGAGACGACCGAGATCGATA*GCATCATCTCAGCAGAGTGTACACGGCTTCGATCT
GTAC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4F413JQ 749 0 0
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GCTCGAATCAATCCATACCTGCGACGTTCTCGAGCTCATCAAAGAACACAGCAACGCAGT
CATCAGTTTGAGAGTTGATTCGACTCTGACCGACGATCTGGAGACGACCGAGATCGATAA
GCATCATCTCAGCAGAGTGTACACGGCTTCGATCTTGTACGGTTACTTTCTGAAGTCCGC
TTCCCTAAGGCACCAGCTCGAATGCTCGCTGCTGTCGGAAGGTATCGTCATCACGAAGCA
GCTGAGACATTACATCTCCGGGTTCGATCCCAATATACTGCAGAGATGCGCAAAGCCGAG
GTCGCGTGAGGCCAAGAACCTGATAGAGAAGCAGAGCTTAGCTCTTTTCGGTCCTGAGGA
GGGGAAGGACGAAGAGAGTGTCGTCGTTGCATCGTTTTCGAGCTTGAAGAGGCTGCTTCT
GGAGGCTGTGGCGTTTGGTACGTTTCTGTGGGACACGGAGGAGTATGTAGACGGCGCGTT
TAAGCTCAAGGAGAATGAGAATGCAGAAGAGAATAGCAGTGTCTTAAATGAGACCAGTTT
GGTATCTTTTTTTGTGTGCACACTGCATATATATAGAGGGAGCGATGAATGGTTTCTACA
GGGCTATGAAAACTATTTGTTTTTTGTCTATAGTTTGCGTGATTATATGTATAGTGTGTT
GTTTATATAGAGAAGACAGTTTGGTTTCG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6205Contig1 929 2 2 U
GGAAGGTCTTTGGTTTTCGTTTCGTGGTGTGGTCCTGTAATAATTTACACAAAAGAGAAC
CCCAACCCTAACTTTTTTTCTTTCCGTCTCCTCCCTCCCACCGCATCATCTCACGATGGA
ATTCAATGCCGCCGACTTCGAAAGGCTTGTGATGTTCGAGCATACTCGCAAAGCTTGTGA
GGCTCAGTACGTTAAGGATCCTCTCGATTCCGAGAATCTGCTGCAGTGGGGTGGAGCATT
GCTTGAGCTTGCTCAGTTCCAGGCTATTCCCGATGCCAAGCTCATGTTAGATGATGCTGT
TTCAAAGTTGGAAGAGGTGTTGACAATAAATCCAGGGAAGCATCAGGCTCTTTGGTGTAT
CGGCAACGCCTACACCGCCCACGCCTTCCTTACCCCTGATCCCGATGCTGCCAAACTTCA
CTTTGATAAAGCCTCTGATTTTTTCCAAAAAGCTGAAAATGAGGATCCAGGTAATGAGAT
GTACCTCAAGTCCTTGGAAGTTACAGCAAGGGCCCCGGCGCTGCATATGAACATACATGC
GGATGGGATGATGATGCAGCAGTCATTAGGTGGAGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGAGGGGG
TCCCTCAGCCTCATCAAATGCTGGCGGTGGTAAGAAGAAGAATAAGAAGGTTAACAACGA
CTTCACTTACGATGTATGTGGTTGGATCATTCTCGCTTGTGGGATTGTTGCTTGGGTTGG
CATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCTCCTCCTGCTAGATAATACATTCCTCGAGGAATTAA
TGTCTGCTAGTTCACGTTTTCCAAACAGAGCGGTCCTAAGCCCTGTGACTATGGTTTTGT
TTTGCTTCCTGTACACGTCCATCAAATCGTTTTGTTACTTTATCTTAGGATGTCTTTTTT
CTCTATAATCGATATATTCGATTTCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GK07TF U 1
AF RR4GK07JQ C 363
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BS 572 929 RR4GK07JQ

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CCCAACCCTAACTTTTTTTCTTTCCGTCTCCTCCCTCCCACCGCATCATCTCACGATGGA
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GGCTCAGTACGTTAAGGATCCTCTCGATTCCGAGAATCTGCTGCAGTGGGGTGGAGCATT
GCTTGAGCTTGCTCAGTTCCAGGCTATTCCCGATGCCAAGCTCATGTTAGATGATGCTGT
TTCAAAGTTGGAAGAGGTGTTGACAATAAATCCAGGGAAGCATCAGGCTCTTTGGTGTAT
CGGCAACGCCTACACCGCCCACGCCTTCCTTACCCCTGATCCCGATGCTGCCAAACTTCA
CTTTGATAAAGCCTCTGATTTTTTCCAAAAAGCTGAAAATGAGGATCCAGGTAATGAGAT
GTACCTCAAGTCCTTGGAAGTTACAGCAAGGGCCCCGGCGCTGCATATGAACATACATGC
GGATGGGATGATGATGCAGCAGTCATTAGGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4GK07JQ 567 0 0
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TTGATAAAGCCTCTGATTTTTTCCAAAAAGCTGAAAATGAGGATCCAGGTAATGAGATGT
ACCTCAAGTCCTTGGAAGTTACAGCAAGGGCCCCGGCGCTGCATATGAACATACATGCGG
ATGGGATGATGATGCAGCAGTCATTAGGTGGAGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGAGGGGGTC
CCTCAGCCTCATCAAATGCTGGCGGTGGTAAGAAGAAGAATAAGAAGGTTAACAACGACT
TCACTTACGATGTATGTGGTTGGATCATTCTCGCTTGTGGGATTGTTGCTTGGGTTGGCA
TGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCTCCTCCTGCTAGATAATACATTCCTCGAGGAATTAATG
TCTGCTAGTTCACGTTTTCCAAACAGAGCGGTCCTAAGCCCTGTGACTATGGTTTTGTTT
TGCTTCCTGTACACGTCCATCAAATCGTTTTGTTACTTTATCTTAGGATGTCTTTTTTCT
CTATAATCGATATATTCGATTTCCTCT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

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AAAAAGAAAAGAGAAATCAGCCTATCCGTCACATTCTTGGGGTTCATTGCAATCTTTTAG
TACACGCAAGAGTATTAATGTAGACTTCTTACTGATCAGTTCAAAATAACTGCCAATCTA
CCAGCAAGTGTTGTCAAACAGAGAATAACAAAAAAACTAGTGCTTAGTACAAAGAGATGA
TTACTGGATTGCATATTATACCAAAGCTAAAAAAATCTGCCCACTGGTTCAAGAGCTTCC
ACGGGGACAATGCTGTTTCCTCTAATCACCACCATGCCAATGTCGGTTTTGTCATCACCG
TTCACCTCAACAGTGTTGTCAACAACAAGATTCATGAACTGGTCAAACCCACGCAAAGTT
CCGACGACCATTCGGTTAGCATTAAGCTTGATTTGAAGTTTCTTGTCCATGTACTTCTTG
AGATCCGGAGGCTGACCTGACCGACTCATCGCTGCAGAATCCGAATTGAGCTTGGTTTTT
CTTTCGTAGAAGAAGTTTGCAGTGCGGCACAGAGACTTTAGAGAAACCCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G923JQ U 145
AF RR4G923TF C 1
BS 1 144 RR4G923TF
BS 145 370 RR4G923JQ
BS 371 534 RR4G923TF

RD RR4G923JQ 226 0 0
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AGCTAAAAAAATCTGCCCACTGGTTCAAGAGCTTCCACGGGGACAATGCTGTTTCCTCTA
ATCACCACCATGCCAATGTCGGTTTTGTCATCACCGTTCACCTCAACAGTGTTGTCAACA
ACAAGATTCATGAACTGGTCAAACCCACGCAAAGTTCCGACGACCA

QA 1 226 1 226
DS 

RD RR4G923TF 534 0 0
AAAAAGAAAAGAGAAATCAGCCTATCCGTCACATTCTTGGGGTTCATTGCAATCTTTTAG
TACACGCAAGAGTATTAATGTAGACTTCTTACTGATCAGTTCAAAATAACTGCCAATCTA
CCAGCAAGTGTTGTCAAACAGAGAATAACAAAAGAACTAGTGCTTAGTACAAAGAGATGA
TTACTGGATTGCATATTATACCAAAGCTAAGAAGATCTGCCCACTGGTTCAAGAGCTTCC
ACGGTGACAATGCTGTTTCCTCTAATCACCACCATGCCAATGTCGGTTTTGTCATCACCG
TTCACCTCAACAGTGTTGTCAACAACAAGATTCATGAACTGGTCAAACCCACGCAGAGTT
CCGACGACCATTCGGTTAGCATTAAGCTTGATTTGAAGTTTCTTGTCCATGTACTTCTTG
AGATCCGGAGGCTGACCTGACCGACTCATCGCTGCAGAATCCGAATTGAGCTTGGTTTTT
CTTTCGTAGAAGAAGTTTGCAGTGCGGCACAGAGACTTTAGAGAAACCCTACCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL6207Contig1 321 2 1 U
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CATCCCCACCAAAGCATCCGCTTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTTCATCTTCTTCACT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL79TF U 3
AF RR4CU22TF U 1
BS 1 321 RR4CU22TF

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TCC
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TCGGACCAGCTAAAGCTGATGAACAGTTATC

QA 4 214 4 214
DS 

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CATCCCCACCAAAGCATCCGCTTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTTCATCTTCTTCACT
GTCTCTCACTCGGCGGGACCTTCTCTACCAATCGGCGGCAGTATCACTCTCCCTTTCCTC
CATCGTCGGACCAGCTAAAGCTGATGAACAGTTATCCGAATGGGAAAGAGTCTTCCTCCC
AATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGCTTTCGTCCCCGACGAGCCTAGCCGCGG
GTTTCTACTGGGGACGAGGCA

QA 1 321 1 321
DS 



AS 1 2

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CTCCACATCTACTCCTTTTTGATCCCTTCATCACAGAACTGACCAGTAATATTAGTTTTG
TCTTCAGTAACTAATCCATCATAGTGCAAAAGCAGCGGCCATAGCGAAAACAAGTGACAT
CAAGACACTGATACCGCCTCTATGTCCTGAGCTCTTCTTTGGGAAATGTTTAGGAAGCGC
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TTGGAACATAACGGTTCTGTTGTTCGGTGGAACACGTGTGCCGTTAAAGGAGTAAACGTT
TTCATACCCTTTACCTGATTTTCCCATCTCAACCGCCGCAAACCAATCCTCAAACGCAAA
GTCTCTCCAGTTAAAAACAGTTAACCTAGCGGTCCAACCGTTTCTGTAATCAGTGTTAAC
ATGCCAGTTAATGCTAACTCCACAGTTATCAGGACAAGGGAGTTTCTTAGGTATTGGCAT
GTGGTTTCGCTTAGCCCAAGCTTTAGCTTTTAGGGTTCGGTTATCAAACGGAACAAGTAG
AGTGTCTGGAGGGAGGAGGAGAGGGTTACGGTCAGCATTGCAAGTGTTGGTATCGATGTC
GTTGCATCCACAAGCGCAAGTGTTACAAGGAATGGCAGAGTTGTTGTAATAGGCAGAGAA
TGAGACACAACATCTCGAGGCTTGTGCTTTAGGTTTGGTTATGTTGCAGACAATTTGCCA
GCTGGAGATTGCATAGGTTACGGCCGGTAGACCGCTAGAATCCGGGAACTTAGACGGGTC
AACCCGAACCGGTGGCCCGCATTTGTACTGTGGGTTGAGAACTCCATCTACTTTCCAGTG
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CAAAACAAATATAAGTTCCACAAATATAAATGTTTTTCTTAAAAAGTATTAGTTCATAGA
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CTTAAGACTTTCTAACTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AM63TF U 1
AF RR4AM63JQ C 559
BS 1 688 RR4AM63TF
BS 689 1279 RR4AM63JQ

RD RR4AM63TF 688 0 0
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TCTTCAGTAACTAATCCATCATAGTGCAAAAGCAGCGGCCATAGCGAAAACAAGTGACAT
CAAGACACTGATACCGCCTCTATGTCCTGAGCTCTTCTTTGGGAAATGTTTAGGAAGCGC
ACATTCTTCTCCATTAAAGAAGAGCTTTGTCGGAAACCCGTCTCCTTCAGCTATTTTCAA
GCCATTAATGTTCTTCTTGGTGAAGGAGATAACAGATTGTTGCTTTCCAGGCACGGGAGG
GTCTCTTAACGGATGTGTTCCGTTAACTTGACCCACAAGATAGTTCAAACCAGGCAACCC
TTGGAACATAACGGTTCTGTTGTTCGGTGGAACACGTGTGCCGTTAAAGGAGTAAACGTT
TTCATACCCTTTACCTGATTTTCCCATCTCAACCGCCGCAAACCAATCCTCAAACGCAAA
GTCTCTCCAGTTAAAAACAGTTAACCTAGCGGTCCAACCGTTTCTGTAATCAGTGTTAAC
ATGCCAGTTAATGCTAACTCCACAGTTA

QA 1 688 1 688
DS 

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AGTTAACCTAGCGGTCCAACCGTTTCTGTAATCAGTGTTAACATGCCAGTTAATGCTAAC
TCCACAGTTATCAGGACAAGGGAGTTTCTTAGGTATTGGCATGTGGTTTCGCTTAGCCCA
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AGTGTTACAAGGAATGGCAGAGTTGTTGTAATAGGCAGAGAATGAGACACAACATCTCGA
GGCTTGTGCTTTAGGTTTGGTTATGTTGCAGACAATTTGCCAGCTGGAGATTGCATAGGT
TACGGCCGGTAGACCGCTAGAATCCGGGAACTTAGACGGGTCAACCCGAACCGGTGGCCC
GCATTTGTACTGTGGGTTGAGAACTCCATCTACTTTCCAGTGCTGAGGTGGGTATAGAGC
TGTTCTGTTCAGATCAGGAGGCAACTTCCAAACCTAACACAACAAAACAAATATAAGTTC
CACAAATATAAATGTTTTTCTTAAAAAGTATTAGTTCATAGAAATAGATAGCTTTTGTGT
GTTTCTTATTTCAATAATTTTTGTTGTGATAACTGTGATGATCTTAAGACTTTCTAACTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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TCCATCACATATATTTTTCAGGCTCCAAGTTCCACTCACTTGCATGAATCTTCAACTCCT
CCTGAGCTACTTGCTTTTTTAATCACCATAACCAAACTGCTCAAAGTATTTCTCGATATC
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CTGCCGCACGTACTTCCGCTGTGATCACCAGGTCTTTAAGGACGGCCTTCTCGAGCATTG
CTTCGAACCAAAGAGTAAACACACCAATGTGCACTCCTCCCTCTGCAGTGACCAGAGGCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G084TF C 1
AF RR4ES28JQ U 89
BS 1 88 RR4G084TF
BS 89 97 RR4ES28JQ
BS 98 98 RR4G084TF
BS 99 699 RR4ES28JQ

RD RR4G084TF 299 0 0
ACAACCCCAAACACGACAACTAGTCATTAGTCACCACGCGGGTCATTTGTTCATGAAGAC
ATACGAAATAAGTTATCACAATTTTTGTCCTCAAATTATAAGTCTGAAATTTAAAAAACA
AAGTTTTACATATTTATATTCATATGAAAGATTAAAAACAAAAGTTCCACACTCCATGCC
TCCATCACATATATTTTTCAGGCTCCAAGTTCCACTCACTTGCATGAATCTTCAACTCCT
CCTGAGCTACTTGCTTTTTTAATCACCATAACCAAACTGCTCAAAGTATTTCTCGATA
C

QA 1 298 1 298
DS 

RD RR4ES28JQ 611 0 0
CCTCAAATTCTAAGTCTGAAATTTAAAAAACAAAGTTTTACATATTTATATTCATATGAA
AGATTAAAAACAAAAGTTCCACACTCCATGCCTCCATCACATATATTTTTCAGGCTCCAA
GTTCCACTCACTTGCATGAATCTTCAACTCCTCCTGAGCTACTTGCTTTTTTAATCACCA
TAACCAAACTGCTCAAAGTATTTCTCGATATCTCCTTCAATAGCAGCAGCCAGACGCGCC
CTCACGCACATGTCTCGCTCTGATATGTTCTTCTGCCGCACGTACTTCCGCTGTGATCAC
CAGGTCTTTAAGGACGGCCTTCTCGAGCATTGCTTCGAACCAAAGAGTAAACACACCAAT
GTGCACTCCTCCCTCTGCAGTGACCAGAGGCACCAACCGCCCTAATAACGAAAGAATTTT
ATTCTCGTCCCCCGGATGTGAATTCATATGATCCTTAAGCTGATACAATGTCCACCCTAA
AGTAGGTTCATCGGCATCTAGAGCCAAAGTGATGGCTTCTTCATAGTAGCGATTTACAAT
GGAAACGGAAATTTGTTGTTTAGTGCTACCGCCAGTAACAGTAGCAACAACATGAGCAGC
TCTGGTCGCAG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6210Contig1 206 2 1 U
GGGCGGAGGACATCGTCGTCGTCGGAGTTTTGGGGGAGTGAGAGTGCCACGGTGATTGCC
CCCCGTTGTTGCTGTTGCTATTGCTCATCGCTGCTACTCTTTCCATTTAATTAATTTCAA
TTATCTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTATTTTTTCTTTTAATACTGACTGGTACAGTGATT
TAAATAGAGTGATTTAGTACTGTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CT52JQ C 1
AF RR4CT52TF U 1
BS 1 206 RR4CT52TF

RD RR4CT52JQ 206 0 0
GGGCGGAGGACATCGTCGTCGTCGGAGTTTTGGGGGAGTGAGAGTGCCACGGTGATTGCC
CCCCGTTGTTGCTGTTGCTATTGCTCATCGCTGCTACTCTTTCCATTTAATTAATTTCAA
TTATCTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTATTTTTTCTTTTAATACTGACTGGTACAGTGATT
TAAATAGAGTGATTTAGTACTGTGTG

QA 1 206 1 206
DS 

RD RR4CT52TF 206 0 0
GGGCGGAGGACATCGTCGTCGTCGGAGTTTTGGGGGAGTGAGAGTGCCACGGTGATTGCC
CCCCGTTGTTGCTGTTGCTATTGCTCATCGCTGCTACTCTTTCCATTTAATTAATTTCAA
TTATCTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTATTTTTTCTTTTAATACTGACTGGTACAGTGATT
TAAATAGAGTGATTTAGTACTGTGTG

QA 1 206 1 206
DS 



AS 1 2

CO CL6211Contig1 884 2 10 U
GGAATCTAGGGTTTACGCACGCCACTGAGAGTTCATCGCAGAGAACACACAGAGAGACAG
AGAAAATGCCGGCGGCTAAGCAGAGGACCCCGAAAGTAAGCCGGAACCCTGATCTGATCA
GAGGCGTCGGCAAATACTCTCGCTCTCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCA
AGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGTCACGACGTTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCTGG
TTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGGC
GCAAGCCTAAGCCTACCAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCC
TTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACTCACTTCTGGTTTGC
TTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGTGTTAACCAGTCGT
ACGTGATTGGGACCTCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAACACTGAGAAATTCGATG
ACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGAAGGCGCGTTCTTTG
AAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAAGAGAAGAAGGAAGACCAGAAAACCG
TAGACGCAGCTCTGATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCG
CCAGGTTCTCTCTGTCACAAGGAATGAAACTACATGAGCTTGTCTTCTAGATTTCATCGT
CTTATCGTTTTGTTTCCCTTCATGTCTCAACAACATCTGTTTTCCCCTGAGAGTTTTTGT
CCCTGGATCTTAAGAAATACACTATTTTCTCTGATTTATATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B679TF U 1
AF RR4B679JQ C 105
BS 1 741 RR4B679TF
BS 742 742 RR4B679JQ
BS 743 809 RR4B679TF
BS 810 810 RR4B679JQ
BS 811 822 RR4B679TF
BS 823 823 RR4B679JQ
BS 824 852 RR4B679TF
BS 853 853 RR4B679JQ
BS 854 866 RR4B679TF
BS 867 884 RR4B679JQ

RD RR4B679TF 866 0 0
GGAATCTAGGGTTTACGCACGCCACTGAGAGTTCATCGCAGAGAACACACAGAGAGACAG
AGAAAATGCCGGCGGCTAAGCAGAGGACCCCGAAAGTAAGCCGGAACCCTGATCTGATCA
GAGGCGTCGGCAAATACTCTCGCTCTCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCA
AGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGTCACGACGTTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCTGG
TTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGGC
GCAAGCCTAAGCCTACCAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCC
TTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACTCACTTCTGGTTTGC
TTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGTGTTAACCAGTCGT
ACGTGATTGGGACCTCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAACACTGAGAAATTCGATG
ACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGAAGGCGCGTTCTTTG
AAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAAGAGAAGAAGGAAGACCAGAAAACCG
TAGACGCAGCTCTGATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCG
CCAGGTTCTCTCTGTCACAAG*AATGAAACTACATGAGCTTGTCTTCTAGATTTCATCGT
CTTATCGTTTTGTTTCCCTTCATGTCTCA*CAACATCTGTTT*CCCCTGAGAGTTTTTGT
CCCTGGATCTTA*GAAATACACTATT

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR4B679JQ 780 0 0
AACCCTGATCTGATCAGAGGCGTCGGCAAATACTCTCGCTCTCAAATGTACCACAAGAGA
GGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGTCACGACGTTAAGTCC
AAGGTCGAAGCTCTGGTTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTTAAGAAG
CCGCTCGCCAACAGGCGCAAGCCTAAGCCTACCAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGA
ACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAA
CTCACTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGA
CGTGTTAACCAGTCGTACGTGATTGGGACCTCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAAC
ACTGAGAAATTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGACGAAGAAAGGA
GAAGGCGCGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAAGAGAAGAAG
GAAGACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTCTGATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTC
AAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCTCTGTCACAAGGAATGAAACTACATGAGCTTGTC
TTCTAGATTTCATCGTCTTATCGTTTTGTTTCCCTTCATGTCTCAACAACATCTGTTTTC
CCCTGAGAGTTTTTGTCCCTGGATCTTAAGAAATACACTATTTTCTCTGATTTATATATC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6212Contig1 855 2 20 U
AGGGCTCCTTGAAACATCCTTCTCCTTCTTCCAAGAGATCAATTCCTTCATCGCTAATCT
TCGGAGAGAGAGAGATTCAAAAAACAATGGTGAAGATCTGTTGTATTGGAGCTGGATATG
TTGGTGGTCCAACAATGGCTGTGATCGCACTCAAATGTCCACACATAGAAGTAGCAGTCG
TTGACATCTCTGTTCCACGTATCAACGCATGGAACAGTGACCAGCTTCCCATCTACGAGC
CAGGTCTTGAAGACATCGTCAAGCAATGCAGAGGCTAAAACCTCTTCTTCAGCACCGACG
TTGAGAAACACGTGCGGGAAGCTGATATCGTCTTTGTCTCCGCCAACACCCCAACCAAAA
CCACCGGTCTCGGAGCTGGCAAAGCCGCGGATCTCACTTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTA
TGATCGCCGATGTTTCGGCTTCCGATAAGATCGTCGTTGAGAAATCCACTGTCCCTGTCA
AAACGGCTGAAGCCATCGAGAAGATTCTGATGCATAACAGTAAAGGGATCAAGTTCCAGA
TCCTGTCCAACCCTGAGTTTCTTCCGGAAGGTACTGCGATCGCTGATCTTTTCAACCGTG
ACCGTGTTCTCATTGGAGGACGAGAGACGCCTGATGGTTTCAAAGCTGTTCAGACGCTTA
AGGAAGTGTATGCCAACTGGGTTCCTGAAGACCAGATCATCACAACCAATCTCTGGTCCG
CTGAGCTCTCCAAGCTGGCGGCAAACGCTTTCTTGGCTCAAAGGATTTCTTCCGTGAACG
CCATGTCGGCTCTTTGTGAATCCACCGGTGCTGATGTCACTCAAGTGGCTTACGCCGTCG
GTACGGATTCGAGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ18TF U 1
AF RR4EL75TF U 515
BS 1 555 RR4DQ18TF
BS 556 556 RR4EL75TF
BS 557 563 RR4DQ18TF
BS 564 564 RR4EL75TF
BS 565 594 RR4DQ18TF
BS 595 595 RR4EL75TF
BS 596 597 RR4DQ18TF
BS 598 598 RR4EL75TF
BS 599 662 RR4DQ18TF
BS 663 663 RR4EL75TF
BS 664 688 RR4DQ18TF
BS 689 689 RR4EL75TF
BS 690 692 RR4DQ18TF
BS 693 693 RR4EL75TF
BS 694 730 RR4DQ18TF
BS 731 731 RR4EL75TF
BS 732 744 RR4DQ18TF
BS 745 745 RR4EL75TF
BS 746 759 RR4DQ18TF
BS 760 855 RR4EL75TF

RD RR4DQ18TF 759 0 0
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TCGGAGAGAGAGAGATTCAAAAAACAATGGTGAAGATCTGTTGTATTGGAGCTGGATATG
TTGGTGGTCCAACAATGGCTGTGATCGCACTCAAATGTCCACACATAGAAGTAGCAGTCG
TTGACATCTCTGTTCCACGTATCAACGCATGGAACAGTGACCAGCTTCCCATCTACGAGC
CAGGTCTTGAAGACATCGTCAAGCAATGCAGAGGCTAAAACCTCTTCTTCAGCACCGACG
TTGAGAAACACGTGCGGGAAGCTGATATCGTCTTTGTCTCCGCCAACACCCCAACCAAAA
CCACCGGTCTCGGAGCTGGCAAAGCCGCGGATCTCACTTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTA
TGATCGCCGATGTTTCGGCTTCCGATAAGATCGTCGTTGAGAAATCCACTGTCCCTGTCA
AAACGGCTGAAGCCATCGAGAAGATTCTGATGCATAACAGTAAAGGGATCAAGTTCCAGA
TCCTGTCCAACCCTGGGTTTCTTGCGGAAGGTACTGCGATCGCTGATCTTTTCACCC*TG
ACCGTGTTCTCATTGGAGGACGAGAGACGCCTGATGGTTTCAAAGCTGTTCAGACGCTTA
AG*AAGTGTATGCCAACTGGGTTCCTGA*GAC*AGATCATCACAACCAATCTCTGGTCCG
CTGAGCTCTC*AAGCTGGCGGCAA*CGCTTTCTTGGCTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4EL75TF 341 0 0
G
AACAGTAAAGGGATCAAGTTCCAGATCCTGTCCAACCCTGAGTTTCTTCCGGAAGGTACT
GCGATCGCTGATCTTTTCAACCGTGACCGTGTTCTCATTGGAGGACGAGAGACGCCTGAT
GGTTTCAAAGCTGTTCAGACGCTTAAGGAAGTGTATGCCAACTGGGTTCCTGAAGACCAG
ATCATCACAACCAATCTCTGGTCCGCTGAGCTCTCCAAGCTGGCGGCAAACGCTTTCTTG
GCTCAAAGGATTTCTTCCGTGAACGCCATGTCGGCTCTTTGTGAATCCACCGGTGCTGAT
GTCACTCAAGTGGCTTACGCCGTCGGTACGGATTCGAGAA

QA 2 341 2 341
DS 



AS 1 2

CO CL6213Contig1 566 2 5 U
GGGTGGATTAGGGTTAACTTTAATATCTCTTCTCTTCTCGTGAGCGCAAACCAACGAAAT
CGAGATCGAAAATGGCGATGAGGAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAAGTGAAGG
AGCTTCCTTCCTACATCAAATCGTCGTTTTCGACGCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGA
AAGGTCTCGATAACTACAACGACAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCC
ACATCTGCTTCGGAGGCATGGCTTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCC
ATCTCGAGCACCAGCAGCATGCCAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTT
TCTGCGATGGTGTGACGGCTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATC
TCCTGGATTTGATATTATTTATTGATCTAAAGGAAAACCTTTTTCCTTTTTTTTTTCTTT
TCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAAT
ATAAGCTGTGGATTCAGCATTTCGTT


BQ
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AF RR4CQ22TF U 1
AF RR4CV19TF U 347
BS 1 429 RR4CQ22TF
BS 430 430 RR4CV19TF
BS 431 463 RR4CQ22TF
BS 464 465 RR4CV19TF
BS 466 566 RR4CQ22TF

RD RR4CQ22TF 566 0 0
GGGTGGATTAGGGTTAACTTTAATATCTCTTCTCTTCTCGTGAGCGCAAACCAACGAAAT
CGAGATCGAAAATGGCGATGAGGAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAAGTGAAGG
AGCTTCCTTCCTACATCAAATCGTCGTTTTCGACGCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGA
AAGGTCTCGATAACTACAACGACAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCC
ACATCTGCTTCGGAGGCATGGCTTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCC
ATCTCGAGCACCAGCAGCATGCCAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTT
TCTGCGATGGTGTGACGGCTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATC
TCCTGGATT*GATATTATTTATTGATCTAAAGGAAAACCTTTT**CTTTTTTTTTTCTTT
TCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAAT
ATAAGCTGTGGATTCAGCATTTCGTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4CV19TF 220 0 0
TCCAGATGTTGGTTTCTGCGATGGTGTGACGGCTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCT
TATTTTCCTGAATCTCCTGGATTTGATATTATTTATTGATCTAAAGGAAAACCTTTTTCT
TTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTT
TCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGGATTCAGCATTTCGTT

QA 1 220 1 220
DS 



AS 1 2

CO CL6214Contig1 1040 2 2 U
GGGTTGACAAGGAGAGGAACCCAACTGTATTGAATGTTACTTTTCCCCCGTTGAGCTGTT
CTTCACTAACGACCGATCCAATCTCTATCTTTCCAACTCTCTCTCTCCCCTCCAATCTCG
AGATCTGTCCCCCAGAGATACGGAATGGAAAAGAAAGAGACCCAAAAACATGTGGTAGAG
AGTGTAGCAGGAGCTGAGCAAGAGAATGGGATCTTGATAGAAGATGAGATCGAGAGGAGC
AAAGTCGGCATCCTGAGAGCTCTTTGCGACCGACAAGATCCCTCCACTAAGGAAGTGGAT
GACCCGATGATGAGGCGGTTTCTGAGGGCGCGTGACATGGACATTGAAAAGGCTTCAACG
CTCTTCCTCAAGTACCTTGCTTGGAAAAAAAGTTTCCTCCCAAAGGGGTGCATACCTAAA
TCAGAGATCGGCAACGAACTGTCGCACAAGAAAGTGTGTATGCAGGGACATGACAAAATG
GGTCGTCCTATCGTTGTTTCCTTTGGGAACAGACATAACCCTTCCAAAGGCAACCCTGAC
GAGTTCAAGCGTTTTGTAGTCTACACGCTGGAGAAGATATGTGCTAGAATGCCAAAAGGT
GTAGAAAAGTTCATATCCATAGGAGATTTGCAAGGGTGGGGATATTCTAACTGTGACATC
CGGGGGTACCTTGCTGCTCTTTCCACTTTGCAGGATTGCTACCCGGAGAGACTGGGGAAA
CTTTACATAGTGCATGCCCCCTACATTTTCATGACCGCATGGAAGGTCGTTTACCTCTTT
ATCGACACCAACACCAAGAAAAAGATTGTTTTTGTGGAGAACAAGAAACTCACAGAAACT
TTGCTTGAAGACATAGACGAAACCCAACTTCCAGACATTTACGGTGGCAAGATGCCACTT
ACTCCTATTCAGGACTCCTAATGACGGATGATATTACTTACTACTTTTTTATTTCCAAAC
AATTACCCTACTTACTATTCTTTGTATTTTGAATTAAACCTTAAAAAGCTTATCGAGTAT
TGCCAATTTTATAGTTAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FO60TF U 1
AF RR4FO60JQ C 388
BS 1 592 RR4FO60TF
BS 593 1040 RR4FO60JQ

RD RR4FO60TF 592 0 0
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CTTCACTAACGACCGATCCAATCTCTATCTTTCCAACTCTCTCTCTCCCCTCCAATCTCG
AGATCTGTCCCCCAGAGATACGGAATGGAAAAGAAAGAGACCCAAAAACATGTGGTAGAG
AGTGTAGCAGGAGCTGAGCAAGAGAATGGGATCTTGATAGAAGATGAGATCGAGAGGAGC
AAAGTCGGCATCCTGAGAGCTCTTTGCGACCGACAAGATCCCTCCACTAAGGAAGTGGAT
GACCCGATGATGAGGCGGTTTCTGAGGGCGCGTGACATGGACATTGAAAAGGCTTCAACG
CTCTTCCTCAAGTACCTTGCTTGGAAAAAAAGTTTCCTCCCAAAGGGGTGCATACCTAAA
TCAGAGATCGGCAACGAACTGTCGCACAAGAAAGTGTGTATGCAGGGACATGACAAAATG
GGTCGTCCTATCGTTGTTTCCTTTGGGAACAGACATAACCCTTCCAAAGGCAACCCTGAC
GAGTTCAAGCGTTTTGTAGTCTACACGCTGGAGAAGATATGTGCTAGAATGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4FO60JQ 653 0 0
AAAAGTTTCCTCCCAAAGGGGTGCATACCTAAATCAGAGATCGGCAACGAACTGTCGCAC
AAGAAAGTGTGTATGCAGGGACATGACAAAATGGGTCGTCCTATCGTTGTTTCCTTTGGG
AACAGACATAACCCTTCCAAAGGCAACCCTGACGAGTTCAAGCGTTTTGTAGTCTACACG
CTGGAGAAGATATGTGCTAGAATGCCAAAAGGTGTAGAAAAGTTCATATCCATAGGAGAT
TTGCAAGGGTGGGGATATTCTAACTGTGACATCCGGGGGTACCTTGCTGCTCTTTCCACT
TTGCAGGATTGCTACCCGGAGAGACTGGGGAAACTTTACATAGTGCATGCCCCCTACATT
TTCATGACCGCATGGAAGGTCGTTTACCTCTTTATCGACACCAACACCAAGAAAAAGATT
GTTTTTGTGGAGAACAAGAAACTCACAGAAACTTTGCTTGAAGACATAGACGAAACCCAA
CTTCCAGACATTTACGGTGGCAAGATGCCACTTACTCCTATTCAGGACTCCTAATGACGG
ATGATATTACTTACTACTTTTTTATTTCCAAACAATTACCCTACTTACTATTCTTTGTAT
TTTGAATTAAACCTTAAAAAGCTTATCGAGTATTGCCAATTTTATAGTTAGTG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL6215Contig1 1328 2 2 U
GGACTCCCATCAAAGCAGCTATCTCTCTCCTCCACATTCCATTTTCTCACTTCTCCAAAA
AGCTCTGCACTTTCTCAAACAGAATGTTCATGGGAAGAATGGGTCTTTTGGGGATTTTCC
TGTTGGGTTTTGCTGCAATGGCGTCCTCTGTTCATGGTTACGATGCTGGGTGGGTCAATG
CTCATGCCACTTTCTATGGTGGAAGCGATGCTTCAGGAACAATGGGTGGAGCTTGTGGGT
ACGGTAACCTCTACAGCCAGGGATACGGGACCAACACGGCTGCGCTAAGCACCGCGCTGT
TCAACAACGGTCTTAGCTGCGGCGCGTGTTTCGAGATCCGGTGCCAGAGCGACGGCGCGT
GGTGTTTACCTGGTGCTATCGTGGTTACGGCAACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGCTC
TGCCCAACAACGCGGGTGGCTGGTGTAACCCTCCGCTTCACCATTTCGATCTCTCTCAGC
CTATCTTCCAGCGCATTGCTCATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAGGG
TTCCGTGTAAGAGAAGGGGAGGCATAAGATTTACAATCAACGGCCACTCTTACTTTAACC
TTGTCTTGGTCACCAATGTTGGAGGCGCAGGAGATGTTCACTCTGTTGCGGTTAAAGGTT
CAAGGACAAAGTGGCAGCAAATGTCTAGGAACTGGGGTCAAAACTGGCAAAGCAACAATC
TCCTTAATGGTCAAGCTTTGTCCTTTAAGGTTACGGCTAGTGATGGTCGAATCGTCGTCT
CCAACAACGTCGCTCCTGCTAGTTGGTCCTTCGGACAAACTTTCACCGGCCGCCAGTTTC
GTTGAATGTGTGTCTGCTTCGGTTTGATATAGTTTAGGGTTTGTGGTAGTGTCAGGTGGT
GGAGAGAAAGAAAAGAGGTTATATGGCTTTTTAGGGTTTTATTTTGAGAGCCATTGAACT
TCTTTCATCTCAGAGGGTAAAATGGAAAAAGAGCTAATTTTAAGGGCTTTTTAGTTATTT
TCAAGAGTTAGGGTTTTAGTAAGTGACAATTGAGTAGAGTGGTGTGTGCATCTTTTATCA
AAGGACAAAGGGTCCCTCTATGTTTCACCAATGGTTTCCTTTGTTTTATCACTTTTTATT
GTCTTTTTTTAAGCTTCTGTCTTTTGGTTAAAAGCGGTTAAAAGGCAGAAGTGGGTAGGG
CAGAGATGGTATTTCACCCCCCGCCAAGTGTGTTTTTGTTCTTTCTTTTTGAGTCGTGTT
TATGTCATGAAGTTGTAATGAAAAGGCTGTGTATGATCAGCTTGATAAGTGTTATGTTAA
CCGAGTTG


BQ
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AF RR4B334TF U 1
AF RR4B334JQ C 536
BS 1 745 RR4B334TF
BS 746 1328 RR4B334JQ

RD RR4B334TF 745 0 0
GGACTCCCATCAAAGCAGCTATCTCTCTCCTCCACATTCCATTTTCTCACTTCTCCAAAA
AGCTCTGCACTTTCTCAAACAGAATGTTCATGGGAAGAATGGGTCTTTTGGGGATTTTCC
TGTTGGGTTTTGCTGCAATGGCGTCCTCTGTTCATGGTTACGATGCTGGGTGGGTCAATG
CTCATGCCACTTTCTATGGTGGAAGCGATGCTTCAGGAACAATGGGTGGAGCTTGTGGGT
ACGGTAACCTCTACAGCCAGGGATACGGGACCAACACGGCTGCGCTAAGCACCGCGCTGT
TCAACAACGGTCTTAGCTGCGGCGCGTGTTTCGAGATCCGGTGCCAGAGCGACGGCGCGT
GGTGTTTACCTGGTGCTATCGTGGTTACGGCAACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGCTC
TGCCCAACAACGCGGGTGGCTGGTGTAACCCTCCGCTTCACCATTTCGATCTCTCTCAGC
CTATCTTCCAGCGCATTGCTCATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAGGG
TTCCGTGTAAGAGAAGGGGAGGCATAAGATTTACAATCAACGGCCACTCTTACTTTAACC
TTGTCTTGGTCACCAATGTTGGAGGCGCAGGAGATGTTCACTCTGTTGCGGTTAAAGGTT
CAAGGACAAAGTGGCAGCAAATGTCTAGGAACTGGGGTCAAAACTGGCAAAGCAACAATC
TCCTTAATGGTCAAGCTTTGTCCTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4B334JQ 793 0 0
AAGGGTTCCGTGTAAGAGAAGGGGAGGCATAAGATTTACAATCAACGGCCACTCTTACTT
TAACCTTGTCTTGGTCACCAATGTTGGAGGCGCAGGAGATGTTCACTCTGTTGCGGTTAA
AGGTTCAAGGACAAGGTGGCAGCAAATGTCTAGGAACTGGGGTCAAAACTGGCAAAGCAA
CAATCTCCTTAATGGTCAAGCTTTGTCCTTTAAGGTTACGGCTAGTGATGGTCGAATCGT
CGTCTCCAACAACGTCGCTCCTGCTAGTTGGTCCTTCGGACAAACTTTCACCGGCCGCCA
GTTTCGTTGAATGTGTGTCTGCTTCGGTTTGATATAGTTTAGGGTTTGTGGTAGTGTCAG
GTGGTGGAGAGAAAGAAAAGAGGTTATATGGCTTTTTAGGGTTTTATTTTGAGAGCCATT
GAACTTCTTTCATCTCAGAGGGTAAAATGGAAAAAGAGCTAATTTTAAGGGCTTTTTAGT
TATTTTCAAGAGTTAGGGTTTTAGTAAGTGACAATTGAGTAGAGTGGTGTGTGCATCTTT
TATCAAAGGACAAAGGGTCCCTCTATGTTTCACCAATGGTTTCCTTTGTTTTATCACTTT
TTATTGTCTTTTTTTAAGCTTCTGTCTTTTGGTTAAAAGCGGTTAAAAGGCAGAAGTGGG
TAGGGCAGAGATGGTATTTCACCCCCCGCCAAGTGTGTTTTTGTTCTTTCTTTTTGAGTC
GTGTTTATGTCATGAAGTTGTAATGAAAAGGCTGTGTATGATCAGCTTGATAAGTGTTAT
GTTAACCGAGTTG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL6216Contig1 771 2 3 U
GGATTTCTGAAACTCAAGAGCTAGTAGTTCTCTGTTTTGGTCACATGGTTTTTGGATCAG
AAACATAATAACTCTTTTACCCACACCAGAAAATTAAATTCTCCCACGTCAGCTTTTCAT
ATTCAAGAAAGCTTCATTTTGGATCGGAGTATTCAAATCATCATCTAGGAAAAAGAAAAT
GGAACGAGGTAGTGGGTTTTATCCAGATTGGAAGGAGACTTCTTCTTCCTTGTTTGGATC
AGAGAACATGGAGGAAGAGCTAGAAGAAGAGCTTTTCTCACCCATTCCACAGCCTCAGAC
TCCAAAAGAGCCAATGGAGTTTCTGTCTAGATCCTGGAGTCTCTCTACCTCTGAAATCGC
CAAAGCACTTGCACTCAAACATAGACAACAACAACAAGAACAGTTTTGTGTTGCACAAAA
CAACACTCCTGTTCTGTTCCCTAATGCTGCCGCACATCCACTCATGGCAGGGAAGATGAT
GAACTCGTTTGGAACACGCAGAACAGGGACGTTATCCCAAATGGTTTCACCACCACAAGG
AACAACATAGCAGTAGCTGTAGCAACCCCACCACCAACTGTCTCAAGAAGAAAGACAAGG
CGCGTGTCGAGAACGCCCACGTGCATTCTGCGGTCTCTATAGCTGCTCTGGCTGCAGGTG
TAGCCTCTGTGACATCTGCAAGCAATTGCAAAGAGTCAAGCTCCAAGATGGCTCTGGCTT
TGGCCTCAGCCACAGAACTGCTGGCCTCGCACTGTGTTGAGACGGCTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK15TF U 481
AF RR4CV72TF U 1
BS 1 517 RR4CV72TF
BS 518 518 RR4BK15TF
BS 519 771 RR4CV72TF

RD RR4BK15TF 218 0 0
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AACAACATAGCAGTAGCTGTAGCAACCCCACCACCAACTGTCTCAAGAAGAAAGACAAGG
CGCGTGTCGAGAACGCCCACGTGCATTCTGCGGTCTCTATAGCTGCTCTGGCTGCAG*TG
TAGCCTCTGTGACATCTGCAAGCAATTGCAAAGAGTCA

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR4CV72TF 771 0 0
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AAACATAATAACTCTTTTACCCACACCAGAAAATTAAATTCTCCCACGTCAGCTTTTCAT
ATTCAAGAAAGCTTCATTTTGGATCGGAGTATTCAAATCATCATCTAGGAAAAAGAAAAT
GGAACGAGGTAGTGGGTTTTATCCAGATTGGAAGGAGACTTCTTCTTCCTTGTTTGGATC
AGAGAACATGGAGGAAGAGCTAGAAGAAGAGCTTTTCTCACCCATTCCACAGCCTCAGAC
TCCAAAAGAGCCAATGGAGTTTCTGTCTAGATCCTGGAGTCTCTCTACCTCTGAAATCGC
CAAAGCACTTGCACTCAAACATAGACAACAACAACAAGAACAGTTTTGTGTTGCACAAAA
CAACACTCCTGTTCTGTTCCCTAATGCTGCCGCACATCCACTCATGGCAGGGAAGATGAT
GAACTCGTTTGGAACACGCAGAACAGGGACGTTATCC*AAATGGTTTCACCACCACAAGG
AACAACATAGCAGTAGCTGTAGCAACCCCACCACCAACTGTCTCAAGAAGAAAGACAAGG
CGCGTGTCGAGAACGCCCACGTGCATTCTGCGGTCTCTATAGCTGCTCTGGCTGCAGGTG
TAGCCTCTGTGACATCTGCAAGCAATTGCAAAGAGTCAAGCTCCAAGATGGCTCTGGCTT
TGGCCTCAGCCACAGAACTGCTGGCCTCGCACTGTGTTGAGACGGCTGAGC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6217Contig1 1210 2 2 U
GGAACCTCATCTCCTGCAACTTCTCTCGCTTTCCTCATCTAAAACCCTCCAGAAAAGCCC
AATCCCTAAGGCAACCCCTAAACCTCACCCTTGCCCAATCAAGAGCTCCTAGAATTCTCC
TACGCAACAACAACAGATGGCAATTCACGAAACACGAGAAGAAGAAAGGTCTCTTCCATT
TCCATGTGTGCAGAAGCTCACTAAACAACCCAGATCCAGACAAGACTGAAATTCAAGATG
AAGGAAGAGACTGGACGAGCTCTGTATTGCTTTTCGCTCTCTGGGGTGCTCTTCTTTACT
ATTGCTTCAACCTTGCTCCTGATCAAACACCAACACAAGACTTGTACTTTCTGAAAAAGC
TGTTGAATTTGAAAGGCGATGATGGTTTTAGAATGAACCAGATCCTTGTTGGTTTGTGGT
ATATAATGGGGTTTATGGCCTGTGGTATACGCTATGCTCTTGCTTCCCACTGGTCGAAGT
AAAACTCAGGCGCGGCCTTTCGTGGTGCTTTCCTTCTTTGGTGGCGTCTACGCTTTGCTA
CCTTATTTTGCACTGTGGAATCCACCTTCTCCTCCTATTTCAGAGTCTGAGCTTACAAAA
TGGCCTTTCAATGTTCTGGAATCAAAAGTAACTGCTGGGGTAACTCTTGTTGCAGGCCTG
GGTTTAATTCTTTACTCAGTAGTTGGTAACCCCGGTGACTTGAAAGAGTTTTATCAGTAC
TTTCGTGAGAGCAAATTCATACATGTCACGAGTCTAGATTTCTGCTTACTTTCTGCTTTT
GCTCCGTTTTGGGTTTACAATGACATGACCGCCAGAAAATGGTTTGATAAAGGCCGTTGG
CTGTTACCTGTATCCGTTGTGCCATTCTTGGGACCTTCTCTGTATCTTTTCTTACGACCA
GCATTGTCAGAGATAACGGCTCCCACAGATTCCGCATCATCTTCTGACCCAAGTCAATAG
CAACATCACGATTGGATTTTGTTGATGACTATTTCAGCTCTTTGCATCGGTATCCACAAT
GGGTTTTACTCCCTTTTTGTTGCCCTGTTATTGATGGAGTTAGAATGAGAAATATTGTAT
TACAAGGGAGAGAACTGACAAAGTTTTCTATAGATGTTAATGAAAGGAAAGTCGAACCCA
AAATTGTCAAAAGTTTATATATATATATATTAGGCAAACAATTTCTAGAGTTCATCTTTG
CACTTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ42TF U 1
AF RR4GZ42JQ C 444
BS 1 651 RR4GZ42TF
BS 652 1210 RR4GZ42JQ

RD RR4GZ42TF 651 0 0
GGAACCTCATCTCCTGCAACTTCTCTCGCTTTCCTCATCTAAAACCCTCCAGAAAAGCCC
AATCCCTAAGGCAACCCCTAAACCTCACCCTTGCCCAATCAAGAGCTCCTAGAATTCTCC
TACGCAACAACAACAGATGGCAATTCACGAAACACGAGAAGAAGAAAGGTCTCTTCCATT
TCCATGTGTGCAGAAGCTCACTAAACAACCCAGATCCAGACAAGACTGAAATTCAAGATG
AAGGAAGAGACTGGACGAGCTCTGTATTGCTTTTCGCTCTCTGGGGTGCTCTTCTTTACT
ATTGCTTCAACCTTGCTCCTGATCAAACACCAACACAAGACTTGTACTTTCTGAAAAAGC
TGTTGAATTTGAAAGGCGATGATGGTTTTAGAATGAACCAGATCCTTGTTGGTTTGTGGT
ATATAATGGGGTTTATGGCCTGTGGTATACGCTATGCTCTTGCTTCCCACTGGTCGAAGT
AAAACTCAGGCGCGGCCTTTCGTGGTGCTTTCCTTCTTTGGTGGCGTCTACGCTTTGCTA
CCTTATTTTGCACTGTGGAATCCACCTTCTCCTCCTATTTCAGAGTCTGAGCTTACAAAA
TGGCCTTTCAATGTTCTGGAATCAAAAGTAACTGCTGGGGTAACTCTTGTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4GZ42JQ 767 0 0
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GGTGCTTTCCTTCTTTGGTGGCGTCTACGCTTTGCTACCTTATTTTGCACTGTGGAATCC
ACCTTCTCCTCCTATTTCAGAGTCTGAGCTTACAAAATGGCCTTTCAATGTTCTGGAATC
AAAAGTAACTGCTGGGGTAACTCTTGTTGCAGGCCTGGGTTTAATTCTTTACTCAGTAGT
TGGTAACCCCGGTGACTTGAAAGAGTTTTATCAGTACTTTCGTGAGAGCAAATTCATACA
TGTCACGAGTCTAGATTTCTGCTTACTTTCTGCTTTTGCTCCGTTTTGGGTTTACAATGA
CATGACCGCCAGAAAATGGTTTGATAAAGGCCGTTGGCTGTTACCTGTATCCGTTGTGCC
ATTCTTGGGACCTTCTCTGTATCTTTTCTTACGACCAGCATTGTCAGAGATAACGGCTCC
CACAGATTCCGCATCATCTTCTGACCCAAGTCAATAGCAACATCACGATTGGATTTTGTT
GATGACTATTTCAGCTCTTTGCATCGGTATCCACAATGGGTTTTACTCCCTTTTTGTTGC
CCTGTTATTGATGGAGTTAGAATGAGAAATATTGTATTACAAGGGAGAGAACTGACAAAG
TTTTCTATAGATGTTAATGAAAGGAAAGTCGAACCCAAAATTGTCAAAAGTTTATATATA
TATATATTAGGCAAACAATTTCTAGAGTTCATCTTTGCACTTGACCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL6218Contig1 1263 2 4 U
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AGGGATTTCGTGTTAAACAAAAGGAATGGTGTTAAAGGTCTCGTCGACTTTATAACCCTA
AACACACTTCCTTCTCCATATATTCAACCTCCTCACGAACGCTTCACCTCCGACAAAATC
ATACCGCCACAAGTTCCTGTCATTGATGTGTCTAATTGGTTAGACCCACGAGTTGCTAGA
GAGATCTGCGACGCAGCGGTTAAGCTCGGGGTGTTTCAGATAGTGAACCACGGGATAGCT
CCGGAGGAGTTAAAGGCAGTCATTGCGGCAGCTCGTGGTTTTTTCGACCTGCCGGCGGAT
GAGAGGAAGAGATATTGGAAAGGAAGTTCGTGTCGGAGACGGCGTGGTTGACAACAAGTT
TCACTCCGTATAAAGAAAGTGTGTTGGAGTGGAGAGACTTTTTCAAGTTTCAGTATCCTC
GTGAAGGACATGACTTCGCTACTACATGGCCTTCTCTATGCAAGGAACAAGTGATACACC
ATTTCGAGAGGATCAAACCAATCACCAAGAAGATTTTAAACATACTCATCAACAATCTAA
ATTCAGTCGTAGATGAGTCTAATGAAGACGCACTAATTGGAACTATGTGAATGAACTTCA
ACTATTATCCAGAGTGTCCTGAACCAAACCTGGCAATAGGAACTGGCCGCCATACAGACA
TCAACACCCTCACTCTCCTCATACAAGAAGATGGCGTCTTAAGCAGCCTATATGGTCGAG
CCAGCGAGCACGAGGACAAATGGGTTGATGTCCCTCCAATTCCGGGAGCCATTGTTGTTA
ATGTCGGAGACGTATTACAAATATTGAGCAACGGTAAGTATAAGAGCGTGGAGCATTGTG
TATTGGTCCATAAGGGTTGTAGCCGAATTTCTGTCCCTATTTTTTACGGACCAGTTGATG
ATACGGTTATCGAGCCATTACCGGAGGTGCTAGAGAACAATGAGGTGGCTCGGTACAGAA
AGATTGTGTATTCTTCGAACTATCTTAAGGATGTTTTGGGAAGACCCCATGATGGAAAGA
AGACTATTGGATCGATCAAGCTACCATGATACAAGATACATAGATTTATATAAAGATCCA
TAGCTAAACATCGATCCTACTAATATCTTTGTGATCACAAAAAACTATCTTATGTCTAAA
ATGTATATTCTCTTTCAACTTTATGTAAAATATGATACATTAAGAAATTACTTAAGTTTG
ATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4FX27TF U 1
AF RR4FX27JQ C 515
BS 1 701 RR4FX27TF
BS 702 702 RR4FX27JQ
BS 703 723 RR4FX27TF
BS 724 1263 RR4FX27JQ

RD RR4FX27TF 737 0 0
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AGGGATTTCGTGTTAAACAAAAGGAATGGTGTTAAAGGTCTCGTCGACTTTATAACCCTA
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ATACCGCCACAAGTTCCTGTCATTGATGTGTCTAATTGGTTAGACCCACGAGTTGCTAGA
GAGATCTGCGACGCAGCGGTTAAGCTCGGGGTGTTTCAGATAGTGAACCACGGGATAGCT
CCGGAGGAGTTAAAGGCAGTCATTGCGGCAGCTCGTGGTTTTTTCGACCTGCCGGCGGAT
GAGAGGAAGAGATATTGGAAAGGAAGTTCGTGTCGGAGACGGCGTGGTTGACAACAAGTT
TCACTCCGTATAAAGAAAGTGTGTTGGAGTGGAGAGACTTTTTCAAGTTTCAGTATCCTC
GTGAAGGACATGACTTCGCTACTACATGGCCTTCTCTATGCAAGGAACAAGTGATACACC
ATTTCGAGAGGATCAAACCAATCACCAAGAAGATTTTAAACATACTCATCAACAATCTAA
ATTCAGTCGTAGATGAGTCTAATGAAGACGCACTAATTGGAACTATGTGAATGAACTTCA
ACTATTATCCAGAGTGTCCTGAACCAAACCTGGCAATAGGA*CTGGCCGCCATACAGACA
TCA
CACCTCACTCTCTC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4FX27JQ 749 0 0
TCTATGCAAGGAACAAGTGATACACCATTTCGAGAGGATCAAACCAATCACCAAGAAGAT
TTTAAACATACTCATCAACAATCTAAATTCAGTCGTAGATGAGTCTAATGAAGACGCACT
AATTGGAACTATGTGAATGAACTTCAACTATTATCCAGAGTGTCCTGAACCAAACCTGGC
AATAGGAACTGGCCGCCATACAGACATCAACACCCTCACTCTCCTCATACAAGAAGATGG
CGTCTTAAGCAGCCTATATGGTCGAGCCAGCGAGCACGAGGACAAATGGGTTGATGTCCC
TCCAATTCCGGGAGCCATTGTTGTTAATGTCGGAGACGTATTACAAATATTGAGCAACGG
TAAGTATAAGAGCGTGGAGCATTGTGTATTGGTCCATAAGGGTTGTAGCCGAATTTCTGT
CCCTATTTTTTACGGACCAGTTGATGATACGGTTATCGAGCCATTACCGGAGGTGCTAGA
GAACAATGAGGTGGCTCGGTACAGAAAGATTGTGTATTCTTCGAACTATCTTAAGGATGT
TTTGGGAAGACCCCATGATGGAAAGAAGACTATTGGATCGATCAAGCTACCATGATACAA
GATACATAGATTTATATAAAGATCCATAGCTAAACATCGATCCTACTAATATCTTTGTGA
TCACAAAAAACTATCTTATGTCTAAAATGTATATTCTCTTTCAACTTTATGTAAAATATG
ATACATTAAGAAATTACTTAAGTTTGATC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6219Contig1 839 2 5 U
AGCTGTCTACAAGAAACTGGGGTGTCTGGTGTGTGTGATCAATCAACGATCTGATCTTGA
GGCAGGACGAAATCAACAGAGAAAATGGGAGGTGCGGTGACGAAACCTGATGGTCAAGAG
ACAAAGCTAGAGGCTAAGATCATAGAAGCCGTGCAACGCAGGGCATCGAGAGGAACCACG
ATGAAATCGTTCAACAGCATTGTTCTCAAGTTCCCAAAGATCGACGAGGGTCTTCGGAAC
TGCAAAGCTATCTTCCAAGAGTTTGATGAGGATTCAAATGGGTCTATTGATCACACGGAG
CTAAAGAACTGTTTCAGGAAGCTAGAGATCTCGTTCGAGGAAGACGAGATCAATGACCTG
TTCGAGGCTTGTGATATTAACGAGGATATGGGGATCACGTTCACCGAGTTCATTGTTCTT
CTCTGCCTCGTCTATCTTCTTAAGGATGACTCATCCACTCTCCAAAAGAAATGGAGACTG
GGAATGCCGAAGCTGGAACCAACGTTTGAGACGCTAGTGGACACGTTCGTGTTCCTGGAT
GAGAACAAGGACGGACTCGTTAGCCGCGAGGAGATGGTCCGAGCCATTGATGAATCTGGA
GAACGTTCCTCTGGGAGGATTGCAATGAAAAGATTTGAGGAGATGGACTGGGACAAGAAT
GGGATGGTGAACTTCAAAGAGTTCTTGTCCGCGTTTACTCAGTGGGTTGGAATAGATGAG
AGTGAAGAAGAAGACGATGAAGATAACAATGACAACAAGGCTTGATGTTTGTGTTTACAA
GTATGTAATAGTAACAAACTATGCTTTATGTTTAATGCAAACAGAATAATTCATTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CV28TF U 51
AF RR4CV28JQ C 1
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BS 51 238 RR4CV28TF
BS 239 239 RR4CV28JQ
BS 240 260 RR4CV28TF
BS 261 839 RR4CV28JQ

RD RR4CV28TF 217 0 0
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AGGAACCACGATGAAATCGTTCAACAGCATTGTTCTCAAGTTCCCAAAGATCGACGAGGG
TCTTCGGA*CTGCAAAGCTATCTTCCAAGA
TTTGATG

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR4CV28JQ 839 0 0
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ACAAAGCTAGAGGCTAAGATCATAGAAGCCGTGCAACGCAGGGCATCGAGAGGAACCACG
ATGAAATCGTTCAACAGCATTGTTCTCAAGTTCCCAAAGATCGACGAGGGTCTTCGGAAC
TGCAAAGCTATCTTCCAAGAGTTTGATGAGGATTCAAATGGGTCTATTGATCACACGGAG
CTAAAGAACTGTTTCAGGAAGCTAGAGATCTCGTTCGAGGAAGACGAGATCAATGACCTG
TTCGAGGCTTGTGATATTAACGAGGATATGGGGATCACGTTCACCGAGTTCATTGTTCTT
CTCTGCCTCGTCTATCTTCTTAAGGATGACTCATCCACTCTCCAAAAGAAATGGAGACTG
GGAATGCCGAAGCTGGAACCAACGTTTGAGACGCTAGTGGACACGTTCGTGTTCCTGGAT
GAGAACAAGGACGGACTCGTTAGCCGCGAGGAGATGGTCCGAGCCATTGATGAATCTGGA
GAACGTTCCTCTGGGAGGATTGCAATGAAAAGATTTGAGGAGATGGACTGGGACAAGAAT
GGGATGGTGAACTTCAAAGAGTTCTTGTCCGCGTTTACTCAGTGGGTTGGAATAGATGAG
AGTGAAGAAGAAGACGATGAAGATAACAATGACAACAAGGCTTGATGTTTGTGTTTACAA
GTATGTAATAGTAACAAACTATGCTTTATGTTTAATGCAAACAGAATAATTCATTACCT

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL6220Contig1 1105 2 2 U
GGCACCAATAAGATCAAACATGTTGAAAACAACCACGAAGGCGACCCTTCTCTGTTTCTT
TCTCGCCGCCTTGGTTCTGATGGACCAAACTTCCTCCACCGCCACATACAACCCGACCTC
CTCCGCCCCCACAGACACGTTCATATTCGCAAAGTGTTCACCTGACAAATTCTCACCTGG
CTCCGCCTACGAGACCAACCTCAAATCCCTTCTCTCTTCCCTCGTCAGCTCCACCGTCGC
CAGCCGATACAATAACCTCACCGTTGGGGTAAAACCCGAACCGGCCGCTACGGTATATGG
TCTCTTCCAGTGCAGCGTTGACCTTGACGCAACATCTTGCTCATCATGCATATCACGCGC
CATAGAACTGGTCGGAAGCACATGTCCCAACTCGTACTCAGTGTTCTTGCAGATGCAAAG
TTGTCTGGTCCGGTTCGACAAGAACTCGTTCTTTGGCGTTCAGGACAAAACAGAGATGCT
CCAGAAATATGGACAGCCGTTGGGATTCAACGACCAAGATGCGTTGACCAGAGTCAGTGA
CGTCATGGGTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGACCCGACAGGACTGGAGGGAACGGGGATGT
TGGGGGTGTGGCTCAGTGCATGGGTGATCTAAGTTCAGCACAGTGTCAAGATTGCTTGAC
TGATGCAATCGGACGGCTCAGATCTGATTGTGGAATGTCCCAGGGAGGATACGTTTACTT
GTCCAAGTGTTACGCGCGTTTTAGCTACGGTGGTAGTCACGCACGTCAGACCCCAAACTC
AAACTTTGCAGGAGAAGGCAAAGACGATAAAGATAATGGCGGCATCGGAAAAACATTGGC
GATTATAATAGGGATCATCACCTTAGTCATCTTGCTCGTCGTGTTTCTCGCTTCTATTGG
AAAGCTATTGAGAAAACTACAAGACGAGAAATGTTGTAAATGAATGGTAAAAGTGGGAAA
GAGATCAATCAACAACTCGAGTCAAGCAGTGCTAGTTTTATTTTTGTAAAAAAAGAAAAT
TGTGACCCGCTGTCTCACAAGATGTAGTTATATAGTGTTTCAACGATTGTATTTTGGACT
CGATTTTAGTATATTATTACCGGAC


BQ
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AF RR4EI09TF U 1
AF RR4EI09JQ C 460
BS 1 667 RR4EI09TF
BS 668 1105 RR4EI09JQ

RD RR4EI09TF 667 0 0
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TCTCGCCGCCTTGGTTCTGATGGACCAAACTTCCTCCACCGCCACATACAACCCGACCTC
CTCCGCCCCCACAGACACGTTCATATTCGCAAAGTGTTCACCTGACAAATTCTCACCTGG
CTCCGCCTACGAGACCAACCTCAAATCCCTTCTCTCTTCCCTCGTCAGCTCCACCGTCGC
CAGCCGATACAATAACCTCACCGTTGGGGTAAAACCCGAACCGGCCGCTACGGTATATGG
TCTCTTCCAGTGCAGCGTTGACCTTGACGCAACATCTTGCTCATCATGCATATCACGCGC
CATAGAACTGGTCGGAAGCACATGTCCCAACTCGTACTCAGTGTTCTTGCAGATGCAAAG
TTGTCTGGTCCGGTTCGACAAGAACTCGTTCTTTGGCGTTCAGGACAAAACAGAGATGCT
CCAGAAATATGGACAGCCGTTGGGATTCAACGACCAAGATGCGTTGACCAGAGTCAGTGA
CGTCATGGGTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGACCCGACAGGACTGGAGGGAACGGGGATGT
TGGGGGTGTGGCTCAGTGCATGGGTGATCTAAGTTCAGCACAGTGTCAAGATTGCTTGAC
TGATGCA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EI09JQ 646 0 0
TCAGGACAAAACAGAGATGCTCCAGAAATATGGACAGCCGTTGGGATTCAACGACCAAGA
TGCGTTGACCAGAGTCAGTGACGTCATGGGTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGACCCGACAG
GACTGGAGGGAACGGGGATGTTGGGGGTGTGGCTCAGTGCATGGGTGATCTAAGTTCAGC
ACAGTGTCAAGATTGCTTGACTGATGCAATCGGACGGCTCAGATCTGATTGTGGAATGTC
CCAGGGAGGATACGTTTACTTGTCCAAGTGTTACGCGCGTTTTAGCTACGGTGGTAGTCA
CGCACGTCAGACCCCAAACTCAAACTTTGCAGGAGAAGGCAAAGACGATAAAGATAATGG
CGGCATCGGAAAAACATTGGCGATTATAATAGGGATCATCACCTTAGTCATCTTGCTCGT
CGTGTTTCTCGCTTCTATTGGAAAGCTATTGAGAAAACTACAAGACGAGAAATGTTGTAA
ATGAATGGTAAAAGTGGGAAAGAGATCAATCAACAACTCGAGTCAAGCAGTGCTAGTTTT
ATTTTTGTAAAAAAAGAAAATTGTGACCCGCTGTCTCACAAGATGTAGTTATATAGTGTT
TCAACGATTGTATTTTGGACTCGATTTTAGTATATTATTACCGGAC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6221Contig1 497 2 3 U
GATTGCAAAAGATGTTTTGGCTCTGCAAGTGTTTTCTGTAGCTTTTGAGAGTGCCTTCAG
TACAAGTGGGAGGTTAATTGAGCCATCTAGGAGCTGCCTTACTCACTACATGATTGAGGT
TCTGATGTGTATTGAGCAATGGCTCAAAGAGGACATTCGTTGTGATTCAAGAGTGCTCAG
TAATGCACAGATTCTTGAGGATATTGAAGAGCTTGAGAAACTTGAAAGAGAATTTGCTGA
TTGAATTCACGGGTGATGTCTGTTCTGATTGAAGACATTGCTTCTTCTGTCATAAGGAAC
AAAAGCCAAGTGGTCGTGTTCTCAAGATTATCATATGCTATCTGTTTCTGTTTTTTTTTA
AACTTTGTTGTTGTTATTTTTTTGCTATTTCGGAGTTGAAGTGTTTTGGATGTTTTCGGA
GTTGATGTGTTTTGAATGTTTTTGGATTTGATGTGTTTGGATGTTTTTTTGTTATGGAAT
GTTTCTATTTTCGGATT


BQ
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AF RR4GV94TF U 51
AF RR4GV94JQ C 1
BS 1 50 RR4GV94JQ
BS 51 266 RR4GV94TF
BS 267 497 RR4GV94JQ

RD RR4GV94TF 216 0 0
GTGCCTTCAGTACAAGTGGGAGGTTAATTGAGCCATCTAGGAGCTGCCTTACTCACTACA
TGATTGAGGTTCTGATGTGTATTGAGCAATGGCTCAAAGAGGACATTCGTTGTGATTCAA
GAGTGCTCAGTAATGCACAGATTCTTGAGGATATTGAAGAGCTTGAGAAACTTGAAAGAG
AATTTGCTGATTGAATTCACGGGTGATGTCTGTTCT

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR4GV94JQ 497 0 0
GATTGCAAAAGATGTTTTGGCTCTGCAAGTGTTTTCTGTAGCTTTTGAGAGTGCCTTCAG
TACAAGTGGGAGGTTAATTGAGCCATTTAGGAGCTGCCTTACTCACTACATGATTGAGGT
TTTGATGTGTATTGAGCAATGGCTCAAAGAGGACATTCGTTGTGATTCAAGAGTGCTCAG
TAATGCACAGATTCTTGAGGATATTGAAGAGCTTGAGAAACTTGAAAGAGAATTTGCTGA
TTGAATTCACGGGTGATGTCTGTTCTGATTGAAGACATTGCTTCTTCTGTCATAAGGAAC
AAAAGCCAAGTGGTCGTGTTCTCAAGATTATCATATGCTATCTGTTTCTGTTTTTTTTTA
AACTTTGTTGTTGTTATTTTTTTGCTATTTCGGAGTTGAAGTGTTTTGGATGTTTTCGGA
GTTGATGTGTTTTGAATGTTTTTGGATTTGATGTGTTTGGATGTTTTTTTGTTATGGAAT
GTTTCTATTTTCGGATT

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL6222Contig1 429 2 3 U
GGGGCAAAAGGGAACTAATCCACATACGACATGTTATTATGAACATTATATCTTATAGTC
GTTAAAGAGTAGAGTGGAGAGAGCAAGAGTAAATTCTGAAAACGAGACAAAGAAAAGAAC
AAAAGACTGATGAAAGTTGGTGTTTTTGATGTTCAGCAAACATCTTTGCTTCAGATAGTC
TGTCCCGCTTGTTACTCGTGCTTTGATGAAGGAAAGAAAAAGTCTTTGACAATCTTGAGC
TGATACTATTCTCTGTTTGATAGGATCAAGAACGTTAGGCTCGGGGCCGTAATCAGCGGT
GAGGAGTAAGTAAGACGAACAGCAGTGGCCACCATAGTCGTTCTTCTCACCACCTTGTCC
ACTTGGGGATTCATCTCGTTTCCAACCAACTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAAATGT
GATGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX06JQ U 178
AF RR4BX06TF C 1
BS 1 177 RR4BX06TF
BS 178 393 RR4BX06JQ
BS 394 429 RR4BX06TF

RD RR4BX06JQ 216 0 0
GTCTGTCCCGCTTGTTACTCGTGCTTTGATGAAGGAAAGAAAAAGTCTTTGACAATCTTG
AGCTGATACTATTCTCTGTTTGATAGGATCAAGAACGTTAGGCTCGGGGCCGTAATCAGC
GGTGAGGAGTAAGTAAGACGAACAGCAGTGGCCACCATAGTCGTTCTTCTCACCACCTTG
TCCACTTGGGGATTCATCTCGTTTCCAACCAACTAG

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR4BX06TF 429 0 0
GGGGCAAAAGGGAACTAATCCACATACGACATGTTATTATGAACATTATATCTTATAGTC
GTTAAAGAGTAGAGTGGAGAGAGCAAGAGTAAATTCTGAAAACGAGACAAAGAAAAGAAC
AAAAGACTGATGAAAGTTGGTGTTTTTGATGTTCAGCAAACATCTTTGCTTCAGATAGTC
TGTCGCGCTTGTTACTCGTGCTTTGATGAAGGAAAGAAGAAGTCTTTGACAATCTTGAGC
TGATACTATTCTCTGTTTGATAGGATCAAGAACGTTAGGCTCGGGGCCGTAATCAGCGGT
GAGGAGTAAGTAAGACGAACAGCAGTGGCCACCATAGTCGTTCTTCTCACCACCTTGTCC
ACTTGGGGATTCATCTCGTTTCCAACCAACTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAAATGT
GATGAGTCC

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 2

CO CL6223Contig1 923 2 4 U
GTCGTATATGAATACCTTCCTAACGGAAGTCTTGATCAGGCTCTTTTTGGGGATAATGCT
TTACATCTTGATTGGTCAACCCGCTATGAGATATGTCTCGGAGTTGCCAGGGGTCTAGTC
TATCTCCACGAGGAGGCGAGGCTTCGCATCGTACACAGGGATGTGAAGGCTAGCAACATT
TTACTTGACTCTAATCTTGTCCCAAAAGTTTCTGATTTTGGGCTTGCAAAGCTATACGAT
GACAAGAAAACCCACATAAGTACCCGAGTAGCAGGGACGATTGGATATCTTGCGCCAGAG
TATGCCATGCGTGGACATCTAACAGAGAAAACTGATGTGTATGCCTTTGGTGTTGCGGCT
CTTGAGCTAGTGAGTGGAAGGCCAAACTCTGATGAGAATGTGGAGGACGAAAAAAGATAT
CTTCTTGAATGGGCATGGGATCTACACGAGAAAAGCCGTGAAGTCGAACTTATTGATCGT
GAGCTAACTGAATTCAACATGGAAGAAGTGAAGCGCATGATAGGCATTGCTCTGCTTTGC
ACTCAGACATCACATGCCTTGAGACCACCAATGTCAAGAGTGGTCGCCATGCTTTCAGGA
GACGTTGAGGTGAGTGATGTCACCTCTAAGCCAGCCTACCTGACCGACTGGAGATTTGAC
GACACCACAAGCGCTTCTGTAAGTGGATTTCAAACCAAAGAGACTTGGGCTTCTGATTCC
TTGTCCACGAGCTTTGTGGCGCCTTGCTCCGAGATATCACCTGGAAGCCGCGACTCTAAA
CCGATGCTTGGAGTGAAAATCAATGAGGGAAGATGACAAAGATCCTTCCTTATCTGTAAC
TATAAAGATAGATGTGTTGTGTAAGTGAATGAGGATCACTATTTTCTTCTTTGATTAGAG
AAATATATATTATATCACTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP75TF U 1
AF RR4DP75JQ C 242
BS 1 427 RR4DP75TF
BS 428 428 RR4DP75JQ
BS 429 453 RR4DP75TF
BS 454 923 RR4DP75JQ

RD RR4DP75TF 453 0 0
GTCGTATATGAATACCTTCCTAACGGAAGTCTTGATCAGGCTCTTTTTGGGGATAATGCT
TTACATCTTGATTGGTCAACCCGCTATGAGATATGTCTCGGAGTTGCCAGGGGTCTAGTC
TATCTCCACGAGGAGGCGAGGCTTCGCATCGTACACAGGGATGTGAAGGCTAGCAACATT
TTACTTGACTCTAATCTTGTCCCAAAAGTTTCTGATTTTGGGCTTGCAAAGCTATACGAT
GACAAGAAAACCCACATAAGTACCCGAGTAGCAGGGACGATTGGATATCTTGCGCCAGAG
TATGCCATGCGTGGACATCTAACAGAGAAAACTGATGTGTATGCCTTTGGTGTTGCGGCT
CTTGAGCTAGTGAGTGGAAGGCCAAACTCTGATGAGAATGTGGAGGACGAAAAAAGATAT
CTTCTTGGATGGGCATGGGATCTACACGAGAAA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4DP75JQ 682 0 0
ACAAGAAAACCCACATAAGTACCCGAGTAGCAGGGACGATTGGATATCTTGCGCCAGAGT
ATGCCATGCGTGGACATCTAACAGAGAAAACTGATGTGTATGCCTTTGGTGTTGCGGCTC
TTGAGCTAGTGAGTGGAAGGCCAAACTCTGATGAGAATGTGGAGGACGAAAAAAGATATC
TTCTTGAATGGGCATGGGATCTACACGAGAAAAGCCGTGAAGTCGAACTTATTGATCGTG
AGCTAACTGAATTCAACATGGAAGAAGTGAAGCGCATGATAGGCATTGCTCTGCTTTGCA
CTCAGACATCACATGCCTTGAGACCACCAATGTCAAGAGTGGTCGCCATGCTTTCAGGAG
ACGTTGAGGTGAGTGATGTCACCTCTAAGCCAGCCTACCTGACCGACTGGAGATTTGACG
ACACCACAAGCGCTTCTGTAAGTGGATTTCAAACCAAAGAGACTTGGGCTTCTGATTCCT
TGTCCACGAGCTTTGTGGCGCCTTGCTCCGAGATATCACCTGGAAGCCGCGACTCTAAAC
CGATGCTTGGAGTGAAAATCAATGAGGGAAGATGACAAAGATCCTTCCTTATCTGTAACT
ATAAAGATAGATGTGTTGTGTAAGTGAATGAGGATCACTATTTTCTTCTTTGATTAGAGA
AATATATATTATATCACTTCGT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6224Contig1 1144 2 2 U
GGAAGTAATATGTTCGTGGGGTGGCGTGGGTCCTCTCAGGCGACTTAACATCATCCGGAG
ATGGACAGAGAAGAAGCTTTAGGCGAGTCTTCATCTTCTTCTTCAAATCAGCTAGAGAAT
TGGACAGAGTAGGATCAGCTGAAGAAGAAACTGATCACGCACGATGACTTCCCCTGGAAG
CTACCTTCATCAGTGAAACTCCCTCAGGGACCGGAGGAGACCCTTAAGTACGTTGGAGGT
GTGGACATAAGCTTCTCCAAGGACGATCCCTCCGTGGCGTGCGCTTGTCTCGTCGTTCTC
GAGCTACCTTCTCTCCGTGTAGTTCACAATGATCTCTCTCTCCTCCGCCTCAATGTTCCT
TACGTTCCTGGGTTTCTCGCCTTTCGTGAGGCTCCGGTTCTGTTGAAGATTCTTGAGAAG
ATGAGGGATGATCAGCATCCTTTCTTTCCTCAGGTAGTGATGGTGGATGGGAATGGGATA
CTTCATCCACGAGGATTTGGCTTGGCGTGTCATTTAGGTGTTCTTGCTCACATTCCTACC
ATTGGGGTCGGAAAGAACCTGCATCATGTGGATGGCCTGGATCATTCTGAGGTTAGACGG
TTGTTTCAGCTCAAAGAAAATGAGAATGAGCAAGTTATCAAGTTGGTAGGGGACTCTGGT
TTCACGTGGGGAGTAGGATTTAGGCCAACTCTGAGTTCTCTGAAGCCCATATACTTTTCA
GTTGGTCATCGCATATCACTTGACTCTGCGGTTGAGGTTGTCAACATGACCTGCAGGTAC
CGTGTGCCTGAACCTACTAGACAGGCAGATCTAAGATCAAGAGCATATCTTCAAAAGCAC
CAACTTCGTCTCTTAAAAGATTTGGGACCACTCGGAATGGACTGAACATTAGTCATTAAA
ACAACCAAAGAAGGCTGTGAACACTTTTCCACATTAAAGAACATTCTGCAATGTCTTTAC
AGAGAAGCTCCACACAAGTTTTTCTTTTATCTCACCGACTCTAACTAACTAAGATTGTTC
CGAAAATGAGTTAACATGTTTGTATTCAGTTCGTTGTATGTATTTTGCGTTAAGCTATGT
AATAATTTCCATATAGCCATGTCACATTTACTTCAAATTTGAATATGATAATTATGTTTT
TTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

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GTGGACATAAGCTTCTCCAAGGACGATCCCTCCGTGGCGTGCGCTTGTCTCGTCGTTCTC
GAGCTACCTTCTCTCCGTGTAGTTCACAATGATCTCTCTCTCCTCCGCCTCAATGTTCCT
TACGTTCCTGGGTTTCTCGCCTTTCGTGAGGCTCCGGTTCTGTTGAAGATTCTTGAGAAG
ATGAGGGATGATCAGCATCCTTTCTTTCCTCAGGTAGTGATGGTGGATGGGAATGGGATA
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ATTGGGGTCGGAAAGAACCTGCATCATGTGGATGGCCTGGATCATTCTGAGGTTAGACGG
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TTCACGTGGGGAGTAG
ATTT

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DS 

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CACATTCCTACCATTGGGGTCGGAAAGAACCTGCATCATGTGGATGGCCTGGATCATTCT
GAGGTTAGACGGTTGTTTCAGCTCAAAGAAAATGAGAATGAGCAAGTTATCAAGTTGGTA
GGGGACTCTGGTTTCACGTGGGGAGTAGGATTTAGGCCAACTCTGAGTTCTCTGAAGCCC
ATATACTTTTCAGTTGGTCATCGCATATCACTTGACTCTGCGGTTGAGGTTGTCAACATG
ACCTGCAGGTACCGTGTGCCTGAACCTACTAGACAGGCAGATCTAAGATCAAGAGCATAT
CTTCAAAAGCACCAACTTCGTCTCTTAAAAGATTTGGGACCACTCGGAATGGACTGAACA
TTAGTCATTAAAACAACCAAAGAAGGCTGTGAACACTTTTCCACATTAAAGAACATTCTG
CAATGTCTTTACAGAGAAGCTCCACACAAGTTTTTCTTTTATCTCACCGACTCTAACTAA
CTAAGATTGTTCCGAAAATGAGTTAACATGTTTGTATTCAGTTCGTTGTATGTATTTTGC
GTTAAGCTATGTAATAATTTCCATATAGCCATGTCACATTTACTTCAAATTTGAATATGA
TAATTATGTTTTTTCT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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CTTGCAGGGGAACACGCTGTTGTCCATGGATCCACGGCAGTAGCAGCTGCCATTGATCTC
TACACTTACGTCACCTTACGCCTTCCTCTTCAAGCAGCTGCTGAGAACAATGATAGGCTT
ACACTTCAGCTCAAGGACCTTTCCTTGGAGTTTTCTTGGTCCATAGCCAGACTCAAAGAA
GTGATTCCTTATGATTCAAGCACTTCTACACCAGCTTCATGTTCAGGCGAGATTCTTAAA
TCAATTGCTGTTCTGGTTGAAGAGCAAAATATTCCAGAAGAAAAGATCTGGCTGTCCTCT
GGGATCTCCACCTTCCTCTGTTTATACACCAGTATCCTAGGATTCAGTCCGGCTACGGTC
ATCATTACAACCGAGCTTCCATACGGATCTGGCCTCGGTTCATCAGCAGCTTTCTGTGTA
GCTCTAACAGCTGCTCTCATTGCATCTTCCATCTCAGACAAAACTCGTGGTGAAGGTTGG
ACTTGTCTAGATGAAACCAATCTCGAGTTGCTGAATAAATGGGCGTTTGAAGGTGAAAAG
ATCATCCATGGGAAGCCTTCCGGGATAGACAACACCGTCAGTGCATACGGCAACATGATC
AAGTTCTGCTCAGGGGAGATAACTCGGTTACAGTCAAACATGCCTCTGAGAATGCTAATC
ACCAACACCAAAGTAGGACGGAACACGAAGGCTCTGGTCTCTGGAGTTTCAGAGAGAACA
GTCAGACACCCAGATGCTATGAAGTCGGTGTTCAATGCCGTGGACTCTATAAGCAAAGAG
CTAGCTTCGATCATCCAATCTAAAGAGGAGATCTCGGTTACTGAGAAAGAAGAGAGTATA
AAAGAACTCATGGAGGTTAACCAAGGCTTGCTGCAGTCAATGGGGGTCAGCCACAGCTCG
ATTGATACCGTGATCCGAACCACGCTCAAGCACAATCTTACCTCAAAACTGACTGGAGCT
GGAGGTGGCGGCTGTGTCCTTACTCTGTTACCAACAGGGACGGTGGTGGACAAAGTGGTT
GAGGAGCTTGAGTCCAGCGGTTTTCAGTGCTTCACTGCATCAATTGGTGGTAACGGAGCT
GAGATTTGCTTTTGATCAGATTGCTATATGGTTTAAACAAAGTCATATTTGGCCTCTCAC
TATATATTAGAAGAAGGCTGCAGTTACAAAATATAAGGAGTCCATTTTTTAACTAATGTA
TTGAATGTAAAAAAATGCTTTTTACCATGTGAAATCTCTTTCGTTCG


BQ
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BS 648 1307 RR4GU07JQ

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CTTGCAGGGGAACACGCTGTTGTCCATGGATCCACGGCAGTAGCAGCTGCCATTGATCTC
TACACTTACGTCACCTTACGCCTTCCTCTTCAAGCAGCTGCTGAGAACAATGATAGGCTT
ACACTTCAGCTCAAGGACCTTTCCTTGGAGTTTTCTTGGTCCATAGCCAGACTCAAAGAA
GTGATTCCTTATGATTCAAGCACTTCTACACCAGCTTCATGTTCAGGCGAGATTCTTAAA
TCAATTGCTGTTCTGGTTGAAGAGCAAAATATTCCAGAAGAAAAGATCTGGCTGTCCTCT
GGGATCTCCACCTTCCTCTGTTTATACACCAGTATCCTAGGATTCAGTCCGGCTACGGTC
ATCATTACAACCGAGCTTCCATACGGATCTGGCCTCGGTTCATCAGCAGCTTTCTGTGTA
GCTCTAACAGCTGCTCTCATTGCATCTTCCATCTCAGACAAAACTCGTGGTGAAGGTTGG
ACTTGTCTAGATGAAACCAATCTCGAGTTGCTGAATAAATGGGCGTTTGAAGGTGAAAAG
ATCATCCATGGGAAGCCTTCCGGGATAGACAACACCGTCAGTGCATA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4GU07JQ 838 0 0
CTTTCTGTGTAGCTCTAACAGCTGCTCTCATTGCATCTTCCATCTCAGACAAAACTCGTG
GTGAAGGTTGGACTTGTCTAGATGAAACCAATCTCGAGTTGCTGAATAAATGGGCGTTTG
AAGGTGAAAAGATCATCCATGGGAAGCCTTCCGGGATAGACAACACCGTCAGTGCATACG
GCAACATGATCAAGTTCTGCTCAGGGGAGATAACTCGGTTACAGTCAAACATGCCTCTGA
GAATGCTAATCACCAACACCAAAGTAGGACGGAACACGAAGGCTCTGGTCTCTGGAGTTT
CAGAGAGAACAGTCAGACACCCAGATGCTATGAAGTCGGTGTTCAATGCCGTGGACTCTA
TAAGCAAAGAGCTAGCTTCGATCATCCAATCTAAAGAGGAGATCTCGGTTACTGAGAAAG
AAGAGAGTATAAAAGAACTCATGGAGGTTAACCAAGGCTTGCTGCAGTCAATGGGGGTCA
GCCACAGCTCGATTGATACCGTGATCCGAACCACGCTCAAGCACAATCTTACCTCAAAAC
TGACTGGAGCTGGAGGTGGCGGCTGTGTCCTTACTCTGTTACCAACAGGGACGGTGGTGG
ACAAAGTGGTTGAGGAGCTTGAGTCCAGCGGTTTTCAGTGCTTCACTGCATCAATTGGTG
GTAACGGAGCTGAGATTTGCTTTTGATCAGATTGCTATATGGTTTAAACAAAGTCATATT
TGGCCTCTCACTATATATTAGAAGAAGGCTGCAGTTACAAAATATAAGGAGTCCATTTTT
TAACTAATGTATTGAATGTAAAAAAATGCTTTTTACCATGTGAAATCTCTTTCGTTCG

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL6228Contig1 965 2 2 U
GGACATTTGTCCCATATGTCGTCCTACACCTGCAAAAATTCATGGCTTCTCCTTACCGGA
CATCTTGGCATGCAATCAGAGATTCAGTTCGATCCACCTCCTTCTTGTCTGCATTTGTTG
GGATTTTTCAGGCTTTCATATGTGCCCATCGAAAAGTTGCATCCAAGGACCACAAGCTCG
TTTACTGGTTTGGGGGTGGAGTAGCTGCTCTTTCGGTTATGCTGGAGAAAAAACCAAGAC
GCTCTGAGCTTGCTCTATATGTTCTTCCCCGTGCAGGAGATTCTCTGTGGGAGATACTTG
TTAACCGCCACATTCTTCCCAATATTAAAAATGCTGAGGTTGCTGTATTCTGTGGATGTA
TGGGAGGAATCATGTATTACCTAGAACATGAGCCTGATACATTGGCTCCGTTTCTGAGAG
GACTCATCCGTCGGTTTCTTGCTAGTCAAATAAGCAATCCAAGTAGCAAAATCAGTCAGA
GTTCTTCCTATACCTATCTCCACACTCTAGATGCATTGGAGAAGCCGAAACCGCCTCCTG
AGAGCCGAGAAAGTGAAATCCAAAAAGCTGAAGAGAAGTACAACCTGGAGGCAATTCCTG
GTCTCTAGAAGCAAAGATATCTGATATTTTCAACAGCTGTATTAGCATCATGGATCATGG
TTTTGATTAAACTCCCCTGGAAGAAAAGGTTTCATCGACAAGAAAAAGAACTGAGAGATT
AAAGTGGTTTTTATAGGATTTTAGGAGTCTTTTTAAGTGTCTTTGTTTTATATTTGACTA
TCTTCCCAAAATAACAACAACAAACAAATGTCTCTTCTTAATTACAATGAGAAGATGCAG
AACGGAGAAGATTTATGGAATTTCGTACATTCATAAGCTTCCTGAAACAGATATGTAAAT
AGTCTCAGTGATTGCATATTCTCGCTTATGGACCAGCAATTTATTATGTTGAAATTATGA
TATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4ET06TF U 1
AF RR4ET06JQ C 385
BS 1 566 RR4ET06TF
BS 567 965 RR4ET06JQ

RD RR4ET06TF 566 0 0
GGACATTTGTCCCATATGTCGTCCTACACCTGCAAAAATTCATGGCTTCTCCTTACCGGA
CATCTTGGCATGCAATCAGAGATTCAGTTCGATCCACCTCCTTCTTGTCTGCATTTGTTG
GGATTTTTCAGGCTTTCATATGTGCCCATCGAAAAGTTGCATCCAAGGACCACAAGCTCG
TTTACTGGTTTGGGGGTGGAGTAGCTGCTCTTTCGGTTATGCTGGAGAAAAAACCAAGAC
GCTCTGAGCTTGCTCTATATGTTCTTCCCCGTGCAGGAGATTCTCTGTGGGAGATACTTG
TTAACCGCCACATTCTTCCCAATATTAAAAATGCTGAGGTTGCTGTATTCTGTGGATGTA
TGGGAGGAATCATGTATTACCTAGAACATGAGCCTGATACATTGGCTCCGTTTCTGAGAG
GACTCATCCGTCGGTTTCTTGCTAGTCAAATAAGCAATCCAAGTAGCAAAATCAGTCAGA
GTTCTTCCTATACCTATCTCCACACTCTAGATGCATTGGAGAAGCCGAAACCGCCTCCTG
AGAGCCGAGAAAGTGAAATCCAAAAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4ET06JQ 581 0 0
AACATGAGCCTGATACATTGGCTCCGTTTCTGAGAGGACTCATCCGTCGGTTTCTTGCTA
GTCAAATAAGCAATCCAAGTAGCAAAATCAGTCAGAGTTCTTCCTATACCTATCTCCACA
CTCTAGATGCATTGGAGAAGCCGAAACCGCCTCCTGAGAGCCGAGAAGGTGAAATCCAAA
AAGCTGAAGAGAAGTACAACCTGGAGGCAATTCCTGGTCTCTAGAAGCAAAGATATCTGA
TATTTTCAACAGCTGTATTAGCATCATGGATCATGGTTTTGATTAAACTCCCCTGGAAGA
AAAGGTTTCATCGACAAGAAAAAGAACTGAGAGATTAAAGTGGTTTTTATAGGATTTTAG
GAGTCTTTTTAAGTGTCTTTGTTTTATATTTGACTATCTTCCCAAAATAACAACAACAAA
CAAATGTCTCTTCTTAATTACAATGAGAAGATGCAGAACGGAGAAGATTTATGGAATTTC
GTACATTCATAAGCTTCCTGAAACAGATATGTAAATAGTCTCAGTGATTGCATATTCTCG
CTTATGGACCAGCAATTTATTATGTTGAAATTATGATATCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL6229Contig1 691 2 4 U
GGTTGGCAGCAGCAAGTGTAAGAGTGTCGAACGAGCTCGGTAGGGGAAACCCGAAAGGAG
CCAAATTTGCAACATTGACAGCGGTTTTCACGTCACTCTCTATAGGAATAGTTCTATTCT
TCGTCTTTTTGTTTCTAAGAGGAAAAGTTTTCTATATTTTCACTACAAGTGAAGCTGTAG
CAGCAGAAGTTGCCGATCTTTCTCCACTTTTAGCCTTTTCCATCCTCATGAACAGTGTTC
AACCTGTTCTCTCAGGAGTTGCTGTTGGAGCAGGATGGCAAGGATATGTTACTTACGTTA
ACCTTGCTTGCTATTACCTTGTCGGAATTCCTACTGGTGTAATCCTTGGTTACGTTGTCG
GTTTGCAAGTCAAAGGTGTCTGGATAGGAATGCTCTTTGGAGTATTCGTTCAAACTTGCG
TGCTTACCATCATGACTCTGAGAACAGATTGGGATCAACAGGTGTATACATCGTTGAGAC
GTTTAAACCGGTGGGTTGTACCAGAATCTAGTCCCGTGAACAAAACTTCATCAGAGGAAT
AACTAATTTGGATTCTGCAAATTCACATGAGATGTTCCTACCATTATACATAAAAATCCG
TGCAATCTTTTAAGCCTCTGAAAACAAGATTGTAAGACATTATTATCCCTAGCACCTCTA
GTGGGACTCTTAATCATTTTTAGTAATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D639TF U 1
AF RR4D639JQ C 488
BS 1 512 RR4D639TF
BS 513 513 RR4D639JQ
BS 514 668 RR4D639TF
BS 669 691 RR4D639JQ

RD RR4D639TF 668 0 0
GGTTGGCAGCAGCAAGTGTAAGAGTGTCGAACGAGCTCGGTAGGGGAAACCCGAAAGGAG
CCAAATTTGCAACATTGACAGCGGTTTTCACGTCACTCTCTATAGGAATAGTTCTATTCT
TCGTCTTTTTGTTTCTAAGAGGAAAAGTTTTCTATATTTTCACTACAAGTGAAGCTGTAG
CAGCAGAAGTTGCCGATCTTTCTCCACTTTTAGCCTTTTCCATCCTCATGAACAGTGTTC
AACCTGTTCTCTCAGGAGTTGCTGTTGGAGCAGGATGGCAAGGATATGTTACTTACGTTA
ACCTTGCTTGCTATTACCTTGTCGGAATTCCTACTGGTGTAATCCTTGGTTACGTTGTCG
GTTTGCAAGTCAAAGGTGTCTGGATAGGAATGCTCTTTGGAGTATTCGTTCAAACTTGCG
TGCTTACCATCATGACTCTGAGAACAGATTGGGATCAACAGGTGTATACATCGTTGAGAC
GTTTAAACCGGTGGGTTGTACCAGAATCTAGTGCCGTGAACAAAACTTCATCAGAGGAAT
AACTAATTTGGATTCTGCAAATTCACATGAGATGTTCCTACCATTATACATAAAAATCCG
TGCAATCTTTTAAGCCTCTGAAAACAAGATTGTAAGACATTATTATCCCTAGCACCTCTA
GTGGGACT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4D639JQ 204 0 0
CCGGTGGGTTGTACCAGAATCTAGTCCCGTGAACAAAACTTCATCAGAGGAATAACTAAT
TTGGATTCTGCAAATTCACATGAGATGTTCCTACCATTATACATAAAAATCCGTGCAATC
TTTTAAGCCTCTGAAAACAAGATTGTAAGACATTATTATCCCTAGCACCTCTAGTGGGAC
TCTTAATCATTTTTAGTAATAAAT

QA 1 204 1 204
DS 



AS 1 2

CO CL6230Contig1 1149 2 10 U
GTGAATGCGTGTGGTTCTGGTTATGATTTCGATGTTTATATCCATTTTGGAGCTGGTGCG
TACATTTGTGGTGAAGAGACGGCGCTTCTTGAGAGTCTCGAAGGGAAGCAAGGGAAGCCT
AGATTGAAGCCTCCGTTCCCTGCTAATGCTGGTTTGTATGGTTGTCCCACGACTGTCACC
AATGTGGAAACGGTGGCTGTGTCTCCTACTATTTTGAGGCGTGGACCTGAGTGGTTTTCG
AGTTTCGGTAGGAAGAATAACGCTGGGACAAAGCTGTTTTGTGTTTCAGGGCATGTGAAC
AAGCCGTGTACCGTTGAAGAGGAGATGAGTATACCTCTCAAGGAGCTGATTGAGAGGCAT
TGCGGAGGCGTTAGGGGTGGATGGGACAACCTGCTTGCTATCATCCCTGGAGGTTCCTCT
GTCCCTTTGATTCCTAAGAACATATGCGAGGATGTGCTGATGGATTTCGATGCGCTCAAA
GCTGTCCAATCAGGACTAGGAACTGCGGCGGTGATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTC
GTGGATGCAATTGCGAGGCTCTCGTACTTCTACAAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGCACT
CCTTGCAGAGAGGGGACTGGTTGGCTTTGGATGATCATGGAGAGAATGAAGGTTGGCAAT
GCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCACGAGGTGACCAAACAGATCGAAGGACACACA
ATCTGTGCCCTGGGTGATGCAGCTGCGTGGCCCGTGCAAGGTTTGATTAGGCACTTTAGG
CCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAAGGAACGCGCTGAAAGGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCT
TAGAAGTCCTTGCTAACCACAGGGAGTTTGCTATTATTCTCAATGGAAATAAAACCTGAA
GAACAATATTAGAGTTTTGGGATTGCAAAGCTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTAATGTAT
TCGTGTTGAATGGGTGAATGTTAAAACTTTAATCAAGTTGTATCAGAAGGAGCTATATTT
GTTCTTTTGATTACTCTGCTTTCTTCAATGTTTGTTTGTTTTCTTATGACTATGCTGAGA
TCACATTTTGGGAAGAACCAAACAAAACCTTTTGATGTTTGAAATAAAGGATGCTCCTTT
TTTTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH76TF U 1
AF RR4CH76JQ C 565
BS 1 651 RR4CH76TF
BS 652 652 RR4CH76JQ
BS 653 698 RR4CH76TF
BS 699 699 RR4CH76JQ
BS 700 712 RR4CH76TF
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BS 730 730 RR4CH76JQ
BS 731 758 RR4CH76TF
BS 759 1149 RR4CH76JQ

RD RR4CH76TF 771 0 0
GTGAATGCGTGTGGTTCTGGTTATGATTTCGATGTTTATATCCATTTTGGAGCTGGTGCG
TACATTTGTGGTGAAGAGACGGCGCTTCTTGAGAGTCTCGAAGGGAAGCAAGGGAAGCCT
AGATTGAAGCCTCCGTTCCCTGCTAATGCTGGTTTGTATGGTTGTCCCACGACTGTCACC
AATGTGGAAACGGTGGCTGTGTCTCCTACTATTTTGAGGCGTGGACCTGAGTGGTTTTCG
AGTTTCGGTAGGAAGAATAACGCTGGGACAAAGCTGTTTTGTGTTTCAGGGCATGTGAAC
AAGCCGTGTACCGTTGAAGAGGAGATGAGTATACCTCTCAAGGAGCTGATTGAGAGGCAT
TGCGGAGGCGTTAGGGGTGGATGGGACAACCTGCTTGCTATCATCCCTGGAGGTTCCTCT
GTCCCTTTGATTCCTAAGAACATATGCGAGGATGTGCTGATGGATTTCGATGCGCTCAAA
GCTGTCCAATCAGGACTAGGAACTGCGGCGGTGATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTC
GTGGATGCAATTGCGAGGCTCTCGTACTTCTACAAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGCACT
CCTTGCAGAGAGGGGACTGGTTGGCTTTGGATGATCATGGAGAGAATGAAG*TTGGCAAT
GCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCACGAGGTGAC*AAACAGATCGAAG*ACACACA
ATCTGTGCC*TGGGTGATGCAGCTGCGTGGCCCGTGCA
GTCTGATAGCACT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4CH76JQ 585 0 0
TACTTCTACAAGCATGAAAGCTGTGGGCAGTGCACTCCTTGCAGAGAGGGGACTGGTTGG
CTTTGGATGATCATGGAGAGAATGAAGGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATG
CTTCACGAGGTGACCAAACAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCCCTGGGTGATGCAGCT
GCGTGGCCCGTGCAAGGTTTGATTAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAAG
GAACGCGCTGAAAGGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCTTAGAAGTCCTTGCTAACCACAGGG
AGTTTGCTATTATTCTCAATGGAAATAAAACCTGAAGAACAATATTAGAGTTTTGGGATT
GCAAAGCTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTAATGTATTCGTGTTGAATGGGTGAATGTTAA
AACTTTAATCAAGTTGTATCAGAAGGAGCTATATTTGTTCTTTTGATTACTCTGCTTTCT
TCAATGTTTGTTTGTTTTCTTATGACTATGCTGAGATCACATTTTGGGAAGAACCAAACA
AAACCTTTTGATGTTTGAAATAAAGGATGCTCCTTTTTTTGGTTT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6231Contig1 1353 2 6 U
GGGGGCCGAATAGGGCTCAACGGCGGCGATTGTTGGTGTCTACAATACGCGGTGGCGTCT
CAGATCCCAATCGGAACTTCAGGGTTCAGCTGCTACAATCGATTTGAAACTGTCACCAGC
TCGATACGAGTTTGGATTGTCAAATTCGAAGAAATCAAAGGCGAAGAGAAAGAAGAAATT
GAATACGATGGGGAAGAAACAGCACAGCAAAGATCGAATGTACATAACGAAGACGGAGTG
GGCAACTGAATGGGGAGGCGCTAAGTCCAAAGAGAATCGTACTCCTTTCAAGAGCCTTCC
TTTCTACTGCTGCGCGCTCACGTTTCTACCGTTCGAGGAGCCTGTGTGTACAAGCGACGG
CAGCGTTTTCGAGCTAACAACGATAGTGCCGTACATAAGGAAGTTTGGAAAGCATCCAGT
AACAGGAGCACCATTGAAAGGAGATGATCTTATTACTCTCAACTTTCACAAGAACTCTGA
AGGAGAGTTTCATTGTCCTGTTCTCAACAAAGTCTTCACTGAGTTTACTCATATTGTTGC
TGTTAAGACCACCGGTAACGTATTCTGCTACGAGGCAATCAAAGAATTGAATATCAAGAC
CAAGAATTGGAAGGAGCTTTTAACTGAGGAACCATTCACAAGAGCTGTCCTTATAACTAT
TCAAAATCCTAATGCAGTTGATAGTAAAATAACGGTGGAATTTGATCACGTTAAAAACGG
CCTGAAGCTTGAAGATGAAGAATTGAAGAAGATGAACTCAGACCCTGCTTATAATATAAA
CGCCTCTGGAGATATCAAGAATATGCTTGCAGATCTTGGAACTGACAAGGCCAAGGAGAT
AGCTCTACACGGTGGAGGTGGTAACAAGGCACGTAACGAAAGAGCCGCTGCTATTGCTGC
CATTCTTGAGTCCAGGTCGAAAATCAAACAGAGTTCTAAAGCAGACGAACCTAAGCAGAC
TTATAGTGTTGTGGATGCTGCTTTTGCTTCGGTTCATGGAAAGAGAAAGCTGAGAAGGAG
AAGAACGAAGACAAAGACATTGAGAAGATCGGGTCGTGGTACAGCAACCCAGGATCAGGT
ACAGCAGAAGGTGGAGCAGGTGGTGGTGGCGTCGGTAAATACTTGAAAGCTAAGAGTAAT
GCAGCAGGCACTAAGGACACTAGTGGTGCAACAGACTCTGATATTGCTGCAACCTCTGGA
GTTGTGGCTAAGAAAAGAAAAACAACTTCCACAGGGTTTAATGATTTCTCTGGCTGGTAG
GTGAAGAAAAACAATTCTCTACCAACTATGTAAAACTTCTGTTCACTTGTCTTTTGATAG
AGAGAGCCCAAACCACAAATGAATTGTTGTGCG


BQ
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AF RR4FI50TF U 1
AF RR4FI50JQ C 567
BS 1 694 RR4FI50TF
BS 695 695 RR4FI50JQ
BS 696 716 RR4FI50TF
BS 717 717 RR4FI50JQ
BS 718 746 RR4FI50TF
BS 747 1353 RR4FI50JQ

RD RR4FI50TF 754 0 0
GGGGGCCGAATAGGGCTCAACGGCGGCGATTGTTGGTGTCTACAATACGCGGTGGCGTCT
CAGATCCCAATCGGAACTTCAGGGTTCAGCTGCTACAATCGATTTGAAACTGTCACCAGC
TCGATACGAGTTTGGATTGTCAAATTCGAAGAAATCAAAGGCGAAGAGAAAGAAGAAATT
GAATACGATGGGGAAGAAACAGCACAGCAAAGATCGAATGTACATAACGAAGACGGAGTG
GGCAACTGAATGGGGAGGCGCTAAGTCCAAAGAGAATCGTACTCCTTTCAAGAGCCTTCC
TTTCTACTGCTGCGCGCTCACGTTTCTACCGTTCGAGGAGCCTGTGTGTACAAGCGACGG
CAGCGTTTTCGAGCTAACAACGATAGTGCCGTACATAAGGAAGTTTGGAAAGCATCCAGT
AACAGGAGCACCATTGAAAGGAGATGATCTTATTACTCTCAACTTTCACAAGAACTCTGA
AGGAGAGTTTCATTGTCCTGTTCTCAACAAAGTCTTCACTGAGTTTACTCATATTGTTGC
TGTTAAGACCACCGGTAACGTATTCTGCTACGAGGCAATCAAAGAATTGAATATCAAGAC
CAAGAATTGGAAGGAGCTTTTAACTGAGGAACCATTCACAAGAGCTGTCCTTATAACTAT
TCAAAATCCTAATGCAGTTGATAGTAAAATAACG*TGGAATTTGATCACGTTAAAA*CGG
CCTGAAGCTTGAAGATGAAGAATTGA
GAAGATGA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4FI50JQ 787 0 0
GCTACGAGGCAATCAAAGAATTGAATATCAAGACCAAGAATTGGAAGGAGCTTTTAACTG
AGGAACCATTCACAAGAGCTGTCCTTATAACTATTCAAAATCCTAATGCAGTTGATAGTA
AAATAACGGTGGAATTTGATCACGTTAAAAACGGCCTGAAGCTTGAAGATGAAGAATTGA
AGAAGATGAACTCAGACCCTGCTTATAATATAAACGCCTCTGGAGATATCAAGAATATGC
TTGCAGATCTTGGAACTGACAAGGCCAAGGAGATAGCTCTACACGGTGGAGGTGGTAACA
AGGCACGTAACGAAAGAGCCGCTGCTATTGCTGCCATTCTTGAGTCCAGGTCGAAAATCA
AACAGAGTTCTAAAGCAGACGAACCTAAGCAGACTTATAGTGTTGTGGATGCTGCTTTTG
CTTCGGTTCATGGAAAGAGAAAGCTGAGAAGGAGAAGAACGAAGACAAAGACATTGAGAA
GATCGGGTCGTGGTACAGCAACCCAGGATCAGGTACAGCAGAAGGTGGAGCAGGTGGTGG
TGGCGTCGGTAAATACTTGAAAGCTAAGAGTAATGCAGCAGGCACTAAGGACACTAGTGG
TGCAACAGACTCTGATATTGCTGCAACCTCTGGAGTTGTGGCTAAGAAAAGAAAAACAAC
TTCCACAGGGTTTAATGATTTCTCTGGCTGGTAGGTGAAGAAAAACAATTCTCTACCAAC
TATGTAAAACTTCTGTTCACTTGTCTTTTGATAGAGAGAGCCCAAACCACAAATGAATTG
TTGTGCG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6233Contig1 947 2 2 U
GATCCACAAACTCGAAGCTCCCAAATGCTCCAAACCATCCTCCAATCCCCAACCTGATTC
CAATCCAAAGCTAACCCCTTTCCGCGTACTGCGCCCAATCATCCGAATCTTCAAAGGTCT
GGTCTCCTCTCAGTCCCGGCAATGGACGTCGCGTTTCCGAGCTTACAGGGACGACACGGC
GTCGTTTTCGGAACACTTTTTCCCCGGAGAGGATTTGAACCGGAGCGGGGGTCTGGGGAT
CGCCCTCTTGAGCGTGACGGCTTCCGCCAAGGTAGATCAGTCCTTTCGTGGCGACGCTCT
CGGCGAACCCGACGTTCGTGTCGGCGGTGTTCGCGTGGTTCTTCGCGCAGACGAGTAAGA
TGGTTATCAATTTCTTCATCGAGAGGAAGTGGGACTTGAGTTTGCTGTTTGCCTCTGGTG
GGATGCCTTCTTCGCATTCTGCTCTGTGTATGCCTTTGACGACGTCTGTTGCGCTTTGTC
ATGGGGTTGCGGACTCGTTGTTTCCTGTTTGTTTGGGGTTTAGTTTGATTGTCATGTATG
ATGCTATTGGTGTTAGACGCCATGCCGGTATGCAAGCTGAGGTTCTGAACTTGATCATAA
GGGACTTGTTCGAAGGGCATCCCATCAGTCAAAGAAAGCTAAAAGAATTGCTGGGTCACA
CTCCTTCGCAGGTTCTCGCAGGAGCATTAGTTGGTATTGTGATCGCCTGCTATTGTTGCC
AAGGCTATCTAGTCTCAGCCTAAGATCCCCTTAACGCATAAGTTTTCTGATTGATTATTA
GCTGAAAAACTCTGTACTTTGAGTACAGCTTAGTATCAATTTGTTTAAGATTTGAGGTGT
ATCATATGTTGTGTTCAGTAATAGAGAAAACTGGTGCTTCTTTCTGTTTATTTTTTGGTT
CTGAGTTTTTGTAATCTCTAGAAAATACAATGAGAGAGTTTACTTTC


BQ
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AF RR4EC39TF U 1
AF RR4EC39JQ C 435
BS 1 610 RR4EC39TF
BS 611 947 RR4EC39JQ

RD RR4EC39TF 610 0 0
GATCCACAAACTCGAAGCTCCCAAATGCTCCAAACCATCCTCCAATCCCCAACCTGATTC
CAATCCAAAGCTAACCCCTTTCCGCGTACTGCGCCCAATCATCCGAATCTTCAAAGGTCT
GGTCTCCTCTCAGTCCCGGCAATGGACGTCGCGTTTCCGAGCTTACAGGGACGACACGGC
GTCGTTTTCGGAACACTTTTTCCCCGGAGAGGATTTGAACCGGAGCGGGGGTCTGGGGAT
CGCCCTCTTGAGCGTGACGGCTTCCGCCAAGGTAGATCAGTCCTTTCGTGGCGACGCTCT
CGGCGAACCCGACGTTCGTGTCGGCGGTGTTCGCGTGGTTCTTCGCGCAGACGAGTAAGA
TGGTTATCAATTTCTTCATCGAGAGGAAGTGGGACTTGAGTTTGCTGTTTGCCTCTGGTG
GGATGCCTTCTTCGCATTCTGCTCTGTGTATGCCTTTGACGACGTCTGTTGCGCTTTGTC
ATGGGGTTGCGGACTCGTTGTTTCCTGTTTGTTTGGGGTTTAGTTTGATTGTCATGTATG
ATGCTATTGGTGTTAGACGCCATGCCGGTATGCAAGCTGAGGTTCTGAACTTGATCATAA
GGGACTTGTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4EC39JQ 513 0 0
CATTCTGCTCTGTGTATGCCTTTGACGACGTCTGTTGCGCTTTGTCATGGGGTTGCGGAC
TCGTTGTTTCCTGTTTGTTTGGGGTTTAGTTTGATTGTCATGTATGATGCTATTGGTGTT
AGACGCCATGCCGGTATGCAAGCTGAGGTTCTGAACTTGATCATAAGGGACTTGTTCGAA
GGGCATCCCATCAGTCAAAGAAAGCTAAAAGAATTGCTGGGTCACACTCCTTCGCAGGTT
CTCGCAGGAGCATTAGTTGGTATTGTGATCGCCTGCTATTGTTGCCAAGGCTATCTAGTC
TCAGCCTAAGATCCCCTTAACGCATAAGTTTTCTGATTGATTATTAGCTGAAAAACTCTG
TACTTTGAGTACAGCTTAGTATCAATTTGTTTAAGATTTGAGGTGTATCATATGTTGTGT
TCAGTAATAGAGAAAACTGGTGCTTCTTTCTGTTTATTTTTTGGTTCTGAGTTTTTGTAA
TCTCTAGAAAATACAATGAGAGAGTTTACTTTC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL6234Contig1 834 2 2 U
GGGACGAGCAAGAGTACATTCCCGACCCTGAAGACAAGAAACTGACGGATACGATGATAT
CCCAAAGGAGATCCCAGATACCGATGCAACGAAGCCTGAGGACTGGGATGAAGAAGAAGA
TGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCTGAGTACATGGGTGAATGGAAGCCCAA
GCAAATCAAGAACCCCAACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCACTGATTGACAACCCTGA
CTTCAAGGATGACGCAGAGCTCTACGTCTTCCCCAAACTGAAGTATGTTGGAATCGAATT
GTGGCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATCTGCGATGACCCAGACTA
CGCCAAGAAGTTGGCTGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTT
CGATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACACTCCAGCAGAAACTGA
TGCTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAGACCGA
GGCCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCGCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGA
GCTGTAAGGGAAAGAACGTTGAAGATTGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTCTTTTTATTT
TTGTTTTTATCCTTTCTTTTGAAGTACTTTAGCATTCTAGCTTGTCGGAGGGTAGAACAA
GTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACACAATGATGT
GATGATCAAGATGCTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGATGACATTTTGCACTT


BQ
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AF RR4GN69JQ C 1
AF RR4EV19TF U 652
BS 1 651 RR4GN69JQ
BS 652 834 RR4EV19TF

RD RR4GN69JQ 834 0 0
GGGACGAGCAAGAGTACATTCCCGACCCTGAAGACAAGAAACTGACGGATACGATGATAT
CCCAAAGGAGATCCCAGATACCGATGCAACGAAGCCTGAGGACTGGGATGAAGAAGAAGA
TGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCTGAGTACATGGGTGAATGGAAGCCCAA
GCAAATCAAGAACCCCAACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCACTGATTGACAACCCTGA
CTTCAAGGATGACGCAGAGCTCTACGTCTTCCCCAAACTGAAGTATGTTGGAATCGAATT
GTGGCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATCTGCGATGACCCAGACTA
CGCCAAGAAGTTGGCTGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTT
CGATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACACTCCAGCAGAAACTGA
TGCTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAGACCGA
GGCCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCGCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGA
GCTGTAAGGGAAAGAACGTTGAAGATTGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTCTTTTTATTT
TTGTTTTTATCCTTTCTTTTGAAGTACTTTAGCATTCTAGCTTGTCGGAGGGTAGAACAA
GTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACACAATGATGT
GATGATCAAGATGCTCTTTT*GTACTGAAAACCATAAGATGACATTTTGCACTT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4EV19TF 183 0 0
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GTAGAACAAGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACA
CAATGATGTGATGATCAAGATGCTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGATGACATTTTGCA
CTT

QA 1 183 1 183
DS 



AS 1 2

CO CL6235Contig1 1172 2 2 U
GGAAACTATATCGTTCTAGTACCTCATCTAAACAAGCCATCTTATAGACAATGGGAGAAC
ATGTCTTGCTTACTGTTTTCACCCTGTGTATGCTTTGTTCAGGGGCTAAGGCACAGCTAA
ACCCTAACCTTTACGCTAAATCATGCCCGTATCTTGTACCAATTGTCCGCAGACAAGTTA
TGATCGCCCTGAAGGCCGATACACGGATGGCTGCTTCTCTCATTCGTCTTCATTTCCATG
ACTGTTTCGTTAATGGGTGCGATGCGTCTGTATTGTTGGATGGAGACGACAGCGAGAAAT
TAGCGTTACCAAATCTGAACTCTGCCAGAGGATTTGAATTAATTGATACTATCAAAGCCG
CTGTGGAATACGCATGTCCTGGTGTTGTTTCTTGCGCTGATATACTCTCTCTTGCCGCTC
GCGACTCCGTTGTCTTAAGCGGAGGACCTCAATGGAGGGTGGCATTAGGGCGAAAAGATG
GACTTGTGGCAAATCAGAGCAGTGCAAATAATCTGCCATCTCCTTTTGAACCCTTAGACG
CTATTATTGCCAAGTTTGTAGCTGTTGGCCTTAATGTCGGCGACGTCGTAGCTTTATCAG
GAGCTCACACCTTTGGGCAAGCAAAGTGTGATGTATTCGCAACCGGCTTTTCAACTTTAA
AGGCGCAGGATCTCCGGACACAACACTTGAGACAACACTCTTGTCCGATCTGCGAACGGT
TTGTCCCGCCGGAGGAAGCGGAAACCAAACAGCTCCCCTAGACAGTAACTCTACCAACGC
CTTCGACAACAATTATTTCAAGAACCTCCTCGAAGGAAAAGGTCTTTTGAGTTCGGATCA
GATTCTTTTCTCGAGTGATTTGGCCGTGAACACAACAAAGAGACTTGTGGAGGCTTATAG
TCGGAGCCAGTACTTGTTTTTCAAGGACTTCACTTGTTCGATGATCAAAATGGGTGGTAT
TGCGAATCTTGTTAATGGATCTAATGGCGAGGTTAGGAAAAACTGTCGGGTTATCAATAA
CTATTAGGTCTGTGTTTTTCTTTTATATTTGCAATGTTTGGGTTTTGATCAAATCCTCGT
GTGTATCTAAATTGTCACGTGTGCAATTAAGAAGTTACCGGGGTCTGTTTTTCGAAATGT
CAATGAAAGCAAAACAAGTATATTTTACCTTT


BQ
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AF RR4D362TF U 1
AF RR4D362JQ C 537
BS 1 598 RR4D362TF
BS 599 1172 RR4D362JQ

RD RR4D362TF 598 0 0
GGAAACTATATCGTTCTAGTACCTCATCTAAACAAGCCATCTTATAGACAATGGGAGAAC
ATGTCTTGCTTACTGTTTTCACCCTGTGTATGCTTTGTTCAGGGGCTAAGGCACAGCTAA
ACCCTAACCTTTACGCTAAATCATGCCCGTATCTTGTACCAATTGTCCGCAGACAAGTTA
TGATCGCCCTGAAGGCCGATACACGGATGGCTGCTTCTCTCATTCGTCTTCATTTCCATG
ACTGTTTCGTTAATGGGTGCGATGCGTCTGTATTGTTGGATGGAGACGACAGCGAGAAAT
TAGCGTTACCAAATCTGAACTCTGCCAGAGGATTTGAATTAATTGATACTATCAAAGCCG
CTGTGGAATACGCATGTCCTGGTGTTGTTTCTTGCGCTGATATACTCTCTCTTGCCGCTC
GCGACTCCGTTGTCTTAAGCGGAGGACCTCAATGGAGGGTGGCATTAGGGCGAAAAGATG
GACTTGTGGCAAATCAGAGCAGTGCAAATAATCTGCCATCTCCTTTTGAACCCTTAGACG
CTATTATTGCCAAGTTTGTAGCTGTTGGCCTTAATGTCGGCGACGTCGTAGCTTTATC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4D362JQ 636 0 0
GACGCTATTATTGCCAAGTTTGTAGCTGTTGGCCTTAATGTCGGCGACGTCGTAGCTTTA
TCAGGAGCTCACACCTTTGGGCAAGCAAAGTGTGATGTATTCGCAACCGGCTTTTCAACT
TTAAAGGCGCAGGATCTCCGGACACAACACTTGAGACAACACTCTTGTCCGATCTGCGAA
CGGTTTGTCCCGCCGGAGGAAGCGGAAACCAAACAGCTCCCCTAGACAGTAACTCTACCA
ACGCCTTCGACAACAATTATTTCAAGAACCTCCTCGAAGGAAAAGGTCTTTTGAGTTCGG
ATCAGATTCTTTTCTCGAGTGATTTGGCCGTGAACACAACAAAGAGACTTGTGGAGGCTT
ATAGTCGGAGCCAGTACTTGTTTTTCAAGGACTTCACTTGTTCGATGATCAAAATGGGTG
GTATTGCGAATCTTGTTAATGGATCTAATGGCGAGGTTAGGAAAAACTGTCGGGTTATCA
ATAACTATTAGGTCTGTGTTTTTCTTTTATATTTGCAATGTTTGGGTTTTGATCAAATCC
TCGTGTGTATCTAAATTGTCACGTGTGCAATTAAGAAGTTACCGGGGTCTGTTTTTCGAA
ATGTCAATGAAAGCAAAACAAGTATATTTTACCTTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL6236Contig1 705 2 2 U
GCAGGCTTGTTCTTGGACACAGCTGATGTGTCTGGTGGACGAACAATCAGGAACTTATAC
AATGGTATAGTAGAGTTTCAAAGTGTGAAGAACAACCTGCCTCGTATGTGCACAAACCAT
CTTGATCCAACTTCGTGTTTCTTCCCAGAGAATCTGATCAGTCAGATGAAAACTCCTCTT
TTTATTGTCAACGCAGCATATGATACATGGCAGATTCAAAGCAGTATGGCTCCAACATCA
GCTGATCCTAGTGGGTTTTGGCATGAGTGTAGACTCAACCATGAAAAATGCACCTCTGGA
CAGATGCGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTTAAGGGCTTCTCA
ATGTCTAGACAGAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCCAAACCGAGAGG
CAAGATACTTGGTTTGCAGATGGCTCCCCTGTCATAAGGAAAAAGGCGGTGGCAATAGCT
GTGGGAGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTAAAGTTAGTTGACTGTCCTTACCCTTGT
GACAGGAGCTGCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTGACTATATACATACCTTAGAAAGCT
TCTCTCAAATGGAGAGGGTTTTGTATCCTTAAAGCATTACCAATGCCTCATTGGAGAATT
GTATGATTGATCTGTGCTTCTCTGGAAAACAATAATAAAACCCGA


BQ
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AF RR4CJ08TF U 1
AF RR4CJ08JQ C 105
BS 1 283 RR4CJ08TF
BS 284 705 RR4CJ08JQ

RD RR4CJ08TF 283 0 0
GCAGGCTTGTTCTTGGACACAGCTGATGTGTCTGGTGGACGAACAATCAGGAACTTATAC
AATGGTATAGTAGAGTTTCAAAGTGTGAAGAACAACCTGCCTCGTATGTGCACAAACCAT
CTTGATCCAACTTCGTGTTTCTTCCCAGAGAATCTGATCAGTCAGATGAAAACTCCTCTT
TTTATTGTCAACGCAGCATATGATACATGGCAGATTCAAAGCAGTATGGCTCCAACATCA
GCTGATCCTAGTGGGTTTTGGCATGAGTGTAGACTCAACCATG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR4CJ08JQ 601 0 0
TATGTGCACAAACCATCTTGATCCAACTTCGTGTTTCTTCCCAGAGAATCTGATCAGTCA
GATGAAAACTCCTCTTTTTATTGTCAACGCAGCATATGATACATGGCAGATTCAAAGCAG
TATGGCTCCAACATCAGCTGATCCTAGTGGGTTTTGGCATGAGTGTAGACTCAACCATGA
AAAATGCACCTCTGGACAGATGCGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGT
AGTTAAGGGCTTCTCAATGTCTAGACAGAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCA
CTGCCAAACCGAGAGGCAAGATACTTGGTTTGCAGATGGCTCCCCTGTCATAAGGAAAAA
GGCGGTGGCAATAGCTGTGGGAGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTAAAGTTAGTTGA
CTGTCCTTACCCTTGTGACAGGAGCTGCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTGACTATATA
CATACCTTAGAAAGCTTCTCTCAAATGGAGAGGGTTTTGTATCCTTAAAGCATTACCAAT
GCCTCATTGGAGAATTGTATGATTGATCTGTGCTTCTCTGGAAAACAATAATAAAACCCG
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL6237Contig1 1113 2 2 U
GTATGAGCAGACAATTATCGCTGGTAATCAATACCAGTCATGGCTCCAGGATACTTCTCA
CATTCTCCTGAGGGGAAAAAAGAGAAAGGCTCGAGGACCCGCCAGCCCAAGTTTTGAGGT
TACTAAGCGTATGAAGCTGCCACTTACACAACTCTTTGAAGAGCATGTGGACGGTTCGTA
CCCACCTCAGCTCATGGAGCTTTGGTCAAAATGCACCCAGCCTCTTCAAACCTCTACATC
TGAGACTGGACGCCCTGATCTCTCTGCGGAGCAATCTCCAGGGTTTGTCCAGGAGAGAAT
GCAAAACCACCACCAAACAGACCATCATCAGGGCACTGAGACAAGCTTCCAAAGTCTTGG
TAGTCCCGCAGAAAGATTTCGTAACGCTCTCGCTGAGAAAGATGGTTCAATAGAAGGCCT
GATGGCTCGATCTCGAGCAAGCGCTGAAAATAATAACCGCAAGTCTGCTGCTGATATTAG
CGTTACACCATTATATTCTGGAGATGACGTGAGATCCATACCTAGCAGCTCACCATCCGC
ACGTGGGGCAGCTTCCATTAACATAGAAATCAACTCTAACAGTCGCAGGCTCAGCAGAAA
AAGGCAACATTCCTCGCCAAGAAGAGGACTCGAACCAGTAGCGGAAGACAGAACGTCGGA
GCACCGTGCTTATGAGTTTGAGTTTTCAATGCTACCTGAAAAGGGGTTTACAGCTGATAA
CGAAGTACTAGCTGAGACTGGACCTACACAAACTCAAAAGCCAGTGACCGCTCACTCAGA
CGAGAAGATAACAGATAGCATCAAAAGTCACCTCAAGACGCACTTTGAAACACCTGGAGC
TGCTCAAGTGGAATCTCTTAACAAACTCGCTATTGGAATGAAAAGAAACGCTGCAGCTCA
ACTTTTCTACCAATCCTGTGTGCTAGCCACTCGCGGAGTGATCAAGGTGGAGCAAACACA
GCCTTATGGGGACATTCTCATTGCAAGAGGACCCAATATGTAAAGGCTTTTGATATTTGG
GATGAAAGGTTATTTAGTTTTTCATATTTAAGCAAAGAGAGAGTCCTGTAGACTTTAAAA
ATTATAACGGCGTAGTACTACTACCTTCATACG


BQ
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AF RR4H634TF U 1
AF RR4H634JQB C 497
BS 1 654 RR4H634TF
BS 655 1113 RR4H634JQB

RD RR4H634TF 654 0 0
GTATGAGCAGACAATTATCGCTGGTAATCAATACCAGTCATGGCTCCAGGATACTTCTCA
CATTCTCCTGAGGGGAAAAAAGAGAAAGGCTCGAGGACCCGCCAGCCCAAGTTTTGAGGT
TACTAAGCGTATGAAGCTGCCACTTACACAACTCTTTGAAGAGCATGTGGACGGTTCGTA
CCCACCTCAGCTCATGGAGCTTTGGTCAAAATGCACCCAGCCTCTTCAAACCTCTACATC
TGAGACTGGACGCCCTGATCTCTCTGCGGAGCAATCTCCAGGGTTTGTCCAGGAGAGAAT
GCAAAACCACCACCAAACAGACCATCATCAGGGCACTGAGACAAGCTTCCAAAGTCTTGG
TAGTCCCGCAGAAAGATTTCGTAACGCTCTCGCTGAGAAAGATGGTTCAATAGAAGGCCT
GATGGCTCGATCTCGAGCAAGCGCTGAAAATAATAACCGCAAGTCTGCTGCTGATATTAG
CGTTACACCATTATATTCTGGAGATGACGTGAGATCCATACCTAGCAGCTCACCATCCGC
ACGTGGGGCAGCTTCCATTAACATAGAAATCAACTCTAACAGTCGCAGGCTCAGCAGAAA
AAGGCAACATTCCTCGCCAAGAAGAGGACTCGAACCAGTAGCGGAAGACAGAAC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4H634JQB 617 0 0
TCTGGAGATGACGTGAGATCCATACCTAGCAGCTCACCATCCGCACGTGGGGCAGCTTCC
ATTAACATAGAAATCAACTCTAACAGTCGCAGGCTCAGCAGAAAAAGGCAACATTCCTCG
CCAAGAAGAGGACTCGAACCAGTAGCGGAAGACAGAACGTCGGAGCACCGTGCTTATGAG
TTTGAGTTTTCAATGCTACCTGAAAAGGGGTTTACAGCTGATAACGAAGTACTAGCTGAG
ACTGGACCTACACAAACTCAAAAGCCAGTGACCGCTCACTCAGACGAGAAGATAACAGAT
AGCATCAAAAGTCACCTCAAGACGCACTTTGAAACACCTGGAGCTGCTCAAGTGGAATCT
CTTAACAAACTCGCTATTGGAATGAAAAGAAACGCTGCAGCTCAACTTTTCTACCAATCC
TGTGTGCTAGCCACTCGCGGAGTGATCAAGGTGGAGCAAACACAGCCTTATGGGGACATT
CTCATTGCAAGAGGACCCAATATGTAAAGGCTTTTGATATTTGGGATGAAAGGTTATTTA
GTTTTTCATATTTAAGCAAAGAGAGAGTCCTGTAGACTTTAAAAATTATAACGGCGTAGT
ACTACTACCTTCATACG

QA 1 617 1 617
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6239Contig1 1017 2 2 U
GGATTGTGCCACTATGCAGAAGACACTACCAAACTCACCACCTCTCCTGCGCAATCCCGG
CGGCGGGGATGATGACGTGGACATAGACTTCAGAGATGTTTTCGGTGGTCCACCTAAAAG
ACGATCCAGAGTTATTGAAACCACCAGTAGACACAGCTTCAGTGATATCAGGCGGCGTGA
CGTCATCGTCGACAACAGCGCGCTGATTCTCCGAGACGAGAAGCCTGTGTTCGGGGAAGA
TCCGTCCATCCGTCGTCGTTTCACTGCTGATGATTTCTTCGACGATATTTTCAGAGTGAA
TGAATCCTCATCATCTTCTTCGCCGCAGAGGAAAATAAAGAACGAGGGAGAAACGTTCGG
ATCATCATCACTTCCGGGTTCTCGGATCCTTAGCCCGGCTCGTCCTGTCTCTCACAAAGC
CGAGTCTCCTGGTACTTCTTTCCCTGCACAGTTCAGTCTTCCAGCAAAACTAATCAAAGG
GACAGAGATTCCTACGTTTGGTTCAGCTGCTCGGAGCTTGAGCAAGAACAGGGAAGCTGC
TTCGAGCTCTCTTTGTCGAGAACTTCTAGCAAAGCTGATATGGTGGGATCTACTGCTAAA
CCGGATTCAGATGGCTATGTTGCTCCAAAGGTTGTTGTTAATGGGAAAGGGAGGCAGTTT
CACTTCTCTATCTACAAGTGGCCTAACAAAGGAGTTCCTGTTGTCATGTGGGGAAGTTCT
AGACTGAGCTCTATGGCTAAGGCTGAAGAGACAACACCAAGTGGTTTATCAGGGATGTCA
GAGGAAAAGAAGACCTCGCAAAAGCGTCCTGGTGTTCAGAAAGACGAAGAAGAGATGTCT
GAACAAGACTTCTCCAGCAATGCATCGAAAGCGCGTGAGGCTAATGTGAAACCTCTGCAT
GCGTTTTTAGATGTTAAGGACAAGAAACAAGGTGAGGATATAGTGTTGGAGAAGGAAGCA
AGTAAAGGTAAAAGCAAAGCGAAGAGCATGAGAAGCTATGCAGGAGATTCAAGAAGC


BQ
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AF RR4EJ31TF U 1
AF RR4EJ31JQ C 410
BS 1 588 RR4EJ31TF
BS 589 1017 RR4EJ31JQ

RD RR4EJ31TF 588 0 0
GGATTGTGCCACTATGCAGAAGACACTACCAAACTCACCACCTCTCCTGCGCAATCCCGG
CGGCGGGGATGATGACGTGGACATAGACTTCAGAGATGTTTTCGGTGGTCCACCTAAAAG
ACGATCCAGAGTTATTGAAACCACCAGTAGACACAGCTTCAGTGATATCAGGCGGCGTGA
CGTCATCGTCGACAACAGCGCGCTGATTCTCCGAGACGAGAAGCCTGTGTTCGGGGAAGA
TCCGTCCATCCGTCGTCGTTTCACTGCTGATGATTTCTTCGACGATATTTTCAGAGTGAA
TGAATCCTCATCATCTTCTTCGCCGCAGAGGAAAATAAAGAACGAGGGAGAAACGTTCGG
ATCATCATCACTTCCGGGTTCTCGGATCCTTAGCCCGGCTCGTCCTGTCTCTCACAAAGC
CGAGTCTCCTGGTACTTCTTTCCCTGCACAGTTCAGTCTTCCAGCAAAACTAATCAAAGG
GACAGAGATTCCTACGTTTGGTTCAGCTGCTCGGAGCTTGAGCAAGAACAGGGAAGCTGC
TTCGAGCTCTCTTTGTCGAGAACTTCTAGCAAAGCTGATATGGTGGGA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4EJ31JQ 608 0 0
TCTCACAAAGCCGAGTCTCCTGGTACTTCTTTCCCTGCACAGTTCAGTCTTCCAGCAAAA
CTAATCAAAGGGACAGAGATTCCTACGTTTGGTTCAGCTGCTCGGAGCTTGAGCAAGAAC
AGGGAAGCTGCTTCGAGCTCTCTTTGTCGAGAACTTCTAGCAAAGCTGATATGGTGGGAT
CTACTGCTAAACCGGATTCAGATGGCTATGTTGCTCCAAAGGTTGTTGTTAATGGGAAAG
GGAGGCAGTTTCACTTCTCTATCTACAAGTGGCCTAACAAAGGAGTTCCTGTTGTCATGT
GGGGAAGTTCTAGACTGAGCTCTATGGCTAAGGCTGAAGAGACAACACCAAGTGGTTTAT
CAGGGATGTCAGAGGAAAAGAAGACCTCGCAAAAGCGTCCTGGTGTTCAGAAAGACGAAG
AAGAGATGTCTGAACAAGACTTCTCCAGCAATGCATCGAAAGCGCGTGAGGCTAATGTGA
AACCTCTGCATGCGTTTTTAGATGTTAAGGACAAGAAACAAGGTGAGGATATAGTGTTGG
AGAAGGAAGCAAGTAAAGGTAAAAGCAAAGCGAAGAGCATGAGAAGCTATGCAGGAGATT
CAAGAAGC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL6240Contig1 1092 2 2 U
GAGAGATCCAAAGAGATACCCTGATATGGTAGATCCAGTTCTGAAGAAGAAGTTCTCAGA
AAGAGGCTTAAACCAAGCAGTTGCAATAGCTTCAATGTGTGTGCAAGAGGAACCAACGGC
TCGTCCTTTGATAAGCGATGTAATGGTTGCACTAAGCTTCCTTTCCATGTCAACAGAAGA
TGGTATTCCCACAGCAGTTCCCATGTTATCCTTCAGGGACAAAAGCATGTCTATAGCCTT
GAGCCGGCATGATTCAAGTCTTGTGTCTCCTACTCCTGAGGTATCTACTGAAGATGACAA
GTCTAGTACATCATCAAATGAAGATTCATCTATGGACAAGGAAAAGGAGATGGAGAGTAA
GAAGAAGAAGGAAGAGGAAGATAGCTTGACCGAATCTGATGATGGGTCTGATTCTAACTC
AGACGATGAACATGAAAAGGACCAAGAATGTCAACCACCAAAGCCTGTTGATGAGAAGAA
CAAGGCGCAGAGCTTGAAGATAAAGTATCGATATAGTTGGGAAGACGTGGAAATGAATGA
TGAGAGGCTAAGCAGTAAAAGCAGCCAAAAATCAGATGATGGAGGAAGCATCTCTTCGGG
CTATGAGAGCAACAAAGAGCAGGATGATTTGCCTAAGGAGGAAGAGAAAGAGGAAGATCA
TACTCATCTGAGCACATGCAAAGCTCAAAAACTGATGATAGTCAAAGCGTTTACTTTGAT
GATGATGGTTCAGGAGATGAAGACAATGAAGTCTCTTTGCAACGTGTAAAATCAGAGGTT
GAAGTTGGTTCTTTTGAAGATGAAAATGGAGCTTCTTTGCACCATACTGAACAATAGCGC
TTGAGAGTGATGCTATTGAAGATTGAAACTTTCTTTAGGATTGTTATTCATCCTTTGAAG
CTAACTATCAAATTAAATTTTGAGGGGAAAACTCTCATTTGAAAATATTATATACATGTT
CAATTTTTTTTAACAAGTTTATAACCATATCTCTTTATATATGATGAAGATGTATTGGAT
TAATAAACAAACAAACAACATGTAGTCATGTACAACTCAAATTATATGATTGAGAAAAAC
TCATTTTTTTCC


BQ
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AF RR4BV60TF U 1
AF RR4BV60JQ C 440
BS 1 618 RR4BV60TF
BS 619 1092 RR4BV60JQ

RD RR4BV60TF 618 0 0
GAGAGATCCAAAGAGATACCCTGATATGGTAGATCCAGTTCTGAAGAAGAAGTTCTCAGA
AAGAGGCTTAAACCAAGCAGTTGCAATAGCTTCAATGTGTGTGCAAGAGGAACCAACGGC
TCGTCCTTTGATAAGCGATGTAATGGTTGCACTAAGCTTCCTTTCCATGTCAACAGAAGA
TGGTATTCCCACAGCAGTTCCCATGTTATCCTTCAGGGACAAAAGCATGTCTATAGCCTT
GAGCCGGCATGATTCAAGTCTTGTGTCTCCTACTCCTGAGGTATCTACTGAAGATGACAA
GTCTAGTACATCATCAAATGAAGATTCATCTATGGACAAGGAAAAGGAGATGGAGAGTAA
GAAGAAGAAGGAAGAGGAAGATAGCTTGACCGAATCTGATGATGGGTCTGATTCTAACTC
AGACGATGAACATGAAAAGGACCAAGAATGTCAACCACCAAAGCCTGTTGATGAGAAGAA
CAAGGCGCAGAGCTTGAAGATAAAGTATCGATATAGTTGGGAAGACGTGGAAATGAATGA
TGAGAGGCTAAGCAGTAAAAGCAGCCAAAAATCAGATGATGGAGGAAGCATCTCTTCGGG
CTATGAGAGCAACAAAGA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4BV60JQ 653 0 0
GACCAAGAATGTCAACCACCAAAGCCTGTTGATGAGAAGAACAAGGCGCAGAGCTTGAAG
ATAAAGTATCGATATAGTTGGGAAGACGTGGAAATGAATGATGAGAGGCTAAGCAGTAAA
AGCAGCCAAAAATCAGATGATGGAGGAAGCATCTCTTCGGGCTATGAGAGCAACAAAGAG
CAGGATGATTTGCCTAAGGAGGAAGAGAAAGAGGAAGATCATACTCATCTGAGCACATGC
AAAGCTCAAAAACTGATGATAGTCAAAGCGTTTACTTTGATGATGATGGTTCAGGAGATG
AAGACAATGAAGTCTCTTTGCAACGTGTAAAATCAGAGGTTGAAGTTGGTTCTTTTGAAG
ATGAAAATGGAGCTTCTTTGCACCATACTGAACAATAGCGCTTGAGAGTGATGCTATTGA
AGATTGAAACTTTCTTTAGGATTGTTATTCATCCTTTGAAGCTAACTATCAAATTAAATT
TTGAGGGGAAAACTCTCATTTGAAAATATTATATACATGTTCAATTTTTTTTAACAAGTT
TATAACCATATCTCTTTATATATGATGAAGATGTATTGGATTAATAAACAAACAAACAAC
ATGTAGTCATGTACAACTCAAATTATATGATTGAGAAAAACTCATTTTTTTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL6241Contig1 1262 2 4 U
GCAATCAACTTCCCCAAGGATACTATTCCCAAATGGAAAGATCCCAAGTCTGGAGAGCTT
GAAGGACTATCATATGAGTTTGACTCGTGCCAAGCAGTTGCTACATGGGACAAGTCAGGA
ATAGCTCTACGATACTCACCAAGGAATACATTGATGCCTTGCCAAATGGATGGGAGGATT
ATGCATGGCGCAGAATCAACAAAGGAATACAACTTAATCGTTGTCAGAATAAATTTTATG
CGTCGAGAAGCTTTCGTTAGTGCTTCCTGAAACACCACCATATTTTCCCCGGCAGTTTGG
GCGATGTGCTGTTATTGGTAACTCTGGTGATCTGTTAAAAACAAAGTTCGGAAAGGAGAT
AGATACTTACGATTCGGTTCTTAGAGAAAATGGTGCTCCCATTCAGAACTACAAGGAATA
TGTTGGAGAGAAAAGTACATTCCGTCTTCTTAATCGAGGGTCTGCAAAAGCTCTTGACAA
AGTCGTGGAGTTGGATGAAAAGAAGCAAGAGGTGCTACTAATAAAAACAACAATACATGA
TATCATGAACAAAATGATACGGGAAGTTCCAATAGACAATCATGTCTACTTAATGCTTGG
TGCTTCATTTGGCTCGGCCGCCAAGGGAACTGGGCTCAAGGCTCTTGAATTTGCTCTCTC
GACTTGTGATTCAGTGGACATGTATGGCTTCACTGTTGATTCAGGTTATAAAGAATGGAC
TAGATATTTTTCAGAATCGCGACAAGGGCATACTATTAGATCTGCAAGAATTGCAGCAGA
GAAGCTCTTAAGGAGAGTTGGAGCAGGATCTGCAGACCCGTTAGCTTCATGCTCGATAGT
AAAGAAGAGGAGCAAAAACGAACGTCATTTGGTCTCACACCTGAGAAAACCCGTGAGAGA
ACATCAAAAATTTGTGAGAAGCACGACCATGTACCCGCTGGAGCACAGTCCAGGACACAG
TCAGCTTTGCATTACACCAGCTGACTAAAGAATTTGGTTTATACAGAGATCGATTTTTCT
CCCTACACAAAAGCACGAAACAGGCTCAGTGGAAGACGCTAGATTCAAAAGCAAAGCCCA
TAATATGAAGCAGTTCAAGAACACCATAGAGAGGAGAGTTTTCCGTGTAATCTCTTGAGG
AGGTTATGATTTGATTCTTTTGTTATCCTGTTTTCGGGTCTTCAAGAGAGTTAATAGGTA
AGTGCGAGAGCTTTGACCCATGTCTACTTTTAGCACATATAATCAAGTTCAAAATTATAA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BH87TF U 1
AF RR4BH87JQ C 605
BS 1 704 RR4BH87TF
BS 705 705 RR4BH87JQ
BS 706 788 RR4BH87TF
BS 789 1262 RR4BH87JQ

RD RR4BH87TF 788 0 0
GCAATCAACTTCCCCAAGGATACTATTCCCAAATGGAAAGATCCCAAGTCTGGAGAGCTT
GAAGGACTATCATATGAGTTTGACTCGTGCCAAGCAGTTGCTACATGGGACAAGTCAGGA
ATAGCTCTACGATACTCACCAAGGAATACATTGATGCCTTGCCAAATGGATGGGAGGATT
ATGCATGGCGCAGAATCAACAAAGGAATACAACTTAATCGTTGTCAGAATAAATTTTATG
CGTCGAGAAGCTTTCGTTAGTGCTTCCTGAAACACCACCATATTTTCCCCGGCAGTTTGG
GCGATGTGCTGTTATTGGTAACTCTGGTGATCTGTTAAAAACAAAGTTCGGAAAGGAGAT
AGATACTTACGATTCGGTTCTTAGAGAAAATGGTGCTCCCATTCAGAACTACAAGGAATA
TGTTGGAGAGAAAAGTACATTCCGTCTTCTTAATCGAGGGTCTGCAAAAGCTCTTGACAA
AGTCGTGGAGTTGGATGAAAAGAAGCAAGAGGTGCTACTAATAAAAACAACAATACATGA
TATCATGAACAAAATGATACGGGAAGTTCCAATAGACAATCATGTCTACTTAATGCTTGG
TGCTTCATTTGGCTCGGCCGCCAAGGGAACTGGGCTCAAGGCTCTTGAATTTGCTCTCTC
GACTTGTGATTCAGTGGACATGTATGGCTTCACTGTTGATTCAG*TTATAAAGAATGGAC
TAGATATTTTTCAGAATCGCGACAAGGGCATACTATTAGATCTGCAAGAATTGCAGCAGA
GAAGCTCT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4BH87JQ 658 0 0
TCATTTGGCTCGGCCGCCAAGGGAACTGGGCTCAAGGCTCTTGAATTTGCTCTCTCGACT
TGTGATTCAGTGGACATGTATGGCTTCACTGTTGATTCAGGTTATAAAGAATGGACTAGA
TATTTTTCAGAATCGCGACAAGGGCATACTATTAGATCTGCAAGAATTGCAGCAGAGAAG
CTCTTAAGGAGAGTTGGAGCAGGATCTGCAGACCCGTTAGCTTCATGCTCGATAGTAAAG
AAGAGGAGCAAAAACGAACGTCATTTGGTCTCACACCTGAGAAAACCCGTGAGAGAACAT
CAAAAATTTGTGAGAAGCACGACCATGTACCCGCTGGAGCACAGTCCAGGACACAGTCAG
CTTTGCATTACACCAGCTGACTAAAGAATTTGGTTTATACAGAGATCGATTTTTCTCCCT
ACACAAAAGCACGAAACAGGCTCAGTGGAAGACGCTAGATTCAAAAGCAAAGCCCATAAT
ATGAAGCAGTTCAAGAACACCATAGAGAGGAGAGTTTTCCGTGTAATCTCTTGAGGAGGT
TATGATTTGATTCTTTTGTTATCCTGTTTTCGGGTCTTCAAGAGAGTTAATAGGTAAGTG
CGAGAGCTTTGACCCATGTCTACTTTTAGCACATATAATCAAGTTCAAAATTATAACC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6242Contig1 579 2 2 U
CCTTGTGAAAGAAGTTTGGAACTCTCAAACTCGGTAAAACCTTTGCTATACAAGTGAAAA
TAGAGTAAAGCCGCCAAGTTACAAAAGAAGATCAATTAAACAACAGAGAATGAATGAACT
AGGAACAAAATACTGAGTTTAGTATGCAAAAAAAACTACTAAATGTTATCTCTCATAAGA
TAGGTAGAGGCTGATTTTCAATCAACAACAATAATTGCAGTTGTCTCCTTCGGGTTTCAA
GTATCCAAGTTATTCCAAAAGTTTCCACGAGAGAATCTTGATGCTTTCAAACGAAGCAGC
ACAACAACCAAACTAAGAACACGCCAACATAAATTCCGAAAATATATTGTGAGGTTTGAT
ATATTACAAACTAGATGTTTAGATAAGTTACTTCGTTGTCAAAGTTCAAATCTTTTGGAA
TCATCGTTTAGCCCACTATGGAATCGCAACATAGAGATCGCCTAAAAACAAATCAATTGG
TAAAGCTATGGTGGAATCAGAATATCAATAAGCAAAATTTGGTACATTGTTTCAAAACAA
TTAAGTCTTGATTCACATTTTATTTGTTCCTCATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C243TF C 1
AF RR4C243JQ U 401
BS 1 400 RR4C243TF
BS 401 579 RR4C243JQ

RD RR4C243TF 579 0 0
CCTTGTGAAAGAAGTTTGGAACTCTCAAACTCGGTAAAACCTTTGCTATACAAGTGAAAA
TAGAGTAAAGCCGCCAAGTTACAAAAGAAGATCAATTAAACAACAGAGAATGAATGAACT
AGGAACAAAATACTGAGTTTAGTATGCAAAAAAAACTACTAAATGTTATCTCTCATAAGA
TAGGTAGAGGCTGATTTTCAATCAACAACAATAATTGCAGTTGTCTCCTTCGGGTTTCAA
GTATCCAAGTTATTCCAAAAGTTTCCACGAGAGAATCTTGATGCTTTCAAACGAAGCAGC
ACAACAACCAAACTAAGAACACGCCAACATAAATTCCGAAAATATATTGTGAGGTTTGAT
ATATTACAAACTAGATGTTTAGATAAGTTACTTCGTTGTCAAAGTTCAAATCTTTTGGAA
TCATCGTTTAGCCCACTATGGAATCGCAACATAGAGATCGCCTAAAAACAAATCAATTGG
TAAAGCTATGGTGGAATCAGAATATCAATAAGCAAAATTTGGTACATTGTTTCAAAACAA
TTAAGTCTTGATTCACATTTTATTTGTTCCTCATTTTCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4C243JQ 179 0 0
AAAGTTCAAATCTTTTGGAATCATCGTTTAGCCCACTATGGAATCGCAACATAGAGATCG
CCTAAAAACAAATCAATTGGTAAAGCTATGGTGGAATCAGAATATCAATAAGCAAAATTT
GGTACATTGTTTCAAAACAATTAAGTCTTGATTCACATTTTATTTGTTCCTCATTTTCC

QA 1 179 1 179
DS 



AS 1 2

CO CL6243Contig1 1049 2 2 U
AAAAAGAGACAGAGAGAAAAACACATTCTCCTTATATTAACTTCTCAACTTCCTTGCATG
AATCTAAACTGAGAACACAACTGGTCTCTTCTTCTCATAGAGTTCTAAAGCAGCAAAAAG
CTTTAAACACTTGTGTTTCTTCTGTGTTAAGTGTGTTTTTTGCTTGTTCGATTCTTCTCC
TCACCAATGGATACTTTCAACTCTCAGAAAACTAAATCAAGAAAGATAAAGAGGCTTGCG
AAGAAGTCTCGTGCTCAGATAATCTTGGATCTGTTTTACCGGGCGATCGAGATAGCTCTT
GTCCTGGTTACGGCAGCTAAGCTTTGCTATCAGCTCGTCATCACGTTGCATGACTCTGGT
GTCGCCGAGGCTATTTTAGCAAACCGTAATCTCGCGTTTGTTGTAGCAAACGCCATAGTC
ATCGCTCTAATCGCGAAATCTGGCCTTCTCTTGAATCAAAAAGTTGTCCCGAAGTGCGAA
AGCAACGACCTTTACGAGGAGTTTGTTCACGAGAGGAGCGACGAGGTGAGAAACAGAGGA
AAACAGAGCGAAGCAGAGAGCAAGGCTACACAGAGCATAATAGAAGCCAGAGCAAAACAG
AGTGAAGCAGAGAAAGAGACACAGAGCATAACTGAGAAGAGAGAGACACAGAGCAAGCCA
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TCTTTCATTGCAAGGCAGAGGAGGAATCAAAATGATATGATTAGCTTGGTTTAGCTTAGA
TAAAACAAAAATATATTAAAATAACAAAAAAATAGTTTTTGCAAATACCATTCACTTATG
ATAATGTGAGTGTTTGCTATAAAAGGGTG


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GTCGCCGAGGCTATTTTAGCAAACCGTAATCTCGCGTTT

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DS 

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ATACCATTCACTTATGATAATGTGAGTGTTTGCTATAAAAGGGTG

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DS 



AS 1 2

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CTTCGGCCATATCTCTTGCTGTTCCGCTAGCCCTCATGTCCTTGAGCAGTGAGGTAAACG
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AF RR4DL67TF U 1
AF RR4DL67JQ C 571
BS 1 677 RR4DL67TF
BS 678 678 RR4DL67JQ
BS 679 702 RR4DL67TF
BS 703 703 RR4DL67JQ
BS 704 708 RR4DL67TF
BS 709 709 RR4DL67JQ
BS 710 752 RR4DL67TF
BS 753 753 RR4DL67JQ
BS 754 762 RR4DL67TF
BS 763 1181 RR4DL67JQ

RD RR4DL67TF 767 0 0
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TTGGGTTTGTGACTTTTTTCCTCAGTTCGATTCTAGACAACCTGACCTCTACCATTGTCA
TGGTTTCTTTACTGAGGAAACTGGTTCCTCAATCAGAGTACCGCAAACTTCTAGGAGCTG
TTGTGGTGATAGCAGCAAATGCAGGAGGAGCATGGACTCCAATTGGTGATGTTACTACAA
CTATGCTATGGATTCATGGTCAGATAACCACTTTGCCGACTATACAGGGCCTTTTCATAC
CTTCGGCCATATCTCTTGCTGTTCCGCTAGCCCTCATGTCCTTGAGCAGTGAGGTAAACG
AAAAGGGACAGGATTCTTCAGATGTATTAGCTTCTGAAAAAATGGCTCCAAGAGGGAAGC
TAGTGTTTGGAGTTGGCCTTGGAGCATTGGTTTTTGTTCCCGTCTTTAAGGCTCTAACTG
GATTGCCTCCTTACATGGGTATCTTGTTGGGTCTTGGAGTACTTTGGGTCTTAACTGATG
CCATCCACTACGGCGAATCAGAAAGGCAAAAGCTCAAAGTACCTCAAGCCTTGTCTCGAA
TCGACACACAAGGCGCTCTGTTTTTCCTGGGCATCCTTTTATCCGTTAGCAGCCTTGAGT
CGGCTGGGATCCTCAGG*AGATTGCAAACTACCTTGATGCTA*TATAC*AAACATTGAGC
TGATAGCTAGTGCAATAGGTGTTGTGTCAGCA*TCATAGACA
TGTTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4DL67JQ 611 0 0
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GCATCCTTTTATCCGTTAGCAGCCTTGAGTCGGCTGGGATCCTCAGGGAGATTGCAAACT
ACCTTGATGCTAATATACCAAACATTGAGCTGATAGCTAGTGCAATAGGTGTTGTGTCAG
CAATCATAGACAATGTTCCATTAGTTGCAGCGACTATGGGGATGTATGACCTCACATCCT
TCCCTCAAGACTCCGAGTTTTGGCAGCTGGTTGCGTTTTGCGCTGGTACTGGTGGTTCGA
TGCTTATCATAGGATCTGCTGCTGGTGTAGCCTTTATGGGAATGGAGAAAATTGATTTCT
TTTGGTACTTCCGGAAGGTAAGTGGTTTTGCTTTTGCTGGTTATGCTGCTGGTATAGCGG
CCTATTTGGCACTCCAAAGTGTTCATTTTTCGATCCCTACAACGGTGGCTCAGATCCCAT
TTCTCACTGGTTCGTGAGCTGCAACATTGTGTGTTTTTTCTCTATGAAAACGAACAGTAC
AGAAGTGAAATCTCTAGCTGGCTGCAATAATTAAAAAAAAAACACATCACTTCGTCGACA
TGCTGCTTTGG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6245Contig1 978 2 4 U
TTACACATGGGGCACAGCCGCTGTTGGGGCCACAAACATATGCCTTAGAAGAGTCGACGC
AAAGACTATCTACGAGTTGATAGACGAGCATCACGTGACACACATGTGCGCTGCGCCAAC
GGTTCTCAACATGTTAACTAATTATCCAGCTCGGAGACAGCTTAAACAGCCTGTTAGGGT
TATGACAGCTGGAGCTCCTCCTCCGGAGACTGTTATCTCCAGCGCAGAGAGTCTAGGTTT
TGATGTTGGTCACGGTTACGGCCTGACAGAAACTGGTTGTCTGAACGTCTCGTGCGCGTG
GAAGCCTGAGTGGGATGGTTTGGAAGCAAACGAGAGATCAAAACTGAAATCAAGGCAAGG
GATTAGAACAGCTGTGTTTGCGGATGTTGACGTGAGAGACACGCTAACGGGTAAAAGCGT
GGAGCACGATGGAGTAACCGTGGGAGAGATCGTCTTCAGAGGTGGTTCTGTCATGTTGGG
TTACTACAAAGATCCTGAAGGTACCGCGGCGAGTATGAGAGAAGACGGGTGGTTCTACAC
TGGAGACATGGGGGTCATGCACCCGGACGGTTACTTGGAAGTCAAGGATAGATCAAAGGA
CGTGATCATATGCGGAGGGGAGAACATAAGCAGCACTGAAGTTGAGACGGTTCTGTACAC
AAACCCTGTGGTTAAGGAAGCGGCTGTGGTGGTTAAGCCGGACAAGATGTGGGGAGAGAC
TCCGTGCGCGTTTGTGAGCTTGAAGTCTCGTGACGGGGTGATTGTGTTTGAGAAAGAGAT
AAGAGAGTTTTGCAAGAGGAAGCTGCCAAAGTATATGGTTCCAAGGAATGTGGTTTTTCA
GGAGGAGCTTCCTAAGACTTTTACTGGAAAGATTCAGAAGTTTTTTTTCAGACAAATGGC
TAAGTTTATGCCTTGATGTGAAGAACAATGTTTGATTTGTTGTTATTATTTACATTGTAT
GCTGCTACCAAGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DM45TF U 1
AF RR4DM45JQ C 514
BS 1 676 RR4DM45TF
BS 677 677 RR4DM45JQ
BS 678 692 RR4DM45TF
BS 693 978 RR4DM45JQ

RD RR4DM45TF 696 0 0
TTACACATGGGGCACAGCCGCTGTTGGGGCCACAAACATATGCCTTAGAAGAGTCGACGC
AAAGACTATCTACGAGTTGATAGACGAGCATCACGTGACACACATGTGCGCTGCGCCAAC
GGTTCTCAACATGTTAACTAATTATCCAGCTCGGAGACAGCTTAAACAGCCTGTTAGGGT
TATGACAGCTGGAGCTCCTCCTCCGGAGACTGTTATCTCCAGCGCAGAGAGTCTAGGTTT
TGATGTTGGTCACGGTTACGGCCTGACAGAAACTGGTTGTCTGAACGTCTCGTGCGCGTG
GAAGCCTGAGTGGGATGGTTTGGAAGCAAACGAGAGATCAAAACTGAAATCAAGGCAAGG
GATTAGAACAGCTGTGTTTGCGGATGTTGACGTGAGAGACACGCTAACGGGTAAAAGCGT
GGAGCACGATGGAGTAACCGTGGGAGAGATCGTCTTCAGAGGTGGTTCTGTCATGTTGGG
TTACTACAAAGATCCTGAAGGTACCGCGGCGAGTATGAGAGAAGACGGGTGGTTCTACAC
TGGAGACATGGGGGTCATGCACCCGGACGGTTACTTGGAAGTCAAGGATAGATCAAAGGA
CGTGATCATATGCGGAGGGGAGAACATAAGCAGCACTGAAGTTGAGACGGTTCTGTACAC
AAACCCTGTGGTTAAG*AAGCGGCTGTGGTGG
CTAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4DM45JQ 465 0 0
TATGAGAGAAGACGGGTGGTTTTACACTGGAGACATGGGGGTCATGCACCCGGACGGTTA
CTTGGAAGTCAAGGATAGATCAAAGGACGTGATCATATGCGGAGGGGAGAACATAAGCAG
CACTGAAGTTGAGACGGTTCTGTACACAAACCCTGTGGTTAAGGAAGCGGCTGTGGTGGT
TAAGCCGGACAAGATGTGGGGAGAGACTCCGTGCGCGTTTGTGAGCTTGAAGTCTCGTGA
CGGGGTGATTGTGTTTGAGAAAGAGATAAGAGAGTTTTGCAAGAGGAAGCTGCCAAAGTA
TATGGTTCCAAGGAATGTGGTTTTTCAGGAGGAGCTTCCTAAGACTTTTACTGGAAAGAT
TCAGAAGTTTTTTTTCAGACAAATGGCTAAGTTTATGCCTTGATGTGAAGAACAATGTTT
GATTTGTTGTTATTATTTACATTGTATGCTGCTACCAAGTTTTAC

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL6246Contig1 1396 2 10 U
GGTTGGAGGGGCTCATCCATTACATCGGCATGAGAAGTCTATTGCTGTCTCAAAAGCCAT
GCGTGGGCATTCCCTTCAGGAAACTAAGAAGGACGGAAGATTCCATGTGCATACCAAAAC
ATACCTAGATGGTGCTATCCTCAAAGAAGAGATGGAAAGGTCTACTGATGTTCTAGCTGC
TGGTTTGCTGGATGTGTCTGACCCTGGGCTTTCTAATAAATACTTCCTCCGCCAGAGCTG
GGAAGATGAATCTGAAGGTTCGAGTGATTCCATAGTAAAACACAAGCCTCTCTGGTCAAC
TTATAGCTCGAAACTTCAGAAGGGAAAGAAAAAGAAGGCTGTTAAGAAAAAAGGCGATCT
CTACCGGACTTACGGAACAAGAGTTATTCCAGTGTTTATACTCTCATTAGCTGATGTGGA
CCCAATGCTCATGATGGAAGATGAGAGCCTCGTGTGGGCGAGTAATGATGTAGTCATTGT
GCTTCAGCATCTAAACGAGAAAATACCTATGAGTTATGTTTCTGAAACAGAGAGACAGCA
CGCTGTTCCATCACAAGTACAGCGGCATATACTTGCAGGTATTGCATCTGCTTTAGGCGG
TGTAAGTGCACCATATGAAAAGACCTCTCATGCGCATGAAAGACCCGTCACCAACTGGCT
TTGGGCAACCGGTTGTCACCCGTTTGGACCCTTCTCAAACGTCTCTCAGATGAGTAAGAT
GCTTCAAGATGTTGCACTGAGGAATACTATTTATGCTCGGGTTGATTCTGCTCTGCACAA
AATACGTGAGGCATCAGAGGCGGTACAAAACTTTGCATCTGACTACCTCAAGACTCCACT
TGGAGAGCCAGTGAAAGACAAAAAGAACAAAACGAGAACGGAGCTATGGGTGGAGAAATT
CTACAAAAAGACAACCACATTGCCTGAGCCTTTCCCACACGAGCTAGTCGAGAGATTAGA
GAAATATCTAGGCACGGTTGAGGAGCAACTGGTGGATCTCTCGTCTTTGCTATACGATCA
CAAACTATACGATGCTCATCTCAACAGCTCAGAGATTCTTCAGACCACCATGTTTACCCA
ACAGTACGTAGAACATGTACTGGAAACAGAAAGGGAGAACATGAGATGCTGTAAGATAGA
GTACAAATACACAGTTGGAGTCAAGTCTTATCAAACGTTGGTGTACGGAGGAATACTTAT
TGCTGGTTTTCTTGTGTACTTCCTTGTCATCTTCTTCTCTTCTCCTCCTTCTCGTTGACC
TCTTTTCTTACTTTCAGGGTCATAGATTTTGTAACGAGGTGTTTCTTGTTGAATCTATGT
GACTAAAAGTTAGTTGACATATATGTTTTGACAAAGTATCAAACCCTCTTTTTCACACCA
CAAACTGGTATTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GB34TF U 1
AF RR4GB34JQ C 597
BS 1 698 RR4GB34TF
BS 699 699 RR4GB34JQ
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BS 745 786 RR4GB34TF
BS 787 1396 RR4GB34JQ

RD RR4GB34TF 786 0 0
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TGGTTTGCTGGATGTGTCTGACCCTGGGCTTTCTAATAAATACTTCCTCCGCCAGAGCTG
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GCTTCAGCATCTAAACGAGAAAATACCTATGAGTTATGTTTCTGAAACAGAGAGACAGCA
CGCTGTTCCATCACAAGTACAGCGGCATATACTTGCAGGTATTGCATCTGCTTTAGGCGG
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GCTTCA*GATGTTGCACTGAGGA*TACTATTTATGCTCGGGTTGATTCTGCTCTGCACAA
AATACG

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GGCTTTGGGCAACCGGTTGTCACCCGTTTGGACCCTTCTCAAACGTCTCTCAGATGAGTA
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CACTTGGAGAGCCAGTGAAAGACAAAAAGAACAAAACGAGAACGGAGCTATGGGTGGAGA
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TAGAGAAATATCTAGGCACGGTTGAGGAGCAACTGGTGGATCTCTCGTCTTTGCTATACG
ATCACAAACTATACGATGCTCATCTCAACAGCTCAGAGATTCTTCAGACCACCATGTTTA
CCCAACAGTACGTAGAACATGTACTGGAAACAGAAAGGGAGAACATGAGATGCTGTAAGA
TAGAGTACAAATACACAGTTGGAGTCAAGTCTTATCAAACGTTGGTGTACGGAGGAATAC
TTATTGCTGGTTTTCTTGTGTACTTCCTTGTCATCTTCTTCTCTTCTCCTCCTTCTCGTT
GACCTCTTTTCTTACTTTCAGGGTCATAGATTTTGTAACGAGGTGTTTCTTGTTGAATCT
ATGTGACTAAAAGTTAGTTGACATATATGTTTTGACAAAGTATCAAACCCTCTTTTTCAC
ACCACAAACTGGTATTAACC

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DS 



AS 1 2

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ACCATATCCCAGCCGCCAGATATTAAGAATTGGTTTTCAAGTTACGTCTATGAATCCCTC
GCACTGACTTCTGTTCGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACAAATGCATTCTTGGTGCCGAC
AAAGATCATAAACCTATCAACAAGAATATGTCAGATACGAATCTCTATGAATCATCATCA
CTCCCTTCTGAACCTCCTGATATAGCCAATTGGTTTTCTAGCTATACCTATGAATCACCG
CCCGTCCTGGATACAAATGATGCTCTTTACTTTTCGGTTGGTGGAGAAGATAGTGAACGT
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CTTCTTTCAGAGCCTCCTGATGTTGGAAACTGGTTTTCAAGCTATGAGTACCAATCTCCT
CACCTTTCAGACACTCATGAACTTGAATTTTGTTCTCCTGAGCTAATCGTTGAGGAGAGT
GACACTGAGGGAGATGATAGTTCTGGTATTTTCCGGAAAACTAAGAGCAAGCAAGACACT
ATTATTGCTCCTGACTGCTTAAAATCAAATGACTGCAATGAAAGCATGGCCACAGACACG
GAGGTCTCTGCATATTCAAACCAAGAAAGGAAAAATAAGTTAATGGTTAGTTTGTTCAGT
GCCTCAACCAGAGAAGTGGGACAAGAAGCATTGTTCTGTGAAATGAAAGACGAGCCAAGC
TTTAGCCACTCGGGAGTTTCTTCTTGTTATAACCCAAAACCACAATCGTTAGCTTATTTA
CAGGAGGAGCTGAGACCAAAAGAAAATGATCGTGAAACCATTTCCACTAGCTCCAGCATG
CAAAAGACTCCAGGAAAATCTGCTCAAAAGGAAGATGGCAAGGAAAATTTAGAGGGAAAA
AGCACTGAGACTGGATTTGTGACGATGAAAAAGGCCAGATTTAGAGACCAAAGTTCCATG
ACGAGACCAATCAGAGGAGTTCTGGGGGAGTGCTCAAGAAGTAAAGAGTTAACGAAGATG
GCAACAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G524TF U 1
AF RR4G524JQ C 520
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BS 690 1207 RR4G524JQ

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GGAGGAAGAAAAGCATAGATCCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGACGTTCGT
AATCTGATGGAAGAAGTTCGCTCATCCGCGGAACCTAACGGATGCTCCGATTCTCCATTT
ACCATATCCCAGCCGCCAGATATTAAGAATTGGTTTTCAAGTTACGTCTATGAATCCCTC
GCACTGACTTCTGTTCGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACAAATGCATTCTTGGTGCCGAC
AAAGATCATAAACCTATCAACAAGAATATGTCAGATACGAATCTCTATGAATCATCATCA
CTCCCTTCTGAACCTCCTGATATAGCCAATTGGTTTTCTAGCTATACCTATGAATCACCG
CCCGTCCTGGATACAAATGATGCTCTTTACTTTTCGGTTGGTGGAGAAGATAGTGAACGT
GTAAAGGAGACGCAAGCAGAAGAAGAAGAAATTGGAGGAAAAGATGTTTGTCCTGGTTTG
TTTGAGCAACAACAACTTGTCTCTTCTGCAAAGGTTACAGATTTCTCTCAGTCTCAGCAT
CTTCTTTCAGAGCCTCCTGATGTTGGAAACTGGTTTTCAAGCTATGAGTACCAATCTCCT
CACCTTTCAGACACTCATGAACTTGAATTTTGTTCTCCTGAGCTAATCGTTGAGGAGAGT
GACACTGAGGGAGATGATAGTTCTGGTAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4G524JQ 688 0 0
GATTTCTCTCAGTCTCAGCATCTTCTTTCAGAGCCTCCTGATGTTGGAAACTGGTTTTCA
AGCTATGAGTACCAATCTCCTCACCTTTCAGACACTCATGAACTTGAATTTTGTTCTCCT
GAGCTAATCGTTGAGGAGAGTGACACTGAGGGAGATGATAGTTCTGGTATTTTCCGGAAA
ACTAAGAGCAAGCAAGACACTATTATTGCTCCTGACTGCTTAAAATCAAATGACTGCAAT
GAAAGCATGGCCACAGACACGGAGGTCTCTGCATATTCAAACCAAGAAAGGAAAAATAAG
TTAATGGTTAGTTTGTTCAGTGCCTCAACCAGAGAAGTGGGACAAGAAGCATTGTTCTGT
GAAATGAAAGACGAGCCAAGCTTTAGCCACTCGGGAGTTTCTTCTTGTTATAACCCAAAA
CCACAATCGTTAGCTTATTTACAGGAGGAGCTGAGACCAAAAGAAAATGATCGTGAAACC
ATTTCCACTAGCTCCAGCATGCAAAAGACTCCAGGAAAATCTGCTCAAAAGGAAGATGGC
AAGGAAAATTTAGAGGGAAAAAGCACTGAGACTGGATTTGTGACGATGAAAAAGGCCAGA
TTTAGAGACCAAAGTTCCATGACGAGACCAATCAGAGGAGTTCTGGGGGAGTGCTCAAGA
AGTAAAGAGTTAACGAAGATGGCAACAG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6248Contig1 829 2 5 U
ATCGAAGAAGTTTCTAGTTAAGTGTTTTGCCATAGAGGATAAGCTTCTTGTTGATGCTGT
AGATGATGGTGGAAAAGAACCTGCTCATCTCGAGATAGAAGTTGATAAGTATGCTGCTGA
GTCTGGAGTGGAAGGTGATTACGATGCACAGTTCAAGAACTTGGAGAAGTTAGTCACTGA
TTTGCAGAATCAGATTCTCTACAAGCTTGATGAAGGACTTAAACCTGTTGTTGCGTCTAC
GTCCCAGACCAGTTCGGAGAGTAACAAAGTGTCTGAGCCTGGATATTACAGTCGAAGGTG
GCCTGTTCCAACAGGCCCTCCGGTCTTTGGTGGTTTTGGCGATGGGAGGAGCATGCTTGT
AGGACCTAATGATACTCGCATGTTTCCCGGATTTGGTGATCATCCTAACTTCATGATACC
ACCACAACCGGGTGTCCCACCTCCTGGTGTTCGGTATGATCCACGTCCACATAATGGCCC
AGATTTTGGCCCAGGTTTTGAGCCAGGCCCGTTCAGAAGGCCTCCTCCAAGGAGGCCAGA
AGATGTTCATCCCGATCTTCAGCATTATCGCCGCGGTTATGATGCAGGCTATATAGGCGG
TTATGATGCATTCTATAGATTAGCCCATATGCAGTCTAAAGGAAAGCCATCTTAGAAATA
AAAAGAAGCACAAATTCATCTTTGTTTTAATGATATAAGCTATATTTGCTTTGCTTTTAG
TCAATATTTCCCTAGCTGTTTATTTCTTTCTTTGGTTCTGTTGCATAGCTGCTTATATTT
ATAAGTTTATAACTTTGATATATATAAATAAAGTTTTGTTTTATTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS64TF U 570
AF RR4AS64JQ C 1
BS 1 569 RR4AS64JQ
BS 570 587 RR4AS64TF
BS 588 588 RR4AS64JQ
BS 589 740 RR4AS64TF
BS 741 829 RR4AS64JQ

RD RR4AS64TF 172 0 0
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TGCAGTCTAAAGGAAAGCCATCTTAGAAATAAAAAGAAGCACAAATTCATCTTTGTTTTA
ATGATATAAGCTATATTTGCTTTGCTTTTAGTCAATATTTCCCTAGCTGTT
A

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR4AS64JQ 829 0 0
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GTCTGGAGTGGAAGGTGATTACGATGCACAGTTCAAGAACTTGGAGAAGTTAGTCACTGA
TTTGCAGAATCAGATTCTCTACAAGCTTGATGAAGGACTTAAACCTGTTGTTGCGTCTAC
GTCCCAGACCAGTTCGGAGAGTAACAAAGTGTCTGAGCCTGGATATTACAGTCGAAGGTG
GCCTGTTCCAACAGGCCCTCCGGTCTTTGGTGGTTTTGGCGATGGGAGGAGCATGCTTGT
AGGACCTAATGATACTCGCATGTTTCCCGGATTTGGTGATCATCCTAACTTCATGATACC
ACCACAACCGGGTGTCCCACCTCCTGGTGTTCGGTATGATCCACGTCCACATAATGGCCC
AGATTTTGGCCCAGGTTTTGAGCCAGGCCCGTTCAGAAGGCCTCCTCCAAGGAGGCCAGA
AGATGTTCATCCCGATCTTCAGCATTATCGCCGCGGTTATGATGCAGGCTATATAGGCGG
TTATGATGCATTCTATAGATTAGCCCATATGCAGTCTAAAGGAAAGCCATCTTAGAAATA
AAAAGAAGCACAAATTCATCTTTGTTTTAATGATATAAGCTATATTTGCTTTGCTTTTAG
TCAATATTTCCCTAGCTGTTTATTTCTTTCTTTGGTTCTGTTGCATAGCTGCTTATATTT
ATAAGTTTATAACTTTGATATATATAAATAAAGTTTTGTTTTATTTCGC

QA 1 829 1 829
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6250Contig1 165 2 1 U
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TTTCCTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTTTCTACGTATTGTAATTTGCCTCTCATTTCTTGTT
GCAATTATTAAGACTTGAATTAAGAAATAGTAGTTTTCATCTATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4A360TF U 1
AF RR4A360TFB U 1
BS 1 165 RR4A360TF

RD RR4A360TF 165 0 0
GGCTTGAAGGGGATGGGATCATTGGGGGGCTCATTCATTAAGTCTTGTAAGGGTTTTTTT
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GCAATTATTAAGACTTGAATTAAGAAATAGTAGTTTTCATCTATT

QA 1 165 1 165
DS 

RD RR4A360TFB 165 0 0
GGCTTGAAGGGGATGGGATCATTGGGGGGCTCATTCATTAAGTCTTGTAAGGGTTTTTTT
TTTCCTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTTTCTACGTATTGTAATTTGCCTCTCATTTCTTGTT
GCAATTATTAAGACTTGAATTAAGAAATAGTAGTTTTCATCTATT

QA 1 165 1 165
DS 



AS 1 2

CO CL6251Contig1 1109 2 2 U
GGAAGGAAGAATCTCTTTTACATCACTACCGTCGGAGAAGAAGCCGTTAACATCGCTTCA
GCCGCCGCTCTCGCTCAAGATGACGTCGTTTTACCTCAGTACCGATAGCCTGGAGTGCTT
CTATGGCGCGGCTTCACGTTGCAAGAGTTTGCGAACCAGTGCTTTGGTAACAAAGCTGAT
CACGGCAAAGGCAGACAGATGCCGGTACATTACGGCTCTAATCGACATAACTACTTCACT
GTCTCCTCTCCTATCGCTACACAGCTTCCTCAAGCTGCTGGAGTTGGTTACTCTTTGAAG
ATGGAGAAGAAGAACGCTTGTGCAGTAACATTCATCGGAGACGGAGGCACAAGCGAGGGA
GATTTCCACGCCGGATTGAATTTTGCGGCGGTGATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATATGT
CGGAACAACGGTTGGGCTATCAGCACTCATATCTCAGAACAGTTCAGAAGTGACGGAATC
GTTGTGAAAGGTCAAGCTTACGGAATCAGAAGCATACGAGTGGACGGTAACGACGCGCTG
GCGGTTTATAGCGCGGTGCGGTCAGCAAGAGAGATGGCTGTTAAAGAACAAAGACCAGTT
CTCATCGAGGCAATGACATATAGAGTAGGACATCATTCTACATCAGATGATTCAACTAAG
TACAGGGCGGCTGATGAGATCCAATACTGGAAAATGTCGAGAAACCCTGTGGATAGGTTC
AGGAAATGGGTGGAGGATAATGGATGGTGGAGGAGGAAGATGAATCCAAGCTAAGATCCG
ACGCAAGAAAACAGCTTCTACAAGCGATTCAGGCGGCGGAGAAGTGGGAGAAACCACCAT
TGACAGAGTTATTTAGCGACGTATATGATGTTAAGACGAAGAATCTAGAGGAGCAAGAAC
TTGGTTTAAAGGAGTTGGTAGAGAAACAGCCTCGAGATTATCCTCATGGTTTTCATATCT
GAATCTATAGGAGGATACTGTGAAGTTGATGATCTCATTTTCATGCATGATGTATTATAG
ACTTCTCATTGCAGACTATTTAGTAGTAGCCATGAGGATGCTATTTTCGTCTTTAAATAA
AATTTCATGGTCTGAAGGTTTAGCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET59TF U 1
AF RR4ET59JQ C 437
BS 1 605 RR4ET59TF
BS 606 1109 RR4ET59JQ

RD RR4ET59TF 605 0 0
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GCCGCCGCTCTCGCTCAAGATGACGTCGTTTTACCTCAGTACCGATAGCCTGGAGTGCTT
CTATGGCGCGGCTTCACGTTGCAAGAGTTTGCGAACCAGTGCTTTGGTAACAAAGCTGAT
CACGGCAAAGGCAGACAGATGCCGGTACATTACGGCTCTAATCGACATAACTACTTCACT
GTCTCCTCTCCTATCGCTACACAGCTTCCTCAAGCTGCTGGAGTTGGTTACTCTTTGAAG
ATGGAGAAGAAGAACGCTTGTGCAGTAACATTCATCGGAGACGGAGGCACAAGCGAGGGA
GATTTCCACGCCGGATTGAATTTTGCGGCGGTGATGGAAGCTCCGGTGGTGTTTATATGT
CGGAACAACGGTTGGGCTATCAGCACTCATATCTCAGAACAGTTCAGAAGTGACGGAATC
GTTGTGAAAGGTCAAGCTTACGGAATCAGAAGCATACGAGTGGACGGTAACGACGCGCTG
GCGGTTTATAGCGCGGTGCGGTCAGCAAGAGAGATGGCTGTTAAAGAACAAAGACCAGTT
CTCAT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4ET59JQ 673 0 0
CTATCAGCACTCATATCTCAGAACAGTTCAGAAGTGACGGAATCGTTGTGAAAGGTCAAG
CTTACGGAATCAGAAGCATACGAGTGGACGGTAACGACGCGCTGGCGGTTTATAGCGCGG
TGCGGTCAGCAAGAGAGATGGCTGTTAAAGAACAAAGACCAGTTTTCATCGAGGCAATGA
CATATAGAGTAGGACATCATTCTACATCAGATGATTCAACTAAGTACAGGGCGGCTGATG
AGATCCAATACTGGAAAATGTCGAGAAACCCTGTGGATAGGTTCAGGAAATGGGTGGAGG
ATAATGGATGGTGGAGGAGGAAGATGAATCCAAGCTAAGATCCGACGCAAGAAAACAGCT
TCTACAAGCGATTCAGGCGGCGGAGAAGTGGGAGAAACCACCATTGACAGAGTTATTTAG
CGACGTATATGATGTTAAGACGAAGAATCTAGAGGAGCAAGAACTTGGTTTAAAGGAGTT
GGTAGAGAAACAGCCTCGAGATTATCCTCATGGTTTTCATATCTGAATCTATAGGAGGAT
ACTGTGAAGTTGATGATCTCATTTTCATGCATGATGTATTATAGACTTCTCATTGCAGAC
TATTTAGTAGTAGCCATGAGGATGCTATTTTCGTCTTTAAATAAAATTTCATGGTCTGAA
GGTTTAGCAAAAA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL6252Contig1 1034 2 2 U
GGACCCCTACTCATTTTCTCCCTTCAAACTTTTCTTTCAATCATAAAAATATGGATTTTT
ATTTCCAGAACTTTATAAAGGCATCTAGAATTGGTTTTTTCCTACGTATCCTAGATATGA
TTGAATGTACGCTCAAGTTTCTGGGTAAAACCAAATGTTTCTATTTTCATTGGGGGGTTT
TAATTGCCCAAGCATTTCTTTCATGCTTTGGCATTGTTGTATGTGCAGTTGGAGTTCAAA
GATACCCCCTAAAGGGCCCTTTCACTCCAGCAATTCTTACGTTCGGTGCCTTTTTAGTTG
TGCTATGCGTGGTTTTCACTGTTGGGATTTATAGACCCATCAAGCGTGCATACAAAGTCT
GGATGGAAAGATACTATCATTTACATTTCATATGTAAAGTAATAGGAACTATTGCTGTTT
TTAAAGGTTTTGTTCATCTTTCAATTATTGTAGAAAAACATGAAAAACTAAATGGTTGGG
TGATTGGGTTTTTTTCTATGTTGTTTTCTTTGTCTAATAACATTAGTAAAGCTTTATGGT
AGAGAAGATGCATTTGGTACCGGGGATAGTTTAACTGTCATTGCAATTATGAAGTTTATT
CTTTTACCAAATGAGAGAATCCATATTAAAAATGCTTGGATCATTTTCTATGGTTTTGTT
TTTCTCTTATTGGTTTTTAAAGGATCTCACATTCCCTTGAGAGGAAATGTTTGTGGAAAA
CCAGCAGAAGATGATGATATTGAGGCACAAAATTTATCTCTCCCTACATTACTTGAGAGA
GGATCCCATGGAGAATCATGGAGATTGCCTTTGAATACTAATAATGTTCTTGGAGAATCA
GCTGAGGTAGAGATTAACAACTCATCCACTTAGGTTGCACTTGGTGGTGAAGTATGAAGA
TTGCTTCTTAATGTTCTATGTTGTCGTTTGTTCCTTTTTTTTCTTTTGTTCTATTTTGTT
TGTTCTAGAATTTGTATTTCTTCAATGTTGTGTACTTTCAGCAAAATTTGATGATGAGTA
GAATTATCTTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E364TF U 1
AF RR4E364JQ C 500
BS 1 656 RR4E364TF
BS 657 1034 RR4E364JQ

RD RR4E364TF 671 0 0
GGACCCCTACTCATTTTCTCCCTTCAAACTTTTCTTTCAATCATAAAAATATGGATTTTT
ATTTCCAGAACTTTATAAAGGCATCTAGAATTGGTTTTTTCCTACGTATCCTAGATATGA
TTGAATGTACGCTCAAGTTTCTGGGTAAAACCAAATGTTTCTATTTTCATTGGGGGGTTT
TAATTGCCCAAGCATTTCTTTCATGCTTTGGCATTGTTGTATGTGCAGTTGGAGTTCAAA
GATACCCCCTAAAGGGCCCTTTCACTCCAGCAATTCTTACGTTCGGTGCCTTTTTAGTTG
TGCTATGCGTGGTTTTCACTGTTGGGATTTATAGACCCATCAAGCGTGCATACAAAGTCT
GGATGGAAAGATACTATCATTTACATTTCATATGTAAAGTAATAGGAACTATTGCTGTTT
TTAAAGGTTTTGTTCATCTTTCAATTATTGTAGAAAAACATGAAAAACTAAATGGTTGGG
TGATTGGGTTTTTTTCTATGTTGTTTTCTTTGTCTAATAACATTAGTAAAGCTTTATGGT
AGAGAAGATGCATTTGGTACCGGGGATAGTTTAACTGTCATTGCAATTATGAAGTTTATT
CTTTTACCAAATGAGAGAATCCATATTAAAAATGCTTGGATCATTTTCTATGGTTT
GTTTTCTCTTATTGG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4E364JQ 535 0 0
GTTGTTTTCTTTGTCTAATAACATTAGTAAAGCTTTATGGTAGAGAAGATGCATTTGGTA
CCGGGGATAGTTTAACTGTCATTGCAATTATGAAGTTTATTCTTTTACCAAATGAGAGAA
TCCATATTAAAAATGCTTGGATCATTTTCTATGGTTTTGTTTTTCTCTTATTGGTTTTTA
AAGGATCTCACATTCCCTTGAGAGGAAATGTTTGTGGAAAACCAGCAGAAGATGATGATA
TTGAGGCACAAAATTTATCTCTCCCTACATTACTTGAGAGAGGATCCCATGGAGAATCAT
GGAGATTGCCTTTGAATACTAATAATGTTCTTGGAGAATCAGCTGAGGTAGAGATTAACA
ACTCATCCACTTAGGTTGCACTTGGTGGTGAAGTATGAAGATTGCTTCTTAATGTTCTAT
GTTGTCGTTTGTTCCTTTTTTTTCTTTTGTTCTATTTTGTTTGTTCTAGAATTTGTATTT
CTTCAATGTTGTGTACTTTCAGCAAAATTTGATGATGAGTAGAATTATCTTTTCC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL6253Contig1 1350 2 2 U
GGGAAAATCTGAAAATCTCCCGAGCGAGCGAGTGAAAGAATCCTTAACATTTGATTCTCC
GAGTCGATTCCGGTTCAGAAAATCACGGTGGTGTTACGGAGGTCTAATGGGCGTGGCGGG
TTCTAAACTGGAGAAAGCTCTCGGCGAGCAGTTCCCTGAGGGAGAGCGATACTTCGGTTT
CGAAAACTTCGGCAACACTTGTTACTGCAACAGTGTTTTGCAGGCTCTTTACTTTTGCGC
TCCCTTTCGTGAGCAGTTGCTTGAATACTACTCCACAAATAATAATAAAAGTGAGGAGGA
GAATCATCTCTTGACCTGCTTGACTGATTTGTTTTCTCAGATAAGTGGTCAGAAGAAGAA
GACAGGAGTAATTGCTCCCAAGCGCTTTGTACAGAGGTTGAAGAAACAAAATGTGCTTTT
CCGGAGTTATATGCATCAGGATGCACATGAGTTCCTCAATTATTTGCTAAATGAACTTGG
TGACATCTTAGAGAAAGAGGCAAAAGCTGCAAAAACGGACAACGAAACCTCATTATCTCC
TGAAAAGATTTCAAATGGACCGAAACATCTTCAGGCAAATGGTGTTCATAAACATCCTAC
TGTTACATGGGTCCACAAGATCTTTCAGGGTATACTTACCAACGAGACAAGGTGTCTGCG
GTGTGAGACAGTAACAGCAAGAGACGAGACATTCCTTGACCTAAGCCTTGATATTGAACA
GAACAGTTCCATAACTAGTTGTTTGAAAAGCTTCTGCTCCACAGAGACTCTACACTCTGA
TGACAAATTCTTCTGTGACAAATGCTGCAGTTTACAAGAAGCGCAGAAGAGGATGAAGAT
CAAGAAACCGCCACACATTTTAGTCATACATCTGAAACGGTTCAAATACATAGAGGGGTT
GGGTCGCTACTAGAAGCTATCTTACAGAGTCGTTTTCCCACTAGAACTGAAACTGAGCAA
CGCAGTGGAAGAATACGTGGACACTGAGTATTCTCTCTTTGCAGTTGTGGTTCATTTCGG
AAACGGTCCCAACTATGGTCACTATGTAAGCCTCGTGAAATCCCATGACCATTGGCTCTT
CTTTGATGATGAGAATGTTGATATGATGGAAGAATCAGCTGTTCAAACATTTTTCGGCTC
ATCACAAGAGTGCTCCAGCAATACTGATCATGGCTATCTCTTGTTCTATGAGAGCCTCGG
AACAAGTTAAGAGGCATTTTTAGTCTTTTGACAACAACTTAATTTCTTTTTTTCATGCTG
TTTTGTGACTTGAAGAAATCAAAAAGTCTGTTTCTTTTAACTTCAAAATAAACTGAAAGT
TTTTATACTAATGACAAGAAAGATTACAGC


BQ
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CGAAAACTTCGGCAACACTTGTTACTGCAACAGTGTTTTGCAGGCTCTTTACTTTTGCGC
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TGTTACATGGGTCCACAAGATCTTTCAGGGTATACTTACCAACGAGACAAGGTGTCTGCG
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GAACAGTTCCATAACTAGTTGTTTGAAAAGCTTCTGCTCCACAGAGACTCTACACTCTG

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ACATTTTAGTCATACATCTGAAACGGTTCAAATACATAGAGGGGTTGGGTCGCTACTAGA
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ATGGTCACTATGTAAGCCTCGTGAAATCCCATGACCATTGGCTCTTCTTTGATGATGAGA
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GAAATCAAAAAGTCTGTTTCTTTTAACTTCAAAATAAACTGAAAGTTTTTATACTAATGA
CAAGAAAGATTACAGC

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DS 



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GGGTTACAAGTGAGCCGTAGATCGGATGGACAATGGATCTCGGTGAAACCAAACCCTGAT
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AAAAAGCTCCAAGGTGAGAGCATCCAGATTGATCATTTCAAGGCCGCTTAAGTAATCTTA
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TG


BQ
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10 10 

AF RR4EK66TF U 1
AF RR4EK66JQ C 541
BS 1 680 RR4EK66TF
BS 681 681 RR4EK66JQ
BS 682 717 RR4EK66TF
BS 718 1262 RR4EK66JQ

RD RR4EK66TF 717 0 0
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AAAACCACCATGGGAGTACTCGACGAAGCTTTTATCCAAGCTCCAGAACACAGACCCAAA
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TCTTCTCTCCAGGACCCACACTCCGACAAGACAGCGCTCACGACAGAGATTGCAGAAGCA
TGCATGAGATGGGGTTTTTTCCAGGTGACCAACCATGGCTTGTCGTTGGACTTAAAGAGT
CGGGTGGAGAAGACGGTGGCGGATTTTTTCAGTTTACCATTGGAGGAGAAGAGAAGAGTG
AAAAGAGATGAAGTGAACCCCATGGGTTATCACGACGGAGAACATACCAAAAACGTTAGA
GACTGGAAAGAGATTTTCGATTTCTTTTTACAGGACTCGACGACGGTTCCGGCGTCTACC
GTGCCGGAAGACACCGAGCTCAGGAAGCTGACTAACCCGTGGCCTCAAAACCCTTCCGAC
TTTAGGGAGATATGCCAAGAATATGCAAGAGAAGTTGAGGAGCTAGCTTTCAAGCTTTTG
GAACTTATCTCCATTAGCTTGGGTCTACCTGGTGATCGGTTTACGGGGTACTTCAATGAC
CAAACAAGCTTTTTGAGGTT*AACCATTACCCTCCTTGCCCGAACCCGGAGCTAGCA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EK66JQ 722 0 0
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GAACTTATCTCCATTAGCTTGGGTCTACCTGGTGATCGGTTTACGGGGTACTTCAATGAC
CAAACAAGCTTTTTGAGGTTTAACCATTACCCTCCTTGCCCGAACCCGGAGCTAGCATTA
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GGGTTACAAGTGAGCCGTAGATCGGATGGACAATGGATCTCGGTGAAACCAAACCCTGAT
GCTTTCATCATTAACATTGGCAACTGCATGCAGGTATGGACAAATGACAAATATTGGAGT
GCAGAACATAGAGTGGTAGTGAATTCAAGCAAAGAGAGATTCTCAATGCCATTCTTCCTG
TTTCCATCCCATGAAGTCAACATTGAGCCAATGGAGGAGTTTATAACCGAAGACAACCCG
CCTTGTTACAAAAAGTACAATTGGGGCAAGTTCTTTGCTGCGAGAAACAGAAGTGATTAC
AAAAAGCTCCAAGGTGAGAGCATCCAGATTGATCATTTCAAGGCCGCTTAAGTAATCTTA
CTATGTTTATTAGCACAACATTTCCTAATAATGTCAATGAGCAAGACTCATGTGCTTACC
TTCTATATCAATATGTAGTTGAGATGTATTGTGTTTATTTTATAATAATTACAGAAGTAT
TG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6256Contig1 1416 2 2 U
GGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACACCAATTTCTCAGGGCAAGTCAAAATACT
TCCTTCTCTGTGTAAAAGGATTATGGAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAGCGTACAACCC
ACGAACGGTGGAGGAGGTTTTTAGGGATTTTAAGGGTCGTAGGAATGGCATGATTAAGGC
TTTAACCACTGGTAAATATTATTATTGTTCACTTATTATTATCTATGCCTCTTCCATTGT
CATCAAAAAATCTCAACTTTTTTTATTTAATTTCGCAGATGTTCAGGAGTTTTACCGACT
TTGCGATCCAGGTGAGCGTTAGTTACCCTTTAAAGATTTGTTTTGGGGATTGACGAAAGT
TACTGTTTTTTTTTAATGTGCGTTTGAATTGTCTTTGTTGTGCTCTGTTTTGAGCTGAGT
GTTTAATGATGCATTTAGGGGTTTTGATAGTTTCTCTGAATTGTGAGCAATAGATGAGTA
AAGTGTTGAACTTTGTTTGTGGAATTGGTTTCCACTGAGGAAAGTCTTTGTCTTTTTCTT
TTGTGATTTTATAGAAAAGGAGAACTTGTGCCCTTATGGACACCCGAACGAGCACTGGGA
AGTGAATCTACCAGCCGAAGAGGTTCCCCCGGAGCTCCCAGAGCCTGTCTTGGGTATCAA
CTTTGCCCGAGACGGGATGATGGAAAAGGATTGGTTTTCCCTTGTTGCTGTCCACAGTGA
TGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTTTCTTTTTTGGAGCCAGGTTTGGATTTGACAAAGCTGA
TAGGTATATGTCTTATCTTCTTGCCTCTATGTTCTTTCTGGCATATGATTAGATGATACC
ATTATTCATTCTTGTCAAGTTTTCTACTCCTTCACAGTTTCAGCTCTCTTTGATTGATGT
TCTTCCACCTTTTCTGTTCTTGCAGGAAACGGCTTTTCAATATGATGAATGACCTCCCGT
CAATATTCGAGGTTGTGACTGGCACTGCAAAGAAACAATCAAAGGAGAAGTCCTCTGTTT
CCAACGACAGCAGCAACAGATCCAAGTCAAACTCCAAGGTAACAAGCTTTTGCTTTATTT
TTTTGCTACTGGCATAAAGTTGAGTGTTATTTTATGTTCCCTTTGTCAAATTACAGAGAG
GATCAGAACCTAAGCCCAAGTACTCAAAGCCAGAGCCCAAAGATGAAGAGGAAGAGGAAG
GTGTGGAAGAGGATGAGGATGATGATGATGATGATGAGCAAGGGGAAACACAATGTGGGG
CATGTGGTGAGAGCTATTCCGCTGATGAGTTCTGGATCTGCTGTGACCTTTGTGAGAATT
GGTTCCATGGGAAGTGTGTGAAGATTACACCAGCCAGGGCTGAGCACATCAAGCAGTACA
AGTGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCTCGATCCC


BQ
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AF RR4AC68TF U 1
AF RR4AC68JQ C 649
BS 1 822 RR4AC68TF
BS 823 1416 RR4AC68JQ

RD RR4AC68TF 822 0 0
GGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACACCAATTTCTCAGGGCAAGTCAAAATACT
TCCTTCTCTGTGTAAAAGGATTATGGAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAGCGTACAACCC
ACGAACGGTGGAGGAGGTTTTTAGGGATTTTAAGGGTCGTAGGAATGGCATGATTAAGGC
TTTAACCACTGGTAAATATTATTATTGTTCACTTATTATTATCTATGCCTCTTCCATTGT
CATCAAAAAATCTCAACTTTTTTTATTTAATTTCGCAGATGTTCAGGAGTTTTACCGACT
TTGCGATCCAGGTGAGCGTTAGTTACCCTTTAAAGATTTGTTTTGGGGATTGACGAAAGT
TACTGTTTTTTTTTAATGTGCGTTTGAATTGTCTTTGTTGTGCTCTGTTTTGAGCTGAGT
GTTTAATGATGCATTTAGGGGTTTTGATAGTTTCTCTGAATTGTGAGCAATAGATGAGTA
AAGTGTTGAACTTTGTTTGTGGAATTGGTTTCCACTGAGGAAAGTCTTTGTCTTTTTCTT
TTGTGATTTTATAGAAAAGGAGAACTTGTGCCCTTATGGACACCCGAACGAGCACTGGGA
AGTGAATCTACCAGCCGAAGAGGTTCCCCCGGAGCTCCCAGAGCCTGTCTTGGGTATCAA
CTTTGCCCGAGACGGGATGATGGAAAAGGATTGGTTTTCCCTTGTTGCTGTCCACAGTGA
TGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTTTCTTTTTTGGAGCCAGGTTTGGATTTGACAAAGCTGA
TAGGTATATGTCTTATCTTCTTGCCTCTATGTTCTTTCTGGC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4AC68JQ 768 0 0
CTTGGGTATCAACTTTGCCCGAGACGGGATGATGGAAAAGGATTGGTTTTCCCTTGTTGC
TGTCCACAGTGATGCATGGCTTCTTGCTGTTGCTTTCTTTTTTGGAGCCAGGTTTGGATT
TGACAAAGCTGATAGGTATATGTCTTATCTTCTTGCCTCTATGTTCTTTCTGGCATATGA
TTAGATGATACCATTATTCATTCTTGTCAAGTTTTCTACTCCTTCACAGTTTCAGCTCTC
TTTGATTGATGTTCTTCCACCTTTTCTGTTCTTGCAGGAAACGGCTTTTCAATATGATGA
ATGACCTCCCGTCAATATTCGAGGTTGTGACTGGCACTGCAAAGAAACAATCAAAGGAGA
AGTCCTCTGTTTCCAACGACAGCAGCAACAGATCCAAGTCAAACTCCAAGGTAACAAGCT
TTTGCTTTATTTTTTTGCTACTGGCATAAAGTTGAGTGTTATTTTATGTTCCCTTTGTCA
AATTACAGAGAGGATCAGAACCTAAGCCCAAGTACTCAAAGCCAGAGCCCAAAGATGAAG
AGGAAGAGGAAGGTGTGGAAGAGGATGAGGATGATGATGATGATGATGAGCAAGGGGAAA
CACAATGTGGGGCATGTGGTGAGAGCTATTCCGCTGATGAGTTCTGGATCTGCTGTGACC
TTTGTGAGAATTGGTTCCATGGGAAGTGTGTGAAGATTACACCAGCCAGGGCTGAGCACA
TCAAGCAGTACAAGTGCCCATCTTGCAGCAACAAGAGAGCTCGATCCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6257Contig1 1216 2 6 U
GGAGAGGTCTTTGGCGGGCAGAGAACGTTGATCCCATTACACGGCATGTTTGAGAATGTA
GTTGACAGGACTTCTCTTAGTACTGGATGGGAGCTTGCTAAAATGTATGGTCGTGAGTCG
AAACATAAAGACATCAGACCAAAAGCACCTCCTTCGGTAGAGGAAGAAACCAAACATGAC
TCGTTGAAGAGCGTAAGACAAAGGCCTCAACCGCTTCCACCTCCACCAGCCAGACCAAAG
TACTACAACATTGAAGGTTGGTGGGGTTGGGTGGCTGAGAGTGACAACGAGCCTGAGAAC
ACGGTTATTGAGCTGAGAACCAATGCTCACAAGCTGTTGTGGGAAGCGATTGATTACGTT
GTGAGCGTTGAAGCTGATGTGTTCATCCCTGGTTTTGATCGTGATGGGAAAGGACATCCG
AGTTTTGCTAGTTTGGTGATGGGTCATAGGCTTTATCAGTCTGCTTCTGCTAAGACATTT
AGACCAGACAGGAAACAAACTGCAATGCTTTTGGAGGAGATAAGAGACCATATGTATGAG
GCGAATCATACTTGGATAACATCTGTTAGGAAGCTTCTCAAGAGAAGTATACTTGAGGGT
CTAGTGGAATCTTCTAAAAGATCAAAAGCCTTTAGTTTTCTTTCGCATCCTGTACCTGAA
TGTTCTTGCATTAAGCGGGAGCATAGAGTTCTAAACGTCTCACTGGTTGAAGCGGATCTT
GGGGTGACACACCGTTGTCCGCAAGGGATGTTTGGCGTTGCAGTTCAAAGATCAAAGGAT
AATAATAAGAATGCAGAGAGAGAAGAGGATCTTGATGAAGAGGACTTGTCTTCTTCAGGA
TTGTTCTTTGGTCACATGGGAAGTGGAGGGAGCAGTAATAGTAACAATGAGACTGTAAAT
TCTGAAGCTAACAACAAGGAGGAAGGGCAGCTTGAAGATCAAGAAGAGCTTGAAGGTGGT
GAAAGATAAGAAGCTCGAGAACTTGAATTGGTTTTTTGATTGAAAATGCAATAGCTTGTT
AGACAAACGAGCAAGTCCTAGGTACACCACCAAGTAGATCTAACTAGGAAAGCTCACTTC
TTGGGTTGCAGTATTTTCCATCTTTTCTCAAAATTAGTTTGTAGCCACTGGTTATTAGGT
TGGTGTATTAGAAGAGACATCTTTTTTGGTGATCAATTTTACAACAGTTCAGTGTGTGTG
TTAAGTGACTTCTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI20TF U 1
AF RR4EI20JQ C 466
BS 1 571 RR4EI20TF
BS 572 572 RR4EI20JQ
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BS 620 654 RR4EI20TF
BS 655 1216 RR4EI20JQ

RD RR4EI20TF 654 0 0
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GTTGACAGGACTTCTCTTAGTACTGGATGGGAGCTTGCTAAAATGTATGGTCGTGAGTCG
AAACATAAAGACATCAGACCAAAAGCACCTCCTTCGGTAGAGGAAGAAACCAAACATGAC
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GTGAGCGTTGAAGCTGATGTGTTCATCCCTGGTTTTGATCGTGATGGGAAAGGACATCCG
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GCGAATCATACTTGGATAACATCTGTTAGGA*GCTTCTCAAGAGAAGTATACTTGAGGGT
CTAGTGGAATCTTCTAAA*GATCAAAAGCCTTTAGTTTTCTTTCGCATCCTGTA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4EI20JQ 751 0 0
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GACCATATGTATGAGGCGAATCATACTTGGATAACATCTGTTAGGAAGCTTCTCAAGAGA
AGTATACTTGAGGGTCTAGTGGAATCTTCTAAAAGATCAAAAGCCTTTAGTTTTCTTTCG
CATCCTGTACCTGAATGTTCTTGCATTAAGCGGGAGCATAGAGTTCTAAACGTCTCACTG
GTTGAAGCGGATCTTGGGGTGACACACCGTTGTCCGCAAGGGATGTTTGGCGTTGCAGTT
CAAAGATCAAAGGATAATAATAAGAATGCAGAGAGAGAAGAGGATCTTGATGAAGAGGAC
TTGTCTTCTTCAGGATTGTTCTTTGGTCACATGGGAAGTGGAGGGAGCAGTAATAGTAAC
AATGAGACTGTAAATTCTGAAGCTAACAACAAGGAGGAAGGGCAGCTTGAAGATCAAGAA
GAGCTTGAAGGTGGTGAAAGATAAGAAGCTCGAGAACTTGAATTGGTTTTTTGATTGAAA
ATGCAATAGCTTGTTAGACAAACGAGCAAGTCCTAGGTACACCACCAAGTAGATCTAACT
AGGAAAGCTCACTTCTTGGGTTGCAGTATTTTCCATCTTTTCTCAAAATTAGTTTGTAGC
CACTGGTTATTAGGTTGGTGTATTAGAAGAGACATCTTTTTTGGTGATCAATTTTACAAC
AGTTCAGTGTGTGTGTTAAGTGACTTCTATG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6260Contig1 1186 2 4 U
AATTCCTGGAGCTCATGGATCAAGTTTAGGAGCCTTTGAAGAAAACATTTGAGAATGTCC
ATCAGGGATACATGAGAGAGCATTTGAGTCGTTTTCTGAAGGCACGGGACTGGAACGTAT
TTAAAGCTCATACAATGCTGGTTGAGTGTTGCGTTGGAGGGTAGATAATGAAATTGACAG
TATATTATCCAAACCCATTGTTCCTAGTGAGTTGTACAGGAACGTACGGGATTCTCAACT
CATAGGAATGTCAGGTTACACCAGAGAGGGCTTGCCTGTCTTCGCTATTGGTGTTGGCCT
CAGCACATTTGACAAAGCTTCGGTTCACTACTATGTCCAATCCCACATCCAAATCAATGA
ATACAGAGACCGTGTGTTACTGCCTTCTATGTCTAAGAAGAATGGACGGCCAATCACAAC
CTGTGTGAAAGTTTTAGACATGACAGGGTTAAAACTTTCAGCGCTGAGCCAAATTAAGCT
AGTGACAATCATATCAACAATCGATGATTTGAACTATCCAGAGAAGACAAACACCTACTA
TGTTGTGAACGCTCCATATATATTTTCTGCCTGTTGGAAGGTTGTGAAACCACTTTTACA
AGAGAGGACGAGGAAGAAAGTTCATGTGTTATCTGGTAGCGGAAGGGATGAATTATTGAA
GATTATGGACTTCACATCCCTCCCACATTTCTGTAGAAGAGGAAGCTCTGGGTCATCTCA
CCACAGTGAGAGTGTAGATTGTTTTTCTTTTGATCATCCTTTCCATCAACAGCTATACAA
CTATGTGAAGCACCATTATGAGACTCAGGGACAAGCAGAACCTGCAAAGCAAGGATCATT
CCACGTGGGGTTTCCTGAGCCTGAAGCTGAGAGTGTTCAGATAGCCATTGAATCGGAACT
GCACAAGTTTGAGAACTGCAATGGTCTATGCAAGCCTGCTGATGACAAAAAAGTCAGTCC
ATGAAACACTGGACGGTGATGCTTCTGAGGGAATTCAAATGAGTGAGTTTTGAGCTCTGT
CATCTCCCTAGCCATGCAAATCCAGTGAAGAAAAAAATAAATCTTGAACTGAATGTCCTC
CTGGCTTTCATGTATAGTGTTATTTGATTCTCTGGATAGACATTTGTAGCAAATTTATTT
GTATTTTTGTAAAATGGAAAACAGAGGCCGAAGAGATCCACTTACC


BQ
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AF RR4CR16TF U 1
AF RR4CR16JQ C 432
BS 1 580 RR4CR16TF
BS 581 581 RR4CR16JQ
BS 582 608 RR4CR16TF
BS 609 1186 RR4CR16JQ

RD RR4CR16TF 608 0 0
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ATCAGGGATACATGAGAGAGCATTTGAGTCGTTTTCTGAAGGCACGGGACTGGAACGTAT
TTAAAGCTCATACAATGCTGGTTGAGTGTTGCGTTGGAGGGTAGATAATGAAATTGACAG
TATATTATCCAAACCCATTGTTCCTAGTGAGTTGTACAGGAACGTACGGGATTCTCAACT
CATAGGAATGTCAGGTTACACCAGAGAGGGCTTGCCTGTCTTCGCTATTGGTGTTGGCCT
CAGCACATTTGACAAAGCTTCGGTTCACTACTATGTCCAATCCCACATCCAAATCAATGA
ATACAGAGACCGTGTGTTACTGCCTTCTATGTCTAAGAAGAATGGACGGCCAATCACAAC
CTGTGTGAAAGTTTTAGACATGACAGGGTTAAAACTTTCAGCGCTGAGCCAAATTAAGCT
AGTGACAATCATATCAACAATCGATGATTTGAACTATCCAGAGAAGACAAACACCTACTA
TGTTGTGAACGCTCCATATATATTTTCTGCCTGTTGGAAG*TTGTGAAACCACTTTTACA
AGAGAGGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4CR16JQ 755 0 0
G
TTTAGACATGACAGGGTTAAAACTTTCAGCGCTGAGCCAAATTAAGCTAGTGACAATCAT
ATCAACAATCGATGATTTGAACTATCCAGAGAAGACAAACACCTACTATGTTGTGAACGC
TCCATATATATTTTCTGCCTGTTGGAAGGTTGTGAAACCACTTTTACAAGAGAGGACGAG
GAAGAAAGTTCATGTGTTATCTGGTAGCGGAAGGGATGAATTATTGAAGATTATGGACTT
CACATCCCTCCCACATTTCTGTAGAAGAGGAAGCTCTGGGTCATCTCACCACAGTGAGAG
TGTAGATTGTTTTTCTTTTGATCATCCTTTCCATCAACAGCTATACAACTATGTGAAGCA
CCATTATGAGACTCAGGGACAAGCAGAACCTGCAAAGCAAGGATCATTCCACGTGGGGTT
TCCTGAGCCTGAAGCTGAGAGTGTTCAGATAGCCATTGAATCGGAACTGCACAAGTTTGA
GAACTGCAATGGTCTATGCAAGCCTGCTGATGACAAAAAAGTCAGTCCATGAAACACTGG
ACGGTGATGCTTCTGAGGGAATTCAAATGAGTGAGTTTTGAGCTCTGTCATCTCCCTAGC
CATGCAAATCCAGTGAAGAAAAAAATAAATCTTGAACTGAATGTCCTCCTGGCTTTCATG
TATAGTGTTATTTGATTCTCTGGATAGACATTTGTAGCAAATTTATTTGTATTTTTGTAA
AATGGAAAACAGAGGCCGAAGAGATCCACTTACC

QA 2 755 2 755
DS 



AS 1 2

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GCTTCTAAAAGATGATGAGAAAGATACAGCTACCGTTTACGCAGACGCAGAAGGTTAGGT
ACGAGAGAGCCATCGAGCGGCTACAATCACTGTCGTCGACGGCAAACTCAGACGCTTCTG
TTATCGTCACAGATACCATTCCCGTCAACCACGAAGACGCCTTCCTCAAGGGACACGGAA
CTTCCGAGGTCGAGGGCGAGTTGCTAGCGACGGTCTGTGGAGTTGTTGAGCGCGTGGATA
AGCTCGTCTATGTACGCACCTTACGCGCCAGGTACAAGCCTTAGGTTGGAGATATTGTTG
TAGGCCGTATCATTGAGGTTGCTCAAAAACGTTGGACAGTAGAGCTCAACTTTACTCAGG
ATGGAGTATTAATGCTTTCTTCCATGAACATGCCCGATGGTAGTCAGAGGCGAAGAACGT
CTGTAGATGAACTCAATATGCGGAACATCTTTGTAGAACATGATGTCGTTTGTGCCGAAG
TACGCAGCATTCAGCATGATGGCAGCTTGCAGTTACACGCAAGAAGTCAAAAGTATGGAA
AGCTCGAGAAGGGACAGCTTCTCAAGGTTGATCCCTACTTGGTTAAGAGAAGCAAACATC
ACTTCCATTACATAGAAAGCCTTGGGATTGATTTGATTATCGGCTGCAACGGCTTCATAT
GGGTCGGGGAACACGTTGAGATCAGAGATCCTGTGATGATCGATGATCAGAAGGATGATG
AGATGATGATCTCTTCCTCCTCCAAAGAGCAAAGCCATACTCCGCTCGAGACTAGACAAA
ACATATGCAGAATCGGGAACGCGATACGCGTCTTGTCTAACCTAGGCTTCACGGTGACTG
TGGAAGTGATCACGGAGACTGTTAACCTCAGCAGCTCGAAGAATGTCGACATATACGACA
TGATTGGATCAGAGTTTCACGTTTTGGTGGCAGAGAATGAAGCGGAAAGAAGACGTCAAA
AGAGAAAAAGTGAAGCTTGAGACTTTTTTTTTGTGGTTGCAGATTCAACAGAGACTTGTA
GCGTGTGTTAGGTTGGTCATGTGGGGGCTTGTTTTTGACTCAACATCTAGAAAGCTCCAA
TTTTATTTTTTTTTTTAAAATATATAAGCATGTCAGAGTAAGTCGATGATAATGGTTGTG
AAACTGAGTTGTGTTTTGTATTTTTTGGAGATAACTTTCCTTTTGCGTTCC


BQ
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AF RR4BO83TF U 1
AF RR4BO83JQ C 537
BS 1 707 RR4BO83TF
BS 708 1251 RR4BO83JQ

RD RR4BO83TF 707 0 0
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GCTTCTAAAAGATGATGAGAAAGATACAGCTACCGTTTACGCAGACGCAGAAGGTTAGGT
ACGAGAGAGCCATCGAGCGGCTACAATCACTGTCGTCGACGGCAAACTCAGACGCTTCTG
TTATCGTCACAGATACCATTCCCGTCAACCACGAAGACGCCTTCCTCAAGGGACACGGAA
CTTCCGAGGTCGAGGGCGAGTTGCTAGCGACGGTCTGTGGAGTTGTTGAGCGCGTGGATA
AGCTCGTCTATGTACGCACCTTACGCGCCAGGTACAAGCCTTAGGTTGGAGATATTGTTG
TAGGCCGTATCATTGAGGTTGCTCAAAAACGTTGGACAGTAGAGCTCAACTTTACTCAGG
ATGGAGTATTAATGCTTTCTTCCATGAACATGCCCGATGGTAGTCAGAGGCGAAGAACGT
CTGTAGATGAACTCAATATGCGGAACATCTTTGTAGAACATGATGTCGTTTGTGCCGAAG
TACGCAGCATTCAGCATGATGGCAGCTTGCAGTTACACGCAAGAAGTCAAAAGTATGGAA
AGCTCGAGAAGGGACAGCTTCTCAAGGTTGATCCCTACTTGGTTAAGAGAAGCAAACATC
ACTTCCATTACATAGAAAGCCTTGGGATTGATTTGATTATCGGCTGC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4BO83JQ 715 0 0
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GGAAAGCTCGAGAAGGGACAGCTTCTCAAGGTTGATCCCTACTTGGTTAAGAGAAGCAAA
CATCACTTCCATTACATAGAAAGCCTTGGGATTGATTTGATTATCGGCTGCAACGGCTTC
ATATGGGTCGGGGAACACGTTGAGATCAGAGATCCTGTGATGATCGATGATCAGAAGGAT
GATGAGATGATGATCTCTTCCTCCTCCAAAGAGCAAAGCCATACTCCGCTCGAGACTAGA
CAAAACATATGCAGAATCGGGAACGCGATACGCGTCTTGTCTAACCTAGGCTTCACGGTG
ACTGTGGAAGTGATCACGGAGACTGTTAACCTCAGCAGCTCGAAGAATGTCGACATATAC
GACATGATTGGATCAGAGTTTCACGTTTTGGTGGCAGAGAATGAAGCGGAAAGAAGACGT
CAAAAGAGAAAAAGTGAAGCTTGAGACTTTTTTTTTGTGGTTGCAGATTCAACAGAGACT
TGTAGCGTGTGTTAGGTTGGTCATGTGGGGGCTTGTTTTTGACTCAACATCTAGAAAGCT
CCAATTTTATTTTTTTTTTTAAAATATATAAGCATGTCAGAGTAAGTCGATGATAATGGT
TGTGAAACTGAGTTGTGTTTTGTATTTTTTGGAGATAACTTTCCTTTTGCGTTCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6262Contig1 1031 2 2 U
GGCCCGCAAACTCTTCGTCTCCATCTCTCCTCCGCTGCGTTTTCCGGCCAGTTTCTTCAT
GGCTTCTACCGGACAAACCTCCATTTGGCGTCGTCCATGGCCCGAGTTAAATCTCTTGTG
GAGTGAGGAGAGTTTGCAGCAGGATTCGAGGGAGTTAGGGAGTTAGGAGAGTGGTGAGGC
GGAGATGAGCAGCAGCGGTGAGGAGACAGAGCTTAACTTGAGTTCTGCCGTATTCGAGCT
CAAGGGAGGAGATGGAGTCGAGGGAGAAGATGGGTTTGGTTCGGGGAGGAGGTGGAATTG
GTTTCAAAGATAAGTCCTCTCTTGTCTCTGTATTTCACACTCTTTTTTTAGATTCTTTAG
TTTGTGCTTTACTGCTTTGTGTAATGACAAGATTTCATCTTTTGTTTGTTTCAGAAACAT
TGTCTCAACGGTGAACTTAGACTGTTAGCGTGATCTTAAAGCCATTGCTTTGCAGGCTCG
GAATGCAGAGTACAATCCCAAGCGTTTTGCTGTGGTTATTATGACAATTTGAGAGCCAAA
GGCCACGTCACAAGGACAATCTGATCGTGTTCTCGTCTGTTCTTAAAGTCCTTAAGCAAA
CACATAGTCTTGTAAGTTCGTGATGGATTAGGTGAAGGGTATGGTATGCTTGGCCAGGCT
GGAAACAACAGACTACGTGTGTTACTGACCCTGCTGAAGAAGCTTGAAGGTGGAGGAGGC
AAACTAATTGTCGCAGGTTTATGGAATGTCGCAGGTTTATGGCATGGATCACATACTGGT
ATGTGATGCTGTTTCTACCCATCTGGTTTCAAGAACCCATGCACTTGTTGATGTTAGCTT
AGTGGAAGATCATGGAGATGGTTGGGGCTGAGTATGGGAACATGGACGGCCAGGAAGATT
AGTTCTAGGTTTTTGGCTTAGTTTAGGTTTATCTGATTTAGTTTAGGTTTGATTTTGGTT
ATTATATTTATTTATAAACCATAATATTTTTGTAAATCAACATTTATTTTTTAATAAATT
AGATTTGTTTT


BQ
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BQ
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RD RR4D454TF 741 0 0
GATATAAAAAAAATTTCATGTCCGAGTTCCCCCCGAAGTCACCCTTATATAGAAACGACA
AGTTTCTTGAGCAAGGTGAGCGCTCAACTTCTACAGGATGCCGGATTGCCAAATACGGCA
GACCCGGCAGCTATGCAATTACTTCATTCAGTCCACAATAATTTGGTGTCCGATTTTCGG
CTAGTGGACAGCTATACCAATAATCCTCTATACAGTTGTATAAGATTTTTTCTAAAGGAT
TATCGGTGAGCAAGAATTCAAATGTAGTTTTTAGTTTCGTTAGTTAACTTACCTTTTTCT
TTTGGTGGTGAGTTTTCTTTTTTCTTTTTTCGCTATGCGCCGCTCCGCCAGCAAGGAGTG
CCACGCACAAGCAGAGCGAAAACAAACAAAGCAGGGTATTCGTTGGGGGAAATCCTTTGA
TTGTGTATTATAGATCCATGTCTTTCTTGTTCCACTAGCTAGGACAAAATTTGCACATGT
CCGTTCCGTTATTACAACCTTCTTTTTTGATGTCAAAGACCAGAAGCTACGCGCAAATTC
TCATTGGGTCTTGGTTGTTCTTAACAGCGATGGCTATTTATTTAAGTCTTGGGGTAGCAC
CGCTAGATCTTCAACAAGGTGAAAATTCTCGTATTCTCTATGTACATGTTCCTGTGGCTT
GGATGAGTATTATTGTTTATATCGCCACGGCTATAAACACTTTCTTGTTCCTATTAACAA
A*CATCCCCTTTATCTTCGCT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4D454JQ 630 0 0
GTTCTTAACAGCGATGGCTATTTATTTAAGTCTTGGGGTAGCACCGCTAGATCTTCAACA
AGGTGAAAATTCTCGTATTCTCTATGTACATGTTCCTGTGGCTTGGATGAGTATTATTGT
TTATATCGCCACGGCTATAAACACTTTCTTGTTCCTATTAACAAAACATCCCCTTTATCT
TCGCTCTTCCGGAACCGGTATAGAAATGGGTGCTTTTTTTACGTTGTTTACCTTAGTTAC
TGGGGGGTTTTGGGGAAAACCAATGTGGGGGACCTTTTGGGTGTGGGATGCTCGTTTGAC
TTCTGTATTCATCTTGTTTTTTATTTACCTGGGTGCACTGTGTTTTCAAAGGCTTTCTGT
CGAACTGGCTTCTATTTTAATTTGTGTTGGACTGATAGATATACCAATAATAAAGTTTTC
AGTCAACTGGTGGAATACATTGCATCAACCTGCGAGCATTAGCCGATTTGATACATCAAT
ACATGTTTCTATGCTCATTCCAATCTTGCCTAACTTTGCTAACTTCCTCTTCTTAACTTG
TATTTTGTTTGTTCTGGAAACACGTCTTCTTATTCTATCTTTTCTCGAATCTTCTATAAC
GGAAGAAATTGAAGCTCGAGAAGGAATACC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6265Contig1 648 2 1 U
GTGTTGTGAAGACCAAACTGGGAGCTCACCGAGTTCTGATGGGTGCTGAAATGGATTGCT
GCGATGAAACTGATGAAGGAAGGAGGATTTATATAGAGTTGAAAACTACTCGCGAGTTGG
ATGATCGTACCGTAGAGAGATATGAGAGAGAGAAACTGCTTAAATTCTGGATACAATCAT
TTGTAGCAGGAGTGCCATACATTCTCGTTGGATATAGAGATGATGGAGGGAGACTAGTAC
GCATAGAGAGATTAAGAACAAAAGATATCGCACACAGAGCCAGACTGAAAAACTACTGGC
AGGGAGGAGTGTGCTCGGCATTTTCTGATGAGGTTCTTTGCTGGCTATACGGCACTGTTA
AAGAGAACGTAGATTACACACTTCAGTTTGTGCATCCATTCATGAGGCTAGAGCTTCTTC
AAGCTCAGTCTTGTCCTGACGCCATCACTAATCATGTTCATCTTCTTCAAAATCCTTCAT
CACCACCGCCACCTCAGTAACTCTCTCTGTGCTTCCTTAGTGGAGTCTTTTATAGGGTTG
AAAATCAAAAAATTCTTTTTAAATAAAAGTTTTGATTTTGTATTTCTACTTTGTAACTTA
TACATAACCAACCCAAACAGTGAAGAAGATTTTATTTTATTTTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FH86TF U 1
AF RR4FH86JQ C 461
BS 1 648 RR4FH86TF

RD RR4FH86TF 648 0 0
GTGTTGTGAAGACCAAACTGGGAGCTCACCGAGTTCTGATGGGTGCTGAAATGGATTGCT
GCGATGAAACTGATGAAGGAAGGAGGATTTATATAGAGTTGAAAACTACTCGCGAGTTGG
ATGATCGTACCGTAGAGAGATATGAGAGAGAGAAACTGCTTAAATTCTGGATACAATCAT
TTGTAGCAGGAGTGCCATACATTCTCGTTGGATATAGAGATGATGGAGGGAGACTAGTAC
GCATAGAGAGATTAAGAACAAAAGATATCGCACACAGAGCCAGACTGAAAAACTACTGGC
AGGGAGGAGTGTGCTCGGCATTTTCTGATGAGGTTCTTTGCTGGCTATACGGCACTGTTA
AAGAGAACGTAGATTACACACTTCAGTTTGTGCATCCATTCATGAGGCTAGAGCTTCTTC
AAGCTCAGTCTTGTCCTGACGCCATCACTAATCATGTTCATCTTCTTCAAAATCCTTCAT
CACCACCGCCACCTCAGTAACTCTCTCTGTGCTTCCTTAGTGGAGTCTTTTATAGGGTTG
AAAATCAAAAAATTCTTTTTAAATAAAAGTTTTGATTTTGTATTTCTACTTTGTAACTTA
TACATAACCAACCCAAACAGTGAAGAAGATTTTATTTTATTTTTGGGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4FH86JQ 188 0 0
TCTTCTTCAAAATCCTTCATCACCACCGCCACCTCAGTAACTCTCTCTGTGCTTCCTTAG
TGGAGTCTTTTATAGGGTTGAAAATCAAAAAATTCTTTTTAAATAAAAGTTTTGATTTTG
TATTTCTACTTTGTAACTTATACATAACCAACCCAAACAGTGAAGAAGATTTTATTTTAT
TTTTGGGT

QA 1 188 1 188
DS 



AS 1 2

CO CL6266Contig1 957 2 2 U
GGGCAACTGAAGATGTGTCTCTTCTTCCGGATTCAAAGGAGTACAACAAGGAAGATTTCT
CTGATAACTACACCAACGCGAAGCTCTTTGTGATCAAGTCTTACAGCGAAGATGATATTC
ACAAAAGCATCAAGTACAATGTGTGGTCCAGCACCCCCAATGGCGATAAGAAGCTTAACG
CTGCATACAATGAAGCAGTTGTAGACAAATCCTCCTGCCCTGTTTTTCTCATCTTCTCTG
TAAACACAAGTGGGCAGTTTGTAGGTTTAGCGGAGATGGTAGGACCAGTTGATTTCAACC
AGACTGTGGAATACTGGCAGCAGGACAAGTGGGTTGGTTGCTTCCCTGTGAAGTGGCACA
TCGTTAAAGATTTCCCAAACAGTTCACTGAGGCATATTACTCTGGAGAATAATGAGAACA
AGCCTGTTACTAATAGCCGAGACACACAGGAGGTAAAGATAGAGCAAGGAGTCAAAGTAA
TCAAGATTTTCAAGGAACATGAGAGCAAGACAAGCATACTCGATGATTTTGTCTTCTATG
AGAGTCGTGAGAAGATAATCAAAGAGGGGAAAAAGAAGCACCAGCTGTATAAAAAACAGC
AAGCTTTGGCTGCCAGTGACAAGAAGGTGACACCAAAAGACGAGGCTAAGGAAACCAAAG
AGACTACTAGTATGATACCAGAAGTAGTTGAAGAGATATCACAAAACGGCGTTGCAGAAG
TTGCTAGCGCATGCTGAATGCAGCTGCAGCAAGCTGCTTACTTTACCTTGGGTGGTTCTT
TCCTAGGAGTTTTGTTTTTTTTTTTGGGTATTTGGTTTTGAAGATGAGAGAGATATACCA
GTAAAATCCGCAAGTCCCGTTTTATGTTTGGCTGTTTTAAGTAGAAGATAAAAGTGATTT
CAAAGGCTGTCGTGTCTTTTCCTTTATTTTTCTATTAATCTTTTCGATTCTGGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DR62TF U 1
AF RR4DR62JQ C 459
BS 1 646 RR4DR62TF
BS 647 957 RR4DR62JQ

RD RR4DR62TF 646 0 0
GGGCAACTGAAGATGTGTCTCTTCTTCCGGATTCAAAGGAGTACAACAAGGAAGATTTCT
CTGATAACTACACCAACGCGAAGCTCTTTGTGATCAAGTCTTACAGCGAAGATGATATTC
ACAAAAGCATCAAGTACAATGTGTGGTCCAGCACCCCCAATGGCGATAAGAAGCTTAACG
CTGCATACAATGAAGCAGTTGTAGACAAATCCTCCTGCCCTGTTTTTCTCATCTTCTCTG
TAAACACAAGTGGGCAGTTTGTAGGTTTAGCGGAGATGGTAGGACCAGTTGATTTCAACC
AGACTGTGGAATACTGGCAGCAGGACAAGTGGGTTGGTTGCTTCCCTGTGAAGTGGCACA
TCGTTAAAGATTTCCCAAACAGTTCACTGAGGCATATTACTCTGGAGAATAATGAGAACA
AGCCTGTTACTAATAGCCGAGACACACAGGAGGTAAAGATAGAGCAAGGAGTCAAAGTAA
TCAAGATTTTCAAGGAACATGAGAGCAAGACAAGCATACTCGATGATTTTGTCTTCTATG
AGAGTCGTGAGAAGATAATCAAAGAGGGGAAAAAGAAGCACCAGCTGTATAAAAAACAGC
AAGCTTTGGCTGCCAGTGACAAGAAGGTGACACCAAAAGACGAGGC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DR62JQ 499 0 0
ATAGAGCAAGGAGTCAAAGTAATCAAGATTTTCAAGGAACATGAGAGCAAGACAAGCATA
CTCGATGATTTTGTCTTCTATGAGAGTCGTGAGAAGATAATCAAAGAGGGGAAAAAGAAG
CACCAGCTGTATAAAAAACAGCAAGCTTTGGCTGCCAGTGACAAGAAGGTGACACCAAAA
GACGAGGCTAAGGAAACCAAAGAGACTACTAGTATGATACCAGAAGTAGTTGAAGAGATA
TCACAAAACGGCGTTGCAGAAGTTGCTAGCGCATGCTGAATGCAGCTGCAGCAAGCTGCT
TACTTTACCTTGGGTGGTTCTTTCCTAGGAGTTTTGTTTTTTTTTTTGGGTATTTGGTTT
TGAAGATGAGAGAGATATACCAGTAAAATCCGCAAGTCCCGTTTTATGTTTGGCTGTTTT
AAGTAGAAGATAAAAGTGATTTCAAAGGCTGTCGTGTCTTTTCCTTTATTTTTCTATTAA
TCTTTTCGATTCTGGTGTC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL6267Contig1 1173 2 2 U
GGGTGGGCGGCTGATATTTTACGACTTTGGAATGATGGGAAGTATCAGCCCAAATATTAG
AGAAGGTTTGTTGGAGGCATTCTACGGTGTTTATGAGAAGGACCCTGATAAGGTCATCCA
AGCAATGGTTCAAATGGGTGTGCTTGTACCTACTGGAGACTTGACATCGATCAGAAGAAC
AGCGCTGTTTTTTCTCAACAGTTTCGAAGAGCGGCTTGCTGCACAAAGAAAGGAGAAAGA
AGAACTAGCAGCAGCAGAACAGCTTGGGTTCAAGAAGCCACTAAGCAAAGAGGAAAAGCA
AGAGAAAAAGAAGCAACGGTTAGCTGCAATAGGAGAAGACTTATTAGCCATTGCAGCTGA
TCAACCTTTCCGGTTCCCAGCCACATTCACATTTGTTGTTAGAGCCTTTTCAGTATTGGA
TGGCATCGGCAAAGGTCTTGACCCCCGGTTTGATATAACAGAGATTGCAAAACCATATGC
TTTGGAATTGCTACGGTTCCGGGAAGCTGGAGTTGAAGTTGTAGTGAAGGACCTGAGAAC
GAGATGGGACAGACAGTCACAAGCATTCTACAATCTATTTAGGCAAGCTGACAGAGTTGA
AAAGCTAGCTGTAATCATCCAACGACTTGAGCAAGGTGATTTGAAGCTTAGAGTCCGAGC
ATTGGAGTCTGAGAGGGCGTTTCAACGTGTAGCAACTGTTCAAAAAACAATTGGAAGTGC
TGTTGCTGCAGGAAGTTTAGTCAATCTCGCAACGATTTTGTATCTGAATTCTTTAAAAAC
ACCAGCTAATATAGCATACACAGTCTGTGCTTTTTTCAGTCTCCAAGTTTTAATCGGAGT
TATAAAAGTCAAGAAGTTCGACCAACGTGAAAAACTGATCACTGGAACAGCTTAAAAGAA
ACCTTGTTTGATGTAGTAAAGCTATTTTGTGCTTAGAAGCCACAATGATTTCTCCCATAA
AAGCTTTCCACTGGAGTGATGATGATTTCTTTGGTCTGCCAAGTGAAAAAAATTCTTGTG
GAAGCTTTAGAGGCAAGAGATGGTAAAAACAGTGAACGACCAGTCTCTATATCTCCTGTT
TTTTTTTTTTTCTGAAAGTTTGATTTTTGGGCATTTTATCAACAGAGCCACTTGTAATGG
TGGTAGAGATGTAGTAGTCATTAGGTAAACTCT


BQ
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DS 

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TTCAACGTGTAGCAACTGTTCAAAAAACAATTGGAAGTGCTGTTGCTGCAGGAAGTTTAG
TCAATCTCGCAACGATTTTGTATCTGAATTCTTTAAAAACACCAGCTAATATAGCATACA
CAGTCTGTGCTTTTTTCAGTCTCCAAGTTTTAATCGGAGTTATAAAAGTCAAGAAGTTCG
ACCAACGTGAAAAACTGATCACTGGAACAGCTTAAAAGAAACCTTGTTTGATGTAGTAAA
GCTATTTTGTGCTTAGAAGCCACAATGATTTCTCCCATAAAAGCTTTCCACTGGAGTGAT
GATGATTTCTTTGGTCTGCCAAGTGAAAAAAATTCTTGTGGAAGCTTTAGAGGCAAGAGA
TGGTAAAAACAGTGAACGACCAGTCTCTATATCTCCTGTTTTTTTTTTTTTCTGAAAGTT
TGATTTTTGGGCATTTTATCAACAGAGCCACTTGTAATGGTGGTAGAGATGTAGTAGTCA
TTAGGTAAACTCT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL6268Contig1 1133 2 2 U
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CCAGAAGCATGCGTGGCGAACATCCTCTCCTTCACAACTCCTGCAGATACGTTATCCTCG
GCGACTGTCTCCTCAGTTTTCAGCGTAGCCGCAGACTCTGACTTCGTCTGGGAGAAGTTT
CTACCCTCTGGTTACAGCCGCCTCATCTCTACATCCACGACTCGTAGGCGGAAATTCTCC
TCTAAAAAGGAGCTCTATCGACGGCTCTGTGAATCAATTCTCATCGATAATGGCAGAAAG
ATATTCAAGATCGATAGGCTTTCTGGAAGATAACGTATGTTCTGTCGGCAAGAGACCTTT
CCATAACTTGGAGCGATCAACGACATTACTGGTTTTGGAGCCGTCGAGCAGATTCAAGAT
TTTCCGAAGCGGTCCAGCTTATGGTAACGAACTGGTTAGAAATCAAGGGAAAGATTCAGA
CGGGAGCTTTATCTCCGAACGCGAGTTACGAGGCTTATCTGATCATGAAAGTTACGGAAC
GAGCGTACGGACTAGAGCTAGTTCCGGCCGAGACTTGGGTGAAAGTGGGAAACGGTAAGA
AGAAAATAAAGTCGAGTTATCTAAGTTGCTTGAGTAACAAGAAACAACAGATGGAAAGGC
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AGTTGAAGGGTGGGATTGTAATTGATGGGATTGAGGTTAGGCCTAAACCCTCAAAAAAGT
TAGTGCCGAATATTTTGGGTTAAGCTGATAAATCGTACGCTGAGGGAACGTTTCTGTTGG
TCAGTGATACAACTGACTGAATCATTCGTTATTATTTTGAATAATTTGAATCGAGTCTTA
TTTGAATATATGACTTGTCATCTGACAGAAAAATAAAAGAAATATTGTAACATAAAAGTT
CATTTCGTTGACATGTTTGGTTTGCATGGCAAATTATTTAAACATGTTTTTTA


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AF RR4BQ69TF U 1
AF RR4BQ69JQ C 329
BS 1 534 RR4BQ69TF
BS 535 1133 RR4BQ69JQ

RD RR4BQ69TF 534 0 0
GAGGATCTCATCAATTTACTATCTTTCAAACTTTTGGAGTCCAAAAGAGTGAATATGTTA
CCAGAAGCATGCGTGGCGAACATCCTCTCCTTCACAACTCCTGCAGATACGTTATCCTCG
GCGACTGTCTCCTCAGTTTTCAGCGTAGCCGCAGACTCTGACTTCGTCTGGGAGAAGTTT
CTACCCTCTGGTTACAGCCGCCTCATCTCTACATCCACGACTCGTAGGCGGAAATTCTCC
TCTAAAAAGGAGCTCTATCGACGGCTCTGTGAATCAATTCTCATCGATAATGGCAGAAAG
ATATTCAAGATCGATAGGCTTTCTGGAAGATAACGTATGTTCTGTCGGCAAGAGACCTTT
CCATAACTTGGAGCGATCAACGACATTACTGGTTTTGGAGCCGTCGAGCAGATTCAAGAT
TTTCCGAAGCGGTCCAGCTTATGGTAACGAACTGGTTAGAAATCAAGGGAAAGATTCAGA
CGGGAGCTTTATCTCCGAACGCGAGTTACGAGGCTTATCTGATCATGAAAGTTA

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4BQ69JQ 805 0 0
AGAT
ACGTATGTTCTGTCGGCAAGAGACCTTTCCATAACTTG*AGCGATCAACGACATTACTGG
TTT*GGAGCCGTCGAGCAGATTCAAGATTT*CCGAAGCGGTCCAGCTTATGGTAACGAAC
TGGTTAGAAATCAAGGGAAAGATTCAGACGGGAGCTTTATCTCCGAACGCGAGTTACGAG
GCTTATCTGATCATGAAAGTTACGGAACGAGCGTACGGACTAGAGCTAGTTCCGGCCGAG
ACTTGGGTGAAAGTGGGAAACGGTAAGAAGAAAATAAAGTCGAGTTATCTAAGTTGCTTG
AGTAACAAGAAACAACAGATGGAAAGGCTGTTTTACGGACATAGAGTGGCCAAGAAGGAC
GAGGCTTTTGGATGTCGTCGGAGGGAGCCGAGGGTTAGAGACGACGGGTGGATGGAGATA
GAGATCGGAGAGTTCGAGACGGAACGAGTAGGTGGTGGTGACAATGACAAGGAGGTTGTT
ATGAGTCTGACCGAAGTTATAGGCTATCAGTTGAAGGGTGGGATTGTAATTGATGGGATT
GAGGTTAGGCCTAAACCCTCAAAAAAGTTAGTGCCGAATATTTTGGGTTAAGCTGATAAA
TCGTACGCTGAGGGAACGTTTCTGTTGGTCAGTGATACAACTGACTGAATCATTCGTTAT
TATTTTGAATAATTTGAATCGAGTCTTATTTGAATATATGACTTGTCATCTGACAGAAAA
ATAAAAGAAATATTGTAACATAAAAGTTCATTTCGTTGACATGTTTGGTTTGCATGGCAA
ATTATTTAAACATGTTTTTTA

QA 5 805 5 805
DS 



AS 1 2

CO CL6269Contig1 1023 2 2 U
GCTCAACAGTCAACACTGACACTAAAATCAATGGGAGAGGAGGATAAGAAGAAAACAGAA
GAGAAAATGGAGAAAAAAGCTGAAGAACCACAAGTGAAAAAACCTGATGATAAGAAAGAA
GAAGAGAAGAAGAAAGAGCCTCAAGAGATTGTTCTTAAGATCTTTATGCATTGTGAAGGT
TGTGCTAAAAAGATTCATAGATGTCTTAAAGTCTTTGAAGGAGTGGAGGATGTAACAACT
GATTGTAAAACTAGTAAAGTTGTGGTGAAAGGAGAGAAGGCAGATCCACTAAAAGTGTTG
CAGAGATTGCAAAGAAAGAGCCACCGTCCAGTGGAGCTCCTTTCTCCTATTCCAGAGCCT
AAACCGGTTTCAGATGAACCGGAGAAAAAGGAGGAGAAACCAAAACCTCAAGAGAAAAAA
GAAGAGGTAGTGACAGTGGTACTGAGAGTTCACATGCATTGTGAAGCATGTGCCATGGAG
ATCCAAAAGAGAATCATGAGAATGAAAGGAGTGGAGTCTGTGGAACCAGATTTTAAAGCA
TCACAAGTGAGCGTGAAAGGAGTTTTTACACCGGAAAAGCTAGTTGAGTACGTTAACAAG
AAAATCGGGAAGCATGCTGCGGTTGTCAAGCAAGATCCGTCCCCAAAACCGGAGAAAGAA
AAAGAAACAAAAGACAAAGACAAAGACGAGAAGAAAAAGGAAGAGGAACAACCCAAAGAA
AGTAAAGAGGCTAAGGAAGACGGTGGTGGAGTGGCCAAATCGGCGGCCGGAGATGGGGGT
GCTGCAGCGGGGGAAGGTGACAAAGTGGTGGATTTAAAGAAGAATGAGTATCAATACCAG
CCACCGAGGTATCCTGTGGAGATGTTTGCGTATCCACCACAGATATTCAGTGATGAGAAC
CCCAACGCTTGTACCATGATGTAGTAAATCGTTTGTTTAAGAAGTTACAACTTTTACTCT
ATTTATGTCGTTAAATGGATTTATTTATTTATTTCAAGCTAATTAGATGATCATATTCTT
GTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4DF41TF U 1
AF RR4DF41JQ C 384
BS 1 555 RR4DF41TF
BS 556 1023 RR4DF41JQ

RD RR4DF41TF 555 0 0
GCTCAACAGTCAACACTGACACTAAAATCAATGGGAGAGGAGGATAAGAAGAAAACAGAA
GAGAAAATGGAGAAAAAAGCTGAAGAACCACAAGTGAAAAAACCTGATGATAAGAAAGAA
GAAGAGAAGAAGAAAGAGCCTCAAGAGATTGTTCTTAAGATCTTTATGCATTGTGAAGGT
TGTGCTAAAAAGATTCATAGATGTCTTAAAGTCTTTGAAGGAGTGGAGGATGTAACAACT
GATTGTAAAACTAGTAAAGTTGTGGTGAAAGGAGAGAAGGCAGATCCACTAAAAGTGTTG
CAGAGATTGCAAAGAAAGAGCCACCGTCCAGTGGAGCTCCTTTCTCCTATTCCAGAGCCT
AAACCGGTTTCAGATGAACCGGAGAAAAAGGAGGAGAAACCAAAACCTCAAGAGAAAAAA
GAAGAGGTAGTGACAGTGGTACTGAGAGTTCACATGCATTGTGAAGCATGTGCCATGGAG
ATCCAAAAGAGAATCATGAGAATGAAAGGAGTGGAGTCTGTGGAACCAGATTTTAAAGCA
TCACAAGTGAGCGTG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4DF41JQ 640 0 0
GAAAAAGGAGGAGAAACCAAAACCTCAAGAGAAAAAAGAAGAGGTAGTGACAGTGGTACT
GAGAGTTCACATGCATTGTGAAGCATGTGCCATGGAGATCCAAAAGAGAATCATGAGAAT
GAAAGGAGTGGAGTCTGTGGAACCAGATTTTAAAGCATCACAAGTGAGCGTGAAAGGAGT
TTTTACACCGGAAAAGCTAGTTGAGTACGTTAACAAGAAAATCGGGAAGCATGCTGCGGT
TGTCAAGCAAGATCCGTCCCCAAAACCGGAGAAAGAAAAAGAAACAAAAGACAAAGACAA
AGACGAGAAGAAAAAGGAAGAGGAACAACCCAAAGAAAGTAAAGAGGCTAAGGAAGACGG
TGGTGGAGTGGCCAAATCGGCGGCCGGAGATGGGGGTGCTGCAGCGGGGGAAGGTGACAA
AGTGGTGGATTTAAAGAAGAATGAGTATCAATACCAGCCACCGAGGTATCCTGTGGAGAT
GTTTGCGTATCCACCACAGATATTCAGTGATGAGAACCCCAACGCTTGTACCATGATGTA
GTAAATCGTTTGTTTAAGAAGTTACAACTTTTACTCTATTTATGTCGTTAAATGGATTTA
TTTATTTATTTCAAGCTAATTAGATGATCATATTCTTGTT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL6270Contig1 896 2 4 U
GGACAATCAAACACAAACAAAAAACCATAAGAACAGATCTATAAGCTCAACACTGTTGAT
CATGTCTACAACCGGACAGATTATTCGATGCAAAGCTGCTGTGGCATGGGAAGCTGGAAA
GCCACTGGTGATGGAGGAAGTAGAGGTTGCTCCACCCCAGAAGCATGAAGTTCGTATCAA
GATTCTCTTCACTTCTCTCTGTCACACTGATGTTTACTTCTGGGAAGCAAAGGGACAAAC
GCCTTTGTTTCCACGTATCTTCGGACATGAAGCTGGAGGGATTGTGGAGAGCGTTGGAGA
AGGAGTGACAGATCTTCAACCAGGAGACCACGTTCTCCCCATCTTCACCGGAGAATGCGG
AGATTGCCGTCACTGCCACTCGGAGGAATCCAACATGTGCGACCTTCTCAGGATCAACAC
TGAGAGAGGAGGGATGATCCACGACGGCCAATCCAGATTCTCCATCAACGAGCAAAGACG
ATGCGTTCAAGACACATCCGATGAACTTGCTGAACGAGAGGACGCTCAAGGGTACTTTCT
TTGGGAACTACAAACCCAAAACTGACATTCCTGGGGTGGTCGAGAAGTACATGAACAAGG
AGCTGGAGCTTGAGAAGTTCATCACTCACACAGTGCCCTTCTCTGAGATCAACAAAGCCT
TTGACTACATGTTGAAAGGGAGAGAGTATCCGTTGCATCATCACCATGGGTGCTTGAAAA
TGAAAACCAAAAACTTTCTCCTTGTCAATAATAAAATGTCTACTTATTAGTAGACTATCT
CATCTCTTATTGCTTTTGGCTTTTTTGCACTGTGTTTTTTTTATGTCTCTAAATCTATTT
TACCATATCGTTGTGATAGTTGTTTCATTCTATTAAGAAGGAAATCTTTTAGACTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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AF RR4BG84TF U 1
AF RR4BG84JQ C 648
BS 1 805 RR4BG84TF
BS 806 806 RR4BG84JQ
BS 807 855 RR4BG84TF
BS 856 896 RR4BG84JQ

RD RR4BG84TF 855 0 0
GGACAATCAAACACAAACAAAAAACCATAAGAACAGATCTATAAGCTCAACACTGTTGAT
CATGTCTACAACCGGACAGATTATTCGATGCAAAGCTGCTGTGGCATGGGAAGCTGGAAA
GCCACTGGTGATGGAGGAAGTAGAGGTTGCTCCACCCCAGAAGCATGAAGTTCGTATCAA
GATTCTCTTCACTTCTCTCTGTCACACTGATGTTTACTTCTGGGAAGCAAAGGGACAAAC
GCCTTTGTTTCCACGTATCTTCGGACATGAAGCTGGAGGGATTGTGGAGAGCGTTGGAGA
AGGAGTGACAGATCTTCAACCAGGAGACCACGTTCTCCCCATCTTCACCGGAGAATGCGG
AGATTGCCGTCACTGCCACTCGGAGGAATCCAACATGTGCGACCTTCTCAGGATCAACAC
TGAGAGAGGAGGGATGATCCACGACGGCCAATCCAGATTCTCCATCAACGAGCAAAGACG
ATGCGTTCAAGACACATCCGATGAACTTGCTGAACGAGAGGACGCTCAAGGGTACTTTCT
TTGGGAACTACAAACCCAAAACTGACATTCCTGGGGTGGTCGAGAAGTACATGAACAAGG
AGCTGGAGCTTGAGAAGTTCATCACTCACACAGTGCCCTTCTCTGAGATCAACAAAGCCT
TTGACTACATGTTGAAAGGGAGAGAGTATCCGTTGCATCATCACCATGGGTGCTTGAAAA
TGAAAACCAAAAACTTTCTCCTTGTCAATAATAAAATGTCTACTTATTAGTAGACTATCT
CATCTCTTATTGCTTTTGGCTTTTT*GCACTGTGTTTTTTTTATGTCTCTAAATCTATTT
TACCATATCGTTGTG

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4BG84JQ 249 0 0
ATCAACAAGGCCTTTGACTACATGTTGAA*GGGAGAGAGTATCCGTTGCATCATCACCAT
GGGTGCTTGAAAATGAAAACCAAAAACTTTCTCCTTGTCAATAATAAAATGTCTACTTAT
TAGTAGACTATTTCATCTCTTATTGCTTTTGGCTTTTTTGCACTGTGTTTTTTTTATGTC
TCTAAATTTATTTTACCATATCGTTGTGATAGTTGTTTCATTCTATTAAGAAGGAAATCT
TTTAGACTT

QA 1 249 1 249
DS 



AS 1 2

CO CL6271Contig1 216 2 1 U
GGATCCTTTGGAAGAATACTGCAGTGATAATCCTGAGACTGATGAGTGTCGTACTTATGA
CAACTGAAAACGTTTTTTTGATGTTTGGAAATAATTGGTACGGTCGGATCGATCTTTATT
TCTTTTCTTCTCGTTGTTGTCGTCCGTGCTTGGTTTGTTTTGATTTGATGGTTGTAATGT
GATAATGAATATGATGAATAGTTCAATTGCAATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A457TF U 1
AF RR4A457JQ C 23
BS 1 216 RR4A457TF

RD RR4A457TF 216 0 0
GGATCCTTTGGAAGAATACTGCAGTGATAATCCTGAGACTGATGAGTGTCGTACTTATGA
CAACTGAAAACGTTTTTTTGATGTTTGGAAATAATTGGTACGGTCGGATCGATCTTTATT
TCTTTTCTTCTCGTTGTTGTCGTCCGTGCTTGGTTTGTTTTGATTTGATGGTTGTAATGT
GATAATGAATATGATGAATAGTTCAATTGCAATACT

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR4A457JQ 194 0 0
AGTGATAATCCTGAGACTGATGAGTGTCGTACTTATGACAACTGAAAACGTTTTTTTGAT
GTTTGGAAATAATTGGTACGGTCGGATCGATCTTTATTTTTTTTTTTCTCGTTGTTGTCG
TCCGTGCTTGGTTTGTTTTGATTTGATGGTTGTAATGTGATAATGAATATGATGAATAGT
TCAATTGCAATACT

QA 1 194 1 194
DS 



AS 1 2

CO CL6272Contig1 792 2 3 U
GAGGTCTCAAATAGTTATATGTGACAGGTTAGACATATCTCTGAGCAGCTTGGCCCGTGC
CTGAGCAAGTTGAACTCGCTTAAAGGCTTTGATTCCTTCCTTTATAAGGCTTCTGTACGT
GGAGAGCTTCGAGATATAGCTCACCAAGGCAGATCTCAGTTCCTCATAGAGTGCAGAGGT
CTCCAGTATCTCCTCAAAATCCGAACGAGTCACGAGCTCACGCGCCATTATACCACGAAA
CTGTTTTAGGATTAATTTCAGCTTCTCTACCGTGTCTGAAGATTCCTTAGAAGATTTTCC
TACGTTTACACTTGAGAGTCCTACATTTCATAGTTAGAGATGAGTTAAAGAGGCTTTAAT
TTTCCAAGGACATGGAAATTGTCAAAGTCTTAAAGAAACCTGGGAAAGCGGATTCTTCAT
TGATGATCGTATCTATGTTATACTTTGGTATAACGATGGAAGCATCTTCTTCTACCTTAA
ATGGTTCTATTGATGCTATATATGGACATCAAATCGTTTTTAAGAATAAAAGTGGAGGTA
AGCCTGACTGCAATTTCTAGAGATCCTAGCCTCCACGAGGGACCATTGCCTTTCTTCAAA
CCACCACAAGTGTTACACTGCCGCCGCCGCGGCTTTCCGTTGATGCAGCTGAGGGAAATA
ATTCCGCGAAGCAAAATGTTCTATATTTTTATATTTTTAGCTAAAAATGTATATTTTTGT
TTTCAAAAAATTATCATGTCACAAACGGAAATTGTATGTGGTTATATTTTCTTACATATA
ACTACATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW46TF U 371
AF RR4EW46JQ C 1
BS 1 378 RR4EW46JQ
BS 379 566 RR4EW46TF
BS 567 792 RR4EW46JQ

RD RR4EW46TF 196 0 0
ATGGAAAT
TTGTCAAAGTCTTAAAGAAACCTGGGAAAGCGGATTCTTCATTGATGATCGTATCTATGT
TATACTTTGGTATAACGATGGAAGCATCTTCTTCTACCTTAAATGGTTCTATTGATGCTA
TATATGGACATCAAATCGTTTTTAAGAATAAAAGTGGAGGTAAGCCTGACTGCAATTTCT
AGAGATCC

QA 9 196 9 196
DS 

RD RR4EW46JQ 792 0 0
GAGGTCTCAAATAGTTATATGTGACAGGTTAGACATATCTCTGAGCAGCTTGGCCCGTGC
CTGAGCAAGTTGAACTCGCTTAAAGGCTTTGATTCCTTCCTTTATAAGGCTTCTGTACGT
GGAGAGCTTCGAGATATAGCTCACCAAGGCAGATCTCAGTTCCTCATAGAGTGCAGAGGT
CTCCAGTATCTCCTCAAAATCCGAACGAGTCACGAGCTCACGCGCCATTATACCACGAAA
CTGTTTTAGGATTAATTTCAGCTTCTCTACCGTGTCTGAAGATTCCTTAGAAGATTTTCC
TACGTTTACACTTGAGAGTCCTACATTTCATAGTTAGAGATGAGTTAAAGAGGCTTTAAT
TTTCCAAGGACATGGAAATTGTCAAAGTCTTAAAGAAACCTGGGAA*GCGGATTCTTCAT
TGATGATCGTATCTATGTTATACTTTGGTATAACGATGGAAGCATCTTCTTCTACCTTAA
ATGGTTCTATTGATGCTATATATGGACATCAAATCGTTTTTAAGAATAAAAGTGGAGGTA
AGCCTGACTGCAATTTCTAGAGATCCTAGCCTCCACGAGGGACCATTGCCTTTCTTCAAA
CCACCACAAGTGTTACACTGCCGCCGCCGCGGCTTTCCGTTGATGCAGCTGAGGGAAATA
ATTCCGCGAAGCAAAATGTTCTATATTTTTATATTTTTAGCTAAAAATGTATATTTTTGT
TTTCAAAAAATTATCATGTCACAAACGGAAATTGTATGTGGTTATATTTTCTTACATATA
ACTACATTTACC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6273Contig1 583 2 3 U
CTAAGAGGGGATTACATGTTGATAAGTTGATAACAAAGCAAGTTCTATAGGTTCAGACAT
AACAAAGCAGCGAGAAATAGAAAGAATGTACATAGTAGACCGAGGCATCAAGGTTCAGAG
ATATGGTAGAGCTCCAAGCGCATTAGAAGATCCCGAACGTGTTCTCCCCACTGTAACTCA
TGTAGAGAAACCCATCTTCGTCTTTGTGCTCTTCATAAATCGAAGACATAATCGCAGCAG
TAGGGGGAAGAATGTTCTTGACGAAAATGAAGATGGCTTTCTCAGGACTGAGCTTGATCC
TCTTGCGGACAACATAAACAAACTGACCAACAGTCAGATCAGCTGGGACCAAGTACTTTT
TCTTATCAATATCAGGGACATCACTCTTCTCGGCTCTTTCGACAATGACGGGTATTCTAT
CTGGATACTTGTCCCTGATACGAGCAGCTTCAGCCTGTCTCTTTTCGAGAGGATGCTCTT
GCTTGAAGGAACTGATCGCCATAATTGCACGAGTTTCGCTGACAAGGGATGAATGAAGAA
GAGAATTGAGAAGGAGGGTTTGCTAAACGTCGGATTAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AX78JQ U 274
AF RR4AX78TF C 1
BS 1 273 RR4AX78TF
BS 274 460 RR4AX78JQ
BS 461 583 RR4AX78TF

RD RR4AX78JQ 187 0 0
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TCAGATCAGCTGGGACCAAGTACTTTTTCTTATCAATATCAGGGACATCACTCTTCTCGG
CTCTTTCGACAATGACGGGTATTCTATCTGGATACTTGTCCCTGATACGAGCAGCTTCAG
CCTGTCT

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR4AX78TF 583 0 0
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AACAAAGCAGCGAGAAATAGAAAGAATGTACATAGTAGACCGAGGCATCAAGGTTCAGAG
ATATGGTAGAGCTCCAAGCGCATTAGAAGATCCCGAACGTGTTCTCCCCACTGTAACTCA
TGTAGAGAAACCCATCTTCGTCTTTGTGCTCTTCATAAATCGAAGACATAATCGCAGCAG
TAGGGGGAAGAATGTTCTTGACGAAAATGAAGATGGCTTTCTCAGGACTGAGCTTGATCC
TCTTGCGGACAACATAAACAAACTGACCAACAGTCAGATCAGCTGGGACCAAGTACTTTT
TCTTATCAATATCAGGGACATCACTCTTCTCGGCTCTTTCGACAATGACGGGTATTCTAT
CTGGATACTTGTCCCTGATACGAGCAGCTTCAGCCTGTCTCTTTTCGAGAGGATGCTCTT
GCTTGAAGGAACTGATCGCCATAATTGCACGAGTTTCGCTGACAAGGGATGAATGAAGAA
GAGAATTGAGAAGGAGGGTTTGCTAAACGTCGGATTAGGATCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6275Contig1 780 2 2 U
GGGCATGATTTATAACAAACCTATACTAAAACCAAAAAGAAAAACTCATGGCTAAGCTCA
TTTTCTTCATCTCCCTCCAAATCCTCCTCCTCTCCGTCGTTTCTTCCACTGGAGATGATG
GAGAAAACTTTGCAAGAACCATAGATAGGAAACTTCTCAGTCTTCACAGGAAAGAGAAGC
TAACACATTTCAAAGTCTATTGGCACGACATCTTAAGCGGTCCAAACCCAACCTCCATTA
TGATCCAGCCACCGGTTACAAACTCTACTACCTACTTTGGAGGAATCACTATGATCGACA
ACGCTTTGACTGCGAAAGTCCCGACGAACTCCACGTTAGTTGGCCAGGCCCAAGGGTTTT
ACGCCGGAGCGGCCCAAAAGGAGTTAGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGTTTTTAAGA
CAGGGAAGTACAACGGAAGCACGATCACGATTCTTGGTCGGAACACCCCATTTTCGGAGG
TCAGAGAAATGCCGATCGTTGGAGGAAGTGGGCTTTTCAGATTTGCCAGAGGCTATGTCG
AGGCTCGGACAAAGTGGTTTAATATCAAGAACGGTGATCTACTGTTGAGTATAGTTGTTA
TGTTCTGCATTATTGATGTTTTTGTCGTGCTTATATATTTAATCCGACGACGTAATAATA
TAACAAGATTTTTATTATGTTATGTTTTATTTGCATTTGGCTTATGGTGTGTGTCGTGTG
GATTTGTTCTACTGATTATGTCGTTTGTTAAATTAATAATATTGATATTTGTTTTCTTCC


BQ
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AF RR4CJ49TF U 1
AF RR4CJ49JQ C 93
BS 1 282 RR4CJ49TF
BS 283 780 RR4CJ49JQ

RD RR4CJ49TF 282 0 0
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TTTTCTTCATCTCCCTCCAAATCCTCCTCCTCTCCGTCGTTTCTTCCACTGGAGATGATG
GAGAAAACTTTGCAAGAACCATAGATAGGAAACTTCTCAGTCTTCACAGGAAAGAGAAGC
TAACACATTTCAAAGTCTATTGGCACGACATCTTAAGCGGTCCAAACCCAACCTCCATTA
TGATCCAGCCACCGGTTACAAACTCTACTACCTACTTTGGAG

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4CJ49JQ 688 0 0
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CTTCTCAGTCTTCACAGGAAAGAGAAGCTAACACATTTCAAAGTCTATTGGCACGACATC
TTAAGCGGTCCAAACCCAACCTCCATTATGATCCAGCCACCGGTTACAAACTCTACTACC
TACTTTGGAGGAATCACTATGATCGACAACGCTTTGACTGCGAAAGTCCCGACGAACTCC
ACGTTAGTTGGCCAGGCCCAAGGGTTTTACGCCGGAGCGGCCCAAAAGGAGTTAGGTTTT
CTAATGGCGATGAACTTTGTTTTTAAGACAGGGAAGTACAACGGAAGCACGATCACGATT
CTTGGTCGGAACACCCCATTTTCGGAGGTCAGAGAAATGCCGATCGTTGGAGGAAGTGGG
CTTTTCAGATTTGCCAGAGGCTATGTCGAGGCTCGGACAAAGTGGTTTAATATCAAGAAC
GGTGATCTACTGTTGAGTATAGTTGTTATGTTCTGCATTATTGATGTTTTTGTCGTGCTT
ATATATTTAATCCGACGACGTAATAATATAACAAGATTTTTATTATGTTATGTTTTATTT
GCATTTGGCTTATGGTGTGTGTCGTGTGGATTTGTTCTACTGATTATGTCGTTTGTTAAA
TTAATAATATTGATATTTGTTTTCTTCC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6276Contig1 1140 2 2 U
GGGCTGACAAAGAAAAAAACCTATCCGCGGTTTCACTTTCATCTTAATTAGGGTTAACTC
TCCTTCCTTATCGCCGTCGTCTCAAGAAGATTTGAAATATGCCTCGATTTGATGATCGTT
ATGGAAACACTCGCCTCTACGTTGGCCGGTTGTCATCTAGAACCCGCAGCAGGGATCTTG
AGCGTCTTTTCAGCAGATACGGAAGAGTACGGGATGTTGATATGAAGCGCGACTATGCCT
TTGTTGAATTTAGCGATCCTCGTGATGCTGATGACGCAAGATACTACTTAGATGGACGAT
ACTTCGATGGAAGTCGCATCACTGTCGAGGCTTCCAGAGGGGCTCCTCGTGGTTCTCGGG
ATGGTGGTAGCAGAGGTCCACCTCCTGGTTCTGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGATG
GTCATTGGGCTAGAGACTGCACAGCAGGTGACTGGAAGAACAAATGTTACCGATGTGGTG
AAAGAGGACACATCGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCTAGTCCTAAGAAGGCCAGGCGTG
GTGGAAGCTACTCCAGGTCACCAGTTAAATCCCGCTCCCCTCGCCGCAGAAGAAGCCCAA
GCCGTAGCCGTAGTTACAGCCGTGGTCGTAGCTACAGTCGTTCACGATCGCCAGTGAGAA
GAGAGAGAAGCGTGGAGGATAGATCACTCAGTCCCAAGGCAATGGAGCGATCCGTATCTC
CCACAGGCAAAGACCAAAGCCTTAGTCCAGAGCGAAGAGCCGTAGATGCAAGCCCAAAAC
TAGAAAAGCAAGTTGGGCCGACTATGAAGCCAGCCCAAGGGAGAATGGTAATGGCAAGAA
CTCGGTGAGTCCCATTGCGGGAGGTGAAGAAAGTCCTGCTCAAGACAGGAGCCCCATTGA
TGATGAGCCTGAGCTTAACCGTTCTTCCCCTAAAGGCAGCGAGTCACCGTGATGGCTCTT
TACCCCCAAACAGGGTAAGAAGCTCAATGTATCATTGTGTGTCAATTGGGTGTTGTTCCT
TCTTTGAACTTTTTCGTTGTGGACTCGTTGGTTTGTCTTGAGACAACTTTTAAACTTTGT
TATGTTTCATAAACTTGTTTTTAGCAAAACATATTTATAATATTCTCGTTTGTAAACTCT


BQ
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AF RR4ET50TF U 1
AF RR4ET50JQ C 482
BS 1 668 RR4ET50TF
BS 669 1140 RR4ET50JQ

RD RR4ET50TF 675 0 0
GGGCTGACAAAGAAAAAAACCTATCCGCGGTTTCACTTTCATCTTAATTAGGGTTAACTC
TCCTTCCTTATCGCCGTCGTCTCAAGAAGATTTGAAATATGCCTCGATTTGATGATCGTT
ATGGAAACACTCGCCTCTACGTTGGCCGGTTGTCATCTAGAACCCGCAGCAGGGATCTTG
AGCGTCTTTTCAGCAGATACGGAAGAGTACGGGATGTTGATATGAAGCGCGACTATGCCT
TTGTTGAATTTAGCGATCCTCGTGATGCTGATGACGCAAGATACTACTTAGATGGACGAT
ACTTCGATGGAAGTCGCATCACTGTCGAGGCTTCCAGAGGGGCTCCTCGTGGTTCTCGGG
ATGGTGGTAGCAGAGGTCCACCTCCTGGTTCTGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGATG
GTCATTGGGCTAGAGACTGCACAGCAGGTGACTGGAAGAACAAATGTTACCGATGTGGTG
AAAGAGGACACATCGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCTAGTCCTAAGAAGGCCAGGCGTG
GTGGAAGCTACTCCAGGTCACCAGTTAAATCCCGCTCCCCTCGCCGCAGAAGAAGCCCAA
GCCGTAGCCGTAGTTACAGCCGTGGTCGTAGCTACAGTCGTTCACGATCGCCAGTGAGAA
GAGAGAGA
GCGTGGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4ET50JQ 659 0 0
AAGAGGACACATCGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCTAGTCCTAAGAAGGCCAGGCGTGG
TGGAAGCTACTCCAGGTCACCAGTTAAATCCCGCTCCCCTCGCCGCAGAAGAAGCCCAAG
CCGTAGCCGTAGTTACAGCCGTGGTCGTAGCTACAGTCGTTCACGATCGCCAGTGAGAAG
AGAGAGAAGCGTGGAGGATAGATCACTCAGTCCCAAGGCAATGGAGCGATCCGTATCTCC
CACAGGCAAAGACCAAAGCCTTAGTCCAGAGCGAAGAGCCGTAGATGCAAGCCCAAAACT
AGAAAAGCAAGTTGGGCCGACTATGAAGCCAGCCCAAGGGAGAATGGTAATGGCAAGAAC
TCGGTGAGTCCCATTGCGGGAGGTGAAGAAAGTCCTGCTCAAGACAGGAGCCCCATTGAT
GATGAGCCTGAGCTTAACCGTTCTTCCCCTAAAGGCAGCGAGTCACCGTGATGGCTCTTT
ACCCCCAAACAGGGTAAGAAGCTCAATGTATCATTGTGTGTCAATTGGGTGTTGTTCCTT
CTTTGAACTTTTTCGTTGTGGACTCGTTGGTTTGTCTTGAGACAACTTTTAAACTTTGTT
ATGTTTCATAAACTTGTTTTTAGCAAAACATATTTATAATATTCTCGTTTGTAAACTCT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6277Contig1 935 2 2 U
GGACTCTCTCTCCTCCGTAGGCTTCGAAAACCCTAAATCCCCAAAAAGGAATCGGAGATC
TCGATCCGATTCGATCCGATTGCAGATGTCGTCGTCTTCTCCGAGTGGTAGCGGTGGCGA
TTTAAGCGAGAGAAGAGGGATTCCCGCCGCGAAATTCATCCAAGATGTGGAGACTTATCT
CTCACAATCCGGCTTCGATTCGAACTCTGCTCTCGCCTTCCATCAAGAAAGGCTTCAGCA
ATATAAAGTTGTTGAGATGAAGCTTCTAGCCCAGCAAAGGGATCTTCAGGCTAAGATCCC
AGATATTGAGAAGTGTTTGGAGGTTGTTGCCACTTTGGAAGCAAGGAAGGGTACTGGTGA
GTCGCTTTTAGCCGACTTCGAAGTGTCTGAAGGAATATATTCACGGGCATGTATTGAGGA
CACAGACTCAGTCTGTTTGTGGTTGGGAGCAAATGTCATGCTGGAATATTCCTGTGAAGA
GGCTACAGCCCTTCTGAAAAACAATCTGGAAAATGCTAAAGCCAGCCTGGAGGTTCTTGT
AACTGATCTACAGTTCTTGAGGGATCAAGTCACAGTTACTCAGGTAACTATAGCGCGTAT
TTATAACTATGATGTTCATCAAAGGAGGGTTAAACAAGTTACCCCTACTGCTGTTGCTGC
TGCAGACTCATGAATCAGAGTTCCAAATTATAATCGTTAAATGGAGGTATTATGATATAT
TGCAACACGGTTTGACCTAACCGGTTGTTTGTAACTCTGATTTTTGCTACACATATAAAG
TTTTGTTTCTGCTATGAACATATGAATAGAACATTAGCATTGCATTCATCGTTTCTCTTG
TGTTATTGGAGTTTTGAGACCTATTTGTATTTTTTTTTTGAAACACGAGACCTATTTGTA
TGTTTTTACATTTAAGGATGTGACAACTATTTGCC


BQ
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AF RR4B089TF U 1
AF RR4B089JQ C 93
BS 1 805 RR4B089TF
BS 806 935 RR4B089JQ

RD RR4B089TF 805 0 0
GGACTCTCTCTCCTCCGTAGGCTTCGAAAACCCTAAATCCCCAAAAAGGAATCGGAGATC
TCGATCCGATTCGATCCGATTGCAGATGTCGTCGTCTTCTCCGAGTGGTAGCGGTGGCGA
TTTAAGCGAGAGAAGAGGGATTCCCGCCGCGAAATTCATCCAAGATGTGGAGACTTATCT
CTCACAATCCGGCTTCGATTCGAACTCTGCTCTCGCCTTCCATCAAGAAAGGCTTCAGCA
ATATAAAGTTGTTGAGATGAAGCTTCTAGCCCAGCAAAGGGATCTTCAGGCTAAGATCCC
AGATATTGAGAAGTGTTTGGAGGTTGTTGCCACTTTGGAAGCAAGGAAGGGTACTGGTGA
GTCGCTTTTAGCCGACTTCGAAGTGTCTGAAGGAATATATTCACGGGCATGTATTGAGGA
CACAGACTCAGTCTGTTTGTGGTTGGGAGCAAATGTCATGCTGGAATATTCCTGTGAAGA
GGCTACAGCCCTTCTGAAAAACAATCTGGAAAATGCTAAAGCCAGCCTGGAGGTTCTTGT
AACTGATCTACAGTTCTTGAGGGATCAAGTCACAGTTACTCAGGTAACTATAGCGCGTAT
TTATAACTATGATGTTCATCAAAGGAGGGTTAAACAAGTTACCCCTACTGCTGTTGCTGC
TGCAGACTCATGAATCAGAGTTCCAAATTATAATCGTTAAATGGAGGTATTATGATATAT
TGCAACACGGTTTGACCTAACCGGTTGTTTGTAACTCTGATTTTTGCTACACATATAAAG
TTTTGTTTCTGCTATGAACATATGA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4B089JQ 843 0 0
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AATTCATCCAAGATGTGGAGACTTATCTCTCACAATCCGGCTTCGATTCGAACTCTGCTC
TCGCCTTCCATCAAGAAAGGCTTCAGCAATATAAAGTTGTTGAGATGAAGCTTCTAGCCC
AGCAAAGGGATCTTCAGGCTAAGATCCCAGATATTGAGAAGTGTTTGGAGGTTGTTGCCA
CTTTGGAAGCAAGGAAGGGTACTGGTGAGTCGCTTTTAGCCGACTTCGAAGTGTCTGAAG
GAATATATTCACGGGCATGTATTGAGGACACAGACTCAGTCTGTTTGTGGTTGGGAGCAA
ATGTCATGCTGGAATATTCCTGTGAAGAGGCTACAGCCCTTCTGAAAAACAATCTGGAAA
ATGCTAAAGCCAGCCTGGAGGTTCTTGTAACTGATCTACAGTTCTTGAGGGATCAAGTCA
CAGTTACTCAGGTAACTATAGCGCGTATTTATAACTATGATGTTCATCAAAGGAGGGTTA
AACAAGTTACCCCTACTGCTGTTGCTGCTGCAGACTCATGAATCAGAGTTCCAAATTATA
ATCGTTAAATGGAGGTATTATGATATATTGCAACACGGTTTGACCTAACCGGTTGTTTGT
AACTCTGATTTTTGCTACACATATAAAGTTTTGTTTCTGCTATGAACATATGAATAGAAC
ATTAGCATTGCATTCATCGTTTCTCTTGTGTTATTGGAGTTTTGAGACCTATTTGTATTT
TTTTTTTGAAACACGAGACCTATTTGTATGTTTTTACATTTAAGGATGTGACAACTATTT
GCC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 2

CO CL6278Contig1 1010 2 2 U
GCAAGAATCTCTGGCTCGAAACCGAAGCTGCCTTACGTTCCTCGACTTGCATGGCTCGCT
ATCATCGTATCAAGAACGAGATTGATAATCTCAAATTGCAGAACAGTGAGGTCTCTGCAG
ATGCATCAACCTTTATGCAGGAACCTGTTCTTAACCCGCAGAAATCGGTTTCCATCATGA
AAACTGTAGAGCCGGATACGACTGAATCACTCATCAAACATGGTGGGAACAGTGTAGTAA
CAATGAGTCATGACGCACCACAAAGCTTTAAATTCAACTCTAATCCCGTGGATGCAGTGT
TTTCACTTATGTCCAGAAGCTTTACCGGTGGTTCAGAACAGGAAAATCATGGGGACGTCA
AGCCTGATGCTCAGAAAAAATATGATGATGTTATAGACAGGTTTCAGATTCTGAAGCATC
TGGAAACAAAGCGCAAACTCAAATCTCAGAACTGCCCGGATTCAGATATTGGTGTTATAG
ACAGGGTTCAGATTCTGAAGCCGCAGGAAACAGATTGCAAACTCAATGCTCAGAACTTCA
CAGAGACAAGAATGGAGAATCCAGATCAAGCTTCGGAGATGGCTAAAACTGGCAGAAGCA
GCCATGTGGCTGATGTAATGGATAGATTCCAGATACTAAAACGCCGAGAAGCTGAGCAAG
TACAGAAGTCTCTCAACAGCTTGGACATAGATTCAGATTCAGGAGACGATCAGCCAAGAA
ACAAGACGCAAATTTGTGATCACCTCTGGCCAGACTCGATGATGACACTAGGTAGAGTTT
CACAGATAGAGATGCACGTCGGCGCTGAACCAGCTGCATACTCGGACTGGGAACATGTCA
TCAAGGATGATTGATGTCATCTACTGGAACTTCCTTGGACAAGAAGTTTCGATCCTTTTT
TTAATGGCTTTGTTTGTGTATAAATAAAACGGCCTAGTGCGACTGACGGTAAATGAAACT
GTGGATTGGTATTTGCTGTTTTTAAATGTGATTGTGTTTGTTCCTAAGTC


BQ
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AF RR4GE11TF U 1
AF RR4GE11JQ C 387
BS 1 576 RR4GE11TF
BS 577 1010 RR4GE11JQ

RD RR4GE11TF 576 0 0
GCAAGAATCTCTGGCTCGAAACCGAAGCTGCCTTACGTTCCTCGACTTGCATGGCTCGCT
ATCATCGTATCAAGAACGAGATTGATAATCTCAAATTGCAGAACAGTGAGGTCTCTGCAG
ATGCATCAACCTTTATGCAGGAACCTGTTCTTAACCCGCAGAAATCGGTTTCCATCATGA
AAACTGTAGAGCCGGATACGACTGAATCACTCATCAAACATGGTGGGAACAGTGTAGTAA
CAATGAGTCATGACGCACCACAAAGCTTTAAATTCAACTCTAATCCCGTGGATGCAGTGT
TTTCACTTATGTCCAGAAGCTTTACCGGTGGTTCAGAACAGGAAAATCATGGGGACGTCA
AGCCTGATGCTCAGAAAAAATATGATGATGTTATAGACAGGTTTCAGATTCTGAAGCATC
TGGAAACAAAGCGCAAACTCAAATCTCAGAACTGCCCGGATTCAGATATTGGTGTTATAG
ACAGGGTTCAGATTCTGAAGCCGCAGGAAACAGATTGCAAACTCAATGCTCAGAACTTCA
CAGAGACAAGAATGGAGAATCCAGATCAAGCTTCGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4GE11JQ 624 0 0
GATGTTATAGACAGGTTTCAGATTCTGAAGCATCTGGAAACAAAGCGCAAACTCAAATCT
CAGAACTGCCCGGATTCAGATATTGGTGTTATAGACAGGGTTCAGATTCTGAAGCCGCAG
GAAACAGATTGCAAACTCAATGCTCAGAACTTCACAGAGACAAGAATGGAGAATCCAGAT
CAAGCTTCGGAGATGGCTAAAACTGGCAGAAGCAGCCATGTGGCTGATGTAATGGATAGA
TTCCAGATACTAAAACGCCGAGAAGCTGAGCAAGTACAGAAGTCTCTCAACAGCTTGGAC
ATAGATTCAGATTCAGGAGACGATCAGCCAAGAAACAAGACGCAAATTTGTGATCACCTC
TGGCCAGACTCGATGATGACACTAGGTAGAGTTTCACAGATAGAGATGCACGTCGGCGCT
GAACCAGCTGCATACTCGGACTGGGAACATGTCATCAAGGATGATTGATGTCATCTACTG
GAACTTCCTTGGACAAGAAGTTTCGATCCTTTTTTTAATGGCTTTGTTTGTGTATAAATA
AAACGGCCTAGTGCGACTGACGGTAAATGAAACTGTGGATTGGTATTTGCTGTTTTTAAA
TGTGATTGTGTTTGTTCCTAAGTC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6279Contig1 1081 2 2 U
GGATCGTTTGTGGTCCATGCAATACCTGACTGCGCGAAAACCCTGGGTCGGTGATAAAAG
AGTTTGTGTTCTTCATATTCTTCGATCGGCGGAGCCTTCCAGTTACGTAACGGAAGTGTC
ATGATTACTCTGCCTTAAATCCTATCATCTTTAATCTCATTAAATCATAAGCCCACTACG
ATATTTTCAGATGCGTTATTCAGATGGCGAGTCCGGTATAAATAGTCCAGCCGATGTTCA
AAGGTTGTCGTGCGAGACTTCTGAGATTCTGGGAGGCTAAGAACATTAAGCGCGGTGGAG
AGCTTATGTGGATGGATTTGCTAATGGTGGATGTTAACGGGACCATGATTGCAATCTACT
ATCAGAGCTAGCCGTCTTCCACAATACCGTGAAAGACTCACCGCCGGAACAATGTTCTCC
GTCTCCGGTTTTGATATCTCAAGATGTGCGCAGAACTTCCGGCTCACAGATTCTTCTTTG
ATGATTCGGTTTAACGAGTCCACCTCTTTCAAAGAGCTAACTGAGCCTGTCTCTCGTATT
TCGGTTCTGTAACCAGTATGAGCTGATTTGTTTAGCCAATACAAATACTCAATTGCCAGG
TGAAATAATTGGTGTGAAAATCTCAGTAAGTGATCCTCCGGAAGATAGAAACCTTGTCAT
GGTGACTATGAAAAGTCTATTGATCCAACAAATTAAAGCTTGGATTCCTCACTTGGCGGG
TGCCTCACGGAAAGTCTACGGTGTTCGAGAGGATCTTATTTTGCGCAACTTGGGCAATAT
CTTAATACGACAGTCTGTTATTGATGAGTTCATTGTTGATCCCAACTCTGAAGAGAAGGT
TCTTATTCATGAGAACCGAACCCACCCGGACCCGGGCAAACCCGACTCGAACCCGCCCCG
AAATTTTATAATACCCGAATGGGGTGTAATTTCAAAACCCGAATGAGGTTTAATTTCAAA
ACCCAAAAACTCGATATCCGAAAGAACCGATCCGAACCCGAATGGGTATCCGAACGTCCA
GGTCTAATGAGTATTTATGTTTAGAAAATTAAACTTTATTTTTAATGAATTAAGTTGGTA
T


BQ
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10 

AF RR4G924TF U 1
AF RR4G924JQ C 435
BS 1 624 RR4G924TF
BS 625 1081 RR4G924JQ

RD RR4G924TF 624 0 0
GGATCGTTTGTGGTCCATGCAATACCTGACTGCGCGAAAACCCTGGGTCGGTGATAAAAG
AGTTTGTGTTCTTCATATTCTTCGATCGGCGGAGCCTTCCAGTTACGTAACGGAAGTGTC
ATGATTACTCTGCCTTAAATCCTATCATCTTTAATCTCATTAAATCATAAGCCCACTACG
ATATTTTCAGATGCGTTATTCAGATGGCGAGTCCGGTATAAATAGTCCAGCCGATGTTCA
AAGGTTGTCGTGCGAGACTTCTGAGATTCTGGGAGGCTAAGAACATTAAGCGCGGTGGAG
AGCTTATGTGGATGGATTTGCTAATGGTGGATGTTAACGGGACCATGATTGCAATCTACT
ATCAGAGCTAGCCGTCTTCCACAATACCGTGAAAGACTCACCGCCGGAACAATGTTCTCC
GTCTCCGGTTTTGATATCTCAAGATGTGCGCAGAACTTCCGGCTCACAGATTCTTCTTTG
ATGATTCGGTTTAACGAGTCCACCTCTTTCAAAGAGCTAACTGAGCCTGTCTCTCGTATT
TCGGTTCTGTAACCAGTATGAGCTGATTTGTTTAGCCAATACAAATACTCAATTGCCAGG
TGAAATAATTGGTGTGAAAATCTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4G924JQ 647 0 0
TATCTCAAGATGTGCGCAGAACTTCCGGCTCACAGATTCTTCTTTGATGATTCGGTTTAA
CGAGTCCACCTCTTTCAAAGAGCTAACTGAGCCTGTCTCTCGTATTTCGGTTCTGTAACC
AGTATGAGCTGATTTGTTTAGCCAATACAAATACTCAATTGCCAGGTGAAATAATTGGTG
TGAAAATCTCAGTAAGTGATCCTCCGGAAGATAGAAACCTTGTCATGGTGACTATGAAAA
GTCTATTGATCCAACAAATTAAAGCTTGGATTCCTCACTTGGCGGGTGCCTCACGGAAAG
TCTACGGTGTTCGAGAGGATCTTATTTTGCGCAACTTGGGCAATATCTTAATACGACAGT
CTGTTATTGATGAGTTCATTGTTGATCCCAACTCTGAAGAGAAGGTTCTTATTCATGAGA
ACCGAACCCACCCGGACCCGGGCAAACCCGACTCGAACCCGCCCCGAAATTTTATAATAC
CCGAATGGGGTGTAATTTCAAAACCCGAATGAGGTTTAATTTCAAAACCCAAAAACTCGA
TATCCGAAAGAACCGATCCGAACCCGAATGGGTATCCGAACGTCCAGGTCTAATGAGTAT
TTATGTTTAGAAAATTAAACTTTATTTTTAATGAATTAAGTTGGTAT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL6280Contig1 335 2 5 U
GGGATAAATAGTTGTTAAGGCGACAATTAAAGGCCCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGATTGCCAGTTTACCATTATTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCA
TGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATG
AATTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCCATACATTTACCACAATTCCTATATGAGCT
TCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCCTTTTTCTTA
TCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G862JQ U 71
AF RR4G862TF C 1
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BS 71 110 RR4G862JQ
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TATATGAATTTATCTTTACCCATACATTTACCACAATTCCTATATGAGCTTCCATTTATG
AACTTTCATCATC

QA 1 193 1 193
DS 

RD RR4G862TF 335 0 0
GGGATAAATAGTTGTTAAGGCGACAATTAAAGGCCCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGATTGCCAGTTTACCATTATTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCA
TGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATG
AATTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCCATACATTTACCACAATTCCTATATGAGCT
TCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCCTTTTTCTTA
TCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACC

QA 1 335 1 335
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6282Contig1 1476 2 6 U
GGTGCAAGCTTGGAACTCGCAGTATTTTCAAGGAAGGTCTAAGGTTGTGGTTGCTCGACC
AGCTTATGGTCTTGATGGTCACCACGTTGTGCACCAGTCACTAGGCTTGCCGGTTAGGAG
TTTAAGGTCGGGTTTGAGAGACGATGCAGCTGTTGAGGACAAGGAGAAAGCTGAGGAAGA
GTCACTGGCTGCTCCTTCTTCTCCATGGCATTCTAGTCCTGAAATGATGGGAATGGGAGA
CGATGAAACCCAGTTTACGACCCGGCGGTCTAGTGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCATCACAAACTAGCTTTGAGTCCAATGACCAGAAGAACAGATACTCGCCTTCTCGTTC
TGTCTCTGAAGAGTCGTTAAACTACAATGTGGAGGAGAAGAGTCTTCAGGGTTCATCACG
GTCTAGTTCGCCGTCATTGCAACCATCACCATCACTATCTCCACCATCTCCAGAGTTAGT
TACCGATGATTCTCACAGGCGTGTGTTACATTCTCGGCATTACAGTGATGGTTCTTTGTT
AGGATGTGAAGATAAACTAGACGGACCAGGATCTGAATCAGTTAAGCTCACTCGCAGATC
TTATCCTCCTGATGGTTCTGATCATTCCACTACTAGTAGAAGACGGTATCTTCAGCAGAA
GAGCGATAGCCATTTGTTTGAGAAAGGATTAGAGTCTGATGACCATAACAAGATGAGTGT
CAAGAAGGTGCGGAGCCACGAGTCTTTGGAGTTCCAACCAAGGCGTGCAATGCGTTCTTC
ACGAGGGGGCAGCGACACTTTGGTGGTGAAAGACAACAAAAAAAACTCAGCGGATGATGA
TGCTGACGACTCTGAGGATTATGATCTTCCTGGTGAGGAGAACAAGGAAGTGATATCAAA
CAGTCTGCAATCTTGGAGAGGTTCTAGTAAAGTTTCATCTAGAGGAAAGTCAGTGAGGAC
CATAAGATCTGACCGCAACCATGGTGATTCATCTGCTGATGACAGAGGGGAAAGTCATGG
AAGAACAAAACCAAGAAGACAATGGCAACAAGAACTAGCAATAGTACTACACCAGGAGAA
GCAGCATTCAGAGCCTGAAGATGATGCGGAAGAGACCGAGACCGAGGCTGAGCAACCCCA
AGAAACCTTAGAGGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCTTGGGAAAGCCAGAGCAATGTAAGCAA
TGAGCATTACGAAGTTGATAGAAAGGCTGATGAGTTCATAGCCAAGTTCAGAGAACAGAT
TAGGTTGCAGAAACTACATTCAGGTGAGCAGCAACGTAGAGGAGGTGGGACTGGCGTTAT
CAGAAACAGCCATTTCAGATGATACTACTACACTCACCATTGCTTCATTCACTTTGTATT
ATTTTGATGTAATAATTGTTTACAGTCATTGTTGATGAGAATCTTGAGTTCTCTCTGTTT
GAGATTTATATTGTTGAATAAAATGATTTTTTTTCG


BQ
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AF RR4BA08TF U 1
AF RR4BA08JQ C 617
BS 1 762 RR4BA08TF
BS 763 763 RR4BA08JQ
BS 764 788 RR4BA08TF
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BS 790 815 RR4BA08TF
BS 816 1476 RR4BA08JQ

RD RR4BA08TF 816 0 0
GGTGCAAGCTTGGAACTCGCAGTATTTTCAAGGAAGGTCTAAGGTTGTGGTTGCTCGACC
AGCTTATGGTCTTGATGGTCACCACGTTGTGCACCAGTCACTAGGCTTGCCGGTTAGGAG
TTTAAGGTCGGGTTTGAGAGACGATGCAGCTGTTGAGGACAAGGAGAAAGCTGAGGAAGA
GTCACTGGCTGCTCCTTCTTCTCCATGGCATTCTAGTCCTGAAATGATGGGAATGGGAGA
CGATGAAACCCAGTTTACGACCCGGCGGTCTAGTGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCATCACAAACTAGCTTTGAGTCCAATGACCAGAAGAACAGATACTCGCCTTCTCGTTC
TGTCTCTGAAGAGTCGTTAAACTACAATGTGGAGGAGAAGAGTCTTCAGGGTTCATCACG
GTCTAGTTCGCCGTCATTGCAACCATCACCATCACTATCTCCACCATCTCCAGAGTTAGT
TACCGATGATTCTCACAGGCGTGTGTTACATTCTCGGCATTACAGTGATGGTTCTTTGTT
AGGATGTGAAGATAAACTAGACGGACCAGGATCTGAATCAGTTAAGCTCACTCGCAGATC
TTATCCTCCTGATGGTTCTGATCATTCCACTACTAGTAGAAGACGGTATCTTCAGCAGAA
GAGCGATAGCCATTTGTTTGAGAAAGGATTAGAGTCTGATGACCATAACAAGATGAGTGT
CAAGAAGGTGCGGAGCCACGAGTCTTTGGAGTTCCAACCAAG*CGTGCAATGCGTTCTTC
ACGAGGGG*CAGCGACACTTTGGTGGTGAAAGACA
C

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4BA08JQ 860 0 0
TCTGATCATTCCACTACTAGTAGAAGACGGTATCTTCAGCAGAAGAGCGATAGCCATTTG
TTTGAGAAAGGATTAGAGTCTGATGACCATAACAAGATGAGTGTCAAGAAGGTGCGGAGC
CACGAGTCTTTGGAGTTCCAACCAAGGCGTGCAATGCGTTCTTCACGAGGGGGCAGCGAC
ACTTTGGTGGTGAAAGACAACAAAAAAAACTCAGCGGATGATGATGCTGACGACTCTGAG
GATTATGATCTTCCTGGTGAGGAGAACAAGGAAGTGATATCAAACAGTCTGCAATCTTGG
AGAGGTTCTAGTAAAGTTTCATCTAGAGGAAAGTCAGTGAGGACCATAAGATCTGACCGC
AACCATGGTGATTCATCTGCTGATGACAGAGGGGAAAGTCATGGAAGAACAAAACCAAGA
AGACAATGGCAACAAGAACTAGCAATAGTACTACACCAGGAGAAGCAGCATTCAGAGCCT
GAAGATGATGCGGAAGAGACCGAGACCGAGGCTGAGCAACCCCAAGAAACCTTAGAGGAG
GAAGAGGAAGTTGCTGCTTGGGAAAGCCAGAGCAATGTAAGCAATGAGCATTACGAAGTT
GATAGAAAGGCTGATGAGTTCATAGCCAAGTTCAGAGAACAGATTAGGTTGCAGAAACTA
CATTCAGGTGAGCAGCAACGTAGAGGAGGTGGGACTGGCGTTATCAGAAACAGCCATTTC
AGATGATACTACTACACTCACCATTGCTTCATTCACTTTGTATTATTTTGATGTAATAAT
TGTTTACAGTCATTGTTGATGAGAATCTTGAGTTCTCTCTGTTTGAGATTTATATTGTTG
AATAAAATGATTTTTTTTCG

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6283Contig1 1196 2 4 U
GGACACCTTCGGCGTATAGAACCCGATAAGCCGCTTTTGTACAGCTCCGCCGCATCCCCG
AAGCCAACACCAATGGCGTCTCTTCTCCAACCTTCATCTCGACTTCTTCTCCAGAGTCAA
ACTCAACAAAATGTTCGTCAACAATCGCTTCTCCCTCTCTCCTCCCCTAAAACACCGTTT
CTCGTCTCCTTACCCTCACTCCGTCCCTCGAGACCGAACCTCCACCTCTCCACTTCCGCG
TCGAAGAAACCATCGGAGATTTCCACGTCGGAGAACAAAAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAG
GAAGTAGAGGAGGACATGATGTGGATTCAGGAGAAGGCGCTTGACCTAGTCGAGTTCACC
GGTTCGGTGACTCAAGCGATTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCAGCAAGCTGCCGTGGATG
CTCGCCGTCCCTCTGGCTTACGCCGGCGTCACGTTCGTAACCGCCTTCGTCAAAACCGTT
AAGAAGTTCTCTTCTCCTAAAGCACAACGCAAGAAACTGGTGAATCAGAATGCTATGCTT
TGTAGATCTATAGACGAGCTGTTACAGAAAGAAGGGACAGTGAATAGCTCTGAGCTTAAG
GCAATTGAAGAAAAGACAGGGTTTAACATGATGGAGATGTTGAGGAAGTACGTTCGCTAT
GCGTTGAATGAGAAGCCGTTTAACCCTGATCTCGTTGCGAGTCTCATTCATCTCAGAAGA
GCTTCTGGTTTGGATGATTCTCAGATTCCTGAGATTTTGAATGAAATCTCTCGTCGTATT
GTTAAAGAAAAAGGTCCTGTTGTGATGAATATGCAAGGCTTTACAGAAAAGGGGTTCAAG
AGAAAACTAGCCGTGCAGGCGCTTTTTGGAAAAATCTACTATCTTTCCGAGCTTCCTGAC
TTCTGCTCAAAAGACAACTCGTTGATGGTCAAGTAAATATTCGGAGTTACAGACGAAGAC
GCGGAGAAGCTGCGGATCCACGCCCTTGCTGAAGCTGGAGACATAGACTCACTTGAGAAA
ATGGTGGAATTCGAGAAAGCGTCGGATTCTTCGTCGGATATAGAAGATACAAATGAAGAA
GACGACACCACTACTACTACCACCCCTTAAAGATTGTCTGTTCAAATACAACTTCAATAC
TAGATATTTTTCCAAGGTTTTTTTCTTCTGCTATTTGAGTTAATCACAGGTTGTCC


BQ
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AF RR4GG20TF U 1
AF RR4GG20JQ C 620
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CTCGTCTCCTTACCCTCACTCCGTCCCTCGAGACCGAACCTCCACCTCTCCACTTCCGCG
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G

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DS 

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CGTTGATGGTCAAGTAAATATTCGGAGTTACAGACGAAGACGCGGAGAAGCTGCGGATCC
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TTTTTCTTCTGCTATTTGAGTTAATCACAGGTTGTCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL6284Contig1 938 2 2 U
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ATTGTATCTCAAACTATTCAAACATTGCATCACAATTTCCTCCGACATATAACAACATCT
CTTTGGTCTCTCGAACCGGAAGAGACCTGCAACGTTACAACACCAATGGGTATCGTCAAG
TCGTCGGATGTATACCGTACCGATACAAGAACCACAGTGGTGGAGAGATCGAAGTGCTTT
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ATCTCGAGGAATCACTTGGGATGTGGCAGTACAAGAGCAAAAGAGACAGTATGATTCACG
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ATATAAAATGAATCATCAATCTTTTAGATCTTGAATAT


BQ
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AF RR4EH55TF U 1
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GACCAAAAAAAAAAAAAGACAACCAAACAAACAAAACGATGACGGAGTTATGTGTTTCTT
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CTTTGGTCTCTCGAACCGGAAGAGACCTGCAACGTTACAACACCAATGGGTATCGTCAAG
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ATGAATCAATTGAAGAAGCAGCTTTGAGAGAGACCATCGAGGAAGCTGGTGTTACGGGAC
ATCTCGAGGAATCACTTGGGATGTGGCAGTACAAGAGCAAAAGAGACAGTATGATTCACG
ACGGGTACATGTTTCCTATGCTCGTTGATCAGCAGTTTGAGCAATGGCCGGAGTCGGGGT
TCAGACAACGGAAGTGGGTTTGTTTGTCTGAAGCGATCGAGTTGTGTCGGAATGGGT

QA 1 597 1 597
DS 

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TTACGGGACATCTCGAGGAATCACTTGGGATGTGGCAGTACAAGAGCAAAAGAGACAGTA
TGATTCACGACGGGTACATGTTTCCTATGCTCGTTGATCAGCAGTTTGAGCAATGGCCGG
AGTCGGGGTTCAGACAACGGAAGTGGGTTTGTTTGTCTGAAGCGATCGAGTTGTGTCGGA
ATGGGTGGATGAGAGAAGCTTTGGAAGTGTTCATTAACCGGAAATGCCAAGGATAATGGC
AACATTTCATCTTCGTTTATTGAAGCTAGAGAGTTTAATCAGAGATAAAGATGATGATTG
CACACGCAACAAAAGACTTTTAAATTTTTCTTAAGAGCTTAATGGGAGTTATAAGAGAAG
ATCAAAGTTTAGTCTTGTGATTCGATTTATTCATTTGTTGGATAGGGTATTTGGTTAGAT
AGAAATCCTTCGAGATCCACTAATTGTTTGAAACCTTTGGCTTTCATGTAAATAACCTTT
AATTGTGTTATATAAAATGAATCATCAATCTTTTAGATCTTGAATAT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL6285Contig1 741 2 2 U
TTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAGGATGTCCAGTGG
CTCCGGACAATCACCAAAATGCCGATTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCA
AGGATAGCGGTTCAAGCTGGTGCAGCAGGAATCATTTGTGTCGAATCATGGAGCTCGCCA
GCTTGACTACGTCCCGGCAACAATCTCAGCCCTTGAAGAGGTTTGTGAAAGCAACACAAG
GACGAATCCCTGTCTTCTTGGATGGTGGTGTTCGTCGTGGCACAGATGTCTTCAAGGCAC
TTGCACTTGGAGCCTCAGGGATCTTTATTGGAAGACCAGTGGTGTTCTCACTTGCTGCTG
AAGGAGAGGCTGGAGTCAGAAAGGTGCTTCAAATGCTGCGTGATGAGTTTGAGCTGACCA
TGGCACTCAGTGGCTGCAGGAATCTCAAGGAAATCACCCGTAACCACATCACCACCGAAT
GGGACACCCCACGCCCTTCGGCCCCACGCCCTTCAGTAAGGTTATAGAGAGACCAAAACC
ACAACCACAACCAAAACCAGAGAAGAGCAACAGTACAGAACATTGGTTTCCTTCTACCTA
CACTCCATTCTTCTTATTGGTCACTTGGCTTCCTACTTTGCTATCTATCTCAAAACTTGT
TTCTCCCTATAATTGAAATCATATACAATGCCTAAAGATTCTGTAAAATGCTACTTGGCT
TCTTCTACCTACAGTCCCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CN52TF U 1
AF RR4CN52JQ C 55
BS 1 250 RR4CN52TF
BS 251 741 RR4CN52JQ

RD RR4CN52TF 250 0 0
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CTCCGGACAATCACCAAAATGCCGATTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCA
AGGATAGCGGTTCAAGCTGGTGCAGCAGGAATCATTTGTGTCGAATCATGGAGCTCGCCA
GCTTGACTACGTCCCGGCAACAATCTCAGCCCTTGAAGAGGTTTGTGAAAGCAACACAAG
GACGAATCCC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR4CN52JQ 687 0 0
CAGTGGCTCCGGACAATCACCAAAATGCCGATTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAG
GATGCAAGGATAGCGGTTCAAGCTGGTGCAGCAGGAATCATT*GTGTCGAATCATGGAGC
TCGCCAGCTTGACTACGTCCCGGCAACAATTTCAGCCCTTGAAGAGGTT*GTGAAAGCAA
CACAAGGACGAATCCCTGTCTTCTTGGATGGTGGTGTTCGTCGTGGCACAGATGTCTTCA
AGGCACTTGCACTTGGAGCCTCAGGGATCTTTATTGGAAGACCAGTGGTGTTCTCACTTG
CTGCTGAAGGAGAGGCTGGAGTCAGAAAGGTGCTTCAAATGCTGCGTGATGAGTTTGAGC
TGACCATGGCACTCAGTGGCTGCAGGAATCTCAAGGAAATCACCCGTAACCACATCACCA
CCGAATGGGACACCCCACGCCCTTCGGCCCCACGCCCTTCAGTAAGGTTATAGAGAGACC
AAAACCACAACCACAACCAAAACCAGAGAAGAGCAACAGTACAGAACATTGGTTTCCTTC
TACCTACACTCCATTCTTCTTATTGGTCACTTGGCTTCCTACTTTGCTATCTATCTCAAA
ACTTGTTTCTCCCTATAATTGAAATCATATACAATGCCTAAAGATTCTGTAAAATGCTAC
TTGGCTTCTTCTACCTACAGTCCCATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL6286Contig1 1402 2 8 U
GGATACACACCGTGACGCGTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCCTCCGCGTTTCTCTCTCGA
ACACTAAGTGGAGAAAGCGATAGACTTCCCGGAGAGGATGGTTTCGTTCGCTGGCTTCGC
CTTCGTCACTGGATTCTTGCTGGGACTCCTCGCCGTCGTTGCCACGGAAGTTGCCGCGTT
TCTGTACCTTGTGAAGCGGTTGAATCGGAAGAGAAATCTCCAGGGATCGAAGAGTTCAGA
TCCCACATTGAAAGGCTCTGATCCTCCTCCCAATTCAATTGATTTCAATCTCAACAAACA
GGGAGTGATTTGGGTATTGGAGTTGGATGAGAGTTTAAAGGAGAAGTTACCGAAAGAGCA
AAAGAAGAAGAACAATGTATTGGAGGTGCATCCCGTTAGGAAGTTTGCTCGGATCAAAGA
CCATAAGCTCCACTTATCCGACGCAGATGGCAACAAGACGGTTGTTACTTTGAAAGGTTG
CTCCGTTGAGGCTGTTTCAGGCTCTGAACTCCCCACAAGAAAATGGGCTAAAAGATTCCC
TATACAAGTAGAGAGCAAGGCTTCTGACTTGTACAAAGGGAACCGTGTGTTTTACATCTA
TCTCGAGACTTCTTGGGAGAAGGAGTCTTGGTGCAAAGCTCTTCGCCTCGCTGCTTCCAG
TGATCACGAGAGGTTTATCTGGTCAACCAAACTGAAAGACGAGTTCCGGAGCTATATGGC
TTCGCTTAACGCTGCATTCCGTGGATGATAGCTGAAAAGGATGATTGGGTCCAACGCAGT
GTCGCGCCTTTCATGTGGCTGAATCAAGGCTCAACTAGTGATCACGACAGCAGCTTCGAA
GCTGCAGAAGGGAAAGCTAAAGCTGAACAAACGAAGAAAACTACCAACGGTCCACAGAAA
CCAAGAGTTGAGGAAGAACCTGTGGCTGCACAACCACCAGCTAGCTCAGCAGCTCTTACA
GTAGAAAGTGACAAAATCTTGGAAGAACTCAAAACTCCGCTTCTGGAAAGCAGCGACAAG
CAGGAAACAGTAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGGCAACGACGGGGAGATTGTTCCGGTTAGT
GTCCAGCCACAGTCGAGGTCTATTGTAGCAACAAATGAAGAGGTTGATACGAGCTTCAAG
GGAAAGAAAATGGGAACAAAGGAGAGGATGTTTGATTTTAGGAAGAAAGTTGGGGAGAAG
TTTGAAGAGAAGAAGCGTCATATGGAGGAAAGAAGTAGACTGATTGTTGAAAAGATGAGA
GGACCTTGAAGAAGAAGAAGCTTCTTTTTCAGGTTTCAGACAAAAAGAACAAGAAAGTCA
ATATAGAGATTAGATTAGGACATTGTTGTTACTTGTATCCGTATATGTTTGGTGGAAAAT
ATCGAAAAGAACTCATTGCGGC


BQ
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AF RR4AK95TF U 1
AF RR4AK95JQ C 640
BS 1 802 RR4AK95TF
BS 803 803 RR4AK95JQ
BS 804 808 RR4AK95TF
BS 809 809 RR4AK95JQ
BS 810 813 RR4AK95TF
BS 814 814 RR4AK95JQ
BS 815 835 RR4AK95TF
BS 836 1402 RR4AK95JQ

RD RR4AK95TF 843 0 0
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ACACTAAGTGGAGAAAGCGATAGACTTCCCGGAGAGGATGGTTTCGTTCGCTGGCTTCGC
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TCTGTACCTTGTGAAGCGGTTGAATCGGAAGAGAAATCTCCAGGGATCGAAGAGTTCAGA
TCCCACATTGAAAGGCTCTGATCCTCCTCCCAATTCAATTGATTTCAATCTCAACAAACA
GGGAGTGATTTGGGTATTGGAGTTGGATGAGAGTTTAAAGGAGAAGTTACCGAAAGAGCA
AAAGAAGAAGAACAATGTATTGGAGGTGCATCCCGTTAGGAAGTTTGCTCGGATCAAAGA
CCATAAGCTCCACTTATCCGACGCAGATGGCAACAAGACGGTTGTTACTTTGAAAGGTTG
CTCCGTTGAGGCTGTTTCAGGCTCTGAACTCCCCACAAGAAAATGGGCTAAAAGATTCCC
TATACAAGTAGAGAGCAAGGCTTCTGACTTGTACAAAGGGAACCGTGTGTTTTACATCTA
TCTCGAGACTTCTTGGGAGAAGGAGTCTTGGTGCAAAGCTCTTCGCCTCGCTGCTTCCAG
TGATCACGAGAGGTTTATCTGGTCAACCAAACTGAAAGACGAGTTCCGGAGCTATATGGC
TTCGCTTAACGCTGCATTCCGTGGATGATAGCTGAAAAGGATGATTGGGTCCAACGCAGT
GTCGCGCCTTTCATGTGGCTGA*TCAAG*CTCA*CTAGTGATCACGACAGCAGCT
CGAGCTGC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4AK95JQ 763 0 0
TCTTCGCCTCGCTGCTTCCAGTGATCACGAGAGGTTTATCTGGTCAACCAAACTGAAAGA
CGAGTTCCGGAGCTATATGGCTTCGCTTAACGCTGCATTCCGTGGATGATAGCTGAAAAG
GATGATTGGGTCCAACGCAGTGTCGCGCCTTTCATGTGGCTGAATCAAGGCTCAACTAGT
GATCACGACAGCAGCTTCGAAGCTGCAGAAGGGAAAGCTAAAGCTGAACAAACGAAGAAA
ACTACCAACGGTCCACAGAAACCAAGAGTTGAGGAAGAACCTGTGGCTGCACAACCACCA
GCTAGCTCAGCAGCTCTTACAGTAGAAAGTGACAAAATCTTGGAAGAACTCAAAACTCCG
CTTCTGGAAAGCAGCGACAAGCAGGAAACAGTAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGGCAACGAC
GGGGAGATTGTTCCGGTTAGTGTCCAGCCACAGTCGAGGTCTATTGTAGCAACAAATGAA
GAGGTTGATACGAGCTTCAAGGGAAAGAAAATGGGAACAAAGGAGAGGATGTTTGATTTT
AGGAAGAAAGTTGGGGAGAAGTTTGAAGAGAAGAAGCGTCATATGGAGGAAAGAAGTAGA
CTGATTGTTGAAAAGATGAGAGGACCTTGAAGAAGAAGAAGCTTCTTTTTCAGGTTTCAG
ACAAAAAGAACAAGAAAGTCAATATAGAGATTAGATTAGGACATTGTTGTTACTTGTATC
CGTATATGTTTGGTGGAAAATATCGAAAAGAACTCATTGCGGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL6287Contig1 1105 2 2 U
GCTGATTTCAACGTCAAAAGCAGGTGGGACAAACCAGGGCATGCCCCAAAGTTTGGATAT
GATTTCTGGTACCAACCTCGATTCAAGACGATGATCAGCACTTCTTGGGGAGCACCTAAA
GCTTTCTCCAAAGGTTTCGATCTCCAGCACGTTGCTGATGGCTTGTATGGAAGTCATTTA
CATATTTATAAATGGCCAGAAGGTGAAATGAAACAGGTTATTGACCTCGGTGATACTGGT
CTCTTACCTCTTGAGATAAGATTCTTGCATGATCCGTCTAAAGATACAGGGTATGTTGGG
AGTGCCTTGTCGAGTAATATGATAAGATTTTTCAGGAACAGTGATGACACATGGAGCCAT
GAGGTGGTTATATCAGTTGAACCACTGAAAGTAGAGAACTGGATTCTTCCAGAAATGCCG
GGGCTTATCACCGACTTCTTGATCTCCCTCGATGATCGGTTCTTCTACTTTGTGAACTGG
CTACATGGAGACATTCGTCAGTGCAACATCGAAGACCCTAAGAATCCTGTTTTGACGGGT
CAAGTTTGGGTGGGGGGATTACTACAAAAAGGCATCCCTGTTAAGGGTGTTAGAGAAGAT
GGTACCACTTACCAGTTTGATGTTCCTCAGATCAAGGGGAAATCTCTACGAGCAGGACCT
CAGATGATCCAGCTGAGCCTTGATGGTAAACGACTGTATGCAACAAACTCACTGTTCAGC
GCGTGGGACCGTCAGTTTTACCCAGAAGTAATGGATAAAGGATCACACATAATCCAGATT
GATGTTGATACAGAAAAAGGTGGTCTCGCAATAAACCCTGATTTCTTTGTGGACTTTGGT
GTAGAGCCTGATGGTCCTGCGCTTGCCCATGAGATGAGATATCCCGGTGGAGACTGCACC
TCTGATATCTGGATTTGAATTGGCCCCCTTAAAAGAGTAAAATTGAGTTTGACCCATGGT
TGTGTTTTTAGAGTGTAATAAATAAGAGGTCGCTAGATCCATCTGTTTTGAATCAGAATG
AAAAGTTTTTTTTACAATGTCGTTGTTCTTATTGTTATGTAACTGACCCCATTGAAATGA
TTATCTGGCTCCGCCACTCGATCTT


BQ
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AF RR4E863TF U 1
AF RR4E863JQ C 469
BS 1 651 RR4E863TF
BS 652 1105 RR4E863JQ

RD RR4E863TF 651 0 0
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GATTTCTGGTACCAACCTCGATTCAAGACGATGATCAGCACTTCTTGGGGAGCACCTAAA
GCTTTCTCCAAAGGTTTCGATCTCCAGCACGTTGCTGATGGCTTGTATGGAAGTCATTTA
CATATTTATAAATGGCCAGAAGGTGAAATGAAACAGGTTATTGACCTCGGTGATACTGGT
CTCTTACCTCTTGAGATAAGATTCTTGCATGATCCGTCTAAAGATACAGGGTATGTTGGG
AGTGCCTTGTCGAGTAATATGATAAGATTTTTCAGGAACAGTGATGACACATGGAGCCAT
GAGGTGGTTATATCAGTTGAACCACTGAAAGTAGAGAACTGGATTCTTCCAGAAATGCCG
GGGCTTATCACCGACTTCTTGATCTCCCTCGATGATCGGTTCTTCTACTTTGTGAACTGG
CTACATGGAGACATTCGTCAGTGCAACATCGAAGACCCTAAGAATCCTGTTTTGACGGGT
CAAGTTTGGGTGGGGGGATTACTACAAAAAGGCATCCCTGTTAAGGGTGTTAGAGAAGAT
GGTACCACTTACCAGTTTGATGTTCCTCAGATCAAGGGGAAATCTCTACGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4E863JQ 637 0 0
TTTGTGAACTGGCTACATGGAGACATTCGTCAGTGCAACATCGAAGACCCTAAGAATCCT
GTTTTGACGGGTCAAGTTTGGGTGGGGGGATTACTACAAAAAGGCATCCCTGTTAAGGGT
GTTAGAGAAGATGGTACCACTTACCAGTTTGATGTTCCTCAGATCAAGGGGAAATCTTTA
CGAGCAGGACCTCAGATGATCCAGCTGAGCCTTGATGGTAAACGACTGTATGCAACAAAC
TCACTGTTCAGCGCGTGGGACCGTCAGTTTTACCCAGAAGTAATGGATAAAGGATCACAC
ATAATCCAGATTGATGTTGATACAGAAAAAGGTGGTCTCGCAATAAACCCTGATTTCTTT
GTGGACTTTGGTGTAGAGCCTGATGGTCCTGCGCTTGCCCATGAGATGAGATATCCCGGT
GGAGACTGCACCTCTGATATCTGGATTTGAATTGGCCCCCTTAAAAGAGTAAAATTGAGT
TTGACCCATGGTTGTGTTTTTAGAGTGTAATAAATAAGAGGTCGCTAGATCCATCTGTTT
TGAATCAGAATGAAAAGTTTTTTTTACAATGTCGTTGTTCTTATTGTTATGTAACTGACC
CCATTGAAATGATTATCTGGCTCCGCCACTCGATCTT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6289Contig1 874 2 4 U
GGATCTAAACACACAAATTCTATATCTTCAATATCTCCTCTTCCACACATTACTTAGCTC
TTTTCATTCATATCAAAACATACAACCATGGAGATGAGTTTATTGTCGGAGTGCAAACAA
TCTTCTTCTCACACTTTCTTGGCTCTCTTCAACTTGTTCCTGATCAGTTTTGGGAGGTGG
GTTTCTTCTGCTCGCATCTTTCTGTCCAGTTTCTTGCCTCTTCTTCAACGTGTGAGGAAC
CAAGACCAGAGTGTGATCACAAACATAGCAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGACCAATATGAT
TATCTCTTTAGAGAAGACGCAGAGACGGTCATGAGAAGTCTAGGTCTTTCGCCCGACCAA
GAAAGCGACGACCTTAAAGAACGGTACAGTTCCAAGGAGATGTCGAGTTTGTTCGAAGAG
AAAGAAGCGAGTTTAGAGGAAGTGAAGCAAGCTTTTGATGTGTTCGATGAAAACAGAGAT
GGGTTCATCGACGCTACAGAGTTGCAGAGAGTTTTGACAATCTTGGGTTTTAAAGAAGGA
TCTTACCTAGAGAACTGCTCGGTTATGATCAGATCATTAGATGGAAACAAAGACGGAAGA
ATCGACTTCAACGGATTTGTTAAATTCATGGAGAGTAGCTTTTGCTAAAGAAATCGCATA
TGATTATTAATTCTTTTCACCAAATGTATTATTTTGTTCGTTTTACACTACTTTGCTTTT
TTAATTCTTATCACTTTTGCGTCTTAGGATGAGATTGTGTATGTTAAAACCTGTACGGGT
TTTTTTTTTTTTGAACAACTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAACATGGTTGTTGTTGT
CACTTGCCACTACTAATCCAAGGACTTTTTAGCG


BQ
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AF RR4ED84TF U 1
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TCTTCTTCTCACACTTTCTTGGCTCTCTTCAACTTGTTCCTGATCAGTTTTGGGAGGTGG
GTTTCTTCTGCTCGCATCTTTCTGTCCAGTTTCTTGCCTCTTCTTCAACGTGTGAGGAAC
CAAGACCAGAGTGTGATCACAAACATAGCAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGACCAATATGAT
TATCTCTTTAGAGAAGACGCAGAGACGGTCATGAGAAGTCTAGGTCTTTCGCCCGACCAA
GAAAGCGACGACCTTAAAGAACGGTACAGTTCCAAGGAGATGTCGAGTTTGTTCGAAGAG
AAAGAAGCGAGTTTAGAGGAAGTGAAGCAAGCTTTTGATGTGTTCGATGAGAACAGAGAT
GGGTTCATCGACGC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4ED84JQ 570 0 0
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GCGACGACCTTAAAGAACGGTACAGTTCCAAGGAGATGTCGAGTTTGTTCGAAGAGAAAG
AAGCGAGTTTAGAGGAAGTGAAGCAAGCTTTTGATGTGTTCGATGAAAACAGAGATGGGT
TCATCGACGCTACAGAGTTGCAGAGAGTTTTGACAATCTTGGGTTTTAAAGAAGGATCTT
ACCTAGAGAACTGCTCGGTTATGATCAGATCATTAGATGGAAACAAAGACGGAAGAATCG
ACTTCAACGGATTTGTTAAATTCATGGAGAGTAGCTTTTGCTAAAGAAATCGCATATGAT
TATTAATTCTTTTCACCAAATGTATTATTTTGTTCGTTTTACACTACTTTGCTTTTTTAA
TTCTTATCACTTTTGCGTCTTAGGATGAGATTGTGTATGTTAAAACCTGTACGGGTTTTT
TTTTTTTTGAACAACTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAACATGGTTGTTGTTGTCACT
TGCCACTACTAATCCAAGGACTTTTTAGCG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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GACGTAGATGTTAAATCAAATTTGATTTAACATTACATTAAAAAGGACGACTGAAAATGA
GTGCCAACTTGGGCAATTTATTTGAATCACAACGCCAAAAGACATAATCATAACTTATTA
GACTTCTCAAGTCGAGACAAACTCTGCGCCTGTGTCCAGCTCAGTTATTGAATCATGACA
AACAGGAAGGATTGCCCACGCCACAACTGGCCAGAACAGACTTGATTTTTGATGGGTCAA
TCCCGGACAGAGAGAGATACGGGCAGAGACATTCAAGATTAGCGGATCTAGCCACTGCGC
AGCAGTCGGTCCCGGAGGTGGCGGGCTGTTTCCAGTTACAGCTGGAGAACATTTCTGCAA
GTCGTTTGTGTCGGTGTTGCATAAAGGATAACTCTTAACTTCTTCCACCATCATTGCCGC
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ATTTTTT


BQ
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AF RR4BI39TF C 1
AF RR4BI39JQ U 360
BS 1 359 RR4BI39TF
BS 360 547 RR4BI39JQ

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GTGCCAACTTGGGCAATTTATTTGAATCACAACGCCAAAAGACATAATCATAACTTATTA
GACTTCTCAAGTCGAGACAAACTCTGCGCCTGTGTCCAGCTCAGTTATTGAATCATGACA
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TCCCGGACAGAGAGAGATACGGGCAGAGACATTCAAGATTAGCGGATCTAGCCACTGCGC
AGCAGTCGGTCCCGGAGGTGGCGGGCTGTTTCCAGTTACAGCTGGAGAACATTTCTGCAA
GTCGTTTGTGTCGGTGTTGCATAGAGGATAACTCTTAGCTTCTTCCACCATCATTGCCGC
GGTTAAAACCATCGCAATGATGAGGATTGTGGTATTGTTCTTACCCATTTGTTTCTTTTA
ATTTTTT

QA 1 547 1 547
DS 

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AGTCGTTTGTGTCGGTGTTGCATAAAGGATAACTCTTAACTTCTTCCACCATCATTGCCG
CGGTTAAAACCATCGCAATGATGAGGATTGTGGTATTGTTCTTACCCATTTGTTTCTTTT
AATTTTTT

QA 1 188 1 188
DS 



AS 1 2

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AGCTGTTCTCTGTTGCCTTCAACTATCCCTCGAGTAAAACCGCGGTTGAGAACATCAGAT
CTCTGCTCTGCGTCAGGAACCCTGGGGTTCTGGATGGTCAGTTGGTGATAGGGAACTGTG
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AGAAGATCAGGGACAGTGTGAAGCACGTGAAGACCTCGGAGTCTCACGAGGAGAGGTTTG
TTGAGCTAAAGGAACAGCTTCAAGTTCCTAGCGACAAGGTGCTCTGTCTTGATGATAAGA
CGCAATGGAACGTATAACATGCTTGTGGCTGCTTCGGAGTTGAAGGAAGTGTTCTCTTGC
TTAGACACTGCTGATCCTGACTTCAAGCAGCCTCCTTCGGCAGAAGACTGGAGGCACGTG
GAGAGTCTCTGCACGTTCCTGAAGCCTCTTTACGAAGCAGCCTCCACTCTTCAGTCTACC
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CGAGCCATAGCGGGAGAGGATCCTTATGTAGCTGGTATAGCTAAAACCACGAAGGAGAAG
GTTGACAAGTACTGGAGGGAGTGTAGCTTGGTCTTGGCGATGGCGGTTGTGATGGATCCT
CGGTTCAAGATGAAGCTGGTGGAGTTCAGCTTCTCCAAGATATTCGGAGAAGACGCTGGG
AAGAACATCAAGACCGTGGACGATGGGATCCACGAGCTCTTCAACGAGTACATGGCACTC
CCTGCACCGCTAAAGCCAGCATCCGAGGCAGACGGGCTGTCTGATTTCGACAACTACATA
CTGGAGACAACAGGGCAGAACCTCAAGTCAGAGCTGGACCAGTACCTTGACGAAACGCTG
CTTCCTCGTGTTCAGGAGTTTGATGTTCTCGACTGGTGGAAACAGAACAAGCTCAAGTAC
CCGACACTGTGCAAGATGGCTAGAGACATCCTCTCCATCCCGGTTTCAGCTGCAGCCTTC
GACTATGTGTTTGACATGGAACCGAGGGAGATGGATGAGTACAAGACGTCTCTGAGGCCT
GAGACTGTGGAGGCTTTGATTTGCGCCAGGGAGTGGCTTCTTGAGAGTGAAGCAGCATCT
TCTCAGCAAATGTCGAGTGCTGTTGTCAACGCTGAAGCCTAGGGGTGAGAGACTTTGGTT
TGTGTATCTATAATCCGTGTTGTTTTCTACTACTTAAAAGCATTTGGACGTTGCTTTGTT
TATCTCTAATCCTTGCTATTTCCTACTACTACTTAAGCATTGGGACTTTGCGTCGTTTTA
TCTCTAATCCTTGTTGTATTATTCTACTACTTAGTTGTGTGGTTAGTCTTAATCCCG


BQ
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AF RR4AH86TF U 1
AF RR4AH86JQ C 647
BS 1 772 RR4AH86TF
BS 773 1437 RR4AH86JQ

RD RR4AH86TF 772 0 0
GGGAAGAAGCGCTGAGTCTCGCTGTTGCTAACTGTGTTTCTGAGTGGGGTCTGGAGGGGA
AGCTGTTCTCTGTTGCCTTCAACTATCCCTCGAGTAAAACCGCGGTTGAGAACATCAGAT
CTCTGCTCTGCGTCAGGAACCCTGGGGTTCTGGATGGTCAGTTGGTGATAGGGAACTGTG
TGGCGAGAACGTTCAGTGCCCTTGCTAAAGATGTTCTTGATAAAGGGAAAGACGTGATCA
AGAAGATCAGGGACAGTGTGAAGCACGTGAAGACCTCGGAGTCTCACGAGGAGAGGTTTG
TTGAGCTAAAGGAACAGCTTCAAGTTCCTAGCGACAAGGTGCTCTGTCTTGATGATAAGA
CGCAATGGAACGTATAACATGCTTGTGGCTGCTTCGGAGTTGAAGGAAGTGTTCTCTTGC
TTAGACACTGCTGATCCTGACTTCAAGCAGCCTCCTTCGGCAGAAGACTGGAGGCACGTG
GAGAGTCTCTGCACGTTCCTGAAGCCTCTTTACGAAGCAGCCTCCACTCTTCAGTCTACC
GGAAACTCTTCTGCTGTGACCTTCTTCCATGAAGTGTGGAAGACACAGTCTGATCTTTCT
CGAGCCATAGCGGGAGAGGATCCTTATGTAGCTGGTATAGCTAAAACCACGAAGGAGAAG
GTTGACAAGTACTGGAGGGAGTGTAGCTTGGTCTTGGCGATGGCGGTTGTGATGGATCCT
CGGTTCAAGATGAAGCTGGTGGAGTTCAGCTTCTCCAAGATATTCGGAGAAG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4AH86JQ 791 0 0
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TTGTGATGGATCCTCGGTTCAAGATGAAGCTGGTGGAGTTCAGCTTCTCCAAGATATTCG
GAGAAGACGCTGGGAAGAACATCAAGACCGTGGACGATGGGATCCACGAGCTCTTCAACG
AGTACATGGCACTCCCTGCACCGCTAAAGCCAGCATCCGAGGCAGACGGGCTGTCTGATT
TCGACAACTACATACTGGAGACAACAGGGCAGAACCTCAAGTCAGAGCTGGACCAGTACC
TTGACGAAACGCTGCTTCCTCGTGTTCAGGAGTTTGATGTTCTCGACTGGTGGAAACAGA
ACAAGCTCAAGTACCCGACACTGTGCAAGATGGCTAGAGACATCCTCTCCATCCCGGTTT
CAGCTGCAGCCTTCGACTATGTGTTTGACATGGAACCGAGGGAGATGGATGAGTACAAGA
CGTCTCTGAGGCCTGAGACTGTGGAGGCTTTGATTTGCGCCAGGGAGTGGCTTCTTGAGA
GTGAAGCAGCATCTTCTCAGCAAATGTCGAGTGCTGTTGTCAACGCTGAAGCCTAGGGGT
GAGAGACTTTGGTTTGTGTATCTATAATCCGTGTTGTTTTCTACTACTTAAAAGCATTTG
GACGTTGCTTTGTTTATCTCTAATCCTTGCTATTTCCTACTACTACTTAAGCATTGGGAC
TTTGCGTCGTTTTATCTCTAATCCTTGTTGTATTATTCTACTACTTAGTTGTGTGGTTAG
TCTTAATCCCG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL6292Contig1 938 2 4 U
GGATCTAAAAAAACCTTTAAAATCGGAAATCGGTAAACAAACGTCTTTTTTTTTTATTGT
TACTGAACTCTTCCGTCTGCAAACAAAACGTCTACTTGGTCTTGTTACACCTCACCTCCC
TCAACAGCAGCTCTCTTTTCCAAATCAGATTCCATTTTCCTGACAATGTCCTCTACTTCT
TCCAACTCATCCATCTCCAATTTATCAAAAGAACAACCACCTACCAGATCCAAAAACTCA
ACAGAAAACTCGATCAACTTCTGAGCATTGGAGACGTGTTGTTCCCTCTCCAAAGATTGG
GAGACTTGTACGACGGGAAAGACTTCTGGTTGTGGCATGAACTGGCGGGTTAGGATGAAC
ACCCTTCCATCACTGATCACATCGCAGAGGCATTTCTCTATCCTTTTCAGTTTCTCCAGT
GAAACAAGAGTACTAACCACAAGCCCCAGCATAGTATGATCCAGTGTTACTGTCTTGACA
TTCCAGACCAAAGCAACTTTTTCATCTTCTCCCGAGAAAGTTGGTGAAGGATGTTTGTCT
TTTGATAAACCCAAAAGCTGAAGCAAATCTTTGCTCTCCTTGCCCTCAGTCTCTAGCAAA
TCAGCTATGCGTCTCAATGCCGGAATTGCAGTCTCGGAATCGCGCTGTGAATCACACAGA
TTTTTCACAATCAAATCAATTTTTGTGAATCATAACCTAAAATTACTACTTACCTCAATG
TAGCTTGTAACTAAGTTCCTCAGCCTATCGAGATTGAGATCATCCGGAATCAGACCTCGG
TTCGCCGCCATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTTCGT
CGACCGTTCTTTTTTTTTCCTCTAGATCTTTGTTTCTTCTACATGTGGAGGATATCATGT
AATTGGGCCTAGGCCCTTTTCTCCTTTTGGCTCATTTG


BQ
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AF RR4A420TF U 1
AF RR4A420JQ C 630
BS 1 808 RR4A420TF
BS 809 809 RR4A420JQ
BS 810 820 RR4A420TF
BS 821 938 RR4A420JQ

RD RR4A420TF 838 0 0
GGATCTAAAAAAACCTTTAAAATCGGAAATCGGTAAACAAACGTCTTTTTTTTTTATTGT
TACTGAACTCTTCCGTCTGCAAACAAAACGTCTACTTGGTCTTGTTACACCTCACCTCCC
TCAACAGCAGCTCTCTTTTCCAAATCAGATTCCATTTTCCTGACAATGTCCTCTACTTCT
TCCAACTCATCCATCTCCAATTTATCAAAAGAACAACCACCTACCAGATCCAAAAACTCA
ACAGAAAACTCGATCAACTTCTGAGCATTGGAGACGTGTTGTTCCCTCTCCAAAGATTGG
GAGACTTGTACGACGGGAAAGACTTCTGGTTGTGGCATGAACTGGCGGGTTAGGATGAAC
ACCCTTCCATCACTGATCACATCGCAGAGGCATTTCTCTATCCTTTTCAGTTTCTCCAGT
GAAACAAGAGTACTAACCACAAGCCCCAGCATAGTATGATCCAGTGTTACTGTCTTGACA
TTCCAGACCAAAGCAACTTTTTCATCTTCTCCCGAGAAAGTTGGTGAAGGATGTTTGTCT
TTTGATAAACCCAAAAGCTGAAGCAAATCTTTGCTCTCCTTGCCCTCAGTCTCTAGCAAA
TCAGCTATGCGTCTCAATGCCGGAATTGCAGTCTCGGAATCGCGCTGTGAATCACACAGA
TTTTTCACAATCAAATCAATTTTTGTGAATCATAACCTAAAATTACTACTTACCTCAATG
TAGCTTGTAACTAAGTTCCTCAGCCTATCGAGATTGAGATCATCCGGAATCAGACCTCGG
TTCGCCGCCATTTTCTTCTTCTTCTTCT*CTTCTTCTTCT
CTCTCTCTCGTCGTCGAC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4A420JQ 309 0 0
AGTT
TCGGAATCGCGCTGTGAATCACACAGATTTTTCACAATCAAATCAATTTTTGTGAATCAT
AACCTAAAATTACTACTTACCTCAATGTAGCTTGTAACTAAGTTCCTCAGCCTATCGAGA
TTGAGATCATCCGGAATCAGACCTCGGTTCGCCGCCATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTTCGTCGACCGTTCTTTTTTTTTCCTCTAGATCTTTGT
TTCTTCTACATGTGGAGGATATCATGTAATTGGGCCTAGGCCCTTTTCTCCTTTTGGCTC
ATTTG

QA 5 309 5 309
DS 



AS 1 2

CO CL6293Contig1 765 2 3 U
GGGGCGGAGAAATTAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCT
TGAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCTGTGGGGACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTC
ACGCTACTCCTCCTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTTTTGCCAATCTTA
AATCATCCGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATGGAAGAGCAAGGATTTCAGA
TATGTCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTATTGGAAAAGCAAGGCCAAGAAAAAA
AACATTTTGAGATCTATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGACTTATGGTGAATAAGTCTG
TTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTTGTTGGAAGAAGCACTTTCAGAAGGG
TTGCTAAAACCATCGCTCCTTCTGTTGTCAATATTGATGGACCTAACGACGGTTATGGCT
CTGGGATTTTGTTTGGGGGAGAAGGCAAAATAATAACTTGTGGTCATTTCGTCCTCAACC
CCCACAAGTTTAGAACGAGTCCTGTCTATCGTTCGAAGCGAATGGAGGTAAAGATATTGA
ACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTATGATGCAGATTATGATCTCGCAC
TAGTCAGATTGAGCACAACGAAAGCTTCATCTCTCTGCAAGTTTGATCTCAGATGTTCTG
TGGGATATGTGCTGTCATCGCATCTCTGAGTTGCAGCAGTTCTCA


BQ
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AF RR4BN43TF U 79
AF RR4BP68TF U 1
BS 1 92 RR4BP68TF
BS 93 93 RR4BN43TF
BS 94 765 RR4BP68TF

RD RR4BN43TF 191 0 0
CCTCCTCTGTGGGGACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACGCTACTCCTCCTGCTC
CTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTTTTGCCAATCTTAAATCATC*GAGAAACCAT
GTGACGACGTTCTGAGAGATATGGAAGAGCAAGGATTTCAGATATGTCAAGCCGATCTGA
TTCGCTGGGCA

QA 1 191 1 191
DS 

RD RR4BP68TF 765 0 0
GGGGCGGAGAAATTAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCT
TGAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCTGTGGGGGCGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTC
ACGCTACTCCTCCTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTTTTGCCAATCTTA
AATCATCCGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATGGAAGAGCAAGGATTTCAGA
TATGTCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTATTGGAAAAGCAAGGCCAAGAAAAAA
AACATTTTGAGATCTATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGACTTATGGTGAATAAGTCTG
TTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTTGTTGGAAGAAGCACTTTCAGAAGGG
TTGCTAAAACCATCGCTCCTTCTGTTGTCAATATTGATGGACCTAACGACGGTTATGGCT
CTGGGATTTTGTTTGGGGGAGAAGGCAAAATAATAACTTGTGGTCATTTCGTCCTCAACC
CCCACAAGTTTAGAACGAGTCCTGTCTATCGTTCGAAGCGAATGGAGGTAAAGATATTGA
ACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTATGATGCAGATTATGATCTCGCAC
TAGTCAGATTGAGCACAACGAAAGCTTCATCTCTCTGCAAGTTTGATCTCAGATGTTCTG
TGGGATATGTGCTGTCATCGCATCTCTGAGTTGCAGCAGTTCTCA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6296Contig1 878 2 4 U
AAGTATTACTTAAGACCACAACCTCTTGTCCTTAAACCACTGTATTAGACATAAGCGACT
CATCATAGTATATCAAAACCAAACACTAATTGTCAAACCAAACTATCTTTTCACTTGAAG
CACTTGGCGTCCAAGAGAGCTTCACCTTCAAAGGGCTCTGCGTCTTCGATCATCTGGCTA
ACACGCTCCTTCTGGGCTTCATCCGAGATGTCAACCTTTGTCCACTCGTACAGCTCCATG
TCGTACACCTCGTCCATTATGAACTTTGGGATATCTGGTCCTCTGAACAACCACAAACCC
TTCACCTTGAACGGAGCCTCTGACCAGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTACTTACGA
GCCAAGTCCATTCTCTGAAGAAACCCGCCTACCTTGTTGAGCGTCACAAAGGACACCATG
TTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGCGAGTATCCCTCTGGGTCATACATG
TCCCAAAATCCTTTAATAGCAACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTCGAGTAAAGCCTC
TTCCACTCATCGAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAATCAAGAGGGTTCTTTGCTTTG
GGCTTTGGAGCCTCTTCTTCCTCTTCAACAACCTTAGGTGCCTCTGGTGCAGGGGCAGCC
TTTTTCTTAGGCTCCTCCTTGGGCTTTGCAGGCTGGGCAGCTTTCTTGGAAGCGACAGGA
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ATCCAAGTTCAGTTGCAGACAGTGATGATATCAGCAGG


BQ
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AF RR4BY33JQ U 1
AF RR4CK63JQ U 1
BS 1 329 RR4BY33JQ
BS 330 330 RR4CK63JQ
BS 331 749 RR4BY33JQ
BS 750 878 RR4CK63JQ

RD RR4BY33JQ 749 0 0
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CATCATAGTATATCAAAACCAAACACTAATTGTCAAACCAAACTATCTTTTCACTTGAAG
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ACACGCTCCTTCTGGGCTTCATCCGAGATGTCAACCTTTGTCCACTCGTACAGCTCCATG
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GCCAAGTCCATTCTCTGAAGAAACCCGCCTACCTTGTTGAGCGTCACAAAGGACACCATG
TTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGCGAGTATCCCTCTGGGTCATACATG
TCCCAAAATCCTTTAATAGCAACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTCGAGTAAAGCCTC
TTCCACTCATCGAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAATCAAGAGGGTTCTTTGCTTTG
GGCTTTGGAGCCTCTTCTTCCTCTTCAACAACCTTAGGTGCCTCTGGTGCAGGGGCAGCC
TTTTTCTTAGGCTCCTCCTTGGGCTTTGCAGGCTGGGCAGCTTTCTTGGAAGCGACAGGA
GGGACAGCTTCAGTCTGTTTGACATCACC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4CK63JQ 878 0 0
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CATCATAGTATATCAAAACCAAACACTAATTGTCAAACCAAACTATCTTTTCACTTGAAG
CACTTGGCGTCCAAGAGAGCTTCACCTTCAAAGGGCTCTGCGTCTTCGATCATCTGGCTA
ACACGCTCCTTCTGGGCTTCATCCGAGATGTCAACCTTTGTCCACTCGTACAGCTCCATG
TCGTACACCTCGTCCATTATGAACTTTGGGATATCTGGTCCTCTGAACAACCACAAACCC
TTCACCTTGAACGGAGCCTCTGACCAGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTACTTACGA
GCCAAGTCCATTCTCTGAAGAAACCCGCCTACCTTGTTGAGCGTCACAAAGGACACCATG
TTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGCGAGTATCCCTCTGGGTCATACATG
TCCCAAAATCCTTTAATAGCAACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTCGAGTAAAGCCTC
TTCCACTCATCGAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAATCAAGAGGGTTCTTTGCTTTG
GGCTTTGGAGCCTCTTCTTCCTCTTCAACAACCTTAGGTGCCTCTGGTGCAGGGGCAGCC
TTTTTCTTAGGCTCCTCCTTGGGCTTTGCAGGCTGGGCAGCTTTCTTGGAAGCGACAGGA
GGGACAGCTTCAGTCTGTTTGACATCACCCACACCTTCTTGAAGTTCGGTTGGTTGATAC
GGTCCAGAAGTATCTCTCACATGAGGGAATGCAGAGTAAGCTCTTGGTATGACAGTGGCA
ATCCAAGTTCAGTTGCAGACAGTGATGATATCAGCAGG

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 2

CO CL6297Contig1 1013 2 2 U
GGAAAATGCAAAAAAATAGGAAACCTTTGTGGCTTTGTCTCCACTGAAAAGAAAAGCGCG
ATAAAAAGCGAGTCACCGACTAAGCAAGTCGCCGGTAAAAAATCCGATGCAATCCACTGA
CGACGACGGCGGCGGTAAAGGAGGAGGAGGTGATGAGGTGAGTCGAAGTGGGTTGTCTCG
GATCCGCTCAGCTCCGGCAACTTGGATTGAAACCCTACTCCAGGATGAAGAAGAAGAAGA
AGACGATTTGAAACCTGACCTCTGTTTAACTGAGCTTCTCACCGGAAACTCGTCCGGGAT
TGAGTTCCCGAGTGCTGCTGTAGAGCAGGGATTATACAATCACCAAGTTGGGTTTCACCG
ACAGAACAGCTCTCCTGCGGATTTTCTCAGTGGCTCTGCTGCTTCTGGGAGTGATGGGTT
TTTCTCGAATTTTGGGATTCCGGCCAACTACGAGTACGTGCCGCCCAACGTTGACATTTC
TCCGGCGAGTAAACGGTCGAGGGAGTTCTCTTCTCACTTTAAAGAAGAGCAAATGAGTGG
TGGGATGATGGAGGATAATAAGCTTCTTGAGGACTCTGTTCCTTTTAGGGTTCGTGCTAA
ACGCGGCTGTGCAACTCATCCTCGTAGCATTGCTGAGCGGGTGAGGAGAACGCGGATAAG
TGACCGGATCAGGAGGCTGCAAGAACTTGTTCCTAACATGGATAAGCAAACCAACACTGC
AGACATGTTAGACGAAGCTTTGCAGTATGTGAAAGCTCTTCAAAGCCAGATCCAGGAGTT
GACAGAGCAGCAGAAGAGGTGCAGTTGCAAACCTAAGGAAGAAAAATAAAGTTTTCCTTT
AGGATTGATATAATATATAATGTATTTTTTTCTATGGTTTATTCTATGAATGGCGATGAT
CTGTTCAAAAAAAAAAAAAATAGATTATTTGATGTATGTACTTTAGCTGTAAATTTTTTG
TACAATAAGGTGAAACTTTTTAAAGAGTCAATAAAAAATGTGTATTCGTTATC


BQ
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AF RR4EU96TF U 1
AF RR4EU96JQ C 484
BS 1 668 RR4EU96TF
BS 669 1013 RR4EU96JQ

RD RR4EU96TF 668 0 0
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ATAAAAAGCGAGTCACCGACTAAGCAAGTCGCCGGTAAAAAATCCGATGCAATCCACTGA
CGACGACGGCGGCGGTAAAGGAGGAGGAGGTGATGAGGTGAGTCGAAGTGGGTTGTCTCG
GATCCGCTCAGCTCCGGCAACTTGGATTGAAACCCTACTCCAGGATGAAGAAGAAGAAGA
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TGAGTTCCCGAGTGCTGCTGTAGAGCAGGGATTATACAATCACCAAGTTGGGTTTCACCG
ACAGAACAGCTCTCCTGCGGATTTTCTCAGTGGCTCTGCTGCTTCTGGGAGTGATGGGTT
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TCCGGCGAGTAAACGGTCGAGGGAGTTCTCTTCTCACTTTAAAGAAGAGCAAATGAGTGG
TGGGATGATGGAGGATAATAAGCTTCTTGAGGACTCTGTTCCTTTTAGGGTTCGTGCTAA
ACGCGGCTGTGCAACTCATCCTCGTAGCATTGCTGAGCGGGTGAGGAGAACGCGGATAAG
TGACCGGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4EU96JQ 530 0 0
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AGAGCAGCAGAAGAGGTGCAGTTGCAAACCTAAGGAAGAAAAATAAAGTTTTCCTTTAGG
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TTCAAAAAAAAAAAAAATAGATTATTTGATGTATGTACTTTAGCTGTAAATTTTTTGTAC
AATAAGGTGAAACTTTTTAAAGAGTCAATAAAAAATGTGTATTCGTTATC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL6298Contig1 1276 2 4 U
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GTTTCGTTACAGAGAGTCTGCTTTACGCAACGAGTCCATGAACAATCGAGAAGAGACTTA
CATGGCTATCAAGAAAATGATTGCAACACTGGACGATCCTTTTACTAGATTCTTGGAGCC
TGGAAAGTTTCAGAGTTTGCGGTCTGGAACTCAAGGTGCGGTTACAGGTGCTGGGTTGTC
TATAGGTTACCCGGCTGCATCTGTGGGATCACCGTCTGGGCTTGTTGTTATATCAGCTGC
TCCAGGTGGTCCTGCAAATAGAGCTGGAGTTTTACCTGGCGATTTTATCTTAGGAATTGA
TAATACAACTACAGAAACTCTGACCATATATGATGCGGCACAGATGCTGCAGGGACCTGA
AGGAAGCACAGTGGAGCTAGCCATTCGCAGTGGACCAGAAACGAGGGTCTTTTCTTTAAC
GAGAGAGCGAGTTTCTGTTAATCCGGTGAAGTCAAGATTATGTGAACTACCTGGCTCTGG
AAGTAATTCCCCAAAGATTGGGTATATCAAGCTAACAACATTCAATCAAAATGCTTCTGG
TGCGGTCAAAGAAGCAATTGAGACCCTGAGAGGCAACAATGTAAATGCATTCGTCTTGGA
TCTTCGAGACAATAGTGGCGGTTCTTTCCCAGAAGGAATCGAGATTGCTAAGTTTTGGTT
AGATAAAGGAGTGATTGTGTATATTTGCGATAGCCGAGGTGTTAGAGATATATATGATAC
TGATGGAAGCAATGCTATATCAACCTTTGAGCCTCTTGCCGTCCTGGTAAACAAAGGTAC
TGCAAGTGCCAGTGAGATATTGGCAGGCGCCTTGAAAGATAACAAACGTGCTCTGGTTTA
TGGAGAACCCACATACGGAAAAGGTAAGATACAGTCAGTGTTTCAGCTATCAGATGGTTC
GGGCTTGGCGGTAACAGTTGCTCGTTACGAAACACCGGCTCATACCGATATAGACAAGGT
CGGTGTTACTCCTGATCATCCGTTGCCAAAGTCATTTCCGAAAGACGAAGAGGCTTTCTG
TGGATGCCTTAAGGATCCATCAGCTGCTTGTTATCTCAATCAAGGCCTGCTTTTCTCTAG
ATGATATTTGATTTGTTCATACTTTGTTCTGAGAGCGTATGAGTAAAGAATGATTCATTG
ACTCAAACCTTTGTATACTCGTGAAGATTTACTTAGCATCATTGTCAGCTTAATCGAGAC
AAGGGATTTCACTTTC


BQ
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AF RR4CW54TF U 1
AF RR4CW54JQ C 497
BS 1 669 RR4CW54TF
BS 670 670 RR4CW54JQ
BS 671 683 RR4CW54TF
BS 684 1276 RR4CW54JQ

RD RR4CW54TF 689 0 0
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TGGAAAGTTTCAGAGTTTGCGGTCTGGAACTCAAGGTGCGGTTACAGGTGCTGGGTTGTC
TATAGGTTACCCGGCTGCATCTGTGGGATCACCGTCTGGGCTTGTTGTTATATCAGCTGC
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TAATACAACTACAGAAACTCTGACCATATATGATGCGGCACAGATGCTGCAGGGACCTGA
AGGAAGCACAGTGGAGCTAGCCATTCGCAGTGGACCAGAAACGAGGGTCTTTTCTTTAAC
GAGAGAGCGAGTTTCTGTTAATCCGGTGAAGTCAAGATTATGTGAACTACCTGGCTCTGG
AAGTAATTCCCCAAAGATTGGGTATATCAAGCTAACAACATTCAATCAAAATGCTTCTGG
TGCGGTCAAAGAAGCAATTGAGACCCTGAGAGGCAACAATGTAAATGCATTCGTCTTGGA
TCTTCGAGA*AATAGTGGCGGTT
TTTCCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4CW54JQ 780 0 0
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ATTGGGTATATCAAGCTAACAACATTCAATCAAAATGCTTCTGGTGCGGTCAAAGAAGCA
ATTGAGACCCTGAGAGGCAACAATGTAAATGCATTCGTCTTGGATCTTCGAGACAATAGT
GGCGGTTCTTTCCCAGAAGGAATCGAGATTGCTAAGTTTTGGTTAGATAAAGGAGTGATT
GTGTATATTTGCGATAGCCGAGGTGTTAGAGATATATATGATACTGATGGAAGCAATGCT
ATATCAACCTTTGAGCCTCTTGCCGTCCTGGTAAACAAAGGTACTGCAAGTGCCAGTGAG
ATATTGGCAGGCGCCTTGAAAGATAACAAACGTGCTCTGGTTTATGGAGAACCCACATAC
GGAAAAGGTAAGATACAGTCAGTGTTTCAGCTATCAGATGGTTCGGGCTTGGCGGTAACA
GTTGCTCGTTACGAAACACCGGCTCATACCGATATAGACAAGGTCGGTGTTACTCCTGAT
CATCCGTTGCCAAAGTCATTTCCGAAAGACGAAGAGGCTTTCTGTGGATGCCTTAAGGAT
CCATCAGCTGCTTGTTATCTCAATCAAGGCCTGCTTTTCTCTAGATGATATTTGATTTGT
TCATACTTTGTTCTGAGAGCGTATGAGTAAAGAATGATTCATTGACTCAAACCTTTGTAT
ACTCGTGAAGATTTACTTAGCATCATTGTCAGCTTAATCGAGACAAGGGATTTCACTTTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6299Contig1 781 2 2 U
GGTATACCTTTTGTCATCTCCTTTAACTGCAAGGTCATGTCCAGTGTGTTGCAACTTCCT
TCCTCACCTAGGAAGAGAAATGGAAAAAGGTCAGTTCACTCCTCCACTGCCATTTGTTCT
CATTCCAAAAAATCAGAGGAAAACTCTGAAGTATTGTGCAAAGAGACTCCACCGTCCTGA
AACGCTATGCCTCTTACCCGACGTTTGCTCAAACATGCTCAACCAGAACAAGAGTGATGA
TAATATGCCCATGGTTATCCGGGTTACAAACTACTGCCCTCGACACGGTAATGTTGAGGT
TCGAGGTTTTGATCCGATTATACCTTTCAGTCCGTCATCTAACTCCATTGTCCTAAGCGT
CCCTATGAAGGCTAAGCTAGCTTTTGAGATTCACCTAGTCTCGCTGAGAAGCTTTGTGGA
GTTTGGAACTGATCATGTCAACTTCAATATCAAATCAAGTCAAATAGGACTTCTTCTTGG
TGTTGTCCAAGGTCTTGGAGCTTCTCACCAAAAGCTCTTACCGGGCAACAGTCCAACCGT
TTCTTATTGGTGTATCAACGTCGACTTCGACTATCAGTTGTTCTTTCGAACAATCGCCTT
AGAGATTAAGGTGAAGCTTCTCCATGGGGTTCTTCATCTTGCTGAGCTTGACTCGCCTCT
TATAGGCTTTATCCTTCTATGTTTCATAATGTTTTCTTTTATCGTTGTACCGTCGAGCAT
GCCTCCGGATTTTTATGCTTAGTTGTAAACTTTTGAGATTTTAATATAAGTTTGGTGTTG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RR4AO49TF U 1
AF RR4AO49JQ C 84
BS 1 762 RR4AO49TF
BS 763 781 RR4AO49JQ

RD RR4AO49TF 762 0 0
GGTATACCTTTTGTCATCTCCTTTAACTGCAAGGTCATGTCCAGTGTGTTGCAACTTCCT
TCCTCACCTAGGAAGAGAAATGGAAAAAGGTCAGTTCACTCCTCCACTGCCATTTGTTCT
CATTCCAAAAAATCAGAGGAAAACTCTGAAGTATTGTGCAAAGAGACTCCACCGTCCTGA
AACGCTATGCCTCTTACCCGACGTTTGCTCAAACATGCTCAACCAGAACAAGAGTGATGA
TAATATGCCCATGGTTATCCGGGTTACAAACTACTGCCCTCGACACGGTAATGTTGAGGT
TCGAGGTTTTGATCCGATTATACCTTTCAGTCCGTCATCTAACTCCATTGTCCTAAGCGT
CCCTATGAAGGCTAAGCTAGCTTTTGAGATTCACCTAGTCTCGCTGAGAAGCTTTGTGGA
GTTTGGAACTGATCATGTCAACTTCAATATCAAATCAAGTCAAATAGGACTTCTTCTTGG
TGTTGTCCAAGGTCTTGGAGCTTCTCACCAAAAGCTCTTACCGGGCAACAGTCCAACCGT
TTCTTATTGGTGTATCAACGTCGACTTCGACTATCAGTTGTTCTTTCGAACAATCGCCTT
AGAGATTAAGGTGAAGCTTCTCCATGGGGTTCTTCATCTTGCTGAGCTTGACTCGCCTCT
TATAGGCTTTATCCTTCTATGTTTCATAATGTTTTCTTTTATCGTTGTACCGTCGAGCAT
GCCTCCGGATTTTTATGCTTAGTTGTAAACTTTTGAGATTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4AO49JQ 698 0 0
AAAAAGGTCAGTTCACTCCTCCACTGCCATTTGTTCTCATTCCAAAAAATCAGAGGAAAA
CTCTGAAGTATTGTGCAAAGAGACTCCACCGTCCTGAAACGCTATGCCTCTTACCCGACG
TTTGCTCAAACATGCTCAACCAGAACAAGAGTGATGATAATATGCCCATGGTTATCCGGG
TTACAAACTACTGCCCTCGACACGGTAATGTTGAGGTTCGAGGTTTTGATCCGATTATAC
CTTTCAGTCCGTCATCTAACTCCATTGTCCTAAGCGTCCCTATGAAGGCTAAGCTAGCTT
TTGAGATTCACCTAGTCTCGCTGAGAAGCTTTGTGGAGTTTGGAACTGATCATGTCAACT
TCAATATCAAATCAAGTCAAATAGGACTTCTTCTTGGTGTTGTCCAAGGTCTTGGAGCTT
CTCACCAAAAGCTCTTACCGGGCAACAGTCCAACCGTTTCTTATTGGTGTATCAACGTCG
ACTTCGACTATCAGTTGTTCTTTCGAACAATCGCCTTAGAGATTAAGGTGAAGCTTCTCC
ATGGGGTTCTTCATCTTGCTGAGCTTGACTCGCCTCTTATAGGCTTTATCCTTCTATGTT
TCATAATGTTTTCTTTTATCGTTGTACCGTCGAGCATGCCTCCGGATTTTTATGCTTAGT
TGTAAACTTTTGAGATTTTAATATAAGTTTGGTGTTGT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6300Contig1 511 2 1 U
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GATATATAAAAAGTAAAGGGAAATGGCGGGACCGGAACAAGCAGCAAGGCAGTCAAGTGA
AGTATTGGGCCAGCGGCGAGCATTAGGGATGCGTCCGGTGAGAGCAGCAGCGGTTGGATT
TGTGATTGTTGGTGGACTTGGCTACATGGTCTTGTACAGCAAAAAGAAGCCAGAAGCTTC
AGCAGGTGATGTCGCTAAAGTTATATCCGGTGTCTCTGGTACTACTGAGAGTACTCGTCC
TCGTAACTGACATTTTCTCAAATTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACATTTTTGCT
ATATTTGTTTGATTGAAGTATATAGTGAATCTTTAAATATTTTAAAAATTTCAGTATTTG
AATTTGTTATTCATTTATTCTTGACATCAATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACTGCA
TATTGACATCACTCCTTCCAAAGTCAGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DC09TF U 1
AF RR4DC09JQ C 328
BS 1 511 RR4DC09TF

RD RR4DC09TF 511 0 0
GGACTTCACAGAGCGATCTTTAGAAGAAATTTCTTGAGAGATATACGTTACTTCCATATA
GATATATAAAAAGTAAAGGGAAATGGCGGGACCGGAACAAGCAGCAAGGCAGTCAAGTGA
AGTATTGGGCCAGCGGCGAGCATTAGGGATGCGTCCGGTGAGAGCAGCAGCGGTTGGATT
TGTGATTGTTGGTGGACTTGGCTACATGGTCTTGTACAGCAAAAAGAAGCCAGAAGCTTC
AGCAGGTGATGTCGCTAAAGTTATATCCGGTGTCTCTGGTACTACTGAGAGTACTCGTCC
TCGTAACTGACATTTTCTCAAATTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACATTTTTGCT
ATATTTGTTTGATTGAAGTATATAGTGAATCTTTAAATATTTTAAAAATTTCAGTATTTG
AATTTGTTATTCATTTATTCTTGACATCAATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACTGCA
TATTGACATCACTCCTTCCAAAGTCAGTTAT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR4DC09JQ 184 0 0
GCAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACATTTTTGCTATATTTGTTTGATTGAAGTATATAGTG
AATCTTTAAATATTTTAAAAATTTCAGTATTTGAATTTGTTATTCATTTATTCTTGACAT
CAATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACTGCATATTGACATCACTCCTTCCAAAGTCAG
TTAT

QA 1 184 1 184
DS 



AS 1 2

CO CL6301Contig1 1346 2 8 U
GCATATTTAATATGCACTTATGAAAATGAAAGGCGGTTGTAGGGAGCTATCAAGAAGACT
GCTAGAAAAGAAGCAAAAGAAATGAATCACGCAATAAAGCAAACAAATGGGAAGACTAAC
CTCACGTATGGCACAAGCATAGTCTTCTTCATCCTTACTTTTCTTCCCACGAGGAAAGCT
CCAGCTTGAACCTTTCCATCCTTTCACCAACAAACACTGAACAGTCCCTCCTCCCAAAAA
AGGAGAGATAAGTGCAAGCATGAGCTAACAACTAAACTTAAGCAGTGCTAATAGAAAAAG
GATTAATAATCCAAAATGGGGTCTATTCTATTCTAACCCGTTGATAAGTCTCATCTAGGA
TAATAGCACCAGTGACAGGAACTCGGTACTTGTAAGAGGTAAAGTCCTTGAAAATGTCAT
CAACGTTAGAGACGTAAGGTCTCAACACATCACAGCTGTTGAATACTAGTTTTCCACATG
TCAAGTGGGAAACAGATCAGCCAATTTTGAAATCATGCTCCAAAAAGCAAATGAGATGGT
TATAAGAAAAAAAAGGATACAGAGCAAAGTGAACTCCTTCAAAGAGAGAGACTTTAACGA
CGGATCAGTCTCCACAGCGTTGTCTTCATAGTACCAGTAAGCGTACTCCACCAGAAACAG
AATCCTCTCGAATGACTGTTGATCTTCTTCTGGTACGTTCAAAACAAACCGGCTGTAAAC
CAAAGAGAAACCCAAATCGAAATCACTATCTTAATGATTTCGTGAACAAAAAGACATTAT
ACAATGATACCTGCAGAGATCGTCGAGAAGCTCCTTAGAGGGGAGGCTGTTTCCGACGTT
CTTCGATGAGCTTGACGATCGGTGCAGATTCGACATTTAGTTTTTTTAGTGTTGTCGCCG
GTGAAATCTAATCGCTCCCGGAGATGTGTAAAGGTGAATATAATATCCGAGATCCGACCC
AAGTTTCTGTTGGATACACCGAGAAAAAGTAAAAAGAGATAAATTATATTTAACTTTTAC
CGCGTAATAAAGAAACATTTGACCGTGTCCACCAGGCTAGGCTGACCAAGCCGTCGCTGA
AGGAGCCAAATTGTTCCAAGACCATTGTAATTTCTCCACTTTTCCTTTGTTATTGGTATT
TACTACTCTCTTTTTTTTTGCTAGATTCTAGTAGTTTTGAATTTTGCTATTAAGAATCAT
GAGTCCTAAACTGTGACATTTCACCATGTTTTGAACTTGTTGTTGCTCGATAGGAATAAT
GACAACTAGATGGCTCATGATTACTCTGCAGATGAGGTTGATGGATGGGAATTCGATTAA
CTTGAGAAAGAAAGAACTGCAATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GE43TF U 1
AF RR4GE43JQ C 558
BS 1 703 RR4GE43TF
BS 704 704 RR4GE43JQ
BS 705 723 RR4GE43TF
BS 724 724 RR4GE43JQ
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BS 743 764 RR4GE43TF
BS 765 1346 RR4GE43JQ

RD RR4GE43TF 764 0 0
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GCTAGAAAAGAAGCAAAAGAAATGAATCACGCAATAAAGCAAACAAATGGGAAGACTAAC
CTCACGTATGGCACAAGCATAGTCTTCTTCATCCTTACTTTTCTTCCCACGAGGAAAGCT
CCAGCTTGAACCTTTCCATCCTTTCACCAACAAACACTGAACAGTCCCTCCTCCCAAAAA
AGGAGAGATAAGTGCAAGCATGAGCTAACAACTAAACTTAAGCAGTGCTAATAGAAAAAG
GATTAATAATCCAAAATGGGGTCTATTCTATTCTAACCCGTTGATAAGTCTCATCTAGGA
TAATAGCACCAGTGACAGGAACTCGGTACTTGTAAGAGGTAAAGTCCTTGAAAATGTCAT
CAACGTTAGAGACGTAAGGTCTCAACACATCACAGCTGTTGAATACTAGTTTTCCACATG
TCAAGTGGGAAACAGATCAGCCAATTTTGAAATCATGCTCCAAAAAGCAAATGAGATGGT
TATAAGAAAAAAAAGGATACAGAGCAAAGTGAACTCCTTCAAAGAGAGAGACTTTAACGA
CGGATCAGTCTCCACAGCGTTGTCTTCATAGTACCAGTAAGCGTACTCCACCAGAAACAG
AATCCTCTCGAATGACTGTTGATCTTCTTCTGGTACGTTCAAA*CAAACCGGCTGTAAAC
CAA*GAGAAACCCAAATCGAA*TCACTATCTTAATGATTTCGTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4GE43JQ 789 0 0
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GTTGATCTTCTTCTGGTACGTTCAAAACAAACCGGCTGTAAACCAAAGAGAAACCCAAAT
CGAAATCACTATCTTAATGATTTCGTGAACAAAAAGACATTATACAATGATACCTGCAGA
GATCGTCGAGAAGCTCCTTAGAGGGGAGGCTGTTTCCGACGTTCTTCGATGAGCTTGACG
ATCGGTGCAGATTCGACATTTAGTTTTTTTAGTGTTGTCGCCGGTGAAATCTAATCGCTC
CCGGAGATGTGTAAAGGTGAATATAATATCCGAGATCCGACCCAAGTTTCTGTTGGATAC
ACCGAGAAAAAGTAAAAAGAGATAAATTATATTTAACTTTTACCGCGTAATAAAGAAACA
TTTGACCGTGTCCACCAGGCTAGGCTGACCAAGCCGTCGCTGAAGGAGCCAAATTGTTCC
AAGACCATTGTAATTTCTCCACTTTTCCTTTGTTATTGGTATTTACTACTCTCTTTTTTT
TTGCTAGATTCTAGTAGTTTTGAATTTTGCTATTAAGAATCATGAGTCCTAAACTGTGAC
ATTTCACCATGTTTTGAACTTGTTGTTGCTCGATAGGAATAATGACAACTAGATGGCTCA
TGATTACTCTGCAGATGAGGTTGATGGATGGGAATTCGATTAACTTGAGAAAGAAAGAAC
TGCAATAGT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL6302Contig1 966 2 2 U
TTATCCCTTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTCTGCCATTGCTATTCCTACGATTCTCTGAG
TCTGTGATTTGAGGATCCGACCCAAAAGTTGATGAGACAGAACCCCCCAGAAGCAAAAAA
GGCAACGTGATTTCCGACCAAACCGGTAAGAAAGTTTCTTGATTTTTTGTTGCCTGGAGA
CGACACGGCGATGGAAGTAATGGCGGGAGGAAGATCTACGTTCTCCATCGAAGACTCGGA
AGAACAAGGAAGCGATCTGCCGACGATGACGATGAGGAGGGACAAAGCTTCCTCCTCCTC
CTCTTCTTTCGATACGGTGAACGATGAGGGAGCCGGTTTGAGTCGTGTCGGAAGCGGAAT
CTGGTCAGGACAGACGGCGGATTATTCGTCGGAAAGTTCATCGACCGGAACTCCGGGAGA
CAGCGAGGAGGAGGACGAAGAAAGCGAAGACGATGACAAAGAACTAGGGCTTCGAGGATT
GGCTTCGATGAGCTCTCTCGAAGATTCTCTCCCCAACAAAAGAGGGCTATCGAATCACTA
CAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGAACTTAGGAGAGATCGGGAGTGTGAAAGAAGTACC
AAAGCAAGAGAATCCGTTGAATAAGCGTAGAAGGTTACAGATTTGCAACAAGTTAGCAAG
AAGATCGTTCTACTCGTGGCAAAACCCTAAATCTATGCCTCTTTTGCCTGTAAACGAAGA
TCAAGATGATGATGATGAAGAAGAGGAGGGAGATTTGAGCGATGAAGAGCGAGGAGGACC
AAGAGGAGTTGTCATTGCAAGAAACTCATCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTAGGAG
TTGTTTTGCTCTATCAGATCTGCAGGAAGAAGAAGATGAGTGATTTGATTTAATCAACAA
TAATGCAAATCATGATTTTTTTTTCTTCCTTTGTTCATAGTTTCTCTTTTTTTTCTTTAT
CTAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU41TF U 1
AF RR4BU41JQ C 383
BS 1 566 RR4BU41TF
BS 567 966 RR4BU41JQ

RD RR4BU41TF 569 0 0
TTATCCCTTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTCTGCCATTGCTATTCCTACGATTCTCTGAG
TCTGTGATTTGAGGATCCGACCCAAAAGTTGATGAGACAGAACCCCCCAGAAGCAAAAAA
GGCAACGTGATTTCCGACCAAACCGGTAAGAAAGTTTCTTGATTTTTTGTTGCCTGGAGA
CGACACGGCGATGGAAGTAATGGCGGGAGGAAGATCTACGTTCTCCATCGAAGACTCGGA
AGAACAAGGAAGCGATCTGCCGACGATGACGATGAGGAGGGACAAAGCTTCCTCCTCCTC
CTCTTCTTTCGATACGGTGAACGATGAGGGAGCCGGTTTGAGTCGTGTCGGAAGCGGAAT
CTGGTCAGGACAGACGGCGGATTATTCGTCGGAAAGTTCATCGACCGGAACTCCGGGAGA
CAGCGAGGAGGAGGACGAAGAAAGCGAAGACGATGACAAAGAACTAGGGCTTCGAGGATT
GGCTTCGATGAGCTCTCTCGAAGATTCTCTCCCCAACAAAAGAGGGCTATCGAATCACTA
CAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGA
CTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4BU41JQ 584 0 0
TATTCGTCGGAAAGTTCATCGACCGGAACTCCGGGAGACAGCGAGGAGGAGGACGAAGAA
AGCGAAGACGATGACAAAGAACTAGGGCTTCGAGGATTGGCTTCGATGAGCTCTCTCGAA
GATTCTCTCCCCAACAAAAGAGGGCTATCGAATCACTACAAAGGGAAATCAAAATCGTTT
GGGAACTTAGGAGAGATCGGGAGTGTGAAAGAAGTACCAAAGCAAGAGAATCCGTTGAAT
AAGCGTAGAAGGTTACAGATTTGCAACAAGTTAGCAAGAAGATCGTTCTACTCGTGGCAA
AACCCTAAATCTATGCCTCTTTTGCCTGTAAACGAAGATCAAGATGATGATGATGAAGAA
GAGGAGGGAGATTTGAGCGATGAAGAGCGAGGAGGACCAAGAGGAGTTGTCATTGCAAGA
AACTCATCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTAGGAGTTGTTTTGCTCTATCAGATCTG
CAGGAAGAAGAAGATGAGTGATTTGATTTAATCAACAATAATGCAAATCATGATTTTTTT
TTCTTCCTTTGTTCATAGTTTCTCTTTTTTTTCTTTATCTAAAA

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL6303Contig1 676 2 2 U
GGAAAACCATAAAAAGTAAAACCCTAAATTCCCCAATTCCCATCGACATCCCGCAGGAAT
CTTAGGTTTTCTTTGCTCTAATGGACGGAGATCATTCGCTTCAGGTACCAAAAGAAGCTT
CGAAGACGATGAAAATGACATCTCCCCCGCGTCAAAGAAGTGTTGCACTTGCACGAAAGG
GGATGAAGAAGGTGTTGCAGCTGCGATGATTGTGTCACTCACTGAGAGTCTTCAGAACTC
TGAAGCTAAGCTTGCTTCATGTCAAAGTGAGCTTGAATCAGCAAAAACAGAGATTGGTAA
GTGGATCTTAGCTTTCATGAAAGAATCCTTTGTACCTGCTAGAACAATTCCTGAACCTAA
GTTTGTGATTGACTACATCCAAACTCTTAGATCTTCCGACAAGTCTTTGAAAGAAGAGTT
GGAAATTGCACAAATGAAGTTAGCTATCCGTGATCTCAAATCTCAACTCAAGCCAGAGTC
AATGAAGACAGATGAGGATCCTGAAGTCGATGGCGAGCAGCAAGGATCGACCCCCGCTGG
CCCCTTCTCTCGTATCGCAGAGCTCGAGGATGAGTTGCGAACAGCAAAAAGGGTGATAGC
AGAGATGAGGGGGGTTCAGGCCGTGAGGGTGGATGCACTGGAGAAAGCGCAGGCCATGCA
TGCGGAGCAGTTCGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F304TF U 1
AF RR4F304JQ C 388
BS 1 575 RR4F304TF
BS 576 676 RR4F304JQ

RD RR4F304TF 575 0 0
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CTTAGGTTTTCTTTGCTCTAATGGACGGAGATCATTCGCTTCAGGTACCAAAAGAAGCTT
CGAAGACGATGAAAATGACATCTCCCCCGCGTCAAAGAAGTGTTGCACTTGCACGAAAGG
GGATGAAGAAGGTGTTGCAGCTGCGATGATTGTGTCACTCACTGAGAGTCTTCAGAACTC
TGAAGCTAAGCTTGCTTCATGTCAAAGTGAGCTTGAATCAGCAAAAACAGAGATTGGTAA
GTGGATCTTAGCTTTCATGAAAGAATCCTTTGTACCTGCTAGAACAATTCCTGAACCTAA
GTTTGTGATTGACTACATCCAAACTCTTAGATCTTCCGACAAGTCTTTGAAAGAAGAGTT
GGAAATTGCACAAATGAAGTTAGCTATCCGTGATCTCAAATCTCAACTCAAGCCAGAGTC
AATGAAGACAGATGAGGATCCTGAAGTCGATGGCGAGCAGCAAGGATCGACCCCCGCTGG
CCCCTTCTCTCGTATCGCAGAGCTCGAGGATGAGT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4F304JQ 289 0 0
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CCGTGATCTCAAATCTCAACTCAAGCCAGAGTCAATGAAGACAGATGAGGATCCTGAAGT
CGATGGCGAGCAGCAAGGATCGACCCCCGCTGGCCCCTTCTTTCGTATCGCAGAGCTCGA
GGATGAGTTGCGAACAGCAAAAAGGGTGATAGCAGAGATGAGGGGGGTTCAGGCCGTGAG
GGTGGATGCACTGGAGAAAGCGCAGGCCATGCATGCGGAGCAGTTCGAG

QA 1 289 1 289
DS 



AS 1 2

CO CL6304Contig1 1098 2 10 U
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AATGTCCATGGCTCCCAAGTTAAAACCTCAGCGACTACTCCATCAAAGTATTGTTGAGAG
TGGTGGTGAGCAACTGGTTAAGAAAGCTGGGACGATGACTACCCAATCCTCAATGAGAGA
TGCTTTCTCTGCATACGCTGATTATCTCAACAACTTCAATGAGAAACGAGAGAGAGTGGT
GAAGGCAAGTCGTGACATCACTATGAACAGTAAAAAAGTCATCTTTCAGGTTCACAGGCT
CAGTAAAGACAACAAAGAGGAGGTTCTGGAGAAAGCAGGGAAAGATTTAGAAGCAGTGAG
GGAACAACACTTTGCCCGCCTGATGAAAGAGCTTCAAGGCACTGATTTTTGGAAGCTCCG
CCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAGTATGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAGTTCTG
TGTGTCAGGAACACTCTCTACTCTCGATGAGATTAACGCCACGCTTTTACCGCTTAGTGA
CCCTTCTTTAGAGCCGCTTCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCGGATTT
GACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATTGGTCGGATATCAGATGGTGAAGTCGAGTTTGC
GCAGAGGATTTGTCAGTTTGTCAGACAGATTCATAGGGAACTGTTGCTGGTCGTGCCTCA
GATGGATGACAGTTATGACATGAAGTCAAAGATGGAAGTGATGCTTCAAAGTGTGATCAA
AATAGAGAATGCTTGCTTTAGCGTTCGCGTGAGAGGATCAGAGTATATTCCGCTGCTTGG
AGATGATGCACCAACGTCATTCCTATTGGGAGGTGCTGATGTTGAATGATTTAAGAAGTG
AGTTTTTAATTATATCCGCCTTTCGGACACAACTCCTAGGATCTTGTTAAGGTTGGTATG
TTTTTGGGAGATTGTGAGAAAACGAGGATCATTTTAGTATGGATGCTATGTTGCAAGACT
TTTTAACTTTTTAAGTATGAATGGTATTTTTTCTTGTTCTGTTTGTTCTTATAGAGAAAC
GAATTTATCAAGTGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN42TF U 1
AF RR4FN42JQ C 431
BS 1 769 RR4FN42TF
BS 770 770 RR4FN42JQ
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BS 806 817 RR4FN42TF
BS 818 1098 RR4FN42JQ

RD RR4FN42TF 817 0 0
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AATGTCCATGGCTCCCAAGTTAAAACCTCAGCGACTACTCCATCAAAGTATTGTTGAGAG
TGGTGGTGAGCAACTGGTTAAGAAAGCTGGGACGATGACTACCCAATCCTCAATGAGAGA
TGCTTTCTCTGCATACGCTGATTATCTCAACAACTTCAATGAGAAACGAGAGAGAGTGGT
GAAGGCAAGTCGTGACATCACTATGAACAGTAAAAAAGTCATCTTTCAGGTTCACAGGCT
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GGAACAACACTTTGCCCGCCTGATGAAAGAGCTTCAAGGCACTGATTTTTGGAAGCTCCG
CCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAGTATGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAGTTCTG
TGTGTCAGGAACACTCTCTACTCTCGATGAGATTAACGCCACGCTTTTACCGCTTAGTGA
CCCTTCTTTAGAGCCGCTTCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCGGATTT
GACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATTGGTCGGATATCAGATGGTGAAGTCGAGTTTGC
GCAGAGGATTTGTCAGTTTGTCAGACAGATTCATAGGGAACTGTTGCTGGTCGTGCCTCA
GATGGATGACAGTTATGACATGAAGTCAAAGATGGAAGTGATGCTTCAA*GTGTGATCAA
A*TAGAGA*TGCTTGCTTTAGCGT*CGCGTGAGAGGA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4FN42JQ 668 0 0
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ACACTCTCTACTCTCGATGAGATTAACGCCACGCTTTTACCGCTTAGTGACCCTTCTTTA
GAGCCGCTTCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCGGATTTGACTGGAGAG
CTAATGAGGATGGCGATTGGTCGGATATCAGATGGTGAAGTCGAGTTTGCGCAGAGGATT
TGTCAGTTTGTCAGACAGATTCATAGGGAACTGTTGCTGGTCGTGCCTCAGATGGATGAC
AGTTATGACATGAAGTCAAAGATGGAAGTGATGCTTCAAAGTGTGATCAAAATAGAGAAT
GCTTGCTTTAGCGTTCGCGTGAGAGGATCAGAGTATATTCCGCTGCTTGGAGATGATGCA
CCAACGTCATTCCTATTGGGAGGTGCTGATGTTGAATGATTTAAGAAGTGAGTTTTTAAT
TATATCCGCCTTTCGGACACAACTCCTAGGATCTTGTTAAGGTTGGTATGTTTTTGGGAG
ATTGTGAGAAAACGAGGATCATTTTAGTATGGATGCTATGTTGCAAGACTTTTTAACTTT
TTAAGTATGAATGGTATTTTTTCTTGTTCTGTTTGTTCTTATAGAGAAACGAATTTATCA
AGTGGCCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6305Contig1 1079 2 2 U
GGGAGATCTTTCTTCCCGACTGCCTTTGCTCGTTTCTCCCGCGAAACCCTGGGAATATGA
TGCCTCAGCATCAGATCAAGGAGCAACATAATGCTCTCGTCATGAACAAGAAGATCATGT
CCATCCTTGCCGAGAGGGACGCTGCCGTCAAGGAAAGAAACGAAGCTTTAGCTGCAAAAC
AGGAAGCGTTAGCTGCTCGGGATGAAGCCCTTCAGCAACGTGACTTAGCTATCTCCGAAA
GAGATAATGCTATCATGGAGAGGGATAACGCCTTAACTGCTCTTCAACACCGTGAAAACC
ATCTCAACTACATTCTCGCTTGTGCAAAGCGTGGTGGCTACCAATCCTGTTTCACTGACG
AAACCCACTTACCCAACCCTTCCCCTTTGTCAACCATTCCACATGAATCACCCACTACCA
AAAGGAAAAAAGATCGCAAACAGGAAACGGTGAGGTCAAAGGGAAAGAGAGCCGGCGGCG
AAGATCTGAACCGTCAGCTTGCTTCTCCTGGGAAGAAATGTAGAAAGGATTGGGACTGTA
ACGATGTGGGGTTAAACCTTGTCACTTTCGATGAGACGACAATGCCAGTCCCAATGTGCA
CTTGTACCGGCACTGCTCGTCAGTGTTACAAATGGGGACATGGCGGGTGGCAATCCTCTT
GCTGCACAACCACTTTGTCGCAGTATCCGCTCCCGCAGATGCCAAACAAGCGGCATTCTC
GAGTTGGCGGTAGGAAAATGAGTGGAAACGTCTTCTCCAGGTTACTTAGCCGTTTAGCTG
GAGAAGGCCACGACCTCTCCTCTCCGGTTGATCTCAAGGACTATTGGGCTAGGCATGGCA
CCAACCGCTACATCATTATCAAGTAGCCGAGATTTATGAACCACTATGTTCTATCAGGTG
TGTTTCTCTTTTTTTTTTAACAATTAGGTTCAGAAGTCGGGTGAAAGAAAAGGCTCATTG
TTGTTGTCTATAGTTCAGCTAATGCCAAATGTTTAGTAGTATTGTTTTCACTTGGTTTCG
TGTTTATGTAATTGTAAACAGTCTAGTGAACGATGTCATATTTTATTTTAAGATTTCGG


BQ
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BS 652 1079 RR4DG33JQ

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GAGATAATGCTATCATGGAGAGGGATAACGCCTTAACTGCTCTTCAACACCGTGAAAACC
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DS 

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AATCCTGTTTCACTGACGAAACCCACTTACCCAACCCTTCCCCTTTGTCAACCATTCCAC
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GAAAGGATTGGGACTGTAACGATGTGGGGTTAAACCTTGTCACTTTCGATGAGACGACAA
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ATTGGGCTAGGCATGGCACCAACCGCTACATCATTATCAAGTAGCCGAGATTTATGAACC
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GAAAGAAAAGGCTCATTGTTGTTGTCTATAGTTCAGCTAATGCCAAATGTTTAGTAGTAT
TGTTTTCACTTGGTTTCGTGTTTATGTAATTGTAAACAGTCTAGTGAACGATGTCATATT
TTATTTTAAGATTTCGG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

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AAGCCATGGATCTGCAGCCAGAAGAACTCCAGTTCTTGAAGATTCCTCAACTAGTTCAAG
AATCCATCTCAATCAAGAAACGATCTCCAAGAACCTTCTACCTCATCACCCTCTCCCTCA
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AGCTCTCCTCTTCGGACCCACCTAACTCGGATCGCTCCCGTCACGACTGGACCGTGCTCC
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ATCTCCGCCATCCCCAAAGTCTTTAAACGCCTCTTGATCACTTTCCTTTGGGTTGCTCTC
TTGATGTTCGCTTACAACGCAGTCTTCTTTGTTTTCCTTGTGATACTATTCATAGCTCTC
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GGTTTTCATGTCTATTTCACTGCGTTATGGCATTTAGGTAGCGTGATCTCTGTTCTTGAG
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GGATCGATTTTGGTTCATGGAGGAGGAAAGTTTGGGACTTTGACTAGGACCCTTGTTGGT
GGCTTGCTTGTTGGTGTTCTTGTGATGGTTAATCTTGTGGGTTTGTTGGTTCAAAGTGTG
TTTTATTATGTTTGCAAGAGTTATCATCATCAGACTATTGATAAGACGGCGTTGTATGAT
CATCTTGGTGGGTATCTTGGAGATTATGTGCCTCTTAAGAGCAACATTCAGTTGGAGAAT
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TGAGTTAATGTAAGATTGGAGAAGAAGAGACAGTGGAATTCGAATAATAGTTGTTATCTA
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TTGAAAGG


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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B650TF U 1
AF RR4B650JQ C 401
BS 1 416 RR4B650TF
BS 417 417 RR4B650JQ
BS 418 772 RR4B650TF
BS 773 1208 RR4B650JQ

RD RR4B650TF 777 0 0
GGGACAAACAAATCTCATCTTCCTTTCAGAATTCTCATAACCTTCCATATCAGAAGAAAG
AAGCCATGGATCTGCAGCCAGAAGAACTCCAGTTCTTGAAGATTCCTCAACTAGTTCAAG
AATCCATCTCAATCAAGAAACGATCTCCAAGAACCTTCTACCTCATCACCCTCTCCCTCA
TCTTCCCTCTCTCCTTCGCCATCCTCGCTCACTCCCTCTTTACTCAGCCCATTCTCTCCA
AGCTCTCCTCTTCGGACCCACCTAACTCGGATCGCTCCCGTCACGACTGGACCGTGCTCC
TCATCTTCGAGTTCAGCTACCTCATCTTCCTCTTCGCCTTCTCTCTCCTCTCGACCGCCG
CCGTGGTCTTCACCGTTGCTTCTCTCTACACCGGCAAAACAGTCTCCTTCTCCTCC*ACC
ATCTCCGCCATCCCCAAAGTCTTTAAACGCCTCTTGATCACTTTCCTTTGGGTTGCTCTC
TTGATGTTCGCTTACAACGCAGTCTTCTTTGTTTTCCTTGTGATACTATTCATAGCTCTC
GATATGAACAGTGTAGGCTTAGCGGTTGTCGCTGGAGTTATAATCTCTGTTCTGTATTTC
GGTTTTCATGTCTATTTCACTGCGTTATGGCATTTAGGTAGCGTGATCTCTGTTCTTGAG
CCGGTTTATGGACTTGCTGCCATGAGAAAAGCTTATGAGCTTCTTAAGGGGAAGACTAAG
ATGGCTATGGGGTTGGTCTTTGTTTACCTTTTTCTCTGTGCATTAATTGGAG
TACTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4B650JQ 808 0 0
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CTTTCCTTTGGGTTGCTCTCTTGATGTTCGCTTACAACGCAGTCTTCTTTGTTTTCCTTG
TGATACTATTCATAGCTCTCGATATGAACAGTGTAGGCTTAGCGGTTGTCGCTGGAGTTA
TAATCTCTGTTCTGTATTTCGGTTTTCATGTCTATTTCACTGCGTTATGGCATTTAGGTA
GCGTGATCTCTGTTCTTGAGCCGGTTTATGGACTTGCTGCCATGAGAAAAGCTTATGAGC
TTCTTAAGGGGAAGACTAAGATGGCTATGGGGTTGGTCTTTGTTTACCTTTTTCTCTGTG
CATTAATTGGAGGTACTTTTGGATCGATTTTGGTTCATGGAGGAGGAAAGTTTGGGACTT
TGACTAGGACCCTTGTTGGTGGCTTGCTTGTTGGTGTTCTTGTGATGGTTAATCTTGTGG
GTTTGTTGGTTCAAAGTGTGTTTTATTATGTTTGCAAGAGTTATCATCATCAGACTATTG
ATAAGACGGCGTTGTATGATCATCTTGGTGGGTATCTTGGAGATTATGTGCCTCTTAAGA
GCAACATTCAGTTGGAGAATTTAGACATTTGAGGTCATGGTACTATTTATTCTCTATCTT
TCTATCTCTGTATATTATATTGAGTTAATGTAAGATTGGAGAAGAAGAGACAGTGGAATT
CGAATAATAGTTGTTATCTAATGTGTATGTATTGACTTGAACCCTCTTTTGCTGGTGTTT
TGATTTGATTAATCTATGATTTGAAAGG

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL6307Contig1 1327 2 2 U
GGGGGCTTGAATTGTGTTGACGCCAAGAAATGGAGTTTTAGGTTTGTATCTCTTCTCTGC
TCTATGGCGACGTCTGATCTTCATCACCATTTATCTTCTTCGATGGATTCTAGGGTGGTC
CTTATTCTGAGCCATTAGGTGAAATTCCAATGGAGGTTATTTGTGTCAAATATACGAGTG
GGATCTGTATGTCGGTCTCTTTCGTGTCGTTTGGTTGATTCATCGTTTCTGCCACGTTAC
GGGAATAACTACCATTAACATCTCTCATTCAATACTTGTTATCTCCCTCTCAAGCTGTGA
AATGGCTAACTCATTTACCATTCTTGCTGATCTGAAGTCTGGACATTGTTCATCCACCGT
GGAGGTGCGGCGTCTGTTGGGATTCACGGCGTTAAGTAGCTTTTAAACTAATCGGTATAA
AAGATAAATTGACGGAGGAGAACCAAGCTTAGATAACGGTGTCACTCACCCATTGTTCTT
CCACCGTGCAACTGTTTCAACTCTTGGAAGTAAGGAAAGTTAATCGCTGTGTCGAGTTGA
TGTCTGACACTTATACTCAGGCTTAACTACAAACACCAGCAACGTGCTCTCAAATTCTCG
GATTCTGTATTGTTGCTTAACCAGGCTGTGGTCATTCTTGATGAACCTTAATGGGAAGTG
GAGTCGAAGCTGGTGAATACGCCAGTGATATGGAATAGATTGTAAGGTATTTAGGAGTAA
GTACAGGAATATGCAAGAAGGCTCTCCCCGCTGCGTTGTCAAAATCCTCAAATCTGTCCA
ATTGGGCAAGTTAAGTTTGTTACCAACGTCAATAAGTTAGCTTTCTTTATTTGTCGTTTG
TAGATTCTGATATTTTTCAGTCAATGTCGACTCTTTATTTTAATTCAGCAGGAGAGAAGC
ATCTGTCGCCGTTGTGTTAGAGAGACATAAAACAGAGCAATACGGTTGGTTGATCTGCGT
TTAGGATTTATTTTCCGGCACCAGTCTACCGACGTCCTCCTTAATCACACAACCACAATC
AGACAACAAATGCGGGTTGTCTTCTACAGCTAATGGAAGACCACAAGAGTCATAACCACT
ATCGTCAATGATAAACTTCGTACTGTCACCACCTGTCTCCCCTGCGAAGTCGTTCATGTC
TTTTCATAGATGTTACACCAAGAGTAACCTGATGTCATCAGGATTCATGTTCACTAACCC
TTCGACTCAGGTCTCGAGATCATATAATATGTTTTCTAAAATTACTTAGAGACTAATGTA
ATAAGAAGGTACTTTGAGAAATACCTAAAGACGATGAATCTAATAAGATTGTAATGCTTT
TCTCACC


BQ
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AF RR4FB22TF U 1
AF RR4FB22JQ C 634
BS 1 706 RR4FB22TF
BS 707 1327 RR4FB22JQ

RD RR4FB22TF 720 0 0
GGGGGCTTGAATTGTGTTGACGCCAAGAAATGGAGTTTTAGGTTTGTATCTCTTCTCTGC
TCTATGGCGACGTCTGATCTTCATCACCATTTATCTTCTTCGATGGATTCTAGGGTGGTC
CTTATTCTGAGCCATTAGGTGAAATTCCAATGGAGGTTATTTGTGTCAAATATACGAGTG
GGATCTGTATGTCGGTCTCTTTCGTGTCGTTTGGTTGATTCATCGTTTCTGCCACGTTAC
GGGAATAACTACCATTAACATCTCTCATTCAATACTTGTTATCTCCCTCTCAAGCTGTGA
AATGGCTAACTCATTTACCATTCTTGCTGATCTGAAGTCTGGACATTGTTCATCCACCGT
GGAGGTGCGGCGTCTGTTGGGATTCACGGCGTTAAGTAGCTTTTAAACTAATCGGTATAA
AAGATAAATTGACGGAGGAGAACCAAGCTTAGATAACGGTGTCACTCACCCATTGTTCTT
CCACCGTGCAACTGTTTCAACTCTTGGAAGTAAGGAAAGTTAATCGCTGTGTCGAGTTGA
TGTCTGACACTTATACTCAGGCTTAACTACAAACACCAGCAACGTGCTCTCAAATTCTCG
GATTCTGTATTGTTGCTTAACCAGGCTGTGGTCATTCTTGATGAACCTTAATGGGAAGTG
GAGTCGAAGCTGGTGAATACGCCAGTGATATGGAATAGATTGTAAG
TATTTAGAGTAAGT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FB22JQ 694 0 0
ATTCTTGATGAACCTTAATGGGAAGTGGAGTCGAAGCTGGTGAATACGCCAGTGATATGG
AATAGATTGTAAGGTATTTAGGAGTAAGTACAGGAATATGCAAGAAGGCTCTCCCCGCTG
CGTTGTCAAAATCCTCAAATCTGTCCAATTGGGCAAGTTAAGTTTGTTACCAACGTCAAT
AAGTTAGCTTTCTTTATTTGTCGTTTGTAGATTCTGATATTTTTCAGTCAATGTCGACTC
TTTATTTTAATTCAGCAGGAGAGAAGCATCTGTCGCCGTTGTGTTAGAGAGACATAAAAC
AGAGCAATACGGTTGGTTGATCTGCGTTTAGGATTTATTTTCCGGCACCAGTCTACCGAC
GTCCTCCTTAATCACACAACCACAATCAGACAACAAATGCGGGTTGTCTTCTACAGCTAA
TGGAAGACCACAAGAGTCATAACCACTATCGTCAATGATAAACTTCGTACTGTCACCACC
TGTCTCCCCTGCGAAGTCGTTCATGTCTTTTCATAGATGTTACACCAAGAGTAACCTGAT
GTCATCAGGATTCATGTTCACTAACCCTTCGACTCAGGTCTCGAGATCATATAATATGTT
TTCTAAAATTACTTAGAGACTAATGTAATAAGAAGGTACTTTGAGAAATACCTAAAGACG
ATGAATCTAATAAGATTGTAATGCTTTTCTCACC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6308Contig1 369 2 1 U
GGGGCTTATCTTTTGAGGTCGTAAAGGCCATCAATGGATGATGCTCATCAAACCTTCCTC
TCTCTCTCTCTTATCTCTACATATCTACCTACATACATGAAGCAACTTCCGAGCTTCCTG
CGCCGGACATGAGATGAAACGCGAGACAGAGATAAGGCTGGAGACGGGAGAGTGATCCAT
TTTCTAATGAGGTGTGATAAATCGAAGAAGAGAAAATAGAATTAGAAAATTGGGCAACCA
TGTAACCTTTGGCAGTCAGTACTTGTTTCTTGCTTCTTCTTGTTATTGAAGAGTTTTTAT
TTTTCCAGGTTCTATTAATGAGAACAAGTGATGTGTTTGTGTCTTACTATATACATCTAA
TTTTCCCGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DC12JQ C 1
AF RR4DC12TF U 1
BS 1 369 RR4DC12TF

RD RR4DC12JQ 369 0 0
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TCTCTCTCTCTTATCTCTACATATCTACCTACATACATGAAGCAACTTCCGAGCTTCCTG
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TTTTCCAGGTTCTATTAATGAGAACAAGTGATGTGTTTGTGTCTTACTATATACATCTAA
TTTTCCCGT

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4DC12TF 369 0 0
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TCTCTCTCTCTTATCTCTACATATCTACCTACATACATGAAGCAACTTCCGAGCTTCCTG
CGCCGGACATGAGATGAAACGCGAGACAGAGATAAGGCTGGAGACGGGAGAGTGATCCAT
TTTCTAATGAGGTGTGATAAATCGAAGAAGAGAAAATAGAATTAGAAAATTGGGCAACCA
TGTAACCTTTGGCAGTCAGTACTTGTTTCTTGCTTCTTCTTGTTATTGAAGAGTTTTTAT
TTTTCCAGGTTCTATTAATGAGAACAAGTGATGTGTTTGTGTCTTACTATATACATCTAA
TTTTCCCGT

QA 1 369 1 369
DS 



AS 1 2

CO CL6309Contig1 930 2 4 U
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GGGGAAAGTGATAATCTTGTAAGCTGCAACACTTGCACTTATGCTTATCATGCTAAATGC
CTTATCCCGCCTCTTAAGGATGCTTCTGTTGAGAATTGGAGATGCCCTGAATGCGTTAGT
CCTCTTAGTGAGATGGATAAGATATTGTACTGTGAACTGCGTCCTACCATATCTGATGAA
CAAGACTCCTCCGATACGGCACCAAAGCCAGTTAATGTGAAACAGTATCTTGTCAAGTGG
AAGGGATTATCATACCTTCACTGCTCCTGGGTGCCTGAGAAGGAGTTTGTGAAGGCTTAT
AAGACCAATCATCGTCTAAAAACCAGGGTGAACAACTTTCACCGTCAGAAGCTGGAATCA
TCCAATAACAACGAAGATTATTTTGTCGCCATTCGTCCTGAATGGACCACCGTTGATCGG
ATTCTTGCTTACAGAGAAGAAGATGGCGTGGAACAATATCTCGTGAAGTATAAAGAGCTT
TCTTATGATGAGTGTTACTGGGAATCAGAATCAGACATCTCGACCTTCCAGAATGAAATC
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AGAAATCCCAAAGACTTTCAGCAGTTTGATCATAGTCCTGAGTTCCTCAAAGGTTTGTTG
CATCCGTATCAGCTTGAGGGCCTTAACTTTTTGCGCTTCTCGTGGTCAAAGCAGACGCAC
GTTATCCTTGCCGATGAAATGGGTCTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR36TF U 1
AF RR4DR36JQ C 379
BS 1 727 RR4DR36TF
BS 728 728 RR4DR36JQ
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BS 756 930 RR4DR36JQ

RD RR4DR36TF 755 0 0
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GGGGAAAGTGATAATCTTGTAAGCTGCAACACTTGCACTTATGCTTATCATGCTAAATGC
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CCTCTTAGTGAGATGGATAAGATATTGTACTGTGAACTGCGTCCTACCATATCTGATGAA
CAAGACTCCTCCGATACGGCACCAAAGCCAGTTAATGTGAAACAGTATCTTGTCAAGTGG
AAGGGATTATCATACCTTCACTGCTCCTGGGTGCCTGAGAAGGAGTTTGTGAAGGCTTAT
AAGACCAATCATCGTCTAAAAACCAGGGTGAACAACTTTCACCGTCAGAAGCTGGAATCA
TCCAATAACAACGAAGATTATTTTGTCGCCATTCGTCCTGAATGGACCACCGTTGATCGG
ATTCTTGCTTACAGAGAAGAAGATGGCGTGGAACAATATCTCGTGAAGTATAAAGAGCTT
TCTTATGATGAGTGTTACTGGGAATCAGAATCAGACATCTCGACCTTCCAGAATGAAATC
CAGAGGT*CAAGGATATCAATTCTAGGACTCGCAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4DR36JQ 552 0 0
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TATTTTGTCGCCATTCGTCCTGAATGGACCACCGTTGATCGGATTCTTGCTTACAGAGAA
GAAGATGGCGTGGAACAATATCTCGTGAAGTATAAAGAGCTTTCTTATGATGAGTGTTAC
TGGGAATCAGAATCAGACATCTCGACCTTCCAGAATGAAATCCAGAGGTTCAAGGATATC
AATTTTAGGACTCGCAGAGGTAACAAAGATGTCGACCATAGAAGAAATCCCAAAGACTTT
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ATGGGTCTAGGC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

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GCTCCAAGGTTTGATGGGTTAAGATTCATTGAGACGCTTGTTACTGCTCACCGATAACCA
AAGCATTCTTCTGATTTCAATATAGTTTCTGCAATTTATCAACAATACTTATCCATTTCA
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TGACGACATGTCATGTTATACGAGATTCATGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RR4BO41TF U 1
AF RR4BO41JQ C 56
BS 1 455 RR4BO41TF

RD RR4BO41TF 455 0 0
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AAGAAATCTGGAATCCTCGCAGCTTCCATCTCTGCGGCAGCTTCCGCCACCACCGCCATC
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GCTCCAAGGTTTGATGGGTTAAGATTCATTGAGACGCTTGTTACTGCTCACCGATAACCA
AAGCATTCTTCTGATTTCAATATAGTTTCTGCAATTTATCAACAATACTTATCCATTTCA
ACGTTTAAGTTTTTTTTTTGTTTTATAGTAACTTTGGGTAAATTGTAACACAACATGTTA
TGACGACATGTCATGTTATACGAGATTCATGTGCC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4BO41JQ 400 0 0
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CCATTTCCGCCAACACGAACACCACCGTATCCTTGTTTTTGCCGGAATTTAACCTTTCCC
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AGTTTGCTCCAAGGTTTGATGGGTTAAGATTCATTGAGACGCTTGTTACTGCTCACCGAT
AACCAAAGCATTTTTTTGATTTCAATATAGTTTTTGCAATTTATCAACAATACTTATCCA
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TGTTATGACGACATGTCATGTTATACGAGATTCATGTGCC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 2

CO CL6311Contig1 739 2 1 U
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AACTGATAATCGATGGCAAATAACTCACAGAGTAGCAGCAAGACCCAGGAGAAGAAGAAG
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CGCCGCATCTCCACTAAACCTTCACCGAATCACCACCACCAAGCAGAGGTCATCCGCGTT
AGATTCTCTGAAACAGCCAAACCCGTTATAAACATTGAGCAGAAGAAGACGCTGATCACT
CGAGTGGAGACGACGCTGAAAACGGACGAGAGGTTCACCGACTATATAAAGAAAGCGAAG
CTGAAGATAGGGGCAATGACAATGAACGATGATGTGCCGGATACAAGTGAAAAAGAGACA
CGTGATCATCACCACCACCATGTACCTATCTCTCGTGTGTCGAGAGAGAGCATCAGTGGG
AGATCATCAGATCGTTTCTCTGAGTACATAAACAAGGCGAAGATGAAGCTCAGGTCATCT
TCTACCATCGTTCGTGCGAACACAACTCACAACTCTTTCAAGTACTGATGAGTTTCGACA
GCTTTCTATGAATAATCTTGGTCTTGGCTTGCAATATTATAAGATATCGATTGTGAAATA
TGTTATGAGTTTGAATAATTCTGTTATGGTAAGAAAGAATCCCATTGTATTGTTGAACTC
CATATTGTAATATTTGATG


BQ
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AF RR4A971JQ C 1
AF RR4A971TF U 1
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CTGAAGATAGGGGCAATGACAATGAACGATGATGTGCCGGATACAAGTGAAAAAGAGACA
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AGATCATCAGATCGTTTCTCTGAGTACATAAACAAGGCGAAGATGAAGCTCAGGTCATCT
TCTACCATCGTTCGTGCGAACACAACTCACAACTCTTTCAAGTACTGATGAGTTTCGACA
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TGTTATGAGTTTGAATAATTCTGTTATGGTAAGAAAGAATCCCATTGTATTGTTGAACTC
CATATTGTAATATTTGATG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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CATTAGAGAAAATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E310TF U 1
AF RR4E108TF U 1
BS 1 139 RR4E108TF
BS 140 140 RR4E310TF
BS 141 794 RR4E108TF

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AGCGAGAGAGGACAAAGGAAAAGGAAAACTGATCGAAGTTGATGAAAGTGACGACAGCGA
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CTTGGTTGTGGTCTGTGTGAGCTTAAATTTCGTTTCTTTGTATGCTTGTGACTTTTACTA
CATTAGAGAAAATA

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL6313Contig1 752 2 6 U
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AAAAAAAAAAGTTATTGCCTTTACCTATGAGAGCCAGTGTGGTCCGAACCATCTCTTCCC
TCTTTGCTTCTTCTTCTCAGCATTAGACACGACGAAAATTCTTGTTTCCGACTAAAGTAT
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GGTCAGTAATCATTCTCTTTCCTTCAAAATCATAACAAAATTATAACGAAATTTTAGGGA
TTTTATTGTAATTGTTGCAGTAGTAGCGGTTAGTGCGGTAGTTAGTTAGGTTTAGAAAAA
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AATCCGTGTCAACTAGCGGCGGCAGTATGGGATCCCCCTCGAGCCGGAGCGAACAAACCA
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ACCCCCCCCCCCCTCTCAATTCCTGGATTTGA


BQ
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AF RR4G222JQ U 1
AF RR4GD80JQ U 1
BS 1 417 RR4G222JQ
BS 418 418 RR4GD80JQ
BS 419 528 RR4G222JQ
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BS 530 751 RR4G222JQ
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ACCCCCCCCCCCCTCTCAATTCCTGGATTTG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4GD80JQ 752 0 0
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TCACACGATCTTTTAAAATAAAAAAAATCGGTTCAGGATTTTTATTATATTAACAAAAGA
AAAAAAAAAAGTTATTGCCTTTACCTATGAGAGCCAGTGTGGTCCGAACCATCTCTTCCC
TCTTTGCTTCTTCTTCTCAGCATTAGACACGACGAAAATTCTTGTTTCCGACTAAAGTAT
CCGATTGCAATCTGCCGTCACTGAAGCCTCGATTCCCTTTAATGTGGAAAAACCAAAGTC
GGTCAGTAATCATTCTCTTTCCTTCAAAATCATAACAAAATTATAACGAAATTTTAGGGA
TTTTATTGTAATTGTTGCAGTAGTAGCGGTTAGTGCGGTAGTTAGTTAGGTTTAGAAAAA
TGACAACAACAAGTGGGTCTAATTCTAATCACAACAACCGCCACGACGATGGTTCTGTAA
CCAACAATAACAATAACAATAACCCTAGTACGAGGTCTTGGGGCACGGGGGTTTCAGCTC
AATCCGTGTCAACTAGCGGCGGCAGTATGGGATCCCCCTCGAGCCGGAGCGAACAAACCA
CCACCTTGGCTACTACTACTACTACATCTGCTACCGACAGTGCCTTTCTACAGCTCAATA
ATTTGGATATTCAGGGTGACGATGCTGCTTCTCAAGGACCTTCTGGGTATGTTTACTTTC
ACCCCCCCCCC**TCTCAATTCCTGGATTTGA

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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CCTTGATGGTAACGAGAGGCTTCTTGTCTATGAGTACATGCCGCAAGGAACACTGAGCCA
GCATCTGTTCCACTGGAAAGAAGAAGAGCGTAAACCACTTGATTGGACTAGAAGGTTGGC
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CATCCATAGGGATCTAAAACCATCTAACATCCTTCTTGGTGATGATATGCGTGCTAAAGT
CTCCGACTTTGGGTTAGTCCGCTTAGCCCCTGAAGGCAAATACTCCATCGAGACGAGAGT
CGCTGGGACCTTCGGTTACCTTGCCCCTGAATATGCAGTGACTGGAAGAGTGACGACCAA
GGTAGATATCTTCAGCCTCGGGGTCATATTAATGGAGCTAATCACTGGTCGTAAAGCCTT
AGATGAGACGCAACCTGAGGACAGCGTCCATCTAGTCACATGGTTCCGTCGTGTGGCAGC
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TGAGCCTTACCAAAGACCTGACATGTCTCACATCGTTAACGTTCTTTCTTCGCTCACTGT
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CTCTGGTTCTTCGTCCTCTGTTTATGGAAGCAAAGATAACACACAGACAAGTATCCCAAC
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TGTGACATCTATTTTTCATGAAAACTTTTGGTTTAAGTGC


BQ
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AF RR4GY64TF U 1
AF RR4GY64JQ C 391
BS 1 739 RR4GY64TF
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RD RR4GY64TF 775 0 0
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CCTTGATGGTAACGAGAGGCTTCTTGTCTATGAGTACATGCCGCAAGGAACACTGAGCCA
GCATCTGTTCCACTGGAAAGAAGAAGAGCGTAAACCACTTGATTGGACTAGAAGGTTGGC
TATCGCGTTGGATGTAGCTAGGGGTGTGGAGTATTTACACACGCTTGCTCATCAGAGTTT
CATCCATAGGGATCTAAAACCATCTAACATCCTTCTTGGTGATGATATGCGTGCTAAAGT
CTCCGACTTTGGGTTAGTCCGCTTAGCCCCTGAAGGCAAATACTCCATCGAGACGAGAGT
CGCTGGGACCTTCGGTTACCTTGCCCCTGAATATGCAGTGACTGGAAGAGTGACGACCAA
GGTAGATATCTTCAGCCTCGGGGTCATATTAATGGAGCTAATCACTGGTCGTAAAGCCTT
AGATGAGACGCAACCTGAGGACAGCGTCCATCTAGTCACATGGTTCCGTCGTGTGGCAGC
AAGCAAAGACAAAGACGAGAACGCCTTCAAGAACGCAATAGACCCAAACATCAAGCTGGA
CGAAGTCACCTTAGCCAGCGTTGAAAAAGTTTGGGAGCTTGCTGGTCATTGCTGTGCACG
TGAGCCTTACCAAAGACCTGACATGTCTCACATCGTTAACGTTCTTTCTTCGCTCACTGT
CCAGTGGAAACCCACTGAG*TCGATCCTGATGAC*TTTACG*TATAGATTATGAT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4GY64JQ 730 0 0
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AATGGAGCTAATCACTGGTCGTAAAGCCTTAGATGAGACGCAACCTGAGGACAGCGTCCA
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GAACGCAATAGACCCAAACATCAAGCTGGACGAAGTCACCTTAGCCAGCGTTGAAAAAGT
TTGGGAGCTTGCTGGTCATTGCTGTGCACGTGAGCCTTACCAAAGACCTGACATGTCTCA
CATCGTTAACGTTCTTTCTTCGCTCACTGTCCAGTGGAAACCCACTGAGGTCGATCCTGA
TGACCTTTACGGTATAGATTATGATCTTCCGCTTCCGCAGGCGGTTAAGAAATGGCAAGC
TTCTGAAGGGCTTAGCCAAACGGGAGATGACTCTGGTTCTTCGTCCTCTGTTTATGGAAG
CAAAGATAACACACAGACAAGTATCCCAACACGCCCGTCTGGATTTGCTGACTCGTTCAC
ATCTGTGGATGGACGTTGAAGAAAATAAAAGACTGCGTTTTTCAGTTTCGTTAAAAACGT
TTTTAGTAGTATAGAAGTAGTAGATGAAGAATCCTTGTGTGAAAAAAGTTCCTATTTTCT
TGTTCTTTGTTTTTGTCTGAAGCATTTACTTGTGACATCTATTTTTCATGAAAACTTTTG
GTTTAAGTGC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6315Contig1 949 2 2 U
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TTCCAAATTTCTGTCAGATTCCAACATCCAGAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAGAGAAACAA
TGAACATCTTCTCCAAGAAACCTAATCCCAGAGAAGTGCTTAGGGAGAGTAAGAGAGAGA
TGACTCAAGCTACTAGAGGAATCGAAAAGGAAATCTCTTCTCTGCAATCAGAAGAGAAAA
AGCTCCTTCTCGAGATCAAAAGAACTGCTAAAACAGGGAATGAGGGAGCGACCAAGACTC
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AACTGCGTGGCATAGCTACTCATACACAGGCTATGCATGCACATACTTCGGTTGCTGCAG
GAATCCAAGGTGCCACTAAGGCTATGACAGCTATGAGCAAGAATATGGATCCAGCAAAAC
AGGCTAAGGTTATGAGAGAATTCCAAAAGCAGTCTGCGCAAATGGACATGACTACTGAGA
GGATGTCAGATTCCATAGACGACGTTTTAGACAATGACGAGGCTGAAGACGAAACAGAGG
ATCTGACCAACCAGGTTCTTGATGAAATCGGCATTGATATCGCATCACAGTTATCATCCG
CTCCAAGAGGTAAAATTGGGAGAAAGGATGCAGAAGATGTCAGCAGCAGTTCTGAAATCG
ATGAACTGGAGAAGCGTTTGGCGGCACTTAGATAGAAAGAAAGAGGTGACATTCATTACA
TTCACTCTTCATTCAGTGTGTCCTTTTTACAGCTTGAATTTCGAGATATGTAAACAATTA
AACAAATATTAGTGATTATATTTTCCTCTGGACCTTTTTCCCCTTTGCAATGTACAAAAC
TTTTCTTCAAAACGCAATTAAAGGCAACAATATATGTAATGTTGTTGAC


BQ
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AF RR4G266TF U 1
AF RR4G266JQ C 294
BS 1 664 RR4G266TF
BS 665 949 RR4G266JQ

RD RR4G266TF 664 0 0
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TTCCAAATTTCTGTCAGATTCCAACATCCAGAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAGAGAAACAA
TGAACATCTTCTCCAAGAAACCTAATCCCAGAGAAGTGCTTAGGGAGAGTAAGAGAGAGA
TGACTCAAGCTACTAGAGGAATCGAAAAGGAAATCTCTTCTCTGCAATCAGAAGAGAAAA
AGCTCCTTCTCGAGATCAAAAGAACTGCTAAAACAGGGAATGAGGGAGCGACCAAGACTC
TTGCTCGGCAACTCATCCGGCTAAGGCAGCAGATAGCTAACTTACAAGGTAGCCGAGCTC
AACTGCGTGGCATAGCTACTCATACACAGGCTATGCATGCACATACTTCGGTTGCTGCAG
GAATCCAAGGTGCCACTAAGGCTATGACAGCTATGAGCAAGAATATGGATCCAGCAAAAC
AGGCTAAGGTTATGAGAGAATTCCAAAAGCAGTCTGCGCAAATGGACATGACTACTGAGA
GGATGTCAGATTCCATAGACGACGTTTTAGACAATGACGAGGCTGAAGACGAAACAGAGG
ATCTGACCAACCAGGTTCTTGATGAAATCGGCATTGATATCGCATCACAGTTATCATCCG
CTCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4G266JQ 656 0 0
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CGAGCTCAACTGCGTGGCATAGCTACTCATACACAGGCTATGCATGCACATACTTCGGTT
GCTGCAGGAATCCAAGGTGCCACTAAGGCTATGACAGCTATGAGCAAGAATATGGATCCA
GCAAAACAGGCTAAGGTTATGAGAGAATTCCAAAAGCAGTCTGCGCAAATGGACATGACT
ACTGAGAGGATGTCAGATTCCATAGACGACGTTTTAGACAATGACGAGGCTGAAGACGAA
ACAGAGGATCTGACCAACCAGGTTCTTGATGAAATCGGCATTGATATCGCATCACAGTTA
TCATCCGCTCCAAGAGGTAAAATTGGGAGAAAGGATGCAGAAGATGTCAGCAGCAGTTCT
GAAATCGATGAACTGGAGAAGCGTTTGGCGGCACTTAGATAGAAAGAAAGAGGTGACATT
CATTACATTCACTCTTCATTCAGTGTGTCCTTTTTACAGCTTGAATTTCGAGATATGTAA
ACAATTAAACAAATATTAGTGATTATATTTTCCTCTGGACCTTTTTCCCCTTTGCAATGT
ACAAAACTTTTCTTCAAAACGCAATTAAAGGCAACAATATATGTAATGTTGTTGAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL6316Contig1 1079 2 2 U
GGACACTTGAATTTTCTTCTTTCTCCTCTTAAGGTTTAAGAATCTGTACTGCCATTTTCT
CGGTAAAATGGGAACCCGCATTCAATCCTTCTTGCTCCTGTTATTGCTTTCATGTTTAAT
CTTTATATCGGCGACCTCATCCGAGCAAAAAGGTGATGGAACCCTTAGAATTGGATTGAA
GAAAAGGAAACTAGACCGCCCAACAGGCTAGCTTCTCAGCTTTTTTTGAAAAACCGAGGG
TCTTGGTCTTCCAAAGGTTTTTTTCACCTGCTTAATGATGGCAATTCGGATACTGTTCCC
CTGAAAAACTATTTGGATGCTCAATACTATGGTGACATTACCATTGGTACACCACCTCAG
AAGTTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATCTCTGGATGCCATCTTCTAAATGC
TACTTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACTCAGCTAGTGAGTCATCAACATAC
AAAAAGAACGGAAAACCTGCATCAATCCGCTATGGGACAGGTGCTATATCTGGTTACTTT
AGCAATGATGATGTTAAAGTTGGTGATCTTGTTATCAAGGATCAGGAATTCATAGAGGCA
ACCAATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTAGCCAAGTTTGATGGAATCCTAGGGTTAGGA
TTCAAAGAGATTGCTGTTGGAAATTCAACACCGGTTTGGTATAACATGGTAGGAAAAGGT
CTGGTTAAGGAACCGATATTTTCGTTTTGGCTTAACCAAACCCTTTGATCTCTCACCTCA
AGATTATATATTCAAGATTGGGGATGGAGTTCAGTCTCAGTGCACCAGTGGTTTCACTGC
TATGGACATCCCTCCACCTCGTGGACCTCTCTGGATCTTGGGTGATATCTTCATGGGACC
ATACCATACTGTGTTCGATTATGGAAAAGCAAGAGTTGGATTCGCAAAATCTGCTTAAAA
ATATCTCTTCTTTAACACCCTTTGTTAATATTATATTGACTATATTTGTGAATGTGTTTA
AATCTTAAATGGTTGTAATAACTTAAAAGCACTGCTATCTTAGAATGGTGTATCATCTT


BQ
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AF RR4G824TF U 1
AF RR4G824JQ C 338
BS 1 709 RR4G824TF
BS 710 1079 RR4G824JQ

RD RR4G824TF 709 0 0
GGACACTTGAATTTTCTTCTTTCTCCTCTTAAGGTTTAAGAATCTGTACTGCCATTTTCT
CGGTAAAATGGGAACCCGCATTCAATCCTTCTTGCTCCTGTTATTGCTTTCATGTTTAAT
CTTTATATCGGCGACCTCATCCGAGCAAAAAGGTGATGGAACCCTTAGAATTGGATTGAA
GAAAAGGAAACTAGACCGCCCAACAGGCTAGCTTCTCAGCTTTTTTTGAAAAACCGAGGG
TCTTGGTCTTCCAAAGGTTTTTTTCACCTGCTTAATGATGGCAATTCGGATACTGTTCCC
CTGAAAAACTATTTGGATGCTCAATACTATGGTGACATTACCATTGGTACACCACCTCAG
AAGTTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATCTCTGGATGCCATCTTCTAAATGC
TACTTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACTCAGCTAGTGAGTCATCAACATAC
AAAAAGAACGGAAAACCTGCATCAATCCGCTATGGGACAGGTGCTATATCTGGTTACTTT
AGCAATGATGATGTTAAAGTTGGTGATCTTGTTATCAAGGATCAGGAATTCATAGAGGCA
ACCAATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTAGCCAAGTTTGATGGAATCCTAGGGTTAGGA
TTCAAAGAGATTGCTGTTGGAAATTCAACACCGGTTTGGTATAACATGG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4G824JQ 742 0 0
TTACCATTGGTACACCACCTCAGAAGTTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATC
TCTGGATGCCATCTTCTAAATGCTACTTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACT
CAGCTAGTGAGTCATCAACATACAAAAAGAACGGAAAACCTGCATCAATCCGCTATGGGA
CAGGTGCTATATCTGGTTACTTTAGCAATGATGATGTTAAAGTTGGTGATCTTGTTATCA
AGGATCAGGAATTCATAGAGGCAACCAATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTAGCCAAGT
TTGATGGAATCCTAGGGTTAGGATTCAAAGAGATTGCTGTTGGAAATTCAACACCGGTTT
GGTATAACATGGTAGGAAAAGGTCTGGTTAAGGAACCGATATTTTCGTTTTGGCTTAACC
AAACCCTTTGATCTCTCACCTCAAGATTATATATTCAAGATTGGGGATGGAGTTCAGTCT
CAGTGCACCAGTGGTTTCACTGCTATGGACATCCCTCCACCTCGTGGACCTCTCTGGATC
TTGGGTGATATCTTCATGGGACCATACCATACTGTGTTCGATTATGGAAAAGCAAGAGTT
GGATTCGCAAAATCTGCTTAAAAATATCTCTTCTTTAACACCCTTTGTTAATATTATATT
GACTATATTTGTGAATGTGTTTAAATCTTAAATGGTTGTAATAACTTAAAAGCACTGCTA
TCTTAGAATGGTGTATCATCTT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL6317Contig1 410 2 2 U
GCTATCTTCCTTTTGCACTTGCAAACGCTCTAACCGCAAGATTGAATGCTGGGGTTCCTC
TTGTCGACGAGTTATGGGTTCTTCTTGGCTACTGCATATTCACAGTGTCGTTATACTTGC
ACTTTGCCACATCGGTCATACATGAGATCACTGCGGCTCTTGGAATCTACTGCTTCAGGA
TCACGAAGAAGCTTGAAAAGAAACCCTGAGGGTAATGTTAATTGTTTTGTTTGGACCGTT
TGATCAATACGGAGAATGATCAATGTGGACCTCCTCCCTGGATCAGTGATGTATTTCTTC
TTATTCATCTTGTGTTTGTTTATCTTTGGGAAAAAATACAAAAAGTTATTAATATTCTCT
TAACTGCTATCATATACACTAAAATTGTAGTTTTAGAGTTTTAGTGTTAC


BQ
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AF RR4F233TF U 1
AF RR4A308JQD C 9
BS 1 368 RR4F233TF
BS 369 410 RR4A308JQD

RD RR4F233TF 368 0 0
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TTGTCGACGAGTTATGGGTTCTTCTTGGCTACTGCATATTCACAGTGTCGTTATACTTGC
ACTTTGCCACATCGGTCATACATGAGATCACTGCGGCTCTTGGAATCTACTGCTTCAGGA
TCACGAAGAAGCTTGAAAAGAAACCCTGAGGGTAATGTTAATTGTTTTGTTTGGACCGTT
TGATCAATACGGAGAATGATCAATGTGGACCTCCTCCCTGGATCAGTGATGTATTTCTTC
TTATTCATCTTGTGTTTGTTTATCTTTGGGAAAAAATACAAAAAGTTATTAATATTCTCT
TAACTGCT

QA 1 368 1 368
DS 

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GAGTTATGGGTTTTTCTTGGCTACTGCATATTCACAGTGTCGTTATACTTGCACTTTGCC
ACATCGGTCATACATGAGATCACTGCGGCTCTTGGAATCTACTGCTTCAGGATCACGAAG
AAGCTTGAAAAGAAACCCTGAGGGTAATGTTAATTGTTTTGTTTGGACCGTTTGATCAAT
ACGGAGAATGATCAATGTGGACCTCCTCCCTGGATCATTGATGTATTTCTTCTTATTCAT
CTTGTGTTTGTTTATCTTTGGGAAAAAATACAAAAAGTTATTAATATTTTCTTAACTGCT
ATCATATACACTAAAATTGTAGTTTTAGAGTTTTAGTGTTAC

QA 1 402 1 402
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAGTTCAAGTTCCAGGTGAGTTCAGCTTGGCCCAGACTTGGCTCGTGTCTGGAGATCGCA
CTCATCTTAACACAATTTAAGCTGGTTTGCAGGTTTATCCGGGAAAATATGGTGATTATA
ACGTAAGATTATTTGTTTACTGGACGGCCGATGGATACCAAAAGACAGGGTGCTACAACA
CCGACTGCTCAGGTTTCGTTCAAAGGAGCACTGTTATCACAGTAGGTGGAACCTTCAACC
CCGTCTCAGTATACAACGGAAATCAATACGAGCTCTCCATGCTTATATGGAAGGACCGCG
GTAGCGGAAACTGGTGGCTACGGATAGGTGAAGAGTTTGTGGGGTACTGGCCTGGCCAGT
TATTCAATTCTATAGGAAGTGGAGCTACGGTAGTTCAATGGGGAGGTGAAATCGTTAACT
TGGCGACTGGTGGGCAACACACGACCACGGACATGGGAAGTGGACATTTTGCAGAGGAAG
GTTTTGGGAAAGCGAGCTTTTTCAGGAATCTTATGACGGTCGATGGAACCAATACTCTGA
GAGAACCACAAAGAGTTAACCCCATAGTGACCAATGCTAACTGTTACAACATTAAGGCAG
GACAAGCTGGAACTACCTGGGGGGTTAATTTCTTTTACGGTGGCCCTGGCAGGAACGCTA
GATGCCCTTGATTCGGATCTGTCTTCTCAAAGATTTTGAGTATTTTACATACATGTCTGC
ATGTATCTGCCTATGAACGTATGAGTAAGAAAAATAATTCACGTCATAGAAGTTGATATC
ATATGTGTCCTTGTATAATACGTGTGTAATAATAATAATAATAATATGTTTGAC


BQ
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AF RR4ER48TF U 1
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BS 548 894 RR4ER48JQ

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GTAGCGGAAACTGGTGGCTACGGATAGGTGAAGAGTTTGTGGGGTACTGGCCTGGCCAGT
TATTCAATTCTATAGGAAGTGGAGCTACGGTAGTTCAATGGGGAGGTGAAATCGTTAACT
TGGCGACTGGTGGGCAACACACGACCACGGACATGGGAAGTGGACATTTTGCAGAGGAAG
GTTTTGG

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DS 

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CAGTTATTCAATTCTATAGGAAGTGGAGCTACGGTAGTTCAATGGGGAGGTGAAATCGTT
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CTGAGAGAACCACAAAGAGTTAACCCCATAGTGACCAATGCTAACTGTTACAACATTAAG
GCAGGACAAGCTGGAACTACCTGGGGGGTTAATTTCTTTTACGGTGGCCCTGGCAGGAAC
GCTAGATGCCCTTGATTCGGATCTGTCTTCTCAAAGATTTTGAGTATTTTACATACATGT
CTGCATGTATCTGCCTATGAACGTATGAGTAAGAAAAATAATTCACGTCATAGAAGTTGA
TATCATATGTGTCCTTGTATAATACGTGTGTAATAATAATAATAATAATATGTTTGAC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

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TCATCTCCTAAACAAAAACAAAAATGTATATTATAACATCAAACTCCAAATATTATATGA
TCTTAATACTATCCATATTCAGCTTATTATTCTCCCTCCAAGTAACTAATGGAGACTATG
GAGGTTGGCAAGGTGGTCATGCCACGTTCTACGGTGGCGGCGACGCTTCCGGCACCATGG
GTGGAGCTTGTGGCTATGGAAATCTGTATAGCCAAGGTTACGGAACCAACACCGCGGCTT
TGAGTACAGCTCTGTTTAACAACGGACTCACCTGCGGTGCGTGCTACGAGATGAAGTGCA
ACGATGACCCGAGATGGTGTCTCGGTTCCACTATCACCGTCACGGCTACAAACTTTTGTC
CACCGAACTTGGGTCTCTCCAACGACAATGGTGGATGGTGCAATCCTCCTCTTCAACACT
TCGACCTAGCCGAGCCAGCTTTTCTCCAAATCGCTCAGTATCGTGCCGGCATTGTCCCCG
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ATGGTCGGACCGTGGTTAGCAATGACGTGGCTCCTTCTAATTGGCAGTTCGGACAAACCT
TCCAAGGTGGTCAGTTCTGAGTCCACACTTCATCCTCTCTATGTTTTGGTGGTGCTGGTG
TGGCTGCGTATTGCTGAGGTGGCTCGTTAACACCCGCTAAACCTAGCCTTCTTCACTTTC
TTTTTTTGTGTCTCTTATTTACGAGTTGTTGCGTACTATGCTTGTATTTCTCGTTCCTAC
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10 10 

AF RR4BO79TF U 1
AF RR4BO79JQ C 372
BS 1 645 RR4BO79TF
BS 646 646 RR4BO79JQ
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BS 655 655 RR4BO79JQ
BS 656 672 RR4BO79TF
BS 673 1022 RR4BO79JQ

RD RR4BO79TF 685 0 0
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TCATCTCCTAAACAAAAACAAAAATGTATATTATAACATCAAACTCCAAATATTATATGA
TCTTAATACTATCCATATTCAGCTTATTATTCTCCCTCCAAGTAACTAATGGAGACTATG
GAGGTTGGCAAGGTGGTCATGCCACGTTCTACGGTGGCGGCGACGCTTCCGGCACCATGG
GTGGAGCTTGTGGCTATGGAAATCTGTATAGCCAAGGTTACGGAACCAACACCGCGGCTT
TGAGTACAGCTCTGTTTAACAACGGACTCACCTGCGGTGCGTGCTACGAGATGAAGTGCA
ACGATGACCCGAGATGGTGTCTCGGTTCCACTATCACCGTCACGGCTACAAACTTTTGTC
CACCGAACTTGGGTCTCTCCAACGACAATGGTGGATGGTGCAATCCTCCTCTTCAACACT
TCGACCTAGCCGAGCCAGCTTTTCTCCAAATCGCTCAGTATCGTGCCGGCATTGTCCCCG
TCTCTTTTCGAAGAGTACCGTGCATGAAGAAAGGAGGGATAAGGTTTACGATCAACGGAC
ACTCTTACTTCAACCTCGTTCTGGTCTCAAACGTAGGAGGAGCAG*AGACGTCA*TGCCG
TCTCGATCAGAG
CTCAAAACAGGTC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BO79JQ 651 0 0
AGATGGTGTCTCGGTTCCACTATCACCGTCACGGCTACAAACTTTTGTCCACCGAACTTG
GGTCTCTCCAACGACAATGGTGGATGGTGCAATCCTCCTCTTCAACACTTCGACCTAGCC
GAGCCAGCTTTTCTCCAAATCGCTCAGTATCGTGCCGGCATTGTCCCCGTCTCTTTTCGA
AGAGTACCGTGCATGAAGAAAGGAGGGATAAGGTTTACGATCAACGGACACTCTTACTTC
AACCTCGTTCTGGTCTCAAACGTAGGAGGAGCAGGAGACGTCAATGCCGTCTCGATCAGA
GGCTCAAAAACAGGGTCTTGGCAAGCAATGTCTAGGAACTGGGGCCAAAACTGGCAGAGC
AATTCTTACCTCAACGGTCAGAGCCTCTCCTTCCAGGTCACCACCAGCGATGGTCGGACC
GTGGTTAGCAATGACGTGGCTCCTTCTAATTGGCAGTTCGGACAAACCTTCCAAGGTGGT
CAGTTCTGAGTCCACACTTCATCCTCTCTATGTTTTGGTGGTGCTGGTGTGGCTGCGTAT
TGCTGAGGTGGCTCGTTAACACCCGCTAAACCTAGCCTTCTTCACTTTCTTTTTTTGTGT
CTCTTATTTACGAGTTGTTGCGTACTATGCTTGTATTTCTCGTTCCTACAA

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL6321Contig1 1013 2 2 U
GGATTGTTTTGAAAATCGGTGAGCCCTAGAATTCGAGAGAGAGAGAGTGGAGTGCGAGAG
CGTAGCAGTAAAAGTGTTGCCGTTGGTAACTAACTCTCGTCGATATCTCTCTTGCTCTTG
GATTCGACTCTGTTTCGAGAAAGCTACTGCTTCAGGGTGCAGGTCTTACCACGAGATGAA
TTCATATCCATCACGAAATCATATGCAACAACCTGCTACAACAAGCACAACCAAGGAGAC
AAGCTTGCCTACTTCTAATCCTCATTGGTTCCATTCTTACTTCCCTGTTCCAAGGACCAC
AGGCTTTGATCTTTCTCAAGTCCCTCAAGCAGAACCTGCTGAAGCTACCATGGTACCTCA
AGTTCATTTGTTTCCTCCTCCTACATTAGACTCTAGGCACGATATGGAGCAGAAGTCCAC
GAAGCTGTCTCCTTCGTTGAAGCCAAAACCACAAAGTAAGAAACGCTCTGCACCCAAAAC
CCCAAAGAAGACACTGAGCGTACCCGAAATAAAGCGAGAGAAAAAGAATCCTGACATCAA
CGTTGTTGACATCTCCAGCTTCGATGTTTCGGGTGCTCCTCCTCCTGTCTGTTCGTGTAC
AGGCGTTCCAAAGGTTTGCTACAAATGGGGCATGGGCGGTTGGCAATCGTCGTGCTGTAC
CATCAGCATATCGACGTTCCCACTGCCCATGAGCACCACGAGGCCTGGAACTCGTCTCGC
CGGAAGGAAAATGAGCAATGGTGCTTATGTCAAGCTACTTATGAGACTTGCTGGTGAAGG
CTATGACTTGACTTGCCCGGTTGACCTCAGTAACCATTGGGCCAGGCATGGTACTAACAA
GTTCGTGACCATCAAGTAGTCCTTTTGATCAGTTGGGGTTTGGTTTTAGGCTTTTAGCTT
TTGTGATTTCCATGTATCTTCGTTTTAGTCTTATCTTTACGTACATATGTTTTGTAGTGG
CTTTAAAATCATGAAGGAGATTCAGTGTCTATGATCAATAGAACAAGGCATCG


BQ
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AF RR4CX71TF U 1
AF RR4CX71JQ C 340
BS 1 704 RR4CX71TF
BS 705 1013 RR4CX71JQ

RD RR4CX71TF 717 0 0
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CGTAGCAGTAAAAGTGTTGCCGTTGGTAACTAACTCTCGTCGATATCTCTCTTGCTCTTG
GATTCGACTCTGTTTCGAGAAAGCTACTGCTTCAGGGTGCAGGTCTTACCACGAGATGAA
TTCATATCCATCACGAAATCATATGCAACAACCTGCTACAACAAGCACAACCAAGGAGAC
AAGCTTGCCTACTTCTAATCCTCATTGGTTCCATTCTTACTTCCCTGTTCCAAGGACCAC
AGGCTTTGATCTTTCTCAAGTCCCTCAAGCAGAACCTGCTGAAGCTACCATGGTACCTCA
AGTTCATTTGTTTCCTCCTCCTACATTAGACTCTAGGCACGATATGGAGCAGAAGTCCAC
GAAGCTGTCTCCTTCGTTGAAGCCAAAACCACAAAGTAAGAAACGCTCTGCACCCAAAAC
CCCAAAGAAGACACTGAGCGTACCCGAAATAAAGCGAGAGAAAAAGAATCCTGACATCAA
CGTTGTTGACATCTCCAGCTTCGATGTTTCGGGTGCTCCTCCTCCTGTCTGTTCGTGTAC
AGGCGTTCCAAAGGTTTGCTACAAATGGGGCATGGGCGGTTGGCAATCGTCGTGCTGTAC
CATCAGCATATCGACGTTCCCACTGCCCATGAGCACCACGAGGC
TGGACTCGTCTCG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4CX71JQ 674 0 0
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CGATATGGAGCAGAAGTCCACGAAGCTGTCTCCTTCGTTGAAGCCAAAACCACAAAGTAA
GAAACGCTCTGCACCCAAAACCCCAAAGAAGACACTGAGCGTACCCGAAATAAAGCGAGA
GAAAAAGAATCCTGACATCAACGTTGTTGACATCTCCAGCTTCGATGTTTCGGGTGCTCC
TCCTCCTGTCTGTTCGTGTACAGGCGTTCCAAAGGTTTGCTACAAATGGGGCATGGGCGG
TTGGCAATCGTCGTGCTGTACCATCAGCATATCGACGTTCCCACTGCCCATGAGCACCAC
GAGGCCTGGAACTCGTCTCGCCGGAAGGAAAATGAGCAATGGTGCTTATGTCAAGCTACT
TATGAGACTTGCTGGTGAAGGCTATGACTTGACTTGCCCGGTTGACCTCAGTAACCATTG
GGCCAGGCATGGTACTAACAAGTTCGTGACCATCAAGTAGTCCTTTTGATCAGTTGGGGT
TTGGTTTTAGGCTTTTAGCTTTTGTGATTTCCATGTATCTTCGTTTTAGTCTTATCTTTA
CGTACATATGTTTTGTAGTGGCTTTAAAATCATGAAGGAGATTCAGTGTCTATGATCAAT
AGAACAAGGCATCG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL6322Contig1 1613 2 2 U
GTTCTAGAACCAAAACGAAAAGAATCAGTGTCGGCTCTTGGGTTCTAAATAAAAACGCTG
AGACCTGAAACCACACACACCAAAAAGGTTACACGCCGGATCGAAATGTTTTTCTACTCC
TCGGAAACAGTTTCTTTGGGCAATGTGCTGTAGCTGAGTGACTCTCCCAGTTAGCCAAGT
GAAACTTGGAAGTTTCTTTTTTTGATCAACAAAACTTGGAAGTTTTAAACTACTCGCGAG
TTGGGTTTTGCGAGAGTGACCAAGTTTCCAGAATGTTCTACTTCAAGCATTGGTTGACTC
TTGTGTTTGTTTGGATGGCAGTCCACCAGCTTATCATCTACACAGAGGTTCTGGAACTGG
GATCAATAGCTGGTTGATACAGCTTGAGGGAGGAGGATGGTTTCATAATGTTACAAACTG
CGTTAGTCGGATGCATACTAAATTAGGTTCATCGAAGAAAATGGTGGAGAATCTTGCTTT
CTCTGCTATTCTTAGCAATAAGGAACAACGTAATCCTGATTTTTACAATTGGAACAGAGT
AAAAGTTAGATATTGTGATGGGTCATCATTCACAGGAGATGTGCAAGCGGTGAACCCTGC
TAATAATCTTCACTTCAGAGGGGCTCGAGTTTGGCTAGCCGTTATGCAGGAGCTGCTAGC
TAAAGGCATGAGAAACGCCGAGAATGCTGTTTTGTCTGGGTGTTCTGCTGGTGGGTTAGC
TTCACTGATGCATTGTGACAGTTTCCGAGCTCTATTACCAATGGGTACCAATGTAAAGTG
TATTTCAGATGCTGGTTTCTTTCTCGACACAAGAGATGTCTCAGGAGCTCAATACATTAA
ATCATACTTCAACGATGTGGTTACACTACATGGATCAGCAAAGAATTTGCCGAGGTCATG
CACATCAAGATTGACCCCTGCAATGTGTTTCTTCCCACAATACGTGGCTCGCAAGATTAC
AACTCCTGTTTTCATTCTTAATGCTGCATACGACTCTTGGCAGATTAAGAACATTTTGGC
TCCTCGTGCTGCTGATCCTGATGGACAGTGGCAGAGTTGTCAGCTTGACATCAGGAATTG
CCAACGAAGCCAGATTAAAGTTATGCAAGATTTCAGGTTAGAGTTCTTGAGCGCAGTGAT
AGGTTTAGGAAGATCTGCATCAAGAGGGATGTTTATAGACTCATGCTACACTCACTGCCA
AACCGAGACACAAACTTCTTGGTTCTGGCAAGATTCTCCAATTATAAACCGAACGACAAT
AGCAAAAGCTGTTGGAGATTGGTTTTATGACAGAAAATTGTTTCAGAAGATAGATTGTCC
TTACCCTTGTAACCCTACTTGCCACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATCCTCCTCCAAT
TTAAGAGATTCTATATTATGAATTTATTAATTTTAAAAAAAAATTCTTATAAATTATTCT
TTGTCCCACAATATAGTGATATTTTAGGGTTTAGCTATATATAGAAGAGAAAGAAAAAGA
GTGTGATTGATTCTTGAAGGTTGAGGATAAGCTTTGTTCAGCACTTGTCTTGTGTGCTGG
TTGAGTTCCTCTGTTTTTTTCTTCCATTTTTATGTAAAACGGGAAATTGTTAC


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AF RR4AQ19TF U 1
AF RR4AQ19JQ C 758
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BS 821 1613 RR4AQ19JQ

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TTGTGTTTGTTTGGATGGCAGTCCACCAGCTTATCATCTACACAGAGGTTCTGGAACTGG
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CGTTAGTCGGATGCATACTAAATTAGGTTCATCGAAGAAAATGGTGGAGAATCTTGCTTT
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AAAAGTTAGATATTGTGATGGGTCATCATTCACAGGAGATGTGCAAGCGGTGAACCCTGC
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TTCACTGATGCATTGTGACAGTTTCCGAGCTCTATTACCAATGGGTACCAATGTAAAGTG
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DS 

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GTCTCAGGAGCTCAATACATTAAATCATACTTCAACGATGTGGTTACACTACATGGATCA
GCAAAGAATTTGCCGAGGTCATGCACATCAAGATTGACCCCTGCAATGTGTTTCTTCCCA
CAATACGTGGCTCGCAAGATTACAACTCCTGTTTTCATTCTTAATGCTGCATACGACTCT
TGGCAGATTAAGAACATTTTGGCTCCTCGTGCTGCTGATCCTGATGGACAGTGGCAGAGT
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TTAGAGTTCTTGAGCGCAGTGATAGGTTTAGGAAGATCTGCATCAAGAGGGATGTTTATA
GACTCATGCTACACTCACTGCCAAACCGAGACACAAACTTCTTGGTTCTGGCAAGATTCT
CCAATTATAAACCGAACGACAATAGCAAAAGCTGTTGGAGATTGGTTTTATGACAGAAAA
TTGTTTCAGAAGATAGATTGTCCTTACCCTTGTAACCCTACTTGCCACCACAGGGTTTTC
ACTCCTCAAGATCCTCCTCCAATTTAAGAGATTCTATATTATGAATTTATTAATTTTAAA
AAAAAATTCTTATAAATTATTCTTTGTCCCACAATATAGTGATATTTTAGGGTTTAGCTA
TATATAGAAGAGAAAGAAAAAGAGTGTGATTGATTCTTGAAGGTTGAGGATAAGCTTTGT
TCAGCACTTGTCTTGTGTGCTGGTTGAGTTCCTCTGTTTTTTTCTTCCATTTTTATGTAA
AACGGGAAATTGTTAC

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

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CTTCTCACCTTCTCTACAAAACCTTTACCATACCCAAGAGTCACTTTTTTTTTTTTACTT
CAGGCTTGTGAACTCTTATTCTCGAAATCAACTTTTGTGTGGTTCTCTTAGAAATCCTAT
ATTCCTATTTCTGGATTTATGATTCTGGAAATTGGAATTTTGATTTTTTTGGTAGTTGTC
GGATGGGGAACAGATGACAAAGCGGTTATAGGCGTTTCAGACAAAAAAGAAACAAGAGCT
AAAGGAGAATCACGATAAGTTACAAAGAGATTTACAAGGGAGGCATAAGGCTTGCTAACA
GGGTCTTGAATGGGGAAGCAAAAACCTAGAAAAACTGAAGGTTTTCGTAGGATCTCTTGC
ATTCGCTAAACCATTTGGTTGTTCCTAACTATGATAATATGAAACTGGGAGACTTCATGA
TAAAACCCACCATAAAGAGAAAGGAGGAGGAACAAGAACATAGAAATCAGATTTGATAAA
AGAAACGACATTTGATAAAAGTTGCTTGCGGCTGGAGGTGGAATGTATGTGGAAGTTTTC
AACAGAGTGATTCCATTGGCTTACAACATCATAAAGAAGAATAAAGTCGGAGAAACTAAC
ACTTACGTGGATGGAACCTACTTTTGTTTCACTTACTTAACCAAACTTGAATCCATTACT
CCAGTCGAGACTGCTCTTACTGCCCAGAACGACGTTATTCGATTTTATTCCTTAGAGATA
AAGAAGAAGTACAACTGAAAAGATGATGAACATTGCATGTGTGTATGTGACCACATCTAG
GATTCTAGATGTTCCCTCCGAATTAAAGTAAATCTATATTTATTTCGTATGTGTCGTTGT
ATCATTTTTTGAATAGTGCTCTGTTTTCTTTATCTACCGAGTGTGAGAAACTGTAATTCA
ATTTTTATTATGTCAGCTATTTAAACTCTTTCGTTTGATGT


BQ
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AF RR4AQ75TF U 1
AF RR4AQ75JQ C 171
BS 1 538 RR4AQ75TF
BS 539 941 RR4AQ75JQ

RD RR4AQ75TF 538 0 0
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CAGGCTTGTGAACTCTTATTCTCGAAATCAACTTTTGTGTGGTTCTCTTAGAAATCCTAT
ATTCCTATTTCTGGATTTATGATTCTGGAAATTGGAATTTTGATTTTTTTGGTAGTTGTC
GGATGGGGAACAGATGACAAAGCGGTTATAGGCGTTTCAGACAAAAAAGAAACAAGAGCT
AAAGGAGAATCACGATAAGTTACAAAGAGATTTACAAGGGAGGCATAAGGCTTGCTAACA
GGGTCTTGAATGGGGAAGCAAAAACCTAGAAAAACTGAAGGTTTTCGTAGGATCTCTTGC
ATTCGCTAAACCATTTGGTTGTTCCTAACTATGATAATATGAAACTGGGAGACTTCATGA
TAAAACCCACCATAAAGAGAAAGGAGGAGGAACAAGAACATAGAAATCAGATTTGATAAA
AGAAACGACATTTGATAAAAGTTGCTTGCGGCTGGAGGTGGAATGTATGTGGAAGTTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4AQ75JQ 771 0 0
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AACAAGAGCTAAAGGAGAATCACGATAAGTTACAAAGAGATTTACAAGGGAGGCATAAGG
CTTGCTAACAGGGTCTTGAATGGGGAAGCAAAAACCTAGAAAAACTGAAGGTTTTCGTAG
GATCTCTTGCATTCGCTAAACCATTTGGTTGTTCCTAACTATGATAATATGAAACTGGGA
GACTTCATGATAAAACCCACCATAAAGAGAAAGGAGGAGGAACAAGAACATAGAAATCAG
ATTTGATAAAAGAAACGACATTTGATAAAAGTTGCTTGCGGCTGGAGGTGGAATGTATGT
GGAAGTTTTCAACAGAGTGATTCCATTGGCTTACAACATCATAAAGAAGAATAAAGTCGG
AGAAACTAACACTTACGTGGATGGAACCTACTTTTGTTTCACTTACTTAACCAAACTTGA
ATCCATTACTCCAGTCGAGACTGCTCTTACTGCCCAGAACGACGTTATTCGATTTTATTC
CTTAGAGATAAAGAAGAAGTACAACTGAAAAGATGATGAACATTGCATGTGTGTATGTGA
CCACATCTAGGATTCTAGATGTTCCCTCCGAATTAAAGTAAATCTATATTTATTTCGTAT
GTGTCGTTGTATCATTTTTTGAATAGTGCTCTGTTTTCTTTATCTACCGAGTGTGAGAAA
CTGTAATTCAATTTTTATTATGTCAGCTATTTAAACTCTTTCGTTTGATGT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

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AAGTGATCTCTTGGCTTCACTTACCATTAATGATCACTGATGAGTAAGCTTTTGTCTGAG
TTCTTACTCTTAACTTTCTCTCTCTTTCTATCTCTGATTGACTAAAATTTTTGTGGGAAC
TGGTTTGCGTTTCTAGACTTTTGCTGGGTATTATGATTGTTGTTTCTTTTTGGACCACAC
TCAAGACTTGGAATGATGTTTTTTTTGGGTTGGATTATCTTTTACTATTGCAAATTTGCG
AGTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4ES82JQ C 1
AF RR4ES82TF U 1
BS 1 366 RR4ES82TF

RD RR4ES82JQ 366 0 0
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TTCAGAGGCATTAAATGTGCTGAGAAACGTGAATCAGCCAACTCAGGTGAGTGCAAGCCC
AAGTGATCTCTTGGCTTCACTTACCATTAATGATCACTGATGAGTAAGCTTTTGTCTGAG
TTCTTACTCTTAACTTTCTCTCTCTTTCTATCTCTGATTGACTAAAATTTTTGTGGGAAC
TGGTTTGCGTTTCTAGACTTTTGCTGGGTATTATGATTGTTGTTTCTTTTTGGACCACAC
TCAAGACTTGGAATGATGTTTTTTTTGGGTTGGATTATCTTTTACTATTGCAAATTTGCG
AGTGGC

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR4ES82TF 366 0 0
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TTCAGAGGCATTAAATGTGCTGAGAAACGTGAATCAGCCAACTCAGGTGAGTGCAAGCCC
AAGTGATCTCTTGGCTTCACTTACCATTAATGATCACTGATGAGTAAGCTTTTGTCTGAG
TTCTTACTCTTAACTTTCTCTCTCTTTCTATCTCTGATTGACTAAAATTTTTGTGGGAAC
TGGTTTGCGTTTCTAGACTTTTGCTGGGTATTATGATTGTTGTTTCTTTTTGGACCACAC
TCAAGACTTGGAATGATGTTTTTTTTGGGTTGGATTATCTTTTACTATTGCAAATTTGCG
AGTGGC

QA 1 366 1 366
DS 



AS 1 2

CO CL6325Contig1 365 2 1 U
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GCAACGGCTCTCTTCACCACCGTCGAAGAAGTCGTGGCCGCAGTGAGGTTGCCGCGAAGG
GTTCCGTACGGATTCCATGGTCTATTTGTTAAGGAGAGTGACCTTAATAAGCTTTAAGTT
AACTATAGTGCATAGGTAAACTAAAACAAAGGATTGAGTTCTTAATCACGTTCCGTGTAA
TGGAAACATATAGTGTTTGTTGTTGCATTTTAAACTCTCTTTAAACATTATAGTATACAT
AGTTTGGTAGTGGTCGAATGTATATAAAAATATCAAAGCCTGTTAATAAAAAAACGTATT
ATGCC


BQ
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20 20 20 20 20 

AF RR4H517JQB C 1
AF RR4H517TF U 1
BS 1 365 RR4H517TF

RD RR4H517JQB 365 0 0
GGAATCAACAACCAAACCGCAGTTTCATCTCCATCCAAACCCCGACCGCAAACGTCTCTC
GCAACGGCTCTCTTCACCACCGTCGAAGAAGTCGTGGCCGCAGTGAGGTTGCCGCGAAGG
GTTCCGTACGGATTCCATGGTCTATTTGTTAAGGAGAGTGACCTTAATAAGCTTTAAGTT
AACTATAGTGCATAGGTAAACTAAAACAAAGGATTGAGTTCTTAATCACGTTCCGTGTAA
TGGAAACATATAGTGTTTGTTGTTGCATTTTAAACTCTCTTTAAACATTATAGTATACAT
AGTTTGGTAGTGGTCGAATGTATATAAAAATATCAAAGCCTGTTAATAAAAAAACGTATT
ATGCC

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4H517TF 365 0 0
GGAATCAACAACCAAACCGCAGTTTCATCTCCATCCAAACCCCGACCGCAAACGTCTCTC
GCAACGGCTCTCTTCACCACCGTCGAAGAAGTCGTGGCCGCAGTGAGGTTGCCGCGAAGG
GTTCCGTACGGATTCCATGGTCTATTTGTTAAGGAGAGTGACCTTAATAAGCTTTAAGTT
AACTATAGTGCATAGGTAAACTAAAACAAAGGATTGAGTTCTTAATCACGTTCCGTGTAA
TGGAAACATATAGTGTTTGTTGTTGCATTTTAAACTCTCTTTAAACATTATAGTATACAT
AGTTTGGTAGTGGTCGAATGTATATAAAAATATCAAAGCCTGTTAATAAAAAAACGTATT
ATGCC

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 2

CO CL6326Contig1 676 2 2 U
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GCTGAGACCAGGAACCAATGGTCACTCACTGAACGTGAAAGTTATCAGCACGAAGAGGTG
ATGCAGAGAGGTGGTGGATTGCTGAGTGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGCATCATTATCT
TTACTGCTAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGGTTGTGACCCTGCGCA
ACGCCAAGATCGACATGTACAAGGGATCTATGAGGCTTGCAGTTGATAGATGGGGACGCG
TTGAAGTCGCTGAGGAGGATGCCACAGACATCACCGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCC
TCATCGAGTATGAGCTTGTGAACGTTGAAGCTTGATTTAGTTAGCCAACGAAAGAAAGCA
GAGTGACTCACAAGACTTATGTTCTCTAGTTGTAGAAGCAATAGCATCTCTCTCTCTCTC
TCTACTCTGCTTTGAGTTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTGGGGTTTGTTGCTGGTTTG
AGTCTTTTATGTATTATCTGGCTTGCCTCTGAGTTACCCTTTCTCGTTTTAAATATAAGG
TTGCTGGATCATTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU11TF U 1
AF RR4GU11JQ C 50
BS 1 655 RR4GU11TF
BS 656 676 RR4GU11JQ

RD RR4GU11TF 655 0 0
GGATCATCAAACAGATCTGATCGCCCTGAGTCGTCGTCTTTTCTCTCTCGATACCAAAAA
AAAAACAATGGCTGAGGCAACAACAGCTTTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGTTAATGA
GCTGAGACCAGGAACCAATGGTCACTCACTGAACGTGAAAGTTATCAGCACGAAGAGGTG
ATGCAGAGAGGTGGTGGATTGCTGAGTGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGCATCATTATCT
TTACTGCTAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGGTTGTGACCCTGCGCA
ACGCCAAGATCGACATGTACAAGGGATCTATGAGGCTTGCAGTTGATAGATGGGGACGCG
TTGAAGTCGCTGAGGAGGATGCCACAGACATCACCGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCC
TCATCGAGTATGAGCTTGTGAACGTTGAAGCTTGATTTAGTTAGCCAACGAAAGAAAGCA
GAGTGACTCACAAGACTTATGTTCTCTAGTTGTAGAAGCAATAGCATCTCTCTCTCTCTC
TCTACTCTGCTTTGAGTTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTGGGGTTTGTTGCTGGTTTG
AGTCTTTTATGTATTATCTGGCTTGCCTCTGAGTTACCCTTTCTCGTTTTAAATA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4GU11JQ 627 0 0
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ACGAAGAGGTGATGCAGAGAGGTGGTGGATTGCTGAGTGTCTTGTTGGTGATGAGACTGG
CATCATTATCTTTACTGCTAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGGTTGT
GACCCTGCGCAACGCCAAGATCGACATGTACAAGGGATCTATGAGGCTTGCAGTTGATAG
ATGGGGACGCGTTGAAGTCGCTGAGGAGGATGCCACAGACATCACCGTCAAGGAAGATAA
CAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGAACGTTGAAGCTTGATTTAGTTAGCCAAC
GAAAGAAAGCAGAGTGACTCACAAGACTTATGTTCTCTAGTTGTAGAAGCAATAGCATCT
CTCTCTCTCTCTCTACTCTGCTTTGAGTTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTGGGGTTTG
TTGCTGGTTTGAGTCTTTTATGTATTATCTGGCTTGCCTCTGAGTTACCCTTTCTCGTTT
TAAATATAAGGTTGCTGGATCATTCGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6327Contig1 1222 2 8 U
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CATGCTCCTTCTCATTCAATGCTGAGACAAGCTAGAAGCAGAAGAAGGACAAGAAGAATC
GAAAACGTATGGTGACTTGGGGTTCAAATGCATGGGAACAAAAGGTAGATATCTAACAGA
GTTCCTCATATTCACCGCTCAATGCGGTGGATCAGTAGCCTATCTAGTCTTCATAGGCCG
GAACATGTCCTCCATCTTCGCATCATACGGTTTAAGCATGGTCTCTTTCATCTTGATCCT
GGTTCCGATAGAAGTCGCGTTGTCATGGATCACCTCTCTATCAGCTCTCTCGCCTTTCAG
CATCTTTGCTGATATATGCAACATCATAGCCATGTGTTTCGTCGTGAAAGAGAACGTGGA
GATGGTGATTGGAGGAGACTTCTCGTTTGGTGACAGAACAGCTGTTTCGTCTAGTATCGG
AGGGTTGCCGTTTGCTGGAGGTGTTGCTGTGTTTTGTTTTGAGGGTTTTGCGATGACGTT
GGCTCTTGAGAATTCTATGAAGGATAGAGAAGCTTTTCCTAAGCTGTTGGCTAAAGTGCT
TGCTGGGATTACGTTTGTTTATGTGTTGTTTGGGTTCTGTGGTTATATGGCTTATGGAGA
TGAAACTAAGGATATTATTACACTCAACCTCCCGAAGAATTGGTCTGCCATTGCCGTGCA
GATTGGCTTATGCGTGGGACTGACGTTTACGTTCCCGATCATGGTACATCCGCTTAACGA
GATCATAGAGCAGAAACTGAAAAGGATAGATTGGCTTTTGGTGGTAGGACTCGCAGCAAT
AGCGTCATTAGTCCCGGGGTTTGGTACGTTTGCATCTCTGGTTGGAAGTACTCTGTGTGC
ACTCATATCATTTGTGTTACCGGCTTCTTATCACCTCACGCTGCTCGGTCCATCGCTAAG
TCTGTGGAACAAATCAGTTGATGTGTTCATCGTGATTTGCGGGTTGCTCTTTGCTGTCTA
TGGTACATACAATACAATCGTTGGAGTGTAACAAAGCGAAGTAAGCGAGTCTGTGTTTAA
AGAACACGCCAACAGAAAGTTGGTCAGAGACTCAGACCAAGAACCATTGTATAGCTGTTT
TACATGAATTTGATATCAGAAGATAGTGGGATTGGGAAAATCCAAATTGTTGTATAATAA
TTACAGGTCTTAAATGTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY10TF U 1
AF RR4BY10JQ C 401
BS 1 670 RR4BY10TF
BS 671 671 RR4BY10JQ
BS 672 698 RR4BY10TF
BS 699 699 RR4BY10JQ
BS 700 723 RR4BY10TF
BS 724 724 RR4BY10JQ
BS 725 784 RR4BY10TF
BS 785 1222 RR4BY10JQ

RD RR4BY10TF 784 0 0
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CATGCTCCTTCTCATTCAATGCTGAGACAAGCTAGAAGCAGAAGAAGGACAAGAAGAATC
GAAAACGTATGGTGACTTGGGGTTCAAATGCATGGGAACAAAAGGTAGATATCTAACAGA
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GAACATGTCCTCCATCTTCGCATCATACGGTTTAAGCATGGTCTCTTTCATCTTGATCCT
GGTTCCGATAGAAGTCGCGTTGTCATGGATCACCTCTCTATCAGCTCTCTCGCCTTTCAG
CATCTTTGCTGATATATGCAACATCATAGCCATGTGTTTCGTCGTGAAAGAGAACGTGGA
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AGGGTTGCCGTTTGCTGGAGGTGTTGCTGTGTTTTGTTTTGAGGGTTTTGCGATGACGTT
GGCTCTTGAGAATTCTATGAAGGATAGAGAAGCTTTTCCTAAGCTGTTGGCTAAAGTGCT
TGCTGGGATTACGTTTGTTTATGTGTTGTTTGGGTTCTGTGGTTATATGGCTTATGGAGA
TGAAACTAAG*ATATTATTACACTCAACCTCCCGAAGA*TTGGTCTGCCATTGCCGTGCA
GAT*GGCTTATGCGTGGGACTGACGTTTACGTTCCCGATCATGGTACATCCGCTTAACGA
GATC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4BY10JQ 822 0 0
GTCGTGAAAGAGAACGTGGAGATGGTGATTGGAGGAGACTTCTCGTTTG*TGACAGAACA
GCTGTTTCGTCTAGTATCGGAGGGTTGCCGTTTGCTGGAGGTGTTGCTGTGTTTTGTTTT
GAGGGTTTTGCGATGACGTTGGCTCTTGAGAATTCTATGAAGGATAGAGAAGCTTTTCCT
AAGCTGTTGGCTAAAGTGCTTGCTGGGATTACGTTTGTTTATGTGTTGTTTGGGTTCTGT
GGTTATATGGCTTATGGAGATGAAACTAAGGATATTATTACACTCAACCTCCCGAAGAAT
TGGTCTGCCATTGCCGTGCAGATTGGCTTATGCGTGGGACTGACGTTTACGTTCCCGATC
ATGGTACATCCGCTTAACGAGATCATAGAGCAGAAACTGAAAAGGATAGATTGGCTTTTG
GTGGTAGGACTCGCAGCAATAGCGTCATTAGTCCCGGGGTTTGGTACGTTTGCATCTCTG
GTTGGAAGTACTCTGTGTGCACTCATATCATTTGTGTTACCGGCTTCTTATCACCTCACG
CTGCTCGGTCCATCGCTAAGTCTGTGGAACAAATCAGTTGATGTGTTCATCGTGATTTGC
GGGTTGCTCTTTGCTGTCTATGGTACATACAATACAATCGTTGGAGTGTAACAAAGCGAA
GTAAGCGAGTCTGTGTTTAAAGAACACGCCAACAGAAAGTTGGTCAGAGACTCAGACCAA
GAACCATTGTATAGCTGTTTTACATGAATTTGATATCAGAAGATAGTGGGATTGGGAAAA
TCCAAATTGTTGTATAATAATTACAGGTCTTAAATGTTTGGC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL6328Contig1 1199 2 2 U
GGGCATAGATTGAAGAACTTCAAAAAGAACTGTTTTCTCTCTCGTGTCTATTCATTTTGC
GACTTCTGCGACAACAACCGTTCTCTTCGTTTTCTCCGGCGGCTTAGGCCGCCGGTGTCG
TTAGATTGTTTCTTTTCTCTTCTGTTTCTTGTTTCTACAGTTTAGATCACAAAAAGCTAT
TATCTTCAATGCTTTTTTCATCTTCCTTTTTGTTGTTGGATGAAACCTCTAAACAATATT
CATCTTCTCCAATTCATTGTGCTATTTTCTTAATTATTTGGGAGGAATCAATCATGTTAT
CTATCATTTTGATTCTCCGACCCGGAATAGTTTCAATTTTATTGGGTCAATTCACAAAGA
TTAAAATTTGGGATTGGACGAGTTTTTGTCTCTCCCTCTGTGAGAGTGTATGTCCGGCGT
TTATGTTGCGATCTTCTCGCACTCACTTCACCGGTGTTTGTCCGTGCTTGTTGTGTTACG
GTTTTTGTCTTCCTCGCTACATATTTGCTGAGAGGAGGTTGTTGTTTGAAACAAACAATA
GGGCTATCAAGCCTCCGTGGCCGGGAGATTGGACAGAGATTGATCGGGTGAAAGTGATGG
AAGGATGTGTATTTTTGAAACTGGCCTTTGCCGAGGATACAACAAAGGAATCATATACGG
AAAGTGCTTGGGTAAGACTGATGCTTAAGGGTGGGATAATGGAGTTCAATTGGTTTTCCA
GTGTACTCGTGACGTTTGATATGTGGATTTTCATTTGGAGTGTTTTCATATCAAACGTGT
TTAATGGAACTATGGGCTGGATGATCCTAGTCGTGGCTGGATGGACATTTTGCATCACTA
AGTTTGAGTGGAAGGTATTTACGTTGAGTTTGCCTATGCTCTTAAGACTTCTAGTGATAC
AGAAGATGATGATGTGTTTATGTGTTTCTCGACTCCCAACTGAGGCATATAACAATTGGG
ATCAAACTAGAAGGATGAATGCAAAGTCAAAGCAAAACCCTCGTAGAAGGTGTTGGATAC
GTAAGCATTGGTATCCATTTACAACAACAAAATTTCATTCAACGGAAACATTGGGTTTTA
AAATGCTGTGTGTAAGAAATAATTTAAGCTACGAGTTGTTAGCTAAACACACAAATCGCA
TCAAAAGAAGTTTGTTTATGGGGAAGGAAAATAACAAAGTGAAAATTTTGTTTGCGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA93TF U 1
AF RR4HA93JQB C 397
BS 1 765 RR4HA93TF
BS 766 1199 RR4HA93JQB

RD RR4HA93TF 765 0 0
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GACTTCTGCGACAACAACCGTTCTCTTCGTTTTCTCCGGCGGCTTAGGCCGCCGGTGTCG
TTAGATTGTTTCTTTTCTCTTCTGTTTCTTGTTTCTACAGTTTAGATCACAAAAAGCTAT
TATCTTCAATGCTTTTTTCATCTTCCTTTTTGTTGTTGGATGAAACCTCTAAACAATATT
CATCTTCTCCAATTCATTGTGCTATTTTCTTAATTATTTGGGAGGAATCAATCATGTTAT
CTATCATTTTGATTCTCCGACCCGGAATAGTTTCAATTTTATTGGGTCAATTCACAAAGA
TTAAAATTTGGGATTGGACGAGTTTTTGTCTCTCCCTCTGTGAGAGTGTATGTCCGGCGT
TTATGTTGCGATCTTCTCGCACTCACTTCACCGGTGTTTGTCCGTGCTTGTTGTGTTACG
GTTTTTGTCTTCCTCGCTACATATTTGCTGAGAGGAGGTTGTTGTTTGAAACAAACAATA
GGGCTATCAAGCCTCCGTGGCCGGGAGATTGGACAGAGATTGATCGGGTGAAAGTGATGG
AAGGATGTGTATTTTTGAAACTGGCCTTTGCCGAGGATACAACAAAGGAATCATATACGG
AAAGTGCTTGGGTAAGACTGATGCTTAAGGGTGGGATAATGGAGTTCAATTGGTTTTCCA
GTGTACTCGTGACGTTTGATATGTGGATTTTCATTTGGAGTGTTT

QA 1 765 1 765
DS 

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TTTGTCCGTGCTTGTTGTGTTACGGTTTTTGTCTTCCTCGCTACATATTTGCTGAGAGGA
GGTTGTTGTTTGAAACAAACAATAGGGCTATCAAGCCTCCGTGGCCGGGAGATTGGACAG
AGATTGATCGGGTGAAAGTGATGGAAGGATGTGTATTTTTGAAACTGGCCTTTGCCGAGG
ATACAACAAAGGAATCATATACGGAAAGTGCTTGGGTAAGACTGATGCTTAAGGGTTGGA
TAATGGAGTTCAATTGGTTTTCCAGTGTACTCGTGACGTTTGATATGTGGATTTTCATTT
GGAGTGTTTTCATATCAAACGTGTTTAATGGAACTATGGGCTGGATGATCCTAGTCGTGG
CTGGATGGACATTTTGCATCACTAAGTTTGAGTGGAAGGTATTTACGTTGAGTTTGCCTA
TGCTCTTAAGACTTCTAGTGATACAGAAGATGATGATGTGTTTATGTGTTTCTCGACTCC
CAACTGAGGCATATAACAATTGGGATCAAACTAGAAGGATGAATGCAAAGTCAAAGCAAA
ACCCTCGTAGAAGGTGTTGGATACGTAAGCATTGGTATCCATTTACAACAACAAAATTTC
ATTCAACGGAAACATTGGGTTTTAAAATGCTGTGTGTAAGAAATAATTTAAGCTACGAGT
TGTTAGCTAAACACACAAATCGCATCAAAAGAAGTTTGTTTATGGGGAAGGAAAATAACA
AAGTGAAAATTTTGTTTGCGGAT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

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TTGCGAGGAAATCGAGTTTTAAACGCTCTCACACATCTTGGATGTTTGATCCCAAGAAAG
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ACAAGAGACAAGAGTTTATGACTGTTGTGACAAAGACAGAGAATCTTCTCTTTCTGTTCC
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TATTTCTTTATATGCATATATATCAGTTGTGAGGATATTTAGTTTTGCTTTGGTTTCACC
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AGAATGAAATTTAGTTATTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D475TF U 1
AF RR4D475JQ C 351
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BS 694 720 RR4D475TF
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RD RR4D475TF 720 0 0
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TTGCGAGGAAATCGAGTTTTAAACGCTCTCACACATCTTGGATGTTTGATCCCAAGAAAG
TAGTCCTCTTCTTTGCAACTCTGTCAAGCATGGGATCAATCTTGTTAATCATATTTACTC
TCTCGATCAGCAAGTCCACTCCCGGAGATATGCCTCTCGAATAATAGTAAAAATACAAGA
AGATATATGAGGTGGACCGACCTCAGTTTGTGGCTTTAGAACATGCCACAATCTCACCGA
CCTACATTCGAGGAGATGAATCAGAAGAACATTACAAAACAAAAAACAAAGAGCGTAAGG
TTGTGATAATAATTATTTTGTATACTTTTTATTTTTTTTAAATGGAAAAAGGAAACATCA
AGAGAAAGTGGAAAGTGGGCACGCACGAGATCATATGAATATTGGAAAAGAAAGCTTAAG
ACAAGAGACAAGAGTTTATGACTGTTGTGACAAAGACAGAGAATCTTCTCTTTCTGTTCC
TTTTAATTAATTTCTCTTTTTCAAGGTATTTTGCCTAGTAATTGCTTTTTTATTTTGTTG
TATTTCTTTATATGCATATATATCAGTTGTGAGGATATTTAGTTTTGCTTTGGTTTCACC
GTTCACATAGAAATAGTTTGAGTCGTGTTAAA*TTGAATGGAATTTAGTAGACAAAAAAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4D475JQ 391 0 0
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GGAAACATCAAGAGAAAGTGGAAAGTGGGCACGCACGAGATCATATGAATATTGGAAAAG
AAAGCTTAAGACAAGAGACAAGAGTTTATGACTGTTGTGACAAAGACAGAGAATCTTCTC
TTTCTGTTCCTTTTAATTAATTTCTCTTTTTCAAGGTATTTTGCCTAGTAATTGCTTTTT
TATTTTGTTGTATTTCTTTATATGCATATATATCAGTTGTGAGGATATTTAGTTTTGCTT
TGGTTTCACCGTTCACATAGAAATAGTTTGAGTCGTGTTAAAATTGAATGGAATTTAGTA
GACAAAAAAAAGAATGAAATTTAGTTATTCG

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 2

CO CL6330Contig1 672 2 1 U
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CTCTAACATGCGCTGGGAGGCTCAGTGTCCCAAGTCAGAATTTCCAAGTGCACAAACACT
TGAAAAGACTGAACAAACCAGCCGTTAAGAGCATTCAGAGTACAGACGGTAACATAATAG
ACTGTGTTCACATGTCTAAGCAACCAGCTTTTGATCATCCTTTCCTCAAAGACCACAAGA
TTCAGATGAATCCTAGTACCATCCCTGAACTGCTGTTTGAAGAGAACAAAGTGTCCAAGA
AACCAAAAGAGGGAATCAATCCAGTCACTCAGTTATGGCACCAGAACGGAGTGTGTTCTG
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AACGTTACGGTAAGAAGAAGCACCTCACAGTTCCTCTACCGAGGTCTGCTGATCCTGATC
TCGCCAACCAAAGTGGTCATCAGCACGCTATAGCTTATGTGGAAGGAGGCAAGTTTTATG
GGGCTAAGGCGACAATAAATGTATGGGAACCCAAAGTACAAAGCCCAAATGAGTTCAGCT
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GTTGGCAGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C224TF U 30
AF RR4BU91TF U 1
BS 1 672 RR4BU91TF

RD RR4C224TF 365 0 0
GTTTGGCTCCTCTGCTTCTGGGGATTGCTCTCTCTAACATGCGCTGGGAGGCTCAGTGTC
CCAAGTCAGAATTTCCAAGTGCACAAACACTTGAAAAGACTGAACAAACCAGCCGTTAAG
AGCATTCAGAGTACAGACGGTAACATAATAGACTGTGTTCACATGTCTAAGCAACCAGCT
TTTGATCATCCTTTCCTCAAAGACCACAAGATTCAGATGAATCCTAGTACCATCCCTGAA
CTGCTGTTTGAAGAGAACAAAGTGTCCAAGAAACCAAAAGAGGGAATCAATCCAGTCACT
CAGTTATGGCACCAGAACGGAGTGTGTTCTGAAGGAACAATACCAGTGAGGAGGACAAAG
AAAGA

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR4BU91TF 672 0 0
GGAATGACAGTGTTTTCAGAGTGTTTCTTGTTTGGCTCCTCTGCTTCTGGGGATTGCTCT
CTCTAACATGCGCTGGGAGGCTCAGTGTCCCAAGTCAGAATTTCCAAGTGCACAAACACT
TGAAAAGACTGAACAAACCAGCCGTTAAGAGCATTCAGAGTACAGACGGTAACATAATAG
ACTGTGTTCACATGTCTAAGCAACCAGCTTTTGATCATCCTTTCCTCAAAGACCACAAGA
TTCAGATGAATCCTAGTACCATCCCTGAACTGCTGTTTGAAGAGAACAAAGTGTCCAAGA
AACCAAAAGAGGGAATCAATCCAGTCACTCAGTTATGGCACCAGAACGGAGTGTGTTCTG
AAGGAACAATACCAGTGAGGAGGACAAAGAAAGAGGATGTCTTGAGAGCAAGCTCTGTCA
AACGTTACGGTAAGAAGAAGCACCTCACAGTTCCTCTACCGAGGTCTGCTGATCCTGATC
TCGCCAACCAAAGTGGTCATCAGCACGCTATAGCTTATGTGGAAGGAGGCAAGTTTTATG
GGGCTAAGGCGACAATAAATGTATGGGAACCCAAAGTACAAAGCCCAAATGAGTTCAGCT
TGTCTCAGCTATGGATTCTTGGAGGTTCTTTTGGTCAAGACCTCAACAGCATTGAAGCTG
GTTGGCAGTTAG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6331Contig1 771 2 2 U
GAGGACAAAGTTGGAGTTGGGGTTGACCATTTGAGATCTGGTGAGGATAATGGTGATGTT
CTGTATGATTCAGATAACTCTGATTCTGGCTATTTCAGGAATGGACCAAAGAAGTTTGAC
TCAGATGTCTCTGTTGATGGCTTCCTCAGGAACACTGGATTCAACAGCTCACAGGATAAG
AGCTTGAACAGATTCAGGACAGGATCAGATCGTTCTTCGACAAAGTATGATCTGAGGAGA
AGCAGAACAGGCTTTACTTCTTACGGTCAAAAGAAAATCAAGTATGAGTTCACTGAATCT
GTGTATGACAGTGGTGATCAGCATAGCTTGGAGACTGGTTCTTGTGCCGACACAATCAAG
GTTCATAATAGTAAACCCCCAATGGTAAAGAAAGCAAGTGGTGGTGGTGGTGCAAAGAAG
AAAAGTAAAGGACACGAGTGTCCTATTTGCTTCAGGGTGTTTAAATCAGGACAAGCTTTA
GGTGGTCACAAGAGATCACATTTCATTGGGAATCATGAACACAGGACTTTGGTGATCCAA
CAACACCAAGTAGCTCATGAGATGCATACTCTCATCGATCTCAATCTTCCTGCTCCTATT
GATTAATGAAATCACTAGTAACCGCAATTTTGTTACTCATTATTATTGCTTCCTCTCTGT
ATTCATTTTATTGTTGCTTCAGATTCAAGAATGCTTTTTGGTTCAGAAGGTAAATCAAAG
TTCTCATATTTTATTTGTTCACAATCATATAAAGAACCGGTGAAGCTGACC


BQ
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AF RR4F714TF U 1
AF RR4F714JQ C 258
BS 1 629 RR4F714TF
BS 630 771 RR4F714JQ

RD RR4F714TF 629 0 0
GAGGACAAAGTTGGAGTTGGGGTTGACCATTTGAGATCTGGTGAGGATAATGGTGATGTT
CTGTATGATTCAGATAACTCTGATTCTGGCTATTTCAGGAATGGACCAAAGAAGTTTGAC
TCAGATGTCTCTGTTGATGGCTTCCTCAGGAACACTGGATTCAACAGCTCACAGGATAAG
AGCTTGAACAGATTCAGGACAGGATCAGATCGTTCTTCGACAAAGTATGATCTGAGGAGA
AGCAGAACAGGCTTTACTTCTTACGGTCAAAAGAAAATCAAGTATGAGTTCACTGAATCT
GTGTATGACAGTGGTGATCAGCATAGCTTGGAGACTGGTTCTTGTGCCGACACAATCAAG
GTTCATAATAGTAAACCCCCAATGGTAAAGAAAGCAAGTGGTGGTGGTGGTGCAAAGAAG
AAAAGTAAAGGACACGAGTGTCCTATTTGCTTCAGGGTGTTTAAATCAGGACAAGCTTTA
GGTGGTCACAAGAGATCACATTTCATTGGGAATCATGAACACAGGACTTTGGTGATCCAA
CAACACCAAGTAGCTCATGAGATGCATACTCTCATCGATCTCAATCTTCCTGCTCCTATT
GATTAATGAAATCACTAGTAACCGCAATT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4F714JQ 514 0 0
TTT
TTACGGTCAAAAGAAAATCAAGTATGAGTTCACTGAATCTGTGTATGACAGTGGTGATCA
GCATAGCTTGGAGACTGGTTCTTGTGCCGACACAATCAAGGTTCATAATAGTAAACCCCC
AATGGTAAAGAAAGCAAGTGGTGGTGGTGGTGCAAAGAAGAAAAGTAAAGGACACGAGTG
TCCTATTTGCTTCAGGGTGTTTAAATCAGGACAAGCTTTAGGTGGTCACAAGAGATCACA
TTTCATTGGGAATCATGAACACAGGACTTTGGTGATCCAACAACACCAAGTAGCTCATGA
GATGCATACTTTCATCGATCTCAATCTTCCTGCTCCTATTGATTAATGAAATCACTAGTA
ACCGCAATTTTGTTACTCATTATTATTGCTTCCTCTCTGTATTCATTTTATTGTTGCTTC
AGATTCAAGAATGCTTTTTGGTTCAGAAGGTAAATCAAAGTTCTCATATTTTATTTGTTC
ACAATCATATAAAGAACCGGTGAAGCTGACC

QA 4 514 4 514
DS 



AS 1 2

CO CL6332Contig1 981 2 2 U
GGGACCTCCGACGATCAAACCGCACCGCCGTGTCGTCTTCTTCGTATTCTCCCCCCAGTA
GATGAACAAGTTCTTCAAACTCGGAAGCTTGATCAGAATCACTGCTTCCCGTATTCCTTC
AAATCAACACCTTCCCTACGCCGGATCCTTTGCTTCTTCCGTTATTCCCAAACCTCGTTT
CTTCTCCAATGGCACCGACGACGAAAGCGCGCTTTATCACCACGCGCGCATGTTCAGGAA
ACCACTTTCCACAGGCTTCAAATTCGACCTTTCCAACTCCGTGAGCCTTATGGGTTTCGT
CGATCAACCTATTCGCGTCATAGACACAGAGCCCGATAGGTTCGGTGTTTCTACTCTGCT
TAGAGTGAAAGACCCGCGTGATCCGAACCGGAGCTTTAGGATACCTCTTAGTATTTGGGA
CGTGATGGCACGGAAGTGCGTTGCGCACTTGAAGCCAAATGATTTCGTATTTGTCTCTGG
CCGCCTTGTTTCTTACGACAAGAGCTCCGGCAGTGAAAACAGCGGCTTTGGTTTGCATTA
CCAGGTTAAAGTGTCAGAGGTGAATCACGTGATGGCTCCACCAAGTCACGTGTTACATTC
TGAGATACCCCAAAGGCCAAAATCAGAAACAGTGTCTCTTGAAGTGGTGAGGGAAGACGG
TGGTATAGAAGAGTCCAAGAATGGTGATATTGACTTGTGGGAAGCCTTCTTTGCCAATCC
AAACGAGTGGTGGGACAAAAGGAAAAGTAAGACTAACCCGAGACAGCCTGACTTCACGCA
CAAAGACACAAGTGAAGCGTTCTGGCTCGATTCAGATGTACCGGTTTGGGTTACTAGACA
ACTTGAATTGTACGACCAAAGTAATTCAAACAAGAGCTGTTACGACCCGGAACAAACAGG
TCGTGGCCGTCTTGGCGACTGGGTTTAGCATGAGATGTTTCCTCACTCTTATTTTTATAA
ATCTTAAGATCGATTATATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN28TF U 1
AF RR4AN28JQ C 360
BS 1 736 RR4AN28TF
BS 737 981 RR4AN28JQ

RD RR4AN28TF 736 0 0
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GATGAACAAGTTCTTCAAACTCGGAAGCTTGATCAGAATCACTGCTTCCCGTATTCCTTC
AAATCAACACCTTCCCTACGCCGGATCCTTTGCTTCTTCCGTTATTCCCAAACCTCGTTT
CTTCTCCAATGGCACCGACGACGAAAGCGCGCTTTATCACCACGCGCGCATGTTCAGGAA
ACCACTTTCCACAGGCTTCAAATTCGACCTTTCCAACTCCGTGAGCCTTATGGGTTTCGT
CGATCAACCTATTCGCGTCATAGACACAGAGCCCGATAGGTTCGGTGTTTCTACTCTGCT
TAGAGTGAAAGACCCGCGTGATCCGAACCGGAGCTTTAGGATACCTCTTAGTATTTGGGA
CGTGATGGCACGGAAGTGCGTTGCGCACTTGAAGCCAAATGATTTCGTATTTGTCTCTGG
CCGCCTTGTTTCTTACGACAAGAGCTCCGGCAGTGAAAACAGCGGCTTTGGTTTGCATTA
CCAGGTTAAAGTGTCAGAGGTGAATCACGTGATGGCTCCACCAAGTCACGTGTTACATTC
TGAGATACCCCAAAGGCCAAAATCAGAAACAGTGTCTCTTGAAGTGGTGAGGGAAGACGG
TGGTATAGAAGAGTCCAAGAATGGTGATATTGACTTGTGGGAAGCCTTCTTTGCCAATCC
AAACGAGTGGTGGGAC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4AN28JQ 622 0 0
TTAGAGTGAAAGACCCGCGTGATCCGAACCGGAGCTTTAGGATACCTCTTAGTATTTGGG
ACGTGATGGCACGGAAGTGCGTTGCGCACTTGAAGCCAAATGATTTCGTATTTGTCTCTG
GCCGCCTTGTTTCTTACGACAAGAGCTCCGGCAGTGAAAACAGCGGCTTTGGTTTGCATT
ACCAGGTTAAAGTGTCAGAGGTGAATCACGTGATGGCTCCACCAAGTCACGTGTTACATT
TTGAGATACCCCAAAGGCCAAAATCAGAAACAGTGTTTCTTGAAGTGGTGAGGGAAGACG
GTGGTATAGAAGAGTCCAAGAATGGTGATATTGACTTGTGGGAAGCCTTTTTTGCCAATC
CAAACGAGTGGTGGGACAAAAGGAAAAGTAAGACTAACCCGAGACAGCCTGACTTCACGC
ACAAAGACACAAGTGAAGCGTTCTGGCTCGATTCAGATGTACCGGTTTGGGTTACTAGAC
AACTTGAATTGTACGACCAAAGTAATTCAAACAAGAGCTGTTACGACCCGGAACAAACAG
GTCGTGGCCGTCTTGGCGACTGGGTTTAGCATGAGATGTTTCCTCACTCTTATTTTTATA
AATCTTAAGATCGATTATATAC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL6333Contig1 1033 2 2 U
GGAATCACATCCATTCCATACGTTCTTCTTCCTCTTGCTTCGCGAAACCAAAAACCGCTT
CTTCATTGCTCGTTTTCGATCTCAATTTTTTTTCTCTGCGGAATCGTTTGTGAATGGTGG
AAACGAATCGGCTCGGTGGAAACTCTACGCTCTCCTTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTTT
TACTCCCTCTCTCTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACT
TCCGCTGCTTCGGCATCGACCCGTGAATCCAATCTCCCCACCACAACAACCCTAATCTCG
CTCTGAGATCTGTTTATTTTTTTTCTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAAGATGTT
GCTTTACAACAAGCAGAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCAG
CGTTACGGTTCTTGGTAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGT
CGCCTCGGTTATCGACACTGCTCTTAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTCT
CGGATCCGATTTCAATGATTTCCTTCTCTATTGTCCCATGGTTGGACCTGAAGGTAAACC
GAATCAATTTCTCTATTCGAATTGATTTTTTGTTAATTGAGTTGGTTTACTAAACCGGGT
TTTTGTTTTTGTTGTGATTATAGCTTTAAGCGCGTGGAGTGCAATTGGATCGCTTGGTGC
AAGGAACTTTACTCTGTGTAGGAAACCAGAGGAGAAGAAAGTGGTCAAGGAAGGAGAATC
TAATTCCATTAATGGAGGAAGGAAAGGAGGAAGCTTAAAGGCTTGGATCAACAAGTCCTT
TAGCCTCAAAGTCTCGACCCATTGAAAGTTCTTCTTTTTTCAGACAAGACAGTTTCCAGT
TTTTATGTCTCTTTTACTTTCGCTTTTTTATTTGATTCCGTACTCTGTCTGAAGCTTCCA
TTGACATTGAAGCTTTTTCTTTTTTTTTTCCATCTCTCATTCAACGGTAATAAAAAATAA
TAATTCTTGTGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AU24TF U 1
AF RR4AU24JQ C 325
BS 1 691 RR4AU24TF
BS 692 1033 RR4AU24JQ

RD RR4AU24TF 691 0 0
GGAATCACATCCATTCCATACGTTCTTCTTCCTCTTGCTTCGCGAAACCAAAAACCGCTT
CTTCATTGCTCGTTTTCGATCTCAATTTTTTTTCTCTGCGGAATCGTTTGTGAATGGTGG
AAACGAATCGGCTCGGTGGAAACTCTACGCTCTCCTTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTTT
TACTCCCTCTCTCTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACT
TCCGCTGCTTCGGCATCGACCCGTGAATCCAATCTCCCCACCACAACAACCCTAATCTCG
CTCTGAGATCTGTTTATTTTTTTTCTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAAGATGTT
GCTTTACAACAAGCAGAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCAG
CGTTACGGTTCTTGGTAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGT
CGCCTCGGTTATCGACACTGCTCTTAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTCT
CGGATCCGATTTCAATGATTTCCTTCTCTATTGTCCCATGGTTGGACCTGAAGGTAAACC
GAATCAATTTCTCTATTCGAATTGATTTTTTGTTAATTGAGTTGGTTTACTAAACCGGGT
TTTTGTTTTTGTTGTGATTATAGCTTTAAGC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4AU24JQ 709 0 0
CTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAAGATGTTGCTTTACAACAAGCAGAAGAAGAA
CCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCAGCGTTACGGTTCTTGGTAGCGCCGG
TCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCCTCGGTTATCGACACTGCTCT
TAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTCTCGGATCCGATTTCAATGATTTCCT
TCTCTATTGTCCCATGGTTGGACCTGAAGGTAAACCGAATCAATTTCTCTATTCGAATTG
ATTTTTTGTTAATTGAGTTGGTTTACTAAACCGGGTTTTTGTTTTTGTTGTGATTATAGC
TTTAAGCGCGTGGAGTGCAATTGGATCGCTTGGTGCAAGGAACTTTACTCTGTGTAGGAA
ACCAGAGGAGAAGAAAGTGGTCAAGGAAGGAGAATCTAATTCCATTAATGGAGGAAGGAA
AGGAGGAAGCTTAAAGGCTTGGATCAACAAGTCCTTTAGCCTCAAAGTCTCGACCCATTG
AAAGTTCTTCTTTTTTCAGACAAGACAGTTTCCAGTTTTTATGTCTCTTTTACTTTCGCT
TTTTTATTTGATTCCGTACTCTGTCTGAAGCTTCCATTGACATTGAAGCTTTTTCTTTTT
TTTTTCCATCTCTCATTCAACGGTAATAAAAAATAATAATTCTTGTGTG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL6334Contig1 1042 2 6 U
GGGGAAAGACCCGCTTGTATACCTCAGGTGGTTCTTGAGGCTAAAGCTGAGGAAGCTGCT
GCTGAGATGGAGAAGCGGAAGACGGAGAAAGATTTGGAAGAGGAGAACGGTGGAGCTGGT
GTTTATTCTGCTAGTTTGAGGAAGCACTACATCTTGTATCACGAAGAGTGGAAGGATGAC
ATAATGCCTGAGATTCTCGACGGTCATAACGTTGCTGACTTCATTGATCCGGATGTTTTG
CTGAGGGTTGAGGAGTTGGAACGTGAAGAAGAGATGAGGCTGGCTAACGCTGAAGAAGAT
GATTCCGAGATGGACGGGGAAGAGCTCACGGAGGAGCAGAAGCAGCAGCTTGCGAAGATT
AGGAACAAGAAAGCTGTGCTCATCCGAGAGCATAGGCTCAAAAAGACCGTTGCGCAGAAC
AGATCAACCGTTCCAAGGAAGTTTGACAAGTACAAGAAGTACACAACTAAGAGAATGGGT
AGGGAACTATCTTCTCTGGGGCTTGATCCGTCTTCTGCAGTGGACCGCGCAAGAAGCAAG
TCGAGAGGGAGGAAGAGGGATCGATCAGAAGATGCAGCAGGTAACGATGCGATGGAAGTG
GATGATGAGCAACAGGCTAACAAGAAGATGCGTGTGAGGTCAAGGTCGAGGTCTATGTCG
ATAGCGAGATCACAGTCAAGGCCACCTCCACATGAAGTTGTGCCTGGTGAAGGGTTCAAA
GACTCTACTCAGAAGAAAGCGGCTCTTAAGATTAGCAATAGCTCTCACAAAAGAGAGACA
AGAGTGCAAGACGCGGTGAAGCTGATAGAGTTATCCCAACTCTGAGACCTAAGCACCTGT
TCTCAGGGAAGAGAGGTAAAGGAAAGACGGATAGGCGTTGATGATGAAGCCAGACAAGGA
AAAACAGATGCTGGATCGATTGAAGAATATCTCTCAAGTTTTGGATTTTACTGTACCTTT
TGTTTACTGTTATTATTATGTTATGCAGCTTTTGTGGTTTTACTACAGACACTGTAGCTT
CTTCTGCAATCGATGTGTTTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BQ67TF U 1
AF RR4BQ67JQ C 235
BS 1 534 RR4BQ67TF
BS 535 535 RR4BQ67JQ
BS 536 580 RR4BQ67TF
BS 581 581 RR4BQ67JQ
BS 582 610 RR4BQ67TF
BS 611 1042 RR4BQ67JQ

RD RR4BQ67TF 610 0 0
GGGGAAAGACCCGCTTGTATACCTCAGGTGGTTCTTGAGGCTAAAGCTGAGGAAGCTGCT
GCTGAGATGGAGAAGCGGAAGACGGAGAAAGATTTGGAAGAGGAGAACGGTGGAGCTGGT
GTTTATTCTGCTAGTTTGAGGAAGCACTACATCTTGTATCACGAAGAGTGGAAGGATGAC
ATAATGCCTGAGATTCTCGACGGTCATAACGTTGCTGACTTCATTGATCCGGATGTTTTG
CTGAGGGTTGAGGAGTTGGAACGTGAAGAAGAGATGAGGCTGGCTAACGCTGAAGAAGAT
GATTCCGAGATGGACGGGGAAGAGCTCACGGAGGAGCAGAAGCAGCAGCTTGCGAAGATT
AGGAACAAGAAAGCTGTGCTCATCCGAGAGCATAGGCTCAAAAAGACCGTTGCGCAGAAC
AGATCAACCGTTCCAAGGAAGTTTGACAAGTACAAGAAGTACACAACTAAGAGAATGGGT
AGGGAACTATCTTCTCTGGGGCTTGATCCGTCTTCTGCAGTGGACCGCGCAAGA*GCAAG
TCGAGAGGGAGGAAGAGGGATCGATCAGAAGATGCAGCAG*TAACGATGCGATGGAAGTG
GATGATGAGC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4BQ67JQ 808 0 0
GTTTTGCTGAGGGTTGAGGAGTTGGAACGTGAAGAAGAGATGAGGCTGGCTAACGCTGAA
GAAGATGATTCCGAGATGGACGGGGAAGAGCTCACGGAGGAGCAGAAGCAGCAGCTTGCG
AAGATTAGGAACAAGAAAGCTGTGCTCATCCGAGAGCATAGGCTCAAAAAGACCGTTGCG
CAGAACAGATCAACCGTTCCAAGGAAGTTTGACAAGTACAAGAAGTACACAACTAAGAGA
ATGGGTAGGGAACTATCTTCTCTGGGGCTTGATCCGTCTTCTGCAGTGGACCGCGCAAGA
AGCAAGTCGAGAGGGAGGAAGAGGGATCGATCAGAAGATGCAGCAGGTAACGATGCGATG
GAAGTGGATGATGAGCAACAGGCTAACAAGAAGATGCGTGTGAGGTCAAGGTCGAGGTCT
ATGTCGATAGCGAGATCACAGTCAAGGCCACCTCCACATGAAGTTGTGCCTGGTGAAGGG
TTCAAAGACTCTACTCAGAAGAAAGCGGCTCTTAAGATTAGCAATAGCTCTCACAAAAGA
GAGACAAGAGTGCAAGACGCGGTGAAGCTGATAGAGTTATCCCAACTCTGAGACCTAAGC
ACCTGTTCTCAGGGAAGAGAGGTAAAGGAAAGACGGATAGGCGTTGATGATGAAGCCAGA
CAAGGAAAAACAGATGCTGGATCGATTGAAGAATATCTCTCAAGTTTTGGATTTTACTGT
ACCTTTTGTTTACTGTTATTATTATGTTATGCAGCTTTTGTGGTTTTACTACAGACACTG
TAGCTTCTTCTGCAATCGATGTGTTTCT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL6335Contig1 877 2 2 U
GGGATATACTAAACACAGAAGATTCAACAAGAAGAAAAAATGTTGGCTATTTTTCAAAAG
ACGTTCGCTCATCCACCGGAAGAGCTAAACAGCCCGGCTTCAAACCTTTCCGGCAAAACC
CCAAAACTTCCGGGAGAAACTCTCTCTGACTTCCTTTTAAACCATCCAGACTCTGCTTTC
TCCATGAGCTTCGGCGACTCCGCTGTCCTCGCTTTCGCCCGCCCAGAAAACTCTAACCGT
CCAAGTATGTTTAGTGGCATCGATGGAATCTACTGTGTGTTTCTTGGAGCGTTGAACAAC
CTATGCGACTTGAACAAGCAGTACGGTTTATTTGGAAAATCCTCAAACGAAGCCATGTTT
GTGATCGAAGCGTACCGAACACTACGTGACCGTGGCCCTTACCCAGCTGATCAAGTTCTC
AGAGGTCTCGATGGAAGTTTTGCTTTTGTCGTCTACGATACTCAGACCTCCTCTGTTTTC
GCCGCTCTTGGATCTGATGGAGCAGAGAGTTTGTATTGCGGGATAGCTGCAGATGGGTCC
GTTGTTATGTCTGATGATATCAAGATTATTAAGCAAGGATGTGCTAAGTCATTTGCTCCT
TTTCCAACAGGGTGTATGTTTCACAGTGAGAGTGGTTTGATGAGTTTTGAGCATCCGAAG
AATAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGATAGTGAAGGGGTTATATGTGGAGCTAACTTT
AAAGTTGATACTTACTCCAAGATCAATAGCATTCCGAGGGGGGGAAGTGAAGCTAATTGG
TCTTTAGCAAACTCTAGTTAATGAAAGGACGAAGAAGAAGAGTTACTTTTGTTCTTTGAT
GTGATTTCTGTAAAATAATAAACGTACTAATAAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GF45TF U 1
AF RR4GF45JQ C 286
BS 1 664 RR4GF45TF
BS 665 877 RR4GF45JQ

RD RR4GF45TF 664 0 0
GGGATATACTAAACACAGAAGATTCAACAAGAAGAAAAAATGTTGGCTATTTTTCAAAAG
ACGTTCGCTCATCCACCGGAAGAGCTAAACAGCCCGGCTTCAAACCTTTCCGGCAAAACC
CCAAAACTTCCGGGAGAAACTCTCTCTGACTTCCTTTTAAACCATCCAGACTCTGCTTTC
TCCATGAGCTTCGGCGACTCCGCTGTCCTCGCTTTCGCCCGCCCAGAAAACTCTAACCGT
CCAAGTATGTTTAGTGGCATCGATGGAATCTACTGTGTGTTTCTTGGAGCGTTGAACAAC
CTATGCGACTTGAACAAGCAGTACGGTTTATTTGGAAAATCCTCAAACGAAGCCATGTTT
GTGATCGAAGCGTACCGAACACTACGTGACCGTGGCCCTTACCCAGCTGATCAAGTTCTC
AGAGGTCTCGATGGAAGTTTTGCTTTTGTCGTCTACGATACTCAGACCTCCTCTGTTTTC
GCCGCTCTTGGATCTGATGGAGCAGAGAGTTTGTATTGCGGGATAGCTGCAGATGGGTCC
GTTGTTATGTCTGATGATATCAAGATTATTAAGCAAGGATGTGCTAAGTCATTTGCTCCT
TTTCCAACAGGGTGTATGTTTCACAGTGAGAGTGGTTTGATGAGTTTTGAGCATCCGAAG
AATA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4GF45JQ 592 0 0
GGAGCGTTGAACAACCTATGCGACTTGAACAAGCAGTACGGTTTATTTGGAAAATCCTCA
AACGAAGCCATGTTTGTGATCGAAGCGTACCGAACACTACGTGACCGTGGCCCTTACCCA
GCTGATCAAGTTCTCAGAGGTCTCGATGGAAGTTTTGCTTTTGTCGTTTACGATACTCAG
ACCTCCTCTGTTTTCGCCGCTCTTGGATTTGATGGAGCAGAGAGTTTGTATTGGGGGATA
GCTGCAGATGGGTCCGTTGTTATGTCTGATGATATCAAGATTATTAAGCAAGGATGTGCT
AAGTCATTTGCTCCTTTTCCAACAGGGTGTATGTTTCACAGTGAGAGTGGTTTGATGAGT
TTTGAGCATCCGAAGAATAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGATAGTGAAGGGGTTATA
TGTGGAGCTAACTTTAAAGTTGATACTTACTCCAAGATCAATAGCATTCCGAGGGGGGGA
AGTGAAGCTAATTGGTCTTTAGCAAACTCTAGTTAATGAAAGGACGAAGAAGAAGAGTTA
CTTTTGTTCTTTGATGTGATTTCTGTAAAATAATAAACGTACTAATAAAATG

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL6336Contig1 1232 2 20 U
GCATCATCCACCTAGAGACGATGCAAAGCGTCCTCATCCTTGGTTCGTCGACTCTTCTTC
TTCTCGCTCAGAGACCTTCCCAAACAAGAAGCAAGCCGTTGTTGTGCAAGATCCAGGGAA
GTCAAACGTAGTAGTAGGTCTCCCTCTATGGGAAACTTCCTCTGTTTTTCAGTCCGTCTC
CAACGGGTTCATGGAGAGGCTTCTCGGAACCGAAATGCCTAGACCCCTTTTGTTTGGTGA
CAACAGAGATAACAGAACAGAGCCCAAGAGTTATATGGTGGAAGACAGGTCTGTTGAGTT
GTCTATATCTAACGGCGTGGAGGTTGGTTTCGGTGGTGGTGATGGTGGGAGTAGAAAGCT
TCAGGTTAGCCGTGTCAAGGAGACGATAAGAGCTTGTGGGAGGGAGAACGAGAGTAGTGG
TAGCTTTGTGAATTTCGCGATGGAGGGTGGTGGGCATCCTCATGGCGGCGAGGATGATGC
TCATGGGATCACGTTTGGTGAACTTAACGGTGTTGACTCCAGTTCTAATGTGGTTGGGAA
CTATCACCAGTCTTATGTTCAAGATCCAGATATGGTTTATGGCCAAGAAACCGCACAACA
GAACAGCAGTGAAGTTGTAGTAAGTGAGCAACAACAGCAAGTGGATAAACAGAGTTTGGA
ATCTCTTCCGAAGAGTAAACCAGAGTATAATAAGCCTTCAAAGAAGGAAGCTTCGACAAG
CTTTCCTTCAAACGTTAGAAGCTTGATATCGACTGGTATGCTCGACGGCGTTCCTGTGAA
GTACGTTGCTCTCTCGCGTGAGGAGCTTCGAGGAGTCATCAAAGGATCAGGCTATCTCTG
TGGATGTCAAGCTTGCGATTATACAAAGGTGCTTAATGCGTATGCATTTGAGAGACACGC
TGGATGTAAGACGAAGCATCCAAACAATCATATTTACTTTGAAAACGGGAAGACTATTTA
TCAGATAGTTCAGGAACTTAGGAACACTCCAGAGACTATGTTGTTTGACGTTGTTCAGAC
TGTTTTTGGCTCTCCTATCAACCAGAAAGCATTCCGCATATGGAAAGAATCATTCCAAGC
AGCAACTAGGGAACTTCAGCGTATCTATGGCAAAGAAGAGCGTTGCTTTTGATTTTGAAT
GTATAAAATATTATTATATTATGTGGAGAACTGTAAGATTGTAAACATTTTATTGGATCT
TTTACTTCTATATTGTTACTTTAATTTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D652TF U 1
AF RR4D652JQ C 407
BS 1 706 RR4D652TF
BS 707 707 RR4D652JQ
BS 708 718 RR4D652TF
BS 719 719 RR4D652JQ
BS 720 731 RR4D652TF
BS 732 732 RR4D652JQ
BS 733 767 RR4D652TF
BS 768 768 RR4D652JQ
BS 769 773 RR4D652TF
BS 774 774 RR4D652JQ
BS 775 779 RR4D652TF
BS 780 780 RR4D652JQ
BS 781 786 RR4D652TF
BS 787 787 RR4D652JQ
BS 788 802 RR4D652TF
BS 803 803 RR4D652JQ
BS 804 812 RR4D652TF
BS 813 813 RR4D652JQ
BS 814 824 RR4D652TF
BS 825 1232 RR4D652JQ

RD RR4D652TF 824 0 0
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TTCTCGCTCAGAGACCTTCCCAAACAAGAAGCAAGCCGTTGTTGTGCAAGATCCAGGGAA
GTCAAACGTAGTAGTAGGTCTCCCTCTATGGGAAACTTCCTCTGTTTTTCAGTCCGTCTC
CAACGGGTTCATGGAGAGGCTTCTCGGAACCGAAATGCCTAGACCCCTTTTGTTTGGTGA
CAACAGAGATAACAGAACAGAGCCCAAGAGTTATATGGTGGAAGACAGGTCTGTTGAGTT
GTCTATATCTAACGGCGTGGAGGTTGGTTTCGGTGGTGGTGATGGTGGGAGTAGAAAGCT
TCAGGTTAGCCGTGTCAAGGAGACGATAAGAGCTTGTGGGAGGGAGAACGAGAGTAGTGG
TAGCTTTGTGAATTTCGCGATGGAGGGTGGTGGGCATCCTCATGGCGGCGAGGATGATGC
TCATGGGATCACGTTTGGTGAACTTAACGGTGTTGACTCCAGTTCTAATGTGGTTGGGAA
CTATCACCAGTCTTATGTTCAAGATCCAGATATGGTTTATGGCCAAGAAACCGCACAACA
GAACAGCAGTGAAGTTGTAGTAAGTGAGCAACAACAGCAAGTGGATAAACAGAGTTTGGA
ATCTCTTCCGAAGAGTAAACCAGAGTATAATAAGCCTTCAAAGAAG*AAGCTTCGACA*G
CTTTCCTTCAA*CGTTAGAAGCTTGATATCGACTGGTATGCTCGACG*CGTTC*TGTGA*
GTACGT*GCTCTCTCGCGTGAG*AGCTTCGAG*AGTCATCAAAG

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4D652JQ 826 0 0
G
ACGAGAGTAGTGGTAGCTTTGTGAATT*CGCGATGGAGGG*GGTGGGCATCCTCATGGCG
GCGAGGATGATGCTCATGGGATCACGTTTGGTGAACTTAACGGTGTTGACTCCAGTTCTA
ATGTGGTTGGGAACTATCACCAGTCTTATGTTCAAGATCCAGATATGGTTTATGGCCAAG
AAACCGCACAACAGAACAGCAGTGAAGTTGTAGTAAGTGAGCAACAACAGCAAGTGGATA
AACAGAGTTTGGAATCTCTTCCGAAGAGTAAACCAGAGTATAATAAGCCTTCAAAGAAGG
AAGCTTCGACAAGCTTTCCTTCAAACGTTAGAAGCTTGATATCGACTGGTATGCTCGACG
GCGTTCCTGTGAAGTACGTTGCTCTCTCGCGTGAGGAGCTTCGAGGAGTCATCAAAGGAT
CAGGCTATCTCTGTGGATGTCAAGCTTGCGATTATACAAAGGTGCTTAATGCGTATGCAT
TTGAGAGACACGCTGGATGTAAGACGAAGCATCCAAACAATCATATTTACTTTGAAAACG
GGAAGACTATTTATCAGATAGTTCAGGAACTTAGGAACACTCCAGAGACTATGTTGTTTG
ACGTTGTTCAGACTGTTTTTGGCTCTCCTATCAACCAGAAAGCATTCCGCATATGGAAAG
AATCATTCCAAGCAGCAACTAGGGAACTTCAGCGTATCTATGGCAAAGAAGAGCGTTGCT
TTTGATTTTGAATGTATAAAATATTATTATATTATGTGGAGAACTGTAAGATTGTAAACA
TTTTATTGGATCTTTTACTTCTATATTGTTACTTTAATTTTGTAT

QA 2 826 2 826
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6338Contig1 624 2 3 U
TTTGCGTTTATTCGTCGTTTTATTTATAAGCTTTTTCAAACATTTTTGTTTTGTAGGTGG
AGCATGTAAGATCAGAGAGGAATCTATTAGCAGAAGTAGATAGTAATTGTATAGTGAAAC
TATACTGTTCATTTCAAGACGATGACTATCTTTACCTGATAATGGAGTATTTGCCCGGTG
GCGATATGATGACTCTTCTGATGAGGAAAGACACTTTAAGTGAAGATGAAGCTAGATTCT
ATGCTGCTGAAACTGTTCTGGCTATTGAATCTATTCATAAACGCAATTATATCCACAGGT
TTATATTGGATCATTTTTTATTACTGATCACAAAGAAGGTGTATGTGTGTTTTGAGATGT
TTTGTTGTTGTTGAGACAGGGATATAAAGCCGGATAATCTGTTGCTTGATAGAATTGGAC
ATTTGAGGCTGTCTGATTTTGGACTATGTAAGCCGTTGGATTGTAGTGTCATTGAAGGTG
AAGATTTTTCCAGAGGAGGTGTAGAGAGAGAAGATATCACATCAACAGCTCCTAAACGCT
CGCAGCAAGAGCAGTTACAACATTGGCAAAAGAATCGAAGAATGCTTGTATGTACCATAC
TCTTCTTTGACCCACTTTTGCTCC


BQ
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AF RR4FL72JQ U 4
AF RR4FL72TF C 1
BS 1 3 RR4FL72TF
BS 4 370 RR4FL72JQ
BS 371 624 RR4FL72TF

RD RR4FL72JQ 367 0 0
GCGTTTATTCGTCGTTTTATTTATAAGCTTTTTCAAACATTTTTGTTTTGTAGGTGGAGC
ATGTAAGATCAGAGAGGAATCTATTAGCAGAAGTAGATAGTAATTGTATAGTGAAACTAT
ACTGTTCATTTCAAGACGATGACTATCTTTACCTGATAATGGAGTATTTGCCCGGTGGCG
ATATGATGACTCTTCTGATGAGGAAAGACACTTTAAGTGAAGATGAAGCTAGATTCTATG
CTGCTGAAACTGTTCTGGCTATTGAATCTATTCATAAACGCAATTATATCCACAGGTTTA
TATTGGATCATTTTTTATTACTGATCACAAAGAAGGTGTATGTGTGTTTTGAGATGTTTT
GTTGTTG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4FL72TF 624 0 0
TTTGCGTTTATTCGTCGTTTTATTTATAAGCTTTTTCAAACATTTTTGTTTTGTAGGTGG
AGCATGTAAGATCAGAGAGGAATCTATTAGCAGAAGTAGATAGTAATTGTATAGTGAAAC
TATACTGTTCATTTCAAGACGATGACTATCTTTACCTGATAATGGAGTATTTGCCCGGTG
GCGATATGATGACTCTTCTGATGAGGAAAGACACTTTAAGTGAAGATGAAGCTAGATTCT
ATGCTGCTGAAACTGTTCTGGCTATTGAATCTATTCATAAACGCAATTATATCCACAGGT
TTATATTGGATCATTTTTTATTACTGATCACAAAGAAGGTGTATGTGTGTTTTGAGATGT
TTTGTTGTTGTTGAGACAGGGATATAAAGCCGGATAATCTGTTGCTTGATAGAATTGGAC
ATTTGAGGCTGTCTGATTTTGGACTATGTAAGCCGTTGGATTGTAGTGTCATTGAAGGTG
AAGATTTTTCCAGAGGAGGTGTAGAGAGAGAAGATATCACATCAACAGCTCCTAAACGCT
CGCAGCAAGAGCAGTTACAACATTGGCAAAAGAATCGAAGAATGCTTGTATGTACCATAC
TCTTCTTTGACCCACTTTTGCTCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6339Contig1 1043 2 4 U
GGACAGAGAAAACCTATCAACTATATACTACTTTCAGAGATTAAAAAATTTGTTGTCTCG
AAATGATAAAGAGAGGCTCTTAATTTAGGGGTATGTTGTGCGTGTGATGTGGATTATCAC
TTGCGAAAGAAATGGCAGGATTCTTCTATTTAGGAGGGAGAGACAACATCAACAACAAGC
AAGATCATCATCAACAAGACAAGAGCAATTACCTTTATCTTTACAAAGACGAGATCTATA
ACACCAACAAGGTTTTCGAGATTTGGCCTCCCCAATACTTCCAACAACAACAAGAACAAC
AACAGCATCATGTCACAGCTTCTACAAACTTATACTCCTTTGGAATGGTCCCAAGCAGCA
GCAGCAACAACAATACCAATAACCGGAGCCGGAGTTTATACTTCAACGTAGTCTCCGATC
ATGAGCCGGGAGGGTTCACGGTGACGAGACGAGGAGGTATGAATTGTCAAGATTGTGGGA
ATCAAGCTAAGAAAGATTGTCCTCATATGAGATGTAGAACATGTTGTAAAAGCCGAGGCT
TTCACTGTCAGACTCATGTTAAGAGCACTTGGGTTCCTGCTGCTAAACGCCGTGAGCGGT
TAGCTCAACTCGCTTCCTTGCAGCATCATTCAGCCACCAGCCGTGAAACGCAGAACGCAA
AAGCAAAACGCCTACGAGAAGGAAATGGTGGTGATAATGATGATAAAGACCATATTGGTG
GTGGTGGATCGGCTCTTGCTACCCGTTTGGTGAATGCTAATTCGAATTCAGGTAAAAATT
GATCATGGTGTGTGTTTTACAAATTGATGATACTGAATTAATCTTAGGAAATCGAGAGAA
AAAAGTGACAAAGCTTTAATTATGAAAGTTTGGGGAGAATTACAACATCATTTGCGTGTG
AATATTGCTGCTTTATTTTTGTCTAAGTTACTGTTTCTTAGTAAACCTGACGACATAAAA
GGGTTTATCCATGTAAAACAATTCGAAAACTAATTAAAGATTTTGGTTTTCTTCGCTGGA
TATATAATCAAGAACATGTTACC


BQ
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AF RR4FG08TF U 1
AF RR4FG08JQ C 344
BS 1 684 RR4FG08TF
BS 685 685 RR4FG08JQ
BS 686 715 RR4FG08TF
BS 716 1043 RR4FG08JQ

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AAATGATAAAGAGAGGCTCTTAATTTAGGGGTATGTTGTGCGTGTGATGTGGATTATCAC
TTGCGAAAGAAATGGCAGGATTCTTCTATTTAGGAGGGAGAGACAACATCAACAACAAGC
AAGATCATCATCAACAAGACAAGAGCAATTACCTTTATCTTTACAAAGACGAGATCTATA
ACACCAACAAGGTTTTCGAGATTTGGCCTCCCCAATACTTCCAACAACAACAAGAACAAC
AACAGCATCATGTCACAGCTTCTACAAACTTATACTCCTTTGGAATGGTCCCAAGCAGCA
GCAGCAACAACAATACCAATAACCGGAGCCGGAGTTTATACTTCAACGTAGTCTCCGATC
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ATCAAGCTAAGAAAGATTGTCCTCATATGAGATGTAGAACATGTTGTAAAAGCCGAGGCT
TTCACTGTCAGACTCATGTTAAGAGCACTTGGGTTCCTGCTGCTAAACGCCGTGAGCGGT
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AAGCAAAACGCCTACGAGAAGGAA*TGGTGGTGATAATGATGATAAAGACCATAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4FG08JQ 700 0 0
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TTGTCAAGATTGTGGGAATCAAGCTAAGAAAGATTGTCCTCATATGAGATGTAGAACATG
TTGTAAAAGCCGAGGCTTTCACTGTCAGACTCATGTTAAGAGCACTTGGGTTCCTGCTGC
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GAATTCAGGTAAAAATTGATCATGGTGTGTGTTTTACAAATTGATGATACTGAATTAATC
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AACATCATTTGCGTGTGAATATTGCTGCTTTATTTTTGTCTAAGTTACTGTTTCTTAGTA
AACCTGACGACATAAAAGGGTTTATCCATGTAAAACAATTCGAAAACTAATTAAAGATTT
TGGTTTTCTTCGCTGGATATATAATCAAGAACATGTTACC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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TCTGCGGTACCCTTCTCCAACGAGGATAGCTACAGCGTTGTGCTCCCAGAAAAGCTGGAC
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CCAGATCATCCTGAAATCAGGACTCTGCACGACAACTTTGTACATGCTGTTGAAACATAT
CCTGGTAACAAGTATCTTGGTACACGAGCTCGTCCTGATGGAACCATTGGAGAGTACACA
TGGATGACATATGCGGAAACAGCTTCTGCTAGACAAGCCATAGGTTCTGGACTTCTGTAT
AATGGAACTAATCTTGGAGCTTGCGTTGGACTCTATTTTATCAACAGACCAGAGTGGTTG
GTTGTTGATCATGCTTGTGCAGCATATTCCTTCATCTCTGTTCCTTTATACGATACACTT
GGTCCAGACGCTGTTAAGTTTGTTGTGAATCATGCTACTCTTCAGGCCATATTTTGTGTA
CCACAAACCTTAAATACCTTGCTAAGCTTCTTATCTGAAATCCCATCCATTCGTCTTGTT
GTGGTGGTGGGAGGGGCTGATGAAAATTTGCCATCACTTCCTACAGGATCTGGAGTAAAA
ATTGTATCATACCAAAAGCTATTGAGTCAGGGTCGCAGTAGCTTACATTCATTTTCCCCT
CCAAAACCTGAAGACATTGCAACCATATGCTACACAAGTGGAACCACAGGAACACCAAAG
GGTGCTATGTTGAGTCATGAAAACTTGATATCAAATGTCGCTGGTTCCAGCTTGTCAATA
AATTTCTTACCTGATGACATTTACATATCATATCTTCCATTGGCGCACATATATGAACGT
TCAAACCAGATAATGGGGGTGTATGGTGGTGTTTCCATCGGTTTCTATCAAGGGGATATC
ATGAAACTTATGGATGATTTGGCTGTGTTAAGGCCAACAGTATTCTGCAGTGTCCCTCGC
TTATATAATCGAGTATATGATGGGATTACAAGTGCGGTAAAATCATCCGGGGTTACAAAA
AGAAGGCTTTTCCAACTTGCCTATGACTCAAAGAAGAAAGCAATCTTAAATGGAAGGAGT
CCGTCTCCACTTTGGGACAAACTGGTCTTCAAC


BQ
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AF RR4A458TF U 1
AF RR4A458JQ C 454
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BS 753 825 RR4A458TF
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RD RR4A458TF 825 0 0
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TCTGCGGTACCCTTCTCCAACGAGGATAGCTACAGCGTTGTGCTCCCAGAAAAGCTGGAC
ACTGGAATATGGAATGTCTACAGATCTGCAAAGTCACCTACCAAGCTCGTTAGCAGATTC
CCAGATCATCCTGAAATCAGGACTCTGCACGACAACTTTGTACATGCTGTTGAAACATAT
CCTGGTAACAAGTATCTTGGTACACGAGCTCGTCCTGATGGAACCATTGGAGAGTACACA
TGGATGACATATGCGGAAACAGCTTCTGCTAGACAAGCCATAGGTTCTGGACTTCTGTAT
AATGGAACTAATCTTGGAGCTTGCGTTGGACTCTATTTTATCAACAGACCAGAGTGGTTG
GTTGTTGATCATGCTTGTGCAGCATATTCCTTCATCTCTGTTCCTTTATACGATACACTT
GGTCCAGACGCTGTTAAGTTTGTTGTGAATCATGCTACTCTTCAGGCCATATTTTGTGTA
CCACAAACCTTAAATACCTTGCTAAGCTTCTTATCTGAAATCCCATCCATTCGTCTTGTT
GTGGTGGTGGGAGGGGCTGATGAAAATTTGCCATCACTTCCTACAGGATCTGGAGTAAAA
ATTGTATCATACCAAAAGCTATTGAGTCAGG*TCGCAGTAGCTTACATTCATTTTCCCCT
CCAAAACCTGAAGACATTGCAACCATATGCTACACAAGTGGAACC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4A458JQ 780 0 0
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ATCTCTGTTCCTTTATACGATACACTTGGTCCAGACGCTGTTAAGTTTGTTGTGAATCAT
GCTACTCTTCAGGCCATATTTTGTGTACCACAAACCTTAAATACCTTGCTAAGCTTCTTA
TCTGAAATCCCATCCATTCGTCTTGTTGTGGTGGTGGGAGGGGCTGATGAAAATTTGCCA
TCACTTCCTACAGGATCTGGAGTAAAAATTGTATCATACCAAAAGCTATTGAGTCAGGGT
CGCAGTAGCTTACATTCATTTTCCCCTCCAAAACCTGAAGACATTGCAACCATATGCTAC
ACAAGTGGAACCACAGGAACACCAAAGGGTGCTATGTTGAGTCATGAAAACTTGATATCA
AATGTCGCTGGTTCCAGCTTGTCAATAAATTTCTTACCTGATGACATTTACATATCATAT
CTTCCATTGGCGCACATATATGAACGTTCAAACCAGATAATGGGGGTGTATGGTGGTGTT
TCCATCGGTTTCTATCAAGGGGATATCATGAAACTTATGGATGATTTGGCTGTGTTAAGG
CCAACAGTATTCTGCAGTGTCCCTCGCTTATATAATCGAGTATATGATGGGATTACAAGT
GCGGTAAAATCATCCGGGGTTACAAAAAGAAGGCTTTTCCAACTTGCCTATGACTCAAAG
AAGAAAGCAATCTTAAATGGAAGGAGTCCGTCTCCACTTTGGGACAAACTGGTCTTCAAC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6341Contig1 1063 2 6 U
GGACAAAACCTTCCTTCCTTTCACCCAACTCTCTATCTCTCTCAGTTCTCACTCCGGATC
CGAATCATGAGCTTAAGAGACCCGAATCCAGTAACTAACACACCCGGATCCTTTTCGGAT
CCTGCCGGGTTCGCTATAAACACGAGAATCATGCTCACCGCCATAATCATAATCATATTC
TTCGTCCTTCTCATGGTCTCTCTTCACCTCTACTCTCGTTTCTACCTCCACCGCTCTCGC
CGTTTCCATATCCGCCGCTTGAACCGCACTAGACGCGCCGCCGCCGCCATGACCTTCTTC
GCCGATCCTTCCTCCTCCTCCGCGGTCGCCACTCGCGGCGGTCTCGACCCCTCCGTCATC
AAATCTCTTCCCACTTTCACGTTCTCCGCCGCAACCGCCGCGATGATCGAGTGTGCGGTT
TGCCTCTCGGAGTTTGAGGAGAGCGAACCGGGTCGGGTTTTGCCCAACTGCAAGCACGCG
TTTCATGTTGAGTGCATTGATATGTGGTTTCACTCTCATTCTTCTTGTCCTCTATGCCGA
TCGCTCGTCGAGCCTATCGCCGGAGGAGTGAAAACTGCGGCGGAGGAGGAAGTCGCGATT
TCGATTTCTGACCCGGTTTCAGACGACGTCGTAGAAGCTGAGACTTCTGATCGTGAAGAC
TCCGGGGAAAAACCGGCTGCGATTGAAGTCTCCAGGAGGAATCTCGGAGAATCGGAGAAC
GAGTTGACTCGGAGTCACTCGTTTAGGTCAAGAGTGATATCTTCCACGTGGATTTTCAGC
AAAGAACGGAGAAGCGCTTCTTTTTCGTCTTCTCTAGGATGTCCTCCGGTCTGTAGCATG
CCGGTGACGGAGTTAGATATTGAGGCCGGAGGAGAAGAGGCTCGTTGACTTTAAGACACG
CAATGTTACTGCCACGTGGACGTGTATGATTTGTTTCAAGTGTTTCTTTATTAGTTTAGA
GTTAAGATGCAGAGATAAAATAATTCTTGGTTACTTTTCAGTTCTGGCGTTTCCGAAAAG
GGTTAATGTAGATTTCATTGTTTAATGAGTTTGGACACGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BW24TF U 1
AF RR4BW24JQ C 360
BS 1 671 RR4BW24TF
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BS 701 701 RR4BW24JQ
BS 702 710 RR4BW24TF
BS 711 1063 RR4BW24JQ

RD RR4BW24TF 710 0 0
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CGAATCATGAGCTTAAGAGACCCGAATCCAGTAACTAACACACCCGGATCCTTTTCGGAT
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TTCGTCCTTCTCATGGTCTCTCTTCACCTCTACTCTCGTTTCTACCTCCACCGCTCTCGC
CGTTTCCATATCCGCCGCTTGAACCGCACTAGACGCGCCGCCGCCGCCATGACCTTCTTC
GCCGATCCTTCCTCCTCCTCCGCGGTCGCCACTCGCGGCGGTCTCGACCCCTCCGTCATC
AAATCTCTTCCCACTTTCACGTTCTCCGCCGCAACCGCCGCGATGATCGAGTGTGCGGTT
TGCCTCTCGGAGTTTGAGGAGAGCGAACCGGGTCGGGTTTTGCCCAACTGCAAGCACGCG
TTTCATGTTGAGTGCATTGATATGTGGTTTCACTCTCATTCTTCTTGTCCTCTATGCCGA
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TCGATTTCTGACCCGGTTTCAGACGACGTCGTAGAAGCTGAGACTTCTGATCGTGAAGAC
TCCGGGGAAAA*CCGGCTGCGATTGAAGTCTCCAGGAGGA*TCTCGGAGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4BW24JQ 704 0 0
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TTGCCTCTCGGAGTTTGAGGAGAGCGAACCGGGTCGGGTTTTGCCCAACTGCAAGCACGC
GTTTCATGTTGAGTGCATTGATATGTGGTTTCACTCTCATTCTTCTTGTCCTCTATGCCG
ATCGCTCGTCGAGCCTATCGCCGGAGGAGTGAAAACTGCGGCGGAGGAGGAAGTCGCGAT
TTCGATTTCTGACCCGGTTTCAGACGACGTCGTAGAAGCTGAGACTTCTGATCGTGAAGA
CTCCGGGGAAAAACCGGCTGCGATTGAAGTCTCCAGGAGGAATCTCGGAGAATCGGAGAA
CGAGTTGACTCGGAGTCACTCGTTTAGGTCAAGAGTGATATCTTCCACGTGGATTTTCAG
CAAAGAACGGAGAAGCGCTTCTTTTTCGTCTTCTCTAGGATGTCCTCCGGTCTGTAGCAT
GCCGGTGACGGAGTTAGATATTGAGGCCGGAGGAGAAGAGGCTCGTTGACTTTAAGACAC
GCAATGTTACTGCCACGTGGACGTGTATGATTTGTTTCAAGTGTTTCTTTATTAGTTTAG
AGTTAAGATGCAGAGATAAAATAATTCTTGGTTACTTTTCAGTTCTGGCGTTTCCGAAAA
GGGTTAATGTAGATTTCATTGTTTAATGAGTTTGGACACGTGAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6342Contig1 371 2 1 U
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TTGACACCGACGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCAATTGCCA
ACCGTGGTCTCATGAAAGATGTTGCCAAGATTTTCTAAGAGGAGTTTCAAAATCTATAAT
TCACATGAAAATGATTTGAGGTCTAATCATGTTTAATTCGTTTTTTAATGACATCATTTG
ATTAAGTATGTATTTTTGGTTGTAAAAGTAAATGAATTATAGTTAACTCAGTGATATCTT
AATAATACTTTCTCTTTTCAAAAAATATAAATGTTGCTTTTAATATTTCAAAAAGATAAA
TTTAAGTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H136JQ C 1
AF RR4H136TF U 1
BS 1 371 RR4H136TF

RD RR4H136JQ 371 0 0
GTGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGCCACACACGATGACATTAAGCGTATGATGGCTGAGA
TTGACACCGACGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAGTTTTTTGATTTCGCAATTGCCA
ACCGTGGTCTCATGAAAGATGTTGCCAAGATTTTCTAAGAGGAGTTTCAAAATCTATAAT
TCACATGAAAATGATTTGAGGTCTAATCATGTTTAATTCGTTTTTTAATGACATCATTTG
ATTAAGTATGTATTTTTGGTTGTAAAAGTAAATGAATTATAGTTAACTCAGTGATATCTT
AATAATACTTTCTCTTTTCAAAAAATATAAATGTTGCTTTTAATATTTCAAAAAGATAAA
TTTAAGTTCTC

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR4H136TF 371 0 0
GTGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGCCACACACGATGACATTAAGCGTATGATGGCTGAGA
TTGACACCGACGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCAATTGCCA
ACCGTGGTCTCATGAAAGATGTTGCCAAGATTTTCTAAGAGGAGTTTCAAAATCTATAAT
TCACATGAAAATGATTTGAGGTCTAATCATGTTTAATTCGTTTTTTAATGACATCATTTG
ATTAAGTATGTATTTTTGGTTGTAAAAGTAAATGAATTATAGTTAACTCAGTGATATCTT
AATAATACTTTCTCTTTTCAAAAAATATAAATGTTGCTTTTAATATTTCAAAAAGATAAA
TTTAAGTTCTC

QA 1 371 1 371
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6344Contig1 1047 2 4 U
GGAAAACTCAGGCTGATGTTTAGCTTTTACTATAGAAAATTAAGGGTAATATCTAAATAT
AAACATCCAAAATGGGTCTCAAGGCCTCTTTTTCTCTTCTCTTTCTCACCATCTTACTCG
GTGTATCATCCATTGTATCAGCGGTTAACATAAACAGAGCACTCGAGAAACACCCTGAAT
TCAGCACCATGACGGAACTGTTCAACAAAACCAAGCTCACACCAATTATCAACAAACGTC
AGACAGTCACCTTGTTGGTTCTAATCAACGATGCTATCGGTTCCATCTCTGGTCGACCCG
AGGACGAGCTCAAGAACATTCTAATGAACCATGTGGTTCTTGACTTCTACGATGGGCTCA
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AAAACAGTTTGAAAATGATACTCGACCGTAGAGATAATCATAGTGATATAAAGTGTACTT
TCTATTCATGTACCTCAAAAATCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BT92TF U 1
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CGGTTAAGGTTCCTCCACCGCCACCCATTTTTCATCACCGGCTCCATCTCCCAAAGAG*C
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AGC

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DS 

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AAACTGCTGAGTACATCACGACCGTGTTCCGTAACCCATTCAATCTCTCTATAGTCCAGA
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CCATTTTTCATCACCGGCTCCATCTCCCAAAGAGGCTGCAGACACTCCAGCTCCTGGACC
AGCTGAGGAAGAGGTTTACGCAGATTCTCCTCCCGGTGCAGCTCCAGAAACATCACCTGC
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TGCTGGTTTCTAAGATGTTTTAGGACGACCGAGTTGAAAACAGTTTGAAAATGATACTCG
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TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTGCATCATCGTACGATCTTTCAGGAACATCGTCGCCGAAGAAAGTGTCGCTGGGCCTGT
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TAACATGTGGGATTTTTTGGAACGTATCAAAACCTCTTTGTTGTCGTACATCGACGTCAC
AGGCCTGCTATAAACACCCTTCTCTTTGTTTTATGATATGTAGCATGATTACTCTAAAAA
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GCG


BQ
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10 10 10 

AF RR4BY06TF U 1
AF RR4BY06JQ C 252
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BS 638 1023 RR4BY06JQ

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TTGCATCATCGTACGATCTTTCAGGAACATCGTCGCCGAAGAAAGTGTCGCTGGGCCTGT
ACTACGAGTCTCTATGTCCCTACTGCTCATCCTTCATCGTTAACCACCTCACGAAGCTCT
TCGAAGATCTAATATCAATCGTCGATCTCCATCTCTCTCCCTGGGGTAACACCAAGCTCC
GCTCCTCCTCCGATAATAATAATGTCACTGCCGTTTGCCAGCACGGTGCGTTTGAATGCT
TATTGGATACAGTTGAGGCTTGTGCGATCGATGCTTGGCCTAAATTGAGCGATCATTTCC
CGTTTATCCTCTGCGTTGAGGGTTTGGTGACTGAGCACAAGTACGACAAGTGGGAGACTT
GTTATGAGAGGCTCAATCTTAACTCTAAACCTGTTGACGATTGCCTCAGCAGTGTGAGCA
TGCCTGTCGAGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAGCGGGGCGAAGCCAGAGGAAAC
TCTGGTGGAGGCCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCGTGCAAG*AAGCTGATTGGTAGG
ATCCCTCACGGGTGCACTACCGACCGACCTTGATCTT
CTGA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4BY06JQ 772 0 0
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CTCAATCTTAACTCTAAACCTGTTGACGATTGCCTCAGCAGTGTGAGCATGCCTGTCGAG
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CCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCGTGCAAGGAAGCTGATTGGTAGGATCCCTCACGG
GTGCACTACCGACCGACCTTGATCTTTTGAGAAGGCCTCATCAATACGTGCCCTGGGTGG
TTGTAGATGGTCAGCCTCTTTATGAGGATTATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAAAG
CTTACAAAGGTAATAAAAAGCCTGCCGCATGTGCCAAATACTCATCCAGGAACTTCATTC
GAAGTGCCAAAGTGAATCGCTTCCCTCTGGTTTGCCGGAAAGGAGTCGATAACATGTGGG
ATTTTTTGGAACGTATCAAAACCTCTTTGTTGTCGTACATCGACGTCACAGGCCTGCTAT
AAACACCCTTCTCTTTGTTTTATGATATGTAGCATGATTACTCTAAAAAGCTATATGGCT
TTTGAGATATGATGAATATGTATGTATTAACACAAAGTGTATGGTTGTTGCG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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TCATCAGGTCAGGATCACAACATTTGTCAACTAGGAAGTGCTGCTGTGGAAGAAAACAAA
CCTACTACTCTTCCACTTGATAGTGACCCGGAAGAGATGATGATGATGATGATGAGAGGC
ATGACTGCCAAGAACTTTGACCCAGTTAGGTACTCTGGAAGATGGTTTGAAGTAGCTTCT
CTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAAGAAGATTGCCATTGTACACAGGGAGTATAC
ACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGTAGACACGTTTTGTGTTCACGGTAGCCCT
GATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAAGTTCAATGCGTTGGAGCACAAGACCTGGAG
AAAACTGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAGATGATTAAAGAGAAATGTTACCTTCGGTTT
CCCACCATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCTTATGATGTCATAGCTACAGACTATGACAAC
TACGCTCTTGTTTCTGGAGCCAAAGACAGGAGCTTTGTTCAGGTATACTCAAGGACACCT
AACCCGGGACCTGAGTTCGTAGCCAAGTACAAAGACTATTTGGCACAGTTTGGTTACGAC
CCGGAGAAAATAAAGGATACTCCACAGGACTGTGAAGTGATGTCTGATGGTCAGCTAGCT
GCTATGATGTCCATGCCAGGTATGGAGAAAACGCTGACAAACCAGTTTCCAGATCTTGAA
CTAAGAAAGGCAGTCCAGTTTGATCCCTTCACAAGTGTGTTTGAAACTTTGAAGAAACTG
GTCCCACTCTATTTCAAGTAGAGAAGCTTTTCTGCCCCCTCAAGAGTCTTTTTGAATTCT
GAATGTAGATTATTTATGCTGCTTGTACACCTGACTGAGTGAGTGTATAGATATGAATTA
TTTTTTAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW91TF U 1
AF RR4BW91JQ C 350
BS 1 683 RR4BW91TF
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AACCCGGGACCTGAGTTCGTAGCCA
GTACAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4BW91JQ 742 0 0
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TGAAGAAACTGGTCCCACTCTATTTCAAGTAGAGAAGCTTTTCTGCCCCCTCAAGAGTCT
TTTTGAATTCTGAATGTAGATTATTTATGCTGCTTGTACACCTGACTGAGTGAGTGTATA
GATATGAATTATTTTTTAAGAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

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CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATG
TTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGAAGAAGAGAAGAAGC
ATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCC
ATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGGGCGTGACCTTATGAAAAACGTAAA
ACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAGGGGAAGTA
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ATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCGAGAAGAATACAA
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GCTATATTCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAA
GACCTCCAAAAATCTGCTCAAAGCACTTCAGAACACGTCTAAGAGTATACGAACGGTTGA
TCTGCCCGAAGAGTATAAAGAACTTAGAGCAAAGATGAACTCCAGGAATAAGGCTAATTC
AATATTTTAAATGCTTTTAAACAAATTACAACGAATCTGTTTAATCAGAATAACTTGACT
TTACAGCTTGTGAATCATCATTGACCGCTTTCTAATCTAATCAACACAACTCTCTTTGCA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4GV88TF U 1
AF RR4GV88JQ C 374
BS 1 603 RR4GV88TF
BS 604 604 RR4GV88JQ
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BS 763 776 RR4GV88TF
BS 777 961 RR4GV88JQ

RD RR4GV88TF 776 0 0
GGGCTCTTATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTA
AGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGT
CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATG
TTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGAAGAAGAGAAGAAGC
ATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCC
ATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGGGCGTGACCTTATGAAAAACGTAAA
ACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAGGGGAAGTA
TAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTAT
ATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCGAGAAGAATACAA
AAA*TGTAGTGGTGGCCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACGGTAAACCAATACTTTGA
GCTATATTCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGA*CACCATCA*
GACCTCCAAAA*TCTGCTCAAAGCACTTCAGA*CACGTCTA*GAGTATACGAACGG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4GV88JQ 588 0 0
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ACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAGGGGAAGTATAAGAAAGAGAAA
GTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAA
GAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGT
GGCCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACGGTAAACCAATACTTTGAGCTATATTCTCCA
TTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAGACCTCCAAAAAT
CTGCTCAAAGCACTTCAGAACACGTCTAAGAGTATACGAACGGTTGATCTGCCCGAAGAG
TATAAAGAACTTAGAGCAAAGATGAACTCCAGGAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAATG
CTTTTAAACAAATTACAACGAATCTGTTTAATCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGA
ATCATCATTGACCGCTTTCTAATCTAATCAACACAACTCTCTTTGCAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL6349Contig1 1081 2 2 U
GGACTCTAGAGCCAAAGATGTACAAAGCAAGCCCTAATAGAAGAGAGGTCTTGGAGAGAA
GTAAGAGTGTAAGAGAGAAGGAGACTAAGCAAACCTCAAACTTCTTTGCCAAACACTTAA
AGAGGATATATCCGATCACGCTTCAACGTAGTACTTCTTCTTCTTTCTCACTCTCTTCTG
TATCTCTATCACTCTCTCAAAACTCGACCGATTCCTCTGCCACGGATTCTACTTCCACAT
TAGAGCAAAGAATCTCTCTAGCACTAGGTTTAATCTCATCTCCTCGTAGAAGAGAAACAT
TTGTTCCTAAAACAATTCCGCGACAACAACAAGAACAACGTCTATATGAGGACATCAAAA
GTGATGAACCAAAGAGGTGTAATTGGATCACCAAGAAAAGTGATGAAGTCTACGTAACGT
TTCATGATCAGCAATGGGGAGTCCCTGTCTATGATGATAACTTGCTTTTTGAGTTCCTTG
CTATGTCGGGGATGTTAATGGACTATAATTGGACCGAGATTTTAAAACGCAAAGAACTCT
TTAGAGAGGCATTTTGTGAGTTTGACCCAAACCTGGTGGCCAAAATGGGAGAGAAAGAGA
TCACAGAGATTGCATCAAACAAAGCAATAATGCTACAAGAGAGTCGAGTTAGGTGTATAG
TTGGCAATGCGAAATGCATAATCAAGGTGGTCAAAGAGTTTGGATCATTTAGCAGCTACA
TGTGGGGGTTTATGGATTACAAACCGATCATTAACAGATTCAAGTATTCGAGAAATGTAC
CACTGAGATCTCCCAAGGCTGAGATAATTAGCAAAGATATGATCAAACGAGGGTTTCGAT
TTGTCGGTCCAGTTATCGTACATTCTTTCATGCAAGCGGCAGGGTTAACAATTGATCACC
TCGTTGATTGTTTTAGACATGGTGATTGTGTGAGCCTCGCTGAGAGGCCATGGAGGCATA
TATGATGTTCACTTTGGGTTAAAACATATATTCGAGCTTTTGACTTTTCTTTGGTCTAAT
AAAAATATTTGAAATCAAACTGCTTGTTATTTCTATAAGTTTTCTTTTGGGTTTTTTGAT
C


BQ
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10 

AF RR4FM55TF U 1
AF RR4FM55JQ C 306
BS 1 682 RR4FM55TF
BS 683 1081 RR4FM55JQ

RD RR4FM55TF 682 0 0
GGACTCTAGAGCCAAAGATGTACAAAGCAAGCCCTAATAGAAGAGAGGTCTTGGAGAGAA
GTAAGAGTGTAAGAGAGAAGGAGACTAAGCAAACCTCAAACTTCTTTGCCAAACACTTAA
AGAGGATATATCCGATCACGCTTCAACGTAGTACTTCTTCTTCTTTCTCACTCTCTTCTG
TATCTCTATCACTCTCTCAAAACTCGACCGATTCCTCTGCCACGGATTCTACTTCCACAT
TAGAGCAAAGAATCTCTCTAGCACTAGGTTTAATCTCATCTCCTCGTAGAAGAGAAACAT
TTGTTCCTAAAACAATTCCGCGACAACAACAAGAACAACGTCTATATGAGGACATCAAAA
GTGATGAACCAAAGAGGTGTAATTGGATCACCAAGAAAAGTGATGAAGTCTACGTAACGT
TTCATGATCAGCAATGGGGAGTCCCTGTCTATGATGATAACTTGCTTTTTGAGTTCCTTG
CTATGTCGGGGATGTTAATGGACTATAATTGGACCGAGATTTTAAAACGCAAAGAACTCT
TTAGAGAGGCATTTTGTGAGTTTGACCCAAACCTGGTGGCCAAAATGGGAGAGAAAGAGA
TCACAGAGATTGCATCAAACAAAGCAATAATGCTACAAGAGAGTCGAGTTAGGTGTATAG
TTGGCAATGCGAAATGCATAAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4FM55JQ 776 0 0
T
CTAAAACAATTCCGCGACAACAACAAGAACAACGTCTATATGAGGACATCAAAAGTGATG
AACCAAAGAGGTGTAATTGGATCACCAAGAAAAGTGATGAAGTCTACGTAACGTTTCATG
ATCAGCAATGGGGAGTCCCTGTCTATGATGATAACTTGCTTTTTGAGTTCCTTGCTATGT
CGGGGATGTTAATGGACTATAATTGGACCGAGATTTTAAAACGCAAAGAACTCTTTAGAG
AGGCATTTTGTGAGTTTGACCCAAACCTGGTGGCCAAAATGGGAGAGAAAGAGATCACAG
AGATTGCATCAAACAAAGCAATAATGCTACAAGAGAGTCGAGTTAGGTGTATAGTTGGCA
ATGCGAAATGCATAATCAAGGTGGTCAAAGAGTTTGGATCATTTAGCAGCTACATGTGGG
GGTTTATGGATTACAAACCGATCATTAACAGATTCAAGTATTCGAGAAATGTACCACTGA
GATCTCCCAAGGCTGAGATAATTAGCAAAGATATGATCAAACGAGGGTTTCGATTTGTCG
GTCCAGTTATCGTACATTCTTTCATGCAAGCGGCAGGGTTAACAATTGATCACCTCGTTG
ATTGTTTTAGACATGGTGATTGTGTGAGCCTCGCTGAGAGGCCATGGAGGCATATATGAT
GTTCACTTTGGGTTAAAACATATATTCGAGCTTTTGACTTTTCTTTGGTCTAATAAAAAT
ATTTGAAATCAAACTGCTTGTTATTTCTATAAGTTTTCTTTTGGGTTTTTTGATC

QA 2 776 2 776
DS 



AS 1 2

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GGGTGACTGGTTTCGCTAGAATCTATGGTCAGACGGTAGGAATCATTGGGAACAATGGCA
TACTGTTCAATGAATCTGCATTAAAAGGAGCACACTTCATTGAGCTGTGTTCTCAACGTA
AAATCCCTCTTGTTTTCCTCCAGAACATCACAGGCTTTATGGTGGGTTCAAGATCTGAGG
CCAATGGCATTGCAAAATCTGGAGCTAAAATGGTGATGGCGGTTTCTTGTGCTAAGGTAC
CAAAGATAACAATTATAACGGGTGCAAGCTTTGGTGCTGGAAACTATGCCATGTGTGGGC
GTTCATACAGTCCTGATTTTCTCTTCATGTGGCCAAACGCAAGAATTGGCGTCATGGGAG
GCGCTCAGGCTGCAGGGTGTTTTGAGTCAGATAGAAAGGGCTACCAAGAAGAGACAAGGA
ATAAAGTGGACAGAGGAAGATGAAGAAGAGTTCAAGAAGAAAACGGTGGATGCTTATGAG
AGAGAGGCGAGTCCTTACTTCTCCACAGCGAGGCTTTGGGATGATGGAGTGATTGATCCA
GCTGATACTAGAAAGGTGTTGGGACTTTGTCTCTCTGCTGCTTCTAACCGTCCTTTAGAA
GATACTCGTTTTGGTGTCTTTAGAATGTAAATCAACTTCCAATCATTTCCACTTTCGAAT
AATTATTTTAAATAAATGAAACAAAACACTTTCATGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM28TF U 13
AF RR4CM28JQ C 1
BS 1 16 RR4CM28JQ
BS 17 396 RR4CM28TF
BS 397 698 RR4CM28JQ

RD RR4CM28TF 384 0 0
TTCG
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TGCATTAAAAGGAGCACACTTCATTGAGCTGTGTTCTCAACGTAAAATCCCTCTTGTTTT
CCTCCAGAACATCACAGGCTTTATGGTGGGTTCAAGATCTGAGGCCAATGGCATTGCAAA
ATCTGGAGCTAAAATGGTGATGGCGGTTTCTTGTGCTAAGGTACCAAAGATAACAATTAT
AACGGGTGCAAGCTTTGGTGCTGGAAACTATGCCATGTGTGGGCGTTCATACAGTCCTGA
TTTTCTCTTCATGTGGCCAAACGCAAGAATTGGCGTCATGGGAGGCGCTCAGGCTGCAGG
GTGTTTTGAGTCAGATAGAA

QA 5 384 5 384
DS 

RD RR4CM28JQ 698 0 0
GGGTGACTGGTTTCGCTAGAATCTATGGTCAGACGGTAGGAATCATTGGGAACAATGGCA
TACTGTTCAATGAATCTGCATTAAAAGGAGCACACTTCATTGAGCTGTGTTCTCAACGTA
AAATCCCTCTTGTTTTCCTCCAGAACATCACAGGCTTTATGGTGGGTTCAAGATCTGAGG
CCAATGGCATTGCAAAATCTGGAGCTAAAATGGTGATGGCGGTTTCTTGTGCTAAGGTAC
CAAAGATAACAATTATAACGGGTGCAAGCTTTGGTGCTGGAAACTATGCCATGTGTGGGC
GTTCATACAGTCCTGATTTTCTCTTCATGTGGCCAAACGCAAGAATTGGCGTCATGGGAG
GCGCTCAGGCTGCAGG*TGTTTTGAGTCAGATAGAAAGGGCTACCAAGAAGAGACAAGGA
ATAAAGTGGACAGAGGAAGATGAAGAAGAGTTCAAGAAGAAAACGGTGGATGCTTATGAG
AGAGAGGCGAGTCCTTACTTCTCCACAGCGAGGCTTTGGGATGATGGAGTGATTGATCCA
GCTGATACTAGAAAGGTGTTGGGACTTTGTCTCTCTGCTGCTTCTAACCGTCCTTTAGAA
GATACTCGTTTTGGTGTCTTTAGAATGTAAATCAACTTCCAATCATTTCCACTTTCGAAT
AATTATTTTAAATAAATGAAACAAAACACTTTCATGCT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6351Contig1 495 2 3 U
ATTGTATAGAAACAACCTTTTATCCATTTTGAAATCATGAAGTGTGCTATTTTGTTTGTT
GTTTTATGCGTTCTCATGTTCCAAGTTTCGAACATTGTAAAAGCGAATGGCCTAGACATG
TGTAGATGGCATGGTAGGTATCCTGGAAAATGTGGCCCGGGAAAGTGTCATAACGAAATA
AAGTCACCTCACAAGTTTCAGCGTTGTGATTGTAAAGATATTCTTTATCTAAAGAAAGAC
CATCATGACTGCGATTGTTACATTAAGCCTCCTTGTCGTCCAAAATAAACGGCTGGTCGG
CTGCTATTGATTTTTTTTTGGAACACTCGGCTGCTATTGATATAAGAAACCTCTTTGTCG
GCAATACACTGCCAGTCTTACCAATAAAATTCACTTACCAATACAAAGGAGATGAGAGAG
GAGAGTTTTTATGCTAATATGTTGTTAGTCTATATTTTTCTAAATTTATTTGTTTTATTA
TAGAAAATAATAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GS76TF U 1
AF RR4GS76JQ C 76
BS 1 284 RR4GS76TF
BS 285 285 RR4GS76JQ
BS 286 495 RR4GS76TF

RD RR4GS76TF 495 0 0
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GTTTTATGCGTTCTCATGTTCCAAGTTTCGAACATTGTAAAAGCGAATGGCCTAGACATG
TGTAGATGGCATGGTAGGTATCCTGGAAAATGTGGCCCGGGAAAGTGTCATAACGAAATA
AAGTCACCTCACAAGTTTCAGCGTTGTGATTGTAAAGATATTCTTTATCTAAAGAAAGAC
CATCATGACTGCGATTGTTACATTAAGCCTCCTTGTCGTCCAAACTAAACGGCTGGTCGG
CTGCTATTGATTTTTTTTTGGAACACTCGGCTGCTATTGATATAAGAAACCTCTTTGTCG
GCAATACACTGCCAGTCTTACCAATAAAATTCACTTACCAATACAAAGGAGATGAGAGAG
GAGAGTTTTTATGCTAATATGTTGTTAGTCTATATTTTTCTAAATTTATTTGTTTTATTA
TAGAAAATAATAAAC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4GS76JQ 420 0 0
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AGGTATCCTGGAAAATGTGGCCCGGGAAAGTGTCATAACGAAATAAAGTCACCTCACAAG
TTTCAGCGTTGTGATTGTAAAGATATTTTTTATTTAAAGAAAGACCATCATGACTGCGAT
TGTTACATTAAGCCTCCTTGTTGTCCAAAATAAACGGCTGGTTGGGTGCTATTGATTTTT
TTTTGGAACACTCGGCTGCTATTGATATAAGAAACCTTTTTGTTGGCAATACACTGCCAG
TTTTACCAATAAAATTCACTTACCAATACAAAGGAGATGAGAGAGGAGAGTTTTTATGCT
AATATGTTGTTAGTTTATATTTTTTTAAATTTATTTGTTTTATTATAGAAAATAATAAAC

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 2

CO CL6352Contig1 414 2 2 U
CCTGAATTTAGTTTGCGCTACATTCAAGACAATTCCGATTTTTCAGTTGTGAACAAATCA
AGAAAGGAAGAAAAACATAGAAACAAATGGAATCCGATTGCATAAAACATTGAACTGACA
TGTGACTTCTTGTAACAGCAAAACTCTAATTTCTCTCTCTCAAAACTCTATTCCTTGATT
CCTAAGTGGCGCCGACGATGATGTTGTTGATGGGAATAAAGATGAGTTTCACAAAGAAGC
CAACGAATCCCATCACTACAAACCCTATCGCCGTGCGAACTGCAACTTTCGTGAACTCTT
TGCGATCTGGTTTGTGGCAACGCTTAACGAGACGGATGCTATCCTTGGCGAAGTCTCTGA
GAGGACCAACGACGGAATCAATGGCGTCCATGGCGATGAAAGGCGGTGGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EM58TF C 1
AF RR4EM58JQ U 39
BS 1 38 RR4EM58TF
BS 39 414 RR4EM58JQ

RD RR4EM58TF 414 0 0
CCTGAATTTAGTTTGCGCTACATTCAAGACAATTCCGATTTTTCAGTTGTGAACAAATCA
AGAAAGGAAGAAAAACATAGAAACAAATGGAATCCGATTGCATAAAACATTGAACTGACA
TGTGACTTCTTGTAACAGCAAAACTCTAATTTCTCTCTCTCAAAACTCTATTCCTTGATT
CCTAAGTGGCGCCGACGATGATGTTGTTGATGGGAATAAAGATGAGTTTCACAAAGAAGC
CAACGAATCCCATCACTACAAACCCTATCGCCGTGCGAACTGCAACTTTCGTGAACTCTT
TGCGATCTGGTTTGTGGCAACGCTTAACGAGACGGATGCTATCCTTGGCGAAGTCTCTGA
GAGGACCAACGACGGAATCAATGGCGTCCATGGCGATGAAAGGCGGTGGATCCC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4EM58JQ 376 0 0
TTTTTCAGTTGTGAACAAATCAAGAAAGGAAGAAAAACATAGAAACAAATGGAATCCGAT
TGCATAAAACATTGAACTGACATGTGACTTCTTGTAACAGCAAAACTCTAATTTCTCTCT
CTCAAAACTCTATTCCTTGATTCCTAAGTGGCGCCGACGATGATGTTGTTGATGGGAATA
AAGATGAGTTTCACAAAGAAGCCAACGAATCCCATCACTACAAACCCTATCGCCGTGCGA
ACTGCAACTTTCGTGAACTCTTTGCGATCTGGTTTGTGGCAACGCTTAACGAGACGGATG
CTATCCTTGGCGAAGTCTCTGAGAGGACCAACGACGGAATCAATGGCGTCCATGGCGATG
AAAGGCGGTGGATCCC

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 2

CO CL6353Contig1 933 2 2 U
GGAAGACTCTCCGGTCTCAAATGACTGATTTGGAGGATCACGCGGCGAAGGTCTCCGTCG
AGAACAGATGCAGATTACCACAATCGCTACCTTGCAGAAAGATCTCGATCATGCATTGTC
TGAGACAAAGAGACTCAAAGAAGAGACGGATCAGAAGACGAGGACTAAAGGCGAACTATG
CTCACAGATACTTGTAAAGCAGAGAAAGATTTCGTCATTGGAATCTGATTCAGCAAATCT
TGCACAGAGTCTGGAGCTTATACTACAAGAACGAGACAGTTTATCTGCAAAGCTTGTATC
CAAACGTTCCAACTATATAAAGACTGCAGAGGAAGCTAGAACCAAACTAGAGGAACATAA
GGGCTGGTTTGTTTCCCATATGAGCAATGAAACTGACCAACAAGGACAGAAAGAAGAATC
AAGCAAAAATCTGATGGACTCATCAGATTCTGCTAGAGCAAAGCTTGATCAAGCAAACCA
AATGAGATCCGAACTTATCCAGGAAAATTCGAAGATCAAGCTATCAATTGAGAATGTTAA
GAACAAGATTAATGATTTCAAGCCAGAGCTGATGTCGTTGGATATTAAAATTCTAGAAGA
GGAATACGCAGCACTCTTGGCAGATGAATCTGGAGAGGCAGAGTATCTACATTCGCTGCA
GAGTCAGGCTGAGAAACTGAAGGGGATATCTTACATTGCTAAATGCGGTTGTGGAGAGGA
ATACAGTGTTGGTCTATTTTAGGCTATCGTCATGCATGCATCATCCCCTTTCAGGTTTAT
GAATATGCGAACGCATTGAGAACCAAAACGAAGTTTTCTTTATGTGTTAGTTCTTTGAAT
CTGTGCTTTACTTGTTTAGTTTTTAGAGACAACTTTAACACTCTTGTTGAAATATATAAT
GTCTCATCGTTTGCACGAGAAGAGCACTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CB34TF U 1
AF RR4CB34JQ C 275
BS 1 663 RR4CB34TF
BS 664 933 RR4CB34JQ

RD RR4CB34TF 663 0 0
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TGCACAGAGTCTGGAGCTTATACTACAAGAACGAGACAGTTTATCTGCAAAGCTTGTATC
CAAACGTTCCAACTATATAAAGACTGCAGAGGAAGCTAGAACCAAACTAGAGGAACATAA
GGGCTGGTTTGTTTCCCATATGAGCAATGAAACTGACCAACAAGGACAGAAAGAAGAATC
AAGCAAAAATCTGATGGACTCATCAGATTCTGCTAGAGCAAAGCTTGATCAAGCAAACCA
AATGAGATCCGAACTTATCCAGGAAAATTCGAAGATCAAGCTATCAATTGAGAATGTTAA
GAACAAGATTAATGATTTCAAGCCAGAGCTGATGTCGTTGGATATTAAAATTCTAGAAGA
GGAATACGCAGCACTCTTGGCAGATGAATCTGGAGAGGCAGAGTATCTACATTCGCTGCA
GAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CB34JQ 659 0 0
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GCTAGAACCAAACTAGAGGAACATAAGGGCTGGTTTGTTTCCCATATGAGCAATGAAACT
GACCAACAAGGACAGAAAGAAGAATCAAGCAAAAATCTGATGGACTCATCAGATTTTGCT
AGAGCAAAGCTTGATCAAGCAAACCAAATGAGATCCGAACTTATCCAGGAAAATTCGAAG
ATCAAGCTATCAATTGAGAATGTTAAGAACAAGATTAATGATTTCAAGCCAGAGCTGATG
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GAGGCAGAGTATTTACATTCGCTGCAGAGTCAGGCTGAGAAACTGAAGGGGATATCTTAC
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CATGCATCATCCCCTTTCAGGTTTATGAATATGCGAACGCATTGAGAACCAAAACGAAGT
TTTCTTTATGTGTTAGTTCTTTGAATCTGTGCTTTACTTGTTTAGTTTTTAGAGACAACT
TTAACACTCTTGTTGAAATATATAATGTCTCATCGTTTGCACGAGAAGAGCACTTTTTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6354Contig1 770 2 11 U
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TTAATTGGGGTTTCTCCTGCTTATTGCTGGCAGGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGA
ATGGACTACATGGAAACGTTCAGGGTTGACCACACAGTGGAGCCAATATATGTTGATGCA
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GGAAAAGGATTTATTGCGTCCAAGATTAAAGTGGACCAGAGTTTTAGGCTTTCTTTTCCT
TGGAATCTGCCTCTGCTGTCTTTGTACTTTCGCCGGTTTACTGTTGAGACCACTAAGAAA
GTGGCGGAAGATCTTCAAAAGCGGGCTGCTGATATCCGAGGTTTTTGAAATACACAGAAC
CCCGGTATCCGTCGGTTGTAACGTCTTCGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAAT
CGCGTTATCATAAATTCGAATAGCAGAATTTTAAAAGTTAAAATCTTGAC


BQ
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AF RR4CL68JQ C 1
AF RR4CL68TF U 3
BS 1 2 RR4CL68JQ
BS 3 693 RR4CL68TF
BS 694 696 RR4CL68JQ
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BS 735 743 RR4CL68TF
BS 744 770 RR4CL68JQ

RD RR4CL68JQ 770 0 0
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AACGTCTCACTCTCTATATATCTCATAAGAATCATTGTTTTTGATCAAGTCTTGGAAAAT
TTAATTGGGGTTTCTCCTGCTTATTGCTGGCAGGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGA
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GGAAAAGGATTTATTGCGTCCAAGATTAAAGTGGACCAGAGTTTTAGGCTTTCTTTTCCT
TGGAATCTGCCTCTGCTGTCTTTGTACTTTCGCCGGTTTACTGTTGAGACCACTAAGAAA
GTGGCGGAAGATCTTCAAAAGCGGGCTGCTGATATCCGAGGTTTTTGAAATACACAGAAC
CCCGGTATCCGTCGGTTGTAACGTCTTCGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAAT
CGCGTTATCATAAATTCGAATAGCAGAATTTTAAAAGTTAAAATCTTGAC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4CL68TF 741 0 0
TTTTTACTTATCATTGTATAATTCAAATGTGTATATTTAAGAGCTTTTTTAAAAATAATA
GAAGAAATTATTTTTAATGAAGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGAGAGGTCT
AGGGGAAAGGCCGATCCTGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTC
AGGAACTATCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAAGCCAGAAGAACTTTCTGTAAGGAA
CGTCTCACTCTCTATATATCTCATAAGAATCATTGTTTTTGATCAAGTCTTGGAAAATTT
AATTGGGGTTTCTCCTGCTTATTGCTGGCAGGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAAT
GGACTACATGGAAACGTTCAGGGTTGACCACACAGTGGAGCCAATATATGTTGATGCAGA
ACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATTGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGG
AAAAGGATTTATTGCGTCCAAGATTAAAGTGGACCAGAGTTTTAGGCTTTCTTTTCCTTG
GAATCTGCCTCTGCTGTCTTTGTACTTTCGCCGGTTTACTGTTGAGACCACTAAGAAAGT
GGCGGAAGATCTTCAAAAGCGGGCTGCTGATATCCGAGGTTTTTGAAATACACAGAACCC
CGGTATCCGTCGGTTGTAACGTCTTCGTAAAC**ACACATCAA*TAGTGTTTTAAA*TCG
CGTTATCATAA*TTCGAATAG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6355Contig1 954 2 2 U
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TGAAGTGTTTCCTGCGCTGAAGAAGATGGTCTTTCTTGATGATGACGTTGTAGTGCAGAA
GGACCTTTCTGCTCTCTTTTCGATCGATTTGAACAGAAACGTGAACGGGGCTGTTGAGAC
GTGCATGGAGACGTTCCACCGGTACCACAAGTACTTGAACTATTCCCATCCTCTGATTCG
CTCACACTTTGATCCGGATGCGTGCGGATGGGCCTTTGGGATGAACGTCTTTGATTTAGT
TGAGTGGAGGAAGAGAAATGTGACAGGAATATACCACTACTGGCAAGAAAAGAACGTGGA
CCGGACCTTGTGGAAACTTGGGACACTGCCTCCAGGGCTACTGACGTTTTACGGGTTAAC
GGAGGCACTAGAGTCGTCGTGGCATGTCCTGGGACTGGGATACGCCAATGTGGATACTCG
TGTGATAGACAAGGGAGCGGTTCTCCACTTCAATGGGAACTTAAAGCCGTGGTTGAAGAT
CGGGATGGAGAAGTACAAACCTCTGTGGGAGAAGTACGTTGATTACAGTCACCCTTTTAT
GCAACAATGCAATTTTCATTGATATCTTAAGAGTTTGTCTAGGTTTACTACATCTTCTAG
ACAATGCCATATCTTCCACATTTACAGAGACACTTGGCAGTGTTTTGTATGCTCAGACAC
CAATCACTTACTATACCACTATGCTCTTTTATACACGTTCGAGCTCTATCGTTGGACTCG
AAACACTAGGGATGGTGAAATAATGAACTCTTTGTTTTAATTGTAGATTGTATAATGAAG
AAATACATAACATTCTTCGAGTATCTTTTGTTTTGGTTTTGAGAAGGCCAACGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FD24TF U 1
AF RR4FD24JQ C 315
BS 1 691 RR4FD24TF
BS 692 954 RR4FD24JQ

RD RR4FD24TF 691 0 0
GCAAGACTCCGATACGCAGAGCTACGATTTCTCTGGACACAACGACGATGGACGCACACC
GATCAAGTTCAGAAACCCCAAGTATCTCTCAATGCTCAATCATCTCAGGTTTTACATCCC
TGAAGTGTTTCCTGCGCTGAAGAAGATGGTCTTTCTTGATGATGACGTTGTAGTGCAGAA
GGACCTTTCTGCTCTCTTTTCGATCGATTTGAACAGAAACGTGAACGGGGCTGTTGAGAC
GTGCATGGAGACGTTCCACCGGTACCACAAGTACTTGAACTATTCCCATCCTCTGATTCG
CTCACACTTTGATCCGGATGCGTGCGGATGGGCCTTTGGGATGAACGTCTTTGATTTAGT
TGAGTGGAGGAAGAGAAATGTGACAGGAATATACCACTACTGGCAAGAAAAGAACGTGGA
CCGGACCTTGTGGAAACTTGGGACACTGCCTCCAGGGCTACTGACGTTTTACGGGTTAAC
GGAGGCACTAGAGTCGTCGTGGCATGTCCTGGGACTGGGATACGCCAATGTGGATACTCG
TGTGATAGACAAGGGAGCGGTTCTCCACTTCAATGGGAACTTAAAGCCGTGGTTGAAGAT
CGGGATGGAGAAGTACAAACCTCTGTGGGAGAAGTACGTTGATTACAGTCACCCTTTTAT
GCAACAATGCAATTTTCATTGATATCTTAAG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FD24JQ 640 0 0
CGGATGCGTGCGGATGGGCCTTTGGGATGAACGTCTTTGATTTAGTTGAGTGGAGGAAGA
GAAATGTGACAGGAATATACCACTACTGGCAAGAAAAGAACGTGGACCGGACCTTGTGGA
AACTTGGGACACTGCCTCCAGGGCTACTGACGTTTTACGGGTTAACGGAGGCACTAGAGT
CGTCGTGGCATGTCCTGGGACTGGGATACGCCAATGTGGATACTCGTGTGATAGACAAGG
GAGCGGTTCTCCACTTCAATGGGAACTTAAAGCCGTGGTTGAAGATCGGGATGGAGAAGT
ACAAACCTCTGTGGGAGAAGTACGTTGATTACAGTCACCCTTTTATGCAACAATGCAATT
TTCATTGATATCTTAAGAGTTTGTCTAGGTTTACTACATCTTCTAGACAATGCCATATCT
TCCACATTTACAGAGACACTTGGCAGTGTTTTGTATGCTCAGACACCAATCACTTACTAT
ACCACTATGCTCTTTTATACACGTTCGAGCTCTATCGTTGGACTCGAAACACTAGGGATG
GTGAAATAATGAACTCTTTGTTTTAATTGTAGATTGTATAATGAAGAAATACATAACATT
CTTCGAGTATCTTTTGTTTTGGTTTTGAGAAGGCCAACGC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL6356Contig1 928 2 2 U
GCAAGACTTTAGTGTTCCTTCAGTGACGAAGACCAAACAACGGAAAGCATCTGTTGATGA
CCAGGCTTCGCAGCACCTTCTTTCTTTATTACAGAGAAGTGCTGACCCAAAAAGTCAAGA
TACGGTCACAGAGACTAGACTACCACCATCTGTGAAAGCAAGTTGTGTCGGAGAAGCAGA
TCCGGGGAAGTCTTTGACTCTTGAGAATCTGTTTGGAAGTGCCTTCATGAATGAACTCCA
GTCAATTGGAGAACCAGTCTCTGCAAGAGCTATGGTTACTGATGCTCCTGGGATCCCGCT
ACGATCAGGATCCTCCACCAAATCACCGGTTTCCACCAAACATGATTCACCAGCGTCCAC
CTTTCCAGCATTCAACAACTAGCGGGTTTCCGGAGTTTGATCGTCTTCCTCCGCATATGA
TGCAGAAGATGCATATGCAAGACAACCTGCAACACCATCATCTAATGTTCCCCGGTGGTG
GTCCACCACAGCATCACTCTCCTAATGTAAACAACCAAATGCAGGGTCTCATCCCCGAGT
TAAATACATCACAAGGCTTTCCCTTTGCTCATCGCCAACCCAACAACGGTATGCCACCAG
CTTCTCAAGTCAACAGAGTTGATCATCCAGCTTCACTTCAGGCACTCTTGGGGATTCACC
AAAGGATGGACCCATCCAAGCAGTCACCAGCAATGGGTCAAGCTGGTGGTCCTAATCGTC
AAGGCTCTATGGGTCATGAACTCGACCTTGGCTTTGGCTACAGGTAACTTTGCTACAGGA
AACCTAAGAGGTGTGTCGTTTGAACAAAACGTTGCTTTGTGATGTGCAAGTAATCAAATT
TATCATTTCTCTTGCTGCTTGTTGTATGTGGATGCTTTTAAATAAAACTTACAGTTTCAC
CTATCACTGAATCAAATTCGTACCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C213TF U 1
AF RR4C213JQ C 264
BS 1 641 RR4C213TF
BS 642 928 RR4C213JQ

RD RR4C213TF 644 0 0
GCAAGACTTTAGTGTTCCTTCAGTGACGAAGACCAAACAACGGAAAGCATCTGTTGATGA
CCAGGCTTCGCAGCACCTTCTTTCTTTATTACAGAGAAGTGCTGACCCAAAAAGTCAAGA
TACGGTCACAGAGACTAGACTACCACCATCTGTGAAAGCAAGTTGTGTCGGAGAAGCAGA
TCCGGGGAAGTCTTTGACTCTTGAGAATCTGTTTGGAAGTGCCTTCATGAATGAACTCCA
GTCAATTGGAGAACCAGTCTCTGCAAGAGCTATGGTTACTGATGCTCCTGGGATCCCGCT
ACGATCAGGATCCTCCACCAAATCACCGGTTTCCACCAAACATGATTCACCAGCGTCCAC
CTTTCCAGCATTCAACAACTAGCGGGTTTCCGGAGTTTGATCGTCTTCCTCCGCATATGA
TGCAGAAGATGCATATGCAAGACAACCTGCAACACCATCATCTAATGTTCCCCGGTGGTG
GTCCACCACAGCATCACTCTCCTAATGTAAACAACCAAATGCAGGGTCTCATCCCCGAGT
TAAATACATCACAAGGCTTTCCCTTTGCTCATCGCCAACCCAACAACGGTATGCCACCAG
CTTCTCAAGTCAACAGAGTTGATCATCCAGCTTCACTTCAG
CAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4C213JQ 665 0 0
CAAGAGCTATGGTTACTGATGCTCCTGGGATCCCGCTACGATCAGGATCCTCCACCAAAT
CACCGGTTTCCACCAAACATGATTCACCAGCGTCCACCTTTCCAGCATTCAACAACTAGC
GGGTTTCCGGAGTTTGATCGTCTTCCTCCGCATATGATGCAGAAGATGCATATGCAAGAC
AACCTGCAACACCATCATCTAATGTTCCCCGGTGGTGGTCCACCACAGCATCACTCTCCT
AATGTAAACAACCAAATGCAGGGTCTCATCCCCGAGTTAAATACATCACAAGGCTTTCCC
TTTGCTCATCGCCAACCCAACAACGGTATGCCACCAGCTTCTCAAGTCAACAGAGTTGAT
CATCCAGCTTCACTTCAGGCACTCTTGGGGATTCACCAAAGGATGGACCCATCCAAGCAG
TCACCAGCAATGGGTCAAGCTGGTGGTCCTAATCGTCAAGGCTCTATGGGTCATGAACTC
GACCTTGGCTTTGGCTACAGGTAACTTTGCTACAGGAAACCTAAGAGGTGTGTCGTTTGA
ACAAAACGTTGCTTTGTGATGTGCAAGTAATCAAATTTATCATTTCTCTTGCTGCTTGTT
GTATGTGGATGCTTTTAAATAAAACTTACAGTTTCACCTATCACTGAATCAAATTCGTAC
CAGTT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6358Contig1 1241 2 2 U
GGATAATGGCATAATGCTCTTGTGAGAGAGCAGAGAGAGAGAGCGGGGCTAGCACGAACG
AACAAGAAGAATCTTTCTTTCTTCGTCGAACATTTGTCTTTGTCTTCCATCTCAATCGAA
TCTCTCCGTCACCGTCTCCGCCGTTTTGAGAGGAGGGTTATGGATGTTTCAGCTAGGAAG
TCTCAGAAAGCAGGACGTGAAAAGTTGAGGAGGGAGAAACTTAATGAGCATTTTGTTGAA
CTTGGCAATGTACTCGATCCAGAAAGACCCAAGAATGACAAAGCTACCATTCTCACTGAT
ACTCTTCAGTTGCTCAAAGACCTCACTTCTGAAGTCACCAAACTCAAATCTGAGTACACC
GCTTTGACTGATGAGTCCCGCGAGCTGACACAGGAGAAAAACGACCTGAGAGAAGAAAAT
ACATCGCTCAAATCAGATATAGAGAATCTCAATCTCCAGTACCAGCAGAGATTAAGGTCA
ATGTCTCCGTGGGGAGCTGCGATGGATCACACCGTCATGATGGCTCCACCACCTTCTTTT
CCATATCCGATGCCTATGGCTATGCCTCCCGGTTCAATCCCAATGCATCATCATCCACCT
ATGCCATCTTACACTTACTTTGGCAACCAGAACCCTAGCATGATGCCAGCGCCTTACATG
CCCTATATGCAGCCTCCTAATACCGTCGTTGAACAACAATCCGTGCACATACCACAGAAC
AACCGTTCCAGGGAACCTAGAACAAAGGTTTCAAGAGAGAGCAGGTCCGATAAAGCAGAG
GACTCTAATGACGTGGCAACACAACTCGAGTTAAAAACTCCTGGATTTACGTTTGATAAG
GATACATTACAAAGGCCAGAGAAGAGCAAGAGATGTAAGAGAAACAGCAACAACAACAAC
TCTGTGGAAGAAAGCTCTCACTCAAGCAAGTGTTCATCTTCTCCGAGCGTCCGAGACAAC
ACTTTTTCCAGTAGCGTAGCTGGTGGCCTAAAACCTGATGATGCAAAATTAGGATTGAGT
ATATGATGCGACTACAAAACGGTTAAACATCGTTTTGATGCCTTAGCTCTACAAACGCAG
CTGATTTGTAACCTCTCTTGTAATGTTTATAGTTGTATAACATTTAATAAGAGGTTTATA
TTCAAATTAGGCCAACTTTCATTAAAGCTAAATAACACATTGTAACAAAATAGCACCATA
AAATCAATCATTCAATAAACTATAAAAAGTTACAAACAAAG


BQ
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BS 813 1241 RR4B931JQ

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ACATCGCTCAAATCAGATATAGAGAATCTCAATCTCCAGTACCAGCAGAGATTAAGGTCA
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CCATATCCGATGCCTATGGCTATGCCTCCCGGTTCAATCCCAATGCATCATCATCCACCT
ATGCCATCTTACACTTACTTTGGCAACCAGAACCCTAGCATGATGCCAGCGCCTTACATG
CCCTATATGCAGCCTCCTAATACCGTCGTTGAACAACAATCCGTGCACATACCACAGAAC
AACCGTTCCAGGGAACCTAGAACAAAGGTTTCAAGAGAGAGCAGGTCCGATAAAGCAGAG
GACTCTAATGACGTGGCAACACAACTCGAGTT

QA 1 812 1 812
DS 

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GCTGCGATGGATCACACCGTCATGATGGCTCCACCACCTTCTTTTCCATATCCGATGCCT
ATGGCTATGCCTCCCGGTTCAATCCCAATGCATCATCATCCACCTATGCCATCTTACACT
TACTTTGGCAACCAGAACCCTAGCATGATGCCAGCGCCTTACATGCCCTATATGCAGCCT
CCTAATACCGTCGTTGAACAACAATCCGTGCACATACCACAGAACAACCGTTCCAGGGAA
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CCAGAGAAGAGCAAGAGATGTAAGAGAAACAGCAACAACAACAACTCTGTGGAAGAAAGC
TCTCACTCAAGCAAGTGTTCATCTTCTCCGAGCGTCCGAGACAACACTTTTTCCAGTAGC
GTAGCTGGTGGCCTAAAACCTGATGATGCAAAATTAGGATTGAGTATATGATGCGACTAC
AAAACGGTTAAACATCGTTTTGATGCCTTAGCTCTACAAACGCAGCTGATTTGTAACCTC
TCTTGTAATGTTTATAGTTGTATAACATTTAATAAGAGGTTTATATTCAAATTAGGCCAA
CTTTCATTAAAGCTAAATAACACATTGTAACAAAATAGCACCATAAAATCAATCATTCAA
TAAACTATAAAAAGTTACAAACAAAG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

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CGGTCCTTTCGGTGATTCTGGTGATCGGCTTAGTCTACTACGTCACACTGTTCGTTTTTC
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TCTTGGCCTCTCTCTGTCTCGTTTCCCTCTCAATTTGCGTTCTCGTAGATCCAGGTCGTG
TCCCTTCGTCTTATGCTCCTGATGTTGAGGGTTCTAGCTGGTCCAATAGTAATAAAGGTA
CAGAAGCAAGGAAATGTGATAAGTGTTTTGCTTATAAGCCTCTTCGGACTCATCATTGTC
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TCTACTCAACAGTATTGCTGGTTTGCTGCGTTTTCAAGAACGGGAACTCATACGCAGGAA
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CACTGGGGACTCTCCTTGGTTGGCATATTTACCTGATCGCACACAATATGACCCCCATTG
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ATCAATTCGATTTTGGGGTTTACAAAAACATCACCTCGGTGTTAGGGTCAAACATAATAA
AATGGCTATGCCCCCCATTCACTAGGAATACTGAAGATGGTGTGAACTTTTTTGCTTCCA
GAGACAGCTAGCTATAAAAAAAAAGTTCATTCCCCAATCAATTTGTATACACACTTGTAC
AAAATTTTGAAACAAAGTTTATTGTTTTAAAAGATTATTTGTTTTGTAATATTTGGGGTT
TATTGTTTCATAAGAAAGTAACGGGGGTAATTTGAT


BQ
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AF RR4GJ27TF U 1
AF RR4GJ27JQ C 631
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BS 675 675 RR4GJ27JQ
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RD RR4GJ27TF 735 0 0
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ATCGCATACTGCCACGTGTTCATTTCTTGTAAATTTGACTGACTTGATTATTCTCGGTGG
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CGGTCCTTTCGGTGATTCTGGTGATCGGCTTAGTCTACTACGTCACACTGTTCGTTTTTC
TCGAGGATTGGGTTGGTCTACGAAGCTCACCTGGGAAATTAAACGCATTGCTCTTCAGCT
TCTTGGCCTCTCTCTGTCTCGTTTCCCTCTCAATTTGCGTTCTCGTAGATCCAGGTCGTG
TCCCTTCGTCTTATGCTCCTGATGTTGAGGGTTCTAGCTGGTCCAATAGTAATAAAGGTA
CAGAAGCAAGGAAATGTGATAAGTGTTTTGCTTATAAGCCTCTTCGGACTCATCATTGTC
GAGTTTGCAGAAGATGCGTCTTGAAGATGGACCACCATTGCGTATGGATAAATAACTGTG
TTGGCTATGCAAACTACAAGGCTTTCTTCCTTCTCGTGTTTTATGCAACTCTGGCTTGCT
TCTACTCAACAGTATTGCTGGTTTGCTGCGTTTTCAAGAACGGGAACTCATACGCAG*AA
ACGTTCCACTAAAA*CCTTCATGGTAGCTTGTGGGGTCTTCGTGATCGGACTAAGCATAA
CACTGGGGACTCTCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GJ27JQ 486 0 0
TTTTCAAGAACGGGAACTCATACGCAGGAAACGTTCCACTAAAAACCTTCATGGTAGCTT
GTGGGGTTTTCGTGATCGGACTAAGCATAACACTGGGGACTCTCCTTGGTTGGCATATTT
ACCTGATCGCACACAATATGACCCCCATTGAGCATTATGATTCAAAGCGGGTTTTGTGGT
TAGCTAAAAAATTTGGACAAAGCTTTAGGCATCAATTCGATTTTGGGGTTTACAAAAACA
TCACCTCGGTGTTAGGGTCAAACATAATAAAATGGCTATGCCCCCCATTCACTAGGAATA
CTGAAGATGGTGTGAACTTTTTTGCTTCCAGAGACAGCTAGCTATAAAAAAAAAGTTCAT
TCCCCAATCAATTTGTATACACACTTGTACAAAATTTTGAAACAAAGTTTATTGTTTTAA
AAGATTATTTGTTTTGTAATATTTGGGGTTTATTGTTTCATAAGAAAGTAACGGGGGTAA
TTTGAT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL6360Contig1 652 2 3 U
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TCAAAAAAATATATAATCGAAGTTGGGTTTCAACATTAAAAGAAAAGGAGCTGAAAACTA
ACCCGAATCGATTAGCAAGCAGACTTCTATAAAGCTTGTACAAATATAATGAAGATAGAA
AAGAAAACTATATTGCAAAAGGAAAATGTGAACAAAAAAGGAAAATGTGAACAAACAAAA
AAAAACTGTGAAGAAAAAGCAAACCTGTAATGGACTAATGGCTTACAATGGTTGTGATTA
CCAAAACTACCATCTCTGCTCTATCTCTTTGTGACAGAGCACAACGACCACAAGTCTTTG
CTTCTTACTTAATCGTATAACTTTCATTCACCATTGATCAAGAGAATAGTGTTATTACAC
CATTCTATCGATTTCAAGATGTTTGATTAGTTTTACTTGATCAGTGCTTACCACTAGAGA
AAACCTCCACCAGTCCAAGCAGTGTCCGGTTTCCCATTGTGACCGACAGATTTCTTATCC
CCTGCTGCACCACTCTGATAATAACCATCATCATCATCATCTTTAGCATCATTATCATCC
CAACCAGCCCAACCATCATCATCATCATCCTTAGAAGTCGACACCTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DI14JQ U 51
AF RR4DI14TF C 1
BS 1 50 RR4DI14TF
BS 51 435 RR4DI14JQ
BS 436 652 RR4DI14TF

RD RR4DI14JQ 385 0 0
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CTGAAAACTAACCCGAATCGATTAGCAAGCAGACTTCTATAAAGCTTGTACAAATATAAT
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ACAAACAAAAAAAAACTGTGAAGAAAAAGCAAACCTGTAATGGACTAATGGCTTACAATG
GTTGTGATTACCAAAACTACCATCTCTGCTCTATCTCTTTGTGACAGAGCACAACGACCA
CAAGTCTTTGCTTCTTACTTAATCGTATAACTTTCATTCACCATTGATCAAGAGAATAGT
GTTATTACACCATTCTATCGATTTC

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR4DI14TF 652 0 0
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TCAAAAAAATATATAATCGAAGTTGGGTTTCAACATTAAAAGAAAAGGAGCTGAAGACTA
ACCCGAATCGATTAGCAAGCAGACTTCTATAAAGCTTGTACAAATATAATGAAGATAGAA
AAGAAAACTATATTGCAAAAGGAAAATGTGAACAAAAAAGGAAAATGTGAACAAACAAAA
AAAAACTGTGAAGAAAAAGCAGACCTGTAATGGACTAATGGCTTACAATGGTTGTGATTA
CCAAAACTACCATCTCTGCTCTATCTCTTTGTGACAGAGCACAACGACCACAAGTCTTTG
CTTCTTACTTAATCGTATAACTTTCATTCACCATTGATCAAGAGAATAGTGTTATTACAC
CATTCTATCGATTTCAAGATGTTTGATTAGTTTTACTTGATCAGTGCTTACCACTAGAGA
AAACCTCCACCAGTCCAAGCAGTGTCCGGTTTCCCATTGTGACCGACAGATTTCTTATCC
CCTGCTGCACCACTCTGATAATAACCATCATCATCATCATCTTTAGCATCATTATCATCC
CAACCAGCCCAACCATCATCATCATCATCCTTAGAAGTCGACACCTTTGGTC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6361Contig1 1047 2 14 U
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ACGCCGGAGAATCCATCGGAATCCGAGATCGGTGAAGACACAGACGCGGCGACGATGGTA
GTCGAAGAGCTCGTGACGTCACTCAACACACAGAGACTCTACAGAGAGCTGACACTATCC
CTCCGAACGGGGTTACGCGACGCTCGCGCCGAGTTCTCCTTCCTCCGCATCCGCGGCCTT
CGATCTCTTCTCAAAACTCTCCGATCTATCGCCGAATCGGATTCCATCATCCGCCTCTTC
TCCCACACCCAAACCATCTCCGATCTCCAACTGGTTCCGGTGCTATTTCGACATTCATTA
AAAGAAGCGGAGGATGATAGAGTGACGAGCTTGGATCACATATTCAGCGTCGAGTCGATG
AAGATAACGAGTCCTTCTACTGACGATGAGGTCGCGGTTGCTCTTAGGGTTCTCGAAGGA
TGCTGCCTCCTCCATCCTCAGAGCACTGTTCTCGCTCATAAACACGGCGCAGTTCGCGTA
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ATCTCAATATTGCTGGATTCTTCAGCAAATCAGGTGGATTTTGGAGCCTGCAATGGGATT
GAGGAGGTTGCAATGCTCATGCGGGACAAACAAGCTGATGAAAATCTCAGGTTAAGATGC
GGAGAGTTCTTACTACTGTTAGTTGGACATGTGAATGGGAAGGATCGATCACCCATTGCG
AGTGTAAATGAAGACATCAGGCGCCTTTTAGGTGAAAAATCCGCTTCTCTAATATGGGCG
GCGAGTCAGTTCGGTTCAACAGGTGACCCTGAACAAAGAATCACTGCTCTTCACATCCAG
GCTGGGAGAGTGCTCGAGTCCCTTGACTTGTACTAATTGTCAAACCCCTTTTTTTGTTGA
TTTTTCGTCCTCTTTTTACATAATGAAAAGTTTAAATGTGTGTAAAAACCCCTATCCAAA
CTACTCAATATCATTTACTTGCCTTGT


BQ
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AF RR4DS58TF U 1
AF RR4DS58JQ C 344
BS 1 633 RR4DS58TF
BS 634 634 RR4DS58JQ
BS 635 668 RR4DS58TF
BS 669 669 RR4DS58JQ
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BS 690 690 RR4DS58JQ
BS 691 703 RR4DS58TF
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BS 715 747 RR4DS58TF
BS 748 1047 RR4DS58JQ

RD RR4DS58TF 747 0 0
GGAGAGATAGAGAAAGCGATGTATCTGAAGAAGCCGATATGGAGCGATGGCGCGTCACCG
ACGCCGGAGAATCCATCGGAATCCGAGATCGGTGAAGACACAGACGCGGCGACGATGGTA
GTCGAAGAGCTCGTGACGTCACTCAACACACAGAGACTCTACAGAGAGCTGACACTATCC
CTCCGAACGGGGTTACGCGACGCTCGCGCCGAGTTCTCCTTCCTCCGCATCCGCGGCCTT
CGATCTCTTCTCAAAACTCTCCGATCTATCGCCGAATCGGATTCCATCATCCGCCTCTTC
TCCCACACCCAAACCATCTCCGATCTCCAACTGGTTCCGGTGCTATTTCGACATTCATTA
AAAGAAGCGGAGGATGATAGAGTGACGAGCTTGGATCACATATTCAGCGTCGAGTCGATG
AAGATAACGAGTCCTTCTACTGACGATGAGGTCGCGGTTGCTCTTAGGGTTCTCGAAGGA
TGCTGCCTCCTCCATCCTCAGAGCACTGTTCTCGCTCATAAACACGGCGCAGTTCGCGTA
ATGATGAATATATTATCAACACGAGGAGTACTTGAGCAAGGTGCCTGCTTAGATGCCTTA
ATCTCAATATTGCTGGATTCTTCAGCAAATCAG*TGGATTTTGGAGCCTGCAATGGGATT
GAGGAGGT*GCAATGCTCATGCGGGACAA*CAAGCTGATGAAA*TCTCAGTT**AGATGC
GGAGAGTTCTTACTACTGTTAGTTGGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4DS58JQ 704 0 0
TATTTCGACATTCATTAAAAGAAGCGGAGGATGATAGAGTGACGAGCTTGGATCACATAT
TCAGCGTCGAGTCGATGAAGATAACGAGTCCTTCTACTGACGATGAGGTCGCGGTTGCTC
TTAGGGTTCTCGAAGGATGCTGCCTCCTCCATCCTCAGAGCACTGTTCTCGCTCATAAAC
ACGGCGCAGTTCGCGTAATGATGAATATATTATCAACACGAGGAGTACTTGAGCAAGGTG
CCTGCTTAGATGCCTTAATCTCAATATTGCTGGATTCTTCAGCAAATCAGGTGGATTTTG
GAGCCTGCAATGGGATTGAGGAGGTTGCAATGCTCATGCGGGACAAACAAGCTGATGAAA
ATCTCAGGTTAAGATGCGGAGAGTTCTTACTACTGTTAGTTGGACATGTGAATGGGAAGG
ATCGATCACCCATTGCGAGTGTAAATGAAGACATCAGGCGCCTTTTAGGTGAAAAATCCG
CTTCTCTAATATGGGCGGCGAGTCAGTTCGGTTCAACAGGTGACCCTGAACAAAGAATCA
CTGCTCTTCACATCCAGGCTGGGAGAGTGCTCGAGTCCCTTGACTTGTACTAATTGTCAA
ACCCCTTTTTTTGTTGATTTTTCGTCCTCTTTTTACATAATGAAAAGTTTAAATGTGTGT
AAAAACCCCTATCCAAACTACTCAATATCATTTACTTGCCTTGT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6362Contig1 1091 2 2 U
GCATCGGAGGCACTGGTTACATCGGGAAGTACATAGTGGAAGCGAGCGCGAGATCTGGAC
ACCCTACCCTTGTTCTCGTTCGAAACTCCACCCTCACCAGCCCCTCGCGATCCACCACCA
TCGACAATTTCAAGAACCTCGGCGTTCGCTTTCTACTCGGAGATCTTAACGATCATACGA
GTCTCGTGAATTCGATCAAGCAAGCTGATGTGGTGATATCCACTGTTGGACACTCTCTCT
TGGGTCAACAAGACAAGATCCTCTCTGCCATTAAAGAAGCTGGTAACGTTAAGAGATTCT
TTCCGTCGGAGTTTGGAAATGATGTAGACCGTACTGAGAGTGTTGAACCTGCCAAAACAG
CCTATACTACAAAGGCAATGTTCCGCAGGTGAATTGAGGAAGCAGGGATACCATTCACTA
TTGTCTCTTGCAACTTCTTTGCTGGCTACTTCCTCCCTACTTTGGCACAGCCTGGTGCTA
CTTCTCCTCCACGTGACAAAGTCATCATCATGGGTGATGGTACCCCCAAAGCTGTGTTCA
ACACGGAGGAAGACATAGGGACTTACACAATCAAGGCCGTAGATGATCCAAGAACCTTAA
ACAAAATTTTATACGTTAGGCCACCCATGAACACTTACTCCTTCAACGACCTTGTCTCGC
TTTGGGAGAAAAAGATTGAGAAAACACTAGAAAGAATCCACGTTCCAGAAGAACAAATCC
TCAAACAGATAACAGAAGCTTCGCCTCCACCGAACGTGTTGCTATCACTTTGTCATTGCG
TATTCGTGAAAGGAGGACAAACAAACTTCGAAATAGAACCTTCCTTTGGTGTAGAAGCTT
CCGAGCTTTACCCTGATGTCAAATACACTACTGTTGATGAAATCCTCGACAACTACGTCT
AAAGGAGCACCAGCTCCTAACTAAAGTCACTCCCTGACATTTATATTTCTGAATAATTTT
GGGTAAAATATTACCTTTCTGCTTCACCAGTATGATGAATCAATTAAACTGAACATGTTG
TCTTATGATGACCCCATTTTGAATGTAAGGCTTTGGACAGGTTTTTTTCTTGTAATAAAT
TTCTGTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G621TF U 1
AF RR4G621JQ C 336
BS 1 712 RR4G621TF
BS 713 1091 RR4G621JQ

RD RR4G621TF 712 0 0
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ACCCTACCCTTGTTCTCGTTCGAAACTCCACCCTCACCAGCCCCTCGCGATCCACCACCA
TCGACAATTTCAAGAACCTCGGCGTTCGCTTTCTACTCGGAGATCTTAACGATCATACGA
GTCTCGTGAATTCGATCAAGCAAGCTGATGTGGTGATATCCACTGTTGGACACTCTCTCT
TGGGTCAACAAGACAAGATCCTCTCTGCCATTAAAGAAGCTGGTAACGTTAAGAGATTCT
TTCCGTCGGAGTTTGGAAATGATGTAGACCGTACTGAGAGTGTTGAACCTGCCAAAACAG
CCTATACTACAAAGGCAATGTTCCGCAGGTGAATTGAGGAAGCAGGGATACCATTCACTA
TTGTCTCTTGCAACTTCTTTGCTGGCTACTTCCTCCCTACTTTGGCACAGCCTGGTGCTA
CTTCTCCTCCACGTGACAAAGTCATCATCATGGGTGATGGTACCCCCAAAGCTGTGTTCA
ACACGGAGGAAGACATAGGGACTTACACAATCAAGGCCGTAGATGATCCAAGAACCTTAA
ACAAAATTTTATACGTTAGGCCACCCATGAACACTTACTCCTTCAACGACCTTGTCTCGC
TTTGGGAGAAAAAGATTGAGAAAACACTAGAAAGAATCCACGTTCCAGAAGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4G621JQ 756 0 0
GAGAGTGTTGAACCTGCCAAAACAGCCTATACTACAAAGGCAATGTTCCGCAGGTGAATT
GAGGAAGCAGGGATACCATTCACTATTGTCTCTTGCAACTTCTTTGCTGGCTACTTCCTC
CCTACTTTGGCACAGCCTGGTGCTACTTCTCCTCCACGTGACAAAGTCATCATCATGGGT
GATGGTACCCCCAAAGCTGTGTTCAACACGGAGGAAGACATAGGGACTTACACAATCAAG
GCCGTAGATGATCCAAGAACCTTAAACAAAATTTTATACGTTAGGCCACCCATGAACACT
TACTCCTTCAACGACCTTGTCTCGCTTTGGGAGAAAAAGATTGAGAAAACACTAGAAAGA
ATCCACGTTCCAGAAGAACAAATCCTCAAACAGATAACAGAAGCTTCGCCTCCACCGAAC
GTGTTGCTATCACTTTGTCATTGCGTATTCGTGAAAGGAGGACAAACAAACTTCGAAATA
GAACCTTCCTTTGGTGTAGAAGCTTCCGAGCTTTACCCTGATGTCAAATACACTACTGTT
GATGAAATCCTCGACAACTACGTCTAAAGGAGCACCAGCTCCTAACTAAAGTCACTCCCT
GACATTTATATTTCTGAATAATTTTGGGTAAAATATTACCTTTCTGCTTCACCAGTATGA
TGAATCAATTAAACTGAACATGTTGTCTTATGATGACCCCATTTTGAATGTAAGGCTTTG
GACAGGTTTTTTTCTTGTAATAAATTTCTGTTGTAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL6363Contig1 916 2 7 U
GATATGCTTTTGAAGCATCATTCATTATTAGCACTTCAGTGTTATACATTTACCTCTACA
TAAATCATGTATTGGTATATCTACAACATTACGAATGTAATAGTAATCTTTGTTATTATT
GTATCAAGTTCCCCGTAAAAGAAATCGATTGTTTAACCGGTAAGGACCACTCCAACTTTA
AGGTCTGAATCGTCTAGCTTCTCTACTCAAAGCGGGAACTCTTTCTGCAAGAGATCCAGA
TTCCTTGCCTCACAAGCTTCGATTAGGTCATGTCTTGACGCACAGCTTAACGAGAGTCTC
AGGTATTGCCAAGCGTTGTCGGCCTTAGGATTCATCGCAAGAGCACGAACATAATAAGGG
ATTGATTCTTTGTACATCCCCTGGTTTGCGTAACTGATCCCCATGTTTGCCCAAGCACGA
ACGTAATTAGGTTTCAAATCCAGAGCCTGTTGATAAGCAGATATGGCATCAGCACTCTGA
ACACTGTTGGCTTGTGTTGCACCAAGCTTATTCCAAAGAGAATAGTCGTTTGGTTTTAAC
TGTAACGCTGTTTGGAAGGAAGTTATTGCTCTATCGAATTCTCTCGACAGATTGAAGAGA
ACGCCTAACACTATATGCACATCGGCGTCCTCAGGATTCATCTGAGAAGCTTCAGTGAAT
AATCTAGCAATATCAGCATGGTATAGGGAATCAGCAAGCTCTGGAGGTGCGATTGATCCA
TACTTTGGGTGATTCCGCAGCCATCCGTATAAGTACTTCAAAGCAGTTGCTTGCTCCAAC
TCGTTGGTATGGCTCACACCAAGCGCAAGAAGCACCTCTAGATTTGAGGGATCAGCCTCC
TGTGCCCGCATCATTGCAGCTATTGCCTGTTGATCGTCATCGTTTTCTGCGTGTGTGACC
CCAGTAATCTCAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E788JQ U 16
AF RR4B713JQ U 1
BS 1 105 RR4B713JQ
BS 106 106 RR4E788JQ
BS 107 133 RR4B713JQ
BS 134 134 RR4E788JQ
BS 135 184 RR4B713JQ
BS 185 186 RR4E788JQ
BS 187 916 RR4B713JQ

RD RR4E788JQ 397 0 0
GAAGCATT
ATTATTAGCACTTCAGTGTTATACATTTACCTCTACATAAATCATGTATTGGTATATCTA
CAACATTACGAATGTAATAGTAATCTTTGTTATTATTGTATCAAGTTCCCCGTAAAAGAA
ATCGATTGTTTAACCGGTAAGGACCACTCCGACTTTAAGGTCTGAATCGTCTAGCTTCTC
TACTCAAAGCGGGAACTCTTTCTGCAAGAGATCCAGATTCCTTGCCTCACAAGCTTCGAT
TAGGTCATGTCTTGACGCACAGCTTAACGAGAGTCTCAGGTATTGCCAAGCGTTGTCGGC
CTTAGGATTCATCGCAAGGGCACGAACATAATAAGGGATTGATTCTTTGTACATCCCCTG
GTTTGCGTAACTGATCCCCATGTTTGCCC

QA 9 397 9 397
DS 

RD RR4B713JQ 916 0 0
GATATGCTTTTGAAGCATCATTCATTATTAGCACTTCAGTGTTATACATTTACCTCTACA
TAAATCATGTATTGGTATATCTACAACATTACGAATGTAATAGTAGTCTTTGTTATTATT
GTATCAAGTTCCC*GTAAAAGAAATCGATTGTTTAACCGGTAAGGACCACTCCAACTTTA
AGGT**GAATCGTCTAGCTTCTCTACTCAAAGCGGGAACTCTTTCTGCAAGAGATCCAGA
TTCCTTGCCTCACAAGCTTCGATTAGGTCATGTCTTGACGCACAGCTTAACGAGAGTCTC
AGGTATTGCCAAGCGTTGTCGGCCTTAGGATTCATCGCAAGAGCACGAACATAATAAGGG
ATTGATTCTTTGTACATCCCCTGGTTTGCGTAACTGATCCCCATGTTTGCCCAAGCACGA
ACGTAATTAGGTTTCAAATCCAGAGCCTGTTGATAAGCAGATATGGCATCAGCACTCTGA
ACACTGTTGGCTTGTGTTGCACCAAGCTTATTCCAAAGAGAATAGTCGTTTGGTTTTAAC
TGTAACGCTGTTTGGAAGGAAGTTATTGCTCTATCGAATTCTCTCGACAGATTGAAGAGA
ACGCCTAACACTATATGCACATCGGCGTCCTCAGGATTCATCTGAGAAGCTTCAGTGAAT
AATCTAGCAATATCAGCATGGTATAGGGAATCAGCAAGCTCTGGAGGTGCGATTGATCCA
TACTTTGGGTGATTCCGCAGCCATCCGTATAAGTACTTCAAAGCAGTTGCTTGCTCCAAC
TCGTTGGTATGGCTCACACCAAGCGCAAGAAGCACCTCTAGATTTGAGGGATCAGCCTCC
TGTGCCCGCATCATTGCAGCTATTGCCTGTTGATCGTCATCGTTTTCTGCGTGTGTGACC
CCAGTAATCTCAACTT

QA 1 916 1 916
DS 



AS 1 2

CO CL6364Contig1 844 2 4 U
AGGGAGAATTCTCTGAAACAAAGTTTCCACCAATTTCAAATCACTTTCGGTGGCCGGTGG
CGTTATACTGCCGGTCATCAACCTTTCTTTTGTTTTATGTTTCCTTGTGTAAGATAGTTT
CAGTAAAATAGTTTCGATCGTGAGATCGACTTTCTAGTTCGCTTGGCGATCTTCACTTCG
TGTTGGCGATTATCCTTCGTTAGACGATTTTTATTGTGTGTTATTTGCTTTTTATTTTAA
ATCCGTTTTCTCTATCCTATGCAAATCAATATTCTGTTTGATTTTGTAAGATTCTAATCA
GCTACTTAGTTATGCTTGATTTTTTTCCTATAAAAGGTACAATCTTCGCATACAGAGTTT
TATGGCGGAGTATCCTTAGCGGGTTTGAGATTAAGCTATTTGATTAAGCAAAGAGAGAGG
ATGCAGGTTCAGATTAGCTGGAGTTTCTTCATCGGAAATGTTCTGGCAAGACCCCCCCTT
AATCTCTCCAAATCTTTTCACCGGAACTCACTTCTATCAAGTGGATGAAGAATCGAGCAA
GATTGACGGCGTATAGGGATAAGAGGAGCGGTCAAGTAGATTCAACTACTCAAGGAAAGC
TGCTGAAAGTTTCCTGTCCCGGCAAGTTTCCGGCGAAGCCAACGGAGCTGCTCTTTGACC
CCAGAAATGTCGAGACTCATCATCTGTACATGTGCTGTTCATTTTCTGTAGTTGTATTAT
TAGTGAACACGTGTTTTCCTTAATCTTATCTTTTGTTTGTTTGGATTTCGATATGGGCTG
AATGTATATTAGGATAGTTGTTTCTACTTGTTTTTCATGGCCTAAAAGACTTAGTAAAAT
ATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4DB55TF U 1
AF RR4DB55JQ C 243
BS 1 475 RR4DB55TF
BS 476 476 RR4DB55JQ
BS 477 624 RR4DB55TF
BS 625 844 RR4DB55JQ

RD RR4DB55TF 624 0 0
AGGGAGAATTCTCTGAAACAAAGTTTCCACCAATTTCAAATCACTTTCGGTGGCCGGTGG
CGTTATACTGCCGGTCATCAACCTTTCTTTTGTTTTATGTTTCCTTGTGTAAGATAGTTT
CAGTAAAATAGTTTCGATCGTGAGATCGACTTTCTAGTTCGCTTGGCGATCTTCACTTCG
TGTTGGCGATTATCCTTCGTTAGACGATTTTTATTGTGTGTTATTTGCTTTTTATTTTAA
ATCCGTTTTCTCTATCCTATGCAAATCAATATTCTGTTTGATTTTGTAAGATTCTAATCA
GCTACTTAGTTATGCTTGATTTTTTTCCTATAAAAGGTACAATCTTCGCATACAGAGTTT
TATGGCGGAGTATCCTTAGCGGGTTTGAGATTAAGCTATTTGATTAAGCAAAGAGAGAGG
ATGCAGGTTCAGATTAGCTGGAGTTTCTTCATCGGAAATGTTCTGGCAAGACCCCGCCTT
AATCTCTCCAAATCTTTTCACCGGAACTCACTTCTATCAAGTGGATGAAGAATCGAGCAA
GATTGACGGCGTATAGGGATAAGAGGAGCGGTCAAGTAGATTCAACTACTCAAGGAAAGC
TGCTGAAAGTTTCCTGTCCCGGCA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4DB55JQ 602 0 0
CCGTTTTCTCTATCCTATGCAAATCAATATTCTGTTTGATTTTGTAAGATTCTAATCAGC
TACTTAGTTATGCTTGATTTTTTTCCTATAAAAGGTACAATCTTCGCATACAGAGTTTTA
TGGCGGAGTATCCTTAGCGGGTTTGAGATTAAGCTATTTGATTAAGCAAAGAGAGAGGAT
GCAGGTTCAGATTAGCTGGAGTTTCTTCATCGGAAATGTTCTGGCAAGACCCCCCCTTAA
TCTCTCCAAATCTTTTCACCGGAACTCACTTCTATCAAGTGGATGAAGAATCGAGCAAGA
TTGACGGCGTATAGGGATAAGAGGAGCGGTCAAGTAGATTCAACTACTCAAGGAAAGCTG
CTGAAGGTTTCCTGTCCCGGCAAGTTTCCGGCGAAGCCAACGGAGCTGCTCTTTGACCCC
AGAAATGTCGAGACTCATCATCTGTACATGTGCTGTTCATTTTCTGTAGTTGTATTATTA
GTGAACACGTGTTTTCCTTAATCTTATCTTTTGTTTGTTTGGATTTCGATATGGGCTGAA
TGTATATTAGGATAGTTGTTTCTACTTGTTTTTCATGGCCTAAAAGACTTAGTAAAATAT
GT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL6365Contig1 1105 2 2 U
GGACACCACCACCCTCTAGCTTGTCTCTAGATGGATACCATGAGAGATAAGCCAATAAAA
TTCTCATATTCTGTTTTCTGTTTGATCATTTTATTATCGGTCTATAACTCCACTGCGGAG
CTACGACGGTTGGTCCAACCACCAAAATCCGATGGTACACTCAGTTTTCTAGTTGTCGGC
GACTGGGGAAGAAGAGGTTCTTATAATCAGTCTCAAGTAGCTCTTCAGATGGGAAAAACA
GGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGATGGA
ATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACCAATATTTACACAGCACCT
AGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTATTAGGAAATCATGATTATAGAGGTAACGTCGCT
GCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTTGACTCTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTAC
TTGGTTAACGCCGATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTTGTAGACAAA
TATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACACC
TATCTTAACAATCTCTTAGCGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAGCTTGAGAAACA
ACTTTTACCTATCCTTGAGGCTAATAAAGTTGATCTCTACATAAACGGGCATGATCATTG
CTTGGAGCACATAAGTAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGTGGCGGTGGGTC
CAAGGCGTGGAAAGGGGACGTGAATGAGTGGAATCCGCAAGAGATGAAGTTTTACTACGA
TGGACAAGGATTCATGTCGATTTATCTATCGGAAGCAGAACTGCGTGTAATTTTTTACGA
TGGGTATGGTCGTGTTCTGCATCAATGGAACACTTACAAGGAGGGGATTTATACGGAAAT
CTAAACGATCTGATTACAAATGTTGAGAAACCAAATACTACTATTCATATTAGTAGTTCA
CTGTTTTTATATTTGGTGGTGATTTTCATGTGACATAATTATTTTTAATGATGTTATTAT
CCAGCTAATAAAGTTTGAGAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A429TF U 1
AF RR4A429JQ C 442
BS 1 814 RR4A429TF
BS 815 1105 RR4A429JQ

RD RR4A429TF 814 0 0
GGACACCACCACCCTCTAGCTTGTCTCTAGATGGATACCATGAGAGATAAGCCAATAAAA
TTCTCATATTCTGTTTTCTGTTTGATCATTTTATTATCGGTCTATAACTCCACTGCGGAG
CTACGACGGTTGGTCCAACCACCAAAATCCGATGGTACACTCAGTTTTCTAGTTGTCGGC
GACTGGGGAAGAAGAGGTTCTTATAATCAGTCTCAAGTAGCTCTTCAGATGGGAAAAACA
GGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGATGGA
ATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACCAATATTTACACAGCACCT
AGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTATTAGGAAATCATGATTATAGAGGTAACGTCGCT
GCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTTGACTCTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTAC
TTGGTTAACGCCGATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTTGTAGACAAA
TATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACACC
TATCTTAACAATCTCTTAGCGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAGCTTGAGAAACA
ACTTTTACCTATCCTTGAGGCTAATAAAGTTGATCTCTACATAAACGGGCATGATCATTG
CTTGGAGCACATAAGTAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGTGGCGGTGGGTC
CAAGGCGTGGAAAGGGGACGTGAATGAGTGGAAT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4A429JQ 664 0 0
AAGGATTTTGACTCTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTACTTGGTTAACGCCGATATCGTC
GATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTTGTAGACAAATATTTTGATGAGCCAAAGGAC
CATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACACCTATCTTAACAATCTCTTAGCG
TGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAGCTTGAGAAACAACTTTTACCTATCCTTGAGGC
TAATAAAGTTGATCTCTACATAAACGGGCATGATCATTGCTTGGAGCACATAAGTAGCAT
TAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGTGGCGGTGGGTCCAAGGCGTGGAAAGGGGACGT
GAATGAGTGGAATCCGCAAGAGATGAAGTTTTACTACGATGGACAAGGATTCATGTCGAT
TTATCTATCGGAAGCAGAACTGCGTGTAATTTTTTACGATGGGTATGGTCGTGTTCTGCA
TCAATGGAACACTTACAAGGAGGGGATTTATACGGAAATCTAAACGATCTGATTACAAAT
GTTGAGAAACCAAATACTACTATTCATATTAGTAGTTCACTGTTTTTATATTTGGTGGTG
ATTTTCATGTGACATAATTATTTTTAATGATGTTATTATCCAGCTAATAAAGTTTGAGAA
AGCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6366Contig1 781 2 2 U
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CTGTAGAGATTTAAGTTTGGACTGTATAGATCTGTGTCAGAAGTTACTGCGCCGTGATCC
AGTGGAACGTTTGACATTTGAAGAGTTCTTTAATCATCCTTTTCTTTCGGACAGGCAGTC
TTCATATGATTTCTCAAGTAGTAGGTTGGGTTCAAGGAGAATGGACGGTTTTCTTTCTTC
TGGAAGTAGTCCTTCGAGAAACATGGAAGAAAGTTCTCAAGAAGACTGTTTGCCATTCCT
TATAGATGACGATTTCAGTGGACCTGAGGGGAGCCCTTCACATTTGAGAAGGACTTCCTC
GATGAAGTCATCCTCTGGATTTAACACTGATTCTAGAGTTGAGAGAAAGGAGATGGAATC
TAGTCCTTTGAACTGTACAGAACTTGCTTCCAGAGTTAGTAGAATCAACCAGGGAGTGGA
AAGCAATATATTTAGAAATGAAACACACATAAATTCTGATATGAGAAACCATGGTGAACC
TCCTAAAGGAAGAGATGATTCTCAAGACTCGGTGGATCAAGACTTTGTTCTCGTATCTGG
ACCACCAGTGGATCTGCCATCATCTTCATCGAGTTCTTCAAAGGCTTATAATTTCCCATT
CAAGTCTCAGTCTCCTCCTGTAGAGTTATTCAACAGAAGCATAAATTCAACGGCTCCTAT
GCCAATAATTGGTGCTACTGGCACCACGTTGGCCGGTTTGGAAGCCTGGACAGTCAGAGC
A


BQ
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10 

AF RR4DK53TF U 1
AF RR4DN04TF U 1
BS 1 378 RR4DK53TF
BS 379 781 RR4DN04TF

RD RR4DK53TF 378 0 0
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TTCATATGATTTCTCAAGTAGTAGGTTGGGTTCAAGGAGAATGGACGGTTTTCTTTCTTC
TGGAAGTAGTCCTTCGAGAAACATGGAAGAAAGTTCTCAAGAAGACTGTTTGCCATTCCT
TATAGATGACGATTTCAGTGGACCTGAGGGGAGCCCTTCACATTTGAGAAGGACTTCCTC
GATGAAGTCATCCTCTGG

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4DN04TF 781 0 0
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CTGTAGAGATTTAAGTTTGGACTGTATAGATCTGTGTCAGAAGTTACTGCGCCGTGATCC
AGTGGAACGTTTGACATTTGAAGAGTTCTTTAATCATCCTTTTCTTTCGGACAGGCAGTC
TTCATATGATTTCTCAAGTAGTAGGTTGGGTTCAAGGAGAATGGACGGTTTTCTTTCTTC
TGGAAGTAGTCCTTCGAGAAACATGGAAGAAAGTTCTCAAGAAGACTGTTTGCCATTCCT
TATAGATGACGATTTCAGTGGACCTGAGGGGAGCCCTTCACATTTGAGAAGGACTTCCTC
GATGAGGTCATCCTCTGGATTTAACACTGATTCTAGAGTTGAGAGAAAGGAGATGGAATC
TAGTCCTTTGAACTGTACAGAACTTGCTTCCAGAGTTAGTAGAATCAACCAGGGAGTGGA
AAGCAATATATTTAGAAATGAAACACACATAAATTCTGATATGAGAAACCATGGTGAACC
TCCTAAAGGAAGAGATGATTCTCAAGACTCGGTGGATCAAGACTTTGTTCTCGTATCTGG
ACCACCAGTGGATCTGCCATCATCTTCATCGAGTTCTTCAAAGGCTTATAATTTCCCATT
CAAGTCTCAGTCTCCTCCTGTAGAGTTATTCAACAGAAGCATAAATTCAACGGCTCCTAT
GCCAATAATTGGTGCTACTGGCACCACGTTGGCCGGTTTGGAAGCCTGGACAGTCAGAGC
A

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL6367Contig1 717 2 1 U
GGAGAACTACGATCTTTGGCTCTGGAACTGAATCATTTCCTTGTATCTGAGAAGAATTTC
CAGATTCATAGGAAGGAAGTTTAATCGGAATGAATCACAAAATTTCTTATATGATCGATC
GGTATAAACATCAACAACTCCGAATTGGATTAGTTTCTCCTCAGCAAATAAGTGCTTGGG
CCACTAAAAAAATACCTAATGGAGAGATAGTTGGAGAGGTGACAAAACCCTATACTTTTC
ATTACAAAACCAATAAACCGGAAAAAGATGGATTATTTTGTGAAAGGATTTTTGGGCCTA
TAAAGAGTGGAATTTGCGCTTGTGGAAATTATCGAGTGATCGGAGATGAAAAAGAAGACT
CGAAATTTTGTGAACAATGTGGAGTTGAATTTGTTGATTCTCGGATACGAAGATATCAAA
TGGGATACATAAAACTGACACGTCCTGTAACTCATGTATGGTATTTGAAACGTCTTCCTA
GTTATATTGCGAATCTTTTAGATAAACCTCTTAAAGAATTAGAAGGTCTAGTATACTGCG
ATGTGCGATTTGATCAAAATTTTTATTTTTAAGAATGATAAACTCTCATCCCCTTCAATC
AATTTGGGATGCCCTCGATCTGACATGTCTCTTGAAAGGAGTAACACGAAGCTCAGACTT
GTGGGTGTATTCAATACTCCCAAATAACAAGGGCGATTGGTCTATGGTCGATTCAGT


BQ
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AF RR4AX93JQ C 1
AF RR4AX93TF U 1
BS 1 717 RR4AX93TF

RD RR4AX93JQ 717 0 0
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GTGGGTGTATTCAATACTCCCAAATAACAAGGGCGATTGGTCTATGGTCGATTCAGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AX93TF 717 0 0
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CAGATTCATAGGAAGGAAGTTTAATCGGAATGAATCACAAAATTTCTTATATGATCGATC
GGTATAAACATCAACAACTCCGAATTGGATTAGTTTCTCCTCAGCAAATAAGTGCTTGGG
CCACTAAAAAAATACCTAATGGAGAGATAGTTGGAGAGGTGACAAAACCCTATACTTTTC
ATTACAAAACCAATAAACCGGAAAAAGATGGATTATTTTGTGAAAGGATTTTTGGGCCTA
TAAAGAGTGGAATTTGCGCTTGTGGAAATTATCGAGTGATCGGAGATGAAAAAGAAGACT
CGAAATTTTGTGAACAATGTGGAGTTGAATTTGTTGATTCTCGGATACGAAGATATCAAA
TGGGATACATAAAACTGACACGTCCTGTAACTCATGTATGGTATTTGAAACGTCTTCCTA
GTTATATTGCGAATCTTTTAGATAAACCTCTTAAAGAATTAGAAGGTCTAGTATACTGCG
ATGTGCGATTTGATCAAAATTTTTATTTTTAAGAATGATAAACTCTCATCCCCTTCAATC
AATTTGGGATGCCCTCGATCTGACATGTCTCTTGAAAGGAGTAACACGAAGCTCAGACTT
GTGGGTGTATTCAATACTCCCAAATAACAAGGGCGATTGGTCTATGGTCGATTCAGT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL6368Contig1 860 2 3 U
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TACTTTGACTAACCGTGAGCCTGACTCTATGCTCGCTGCCATGTTTAGCGGCCGTCATGC
TATGTCCCACCAACCCAACTCGCAGGGATATGTGTTCATAGACAGAGACGGGAAGCACTT
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CTGGTGCAAGTCTTCAGAGTGCTAATTTACAAGATGCCTGCTTAGTGGACTGTAGCTTCT
GTGGTGCAGATCTCCGCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS30TF U 163
AF RR4A017TFB U 1
BS 1 519 RR4A017TFB
BS 520 520 RR4AS30TF
BS 521 860 RR4A017TFB

RD RR4AS30TF 401 0 0
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GTTTAGCGGCCGTCATGCTATGTCCCACCAACCCAACTCG***GGATATGTGTTCATAGA
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CGCGTGTGGATATCA**AAATGTATTCAATCTGAAAGAGTC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR4A017TFB 860 0 0
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TATGTCCCACCAACCCAACTCGCAGGGATATGTGTTCATAGACAGAGACGGGAAGCACTT
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CTCGTACAAACCTTCAGTTAGCCAAATTTCGTGATGCTGATGCTGAGGGCTCCATCTTTC
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CTGGTGCAAGTCTTCAGAGTGCTAATTTACAAGATGCCTGCTTAGTGGACTGTAGCTTCT
GTGGTGCAGATCTCCGCTCT

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6369Contig1 741 2 2 U
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ATAGCTGCCTCAGTTATATCAGTACGGATTGGTTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTG
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CF06TF C 1
AF RR4CF06JQ U 7
BS 1 6 RR4CF06TF
BS 7 741 RR4CF06JQ

RD RR4CF06TF 741 0 0
TATATAAGATCATACCCAGGGTA*TAAGACAAATATCTGATTCCATAAGAGTAAAGTACA
AAGGCCCTTGCTTCCCTCTGC*TGACTGATAAATAGAGAAAAAAGCTCACAC*TGAAACT
TGAACGTGACAAACAAATCAAAAACAGTTTCTTTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGC
GGCATGCCTAAGCTCTGCGCAAGGTCACTCATTCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTT
GCGTGTGCGTCCTTGTAAGCCTCCGTGACTAACAGTGAAAGTTTCTCAGAGCCTAACTCC
ATAGCTGCCTCAGTTATATCAGTACGGATTGGTTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTG
ACAAGCTCGCCTTCACAATAACCATCGAACTCTGCGGCAGCTAACTCTTTTTGAACACGA
ACAGCCTCAACTTGAACAACCATTTGAGCTTTCTTGACTGTCTCATACATATTCTGCATA
TTACCAAAGATTCCTCCTGCCTTTGACTGTCCATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTG
TTTCCACCTCCGAACAACCCATTCACACGAGGAGACCTTCTGGGCCATGCCGCGTTCTTG
TTCTGTCTACTACTTCCTCTCTGGGAATTAAAACCATGCTGGGAGAAGGGAGATAGTAAA
GACTTTGTGAAATCGGTGGTTGAAGCCATGGGTTCTTCTACCGGAGGAGGGAGGAGATAA
GAGCGCAGAGAGAAAGGGCCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4CF06JQ 735 0 0
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CTTGCTTCCCTCTGCCTGACTGATAAATAGAGAAAAAAGCTCACACCTGAAACTTGAACG
TGACAAACAAATCAAAAACAGTTTCTTTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGCGGCATG
CCTAAGCTCTGCGCAAGGTCACTCATTCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTTGCGTGT
GCGTCCTTGTAAGCCTCCGTGACTAACAGTGAAAGTTTCTCAAAGCCTAACTCCATAGCT
GCCTCAGTTATATCAGTACGGATTGGTTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTGACAAGC
TCGCCTTCACAATAACCATCGAACTCTGCGGCAGCTAACTCTTTTTGAACACGAACAGCC
TCAACTTGAACAACCATTTGAGCTTTCTTGACTGTCTCATACATATTCTGCATATTACCA
AAGATTCCTCCTGCCTTTGACTGTCCATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTGTTTCCA
CCTCCGAACAACCCATTCACACGAGGAGACCTTCTGGGCCATGCCGCGTTCTTGTTCTGT
CTACTACTTCCTCTCTGGGAATTAAAACCATGCTGGGAGAAGGGAGATAGTAAAGACTTT
GTGAAATCGGTGGTTGAAGCCATGGGTTCTTCTACCGGAGGAGGGAGGAGATAAGAGCGC
AGAGAGAAAGGGCCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL6370Contig1 820 2 2 U
GGACGAGAGCTTTCAAAAAGAATATCAAAGGAGAATAATGGAGAAGGAAGATTTCTTGAG
GAGTGGCCATGGAAAAGAAGAAAGAACCGAGGAGATGAGAAAACTTGATTCTCATCAAGA
ATACGACCTCACAACCTCCTCCTCGTCCCAGCAACCATTCTTATCAATGCTAAATAAGTT
CACTGCTCCTCCTCCGAGTAATGTCTCAAGAGCTAATAGTTACCCTTCGACCAATCTCAA
CTTCTCAAACAACACCAACACACTGATGAACTGGGGTGGTGGCGGTAGTAACCGCAATGA
GCAGTACCGTGCACCATACGGAAACATCAGCACCCATCAACAATCACCTTACCAACATAT
GATTCAAACCCGAGCCGCTGGGTTATCTTTTGACCCATTTGGAAGATCGTCTACATCTTC
TCCACATCCCACACCAAACAGTCTTGATATCAAGACTATTCATCAAGTGCAATCTTTACC
GGCGGAAACAATCAAGGCGATCACAACAGATCCACATTTCCAATCGGCTTTGGCGACTGC
TCTATCCTCCATAATAGGCGGCAACTTAAAGATGGATAATGTGGCTAGAAATGAAGACGA
GAAGAGCCCTTAAAATAAGTGTTCTATATATGTTCTCATACATTTGTATATGGGTTTCCT
TTTACAAGTTTCCTAGACTCCTAGTTGATTTATACCTTCGTTTTTAATCATAATTTTAAT
TTTTTTTGGTTGGAGTTTATGGAAGTAATGTGTACAGATTTGTATGTTAAAGGTGTACAT
GAATTTGACAAAAAAAGGTGTGCATGTCAAACATGAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI89TF U 1
AF RR4AI89JQ C 413
BS 1 788 RR4AI89TF
BS 789 820 RR4AI89JQ

RD RR4AI89TF 788 0 0
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GAGTGGCCATGGAAAAGAAGAAAGAACCGAGGAGATGAGAAAACTTGATTCTCATCAAGA
ATACGACCTCACAACCTCCTCCTCGTCCCAGCAACCATTCTTATCAATGCTAAATAAGTT
CACTGCTCCTCCTCCGAGTAATGTCTCAAGAGCTAATAGTTACCCTTCGACCAATCTCAA
CTTCTCAAACAACACCAACACACTGATGAACTGGGGTGGTGGCGGTAGTAACCGCAATGA
GCAGTACCGTGCACCATACGGAAACATCAGCACCCATCAACAATCACCTTACCAACATAT
GATTCAAACCCGAGCCGCTGGGTTATCTTTTGACCCATTTGGAAGATCGTCTACATCTTC
TCCACATCCCACACCAAACAGTCTTGATATCAAGACTATTCATCAAGTGCAATCTTTACC
GGCGGAAACAATCAAGGCGATCACAACAGATCCACATTTCCAATCGGCTTTGGCGACTGC
TCTATCCTCCATAATAGGCGGCAACTTAAAGATGGATAATGTGGCTAGAAATGAAGACGA
GAAGAGCCCTTAAAATAAGTGTTCTATATATGTTCTCATACATTTGTATATGGGTTTCCT
TTTACAAGTTTCCTAGACTCCTAGTTGATTTATACCTTCGTTTTTAATCATAATTTTAAT
TTTTTTTGGTTGGAGTTTATGGAAGTAATGTGTACAGATTTGTATGTTAAAGGTGTACAT
GAATTTGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AI89JQ 408 0 0
ACATTTTCTCCACATCCCACACCAAACAGTCTTGATATCAAGACTATTCATCAAGTGCAA
TCTTTACCGGCGGAAACAATCAAGGCGATCACAACAGATCCACATTTCCAATCGGCTTTG
GCGACTGCTCTATCCTCCATAATAGGCGGCAACTTAAAGATGGATAATGTGGCTAGAAAT
GAAGACGAGAAGAGCCCTTAAAATAAGTGTTCTATATATGTTCTCATACATTTGTATATG
GGTTTCCTTTTACAAGTTTCCTAGACTCCTAGTTGATTTATACCTTCGTTTTTAATCATA
ATTTTAATTTTTTTTGGTTGGAGTTTATGGAAGTAATGTGTACAGATTTGTATGTTAAAG
GTGTACATGAATTTGACAAAAAAAGGTGTGCATGTCAAACATGAACAT

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 2

CO CL6371Contig1 626 2 2 U
ATCTAATGTGTATATTTGTAACTCTATACAAGTTTCTCAAATCACACACATTAGACCTCC
ATTTCTCATTCACACTAACTCTATTTTTAGCATATGAATACATTGCTAAAAAATAGTTCC
AACAGTTTGATGATTTGATATAAACACGATATTGTGTCCCTGCCGAATCTTGTCTTCCAG
CTCAGAGAAAAGAGAAACATTCCCAACGTAAGAATTTTTGAAATCAATGAGGGGACGGAT
GTATGTATGAACAAACTGGTAGTAGTCAAATGGTTGTCTAACAGCTTTATGATAAGGATT
GAAGGTATAAGGATGCTCGACACCAAGAAGCATGCGATCGAAAGCAACAGACATGTTGGA
TATAACAGTCTGATCTGCCATGGAAGCTCCACTACTTAACACAGCATTTTTGTAGTTCCA
GTAAAGCTCTTCCATCCCTGAAGCAACATTGGGAGGCAACCTTCCAGCTTCTTTTTCTTT
CCTTAAACCAGAGATAAGATCTTGTTCAGTTCGTGCATCCAAGAAGGTACGGGAATGGTT
GAGCTCAGTGGTAGCCGGGAGGACAGATTCCTTATCCTTAACAAGCTCAGACATGGCTCT
CACTCTAACAAACGATGCGACGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU54TF C 1
AF RR4GU54JQ U 84
BS 1 83 RR4GU54TF
BS 84 626 RR4GU54JQ

RD RR4GU54TF 456 0 0
ATCTAATGTGTATATTTGTAACTCTATACAAGTTTCTCAAATCACACACATTAGACCTCC
ATTTCTCATTCACACTAACTCTATTTTTAGCATATGAATACATTGCTAAAAAATAGTTCC
AACAGTTTGATGATTTGATATAAACACGATATTGTGTCCCTGCCGAATCTTGTCTTCCAG
CTCAGAGAAAAGAGAAACATTCCCAACGTAAGAATTTTTGAAATCAATGAGGGGACGGAT
GTATGTATGAACAAACTGGTAGTAGTCAAATGGTTGTCTAACAGCTTTATGATAAGGATT
GAAGGTATAAGGATGCTCGACACCAAGAAGCATGCGATCGAAAGCAACAGACATGTTGGA
TATAACAGTCTGATCTGCCATGGAAGCTCCACTACTTAACACAGCATTTTTGTAGTTCCA
GTAAAGCTCTTCCATCCCTGAAGCAACATTGGGAGG

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR4GU54JQ 543 0 0
TTTTTAGCATATGAATACATTGCTAAAAAATAGTTCCAACAGTTTGATGATTTGATATAA
ACACGATATTGTGTCCCTGCCGAATCTTGTCTTCCAGCTCAGAGAAAAGAGAAACATTCC
CAACGTAAGAATTTTTGAAATCAATGAGGGGACGGATGTATGTATGAACAAACTGGTAGT
AGTCAAATGGTTGTCTAACAGCTTTATGATAAGGATTGAAGGTATAAGGATGCTCGACAC
CAAGAAGCATGCGATCGAAAGCAACAGACATGTTGGATATAACAGTCTGATCTGCCATGG
AAGCTCCACTACTTAACACAGCATTTTTGTAGTTCCAGTAAAGCTCTTCCATCCCTGAAG
CAACATTGGGAGGCAACCTTCCAGCTTCTTTTTCTTTCCTTAAACCAGAGATAAGATCTT
GTTCAGTTCGTGCATCCAAGAAGGTACGGGAATGGTTGAGCTCAGTGGTAGCCGGGAGGA
CAGATTCCTTATCCTTAACAAGCTCAGACATGGCTCTCACTCTAACAAACGATGCGACGA
CCC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL6372Contig1 1063 2 2 U
GGAGAGCCATAAGTGAGAAACTTTAATTTACTCTCATATTTTTTTGTTTCTGTGTTTGGC
TTTGTGTTGGATCTTAAATGGATTCGAGAACAAGACTTGACTATGTTCTGTTTCAACTCA
CACCCACCAGGACAAGATGCGAGCTTGTGATTTTCTCCGGTGGCGAGAACGAGAAACTTG
CTTCCGGGATTTTTCAGCCGTTCGTTACGCATCTCAAAAGCGTAAGAGACAGATTTCTAA
AGGCGGATACTCCGTCACTCTCCGTCCTTCCTCCGGCGCCGCCGGCGATAATTGGTTCAC
CAAAGTGACGCTTCAGCGATTTGTTCGATTCGTGACAACACCGGAGGTTCTTGAGAGGTC
CGTGACATTAGAGAAGGAGATTGAACAGATCGAGGATTCGATCCAGTCTAATGCCGCCGC
TATTTCCGGCGAAGCTGAAGGGAATGAGTTGGGTAGTAGTACTCAAAAGTCTACGGCTTT
GTCAAAGGAACATGGTGAATCTGATGGTCAAGAAAATTCGAAGGTTGGTCTACAGCGAGT
TCTCGAAACCCGGAAAGCGGCTTTGTGCAAAGAGCAAGCCATGGCTTACGCTAGAGCTTT
GGTTGTTGGGTTTGAATTGGACTACATGGATGACTTATTATCCTTCGCAGATACTTTTGG
AGCTTCCCGTTTAAGGGAAGCATGTGTGAACTATGTGGACTTGTGCAAGAGGAAAAACGA
AGATAGGATGTGGGTGGACCAAATCACAGCAATGCAAGCCTTTCCTAGGCCTGAACTATC
ATCCTTCATGGGTGACTCCTCTGGGATCATACTCGCTGGTGAAGAGAATGATAACTTCAA
ACAAGGGAACAACATGGATGCAATGAGCCAGGGTAGCTTTGAGACTACTAGCCAAGTTCC
TCCTCCTCAGATGTCAATGCCGTGGCCTAACCATTATCCTCAGTACATGCAAGGACATGG
CTATCCTCCTTATATGTTCCCTGGCATGCAAGGCCAGCCCCCTTATTTCCCTCAGTGGCC
TGTGAACATGGGAGGAGATGTGGAGACAAGTGAGAAGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GN55TF U 1
AF RR4GN55JQ C 334
BS 1 706 RR4GN55TF
BS 707 1063 RR4GN55JQ

RD RR4GN55TF 706 0 0
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TTTGTGTTGGATCTTAAATGGATTCGAGAACAAGACTTGACTATGTTCTGTTTCAACTCA
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CTTCCGGGATTTTTCAGCCGTTCGTTACGCATCTCAAAAGCGTAAGAGACAGATTTCTAA
AGGCGGATACTCCGTCACTCTCCGTCCTTCCTCCGGCGCCGCCGGCGATAATTGGTTCAC
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CGTGACATTAGAGAAGGAGATTGAACAGATCGAGGATTCGATCCAGTCTAATGCCGCCGC
TATTTCCGGCGAAGCTGAAGGGAATGAGTTGGGTAGTAGTACTCAAAAGTCTACGGCTTT
GTCAAAGGAACATGGTGAATCTGATGGTCAAGAAAATTCGAAGGTTGGTCTACAGCGAGT
TCTCGAAACCCGGAAAGCGGCTTTGTGCAAAGAGCAAGCCATGGCTTACGCTAGAGCTTT
GGTTGTTGGGTTTGAATTGGACTACATGGATGACTTATTATCCTTCGCAGATACTTTTGG
AGCTTCCCGTTTAAGGGAAGCATGTGTGAACTATGTGGACTTGTGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4GN55JQ 730 0 0
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GCAAGCCATGGCTTACGCTAGAGCTTTGGTTGTTGGGTTTGAATTGGACTACATGGATGA
CTTATTATCCTTCGCAGATACTTTTGGAGCTTCCCGTTTAAGGGAAGCATGTGTGAACTA
TGTGGACTTGTGCAAGAGGAAAAACGAAGATAGGATGTGGGTGGACCAAATCACAGCAAT
GCAAGCCTTTCCTAGGCCTGAACTATCATCCTTCATGGGTGACTCCTCTGGGATCATACT
CGCTGGTGAAGAGAATGATAACTTCAAACAAGGGAACAACATGGATGCAATGAGCCAGGG
TAGCTTTGAGACTACTAGCCAAGTTCCTCCTCCTCAGATGTCAATGCCGTGGCCTAACCA
TTATCCTCAGTACATGCAAGGACATGGCTATCCTCCTTATATGTTCCCTGGCATGCAAGG
CCAGCCCCCTTATTTCCCTCAGTGGCCTGTGAACATGGGAGGAGATGTGGAGACAAGTGA
GAAGTCTTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6373Contig1 786 2 3 U
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AAAATAATAACCCATCAAAGTTCCTTCCTTTCTTTCCCACAGAGATGCTGAAACAGAGCT
TTGTGTCTCATAACACCAATGCTCTCTGTTTCTCTATATCCTCCAACCCGAAATCGAGTC
TTTTAATCCCACAAAAGAAGCCAAAGCGTCTCACGTCCTGCGCTCTCAATGTTGGACTCC
AAGATGTAACCGAAGTCATCCACAACAAGGTACTCATAGCTGCTGGGTTCTCCGGGGCGA
TTGGGCAGCTCTTAAAGCCCTTCACTTCCGTGGTTTTCTATAAGAAAAAGCTCGACTTTA
GAACCGCTTTACAAGCTGGAGGCTTCCCTTCAACACATTCCTCTGGGATTTGATGACTCC
ATTTTTGGTCTCACTGTGGTTTATGCTGCTCTGATCATGTATGATGCACAGGGTGTGAGG
AGAGAAGTTGGGAAGCATGCGAGAGTGTTGAACAAACTAACGGCTAATGCTCGGAGAGGC
GAAGAGATGAGTTTAAAGGGCAAGGAAGGTGAGACTTTGGAGTCAGATGAGATCAGCGAG
GAAGTGAAACTTCCGTTGAAAGAATCAATAGGACATACTGAAGTTGAAGTGATAGCAGGC
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GAATCT


BQ
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AF RR4CM82TF U 16
AF RR4CM82JQ C 1
BS 1 15 RR4CM82JQ
BS 16 389 RR4CM82TF
BS 390 786 RR4CM82JQ

RD RR4CM82TF 374 0 0
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CAAAGTTCCTTCCTTTCTTTCCCACAGAGATGCTGAAACAGAGCTTTGTGTCTCATAACA
CCAATGCTCTCTGTTTCTCTATATCCTCCAACCCGAAATCGAGTCTTTTAATCCCACAAA
AGAAGCCAAAGCGTCTCACGTCCTGCGCTCTCAATGTTGGACTCCAAGATGTAACCGAAG
TCATCCACAACAAGGTACTCATAGCTGCTGGGTTCTCCGGGGCGATTGGGCAGCTCTTAA
AGCCCTTCACTTCCGTGGTTTTCTATAAGAAAAAGCTCGACTTTAGAACCGCTTTACAAG
CTGGAGGCTTCCCT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4CM82JQ 786 0 0
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AAAATAATAACCCATCAAAGTTCCTTCCTTTCTTTCCCACAGAGATGCTGAAACAGAGCT
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TTTTAATCCCACAAAAGAAGCCAAAGCGTCTCACGTCCTGCGCTCTCAATGTTGGACTCC
AAGATGTAACCGAAGTCATCCACAACAAGGTACTCATAGCTGCTGGGTTCTCCGGGGCGA
TTGGGCAGCTCTTAAAGCCCTTCACTTCCGTGGTTTTCTATAAGAAAAAGCTCGACTTTA
GAACCGCTTTACAAGCTGGAGGCTTCCCTTCAACACATTCCTCTGGGATTTGATGACTCC
ATTTTTGGTCTCACTGTGGTTTATGCTGCTCTGATCATGTATGATGCACAGGGTGTGAGG
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GAAGAGATGAGTTTAAAGGGCAAGGAAGGTGAGACTTTGGAGTCAGATGAGATCAGCGAG
GAAGTGAAACTTCCGTTGAAAGAATCAATAGGACATACTGAAGTTGAAGTGATAGCAGGC
GCTTTGTTTGGTTTCTTAGTTAGCTTTGGTGTTTATTCCCTTATGTAAAAAGCTACCAAC
TTTATATGTGGTGTTGTTAAGAAAGAAGGAGAGTTTGATTATTATTGTAAAAACTTAAGA
GAATCT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6374Contig1 375 2 1 U
GGGTTTAGAAACCAAAAGAGAAAAGAGAAAACCAAAAGAAAAAGAACATAGCCCTCTATG
ATCTTCATCCGCTTCACCTTTCCTTGTTCTTCTTCTTTTTTCTAAAGTATTCGTCAGTTT
TGAAATTTTTTTTGAAGACAAAAAAAACAAAAGGATTCTCCGATGTCGATTCAGCGGCCA
CAAGAGATCGACTGCGACTCGTTCCTCTCAGATCGGAATTTTTTTGAAGACAAAAAAAAC
AAAAGGATTCTCCGATATCGATTCAGCGGCCACAAGAGATCGCATGCGACTCGTTCCTCT
CAGATCGGAACTGTTTGTATGTTGTTTCTCAGACAAAATAATCAGATATCGGACATATCT
GAAGCAATATCCGAC


BQ
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AF RR4BN38JQ C 1
AF RR4BN38TF U 1
BS 1 375 RR4BN38TF

RD RR4BN38JQ 375 0 0
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ATCTTCATCCGCTTCACCTTTCCTTGTTCTTCTTCTTTTTTCTAAAGTATTCGTCAGTTT
TGAAATTTTTTTTGAAGACAAAAAAAACAAAAGGATTCTCCGATGTCGATTCAGCGGCCA
CAAGAGATCGACTGCGACTCGTTCCTCTCAGATCGGAATTTTTTTGAAGACAAAAAAAAC
AAAAGGATTCTCCGATATCGATTCAGCGGCCACAAGAGATCGCATGCGACTCGTTCCTCT
CAGATCGGAACTGTTTGTATGTTGTTTCTCAGACAAAATAATCAGATATCGGACATATCT
GAAGCAATATCCGAC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR4BN38TF 375 0 0
GGGTTTAGAAACCAAAAGAGAAAAGAGAAAACCAAAAGAAAAAGAACATAGCCCTCTATG
ATCTTCATCCGCTTCACCTTTCCTTGTTCTTCTTCTTTTTTCTAAAGTATTCGTCAGTTT
TGAAATTTTTTTTGAAGACAAAAAAAACAAAAGGATTCTCCGATGTCGATTCAGCGGCCA
CAAGAGATCGACTGCGACTCGTTCCTCTCAGATCGGAATTTTTTTGAAGACAAAAAAAAC
AAAAGGATTCTCCGATATCGATTCAGCGGCCACAAGAGATCGCATGCGACTCGTTCCTCT
CAGATCGGAACTGTTTGTATGTTGTTTCTCAGACAAAATAATCAGATATCGGACATATCT
GAAGCAATATCCGAC

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL6375Contig1 727 2 2 U
AACTTTTGTGTCACATAGGTAGGGAGACAGATGCTTTCTTTAACAATACAAACTTTATTG
GCAAATCAACATGATAATGATGACAACATGATGTATATAAAACTATATTCCCAATATTTT
AAGAGACATTACAAAAGCCAAATCATGAAAGCCGTGGGACACAGATGTTCTTCTCAAAGA
TCACCAAAGACTGTGAATATGTTACCGTTGATGTAATCATTCTCAACCAAACTCACCAAA
TAGTAACTGTTCTTGACCTCTTCGAGCAAGTTTCTTGAAGGGTCAGATTGAGGGTACAAG
TTAGCCCAGCTTCTTGACCAAGTCTCAAACGCTTCATCTTTCCAGATTTTGAAGCTAGCC
GGATCCACAATGGTTGGTTGAATGATCTCCTTAGCCGAAAAAACTCCCCAAGTAACAGCA
TTCACATCGGATTGGGCAGTGTTTGACACCCAGTTGTCTCCTTTGTTGACAGCTATGTAA
GTTATAGATGGCAAAGCTTTGCATTTCTCAACAACTGCATCTAACTTCTCCCTTGAGCAG
AAGAACTCTAGGTAAGCCTTTTGGTATACGTATCCACCAGGACCACCCCATCCAACAGTT
GAGGAATCAGATCTCTCTGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGACAAGAAGCCTTTG
GAGTTGATGTTCACCAGCAGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGCTGGAGCCCATCCAGT
TCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GU04TF C 1
AF RR4GU04JQ U 290
BS 1 289 RR4GU04TF
BS 290 727 RR4GU04JQ

RD RR4GU04TF 668 0 0
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TCACCAAAGACTGTGAATATGTTACCGTTGATGTAATCATTCTCAACCAAACTCACCAAA
TAGTAACTGTTCTTGACCTCTTCGAGCAAGTTTCTTGAAGGGTCAGATTGAGGGTACAAG
TTAGCCCAGCTTCTTGACCAAGTCTCAAACGCTTCATCTTTCCAGATTTTGAAGCTAGCC
GGATCCACAATGGTTGGTTGAATGATCTCCTTAGCCGAGAAAACTCCCCAAGTAACAGCA
TTCACATCGGATTGGGCAGTGTTTGACACCCAGTTGTCTCCTTTGTTGACAGCTATGTAA
GTTATAGATGGCAAAGCTTTGCATTTCTCAACAACTGCATCTAACTTCTCCCTTGAGCAG
AAGAACTCTAGGTAAGCCTTTTGGTATACGTATCCACCAGGACCACCCCATCCAACAGTT
GAGGAATCAGATCTCTCTGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGACAAGAAGCCTTTG
GAGTTGAT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4GU04JQ 438 0 0
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TGAAGCTAGCCGGATCCACAATGGTTGGTTGAATGATCTCCTTAGCCGAAAAAACTCCCC
AAGTAACAGCATTCACATCGGATTGGGCAGTGTTTGACACCCAGTTGTCTCCTTTGTTGA
CAGCTATGTAAGTTATAGATGGCAAAGCTTTGCATTTCTCAACAACTGCATCTAACTTCT
CCCTTGAGCAGAAGAACTCTAGGTAAGCCTTTTGGTATACGTATCCACCAGGACCACCCC
ATCCAACAGTTGAGGAATCAGATCTCTCTGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGACA
AGAAGCCTTTGGAGTTGATGTTCACCAGCAGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGCTGGA
GCCCATCCAGTTCAGACC

QA 1 438 1 438
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6377Contig1 426 2 1 U
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GAATAAATAAAAGATAGACCAATCAACCACATCACTGGTTTGGTTAGCCCCACTGTCGAT
TAGAAAGTTTCGAATATGTGTATTTTTACATATCTCGTATCTTTGTCTAGCGAAGGGATG
TTAGATGATAAGTCTTGGATATCAAGTCCGCTGAGTGAAAAACCTGGGTAGGAAAAAAAG
GAAAGAAAATGGAAACCAAAAACTGGAATCTGGGTTCCAAGAGTTTTGGCTGTTCTCATA
GTGTTGTGTCATAAGTCATGTGTGGAACTGATCTCATAGCGTTGTGTCGTAAGTCATGTG
TGGAACTGATACAAAAGCTTGTTAAATTATATTATCATCTTTTCTTTATATTATTGTTAC
AGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4D509TF U 1
AF RR4D509JQ C 51
BS 1 426 RR4D509TF

RD RR4D509TF 426 0 0
GGTGATCAACGCTTCACAGAAACGAGCTCTGCTTCAAGAAATGGCTCTACGGCTAACGTA
GAATAAATAAAAGATAGACCAATCAACCACATCACTGGTTTGGTTAGCCCCACTGTCGAT
TAGAAAGTTTCGAATATGTGTATTTTTACATATCTCGTATCTTTGTCTAGCGAAGGGATG
TTAGATGATAAGTCTTGGATATCAAGTCCGCTGAGTGAAAAACCTGGGTAGGAAAAAAAG
GAAAGAAAATGGAAACCAAAAACTGGAATCTGGGTTCCAAGAGTTTTGGCTGTTCTCATA
GTGTTGTGTCATAAGTCATGTGTGGAACTGATCTCATAGCGTTGTGTCGTAAGTCATGTG
TGGAACTGATACAAAAGCTTGTTAAATTATATTATCATCTTTTCTTTATATTATTGTTAC
AGCTCC

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4D509JQ 376 0 0
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CACTGTCGATTAGAAAGTTTCGAATATGTGTATTTTTACATATCTCGTATCTTTGTCTAG
CGAAGGGATGTTAGATGATAAGTCTTGGATATCAAGTCCGCTGAGTGAAAAACCTGGGTA
GGAAAAAAAGGAAAGAAAATGGAAACCAAAAACTGGAATCTGGGTTCCAAGAGTTTTGGC
TGTTCTCATAGTGTTGTGTCATAAGTCATGTGTGGAACTGATCTCATAGCGTTGTGTCGT
AAGTCATGTGTGGAACTGATACAAAAGCTTGTTAAATTATATTATCATCTTTTCTTTATA
TTATTGTTACAGCTCC

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 2

CO CL6378Contig1 692 2 3 U
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CCATCCTACGGTCAGCCACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAAACATGACACATAT
AGTAGTAGGAATAGGTATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGTTAAGGCGGGAAGT
ATAAGTTGCTTTAGGAGCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTGACAGTGTTTTACC
GGCTGACAAAGTGGTGAGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTGGTCCTCCAACAATGCA
CCAGTTGGCTCCCCATACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTCCTGCCTGCACCAT
TTAACAAAGGAAACCCATCTTTACACTTTTGAGTCTGTTTTATTGTTACTTTAGTAGACT
TTAGCAGACTTTACTGGTGCGCCTTTCTAGTTGGTCAATAAAGAACCATGAGTGTGCTCA
CTCCACTAAAACTCTTCCTCCTTTTTTCATTTAATTTAGAATTATACAAAATAAAAGTAG
ACTTTGAAGTGGAAGTGACTTCGTGGTAAGAAAAAGGGAAACTAAAGTCTAAAAAGAGAT
TAAAAAAGAAAGAGTTTGGTTATTTTTTTTTGCAAAAGAGTTTGGTTATAAAGAAAAAGA
AAAGTACTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CF69JQ U 45
AF RR4CF69TF C 1
BS 1 44 RR4CF69TF
BS 45 424 RR4CF69JQ
BS 425 692 RR4CF69TF

RD RR4CF69JQ 380 0 0
GACTCAATTACAGTTGCCATCCTACGGTCAGCCACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAAT
AAAACATGACACATATAGTAGTAGGAATAGGTATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGA
AGTTAAGGCGGGAAGTATAAGTTGCTTTAGGAGCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGG
CTGACAGTGTTTTACCGGCTGACAAAGTGGTGAGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTG
GTCCTCCAACAATGCACCAGTTGGCTCCCCATACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCG
CTCCTGCCTGCACCATTTAACAAAGGAAACCCATCTTTACACTTTTGAGTCTGTTTTATT
GTTACTTTAGTAGACTTTAG

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4CF69TF 692 0 0
ACATACAAGGGTAGAGAGAGATCGCAGGACCCGTGGATCGGATGGACTCAATTACAGTTG
CCATC*TACGGTCAGCCACCACCCTCTATTTATCTCTTCAAAATAAAACATGACACATAT
AGTAGTAGGAATAGGTATATGAGGCTTTCAGAGGACGGGGGAGAAGTTAAGGCGGGAAGT
ATAAGTTGCTTTAGGAGCCCAGTTTCTAGGCACCACGTCGGTGGCTGACAGTGTTTTACC
GGCTGACAAAGTGGTGAGCTTGATGGAGAATGGTCCTTTGAGTGGTCCTCCAACAATGCA
CCAGTTGGCTCCCCATACATGCTTCATCTCCAGCCATTCACTCGCTCCTGCCTGCACCAT
TTAACAAAGGAAACCCATCTTTACACTTTTGAGTCTGTTTTATTGTTACTTTAGTAGACT
TTAGCAGACTTTACTGGTGCGCCTTTCTAGTTGGTCAATAAAGAACCATGAGTGTGCTCA
CTCCACTAAAACTCTTCCTCCTTTTTTCATTTAATTTAGAATTATACAAAATAAAAGTAG
ACTTTGAAGTGGAAGTGACTTCGTGGTAAGAAAAAGGGAAACTAAAGTCTAAAAAGAGAT
TAAAAAAGAAAGAGTTTGGTTATTTTTTTTTGCAAAAGAGTTTGGTTATAAAGAAAAAGA
AAAGTACTTGGCGAATATGCATGGAGCCAATC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL6379Contig1 1072 2 2 U
GGGGACAAGAACAGAGAAAAGATAAACAATGATTAGCCTTAGGTTTCAACCAAGCACCGC
CGGTGTTCTGTCGGCGTCAGTCAGCCGCGCGGGATTCATCAAGCGGTGCGGTTTGACTAA
ACCGAGAAGAACCGCCCGGCTCGGAACGATGGCCATGGCCGCTGCTCCTCTCGAAATCTG
CGTCAAAGCTTCCATCACCACACCCAACAAGCTCGGAGACTGCCCTTTTTGCCAAAGGGT
GTTGTTGACTATGGAGGAGAAGCATGTACCTTATGACATGAAAATGGTGGATTTGAGTAA
CAAGCCTGAGTGGTTCTTGCAAATTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGTGAAGTTTGA
TGGGAAATGGGTTCCGGATTCTGATGTCATAACAGAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGA
GCCTCCTCTAGCAACTCCACCCGAAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTT
TATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAGATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTGTTACTAGATGA
GCTTAGTACATTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGTAAGCTCTTTCTGTCTTGATCTCTT
CCATAACTTAGTCTTCGAATTTGTGTTACATCTTTGATTACTTCCTTACTCTGAAGGGAC
CTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGCTATACC
ACATGAAGATTGTACTGGGACATTTCAAGAACTGGTCTGTTCCAGATTCACTTCCTTTCC
TTAAATCTTACATGGAGAATGTGTTCTCGAGGGAATCATTCAAGAATACAGAGGCGCAAA
CAGAGGATGTGATTGCTGGTTGGAGACCAAAGGTGATGGGTTGAAGAGAGTAAAAAGGTT
TAAGATGTTGGCCTCATCACTCAAGTCAAAGGGATCCATCATCTTCTCTCTTACTTTCTT
CCTTCTAGTACAATGTACAAAACATAATCAAATTTTCTTCAAATGTTTGTTAACAATAAT
TGTGGCGCGCTAGAGCAATAAACAGAACGACTATTCAGAGAATGAAAACTAG


BQ
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AF RR4F802TF U 1
AF RR4F802JQ C 385
BS 1 762 RR4F802TF
BS 763 1072 RR4F802JQ

RD RR4F802TF 764 0 0
GGGGACAAGAACAGAGAAAAGATAAACAATGATTAGCCTTAGGTTTCAACCAAGCACCGC
CGGTGTTCTGTCGGCGTCAGTCAGCCGCGCGGGATTCATCAAGCGGTGCGGTTTGACTAA
ACCGAGAAGAACCGCCCGGCTCGGAACGATGGCCATGGCCGCTGCTCCTCTCGAAATCTG
CGTCAAAGCTTCCATCACCACACCCAACAAGCTCGGAGACTGCCCTTTTTGCCAAAGGGT
GTTGTTGACTATGGAGGAGAAGCATGTACCTTATGACATGAAAATGGTGGATTTGAGTAA
CAAGCCTGAGTGGTTCTTGCAAATTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGTGAAGTTTGA
TGGGAAATGGGTTCCGGATTCTGATGTCATAACAGAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGA
GCCTCCTCTAGCAACTCCACCCGAAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTT
TATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAGATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTGTTACTAGATGA
GCTTAGTACATTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGTAAGCTCTTTCTGTCTTGATCTCTT
CCATAACTTAGTCTTCGAATTTGTGTTACATCTTTGATTACTTCCTTACTCTGAAGGGAC
CTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGCTATACC
ACATGAAGATTGTACTGGGACATTTCAAGAACTGGTCTGTTC
AG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4F802JQ 688 0 0
TGTCATAACAGAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGAGCCTCCTCTAGCAACTCCACCCGA
AAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTTTATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAGA
TTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTGTTACTAGATGAGCTTAGTACATTCAACGAGTATCT
CAAAGAAAATGTAAGCTCTTTCTGTCTTGATCTCTTCCATAACTTAGTCTTCGAATTTGT
GTTACATCTTTGATTACTTCCTTACTTTGAAGGGACCTTACATAAACGGAGAGAAGATCT
CAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGCTATACCACATGAAGATTGTACTGGGACATT
TCAAGAACTGGTCTGTTCCAGATTCACTTCCTTTCCTTAAATCTTACATGGAGAATGTGT
TCTCGAGGGAATCATTCAAGAATACAGAGGCGCAAACAGAGGATGTGATTGCTGGTTGGA
GACCAAAGGTGATGGGTTGAAGAGAGTAAAAAGGTTTAAGATGTTGGCCTCATCACTCAA
GTCAAAGGGATCCATCATCTTCTCTCTTACTTTCTTCCTTCTAGTACAATGTACAAAACA
TAATCAAATTTTCTTCAAATGTTTGTTAACAATAATTGTGGCGCGCTAGAGCAATAAACA
GAACGACTATTCAGAGAATGAAAACTAG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6380Contig1 1150 2 8 U
AAAAACGGGTATCGAAGAAGCCGACCCGTTAGCCCAGTTGAGTCTACCACCGGGTTTTCG
GTTTTACCCGACCGACGAAGAGCTTATGGTTCAATATCTCTGCAGAAAAGCAGCCGGTTA
TGATTTTTCTCTCCAGCTTATCGCTGAAATCGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGTCTT
ACCAAATAAGGCACTATTCGGAGAAAAGGAATGGTATTTTTTTAGTCCTAGGGACAGAAA
GTACCCAAACGGATCAAGACCGAACCGGGTAGCCGGGTCGGGTTATTGGAAAGCTACGGG
TACGGATAAGATTATCTCGACAGAAGGAAAGAGAGTTGGTATCAAGAAGGCTTTGGTGTT
TTACATCGGTAAAGCACCTAAAGGCACTAAAACAAATTGGATCATGCATGAGTATCGTCT
CCTTGAACCCTCTCGTAGAGACGGAAGCTCTAAGTTAGATGATTGGGTTCTATGTAGAAT
ATACAAGAAGCAATCAAGCGCACAAAAACAAGCATACGAAAATGTAATCACGAGTACTAG
AGAACTTAGCAACAATGGTACTTCATCAACGACGTCATCTTCTTCTCACTTTGAAGACGT
TCTTGATTCATTACATCATGAGACCGACAACAGGAATTTCCAGTATGCTAATCCAAACCA
GTTCTCTTCACTTAGACCAGACCTAACCGGAGATAAAACCGGGATCAACGGTTTATCGGA
TACGTCGAGCTTCGATTGGGGAAGTTTTGTAGGCAATGTTGAACATAACTCAGGTCCAGA
ACCTGGACTGAGTCATGTTGTTCCTAGTATTGAGTTTAATTCTGGCTACCTGAAGATGGA
GGAAGAGTTTAACAACCCGGACGACTTTGGTTTTGCTCAAAATGGGTATGGTATTGACTC
GGTCGGGTTTGGTTATCCGGGGCAAGTTGGTGGGTTTGGTTTTATATGATGATGCAGTTC
TGACGCAATAAAGAGAGGACATTTGAGTTTTTATTTTTGTTGTCATGTAGGAAACGTTAT
CTATTTGGATTCCAATTCTTTCGGGTTTAGAGGCAAGCTTGTAGATCTGTAGGTGTACAT
TTGTATTCTATAACCTTTATATTTGTAAATATTTTGTATGCGTATATATATTTAGACAAT
GAATTTGCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK20TF U 1
AF RR4CK20JQ C 385
BS 1 731 RR4CK20TF
BS 732 732 RR4CK20JQ
BS 733 747 RR4CK20TF
BS 748 748 RR4CK20JQ
BS 749 752 RR4CK20TF
BS 753 753 RR4CK20JQ
BS 754 772 RR4CK20TF
BS 773 1150 RR4CK20JQ

RD RR4CK20TF 783 0 0
AAAAACGGGTATCGAAGAAGCCGACCCGTTAGCCCAGTTGAGTCTACCACCGGGTTTTCG
GTTTTACCCGACCGACGAAGAGCTTATGGTTCAATATCTCTGCAGAAAAGCAGCCGGTTA
TGATTTTTCTCTCCAGCTTATCGCTGAAATCGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGTCTT
ACCAAATAAGGCACTATTCGGAGAAAAGGAATGGTATTTTTTTAGTCCTAGGGACAGAAA
GTACCCAAACGGATCAAGACCGAACCGGGTAGCCGGGTCGGGTTATTGGAAAGCTACGGG
TACGGATAAGATTATCTCGACAGAAGGAAAGAGAGTTGGTATCAAGAAGGCTTTGGTGTT
TTACATCGGTAAAGCACCTAAAGGCACTAAAACAAATTGGATCATGCATGAGTATCGTCT
CCTTGAACCCTCTCGTAGAGACGGAAGCTCTAAGTTAGATGATTGGGTTCTATGTAGAAT
ATACAAGAAGCAATCAAGCGCACAAAAACAAGCATACGAAAATGTAATCACGAGTACTAG
AGAACTTAGCAACAATGGTACTTCATCAACGACGTCATCTTCTTCTCACTTTGAAGACGT
TCTTGATTCATTACATCATGAGACCGACAACAGGAATTTCCAGTATGCTAATCCAAACCA
GTTCTCTTCACTTAGACCAGACCTAACCGGAGATAAAACCGGGATCAACGGTTTATCGGA
TACGTCGAGCT*CGATTGGGGAAGTTT*GTAG*CAATGTTGAACATAACTCA
CGTCAGACCTG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4CK20JQ 766 0 0
CACTAAAACAAATTGGATCATGCATGAGTATCGTCTCCTTGAACCCTCTCGTAGAGACGG
AAGCTCTAAGTTAGATGATTGGGTTCTATGTAGAATATACAAGAAGCAATCAAGCGCACA
AAAACAAGCATACGAAAATGTAATCACGAGTACTAGAGAACTTAGCAACAATGGTACTTC
ATCAACGACGTCATCTTCTTCTCACTTTGAAGACGTTCTTGATTCATTACATCATGAGAC
CGACAACAGGAATTTCCAGTATGCTAATCCAAACCAGTTCTCTTCACTTAGACCAGACCT
AACCGGAGATAAAACCGGGATCAACGGTTTATCGGATACGTCGAGCTTCGATTGGGGAAG
TTTTGTAGGCAATGTTGAACATAACTCAGGTCCAGAACCTGGACTGAGTCATGTTGTTCC
TAGTATTGAGTTTAATTCTGGCTACCTGAAGATGGAGGAAGAGTTTAACAACCCGGACGA
CTTTGGTTTTGCTCAAAATGGGTATGGTATTGACTCGGTCGGGTTTGGTTATCCGGGGCA
AGTTGGTGGGTTTGGTTTTATATGATGATGCAGTTCTGACGCAATAAAGAGAGGACATTT
GAGTTTTTATTTTTGTTGTCATGTAGGAAACGTTATCTATTTGGATTCCAATTCTTTCGG
GTTTAGAGGCAAGCTTGTAGATCTGTAGGTGTACATTTGTATTCTATAACCTTTATATTT
GTAAATATTTTGTATGCGTATATATATTTAGACAATGAATTTGCAT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6381Contig1 743 2 2 U
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CGCCTCAGCTTCAAAACTTGTGTGTATTAAATTATCCAAAGACAGAAAAAAGAAATCAAC
TTTTGGATCTAATGCGATGATAAACCGCCAGTTTATGGATTTAAAAAAGGCTGTTTTTCA
GCGTTCGATGATTTCAAAAGGCATGTTTGTTCATGGAAGGGGGGGTTGCTTTTGTTTCTT
CAAGGGTAGTAGCCAGTGAAAGTGAAGCCTCTTCCAACGATCTCACCTGCACAGTACCAA
GCGAAGCATTCCAGACCGAAAAGTGCTGCGATTCCAGCATCTTCAACCTTCAAATCCGCC
CTATTCTTCCACAAGCCTTTCACGTGATCCACTTCCTTCCGGAACAACTCAGTACGTCCA
GGAATGCTAGCAAGACGAGTGTAGAGAAGCTGCTTAGACAACTCATTGCATTTCTCGACA
GTGGCTGGCTCCTGGATATACTGCTTGTTCTTCTCCAGTAACTGATTGTAGTAAGTCGTG
CCGTGCTTCGACACAAACTTGGATGCTTCACAGGCCTTCGATTTCAGTTGTAGTAACTTT
GACGCCATCTCTAGATAGACAACTCTTCCTTATGTCGACGGCGGCGGAGATTCTGTTCTA
CTGGTGTGTCACCGTTAACGAAGAAACGAGAGCGATGCAGCTGTATCAAACAGAATCTCT
AGACTTGCGAGTTTTTTCTTTCC


BQ
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AF RR4FK04TF C 1
AF RR4FK04JQ U 10
BS 1 9 RR4FK04TF
BS 10 743 RR4FK04JQ

RD RR4FK04TF 743 0 0
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CGCCTCAGCTTCAAAACTTGTGTGTATTAAATTATCCAAAGACAGAAAAAAGAAATCAAC
TTTTGGATCTAATGCGATGATAAACCGCCAGTTTATGGATTTAAAAAAGGCTGTTTTTCA
GCGTTCGATGATTTCAAAAGGCATGTTTGTTCATGGAAGGGGGGGTTGCTTTTGTTTCTT
CAAGGGTAGTAGCCAGTGAAAGTGAAGCCTCTTCCAACGATCTCACCTGCACAGTACCAA
GCGAAGCATTCCAGACCGAAAAGTGCTGCGATTCCAGCATCTTCAACCTTCAAATCCGCC
CTATTCTTCCACAAGCCTTTCACGTGATCCACTTCCTTCCGGAACAACTCAGTACGTCCA
GGAATGCTAGCAAGACGAGTGTAGAGAAGCTGCTTAGACAACTCATTGCATTTCTCGACA
GTGGCTGGCTCCTGGATATACTGCTTGTTCTTCTCCAGTAACTGATTGTAGTAAGTCGTG
CCGTGCTTCGACACAAACTTGGATGCTTCACAGGCCTTCGATTTCAGTTGTAGTAACTTT
GACGCCATCTCTAGATAGACAACTCTTCCTTATGTCGACGGCGGCGGAGATTCTGTTCTA
CTGGTGTGTCACCGTTAACGAAGAAACGAGAGCGATGCAGCTGTATCAAACAGAATCTCT
AGACTTGCGAGTTTTTTCTTTCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4FK04JQ 734 0 0
AGAGCAAACATGTTGTCCTTTGATATTATTAAGAGCTAGCATGAGTGATGACGCCTCAGC
TTCAAAACTTGTGTGTATTAAATTATCCAAAGACAGAAAAAAGAAATCAACTTTTGGATC
TAATGCGATGATAAACCGCCAGTTTATGGATTTAAAAAAGGCTGTTTTTCAGCGTTCGAT
GATTTCAAAAGGCATGTTTGTTCATGGAAGGGGGGGTTGCTTTTGTTTCTTCAAGGGTAG
TAGCCAGTGAAAGTGAAGCCTCTTCCAACGATCTCACCTGCACAGTACCAAGCGAAGCAT
TCCAGACCGAAAAGTGCTGCGATTCCAGCATCTTCAACCTTCAAATCCGCCCTATTCTTC
CACAAGCCTTTCACGTGATCCACTTCCTTCCGGAACAACTCAGTACGTCCAGGAATGCTA
GCAAGACGAGTGTAGAGAAGCTGCTTAGACAACTCATTGCATTTCTCGACAGTGGCTGGC
TCCTGGATATACTGCTTGTTCTTCTCCAGTAACTGATTGTAGTAAGTCGTGCCGTGCTTC
GACACAAACTTGGATGCTTCACAGGCCTTCGATTTCAGTTGTAGTAACTTTGACGCCATC
TCTAGATAGACAACTCTTCCTTATGTCGACGGCGGCGGAGATTCTGTTCTACTGGTGTGT
CACCGTTAACGAAGAAACGAGAGCGATGCAGCTGTATCAAACAGAATCTCTAGACTTGCG
AGTTTTTTCTTTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6382Contig1 441 2 2 U
GGGAAACACCGTTTCGCAGGTGTTGACATGAGGATCCGCGTCAAGGGAGGTGGTCACACT
TCTCAGGTCTACGCCATCCGTCAGAGTATCGCCAAGGCGCTCGTTGCGTTTTACCAGAAG
TATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTGAAGGATATTCTGATTCGTTACGATAGGACT
CTGCTTGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGCCGTGGTGCTCGT
TCTCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAAACATTTCTGGTTTTGGTTTGTTTCGATCGTTG
CAAGGTTTGTTTTTGTTTGGGAGTGATGAGTATGATGGAGTTGTGAGACTCTTTAGATTA
TATCATTTTCAGTTATTATGCTTTATTTGGATTATGTTTGACGATGTTTACCTCTTTGCT
ATCAGAAAAGTTTTAATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BC05JQ C 1
AF RR4BC05TF U 55
BS 1 54 RR4BC05JQ
BS 55 441 RR4BC05TF

RD RR4BC05JQ 441 0 0
GGGAAACACCGTTTCGCAGGTGTTGACATGAGGATCCGCGTCAAGGGAGGTGGTCACACT
TTTCAGGTTTACGCCATCCGTCAGAGTATCGCCAAGGCGCTCGTTGCGTTTTACCAGAAG
TATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTGAAGGATATTTTGATTCGTTACGATAGGACT
CTGCTTGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGCCGTGGTGCTCGT
TCTCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAAACATTTCTGGTTTTGGTTTGTTTCGATCGTTG
CAAGGTTTGTTTTTGTTTGGGAGTGATGAGTATGATGGAGTTGTGAGACTCTTTAGATTA
TATCATTTTCAGTTATTATGCTTTATTTGGATTATGTTTGACGATGTTTACCTCTTTGCT
ATCAGAAAAGTTTTAATATTT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR4BC05TF 387 0 0
CACACTTCTCAGGTCTACGCCATCCGTCAGAGTATCGCCAAGGCGCTCGTTGCGTTTTAC
CAGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTGAAGGATATTCTGATTCGTTACGAT
AGGACTCTGCTTGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGCCGTGGT
GCTCGTTCTCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAAACATTTCTGGTTTTGGTTTGTTTCGA
TCGTTGCAAGGTTTGTTTTTGTTTGGGAGTGATGAGTATGATGGAGTTGTGAGACTCTTT
AGATTATATCATTTTCAGTTATTATGCTTTATTTGGATTATGTTTGACGATGTTTACCTC
TTTGCTATCAGAAAAGTTTTAATATTT

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

CO CL6383Contig1 809 2 4 U
GGGAGGCTATTAATCTCCTTCACATCTCTTCCTTCTTCCTCCCTCCTCAACAAAAATAAA
TAAATCCTTTCTTTTCCCAGAAATCTAAATCTCCACTCCTTCAAAAAAGGTTTCAACTTT
GTACATCTCCTCTGTATTTAACCTTCTGGGTAACATCATTTTCGATCAAAATCAACTGGG
TTTCGATCAAATTTAGTTTTTATTTATTTTTTAAATAATCCCTACTCGTTCGTCTCTGCT
CACTATTCTCGTCAAAGTTCTCTCCTTTAAGCTCGAGACCATCATCAAACACGAAGGATG
ACGATTGAAGATGTTACTCCGATTCAGAAGAGAAACTCTTCTTCTGCTTCTTCCTCCTCA
GACGACGTTGCTGCTCCGTTGCTGCCTAAATCTAAAGGAGACGAAGTAGCTGCTTACGAT
GAGTTCAACGGAGCTTCGTTCAGTGGCGCGGTTTTCAACCTCGCCACGACTATAATCGGT
GCTGGCATCATGGCCTTGCCAGCTACGATGAAGATCTTGGGGCTCGTGCTCGGGATCGCT
ATGATAGTTGTCATGGCTTTCTTGACCGATGCTTCGATTGAGTTCTTGCTTAGGTTTAGT
AAGATTAAGAGAAGCAGGTCTTACGGTGGGCTGATGGGTGATTCCTTTGGGAGACCTGGG
AGGGTTTTGCTTCAGTTGCTGTGTTGGTTAACAACATTGGTGTTTTGATTGTTTACATGA
TCATCATTGGTGATGTGTTGGCTGGGAAGACAGAAGATGGGACTCACCATTATGGTGTTC
TTGAAGTTGGTTCGGTCACCATTGTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ78TF U 1
AF RR4DP29TF U 76
BS 1 389 RR4FZ78TF
BS 390 390 RR4DP29TF
BS 391 440 RR4FZ78TF
BS 441 809 RR4DP29TF

RD RR4FZ78TF 440 0 0
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TAAATCCTTTCTTTTCCCAGAAATCTAAATCTCCACTCCTTCAAAAAAGGTTTCAACTTT
GTACATCTCCTCTGTATTTAACCTTCTGGGTAACATCATTTTCGATCAAAATCAACTGGG
TTTCGATCAAATTTAGTTTTTATTTATTTTTTAAATAATCCCTACTCGTTCGTCTCTGCT
CACTATTCTCGTCAAAGTTCTCTCCTTTAAGCTCGAGACCATCATCAAACACGAAGGATG
ACGATTGAAGATGTTACTCCGATTCAGAAGAGAAACTCTTCTTCTGCTTCTTCCTCCTCA
GACGACGTTGCTGCTCCGTTGCTGCCTAA*TCTAAAGGAGACGAAGTAGCTGCTTACGAT
GAGTTCAACGGAGCTTCGTT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR4DP29TF 734 0 0
GGG
AGAAATCTAAATCTCCACTCCTTCAAAAAAGGTTTCAACTTTGTACATCTCCTCTGTATT
TAACCTTCTGGGTAACATCATTTTCGATCAAAATCAACTGGGTTTCGATCAAATTTAGTT
TTTATTTATTTTTTAAATAATCCCTACTCGTTCGTCTCTGCTCACTATTCTCGTCAAAGT
TCTCTCCTTTAAGCTCGAGACCATCATCAAACACGAAGGATGACGATTGAAGATGTTACT
CCGATTCAGAAGAGAAACTCTTCTTCTGCTTCTTCCTCCTCAGACGACGTTGCTGCTCCG
TTGCTGCCTAAATCTAAAGGAGACGAAGTAGCTGCTTACGATGAGTTCAACGGAGCTTCG
TTCAGTGGCGCGGTTTTCAACCTCGCCACGACTATAATCGGTGCTGGCATCATGGCCTTG
CCAGCTACGATGAAGATCTTGGGGCTCGTGCTCGGGATCGCTATGATAGTTGTCATGGCT
TTCTTGACCGATGCTTCGATTGAGTTCTTGCTTAGGTTTAGTAAGATTAAGAGAAGCAGG
TCTTACGGTGGGCTGATGGGTGATTCCTTTGGGAGACCTGGGAGGGTTTTGCTTCAGTTG
CTGTGTTGGTTAACAACATTGGTGTTTTGATTGTTTACATGATCATCATTGGTGATGTGT
TGGCTGGGAAGACAGAAGATGGGACTCACCATTATGGTGTTCTTGAAGTTGGTTCGGTCA
CCATTGTGGAA

QA 4 734 4 734
DS 



AS 1 2

CO CL6384Contig1 357 2 1 U
GGCCTCGCGTACGCAGCCGCAAATCGGACGACTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTCA
TGATCAAGAAGAAGCTCGCGAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATTC
GTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCGAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACCA
AGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGAGTGTTCTTTTCTTTTGGGATTAGTCTC
AAGTTTTCTGATTCTAAGTGATATGACTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTTTAGCACTC
TTTTGAGTGATGTTACCAAATATCCTATGGCAAGAGTTACTTCATGTCATTTGTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F419JQ C 1
AF RR4F419TF U 1
BS 1 357 RR4F419TF

RD RR4F419JQ 357 0 0
GGCCTCGCGTACGCAGCCGCAAATCGGACGACTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTCA
TGATCAAGAAGAAGCTCGCGAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATTC
GTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCGAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACCA
AGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGAGTGTTCTTTTCTTTTGGGATTAGTCTC
AAGTTTTCTGATTCTAAGTGATATGACTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTTTAGCACTC
TTTTGAGTGATGTTACCAAATATCCTATGGCAAGAGTTACTTCATGTCATTTGTTTG

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR4F419TF 357 0 0
GGCCTCGCGTACGCAGCCGCAAATCGGACGACTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTCA
TGATCAAGAAGAAGCTCGCGAAGAAGATGAGACAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATTC
GTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCGAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACCA
AGCTCGGATTCTAGATGAATGCGATAATCAAGAGTGTTCTTTTCTTTTGGGATTAGTCTC
AAGTTTTCTGATTCTAAGTGATATGACTTTTGTCAGATTTATGTAAGACTTTTAGCACTC
TTTTGAGTGATGTTACCAAATATCCTATGGCAAGAGTTACTTCATGTCATTTGTTTG

QA 1 357 1 357
DS 



AS 1 2

CO CL6385Contig1 984 2 8 U
TTTTTTTTCTGGAGACAAAAAAAAAAAGTGAAAGAAAGAGAGAAGCGGAAGAAACAATGT
ACAAGAGATCACCACTAACGTTGCTCACCCTCCTGTCTCTGTTATTGGGATTCCTCAATC
TCACCAACGCTCTTTACGGATCCTCGTCACCTGTGGTTCAGCTCACTGCTTCTAACTTCA
AATCCAAGGTACTTAATTCAAATGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCATGGTGTG
GTCATTGCAAAGCTCTCACACCAACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTCTGAAAGGTGTTG
CTACTGTGGCAGCTATTGATGCAGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATTGGTATT
CAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAAGCCTCCTGTTGATTACCAAGGA
GCTAGAGATGCTAAATCCATTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATTAAAGCTCTTCTGAGT
GACCGTTTGGAAGGAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATCTAATGAAAAGAAATCTGAGCCT
AGTGCATCTGTGGAACTAAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCACCAAAAGCAATGAC
CTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCCCCAGAG
TGGAAAAGGGCTGCAAAGAACTTGAAGGGGAAGGTGAAATTAGGTCATGTCAATTGCGAT
GTTGAGCAGTCGATTATGAGCAGATTCAAGGTGCAAGGATTCCCTACCATTATGGTATTT
GGTGTAGACAAAAGCAGCCCATATGCTTATGATGGTGCTAGATCTGCGTCAGCTATAGAA
TCTTTTGCTACTGAACTTGTGGAGTCTAGTGCTGGGCCTGTTGAAGTAACTGAACTTACC
GGACCGGATGTCATGGAAAAGAAGTGTGGTTCTGCTGCTATTTGCTTCGTCTCTTTCCTA
CCAGACATTCTCGACTCCAAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4H503TF U 1
AF RR4EY13TF U 290
BS 1 481 RR4H503TF
BS 482 482 RR4EY13TF
BS 483 543 RR4H503TF
BS 544 544 RR4EY13TF
BS 545 646 RR4H503TF
BS 647 647 RR4EY13TF
BS 648 669 RR4H503TF
BS 670 984 RR4EY13TF

RD RR4H503TF 677 0 0
TTTTTTTTCTGGAGACAAAAAAAAAAAGTGAAAGAAAGAGAGAAGCGGAAGAAACAATGT
ACAAGAGATCACCACTAACGTTGCTCACCCTCCTGTCTCTGTTATTGGGATTCCTCAATC
TCACCAACGCTCTTTACGGATCCTCGTCACCTGTGGTTCAGCTCACTGCTTCTAACTTCA
AATCCAAGGTACTTAATTCAAATGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCATGGTGTG
GTCATTGCAAAGCTCTCACACCAACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTCTGAAAGGTGTTG
CTACTGTGGCAGCTATTGATGCAGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATTGGTATT
CAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAAGCCTCCTGTTGATTACCAAGGA
GCTAGAGATGCTAAATCCATTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATTAAAGCTCTTCTGAGT
GGCCGTTTGGAAGGAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATCTAATGAAAAGAAATCTGAGCCT
AGTTCATCTGTGGAACTAAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCACCAAAAGCAATGAC
CTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAA*GCTTGCCCCAGAG
TGGAAAAGG
CTGCAAGA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4EY13TF 695 0 0
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TTAT*GGTATTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAAGCCTCCTGTTG
ATTACCAAGGAGCTAGAGATGCTAAATCCGTTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATTAAAG
CTCTTCTGAGTGACCGTTTGGAAGGAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATCTAATGAAAAGA
AATCTGAGCCTAGTGCATCTGTGGAACTAGACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCACCA
AAAGCAATGACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAAAGC
TTGCCCCAGAGTGGAAAAGGGCTGCAAAGAACTTGAAGGGGAAGGTGAAATTAGGTCATG
TCAATTGCGATGTTGAGCAGTCGATTATGAGCAGATTCAAGGTGCAAGGATTCCCTACCA
TTATGGTATTTGGTGTAGACAAAAGCAGCCCATATGCTTATGATGGTGCTAGATCTGCGT
CAGCTATAGAATCTTTTGCTACTGAACTTGTGGAGTCTAGTGCTGGGCCTGTTGAAGTAA
CTGAACTTACCGGACCGGATGTCATGGAAAAGAAGTGTGGTTCTGCTGCTATTTGCTTCG
TCTCTTTCCTACCAGACATTCTCGACTCCAAAGCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6387Contig1 1109 2 8 U
GCTCATAGAGACAATCATGACCATCAGATACCGCTGCTGGAAGGATCAAATCCAGTTAAC
CAGAAACCATACCGATATGCCCTATATCAGAAAACGGAGATTGATAAGATGGTGCAGAAC
TTATTAGATGCAGGCACTATTCAGACGAGTTCTAGTCCTTATGCTTCTCCTGTGGTGCTG
GTTAAGAAAAAAGATAACTCTTGGAGATTGTGCGTGGATTATAGGAATCTTAATAGCATG
ACTATCAAAGATCGTTTTCCGATTCCACTGATTGAAGATTTGATGGATGAGTTGGGTGGA
TCAGTCATATACTCTAAGATTGATCTTCGCGCAGGCTATCATCAAGTGAGAATGCATCCA
TCTGACATTCACAAGACTGCTTTTAAGACTCACAGTGGCCACTATGAATACTTGGTGATG
CCCTTTGGATTAACAAACGCACCTGCAACCTTTCAGAGCTTGATGAACTCTGTTTTTAAG
GCATTCTTGAGGAAGTTTGTTCTTATCTTCTTCGATGACATACTCATCTACAGCAGGTCT
GTTGAGGAACATAAACATCATCTGGAGCAAGTGTTTGAGTTGATGAGACAACACAAATTG
TTTGCGAAAAGGAGTAAGTGCGAGTTCGCAACTAAGAGAGTGGAGTATTTGGGGCATTTC
ATTGAAGCTCGAGGAGTGTCAACTGATCCTAATGAGGTCAAGGCAGTGAAGGAATGGCCT
CAACCAGCGACCTAAAACAACTTCATGAGCTGCTGGATATACCGCAAGGAGATAGAAGAA
AGTATCATGATGATTGCACTGTATTAGTGATAGCACTTGGAGGAAGTAGGATCTGGAAGT
CATCAGGGAAGTATCTTTGAGACCATAAAAACTACAAGTTGAGGAAGCAGAGAAACTCAA
ATACATAAAAAAGAAAAAAGAAGGTGGCAAAAACTTTGTTTAATTTTGGTCTGCTTTTTG
TTTCCTTGTGTTTATTTTTATATGAATGTTTTTTGTCAGATTAGGAGGGTACTTTTGTTT
CTTTGTCGAGAATAGGGTAGAGATTGGAACAGGGAAGAAGGGTGGGGACCAAAAGGGGTA
GGTAATACATAGAACATTTTCCTCCTGGG


BQ
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AF RR4AM27TF U 1
AF RR4AM27JQ C 525
BS 1 847 RR4AM27TF
BS 848 848 RR4AM27JQ
BS 849 870 RR4AM27TF
BS 871 871 RR4AM27JQ
BS 872 883 RR4AM27TF
BS 884 884 RR4AM27JQ
BS 885 894 RR4AM27TF
BS 895 1109 RR4AM27JQ

RD RR4AM27TF 894 0 0
GCTCATAGAGACAATCATGACCATCAGATACCGCTGCTGGAAGGATCAAATCCAGTTAAC
CAGAAACCATACCGATATGCCCTATATCAGAAAACGGAGATTGATAAGATGGTGCAGAAC
TTATTAGATGCAGGCACTATTCAGACGAGTTCTAGTCCTTATGCTTCTCCTGTGGTGCTG
GTTAAGAAAAAAGATAACTCTTGGAGATTGTGCGTGGATTATAGGAATCTTAATAGCATG
ACTATCAAAGATCGTTTTCCGATTCCACTGATTGAAGATTTGATGGATGAGTTGGGTGGA
TCAGTCATATACTCTAAGATTGATCTTCGCGCAGGCTATCATCAAGTGAGAATGCATCCA
TCTGACATTCACAAGACTGCTTTTAAGACTCACAGTGGCCACTATGAATACTTGGTGATG
CCCTTTGGATTAACAAACGCACCTGCAACCTTTCAGAGCTTGATGAACTCTGTTTTTAAG
GCATTCTTGAGGAAGTTTGTTCTTATCTTCTTCGATGACATACTCATCTACAGCAGGTCT
GTTGAGGAACATAAACATCATCTGGAGCAAGTGTTTGAGTTGATGAGACAACACAAATTG
TTTGCGAAAAGGAGTAAGTGCGAGTTCGCAACTAAGAGAGTGGAGTATTTGGGGCATTTC
ATTGAAGCTCGAGGAGTGTCAACTGATCCTAATGAGGTCAAGGCAGTGAAGGAATGGCCT
CAACCAGCGACCTAAAACAACTTCATGAGCTGCTGGATATACCGCAAGGAGATAGAAGAA
AGTATCATGATGATTGCACTGTATTAGTGATAGCACTTGGAGGAAGTAGGATCTGGAAGT
CATCAGG*AAGTATCTTTGAGACCATAAAA*CTACAAGTTGAG*AAGCAGAGAA

QA 1 894 1 894
DS 

RD RR4AM27JQ 585 0 0
CATCTACAGCAGGTCTGTTGAGGAACATAAACATCATCTGGAGCAAGTGTTTGAGTTGAT
GAGACAACACAAATTGTTTGCGAAAAGGAGTAAGTGCGAGTTCGCAACTAAGAGAGTGGA
GTATTTGGGGCATTTCATTGAAGCTCGAGGAGTGTCAACTGATCCTAATGAGGTCAAGGC
AGTGAAGGAATGGCCTCAACCAGCGACCTAAAACAACTTCATGAGCTGCTGGATATACCG
CAAGGAGATAGAAGAAAGTATCATGATGATTGCACTGTATTAGTGATAGCACTTGGAGGA
AGTAGGATCTGGAAGTCATCAGGGAAGTATCTTTGAGACCATAAAAACTACAAGTTGAGG
AAGCAGAGAAACTCAAATACATAAAAAAGAAAAAAGAAGGTGGCAAAAACTTTGTTTAAT
TTTGGTCTGCTTTTTGTTTCCTTGTGTTTATTTTTATATGAATGTTTTTTGTCAGATTAG
GAGGGTACTTTTGTTTCTTTGTCGAGAATAGGGTAGAGATTGGAACAGGGAAGAAGGGTG
GGGACCAAAAGGGGTAGGTAATACATAGAACATTTTCCTCCTGGG

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6388Contig1 1029 2 10 U
GACCAGAGATATGATATCCAGCAGGCTGCGCGCTGGATCGAGCAGATTCTTCCCTTTTCT
TTGCTCCTCTTGGTCGTCTTTATCCGCCAGCATCTCCAAGGTTTCTTTGTTGCAATCTGG
ATTGCTGCTGTCATGTTCAAGTCGAATGATATTTTGAAGAAGCAAACTGCATTAAAGGGT
GAGAGGCAGATCTCGGCTTTAATCGGGATCTCTGTAGCGTTTGCTGCCCATGTGGTTGGT
GTTTATTGGTGGTTCCGTAAGGATGACCTCTTGTATCCCTTGATCATGTTCCCTCCCAAG
TCCATTCCTCCTTTCTGGCATGCCATTTTCATCATCGTCGTCAATGATACACTAGCACGT
CAGGCCTCGATGATATTAAAGTGTTTTCTCTTGATTTACTACAAGAACAGTAGGGGTCGA
AACTATCGTAAACAGGGTCAATTGCTAACTTTGGTTGAATATATGATGCTTCTGTATCGC
TCTTTGCTGCCTACCCCTGTGTGGTACCGTTTCTTCTTGAACAAGGATTACGGAAGCCTA
TTCTCCTCTCTCATGACAGGACTGTATCTCACTTTCAAGCTTACTTCTGTAGTTGAGAAG
GTTCAATCTTTCTTTACGTCGTTAAAGTCTTTGTCACGTAAAGAAGTGCATTATGGATCA
TATGCAACTACGGAGCAGGTGAATGCTGCGGGCGACCTGTGTGCTATTTGCCAGGAGAAG
ATGCACACCCCAGTTCTTCTTCGCTGCAAGCACATGTTCTGCGAAGATTGCGTTTCAGAA
TGGTTTGAGAGAGAGAGGACTTGTCCTCTGTGCAGGGCCTTGGTGAAACCAGCGGATTTG
AAATCATGGTGATGGATCCACCAGCCTTTTCTTTCAGATATTTTGATTAAACATGCATAC
AAAAGTACAAATAGTGATTACAACTCCCAAGCCCCTTGATAGAGAGTATTGCCCGTTTAA
GTTGTGCACGAAAGACACCACTGATGATGATGCCTTGAAGATGTGTATACAATGTCATTT
GTTAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW91TF U 1
AF RR4CW91JQ C 282
BS 1 678 RR4CW91TF
BS 679 679 RR4CW91JQ
BS 680 696 RR4CW91TF
BS 697 697 RR4CW91JQ
BS 698 718 RR4CW91TF
BS 719 719 RR4CW91JQ
BS 720 748 RR4CW91TF
BS 749 749 RR4CW91JQ
BS 750 768 RR4CW91TF
BS 769 1029 RR4CW91JQ

RD RR4CW91TF 769 0 0
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TTGCTCCTCTTGGTCGTCTTTATCCGCCAGCATCTCCAAGGTTTCTTTGTTGCAATCTGG
ATTGCTGCTGTCATGTTCAAGTCGAATGATATTTTGAAGAAGCAAACTGCATTAAAGGGT
GAGAGGCAGATCTCGGCTTTAATCGGGATCTCTGTAGCGTTTGCTGCCCATGTGGTTGGT
GTTTATTGGTGGTTCCGTAAGGATGACCTCTTGTATCCCTTGATCATGTTCCCTCCCAAG
TCCATTCCTCCTTTCTGGCATGCCATTTTCATCATCGTCGTCAATGATACACTAGCACGT
CAGGCCTCGATGATATTAAAGTGTTTTCTCTTGATTTACTACAAGAACAGTAGGGGTCGA
AACTATCGTAAACAGGGTCAATTGCTAACTTTGGTTGAATATATGATGCTTCTGTATCGC
TCTTTGCTGCCTACCCCTGTGTGGTACCGTTTCTTCTTGAACAAGGATTACGGAAGCCTA
TTCTCCTCTCTCATGACAGGACTGTATCTCACTTTCAAGCTTACTTCTGTAGTTGAGAAG
GTTCAATCTTTCTTTACGTCGTTAAAGTCTTTGTCACGTAAAGAAGTGCATTATGGATCA
TATGCAACTACGGAGCAG*TGAATGCTGCGGGCGAC*TGTGTGCTATTTGCCAGGAGA*G
ATGCACACCCCAGTTCTTCTTCGCTGCA*GCACATGTTCTGCGAAGAT
G

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4CW91JQ 748 0 0
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CAATGATACACTAGCACGTCAGGCCTCGATGATATTAAAGTGTTTTCTCTTGATTTACTA
CAAGAACAGTAGGGGTCGAAACTATCGTAAACAGGGTCAATTGCTAACTTTGGTTGAATA
TATGATGCTTCTGTATCGCTCTTTGCTGCCTACCCCTGTGTGGTACCGTTTTTTCTTGAA
CAAGGATTACGGAAGCCTATTCTCCTCTCTCATGACAGGACTGTATCTCACTTTCAAGCT
TACTTCTGTAGTTGAGAAGGTTCAATCTTTCTTTACGTCGTTAAAGTCTTTGTCACGTAA
AGAAGTGCATTATGGATCATATGCAACTACGGAGCAGGTGAATGCTGCGGGCGACCTGTG
TGCTATTTGCCAGGAGAAGATGCACACCCCAGTTTTTTTTCGCTGCAAGCACATGTTTTG
CGAAGATTGCGTTTCAGAATGGTTTGAGAGAGAGAGGACTTGTCCTCTGTGCAGGGCCTT
GGTGAAACCAGCGGATTTGAAATCATGGTGATGGATCCACCAGCCTTTTCTTTCAGATAT
TTTGATTAAACATGCATACAAAAGTACAAATAGTGATTACAACTCCCAAGCCCCTTGATA
GAGAGTATTGCCCGTTTAAGTTGTGCACGAAAGACACCACTGATGATGATGCCTTGAAGA
TGTGTATACAATGTCATTTGTTAATATG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6389Contig1 874 2 2 U
GGACACAAACAAGATGGATTGGTTCTCGTGGCTATCAAAAACCGACCTTGACCCGACCAT
AAGCTACGAGTACGGACTCATCTTCGCCCAGAAGAAGCTAAGGAATGAAGACATCGCACT
TTTCAACCACAATTTTCTCAAGCGACATGGCATTAATGTGGCCGAACACCGCCTAGAGAT
TCTAAAGCTCTCCAAGAGAGGAACAAAAACAGTTAGCAACTATCACAGTCGTCCAGCCTC
AGCTAAACTCATCTCTGTCCTCACTAAGGCGACCAAAAGTATTGGCAACCGCTTCAACAA
GTGGCTTTTCCTCGTAGGAACCGCTGTGGTTGAACCGATGAAGGAGAAGCAGTCGCCAGA
ACCTGCCAGCCGTGGAGTAGCGTTTGTGAGTGGAAATAATAAAGCTAACGACGGAAAAGC
TGAGCCCCAAGTGGAGAGATTACCAGTGATAAGGAAAAAGAGGATCGCCAAATCTGGACC
GTTGGATTTAAAACATAGAATGCAAGAGAAAACGACATTTACAGCTAACCGGAGCATGAA
CCTATCTGGACCGCTGGATCAAAGTGTCCAAGAAAGACTCGTATTAGCATACAGAAGCCC
TGTTGTGTCGGGACAGTTGGATGGAAACTTAAACGAACGGCTCAAATTATCAGGGCCGTT
GAATGCAAGACCACCGAGCCCAAGTGTGTATGTGGAGTACAGTAAAAGAGACGATGACAC
AAGATGGGCTGCTCTGTTTCACAACTTGAAGCCCACATAGATCTCAAGTTTTAAGTGGTT
TTTGTTTAGTGTTGGGAAAACGGTATGTAGCCAGGGGTACTCAATTTTGGGGTATCCGTT
GTGCTGAATATACAAACTATTTTCTTATGCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DD82TF U 1
AF RR4DD82JQ C 296
BS 1 650 RR4DD82TF
BS 651 874 RR4DD82JQ

RD RR4DD82TF 650 0 0
GGACACAAACAAGATGGATTGGTTCTCGTGGCTATCAAAAACCGACCTTGACCCGACCAT
AAGCTACGAGTACGGACTCATCTTCGCCCAGAAGAAGCTAAGGAATGAAGACATCGCACT
TTTCAACCACAATTTTCTCAAGCGACATGGCATTAATGTGGCCGAACACCGCCTAGAGAT
TCTAAAGCTCTCCAAGAGAGGAACAAAAACAGTTAGCAACTATCACAGTCGTCCAGCCTC
AGCTAAACTCATCTCTGTCCTCACTAAGGCGACCAAAAGTATTGGCAACCGCTTCAACAA
GTGGCTTTTCCTCGTAGGAACCGCTGTGGTTGAACCGATGAAGGAGAAGCAGTCGCCAGA
ACCTGCCAGCCGTGGAGTAGCGTTTGTGAGTGGAAATAATAAAGCTAACGACGGAAAAGC
TGAGCCCCAAGTGGAGAGATTACCAGTGATAAGGAAAAAGAGGATCGCCAAATCTGGACC
GTTGGATTTAAAACATAGAATGCAAGAGAAAACGACATTTACAGCTAACCGGAGCATGAA
CCTATCTGGACCGCTGGATCAAAGTGTCCAAGAAAGACTCGTATTAGCATACAGAAGCCC
TGTTGTGTCGGGACAGTTGGATGGAAACTTAAACGAACGGCTCAAATTAT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DD82JQ 579 0 0
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CCAGAACCTGCCAGCCGTGGAGTAGCGTTTGTGAGTGGAAATAATAAAGCTAACGACGGA
AAAGCTGAGCCCCAAGTGGAGAGATTACCAGTGATAAGGAAAAAGAGGATCGCCAAATCT
GGACCGTTGGATTTAAAACATAGAATGCAAGAGAAAACGACATTTACAGCTAACCGGAGC
ATGAACCTATCTGGACCGCTGGATCAAAGTGTCCAAGAAAGACTCGTATTAGCATACAGA
AGCCCTGTTGTGTCGGGACAGTTGGATGGAAACTTAAACGAACGGCTCAAATTATCAGGG
CCGTTGAATGCAAGACCACCGAGCCCAAGTGTGTATGTGGAGTACAGTAAAAGAGACGAT
GACACAAGATGGGCTGCTCTGTTTCACAACTTGAAGCCCACATAGATCTCAAGTTTTAAG
TGGTTTTTGTTTAGTGTTGGGAAAACGGTATGTAGCCAGGGGTACTCAATTTTGGGGTAT
CCGTTGTGCTGAATATACAAACTATTTTCTTATGCTCTT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL6390Contig1 703 2 1 U
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TAATCACATATATCCTCATAAACCCTAAACCCTACCTAGTTTCAACAACTCTCTTGTTCC
AAATCCAAGAAAAAGGTTAGTTTCATAAGTAATGGCCAAAGTCGGGAAGCTGACAAAGCT
CAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCGTCCTTCGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTC
CTCAGCTGCCGTCTCCGATGAGCTATCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGG
TCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGACCCGACATCATCTCTCACCCACTCTTCCAAGA
ACTCGTGGATCGGTCTTCTACGTCTGTTGAACAAGATCGTGAGATTGTTGTAGCTTGAAG
TTGTTTTGTTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTCAAGACTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTG
AAGAATTGGCTGAGTTCTATACTTATTGACATCGACCAATTGATTTTTACACATTTGTTT
CAAATAATATATACTTTCGTTGTTCTTATTTTTGTTTGTTCCTGCTGATTTGTAATTCGA
TTCGATGCGGTGTGTGATTCCAACGAGATCACGTAAGCCATGTCATTTTGCTTCTGTTTT
TCTCGAGCAAGTTTATTATATATGATGATGATCATTTACGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FR73TF U 1
AF RR4FR73JQ C 368
BS 1 703 RR4FR73TF

RD RR4FR73TF 703 0 0
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TAATCACATATATCCTCATAAACCCTAAACCCTACCTAGTTTCAACAACTCTCTTGTTCC
AAATCCAAGAAAAAGGTTAGTTTCATAAGTAATGGCCAAAGTCGGGAAGCTGACAAAGCT
CAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCGTCCTTCGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTC
CTCAGCTGCCGTCTCCGATGAGCTATCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGG
TCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGACCCGACATCATCTCTCACCCACTCTTCCAAGA
ACTCGTGGATCGGTCTTCTACGTCTGTTGAACAAGATCGTGAGATTGTTGTAGCTTGAAG
TTGTTTTGTTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTCAAGACTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTG
AAGAATTGGCTGAGTTCTATACTTATTGACATCGACCAATTGATTTTTACACATTTGTTT
CAAATAATATATACTTTCGTTGTTCTTATTTTTGTTTGTTCCTGCTGATTTGTAATTCGA
TTCGATGCGGTGTGTGATTCCAACGAGATCACGTAAGCCATGTCATTTTGCTTCTGTTTT
TCTCGAGCAAGTTTATTATATATGATGATGATCATTTACGACC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FR73JQ 336 0 0
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GTTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTCAAGACTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATT
GGCTGAGTTCTATACTTATTGACATCGACCAATTGATTTTTACACATTTGTTTCAAATAA
TATATACTTTCGTTGTTCTTATTTTTGTTTGTTCCTGCTGATTTGTAATTCGATTCGATG
CGGTGTGTGATTCCAACGAGATCACGTAAGCCATGTCATTTTGCTTCTGTTTTTCTCGAG
CAAGTTTATTATATATGATGATGATCATTTACGACC

QA 1 336 1 336
DS 



AS 1 2

CO CL6391Contig1 1204 2 4 U
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GGAGGTTCTGCAACTCCGAGAAGTGGAAGACCCGGAAGTGAAAGACGACGAGGTTCTCAT
CAGAGTTCACGCCACTGCTCTGAATCGCGCAGATACACTCCAGAGACTGGGCTCTTACTC
TCCACCACCTGGCTCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGTAGCATCGAATCCCT
CGGAAACTCCCTCTTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCAGGTGTGTGCTCTTCTTTCTGG
AGGAGGTTATGCTGAGAAGGTTGCTGTACCCGTTGGACAAATCCTTCCAGTCCCTGCTGG
TATCTGTCTGAAAGATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACTGTTTGGTCTACTGT
CTTCATGATGGGCCGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCATGGAGGTTCAAGTGG
GATTGGGACATTTGCAATTCAGATGGCTAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTTGTCACGGC
AGGAAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGATGTTTGTATAAATTA
CAAAACCGAGGACTTTGTTGCAAAGGTGAAAGCTGAAACAGATGGGAAAGGTGTGGATGT
TATCTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAAACCTCGACAGCTTAAACTTCGA
TGGAAGGTTATGTATCATCGGTTTAATGGGAGGAGCTAATGCAGAGATAAAACTAAGTAG
TCTGCTCCCGAAGCGTCTCACTGTCTTAGGAGCTGCGTTAAGACCAAGAAGCAAGGAGAA
CAAAGCGATTGTTGTAGCGGAATTGGAGAAGATTGTTTGGCCAGCGATAGAAGCAGGGAA
GGTAAAACCGGTGATTTACAAGTACTTACCATTGTCGCAAGCAGCAGAAGCTCATAGTCT
TATGGAGAGTAGTAGCCATATTGGTAAGATTCTGCTTGTGACTTGATTCTCTTGCAAAGG
GAGAAAGAAAATGTTCAGGAGACACGAATCATGGTGGGAAAATAATAAAATTTGGTGGAT
TGTGTTCATAGATGTATTAAGAGGTCTGTTTGTTCACTGGCTTTTATGTAATCTCTATGT
TTGGGACTATGTAACTATGGAATATCAATAAGCTGTCAACACTAAAGTATTATGTTTACT
TCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4BV50TF U 1
AF RR4BV50JQ C 358
BS 1 698 RR4BV50TF
BS 699 699 RR4BV50JQ
BS 700 726 RR4BV50TF
BS 727 1204 RR4BV50JQ

RD RR4BV50TF 734 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGAAGGCGATCGTGATCACGGAGCCAGGAGCGCC
GGAGGTTCTGCAACTCCGAGAAGTGGAAGACCCGGAAGTGAAAGACGACGAGGTTCTCAT
CAGAGTTCACGCCACTGCTCTGAATCGCGCAGATACACTCCAGAGACTGGGCTCTTACTC
TCCACCACCTGGCTCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGTAGCATCGAATCCCT
CGGAAACTCCCTCTTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCAGGTGTGTGCTCTTCTTTCTGG
AGGAGGTTATGCTGAGAAGGTTGCTGTACCCGTTGGACAAATCCTTCCAGTCCCTGCTGG
TATCTGTCTGAAAGATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACTGTTTGGTCTACTGT
CTTCATGATGGGCCGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCATGGAGGTTCAAGTGG
GATTGGGACATTTGCAATTCAGATGGCTAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTTGTCACGGC
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CAAAACCGAGGACTTTGTTGCAAAGGTGAAAGCTGAAACAGATGGGAAAGGTGTGGATGT
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TGGAAG
TATGTATC

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DS 

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TGGGATTGGGACATTTGCAATTCAGATGGCTAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTTGTCAC
GGCAGGAAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGATGTTTGTATAAA
TTACAAAACCGAGGACTTTGTTGCAAAGGTGAAAGCTGAAACAGATGGGAAAGGTGTGGA
TGTTATCTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAAACCTCGACAGCTTAAACTT
CGATGGAAGGTTATGTATCATCGGTTTAATGGGAGGAGCTAATGCAGAGATAAAACTAAG
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GAAGGTAAAACCGGTGATTTACAAGTACTTACCATTGTCGCAAGCAGCAGAAGCTCATAG
TCTTATGGAGAGTAGTAGCCATATTGGTAAGATTCTGCTTGTGACTTGATTCTCTTGCAA
AGGGAGAAAGAAAATGTTCAGGAGACACGAATCATGGTGGGAAAATAATAAAATTTGGTG
GATTGTGTTCATAGATGTATTAAGAGGTCTGTTTGTTCACTGGCTTTTATGTAATCTCTA
TGTTTGGGACTATGTAACTATGGAATATCAATAAGCTGTCAACACTAAAGTATTATGTTT
ACTTCTT

QA 1 847 1 847
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTGGAGGTTTGGTGGATGTGGTTAATGGGACAAGGAGTAAGCCAAGTACACCATCTTGTT
TGCAAACTAATGGGACAAGAAGTAACTCAGGTACACCATCTTGTTCGCAAAATAATGGGA
CAAGAAGTAAATCAAGTACACCAACTTGTTCGCAAAACAATAGTCCGGATAGGGTCATCC
GCCAAAAGGGTCCACGTATAGCAAAAGTTGTGAGGAGAGTCAAATGCAAAGTAGAGCCTT
TAAGCTATGGATGTGTGCTCTCTGGAAAATCATGGTGCAACCGCCAAGCAATTTTTCCAA
AGGTTTTCGTAGCAGGGTTAGGTACATCAATATCGTGGATCCAACAAACATGTGCTTCTA
CAATTCAGAGATTCTGGATACTGGACGTAATAGTCCCTTGTTCATGGTTTACTTGGAGGC
TAATCCGAGTGAGGTGTTTGCGCACTTGTCGCCAACAAGATGCTGGGAGATGGTAAGAGA
AAGAGTAAACCAAGAGATAAGTAAGCAACACAAAGCCGGTAAATTAGATCTTCCTCCTCT
GCAGCCTTCTGGGAGTCCTGACGGTTTTGAAATGTTTGGATACACGTCACCCGCCATCAT
ACAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTGCACAGAGTATTGGGATTCAAGGCC
TTATTCGAGGCCACAAGTTCAGTTCCCAGCCAACACAAGCATCCAACCATCATCGGATGT
GAGAAATCTCCAGAAAGCTCCCGGTCAATTGCCTGCTGGAACAAACTCTACTCTCAAAGT
TCTGCTGAAGAGAGCTAACGTGGAGGAACTCAGCTCACTGCAACAGGTTTTAAGTCAGTC
TAACATAGATTTGGTAACCGAACTTGTGAAGGAAGAGCTCCAGAATCGTAGCTGATATGA
CTCAAAAAGGAGATTGATTTTAGTTGTGTACATACAGAGTTGATGAGGCTCACTGGCCAC
TGCTCATTCTTTTTGGATACCCTTTCAGAGGAAGGAGGATAGAAACTTGTAACTAGGACC
CCTGTTTCTTCTTCCGTTCTCTTGAAACAACAAGAACAAGGAGAAAGAAAGAAGATGTTT
AGGGTTCTTTGAAACCATTAGTTTTGGTTACTAGTCGGGTTCCCCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AP68TF U 1
AF RR4AP68JQ C 357
BS 1 714 RR4AP68TF
BS 715 1189 RR4AP68JQ

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TAAGCTATGGATGTGTGCTCTCTGGAAAATCATGGTGCAACCGCCAAGCAATTTTTCCAA
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TAATCCGAGTGAGGTGTTTGCGCACTTGTCGCCAACAAGATGCTGGGAGATGGTAAGAGA
AAGAGTAAACCAAGAGATAAGTAAGCAACACAAAGCCGGTAAATTAGATCTTCCTCCTCT
GCAGCCTTCTGGGAGTCCTGACGGTTTTGAAATGTTTGGATACACGTCACCCGCCATCAT
ACAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTGCACAGAGTATTGGGATTC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AP68JQ 833 0 0
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TCTACAATTCAGAGATTCTGGATACTGGACGTAATAGTCCCTTGTTCATGGTTTACTTGG
AGGCTAATCCGAGTGAGGTGTTTGCGCACTTGTCGCCAACAAGATGCTGGGAGATGGTAA
GAGAAAGAGTAAACCAAGAGATAAGTAAGCAACACAAAGCCGGTAAATTAGATCTTCCTC
CTCTGCAGCCTTCTGGGAGTCCTGACGGTTTTGAAATGTTTGGATACACGTCACCCGCCA
TCATACAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTGCACAGAGTATTGGGATTCAA
GGCCTTATTCGAGGCCACAAGTTCAGTTCCCAGCCAACACAAGCATCCAACCATCATCGG
ATGTGAGAAATCTCCAGAAAGCTCCCGGTCAATTGCCTGCTGGAACAAACTCTACTCTCA
AAGTTCTGCTGAAGAGAGCTAACGTGGAGGAACTCAGCTCACTGCAACAGGTTTTAAGTC
AGTCTAACATAGATTTGGTAACCGAACTTGTGAAGGAAGAGCTCCAGAATCGTAGCTGAT
ATGACTCAAAAAGGAGATTGATTTTAGTTGTGTACATACAGAGTTGATGAGGCTCACTGG
CCACTGCTCATTCTTTTTGGATACCCTTTCAGAGGAAGGAGGATAGAAACTTGTAACTAG
GACCCCTGTTTCTTCTTCCGTTCTCTTGAAACAACAAGAACAAGGAGAAAGAAAGAAGAT
GTTTAGGGTTCTTTGAAACCATTAGTTTTGGTTACTAGTCGGGTTCCCCTTTC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

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CAATAATAATCCTTCACAAGAATGGGAAACCCGTTCAACTAAGAACAACAAAAATAAATT
CGTAGCAAATTTACATGATTCCTTGCCCAAAAAACACAATAAGAAGGGAAACAATAAGCA
AATTGTTGGGTAGTTTCATTTTGACGAATTGAGAAAAGAAAGTTTTGAGAAGGTTGTTTT
GTTTTGTCTTTTGTGGTGGGGAGTAGTTAAAGACCAAGCAGGAACCGGAAAACATCACTC
AAAGATATGATACCTTCTACACGTTTGCTCCCTGCTTCCACTATCACCAGCCTCCTTACT
CCTGGATTCGCTAACCGCTCCATCACTTTCACAAGAGAGTCTGAGCGCAAGCACATGTGA
CATCTCTGCCCGTTGAAGATTCCGTAAGGCGGACTTGCATCTTGTCCCAGCCGCAGCGCC
TGGTGAACCGTCATGTCATCAAGATGAATCTGTGCGTATGCCTTGTCTTTAGCCAGGGCT
GTTATGTCACTTCGAGAGTATATGTCAATAAGCGAGTCATTGTCATCCACTACAGGAATT
GAACTAACTCCAGCTTGAACTAATAACGAGAGTGCAGAACCCAAAGAGGCGTGTGGTCTC
AATGTAGCGAGAGGTTTGCTACTTGATTCTCCGATTCTAGGGACCCAAGTACCCAGGGGA
ATTGAACAAATGGGCTGCT


BQ
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AF RR4CC03JQ U 32
AF RR4EQ06JQ U 1
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DS 

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CGTAGCAAATTTACATGATTCCTTGCCCAAAAAACACAATAAGAAGGGAAACAATAAGCA
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GTTTTGTCTTTTGTGGTGGGGAGTAGTTAAAGACCAAGCAGGAACCGGAAAACATCACTC
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ATTGAACAAATGGGCTGCT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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GGACTTGGTGGTCTTGGAGGTCTTGGTGGACTTGGTGGTCTTGGAGGCCTTGGTGGACTC
GGTATGCTTGGAGCGGATTCACCTCTTGGTGCCACTCCAGATGCTTCTCAGTTGAGCCAT
ATATTGCAAAATCCAGCCATGTCCCAGATGATGCAAAGCGTACTTTCTAATCCACAATAC
ATGAACCAGCTTATGAATCTCAACCCACAACTGAGAACCATGCTAGATTCGAATCCTCAG
TTGAGGGAAATGATGCAGAACCCAGATTTCCTTCGCCAGTTTAGCTCCCCGGAGATGATG
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GATCCGGGGCAAACTGGTACTGCTGCAGCAGGGGCAGGCAATAACGCAGGGCTGGATTTA
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GACAGAGCTGAGAACATAAGGGCTTTGCTTGCAACCAATGGAAACGTTAACGCTGCTGTA
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BQ
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AF RR4GY50TF U 1
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ATCGTGAAAGTTGTGGATAAGATTATATTTTGAGCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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TTTTGTCATTTGGTTGCTTGTCATGTGGCAAGGCTTCTTTTGGGTGAGATTCTCTCTTAG
ATTGTAGCGTGTGGACCGAGTTGTGTGTTCTCCTACTTGAGGTTTGAAGTCTCTGGTTCT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E887TF U 1
AF RR4E887JQ C 242
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BS 580 580 RR4E887JQ
BS 581 605 RR4E887TF
BS 606 857 RR4E887JQ

RD RR4E887TF 605 0 0
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TGGTGTTCTTGAGCGTTTGCTCCGGCGTTGGTCTCTCCAGCGTCGGAAGCTTTTTTTTTC
CCCCAAAATTAGTTTTATCTTTGTCCTCTTGTTCTATCAAGATCCATCTTCGATATGTTT
TGGAGCTCTGGAATTTTCTTCGTCGGTGTGTGTTTCCTTGCCGATTATTTGAACATTCTG
GTGTTCCGACGAGTTGGTGTAAGCTTGGTTGAGCACGGGACTCGTTTCTTTTATCTCCGA
TAACTGTATTTTGCGTGCTGTTTTGGATCTTGTTTCTTTGGATTCGTGGGTCTGGTTCGG
TTTGAGCCATGGTAGTAAGTGTGTTGATGGTTGTGGCTTAGCAGTCTCTTGATTAGGGTA
TTTTGTCATTTGGTTGCTTGTCATGTGGCAAGGCTTCTTTTGGGTGAGATTCTCTCTTAG
ATTGTAGCGTGTGGACCGAGTTGTGTGTTCTCCTACTTGAGGTTTGAAGTCTCTGGTTCT
TGGACTTATCGTTTAGCGGGCGAGGCAGCAACGATAAGG*TGGTTTCGGGCAGAATTGGA
AGATT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4E887JQ 616 0 0
TGTTCCGACGAGTTGGTGTAAGCTTGGTTGAGCACGGGACTCGTTTCTTTTATCTCCGAT
AACTGTATTTTGCGTGCTGTTTTGGATCTTGTTTCTTTGGATTCGTGGGTCTGGTTCGGT
TTGAGCCATGGTAGTAAGTGTGTTGATGGTTGTGGCTTAGCAGTCTCTTGATTAGGGTAT
TTTGTCATTTGGTTGCTTGTCATGTGGCAAGGCTTCTTTTGGGTGAGATTCTCTCTTAGA
TTGTAGCGTGTGGACCGAGTTGTGTGTTCTCCTACTTGAGGTTTGAAGTCTCTGGTTCTT
GGACTTATCGTTTAGCGGGCGAGGCAGCAACGATAAGGGTGGTTTCGGGCAGAATTGGAA
GATTCCGGGTGTCGGGCTATAGGCAGCAGCGGTATCTCTCAATCAATGATGTTTTCTCCT
CTCCAAAGACTGCTAGTTTTATAATGTGGCTCTTGCGCATATATTATTCGTTTCTGGTAA
TTTTGACTCCGATGTGGGTTATAGTTGTCCTATATGGGTTTAAGTGGTCGCTTCTTATGG
ACCTTTTTGTTTGTTTTTTTAAGTCGCTCTTGTGTGAGCTCTAATTGCCTTTCCTATAGG
CTCTTGGTTCTGGGAC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6397Contig1 962 2 4 U
GGAGACTTTCAAGACACAAAACAAACAGATAAGAGAATATCTCAGTGTAAGCTTAATCAA
AGAGCAACAATGGTGGACGAGGTGATTCTTCTGGATTACTGGCCGAGTATGCTCGGAGTG
AGGACGAGGATTGCTCTAGAGGAAAAAAACATCAAATTCGATTACAGAGAACAAGATCTG
TGTAATAAAAGTGCCTTGCTCCTCGAGATGAACCCGGTTCATAAGAAAATACCGGTTCTC
ATTCACAATGGTAAACCGGTCTGTGAATCTCTCATCCAGGTCGAGTACATTGACGAGACT
TGGCCAATGGAGTACCCGCTCCTTCCTTCTGATCCTTACCAAAGAGCTTATGCCAGGTTT
TGGGGAGATTTCATCGACAAAATGCTGCCCGGTCTAGGGAAGTTGATGTGGGGAGCGAAA
GGTGTGGAGCAAGAGTCGGGGAAGAAGGAGTTCATAGAGATGCTAAAGACGGTAGAGTTC
GAGCTTGGAGACAGGACTTACTTTGGAGGCGAAACATTTGGTTATGGATATAGCCCTGAT
TGGATTCTACGGCTGGTTCGACGCTTTTGAGAAGTATGGGAACTTTAGCATTGAAGCAGA
GTGCCCTACAATTTTTGCTTGGGCTAAAAGGTGTGTGAAGAGAGACAGTGTGGCTAAGTC
ACTTCCTGATTCAGAGAAGGTTACTGAGCTCATTCCTGAGCTAAAGAAGAAAAAACGGGT
CGAGTAGATCGGTCATTATTCTGCTTTGTTTTTGTTATGTTTCAAGCCATCATAATAATA
CATACCTGCGATGTGGTTTGGGTAGTAAAAGCATGTTTCATCTTTGTTTCATTACGAGAA
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ATCGAGTGTAGACATTTAACATATCCAAGACGGGAAGTTACTAATAATTGTTTTATATTG
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4GT03TF U 1
AF RR4GT03JQ C 333
BS 1 679 RR4GT03TF
BS 680 680 RR4GT03JQ
BS 681 699 RR4GT03TF
BS 700 962 RR4GT03JQ

RD RR4GT03TF 699 0 0
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AGAGCAACAATGGTGGACGAGGTGATTCTTCTGGATTACTGGCCGAGTATGCTCGGAGTG
AGGACGAGGATTGCTCTAGAGGAAAAAAACATCAAATTCGATTACAGAGAACAAGATCTG
TGTAATAAAAGTGCCTTGCTCCTCGAGATGAACCCGGTTCATAAGAAAATACCGGTTCTC
ATTCACAATGGTAAACCGGTCTGTGAATCTCTCATCCAGGTCGAGTACATTGACGAGACT
TGGCCAATGGAGTACCCGCTCCTTCCTTCTGATCCTTACCAAAGAGCTTATGCCAGGTTT
TGGGGAGATTTCATCGACAAAATGCTGCCCGGTCTAGGGAAGTTGATGTGGGGAGCGAAA
GGTGTGGAGCAAGAGTCGGGGAAGAAGGAGTTCATAGAGATGCTAAAGACGGTAGAGTTC
GAGCTTGGAGACAGGACTTACTTTGGAGGCGAAACATTTGGTTATGGATATAGCCCTGAT
TGGATTCTACGGCTGGTTCGACGCTTTTGAGAAGTATGGGAACTTTAGCATTGAAGCAGA
GTGCCCTACAATTTTTGCTTGGGCTAAAAGGTGTGTGAAGAGAGACAGTGTGGCTAAGTC
ACTTCCTGATTCAGAGAAG*TTACTGAGCTCATTCCTGA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4GT03JQ 630 0 0
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TCTAGGGAAGTTGATGTGGGGAGCGAAAGGTGTGGAGCAAGAGTCGGGGAAGAAGGAGTT
CATAGAGATGCTAAAGACGGTAGAGTTCGAGCTTGGAGACAGGACTTACTTTGGAGGCGA
AACATTTGGTTATGGATATAGCCCTGATTGGATTTTACGGCTGGTTCGACGCTTTTGAGA
AGTATGGGAACTTTAGCATTGAAGCAGAGTGCCCTACAATTTTTGCTTGGGCTAAAAGGT
GTGTGAAGAGAGACAGTGTGGCTAAGTCACTTCCTGATTCAGAGAAGGTTACTGAGCTCA
TTCCTGAGCTAAAGAAGAAAAAACGGGTCGAGTAGATCGGTCATTATTCTGCTTTGTTTT
TGTTATGTTTCAAGCCATCATAATAATACATACCTGCGATGTGGTTTGGGTAGTAAAAGC
ATGTTTCATCTTTGTTTCATTACGAGAAATGCTTCAATGGTTTTTAATTTTCTTGATCGG
TGGGGAAAGAAGGGAAGAAGATTCTTTTATCGAGTGTAGACATTTAACATATCCAAGACG
GGAAGTTACTAATAATTGTTTTATATTGGC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6398Contig1 1122 2 4 U
GGAGATAAAGGAAAAAAGACCTAATATCTCTCTCGTCTCCTCCTCAACCCCATTAAAGCG
GCGGATCTGTAACTTCGGCTGATCGGCGCGTGGTGGCTCCGATAGCACCACCGCCGGTCC
TAGTAGGTGTCTTTCGTCTTCTAGTTTAGTTTGTTGTGTCTTGTGCTTTGGTGGTCGCAG
ATCTGATAAAGCGGAGGTTCTGTTGTCAAAGTGATGATCTGGAAACGGGTCTGGTGGTGT
ACGGCGGCGTCTCGTCGCAGTGATTCTGACTGGAGCCGAGCTTGTGTTCCTTTGCTGATT
GAGATGGTCTGGAGGGGCGAAAGGCTCAGTCTCCTGCCTTCGGTTTGTGGTGTTTCTGGG
CTGGTTGGTTGGGTCCGTCACCGGTGAAGGGCTATGGTGTCTGTTCGTCTGAAGCTTCTC
CAGTTTGCGGTCCTCCATAAGCGGTTAGTGTTGTCTGATTTTAGTTCTTGTCTAGGGATG
AGGATGGGATAACTTGTGATGAGCTTGGCTTCTTGGGCGCAACTGATTACGTTTTTGGCG
TTTTGAGAAGCTACAACTCTTACGGTTCTCAAATCCGTATTCTCTTTCCACTATGTGGTT
TCGTTGGATATGGATGAATGATTATGGATTATGCTTTAGCCTTGAAGCTCATTTCAATAA
TTGTGGAGGGTCTCTGCTTTTGTTTGTGACAAGAGTGTCTTCTCCGGTTCTCATATAAAG
TTCCAAATGGTTTTAATTGTGTTACGATATGGCTGGAGCCAATGGAAGTACCGGCTTAAG
GTTGTGCGAGCTTTGAGGTCTCTGCCAAATTAGTTCTTTGGTTCTTGGATAGGAAGCTTC
TTCAAGTCCACAAACAAGATTCCTAGACTTGTTTCTATCCGTAATTTGAAGATTGGTGCA
CTCTTCTCCAATGGTCGCTATCATCAGGACATCCGCTTCGGTTCTCTTAATAAGTTTCTA
GGTTTAAGTTTTAGTATTCCATCTCTTGTTTGGTTTGTATCCTTAATATCTTCTGACTCC
GGAAGGATTGCGATCCTTGCCGGCTTATGGCTTTGGAAGGAATGTGTTCTTTACCGGCTG
ATGTAAAACCTTTCATGTTTTTAAATTAATCCAAAAGATGAC


BQ
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AF RR4GP16TF U 1
AF RR4GP16JQ C 341
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BS 657 657 RR4GP16JQ
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BS 703 1122 RR4GP16JQ

RD RR4GP16TF 702 0 0
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ACGGCGGCGTCTCGTCGCAGTGATTCTGACTGGAGCCGAGCTTGTGTTCCTTTGCTGATT
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CTGGTTGGTTGGGTCCGTCACCGGTGAAGGGCTATGGTGTCTGTTCGTCTGAAGCTTCTC
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AGGATGGGATAACTTGTGATGAGCTTGGCTTCTTGGGCGCAACTGATTACGTTTTTGGCG
TTTTGAGAAGCTACAACTCTTACGGTTCTCAAATCCGTATTCTCTTTCCACTATGTGGTT
TCGTTGGATATGGATGAATGATTATGGATTATGCTTTAGCCTTGAAGCTCATTTCA*TAA
TTGTGGAGGGTCTCTGCTTTTGTTTGTGACAAGAGTGTCTTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4GP16JQ 782 0 0
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AACTGATTACGTTTTTGGCGTTTTGAGAAGCTACAACTCTTACGGTTCTCAAATCCGTAT
TCTCTTTCCACTATGTGGTTTCGTTGGATATGGATGAATGATTATGGATTATGCTTTAGC
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TCTCCGGTTCTCATATAAAGTTCCAAATGGTTTTAATTGTGTTACGATATGGCTGGAGCC
AATGGAAGTACCGGCTTAAGGTTGTGCGAGCTTTGAGGTCTCTGCCAAATTAGTTCTTTG
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GTAATTTGAAGATTGGTGCACTCTTCTCCAATGGTCGCTATCATCAGGACATCCGCTTCG
GTTCTCTTAATAAGTTTCTAGGTTTAAGTTTTAGTATTCCATCTCTTGTTTGGTTTGTAT
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AATGTGTTCTTTACCGGCTGATGTAAAACCTTTCATGTTTTTAAATTAATCCAAAAGATG
AC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL6399Contig1 1199 2 2 U
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AATGTGTTTGAGAATCAAAGCTATTGAAGAGGCTGTAACCGAAAAGCTTGCAGTGCAAGA
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ATATGGGATTAGTAAGAGAGACATTCTGAAGATAGAAGATGATCACAGTCTTGAGGTAAA
GCCACAACACCCTCAGAAAGGTAAATCCATGTCTGAAGAGTCACTGGTCGTGGACAAACT
AGAGGTCTCCGACAGGTTCACGGATCCAAACAAAGAAGTAAACAAGAGGAAAGTTCTCGA
GAGACTTGATTCGGATTTACAGAAGCTCGAATCTTCATATAGCCGTAGAAGATTTGAAAA
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AAGGAGAAAGAGAGAATCGAGCGAAAGCTAAGGTGTCGGATAGTAAAACGAGGACTCTTC
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TTGCGTTTTGTGGGTGTGTGCAGCAACCACCTCCATCTCCTTGATCGTTTTGAAACTTGT
TAAAAGCATAATAATAGTATTCATGTGAATGAAAAGTGAGTGTGAGTTTAATATATGAAT
GACAAACACCTTTCTTAATATATGTTTTGCGTTTGGAAGATTTTAAAATAAATTTGTGC


BQ
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AF RR4A895TF U 1
AF RR4A895JQ C 435
BS 1 788 RR4A895TF
BS 789 1199 RR4A895JQ

RD RR4A895TF 798 0 0
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GGAGGAGAGCATAGAATCTCTTGAAAAAAATATTGACATGCCTCACGCATTCAAGAATGA
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ACTAAAAACAGCTGCCCGCAGAAGTGGAAGTCTGCAGAAACAGAACCATGAAATCTATGC
AGAGGAAAACGAAATGATCACGAAAGATATCTTACTCGACCAGGTTTCTGATTGCTCGTC
ATATGGGATTAGTAAGAGAGACATTCTGAAGATAGAAGATGATCACAGTCTTGAGGTAAA
GCCACAACACCCTCAGAAAGGTAAATCCATGTCTGAAGAGTCACTGGTCGTGGACAAACT
AGAGGTCTCCGACAGGTTCACGGATCCAAACAAAGAAGTAAACAAGAGGAAAGTTCTCGA
GAGACTTGATTCGGATTTACAGAAGCTCGAATCTTCATATAGCCGTAGAAGATTTGAAAA
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AGGGACAGATCAATGAAGCAGAAGAAGCGTTAGAGAAACTTCTAAGCATCAACAGGAAAC
TGGTGACAAAAGTGGTGAGGGGATTTGAGATATCAGATGGAAGCAAGTCATCAATGGATC
TTGATGAG
ATGAGACAGC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4A895JQ 765 0 0
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GGTTCACGGATCCAAACAAAGAAGTAAACAAGAGGAAAGTTCTCGAGAGACTTGATTCGG
ATTTACAGAAGCTCGAATCTTCATATAGCCGTAGAAGATTTGAAAAGCAAAGTGGAGAGA
GAGGAGAGAAGCGAGAAAGGAAAGGAAGACGAGTACGAAACAGTGAAGGGACAGATCAAT
GAAGCAGAAGAAGCGTTAGAGAAACTTCTAAGCATCAACAGGAAACTGGTGACAAAAGTG
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AACAGCAGAAGGAGGCGGATATCAGAACAAGCGAGGAGAGGATCAGAGAAGATTGGGAGG
TTGCAGCTGGAGATACAGAGGTTACAGTTTTTGTTGCTGAAGCTGGAAGGAGAAAGAGAG
AATCGAGCGAAAGCTAAGGTGTCGGATAGTAAAACGAGGACTCTTCTTAAGGACTATATC
TATGGTGGAGTGAGAGGTGAGCGACGGAAGAGGATTAAAAAGCGGTTTGCGTTTTGTGGG
TGTGTGCAGCAACCACCTCCATCTCCTTGATCGTTTTGAAACTTGTTAAAAGCATAATAA
TAGTATTCATGTGAATGAAAAGTGAGTGTGAGTTTAATATATGAATGACAAACACCTTTC
TTAATATATGTTTTGCGTTTGGAAGATTTTAAAATAAATTTGTGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6400Contig1 850 2 4 U
GGGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAACATCATCATCTACTCCTCCTC
CAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCCTTGTCTTAACGCTCCTTTCATCGATCGCCATGG
CCGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCGGAAGCGAAGGTTCACATCGTCTACACAGAGAAAC
CCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCG
AGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGTTACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTG
CTAAGCTCACACCTGCGCAAGTCGAAGAGATATCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTTG
TGCCGAGTCAGACTTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGACCT
AAGTTTGACTTTGTGTAGCGTCTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGAATCC
CAACCTCTCTGCTTTTGAAACAGCCGCTGCAGTTATCGTCAAGGCGGCGGAGATCATTAC
GCGAGCCGGATCCTCTCCATATATATCACACGGGTGAGGAGCATCACCCCGTTCCATGCA
TCCATCTTCTCAATCCAAGATTTTTCATTGAGTGAAGACGAAACGTGAAAAACTGTAAGT
TTCTGATTTTGGGTTCGAAGACGAGGTAGAAGATGAAGATAAACAGTGAATGTGTTTTTA
TACTATTTTATGAAATGGAACAGAATATCTTTCTTTCAAATTTGGCTATTTTATTATTTT
AGTTTGATTCTTGAAAAGAAAGCAAAATCTTGTTTGTTGTTTCATGTTCTATTGATATGA
GTTTTGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C228TF U 1
AF RR4C228JQ C 293
BS 1 651 RR4C228TF
BS 652 652 RR4C228JQ
BS 653 681 RR4C228TF
BS 682 850 RR4C228JQ

RD RR4C228TF 681 0 0
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CAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCCTTGTCTTAACGCTCCTTTCATCGATCGCCATGG
CCGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCGGAAGCGAAGGTTCACATCGTCTACACAGAGAAAC
CCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCG
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TGCCGAGTCAGACTTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGACCT
AAGTTTGACTTTGTGTAGCGTCTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGAATCC
CAACCTCTCTGCTTTTGAAACAGCCGCTGCAGTTATCGTCAAGGCGGCGGAGATCATTAC
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TTCTGATTTTGGGTTCGAAGA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4C228JQ 558 0 0
TTTTTT
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TGTGCCGAGTCAGACTTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGAC
CTAAGTTTGACTTTGTGTAGCGTCTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGAAT
CCCAACCTTTTTGCTTTTGAAACAGCCGCTGCAGTTATCGTCAAGGCGGCGGAGATCATT
ACGCGAGCCGGATCCTCTCCATATATATCACACGGGTGAGGAGCATCACCCCGTTCCATG
CATCCATTTTCTCAATCCAAGATTTTTCATTGAGTGAAGACGAAACGTGAAAAACTGTAA
GTTTTTGATTTTGGGTTCGAAGACGAGGTAGAAGATGAAGATAAACAGTGAATGTGTTTT
TATACTATTTTATGAAATGGAACAGAATATCTTTCTTTCAAATTTGGCTATTTTATTATT
TTAGTTTGATTCTTGAAAAGAAAGCAAAATCTTGTTTGTTGTTTCATGTTCTATTGATAT
GAGTTTTGTATC

QA 7 558 7 558
DS 



AS 1 2

CO CL6401Contig1 789 2 2 U
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TTGGATAAGCATGGGAAGCCTAATGAGAAGACGCCTGTGGAGTGGAGCAGGAACGTGGTT
TTGCCTACCGGTGGTGATGCTATGATTGCTGGTGCTGCTGCGGCTCCTGAGAAGGTTGCA
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GCAAGGAGACAGATGAAGCTGCTTCAGCAGAGAAGAGTGAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGA
AGAAGAAGAAAGGCAAAGACAGCGAAGATGATGAAGAGTAATAGTTAAGATGAGTTTTGT
GTTATAAGTATCTATTCTGGATAAAAGTGAGACAAAAGGCATTTTATGCTTGTATCCAAC
GTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTAGTTTTTTATATTTATGTTTTTCCTTTAATTT
GTAAGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH57TF U 1
AF RR4EH57JQ C 285
BS 1 729 RR4EH57TF
BS 730 789 RR4EH57JQ

RD RR4EH57TF 729 0 0
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TTGGATAAGCATGGGAAGCCTAATGAGAAGACGCCTGTGGAGTGGAGCAGGAACGTGGTT
TTGCCTACCGGTGGTGATGCTATGATTGCTGGTGCTGCTGCGGCTCCTGAGAAGGTTGCA
GCTGTAGTGGAGAAGGTTGAGGCTGACAATGGAGAAGTGAGCAAGCGTAAGCATAAGCGT
GATGATAGCAGTGACAGCCCTGCTCCTGTGTCGACCAAGAAAGCCAAGACCAAAGACGTT
GAAGGAGGTGAGGTTGAGGAGAAGGTGAAGTCTTCCAAGAAGAAGAAGGACAAGGCTGAG
GAGAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCAAGTCTGAGAAAAAGGAGAAGAAGAAAAAGAAG
GACAAGGAGGAGGATAAAGAAGACTAGCAACGCCGAAGTCAGAAAAGAAGAAAAAGAAGA
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GCAAGGAGACAGATGAAGCTGCTTCAGCAGAGAAGAGTGAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGA
AGAAGAAGAAAGGCAAAGACAGCGAAGATGATGAAGAGTAATAGTTAAGATGAGTTTTGT
GTTATAAGTATCTATTCTGGATAAAAGTGAGACAAAAGGCATTTTATGCTTGTATCCAAC
GTCTCACTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4EH57JQ 505 0 0
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GAAGGACAAGGCTGAGGAGAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCAAGTTTGAGAAAAAGGA
GAAGAAGAAAAAGAAGGACAAGGAGGAGGATAAAGAAGACTAGCAACGCCGAAGTCAGAA
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AAGAAGAAAAAGAAGAGCAAGGAGACAGATGAAGCTGTTTCAGCAGAGAAGAGTGAGAAG
AAGAAAAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAAGGCAAAGACAGCGAAGATGATGAAGAGTAATAG
TTAAGATGAGTTTTGTGTTATAAGTATTTATTCTGGATAAAAGTGAGACAAAAGGCATTT
TATGCTTGTATCCAACGTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTAGTTTTTTATATTTAT
GTTTTTCCTTTAATTTGTAAGGTTC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL6402Contig1 835 2 2 U
GCATTCGAGACACTCAGGGTCCAAGCTGGTCAAGATGCTGGTGGTGTAGGAACCGATATG
ATCACCATGAACGCGACTCTTAGAATGTTGTATCGAAACACTGGGACTTTCTTCGGTGTT
CATGTAACTTCAACTCCTGTCGATCTTAGTTTCTCTCAGATGAAAATCGGCTCCGGTTCA
ATTAAGAAGTTTTATCAGTCAAGGAAGAGCGAGAGAACGGTATTGGTACACGTGATCGGA
GAGAAGATTCCTTTATACGGAAGTGGCGCGACATTAATACCGCCAGCGCCTCCAGCTCCG
CTTCCCAAACCTAAAAAGAAGAAGAAAGGAGCTCCGGTTGTTATTCCTGACCCGCCCGCA
CCTCCTGCGCCGGTTCCTATGAGACTCAGTTTCGTTGTTCGATCATGAGCTTACGTGTTG
GGGAGGTTAGTGAAGCCCAAGTTCCTCAAGAAGATCGAGTGTGACATCAACTTCGAACAC
AAGAAGCTCAATAAGCATATACCTATCACCAAGAACTGCACCGTCACTACTGTTTGAAGA
AAGAAAGAATAAAAAACATTTTTAGTGAGGAAAAAAAGATGTCGTATAAGGGTAACGTGA
TTACAGCTCTACGGTCAGTATTTTGGGTTGTCTGGGCAGCGCGTTGAAGATAACGAATGA
AAAACTGTCGGTGGCTTTAGTTTACTTGAGTGGTTGGTTTTGGACCTTTGTGGTTAGTTA
TTTTATTTTATCTGTGAAAAAAATTTAAAATTGTGTGGAGAATTTATTAATTCATTTGTT
TCCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTTACAGAATATATTAATTCATTTTTTTTGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AY69TF U 1
AF RR4AY69JQ C 10
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BS 726 835 RR4AY69JQ

RD RR4AY69TF 725 0 0
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ATTAAGAAGTTTTATCAGTCAAGGAAGAGCGAGAGAACGGTATTGGTACACGTGATCGGA
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CTTCCCAAACCTAAAAAGAAGAAGAAAGGAGCTCCGGTTGTTATTCCTGACCCGCCCGCA
CCTCCTGCGCCGGTTCCTATGAGACTCAGTTTCGTTGTTCGATCATGAGCTTACGTGTTG
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TTACAGCTCTACGGTCAGTATTTTGGGTTGTCTGGGCAGCGCGTTGAAGATAACGAATGA
AAAACTGTCGGTGGCTTTAGTTTACTTGAGTGGTTGGTTTTGGACCTTTGTGGTTAGTTA
TTTTA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4AY69JQ 826 0 0
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AACGCGACTCTTAGAATGTTGTATCGAAACACTGGGACTTTCTTCGGTGTTCATGTAACT
TCAACTCCTGTCGATCTTAGTTTCTCTCAGATGAAAATCGGCTCCGGTTCAATTAAGAAG
TTTTATCAGTCAAGGAAGAGCGAGAGAACGGTATTGGTACACGTGATCGGAGAGAAGATT
CCTTTATACGGAAGTGGCGCGACATTAATACCGCCAGCGCCTCCAGCTCCGCTTCCCAAA
CCTAAAAAGAAGAAGAAAGGAGCTCCGGTTGTTATTCCTGACCCGCCCGCACCTCCTGCG
CCGGTTCCTATGAGACTCAGTTTCGTTGTTCGATCATGAGCTTACGTGTTGGGGAGGTTA
GTGAAGCCCAAGTTCCTCAAGAAGATCGAGTGTGACATCAACTTCGAACACAAGAAGCTC
AATAAGCATATACCTATCACCAAGAACTGCACCGTCACTACTGTTTGAAGAAAGAAAGAA
TAAAAAACATTTTTAGTGAGGAAAAAAAGATGTCGTATAAGGGTAACGTGATTACAGCTC
TACGGTCAGTATTTTGGGTTGTCTGGGCAGCGCGTTGAAGATAACGAATGAAAAACTGTC
GGTGGCTTTAGTTTACTTGAGTGGTTGGTTTTGGACCTTTGTGGTTAGTTATTTTATTTT
ATCTGTGAAAAAAATTTAAAATTGTGTGGAGAATTTATTAATTCATTTGTTTCCTTTTTC
TTTTTCTTTTTGTTTACAGAATATATTAATTCATTTTTTTTGATGC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6403Contig1 1124 2 2 U
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ATCCACAACAATGGCGCCTCTCAAAGTCCCGGCCAACGTTCCTCTTCCCCAAGAAGACGC
CGAGCAACTCCACAAGGCTTTTGCAGGATGGGGTACCAACGAGAAGCTGATCATATCAAT
TCTAGCCCACAGGAACTCTGCACAGCGCACCTTAATCCGCAGCGCTTACGCCGCTACGTA
CAATGAGGATCTTCTCAAGGCCTTAGACAAAGAGCTTTCTAGTGACTTTGAGAGAGTTGT
CATGTTGTGGACTCTTGATCAAGCGGAGAGAGATGCTTTTCCTGCTAAAGAATCAACCAA
AATGTTCACCAAGAACAATTGGGTTCTTGTTGAAATCGCTTGCACTAGGTCTCCTCTTGA
TTTTTTCAAGGTCAAGCAAGCTTACCAAGCACGTTACAAGAATTACTCGAGGAAGATGTT
GCGCAACACACATCTGGTGACCTTCGTAAGCTATTGCTTCCTCTTGTTAGCACTTTTAGG
TACGAAGGAGATGAGGTGAACATGAGGCTTGCAAGATCTGAAGCCAAGTTACTTCACGAG
AAGGTCTCAGAGAAAGCCTTCAGCGATGATGACTTCATCAGAATCTTGACAACAAGAAGC
AAAGCACAGCTCGGTGCAACTCTTAACCAATACAACAATGAGTATGGAAACGCCATTAAC
AAGAACTTGAAGGAAGATTCGGATGACGAATACCTTAAACTACTAAGAGCTGTAGTCACG
TGTTTGACATATCCTGAGAAGCATTTTGAGAAGGTTTTGCGTCTAGCAATTAACAGAATG
GGGACTGACGAGTGGGCACTAACCCGAGTCGTGAGTACACGAACTGAAGTTGACATGGAA
CGTATTAAAGAGGAGTATCAGCGAAGGAACAGCATTCCTTTGCACGATGCCGTCGCTAAA
GACACTTCTGGTGATTATGAGGACATGCTTGTTGCTCTTCTTGGACATGGAGATGTTTAA
AACTGGTTCAGTCCCCATGCTTTCTTTCTTTTTACTGGTTTGTTTTGAATAAAAGAGTTG
TGTAAACTGGTTTCTGCTACTATCTATCTATCTATGTATTTGAG


BQ
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AF RR4BK84TF U 1
AF RR4BK84JQ C 346
BS 1 703 RR4BK84TF
BS 704 1124 RR4BK84JQ

RD RR4BK84TF 703 0 0
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ATCCACAACAATGGCGCCTCTCAAAGTCCCGGCCAACGTTCCTCTTCCCCAAGAAGACGC
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TCTAGCCCACAGGAACTCTGCACAGCGCACCTTAATCCGCAGCGCTTACGCCGCTACGTA
CAATGAGGATCTTCTCAAGGCCTTAGACAAAGAGCTTTCTAGTGACTTTGAGAGAGTTGT
CATGTTGTGGACTCTTGATCAAGCGGAGAGAGATGCTTTTCCTGCTAAAGAATCAACCAA
AATGTTCACCAAGAACAATTGGGTTCTTGTTGAAATCGCTTGCACTAGGTCTCCTCTTGA
TTTTTTCAAGGTCAAGCAAGCTTACCAAGCACGTTACAAGAATTACTCGAGGAAGATGTT
GCGCAACACACATCTGGTGACCTTCGTAAGCTATTGCTTCCTCTTGTTAGCACTTTTAGG
TACGAAGGAGATGAGGTGAACATGAGGCTTGCAAGATCTGAAGCCAAGTTACTTCACGAG
AAGGTCTCAGAGAAAGCCTTCAGCGATGATGACTTCATCAGAATCTTGACAACAAGAAGC
AAAGCACAGCTCGGTGCAACTCTTAACCAATACAACAATGAGT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4BK84JQ 779 0 0
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CTCGAGGAAGATGTTGCGCAACACACATCTGGTGACCTTCGTAAGCTATTGCTTCCTCTT
GTTAGCACTTTTAGGTACGAAGGAGATGAGGTGAACATGAGGCTTGCAAGATCTGAAGCC
AAGTTACTTCACGAGAAGGTCTCAGAGAAAGCCTTCAGCGATGATGACTTCATCAGAATC
TTGACAACAAGAAGCAAAGCACAGCTCGGTGCAACTCTTAACCAATACAACAATGAGTAT
GGAAACGCCATTAACAAGAACTTGAAGGAAGATTCGGATGACGAATACCTTAAACTACTA
AGAGCTGTAGTCACGTGTTTGACATATCCTGAGAAGCATTTTGAGAAGGTTTTGCGTCTA
GCAATTAACAGAATGGGGACTGACGAGTGGGCACTAACCCGAGTCGTGAGTACACGAACT
GAAGTTGACATGGAACGTATTAAAGAGGAGTATCAGCGAAGGAACAGCATTCCTTTGCAC
GATGCCGTCGCTAAAGACACTTCTGGTGATTATGAGGACATGCTTGTTGCTCTTCTTGGA
CATGGAGATGTTTAAAACTGGTTCAGTCCCCATGCTTTCTTTCTTTTTACTGGTTTGTTT
TGAATAAAAGAGTTGTGTAAACTGGTTTCTGCTACTATCTATCTATCTATGTATTTGAG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL6404Contig1 1060 2 2 U
GGCCCGACTGTTCTTCTTCTCCTCTCTAAAAGTCAGTTCCTTTTCTCAGATCTTGTTAAG
ACCGGCGTGCGTGGGCTTACACAGCCACGACGTTGGTCTTAGTCCTTCCTTTAGCTTGCT
GTTGGTGTTAGTTTTCTCGCTTTTGATAGAGATTTTTTTTGGTGGCTGTGTGGTTGCGGT
GGAAGAGGTTCTCTCGACAGATCTACTTGTTTTTGATGAAGAAGACGCCGGATCCGGTAT
AGGTACGGAGCAGTTCACCTGCATACGTCTTCTTCTCTGTTCTTTAATTAGCTGCTGTTA
AGATCTTGTCTGGTGACCAAATCCATCACCTCACGCCATGTTTTGAAATCTCTACTCGGG
TCAGATGTGTTTATGGCTTGTGAAAGACTGAATCTGAAGCGTCTTTGTTTGGATTATAGT
ATTTATCCTATTTTACCTTTGTTCTAGCATCGGTGTAAGCGGTGTGAGATGGTGGCATGG
TGGTGTGTAGAGAGCAGACATGTTTAACATCTTTGAGAAGTTTCAGGTTGCTTTGTCCCG
CTTTAGGAAAGAGTCATTCTCGCGGCCATTGATTAAGTGTATTTTCCGGTTTGTCTTTGC
TCTCGTGTTCCTCACTGGCTTCGACTGGTTGAAGCATTATAAGGAGGTTGAGAGTTTTAA
GATTTCTGATTAAGGTTCGTTTGAGGAGGGAGCTTAGCCCCAGTTGGTGTTCTTCTCTGG
TTGATTTCTGATGTTAGTCTATTGATTCTGGCTTGGTACCGTGAACTAGAGGTTCAGGTA
AGTTTATGTCTCATTGTTGTGGCCACTACATCGTTTCCCTTCTCGTTGAGAGTTCCGGCT
GCAAAGCGTAGAAGGATTAATATTGTTTTCCATTGTCAAAGACTGTCCTTTAGATTTGGT
TTATGAGTTTAGAGTCCTCTTGTAATCGTGTAGTTTAATCAAATGTCACCCGTTGTTTGG
GTTTAAGCCACCCGTTGTCTGGGTTCAAGCCACCTGTTGTATGGGTTTAAGGATCTCACT
TTTGTATATTCTTCATGTTTCGTTAATAAAAACCAGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C910TF U 1
AF RR4C910JQ C 286
BS 1 638 RR4C910TF
BS 639 1060 RR4C910JQ

RD RR4C910TF 638 0 0
GGCCCGACTGTTCTTCTTCTCCTCTCTAAAAGTCAGTTCCTTTTCTCAGATCTTGTTAAG
ACCGGCGTGCGTGGGCTTACACAGCCACGACGTTGGTCTTAGTCCTTCCTTTAGCTTGCT
GTTGGTGTTAGTTTTCTCGCTTTTGATAGAGATTTTTTTTGGTGGCTGTGTGGTTGCGGT
GGAAGAGGTTCTCTCGACAGATCTACTTGTTTTTGATGAAGAAGACGCCGGATCCGGTAT
AGGTACGGAGCAGTTCACCTGCATACGTCTTCTTCTCTGTTCTTTAATTAGCTGCTGTTA
AGATCTTGTCTGGTGACCAAATCCATCACCTCACGCCATGTTTTGAAATCTCTACTCGGG
TCAGATGTGTTTATGGCTTGTGAAAGACTGAATCTGAAGCGTCTTTGTTTGGATTATAGT
ATTTATCCTATTTTACCTTTGTTCTAGCATCGGTGTAAGCGGTGTGAGATGGTGGCATGG
TGGTGTGTAGAGAGCAGACATGTTTAACATCTTTGAGAAGTTTCAGGTTGCTTTGTCCCG
CTTTAGGAAAGAGTCATTCTCGCGGCCATTGATTAAGTGTATTTTCCGGTTTGTCTTTGC
TCTCGTGTTCCTCACTGGCTTCGACTGGTTGAAGCATT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4C910JQ 775 0 0
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AAATCTCTACTCGGGTCAGATGTGTTTATGGCTTGTGAAAGACTGAATCTGAAGCGTCTT
TGTTTGGATTATAGTATTTATCCTATTTTACCTTTGTTCTAGCATCGGTGTAAGCGGTGT
GAGATGGTGGCATGGTGGTGTGTAGAGAGCAGACATGTTTAACATCTTTGAGAAGTTTCA
GGTTGCTTTGTCCCGCTTTAGGAAAGAGTCATTCTCGCGGCCATTGATTAAGTGTATTTT
CCGGTTTGTCTTTGCTCTCGTGTTCCTCACTGGCTTCGACTGGTTGAAGCATTATAAGGA
GGTTGAGAGTTTTAAGATTTCTGATTAAGGTTCGTTTGAGGAGGGAGCTTAGCCCCAGTT
GGTGTTCTTCTCTGGTTGATTTCTGATGTTAGTCTATTGATTCTGGCTTGGTACCGTGAA
CTAGAGGTTCAGGTAAGTTTATGTCTCATTGTTGTGGCCACTACATCGTTTCCCTTCTCG
TTGAGAGTTCCGGCTGCAAAGCGTAGAAGGATTAATATTGTTTTCCATTGTCAAAGACTG
TCCTTTAGATTTGGTTTATGAGTTTAGAGTCCTCTTGTAATCGTGTAGTTTAATCAAATG
TCACCCGTTGTTTGGGTTTAAGCCACCCGTTGTCTGGGTTCAAGCCACCTGTTGTATGGG
TTTAAGGATCTCACTTTTGTATATTCTTCATGTTTCGTTAATAAAAACCAGTTGG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6405Contig1 792 2 1 U
GGGAATGTAATGTCTCTTTGACCATTAACTTTTGAGACAAGAAAAGTTAGCAAGAAGATG
AAGAACGGTCTGCTTATCTTAATCTGCATGATCTTGGCTATTGGAACATGTGGAGGTCCT
TTGTTAACTCGTCTCTACTACAACAACGGAGGAGAACGAATCTGGTTCATGAGCTTTCTC
TCAACGGCAGGTTTCCCAGTCATCCTCATCCCTCTCGTTCTCTCCTTCCTACGCCGCAGA
AACCGCAACAACTCTGGAAACATAGAAAAAACAGAGATTGTCCTCATGGAAACTCCAATG
TTCATTGCATCTATCGTCATAGGGTTGCTCATAGGACTTGACAACTACTGTTTCGCGTAT
GGGCTAGCTTATCTGCCGCTTTCCACAACGTCACTCATTGTCGGAACTCAGTTAGGGTTC
AATGCGATCTTCTCTTTCTTCATGGTCAAGCAAACGTTCACTCCTTTTTCTATAAACGCC
GTCGTTTTGTTAACGGCCGGCACGGGAATCCTAGCCTTACGTGGCGGCGACGGAGACAGG
CCGGCTGACGTGAGCCACGAGGAGTATGTGGTTGGGTTCTTGGTGACTCTCACTGCAGCT
GTTCTTTACGCTTTTATATTACCGTTCGTTGAGCTCACTTACAAGAAAGTTCGACAAGAA
ATCACTTTCACACTTGTGTTGGAGATGCAGTTGGTCATGTGCGTCGCTGCTTCTTGCTTC
TGTATTGTTGGGATGCTTGTAGAAGCGACTTCAGTTATACAAGAGAAGCAGAGAGTCAAG
ATAGGAGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C047TF U 7
AF RR4BP25TF U 1
BS 1 792 RR4BP25TF

RD RR4C047TF 743 0 0
GGG
ATGTCTCTTTGACCATTAACTTTTGAGACAAGAAAAGTTAGCAAGAAGATGAAGAACGGT
CTGCTTATCTTAATCTGCATGATCTTGGCTATTGGAACATGTGGAGGTCCTTTGTTAACT
CGTCTCTACTACAACAACGGAGGAGAACGAATCTGGTTCATGAGCTTTCTCTCAACGGCA
GGTTTCCCAGTCATCCTCATCCCTCTCGTTCTCTCCTTCCTACGCCGCAGAAACCGCAAC
AACTCTGGAAACATAGAAAAAACAGAGATTGTCCTCATGGAAACTCCAATGTTCATTGCA
TCTATCGTCATAGGGTTGCTCATAGGACTTGACAACTACTGTTTCGCGTATGGGCTAGCT
TATCTGCCGCTTTCCACAACGTCACTCATTGTCGGAACTCAGTTAGGGTTCAATGCGATC
TTCTCTTTCTTCATGGTCAAGCAAACGTTCACTCCTTTTTCTATAAACGCCGTCGTTTTG
TTAACGGCCGGCACGGGAATCCTAGCCTTACGTGGCGGCGACGGAGACAGGCCGGCTGAC
GTGAGCCACGAGGAGTATGTGGTTGGGTTCTTGGTGACTCTCACTGCAGCTGTTCTTTAC
GCTTTTATATTACCGTTCGTTGAGCTCACTTACAAGAAAGTTCGACAAGAAATCACTTTC
ACACTTGTGTTGGAGATGCAGTTGGTCATGTGCGTCGCTGCTTCTTGCTTCTGTATTGTT
GGGATGTTTGTAGAAGCGAC

QA 4 743 4 743
DS 

RD RR4BP25TF 792 0 0
GGGAATGTAATGTCTCTTTGACCATTAACTTTTGAGACAAGAAAAGTTAGCAAGAAGATG
AAGAACGGTCTGCTTATCTTAATCTGCATGATCTTGGCTATTGGAACATGTGGAGGTCCT
TTGTTAACTCGTCTCTACTACAACAACGGAGGAGAACGAATCTGGTTCATGAGCTTTCTC
TCAACGGCAGGTTTCCCAGTCATCCTCATCCCTCTCGTTCTCTCCTTCCTACGCCGCAGA
AACCGCAACAACTCTGGAAACATAGAAAAAACAGAGATTGTCCTCATGGAAACTCCAATG
TTCATTGCATCTATCGTCATAGGGTTGCTCATAGGACTTGACAACTACTGTTTCGCGTAT
GGGCTAGCTTATCTGCCGCTTTCCACAACGTCACTCATTGTCGGAACTCAGTTAGGGTTC
AATGCGATCTTCTCTTTCTTCATGGTCAAGCAAACGTTCACTCCTTTTTCTATAAACGCC
GTCGTTTTGTTAACGGCCGGCACGGGAATCCTAGCCTTACGTGGCGGCGACGGAGACAGG
CCGGCTGACGTGAGCCACGAGGAGTATGTGGTTGGGTTCTTGGTGACTCTCACTGCAGCT
GTTCTTTACGCTTTTATATTACCGTTCGTTGAGCTCACTTACAAGAAAGTTCGACAAGAA
ATCACTTTCACACTTGTGTTGGAGATGCAGTTGGTCATGTGCGTCGCTGCTTCTTGCTTC
TGTATTGTTGGGATGCTTGTAGAAGCGACTTCAGTTATACAAGAGAAGCAGAGAGTCAAG
ATAGGAGGATCT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6406Contig1 829 2 6 U
GATCAAATCCGATGGTGACTGTAATGGATACCTTGAGCCGGCTTAGCCATGACACAGATT
CAGAAGTTGCCATGGCAGCAATTATATCATTGGGACTGATTGGCGCTGGAACTAATAACG
CAAGGCTAACCGGGATGCTTCGAAACCTCTCCAGCTATTATTACAAGGACGCCAGTCTTC
TCTTTTGTGTGCGTATTGCTCAAGGGCTGGTGCACATGGGAAAGGGTCTTTTAACACTCA
CCCCCTTCCACTCAGAACGATTCCTGCTATCACCAACCGCACTTGCTGGTATAGTGACGC
TCTTGCATGCATGCCTGGACATGAAACCAATCATACTAGGGAAATACCATTATGTGCTCT
ACTTCCTCGTTTTGGCGATGCAACCGAGGATGATGTTGACAGTGGACAAAGACCTGAAGC
CACTGTCAGTGCCAGTGAGGGTAGGACAAGCAGTTGATGTGGTTGGACAAGCGGGTCGGC
CAAAGACGATAACAGGATTCCAGACACACTCCACACCTGTTCTCTTGGCTGCTGGTGAGA
GAGCGGAGCTAGCAACGGACAAGTACATTCCTCTGTCGCCTATACTAGAAGGGTTCATCA
TTTTAGAGGAGAACCCAGACTACAGAGAAGAGTGAAGAGCTGATGAGTTGTCAAGAGAAT
AAAGAGAAGCTGCCTGCATTCTCACTAGTCTTTTTCATGTGTGGGTTATTTCGTCTATGT
TATTCATGGTTTTTTTTTTTTTTTTATAGAAAAAAATGTTGTATCTCGGTTTCATTATCT
TTGGATCTTTGTACAATACGTTAATTTATATCTTCCTAGTCTGTTTTCC


BQ
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AF RR4DA91TF U 1
AF RR4DA91JQ C 367
BS 1 694 RR4DA91TF
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CAGAAGTTGCCATGGCAGCAATTATATCATTGGGACTGATTGGCGCTGGAACTAATAACG
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TCTTTTGTGTGCGTATTGCTCAAGGGCTGGTGCACATGGGAAAGGGTCTTTTAACACTCA
CCCCCTTCCACTCAGAACGATTCCTGCTATCACCAACCGCACTTGCTGGTATAGTGACGC
TCTTGCATGCATGCCTGGACATGAAACCAATCATACTAGGGAAATACCATTATGTGCTCT
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CACTGTCAGTGCCAGTGAGGGTAGGACAAGCAGTTGATGTGGTTGGACAAGCGGGTCGGC
CAAAGACGATAACAGGATTCCAGACACACTCCACACCTGTTCTCTTGGCTGCTGGTGAGA
GAGCGGAGCTAGCAACGGACAAGTACATTCCTCTGTCGCCTATACTAGAAGGGTTCATCA
TTTTAGAGGAGAACCCAGACTACAGAGAAGAGTGAAGAGCTGATGAGTTGTCAAGAGAAT
AAAGAGAAGCTGCCTGCATTCTCACTAGTCTTTT*CATGTGTGGGT*ATTTCGTCTATGT
TATTCATGGTTTTTTTTTTT
CTATAGAAAAAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4DA91JQ 463 0 0
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CAGTGCCAGTGAGGGTAGGACAAGCAGTTGATGTGGTTGGACAAGCGGGTCGGCCAAAGA
CGATAACAGGATTCCAGACACACTCCACACCTGTTTTTTTGGCTGCTGGTGAGAGAGCGG
AGCTAGCAACGGACAAGTACATTCCTCTGTCGCCTATACTAGAAGGGTTCATCATTTTAG
AGGAGAACCCAGACTACAGAGAAGAGTGAAGAGCTGATGAGTTGTCAAGAGAATAAAGAG
AAGCTGCCTGCATTCTCACTAGTCTTTTTCATGTGTTGGTTATTTCGTCTATGTTATTCA
TGGTTTTTTTTTTTTTTTTATAGAAAAAAATGTTGTATCTCGGTTTCATTATCTTTGGAT
CTTTGTACAATACGTTAATTTATATCTTCCTAGTCTGTTTTCC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

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AF RR4C814JQ C 1
AF RR4C814TF U 1
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AGGGTTGCACTATGCTGTAGCACCTGAGCTGGTACCGAGTCCACAACAACACCAACCTGA
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AAGTTTCTGTGTCTATGTTATTACAGACGAGAAAATAAAAGATTGTTCACACC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4C814TF 353 0 0
GAGCTTTCTTCTTTCTTTTCATGCTACGTGCTGCTGGTTTTCTCCTTCCCTGTTACATCA
TGGCTTGGGCCATCAGTATATTACAACGCCGTAGACAACGACAGGAAGCAGCCGCTTTGG
CCGCTGCAGAAGTTGCGTTTATGTTAACAGCGGTGGTGGAGGTGGAGTCCAACGCAGAGG
AGGGTTGCACTATGCTGTAGCACCTGAGCTGGTACCGAGTCCACAACAACACCAACCTGA
ATCTTCACAGTAATGATGATTATATTCTTGAAGAAACTGAGATTAAAAATAAAATACGGG
AAGTTTCTGTGTCTATGTTATTACAGACGAGAAAATAAAAGATTGTTCACACC

QA 1 353 1 353
DS 



AS 1 2

CO CL6408Contig1 886 2 2 U
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CTCTCGACTTGATTGAATGAGAAACCCTCCTCCTCCGTCACTGCTCTCCCTCACCGTCAA
GGCCGCCGTGTTAAACATCTCACGCATCAACGATCCATCGCACCTTCCTGATCACATCGT
CCTTGATCTCTTCGAGGGGATATTGAAAGCTGGGAAATTGAATGAGAGAGTTTTGAGAGT
CTTTATGGCATCTGGAAACGAAGATGTTCTTGCTTATATCGACGCACTTAAGATTAAAAT
CGACCTTACTCCCATTGTTCCTACTCGATGTGATGAGGAATTTATAATGAACTGGACTAG
ACGCTAAGTTGATTTATGATGATGGCGATGACCGGTGTTTGGAAGCTCTTGATCCTATGT
GTTAGAAAAGGTCGGTTTCCTAATTGTATATTTCGGATCAACAATCTTAGAGAAGTGAAG
ATAACATTTACAGATTGAAAGTCTGTTTCTTCTTTTTTTTTTCTTATTGTGTGTAAATAT
TAACGGAATTTTTTTTTTTTCCCGTTCCCATGAAGTCGTTATGCAATCTTGGAAGCTTAT
TATTTGCTGCAGGAGTTATATCATATAACTGTAACCTCTTATCATGATCCATGTAGCTGT
AACCTCCTTGCTCTTCATCCTCATGTCATGTCTTTCAGCTTTTCTGTTAGTTTTCTTCTT
GGCTTATCTACTTTGTAGAGAATCCAATTAGCTCTCACTAGTTTAGCAAACTACTACTTG
GCAAAGTTCTCCATCTTTCCTCTGTTTAAGATTCAGTTGGGGTAGCCACATGAGACTTCT
TCAATTGAAATAATGATAAAAGTTTACTTGAGGCTGTCGTTCCAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS33TF U 1
AF RR4DS33JQ C 242
BS 1 609 RR4DS33TF
BS 610 886 RR4DS33JQ

RD RR4DS33TF 609 0 0
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CTCTCGACTTGATTGAATGAGAAACCCTCCTCCTCCGTCACTGCTCTCCCTCACCGTCAA
GGCCGCCGTGTTAAACATCTCACGCATCAACGATCCATCGCACCTTCCTGATCACATCGT
CCTTGATCTCTTCGAGGGGATATTGAAAGCTGGGAAATTGAATGAGAGAGTTTTGAGAGT
CTTTATGGCATCTGGAAACGAAGATGTTCTTGCTTATATCGACGCACTTAAGATTAAAAT
CGACCTTACTCCCATTGTTCCTACTCGATGTGATGAGGAATTTATAATGAACTGGACTAG
ACGCTAAGTTGATTTATGATGATGGCGATGACCGGTGTTTGGAAGCTCTTGATCCTATGT
GTTAGAAAAGGTCGGTTTCCTAATTGTATATTTCGGATCAACAATCTTAGAGAAGTGAAG
ATAACATTTACAGATTGAAAGTCTGTTTCTTCTTTTTTTTTTCTTATTGTGTGTAAATAT
TAACGGAATTTTTTTTTTTTCCCGTTCCCATGAAGTCGTTATGCAATCTTGGAAGCTTAT
TATTTGCTG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4DS33JQ 645 0 0
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GACCTTACTCCCATTGTTCCTACTCGATGTGATGAGGAATTTATAATGAACTGGACTAGA
CGCTAAGTTGATTTATGATGATGGCGATGACCGGTGTTTGGAAGCTCTTGATCCTATGTG
TTAGAAAAGGTCGGTTTCCTAATTGTATATTTCGGATCAACAATTTTAGAGAAGTGAAGA
TAACATTTACAGATTGAAAGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTATTGTGTGTAAATATT
AACGGAATTTTTTTTTTTTCCCGTTCCCATGAAGTCGTTATGCAATCTTGGAAGCTTATT
ATTTGCTGCAGGAGTTATATCATATAACTGTAACCTCTTATCATGATCCATGTAGCTGTA
ACCTCCTTGCTCTTCATCCTCATGTCATGTCTTTCAGCTTTTCTGTTAGTTTTCTTCTTG
GCTTATCTACTTTGTAGAGAATCCAATTAGCTCTCACTAGTTTAGCAAACTACTACTTGG
CAAAGTTCTCCATCTTTCCTCTGTTTAAGATTCAGTTGGGGTAGCCACATGAGACTTCTT
CAATTGAAATAATGATAAAAGTTTACTTGAGGCTGTCGTTCCAGT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL6409Contig1 743 2 5 U
GGAAGCAGCCATCACAGCTGAGAGCAAGGAATCTCAACCAGAATCTGACAGCATTAACCA
TAACATACCTGACCTTATAAGCGAGAAAGAAAAAGAGCTAGAGTTACTGATCCGTGAGCT
GGACGACAAAATCAGGTTCAGGCCAAGAGCAGTTGAGAGGCCTGGATCCGGTGCAGGCAG
AACAGGTAACTATTCTGAAAGGCCTCATTCCCGGGGTGGGTCAGTTGAAGATGGTTGGAG
TGTGGAATCCATGGAAAGACCTAGATCACGAGGCACAGGTGATGATAGAAGAAACTTCCA
AGGAAGCAAGGAACGTGGATTCTTCAGCAACAGGAACGTCGACAGGTCATCATCGGCCAG
GGGTGGATGGTAAAAGAAGGAAACAAAGAATGAATATGGAGTGAGATTTTGGAGTTTGGT
TTGGTTCCCATATTTTGAAGAAGCTTCAATAATAATATTTAATAATAAAAGAAAAATTCA
TCTCCTTTTGAATTCAAACCTAATTTTGGGGGGACTAGTTTTATGCTTTTGTATTGATTC
ATCTTCGGAAATCGAAGCCTAATGGTTTCTTCTTCTTTCGCTTTTCTTAATTGTATTTTG
TTTGGTCTTTTGCTCGTTGATCAGCATGATTTGTCACAAATATTGTGTCTTCAGAATTTT
GGAGACAGACTCTGTTCTTCTTCTTCTTCTTATGTGTTTTAAATTTTTGTTTACCGCTGC
TGCTTCAGCAGTCTGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ43TF U 1
AF RR4AD02TF U 362
BS 1 580 RR4EJ43TF
BS 581 581 RR4AD02TF
BS 582 661 RR4EJ43TF
BS 662 662 RR4AD02TF
BS 663 743 RR4EJ43TF

RD RR4EJ43TF 743 0 0
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TAACATACCTGACCTTATAAGCGAGAAAGAAAAAGAGCTAGAGTTACTGATCCGTGAGCT
GGACGACAAAATCAGGTTCAGGCCAAGAGCAGTTGAGAGGCCTGGATCCGGTGCAGGCAG
AACAGGTAACTATTCTGAAAGGCCTCATTCCCGGGGTGGGTCAGTTGAAGATGGTTGGAG
TGTGGAATCCATGGAAAGACCTAGATCACGAGGCACAGGTGATGATAGAAGAAACTTCCA
AGGAAGCAAGGAACGTGGATTCTTCAGCAACAGGAACGTCGACAGGTCATCATCGGCCAG
GGGTGGATGGTAAAAGAAGGAAACAAAGAATGAATATGGAGTGAGATTTTGGAGTTTGGT
TTGGTTCCCATATTTTGAAGAAGCTTCAATAATAATATTTAATAATAAAAGAAAAATTCA
TCTCCTTTTGAATTCAAACCTAATTTTGGGGGGACTAGTTTTATGCTTTTGTATTGATTC
ATCTTCGGAAATCGAAGCCTAATGGTTTCTTCTTCTTTCGTTTTTCTTAATTGTATTTTG
TTTGGTCTTTTGCTCGTTGATCAGCATGATTTGTCACAAATATTGTGTCTTCAGAATTTT
G*AGACAGACTCTGTTCTTCTTCTTCTTCTTATGTGTTTTAAATTTTTGTTTACCGCTGC
TGCTTCAGCAGTCTGAAAAAAAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4AD02TF 374 0 0
GGTGGATGGTAAAAGAAGGAAACAAAGAATGAATATGGAGTGAGATTTTGGAGTTTGGTT
TGGTTCCCATATTTTGAAGAAGCTTCAATAATAATATTTAATAATAAAAGAAAAATTCAT
CTCCTTTTGAATTCAAACCTAATTTTGGGGGGACTAGTTTTATGCTTTTGTATTGATTCA
TCTTCGGAAATCGAAGCCTAATGGTTTCTTCTTCTTTCGCTTTTCTTAATTGTATTTTGT
TTGGTCTTTTGCTCGTTGATCAGCATGATTTGTCACAAATATTGTGTCTTCAGAATTTTG
GAGACAGACTCTGTTCTTCTTCTTCTT***ATGTGTTTTAAATTTTTGTTTACCGCTGCT
GCTTCAGCAGTCTG

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 2

CO CL6410Contig1 619 2 2 U
GGTGGAAAGGCACATGTATATTTATAAAGTTGAGAATCATCACATAAAATGATAAAATAA
ATAAAATAAAAAGCTACCAAAAAAAAAAAAAAAGCTACCAAGATGAAGGAACCTTTTAAC
ATGATTGTGGTTAATTCCAATTATTGATCATCTCCGGGAACAAGAACGGAAACTTCTCCG
TCGCCTAGCCACCGCGAGAACGGACGTCGTTGTGGTGGTGGTGGAGATGACGTCATCGTC
TGGTTGTAAACAGAGGAGAAGAAGCGATCTATCTCATCTTTGTTGACGATGATCTCAAAC
TTTGATGACGTCAAAAGCTTCCTCTTGCAAGATCTGTAAACAAGAAACGACGGAGGTGCA
CGTCGTTTTTGAGGTGGATGAGGAGGAGTAGTGGCGGTGGAGGGAGGAATCTTGTGGTCG
GAGGAAGTGGGAGTGGTGCAGCCACCGCCGCCGTCCTCATCTCTGTTGTTGGATCGGATC
TTGATGGGTGATGGGAATTTCAACATGGACAGATCTTGCAATAAATCAAGATCCATTTTC
TACTAATATATAATAAAATGATATGTTCTTGAAGGTTTTGTTTTTGTGTGTTTAGCGTGT
GTTCTCTGAACAAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BT17TF C 1
AF RR4BT17JQ U 260
BS 1 259 RR4BT17TF
BS 260 619 RR4BT17JQ

RD RR4BT17TF 619 0 0
GGTGGAAAGGCACATGTATATTTATAAAGTTGAGAATCATCACATAAAATGATAAAATAA
ATAAAATAAAAAGCTACCAAAAAAAAAAAAAAAGCTACCAAGATGAAGGAACCTTTTAAC
ATGATTGTGGTTAATTCCAATTATTGATCATCTCCGGGAACAAGAACGGAAACTTCTCCG
TCGCCTAGCCACCGCGAGAACGGACGTCGTTGTGGTGGTGGTGGAGATGACGTCATCGTC
TGGTTGTAAACAGAGGAGAAGAAGCGATCTATCTCATCTTTGTTGACGATGATCTCAAAC
TTTGATGACGTCAAAAGCTTCCTCTTGCAAGATCTGTAGACAAGAGACGACGGAGGTGCA
CGTCGTTTTTGAGGTGGATGAGGAGGAGTAGTGGCGGTGGAGGGAGGAATCTTGTGGTCG
GAGGAAGTGGGAGTGGTGCAGCCACCGCCGCCGTCCTCATCTCTGTTGTTGGATCGGATC
TTGATGGGTGATGGGAATTTCAACATGGACAGATCTTGCAATAAATCAAGATCCATTTTC
TACTAATATATAATAAAATGATATGTTCTTGAAGGTTTTGTTTTTGTGTGTTTAGCGTGT
GTTCTCTGAACAAATCTCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BT17JQ 360 0 0
AGAAGCGATCTATCTCATCTTTGTTGACGATGATCTCAAACTTTGATGACGTCAAAAGCT
TCCTCTTGCAAGATCTGTAAACAAGAAACGACGGAGGTGCACGTCGTTTTTGAGGTGGAT
GAGGAGGAGTAGTGGCGGTGGAGGGAGGAATCTTGTGGTCGGAGGAAGTGGGAGTGGTGC
AGCCACCGCCGCCGTCCTCATCTCTGTTGTTGGATCGGATCTTGATGGGTGATGGGAATT
TCAACATGGACAGATCTTGCAATAAATCAAGATCCATTTTCTACTAATATATAATAAAAT
GATATGTTCTTGAAGGTTTTGTTTTTGTGTGTTTAGCGTGTGTTCTCTGAACAAATCTCC

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 2

CO CL6411Contig1 1132 2 4 U
GGACTGCCTCTCTTCTCTCTCTTGTTAGTTCACTCCACATAATAAACACTAAGAGAAAAA
CTAATTTCTTCTTATCGTAATTTCGAAATTTCTTGAAATTAGGTTTGTTTCTTGATTGAG
TTCTTGAATCGGGCTGTCTTCTCTTGTTACTATATTCAGAGTTTATAATCATGATGAGTC
AAGATCATCATGACGTTGGTAGTGACCAGACACAAATCATAAAGGGTAAGCGTACGAAGC
GACAGAGATCATCTTCGTCGGCCTTTTTTGTGGCGGCGGCGGCTACCACCATCACCTCCA
CAAGCTCATCGGCCGAGGATGGTAGCGGAGGAAGAACAGTTCCCGATGAATACAACTCGG
CGGTTTCGTCTCCAGTAACCACAACTGATTGTACCGAAGAAGAGGAAGACATGGCTGTTT
GTCTCATCATGCTTGCGCGCGGAGCGGATCTCAAGAATTCGAGAAAAAACGGCAAAGTTC
TTTCGTCCGCAGAGAATTCGAGTTTCTATGTCTACGAGTGTAAAACGTGCAAGCGGACGT
TCTCGTCGTTCCAAGCTCTCGGTGGACACAGGGCGAGCCACAAGAAGCCTAGAGCGTCGA
TAGAGGAAAAGTCCAAACTACCCCTGATGTTGACCAAGTCTAGTGGGTCAGAGGAAGGGC
AAAAAGGTAATTTCAAAGTTTTTGGTTCAGCACTAGCTTCGCAGTCAAGTAACATCATCA
TCACAAAGGCAAACAAAGTACATTAGTGTTCGATCTGCGGTTCTGAGTTCGCTTCGGGAC
AAGCCCTCGGCGGCCACATGAGGCGGCACAGGACAGCCACCAGTGCGGTAATACCTGTCG
CTACCATGGAAGTTAGCAGAAACAGTACAGAGGAGGAGACTGAGAATTTGAGCTCTTCCA
TTGAACAGAGGAAATACTTACCGTTGGATCTTAATCTACCGGCACCAGATGATGATCTAA
GAGAGTCAAAGTTTCAAGGGATAGTGTTCTCAACCACACCAGCGTTAATAGACTGTCATT
ACTAGTTGTTTGAAGTTAAATGCATAGTTACATGATAACATATTTGTGAATTCTTCTTCT
ATTACTATATTGTTGATGAATTGGAGTTATTTTCAAAAAAATATTGAATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DN36TF U 1
AF RR4DN36JQ C 368
BS 1 666 RR4DN36TF
BS 667 667 RR4DN36JQ
BS 668 724 RR4DN36TF
BS 725 1132 RR4DN36JQ

RD RR4DN36TF 724 0 0
GGACTGCCTCTCTTCTCTCTCTTGTTAGTTCACTCCACATAATAAACACTAAGAGAAAAA
CTAATTTCTTCTTATCGTAATTTCGAAATTTCTTGAAATTAGGTTTGTTTCTTGATTGAG
TTCTTGAATCGGGCTGTCTTCTCTTGTTACTATATTCAGAGTTTATAATCATGATGAGTC
AAGATCATCATGACGTTGGTAGTGACCAGACACAAATCATAAAGGGTAAGCGTACGAAGC
GACAGAGATCATCTTCGTCGGCCTTTTTTGTGGCGGCGGCGGCTACCACCATCACCTCCA
CAAGCTCATCGGCCGAGGATGGTAGCGGAGGAAGAACAGTTCCCGATGAATACAACTCGG
CGGTTTCGTCTCCAGTAACCACAACTGATTGTACCGAAGAAGAGGAAGACATGGCTGTTT
GTCTCATCATGCTTGCGCGCGGAGCGGATCTCAAGAATTCGAGAAAAAACGGCAAAGTTC
TTTCGTCCGCAGAGAATTCGAGTTTCTATGTCTACGAGTGTAAAACGTGCAAGCGGACGT
TCTCGTCGTTCCAAGCTCTCGGTGGACACAGGGCGAGCCACAAGAAGCCTAGAGCGTCGA
TAGAGGAAAAGTCCAAACTACCCCTGATGTTGACCAAGTCTAGTGGGTCAGAGGAAGGGC
AAAAAG*TAATTTCAAAGTTTTTGGTTCAGCACTAGCTTCGCAGTCAAGTAACATCATCA
TCAC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4DN36JQ 765 0 0
GTCTCCAGTAACCACAACTGATTGTACCGAAGAAGAGGAAGACATGGCTGTTTGTCTCAT
CATGCTTGCGCGCGGAGCGGATCTCAAGAATTCGAGAAAAAACGGCAAAGTTCTTTCGTC
CGCAGAGAATTCGAGTTTCTATGTCTACGAGTGTAAAACGTGCAAGCGGACGTTCTCGTC
GTTCCAAGCTCTCGGTGGACACAGGGCGAGCCACAAGAAGCCTAGAGCGTCGATAGAGGA
AAAGTCCAAACTACCCCTGATGTTGACCAAGTCTAGTGGGTCAGAGGAAGGGCAAAAAGG
TAATTTCAAAGTTTTTGGTTCAGCACTAGCTTCGCAGTCAAGTAACATCATCATCACAAA
GGCAAACAAAGTACATTAGTGTTCGATCTGCGGTTCTGAGTTCGCTTCGGGACAAGCCCT
CGGCGGCCACATGAGGCGGCACAGGACAGCCACCAGTGCGGTAATACCTGTCGCTACCAT
GGAAGTTAGCAGAAACAGTACAGAGGAGGAGACTGAGAATTTGAGCTCTTCCATTGAACA
GAGGAAATACTTACCGTTGGATCTTAATCTACCGGCACCAGATGATGATCTAAGAGAGTC
AAAGTTTCAAGGGATAGTGTTCTCAACCACACCAGCGTTAATAGACTGTCATTACTAGTT
GTTTGAAGTTAAATGCATAGTTACATGATAACATATTTGTGAATTCTTCTTCTATTACTA
TATTGTTGATGAATTGGAGTTATTTTCAAAAAAATATTGAATCAT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6412Contig1 965 2 8 U
AAAGCTTGTTAGTCGTTACGCGATGGCGTCAAGTGATAAGGCTCCCGTGGCGTATCCAGC
AAGTATCGGAGAAGATAAGGAGCCAATAGGAGATCCTACGAAGACCACTACGGCGATGCG
AGAAAAAGGAACGGCTATGATGCAGTCGATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCCAATG
TGTTCATTCGCTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGTCGAAGTTCATATCTACGGTC
ACCGTGTAAACCAAGACTTTCCCCAGTGTGCCGTCTACGATTCGAGTTCCTCTAAGGCCC
ATCTCATACATAGACATTGATTATACGTATAAATGTCCAGGTTGTAACGTTGAGTATTGA
AGCTTTTGCGTTAGATTATGACTTAAGATTTATGATGTGTTTTTTATTGTATTAAATTAC
TAGGGATCGAATATATAGTGTCAGAGAAGTTATTCGAAAGCCTCTCACCAGGTGCACACA
AACAAAAAAAAAGCCTCTCACCGGAGGAACAAAAGCTTTGGCATTCCCATGATTATGAGA
TCCAGATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTCGTTGCAAAGCCCGAGCTTA
AAAATCTTGCCGAGTCTTACGGGAAATTTTGGTGTACTTGGCAAATCGATCGTGGGGATA
GATTACCACTAGGTGTACCATCACTGATGGTGTCACCACAAGACGTGAATCTAGGGAGGA
TCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACTGAATCGTTAA
AGCCGTCACGAGAAGAGATTTGTGGACCGGAGAAAAAGAATGTTGTCGCTGATTATTGGG
TTCGGTTTAGGGAAGGCTTTGCGCTTGATGTCGTTGAGACAGATATGAAGAAAACAGTTC
CCTTCCCGTGACTTTTCTTTTGTTTGCTTTTTTCCTTAATGAATTTCGAGACATTTTAAG
TTCGT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4BM01TF U 1
AF RR4CM11TF U 231
BS 1 261 RR4BM01TF
BS 262 262 RR4CM11TF
BS 263 298 RR4BM01TF
BS 299 299 RR4CM11TF
BS 300 443 RR4BM01TF
BS 444 444 RR4CM11TF
BS 445 600 RR4BM01TF
BS 601 965 RR4CM11TF

RD RR4BM01TF 600 0 0
AAAGCTTGTTAGTCGTTACGCGATGGCGTCAAGTGATAAGGCTCCCGTGGCGTATCCAGC
AAGTATCGGAGAAGATAAGGAGCCAATAGGAGATCCTACGAAGACCACTACGGCGATGCG
AGAAAAAGGAACGGCTATGATGCAGTCGATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCCAATG
TGTTCATTCGCTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGTCGAAGTTCATATCTACGGTC
ACCGTGTAAACCAAGACTTTCTCCAGTGTGCCGTCTACGATTCGAGTTCCTCTAAGGCTC
ATCTCATACATAGACATTGATTATACGTATAAATGTCCAGGTTGTAACGTTGAGTATTGA
AGCTTTTGCGTTAGATTATGACTTAAGATTTATGATGTGTTTTTTATTGTATTAAATTAC
TAGGGATCGAATATATAGTGTCATAGAAGTTATTCGAAAGCCTCTCACCAGGTGCACACA
AACAAAAAAAAAGCCTCTCACCGGAGGAACAAAAGCTTTGGCATTCCCATGATTATGAGA
TCCAGATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTCGTTGCAAAGCCCGAGCTTA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4CM11TF 735 0 0
G
TCTACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCCCCAGTGTGCCGTCTACGATTCGAGTTCCT
CTAAGGCCCATCTCATACATAGACATTGATTATACGTATAAATGTCCAGGTTGTAACGTT
GAGTATTGAAGCTTTTGCGTTAGATTATGACTTAAGATTTATGATGTGTTTTTTATTGTA
TTAAATTACTAGGGATCGAATATATAGTGTCAGAGAAGTTATTCGAAAGCCTCTCACCAG
GTGCACACAAACAAAAAAAAAGCCTCTCACCGGAGGAACAAAAGCTTTGGCATTCCCATG
ATTATGAGATCCAGATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTCGTTGCAAAGC
CGGAGCTTAAAAATCTTGCCGAGTCTTACGGGAAATTTTGGTGTACTTGGCAAATCGATC
GTGGGGATAGATTACCACTAGGTGTACCATCACTGATGGTGTCACCACAAGACGTGAATC
TAGGGAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACTG
AATCGTTAAAGCCGTCACGAGAAGAGATTTGTGGACCGGAGAAAAAGAATGTTGTCGCTG
ATTATTGGGTTCGGTTTAGGGAAGGCTTTGCGCTTGATGTCGTTGAGACAGATATGAAGA
AAACAGTTCCCTTCCCGTGACTTTTCTTTTGTTTGCTTTTTTCCTTAATGAATTTCGAGA
CATTTTAAGTTCGT

QA 2 735 2 735
DS 



AS 1 2

CO CL6413Contig1 358 2 1 U
GGGAAAGAAACGAAAATCGCAATAGTCTCTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTAC
AATCTCTTTACCCAGTTTTTTTTCTCTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCA
AGCTCCTACCCTTTTCATCTTCCCTCTCCTCTAATAATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAAA
CAGAAAAAGTAAAAACGATCAGAAAAAAAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTTGTGTTATT
ACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTCAATCCGATTTGATTTACATCTAAAATAACGAAG
AGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCCCAAAAAAAATTCAAAAAAGTTTCAAAAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DA55JQ C 1
AF RR4DA55TF U 1
BS 1 358 RR4DA55TF

RD RR4DA55JQ 358 0 0
GGGAAAGAAACGAAAATCGCAATAGTCTTTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTAC
AATCTCTTTACCCAGTTTTTTTTCTCTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCA
AGCTCCTACCCTTTTCATCTTCCCTCTCCTCTAATAATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAAA
CAGAAAAAGTAAAAACGATCAGAAAAAAAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTTGTGTTATT
ACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTCAATCCGATTTGATTTACATCTAAAATAACGAAG
AGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCCCAAAAAAAATTCAAAAAAGTTTCAAAAATCC

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4DA55TF 358 0 0
GGGAAAGAAACGAAAATCGCAATAGTCTCTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTAC
AATCTCTTTACCCAGTTTTTTTTCTCTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCA
AGCTCCTACCCTTTTCATCTTCCCTCTCCTCTAATAATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAAA
CAGAAAAAGTAAAAACGATCAGAAAAAAAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTTGTGTTATT
ACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTCAATCCGATTTGATTTACATCTAAAATAACGAAG
AGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCCCAAAAAAAATTCAAAAAAGTTTCAAAAATCC

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

CO CL6414Contig1 358 2 1 U
GGTGATCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTACCAATCTACGTGCCACCGGTGGTGAT
TCCGAAGAAGCCATGTCCGCCACTTCCACCACTTCCAAAGTTTCCGCCTCTTCCTCCTAA
ATACATTCACCACCCCAAGTTCGGCAAATGGCCTCCATTGCCGACTCACCCTTGAGAGTT
TAATACGTATACTTGTATGTAATCAACGTGTTGCTTTTAAAAAAAAATATTATCCTGCAT
GTTTGAAATTTGGTTTGTTTTGTGACTTTCATCTTTTGTCTACTTAATTTCTCTCTGAGT
TTTATGTGTAGACTGTTTCTTCATCTCTTCCAGGAATAATATGGTAATGATTTTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FJ28JQ C 1
AF RR4FJ28TF U 1
BS 1 358 RR4FJ28TF

RD RR4FJ28JQ 358 0 0
GGTGATCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTACCAATTTACGTGCCACCGGTGGTGAT
TCCGAAGAAGCCATGTCCGCCACTTCCACCACTTCCAAAGTTTCCGCCTCTTCCTCCTAA
ATACATTCACCACCCCAAGTTCGGCAAATGGCCTCCATTGCCGACTCACCCTTGAGAGTT
TAATACGTATACTTGTATGTAATCAACGTGTTGCTTTTAAAAAAAAATATTATCCTGCAT
GTTTGAAATTTGGTTTGTTTTGTGACTTTCATCTTTTGTCTACTTAATTTCTCTCTGAGT
TTTATGTGTAGACTGTTTCTTCATCTCTTCCAGGAATAATATGGTAATGATTTTCTCG

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4FJ28TF 358 0 0
GGTGATCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTACCAATCTACGTGCCACCGGTGGTGAT
TCCGAAGAAGCCATGTCCGCCACTTCCACCACTTCCAAAGTTTCCGCCTCTTCCTCCTAA
ATACATTCACCACCCCAAGTTCGGCAAATGGCCTCCATTGCCGACTCACCCTTGAGAGTT
TAATACGTATACTTGTATGTAATCAACGTGTTGCTTTTAAAAAAAAATATTATCCTGCAT
GTTTGAAATTTGGTTTGTTTTGTGACTTTCATCTTTTGTCTACTTAATTTCTCTCTGAGT
TTTATGTGTAGACTGTTTCTTCATCTCTTCCAGGAATAATATGGTAATGATTTTCTCG

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

CO CL6415Contig1 752 2 6 U
AAGTTAAAATGTCATCTTTTGAGATTGCTTGGTTCTAAACCTGATTGTGTTTAAACATGA
TTTTGGAAAAGAAGTACAAAACCGAAATTTAGTAAAAAAAAAAACACACAAGAGGACATG
GACCTCCAGCTACCAAAGAGAGTTGGAAAAACTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TAGAAGGCTGACCAGTCCAATAAGTTTTGACAGCAACAAGAATCTTCTCAGGGTTGTACG
GACCTTTCTCATGATCTACAATCTGAGTGTTCCACTTCATTCCCTTCGCTATCCTCTCTA
CTTTCGTCAACGTCTCCACATTATCTCTCATCACAACCGTTCCTTCTGGTCTCAGTATTC
GATCCATCTCCAACAATATCAACGTAAAATCACACCTGTTTTCGTAAAAGCTGAACAATC
CTCCCGCGCGAATCATATCATAAGTTCTTGGATAAGTAGAGAATCCTTCACACCAGTCTT
GATACGTCCCAATCAGTCCACGCTCGTAGATCACGCCTAGCGTTTGTTTCTCTGCATCGA
CCGGAACAACATTCATGACCCATGACGGGTACTTCAGCATGGACGCGGCGAATCCACCGA
GGTAAGCGTTCATGTCCATTATGTTCCTGAACCTCCCATGCGAAATCTCAGGCACTATCT
TCTTGTAATACGCTATCCTCTCTTTCCAAACCTCGTTGTCTTCTCTGAACTTCTCCGCGT
TCATGTCTTCTATCGTTCCTCTAATGATCCTA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4E673JQ U 1
AF RR4GM67JQ U 2
BS 1 103 RR4E673JQ
BS 104 104 RR4GM67JQ
BS 105 428 RR4E673JQ
BS 429 429 RR4GM67JQ
BS 430 749 RR4E673JQ
BS 750 752 RR4GM67JQ

RD RR4E673JQ 749 0 0
AAGTTAAAATGTCATCTTTTGAGATTGCTTGGTTCTAAACCTGATTGTGTTTAAACATGA
TTTTGGAAAAGAAGTACAAAACCGAAATTTAGTAAAAAAAAAA*CACACAAGAGGACATG
GACCTCCAGCTACCAAAGAGAGTTGGAAAAACTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TAGAAGGCTGACCAGTCCAATAAGTTTTGACAGCAACAAGAATCTTCTCAGGGTTGTACG
GACCTTTCTCATGATCTACAATCTGAGTGTTCCACTTCATTCCCTTCGCTATCCTCTCTA
CTTTCGTCAACGTCTCCACATTATCTCTCATCACAACCGTTCCTTCTGGTCTCAGTATTC
GATCCATCTCCAACAATATCAACGTAAAATCACACCTGTTTTCGTAAAAGCTGAACAATC
CTCCCGCGTGAATCATATCATAAGTTCTTGGATAAGTAGAGAATCCTTCACACCAGTCTT
GATACGTCCCAATCAGTCCACGCTCGTAGATCACGCCTAGCGTTTGTTTCTCTGCATCGA
CCGGAACAACATTCATGACCCATGACGGGTACTTCAGCATGGACGCGGCGAATCCACCGA
GGTAAGCGTTCATGTCCATTATGTTCCTGAACCTCCCATGCGAAATCTCAGGCACTATCT
TCTTGTAATACGCTATCCTCTCTTTCCAAACCTCGTTGTCTTCTCTGAACTTCTCCGCGT
TCATGTCTTCTATCGTTCCTCTAATGATC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GM67JQ 751 0 0
G
GTTAAAATGTCATCTTTTGAGATTGCTTGGTTCTAAACCTGATTGTGTTTAAACATGATT
TTGGAAAAGAAGTACAAAACCGAAATTTAGTAAAAAAAAAAACACACAAGAGGACATGGA
CTTCCAGCTACCAAAGAGAGTTGGAAAAACTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT***A
GAAGGCTGACCAGTCCAATAAGTTTTGACAGCAACAAGAATCTTCTCAGGGTTGTACGGA
CCTTTCTCATGATCTACAATCTGAGTGTTCCACTTCATTCCCTTCGCTATCCTCTCTACT
TTCGTCAACGTCTCCACATTATCTCTCATCACAACCGTTCCTTCTGGTCTCAGTATTCGA
TCCATCTCCAACAATATCAACGTAAAATCACACCTGTTTTCGTAAAAGCTGAACAATCCT
CCCGCGCGAATCATATCATAAGTTCTTGGATAAGTAGAGAATCCTTCACACCAGTCTTGA
TACGTCCCAATCAGTCCACGCTCGTAGATCACGCCTAGCGTTTGTTTCTCTGCATCGACC
GGAACAACATTCATGACCCATGACGGGTACTTCAGCATGGACGCGGCGAATCCACCGAGG
TAAGCGTTCATGTCCATTATGTTCCTGAACCTCCCATGCGAAATCTCCGGCACTATCTTC
TTGTAATACGCTATCCTCTCTTTCCAAACCTCGTTGTCTTCTCTGAACTTCTCCGCGTTC
ATGTCTTCTATCGTTCCTCTAATGATCCTA

QA 2 751 2 751
DS 



AS 1 2

CO CL6416Contig1 935 2 2 U
GGAAAGAAAACGAACGAACCCTAACTCGGACATGGAAGGAGAGCTTCAAGAAGACTGGGA
AGTGGTGATCGAGAGGTCTGGAACTACTACTCAGGAGGGGGAGAATCCGAAGAGCTTAGA
GGAGATTGAAGATGGCACGCGAGGTATGGTTACCTTCGATTACTTCTCTATCGAGAACTC
AAACTTTGTGGGTCGCGTTGATGCGATCGATGAGGATGGATCTGTTCAATCGGGTAGTCC
AGGCTGGGTCGAACCTATCTCCGACGCTCCCTATGGCCCTAAGCTTTTTAGCGAGTTATG
GTCTGATTCCAGCAGCGATCGGCTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAACAACGAGTTGGG
TTTGGAGAAATCAGAGGAAGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAGGAATCGCCAGT
TTCAGTAGTAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTCATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAG
GGTATTTATGTGGTGGAAGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTTTTCAGAGTTAA
TCCTATCTGGTCTTTCTCCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATGTTAGGGCGCAG
ATTGTATAATATGAAGAAGAGCAAGAGCTCTACCTTGCAGCTTAAGGTCTTCCTTAATGA
TAAGAAGGTTGCGAATCATGCTGCTCGGTTGAATGAAGCAGCAATCTCATTAGTGAAACG
TGTGCCCATAATCAGGCCAGCACTCCCATCATCGGTGGTGGGTATGAACCAGTGGCCTAT
GATGAGTTTAAGGTGAAATATAATGCATATATATGCAAGATAAATGATTGATGTGGTTGG
CATGTATCATATGATTGTGTTATATGACAAGTCTCAGAATGGTACAAAATATGCTTGTAA
GTTTTTACCGTGTGTGTATATAAATACTTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GJ01TF U 1
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BS 643 935 RR4GJ01JQ

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AGGCTGGGTCGAACCTATCTCCGACGCTCCCTATGGCCCTAAGCTTTTTAGCGAGTTATG
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TTCAGTAGTAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTCATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAG
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DS 

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TGATGTGGTTGGCATGTATCATATGATTGTGTTATATGACAAGTCTCAGAATGGTACAAA
ATATGCTTGTAAGTTTTTACCGTGTGTGTATATAAATACTTTTACTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL6417Contig1 1088 2 2 U
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TGGGAGCTTTTCCTCCTATGCATTGTTCTCCTCCATTTGGGATAGGCAACTGCTCCAGAG
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ATTTCTATATAGCCTGGGTGTTGCACCCGCTGGTGTTTGGGGATTATCCTGATGTGATGA
AGAGAACCGTGGGGGAGAGGTTACCAAGCTTTTCGAAAGAAGAATCAGAACTCGTTAAAG
GCTCATCCGACTTCTTGGGACTCATTCACTATACAACAATGTACACGGCACAATTATCTA
GTAATATCCACGCAGGAGATTTTAATTCAGACATGAATGCTCTACTACTACCCATTGGGA
ATTCTACACTGGTCAAGTTTGATTTGCTTCCATGGGGTCTTGAAGGAGTGTTGGAATACA
TAAAGCAGAACTATGGGAATATTCCCATCTACATTATTGAAAATGGTCTACCAACTAACC
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ATCCAGAACGTGAAAGATCTCCAAAAACCTCTGCTCTTTGGTACACTGCTCTTCTCGAGG
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AAGAGTGTCCCGGTTGGTCTCTATTCTAGTTTGGTTTATTTATTCAGCTGAGGACATTAC
TCACGTACGTAATGTAATGAATACAACAACAAAAAATGTTGCAATAAGAAAGTGGAATGT
ATTGTGCC


BQ
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AF RR4DQ71TF U 1
AF RR4DQ71JQ C 371
BS 1 724 RR4DQ71TF
BS 725 1088 RR4DQ71JQ

RD RR4DQ71TF 724 0 0
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GTAATATCCACGCAGGAGATTTTAATTCAGACATGAATGCTCTACTACTACCCATTGGGA
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TAAAGCAGAACTATGGGAATATTCCCATCTACATTATTGAAAATGGTCTACCAACTAACC
AGCATTCATCTCTTAATGACGTGGGAAGAGTTGAATACCTTCATGCGTATATTGCTGCTG
TTCT

QA 1 724 1 724
DS 

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CGCAGGAGATTTTAATTCAGACATGAATGCTCTACTACTACCCATTGGGAATTCTACACT
GGTCAAGTTTGATTTGCTTCCATGGGGTCTTGAAGGAGTGTTGGAATACATAAAGCAGAA
CTATGGGAATATTCCCATCTACATTATTGAAAATGGTCTACCAACTAACCAGCATTCATC
TCTTAATGACGTGGGAAGAGTTGAATACCTTCATGCGTATATTGCTGCTGTTCTCAGTTC
AGTGAGAAATGGGTCAGATATAAGAGGCTATTTCCAGTGGTCCTTCATGGATTTGTACGA
GTTTATGGGTCCCAATTACACATATGGATTATACTATGTGAATTTCAGCGATCCAGAACG
TGAAAGATCTCCAAAAACCTCTGCTCTTTGGTACACTGCTCTTCTCGAGGGAACAATCGT
TAGTTCACAAAAGCTGAAGAACCTCTCGATGTCTTCTTCTCAGTAAATATAAGAGTGTCC
CGGTTGGTCTCTATTCTAGTTTGGTTTATTTATTCAGCTGAGGACATTACTCACGTACGT
AATGTAATGAATACAACAACAAAAAATGTTGCAATAAGAAAGTGGAATGTATTGTGCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6418Contig1 810 2 2 U
CAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTTTCTCAAC
ATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTTACACTGGCTA
CTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGGCTATGGATGT
TAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCTGGGGTTGCTCACAA
GATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGAA
GAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTA
CCATAAACGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCT
TTGGAACGGCTCCGTTGTGGCTCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTA
CAGAGACTTTGTTCTTGGGCTTAACAAGGCTCTCGCTGCTGACCCTAGGATCGAGATTTG
CATGCTTCCCGTTGGTGATGGGATCACTATCTGTCGTCGGATCAATTGATTGAGATATCA
CACTTTTGGGTGTGGGTGGATAACTTTCCTCCCTCTGTTTTTCAAATTGCTCTTATCACC
ACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGTATTTTGTTTAGTATCTCCCCAT
TGTTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAACAGATAAATAATGTTCTCAACCTTATATGA
TAAAACATCTAAAACAAAATATCACTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ34TF U 1
AF RR4CQ34JQ C 26
BS 1 124 RR4CQ34TF
BS 125 810 RR4CQ34JQ

RD RR4CQ34TF 124 0 0
CAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTTTCTCAAC
ATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTTACACTGGCTA
CTCT

QA 1 124 1 124
DS 

RD RR4CQ34JQ 785 0 0
GACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTT*CTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCA
AGAACACTATGGAGATCGGCGTTT*ACACTGGCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCT
CTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGGCTATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGG
CTACCGATCATCGAGAAAGCTGGGGTTGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCT
CTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATA
TTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACCATAAACGTTTGATTGATCTTGTG
AAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCTCCT
CCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGGGCTTAAC
AAGGCTCTCGCTGCTGACCCTAGGATCGAGATTTGCATGCTTCCCGTTGGTGATGGGATC
ACTATCTGTCGTCGGATCAATTGATTGAGATATCACACTTTTGGGTGTGGGTGGATAACT
TTCCTCCCTCTGTTTTTCAAATTGCTCTTATCACCACCATTCACCAACCAACCAAAATGG
ACCGCTTTTATGTATTTTGTTTAGTATCTCCCCATTGTTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTT
GTGAACAGATAAATAATGTTCTCAACCTTATATGATAAAACATCTAAAACAAAATATCAC
TCATT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL6419Contig1 361 2 1 U
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TACGGACTGGGGGACGGTGATTGTAGCGGTGTCTCTGTTCATCCTACTACCACCAGGGCT
ACTGTTTCAGATTCCGGCGAGGACCAGAGTGGTTGAGTTCGGGAACATGAGCACGAGCGG
CATAGCGATTTTGGTTCACGCAGTTATATACTTTTGTATTCTTACAATCTTGGTGGTTGC
TATACAAGTTCACATCCATTTCTGATCTCCGCTCTTTCTTATATCATGTAAATATAACAA
AAAGTGGGGAGCTTTATTGCAAATTCTTAATGTAATGTACAAATCTCTCTGATAAAAAAA
A


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4E233TF U 1
AF RR4DZ11TF U 1
BS 1 361 RR4DZ11TF

RD RR4E233TF 353 0 0
GGAGCAAAAACAAACACTCTATAGTCTATACATACACACACTCGAACACTCATCCATGAG
TACGGACTGGGGGACGGTGATTGTAGCGGTGTCTCTGTTCATCCTACTACCACCAGGGCT
ACTGTTTCAGATTCCGGCGAGGACCAGAGTGGTTGAGTTCGGGAACATGAGCACGAGCGG
CATAGCGATTTTGGTTCACGCAGTTATATACTTTTGTATTCTTACAATCTTGGTGGTTGC
TATACAAGTTCACATCCATTTCTGATCTCCGCTCTTTCTTATATCATGTAAATATAACAA
AAAGTGGGGAGCTTTATTGCAAATTCTTAATGTAATGTACAAATCTCTCTGAT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR4DZ11TF 361 0 0
GGAGCAAAAACAAACACTCTATAGTCTATACATACACACACTCGAACACTCATCCATGAG
TACGGACTGGGGGACGGTGATTGTAGCGGTGTCTCTGTTCATCCTACTACCACCAGGGCT
ACTGTTTCAGATTCCGGCGAGGACCAGAGTGGTTGAGTTCGGGAACATGAGCACGAGCGG
CATAGCGATTTTGGTTCACGCAGTTATATACTTTTGTATTCTTACAATCTTGGTGGTTGC
TATACAAGTTCACATCCATTTCTGATCTCCGCTCTTTCTTATATCATGTAAATATAACAA
AAAGTGGGGAGCTTTATTGCAAATTCTTAATGTAATGTACAAATCTCTCTGATAAAAAAA
A

QA 1 361 1 361
DS 



AS 1 2

CO CL6420Contig1 686 2 2 U
GGATCGCACTCTCTCTCTCAAAATCTTATCATCCTATCTCTCTGTACACAATGAACAACA
AATCAACAAAGACTGAGAGAAGAAGAAGCAATCTCTTTTCTCAAAAAAAGAAGAAGAAGC
AATCTCACTATCACAATATCTCTCGCACAAGAAGAAGAAGAAGAATATGTCATGAAGAAG
CAGAGATGGAGAGGGAGCTTCGGTGTGGCTCTACCTCATCTCGTCGCCACCTCTCTTCAC
TTCGTCTCCAATCATCAAGTTCTTCTCAGCCTCTCTTTGCCATGAACCTCGCCGGTCAAG
ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATTTTGTATTGTTTTTGGTAAAGTTAGGTGG
GTGTTCGTGAGCTTCAAGACAGGTACGACGTCGTGGTGCGGGGGTGTTGCTAGCCGCCTC
TGGTCAATGGAGAGTAAAGACGAAGCTTCATGGTCGTTCCCGTCGGAGTTATCAGCTAGG
AACGGGGAGAGCTGAGAAAGAGTGAAGACAAGGACTGGAGCTAAGGGTCACCGGAGAACA
CGGCGGCGGCAGTTTGATAACGATCTCATTGTCGGTTATCTAGGGCTTCTTTGGTTTTTC
GGTTTAATTGTCTGGGTTCTTCTTTTATCTGATTGTATCTGCTTACCATTAACCATTCCC
GGTTTGGGACAAATTAATAATACTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE65TF U 1
AF RR4EE65JQ C 269
BS 1 622 RR4EE65TF
BS 623 686 RR4EE65JQ

RD RR4EE65TF 622 0 0
GGATCGCACTCTCTCTCTCAAAATCTTATCATCCTATCTCTCTGTACACAATGAACAACA
AATCAACAAAGACTGAGAGAAGAAGAAGCAATCTCTTTTCTCAAAAAAAGAAGAAGAAGC
AATCTCACTATCACAATATCTCTCGCACAAGAAGAAGAAGAAGAATATGTCATGAAGAAG
CAGAGATGGAGAGGGAGCTTCGGTGTGGCTCTACCTCATCTCGTCGCCACCTCTCTTCAC
TTCGTCTCCAATCATCAAGTTCTTCTCAGCCTCTCTTTGCCATGAACCTCGCCGGTCAAG
ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATTTTGTATTGTTTTTGGTAAAGTTAGGTGG
GTGTTCGTGAGCTTCAAGACAGGTACGACGTCGTGGTGCGGGGGTGTTGCTAGCCGCCTC
TGGTCAATGGAGAGTAAAGACGAAGCTTCATGGTCGTTCCCGTCGGAGTTATCAGCTAGG
AACGGGGAGAGCTGAGAAAGAGTGAAGACAAGGACTGGAGCTAAGGGTCACCGGAGAACA
CGGCGGCGGCAGTTTGATAACGATCTCATTGTCGGTTATCTAGGGCTTCTTTGGTTTTTC
GGTTTAATTGTCTGGGTTCTTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4EE65JQ 418 0 0
GCCTCTCTTTGCCATGAACCTCGCCGGTCAAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
GATTTTGTATTGTTTTTGGTAAAGTTAGGTGGGTGTTCGTGAGCTTCAAGACAGGTACGA
CGTCGTGGTGCGGGGGTGTTGCTAGCCGCCTCTGGTCAATGGAGAGTAAAGACGAAGCTT
CATGGTCGTTCCCGTCGGAGTTATCAGCTAGGAACGGGGAGAGCTGAGAAAGAGTGAAGA
CAAGGACTGGAGCTAAGGGTCACCGGAGAACACGGCGGCGGCAGTTTGATAACGATCTCA
TTGTCGGTTATCTAGGGCTTCTTTGGTTTTTCGGTTTAATTGTCTGGGTTCTTCTTTTAT
CTGATTGTATCTGCTTACCATTAACCATTCCCGGTTTGGGACAAATTAATAATACTAA

QA 1 418 1 418
DS 



AS 1 2

CO CL6421Contig1 354 2 1 U
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GAAAAAGAAGAAGGACAAGGACCATGATGATGATTGTGATGAGAAAAAGAAGAAGAAGGA
TCATTATGACAATGATGATGAGAAGAGGAAGAAGAAAGACTATCGTGATGGCTATGATGA
AAAGAAGAAGAAGGACCATCATGATAGTGATGATGAGAAGAATAAGAAGAAGGATCACTA
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GTACATCTCTTTTAAGTTTCTAACACTAATTAAGAAACCAACGCACACTTTTTC


BQ
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AF RR4AZ57JQ C 1
AF RR4AZ57TF U 1
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GAAAAAGAAGAAGGACAAGGACCATGATGATGATTGTGATGAGAAAAAGAAGAAGAAGGA
TCATTATGACAATGATGATGAGAAGAGGAAGAAGAAAGACTATCGTGATGGCTATGATGA
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GTACATCTCTTTTAAGTTTCTAACACTAATTAAGAAACCAACGCACACTTTTTC

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR4AZ57TF 354 0 0
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TCATTATGACAATGATGATGAGAAGAGGAAGAAGAAAGACTATCGTGATGGCTATGATGA
AAAGAAGAAGAAGGACCATCATGATAGTGATGATGAGAAGAATAAGAAGAAGGATCACTA
CAAGCACAACAAAGGACATCGTGAATACGATGACTAAATAACCTTGTTTTGCTTCCGGGA
GTACATCTCTTTTAAGTTTCTAACACTAATTAAGAAACCAACGCACACTTTTTC

QA 1 354 1 354
DS 



AS 1 2

CO CL6422Contig1 660 2 3 U
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TGGTTGTCCTGGTCTAGCTGGGAGAACCAAAGGGTTAAAGAGATTTGGTAACATCCTTCT


BQ
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AF RR4GZ77JQ U 4
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QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4GZ77TF 660 0 0
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TGAAGGATCATCGTCCTCTTTCTTAGCCTCTGGACTTGGATTCTCAGCCTCATTGGACAA
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GTGGTCTTGTTTCTCAGTCTCTGAGCTCTTATTCTCTGCAGCAGGTTCATCACCATCGGA
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TGGGGCATAAGCAGTAGGCAGAGAAGGCATGGTCAAGCCTGGGTTTACTGGCACTGGGTG
ATCAAACTTGCAGCTTGCTCCATACTTGCAAAATCCATAGGCCTTGAAGTTACCACATGC
TGGTTGTCCTGGTCTAGCTGGGAGAACCAAAGGGTTAAAGAGATTTGGTAACATCCTTCT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

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AAGAGGTCGCCTACTCCATAGTCGAATATATCCCAGTAATCGGCACCCTGTACTCTCTAA
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ACTACCTCGAGGGCTCCGTCCGCGATGTCATTCTCTTAAGCGAAACCGCCGAACCCAAAG
AAGTCGCCATTATACACACCATGGCCGAGTCGTTCACCGACAAAATGATTGAGCTCTACC
ATAAAGAGCCCAAAAGGCCTGAGATCAATATCACCCAAAAGCTGGATGACCAAAGCGGAC
ATGTACTCGTCGCCGAGTCCTCACAGGGCAAGAATGTGACTCAACTCTTCGGAGACAAAG
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ATGCCCCGGACGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGTACGACGGGGGAC
GAGTCACCTTCTCCTGGAAATGGACTAAAAACTACTATGGAGAAGAGAATGTACCTGAAG
CCACGTATGGTCGTATTAAATTGGACGCCGGCACACCCACACGGTTCAAATTGTCCAGCC
GCAAGGGTGCCGGATGGGAAGGTTATGACTTTTGGGGTACGATAGACTCCAAGGACGAAA
TCAATGCTACAACCATAATCGATAATAAAGAAACTCAGATTGTCTTCAAAAGGTTGGACG
GAACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCGATACCCTGTACTAAAAATAATTTATCGTTGTT
TTTTTAATATTCAGTACTTGAAAAATAAAATGCTAATTGAATACACAACGGATTTTTCCG
TTGTTTATTTGAATTTAGCTTATTGTCTTTAATAGTTATGTAATATCATTACATTAATAA
AAGTCTGGTCGGTCTGGATCCTCTTGTGGAGGTCTGATCCAACCCAGCCCCCTATGG


BQ
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AF RR4A648TF U 1
AF RR4A648JQ C 314
BS 1 676 RR4A648TF
BS 677 1017 RR4A648JQ

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AAGTCGCCATTATACACACCATGGCCGAGTCGTTCACCGACAAAATGATTGAGCTCTACC
ATAAAGAGCCCAAAAGGCCTGAGATCAATATCACCCAAAAGCTGGATGACCAAAGCGGAC
ATGTACTCGTCGCCGAGTCCTCACAGGGCAAGAATGTGACTCAACTCTTCGGAGACAAAG
CCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTGTTCACTGGTACGCTCACTGACCCCAGAT
ATGCCCCGGACGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGTACGACGGGGGAC
GAGTCACCTTCTCCTGGAAATGGACTAAAAACTACTATGGAGAAGAGAATGTACCTGAAG
CCACGTATGGTCGTATTAAATTGGACGCCGGCACACCCACACGGTTCAAATTGTCCAGCC
GCAAGGGTGCCGGATG

QA 1 676 1 676
DS 

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AAGGCCTGAGATCAATATCACCCAAAAGCTGGATGACCAAAGCGGACATGTACTCGTCGC
CGAGTCCTCACAGGGCAAGAATGTGACTCAACTCTTCGGAGACAAAGCCAAGGGTGTGCA
CCACTTTCACGGCGCTGTGTTCACTGGTACGCTCACTGACCCCAGATATGCCCCGGACGG
CGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGTACGACGGGGGACGAGTCACCTTCTC
CTGGAAATGGACTAAAAACTACTATGGAGAAGAGAATGTACCTGAAGCCACGTATGGTCG
TATTAAATTGGACGCCGGCACACCCACACGGTTCAAATTGTCCAGCCGCAAGGGTGCCGG
ATGGGAAGGTTATGACTTTTGGGGTACGATAGACTCCAAGGACGAAATCAATGCTACAAC
CATAATCGATAATAAAGAAACTCAGATTGTCTTCAAAAGGTTGGACGGAACCTGAACCTG
GCCCTTTCAACAGCGATACCCTGTACTAAAAATAATTTATCGTTGTTTTTTTAATATTCA
GTACTTGAAAAATAAAATGCTAATTGAATACACAACGGATTTTTCCGTTGTTTATTTGAA
TTTAGCTTATTGTCTTTAATAGTTATGTAATATCATTACATTAATAAAAGTCTGGTCGGT
CTGGATCCTCTTGTGGAGGTCTGATCCAACCCAGCCCCCTATGG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6424Contig1 1089 2 2 U
CAATCGCATAAAACTTCTTCAAATAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCAGAGGA
AGAAACCGTTCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAGAAGAA
AGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCTGCGAAATCTCCGAG
GAAGAGATCTTCTTCTTCTCACCCAACCTACGAAGAGATGATTAAAGACGCGATCACGAC
GTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTGATAGAGGAGAAGCA
GAAGACGCTTCCTCCCACCTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTCGTCGC
TTCAGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCTTCCTCCGCTACTAAATC
AACCGCCGTTGCTGCTCCTGCTCCTAAACCGTCTGCTCCGGTTAAGAAGAAGGCGACCCT
TGCTAAACCGAAGGCTGCTAACCGGCTGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCTGCTGTT
GCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTGAACCGAAGACGAAGACA
GTGGCTGCTGTGTCCAAGACTAAAGCTGTCGCTGCTGCTGCTAAGCCTAACGCTAAAGAG
AGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAGAAGGCTGCT
CCTCCTGCTAAGAAAGCCGCAGCGGCTGTAACTAAAAAGGCAAAGGCCAAGGCTCCGGCT
AAGAGCGTGGAGGCGAAGGCTGTAAAGTCTCCGGCGAAGAGGGTTTCGACGAGGAAGGTG
AAGAAGTGAAAGAAGATTGGGGTTTAGGGTTAGTGAATTGGGGAGATTGAATGAATGAAT
GAATGAATACATGTGTTGTAATGGTGGTTAGAGCTTCTCTTAGGGGGTAGTCTTTGTATA
ATTTGAATCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTTATCTTTGTTTCTGGTTTCTTCT
TGAAACCCCCCTTTTGTTCCTTGTTGTAATTTTTGTGTTTGTTTTGAAATTAAAGCTTCT
TACATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF91TF U 1
AF RR4CF91JQ C 345
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BS 712 1089 RR4CF91JQ

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AGAAACCGTTCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAGAAGAA
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GTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTGATAGAGGAGAAGCA
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GTGGCTGCTGTGTCCAAGACTAAAGCTGTCGCTGCTGCTGCTAAGCCTAACGCTAAAGAG
AGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4CF91JQ 745 0 0
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GACCAAAGCTGCTGTTGCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTGA
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GAAGAAGAAGGCTGCTCCTCCTGCTAAGAAAGCCGCAGCGGCTGTAACTAAAAAGGCAAA
GGCCAAGGCTCCGGCTAAGAGCGTGGAGGCGAAGGCTGTAAAGTCTCCGGCGAAGAGGGT
TTCGACGAGGAAGGTGAAGAAGTGAAAGAAGATTGGGGTTTAGGGTTAGTGAATTGGGGA
GATTGAATGAATGAATGAATGAATACATGTGTTGTAATGGTGGTTAGAGCTTCTCTTAGG
GGGTAGTCTTTGTATAATTTGAATCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTTATCTTT
GTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCCCCTTTTGTTCCTTGTTGTAATTTTTGTGTTTGTTT
TGAAATTAAAGCTTCTTACATGGTC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

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GGGGTCATAATGGGGGCTCCAATCAACGACTCCTCTAATTTGGTATCTTTCTCATAACGA
CGCCGTCTAGCTCTTTTTTCATTCTTCATCCTTGATCCTTCATCATTCAGTTCTCTTTCT
TCTTTCTATCGTCTCTTTTCAATTGTCTTTCCTTGTTTCTTAGTCTTCTGTCGAAATCTT
AAAACCTTCTTTTTCTTCCCTTTCTTTCGTACGTTGTTTAAGCCTCATATCATATCCGTT
ATCCCAAGGATATTTGCAAAGAAAAGAAAAAAGAGAAGAAAGCCTATTCTGTTTTCAAAT
TTACAGAGCATTCATTCAGATGGGAAGCTGCGTCTCTAAGGATACAGGAGACGATGATTC
AGTCCATAACGTTGATTTCTCAGGTGGCAACGTTCATCTTATCACAACAAAAGAGAGCTG
GGATGAGAAATTAGCTGAAGCTGGTCGTGATGGCAAAATTGTGATTGCAAACTTCAGCGC
GACTTGGTGTGGTCCTTGTAAGATCGTGGCACCGTTTTACGTCGAGCTCTCTGAGAAACA
TCCTTCTCTTATGTTCCTTCTCGTAGATGTTGATGAACTCAGCGATTTTAGCTCAACATG
GGACATAAAGGCAACACCAACCTTCTTCTTCCTCAAGAACGGAGAGCAAATAGGCAAGCT
TGTCGGTGCAAACAAGCCCTAGCTACAGAAGAAGGTTACTTCTATCATCGACTCTGTCCC
TGAAAGTCCACGACGGCCTTGATGCCCCCAAGAAGGAGTCAACTGTGGAGTGTATCAAAA
ACTCTGTTTTACGATGTATGTAAAATGCACAAGGCTTTTTTTATAAAAAAATGTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG39TF U 1
AF RR4DG39JQ C 357
BS 1 692 RR4DG39TF
BS 693 693 RR4DG39JQ
BS 694 694 RR4DG39TF
BS 695 695 RR4DG39JQ
BS 696 719 RR4DG39TF
BS 720 720 RR4DG39JQ
BS 721 728 RR4DG39TF
BS 729 729 RR4DG39JQ
BS 730 735 RR4DG39TF
BS 736 736 RR4DG39JQ
BS 737 748 RR4DG39TF
BS 749 838 RR4DG39JQ

RD RR4DG39TF 752 0 0
GGGGTCATAATGGGGGCTCCAATCAACGACTCCTCTAATTTGGTATCTTTCTCATAACGA
CGCCGTCTAGCTCTTTTTTCATTCTTCATCCTTGATCCTTCATCATTCAGTTCTCTTTCT
TCTTTCTATCGTCTCTTTTCAATTGTCTTTCCTTGTTTCTTAGTCTTCTGTCGAAATCTT
AAAACCTTCTTTTTCTTCCCTTTCTTTCGTACGTTGTTTAAGCCTCATATCATATCCGTT
ATCCCAAGGATATTTGCAAAGAAAAGAAAAAAGAGAAGAAAGCCTATTCTGTTTTCAAAT
TTACAGAGCATTCATTCAGATGGGAAGCTGCGTCTCTAAGGATACAGGAGACGATGATTC
AGTCCATAACGTTGATTTCTCAGGTGGCAACGTTCATCTTATCACAACAAAAGAGAGCTG
GGATGAGAAATTAGCTGAAGCTGGTCGTGATGGCAAAATTGTGATTGCAAACTTCAGCGC
GACTTGGTGTGGTCCTTGTAAGATCGTGGCACCGTTTTACGTCGAGCTCTCTGAGAAACA
TCCTTCTCTTATGTTCCTTCTCGTAGATGTTGATGAACTCAGCGATTTTAGCTCAACATG
GGACATAAAGGCAACACCAACCTTCTTCTTCCTCAAGAACGGAGAGCAAATAGGCAAGCT
TGTCGGTGCAAACAAGCCCTAGCTACAGAAGATG*TTACTTCTATCATCGACTCTGTCC*
TGAAAGTC*ACGACG*CCTTGATGCCCC
AGAA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DG39JQ 482 0 0
ATC
CAGTCCATAACGTTGATTTCTCAGGTGGCAACGTTCATCTTATCACAACAAAAGAGAGCT
GGGATGAGAAATTAGCTGAAGCTGGTCGTGATGGCAAAATTGTGATTGCAAACTTCAGCG
CGACTTGGTGTGGTCCTTGTAAGATCGTGGCACCGTTTTACGTCGAGCTTTCTGAGAAAC
ATCCTTCTCTTATGTTCCTTCTCGTAGATGTTGATGAACTCAGCGATTTTAGCTCAACAT
GGGACATAAAGGCAACACCAACCTTCTTCTTCCTCAAGAACGGAGAGCAAATAGGCAAGC
TTGTCGGTGCAAACAAGCCCTAGCTACAGAAGAAGGTTACTTCTATCATCGACTCTGTCC
CTGAAAGTCCACGACGGCCTTGATGCCCCCAAGAAGGAGTCAACTGTGGAGTGTATCAAA
AACTCTGTTTTACGATGTATGTAAAATGCACAAGGCTTTTTTTATAAAAAAATGTCATG

QA 4 482 4 482
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6427Contig1 973 2 2 U
AACTTCTTCAAGCTGCTGCTGATGGGGATCCCGCAAATACCAAATGCGTTGTTCGTCTTA
TCGATGACTTCAAGCACGCAGGTCCCAACGGGCAGCATTTATGCATGGTGCTTGAGTTTC
TTGGCGATAGCTTGCTCCGTTTGATTAAATACAACCGTTATAAAGCCATGGAGTTGAATA
AAGTGCGGGAGATATGCAAATGTATACTGACCGGTCTAGACTATCTGCATCGTGAACTCG
GTATGATCCACTCCGACTTAAAACCCGAAAACATCCTTCTCTGTTCCACCATTGACGCTG
CCAAGGATCCCATCAGATCCGGACTAACACCGATACTAGAAAAACCAGAGGGAAACCAAA
ACGGTGCAACAACCATGAATCTGATTGAGAAGAAGTTGAAGAGGACCACCTTGCTCTTAT
GATGGAACTCTTAGGAAAAATACCTCGGAAGATTGCCATTGGAGGTGCGAAATCAAAGGA
TTACTTTGACAGACATGGTGACCTAAAGAGGATCCGGAGGTTGAAATATTGGCTACTGGA
CCGTTTACTGACAGATAAGTACAAGCTTCAAGAAGCAGAAGCACAAGAATTTGCAGATTT
TCTTTGTCCGATTCTTTCTTTTGAGCCAGAGAAACGACCTAGTGCTCAACAATGCCTGCA
GCATCCTTGGCTGAATCTCAGGGCACAGAACAATGAAGATCATATTGAAGGTCAGATGAG
TAACTTGCAGATCAAAGGTTGAAGAATTTTAACTTTTCAATTATGACCTTTTTGGCTTAC
AAATGATATATAACTTCTCTTCTCCTTTTCATTATTTGGTTCGTTTCTGTTTGAATAATT
TTGATTCTTTATTTGTTTGTTCTTCATTTTTTTACTAAATTTTGGAGAGACATGATTAGT
GACTAACCATTGGTTTATGTATAAAACATTGGAACGTAATGAGCTTGGTTTCATGAAAAC
TCTTTGTTATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM52TF U 1
AF RR4BM52JQ C 182
BS 1 243 RR4BM52TF
BS 244 973 RR4BM52JQ

RD RR4BM52TF 243 0 0
AACTTCTTCAAGCTGCTGCTGATGGGGATCCCGCAAATACCAAATGCGTTGTTCGTCTTA
TCGATGACTTCAAGCACGCAGGTCCCAACGGGCAGCATTTATGCATGGTGCTTGAGTTTC
TTGGCGATAGCTTGCTCCGTTTGATTAAATACAACCGTTATAAAGCCATGGAGTTGAATA
AAGTGCGGGAGATATGCAAATGTATACTGACCGGTCTAGACTATCTGCATCGTGAACTCG
GTA

QA 1 243 1 243
DS 

RD RR4BM52JQ 792 0 0
AGTGCGGGAGATATGCAAATGTATACTGACCGGTCTAGACTATCTGCATCGTGAACTCGG
TATGATCCACTCCGACTTAAAACCCGAAAACATCCTTCTCTGTTCCACCATTGACGCTGC
CAAGGATCCCATCAGATCCGGACTAACACCGATACTAGAAAAACCAGAGGGAAACCAAAA
CGGTGCAACAACCATGAATCTGATTGAGAAGAAGTTGAAGAGGACCACCTTGCTCTTATG
ATGGAACTCTTAGGAAAAATACCTCGGAAGATTGCCATTGGAGGTGCGAAATCAAAGGAT
TACTTTGACAGACATGGTGACCTAAAGAGGATCCGGAGGTTGAAATATTGGCTACTGGAC
CGTTTACTGACAGATAAGTACAAGCTTCAAGAAGCAGAAGCACAAGAATTTGCAGATTTT
CTTTGTCCGATTCTTTCTTTTGAGCCAGAGAAACGACCTAGTGCTCAACAATGCCTGCAG
CATCCTTGGCTGAATCTCAGGGCACAGAACAATGAAGATCATATTGAAGGTCAGATGAGT
AACTTGCAGATCAAAGGTTGAAGAATTTTAACTTTTCAATTATGACCTTTTTGGCTTACA
AATGATATATAACTTCTCTTCTCCTTTTCATTATTTGGTTCGTTTCTGTTTGAATAATTT
TGATTCTTTATTTGTTTGTTCTTCATTTTTTTACTAAATTTTGGAGAGACATGATTAGTG
ACTAACCATTGGTTTATGTATAAAACATTGGAACGTAATGAGCTTGGTTTCATGAAAACT
CTTTGTTATCCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6428Contig1 452 2 2 U
GGGGGGGGTTGCGCGACTGTAGAAGAAGAGAAGAAGCAAATGGCGTGGAGAGGAAACGTA
TCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCC
GCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCGCCAAACCCTAAGTTTCCC
TTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCGCGATATGATATGGGT
GTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAA
GACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTGTTTTTGTTTT
TGTTTTTTTTTTCCAGATGATCCCGAATAAGCTTTAACTGGTAACACTCATTTGACATTT
TCCTGTCAATCTACTATCCGATTACTTTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO84TF U 1
AF RR4EO84JQ C 6
BS 1 371 RR4EO84TF
BS 372 452 RR4EO84JQ

RD RR4EO84TF 371 0 0
GGGGGGGGTTGCGCGACTGTAGAAGAAGAGAAGAAGCAAATGGCGTGGAGAGGAAACGTA
TCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCC
GCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCGCCAAACCCTAAGTTTCCC
TTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCGCGATATGATATGGGT
GTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAA
GACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTGTTTTTGTTTT
TGTTTTTTTTT

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR4EO84JQ 447 0 0
GGGTTGCGCGACTGTAGAAGAAGAGAAGAAGCAAATGGCGTGGAGAGGAAACGTATCGAA
GTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTTTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCGCCAG
AACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCGCCAAACCCTAAGTTTCCCTTCCT
GATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCGCGATATGATATGGGTGTGGA
GAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAGACCT
TGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTT
TTTTTTTCCAGATGATCCCGAATAAGCTTTAACTGGTAACACTCATTTGACATTTTCCTG
TCAATCTACTATCCGATTACTTTCGTC

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

CO CL6429Contig1 1175 2 4 U
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GATTCAGAGCAGGAGACAAAGCTCATTTCACTCATTTCTCAGCTAGTAAACCTCGACAAC
TTTCAACGGTTTGTGTTATACGAAGTGAAACTGGATTGCGAGTCAGAGGTCAAACCAATG
GTTATTCATAATCCATCTCCTCAGGTCAATGGATTTGGATTCGCAGCCGAAGCCGGAGTC
GGAGTCGGAGCTCATGTCACTCGTTACTCAAACAATCTCTCTTTTCAACTCTATTGATTT
GGATTCCCAGCCGAAGCCTCTGTCACAGCTCATAACACTACTTTCTCAAAACATATAACC
CGATACATCCACATCTACTCACTCTAGTAGGAGGATACGACCGTGTCATGATTTATTATG
AAGATACATGCTCAGCTTGTGGCTGGAGGTGTTCGGGTTTCTTTTACAAGTGTGGTAAAG
AAGATTGTGATTTTCATCTGCATGTGCAGTGTGCTACAATTTCTGAGCCATTAGTCCATG
GAAGTCATGCACATCCTTTATTCCTAACATCCAAACCAGAAGAACAAAGAGAATGTTGTG
TTTGCAAATCTATGGGGAATGAGACATTCAATTGCATTGAGTGTGAGTGCGACTTTGCTT
TGTGTTTCGAATGTGCTACTTTGCCTGAAAAGGTGAGGTATAAGCATGATGATCATATGC
TCACTCTTTCTTATAGTAAGGAAACAAGTACCATGATGTATTGGTGTGAAGCTTGCGAAG
GAGAAGTAAAGCCAAAAGAGAGGTTTTATTCGTGTGATGAGTATTGTTGTGTCACCCTCC
ACATTGAATGCTTACTTGGGAAGGACTTATACATGAAACCCGGTTCATCTTTTATCATGC
CAAGCGATGAAAAGGTTAGTGTTCTGTCCAACAATCATCACATGTCTAGACCTATTTGTT
CCTTTTTTAAGGAGCGTTGTCTTGGAAAAGTAGTTTTCCAGTTTCGTGGAAAGCCTATTT
GTTCCATAGAATGTTGTTTCCGTTTCCGTTAAAATATTATATGGGGGTATTGTCACTAGA
GAGAGGCCAATGGAGGAGCTCGATGGTCATTAGACTCAGCGCTCATGTTGTAAGAACTAA
GTGATATTATATATGTGTATTCTGTGTTATTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE15TF U 1
AF RR4FE15JQ C 358
BS 1 692 RR4FE15TF
BS 693 693 RR4FE15JQ
BS 694 723 RR4FE15TF
BS 724 1175 RR4FE15JQ

RD RR4FE15TF 723 0 0
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TTTCAACGGTTTGTGTTATACGAAGTGAAACTGGATTGCGAGTCAGAGGTCAAACCAATG
GTTATTCATAATCCATCTCCTCAGGTCAATGGATTTGGATTCGCAGCCGAAGCCGGAGTC
GGAGTCGGAGCTCATGTCACTCGTTACTCAAACAATCTCTCTTTTCAACTCTATTGATTT
GGATTCCCAGCCGAAGCCTCTGTCACAGCTCATAACACTACTTTCTCAAAACATATAACC
CGATACATCCACATCTACTCACTCTAGTAGGAGGATACGACCGTGTCATGATTTATTATG
AAGATACATGCTCAGCTTGTGGCTGGAGGTGTTCGGGTTTCTTTTACAAGTGTGGTAAAG
AAGATTGTGATTTTCATCTGCATGTGCAGTGTGCTACAATTTCTGAGCCATTAGTCCATG
GAAGTCATGCACATCCTTTATTCCTAACATCCAAACCAGAAGAACAAAGAGAATGTTGTG
TTTGCAAATCTATGGGGAATGAGACATTCAATTGCATTGAGTGTGAGTGCGACTTTGCTT
TGTGTTTCGAATGTGCTACTTTGCCTGAAAAG*TGAGGTATAAGCATGATGATCATATGC
TCA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4FE15JQ 818 0 0
ACCCGATACATCCACATCTACTCACTCTAGTAGGAGGATACGACCGTGTCATGATTTATT
ATGAAGATACATGCTCAGCTTGTGGCTGGAGGTGTTCGGGTTTCTTTTACAAGTGTGGTA
AAGAAGATTGTGATTTTCATCTGCATGTGCAGTGTGCTACAATTTCTGAGCCATTAGTCC
ATGGAAGTCATGCACATCCTTTATTCCTAACATCCAAACCAGAAGAACAAAGAGAATGTT
GTGTTTGCAAATCTATGGGGAATGAGACATTCAATTGCATTGAGTGTGAGTGCGACTTTG
CTTTGTGTTTCGAATGTGCTACTTTGCCTGAAAAGGTGAGGTATAAGCATGATGATCATA
TGCTCACTCTTTCTTATAGTAAGGAAACAAGTACCATGATGTATTGGTGTGAAGCTTGCG
AAGGAGAAGTAAAGCCAAAAGAGAGGTTTTATTCGTGTGATGAGTATTGTTGTGTCACCC
TCCACATTGAATGCTTACTTGGGAAGGACTTATACATGAAACCCGGTTCATCTTTTATCA
TGCCAAGCGATGAAAAGGTTAGTGTTCTGTCCAACAATCATCACATGTCTAGACCTATTT
GTTCCTTTTTTAAGGAGCGTTGTCTTGGAAAAGTAGTTTTCCAGTTTCGTGGAAAGCCTA
TTTGTTCCATAGAATGTTGTTTCCGTTTCCGTTAAAATATTATATGGGGGTATTGTCACT
AGAGAGAGGCCAATGGAGGAGCTCGATGGTCATTAGACTCAGCGCTCATGTTGTAAGAAC
TAAGTGATATTATATATGTGTATTCTGTGTTATTGTTT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL6430Contig1 894 2 2 U
GAACCAATTAGATGAGCGAAAGCGTCTGAGGATGGCTCTAGATGCTGTATTATTACTAAT
TTCACTTGCACTCCTTTTACCTCTATTTGTATCTTCTTGATTGTGTCTTACCAAAAAAGC
TTCCCAACCTTTGCAGGCTCGTGGAATGAATTATTTACACAGCTGTAATCCAGTAATTGT
CCATCGTGATCTTAAATCTCCAAGCCTTCTAGTTGACAAAAACTGGGTTGTCAAGGTGTG
CGATTTTGGATTGTCTAGAATGAAACTAAGCACATACCTCTCTTCAAAGTCAACAGCAGG
CACGGCTGAGTGGATGGCTCCAGAAGTACTTAGAAATGAACCTGCGGATGAAAAGTACGT
ATTGTAAAGCACCTGCTTAACTGCTTTCTACTTTTTTTATACACGTGGTGTTCCCTTTTA
AAAAAACAGATCCATCATGTGAAAAAAACAGGTGTGATGTGTACAGCTATGGAGTAATTC
TATGGGAACTCTTTACGTTACAGCAACCATGGGGAAAGATGAACCCAATGCAAGTTGTTG
GTGCGGTTGGGTTTCAATCGACGACTAGAAATTCCTGAATCTGTGGATCCTCGAATTGCA
GATATCATCAGTAAATGTTGGCAGACGGATCCAAGGTTAAGACCAAGTTTTGCAGAGATT
ATGAACTCTCTAAAGCAGCTACAGAAACCTATAATGAGTCCAAACATACAAAGAGCTATT
CCCAGTTCTTCGTCAATGATCACTGATCAGGAACAATAATAGAGAGTTGAAGAAGATGAC
TAAATTGATGATGGTGGGATCATTCTGTGCATGTTTTGTTGTGGTGTGCTGGTTCATGTG
GACTTTCCCAATGTTTTTTTTTTGCGTAACAAACTGTAAAAAGGAAGAATGCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DF04TF U 1
AF RR4DF04JQ C 272
BS 1 633 RR4DF04TF
BS 634 894 RR4DF04JQ

RD RR4DF04TF 634 0 0
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TTCACTTGCACTCCTTTTACCTCTATTTGTATCTTCTTGATTGTGTCTTACCAAAAAAGC
TTCCCAACCTTTGCAGGCTCGTGGAATGAATTATTTACACAGCTGTAATCCAGTAATTGT
CCATCGTGATCTTAAATCTCCAAGCCTTCTAGTTGACAAAAACTGGGTTGTCAAGGTGTG
CGATTTTGGATTGTCTAGAATGAAACTAAGCACATACCTCTCTTCAAAGTCAACAGCAGG
CACGGCTGAGTGGATGGCTCCAGAAGTACTTAGAAATGAACCTGCGGATGAAAAGTACGT
ATTGTAAAGCACCTGCTTAACTGCTTTCTACTTTTTTTATACACGTGGTGTTCCCTTTTA
AAAAAACAGATCCATCATGTGAAAAAAACAGGTGTGATGTGTACAGCTATGGAGTAATTC
TATGGGAACTCTTTACGTTACAGCAACCATGGGGAAAGATGAACCCAATGCAAGTTGTTG
GTGCGGTTGGGTTTCAATCGACGACTAGAAATTCCTGAATCTGTGGATCCTCGAATTGCA
GATATCATCAGTAAATGTTGGCAGACGGATCCA
G

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4DF04JQ 623 0 0
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AGAAATGAACCTGCGGATGAAAAGTACGTATTGTAAAGCACCTGCTTAACTGCTTTCTAC
TTTTTTTATACACGTGGTGTTCCCTTTTAAAAAAACAGATCCATCATGTGAAAAAAACAG
GTGTGATGTGTACAGCTATGGAGTAATTCTATGGGAACTCTTTACGTTACAGCAACCATG
GGGAAAGATGAACCCAATGCAAGTTGTTGGTGCGGTTGGGTTTCAATCGACGACTAGAAA
TTCCTGAATCTGTGGATCCTCGAATTGCAGATATCATCAGTAAATGTTGGCAGACGGATC
CAAGGTTAAGACCAAGTTTTGCAGAGATTATGAACTCTCTAAAGCAGCTACAGAAACCTA
TAATGAGTCCAAACATACAAAGAGCTATTCCCAGTTCTTCGTCAATGATCACTGATCAGG
AACAATAATAGAGAGTTGAAGAAGATGACTAAATTGATGATGGTGGGATCATTCTGTGCA
TGTTTTGTTGTGGTGTGCTGGTTCATGTGGACTTTCCCAATGTTTTTTTTTTGCGTAACA
AACTGTAAAAAGGAAGAATGCAG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL6431Contig1 678 2 2 U
GTACTTCAATGGGGTCTCTTCAGCAACCTGTAAGGGTTCAAGGACCTGTCTTTGCCCCAG
TAATCTCCCCTGTTACCAAATTTTCTCAGCAATTGAAGCTCAGTTACCCTAGACCTTGCC
CTTCTTTGTTTCTGAGAAAAAGCTTAGTCTTTGAGAGGAGAGCCTCTTCAGTCTCAGTAC
CTGATGTGGAGACTACCAGCAACGAGATCCCATTCGAGGACTATGGTCGTCGCGAAGTGG
ATCCATAGGTCGATGATATTATCATCAAGGAGAAAAACAGACAGTTCAGGAGCTTGGAGC
TTATTGCATCCGAGAATTTCACTTCTCGAGCTGTTATGGAGACGGTTGGATCATGCCTTA
CCAACAAGTATTCCGAGGGCCTTCCTGGTAAAAGGTATTATGGTGGCAATGAGTTCATAG
ATCAGTTGGAAACGCTTTGCCAGAACCGTGCTTTAGCAACCTTCCGCTTAGATTCTACCA
AATGGGGGGTTAATGTTCAGCCCTTGTCAGGTTCACCTGCAAACTTTGCTGTCTACACCG
CCATTCTTAAGCCTCATGATCGGATCATGGGTTTGGATTTACCTCATGGTGGACATCTAT
CACATGGGTTCATGACTGCCAAAAGACGTGTTTCTGGAACTTCAATATACTTCGAGTCCA
TGCCTTATCGACTTGATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW11TF U 1
AF RR4DY49TF U 1
BS 1 362 RR4DW11TF
BS 363 678 RR4DY49TF

RD RR4DW11TF 362 0 0
GTACTTCAATGGGGTCTCTTCAGCAACCTGTAAGGGTTCAAGGACCTGTCTTTGCCCCAG
TAATCTCCCCTGTTACCAAATTTTCTCAGCAATTGAAGCTCAGTTACCCTAGACCTTGCC
CTTCTTTGTTTCTGAGAAAAAGCTTAGTCTTTGAGAGGAGAGCCTCTTCAGTCTCAGTAC
CTGATGTGGAGACTACCAGCAACGAGATCCCATTCGAGGACTATGGTCGTCGCGAAGTGG
ATCCATAGGTCGATGATATTATCATCAAGGAGAAAAACAGACAGTTCAGGAGCTTGGAGC
TTATTGCATCCGAGAATTTCACTTCTCGAGCTGTTATGGAGACGGTTGGATCATGCCTTA
CC

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR4DY49TF 678 0 0
GTACTTCAATGGGGTCTCTTCAGCAACCTGTAAGGGTTCAAGGACCTGTCTTTGCCCCAG
TAATCTCCCCTGTTACCAAATTTTCTCAGCAATTGAAGCTCAGTTACCCTAGACCTTGCC
CTTCTTTGTTTCTGAGAAAAAGCTTAGTCTTTGAGAGGAGAGCCTCTTCAGTCTCAGTAC
CTGATGTGGAGACTACCAGCAACGAGATCCCATTCGAGGACTATGGTCGTCGCGAAGTGG
ATCCATAGGTCGATGATATTATCATCAAGGAGAAAAACAGACAGTTCAGGAGCTTGGAGC
TTATTGCATCCGAGAATTTCACTTCTCGAGCTGTTATGGAGACGGTTGGATCATGCCTTA
CCAACAAGTATTCCGAGGGCCTTCCTGGTAAAAGGTATTATGGTGGCAATGAGTTCATAG
ATCAGTTGGAAACGCTTTGCCAGAACCGTGCTTTAGCAACCTTCCGCTTAGATTCTACCA
AATGGGGGGTTAATGTTCAGCCCTTGTCAGGTTCACCTGCAAACTTTGCTGTCTACACCG
CCATTCTTAAGCCTCATGATCGGATCATGGGTTTGGATTTACCTCATGGTGGACATCTAT
CACATGGGTTCATGACTGCCAAAAGACGTGTTTCTGGAACTTCAATATACTTCGAGTCCA
TGCCTTATCGACTTGATG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6432Contig1 900 2 2 U
GACTGCAGAAATGTCTAGAGAAGATTGATCATCTTAGTTATGAAGAAATCTCTCCTGTCA
TTGATGTTGCTCTTAGGGACCATAGAGATAGCGTTGGACCGACCCCAGAGATGTTAGTAA
AAATCGGAGAGAACACTGGTCTGAGATCAAACCAAGAGATTCTAATCGAAGCAGTTGCTC
TGGAGAGGCAAAAAGAGATCGCTGAGCAGTCTGAGAACAACGCAGAAGTCGAGTTCCTCG
ACCAGCTGATTGTCATCGTTAACCGAATGCACGAGCGTCTTCTTCTCATCAAACAGACTG
AGACATCTAGCGTCTCCATTCTCGCCGACTTCTTCTGCTCTCTGTCTCTCGAAGTCATGA
CCGATCCAGTGATCGTCTCATCAGGACAGACTTATGAGAAGGCTTTCATCAAGAGATGGA
TTGATTTGGGTTTGAAAGTTTGTCCCAAGACTAGGCAGACTCTGACTCACACCACTTTGA
TACCTAATTACACAGTCAAGGCTATGATCCGGCTTACGGTGCACGACCACTGCGTAGAAC
CGTCACAGAGATTGTGGAAGATCCACTCAGCGAAGCCTTTCTTGCTGGGAGTTTCAAGCC
CGGTGACACCGCATTTGTGGTTCTCGATGATACTGGAAACCCTTCGGTTCGGACCAAACC
AGATTCTCACAGTGTACGAGTTACCGACAAGACATCAATCGCATAGATTTCACCATTGGA
GGATTGTATATAAAGATTCTTTGGTTATACTCACTCGTCTTGTACGTGAATCTCAATTAC
TTTACTTGTTGCAAACATGTATATATATAAAGATACATAGTGATTAGTGCGTGAGGTAAT
TGTAATAGCTTTATGTATTTGTTACTCGAATTATATTAATACCACATTATAAAATTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F371TF U 1
AF RR4F371JQ C 344
BS 1 706 RR4F371TF
BS 707 900 RR4F371JQ

RD RR4F371TF 706 0 0
GACTGCAGAAATGTCTAGAGAAGATTGATCATCTTAGTTATGAAGAAATCTCTCCTGTCA
TTGATGTTGCTCTTAGGGACCATAGAGATAGCGTTGGACCGACCCCAGAGATGTTAGTAA
AAATCGGAGAGAACACTGGTCTGAGATCAAACCAAGAGATTCTAATCGAAGCAGTTGCTC
TGGAGAGGCAAAAAGAGATCGCTGAGCAGTCTGAGAACAACGCAGAAGTCGAGTTCCTCG
ACCAGCTGATTGTCATCGTTAACCGAATGCACGAGCGTCTTCTTCTCATCAAACAGACTG
AGACATCTAGCGTCTCCATTCTCGCCGACTTCTTCTGCTCTCTGTCTCTCGAAGTCATGA
CCGATCCAGTGATCGTCTCATCAGGACAGACTTATGAGAAGGCTTTCATCAAGAGATGGA
TTGATTTGGGTTTGAAAGTTTGTCCCAAGACTAGGCAGACTCTGACTCACACCACTTTGA
TACCTAATTACACAGTCAAGGCTATGATCCGGCTTACGGTGCACGACCACTGCGTAGAAC
CGTCACAGAGATTGTGGAAGATCCACTCAGCGAAGCCTTTCTTGCTGGGAGTTTCAAGCC
CGGTGACACCGCATTTGTGGTTCTCGATGATACTGGAAACCCTTCGGTTCGGACCAAACC
AGATTCTCACAGTGTACGAGTTACCGACAAGACATCAATCGCATAG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4F371JQ 557 0 0
GTCTCTCGAAGTCATGACCGATCCAGTGATCGTCTCATCAGGACAGACTTATGAGAAGGC
TTTCATCAAGAGATGGATTGATTTGGGTTTGAAAGTTTGTCCCAAGACTAGGCAGACTCT
GACTCACACCACTTTGATACCTAATTACACAGTCAAGGCTATGATCCGGCTTACGGTGCA
CGACCACTGCGTAGAACCGTCACAGAGATTGTGGAAGATCCACTCAGCGAAGCCTTTCTT
GCTGGGAGTTTCAAGCCCGGTGACACCGCATTTGTGGTTCTCGATGATACTGGAAACCCT
TCGGTTCGGACCAAACCAGATTCTCACAGTGTACGAGTTACCGACAAGACATCAATCGCA
TAGATTTCACCATTGGAGGATTGTATATAAAGATTCTTTGGTTATACTCACTCGTCTTGT
ACGTGAATCTCAATTACTTTACTTGTTGCAAACATGTATATATATAAAGATACATAGTGA
TTAGTGCGTGAGGTAATTGTAATAGCTTTATGTATTTGTTACTCGAATTATATTAATACC
ACATTATAAAATTATGG

QA 1 557 1 557
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6434Contig1 526 2 1 U
GAACTCTCTCCGCAGCCGCAACGCCGAGTGATATTCTGTGCAACCGCAGCGTCTTGGTCA
TCCACAAGAGTATCAATCGGATCCTTCCCGAGTGCTTCTGAAGCTGAGAAGCCGTAAAGC
TTTTCCGCCATTGAGTTCCTGGAAATAATCATGCCATAGAATTTTGAATCTAAACATCAG
TACGGACACATGAGATAGACATACACTTAGATTGTTTTTATTACAGAAGCAAAGAGTTCT
GAATCTGAAAATCATTTAGAACGCATGAGATAGAGAGAGATACTAGATTGTTTCTATCAC
AAAAGCAACGAGTTCTGAATCTGGGTGTCATAAGGAGACATACGATAGAGAGACACTAGA
TTGTTTCTATTGCAGAAGCATAGAGTTCTGAATCTGAATATCAGTTCTGACACATGAGAC
ATACAGATACTAGATTGTTTCTATCACAAAAGCATCGAATTTTGAATCTGAATATCAGTT
GGGACACATAAGAGGAGACATCTATTATAAGAGAATCGAGCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FC91TF U 1
AF RR4FC91JQ C 55
BS 1 526 RR4FC91TF

RD RR4FC91TF 526 0 0
GAACTCTCTCCGCAGCCGCAACGCCGAGTGATATTCTGTGCAACCGCAGCGTCTTGGTCA
TCCACAAGAGTATCAATCGGATCCTTCCCGAGTGCTTCTGAAGCTGAGAAGCCGTAAAGC
TTTTCCGCCATTGAGTTCCTGGAAATAATCATGCCATAGAATTTTGAATCTAAACATCAG
TACGGACACATGAGATAGACATACACTTAGATTGTTTTTATTACAGAAGCAAAGAGTTCT
GAATCTGAAAATCATTTAGAACGCATGAGATAGAGAGAGATACTAGATTGTTTCTATCAC
AAAAGCAACGAGTTCTGAATCTGGGTGTCATAAGGAGACATACGATAGAGAGACACTAGA
TTGTTTCTATTGCAGAAGCATAGAGTTCTGAATCTGAATATCAGTTCTGACACATGAGAC
ATACAGATACTAGATTGTTTCTATCACAAAAGCATCGAATTTTGAATCTGAATATCAGTT
GGGACACATAAGAGGAGACATCTATTATAAGAGAATCGAGCTCAGC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4FC91JQ 472 0 0
TGGTCATCCACAAGAGTATCAATCGGATCCTTCCCGAGTGCTTCTGAAGCTGAGAAGCCG
TAAAGCTTTTCCGCCATTGAGTTCCTGGAAATAATCATGCCATAGAATTTTGAATCTAAA
CATCAGTACGGACACATGAGATAGACATACACTTAGATTGTTTTTATTACAGAAGCAAAG
AGTTCTGAATCTGAAAATCATTTAGAACGCATGAGATAGAGAGAGATACTAGATTGTTTC
TATCACAAAAGCAACGAGTTCTGAATCTGGGTGTCATAAGGAGACATACGATAGAGAGAC
ACTAGATTGTTTTTATTGCAGAAGCATAGAGTTCTGAATCTGAATATCAGTTCTGACACA
TGAGACATACAGATACTAGATTGTTTCTATCACAAAAGCATCGAATTTTGAATCTGAATA
TCAGTTGGGACACATAAGAGGAGACATCTATTATAAGAGAATCGAGCTCAGC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL6435Contig1 882 2 14 U
GGAGACGTGAGTTTGGTGTGCAGGAACAGCGGCGGAGAATGATCGGCGAAGCATAGACAT
TAAGGCATCTGCTCCTTCTACCTTCGAGCTACCAGCCCAAGCTCCTCTCATTCATCCGAC
AGCGTTCAGTCTTCAATTTTCTCTTTGTCTGCCCTACCTCCGCCGTGTGCCAGGTGGAGG
TGGTGCAGCCGTTCCTAAGGAGGACGAGAAAAAACAAAGAAAGACTAAATAACTTATAGG
CAGCCCGAATAGTTTCATTGCCTTCTCTCAGATTTCTCTGTGAACTAAACAATGTTCACG
GCGGCAAGCGCGGGAAAGTGGCGGACAGCGTTTCTATCTCTCAGGGACGAAATCTCAACC
ACTCCACAGCCACCTGTCCCTCGTTTGCTTCAGGATCTAATCTTCTCTCACTCCGACACC
AACAAATTTCAAATATAAGAGATCGCTTGAGAATCAGTTAACCTCGACCATGCTGCATCT
CCTTAGCCTAGTTTCAAGCGGTCGTTGTGGAGCGTTGACAGACTTTCTTCTAAAAAAAGC
CTCTTTTCTAGAAGAGTGGTTAAGAGGATTGTGTGTTACATTGAAGGAGGAAGACAATGC
GTCGGGATCATCAAGCAGCACGAGCATTTCGGGTGAGAAGCAGAAAAAAGAGTTGATCTC
TAAAGCTATACGGTCACTTGCCAGTAGCCTAGAGGCTGGGCGTATCCCTGAAGTGGCTCT
AAAGTTGCAAGAGTTAGATAGCAATGTGAATTGATATAGCAGGCTACGTTTTCGGGGGTT
ATATTCGCCCTGTTGTAACTCAAGTATACAATTCAACAAATGTACATTACCTCCGTGACA
AATTTTGTTATGTGCCGATATATAGAAAACATATTTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D258TF U 1
AF RR4D258JQ C 401
BS 1 729 RR4D258TF
BS 730 730 RR4D258JQ
BS 731 734 RR4D258TF
BS 735 735 RR4D258JQ
BS 736 743 RR4D258TF
BS 744 744 RR4D258JQ
BS 745 749 RR4D258TF
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BS 764 777 RR4D258TF
BS 778 778 RR4D258JQ
BS 779 789 RR4D258TF
BS 790 882 RR4D258JQ

RD RR4D258TF 799 0 0
GGAGACGTGAGTTTGGTGTGCAGGAACAGCGGCGGAGAATGATCGGCGAAGCATAGACAT
TAAGGCATCTGCTCCTTCTACCTTCGAGCTACCAGCCCAAGCTCCTCTCATTCATCCGAC
AGCGTTCAGTCTTCAATTTTCTCTTTGTCTGCCCTACCTCCGCCGTGTGCCAGGTGGAGG
TGGTGCAGCCGTTCCTAAGGAGGACGAGAAAAAACAAAGAAAGACTAAATAACTTATAGG
CAGCCCGAATAGTTTCATTGCCTTCTCTCAGATTTCTCTGTGAACTAAACAATGTTCACG
GCGGCAAGCGCGGGAAAGTGGCGGACAGCGTTTCTATCTCTCAGGGACGAAATCTCAACC
ACTCCACAGCCACCTGTCCCTCGTTTGCTTCAGGATCTAATCTTCTCTCACTCCGACACC
AACAAATTTCAAATATAAGAGATCGCTTGAGAATCAGTTAACCTCGACCATGCTGCATCT
CCTTAGCCTAGTTTCAAGCGGTCGTTGTGGAGCGTTGACAGACTTTCTTCTAAAAAAAGC
CTCTTTTCTAGAAGAGTGGTTAAGAGGATTGTGTGTTACATTGAAGGAGGAAGACAATGC
GTCGGGATCATCAAGCAGCACGAGCATTTCGGGTGAGAAGCAGAAAAAAGAGTTGATCTC
TAAAGCTATACGGTCACTTGCCAGTAGCCTAGAGGCTGGGCGTATCCCTGAAGTGGCTCT
AAAGTTGCA*GAGT*AGATAGCA*TGTGA*TTGATATAGCAG*CTACGTTTTCGGGG*TT
ATATTCGCC
TGTTGTACTC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4D258JQ 482 0 0
TCTTCTCTCACTCCGACACCAACAAATTTCAAATATAAGAGATCGCTTGAGAATCAGTTA
ACCTCGACCATGCTGCATCTCCTTAGCCTAGTTTCAAGCGGTCGTTGTGGAGCGTTGACA
GACTTTCTTCTAAAAAAAGCCTCTTTTCTAGAAGAGTGGTTAAGAGGATTGTGTGTTACA
TTGAAGGAGGAAGACAATGCGTCGGGATCATCAAGCAGCACGAGCATTTCGGGTGAGAAG
CAGAAAAAAGAGTTGATCTCTAAAGCTATACGGTCACTTGCCAGTAGCCTAGAGGCTGGG
CGTATCCCTGAAGTGGCTCTAAAGTTGCAAGAGTTAGATAGCAATGTGAATTGATATAGC
AGGCTACGTTTTCGGGGGTTATATTCGCCCTGTTGTAACTCAAGTATACAATTCAACAAA
TGTACATTACCTCCGTGACAAATTTTGTTATGTGCCGATATATAGAAAACATATTTTGTT
GC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL6436Contig1 1091 2 10 U
GGTGGAGAGGTAACTCTGGACTTCAGGATGGGAAAGGTGAAACTGGAAGCTTCTATAAAG
ATCTGGTCGGTGGCTATTACGATGCTGGAGATACTATCAAGTTCAATTTCCCCATGGCTT
ATGCTATGACCATGCTGAGCTGGAGTGTCATTGAGTACAGTGCTAAATACGAAGCTGCTG
GAGAGCTTGCCCATGTTCGGGAGCTCATTAAATGGGGAACTGATTACTTTCTCAAGACCT
TTAACAGTACTGCTGATTCCATCGATGATTTGGTTTCACAGGTTGGAGCTGGAAACACTG
ACGACGGAAGTACGGATCCTAATGACCATTACTGCTGGATGCGACCTGAAGACATGGACT
ACAAAAGGCCTGTGACTACTTGTAACGGCGGATGTTCGGATCTCGCTGCAGAGATGGCGG
CTGCTCTGGCTTCAGCATCCATTGTGTTCAAAGACAACAGAGAGTATTCTAAGAAGCTTG
TGCATGGTGCTAAGACGGTGTATCAGTTCGGAAGGACTCGGAGAGGGAGATACAGCGCAG
GGACTGCGGAATCAGCCAAGTTTTACAATTCTAGCATGTACTGGGATGAGTTTATTTGGG
GTGGTGCTTGGTTATACTATGCCACGGGGAACGTAACTTATCTCGATCTCATCACAAAGC
CGACTATGGCTAAGCATGCTGGTGCCTTTCTGGGGTGGGCCTTACTATGGTGTATTTAGC
TGGGACAACAAACTTGCTGGTGCTCAGTTGCTGCTGAGCCGGTTGAGGTTGTTTTTGAGT
CCTGGATATCCTTATGAAGAAATTCTAAGGACATTCCATAATCAGACCAGCATAGTCATG
TGCTCCTACTTGCCCTATTTCAACAAATTTAACAGAACCAGGGGAGGTTTGATAGAGTTA
AATCATGGAGATCCACAGCCCCTCCAGTATGCTGCAAATGCAGCTTTCTTAGCTACGTTG
TACAGTGATTATCTGGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATTTCTAT
TCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCAGACTCAGATTGATTACATACTCGGTAAAACCCT
CGAAAATGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E889TF U 1
AF RR4D228TF U 355
BS 1 361 RR4E889TF
BS 362 362 RR4D228TF
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BS 751 757 RR4E889TF
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DS 

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G
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GCTTGTGCATGGTGCTAAGACGGTGTATCAGTTCGGGAGGACTCGGAGAGGGAGATACAG
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TTGGGGTGGTGCTTGGTTATACTATGCCACGGGGAACGTAACTTATCTCGATCTCATCAC
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TTAGCTGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCAGTTGCTGCTGAGCCGGTTGAGGTTGTTTT
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TCATGTGCTCCTACTTGCCCTATTTCAACAAATTTAACAGAACCAGGGGAGGTTTGATAG
AGTTAAATCATGGAGATCCACAGCCCCTCCAGTATGCTGCAAATGCAGCTTTCTTAGCTA
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TCTATTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCAGACTCAGATTGATTACATACTCGGTAAA
ACCCTCGAAAATGAGT

QA 2 737 2 737
DS 



AS 1 2

CO CL6437Contig1 1202 2 4 U
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CATATTGGAAAAATATAATGAGCTTCCGGTTCGGTTTGGTTTCCTTCCTTCCTTTTCCAA
ATTAAATGAAATGTTTTATCTTGTCGGCCCAAATTTATAAATAAAGCCCAAAGGGTACTA
TT


BQ
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10 10 

AF RR4DG56TF U 1
AF RR4DG56JQ C 343
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BS 704 704 RR4DG56JQ
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BS 730 1202 RR4DG56JQ

RD RR4DG56TF 729 0 0
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AGAATCGAAAGGGATTCGTTTCTTCGTCTTCGTCGTCTCCAAAGAAGAACAAAAAGAAAA
GTTTTGGGGGAAATGATAATGAAGGAGGTGAGGAGGAAGAGGAGGATGATCCGTTTGAGG
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GTGACGATGTTGATGGCATCGACTTTTTCGGTTCAGACACTGGTGATGTTGCTGATGATG
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AAGAAGATGAAAGACCTGTGAAGCTGAAGAATTGGCAGCTTAGGAGATTGGCTTATGCAT
TGAAAGCTGGGCGTCGTAAGACTAGTATAAAGAATCTGGCAGCCGAGCTATGTCTTGACA
GGGCTTATGTTCTTGAACTGCTACGTGACCCTCCTCCAAAGCT*CTAATGCTAAGTGCTA
CATTACCAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4DG56JQ 860 0 0
CGTCAATCGATGACGAGGAGATA*GCGAGGAAGACTTAGATAGACTAGCAGCAGAGT*AG
CTGAAGTATTGGGTGGTG*TGACGATGTTGATGGCATCGACTTTT*CGGTTCAGACACTG
GTGATGTTGCTGATGATGAAGAAGATGATGGCAATGATGATGATATCGAGGATGACGATG
ATGATGATGACAGCGAAGAAGAAGATGAAAGACCTGTGAAGCTGAAGAATTGGCAGCTTA
GGAGATTGGCTTATGCATTGAAAGCTGGGCGTCGTAAGACTAGTATAAAGAATCTGGCAG
CCGAGCTATGTCTTGACAGGGCTTATGTTCTTGAACTGCTACGTGACCCTCCTCCAAAGC
TTCTAATGCTAAGTGCTACATTACCAAATGAGAAGCCGCCAAGAGCAGCACCTGAGAACT
CATCAAATCCTCTGGAATCATCAGCAGCTGAAGATGCTGCTGTAGAGGTCGAACCTGAGG
AAAAAGTGAAAGATGAAGCAGTACATGTGATGCAACAGAGATGGTCTTCTCAGAAGAGAG
TGAAGAAAGCTCACATTGAAACACTAGAGAAAGTTTACAGGAGATCAAAACGCCCCACTA
ATGCTGTGGTTAGCAGCATTGTTCAAGTGACCAATCTTCCAAGAAGGCGTGTTTTGAAGT
GGTTTGAAGATAGAAGAGCAGAGGATGGAGTTCCAGAGAAGCGAGCTCCCTATCAAGCTC
CGGTTTAATTTAATGTTTCATATTGGAAAAATATAATGAGCTTCCGGTTCGGTTTGGTTT
CCTTCCTTCCTTTTCCAAATTAAATGAAATGTTTTATCTTGTCGGCCCAAATTTATAAAT
AAAGCCCAAAGGGTACTATT

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6438Contig1 619 2 2 U
GAATTCCTAACCATAGACTTTATGCACTATATTATCAGCATTTGGCATGAACAAGAAATT
TGATAGAAAAGAATCTGATGCATCTATAAATTTTAAACGAAATGTAGATGTTTATACTAG
TATAGAAAAACAAGAGACAATGGATATATCTAATATTAATGAATTGCTAAAGAATTAAGG
CTCAACGTCAATGTAGTCAAAGCTGCTGTTTTTAGGCTATCAACGAGGAGACCGGGGAGC
ACGAGGAGATTGATTAGGGAGAGTCTGAGGAATCTTTCTAAAAACATGTTTCCTGCAACG
TTGGAAGATACTATCGTATATTAGATCAAACTGCACTCCAGCTCTCTCTCTATTCACTAT
GAACGTTATGTGATCTGCTTCCACTATTTTATAGTACCATATTCCAGGTAGTAGCGTTTG
GCACTCAGAGTCGCTCACGAAGAGTTCAGCGATTTCAAGAGAAGTCACCATCCATAACTT
AATCATCTTCTTTCCCTTCTCTCAAGATAAGAATTAAAAACAGAGTCCGAACAGGGGAGA
CAAATGCAGAGAGACCCTGGTGAGGCTTTCTTCAAAAGAACATTGAGACGATGATTCTTT
GGACCCAGAAATCAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD27JQ U 1
AF RR4AV37TF C 63
BS 1 425 RR4DD27JQ
BS 426 619 RR4AV37TF

RD RR4DD27JQ 425 0 0
GAATTCCTAACCATAGACTTTATGCACTATATTATCAGCATTTGGCATGAACAAGAAATT
TGATAGAAAAGAATCTGATGCATCTATAAATTTTAAACGAAATGTAGATGTTTATACTAG
TATAGAAAAACAAGAGACAATGGATATATCTAATATTAATGAATTGCTAAAGAATTAAGG
CTCAACGTCAATGTAGTCAAAGCTGCTGTTTTTAGGCTATCAACGAGGAGACCGGGGAGC
ACGAGGAGATTGATTAGGGAGAGTCTGAGGAATCTTTCTAAAAACATGTTTCCTGCAACG
TTGGAAGATACTATCGTATATTAGATCAAACTGCACTCCAGCTCTCTCTCTATTCACTAT
GAACGTTATGTGATCTGCTTCCACTATTTTATAGTACCATATTCCAGGTAGTAGCGTTTG
GCACT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR4AV37TF 557 0 0
ATAGAAAAGAATCTGATGCATCTATAAATTTTAAACGAAATGTAGATGTTTATACTAGTA
TAGAAAAACAAGAGACAATGGATATATCTAATATTAATGAATTGCTAAAGAATTAAGGCT
CAACGTCAATGTAGTCAAAGCTGCTGTTTTTAGGCTATCAACGAGGAGACCGGGGAGCAC
GAGGAGATTGATTAGGGAGAGTCTGAGGAATCTTTCTAAAAACATGTTTCCTGCAACGTT
GGAAGATACTATCGTATATTAGATCAAACTGCACTCCAGCTCTCTCTCTATTCACTATGA
ACGTTATGTGATCTGCTTCCACTATTTTATAGTACCATATTCCAGGTAGTAGCGTTTGGC
ACTCAGAGTCGCTCACGAAGAGTTCAGCGATTTCAAGAGAAGTCACCATCCATAACTTAA
TCATCTTCTTTCCCTTCTCTCAAGATAAGAATTAAAAACAGAGTCCGAACAGGGGAGACA
AATGCAGAGAGACCCTGGTGAGGCTTTCTTCAAAAGAACATTGAGACGATGATTCTTTGG
ACCCAGAAATCAAATTC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL6439Contig1 968 2 2 U
GATTTAATATAACGAGGGACCAACAAGATGACTATGCCGTTCAGAGTTTTGAACGTGGTA
TTGCTGCCCAGGAAGCTGGCGCCTTCACATGGGAAATCGTCCCTGTTGAAGTTTCTGGAG
GAAGGGGTAGGCCATCAACCATCGTTGACAAGGACGAAGGTCTTGGGAAGTTTGATGCTG
CAAAATTGAGGAAACTCCGTCCAAGTTTTAAGGAGAATGGAGGCACCGTTACAGCTGGAA
ATGCGTCTAGCATAAGCGATGGTGCAACTGCACTTGTCCTAGTGAGTGGAGAGAAGGCGC
TTCAGCTAGGACTTCAAGTACTCGCAAAAGTTAAAGGTTACGGTGATGCAGCTCAGGAAC
CGGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTTGCAATACCGAAAGCTATTGCGCATGCTGGTT
TGGAATCTTCTCAAGTCGATTACTATGAGATCAATGAAGCATTTGCAGTTGTAGCACTCG
CGAATCAAAAGCTACTCGGGATTAGTCCGGAGAAGGTGAATGTAAATGGAGGAGCTGTCT
CTTTAGGACACCCTCTTGGGTGCAGTGGGGCTCGTATTCTAATCACATTGCTTGGGATAC
TAAAGAATAGAAACGGCAAGTACGGTGTGGGAGGAGTGTGTAACGGAGGAGGAGGTGCTT
CTGCTCTTGTTCTTGAACTTGTTTGATGCATTATGAATCCAGGTTTGTGAATTTGACGAC
GTATCTCTTTCAAGTTCCAAGAGAGTGATTGCGCTTCAAGTTTGCTATTAGTTGGTCTCT
CAACAAAGAAGAGTGATCCTTGATGTTGTTAAGTTATATATGAACTCGGTTTCTGCTTTT
TCAAGTTTGCTATTAGTTGGTCTCTCAATAAAGGAGAGTGATCCTTGATGTTGTTAAGTT
ATATATGAACTCGGTTTTTGCTTAGTATTTGGTGGACCTCAGTTATAAATTATGAACCCA
TTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G137TF U 1
AF RR4G137JQ C 417
BS 1 782 RR4G137TF
BS 783 968 RR4G137JQ

RD RR4G137TF 787 0 0
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TTGCTGCCCAGGAAGCTGGCGCCTTCACATGGGAAATCGTCCCTGTTGAAGTTTCTGGAG
GAAGGGGTAGGCCATCAACCATCGTTGACAAGGACGAAGGTCTTGGGAAGTTTGATGCTG
CAAAATTGAGGAAACTCCGTCCAAGTTTTAAGGAGAATGGAGGCACCGTTACAGCTGGAA
ATGCGTCTAGCATAAGCGATGGTGCAACTGCACTTGTCCTAGTGAGTGGAGAGAAGGCGC
TTCAGCTAGGACTTCAAGTACTCGCAAAAGTTAAAGGTTACGGTGATGCAGCTCAGGAAC
CGGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTTGCAATACCGAAAGCTATTGCGCATGCTGGTT
TGGAATCTTCTCAAGTCGATTACTATGAGATCAATGAAGCATTTGCAGTTGTAGCACTCG
CGAATCAAAAGCTACTCGGGATTAGTCCGGAGAAGGTGAATGTAAATGGAGGAGCTGTCT
CTTTAGGACACCCTCTTGGGTGCAGTGGGGCTCGTATTCTAATCACATTGCTTGGGATAC
TAAAGAATAGAAACGGCAAGTACGGTGTGGGAGGAGTGTGTAACGGAGGAGGAGGTGCTT
CTGCTCTTGTTCTTGAACTTGTTTGATGCATTATGAATCCAGGTTTGTGAATTTGACGAC
GTATCTCTTTCAAGTTCCAAGAGAGTGATTGCGCTTCAAGTTTGCTATTAGTTGGTCTCT
CA
CAAAG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4G137JQ 552 0 0
GGTTTGGAATCTTCTCAAGTCGATTACTATGAGATCAATGAAGCATTTGCAGTTGTAGCA
CTCGCGAATCAAAAGCTACTCGGGATTAGTCCGGAGAAGGTGAATGTAAATGGAGGAGCT
GTCTCTTTAGGACACCCTTTTGGGTGCAGTGGGGCTCGTATTCTAATCACATTGCTTGGG
ATACTAAAGAATAGAAACGGCAAGTACGGTGTGGGAGGAGTGTGTAACGGAGGAGGAGGT
GCTTCTGCTCTTGTTCTTGAACTTGTTTGATGCATTATGAATCCAGGTTTGTGAATTTGA
CGACGTATCTCTTTCAAGTTCCAAGAGAGTGATTGCGCTTCAAGTTTGCTATTAGTTGGT
CTCTCAACAAAGAAGAGTGATCCTTGATGTTGTTAAGTTATATATGAACTCGGTTTCTGC
TTTTTCAAGTTTGCTATTAGTTGGTCTCTCAATAAAGGAGAGTGATCCTTGATGTTGTTA
AGTTATATATGAACTCGGTTTTTGCTTAGTATTTGGTGGACCTCAGTTATAAATTATGAA
CCCATTTATCCC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL6440Contig1 894 2 2 U
GGGACATTTTGTCTATCTAAGCTAGTAATAAGGTTATGCGGAAGAATTTATCCATGCTTA
GTTTATCATGAAATGCTGTCTCCCATGTGAGACACTTCAAGGTTACACGCAATTCAGGAG
TCATTGATCAAATGTTATCATAGCTTTTTATGATTAGATCGTCCACTAGAATATGTTCTC
CATTCATCATACTTGTGTATGATGCTTTATCAGAAACGGACTAAGAAGACATCAAGATGC
CAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGTATGACCTTAGCCCCTTTTTGC
CATGATAAATTAGCTTTTCCATACCAAAAAAAAGAAGAAGAATTCACTCTCCATCTTGCT
GAAATGGTAAAAAAAAACATTCAGGTTTAATCCTTTGTAAGTGATTAGTAGGATGGTAAA
TTCTGAGGAAATTGTGAATGATTTTGCTGAGTGTCCCATTGAGTTTACAAGTTTCTGCCA
TGCTGAGTGTTCTTGTAGGGATCATCATCTCCTCCTCCAGGGAAAGTAAAGGCCAAAAAA
GAAGTAATCATGGTAGACCCTCTTGAGGCTAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAG
ATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAAAGCGTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGG
GCAATCATAGGGCTCCTGATAGGGCTTGTGATCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTG
GCTCAGTTGGATGGCTATTGGTCTGCTGCTCTGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAAT
CTCCCACAGTAAACAAAAAACCTTAGACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTT
CACTCTCTACTGTGATGAAAATAGATGTTGTTTATGTTAAGCTATTAACAGTGC


BQ
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AF RR4EA51TF U 1
AF RR4EA51JQ C 294
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BS 661 894 RR4EA51JQ

RD RR4EA51TF 665 0 0
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GTTTATCATGAAATGCTGTCTCCCATGTGAGACACTTCAAGGTTACACGCAATTCAGGAG
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CATTCATCATACTTGTGTATGATGCTTTATCAGAAACGGACTAAGAAGACATCAAGATGC
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CATGATAAATTAGCTTTTCCATACCAAAAAAAAGAAGAAGAATTCACTCTCCATCTTGCT
GAAATGGTAAAAAAAAACATTCAGGTTTAATCCTTTGTAAGTGATTAGTAGGATGGTAAA
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CAATC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4EA51JQ 601 0 0
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CAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTTGAGGCTAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAAT
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TATTCTGGCTCAGTTGGATGGCTATTGGTCTGCTGCTCTGCATCTATTCCCTTCATCAAC
ACAGAATCTCCCACAGTAAACAAAAAACCTTAGACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGG
TTTATTTCACTCTCTACTGTGATGAAAATAGATGTTGTTTATGTTAAGCTATTAACAGTG
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

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CTTCTCCTTCGGTCTCTGATACAACTATGGAGTTTCGAGATGATCAATCCAGTTTATTCC
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CATATCGGATAACCACTTCATTTTGTTTTCAAATTACTCGGCTACAAGAGCTTATGGACA
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TTAAGCCCCCATATTCTCAC


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AF RR4CG17TF U 1
AF RR4CG17JQ C 252
BS 1 615 RR4CG17TF
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RD RR4CG17TF 615 0 0
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TCTCAAATCTGTGAAGACAACAAATAAAACTTAATATCTGTCTCTCTTCTTCATGGTCCT
ATTGCCTTCGATCCTCATCTATCTCGCGAACATGTCCATCTTTGATTCAGAGTCGGCATC
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AAGATTCTTTCATCACATTTGTTCATTGCCAACAACAAAGACAAATGTTGTGTATTTGAC
ACCTTTTGCAAAATGACTTCTTCAGCGACTCTTCATGTTTCAGCGGCTTTCCCTTTCCTA
AACAGATCCAGGAGGCCACAATATCTACAGAAAAATGAAAAAAAATTAGTTCCCAAATGA
AAGAACTTGCAAACCATTCCTAGAGTTTACTCATACAACATCACCAAAGAAGAAATAGGA
GGGACATGAGGGATA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4CG17JQ 729 0 0
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AATGACTTCTTCAGCGACTCTTCATGTTTCAGCGGCTTTCCCTTTCCTAAACAGATCCAG
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AACCATTCCTAGAGTTTACTCATACAACATCACCAAAGAAGAAATAGGAGGGACATGAGG
GATAAGAATGGAGACAGCGTGGGTAATGGCGAAGAGAAGTGCTCATGTGGTGATTAGTGC
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ACCACTTCATTTTGTTTTCAAATTACTCGGCTACAAGAGCTTATGGACAATATATTGCAC
GCCAACTTCAGGTCACCTTTACACAGGCAAACACATAAATCTATGTGAAGAGAGAGTACC
CATGTCTCATCACCAATATCTCTCCCAACACACTGCTCTATTAGTGCGTTAAGTTACTTT
CTCTGTTGTTTCTTCAGATTATTTATTTATTATTTTTACTATTATTCATTTAAGCCCCCA
TATTCTCAC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL6442Contig1 727 2 2 U
GAAGAACAATCTGAAATAAAAATTAGGTCTCGTTCTTCTGATGAAGAAGAAGAACACGTG
ATGGATTTAATATGCATGTGAGACTGGTTATATAAAGGGCCCTTCATTAAACAAGAATCA
AAATGGGCCTAAAATATTTAGTATTTTTTTCGTTTTAGCACAGGGTTTGTTGAAAGTTTG
AGCCGGGCCTGGGTCTACTACACATAGACCTTTGTAGTAACTCGTCTTTGCGATGCTAGA
GTGTATGGCTACTGAGAATTGCTTTGGCTCAAAACACGTTAGAACCTTTGAGACAAGATA
GCTCAAGTCCATGGTTTCGAAATCGTACCCCACTGCCTCAAAGCTAGCGTAGCTGAACCC
GTCTTCAGGGGTTACGTGGATGGTGGAGATGGCCTCACCTTCCACGCTGTTCATAGAGTA
ACCGCATGGCTCGAACTCAAAGTCGCAGATTTGGGATTGAGGAAGTATCTTTCTGATACC
AGAGGTATCAGTCATGGAACTTGATTCGTTCTTGTAGAACATAGATGCCTTGTCTTTGTC
CAGACCAGTCATGCACATCTCTAACGTGTATACATTCTTGTTGTTTGAGCTCTTGGCAGG
AGAAGAAGCTGAGTAAACGTGCCATTTCTTGGTTTCATCATCATCACCCATCAAGTACGC
GACACTGCTCAAACCCAGCTTGGTGAAGTGAGCATCGAGGACAGAAGCTTCTTCAGAGAA
GTTGCGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E317JQ U 1
AF RR4E339JQ U 1
BS 1 717 RR4E317JQ
BS 718 727 RR4E339JQ

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GACACTGCTCAAACCCAGCTTGGTGAAGTGAGCATCGAGGACAGAAGCTTCTTCAGAGAA
GTTGCGG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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G


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10 

AF RR4FS75TF U 1
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QA 1 775 1 775
DS 

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AAAG
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AAGATATACGGCTGTAAAAGATGCAGACCACATGGAAACAGGAGTATTTGACGAACCTCT
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AAGAGCTGGTCTTGCTGCTTCCGCAATCACTGCAATGGGATTCTCTCTTGTGTTTCTCGT
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QA 5 817 5 817
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FF07JQ C 1
AF RR4FF07TF U 1
BS 1 360 RR4FF07TF

RD RR4FF07JQ 360 0 0
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ACTTAAAGAACATATGTAGGTAATCCAAATTACAATATCGATTTTTTTTGAAATATAATA
TCATATAAAGTATAAACATTTATATACTTAACCATGCATATAACTTTTTCTAAATCATCA
AATATTTATTAAAGTTTATTATAATTTAATCTTCTCATGTTTTGAAATCCCAATCCTCTT
TTCGTCAAAATATTCATGTTTTGAAGCTGTTAGACTCATCTCTGTTGACTCCAAGAACTT
TCATGTGTTTGCTGATGTTTGAATGTCTTTTATCATTTGTTTAATGTTGTAACCTTTTAT

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR4FF07TF 360 0 0
GTATAAAATCTTCTACGGATGTATCAGCGGATACATAACATCTCCCATAAACATTTATAT
ACTTAAAGAACATATGTAGGTAATCCAAATTACAATATCGATTTTTTTTGAAATATAATA
TCATATAAAGTATAAACATTTATATACTTAACCATGCATATAACTTTTTCTAAATCATCA
AATATTTATTAAAGTTTATTATAATTTAATCTTCTCATGTTTTGAAATCCCAATCCTCTT
TTCGTCAAAATATTCATGTTTTGAAGCTGTTAGACTCATCTCTGTTGACTCCAAGAACTT
TCATGTGTTTGCTGATGTTTGAATGTCTTTTATCATTTGTTTAATGTTGTAACCTTTTAT

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 2

CO CL6445Contig1 769 2 4 U
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GGAATACTCATAGGCGTTGTCCGTGTTGTCCGAGCCATTGTGGACAACGCGAGAGAAGAG
AACACGCAAGGCATGGTCAACTTTGTTCTCCGATGCTGCGCAAACGCTTTGCTTGGAGCT
TTTGACTATCTCAACAAGTTCACCATCAACTTTGCTGCGATAACAGGCGAATCTTATTAC
ACCTCTGCCAAAATGACTTACGAGCTGTTAAGACGCAACCTGCTCTCAGCTGTTTTTGTG
GAAACCGTTTCCACTAGAATCCTAACCGGGATTATCTTTGTCCTCTCAGCTGCTTATGCG
GTCGCGACATGGGTTGTTCTGAGAGGAGTGAGTAGCTTGGGTGTAGATTCGTACTTGGTG
GCTATTCTGGCGTGGCTCTTGCTGACTGTGGTCTTGGCTTTCTTTGTACATGTTCTTGAT
AATGTGATAGACACGATCTATGTATGTTACGCTATAGATCGAGACAAGGGAGATGTGTGT
AAGCAGGAAGTTCACGAGGTGTATGTTCACTTGCCGATCAGCAGAAGCTCAAAATCTGCC
CTCATCCCAAATGCTCTTAATGCATAGAAGAAGAACATGATATCCCAATATTGTCTCGGC
TTGTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTTGTTTTTCACCATTGTAAATTCCTGAGTAGAGTGG
ATTTGGTGAATTGTCGTTTGTATCATGAGTATTATATTGGGTAATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI11TF U 1
AF RR4EI11JQ C 246
BS 1 592 RR4EI11TF
BS 593 593 RR4EI11JQ
BS 594 669 RR4EI11TF
BS 670 769 RR4EI11JQ

RD RR4EI11TF 669 0 0
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GGAATACTCATAGGCGTTGTCCGTGTTGTCCGAGCCATTGTGGACAACGCGAGAGAAGAG
AACACGCAAGGCATGGTCAACTTTGTTCTCCGATGCTGCGCAAACGCTTTGCTTGGAGCT
TTTGACTATCTCAACAAGTTCACCATCAACTTTGCTGCGATAACAGGCGAATCTTATTAC
ACCTCTGCCAAAATGACTTACGAGCTGTTAAGACGCAACCTGCTCTCAGCTGTTTTTGTG
GAAACCGTTTCCACTAGAATCCTAACCGGGATTATCTTTGTCCTCTCAGCTGCTTATGCG
GTCGCGACATGGGTTGTTCTGAGAGGAGTGAGTAGCTTGGGTGTAGATTCGTACTTGGTG
GCTATTCTGGCGTGGCTCTTGCTGACTGTGGTCTTGGCTTTCTTTGTACATGTTCTTGAT
AATGTGATAGACACGATCTATGTATGTTACGCTATAGATCGAGACAAGGGAGATGTGTGT
AAGCAGGAAGTTCACGAGGTGTATGTTCACTTGCCGATCAGCAGAAGCTCAAGATCTGCC
CTCATCCCAAATGCTCTTAATGCATAGAAGAAGAACATGATATCCCAATATTGTCTCGGC
TTGTTTTTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4EI11JQ 524 0 0
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CGTTTCCACTAGAATCCTAACCGGGATTATTTTTGTCCTTTCAGCTGCTTATGCGGTCGC
GACATGGGTTGTTTTGAGAGGAGTGAGTAGCTTGGGTGTAGATTTGTACTTGGTGGCTAT
TTTGGGGTGGCTCTTGCTGACTGTGGTTTTGGCTTTTTTTGTACATGTTTTTGATAATGT
GATAGACACGATTTATGTATGTTACGCTATAGATCGAGACAAGGGAGATGTGTGTAAGCA
GGAAGTTCACGAGGTGTATGTTCACTTGCCGATCAGCAGAAGCTCAAAATTTGCCCTCAT
CCCAAATGCTTTTAATGCATAGAAGAAGAACATGATATCCCAATATTGTTTTGGCTTGTT
TTTTTTTTTTTTTTACAATTTGTTTTTCACCATTGTAAATTCCTGAGTAGAGTGGATTTG
GTGAATTGTCGTTTGTATCATGAGTATTATATTGGGTAATTTTG

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL6446Contig1 741 2 2 U
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CCATAAGAGTTTCAAACCGATACCTAAACCGGTGAAAAATAGGAAATTTGCAACGAACAA
CATACATATATAGTAGACATGGAGATATGTACATCAACACCAACGAATTATTACTACTCT
GTTTGAACAAAAACACAACTAAGATCCATCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTACCAA
GGATTCTTCTAAAAATCTTCTCACATACACTCCTCGCTGATTAGATCTTGCAAGTCACTT
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GGGATTTGAAGAACTCCTTTCTGTTCGTATCCATACTCCTGAGCCGACCGCTTCAGCAAA
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CCCACGTAGACCGGTACGTGTCCTTGAGGAACAGAGGATGTATGTTTCTTCAAGCGGCGA
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TTCTTGTTGTGAGGTAGAGAGAGGAAGCTTTTGCCAGAGTGATGAAACTGAATGAGCTGT
AAGAATGAATGAATGACTCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GE44TF C 1
AF RR4GE44JQ U 2
BS 1 1 RR4GE44TF
BS 2 741 RR4GE44JQ

RD RR4GE44TF 741 0 0
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CCATAAGAGTTTCAAACCGATACCTAAACCGGTGAAAAATAGGAAATTTGCAACGAACAA
CATACATATATAGTAGACATGGAGATATGTACATCAACACCAACGAATTATTACTACTCT
GTTTGAACAAAAACACAACTAAGATCCATCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTACCAA
GGATTCTTCTAAAAATCTTCTCACATACACTCCTCGCTGATTAGATCTTGCAAGTCACTT
GGAACCGCTAATCCAAGCCGAACCGACTCCATGATGCGCTCGAAGACAAGAACGTGGCAT
GGGATTTGAAGAACTCCTTTCTGTTCGTATCCATACTCCTGAGCCGACCGCTTCAGCAAA
CCGATGAAAACCGGGTGGTTAAGCACCTCCGCGCTAACCAAGAACCTCTCCATCTCGTCT
CCCACGTAGACCGGTACGTGTCCTTGAGGAACAGAGGATGTATGTTTCTTCAAGCGGCGA
GCCATCGAAGACCGGAGGGAAAACTCAGAGCGGCGGCTCCGTCGTTGCGAATCTGACCGG
AGGAGATTGTAGTGAGTGGAGTCAGCCACGCGGGAGAGACGGCGGATCAGATGCTTCATC
TTCTTGTTGTGAGGTAGAGAGAGGAAGCTTTTGCCAGAGTGATGAAACTGAATGAGCTGT
AAGAATGAATGAATGACTCCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4GE44JQ 740 0 0
AACAAAGCCCAGAACTTACGCTTACATACTAAACCGATGCAATTTCCACATATATATCTC
CATAAGAGTTTCAAACCGATACCTAAACCGGTGAAAAATAGGAAATTTGCAACGAACAAC
ATACATATATAGTAGACATGGAGATATGTACATCAACACCAACGAATTATTACTACTCTG
TTTGAACAAAAACACAACTAAGATCCATCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTACCAAG
GATTCTTCTAAAAATCTTCTCACATACACTCCTCGCTGATTAGATCTTGCAAGTCACTTG
GAACCGCTAATCCAAGCCGAACCGACTCCATGATGCGCTCGAAGACAAGAACGTGGCATG
GGATTTGAAGAACTCCTTTCTGTTCGTATCCATACTCCTGAGCCGACCGCTTCAGCAAAC
CGATGAAAACCGGGTGGTTAAGCACCTCCGCGCTAACCAAGAACCTCTCCATCTCGTCTC
CCACGTAGACCGGTACGTGTCCTTGAGGAACAGAGGATGTATGTTTCTTCAAGCGGCGAG
CCATCGAAGACCGGAGGGAAAACTCAGAGCGGCGGCTCCGTCGTTGCGAATCTGACCGGA
GGAGATTGTAGTGAGTGGAGTCAGCCACGCGGGAGAGACGGCGGATCAGATGCTTCATCT
TCTTGTTGTGAGGTAGAGAGAGGAAGCTTTTGCCAGAGTGATGAAACTGAATGAGCTGTA
AGAATGAATGAATGACTCCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6447Contig1 976 2 2 U
GGGTCACCTTCTTTGTTGTTGTTACTTCCCCTCTTTCTTTGGGCTAATAGGGTTTCTATT
CTTCTTTCGTATCCCCGCTAGAATGCTCAGATGGTCGATTGAGGTTGATCATCTAGAAGA
AGAAAATCAATAGAGGATCTCCAATTCTAGGATCTTTTTCTTTTTTGAAGATCTAAAAGG
CTCAAAATCTTAAGCTTTTTTTTTGGTTTTTTCCCTGAAAGTATTATTACAAATGAGCGC
TTCAAGATTTGTAAAGTGTGTTACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTCTGTT
GATTTCTTACACTAGCAACACTTTCCCTACGGATTATGTTCCACCGTTTTCGATAATTTC
AGTGCAAATGTGGTGGTTAATGGAGCCACCGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGG
CAAGAGGATTACAACAGATTAAGACCACTAAGCTACCGTGGAGCAGATGTTTTTATATTG
GCATTCTCCCTTATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAACGTCTCCAAAAAGTGGATTCCGGAG
TTGAAACATTACGCACCTGGTGTCCCCATTATCCTTGTTGGATCAAAACTTAATCTTCGA
GATGATAAGCAGTTCTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCAATCACTACTGCTCAGGGA
GAGGAGCTTAAGAAGCTAATAGAAGCACCTTCTTACATCGAATGCAGTTCCAAATCTCAA
GAGAATGTGAAGGCAGTGTTTGACGCGGCCATTCGAGTTGTGTTGCAACCTCCGAAGCAG
AAGAAGAAAAAGAGCAAAGCGCAGAAGGCATGCTCCATCCTATGAAGATGATGATTTGGA
CAACTCTGTTTTTTTTTATTTGTGGTTTTGGTAATTATTAATCTTCTAACACTACATCAA
TGTGTTAATGGATGATAAACACCCCAAGTTTGGTTTGGTCCTTTTTCATGTTCTTAACAC
TAATGGAGTTTGTTCG


BQ
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AGTGCAAATGTGGTGGTTAATGGAGCCACCGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGG
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GAGGAGCTTAAGA

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DS 

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GTGGTGGTTAATGGAGCCACCGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAAGAGGAT
TACAACAGATTAAGACCACTAAGCTACCGTGGAGCAGATGTTTTTATATTGGCATTCTCC
CTTATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAACGTCTCCAAAAAGTGGATTCCGGAGTTGAAACAT
TACGCACCTGGTGTCCCCATTATCCTTGTTGGATCAAAACTTAATCTTCGAGATGATAAG
CAGTTTTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCAATCACTACTGCTCAGGGAGAGGAGCTT
AAGAAGCTAATAGAAGCACCTTCTTACATCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTG
AAGGCAGTGTTTGACGCGGCCATTCGAGTTGTGTTGCAACCTCCGAAGCAGAAGAAGAAA
AAGAGCAAAGCGCAGAAGGCATGCTCCATCCTATGAAGATGATGATTTGGACAACTCTGT
TTTTTTTTATTTGTGGTTTTGGTAATTATTAATCTTCTAACACTACATCAATGTGTTAAT
GGATGATAAACACCCCAAGTTTGGTTTGGTCCTTTTTCATGTTCTTAACACTAATGGAGT
TTGTTCG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL6448Contig1 1187 2 4 U
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CCACCACTTCACCATCCTCCCCTCCATACTTCTTGCTCGCCTTCCTCTCAAACAACAGAC
CGACCATGGATGATGACCTTCATGGAAACAACGGTGGAATGCACAACAACGGCGGAGTTC
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CTGTGCTTTTGTTACTTGGAGGAAGGGAAGTACCACAGACAATCCCAACAACCGTAGGAT
CACCTCATCAGAACAATAGGGGTCTATCTGGTACTCCTCAAAGGTTTAGTGCCCCGCAGA
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TTCGTTACACTGTCAGGAAAGAGGTAGCATTGAGAATGCAACGTAAGAAAGGTCAGTTCA
CATCTGCCAAGTCAAGCAATGAGGATTCTGCATCCACTGGATCGGATTGGGGGTCAGGCC
AGAGCTGGGCCTTGGAAGGGTCTGAGTCTCAGAAACCAGAGGCTTTATGTCGGCACTGTG
GAACCAGTGAGAAGTCAACTCCAATGATGCGACGTGGACCTGAAGGGCCAAGAACACTTT
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CTCCTCCTCCAACAGCCCAGAATCTGCATGCAAATAAAATTGATGAATCAATTCTTGAGG
CTGAACTGGCTGGTGATATTAGCAACTCACAGTGAGAGAAGTGGGTAAACCCATTGTACG
CAATAAAAAAAAAGATGTGAGTTTGGTTGAGGGTTCTTTGGGACACTCATAATCTGTTGT
TGTATAATTTAGAAAGATCACTCATGAGAAGAGAAACAAAAAAGACATATTTGCTCAGTC
TCTTCCATCTGTAAGTTTGATTTGTTTCAGAAGTCCTTTTTATTTCT


BQ
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AF RR4AK87TF U 1
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BS 1 717 RR4AK87TF
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BS 758 1187 RR4AK87JQ

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CCACCACTTCACCATCCTCCCCTCCATACTTCTTGCTCGCCTTCCTCTCAAACAACAGAC
CGACCATGGATGATGACCTTCATGGAAACAACGGTGGAATGCACAACAACGGCGGAGTTC
AAGATCCAAGTCATTCGATGCATGTGCAGTATGAACATCACGGTATGATGGATGAGCAGC
ACGCTGATGATGTGATGAATGAGGGACTAGTGGAGCCTGACATTCCTTCCCACCTTGGAA
ACGCATCTGACCATCGCGGCGAAGTCGTTGACCGTGGCAGTGAAAACGGAGATCAGTTGA
CCTTGTCCTTTCAGGGTCAAGTTTATGTTTTTGACCGTGTCTTGCCTGAGAAGGTTCAAG
CTGTGCTTTTGTTACTTGGAGGAAGGGAAGTACCACAGACAATCCCAACAACCGTAGGAT
CACCTCATCAGAACAATAGGGGTCTATCTGGTACTCCTCAAAGGTTTAGTGCCCCGCAGA
GGCAAGCCTCGTTGCTCAGATTCAGGGAGAAAAGAAAAGGGAGGAATTTTGATAAGACTA
TTCGTTACACTGTCAGGAAAGAGGTAGCATTGAGAATGCAACGTAAGAAAGGTCAGTTCA
CATCTGCCAAGTCAAGCAATGAGGATTCTGCATCCACTGGATCGGATTGGGGGTCAG*CC
AGAGCTGGGCCTTGGAAGGGTCTGAGTCTCAGAAACC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4AK87JQ 795 0 0
GACCGTGTCTTGCCTGAGAAGGTTCAAGCTGTGCTTTTGTTACTTGGAGGAAGGGAAGTA
CCACAGACAATCCCAACAACCGTAGGATCACCTCATCAGAACAATAGGGGTCTATCTGGT
ACTCCTCAAAGGTTTAGTGCCCCGCAGAGGCAAGCCTCGTTGCTCAGATTCAGGGAGAAA
AGAAAAGGGAGGAATTTTGATAAGACTATTCGTTACACTGTCAGGAAAGAGGTAGCATTG
AGAATGCAACGTAAGAAAGGTCAGTTCACATCTGCCAAGTCAAGCAATGAGGATTCTGCA
TCCACTGGATCGGATTGGGGGTCAGGCCAGAGCTGGGCCTTGGAAGGGTCTGAGTCTCAG
AAACCAGAGGCTTTATGTCGGCACTGTGGAACCAGTGAGAAGTCAACTCCAATGATGCGA
CGTGGACCTGAAGGGCCAAGAACACTTTGTAATGCGTGCGGATTGATGTGGGCAAACAAG
GGGGCACTTATAGACTTATCCAAAGCCCCTCCTCCTCCAACAGCCCAGAATCTGCATGCA
AATAAAATTGATGAATCAATTCTTGAGGCTGAACTGGCTGGTGATATTAGCAACTCACAG
TGAGAGAAGTGGGTAAACCCATTGTACGCAATAAAAAAAAAGATGTGAGTTTGGTTGAGG
GTTCTTTGGGACACTCATAATCTGTTGTTGTATAATTTAGAAAGATCACTCATGAGAAGA
GAAACAAAAAAGACATATTTGCTCAGTCTCTTCCATCTGTAAGTTTGATTTGTTTCAGAA
GTCCTTTTTATTTCT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL6449Contig1 359 2 1 U
GGGGACAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATAAAGAATAACAGACAAATA
ATGGCCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTGATGATCTTCATGTTGATA
TCAACAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGGCCTTTGATTAAATGTACAAGTGTACATCTGCCC
CGCAATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATATATAAGAATAAA
ACACAAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGGGAATACCTAAAAATGACT
TGCGAGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAATAATTCAATTTACTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DU51JQ C 1
AF RR4DU51TF U 1
BS 1 359 RR4DU51TF

RD RR4DU51JQ 359 0 0
GGGGACAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATAAAGAATAACAGACAAATA
ATGGCCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTGATGATCTTCATGTTGATA
TCAACAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGGCCTTTGATTAAATGTACAAGTGTACATCTGCCC
CGCAATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATATATAAGAATAAA
ACACAAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGGGAATACCTAAAAATGACT
TGCGAGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAATAATTCAATTTACTATT

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4DU51TF 359 0 0
GGGGACAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATAAAGAATAACAGACAAATA
ATGGCCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTGATGATCTTCATGTTGATA
TCAACAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGGCCTTTGATTAAATGTACAAGTGTACATCTGCCC
CGCAATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATATATAAGAATAAA
ACACAAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGGGAATACCTAAAAATGACT
TGCGAGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAATAATTCAATTTACTATT

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL6450Contig1 371 2 3 U
GGGCAGTAGTTCTACTCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGT
CGCACAAGTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGGCCTA
TTCCTCACTGGATTCGTCTCCGGACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGC
ACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGTCTTCTT
TTCTGTTGTTGGTTTTTAGCATTTCCTCTAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTT
CATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATAAAAAG
CACTTCCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FT56TF U 1
AF RR4AX96TF U 6
BS 1 65 RR4FT56TF
BS 66 66 RR4AX96TF
BS 67 371 RR4FT56TF

RD RR4FT56TF 371 0 0
GGGCAGTAGTTCTACTCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGT
CGCACGAGTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGGCCTA
TTCCTCACTGGATTCGTCTCCGGACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGC
ACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGTCTTCTT
TTCTGTTGTTGGTTTTTAGCATTTCCTCTAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTT
CATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATAAAAAG
CACTTCCTAGC

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR4AX96TF 366 0 0
GG
AGTTCTACTCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGTCGCACAA
GTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGGCCTATTCCTCA
CTGGATTCGTCTCCGGACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCG
TAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGTCTTCTTTTCTGTT
GTTGGTTTTTAGCATTTCCTCTAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCATTTCT
CTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATAAAAAGCACTTCC
TAGC

QA 3 366 3 366
DS 



AS 1 2

CO CL6451Contig1 746 2 2 U
GGGTCGTTCTCTTCTCCTCCACCACACGCTTTTATTTGGTTACTATCAGATTCTCATCTG
TTGCAATGTCCAAGAACAACGGCGGAGCTCGTAGCTGCTTAGGTTCGATGGACGACATCC
GCGTCGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAAAATCTCCGTCGACGAGCTCA
AGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCTTCGCCGGAGGAGACAGTGAAGATGATGA
AACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTTTCTCTTTTCC
AGATCGGAATGAACCAAGGAGGAGGAGGAGGAAACAGCAAAAACGATCTGAAGGAAGCGT
TCGAGCTGTACGATCTGGACGGTAACGGGCGGATCTCGGCGAAGGAGCTTCACTCGGTGA
TGAAGAATCTGGGGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAGGAAGATGATTAGCAAAGTTG
ATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTCGAGGAGTTTAAGCTGATGATGAAAAACGGCG
GAGCTTGATGATCGATCGTATTAGGGATTGTTTGTATAGAGGAAAGCTAGAAAAGTTTGG
TTTTATGAGTTTTTTTTTACTTTATGTGCTACAACTTCCCTTATTCACTATTGAGATTGT
TCTGATGGGCCTGACTTGTGAATCTGATGTTCCAATCTTGTTTCAACTTTTCCAATTGCA
AAATTCAAAGGAATATGGGATGTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF20TF U 1
AF RR4DF20JQ C 41
BS 1 400 RR4DF20TF
BS 401 746 RR4DF20JQ

RD RR4DF20TF 400 0 0
GGGTCGTTCTCTTCTCCTCCACCACACGCTTTTATTTGGTTACTATCAGATTCTCATCTG
TTGCAATGTCCAAGAACAACGGCGGAGCTCGTAGCTGCTTAGGTTCGATGGACGACATCC
GCGTCGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAAAATCTCCGTCGACGAGCTCA
AGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCTTCGCCGGAGGAGACAGTGAAGATGATGA
AACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTTTCTCTTTTCC
AGATCGGAATGAACCAAGGAGGAGGAGGAGGAAACAGCAAAAACGATCTGAAGGAAGCGT
TCGAGCTGTACGATCTGGACGGTAACGGGCGGATCTCGGC

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR4DF20JQ 706 0 0
TACTATCAGATTCTCATCTGTTGCAATGTCCAAGAACAACGGCGGAGCTCGTAGCTGCTT
AGGTTCGATGGACGACATCCGCGTCGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAA
AATCTCCGTCGACGAGCTCAAGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCTTCGCCGGA
GGAGACAGTGAAGATGATGAAACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGA
CGAGTTCGTTTCTCTTTTCCAGATCGGAATGAACCAAGGAGGAGGAGGAGGAAACAGCAA
AAACGATCTGAAGGAAGCGTTCGAGCTGTACGATCTGGACGGTAACGGGCGGATCTCGGC
GAAGGAGCTTCACTCGGTGATGAAGAATCTGGGGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAG
GAAGATGATTAGCAAAGTTGATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTCGAGGAGTTTAA
GCTGATGATGAAAAACGGCGGAGCTTGATGATCGATCGTATTAGGGATTGTTTGTATAGA
GGAAAGCTAGAAAAGTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTTTACTTTATGTGCTACAACTTCCC
TTATTCACTATTGAGATTGTTCTGATGGGCCTGACTTGTGAATCTGATGTTCCAATCTTG
TTTCAACTTTTCCAATTGCAAAATTCAAAGGAATATGGGATGTGAT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL6452Contig1 440 2 2 U
GGATGGTGAAGAACAACAATCTCTTCCACTTTTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTTCAA
TGAGAGTACACACATAATAAAGGTTTGCTAGGCTTCTTATTCAAGTGATTGTGAAAAGAA
GAAAGATGCAGTTTTATCCTGGGACTCTAATCGTCATGCAACCGTCACATTACGTGGCGA
TTTTTGAGTTAAGAAAAGAGATTTTCAAGTCTTGACTCTGCAAAAACTCATTGTCCATCT
CGTTTGATTCATGGTATTTCTATATTTATTCAATGTTCTTTATAATCTATCTTACAATTA
TTCAGATTGTGCCCCTTTGTAAATTAAGGTCCTACACTGGGTGCATTTGCCCTCTGATTG
TTTTCGCAAATCGCATGGTATGCTCATTTGTTTGATTGCTTATGGACAAATTAAATTAAT
ACAAATCTGTTGACTATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D381TF U 1
AF RR4EC13TF U 6
BS 1 367 RR4D381TF
BS 368 440 RR4EC13TF

RD RR4D381TF 367 0 0
GGATGGTGAAGAACAACAATCTCTTCCACTTTTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTTCAA
TGAGAGTACACACATAATAAAGGTTTGCTAGGCTTCTTATTCAAGTGATTGTGAAAAGAA
GAAAGATGCAGTTTTATCCTGGGACTCTAATCGTCATGCAACCGTCACATTACGTGGCGA
TTTTTGAGTTAAGAAAAGAGATTTTCAAGTCTTGACTCTGCAAAAACTCATTGTCCATCT
CGTTTGATTCATGGTATTTCTATATTTATTCAATGTTCTTTATAATCTATCTTACAATTA
TTCAGATTGTGCCCCTTTGTAAATTAAGGTCCTACACTGGGTGCATTTGCCCTCTGATTG
TTTTCGC

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR4EC13TF 435 0 0
GG
GAAGAACAACAATCTCTTCCACTTTTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTTCAATGAGAGT
ACACACATAATAAAGGTTTGCTAGGCTTCTTATTCAAGTGATTGTGAAAAGAAGAAAGAT
GCAGTTTTATCCTGGGACTCTAATCGTCATGCAACCGTCACATTACGTGGCGATTTTTGA
GTTAAGAAAAGAGATTTTCAAGTCTTGACTCTGCAAAAACTCATTGTCCATCTCGTTTGA
TTCATGGTATTTCTATATTTATTCAATGTTCTTTATAATCTATCTTACAATTATTCAGAT
TGTGCCCCTTTGTAAATTAAGGTCCTACACTGGGTGCATTTGCCCTCTGATTGTTTTCGC
AAATCGCATGGTATGCTCATTTGTTTGATTGCTTATGGACAAATTAAATTAATACAAATC
TGTTGACTATTAG

QA 3 435 3 435
DS 



AS 1 2

CO CL6453Contig1 606 2 5 U
GTCAAAATGAACTGATAGATTGGTCTCAAAGAATTCAAAGTTACACATGACAAAATCATC
TCTAACCAAAGGTAGAAAACATGTTCAAAAATTCCAGACAGCGCAGAGACTGAATCTATA
ACATTAAGAGTTTTGAGTGAACAGCTTCTTGCAGTCTTTTAAGTACGAGGAGCAGCAGGT
GCACCAGCAGGGCGAGGGGCCTGACCAGGTTGTCCAGGCTTGGGAGTATCCTCCTTGCGT
CTGGCAAAACGGGGAGGAGGAGTACGAACCCTACGGTTGGGGCGGGATCGAACTCTCACA
ACGTGAGAGTGGATAGCACATGAAACACAGTATTGCACCTTAAAGTACAGCTTTGGGAGA
GTGTAACCATCGTAAACACTGGCTTCTTGAACATCTCTAATAGCAGCCTGCTCAACAATG
TTCCTGACGAGGAATCTCTTAATCGCCTTATCCTTGGGACAGCATTTCCCGCAGTTGGAA
CACCTGATGGGATTCACGTGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTACCACCGTTCCTACGCTTG
AAAGTCATGTTTGCAAGCAAAAGAGTTTCAAGCCTTCTGCGATCTGTTCTCTTCTTCGTT
ACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM90JQ U 185
AF RR4FM90TF C 1
BS 1 184 RR4FM90TF
BS 185 192 RR4FM90JQ
BS 193 193 RR4FM90TF
BS 194 561 RR4FM90JQ
BS 562 606 RR4FM90TF

RD RR4FM90JQ 377 0 0
CAGCAGGGGGAGGGGCCTGACCAGGTTGTCCAGGCTTGGGAGTATCCTCCTTGCGTCTGG
CAAAACGGGGAGGAGGAGTACGAACCCTACGGTTGGGGCGGGATCGAACTCTCACAACGT
GAGAGTGGATAGCACATGAAACACAGTATTGCACCTTAAAGTACAGCTTTGGGAGAGTGT
AACCATCGTAAACACTGGCTTCTTGAACATCTCTAATAGCAGCCTGCTCAACAATGTTCC
TGACGAGGAATCTCTTAATCGCCTTATCCTTGGGACAGCATTTCCCGCAGTTGGAACACC
TGATGGGATTCACGTGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTACCACCGTTCCTACGCTTGAAAG
TCATGTTTGCAAGCAAA

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR4FM90TF 606 0 0
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TCTAACCAAAGGTAGAAAACATGTTCAAAAATTCCAGACAGCGCAGAGACTGAATCTATA
ACATTAAGAGTTTTGAGTGAACAGCTTCTTGCAGTCTTTTAAGTACGAGGAGCAGCAGGT
GCACCAGCAGGGCGAGGGGCCTGACCAGGTTGTCCAGGCTTGGGAGTATCCTCCTTGCGT
CTGGCAAAACGGGGAGGAGGAGTACGAACCCTACGGTTGGTGCGGGATCGAACTCTCACA
ACGTGAGAGTGGATAGCACATGAAACACAGTATTGCACCTTAGAGTACAGCTTTGGGAGA
GTGTAACCATCGTAGACACTGGCTTCTTGAACATCTCTAATAGCAGCCTGCTCAACAATG
TTCCTGACGAGGAATCTCTTAATCGCCTTATCCTTGGGACAGCATTTCCCGCAGTTGGAA
CACCTGATGGGATTCACGTGACCACGGTTGTGCTTGTTCCTACCACCGTTCCTACGCTTG
AAAGTCATGTTTGCAAGCAAAAGAGTTTCAAGCCTTCTGCGATCTGTTCTCTTCTTCGTT
ACGGCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL6454Contig1 361 2 1 U
GAGAGAAGCAGTGGTGGACAGAGAGGTGTTTCCGGATTCGTCGCTGTATCTACGGCTTCG
TCGCTGCATCTCCGGGTTCGTCAATGCTTGAAGGTGGTGGTCTCGGAATCAACAGTGGTC
TCAGCGGCGACAATAGTGACTGAGCGCGGTGGAGGAGATTGATGAAGCTTCCTGTCGTGG
CTGGTGGTCTCCGCGTCAACAAGGAGTGCGGCGGAGATGAAGAAGAACGTGTTTAGTTAG
GTTTAGTTAGGGTTGGTTAGACCGGGTTTGTATGTAAACCAGTTTTTATAATAAACCGAT
ATCATTTTGTAAACCAAAATTTTAATAATAAATAATTTTATTCTCAAACCAATTTTATTA
C


BQ
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20 

AF RR4AD08JQ C 1
AF RR4AD08TF U 1
BS 1 361 RR4AD08TF

RD RR4AD08JQ 361 0 0
GAGAGAAGCAGTGGTGGACAGAGAGGTGTTTCCGGATTCGTCGCTGTATCTACGGCTTCG
TCGCTGCATCTCCGGGTTCGTCAATGCTTGAAGGTGGTGGTCTCGGAATCAACAGTGGTC
TCAGCGGCGACAATAGTGACTGAGCGCGGTGGAGGAGATTGATGAAGCTTCCTGTCGTGG
CTGGTGGTCTCCGCGTCAACAAGGAGTGCGGCGGAGATGAAGAAGAACGTGTTTAGTTAG
GTTTAGTTAGGGTTGGTTAGACCGGGTTTGTATGTAAACCAGTTTTTATAATAAACCGAT
ATCATTTTGTAAACCAAAATTTTAATAATAAATAATTTTATTCTCAAACCAATTTTATTA
C

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4AD08TF 361 0 0
GAGAGAAGCAGTGGTGGACAGAGAGGTGTTTCCGGATTCGTCGCTGTATCTACGGCTTCG
TCGCTGCATCTCCGGGTTCGTCAATGCTTGAAGGTGGTGGTCTCGGAATCAACAGTGGTC
TCAGCGGCGACAATAGTGACTGAGCGCGGTGGAGGAGATTGATGAAGCTTCCTGTCGTGG
CTGGTGGTCTCCGCGTCAACAAGGAGTGCGGCGGAGATGAAGAAGAACGTGTTTAGTTAG
GTTTAGTTAGGGTTGGTTAGACCGGGTTTGTATGTAAACCAGTTTTTATAATAAACCGAT
ATCATTTTGTAAACCAAAATTTTAATAATAAATAATTTTATTCTCAAACCAATTTTATTA
C

QA 1 361 1 361
DS 



AS 1 2

CO CL6455Contig1 897 2 2 U
GGAACTCAAAAAAAAATCTTCCCTTTTCTCCCCAAATTAATCAGATCAAACGATCAATCA
TCACCGATAACACAAATCCCTTTTTTGTTTGTTGATGATCATAGATCTTACGCTCATAAA
AACTTTATTTTCAAACTAAAACTTAATGCTTTTAACTTTGCAGATACGGTTGCATGTGTT
CTCACATGATAAATCTGCTTAATCAGATGAGAATCTGTTGTTTTTGGTTTATGCCCGAAG
AGGATCTTAAAAAATAAAGTCATAGGGGTAATACTAACCAAGATCGGACACTTCGGATCT
TGTATTTCTTATCTATTCAGATATAGTTGCATGTGTCCAAAGAGGATCTTAAAAAAAGTA
GTTTTTTTTAGTAGAAACCAAGCTCGGACACCCCGGTTCCAGATTTCCTATCTATTCAGG
TAAATATATTTCATCATTTATCTTTATCTGTATGAGTACGTTGACTGAGACAGATTAATA
AGTAAATAAATCTTGAATCTAACCCTTTTTATTATGTACTTTGTTATTTTACATGTCGGA
ATCGCGAGTAATTCCGTTCAATTTTTTTTGGACATACAGAAAAGGGAGATCGAGTGAAAC
ATGGTCAAACGAAGGTGTGGAGTACTTTCACCTGGATGGACCAATCGATTCTGTAAGATT
TCAGCTGGGAAAGGTTATGTCTAACCGGCTGTGTATTTGCTTAACGTTTGGGAAACCTTT
TTGGAAACAGCTATTAATCTAATCAAGGATTAGTTCCTTTCATAACAGAGCAATATATAG
ATATAACATGTCAATGTGTTAATTAGTTGCAACATATTTCTGTAACGATGGAAACTTATT
ATCTTGTCATATATGTAAAAGTTACATTTAGTTGGATAGTAAAGAACTAATTGGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EN91TF U 1
AF RR4EN91JQ C 315
BS 1 675 RR4EN91TF
BS 676 897 RR4EN91JQ

RD RR4EN91TF 677 0 0
GGAACTCAAAAAAAAATCTTCCCTTTTCTCCCCAAATTAATCAGATCAAACGATCAATCA
TCACCGATAACACAAATCCCTTTTTTGTTTGTTGATGATCATAGATCTTACGCTCATAAA
AACTTTATTTTCAAACTAAAACTTAATGCTTTTAACTTTGCAGATACGGTTGCATGTGTT
CTCACATGATAAATCTGCTTAATCAGATGAGAATCTGTTGTTTTTGGTTTATGCCCGAAG
AGGATCTTAAAAAATAAAGTCATAGGGGTAATACTAACCAAGATCGGACACTTCGGATCT
TGTATTTCTTATCTATTCAGATATAGTTGCATGTGTCCAAAGAGGATCTTAAAAAAAGTA
GTTTTTTTTAGTAGAAACCAAGCTCGGACACCCCGGTTCCAGATTTCCTATCTATTCAGG
TAAATATATTTCATCATTTATCTTTATCTGTATGAGTACGTTGACTGAGACAGATTAATA
AGTAAATAAATCTTGAATCTAACCCTTTTTATTATGTACTTTGTTATTTTACATGTCGGA
ATCGCGAGTAATTCCGTTCAATTTTTTTTGGACATACAGAAAAGGGAGATCGAGTGAAAC
ATGGTCAAACGAAGGTGTGGAGTACTTTCACCTGGATGGACCAATCGATTCTGTAAGATT
TCAGCTGGGAAAGGT
AT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EN91JQ 583 0 0
ATTCAGATATAGTTGCATGTGTCCAAAGAGGATCTTAAAAAAAGTAGTTTTTTTTAGTAG
AAACCAAGCTCGGACACCCCGGTTCCAGATTTCCTATCTATTCAGGTAAATATATTTCAT
CATTTATCTTTATCTGTATGAGTACGTTGACTGAGACAGATTAATAAGTAAATAAATCTT
GAATCTAACCCTTTTTATTATGTACTTTGTTATTTTACATGTCGGAATCGCGAGTAATTC
CGTTCAATTTTTTTTGGACATACAGAAAAGGGAGATCGAGTGAAACATGGTCAAACGAAG
GTGTGGAGTACTTTCACCTGGATGGACCAATCGATTCTGTAAGATTTCAGCTGGGAAAGG
TTATGTCTAACCGGCTGTGTATTTGCTTAACGTTTGGGAAACCTTTTTGGAAACAGCTAT
TAATCTAATCAAGGATTAGTTCCTTTCATAACAGAGCAATATATAGATATAACATGTCAA
TGTGTTAATTAGTTGCAACATATTTCTGTAACGATGGAAACTTATTATCTTGTCATATAT
GTAAAAGTTACATTTAGTTGGATAGTAAAGAACTAATTGGCAT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL6456Contig1 1022 2 8 U
GGATCACAACTCAACAAACGTGTGACAAAACGTACAAACAGCTCTCGAGATGGCCGCCAC
TTCAACAGCCGCTGCTGCTTCTTCTATCATGGGTGGTACTCGGGTGGTTTCCGACATCAA
CTCCGGTTCAGGCCGGTTCACAGCCCGGTTTGGATTCGGGACCAAGAAAGCAGCCGCTCC
CAAGAAGGCTAAGACGGTTATCTCAGACCGGCCTCTGTGGTTCCCGGGCGCGAAATCCCC
CGAGTATCTCGACGGTTCGCTGATCGGAGACTACGGTTTCGACCCTTTCGGTTTAGGTAA
ACCGGCGGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTTAGCCAAGAACAT
AGCCGGAGACGTGATCGGGGCACGTACGGAGGCCGTTGACCCCAAGTCGACGCCGTTTCA
GCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCAGAGAGTGTGAGCTGATCCATGGGAG
ATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGTGTTACTTG
GCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGGACAGCCGCTACC
GTTCTCGATCTCGACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTACATCGAGTTCCA
AAGAAACGCTGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGGCAAGTTTTTCGACCC
GCTGGGTCTAGCTTCTGACCCGGAGAAGAAGGCTCAGCTTCAGTTGGCTGAGATCAAACA
CGCTCGTTTAGCCATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCAGGCGGCTGCAACGGGTAA
AGGACCGCTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTCACACCACCATCATCGA
CACCTTCTCGTCCTCTTAATCTGGTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTAATGTAATGA
TGTAATGATGTCCATCTTTAAGACAAGTTTGTATAACTATAAACAAACTTCTTGAAAGGT
TT


BQ
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10 10 

AF RR4FP39TF U 1
AF RR4FP39JQ C 310
BS 1 698 RR4FP39TF
BS 699 699 RR4FP39JQ
BS 700 704 RR4FP39TF
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BS 715 744 RR4FP39TF
BS 745 1022 RR4FP39JQ

RD RR4FP39TF 744 0 0
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TTCAACAGCCGCTGCTGCTTCTTCTATCATGGGTGGTACTCGGGTGGTTTCCGACATCAA
CTCCGGTTCAGGCCGGTTCACAGCCCGGTTTGGATTCGGGACCAAGAAAGCAGCCGCTCC
CAAGAAGGCTAAGACGGTTATCTCAGACCGGCCTCTGTGGTTCCCGGGCGCGAAATCCCC
CGAGTATCTCGACGGTTCGCTGATCGGAGACTACGGTTTCGACCCTTTCGGTTTAGGTAA
ACCGGCGGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTTAGCCAAGAACAT
AGCCGGAGACGTGATCGGGGCACGTACGGAGGCCGTTGACCCCAAGTCGACGCCGTTTCA
GCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCAGAGAGTGTGAGCTGATCCATGGGAG
ATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGTGTTACTTG
GCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGGACAGCCGCTACC
GTTCTCGATCTCGACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTACATCGAGTTCCA
AAGAAACGCTGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATC*AGGAG*CAAGTTTT*CGACCC
GCTGGGTCTAGCTTCTGACCCGGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FP39JQ 713 0 0
GTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTTAGCCAAGAACATAGCCGGAGA
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CGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCAGAGAGTGTGAGCTGATCCATGGGAGATGGGCTAT
GCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGTGTTACTTGGCAAGACGC
TGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGGACAGCCGCTACCGTTCTCGAT
CTCGACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTACATCGAGTTCCAAAGAAACGC
TGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGGCAAGTTTTTCGACCCGCTGGGTCT
AGCTTCTGACCCGGAGAAGAAGGCTCAGCTTCAGTTGGCTGAGATCAAACACGCTCGTTT
AGCCATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCAGGCGGCTGCAACGGGTAAAGGACCGCT
CAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTCACACCACCATCATCGACACCTTCTC
GTCCTCTTAATCTGGTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTAATGTAATGATGTAATGAT
GTCCATCTTTAAGACAAGTTTGTATAACTATAAACAAACTTCTTGAAAGGTTT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6457Contig1 683 2 2 U
GATTCCTTAGATTCAAAGCTTGCATCTTGCTGTCAAGAGGCAATATTAATTTCGAGGGTG
TCTATGATAACGATGATGAAGAGGATGAGAATTTATCGATGTGTGTGTTTTGTAGTTTAG
GGGTAAACAGAATGACATCACTGTCCCATATGGATCAAAAGAGCGCGACATGCCTTATCT
ATATGGATGTGACGACCGTCTGTATACATTTGAAGATTCTTTCTGTCTAGAACAGGATTT
CCCTGAAGCTGAAGAACCCACTTTCAGCGAGCTTGAGTTTGAGTTCAAAGTTTTTTATAT
TAATTGGAAGGTGAAAGCTTGCGGTGTACAAATTTTGAAGGACAAAGAAGAATCTGGACG
TGATGAGGATGCAGATTATGAAGCTGGTGACGGTGATACTGATGTGGTTGAGGAGGATAT
AAAGGATGATGTAGGTAAAACTCAACAGGGAGAAGAATCTAGACGTGATGATGATGAAGA
GACAACGAGTGAGGTTCAGCCCTTCCGTAGGTATATGAAATTGTCATGTTGTTATATTTT
GTAATTCTGTGCAATGTAATTTTCCAAGAAGAGAAGATCAATCTGAACACCCCATGGACA
AGATCAATCTGGGGTTTATTAAGGCTCCAAGAGACTAACTGGACTTTACCAGTAATAGCA
AGGTTGCGTTTGTAAGAACAATT


BQ
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AF RR4D192TF U 1
AF RR4D192JQ C 291
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BS 676 683 RR4D192JQ

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TCTATGATAACGATGATGAAGAGGATGAGAATTTATCGATGTGTGTGTTTTGTAGTTTAG
GGGTAAACAGAATGACATCACTGTCCCATATGGATCAAAAGAGCGCGACATGCCTTATCT
ATATGGATGTGACGACCGTCTGTATACATTTGAAGATTCTTTCTGTCTAGAACAGGATTT
CCCTGAAGCTGAAGAACCCACTTTCAGCGAGCTTGAGTTTGAGTTCAAAGTTTTTTATAT
TAATTGGAAGGTGAAAGCTTGCGGTGTACAAATTTTGAAGGACAAAGAAGAATCTGGACG
TGATGAGGATGCAGATTATGAAGCTGGTGACGGTGATACTGATGTGGTTGAGGAGGATAT
AAAGGATGATGTAGGTAAAACTCAACAGGGAGAAGAATCTAGACGTGATGATGATGAAGA
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GTAATTCTGTGCAATGTAATTTTCCAAGAAGAGAAGATCAATCTGAACACCCCATGGACA
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AGGTTGCGTTTGTAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4D192JQ 393 0 0
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AATCTGGACGTGATGAGGATGCAGATTATGAAGCTGGTGACGGTGATACTGATGTGGTTG
AGGAGGATATAAAGGATGATGTAGGTAAAACTCAACAGGGAGAAGAATCTAGACGTGATG
ATGATGAAGAGACAACGAGTGAGGTTCAGCCCTTCCGTAGGTATATGAAATTGTCATGTT
GTTATATTTTGTAATTTTGTGCAATGTAATTTTCCAAGAAGAGAAGATCAATTTGAACCC
CCCATGGACAAGATCAATTTGGGGTTTATTAAGGCTCCAAGAGACTAACTGGACTTTCCC
AGTAATAGCAAGGTTGGGTTTGTAAGAACAATT

QA 1 393 1 393
DS 



AS 1 2

CO CL6458Contig1 361 2 1 U
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AGAACATGTCTCGAAATATACTAGTTCAAGCATTTTGTGTGGACACATCACTAACAATTT
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C


BQ
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20 

AF RR4BU83JQ C 1
AF RR4BU83TF U 1
BS 1 361 RR4BU83TF

RD RR4BU83JQ 361 0 0
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TATCTTGGTTGGATGCAACGAGATTTGGTCGCCTCCTGTGCATGGAAATGACACGGAGAA
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ATTTGAATCTTCGAAACGTTAGAAGAATCTCATGTCTACTTCTAGAAACCATTGCATGAT
AGAACATGTCTCGAAATATACTAGTTCAAGCATTTTGTGTGGACACATCACTAACAATTT
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C

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR4BU83TF 361 0 0
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TATCTTGGTTGGATGCAACGAGATTTGGTCGCCTCCTGTGCATGGAAATGACACGGAGAA
GAGTCTATATATTGTAACCGTAATCAAAGTGTGTCTACTTGTATGCAGTTTCAGTTGTTC
ATTTGAATCTTCGAAACGTTAGAAGAATCTCATGTCTACTTCTAGAAACCATTGCATGAT
AGAACATGTCTCGAAATATACTAGTTCAAGCATTTTGTGTGGACACATCACTAACAATTT
ATTTACTATATGAGTTTACTCAAACCCAAAAATTAAGACATGGTAATAATACACATCACG
C

QA 1 361 1 361
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACGTAGGACTCTACACATGGATCCATCATCAAACAACACAGTCACATTGTCCAACACAT
CATCAATTCTACCTAGCCAAGGGCCGTGAACCACATAATCACCAACACAAAAATCCCTGA
CGCGTTTCAATTCTTTCGTTGAGATGTCCTTGTGGACAGAACCATCCAGAGCCAATAAAT
CAACTGACATCTCTACATCCACTACTACTCCCACCTGCCCTGTTGGGTCAGAAGCTGAAG
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CTGGCTCGGTGTCATCCATCCACAGAACACGAATCTGATCACCCTCAAGAGTACCACACT
TGTAGTTCCCATCGGCTTTTCTCTCTCCACGACCAACATTTTCCTCATTGGTCTTTTCCC
CTTCCTCATCATCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCCTCATCAT
CATCATCATCGTCCTCATCATCATCGTCCTCATCATCACTTTCAGAGTCAGAATCACCAG
CAACTTCGCTCACAACCCCAACACCACCTGTCTTGTTGTTCCTGACAATATCGTGTCTAT
AAATGTTGGGATGCGAATCATCAGCCTTAACTACACGACTGCTGCTGTCATCCACAGTTG
GATGATCACATATAGGCTCACTCCCCAACGAATCATCAAGTGGCAAATCAACCCCACCAT
GCGGTGTTGTACCAGGGTCATCTTTCCCATGCTCCATCTGAAACAAAAAAAAAGTGCCAA
GCAAAGAGTCTTCAATAAATCGTTACGGAACTTGTAAAGAAAGCTACAGAAGAACAATTC
AAAGTAGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED38TF U 1
AF RR4ED38JQ C 354
BS 1 718 RR4ED38TF
BS 719 912 RR4ED38JQ

RD RR4ED38TF 718 0 0
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CATCAATTCTACCTAGCCAAGGGCCGTGAACCACATAATCACCAACACAAAAATCCCTGA
CGCGTTTCAATTCTTTCGTTGAGATGTCCTTGTGGACAGAACCATCCAGAGCCAATAAAT
CAACTGACATCTCTACATCCACTACTACTCCCACCTGCCCTGTTGGGTCAGAAGCTGAAG
CAACGTAATCTCCATGTAAGAAACCACGATCTACAACGGTAACATTGCTAACATCCTGAA
CTGGCTCGGTGTCATCCATCCACAGAACACGAATCTGATCACCCTCAAGAGTACCACACT
TGTAGTTCCCATCGGCTTTTCTCTCTCCACGACCAACATTTTCCTCATTGGTCTTTTCCC
CTTCCTCATCATCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCCTCATCAT
CATCATCATCGTCCTCATCATCATCGTCCTCATCATCACTTTCAGAGTCAGAATCACCAG
CAACTTCGCTCACAACCCCAACACCACCTGTCTTGTTGTTCCTGACAATATCGTGTCTAT
AAATGTTGGGATGCGAATCATCAGCCTTAACTACACGACTGCTGCTGTCATCCACAGT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4ED38JQ 559 0 0
TCCTGAACTGGCTCGGTGTCATCCATCCACAGAACACGAATCTGATCACCCTCAAGAGTA
CCACACTTGTAGTTCCCATCGGCTTTTCTCTCTCCACGACCAACATTTTCCTCATTGGTC
TTTTCCCCTTCCTCATCATCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCC
TCATCATCATCATCATCGTCCTCATCATCATCGTCCTCATCATCACTTTCAGAGTCAGAA
TCACCAGCAACTTCGCTCACAACCCCAACACCACCTGTCTTGTTGTTCCTGACAATATCG
TGTCTATAAATGTTGGGATGGGAATCATCAGCCTTAACTACACGACTGCTGCTGTCATCC
ACAGTTGGATGATCACATATAGGCTCACTCCCCAACGAATCATCAAGTGGCAAATCAACC
CCACCATGCGGTGTTGTACCAGGGTCATCTTTCCCATGCTCCATCTGAAACAAAAAAAAA
GTGCCAAGCAAAGAGTCTTCAATAAATCGTTACGGAACTTGTAAAGAAAGCTACAGAAGA
ACAATTCAAAGTAGTAGCC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL6461Contig1 500 2 2 U
GCAGAGACACAATTAGGAAAAGGAAGAAATTCTGTAGACAAAACCAGACAAGCCCTTCCT
AAAGACGGATTCCGGGATTTCCACTCACGACAAGTAACAGATTCTGGAATTTGAATCAGA
TTCTGCAAAGGCCTTTGTTACTTGAAGAATATATTATGTATATATTATGTATAAAGTCGG
TTACAGAGATTTTACCTCAGACACACATCATCTGATCGCAGTTTTGAGCAGAGAAATTCT
TTCGTCATTCATAACTGAAAATATCACGCCAAACTGACGATAAAATATCACTCAAAATTG
GTGTGGAAATACTCACCTCCAAATTGACGATCTCTTATCGACTTTAAATTTATAAGGAGA
GAAAATATCACTCGAAACTCTATGGTAACAAAGTTTAGTCAAAACTCCCTGGAAAAGAAA
ACTCAAGCGGTCTTCTTTGATCCGCTTGGCCAACTCTCTCTCTCTAGCTCCCCCCTCTCT
CTAAGTCTCTTCAGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BB20TF C 1
AF RR4BB20JQ U 140
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BS 140 500 RR4BB20JQ

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AAAGACGGATTCCGGGATTTCCACTCACGACAAGTAACAGATTCTGGAATTTGAATCAGA
TTCTGCAAAGGCCTTTGTTACTTGAAGAATATATTATGTATATATTATGTATAAAGTCGG
TTACAGAGATTTTACCTCAGACACACATCATCTGATCGCAGTTTTGAGCAGAGAAATTCT
TTCGTCATTCATAACTGAAAATATCACGCCAAACTGACGATAAAATATCACTCAAAATTG
GTGTGGAAATACTCACCTCCAAATTGACGATCTCTTATCGACTTTAAATTTATAAGGAGA
GAAAATATCACTCGAAACTCTATGGTAACAAAGTTTAGTCAAAACTCCCTGGAAAAGAAA
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CTAAGTCTCTTCAGCGATCC

QA 1 500 1 500
DS 

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GACACACATCATCTGATCGCAGTTTTGAGCAGAGAAATTCTTTCGTCATTCATAACTGAA
AATATCACGCCAAACTGACGATAAAATATCACTCAAAATTGGTGTGGAAATACTCACCTC
CAAATTGACGATCTCTTATCGACTTTAAATTTATAAGGAGAGAAAATATCACTCGAAACT
CTATGGTAACAAAGTTTAGTCAAAACTCCCTGGAAAAGAAAACTCAAGCGGTCTTCTTTG
ATCCGCTTGGCCAACTCTCTCTCTCTAGCTCCCCCCTCTCTCTAAGTCTCTTCAGCGATC
C

QA 1 361 1 361
DS 



AS 1 2

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GTCAGTCCTGAAGGTTGCGCTAGACCACGGGAAGCAAGCAGGAGTGATCAAATCGCATGA
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GCCAGGAGTGAGTATATTTATCTACGGAACCTTTGGTTTTCGAGATTTGATGTCTCTAAT
TATTCCCCTTCTTATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B646JQ C 1
AF RR4B646TF U 1
BS 1 378 RR4B646TF

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CCTTTTCCCCATGCTCGCTGATCCTCGTCACCCAGCGGAATCGACAAGTGCGACGAACGA
GTCAGTCCTGAAGGTTGCGCTAGACCACGGGAAGCAAGCAGGAGTGATCAAATCGCATGA
CAGAGTAGTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGATGCATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGA
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GCCAGGAGTGAGTATATTTATCTACGGAACCTTTGGTTTTCGAGATTTGATGTCTCTAAT
TATTCCCCTTCTTATTCC

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4B646TF 378 0 0
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CCTTTTCCCCATGCTCGCTGATCCTCGTCACCCAGCGGAATCGACAAGTGCGACGAACGA
GTCAGTCCTGAAGGTTGCGCTAGACCACGGGAAGCAAGCAGGAGTGATCAAATCGCATGA
CAGAGTAGTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGATGCATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGA
GGATTAACAAAATTGGGAGAAAAAAAACAAATTGCTATATTTTTCTTACTTCGAGGCAGT
GCCAGGAGTGAGTATATTTATCTACGGAACCTTTGGTTTTCGAGATTTGATGTCTCTAAT
TATTCCCCTTCTTATTCC

QA 1 378 1 378
DS 



AS 1 2

CO CL6463Contig1 426 2 1 U
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AAAGTTTCAAGTAATAGAGGACTTGGTGGTGTTCTCAGAGAGCAAAGAGCTAGGCTTTAC
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GTGGTGATACTTTGAAGCTGAAACGGAGCAAACCAATGATAGCAAGAAGATATGAAGGAG
AAAGTGGTTTAGGTTTGCTTGCCAATCGTCGATTATGGGGGATGAAGGTTAAATTTTGAT
ATGGGTATATATTTACAGTTGGTGGTTGTTAGTTTGTAAAAATGACGAATAAAACGTTGG
GATAAATTTTGTAATGGCGTCTGCCTTAGTTCTGTAGCTCCTTGTATAAATTCAGTTATC
TCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4F154TF U 1
AF RR4F154JQ C 9
BS 1 426 RR4F154TF

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AAAGTTTCAAGTAATAGAGGACTTGGTGGTGTTCTCAGAGAGCAAAGAGCTAGGCTTTAC
ATCATCAAACGATGTGTTGTGATGCTCTTATGTTGGCAAGATTGATCTTGGTTGATCCAA
GTGGTGATACTTTGAAGCTGAAACGGAGCAAACCAATGATAGCAAGAAGATATGAAGGAG
AAAGTGGTTTAGGTTTGCTTGCCAATCGTCGATTATGGGGGATGAAGGTTAAATTTTGAT
ATGGGTATATATTTACAGTTGGTGGTTGTTAGTTTGTAAAAATGACGAATAAAACGTTGG
GATAAATTTTGTAATGGCGTCTGCCTTAGTTCTGTAGCTCCTTGTATAAATTCAGTTATC
TCACAT

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4F154JQ 418 0 0
TTATTTTCAGACTAAAATCTCTATAATATTAAAGATGGGAGTTTTAAAGAGAAAAGTTTC
AAGTAATAGAGGACTTGGTGGTGTTTTCAGAGAGCAAAGAGCTAGGCTTTACATCATCAA
ACGATGTGTTGTGATGCTCTTATGTTGGCAAGATTGATCTTGGTTGATCCAAGTGGTGAT
ACTTTGAAGCTGAAACGGAGCAAACCAATGATAGCAAGAAGATATGAAGGAGAAAGTGGT
TTAGGTTTGCTTGCCAATCGTCGATTATGGGGGATGAAGGTTAAATTTTGATATGGGTAT
ATATTTACAGTTGGTGGTTGTTAGTTTGTAAAAATGACGAATAAAACGTTGGGATAAATT
TTGTAATGGCGTCTGCCTTAGTTCTGTAGCTCCTTGTATAAATTCAGTTATCTCACAT

QA 1 418 1 418
DS 



AS 1 2

CO CL6464Contig1 647 2 2 U
TTTTTTGCAATGTAACGAAATGGACTGTTTTATTACATGAAAACATTTCACAATGCAAAT
CGAAGTTTCTGCTCATTCACCCCATGCATAATGGTCTAACCCAAGAGTAAAGGCTCAACA
ATGAGTAAACTGATTGGCCCATTTTACAACTAGGCCCATTAACAAACCAATCAATATTCA
GAGCGCAGTTTTAATCATCAATCAGAATGACTGAACTGAGCCCTGACTCCACTGAACAGC
CACCGGGCTCTTAACGACATGCTCACCGTCGGTCCATACAATCGACCCGAACTCATGACC
CGGAACGGATCCAACCCCGCCACCAAGCACAACGCTCTTAAACGTCACTTCGTATTCCAG
CTCCCTAGTCTCCTTACTAAACACAAGCTTCCTCGGAAACACATCGATCTCCACACTCGC
CGGAAATCTAACCCCGACTTCATACACCGCGTCTACATTGCTCCCCACGTTCTTGACAAC
TCTCCTGTACTTAACAACATCGACACTCGATCCGAAAACGACGGAAAAAGACGGGTAGTT
AAGATCTCCGGCGGTTCTGAGCTTGCTCGTTTCACAAGCGTCGTAAAGAGACGGATCTTG
AAGGAACACTAGAATCCCGGGGAACTCGTACCCCACGGCACAGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C757TF C 1
AF RR4C757JQ U 6
BS 1 10 RR4C757TF
BS 11 647 RR4C757JQ

RD RR4C757TF 424 0 0
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CGAAGTTTCTGCTCATTCACCCCATGCATAATGGTCTAACCCAAGAGTAAAGGCTCAACA
ATGAGTAAACTGATTGGCCCATTTTACAACTAGGCCCATTAACAAACCAATCAATATTCA
GAGCGCAGTTTTAATCATCAATCAGAATGACTGAACTGAGCCCTGACTCCACTGAACAGC
CACCGGGCTCTTAACGACATGCTCACCGTCGGTCCATACAATCGACCCGAACTCATGACC
CGGAACGGATCCAACCCCGCCACCAAGCACAACGCTCTTAAACGTCACTTCGTATTCCAG
CTCCCTAGTCTCCTTACTAAACACAAGCTTCCTCGGAGACACATCGATCTCCACACTCGC
CGGA

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4C757JQ 642 0 0
GCAAT
TGTAACGAAATGGACTGTTTTATTACATGAAAACATTTCACAATGCAAATCGAAGTTTCT
GCTCATTCACCCCATGCATAATGGTCTAACCCAAGAGTAAAGGCTCAACAATGAGTAAAC
TGATTGGCCCATTTTACAACTAGGCCCATTAACAAACCAATCAATATTCAGAGCGCAGTT
TTAATCATCAATCAGAATGACTGAACTGAGCCCTGACTCCACTGAACAGCCACCGGGCTC
TTAACGACATGCTCACCGTCGGTCCATACAATCGACCCGAACTCATGACCCGGAACGGAT
CCAACCCCGCCACCAAGCACAACGCTCTTAAACGTCACTTCGTATTCCAGCTCCCTAGTC
TCCTTACTAAACACAAGCTTCCTCGGAAACACATCGATCTCCACACTCGCCGGAAATCTA
ACCCCGACTTCATACACCGCGTCTACATTGCTCCCCACGTTCTTGACAACTCTCCTGTAC
TTAACAACATCGACACTCGATCCGAAAACGACGGAAAAAGACGGGTAGTTAAGATCTCCG
GCGGTTCTGAGCTTGCTCGTTTCACAAGCGTCGTAAAGAGACGGATCTTGAAGGAACACT
AGAATCCCGGGGAACTCGTACCCCACGGCACAGAGGA

QA 6 642 6 642
DS 



AS 1 2

CO CL6465Contig1 1071 2 2 U
GACACAGAATAATGTTAAGCCAAACACTTCGGTTCTTGTAGGATCTTGACTAAGATGGAT
CTCAAAATCTTGAATTGGGACTGGGATCAAGAATCTTACCCAGCTTCTTCTGATTTCTGG
ATCCTCATCTTCTTCGCTCCTTTCTTCCTTTTTCTCCGAGTCATACTCGACAGATCCATA
TTTGAGAGAGTCGCTAGTAGTATGGTGTTTCCTAGAGGAAGCTCTGCTGATTCAAACGGT
AGAAGAAAGAGGATAGTGAAATTCAAAGAATCAGCTTGGAAATGTCTCTGCTCCATCTCT
ATCGAAGCACTTGCTCTCCACGTCACTTATAGTGAGCCATGGTTTAAAGACACAAGATGC
TTCTGGTTAGGACCAGGAGACCAGATATGGCCTGACCAAAAGATAAAGATGAAAATGAAG
GGACTGTACATGTTTGTGGGCGGGTTGAATGTGTATTCCTTCTTTGCTCTGTTCTTTTGG
GAAACAAGACGATCTGATTTCAAAGTCATGATAGTTCATCACATTGTAACTTCATTCCTC
ATCATTTTGTCTTACGTTTTCAGATTTGCTCGTATAGGTTCTGTAATATTGGCTCTTCAC
GAAATCAGCGACGTGTTTCTAGAGATAGGCAAGATGTGCAAATACAGCGGCTTAGAATCC
ATGACTAGTGTCTCGTTCATCCTGTTTTTCCTGTCGTGGACGGCTTTGCGACTCGTTTCT
TACCCTTTATGGATCCTGTGGAGTACCAGCTATGAATCTATAAACGTGAAACTGGAGTGG
GACAAGAAGCATACGATGGAAACTGGACTGCCATTTACAGTGTACTACGTTTTCAACACA
CTTTTCTGGTGCTTACAGATTCTTCACATCTACTGGTGGGTCTTGATATGTCGTGTGCTC
ATCAACCAAGTCCGTTCCAAAGGCAAAATCGATAGAGACGTTCGTTCTGACTCAGAAGGT
GAAGATGATGAACACCAAGATTAATTGTCTTGACTCTTGTCCAATCAATTTGGAGCATCA
GTGATGTCGACTTGTTAGATACATTTTCCGAATAAAAACAATAGTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CR26TF U 1
AF RR4CR26JQ C 282
BS 1 696 RR4CR26TF
BS 697 1071 RR4CR26JQ

RD RR4CR26TF 696 0 0
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CTCAAAATCTTGAATTGGGACTGGGATCAAGAATCTTACCCAGCTTCTTCTGATTTCTGG
ATCCTCATCTTCTTCGCTCCTTTCTTCCTTTTTCTCCGAGTCATACTCGACAGATCCATA
TTTGAGAGAGTCGCTAGTAGTATGGTGTTTCCTAGAGGAAGCTCTGCTGATTCAAACGGT
AGAAGAAAGAGGATAGTGAAATTCAAAGAATCAGCTTGGAAATGTCTCTGCTCCATCTCT
ATCGAAGCACTTGCTCTCCACGTCACTTATAGTGAGCCATGGTTTAAAGACACAAGATGC
TTCTGGTTAGGACCAGGAGACCAGATATGGCCTGACCAAAAGATAAAGATGAAAATGAAG
GGACTGTACATGTTTGTGGGCGGGTTGAATGTGTATTCCTTCTTTGCTCTGTTCTTTTGG
GAAACAAGACGATCTGATTTCAAAGTCATGATAGTTCATCACATTGTAACTTCATTCCTC
ATCATTTTGTCTTACGTTTTCAGATTTGCTCGTATAGGTTCTGTAATATTGGCTCTTCAC
GAAATCAGCGACGTGTTTCTAGAGATAGGCAAGATGTGCAAATACAGCGGCTTAGAATCC
ATGACTAGTGTCTCGTTCATCCTGTTTTTCCTGTCG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4CR26JQ 790 0 0
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GTTTAAAGACACAAGATGCTTCTGGTTAGGACCAGGAGACCAGATATGGCCTGACCAAAA
GATAAAGATGAAAATGAAGGGACTGTACATGTTTGTGGGCGGGTTGAATGTGTATTCCTT
CTTTGCTCTGTTCTTTTGGGAAACAAGACGATCTGATTTCAAAGTCATGATAGTTCATCA
CATTGTAACTTCATTCCTCATCATTTTGTCTTACGTTTTCAGATTTGCTCGTATAGGTTC
TGTAATATTGGCTCTTCACGAAATCAGCGACGTGTTTCTAGAGATAGGCAAGATGTGCAA
ATACAGCGGCTTAGAATCCATGACTAGTGTTTCGTTCATCCTGTTTTTCCTGTCGTGGAC
GGCTTTGCGACTCGTTTCTTACCCTTTATGGATCCTGTGGAGTACCAGCTATGAATCTAT
AAACGTGAAACTGGAGTGGGACAAGAAGCATACGATGGAAACTGGACTGCCATTTACAGT
GTACTACGTTTTCAACACACTTTTCTGGTGCTTACAGATTCTTCACATCTACTGGTGGGT
CTTGATATGTCGTGTGCTCATCAACCAAGTCCGTTCCAAAGGCAAAATCGATAGAGACGT
TCGTTCTGACTCAGAAGGTGAAGATGATGAACACCAAGATTAATTGTCTTGACTCTTGTC
CAATCAATTTGGAGCATCAGTGATGTCGACTTGTTAGATACATTTTCCGAATAAAAACAA
TAGTTTTTGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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AAGAAAACGGAAGCTCCGGGGAGAAATCGAGTTACTAGGAGCGAGACTAATTTTCCAAAC
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CATCCACTCGTCCTGCGTAATATCGTCGACAATCACAACCGCATGGCTGGGGCCTCGGGA
AAGCGTGTTGTCGGTGTTCTTCTCGGCAGTAGCTCCCGTGGTATCGTTGGTGTCACCAAC
AGCTACGCAGTGCCCTTCGAGGAGGATGAAAAAGACCCAAGTATCTGGTCTTTTGATCGC
AACCACCATGAGTACATGCTGCGCATGTTCAAGGGCCTTAACGACAACGAGGATGTGGTT
GGTTGGTACAGCACATGCCCTAAACTCAGAGAGAATGATTTGGCTGTTCACGCTTCTATC
TTTAGGAGCTGCGGCTATGTTCTCAATCCAGTTGTGTTGGTCACTATTGACGTCCAGCCT
CAACCACTTGGAATTCCCACAAAAGCTTACTATGCAGTGACAGAAGCCTTCGTCCCTCTG
TCTACAGAAATTGCCCCTCCTGAAGTCGATCATATCGGCGGGAGTGTCCTGGTGACTGAG
ATGACTCCGGGTGGTGATAATGGCTTGGTGGATTTTTTGGAAGATTACTACATGTATGTC
AAAAGCAGTGTTAGGATTAGCGTTTCAGGATATGACACTTCGCTTGATGCTGTTGATCTT
GTTGGATATTTGGAGAAGCACTTTGAGTCATGTGGTTCTGTGGAGGACATTATGGTGCCG
AGACACCCGGTAACCAATGCGATTATCAGCAGTTCTACCACCGTGGTTCTCCGCGGAGAA
GGTGCAGCAGATAAGGCGTTGGCTCTCAACGGAAGTGACGTTGGAGGATGGAGAGTGTCT
GTCACCATTTTACCACCCGAGCTGGATGAGATGAGCTCTGAGATGCCTGCCAGCGAGTTT
GCTCTTGGTTACGCCAGCCGCTGAGAACCCCTTTTAAAATTATATATGCGCATGTTTATT
TCTTCTCTTGATTCTGTTTTTTAATTTGCTAGCCTAAAAGACAAACTCAAAATCCT


BQ
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AF RR4AJ73TF U 1
AF RR4AJ73JQ C 404
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BS 749 749 RR4AJ73JQ
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BS 819 1136 RR4AJ73JQ

RD RR4AJ73TF 818 0 0
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CAACCACTTGGAATTCCCACAAAAGCTTACTATGCAGTGACAGAAGCCTTCGTCCCTCTG
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ATGACTCCGGGTGGTGATAATGGCTTGGTGGATTTTTTGGAAGATTACTACATGTATGTC
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DS 

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AAGCCTTCGTCCCTCTGTCTACAGAAATTGCCCCTCCTGAAGTCGATCATATCGGCGGGA
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ATATGCGCATGTTTATTTCTTCTCTTGATTCTGTTTTTTAATTTGCTAGCCTAAAAGACA
AACTCAAAATCCT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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ATTCCAAGGAAAACGCCTTAGGAAATAATGTGGAGAACCAAAAGAAGGATGGTGTTATCA
CGTCTTCATCATCTTCAGCCTCTTGGTCCTCTAACAACAACCAAGCATTAAAGGCCGAAG
AAGACGAGGAAGATCTAGACATAGCTAGTTGTTTGATCCTCCTTTCCCAAGGCCACTCTC
TTCCACAGCTCAAGATACCTAACCAAGAAACAAACAACAACAATACGTATAGAATTAGCA
GCAAGAGGTTTCTAGAGACTTCTTCAGCTAACGGTGCTGGTAAAGCCGGTTACTACGTAT
ATCAGTGCAAAACATGTGAACGGACCTTCTCTTCTTTTCAGGCTTTAGGTGGCCATAGAG
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ATTTACGAAAATGATTCACTCGTTACAACCACAACTATTTACAATAATAACAAGAATAAC
AACAAAGACAATAGATCGCTTGTCGTGTACGGTAAGGCAGGTAACAACAAGGTTCATGAA
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CATAGAGGCGCGGTTGTTGTTGCTCCCACTGTGACGGTGGCCTTAGCTGTAGCCAACACG
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GTCGTGTCACTGGATTTGGATCTGAATCTACCCGCACCGGAAGATGAGAATCGGATCAAC
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GATGAACCAAAGTGTCTCGTCTTGTCTCCTCCTACTTTGGTGGACTGCCATTACTGATTT
ATTATTACTATTATAAACCATAATCTCAAAAAAAAAATTGGTTTCTAT


BQ
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AF RR4E270TF U 1
AF RR4E270JQ C 289
BS 1 651 RR4E270TF
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RD RR4E270TF 716 0 0
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TCTCTCCTCCTATAGTTTCTTGCCACACACGCGACGTTGAAGAGGAATACACTGATCTTG
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CGTCTTCATCATCTTCAGCCTCTTGGTCCTCTAACAACAACCAAGCATTAAAGGCCGAAG
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TTCCACAGCTCAAGATACCTAACCAAGAAACAAACAACAACAATACGTATAGAATTAGCA
GCAAGAGGTTTCTAGAGACTTCTTCAGCTAACGGTGCTGGTAAAGCCGGTTACTACGTAT
ATCAGTGCAAAACATGTGAACGGACCTTCTCTTCTTTTCAGGCTTTAGGTGGCCATAGAG
CTAGCCACAAGAAACCTAAGGCCACATCCCATAACTCCAACCTTGACCATCAAGAAAAAC
ATTTACGAAAATGATTCACTCGTTACAACCACAACTATTTACAATAATAACAAGAATAAC
AACAAAGACAATAGATCGCTTGTCGTGTACGGTAAGGCAGGTAACAACAAG*TTCATGAA
TGTGGA*TCTGTGGAGCGGAGTTTACGTCCCGACAAGCCTTAG*TGGCCACATGAG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4E270JQ 780 0 0
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GTTACTACGTATATCAGTGCAAAACATGTGAACGGACCTTCTCTTCTTTTCAGGCTTTAG
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ATCAAGAAAAACATTTACGAAAATGATTCACTCGTTACAACCACAACTATTTACAATAAT
AACAAGAATAACAACAAAGACAATAGATCGCTTGTCGTGTACGGTAAGGCAGGTAACAAC
AAGGTTCATGAATGTGGAATCTGTGGAGCGGAGTTTACGTCCGGACAAGCCTTAGGTGGC
CACATGAGACGGCATAGAGGCGCGGTTGTTGTTGCTCCCACTGTGACGGTGGCCTTAGCT
GTAGCCAACACGGAGTTATCATTGTTTTCGGTGTCCTTCGATCAAAAATCGACAAAGATA
GCTAAGAAGACGGTCGTGTCACTGGATTTGGATCTGAATCTACCCGCACCGGAAGATGAG
AATCGGATCAACGAATTCAGCTTAAGTTTGAAGCAAAAACATGAACAAGAACATCAACAA
ACGAAGCAAAGAGATGAACCAAAGTGTCTCGTCTTGTCTCCTCCTACTTTGGTGGACTGC
CATTACTGATTTATTATTACTATTATAAACCATAATCTCAAAAAAAAAATTGGTTTCTAT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6468Contig1 774 2 2 U
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CGAACTCACCGGGTCGATTCCCGGGTCGATCTCGGGTATGAAACGGTTAGCGGATCTGGA
TCTATCCAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACCTGAGTGGATGGGTAAAATGAATGTACT
CTCTGTTTTGAATCTCGATAGCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTCAATTCTTAG
CAGTTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGCCGGAATGCGTTGGAAGGATCCATACCCGA
CGTATTCGGATCCACAACTTATTTCATGTCGCTTGATTTGTCGCACAATAATCTATCGGG
TCGGATCCCGGATTCGCTCTCTTCAGCTAAGTTCGTGGGTCATCTAGATATCAGCCATAA
CAGGCTTTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTTTGATCACCTTGAGGCGTCGTCGTT
TAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTTAAAGTAATAAATA
AGGCAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCAGTTTGTTTATATTCTTCGCTTGCT
TTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAATCTGTTCTGCTAGCAACGAATGGC
TACACCGATCCAAATCTGTTCCTGGTGTATGGGTATGGTAGAGCATGTATAATGTATCAT
GTATAAGCAATGTTATAGATCTTAAATGTTTTAGAAATATATGTCTTTTGAAAT


BQ
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AF RR4B759JQ C 1
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BS 42 774 RR4B759TF

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CTCTGTTTTGAATCTCGATAGCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTCAATTCTTAG
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TCGGATCCCGGATTCGCTCTCTTCAGCTAAGTTCGTGGGTCATCTAGATATCAGCCATAA
CAGGCTTTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTTTGATCACCTTGAGGCGTCGTCGTT
TAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTTAAAGTAATAAATA
AGGCAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCAGTTTGTTTATATTCTTCGCTTGCT
TTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAATCTGTTCTGCTAGCAACGAATGGC
TACACCGATCCAAATCTGTTCCTGGTGTATGGGTATGGTAGAGCATGTATAATGTATCAT
GTATAAGCAATGTTATAGATCTTAAATGTTTTAGAAATATATGTCTTTTGAAAT

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TCCCCGGTTCAATTCTTAGCAGTTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGCCGGAATGCGT
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CGCACAATAATCTATCGGGTCGGATCCCGGATTCGCTCTCTTCAGCTAAGTTCGTGGGTC
ATCTAGATATCAGCCATAACAGGCTTTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTTTGATC
ACCTTGAGGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGA
CATGTTAAAGTAATAAATAAGGCAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCAGTTTG
TTTATATTCTTCGCTTGCTTTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAATCTGT
TCTGCTAGCAACGAATGGCTACACCGATCCAAATCTGTTCCTGGTGTATGGGTATGGTAG
AGCATGTATAATGTATCATGTATAAGCAATGTTATAGATCTTAAATGTTTTAGAAATATA
TGTCTTTTGAAAT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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AF RR4AZ23JQ C 1
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CAAACAATCAATCTGAATAGATATTTTTATTCATAAAGAGAGTGATTTTCGCAAGGTTTT
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RD RR4AZ23TF 410 0 0
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CATCTCAGGTGAATGGTAGGAGGAGAGTGTTGGAAGCCCATCTTGATCTTGATAGTGAAT
CTCAAGCATCAGCCGTACCACCACAATCGCCTCCAGGCTTGGAACAACCCAGATAGGACA
CAAACAATCAATCTGAATAGATATTTTTATTCATAAAGAGAGTGATTTTCGCAAGGTTTT
GAAACATGAGCTGCTGGTGTACATTTCGGAAAAGTTTGTTTCCCAATAGGTTGGTTATAC
ACACAGATGAATAGGAGGAAATAGAAGGATAGCAGGCTTTTCTATTCTACTATAATATGC
AGGATACTTGATTCTATATTACTTCTAATACAAAGTCAATCACCTTTTCC

QA 1 410 1 410
DS 



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TGACCTCCTGCTTCGTTTTTTCCTTTGGTGAGGTTCTTTAGAGTGTAATGGGTTTTTAGT
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TTAATGACTTTTGTTGGTTCGTCTTCGGTGAATT


BQ
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BS 598 934 RR4DM10JQ

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ACGGGTTCGTTTATACCAAGCGAGAGTGGAGGAACCCGAAGCAGAGCTGGAGGGATGAGT
GTGTCTCTTGCAGGACCTGATGGTCGTGTCTTTGGTGGTGGTCTCGCCGGTCTCTTTATA
GCCGCTGGTCCTGTTCAGGTAGTGGTAGGGCGTTTTGTAGCGGGTCAGGAGGAATCACAG
CAGCAGCAGCAGCAGCATCAGATGAAGAAGCAAAGAGGAGAAAGATTTGGGATCCCGACT
ACAACACAAGCTTCTAACATCTCATTCGGTGGTGGCTCAGCGGAAGAACCAAAGGCTAGA
TATGGGCTGAACAAGCCTGTTGTTATTCAGTCACCACCAATGTCCGCACCACCTGTACCC
TTTTCTCATGAGCCCCAGCCGAGCACCAACGCTGTCCAAGGTTACTACACAAACAACACT
GCTGAACAGATCAGGGATCTCTTCTCTTCTCTCCCAGGAGAGGATGATGATGAAGATGAT
TTAGAAGGTGAAGATGGAGATGATGTAGAATTTGGTGACCATAGCGACTCTGACACC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4DM10JQ 747 0 0
GTCCTGTTCAGGTAGTGGTAGGGCGTTTTGTAGCGGGTCAGGAGGAATCACAGCAGCAGC
AGCAGCAGCATCAGATGAAGAAGCAAAGAGGAGAAAGATTTGGGATCCCGACTACAACAC
AAGCTTCTAACATCTCATTCGGTGGTGGCTCAGCGGAAGAACCAAAGGCTAGATATGGGC
TGAACAAGCCTGTTGTTATTCAGTCACCACCAATGTCCGCACCACCTGTACCCTTTTCTC
ATGAGCCCCAGCCGAGCACCAACGCTGTCCAAGGTTACTACACAAACAACACTGCTGAAC
AGATCAGGGATCTCTTCTCTTCTCTCCCAGGAGAGGATGATGATGAAGATGATTTAGAAG
GTGAAGATGGAGATGATGTAGAATTTGGTGACCATAGCGACTCTGACACCGAGGTTCCAA
GCTGATGATTGATTGAGTGAGAGTGTGAATGAGACATGGATCGTTCTTGATCTTGACCTC
CTGCTTCGTTTTTTCCTTTGGTGAGGTTCTTTAGAGTGTAATGGGTTTTTAGTTGTTTTG
TTAAACAGAGATGATGCTCACTAAAGAGTTAGGGCTTATTAAAGGATGTAATCTTTAGGG
TTCTTCGACTTGTTTTCTTTGTGTCCCCAAGTGGGTTGTTGTAGAAGTGCAAAACTTAAG
TGTGTGTGCAAACTCTCTCGGTTAATTTACTCTTCAGTGACTTATTTTGAAACTTAATGA
CTTTTGTTGGTTCGTCTTCGGTGAATT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL6471Contig1 1225 2 6 U
GCAATCGCGAAAAAAATATCTTACGAATCTCTCTCTCTATCTGTCCAATCTCCTACCTGC
GATTCACAATGGCGAGCAACGGAGTGAAGGACACGACTACGGCGGAGAATGGCTCGGGGC
TTACTACCACTGGTGAAAACCCTAAGAAAATCCTCGACCTCAACACTGCGGAGCCAGATG
ACATTCTCGACGGAGGAGAAGTCAAGGGATTATCTGATTCTACTGATGAGAAGAAGGACG
AAGCCGACTCTAAGGCTATTGGTTCGACTGCTGGGGATGCATCATCTCCCGTCGATGATA
TACAGAAGAAGATCCGACGTGCTGAGAGGTTTGGCGTTTCGGTGAAGCTGACCGAAGAGG
AGAAACGCAATTCTCGTGCTGAGAGGTTCGGGACTGTAGCAGCGGTGAGTGGCTCAGAGG
GAACGAAGAAAGCTGAGGAGTTGAAGCGAAAGGCTAGAGCTGACAGATTTGGGGTTCCTG
CATCATCATCAGCCACTACTAAAGTATCTATCTTTATTAAGGTCGAAGTTTGGTCGTGGA
GCAAGGTTATGTGGTCATGCAATGATTCTCTCAGATGGACGGAAGCTAAGTTGTCACCAG
ATGAGATCATGAGAAATCAATAAAGTAACCTATAGTTCTGATTGTCTTAGAAAAGCAAAT
GTGTTAGGACCTAGGGATTCTGAAGTGGCTGTTTTCTTAACCTTTTTCCGTGTTACAGGT
GCTTAAAGTGGTAAGTTTAGATTGAGTGATGCCTTTATTTCCTTAAATGCACTGCATGTT
GGTATCAAGCATAGGCAGCATCAATAGAGCTTTTTATACTAGTAGTTGGAAATTGAAAAT
GTTGAATCCGTTGATTGCTTTCCGAGTTGCCTAATTTGCTAGCTTATCTATATATTGTTA
CGGATCCCATTACAATTTGTCGTTTGGTTTGCTATTTATATGAACTGTTAAGCCGCTACT
TCAGAATTCCTTTGTCAATCATCTAAGACAATATCATTAGAACTATAGAAGTGCTTTGTT
GGTTTCCATTTCTCTGGTTTCTGTGGCAACTGGAAGTGAAGGGACGTTGAATCTCTGTTC
GTGGAACTTGGACTTTTGCTGGCTTTCTGATGCTACACAATTTCTCTGAGTCTGTAATAG
TTTTTAGATAAAACTTTGTTGATAACTTTGAATCAAGCGCCAGAAAACTTTTATAAAGGG
AATGAAACATTCAGTTTTACTTCTT


BQ
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AF RR4B337TF U 1
AF RR4B337JQ C 391
BS 1 766 RR4B337TF
BS 767 767 RR4B337JQ
BS 768 794 RR4B337TF
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BS 796 809 RR4B337TF
BS 810 1225 RR4B337JQ

RD RR4B337TF 809 0 0
GCAATCGCGAAAAAAATATCTTACGAATCTCTCTCTCTATCTGTCCAATCTCCTACCTGC
GATTCACAATGGCGAGCAACGGAGTGAAGGACACGACTACGGCGGAGAATGGCTCGGGGC
TTACTACCACTGGTGAAAACCCTAAGAAAATCCTCGACCTCAACACTGCGGAGCCAGATG
ACATTCTCGACGGAGGAGAAGTCAAGGGATTATCTGATTCTACTGATGAGAAGAAGGACG
AAGCCGACTCTAAGGCTATTGGTTCGACTGCTGGGGATGCATCATCTCCCGTCGATGATA
TACAGAAGAAGATCCGACGTGCTGAGAGGTTTGGCGTTTCGGTGAAGCTGACCGAAGAGG
AGAAACGCAATTCTCGTGCTGAGAGGTTCGGGACTGTAGCAGCGGTGAGTGGCTCAGAGG
GAACGAAGAAAGCTGAGGAGTTGAAGCGAAAGGCTAGAGCTGACAGATTTGGGGTTCCTG
CATCATCATCAGCCACTACTAAAGTATCTATCTTTATTAAGGTCGAAGTTTGGTCGTGGA
GCAAGGTTATGTGGTCATGCAATGATTCTCTCAGATGGACGGAAGCTAAGTTGTCACCAG
ATGAGATCATGAGAAATCAATAAAGTAACCTATAGTTCTGATTGTCTTAGAAAAGCAAAT
GTGTTAGGACCTAGGGATTCTGAAGTGGCTGTTTTCTTAACCTTTTTCCGTGTTACAGGT
GCTTAAAGTGGTAAGTTTAGATTGAGTGATGCCTTTATTTCCTTAA*TGCACTGCATGTT
GGTATCAAGCATAG*CAGCATCAATAGAG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4B337JQ 835 0 0
GGACTGTAGCAGCGGTGAGTGGCTCAGAGGGAACGAAGAAAGCTGAGGAGTTGAAGCGAA
AGGCTAGAGCTGACAGATTTGGGGTTCCTGCATCATCATCAGCCACTACTAAAGTATCTA
TCTTTATTAAGGTCGAAGTTTGGTCGTGGAGCAAGGTTATGTGGTCATGCAATGATTCTC
TCAGATGGACGGAAGCTAAGTTGTCACCAGATGAGATCATGAGAAATCAATAAAGTAACC
TATAGTTCTGATTGTCTTAGAAAAGCAAATGTGTTAGGACCTAGGGATTCTGAAGTGGCT
GTTTTCTTAACCTTTTTCCGTGTTACAGGTGCTTAAAGTGGTAAGTTTAGATTGAGTGAT
GCCTTTATTTCCTTAAATGCACTGCATGTTGGTATCAAGCATAGGCAGCATCAATAGAGC
TTTTTATACTAGTAGTTGGAAATTGAAAATGTTGAATCCGTTGATTGCTTTCCGAGTTGC
CTAATTTGCTAGCTTATCTATATATTGTTACGGATCCCATTACAATTTGTCGTTTGGTTT
GCTATTTATATGAACTGTTAAGCCGCTACTTCAGAATTCCTTTGTCAATCATCTAAGACA
ATATCATTAGAACTATAGAAGTGCTTTGTTGGTTTCCATTTCTCTGGTTTCTGTGGCAAC
TGGAAGTGAAGGGACGTTGAATCTCTGTTCGTGGAACTTGGACTTTTGCTGGCTTTCTGA
TGCTACACAATTTCTCTGAGTCTGTAATAGTTTTTAGATAAAACTTTGTTGATAACTTTG
AATCAAGCGCCAGAAAACTTTTATAAAGGGAATGAAACATTCAGTTTTACTTCTT

QA 1 835 1 835
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6474Contig1 1191 2 4 U
GATACAGTGAGAACGTTGTCTGGTTAATTCAGCTTCCACGCCTGTACAACATTTACAAGG
ACATGGGAATTGTGACATCGTTCCAGAATATCCTTGACAATATATTCATTCCTCTGTTTG
AAGCCACGGTAGATCCCGATTCGCATCCCCAGCTCCATGTTTTTCTGAAGCAGGTTGTTG
GATTTGATTTGGTGGATGATGAAAGCAAACCTGAGAGACGTCCCACAAAGCACATGCCCA
CTCCAGCTCAATGGACTAACGCTTTTAATCCTGCATTCTCTTACTATGTCTACTACTGCT
ACGCTAACCTCTATGTGCTAAACAAGCTTCGGGAGTCTAAGGGCATGACAACCATCACAC
TACGGCCACATTCTGGGGAGGCTGGTGATATTGACCACTTGGCTGCTACATTTCTCACAT
GTCATAGCATTGCTCACGGAATCAATCTACGAAAGTCTCCTGTGCTTCAGTACCTCTACT
ACCTCGCCCAGATTGGTCTGGCCATGTCTCCACTGAGCAACAACTCTCTGTTTCTAGATT
ACCACCGAAACCCGTTTCCTGTGTTTTTCTTAAGAGGTCTCAATGTTTCCCTGTCCACGG
ATGATCCTCTCCAGATTCACTTAACTAAAGAACCTCTCGTGGAAGAGTACAGCATTGCTG
CCTCGGTGTGGAAGCTGAGTTCGTGTGACCTGTGCGAGATAGCTCGTAACTCAGTGTACC
AGTCAGGTTTCTCACATGCCCTGAAGTCGCACTGGATTGGAAAAGACTACTACAAAAGAG
GACCTGATGGAAACGACATTCACAAAACAAATGTACCTCACATAAGGGTGGAGTTCCGTG
ACGCGATCTGGAAAGAGGAGATGCAACAGGTCTATTTGGGAAAGGCTGTTATCTCAGATG
AAGTTGTTCCATAAGAAACAGAAATGAGAAATGACAATGTGGGAAGGGGGTTTATACACC
AAGGGAGACGTCTTCAGAAGTATACGATGCAGGAAGTAGATAGGGTAATAAATAAAGTGA
GAGTGGCTATGTTGTGCCCTTATGAAGGCTGCTGCCAAATCTATTGTTTCTATGAATCGT
AATTCTTTTTTTTCTAGAGCTGTGACTCTAAAGAGCTGCAAACGACATTGAGACTTTTTT
TTCTATATATAAAGAGACCATAAGAGTTATACTATCATTTAATTCTAGTTG


BQ
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AF RR4A768TF U 1
AF RR4A768JQ C 356
BS 1 726 RR4A768TF
BS 727 727 RR4A768JQ
BS 728 772 RR4A768TF
BS 773 1191 RR4A768JQ

RD RR4A768TF 772 0 0
GATACAGTGAGAACGTTGTCTGGTTAATTCAGCTTCCACGCCTGTACAACATTTACAAGG
ACATGGGAATTGTGACATCGTTCCAGAATATCCTTGACAATATATTCATTCCTCTGTTTG
AAGCCACGGTAGATCCCGATTCGCATCCCCAGCTCCATGTTTTTCTGAAGCAGGTTGTTG
GATTTGATTTGGTGGATGATGAAAGCAAACCTGAGAGACGTCCCACAAAGCACATGCCCA
CTCCAGCTCAATGGACTAACGCTTTTAATCCTGCATTCTCTTACTATGTCTACTACTGCT
ACGCTAACCTCTATGTGCTAAACAAGCTTCGGGAGTCTAAGGGCATGACAACCATCACAC
TACGGCCACATTCTGGGGAGGCTGGTGATATTGACCACTTGGCTGCTACATTTCTCACAT
GTCATAGCATTGCTCACGGAATCAATCTACGAAAGTCTCCTGTGCTTCAGTACCTCTACT
ACCTCGCCCAGATTGGTCTGGCCATGTCTCCACTGAGCAACAACTCTCTGTTTCTAGATT
ACCACCGAAACCCGTTTCCTGTGTTTTTCTTAAGAGGTCTCAATGTTTCCCTGTCCACGG
ATGATCCTCTCCAGATTCACTTAACTAAAGAACCTCTCGTGGAAGAGTACAGCATTGCTG
CCTCGGTGTGGAAGCTGAGTTCGTGTGACCTGTGCGAGATAGCTCGTAACTCAGTGTACC
AGTCAG*TTTCTCACATGCCCTGAAGTCGCACTGGATTGGAAAAGACTACTA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4A768JQ 836 0 0
CACACTACGGCCACATTCTGGGGAGGCTGGTGATATTGACCACTTGGCTGCTACATTTCT
CACATGTCATAGCATTGCTCACGGAATCAATCTACGAAAGTCTCCTGTGCTTCAGTACCT
CTACTACCTCGCCCAGATTGGTCTGGCCATGTCTCCACTGAGCAACAACTCTCTGTTTCT
AGATTACCACCGAAACCCGTTTCCTGTGTTTTTCTTAAGAGGTCTCAATGTTTCCCTGTC
CACGGATGATCCTCTCCAGATTCACTTAACTAAAGAACCTCTCGTGGAAGAGTACAGCAT
TGCTGCCTCGGTGTGGAAGCTGAGTTCGTGTGACCTGTGCGAGATAGCTCGTAACTCAGT
GTACCAGTCAGGTTTCTCACATGCCCTGAAGTCGCACTGGATTGGAAAAGACTACTACAA
AAGAGGACCTGATGGAAACGACATTCACAAAACAAATGTACCTCACATAAGGGTGGAGTT
CCGTGACGCGATCTGGAAAGAGGAGATGCAACAGGTCTATTTGGGAAAGGCTGTTATCTC
AGATGAAGTTGTTCCATAAGAAACAGAAATGAGAAATGACAATGTGGGAAGGGGGTTTAT
ACACCAAGGGAGACGTCTTCAGAAGTATACGATGCAGGAAGTAGATAGGGTAATAAATAA
AGTGAGAGTGGCTATGTTGTGCCCTTATGAAGGCTGCTGCCAAATCTATTGTTTCTATGA
ATCGTAATTCTTTTTTTTCTAGAGCTGTGACTCTAAAGAGCTGCAAACGACATTGAGACT
TTTTTTTCTATATATAAAGAGACCATAAGAGTTATACTATCATTTAATTCTAGTTG

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL6475Contig1 687 2 10 U
GGATCTTACTCTCATTCTATAAGTAAACTAGAAGACTATTTAATTACCTGAAAAATAATG
GCACAGGCGATGCTGAGGTCTTCTTTACAAGGAGAGATTGAGGCAGATGTTGAGATCAAA
GCTCCGGCTACGAAATTCTATCACGTGTTCGCAGTAAGACCACAGGATGTGCCTAAAGCC
TCTCCTAATAACATCCAGGGAGCCAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGCAGAGTTGGCACT
CGTGCCACCTGGAACTATGTTCTTGATGGGAAGCCAAAAGTGGCCAAGGATAGGATCGAG
GCTGTGGAGCCCAAGAAGAATATTATAAAGTACAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGAAA
GACTTCAAGAGCTTCCTATTCACGGTCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGACATGGAAGT
GTGGTGAAGTGGAACATGTCATACGAGAAGATTGATGAAAACGTGGCTCATCCGGAGAGT
CTTCTACAACTCTGTGTCAACATGATTAAAGACATCGACAAAATGCTTGTCTAAGGAATA
GATCCTAGTCAAATATCTATAAATATATATATCTTTATGTATTTGGATGTTTTATATCAA
TAATGTGCTCTCTCTAGATGTAAAGAGATGTGAGTGATATGAAAGTGTGTTATCAGATCA
CAGTAAAGACAACTTATTTCGCAAGTT


BQ
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AF RR4FB56TF U 1
AF RR4CZ39TF U 224
BS 1 244 RR4FB56TF
BS 245 245 RR4CZ39TF
BS 246 265 RR4FB56TF
BS 266 266 RR4CZ39TF
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BS 500 616 RR4FB56TF
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BS 618 656 RR4FB56TF
BS 657 687 RR4CZ39TF

RD RR4FB56TF 656 0 0
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GCACAGGCGATGCTGAGGTCTTCTTTACAAGGAGAGATTGAGGCAGATGTTGAGATCAAA
GCTCCGGCTACGAAATTCTATCACGTGTTCGCAGTAAGACCACAGGATGTGCCTAAAGCC
TCTCCTAATAACATCCAGGGAGCCAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGCAGAGTTGGCACT
CGTGTCACCTGGAACTATGTTCTTGGTGGGAAGCCAAAAGTGGCCAAGGATAGGATCGAG
GCTGTGGAGCCCAAGAAGAATATTATAAAGTACAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGAAA
GACTTCAAGAGCTTCCTATTCACGGTCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGACATGGAAGT
GTGGTGAAGTGGAACATGTCATACGAGAAGATTGATGAAAACGTGGCTCATCCGGAGAGT
CTTCTACAACTCTGTGTCGACATGATTAAAGACATCGACAAAATGCTTGTCTAAGGAATA
GATCCTAGTCAAATATCTATAAATATATATATCTTTATGTATTTGGATGTTTTATATCAA
TAATGTGCTCTCTCTATATGTAAAGAGATGTGAGTGATATGAAAGTGTGTTATCAG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CZ39TF 464 0 0
G
GGGCAGAGTTGGCACTCGTGCCACCTGGAACTATGTTCTTGATGGGAAGCCAAAAGTGGC
CAAGGATAGGATCGAGGCTGTGGAGCCCAAGAAGAATATTATAAAGTACAGAGTGATAGA
GGGAGATCTGATGAAAGACTTCAAGAGCTTCCTATTCACGGTCCAGGTGACCCCGAAGCA
AGGAGGACATGGAAGTGTGGTGAAGTGGAACATGTCATACGAGAAGATTGATGAAAACGT
GGCTCATCCGGAGAGTCTTCTACAACTCTGTGTCAACATGATTAAAGACATCGACAAAAT
GCTTGTCTAAGGAATAGATCCTAGTCAAATATCTATAAATATATATATCTTTATGTATTT
GGATGTTTTATATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATGTAAAGAGATGTGAGTGATATGAAA
TTGTGTTATCAGATCACAGTAAAGACAACTTATTTCGCAAGTT

QA 2 464 2 464
DS 



AS 1 2

CO CL6476Contig1 1132 2 18 U
GGATCGACATTTCTATAAATCATACGTCTTAACACACTCTTTCCACAATATAATACAAAT
GGCGGGGAAGGAGGAGAGTGAAACGTTTTACTCGGCGGCAACTCCTTTGGAGTTTGAGAA
AGGCAGCCTTCCAACAACCGTGATCCCCGCAGACCCATCGGCAAACGATTTGACCGCACC
TCCAAAGCCTGTAACAATCACCTCCCCAACCGTCGCCGGAACTTACCCCGTCGTCCTATT
CTTCCATGGATTCTATCTTCGTAACTACTTCTACTCTGATGTTATTAACCACGTAGCTTC
TCATGGCTACATTGTTGTAGCCCCACAGCTGTGCAAGATTCTGCCGCCAGGAGGGCAAGT
GGAAGTGGACGATGCTGGAAAAGTGATAAACTGGATCTCAAAAAACCTCAAAGCTCACCT
CCCAAATCCGGTAAACGCTAATGGCAAGTACACCGCACTCGTGGGCCATAGCCGCGGTGG
TAAAACCGCGTTTGCGGTTGCGTTAGGCCATGCCGCAACACTTGACCCATCCATCAAGTT
TTCAGCTCTTGTAGGAATAGATCCAGTTGCCGGAATCAGCAAATGCATGAGAACCAAGCC
GGAAATCTTAACTTACAAACCGGAATCGTTCGACCTGGACATACCGGTTGCAGTGATCGG
TACGGGTCTCGGACCGAAGAGTAACATGCTGATGCCACCATGCGCACCAGCGGAAGTGAA
CCATGTGGAGTTTTATAATGAGTGTAAGCCTACGAAGGGACATTTCGTGGCTGCGGATTA
CGGACATATGGATATGTTGGACGATAATTTGCCTGGTTTTGTCGGGTTTATGGCGGGTTG
TATGTGTAAGAACGGGAAACGCAACAAGAGTGAGATGAGGAGTTTTGTGGGTGGGATCGT
GGTTGCGTTTTTAAAGTATAGTCTATGGGGTGAAAAGTCAGAGATTCGACAGATTGTGAA
GGATCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGGCTTGATCCTTTGCCGGAGCTGGAAGAGGCTTCTGG
TCATCTCGTCTAGATTTGTGGCTATGTAACGTATTGGTATCCTCGGAGAGGCTCCAAACT
CGTAATAAACTTGTTGCATGTTTCACTATTTTTAATAAACTTATTGAATATT


BQ
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DS 

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CB83TF U 1
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GGTCTCAAACATGTTCCCCGATTCACATAGAACTGTGACGGAGCCTAGAATCATTGTCCA
GACGACGAGTGAAGTTGATCTATTAGATGATGGATATAGGTGGCGTAAATATGGACAGAA
AGTAGTCAAAGGAAACCCTTATCCGAGGAGTTACTATAAGTGCACAACACAGGGATGTGG
AGTGAGGAAACATGTAGAGAGAGCAGCAACAGATCCAAAAGCTGTAGTAACAACCTATGA
AGGAAAACATAACCATGACCTTCCTGCATCTAAATCAAGCAGCTGCACATTTAAGGCTAG
AAAACCGACCGGGCGGTTCGGCTAACTTAAATCAGCAGCAGTAGCAGCAGCCTGTTGCGC
GTCTAAGGCTGAAAGAAGAGCAAACAATTTAAGATCTTTTTTTCTCATGACAAAAAGCTT
TCAACTTTGATGGAATCTTAGTGGTTGAAGTTGAGCAG*TAACTAAATTATATACACAAT
TGTCTGAGAAGTCTAGCAGTTT

QA 1 682 1 682
DS 

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AGGAGTTACTATAAGTGCACAACACAGGGATGTGGAGTGAGGAAACATGTAGAGAGAGCA
GCAACAGATCCAAAAGCTGTAGTAACAACCTATGAAGGAAAACATAACCATGACCTTCCT
GCATCTAAATCAAGCAGCTGCACATTTAAGGCTAGAAAACCGACCGGGCGGTTCGGCTAA
CTTAAATCAGCAGCAGTAGCAGCAGCCTGTTGCGCGTCTAAGGCTGAAAGAAGAGCAAAC
AATTTAAGATCTTTTTTTCTCATGACAAAAAGCTTTCAACTTTGATGGAATCTTAGTGGT
TGAAGTTGAGCAGGTAACTAAATTATATACACAATTGTCTGAGAAGTCTAGCAGTTTACA
GGGAAGAAAAAGAGTTCATCAGAAGGGGTTGTAAAACCTTAAGGCTTTGTAGGTTTTTTA
AGATGTCTGTTTGTTTTACTTGTGTGAATTCATTTGTACATGAGGAGGAATACTACAGGG
AGGGGTTTTGTGTTGTATCTTTGTGTTATTGTTTTCAGAGGATGATAGGTTTAATAATAT
ACATTCTGTGGATGTATTTATTATCTGTTTGTAATATTTTGTTTGTTTATTTTTATTATG
GTATTACACTATTGACCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTCTTCTGGCTCAGGTCAGGCCCGACGATGAAGCCTCCGGGAGGAAATGGTGGCCGTATT
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ATCAGACAGAGTATGTGGAAGTACTAATAATTACAACTTTTGTTGCTATGCGTTTAATAA
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TTTAAATTACTCGTTTTTTTACATGAGCTGATGAAAAACGAGAGATATTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F346JQ C 1
AF RR4F346TF U 1
BS 1 411 RR4F346TF

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TTCAAAGTCATTTGAAAAGAACCCCAAAGGTTACTTCAGGGATCTGCGCAAGAAGTAAAC
ATCAGACAGAGTATGTGGAAGTACTAATAATTACAACTTTTGTTGCTATGCGTTTAATAA
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DS 

RD RR4F346TF 411 0 0
GGAAACCAATCAAGAATAGGAAAAAAAAAAATGAATCTTTCATCTCCTATCAAGATGATC
TCGGAGTATATCGATACCCCAACAAAGGTCACTGGCCTGGTAACAGCACTGGTCGTAGCC
TTCTTCTGGCTCAGGTCAGGCCCGACGATGAAGCCTCCGGGAGGAAATGGTGGCCGTATT
TTCAAAGTCATTTGAAAAGAACCCCAAAGGTTACTTCAGGGATCTGCGCAAGAAGTAAAC
ATCAGACAGAGTATGTGGAAGTACTAATAATTACAACTTTTGTTGCTATGCGTTTAATAA
TACTACATGGATGCCATATGTATGTTCCATTCCCTGTCGTGGATCTGTATGAAATGACTG
TTTAAATTACTCGTTTTTTTACATGAGCTGATGAAAAACGAGAGATATTTC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

CO CL6480Contig1 1008 2 10 U
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TATACACCATACATAGATCTGTTCTTCATTCTTCGATCTAAAACACTAAAAACTCCAAAA
AAATTTTTTTTTTTAATAAATCCGATTTTTTGGCCGATCATAGTAAATTCGCTACGGTGG
AGCTCCGGTTAGCGTTGCAGCGCCCGATTAAACAGTTCCGCGGCCGCGTTTTCGAACACG
GCCGATAACATGACATAAAGCATCGTTTCGCGGAATAGGGATACAATGAAACCTATTTCA
ACCACTAAACCGATACAATGAGACCTACTTCAACCACTAAAAAATAAGAAGTATGTGAAC
ATGCAATTATGCTGTGTAAACCTGGCCGTAAAGAATCTTCTTGGCTTGGTGTTTTGATTT
TGCTCCCTTATCTCTCTTACAACAGTAACTCTAAACTAGAAGATGTTATTTCTTTTTACC
GGACTGCGATATTGTAATTGGGCTCTTAGCTTAATATTGTGGCTTGATTATACTGGGTTT
GTGGCAAGAGTCTTATCGTGTGGTAGATGATGTATTGCATTCCTCCGTTGATCCTGTGCG
TACTCTTGGTCATCCCAGTTCCCACAGTCGTAATATGACCTGTGAATTTACAGGAAGTTG
GATGATTTTGGCCGGTGGTTCAACCCATGACAAGAAAAAAAAAATATGGTGCATAGAGAT
GGAAGGCGAAAAGACGCCAAGGAGGTGTAAATCGAGGGGGAGTCAAATAAGTCGATCTTG
TATATAAAACCATGGAAGCTACCCGTACGATTGAGAAATGTCATGAACTGTTCCAGTCTG
GTGATCTTGTTGAAGATGAAGGATCTCATGTTTACATCCGACTGTTTTAAGCAGCTTGTT
TAAGAAGCAGTGTGTATCTTAAGAGTAGTAACAACTTGTTCTTCTCCTACTTACTCTTTT
AGCCTTTGATGAGTAGAGTGGCTTAAGGGGTTAAGACCATTCTTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D936TF U 1
AF RR4D936JQ C 330
BS 1 703 RR4D936TF
BS 704 704 RR4D936JQ
BS 705 725 RR4D936TF
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BS 767 1008 RR4D936JQ

RD RR4D936TF 766 0 0
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TATACACCATACATAGATCTGTTCTTCATTCTTCGATCTAAAACACTAAAAACTCCAAAA
AAATTTTTTTTTTTAATAAATCCGATTTTTTGGCCGATCATAGTAAATTCGCTACGGTGG
AGCTCCGGTTAGCGTTGCAGCGCCCGATTAAACAGTTCCGCGGCCGCGTTTTCGAACACG
GCCGATAACATGACATAAAGCATCGTTTCGCGGAATAGGGATACAATGAAACCTATTTCA
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ATGCAATTATGCTGTGTAAACCTGGCCGTAAAGAATCTTCTTGGCTTGGTGTTTTGATTT
TGCTCCCTTATCTCTCTTACAACAGTAACTCTAAACTAGAAGATGTTATTTCTTTTTACC
GGACTGCGATATTGTAATTGGGCTCTTAGCTTAATATTGTGGCTTGATTATACTGGGTTT
GTGGCAAGAGTCTTATCGTGTGGTAGATGATGTATTGCATTCCTCCGTTGATCCTGTGCG
TACTCTTGGTCATCCCAGTTCCCACAGTCGTAATATGACCTGTGAATTTACAGGAAGTTG
GATGATTTTGGCCGGTGGTTCAACCCATGACAAGAAAAAAAAA*TATGGTGCATAGAGAT
GGAAG*CGAAA*GACGCCAAGGAG*TGTAAATCGAGGGGGAGTCAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4D936JQ 679 0 0
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TCTAAACTAGAAGATGTTATTTCTTTTTACCGGACTGCGATATTGTAATTGGGCTCTTAG
CTTAATATTGTGGCTTGATTATACTGGGTTTGTGGCAAGAGTCTTATCGTGTGGTAGATG
ATGTATTGCATTCCTCCGTTGATCCTGTGCGTACTTTTGGTCATCCCAGTTCCCACAGTC
GTAATATGACCTGTGAATTTACAGGAAGTTGGATGATTTTGGCCGGTGGTTCAACCCATG
ACAAGAAAAAAAAAATATGGTGCATAGAGATGGAAGGCGAAAAGACGCCAAGGAGGTGTA
AATCGAGGGTGAGTCAAATAAGTCGATCTTGTATATAAAACCATGGAAGCTACCCGTACG
ATTGAGAAATGTCATGAACTGTTCCAGTCTGGTGATCTTGTTGAAGATGAAGGATCTCAT
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AACAACTTGTTCTTCTCCTACTTACTCTTTTAGCCTTTGATGAGTAGAGTGGCTTAAGGG
GTTAAGACCATTCTTTAGT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6481Contig1 977 2 2 U
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GCTTTCATCAACGCTGCGAATTCTTTCCCCAATTTTGCCAATTCCGTTACTAGGCTTGAA
ATTGCAACTATGTTTGCTCATTTCACCTAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATAGAAGAG
ATAGATGGAGCGTCACAAAACTACTGCAACGACAGGGAATACCCACAATACCCATGTGCA
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CCATGTGGTCAGAGTCTCGGTCTCGACCTTCTAGGGCAGCCCGAGCTCGTAGGTAGCGAT
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AGCCAAGGATTCGGAGCCACCATAAGAGCAATCAATGGAAGAGTAGAATGTGACGGTGCG
AGTCCAGATAAGGTTAACTCAAGGATTAGTTACTATAGAGACTATTGTGGGCAGCTTGGT
GTGGACCCTGGTTCTAACCTTAGCTGCTAAGAAGCTCTTTAAAGACTACTATTGGACGGT
CGTGTCTATGTTGAAATAATATGTAATCAAATAAAATTTCATGCATGTTTGGGTCTGTGT
TTCATGCTTCATAAGCAAAAGGATTGTTGCAATGATCTTGTAAAAGTTAATTCAGATTTA
TAAGTGTCCTGAGTTGC


BQ
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AF RR4FB72TF U 1
AF RR4FB72JQ C 203
BS 1 613 RR4FB72TF
BS 614 977 RR4FB72JQ

RD RR4FB72TF 613 0 0
GGACAAAACAATCACCAAAACATGACTCTCACAAAAACCTCATTAGTCTTTCTTCTTTGC
CTCTTAGGTTTCTATTCCGAAACCGTCAAGTCGCAGAACTGCGGCTGTTCCCCGGACCTA
TGCTGTAGTCAGTACGGTTTTTGCGGTACGGGTAATGACTTCTGTGGTCTCGGTTGCCAA
TCAGGTCCTTGTACAACCCAAGCCGAAAGTCTTGGTACCATAGTAACACGAGCTTTCTTT
GACGGTATTATCAACCGAGCCGCTAGTGACTGCGCCGGAAAAGGATTCTACACACGTGAC
GCTTTCATCAACGCTGCGAATTCTTTCCCCAATTTTGCCAATTCCGTTACTAGGCTTGAA
ATTGCAACTATGTTTGCTCATTTCACCTAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATAGAAGAG
ATAGATGGAGCGTCACAAAACTACTGCAACGACAGGGAATACCCACAATACCCATGTGCA
CCGGGCAAAAACTACTACGGTCGTGGTCCGATTCAACTATCATGGAACTACAACTACGCA
CCATGTGGTCAGAGTCTCGGTCTCGACCTTCTAGGGCAGCCCGAGCTCGTAGGTAGCGAT
CCAACTGTAGCTT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4FB72JQ 775 0 0
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CTAGTGACTGCGCCGGAAAAGGATTCTACACACGTGACGCTTTCATCAACGCTGCGAATT
CTTTCCCCAATTTTGCCAATTCCGTTACTAGGCTTGAAATTGCAACTATGTTTGCTCATT
TCACCTAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATAGAAGAGATAGATGGAGCGTCACAAAACT
ACTGCAACGACAGGGAATACCCACAATACCCATGTGCACCGGGCAAAAACTACTACGGTC
GTGGTCCGATTCAACTATCATGGAACTACAACTACGCACCATGTGGTCAGAGTCTCGGTC
TCGACCTTCTAGGGCAGCCCGAGCTCGTAGGTAGCGATCCAACTGTAGCTTTCAGGACAG
CTTTGTGGTTTTGGGTGAATAACGTAAGGCCGGTACTGAGCCAAGGATTCGGAGCCACCA
TAAGAGCAATCAATGGAAGAGTAGAATGTGACGGTGCGAGTCCAGATAAGGTTAACTCAA
GGATTAGTTACTATAGAGACTATTGTGGGCAGCTTGGTGTGGACCCTGGTTCTAACCTTA
GCTGCTAAGAAGCTCTTTAAAGACTACTATTGGACGGTCGTGTCTATGTTGAAATAATAT
GTAATCAAATAAAATTTCATGCATGTTTGGGTCTGTGTTTCATGCTTCATAAGCAAAAGG
ATTGTTGCAATGATCTTGTAAAAGTTAATTCAGATTTATAAGTGTCCTGAGTTGC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6482Contig1 762 2 5 U
TTATTCTTGAGCGTCGCAGTCACCAAGTCTCTCTCTAAGTCGAAGGGTTTTATCTCCACC
GTCACTGCTTTGATGTACTCGAACCTTTTTAGCTTGTTCTTCTCTGCCGTGGACTTCAGT
TCTAAAATGATGTGTTCTTGCAACTCCGAGAGAGAACAGAGTTCTTCAAATGGTTTATTA
AAACCGAGATCTTTAGCCCACCGGTTCACGACTTCAGGGTTTGGAACAATCACCGCGACA
AGCATTGATTTGAAGCTGTCTCCATAAACCCATATATCTTGTACTACAGAGTTTTGCCCG
TAGATGTTTTCCAGATTCTCAAGAGCAACGTACTCTCCTTGAGAAAGTTTAATCAAATTC
TTTTTACGATCAATTATCTTGAGTACTCCATTTGGCTGAATCTCACCTATATCTCCTGTA
TGGAACCATCCGTCTTTCAAGACTTCATCAGTAAGCTCAGGGTTCTTGTAATAACCAGAG
AACAAACATTTTCCTCTTATACAGATCTCGCCTGCGGGATTTTCACCGAGTGGGTCGTAG
CCCATTTCAGCCACCTCCTCAAGCCGTATCTCGTTGTAAACCGCCGGTATACCGACTGTC
CCTAGCATACACATCTCATCTGGGATACACAAAGCCGTTCCTCCAAGCGTCTCCGTCAGA
CCGTAGCCCTGGAGGACAAAGCAACAACAAGTAACTCTCAAGAACTCTTCAATCTCAGGG
CTCAAAGGTGCTCCTCCAGATATTAGCAACCGGATTCGACCC


BQ
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AF RR4B954JQ U 222
AF RR4B954TF C 1
BS 1 221 RR4B954TF
BS 222 514 RR4B954JQ
BS 515 515 RR4B954TF
BS 516 634 RR4B954JQ
BS 635 762 RR4B954TF

RD RR4B954JQ 413 0 0
TGGAACAATCACCGCGACAAGCATTGATTTGAAGCTGTCTCCATAAACCCATATATCTTG
TACTACAGAGTTTTGCCCGTAGATGTTTTCCAGATTCTCAAGAGCAACGTACTCTCCTTG
AGAAAGTTTAATCAAATTCTTTTTACGATCAATTATCTTGAGTACTCCATTTGGCTGAAT
CTCACCTATATCTCCTGTATGGAACCATCCGTCTTTCAAGACTTCATCAGTAAGCTCAGG
GTTCTTGTAATAACCAGAGAACAAACATTTTCCTCTTATACAGATCTCGCCTGGGGGATT
TTCACCGAGTGGGTCGTAGCCCATTTCAGCCACCTCCTCAAGCCGTATCTCGTTGTAAAC
CGCCGGTATACCGACTGTCCCTAGCATACACATCTCATCTGGGATACACAAAG

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4B954TF 762 0 0
TTATTCTTGAGCGTCGCAGTCACCAAGTCTCTCTCTAAGTCGAAGGGTTTTATCTCCACC
GTCACTGCTTTGATGTACTCGAACCTTTTTAGCTTGTTCTTCTCTGCCGTGGACTTCAGT
TCTAAAATGATGTGTTCTTGCAACTCCGAGAGAGAACAGAGTTCTTCAAATGGTTTATTA
AAACCGAGATCTTTAGCCCACCGGTTCACGACTTCAGGGTTTGGAACAATCACCGCGACA
AGCATTGATTTGAAGCTGTCTCCATAAACCCATATATCTTGTACTACAGAGTTTTGCCCG
TAGATGTTTTCCAGATTCTCAAGAGCAACGTACTCTCCTTGAGAAAGTTTAATCAAATTC
TTTTTACGATCAATTATCTTGAGTACTCCATTTGGCTGAATCTCACCTATATCTCCTGTA
TGGAACCATCCGTCTTTCAAGACTTCATCAGTAAGCTCAGGGTTCTTGTAATAACCAGAG
AACAAACATTTTCCTCTTATACAGATCTCGCCTGCGGGATTTTCACCGAGTGGGTCGTAG
CCCATTTCAGCCACCTCCTCAAGCCGTATCTCGTTGTAAACCGCCGGTATACCGACTGTC
CCTAGCATACACATCTCATCTGGGATACACAAAGCCGTTCCTCCAAGCGTCTCCGTCAGA
CCGTAGCCCTGGAGGACAAAGCAACAACAAGTAACTCTCAAGAACTCTTCAATCTCAGGG
CTCAAAGGTGCTCCTCCAGATATTAGCAACCGGATTCGACCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6483Contig1 911 2 2 U
GCATGGACGAAGGTTCCTTGGAAGGTCGCCACGTGTCCAACGAGCGTGATTTGGCCAAAC
TCTCGTTTCAGATCTTGAACGGTTTGGCGTATCTCCACGGACGTCATATAGTCCACAGAG
ACATCAAGCCTTCGAATCTGCTTGTTAACAAGGCGGCTAACGTCAAGATTGCTGATTTTG
GAGTGAGTAGGATCTTGGCTCAGACCATGGATCCCTGCAACTCCTCTGTTGGGACGATTG
CTTACATGAGTCCTGAGAGGATTAATACTGATTTGAATCAGGGGAGGTATGACGGTTACG
CTGGGGATATATGGAGCTTAGGTGTTAGCATTCTTGAGTTTTTCTTGGGGAGGTTTCCTT
TCAATGTGAGTAGGCAGGGGGATTGGGCGAGTCTCATGTGTGCTATCTGTATGTCTCAGC
CTCCCGAGGCTCCGGCGAGTGCGTCTCCGGAGTTTCGGCATTTTATTTCGCGTTGCTTGC
AGAGGGAACCGGGGAGGAGGATGACGGCGAGTCAGCTTTTGAGGCATCCTTTTATACTTA
GAGGTGCGAGTCAGGGGCAGAACAGGTCTCCTCAGAATCCGCATCAGCTCTTGCCTCCTC
CTCGTCCTCTCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTTCGTCCCCAATGACGT
AGTGATTACTGGTTCTTGGGTCAGTCTCCTCCTTTGTACTTTTGAGTTCTTGGTTTACTC
TTGTTGTCCGATTTTTGCGTAAGCTTTGCGTAACTTTATCAAGAAGGGCAAAACGACTTT
GCTTTTGTAATCCCAAACTGTAGCTTTGTTGAATTTTCATAAAATGGTTTATGCCTTTTT
CTTTGTTCTTTTGCAATTTATGCTTCGCCGTTTGCATCTTAAGCCTCGTTAAAAAATGTT
GGTTTCTATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H223TF U 1
AF RR4H223JQ C 303
BS 1 710 RR4H223TF
BS 711 911 RR4H223JQ

RD RR4H223TF 710 0 0
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TCTCGTTTCAGATCTTGAACGGTTTGGCGTATCTCCACGGACGTCATATAGTCCACAGAG
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CTTACATGAGTCCTGAGAGGATTAATACTGATTTGAATCAGGGGAGGTATGACGGTTACG
CTGGGGATATATGGAGCTTAGGTGTTAGCATTCTTGAGTTTTTCTTGGGGAGGTTTCCTT
TCAATGTGAGTAGGCAGGGGGATTGGGCGAGTCTCATGTGTGCTATCTGTATGTCTCAGC
CTCCCGAGGCTCCGGCGAGTGCGTCTCCGGAGTTTCGGCATTTTATTTCGCGTTGCTTGC
AGAGGGAACCGGGGAGGAGGATGACGGCGAGTCAGCTTTTGAGGCATCCTTTTATACTTA
GAGGTGCGAGTCAGGGGCAGAACAGGTCTCCTCAGAATCCGCATCAGCTCTTGCCTCCTC
CTCGTCCTCTCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTTCGTCCCCAATGACGT
AGTGATTACTGGTTCTTGGGTCAGTCTCCTCCTTTGTACTTTTGAGTTCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4H223JQ 609 0 0
GGGGATATATGGAGCTTAGGTGTTAGCATTCTTGAGTTTTTCTTGGGGAGGTTTCCTTTC
AATGTGAGTAGGCAGGGGGATTGGGCGAGTCTCATGTGTGCTATCTGTATGTCTCAGCCT
CCCGAGGCTCCGGCGAGTGCGTCTCCGGAGTTTCGGCATTTTATTTCGCGTTGCTTGCAG
AGGGAACCGGGGAGGAGGATGACGGCGAGTCAGCTTTTGAGGCATCCTTTTATACTTAGA
GGTGCGAGTCAGGGGCAGAACAGGTCTCCTCAGAATCCGCATCAGCTCTTGCCTCCTCCT
CGTCCTCTCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTTCGTCCCCAATGACGTAG
TGATTACTGGTTCTTGGGTCAGTCTCCTCCTTTGTACTTTTGAGTTCTTGGTTTACTCTT
GTTGTCCGATTTTTGCGTAAGCTTTGCGTAACTTTATCAAGAAGGGCAAAACGACTTTGC
TTTTGTAATCCCAAACTGTAGCTTTGTTGAATTTTCATAAAATGGTTTATGCCTTTTTCT
TTGTTCTTTTGCAATTTATGCTTCGCCGTTTGCATCTTAAGCCTCGTTAAAAAATGTTGG
TTTCTATCC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6484Contig1 1070 2 2 U
TCTCTTCGAAGATCTCCAAGGGATCCTCCTCCGCGTCAGAAAAGAGATGCATGCGTCGTT
CGTGTGGCTGTTCCAGCAAGTTTTCTCCGCCACTCCTACGTTGATGGTCTCTGTTATGAT
CCTCCTCGCAAACTTCACGGTTTATTCTATTGGCAGCAACTCCGCTTTAGCCGCCGCAAC
GCCTCCAACGGCTACAGTCTCTTTCAGGTTTGACACTACGGAGATAAGTGAGCCACAGGA
GAAGTTCGACTCCGATATGATCAAGACGTTCTCTGTTTCTTCTCCCAACGGGAAGACATC
TTTTGTCGGCGGAGGAAACGGTGGGAACAACGTGCCCCCCGTGCAGAGCGGAACAGAAGG
AGATGGTTCTGATCAGTTCAGAACACCATCTCAGTTCTCTTCGTCGTCTCTCGGCTCAAC
AGCTGCGGATTCAGAGGTATCGGTGTCGGGGCAGGAAGAGACTCGGCTGTGGAACTCGAT
CTTGGAGGAAACGGAGAAGATGGAGGCGTTGGATCACGACACGATGAAGCAGATGGTTGC
TCCCGTGGAGGCACGAGTAGAGGCAGAAGAGTCGATGGATTACTTCAAGACGGAGCTTCT
CTACCAAACGGGTCTGTCTCAGCAGCCTGATAACGTTCTCCTTCTTGCTAATTACGCTCA
GTTTCTCTACCTAATCATACATGATTACGACGGAGCGGAGAAGTATTTCAAGAGAGCGGC
AAAAGCAGAGCCAGCTGACGCCGAGGCGTTGAGTAAATACGCGACGTTCTTGTGGAAGGC
AAGGAACGATTTGTGGAGAGCAGAGGAGACGTTCTTGGAAGCAATCTCTGCTGATCCAAC
AAACTCATTTTACTCTGCAAACTATGCACATTTCCTTTGGAACACGGGTGGTGATGAGAC
GTGTTTCCCTCTCGACGCTCCACCACAACAGAACACAACCTAAAGATAAAAGAGTGATAA
CAATTGTCCAAGTGTACAGTGTGTTTCTTTTTAGTACAATTCATGTCATGTGGCAACTTT
TTGTTCTGTAAAACAAACAAGACTTTTGTTTATATATACGCACATATTCC


BQ
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AF RR4EX15TF U 1
AF RR4EX15JQ C 344
BS 1 685 RR4EX15TF
BS 686 1070 RR4EX15JQ

RD RR4EX15TF 687 0 0
TCTCTTCGAAGATCTCCAAGGGATCCTCCTCCGCGTCAGAAAAGAGATGCATGCGTCGTT
CGTGTGGCTGTTCCAGCAAGTTTTCTCCGCCACTCCTACGTTGATGGTCTCTGTTATGAT
CCTCCTCGCAAACTTCACGGTTTATTCTATTGGCAGCAACTCCGCTTTAGCCGCCGCAAC
GCCTCCAACGGCTACAGTCTCTTTCAGGTTTGACACTACGGAGATAAGTGAGCCACAGGA
GAAGTTCGACTCCGATATGATCAAGACGTTCTCTGTTTCTTCTCCCAACGGGAAGACATC
TTTTGTCGGCGGAGGAAACGGTGGGAACAACGTGCCCCCCGTGCAGAGCGGAACAGAAGG
AGATGGTTCTGATCAGTTCAGAACACCATCTCAGTTCTCTTCGTCGTCTCTCGGCTCAAC
AGCTGCGGATTCAGAGGTATCGGTGTCGGGGCAGGAAGAGACTCGGCTGTGGAACTCGAT
CTTGGAGGAAACGGAGAAGATGGAGGCGTTGGATCACGACACGATGAAGCAGATGGTTGC
TCCCGTGGAGGCACGAGTAGAGGCAGAAGAGTCGATGGATTACTTCAAGACGGAGCTTCT
CTACCAAACGGGTCTGTCTCAGCAGCCTGATAACGTTCTCCTTCTTGCTAATTACGCTCA
GTTTCTCTACCTAATCATACATGAT
AC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4EX15JQ 727 0 0
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TCGTCTCTCGGCTCAACAGCTGCGGATTCAGAGGTATCGGTGTCGGGGCAGGAAGAGACT
CGGCTGTGGAACTCGATCTTGGAGGAAACGGAGAAGATGGAGGCGTTGGATCACGACACG
ATGAAGCAGATGGTTGCTCCCGTGGAGGCACGAGTAGAGGCAGAAGAGTCGATGGATTAC
TTCAAGACGGAGCTTCTCTACCAAACGGGTCTGTCTCAGCAGCCTGATAACGTTCTCCTT
CTTGCTAATTACGCTCAGTTTCTCTACCTAATCATACATGATTACGACGGAGCGGAGAAG
TATTTCAAGAGAGCGGCAAAAGCAGAGCCAGCTGACGCCGAGGCGTTGAGTAAATACGCG
ACGTTCTTGTGGAAGGCAAGGAACGATTTGTGGAGAGCAGAGGAGACGTTCTTGGAAGCA
ATCTCTGCTGATCCAACAAACTCATTTTACTCTGCAAACTATGCACATTTCCTTTGGAAC
ACGGGTGGTGATGAGACGTGTTTCCCTCTCGACGCTCCACCACAACAGAACACAACCTAA
AGATAAAAGAGTGATAACAATTGTCCAAGTGTACAGTGTGTTTCTTTTTAGTACAATTCA
TGTCATGTGGCAACTTTTTGTTCTGTAAAACAAACAAGACTTTTGTTTATATATACGCAC
ATATTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6485Contig1 664 2 3 U
GTGCTGAAAATGGAGATCATATGATTTCTTACTGATTCTGTCCTTCACAAACTTTTATAA
GACGGACAGAGTTTCATTACAAAGAAATAAAGAAGAGTTTTTTAATTATTAAAATTCATC
CTCACGGACAGATAGATAATAACACAGCGTCAGCCCATGGCGTACTTTTGGGTCCAGGTC
CAAGCAGTGGACTCGTACTTGGTCTTGTCTGTCTTGTACATGTGAGCTATCTCCGGAACC
AAGGGATCATCTGGGTTTGGATCCGTTAACAGCGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAA
ATAGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGACAGATGCTCCCATTGCCG
TTAATGTTTGGGTGGAACACCTTCGTCCTAAAAGCCACCTTAGGAGGTTTAAAGGGATAA
TCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCACCAGAATAAGAACTGTCGGATGGA
CCCATTATCGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCAGCTACAGGTCCTGCGCTACAAGAA
GTCGGAGGATCCTTCTGGAGATCCTTCAACTCTTTCAAAATCCGTTTCGATGCCATCTCC
GAAACCTTTCGATCGAGCTTAGATTCTTCGGAATTAGGGATTTAGGAGAAGAAAGGGAAG
AGCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4FN77JQ U 116
AF RR4FN77TF C 1
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BS 536 664 RR4FN77TF

RD RR4FN77JQ 420 0 0
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TGGAAATAGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGACAGATGCTCCCAT
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ATGGACCCATTATCGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCAGCTACAGGTCCTGCGCTAC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR4FN77TF 664 0 0
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GACGGACAGAGTTTCATTACAAAGAAATAAAGAAGAGTTTTTTAATTATTAAAATTCATC
CTCACGGACAGATAGATAATAACACAGCGTCAGCCCATGGCGTACTTTTGGGTCCAGGTC
CAAGCAGTGGACTCGTACTTGGTCTTGTCTGTCTTGTACATGTGAGCTATCTCCGGAACC
AAGGGATCATCTGGGTTTGGATCCGTTAACAGCGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAG
ATAGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGACAGATGCTCCCATTGCCG
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TCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCACCAGAGTAAGAGCTGTCGGATGGA
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GTCGGAGGATCCTTCTGGAGATCCTTCAACTCTTTCAAAATCCGTTTCGATGCCATCTCC
GAAACCTTTCGATCGAGCTTAGATTCTTCGGAATTAGGGATTTAGGAGAAGAAAGGGAAG
AGCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6486Contig1 1091 2 6 U
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AGAACTAGACTTAAGTGGAAATGATTTTGACAACTTACCAGAAGCTATGGGTAGACTTCC
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TAACTGCAAAAATCTCAAATCAGTGGACGTGATTCCACAGAGCCTCCAATTTCTCCATGC
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AAAGCCGCAGAGTGTCTGCTTCCAAGAAACCGGAATGGTGAGCCAACAGCCAGATCACCA
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CATTTACAATTCTTGTATCAGCTATATATTAATGTGTTTGATGCAGAGATTATGATGATA
AAGCTGGACCATGCTTTTGAAATTTCCCATGAGTCAGTATTAGAAATAGATGAATTTTTT
TTTTTTGCTCTCTGTCGCTGCGAAAGCATTTGTTTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTTTAGT
TTATTTCGAACTAGTGGTTTGCCCGCCCTGCGGGCGGGGCGGTTGTATTTTGTTGTAATT
TGTGTTTTGATGGTGTTATCTGTTTTTGTTTGATGTTTATTCTGATTCGAGTAAAATTTA
CATTTATTCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F974TF U 1
AF RR4F974JQ C 348
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BS 687 687 RR4F974JQ
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GGTGCAGCGCTTTTCCCTTGGAGGG*ACTTTGCTTC
TTGGCAATCTCTATT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4F974JQ 744 0 0
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AATTTCTCCATGCACATGGCTGTGATTCCCTTCACGCTGATGCTTTAGAAAATTTTTATA
AGAGAAGAAATATAAAGCCGCAGAGTGTCTGCTTCCAAGAAACCGGAATGGTGAGCCAAC
AGCCAGATCACCAGGCAACAAAGAGTCGCATGCCCAAGTTCCTAAGCTGTTTATATTCCT
AGTCATTCCTAAATGCCACGGTTATGCTTCATCTTTTCAATTTGCTCCTGCGTTTTTACC
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TCTATTTTAAGAACATTTACAATTCTTGTATCAGCTATATATTAATGTGTTTGATGCAGA
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AGATGAATTTTTTTTTTTTGCTCTCTGTCGCTGCGAAAGCATTTGTTTGTGTGTGTGTGG
GTGTGTGTTTAGTTTATTTCGAACTAGTGGTTTGCCCGCCCTGCGGGCGGGGCGGTTGTA
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QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6487Contig1 1097 2 4 U
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TTCAAGACTAACAAGAACAAAACATATGGTCCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCG
TTGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCA
TCACCAACTGATCGTGGATCACGTGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAA
TGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCTACCTTTTACTAGTTTCTATTTGTTTCAAGT
TCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTTGTTCTGTCTAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAA
TAAATTTTATTTGAATT


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AF RR4D694TF U 1
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BS 735 747 RR4D694TF
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GTCAAGAACGGACAACCCGAAACCGCCCCTCTTCGCGGTGTCAAGGGCCGTGCCATCGCA
GCTGATCCGTTTGTGATTAACCATCCAGAGGAGCATCTAGTTTCCGTAGAAGGTTGGTAT
GACTCTTCTGGTGTCATTCAAGGGCTTAAGTTCAACTCCAACAAGAAGTCTTCTGATGTC
ATTGGATACAATGATGGTACTCCATTTACCCTCCAAGTCCAAGACAAGAAGATAATTGGC
TTTCATGGCTTCGCCGGAGACAATCTTAATTCTCTTGGAGCTTACTTTGCTCCATTAATA
GCCGCCCCTCCTTCAGTTCCCCCGAAGAAGCTTGAAGCTAAGAGTGGTGAGTCTGGAGCT
GTGTGGGACGATGGTGCACACGACAATGTTAAAAAGGTGTCTGTAGGACAAGGCGAAGAT
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CGTGGGACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGTTTGAGCTTGAATCAGATGAATACATA
ACCATCATGGAAG*CACCTACGACAAA
TC

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DS 

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AGGTGTCTGTAGGACAAGGCGAAGATGGTATAGCAGCTGTCAAGTTTGAATACACAAATG
GTTCTCAAGTGGTCATTGGAGCTGAACGTGGGACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGT
TTGAGCTTGAATCAGATGAATACATAACCATCATGGAAGGCACCTACGACAAAATCTTAG
GGAGTGATGGGCTGACGATGCTCACTTTCAAGACTAACAAGAACAAAACATATGGTCCCA
TCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTTGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCA
TAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACGTGAATTTGTCA
CAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCTACCT
TTTACTAGTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTTGTTCTGTCTAAG
ATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTGAATT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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CTTTAGCATCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAACACACATTTATCATTCTTCTTTTTTTT
TGGTTCATTTGTTTTATTGTTTTTGCTAATGAGTTTGTGTGTCATTTGATTATATTGTTA
ATAGAGTGTTGTATTACTCTTAATGTAACCATCTGTTTCTATGTGTTTTAAT


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AF RR4A453JQ C 1
AF RR4A453TF U 1
BS 1 412 RR4A453TF

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TCGTTGCAGTGGCTTTTTCAGCTGTAGGACAAGCAGCTGCCGCCACCGTAGAAGCTCCGG
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DS 

RD RR4A453TF 412 0 0
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TGTTCTTCTTCCTACATTAAACATAACCAATGGCAATGAAGATGATGGTTGTTTTCATGG
TCGTTGCAGTGGCTTTCTCAGCTGTAGGACAAGCAGCTGCCGCCACCGTAGAAGCTCCGG
CTCCAAGTCCAATTTCCGATGCTGCCATGTTTGTACCAGCATTGTTTGCATCTGTTGTTG
CTTTAGCATCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAACACACATTTATCATTCTTCTTTTTTTT
TGGTTCATTTGTTTTATTGTTTTTGCTAATGAGTTTGTGTGTCATTTGATTATATTGTTA
ATAGAGTGTTGTATTACTCTTAATGTAACCATCTGTTTCTATGTGTTTTAAT

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 2

CO CL6489Contig1 753 2 2 U
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TACTTGTCAACAGAAATTATCAAAGTAGTGAAGAAATTACTCCAGTGAAAAGAACACTAA
GGCATATCACCAGCAAAGAAAAAAACAAGAACCAAAGCGACTTCCGGAATTAGTCCCTTC
AAACGAAGGATCCATAAAGAACATGCAAAGGCTAATCCTAGAACCGGAAGATAAAATCTC
TATCTAATCTAAGAACTAGCAACACTTGGATCAACACTCACTCCACTTTTGATCTTCTCC
ATCTCATTACTCAGTACTTCCTTTACTCTGCTCTTTAACTCACTGAGACTTTGTTCTGTT
TTCACTGAGACATGAAATGATTCATCAGGCCCTGTTTCCCTGTACTTAATGATTTCTGCT
TCATCATTACTTATATCTTCTTCGGCATAAATCACTGGAGAGCCTCCCCCAAGCAGATCG
CATTTGGAAACAACATCAATCCACAGGTAATCCTTAAACCTTTCTTTTATTTCTTTATAT
ATTCTAAACTGATCAGAAGGTGAAGTCCCACACTCTCCAGTTAGATCATGAACATATAGA
ACCGCGGTTGGAAGATGAGTGAGTACAGCAAGAGTTAGCTTCTCTAGATTATTCCTATCC
TCATCACATCTCCTGAGAAGCCCAGGGGTGTCTGTCACCTGAAATCGTTGGTAGTTCAAA
ATGACATGGCCCATCAGAATCCCTCTGGTGGTG


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AF RR4DE53JQ U 1
AF RR4DG77JQ U 1
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BS 734 753 RR4DG77JQ

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QA 1 733 1 733
DS 

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AAACGAAGGATCCATAAAGAACATGCAAAGGCTAATCCTAGAACCGGAAGATAAAATCTC
TATCTAATCTAAGAACTAGCAACACTTGGATCAACACTCACTCCACTTTTGATCTTCTCC
ATCTCATTACTCAGTACTTCCTTTACTCTGCTCTTTAACTCACTGAGACTTTGTTCTGTT
TTCACTGAGACATGAAATGATTCATCAGGCCCTGTTTCCCTGTACTTAATGATTTCTGCT
TCATCATTACTTATATCTTCTTCGGCATAAATCACTGGAGAGCCTCCCCCAAGCAGATCG
CATTTGGAAACAACATCAATCCACAGGTAATCCTTAAACCTTTCTTTTATTTCTTTATAT
ATTCTAAACTGATCAGAAGGTGAAGTCCCACACTCTCCAGTTAGATCATGAACATATAGA
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ATGACATGGCCCATCAGAATCCCTCTGGTGGTG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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CCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA47TF U 1
AF RR4BA47JQ C 367
BS 1 782 RR4BA47TF
BS 783 966 RR4BA47JQ

RD RR4BA47TF 782 0 0
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CCGGCAGAGAATGAGCTCGAGCTCGAGCTCGGTCTCACGTTGAACATAGGTCGAGAACGT
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AGCAGAGCTAGCGTGACTGCTGGGATCAAGAGAACAGCTGATTCGATGGCCGCAACTAGT
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GCCAAGACATTGGCAATGGAAGAGATCCGTCAAGAAGTAAACAAAAACAGAACCGATGCT
ACAAAGATGAGAATGTTTGTGAAGGTGACTATGGATGGTATTCCCATTGGAAGGAAAATC
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GA

QA 1 782 1 782
DS 

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AAGCATATAGTATACTCTACAAGAACCCTTCATGTTTGAAACCGTATAATAAGACCTATC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

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ATCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCGCCGAGCGGTGGCTTCAACAATCCGAACC
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BQ
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AF RR4C112TF U 1
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BS 1 488 RR4C112TF
BS 489 839 RR4C112JQ

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ATTACTGTGATTATTGCGACACTTATCTCACCCACGATTCCCCATCGGTGAGGAAGCAGC
ATAACGCCGGTTACAAACACAAGGCGAATGTGAGGATATACTATCAGCAATTTGAGGAAC
AGCAAACACAAAGTCTGATTGATCAGAGAATTAAAGAGCATCTTGGCCAAGCTGCAGCGT
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CGCCTATGCCTATGGGAATGCGACCTCCTGTTCTCCCTAGACCCATGATGCCTGGTCAAG
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CACCACCACAAAACGGTATGCTTAGGCCACCAGGAATGGCTCCATTACCAGGTCAAGGTG
GTGGACCG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4C112JQ 690 0 0
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ATTAAAGAGCATCTTGGCCAAGCTGCAGCGTACAATCAGGTTGGTGGTGCGTTTAACCAG
CATATGCTCGCTAGACCTCGCCTCCCTATGACGCCTATGCCTATGGGAATGCGACCTCCT
GTTCTCCCTAGACCCATGATGCCTGGTCAAGGTTACATGCCACCTCCGGGAGTACCACAG
ATGATGGCACCACCTGGTGCTCCTCTACCTCCACCACCACAAAACGGTATGCTTAGGCCA
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CCTCTTCCTCCGCCTCCTCCTTATCAAACAAATCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT
CCGCCGAGCGGTGGCTTCAACAATCCGAACCCTGGTGCTGAATCTCCTGAAAGCAATGAG
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TTTAGCATTTTACCTTTTCTAATTAATGTATGTGAAGTGCATAAATTTTTATGTGCTAAA
TTTGTCTTTTTGTAGAATGTTGAAAGGTCTCTTATAACGAACAGTCATCAGTCCTGTTTG
TGAAAGATTTTGATAAGATGGCTTTCATTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

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GGTCCGTTCTCCGTACGTTTACCACAATGAGGTTCCTTTTTCTCCAAGTAATAATCATAA
TTTTGGTAATCAAAGCCCTTGGAGTTATTCACACGGTTATGTGCCTCGGACCTATGATCT
ATTCAATATGAATAACTCTAGGGCTACGGATAACACAGTGTCCCACGCTAAAAACCGTGT
GGACTATGTCGAGTTGCAAAACTTGATTGCGGAAGGTTCAAGAGACACTATTGATAAGAT
ATTTGATGAGCTGATATCACATGTTTGTGAGCTGATGACTGACCCTTTTGGCCATCAAGT
CTTTGAAAAGCTCATGGAGAAATGCACAAATGAACAAATCACTCGGGTTTTGAAAACTGT
CATCCAACAACCTAATCAGTTTGTGAGAATTTGTGGCGATTCGCATGGAACGCATGCAGT
ACGAGATTTGATCCGATGTCTTAGTTCTGAAGAGCAAGTATCCCACTTCATGGTAACTAT
ATGCCATGTTGCACTACTTCTGAGCAAGAGCACTAATGCAAATGATGTGATTCTTTTTTG
CTTCAGCCATTTTTCTCCTTCACAAACCAATGGACTTCTCCAAATGATTGTTCAAAACTG
TTATCAAATTGCAATCGATCATTATGGGTCTTGTCTGCTTCAACAATGCATTGGAAAATC
TCGTCGAGAAATAAGAGAGCCTTTGATTAGAGAGATAATCACTAATGCCATGAATCTATG
TGTGGATCGCTATGGAAACTATGTGGTCCAGTATGTGTTGGAATTGGAAAATTTTCAAGT
GGCAGCAGCTCTGTCGAGATACCTCAGTGGGAATTACGTGCAACTCTCTTGTGACAAGTA
TGGAAGTCATGCGGTGCAAAAATGTTTAGAAAGTAGACAATTTAACTCGAGAATGATCAT
CCACGAGCTGCTTACTGACATTGATTCACTTCTTGTACATCCTTTTGGAAACTATGTGAT
TCAGACTGCATGGGTTGTATCTCAGAATGATATGCGACGTGAATTGTTTGTGCCATATCA
ACAGGAATCATCCGTTGATGAGGTGCAATAGATACGGGCGAAAAATTCTTGAAAAACTTA
ATCTTTGGACATAAGAGGTTATGTTGTGGAATTAGATGAGAAGACCAGGCACGATTAGTT
ATTCATGTTGGTGTTGTTGTTTTTCTTTTTCATTCAGACGTTGACTCAATATTGTCAACT
GTTTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H556TF U 1
AF RR4H556JQB C 378
BS 1 793 RR4H556TF
BS 794 1208 RR4H556JQB

RD RR4H556TF 793 0 0
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TTTTGGTAATCAAAGCCCTTGGAGTTATTCACACGGTTATGTGCCTCGGACCTATGATCT
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GGACTATGTCGAGTTGCAAAACTTGATTGCGGAAGGTTCAAGAGACACTATTGATAAGAT
ATTTGATGAGCTGATATCACATGTTTGTGAGCTGATGACTGACCCTTTTGGCCATCAAGT
CTTTGAAAAGCTCATGGAGAAATGCACAAATGAACAAATCACTCGGGTTTTGAAAACTGT
CATCCAACAACCTAATCAGTTTGTGAGAATTTGTGGCGATTCGCATGGAACGCATGCAGT
ACGAGATTTGATCCGATGTCTTAGTTCTGAAGAGCAAGTATCCCACTTCATGGTAACTAT
ATGCCATGTTGCACTACTTCTGAGCAAGAGCACTAATGCAAATGATGTGATTCTTTTTTG
CTTCAGCCATTTTTCTCCTTCACAAACCAATGGACTTCTCCAAATGATTGTTCAAAACTG
TTATCAAATTGCAATCGATCATTATGGGTCTTGTCTGCTTCAACAATGCATTGGAAAATC
TCGTCGAGAAATAAGAGAGCCTTTGATTAGAGAGATAATCACTAATGCCATGAATCTATG
TGTGGATCGCTATGGAAACTATGTGGTCCAGTATGTGTTGGAATTGGAAAATTTTCAAGT
GGCAGCAGCTCTG

QA 1 793 1 793
DS 

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CAG
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CACAAACCAATGGACTTCTCCAAATGATTGTTCAAAACTGTTATCAAATTGCAATCGATC
ATTATGGGTCTTGTCTGCTTCAACAATGCATTGGAAAATCTCGTCGAGAAATAAGAGAGC
CTTTGATTAGAGAGATAATCACTAATGCCATGAATCTATGTGTGGATCGCTATGGAAACT
ATGTGGTCCAGTATGTGTTGGAATTGGAAAATTTTCAAGTGGCAGCAGCTCTGTCGAGAT
ACCTCAGTGGGAATTACGTGCAACTCTCTTGTGACAAGTATGGAAGTCATGCGGTGCAAA
AATGTTTAGAAAGTAGACAATTTAACTCGAGAATGATCATCCACGAGCTGCTTACTGACA
TTGATTCACTTCTTGTACATCCTTTTGGAAACTATGTGATTCAGACTGCATGGGTTGTAT
CTCAGAATGATATGCGACGTGAATTGTTTGTGCCATATCAACAGGAATCATCCGTTGATG
AGGTGCAATAGATACGGGCGAAAAATTCTTGAAAAACTTAATCTTTGGACATAAGAGGTT
ATGTTGTGGAATTAGATGAGAAGACCAGGCACGATTAGTTATTCATGTTGGTGTTGTTGT
TTTTCTTTTTCATTCAGACGTTGACTCAATATTGTCAACTGTTTTTCC

QA 4 831 4 831
DS 



AS 1 2

CO CL6493Contig1 978 2 4 U
GGGTCGGTGATCTTTTGAACTCCTCCTTTGCGGTTTCGTGTTCCTCTACTCTTCTTGGCC
CACGTGTTCATCATATCTTCCTCCGCATGTAATCGCTTCGCCGTCAAACTCACATCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTAAAGCTTCTCGTTGATTATAAGTCTTTAGATCGGTGAAGAAGTTT
ATTCTCAAGTTGATTTTTGGACTCTCCGGCGAAAACCCATATGGAGACAGTGAGGGAAGT
GGCGGCGGCTGTTCCAACTTCGACGGTTGCGTCGGCGGGGGCGACGAGGAAGAGAGAGAA
ACCGTATAAAGGGATAAGGATGAGGAAGTGGGGAAGTGGGTGGCGGAGATCAGAGAGCCT
AATAAACGGTCGAGGATATGGCTTGGCTCTTACTACTCCTGAAGCGGCGGCTAGAGCTTA
CGACACGGCGGTGTTCTATCTCCGAGGTCCGTCCGCTCGGCTTAACTTCCCGGAGCTTTT
AGCCGGCGTCACGGTGGAGGGAGGAAACGGTGGTGGGGATATGTCGGCGGCGTATATAAG
GAGAAAAGCGGCTGAGGTTGGTGCTCAAGTGGATGCGTTAGAAGCTGCGGGAGGGAATCG
TCATCACCATCACCATCATCAACAACAGCAACAACGTGGAAGTCATGAGTACGTGGATGA
TGATCATAGTGCTAATCATAGTGATTATCGTCTTAATGATGGTCACAACGAGTGTAGTAG
TAGGGAAGGGTTTAAGAGGTGTAACGGGTCATGGGAAGCCGTCGATTTGAACAAAATACC
CAACCCGGAAACTTCTGATGACGATTAGGATCTTTCTCCCTCCCACCAAGAAAAAACCTT
GTAGAAGCAAGGAAGGTCTAAAGAATGTTTATCTTTATGGCGCAGCCTGGGGTTGCTAAC
ATGCACCTCCACCCTGAGTTTGTGGATTAGTAGTACTAAAGTGTAATGATATTTTTTCCA
TAAAATAGTTTTCATTCG


BQ
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AF RR4FH58TF U 1
AF RR4FH58JQ C 308
BS 1 707 RR4FH58TF
BS 708 708 RR4FH58JQ
BS 709 721 RR4FH58TF
BS 722 978 RR4FH58JQ

RD RR4FH58TF 721 0 0
GGGTCGGTGATCTTTTGAACTCCTCCTTTGCGGTTTCGTGTTCCTCTACTCTTCTTGGCC
CACGTGTTCATCATATCTTCCTCCGCATGTAATCGCTTCGCCGTCAAACTCACATCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTAAAGCTTCTCGTTGATTATAAGTCTTTAGATCGGTGAAGAAGTTT
ATTCTCAAGTTGATTTTTGGACTCTCCGGCGAAAACCCATATGGAGACAGTGAGGGAAGT
GGCGGCGGCTGTTCCAACTTCGACGGTTGCGTCGGCGGGGGCGACGAGGAAGAGAGAGAA
ACCGTATAAAGGGATAAGGATGAGGAAGTGGGGAAGTGGGTGGCGGAGATCAGAGAGCCT
AATAAACGGTCGAGGATATGGCTTGGCTCTTACTACTCCTGAAGCGGCGGCTAGAGCTTA
CGACACGGCGGTGTTCTATCTCCGAGGTCCGTCCGCTCGGCTTAACTTCCCGGAGCTTTT
AGCCGGCGTCACGGTGGAGGGAGGAAACGGTGGTGGGGATATGTCGGCGGCGTATATAAG
GAGAAAAGCGGCTGAGGTTGGTGCTCAAGTGGATGCGTTAGAAGCTGCGGGAGGGAATCG
TCATCACCATCACCATCATCAACAACAGCAACAACGTGGAAGTCATGAGTACGTGGATGA
TGATCATAGTGCTAATCATAGTGATTATCGTCTTAATGATGGTCACA*CGAGTGTAGTAG
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FH58JQ 671 0 0
AAAGGGATAAGGATGAGGAAGTGGGGAAGTGGGTGGCGGAGATCAGAGAGCCTAATAAAC
GGTCGAGGATATGGCTTGGCTCTTACTACTCCTGAAGCGGCGGCTAGAGCTTACGACACG
GCGGTGTTCTATCTCCGAGGTCCGTCCGCTCGGCTTAACTTCCCGGAGCTTTTAGCCGGC
GTCACGGTGGAGGGAGGAAACGGTGGTGGGGATATGTCGGCGGCGTATATAAGGAGAAAA
GCGGCTGAGGTTGGTGCTCAAGTGGATGCGTTAGAAGCTGCGGGAGGGAATCGTCATCAC
CATCACCATCATCAACAACAGCAACAACGTGGAAGTCATGAGTACGTGGATGATGATCAT
AGTGCTAATCATAGTGATTATCGTCTTAATGATGGTCACAACGAGTGTAGTAGTAGGGAA
GGGTTTAAGAGGTGTAACGGGTCATGGGAAGCCGTCGATTTGAACAAAATACCCAACCCG
GAAACTTCTGATGACGATTAGGATCTTTCTCCCTCCCACCAAGAAAAAACCTTGTAGAAG
CAAGGAAGGTCTAAAGAATGTTTATCTTTATGGCGCAGCCTGGGGTTGCTAACATGCACC
TCCACCCTGAGTTTGTGGATTAGTAGTACTAAAGTGTAATGATATTTTTTCCATAAAATA
GTTTTCATTCG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL6494Contig1 800 2 4 U
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CCGAACGACGCAGTGGTCTCATTGAGAAAGCTCGTCAGCTTTCTGTTCTCTGCGATGCAT
CCGTTGCTCTTCTCGTTGTCTCCTCCTCCGGCAAGCTCTACAGCTTCTCCTCCGGCGATA
ACCTTGTCAGGATCCTTCATCGATATGAAAAACAACATGCTGATGATCTTAAAGCCCTGC
TGGATCTTCAGTCAAAATCTCTGAGCTATGGTTCACACAATGAGTTACTTGAACTTGTGG
AAAGCAAGCTTGTGGAATCAAACGTTGGTGTAAGCGTGGACGCCCTCGTTCAGCTGGAGG
GTCACCTTGAGACTGCACTATCTCTAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGC
TTGTTGATAGCCTCAAAGAAAAGGAGAAGCTGCTGAAAGAAGAGAACAAGGTTTTGGCTA
GCCAGATGGAGAAGAACAATCTTGCGGGAGCCGAAGCTGATAATATGGAGATCGCACGTG
CACAAATCTCCGACATCAATCTTCCGGTAACTCTCCCGCTGCTTAATTAGCCACCTTTAG
ACGGGGCTCAAATTAAAAATCCAAAACATACAACTAAACAAATAAGCTTTGTTGTTTTCC
CCCTTGAAGGGTGCACGTTGTATATCTTAATACTCCCTTGGCTGAGAGATTGTGTGTGTA
CTCCTATGTTGGATATAGGT


BQ
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AF RR4GR14TF U 1
AF RR4GR14JQ C 249
BS 1 645 RR4GR14TF
BS 646 646 RR4GR14JQ
BS 647 659 RR4GR14TF
BS 660 800 RR4GR14JQ

RD RR4GR14TF 659 0 0
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GAAGAAAAAAACTAGAAATCAAACGAATTGAGAAAAAAAGTAGCCGACAAGTTACCTTCT
CCGAACGACGCAGTGGTCTCATTGAGAAAGCTCGTCAGCTTTCTGTTCTCTGCGATGCAT
CCGTTGCTCTTCTCGTTGTCTCCTCCTCCGGCAAGCTCTACAGCTTCTCCTCCGGCGATA
ACCTTGTCAGGATCCTTCATCGATATGAAAAACAACATGCTGATGATCTTAAAGCCCTGC
TGGATCTTCAGTCAAAATCTCTGAGCTATGGTTCACACAATGAGTTACTTGAACTTGTGG
AAAGCAAGCTTGTGGAATCAAACGTTGGTGTAAGCGTGGACGCCCTCGTTCAGCTGGAGG
GTCACCTTGAGACTGCACTATCTCTAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGC
TTGTTGATAGCCTCAAAGAAAAGGAGAAGCTGCTGAAAGAAGAGAACAAGGTTTTGGCTA
GCCAGATGGAGAAGAACAATCTTGCGGGAGCCGAAGCTGATAATATGGAGATCGCACGTG
CACAAATCTCCGACATCAATCTTCCGGTAACTCTCCCGCTGCTTA*TTAGCCACCTTTA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4GR14JQ 552 0 0
AGGATCCTTCATCGATATGAAAAACAACATGCTGATGATCTTAAAGCCCTGCTGGATCTT
CAGTCAAAATCTCTGAGCTATGGTTCACACAATGAGTTACTTGAACTTGTGGAAAGCAAG
CTTGTGGAATCAAACGTTGGTGTAAGCGTGGACGCCCTCGTTCAGCTGGAGGGTCACCTT
GAGACTGCACTATCTCTAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTTGAT
AGCCTCAAAGAAAAGGAGAAGCTGCTGAAAGAAGAGAACAAGGTTTTGGCTAGCCAGATG
GAGAAGAACAATCTTGCGGGAGCCGAAGCTGATAATATGGAGATCGCACGTGCACAAATC
TCCGACATCAATCTTCCGGTAACTCTCCCGCTGCTTAATTAGCCACCTTTAGACGGGGCT
CAAATTAAAAATCCAAAACATACAACTAAACAAATAAGCTTTGTTGTTTTCCCCCTTGAA
GGGTGCACGTTGTATATCTTAATACTCCCTTGGCTGAGAGATTGTGTGTGTACTCCTATG
TTGGATATAGGT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL6495Contig1 413 2 1 U
GCACTTAAAACCAATTGGTGATAAGTGGAGTGATCCAATCATCTTATATATTACTAAAGA
TCCCTTCCAACTACCGATGTGGGACACTTTGTGTCAAATACGCCCCTTCGAGATGATGGC
TCTCTGAGCGTCAATCTCGGAATGCTCGGGCAAAGATCGATGGCCAACTTTGGGCCAGAT
CGATGTGGATCGGGTTGGACTGCGTGGATCGGGCTCTGATACCATGTTAAAGTAGATGGA
CTTCACACTTAAAACCAATTGGTGATAAGTGGAGTGGCCCAATCATCTTATATATTACTA
AGGATCCCTTCCAACTACCGATGTGGGACATTTGTGTCTAATAGTTGGAGCTTCTTATCA
TTTTAATTGCCAGAAATCTCTCTCTGAACCAAATAAGACATATGACCGTTTGT


BQ
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AF RR4D888JQ C 1
AF RR4D888TF U 1
BS 1 413 RR4D888TF

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TCTTTGAGCGTCAATCTCGGAATGCTCGGGCAAAGATCGATGGCCAACTTTGGGCCAGAT
CGATGTGGATCGGGTTGGACTGCGTGGATCGGGCTCTGATACCATGTTAAAGTAGATGGA
CTTCACACTTAAAACCAATTGGTGATAAGTGGAGTGGCCCAATCATCTTATATATTACTA
AGGATCCCTTCCAACTACCGATGTGGGACATTTGTGTCTAATAGTTGGAGCTTCTTATCA
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QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4D888TF 413 0 0
GCACTTAAAACCAATTGGTGATAAGTGGAGTGATCCAATCATCTTATATATTACTAAAGA
TCCCTTCCAACTACCGATGTGGGACACTTTGTGTCAAATACGCCCCTTCGAGATGATGGC
TCTCTGAGCGTCAATCTCGGAATGCTCGGGCAAAGATCGATGGCCAACTTTGGGCCAGAT
CGATGTGGATCGGGTTGGACTGCGTGGATCGGGCTCTGATACCATGTTAAAGTAGATGGA
CTTCACACTTAAAACCAATTGGTGATAAGTGGAGTGGCCCAATCATCTTATATATTACTA
AGGATCCCTTCCAACTACCGATGTGGGACATTTGTGTCTAATAGTTGGAGCTTCTTATCA
TTTTAATTGCCAGAAATCTCTCTCTGAACCAAATAAGACATATGACCGTTTGT

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 2

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GGAGTACTAGTATTCTTCTTCGTCTTCACCTACCTTTCTCTCTCTCTCTAAATCTCTTTC
ATACAACTATTTGGCGTGTGAGTCCTTTTTTTACCTCCTTTGACTTCGCCGGAGATAGAA
AGTCAAATTATTTGGTCCGTCTTTTTTTGTAACCAAAGACGGTCCGTCTTCAGATCCATA
AACGCGCCAACTCTCGACATCTCTGCCGCACTTCGCTCTTTCACTCGTACCCCATTGGTC
TCCGCAGGTGCAACGACACTCGCTGGTGTTTTCCTTTTCAGAATGTCTTCTTCGAGCTCT
TCTCATTTCGCTTCACTCTCAATCTCAGATTCTTCTGCTTCTGATGATAACCACTTACCT
ATCATTTGTAAGAAGAAGAAGGAAGTTGTGTCTACAGATAAAGCACCACCTGCTGTAGGA
CCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAATGGTTTCGTTTTCGTTTCTGGAGTTCTTGGACTT
ATACCCGAGACTGGAGAGTTAATTTCGGACGACGTTGAAGATCAGACTTACCAGGTACTT
AAGAACATGGGGGAGATATTGAAAGCTGGTGGTGCTAGTTACTGCGCCGTGGTAAAGACA
ACCATCATGCTTGCTGACTTGGCTGACTTCAAGAAAGTGAACGAAATATACGGCAAATAC
TTCCCACATGCTCCTCCAGCAAGATCCACATATCAAGCTGCGGCTTTGCCACTAAACGCC
AAGATCGAGATCGATTGTATTGCAGTACTCTAGAACAGCATCAATCTCTGATAAAATTAA
TAAAGAGGAAACCATGGTCTAGGGAGCCTTATCTTTATCAATTCATTCTTAACGTACTTT
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TAATCAAGAATAAGTGATTTCTTGTTGACTTGATATGTATTGAGTACAATATTTGATAAG
AAACCCTTTATGATTTGGAGC


BQ
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AF RR4G495TF U 1
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BS 1 173 RR4G495TF
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TCCGCAGGTGCAACGACACTCGCTGGTGTTTTCCTTTTCAGAATGTCTTCTTCGAGCTCT
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DS 

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TCTTCGAGCTCTTCTCATTTCGCTTCACTCTCAATCTCAGATTCTTCTGCTTCTGATGAT
AACCACTTACCTATCATTTGTAAGAAGAAGAAGGAAGTTGTGTCTACAGATAAAGCACCA
CCTGCTGTAGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAATGGTTTCGTTTTCGTTTCTGGA
GTTCTTGGACTTATACCCGAGACTGGAGAGTTAATTTCGGACGACGTTGAAGATCAGACT
TACCAGGTACTTAAGAACATGGGGGAGATATTGAAAGCTGGTGGTGCTAGTTACTGCGCC
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TACGGCAAATACTTCCCACATGCTCCTCCAGCAAGATCCACATATCAAGCTGCGGCTTTG
CCACTAAACGCCAAGATCGAGATCGATTGTATTGCAGTACTCTAGAACAGCATCAATCTC
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TTAACGTACTTTTCATTTTGTTGCGGATTATCAACCATTAGGTTGGTTGCTAAAACCTAA
AGCCCCTTTGCTTAATCAAGAATAAGTGATTTCTTGTTGACTTGATATGTATTGAGTACA
ATATTTGATAAGAAACCCTTTATGATTTGGAGC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

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AAGAAGGGTCCAGTTTTCACAGATCCTAAGCTCAAATGGTATGAACCATTGTCTCATCTG
CTGGGAAAGGAATATTTTCTTCATGCTTATGGCCCGATCTATGTTCTCTCTTCTGATGTC
GTAGCAAGTTTGGTTGCCCTCAAGAATAACAGTTTCAGGATGTTTAACAACGAGGACGTA
ACAATAGGTGCGTGGATGCTAGCAATGAACGTCAACCACGAGAATCATCACATACTTTGC
GAACCAGAATGTTCTCCTTCCTCTGTTGCTGTTTGGGACATCCCCAAATGCTCAGGTCTT
TGTAATCCAGAGAAGAGAATGTTGGAACTTCACAAGCAAGAAAGCTGTTCGAAAAGCCCG
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ATTGTCTCCAATCTTAGAAGAGCGAAAGTTTTGATTTTCTTTTGTTCATTGAGGAAAAAA
AGGTGGAGGATTTTTTGTCAGAGCCAGTATAATCTTAGTACATAGACTCATATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C892TF U 1
AF RR4C892JQ C 360
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BS 655 655 RR4C892JQ
BS 656 769 RR4C892TF
BS 770 835 RR4C892JQ

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CAAAAAATGGCTGAGCTCAGAAGCGAGATCGCAGAGTATGATGACTTTGTACTGCTTGAT
GTAGAAGAGGAGTACAGTAGGCTCCCTTACAAAACTTTGGCTTTCTTCAAAGCTGCGTAT
GGGCTTTACGATGCTGAGTTCTATGTCAAAGCTGATGATGATATATACTTGAGGCCAGAT
CGACTCTCTCTGCTGCTGGCTAAAGAGCGGAGTCACTCTCAAACATACCTAGGATGCTTG
AAGAAGGGTCCAGTTTTCACAGATCCTAAGCTCAAATGGTATGAACCATTGTCTCATCTG
CTGGGAAAGGAATATTTTCTTCATGCTTATGGCCCGATCTATGTTCTCTCTTCTGATGTC
GTAGCAAGTTTGGTTGCCCTCAAGAATAACAGTTTCAGGATGTTTAACAACGAGGACGTA
ACAATAGGTGCGTGGATGCTAGCAATGAACGTCAACCACGAGAATCATCACATACTTTGC
GAACCAGAATGTTCTCCTTCCTCTGTTGCTGTTTGGGACATCCCCAAATGCTCAGGTCTT
TGTAATCCAGAGAAGAGAATGTTGGAACTTCACAAGCAAGAAAGCTGTTCGAAA*GCCCG
ACTTTGCCATCAGATGATGAGTGATCTTTTGCCACATCTTCGACTCATACCCGCAGCAAG
ATTGTCTCCAATCTTAGAAGAGCGAAAGTTTTGATTTTCTTTTGTTCAT
GAGGAAA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4C892JQ 476 0 0
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CGTAGCAAGTTTGGTTGCCCTCAAGAATAACAGTTTCAGGATGTTTAACAACGAGGACGT
AACAATAGGTGCGTGGATGCTAGCAATGAACGTCAACCACGAGAATCATCACATACTTTG
CGAACCAGAATGTTCTCCTTCCTCTGTTGCTGTTTGGGACATCCCCAAATGCTCAGGTCT
TTGTAATCCAGAGAAGAGAATGTTGGAACTTCACAAGCAAGAAAGCTGTTCGAAAAGCCC
GACTTTGCCATCAGATGATGAGTGATCTTTTGCCACATCTTCGACTCATACCCGCAGCAA
GATTGTCTCCAATCTTAGAAGAGCGAAAGTTTTGATTTTCTTTTGTTCATTGAGGAAAAA
AAGGTGGAGGATTTTTTGTCAGAGCCAGTATAATCTTAGTACATAGACTCATATAC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

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GTCTCTTTCTTCACCGATTTGCAGTGACGAAATGGCTGCTCGTATCTGGATCTTCGCCGT
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TCTACAGATCGTAAATGCCGAGCGAAGGATTGATTTAAGCTCACACATCGTGAAGGCCTT
CTTGACCCTTAAGGTCGAAAATATTGGGAAAGATCCTGCGGCAGACATGCATCTTGCTTT
CCCACCAACCCAAATCAAGCATTTATCTATGGTCCAAGCCTTATCAATCACAGGCAAGAA
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CGACACCGGTTACTTCCTCGTTACCTTTGCCACCCCCTTAACCCCAGGCGAAACCGTTAC
ACTCGAGGTGCTATACATACTGACTCATTCCCTTGAGCCTTTCCCCTCGGAGATAGCCCA
GTCAGAAGCTCAGCTGGTTTACTACCGCGACAGTGCAGTGATACTCTCACCTTATCGTAT
CAAGCAACAGACGAGTTTTTTCAAGACTCCTAGTACGAGAGTAGAGTCTTTCACCAGCGT
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GGAGCTTGTGCGTGAGATGAGAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B139TF U 1
AF RR4EY04TF U 2
BS 1 81 RR4B139TF
BS 82 86 RR4EY04TF
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RD RR4B139TF 778 0 0
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CGACACCGGTTACTTCCTCGTTACCTTTGCCACCCCCTTAACCCCAGGCGAAACCGTTAC
ACTCGAGGTGCTATACATACTGACTCATTCCCTTGAGCCTTTCCCCTCGGAGATAGCCCA
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QA 1 778 1 778
DS 

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CCACCAACCCAAATCAAGCATTTATCTATGGTCCAAGCCTTATCAATCACAGGCAAGAAG
AAGAAGAAAACCTACTTGCCTCTAGACGTCAAACCAACTGAACAACCTGACGCACCAAAC
GACACCGGTTACTTCCTCGTTACCTTTGCCACCCCCTTAACCCCAGGCGAAACCGTTACA
CTCGAGGTGCTATACATACTGACTCATTCCCTTGAGCCTTTCCCCTCGGAGATAGCCCAG
TCAGAAGCTCAGCTGGTTTACTACCGCGACAGTGCAGTGATACTCTCACCTTATCGTATC
AAGCAACAGACGAGTTTTTTCAAGACTCCTAGTACGAGAGTAGAGTCTTTCACCAGCGTT
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TACTCTTACGCACCTGTTATCGTTCATTT*GAGAATAA*AGTCCGTTTGCTGTTGTTGAG
GAGCTTGTGCGTGAGATGAGAT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

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TCTAACTGGAAGCGACAAGATCGATGATGAAACCGCAATGTCCTTGTGGCATCCCAACTT
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TGGATCGGTTGACCCTTTCCATGTGAACGCCGTGGATACAACCGGAGCTGGAGATTCGTT
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TGTTTTCTGATGTTTGGTTTAAATCAATTGGCTCTGTTTTTGTTTCTTATCTTCACATGT
AACGATTTAAAAAAAAGACATGTTTCAATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AE73TF U 1
AF RR4AE73JQ C 53
BS 1 785 RR4AE73TF
BS 786 812 RR4AE73JQ

RD RR4AE73TF 785 0 0
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CCTTGACCTCATCAGATCTGCTAAAGTGTTTCACTATGGATCAATAAGCTTAATAGTGGA
GCCATGTAGGTCAGCTCACTTGAAGGCCATGGAAGTGGCGAAAGAAGCAGGAGCTCTCCT
CTCCTACGACCCAAACCTCAGGGAGCCTCTGTGGCCATCAAAGGAGGAAGCCAAAACACA
GATCATGAGCATCTGGGACAAGGCTGAGATCATCAAGGTCAGCGACGTCGAGCTCGAGTT
TCTAACTGGAAGCGACAAGATCGATGATGAAACCGCAATGTCCTTGTGGCATCCCAACTT
GAAGCTCTTGCTTGTCACTCTCGGTGAAAAGGGCTGCCGGTATTACGCCAAGACTTTCCG
TGGATCGGTTGACCCTTTCCATGTGAACGCCGTGGATACAACCGGAGCTGGAGATTCGTT
TGTTGGTGCTCTCCTAAACCAGATTGCTGAGGATCAATCTATTCTCGAGGACGAAGAGAG
ATTGAGAAAGGTGCTAAGATTCGCAAACGCTTGTGGAGCAATCACCACGACCAAAAAAGG
AGCCATTCCAGCTCTTCCCACCGATGCTGAAGTTCTCACCTTTCTTGAAGGGAAGTAAAC
ACACAAAAACATTTCTCAAGCTTACTCCCGTGTAATCTGTGTTGTTCGCTTATGTATTCT
TGTTTTCTGATGTTTGGTTTAAATCAATTGGCTCTGTTTTTGTTTCTTATCTTCACATGT
AACGA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4AE73JQ 760 0 0
GAACTCGACCTTGACCTCATCAGATCTGCTAAAGTGTTTCACTATGGATCAATAAGCTTA
ATAGTGGAGCCATGTAGGTCAGCTCACTTGAAGGCCATGGAAGTGGCGAAAGAAGCAGGA
GCTCTCCTCTCCTACGACCCAAACCTCAGGGAGCCTCTGTGGCCATCAAAGGAGGAAGCC
AAAACACAGATCATGAGCATCTGGGACAAGGCTGAGATCATCAAGGTCAGCGACGTCGAG
CTCGAGTTTCTAACTGGAAGCGACAAGATCGATGATGAAACCGCAATGTCCTTGTGGCAT
CCCAACTTGAAGCTCTTGCTTGTCACTCTCGGTGAAAAGGGCTGCCGGTATTACGCCAAG
ACTTTCCGTGGATCGGTTGACCCTTTCCATGTGAACGCCGTGGATACAACCGGAGCTGGA
GATTCGTTTGTTGGTGCTCTCCTAAACCAGATTGCTGAGGATCAATCTATTCTCGAGGAC
GAAGAGAGATTGAGAAAGGTGCTAAGATTCGCAAACGCTTGTGGAGCAATCACCACGACC
AAAAAAGGAGCCATTCCAGCTCTTCCCACCGATGCTGAAGTTCTCACCTTTCTTGAAGGG
AAGTAAACACACAAAAACATTTCTCAAGCTTACTCCCGTGTAATCTGTGTTGTTCGCTTA
TGTATTCTTGTTTTCTGATGTTTGGTTTAAATCAATTGGCTCTGTTTTTGTTTCTTATCT
TCACATGTAACGATTTAAAAAAAAGACATGTTTCAATTCG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6500Contig1 343 2 1 U
GTATGAAGACAGCGTCTATGGCCTTGCTTGGAGTTCACGTGAGCCTTTTCTTGCATCATT
ATCATATGACGGAAGGGTCGTCATCGAATCAGTGAAGCCTTTCCTTCCAAGACTGTAATA
AAAAGCTCAGCATCTCTTTTGCTCTGACCCACACACGACCCATCGAAATCTTTGTCTGAA
GAAAAGTTGGCACTTGCAACAATGTACTTTTGACACAATTTGTTTTGAATCTTTATGTAT
CTATCTATCTATCATTCACGCAGATTCCTTTCAGCACCCAATATTCTGTTGTTCTGAACT
AAACACACTCAACTACTGATTCTTGTCGAGTAAAAGAAAAGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EO73JQ C 1
AF RR4EO73TF U 1
BS 1 343 RR4EO73TF

RD RR4EO73JQ 343 0 0
GTATGAAGACAGCGTCTATGGCCTTGCTTGGAGTTCACGTGAGCCTTTTCTTGCATCATT
ATCATATGACGGAAGGGTCGTCATCGAATCAGTGAAGCCTTTCCTTCCAAGACTGTAATA
AAAAGCTCAGCATCTCTTTTGCTCTGACCCACACACGACCCATCGAAATCTTTGTCTGAA
GAAAAGTTGGCACTTGCAACAATGTACTTTTGACACAATTTGTTTTGAATCTTTATGTAT
CTATCTATCTATCATTCACGCAGATTCCTTTCAGCACCCAATATTCTGTTGTTCTGAACT
AAACACACTCAACTACTGATTCTTGTCGAGTAAAAGAAAAGGT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4EO73TF 343 0 0
GTATGAAGACAGCGTCTATGGCCTTGCTTGGAGTTCACGTGAGCCTTTTCTTGCATCATT
ATCATATGACGGAAGGGTCGTCATCGAATCAGTGAAGCCTTTCCTTCCAAGACTGTAATA
AAAAGCTCAGCATCTCTTTTGCTCTGACCCACACACGACCCATCGAAATCTTTGTCTGAA
GAAAAGTTGGCACTTGCAACAATGTACTTTTGACACAATTTGTTTTGAATCTTTATGTAT
CTATCTATCTATCATTCACGCAGATTCCTTTCAGCACCCAATATTCTGTTGTTCTGAACT
AAACACACTCAACTACTGATTCTTGTCGAGTAAAAGAAAAGGT

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 2

CO CL6501Contig1 720 2 2 U
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TGAGGTGGATATACCAGTCAAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGA
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CACTGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACATCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGA
TGAGATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGACCTCTCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAG
ATGAAACCCTCTTTTTGGCTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGAATTGTCTTCTGTTTTA
TTTTGATGTTTTTGATATGATGAATCGGTTCATGAAATGTTTAAAATAGACGTTTTATAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4A651JQ C 1
AF RR4A651TF U 1
BS 1 718 RR4A651TF
BS 719 720 RR4A651JQ

RD RR4A651JQ 720 0 0
GATTGGAAAACTCAGTTTCCCTCCTGTGCAGGCAGTTCCATCATTTCCTAGCTCATTCCC
ACACTTGTTCCCTGGCAAAGACAAGCTCCGCTGCTTGATCCCTTGTGCAATTGACCAGGA
TCCTTACTTCAGGATGACTCGCGATGTTGCACCTCGGTTAGGCTATAGCAAGCCTGCACT
GATTGAGTCATCATTTTTCCCTGCTCTGCAGGGAGAGAACGGAAAAATGTCTGCGAGCGA
TCCTAATTCAGCGATCTATGTGACAGATACTGCTAAAGAAATAAAAAATAAGATAAACAG
GTATGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGAAATTGGAGCTAATCT
TGAGGTGGATATACCAGTCAAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGA
ACACATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATGCTAACGGGTGAAGTAAAGAAGCGGCT
CACTGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACATCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGA
TGAGATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGACCTCTCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAG
ATGAAACCCTCTTTTTGGCTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGAATTGTCTTCTGTTTTA
TTTTGATGTTTTTGATATGATGAATCGGTTCATGAAATGTTTAAAATAGACGTTTTATAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4A651TF 718 0 0
GATTGGAAAACTCAGTTTCCCTCCTGTGCAGGCAGTTCCATCATTTCCTAGCTCATTCCC
ACACTTGTTCCCTGGCAAAGACAAGCTCCGCTGCTTGATCCCTTGTGCAATTGACCAGGA
TCCTTACTTCAGGATGACTCGCGATGTTGCACCTCGGTTAGGCTATAGCAAGCCTGCACT
GATTGAGTCATCATTTTTCCCTGCTCTGCAGGGAGAGAACGGAAAAATGTCTGCGAGCGA
TCCTAATTCAGCGATCTATGTGACAGATACTGCTAAAGAAATAAAAAATAAGATAAACAG
GTATGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGAAATTGGAGCTAATCT
TGAGGTGGATATACCAGTCAAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGA
ACACATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATGCTAACGGGTGAAGTAAAGAAGCGGCT
CACTGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACATCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGA
TGAGATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGACCTCTCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAG
ATGAAACCCTCTTTTTGGCTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGAATTGTCTTCTGTTTTA
TTTTGATGTTTTTGATATGATGAATCGGTTCATGAAATGTTTAAAATAGACGTTTTAT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6502Contig1 480 2 2 U
GGAAGGAGAAAGTTGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAATAGTGAAGAGC
TCCGTCTCCCTGTTGTTGGGCACTGCTTTCGGAGTCTACTTGGCCCAGAATTACAACGTT
CCCAACATCAGGAAGCTCACCAACACCAGTCTCGTCGTCGCCAAGCACATCGAGGAGAAC
TATCGCAAGCCCAAGAAGGACGACGTTGAATGATTAGAGACAGGGAGAGGAGAATGGAGA
TGGTGGCTCGAAGCATGGTTTGGTCGGAGAGAGTATTGATTTGATTTTTCTCACTAGGAA
GTTGATTTAACTTCTAATGTAATTTGACACATTCTGGATCCATTGAAGTTTATCAGTGGG
ACTTGTGGTGTTGTTTAAATTCTTGTTTTATCACTGTCATTATACTGGCTAAACCCAGCA
ATGTACATGTCATTATCATATACTTTCTTTGGCAATATGTAATAACCACAAACCCCTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4ED78TF U 1
AF RR4DP21TF U 33
BS 1 453 RR4ED78TF
BS 454 480 RR4DP21TF

RD RR4ED78TF 453 0 0
GGAAGGAGAAAGTTGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAATAGTGAAGAGC
TCCGTCTCCCTGTTGTTGGGCACTGCTTTCGGAGTCTACTTGGCCCAGAATTACAACGTT
CCCAACATCAGGAAGCTCACCAACACCAGTCTCGTCGTCGCCAAGCACATCGAGGAGAAC
TATCGCAAGCCCAAGAAGGACGACGTTGAATGATTAGAGACAGGGAGAGGAGAATGGAGA
TGGTGGCTCGAAGCATGGTTTGGTCGGAGAGAGTATTGATTTGATTTTTCTCACTAGGAA
GTTGATTTAACTTCTAATGTAATTTGACACATTCTGGATCCATTGAAGTTTATCAGTGGG
ACTTGTGGTGTTGTTTAAATTCTTGTTTTATCACTGTCATTATACTGGCTAAACCCAGCA
ATGTACATGTCATTATCATATACTTTCTTTGGC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4DP21TF 448 0 0
G
GAGAGAGAGATGGGAATAGTGAAGAGCTCCGTCTCCCTGTTGTTGGGCACTGCTTTCGGA
GTCTACTTGGCTCAGAATTACAACGTTCCCAACATCAGGAAGCTCACCAACACCAGTCTC
GTCGTCGCCAAGCACATCGAGGAGAACTATCGCAAGCCCAAGAAGGACGACGTTGAATGA
TTAGAGACAGGGAGAGGAGAATGGGGATGGTGGCTCGAAGCATGGTTTGGTCGGAGAGAG
TATTGATTTGATTTTTCTCACTAGGAAGTTGATTTAACTTCTAATGTAATTTGACACATT
CTGGATCCATTGAAGTTTATCAGTGGGACTTGTGGTGTTGTTTAAATTCTTGTTTTATCA
CTGTCATTATACTGGCTAAACCCAGCAATGTACATGTCATTATCATATACTTTCTTTGGC
AATATGTAATAACCACAAACCCCTGCT

QA 2 448 2 448
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6504Contig1 947 2 10 U
GCAACCACTACGGCTCTGGGAATCAGACACGATGCTATCCTATCTACCATCTACCGTAAT
GGGAATTGGCAGCTCCCCTCTCCTCGATCAGAACCTCAACTAAACCTACAAGTCTATCTC
ACTACCATTGCTTTGACGCTAGAGGAGGACAAATTTGTATGGGCTCCAGACGGGAAAGAA
CTCTCCACTTACTCCACAGGTCAAGTGTACAACCTCATCAAGACTCATCAGCCGGTGGTT
CCTTGGGCAGCCTGCGTTTGGTCGCCAAGAGGTATACCTAAGCACAATTTTCTCACTTGG
TTAGTGGTATTAAATCGATGTCCTACAAAGGATCGTATTCTCGGATGGGGACTTACAACT
AGCCCTCTTTGCCTTCTCTGCAACTCTGCAAATGAGTCAAGAGATCACCTCTACTTCACA
TGTTCCTTCTCGGCTTCAATATGGGGATCACTAGCCATGCGAGCTCGAAGCACTCCTATT
ACTTCCTGGCCCCAGGTTATCAACCATATGCAGCAGCTAACTGGACCGAAACACCTCCGT
ATCTTAGCATTATTGGCTTGGCAATCGGCAATTTACTTCATCTGGATGGAGAGAAACAGC
CGCCTTCACCGTCAGCAATTCCGTTCCTCAGATTTGATTGTCTCTGCCGCTACATCACTG
ATCAAGAACAGGATCTCCAGCCTACGATTATCGTCTCCTTCATTATCTTCCAAGATGATG
CAGGTGTGGTTAAGCCCATAGCATATCTCGCCACTGATACCATTTACTCTGCTCTAACTG
AAGAAGACGCTTCGTGATCATCGATCTTTTCCAATTGCCTTTTGGGCTTCTTTTTAAATT
GGGTCTTCCCCTTTTAATTGTAAGGTTATTATTAGGCTACTGCCAACCAAACTGTCCATT
GGGCTTCCTGCAGTTTCATATATATATATATATAAAAGCCCTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CJ42TF U 1
AF RR4CJ42JQ C 220
BS 1 560 RR4CJ42TF
BS 561 561 RR4CJ42JQ
BS 562 609 RR4CJ42TF
BS 610 610 RR4CJ42JQ
BS 611 626 RR4CJ42TF
BS 627 627 RR4CJ42JQ
BS 628 647 RR4CJ42TF
BS 648 648 RR4CJ42JQ
BS 649 661 RR4CJ42TF
BS 662 947 RR4CJ42JQ

RD RR4CJ42TF 661 0 0
GCAACCACTACGGCTCTGGGAATCAGACACGATGCTATCCTATCTACCATCTACCGTAAT
GGGAATTGGCAGCTCCCCTCTCCTCGATCAGAACCTCAACTAAACCTACAAGTCTATCTC
ACTACCATTGCTTTGACGCTAGAGGAGGACAAATTTGTATGGGCTCCAGACGGGAAAGAA
CTCTCCACTTACTCCACAGGTCAAGTGTACAACCTCATCAAGACTCATCAGCCGGTGGTT
CCTTGGGCAGCCTGCGTTTGGTCGCCAAGAGGTATACCTAAGCACAATTTTCTCACTTGG
TTAGTGGTATTAAATCGATGTCCTACAAAGGATCGTATTCTCGGATGGGGACTTACAACT
AGCCCTCTTTGCCTTCTCTGCAACTCTGCAAATGAGTCAAGAGATCACCTCTACTTCACA
TGTTCCTTCTCGGCTTCAATATGGGGATCACTAGCCATGCGAGCTCGAAGCACTCCTATT
ACTTCCTGGCCCCAGGTTATCAACCATATGCAGCAGCTAACTGGACCGAAACACCTCCGT
ATCTTAGCATTATTGGCTTG*CAATCGGCAATTTACTTCATCTGGATGGAGAGAAACAGC
CGCCTTCAC*GTCAGCAATTCCGTTC*TCAGATTTGATTGTCTCTGC*GCTACATCACTG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4CJ42JQ 728 0 0
AAGACTCATCAGCCGGTGGTTCCTTGGGCAGCCTGCGTTTGGTCGCCAAGAGGTATACCT
AAGCACAATTTTCTCACTTGGTTAGTGGTATTAAATCGATGTCCTACAAAGGATCGTATT
CTCGGATGGGGACTTACAACTAGCCCTCTTTGCCTTCTCTGCAACTCTGCAAATGAGTCA
AGAGATCACCTCTACTTCACATGTTCCTTTTCGGCTTCAATATGGGGATCACTAGCCATG
CGAGCTCGAAGCACTCCTATTACTTCCTGGCCCCAGGTTATCAACCATATGCAGCAGCTA
ACTGGACCGAAACACCTCCGTATCTTAGCATTATTGGCTTGGCAATCGGCAATTTACTTC
ATCTGGATGGAGAGAAACAGCCGCCTTCACCGTCAGCAATTCCGTTCCTCAGATTTGATT
GTTTCTGCCGCTACATCACTGATCAAGAACAGGATCTCCAGCCTACGATTATCGTCTCCT
TCATTATCTTCCAAGATGATGCAGGTGTGGTTAAGCCCATAGCATATCTCGCCACTGATA
CCATTTACTCTGCTCTAACTGAAGAAGACGCTTCGTGATCATCGATCTTTTCCAATTGCC
TTTTGGGCTTCTTTTTAAATTGGGTCTTCCCCTTTTAATTGTAAGGTTATTATTAGGCTA
CTGCCAACCAAACTGTCCATTGGGCTTCCTGCAGTTTCATATATATATATATATAAAAGC
CCTTTCAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6505Contig1 931 2 4 U
GCTATTCAGAACCGGTTAGCAAGGGGAGTCCAAAACTTATATCTCTTGTTGATCTTAAGA
GGAACGGGTTCCTTATTGGAGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAGCTTCATGGGATTGAAC
CTTCTGCTTCCGGAACAGCGGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAACCTCCCAACCACAAAG
TCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCATCATTCTCATG
AATTTGTCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCAAGAGGGTTTGAGGAAG
AAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTATCTAATAGGAGAAGGGTTCATCAACAACGCGCCAA
ATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAGCTGAGGGTATTGGATCAAGTTAACCGCAATCATG
TTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTGGAGACATCTAAAGGCTTTGCAGACTTCATGTGTC
TGACGAAACTTGTTGAACCTTATCTGGTGAATGATAAACTGTATGTGGGAGTTGATTTTG
AAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGCTAATTCGGCAGCTTCTTGCCTTTCATAAAGTCAT
GCTGTGAAACTACTATACCAATAAGTGATATAATGTAATGAATAAGATCGGAGAATATAC
TTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCCAAGAGACGAAAAACTATATACATATGGTGTGTAACG
TTCCTAGAGCTCAACTTTCACGCTGATGTCCTAGCCAAGGAAACTAGAACCAGAAACGTT
TTATTTTTTTTCATGTAAACCATATACGGTCAGTTATTCTTGGCAATAGTTTTAATGTCA
GTTAAAACTTAGTTTAAGAATATGGATAATTGATAAAATATGTATATATAGTGTGTGTAA
AAGAAATAATATATATGGTGTGTATCAGTTT


BQ
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AF RR4CP13TF U 1
AF RR4CP13JQ C 329
BS 1 733 RR4CP13TF
BS 734 734 RR4CP13JQ
BS 735 759 RR4CP13TF
BS 760 931 RR4CP13JQ

RD RR4CP13TF 764 0 0
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GGAACGGGTTCCTTATTGGAGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAGCTTCATGGGATTGAAC
CTTCTGCTTCCGGAACAGCGGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAACCTCCCAACCACAAAG
TCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCATCATTCTCATG
AATTTGTCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCAAGAGGGTTTGAGGAAG
AAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTATCTAATAGGAGAAGGGTTCATCAACAACGCGCCAA
ATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAGCTGAGGGTATTGGATCAAGTTAACCGCAATCATG
TTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTGGAGACATCTAAAGGCTTTGCAGACTTCATGTGTC
TGACGAAACTTGTTGAACCTTATCTGGTGAATGATAAACTGTATGTGGGAGTTGATTTTG
AAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGCTAATTCGGCAGCTTCTTGCCTTTCATAAAGTCAT
GCTGTGAAACTACTATACCAATAAGTGATATAATGTAATGAATAAGATCGGAGAATATAC
TTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCCAAGAGACGAAAAACTATATACATATGGTGTGTAACG
TTCCTAGAGCTCA*CTTTCACGCTGATGTCCTAGCCAAG
AAACT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4CP13JQ 603 0 0
AATAGGAGAAGGGTTCATCAACAACGCGCCAAATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAGCT
GAGGGTATTGGATCAAGTTAACCGCAATCATGTTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTGGA
GACATTTAAAGGCTTTGCAGACTTCATGTGTTTGACGAAACTTGTTGAACCTTATTTGGT
GAATGATAAACTGTATGTGGGAGTTGATTTTGAAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGCTA
ATTCGGCAGCTTCTTGCCTTTCATAAAGTCATGCTGTGAAACTACTATACCAATAAGTGA
TATAATGTAATGAATAAGATCGGAGAATATACTTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCCAAGA
GACGAAAAACTATATACATATGGTGTGTAACGTTCCTAGAGCTCAACTTTCACGCTGATG
TCCTAGCCAAGGAAACTAGAACCAGAAACGTTTTATTTTTTTTCATGTAAACCATATACG
GTCAGTTATTCTTGGCAATAGTTTTAATGTCAGTTAAAACTTAGTTTAAGAATATGGATA
ATTGATAAAATATGTATATATAGTGTGTGTAAAAGAAATAATATATATGGTGTGTATCAG
TTT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL6506Contig1 621 2 2 U
GGGAGCCATTAATCAGGTGCGGTATTCTTCAACCGGATCCGTCTACGTTACAGCCTCAAA
GGATGGAGCTATACGACTCTTTGATGGGGTCAGCGCAAAGTGTGTACGCTCCATTAGTAG
TGCACATGGAAAAGCAGAGGTCACCAGCGCAGTATTCACCAGAGATCAAAGGTTTGTTCT
CTCGTCCGGTAAGGATTCTACGGTTAAGCTATGGGAAATAGCTTCTGGTCGAATGGTGAA
GGAATACCTCGGAGCAAAGAGGTTAAAACTGCGGTCGCAGGCAATCTTTAATGACACGGA
AGAGTTTGTAATCTCCATAGATGAAGGAAACAATGAGGTGGTTACGTGGGATGCAAGAAC
CGCAGAGAAAGTGGCAAAGTGGCCTTCAAACCATAACGGTGTACCGCGGTGGATCGAGCA
CTCACCGGTTGAATCAGTCTTTGTTACTTGTGGAACCACAGATAGATCAGTTCGGTTCTG
GAAGGAAACCGTGAAGAAGAGAATTCAACCAATCAAACAAGTGTTTTTCCAATTTTATTA
AGAACGTAAACCTTACATGAAAATACAAAACAACATAAATACTGGAAGTAGATTTCCTTA
TGATATTGTTTCTTTTAGAGC


BQ
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AF RR4BC65JQ C 1
AF RR4BB56TF U 305
BS 1 304 RR4BC65JQ
BS 305 621 RR4BB56TF

RD RR4BC65JQ 621 0 0
GGGAGCCATTAATCAGGTGCGGTATTCTTCAACCGGATCCGTCTACGTTACAGCCTCAAA
GGATGGAGCTATACGACTCTTTGATGGGGTCAGCGCAAAGTGTGTACGCTCCATTAGTAG
TGCACATGGAAAAGCAGAGGTCACCAGCGCAGTATTCACCAGAGATCAAAGGTTTGTTCT
CTCGTCCGGTAAGGATTCTACGGTTAAGCTATGGGAAATAGCTTCTGGTCGAATGGTGAA
GGAATACCTCGGAGCAAAGAGGTTAAAACTGCGGTCGCAGGCAATCTTTAATGACACGGA
AGAGTTTGTAATCTCCATAGATGAAGGAAACAATGAGGTGGTTACGTGGGATGCAAGAAC
CGCAGAGAAAGTGGCAAAGTGGCCTTCAAACCATAACGGTGTACCGCGGTGGATCGAGCA
CTCACCGGTTGAATCAGTCTTTGTTACTTGTGGAACCACAGATAGATCAGTTCGGTTCTG
GAAGGAAACCGTGAAGAAGAGAATTCAACCAATCAAACAAGTGTTTTTCCAATTTTATTA
AGAACGTAAACCTTACATGAAAATACAAAACAACATAAATACTGGAAGTAGATTTCCTTA
TGATATTGTTTCTTTTAGAGC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4BB56TF 317 0 0
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GAGAAAGTGGCAAAGTGGCCTTCAAACCATAACGGTGTACCGCGGTGGATCGAGCACTCA
CCGGTTGAATCAGTCTTTGTTACTTGTGGAACCACAGATAGATCAGTTCGGTTCTGGAAG
GAAACCGTGAAGAAGAGAATTCAACCAATCAAACAAGTGTTTTTCCAATTTTATTAAGAA
CGTAAACCTTACATGAAAATACAAAACAACATAAATACTGGAAGTAGATTTCCTTATGAT
ATTGTTTCTTTTAGAGC

QA 1 317 1 317
DS 



AS 1 2

CO CL6507Contig1 1153 2 2 U
GAGGAAATAGAGTCAGGTGAGCCAGAGAATAATAATGCACCAGCAGAACCAACTGAGAGT
CTCGAGGGGGACATGACCAAGAAGAAGAGTACAGTGGTTGAAGGCAAATATGAACCATAT
GTTTGCGGTATTTGCAATGTCGTTTGTGCACATCCTTCCGTGTTCGAGTCTCATCATAAG
GGAAGGAAGCATGCTGCTAAGTTTGAGAAGCACACAGAGGCTCTGCTTGATGGTCAACAA
ATACAAGAGGAAATCATTCAAGATAATGGTCTCCCGAAAGATATGACAGAGGAGCTCCAA
ATCAAGCTTGTAGAGGCACCTGAGAACATCGACTACTTGGATAAGCAAAGACAGGAGCTG
GGAGAGAGCTGTGCCACCACCTCTGAGAGGAGTGTTGATGATTTATTTCAAACTATTGAA
GTAGGAGAGAATGACTACAAATCTCTTCCACATGCAGAGTGTATCTTCACCGAACTAAAC
CCCGTGTCTTCTGCCCCTCGAGAACCTAGGGATGGGATTGATGATAAAAAGATTGTGGAA
CAGGAAGAGCTAAGGTTTGTGCCTAAGGACGCACAAGTGAGCGTCAAAGAAGTTACTCAA
ATCAGTAAAGCACGAGTAGATAATAAAGATAATGAACAGATTCTAAGTGTTGAGTTTGCA
GAACCCAAAGAAGCGAGAGAGCGATTTGACTCGATTGTCAAAAGATTAGACCTTTTCATG
GAGAAAACGTCAAAGCAGACGCTGGTCGAGTCTGAAAACGCATCTGAAGGTGTGGAGGAG
GTGGTGGGGACAGGGGAGGAGAATGGAGTTGCAGCAGCTCTAGTTAGGGCTTGTGATTGG
TGCAGTGTGGTATGCAATACACAAATGGATTTTGATTCACATGTAGCAGGTGAGAAGCAT
GCTGCCACTTTAAGAAAGCATGTTCCTCTGGTGAAGAAGGACGTTGCCGTGGTGTAGAAG
CAAGCTGGGGCCAAACTTGCTTATGTTCAGAAAGAATTGGCCTTATGCTCACTGGTATCC
ATTGTCACGTGATGACTAACAAAACTGTAATTAATGGGCCTCTCTTAAGGTTCATTAAGA
TGTGGCCTATTTAAATAAATATTGCCCATAACTGAAAGAAATAAATGAATGGGTCAAGAA
AACAATTGGTTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW74TF U 1
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BS 703 1153 RR4FW74JQ

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CTCGAGGGGGACATGACCAAGAAGAAGAGTACAGTGGTTGAAGGCAAATATGAACCATAT
GTTTGCGGTATTTGCAATGTCGTTTGTGCACATCCTTCCGTGTTCGAGTCTCATCATAAG
GGAAGGAAGCATGCTGCTAAGTTTGAGAAGCACACAGAGGCTCTGCTTGATGGTCAACAA
ATACAAGAGGAAATCATTCAAGATAATGGTCTCCCGAAAGATATGACAGAGGAGCTCCAA
ATCAAGCTTGTAGAGGCACCTGAGAACATCGACTACTTGGATAAGCAAAGACAGGAGCTG
GGAGAGAGCTGTGCCACCACCTCTGAGAGGAGTGTTGATGATTTATTTCAAACTATTGAA
GTAGGAGAGAATGACTACAAATCTCTTCCACATGCAGAGTGTATCTTCACCGAACTAAAC
CCCGTGTCTTCTGCCCCTCGAGAACCTAGGGATGGGATTGATGATAAAAAGATTGTGGAA
CAGGAAGAGCTAAGGTTTGTGCCTAAGGACGCACAAGTGAGCGTCAAAGAAGTTACTCAA
ATCAGTAAAGCACGAGTAGATAATAAAGATAATGAACAGATTCTAAGTGTTGAGTTTGCA
GAACCCAAAGAAGCGAGAGAGCGATTTGACTCGATTGTCAAA
GA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4FW74JQ 741 0 0
CTATTGAAGTAGGAGAGAATGACTACAAATCTCTTCCACATGCAGAGTGTATCTTCACCG
AACTAAACCCCGTGTCTTCTGCCCCTCGAGAACCTAGGGATGGGATTGATGATAAAAAGA
TTGTGGAACAGGAAGAGCTAAGGTTTGTGCCTAAGGACGCACAAGTGAGCGTCAAAGAAG
TTACTCAAATCAGTAAAGCACGAGTAGATAATAAAGATAATGAACAGATTCTAAGTGTTG
AGTTTGCAGAACCCAAAGAAGCGAGAGAGCGATTTGACTCGATTGTCAAAAGATTAGACC
TTTTCATGGAGAAAACGTCAAAGCAGACGCTGGTCGAGTCTGAAAACGCATCTGAAGGTG
TGGAGGAGGTGGTGGGGACAGGGGAGGAGAATGGAGTTGCAGCAGCTCTAGTTAGGGCTT
GTGATTGGTGCAGTGTGGTATGCAATACACAAATGGATTTTGATTCACATGTAGCAGGTG
AGAAGCATGCTGCCACTTTAAGAAAGCATGTTCCTCTGGTGAAGAAGGACGTTGCCGTGG
TGTAGAAGCAAGCTGGGGCCAAACTTGCTTATGTTCAGAAAGAATTGGCCTTATGCTCAC
TGGTATCCATTGTCACGTGATGACTAACAAAACTGTAATTAATGGGCCTCTCTTAAGGTT
CATTAAGATGTGGCCTATTTAAATAAATATTGCCCATAACTGAAAGAAATAAATGAATGG
GTCAAGAAAACAATTGGTTCT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6508Contig1 826 2 2 U
GTATGACCCGTTGATTGGAAAGAAGGTATGGACAAAGTGGCCTGAGGACAACCATTTCTA
TGAAGCTGTTATTACCGACTACAACCCTGTGGAGGGGCGGCATGCCTTAGTATATGACAT
TAGCACTCCTAATGAAACTTGGGAATGGGTAAATCTTAAAGAGATATCTCCGGGAGATAT
CAGATGGGAAGGAGAGGACTCTGGGGTTTCTCGCAAAGGAGGAGGACATCCTGGACAAGG
CCGTGGAAGTAGTACAAAGGCCATGATGCCTCGTGGTGGTGGTCCTACATGCAACAACGC
CGGTGGTGGTAGAGGTAGGGGAAACATGAAGATACAGCCACACAAGGCACAGAATGGCAT
CGGGAAGAAAGCTTTAGTCGATATCGAAATACTCCACACTGATACACTAATAAAAGAGAT
AGAAAAAGTTTTTGGATCGGTTAACCCAAATCCAGCAGAGGTAGAGAAAGCAAAGAGAGT
GCTAAGAGATCATGAGCAAGCTCTTGTGGATGCAATTGCAAAGCTTGGAGAACTATCAGA
CGGAGAAAGTGGTAATATTTGATAGGGTTCCTCTAACTCTCCTCAGATGGAGTTTGGCTA
AAAGGTGTAGATGGACTGGTGGCAGTGTGTGAATCGATGATGAAGAAACTTGTATGGATT
AAGCAAACTGTATTTTTTTTAGGGAGAAGATCTTTAATGACCTTTATGTGCCACATTACT
CCAGTAAGATTAGGGGTCTTGAGCATTGTAATATCCACCAGATTGCATATAAATGTTTAA
GCTTGGATAAATTGTTAGTTTTTGAATTAGAAACCAGTTGTTTGAC


BQ
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AF RR4D396TF U 1
AF RR4D396JQ C 213
BS 1 630 RR4D396TF
BS 631 826 RR4D396JQ

RD RR4D396TF 630 0 0
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TGAAGCTGTTATTACCGACTACAACCCTGTGGAGGGGCGGCATGCCTTAGTATATGACAT
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CGGGAAGAAAGCTTTAGTCGATATCGAAATACTCCACACTGATACACTAATAAAAGAGAT
AGAAAAAGTTTTTGGATCGGTTAACCCAAATCCAGCAGAGGTAGAGAAAGCAAAGAGAGT
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CGGAGAAAGTGGTAATATTTGATAGGGTTCCTCTAACTCTCCTCAGATGGAGTTTGGCTA
AAAGGTGTAGATGGACTGGTGGCAGTGTGT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4D396JQ 614 0 0
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CAGCAGAGGTAGAGAAAGCAAAGAGAGTGCTAAGAGATCATGAGCAAGCTTTTGTGGATG
CAATTGCAAAGCTTGGAGAACTATCAGACGGAGAAAGTGGTAATATTTGATAGGGTTCCT
CTAACTCTCCTCAGATGGAGTTTGGCTAAAAGGTGTAGATGGACTGGTGGCAGTGTGTGA
ATCGATGATGAAGAAACTTGTATGGATTAAGCAAACTGTATTTTTTTTAGGGAGAAGATC
TTTAATGACCTTTATGTGCCACATTACTCCAGTAAGATTAGGGGTCTTGAGCATTGTAAT
ATCCACCAGATTGCATATAAATGTTTAAGCTTGGATAAATTGTTAGTTTTTGAATTAGAA
ACCAGTTGTTTGAC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL6509Contig1 828 2 8 U
GCTTCCTCTCCAAGATATCAGCCATCTCTATCTTCTTGATTTCACAGGACCTCCCGGTTT
TGTCCAACGAGTCTCTCCCAACGTCGACAATGTAGTCATCCTCGACCACCATAAAACCGC
TATTGAGAGCCTCGGTGAAGTCTCTTCCACTTGCAAGAACGTCACCAAAGTTTTGGACGT
AGGGAGAAGCGGCGCCACCATTGCGTTTGACTATTTTACTCAGAAGTTGATGGAAGAGTC
TCCAGGAAACTGTAGAGAGATGAATGATTTCAAGAGAATGAGGCGTGTTTTCGAGTACAT
TGAAGACGCAGATATCTGGAAGTGGGAACTACCAGAGAGCAAAGCATTCAACAGCGGGAT
CGTGGACTTAGGGATCGAATACGATCTCAATCAGAACGAGTCACTGTTTCAGCAGCTACT
TTCGTTGGATCATGAAAGCGTGATCAAAAGAGGGAAAGAGAGTTTGTCTAGGAAGCACAA
ACTGATTCAGGAGGCGCTAGAACAGTCCTACGAGATTGTTCTTGGAGGTGATGAAGAGTT
TGGTCGGTGTTTGGCTGTAAATGCAGATGAGATTGCAGAGCTTAGAAGCGAGCTAGGGAA
TCAATTGGTGGAGAAGAGCACGCGTATGAGATTACGAGGCGTTTGGAGCTGTTGTTTACA
GAGTCCCAGAGCTTGAGGATGAGACAAAACTGAAAATAAGTTTGAGGAGTGTTGCAGAAG
AAGACACAACACAGGTTTCACAGAGATTCGGAGGTGGTGGTCATAAAAACGCAAGCTCCT
TCCTGTTAAGCTCAGTGGAGTTGGAGCTATGGAAGGTGAAAAGAAACT


BQ
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AF RR4G869TF U 1
AF RR4G869JQ C 282
BS 1 677 RR4G869TF
BS 678 678 RR4G869JQ
BS 679 688 RR4G869TF
BS 689 689 RR4G869JQ
BS 690 706 RR4G869TF
BS 707 707 RR4G869JQ
BS 708 717 RR4G869TF
BS 718 828 RR4G869JQ

RD RR4G869TF 717 0 0
GCTTCCTCTCCAAGATATCAGCCATCTCTATCTTCTTGATTTCACAGGACCTCCCGGTTT
TGTCCAACGAGTCTCTCCCAACGTCGACAATGTAGTCATCCTCGACCACCATAAAACCGC
TATTGAGAGCCTCGGTGAAGTCTCTTCCACTTGCAAGAACGTCACCAAAGTTTTGGACGT
AGGGAGAAGCGGCGCCACCATTGCGTTTGACTATTTTACTCAGAAGTTGATGGAAGAGTC
TCCAGGAAACTGTAGAGAGATGAATGATTTCAAGAGAATGAGGCGTGTTTTCGAGTACAT
TGAAGACGCAGATATCTGGAAGTGGGAACTACCAGAGAGCAAAGCATTCAACAGCGGGAT
CGTGGACTTAGGGATCGAATACGATCTCAATCAGAACGAGTCACTGTTTCAGCAGCTACT
TTCGTTGGATCATGAAAGCGTGATCAAAAGAGGGAAAGAGAGTTTGTCTAGGAAGCACAA
ACTGATTCAGGAGGCGCTAGAACAGTCCTACGAGATTGTTCTTGGAGGTGATGAAGAGTT
TGGTCGGTGTTTGGCTGTAAATGCAGATGAGATTGCAGAGCTTAGAAGCGAGCTAGGGAA
TCAATTGGTGGAGAAGAGCACGCGTATGAGATTACGAGGCGTTTGGAGCTGTTGTTTACA
GAGTCCCAGAGCTTGAG*ATGAGACAAA*CTGAAAATAAGTTTGAG*AGTGTTGCAG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4G869JQ 547 0 0
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AAGCATTCAACAGCGGGATCGTGGACTTAGGGATCGAATACGATCTCAATCAGAACGAGT
CACTGTTTCAGCAGCTACTTTCGTTGGATCATGAAAGCGTGATCAAAAGAGGGAAAGAGA
GTTTGTCTAGGAAGCACAAACTGATTCAGGAGGCGCTAGAACAGTCCTACGAGATTGTTC
TTGGAGGTGATGAAGAGTTTGGTCGGTGTTTGGCTGTAAATGCAGATGAGATTGCAGAGC
TTAGAAGCGAGCTAGGGAATCAATTGGTGGAGAAGAGCAGGCGTATGAGATTACGAGGCG
TT*GGAGCTGTTGTTTACAGAGTCCCAGAGCTTGAGGATGAGACAAAACTGAAAATAAGT
TTGAGGAGTGTTGCAGAAGAAGACACAACACAGGTTTCACAGAGATTCGGAGGTGGTGGT
CATAAAAACGCAAGCTCCTTCCTGTTAAGCTCAGTGGAGTTGGAGCTATGGAAGGTGAAA
AGAAACT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL6510Contig1 890 2 2 U
GGGCCCCTTCCTCTTCTTCATATATGGTTTCTCTCCTTATCCACCTCTCTTCTTCTTTTT
CTTTCCTTGCTTTCTTTTTCGATGCTATGTGCTTACGTCACCGCGATTCCGTTCTGGCAT
ATCTCAGCTTGGAGCATCGGTGAAGTTTTGCGGTTGAATTATTGAGCGGTTTCTTTGATC
GAGCTCGTTAGTGGCGGTTTAGATATGGTGTAAAATCTGGCTGTTGTAAGTGGATCTCTC
TTTTTCGTGTTTCCTCTGCTCTTTCTTCTCGTGTGGGTAAGCTTGCTTGCTTGGTCTGAA
CCGTCACCGACAGTGTTTTGATTTTCTTCTTGTTCTCTACTGTGCGTTTCTTAAGATCTG
TCAGCTTGATTTTGAGAAGTTTCCAGAGTTACTTCCAATTCCAAGGAAAAAAATCTATGA
TTTTAAGGCGGTTTCTCCGTTGTGGGGGCCTGAGAGACGTAGAACTGTCGGACCTGTCAA
TCATGGTTCTGTCTTGGTGGCGTCATGTGCTGATGCGGAAATTTTCAGGGGTATTTTCCA
AGGTTGCTTCATGTCCATCTTGGCTAAAGGTGGTGCATGCTTTCTCTGTTTTTTTTGGTG
TAGGTTTAAGGTGGATGGCGTCTCTTGATGGCTCATCTGTCCGAATAAAGCTCAACCTTT
CTCTTTATGGGTGTGCTTGGTCTTGGGTGTTGTTGTATGTCAGTGTTGGCTGCGGATTAT
AAGGTCTTTTGTAAGCTGTTCTTGTGTGAGTCGATTTCTTAGAGTTAATCATCAAGAAAA
CCAATTTCTACGGGGTTTAGTTTTTTTATTTCACTTTATTCTTCTTTTGTGGCAAGCGGA
TTGTACCAATTTTGATGTCTCCATGGGTTAGCTTCTTTGATTTTAGTTTC


BQ
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AF RR4G646TF U 1
AF RR4G646JQ C 301
BS 1 719 RR4G646TF
BS 720 890 RR4G646JQ

RD RR4G646TF 719 0 0
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CTTTCCTTGCTTTCTTTTTCGATGCTATGTGCTTACGTCACCGCGATTCCGTTCTGGCAT
ATCTCAGCTTGGAGCATCGGTGAAGTTTTGCGGTTGAATTATTGAGCGGTTTCTTTGATC
GAGCTCGTTAGTGGCGGTTTAGATATGGTGTAAAATCTGGCTGTTGTAAGTGGATCTCTC
TTTTTCGTGTTTCCTCTGCTCTTTCTTCTCGTGTGGGTAAGCTTGCTTGCTTGGTCTGAA
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TCAGCTTGATTTTGAGAAGTTTCCAGAGTTACTTCCAATTCCAAGGAAAAAAATCTATGA
TTTTAAGGCGGTTTCTCCGTTGTGGGGGCCTGAGAGACGTAGAACTGTCGGACCTGTCAA
TCATGGTTCTGTCTTGGTGGCGTCATGTGCTGATGCGGAAATTTTCAGGGGTATTTTCCA
AGGTTGCTTCATGTCCATCTTGGCTAAAGGTGGTGCATGCTTTCTCTGTTTTTTTTGGTG
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CTCTTTATGGGTGTGCTTGGTCTTGGGTGTTGTTGTATGTCAGTGTTGGCTGCGGATTA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4G646JQ 590 0 0
CCGTCACCGACAGTGTTTTGATTTTCTTCTTGTTCTCTACTGTGCGTTTCTTAAGATCTG
TCAGCTTGATTTTGAGAAGTTTCCAGAGTTACTTCCAATTCCAAGGAAAAAAATCTATGA
TTTTAAGGCGGTTTTTCCGTTGTGGGGGCCTGAGAGACGTAGAACTGTCGGACCTGTCAA
TCATGGTTCTGTCTTGGTGGCGTCATGTGCTGATGCGGAAATTTTCAGGGGTATTTTCCA
AGGTTGCTTCATGTCCATCTTGGCTAAAGGTGGTGCATGCTTTCTCTGTTTTTTTTGGTG
TAGGTTTAAGGTGGATGGCGTCTCTTGATGGCTCATCTGTCCGAATAAAGCTCAACCTTT
CTCTTTATGGGTGTGCTTGGTCTTGGGTGTTGTTGTATGTCAGTGTTGGCTGCGGATTAT
AAGGTCTTTTGTAAGCTGTTCTTGTGTGAGTCGATTTCTTAGAGTTAATCATCAAGAAAA
CCAATTTCTACGGGGTTTAGTTTTTTTATTTCACTTTATTCTTCTTTTGTGGCAAGCGGA
TTGTACCAATTTTGATGTCTCCATGGGTTAGCTTCTTTGATTTTAGTTTC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL6511Contig1 971 2 2 U
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ATGTGCATAGTTCAAGAGGCACGCAGCTTCTGAATTTTCAAAGCCACAAGACAATGGCAA
CACTAACAATGTGGATGGAAATCGAAGCTCACCAGTTCGATCCATTGGCATCGATACTCA
CTTGGGAGCAAGTTATTAAACCTATTTACGGTCTAGAAACTGACCACGCGGTCGTCGAAG
AAAACGAGGCTAGTCTAGAGAAAGTTCTAGATGTCTATGAAAAACGACTCGGAGAATCTA
GATTCTTGGCTTGTAATACCTTTACTTTGGTTGATCTTCACCACTTACCTAACATACAAT
ACCTTTTTGGGAAGTTCGATGGAAAAAATGTTGGAAAATCGACCTAAACTACGTATGTGG
GTGGATGAGATTACTGGTAGAGAGGCTTGGAAGATGGTTTGTGATCAAGAGATGTCCTGG
TATGGCATTAGCGGATAAGCTCTCAAGATGTCTTATGATCAAGTTAAGTCCTGGTTTAGT
AATCAAAAGAAAACTTTGTGTGAGAATGCATGTTGTGTTGCGGTGTTTGTTGTAAGTTTG
TGTTGTTGCTAAAGTAAGCTTTTAATTGTTGTTTGTTGACTGTTGTGGGGTGCATCTTTT
AAGATTCGTTGTGTGTTGGTTTATGTATGCATGATGTATATAAATAAAGTGAACAAAATA
ATAATTTAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO91TF U 1
AF RR4GO91JQ C 257
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BS 672 971 RR4GO91JQ

RD RR4GO91TF 679 0 0
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TTTTTGAAGATGGAAACGTTAAGCTGTGTGAGTCTCGAGCCATCACACAATACATTGCAT
ATGTGCATAGTTCAAGAGGCACGCAGCTTCTGAATTTTCAAAGCCACAAGACAATGGCAA
CACTAACAATGTGGATGGAAATCGAAGCTCACCAGTTCGATCCATTGGCATCGATACTCA
CTTGGGAGCAAGTTATTAAACCTATTTACGGTCTAGAAACTGACCACGCGGTCGTCGAAG
AAAACGAGGCTAGTCTAGAGAAAGTTCTAGATGTCTATGAAAAACGACTCGGAGAATCTA
GATTCTTGGCTTGTAATACCTTTACTTTGGTTGATCTTCACCACTTACCTAACATACAAT
ACCTTTTTGGGAAGTTCGATGGAAAAAATGTTGGAAAATCGACCTAAACTACGTATGTGG
GTGGATGAGAT
ACTGGTAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4GO91JQ 715 0 0
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AGGCACGCAGCTTCTGAATTTTCAAAGCCACAAGACAATGGCAACACTAACAATGTGGAT
GGAAATCGAAGCTCACCAGTTCGATCCATTGGCATCGATACTCACTTGGGAGCAAGTTAT
TAAACCTATTTACGGTCTAGAAACTGACCACGCGGTCGTCGAAGAAAACGAGGCTAGTCT
AGAGAAAGTTCTAGATGTCTATGAAAAACGACTCGGAGAATCTAGATTCTTGGCTTGTAA
TACCTTTACTTTGGTTGATCTTCACCACTTACCTAACATACAATACCTTTT*GGGAAGTT
CGATGGAAAAAATGTTGGAAAATCGACCTAAACTACGTATGTGGGTGGATGAGATTACTG
GTAGAGAGGCTTGGAAGATGGTTTGTGATCAAGAGATGTCCTGGTATGGCATTAGCGGAT
AAGCTCTCAAGATGTCTTATGATCAAGTTAAGTCCTGGTTTAGTAATCAAAAGAAAACTT
TGTGTGAGAATGCATGTTGTGTTGCGGTGTTTGTTGTAAGTTTGTGTTGTTGCTAAAGTA
AGCTTTTAATTGTTGTTTGTTGACTGTTGTGGGGTGCATCTTTTAAGATTCGTTGTGTGT
TGGTTTATGTATGCATGATGTATATAAATAAAGTGAACAAAATAATAATTTAACC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6512Contig1 928 2 20 U
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AGAAACGTTTCATACATCACATAATGTGTAATAAAATTTATCATCATAATCTAGAAAACC
TAGAGATGGTACAACTCAAGGATTCACCATTATTAGGCATATAAGGGAGAGAGAAACCTT
TTTAGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATGGAAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGT
TGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAAAGGAA
TCGTAGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTTCCAACCCTGAGTGCTCTCA
TCAACCTATTCGCTGTGTCAAGATTCTGTGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCTCG
AGTTGTTCGCCCTAGCAATCACCTCATCCAGATCCTTGAATTTAAGTATGGTTTGAACTG
GCCCGAAAATCTCGTCTTTGGCAATGAGCATGTCGTCCTTGACGTCAGAGAAGACAGTGG
GTTGAATGTAGTAACCCTTGGAACCATGACGATCACCACCAGCTTGTAAGGTGGCTCCAC
TATCAACTCCATGTCTAATGTACTTCAAGATTTTCTCGAACTGCTCTGAGTCCACCTGGG
GACCTTGCTCAATGCCAGACTTGAAAGGGATCTCCAACAGCTCGGTTGATTGCACGAGCT
TTAGCTTTCTCTACAAACTCGTCATACACGCGTTCGTGTACAAACGTACGCGAGCCAGCA
CAGCAGCATTGCCCCTGGTTAAAGAACAAAGCGAAATGAGCGAGCTCAACGGCCTGATCC
ACATCAGCATATTCACACACAATGAACGGTGACTTGCCTCCAAGCTCAAGAGTCACTGCC
TTGAGGTTACTTTTTGAAGCCAGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F033JQ U 1
AF RR4BM88TF C 213
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BS 699 928 RR4BM88TF

RD RR4F033JQ 698 0 0
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TTTAGAGCCAAGCGGGGTTCTTGATGGAAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGT
TGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAATGGAA
TCGTAGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTTCCAACTCTGAGTGCTCTCA
TCAACCTATTCGCTGTGTCAAGATTCTGTGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTATCTTG
AGTTGTTCGCCCTTGCAATCACCTCATCCAGATCCTTGAATTTAAGTATGGTTTGAACTG
GTCCGAAAATCTCGTCTTTGGCTATGAGCATGTCGTCCTTGACGTCAGAGAAGACAGTGG
GTTGAATGTAGTAACCCTTGGAACCATGACGATCACCACCAGCTTGTAAGGTGGCTCCAC
TATCAACTCCATGTCTAATGTACTTCAAGATTTTCTCGAACTGCTCTGAGTCCACCTGGG
GACCTTGCTCGATGCCTGACTTGAAAGGGATCTCCAAC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4BM88TF 716 0 0
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CTTATACCCTCCAAAAGGAATCGTGGCATCAAACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCT
TCCAACCCTGAGTGCTCTCATCAACCTATTCGCTGTGTCCAGATTCTGTGTGAACACTCC
TGCAGCTAAACCGTACCTCGAGTTGTTCGCCCTAGCAATCACCTCATCCAGATCCTTGAA
TTTCAGTATGGTTTGAACTGGCCCGAAAATCTCGTCTTTGGCAATGAGCATGTCGTCCTT
GACGTCAGAGAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAACCCTTGGAACCATGACGATCACCACC
AGCTTGTAAGGTGGCTCCATTATCAACTCCATGTCTAATGTACTTCAGGATTTTCTCGAA
CTGCTCTGAGTCCACCTGGGGACCTTGCTCAATGCCAGACTTGAA*GGGATCTCCAACAG
CTCGGTTGATTGCACGAGCTTTAGCTTTCTCTACAAACTCGTCATACACGCGTTCGTGTA
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CGAGCTCAACGGCCTGATCCACATCAGCATATTCACACACAATGAACGGTGACTTGCCTC
CAAGCTCAAGAGTCACTGCCTTGAGGTTACTTTTTGAAGCCAGCTCCC

QA 9 716 9 716
DS 



AS 1 2

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GGCTGCTGACAAGGTACCTAATGGTGCTCCAAAGCTGACTTCAATGGTCAAATGCAATGA
TCCTGTGCGTGACAAAATCCGTGAGCTGCTTGTGGACGCTATGTCAAGGTTCATGGAGAG
TCTGATGAGTACGATAGAGCGAGAGTAGTTGGATGTGATCCAATCCGCGTTGCTGTTTCA
GTGGAATCTCATATGTTTGAGAAACTGGGCCGGTCCACGGGAGCTCAGAAGGTCAAGTAC
AGATCAATAATGTTCAACCTGAGGGACAGTAACAACCCAGACCTGAGAAGGAGAGTTCTC
ACAGGGGAGGTGTCACCAGAGAAACTCATCACACTGTCCGGTGAAGAGATGGCAAGCGAC
AAGAGGAAACAAGAGACCAATCAGATCAAAGAGAAGTTCCTGTTCGACTGTGAGCGTGGT
CAGGCACCAAAAGCAAGTACTGACCAGTTCAAATGTGGACGGTGTGGTCAGCGCAAATGT
ACCTACTATCAGATGCAAACAAGGAGTGCTGATGAGCCGATGACAACTTATGTTACATGT
GTTAACTGCGACAACCACTGGAAGTTCTGTTGAAGTGAGATATGTGTGTTCTTTTTATTT
CAGGAGTCCGTGTCAAGACACAGAGGCCCTGATTGATTTATCAGGAGCTTTCATGTCTAT
TTGCCACCATTCTGTGAATGTTCTGGCTCTGACGTTTGTTTAAGGATATCAGTTCAGTGT
CTTAGAGATTAGCAAGTAGGAGAGTTTACTAATTTAGCTGGTTGTTAGCTCTTATCTCTT
CTGCTTCTTTGATTCCAAATTGTCAGACTCATTATCTTTCTTTGCAAATTTTATCAAAGT
TTTGAAATTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM92TF U 1
AF RR4FM92JQ C 239
BS 1 655 RR4FM92TF
BS 656 910 RR4FM92JQ

RD RR4FM92TF 658 0 0
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GGCTGCTGACAAGGTACCTAATGGTGCTCCAAAGCTGACTTCAATGGTCAAATGCAATGA
TCCTGTGCGTGACAAAATCCGTGAGCTGCTTGTGGACGCTATGTCAAGGTTCATGGAGAG
TCTGATGAGTACGATAGAGCGAGAGTAGTTGGATGTGATCCAATCCGCGTTGCTGTTTCA
GTGGAATCTCATATGTTTGAGAAACTGGGCCGGTCCACGGGAGCTCAGAAGGTCAAGTAC
AGATCAATAATGTTCAACCTGAGGGACAGTAACAACCCAGACCTGAGAAGGAGAGTTCTC
ACAGGGGAGGTGTCACCAGAGAAACTCATCACACTGTCCGGTGAAGAGATGGCAAGCGAC
AAGAGGAAACAAGAGACCAATCAGATCAAAGAGAAGTTCCTGTTCGACTGTGAGCGTGGT
CAGGCACCAAAAGCAAGTACTGACCAGTTCAAATGTGGACGGTGTGGTCAGCGCAAATGT
ACCTACTATCAGATGCAAACAAGGAGTGCTGATGAGCCGATGACAACTTATGTTACATGT
GTTAACTGCGACAACCACTGGAAGTTCTGTTGAAGTGAGATATGTGTGTTCTTTT
ATT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4FM92JQ 672 0 0
CAGTGGAATCTCATATGTTTGAGAAACTGGGCCGGTCCACGGGAGCTCAGAAGGTCAAGT
ACAGATCAATAATGTTCAACCTGAGGGACAGTAACAACCCAGACCTGAGAAGGAGAGTTC
TCACAGGGGAGGTGTCACCAGAGAAACTCATCACACTGTCCGGTGAAGAGATGGCAAGCG
ACAAGAGGAAACAAGAGACCAATCAGATCAAAGAGAAGTTCCTGTTCGACTGTGAGCGTG
GTCAGGCACCAAAAGCAAGTACTGACCAGTTCAAATGTGGACGGTGTGGTCAGCGCAAAT
GTACCTACTATCAGATGCAAACAAGGAGTGCTGATGAGCCGATGACAACTTATGTTACAT
GTGTTAACTGCGACAACCACTGGAAGTTCTGTTGAAGTGAGATATGTGTGTTCTTTTTAT
TTCAGGAGTCCGTGTCAAGACACAGAGGCCCTGATTGATTTATCAGGAGCTTTCATGTCT
ATTTGCCACCATTCTGTGAATGTTCTGGCTCTGACGTTTGTTTAAGGATATCAGTTCAGT
GTCTTAGAGATTAGCAAGTAGGAGAGTTTACTAATTTAGCTGGTTGTTAGCTCTTATCTC
TTCTGCTTCTTTGATTCCAAATTGTCAGACTCATTATCTTTCTTTGCAAATTTTATCAAA
GTTTTGAAATTC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6514Contig1 819 2 2 U
GGATCTGAGGAGCATAGAGAAGTAGCGAGAGAGGCGGTGAGTAAATCAATGGTGCTTCTA
AAGAACGGGAAGACAGACAACGATAAAATTATTCCGCTTCCGAAGAAGGTGAAAAAGATA
GTTGTTGCGGGCACACACGCTAACAACATGGGTTGGCAATGTGGTGGCTTCACTCTCACT
TGGCAAGGATTCAACGGAACCGGAGAAAACATCGGTCGTAACAAAGCCTTGCATCTCCCT
ACCGGTAAAACCAGAGGAACAACAATCTTGGAAGGAATCATGAAAACAGTAGATGCCACC
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GCATACACAATTGTGGTTGTAGGTGAAGCTCCATATGCTGAGTCACAAGGGGACAGCACC
ACACTAAACATGGCTGCACCAGGTCCAGACACGATCAGCCACACGTGTGCTAGTGGTATG
AAGTGTGTAGTGGTTCTAGTCACAGGACGTCCTCTCATGATCGAAGCGTACATTGACCAC
ATCGACGCTGTTGCGGTAGCTTGGCTTCCAGGAACCGAAGGACAAGGAGTCGCTGATGTT
TTGTTTGGTGATCATCCATTCACCGGCACTTTGCCTCGCACGTGGATGAAGAGTGTGGCT
CAACTTCCAATGAACGTTGGCGACTCGGCCTACGACCCTCTCTTCCCCTTCGGATTCGGA
ATTACAAATTAAATGAAGAATCAAATCATCTATCATGTATGTTAAATATGTGAAAAAATG
TTAAATGTAACGCTTTTTCAATGAATATTGGATCACTTT


BQ
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AF RR4GB23TF U 1
AF RR4GB23JQ C 314
BS 1 735 RR4GB23TF
BS 736 819 RR4GB23JQ

RD RR4GB23TF 735 0 0
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AAGAACGGGAAGACAGACAACGATAAAATTATTCCGCTTCCGAAGAAGGTGAAAAAGATA
GTTGTTGCGGGCACACACGCTAACAACATGGGTTGGCAATGTGGTGGCTTCACTCTCACT
TGGCAAGGATTCAACGGAACCGGAGAAAACATCGGTCGTAACAAAGCCTTGCATCTCCCT
ACCGGTAAAACCAGAGGAACAACAATCTTGGAAGGAATCATGAAAACAGTAGATGCCACC
ACTGAAGTTGTCTACGTGGAGGAACCAAACAAAGATACAGCTAAGCTTCATGCCGACGCA
GCATACACAATTGTGGTTGTAGGTGAAGCTCCATATGCTGAGTCACAAGGGGACAGCACC
ACACTAAACATGGCTGCACCAGGTCCAGACACGATCAGCCACACGTGTGCTAGTGGTATG
AAGTGTGTAGTGGTTCTAGTCACAGGACGTCCTCTCATGATCGAAGCGTACATTGACCAC
ATCGACGCTGTTGCGGTAGCTTGGCTTCCAGGAACCGAAGGACAAGGAGTCGCTGATGTT
TTGTTTGGTGATCATCCATTCACCGGCACTTTGCCTCGCACGTGGATGAAGAGTGTGGCT
CAACTTCCAATGAACGTTGGCGACTCGGCCTACGACCCTCTCTTCCCCTTCGGATTCGGA
ATTACAAATTAAATG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GB23JQ 506 0 0
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CTGCACCAGGTCCAGACACGATCAGCCACACGTGTGCTAGTGGTATGAAGTGTGTAGTGG
TTCTAGTCACAGGACGTCCTTTCATGATCGAAGCGTACATTGACCACATCGACGCTGTTG
CGGTAGCTTGGCTTCCAGGAACCGAAGGACAAGGAGTCGCTGATGTTTTGTTTGGTGATC
ATCCATTCACCGGCACTTTGCCTCGCACGTGGATGAAGAGTGTGGCTCAACTTCCAATGA
ACGTTGGGGACTCGGCCTACGACCCTCTCTTCCCCTTCGGATTCGGAATTACAAATTAAA
TGAAGAATCAAATCATCTATCATGTATGTTAAATATGTGAAAAAATGTTAAATGTAACGC
TTTTTCAATGAATATTGGATCACTTT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL6515Contig1 1025 2 4 U
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TCACCCTCTCCCCGTGTTTCCCGTCCACATATTTCCAGAAATACCCCTACCCTTACTCTC
TATTCACGCTTCACACCATCCTTCTCCTTCCCCTCTCTCTCCTCCACGCTCCGCGTCGAC
ACACCCCGATCTCGCCGTCCCTTCCTAATCGCCTCCGCCTTAAAGTCACTGGGGGAGACG
GAGCAGCTCCCGATCGCGGAGGCCGAGTCGATTCCGGCGGAGTCCGGCGTGTACGCCGTC
TACGATAATAGCGACGAGCTTCAGTTCGTCGGAATATCTCGGAACATCGGGGCGAGTGTA
GCTGCTCACGTGAAATCGGTTCCGGAGCTTTGTGGCTCCGTCAAGGTTGGTATAGTAGAA
GAACCAGACAAAGCTGTTCTAACACAAGCATGGAAATCATGGATAGAAGAGCACATAAAA
GTAACGGGAAATGTCCCTCCAGGGAACAAGTCAGGGAACAACACATGGGTCAAACAGACT
CCAAGGAAGAAATCTGACATCCGTCTCACTCCAGGTCGCCATGTCGAGCTCAATGTCCCC
TTAGAGGAACTGATTGACAGGTTAGTAAAAGAGAACAAAGTGGTAGCTTTCATAAAAGGG
TCGAGAAGCGCTCCTCAATGTGGATTCTCGCAGAGAGTTGTTGGGATTCTTGAGAGCCAA
GGAGTGGATTATGAAACGGTTGATGTTCTTGACGATGATTATAACCATGGGCTAAGAGAG
AAGCTGAAGAGTTATAGTAATTGGCCTACGTTCCCGCAGGTGTTTGTGAAAGGAGAGCTG
TTAGGAGGTTGTGATATATTGACCTCAATGTATGAGAATGGCGAGCTTGCCAATATGTTT
AAGTAGTTTCATCTCTGTTTATTTCTCTGTTTCTAGTTTGTACAACTCAAAACATTTATA
ATAAACGTTTGGAACCTCTTTACTTTCAAACTTGTTTGTTCACATATTTCAAGCTTACAG
ATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4BZ83TF U 1
AF RR4BZ83JQ C 301
BS 1 685 RR4BZ83TF
BS 686 686 RR4BZ83JQ
BS 687 721 RR4BZ83TF
BS 722 1025 RR4BZ83JQ

RD RR4BZ83TF 725 0 0
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TCACCCTCTCCCCGTGTTTCCCGTCCACATATTTCCAGAAATACCCCTACCCTTACTCTC
TATTCACGCTTCACACCATCCTTCTCCTTCCCCTCTCTCTCCTCCACGCTCCGCGTCGAC
ACACCCCGATCTCGCCGTCCCTTCCTAATCGCCTCCGCCTTAAAGTCACTGGGGGAGACG
GAGCAGCTCCCGATCGCGGAGGCCGAGTCGATTCCGGCGGAGTCCGGCGTGTACGCCGTC
TACGATAATAGCGACGAGCTTCAGTTCGTCGGAATATCTCGGAACATCGGGGCGAGTGTA
GCTGCTCACGTGAAATCGGTTCCGGAGCTTTGTGGCTCCGTCAAGGTTGGTATAGTAGAA
GAACCAGACAAAGCTGTTCTAACACAAGCATGGAAATCATGGATAGAAGAGCACATAAAA
GTAACGGGAAATGTCCCTCCAGGGAACAAGTCAGGGAACAACACATGGGTCAAACAGACT
CCAAGGAAGAAATCTGACATCCGTCTCACTCCAGGTCGCCATGTCGAGCTCAATGTCCCC
TTAGAGGAACTGATTGACAGGTTAGTAAAAGAGAACAAAGTGGTAGCTTTCATAAAAGGG
TCGAGAAGCGCTCCTCAATGTGGAT*CTCGCAGAGAGTTGTTGGGATTCTTGAGAGCCAA
G
AGTG

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4BZ83JQ 725 0 0
TACGATAATAGCGACGAGCTTCAGTTCGTCGGAATATCTCGGAACATCGGGGCGAGTGTA
GCTGCTCACGTGAAATCGGTTCCGGAGCTTTGTGGCTCCGTCAAGGTTGGTATAGTAGAA
GAACCAGACAAAGCTGTTCTAACACAAGCATGGAAATCATGGATAGAAGAGCACATAAAA
GTAACGGGAAATGTCCCTCCAGGGAACAAGTCAGGGAACAACACATGGGTCAAACAGACT
CCAAGGAAGAAATCTGACATCCGTCTCACTCCAGGTCGCCATGTCGAGCTCAATGTCCCC
TTAGAGGAACTGATTGACAGGTTAGTAAAAGAGAACAAAGTGGTAGCTTTCATAAAAGGG
TCGAGAAGCGCTCCTCAATGTGGATTCTCGCAGAGAGTTGTTGGGATTCTTGAGAGCCAA
GGAGTGGATTATGAAACGGTTGATGTTCTTGACGATGATTATAACCATGGGCTAAGAGAG
AAGCTGAAGAGTTATAGTAATTGGCCTACGTTCCCGCAGGTGTTTGTGAAAGGAGAGCTG
TTAGGAGGTTGTGATATATTGACCTCAATGTATGAGAATGGCGAGCTTGCCAATATGTTT
AAGTAGTTTCATCTCTGTTTATTTCTCTGTTTCTAGTTTGTACAACTCAAAACATTTATA
ATAAACGTTTGGAACCTCTTTACTTTCAAACTTGTTTGTTCACATATTTCAAGCTTACAG
ATTGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6516Contig1 828 2 2 U
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TTGTAAAAGACACACAGAGGAATAAATTCGAAGACAAAAAAGAAGAGATAGATGGAAAGT
AATGGTGGAGCAGGAGAAGTAAGAAGAGTGAGATTAGTTTATTTCCTCAGCCGTGTTGGT
CATGTTGACCAGCCTCATCTCTTTTCTGTTCAACATATCTCCCGTAATGGTGTCTTCCTT
CGAGATGTGAAGCGATGGTTAGCGGGTGTACGAGGCGATGCGATGCCAGACGCATATTCT
TGGTCGTGTAAGAGGAGATACAAGAATGGATATGTATGGCAAGATTTATTGGACGACGAT
CTTATTACACCAACAGCACAATGCTCGAAAAAGCTTAGAAGGGGCATGGAGTGACATAAA
GATGAAAGAGACAATTGAATTTTGTAAACCAAAGGTGGCATCAAGCAAGCCTTCCATCAC
GGCTCCATTATGCTCGCAATGTGGGAAGTCATTTAAACCCGAGAAGATGCATTCACACAT
GAAATTGTGTCCAAGGATGAAGAATTCATCGGCGAGGAATGATTTGATGTTGGGAAATAA
ACATGATACCGTTAAACCGAGGCAGCAACGGTGCAGAAACATTCCGGGACAACAACGTAT
AGTGAGGACCATTCTTAAAGAGTGATGATGCTTAGTCATAGTTGATTCTGTAGTTGTGAA
ATACTGAAATGGTGCGGGAGTGTTTGCCTAGTTCGGTGAATTTATCTTTGATGAAGTGGA
TTTGGATCATGAGGTATTTGGATAATCTAATTGAAGATTTTAGTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BO23TF U 1
AF RR4BO23JQ C 97
BS 1 643 RR4BO23TF
BS 644 828 RR4BO23JQ

RD RR4BO23TF 643 0 0
GGGGAGAAAGAAGTTCCAATAAAAATATATTGTACCAAGGAAACAAAAACAAAAGCTCTT
TTGTAAAAGACACACAGAGGAATAAATTCGAAGACAAAAAAGAAGAGATAGATGGAAAGT
AATGGTGGAGCAGGAGAAGTAAGAAGAGTGAGATTAGTTTATTTCCTCAGCCGTGTTGGT
CATGTTGACCAGCCTCATCTCTTTTCTGTTCAACATATCTCCCGTAATGGTGTCTTCCTT
CGAGATGTGAAGCGATGGTTAGCGGGTGTACGAGGCGATGCGATGCCAGACGCATATTCT
TGGTCGTGTAAGAGGAGATACAAGAATGGATATGTATGGCAAGATTTATTGGACGACGAT
CTTATTACACCAACAGCACAATGCTCGAAAAAGCTTAGAAGGGGCATGGAGTGACATAAA
GATGAAAGAGACAATTGAATTTTGTAAACCAAAGGTGGCATCAAGCAAGCCTTCCATCAC
GGCTCCATTATGCTCGCAATGTGGGAAGTCATTTAAACCCGAGAAGATGCATTCACACAT
GAAATTGTGTCCAAGGATGAAGAATTCATCGGCGAGGAATGATTTGATGTTGGGAAATAA
ACATGATACCGTTAAACCGAGGCAGCAACGGTGCAGAAACATT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4BO23JQ 732 0 0
AAAAAGAAGAGATAGATGGAAAGTAATGGTGGAGCAGGAGAAGTAAGAAGAGTGAGATTA
GTTTATTTCCTCAGCCGTGTTGGTCATGTTGACCAGCCTCATCTCTTTTCTGTTCAACAT
ATCTCCCGTAATGGTGTCTTCCTTCGAGATGTGAAGCGATGGTTAGCGGGTGTACGAGGC
GATGCGATGCCAGACGCATATTCTTGGTCGTGTAAGAGGAGATACAAGAATGGATATGTA
TGGCAAGATTTATTGGACGACGATCTTATTACACCAACAGCACAATGCTCGAAAAAGCTT
AGAAGGGGCATGGAGTGACATAAAGATGAAAGAGACAATTGAATTTTGTAAACCAAAGGT
GGCATCAAGCAAGCCTTCCATCACGGCTCCATTATGCTCGCAATGTGGGAAGTCATTTAA
ACCCGAGAAGATGCATTCACACATGAAATTGTGTCCAAGGATGAAGAATTCATCGGCGAG
GAATGATTTGATGTTGGGAAATAAACATGATACCGTTAAACCGAGGCAGCAACGGTGCAG
AAACATTCCGGGACAACAACGTATAGTGAGGACCATTCTTAAAGAGTGATGATGCTTAGT
CATAGTTGATTCTGTAGTTGTGAAATACTGAAATGGTGCGGGAGTGTTTGCCTAGTTCGG
TGAATTTATCTTTGATGAAGTGGATTTGGATCATGAGGTATTTGGATAATCTAATTGAAG
ATTTTAGTAACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL6517Contig1 963 2 4 U
GGAAACAACCCTAAACGAACAAAAACTCGTCCTCTCATCATGGCATCATCTCTTCCTCAG
TTCTACCCCGATTTCACATTTTCCGATGAGACTCCGTCGCTGTTTCACGGCTCTTCTTCA
TGTCCTGACGTCTCAGCTCTATCCAATTACTTTGACGACGGCTATGGCTCCTTCAACGCA
TCTTCTAACCCAGAATCCACGTTTTTCCCGCAAGTTTTTGGGGTTTCTGACGTTTCTATG
CCGGAGTACAACAATTACTACCAGAATGTAGGTGTGAATGTGAATGGCACACAATATTTT
CATGTTGGGAATCAAGAGTACTACGGCTATTCACCGGAGATAAAGCCCTTGTTCCATCCG
TCCACTGGAGAGCAATCATTGGGAAATAGTGAAGGAGGGATGCAAGCTGAGCCGAACACA
AAAGTGGGACGCTATTCGGTTGAGGAACGTAACGACAGAATCATGAGGTACTTGAAGAAG
AAGAACCAGCGCAACTTCAATAAGACAATCAAGTATGTATGTCGTAAAACCCTAGCTGAC
CGGCGAGTTCGTGTTCGAGGACGATTTGCTAGAAACAATGATACATGTGAGCAACCATCT
CACATGTCTAAGAATCACAACAACCATTCTGAAAAAGACGAAGATATGTTTTCTGGATCA
GACGACTATCTAATTCAGCAGGTGGAAAACGACGATGTATGGCTTCAAGAAGCAATGTCC
AATCTAATTTCGTTTCCTTGTGAATTAAACACTGCCGGATATTCTCATCATCCAAACACA
TGGAGCTTCTGATCCTATACTACCTCGCTCATTTACTGCTGAATCAAAAAAAAAAATTAC
TGCTGAATCATTTAATTAATGTCGCTTGGTATAAAATTTGATCTATTAGTTCAGTTTAAT
TATAACTAAGCAGGTTAGTTATTTTATTATATATCTTGTTATCATAATATACTTAATTAT
TCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4FA37TF U 1
AF RR4FA37JQ C 268
BS 1 681 RR4FA37TF
BS 682 682 RR4FA37JQ
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BS 706 963 RR4FA37JQ

RD RR4FA37TF 705 0 0
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TTCTACCCCGATTTCACATTTTCCGATGAGACTCCGTCGCTGTTTCACGGCTCTTCTTCA
TGTCCTGACGTCTCAGCTCTATCCAATTACTTTGACGACGGCTATGGCTCCTTCAACGCA
TCTTCTAACCCAGAATCCACGTTTTTCCCGCAAGTTTTTGGGGTTTCTGACGTTTCTATG
CCGGAGTACAACAATTACTACCAGAATGTAGGTGTGAATGTGAATGGCACACAATATTTT
CATGTTGGGAATCAAGAGTACTACGGCTATTCACCGGAGATAAAGCCCTTGTTCCATCCG
TCCACTGGAGAGCAATCATTGGGAAATAGTGAAGGAGGGATGCAAGCTGAGCCGAACACA
AAAGTGGGACGCTATTCGGTTGAGGAACGTAACGACAGAATCATGAGGTACTTGAAGAAG
AAGAACCAGCGCAACTTCAATAAGACAATCAAGTATGTATGTCGTAAAACCCTAGCTGAC
CGGCGAGTTCGTGTTCGAGGACGATTTGCTAGAAACAATGATACATGTGAGCAACCATCT
CACATGTCTAAGAATCACAACAACCATTCTGAAAAAGACGAAGATATGTTTTCTGGATCA
GACGACTATCTAATTCAGCAG*TGGAAAACGACGATGTATGGCTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4FA37JQ 696 0 0
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TATTCACCGGAGATAAAGCCCTTGTTCCATCCGTCCACTGGAGAGCAATCATTGGGAAAT
AGTGAAGGAGGGATGCAAGCTGAGCCGAACACAAAAGTGGGACGCTATTCGGTTGAGGAA
CGTAACGACAGAATCATGAGGTACTTGAAGAAGAAGAACCAGCGCAACTTCAATAAGACA
ATCAAGTATGTATGTCGTAAAACCCTAGCTGACCGGCGAGTTCGTGTTCGAGGACGATTT
GCTAGAAACAATGATACATGTGAGCAACCATCTCACATGTTTAAGAATCACAACAACCAT
TTTGAAAAAGACGAAGATATGTTTTTTGGATCAGACGACTATTTAATTCAGCAGGTGGAA
AACGACGATGTATGGCTTCAAGAAGCAATGTCCAATCTAATTTCGTTTCCTTGTGAATTA
AACACTGCCGGATATTCTCATCATCCAAACACATGGAGCTTCTGATCCTATACTACCTCG
CTCATTTACTGCTGAATCAAAAAAAAAAATTACTGCTGAATCATTTAATTAATGTCGCTT
GGTATAAAATTTGATCTATTAGTTCAGTTTAATTATAACTAAGCAGGTTAGTTATTTTAT
TATATATCTTGTTATCATAATATACTTAATTATTCG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6518Contig1 831 2 1 U
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CGACTCTCGATCAACGAAGATCCCATGGAACCTTCTTCTTCTTCATCTCAGGCTAAGATC
GCTGGAATACGAGAGAGATATGGGAGAGAGATTCGTGTTTTCGAGACTTCGAGCATTTCT
CAGAGGCCTAGTCAAGCTTCTTCTGTTGCTCAAGAGGAATCTGATGAGTTCTACGAGCTC
ACACCCACAGATTACTACCGTCTTGTAGCCTCTAAGAAAGAAGATAAATCTTTGAAGACA
AGAAAGCTCCGTGAAGCTGAAGAAGCTGCTCGACGGGCCAAGCTCACTAAGGCTGTGATG
CGGGTTCGTTTTCCTGATAACCACACATTGGAGGCGACGTTTCATCCCTCAGAAAAGATC
CAATTGTCTACTTTGCAAATGATCAACCAAAAGATGATGGTGCAAGTTCAACTCCTTACC
TTAATGAAGAGATCTTGTCTCTGAAAGATGTAGAGGACATGGCCAAAGTAGAGGAACCCG
CTGAGCCATCATCTTCAGAACCAGCCACGAGCGAGGTTGGTACTGTACCAGTTGACCAAG
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AAAAGGGATGTTTATCCATAATTTGAGTATATCATTTCTTCTTCTATTAAG


BQ
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AF RR4AN08TF U 1
AF RR4AN08JQ C 100
BS 1 831 RR4AN08TF

RD RR4AN08TF 831 0 0
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CGACTCTCGATCAACGAAGATCCCATGGAACCTTCTTCTTCTTCATCTCAGGCTAAGATC
GCTGGAATACGAGAGAGATATGGGAGAGAGATTCGTGTTTTCGAGACTTCGAGCATTTCT
CAGAGGCCTAGTCAAGCTTCTTCTGTTGCTCAAGAGGAATCTGATGAGTTCTACGAGCTC
ACACCCACAGATTACTACCGTCTTGTAGCCTCTAAGAAAGAAGATAAATCTTTGAAGACA
AGAAAGCTCCGTGAAGCTGAAGAAGCTGCTCGACGGGCCAAGCTCACTAAGGCTGTGATG
CGGGTTCGTTTTCCTGATAACCACACATTGGAGGCGACGTTTCATCCCTCAGAAAAGATC
CAATTGTCTACTTTGCAAATGATCAACCAAAAGATGATGGTGCAAGTTCAACTCCTTACC
TTAATGAAGAGATCTTGTCTCTGAAAGATGTAGAGGACATGGCCAAAGTAGAGGAACCCG
CTGAGCCATCATCTTCAGAACCAGCCACGAGCGAGGTTGGTACTGTACCAGTTGACCAAG
AGCCCAAACCCGTGGAAAAGAAGAGCACAAAGCCTAAGTGGTTTAAAATGTGATTGAACA
TGGTTGATAGTCACAGAGGGAAAGAAAAAGCATGTTGCCTTTGAATTGAAACGTGACAGT
TAGTGTGACGGTAACAGTCTTATTGTGTCGGTCATGGCTTGTTTGGATTTCCTCCGGCCT
AAAAGGGATGTTTATCCATAATTTGAGTATATCATTTCTTCTTCTATTAAG

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR4AN08JQ 732 0 0
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TTCGAGACTTCGAGCATTTCTCAGAGGCCTAGTCAAGCTTCTTCTGTTGCTCAAGAGGAA
TCTGATGAGTTCTACGAGCTCACACCCACAGATTACTACCGTCTTGTAGCCTCTAAGAAA
GAAGATAAATCTTTGAAGACAAGAAAGCTCCGTGAAGCTGAAGAAGCTGCTCGACGGGCC
AAGCTCACTAAGGCTGTGATGCGGGTTCGTTTTCCTGATAACCACACATTGGAGGCGACG
TTTCATCCCTCAGAAAAGATCCAATTGTCTACTTTGCAAATGATCAACCAAAAGATGATG
GTGCAAGTTCAACTCCTTACCTTAATGAAGAGATCTTGTCTCTGAAAGATGTAGAGGACA
TGGCCAAAGTAGAGGAACCCGCTGAGCCATCATCTTCAGAACCAGCCACGAGCGAGGTTG
GTACTGTACCAGTTGACCAAGAGCCCAAACCCGTGGAAAAGAAGAGCACAAAGCCTAAGT
GGTTTAAAATGTGATTGAACATGGTTGATAGTCACAGAGGGAAAGAAAAAGCATGTTGCC
TTTGAATTGAAACGTGACAGTTAGTGTGACGGTAACAGTCTTATTGTGTCGGTCATGGCT
TGTTTGGATTTCCTCCGGCCTAAAAGGGATGTTTATCCATAATTTGAGTATATCATTTCT
TCTTCTATTAAG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL6519Contig1 808 2 2 U
GGGACAGCGACGCCGGAGATCAGCAATGGGGGCGTACAAGTATGCGTCTGGGCTATGGAG
GAAGAAGCAGTCCGATGTCATGAGGTTTGTTCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTATCGCCA
GCAGCCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCTCGTCGTCTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTTCGTGTGAGGCGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAA
ATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGCCGCAAACTTGGAGGCCT
CAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAATATTACGAGATTAT
ACTTGTGGACCCGGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAA
CCCCGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGGGGGCTTACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGG
ACTTCGTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTTGAA
GAAGAACAATTCCCTCTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAGCTTTTATGTTTTGTTTTTT
TGCTCGAGTGGTATATCTTCTGTGTGGATTTGTGTGGTCAGAATTCTCGAATTTCATTTG
TATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTCAAGTTTTGTGTTTCTTCAAACTTTGA
AACCTTTAAATGTTCGAGGTTCTTGAGC


BQ
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AF RR4BE88TF U 1
AF RR4BE88JQ C 175
BS 1 806 RR4BE88TF
BS 807 808 RR4BE88JQ

RD RR4BE88TF 806 0 0
GGGACAGCGACGCCGGAGATCAGCAATGGGGGCGTACAAGTATGCGTCTGGGCTATGGAG
GAAGAAGCAGTCCGATGTCATGAGGTTTGTTCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTATCGCCA
GCAGCCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCTCGTCGTCTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTTCGTGTGAGGCGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAA
ATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGCCGCAAACTTGGAGGCCT
CAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAATATTACGAGATTAT
ACTTGTGGACCCGGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAA
CCCCGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGGGGGCTTACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGG
ACTTCGTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTTGAA
GAAGAACAATTCCCTCTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAGCTTTTATGTTTTGTTTTTT
TGCTCGAGTGGTATATCTTCTGTGTGGATTTGTGTGGTCAGAATTCTCGAATTTCATTTG
TATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTCAAGTTTTGTGTTTCTTCAAACTTTGA
AACCTTTAAATGTTCGAGGTTCTTGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4BE88JQ 634 0 0
TT
TCGGCTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTTCGTGTGAGGCGTGGAGGTC
GCAAGAGGCCTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGC
TCAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGCCGCAAACTTGGAG
GCCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAATATTACGAGA
TTATACTTGTGGACCCGGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCT
GCAACCCCGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGGGGGCTTACCTCAGAGGGAAAGAAGAATC
GTGGACTTCGTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCT
TGAAGAAGAACAATTCCCTCTCTTTCCGTCGTTACCGGTGATCAGCTTTTATGTTTTGTT
TTTTTGCTCGAGTGGTATATCTTCTGTGTGGATTTGTGTGGTCAGAATTCTCGAATTTCA
TTTGTATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTCAAGTTTTGTGTTTCTTCAAACT
TTGAAACCTTTAAATGTTCGAGGTTCTTGAGC

QA 3 634 3 634
DS 



AS 1 2

CO CL6520Contig1 1036 2 2 U
GGAAGTCATTGAGAATCCTCCATTTCACGTATCTCCTAAGCAAACCAACAAAGCTTGCTC
AGCTTCTTCTTCTTCATCGTAGACCAACTACCAAAAATGTCAGAATCATTCAACCGGAGA
AAACTCACGTCATCGGACTTAAGCCTAGGCCGGATCTCAAGGACCACTAGACGTAAGGTG
AAGCACCGAGTCTCCCGTCGTAATCCCAGTAAGATTCGTTCAAAGTCTAATAAAATCCTC
AGCCGAAGTTTCTCGGAGCCGAATCTCCACCAAAGCATCGCTGTTGAGGATGATGGTGAT
CGACTTTGCTCTACGCCGGTGGTAGATCTCCCGGAGGAAATCGTTTACCTCTCTAAGATC
CGTTCGGAGGTTTTCGCTTCAGCTCCGTCGTTATCTGGCTTCTCCTCACCGTCTTCTTCT
CCGATTAACCAACAGGTTTACAAGAGGGAAGCAGAAAAGGTTGTGATCAATGTATCAGTA
GAAGGAAGTCCAGGACCTATAAGGATTTTGGTTGAGCTAAGCTGCAGCGTGGAAGAAACG
ATCAAGATGGTTGTGGACAAGTATCGAAAAGAAGGACGAACGCCGAAACTCGATAAAGAT
CTTGCCTTTGAACTGCATCAGTCTCACTTTAGTATCCAATGTTTGGAGAAAACCGAAATA
GTTGGTAAAATAGGTAGTAGAAGCTTCTACATGAGGAAGAAGGAACCTGAAAACATGATT
CTCGTGATAAAGAATCTTCCATCATCGAACTTGATCCAATCTTTTGTCGCACAAAAGATT
GGGAGAATTGTGAGGAGGACAAGGAAGATATGGAACATCTTGGTATGTGCTCAGTGAACA
ACAAAACCGGTTTTAAATAGTAACAATGTATTGTTCTAGTTATACTTTGCCCTTTGGAGC
GACACATAATATTTACTCGTGTTGGCTCAAACTTTATAAAATAGAGTTAAGTTATTTGTA
AAAGTTATGACTTGCAACATACAAACCATATGTATTTTTATATTTGCAAATCTAGATGTA
CTATAATTTTACTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU06TF U 1
AF RR4FU06JQ C 249
BS 1 670 RR4FU06TF
BS 671 1036 RR4FU06JQ

RD RR4FU06TF 670 0 0
GGAAGTCATTGAGAATCCTCCATTTCACGTATCTCCTAAGCAAACCAACAAAGCTTGCTC
AGCTTCTTCTTCTTCATCGTAGACCAACTACCAAAAATGTCAGAATCATTCAACCGGAGA
AAACTCACGTCATCGGACTTAAGCCTAGGCCGGATCTCAAGGACCACTAGACGTAAGGTG
AAGCACCGAGTCTCCCGTCGTAATCCCAGTAAGATTCGTTCAAAGTCTAATAAAATCCTC
AGCCGAAGTTTCTCGGAGCCGAATCTCCACCAAAGCATCGCTGTTGAGGATGATGGTGAT
CGACTTTGCTCTACGCCGGTGGTAGATCTCCCGGAGGAAATCGTTTACCTCTCTAAGATC
CGTTCGGAGGTTTTCGCTTCAGCTCCGTCGTTATCTGGCTTCTCCTCACCGTCTTCTTCT
CCGATTAACCAACAGGTTTACAAGAGGGAAGCAGAAAAGGTTGTGATCAATGTATCAGTA
GAAGGAAGTCCAGGACCTATAAGGATTTTGGTTGAGCTAAGCTGCAGCGTGGAAGAAACG
ATCAAGATGGTTGTGGACAAGTATCGAAAAGAAGGACGAACGCCGAAACTCGATAAAGAT
CTTGCCTTTGAACTGCATCAGTCTCACTTTAGTATCCAATGTTTGGAGAAAACCGAAATA
GTTGGTAAAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4FU06JQ 788 0 0
TTTCTCGGAGC*GAATCTCCACCAAAGCATCGCTGTTGAGGATGATGGTGATCGACTTTG
CTCTACGCCGGTGGTAGATCTCCCGGAGGAAATCGTTTACCTCTCTAAGATCCGTTCGGA
GGTTTTCGCTTCAGCTCCGTCGTTATCTGGCTTCTCCTCACCGTCTTCTTCTCCGATTAA
CCAACAGGTTTACAAGAGGGAAGCAGAAAAGGTTGTGATCAATGTATCAGTAGAAGGAAG
TCCAGGACCTATAAGGATTTTGGTTGAGCTAAGCTGCAGCGTGGAAGAAACGATCAAGAT
GGTTGTGGACAAGTATCGAAAAGAAGGACGAACGCCGAAACTCGATAAAGATCTTGCCTT
TGAACTGCATCAGTCTCACTTTAGTATCCAATGTTTGGAGAAAACCGAAATAGTTGGTAA
AATAGGTAGTAGAAGCTTCTACATGAGGAAGAAGGAACCTGAAAACATGATTCTCGTGAT
AAAGAATCTTCCATCATCGAACTTGATCCAATCTTTTGTCGCACAAAAGATTGGGAGAAT
TGTGAGGAGGACAAGGAAGATATGGAACATCTTGGTATGTGCTCAGTGAACAACAAAACC
GGTTTTAAATAGTAACAATGTATTGTTCTAGTTATACTTTGCCCTTTGGAGCGACACATA
ATATTTACTCGTGTTGGCTCAAACTTTATAAAATAGAGTTAAGTTATTTGTAAAAGTTAT
GACTTGCAACATACAAACCATATGTATTTTTATATTTGCAAATCTAGATGTACTATAATT
TTACTCGC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL6521Contig1 1112 2 8 U
GTGGTTAAAAGCATGCTTCGAAAGAATCCAGAACTCAGACCAAGTGCTGCTGAGCTTCTC
AGACAGCCGTTACTTCAGCCATATATCCAGAAGATTCATCTGAAAGTGAACGATCCAGTT
AACAATGTGTTGCCTGCGGAATGGCCAGAATCTGAATCCGCCAGGAGATGCAGCTTCCCT
GAGCAGAGAAGGCGTCGTGCAGTCAAAAGCAAGAGCTTTGGTCCAAGCAGGTTTAGGGGT
AACCAGGAAGATTCTGTTTCTTCGATTAAAAAACCTGTGCCTGCATATCTGTCTACAGAT
GAAAGTGATGATGGAACGGTTGTTCGTAGAACCACAGAAGCTTCTAAAAGTACTAAGTAT
GTTCCAGTGAGAGCTTCGGCCTCACCTGTGCGATCAAGACAGCCTAAGAGTGACCGTGGT
CAACTTCCTGTTTCATCACAGCATACCAACCGAAAATCAGCAGCTTTGATTCGTAGAGCA
TCCATGCCAAGCTCAAGAAAGCCTGTAAAAGAAATCAAAGACTCTCTGTACAACTCGAAA
ACCAGTATTCTCCACCAGATAAAATCTCCTGACGTGTCAATGAACGCACCAAGAATCGAC
AAGATTGAGTTTCCACTGGCGTCATACGAGGAAGAACCGTTTGTTCCGGTTGTGCGTGGG
AAGAAGAAGAAGAAAGCATCGTCTAGAGGTTCATACAGCCCACCTCCAGAGCCACCACTA
GACTGCTCAGTCACAAAAGACAAATTCGCGCTTGAACCAGGGCAAAACGTAGAAGTGGCG
TTTATGAAGGCGGTGTATCAGTATGAAGAAGCATACCCTGAAAACAAGAGCGAGTCATCC
GATCATAATGCAACTGCAGGAGCGTCAAGCAGGGCTTCGTTTGGTATAAGAAGACAAAGA
TTTGATCCTAGTTTTTATCAGCAACGAGCTGAGGCACTGGAGGGATTGCTCGAGTTCAGT
GCGAGATTGCTTCAAGGTGAGAGGTACGATGAGCTTAACGTCTTACTGAGACCATTTGGT
CCAGGGAAAGTTTCACCCAGAGAGACAGCCATTTGGTTGTCCAAGAGCTTCAAGGAAACT
ACTAAGCTGGAAGATTGAGAAACTGTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV35TF U 1
AF RR4BV35JQ C 432
BS 1 690 RR4BV35TF
BS 691 691 RR4BV35JQ
BS 692 737 RR4BV35TF
BS 738 738 RR4BV35JQ
BS 739 755 RR4BV35TF
BS 756 757 RR4BV35JQ
BS 758 773 RR4BV35TF
BS 774 1112 RR4BV35JQ

RD RR4BV35TF 781 0 0
GTGGTTAAAAGCATGCTTCGAAAGAATCCAGAACTCAGACCAAGTGCTGCTGAGCTTCTC
AGACAGCCGTTACTTCAGCCATATATCCAGAAGATTCATCTGAAAGTGAACGATCCAGTT
AACAATGTGTTGCCTGCGGAATGGCCAGAATCTGAATCCGCCAGGAGATGCAGCTTCCCT
GAGCAGAGAAGGCGTCGTGCAGTCAAAAGCAAGAGCTTTGGTCCAAGCAGGTTTAGGGGT
AACCAGGAAGATTCTGTTTCTTCGATTAAAAAACCTGTGCCTGCATATCTGTCTACAGAT
GAAAGTGATGATGGAACGGTTGTTCGTAGAACCACAGAAGCTTCTAAAAGTACTAAGTAT
GTTCCAGTGAGAGCTTCGGCCTCACCTGTGCGATCAAGACAGCCTAAGAGTGACCGTGGT
CAACTTCCTGTTTCATCACAGCATACCAACCGAAAATCAGCAGCTTTGATTCGTAGAGCA
TCCATGCCAAGCTCAAGAAAGCCTGTAAAAGAAATCAAAGACTCTCTGTACAACTCGAAA
ACCAGTATTCTCCACCAGATAAAATCTCCTGACGTGTCAATGAACGCACCAAGAATCGAC
AAGATTGAGTTTCCACTGGCGTCATACGAGGAAGAACCGTTTGTTCCGGTTGTGCGTGGG
AAGAAGAAGAAGAAAGCATCGTCTAGAGGT*CATACAGCCCACCTCCAGAGCCACCACTA
GACTGCTCAGTCACAAA*GACAAATTCGCGCTTGA**CAGGGCAAAACGTAGA
GTGCGTTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4BV35JQ 681 0 0
TTCATCACAGCATACCAACCGAAAATCAGCAGCTTTGATTCGTAGAGCATCCATGCCAAG
CTCAAGAAAGCCTGTAAAAGAAATCAAAGACTCTCTGTACAACTCGAAAACCAGTATTCT
CCACCAGATAAAATCTCCTGACGTGTCAATGAACGCACCAAGAATCGACAAGATTGAGTT
TCCACTGGCGTCATACGAGGAAGAACCGTTTGTTCCGGTTGTGCGTGGGAAGAAGAAGAA
GAAAGCATCGTTTAGAGGTTCATACAGCCCACCTCCAGAGCCACCACTAGACTGCTCAGT
CACAAAAGACAAATTCGCGCTTGAACCAGGGCAAAACGTAGAAGTGGCGTTTATGAAGGC
GGTGTATCAGTATGAAGAAGCATACCCTGAAAACAAGAGCGAGTCATCCGATCATAATGC
AACTGCAGGAGCGTCAAGCAGGGCTTCGTTTGGTATAAGAAGACAAAGATTTGATCCTAG
TTTTTATCAGCAACGAGCTGAGGCACTGGAGGGATTGCTCGAGTTCAGTGCGAGATTGCT
TCAAGGTGAGAGGTACGATGAGCTTAACGTCTTACTGAGACCATTTGGTCCAGGGAAAGT
TTCACCCAGAGAGACAGCCATTTGGTTGTCCAAGAGCTTCAAGGAAACTACTAAGCTGGA
AGATTGAGAAACTGTTCATTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL6522Contig1 853 2 6 U
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TTGAACAAGTGAAGAAACTATACGAACTCTTCCGCAAGACTGACTGCACAATGTTGGAAA
TCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCAATTGGTAGCTGCCGATGCCAAGTTGAACT
TTGATGATAACGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATCTTTGCCCTTCGTGATCCAACACAGG
AGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTTGACCTGAACTATATCGGATTAGATGGAG
AGATTGGCTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATTAAAC
TGCACGGTGGTACTCCCGCAAATTTCCTTGATGTTGGCGGAAACGCTTCTGAGCACCAGG
TGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATATTGGTGAACA
TATTCGGTGGAATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTACTAAAG
AGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTAGAAAGAACAAACGTTGAACAGGGGA
AGAGAATCCTCAAGGAAAGTAGAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTG
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TGCCCCTCTTTATACAAGAAGCTTTTTTTAAGAGGTTTTTTTCTTCTATGGTTCTCAACC
ATCTTTATGGTCGACGCAATCGCATATTGTTGGGATATAATTTCTGAAACAGATCAAATA
ATGAATGGTCTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA53TF U 1
AF RR4D344TF U 306
BS 1 533 RR4DA53TF
BS 534 534 RR4D344TF
BS 535 661 RR4DA53TF
BS 662 662 RR4D344TF
BS 663 736 RR4DA53TF
BS 737 853 RR4D344TF

RD RR4DA53TF 749 0 0
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TTGAACAAGTGAAGAAACTATACGAACTCTTCCGCAAGACTGACTGCACAATGTTGGAAA
TCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCAATTGGTAGCTGCCGATGCCAAGTTGAACT
TTGATGATAACGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATCTTTGCCCTTCGTGATCCAACACAGG
AGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTTGACCTGAACTATATCGGATTAGATGGAG
AGATTGGCTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATTAAAC
TGCACGGTGGTACTCCCGCAAATTTCCTTGATGTTGGCGGAAACGCTTCTGAGCACCAGG
TGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATATTGGTGAACA
TATTCGGTGGAATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAG
AGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTAGAAAGAACAAACGTTGAACAGGGGA
AGAGAATCCTCAAGGAAAGTAGAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTG
CGGAGAAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATTAAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTC
TGCCCCTCTTTATACA
GAGCTTTTTTAGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4D344TF 548 0 0
GGCTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCGACCATGGACATCATTAAACTGCAC
GGTGGTACTCCCGCAAATTTCCTTGATGTTGGCGGAAACGCTTCTGAGCACCAGGTGGTG
GAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATATTGGTGAACATATTC
GGTGGAATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTACTAAAGAGGTG
TCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGAGA
ATCCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAGAG
AAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATTAAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCTGCCC
CTCTTTATACAAGAAGCTTTTTTTAAGAGGTTTTTTTCTTCTATGGTTCTCAACCATCTT
TATGGTCGACGCAATCGCATATTGTTGGGATATAATTTCTGAAACAGATCAAATAATGAA
TGGTCTCT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL6523Contig1 1288 2 2 U
ATACGAAAAAACAGAGGCCAGACACATACACAAAAGAGAGAAAGCAAAGTAAAGACAAGT
ATAATGTTAACATCGAGGGCATGGATCATCTCTTCGGGTTTGGTCAGAGCTATATCACTG
ATGCTCCGATCGGCGTTGAACTTCTCCATCGCCGGATCCAATTTCTCTCTGCCTACCTTC
AATCCCCTCTTCATCATAATCAACGTTATCATCTTCGCTCTCGCCGCCTCCTCTTCTCTC
TTCGGTCATGGATCTGACTCTTCGGCCACGGAGCGTAACCACGATCATGATACATATCAT
CACTATGAACATGATGACTATAACCATAACCGTAGCCAGAACCATGACCAAGACCGTTCT
TGGAATAACCCATCATCATCCGGTTATTCCTTTGATCGATACAACAATAAGGTTCACGTG
GAAAAAAAGTTTCCGATGAAGTCAGAGAGTGAAGGATCTTCTGGTAATCGTAGACCGGTT
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AAAAGACGATAGTGCATTTTATACTGTTTTCCCTTATGGCGCGCTCGGTTTCATCCACAC
TCCATACGGTAGTAGTTTTTATCTACTCAAAGCCAGAATGAATATCCACCATTCAACGAC
GGACGACCTGTGGTCTTTTGTAATCATTGTCAAGAAGGTTATATACAAATCCTTCAAAAA
AAAAAGGGTTATATGTGCATTTGTGTGTGTTAGCTTAGATTTGCGTTTAGCTGTGTAAGA
CAATGTGTTTCTTTATTAATTAATTATGTAAAAAATTGGTATAAAACATGTAAATATTGT
GCCACGTTCAATAGAGGTTGTTAATAAT


BQ
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AF RR4AC27TF U 1
AF RR4AC27JQ C 528
BS 1 803 RR4AC27TF
BS 804 1288 RR4AC27JQ

RD RR4AC27TF 803 0 0
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AATCCCCTCTTCATCATAATCAACGTTATCATCTTCGCTCTCGCCGCCTCCTCTTCTCTC
TTCGGTCATGGATCTGACTCTTCGGCCACGGAGCGTAACCACGATCATGATACATATCAT
CACTATGAACATGATGACTATAACCATAACCGTAGCCAGAACCATGACCAAGACCGTTCT
TGGAATAACCCATCATCATCCGGTTATTCCTTTGATCGATACAACAATAAGGTTCACGTG
GAAAAAAAGTTTCCGATGAAGTCAGAGAGTGAAGGATCTTCTGGTAATCGTAGACCGGTT
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DS 

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GTCGTGTCCATCACCGTCGGGAGCGAGGAGGCCTCCTCCGTTGTCGGGGTCGGGAAAGAA
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GTTTCATCCACACTCCATACGGTAGTAGTTTTTATCTACTCAAAGCCAGAATGAATATCC
ACCATTCAACGACGGACGACCTGTGGTCTTTTGTAATCATTGTCAAGAAGGTTATATACA
AATCCTTCAAAAAAAAAAGGGTTATATGTGCATTTGTGTGTGTTAGCTTAGATTTGCGTT
TAGCTGTGTAAGACAATGTGTTTCTTTATTAATTAATTATGTAAAAAATTGGTATAAAAC
ATGTAAATATTGTGCCACGTTCAATAGAGGTTGTTAATAAT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6524Contig1 890 2 2 U
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TGGCTAAGTTCTTCATAAATCAAGCCAAGCAATACGCTGCAGCCCGACCTAATTACCCGA
TCCAACTCTTCGAGTTCATTGCATCGAAAACACCATGCCACGACCTTGCATGGGACGTTG
GTGCCGGAAGCGGCCAGGCCTCACGATCGCTAGCTGGAATCTACAAGAATGTCATTGCTA
CCGACACAAGCTCCAAGCAACTTGAGTTTGCTGCAAAGCTTCCCAACGTACGTTACGAGC
TCACTCCACCAGTGTTGTCTTTGTCGGAGATCGAACAGCTAGTAGCGCCTGAATCATCGG
TGGACTTAGTCACCGTCGCTCAAGCCCTTCACTGGTTCGACCTACCGACCTTTTACAGCA
ACGTGAAACACGTGCTCAAGAAACCAGACGGAGTATTCGCCGCCTGGTGTTACACCAACC
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CGTATTGAGATAAAGCTAGGCGGCTTGTTGAAGGTGGGTACAAAGAAATAGAGTTTCCGT
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AF RR4CF45TF U 1
AF RR4CF45JQ C 169
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TCACTCCACCAGTGTTGTCTTTGTCGGAGATCGAACAGCTAGTAGCGCCTGAATCATCGG
TGGACTTAGTCACCGTCGCTCAAGCCCTTCACTGGTTCGACCTACCGACCTTTTACAGCA
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CTGAGATCAACGCCGCCGTTGACGAGGTTTTCCGGAGGTTTTACGAGGAAAAACTTGGCC
CGTATTGAGATAAAGCTAGGCGGCTTGTTGAAGGTGGGTACAAAGAAAT

QA 1 589 1 589
DS 

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TACGTTACGAGCTCACTCCACCAGTGTTGTCTTTGTCGGAGATCGAACAGCTAGTAGCGC
CTGAATCATCGGTGGACTTAGTCACCGTCGCTCAAGCCCTTCACTGGTTCGACCTACCGA
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AAAAACTTGGCCCGTATTGGGATAAAGCTAGGCGGCTTGTTGAAGGTGGGTACAAGGAAA
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GGTTGGTGACGGAGAGAGAGATGGGGATTGAAGAGTTTCTGACGTATCTGAGGTCATCTT
CGGCTTATCAGACGGCTAAAGATAAGGGGGTTGAGCTTTTAACGGCGGAGATGGAAGGAG
AGTTTGTTGGTTCGTGGAAAGAAGATGGTGAAGAGAAGAAAGTTGTTAGGTTTCCTATCT
ATTTGTTGATTGGTAGAGTTGGAGAAGATCGTGTCTGAAACTGAATATCTGTCTTCTTGA
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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GTTTCATATGGCATTGCTTCAATGGCTATGGTCTTTATCAACAAAGCTGTTATCATGCAG
TATCCACACTCCATGACTGTTCTTTTTTTTGAAGGTGTGTGGCATTGTATGGCCTGATGT
CCTGTACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTGACTGGTCCATTGCGTTGCTTGTTCTCATGTA
ATTTGTTTAGTGCTGTCTTTTGTTTAGCCAGCTAACTTTGTTCTCTGGCTACTCTTTTTT
ATGTTTGTGTCTTTGCTGTTTTTTTTATTGATGAGGAGCATTGCGTTGCTTGTTCTCATG
ACTTGTTGTATGTCCTTACTTGCATGTGAAAAGGAGTGAAAAACTTGACTTAC


BQ
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AF RR4F856JQ C 1
AF RR4F856TF U 1
BS 1 413 RR4F856TF

RD RR4F856JQ 413 0 0
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TATCCACACTCCATGACTGTTCTTTTTTTTGAAGGTGTGTGGCATTGTATGGCCTGATGT
CCTGTACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTGACTGGTCCATTGCGTTGCTTGTTCTCATGTA
ATTTGTTTAGTGCTGTCTTTTGTTTAGCCAGCTAACTTTGTTCTCTGGCTACTCTTTTTT
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ACTTGTTGTATGTCCTTACTTGCATGTGAAAAGGAGTGAAAAACTTGACTTAC

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4F856TF 413 0 0
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TATCCACACTCCATGACTGTTCTTTTTTTTGAAGGTGTGTGGCATTGTATGGCCTGATGT
CCTGTACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTGACTGGTCCATTGCGTTGCTTGTTCTCATGTA
ATTTGTTTAGTGCTGTCTTTTGTTTAGCCAGCTAACTTTGTTCTCTGGCTACTCTTTTTT
ATGTTTGTGTCTTTGCTGTTTTTTTTATTGATGAGGAGCATTGCGTTGCTTGTTCTCATG
ACTTGTTGTATGTCCTTACTTGCATGTGAAAAGGAGTGAAAAACTTGACTTAC

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 2

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TCTCCAAGACTGGATAGATGAAATGACGAGCTTCATAAAATCAATTGACGACAAGCATCT
CCTCACAGTTGGCCTTGAAGGCTTCTACGGTCCCAATAGCCCCAAAAGGCTGACAGTTAA
TCCAGAACAGTGGCCTTCTGAGCTCGGAACAGACTTTGTTCGTAACTCAAACTCCTCAAA
CATAGACTTCGCGTCTGTCCATATCTACCCTGATCACTGGTTTCATGATCAAACCTTTGA
AGATAAGCTAAAGTTCGTGTTGAAATGGATGCAATCTCACATCGAAGACGGGATGAAGGA
ACTCAAGAAGCCGGTTCTATTCACAGAGTTCGGACTCTCGAACCTGAACAAAGACTACGA
GCCATCCCAGAGAGAACGTTTCTACAGAACAATCTTCGATGTGGTGTACAAATCAGCGAA
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TTTCAACGACGAGTTTGGGATTGTTCCACACGAACAAGACCCCGTGTATAGGTTAATGGT
CGAACAATCTTGCAGGTTAGGTCGTGTCTCAGGACGTCGTGAGGAACGTAAGTTGAGAAA
ACTCTGTGGACACAGACGTTGAAAGAGAAAGAGAGAGGGAGAGAATCACATGTACACAGA
GTTGTTTTTTTTTATGTATACAGTGAGATATGATTCTAGTTTTGATCC


BQ
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AF RR4CI89TF U 1
AF RR4CI89JQ C 183
BS 1 603 RR4CI89TF
BS 604 888 RR4CI89JQ

RD RR4CI89TF 603 0 0
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GATTTTCGCTTGGGAGTTGATAAACGAGCCTAGATGCACCTCTGATGTCTCTGGCGACAC
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CCTCACAGTTGGCCTTGAAGGCTTCTACGGTCCCAATAGCCCCAAAAGGCTGACAGTTAA
TCCAGAACAGTGGCCTTCTGAGCTCGGAACAGACTTTGTTCGTAACTCAAACTCCTCAAA
CATAGACTTCGCGTCTGTCCATATCTACCCTGATCACTGGTTTCATGATCAAACCTTTGA
AGATAAGCTAAAGTTCGTGTTGAAATGGATGCAATCTCACATCGAAGACGGGATGAAGGA
ACTCAAGAAGCCGGTTCTATTCACAGAGTTCGGACTCTCGAACCTGAACAAAGACTACGA
GCCATCCCAGAGAGAACGTTTCTACAGAACAATCTTCGATGTGGTGTACAAATCAGCGAA
GAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4CI89JQ 706 0 0
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TAGACTTCGCGTCTGTCCATATCTACCCTGATCACTGGTTTCATGATCAAACCTTTGAAG
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CATCCCAGAGAGAACGTTTTTACAGAACAATTTTCGATGTGGTGTACAAATCAGCGAAGA
GAAGGAAGGCAGGAGCAGGGACACTGGTGTGGCAGCTGTTCATGGAAGGCATGGAAGGTT
TCAACGACGAGTTTGGGATTGTTCCACACGAACAAGACCCCGTGTATAGGTTAATGGTCG
AACAATCTTGCAGGTTAGGTCGTGTCTCAGGACGTCGTGAGGAACGTAAGTTGAGAAAAC
TCTGTGGACACAGACGTTGAAAGAGAAAGAGAGAGGGAGAGAATCACATGTACACAGAGT
TGTTTTTTTTTATGTATACAGTGAGATATGATTCTAGTTTTGATCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6528Contig1 741 2 1 U
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TATACGCAAACCTGAGATATCAGCTTTTATGTGGATTTGAAAGAGCAATGAGCAACCACT
TTGATGTCATTGGAGTAGCACTCTTCTTTGGCACTGCCGTGAGGATTATGAACGTTCAGT
TAGGGGAAAGATCAAGACAAGTATGGCTAGGTGTGGAGGCAGACCCGCTGGCTCAGTCCG
ATGATCTGCTGGCGAAAGCATACAACCGACCCTCAGAGGAAACGGCAGCAAAGCCAGAGT
CAAGATGGTTCATCTCAAAGAATGCAATAGTCTCAGGGCTACTTGGTATGAAGCAACAGG
ACTCAGCTTCAGATTCTCCACCTCCAAAGGCTAGGCGAAAGAGGATTGTACGGAAGAAGG
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GAGAAACAATGAAGTTGTGTTGTCACTAAGTTTTGTTGCCAGAAGGAATCACCAAACTGC
GAGAGATGGGTAAGAAAAATTCTAAAGCGCTTTTTTTTTTCTTCTTTATGACTATCTCTC
AAAAGTCCTTCAATTTCTTTTGAGATAAGACATTTATATTCTTAGGTGTTGTGATTTTAT
ATCTGCTCAGATCTCAAAATTTGTCATTCTGTAACTTTCTCAGACCTTTTTTGCTAATAA
ATAGCCACATCTTTTATATCC


BQ
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AF RR4B645JQ C 1
AF RR4B645TF U 1
BS 1 741 RR4B645TF

RD RR4B645JQ 741 0 0
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QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4B645TF 741 0 0
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TTGATGTCATTGGAGTAGCACTCTTCTTTGGCACTGCCGTGAGGATTATGAACGTTCAGT
TAGGGGAAAGATCAAGACAAGTATGGCTAGGTGTGGAGGCAGACCCGCTGGCTCAGTCCG
ATGATCTGCTGGCGAAAGCATACAACCGACCCTCAGAGGAAACGGCAGCAAAGCCAGAGT
CAAGATGGTTCATCTCAAAGAATGCAATAGTCTCAGGGCTACTTGGTATGAAGCAACAGG
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TGGCTGCCTCTTAACTAACAACCTCTAAAAATTGTTCACAATTTTCGGAGCCCCGTGGAA
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GAGAGATGGGTAAGAAAAATTCTAAAGCGCTTTTTTTTTTCTTCTTTATGACTATCTCTC
AAAAGTCCTTCAATTTCTTTTGAGATAAGACATTTATATTCTTAGGTGTTGTGATTTTAT
ATCTGCTCAGATCTCAAAATTTGTCATTCTGTAACTTTCTCAGACCTTTTTTGCTAATAA
ATAGCCACATCTTTTATATCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6529Contig1 1158 2 6 U
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AACTTGTCTACACAGACAAATCTGGGAGAAGGAATCCTGAGTACATCTCCTTGGGGTGTG
ACTCTGTGCCTGTCCTAAGAGGAAGAACACCTATCCAGGTCTACTCAGATTTCATGAGGA
GCTTCCGTGAAAGATTCGATAATTACATTGGAGGAGTTATTGCGGAAATTCAAGTGGGAA
TGGGACCTTGTGGAGAACTGAGATACCCATCATACCCTGAGAGCAATGGGACATGGAGGT
TCCCAGGAATTGGAGAGTTCCAGTGCTATGACAAGTATATGAAATCGTCGCTTCAAGCAT
ATGCTGAATCAATAGGGAAAACAAACTGGGGAACAAGCGGACCTCATGACGCCGGCGAGT
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GTTTCTGACCAGCTGATTTTTTTGCTTATTAATGTCAATTCATTGTGTTACCATTATCTC
TGAATACAATGAGATGGAAACCCAACTTTGTTTTCAATACTTGAAGCCATATATATATAA
GATACCCTGTATTGTCAT


BQ
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AF RR4AC51TF U 1
AF RR4AC51JQ C 384
BS 1 694 RR4AC51TF
BS 695 695 RR4AC51JQ
BS 696 750 RR4AC51TF
BS 751 751 RR4AC51JQ
BS 752 804 RR4AC51TF
BS 805 1158 RR4AC51JQ

RD RR4AC51TF 804 0 0
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AAAGGCACGGTCTCAAACTCCAGGTTGTTATGTCTTTCCATCAATGCGGAGGAAACGTTG
GAGACTCTTGCAGTATTCCTTTGCCCCCGTGGGTGCTTGAAGAGATCAGCAAGAACCCTG
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TCCCAGGAATTGGAGAGTTCCAGTGCTATGACAAGTATATGAAATCGTCGCTTCAAGCAT
ATGCTGAATCAATAGGGAAAACAAACTGGGGAACAAGCGGACCTCATGACGCCGGCGAGT
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ACGGAAAGTTTTTCATGGAGTGGTACTCAG*AAAGCTACTAGAGCACGGAGACAAGCTCC
TGTCTTCAGCGAAAGCGATCTTCC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4AC51JQ 775 0 0
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TACCCATCATACCCTGAGAGCAATGGGACATGGAGGTTCCCAGGAATTGGAGAGTTCCAG
TGCTATGACAAGTATATGAAATCGTCGCTTCAAGCATATGCTGAATCAATAGGGAAAACA
AACTGGGGAACAAGCGGACCTCATGACGCCGGCGAGTACAAGAACCTCCCAGAAGACACT
GAGTTTTTCAGGAGAGACGGTACATGGAACAGCGAGTACGGAAAGTTTTTCATGGAGTGG
TACTCAGGAAAGCTACTAGAGCACGGAGACAAGCTCCTGTCTTCAGCGAAAGCGATCTTC
CAAGGCTCCGGAGCCTGATAAGTCTGGACCTTTGCCATTACATTTACTGGGAATCTTAGC
AAAAAGTATTAAAGAAGATCATTTTGTGAGCGATGAAGGAGATGTTGTATACTATGAAGC
AGACCCTAATCTCTATGGACAGATCAAGGTAACAGCAGAATGAAATGAAGCAGGCAAAGA
GAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTTGTCAGATTCATTTGTTTCTGACCAGCTGATTTTTTT
GCTTATTAATGTCAATTCATTGTGTTACCATTATCTCTGAATACAATGAGATGGAAACCC
AACTTTGTTTTCAATACTTGAAGCCATATATATATAAGATACCCTGTATTGTCAT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6530Contig1 793 2 3 U
TTTTTTTTCATGATCACAAGCAAAATAGTATTTTACAGAAATACAAATTGGTAGGAAGAA
GAAACATGCCATACCGGTACACATTTTTTTTAGTCTTCTGTGTGTTCTAATGAAGTTATT
GGTGTTCATTTGTATAGCTCTTAAGCAAGCATAAGCTGAAGCTGAGCACAACGCAGCTGA
ACCTAACAGTACAGCCTTCCACTGCCTACTAACCACCAAAATGGCCAAAGCCGTCAAGGC
CACGGCTGTGCCAAAGAGGATATTTTTCCAGAGTTCAAAGGATTTGATCACTTTGCTGCA
GCTTCTACAATGGATCACATGTCTGAAGTAGCGGTTAGCCAAATTAGGAGCCTGCATAGT
ACCAATTCCACCTTTTGCAGGATAAGAAGCCGAGAGACCTGCAATGAGTCCCGCAGGGGC
GTGTTCCACCACAGGAGGGACCTTAGGGAGAGAGATTGTCCTATGCCCGAAATGGTAAGG
CATCCCATGACCAACTTTGTCCATCCACTTTCTATATTCAGCAACCCACGTGTCTGATGA
CTTCAGGTTAAGATATAACTCCTTAGTTGGTACTTTCTCCTTCATCAAAACCTCGTTTTG
TGACGATAGAAACCCCATGTCCTGTTCAAAGACCTTGCATGCATTCTGATGCCAGAACCA
TAGAGGTAACACCTGAACCAAAGGCGATCTTTTCGTGACACCAAACCTAACTATAAGCAT
AGACTTCCCTTGTCCTGTAGGTCTACAAAGAAACAGCCCTGAAAAGTAGTTCTTCACCCC
GTCCTTTCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF90JQ U 13
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ATATAACTCCTTAGTTGGTACTTTCTCCTTCATCAAAACCTCGTTTTGTGACGATAGAAA
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CTGAACCAAAGGCGATCTTTTCGTGACACCAAACCTAACTATAAGCATAGACTTCCCTTG
TCCTGTAGGTCTACAAAGAAACAGCCCTGAAAAGTAGTT

QA 1 759 1 759
DS 

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CACGGCTGTGCCAAAGAGGATATTTTTCCAGAGTTCAAAGGATTTGATCACTTTGCTGCA
GCTTCTACAATGGATCACATGTCTGAAGTAGCGGTTAGCCAAATTAGGAGCCTGCATAGT
ACCAATTCCACCTTTTGCAGGATAAGAAGCCGAGAGACCTGCAATGAGTCCCGCAGGGGC
GTGTTCCACCACAGGAGGGACCTTAGGGAGAGAGATTGTCCTATGCCCGAAATGGTAAGG
CATCCCATGACCAACTTTGTCCATCCACTTTCTATATTCAGCAACCCACGTGTCTGATGA
CTTCAGGTTAAGATATAACTCCTTAGTTGGTACTTTCTCCTTCATCAAAACCTCGTTTTG
TGACGATAGAAACCCCATGTCCTGTTCAAAGACCTTGCATGCATTCTGATGCCAGAACCA
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AGACTTCCCTTGTCCTGTAGGTCTACAAAGAAACAGCCCTGAAAAGTAGTTCTTCACCCC
GTCCTTTCCCTCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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GGAGCTTTGTTGAGACGGTACATTGGTCAGAAAGTGAGAGCTGTGGTTCAGGTGATCCGG
TCTGATATTGGATCCGTCACTGGGAAATCCACTGATGATCAGCAGATTGTTGTTAAAGGC
TCGCCTCCTCCTTCGCTGACCACTTTCCTCGAGGTTATTGGAATCGCTGAGAGTGACAAC
ACCATTCGAGCTGATGTTTGGACCAACTTTGGTGACAATTTCGATGCAGGGAACTACAAT
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AGATTCGCTTTTCTGTATGGAAACTCTTTTAATAGATTCAGTGACTTTGTTATGTTAATT
TGACTATGAATCATATGTTTTCTTATTTAGTGTTTCGGTTCTCTTCCGTTT


BQ
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AF RR4B426JQ C 1
AF RR4B426TF U 180
BS 1 179 RR4B426JQ
BS 180 591 RR4B426TF

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GGAGCTTTGTTGAGACGGTACATTGGTCAGAAAGTGAGAGCTGTGGTTCAGGTGATCCGG
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TCGCCTCCTCCTTCGCTGACCACTTTCCTCGAGGTTATTGGAATCGCTGAGAGTGACAAC
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GAGCTATGTAAGCTCGCAAATGGGGAGTTCAGACACATGTTCATCTAGAATAACAGGGTA
CCGGCGATGAATAACGGAAGCTCTTCTTGTTTCACGCTTGAACTATTTGATCATATTATG
AGATTCGCTTTTCTGTATGGAAACTCTTTTAATAGATTCAGTGACTTTGTTATGTTAATT
TGACTATGAATCATATGTTTTCTTATTTAGTGTTTCGGTTCTCTTCCGTTT

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DS 

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CTCGCCTCCTCCTTCGCTGACCACTTTCCTCGAGGTTATTGGAATCGCTGAGAGTGACAA
CACCATTCGAGCTGATGTTTGGACCAACTTTGGTGACAATTTCGATGCAGGGAACTACAA
TGAGCTATGTAAGCTCGCAAATGGGGAGTTCAGACACATGTTCATCTAGAATAACAGGGT
ACCGGCGATGAATAACGGAAGCTCTTCTTGTTTCACGCTTGAACTATTTGATCATATTAT
GAGATTCGCTTTTCTGTATGGAAACTCTTTTAATAGATTCAGTGACTTTGTTATGTTAAT
TTGACTATGAATCATATGTTTTCTTATTTAGTGTTTCGGTTCTCTTCCGTTT

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 2

CO CL6532Contig1 853 2 2 U
GGAAATTTTGAAAAGTAAAGATAACGGTAAAAAATATATAGAAGTACCTCAATTGCTTCA
AAATTGATCACCGACCATGCCCTTGAGTCCTCGACAATCCCTAGAGAAATCAACAAAAGC
AATAACCAGAAATTACAGTTGCTTTTAAATTATCGTCATTCAAACCCGTGTGAAGATTCA
GTGATGATGTTGGGTCCTCGTTATTGAAGATCGGGTTGCTGCTGGTTCCATCGAGCTTTT
TCATGTTCAGATCTGGGCTAAATGTCAATGTTTGCAAGCGTTTTGAAAGCATTGAAGAGC
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CATATGCTTTCAAGAACACTCGACAATCAACACAAAACCTTTGTTCTCAAATTTACGTGA
TGCTTCCGTCGAGGACCCGGGAAGGAACTTTCAGTAGGAAAACTTGTAACTAGCAGGTAA
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GAAGTCACTTCGAAGAAAATAAATGCTGTGTTGGCCACCAAAATCTGAATCATGTGACCT
GAAGAAATTCCAATTAGGAGACATAATTATTTCTGGGAGAATTAAACTTGTAAGGTTTTG
CGAGCTTTTAGGGCTTGTTCATTGGAATAGATCATACGGGCATGGTAAAGATCTAGTTTC
TTGTAAACACTATGCTGCTTGCCAAATAGTTACTAGGGAGTAAACTAACTTGCCATTTTA
ATTGATATCATTCTTGTTTTGTGGTAAGTTGGATTATGTCATAAATCATAGCTTTTCTTA
TGACTATATCGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E022TF U 1
AF RR4E022JQ C 255
BS 1 667 RR4E022TF
BS 668 853 RR4E022JQ

RD RR4E022TF 667 0 0
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AAATTGATCACCGACCATGCCCTTGAGTCCTCGACAATCCCTAGAGAAATCAACAAAAGC
AATAACCAGAAATTACAGTTGCTTTTAAATTATCGTCATTCAAACCCGTGTGAAGATTCA
GTGATGATGTTGGGTCCTCGTTATTGAAGATCGGGTTGCTGCTGGTTCCATCGAGCTTTT
TCATGTTCAGATCTGGGCTAAATGTCAATGTTTGCAAGCGTTTTGAAAGCATTGAAGAGC
TTTCTCCTGATATGGGAATCGAGGGTTATATCAAGACTACGATGTCAAAGGTTGTTTCAT
CATATGCTTTCAAGAACACTCGACAATCAACACAAAACCTTTGTTCTCAAATTTACGTGA
TGCTTCCGTCGAGGACCCGGGAAGGAACTTTCAGTAGGAAAACTTGTAACTAGCAGGTAA
AGCAGATTTCCTGTCAAACAGACTCTGTATTACTGTATTTTCTGCTCTAACTGGCGGGTA
GAAGTCACTTCGAAGAAAATAAATGCTGTGTTGGCCACCAAAATCTGAATCATGTGACCT
GAAGAAATTCCAATTAGGAGACATAATTATTTCTGGGAGAATTAAACTTGTAAGGTTTTG
CGAGCTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4E022JQ 599 0 0
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GGAATCGAGGGTTATATCAAGACTACGATGTCAAAGGTTGTTTCATCATATGCTTTCAAG
AACACTCGACAATCAACACAAAACCTTTGTTCTCAAATTTACGTGATGCTTCCGTCGAGG
ACCCGGGAAGGAACTTTCAGTAGGAAAACTTGTAACTAGCAGGTAAAGCAGATTTCCTGT
CAAACAGACTCTGTATTACTGTATTTTCTGCTCTAACTGGCGGGTAGAAGTCACTTCGAA
GAAAATAAATGCTGTGTTGGCCACCAAAATCTGAATCATGTGACCTGAAGAAATTCCAAT
TAGGAGACATAATTATTTCTGGGAGAATTAAACTTGTAAGGTTTTGCGAGCTTTTAGGGC
TTGTTCATTGGAATAGATCATACGGGCATGGTAAAGATCTAGTTTCTTGTAAACACTATG
CTGCTTGCCAAATAGTTACTAGGGAGTAAACTAACTTGCCATTTTAATTGATATCATTCT
TGTTTTGTGGTAAGTTGGATTATGTCATAAATCATAGCTTTTCTTATGACTATATCGAA

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL6533Contig1 964 2 2 U
CAAGGTTTATCCGACATGGTACAAATGACTTCCGCTGGGAACCACCACCTCTTTCCGTTG
TCTTCATCATCAGTCCTCCCTGACTCTCCGGCCACCACCACAACCAACAATTCCAAATTC
CCACAACTTCCACAAACCCTAATCTCACCTTATCATCATCCTCAACATCACAACAAACCT
CAGCTTCACTACCATCACTACAGCACCAAACCCTAAAAGACTCTTCTTTCTCCCCGCTCT
TCTCCTCCTCCTCCTCCGAAAGCAAACAAAACAAGCCTCTCTCTCCAATGTCTGCCACTG
CACTCTTACAAAAAGCTGCACAAATGGGATCCACTAGAAGCAACTCCACCACGGCTCCGT
CCATCTTCGCCGGCCCAACAATGACGTCAATTTCATCCGCAGCTTCTCCTCCTCCTCGAT
CATCTTCTCCAATGATGATCCAACAACAGCTCAACAACAACTTCAACACCAATGCCCCAA
GAGAGATCCATAATCTTGCTCCTCCTATCAGTGGTGTAACCATGAGTAGTGTGGATAATA
ACCATCGATTTCAATCAAACCGGTCAGGTATGAACCCGGCTCAGCAGATGGGTCTAACCC
GGGATTTCCTCGGAGTGAGCAACGAGCATCACGCTCACCAAACTGGTCATCGTCCGTTTT
TGCCTCAGGAACTCGCAAGGTTTGCTCCATCGAGTTGATGGGTTGTCTGTTATTATTAGA
TCTGATCAACTACATATATTTGGGGCTTAGGACTGGAAGTTTCTTTGAGGAGACAAGTCT
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TCATACATTTATATGTATGTACTTTTAATATGTTCATGATGATCATCATTTCTATACCAT
GCATGGGGTTTGTATTTTGCCACAATATTGTCGTTTTGTAAATGTTATTTCTTTTCGTTA
TTAC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4CU20TF U 1
AF RR4CU20JQ C 257
BS 1 668 RR4CU20TF
BS 669 964 RR4CU20JQ

RD RR4CU20TF 674 0 0
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TCTTCATCATCAGTCCTCCCTGACTCTCCGGCCACCACCACAACCAACAATTCCAAATTC
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TCTCCTCCTCCTCCTCCGAAAGCAAACAAAACAAGCCTCTCTCTCCAATGTCTGCCACTG
CACTCTTACAAAAAGCTGCACAAATGGGATCCACTAGAAGCAACTCCACCACGGCTCCGT
CCATCTTCGCCGGCCCAACAATGACGTCAATTTCATCCGCAGCTTCTCCTCCTCCTCGAT
CATCTTCTCCAATGATGATCCAACAACAGCTCAACAACAACTTCAACACCAATGCCCCAA
GAGAGATCCATAATCTTGCTCCTCCTATCAGTGGTGTAACCATGAGTAGTGTGGATAATA
ACCATCGATTTCAATCAAACCGGTCAGGTATGAACCCGGCTCAGCAGATGGGTCTAACCC
GGGATTTCCTCGGAGTGAGCAACGAGCATCACGCTCACCAAACTGGTCATCGTCCGTTTT
TGCCTCAG
AACTCG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4CU20JQ 708 0 0
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TGCACAAATGGGATCCACTAGAAGCAACTCCACCACGGCTCCGTCCATCTTCGCCGGCCC
AACAATGACGTCAATTTCATCCGCAGCTTCTCCTCCTCCTCGATCATCTTCTCCAATGAT
GATCCAACAACAGCTCAACAACAACTTCAACACCAATGCCCCAAGAGAGATCCATAATCT
TGCTCCTCCTATCAGTGGTGTAACCATGAGTAGTGTGGATAATAACCATCGATTTCAATC
AAACCGGTCAGGTATGAACCCGGCTCAGCAGATGGGTCTAACCCGGGATTTCCTCGGAGT
GAGCAACGAGCATCACGCTCACCAAACTGGTCATCGTCCGTTTTTGCCTCAGGAACTCGC
AAGGTTTGCTCCATCGAGTTGATGGGTTGTCTGTTATTATTAGATCTGATCAACTACATA
TATTTGGGGCTTAGGACTGGAAGTTTCTTTGAGGAGACAAGTCTAAAATCGTAGCTCCCT
TGTGAAGCGGTCGGAACGTGGGGACAAAGATTGACAAGACATCGTCATACATTTATATGT
ATGTACTTTTAATATGTTCATGATGATCATCATTTCTATACCATGCATGGGGTTTGTATT
TTGCCACAATATTGTCGTTTTGTAAATGTTATTTCTTTTCGTTATTAC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6534Contig1 924 2 4 U
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GAGTGTAACTCCTGCTGATGAGGAAGAAATGAGAAACAGTAGAGCCAGGAAGAGGATCTA
TGAACTGCTGTCAAAGGCAGCAGCAGGAACATCCAAAGGAGACTGTGATCAACGAGAGCT
TCACTTTGTTTTCTTCCGCTAACCTGAGCGATTCTTAGAGTCAGATGAAAGCAAGGGTCA
TGTTTCTGGTGTAAACTTGGAGAAAACCATTCTTGAAAGTGTTGGAAGCGGAAAGCAAAT
TGCAGTTGGTACAGGAGAGTTTGAAGATATTAACTGCAGTATGGTGCTGAAAGCCATTGG
TTACAAGTCGGTTCCAATCGAAGGTTTACCCTTTGATCACAAGAAAGGCATTGTCCCGAA
TGTAAGAGGTCGAGTGGTTAGTGGAGACATTTCAGAGACAGAGCCAGGCTTATACGTATG
TGGATGGCTCAAAAGAGGACCAGTAGGCATAATTGCCACAAACCTTTACTGCGCCGAAGA
AACAGTTGGTAGCATAAGCCAAGACATTGAAGAAGAAGAAGGTGTTGTTGGTAAGAGCGA
GAAAGCAGGAAGGAAAGGACTGGTGCAGTTGCTTGAGAACAAAAAGGTGAAAAAGGTAGA
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GTTTTTAGCATTGATCTGTGACTTATTGAATTATTTTTTTTTTTTTTGTCAACAAAATGA
ATAAGCGACTTTCAGTTAAACCAGTCGGTGGATTGAGTTATATCTTTTAATATTTTGTAA
CGAGGTGCATATTCAACTTGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM34TF U 1
AF RR4B653TF U 286
BS 1 333 RR4CM34TF
BS 334 334 RR4B653TF
BS 335 424 RR4CM34TF
BS 425 924 RR4B653TF

RD RR4CM34TF 424 0 0
GGAGCTTCGAGAAATTCTAGGGATTAAGAACTTGCACATTCGAATAAAGGAAACTGACTT
GAGTGTAACTCCTGCTGATGAGGAAGAAATGAGAAACAGTAGAGCCAGGAAGAGGATCTA
TGAACTGCTGTCAAAGGCAGCAGCAGGAACATCCAAAGGAGACTGTGATCAACGAGAGCT
TCACTTTGTTTTCTTCCGCTAACCTGAGCGATTCTTAGAGTCAGATGAAAGCAAGGGTCA
TGTTTCTGGTGTAAACTTGGAGAAAACCATTCTTGAAAGTGTTGGAAGCGGAAAGCAAAT
TGCAGTTGGTACAGGAGAGTTTGAAGATATTAAGTGCAGTATGGTGCTGAAAGCCATTGG
TTACAAGTCGGTTCCAATCGAAGGTTTACCCTTTGATCACAAGAAAGGCATTGTCCCGAA
TGTA

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4B653TF 639 0 0
GT
GCGGAAAGCAAATTGCAGTTGGTACAGGAGAGTTTGAAGATATTAACTGCAGTATGGTGC
TGAAAGCCATTGGTTACAAGTCGGTTCCAATCGACGGTTTACCCTTTGATCACAAGAAAG
GCATTGTCCCGAATGTAAGAGGTCGAGTGGTTAGTGGAGACATTTCAGAGACAGAGCCAG
GCTTATACGTATGTGGATGGCTCAAAAGAGGACCAGTAGGCATAATTGCCACAAACCTTT
ACTGCGCCGAAGAAACAGTTGGTAGCATAAGCCAAGACATTGAAGAAGAAGAAGGTGTTG
TTGGTAAGAGCGAGAAAGCAGGAAGGAAAGGACTGGTGCAGTTGCTTGAGAACAAAAAGG
TGAAAAAGGTAGACTTTAGTGGGTGGGAGAAGATTGATGCCAAAGAAAAACAAATAGGTA
TTGAGAAAAATAAACCAAGAGAAAAATTAGTTACATGGGAGGATCTTTTAGCAGCAGCAG
CTAGCTAGGAATTGTTTTTAGCATTGATCTGTGACTTATTGAATTATTTTTTTTTTTTTT
GTCAACAAAATGAATAAGCGACTTTCAGTTAAACCAGTCGGTGGATTGAGTTATATCTTT
TAATATTTTGTAACGAGGTGCATATTCAACTTGTTTT

QA 3 639 3 639
DS 



AS 1 2

CO CL6535Contig1 1125 2 2 U
GGGACACAAAACGCCAACTAATTTACAGTATTCTCTTCTGACTTGGGAGGTGAGAAGAAG
GAAGAATCTGTGCTTCGACTCCAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTTCTCTCTTTCTC
ATTTAGCTCCCTTTACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCGCCACCAGCTGCCAGACTCGCT
CTCCCGCTCTAATTTCACCTCCAGATCTACTATCATCGCCTGCTTTCTTCGCTGATCCCC
GGAAGTTAATTCATCTATCCACGAGGAGTATAAGGAAGAACCGTGTATATGCTTTGATTA
ACAGCACTAATGCTACTCCTCCCTCTTATCCGAAAACGGAAGATGATGATGATGATGACT
TCTTTCCAATGCCAATGGTTTTGATAGACCAGGATGCTGACCCTGAAGCCACCATTGTTC
AACTCAATTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATGAGGGCGCTGAAAGATT
TGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACCGTCTCAACTGAAGGATCTGTTAAGCAGACCAAAT
TTTCTATAACAAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCTGACTCCTTGGAGCAAA
TCCGATTAACAATCATCAACAATCTTTTGAAGTACCATCCGGAATGCAGTGATCAACTTG
CAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAGGCCCCAAAAAAGAAGATTGATGTTGATATCGCGA
CTCACATACATGTGAAAGAAGATGGACCAAAGAGGAGCTTGCTTTGCATAGAGACAGCAG
ACAGGCCAGGTCTTGTTGTGGAGATGATAAAAGTGATGGCAGATATCAACATAGACGTTG
AATCCGCGGAGATAGACACAGAAGGACTGGTTGCGAAAGACAAGTTTCATGTAAGCTACC
AAGGGCAAGCGCTAAACAGTTCATTGTCACAGGTGTTGGTGAACTGTTTACGTTACTTCC
TGAGAAGGCCTGAAACTGATATCGACAGCTATTAATTAGCTTTTTTTGTTTGTTCCAAAA
CAAAAAAACTGCTCTTTCTCCTTTTCGAAATCGCATCTGTTGCGGCATATCAAGTCTTTC
TCTTTTGAACATTTTGTGGAAACTCGTAATACCATCACGTCTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CN64TF U 1
AF RR4CN64JQ C 253
BS 1 686 RR4CN64TF
BS 687 1125 RR4CN64JQ

RD RR4CN64TF 691 0 0
GGGACACAAAACGCCAACTAATTTACAGTATTCTCTTCTGACTTGGGAGGTGAGAAGAAG
GAAGAATCTGTGCTTCGACTCCAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTTCTCTCTTTCTC
ATTTAGCTCCCTTTACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCGCCACCAGCTGCCAGACTCGCT
CTCCCGCTCTAATTTCACCTCCAGATCTACTATCATCGCCTGCTTTCTTCGCTGATCCCC
GGAAGTTAATTCATCTATCCACGAGGAGTATAAGGAAGAACCGTGTATATGCTTTGATTA
ACAGCACTAATGCTACTCCTCCCTCTTATCCGAAAACGGAAGATGATGATGATGATGACT
TCTTTCCAATGCCAATGGTTTTGATAGACCAGGATGCTGACCCTGAAGCCACCATTGTTC
AACTCAATTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATGAGGGCGCTGAAAGATT
TGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACCGTCTCAACTGAAGGATCTGTTAAGCAGACCAAAT
TTTCTATAACAAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCTGACTCCTTGGAGCAAA
TCCGATTAACAATCATCAACAATCTTTTGAAGTACCATCCGGAATGCAGTGATCAACTTG
CAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAG
CCCCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4CN64JQ 873 0 0
CATCTAT
CACGAGGAGTATAAG*AAGAACCGTGTATATGCTTTGATTA*CAGCACTAATGCTACTCC
TCC*TCTTATCCGAAA*CGGAAGATGATGATGATGATGACTTCTTTCCAATGCCAATGGT
TTTGATAGACCAGGATGCTGACCCTGAAGCCACCATTGTTCAACTCAATTTTGGAGATCG
TCTTGGGGCTCTCATTGACACTATGAGGGCGCTGAAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAA
AGGAACCGTCTCAACTGAAGGATCTGTTAAGCAGACCAAATTTTCTATAACAAAACTAGA
CACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCTGACTCCTTGGAGCAAATCCGATTAACAATCATCAA
CAATCTTTTGAAGTACCATCCGGAATGCAGTGATCAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGG
AATAAAGGCCCCAAAAAAGAAGATTGATGTTGATATCGCGACTCACATACATGTGAAAGA
AGATGGACCAAAGAGGAGCTTGCTTTGCATAGAGACAGCAGACAGGCCAGGTCTTGTTGT
GGAGATGATAAAAGTGATGGCAGATATCAACATAGACGTTGAATCCGCGGAGATAGACAC
AGAAGGACTGGTTGCGAAAGACAAGTTTCATGTAAGCTACCAAGGGCAAGCGCTAAACAG
TTCATTGTCACAGGTGTTGGTGAACTGTTTACGTTACTTCCTGAGAAGGCCTGAAACTGA
TATCGACAGCTATTAATTAGCTTTTTTTGTTTGTTCCAAAACAAAAAAACTGCTCTTTCT
CCTTTTCGAAATCGCATCTGTTGCGGCATATCAAGTCTTTCTCTTTTGAACATTTTGTGG
AAACTCGTAATACCATCACGTCTGCG

QA 8 873 8 873
DS 



AS 1 2

CO CL6536Contig1 982 2 6 U
GGACCTCTGAGACCAAGTAGAGATGAAAGCAATGAGTCTGATTACGAATAAGGTTGAGAG
AGCCGAGCTTAAACCTGGTGATCACATCTACACTTACCGAGCCGTCTTCGCCTATTCTCA
CCACGGTGTGTTTGTTGGTGGTTGTAAGGTGGTTCATTTCAAACCTGAGCAAACCTTGAA
AGCAGCTCCCACACTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGTTTC
AGAGGTTAATGATTCTTCAGAAGCTCCTTGCCCTACCTACCCTGACTGTGGATTCAAACA
ACCAAACAGTGGAGTACTACTCTCTTGCCTTGACTGTTTCCTCAAGAACGGTTCTCTCTA
CCGCTTCGAATATGGAGTCAGCTCATCCATTTTCTTAACCAGAGTCCGAGGTGGTACCTG
CACAACCGCTCCATCTGACCCCTTTCAGACAGTTGTCCACAGAGCAATGCACCTTCTCCA
GAACGGGTTTGGTAACTACGACATCTTCCAACTGCGAAGATTTTGCTCTCTACTGCAAGA
CGGGACTGCTCATTCTGGATAAGAACGGTGTTGGGAGAAGCGGTCAAGCCAGCTCCATTC
TCGGCGCTCCTTTAGCTGCACTCCTCTCTTCACCTCTCACGCTGTTGATTCCAAATCCTG
TTGGTGTAGCGACAGTCACTGCTGGGATGTATTGTATGAGCAGGTATGCTACTGATATAG
GTGTTAGAACCGATGTGATCAAGGTTCCCGTTGAGGATTTGGCTCTGAACCTTGGTATTA
AAACCCTCAAGAAAAGGTGAAAAAGCTTATGGCTCTTGCATTTGCAAGTGAACATAGATT
CTATCATGTACATAAGACTGGCCAGTTTTTTTAGCTATGATCTTGATTTGTCCTTGATCT
CATCTCTTGTTTTCTATTGAGAAACTGTAAAGATTCTCTAGGTTTTATTGTGGTTTCCAA
CATTATCAAGATTTAGTTCTGT


BQ
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AF RR4D187TF U 1
AF RR4D187JQ C 321
BS 1 703 RR4D187TF
BS 704 704 RR4D187JQ
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BS 722 743 RR4D187TF
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AGCCGAGCTTAAACCTGGTGATCACATCTACACTTACCGAGCCGTCTTCGCCTATTCTCA
CCACGGTGTGTTTGTTGGTGGTTGTAAGGTGGTTCATTTCAAACCTGAGCAAACCTTGAA
AGCAGCTCCCACACTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGTTTC
AGAGGTTAATGATTCTTCAGAAGCTCCTTGCCCTACCTACCCTGACTGTGGATTCAAACA
ACCAAACAGTGGAGTACTACTCTCTTGCCTTGACTGTTTCCTCAAGAACGGTTCTCTCTA
CCGCTTCGAATATGGAGTCAGCTCATCCATTTTCTTAACCAGAGTCCGAGGTGGTACCTG
CACAACCGCTCCATCTGACCCCTTTCAGACAGTTGTCCACAGAGCAATGCACCTTCTCCA
GAACGGGTTTGGTAACTACGACATCTTCCAACTGCGAAGATTTTGCTCTCTACTGCAAGA
CGGGACTGCTCATTCTGGATAAGAACGGTGTTGGGAGAAGCGGTCAAGCCAGCTCCATTC
TCGGCGCTCCTTTAGCTGCACTCCTCTCTTCACCTCTCACGCTGTTGATTCCAAATCCTG
TTGGTGTAGCGACAGTCACTGCTGGGATGTATTGTATGAGCAG*TATGCTACTGATATAG
*TGTTAGAACCGATGTGATCAAG

QA 1 743 1 743
DS 

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GCTCATCCATTTTCTTAACCAGAGTCCGAGGTGGTACCTGCACAACCGCTCCATCTGACC
CCTTTCAGACAGTTGTCCACAGAGCAATGCACCTTCTCCAGAACGGGTTTGGTAACTACG
ACATCTTCCAACTGCGAAGATTTTGCTCTCTACTGCAAGACGGGACTGCTCATTCTGGAT
AAGAACGGTGTTGGGAGAAGCGGTCAAGCCAGCTCCATTCTCGGCGCTCCTTTAGCTGCA
CTCCTCTCTTCACCTCTCACGCTGTTGATTCCAAATCCTGTTGGTGTAGCGACAGTCACT
GCTGGGATGTATTGTATGAGCAGGTATGCTACTGATATAGGTGTTAGAACCGATGTGATC
AAGGTTCCCGTTGAGGATTTGGCTCTGAACCTTGGTATTAAAACCCTCAAGAAAAGGTGA
AAAAGCTTATGGCTCTTGCATTTGCAAGTGAACATAGATTCTATCATGTACATAAGACTG
GCCAGTTTTTTTAGCTATGATCTTGATTTGTCCTTGATCTCATCTCTTGTTTTCTATTGA
GAAACTGTAAAGATTCTCTAGGTTTTATTGTGGTTTCCAACATTATCAAGATTTAGTTCT
GT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

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ATGGGAACAGCTACTTTCATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCACTTGGAGTC
TTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTAGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGACGCTGCTTGGA
TACATCCCTGGGATCATATACGCCCTTTATGTGCTCACCAAATGATTTACCATCTATCAT
CTCTTCTTGTATCTTCATCTCCTTGAACAGCTGTCTGGTCGTGTTCTACTCTTTGTGTGC
GACTGACTCAACGTTTATTTCATCAAATGGTTTTTATGTTTCGAGCAATTTAATTCATCG
TTGTTGTGTTTGCACTGTTATATAATTTTCTGTTGATATAAAGAAGACATCCTTTGC


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AF RR4CR07JQ C 1
AF RR4CR07TF U 1
BS 1 417 RR4CR07TF

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TTTTTCAGATATGGTTGCGGGGTAGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGACGCTGCTTGGA
TACATCCCTGGGATCATATACGCCCTTTATGTGCTCACCAAATGATTTACCATCTATCAT
CTCTTCTTGTATCTTCATCTCCTTGAACAGCTGTCTGGTCGTGTTCTACTCTTTGTGTGC
GACTGACTCAACGTTTATTTCATCAAATGGTTTTTATGTTTCGAGCAATTTAATTCATCG
TTGTTGTGTTTGCACTGTTATATAATTTTCTGTTGATATAAAGAAGACATCCTTTGC

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR4CR07TF 417 0 0
ACAAACACACTTTGAAGCTTTAATAATTTCTGACAAGCATCAAAAAGAGCTAAAAAGAAG
ATGGGAACAGCTACTTTCATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCACTTGGAGTC
TTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTAGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTGACGCTGCTTGGA
TACATCCCTGGGATCATATACGCCCTTTATGTGCTCACCAAATGATTTACCATCTATCAT
CTCTTCTTGTATCTTCATCTCCTTGAACAGCTGTCTGGTCGTGTTCTACTCTTTGTGTGC
GACTGACTCAACGTTTATTTCATCAAATGGTTTTTATGTTTCGAGCAATTTAATTCATCG
TTGTTGTGTTTGCACTGTTATATAATTTTCTGTTGATATAAAGAAGACATCCTTTGC

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL6538Contig1 1048 2 8 U
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GAAAGATGATTTGGTGACCAAACCTATGATTCTGAAGAAACGTAAGGAGGAGGTTGTCGT
AAAAAAGAAAACCATCTTGGTTCGCGGTCTCTCTAAGGACGCTGGGATAGCAGATATCAT
CGATTTCTTCAAAGATGTTGGACAAGTTGTTCGTGTTCAACTTGTTGTTCACCACGGTTT
CAGGAAGACTAGAAAATATGGTTTTGTTAAGTTTGCTTCTTCTAACGAAGCAGACAAGGC
TCTCCAAAAGATTAAAAATTTGCCCGGTCCCCAGACTTTTGCTCAGATTTTCCCTTATGT
GTACATCATACCCAGGTATTGCAAAGATTACAAAGTCTGGAACAAAGATTTCATCCTACG
AGAGAAGATGAGACACCTCCTCCCAAGTTTGTTGAGAACGTTCTCTTTGTTTCCAACCTC
TCTCCTCAGACTAAATTATTTCATATCATCGATCACTTCAGTCCTCTTGGACAAGTTGTT
AGTGTTCGACTTGTTGTAAATCCCGAGGGCAAGCATGTAGGCTATGGCTTTGTGGAGTTT
GGTTCTGCTGAGGAAGCAATGACAGCGTTGCACTTCTACCTGAGGAGTAGTAGAGCTCTG
CAAATTCTTTCCGACGTGGTTGAGATGGCTCCATACCCTATCCGACCCAAGTACATGCGT
GCAGAGAAGCTCTGGAACGAAGAGTACCTTCGACAAGAAAGCGTTCGGACAGAAGAAGAT
TATCTGGAGAGACGGGAGGTAACCGAATTATTTTGCGGTAAGAAGAAAATCTTCTCTGAT
GATGACTGATGGAAGAAGATGAAGAAGCTATCTGGTGTTTTAAACTTATGATACAATGCA
AGAAGCTATTTGGTGTTTTTAACTTATGATACATTCTTAGGTTTATTGTGTCGATGAATC
TTTGTTAAAATATGATTAACTTGTGACG


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AF RR4CO92TF U 1
AF RR4CO92JQ C 296
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CAAGCGAACGATGTCGGGCTCTGATTCGAAGCCAGCTAATTTATTGGTGAAGCGTAAGCT
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AAAAAAGAAAACCATCTTGGTTCGCGGTCTCTCTAAGGACGCTGGGATAGCAGATATCAT
CGATTTCTTCAAAGATGTTGGACAAGTTGTTCGTGTTCAACTTGTTGTTCACCACGGTTT
CAGGAAGACTAGAAAATATGGTTTTGTTAAGTTTGCTTCTTCTAACGAAGCAGACAAGGC
TCTCCAAAAGATTAAAAATTTGCCCGGTCCCCAGACTTTTGCTCAGATTTTCCCTTATGT
GTACATCATACCCAGGTATTGCAAAGATTACAAAGTCTGGAACAAAGATTTCATCCTACG
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TCTCCTCAGACTAAATTATTTCATATCATCGATCACTTCAGTCCTCTTGGACAAGTTGTT
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CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CO92JQ 753 0 0
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TATGTGTACATCATACCCAGGTATTGCAAAGATTACAAAGTCTGGAACAAAGATTTCATC
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ACCTCTCTCCTCAGACTAAATTATTTCATATCATCGATCACTTCAGTCCTCTTGGACAAG
TTGTTAGTGTTCGACTTGTTGTAAATCCCGAGGGCAAGCATGTAGGCTATGGCTTTGTGG
AGTTTGGTTCTGCTGAGGAAGCAATGACAGCGTTGCACTTCTACCTGAGGAGTAGTAGAG
CTCTGCAAATTCTTTCCGACGTGGTTGAGATGGCTCCATACCCTATCCGACCCAAGTACA
TGCGTGCAGAGAAGCTCTGGAACGAAGAGTACCTTCGACAAGAAAGCGTTCGGACAGAAG
AAGATTATCTGGAGAGACGGGAGGTAACCGAATTATTTTGCGGTAAGAAGAAAATCTTCT
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QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CD93TF U 1
AF RR4CD93JQ C 8
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BS 706 744 RR4CD93TF
BS 745 779 RR4CD93JQ

RD RR4CD93TF 744 0 0
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GGTTGTTCTAAGCGAAGTCTATTTTAAGAGTTGGTTAGTAACTACGACTTTCTTAGCATT
CATACAAAAAAGTACCAAGTTCTTTATTTTTTTTCACAAACAACCCAAATTATAATAAAC
CCATGCCGGTCTAATAAACCTTCTAATATTCTGAGCAGTCAAAAGTTAATTATTAATTCA
TAACAGGACTCATCTCAAAGATATGATTTTAAAAGGAAAAGATGCATTCGCCTCTGCTCA
TGGCATGACACTCTTTGAATACATTAATTCAAAGGAACCGTTCGGTGAGCTGTTTAACCG
GGCAATGTCAGAAGCCTCTACCCTGACCATGAAGAAAGTTTTAGAAGTTTATAGAGGATT
TGAAGATGTAAATACTTTAGTGGATGTTGGAGGAGGAATAGGAACTGTTATAAGTCTAGT
GGTTTCCAAGTATCCTCACATCAAAGGCATCAATTTTGACCTACCCTCAGTATTAGCCCA
TCCTTCTGTTTATCCAGGAGTGGAGAATGTTTCAGGAGATATGTTTAAAGAAATTCCAAA
CGGAGATGCCATCTTCTTGAAAGTAACTTCAAATATACGCTTATAGTCTTTCATAACAAA
TTACTAATTTCATTGTTTAAGATAGATATTGACTATGAAATAAA*TGGATAATTTGACAG
TGGATACTACATGATTGGACAGAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4CD93JQ 772 0 0
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CTAAGCGAAGTCTATTTTAAGAGTTGGTTAGTAACTACGACTTTCTTAGCATTCATACAA
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TCAGAAGCCTCTACCCTGACCATGAAGAAAGTTTTAGAAGTTTATAGAGGATTTGAAGAT
GTAAATACTTTAGTGGATGTTGGAGGAGGAATAGGAACTGTTATAAGTCTAGTGGTTTCC
AAGTATCCTCACATCAAAGGCATCAATTTTGACCTACCCTCAGTATTAGCCCATCCTTCT
GTTTATCCAGGAGTGGAGAATGTTTCAGGAGATATGTTTAAAGAAATTCCAAACGGAGAT
GCCATCTTCTTGAAAGTAACTTCAAATATACGCTTATAGTCTTTCATAACAAATTACTAA
TTTCATTGTTTAAGATAGATATTGACTATGAAATAAAATGGATAATTTGACAGTGGATAC
TACATGATTGGACAGATGAAGATTGTATAAAAATTCTAAAAAATTGCTGGCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL6540Contig1 860 2 1 U
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TTATGAAGTCAAACGGGCTTTTTACAGACAAAACAGAGCTTTTAAAGGGTTACTTAAACG
AGTTGTTGTTGTTGTCGTCGGGGAGAAACAGATATCTAAAACGAGAATCAAAGGGGAGTA
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AGGCTGCTTGATGTGGAGGGAGGTACTTCGCTATCCAGACCGCCAAGTTCGAATCCTCCA
CCAAACTCTTGGCGTAACAATGGACCATTTTGGGTACCAAGAGCTTCCCTTTGCTGCTCA
GCCCTACAGATGCTTGTATGAACTCCCTTTGAGCTTCTAGTAGCTCTTCCTTCACTCCTT
TGGCTGTGTAGATCCTCACCGCAGGGGAAGAGTACATTCCACAGCTTAGGGCAAAGGCGA
GAAGAGGTTCATGAGTATCAATGCTTGCCTTGCGTTGTTCTTCTGATACTTTCAGCTTGT
GGATGGCAAGAAGCAGAGCAATTTGTGGCCTGTGCGTAGGAGGTTTCATCTTCAGTATCA
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TCAAGGAGAAGAGTTTCAAGTCGCTTTTTGGGACACCATAAGCCAAATACGCATGCATGA
TCAATGCGTTGTAAAGGTTAATCCAGAAAGCTAGCTTCTCATTGCAGCTCAAATGAATTG
GGTTCACTCTAGCAAGTTGC


BQ
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AF RR4A039JQ U 1
AF RR4A039JQD U 1
BS 1 860 RR4A039JQ

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TTATGAAGTCAAACGGGCTTTTTACAGACAAAACAGAGCTTTTAAAGGGTTACTTAAACG
AGTTGTTGTTGTTGTCGTCGGGGAGAAACAGATATCTAAAACGAGAATCAAAGGGGAGTA
TTCCACAGTTACGTGAGGCAAGAAGGCTTTGTCTTCTCTGAAAGATGCATTGTTCCACAA
AGGCTGCTTGATGTGGAGGGAGGTACTTCGCTATCCAGACCGCCAAGTTCGAATCCTCCA
CCAAACTCTTGGCGTAACAATGGACCATTTTGGGTACCAAGAGCTTCCCTTTGCTGCTCA
GCCCTACAGATGCTTGTATGAACTCCCTTTGAGCTTCTAGTAGCTCTTCCTTCACTCCTT
TGGCTGTGTAGATCCTCACCGCAGGGGAAGAGTACATTCCACAGCTTAGGGCAAAGGCGA
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CATACTCCATTGCCGCTGCAGTATATGAATGCCCTCCAACCGTATAAGCAGCCTTTTGCA
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GGTTCACTCTAGCAAGTTGC

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DS 

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CGACAACATTTTTTCACATATATTTTATTTTTTTAAATGTACACTGATAAGCCCCAAAAC
TAAGCTGGGAATAATAATATGATCATGTTGCTGAACACGGCTCCTTATGGCTCTTGGTTC
TTATGAAGTCAAACGGGCTTTTTACAGACAAAACAGAGCTTTTAAAGGGTTACTTAGACG
AGTTGTTGTTGTTGTCGTCGGGGAGAAACAGATATCTAAAACGAGAATCAAAGGGGAGTA
TTCCACAGTTACGTGAGGCAAGAAGGCTTTGTCTTCTCTGAGAGATGCATTGTTCCACAA
AGGCTGCTTGATGTGGAGGGAGGTACTTCGCTATCCAGACCGCCAAGTTCGAATCCTCCA
CCAAACTCTTGGCGTAACAATGGACCATTTTGGGTACCAAGAGCTTCCCTTTGCTGCTCA
GCCCTACAGATGCTTGTATGAACTCCCTTTGAGCTTCTAGTAGCTCTTCCTTCACTCCTT
TGGCTGTGTAGATCCTCACCGCAGGGGAAGAGTACATTCCACAGCTTAGGGCAAAGGCGA
GAAGAGGTTCATGAGTATCAATGCTTGCCTTGCGTTGTTCTTCTGATACTTTCAGCTTGT
GGATGGCAAGAAGCAGAGCAATTTGTGGCCTGTGCGTAGGAGGTTTCATCTTCAGTATCA
CATACTCCATTGCCGCTGCAGTATATGAATGCCCTCCAACCGTATAAGCAGCCTTTTGCA
TCAAGGAGAAGAGTTTCAAGTCGCTTTTTGGGACACCATAAGCCAAATACGCATGCATGA
TCAATGCGTTGTAAAGGTTAATCCAGAAAGCTAGCTTCTCATTGCAGCTCAAATGAATTG
GGTTCACTCTAGC

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

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ATGATATGGAGATAACATTTCAAGCTCTTCAGGAAACTGATATTGGGAGGCATGTGAATA
AAGTTCGGAAGCATCAATCGAACGAAGTTCGGAGACTAGCTAAACAGCTTGTCAAAAAAT
GGAAGTAAACAGTGGATGAATGGGTCAAACTTAACCCGCCTGGTGATTTTGAACCTCCGA
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AGTGAAATCTTAATATGTTTCAAGAGTTTGGAGTTAAGTTGATCGGTACACTTGTTTTCC
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TTTTATGAATAATAGTTTCGAAAAACCAAGGTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D351TF U 1
AF RR4D351JQ C 312
BS 1 724 RR4D351TF
BS 725 997 RR4D351JQ

RD RR4D351TF 724 0 0
GGGGAAGAAGAAGAAGAGAAAGCCGTTAATGGTGATGACGAAGAGGGTGAGGATGATGAT
GGTTATATCCGTTTGCTGGTTTGTTTGATGATGAGCAGAAGAGTGTTCTTGAAATCAAGG
AGAGGCTTGAAGATCCTGATCTGTCTGAAGAAGATTTGGTTGAGCTGCTTCAGAATCTGG
ATGATATGGAGATAACATTTCAAGCTCTTCAGGAAACTGATATTGGGAGGCATGTGAATA
AAGTTCGGAAGCATCAATCGAACGAAGTTCGGAGACTAGCTAAACAGCTTGTCAAAAAAT
GGAAGTAAACAGTGGATGAATGGGTCAAACTTAACCCGCCTGGTGATTTTGAACCTCCGA
GTTTGATAGCTGACGAGGACTCACCGCAGCAGAGAGCAGCTCTCCGTAATGGTAACCGTC
AACAGGTTCCTGATTTTGGGTATTCACCGGTTCCTCAGTCTCAGAATGGGTATTCAAGTT
CAAGCAGGAACAGTAACATTAGTAGCGAGCCAGAGAGGAAGCCAAGACCTGTTGCTCCTC
CTCCTAGGAGAGAGTCTCCTTCTCAAGCTAAACCTTCTCGTCCCATTCAGAGGGAGAAGG
AGCACATGAAATTGATTTTGACTCAGCTAGGAAAAGACTGCAACAAAACTACCGACAAGC
TGAGAATACTAAAAAGCAAAGGACTATACAGGTGATGGACATTCATGAGATACCTAAACC
TAAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4D351JQ 686 0 0
GTGGATGAATGGGTCAAACTTAACCCGCCTGGTGATTTTGAACCTCCGAGTTTGATAGCT
GACGAGGACTCACCGCAGCAGAGAGCAGCTCTCCGTAATGGTAACCGTCAACAGGTTCCT
GATTTTGGGTATTCACCGGTTCCTCAGTCTCAGAATGGGTATTCAAGTTCAAGCAGGAAC
AGTAACATTAGTAGCGAGCCAGAGAGGAAGCCAAGACCTGTTGCTCCTCCTCCTAGGAGA
GAGTCTCCTTCTCAAGCTAAACCTTCTCGTCCCATTCAGAGGGAGAAGGAGCACATGAAA
TTGATTTTGACTCAGCTAGGAAAAGACTGCAACAAAACTACCGACAAGCTGAGAATACTA
AAAAGCAAAGGACTATACAGGTGATGGACATTCATGAGATACCTAAACCTAAGAAAGGTG
GATTTTTTCCAAGAAGAGGCGGCAGTTCTCAAGGAGGTGGTAGACACTGGTAAAATTGAG
TATGAGAGAGAACAGAGAACAAAGCTCTGTTTTTGAGACACAAGAAGAAAGTGAAATCTT
AATATGTTTCAAGAGTTTGGAGTTAAGTTGATCGGTACACTTGTTTTCCATTTTGTTGTT
ACTTTTTCTTTAAAAAAAAACATCTGATTAAGAACATAATTTTCTTGGATTTTATGAATA
ATAGTTTCGAAAAACCAAGGTTAAGG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL6542Contig1 738 2 4 U
GATGCGCTTCATATTCGCATGGAGTTCGCTCCCAGAAATATAGCTACCCCTACCCCCTCA
CGTCAATCCCACGAGCCTCTTATCCATTCTTATTCGATCACAGCGAGGGAGCAAGTCAAA
ATAGAAAAACTCACATTCATTGGGTTTAGGGATAATCAGGCTCGAACTGATGACTTCCAC
CACGTCAAGGTGACACTCTACCGCTGAGTTATATCCCTTCCCCCATCAAGAAATAGAACT
GACTAATCCTAAGTCAAAGGGTCGAGAAACTCAAGGCCACTATTCTTGAACAACTTGGAT
TGGAGCCGGGCTTTCCTTTCGCACTATTACGGGTATGAAATGAAAATAATGGAAAAAGTT
GGATTCAATTGTCAACTACTCCTATCGGAAATAGGATTGACTACGGATTCGAGCCATAGC
ACATGGTTTCATAAAACCGTACGATTCTCCCGATCTAAATCAAGCCGGTTTTACATGAAG
AAGATTTTACTCAGCATGTTCTATTCGATACGGGTAGGAGAAACGGTATTCTTTTCTTAA
ACTTAAAAAAATAGAGAAATCAGAACCAAGTCAAGATGATACGGATTAATCCTTTATTCT
TGCGCCAAAGATCTTCCTATTTCCAAAGGAACTGGAGTTACATCTCTTTTCCATTTCCAT
TCAAGAGTTCTTATGTGTTTCCACGCCCCTTTAAGACCCCGAAAAATTAACAAATTCCCT
TTTCTTAGGAACACGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D313TF U 1
AF RR4D313JQ C 331
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BS 706 706 RR4D313JQ
BS 707 716 RR4D313TF
BS 717 738 RR4D313JQ

RD RR4D313TF 716 0 0
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CGTCAATCCCACGAGCCTCTTATCCATTCTTATTCGATCACAGCGAGGGAGCAAGTCAAA
ATAGAAAAACTCACATTCATTGGGTTTAGGGATAATCAGGCTCGAACTGATGACTTCCAC
CACGTCAAGGTGACACTCTACCGCTGAGTTATATCCCTTCCCCCATCAAGAAATAGAACT
GACTAATCCTAAGTCAAAGGGTCGAGAAACTCAAGGCCACTATTCTTGAACAACTTGGAT
TGGAGCCGGGCTTTCCTTTCGCACTATTACGGGTATGAAATGAAAATAATGGAAAAAGTT
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AAGATTTTACTCAGCATGTTCTATTCGATACGGGTAGGAGAAACGGTATTCTTTTCTTAA
ACTTAAAAAAATAGAGAAATCAGAACCAAGTCAAGATGATACGGATTAATCCTTTATTCT
TGCGCCAAAGATCTTCCTATTTCCAAAGGAACTGGAGTTACATCTCTTTTCCATTTCCAT
TCAAGAGTTCTTATGTGTTTCCACGCCCCTTTAAGACCCCGAAAA*TTAACAAATT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4D313JQ 408 0 0
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ATAGGATTGACTACGGATTCGAGCCATAGCACATGGTTTCATAAAACCGTACGATTCTCC
CGATCTAAATCAAGCCGGTTTTACATGAAGAAGATTTTACTCAGCATGTTCTATTCGATA
CGGGTAGGAGAAACGGTATTCTTTTCTTAAACTTAAAAAAATAGAGAAATCAGAACCAAG
TCAAGATGATACGGATTAATCCTTTATTCTTGCGCCAAAGATCTTCCTATTTCCAAAGGA
ACTGGAGTTACATCTCTTTTCCATTTCCATTCAAGAGTTCTTATGTGTTTCCACGCCCCT
TTAAGACCCCGAAAAATTAACAAATTCCCTTTTCTTAGGAACACGTGC

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 2

CO CL6543Contig1 1206 2 6 U
GGGTAATGCAGCCGCAACTAAAAATGCTGTGAAACCACCGGATATTATTTGTACATTGCA
GGACAAAGGTTCAGGGAATAAGCTCAAAAAACCTTTAAAGGATGGGGATAAGCATTCTAG
CGAAAATAAAGCTGCCTCTCAAGCAACTGTCTCCAAGGCAGCTGCAGATGCTTCTCAGCC
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TATGGTCAAAACTGCAGGAGAGGAGGCTGAGCAGGCTAGGGAGGGTGCAAAGGATGTTCG
TAATATGCCAGACACGTCCGTTGCGGAGAAGGCCATTGGATCAGCTTCTGTACCCGAAAA
TGGAACAGATGGTGAAAATCCAAATAAATAAGGAAGTAAAGAGAAGAATGTTTGTAAAGG
GACAAAAGACAAACATAACACTGATAAGCTTAAGCGTGCAGCTATCTCTGCTCTCTCAGC
TGCAGCAGTAAAGGCAAAGCATCTTGCGAAGCTTGAAGAAGATCAAATCCGACAACTTTC
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CCGTGAAAGAGCACAGATCATAGCGGCTCGTCTCGGTGCCCCGCCTTCAGTATCCTCAAA
AGCATCACTACCAGCAAACAGAATTGCTGCAAATTTTGCTAATGTGGCTCAGAGACCTCC
CATCGGCATGACCTTTCCACGCCCACCAATGCCAAGACCTCCAGGACCAGGTACATGAAC
TTTATCATTCCCTGTTCCTGAAGTTCAGATCCAGCTCCATCCAGGATCAGACAGTTGTTT
TTTCGGTTTAGTGGTTCCACATGATAGAGTTCAGATTCGCGGGGTAGCTCCTTATGTTAT
ATTTGTAAGACCAGGTACATTGTCCCACCTCTTTCGGCTTCAACCTATGAGCTTTGGTTT
ATTTTTCTGGAGATTTGATTTATCGGACTTATGTAGGAGATGAAGTTAGTTAAGGGTTGT
AGACCCATCAGTTAATGTTTAATGTAAGCGACGAATGGAACATGTGGAGATATGTGAATG
TGTTTTATTTATGGTTCTATGAACACTGAGCAGCGATATAAGATTCTGCAGAAGGTTTGA
ATGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FJ52TF U 1
AF RR4FJ52JQ C 509
BS 1 642 RR4FJ52TF
BS 643 643 RR4FJ52JQ
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BS 722 736 RR4FJ52TF
BS 737 1206 RR4FJ52JQ

RD RR4FJ52TF 736 0 0
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GGACAAAGGTTCAGGGAATAAGCTCAAAAAACCTTTAAAGGATGGGGATAAGCATTCTAG
CGAAAATAAAGCTGCCTCTCAAGCAACTGTCTCCAAGGCAGCTGCAGATGCTTCTCAGCC
AGAAGCATCAAAAGATGTGGAGATGAAGGAAGCATCACAGTCCGAGAAGGATCCTCAAGA
TATGGTCAAAACTGCAGGAGAGGAGGCTGAGCAGGCTAGGGAGGGTGCAAAGGATGTTCG
TAATATGCCAGACACGTCCGTTGCGGAGAAGGCCATTGGATCAGCTTCTGTACCCGAAAA
TGGAACAGATGGTGAAAATCCAAATAAATAAGGAAGTAAAGAGAAGAATGTTTGTAAAGG
GACAAAAGACAAACATAACACTGATAAGCTTAAGCGTGCAGCTATCTCTGCTCTCTCAGC
TGCAGCAGTAAAGGCAAAGCATCTTGCGAAGCTTGAAGAAGATCAAATCCGACAACTTTC
TGGATCATTGATAGAGAAGCAGTTACATAAACTAGAAGCAAAGCTATCTATCTTCAACGA
CGCTGAAAGCGTGACAGCGAGGGTAAGAGAGCAATTAGAAAG*TCAAGGCAACGGCTATA
CCGTGAAAGAGCACAGATCATAGCGGCTCGTCTCGGTGCCCCGCCTTCAGTATCCTCAAA
*GCATCACTACCAGCA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4FJ52JQ 698 0 0
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CGTCTCGGTGCCCCGCCTTCAGTATCCTCAAAAGCATCACTACCAGCAAACAGAATTGCT
GCAAATTTTGCTAATGTGGCTCAGAGACCTCCCATCGGCATGACCTTTCCACGCCCACCA
ATGCCAAGACCTCCAGGACCAGGTACATGAACTTTATCATTCCCTGTTCCTGAAGTTCAG
ATCCAGCTCCATCCAGGATCAGACAGTTGTTTTTTCGGTTTAGTGGTTCCACATGATAGA
GTTCAGATTCGCGGGGTAGCTCCTTATGTTATATTTGTAAGACCAGGTACATTGTCCCAC
CTCTTTCGGCTTCAACCTATGAGCTTTGGTTTATTTTTCTGGAGATTTGATTTATCGGAC
TTATGTAGGAGATGAAGTTAGTTAAGGGTTGTAGACCCATCAGTTAATGTTTAATGTAAG
CGACGAATGGAACATGTGGAGATATGTGAATGTGTTTTATTTATGGTTCTATGAACACTG
AGCAGCGATATAAGATTCTGCAGAAGGTTTGAATGTTT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6544Contig1 741 2 2 U
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CAGTGGAAGATAAGGTGAAGAGGCTTGATGCTGAGCTCTGCAAATACAAAGACCAGATCA
AAAGGACCAGACCTGGTCCTGCTCAAGAAGCTATCAAAGCTCGCGCTATGCGAGTTCTCA
AGATTCAAGATATTGATAATTTACAAGATGAAATGATGGACTTAATGGATGTGAGCTCTG
AAATTCAAGATTCACTGGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACC
TCATGGGCGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACGGAG
TGCCTTCCTATCTCCAACCCGATAAGGAACCGGATCTTGATGAGGAACTTGACTTGCCTC
CTCCACCAGTAAGGACAACAACTGGAGCTCAACCTGAACGAGCTGCTCAAAAGGCTGAGG
ATGAATGGGGATTACCCGCGGTACCACGTGCTTCACTTCGGGGTTAAATTCACACTTTAC
ACTTTTCATTTGTGAAAGCTACTATTGTTTTTTTTTATAAATCCCTTACTCATGTGATAT
AATACGTTTTGTGCATAACAGTCTCATAGACCTTGGATCCTCGATTTGGTTATGGTTAGT
TATGTATGATCCGTTTCTCAC


BQ
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AF RR4AH14JQ C 1
AF RR4AH14TF U 1
BS 1 734 RR4AH14TF
BS 735 741 RR4AH14JQ

RD RR4AH14JQ 741 0 0
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AAATTCAAGATTCACTGGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACC
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AATACGTTTTGTGCATAACAGTCTCATAGACCTTGGATCCTCGATTTGGTTATGGTTAGT
TATGTATGATCCGTTTCTCAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4AH14TF 734 0 0
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ACAAAGAGCCTCCACCGTCTATCCAGGATGCTTCTGATCGGATCAATAAAAGAGGAGAGT
CAGTGGAAGATAAGGTGAAGAGGCTTGATGCTGAGCTCTGCAAATACAAAGACCAGATCA
AAAGGACCAGACCTGGTCCTGCTCAAGAAGCTATCAAAGCTCGCGCTATGCGAGTTCTCA
AGATTCAAGATATTGATAATTTACAAGATGAAATGATGGACTTAATGGATGTGAGCTCTG
AAATTCAAGATTCACTGGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACC
TCATGGGCGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACGGAG
TGCCTTCCTATCTCCAACCCGATAAGGAACCGGATCTTGATGAGGAACTTGACTTGCCTC
CTCCACCAGTAAGGACAACAACTGGAGCTCAACCTGAACGAGCTGCTCAAAAGGCTGAGG
ATGAATGGGGATTACCCGCGGTACCACGTGCTTCACTTCGGGGTTAAATTCACACTTTAC
ACTTTTCATTTGTGAAAGCTACTATTGTTTTTTTTTATAAATCCCTTACTCATGTGATAT
AATACGTTTTGTGCATAACAGTCTCATAGACCTTGGATCCTCGATTTGGTTATGGTTAGT
TATGTATGATCCGT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6545Contig1 1052 2 2 U
GGATGGCTCTGTTTCAGGATATGATGTCACTTTCCTCGACTCGTTCGTCCTTCCACTCTC
TCCCCAGGAGACTCTCGCCTCAGCGGCCTCATCCCGTGAAAAAGTCCCGTTCTATTTGCA
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TTAAAGCAATCGCCAACAGCTCCTTGGGAGAATCTCTGCGGCGGAGATTAGAAGAAAAAA
AGAAAGAAGCCCTGGAGAACACTTCAAGATTCAACGCCAGAGCTCAGAAGGCTAGAGCCG
ACAGCAAGTGGTATGGACAAGAACGTCCCCGTTGGTTTGGTCCCATCCCATATGATTACC
CGTCTTACCTTACCGGAGAGCTTCCTGGTGATTACGGATTCGACATTGCAGGTCTTGGCA
AGGAACGTTTGAACTTTGATAAGTACTTCAACTTTGAGATACTTCATGCTCGTTGGGCCA
TGCTTGCAGCGTTGGGTGCTCTAATCCCAGAAATGTTTGATCTCACTGGAGCTTTTCATT
TTGCTGAACCTGTATGGTGGCGAGTCGGTTATTCTAAGCTTCAGGGAGAGACGTTGGACT
ACCTTGGGATCCCAGGGCTTCACGTAGCTGGAAGCCAAAGTGTCATTGTTATAGCCATTT
GCCAAGCACTCTTGATGGTAGGACCTGAATACGCAAGATACTGTGGCATTGAGGCCTTAG
AGCCACTGGGAATATACTTGCCAGGAGACATAAACTATCCAGGAGGAACGCTTTTTGATC
CCTTGAACCTTTCTCAAGACCCGGTAGCTTTTGAAGAGCTTAAGGTCAAGGAGATCAAAA
ACGGGAGACTAGCGATGGTGGCGTGGCTTGGATTCTATGCACAAGCTGCTTTCACAGGCA
AAGGACCTGTGCAAAATCTCGTTGACCATGTCTCTGATCCACTACATAACAATCTGCTTG
CCACGCTTCATATATGAAAAACAGAGACTGTGTACTGTGTACATATATATATACATGTCA
AAAAGACAATGCAATGAAATATGTTCTGTGTC


BQ
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AF RR4EJ63TF U 1
AF RR4EJ63JQ C 341
BS 1 677 RR4EJ63TF
BS 678 1052 RR4EJ63JQ

RD RR4EJ63TF 677 0 0
GGATGGCTCTGTTTCAGGATATGATGTCACTTTCCTCGACTCGTTCGTCCTTCCACTCTC
TCCCCAGGAGACTCTCGCCTCAGCGGCCTCATCCCGTGAAAAAGTCCCGTTCTATTTGCA
GAGCTTCATGGCAAGAGCTCGCCGGTGTATTGGTTTTCTCCGCGGTTCCTTTCACGGCGG
TTAAAGCAATCGCCAACAGCTCCTTGGGAGAATCTCTGCGGCGGAGATTAGAAGAAAAAA
AGAAAGAAGCCCTGGAGAACACTTCAAGATTCAACGCCAGAGCTCAGAAGGCTAGAGCCG
ACAGCAAGTGGTATGGACAAGAACGTCCCCGTTGGTTTGGTCCCATCCCATATGATTACC
CGTCTTACCTTACCGGAGAGCTTCCTGGTGATTACGGATTCGACATTGCAGGTCTTGGCA
AGGAACGTTTGAACTTTGATAAGTACTTCAACTTTGAGATACTTCATGCTCGTTGGGCCA
TGCTTGCAGCGTTGGGTGCTCTAATCCCAGAAATGTTTGATCTCACTGGAGCTTTTCATT
TTGCTGAACCTGTATGGTGGCGAGTCGGTTATTCTAAGCTTCAGGGAGAGACGTTGGACT
ACCTTGGGATCCCAGGGCTTCACGTAGCTGGAAGCCAAAGTGTCATTGTTATAGCCATTT
GCCAAGCACTCTTGATG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4EJ63JQ 712 0 0
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CGACATTGCAGGTCTTGGCAAGGAACGTTTGAACTTTGATAAGTACTTCAACTTTGAGAT
ACTTCATGCTCGTTGGGCCATGCTTGCAGCGTTGGGTGCTCTAATCCCAGAAATGTTTGA
TCTCACTGGAGCTTTTCATTTTGCTGAACCTGTATGGTGGCGAGTCGGTTATTCTAAGCT
TCAGGGAGAGACGTTGGACTACCTTGGGATCCCAGGGCTTCACGTAGCTGGAAGCCAAGG
TGTCATTGTTATAGCCATTTGCCAAGCACTCTTGATGGTAGGACCTGAATACGCAAGATA
CTGTGGCATTGAGGCCTTAGAGCCACTGGGAATATACTTGCCAGGAGACATAAACTATCC
AGGAGGAACGCTTTTTGATCCCTTGAACCTTTCTCAAGACCCGGTAGCTTTTGAAGAGCT
TAAGGTCAAGGAGATCAAAAACGGGAGACTAGCGATGGTGGCGTGGCTTGGATTCTATGC
ACAAGCTGCTTTCACAGGCAAAGGACCTGTGCAAAATCTCGTTGACCATGTCTCTGATCC
ACTACATAACAATCTGCTTGCCACGCTTCATATATGAAAAACAGAGACTGTGTACTGTGT
ACATATATATATACATGTCAAAAAGACAATGCAATGAAATATGTTCTGTGTC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL6546Contig1 841 2 2 U
ACTGTTATCGGTACAATTTGGTTTACAAGGGCAAGAAGCTGTTTACCTGAAGAAGGCCAA
AAATGGGGTTTCCTCATTTGGCTGATATTCAGCTACTCTGGCCTCCTCTGCATTGCGTGC
ATCTGTGTCGGGAAGTGGTTGGCGCGAAGACAGGTGCACGTATTACGTGCTCAGCAGGGA
ATCCCGAGTTCAGAGTTTGGGATTTTAGTTGACATGATTAGAGTCCCTGACTGGGCATTT
GAAGCCGCGGGCCAAGAGATGAGAGGCATAAGTCAAGATGCTGCTGCATACCATCCTGGT
CTTTACATGACTCCTGCTCAGACTGAAGCTGTCGAGGCACTCATTCAAGAACTTCCAAAG
TTCAGGTTAAAAGCTGTACCAGATGATTGCGGTGAATGCTTAATCTGCTTAGAGGAGTTC
CATATCGGACATGAGGTTAGAGGTTTACCTTGCGCCCATAATTTCCATGTTGAGTGCATA
GACCAGTGGCTGCGTTTAAACGTGAAATGTCCTCGGTGCCGGTGCTCAGTTTTTCCAGAC
CTTGATCTCAGCGCATTATCCAACCTCCAGAGCTCATCAACACAGCAGCCCCCACAGGGG
GACAACACGGAAACAACAGAAGCTCGGTACATAAGAAGCCAACCACAAAGCGAGAGCTAC
TTTTTGAGACTTCAGTCTCTAATTCACCCAGTTCACACAGACACTGCTCTGGAGACCGCA
GAGAACGGTGGGGTTCCTCCTGTCTTGGCTGGTCATCTCCATCAAGGAGATGAGAGACAG
AAGTGTGAGTCGAGTCTATGGTTATTCTACTACTCATTACTAACTCTCGACTGATTGAAG
G


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10 

AF RR4D184TF U 1
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GAAGCCGCGGGCCAAGAGATGAGAGGCATAAGTCAAGATGCTGCTGCATACCATCCTGGT
CTTTACATGACTCCTGCTCAGACTGAAGCTGTCGAGGCACTCATTCAAGAACTTCCAAAG
TTCAGGTTAAAAGCTGTACCAGATGATTGCGGTGAATGCTTAATCTGCTTAGAGGAGTTC
CATATCGGACATGAGGTTAGAGGTTTACCTTGCGCCCATAATTTCCATGTTGAGTGCATA
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CTTGATCTCAGCGCATTATCCAACCTCCAGAGCTCATCAACACAGCAGCCCCCACAGGGG
GACAACACGGAAACAACAGAAGCTCGGTA

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DS 

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GACTCCTGCTCAGACTGAAGCTGTCGAGGCACTCATTCAAGAACTTCCAAAGTTCAGGTT
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ACATGAGGTTAGAGGTTTACCTTGCGCCCATAATTTCCATGTTGAGTGCATAGACCAGTG
GCTGCGTTTAAACGTGAAATGTCCTCGGTGCCGGTGCTCAGTTTTTCCAGACCTTGATCT
CAGCGCATTATCCAACCTCCAGAGCTCATCAACACAGCAGCCCCCACAGGGGGACAACAC
GGAAACAACAGAAGCTCGGTACATAAGAAGCCAACCACAAAGCGAGAGCTACTTTTTGAG
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GTCGAGTCTATGGTTATTCTACTACTCATTACTAACTCTCGACTGATTGAAGG

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

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GCTAAGATGAGCGGTGGCCTCCTGGCGCGGCTCCTTCTCTTCTTTCTAGTTCCGGTGATG
ATTCAGGTCGGTGAGGCTATATTGCAAGGTATGCCTCCCACTGATACAAAGTGTGTGTGT
CAGGAAATCAATAGCAATGTCGACATCATCTCCGAGGATCATTCCACTATCTCAGTTAAG
GTGACCTCCCCATGCAACAAAAATATTAGCATCAACGTTGACCGCATCAAAACTACTCAG
AAAGAAAAGATCGAGGGAGTGGAGGTGGAGATTAGAAAACTTGAAGGCACAGTCAAAGCC
ATCCATGAAAATCTACTCAAGCTAATGAACGGAGACGCAGATGTAATAACAGTGAGTGCG
AACACGAACACGCTATTAGCTTCGTACAGTATGATGGCGGTGGTTTTTTGCATTATGATC
TCTGTTTATCAAGTAGTCTACTTGAAGGCATACTTAGAGACGAAGAAACTTACATAAAGA
TTTGTGATTCATCGAGATCCTTTTCCATAATTTTTTTATGTTGAATTATATTCAGGTTCC
TCCTTTCTT


BQ
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AF RR4DP13TF U 1
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CAGGAAATCAATAGCAATGTCGACATCATCTCCGAGGATCATTCCACTATCTCAGTTAAG
GTGACCTCCCCATGCAACAAAAATATTAGCATCAACGTTGACCGCATCAAAACTACTCAG
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ATCCATGAAAATCTACTCAAGCTAATGAACGGAGACGCAGATGTAATAACAGTGAGTGCG
AACACTAACACGCTATTAGCTTCGTACAGTATGATGGCGGTGGTTTTTTGCATTATGATC
TCTGTTTATCAAGTA

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR4DP13JQ 507 0 0
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TCCACTATTTCAGTTAAGGTGACCTCCCCATGCAACAAAAATATTAGCATCAACGTTGAC
CGCATCAAAACTACTCAGAAAGAAAAGATCGAGGGAGTGGAGGTGGAGATTAGAAAACTT
GAAGGCACAGTCAAAGCCATCCATGAAAATCTACTCAAGCTAATGAACGGAGACGCAGAT
GTAATAACAGTGAGTGCGAACACGAACACGCTATTAGCTTCGTACAGTATGATGGCGGTG
GTTTTTTGCATTATGATCTCTGTTTATCAAGTAGTCTACTTGAAGGCATACTTAGAGACG
AAGAAACTTACATAAAGATTTGTGATTCATCGAGATCCTTTTCCATAATTTTTTTATGTT
GAATTATATTCAGGTTCCTCCTTTCTT

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL6548Contig1 982 2 4 U
GGACAGACCAGATGTATGCCGCAACATCTTCGGTTCTGTCTCCAACACCACAAAGTCTCT
TCCTTTCCTCTCATCTTCCTCAAATCCAGTTCCTTTATCGGATTAAATTTCTGGGTTCTC
CCGTAACGAACCGGTGCTATGGCGGCGGCGGTTCGTCGTATAACCGACGGAGCTGCGATG
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TTCTTGGTGTGTCTCCATCAGCGACTCCTCAGGGTATAAAGAGGGCTTACCGCAAACTTG
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TTGGGGAAGAGTTTGTGGAGTTTCTTGAGAAAGAACTAAACATAACCGATGAAGACAATG
ATGGATCAAGCAAAAAAGGAGAAAGATTTGATTTTGATGAACGCTCCTCAACGGGGAAAT
CACCAGGGAATAGTAGTAATAGCACGAAGAACAGTATAGAAGACAATATTGATGAGATCG
AAGCAACGCTAGCTCAGTTGAAAAAAGATCTTGGCTTGCAATAATAAACAATCTCGAATA
TTGCAGTGAAATGTCTTCTTCTTAGCTTGGTTTAGATATTCTCATGTTTCTTTCAAGCCA
TTAAAGATTTTGTCTCTAAAAGCGTTGAGAACGTGTATAATCTTATAGAATATTGTTTCA
TGAAAGCAATAGTCTTTTGTAT


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AF RR4BE18TF U 1
AF RR4BE18JQ C 123
BS 1 805 RR4BE18TF
BS 806 806 RR4BE18JQ
BS 807 861 RR4BE18TF
BS 862 982 RR4BE18JQ

RD RR4BE18TF 861 0 0
GGACAGACCAGATGTATGCCGCAACATCTTCGGTTCTGTCTCCAACACCACAAAGTCTCT
TCCTTTCCTCTCATCTTCCTCAAATCCAGTTCCTTTATCGGATTAAATTTCTGGGTTCTC
CCGTAACGAACCGGTGCTATGGCGGCGGCGGTTCGTCGTATAACCGACGGAGCTGCGATG
AAAGACGACGACAGAGGAATCGAATCATGGTGCCGAGAGCTAGAGCATCTCCTTACGAGG
TTCTTGGTGTGTCTCCATCAGCGACTCCTCAGGGTATAAAGAGGGCTTACCGCAAACTTG
CTCTCAAGTATCACCCTGATGTTAATAAAGAGGCAAATGCGCAGGAGAAGTTTCTGAGGA
TAAAGCATGCGTACACCACTTTGATTAACTCTGATTCACGGCGTAAGTACGGTTCAGATA
CTCGTGCGTCGTCTGGTTACTCTACGGGTCAACAAACAAGCCGGAAAAGCAATAGTTAAG
TCGAGGATTTCTACGGGCTTGGGGATTTCTTCAAAGATCTTCAAGAAGAGTTCAAGAACT
GGGAAGCTAGTGCGTCTTCACAAGGAAAACCTAAAAGTCTTTGGGAAGAACTAGCGGAAA
TTGGGGAAGAGTTTGTGGAGTTTCTTGAGAAAGAACTAAACATAACCGATGAAGACAATG
ATGGATCAAGCAAAAAAGGAGAAAGATTTGATTTTGATGAACGCTCCTCAACGGGGAAAT
CACCAGGGAATAGTAGTAATAGCACGAAGAACAGTATAGAAGACAATATTGATGAGATCG
AAGCAACGCTAGCTCAGTTGAAAAA*GATCTTGGCTTGCAATAATAAACAATCTCGAATA
TTGCAGTGAAATGTCTTCTTC

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR4BE18JQ 860 0 0
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AGACGACGACAGAGGAATCGAATCATGGTGCCGAGAGCTAGAGCATCTCCTTACGAGGTT
CTTGGTGTGTCTCCATCAGCGACTCCTCAGGGTATAAAGAGGGCTTACCGCAAACTTGCT
CTCAAGTATCACCCTGATGTTAATAAAGAGGCAAATGCGCAGGAGAAGTTTCTGAGGATA
AAGCATGCGTACACCACTTTGATTAACTCTGATTCACGGCGTAAGTACGGTTCAGATACT
CGTGCGTCGTCTGGTTACTCTACGGGTCAACAAACAAGCCGGAAAAGCAATAGTTAAGTC
GAGGATTTCTACGGGCTTGGGGATTTCTTCAAAGATCTTCAAGAAGAGTTCAAGAACTGG
GAAGCTAGTGCGTCTTCACAAGGAAAACCTAAAAGTCTTTGGGAAGAACTAGCGGAAATT
GGGGAAGAGTTTGTGGAGTTTCTTGAGAAAGAACTAAACATAACCGATGAAGACAATGAT
GGATCAAGCAAAAAAGGAGAAAGATTTGATTTTGATGAACGCTCCTCAACGGGGAAATCA
CCAGGGAATAGTAGTAATAGCACGAAGAACAGTATAGAAGACAATATTGATGAGATCGAA
GCAACGCTAGCTCAGTTGAAAAAAGATCTTGGCTTGCAATAATAAACAATCTCGAATATT
GCAGTGAAATGTCTTCTTCTTAGCTTGGTTTAGATATTCTCATGTTTCTTTCAAGCCATT
AAAGATTTTGTCTCTAAAAGCGTTGAGAACGTGTATAATCTTATAGAATATTGTTTCATG
AAAGCAATAGTCTTTTGTAT

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6549Contig1 694 2 1 U
ACGCGCGCCACGTGGAAGGTCATTTCAGTAACTCCGTTCTGTTTGTTTCCCTTTTTGAAT
TTCGGCCAACTTTGCAATCTCCAGTTTTCATGGGGGGCGCGAATCCAAGGAATCTCGATA
GGTTAAGCAATCTGCCTGAATCGTTGCTGTGTGAGATCCTCTCTGATCTCCCCACCAAGG
AATCGGTTCGAACCAGCGTTCTATCAAAACGGTGTAGAAACCTCTGGTTAAATGTTGCAG
CACTGGACTTAGATTCCAACGACTTTTCAGATGATGACGTCTTTGTGAGTATCATGGATA
GGTTTCTGTGTTCTGAGAACGAGCAACACTTGGAGAGATTCAAGCTGAAATATGGGATTC
TTGACCATGATGAATCTCGTTTCAAGTCTTGGATCGATGCAGTGACTAGACGTAGGGTTC
TTCATCTCGCTCTTGCTATCGAGGGGCACGATGGTATCTTAGTCAAGATGCCTTCATCTC
TCTATTCATGTGAGAGTTTGGTGAGCTTAAATCTCTGCGACGTGTTCTTGGAACATCCTC
AATCTGTATTCTTACCTTGTGTCAAGATTATGCATCTAGGGAGGGTCATATACGACGTTG
ATTTGACTCTGGAGCCTGGTGATTCGACTCTGGAGACTTTAATATCAAGCTGTCCTGTCC
TCGAGCAGCTACCCATATTGCGTGGATTATATGA


BQ
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AF RR4A245TF U 170
AF RR4A245TFB U 1
BS 1 694 RR4A245TFB

RD RR4A245TF 404 0 0
CCCCACCAAGGAATCGGTTCGAACCAGCGTTCTATCAAAACGGTGTAGAAACCTCTGGTT
AAATGTTGCAGCACTGGACTTAGATTCCAACGACTTTTCAGATGATGACGTCTTTGTGAG
TATCATGGATAGGTTTCTGTGTTCTGAGAACGAGCAACACTTGGAGAGATTCAAGCTGAA
ATATGGGATTCTTGACCATGATGAATCTCGTTTCAAGTCTTGGATCGATGCAGTGACTAG
ACGTAGGGTTCTTCATCTCGCTCTTGCTATCGAGGG*CACGATGGTATCTTAGTCAAGAT
GCCTTCATCTCTCTATTCATGTGAGAGTTTGGTGAGCTTAA*TCTCTGCGACGTGTTCTT
GGA*CATCCTCAATCTGTATTCTTACCTTGTGTCA
GATATGATC

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4A245TFB 694 0 0
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TTCGGCCAACTTTGCAATCTCCAGTTTTCATGGGGGGCGCGAATCCAAGGAATCTCGATA
GGTTAAGCAATCTGCCTGAATCGTTGCTGTGTGAGATCCTCTCTGATCTCCCCACCAAGG
AATCGGTTCGAACCAGCGTTCTATCAAAACGGTGTAGAAACCTCTGGTTAAATGTTGCAG
CACTGGACTTAGATTCCAACGACTTTTCAGATGATGACGTCTTTGTGAGTATCATGGATA
GGTTTCTGTGTTCTGAGAACGAGCAACACTTGGAGAGATTCAAGCTGAAATATGGGATTC
TTGACCATGATGAATCTCGTTTCAAGTCTTGGATCGATGCAGTGACTAGACGTAGGGTTC
TTCATCTCGCTCTTGCTATCGAGGGGCACGATGGTATCTTAGTCAAGATGCCTTCATCTC
TCTATTCATGTGAGAGTTTGGTGAGCTTAAATCTCTGCGACGTGTTCTTGGAACATCCTC
AATCTGTATTCTTACCTTGTGTCAAGATTATGCATCTAGGGAGGGTCATATACGACGTTG
ATTTGACTCTGGAGCCTGGTGATTCGACTCTGGAGACTTTAATATCAAGCTGTCCTGTCC
TCGAGCAGCTACCCATATTGCGTGGATTATATGA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6550Contig1 1011 2 8 U
GACTCTTAGCTACGAGGCTCACATGACGGGTGCACCAATGGCTAGACCGCTCTTCTTCTC
GTTCCCTGAGTACACCAAATGTTACGGCTTGAGCACACAGTTCTTGCTAGGAAGCAGCTT
AATGATATCTCCGGTTCTCAAAAAAGGCAGAACACAAGTAAAAGCACTGTTCCCACCAGG
CTCTTGGTACCACATGTTCGACATGACTCAAGCCGTTGTGACCAAGACGGGGAAGCGCGT
GGCTCTCCCTGCTCCATTGAACTTCGTAAACGTTCATCTTTACCAAAACACTATATTACC
CATGCAAGAGGAGGGTTGATATCTAAAGAAGCGAGAACGACACCGTTTAGTCTCGTTATT
ACATTCCCTATGGGAGCTACCGAGGGATACGCTACGGGTAAGCTCTACCAAGACGAGGAC
GAGCTTCCGGAGATGAGGCTAGGAAACGGTCAGTCCACGTACGTTGACTTCTATGCTTCG
GTCGGAAATGGAACTGTGAAGATGTGGTCACAAGTGAAGGAAGGGAAGTTTGCGTTGAGC
AAAGGTTGGGTCATTGAGAAAGTTAGTGTTTCGGGACTTAAAGGGGCAGGGCCAGCTTCT
GAGGTTGAGATCAATGGAAATCCCATCTCGAACGAGGCTAAGAAGATTGAGGTAAGCTCG
AAGGAGCATACTTATGTGGTGGAGTTGGAAGAGGAAGGAGAGAACAAGAGTGTGATGGTT
GAAGTTAAGGGACTTGAGATGATGGTTGGTAAGGACTTTAACATGTCGTGGAAAATGGGT
ATTAATGGTGCAAATTAATTTGCATGTGAGAGTTTGGTGAAGTATTGGAGAAGAGAATGA
GATTATTTACTAGAGAAGGGTATGATCAGTCTTATTCGTTCGGATTATAAATGGGAACAG
AGGTTTGTTTTGAGATTGTGTCCCTCTTTTATCAGAAGATGTGTTGTTTTTCGTTGGAAT
GAAAAGTGAAACTAAAAATATTATAATTACATGACTTTAATTTCAGAAGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV49TF U 1
AF RR4DV49JQ C 293
BS 1 636 RR4DV49TF
BS 637 637 RR4DV49JQ
BS 638 651 RR4DV49TF
BS 652 652 RR4DV49JQ
BS 653 663 RR4DV49TF
BS 664 664 RR4DV49JQ
BS 665 687 RR4DV49TF
BS 688 1011 RR4DV49JQ

RD RR4DV49TF 687 0 0
GACTCTTAGCTACGAGGCTCACATGACGGGTGCACCAATGGCTAGACCGCTCTTCTTCTC
GTTCCCTGAGTACACCAAATGTTACGGCTTGAGCACACAGTTCTTGCTAGGAAGCAGCTT
AATGATATCTCCGGTTCTCAAAAAAGGCAGAACACAAGTAAAAGCACTGTTCCCACCAGG
CTCTTGGTACCACATGTTCGACATGACTCAAGCCGTTGTGACCAAGACGGGGAAGCGCGT
GGCTCTCCCTGCTCCATTGAACTTCGTAAACGTTCATCTTTACCAAAACACTATATTACC
CATGCAAGAGGAGGGTTGATATCTAAAGAAGCGAGAACGACACCGTTTAGTCTCGTTATT
ACATTCCCTATGGGAGCTACCGAGGGATACGCTACGGGTAAGCTCTACCAAGACGAGGAC
GAGCTTCCGGAGATGAGGCTAGGAAACGGTCAGTCCACGTACGTTGACTTCTATGCTTCG
GTCGGAAATGGAACTGTGAAGATGTGGTCACAAGTGAAGGAAGGGAAGTTTGCGTTGAGC
AAAGGTTGGGTCATTGAGAAAGTTAGTGTTTCGGGACTTAAAGGGGCAGGGCCAGCTTCT
GAGGTTGAGATCAATGGAAATCCCATCTCGAACGAG*CTAAGAAGATTGAG*TAAGCTCG
AAG*AGCATACTTATGTGGTGGAGTTG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4DV49JQ 719 0 0
ATATTACCCATGCAAGAGGAGGGTTGATATCTAAAGAAGCGAGAACGACACCGTTTAGTC
TCGTTATTACATTCCCTATGGGAGCTACCGAGGGATACGCTACGGGTAAGCTCTACCAAG
ACGAGGACGAGCTTCCGGAGATGAGGCTAGGAAACGGTCAGTCCACGTACGTTGACTTCT
ATGCTTCGGTCGGAAATGGAACTGTGAAGATGTGGTCACAAGTGAAGGAAGGGAAGTTTG
CGTTGAGCAAAGGTTGGGTCATTGAGAAAGTTAGTGTTTCGGGACTTAAAGGGGCAGGGC
CAGCTTCTGAGGTTGAGATCAATGGAAATCCCATCTCGAACGAGGCTAAGAAGATTGAGG
TAAGCTCGAAGGAGCATACTTATGTGGTGGAGTTGGAAGAGGAAGGAGAGAACAAGAGTG
TGATGGTTGAAGTTAAGGGACTTGAGATGATGGTTGGTAAGGACTTTAACATGTCGTGGA
AAATGGGTATTAATGGTGCAAATTAATTTGCATGTGAGAGTTTGGTGAAGTATTGGAGAA
GAGAATGAGATTATTTACTAGAGAAGGGTATGATCAGTCTTATTCGTTCGGATTATAAAT
GGGAACAGAGGTTTGTTTTGAGATTGTGTCCCTCTTTTATCAGAAGATGTGTTGTTTTTC
GTTGGAATGAAAAGTGAAACTAAAAATATTATAATTACATGACTTTAATTTCAGAAGCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL6551Contig1 401 2 1 U
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TATGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTG
ATTGCTTGCTCTGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTT
AAGGATGCTATTGAGAAACTCCTCATCTAAGGATGTGTTGGTGGGGTTATGAATGATGGG
TCTTTCTCCATTTAATGGAAAAGGCTTTGACTACTAAAGTGTGTTTGCGTGAGTTTTAGC
CGTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAATGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATCTA
GTCTTGAACAAGAACAATTATTTATAAATCGGGTTTCTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A047TFB U 1
AF RR4A047TF U 20
BS 1 401 RR4A047TFB

RD RR4A047TFB 401 0 0
GCTGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTCATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCCG
TATGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTG
ATTGCTTGCTCTGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTT
AAGGATGCTATTGAGAAACTCCTCATCTAAGGATGTGTTGGTGGGGTTATGAATGATGGG
TCTTTCTCCATTTAATGGAAAAGGCTTTGACTACTAAAGTGTGTTTGCGTGAGTTTTAGC
CGTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAATGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATCTA
GTCTTGAACAAGAACAATTATTTATAAATCGGGTTTCTAAG

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR4A047TF 382 0 0
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AGCAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGCTCTGTTACAT
CAAACGATGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTTAAGGATGCTATTGAGAAAC
TCCTCATCTAAGGATGTGTTGGTGGGGTTATGAATGATGGGTCTTTCTCCATTTAATGGA
AAAGGCTTTGACTACTAAAGTGTGTTTGCGTGAGTTTTAGCCGTATCTGTTTTTGAAGTT
TGTAATGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATCTAGTCTTGAACAAGAACAATT
ATTTATAAATCGGGTTTCTAAG

QA 1 382 1 382
DS 



AS 1 2

CO CL6552Contig1 842 2 6 U
GCCATCTGGTGGTCTTGTTCAGAAGGAAGAGAGCTTCCCTGAGAGACCCGGTGAACCAGA
GTGCCAGTACTATTTGAAAACAGGAGATTGTAAGTTTGGTACATCTTGCAAGTTTCATCA
TCCTCGACTTCGTGTTCCACCTACACCTAATTGCGTCCTCAGCTCCATTGGTCTTCATCT
ACGTCCGGGTGTGCAATGTCGCACTTTCTACGTACAAAACGGCTTCTGTAAGTTTGGATC
AACATGTAAATTTGATCATCCTGTGGGAGTCATCAGATACAATCCTTCTGCATCCTCCCT
CGCTGATGCACCCGTGGCTCCTTTCCCTCTCTTGGCCTCTTCTTCTTCGTCTGCTGCTGA
GCTCATTTCAGGGGATGATCCTTACTTGTCAACCTCAAGAAGCGCATCTAACAACATCTC
AGCCGGTTTGATATTCTCCCAGAGTGGCGTCTCAGTTCCATTCAATGACCTCCAGCTCTC
CACCCAGACCTCTCTTTCCCTAACCGGTACCAGAATCACAAGACAAGGCCGAGAAATCCG
TCGATCCTTTTAAAAAATAAAGGGTAAGCATATACGCAGGCCTCAGGATCATTCTTAATA
TTATATCATATATATATATAGAAGCATGTGATGTGAGATATTATAATCTCCCTACCCTAA
ACCCTACCTAAAAAAGAACAAGTCTAGTTGAGTAGAAGAACCGATTGAGAATCGAATCAC
ATATACCTAAGAGGAAATGTATATGTGCATATATATAAAAAAAAAAAACAAGAAAAGGCC
CTTTCTTTCTTATGTGTTGTGTGTGTATGTGTGTGTAAGGTTTCTATAGTGAGGTTTCTC
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4D068TF U 1
AF RR4D068JQ C 350
BS 1 674 RR4D068TF
BS 675 675 RR4D068JQ
BS 676 736 RR4D068TF
BS 737 737 RR4D068JQ
BS 738 756 RR4D068TF
BS 757 842 RR4D068JQ

RD RR4D068TF 756 0 0
GCCATCTGGTGGTCTTGTTCAGAAGGAAGAGAGCTTCCCTGAGAGACCCGGTGAACCAGA
GTGCCAGTACTATTTGAAAACAGGAGATTGTAAGTTTGGTACATCTTGCAAGTTTCATCA
TCCTCGACTTCGTGTTCCACCTACACCTAATTGCGTCCTCAGCTCCATTGGTCTTCATCT
ACGTCCGGGTGTGCAATGTCGCACTTTCTACGTACAAAACGGCTTCTGTAAGTTTGGATC
AACATGTAAATTTGATCATCCTGTGGGAGTCATCAGATACAATCCTTCTGCATCCTCCCT
CGCTGATGCACCCGTGGCTCCTTTCCCTCTCTTGGCCTCTTCTTCTTCGTCTGCTGCTGA
GCTCATTTCAGGGGATGATCCTTACTTGTCAACCTCAAGAAGCGCATCTAACAACATCTC
AGCCGGTTTGATATTCTCCCAGAGTGGCGTCTCAGTTCCATTCAATGACCTCCAGCTCTC
CACCCAGACCTCTCTTTCCCTAACCGGTACCAGAATCACAAGACAAGGCCGAGAAATCCG
TCGATCCTTTTAAAAAATAAAGGGTAAGCATATACGCAGGCCTCAGGATCATTCTTAATA
TTATATCATATATATATATAGAAGCATGTGATGTGAGATATTATAATCTCCCTACCCTAA
ACCCTACCTAAAAA*GAACAAGTCTAGTTGAGTAGAAGAACCGATTGAGAATCGAATCAC
ATATACCTAAGAGGAA*TGTATATGTGCATATATAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4D068JQ 493 0 0
TCTGCTGCTGAGCTCATTTCAGGGGATGATCCTTACTTGTCAACCTCAAGAAGCGCATCT
AACAACATTTCAGCCGGTTTGATATTCTCCCAGAGTGGCGTTTCAGTTCCATTCAATGAC
CTCCAGCTCTCCACCCAGACCTTTTTTTCCCTAACCGGTACCAGAATCACAAGACAAGGC
CGAGAAATCCGTCGATCCTTTTAAAAAATAAAGGGTAAGCATATACGCAGGCCTCAGGAT
CATTCTTAATATTATATCATATATATATATAGAAGCATGTGATGTGAGATATTATAATCT
CCCTACCCTAAACCCTACCTAAAAAAGAACAAGTCTAGTTGAGTAGAAGAACCGATTGAG
AATCGAATCACATATACCTAAGAGGAAATGTATATGTGCATATATATAAAAAAAAAAAAC
AAGAAAAGGCCCTTTCTTTCTTATGTGTTGTGTGTGTATGTGTGTGTAAGGTTTCTATAG
TGAGGTTTCTCTC

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL6553Contig1 935 2 4 U
CTTCGAGCTCCCAAGTCGCCGTCTTTCGTCAGGCTTCTTCCACGAAAGTTGTTGCAGAGC
AGGATCGTGATACGTGCTGCTTCGTCTTCTGCGGCTGGAAATCCACAGTCTGATGGTGAA
TTTAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTTAACCCTATAGAGGGATTTGATAAGATCAAGCAG
ACTTATGGAAGAAAACTTAAAGAAGCTCAGAGGAGTGGTGATGGAGCCACTGCTGCTCTA
CTTGAGAAAGCATATGATAAACTCATGTATTCCCAGTTAATGGATAGGAAAAAAGGTGTG
ACTTTCGGTTCGTTTAAGGTTTCCAAGGACATTAGATATGCTGATAAGCAGCCGATGATA
CCATGGGGTCCAAGGTATTCCAAGTCCCCCAAGAACGATATGTTGAATACAAACCGCTGC
AGTTCATGTCCTTTGTGTTTGTCTACAGAATTTTTGAGAAACTTAAATCCTTTGAAGGAC
CTTCAACTCCGACATATAACGAGGAAGGCGAAGAGAGCGGACGAGGATTGAAAATGGGAA
AGAGGCTTCTTCGGTCTCTTTCATTAGTTTTCGGTTCTATACTTGTGGCATCCTTGGCTT
ACACTGGGATCTTAAATGTTATTGAGTACATGGGTAGCTCCATACCCATAGTACTTTACA
ATAACCAGGAACTTATAGTGACGGCCTCATCGGCTTTGATGCTCTATGTCATAGCGTCGT
ATTACAGATAATGCGAGAGAGATCACAAAGAGCTTGCTTTGATCTACCAGGAGGTTTTTT
ATTTTGAGAAGTTTTTGATGTGTAGTCTGTGGCTGCTAGATGTTTAACAATTTGAGATGA
AGTTCTCTTTTCTTGGGAGAGATTGGATTTTTTATCTTTATAATATCTTATTGTGGAATC
AAGTAAAAGACTAGTTGTTGAAAAGTTTTGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A503TF U 1
AF RR4A503JQ C 39
BS 1 46 RR4A503TF
BS 47 47 RR4A503JQ
BS 48 776 RR4A503TF
BS 777 935 RR4A503JQ

RD RR4A503TF 776 0 0
CTTCGAGCTCCCAAGTCGCCGTCTTTCGTCAGGCTTCTTCCACGAAGGTTGTTGCAGAGC
AGGATCGTGATACGTGCTGCTTCGTCTTCTGCGGCTGGAAATCCACAGTCTGATGGTGAA
TTTAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTTAACCCTATAGAGGGATTTGATAAGATCAAGCAG
ACTTATGGAAGAAAACTTAAAGAAGCTCAGAGGAGTGGTGATGGAGCCACTGCTGCTCTA
CTTGAGAAAGCATATGATAAACTCATGTATTCCCAGTTAATGGATAGGAAAAAAGGTGTG
ACTTTCGGTTCGTTTAAGGTTTCCAAGGACATTAGATATGCTGATAAGCAGCCGATGATA
CCATGGGGTCCAAGGTATTCCAAGTCCCCCAAGAACGATATGTTGAATACAAACCGCTGC
AGTTCATGTCCTTTGTGTTTGTCTACAGAATTTTTGAGAAACTTAAATCCTTTGAAGGAC
CTTCAACTCCGACATATAACGAGGAAGGCGAAGAGAGCGGACGAGGATTGAAAATGGGAA
AGAGGCTTCTTCGGTCTCTTTCATTAGTTTTCGGTTCTATACTTGTGGCATCCTTGGCTT
ACACTGGGATCTTAAATGTTATTGAGTACATGGGTAGCTCCATACCCATAGTACTTTACA
ATAACCAGGAACTTATAGTGACGGCCTCATCGGCTTTGATGCTCTATGTCATAGCGTCGT
ATTACAGATAATGCGAGAGAGATCACAAAGAGCTTGCTTTGATCTACCAGGAGGTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4A503JQ 897 0 0
TCCACGAAAGTTGTTGCAGAGCAGGATCGTGATACGTGCTGCTTCGTCTTCTGCGGCTGG
AAATCCACAGTCTGATGGTGAATTTAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTTAACCCTATAGA
GGGATTTGATAAGATCAAGCAGACTTATGGAAGAAAACTTAAAGAAGCTCAGAGGAGTGG
TGATGGAGCCACTGCTGCTCTACTTGAGAAAGCATATGATAAACTCATGTATTCCCAGTT
AATGGATAGGAAAAAAGGTGTGACTTTCGGTTCGTTTAAGGTTTCCAAGGACATTAGATA
TGCTGATAAGCAGCCGATGATACCATGGGGTCCAAGGTATTCCAAGTCCCCCAAGAACGA
TATGTTGAATACAAACCGCTGCAGTTCATGTCCTTTGTGTTTGTCTACAGAATTTTTGAG
AAACTTAAATCCTTTGAAGGACCTTCAACTCCGACATATAACGAGGAAGGCGAAGAGAGC
GGACGAGGATTGAAAATGGGAAAGAGGCTTCTTCGGTCTCTTTCATTAGTTTTCGGTTCT
ATACTTGTGGCATCCTTGGCTTACACTGGGATCTTAAATGTTATTGAGTACATGGGTAGC
TCCATACCCATAGTACTTTACAATAACCAGGAACTTATAGTGACGGCCTCATCGGCTTTG
ATGCTCTATGTCATAGCGTCGTATTACAGATAATGCGAGAGAGATCACAAAGAGCTTGCT
TTGATCTACCAGGAGGTTTTTTATTTTGAGAAGTTTTTGATGTGTAGTCTGTGGCTGCTA
GATGTTTAACAATTTGAGATGAAGTTCTCTTTTCTTGGGAGAGATTGGATTTTTTATCTT
TATAATATCTTATTGTGGAATCAAGTAAAAGACTAGTTGTTGAAAAGTTTTGTTTCG

QA 1 897 1 897
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6555Contig1 1018 2 2 U
GGGATACGGCGACTGAGGAAGCTTTGTACCTCACGAAATATGCAGGTCATGTTCATTTGC
TTGTTCGCAGAGACCAGTTAAGAGCATCCAAGGCTATGCAAGATAGAGTGAACAACAATC
CAAACATCACAGTGCATTACAACACGGAAACGGTGGACGTATTGAGCAACACCAAGGGAC
AGATGTCTGGCCTTCTACTCAGAAGAGTCGATCCTGGAGAAGAAACCGAGCTGGAGGCAA
AAGGATTGTTTTATGGAATAGGTCATTCGCCGAACAGTCAGTTACTAGAAGGCCAAGTCG
AACTCGACAGCTCAGGGTACGTGTTGGTTCGTGAAGGAACATCGAATACATCAGTTGAAG
GTGTATTTGCTGCAGGAGATGTGCAGGACCATGAATGGAGACAAGCTGTAACGGCTGCTG
GATCAGGATGCATAGCCGCGTTGTCAGCCGAGAGATACCTCACAAGTAACAATCTTCTTG
TTGAATTTCACCAGCCTCAAACTGAAGAGACCAAAAAAGAGTTCACACAGCGGGATGTCC
AAGAAAAGTTCGACGTCACTCTTACAAAGCATAGGGGACAGTATGCTCTTAGAAAACTAT
ACCATGAGAGTTCAAGAGTTATATGTGTATTATACACATCACCAACATGTGGTCCCTGTA
GGACTCTGAAGCCAATCTTGAACAAGGTGGTCGATGAGTATAACAATGATGTGCACTTGG
TTGAGATTGATATCGAGGAAGATCAAGAAATTGCTGAAGCAGCCGGGATCATGGGAACAC
CATGTGTGCAATTCTTCAAGAACAAAGAAATGCTCAGGACTATATCTGGTGTGAAGATGA
AGAAAGAGTACAGGGAACTCATCGAAGCCAATAAATGAGGATCAGCATATAGATATGATT
GTTTCTGGCAGATGCCATTGTTTCATTCTAATACGTTAGAGTTAACGCCATTGAATCTCA
AATGGAAACAAATTAAATGTTCGTTATCTTAAGCTCAGGGCCGTCTCAAATTATTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG09TF U 1
AF RR4AG09JQ C 301
BS 1 682 RR4AG09TF
BS 683 1018 RR4AG09JQ

RD RR4AG09TF 682 0 0
GGGATACGGCGACTGAGGAAGCTTTGTACCTCACGAAATATGCAGGTCATGTTCATTTGC
TTGTTCGCAGAGACCAGTTAAGAGCATCCAAGGCTATGCAAGATAGAGTGAACAACAATC
CAAACATCACAGTGCATTACAACACGGAAACGGTGGACGTATTGAGCAACACCAAGGGAC
AGATGTCTGGCCTTCTACTCAGAAGAGTCGATCCTGGAGAAGAAACCGAGCTGGAGGCAA
AAGGATTGTTTTATGGAATAGGTCATTCGCCGAACAGTCAGTTACTAGAAGGCCAAGTCG
AACTCGACAGCTCAGGGTACGTGTTGGTTCGTGAAGGAACATCGAATACATCAGTTGAAG
GTGTATTTGCTGCAGGAGATGTGCAGGACCATGAATGGAGACAAGCTGTAACGGCTGCTG
GATCAGGATGCATAGCCGCGTTGTCAGCCGAGAGATACCTCACAAGTAACAATCTTCTTG
TTGAATTTCACCAGCCTCAAACTGAAGAGACCAAAAAAGAGTTCACACAGCGGGATGTCC
AAGAAAAGTTCGACGTCACTCTTACAAAGCATAGGGGACAGTATGCTCTTAGAAAACTAT
ACCATGAGAGTTCAAGAGTTATATGTGTATTATACACATCACCAACATGTGGTCCCTGTA
GGACTCTGAAGCCAATCTTGAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4AG09JQ 718 0 0
AACTCGACAGCTCAGGGTACGTGTTGGTTCGTGAAGGAACATCGAATACATCAGTTGAAG
GTGTATTTGCTGCAGGAGATGTGCAGGACCATGAATGGAGACAAGCTGTAACGGCTGCTG
GATCAGGATGCATAGCCGCGTTGTCAGCCGAGAGATACCTCACAAGTAACAATCTTCTTG
TTGAATTTCACCAGCCTCAAACTGAAGAGACCAAAAAAGAGTTCACACAGCGGGATGTCC
AAGAAAAGTTCGACGTCACTCTTACAAAGCATAGGGGACAGTATGCTCTTAGAAAACTAT
ACCATGAGAGTTCAAGAGTTATATGTGTATTATACACATCACCAACATGTGGTCCCTGTA
GGACTCTGAAGCCAATCTTGAACAAGGTGGTCGATGAGTATAACAATGATGTGCACTTGG
TTGAGATTGATATCGAGGAAGATCAAGAAATTGCTGAAGCAGCCGGGATCATGGGAACAC
CATGTGTGCAATTCTTCAAGAACAAAGAAATGCTCAGGACTATATCTGGTGTGAAGATGA
AGAAAGAGTACAGGGAACTCATCGAAGCCAATAAATGAGGATCAGCATATAGATATGATT
GTTTCTGGCAGATGCCATTGTTTCATTCTAATACGTTAGAGTTAACGCCATTGAATCTCA
AATGGAAACAAATTAAATGTTCGTTATCTTAAGCTCAGGGCCGTCTCAAATTATTAAT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6556Contig1 1088 2 4 U
GGACCAAAAAAAAGAAAGCTATTCCCAGTTTTAGATCTCTCTAAGCGACTGAGTAACTAA
TGTCGATGTCCCGCGGTGGATTGTTGTTGCTACTCTTCACCATCTTCCTCGTCCAGCTTC
AGTCTTCTACCTCTCTGATTAGTTCTCCAAGTTCTATCATCAACCCTTCAAAAGTCAAAC
AGGTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACTTGGAATGTG
ATCACCTGATCTCACTTGCGAAAGAGAATCTGCAGAGATCTGCGGTTGCTGGTAGCGATA
ATGGAGAGAGTCAAGTTAGTGATGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTCCAAAGGAA
AGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAAG
AAAATGGAGAAGACCTTCAGGTGTTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGACGCACACT
TTGACTACTTTCACGACAAAGTCAACATCGCCCGTGGTGGACTCCGCATAGCAACGGTTC
TCATGTATCTATCAAATGTCACAAAAGGTGGAGAAACTGTCTTCCCTAATGCAGTGGAAT
CTTCTCGCCGTAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAA
TCGCTGTGAAACCGAGGAAAGGAGATGCGCTGTTGTTCTTTAACCTCCACGAAGACGCAA
CTCCAGATGTATTGAGCCTTCACGGAGGTTGTCCTGTGATTGAAGGAGAGAAATGGTCAG
CAACTAAGTGGATCCACGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTGACGCATGATGGTAACTGTA
CGGATGTAAACGAGAGCTGTGAAAGATGGGCAGTGCTTGGAGAATGCGCGAAGAACCCAG
AGTATATGGTGGGAACTCCAGAGCTCCCTGGAAACTGTAGGCGTAGCTGTAAAGCTTGTT
AATCAAAAGAGTTTAAACTTCTTCTTCTTCTCTATGTATCATTTAGTACTTGTTATCTTG
ATTGAGCTTCGTTTTCTAAGTTTCTTGTCTCTGACTGTTCTTGAATGAGTTACAACAAAA
TTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM79TF U 1
AF RR4GM79JQ C 374
BS 1 737 RR4GM79TF
BS 738 738 RR4GM79JQ
BS 739 760 RR4GM79TF
BS 761 1088 RR4GM79JQ

RD RR4GM79TF 760 0 0
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TGTCGATGTCCCGCGGTGGATTGTTGTTGCTACTCTTCACCATCTTCCTCGTCCAGCTTC
AGTCTTCTACCTCTCTGATTAGTTCTCCAAGTTCTATCATCAACCCTTCAAAAGTCAAAC
AGGTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACTTGGAATGTG
ATCACCTGATCTCACTTGCGAAAGAGAATCTGCAGAGATCTGCGGTTGCTGGTAGCGATA
ATGGAGAGAGTCAAGTTAGTGATGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTCCAAAGGAA
AGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAAG
AAAATGGAGAAGACCTTCAGGTGTTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGACGCACACT
TTGACTACTTTCACGACAAAGTCAACATCGCCCGTGGTGGACTCCGCATAGCAACGGTTC
TCATGTATCTATCAAATGTCACAAAAGGTGGAGAAACTGTCTTCCCTAATGCAGTGGAAT
CTTCTCGCCGTAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAA
TCGCTGTGAAACCGAGGAAAGGAGATGCGCTGTTGTTCTTTAACCTCCACGAAGACGCAA
CTCCAGATGTATTGAGC*TTCACGGAGGTTGTCCTGTGAT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GM79JQ 715 0 0
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AAATGTCACAAAAGGTGGAGAAACTGTCTTCCCTAATGCAGTGGAATCTTCTCGCCGTAA
GCTTTCTGTAAACAAAGACGATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAATCGCTGTGAAACC
GAGGAAAGGAGATGCGCTGTTGTTCTTTAACCTCCACGAAGACGCAACTCCAGATGTATT
GAGCCTTCACGGAGGTTGTCCTGTGATTGAAGGAGAGAAATGGTCAGCAACTAAGTGGAT
CCACGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTGACGCATGATGGTAACTGTACGGATGTAAACGA
GAGCTGTGAAAGATGGGCAGTGCTTGGAGAATGCGCGAAGAACCCAGAGTATATGGTGGG
AACTCCAGAGCTCCCTGGAAACTGTAGGCGTAGCTGTAAAGCTTGTTAATCAAAAGAGTT
TAAACTTCTTCTTCTTCTCTATGTATCATTTAGTACTTGTTATCTTGATTGAGCTTCGTT
TTCTAAGTTTCTTGTCTCTGACTGTTCTTGAATGAGTTACAACAAAATTCTTACC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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GAAATTGCCCGTCAGAATTTGTTTCATACTTCCATTACTGCAGATCTTTACGGTTTGATG
ACAAACCTGATTACTCTTACCTCAAGCGTCTTTTCCGTGACTTGTTCATCCGAGAAGGTT
ACCAATTCGATTACGTGTTTGACTGGACAGTCTTAAAGTATCCTCAAATCGGTTCCAGTT
CTGGTTCTAGCTCACGTACAAGGCAGCAAACAACGACGAAACCAGGATTCAACGCGGTTC
CTTCTACAAGCAGGCACGAGAGGCACGCTGGTAAGGAAACAACCAGAGTCTCGGGTGCAG
TGGAAGCCTTCTCCCGAAGACACCCGACAAACAACACTTCTTCGCCACGTGATCGTTCAA
GATCAAGAAACTCTGATGACGGACCTTTCACTAAGCATATACATGGAGAGACTGGAAGAG
GAAGCAGTTCGTCAAGACAGGGAACATCAACGTCAAGGAAAGCAGTTGGTGGTGGTTCAA
GCTCTAGGCCAAGTTCTGCAGGTGGACCAAGTGGTAGCCGAGTTTCAAGCCGTCTGGTAT
CATCAAGCGGTGGTGGTGGCAGTGGGCGTCCCTCGAGCAGTCAGAGAGTCCAAGCTGGAT
ATGAATCGAAGACACTGTCTTTCGCTCGTGCAACGGCTTCAAGAAACGCTAGGGAAGATC
AGTTGAGAAGCTTCGAGCTTCTGTCTCTTCGCAAATAAATCCAAAGAAAAAGAGGGATAG
AGAGACTCCATGAAAACCCAACCGAAAGGTTTCAGTTACTTGAAAAAGATCTTTACAGGT
GATTTCAGCAGAGATCTTTTGCCAGCACTCTTGCTCGTTTGTATATTTTTAAATGGTGAT
GTGTTGGAGAAAAGAGAGTAAAAAATGTAGAAAGTCTCAAATTGTAAAAGAGGTGAACTT
GTATTCCTCCTATTATTATCCTATATATACTCCCATTACTTCCAGTCTTATCATTGT


BQ
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AF RR4A556TF U 1
AF RR4A556JQ C 626
BS 1 766 RR4A556TF
BS 767 1017 RR4A556JQ

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GAAATTGCCCGTCAGAATTTGTTTCATACTTCCATTACTGCAGATCTTTACGGTTTGATG
ACAAACCTGATTACTCTTACCTCAAGCGTCTTTTCCGTGACTTGTTCATCCGAGAAGGTT
ACCAATTCGATTACGTGTTTGACTGGACAGTCTTAAAGTATCCTCAAATCGGTTCCAGTT
CTGGTTCTAGCTCACGTACAAGGCAGCAAACAACGACGAAACCAGGATTCAACGCGGTTC
CTTCTACAAGCAGGCACGAGAGGCACGCTGGTAAGGAAACAACCAGAGTCTCGGGTGCAG
TGGAAGCCTTCTCCCGAAGACACCCGACAAACAACACTTCTTCGCCACGTGATCGTTCAA
GATCAAGAAACTCTGATGACGGACCTTTCACTAAGCATATACATGGAGAGACTGGAAGAG
GAAGCAGTTCGTCAAGACAGGGAACATCAACGTCAAGGAAAGCAGTTGGTGGTGGTTCAA
GCTCTAGGCCAAGTTCTGCAGGTGGACCAAGTGGTAGCCGAGTTTCAAGCCGTCTGGTAT
CATCAAGCGGTGGTGGTGGCAGTGGGCGTCCCTCGAGCAGTCAGAGAGTCCAAGCTGGAT
ATGAATCGAAGACACTGTCTTTCGCTCGTGCAACGGCTTCAAGAAACGCTAGGGAAGATC
AGTTGAGAAGCTTCGAGCTTCTGTCTCTTCGCAAATAAATCCAAAG

QA 1 766 1 766
DS 

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TCGTGCAACGGCTTCAAGAAACGCTAGGGAAGATCAGTTGAGAAGCTTCGAGCTTCTGTC
TTTTCGCAAATAAATCCAAAGAAAAAGAGGGATAGAGAGACTCCATGAAAACCCAACCGA
AAGGTTTCAGTTACTTGAAAAAGATCTTTACAGGTGATTTCAGCAGAGATCTTTTGCCAG
CACTCTTGCTCGTTTGTATATTTTTAAATGGTGATGTGTTGGAGAAAAGAGAGTAAAAAA
TGTAGAAAGTCTCAAATTGTAAAAGAGGTGAACTTGTATTCCTCCTATTATTATCCTATA
TATACTCCCATTACTTCCAGTCTTATCATTGT

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 2

CO CL6558Contig1 1020 2 6 U
GAGACCAGCCTGATTTCGTCGCCGTCGTCACCGGTCTGATTTTGTCGCCGTCGTCACCGG
TCTGATTTTGTCGCCGTCGACCTGTCTCTACTCCTCGTCACTTTGTTCTTCCGGAATCTG
TACTTCTCCTGAGAACGCCTCTGTTTCCTCTGCAGCCGAATCCAAAACCAACACTCGTCT
CACTCTCAAACTCCTCTCGTGTCTGTTCCTCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTAC
CGATTCAATTTCACTAAACAACAGATCTGAAAAAAACGAAGTCCTTAAAGTTTGTATCTT
TATGTAGGATCTGGTGCTTCCTCTTCAAAGACAGATGAAATCTACATCCCAAACCAATCT
TGGATGCAATCACCTTCGTACGAAGAGGCTGTAACGAGTCACAAAGTTTGTGCAGGGCTT
CCAAGAAACTTAGAATGGATTGTGAGGGAGACGTTGGGAAGGACTCTCTCGTTCTGATAA
AACAAGGAGATGAAGCTATGGTGTTCGAGTCTACATCTTCGATCCCAACGATGATCACTT
GGTGCCGTAGAGGAAGGGAGATTGCTGTTGAGGGGTCTTGGTTGATGAGGCAAAAGAGGT
TGAGGAGACAAAACTCAAAGCTGGACGAAAGTCAGATTTGTTTTGTTGTTTTGTTCTCTC
TGTGAACAAGAAGCCTACGAAGGCAAGCAAAGCTGCAGGAGAAGCCTCCCTATTGTTAAG
GATAATAAACGCAAGGTTGAGCATTAGAAGACGAGAAACTCCCAGTCATTCACAAGCGTA
AGAGGAGGATGAGATGACGAAGAAAAAGCTTCAAGTGGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAA
GCTTCGGTGTTGCCTAAGAATGACTTGGCCTCAGATAAATCATAAGTGTAGCTTTGATAG
GTGTAGTGATCGTGATTGTAAACAATAGATGTAGTGCATTCATTGTTTAGACTTTGGTTT
AGGTTTTGGTTATTTTGTAAACAAATTTTATATATAAAATTTTCAAAATATTTTTATTTA


BQ
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AF RR4BU68TF U 1
AF RR4BU68JQ C 277
BS 1 598 RR4BU68TF
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TACTTCTCCTGAGAACGCCTCTGTTTCCTCTGCAGCCGAATCCAAAACCAACACTCGTCT
CACTCTCAAACTCCTCTCGTGTCTGTTCCTCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTAC
CGATTCAATTTCACTAAACAACAGATCTGAAAAAAACGAAGTCCTTAAAGTTTGTATCTT
TATGTAGGATCTGGTGCTTCCTCTTCAAAGACAGATGAAATCTACATCCCAAACCAATCT
TGGATGCAATCACCTTCGTACGAAGAGGCTGTAACGAGTCACAAAGTTTGTGCAGGGCTT
CCAAGAAACTTAGAATGGATTGTGAGGGAGACGTTGGGAAGGACTCTCTCGTTCTGATAA
AACAAGGAGATGAAGCTATGGTGTTCGAGTCTACATCTTCGATCCCAACGATGATCACTT
GGTGCCGTAGAGGAAGGGAGATTGCTGTTGAGGGGTCTTGGTTGATGAGGCAAAAGAG*T
TGAGGAGACAAA*CTCAAAGCTGGACGAAAGTCAGATTTGTTTTGTTGTTTTGTTCTCTC
TGTGAAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BU68JQ 744 0 0
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CTTCGATCCCAACGATGATCACTTGGTGCCGTAGAGGAAGGGAGATTGCTGTTGAGGGGT
CTTGGTTGATGAGGCAAAAGAGGTTGAGGAGACAAAACTCAAAGCTGGACGAAAGTCAGA
TTTGTTTTGTTGTTTTGTTCTCTCTGTGAACAAGAAGCCTACGAAGGCAAGCAAAGCTGC
AGGAGAAGCCTCCCTATTGTTAAGGATAATAAACGCAAGGTTGAGCATTAGAAGACGAGA
AACTCCCAGTCATTCACAAGCGTAAGAGGAGGATGAGATGACGAAGAAAAAGCTTCAAGT
GGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAAGCTTCGGTGTTGCCTAAGAATGACTTGGCCTCAGAT
AAATCATAAGTGTAGCTTTGATAGGTGTAGTGATCGTGATTGTAAACAATAGATGTAGTG
CATTCATTGTTTAGACTTTGGTTTAGGTTTTGGTTATTTTGTAAACAAATTTTATATATA
AAATTTTCAAAATATTTTTATTTA

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6559Contig1 838 2 3 U
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ATTAATTATTGTAGAAAGCAACGTTTAAAGCATGTCGTGGTTCCGAGGAAATGGAGATAA
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CCAATCAGCAAGAGATAAGAGTTTCGTTTAGGCTGATGTCGGGAGGAAGTAAGGAGATGT
TGATACTAATCTCTCTTTGCGCTTCTCAAGAAACCTTTGCAGTGACTTTGTCCTTTGGAT
GGGAAGATCTCCTTCTAGATTCTGGCCAAAGAGCTTTGTCCTTATGGTGGTCGGAGGAAT
TACCGAATGATCTTTCACAATCGATTTGTCTTTTTTTGGTGCTGTTTCCATGACAACCTT
CAGAATATCATCGGCCTTGTTAGGAGACATTTGGTAAACGGAGACGGTTCCATTGTAGAA
GATGGTCATAGGAACAGTTCCAGAGACGAGTTCCGTAGGCATGTTGAGAGGCGCTTGGAC
CGGAGAAATAGGGATCTGAGGATGATATGCCTTTGGAGTAGACGGAACCGAAGGAGATAT
AGTCGATGAATCTGCATGGTCAGCACCAGAAGCTAACAATGATTTGATAATCCCCGGGAT
TGATCTTAGAAATGGCACCTTGAATATCTCGGAAACTGCGACGACGGTCGAGAAATTTCT
TGAACTTAGGCTTCGGAACGTTGTTGGTCTGCTTCTTCTCAAGACCGAAGAAGTCGAGCT
CTGTGGTAACTCTAGACATCTTTGATCTGATCTTTCTTGCTAGCTAAAACAGAGATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB44JQ U 597
AF RR4BB44TF C 1
BS 1 596 RR4BB44TF
BS 597 725 RR4BB44JQ
BS 726 838 RR4BB44TF

RD RR4BB44JQ 129 0 0
ATATAGTCGATGAATCTGCATGGTCAGCACCAGAAGCTAACAATGATTTGATAATCCCCG
GGATTGATCTTAGAAATGGCACCTTGAATATCTCGGAAACTGCGACGACGGTCGAGAAAT
TTCTTGAAC

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR4BB44TF 838 0 0
ACTAGAGAGAGTAATCATTTAAGAAATTAACAAACATATTTATATACTAGCATACTGTAT
ATTAATTATTGTAGAAAGCAACGTTTAAAGCATGTCGTGGTTCCGAGGAAATGGAGATAA
GCCAAACGCAAAACGAACGTTGATGTATTGGAAGGTGAAATGGTCATTTGGTTTCAAGTC
CCAATCAGCAAGAGATAAGAGTTTCGTTTAGGCTGATGTCGGGAGGAAGTAAGGAGATGT
TGATACTAATCTCTCTTTGCGCTTCTCAAGAAACCTTTGCAGTGACTTTGTCCTTTGGAT
GGGAAGATCTCCTTCTAGATTCTGGCCAAAGAGCTTTGTCCTTATGGTGGTCGGAGGAAT
TACCGAATGATCTTTCACAATCGATTTGTCTTTTTTTGGTGCTGTTTCCATGACAACCTT
CAGAATATCATCGGCCTTGTTAGGAGACATTTGGTAAACGGAGACGGTTCCATTGTAGAA
GATGGTCATAGGAACAGTTCCAGAGACGAGTTCCGTAGGCATGTTGAGAGGCGCTTGGAC
CGGAGAAATAGGGATCTGAGGATGATATGCCTTTGGAGTAGACGGAACCGAAGGAGATAT
AGTCGATGAATCTGCATGGTCAGCACCAGAAGCTAACAATGATTTGATAATCTCCGG*AT
TGATCTTAGAAATGGCACCTTGAATATCTCGGAAACTGCGACGACGGTCGAGAAATTTCT
TGAACTTAGGCTTCGGAACGTTGTTGGTCTGCTTCTTCTCAAGACCGAAGAAGTCGAGCT
CTGTGGTAACTCTAGACATCTTTGATCTGATCTTTCTTGCTAGCTAAAACAGAGATCC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL6560Contig1 415 2 1 U
GGATATTCAGGCAACAACGGAGGCGAGAGTTTCTGATGTAAGAGAAATATCTGCAGAGAC
TGAACGAGACAGAGGTAACAGCTTGGATATCACAGTAGTAACTCCTGAATCTAACGTTGT
TCCACGCAATGATCTGCTCCTGAGTCTTTTCACCATCAGCCTTGATGAATAAATGGTAGT
AGAGACCTTGGTACATTTTTCATATACTCTTTGATGTGTTGGTAATGCTTGGAGAGTTAA
ATTGTTCTAACAAACCAAAAAGAGTTTGCTATTTGGTTTTTGCTTGTGCCTCTAAACACT
TGTCTTATCTATCAGCAACCTCTTTGAGTTTCTGTCTGACATGGTAATGACTTGGGAAGA
ACAAAGAGATGTGTGTTTAAACTTTTAATTGTTGAATGATGTTATGTTTGTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EV44TF U 1
AF RR4EV44JQ C 30
BS 1 415 RR4EV44TF

RD RR4EV44TF 415 0 0
GGATATTCAGGCAACAACGGAGGCGAGAGTTTCTGATGTAAGAGAAATATCTGCAGAGAC
TGAACGAGACAGAGGTAACAGCTTGGATATCACAGTAGTAACTCCTGAATCTAACGTTGT
TCCACGCAATGATCTGCTCCTGAGTCTTTTCACCATCAGCCTTGATGAATAAATGGTAGT
AGAGACCTTGGTACATTTTTCATATACTCTTTGATGTGTTGGTAATGCTTGGAGAGTTAA
ATTGTTCTAACAAACCAAAAAGAGTTTGCTATTTGGTTTTTGCTTGTGCCTCTAAACACT
TGTCTTATCTATCAGCAACCTCTTTGAGTTTCTGTCTGACATGGTAATGACTTGGGAAGA
ACAAAGAGATGTGTGTTTAAACTTTTAATTGTTGAATGATGTTATGTTTGTGTGC

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4EV44JQ 386 0 0
TTTT
TGATGTAAGAGAAATATCTGCAGAGACTGAACGAGACAGAGGTAACAGCTTGGATATCAC
AGTAGTAACTCCTGAATCTAACGTTGTTCCACGCAATGATCTGCTCCTGAGTCTTTTCAC
CATCAGCCTTGATGAATAAATGGTAGTAGAGACCTTGGTACATTTTTCATATACTCTTTG
ATGTGTTGGTAATGCTTGGAGAGTTAAATTGTTCTAACAAACCAAAAAGAGTTTGCTATT
TGGTTTTTGCTTGTGCCTCTAAACACTTGTCTTATCTATCAGCAACCTCTTTGAGTTTCT
GTCTGACATGGTAATGACTTGGGAAGAACAAAGAGATGTGTGTTTAAACTTTTAATTGTT
GAATGATGTTATGTTTGTGTGC

QA 5 386 5 386
DS 



AS 1 2

CO CL6561Contig1 999 2 2 U
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GTCTCTCGCATCCGAATCTATCCAAATCCACTCGCGTTGATTTCCTCTGCCGCTGTGCTC
CTCCGCCATCAGAACTCCAACAACCACTTCGGTCTGGACTCTCTCTGTCGGCAGGAGCTC
ACGCTATCCCGCATCCAGATAAGGTAGAGAAAGGTGGGGAAGATGCTCTCTTTGTAAGTA
GCTATAGAGGAGGTGTCATTGCTGTTGCTGATGGTGTTTCCAGCTGGGCTGAACAAGATG
TTGACCCTTCCTTGTTCTCCAAAGAGCTCATTGCTAATGCTTCTAGACTAGTTGATGATG
AAGAGGTGAGATATGATCCTGGTTTCCTCATTGACAAAGCTCATACCGCAACTACTTCCA
TAGGTTCTGCAACAATTATAGTAGCCATGCTTGAAGAAGTTGGTGTTCTGAAAATAGGCA
ATGTTGGAGACTGTGGACTTAAGCTTCTTCGTCAAGGTCAGATCATATTTTCGACTACTC
CACAAGAGCATTACTTTGACTGTCCCTACCAACTAAGCTCTGAAGAGTCTGCTCAAACAT
ATCTAGACGCATCGTTTAACGTAATGGAAGTAAAGAAAGGAGACGTGATCGTGATGGGTT
CAGACGGGCTTTTCGATAACGTATTTGATCATGAGATTGTTAGTATAGTGACCAAACATA
CAGATGTGGCTGAGTCATCGAGATTATTAGCTGAAGTGGCGAGTAGACATTCAAGAGATC
CAGGCTTTGAGTCCCCATATGCATTGGAAGCAAAAGCCAAGGGTTTTGATGTTCCTCTCT
GGAAGAAGGCAATGGGAATGAAGCTTACAGGAGGGAAGCTTGATGATGTGACTGTAATCG
TTGCCCAAGTGGTGGACTCTTGAGTCTTATGTGATCTTTTCTCATTATTCTTTTGTAAAA
TGAAACTTGTCATTTGTATTGGAGCATCTTATCCTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H063TF U 1
AF RR4H063JQ C 282
BS 1 665 RR4H063TF
BS 666 999 RR4H063JQ

RD RR4H063TF 665 0 0
GCGCGATTCCGATGACAAGAATAATGGTTCGTCCTCCTTCTCAGGCAAGCTCTTCACTTC
GTCTCTCGCATCCGAATCTATCCAAATCCACTCGCGTTGATTTCCTCTGCCGCTGTGCTC
CTCCGCCATCAGAACTCCAACAACCACTTCGGTCTGGACTCTCTCTGTCGGCAGGAGCTC
ACGCTATCCCGCATCCAGATAAGGTAGAGAAAGGTGGGGAAGATGCTCTCTTTGTAAGTA
GCTATAGAGGAGGTGTCATTGCTGTTGCTGATGGTGTTTCCAGCTGGGCTGAACAAGATG
TTGACCCTTCCTTGTTCTCCAAAGAGCTCATTGCTAATGCTTCTAGACTAGTTGATGATG
AAGAGGTGAGATATGATCCTGGTTTCCTCATTGACAAAGCTCATACCGCAACTACTTCCA
TAGGTTCTGCAACAATTATAGTAGCCATGCTTGAAGAAGTTGGTGTTCTGAAAATAGGCA
ATGTTGGAGACTGTGGACTTAAGCTTCTTCGTCAAGGTCAGATCATATTTTCGACTACTC
CACAAGAGCATTACTTTGACTGTCCCTACCAACTAAGCTCTGAAGAGTCTGCTCAAACAT
ATCTAGACGCATCGTTTAACGTAATGGAAGTAAAGAAAGGAGACGTGATCGTGATGGGTT
CAGAC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4H063JQ 718 0 0
AGCTGGGCTGAACAAGATGTTGACCCTTCCTTGTTCTCCAAAGAGCTCATTGCTAATGCT
TCTAGACTAGTTGATGATGAAGAGGTGAGATATGATCCTGGTTTCCTCATTGACAAAGCT
CATACCGCAACTACTTCCATAGGTTCTGCAACAATTATAGTAGCCATGCTTGAAGAAGTT
GGTGTTCTGAAAATAGGCAATGTTGGAGACTGTGGACTTAAGCTTCTTCGTCAAGGTCAG
ATCATATTTTCGACTACTCCACAAGAGCATTACTTTGACTGTCCCTACCAACTAAGCTTT
GAAGAGTCTGCTCAAACATATCTAGACGCATCGTTTAACGTAATGGAAGTAAAGAAAGGA
GACGTGATCGTGATGGGTTCAGACGGGCTTTTCGATAACGTATTTGATCATGAGATTGTT
AGTATAGTGACCAAACATACAGATGTGGCTGAGTCATCGAGATTATTAGCTGAAGTGGCG
AGTAGACATTCAAGAGATCCAGGCTTTGAGTCCCCATATGCATTGGAAGCAAAAGCCAAG
GGTTTTGATGTTCCTCTCTGGAAGAAGGCAATGGGAATGAAGCTTACAGGAGGGAAGCTT
GATGATGTGACTGTAATCGTTGCCCAAGTGGTGGACTCTTGAGTCTTATGTGATCTTTTC
TCATTATTCTTTTGTAAAATGAAACTTGTCATTTGTATTGGAGCATCTTATCCTGTGG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6562Contig1 282 2 1 U
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CAACAACCAACCAACCAACTCTGTTTAGGAAGATGAAGAAAAAAGAAGCCAAAAAGATTC
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ACACAGTAGTCCTTGCGGTTTACCTCTGATTTAGGTTTGTTTAGGGGAGTCATCTTTAGT
CTGAATATTGTGACACACTTTATCGAATGGTTAAGGCTTAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DV05JQ C 1
AF RR4DV05TF U 1
BS 1 282 RR4DV05TF

RD RR4DV05JQ 282 0 0
GCAAGAAGCTCCACTAACGGTAGAAGATCAAGAGAAGGCTAGAAACAACTAGCTAACCAT
CAACAACCAACCAACCAACTCTGTTTAGGAAGATGAAGAAAAAAGAAGCCAAAAAGATTC
AGAAGTGAAGCAGAGTTGTTTAGGATGATCCTGTTTTGCTTTGTACTTCACTAAAACCAA
ACACAGTAGTCCTTGCGGTTTACCTCTGATTTAGGTTTGTTTAGGGGAGTCATCTTTAGT
CTGAATATTGTGACACACTTTATCGAATGGTTAAGGCTTAAT

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4DV05TF 282 0 0
GCAAGAAGCTCCACTAACGGTAGAAGATCAAGAGAAGGCTAGAAACAACTAGCTAACCAT
CAACAACCAACCAACCAACTCTGTTTAGGAAGATGAAGAAAAAAGAAGCCAAAAAGATTC
AGAAGTGAAGCAGAGTTGTTTAGGATGATCCTGTTTTGCTTTGTACTTCACTAAAACCAA
ACACAGTAGTCCTTGCGGTTTACCTCTGATTTAGGTTTGTTTAGGGGAGTCATCTTTAGT
CTGAATATTGTGACACACTTTATCGAATGGTTAAGGCTTAAT

QA 1 282 1 282
DS 



AS 1 2

CO CL6563Contig1 815 2 4 U
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TCTTCTCTGTTCTTTCTCGTTCTCTCTCTGAAACTCTTCAGACACCAAAATAAAACAAGG
AGTAATAAAATGTCTCAAATGGACATTTCTACCAGAACGGAGGAAGGGGGATGGAGAAGC
AAGCCATCGTTTATGACGTGGAGAGCCCGCGACGTTGTCTACGTGATGAGACACCATTGG
ATACCGTGTTTGTTCGCGGCCGGATTCTTGTTCGTCGTAAGCGTGGAGTCCTCGATCAAG
ATGGTTTCCGAGAGTTCTCCACCGTTCGATATTGGGTTTGTGGCCACGGAGTCTTTGCAT
CATCTCTTGGCTTCTTCACCGGATCTGAACACCGGTTTGGCCGCTCTAAACTCGGTGTTA
GGAGTGATGCAAGTATCGTATATTGCATGGACATGGTTAATAGAAGGACGGCCACGAGCC
ACCATCACGGCTTTATTCCTCTTCACTTGTCGCGGTGTTCTCGGTTACTGTACTCAGCTC
CCTCTTTCAAAGGAGTATCTAGGATCAGCAATCGATTTCCCGCTAGGAAACCTCTCGTTC
TTCTATTTCTTCTCGGGTCACGTGGCAGGCACGACCATCGCATCTTTAGACATGAGGAGA
ATGCAGAGATTGAGACTTGCAATGGTTTTTGACATCCTCAATGTATTACAGTCTATCAGG
CTGCTAGCGACGAGAGGACACTACACAATCGATCTCGCAGTGGAGTTGCCGCCGCGATTC
TCTTTGACTCATTGGCCGGCAAGTATGAAGCTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AX95TF U 1
AF RR4A688TF U 66
BS 1 402 RR4AX95TF
BS 403 403 RR4A688TF
BS 404 814 RR4AX95TF
BS 815 815 RR4A688TF

RD RR4AX95TF 814 0 0
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TCTTCTCTGTTCTTTCTCGTTCTCTCTCTGAAACTCTTCAGACACCAAAATAAAACAAGG
AGTAATAAAATGTCTCAAATGGACATTTCTACCAGAACGGAGGAAGGGGGATGGAGAAGC
AAGCCATCGTTTATGACGTGGAGAGCCCGCGACGTTGTCTACGTGATGAGACACCATTGG
ATACCGTGTTTGTTCGCGGCCGGATTCTTGTTCGTCGTAAGCGTGGAGTCCTCGATCAAG
ATGGTTTCCGAGAGTTCTCCACCGTTCGATATTGGGTTTGTGGCCACGGAGTCTTTGCAT
CATCTCTTGGCTTCTTCACCGGATCTGAACACCGGTTTGGCCTCTCTAAACTCGGTGTTA
GGAGTGATGCAAGTATCGTATATTGCATGGACATGGTTAATAGAAGGACGGCCACGAGCC
ACCATCACGGCTTTATTCCTCTTCACTTGTCGCGGTGTTCTCGGTTACTGTACTCAGCTC
CCTCTTTCAAAGGAGTATCTAGGATCAGCAATCGATTTCCCGCTAGGAAACCTCTCGTTC
TTCTATTTCTTCTCGGGTCACGTGGCAGGCACGACCATCGCATCTTTAGACATGAGGAGA
ATGCAGAGATTGAGACTTGCAATGGTTTTTGACATCCTCAATGTATTACAGTCTATCAGG
CTGCTAGCGACGAGAGGACACTACACAATCGATCTCGCAGTGGAGTTGCCGCCGCGATTC
TCTTTGACTCATTGGCCGGCAAGTATGAAGCTAA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4A688TF 750 0 0
GGG
GTTCTTTCTCGTTCTCTCTCTGAAACTCTTCAGACACCAAAATAAAACAAGGAGTAATAA
AATGTCTCAAATGGACATTTCTACCAGAACGGAGGAAGGGGGATGGAGAAGCAAGCCATC
GTTTATGACGTGGAGAGCCCGCGACGTTGTCTACGTGATGAGACACCATTGGATACCGTG
TTTGTTCGCGGCCGGATTCTTGTTCGTCGTAAGCGTGGAGTCCTCGATCAAGATGGTTTC
CGAGAGTTCTCCACCGTTCGATATTGGGTTTGTGGCCACGGAGTCTTTGCATCATCTCTT
GGCTTCTTCACCGGATCTGAACACCGGTTTGGCCGCTCTAAACTCGGTGTTAGGAGTGAT
GCAAGTATCTTATATTGCATGGACATGGTTAATAGAAGGACGGCCACGAGCCACCATCAC
GGCTTTATTCCTCTTCACTTGTCGCGGTGTTCTCGGTTACTGTACTCAGCTCCCTCTTTC
AAAGGAGTATCTAGGATCAGCAATCGATTTCCCGCTAGGAAACCTCTCGTTCTTCTATTT
CTTCTCGGGTCACGTGGCAGGCACGACCATCGCATCTTTAGACATGAGGAGAATGCAGAG
ATTGAGACTTGCAGTGGTTTTTGACATCCTCAATGTATTACAGTCTATCAGGCTGCTAGC
GACGAGAGGACACTACACAATCGATCTCGCAGTGGAGTTGCCGCCGCGATTCTCTTTGAC
TCATTGGCCGGCAAGTATGAAGCTAAT

QA 4 750 4 750
DS 



AS 1 2

CO CL6564Contig1 1169 2 4 U
GAATCTCTTCAACGGCTCCATTCCTCTATGCTTGGAGGATTCCATTGCTTCTTTTAGTGA
CCTCATCTTCCGCAACAACAGTTTCAGTGGACCTCTTCCAGATATATTTGCCAGTGCTAC
AGAGTTAAGATCACTCGACGTCAGCCGCAACCACCTCGAGGGAAATCTTCCAAAGTCTTT
GGTCAACTGCAAAGCTTTGCAACTTGTGAACATGGAAAGCAACAGAATCAAGGACGTGTT
TCCATCATGGTTGGGATCACTGCCGTCATTGCATGTTCTCATCCTCAGATCAAATGAGTT
TCATGGGACGTTGCATGTGTTCATTGGGTTTCAGAGTTTAAGAATCATCGATATTTCACG
TAATGACTTCTCCGGGACCCTCCCACCTCACTGTTTCTCCAGCTGGCGGGGAATGACTGT
ATTGAGGGAAGAAGATGACCCGTACATGGCAGATATCATCAACGAGTCTGTCTTTTATCG
TAACTCGATGGTGATGGTGGTTAAAGGAGTGGAGCTGAGCTTTGAGCGGATCCAACAAGA
CTTCAGAGCCATTGATATCTCTGTAAACAGAATTCATGGCAAAATCCCTGAATCTTTGGC
TTTCTTGAAAGAGCTGCATCTTCTCAACTTGTCAGGTAATGTCTTCACAAGCCATATCCC
ACGGTCCTTGGCGAATCTAACAAAGCTGGAGACGCTAGACTTATCGCGTAATAAGCTGTC
TGGTAAAATCCCTCAAGATCTTGGTGAACTCTCCTCTCTGTCGTACATGAACTTCTCCAG
TAACCTTCTCATAGGTCTAGTGCCACGAGGCACACAGTTTCAAAGTCAAAACTGTTCTTT
CTTCTCGGACAACGATAGACTTTTCGGCCTGGAAGAAATCTGTGGAAAAATCCAAGTTTC
GGATCCTACATCACAGCAACCTGAGCAACTGTCAGAGCCGGAGGAAGAACTGTTCAGCTG
GACAGCAGCTGCAATAGCCTACGGGCCTGGTGTGTTTTGTGGATTGGTGATCGGACATAT
CTTCACTTTATACTATCATAAAATTTGGTCCAAGAAAAACACCACAAGTAGTCGTTAATC
TCATATGCTGCAGTTGCTCTAAGCATTTGTAAATTGTATGTTGTCCAACGTCTTCTTCTT
CGTGTTTATACTGAATTTAAAAGACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E721TF U 1
AF RR4E721JQ C 383
BS 1 727 RR4E721TF
BS 728 728 RR4E721JQ
BS 729 773 RR4E721TF
BS 774 1169 RR4E721JQ

RD RR4E721TF 781 0 0
GAATCTCTTCAACGGCTCCATTCCTCTATGCTTGGAGGATTCCATTGCTTCTTTTAGTGA
CCTCATCTTCCGCAACAACAGTTTCAGTGGACCTCTTCCAGATATATTTGCCAGTGCTAC
AGAGTTAAGATCACTCGACGTCAGCCGCAACCACCTCGAGGGAAATCTTCCAAAGTCTTT
GGTCAACTGCAAAGCTTTGCAACTTGTGAACATGGAAAGCAACAGAATCAAGGACGTGTT
TCCATCATGGTTGGGATCACTGCCGTCATTGCATGTTCTCATCCTCAGATCAAATGAGTT
TCATGGGACGTTGCATGTGTTCATTGGGTTTCAGAGTTTAAGAATCATCGATATTTCACG
TAATGACTTCTCCGGGACCCTCCCACCTCACTGTTTCTCCAGCTGGCGGGGAATGACTGT
ATTGAGGGAAGAAGATGACCCGTACATGGCAGATATCATCAACGAGTCTGTCTTTTATCG
TAACTCGATGGTGATGGTGGTTAAAGGAGTGGAGCTGAGCTTTGAGCGGATCCAACAAGA
CTTCAGAGCCATTGATATCTCTGTAAACAGAATTCATGGCAAAATCCCTGAATCTTTGGC
TTTCTTGAAAGAGCTGCATCTTCTCAACTTGTCAGGTAATGTCTTCACAAGCCATATCCC
ACGGTCCTTGGCGAATCTAACAAAGCTGGAGACGCTAGACTTATCGCGTAATAAGCTGTC
TGGTAAA*TCCCTCAAGATCTTGGTGAACTCTCCTCTCTGTCGTACATGAACT
CTCAGTAC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4E721JQ 787 0 0
CCC
CCTCACTGTTTCTCCAGCTGGCGGG*AATGACTGTATTGAGGGAAGAAGATGACCCGTAC
ATGGCAGATATCATCAACGAGTCTGTCTTTTATCGTAACTCGATGGTGATGGTGGTTAAA
GGAGTGGAGCTGAGCTTTGAGCGGATCCAACAAGACTTCAGAGCCATTGATATCTCTGTA
AACAGAATTCATGGCAAAATCCCTGAATCTTTGGCTTTCTTGAAAGAGCTGCATCTTCTC
AACTTGTCAGGTAATGTCTTCACAAGCCATATCCCACGGTCCTTGGCGAATCTAACAAAG
CTGGAGACGCTAGACTTATCGCGTAATAAGCTGTCTGGTAAAATCCCTCAAGATCTTGGT
GAACTCTCCTCTCTGTCGTACATGAACTTCTCCAGTAACCTTCTCATAGGTCTAGTGCCA
CGAGGCACACAGTTTCAAAGTCAAAACTGTTCTTTCTTCTCGGACAACGATAGACTTTTC
GGCCTGGAAGAAATCTGTGGAAAAATCCAAGTTTCGGATCCTACATCACAGCAACCTGAG
CAACTGTCAGAGCCGGAGGAAGAACTGTTCAGCTGGACAGCAGCTGCAATAGCCTACGGG
CCTGGTGTGTTTTGTGGATTGGTGATCGGACATATCTTCACTTTATACTATCATAAAATT
TGGTCCAAGAAAAACACCACAAGTAGTCGTTAATCTCATATGCTGCAGTTGCTCTAAGCA
TTTGTAAATTGTATGTTGTCCAACGTCTTCTTCTTCGTGTTTATACTGAATTTAAAAGAC
TTAT

QA 4 787 4 787
DS 



AS 1 2

CO CL6565Contig1 880 2 2 U
TTTTTTGTGGTCAAAAGTCAAGTTACATCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTCTTCTCGAGTT
CTTGTCGATGTTCTTATACAGAAGCCAAAAAACGTGAATCAAGTTACAAACCTAATGGTT
CTCTGTCTTAACTTTCAACCTGGTGTAGGAACCGACAGAATCAAAGATCAGTCATCTGCA
TGAGTAGATCGGAGTTCAATAATCGTCTTTAAGCACTCCAAAAGTCAGATCGGGGGATAT
TGAAAGACGGTTTGAACATCGACGAAGATATAACAATGGTCGGTGAATCCGGAATTGATG
AACTCTAGTAGAGGAAGAGGAGCTTCAGTTAAGAAGCCATCTGCTGGTGAACTTCGTCTT
CAGAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCGAAGCTCTTGCACGATATCATTTCCCAATGGC
AAAGATGATTTGATGAACTGCAGAGATTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCAGGTG
TTGTTGCGGGGCTTTTGGTTGAAAACTCTCTGAAGTTCTTACTGAATTTTGGTGAAGTTT
CTACATACCAGGTGGTCAACTCAGTGAAGGAGTACATGCTTGTGAAACCTGCAAGGGACG
CTGCTGCTAAGATGGAAGCCGAAGCAGCTACAGCTATAGATGATGGTCGACTCCATGATG
ATAATGAGTCAAACATAAGGTAACAACTCAGTGAATTAGTTCAAAATAGTTTTCGTATCC
TTTAAAATTGCAAACCGGATCAAACAAATAATGGTTTGATCTTTGGCAGTCTCACAAAAT
GGTTCAAGTAGCTCTGCATAGGTTCCCCACAGACAGCATGGAAGAGAATTTCCTCTAATG
AAAAAAATGCATGTTATAAACTAATCCAAGCCTCTATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EJ66TF U 1
AF RR4EJ66JQ C 213
BS 1 591 RR4EJ66TF
BS 592 880 RR4EJ66JQ

RD RR4EJ66TF 591 0 0
TTTTTTGTGGTCAAAAGTCAAGTTACATCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTCTTCTCGAGTT
CTTGTCGATGTTCTTATACAGAAGCCAAAAAACGTGAATCAAGTTACAAACCTAATGGTT
CTCTGTCTTAACTTTCAACCTGGTGTAGGAACCGACAGAATCAAAGATCAGTCATCTGCA
TGAGTAGATCGGAGTTCAATAATCGTCTTTAAGCACTCCAAAAGTCAGATCGGGGGATAT
TGAAAGACGGTTTGAACATCGACGAAGATATAACAATGGTCGGTGAATCCGGAATTGATG
AACTCTAGTAGAGGAAGAGGAGCTTCAGTTAAGAAGCCATCTGCTGGTGAACTTCGTCTT
CAGAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCGAAGCTCTTGCACGATATCATTTCCCAATGGC
AAAGATGATTTGATGAACTGCAGAGATTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCAGGTG
TTGTTGCGGGGCTTTTGGTTGAAAACTCTCTGAAGTTCTTACTGAATTTTGGTGAAGTTT
CTACATACCAGGTGGTCAACTCAGTGAAGGAGTACATGCTTGTGAAACCTG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4EJ66JQ 668 0 0
GCACTCCAAAAGTCAGATCGGGGGATATTGAAAGACGGTTTGAACATCGACGAAGATATA
ACAATGGTCGGTGAATCCGGAATTGATGAACTCTAGTAGAGGAAGAGGAGCTTCAGTTAA
GAAGCCATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCAGAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCGAAG
CTCTTGCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTGCAGAGATTCCAT
TAAACCCGATGATGGTTACTACCAGGTGTTGTTGCGGGGCTTTTGGTTGAAAACTCTCTG
AAGTTCTTACTGAATTTTGGTGAAGTTTCTACATACCAGGTGGTCAACTCAGTGAAGGAG
TACATGCTTGTGAAACCTGCAAGGGACGCTGCTGCTAAGATGGAAGCCGAAGCAGCTACA
GCTATAGATGATGGTCGACTCCATGATGATAATGAGTCAAACATAAGGTAACAACTCAGT
GAATTAGTTCAAAATAGTTTTCGTATCCTTTAAAATTGCAAACCGGATCAAACAAATAAT
GGTTTGATCTTTGGCAGTCTCACAAAATGGTTCAAGTAGCTCTGCATAGGTTCCCCACAG
ACAGCATGGAAGAGAATTTCCTCTAATGAAAAAAATGCATGTTATAAACTAATCCAAGCC
TCTATAAC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6566Contig1 662 2 3 U
ATAGGAGAAAGAGTGAAATGTTTACACTTTACAGTTGAAAAAAAAAATTCATTTGAAAGC
AAATTTAAAAGATCAGAAACAACCACAGGTTGCCTTGGGGACAATACCGGTGGCTCTGTG
TTTAGCAGCCATCTCTTCAGCTTTGAAAACATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGC
TCTTCTCTCTTCTGCTTCTTTGTGGATCGCTGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATA
CTCTGCTTTCTTATTCTCAAGTTGCTCCTCGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGC
TTTCTTGCTGTTTTCCCAAGCAAGAATATCAAACATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCAGC
TTTGGTCTTTTCGCTATCTTCCCATGCTTTGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAA
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CTCTAAAGGTTTCTCCACGACGGCAAGGGCTTTGGAGTCATCAGCAGTTTTTTCCGGAGC
CGGAGCTGGAGTTGGAGAAGGAGTCTCAGCTGCAGCCGGAGGTGGAGCAAGAGTCTCAGC
CGGAGCCGGAGCCGGAGGTGCTGTGTCTAACGTTATCTTTTGTTCCTCAGCCATAGTCTC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4H478JQB U 78
AF RR4H478TF C 1
BS 1 77 RR4H478TF
BS 78 463 RR4H478JQB
BS 464 662 RR4H478TF

RD RR4H478JQB 386 0 0
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CAGCTTTGAAAACATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGCTCTTCTCTCTTCTGCTT
CTTTGTGGATCGCTGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATACTCTGCTTTCTTATTCT
CAAGTTGCTCCTCGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGCTTTCTTGCTGTTTTCCC
AAGCAAGAATATCAAACATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCAGCTTTGGTCTTTTCGCTAT
CTTCCCATGCTTTGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAAATCAGCTAGCTTAATAT
CTCTATCGATCGAACCACCAGACGAA

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4H478TF 662 0 0
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AAATTTAAAAGATCAGAAACAACCACAGGTTGCCTTGGGGACAATACCGGTGGCTCTGTG
TTTAGCAGCCATCTCTTCAGCTTTGAGAACATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGC
TCTTCTCTCTTCTGCTTCTTTGTGGATCGCTGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATA
CTCTGCTTTCTTATTCTCAAGTTGCTCCTCGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGC
TTTCTTGCTGTTTTCCCAAGCAAGAATATCAGACATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCAGC
TTTGGTCTTTTCGCTATCTTCCCATGCTTTGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAA
ATCAGCTAGCTTAATATCTCTATCGATCGAACCACCAGACGAAGCTTTCTTTGGTGAAGG
CTCTAAAGGTTTCTCCACGACGGCAAGGGCTTTGGAGTCATCAGCAGTTTTTTCCGGAGC
CGGAGCTGGAGTTGGAGAAGGAGTCTCAGCTGCAGCCGGAGGTGGAGCAAGAGTCTCAGC
CGGAGCCGGAGCCGGAGGTGCTGTGTCTAACGTTATCTTTTGTTCCTCAGCCATAGTCTC
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6567Contig1 944 2 6 U
GGGGTAAAAATGTTGAAAACCATAATAGAATTCAGAGAGCAGAAGACAGATAGATAGTAA
AAACCATAATAGAATTCAGAAAGCAAGGGACGGATAGTTGCAAGAAAATACAAACTAAAG
ACTCGTCACAAGAATGTTTCGAGCCCCTTCACGCAAACATAAAACGATAGCAGAAAAGCC
AAACAGAATATCCATGTTTCTCCAACACACTGGTTCTTAGTACTCCTCACCTTCATCATC
CTCATCGTCACCACCTTCAGCACCAACCTCTTCATAATCCTTCTCCAACGCTGCAAGATC
CTCACGAGCCTCAGAGAACTCTCACTCCTCCATACCCTCACCGACATACCAGTGAACGAA
AGCACGTTTTGCGTACATGAGATCGAACTTGTGATCAATCCTGGAGAAGACCTCAGCAAC
ACTTGTGGAGTTGGAGATCATACAAACAGCTCTCTGCACTTTAGCAAGATCACCTCCTGG
GACAACAGTTGGTGGCTGGTAGTTGATACCGCACTTGAATCCAGTAGGACACCAGTCGAC
AAACTGGATGGTACGCTTGGTCTTGATGGTGCCAACAGCTGCGTTCACGTCTTTAGGGAC
GACATCACCACGGTACATCAGACAACAAGCCATGTATTTCCCGTGACGTGGGTCACACTT
GGCCATCATGGAAGCTGGCTCAAAGGCGCTGTTTGTGATCTCAGCAACAGAGAGCTGCTC
GTGGAAGGCTTTCTCAGCAGAGATGACTGGAGCGTAGGATGAAAGCATGAAGTGGATTCT
TGGGTATGGGACCAAGTTGGTTTGGGACTCAGTCACATCCACGTTCAAGGCACCATCGAA
CCTGAGAGAAGCAGTCAAGGAAGAGATAACCTGAGAAACAAGACGGTTAAGGTTGGTGTA
GGTTGGCCTCTCAATGTTTAGTGAACGTCTGCAGATGTCGTAGC


BQ
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AF RR4F192JQ U 1
AF RR4EP49TF C 287
BS 1 323 RR4F192JQ
BS 324 324 RR4EP49TF
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BS 682 944 RR4EP49TF

RD RR4F192JQ 681 0 0
GGGGTAAAAATGTTGAAAACCATAATAGAATTCAGAGAGCAGAAGACAGATAGATAGTAA
AAACCATAATAGAATTCAGAAAGCAAGGGACGGATAGTTGCAAGAAAATACAAACTAAAG
ACTCGTCACAAGAATGTTTCGAGCCCCTTCACGCAAACATAAAACGATAGCAGAAAAGCC
AAACAGAATATCCATGTTTCTCCAACACACTGGTTCTTAGTACTCCTCACCTTCATCATC
CTCATCGTCACCACCTTCAGCACCAACCTCTTCATAATCCTTCTCCAACGCTGCAAGATC
CTCACGAGCCTCAGAGAACTCTCCCTCCTCCATACCCTCACCGACATACCAGTGAACGAA
AGCACGTTTTGCGTACATGAGATCGAACTTGTGATCAATCCTGGAGAAGACCTCAGCAAC
ACTTGTGGAGTTGGAGATCATACAAACAGCTCTCTGCACTTTAGCAAGATCGCCTCCTGG
GACAACAGTTGGTGGCTGGTAGTTGATACCGCACTTGAATCCAGTAGGACACCAGTCGAC
AAACTGGATGGTACGCTTGGTCTTGATGGTGCCAACAGCTGCGTTCACGTCTTTAGGGAC
GACATCACCACGGTACATCAGACAACAAGCCATGTATTTCCCGTGACGTGGGTCACACTT
GGCCATCATGGAAGCTGGCTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4EP49TF 658 0 0
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TACCAGTGAACGAAAGCACGTTTTGCGTACATGAGATCGAACTTGTGATCAATCCTGGAG
AAGACCTCAGCAGCACTTGTGGAGTTGGAGATCATACAAACAGCTCTCTGCACTTTAGCA
AGATCACCTCCTGGGACAACAGTTGGTGGCTGGTAGTTGATACCGCACTTGAATCCAGTA
GGACACCAGTCGACAAACTGGATGGTACGCTTGGTCTTGATGGTGCCAACAGCTGCGTTC
ACGTCTTTAGGGACGACATCACCACGGTACATCAGACAACAAGCCATGTATTTCCCGTGA
CGTGGGTCACACTTGGCCATCATGGAAGCTGGCTCAAAGGCGCTGTTTGTGATCTCAGCA
ACAGAGAGCTGCTCGTGGAAGGCTTTCTCAGCAGAGATGACTGGAGCGTAGGATGAAAGC
ATGAAGTGGATTCTTGGGTATGGGACCAAGTTGGTTTGGGACTCAGTCACATCCACGTTC
AAGGCACCATCGAACCTGAGAGAAGCAGTCAAGGAAGAGATAACCTGAGAAACAAGACGG
TTAAGGTTGGTGTAGGTTGGCCTCTCAATGTTTAGTGAACGTCTGCAGATGTCGTAGC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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AGCTTGCCATCTTCCATCAACATAAACTCCTCCTCGATTCTAAGGGGACCGGGCCAGAGC
CATAACCATGGACTCCCAGATCTTACTCTGTTGGACAGATCTTCCAAGCATCTCACCGTT
GCGGAGATTCTTGCTTGGCTTAACAACGGCAGCAGTGAAAATGGCGGTTCTTGTTTGGCT
CAACGGTGAGAGTCCGCCTTCACTAAGATTTCATCTAGAGACACACACGTTTCTTTGATC
TTGTACACTAGAGCATCAATCAAGGACTTGCACATTTGAAAAAGATGAAGAATCAGTATA
TGGGTAAGTAGAAATTCTAAAGTGTCTTTCTATATGATTCAAAGATCTAAGAGTCTCTTC
ATTAGGTATGTTTAGTTTACTCATAGTTCCTCTAATCATACTAACAATCTAATATTTTTT
GAAAGTGGTGCTGCATATGTGTCCGTGGAGGACCAGAAGAAGCGCGTTTAGCTATGGAGA
GTACTTGGAACTTATAGAGTGTGAGTATGATCTCAAGAGATGTGTAGACTTTTACAAGCT
GAGTCACAACGTCCCCAATTCTGATGAATAAACCTCTTATCTTATACTCATGTAAGTGAC
CTTACAAAGGAAGATGATCCCCTGAATCCAGCTGTAACTAGGGTGATGGTGTAAGGGAAT
GTAGGAAACAGAAACCGCAGTTTTCAAAGTTGTAACCTGGTGATGACTGAGCCCACTGTA
GGAACTGTTGAGAAAGAGTTGGCGACAGCAAAGTAATAAGAACAGACGAGAGAGAATGAG
ATGGATGAGGAGAGAGGACACACCACAAGAGAAGCTGCATAGATGCTGGAGACTTATAGA
GATGGAGGCGGTGTCCCTCAACTCAAAAGAGGGGCAGAATATGGTGGAGGTTGTAAACGC
CTACACGTCTATTTCAACTTCTAAAATAACCACAATATGTGACAAGAATAAGTCACAATT
TTATATTTTACTATATTTGATTCAACTTAATAGATTTATTGTACCAAACGAAAACCAATA
TTTTCAATTTGTCTTTCAATGGAAAACACTTCTTATG


BQ
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AF RR4AD93TF U 1
AF RR4AD93JQ C 339
BS 1 714 RR4AD93TF
BS 715 1117 RR4AD93JQ

RD RR4AD93TF 721 0 0
GTTGTTCAAGGCGGTGGAATCGACTATAAGAAGTTTTGTATGAGATTAGGAGGACACAAG
AGCTTGCCATCTTCCATCAACATAAACTCCTCCTCGATTCTAAGGGGACCGGGCCAGAGC
CATAACCATGGACTCCCAGATCTTACTCTGTTGGACAGATCTTCCAAGCATCTCACCGTT
GCGGAGATTCTTGCTTGGCTTAACAACGGCAGCAGTGAAAATGGCGGTTCTTGTTTGGCT
CAACGGTGAGAGTCCGCCTTCACTAAGATTTCATCTAGAGACACACACGTTTCTTTGATC
TTGTACACTAGAGCATCAATCAAGGACTTGCACATTTGAAAAAGATGAAGAATCAGTATA
TGGGTAAGTAGAAATTCTAAAGTGTCTTTCTATATGATTCAAAGATCTAAGAGTCTCTTC
ATTAGGTATGTTTAGTTTACTCATAGTTCCTCTAATCATACTAACAATCTAATATTTTTT
GAAAGTGGTGCTGCATATGTGTCCGTGGAGGACCAGAAGAAGCGCGTTTAGCTATGGAGA
GTACTTGGAACTTATAGAGTGTGAGTATGATCTCAAGAGATGTGTAGACTTTTACAAGCT
GAGTCACAACGTCCCCAATTCTGATGAATAAACCTCTTATCTTATACTCATGTAAGTGAC
CTTACAAAGGAAGATGATCCCCTGAATCCAGCTGTAACTAGGGTGATGGTGTAA
AGGGAAT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4AD93JQ 779 0 0
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TCAAAGATCTAAGAGTCTCTTCATTAGGTATGTTTAGTTTACTCATAGTTCCTCTAATCA
TACTAACAATCTAATATTTTTTGAAAGTGGTGCTGCATATGTGTCCGTGGAGGACCAGAA
GAAGCGCGTTTAGCTATGGAGAGTACTTGGAACTTATAGAGTGTGAGTATGATCTCAAGA
GATGTGTAGACTTTTACAAGCTGAGTCACAACGTCCCCAATTCTGATGAATAAACCTCTT
ATCTTATACTCATGTAAGTGACCTTACAAAGGAAGATGATCCCCTGAATCCAGCTGTAAC
TAGGGTGATGGTGTAAGGGAATGTAGGAAACAGAAACCGCAGTTTTCAAAGTTGTAACCT
GGTGATGACTGAGCCCACTGTAGGAACTGTTGAGAAAGAGTTGGCGACAGCAAAGTAATA
AGAACAGACGAGAGAGAATGAGATGGATGAGGAGAGAGGACACACCACAAGAGAAGCTGC
ATAGATGCTGGAGACTTATAGAGATGGAGGCGGTGTCCCTCAACTCAAAAGAGGGGCAGA
ATATGGTGGAGGTTGTAAACGCCTACACGTCTATTTCAACTTCTAAAATAACCACAATAT
GTGACAAGAATAAGTCACAATTTTATATTTTACTATATTTGATTCAACTTAATAGATTTA
TTGTACCAAACGAAAACCAATATTTTCAATTTGTCTTTCAATGGAAAACACTTCTTATG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL6569Contig1 378 2 1 U
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CTCTTTGAGGATGAATCGGCGAGTAGCAACACAAGTCACCAAGGAAGCTTCTTGAACCTC
TTGCCCCAAGTTCCAGAGAAAGAAGGCATCCAGCTCATCATCCGGTTGACGACAATATGG
CTGTCACAAGCCTAAACCAAAACTTGTAGAGAGAGAGAGAGATACAACATTCATTTTAAA
TTAACAGGTCTGAGTTTTCGAATTCAGGGTTCGAGAAAGTACAGTTTCCCTCCTGCCCTT
TGATATTTGTGTGGAGATAGAGAGAGTTTTAAGTATTGTTCAAACAGTTCCCAGAGAGAG
ATTGATATGGTTTGGTTG


BQ
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AF RR4FA62TF U 1
AF RR4FA64TF U 1
BS 1 378 RR4FA62TF

RD RR4FA62TF 378 0 0
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TTGCCCCAAGTTCCAGAGAAAGAAGGCATCCAGCTCATCATCCGGTTGACGACAATATGG
CTGTCACAAGCCTAAACCAAAACTTGTAGAGAGAGAGAGAGATACAACATTCATTTTAAA
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ATTGATATGGTTTGGTTG

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4FA64TF 378 0 0
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CTCTTTGAGGATGAATCGGCGAGTAGCAACACAAGTCACCAAGGAAGCTTCTTGAACCTC
TTGCCCCAAGTTCCAGAGAAAGAAGGCATCCAGCTCATCATCCGGTTGACGACAATATGG
CTGTCACAAGCCTAAACCAAAACTTGTAGAGAGAGAGAGAGATACAACATTCATTTTAAA
TTAACAGGTCTGAGTTTTCGAATTCAGGGTTCGAGAAAGTACAGTTTCCCTCCTGCCCTT
TGATATTTGTGTGGAGATAGAGAGAGTTTTAAGTATTGTTCAAACAGTTCCCAGAGAGAG
ATTGATATGGTTTGGTTG

QA 1 378 1 378
DS 



AS 1 2

CO CL6570Contig1 586 2 2 U
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CTCATGGTTAGTAATAGGCTGAGAAGGAGCAACACTCTGTTTGTGAGGTATTATTGTTGG
CAGTGGCTTTGCCATGGGTAAGGCAGTGACATGTTGTTGCGGAACAATCCTAGTAGGGTT
GATGTTATTAGTCTCAAGGGGCTGATTCTTAGTTTCAGAGGGTTTACCTGATGCGTCGTC
AGTGATCAGATTCTTGATCATTACGGGGTCGCGGAGGAGTTTGATAAGTAGATCAGGATC
GATCATACTCCCCTGTTCATTGGTTTTCATCAGTGCGGCAAGAGCCGCAGAAGCAGCCAG
GCTCAAGTGTGGTGCAAGACCAGAAGCCAGTTCTTGGATTGAACAGGGAAGAGGTTTTGT
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CTCTGAAGATTCAGACTCGTCCTCGATGGGAGTGAGACGAATGGCAGGAGTTTTGCTGTC
GTCAAAGCTTTCGGCTTCAACAACAGGTGAAACAGACGGTCTGCGT


BQ
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AF RR4DQ69TF U 1
AF RR4DQ69JQ C 1
BS 1 378 RR4DQ69TF
BS 379 586 RR4DQ69JQ

RD RR4DQ69TF 378 0 0
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GCTCAAGTGTGGTGCAAG

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4DQ69JQ 586 0 0
GATAGGCTTAGGTGGAGACACTCGTCTCTGCTCAGGCTTGGGTGGAGACACTCGTTTCTG
CTCATGGTTAGTAATAGGCTGAGAAGGAGCAACACTCTGTTTGTGAGGTATTATTGTTGG
CAGTGGCTTTGCCATGGGTAAGGCAGTGACATGTTGTTGCGGAACAATCCTAGTAGGGTT
GATGTTATTAGTCTCAAGGGGCTGATTCTTAGTTTCAGAGGGTTTACCTGATGCGTCGTC
AGTGATCAGATTCTTGATCATTACGGGGTCGCGGAGGAGTTTGATAAGTAGATCAGGATC
GATCATACTCCCCTGTTCATTGGTTTTCATCAGTGCGGCAAGAGCCGCAGAAGCAGCCAG
GCTCAAGTGTGGTGCAAGACCAGAAGCCAGTTCTTGGATTGAACAGGGAAGAGGTTTTGT
CTCCAACGAACCTTGCTTGCTTGCGGTGACACAAGATTCAAGAGAAGTGTTGGATGACTC
CTCTGAAGATTCAGACTCGTCCTCGATGGGAGTGAGACGAATGGCAGGAGTTTTGCTGTC
GTCAAAGCTTTCGGCTTCAACAACAGGTGAAACAGACGGTCTGCGT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6572Contig1 1124 2 2 U
GAACAGCCATGGGAATCCTCAACTCGAATTCCACGGAGTAAGAATTGAGCTTGGATGGTT
TCAAGCTACAGCTTCTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTCCC
TCTTAACACTGTAAACCAATCAGTTTCATTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCCCCTCGGAA
CAGCTCTGCATGTCCCAGCAATTCTCTTATCGAGTTGCAACAAGACTTGATCCAACCAGG
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TTCAGTACAATCTCTGGACTACAGGAGGGATTTGCTTTATCCATTTTCTCTCTTATTAAA
CAATACACGACCCGTTGGTCGTCAGGATACCCTTCTACGTTTGATCTCCATCCTTCTTCT
TGCGGATCTTTCAGTCACGGTCCTTGCATTGCTTCAGTTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGC
CTTTCTCGCTATCCTCCTGATCCTCCCTCTCGCTCTGCTTTGTCCATTCCCGGCTGGCCT
TAACGCGTTATTAAGTAAAGAAATTAGAAGAGCTTCACTTACTCGTGTCTACGCCCTTTG
GAACGCTACATCTCTAACTAACGTCATTATGGCTTTCGTTTTCGGTGTCCTTCATTCCGT
TTTTTTCTCTGGCCAACTAAGTGATAAGACAAGCATCTGGAACGCCATAAGAGATGATGA
TAAGTGGTGGGTATTACCAACAATACTGTTGTTACTCAAGTGGATACAAGCTCGGTTCCT
TGATTGGCACGTCGCAAATCTGGAAGTATCAGACTTTTCTCTTCTTTGTCCCGATCCAGA
CACGTTCTGGGCATATGAATCTGGAGCTTGACGAACGAAATGAGTAGATTGCATGTTATT
TATCATGTAAATCTGCTTAAAAAGTACAAGTAGGTAGTTCTCACTTCTCACTGCTAGGTG
GTTATCTGGTGTAGGTTATGCCATATAAAACGCTAGTTCTATAAACTAGAGAGTTTAGGT
GGAGATCAAATCCTAAAACGAAACTGAAAGTTATTCTATTTATTTTGGTATATGTATGAT
GTAAAAAGTTCAGTATATATTATAAGTTCAAATCTAATTTTATT


BQ
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AF RR4DI37TF U 1
AF RR4DI37JQ C 389
BS 1 754 RR4DI37TF
BS 755 1124 RR4DI37JQ

RD RR4DI37TF 754 0 0
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TCAAGCTACAGCTTCTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTCCC
TCTTAACACTGTAAACCAATCAGTTTCATTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCCCCTCGGAA
CAGCTCTGCATGTCCCAGCAATTCTCTTATCGAGTTGCAACAAGACTTGATCCAACCAGG
ACATGGGTTATCTCGGAAGAGAATCAATGGTGGAATAAACGGAGGCCTCGTCAACGAGAT
TTCAGTACAATCTCTGGACTACAGGAGGGATTTGCTTTATCCATTTTCTCTCTTATTAAA
CAATACACGACCCGTTGGTCGTCAGGATACCCTTCTACGTTTGATCTCCATCCTTCTTCT
TGCGGATCTTTCAGTCACGGTCCTTGCATTGCTTCAGTTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGC
CTTTCTCGCTATCCTCCTGATCCTCCCTCTCGCTCTGCTTTGTCCATTCCCGGCTGGCCT
TAACGCGTTATTAAGTAAAGAAATTAGAAGAGCTTCACTTACTCGTGTCTACGCCCTTTG
GAACGCTACATCTCTAACTAACGTCATTATGGCTTTCGTTTTCGGTGTCCTTCATTCCGT
TTTTTTCTCTGGCCAACTAAGTGATAAGACAAGCATCTGGAACGCCATAAGAGATGATGA
TAAGTGGTGGGTATTACCAACAATACTGTTGTTA

QA 1 754 1 754
DS 

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ACCT
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TTCAGTTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTCGCTATCCTCCTGATCCTCCCTCTCG
CTCTGCTTTGTCCATTCCCGGCTGGCCTTAACGCGTTATTAAGTAAAGAAATTAGAAGAG
CTTCACTTACTCGTGTCTACGCCCTTTGGAACGCTACATCTCTAACTAACGTCATTATGG
CTTTCGTTTTCGGTGTCCTTCATTCCGTTTTTTTCTCTGGCCAACTAAGTGATAAGACAA
GCATCTGGAACGCCATAAGAGATGATGATAAGTGGTGGGTATTACCAACAATACTGTTGT
TACTCAAGTGGATACAAGCTCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTGGAAGTATCAG
ACTTTTCTCTTCTTTGTCCCGATCCAGACACGTTCTGGGCATATGAATCTGGAGCTTGAC
GAACGAAATGAGTAGATTGCATGTTATTTATCATGTAAATCTGCTTAAAAAGTACAAGTA
GGTAGTTCTCACTTCTCACTGCTAGGTGGTTATCTGGTGTAGGTTATGCCATATAAAACG
CTAGTTCTATAAACTAGAGAGTTTAGGTGGAGATCAAATCCTAAAACGAAACTGAAAGTT
ATTCTATTTATTTTGGTATATGTATGATGTAAAAAGTTCAGTATATATTATAAGTTCAAA
TCTAATTTTATT

QA 5 736 5 736
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6574Contig1 380 2 1 U
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ATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCCCACCAGAGGGATGGACCCAAAGTTCCTG
AGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGCGAGAATGCCACCACTGAA
GACTAAGTTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTAGTAGACAAGTGAACCTTTTTACCTT
TATCTGTTCGTTTGATTATGTTTCCGCAAATGGTTTGTGCACTCTTTCAATCCAGGCTTT
AATTTAATATCAGATATTTT


BQ
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AF RR4BW16JQ C 1
AF RR4BW16TF U 1
BS 1 380 RR4BW16TF

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TATCTGTTCGTTTGATTATGTTTCCGCAAATGGTTTGTGCACTCTTTCAATCCAGGCTTT
AATTTAATATCAGATATTTT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR4BW16TF 380 0 0
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ATGGCAAAGTCGAAGAATCACACCGCGCATAACCAGTCGGCCAAGGCCCACAAGAACGGA
ATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCCCACCAGAGGGATGGACCCAAAGTTCCTG
AGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGCGAGAATGCCACCACTGAA
GACTAAGTTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTAGTAGACAAGTGAACCTTTTTACCTT
TATCTGTTCGTTTGATTATGTTTCCGCAAATGGTTTGTGCACTCTTTCAATCCAGGCTTT
AATTTAATATCAGATATTTT

QA 1 380 1 380
DS 



AS 1 2

CO CL6575Contig1 901 2 4 U
TTTTTATCGGTGCCTCATCTTTCTTTAAACAACTCCAAGGAGGGAACAAGGAAGACGAAT
ACAGAGAAACAGTGAACTTTATTATCATCGTTTCTTTTAATTAGTTTTGACCTTTAAAAA
AAAAGGATTAGAGTGGGTGTGTTTTGTTTGTTGTGGAGGAGATATGGCGGTGGAGCTTAT
GATGAACAGCAGCCACGGTGGCGTTAGAGTCAAAGGAGAAGACGGAGTCTTTTCTCCAAT
CATTGAAGAAGACACCGCCCTGAGAGAAGCTGCGTCTGCTGGGATTCACGGCGTCAAGGA
GTTTCTCAAACTGATCGGTCAGAAAAGTCAACCGACCGAGATAACGGCGGTGACCGACGT
CGCCGTCAACAGTTTCAAGAAGGTGATATCCCTCCTCGGCAGATCTAGAACCGGACACGC
TAGATTCAGACGAGGTCCCGCGACGACGAAAACTGAAGAAAGTGGAGGAGATTGGAAGAC
GGAGGAGAAACCAGCAACCACAACAACCACCGTCGTGTTAAACAGACAGAAAACAGAGCA
GAACGGTGGATCCGCGTTTCGCGTTTATTGTCCGACACCAATCCATCGACGTCCACCTTT
ATCACACAACAACAACAACAGTCCGACAACAAAGAACGGTTCGTCTTCTTCGGCTAACGG
AAGACCACCACAAGAGACATCAACGATAAACTTCTCGCCGTCACCACCTGTCTCAGCGGC
GAACTCGTTCATGTCTTCTCATCATAGATGTGACACCGAGAGTAACCAGATGTCATCAGG
ATTCGAGTTCACTAACCCTTCCTCTCAGGTCTCGGGTTCGATTGGTAAGCCTCCGTTATC
ATCATCAGTTTCGTTGAAGAGAAAGTGTAACTCATCTCCCTCGGGCCGTTGCCATTGTAC
C


BQ
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10 

AF RR4H738TF U 1
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ACAGAGAAACAGTGAACTTTATTATCATCGTTTCTTTTAATTAGTTTTGACCTTTAAAAA
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CATTGAAGAAGACACCGCCCTGAGAGAAGCTGCGTCTGCTGGGATTCACGGCGTCAAGGA
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CGCCGTCAACAGTTTCAAGAAGGTGATATCCCTCCTCGGCAGATCTAGAACCGGACACGC
TAGATTCAGACGAGGTCCCGCGACGACGAAAACTGAAGAAAGTGGAGGAGATTGGAAGAC
GGAG*AGAAACCAGCAACCACAACAACCACCGTCGTGTTAAACAGACAGAAAACAGAGCA

QA 1 540 1 540
DS 

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AGTGGAGGAGATTGGAAGACGGAGGAGAAACCAGCAACCACAACAACCACCGTCGTGTTA
AACAGACAGAAAACAGAGCAGAACGGTGGATCCGCGTTTCGCGTTTATTGTCCGACACCA
ATCCATCGACGTCCACCTTTATCACACAACAACAACAACAGTCCGACAACAAAGAACGGT
TCGTCTTCTTCGGCTAACGGAAGACCACCACAAGAGACATCAACGATAAACTTCTCGCCG
TCACCACCTGTCTCAGCGGCGAACTCGTTCATGTCTTCTCATCATAGATGTGACACCGAG
AGTAACCAGATGTCATCAGGATTCGAGTTCACTAACCCTTCCTCTCAGGTCTCGGGTTCG
ATTGGTAAGCCTCCGTTATCATCATCAGTTTCGTTGAAGAGAAAGTGTAACTCATCTCCC
TCGGGCCGTTGCCATTGTACC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

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TGATCACGATCCTACAAGCTCCGGCGATAACTCTGTCTGGGCCCATGTATCGCCTCTCCT
TTCCGCCGCTTGCAATGATCTTCAAGAGGGCGAGCTCATTCATGGAGATAATTTCAATCT
TTTCGCTGCTATGTCTGCCTTGGAGATAATGGACCCGAAGATGGATTCTGGTATGGTGTC
TACATTTTATTCGATCGACGAAGCCATCGAAAGTGGTTTCGCCCCCGTCCCTATCAGTTC
CGATAGGACCGCTGATGTGCAGTGCATCATTGACATTATGGACCATCTCTTGGCTTGCGA
GGCAACGTGGCACATGGGTCATTCATTGGCACAAACTGTGTTTTCATGCATCTATGTTCT
GAAACCTGAGAGGACATCTTCACATGCTCTCTTGCATTCCTTTTGTAGGGTCATCCGAGC
AACTTGCAGGGCTCTTGTTTCTGTTGTTTCAGATGCACGTACTAACGAAGTAAATTCACT
TTAGCAGATTTTCGTCCCTCTTTATTTAATGTCCCGCTTTTTATTAGTGGTGTAATTTGT
GTTCAATGTTTGAAGAATTGCATACCCTTTCTGAATTTCATTTTTCTCAATATGCTTAAG
TTTA


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4DJ70TF U 1
AF RR4DJ70JQ C 321
BS 1 709 RR4DJ70TF
BS 710 724 RR4DJ70JQ

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TGATCACGATCCTACAAGCTCCGGCGATAACTCTGTCTGGGCCCATGTATCGCCTCTCCT
TTCCGCCGCTTGCAATGATCTTCAAGAGGGCGAGCTCATTCATGGAGATAATTTCAATCT
TTTCGCTGCTATGTCTGCCTTGGAGATAATGGACCCGAAGATGGATTCTGGTATGGTGTC
TACATTTTATTCGATCGACGAAGCCATCGAAAGTGGTTTCGCCCCCGTCCCTATCAGTTC
CGATAGGACCGCTGATGTGCAGTGCATCATTGACATTATGGACCATCTCTTGGCTTGCGA
GGCAACGTGGCACATGGGTCATTCATTGGCACAAACTGTGTTTTCATGCATCTATGTTCT
GAAACCTGAGAGGACATCTTCACATGCTCTCTTGCATTCCTTTTGTAGGGTCATCCGAGC
AACTTGCAGGGCTCTTGTTTCTGTTGTTTCAGATGCACGTACTAACGAAGTAAATTCACT
TTAGCAGATTTTCGTCCCTCTTTATTTAATGTCCCGCTTTTTATTAGTGGTGTAATTTGT
GTTCAATGTTTGAAGAATTGCATACCCTTTCTGAATTTCATTTTTCTCA
TATGCTTA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4DJ70JQ 404 0 0
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AGTGCATCATTGACATTATGGACCATTTCTTGGCTTGGGAGGCAACGTGGCACATGGGTC
ATTCATTGGCACAAACTGTGTTTTCATGCATTTATGTTTTGAAACCTGAGAGGACATCTT
CACATGCTTTCTTGCATTCCTTTTGTAGGGTCATCCGAGCAACTTGCAGGGTTCTTGTTT
TTGTTGTTTCAGATGCACGTACTAACGAAGTAAATTCACTTTAGCAGATTTTCGTCCCTC
TTTATTTAATGTCCCGCTTTTTATTAGTGGTGTAATTTGTGTTCAATGTTTGAAGAATTG
CATACCCTTTTTGAATTTCATTTTTCTCAATATGCTTAAGTTTA

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL6577Contig1 797 2 10 U
TTTTTCCACGAAACTAAACTCCTCCTCCTCATCTTCACCTTCATCTTCGATGGTCATTTT
TTTGTCACAACCGGCTTCGTCTCCATCACCCCTACCGTAACTCGACTCTGTCTCCTACAT
CCTCCACTTGAACTCACCTTTGTCTCTGCGTTTTTATACAAACCCAAATTGATTTCACCT
CACTCACTTCCGGCTTCAGTTGCAACTTACTCTAATCTAATTTCTGAGTTGAAGGAGAAT
GAGAGACGGAGGAGGACGTTAGAAGATATTTCTTGAAACTGGGTGGATCAAAGGTTTCAG
CTTGAGAAGACAATGAAGATTCTTCCTGGTGGTGGAGCTGATGAAAGCAAAATAGGCGTT
GAACAAGTCAGATGGAGAATATCAATCTCTTTCTTTGCTCATATCGGGGATGGTGCACTA
TGACACCCTTGAAGTTCTGTCCAGCACTGCTACTCAGAATCTGGGATTATGTAAGAAACA
GAGAAGACTATTTCCAAATTGCAGAAACTTATATGTTTTATTCTCTGTTTGTGTTGATAG
GGAATGCTCAGAGCTTCTAGATTTATATCACTCTGAGATGCGGAGAGAGAGGAGGTTACA
TGCTGTGTACAGGAAATACTCTAAGATTGAGAACGGCAGAGGTGTTTTAGTTTCACCAGC
CAAGTCTCTCTTGAGTGCTGCTCCTCTTTCTTTATGCTTAATTTGTTGATTTGACGGGAA
AATAGTCATTCCTCAGATTCAATTTTTTTTGTTTTGAGTTCAAAAGTACTAATGAATTTC
TCTTTTTTGTATTAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C790TF U 1
AF RR4C790JQ C 340
BS 1 594 RR4C790TF
BS 595 595 RR4C790JQ
BS 596 627 RR4C790TF
BS 628 628 RR4C790JQ
BS 629 632 RR4C790TF
BS 633 633 RR4C790JQ
BS 634 656 RR4C790TF
BS 657 657 RR4C790JQ
BS 658 671 RR4C790TF
BS 672 797 RR4C790JQ

RD RR4C790TF 676 0 0
TTTTTCCACGAAACTAAACTCCTCCTCCTCATCTTCACCTTCATCTTCGATGGTCATTTT
TTTGTCACAACCGGCTTCGTCTCCATCACCCCTACCGTAACTCGACTCTGTCTCCTACAT
CCTCCACTTGAACTCACCTTTGTCTCTGCGTTTTTATACAAACCCAAATTGATTTCACCT
CACTCACTTCCGGCTTCAGTTGCAACTTACTCTAATCTAATTTCTGAGTTGAAGGAGAAT
GAGAGACGGAGGAGGACGTTAGAAGATATTTCTTGAAACTGGGTGGATCAAAGGTTTCAG
CTTGAGAAGACAATGAAGATTCTTCCTGGTGGTGGAGCTGATGAAAGCAAAATAGGCGTT
GAACAAGTCAGATGGAGAATATCAATCTCTTTCTTTGCTCATATCGGGGATGGTGCACTA
TGACACCCTTGAAGTTCTGTCCAGCACTGCTACTCAGAATCTGGGATTATGTAAGAAACA
GAGAAGACTATTTCCAAATTGCAGAAACTTATATGTTTTATTCTCTGTTTGTGTTGATAG
GGAATGCTCAGAGCTTCTAGATTTATATCACTCTGAGATGCGGAGAGAGAGGAG*TTACA
TGCTGTGTACAGGAAATACTCTAAGAT*GAGA*CGGCAGAGGTGTTTTAGTTTCAC*AGC
CAAGTCTCTCT
GAGTG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4C790JQ 458 0 0
GATGAAAGCAAAATAGGCGTTGAACAAGTCAGATGGAGAATATCAATCTCTTTCTT*GCT
CATATCGGGGATGGTGCACTATGACACC*TTGAAGTTCTGTCCAGCACTGCTACTCAGAA
TCTGGGATTATGTAAGAA*CAGAGAAGACTATTTCCAAATTGCAGAAACTTATATGTTTT
ATTCTCTGTTTGTGTTGATAGGGAATGCTCAGAGCTTCTAGATTTATATCACTCTGAGAT
GCGGAGAGAGAGGAGGTTACATGCTGTGTACAGGAAATACTCTAAGATTGAGAACGGCAG
AGGTGTTTTAGTTTCCCCAGCCAAGTCTCTCTTGAGTGCTGCTCCTCTTTCTTTATGCTT
AATTTGTTGATTTGACGGGAAAATAGTCATTCCTCAGATTCAATTTTTTTTGTTTTGAGT
TCAAAAGTACTAATGAATTTCTCTTTTTTGTATTAGTT

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL6578Contig1 1096 2 8 U
GCACCGGCGTCGCCGCCGGCGAAAATATCCCGACGTCAACGTCGGATAATGACGAACGGA
GATGGGTTTCCGGTGTTTCTTCCAAAGGAGGTAAAGAACATAAAAGATCCATTCGCAAGA
GCTCTGGCTCAAAGGATAGTACGGATTCCTGTTCCTCTTCAGATGGGAAACTTCAAAGGC
TGCGTAATGAGCAGCTGTATCAAACCAATTGTTCAACAACACGACAAAAGTCCCGTTGTT
CTTCTGCATTGTTTCGACAGTTCATGTCTTGAATGGAGACGTACTTATCCTCTGCTTGAA
CAAGCTTCTCTTGAGACTTGGGCTATTGATGTTCTTGGTTGGGGCTTCTCCGATCTTGAG
AAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCCAAGCGGCATCATCTATTCGAGCTTTGGAAAACA
TATATCAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGAGCAACAGTAGCAGTTGAT
TTCACCGCTACGTACCCTGAAGCAGTTGATAAATTGGTTCTCATTAATGCCAATGCGTAC
TCGGAAGGAACCGGTGCGCTTAAAGACTTACCAAAGTCACTTGCTTACGCTGGGGTTAAG
TTGTTGAAGTCATTCCCTCTTCGCCTTTCGGCGAACGTATTAGCCTTTTCATCTCCCTTG
TCAGAGAACATAGATTGGACTAATGTAACATCAAAACTCCCTTCATTTTCGGTTTTATTA
TTCCATATGTCAAATTGATTTTGGGAAATGAATCTATTTTTGCTTTAGATTGGCCGGTTG
CATTGTCAAATGCCGTGGTGGGAAGATGCAATGGTCGATCTTATGATTAGCGGTGGCTAT
AACGTTGCGTCACATATCAAACACATCAACCACAAGACGCTCGTCGTATGCAGTGAAAAT
GATCAGATTGTTAGCAACCAACTCTCAGTTAAACTGTTGTGTGAGCTACTGTTGAGATTG
AACCTTGATTAAATCCTCCAAGAGAAGAAGTGGAAGCAAGGAAGCTTGCCACACAAGAAA
AGAAGAATGAAGAAGTGACCAAAGAGTCATGTAGAATAAGGATGAAGAAGTGGAAGCAAG
AGATAGCTTACCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW94TF U 1
AF RR4DW94JQ C 346
BS 1 642 RR4DW94TF
BS 643 643 RR4DW94JQ
BS 644 695 RR4DW94TF
BS 696 696 RR4DW94JQ
BS 697 711 RR4DW94TF
BS 712 713 RR4DW94JQ
BS 714 741 RR4DW94TF
BS 742 1096 RR4DW94JQ

RD RR4DW94TF 748 0 0
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GATGGGTTTCCGGTGTTTCTTCCAAAGGAGGTAAAGAACATAAAAGATCCATTCGCAAGA
GCTCTGGCTCAAAGGATAGTACGGATTCCTGTTCCTCTTCAGATGGGAAACTTCAAAGGC
TGCGTAATGAGCAGCTGTATCAAACCAATTGTTCAACAACACGACAAAAGTCCCGTTGTT
CTTCTGCATTGTTTCGACAGTTCATGTCTTGAATGGAGACGTACTTATCCTCTGCTTGAA
CAAGCTTCTCTTGAGACTTGGGCTATTGATGTTCTTGGTTGGGGCTTCTCCGATCTTGAG
AAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCCAAGCGGCATCATCTATTCGAGCTTTGGAAAACA
TATATCAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGAGCAACAGTAGCAGTTGAT
TTCACCGCTACGTACCCTGAAGCAGTTGATAAATTGGTTCTCATTAATGCCAATGCGTAC
TCGGAAGGAACCGGTGCGCTTAAAGACTTACCAAAGTCACTTGCTTACGCTGGGGTTAAG
TTGTTGAAGTCATTCCCTCTTCGCCTTTCGGCGAACGTATTA*CCTTTTCATCTCCCTTG
TCAGAGAACATAGATTGGACTAATGTAACATCAAA*CTCCCTTCATTTTCG**TTTATTA
TTCCATATGTCAAATTGATTT
GGGAATG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4DW94JQ 751 0 0
TTCTCCGATCTTGAGAAACTTCCACCATGTGATGCAGCATCCAAGCGGCATCATCTATTC
GAGCTTTGGAAAACATATATCAAACGACCAATGATTTTAGTTGGACCAAGCTTAGGAGCA
ACAGTAGCAGTTGATTTCACCGCTACGTACCCTGAAGCAGTTGATAAATTGGTTCTCATT
AATGCCAATGCGTACTCGGAAGGAACCGGTGCGCTTAAAGACTTACCAAAGTCACTTGCT
TACGCTGGGGTTAAGTTGTTGAAGTCATTCCCTCTTCGCCTTTCGGCGAACGTATTAGCC
TTTTCATCTCCCTTGTCAGAGAACATAGATTGGACTAATGTAACATCAAAACTCCCTTCA
TTTTCGGTTTTATTATTCCATATGTCAAATTGATTTTGGGAAATGAATCTATTTTTGCTT
TAGATTGGCCGGTTGCATTGTCAAATGCCGTGGTGGGAAGATGCAATGGTCGATCTTATG
ATTAGCGGTGGCTATAACGTTGCGTCACATATCAAACACATCAACCACAAGACGCTCGTC
GTATGCAGTGAAAATGATCAGATTGTTAGCAACCAACTCTCAGTTAAACTGTTGTGTGAG
CTACTGTTGAGATTGAACCTTGATTAAATCCTCCAAGAGAAGAAGTGGAAGCAAGGAAGC
TTGCCACACAAGAAAAGAAGAATGAAGAAGTGACCAAAGAGTCATGTAGAATAAGGATGA
AGAAGTGGAAGCAAGAGATAGCTTACCACCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL6579Contig1 1201 2 2 U
GGGAACCAATCTTCTGTTCCCTAAGAAAGATAGTTGTTGAGTTCCAGGCGTTCTTCTCCG
GCTATGTGTAACAAGTGCTCATCTTCCTTTCTCCTTTCTCTTCCCGCCCTCGATGCTCGA
CCCACTTCATACAACTTTAGACTACGGGCTCAGCATTCGATAATCACTAGCTCAGGAAGG
AGGAGGAGTCACCTCTCAATCCATGAAATCAAGACTCTTTCATCATCAAAACAAGCATCT
TGCAGTTTTGGTGCCCAAGACTCTGCCTTTCTCCGGAAATTCAAGTTTAAAGCGAAATCA
AGCGGCAAGTTCGTAGCTTGCTCCAGTGAAGAAGAAGAAGAAGATGTAGTAGTAGATTCT
GCTCATTTGGGTTTCCTGGAAAACGAATCTCCTGGAGATGGTGGTTTGATTCAGCAAGCG
GGTCAAGACAATCTGACCAACATAGGCTCGAAAGGATTCAAACAGACGTTGACGAGATCG
AATCTTTTAGCTAAGCAAGTTATTAGTATACAATCAGCTCTGAGTTTAGGCTTTATCTCT
CAGCTCTGGGTTGACACTTCTTCTTGGTTGGTTTTGGTGGTGGATGTTAAACCCAGCTTG
CTATCTGGAGAGTCTGAGAGATTCTTGCTCAACGACATCACTCGGGTGGGTGATGTTGTT
CTTGTGAAAGATGATGCTGTACTGGACACTGAGTTCAAAATGGTCCGACTTGAAACACTG
GTAGGTTACAGAGTAGTGACACCAGGAGGACGGAACATCTGAAAGGTTCGAGGTTACTCA
TTCAACATTAACTCCGGAGCAGTTGAATCGCTTGAGCTTGATTCGTTTGGAGTTACCATC
ATACCATCAAGTTTGGTCAGTACATACAGATTAGATGTTGAGGACGTAATTGAGGTCTTA
GAAGACATAGTTGTGGTTGACGAATCTGCAGCTTTTAGAAAACAGAGGTTGACAAAGGGA
CTATGGGATACTCAGTTTGGTAGTGAATACTCTTCTGACGTTGAGGAGTTCGAGAGTTCA
TCTGATAGAAGGCGGCGAAGCAGAAGCAGTAGATCAAGTCGAAAGAAGAAAGATTTAGAC
GACGACGAATGGGACATGTTTCGCTAGAAGTCATACATTCATTGTTTGCCATTCATCTTA
AGCTTCTTGACTTACATCGTCAGCTGTGTCTGATAGAGAGAATGTAAAATAACGTTTGTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4DQ49TF U 1
AF RR4DQ49JQ C 518
BS 1 721 RR4DQ49TF
BS 722 1201 RR4DQ49JQ

RD RR4DQ49TF 721 0 0
GGGAACCAATCTTCTGTTCCCTAAGAAAGATAGTTGTTGAGTTCCAGGCGTTCTTCTCCG
GCTATGTGTAACAAGTGCTCATCTTCCTTTCTCCTTTCTCTTCCCGCCCTCGATGCTCGA
CCCACTTCATACAACTTTAGACTACGGGCTCAGCATTCGATAATCACTAGCTCAGGAAGG
AGGAGGAGTCACCTCTCAATCCATGAAATCAAGACTCTTTCATCATCAAAACAAGCATCT
TGCAGTTTTGGTGCCCAAGACTCTGCCTTTCTCCGGAAATTCAAGTTTAAAGCGAAATCA
AGCGGCAAGTTCGTAGCTTGCTCCAGTGAAGAAGAAGAAGAAGATGTAGTAGTAGATTCT
GCTCATTTGGGTTTCCTGGAAAACGAATCTCCTGGAGATGGTGGTTTGATTCAGCAAGCG
GGTCAAGACAATCTGACCAACATAGGCTCGAAAGGATTCAAACAGACGTTGACGAGATCG
AATCTTTTAGCTAAGCAAGTTATTAGTATACAATCAGCTCTGAGTTTAGGCTTTATCTCT
CAGCTCTGGGTTGACACTTCTTCTTGGTTGGTTTTGGTGGTGGATGTTAAACCCAGCTTG
CTATCTGGAGAGTCTGAGAGATTCTTGCTCAACGACATCACTCGGGTGGGTGATGTTGTT
CTTGTGAAAGATGATGCTGTACTGGACACTGAGTTCAAAATGGTCCGACTTGAAACACTG
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4DQ49JQ 684 0 0
CTCTGAGTTTAGGCTTTATCTCTCAGCTCTGGGTTGACACTTCTTCTTGGTTGGTTTTGG
TGGTGGATGTTAAACCCAGCTTGCTATCTGGAGAGTCTGAGAGATTCTTGCTCAACGACA
TCACTCGGGTGGGTGATGTTGTTCTTGTGAAAGATGATGCTGTACTGGACACTGAGTTCA
AAATGGTCCGACTTGAAACACTGGTAGGTTACAGAGTAGTGACACCAGGAGGACGGAACA
TCTGAAAGGTTCGAGGTTACTCATTCAACATTAACTCCGGAGCAGTTGAATCGCTTGAGC
TTGATTCGTTTGGAGTTACCATCATACCATCAAGTTTGGTCAGTACATACAGATTAGATG
TTGAGGACGTAATTGAGGTCTTAGAAGACATAGTTGTGGTTGACGAATCTGCAGCTTTTA
GAAAACAGAGGTTGACAAAGGGACTATGGGATACTCAGTTTGGTAGTGAATACTCTTCTG
ACGTTGAGGAGTTCGAGAGTTCATCTGATAGAAGGCGGCGAAGCAGAAGCAGTAGATCAA
GTCGAAAGAAGAAAGATTTAGACGACGACGAATGGGACATGTTTCGCTAGAAGTCATACA
TTCATTGTTTGCCATTCATCTTAAGCTTCTTGACTTACATCGTCAGCTGTGTCTGATAGA
GAGAATGTAAAATAACGTTTGTTC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6580Contig1 847 2 12 U
GGATAACATTTAACTACAGCAAACACAAAAGGATATGAAGTCTATCTACTGAGGATCGAG
AGCTAATTATTTTATATATGGGTCATATGGCGATTTCTCACGGCCAGCCTTTGCTTCTTC
TGCTCCTTGTATCACTCTTTCTCTTACCGGCTGCTTTGGGCGAATCTACTGGATTCGTAA
CCTGCAATAGCACTTTTGACTACCCCGTTGTTGTCAACACTGTGGAGATCTCCCCAGACA
CGATTACGAGTAGCACTAATGCAAACATTACGATAACCGGTGATACAAGCATAGACATCC
TTGATGAAACAATCGTACGATTAAACCTTTGGTCAGGCCTTTTTGAGGCGAAGAGAAGCT
ACCCCTTATGTGATATAGTGGCCTGCCCTGTTAAACCAGGCCCCATTGTGTTTACTTTCT
CTAACGTATTCACTGAGGAAGAACTAGAACCAGGGAGGCTATATCTTGTTGGAATAGCCA
TCTATGGGAAGGACCAGCGTACATTTATGCCAGAGATAATGTGCATCGAGTTCAGCTGTG
ATACCCATACGTCTGCTTAGGCAAGTTACCGAGTGAAACTATGTGGCAAGTCTTTTATGA
ATCTGATGATCTCTCGTTACTCTTTGTATGCATTGTAATCTTAATGTTTTTATCCTTTTA
ACCTTTATGTGTCACCCAACAAATAAAATAAGCGTGTTGATAAACACACTTGACCTATTT
CGATTTGTCTATGTTTTTAATCTGTTTTTAAGCACCTAAATTTATATACTCGTTATTGTG
TTTTCCATTTCGGAACCTATGCTGATATACTTAATGTGAGAAAGATTTGGTCAACCTTCC
TAACGGG


BQ
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AF RR4CU02TF U 1
AF RR4CU02JQ C 361
BS 1 682 RR4CU02TF
BS 683 683 RR4CU02JQ
BS 684 703 RR4CU02TF
BS 704 704 RR4CU02JQ
BS 705 737 RR4CU02TF
BS 738 739 RR4CU02JQ
BS 740 748 RR4CU02TF
BS 749 750 RR4CU02JQ
BS 751 763 RR4CU02TF
BS 764 764 RR4CU02JQ
BS 765 776 RR4CU02TF
BS 777 847 RR4CU02JQ

RD RR4CU02TF 786 0 0
GGATAACATTTAACTACAGCAAACACAAAAGGATATGAAGTCTATCTACTGAGGATCGAG
AGCTAATTATTTTATATATGGGTCATATGGCGATTTCTCACGGCCAGCCTTTGCTTCTTC
TGCTCCTTGTATCACTCTTTCTCTTACCGGCTGCTTTGGGCGAATCTACTGGATTCGTAA
CCTGCAATAGCACTTTTGACTACCCCGTTGTTGTCAACACTGTGGAGATCTCCCCAGACA
CGATTACGAGTAGCACTAATGCAAACATTACGATAACCGGTGATACAAGCATAGACATCC
TTGATGAAACAATCGTACGATTAAACCTTTGGTCAGGCCTTTTTGAGGCGAAGAGAAGCT
ACCCCTTATGTGATATAGTGGCCTGCCCTGTTAAACCAGGCCCCATTGTGTTTACTTTCT
CTAACGTATTCACTGAGGAAGAACTAGAACCAGGGAGGCTATATCTTGTTGGAATAGCCA
TCTATGGGAAGGACCAGCGTACATTTATGCCAGAGATAATGTGCATCGAGTTCAGCTGTG
ATACCCATACGTCTGCTTAGGCAAGTTACCGAGTGAAACTATGTGGCAAGTCTTTTATGA
ATCTGATGATCTCTCGTTACTCTTTGTATGCATTGTAATCTTAATGTTTTTATCCTTTTA
ACCTTTATGTGTCACCCAACAA*TAAAATAAGCGTGTTGATAA*CACACTTGACCTATTT
CGATTTGTCTATGTTTT**ATCTGTTTT**AGCACCTAAATTT*TATACTCGTTAT
GTGTTTCATT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4CU02JQ 487 0 0
ACCCCTTATGTGATATAGTGGCCTGCCCTGTTAAACCAGGCCCCATTGTGTTTACTTTTT
CTAACGTATTCACTGAGGAAGAACTAGAACCAGGGAGGCTATATCTTGTTGGAATAGCCA
TTTATGGGAAGGACCAGCGTACATTTATGCCAGAGATAATGTGCATCGAGTTCAGCTGTG
ATACCCATACGTCTGCTTAGGCAAGTTACCGAGTGAAACTATGTGGCAAGTCTTTTATGA
ATCTGATGATCTCTCGTTACTCTTTGTATGCATTGTAATCTTAATGTTTTTATCCTTTTA
ACCTTTATGTGTCACCCAACAAATAAAATAAGCGTGTTGATAAACACACTTGACCTATTT
CGATTTGTCTATGTTTTTAATCTGTTTTTAAGCACCTAAATTTATATACTCGTTATTGTG
TTTTCCATTTCGGAACCTATGCTGATATACTTAATGTGAGAAAGATTTGGTCAACCTTCC
TAACGGG

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL6581Contig1 945 2 6 U
CTAAAAAGACATTAAACTCTTAGCAAAACAAGAACAGAGCATCATAATTTTTCATAACAA
GCCAACAATAAGCGTTTCAGATATTGTACTACAGTCTTTTAAAAATCGAATGAAAAGCTT
CTTTCTTTGCCTTGGTTTTTGTATTGTTATTATTACCTAGCCCTAGCTTTAAGAGTTAAA
GCTTTGTGCTGAAGCTTTCTTGAGCTCAATAGCTCTTTTATAAGGCGGTGCGATCGGAGG
CTGGATCGGGTCCAGACTTCGGTATGACGATCCATCTGCCTCTTTTGGGAGTGGGTACGA
CCGGTCCGAGTCATAACCGCTTAAGTCACCACATGCCAAGAATGGAATATAAACTTTGTT
GGGTCCTTCAAGCCAACCACTGCTGCAATCGAGATCGCTTCCACCTGAAGGGCTTCCGAC
TTTCTCCAAGAGACGATGCAGATCTCTCGGGTTAAATCCTTCTGGTGGGGAGTAATTTTC
GCAGACAGCAAAAGCCTCTATACTAGAATTGCGGCTGCTTTTAGGTTTCGCAAAAGTCAC
AGTTGGAAAAAACAACTTCAGCTGACAGTACAAGAGACTTGTGTCTTTTCCACGGAAGAT
TTTTGCAATAAATTTTCCACCTTCTTTAAGAATATGGGTTACAATCGTTAAGCCCGCCAG
TATGAGTTGGGACTGGACAAATTCATCCATGTCATGCAAACCGGTAACATCTGGAGCACC
ATCACAGACAACCAGATCAGCCTTGCAACCGTCAAAATGTCTAATGACCACTTCGGCAGT
CCGAGCATTAGTTATGTCCCCTTGAACTTGGATTACACCTTCGATTGGAGCCATAGGCTG
CAAATCTATGGCCACTATAAGAGGAAGATCTTCTTCTTTGGAATCAGCTGAATACTTTGC
AGGAAGATACAGTTGACGACTGAGAACCTGACTCCAGCTACCAGC


BQ
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AF RR4EK22JQ U 1
AF RR4DI09TF C 369
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BS 716 728 RR4EK22JQ
BS 729 945 RR4DI09TF

RD RR4EK22JQ 728 0 0
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GCCAACAATAAGCGTTTCAGATATTGTACTACAGTCTTTTAAAAATCGAATGAAAAGCTT
CTTTCTTTGCCTTGGTTTTTGTATTGTTATTATTACCTAGCCCTAGCTTTAAGAGTTAAA
GCTTTGTGCTGAAGCTTTCTTGAGCTCAATAGCTCTTTTATAAGGCGGTGCGATCGGAGG
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TTTCTCCAAGAGACGATGCAGATCTCTCGGGTTAAATCCTTCTGGTGGGGAGTAATTTTC
GCAGACAGCAAAAGCCTCTATACTAGAATTGCGGCTGCTTTTAGGTTTCGCAAAAGTCAC
AGTTGGAAAAAACAACTTCAGCTGACAGTACAAGAGACTTGTGTCTTTTCCACGGAAGAT
TTTTGCAATAAATTTTCCACCTTCTTTAAGAATATGGGTTACAATCGTTAAGCCCGCTAG
TATGAGTTGGGACTGGACAAATTCATCCATGTCATGCAAACCGGTAACATCTGGGGCACC
ATCACAGA

QA 1 728 1 728
DS 

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AGAGACGATGCAGATCTCTCGGGTTAAATCCTTCTGGTGGGGAGTAATTTTCGCAGACCG
CAAATGCCTCTATACTAGAATTGCGGCTGCTTTTAGGTTTCGCAAAAGTCACAGTTGGAA
AAAACAACTTCAGCTGACAGTACAAGAGACTTGTGTCTTTTCCACGGAATATTTTTGCAA
TAAATTTTCCACCTTCTTTAAGAATATGGGTTACAATCGTTAAGCCCGCCAGTATGAGTT
GGGACTGGACAAATTCATCCATGTCATGCAAACCGGTAACATCTGGAGCACCATCACAGA
CAACCAGATCAGCCTTGCAACCGTCAAAATGTCTAATGACCACTTCGGCAGTCCGAGCAT
TAGTTATGTCCCCTTGAACTTGGATTACACCTTCGATTGGAGCCATAGGCTGCAAATCTA
TGGCCACTATAAGAGGAAGATCTTCTTCTTTGGAATCAGCTGAATACTTTGCAGGAAGAT
ACAGTTGACGACTGAGAACCTGACTCCAGCTACCAGC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

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TCTTTTAACCTTTTTAATTGCATCAAAGATCGCTCTCCTTCTTTTCGCAGTGGTCTTGTT
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TTTCAATGCTTCTTGCACAAACACCTTCAGCCTCCACAAAGTTACATCAGTCTGAAAATC
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TTTCAAAGCCTTAAACAGATCCTCAGGAGAGAGACGACCTAAAGCTGCAGAAAGTCCCTT
CTTTTCTTGAGTGGACAGCTTTCTGCACTTCTGGACCACTACCTCCCGAAGTTTCTCAAG
CTCCTGATCGATCTCATACAGTTCGTTGCTTAAATCTCTAGCCTTCTCTGCTTGAGCAGC
CTCCACAGCAAGCTGCCTACTCGCACGATCCTGAGCCTCTTCCTCTGCTTGTT


BQ
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AF RR4DG20JQ U 1
AF RR4CT73JQ U 6
BS 1 388 RR4DG20JQ
BS 389 593 RR4CT73JQ

RD RR4DG20JQ 388 0 0
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CGGATTAATACAAAGAGATATTAGGGAAAGAAAAGAAAAGGGATTTCAAGCCTTCTTGGC
TCTTTTAACCTTTTTAATTGCATCAAAGATCGCTCTCCTTCTTTTCGCAGTGGTCTTGTT
CATCTCTCCACCATTGTTGTTGTTTTGGGCGTTTGTTCCACCAAAGCTCTTGTTAGCTGC
TTTCAATGCTTCTTGCACAAACACCTTCAGCCTCCACAAAGTTACATCAGTCTGAAAATC
GATGTCAAGCTCCACTTCTGGTGCTCCGGCCGGGAACTGCGGGTTGCCCTATGAAACCAT
TTTCAAAGCCTTAAACAGATCCTCAGGA

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4CT73JQ 588 0 0
C
GGAAAGGCTTCTGCTAATTTAGATTTGATGTTCACCAGTTTCATCTTTTCCTTGCGGATT
AATACAAAGAGATATTAGGGAAAGAAAAGAAAAGGGATTTCAAGCCTTCTTGGCTCTTTT
AACCTTTTTAATTGCATCAAAGATCGCTCTCCTTCTTTTCGCAGTGGTCTTGTTCATCTC
TCCACCATTGTTGTTGTTTTGGG*GTTTGTTCCACCAGAGCTCTTGTTAGCTGCTTTCAA
TGCTTCTTGCACAAACACCTTCAGCCTCCACAAAGTTACATCAGTCTGAAGATCGATGTC
AAGCTCCACTTCTGGTGCTCCGGCCGGGAACTGCGGGTTGCCCTCTGAAACCATTTTCAG
AGCCTTAGACAGGTCCTCAGGAGAGAGACGACCTAAAGCTGCAGAAAGTCCCTTCTTTTC
TTGAGTGGACAGCTTTCTGCACTTCTGGACCACTACCTCCCGAAGTTTCTCAAGCTCCTG
ATCGATCTCATACAGTTCGTTGCTTAAATCTCTAGCCTTCTCTGCTTGAGCAGCCTCCAC
AGCAAGCTGCCTACTCGCACGATCCTGAGCCTCTTCCTCTGCTTGTT

QA 2 588 2 588
DS 



AS 1 2

CO CL6583Contig1 711 2 3 U
AAATACTTTAGCTGCGGGCTGTTACAAGATTTTCTCATAGCCACTTCAGCTATATAACTC
ACAATTAAAAAACGAACTCACAAAAAAAGAAACAAAACATTAAAAAGAAAATACACACAA
AAAGTCAAAGATACTATTCTCCCCTCAATTAGCGGAGAGATTTCTTTTGTCTCGACCACT
TCAATGTTTAGTTTCTCGAAACTCACTTTAGACCCTGAAATTCTTCCCGACAAAGGTTTG
ACCAAACTGCCAGTTAGAAGGAACGATGTTCCATGAAGTAGAGGTTCTACGGTCACTGCC
GGTGACACGAAAAGAAAGTGACTGACCAACCAAAACAGCGTTAGATTGCCAGTTCTGACC
CCAGTTTCTGCTCAGACTCATCCAACCAGTCCTTGAACCTTTCACACTCGTCCTCACGAT
GTCTCCTGCTCCCGCAACGTTAGTTATCAGAACCAAGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGAT
TGTGAGCCTTATTCCTCCTCTCTTTCTGCATGGCACCCTGCGGTATGAGACAGGGACAAT
GCCGGCACGGTATTGAGCAATCTTGAGGAATGCAGGCATGGCTAGGTCGAAGTGTTCACG
TGGCGGGTTGCACCACCCACCGTTATCGCTGGCCTGAGCAAAGTTTGGTGGGCAGAAATT
GGTTGCGGTAATGAGGAGATGGGCTACCTGAATGGCACCATTGTGGGTCGC


BQ
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AF RR4GU33TF C 1
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TCAATGTTTAGTTTCTCGAAACTCACTTTAGACCCTGAAATTCTTCCCGACAAAGGTTTG
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GTCTCCTGCTCCCGCAACGTTAGTTATCAGAACCAAGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGAT
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QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4GU33JQ 684 0 0
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AAAAAAAGAAACAAAACATTAAAAAGAAAATACACACAAAAAGTCAAAGATACTATTCTC
CCCTCAATTAGCGGAGAGATTTCTTTTGTCTCGACCACTTCAATGTTTAGTTTCTCGAAA
CTCACTTTAGACCCTGAAATTCTTCCCGACAAAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAGAAGG
AACGATGTTCCATGAAGTAGAGGTTCTACGGTCACTGCCGGTGACACGAAAAGAAAGTGA
CTGACCAACCAAAACAGCGTTAGATTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAGACTCAT
CCAACCAGTCCTTGAACCTTTCACACTCGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCAACGTT
AGTTATCAGAACCAAGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGATTGTGAGCCTTATTCCTCCTCT
CTTTCTGCATGGCACCCTGCGGTATGAGACAGGGACAATGCCGGCACGGTATTGAGCAAT
CTTGAGGAATGCAGGCATGGCTAGGTCGAAGTGTTCACGTGGCGGGTTGCACCACCCACC
GTTATCGCTGGCCTGAGCAAAGTTTGGTGGGCAGAAATTGGTTGCGGTAATGAGGAGATG
GGCTACCTGAATGGCACCATTGTG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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GTTCTCGGGCGACACAAACCTCAGGTCGAGGTTTTGGGGAGATCGATTCAACTTGAACCC
GTTGGAGTCTTGACTCTTGAGTTCGATGATGGAGAGACTTTCCAGTGGAGCAAAGTAACA
ACAACTATATACAATATTCTACTTGGTAAATTGTACTGTGATCACCATGGGACAATGCAA
ATCCGTGGGAATCGCCAATATTCTTGTACGCTTAAGTTCAAAGAGCAATCGATCCTCGAT
AGAAACCCACATCAGGTTAATGGTGTTGTAGAAGATGTAACTGGGAAAAAGGCTGCGACA
GTATTTGGTAAATGGAATGATAGCCTTCACTATGTTGCTGGTGATGCGCTTAACAAAGCA
AGCGCCTCGTTGCTGTGGAAAACGACCAAGCCACCACCTAATGTGACTAGATACAACTTA
ACATCATTCGCGATCACTCTAAATGAATTGACACCTGGTTTGGAGGAGAAGCTGCCACCG
ACAGATTCTAGGCTCCGACCAGATCAACGGCACCTGGAGAAGGGTGAATATGAGAAGGCA
AACGAAGAGAAACAGAGATTAGAGAGAAGGCAAAGAATGTCACGGAAGATTCAGGAAAGC
GGGTGGAGGCCGAGATGGTTCGAGCAGCAAGGGGAGAGTGAAAGCTACAAGTTTACAGGT
GGTTATTGGGAAGCACGAGAAGAGAGGAGGGGATGATTGCCCTAACATATTTGGAGAGTT
CGCCGAGGAGATTACAGATTGTGCTTAAGATGAGGGCTAAGGAGGCTTTTTTCCGTGCAC
CAGAGATGATCTCTTTTCGGCAATGACAGAGTTTTCTTTCTGTTCTTCTAAACTCGGGAG
ATAGAAAGAGGCAAATGAAAGATGATTTTTCTTTTTCTTTTTGTGGTAACGGTGTTTGTT
ATATCTTCAAGAGGGTCCTAAAAGTTCTTTTAAAAAAAAGAAAGTTTATAGAAGAAATCA
CTGTAAAGGTCAGTGGGAAAAA


BQ
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AF RR4FA68JQ C 487
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ACAACTATATACAATATTCTACTTGGTAAATTGTACTGTGATCACCATGGGACAATGCAA
ATCCGTGGGAATCGCCAATATTCTTGTACGCTTAAGTTCAAAGAGCAATCGATCCTCGAT
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GTATTTGGTAAATGGAATGATAGCCTTCACTATGTTGCTGGTGATGCGCTTAACAAAGCA
AGCGCCTCGTTGCTGTGGAAAACGACCAAGCCACCACCTAATGTGACTAGATACAACTTA
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ACAGATTCTAGGCTCCGACCA

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DS 

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AGAGGCAAATGAAAGATGATTTTTCTTTTTCTTTTTGTGGTAACGGTGTTTGTTATATCT
TCAAGAGGGTCCTAAAAGTTCTTTTAAAAAAAAGAAAGTTTATAGAAGAAATCACTGTAA
AGGTCAGTGGGAAAAA

QA 1 556 1 556
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAAATCCCAGATACCGATGCAAAGCAGCCTGAGGACTGGGATGAAGAAGAAGATGGTGAG
TGGACTGCCCCGACCGTTCCCAACCCTGAGTACATGGGTGAATGGAAACCGAAGCAAATT
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GATGACCCAGAGCTCTACGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGTGGCAG
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ATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCTCCTGCGGAAACTGATGCT
GAAGATGATGCAGTGGACGATGAGGGAGATGAATCTGATACTGAAGCTAACACCGAAGCC
AAATCAGGAGTTAGCGAGGAGACTTCAGAGAAAGACGCCACTGCTCATGATGAGCTATGA
GGTTGAAGATTCAAGACCAAAGTTTTCAAGTCTCTGTTTTGTGTTTTTATCCTTGCTTTT
GAAGTATTTTTAGCAGTCTAGTTTTAGCATATGATATGACGATCATAGGCTCTTTTTTTA
CTGAAAACCGTATGATGACATTTTAC


BQ
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AF RR4CK39TF U 1
AF RR4CK39JQ C 24
BS 1 435 RR4CK39TF
BS 436 746 RR4CK39JQ

RD RR4CK39TF 441 0 0
CAAGAGTACATTTCCGACCCTGAAGACAAGAAACCTGACGGATACGATGATATCCCAAAG
GAAATCCCAGATACCGATGCAAAGCAGCCTGAGGACTGGGATGAAGAAGAAGATGGTGAG
TGGACTGCCCCGACCGTTCCCAACCCTGAGTACATGGGTGAATGGAAACCGAAGCAAATT
AAGAACCCCAACTACAAGGGAAAGTGGGAGGCTCCAGAGATTGACAACCCTGACTTTAAG
GATGACCCAGAGCTCTACGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGTGGCAG
GTGAAATCAGGATCGTTGTTCGACAATGTTTTAATCTGCGGTGACCCAGACTATGCCAAG
AAGTTGGCAGATGAAACATGGGGGAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCGATGAG
ATTGAGAAGAAGAAA
AGAGGA

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR4CK39JQ 723 0 0
AGACAAGAAAC*TGACGGATACGATGATATCCCAAAGGAAATCCCAGATACCGATGCAAA
GCAGCCTGAGGACTGGGATGAAGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCGACCGTTCCCAA
CCCTGAGTACATGGGTGAATGGAAACCGAAGCAAATTAAGAACCCCAACTACAAGGGAAA
GTGGGAGGCTCCAGAGATTGACAACCCTGACTTTAAGGATGACCCAGAGCTCTACGTCTT
CCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGTGGCAGGTGAAATCAGGATCGTTGTTCGA
CAATGTTTTAATTTGCGGTGACCCAGACTATGCCAAGAAGTTGGCAGATGAAACATGGGG
GAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCGATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGA
GGAATCCAAGGACGCTCCTCCTGCGGAAACTGATGCTGAAGATGATGCAGTGGACGATGA
GGGAGATGAATCTGATACTGAAGCTAACACCGAAGCCAAATCAGGAGTTAGCGAGGAGAC
TTCAGAGAAAGACGCCACTGCTCATGATGAGCTATGAGGTTGAAGATTCAAGACCAAAGT
TTTCAAGTCTCTGTTTTGTGTTTTTATCCTTGCTTTTGAAGTATTTTTAGCAGTCTAGTT
TTAGCATATGATATGACGATCATAGGCTCTTTTTTTACTGAAAACCGTATGATGACATTT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL6587Contig1 404 2 1 U
GGAATGGCCCAAGAAGCGGCCCAGAAACGTTCAGAGACAGATTGATTCGCAGTCATTGTA
TCCAGCTCATTATTTTGGTGAAGTCACGAAAGATATGTACGATGTCCCAGACGCAGCCGA
GAGCGGAAAGAAATTATGCTTATGGATGAAAGTTGCACGGCTTTATTTCGCTGACTTGTG
GAAAATGTTTTGAAGTTGGGAGTGTTGATCAAACTAGAAGATGCTTTTGAATTTCTTTTG
CTATTCTTTTTGTTAGTTTTAGTTTGGGCTGAAATAAGCTGTACAAAGATATTGGAGGAA
GTTAAGCAAGGTGTTGATGTAATTAGAACATACTCTTTGATTCAGTATGTCAGCAACGAA
CAGCCAATAATAATAATCATCAATAAAAGGATGAACAATTCACC


BQ
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AF RR4H265JQ C 1
AF RR4H265TF U 1
BS 1 404 RR4H265TF

RD RR4H265JQ 404 0 0
GGAATGGCCCAAGAAGCGGCCCAGAAACGTTCAGAGACAGATTGATTCGCAGTCATTGTA
TCCAGCTCATTATTTTGGTGAAGTCACGAAAGATATGTACGATGTCCCAGACGCAGCCGA
GAGCGGAAAGAAATTATGCTTATGGATGAAAGTTGCACGGCTTTATTTCGCTGACTTGTG
GAAAATGTTTTGAAGTTGGGAGTGTTGATCAAACTAGAAGATGCTTTTGAATTTCTTTTG
CTATTCTTTTTGTTAGTTTTAGTTTGGGCTGAAATAAGCTGTACAAAGATATTGGAGGAA
GTTAAGCAAGGTGTTGATGTAATTAGAACATACTCTTTGATTCAGTATGTCAGCAACGAA
CAGCCAATAATAATAATCATCAATAAAAGGATGAACAATTCACC

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4H265TF 404 0 0
GGAATGGCCCAAGAAGCGGCCCAGAAACGTTCAGAGACAGATTGATTCGCAGTCATTGTA
TCCAGCTCATTATTTTGGTGAAGTCACGAAAGATATGTACGATGTCCCAGACGCAGCCGA
GAGCGGAAAGAAATTATGCTTATGGATGAAAGTTGCACGGCTTTATTTCGCTGACTTGTG
GAAAATGTTTTGAAGTTGGGAGTGTTGATCAAACTAGAAGATGCTTTTGAATTTCTTTTG
CTATTCTTTTTGTTAGTTTTAGTTTGGGCTGAAATAAGCTGTACAAAGATATTGGAGGAA
GTTAAGCAAGGTGTTGATGTAATTAGAACATACTCTTTGATTCAGTATGTCAGCAACGAA
CAGCCAATAATAATAATCATCAATAAAAGGATGAACAATTCACC

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL6588Contig1 1005 2 2 U
GGAATTTTGTGTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGATATTTCTAGGGT
TTGTTCGATTCTCCGACAACGATGATGAATCCCGAGGATGCGAAGGCGAAACGAGATTCA
ACGGAGGTGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAACCGAAGATCGAAGATGAAGACGAC
ACAGGCATGGAAGACGAAGTCGATAGCGATAGCAATAACCCATACTTATGGAGTGCCGAC
GAAGAAGACGATGACTCTCCGACAATCAACTATTCAAACTTGCAAGATCCGGAACCGGAG
TGGGACAAGGACAGTTACGACGACCACGAATTGGTATTCGATTCTGACGGCCGTAAAGGT
TTCTCTAGCGACAAGGCGTATGAAGAGTTCCGCGAGTATAAAACCATGTGCTTTAAGAAT
AGGGGGTTTATAGATGATCCATTCAGATCCATCTACCCCATGAGAGATCTGGACGATCTC
TCGATAACCCCGACTGATAGGCAATATTTGACAGATATTGCTTCCCTCTGTGTTAAGAAA
CTCAACGAGCAGAATGGTTCGTCTGTGGAAGTTGTAAGCATTGTGAGAGGCAATCTTAAA
CCAGGAGGTGGGTTTAAGCTTTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGTATCCTAATGGTCCT
CCCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCCATGGATTTTGCGGGAGACAAAATACCTCCATTTCCC
ATTCTCTGCAGACCAACGTCTAGCATGCCTTAAAGATTGGGTATGATCCTCTTCTAGAGG
AAGATGAAGATCAAAATAAGGATTTTCAGTTATAAGTTTCATGAGTTCTCATGTGGATTT
AGCTTTTCTATTTGGCTTTCAAACTTATAAGTTGTATCTTATAATGGTTGCTATTTTATG
TTCAATGTTTCTTTTATATTTTGGAGGTTTAAGTGGAGAGTATACATTCATTCAACACTA
GTGCATTGATCCCTTTTATATTAGACTTTCTCACAACATTTAACC


BQ
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AF RR4GA85TF U 1
AF RR4GA85JQ C 281
BS 1 684 RR4GA85TF
BS 685 1005 RR4GA85JQ

RD RR4GA85TF 684 0 0
GGAATTTTGTGTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGATATTTCTAGGGT
TTGTTCGATTCTCCGACAACGATGATGAATCCCGAGGATGCGAAGGCGAAACGAGATTCA
ACGGAGGTGGAATCTGACTCTTCTGTCTCTAAAAAACCGAAGATCGAAGATGAAGACGAC
ACAGGCATGGAAGACGAAGTCGATAGCGATAGCAATAACCCATACTTATGGAGTGCCGAC
GAAGAAGACGATGACTCTCCGACAATCAACTATTCAAACTTGCAAGATCCGGAACCGGAG
TGGGACAAGGACAGTTACGACGACCACGAATTGGTATTCGATTCTGACGGCCGTAAAGGT
TTCTCTAGCGACAAGGCGTATGAAGAGTTCCGCGAGTATAAAACCATGTGCTTTAAGAAT
AGGGGGTTTATAGATGATCCATTCAGATCCATCTACCCCATGAGAGATCTGGACGATCTC
TCGATAACCCCGACTGATAGGCAATATTTGACAGATATTGCTTCCCTCTGTGTTAAGAAA
CTCAACGAGCAGAATGGTTCGTCTGTGGAAGTTGTAAGCATTGTGAGAGGCAATCTTAAA
CCAGGAGGTGGGTTTAAGCTTTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGTATCCTAATGGTCCT
CCCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4GA85JQ 725 0 0
TGCAAGATCCGGAACCGGAGTGGGACAAGGACAGTTACGACGACCACGAATTGGTATTCG
ATTCTGACGGCCGTAAAGGTTTCTCTAGCGACAAGGCGTATGAAGAGTTCCGCGAGTATA
AAACCATGTGCTTTAAGAATAGGGGGTTTATAGATGATCCATTCAGATCCATCTACCCCA
TGAGAGATCTGGACGATCTCTCGATAACCCCGACTGATAGGCAATATTTGACAGATATTG
CTTCCCTCTGTGTTAAGAAACTCAACGAGCAGAATGGTTCGTCTGTGGAAGTTGTAAGCA
TTGTGAGAGGCAATCTTAAACCAGGAGGTGGGTTTAAGCTTTACATCACCTTTATGGCTC
GAGAGTATCCTAATGGTCCTCCCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCCATGGATTTTGCGGGAG
ACAAAATACCTCCATTTCCCATTCTCTGCAGACCAACGTCTAGCATGCCTTAAAGATTGG
GTATGATCCTCTTCTAGAGGAAGATGAAGATCAAAATAAGGATTTTCAGTTATAAGTTTC
ATGAGTTCTCATGTGGATTTAGCTTTTCTATTTGGCTTTCAAACTTATAAGTTGTATCTT
ATAATGGTTGCTATTTTATGTTCAATGTTTCTTTTATATTTTGGAGGTTTAAGTGGAGAG
TATACATTCATTCAACACTAGTGCATTGATCCCTTTTATATTAGACTTTCTCACAACATT
TAACC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6589Contig1 585 2 2 U
GTACTTACCCACGGCTTGACTCAAAAATCTGTTTTCAGATGTTAGAAGGGAGACCCTATG
GTTTGAAAAAGTCTTAAAGACAATAAGACTACAAACTGAAAACAGATTCTTGATTGGGAA
CATTGTCCCGTTGCTGCCTCTATAAGACTATCCCCTAGTAACATTGGTAGTGCAGGAAAG
ATGTTAGGGGATGGCAAATAAGACCCACACGGCTCTATGGTCTTTAAAGATTAAAAGACT
TTACTTACCCACGGCTTGACTCAAAAATCTGTTTTCAGAGGGGAGACCCTACGGTTTGAG
AAAGTCCTAAAGACAATAAGACTACAAACTGAAAACAGATTTTTGATTGGGAACATTGTC
CCGTTGCTGCCTCTATAAGACCATCCCCTAGTAAGATTGGTAGTGCAGGAAAGATGTTAG
GGGATGGCAAATAAGACCCACACGACTCTATGGTCTTTAAAGATCAAAAGACTTTACTTA
CCCACGGCTTGACTCAGAAATCTGTTTTCAGAAGTTAAATGGGAGACCCTACGGTTTGAG
AAAGTCTTAAAGACAATAAGACTTCAAACTGAAAACAGATTTTTG


BQ
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AF RR4FN16TF U 1
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TTACTTACCCACGGCTTGACTCAAAAATCTGTTTTCAGAGGGGAGACCCTACGGTTTGAG
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AAAGTCTTAAAGACAATAAGACTTCAAACTGAAAACAGATT
CTTG

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DS 

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AGTTAAATGGGAGACCCTACGGTTTGAGAAAGTTTTAAAGACAATAAGACTTCAAACTGA
AAACAGATTTTTG

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FS73TF U 1
AF RR4FS73JQ C 212
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BS 617 698 RR4FS73JQ

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QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B069TF U 1
AF RR4B069JQ C 379
BS 1 792 RR4B069TF
BS 793 1166 RR4B069JQ

RD RR4B069TF 792 0 0
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ACGAGCAAGAGTTCCGTAGCATCCTCAATCTATTCCCCGTCGTACGCTCTCGCGACCACC
GTTCTGAATTAGATTCTTCAAGTCCAGCGCAATCAACTTCACAGTCAATTGTTGAGCGAG
AGCTAAGTGTTGATGAGCCCAAAGACTTTAAAGATCTGAAGACTGATCAAGGTATGCATC
TTTTTCTCCGACCTTGGTCCTTGGGATGTTTTTACTAACTAGGTGTAATAGCTCCTTCGA
ATTATGTGAGTGAATCGGGTTCAGAGAGAAAGCTGAATCTAAATAGAAAAATTAATCAAT
AAGCTTTGTTTTTTTGTTGTTGTGATATGTGTTTTCCTTAGGTAGATTCGGATATGTATT
TGCATGTCATATATATGACCGATGAAATCTAAACCTATTCACTACATTTGCTGAACACAT
AGCTTGCATCTGGATGCTACTGTTATAATCTTTGCATAAATTATCTCTAAAAATAAAGTA
TGCAGTTTTATGATTACTATGATTAAGATTGTTATACATGTGCATCATCTTTTATCCTGA
TTTTTGGACTTCTTTTGATAGATACGTTTACATTCTGGGATAAACTCAGAACGGCTGCTG
CGAATAAAGTAATTTATCACCAGCGACTTTGTTCCAACGTTTCAAGCTTGTTCGTTCTTC
ACTTGTGAACTTAGATACTTACCACTGGAAGAGATTATTCTTGTTTCACCTCTGATTCTA
CTACTTATACTG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4B069JQ 788 0 0
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CCGATGAAATCTAAACCTATTCACTACATTTGCTGAACACATAGCTTGCATCTGGATGCT
ACTGTTATAATCTTTGCATAAATTATCTCTAAAAATAAAGTATGCAGTTTTATGATTACT
ATGATTAAGATTGTTATACATGTGCATCATCTTTTATCCTGATTTTTGGACTTCTTTTGA
TAGATACGTTTACATTCTGGGATAAACTCAGAACGGCTGCTGCGAATAAGGTAATTTATC
ACCAGCGACTTTGTTCCAACGTTTCAAGCTTGTTCGTTCTTCACTTGTGAACTTAGATAC
TTACCACTGGAAGAGATTATTCTTGTTTCACCTCTGATTTTACTACTTATACTGAGATTT
CTCCTTTCAATTTGGGGATGTTAAATTGTCGTTAAACCTTAATGAAACATCACATTTATT
GCAGGTTGGTGAGGTTGAAGCAGAGAGGTTTTGCAAGGCTTTCGAGAAACTCCCCAAGAA
ACTTGTTTATGAAGAGTTGGATACTGAAACTGCAAAGCGATACTTATTAAACTCTTAAAA
CAACTTCATGTCTTCATTACAATATGCCACCAAAGGTTTGAGATTATGTGGAGATGTTTC
GACTCTCTTTTTGCTTTTTGGATTATCGTAATTATGTATGAGTGGTCAACAATACATTCT
CTTCCCGTGTTCATCTAATGATGATTCTCATCTTAAATGGTAGAAAAAGTTATGCTTGGG
ACATGATT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6593Contig1 504 2 1 U
GGGTTTGTTTGGAATATACCATGACTGGTGCGAATCATTCAGCACTTACCCTCGAACTTA
CGACCTCCTTCATGCCGATCATCTTTTCTCTGCTCTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTC
GGCAATGGCTGAAGTGGACAGGATTCTTAGACCACAAGGAACTTTTATAGTAAGAGATGA
CATGGAAACAATAGGAGAAATAGAGAAGATGGTGAAGTCGATGAAATGGAATGTAAGAAT
GACACATTCCAAAGATGGAGAAGGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTAC
AGAGTTCGAGGCAATTACATCGGCAATAGTCTAAGAGGTGAAGGAAACGAAGAAGAATGT
GTTTTTTATATTTTATTATAGTTGTATGATTAAAGTTGTTTCTTTTATGATCACATTGAT
TAGTCCAATACTTGTATCCTTTTCCTTTGCATTGACAAAAATTGTATGCAAGACAATTAT
CTCAAAACTGTAAACTTATGAGTC


BQ
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AF RR4FR54TF U 1
AF RR4FR54JQ C 94
BS 1 504 RR4FR54TF

RD RR4FR54TF 504 0 0
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CGACCTCCTTCATGCCGATCATCTTTTCTCTGCTCTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTC
GGCAATGGCTGAAGTGGACAGGATTCTTAGACCACAAGGAACTTTTATAGTAAGAGATGA
CATGGAAACAATAGGAGAAATAGAGAAGATGGTGAAGTCGATGAAATGGAATGTAAGAAT
GACACATTCCAAAGATGGAGAAGGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTAC
AGAGTTCGAGGCAATTACATCGGCAATAGTCTAAGAGGTGAAGGAAACGAAGAAGAATGT
GTTTTTTATATTTTATTATAGTTGTATGATTAAAGTTGTTTCTTTTATGATCACATTGAT
TAGTCCAATACTTGTATCCTTTTCCTTTGCATTGACAAAAATTGTATGCAAGACAATTAT
CTCAAAACTGTAAACTTATGAGTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR4FR54JQ 411 0 0
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GAAGTCGATGAAATGGAATGTAAGAATGACACATTCCAAAGATGGAGAAGGAGTGCTCTC
TGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTACAGAGTTCGAGGCAATTACATCGGCAATAGTTTA
AGAGGTGAAGGAAACGAAGAAGAATGTGTTTTTTATATTTTATTATAGTTGTATGATTAA
AGTTGTTTCTTTTATGATCACATTGATTAGTCCAATACTTGTATCCTTTTCCTTTGCATT
GACAAAAATTGTATGCAAGACAATTATCTCAAAACTGTAAACTTATGAGTC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

CO CL6594Contig1 1274 2 4 U
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TGTATCGTATCGCCAACGCCAAGACTGCGTTTCGAAACAAAAACTCTACTCTCGCTACGC
TCCTCTTCTACTCTCCTCAGGTTCGCTCAATCTCCAGCCAAAGTGAACTAGTTAAACCCA
AGACAATGGTTGAGAAAGAAGACAAGAAAGTAACTCGTGTTCTGTTTTGCGGCCCTCACT
TTCCCGATTCCTACAACTTCACTAGAGATTACTTGCAGCCTTACCCTTTTATCCAGGCAG
ATGTTGCCCATCTCCGTGATGTTCCTCAAGTTATAAACAACTATCATATATGTGTGACTA
TGTTGATGCATATGGATTCGTATGTTATCTCTCGTGCCACCAACATGAAGCTTCTTATGC
AGTTCGGTGTTGGTCTCGACGGTGTTGATATCGATGCTGCTACTAAACAAGGGATCAAGG
TCGCTAGAATCCCCAGTGAGGGTAACGGAAACGCAGTCTCTTGTTCTGAAATGGCTATTT
ATCTAATGCTTGGCCTCCTTAAAAAACAGAACGAAATGCAGATGGCTGTGCAAAGCGGAC
TACTTGGACAGCCAACCGGTGGAACCCTTCTCGGTAAAACTGTGTTTATCTTGGGATATG
GTAACATTGGAATAGAGCTGGCTAAACGGTTGAATTCATTTGGGTCGAGAGTAATAGCTA
CCAAAAGAAGCTGGCCTGCTTCCATCATTGACTCAGACTCGAATCTAGTTGATGAGAAAG
GTAGCCATAAAGACATCTACACATTCGCTAGCAAAGCAGATATAGTCGTTGTGTGCTTGA
GGCTGAGCAAAGAAACGGCTGAAATCGTGGACAACAAGTTCATATCTTCAATGAAAAAGG
GTGCTCTTCTTGTAAATATTGCTAGAGGCGGTCTGGTAAACTACGAATCAGCTTACCAAA
GTCTGGAGTCCGGTCATCTTGGAGGCCTAGGGACTGACGTGGCGTGGTCTGAGCCGTTTG
ATCCAAACGATCCGATCTTGAAGTTTAAAAACGTAATCATGACCCCACATGTCGCTGGAG
TTACCGAGTATTCATATAGGTCCATGGCCAAGGTGGTCGGAGATGTTGCCTTACAATTTC
ATGAAGGACTTCCTCTCACCGGAATCGAACTTGTTAACTGATGAGATAGCTTTGACAAGA
ACCAAACCATGTTTACGCCATACTTTTTGTATTGTATTTTATTTTACTCGAGTTACAGAG
AAGCTTTTGTGACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG46TF U 1
AF RR4AG46JQ C 442
BS 1 841 RR4AG46TF
BS 842 842 RR4AG46JQ
BS 843 854 RR4AG46TF
BS 855 1274 RR4AG46JQ

RD RR4AG46TF 854 0 0
GGATGTAAAGTTGGATTCAAGTAAAACGGAAGAATGTGATGGGAGTGGCGACGAAGACGA
TGTATCGTATCGCCAACGCCAAGACTGCGTTTCGAAACAAAAACTCTACTCTCGCTACGC
TCCTCTTCTACTCTCCTCAGGTTCGCTCAATCTCCAGCCAAAGTGAACTAGTTAAACCCA
AGACAATGGTTGAGAAAGAAGACAAGAAAGTAACTCGTGTTCTGTTTTGCGGCCCTCACT
TTCCCGATTCCTACAACTTCACTAGAGATTACTTGCAGCCTTACCCTTTTATCCAGGCAG
ATGTTGCCCATCTCCGTGATGTTCCTCAAGTTATAAACAACTATCATATATGTGTGACTA
TGTTGATGCATATGGATTCGTATGTTATCTCTCGTGCCACCAACATGAAGCTTCTTATGC
AGTTCGGTGTTGGTCTCGACGGTGTTGATATCGATGCTGCTACTAAACAAGGGATCAAGG
TCGCTAGAATCCCCAGTGAGGGTAACGGAAACGCAGTCTCTTGTTCTGAAATGGCTATTT
ATCTAATGCTTGGCCTCCTTAAAAAACAGAACGAAATGCAGATGGCTGTGCAAAGCGGAC
TACTTGGACAGCCAACCGGTGGAACCCTTCTCGGTAAAACTGTGTTTATCTTGGGATATG
GTAACATTGGAATAGAGCTGGCTAAACGGTTGAATTCATTTGGGTCGAGAGTAATAGCTA
CCAAAAGAAGCTGGCCTGCTTCCATCATTGACTCAGACTCGAATCTAGTTGATGAGAAAG
GTAGCCATAAAGACATCTACACATTCGCTAGCAAAGCAGATATAGTCGTTGTGTGCTTGA
G*CTGAGCAAAGAA

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4AG46JQ 833 0 0
GTGTTGATATCGATGCTGCTACTAAACAAGGGATCAAGGTCGCTAGAATCCCCAGTGAGG
GTAACGGAAACGCAGTCTCTTGTTCTGAAATGGCTATTTATCTAATGCTTGGCCTCCTTA
AAAAACAGAACGAAATGCAGATGGCTGTGCAAAGCGGACTACTTGGACAGCCAACCGGTG
GAACCCTTCTCGGTAAAACTGTGTTTATCTTGGGATATGGTAACATTGGAATAGAGCTGG
CTAAACGGTTGAATTCATTTGGGTCGAGAGTAATAGCTACCAAAAGAAGCTGGCCTGCTT
CCATCATTGACTCAGACTCGAATCTAGTTGATGAGAAAGGTAGCCATAAAGACATCTACA
CATTCGCTAGCAAAGCAGATATAGTCGTTGTGTGCTTGAGGCTGAGCAAAGAAACGGCTG
AAATCGTGGACAACAAGTTCATATCTTCAATGAAAAAGGGTGCTCTTCTTGTAAATATTG
CTAGAGGCGGTCTGGTAAACTACGAATCAGCTTACCAAAGTCTGGAGTCCGGTCATCTTG
GAGGCCTAGGGACTGACGTGGCGTGGTCTGAGCCGTTTGATCCAAACGATCCGATCTTGA
AGTTTAAAAACGTAATCATGACCCCACATGTCGCTGGAGTTACCGAGTATTCATATAGGT
CCATGGCCAAGGTGGTCGGAGATGTTGCCTTACAATTTCATGAAGGACTTCCTCTCACCG
GAATCGAACTTGTTAACTGATGAGATAGCTTTGACAAGAACCAAACCATGTTTACGCCAT
ACTTTTTGTATTGTATTTTATTTTACTCGAGTTACAGAGAAGCTTTTGTGACC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL6595Contig1 1009 2 4 U
ATACAAGGTGCGGTTTGAAGATATTGGCAGATGTCTTAAATGCGAATGTGTAGTACATGA
TGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACCAGCATCTGCCGAGACTGGTCCAATCTCACCAGGTTT
CCCTAGGATAGAGAAGCTGGAGATTGAAGGAGGAGGTTTCCACACCAACTTATACGCTCT
TCAAGGCAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAGTGGCTTAGAACAAT
GGTTGGAAGCCCTGAACTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTATGAAGCTAA
TGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGAAGATGGTGT
TGAAGGCCACCCAATTTCTGCATCTACGGAGCCTGTTTCTGTTGAACCTGATCTTTATAA
GGAAGTGGAGCTGAAACTAGAAACTGGTTTAGTGAAGTTTGAGGTGCTGTGTGACAAGGA
CCCTTATCCAAAAAAGATTGCGGGTGAGGGAAATCTGGAGAGACGGATGCTAGAAATGAA
CAGGAAGAGATTAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCTCGAGCACTGAAGT
TCGTGGAAGCTATGTTCCTCCTTTCCATGTGGAGACATTTCGTAATGACCAGAGAAGGCT
GAGGGTTGTTGTAAATAGCGAGAATGCAGTAGACATGGTGGTACATTCGCGCCATCTCCG
CGATGTTATAGTGCTTGTAATCCGAGGCTTTGCGCAGAAGTTCAACAGTACTTCACTCAA
CTCGCTACTTAAGATCGATGCTTGATTGAAATCGAAAAGAGTGGATTGCGTCTATTGCAA
GTTTTTTCTGTGTGCCATTCAATATGTTATGGTGATGAAAACTAATGTAAAACCCCCCAT
GAGAATGCTCAATGAACCGTTGTGGTTTAAACCCTTTTATCATTTTATATCTATGTGTGT
ATACAACTTAGTAATGAGACTAGTGTTAACCCCGTGCTATGCACGTTTT


BQ
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AF RR4CQ93TF U 1
AF RR4CQ93JQ C 212
BS 1 625 RR4CQ93TF
BS 626 626 RR4CQ93JQ
BS 627 639 RR4CQ93TF
BS 640 1009 RR4CQ93JQ

RD RR4CQ93TF 639 0 0
ATACAAGGTGCGGTTTGAAGATATTGGCAGATGTCTTAAATGCGAATGTGTAGTACATGA
TGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACCAGCATCTGCCGAGACTGGTCCAATCTCACCAGGTTT
CCCTAGGATAGAGAAGCTGGAGATTGAAGGAGGAGGTTTCCACACCAACTTATACGCTCT
TCAAGGCAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAGTGGCTTAGAACAAT
GGTTGGAAGCCCTGAACTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTATGAAGCTAA
TGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGAAGATGGTGT
TGAAGGCCACCCAATTTCTGCATCTACGGAGCCTGTTTCTGTTGAACCTGATCTTTATAA
GGAAGTGGAGCTGAAACTAGAAACTGGTTTAGTGAAGTTTGAGGTGCTGTGTGACAAGGA
CCCTTATCCAAAAAAGATTGCGGGTGAGGGAAATCTGGAGAGACGGATGCTAGAAATGAA
CAGGAAGAGATTAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCTCGAGCACTGAAGT
TCGTGGAAGCTATGTTCCTCCTTTC*ATGTGGAGACATT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4CQ93JQ 798 0 0
AAAGAGT
AAATCCAGTGGCTTAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAAT*CCAGGTGAGA
CAGGAAGGATGTATGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATA
CACCCATACGTGAAGATGGTGTTGAAGGCCACCCAATTTCTGCATCTACGGAGCCTGTTT
CTGTTGAACCTGATCTTTATAAGGAAGTGGAGCTGAAACTAGAAACTGGTTTAGTGAAGT
TTGAGGTGCTGTGTGACAAGGACCCTTATCCAAAAAAGATTGCGGGTGAGGGAAATCTGG
AGAGACGGATGCTAGAAATGAACAGGAAGAGATTAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGA
CGTCTTTCTCGAGCACTGAAGTTCGTGGAAGCTATGTTCCTCCTTTCCATGTGGAGACAT
TTCGTAATGACCAGAGAAGGCTGAGGGTTGTTGTAAATAGCGAGAATGCAGTAGACATGG
TGGTACATTCGCGCCATCTCCGCGATGTTATAGTGCTTGTAATCCGAGGCTTTGCGCAGA
AGTTCAACAGTACTTCACTCAACTCGCTACTTAAGATCGATGCTTGATTGAAATCGAAAA
GAGTGGATTGCGTCTATTGCAAGTTTTTTCTGTGTGCCATTCAATATGTTATGGTGATGA
AAACTAATGTAAAACCCCCCATGAGAATGCTCAATGAACCGTTGTGGTTTAAACCCTTTT
ATCATTTTATATCTATGTGTGTATACAACTTAGTAATGAGACTAGTGTTAACCCCGTGCT
ATGCACGTTTT

QA 8 798 8 798
DS 



AS 1 2

CO CL6596Contig1 394 2 1 U
GGGCAGAGAATGGGAGGAAGAGGGAGAAACCAGTAGAAGAGTCTAAAGAGAGCAATGTAA
CAGAAGAAGAGAAGGTGTTAGGATCGAAATCAAGCACAGATGATTCAGTGAAGTCATCGT
TGTCCACAGGGTTTAGACAAGTTGGGAGTAGAAGGAAGAACAAACCAAGACGAGCTGCAG
AAGCTGTTGTTGAATGTAATGGTGTTTGAAGAAAGAGATTCTTAGAGACTGCCTTTTTGA
TTTGTTTTTTGTTGACTTGAATATTACCTTTTTGTGGTAAGGACTTTTGATGCAGTTGCG
TTTTAGTTTTCATACATGGAATCAGATTTTATCAACTTTCCACAACAGTAGCACTTTGCC
TGAGTTGCTATGAAGAAGTTTACTTTTCAGAGTT


BQ
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AF RR4GY51JQ C 1
AF RR4GY51TF U 1
BS 1 394 RR4GY51TF

RD RR4GY51JQ 394 0 0
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CAGAAGAAGAGAAGGTGTTAGGATCGAAATCAAGCACAGATGATTCAGTGAAGTCATCGT
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TTTTAGTTTTCATACATGGAATCAGATTTTATCAACTTTCCACAACAGTAGCACTTTGCC
TGAGTTGCTATGAAGAAGTTTACTTTTCAGAGTT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4GY51TF 394 0 0
GGGCAGAGAATGGGAGGAAGAGGGAGAAACCAGTAGAAGAGTCTAAAGAGAGCAATGTAA
CAGAAGAAGAGAAGGTGTTAGGATCGAAATCAAGCACAGATGATTCAGTGAAGTCATCGT
TGTCCACAGGGTTTAGACAAGTTGGGAGTAGAAGGAAGAACAAACCAAGACGAGCTGCAG
AAGCTGTTGTTGAATGTAATGGTGTTTGAAGAAAGAGATTCTTAGAGACTGCCTTTTTGA
TTTGTTTTTTGTTGACTTGAATATTACCTTTTTGTGGTAAGGACTTTTGATGCAGTTGCG
TTTTAGTTTTCATACATGGAATCAGATTTTATCAACTTTCCACAACAGTAGCACTTTGCC
TGAGTTGCTATGAAGAAGTTTACTTTTCAGAGTT

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

CO CL6597Contig1 864 2 2 U
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TTAGTTTCCGGCGCTTTCTCCGGCGCTCTTACTGGTTTTTTCGCTATGGCTGGAGCTTTC
ACAGGAGCAGTAACTGGTGCGGTGGCAGGCAGAGCTGCACAGTACGGAGTCCTCCGTGGG
GCTGCACTTGGCGCTGTAGCTGGAGCTATTCTCTCTGTTGAAGTCTTGGAGGCTTCTCGT
GCCTACTGGTATTTAGAGCTATCAGGATCTAGGGGTCCTTCATCTATGGCAGACTTTGTA
GAGCAACTGTTTCGTGGGAGACTAGTAGATGAACAACTTATGTCAACAATGATAAATTCA
CACCACTGGCAGTTAAGGATATCAGATGTGAGCTATGAAGAGAGGGATGATGTGTATGGT
GAATTGGAACCCAGAGGCTTATCAGGTGACTCGTTAAGTAAACTACCATGCTATATCATG
TCAAGTGAGATGACCAAGAAGCAGATCGTTCACTGCACTATTTGTCTACAGGACATCGCA
GTAGGCGAAATCACACGAAGCTTGCCGAGATGTGATCATACGTTTCACCTGGTTTGTGTT
GATAAATGGCTCATCAGACATGGATCATGCCCCATTTGCAGACAGGCCGTTAAAGATAAA
AAAATGGTGTCCGAGGAGTGTATGTAGCAAAAAGAAAAAACCATTGTCCTTAATATGTTG
TTGTAAGTCTCTGAATCCTTTGTTTCGATCTATCTTTTATTTTTTACTTTTTTACATTTT
ACTTATAGCATCATCCATAGGTTTCTACTTTTGAATGTATACTATTACTGTAGACATGAA
TAAGAACAGTTACAGATATGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E579TF U 1
AF RR4E579JQ C 97
BS 1 271 RR4E579TF
BS 272 864 RR4E579JQ

RD RR4E579TF 271 0 0
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TTAGTTTCCGGCGCTTTCTCCGGCGCTCTTACTGGTTTTTTCGCTATGGCTGGAGCTTTC
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GCTGCACTTGGCGCTGTAGCTGGAGCTATTCTCTCTGTTGAAGTCTTGGAGGCTTCTCGT
GCCTACTGGTATTTAGAGCTATCAGGATCTA

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR4E579JQ 768 0 0
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GCACAGTACGGAGTCCTCCGTGGGGCTGCACTTGGCGCTGTAGCTGGAGCTATTCTCTCT
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CTTATGTCAACAATGATAAATTCACACCACTGGCAGTTAAGGATATCAGATGTGAGCTAT
GAAGAGAGGGATGATGTGTATGGTGAATTGGAACCCAGAGGCTTATCAGGTGACTCGTTA
AGTAAACTACCATGCTATATCATGTCAAGTGAGATGACCAAGAAGCAGATCGTTCACTGC
ACTATTTGTCTACAGGACATCGCAGTAGGCGAAATCACACGAAGCTTGCCGAGATGTGAT
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TGCAGACAGGCCGTTAAAGATAAAAAAATGGTGTCCGAGGAGTGTATGTAGCAAAAAGAA
AAAACCATTGTCCTTAATATGTTGTTGTAAGTCTCTGAATCCTTTGTTTCGATCTATCTT
TTATTTTTTACTTTTTTACATTTTACTTATAGCATCATCCATAGGTTTCTACTTTTGAAT
GTATACTATTACTGTAGACATGAATAAGAACAGTTACAGATATGTTGG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6598Contig1 756 2 2 U
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CTTTTCTTCATGACGGTTGGCATGTCTATTGATCCGAAACTTCTTCTCTCTAACTTCCCT
GTCGTAGTTGGGACATTGGGACTCTTGATATTGGGCAAGACTATATTAGTAGTTGTCATG
GCAAGTTATTCGGAATTTCAATCATATCTGCAATTAGAGCCGGTCTTCTTCTGGCCCCTG
GTGGAGAGTTTGCATTTGTTGCTTTTGGAGAAGCTGTCAATCAGGGTATAATGTCTCCTC
AGCTATCTTCGTTGCTGTTTCTTGTGGTGGGAATCTCGATGGCTATCACACCTTGGTTAG
CTGCTGGTGGCCAGTTAATTGCATCCCGGTTTGAGTTGCATGATGTTAGAAGTTTATTGC
CGGTTGAAAGTGAGACGGATGATTTGCAGATCACATAATTATTTGCGGATTTGGACGAGT
TGGGCAGATAATTGCTCAGCTTCTCTCAGAAAGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FU50TF U 1
AF RR4G189TF U 1
BS 1 406 RR4FU50TF
BS 407 756 RR4G189TF

RD RR4FU50TF 406 0 0
GAAGCCATTGCTGAAGCTCTTGGACTTGCTGCGGTCAAAGCAGCAGTTGCTATTACTGCC
ATAATTGCTGGTGGCCGTCTTCTTCTTCGACCAATCTACAAGCAGATTGCAGAAAATCGA
AACGCTGAGATATTCTCTGCCAACACACTTCTTGTTATCCTTGGGACTAGTTTACTGACA
GCTAGGGCGGGACTCTCCATGGCTTTAGGAGCGTTTTTGGCTGGTCTACTTCTTGCGGAG
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CTTTTCTTCATGACGGTTGGCATGTCTATTGATCCGAAACTTCTTCTCTCTAACTTCCCT
GTCGTAGTTGGGACATTGGGACTCTTGATATTGGGCAAGACTATAT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR4G189TF 756 0 0
GAAGCCATTGCTGAAGCTCTTGGACTTGCTGCGGTCAAAGCAGCAGTTGCTATTACTGCC
ATAATTGCTGGTGGCCGTCTTCTTCTTCGACCAATCTACAAGCAGATTGCAGAAAATCGA
AACGCTGAGATATTCTCTGCCAACACACTTCTTGTTATCCTTGGGACTAGTTTACTGACA
GCTAGGGCGGGACTCTCCATGGCTTTAGGAGCGTTTTTGGCTGGTCTACTTCTTGCGGAG
ACAGAGTTTTCCTTGCAAGTAGAATCAGATATTGCTCCTTATCGTGGTCTTCTGCTGGGT
CTTTTCTTCATGACGGTTGGCATGTCTATTGATCCGAAACTTCTTCTCTCTAACTTCCCT
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GCAAGTTATTCGGAATTTCAATCATATCTGCAATTAGAGCCGGTCTTCTTCTGGCCCCTG
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AGCTATCTTCGTTGCTGTTTCTTGTGGTGGGAATCTCGATGGCTATCACACCTTGGTTAG
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CGGTTGAAAGTGAGACGGATGATTTGCAGATCACATAATTATTTGCGGATTTGGACGAGT
TGGGCAGATAATTGCTCAGCTTCTCTCAGAAAGACT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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TTCTTCAGCAACCTAATTTGCTTGAGCTTGAGGCACCCATCAAAATCTGCGGTGATATAC
ATGGGCAGTATAGTGATTTGCTGAGGCTGTTTGAGTACGGTGGATTCCCCCCTAGTGCCA
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TGAGGGTGTGGAAGGTTTTCACAGACTGTTTCAACTGCCTTCCTGTTGCCGCGCTTATAG
ATGACAAGATACTGTGTATGCACGGTGGACTTTCGCCTGATCTCAACCATTTGGATGAGA
TTAGAAGCTTGCCGCGTCCGACTATGATTCCTGACACGGGGCTCCTCTGTGATTTGCTCT
GGTCTGATCCTGGGAAAGATGTTAACGGATGGGGGATGAATGATAGAGGCGTTTCTTACA
CTTTTGGTCCGGACAAAGTCTCTGAGTTTCTAGCGAAACATGATCTAGACCTTGTGTGTC
GTGCTCATCAGGTGGTGGAAGATGGGTATGAGTTCTTTGCTGATAGACAGCTAGTGACGG
TTTTTTCAGCTCCTAACTACTGTGGAGAATTTGATAATGCTGGTGCGATGATGAGCGTGG
ATGAGAACCTTATGTGCTCGTTTCAGATTTTGAAGCCCGCTGAGAAGAAGTCCAAGTTCA
TGATGTCCACAAAGATTTGAATCCTTTCATTGAAAGGTTAGTAGTCAATAGTGTGTACTT
AGCAACACCAAACAAGTGAATGAATGGATTCTTATGCACTGATTTGTTTGTCTTCATATT
TTACAAGTCAGTGTTTCTCTGTTAAATGGTTATTTCCTTTGTTTCTGTAGATGGATTTGG
TCTTTGCTTAGAGATTGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY74TF U 1
AF RR4FY74JQ C 449
BS 1 708 RR4FY74TF
BS 709 709 RR4FY74JQ
BS 710 727 RR4FY74TF
BS 728 1161 RR4FY74JQ

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TGAGGGTGTGGAAGGTTTTCACAGACTGTTTCAACTGCCTTCCTGTTGCCGCGCTTATAG
ATGACAAGATACTGTGTATGCACGGTGGACTTTCGCCTGATCTCAACCATTTGGATGAGA
TTAGAAGCTTGCCGCGTCCGACTATGATTCCTGACACGGGGCTCCTCTGTGATTTGCTCT
GGTCTGATCCTGGGAAAGATGTTAACGGATGGGGGATGAATGATAGAG*CGTTTCTTACA
CTTTTGG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4FY74JQ 713 0 0
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TTTCAACTGCCTTCCTGTTGCCGCGCTTATAGATGACAAGATACTGTGTATGCACGGTGG
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TCCTGACACGGGGCTCCTCTGTGATTTGCTCTGGTCTGATCCTGGGAAAGATGTTAACGG
ATGGGGGATGAATGATAGAGGCGTTTCTTACACTTTTGGTCCGGACAAAGTCTCTGAGTT
TCTAGCGAAACATGATCTAGACCTTGTGTGTCGTGCTCATCAGGTGGTGGAAGATGGGTA
TGAGTTCTTTGCTGATAGACAGCTAGTGACGGTTTTTTCAGCTCCTAACTACTGTGGAGA
ATTTGATAATGCTGGTGCGATGATGAGCGTGGATGAGAACCTTATGTGCTCGTTTCAGAT
TTTGAAGCCCGCTGAGAAGAAGTCCAAGTTCATGATGTCCACAAAGATTTGAATCCTTTC
ATTGAAAGGTTAGTAGTCAATAGTGTGTACTTAGCAACACCAAACAAGTGAATGAATGGA
TTCTTATGCACTGATTTGTTTGTCTTCATATTTTACAAGTCAGTGTTTCTCTGTTAAATG
GTTATTTCCTTTGTTTCTGTAGATGGATTTGGTCTTTGCTTAGAGATTGATGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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ACCGTTAATGGCTTTGGTTCTCTTGTTGAAATCATCTATGTCTTGCTTTTTCTCATTTAT
GTCCCTCTACATCTCAAGTTAAATACAATCGTAGTGGTTGCGTTGTTGAACGTCTTTTTC
CCAGTAGTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGCGTTTCAAGATGAGAAAATGCGTTCTCAA
TCGATGGGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGGTTCTCCTCTTTCTGCT
ATGAAAACAGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTC
CTCTTCTTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACTACGTTTTTCTA
CTTGTGCCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATACTTTATGGAATC
TACAGAAACGCCAAACCGGCCGGTTTAAGCTCAAGTAAGATTGCTGCAGATGAAGAGGAA
GGCCCCACAGCACGTGCCCCTCTCCTTTCTTAAACCTATTTTATAAAAAATTATAAGATA
CTTTCTTTTAGTTTTTTGGGGAGTGTTTGTGTTGATTTTCTTTTATAAATAAAATCTTTT
TATCATTTCTTTGCCACTATTGTGGTGTACGATTTTTTGTGTCCCTTGTTTTTTTGAAGC
AAATTAGATCAAACTGGTGTGTCCTTTTTTTGTCTTGTACTTGTAATGATACACGTTAAT
ATAGTATCGATCGGAGGATTGTCGGCCAGACCAAATAGTGTAGCTTAGTGACATTTAGCT
GAAGCTTATGTTAAGCCCATCATAGTATAATGGCATTGTATTGCCCTCTTCTTTTTCCTT
TTCAAAACAATATAAAGAAAGAGATGAATAGAGAAGTATGATGTATTCTCTCTATAATGA
TAGTATTCCTTCCAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CK50TF U 1
AF RR4CK50JQ C 238
BS 1 656 RR4CK50TF
BS 657 1098 RR4CK50JQ

RD RR4CK50TF 656 0 0
AGGGACGCAGGAAATGTAATCTCCCTTCTCGTCTTCCTCTCACCAGTGGAGACGTTTTGG
AAAATAGTGAAGCGAAAATCGACCGAAGAGTACAAAAGCTTGCCCTACATTTGCACGTTG
TTAGGATCGACGTTATGGACATACTACGGCATCGTCACTCCCGGAGAATATCTTGTCTCC
ACCGTTAATGGCTTTGGTTCTCTTGTTGAAATCATCTATGTCTTGCTTTTTCTCATTTAT
GTCCCTCTACATCTCAAGTTAAATACAATCGTAGTGGTTGCGTTGTTGAACGTCTTTTTC
CCAGTAGTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGCGTTTCAAGATGAGAAAATGCGTTCTCAA
TCGATGGGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGGTTCTCCTCTTTCTGCT
ATGAAAACAGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTC
CTCTTCTTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACTACGTTTTTCTA
CTTGTGCCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATACTTTATGGAATC
TACAGAAACGCCAAACCGGCCGGTTTAAGCTCAAGTAAGATTGCTGCAGATGAAGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CK50JQ 861 0 0
TTTT
TCCCTCTACATCTCAAGTTAAATACAATCGTAGTGGT*GCGTTGTTGAACGTCTTTT*CC
CAGTAGTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGCGTTTCAAGATGAGAAAATGCGTTCTCAAT
CGATGGGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGGTTCTCCTCTTTCTGCTA
TGAAAACAGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTCC
TCTTCTTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACTACGTTTTTCTAC
TTGTGCCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATACTTTATGGAATCT
ACAGAAACGCCAAACCGGCCGGTTTAAGCTCAAGTAAGATTGCTGCAGATGAAGAGGAAG
GCCCCACAGCACGTGCCCCTCTCCTTTCTTAAACCTATTTTATAAAAAATTATAAGATAC
TTTCTTTTAGTTTTTTGGGGAGTGTTTGTGTTGATTTTCTTTTATAAATAAAATCTTTTT
ATCATTTCTTTGCCACTATTGTGGTGTACGATTTTTTGTGTCCCTTGTTTTTTTGAAGCA
AATTAGATCAAACTGGTGTGTCCTTTTTTTGTCTTGTACTTGTAATGATACACGTTAATA
TAGTATCGATCGGAGGATTGTCGGCCAGACCAAATAGTGTAGCTTAGTGACATTTAGCTG
AAGCTTATGTTAAGCCCATCATAGTATAATGGCATTGTATTGCCCTCTTCTTTTTCCTTT
TCAAAACAATATAAAGAAAGAGATGAATAGAGAAGTATGATGTATTCTCTCTATAATGAT
AGTATTCCTTCCAGGTC

QA 5 861 5 861
DS 



AS 1 2

CO CL6601Contig1 404 2 1 U
GGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACCTGTAAAGA
GAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTCGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGCT
TCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGACAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCAAAACGTCCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTCTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCT
TTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4E708TF U 1
AF RR4E829TF U 1
BS 1 404 RR4E708TF

RD RR4E708TF 404 0 0
GGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACCTGTAAAGA
GAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTCGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGCT
TCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGACAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCAAAACGTCCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTCTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCT
TTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGAT

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4E829TF 404 0 0
GGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACCTGTAAAGA
GAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTCGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGCT
TCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGACAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCAAAACGTCCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTCTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCT
TTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGAT

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL6602Contig1 744 2 2 U
GGAGCTGACGGAAAACGGAATCTCCGGCGAGATCCCGGCGGATTTTGGATCGTTGAAGAT
GCTGAGCAGGGCGTTACTGGGCCGTAACGAACTAACCGGTTCGCTTCCGGAGTCTATCTC
CGGTATGGACCGGTTAGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACC
GGAATGGGTGGGTAACATGAAGGTGCTCTCTCTTTTGAATCTCGATTGCAACTCGTTAAC
CGGTCCGATCCCCGGTTCGATTCTAAGCAATTCCGGCTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCG
AAATGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGTTTTCGGATCCGCGACCTATTTCGTGGCGCT
TGATTTGTCTTACAATAATCTAGCGGGGCGGATCCCTGACTCGCTATCTTCAGCTAAGTT
CGTGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCCTATTCCAACCGGTTCTCC
TTTTGATCACCTTGAAGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTT
GATGAAGACATGTTAATAAACAATCGATTATGGTTCCGGTTCTGCTGAACCGGGGGTTTA
TCAAGTTCCTTGTTGCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTGTTTATTTATTTACCTTTTCA
AATCATAAGTGCCTGCCAATTGCTACAATGGTCCAATTTGTTTCCTGGTGTATGGAATAT
GGTAGCACATGTTATAGATGTTAC


BQ
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AF RR4EI92TF U 1
AF RR4EI92JQ C 79
BS 1 465 RR4EI92TF
BS 466 744 RR4EI92JQ

RD RR4EI92TF 465 0 0
GGAGCTGACGGAAAACGGAATCTCCGGCGAGATCCCGGCGGATTTTGGATCGTTGAAGAT
GCTGAGCAGGGCGTTACTGGGCCGTAACGAACTAACCGGTTCGCTTCCGGAGTCTATCTC
CGGTATGGACCGGTTAGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACC
GGAATGGGTGGGTAACATGAAGGTGCTCTCTCTTTTGAATCTCGATTGCAACTCGTTAAC
CGGTCCGATCCCCGGTTCGATTCTAAGCAATTCCGGCTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCG
AAATGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGTTTTCGGATCCGCGACCTATTTCGTGGCGCT
TGATTTGTCTTACAATAATCTAGCGGGGCGGATCCCTGACTCGCTATCTTCAGCTAAGTT
CGTGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCCTAT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR4EI92JQ 666 0 0
GGGCCGTAACGAACTAACCGGTTCGCTTCCGGAGTCTATCTCCGGTATGGACCGGTTAGC
GGATCTGGATCTATCGAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACCGGAATGGGTGGGTAACAT
GAAGGTGCTCTCTCTTTTGAATCTCGATTGCAACTCGTTAACCGGTCCGATCCCCGGTTC
GATTCTAAGCAATTCCGGCTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCGAAATGCGTTGGAAGGAAC
CATACCCGACGTTTTCGGATCCGCGACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAATAA
TCTAGCGGGTCGGATCCCTGACTCGCTATCTTCAGCTAAGTTCGTGGGCCATCTCGATAT
CAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCCTATTCCAACCGGTTCTCCTTTTGATCACCTTGAAGC
GTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTTAATA
AACAATCGATTATGGTTCCGGTTCTGCTGAACCGGGGGTTTATCAAGTTCCTTGTTGCTC
TTGTTCCATATTGGTTTAACTGTTTATTTATTTACCTTTTCAAATCATAAGTGCCTGCCA
ATTGCTACAATGGTCCAATTTGTTTCCTGGTGTATGGAATATGGTAGCACATGTTATAGA
TGTTAC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL6603Contig1 955 2 2 U
GGAATCATCTCAAAGCAAAAAGAAAACAAAAAAAGTCATGGAATCATTCTCGTCCTTCTT
CGATTCACAACCTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACCTCCGTCAGAT
TTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTGTTGTGCTCTTGT
TGCGTCTGCGTTTGGAGCTCACCTCCACGTCCTCTGGAACATTGGTGGTATTCTCACTAC
CATTGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTCTCCTCCTTATCAACAACAAAA
GAGGCTTTTACTTCTGTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCAGTTGGTCCCTTGAT
CAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTTGTCGGAACTGCGAT
AGCCTTTATCTGTTTCTCCGGAGCAGCGATGTTGGCAAGACGCAGAGAGTATCTCTACCT
CGGAGGGCTTCTTTCATCTGGCTTCAGTTCGCCTCTTCCATCTTCGGTGGCTCTACATCT
ATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGAC
ACTCAAGATATTATAGAGAAGTCCCACCTCGGTGACATGGACTACGTGAAACATTCCTTG
ACCCTTTTCACCGATTTTGTAGCTGTGTTTGTTCGTATCCTCATCATAATGCTGAAGAAC
TCGGCAGATAAAGAAGAGAAAAAGAAGAAGAGGAGGAGGAACTGAGACTAAATGTGAGAA
AGAAAGCTAATAGAGAGTGGGTGATATAACTACATGAAAGCTTTGGTGTTTTTACTTGTT
TGAGACGGTTTTGCTAAAAACACATGTTACCTTATTTGTGTATTCCTCTAAGTGGCTCCC
GATTGTAAATGGATCTAGTGGTGTTCGTTTTTCGTTCATTATCTTAGTACTGTCT


BQ
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TTGTGTATTCCTCTAAGTGGCTCCCGATTGTAAATGGATCTAGTGGTGTTCGTTTTTCGT
TCATTATCTTAGTACTGTCT

QA 1 620 1 620
DS 



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ACCAGCGGTAGCAACTTCTTCATTATTCGGACTGATCAGTGTGATCAACAAATCAATCTT
TTCTTCGATCTTCTGAACACGATCAGCCAATATTTCTATCACCTCCTTGGTATCAGACTG
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BS 606 638 RR4GE22TF

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TTCATCAGATTCGTCGCTATTATCACCAGCCATGTAATCATCTAATTTAGCTTTTTTCTT
AGAAGGTTCCTCATCATCAGACGAATTGCTCTCTGTCTCGGCTTTTACAGAGACACTTTT
ACCAGCGGTAGCAACTTCTTCATTATTCGGACTGATCAGTGTGATCAACAAATCAATCTT
TTCTTCGATCTTCTGAACACGATCAGCCAATATTTCTATCACCTCCTTGGTATCAGACTG
TTCCTTCCCAGTCACGTTTTTCTTATTATTTTTCTTCATAACTTTCTTCACAGGCTTTGT
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GATGATAAGAGCGGCACTAGGTTAGCAAGAGAAAGTCC

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DS 

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GTTCCTCATCATCAGACGAATTGCTCTCTGTCTCGGCTTTTACAGAGACACTTTTACCAG
CGGTAGCAACTTCTTCATTATTCGGACTGATCAGTGTGATCAACAAATCAATCTTTTCTT
CGATCTTCTGAACACGATCAGCCAATATTTCTATCACCTCCTTGGTATCAGACTGTTCCT
TCCCAGTCACGTTTTTCTTATTATTTTTCTTCATAACTTTCTTCACAGGCTTTGTGGCCT
TATTCGCAGAAAGAGATGATTTACCTTTGATTGCAGATTTCTTGTCCATGTAGAAGATGA

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

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ATGCATGTGGTTATGTAAAATATATGATATTGTGGGGTTATTGAACTAATAGAATATGAT
ATTATTGTACC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU69TF U 41
AF RR4EW23JQ C 1
BS 1 40 RR4EW23JQ
BS 41 428 RR4CU69TF
BS 429 611 RR4EW23JQ

RD RR4CU69TF 388 0 0
TATTGACGAGAGCAGCTCAAGTTATGATTTACTCGTTTGGGTCCTTGAAAATCTTCAAGA
TATAAGTAACAGCAATAAACTTTTGATATTTGCAAAACAGCCACAAAGTTTTGTTGGTCC
TATCTCGCTCTCTTCATCGTTGGGATTTGCACAGCTTTTCTATCCATTTTCACCCAGGGC
AGAACTTATAAGACTAGCTCAAGAAAAGAATATGAAGATTGCTTTGGGTATATTAGAGAA
AGCCAAGAAGATAAGTGGAAATCATGGGATTAAAGCAGAGACATTAACTGATGTCGGAGA
CCCTAAAGAGCCAATCCACAAGATAATTCAAGAGCGAATGATCAATTTATTAGTTATGAG
CGAGGGCGATCAAAAAAACTCTTAAAAA

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4EW23JQ 611 0 0
GGAACACAAACTTGAAGAAGATGAAGAATGTTATGGTGGTTATTGACGAGAGCAGCTCAA
GTTATGATTTACTCGTTTGGGTCCTTGAAAATCTTCAAGATATAAGTAACAGCAATAAAC
TTTTGATATTTGCAAAACAGCCACAAAGTTTTGTTGGTCCTATCTCGCTCTCTTCATCGT
TGGGATTTGCACAGCTTTTCTATCCATTTTCACCCAGGGCAGAACTTATAAGACTAGCTC
AAGAAAAGAATATGAAGATTGCTTTGGGTATATTAGAGAAAGCCAAGAAGATAAGTGGAA
ATCATGGGATTAAAGCAGAGACATTAACTGATGTCGGAGACCCTAAAGAGCCAATCCACA
AGATAATTCAAGAGCGAATGATCAATTTATTAGTTATGAGCGAGGGCGATCAAAAAA*CT
CTTAAAAAGTGTTTACATAATACACATTGTTCTCTTCTTGTCGTGGAGAAAGGAATTCGT
ATAAATTAGTGATTCGATAAATTAATGATGGTACGGACCACTAAGATCTTTTATAATTGT
ATGCATGTGGTTATGTAAAATATATGATATTGTGGGGTTATTGAACTAATAGAATATGAT
ATTATTGTACC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6606Contig1 929 2 2 U
TTTTTATTCTCTCTCCCTTTTTCTCAGTTTTTTCCTTAAATGGTTTCTTGATATCTTTCT
TCACCACCTGCTCTCTCTTTTCCTCTCATCCTCTCGTTTTCGATCTTCTAACAATTTCTC
TTGAAACCTAGTTTCCACTTGCATTCCCATTTTTTTTAATTTTCAAGTTTACGCTTCATC
CTTCCGATCCCTTACTCGACGTTAGATTCCTTCTGCGTTTCCCGCCAATTTGATCGGAGA
AAGGAAATGGAGAGAGTGAATCTAGGAGGTTTAGGTTATGAAAATGGTGGAGTGATGATG
ACTAGAGATCCTAAACCGAGGCTGAGATGGACCGCCGATCTCCACGATCGCTTCGTCGAC
GCGGTCGCAAAACTTGGTGGCGCAGACAAAGCAACTCCTAAGTCGGTTCTGAAGCTTATG
GGATTAAAAGGCTTAACATTGTACCATCTCAAACGCCATTTACAGAAGTATAGACTTGGT
CAACAGCAGGCGAAAAAACAAAATCGAACAGAACAAAACAAGGAAAATGCTGGAAGTTCA
TATGTGCATTTTGATAATTGTTCTCAAGGAGGAATCTCGAATGAATCAAGATTTGATAAC
CATTTTAGACAAAGTGGGAATGTACCTTTTGCTGACACGTTGAGACATCAGGTCGATGCA
CAACAGAGGTTCCAAGAACAGCTCGAGGTGCAGAGAAAGTTGCAGATGAGAATGGAGGCA
CAAGGAAAGTATTTGTTGACTTTACTAGAGAAAGCACAGAAGAGCATGCCCTGTGGTGGT
AATGGAGGAGAGACAGACAAGGGTCAATTTTCCGACTTCAGTCTCGCACTTTCAGGACTT
GTAGGAGATCATGATCACAAGAATGATTTGATTCCCTTCCAAATTTGTAAGTTTCGGAAG
TTCTTGTTTTAAGAATGATTTGAACACGT


BQ
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AF RR4G217TF U 1
AF RR4G217JQ C 397
BS 1 485 RR4G217TF
BS 486 929 RR4G217JQ

RD RR4G217TF 485 0 0
TTTTTATTCTCTCTCCCTTTTTCTCAGTTTTTTCCTTAAATGGTTTCTTGATATCTTTCT
TCACCACCTGCTCTCTCTTTTCCTCTCATCCTCTCGTTTTCGATCTTCTAACAATTTCTC
TTGAAACCTAGTTTCCACTTGCATTCCCATTTTTTTTAATTTTCAAGTTTACGCTTCATC
CTTCCGATCCCTTACTCGACGTTAGATTCCTTCTGCGTTTCCCGCCAATTTGATCGGAGA
AAGGAAATGGAGAGAGTGAATCTAGGAGGTTTAGGTTATGAAAATGGTGGAGTGATGATG
ACTAGAGATCCTAAACCGAGGCTGAGATGGACCGCCGATCTCCACGATCGCTTCGTCGAC
GCGGTCGCAAAACTTGGTGGCGCAGACAAAGCAACTCCTAAGTCGGTTCTGAAGCTTATG
GGATTAAAAGGCTTAACATTGTACCATCTCAAACGCCATTTACAGAAGTATAGACTTGGT
CAACA

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR4G217JQ 533 0 0
CCTAAGTCGGTTCTGAAGCTTATGGGATTAAAAGGCTTAACATTGTACCATCTCAAACGC
CATTTACAGAAGTATAGACTTGGTCAACAGCAGGCGAAAAAACAAAATCGAACAGAACAA
AACAAGGAAAATGCTGGAAGTTCATATGTGCATTTTGATAATTGTTCTCAAGGAGGAATC
TCGAATGAATCAAGATTTGATAACCATTTTAGACAAAGTGGGAATGTACCTTTTGCTGAC
ACGTTGAGACATCAGGTCGATGCACAACAGAGGTTCCAAGAACAGCTCGAGGTGCAGAGA
AAGTTGCAGATGAGAATGGAGGCACAAGGAAAGTATTTGTTGACTTTACTAGAGAAAGCA
CAGAAGAGCATGCCCTGTGGTGGTAATGGAGGAGAGACAGACAAGGGTCAATTTTCCGAC
TTCAGTCTCGCACTTTCAGGACTTGTAGGAGATCATGATCACAAGAATGATTTGATTCCC
TTCCAAATTTGTAAGTTTCGGAAGTTCTTGTTTTAAGAATGATTTGAACACGT

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL6607Contig1 722 2 2 U
GTCACGGACACAGACTCGACAACTTCAAGCCACTTTGGGCGAAAACAGTTACCAGACCTT
GGGATCCTCCTCTCTTCGAGGACGGCGTGGTTCGAGCGTTTATAACCGGTCAAAGGATCG
GAACTCAGACCGGGTCTCCTATTCACCGCGTCTTCGTCTCTCCTTTCCTCAGGTTTCTCC
TCAAGATGGAAAATCTGACTTCAATATTTTGGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAAGGAAT
GGTGGATCATAATGTCGATTCTATTTATAAAGAGATGCCAAAACGGGGGGAGACTGTGGA
AAATTGCAGAAAAAGATATGTTGAAGTTGTAAAGACTCTTGCCGATAAGTATCCTACAGA
GAACTTGCTCTTAATCACCCACGGGGAAGGATTGGACACAACATTCTCGACCTTCTTTAA
AGATGCAACCGTTCACAAAGTAGACTATTGTGCTTATGTTGAATTGAGAAGAGAGGTCTC
AAGTAAAGATGGGGGATGTTGTTGAAACTGGGGAGTATGAAGTGGTTTTTGAGTCATGGC
CCAACTGGAATCAGGTTTAGTCATGGTCCTGTCGTAATCCCAACACCGATTTAGCCAATG
TTCATCAGTTCCTCTGTTTTCTGTACTTTTTATTTGTATTTTCTTCTGAACATTTATCTA
AACTATTAAAGCTGAAGTACACTTAACTATGTCTCTTTAAAGTTGCTCAAATATTACAAA
GG


BQ
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10 10 

AF RR4BV84TF U 1
AF RR4BV84JQ C 159
BS 1 550 RR4BV84TF
BS 551 722 RR4BV84JQ

RD RR4BV84TF 550 0 0
GTCACGGACACAGACTCGACAACTTCAAGCCACTTTGGGCGAAAACAGTTACCAGACCTT
GGGATCCTCCTCTCTTCGAGGACGGCGTGGTTCGAGCGTTTATAACCGGTCAAAGGATCG
GAACTCAGACCGGGTCTCCTATTCACCGCGTCTTCGTCTCTCCTTTCCTCAGGTTTCTCC
TCAAGATGGAAAATCTGACTTCAATATTTTGGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAAGGAAT
GGTGGATCATAATGTCGATTCTATTTATAAAGAGATGCCAAAACGGGGGGAGACTGTGGA
AAATTGCAGAAAAAGATATGTTGAAGTTGTAAAGACTCTTGCCGATAAGTATCCTACAGA
GAACTTGCTCTTAATCACCCACGGGGAAGGATTGGACACAACATTCTCGACCTTCTTTAA
AGATGCAACCGTTCACAAAGTAGACTATTGTGCTTATGTTGAATTGAGAAGAGAGGTCTC
AAGTAAAGATGGGGGATGTTGTTGAAACTGGGGAGTATGAAGTGGTTTTTGAGTCATGGC
CCAACTGGAA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4BV84JQ 564 0 0
TCTCCTTTCCTCAGGTTTCTCCTCAAGATGGAAAATCTGACTTCAATATTTTGGATCTTG
AAGCTATGTTTCCTGAAGGAATGGTGGATCATAATGTCGATTCTATTTATAAAGAGATGC
CAAAACGGGGGGAGACTGTGGAAAATTGCAGAAAAAGATATGTTGAAGTTGTAAAGACTC
TTGCCGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAATCACCCACGGGGAAGGATTGGACA
CAACATTCTCGACCTTCTTTAAAGATGCAACCGTTCACAAAGTAGACTATTGTGCTTATG
TTGAATTGAGAAGAGAGGTCTCAAGTAAAGATGGGG*ATGTTGTTGAAACTGGGGAGTAT
GAAGTGGTTTT*GAGTCATGGCCCAACTGGAATCAGGTTTAGTCATGGTCCTGTCGTAAT
CCCAACACCGATTTAGCCAATGTTCATCAGTTCCTCTGTTTTCTGTACTTTTTATTTGTA
TTTTCTTCTGAACATTTATCTAAACTATTAAAGCTGAAGTACACTTAACTATGTCTCTTT
AAAGTTGCTCAAATATTACAAAGG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL6608Contig1 956 2 2 U
TTTGTAAGAAATCTCGTACGAAGGAAAACATCAAAGTAACTGTAACGATGAGCACAAAGA
ACTTCTCGTTCGTAACGGAGACTCCCAGTGTGGATTCCAACGAAGGCACCAAAACCGATT
CGGGTACCGGCTTAAAGAAGATCTCGGAGTCCTCTTGTTTACCTGAATGTTAATGCTATG
AATCAGGTAATCACCAAAGCTGGCGAAATCAGCAAAGCTGATTCCGGTTGCAACTCTCCT
GAATTGACTAAGCTCAGCGACTCTGACGAAAGAACCAAGGCTGATTCTGATTCTGGATCT
GGATCTCTTGCTTTGAAGACGGTAAGTCTCAGGATCGCAAGCTTTGTTTATTGTATGAAA
TTGTTGTTGTTATGTTGTGAATCAGGTAAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCATCA
AGCGGATTCCGGCTCTCCTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGGTGATGAAAG
CACCAAGGCGGATTCCGGCTCTTTTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAGCTGATGAT
GAAAGCACCGAGGCGGATTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAGATTCCTGGGAGTTCCTCC
AGGGAAACAGAAGTTCTGCTCCTTAACTATTTGTTGTTCCATACTTGGGTCGTGGCTATT
CTTCACTTAGACTTCACCATAGCAAAAGGATGAAGCTGGAAAGCGAATATTACATAGACG
AAGCGAATGGAAACTGGCACCTAAGACGGCAAGCGCAAGAGGGTTTATCAAAGTGACTAC
TAAATCTGAAGCCTTCCGTGAAGTTGAACCATTTATGAACGACTCCAGACTGAATCTATT
ACTAAAAGTTGTGTGAGTTTCTTAGACTAATTTTCTTGTATTACAAAGTGTCTGGGTATG
TAAAGACAAGTATAAAAACAGACATGAGAACAATTAATGTAGAGGGATTGTTTGAC


BQ
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AF RR4E209TF U 1
AF RR4E209JQ C 244
BS 1 625 RR4E209TF
BS 626 956 RR4E209JQ

RD RR4E209TF 625 0 0
TTTGTAAGAAATCTCGTACGAAGGAAAACATCAAAGTAACTGTAACGATGAGCACAAAGA
ACTTCTCGTTCGTAACGGAGACTCCCAGTGTGGATTCCAACGAAGGCACCAAAACCGATT
CGGGTACCGGCTTAAAGAAGATCTCGGAGTCCTCTTGTTTACCTGAATGTTAATGCTATG
AATCAGGTAATCACCAAAGCTGGCGAAATCAGCAAAGCTGATTCCGGTTGCAACTCTCCT
GAATTGACTAAGCTCAGCGACTCTGACGAAAGAACCAAGGCTGATTCTGATTCTGGATCT
GGATCTCTTGCTTTGAAGACGGTAAGTCTCAGGATCGCAAGCTTTGTTTATTGTATGAAA
TTGTTGTTGTTATGTTGTGAATCAGGTAAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCATCA
AGCGGATTCCGGCTCTCCTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGGTGATGAAAG
CACCAAGGCGGATTCCGGCTCTTTTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAGCTGATGAT
GAAAGCACCGAGGCGGATTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAGATTCCTGGGAGTTCCTCC
AGGGAAACAGAAGTTCTGCTCCTTA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4E209JQ 713 0 0
TTGACTAAGCTCAGCGACTCTGACGAAAGAACCAAGGCTGATTCTGATTCTGGATCTGGA
TCTCTTGCTTTGAAGACGGTAAGTCTCAGGATCGCAAGCTTTGTTTATTGTATGAAATTG
TTGTTGTTATGTTGTGAATCAGGTAAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCATCAAGC
GGATTCCGGCTCTCCTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGGTGATGAAAGCAC
CAAGGCGGATTCCGGCTCTTTTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAGCTGATGATGAA
AGCACCGAGGCGGATTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAGATTCCTGGGAGTTCCTCCAGG
GAAACAGAAGTTCTGCTCCTTAACTATTTGTTGTTCCATACTTGGGTCGTGGCTATTCTT
CACTTAGACTTCACCATAGCAAAAGGATGAAGCTGGAAAGCGAATATTACATAGACGAAG
CGAATGGAAACTGGCACCTAAGACGGCAAGCGCAAGAGGGTTTATCAAAGTGACTACTAA
ATCTGAAGCCTTCCGTGAAGTTGAACCATTTATGAACGACTCCAGACTGAATCTATTACT
AAAAGTTGTGTGAGTTTCTTAGACTAATTTTCTTGTATTACAAAGTGTCTGGGTATGTAA
AGACAAGTATAAAAACAGACATGAGAACAATTAATGTAGAGGGATTGTTTGAC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6609Contig1 1199 2 4 U
GGTGGGTATTATTCATAATAACATCGCACTCCTCTCGTCCCTCATCCTCATCGCCTCAGC
TCTCAGCTTTTTTTCTCCGGATCTGCATCTCCGTCAACCACGCCGATCAAGATCAACCAG
GATAACTTTGTTTTTTTGAGAAGATGTCTACTGTGTCCAAGACCAGATCAAGAGACAAGA
ACGTCGTGAGTGATTCACACAAGGCACCAAGTAAAGCCTCGGGATCCATAGGTGCAACTA
CTGGTGGTGCTTACAATCTTCTTTTGGAGACCGTTGAGTCAACCGGTTCCTCATCGCTTC
ACAACAATGGCCGTTTCAGAAACATTGATGACTCGGATTCAACCGGAGCCGACTGTGATT
CCGTCTCTAACAACGGTAGTTGGTCAGGCGATTCGGAAGATCACAAAGAGAAAGCAGCAC
CTTCCACAGCTACCGCGAAGCAAGAAACCATCCCCGGAGCAGCTGACAACGATAAGCGAG
AGAAGATGCGGCTTAAGAACGAAAGAAAGCACCGGCGTCAGAAGGAGAAGCGAGCGCAGG
AGTTGCACGAGCGGTGCTGTCAGTTTCTGATGTCGAGGAAACTCAAAGTGCTTGTTCAGC
AGGTCATAGCTATGGGGATTTCTCATGAGAGGGCGACTTACGCTCTGATGTTGAACGAAG
GGAAAATAGAAGAGGCTATTAGTTGGCTGTTTGATGATGGTGGGGCGAATGTAGCGGATG
GGAAACTAGTTCCCACCTCTGGGAGCTTAAAGCTTGACATATCGCAAGAGCTGGGGAGAA
TCTTGGAGTTGGAGAGGGAATATAAGTGCGCCAAGCAGGATGTAGAAAAGGCTGTGGTTA
CAGCGGAAGGGGATATTGAGAAAGCAGAAGAGTCATTAAGAAGACAGAAGCAAGAACAAT
CTACTACTACTTCTGTAAAAACAGAGGATGTTAGTGATAATGCTTCAGTTAGCAAAGCCG
CTTCTGTGCACGCAAGCGAAAGCAGAGTAGCCCGGTTGCAACCTAACTCAGGTATGTATA
CTTCAGGGGGAGAGGAAGATAGAAAGAGTCTCGGTTACCTTAGAGGATCCAGCTATGTTA
ATGGAGGATCCGGAAACCAGAGAGTCGATAGAATTCACATGGAATTGCAGTGGATGAAAA
TGCAACAGAATGCTGCCCTGGAAGAGAAGAAACGCCTGTTAATCTACAGACACAGCTGT


BQ
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AF RR4EE23TF U 1
AF RR4GG86TF U 516
BS 1 602 RR4EE23TF
BS 603 603 RR4GG86TF
BS 604 626 RR4EE23TF
BS 627 1199 RR4GG86TF

RD RR4EE23TF 626 0 0
GGTGGGTATTATTCATAATAACATCGCACTCCTCTCGTCCCTCATCCTCATCGCCTCAGC
TCTCAGCTTTTTTTCTCCGGATCTGCATCTCCGTCAACCACGCCGATCAAGATCAACCAG
GATAACTTTGTTTTTTTGAGAAGATGTCTACTGTGTCCAAGACCAGATCAAGAGACAAGA
ACGTCGTGAGTGATTCACACAAGGCACCAAGTAAAGCCTCGGGATCCATAGGTGCAACTA
CTGGTGGTGCTTACAATCTTCTTTTGGAGACCGTTGAGTCAACCGGTTCCTCATCGCTTC
ACAACAATGGCCGTTTCAGAAACATTGATGACTCGGATTCAACCGGAGCCGACTGTGATT
CCGTCTCTAACAACGGTAGTTGGTCAGGCGATTCGGAAGATCACAAAGAGAAAGCAGCAC
CTTCCACAGCTACCGCGAAGCAAGAAACCATCCCCGGAGCAGCTGACAACGATAAGCGAG
AGAAGATGCGGCTTAAGAACGAAAGAAAGCACCGGCGTCAGAAGGAGAAGCGAGCGCAGG
AGTTGCACGAGCGGTGCTGTCAGTTTCTGATGTCGAGGAAACTCAAAGTGCTTGTTCAGC
AG*TCATAGCTATGGGGATTTCTCAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4GG86TF 684 0 0
G
GTCAGAAGGAGAATCGAGCGCAGGAGTTGCACGAGCGGTGCTGTCAGTTTCTGATGTCGA
GGAAACTCGAAGTGCTTGTTCAGCAGGTCATAGCTATGGGGATTTCTCATGAGAGGGCGA
CTTACGCTCTGATGTTGAACGAAGGGAAAATAGAAGAGGCTATTAGTTGGCTGTTTGATG
ATGGTGGGGCGAATGTAGCGGATGGGAAACTAGTTCCCACCTCTGGGAGCTTAAAGCTTG
ACATATCGCAAGAGCTGGGGAGAATCTTGGAGTTGGAGAGGGAATATAAGTGCGCCAAGC
AGGATGTAGAAAAGGCTGTGGTTACAGCGGAAGGGGATATTGAGAAAGCAGAAGAGTCAT
TAAGAAGACAGAAGCAAGAACAATCTACTACTACTTCTGTAAAAACAGAGGATGTTAGTG
ATAATGCTTCAGTTAGCAAAGCCGCTTCTGTGCACGCAAGCGAAAGCAGAGTAGCCCGGT
TGCAACCTAACTCAGGTATGTATACTTCAGGGGGAGAGGAAGATAGAAAGAGTCTCGGTT
ACCTTAGAGGATCCAGCTATGTTAATGGAGGATCCGGAAACCAGAGAGTCGATAGAATTC
ACATGGAATTGCAGTGGATGAAAATGCAACAGAATGCTGCCCTGGAAGAGAAGAAACGCC
TGTTAATCTACAGACACAGCTGT

QA 2 684 2 684
DS 



AS 1 2

CO CL6610Contig1 1081 2 2 U
GGGGCTCAAATTCCTATTTCTACTTGCAGGAAAACAGATTCTAATTAATTAAAAAGAGCA
GATAGGAGAAAAATGTATGCAGATACAGGGCCAGCGTTCCGATTCATGCAGGGCTGTTCT
CCAGAAACTCATCAGTTCGATGACCTCTTTAAACCCTACAAGCTCTCTGATCAGACGATC
AGTCTTGTTGAGGCATGTGAGTATGGTGGGTTCGGAGGAGAAGAGAGTGACCTATTCAAA
GCCCCTGAGCCGATCATCATTGAAGAGCCAATGCTAGCCGTTGACCCACTCTCTCAAGAG
ATTGTTGGACTCAGCGATCTCGGGTCGTTGCAGAGCGACCAGCAGCTTATAGAAAAGGCT
TTCTACGAGTGTGAACAGGAGGAGCTCTTGGTGAAATCAGCCATGGAGTCTCCGCTGCTC
TCCGATGTGCTAGACGCCGAGAACGTCTCTCTAGCGGCGGAAATGGACAGTAGTGGTGGT
GTTGTTGTTTCTGATGTCGCAGTTCCTAAGAGCGTGAGCTCGGGGAACCTGAGATCAATG
GATATGCCACAGCAGCAGCAAGAGGATGCGGTGATTCAGAGATTCTTCCCTCCAGTCGAT
AATGGAATGAGAAGAGCCTTTAGCGAAAGCGATATACAGACACTTGGGACTAGAAACGCT
GGTCAGGTTAGGTCTCAACTGGATCGGATGATAGTTAGTTGCACCTCTGAGGACCGTCGT
GAGAAGCTTTCTCGATACAGGGACAAGAAGAGCAGGAGGAATTTCGGGCGTAAAATCAAG
TATGCTTGCAGGAAGACTCTTGCAGACAGTCAGCCGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCAAAA
ACAGAGGAGATGCAGAAATGAGGATTCATATAGTTTGGTACCTGAAGATAAGCAGAACAG
TTTGATGCAGTTTGTTAAGCCCAACAACCTCTTTGGTGTCTTTTTTTGTATATAAGGGTT
TGTCTGAATAAGCCTCTAAGGAGTAAGGATTAGGAAGGAAAACAAGTTGTAGTAGGGTTA
CTCAAATGATATGCTTTTATCTATGTTAGATCTTGCGAAGCTCAGTCTCTTAAGTTCTTA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4BX09TF U 1
AF RR4BX09JQ C 275
BS 1 662 RR4BX09TF
BS 663 1081 RR4BX09JQ

RD RR4BX09TF 662 0 0
GGGGCTCAAATTCCTATTTCTACTTGCAGGAAAACAGATTCTAATTAATTAAAAAGAGCA
GATAGGAGAAAAATGTATGCAGATACAGGGCCAGCGTTCCGATTCATGCAGGGCTGTTCT
CCAGAAACTCATCAGTTCGATGACCTCTTTAAACCCTACAAGCTCTCTGATCAGACGATC
AGTCTTGTTGAGGCATGTGAGTATGGTGGGTTCGGAGGAGAAGAGAGTGACCTATTCAAA
GCCCCTGAGCCGATCATCATTGAAGAGCCAATGCTAGCCGTTGACCCACTCTCTCAAGAG
ATTGTTGGACTCAGCGATCTCGGGTCGTTGCAGAGCGACCAGCAGCTTATAGAAAAGGCT
TTCTACGAGTGTGAACAGGAGGAGCTCTTGGTGAAATCAGCCATGGAGTCTCCGCTGCTC
TCCGATGTGCTAGACGCCGAGAACGTCTCTCTAGCGGCGGAAATGGACAGTAGTGGTGGT
GTTGTTGTTTCTGATGTCGCAGTTCCTAAGAGCGTGAGCTCGGGGAACCTGAGATCAATG
GATATGCCACAGCAGCAGCAAGAGGATGCGGTGATTCAGAGATTCTTCCCTCCAGTCGAT
AATGGAATGAGAAGAGCCTTTAGCGAAAGCGATATACAGACACTTGGGACTAGAAACGCT
GG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4BX09JQ 807 0 0
TAGCCGTTGACCCACTCTCTCAAGAGATTGTTGGACTCAGCGATCTCGGGTCGT*GCAGA
GCGACCAGCAGCTTATAGAAAAGGCTTTCTACGAGTGTGAACAGGAGGAGCTCTTGGTGA
AATCAGCCATGGAGTCTCCGCTGCTCTCCGATGTGCTAGACGCCGAGAACGTCTCTCTAG
CGGCGGAAATGGACAGTAGTGGTGGTGTTGTTGTTTCTGATGTCGCAGTTCCTAAGAGCG
TGAGCTCGGGGAACCTGAGATCAATGGATATGCCACAGCAGCAGCAAGAGGATGCGGTGA
TTCAGAGATTCTTCCCTCCAGTCGATAATGGAATGAGAAGAGCCTTTAGCGAAAGCGATA
TACAGACACTTGGGACTAGAAACGCTGGTCAGGTTAGGTCTCAACTGGATCGGATGATAG
TTAGTTGCACCTCTGAGGACCGTCGTGAGAAGCTTTCTCGATACAGGGACAAGAAGAGCA
GGAGGAATTTCGGGCGTAAAATCAAGTATGCTTGCAGGAAGACTCTTGCAGACAGTCAGC
CGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCAAAAACAGAGGAGATGCAGAAATGAGGATTCATATAGT
TTGGTACCTGAAGATAAGCAGAACAGTTTGATGCAGTTTGTTAAGCCCAACAACCTCTTT
GGTGTCTTTTTTTGTATATAAGGGTTTGTCTGAATAAGCCTCTAAGGAGTAAGGATTAGG
AAGGAAAACAAGTTGTAGTAGGGTTACTCAAATGATATGCTTTTATCTATGTTAGATCTT
GCGAAGCTCAGTCTCTTAAGTTCTTAT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL6611Contig1 782 2 2 U
GGGGCACTGGTGGATGCAGTTTGGAGACGGGTATGTGTTGGGATACTGGCCGAGCTTTCT
GTTCTCGTACTTAGCAGACAGTGCATCGACAGTGGAATGGGGTGGGGAAGTAGTGAACAT
GGAAGAAGACGGTCACCATACCACCACTCAGATGGGAAGCGGTCTGTTTCCTGATGCAGG
GTTCTCGAGAGCAAGTTACTTTCGGAATGTTCAAGTTGTTGATCGCTCTAATAACCTGAA
AGAACCAAAAGGGCTCAACACTTTCACCGAGAAGTCTAATTGCTATGATGTTGAGGTTGG
TAAGAATGATGACTGGGGGCATTATTTTTACTACGGTGGCCCTGGAAGAAACCCTAATTG
TCAGTAGATGGTGAACAGAAGAAAGAAGATGATGATGATTGATGAAGATGTAGAGTAACA
CTTGTGCTGTGTGGAAATATCGTTTTTGATGATTTATTCTTACACTATCTGGTTTTTCAA
AGTACTTTTTGTTTTGGTTTCTAGGTTTTGATTAGGTTTTAGTTGCGGTTTTTGGGGGTT
CTTACTTGTTACTTGGGTTGGAAGAGACCAAGTGTGACTGCAGTTCGTAAGTGTGAAAGA
GATTTTGAGAAGTCTTGTTTCTTGTAACCTTGAAGACAAGGAGGTTGCAGGGCTTTGGGT
TGTTTTTTAGAGTCTTTCCTTTGTTGCATTTGCTGCTTATTGAAAAGAGAATTTGTAAGT
GGGAAAGAGAGAGCTTGAACAAGTTTGTTTGTAGTTTGTAATTGTGAAAGAGAGAATCTG
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4EC30TF U 1
AF RR4EC30JQ C 232
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CTTACTTGTTACTTGGGTTGGAAGAGACCAAGTGTGACTGCAGTTCGTAAGTGTGAAAGA
GATTTTGAGAAGTCTTGT
C

QA 1 618 1 618
DS 

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TTTGTAAGTGGGAAAGAGAGAGCTTGAACAAGTTTGTTTGTAGTTTGTAATTGTGAAAGA
GAGAATCTGTC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

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AGATTTGGGAAAGTGGAATCAATCTGTCGGAAAAAA


BQ
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AF RR4EH64JQ U 22
AF RR4EH64TF C 1
BS 1 21 RR4EH64TF
BS 22 429 RR4EH64JQ
BS 430 516 RR4EH64TF

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QA 1 408 1 408
DS 

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GAGATTACCTTCCATCCCTTCCAAATCAATCTCCGGGACGCGGTTCACGTGGTAAACCTT
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AGATTTGGGAAAGTGGAATCAATCTGTCGGAAAAAA

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

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AATATAAACAAATCTTTTGCTTCT


BQ
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AF RR4C170JQ C 1
AF RR4C170TF U 1
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AATATAAACAAATCTTTTGCTTCT

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4C170TF 384 0 0
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GAGAACAAGAAAAAGGCCAATTATGAAGATGAAGGTCGTGATTGTGTTCTTCCTGTACAT
AGCCAAGTAGTGAAGATCAAGAAAGAGTGCGAGAAGATTCATCAGCCGGAGATGCTGAGG
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GACAATAGACCCATCACCGTTTGGAATTGATAACAAAGAAAGAGAGAGAGATGGAGATAA
GTTATTCTCTGTGTATTTTAGGCTTCTCTCTTTTGTCTTTGAACGTAAATATCTTTAGTT
AATATAAACAAATCTTTTGCTTCT

QA 1 384 1 384
DS 



AS 1 2

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AGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTT
TCCTGCTACTTAATTTTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCTACCTAAATATC
ATAATTGCTGTTCGTACTGTTTTTTGCCTGTTTCCATGAACCATGGGGAGGAGAAAGCTA
GCGACGGCGTAATATGGTATTTTATAAATTTAGAGTTGAAAGCC


BQ
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AF RR4FH70JQ C 1
AF RR4FH70TF U 1
BS 1 404 RR4FH70TF

RD RR4FH70JQ 404 0 0
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QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4FH70TF 404 0 0
GGATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAGTCCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAA
GATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGAC
CTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAA
AGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTT
TCCTGCTACTTAATTTTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCTACCTAAATATC
ATAATTGCTGTTCGTACTGTTTTTTGCCTGTTTCCATGAACCATGGGGAGGAGAAAGCTA
GCGACGGCGTAATATGGTATTTTATAAATTTAGAGTTGAAAGCC

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL6615Contig1 794 2 3 U
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AATAAGTAAAACAGAAATAGTGAGAAATTACATAAAGCCACTCAAAACTCAAGACAGAAC
ACACTAAACAACACACAAACACAAGTCAGAACGTAGAAGCAGTTCTGTTCCTTTCTTTTT
TCTGCTTTCATATGTTGCTGACGAAGGAAAGTCCTTCCTTGGACAACACCTCAACGCTCT
CAACAGAAGGCTGTTCCCTCGCAGCCTTAGCAATCGCCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTC
CTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTAATCCAGTAGCTCCCGAACTTCGGTT
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CACCCTTGTCTTCTTCAACTTGGCCTTTGAAGAGAGATGTAATAGGTCTAGCACCAACAC
CTACGATCACTATATCAGCTTCTAGTTTTCTTCCGTCCTTCAATAACACCTCAGTGACCT
CTCTAGCAGAGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C136JQ U 18
AF RR4EW56JQ U 1
BS 1 181 RR4EW56JQ
BS 182 182 RR4C136JQ
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GCTTCTAGTTTTCTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4EW56JQ 794 0 0
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CTACGATCACTATATCAGCTTCTAGTTTTCTTCCGTCCTTCAATAACACCTCAGTGACCT
CTCTAGCAGAGTTA

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

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CGGTCTAGTGGCCGCGTCTTTGTCACATGCGTTTGCATTGTTCGTGGCGGTTTCCGTTGG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR28TF U 1
AF RR4GR28JQ C 357
BS 1 713 RR4GR28TF
BS 714 714 RR4GR28JQ
BS 715 726 RR4GR28TF
BS 727 727 RR4GR28JQ
BS 728 749 RR4GR28TF
BS 750 969 RR4GR28JQ

RD RR4GR28TF 753 0 0
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TCCAGATGCGATCCGAGCGGCTTTTGCTGAGTTTTTCTCCATGGTTATATTCGTTTTCGC
CGGTCAAGGTTCCGGTATGGCTTACGGAAAGCTAACAGGAGACGGTCCAGCCACACCTTC
CGGTCTAGTGGCCGCGTCTTTGTCACATGCGTTTGCATTGTTCGTGGCGGTTTCCGTTGG
AGCAAACGTTTCAGGCGGTCACGTGAATCCCGCAGTTACGTTTGGAGCTTTTATAGGTGG
GAACATAACGTTGTTGAGAGCTATTCTTTATTGGATCGCTCAGTTACTTGGAGCAGTCGT
AGCTTGCTTGTTGCTCAAGGTAAGTACTGGCGGGATGGAAACGGCAGCGTTTTCGCTCTC
TTACGGAGTCACACCGTGGAATGCCGTCGTTTTCGAGATTGTGATGACGTTTGGGTTGGT
TTACACTGTTTATGCTACTGCCGTGGATCCCAAGAAAGGTGATATTGGAATCATTGCCCC
TTTAGCGACTGGGCTAATTGTTGGAGCTAATATTCTCGTTGGTGGTGCGTTTGATGGTGC
GTCGATGAACCCAGCGGTTTCGTTCGGTCCTGCCGTGGTTAGCTGGACGTGGACGAACCA
TTGGGTCTATTGGGTTGGTCCGTTTATTGGTGCAGCCATTGCAGCTATCGTTT*TGACAC
TATCTT*ATTGATAGTAATGGATATGAAC
ACTT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4GR28JQ 613 0 0
TCGTAGCTTGCTTGTTGCTCAAGGTAAGTACTGGCGGGATGGAAACGGCAGCGTTTTCGC
TCTCTTACGGAGTCACACCGTGGAATGCCGTCGTTTTCGAGATTGTGATGACGTTTGGGT
TGGTTTACACTGTTTATGCTACTGCCGTGGATCCCAAGAAAGGTGATATTGGAATCATTG
CCCCTTTAGCGACTGGGCTAATTGTTGGAGCTAATATTCTCGTTGGTGGTGCGTTTGATG
GTGCGTCGATGAACCCAGCGGTTTCGTTCGGTCCTGCCGTGGTTAGCTGGACGTGGACGA
ACCATTGGGTCTATTGGGTTGGTCCGTTTATTGGTGCAGCCATTGCAGCTATCGTTTATG
ACACTATCTTTATTGATAGTAATGGATATGAACCACTTCCTTCAAGTGATTTCTAATTTA
GGGTGTTGCTGATTTCTTCAGAAGCAAGAAAACTGATGTTGTACTGACTACCGGTATTGT
GATAGAGGTGTATGTTTTTAACTCTCATGCGTGTCTTTCTTTTAAAATATGGTTTTAGTC
AAGTGGCTAAAGATGTTACTTTTTACTTACTTTGTTTTTAAAGTGATTAATAAACTAAAT
CTTGGAAAGTTCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL6617Contig1 1011 2 6 U
GGACTCTGACCTTGCACTCATGTGACACACTGACGCATTATCAATTACATCACATACATT
TATCACGTAACGTAATATATGTCTGTTTCTATATATTAACGAGCTTTTGTTTCTGCAAAA
GCTTGTATCCAATATGTTCTGTGCATCGCAAGCATCGACGGCCACAGCTAGCCACGACGA
ACGGAGCGCTGCGGCACGTGCCATCGACCGTCATAACCCCATTATCAAAGATGGTCGAAG
ATCTTTCACGGCACCTTGCTCTTCCGGCGACGACTACATTGCACCGTACCGTCAGATTTC
GAAAATTACGAGAATACCCTCCTCCTCCGGTGAAGGGAAGATGATTGCGGTGGTGGAGAA
AGGAAGAAAGAGCAGTTCAGGGTCGTTGCTGAAACTCAGTGATAATATTAGCTTAGCTAG
GAAGAGTTTTGGCTGTGTTGCGGGACCCGCGTGTGCCGTTACTGAGAGTACACCTCCTGG
TTCTACTAGGTATCTTCTGGGATCCGAACCGGTTTCTTCGAGTAAGGATGCGGTTGTAAC
GGAGGAGGGTGAACCTTCTTTGCCAAAAGGAGGCTCTACTGCTGCAGTGGAAGAGAAGAA
GAAGACTTCTTCTGGTTTAGACCAGGTGGTTGTTCTTAGAGTGTCTCTTCACTGTCACTG
CAGAGGCTGCCAAGGCAAAGTGAAGAAACATCTATCTAGAATGCAAGGTGTGACATCTTT
CAGCATAGATTTTGCATCAAAGAAGGTAACTGTGACTGGAGATGTCACTCCCTTGGAAGT
ACTAGGTTGCCTCTCAAAGGTCAAAAATGCCCAATTCTGGACACCACCTCCTCCACCTCC
ATCATCACTCACAAGGACAAATCCGGAAAACTAAAACCAAAACCAGTATTTCTGTAATTC
TAATTCTGTTTTCTCCCATTTGTTTGAATCAAATCAATGGTAAAACTTAAGACTTAACCT
ACTCCATTTATTTTTCATTGTTCATCAAGGAAGGCCAAAACTTTCAGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BX78TF U 1
AF RR4BX78JQ C 262
BS 1 674 RR4BX78TF
BS 675 675 RR4BX78JQ
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BS 709 732 RR4BX78TF
BS 733 1011 RR4BX78JQ

RD RR4BX78TF 739 0 0
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TATCACGTAACGTAATATATGTCTGTTTCTATATATTAACGAGCTTTTGTTTCTGCAAAA
GCTTGTATCCAATATGTTCTGTGCATCGCAAGCATCGACGGCCACAGCTAGCCACGACGA
ACGGAGCGCTGCGGCACGTGCCATCGACCGTCATAACCCCATTATCAAAGATGGTCGAAG
ATCTTTCACGGCACCTTGCTCTTCCGGCGACGACTACATTGCACCGTACCGTCAGATTTC
GAAAATTACGAGAATACCCTCCTCCTCCGGTGAAGGGAAGATGATTGCGGTGGTGGAGAA
AGGAAGAAAGAGCAGTTCAGGGTCGTTGCTGAAACTCAGTGATAATATTAGCTTAGCTAG
GAAGAGTTTTGGCTGTGTTGCGGGACCCGCGTGTGCCGTTACTGAGAGTACACCTCCTGG
TTCTACTAGGTATCTTCTGGGATCCGAACCGGTTTCTTCGAGTAAGGATGCGGTTGTAAC
GGAGGAGGGTGAACCTTCTTTGCCAAAAGGAGGCTCTACTGCTGCAGTGGAAGAGAAGAA
GAAGACTTCTTCTGGTTTAGACCAGGTGGTTGTTCTTAGAGTGTCTCTTCACTGTCACTG
CAGAGGCTGCCAAG*CAAAGTGAAGAAACATCTATCTAGAATGCAAG*TGTGACATCTTT
CAGCATAGATTT
GCATCAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4BX78JQ 750 0 0
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CTCCTCCGGTGAAGGGAAGATGATTGCGGTGGTGGAGAAAGGAAGAAAGAGCAGTTCAGG
GTCGTTGCTGAAACTCAGTGATAATATTAGCTTAGCTAGGAAGAGTTTTGGCTGTGTTGC
GGGACCCGCGTGTGCCGTTACTGAGAGTACACCTCCTGGTTCTACTAGGTATCTTCTGGG
ATCCGAACCGGTTTCTTCGAGTAAGGATGCGGTTGTAACGGAGGAGGGTGAACCTTCTTT
GCCAAAAGGAGGCTCTACTGCTGCAGTGGAAGAGAAGAAGAAGACTTCTTCTGGTTTAGA
CCAGGTGGTTGTTCTTAGAGTGTCTCTTCACTGTCACTGCAGAGGCTGCCAAGGCAAAGT
GAAGAAACATCTATCTAGAATGCAAGGTGTGACATCTTTCAGCATAGATTTTGCATCAAA
GAAGGTAACTGTGACTGGAGATGTCACTCCCTTGGAAGTACTAGGTTGCCTCTCAAAGGT
CAAAAATGCCCAATTCTGGACACCACCTCCTCCACCTCCATCATCACTCACAAGGACAAA
TCCGGAAAACTAAAACCAAAACCAGTATTTCTGTAATTCTAATTCTGTTTTCTCCCATTT
GTTTGAATCAAATCAATGGTAAAACTTAAGACTTAACCTACTCCATTTATTTTTCATTGT
TCATCAAGGAAGGCCAAAACTTTCAGATGG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL6618Contig1 663 2 2 U
CTCTCCGCCTCCGTAACACTCTTCTAGCTGCGACTCCTCTCTTCGTCTCGAGCCTCCCCG
TAACAGATGGCGAGCAGTATAATCTTGTTCGAGGACATCTTCGTGGTCGATAAGCTTGAC
CCTGATGGCAAAAAGTTCGATAAAGTTACGCGTATTGAAGCAACTAGCCACAACTTGGAC
ATGTTTATGCATTTGGATGTTAACACAGAGGTTTATCCGATGGCGGTTGGTGATAAGTTC
ACACTGGCTATGGCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAACACCTGATACCGGATATTTTACC
CCGGGAGCAAAGAAAACGCTTGCTGACAAGTACGAATACGTTATGCACGGGAAGCTTTAC
AAGATCACTGAGCGTGACGGCCAAACTCCAAAAGCAGAGATGTATGTTTCTTTCGGTGGC
CTCCTAATGTTGCTTCGTGGAGATCCAGCTCACATTTCTCACTTTGAACTTGACCAGAGG
CTCTTCCTTCTCATGAGGAAGCTTTGAGATTCCTTTGTCTGATCTTTTTTTGGCTTAGAC
CAAGATTTATCTTATGTTCAACTTTGCTTTTGATGTTATGCTCACGAATCAGCTATTGTA
CCAACGCAAGTTCTCCGTACTGTTTCAACATCTTGCATAATTAGTTATCAGCTACTGCAA
TTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RR4CV39TF U 1
AF RR4CV39JQ C 13
BS 1 395 RR4CV39TF
BS 396 663 RR4CV39JQ

RD RR4CV39TF 395 0 0
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TAACAGATGGCGAGCAGTATAATCTTGTTCGAGGACATCTTCGTGGTCGATAAGCTTGAC
CCTGATGGCAAAAAGTTCGATAAAGTTACGCGTATTGAAGCAACTAGCCACAACTTGGAC
ATGTTTATGCATTTGGATGTTAACACAGAGGTTTATCCGATGGCGGTTGGTGATAAGTTC
ACACTGGCTATGGCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAACACCTGATACCGGATATTTTACC
CCGGGAGCAAAGAAAACGCTTGCTGACAAGTACGAATACGTTATGCACGGGAAGCTTTAC
AAGATCACTGAGCGTGACGGCCAAACTCCAAAAGC

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR4CV39JQ 651 0 0
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AGCAGTATAATCTTGTTCGAGGACATCTTCGTGGTCGATAAGCTTGACCCTGATGGCAAA
AAGTTCGATAAAGTTACGCGTATTGAAGCAACTAGCCACAACTTGGACATGTTTATGCAT
TTGGATGTTAACACAGAGGTTTATCCGATGGCGGTTGGTGATAAGTTCACACTGGCTATG
GCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAACACCTGATACCGGATATTTTACCCCGGGAGCAAAG
AAAACGCTTGCTGACAAGTACGAATACGTTATGCACGGGAAGCTTTACAAGATCACTGAG
CGTGACGGCCAAACTCCAAAAGCAGAGATGTATGTTTCTTTCGGTGGCCTCCTAATGTTG
CTTCGTGGAGATCCAGCTCACATTTCTCACTTTGAACTTGACCAGAGGCTCTTCCTTCTC
ATGAGGAAGCTTTGAGATTCCTTTGTCTGATCTTTTTTTGGCTTAGACCAAGATTTATCT
TATGTTCAACTTTGCTTTTGATGTTATGCTCACGAATCAGCTATTGTACCAACGCAAGTT
CTCCGTACTGTTTCAACATCTTGCATAATTAGTTATCAGCTACTGCAATTT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL6619Contig1 676 2 4 U
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CTAGCTAGCTTACTTTTTTTAGGTCTTTCTCTCATCTTATAATCTGTGATATTCAGATTC
AGATCCGAGTTTCCATTTTATCAGCTTCCTTCGGTGTTGCTCTAATCCTATTTCCAGCTG
TCGTCTTCACGATGATTAAGAACTGGAAACCCGTACGGTTAAGGCTTCAAATGCGTACTA
TCATGGTGTTTCTGGTGATTTTGAGCTTTGACTCGTTGGAAACTGAAGGTATATCGATGA
CGAAAGATCTACAGGCTGATAGAGATGCAGCAGATTTGGGAGCTGTTAGTTTCCATAGGA
GAAGTGATCAAAAGGTGTGTAAGGGAAGACACGAAAGAGAGACCGACAATGAAGGAAGTG
ACAGGGAGGTTACGAGAGATCACAGGATTGTCAACGGAGGATGCTATTCCGAAACTTTCA
CCTCTTTGGTGGGCAGAGCTTGAAGTGATGTCCACTGCGTGAAAAGTGTAGTAGTTACTA
GGTTGCTTCATAAAACGAGTCTGTAAGTATTATGAATATGAAGTTTGTGTTGGGGTTGAT
GAGTCTCTTTGGAGCTTGTTACTACTCTTTAGGCCTATGTAAATGTATGAATCTATGCTA
GTTTATATAACGACGC


BQ
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AF RR4FR78TF U 1
AF RR4FR78JQ C 1
BS 1 380 RR4FR78TF
BS 381 381 RR4FR78JQ
BS 382 388 RR4FR78TF
BS 389 676 RR4FR78JQ

RD RR4FR78TF 388 0 0
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CTAGCTAGCTTACTTTTTTTAGGTCTTTCTCTCATCTTATAATCTGTGATATTCAGATTC
AGATCCGAGTTTCCATTTTATCAGCTTCCTTCGGTGTTGCTCTAATCCTATTTCCAGCTG
TCGTCTTCACGATGATTAAGAACTGGAAACCCGTACGGTTAAGGCTTCAAATGCGTACTA
TCATGGTGTTTCTGGTGATTTTGAGCTTTGACTCGTTGGAAACTGAAGGTATATCGATGA
CGAAAGATCTACAGGCTGATAGAGATGCAGCAGATTTGGGAGCTGTTAGTTTCCATAGGA
GAAGTGATCAAAAGGTGTGTGAGGGAAG

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4FR78JQ 676 0 0
GGGCGAACTCAAACTCAGAGCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTCGTCTT
CTAGCTAGCTTACTTTTTTTAGGTCTTTCTCTCATCTTATAATCTGTGATATTCAGATTC
AGATCCGAGTTTCCATTTTATCAGCTTCCTTCGGTGTTGCTCTAATCCTATTTCCAGCTG
TCGTCTTCACGATGATTAAGAACTGGAAACCCGTACGGTTAAGGCTTCAAATGCGTACTA
TCATGGTGTTTCTGGTGATTTTGAGCTTTGACTCGTTGGAAACTGAAGGTATATCGATGA
CGAAAGATCTACAGGCTGATAGAGATGCAGCAGATTTGGGAGCTGTTAGTTTCCATAGGA
GAAGTGATCAAAAGGTGTGTAAGGGAAGACACGAAAGAGAGACCGACAATGAAGGAAGTG
ACAGGGAGGTTACGAGAGATCACAGGATTGTCAACGGAGGATGCTATTCCGAAACTTTCA
CCTCTTTGGTGGGCAGAGCTTGAAGTGATGTCCACTGCGTGAAAAGTGTAGTAGTTACTA
GGTTGCTTCATAAAACGAGTCTGTAAGTATTATGAATATGAAGTTTGTGTTGGGGTTGAT
GAGTCTCTTTGGAGCTTGTTACTACTCTTTAGGCCTATGTAAATGTATGAATCTATGCTA
GTTTATATAACGACGC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6620Contig1 1095 2 2 U
GAGACAGAGGAAGAAGATGAGAGTGTTGCATCGGATCAGGTGGGTGTGATGTTTGGATAT
CTCAATCTCTCTCTCCATAATCTACTGCAAAGTAACTGGACCGGTGCTTGCTCGGCCATT
GACCAAGCACTTAAAGCTACAGCTCCTGCTCATTTTATGCACTGTCTGAGAGAACATGCT
GTGTTTCAGCTGATCAATTCGTTGCAAGCAACAGGCGAATTTCCAATCAACCTACAATCG
AGATTACTCAACTCTTATCTGGATCAAGCAAGTTCTTTACCTGTTAAAGAGCCACTGTCG
TGGAAATTCATCAGCAACAGCGCCGAGAAACCAAGAGCAAGGAAGCTAGTAAGTAACCTT
CTGGCGCCAGTTTCATCTGAAGTCTTAGTGGTAAACACGGTTCTTGAAGCATGGCACGGA
CCATCTCTTGTCCCGGAGAAGCTGAGTAAACAAAAGGAACTTGTGGATTTTGTGGAAACA
ATCCTAGGTTTGGTCCCATGCAACTACCCGCTGGCTTTGTCTGTAAGTAAGCTGTTGAGG
AAAGAAGAGGACTCTGGTTCCTCGAGTATACATTTCTGGGCAGGTTTGAATCTGGTGAGT
GCAATTTCTTGTGCAATGCCAGTAGCTCCCGAGTATATATGGGTGGAGGCTGGAGAGATT
TTGAGCAATGTCAATGGTTTTAAGACCAGAGCAGAGAGGTTCTTGAGTAAAGCTGTGTCT
GTATATCCAATGTCTGTGAAGCTATGGAGATGTTATGGGAGTGTAGCTAGAAGTATAGAA
GAGAAAAGAGGCGTTAAGATTGAAGAAGAAGCTAGAAAGAAAGGAATCACTCTGGTGGAT
TGATATTTGAAAAGGCGACTCGTGTGTTTTTTCCCTTTACATAGCTAGAACACACTTAAG
AGGGAACATAGTAACGAAGAAAATGGGAATACAGTTTTAGAAAAGGGGCAAGTGAATACT
GATTGTTATACTTTTGGTCAGTTTCTAGCATAAGCTTTTTTTTTTTTTGTTATACAACTG
TAATTGACCATGCTTTTGCATCTTGGTTCTTAATGTATCACTTTGGATGAAGGTTTTATC
ATGACTTGGTGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G382TF U 1
AF RR4G382JQ C 407
BS 1 789 RR4G382TF
BS 790 1095 RR4G382JQ

RD RR4G382TF 789 0 0
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CTCAATCTCTCTCTCCATAATCTACTGCAAAGTAACTGGACCGGTGCTTGCTCGGCCATT
GACCAAGCACTTAAAGCTACAGCTCCTGCTCATTTTATGCACTGTCTGAGAGAACATGCT
GTGTTTCAGCTGATCAATTCGTTGCAAGCAACAGGCGAATTTCCAATCAACCTACAATCG
AGATTACTCAACTCTTATCTGGATCAAGCAAGTTCTTTACCTGTTAAAGAGCCACTGTCG
TGGAAATTCATCAGCAACAGCGCCGAGAAACCAAGAGCAAGGAAGCTAGTAAGTAACCTT
CTGGCGCCAGTTTCATCTGAAGTCTTAGTGGTAAACACGGTTCTTGAAGCATGGCACGGA
CCATCTCTTGTCCCGGAGAAGCTGAGTAAACAAAAGGAACTTGTGGATTTTGTGGAAACA
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AAAGAAGAGGACTCTGGTTCCTCGAGTATACATTTCTGGGCAGGTTTGAATCTGGTGAGT
GCAATTTCTTGTGCAATGCCAGTAGCTCCCGAGTATATATGGGTGGAGGCTGGAGAGATT
TTGAGCAATGTCAATGGTTTTAAGACCAGAGCAGAGAGGTTCTTGAGTAAAGCTGTGTCT
GTATATCCAATGTCTGTGAAGCTATGGAGATGTTATGGGAGTGTAGCTAGAAGTATAGAA
GAGAAAAGA

QA 1 789 1 789
DS 

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ATTTTGTGGAAACAATCCTAGGTTTGGTCCCATGCAACTACCCGCTGGCTTTGTCTGTAA
GTAAGCTGTTGAGGAAAGAAGAGGACTCTGGTTCCTCGAGTATACATTTCTGGGCAGGTT
TGAATCTGGTGAGTGCAATTTCTTGTGCAATGCCAGTAGCTCCCGAGTATATATGGGTGG
AGGCTGGAGAGATTTTGAGCAATGTCAATGGTTTTAAGACCAGAGCAGAGAGGTTCTTGA
GTAAAGCTGTGTCTGTATATCCAATGTCTGTGAAGCTATGGAGATGTTATGGGAGTGTAG
CTAGAAGTATAGAAGAGAAAAGAGGCGTTAAGATTGAAGAAGAAGCTAGAAAGAAAGGAA
TCACTCTGGTGGATTGATATTTGAAAAGGCGACTCGTGTGTTTTTTCCCTTTACATAGCT
AGAACACACTTAAGAGGGAACATAGTAACGAAGAAAATGGGAATACAGTTTTAGAAAAGG
GGCAAGTGAATACTGATTGTTATACTTTTGGTCAGTTTCTAGCATAAGCTTTTTTTTTTT
TTGTTATACAACTGTAATTGACCATGCTTTTGCATCTTGGTTCTTAATGTATCACTTTGG
ATGAAGGTTTTATCATGACTTGGTGTTCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

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ATCAAAAGATTTAATAATGTTGTTGAGAAACAAAAGAATATAACGTTTACACCACACTCT
AACATACAATCAAACCAACCGCCGCATAACTCTTAACAGAACCGGCAATCTTAGGTTACG
TGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAACAGGAAGGAGCACGGCGGAGAAGACAGAGAACTGTT
GCCGGGAACCACCGTTGGGAAGAAAAGGGTAAGCATCAGGAGGAGGCATGACACAATTGT
CTCCATTAAAGTAAATCCTACGAGGAAAGGCCCATCCTTTCTCGAAAGTAAAGGTTGCTT
GATCCTTACGGAACAGAATCTCAGACTGCACATTCCCAAGAGGCCCTGCTTCTGATAAAA
AATCATTATAGAACTTCACTCCCCACAACATAGCCGTATCATTTAGTCCTGCGTAAGGAG
TGAGAAACTTGTAGTTGAAACTGAAGATCTGAGTGATGTTGTCTAGGTTTGGATGCTGAG
CAACCATGTTCCACTGTGAGTAGTTTAACCGGTAGTTGAAGTTTGTGATTGTGATCTTCA
CTCGCCAATACTCTTTGTAGTTCTGCTTCACGTGCCAGTGCACTCTGATGGGACACAAGT
GTCTCGTGCATTGCACCAATGGGGGCAAAACCGTCCCTTTCTTAGTAGGTGGTGACACAA
CAGACTCCAAGTGAGGTGTGTCTGGATCAAGACAGGCACCAGATTCTGTTTTGTTGTTTT
GGCATCCGCAAGCGCAAGTTGGACATCCAACAATGGTTTCATTGC


BQ
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AF RR4CO57JQ U 328
AF RR4CO57TF C 1
BS 1 327 RR4CO57TF
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BS 648 765 RR4CO57TF

RD RR4CO57JQ 320 0 0
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QA 1 320 1 320
DS 

RD RR4CO57TF 765 0 0
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CAACCATGTTCCACTGTGAGTAGTTTAACCGGTAGTTGAAGTTTGTGATTGTGATCTTCA
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CAGACTCCAAGTGAGGTGTGTCTGGATCAAGACAGGCACCAGATTCTGTTTTGTTGTTTT
GGCATCCGCAAGCGCAAGTTGGACATCCAACAATGGTTTCATTGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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ATTACAAATAACGATATGAAGACGTATAACGTCTTGCTTCTTCTGCTTGTTCAAGTGATT
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TACGTAGTGGCAATGGACTACGGAGAAGGACATGGCACGGACTTCGTCTTTAGCCCTAAG
GCCTACGGACGTATGGCGAGGCCCGGCACAGAGGATCAGCTCTATTCATTTGGTGTGGTA
GACGTCGAGTACCAGAGGGTCCCTTGTAAGTATGAAGGATACAATTTGGTGTATAAGGTC
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AACGACATCCTCGCCGTTGAAGCCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGCGACGTATGAGA
AGAGTGTTTGGAGCGGTTCACGATTTGCAGAATCCTCCAAGAGGCACTCTCACTTTGAGG
TTTTTAGTCTATGGTAGCGCCGGTATCAATTGGGTCCAATCGCCAAACGCTATTCCAGCC
GACTGGACCGCCGGAGCCACCTATAACTCCAACATTCTACTTACTTGATTCCCTTTGGCT
GCTCTTCTCTATCTCTTTCTCCAGTGTGTTTATATATAATACATGGTTTCTCATGTGTAG
TGGCTATATACCTATTTAAATAATGCCCTCTAGAATAGGGATAGTCATCGATCTAGATTT
ATATAAGTATCATGTATTGTGTCTAAGATTATCATGATTTGTAAGGTTTTGATTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY29TF U 1
AF RR4CY29JQ C 148
BS 1 471 RR4CY29TF
BS 472 1015 RR4CY29JQ

RD RR4CY29TF 471 0 0
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ATTACAAATAACGATATGAAGACGTATAACGTCTTGCTTCTTCTGCTTGTTCAAGTGATT
GTCCTTTTGCCTCTCCTTTGTTCATCTGATGATTTTGTAAGCTCTATAGCTACTTACTAT
GGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAACCCTCGAGGAGCATGTGGGTATGAAGAATTTGGAAGA
GATATAAATAATGGTGAAGTGAGTGGTGTTTCATCGAGACTATGGAACAATGGAACTGGC
TGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGGTGCAAAATACCTCCGCACTGCAGCGAGGAAGGAGTA
TACGTAGTGGCAATGGACTACGGAGAAGGACATGGCACGGACTTCGTCTTTAGCCCTAAG
GCCTACGGACGTATGGCGAGGCCCGGCACAGAGGATCAGCTCTATTCATTT

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR4CY29JQ 868 0 0
TGATGA
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GCATGTGGGTATGAAGAATTTGGAAGAGATATAAATAATGGTGAAGTGAGTGGTGTTTCA
TCGAGACTATGGAACAATGGAACTGGCTGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGGTGCAAAATA
CCTCCGCACTGCAGCGAGGAAGGAGTATACGTAGTGGCAATGGACTACGGAGAAGGACAT
GGCACGGACTTCGTCTTTAGCCCTAAGGCCTACGGACGTATGGCGAGGCCCGGCACAGAG
GATCAGCTCTATTCATTTGGTGTGGTAGACGTCGAGTACCAGAGGGTCCCTTGTAAGTAT
GAAGGATACAATTTGGTGTATAAGGTCCATGAGAAAAGCTACAATCCTCATTATCTTGCC
GTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGCCAACGACATCCTCGCCGTTGAAGCCTGGCAGGAG
GATTGCAAAGAGTGGCGACGTATGAGAAGAGTGTTTGGAGCGGTTCACGATTTGCAGAAT
CCTCCAAGAGGCACTCTCACTTTGAGGTTTTTAGTCTATGGTAGCGCCGGTATCAATTGG
GTCCAATCGCCAAACGCTATTCCAGCCGACTGGACCGCCGGAGCCACCTATAACTCCAAC
ATTCTACTTACTTGATTCCCTTTGGCTGCTCTTCTCTATCTCTTTCTCCAGTGTGTTTAT
ATATAATACATGGTTTCTCATGTGTAGTGGCTATATACCTATTTAAATAATGCCCTCTAG
AATAGGGATAGTCATCGATCTAGATTTATATAAGTATCATGTATTGTGTCTAAGATTATC
ATGATTTGTAAGGTTTTGATTG

QA 7 868 7 868
DS 



AS 1 2

CO CL6623Contig1 768 2 3 U
GGACGCTAGAGATGGCCACGACCTTCCTCGCTTTCACGGCTCCTCGTTCCGCCACCGCCC
TGAACTACCGCTTATCTTCTGCCGGCTTCCCGATTTTCTCTAGCCGCGTTCCCGTTTCCG
TCAGGGCGAAACCGTCGTTACTCTATTCCCCTGTCGTAAACTCCAATCGAACTCGAAGAT
TCTCCTCGGCTTCCGCGTCGTCGGCGCCACCGCAAACAGAAGATTCCGATGTTACCACTA
AGATTCCGCCAGACAACCGGATTCCAGCTACTATTATCACGGGGTTTCTGGGCTCTGGCA
AGACGACATTACTGAACCATATACTGACTAGAGATCATGGGAAGCGCATAGCCGTTATCG
AGAATGAGTTTGGTGAAGTTGACATTGATGGGTCACTTGTTGCTTCCAAATCTGTGGGAG
CTGAGGATATAGTGATGCTCAACAACGGCTACCTGTGCTGCACTGTCAGGGGCGATCTTG
TGAGGATGATTTCTGAGTTAGTCAACAAGAAGAAAGGAAAGTTCGACCATATTGTCATTG
AGACTACAGGGTTGGCTAACCCGGCTCCGATTATCCAAACCTTTTATGCGGAGGACGAGA
TTTTCAATGATGTCAAACTGGACGGCGTTGTTACTCTAGTTGATGCTAAGCATGCTCGTT
TGCATCTTGATGAGGTCAAGCCCAAAGTGTTGTCAACGAGCTGTTGAACAGATAGCCTAT
GCTGACCGTATCATAGTTAACAAGATTGATCTTGTTGGTGAGTCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CX41TF U 227
AF RR4D567TF U 1
BS 1 450 RR4D567TF
BS 451 451 RR4CX41TF
BS 452 768 RR4D567TF

RD RR4CX41TF 334 0 0
G
GATGTTACCACTAAGATTCCGCCAGACAACCGGATTCCAGCTACTATTATCACGGGGTTT
CTGGGCTCTGGCAAGACGACATTACTGAACCATATACTGACTAGAGATCATGGGAAGCGC
ATAGCCGTTATCGAGAATGAGTTTGGTGAAGTTGACATTGATGGGTCACTTGTTGCTTCC
AAATCTGTGGGAGCTGAGGATATAGTGATGCTCAACAACGGCTACCTGTGCTGCACTGTC
AGGGGCGATCTTGTGAGGATGATTTCTGAGTTAGTCAACAAGAAGAAAGGAAAGT*CGAC
CATATTGTC*TTGAGACTACAGGGTTGG
TAACC

QA 2 329 2 329
DS 

RD RR4D567TF 768 0 0
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TGAACTACCGCTTATCTTCTGCCGGCTTCCCGATTTTCTCTAGCCGCGTTCCCGTTTCCG
TCAGGGCGAAACCGTCGTTACTCTATTCCCCTGTCGTAAACTCCAATCGAACTCGAAGAT
TCTCCTCGGCTTCCGCGTCGTCGGCGCCACCGCAAACAGAAGATTCCGATGTTACCACTA
AGATTCCGCCAGACAACCGGATTCCAGCTACTATTATCACGGGGTTTCTGGGCTCTGGCA
AGACGACATTACTGAACCATATACTGACTAGAGATCATGGGAAGCGCATAGCCGTTATCG
AGAATGAGTTTGGTGAAGTTGACATTGATGGGTCACTTGTTGCTTCCAAATCTGTGGGAG
CTGAGGATATAGTGATGCTCAACAACGGCTGCCTGTGCTGCACTGTCAGGGGCGATCTTG
TGAGGATGATTTCTGAGTTAGTCAACAAGAAGAAAGGAAAGTTCGACCATATTGTCATTG
AGACTACAGGGTTGGCTAACCCGGCTCCGATTATCCAAACCTTTTATGCGGAGGACGAGA
TTTTCAATGATGTCAAACTGGACGGCGTTGTTACTCTAGTTGATGCTAAGCATGCTCGTT
TGCATCTTGATGAGGTCAAGCCCAAAGTGTTGTCAACGAGCTGTTGAACAGATAGCCTAT
GCTGACCGTATCATAGTTAACAAGATTGATCTTGTTGGTGAGTCAGAG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6624Contig1 825 2 4 U
GGCTGCTTCTTTCCTTGGTGATTCCAAGAAGAGGGATGGGGCAGGTCCAAAGGCGGATAG
ATGGGAAAAATATCAGATAAAAATGGAAAACTTTGACCCTCCCCCATTTTGTTTGATTCA
ATACACTGCCTGACTCTCTTCATCTCAATCTCATTTGCCAACTCTCTCTCTATCTCCCTC
TCCCTCTATTTCTCTCTGATGCCTGTTCTTGTTTGAGTTCAGATCAGTCACAGAGCCACA
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TCTTTAGAATCCTCTGTAGTACGGTTGGTTCTTTTTTTTTTTTTGCAAATATAGATATGG
CAGAAGTTCATGATCAGCTAGAGATCAAGTTTCGCTTATACGACGGTTCTGATATCGGTC
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GGCCAAGAGAGAAGGAAAATGGACCGAGGACAGTGAAAGAGGTGAAGCTGATAAGCGCAG
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TAGACGCTGTCACCACAATGCATGTCATCATCCAACCTCTTGTTTCTGAAAAAGAAAAGA
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TGACAGATTTGTTGTTTGGTTTTAGATTTTTTACTGATACAGGATCAAAAAAAAAGTGTT
GAACGTTTTTTTAATTATAAAAGTATAAAATCGGATCTCTTTTCT


BQ
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AF RR4D583TF U 1
AF RR4D583JQ C 188
BS 1 652 RR4D583TF
BS 653 653 RR4D583JQ
BS 654 742 RR4D583TF
BS 743 825 RR4D583JQ

RD RR4D583TF 745 0 0
GGCTGCTTCTTTCCTTGGTGATTCCAAGAAGAGGGATGGGGCAGGTCCAAAGGCGGATAG
ATGGGAAAAATATCAGATAAAAATGGAAAACTTTGACCCTCCCCCATTTTGTTTGATTCA
ATACACTGCCTGACTCTCTTCATCTCAATCTCATTTGCCAACTCTCTCTCTATCTCCCTC
TCCCTCTATTTCTCTCTGATGCCTGTTCTTGTTTGAGTTCAGATCAGTCACAGAGCCACA
ATAAGAGTGAAGAGCAAAAGAAGGGTCCTGTGGGGTTTGACAAATTGATAAACTGCCAAT
TCTTTAGAATCCTCTGTAGTACGGTTGGTTCTTTTTTTTTTTTTGCAAATATAGATATGG
CAGAAGTTCATGATCAGCTAGAGATCAAGTTTCGCTTATACGACGGTTCTGATATCGGTC
CTAAATCATTTCCCGATGCTACCACTGTTGCTGCATTGAAGGAGACTGTCATCTCTCAGT
GGCCAAGAGAGAAGGAAAATGGACCGAGGACAGTGAAAGAGGTGAAGCTGATAAGCGCAG
TGAAAGTTTTGGAGAACAACAAGACGGTTAAAGACTACCGAAGCCCTGTCCCTACTCTCG
TAGACGCTGTCACCACAATGCATGTCATCATCCAACCTCTTGTTTCTGAAAA*GAAAAGA
AGCCTAAACATGGTGATCCCAAGATGAACAAATGTGTATGTTCAATCATGTAAGAGACAG
TGACAGATTTGTTGTTTGGTTT
AGA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4D583JQ 638 0 0
ATTTCTCTCTGATGCCTGTTCTTGTTTGAGTTCAGATCAGTCACAGAGCCACAATAAGAG
TGAAGAGCAAAAGAAGGGTCCTGTGGGGTTTGACAAATTGATAAACTGCCAATTCTTTAG
AATCCTCTGTAGTACGGTTGGTTCTTTTTTTTTTTTTGCAAATATAGATATGGCAGAAGT
TCATGATCAGCTAGAGATCAAGTTTCGCTTATACGACGGTTCTGATATCGGTCCTAAATC
ATTTCCCGATGCTACCACTGTTGCTGCATTGAAGGAGACTGTCATCTCTCAGTGGCCAAG
AGAGAAGGAAAATGGACCGAGGACAGTGAAAGAGGTGAAGCTGATAAGCGCAGTGAAAGT
TTTGGAGAACAACAAGACGGTTAAAGACTACCGAAGCCCTGTCCCTACTCTCGTAGACGC
TGTCACCACAATGCATGTCATCATCCAACCTCTTGTTTCTGAAAAAGAAAAGAAGCCTAA
ACATGGTGATCCCAAGATGAACAAATGTGTATGTTCAATCATGTAAGAGACAGTGACAGA
TTTGTTGTTTGGTTTTAGATTTTTTACTGATACAGGATCAAAAAAAAAGTGTTGAACGTT
TTTTTAATTATAAAAGTATAAAATCGGATCTCTTTTCT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6625Contig1 756 2 2 U
GGATAGCGAAAAAAAGAAAACACACAAAATAAGTGTGAGAAAGAGTCTCTCTCTTGAGTG
TTAAAGTCATGCTGCTCAAATCATCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAA
CACCGTCCATGAAACTCAAAACCCTAATCCAAAATCTCCTTGCACACCCTCTCTACCGTT
TCCTTAGAGCTGTCTCTAGAGCTAAATCAATCTTTCTAGAGATGTCTAAACACAACAGCA
ACAAGAAACGAAAGCTGACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCAAAGAATCAACGCAAGA
TCTTCTTCGGATCGTTTAGATTGCACTACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGC
CTCAACCTTTCCCTTTTTCTGTCTCTGGCATCAATGGTGAAGAAGCTGATGACTCTCACC
TCTCTGGCTACCTCGAGTGGCTAGAGCACAAGAAGGTCGAGGATTTGGAAGAGGTAAGAG
ATGATGAAGGAGCCAATGATGATGATGATATTGATCATTTGGCCGATATGTTCATTGCTA
ATTGCCACGAGAAGTTCTTGCTCGAGAAAGTCGAATCTTACAGGAGGTTTCAAGAAATGT
TAGAAAGGAGTTTGTGAAACATAATAGATTTTCATTGTCTCATTAATTAATAATCATGTT
GTAAAATCTTAGCTAGTTTGATTTGATAATATTGCCCCAAGGTGGGGAAATGTGTAACTT
GAAAGTTTTGGTGGTAATGTGCAAGAAGTTCGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF73TF U 1
AF RR4CF73JQ C 307
BS 1 622 RR4CF73TF
BS 623 756 RR4CF73JQ

RD RR4CF73TF 622 0 0
GGATAGCGAAAAAAAGAAAACACACAAAATAAGTGTGAGAAAGAGTCTCTCTCTTGAGTG
TTAAAGTCATGCTGCTCAAATCATCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAA
CACCGTCCATGAAACTCAAAACCCTAATCCAAAATCTCCTTGCACACCCTCTCTACCGTT
TCCTTAGAGCTGTCTCTAGAGCTAAATCAATCTTTCTAGAGATGTCTAAACACAACAGCA
ACAAGAAACGAAAGCTGACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCAAAGAATCAACGCAAGA
TCTTCTTCGGATCGTTTAGATTGCACTACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGC
CTCAACCTTTCCCTTTTTCTGTCTCTGGCATCAATGGTGAAGAAGCTGATGACTCTCACC
TCTCTGGCTACCTCGAGTGGCTAGAGCACAAGAAGGTCGAGGATTTGGAAGAGGTAAGAG
ATGATGAAGGAGCCAATGATGATGATGATATTGATCATTTGGCCGATATGTTCATTGCTA
ATTGCCACGAGAAGTTCTTGCTCGAGAAAGTCGAATCTTACAGGAGGTTTCAAGAAATGT
TAGAAAGGAGTTTGTGAAACAT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4CF73JQ 450 0 0
TCGGATCGTTTAGATTGCACTACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGCCTCAAC
CTTTCCCTTTTTCTGTCTCTGGCATCAATGGTGAAGAAGCTGATGACTCTCACCTCTCTG
GCTACCTCGAGTGGCTAGAGCACAAGAAGGTCGAGGATTTGGAAGAGGTAAGAGATGATG
AAGGAGCCAATGATGATGATGATATTGATCATTTGGCCGATATGTTCATTGCTAATTGCC
ACGAGAAGTTCTTGCTCGAGAAAGTCGAATCTTACAGGAGGTTTCAAGAAATGTTAGAAA
GGAGTTTGTGAAACATAATAGATTTTCATTGTCTCATTAATTAATAATCATGTTGTAAAA
TCTTAGCTAGTTTGATTTGATAATATTGCCCCAAGGTGGGGAAATGTGTAACTTGAAAGT
TTTGGTGGTAATGTGCAAGAAGTTCGAACT

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL6626Contig1 981 2 4 U
CAATCATTGATTATGGTAGAAACTAGTAAATAGTGGGAAAAGTATTACAGTTTATGAGTT
TGGTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACACATACATAATCAAAAAATGCATTTGCATCA
AGCCAAGCCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCCCACAGTTTCTTTGCCTTCTCAGCATCACT
TGCTTCTTTTGAAAGCTGATTCTCAAAGGAAGACGAGTTATTGTTCCAGCTCCAATACAC
CCCTGACTTTCCCAAACTCGGATCACTCACAACCTGTGCTAGTCTTTTCACAGCTTCCTC
CTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCCTGAACAG
AGGTACGTGCTCTCTGAACAACCCCGTCGTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCAAA
CGTGACACCTGTTTCCTCGTGGTAACGCCTGTGAAGCTCCTGCATTGTCAGCATATTGCA
TACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCTCCGTCATACTCTCCTCCATCTATCATCGAACT
GTTTTGCCCGCTCAGTCCCGATGCTAAGCCTCTTAGGTCTCCGAGGTTCGCCTTTGGCGG
TACATTCCCAGCCAAAGTGTTTGTGTTCCCTGTTATAGATCCTACGATGATCATACGTTT
TGATGGATAATCAGAATGTTTCAAGTCATCAAGAAGCAACCTCGAGAGAAGAAAATGTCC
TAAATGATTGGTTCCAACGCTGAGCTCAAACCCTTCGGCTGTGAAAGAAGGTTCCTTAGC
AGTCGGCTGGTAAACCGCTGCGTTGCAAACAAGAACATCTAACGGCCGTTCTGTTCTGCG
GAAACTATCAACGAACTGCTTCACGCTTTCGAGCGAGGCGAGATCGAGATGCATCACCGT
GTAGTCTTCCTTGGACATCCCAACGAATTTCGCAGCTTTCTCGGCCTTGAGAAAGTTCCT
GCAAGACATGATCACGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H312JQ U 1
AF RR4DJ56TF C 298
BS 1 627 RR4H312JQ
BS 628 628 RR4DJ56TF
BS 629 632 RR4H312JQ
BS 633 981 RR4DJ56TF

RD RR4H312JQ 632 0 0
CAATCATTGATTATGGTAGAAACTAGTAAATAGTGGGAAAAGTATTACAGTTTATGAGTT
TGGTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACACATACATAATCAAAAAATGCATTTGCATCA
AGCCAAGCCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCCCACAGTTTCTTTGCCTTCTCAGCATCACT
TGCTTCTTTTGAAAGCTGATTCTCAAAGGAAGACGAGTTATTGTTCCAGCTCCAATACAC
CCCTGACTTTCCCAAACTCGGATCACTCACAACCTGTGCTAGTCTTTTCACAGCTTCCTC
CTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCCTGAACAG
AGGTACGTGCTCTCTGAACAACCCCGTCGTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCAAA
CGTGACACCTGTTTCCTCGTGGTAACGCCTGTGAAGCTCCTGCATTGTCAGCATATTGCA
TACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCTCCGTCATACTCTCCTCCATCTATCATCGAACT
GTTTTGCCCGCTCAGTCCCGATGCTAAGCCTCTTAGGTCTCCGAGGTTCGCCTTTGGCGG
TACATTCCCAGCCAAAGTGTTTGTGTTTCCTG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4DJ56TF 684 0 0
CTCCTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCGTGAA
CAGAGGTACGTGCTCTCTGAACAACCCCGTCGTAGCGATGCAACCAGGGTAAGGAGAAGC
AAACGTGACACCTGTTTCCTCGTGGTAACGCCTGTGAAGCTCCTGCATTGTCAGCATATT
GCATACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCTCCGTCATACTCTCCTCCATCTATCATCGA
ACTGTTTTGCCCGTTCAGTCCCGATGCTAAGCCTCTTAGGTCTCCGAGGTTCGCCTTTGG
CGGTACATTCCCAGCCAATGTGTTTGTGTTCCCTGTTATAGATCCTACGATGATCATACG
TTTTGATGGATAATCAGAATGTTTCAAGTCATCAAGAAGCAACCTCGAGAGAAGAAAATG
TCCTAAATGATTGGTTCCAACGCTGAGCTCAAACCCTTCGGCTGTGAAAGAAGGTTCCTT
AGCAGTCGGCTGGTAAACCGCTGCGTTGCAAACAAGAACATCTAACGGCCGTTCTGTTCT
GCGGAAACTATCAACGAACTGCTTCACGCTTTCGAGCGAGGCGAGATCGAGATGCATCAC
CGTGTAGTCTTCCTTGGACATCCCAACGAATTTCGCAGCTTTCTCGGCCTTGAGAAAGTT
CCTGCAAGACATGATCACGTGCCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6627Contig1 1056 2 2 U
GGACTTCGTGCTCAATCCCTCAGAAGAGAAAAGAAAGATTCAAAGTCGTAGTAATGGAGA
GTGAGACGAAGAAGAAGAAGCATCTAATGGAAATCTAAGGCTACCCAATCGACGGATTAT
CAATCGGTGGTCACGAGACTTGCATCATGTTCCCTTCTCTCCGTATAGCTTTCGACATCG
GACGTTGCCCACACCGCGCAATCTCCCAAGACTTCCTCTTCATCATCACTCCCACATGGA
TCACATCGGTGGATTGCCAATGTATGTTGCGACTAGAGGGTTGTATAAGATGAAGCCTCC
AACGATTATAGTGCCCACGTCGATTAAAGAATGTGTTGAGAGTTTGTTCGAGGTTCATAG
GAAGCTAGATTCTTCAGAGCTGAAGCATAATCTTGTCGGCTTGGACATTGGGGAGGAGTT
TATGATCAGGAAAGATCTTAGAGTGAAAGCCTTTAAGACATACCATGTCATCCAAAGCCA
GGGTTATGTAGTGTATTCGACTAAACATAAACTCAAGCAGGAGTATGTTGGTCTTCCTGC
AAATGAGATTAAGAACCTGAAGGCTTCTGGTGTCGAGATCACAAACAGTATAACAACTCC
TGAAGTCGCGTTTACGGGAGATACAACTTCAGATTTTGTAGTTGATGAGAATAACGCTGA
TGCTCTCAAGGCAAGGGTACTCGTCATGGAGAGCACGTTTCTTGATGATTCGGTATCGGT
AGAGCACGCTAGGGATTATGGACATATACATTTATCTGAGATAGTTAAGCATGCTGAAAA
GTTTGAAAACAGAGCAATCCTGCTGATTCATTTCTCGGCTCGGTATACAGAGGAGGAAAT
CGAAGCTGCAGTTTCTACATTGCCTCCACCTTTAAAAGGACGTGTGTATGCTTTAACACA
AGGATTCTAAACAGTAGACACTCTCACACTTTGGTTTTGTTGTTCCCCAAGTTATTGTAT
CGCACATGTAAACGTTATACCCTTGTTGTTGAGTTTCTAAGATAGAGATGTTTATGTGAT
TTGCTAAATTAATTAATCCGTACAAATTTTAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AA70TF U 1
AF RR4AA70JQ C 277
BS 1 828 RR4AA70TF
BS 829 1056 RR4AA70JQ

RD RR4AA70TF 828 0 0
GGACTTCGTGCTCAATCCCTCAGAAGAGAAAAGAAAGATTCAAAGTCGTAGTAATGGAGA
GTGAGACGAAGAAGAAGAAGCATCTAATGGAAATCTAAGGCTACCCAATCGACGGATTAT
CAATCGGTGGTCACGAGACTTGCATCATGTTCCCTTCTCTCCGTATAGCTTTCGACATCG
GACGTTGCCCACACCGCGCAATCTCCCAAGACTTCCTCTTCATCATCACTCCCACATGGA
TCACATCGGTGGATTGCCAATGTATGTTGCGACTAGAGGGTTGTATAAGATGAAGCCTCC
AACGATTATAGTGCCCACGTCGATTAAAGAATGTGTTGAGAGTTTGTTCGAGGTTCATAG
GAAGCTAGATTCTTCAGAGCTGAAGCATAATCTTGTCGGCTTGGACATTGGGGAGGAGTT
TATGATCAGGAAAGATCTTAGAGTGAAAGCCTTTAAGACATACCATGTCATCCAAAGCCA
GGGTTATGTAGTGTATTCGACTAAACATAAACTCAAGCAGGAGTATGTTGGTCTTCCTGC
AAATGAGATTAAGAACCTGAAGGCTTCTGGTGTCGAGATCACAAACAGTATAACAACTCC
TGAAGTCGCGTTTACGGGAGATACAACTTCAGATTTTGTAGTTGATGAGAATAACGCTGA
TGCTCTCAAGGCAAGGGTACTCGTCATGGAGAGCACGTTTCTTGATGATTCGGTATCGGT
AGAGCACGCTAGGGATTATGGACATATACATTTATCTGAGATAGTTAAGCATGCTGAAAA
GTTTGAAAACAGAGCAATCCTGCTGATTCATTTCTCGGCTCGGTATAC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR4AA70JQ 780 0 0
AGGGTTGTATAAGATGAAGCCTCCAACGATTATAGTGCCCACGTCGATTAAAGAATGTGT
TGAGAGTTTGTTCGAGGTTCATAGGAAGCTAGATTCTTCAGAGCTGAAGCATAATCTTGT
CGGCTTGGACATTGGGGAGGAGTTTATGATCAGGAAAGATCTTAGAGTGAAAGCCTTTAA
GACATACCATGTCATCCAAAGCCAGGGTTATGTAGTGTATTCGACTAAACATAAACTCAA
GCAGGAGTATGTTGGTCTTCCTGCAAATGAGATTAAGAACCTGAAGGCTTCTGGTGTCGA
GATCACAAACAGTATAACAACTCCTGAAGTCGCGTTTACGGGAGATACAACTTCAGATTT
TGTAGTTGATGAGAATAACGCTGATGCTCTCAAGGCAAGGGTACTCGTCATGGAGAGCAC
GTTTCTTGATGATTCGGTATCGGTAGAGCACGCTAGGGATTATGGACATATACATTTATC
TGAGATAGTTAAGCATGCTGAAAAGTTTGAAAACAGAGCAATCCTGCTGATTCATTTCTC
GGCTCGGTATACAGAGGAGGAAATCGAAGCTGCAGTTTCTACATTGCCTCCACCTTTAAA
AGGACGTGTGTATGCTTTAACACAAGGATTCTAAACAGTAGACACTCTCACACTTTGGTT
TTGTTGTTCCCCAAGTTATTGTATCGCACATGTAAACGTTATACCCTTGTTGTTGAGTTT
CTAAGATAGAGATGTTTATGTGATTTGCTAAATTAATTAATCCGTACAAATTTTAGTTTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6628Contig1 968 2 2 U
AGAAGTCATTGAGTTTGCTTCACTCTATCAGCTCAAAGACTACATGAACGCTACATACGA
TGGAGCAGACGAGAACCGGCTTTTACCTGCTATCAACAAAATCTGGCCATTCTTTGTTGC
TTGCATACGAATCAGAAATCCTGTGGCTGTACGGAGATGCTTGAATGTGATAACCAGAGT
CATTCAAACATCTGGAGGAGACTTCTTCACACGTCGTTTCCGCAACGATGGCCAAGACTT
CTGGAAGCTTTTAACAACATCTCCCTTCCACGTTATGACACCAAAGAGCCTCCGAGAAGA
GAACAAATCAGTTCTCAGGCTTCCTTACAGAACCATTTCCGAGTCATCTTCTTCTTCCAC
TGCTGAAGTATCCAGCTTGAAAGTGCAAGCTGCACTTCTCAACATGATCGCCGAGCTTTC
CAGAGACAAACGCTGCGCTTCAGCGTTAGATGCGGTCTTGAAGAGAGTTTCGGGATTGGT
CGTTGGGATAGCGTGCAGCGGGGTAACAGGGTTGAGAGAAGCGGCTTTGAACGCGTTGAG
AGGTTCGGCTTGCGTTGATGCTGATCTCATTTGGATTCTCTTAGCAGATGTGTATTATTC
TCTTAAGAAGAGGAGAGACCTGCCTCTCCCACCTTCTCCGGAGTTCCCAGAGGTATCAAC
GGTTTTGCCTTCACTGTCGGAAGATTCTACTCCGGGGAGGTTTCTGTATGTTGAGTACGG
TGGTCGGAGCTATGGTTTTGAGTTGGAGTTTGGCTCTGTTGAGACCGTTTTCAAGAAAAT
GCAGTCTCTCGCCTTTGTAGATCAGATGAGTTGTTAAATATAAACTGCTTGTAAAATACC
TTTTTGTTTACTTTCTTGTGTCAATTGATTTGTTATTTCATAATTTTTCATAGAAGACAT
AATACTGTTAGTTACCAAAATCACTTTATTGTTCAAGTTAAGAGCGTGTTAATATTGATT
TTACATGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI36TF U 1
AF RR4FI36JQ C 294
BS 1 608 RR4FI36TF
BS 609 968 RR4FI36JQ

RD RR4FI36TF 608 0 0
AGAAGTCATTGAGTTTGCTTCACTCTATCAGCTCAAAGACTACATGAACGCTACATACGA
TGGAGCAGACGAGAACCGGCTTTTACCTGCTATCAACAAAATCTGGCCATTCTTTGTTGC
TTGCATACGAATCAGAAATCCTGTGGCTGTACGGAGATGCTTGAATGTGATAACCAGAGT
CATTCAAACATCTGGAGGAGACTTCTTCACACGTCGTTTCCGCAACGATGGCCAAGACTT
CTGGAAGCTTTTAACAACATCTCCCTTCCACGTTATGACACCAAAGAGCCTCCGAGAAGA
GAACAAATCAGTTCTCAGGCTTCCTTACAGAACCATTTCCGAGTCATCTTCTTCTTCCAC
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CAGAGACAAACGCTGCGCTTCAGCGTTAGATGCGGTCTTGAAGAGAGTTTCGGGATTGGT
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TCTTAAGA

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AGCTTTCCAGAGACAAACGCTGCGCTTCAGCGTTAGATGCGGTCTTGAAGAGAGTTTCGG
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CGTTGAGAGGTTCGGCTTGCGTTGATGCTGATCTCATTTGGATTCTCTTAGCAGATGTGT
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AAGACATAATACTGTTAGTTACCAAAATCACTTTATTGTTCAAGTTAAGAGCGTGTTAAT
ATTGATTTTACATGG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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GGTGTGTCACGTGAGCCCACGATGATGAATCTCTTCCCTTCTACGGCTGCTCAAGACGTT
AAACCACCGAAGAGTGATGTGATTCCTCGGCAATCAAGCTTTTCTTCTTCCTCTTCCCCT
GGAGGAGCCAAGGAAGAAGTCGATAAGATCATGGATACTAAATCTGTGAACGTGGAGTCT
CTATCTGCGCCATTGACCATATTCTACGGCGGTCAAGTTATGGTGTTTGATGATTTTCCT
GCTGAGAAAGCCAAGCAAGTCATTGACTTGGCTCACAAAGCAAGTGCTAAAAGCTTCACA
TCTGAACTGAATAGTAGCCAGATTGCTTATACTCAAAACATTGCCAGTAATCATAAAGAG
TTTGCTTCCACTACCCCAAATCCAGTTTCTATTCATGTAAAAACGGCTGCACCAGAGCCA
ATCCAAGCCAACAAATCCTCTTTAGCTTGCGGTAACGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCT
TCACTTCATCGATTCCTTGAGAAGAGAAAGGATAGGATTTCATCAAAGGCACCGTACCAG
ATAGACGGTTCAACCGAAGCATCTTCCAAGCCTAACGCACCTTGGCTCGGTTCCCAGTAA
TCTCTTTGAGTTGTGACTCCTCCTTTTGATGATGCTCCCATCGTTTAATATAATATCAAG
AAGCTCTACTGATTCCACTCCTAGGAGTTTTGTTGTCTGTTCAATGCGCCAGAAAAAAAA
CTCAGTATATCTGTACGAAACTAATCCTTATAGTTTTGCTACTTTTTTGGGTTTAAATCC
ATTGTGTTATAGACCTTTTCCTCTCCTGTTTTCAGCATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAA
ACATCAGTTTCTTATTTATTTATTTTTGGTTGTTGTTGTTGACGACCTTAATATCAGGTT
ACTTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GGTGTGTCACGTGAGCCCACGATGATGAATCTCTTCCCTTCTACGGCTGCTCAAGACGTT
AAACCACCGAAGAGTGATGTGATTCCTCGGCAATCAAGCTTTTCTTCTTCCTCTTCCCCT
GGAGGAGCCAAGGAAGAAGTCGATAAGATCATGGATACTAAATCTGTGAACGTGGAGTCT
CTATCTGCGCCATTGACCATATTCTACGGCGGTCAAGTTATGGTGTTTGATGATTTTCCT
GCTGAGAAAGCCAAGCAAGTCATTGACTTGGCTCACAAAGCAAGTGCTAAAAGCTTCACA
TCTGAACTGAATAGTAGCCAGATTGCTTATACTCAAAACATTGCCAGTAATCATAAAGAG
TTTGCTTCCACTACCCCAAATCCAGTTTCTATTCAT

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DS 

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CCA
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AAGCCAAGCAAGTCATTGACTTGGCTCACAAAGCAAGTGCTAAAAGCTTCACATCTGAAC
TGAATAGTAGCCAGATTGCTTATACTCAAAACATTGCCAGTAATCATAAAGAGTTTGCTT
CCACTACCCCAAATCCAGTTTCTATTCATGTAAAAACGGCTGCACCAGAGCCAATCCAAG
CCAACAAATCCTCTTTAGCTTGCGGTAACGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTTCACTTC
ATCGATTCCTTGAGAAGAGAAAGGATAGGATTTCATCAAAGGCACCGTACCAGATAGACG
GTTCAACCGAAGCATCTTCCAAGCCTAACGCACCTTGGCTCGGTTCCCAGTAATCTCTTT
GAGTTGTGACTCCTCCTTTTGATGATGCTCCCATCGTTTAATATAATATCAAGAAGCTCT
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TATAGACCTTTTCCTCTCCTGTTTTCAGCATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAAACATCAG
TTTCTTATTTATTTATTTTTGGTTGTTGTTGTTGACGACCTTAATATCAGGTTACTTTAA
TT

QA 4 845 4 845
DS 



AS 1 2

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GGAGCAATCAATTACTAGATAAAAAAAACTGGAGTCGAAACGCTTTGTATACAAACATAG
AATAAGTGAAATGGCAAACGAGAGATCATTTGTGTTTATATATACTTGTGGTGAGGACCC
ATGATGAGGCTTGGCGAGCACGAACAAGTGCATTGAGTTCCCTCACTTGGCTTCTCAATC
GCTCAGGGTTGCAGAAAAAGTCCATGAATACCCGTCTTTGGAGTTCCACGTCCTTGGAGT
GATGCTTCACGATCTCCCTTTTCTCGCGGTGCTCTAGCGTTATCTCCTCCACTGCTGCAG
AGAGTTTGGAGTTGATTTTTCCCATCTCATCAAGTTCTTTCATCAGCGGCCATGGTGTCA
ATATGGGCTGCGCCGTAGTTGAAGATGCAAAGAGTAGTTGCTGCAGATTCTGAATAAGGG
TACACAGCTCGTTAATGCATCTATTTCTGTCATCTGGAAGGGAATTTTCGAGGTCAGACT
GTAGAGATGATAGATCCGATTGAAGAGAAACTATTTGCTGAATGATGGCTGGAGCTGAGA
CATAAGTTGATAACCCGGCTTGGACATTTGAGTGAATGCTTAATAGATCTCTAACTCCAT
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TCAGTGACAAACACCGTCCCACACGGCTTCTTGTGGCGGAGAGGTAACCCTGGAGTTCGG
ATTCAATTACTTTTAGTAGAGAGAATGCTCCAAGCATGTTTTCTTTTCTAGCTGACATGC
TAATTTCAAGAACTGGTGTCTTGCAAGCTGATTAACCAGGTGATTGATGAACACTTTCTG
TTTACTAATATACAGTTCTTGACGCATGACCTTTAGATCGTAATCACCTTGCAAAAT


BQ
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AF RR4A301JQ U 1
AF RR4A301JQD U 1
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BS 894 897 RR4A301JQD

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CATAAGTTGATAACCCGGCTTGGACATTTGAGTGAATGCTTAATAGATCTCTAACTCCAT
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AATAAGTGAAATGGCAAACGAGAGATCATTTGTGTTTATATATACTTGTGGTGAGGACCC
ATGATGAGGCTTGGCGAGCACGAACAAGTGCATTGAGTTCCCTCACTTGGCTTCTCAATC
GCTCAGGGTTGCAGAAAAAGTCCATGAATACCCGTCTTTGGAGTTCCACGTCCTTGGAGT
GATGCTTCACGATCTCCCTTTTCTCGCGGTGCTCTAGCGTTATCTCCTCCACTGCTGCAG
AGAGTTTGGAGTTGATTTTTCCCATCTCATCAAGTTCTTTCATCAGCGGCCATGGTGTCA
ATATGGGCTGCGCCGTAGTTGAAGATGCAAAGAGTAGTTGCTGCAGATTCTGAATAAGGG
TACACAGCTCGTTAATGCATCTATTTCTGTCATCTGGAAGGGAATTTTCGAGGTCAGACT
GTAGAGATGATAGATCCGATTGAAGAGAAACTATTTGCTGAATGATGGCTGGAGCTGAGA
CATAAGTTGATAACCCGGCTTGGACATTTGAGTGAATGCTTAATAGATCTCTAACTCCAT
GTAAAAAGCTATCACGGTCATCCACTGCTCCCTGTTCTTGGACATCAGATGCGGCTTGGA
TCAGTGACAAACACCGTCCCACACGGCTTCTTGTGGCGGAGAGGTAACCCTGGAGTTCGG
ATTCAATTACTTTTAGTAGAGAGAATGCTCCAAGCATGTTTTCTTTTCTAGCTGACATGC
TAATTTCAAGAACTGGTGTCTTGCAAGCTGATTAACCAGGTGATTGATGAACACTTTCTG
TTTACTAATATACAGTTCTTGACGCATGACCTTTAGATCGTAATCACCTTGCAAAAT

QA 1 897 1 897
DS 



AS 1 2

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TCCGTGTCCAAAGGCTTTTTTTATTTCTTCTTTTGATATGTGTTTGAATTCGATTGATCA
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AACATAACTTATTTATATGAGCAAAAACGATTCTTGTTTTGTGCAGTAACATGTTCTGAT
GTACTTCTTTTTTATGCTTTGCAGTAAAGGAGAAAAGATGGGTTGTCTTTAGAAGAGAAG
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TAAAGGTAAAGTTGAGGGTCCCGATTTGCCAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCAGCGGATTC
GAAAGGTGATAAGACAAAGGAAGCTAGTAAAGAAGCAGATCAACCAAGGGTCAAGGAACA
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TGGATCATCATTTAGGCCCGGAACATGGCAACCACCATCCTGAACACATCTCATGTTCAC
GTTGATAAACAACCAACTGATTTTTTTGTGCATTCATCTGTTTGTTGTAGTCTACATAAA
TCGATTGGTTCTGACATCAATGAAATGCCATTTATTTAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DD71TF U 1
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TAAAGGTAAAGTTGAGGGTCCCGATTTGCCAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCAGCGGATTC
GAAAGGTGATAAGACAAAG*AAGCTAGTAAAGAAGCAGATCAACC

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DS 

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TGAACTTGATGCAAGACGTGAGCGTGTGAAGCTTAATACTGCTCTTCTCAAGAAAGAAGA
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GCTAGTAAAGAAGCAGATCAACCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCGAGATAGCCACTGCA
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AAATGCCATTTATTTAGCTC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL6632Contig1 608 2 1 U
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CTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E584TF U 1
AF RR4E584JQ C 239
BS 1 608 RR4E584TF

RD RR4E584TF 608 0 0
GGAATTATGTCGGACGAGCGAGCATAGCTGGGTCTTTAGCTTTAATTCGCCGATCTGATT
GTATTTGATTAGGGATCTCTCATCTATCATCTGCGACTCTTGGCTACTACCACCAAGATC
TGCACCCCTCTACATTAACATTTTATTTAAAAGAAAAAATGAAGCATATAGTAAAGATAT
TGAGCCTGTTGGTGGCGATCTCTGCCTTCTGGATTGGTCTTTTGCAGGCTGCTATCGTTC
CTCGAACCCACACATGGTTGCTACCGATCTACTTTGTAGTGTCTCTCGGATGCTATGGTC
CATTAATGGTTGGTATTGGGCTAATGCAGTTTCCTACCTGTCCCCAAGAAGCAGTTCTTT
TGTAGCAGGATATTGCAGAGGCCAAGGACTTCTTCAAGCACAAAGGAGTCGATGTCGGAT
CAGACTGATACGATGGCTTGTTAATGACCAAACATTAGAATAGTTAATCTTTTATGGCAA
GAGATCTTACATGTGTCTGTTTGAGTAGTTGAATTAAACAAGTTTTTTCTGACGTTACTT
GAGGAAATGTGGCAAACGCCATTACGCAAAAAGCAACAGCTAATAATAATTTGTCTCCTT
CTTTTGTT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4E584JQ 370 0 0
TCCTCGAACCCACACATGGTTGCTACCGATTTACTTTGTAGTGTTTTTCGGATGCTATGG
TCCATTAATGGTTGGTATTGGGGTAATGCAGTTTCCTACCTGTCCCCAAGAAGCAGTTTT
TTTGTAGCAGGATATTGCAGAGGCCAAGGACTTTTTCAAGCACAAAGGAGTCGATGTCGG
ATCAGACTGATACGATGGCTTGTTAATGACCAAACATTAGAATAGTTAATTTTTTATGGC
AAGAGATTTTACATGTGTTTGTTTGAGTAGTTGAATTAAACAAGTTTTTTTTGACGTTAC
TTGGGGAAATGTGGCAAACGCCATTACGCAAAAAGCAACAGCTAATAATAATTTGTTTCC
TTTTTTTGTT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 2

CO CL6633Contig1 1012 2 6 U
GGAAATCCACTCGTGTCGCGTCTGTTCAAACAAAATATCTACTGATCCCACCAGATACGG
TTTTAATCGGAGCTTTCATGAATCTGTGAGAAGAAGATATCAACTCCTATTGAGGTTCTT
GACGCGGCTTTTTCGTGATTTATTCTCACGGGAAGGTATTTAGAGAAAAAAAGGCATTTC
TATATCATCTTTATAGTTTCCCTCAGCTGATAAGGAGGAACTAGTATCTCACATGAAGCT
GAGGCCTCTGTGCGTGTTTAGATCGGCTATTGGCCCAACCCCGCAGATGAATAACAATAG
GAGTCCAGGTTTTGATCACTCCCTCCACAATAAGATGCAAATGCCATTCACTTCAGCATC
ACCTGAGTTGTGGCGTTAACTTGGTTTTGCTGCTTGATTAACATGTGTTTGCAGAAAAAA
ACAAGAGCCAAGCCTTGAGCAGAGAGATGTTCTCAAAAGGCTTTTTGAGTCGAGAGGTGC
TTGTGGCAGGGGACACGTGACCTAGCATTACGGGTTTAGTTGGTGGTTGACTTCACCATC
ATTTAGCCAGCTTTCTGATGATTTTCATAATTAATGATTTTGCCAAGACTTATGATCAGT
TTAATTTGGAAAAGAACAAATATTAATGAGCTCACTCATGAAGCCAGTCTAATTGTCAAG
TCTTGTATTGGTGTCGGCCTGTGTTTCTGCGGTATCCGACAGCTCGGTTTGTTTGCGCTC
TTTACGAAAAACCATCATCACTGCATCATCATCCTCATCATCATAATCACTATCATCCAA
GAGATAGGTGTAGGTGTTATCTGTAGCTTCAACTGAAGCAATATTTCAGGCGTAAGCGAG
GATCTACTTCACAATCGTCATAAAGTTGAACCACCACATGATATGATGCAATGACTTCCT
TTCTACATAACAATAATGTTTGGCTTCATTTACCTATTTTATTATTATATTTATGTTCTT
TGAATTGTTTACATATGTGGATGAAATTTTCTTAAATCTGAAAATAATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H452TF U 1
AF RR4H452JQB C 385
BS 1 676 RR4H452TF
BS 677 677 RR4H452JQB
BS 678 691 RR4H452TF
BS 692 692 RR4H452JQB
BS 693 711 RR4H452TF
BS 712 1012 RR4H452JQB

RD RR4H452TF 711 0 0
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TTTTAATCGGAGCTTTCATGAATCTGTGAGAAGAAGATATCAACTCCTATTGAGGTTCTT
GACGCGGCTTTTTCGTGATTTATTCTCACGGGAAGGTATTTAGAGAAAAAAAGGCATTTC
TATATCATCTTTATAGTTTCCCTCAGCTGATAAGGAGGAACTAGTATCTCACATGAAGCT
GAGGCCTCTGTGCGTGTTTAGATCGGCTATTGGCCCAACCCCGCAGATGAATAACAATAG
GAGTCCAGGTTTTGATCACTCCCTCCACAATAAGATGCAAATGCCATTCACTTCAGCATC
ACCTGAGTTGTGGCGTTAACTTGGTTTTGCTGCTTGATTAACATGTGTTTGCAGAAAAAA
ACAAGAGCCAAGCCTTGAGCAGAGAGATGTTCTCAAAAGGCTTTTTGAGTCGAGAGGTGC
TTGTGGCAGGGGACACGTGACCTAGCATTACGGGTTTAGTTGGTGGTTGACTTCACCATC
ATTTAGCCAGCTTTCTGATGATTTTCATAATTAATGATTTTGCCAAGACTTATGATCAGT
TTAATTTGGAAAAGAACAAATATTAATGAGCTCACTCATGAAGCCAGTCTAATTGTCAAG
TCTTGTATTGGTGTCG*CCTGTGTTTCTGCG*TATCCGACAGCTCGGTTTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4H452JQB 628 0 0
TTTTGCTGCTTGATTAACATGTGTTTGCAGAAAAAAACAAGAGCCAAGCCTTGAGCAGAG
AGATGTTCTCAAAAGGCTTTTTGAGTCGAGAGGTGCTTGTGGCAGGGGACACGTGACCTA
GCATTACGGGTTTAGTTGGTGGTTGACTTCACCATCATTTAGCCAGCTTTCTGATGATTT
TCATAATTAATGATTTTGCCAAGACTTATGATCAGTTTAATTTGGAAAAGAACAAATATT
AATGAGCTCACTCATGAAGCCAGTCTAATTGTCAAGTCTTGTATTGGTGTCGGCCTGTGT
TTCTGCGGTATCCGACAGCTCGGTTTGTTTGCGCTCTTTACGAAAAACCATCATCACTGC
ATCATCATCCTCATCATCATAATCACTATCATCCAAGAGATAGGTGTAGGTGTTATCTGT
AGCTTCAACTGAAGCAATATTTCAGGCGTAAGCGAGGATCTACTTCACAATCGTCATAAA
GTTGAACCACCACATGATATGATGCAATGACTTCCTTTCTACATAACAATAATGTTTGGC
TTCATTTACCTATTTTATTATTATATTTATGTTCTTTGAATTGTTTACATATGTGGATGA
AATTTTCTTAAATCTGAAAATAATTATG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6634Contig1 724 2 3 U
GGTTAATTAGTAACATAATACACTCACTTGTGGTAAGTTTAGAATTTTACATATTCAATT
AATGATACACCCCACTTTGTGGAGTATAGTTACTTTAACTTAAGTGTAGCTTGCAGACAA
TGGCAAGCCCTTGACGATGCCACAGAGGTTAGTGTTGAGGGGGATGTTGTACTCGTCCCT
TAGAGACTTCTCTGGTAACAGAACGCTAACATACAATTGTTGTCCAAGGTATCTCCTCTC
CAAGTTCTCAGACCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATAGCTGA
CCAAGACTTTGGGTAGACTTGGACCGTGTGTCTGCTAACCGCATCCAGCAAGTTGTAGTT
CTTTCTCTTTTCAGGTGTCCACCTCCCTGGCTCAGAGGCGACTGCGAAGAAGGAGTAACC
ATCCAACTGGAATGACTCCATGCTCTTCTCATGGTTCTCGAATATGATCTCTACAAAGGT
ACGGTAAGTAATGTTGAGCACATTAGGCTGCACGGTCAAGGCTGTGATTTGTGCTGCAGG
CTCGTCCTTGATGACGTTGTACTTGAACACCTTCTCTGCCATCTGGAAGTACTCAGCATG
CTTCAAAGGGGTCTCTGTGTCAACGTGTGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACTTTACC
GTTCACCACGTTCTTGCTGTTGACAAGCTTAATGCTACGGGTGATGTTGATCTTTCCATA
ATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4DP23JQ U 23
AF RR4DP23TF C 1
BS 1 22 RR4DP23TF
BS 23 340 RR4DP23JQ
BS 341 724 RR4DP23TF

RD RR4DP23JQ 318 0 0
CTCACTTGTGGTAAGTTTAGAATTTTACATATTCAATTAATGATACACCCCACTTTGTGG
AGTATAGTTACTTTAACTTAAGTGTAGCTTGCAGACAATGGCAAGCCCTTGACGATGCCA
CAGAGGTTAGTGTTGAGGGGGATGTTGTACTCGTCCCTTAGAGACTTCTCTGGTAACAGA
ACGCTAACATACAATTGTTGTCCAAGGTATCTCCTCTCCAAGTTCTCAGACCTGATGTTC
CACATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATAGCTGACCAAGACTTTGGGTAGACTTGG
ACCGTGTGTCTGCTAACC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR4DP23TF 724 0 0
GGTTAATTAGTAACATAATACACTCACTTGTGGTAAGTTTAGAATTTTACATATTCAATT
AATGATACACCCCACTTTGTGGAGTATAGTTACTTTAACTTAAGTGTAGCTTGCAGACAA
TGGCAAGCCCTTGACGATGCCACAGAGGTTAGTGTTGAGGGGGATGTTGTACTCGTCCCT
TAGAGACTTCTCTGGTAACAGAACGCTAACATACAATTGTTGTCCAAGGTATCTCCTCTC
CAAGTTCTCAGACCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATAGCTGA
CCAAGACTTTGGGTAGACTTGGACCGTGTGTCTGCTAACCGCATCCAGCAAGTTGTAGTT
CTTTCTCTTTTCAGGTGTCCACCTCCCTGGCTCAGAGGCGACTGCGAAGAAGGAGTAACC
ATCCAACTGGAATGACTCCATGCTCTTCTCATGGTTCTCGAATATGATCTCTACAAAGGT
ACGGTAAGTAATGTTGAGCACATTAGGCTGCACGGTCAAGGCTGTGATTTGTGCTGCAGG
CTCGTCCTTGATGACGTTGTACTTGAACACCTTCTCTGCCATCTGGAAGTACTCAGCATG
CTTCAAAGGGGTCTCTGTGTCAACGTGTGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACTTTACC
GTTCACCACGTTCTTGCTGTTGACAAGCTTAATGCTACGGGTGATGTTGATCTTTCCATA
ATGC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6635Contig1 731 2 2 U
GGACAGGAAGTTATAGCAGGGAATATGTACAACCTAGAGGCGTACAAGGCTTCGGCGGAG
AGCTTCATGTGTAGTTTGGTGCCGGAGTCTCCGGGACAGCACATTGAATATACTCCTGGC
GGTCTTCTTTACAAACCCGGCGGTAGTCAGCTCCAGCACGCGACCACGATATCTTTCCTC
CTGCTGGTCTACGCTCAGTATCTTTCTAGAAGTTCCCTCTCCCCCAATTGTGGCAGCCTC
TCTGTCCCTCCTGATCATCTACGTCGTCTCGCCAAGAAACAGGTGGACTATGTTTTGGGG
GAGAATCCAATGGGATTATCGTACATGGTCGGGTACGGAGAGATGTATCCAAAGACGGAT
CGGTATATTTCAACTCGACCGAACCAAACCCCAACGTTTTGATTGGAGCAGTGGTCGGTG
GGCCCGGAGAGGACGATAAGTACGACGATGACAGGTCTGATTTCCGCAAGTCAGAGCCCA
CTACCTACATCAACGCTCCTTTCGTTGGTGTATTGGCTTACTTTGCAGCCAATCCTAGTT
TTAGCTGACGTCACTGGATTAACATTAGAAAAAAAGGTCCCTCTAGCTAATCTTGCATAC
GCAAAGCTAAGAAAGAAATTTTCTATCTGAATATCTCATTCGGATTATTTACTTGGATAT
CATCTTTTAATTCAAATGTAATGGATAGTCTATTCGTATATCATATATACACTGACATAA
ATTATGTTACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 1 574 RR4EU50TF
BS 575 731 RR4EU50JQ

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TCTGTCCCTCCTGATCATCTACGTCGTCTCGCCAAGAAACAGGTGGACTATGTTTTGGGG
GAGAATCCAATGGGATTATCGTACATGGTCGGGTACGGAGAGATGTATCCAAAGACGGAT
CGGTATATTTCAACTCGACCGAACCAAACCCCAACGTTTTGATTGGAGCAGTGGTCGGTG
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CTACCTACATCAACGCTCCTTTCGTTGGTGTATTGGCTTACTTTGCAGCCAATCCTAGTT
TTAGCTGACGTCACTGGATTAACATTAGAAAAAA

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DS 

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CGATGACAGGTTTGATTTCCGCAAGTCAGAGCCCACTACCTACATCAACGCTCCTTTCGT
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TAGTCTATTCGTATATCATATATACACTGACATAAATTATGTTACG

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

CO CL6636Contig1 1211 2 2 U
GGGAGCGAAAAATCGAGAGCGAGAATGGCGGGAGGGAAGATAAGGAAGGAGAAGGCCAAG
GCACCGTCAAACAATTACCAAGGAGGAATCTCGTTCCACAAATCGAAAGGACAGCATATC
CTCAAGAACCCTCTGCTGGTCGACTCAATCGTCCAGAAAGCAGGGATTAAGAGCACCGAT
GTGATCCTCGAGATCGGTCCAGGTACTGGTAACTTGACCAAGAAGCTTCTAGAAGCTGGT
AAAGAAGTCATCGCCGTCGAACTCGATTCCCGTATGGTTCTCGAGCTTCAGCGCCGTTTC
CAAGGCACTCCCCTTTCTAACCGCTTGAAGGTGATCCAAGGTGATGTTCTGAAGACTGAG
CTTCCACGGTTTGACATATGTGTTGCCAATATTCCGTATCAGATATCGTCTCCTCTTACA
TTCAAGCTTCTCTTTCACCCGACGAGCTTCAGGTGCGCCGTGATCATGTACCAGAGAGAG
TTCGCGATGAGACTCGTTGCCCAACCTGGAGATAATCTTTACTGTCGACTGTCAGTTAAC
ACTCAGCTGTATGCCAGAGTCTCGCATCTTCTCAAAGTCGGGAAGAACAACTTCCGTCCG
CCTCCCAAGGTGGATTCTTCTGTTGTTAGGATCGAACCGAGGAAGCCGCAGCCTCAGGTG
AATAAGAAAGAGTGGGATGGGTTCTTGAGAGTCTGTTTTATTAGGAAGAACAAGACCTTG
GGAGCTATTTTCAGGCAGAAGTCTGTTGTTTCTATGCTGGAGAAGAACTTCAAGACTCTT
CAGGCGGCGCTAGCTTCGTTGAATGGCTCCACTGGAGAAGCTGTTATGGATGTTGGTGGT
GACCAGAGCATGGGAATGGAAGATGATGACAACGAGATGGAGGATGATGATGATGACATG
GAGATGGAAGAAGGACAAGGAGGGGGAGGAGGAGAGTTTAAGGAGAAGGTTATGAATGTG
TTGAAGGAAGGTGGTTTCGAGGAGAAGAGGTCTTCAAAGCTATCTCAACAAGAGTTTTTG
TATCTTCTTTCCTTATTCAACAAGTCTGGTATTCACTTCTCCTAAAAGTGTTTTGTCCCT
TTCTGTTTCTTCATCAAAGGAGAATGTGTACCGCCCTGTCTTTGTTCTTGATAGTTTTTT
TGAGTTATTGGATACTATGGAGTCTTGCTTTTGAGTTTACAAAGAGATGATAAAATTTAC
TAAGTTATTAG


BQ
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AF RR4A659TF U 1
AF RR4A659JQ C 409
BS 1 730 RR4A659TF
BS 731 1211 RR4A659JQ

RD RR4A659TF 730 0 0
GGGAGCGAAAAATCGAGAGCGAGAATGGCGGGAGGGAAGATAAGGAAGGAGAAGGCCAAG
GCACCGTCAAACAATTACCAAGGAGGAATCTCGTTCCACAAATCGAAAGGACAGCATATC
CTCAAGAACCCTCTGCTGGTCGACTCAATCGTCCAGAAAGCAGGGATTAAGAGCACCGAT
GTGATCCTCGAGATCGGTCCAGGTACTGGTAACTTGACCAAGAAGCTTCTAGAAGCTGGT
AAAGAAGTCATCGCCGTCGAACTCGATTCCCGTATGGTTCTCGAGCTTCAGCGCCGTTTC
CAAGGCACTCCCCTTTCTAACCGCTTGAAGGTGATCCAAGGTGATGTTCTGAAGACTGAG
CTTCCACGGTTTGACATATGTGTTGCCAATATTCCGTATCAGATATCGTCTCCTCTTACA
TTCAAGCTTCTCTTTCACCCGACGAGCTTCAGGTGCGCCGTGATCATGTACCAGAGAGAG
TTCGCGATGAGACTCGTTGCCCAACCTGGAGATAATCTTTACTGTCGACTGTCAGTTAAC
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CCTCCCAAGGTGGATTCTTCTGTTGTTAGGATCGAACCGAGGAAGCCGCAGCCTCAGGTG
AATAAGAAAGAGTGGGATGGGTTCTTGAGAGTCTGTTTTATTAGGAAGAACAAGACCTTG
GGAGCTATTT

QA 1 730 1 730
DS 

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TCTCCTCTTACATTCAAGCTTCTCTTTCACCCGACGAGCTTCAGGTGCGCCGTGATCATG
TACCAGAGAGAGTTCGCGATGAGACTCGTTGCCCAACCTGGAGATAATCTTTACTGTCGA
CTGTCAGTTAACACTCAGCTGTATGCCAGAGTCTCGCATCTTCTCAAAGTCGGGAAGAAC
AACTTCCGTCCGCCTCCCAAGGTGGATTCTTCTGTTGTTAGGATCGAACCGAGGAAGCCG
CAGCCTCAGGTGAATAAGAAGGAGTGGGATGGGTTCTTGAGAGTCTGTTTTATTAGGAAG
AACAAGACCTTGGGAGCTATTTTCAGGCAGAAGTCTGTTGTTTCTATGCTGGAGAAGAAC
TTCAAGACTCTTCAGGCGGCGCTAGCTTCGTTGAATGGCTCCACTGGAGAAGCTGTTATG
GATGTTGGTGGTGACCAGAGCATGGGAATGGAAGATGATGACAACGAGATGGAGGATGAT
GATGATGACATGGAGATGGAAGAAGGACAAGGAGGGGGAGGAGGAGAGTTTAAGGAGAAG
GTTATGAATGTGTTGAAGGAAGGTGGTTTCGAGGAGAAGAGGTCTTCAAAGCTATCTCAA
CAAGAGTTTTTGTATCTTCTTTCCTTATTCAACAAGTCTGGTATTCACTTCTCCTAAAAG
TGTTTTGTCCCTTTCTGTTTCTTCATCAAAGGAGAATGTGTACCGCCCTGTCTTTGTTCT
TGATAGTTTTTTTGAGTTATTGGATACTATGGAGTCTTGCTTTTGAGTTTACAAAGAGAT
GATAAAATTTACTAAGTTATTAG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6637Contig1 788 2 2 U
GGAAGCTTTTGGATTCGAGCTTCTTTAACTATGACCCTCTGTCTCCGAATCGCTCCGTCA
CCGGTATCTTTCCGTTACTCTCCGGCTACGGCAACCGCCTCCGGCGGAGGATTACGTTCC
GTGAAGCAGCGTTGCCGGATCCCGAACTCAGGCGTCGCGGCGGCGAAAACAGGATTCTGC
TCCGGCGGTGGTGGTGTGTTAGATTTAAGGAAGAAGATCGGTTCCTGTGTGGTGGTGAGG
TGTAGCTTAGAGACAGTGAATGTCAGTGTCGGCGAGGTGACGGAGGTTGACAAGGACACG
TTCTGGCCAATCGTTAAAGCCGCCGGTGATAAGATTGTTGTCCTCGACATGTACACTCAG
TGGTGTGGACCGTGCAAAGTTATGGCTCCTAAATACAAAGAGCTATCAGAGAAGTACCAG
GACATGGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACGAAGACAACAAGCCAGTGGCAAAGGAGCTA
GGAATTAGAGTGGTTCCAACCTTTAAGATCTTGAAGGACAGCAAGGTTATAACGGAAGTG
GTCGGGGCAAAATTTGATGAGTTACTTGCAGCTATTGATGCAGCGAGGTCAGGCTGAGCC
TCATCTCTATATACATATAATATCACTCCCTGCTGTAGAGTATTAGGACAATTCTCCATC
AACATGTAATTGGTTTGGTTCTATGTAAACTCTCTCTGTGCTGTTCCTTAACCGGATTCA
GTTGTAATGTAACAGTGTATGTATAAACGCTGGAGGGCTAAATTGCTTTATATATCAAAA
GTTTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU91TF U 1
AF RR4EU91JQ C 197
BS 1 512 RR4EU91TF
BS 513 788 RR4EU91JQ

RD RR4EU91TF 512 0 0
GGAAGCTTTTGGATTCGAGCTTCTTTAACTATGACCCTCTGTCTCCGAATCGCTCCGTCA
CCGGTATCTTTCCGTTACTCTCCGGCTACGGCAACCGCCTCCGGCGGAGGATTACGTTCC
GTGAAGCAGCGTTGCCGGATCCCGAACTCAGGCGTCGCGGCGGCGAAAACAGGATTCTGC
TCCGGCGGTGGTGGTGTGTTAGATTTAAGGAAGAAGATCGGTTCCTGTGTGGTGGTGAGG
TGTAGCTTAGAGACAGTGAATGTCAGTGTCGGCGAGGTGACGGAGGTTGACAAGGACACG
TTCTGGCCAATCGTTAAAGCCGCCGGTGATAAGATTGTTGTCCTCGACATGTACACTCAG
TGGTGTGGACCGTGCAAAGTTATGGCTCCTAAATACAAAGAGCTATCAGAGAAGTACCAG
GACATGGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACGAAGACAACAAGCCAGTGGCAAAGGAGCTA
GGAATTAGAGTGGTTCCAACCTTTAAGATCTT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR4EU91JQ 592 0 0
TGTTAGATTTAAGGAAGAAGATCGGTTCCTGTGTGGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACAG
TGAATGTCAGTGTCGGCGAGGTGACGGAGGTTGACAAGGACACGTTCTGGCCAATCGTTA
AAGCCGCCGGTGATAAGATTGTTGTCCTCGACATGTACACTCAGTGGTGTGGACCGTGCA
AAGTTATGGCTCCTAAATACAAAGAGCTATCAGAGAAGTACCAGGACATGGTGTTTCTTA
AGCTTGACTGCAACGAAGACAACAAGCCAGTGGCAAAGGAGCTAGGAATTAGAGTGGTTC
CAACCTTTAAGATCTTGAAGGACAGCAAGGTTATAACGGAAGTGGTCGGGGCAAAATTTG
ATGAGTTACTTGCAGCTATTGATGCAGCGAGGTCAGGCTGAGCCTCATCTCTATATACAT
ATAATATCACTCCCTGCTGTAGAGTATTAGGACAATTCTCCATCAACATGTAATTGGTTT
GGTTCTATGTAAACTCTCTCTGTGCTGTTCCTTAACCGGATTCAGTTGTAATGTAACAGT
GTATGTATAAACGCTGGAGGGCTAAATTGCTTTATATATCAAAAGTTTCATG

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL6638Contig1 1027 2 2 U
GTGTGTGTTGATTAAAGAGGTGAATCGTCTACTCCGACCCAATGGATACTTTGTGTACTC
AGCACCACCTGCTTACAGAAAGGATAAAGATTTCCCTGTGATTTGGGATAAGTTGGTGAA
CCTAACAACCGCAATGTGCTGGAAGCTCGTCTCCCGGAAGGTGCAGACTGCAATATGGGT
TAAAGAAGGTGACGAGGCTTGCCTTAGGAAGAATGCAGAGCTTGAGCTCATAACTATATG
TGATTCGGAAGATGTTTCAAAAGCTTCTTGGAAAGTCCCTCTTAGAGACTGTGTTGACGT
TAGTGAGAGCATACAACAGAAGTCCTCTTCGTATCCAGCAAGTCTAAGTAAACTAGGCAT
CAGCGAAGATGAGTTTGCATTGGACACAGACTTCTGGAGAGAGCAAGTGAACCGTTACTG
GGAGTTGATGAAAGTTAACAAGACGGAAGTGCGGAACGTGATGGACACAAACGCGTACGT
TGGTGGATTTGCTGCAGCTATGATGAACTCATACCCCGTTTGGGTCATGAACGTTGTCCC
TGCTACGATGATTAAAGATACCTTGTCAGGAATTTACCAGAGGGGCTTAACCGGTGTATA
CCATGATTGGTGTGAGCCATTCTCAACGTATCCATGCACATACGATCTGCTACACGCGGA
CAGACTCTTGTCACACTATCAAAACCACGGTGAAGGTTGTTTACTAGAGGACATCATGCT
TGAGATGGACCGCATCATACGCCCTCAGGGATTCATCATTATTAGAGACGAGGAATCGAT
CATCTCAAAAGTCCAAGACTTGGCTCCTAAGTTCCTTTGGGAAGTGGAGACACATGAGCT
TCAAGACAAATACAAGAAGACAGGAACTGTTCTGTTTTGCAGGAAGAAGTTCTGGTCAAT
TGTCTGAAACACACACAAGGTTGACAGAGTTTTTGCAGAAAACATAGAAAAATCTTGTTT
ATTTTTTATTGTTGTTTGTAAGAGAAAAGAAATTAAATACCACTTAATGTAACTTATATG
TTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED70TF U 1
AF RR4ED70JQ C 368
BS 1 685 RR4ED70TF
BS 686 1027 RR4ED70JQ

RD RR4ED70TF 685 0 0
GTGTGTGTTGATTAAAGAGGTGAATCGTCTACTCCGACCCAATGGATACTTTGTGTACTC
AGCACCACCTGCTTACAGAAAGGATAAAGATTTCCCTGTGATTTGGGATAAGTTGGTGAA
CCTAACAACCGCAATGTGCTGGAAGCTCGTCTCCCGGAAGGTGCAGACTGCAATATGGGT
TAAAGAAGGTGACGAGGCTTGCCTTAGGAAGAATGCAGAGCTTGAGCTCATAACTATATG
TGATTCGGAAGATGTTTCAAAAGCTTCTTGGAAAGTCCCTCTTAGAGACTGTGTTGACGT
TAGTGAGAGCATACAACAGAAGTCCTCTTCGTATCCAGCAAGTCTAAGTAAACTAGGCAT
CAGCGAAGATGAGTTTGCATTGGACACAGACTTCTGGAGAGAGCAAGTGAACCGTTACTG
GGAGTTGATGAAAGTTAACAAGACGGAAGTGCGGAACGTGATGGACACAAACGCGTACGT
TGGTGGATTTGCTGCAGCTATGATGAACTCATACCCCGTTTGGGTCATGAACGTTGTCCC
TGCTACGATGATTAAAGATACCTTGTCAGGAATTTACCAGAGGGGCTTAACCGGTGTATA
CCATGATTGGTGTGAGCCATTCTCAACGTATCCATGCACATACGATCTGCTACACGCGGA
CAGACTCTTGTCACACTATCAAAAC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4ED70JQ 660 0 0
GATGAGTTTGCATTGGACACAGACTTCTGGAGAGAGCAAGTGAACCGTTACTGGGAGTTG
ATGAAAGTTAACAAGACGGAAGTGCGGAACGTGATGGACACAAACGCGTACGTTGGTGGA
TTTGCTGCAGCTATGATGAACTCATACCCCGTTTGGGTCATGAACGTTGTCCCTGCTACG
ATGATTAAAGATACCTTGTCAGGAATTTACCAGAGGGGCTTAACCGGTGTATACCATGAT
TGGTGTGAGCCATTCTCAACGTATCCATGCACATACGATCTGCTACACGCGGACAGACTC
TTGTCACACTATCAAAACCACGGTGAAGGTTGTTTACTAGAGGACATCATGCTTGAGATG
GACCGCATCATACGCCCTCAGGGATTCATCATTATTAGAGACGAGGAATCGATCATCTCA
AAAGTCCAAGACTTGGCTCCTAAGTTCCTTTGGGAAGTGGAGACACATGAGCTTCAAGAC
AAATACAAGAAGACAGGAACTGTTCTGTTTTGCAGGAAGAAGTTCTGGTCAATTGTCTGA
AACACACACAAGGTTGACAGAGTTTTTGCAGAAAACATAGAAAAATCTTGTTTATTTTTT
ATTGTTGTTTGTAAGAGAAAAGAAATTAAATACCACTTAATGTAACTTATATGTTCATCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL6639Contig1 1214 2 2 U
GGAAATACATACACATAGATCTGAAAAGTTTTGTTTTTAATTCTTGTTATAAGGTTTTCA
TACTGATGATGATGAACAAAGATATATTATTTCATCATCAACAGCAACAAGTGGAGGAAA
ACATGCCCAATCTTACATCAGCTTCAGGAGATCAAGCAAGTGTGTCCTCAGGAAACAGAA
CTGAAACTAGTGGCTCCAACTTTCAGTACAACATTAATCCAAACCAGCAACAAGAAGAAC
AGTGTCCTGCTCCACAAAAGAAGAAGAGAAACCAACCTGGCAATCCAGACCCAGATGCAG
AAGTGATGGCTTTATCACCAAAAACACTAATGGCAACAAACAGATTCATATGCGAAATCT
GTAACAAAGGGTTCCAAAGAGATCAGAACTTGCAGCTTCACAAAAGAGGACACAATCTAC
CATGGAAGCTTAAACAAAGACCAAACCCTATTCTCATCCAATCTTCATCTCCTCATGATC
ATCAAACTCAACACAACATCAACTTCTCTTCTTCCTCGCAAAACATCACCAGCAACAACA
ACAATCTCCATGGTCATGAACTTCCTACGAAGCAAGAAGAGCCACATCATCACTTCCACA
ACATCCCTCCTTGGCTCATCTCATCAAACCCTAACCCTGTCAGTAACGCTAATTACTTCC
CGCTTGCTTCTTCTTCTGCAAGCTTCCACCACTCATCTCCGGCAATGTCAGCCACAGCTT
TGCTCCAGAAAGCAGCTCAAATGGGTCACTCAAAGCCAACAACTACACCAGAGGAAGAAG
AAGAGAGGGCAGCGTCATTGATGACTACTACAACAATGGCTGCATCGATGATGACGTCAC
CATCAGAACATGGATTCGGGTTTCAAGACTACTATATGATGAATCATCATCCTCATCATC
ACCACGGCGTTGGAGAAGCTTTCAACGGTGGTTTTATCGCCGGAGACGAGAAGAACGATG
TGGGGGACGACGGTGGAGGAGAGACTAGAGATTTCTTGGGGTTAATATCGTTAATGTCTC
ATAATGAGATTCTAAGTTTCGCTAATAATCTTGGTAACTGTATCAACACTCTGCTTCAGA
GCAGCAACAGCGATTCAGCCATCAAGATTAGGTACTAGGTCGCTAGCATATGTATAGAGA
TATTTATATAGTTTTAAAAATTTATTAGTGTTCTCGAAAGATAATTTTCATATAAGGTTT
TTATAATTCTATTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G766TF U 1
AF RR4G766JQ C 380
BS 1 697 RR4G766TF
BS 698 1214 RR4G766JQ

RD RR4G766TF 697 0 0
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CTGAAACTAGTGGCTCCAACTTTCAGTACAACATTAATCCAAACCAGCAACAAGAAGAAC
AGTGTCCTGCTCCACAAAAGAAGAAGAGAAACCAACCTGGCAATCCAGACCCAGATGCAG
AAGTGATGGCTTTATCACCAAAAACACTAATGGCAACAAACAGATTCATATGCGAAATCT
GTAACAAAGGGTTCCAAAGAGATCAGAACTTGCAGCTTCACAAAAGAGGACACAATCTAC
CATGGAAGCTTAAACAAAGACCAAACCCTATTCTCATCCAATCTTCATCTCCTCATGATC
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ACATCCCTCCTTGGCTCATCTCATCAAACCCTAACCCTGTCAGTAACGCTAATTACTTCC
CGCTTGCTTCTTCTTCTGCAAGCTTCCACCACTCATC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4G766JQ 835 0 0
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CTCATCAAACCCTAACCCTGTCAGTAACGCTAATTACTTCCCGCTTGCTTCTTCTTCTGC
AAGCTTCCACCACTCATCTCCGGCAATGTCAGCCACAGCTTTGCTCCAGAAAGCAGCTCA
AATGGGTCACTCAAAGCCAACAACTACACCAGAGGAAGAAGAAGAGAGGGCAGCGTCATT
GATGACTACTACAACAATGGCTGCATCGATGATGACGTCACCATCAGAACATGGATTCGG
GTTTCAAGACTACTATATGATGAATCATCATCCTCATCATCACCACGGCGTTGGAGAAGC
TTTCAACGGTGGTTTTATCGCCGGAGACGAGAAGAACGATGTGGGGGACGACGGTGGAGG
AGAGACTAGAGATTTCTTGGGGTTAATATCGTTAATGTCTCATAATGAGATTCTAAGTTT
CGCTAATAATCTTGGTAACTGTATCAACACTCTGCTTCAGAGCAGCAACAGCGATTCAGC
CATCAAGATTAGGTACTAGGTCGCTAGCATATGTATAGAGATATTTATATAGTTTTAAAA
ATTTATTAGTGTTCTCGAAAGATAATTTTCATATAAGGTTTTTATAATTCTATTT

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL6640Contig1 771 2 2 U
GGAATCACTTGTTAAAGAGAACCGATAAGAAAAGAAAAAAGACTGGAGATGGAGTATCAA
ACTAGCTTCTTCTACGAAAACAAAAGTCAAGAGTTCTCACCGGAGAACTCTTGTTCGACA
AACTCATGGAGCTCACAAGAATCATTCTTGTGGGAAGAAAGTTTCTTACATGATCAATCC
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AAGAGGCCATGGGGTAAATACGCAGCCGAGATAAGAGACTCAACGAGGAAAGGTATAAGA
GTGTGGCTCGGGACGTTCGACACCGCGGAAGAGGCGGCTCTTGCTTATGATCAGGCAGCT
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CTCCAAAAGATGGAGAATGTTAATCTCAACGGAGGAGAGTCTCCGGTGATAGCTTTGAAG
AGAAAACATTCCATGAGAAACCGACCCAGAGGAAAGAAGAATTCTTCTCCTTCTTCATCT
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BQ
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AF RR4GW19TF U 1
AF RR4GW19JQ C 185
BS 1 498 RR4GW19TF
BS 499 771 RR4GW19JQ

RD RR4GW19TF 498 0 0
GGAATCACTTGTTAAAGAGAACCGATAAGAAAAGAAAAAAGACTGGAGATGGAGTATCAA
ACTAGCTTCTTCTACGAAAACAAAAGTCAAGAGTTCTCACCGGAGAACTCTTGTTCGACA
AACTCATGGAGCTCACAAGAATCATTCTTGTGGGAAGAAAGTTTCTTACATGATCAATCC
TTCCTCTCATTTAGCCCTTCCTATGATGACTTCTTCACATTTGAATTATCACTCATCAAA
GAAGAAGTAGAAGACACCGTGGTGGCCGAGGAGGAGGAGAGGTCATACAGAGGAGTGAGG
AAGAGGCCATGGGGTAAATACGCAGCCGAGATAAGAGACTCAACGAGGAAAGGTATAAGA
GTGTGGCTCGGGACGTTCGACACCGCGGAAGAGGCGGCTCTTGCTTATGATCAGGCAGCT
TTCGCTTTGAAAGGTGACCTTGCGGTACTCAACTTCCCCGTAAATGTTGTTAAGGAGTCT
CTCCAAAAGATGGAGAAT

QA 1 498 1 498
DS 

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TCTCATTTAGCCCTTCCTATGATGACTTCTTCACATTTGAATTATCACTCATCAAAGAAG
AAGTAGAAGACACCGTGGTGGCCGAGGAGGAGGAGAGGTCATACAGAGGAGTGAGGAAGA
GGCCATGGGGTAAATACGCAGCCGAGATAAGAGACTCAACGAGGAAAGGTATAAGAGTGT
GGCTCGGGACGTTCGACACCGCGGAAGAGGCGGCTCTTGCTTATGATCAGGCAGCTTTCG
CTTTGAAAGGTGACCTTGCGGTACTCAACTTCCCCGTAAATGTTGTTAAGGAGTCTCTCC
AAAAGATGGAGAATGTTAATCTCAACGGAGGAGAGTCTCCGGTGATAGCTTTGAAGAGAA
AACATTCCATGAGAAACCGACCCAGAGGAAAGAAGAATTCTTCTCCTTCTTCATCTTCCT
CTTCTTCTTCATCTTCAAGAAGTAGTATACAAAGTCTTGCTACGAAGCAAGAAAGTACTA
CAACCCTTGTAGTTTTTGAAGATTTGGGTGCTGAGTACTTAGAAGAGCTTATGAGATCAT
GTTCATAATCATATCTACTTTAACAATAATATGAGATTTGAGTGACC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL6641Contig1 1356 2 2 U
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AAGGTTTTCTGAATTTCGAGATCAGCTTAAGGGAATTCTTTTCCACGAAAAGCTGGGGAC
GATGCTGGATTAGATGAACCGTCTAGAAAAGATGGTAACTAAGCTTTGTTTAGCCCTCGA
AGTTGATGAAGACCTGCTTCCAGTTGTGGAGGGGGCTGCTTCACTTGCTCTGTCAGACCT
TGCAACTTCTGTGGTTACAGAATTTACTTCCCTGTCAGGAATAATGGCTCGTCATTATGC
TCTCAGAGATGGCTATTCAGAGCAGATTGCAGAAGCTTTACTGGAAATCACACTTCCTAG
ATTTTCTGGAGATGTCATCCCTACAACAGATGCAGGAATGGTTTTGGCAATAGGTGATAG
ATTGGATAGCCTCGTTGGTCTATTTGCTGCTGGTTGCCAGCCAAGTTCAACAAATGACCC
ATTTGGCCTTAGAAGAATATCTTATGGCTTAGTTCAGATTCTGGTCGAGAAGGATAAAAA
TGTCAACTTCAAACATGCTCTAGAAATTGCAGCCAGTGTACAACCAATAAATGTTGAGGC
AAACACTTTAGACGATGTATATCAATTTGTTACTCGAAGACTTGAACAGCTTTTGGTTGA
CAACGGAATAAGCCCTGAAGTAGTTAGGTCTGTCCTAGCAGAACGTGGAAATGATCCTTG
TCTGGCATCACGAACTGCATACAAGATGGAAAAGCTGAGCAAAGGTGAGATCTTTCCGAA
GATAGTGGAAGCATATTCTCGTCCCACACGAATTGTCCGTGGGAAAGATCTTGATGTTGG
AGTTGAGGTGGATGAGAGTGTATTTGAGACTTCCCAAGAAAGAGTTGTGGAACATTTACA
CCTCCATAAAAGATCGAATTCACAGTGGCATAGGAATCGAGGAGTTCACTGAGATATCGA
CGCAGTTGGTGGAGCCGCTGGAGGATTTTTTCAACAATGTATTTGTGATGGTGGAGGAAG
AAAGAGTGAGGAAGAACAGACTGGCTCTTCTAAATAACATTGCCAATCTTCCCTCAGGAA
TTGCTGACCTTTCATTTTTGCCTGGTTTTTGAGGTTTTTACTTATAATCTTTTCCCTCTC
GAGGGGAAAAATACAAGTTCAAGCATAGAGAGAATCAAACGGTGTTGCAGACTGTTCGGA
GTATTATTTGTATGATTTATTTTGATCGAATCAACTTGTGTCGCAAGTTGGTTTAAGAGA
GAGACGGTACAAATTAGTTCATTGTTCCGCTGCATTGAGCATGGAACTAGTTTCTTGAAT
TGGACTTATTCTCGTATTCTGATTTTGTTAAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G256TF U 1
AF RR4G256JQ C 558
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BS 663 1356 RR4G256JQ

RD RR4G256TF 664 0 0
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GATGCTGGATTAGATGAACCGTCTAGAAAAGATGGTAACTAAGCTTTGTTTAGCCCTCGA
AGTTGATGAAGACCTGCTTCCAGTTGTGGAGGGGGCTGCTTCACTTGCTCTGTCAGACCT
TGCAACTTCTGTGGTTACAGAATTTACTTCCCTGTCAGGAATAATGGCTCGTCATTATGC
TCTCAGAGATGGCTATTCAGAGCAGATTGCAGAAGCTTTACTGGAAATCACACTTCCTAG
ATTTTCTGGAGATGTCATCCCTACAACAGATGCAGGAATGGTTTTGGCAATAGGTGATAG
ATTGGATAGCCTCGTTGGTCTATTTGCTGCTGGTTGCCAGCCAAGTTCAACAAATGACCC
ATTTGGCCTTAGAAGAATATCTTATGGCTTAGTTCAGATTCTGGTCGAGAAGGATAAAAA
TGTCAACTTCAAACATGCTCTAGAAATTGCAGCCAGTGTACAACCAATAAATGTTGAGGC
AAACACTTTAGACGATGTATATCAATTTGTTACTCGAAGACTTGAACAGCTTTTGGTTGA
CA
CG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4G256JQ 799 0 0
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TATATCAATTTGTTACTCGAAGACTTGAACAGCTTTTGGTTGACAACGGAATAAGCCCTG
AAGTAGTTAGGTCTGTCCTAGCAGAACGTGGAAATGATCCTTGTCTGGCATCACGAACTG
CATACAAGATGGAAAAGCTGAGCAAAGGTGAGATCTTTCCGAAGATAGTGGAAGCATATT
CTCGTCCCACACGAATTGTCCGTGGGAAAGATCTTGATGTTGGAGTTGAGGTGGATGAGA
GTGTATTTGAGACTTCCCAAGAAAGAGTTGTGGAACATTTACACCTCCATAAAAGATCGA
ATTCACAGTGGCATAGGAATCGAGGAGTTCACTGAGATATCGACGCAGTTGGTGGAGCCG
CTGGAGGATTTTTTCAACAATGTATTTGTGATGGTGGAGGAAGAAAGAGTGAGGAAGAAC
AGACTGGCTCTTCTAAATAACATTGCCAATCTTCCCTCAGGAATTGCTGACCTTTCATTT
TTGCCTGGTTTTTGAGGTTTTTACTTATAATCTTTTCCCTCTCGAGGGGAAAAATACAAG
TTCAAGCATAGAGAGAATCAAACGGTGTTGCAGACTGTTCGGAGTATTATTTGTATGATT
TATTTTGATCGAATCAACTTGTGTCGCAAGTTGGTTTAAGAGAGAGACGGTACAAATTAG
TTCATTGTTCCGCTGCATTGAGCATGGAACTAGTTTCTTGAATTGGACTTATTCTCGTAT
TCTGATTTTGTTAAAAGGG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL6642Contig1 476 2 12 U
AGAGGAACCTGAGGGGGATATGGAACTTCACCAATCCTGGAGTGGTGAGCCACAACGAGA
TACTGGAGATGTACAAGAACTACATCGAGCCGGGTTTCAAATGGTCCAACTTCACTTTGG
AAGAACAGGCTAAAGTCATTGTCGCGGCAAGAAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGC
TCAGCAAGGAGTTTCCAGAGATGCTTTCCATCAAAGACTCGTTGATCAAATACGTCTTCG
AACCCAACAAGAGAACGTAAAAGCCTGGTTAGTTAAACACACACACGCACACTTCCCCTT
TCTCTGTTCATTGTTATACTATTATCCTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATA
ATTTGATTTGATTTATCATGTAATTCTTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACAC
ATCTTTGTTTACATTAATATTATTACAGATTTATTTGAGTTTTCATTATAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G401JQ C 1
AF RR4CK86TF U 126
BS 1 126 RR4G401JQ
BS 127 149 RR4CK86TF
BS 150 150 RR4G401JQ
BS 151 196 RR4CK86TF
BS 197 197 RR4G401JQ
BS 198 200 RR4CK86TF
BS 201 201 RR4G401JQ
BS 202 276 RR4CK86TF
BS 277 277 RR4G401JQ
BS 278 296 RR4CK86TF
BS 297 297 RR4G401JQ
BS 298 476 RR4CK86TF

RD RR4G401JQ 470 0 0
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TACTGGAGATGTACAAGAACTACATCGAGCCGGGTTTCAAATGGTCCAACTTCACTTTGG
AAGAACAGGCTAAGGTCATTGTCGCGGCAAGAAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGC
TCAGCAAGGAGTTTCCAGAGATGCTTTCCATCAAAGACTCGTTGATCAAATACGTCTTCG
AACCCAACAAGAGAACGTAAAAGCCTGGTTAGTTAAACACACACACGCACACTTGCCCTT
TCTCTGTTCATTGTTATATTATTATCCTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATA
ATTTGATTTGATTTATCATGTAATTCTTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACAC
ATCTTTGTTTACATTAATATTATTACAGATTTATTTGAGTTTTCATTA
AA

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR4CK86TF 351 0 0
G
AGGCTAAAGTCATTGTCGCGGCACGAAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGCTCAGCA
AGGAGTTTCCGGAGTTGCTTTCCATCAAAGACTCGTTGATCAAATACGTCTTCGAACCCA
ACAAGAGAACGTAAAAGCCTGGTTAGTTAA*CACACACACGCACACTTCCTCTTTCTCTG
TTCATTGTTATACTATTATCCTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATAATTTGA
TTTGATTTATCATGTAATTCTTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACACATCTTT
GTTTACATTAATATTATTACAGATTTATTTGAGTTTTCATTATAGTTTCC

QA 2 351 2 351
DS 



AS 1 2

CO CL6643Contig1 1127 2 6 U
GCTCATGGAAAATGAGAAGAACGAGGTGATTGTTGCTGATAACTACTTCACTGGATCAAA
GGAGAACCTCAAGAAGTGGATCGGTCACCCAAGATTTGAGCTCATTCGTCACGATGTTAC
CGAGCCTTTGTTGATCGAGGTTGATAGGATCTACCATCTCGCTTGTCCTGCCTCTCCTAT
CTTCTACAAGTACAACCCCGTTAAGACCATCAAGACCAATGTGATTGGTACACTCAACAT
GCTCGGTCTCGCCAAGCGTGTTGGAGCAAGAATCCTGCTCACCTCGACCTCGGAGGTCTA
CGGAGACCCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAACGTCAACCCTATTGG
TGTTAGGAGTTGCTACGACGAAGGCAAGCGTGTGGCTGAGACGTTGATGTTTGACTACCA
CAGACAGCATGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTATGGTCCTAGGAT
GAACATTGATGATGGGCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTTCGAGGTGAGGC
TTTGACAGTTCAGAAACCGGGGACGCAGACTCGCAGTTTCTGCTATGTGTCAGACATGGT
GGATGGACTTATCCGTCTCATGGAAGGAGATGATACTGGTCCTATCAACATCGGTAACCC
AGGTGAGTTCACAATGGTGGAACTGGCTGAGACAGTTAAGGAGCTGATTAACCCGAGCAT
AGAGATAAAGATGGTGGAGAACACACCGGACGATCCAAGACAGAGGAAGCCAGACATAAC
CAAGGCTAAAGAAGTGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTCAGAGAAGGACTTCCTTT
CATGGAAGAAGACTTCCGGCTAAGGCTTAACGTCCCCAAGAATTAAAGAAATGTGAAGGC
ACAGGAGAACAACGTTTTAAGAGTATATGGTGTTTCATTATATACTACAGAGTGATGGTT
TGGTTTCATACTTTCATGTATTGTTATTGATCTTTCCTTCTATTCATAGAAAAATAAGTT
GGGAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTAATGAGGATCGACTCTTTTTGTTTGAATATATT
GCGGTATGGTTATCGTGTCATATTATAATGTTTCTTTCTATTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FR90TF U 1
AF RR4FR90JQ C 440
BS 1 700 RR4FR90TF
BS 701 701 RR4FR90JQ
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BS 741 741 RR4FR90JQ
BS 742 765 RR4FR90TF
BS 766 1127 RR4FR90JQ

RD RR4FR90TF 766 0 0
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CGAGCCTTTGTTGATCGAGGTTGATAGGATCTACCATCTCGCTTGTCCTGCCTCTCCTAT
CTTCTACAAGTACAACCCCGTTAAGACCATCAAGACCAATGTGATTGGTACACTCAACAT
GCTCGGTCTCGCCAAGCGTGTTGGAGCAAGAATCCTGCTCACCTCGACCTCGGAGGTCTA
CGGAGACCCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAACGTCAACCCTATTGG
TGTTAGGAGTTGCTACGACGAAGGCAAGCGTGTGGCTGAGACGTTGATGTTTGACTACCA
CAGACAGCATGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTATGGTCCTAGGAT
GAACATTGATGATGGGCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTTCGAGGTGAGGC
TTTGACAGTTCAGAAACCGGGGACGCAGACTCGCAGTTTCTGCTATGTGTCAGACATGGT
GGATGGACTTATCCGTCTCATGGAAGGAGATGATACTGGTCCTATCAACATCGGTAACCC
AGGTGAGTTCACAATGGTGGAACTGGCTGAGACAGTTAAG*AGCTGATTAACCCGAGCAT
AGAGATAAAGATGGTGGAGA*CACACCGGACGATCCAAGACAGAG
A

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4FR90JQ 688 0 0
ATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTATGGTCCTAGGATGAACATTGATGATGGGCGT
GTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTTCGAGGTGAGGCTTTGACAGTTCAGAAACCG
GGGACGCAGACTCGCAGTTTTTGCTATGTGTCAGACATGGTGGATGGACTTATCCGTTTC
ATGGAAGGAGATGATACTGGTCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAGTTCACAATGGTG
GAACTGGCTGAGACAGTTAAGGAGCTGATTAACCCGAGCATAGAGATAAAGATGGTGGAG
AACACACCGGACGATCCAAGACAGAGGAAGCCAGACATAACCAAGGCTAAAGAAGTGTTG
GGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTCAGAGAAGGACTTCCTTTCATGGAAGAAGACTTCCGG
CTAAGGCTTAACGTCCCCAAGAATTAAAGAAATGTGAAGGCACAGGAGAACAACGTTTTA
AGAGTATATGGTGTTTCATTATATACTACAGAGTGATGGTTTGGTTTCATACTTTCATGT
ATTGTTATTGATCTTTCCTTCTATTCATAGAAAAATAAGTTGGGAAAGTTTTTTTTTTTT
TTTTTCTTAATGAGGATCGACTCTTTTTGTTTGAATATATTGCGGTATGGTTATCGTGTC
ATATTATAATGTTTCTTTCTATTTTTCC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6644Contig1 755 2 1 U
GGCAATAACCAAATCATCAAACTTCACAGACAAAACCGAAGGCAACATGGGTTCGAGCAT
CTCCCCAAACAACAAAGCCGTTCTTGATTACTGCAGGAAAGTTTTCATGTACTCGCTTGA
GGATCTCGGTACCATTCTTGAGGAAATGGGTGAAGATCTTAACACGATCGGTAACAAATT
CGACCAGATTAAACAATGGTTAACCGGTGTTTACAATTACCAAACCGATTGTCTTGACGA
TATTCAAGAAGATGATTTGAGAAAGACTATTGCTGAAGGCATTGCAAGCTCCAAGATTCT
TACTGGTAATGCTATCGACATCTTCCACACAGTTGTTAGCGCAATGGCCAAGATCGACGC
TAAAGTCGACGATTTCAAGAACATGACAAGTGGAATCTTCACTCCTTCCGACAAAGGATC
AGCTCCGGCCGGCAAAGAAGCCACTCCTGTCGACACTCCCGTGGCTGACCCAGACGGTCC
TTCCCGTCGCCTTCTTGAAGACCTTGACGATCTCGGAGTCCCAACATGGGTTTCAGGTGC
AGACAGGAAGCTTATGGCTAACGCTGGACGTGGCCGAAGAGGAGGTGGTGGAGCTCCTAG
AATCAGGGCAACCTATGTGGTCGCTAAAGATGGAAGCGGACAGTCCAAGTCATTCAACAA
GCTGTTAACGCTTGTCCCGACAAAACGCTGGAGATGCATCATCCACATCAAGGCTGGTAT
CTACAGAGAGCAAGTCATCATCCCTAGAGAGACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C488TF U 135
AF RR4C376TF U 1
BS 1 755 RR4C376TF

RD RR4C488TF 309 0 0
TTCTTGAGGAAATGGGTGAAGATCTTAACACGATCGGTAACAAATTCGACCAGATTAAAC
AATGGTTAACCGGTGTTTACAATTACCAAACCGATTGTCTTGACGATATTCAAGAAGATG
ATTTGAGAAAGACTATTGCTGAAGGCATTGCAAGCTCCAAGATTCTTACTGGTAATGCTA
TCGACATCTTCCACACAGTTGTTAGCGCAATGGCCAAGATCGACGCTAAAGTCGACGATT
TCAAGAACATGACAAGTGGAATCTTCACTCCTTCCGACAAAGGATCAGCTCCGGCCGGCA
AAGAAGCCA

QA 1 309 1 309
DS 

RD RR4C376TF 755 0 0
GGCAATAACCAAATCATCAAACTTCACAGACAAAACCGAAGGCAACATGGGTTCGAGCAT
CTCCCCAAACAACAAAGCCGTTCTTGATTACTGCAGGAAAGTTTTCATGTACTCGCTTGA
GGATCTCGGTACCATTCTTGAGGAAATGGGTGAAGATCTTAACACGATCGGTAACAAATT
CGACCAGATTAAACAATGGTTAACCGGTGTTTACAATTACCAAACCGATTGTCTTGACGA
TATTCAAGAAGATGATTTGAGAAAGACTATTGCTGAAGGCATTGCAAGCTCCAAGATTCT
TACTGGTAATGCTATCGACATCTTCCACACAGTTGTTAGCGCAATGGCCAAGATCGACGC
TAAAGTCGACGATTTCAAGAACATGACAAGTGGAATCTTCACTCCTTCCGACAAAGGATC
AGCTCCGGCCGGCAAAGAAGCCACTCCTGTCGACACTCCCGTGGCTGACCCAGACGGTCC
TTCCCGTCGCCTTCTTGAAGACCTTGACGATCTCGGAGTCCCAACATGGGTTTCAGGTGC
AGACAGGAAGCTTATGGCTAACGCTGGACGTGGCCGAAGAGGAGGTGGTGGAGCTCCTAG
AATCAGGGCAACCTATGTGGTCGCTAAAGATGGAAGCGGACAGTCCAAGTCATTCAACAA
GCTGTTAACGCTTGTCCCGACAAAACGCTGGAGATGCATCATCCACATCAAGGCTGGTAT
CTACAGAGAGCAAGTCATCATCCCTAGAGAGACAC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6645Contig1 1188 2 4 U
GGAGAGATCATTTTCGCAATCATCATTTGTATCTCTGGACTAGTCTTGTTTGCTCTTCTC
ATAGGAAACATGCAGAAATATTTGCAATCAACTACGGTAAGAGTTGAGGAAATGAGAGTG
AAAAGGAGAGATGCAGAGCAATGGATGTCTCACCGTATGTTGCCAGATGATCTGAGAAAA
CGTATCCGTAAATACGAACAGTATAAATGGCAAGAAACCAGAGGAGTTGAAGAAGAAGCT
CTTCTCTCTAGTCTTCCAAAAGATCTCAGAAAAGACATTAAACGCCATCTTTGTTTGAAT
CTCCTCAAAAAGGTGCCGTGGTTTAAAGCCATGGATGACCGGCTACTAGACGCACTTTGT
GCACGTTTGAATACAGTTCTTTACACGGAGAACAGTTACATTGTGCGTGAAGGCGAACCG
GTTGAGGATATGGTATTTATAATGAGAGGAAACCTTACAAGTACAACTACTTATGGTGGC
CAAACCGGATTCTTCAATTCTGCTCATTTGAAAGCCGGTGATTTCTGTGGAGATCTTCTC
ACTTGGGCACTGGATCCTAACACTTCTCACTTGCCTATCTCTACTAGAACCGTTCAAGCT
CAGACAGAAGTCGAAGGCTTTGTCCTCTCTGCTGAGGATCTCAAATTTTTCTCTACACAG
TACCGTCGCCTCCATAGCAAGCAACTACGACACACGTACAGGTGTTATTCAGTGCAGTGG
CAGACATGGGCAGCATGTTTCATACAAGCAGCATGGAAGAGATACTGTAGAAGGAAGCTC
TCAAGGGCTTTACGTGAAGAAGAAGAAAGACTACAATACTCTCTTCAGACAGATGATTCA
TCAGGAGGCAATAAACTTAACTTAGGTGCTGCGATTTATGCGTCGAGGTTTGCTTCTCAT
GCTCTGAGGAATGTAAGGGCGAATGCAGCAGCACGCAACTCTATGCTTCCTCATATGTTA
TCTTTGTTGCCTCAGAAGCCAGCTGATCCTGAGTTTCCTATGGATGAAACCTAATCTTGT
GTACATATTAGAAATAAGGAATGTCCGTAGTGGTTTCAAATAATTATGTAAAACAGTTTC
TTTATTGTGCCTACAATGCATTTATTTGCACATATATGGTCCATTTAATTTGTTGTCAAT
GTTTTTTGTTAGCTTTTAGGGCTCAATATATATTGTGTGGGCATAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA76TF U 1
AF RR4FA76JQ C 459
BS 1 757 RR4FA76TF
BS 758 758 RR4FA76JQ
BS 759 771 RR4FA76TF
BS 772 1188 RR4FA76JQ

RD RR4FA76TF 782 0 0
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AAAAGGAGAGATGCAGAGCAATGGATGTCTCACCGTATGTTGCCAGATGATCTGAGAAAA
CGTATCCGTAAATACGAACAGTATAAATGGCAAGAAACCAGAGGAGTTGAAGAAGAAGCT
CTTCTCTCTAGTCTTCCAAAAGATCTCAGAAAAGACATTAAACGCCATCTTTGTTTGAAT
CTCCTCAAAAAGGTGCCGTGGTTTAAAGCCATGGATGACCGGCTACTAGACGCACTTTGT
GCACGTTTGAATACAGTTCTTTACACGGAGAACAGTTACATTGTGCGTGAAGGCGAACCG
GTTGAGGATATGGTATTTATAATGAGAGGAAACCTTACAAGTACAACTACTTATGGTGGC
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ACTTGGGCACTGGATCCTAACACTTCTCACTTGCCTATCTCTACTAGAACCGTTCAAGCT
CAGACAGAAGTCGAAGGCTTTGTCCTCTCTGCTGAGGATCTCAAATTTTTCTCTACACAG
TACCGTCGCCTCCATAGCAAGCAACTACGACACACGTACAGGTGTTATTCAGTGCAGTGG
CAGACATGGGCAGCATGTTTCATACAAGCAGCATGGA*GAGATACTGTAGA
GAGCTCTCAAG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4FA76JQ 730 0 0
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TGATTTCTGTGGAGATCTTCTCACTTGGGCACTGGATCCTAACACTTCTCACTTGCCTAT
CTCTACTAGAACCGTTCAAGCTCAGACAGAAGTCGAAGGCTTTGTCCTCTCTGCTGAGGA
TCTCAAATTTTTCTCTACACAGTACCGTCGCCTCCATAGCAAGCAACTACGACACACGTA
CAGGTGTTATTCAGTGCAGTGGCAGACATGGGCAGCATGTTTCATACAAGCAGCATGGAA
GAGATACTGTAGAAGGAAGCTCTCAAGGGCTTTACGTGAAGAAGAAGAAAGACTACAATA
CTCTCTTCAGACAGATGATTCATCAGGAGGCAATAAACTTAACTTAGGTGCTGCGATTTA
TGCGTCGAGGTTTGCTTCTCATGCTCTGAGGAATGTAAGGGCGAATGCAGCAGCACGCAA
CTCTATGCTTCCTCATATGTTATCTTTGTTGCCTCAGAAGCCAGCTGATCCTGAGTTTCC
TATGGATGAAACCTAATCTTGTGTACATATTAGAAATAAGGAATGTCCGTAGTGGTTTCA
AATAATTATGTAAAACAGTTTCTTTATTGTGCCTACAATGCATTTATTTGCACATATATG
GTCCATTTAATTTGTTGTCAATGTTTTTTGTTAGCTTTTAGGGCTCAATATATATTGTGT
GGGCATAGAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6646Contig1 673 2 5 U
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CTTGTGGCAATCATCGTATACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAGTTTGATTACATA
AACCCATACGACTCAGCGTCGAGGATAAACTATGTGGTGTTACCGGAGTTCATTATTCAA
GGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTTACAGGACACTGGTTCATGGCAATCCTCTGTCTC
CCTTATATGTACTACAACTTCCAACTTTACTGGAAGCGACAACACTTGGTAGATGTGACG
GAGATATTCAACCTGCTAAACTGGGAGAAGAAGAAGCGTCTGTTCAAGCTTGCTTACATA
ATACTTAACCTCTTTTCTCACTATCTTCTGGATGATATATTCAGCGTTGGATGATTATGA
GGACTGATTGACAAGACGTCATCCATCCCATCTGATTGACACACCCGCTGCTCAAAGATA
ACAGCCTCCTCCTGCTCGTCGTCCTCGTGGACACCATGGAAAAGAATGAAAGGACTAATT
GTATTTGCTTTTACGTGTTTGATGATGCATGTTTGTAAGATTAGTGGCAGAAAGATTTGT
GTTATTATATATGTCATTGATGTTTCAACTGTCTGTTATGTCTGATGATTAATTGTAAAA
ACTAATTTAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO68TF U 338
AF RR4CO68JQ C 1
BS 1 337 RR4CO68JQ
BS 338 602 RR4CO68TF
BS 603 603 RR4CO68JQ
BS 604 659 RR4CO68TF
BS 660 673 RR4CO68JQ

RD RR4CO68TF 322 0 0
GTCTGTTCAAGCTTGCTTACATAATACTTAACCTCTTTTCTCACTATCTTCTGGATGATA
TATTCAGCGTTGGATGATTATGAGGACTGATTGACAAGACGTCATCCATCCCATCTGATT
GACACACCCGCTGCTCAAAGATAACAGCCTCCTCCTGCTCGTCGTCCTCGTGGACACCAT
GGAAAAGAATGAAAGGACTAATTGTATTTGCTTTTACGTGTTTGATGATGCATGTTTGTA
AGATTAGTGGCAGAAAGATTTGTGT*ATTATATATGTCATTGATGTTTCAACTGTCTGTT
ATGTCTGATGATTAATTGTAAA

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR4CO68JQ 673 0 0
AAGGAGGGGAAGATGGGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCTCATCGCT
CTTGTGGCAATCATCGTATACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAGTTTGATTACATA
AACCCATACGACTCAGCGTCGAGGATAAACTATGTGGTGTTACCGGAGTTCATTATTCAA
GGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTTACAGGACACTGGTTCATGGCAATCCTCTGTCTC
CCTTATATGTACTACAACTTCCAACTTTACTGGAAGCGACAACACTTGGTAGATGTGACG
GAGATATTCAACCTGCTAAACTGGGAGAAGAAGAAGCGTCTGTTCAAGCTTGCTTACATA
ATACTTAACCTCTTT*CTCACTATCTTCTGGATGATATATTCAGCGTTGGATGATTATGA
GGACTGATTGACAAGACGTCATCCATCC*ATCTGATTGACACACCCGCTGCTCAAAGATA
ACAGCCTCCTCCTGCTCGTCGTCCTCGTGGACACCATGGAAAAGAATGAAAGGACTAATT
GTATTTGCTTTTACGTGTTTGATGATGCATGTTTGTAAGATTAGTGGCAGAAAGATTTGT
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ACTAATTTAAGCT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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TATCGATGATTCAACAACGTTAGGATTTGGATAATTTGAGAGAATCATCAAATCTCTCTT
TCTTTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EL05JQ C 1
AF RR4EL05TF U 1
BS 1 307 RR4EL05TF

RD RR4EL05JQ 307 0 0
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CGGCGGCTCCAGAGAGTACCAGTTGTTAACAATGGGGTTCCCTCCTAAACAGTTGACAGA
CTTGGACCAAACCATCGAGCAAGCCGGTATAGCTAACTCGGTCGTCATCCAGAAGTTCTA
ATAGCTTTATTCAGATTTTAAGACCCATTCAGTTTTTTTTTCTAAGTGTTTGAGAACCTT
TATCGATGATTCAACAACGTTAGGATTTGGATAATTTGAGAGAATCATCAAATCTCTCTT
TCTTTTT

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR4EL05TF 307 0 0
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CGGCGGCTCCAGAGAGTACCAGTTGTTAACAATGGGGTTCCCTCCTAAACAGTTGACAGA
CTTGGACCAAACCATCGAGCAAGCCGGTATAGCTAACTCGGTCGTCATCCAGAAGTTCTA
ATAGCTTTATTCAGATTTTAAGACCCATTCAGTTTTTTTTTCTAAGTGTTTGAGAACCTT
TATCGATGATTCAACAACGTTAGGATTTGGATAATTTGAGAGAATCATCAAATCTCTCTT
TCTTTTT

QA 1 307 1 307
DS 



AS 1 2

CO CL6648Contig1 1008 2 8 U
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TCCTCCGTCGCTGGATCGCTCGTCGAAGAAGAAGATGTATCTCTCTCTCGCTGATGATCC
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TTACATGTTGTCTGCGATGGATTTGAAGATCACATGGAGTGATTCTCCTGCGTATTGGCA
ATGGGTTACAGTTCCTGAATCTAAGTTTGAGAAAGTAGCAGAGCTTTGTAACGTGTGTTG
GTTCGAGATTCGAGGCAAGATAAGTGTTGGAATGCTGTCTAAGGGGACGCATTACTCTGT
TTACTTAGTGTTCAAGAGAGCGAGTAGTAGATCATACGGTTTCGACCACACGCCCATCGA
AACTGAAGTTGGGTTTGCCGGGAAGGAGGCTAAGAAGACGTTTTGTTTTCTCGAACCGAG
CGATACGGATCCTCGCAGCGGGTATGGTTACTCGGGTGTTTCGTTAGCAGCGGTGTCTAG
AGCGTTTAGGACGAGGCGTCCGTGGATGAGGTTTCCGAGGGAAGAAGTTGAAGGAGAGAG
GGAGAGCGGTGGGAACGTGGAGGAGCCCAAGGAGAGAGGTGATAAGTGGAGTGAAGTGAA
GCTTGGGAGTTTTTACATTAACGATGGAGGTTGTGATGATGGTGATGAGGTTGAGATTGC
TATCATGGAGACTCAGATGGGACAATGGAAGAGTGGTCTGGTTTTCCAGGGGATTGAGAT
AAGGCCTGTGAAAGAAGAAGTAACTAAATGATCAAAATCAAGATAATGCTGTGTTCTTTG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F117TF U 1
AF RR4F117JQ C 446
BS 1 673 RR4F117TF
BS 674 674 RR4F117JQ
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RD RR4F117TF 772 0 0
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TCCTCCGTCGCTGGATCGCTCGTCGAAGAAGAAGATGTATCTCTCTCTCGCTGATGATCC
CGTCCTAATCGATGAGGGCAAAAAGAGCTTTTGGTTGGAGAAAGCTAGTGGGAAGAAGTG
TTACATGTTGTCTGCGATGGATTTGAAGATCACATGGAGTGATTCTCCTGCGTATTGGCA
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AGGGAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4F117JQ 563 0 0
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GGTTACTCGGGTGTTTCGTTAGCAGCGGTGTCTAGAGCGTTTAGGACGAGGCGTCCGTGG
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CCCAAGGAGAGAGGTGATAAGTGGAGTGAAGTGAAGCTTGGGAGTTTTTACATTAACGAT
GGAGGTTGTGATGATGGTGATGAGGTTGAGATTGCTATCATGGAGACTCAGATGGGACAA
TGGAAGAGTGGTCTGGTTTTCCAGGGGATTGAGATAAGGCCTGTGAAAGAAGAAGTAACT
AAATGATCAAAATCAAGATAATGCTGTGTTCTTTGGAAGTATGAACAGAGTTTAAAGCTT
GTGTACTACTACTAATACTACAGCTTTTGGTATTCCATGTCTCGAGTTTAACAGTTTGAG
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AATGACAATAATTTAATTTGACG

QA 1 563 1 563
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAAAACGATTACTTAGCTGCTGAAGATGCAAGAGATGTGAGCGTAGTAGCAGTGAGTGAC
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ATGGAGGCGTTGCAGTATCAGAGAATGATGGAGGAGCAAGCCGAGTATGACCAAAGCCTT
GCAGCTGTTGAATCATCTGATGGTTAAACGAGAGAAAGAGAAGGAAGAGCTTCAGAGAGA
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AAGATAACATTGGACTTTGTAACGCACATGGGGATGCTTGATGAGTCTTTTTCAGAGCTT
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TGGTTCGGAAAGCGAGAAGCTAGAGATCATCAAACAAGTTGATAGTGTATATGAGAGGCT
ACAGGTGCTTGAAACAGATGGAGAGTTTATGAAGAGCTGTATGAGTTCGGCTAAGGATGG
TGACAAAGGAACGGATTTTTTTCAAGATATATTGCAGCATCTTCGTGATTTCAGAAACAT
TGAACTCACTGCTGACACAATCGACAACCAGAAGACGCATGAGGAATGAAGTTCAGTTAT
ACAAGACTTTGTTACCATTATTCAGACAGGTTTCAAGAACAGGAATCAATGTCTTGCTAC
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GTCTTTTTGTTTTTGTTTGGAGTAAACAAAAAGGTTTCACTTTAGTCTTTGGAGTTGGAC
CTGTCATGTAAATTGTTTGTGTTTCCTTTAGTTTTGAAGTTAAGTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B528TF U 1
AF RR4B528JQ C 373
BS 1 444 RR4B528TF
BS 445 445 RR4B528JQ
BS 446 556 RR4B528TF
BS 557 1247 RR4B528JQ

RD RR4B528TF 562 0 0
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ACCGACGGGGACGACCCTATAAGGACAATCGAACGTCTGAGAGAGACAGCGAGATCAGAA
CAAGAAGCGCTGAGAGGTTTATACGCAGAGCTGGAAGAAGAGAGAAGCGCGTCTGCGATA
GCAGCTAACCAGACAATGGCGATGATCACGAGGCTGCAAGAGGAGAAAGCGAAAGTTCAG
ATGGAGGCGTTGCAGTATCAGAGAATGATGGAGGAGCAAGCCGAGTATGACCAAAGCCTT
GCAGCTGTTGAATCATCTGATGGTTAAACGAGAGAAAGAGAAGGAAGAGCTTCAGAGAGA
GCTTGATGTTTGCAAGACCAAGTTTTGCAGTATGAGAAGAACAAACCCAAATGCGGGTCT
GATGATGGTGATGATAAGAAAGAG*AGGATAACTGTTCTGAGACGGATGTGGACTTGGAG
AAGATAACATTGGACTTTGTAACGCACATGGGGATGCTTGATGAGTCTTTTTCAGAGCTT
GGAAGAGAGGTTAGTG
GATTTT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4B528JQ 875 0 0
AAGACCAAG
GTTTTGCAGTATGAGAAGAACAAACCCAAATGCGGGTCTGATGATGGTGATGATAAGAAG
GAGGAGGATAACTGTTCTGAGACGGATGTGGACTTGGAGAAGATAACATTGGACTTTGTA
ACGCACATGGGGATGCTTGATGAGTCTTTTTCAGAGCTTGGAAGAGAGGTTAGTGATTTT
GGATCAGCTCAAGGTGTTAGAGGACAGGCTACTAACAATGCAAGACAAAGAATCAGCAGG
AGAGTTCAGCAATAGTTACGAAGGAGAGAGCTATGAACACGAAGGAGGACTAACAATGGC
ATCAATGGCGAAGAGTCTGCTTCCTCTTCTAGACGCTGCAGGGAACGAATCAGAAGATGA
TGAGTACCAAGAGCAACGTGAATCAGTTGGAAAGAGTGTTGGTTCGGAAAGCGAGAAGCT
AGAGATCATCAAACAAGTTGATAGTGTATATGAGAGGCTACAGGTGCTTGAAACAGATGG
AGAGTTTATGAAGAGCTGTATGAGTTCGGCTAAGGATGGTGACAAAGGAACGGATTTTTT
TCAAGATATATTGCAGCATCTTCGTGATTTCAGAAACATTGAACTCACTGCTGACACAAT
CGACAACCAGAAGACGCATGAGGAATGAAGTTCAGTTATACAAGACTTTGTTACCATTAT
TCAGACAGGTTTCAAGAACAGGAATCAATGTCTTGCTACAGTGCTCAATGGAGGAGGATT
TGAGAGTTATAGAAATTTTTAGATGTGTTCTTATGTTGTGTCTTTTTGTTTTTGTTTGGA
GTAAACAAAAAGGTTTCACTTTAGTCTTTGGAGTTGGACCTGTCATGTAAATTGTTTGTG
TTTCCTTTAGTTTTGAAGTTAAGTTG

QA 10 875 10 875
DS 



AS 1 2

CO CL6651Contig1 1136 2 10 U
GGGAAGCCTTCACTTGACAGCGTCTCGTCTGATAAACCCTAACCCCATCTCCTCTTCTCT
CCTCCATCTTCTCCCTCTCTGCTCCATCAACGCTTCTCCTCGGCGCTCCATTCCTCCCCT
CCGCCGCCGAAACGCACTGACTCCTTTCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTTGTACATTCCAAT
GGCTGGAGGAGATGACCAGGTTCATTTGCTGGAGAATCAGTTCGAGAGCTTCCGTGCTCA
GCTTGAAGAGTCTGCAGCTTTGAGAGAGCAGATTCGTGCTGTGGTTATGGAGATTGAGTC
CGCCACCAGGCTCATTCAAGCTAACCTCCTCCTCGTTCACCAGTCTCGACCCATTCCTGA
GATTATCGAGAAAGCTAAGGAAAAGATGAATGATTTGAAGAAGTTTTACGGTCGGCTTGC
TGAGATCCTTCAGAAGTGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGGGACTGGAGGAGTGA
GACACAGGCAGTGGTATCTCAGCCCGCTTTTATGCACTGGCTAGAAACTGGAACTCTTCT
TGTGCATACCGAAGCTGAAGCTAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGAC
GGAAGATTATCTGACTGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTTGTGAA
CAGAGTAACAGCAGGTGACTATGACTGTCCAAGAAAGGTGATGAACTTCTTGACGGATCT
TCATGCTGCCTTCCGCATGCTCAACCTCAGGAACGATTTTCTGCGCAAGAAATTCGACAG
TATGAAATATGACCTAAGAAGAGTGGAAGAAGTATACTATGATGTTAAGATCCGAGGTTT
GATTTCTGGTGGAGATCCTCCTCCTCCTCAAGTCCAAGACCAATCCTAAATTAGGAGTCT
TTCACTCTCGTTTGCTCTTTGCAACTTTGTTTAGCTAATCATGAAACAGCAAGGAGTGTT
TTTCTTTAAGACCTAAAACAGCAATGAGTTTGTTTCTGTAAAACTAAAACGGCAAGGAAT
AGGCAGATCATTTTGGTTTCCTGAAACGACGAGTGTTTTTATTTATTCCGACTTTAGCGT
ACACTTGTGAATAGTGGGCCTTGTATGTAGCCCATGTTTATTATGTTCACTAGAGC


BQ
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AF RR4EB93TF U 1
AF RR4EB93JQ C 432
BS 1 674 RR4EB93TF
BS 675 675 RR4EB93JQ
BS 676 697 RR4EB93TF
BS 698 698 RR4EB93JQ
BS 699 743 RR4EB93TF
BS 744 744 RR4EB93JQ
BS 745 750 RR4EB93TF
BS 751 751 RR4EB93JQ
BS 752 762 RR4EB93TF
BS 763 1136 RR4EB93JQ

RD RR4EB93TF 762 0 0
GGGAAGCCTTCACTTGACAGCGTCTCGTCTGATAAACCCTAACCCCATCTCCTCTTCTCT
CCTCCATCTTCTCCCTCTCTGCTCCATCAACGCTTCTCCTCGGCGCTCCATTCCTCCCCT
CCGCCGCCGAAACGCACTGACTCCTTTCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTTGTACATTCCAAT
GGCTGGAGGAGATGACCAGGTTCATTTGCTGGAGAATCAGTTCGAGAGCTTCCGTGCTCA
GCTTGAAGAGTCTGCAGCTTTGAGAGAGCAGATTCGTGCTGTGGTTATGGAGATTGAGTC
CGCCACCAGGCTCATTCAAGCTAACCTCCTCCTCGTTCACCAGTCTCGACCCATTCCTGA
GATTATCGAGAAAGCTAAGGAAAAGATGAATGATTTGAAGAAGTTTTACGGTCGGCTTGC
TGAGATCCTTCAGAAGTGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGGGACTGGAGGAGTGA
GACACAGGCAGTGGTATCTCAGCCCGCTTTTATGCACTGGCTAGAAACTGGAACTCTTCT
TGTGCATACCGAAGCTGAAGCTAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGAC
GGAAGATTATCTGACTGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTTGTGAA
CAGAGTAACAGCAG*TGACTATGACTGTCCAAGAAAG*TGATGAACTTCTTGACGGATCT
TCATGCTGCCTTCCGCATGCTCA*CCTCAG*AACGATTTTCT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4EB93JQ 705 0 0
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TGGTATCTCAGCCCGCTTTTATGCACTGGCTAGAAACTGGAACTCTTCTTGTGCATACCG
AAGCTGAAGCTAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAAGATTATC
TGACTGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTTGTGAACAGAGTAACAG
CAGGTGACTATGACTGTCCAAGAAAGGTGATGAACTTCTTGACGGATCTTCATGCTGCCT
TCCGCATGCTCAACCTCAGGAACGATTTTCTGCGCAAGAAATTCGACAGTATGAAATATG
ACCTAAGAAGAGTGGAAGAAGTATACTATGATGTTAAGATCCGAGGTTTGATTTCTGGTG
GAGATCCTCCTCCTCCTCAAGTCCAAGACCAATCCTAAATTAGGAGTCTTTCACTCTCGT
TTGCTCTTTGCAACTTTGTTTAGCTAATCATGAAACAGCAAGGAGTGTTTTTCTTTAAGA
CCTAAAACAGCAATGAGTTTGTTTCTGTAAAACTAAAACGGCAAGGAATAGGCAGATCAT
TTTGGTTTCCTGAAACGACGAGTGTTTTTATTTATTCCGACTTTAGCGTACACTTGTGAA
TAGTGGGCCTTGTATGTAGCCCATGTTTATTATGTTCACTAGAGC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6652Contig1 1130 2 4 U
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ATCGATCTAGGGTTTCTGATTGAACAGGCGAGTAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAC
AGAATCCGCTACAATGGGAGGTGAAGGAGAAGATCTAGAGCCGCTCTTCGATTATCACCG
TGTTCAGCCGTCGAATTTCGTTTGCATTGACGACGATGATGATGATGATTCTGATGTCTC
CGAGGTGGTTCCGGTCAAGAAGAGAGCAAAAGTTTCCCACACAGTAATGATTCATCTTTT
TATGATTTTATTTATTTACTTTCTTACTCAGCTGTAACTCCTTCTTTTGATTTGTTTGAT
TTGCTTTAATATATAAAATAGGTAGTAAAGAAGGATGAAGAAGTGAAAGTGATTGAAGTG
GCGGGTGATGAAGATTGGTTGTTTCCACCGCCAAAGGTTGTCTTCGATAAAAGCAAAAAG
TCTGGTGAAGATTCCACCATTAAAGCTTTGAGATCGAAGAAGATGGAGCTCATATCATTC
ACAAAAAACGTAGTGGATGTGATGCAGGAAGCAGAGGAGTCTGCTAAAAAGGAAGCTCAA
GTATTATCACTCAAACCATCTTCAGAAGCTGCTGCTGCTCAGGAACCACCAGGTCCGCCT
GTTAATGACAGGGCCAAGATTGTCATTACGATACAGGACAAAGCTGGACAGAAGCAGTTC
CGGGTGTTTGCGGACGAGAAGTTTGAACGGGTTTTCAAAATGTATACTGACAAAGTAAAG
CTCGACCCGCAAAATCTTGTATTTACTTTTGACGGTGACAAGATTGATCCATCGACCACT
CCTTCTAACCTCGAGATGGAGGACGGTGATATGATTGAAGTACACACCAAAAAGAGATGA
CAGAACAGGTTTTTAGCGGAAGTGAACGCTTGTCTGCTGCCAAATCTGGAATGTCAATCC
GGTCATCTTCACCAGAGCTTGTACATCAACATGGGACGTGGAAGGGATTTCTGCTAAAGA
CATTGGTCTTGTATCTGTGACCTTTTCTCATTTGTTTTCTGAATTCTTCTCTTTCATCGG
TTAGATTCGGCATATTTTGTTTCTTACGAGTGTTCTGTATATAGCTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BZ59TF U 1
AF RR4BZ59JQ C 346
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RD RR4BZ59TF 667 0 0
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TGTTCAGCCGTCGAATTTCGTTTGCATTGACGACGATGATGATGATGATTCTGATGTCTC
CGAGGTGGTTCCGGTCAAGAAGAGAGCAAAAGTTTCCCACACAGTAATGATTCATCTTTT
TATGATTTTATTTATTTACTTTCTTACTCAGCTGTAACTCCTTCTTTTGATTTGTTTGAT
TTGCTTTAATATATAAAATAGGTAGTAAAGAAGGATGAAGAAGTGAAAGTGATTGAAGTG
GCGGGTGATGAAGATTGGTTGTTTCCACCGCCAAAGGTTGTCTTCGATAAAAGCAAAAAG
TCTGGTGAAGATTCCACCATTAAAGCTTTGAGATCGAAGAAGATGGAGCTCATATCATTC
ACAAAAAACGTAGTGGATGTGATGCAGGAAGCAGAGGAGTCTGCTAAAAAGGAAGCTCAA
GTATTATCACTCAAACCATCTTCAGAAGCTGCTGCTGCTCAG*AACCACCAGGTCCGCCT
GTTAATG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BZ59JQ 785 0 0
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AAAGTGAT*GAAGTGGCGGGTGATGAAGATTGGTTGTTTCCACCGCCAAAGGTTGTCTTC
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GAGCTCATATCATTCACAAAAAACGTAGTGGATGTGATGCAGGAAGCAGAGGAGTCTGCT
AAAAAGGAAGCTCAAGTATTATCACTCAAACCATCTTCAGAAGCTGCTGCTGCTCAGGAA
CCACCAGGTCCGCCTGTTAATGACAGGGCCAAGATTGTCATTACGATACAGGACAAAGCT
GGACAGAAGCAGTTCCGGGTGTTTGCGGACGAGAAGTTTGAACGGGTTTTCAAAATGTAT
ACTGACAAAGTAAAGCTCGACCCGCAAAATCTTGTATTTACTTTTGACGGTGACAAGATT
GATCCATCGACCACTCCTTCTAACCTCGAGATGGAGGACGGTGATATGATTGAAGTACAC
ACCAAAAAGAGATGACAGAACAGGTTTTTAGCGGAAGTGAACGCTTGTCTGCTGCCAAAT
CTGGAATGTCAATCCGGTCATCTTCACCAGAGCTTGTACATCAACATGGGACGTGGAAGG
GATTTCTGCTAAAGACATTGGTCTTGTATCTGTGACCTTTTCTCATTTGTTTTCTGAATT
CTTCTCTTTCATCGGTTAGATTCGGCATATTTTGTTTCTTACGAGTGTTCTGTATATAGC
TAAAC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

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TGAGCCAGTGTCTCTTCAACTTTGAACTATCAAGAAATTTCTGTTACAGAACACACAAGA
CGAAGGTTGTGTTATTATACTAACGTTTAAGGTATAACGTTAAAGGTATACATACTACCT
TGTCGCAACCAGGGTAATCACAAACATACTGCCTTTCACCATGGATGTGGGAATGCTTGC
GCAAGGCACTAACATCAAAGAACATCTTTCCACAACCCTCGTAACTGCATAGAAACAGAA
TCTCAGAAGTAGGTTCGGGCTCAGGGTCTGGAACATCAGTGGTAGGCTCTTTCTCTGTTT
CTTTCAGTCTCTTCACCGTTTCCTCTGTTTAAGAGCAGACACTGACATGAATAATCACCA
ATCTGAAAGTAGATCAAGTATCGAAACCGACAGATCTCCTTTACCTGTGACCCATTTGTG
AAGATAACACTTTCCACCTGTAGCAACAATATCTTGTGGAACCCTGAAGAAAGGACAAGA
ATGCATGTAAGGCCCTAATCAACAAGGAAGAGAGTAGATTTTCGAATTTTTTACCACTCC
TTGATCCACTTAACAGCAGGAGACTTGGATTCACGATTGGGCGTCTTTCGAACGGATTTT
GATAAGGATACTGTTCCATCTATTCGAATTGGTGATGATTAGGGTTTACAGTCTCTCTCT
CTGGGGAAGAGAACCGATAGACATCAGCTATTATACCTTTTTGCTAACGGAGCCCCGGTT
TCGATTCCTTCTCTCCTCTTTCCAAGTCCAACTCGTAAAATAGGAAAATCAAGGGTGTTG
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4FP04TF U 1
AF RR4FP04JQ C 477
BS 1 732 RR4FP04TF
BS 733 733 RR4FP04JQ
BS 734 761 RR4FP04TF
BS 762 762 RR4FP04JQ
BS 763 766 RR4FP04TF
BS 767 767 RR4FP04JQ
BS 768 775 RR4FP04TF
BS 776 776 RR4FP04JQ
BS 777 808 RR4FP04TF
BS 809 843 RR4FP04JQ

RD RR4FP04TF 811 0 0
GATACAGAACCTTTCCACAGCCTTCATAAGTGCAAACAAAGTCCCTAGCCCCAGTATGAA
TGAGCCAGTGTCTCTTCAACTTTGAACTATCAAGAAATTTCTGTTACAGAACACACAAGA
CGAAGGTTGTGTTATTATACTAACGTTTAAGGTATAACGTTAAAGGTATACATACTACCT
TGTCGCAACCAGGGTAATCACAAACATACTGCCTTTCACCATGGATGTGGGAATGCTTGC
GCAAGGCACTAACATCAAAGAACATCTTTCCACAACCCTCGTAACTGCATAGAAACAGAA
TCTCAGAAGTAGGTTCGGGCTCAGGGTCTGGAACATCAGTGGTAGGCTCTTTCTCTGTTT
CTTTCAGTCTCTTCACCGTTTCCTCTGTTTAAGAGCAGACACTGACATGAATAATCACCA
ATCTGAAAGTAGATCAAGTATCGAAACCGACAGATCTCCTTTACCTGTGACCCATTTGTG
AAGATAACACTTTCCACCTGTAGCAACAATATCTTGTGGAACCCTGAAGAAAGGACAAGA
ATGCATGTAAGGCCCTAATCAACAAGGAAGAGAGTAGATTTTCGAATTTTTTACCACTCC
TTGATCCACTTAACAGCAGGAGACTTGGATTCACGATTGGGCGTCTTTCGAACGGATTTT
GATAAGGATACTGTTCCATCTATTCGAATTGGTGATGATTAGGGTTTACAGTCTCTCTCT
CTGGGGAAGAGA*CCGATAGACATCAGCTATTATACCTTTT*GCTA*CGGAGCCC*GGTT
TCGATTCCTTCTCTCCTCTTTCCAAGTC
AAC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4FP04JQ 367 0 0
TGTGAAGATAACACTTTCCACCTGTAGCAACAATATCTTGTGGAACCCTGAAGAAAGGAC
AAGAATGCATGTAAGGCCCTAATCAACAAGGAAGAGAGTAGATTTTCGAATTTTTTACCA
CTCCTTGATCCACTTAACAGCAGGAGACTTGGATTCACGATTGGGCGTCTTTCGAACGGA
TTTTGATAAGGATACTGTTCCATCTATTCGAATTGGTGATGATTAGGGTTTACAGTCTCT
CTCTCTGGGGAAGAGAACCGATAGACATCAGCTATTATACCTTTTTGCTAACGGAGCCCC
GGTTTCGATTCCTTCTCTCCTCTTTCCAAGTCCAACTCGTAAAATAGGAAAATCAAGGGT
GTTGCCC

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 2

CO CL6654Contig1 1189 2 2 U
GGGTCGCCTCTTTCGAATAAACCCCCCAACAACAGACTCTCACTCCTCAAAACCCTAAAA
CCATGGCTGACGGACTCGTCTTGAAAGGCACCATGTGCGCCCACACCGACATGGTCACCG
CCATCGCCACCCCCGTCGACAACTCAGACATGATCGTCACCTCTTCCCGCGACAAGTCCA
TCATCCTCTGGAAACTCAACAGGGACGAGAAATCATCCTACGGCGTCGCTCAGCGCCGCC
TCACCGGTCACTCTCACTTCGTGGAAGACGTCGTTCTCTCCTCCGACGGACAGTTCGCTC
TCTCCGGCAGCTGGGACGGCGAGCTTCGTCTCTGGGATCTCGCCACGGGCGAGTCCAGCC
GACGTTTCGTGGTGCACAAGAAAGACGTTCTCTCTGTAGCCTTCTCCACTGATAACCGTC
AGATCGTGTCCGCTTCTCGCGACGGTACGATCAAGCTCTGGAACACGCTCGGAGAGTGCA
AGTACACGATCTCCGACGAAGGTGAGGGACACAAGCAATGGGTAAGCTGTGTTAGGTTTA
GCCCCAACACGCTTGTGCCTACCATTGTGTCTGCTTCTTGGGATCACACCGTGAAGGTTT
GGAATCTCTCCAACTGTAAGCTTAGGAACACTCTCGCTGGCCACTCTGGGTACCTGAACA
CTGTGGCTGTTTCGCCTGATGGTTCCTTGTGTGCTAGTGGTGGGAAAGATGGTGCGATCT
TGCTTTGGGATTTGGCTGAAGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCTGGCTCTATTATTC
ACTCTCTTTGCTTCAGTCCCAATAGGTACTGGTTGTGTGCGGCGACTGAGAATAGTATTA
GGATATGGGATCTTGAGAGCAAGAGTGTTGTTGAAGATTTGAAGGTTGATCTTAAGGCTG
AGGCTGAGAAGTCTGATGTTTCTGCTGGAACCGGAAACAAGACAAAGGTGATCTACTGCA
CAAGCTTGAACTGGAGTGCAGATGGAAACACATTGTTCAGTGGATACACAGATGGAGTCA
TCAGGGTTTGGGGTATTGGTCGTTTTTAGAGAGAAGACTGGAATCAATTCCCTAAAAATT
TTCTTTATTCTCTCAAATTTTTCGATAGGCTCTTCTGTGTCGGTGTTTTGATACTGAATT
TTTTTTCTCTATTTCCAGAACCACTCATAAATCATATGATGGTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP54TF U 1
AF RR4EP54JQ C 423
BS 1 736 RR4EP54TF
BS 737 1189 RR4EP54JQ

RD RR4EP54TF 736 0 0
GGGTCGCCTCTTTCGAATAAACCCCCCAACAACAGACTCTCACTCCTCAAAACCCTAAAA
CCATGGCTGACGGACTCGTCTTGAAAGGCACCATGTGCGCCCACACCGACATGGTCACCG
CCATCGCCACCCCCGTCGACAACTCAGACATGATCGTCACCTCTTCCCGCGACAAGTCCA
TCATCCTCTGGAAACTCAACAGGGACGAGAAATCATCCTACGGCGTCGCTCAGCGCCGCC
TCACCGGTCACTCTCACTTCGTGGAAGACGTCGTTCTCTCCTCCGACGGACAGTTCGCTC
TCTCCGGCAGCTGGGACGGCGAGCTTCGTCTCTGGGATCTCGCCACGGGCGAGTCCAGCC
GACGTTTCGTGGTGCACAAGAAAGACGTTCTCTCTGTAGCCTTCTCCACTGATAACCGTC
AGATCGTGTCCGCTTCTCGCGACGGTACGATCAAGCTCTGGAACACGCTCGGAGAGTGCA
AGTACACGATCTCCGACGAAGGTGAGGGACACAAGCAATGGGTAAGCTGTGTTAGGTTTA
GCCCCAACACGCTTGTGCCTACCATTGTGTCTGCTTCTTGGGATCACACCGTGAAGGTTT
GGAATCTCTCCAACTGTAAGCTTAGGAACACTCTCGCTGGCCACTCTGGGTACCTGAACA
CTGTGGCTGTTTCGCCTGATGGTTCCTTGTGTGCTAGTGGTGGGAAAGATGGTGCGATCT
TGCTTTGGGATTTGGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4EP54JQ 767 0 0
ATCGTGTCCGCTTCTCGCGACGGTACGATCAAGCTCTGGAACACGCTCGGAGAGTGCAAG
TACACGATCTCCGACGAAGGTGAGGGACACAAGCAATGGGTAAGCTGTGTTAGGTTTAGC
CCCAACACGCTTGTGCCTACCATTGTGTCTGCTTCTTGGGATCACACCGTGAAGGTTTGG
AATCTCTCCAACTGTAAGCTTAGGAACACTCTCGCTGGCCACTCTGGGTACCTGAACACT
GTGGCTGTTTCGCCTGATGGTTCCTTGTGTGCTAGTGGTGGGAAAGATGGTGCGATCTTG
CTTTGGGATTTGGCTGAAGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCTGGCTCTATTATTCAC
TCTCTTTGCTTCAGTCCCAATAGGTACTGGTTGTGTGCGGCGACTGAGAATAGTATTAGG
ATATGGGATCTTGAGAGCAAGAGTGTTGTTGAAGATTTGAAGGTTGATCTTAAGGCTGAG
GCTGAGAAGTCTGATGTTTCTGCTGGAACCGGAAACAAGACAAAGGTGATCTACTGCACA
AGCTTGAACTGGAGTGCAGATGGAAACACATTGTTCAGTGGATACACAGATGGAGTCATC
AGGGTTTGGGGTATTGGTCGTTTTTAGAGAGAAGACTGGAATCAATTCCCTAAAAATTTT
CTTTATTCTCTCAAATTTTTCGATAGGCTCTTCTGTGTCGGTGTTTTGATACTGAATTTT
TTTTCTCTATTTCCAGAACCACTCATAAATCATATGATGGTTGATCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL6655Contig1 362 2 2 U
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TAATTTCAATTGACAATTATGGAGTCACAACTCCTACACACTTAGAAGTAAAAATAAGAA
ATAAAACGGAAAAGTGGGTTTGTCCTCAAAGTTATGAACATAAAACCACTATTTTATTAT
TTGGAAAAAAAAAATAGAAATGTGCGCTTCTCCTCCTCATCAACATCCTCCACCAAGTCG
TCATCATCATCATCACTATCGCTCTCATCATCACCATCATCATCTTCATTATCATCGCTT
CCTGCTCCACCATTGGGCGCTGGGTCATCCTCTGGATCAGCTTCCTCCTCCCCTTCATCC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4EV11TF C 1
AF RR4EV11JQ U 43
BS 1 42 RR4EV11TF
BS 43 362 RR4EV11JQ

RD RR4EV11TF 362 0 0
CGCAACACAAAATTTCTTATTATTTGCTTTTATACTAGTAAGAACACAAGAACAATGTTT
TAATTTCAATTGACAATTATGGAGTCACAACTCCTACACACTTAGAAGTAAAAATAAGAA
ATAAAACGGAAAAGTGGGTTTGTCCTCAAAGTTATGAACATAAAACCACTATTTTATTAT
TTGGAGAAAAAAGATAGAAATGTGCGCTTCTCCTCCTCATCAACATCCTCCACCAAGTCG
TCATCATCATCATCACTATCGCTCTCATCATCACCATCATCATCTTCATTATCATCGCTT
CCTGCTCCACCATTGGGCGCTGGGTCATCCTCTGGATCAGCTTCCTCCTCCCCTTCATCC
CC

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR4EV11JQ 320 0 0
AACACAAGAACAATGTTTTAATTTCAATTGACAATTATGGAGTCACAACTCCTACACACT
TAGAAGTAAAAATAAGAAATAAAACGGAAAAGTGGGTTTGTCCTCAAAGTTATGAACATA
AAACCACTATTTTATTATTTGGAAAAAAAAAATAGAAATGTGCGCTTCTCCTCCTCATCA
ACATCCTCCACCAAGTCGTCATCATCATCATCACTATCGCTCTCATCATCACCATCATCA
TCTTCATTATCATCGCTTCCTGCTCCACCATTGGGCGCTGGGTCATCCTCTGGATCAGCT
TCCTCCTCCCCTTCATCCCC

QA 1 320 1 320
DS 



AS 1 2

CO CL6656Contig1 765 2 4 U
GGAGAAAGAGGAAGAAGAAGAATTATCGCCATCAAGCTTTAACGGCGATGACGACGACGT
CGACTATCTCTTCCTTCTTCTCCCTTTCTCTTCCTCAAGTCTTCACCATCCGTAACAACA
AACCCGCAAACCCTTCTCCTCCCTTCCTTTTCCCTCGGCTCAACTCGAGATTTCGACCCC
TCACTCTCACTGCTTCCGCCTCAGCTTCCCAACAGTTTCAGCGACGATGGCGGCGGCTTC
TCCCTCGACGATTTCGCACTCCATTCCGATTCTCGATCACCTAATAAGAAGTGGTTACTT
GCAGATCTAATCCAAGAGATTGAACCATTAGATGTGAGTCTGATTCAGAAAGATGTCCCA
CTCACTACTTTGGATGCTATGAAAAGAACAATCTCAGGAATGTTGGGTCTTCTTCCTTCT
GATAGGTTTCAAGTCCATATCGAATCTCTTTGGGACCCTCTGTCTAAGCTACTGGTCTCT
TCCATGATGACTGGGTATACATTGAGGAATGCAGAGTATCGGCTTTTTCTTGAAAAAAAC
CTTGACATGGATGATGAGGAGCTTGAAAGCCACGCTACTGTTGGAAATACGGAACCGGAT
GACGTTTCTGTTGAGAATAATGCTTCTTCATCCACAAAGGATAGCAACCTCTCTGAAATG
ATTGATAAAGAAAGTCTTGGCAGAGTATCCTCCGAAGCTCAGAATATATCTTCCGTCTGC
AGTCACAATGTCTTCTGTCAAAAGATTACAGAGTGAGACGAAAAA


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BM87TF U 1
AF RR4CG32TF U 1
BS 1 662 RR4BM87TF
BS 663 663 RR4CG32TF
BS 664 737 RR4BM87TF
BS 738 765 RR4CG32TF

RD RR4BM87TF 737 0 0
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AACCCGCAAACCCTTCTCCTCCCTTCCTTTTCCCTCGGCTCAACTCGAGATTTCGACCCC
TCACTCTCACTGCTTCCGCCTCAGCTTCCCAACAGTTTCAGCGACGATGGCGGCGGCTTC
TCCCTCGACGATTTCGCACTCCATTCCGATTCTCGATCACCTAATAAGAAGTGGTTACTT
GCAGATCTAATCCAAGAGATTGAACCATTAGATGTGAGTCTGATTCAGAAAGATGTCCCA
CTCACTACTTTGGATGCTATGAAAAGAACAATCTCAGGAATGTTGGGTCTTCTTCCTTCT
GATAGGTTTCAAGTCCATATCGAATCTCTTTGGGACCCTCTGTCTAAGCTACTGGTCTCT
TCCATGATGACTGGGTATACATTGAGGAATGCAGAGTATCGGCTTTTTCTTGAAAAAAAC
CTTGACATGGATGATGAGGAGCTTGAAAGCCACGCTACTGTTGGAAATACGGAACCGGAT
GACGTTTCTGTTGAGAATAATGCTTCTTCATCCACAAAGGATAGCAACCTCTCTGAAATG
AT*GATAAAGAAAGTCTTGGCAGAGTATCCTCCGAAGCTCAGAATATATCTTCCGTCTGC
AGTCACAATGTCTTCTG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4CG32TF 765 0 0
GGAGAAAGAGGAAGAAGAAGAATTATCGCCATCAAGCTTTAACGGCGATGACGACGACGT
CGACTATCTCTTCCTTCTTCTCCCTTTCTCTTCCTCAAGTCTTCACCATCCGTAACAACA
AACCCGCAAACCCTTCTCCTCCCTTCCTTTTCCCTCGGCTCAACTCGAGATTTCGACCCC
TCACTCTCACTGCTTCCGCCTCAGCTTCCCAACAGTTTCAGCGACGATGGCGGCGGCTTC
TCCCTCGACGATTTCGCACTCCATTCCGATTCTCGATCACCTAATAAGAAGTGGTTACTT
GCAGATCTAATCCAAGAGATTGAACCATTAGATGTGAGTCTGATTCAGAAAGATGTCCCA
CTCACTACTTTGGATGCTATGAAAAGAACAATCTCAGGAATGTTGGGTCTTCTTCCTTCT
GATAGGTTTCAAGTCCATATCGAATCTCTTTGGGACCCTCTGTCTAAGCTACTGGTCTCT
TCCATGATGACTGGGTATACATTGAGGAATGCAGAGTATCGGCTTTTTCTTGAAAAAAAC
CTTGACATGGATGATGAGGAGCTTGAAAGCCACGCTACTGTTGGAAATACGGAACCGGAT
GACGTTTCTGTTGAGAATAATGCTTCTTCATCCACAAAGGATAGCAACCTCTCTGAAATG
ATTGATAAAGAT*GTCTTGGCAGAGTATCCTCCGAAGCTCAGA*TATATCTTCCGTCTGC
AGTCACATTGTCTTCTGTCAAAAGATTACAGAGTGAGACGAAAAA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6657Contig1 325 2 2 U
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TGGATCCGAATGGTATCGTTGTGCTTCATCAGGCGGATATTGGAGAGTATTTGAGGGATG
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GCTTGTTGTTTTAAGTTTTTTTTTATTATGAGGATTAAGAGATATGTAACTGTTTCAAAA
AGATATGGAACTTGGTGTTGGATTT


BQ
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AF RR4CN57JQ C 1
AF RR4CN57TF U 12
BS 1 16 RR4CN57JQ
BS 17 325 RR4CN57TF

RD RR4CN57JQ 325 0 0
GAGGGTTGGGGAGGATTACTGATAGCATTGTCCCTGGGGATGGGGTTGTCGTGTTCTCGA
TGTCTGATGTTCCGTTGGGGTTTGGGATCGCGGCGAAGAGTACGCAGGATTGTCGGAAGT
TGGATCCGAATGGTATCGTTGTGCTTCATCAGGCGGATATTGGAGAGTATTTGAGGGATG
AAGACGAGCTTTGAGACAGCAGAAAGGTTTTGTCTTTATGAGGATCTTGGCTTTGGTTCT
GCTTGTTGTTTTAAGTTTTTTTTTATTATGAGGATTAAGAGATATGTAACTGTTTCAAAA
AGATATGGAACTTGGTGTTGGATTT

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR4CN57TF 314 0 0
GAGGA
TACTGATAGCATTGTCCCTGGGGATGGGGTTGTCGTGTTCTCGATGTCTGATGTTCCGTT
GGGGTTTGGGATCGCGGCGAAGAGTACGCAGGATTGTCGGAAGTTGGATCCGAATGGTAT
CGTTGTGCTTCATCAGGCGGATATTGGAGAGTATTTGAGGGATGAAGACGAGCTTTGAGA
CAGCAGAAAGGTTTTGTCTTTATGAGGATCTTGGCTTTGGTTCTGCTTGTTGTTTTAAGT
TTTTTTTTATTATGAGGATTAAGAGATATGTAACTGTTTCAAAAAGATATGGAACTTGGT
GTTGGATTT

QA 6 314 6 314
DS 



AS 1 2

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GGTCGGAGAATGAGATAAGGAGAGAGTTGAGATGGCTTAAGGCGAGGCATAAGATTCAGC
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CACCGCCTCTTCTTTATAGGGCGATCTCGCTTCCTGTCGATGCCGTGGATACTTGAGATT
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GCTTACAGTTT


BQ
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AF RR4C284JQ C 1
AF RR4C284TF U 1
BS 1 311 RR4C284TF

RD RR4C284JQ 311 0 0
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GGTCGGAGAATGAGATAAGGAGAGAGTTGAGATGGCTTAAGGCGAGGCATAAGATTCAGC
TAGCGAGAGTTAGTGATCATCAAAGGATCTGTTGTGAGAAGAAACAGACGGAGTCAGCTT
CACCGCCTCTTCTTTATAGGGCGATCTCGCTTCCTGTCGATGCCGTGGATACTTGAGATT
GTATAAAGCCTAATTACTCAAGCTGAAGCTGTAACTTTATGAGAACATCTAATCAAATGG
GCTTACAGTTT

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR4C284TF 311 0 0
GTCCGTCGGTGAGTTTGAGTTTGAGTTTGAGTACGAGGAAGAAAGTGAGAGGTGAGTGGT
GGTCGGAGAATGAGATAAGGAGAGAGTTGAGATGGCTTAAGGCGAGGCATAAGATTCAGC
TAGCGAGAGTTAGTGATCATCAAAGGATCTGTTGTGAGAAGAAACAGACGGAGTCAGCTT
CACCGCCTCTTCTTTATAGGGCGATCTCGCTTCCTGTCGATGCCGTGGATACTTGAGATT
GTATAAAGCCTAATTACTCAAGCTGAAGCTGTAACTTTATGAGAACATCTAATCAAATGG
GCTTACAGTTT

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 2

CO CL6659Contig1 1227 2 6 U
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CCTAAAAAGTTAAGAGAGATGGACAGTGGTGCCACTTACCAGAGATTCCCAAAGGTGAAG
ATCCGTGAGCTCAAAGATGACTATGCCAAGTTCGAGCTTCGCGACACCGATGTTTCCATG
GCGAACGCTCTCCGTCGCGTTATGATCTCCGAAGTCCCCACGGTCGCAATCGATCTGGTC
GAAATCGAGGTTAACTCCTCTGTTCTCAACGACGAGTTCATCGCTCATCGATTAGGTCTA
ATCCCTCTAACTAGCGAACGTGCGATGAGCATGCGCTTCTCTCGAGACTGCGATGCTTGC
GATGGAGATGGACAGTGCGAGTTTTGCTCTGTTGAGTTTCATCTTAGAGCTAAATGTATC
ACTGACCAAACCCTAGATGTTACTAGTAGGGATCTCTACAGTGCTGATCCTACTGTCACT
ACTGTTGATTTCGGTCTCGATTCATCTGGAGCTGACTCAAGCGAGCAAAGGGGCATTATC
ATAGTCAAACTGAGACGTGGACAAGAACTGAAGCTTAGGGCGATAGCAAGGAAAGGAATT
GGGAAAGATCACGCTAAATGGTCTCCTGCAGCCACTGTTACGTTCATGTATGAGCCTGAC
ATTGTTATCAATGAAGATATGATGGATACTTTGACAGACGAGGAAAAGATTGACTTGATT
GAGAGCAGCCCGACCAAAGTTTTTGACTTTGATGCAGTCACCAGACAGGTTGTGGTGGTC
GACCCAGAAGCATACACTTACGATGAAGAAGTGATCAAGAAAGCAGAAGCCATGGGGAAA
CAAGGGCTAATTGAGATCCGTCCGAAAGATGACAGTTTTATATTCACTGTTGAATCCACA
GGTGCAGTGAAGGCTCCGCAGCTGGTACTAAATGCCATAGATCTCCTGAAGCAGAAGCTC
GATGCAGTCCGTCTTTCAGACGACACTGTTGAAGCTGATGATCAGTTTGGCGAACTAGGT
GCACATATGCGTGGAGGATGAGCGTGTGGTTAATTTGGGATCTCCATGTTCTTCCCGTTT
GTTTCGGGTTTAAGTTTATGTTGGACCAGGGCAATCTATTTTCCATAGCGGTACACTCTT
GTTAGATAACAACTTGTGAAGCAGTGGTCTTCTGTTCTTGCCCCTTCAAACTGAACCTTC
CTTTCTTTAATCTTGTTTTTACGTGAT


BQ
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AF RR4HA65TF U 1
AF RR4HA65JQB C 441
BS 1 702 RR4HA65TF
BS 703 704 RR4HA65JQB
BS 705 743 RR4HA65TF
BS 744 744 RR4HA65JQB
BS 745 764 RR4HA65TF
BS 765 1227 RR4HA65JQB

RD RR4HA65TF 764 0 0
GGAAGAAGGAAAGTTAAGAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTACTTCACCTTCATTCGAAAAC
CCTAAAAAGTTAAGAGAGATGGACAGTGGTGCCACTTACCAGAGATTCCCAAAGGTGAAG
ATCCGTGAGCTCAAAGATGACTATGCCAAGTTCGAGCTTCGCGACACCGATGTTTCCATG
GCGAACGCTCTCCGTCGCGTTATGATCTCCGAAGTCCCCACGGTCGCAATCGATCTGGTC
GAAATCGAGGTTAACTCCTCTGTTCTCAACGACGAGTTCATCGCTCATCGATTAGGTCTA
ATCCCTCTAACTAGCGAACGTGCGATGAGCATGCGCTTCTCTCGAGACTGCGATGCTTGC
GATGGAGATGGACAGTGCGAGTTTTGCTCTGTTGAGTTTCATCTTAGAGCTAAATGTATC
ACTGACCAAACCCTAGATGTTACTAGTAGGGATCTCTACAGTGCTGATCCTACTGTCACT
ACTGTTGATTTCGGTCTCGATTCATCTGGAGCTGACTCAAGCGAGCAAAGGGGCATTATC
ATAGTCAAACTGAGACGTGGACAAGAACTGAAGCTTAGGGCGATAGCAAGGAAAGGAATT
GGGAAAGATCACGCTAAATGGTCTCCTGCAGCCACTGTTACGTTCATGTATGAGCCTGAC
ATTGTTATCAATGAAGATATGATGGATACTTTGACAGACGAG**AAAGATTGACTTGATT
GAGAGCAGCCCGACCAAAGTTTT*GACTTTGATGCAGTCACCAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4HA65JQB 787 0 0
TACTAGTAGGGATCTCTACAGTGCTGATCCTACTGTCACTACTGTTGATTTCGGTCTCGA
TTCATCTGGAGCTGACTCAAGCGAGCAAAGGGGCATTATCATAGTCAAACTGAGACGTGG
ACAAGAACTGAAGCTTAGGGCGATAGCAAGGAAAGGAATTGGGAAAGATCACGCTAAATG
GTCTCCTGCAGCCACTGTTACGTTCATGTATGAGCCTGACATTGTTATCAATGAAGATAT
GATGGATACTTTGACAGACGAGGAAAAGATTGACTTGATTGAGAGCAGCCCGACCAAAGT
TTTTGACTTTGATGCAGTCACCAGACAGGTTGTGGTGGTCGACCCAGAAGCATACACTTA
CGATGAAGAAGTGATCAAGAAAGCAGAAGCCATGGGGAAACAAGGGCTAATTGAGATCCG
TCCGAAAGATGACAGTTTTATATTCACTGTTGAATCCACAGGTGCAGTGAAGGCTCCGCA
GCTGGTACTAAATGCCATAGATCTCCTGAAGCAGAAGCTCGATGCAGTCCGTCTTTCAGA
CGACACTGTTGAAGCTGATGATCAGTTTGGCGAACTAGGTGCACATATGCGTGGAGGATG
AGCGTGTGGTTAATTTGGGATCTCCATGTTCTTCCCGTTTGTTTCGGGTTTAAGTTTATG
TTGGACCAGGGCAATCTATTTTCCATAGCGGTACACTCTTGTTAGATAACAACTTGTGAA
GCAGTGGTCTTCTGTTCTTGCCCCTTCAAACTGAACCTTCCTTTCTTTAATCTTGTTTTT
ACGTGAT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6660Contig1 1105 2 6 U
GGCTCTTCACTGCGTCTTTCTCTGTACAAACTCTCTCTCTCTCGACGAACAAAGAAGAAG
AAGCGAAGCAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACAGACGTGACAACATGGAGTCCCAC
TGGTCGTCTTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGTCAAGCAAGGCTCCGCCGCGAT
CGGACTCAGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGTCAAAAAGCCCAATCCGAGCTC
TCTTCTCACCAAAGGAAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCTATCGCTGGT
CTCACCGCCGACGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAGATCTGAATCCATCAATCACTCT
TTCACCTACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCT
CAGGTATGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTTGGTTTGCTGGTTGGTGGA
CTGGACGAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAAACTACTTTGAATAC
CAAGCTTTCGCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTC
CAGAGCTTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAAAGATGCTATTTTGGCCATAAAG
GAAACTTTGCAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTGCACGGTTTCTGTTCTAGGAGTG
GATGAACCGTTCCATTTCTTGGACCAGGAAAGTATACAAGGTGATTGATACGTTTGAGAA
GGTTCCCGAGGAAGAGGAGGATGGTGGTGACGGTGAGGCCGAGGCTGAAGCTGCTTCTGC
TGCACCTGCGGAACAAGGTGGTGCAGGTGATCAAGATGTTGCACCAATGGAAATGTGAGC
AAGTGAGGGTGTTAGAGTTTGATCTACAAATAATAAGGTGTTGGTTATAACTGTGTCGTC
TTTAGCTCTTTGGTGTCAAAGTTCCATGCTGAGTTTAAAAGAGTCTATGTCCCAAGTACT
TTGGCTTTTTACTCCCGTGAAATCTTTCTTTTTCTTTTTGTGGTTACAACTTTCAGTTGG
TTACTAAAAAATTGTAGTTTTATTT


BQ
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AF RR4GM02TF U 1
AF RR4GM02JQ C 370
BS 1 526 RR4GM02TF
BS 527 527 RR4GM02JQ
BS 528 661 RR4GM02TF
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BS 663 700 RR4GM02TF
BS 701 1105 RR4GM02JQ

RD RR4GM02TF 700 0 0
GGCTCTTCACTGCGTCTTTCTCTGTACAAACTCTCTCTCTCTCGACGAACAAAGAAGAAG
AAGCGAAGCAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACAGACGTGACAACATGGAGTCCCAC
TGGTCGTCTTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGTCAAGCAAGGCTCCGCCGCGAT
CGGACTCAGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGTCAAAAAGCCCAATCCGAGCTC
TCTTCTCACCAAAGGAAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCTATCGCTGGT
CTCACCGCCGACGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAGATCTGAATCCATCAATCACTCT
TTCACCTACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCT
CAGGTATGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTTGGTTTGCTGGTTGGTGGA
CTGGACGAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAA*CTACTTTGAATAC
CAAGCTTTCGCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTC
CAGAGCTTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAAAGATGCTATTTTGGCCATAAAG
GGAACTTTGCAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTGCA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4GM02JQ 736 0 0
GAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCTCAGGTATGT
ACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTTGGTTTGCTGGTTGGTGGACTGGACGAG
TCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAAACTACTTTGAATACCAAGCTTTC
GCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTCCAGAGCTTC
AATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAAAGATGCTATTTTGGCCATAAGGGAAACTTTG
CAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTGCACGGTTTCTGTTCTAGGAGTGGATGAACCG
TTCCATTTCTTGGACCAGGAAAGTATACAAGGTGATTGATACGTTTGAGAAGGTTCCCGA
GGAAGAGGAGGATGGTGGTGACGGTGAGGCCGAGGCTGAAGCTGCTTCTGCTGCACCTGC
GGAACAAGGTGGTGCAGGTGATCAAGATGTTGCACCAATGGAAATGTGAGCAAGTGAGGG
TGTTAGAGTTTGATCTACAAATAATAAGGTGTTGGTTATAACTGTGTCGTCTTTAGCTCT
TTGGTGTCAAAGTTCCATGCTGAGTTTAAAAGAGTCTATGTCCCAAGTACTTTGGCTTTT
TACTCCCGTGAAATCTTTCTTTTTCTTTTTGTGGTTACAACTTTCAGTTGGTTACTAAAA
AATTGTAGTTTTATTT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6662Contig1 739 2 1 U
CAACTTCTTCTATACACCCAAAACCTTCCATCTCTACACTCATAATCTCTTTTCTCCATT
CTGAATCAACCCCTATGTTTTCTTGACATTCGCAACCGAGCCCCATTCTTTTTCTTCGGT
TTATTCCCCATTTTGTGTAGCACTTTCTCGTGTTCTTGACCAGCTTTTGAGGAAGTCCAA
GGAAGATGAAGATCGCGATCTGGAGTACAAGACAATTGCAACAACACGATACAACGACGC
AATCAGCCGCATATGTGGTAAGATCTTCCATGAAATCTTGAATAAGAGAGTGGAATGAGA
AATAGAAACACAATAGAAGAAATTAAAGAACAAACTATATCCTAACATATTGTAGTGATT
TAGGATATTTGGTTTGAAGGAACTCCTTTGTTCTTTGCTTCTATAAGGAAGACATCGAGA
AATGGATAATCAAGGAAGCAAAAAACATAATAAATGAACTTATTTGGAGTATTATTTTAG
GTAATGTAATATGTGAACAGAACTTGAGATTAGGACAATGGTGGCTAATTTTCCTTGAAT
AACACTCTAACTTTATGTAGCCATTCGTTCAAGATATTCTTTTTGGTAGGGTATGGACGA
AGAAAATGGTTTTCAATCAGATTATAAAGCCATTTCAGATTTTTGTAGCTAAAAAAAAAT
ACTCCATTATTTTTTATGTGTCCTGTTTAATTACACATTAAATTCGAATAGTTCTTGAAT
CTAAAATAATCCTTTACGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AO53JQ C 1
AF RR4AO53TF U 1
BS 1 739 RR4AO53TF

RD RR4AO53JQ 739 0 0
CAACTTCTTCTATACACCCAAAACCTTCCATCTCTACACTCATAATCTCTTTTCTCCATT
CTGAATCAACCCCTATGTTTTCTTGACATTCGCAACCGAGCCCCATTCTTTTTCTTCGGT
TTATTCCCCATTTTGTGTAGCACTTTCTCGTGTTCTTGACCAGCTTTTGAGGAAGTCCAA
GGAAGATGAAGATCGCGATCTGGAGTACAAGACAATTGCAACAACACGATACAACGACGC
AATCAGCCGCATATGTGGTAAGATCTTCCATGAAATCTTGAATAAGAGAGTGGAATGAGA
AATAGAAACACAATAGAAGAAATTAAAGAACAAACTATATCCTAACATATTGTAGTGATT
TAGGATATTTGGTTTGAAGGAACTCCTTTGTTCTTTGCTTCTATAAGGAAGACATCGAGA
AATGGATAATCAAGGAAGCAAAAAACATAATAAATGAACTTATTTGGAGTATTATTTTAG
GTAATGTAATATGTGAACAGAACTTGAGATTAGGACAATGGTGGCTAATTTTCCTTGAAT
AACACTCTAACTTTATGTAGCCATTCGTTCAAGATATTCTTTTTGGTAGGGTATGGACGA
AGAAAATGGTTTTCAATCAGATTATAAAGCCATTTCAGATTTTTGTAGCTAAAAAAAAAT
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CTAAAATAATCCTTTACGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AO53TF 739 0 0
CAACTTCTTCTATACACCCAAAACCTTCCATCTCTACACTCATAATCTCTTTTCTCCATT
CTGAATCAACCCCTATGTTTTCTTGACATTCGCAACCGAGCCCCATTCTTTTTCTTCGGT
TTATTCCCCATTTTGTGTAGCACTTTCTCGTGTTCTTGACCAGCTTTTGAGGAAGTCCAA
GGAAGATGAAGATCGCGATCTGGAGTACAAGACAATTGCAACAACACGATACAACGACGC
AATCAGCCGCATATGTGGTAAGATCTTCCATGAAATCTTGAATAAGAGAGTGGAATGAGA
AATAGAAACACAATAGAAGAAATTAAAGAACAAACTATATCCTAACATATTGTAGTGATT
TAGGATATTTGGTTTGAAGGAACTCCTTTGTTCTTTGCTTCTATAAGGAAGACATCGAGA
AATGGATAATCAAGGAAGCAAAAAACATAATAAATGAACTTATTTGGAGTATTATTTTAG
GTAATGTAATATGTGAACAGAACTTGAGATTAGGACAATGGTGGCTAATTTTCCTTGAAT
AACACTCTAACTTTATGTAGCCATTCGTTCAAGATATTCTTTTTGGTAGGGTATGGACGA
AGAAAATGGTTTTCAATCAGATTATAAAGCCATTTCAGATTTTTGTAGCTAAAAAAAAAT
ACTCCATTATTTTTTATGTGTCCTGTTTAATTACACATTAAATTCGAATAGTTCTTGAAT
CTAAAATAATCCTTTACGT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6663Contig1 760 2 2 U
GCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCCTCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACG
GAGATGGAGAATACTGATATACCCAGAAGGAAAGGCAGGAAATTTTTCGTTGTATTTGTC
TGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGACCAACTTTTGCCAACTATAAACTGCG
AGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACCATGAATCTGGGCACCAAGGTTGGTTTTCCTA
CGATACATCAGAAACTTCGGGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATGGAAGAACTCCA
TGATTCTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAGATATATATTGGTGTTGAGTTCTTACT
TGTCTCAATTACCGAGGATCTCTGAGACGTATGCATTACTGGATTCGATCAAGACCCACA
AGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTATCTATCATTCCACATTTCGTATC
GATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTATTAAAATAAAGTGACGGGTCAAATCGGTTGA
TTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATGTGTGTTTAAATATCCTGCACTACTT
ACCTTCCTTGTTTGTAATAACAACAATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTT
TTTTCATGGTTGCTGCTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTGTAATAACAACA
ATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AY48JQ C 1
AF RR4AY48TF U 1
BS 1 739 RR4AY48TF
BS 740 760 RR4AY48JQ

RD RR4AY48JQ 760 0 0
GCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCCTCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACG
GAGATGGAGAATACTGATATACCCAGAAGGAAAGGCAGGAAATTTTTCGTTGTATTTGTC
TGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGACCAACTTTTGCCAACTATAAACTGCG
AGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACCATGAATCTGGGCACCAAGGTTGGTTTTCCTA
CGATACATCAGAAACTTCGGGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATGGAAGAACTCCA
TGATTCTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAGATATATATTGGTGTTGAGTTCTTACT
TGTCTCAATTACCGAGGATCTCTGAGACGTATGCATTACTGGATTCGATCAAGACCCACA
AGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTATCTATCATTCCACATTTCGTATC
GATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTATTAAAATAAAGTGACGGGTCAAATCGGTTGA
TTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATGTGTGTTTAAATATCCTGCACTACTT
ACCTTCCTTGTTTGTAATAACAACAATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTT
TTTTCATGGTTGCTGCTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTGTAATAACAACA
ATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTTTTTCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4AY48TF 739 0 0
GCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCCTCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACG
GAGATGGAGAATACTGATATACCCAGAAGGAAAGGCAGGAAATTTTTCGTTGTATTTGTC
TGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGACCAACTTTTGCCAACTATAAACTGCG
AGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACCATGAATCTGGGCACCAAGGTTGGTTTTCCTA
CGATACATCAGAAACTTCGGGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATGGAAGAACTCCA
TGATTCTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAGATATATATTGGTGTTGAGTTCTTACT
TGTCTCAATTACCGAGGATCTCTGAGACGTATGCATTACTGGATTCGATCAAGACCCACA
AGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTATCTATCATTCCACATTTCGTATC
GATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTATTAAAATAAAGTGACGGGTCAAATCGGTTGA
TTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATGTGTGTTTAAATATCCTGCACTACTT
ACCTTCCTTGTTTGTAATAACAACAATAATGTATGACTGTATGTGTGTTGGGCCTTGTTT
TTTTCATGGTTGCTGCTGTGTACATGCATGTTTGTACCTTCCTTGTTTGTAATAACAACA
ATAATGTATGACTGTATGT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6664Contig1 694 2 7 U
CAAGACAACATCAGCCAATATATAAAATTGTAATTACCAAATTATATGATTTTCACTTTG
CTAAAATAAGCATACATAAACAGTGAGAGAGACAGTAAAAAAAAAAGTAAACGGACAAAG
CTGTAAAAAAGGATAAATTGCTTGTCTACGGGGGAAAAAGGGATCATCTTTCAGGTAAAT
CAAAACGTTGGTACAACACCGTAATGTCCAGCTGAAGCGTAAACCTGACTGAAAAAAACG
TCGTCGTTTTCACCCTCCGTCCGTTTCGCGAAACGTCCTTTGATCCTTGGCCGTGACTCA
CCGTAAGCTTTCCTCGAAGCGTAACGTATCGTCTTCACAAACTTCCTGTTCTTTCTCTTC
TCCCTGTACCTCAAAACCCTACCCTCCCTGTCCATAGAGCTCGGTTGCTCCCCGGTGGTC
GCCGTCGAAGTAGTGATCGTGCTCCGGTTAAACGGAACCGAGGTGGTCCCGTCGGGAACG
ACGCCGTATTCGAGAGACGAAGTCGAAACACTGTGGCTGATTGATTGAGTTGGGTAGGTG
AAAGTGGAGAGCTTTGATCTGCAGAAGTCTATGTCGAAGCAGTGTTCGTTGTTAGTCAAA
GGAAGAGGCTCTGTTTTTGTCTGAACCGGTACGAGGCTGTCTGCTCCGAAAGTGTTTGGG
TACTCGAAGTCAATGAGTCGGTCGAAGTCGGAGC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4HB75JQB U 17
AF RR4HB75TF C 1
BS 1 16 RR4HB75TF
BS 17 197 RR4HB75JQB
BS 198 198 RR4HB75TF
BS 199 245 RR4HB75JQB
BS 246 246 RR4HB75TF
BS 247 390 RR4HB75JQB
BS 391 694 RR4HB75TF

RD RR4HB75JQB 374 0 0
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TAAACAGTGAGAGAGACAGTAAAAAAAAAAGTAAACGGACAAAGCTGTAAAAAAGGATAA
ATTGCTTGTCTACGGGGGAAAAAGGGATCATCTTTCAGGTAAATCAAAACGTTGGTACAA
CCCCGTAATGTCCAGCTGAAGCGTAAACCTGACTGAAAAAAACGTCGTCTTTTTCACCCT
CCGTCCGTTTCGCGAAACGTCCTTTGATCCTTGGCCGTGACTCACCGTAAGCTTTCCTCG
AAGCGTAACGTATCGTCTTCACAAACTTCCTGTTCTTTCTCTTCTCCCTGTACCTCAAAA
CCCTACCCTCCCTG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4HB75TF 694 0 0
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CTAAAATAAGCATACATAAACAGTGAGAGAGACAGTAAAAAAAAAAGTAAACGGACGAAG
CTGTAAGAAAGGATAAATTGCTTGTCTACGGTGGAAGAAGGGATCATCTTTCAGGTAAAT
CAGAACGTTGGTACGACACCGTAATGTCCAGCTGAAGCGTAAACCTGACTGAAGAAAACG
TCGTCGTTTTCAGCCTCCGTCCGTTTCGCGAAACGTCCTTTGATCCTTGGCCGTGACTCA
GCGTAAGCTTTCCTCGAAGCGTAACGTATCGTCTTCACGAACTTCCTGTTCTTTCTCTTC
TCCCTGTACCTCAAAACCCTAGCCTCCCTGTCCATAGAGCTCGGTTGCTCCCCGGTGGTC
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ACGCCGTATTCGAGAGACGAAGTCGAAACACTGTGGCTGATTGATTGAGTTGGGTAGGTG
AAAGTGGAGAGCTTTGATCTGCAGAAGTCTATGTCGAAGCAGTGTTCGTTGTTAGTCAAA
GGAAGAGGCTCTGTTTTTGTCTGAACCGGTACGAGGCTGTCTGCTCCGAAAGTGTTTGGG
TACTCGAAGTCAATGAGTCGGTCGAAGTCGGAGC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

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AAACAGATATCAACTTCCTTCTGTTTACAACTAGTACTAACCGGTACAACTTAAAATGTT
TATAGTCCATCACATATTTTCCCTTTAAAACAAAATGAATTATATATGTATAGTTTATCA
TATGAGCTTTTAAAAGGCATCAAATAAAAAAAGCAGGTGATTTGCAAATAGGGCAAGAGT
TCTTCAAAAACAGCCATTTCTTTATGCACACTCCGTGGTAGTCATGACCACACCCTTTCA
GTTCCCCCAACTCTTCTCCTTCCTTGTATTCCTCCAGGCAAATTGCACATTTTCTTTGAT
CATCCGTTTGATACAATATTGTCTCTAACAAGCAACTGGTGATCGCCCCGTTGGATAAAC
CACTGTTGACACTCCCGATCCTTTCACCAAGATCAAGAC


BQ
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AF RR4E431TF C 1
AF RR4E431JQ U 28
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BS 28 385 RR4E431JQ
BS 386 399 RR4E431TF

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TATAGTCGATCACATATTTTCCCTTTAAAACAAAATGAATTATATATGTATAGTTTATCA
TATGAGCTTTTAGAAGGCATCAGATAAAAAAAGCAGGTGATTTGCAGATAGGGCAAGAGT
TCTTCAAAGACAGCCATTTCTTTATGCACACTCCGTGGTAGTCATGACCACACCCTTTCA
GTTCCCCCAACTCTTCTCCTTCCTTGTATTCCTCCAGGCAGATTGCACATTTTCTTTGAT
CATCCGTTTGATACAATATTGTCTCTAACAAGCAACTGGTGATCGCGCCGTTGGATAGAC
CACTGTTGACACTCCCGATCCTTTCACCAAGATCAAGAC

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR4E431JQ 358 0 0
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AAACAAAATGAATTATATATGTATAGTTTATCATATGAGCTTTTAAAAGGCATCAAATAA
AAAAAGCAGGTGATTTGCAAATAGGGCAAGAGTTCTTCAAAAACAGCCATTTCTTTATGC
ACACTCCGTGGTAGTCATGACCACACCCTTTCAGTTCCCCCAACTCTTCTCCTTCCTTGT
ATTCCTCCAGGCAAATTGCACATTTTCTTTGATCATCCGTTTGATACAATATTGTCTCTA
ACAAGCAACTGGTGATCGCCCCGTTGGATAAACCACTGTTGACACTCCCGATCCTTTC

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

CO CL6666Contig1 1039 2 6 U
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TGCAGCTCCAACTGATCCTTTCACATTAACTGTTGAAGAGAAGCTCAATGTCGTTTGAGA
CGAGATGGTGGAATCAGTAGCTTTGACATGCAGGGAACCCTGTCGCTTCAAATTCTTAAC
CAAGAAGATGGGTTTGTCCAAGTTCAGATTGAAACCGGTGGAAATCCTGAAATTCTTTTC
AAGACTCATCCCAACATCAACAGGGAACTCTTTAATAGCGAGAGTATACTAGGGCTGAAG
AGACCTGATCAGCCATTTCCCACTGGTCAAGGTGGAGATGGTGTTGGTCTTCTGAGGTGG
AGAATGCAAAGAGCAGATGAGTCGATGGTGCCACTAACAATCAACTGCTGGCCTTCAGTG
TCTGGAAACGAGACATATGTGAGCATCGAGTATGAAGCCTCGTCCATGTTTGATCTGACT
AATGTTATCATCTCGGTTCCTCTTCCTGCTCTGAGAGATGCACCGATCGTTAAACAATGC
GATGGGGACTGGAGGTACGACTCAAGAAATTCTGTTGTGGAATGGTCTATACTTCTCATT
GACAACTCCAACCGCAGTGGTCAATGGAGTTTGTTGTGCCACCAGTTGATTCGTCGGTGT
TCTTCCCTATCTCTGTTCAGTTTGCAGCCACCACTACATACAGTGGCTTGAAGGTGAACG
GAATGATTCCTCTCAGAGGTGGTGGTACGACTCCAAGGTTTGTGCGGAGGACGCAGCTAA
TAACACAGAATTACCAAGTCGTATGAGAAGGCTGTTCGAGTTACTCCGTTTGGTACCGCT
GTTTCTTTTAGTTTATTGCTGCTTCTCTACTATCTCTGTGGTCTGGGAATAAAATCTTAA
ATCTTCTGGGATTTTACTAGTTTCTTTATCAGACTTACTTCTAAGACGCATTCTTATCAT
TGTTTCTTTTTTTTTGATC


BQ
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AF RR4FW95TF U 1
AF RR4FW95JQ C 369
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AGAATGCAAAGAGCAGATGAGTCGATGGTGCCACTAACAATCAACTGCTGGCCTTCAGTG
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AATGTTATCATCTCGGTTCCTCTTCCTGCTCTGAGAGATGCACCGATCGTTAAACAATGC
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GACA*CTCCA*CCGCAGTGGTCAATGGAGTTTGTTGTGC
ACAGTTG

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DS 

RD RR4FW95JQ 671 0 0
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AAGAGCAGATGAGTCGATGGTGCCACTAACAATCAACTGCTGGCCTTCAGTGTCTGGAAA
CGAGACATATGTGAGCATCGAGTATGAAGCCTCGTCCATGTTTGATCTGACTAATGTTAT
CATCTCGGTTCCTCTTCCTGCTCTGAGAGATGCACCGATCGTTAAACAATGCGATGGGGA
CTGGAGGTACGACTCAAGAAATTCTGTTGTGGAATGGTCTATACTTCTCATTGACAACTC
CAACCGCAGTGGTCAATGGAGTTTGTTGTGCCACCAGTTGATTCGTCGGTGTTCTTCCCT
ATCTCTGTTCAGTTTGCAGCCACCACTACATACAGTGGCTTGAAGGTGAACGGAATGATT
CCTCTCAGAGGTGGTGGTACGACTCCAAGGTTTGTGCGGAGGACGCAGCTAATAACACAG
AATTACCAAGTCGTATGAGAAGGCTGTTCGAGTTACTCCGTTTGGTACCGCTGTTTCTTT
TAGTTTATTGCTGCTTCTCTACTATCTCTGTGGTCTGGGAATAAAATCTTAAATCTTCTG
GGATTTTACTAGTTTCTTTATCAGACTTACTTCTAAGACGCATTCTTATCATTGTTTCTT
TTTTTTTGATC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL6667Contig1 1159 2 10 U
GCATGCGTTTGTATCAACCTGTCCATTTGCTGGTTGGAACCTCTGGGAGAATCTTAGATC
TTACCAAAAAGGGTGTCTGCGTTTTGAAAGATTGTGCCATGCTTGTGATGGATGAGGCCG
ACAAGCTTCTGTCTGCAGAATTTCAACCTTCTATAGAGGAGTTGATTCAGTTCTTGCCCC
AAAACCGTCAGATTTTGATGTTTTCAGCTACATTTCCCGTCACTGTCAAGTACTTCAAGG
ATCGTTATCTCAGGAAGCCTTACATTATTAATCTCATGGACCAGCTGACACTTATGGGTG
TCACACAGTACTATGCTTTTGTTGAAGAGAGGCAGAAGGTGCACTGCCTTAACACGCTTT
TCTCCAAGCTTCAAATAAACCAATCCATTATCTTTTGCAACTCTGTCAATCGTGTGGAGC
TGCTAGCCAAGAAAATCACAGAACTTGGTTACTCATGCTTCTATATCCATGCAAAGATGG
CTCAAGACCACCGTAACAGGGTCTTCCATGATTTCCGCAACGGTGCATGCAGAAACCTTG
TTTGCACTGATTTGTTTACACGTGGAATTGACATTCAAGCTGTGAATGTGGTCATTAATT
TTGATTTCCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTTGGTCGATCAGGAACGTATG
GACACCTTGGGTTGGTTGTGAACTTGGTAACGTATGAGGACCGCTTCAAAATGTACCAAA
CTGAGCAAGAACTTGGAACCGAAATCAAGCCAATTCCGTCACTTATCGACAAGGCAATCT
ACTGTCAGTAACTTCAACAAGGTTCACATTCTCCAGGCGGTGTGTTGTGGAGGCAAATCG
TTAAGCTTTGGCAGTTACAAGCTCGTTCCAGAGATGAAGGCAACACTCAGGCAAGAAGAA
AGGCCGTATTAATAGCGGTTGATTATATCTGAACCTTTCAACCCGAGGACTGGTGGTTTG
GTTTTGCTTTGAAGAATTCTTCTGCATGATGTGCATCTTTAAGTGACCTTCGGTCAACTT
TCGTTTTTCATATTTTAAGAAACCTTTTAACCCTTTGGGATTTGGGTGTTTGATGACTTT
TCATGTTTTTTTCTTATTTCAAGACTTGAGGCCTAATTTCCTAGTAGTAAGATCAAACAG
AAGAAGACAATTTTACTAC


BQ
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AF RR4C537TF U 1
AF RR4C537JQ C 425
BS 1 698 RR4C537TF
BS 699 699 RR4C537JQ
BS 700 710 RR4C537TF
BS 711 711 RR4C537JQ
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BS 744 744 RR4C537JQ
BS 745 756 RR4C537TF
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BS 758 768 RR4C537TF
BS 769 1159 RR4C537JQ

RD RR4C537TF 768 0 0
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TTACCAAAAAGGGTGTCTGCGTTTTGAAAGATTGTGCCATGCTTGTGATGGATGAGGCCG
ACAAGCTTCTGTCTGCAGAATTTCAACCTTCTATAGAGGAGTTGATTCAGTTCTTGCCCC
AAAACCGTCAGATTTTGATGTTTTCAGCTACATTTCCCGTCACTGTCAAGTACTTCAAGG
ATCGTTATCTCAGGAAGCCTTACATTATTAATCTCATGGACCAGCTGACACTTATGGGTG
TCACACAGTACTATGCTTTTGTTGAAGAGAGGCAGAAGGTGCACTGCCTTAACACGCTTT
TCTCCAAGCTTCAAATAAACCAATCCATTATCTTTTGCAACTCTGTCAATCGTGTGGAGC
TGCTAGCCAAGAAAATCACAGAACTTGGTTACTCATGCTTCTATATCCATGCAAAGATGG
CTCAAGACCACCGTAACAGGGTCTTCCATGATTTCCGCAACGGTGCATGCAGAAACCTTG
TTTGCACTGATTTGTTTACACGTGGAATTGACATTCAAGCTGTGAATGTGGTCATTAATT
TTGATTTCCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTTGGTCGATCAGGAACGTATG
GACACCTTGGGTTGGTTGTGAACTTGGTAACGTATGAG*ACCGCTTCAAA*TGTACCAAA
CTGAGCAAGAACTTGGAACCGAA*TCAAGCCAATTC*GTCACTTATCG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4C537JQ 735 0 0
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AGACCACCGTAACAGGGTCTTCCATGATTTCCGCAACGGTGCATGCAGAAACCTTGTTTG
CACTGATTTGTTTACACGTGGAATTGACATTCAAGCTGTGAATGTGGTCATTAATTTTGA
TTTCCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTTGGTCGATCAGGAAGGTATGGACA
CCTTGGGTTGGTTGTGAACTTGGTAACGTATGAGGACCGCTTCAAAATGTACCAAACTGA
GCAAGAACTTGGAACCGAAATCAAGCCAATTCCGTCACTTATCGACAAGGCAATCTACTG
TCAGTAACTTCAACAAGGTTCACATTCTCCAGGCGGTGTGTTGTGGAGGCAAATCGTTAA
GCTTTGGCAGTTACAAGCTCGTTCCAGAGATGAAGGCAACACTCAGGCAAGAAGAAAGGC
CGTATTAATAGCGGTTGATTATATCTGAACCTTTCAACCCGAGGACTGGTGGTTTGGTTT
TGCTTTGAAGAATTCTTCTGCATGATGTGCATCTTTAAGTGACCTTCGGTCAACTTTCGT
TTTTCATATTTTAAGAAACCTTTTAACCCTTTGGGATTTGGGTGTTTGATGACTTTTCAT
GTTTTTTTCTTATTTCAAGACTTGAGGCCTAATTTCCTAGTAGTAAGATCAAACAGAAGA
AGACAATTTTACTAC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCCAAATTTTCTACCGAGGGCAACGGATTTGGCAAGCGGCTATGGAAGAGTTTTGGTCTT
TAGGCATGCAGCAAGCAAACCAGGCTCTGCTTTCTGGATGCTCAGCCGGAGGATTAGCTT
CCATCTTGCACTGTGATGAGTTCAGAGAGCTCTTGCCTAGTTCCACTAAAGTCAAGTGCT
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ATATGTTCCAAGGTGTTGTTACTGTGCAGAACCTCCAGAAGGACTTTTCCAGCAATTGTA
CAAACCATTTGGATCCTACCTCGTGCTTCTTTCCCCAGAACTTGGTTTCAGACATCAAAA
CCCCCATGTTTCTTCTCAACACAGCATATGACTCGTGGCAGATCCAAGAGAGCTTAGCTC
CTCGAACTGCTGACCCAGGCGGCATCTGGAAGGCATGCAAAGCAGACCACTCGCAATGTA
ACTCATCACAGATCCAATTCTTCCAAGGAACCAAATGCTGTTTGCCGTAAATTCATTCTC
CACATCAGACCAAAACGGTCTTTTCATAAACTCTTGCTTCGCTCATTGTCAAACTGAAAG
ACAAGACACTTGGTTTGCCCAAGATTCTCCCCAACTCAACGGAAAGAGAGTCGCAGAGAC
TGTAGGTGACTGGTACTTCGACCGAGCAAAAAATATCAAAGCCATCGACTGTGCTTACCC
ATGTGACAAAACATGTCACAATCTGATTTTCGATGTTCATCAAACAGGTGTAGATTGGAG
TGTTGATCAAACAGCTCTAGAGATCTCAGCTTCTTCTTCTTCTTCAAGATTTTGTTTTAC
TCTTTTTAGAGCCTCTTTGGTCTCTCTAGTGTTGACAACGCTCATCCTCATATGCTTAGT
TCAGTAGGTATAGGGAGACCTTATTCTTTCATACCTCATAGTTTTTATAACCTTTTGATT
CACATGTTGAATCTAAGTTAGTAATCAAATCTATGTATGCAGAACAGAATATATCACTAA
GAGAAAAAATAATACTCCCTCTGTTTTTTTAAAGATAGATGTTTTAGAAAAATAAATTG


BQ
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AF RR4AF78TF U 1
AF RR4AF78JQ C 345
BS 1 661 RR4AF78TF
BS 662 1079 RR4AF78JQ

RD RR4AF78TF 661 0 0
GCCAAATTTTCTACCGAGGGCAACGGATTTGGCAAGCGGCTATGGAAGAGTTTTGGTCTT
TAGGCATGCAGCAAGCAAACCAGGCTCTGCTTTCTGGATGCTCAGCCGGAGGATTAGCTT
CCATCTTGCACTGTGATGAGTTCAGAGAGCTCTTGCCTAGTTCCACTAAAGTCAAGTGCT
TAAGTGATGCTGGAATGTTTCTAGACGCAGTGGATGTCTCTGGGGGCCACTCGCTCAGGA
ATATGTTCCAAGGTGTTGTTACTGTGCAGAACCTCCAGAAGGACTTTTCCAGCAATTGTA
CAAACCATTTGGATCCTACCTCGTGCTTCTTTCCCCAGAACTTGGTTTCAGACATCAAAA
CCCCCATGTTTCTTCTCAACACAGCATATGACTCGTGGCAGATCCAAGAGAGCTTAGCTC
CTCGAACTGCTGACCCAGGCGGCATCTGGAAGGCATGCAAAGCAGACCACTCGCAATGTA
ACTCATCACAGATCCAATTCTTCCAAGGAACCAAATGCTGTTTGCCGTAAATTCATTCTC
CACATCAGACCAAAACGGTCTTTTCATAAACTCTTGCTTCGCTCATTGTCAAACTGAAAG
ACAAGACACTTGGTTTGCCCAAGATTCTCCCCAACTCAACGGAAAGAGAGTCGCAGAGAC
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4AF78JQ 735 0 0
GTTTCAGACATCAAAACCCCCATGTTTCTTCTCAACACAGCATATGACTCGTGGCAGATC
CAAGAGAGCTTAGCTCCTCGAACTGCTGACCCAGGCGGCATCTGGAAGGCATGCAAAGCA
GACCACTCGCAATGTAACTCATCACAGATCCAATTCTTCCAAGGAACCAAATGCTGTTTG
CCGTAAATTCATTCTCCACATCAGACCAAAACGGTCTTTTCATAAACTCTTGCTTCGCTC
ATTGTCAAACTGAAAGACAAGACACTTGGTTTGCCCAAGATTCTCCCCAACTCAACGGAA
AGAGAGTCGCAGAGACTGTAGGTGACTGGTACTTCGACCGAGCAAAAAATATCAAAGCCA
TCGACTGTGCTTACCCATGTGACAAAACATGTCACAATCTGATTTTCGATGTTCATCAAA
CAGGTGTAGATTGGAGTGTTGATCAAACAGCTCTAGAGATCTCAGCTTCTTCTTCTTCTT
CAAGATTTTGTTTTACTCTTTTTAGAGCCTCTTTGGTCTCTCTAGTGTTGACAACGCTCA
TCCTCATATGCTTAGTTCAGTAGGTATAGGGAGACCTTATTCTTTCATACCTCATAGTTT
TTATAACCTTTTGATTCACATGTTGAATCTAAGTTAGTAATCAAATCTATGTATGCAGAA
CAGAATATATCACTAAGAGAAAAAATAATACTCCCTCTGTTTTTTTAAAGATAGATGTTT
TAGAAAAATAAATTG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL6670Contig1 1043 2 4 U
GGGATTTCGATTTTCTCTTTCTCCGATTTAGACACACACAGAGAGAGTAGGGTTTCTAAT
TTCGGATCTGTACTTTTTGTCGATGGATGCTCGTAAGAGAGGACGGCCTGAAGCTGCTGG
CTCATTCAACAACTCCAATGGCGGCGGATTCAAGAAGTCTAAGCAAGAGATGGAATCTGG
TTTAGGAAGCAAATCGAAGCCATGCACAAAATTTTTCAGCACTTCTGGCTGTCCTTTTGG
TGAGAACTGCCATTTCTTGCACTATGTTCCCGGAGGATACAATCCTGTATCACAGATGAC
GAACATGGGATCACCCATGTCTCAAGTTTCCAGAAACATGCAAGGATCTGGTGGTGGTGG
GGGACGGTTTACAGGGAGAGGAGAGTCTGGGCCAGGCCATGTCTCTAGCTTCGGTGCCTC
AGCCACGGCCAAAATCAGCGTGGATGCTTCCTTGGCAGGCGCAATCATTGGAAAAGGTGG
AGTCAGTTCGAAACAAATATGTCGTCAGACAGGAGCAAAGCTATCGATACAAGATCACGA
GAGAGATCCGAACCTGAAGAACATTGAGCTTGAAGGAACCTTTGAGCAGATTAACGAAGC
GAGCGCAATGGTTAGAGAGCTGATTGGGAGGCTTAATTCGGCATCTAGGAGACCACCTGG
TGTTGGCGGCGGCGGAGGCGGGCTTGGTTCGGAAGGGAAACCGCATCCAGGGAGCAACTA
CAAGACGAAGATGTGTGAGAGATTTTCGAAAGGAAACTGTACATTTGGTGATAGATGTCA
CTTTGCACACGGCGAAGCAGAGCTACGCAGGTCATGAATTGTTGCCTAGAGTTTGCTGGT
GGAGTTAGAGAATTCAAGTCTCTTTCATTTGTGGTGGTGATCTTTAGTATTATCTTTCCC
CTACTTGTCTTTTTAGCTGTCTTTCTTCATGAGAGAATACAATGTCATTTTAAAGTGTTC
CCTATTTGTTTTTTTTTTTAGAATCTAGTTTGATTTGTATGCTGTCTTTACTTGATATTC
CATGTTTTCTCTGTTTTTTACCC


BQ
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AF RR4F409TF U 1
AF RR4F409JQ C 364
BS 1 677 RR4F409TF
BS 678 678 RR4F409JQ
BS 679 691 RR4F409TF
BS 692 1043 RR4F409JQ

RD RR4F409TF 691 0 0
GGGATTTCGATTTTCTCTTTCTCCGATTTAGACACACACAGAGAGAGTAGGGTTTCTAAT
TTCGGATCTGTACTTTTTGTCGATGGATGCTCGTAAGAGAGGACGGCCTGAAGCTGCTGG
CTCATTCAACAACTCCAATGGCGGCGGATTCAAGAAGTCTAAGCAAGAGATGGAATCTGG
TTTAGGAAGCAAATCGAAGCCATGCACAAAATTTTTCAGCACTTCTGGCTGTCCTTTTGG
TGAGAACTGCCATTTCTTGCACTATGTTCCCGGAGGATACAATCCTGTATCACAGATGAC
GAACATGGGATCACCCATGTCTCAAGTTTCCAGAAACATGCAAGGATCTGGTGGTGGTGG
GGGACGGTTTACAGGGAGAGGAGAGTCTGGGCCAGGCCATGTCTCTAGCTTCGGTGCCTC
AGCCACGGCCAAAATCAGCGTGGATGCTTCCTTGGCAGGCGCAATCATTGGAAAAGGTGG
AGTCAGTTCGAAACAAATATGTCGTCAGACAGGAGCAAAGCTATCGATACAAGATCACGA
GAGAGATCCGAACCTGAAGAACATTGAGCTTGAAGGAACCTTTGAGCAGATTAACGAAGC
GAGCGCAATGGTTAGAGAGCTGATTGGGAGGCTTAATTCGGCATCTAGGAGACCACCTGG
TGTTGGCGGCGGCGGAG*CGGGCTTGGTTCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4F409JQ 680 0 0
ACGGTTTACAGGGAGAGGAGAGTCTGGGCCAGGCCATGTCTCTAGCTTCGGTGCCTCAGC
CACGGCCAAAATCAGCGTGGATGCTTCCTTGGCAGGCGCAATCATTGGAAAAGGTGGAGT
CAGTTCGAAACAAATATGTCGTCAGACAGGAGCAAAGCTATCGATACAAGATCACGAGAG
AGATCCGAACCTGAAGAACATTGAGCTTGAAGGAACCTTTGAGCAGATTAACGAAGCGAG
CGCAATGGTTAGAGAGCTGATTGGGAGGCTTAATTCGGCATCTAGGAGACCACCTGGTGT
TGGCGGCGGCGGAGGCGGGCTTGGTTCGGAAGGGAAACCGCATCCAGGGAGCAACTACAA
GACGAAGATGTGTGAGAGATTTTCGAAAGGAAACTGTACATTTGGTGATAGATGTCACTT
TGCACACGGCGAAGCAGAGCTACGCAGGTCATGAATTGTTGCCTAGAGTTTGCTGGTGGA
GTTAGAGAATTCAAGTCTCTTTCATTTGTGGTGGTGATCTTTAGTATTATCTTTCCCCTA
CTTGTCTTTTTAGCTGTCTTTCTTCATGAGAGAATACAATGTCATTTTAAAGTGTTCCCT
ATTTGTTTTTTTTTTTAGAATCTAGTTTGATTTGTATGCTGTCTTTACTTGATATTCCAT
GTTTTCTCTGTTTTTTACCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6671Contig1 851 2 12 U
GCGGATTACGTCTGAAGATAGAAGACTATCCTTACGCTGTGGATGGGCTTGAGGTTTGGT
ACGCTATCGAGTCATGGATCCAAGACTATATTCCCTTGTATTACAAGACGGACGAGGATG
TCCAAAACGACAGGGAGCTCCAAGCTTGGTGGAAGGAGGTGCGTGAGGAAGGTCACGGAG
ACAAAAAGTCAGAACCTTGGTGGCCCAAAATGCAAACCCGCAAAGAACTGATTGACTCTT
GCACTATAATAATATGGGTGGCTTCTGCTCTGCATGCAGCTGTTAACTTCGGACAGTATC
CCTTTGCTGGGTATCTCCCCAACAGGCCGACCATAAGCCGACAGTTCATGCCAGAGGAAA
ACACTCCAGAGTTTGAAGAACTTGAGAAGAATCCCGAGAAAGTGTTTTTGAAGACGATCA
CGGCTCAGCTTCAGACGCTTCTTGGGATATCTCTGATTGAGATACTGTCTACTCATTCGA
GCGACGAGGTGTATTTGGGGCAGAGAGATTCTAAGGAATGGGCAGCTGAGAAAGAGGCGT
TGGAAGTGTTTGAGAAGTTTGGAGAGAAAGTAAAAGAGATTGAGAAGAAGATTGATGAAA
GGAACGAAGACGAGAATCTCAAGAACAGGACTGGCCCAGTTAAGATGCCATACACTTCTT
TGTTTCCGACCAGTGTAGCGGGAGTCACTGGCAGGGGAATCCCGAACAGTGTCTCCATCT
GAAACATGTCTCAAGGTTGTTGTTTGTTTTCTGCTTATTGTGTGTGTTGCACTCCGTTTG
TGTTCTCCCATGGTTTGCCTTTTTTCACATGTTAACAGTTGATTCTTGCCGGTCTTGGGG
ATCGGTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D058TF U 1
AF RR4D058JQ C 455
BS 1 696 RR4D058TF
BS 697 697 RR4D058JQ
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BS 799 800 RR4D058JQ
BS 801 814 RR4D058TF
BS 815 851 RR4D058JQ

RD RR4D058TF 829 0 0
GCGGATTACGTCTGAAGATAGAAGACTATCCTTACGCTGTGGATGGGCTTGAGGTTTGGT
ACGCTATCGAGTCATGGATCCAAGACTATATTCCCTTGTATTACAAGACGGACGAGGATG
TCCAAAACGACAGGGAGCTCCAAGCTTGGTGGAAGGAGGTGCGTGAGGAAGGTCACGGAG
ACAAAAAGTCAGAACCTTGGTGGCCCAAAATGCAAACCCGCAAAGAACTGATTGACTCTT
GCACTATAATAATATGGGTGGCTTCTGCTCTGCATGCAGCTGTTAACTTCGGACAGTATC
CCTTTGCTGGGTATCTCCCCAACAGGCCGACCATAAGCCGACAGTTCATGCCAGAGGAAA
ACACTCCAGAGTTTGAAGAACTTGAGAAGAATCCCGAGAAAGTGTTTTTGAAGACGATCA
CGGCTCAGCTTCAGACGCTTCTTGGGATATCTCTGATTGAGATACTGTCTACTCATTCGA
GCGACGAGGTGTATTTGGGGCAGAGAGATTCTAAGGAATGGGCAGCTGAGAAAGAGGCGT
TGGAAGTGTTTGAGAAGTTTGGAGAGAAAGTAAAAGAGATTGAGAAGAAGATTGATGAAA
GGAACGAAGACGAGAATCTCAAGAACAGGACTGGCCCAGTTAAGATGCCATACACTTCTT
TGTTTCCGACCAGTGTAGCGGGAGTCACTGGCAGGG*AATCCCGAACAGTGTCTC*ATCT
GAAACATGTCTCAAGGTTGTTGTTTGTTT*CTGCTTATTGTGTGTGTTGCACTCCGTT*G
TGTTCTCCCATGGTTTGC**TTTTTCACATGTTA
CAGTGATCTGCGGTC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4D058JQ 397 0 0
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GGAATGGGCAGCTGAGAAAGAGGCGTTGGAAGTGTTTGAGAAGTTTGGAGAGAAAGTAAA
AGAGATTGAGAAGAAGATTGATGAAAGGAACGAAGACGAGAATCTCAAGAACAGGACTGG
CCCAGTTAAGATGCCATACACTTCTTTGTTTCCGACCAGTGTAGCGGGAGTCACTGGCAG
GGGAATCCCGAACAGTGTCTCCATTTGAAACATGTCTCAAGGTTGTTGTTTGTTTTCTGC
TTATTGTGTGTGTTGCACTCCGTTTGTGTTCTCCCATGGTTTGCCTTTTTTCACATGTTA
ACAGTTGATTCTTGCCGGTCTTGGGGATCGGTTTATT

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL6672Contig1 636 2 3 U
CGGATCAAGAAAATTCATAATAACATCTCTTTTCACACATTATTAAAACACATATTATAA
ATAAAACATTATAAAAAATACAAAAAAAGAAGTGAAATTAAATGACTAGGAAGTCTCAAA
CCCCTTGAACGATATAAGACATTAAATACGGGTAAAAAAGCTATAGGTAGCAAACTTGTG
AAGGAAATCTGAAACCATAAACTGTAAACGAGAGAGAGACAAAAGGTTGTTATTATATGG
CTAACCCTTCTGGATATCTGCAAGCGGTCTCTTATGGTCCAAGACGATAAGGACCATCGC
CCATGTAATGACCATCCATGTATAGAGCTGCGTGGTGCGGGTGCTGTAAACCATCCATCA
CCATAAACTGCATGTCTTCGGATGGTTTCCAGTGACGTTTTCTTTGGTTTATGAACCAAT
TGTTGATCTGTTTCTGATCTAACCCCGTTGATTCCGCCAACGCGACCTTCTCTGATTCAG
AAGGATATGGCCACTTGTAATGCAATTCCCACCACGTGAGAAGCTTCTGCCTTGCTTCTT
TGGGAAGTTTACCTTTCTTTTTTTTCTTGGAGAGTTCTTGCTTTAGACTGCTCAAGTATC
CACTATACTTCTTCAGCAAGTGATTCTTGAGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BG95JQ U 41
AF RR4BG95TF C 1
BS 1 40 RR4BG95TF
BS 41 353 RR4BG95JQ
BS 354 636 RR4BG95TF

RD RR4BG95JQ 313 0 0
TATTAAAACACATATTATAAATAAAACATTATAAAAAATACAAAAAAAGAAGTGAAATTA
AATGACTAGGAAGTCTCAAACCCCTTGAACGATATAAGACATTAAATACGGGTAAAAAAG
CTATAGGTAGCAAACTTGTGAAGGAAATCTGAAACCATAAACTGTAAACGAGAGAGAGAC
AAAAGGTTGTTATTATATGGCTAACCCTTCTGGATATCTGCAAGCGGTCTCTTATGGTCC
AAGACGATAAGGACCATCGCCCATGTAATGACCATCCATGTATAGAGCTGCGTGGTGCGG
GTGCTGTAAACCA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR4BG95TF 636 0 0
CGGATCAAGAAAATTCATAATAACATCTCTTTTCACACATTATTAAAACACATATTATAA
ATAAAACATTATAAAAAATACAAAAAAAGAAGTGAAATTAAATGACTAGGAAGTCTCAAA
CCCCTTGAACGATATAAGACATTAAATACGGGTAAAAAAGCTATAGGTAGCAAACTTGTG
AAGGAAATCTGAAACCATAAACTGTAAACGAGAGAGAGACAAAAGGTTGTTATTATATGG
CTAACCCTTCTGGATATCTGCAAGCGGTCTCTTATGGTCCAAGACGATAAGGACCATCGC
CCATGTAATGACCATCCATGTATAGAGCTGCGTGGTGCGGGTGCTGTAGACCATCCATCA
CCATAAACTGCATGTCTTCGGATGGTTTCCAGTGACGTTTTCTTTGGTTTATGAACCAAT
TGTTGATCTGTTTCTGATCTAACCCCGTTGATTCCGCCAACGCGACCTTCTCTGATTCAG
AAGGATATGGCCACTTGTAATGCAATTCCCACCACGTGAGAAGCTTCTGCCTTGCTTCTT
TGGGAAGTTTACCTTTCTTTTTTTTCTTGGAGAGTTCTTGCTTTAGACTGCTCAAGTATC
CACTATACTTCTTCAGCAAGTGATTCTTGAGTTCCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL6673Contig1 326 2 1 U
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GTAGGTGCAAAGTGGTGGGACCGACGTTAGGATTCGTAGCTTTTCTTGTGACCGGAATCA
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TGGGTCATCCAGCCACTGTTGTTTATCCTAAAGTCTCAAGATCTATTCCCATTTGACTCT
GTCTTCGTTTCGTTATTGTGCTATTGTCTTTGGTTAACAAATGTTTTTCCTCCTTTTCTT
CCTAATATATAAAGTTTCGGATCTAT


BQ
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AF RR4GW33JQ C 1
AF RR4GW33TF U 1
BS 1 326 RR4GW33TF

RD RR4GW33JQ 326 0 0
GCAACAAGTTGTCTATGGCGTTTCCGTCGTGTGTTCAGTGCGGGACGAGACAAAACCCGT
GTAGGTGCAAAGTGGTGGGACCGACGTTAGGATTCGTAGCTTTTCTTGTGACCGGAATCA
TCGAATGGCCAGTTGGTGCGGTGGTCTATATATTTAAACACGGAAAGGGTCGCCGTATAA
TGGGTCATCCAGCCACTGTTGTTTATCCTAAAGTCTCAAGATCTATTCCCATTTGACTCT
GTCTTCGTTTCGTTATTGTGCTATTGTCTTTGGTTAACAAATGTTTTTCCTCCTTTTCTT
CCTAATATATAAAGTTTCGGATCTAT

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR4GW33TF 326 0 0
GCAACAAGTTGTCTATGGCGTTTCCGTCGTGTGTTCAGTGCGGGACGAGACAAAACCCGT
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TGGGTCATCCAGCCACTGTTGTTTATCCTAAAGTCTCAAGATCTATTCCCATTTGACTCT
GTCTTCGTTTCGTTATTGTGCTATTGTCTTTGGTTAACAAATGTTTTTCCTCCTTTTCTT
CCTAATATATAAAGTTTCGGATCTAT

QA 1 326 1 326
DS 



AS 1 2

CO CL6674Contig1 748 2 3 U
TTTCATGATAAGCATTCCTTTGATCATTCATTCAAAGCCTACCAGTATTATCTTGGTTCA
AAGACTATGATCCTGAGATACTTAAACATAGTAAATATAGTACAAACACACGACATAATT
TGTCTACAAAGATAACGGCTAGAATAAAAACTTAAGGGGATGATGACGATAGTTGCAAAA
GCTCCATGACGCCTGTTGTAAACTGAAGTTCTTGCCGAGAGACGATGCTAGTTTAAGACG
GCATGTATGTGGAAGTATCAATCTGCTCAGGAAGTTCCTTAATATCAACCTCAAAACTGT
CTTGCACCTGATTAAGAACTTCTGAGTCTGAAGCTGATGCCACAAATGTTATTGCAAGAC
CCTTTGTTCCAAACCTACCAGCTCTCCCGACCCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTG
GCATGTCGTAATTGATAACAATATTGACACGCTCAATGTCAATGCCTCTCCCTACCAAAT
CTGTCGCCACAAGAATTCTCTTGTGCCCTTCCTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCT
CTCCCTGAGACATGCCAGAATGAATGCATATTGAGGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACT
TGTTCAGCTCCCCAGCTCTGCTAACACTCTTCACAAATATGACAACTTGATTGAAGTCCA
ATGCGTCCAGAAGGTCATTCAACTTGCGGTTCTTCTCCATCTCGCTCAGCTTGATGTAGT
GCTGGACAAGCCCATGAAGAGTCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AQ25JQ U 188
AF RR4GP11JQ U 1
BS 1 295 RR4GP11JQ
BS 296 296 RR4AQ25JQ
BS 297 748 RR4GP11JQ

RD RR4AQ25JQ 209 0 0
GACC
CCTGTTGTAAACTGAAGTTCTTGCCGAGAGACGATGCTAGTTTAAGACGGCATGTATGTG
GAAGTATCAATCTGCTCGGGAAGTTCCTTAATATCAACCTCAAAACTGTCTTGCACCTGG
TTAAGAACTTCTGAGTCTGAAGCTGATGCCACAAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCA
AACCTACCAGCTCTCCCGACCCTGT

QA 5 209 5 209
DS 

RD RR4GP11JQ 748 0 0
TTTCATGATAAGCATTCCTTTGATCATTCATTCAAAGCCTACCAGTATTATCTTGGTTCA
AAGACTATGATCCTGAGATACTTAAACATAGTAAATATAGTACAAACACACGACATAATT
TGTCTACAAAGATAACGGCTAGAATAAAAACTTAAGGGGATGATGACGATAGTTGCAAAA
GCTCCATGACGCCTGTTGTAAACTGAAGTTCTTGCCGAGAGACGATGCTAGTTTAAGACG
GCATGTATGTGGAAGTATCAATCTGCTCAGGAAGTTCCTTAATATCAACCTCAAACCTGT
CTTGCACCTGATTAAGAACTTCTGAGTCTGAAGCTGATGCCACAAATGTTATTGCAAGAC
CCTTTGTTCCAAACCTACCAGCTCTCCCGACCCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTG
GCATGTCGTAATTGATAACAATATTGACACGCTCAATGTCAATGCCTCTCCCTACCAAAT
CTGTCGCCACAAGAATTCTCTTGTGCCCTTCCTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCT
CTCCCTGAGACATGCCAGAATGAATGCATATTGAGGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACT
TGTTCAGCTCCCCAGCTCTGCTAACACTCTTCACAAATATGACAACTTGATTGAAGTCCA
ATGCGTCCAGAAGGTCATTCAACTTGCGGTTCTTCTCCATCTCGCTCAGCTTGATGTAGT
GCTGGACAAGCCCATGAAGAGTCAATTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6675Contig1 868 2 2 U
GTGCAATGACGACGACCGTAAAACCGTCGACTTTGACCTACTTGATCCAACAACATCTTA
TCCGACATGCCAAACCGAAGTCTCCAGCTTGTCTGTTCCGCAGACCCTTTTCACTATTAA
TCAGTAAACCCAATCAGCAGCGTCGCTTCCCTTGCTTCTTCTTATCCTCGTCGATCTCCT
CTTCTTTACCTCTCCAATGTTGTCCTCATATCTCACTCTCTTCTCTCCTCCTACCTAAAT
ATTTATCTTCCGCTTGCGAACCAAAACAAGATGGAGATGAGGTGTCCTTACCCTCTCATA
GCGCGAAAATGGATGAAAACGAAGACGACAGAGAAAGTGGAACAAGTGCTCAAGAGGTGA
TGACTGAGAGCTCGCCAATGAAGTTGTCGGCGAAGGAGAAGAAAAAGATTGCTTCTTACG
CGAACAGCCTTGGAGACAAGCTGAAATGTCAACTCGTAGGCAAGTCAGGCGTCACGGATT
CGGTCGTCTTCTCCGTCCTAGAGACGCTGCAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAAATAC
ACAGGACATGCCCTGGAACGTTAGAGGACATGATTCTGCATTTGTAGGAAGCTACTGGTC
CTGTAGCAGTCGGGAAAATTGGACGGACTGTAATACTTTATCGTTCTAGTCCCACCAATT
TTGACATCAAAGGGGGAGGTAGTTGAGTAGTAACAGATTAGTTGTATCATCATTTTATAT
ACAATTTTGGAATCTCAGGACTGAAGTAATGGACTCGAAACAGAGCCACCACCTATGGCA
AGACTTTTCCATTTTTTCTGTTCTTAAGAGAATTACAATCTCAAACATAGTATCAACCGA
ATGAATAATATATATCCTGATTCGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DC24TF U 1
AF RR4DC24JQ C 285
BS 1 609 RR4DC24TF
BS 610 868 RR4DC24JQ

RD RR4DC24TF 609 0 0
GTGCAATGACGACGACCGTAAAACCGTCGACTTTGACCTACTTGATCCAACAACATCTTA
TCCGACATGCCAAACCGAAGTCTCCAGCTTGTCTGTTCCGCAGACCCTTTTCACTATTAA
TCAGTAAACCCAATCAGCAGCGTCGCTTCCCTTGCTTCTTCTTATCCTCGTCGATCTCCT
CTTCTTTACCTCTCCAATGTTGTCCTCATATCTCACTCTCTTCTCTCCTCCTACCTAAAT
ATTTATCTTCCGCTTGCGAACCAAAACAAGATGGAGATGAGGTGTCCTTACCCTCTCATA
GCGCGAAAATGGATGAAAACGAAGACGACAGAGAAAGTGGAACAAGTGCTCAAGAGGTGA
TGACTGAGAGCTCGCCAATGAAGTTGTCGGCGAAGGAGAAGAAAAAGATTGCTTCTTACG
CGAACAGCCTTGGAGACAAGCTGAAATGTCAACTCGTAGGCAAGTCAGGCGTCACGGATT
CGGTCGTCTTCTCCGTCCTAGAGACGCTGCAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAAATAC
ACAGGACATGCCCTGGAACGTTAGAGGACATGATTCTGCATTTGTAGGAAGCTACTGGTC
CTGTAGCAG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4DC24JQ 584 0 0
TCCTTACCCTCTCATAGCGCGAAAATGGATGAAAACGAAGACGACAGAGAAAGTGGAACA
AGTGCTCAAGAGGTGATGACTGAGAGCTCGCCAATGAAGTTGTCGGCGAAGGAGAAGAAA
AAGATTGCTTCTTACGCGAACAGCCTTGGAGACAAGCTGAAATGTCAACTCGTAGGCAAG
TCAGGCGTCACGGATTCGGTCGTCTTCTCCGTCCTAGAGACGCTGCAGAAGAACGAGCTC
TTAAAGGTGAAAATACACAGGACATGCCCTGGAACGTTAGAGGACATGATTCTGCATTTG
TAGGAAGCTACTGGTCCTGTAGCAGTCGGGAAAATTGGACGGACTGTAATACTTTATCGT
TCTAGTCCCACCAATTTTGACATCAAAGGGGGAGGTAGTTGAGTAGTAACAGATTAGTTG
TATCATCATTTTATATACAATTTTGGAATCTCAGGACTGAAGTAATGGACTCGAAACAGA
GCCACCACCTATGGCAAGACTTTTCCATTTTTTCTGTTCTTAAGAGAATTACAATCTCAA
ACATAGTATCAACCGAATGAATAATATATATCCTGATTCGATTC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL6676Contig1 1053 2 6 U
GGATGTTAATGGATCTAAAAGAGAAGTTGTTCTTATAAATTTGTTTGATTCTAAGAGATC
TAAAAGAGTTATCAAAGATTAAATTGTAGCTTTGAGATTTGATCTCTCAACTTGAATATT
TTTTGGACGAGCTTGGTTATTAATTGAACCGGCTAATACTCCGGCGATTTAATCACAATG
AGTAACAAGCTTCTCGACATCTATCCTCTCGACCTTAAATTCCATTTTGAATTGAAGAAA
TATATCTCTTGCACTCAGTATTTGACTAACAAGACCGACAATTATGTGGCCTTCAAGGTT
AAAACGACGAATCCAAAAAGATATTGTGTGAGGCCTAATATTGGCGTTGTTCTTCCTGGA
TCCTCTATCGAAGTTGTAGTGATCGTGCAAGCGCAAAAGGAAGTTCCGGCTGATATGCAG
TGCAAGGATAAGTTCTTGTTTCAGAGTGTTGTGGCTAGTCCCGGAACCAATGCCAAAGAA
GTTACTCGTGAGATGTTTAGCAAAGAGTCAGGGAATCAAGTCGAGAACATTAAACTGAGA
GTTGTCTATGTTGATCCACCTCGACCACCATTAAAAGAAGGTTCTTTACCAAGAGCTTCC
GTCTCTGATAATGGGAACGCTTCTGCGAGTGCAGTCATCACAAGGCTCACTGAGGAAAAG
AACTCTGCGGTTCAGCTGAACAAAAAACTTCAACAAGAATTGGACCAGTTGAAGCAGGGA
AGCAATAAAAGTCAGAGTGGTTGTGGAATCGATAAAAGCCAGCGTGGTTGTGGACTCCTG
ATACATATCAAATGGTATATTTCCGCAAGAGTCTTAAGAAGAAAGACAGTGAAAGAAGGG
GAAGTGGCAATACAGATTTAACGTGAACAAAGGAAGTCAACGTTACTGTATGACTACAGA
ACTTCTGGAGACGAAAGATTTGCACGAGAGATCGTTATCTTAATAAACAATCTTGTAACG
GTTTTCTGTTTTTTTTCATGCTAAATGTGTGTTCTGAGTGTCGCCATGATGAAACCTCTG
AATGTATCGCGTAATATGATTATGATTGATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FK61TF U 1
AF RR4FK61JQ C 346
BS 1 644 RR4FK61TF
BS 645 645 RR4FK61JQ
BS 646 658 RR4FK61TF
BS 659 659 RR4FK61JQ
BS 660 678 RR4FK61TF
BS 679 1053 RR4FK61JQ

RD RR4FK61TF 678 0 0
GGATGTTAATGGATCTAAAAGAGAAGTTGTTCTTATAAATTTGTTTGATTCTAAGAGATC
TAAAAGAGTTATCAAAGATTAAATTGTAGCTTTGAGATTTGATCTCTCAACTTGAATATT
TTTTGGACGAGCTTGGTTATTAATTGAACCGGCTAATACTCCGGCGATTTAATCACAATG
AGTAACAAGCTTCTCGACATCTATCCTCTCGACCTTAAATTCCATTTTGAATTGAAGAAA
TATATCTCTTGCACTCAGTATTTGACTAACAAGACCGACAATTATGTGGCCTTCAAGGTT
AAAACGACGAATCCAAAAAGATATTGTGTGAGGCCTAATATTGGCGTTGTTCTTCCTGGA
TCCTCTATCGAAGTTGTAGTGATCGTGCAAGCGCAAAAGGAAGTTCCGGCTGATATGCAG
TGCAAGGATAAGTTCTTGTTTCAGAGTGTTGTGGCTAGTCCCGGAACCAATGCCAAAGAA
GTTACTCGTGAGATGTTTAGCAAAGAGTCAGGGAATCAAGTCGAGAACATTAAACTGAGA
GTTGTCTATGTTGATCCACCTCGACCACCATTAAAAGAAGGTTCTTTACCAAGAGCTTCC
GTCTCTGATAATGGGAACGCTTCTGCGAGTGCAGTCATCACAAG*CTCACTGAGGAAA*G
AACTCTGCGGTTCAGCTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FK61JQ 708 0 0
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CCGGCTGATATGCAGTGCAAGGATAAGTTCTTGTTTCAGAGTGTTGTGGCTAGTCCCGGA
ACCAATGCCAAAGAAGTTACTCGTGAGATGTTTAGCAAAGAGTCAGGGAATCAAGTCGAG
AACATTAAACTGAGAGTTGTCTATGTTGATCCACCTCGACCACCATTAAAAGAAGGTTCT
TTACCAAGAGCTTCCGTCTCTGATAATGGGAACGCTTCTGCGAGTGCAGTCATCACAAGG
CTCACTGAGGAAAAGAACTCTGCGGTTCAGCTGAACAAAAAACTTCAACAAGAATTGGAC
CAGTTGAAGCAGGGAAGCAATAAAAGTCAGAGTGGTTGTGGAATCGATAAAAGCCAGCGT
GGTTGTGGACTCCTGATACATATCAAATGGTATATTTCCGCAAGAGTCTTAAGAAGAAAG
ACAGTGAAAGAAGGGGAAGTGGCAATACAGATTTAACGTGAACAAAGGAAGTCAACGTTA
CTGTATGACTACAGAACTTCTGGAGACGAAAGATTTGCACGAGAGATCGTTATCTTAATA
AACAATCTTGTAACGGTTTTCTGTTTTTTTTCATGCTAAATGTGTGTTCTGAGTGTCGCC
ATGATGAAACCTCTGAATGTATCGCGTAATATGATTATGATTGATGCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6677Contig1 766 2 2 U
GTGTTAACGCATTCGCAGCATTTGAATTTCTTCACCGTCTTTGTTCTTGCTTCGGTCCCA
AATCCTCTGTTTGACCTAGCTGGGATAATGTGTGGACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAG
TTTTTTCTGGCTACTTTGATCGGAAAAGCGATCATCAAAACTCACATACAGACGATATTT
ATCATCTGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGGATGGAGAACGAGCTGATCTGGATA
CTTAGCCATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCTGGACTCACAGCCAAACTCCATGCC
ATGAAAGAAAAGTATATTGATGCACCACCTCCTGTTCCATCACATATCAAGGTGAAAAGA
TGGGATTTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATAGTGTGGCTGACGCTTCTCAACTTC
TTCGTCAAGATTGTGACAGCGACTGCACAGAGACACTTGAAGAAGAAGCGAGAGAAAGAA
GTAGCTGCTTTGACTCATTTAGATTGATCTTTCTTCCTTATATGCTCTCCAACATCAAAA
CTGAAGAAGGACCAAAACTGATCAAGAAAATGGCAGTTTTTCTTCTTCTCATTTTCGCAT
CGTTGACACATTGTTCTGGTGGGATTTGTACTTTATAGAACATAAAATGGTTAGGAGGAA
TTGGGATTATGAGATTGCAGGAGGCTTATTTTGACCTTGTGATTCCATTGAGAATGATTT
GTTTGAATAATTCAGAGAATGGAAGAAAAAAAAAGCTCTAGTTACT


BQ
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AF RR4G810TF U 1
AF RR4G810JQ C 79
BS 1 402 RR4G810TF
BS 403 766 RR4G810JQ

RD RR4G810TF 402 0 0
GTGTTAACGCATTCGCAGCATTTGAATTTCTTCACCGTCTTTGTTCTTGCTTCGGTCCCA
AATCCTCTGTTTGACCTAGCTGGGATAATGTGTGGACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAG
TTTTTTCTGGCTACTTTGATCGGAAAAGCGATCATCAAAACTCACATACAGACGATATTT
ATCATCTGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGGATGGAGAACGAGCTGATCTGGATA
CTTAGCCATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCTGGACTCACAGCCAAACTCCATGCC
ATGAAAGAAAAGTATATTGATGCACCACCTCCTGTTCCATCACATATCAAGGTGAAAAGA
TGGGATTTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATAGTGTGG

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4G810JQ 688 0 0
GCTGGGATAATGTGTGGACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAGTTTTTTCTGGCTACTTTG
ATCGGAAAAGCGATCATCAAAACTCACATACAGACGATATTTATCATCTGTGTCTGTAAC
AACCAACTGCTCGATTGGATGGAGAACGAGCTGATCTGGATACTTAGCCATGTCCCCGGT
TTGGCTGCTGTGTTGCCTGGACTCACAGCCAAACTCCATGCCATGAAAGAAAAGTATATT
GATGCACCACCTCCTGTTCCATCACATATCAAGGTGAAAAGATGGGATTTTTCATTTGCA
TCAATCTGGAATGGGATAGTGTGGCTGACGCTTCTCAACTTCTTCGTCAAGATTGTGACA
GCGACTGCACAGAGACACTTGAAGAAGAAGCGAGAGAAAGAAGTAGCTGCTTTGACTCAT
TTAGATTGATCTTTCTTCCTTATATGCTCTCCAACATCAAAACTGAAGAAGGACCAAAAC
TGATCAAGAAAATGGCAGTTTTTCTTCTTCTCATTTTCGCATCGTTGACACATTGTTCTG
GTGGGATTTGTACTTTATAGAACATAAAATGGTTAGGAGGAATTGGGATTATGAGATTGC
AGGAGGCTTATTTTGACCTTGTGATTCCATTGAGAATGATTTGTTTGAATAATTCAGAGA
ATGGAAGAAAAAAAAAGCTCTAGTTACT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6678Contig1 873 2 2 U
CATTGGCTTATACTCAATTCGAAGCTCTTTGTGGTTTTGTACCTCTTCAGGAGCTTAAGA
GTGTCATTCGTGCTATTCCGGAGATTGAAGAACTTGTTGGGAGCGAAGAAACAAACCAAG
TCTTCTCCATCAGTGAACATGATGATGAGAAAGTTAAATCTGTTGTCCGAACTATCTTCA
CCCTGCTAATGTCTGCAGGCCCTGACACGACAAAGCAGATCGTATTCAAACTAAAACGCC
GTCTGCATTTTGAGAGTCAGGAACGACATCTGACAGACAAGGAACGGCTAGTGTTGAAGC
TAGAGAAGCAATATCCAAATGATATTGGGGTCATATCTGCATTCTTCTTCAACTACGTGA
AGCTCAATCCTGGTGAAGCCTTGTACCTCGGTGCAAACGAGCCACATGCATACTTATTCG
GTGAGTGCATTGAGGTCATGGCGACTTCAGACAATGTAGTACGAGCTGGCCTCACTTCCA
AGCCTCTTGATATTCAATCACTTTGTTCCATGCTCACATATAAACTGGGCTTTCCTTAAA
TACTAAAGGGATCAAAGATTAGACCATACATCACGAGATACCTCCCGCCTTTTGACGAGT
TTGAAGTTGATGTCTGTGATCTTCCCTGTGGAGCCTCGACGGTGTTTCCCTCTGTACCAG
GTCCCTCTCTTCTGCTTGTACTCCATGGTGAAGGAAGAATGTCTACAGACGGTTCTGCTG
ATGAGGTTTCAATGGGAGATGTTCTGTTTGTGCCTGCAGATACTGAGATCCACTTGAAGT
CTTCTTCTGACTTGAAGCTGTACAGAGCAGGAGTGAACAATAGGTTTTTGTATTCTCTAT
AGTTTGAACTACACACAACACAAGCTTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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ATTTTATTCTTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA87TF U 1
AF RR4DA87JQ C 449
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TACTCTGAGTT
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DS 

RD RR4DA87JQ 765 0 0
CAAAGATAGCAGGGACGATCCTATGTGTAGCAGGAGCGACCTCCATGACTCTGCTTCGTG
GACCTAAGATTCTCAACTCAGAATCTGCTTTACCAGTGGCCAATGCAGTATTAGAAGATA
TGAAAGATCAGAACACGTGGCTCTTTGGTTGTTTGTTCTTGTTCTCTAGCACTCTTTGCT
GGTCCTTTTGGCTTACACTTCAGGTTCCAATATCTGCCTATTACCCAGATCACCTCTCTT
TATCAGCTTGGATGTGTCTATTCGGAACAATACAATGTGCAGTCGTCACTTTCTTCCTTG
AAAAGGACCCGAACGCTCGGATTCTCCATTCATACTCTGAGTTTGCAACCTGTCTTTACG
CAGGAGTTGGGGCGTCAGCACTTTCGTTTACGGTCCAAGCTTGGGCTATATCAAAGAGAG
GTCCTGTTTTCTCTGCGTTGTTTAATCCTCTCTGCACAGTCATCGTTACAATCTTGGCTG
CTATGTTCTTCCAAGAAGAGATTTACATTGGAAGTTTAATCGGATGAGTAGGTGTAATTA
TGGGACTTTACATTGTGCTTTGGGGTAAAGCAAAAGATGTCATGATGAATCAAGAACAGA
GAGACAGTGAAAACGACTCAGAAGTGAAGATTCATAACGAAGATTTTTCAAACACAACAA
ACTGTAACAGAGATCTTGAGGATCCCCTTCTGTCAAAATAGATATCAACAGAAGAAATCA
AAACACAGCAACAACTAAACTGATTCAAGAATATTTTATTCTTCT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6680Contig1 1061 2 6 U
CGGATTTCCATCAGGAAGCACACCTTCTGATCTAGCCTACGCTAATGGCTATAAAGGAAT
CGCTGGTTATCTCTCAGAGTATGCCTTGAGAGCACATGTTTCTTTGCTCAGTCTAAACGA
GAAAAACGCAGCGTTTGAGACAGCTCCTAGCCCGTCCAGCTCGGCATTAACAGACTCTCT
CACGGCTGTACGTAACGCTAGCCAAGCAGCGGCTCGGATTCATCAGGTTTTCAGGGCTCA
GTCTTTCCAGAAGAAGCAGATGAAAGAGTTAGGAGACAGAAGGCTAGGAATGTCGGAAGA
GCGTGCTCTTTCAATGCTTGCTCCAAAAACACACAAACAAGGAAGGGCGCATTGTGATGA
TTCCGTGCAAGCTGCTGCCATCCGGATTCAGAACAAGTTCCGTGGTTACAAGGGAAGAAA
AGATTACTTGATTACTCGTCAAAGAATCATCAAGATACAGGCTCATGTGAGAGGTTATCA
GGTTAGGAAAAACTACAGGAAGATTATTTGGTCAGTGGGGATACTAGAGAAGGTGATATT
GCGTTGGAGAAGGAAAGGAGCTGGTCTGCGTGGGTTTAAGTCAGACGCACTTGTTACTAA
AATGCAAGATGGAACAGAGAAAGAAGAAGATGATGATTTTTTCAAACAAGGTAGAAAGCA
AACAGAGGAAAGGCTTGAAAAGGCTCTTGCAAGAGTTAAGTCAATGGCTCAGTATCCTGA
AGCTAGAGATCAATACCGCAGATTACTAAATGTGGTCAACGACATCCAAGAAAGCAAGGT
TGAAAAGGCTCTTGCAAATTCAGAAGAAGCAGCTTGTTTTGATGATGATCTGATAGATAT
TGAGGCATTGCTGGGAGATGATGACACTTTGATGATGCCTATGCCCTCAACTTTGTGGAA
CACTGAAACCATTCTCAAGCCTACTATGTGAGATATTCTTATAGTTATGGACTCATTAGA
CTTGTAAATTCTTATGTAATCACACGCTTTTATCTTGTTCTGTAACTGCATTCATGATTA
ATTTATATATTTGACGACATGAACTACATCAACTTATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EY48TF U 1
AF RR4EY48JQ C 387
BS 1 672 RR4EY48TF
BS 673 673 RR4EY48JQ
BS 674 682 RR4EY48TF
BS 683 683 RR4EY48JQ
BS 684 717 RR4EY48TF
BS 718 1061 RR4EY48JQ

RD RR4EY48TF 717 0 0
CGGATTTCCATCAGGAAGCACACCTTCTGATCTAGCCTACGCTAATGGCTATAAAGGAAT
CGCTGGTTATCTCTCAGAGTATGCCTTGAGAGCACATGTTTCTTTGCTCAGTCTAAACGA
GAAAAACGCAGCGTTTGAGACAGCTCCTAGCCCGTCCAGCTCGGCATTAACAGACTCTCT
CACGGCTGTACGTAACGCTAGCCAAGCAGCGGCTCGGATTCATCAGGTTTTCAGGGCTCA
GTCTTTCCAGAAGAAGCAGATGAAAGAGTTAGGAGACAGAAGGCTAGGAATGTCGGAAGA
GCGTGCTCTTTCAATGCTTGCTCCAAAAACACACAAACAAGGAAGGGCGCATTGTGATGA
TTCCGTGCAAGCTGCTGCCATCCGGATTCAGAACAAGTTCCGTGGTTACAAGGGAAGAAA
AGATTACTTGATTACTCGTCAAAGAATCATCAAGATACAGGCTCATGTGAGAGGTTATCA
GGTTAGGAAAAACTACAGGAAGATTATTTGGTCAGTGGGGATACTAGAGAAGGTGATATT
GCGTTGGAGAAGGAAAGGAGCTGGTCTGCGTGGGTTTAAGTCAGACGCACTTGTTACTAA
AATGCAAGATGGAACAGAGAAAGAAGAAGATGATGATTTTTTCAAACAAGGTAGAAAGCA
AACAGAGGAAAG*CTTGAAAAG*CTCTTGCAAGAGTTAAGTCAATGGCTCAGTATCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4EY48JQ 675 0 0
TTCAGAACAAGTTCCGTGGTTACAAGGGAAGAAAAGATTACTTGATTACTCGTCAAAGAA
TCATCAAGATACAGGCTCATGTGAGAGGTTATCAGGTTAGGAAAAACTACAGGAAGATTA
TTTGGTCAGTGGGGATACTAGAGAAGGTGATATTGCGTTGGAGAAGGAAAGGAGCTGGTC
TGCGTGGGTTTAAGTCAGACGCACTTGTTACTAAAATGCAAGATGGAACAGAGAAAGAAG
AAGATGATGATTTTTTCAAACAAGGTAGAAAGCAAACAGAGGAAAGGCTTGAAAAGGCTC
TTGCAAGAGTTAAGTCAATGGCTCAGTATCCTGAAGCTAGAGATCAATACCGCAGATTAC
TAAATGTGGTCAACGACATCCAAGAAAGCAAGGTTGAAAAGGCTCTTGCAAATTCAGAAG
AAGCAGCTTGTTTTGATGATGATCTGATAGATATTGAGGCATTGCTGGGAGATGATGACA
CTTTGATGATGCCTATGCCCTCAACTTTGTGGAACACTGAAACCATTCTCAAGCCTACTA
TGTGAGATATTCTTATAGTTATGGACTCATTAGACTTGTAAATTCTTATGTAATCACACG
CTTTTATCTTGTTCTGTAACTGCATTCATGATTAATTTATATATTTGACGACATGAACTA
CATCAACTTATAACC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6681Contig1 1003 2 10 U
GGAATTCCAGGAAAGACGATGAAGATGATGATGATCATGGATTCATGGTGATGATGACGA
AGACGAGAGATTCCTCAATCAGTCAAGATTGGCATTCGGAAAGTCGGATAATTTGGGGTA
TTGAAATCTCCGATGGACAGTTCGAGTGACAACGAGGGCGATTACGACGAAAGAAATGAA
GGAGGATCCACATCGGAGGATTATCGATTGTTGGGTCGGCAAGTTACGGTTCATCAGTTC
ATGGGCGGTGGCAAAGCTGCTGACTTGCTTTTGTGGAGGAAGAGACATCATTCGTTGGGA
GTTATCGTCTTATCAACCGTAGCTTGGCTTATATTCGAGTTTTCTGGATTGCCTTTCTTA
TCTGTTTCTTCAGATGTCTTACTGATCGTTGTTATAATATCATTCGTCCTTGCCCGGGCT
TCTGGTTTTAGGAGCAGACATGTGAATTCGTTACCAGAGCTTGTTCTATCTGAGGAAATG
GTGAATAGTGCCGCAGCTTCTTTGCGTATCAAACTTAATCACTTACTTGTGATGGCTCAT
GATGTCACAGTTGGCAACGATTTTCGGCTCTTCTTCAAGGTGGTGATTTGTCTGTGGCTT
CTTTCTGCCATTGGTTGCTATATTTCTTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGGACCATCCTA
TCTGTAACAATACCAGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAAAGTAGACAAGTGTTGCGGT
TTGATTCACAGGCAGTTGACTCATCACTACAAGTTAGTTGACGAAAATGTTATAAGCAGA
CTCTCATGGAGCTTTTCTAAAGATAAAGATTCATGAGCTTAGGTTTGGTGATTTTTGAAA
ATGCTTTCACTCTGTCTTTCTTCACTAGTTGAGTTTTCTTCTTATTTTACCATGTGTAGT
ATGTAACTAAACGACTGATATAATTGATGAATATATAAGATGGTTTCAATTGTTCAAGTT
GATTAACTGTCTCCATTTTTATCTTAGAGTTTAAACACTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F467TF U 1
AF RR4F467JQ C 461
BS 1 731 RR4F467TF
BS 732 732 RR4F467JQ
BS 733 751 RR4F467TF
BS 752 752 RR4F467JQ
BS 753 766 RR4F467TF
BS 767 767 RR4F467JQ
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BS 772 795 RR4F467TF
BS 796 1003 RR4F467JQ

RD RR4F467TF 805 0 0
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AGACGAGAGATTCCTCAATCAGTCAAGATTGGCATTCGGAAAGTCGGATAATTTGGGGTA
TTGAAATCTCCGATGGACAGTTCGAGTGACAACGAGGGCGATTACGACGAAAGAAATGAA
GGAGGATCCACATCGGAGGATTATCGATTGTTGGGTCGGCAAGTTACGGTTCATCAGTTC
ATGGGCGGTGGCAAAGCTGCTGACTTGCTTTTGTGGAGGAAGAGACATCATTCGTTGGGA
GTTATCGTCTTATCAACCGTAGCTTGGCTTATATTCGAGTTTTCTGGATTGCCTTTCTTA
TCTGTTTCTTCAGATGTCTTACTGATCGTTGTTATAATATCATTCGTCCTTGCCCGGGCT
TCTGGTTTTAGGAGCAGACATGTGAATTCGTTACCAGAGCTTGTTCTATCTGAGGAAATG
GTGAATAGTGCCGCAGCTTCTTTGCGTATCAAACTTAATCACTTACTTGTGATGGCTCAT
GATGTCACAGTTGGCAACGATTTTCGGCTCTTCTTCAAGGTGGTGATTTGTCTGTGGCTT
CTTTCTGCCATTGGTTGCTATATTTCTTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGGACCATCCTA
TCTGTAACAATACCAGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAAAGTAGACAAGTGTTGCGGT
TTGATTCACAG*CAGTTGACTCATCACTACA*GTTAGTTGACGAAA*TGT*ATAAGCAGA
CTCTCATGGAGCTTT
CTAAGATAAG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4F467JQ 543 0 0
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ACTTACTTGTGATGGCTCATGATGTCACAGTTGGCAACGATTTTCGGCTCTTCTTCAAGG
TGGTGATTTGTCTGTGGCTTCTTTCTGCCATTGGTTGCTATATTTCTTTCTGCACTCTTG
TTTATATCGGGACCATCCTATCTGTAACAATACCAGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCA
AAGTAGACAAGTGTTGCGGTTTGATTCACAGGCAGTTGACTCATCACTACAAGTTAGTTG
ACGAAAATGTTATAAGCAGACTCTCATGGAGCTTTTCTAAAGATAAAGATTCATGAGCTT
AGGTTTGGTGATTTTTGAAAATGCTTTCACTCTGTCTTTCTTCACTAGTTGAGTTTTCTT
CTTATTTTACCATGTGTAGTATGTAACTAAACGACTGATATAATTGATGAATATATAAGA
TGGTTTCAATTGTTCAAGTTGATTAACTGTCTCCATTTTTATCTTAGAGTTTAAACACTA
TCT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL6682Contig1 862 2 2 U
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TGTGCCTATAAGCTGTTCGAGAAAATGACTCGATGAGAACAAGTTGCCACTACTGAAGAA
AAGGAAGTTATATGACCTGAGGTTTGTTTTGTTTGGTTGTTTTAGGTGGAACAATGCTGG
CGAAGACATTTGTTCATAGACATCTCCTTGTTTCGAGGTGTTTCTCATCAGTTAATTCAA
AGATACTTAAGGTGGGAGATGTTTTAAGAGAAGCGAGAGTGTTCACAAGTGAAGATGTTA
AGGGCTATGCTGAGGTGAGCCATGATTGGAACCCACTTCATTTTGATCAAGAATCTGCTC
GTAAAGCTGGGTTCGAGAATCGTCTTGTTCATGGAATGCTTGTTTCTTCTATGTTTCCTC
GTATCATCTCTGCCCATTTTCCTGGAGCAGTTTATGTGTCTCAAACTCTGCATTTTCGAT
CACCGGTTTACATAGGGGATGATGTTCTCGGAATTATACAAGCTACAACTTTAAGAGAAA
CCAAGAATAAGTACATTGTCAAATTCTCAACCAAATGCATCAAGAATCACAGTGAGCTTG
TTGTTCTTGATGGTGAAGCTACTGCAATCTTACCGAACCTCGAGATGCGACAACCAAATC
ATTCGGAATGACATGAAACATATCTGACCTGTGAGTTTCTATGCGTTTTCTCTCTTTTAC
TATGACTAGTCTGTTCTTGTTCTGTTTTATTCTTTCATTTCTGCTGTCTTTGAAGACTAT
GGTCTGAAACTTGTGAGATTTTCGCTGTAACTTTTATTAGCAAGGAACTAGATTGCTACT
ATATAACCTTTTATGATGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EB70TF U 1
AF RR4EB70JQ C 378
BS 1 712 RR4EB70TF
BS 713 862 RR4EB70JQ

RD RR4EB70TF 712 0 0
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AAGGAAGTTATATGACCTGAGGTTTGTTTTGTTTGGTTGTTTTAGGTGGAACAATGCTGG
CGAAGACATTTGTTCATAGACATCTCCTTGTTTCGAGGTGTTTCTCATCAGTTAATTCAA
AGATACTTAAGGTGGGAGATGTTTTAAGAGAAGCGAGAGTGTTCACAAGTGAAGATGTTA
AGGGCTATGCTGAGGTGAGCCATGATTGGAACCCACTTCATTTTGATCAAGAATCTGCTC
GTAAAGCTGGGTTCGAGAATCGTCTTGTTCATGGAATGCTTGTTTCTTCTATGTTTCCTC
GTATCATCTCTGCCCATTTTCCTGGAGCAGTTTATGTGTCTCAAACTCTGCATTTTCGAT
CACCGGTTTACATAGGGGATGATGTTCTCGGAATTATACAAGCTACAACTTTAAGAGAAA
CCAAGAATAAGTACATTGTCAAATTCTCAACCAAATGCATCAAGAATCACAGTGAGCTTG
TTGTTCTTGATGGTGAAGCTACTGCAATCTTACCGAACCTCGAGATGCGACAACCAAATC
ATTCGGAATGACATGAAACATATCTGACCTGTGAGTTTCTATGCGTTTTCTC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EB70JQ 485 0 0
AATCGTCTTGTTCATGGAATGCTTGTTTCTTCTATGTTTCCTCGTATCATCTCTGCCCAT
TTTCCTGGAGCAGTTTATGTGTCTCAAACTTTGCATTTTCGATCACCGGTTTACATAGGG
GATGATGTTCTCGGAATTATACAAGCTACAACTTTAAGAGAAACCAAGAATAAGTACATT
GTCAAATTTTCAACCAAATGCATCAAGAATCACAGTGAGCTTGTTGTTCTTGATGGTGAA
GCTACTGCAATCTTACCGAACCTCGAGATGGGACAACCAAATCATTCGGAATGACATGAA
ACATATTTGACCTGTGAGTTTCTATGCGTTTTCTCTCTTTTACTATGACTAGTCTGTTCT
TGTTCTGTTTTATTCTTTCATTTCTGCTGTCTTTGAAGACTATGGTCTGAAACTTGTGAG
ATTTTCGCTGTAACTTTTATTAGCAAGGAACTAGATTGCTACTATATAACCTTTTATGAT
GTTTT

QA 1 485 1 485
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6684Contig1 1173 2 2 U
GGATTTCACTCAATAAGAACCGTCTGAGAGAGAAAAGAAGAAAAAGTTTTGTAGAGATGG
ATAAGGAAGTAATAGCAGTTTCGGCGATGGACGCTTTCGAGAAGCTCGAGAAAGTCGGGG
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AGGGACTGAGCAAAGATGGAAAGACAGTGCTGTACTTGGTGTTTGAGTACATTGACACTG
ACGTCAAGAAGTACATCAGAAGTTTCCGTCAGACTGGAGCCAACATTCCTCCCCACATTG
TCAAGAGTTTGATGTACCAACTTTGCAAAGGAATCGCTTTCTGCCATGGCCACGGTGTGC
TCCACAGAGATCTCAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCCCAAGACAATGAGGCTTAAGA
TTGCTGATCTTGGTTTAGCCAGAGCCTTTACTCTCCCTATGAAGAAGTATACTCATGAGA
TATTGACTCTATGGTATAGAGCACCAGAGGTGCTTCTTGGGGCCACTCATTACTCTACTG
CTGTTGATATGTGGTCTGTTGGCTGCGTCTTTGCTGAGCTTGTGACCAACCAAGCCATCT
TTGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTTCTCCATATCTTCAGGTTGCTCGGGACACCTA
ATGAAGAAATGTGGCCAGGTGTGAGCACACTCAAGAACTGGCACGAATACCCACAGTGGA
AGCCCTTGAGTCTCTCCACATCTGTTCCCAAACTTGACCAGGCTGGACTTGATCTTCTCT
CTAAAATGCTGCAGTACGAGCCAGCGAAACGAATTTCAGCGAAGATGGCTATGGAGCATC
CTTACTTTGATGATCTCCCGGACAAGTCCTCTCTCTGAGGATTTTGATCTTTTGAGTTAC
TGCTTCTTTCAAGCATATCTCTAGTGTGCTTCTCACTCTCTTCGCTTTTTAGCTTATTAT
CATCACCTCTGTTTGTGTTTCTTTCTGTTCCCAAGTTTGTATCAAATGCTCAACGTTTTT
AAGTAAGAAAACTTATCTATTCTATAATGATAC


BQ
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AF RR4H126TF U 1
AF RR4H126JQ C 433
BS 1 751 RR4H126TF
BS 752 1173 RR4H126JQ

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ATAAGGAAGTAATAGCAGTTTCGGCGATGGACGCTTTCGAGAAGCTCGAGAAAGTCGGGG
AAGGCACCTACGGTAAAGTCTACAGAGCCAGAGAGAAATCCACCGGGAAAATCGTCGCGC
TCAAGAAGACGCGTCTCCACGAGGACGAAGAAGGCGTTCCTTCCACCACTCTCCACGAGA
TCTCCATCTTACGCATGCTCGCTCGCGATCCTCACATCGTCAAGTTGATGGATGTGAAGC
AGGGACTGAGCAAAGATGGAAAGACAGTGCTGTACTTGGTGTTTGAGTACATTGACACTG
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TCAAGAGTTTGATGTACCAACTTTGCAAAGGAATCGCTTTCTGCCATGGCCACGGTGTGC
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TTGCTGATCTTGGTTTAGCCAGAGCCTTTACTCTCCCTATGAAGAAGTATACTCATGAGA
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CTGTTGATATGTGGTCTGTTGGCTGCGTCTTTGCTGAGCTTGTGACCAACCAAGCCATCT
TTGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTTCT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4H126JQ 741 0 0
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TCAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCCCAAGACAATGAGGCTTAAGATTGCTGATCTTG
GTTTAGCCAGAGCCTTTACTCTCCCTATGAAGAAGTATACTCATGAGATATTGACTCTAT
GGTATAGAGCACCAGAGGTGCTTCTTGGGGCCACTCATTACTCTACTGCTGTTGATATGT
GGTCTGTTGGCTGCGTCTTTGCTGAGCTTGTGACCAACCAAGCCATCTTTGCTGGAGACT
CTGAGCTCCAACAGCTTCTCCATATCTTCAGGTTGCTCGGGACACCTAATGAAGAAATGT
GGCCAGGTGTGAGCACACTCAAGAACTGGCACGAATACCCACAGTGGAAGCCCTTGAGTC
TCTCCACATCTGTTCCCAAACTTGACCAGGCTGGACTTGATCTTCTCTCTAAAATGCTGC
AGTACGAGCCAGCGAAACGAATTTCAGCGAAGATGGCTATGGAGCATCCTTACTTTGATG
ATCTCCCGGACAAGTCCTCTCTCTGAGGATTTTGATCTTTTGAGTTACTGCTTCTTTCAA
GCATATCTCTAGTGTGCTTCTCACTCTCTTCGCTTTTTAGCTTATTATCATCACCTCTGT
TTGTGTTTCTTTCTGTTCCCAAGTTTGTATCAAATGCTCAACGTTTTTAAGTAAGAAAAC
TTATCTATTCTATAATGATAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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TTAAACAGAGAGATGTGTATGGGTCCTAGTCTTACAATAAAGTTTACAAAGCAGTTCTTG
TTTCGACTGCAATGTTGATTTTGTTGATGAATTCATCAACAGGAATGGTTCCGAGCTCTC
CTCCAAACCTCGATCTAACGGTAACAGTTCCGGTCTCGACTTCCTTAGGACCCACAACCG
CCATCAACGGGATCTTCTGCGTCTCTGCGTTTCTTATGAGCTTTGGCAACCTCTCCCCAT
GGCACAACTCAGCCCTCACTCCACAAGCTCTCAGCTTCTTACTCACTTCCTTGCAGAACT
CCAACTGATTGTCTGTGACGGGCAAAACCCGAACTTGAACAGGAGAGAGCCACAATGGAA
AATCCCCTGCGTAATGTTCAATGAGAACCCCAAAAAACCTTTCCAAAGAGCCCAAAACCG
CCCTGTGGATCATTATAGGACGTTTCTTATCCGAGTTTGTGTCCACATAAGTAATGTCAA
ACCTCTGAGGAAGATTAAAGTCAACCTGTATGGTTGAGCACTGCCACTTTCTTCCCAATG
CATCTTCGATCTTAAGATCAATCTTCGGTCCATAAAAGGCGCCACCTCCTTCATCAACCT
CATAGCTCCATCCCTTATCATCTAAAGCATCCTTAAGAGCACACGTCGCCTTTTCCCATA
TATCATCACTTCCAACTGACTTTTCAGGTCTAGTTGATAAGTTAACCTCATACTTATCGA
ACCCAAACCTAGACATATCTCTTCCGTGAGATCCAATACACCTCTGATCTCGTCTTTGAT
CTGATCTCTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4C926JQ U 1
AF RR4C963JQ U 42
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BS 708 790 RR4C926JQ
BS 791 791 RR4C963JQ
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BS 816 816 RR4C963JQ
BS 817 856 RR4C926JQ

RD RR4C926JQ 856 0 0
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TTAAACAGAGAGATGTGTATGG*TCCTAGTCTTACAATAAAGTT*ACAAAGCAGTTCTTG
TTTCGACTGCAATGTTGATTTTGTTGATGAATTCATCAACAGGAATGGTTCCGAGCTCTC
CTCCAAACCTCGATCTAACGGTAACAGTTCCGGTCTCGACTTCCTTAGGACCCACAACCG
CCATCAACGGGATCTTCTGCGTCTCTGCGTTTCTTATGAGCTTTGGCAACCTCTCCCCAT
GGCACAACTCAGCCCTCACTCCACAAGCTCTCAGCTTCTTACTCACTTCCTTGCAGAACT
CCAACTGATTGTCTGTGACGGGCAAAACCCGAACTTGAACAGGAGAGAGCCACAGTGGAA
AATCCCCTGCGTAATGTTCAATGAGAACCCCAAAAAATCTTTCCAAAGAGCCCAAAACCG
CCCTGTGGATCATTATAGGACGTTTCTTATCCGAGTTTGTGTCCACATAAGTAATGTCAA
ACCTCTGAGGAAGATTAAAGTCAACCTGTATTGTTGAGCATTGCCACTTTCTTCCCAATG
CATCTTCGATCTTAAGATCAATCTTCGGTCCATAAAAGGCGCCACCTCCTTCATCAACCT
CATAGCTCCATCCCTTATCATCTAAAGCATCCTTAAGAGCACACGTTGCCTTTTCCCATA
TATCATCACTTCCAACTGACTTTTCAGGTCTAGTTGATAAGTTAACCTCATACTTATCGA
ACCCAAACCTCGACATATCTCTTCCGTGAGATCCA*TACACCTCTGATCTCGTCTTTGAT
CTGATCTCTAAAAAAA

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR4C963JQ 808 0 0
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GTTTACAAAGCAGTTCTTGTTTCGACTGCAATGTTGATTTTGTTGATGAATTCATCAACA
GGAATGGTTCCGAGCTCTCCTCCAAACCTCGATCTAACGGTTACAGTTCCGGTCTCGACT
TCCTTAGGACCCACAACCGCCATCAACGGGATCTTCTGCGTCTCTGCGTTTCTTATGAGC
TTTGGCAACCTCTCCCCATGGCACAACTCAGCCCTCACTCCACAAGCTCTCAGCTTCTTA
CTCACTTCCTTGCAGAACTCCAACTGATTGTCTGTGACGGGCAGAACCCGAACTTGAACA
GGAGAGAGCCACAATGGAAAATCCCCTGCGTAGTGTTCAATGAGAACCCCAAAAAACCTT
TCCAAAGAGCTCAAAACCGCCCTGTGGATCATTATAGGACGTTTCTTATCCGAGTTTGTG
TCCACATAAGTAATGTCAAACCTCTGAGGAAGATTAAAGTCAACCTGTATGGTTGAGCAC
TGCCACTTTCTTCCCAATGCATCTTCGATCTTAAGATCAATCTTTGGTCCATAAAAGGCG
CCACCTCCTTCATCAACCTCATAGCTCCATCCCTTATCATCTAAAGCATCCTTAAGAGCA
CACGTCGCCTTTTCCCATATATTATCACTTCCAACTGACTTTTCAGGTCTGGTTGATAAG
TTAACCTCATACTTATCGAACCCAAACCTAGACATATCTCTTCCGTGAGATCCAATACAC
CTCTGATCTCGTCTTTGATCTGATC
CCT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL6686Contig1 1215 2 16 U
GGACCACATCGATCACGAAATCTTGGGTCGTCTCCTGCCATTAAAAACATCTCGCCAGAT
ACATAGATAGATAAACTCCGATCTCTCTCTCTCTCTGCACGTCGACTTCTTGTGTTTTTT
TTTCGTAAAGATGAAAGCTTTCTGCATATTCGTCGCCTCATTGCTTCTCACCGTTAATTC
CAGGGGAGAAGCTACCTCTTCTGTTTTCCTCATTGATGGATCCAACAACCAATTTCTTCG
TCCACCATCAGCCGAGGCGCTTCACATGTCCCTCTCTGAGATATCTGCATCAGTGTCTGC
CTTGTTGGGTTTTGCACCTCCATCTACTTTGACCGCCCATGGCTCCTCCAAGCTGAACAA
AATTCTAAAGCCTAATCCTTTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTTCTAGAAATCGCCGG
AGCTCATGATGCGCTTGTGGAAACCTACACTAGTCATTCTTTCTTGGGCAACGCCATAAG
AGGAAGTATCAGCTCTGATTCTTACAATGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGGAGTTGC
TGTTGTGTCTGTCAACGAACCCTCATCTGATGTGACTGACAAAGACATGAATGAGTTTGC
ATCTTGGTTGGGTGGGTCCTATGTTACTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAG
TATCCCTCTGGCTGAGGGTGCTAATGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAA
ATTTGCATTGAACCTTTTGGATCTATATAATAATATCAGAGGAGCAGTCAACCTTCGTGG
GGATCTATCTCATGGTATTGAGAGACCTGCTGAACTAACGGTTGGACGCTTTGTCGGTAT
TAATGCTTTAGCACAGGAGTATGGGCAAGTTATGGCTAAGCAAGGGATGGATGTATTGCT
TACTACACTATCAAAGCTATTTGATCTGTTGGAGACATCTCACAAAGGCCAAATTGTTGG
AGTGATCGTCCTTGATGAGAGAGTAAATCAAGAATCAGCTAATCTTCTGAGCGTTGAGTC
TTCATCTCGTTCATCTGCACGGTCTATGGCTGAGTAGAGGGAGTTCCAAGTGCAGCCATT
ATCGCTCAGTTATACTCGTTAGCTGACGCTTGCATGGTTACTGGATATCCTTCTCATTGC
ACTATCCTTGGTGTGTACTTCCTATGTACATGCCTTTGACAAGACACGCTCTATACTCAA
CGTGAAGCTCGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BB01TF U 1
AF RR4ER55TF U 393
BS 1 471 RR4BB01TF
BS 472 472 RR4ER55TF
BS 473 483 RR4BB01TF
BS 484 484 RR4ER55TF
BS 485 492 RR4BB01TF
BS 493 493 RR4ER55TF
BS 494 593 RR4BB01TF
BS 594 594 RR4ER55TF
BS 595 618 RR4BB01TF
BS 619 619 RR4ER55TF
BS 620 674 RR4BB01TF
BS 675 675 RR4ER55TF
BS 676 738 RR4BB01TF
BS 739 739 RR4ER55TF
BS 740 755 RR4BB01TF
BS 756 1215 RR4ER55TF

RD RR4BB01TF 755 0 0
GGACCACATCGATCACGAAATCTTGGGTCGTCTCCTGCCATTAAAAACATCTCGCCAGAT
ACATAGATAGATAAACTCCGATCTCTCTCTCTCTCTGCACGTCGACTTCTTGTGTTTTTT
TTTCGTAAAGATGAAAGCTTTCTGCATATTCGTCGCCTCATTGCTTCTCACCGTTAATTC
CAGGGGAGAAGCTACCTCTTCTGTTTTCCTCATTGATGGATCCAACAACCAATTTCTTCG
TCCACCATCAGCCGAGGCGCTTCACATGTCCCTCTCTGAGATATCTGCATCAGTGTCTGC
CTTGTTGGGTTTTGCACCTCCATCTACTTTGACCGCCCATGGCTCCTCCAAGCTGAACAA
AATTCTAAAGCCTAATCCTTTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTTCTAGAAATCGCCGG
AGCTCATGATGCGCTTGTGGAAACCTACACTAGTCATTCTTTCTTGGGCAATGCCATAAG
AGGCAGTATCAGTTCTGATTCTTACAATGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGGAGTTGC
TGTTGTGTCTGTCAACGAACCCTCATCTGATGTGACTGACAAAGACATGAATGGGTTTGC
ATCTTGGTTGGGTGGGTCGTATGTTACTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAG
TATCCCTCTGGCTGCGGGTGCTAATGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAA
ATTTGCATTGAACCTTTTTGATCTATATAATAATA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4ER55TF 823 0 0
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GTCATTCTTTCTTGGGCAACTCCATAAGAGGAAGTATCAGCTCTGATTCTTACAATGCTG
ATATTGAACTTCCAGGAAGTGGAGTTGCTGTTGTGTCTGTCAACGAACCTTCATCTGATG
TGACTGACAAAGACATGAATGAGTTTGCATCTTGGTTGGGTGGGTCCTATGTTACTGGCT
CTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTATCCCTCTGGCTGATGGTGCTAATGTGGAGT
TCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAATTTGCATTGAACCTTTTGGATCTATATAATA
ATATCAGAGGAGCAGTCAACCTTCGTGGGGATCTATCTCATGGTATTGAGAGACCTGCTG
AACTAACGGTTGGACGCTTTGTCGGTATTAATGCTTTAGCACAGGAGTATGGGCAAGTTA
TGGCTAAGCAAGGGATGGATGTATTGCTTACTACACTATCAAAGCTATTTGATCTGTTGG
AGACATCTCACAAAGGCCAAATTGTTGGAGTGATCGTCCTTGATGAGAGAGTAAATCAAG
AATCAGCTAATCTTCTGAGCGTTGAGTCTTCATCTCGTTCATCTGCACGGTCTATGGCTG
AGTAGAGGGAGTTCCAAGTGCAGCCATTATCGCTCAGTTATACTCGTTAGCTGACGCTTG
CATGGTTACTGGATATCCTTCTCATTGCACTATCCTTGGTGTGTACTTCCTATGTACATG
CCTTTGACAAGACACGCTCTATACTCAACGTGAAGCTCGATAG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL6687Contig1 443 2 2 U
GGCTTCCTCCACAACTGAAGGACCCAAATTTTCGCCGTTGAAATGGAGAAAGCGACGAAG
AATCCCAATTCGGAGACGCAACCTCCTCCTCCTCAGCCGAATCATCAAATGGATGCAGAC
GATGACGATGAGAATGTGAAACAGCTCAAAGAGTGTTCTTCTCTCTACTTGTCTTTACAG
GATTGTCTCGTTGAGAGCAACAGGGACTGGAAATCTTGCCAGAAACACGTTCAAGCTTTG
AAGGCATGCCATGAAAGGAAAACCAAGAAATGACAAGAGATGAAGAAAAACCACACCTGA
TTGGGAAGTGTTGTTGATTAGTAGTCACTGCTATTACTTAATAGTATCCTCTTATGTATA
CCGTTTTGTGAAACTGGCTTTTCTAACGATTGTTCCTGACTCTAGTTGAGTTTTTGTTTC
TGAGATTAATGGTTATTTCGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H865JQB C 1
AF RR4H865TF U 117
BS 1 116 RR4H865JQB
BS 117 443 RR4H865TF

RD RR4H865JQB 443 0 0
GGCTTCCTCCACAACTGAAGGACCCAAATTTTCGCCGTTGAAATGGAGAAAGCGACGAAG
AATCCCAATTCGGAGACGCAACCTCCTCCTCCTCAGCCGAATCATCAAATGGATGCAGAC
GATGACGATGAGAATGTGAAACAGCTCAAAGAGTGTTTTTCTCTCTACTTGTCTTTACAG
GATTGTCTCGTTGAGAGCAACAGGGACTGGAAATCTTGCCAGAAACACGTTCAAGCTTTG
AAGGCATGCCATGAAAGGAAAACCAAGAAATGACAAGAGATGAAGAAAAACCACACCTGA
TTGGGAAGTGTTGTTGATTAGTAGTCACTGCTATTACTTAATAGTATCCTCTTATGTATA
CCGTTTTGTGAAACTGGCTTT*CTAACGATTGTTCCTGACTCTAGTTGAGTTTTTGTTTC
TGAGATTAATGGTTATTTCGCCG

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR4H865TF 327 0 0
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ACAGGATTGTCTCGTTGAGAGCAACAGGGACTGGAAATCTTGCCAGAAACACGTTCAAGC
TTTGAAGGCATGCCATGAAAGGAAAACCAAGAAATGACAAGAGATGAAGAAAAACCACAC
CTGATTGGGAAGTGTTGTTGATTAGTAGTCACTGCTATTACTTAATAGTATCCTCTTATG
TATACCGTTTTGTGAAACTGGCTTTTCTAACGATTGTTCCTGACTCTAGTTGAGTTTTTG
TTTCTGAGATTAATGGTTATTTCGCCG

QA 1 327 1 327
DS 



AS 1 2

CO CL6688Contig1 1013 2 2 U
GAAAGCGTTGGGAAGACGACGCAGTTCTATGCTAATATGGCTGGTAGAGTAGAAGGTAAT
GCTATGGACATTGTTCAAGCGCTGGAGGATTTGGGATCTGGATTGGGTTTCAGCGGTGCT
CCTGATGTTGAGCATTGTCTTGCTGAGTCCGGTGTGGTCAAGGATATTGTACGTTATACG
TTTGAAGCGGAGGAGGTGCCTTTTGTTTACTCTCTTCCTCGTTTCCCTTTTAACAGAGGA
AAAAGACCTGCTCCTAGCTTTGCTGAGGTTGGAGCCGAGCTACCAGATGAGCATATTCCA
GCTTGGCTTCCTGCTTTTCCCCAAACCAAAATGTGTAGCGGGTTGGAGGAGGCTAGCGTT
GACAAAATACAAGGTGAGGTGCAAAGTAATGGGAACGGACTGTCTTTGCCGAGCTTGCAG
CAGTCTGTTGATGTTGATAGGCTAAAAGTTCAGAAATCCATGGATCAAAAGGATGTTGAG
AAACCATCAGAGGAGCCGGAATGTAACCCGTTCCTTGCTGCACCAGTTTGGGTTGGAGAG
AAGAACGTGCCACGTGTGTTTTGCCCGTCACAGCTTACTAATGAAGAAGTTAGCACTGGT
CACGTTCCTGAGAAACAAACCAACAAGAGCCATCACATTCCGCCCCTTGAGGCGTATGCT
CCATCGGGTATGATCGTAGACAAGAGCAGATTAGGTGAAACGGAGGGAGGAGAGAAAAAT
GATGACGGGAGAACACAACGTGCGTTGCTACGTTTCAAGATTGAGACTCGAAAGGCCCCT
GTGCGTTGGACGATAAAGGAGAGCTTAGAGGAAAAGGGTTGGTTTCTAGAGGATGGAGAC
AAGAGGAAGAAAAATGTAGAACGCGAAGAAAAGCCAGTAACCATTGACACAAATGTAAAA
TAGGTATTTTGCCATTTAGAATTTGTAGACGGAATATCATTTGCCTCTTGAGTTTAGTGA
TAGTTTGCAATTGAATACGTGACTCGTTAAGGAAAAGAGATTTTTACTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GM83TF U 1
AF RR4GM83JQ C 329
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BS 648 1013 RR4GM83JQ

RD RR4GM83TF 647 0 0
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GCTATGGACATTGTTCAAGCGCTGGAGGATTTGGGATCTGGATTGGGTTTCAGCGGTGCT
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TTTGAAGCGGAGGAGGTGCCTTTTGTTTACTCTCTTCCTCGTTTCCCTTTTAACAGAGGA
AAAAGACCTGCTCCTAGCTTTGCTGAGGTTGGAGCCGAGCTACCAGATGAGCATATTCCA
GCTTGGCTTCCTGCTTTTCCCCAAACCAAAATGTGTAGCGGGTTGGAGGAGGCTAGCGTT
GACAAAATACAAGGTGAGGTGCAAAGTAATGGGAACGGACTGTCTTTGCCGAGCTTGCAG
CAGTCTGTTGATGTTGATAGGCTAAAAGTTCAGAAATCCATGGATCAAAAGGATGTTGAG
AAACCATCAGAGGAGCCGGAATGTAACCCGTTCCTTGCTGCACCAGTTTGGGTTGGAGAG
AAGAACGTGCCACGTGTGTTTTGCCCGTCACAGCTTACTAATGAAGAAGTTAGCACTGGT
CACGTTCCTGAGAAACAAACCAACAAGAGCCATCACATTCCGCCCCT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4GM83JQ 685 0 0
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ATGGGAACGGACTGTCTTTGCCGAGCTTGCAGCAGTCTGTTGATGTTGATAGGCTAAAAG
TTCAGAAATCCATGGATCAAAAGGATGTTGAGAAACCATCAGAGGAGCCGGAATGTAACC
CGTTCCTTGCTGCACCAGTTTGGGTTGGAGAGAAGAACGTGCCACGTGTGTTTTGCCCGT
CACAGCTTACTAATGAAGAAGTTAGCACTGGTCACGTTCCTGAGAAACAAACCAACAAGA
GCCATCACATTCCGCCCCTTGAGGCGTATGCTCCATCGGGTATGATCGTAGACAAGAGCA
GATTAGGTGAAACGGAGGGAGGAGAGAAAAATGATGACGGGAGAACACAACGTGCGTTGC
TACGTTTCAAGATTGAGACTCGAAAGGCCCCTGTGCGTTGGACGATAAAGGAGAGCTTAG
AGGAAAAGGGTTGGTTTCTAGAGGATGGAGACAAGAGGAAGAAAAATGTAGAACGCGAAG
AAAAGCCAGTAACCATTGACACAAATGTAAAATAGGTATTTTGCCATTTAGAATTTGTAG
ACGGAATATCATTTGCCTCTTGAGTTTAGTGATAGTTTGCAATTGAATACGTGACTCGTT
AAGGAAAAGAGATTTTTACTGATTC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

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ATGCAAGTTGAGTGAATGATTCATGTTTTTTTTCTTTCTTTTGCTGAAGAGTTTCATGTC
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AATAATTTGTTTGGTTTCG


BQ
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AF RR4AH47JQ C 1
AF RR4AH47TF U 1
BS 1 319 RR4AH47TF

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CCAAAGAATACCAAACTGCTTATTTAACAAAAATTTGGAGTTTTGGCAGTGCATGAACTG
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AATAATTTGTTTGGTTTCG

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR4AH47TF 319 0 0
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CCAAAGAATACCAAACTGCTTATTTAACAAAAATTTGGAGTTTTGGCAGTGCATGAACTG
CCATCAGCTCTACTGGGAGGGAACTCAGTATCATAACGCAGTTCAGAAGTTCATGGATGT
ATGCAAGTTGAGTGAATGATTCATGTTTTTTTTCTTTCTTTTGCTGAAGAGTTTCATGTC
ACTTTTCTCTTAGCCTTGGTTCCCTCGTCATGTCTGAGCAAACATGATGTGTTTTGTAAT
AATAATTTGTTTGGTTTCG

QA 1 319 1 319
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6691Contig1 1282 2 4 U
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CCTCGTAGTTATAAGTGGGGCTATCATAATAGTAATAAGCCTTGCTGCAAAGTGGATAGA
CACACATGCAGAAGGGAACAAATTTTGGCAGAGTATCACTTTTCACGAAAGCAAGAAGCC
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GTCTCTGTCAACAAAGCACCGAACACAGAATCAAGAACTACATTCGTCACACCAGTTCAT
AAACTGGTTAGTTGCCGGTTCTTCGATGGTTCTTCCGTTGTTTTCAGGAAATGGCATCCT
TTCACGTTTAAGTTCAATATTTCTTGGTTTCGCTCCTCTATTCCTTCTTCTGTCTATTGG
ATATGAAGCTGTCTTTTACAGTGCTCTAGCCGTTGTACTAATGGCATGGATATTATTTGA
GAACGCTTCTCATCATTCTAGTAAAGCAAAAGATTCATCTCCATCAGAACAAAACACAGA
GGAACATGTCACTATTGGAAGTGAGGAGAGATACTTGCAGCTATCAGATGTGCGGATTCC
TTTGATTTTTATGGTTTTGTTCAATGTGGCTTTCTTCGGAACTGGGAATTTTGCAAGTAT
AGCAAGTTTTGAGATATCATCTGTCTACCGGTTCATCACAATCTTCAGCCCCTTTCTGAT
GGCAGCTCTTCTTATATTCAAGCTGTTCATACCGTTCATGCTTGTCATATGTGCTTTCAG
TGCAATAACGAAATTAGTGAGAGTGCCAAGACTGGGATGTTACTTCCTTGTGATCTTATT
TTCAGACATAATGACAATACATTTCTTCTTTCTGGTGAAAAACACAGGAAGCTGGATGGA
GATAGGGAATAGCATAAGCCATTTTGGGATAGTGAGTGCTCAAGTGGTCTTTGTGCTTTT
ACTCTTTGCGCTCACAAACGTCTACACCAGAACCATCCGAGTCAAGCCGCTCTCTTCCTC
CCCTTCTCTCAAAACGCTCTGAGATATGTTAGCAAATCAAATCTTAGTTAGAGCGGTTCG
ATCAGGAGATTAGTTTATGTTATATCGTTTGCTCTATGAATATGAAGTTTTGTTTCAATC
CACTTCGAGTTTTAGAGGAAACTTATAGAATATTTTCTTCATTCAGGTTTTATAGTATTT
TGATAAATTAACATCTGATAAATTGATTCAAACATTTTTCTCCTTTGTGATGGATGAATG
ATGAATTTCCCTAACTTATATC


BQ
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AF RR4CF84TF U 1
AF RR4CF84JQ C 501
BS 1 733 RR4CF84TF
BS 734 734 RR4CF84JQ
BS 735 781 RR4CF84TF
BS 782 1282 RR4CF84JQ

RD RR4CF84TF 781 0 0
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CCTCGTAGTTATAAGTGGGGCTATCATAATAGTAATAAGCCTTGCTGCAAAGTGGATAGA
CACACATGCAGAAGGGAACAAATTTTGGCAGAGTATCACTTTTCACGAAAGCAAGAAGCC
GATGTGGTCCAAGCTATATTTCATACAGATTATTTTGGTTGGAGTTTCGTCGGTGATGGT
GTCTCTGTCAACAAAGCACCGAACACAGAATCAAGAACTACATTCGTCACACCAGTTCAT
AAACTGGTTAGTTGCCGGTTCTTCGATGGTTCTTCCGTTGTTTTCAGGAAATGGCATCCT
TTCACGTTTAAGTTCAATATTTCTTGGTTTCGCTCCTCTATTCCTTCTTCTGTCTATTGG
ATATGAAGCTGTCTTTTACAGTGCTCTAGCCGTTGTACTAATGGCATGGATATTATTTGA
GAACGCTTCTCATCATTCTAGTAAAGCAAAAGATTCATCTCCATCAGAACAAAACACAGA
GGAACATGTCACTATTGGAAGTGAGGAGAGATACTTGCAGCTATCAGATGTGCGGATTCC
TTTGATTTTTATGGTTTTGTTCAATGTGGCTTTCTTCGGAACTGGGAATTTTGCAAGTAT
AGCAAGTTTTGAGATATCATCTGTCTACCGGTTCATCACAATCTTCAGCCCCTTTCTGAT
GGCAGCTCTTCTT*TATTCAAGCTGTTCATACCGTTCATGCTTGTCATATGTGCTTTCAG
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4CF84JQ 782 0 0
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GTGAGGAGAGATACTTGCAGCTATCAGATGTGCGGATTCCTTTGATTTTTATGGTTTTGT
TCAATGTGGCTTTCTTCGGAACTGGGAATTTTGCAAGTATAGCAAGTTTTGAGATATCAT
CTGTCTACCGGTTCATCACAATCTTCAGCCCCTTTCTGATGGCAGCTCTTCTTATATTCA
AGCTGTTCATACCGTTCATGCTTGTCATATGTGCTTTCAGTGCAATAACGAAATTAGTGA
GAGTGCCAAGACTGGGATGTTACTTCCTTGTGATCTTATTTTCAGACATAATGACAATAC
ATTTCTTCTTTCTGGTGAAAAACACAGGAAGCTGGATGGAGATAGGGAATAGCATAAGCC
ATTTTGGGATAGTGAGTGCTCAAGTGGTCTTTGTGCTTTTACTCTTTGCGCTCACAAACG
TCTACACCAGAACCATCCGAGTCAAGCCGCTCTCTTCCTCCCCTTCTCTCAAAACGCTCT
GAGATATGTTAGCAAATCAAATCTTAGTTAGAGCGGTTCGATCAGGAGATTAGTTTATGT
TATATCGTTTGCTCTATGAATATGAAGTTTTGTTTCAATCCACTTCGAGTTTTAGAGGAA
ACTTATAGAATATTTTCTTCATTCAGGTTTTATAGTATTTTGATAAATTAACATCTGATA
AATTGATTCAAACATTTTTCTCCTTTGTGATGGATGAATGATGAATTTCCCTAACTTATA
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL6692Contig1 764 2 3 U
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AAGATCATCCTTTACATGTTACATAACATAATGAATGTCTCTGTTCGATTTAATAATTTG
GAGATGATTTTCTTCGCCAGATAAATCACATTACTTAGGCGCAGGTGTGTCTAACTCAGA
CAAAATGTTGTTCATGTCCTCATAATGTGACCAGCTCGTCTTGCTCCTTTCATCAGCTTT
ACACTCCTCGTATTTCTGAATAAGAGACGCCCACAGAGACTTGCACTGTCCCGGGCTTCT
GTTGATTCCTTCAGCTGATAGATTTGAAGAGATCTCTTCCCACAAAGCCATTCTACCTTT
CACCACTTGGAACCTGCTGTGCAACTCTCCACGCATTCTGATCACCCTCTTAACTTCCTC
AGGTTTCCATTTGTTCCTCCTCACACGTTTTGTTGTCGACTTCGTTTGAGAATCGGATGT
ATCACCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTCTCCTGCTTTCGCTATCCTCTGTTTTAGTCTCTGC
ATCAGTTAACCTATCCACTTTTTTGGTTTCACCAGGAGAAGATGGTGATGATGGATTGAT
GAATGAGTTCCAAAAATCATCTGATTCTTCTGAAGAACTCCGAACAGGCACATCTTCAGC
ACCTTCTGTGTATGATGATGACGAAGCCGTTTCTTCCTCACCTAGTAGTCCTACACTACT
ATCAATTATCTCACCAGCTTCTTCTTGCGAAGGTGCTTTCTTGC


BQ
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AF RR4AX42JQ U 354
AF RR4AX42TF C 1
BS 1 353 RR4AX42TF
BS 354 579 RR4AX42JQ
BS 580 764 RR4AX42TF

RD RR4AX42JQ 226 0 0
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CTTCCTCAGGTTTCCATTTGTTCCTCCTCACACGTTTTGTTGTCGACTTCGTTTGAGAAT
CGGATGTATCACCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTCTCCTGCTTTCGCTATCCTCTGTTTTAG
TCTCTGCATCAGTTAACCTATCCACTTTTTTGGTTTCACCAGGAGA

QA 1 226 1 226
DS 

RD RR4AX42TF 764 0 0
AGGCCTTCTTTCTTCCTTGGCATTTTAATCCTGCTTTTAATGGCTTCTACAGACAAAAAA
AAGATCATCCTTTACATGTTACATAACATAATGAATGTCTCTGTTCGATTTAATAATTTG
GAGATGATTTTCTTCGCCAGATAAATCACATTACTTAGGCGCAGGTGTGTCTAACTCAGA
CAAAATGTTGTTCATGTCCTCATAATGTGACCAGCTCGTCTTGCTCCTTTCATCAGCTTT
ACACTCCTCGTATTTCTGAATAAGAGACGCCCACAGAGACTTGCACTGTCCCGGGCTTCT
GTTGATTCCTTCAGCTGATAGATTTGAAGAGATCTCTTCCCACAAAGCCATTCTACCTTT
CACCACTTGGAACCTGCTGTGCAACTCTCCACGCATTCTGATCACCCTCTTAACTTCCTC
AGGTTTCCATTTGTTCCTCCTCACACGTTTTGTTGTCGACTTCGTTTGAGAATCGGATGT
ATCACCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTCTCCTGCTTTCGCTATCCTCTGTTTTAGTCTCTGC
ATCAGTTAACCTATCCACTTTTTTGGTTTCACCAGGAGAAGATGGTGATGATGGATTGAT
GAATGAGTTCCAAAAATCATCTGATTCTTCTGAAGAACTCCGAACAGGCACATCTTCAGC
ACCTTCTGTGTATGATGATGACGAAGCCGTTTCTTCCTCACCTAGTAGTCCTACACTACT
ATCAATTATCTCACCAGCTTCTTCTTGCGAAGGTGCTTTCTTGC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL6693Contig1 990 2 8 U
GGATCATCATCTCATCTCATTACCCTTAAACTCTCAGATCAAAGTGATTTAAACCCCTTT
TTCGATTTCTTTTTGTGTTCTTAAAGTTAGGATCTTTCTTCCTTCCTTCCGTTCACACTT
TTGATTTGATAGTGAGCCATGAATGCTTTAGCCGCAACGAACAGGAACTTCCGTCACGCA
TCTCGGATCCTCGGTTTGGATTCGAAGATCGAGAAGAGTCTCATGATCCCATTCAGAGAA
ATCAAGGTGGAGTGCACGATCCCCAAAGACGACGGAACTCTTGTTTCCTACGTCGGGTTT
AGGGTTCAACACGACAATGCTCGTGGACCCATGAAAGGAGGAATCAGATATCACCCCGAG
GTTGATCCCGATGAAGTCAACGCATTGGCTCAGCTCATGACTTGGAAGACAGCTGTTGCT
GACATTCCATACGGTGGAGCTAAAGGTGGGATCGGATGCAGCCCTCGTGACTTGAGCTTG
AGCGAGCTCGAGAGACTCACCCGTGTCTTCACTCAGAAGATCCACGATCTCATCGGTATT
CACACCGATGTCCCTGCTCCTGATATGGGTACAAACGCTCAGACCATGGCTTGGATTCTT
GATGAGTACTCCAAGTTTCATGGTCATTCCCCCGCTGTTGTCACCGGCAAGCCCATTGAT
CTTGGTGGTTCGCTTGGTAGGGAAGCTGCCACAGGACGTGGTGATAAACATAGGGCGTGG
GCCACATGTTGATGAGAAAGAGCTAGTGAAAGCTCTGACGGAAGGGCGCCTAGGTGGAGC
CGGGCTGGATGTGTTCGAGGAGGAGCCGCATGTGCCTGAGGAGCTCTTTGGACTTGAAAA
TGTGGTTCTGCTTCCTCACGTTGGGAGTGGCACTGTGGAGACACGGAATGCAATGGCGGA
TCTTGTGGTTGGTAACTTGGAAGCGCATTTTGCTGGGAAACCACTTCTGACCCAGGTGGT
CTGAGTGATTTCTTGTCCTTTTTTACCTTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ55TF U 1
AF RR4FM72TF U 235
BS 1 286 RR4EQ55TF
BS 287 287 RR4FM72TF
BS 288 307 RR4EQ55TF
BS 308 308 RR4FM72TF
BS 309 524 RR4EQ55TF
BS 525 525 RR4FM72TF
BS 526 573 RR4EQ55TF
BS 574 990 RR4FM72TF

RD RR4EQ55TF 575 0 0
GGATCATCATCTCATCTCATTACCCTTAAACTCTCAGATCAAAGTGATTTAAACCCCTTT
TTCGATTTCTTTTTGTGTTCTTAAAGTTAGGATCTTTCTTCCTTCCTTCCGTTCACACTT
TTGATTTGATAGTGAGCCATGAATGCTTTAGCCGCAACGAACAGGAACTTCCGTCACGCA
TCTCGGATCCTCGGTTTGGATTCGAAGATCGAGAAGAGTCTCATGATCCCATTCAGAGAA
ATCAAGGTGGAGTGCACGATCCCCAAAGACGACGGAACTCTTGTTTTCTACGTCGGGTTT
AGGGTTCCACACGACAATGCTCGTGGACCCATGAAAGGAGGAATCAGATATCACCCCGAG
GTTGATCCCGATGAAGTCAACGCATTGGCTCAGCTCATGACTTGGAAGACAGCTGTTGCT
GACATTCCATACGGTGGAGCTAAAGGTGGGATCGGATGCAGCCCTCGTGACTTGAGCTTG
AGCGAGCTCGAGAGACTCACCCGTGTCTTCACTCAGAAGATCCATGATCTCATCGGTATT
CACACCGATGTCCCTGCTCCTGATATGGGTACA
CA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4FM72TF 756 0 0
G
GAGAAATCAAGGTGGAGTGCACGATCCCCAAAGACGACGGAACTCTTGTTTCCTACGTCG
GGTTTAGGGTTCAACACGACAATGCTCGTGGACCCATGAAAGGAGGAATCAGATATCACC
CCGAGGTTGATCCCGATGAAGTCAACGCATTGGCTCAGCTCATGACTTGGAAGACAGCTG
TTGCTGACATTCCATACGGTGGAGCTAAAGGTGGGATCGGATGCAGCCCTCGTGACTTGA
GCTTGAGCTAGCTCGAGAGACTCACCCGTGTCTTCACTCAGAAGATCCACGATCTCATCG
GTATTCACACCGATGTCCCTGCTCCTGATATGGGTACAAACGCTCAGACCATGGCTTGGA
TTCTTGATGAGTACTCCAAGTTTCATGGTCATTCCCCCGCTGTTGTCACCGGCAAGCCCA
TTGATCTTGGTGGTTCGCTTGGTAGGGAAGCTGCCACAGGACGTGGTGATAAACATAGGG
CGTGGGCCACATGTTGATGAGAAAGAGCTAGTGAAAGCTCTGACGGAAGGGCGCCTAGGT
GGAGCCGGGCTGGATGTGTTCGAGGAGGAGCCGCATGTGCCTGAGGAGCTCTTTGGACTT
GAAAATGTGGTTCTGCTTCCTCACGTTGGGAGTGGCACTGTGGAGACACGGAATGCAATG
GCGGATCTTGTGGTTGGTAACTTGGAAGCGCATTTTGCTGGGAAACCACTTCTGACCCAG
GTGGTCTGAGTGATTTCTTGTCCTTTTTTACCTTT

QA 2 756 2 756
DS 



AS 1 2

CO CL6694Contig1 1000 2 10 U
GGATCTCAGAACTCGAAGTTAAAAGTTTGAAAACGACAAAGACTGATCTATCTCGGAGCA
ATACAGAAGACATGTTTCAGATTAGAAGACATGCATTGATCAAGATATTGTATGTGGGCA
AAAGCTTCGTCATCAAGGGAATCTCCTCTTCTGCATCATCTCATTCAAGCTCAAGGAAGC
TAGAAGGCAAAGTAGCGCTCATCACAGGAGGAGCAAGTGGGATTGGCAAAGCAACAGCCG
GAAAGTTCATCAGCCATGGAGCCAAAGTTGTCATTGCAGACATCCAACCGCACCTAGGGA
AAGAAACCGAGCAAGAGCTCGGTCCAAACGCAGCGTTTTGTCTCTGCGACGTGACCAAAG
AGTCAGACATCGCAAACGCAGTTGACTTCGCAGTCTCTCTACACACTAAGCTTGACATTA
TGTACAACAATGCCGGTATCCCCTGCAAAACTCCTCCTAGTATCGTCGATCCGATCTCAA
TGCTTTCGACAAGGTAATCAACACAAATGTTCGTGGAGTCATAACAGGAATCAAACACGC
AGCTCGTGTGATGATCCCACGTAACTCAGGATCCATCATTTGCGCAGGGAGTGTGACAGG
GATGATGGGAGGTTTAGCTCAACACACTTACAGCGTCTCGAAATCTGCGGTTATCGGTAT
CGTGAGATCAACAGCTTCAGAGCTATGTAGGCACAGGATCAGAGTCAACTGCATTTCCCC
ATTCGCAATCACAACATCGTTCGTGATGGACGAGATGAGGCAGATGTACCCTAACGTCGA
CGACTCGAGGCTGATCCAGATAGTGCACGGCACAGGAGTGTTGAACGGAGAGGTTTGCGA
ACCGGTGGATGTAGCTAACGCAGCGGTTTACCTCGCGTCGGATGATTCGAAGTATGTAAA
TGGGCATAACCTGGTGGTAGATGGTGGATTCACAACTGTAAAGAGTTTAGACTTCCCTGC
ACCTGATCAAGTTTAATATTATTATTCATAACTCTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET22TF U 1
AF RR4ET22JQ C 469
BS 1 690 RR4ET22TF
BS 691 691 RR4ET22JQ
BS 692 733 RR4ET22TF
BS 734 734 RR4ET22JQ
BS 735 759 RR4ET22TF
BS 760 760 RR4ET22JQ
BS 761 796 RR4ET22TF
BS 797 797 RR4ET22JQ
BS 798 807 RR4ET22TF
BS 808 1000 RR4ET22JQ

RD RR4ET22TF 807 0 0
GGATCTCAGAACTCGAAGTTAAAAGTTTGAAAACGACAAAGACTGATCTATCTCGGAGCA
ATACAGAAGACATGTTTCAGATTAGAAGACATGCATTGATCAAGATATTGTATGTGGGCA
AAAGCTTCGTCATCAAGGGAATCTCCTCTTCTGCATCATCTCATTCAAGCTCAAGGAAGC
TAGAAGGCAAAGTAGCGCTCATCACAGGAGGAGCAAGTGGGATTGGCAAAGCAACAGCCG
GAAAGTTCATCAGCCATGGAGCCAAAGTTGTCATTGCAGACATCCAACCGCACCTAGGGA
AAGAAACCGAGCAAGAGCTCGGTCCAAACGCAGCGTTTTGTCTCTGCGACGTGACCAAAG
AGTCAGACATCGCAAACGCAGTTGACTTCGCAGTCTCTCTACACACTAAGCTTGACATTA
TGTACAACAATGCCGGTATCCCCTGCAAAACTCCTCCTAGTATCGTCGATCCGATCTCAA
TGCTTTCGACAAGGTAATCAACACAAATGTTCGTGGAGTCATAACAGGAATCAAACACGC
AGCTCGTGTGATGATCCCACGTAACTCAGGATCCATCATTTGCGCAGGGAGTGTGACAGG
GATGATGGGAGGTTTAGCTCAACACACTTACAGCGTCTCGAAATCTGCGGTTATCGGTAT
CGTGAGATCAACAGCTTCAGAGCTATGTAG*CACAGGATCAGAGTCAACTGCATTTCCCC
ATTCGCAATCACA*CATCGTTCGTGATGGACGAGATGAG*CAGATGTACCCTAACGTCGA
CGACTCGAGGCTGATC*AGATAGTGCA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4ET22JQ 532 0 0
ATCCGATCTCAATGCTTTCGACAAGGTAATCAACACAAATGTTCGTGGAGTCATAACAGG
AATCAAACACGCAGCTCGTGTGATGATCCCACGTAACTCAGGATCCATCATTTGCGCAGG
GAGTGTGACAGGGATGATGGGAGGTTTAGCTCAACACACTTACAGCGTCTCGAAATCTGC
GGTTATCGGTATCGTGAGATCAACAGCTTCAGAGCTATGTAGGCACAGGATCAGAGTCAA
CTGCATTTCCCCATTCGCAATCACAACATCGTTCGTGATGGACGAGATGAGGCAGATGTA
CCCTAACGTCGACGACTCGAGGCTGATCCAGATAGTGCACGGCACAGGAGTGTTGAACGG
AGAGGTTTGCGAACCGGTGGATGTAGCTAACGCAGCGGTTTACCTCGCGTCGGATGATTC
GAAGTATGTAAATGGGCATAACCTGGTGGTAGATGGTGGATTCACAACTGTAAAGAGTTT
AGACTTCCCTGCACCTGATCAAGTTTAATATTATTATTCATAACTCTTTTAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6696Contig1 1167 2 8 U
GAGGAGAATTTCGGTAGAGTTTTCTACAACGAGTCTGTCATGTCATCACAAGGGATCCCA
CAGATCGCCATCGTGTTGGGCTCGTGCACTGCCGGTGGTGCTTATATCCCTGCCATGGCT
GATGAGAGTGTCATGGTGAAAGGGAACGGTACCATATTTTTGGCTGGACCTCCTCTTGTC
AAGGCTGCCACAGGAGAGGTGGTCTCAGCTGAGGATTTAGGAGGCGCAACGGTTCACTGT
AATGTGTCTGGCGTCTCTGATTATTTTGCTCAAGACGAGCTGCATTGACTCGCTATTGGA
AGAAACATTGTCAAGAATCTGCACATGGCGGCAAAACAAGGGAATGAAGGAAGCAAAAAC
GTTGAGTGCAAAGAACCGCTCTACGACATAACGGAGCTTAGGTCCATTGCTCCTGTAGAC
CACAAGCAGCAGTTCGATGTCCGGTCTATCATTGCTCGGATTGTTGATGGGAGTGAGTTT
GACGAGTTCAAGAAACAATACGGCACTACTCTTGTGACGGGTTTCGCTAGAATATATGGC
CAGACAGTGGGGATCATTGGGAACAATGGCATACTGTTCAATGAATCTGCACTAAAAGGA
GCTCACTTCATAGAGTTATGCTCTCAGCGTAAAATCCCTCTCGTTTTTCTACAGAACATC
ACAGGCTTTATGGTGGGCTCAAGAGCTGAGGCTAATGGAATTGCAAAATCTGGAGCGAAA
ATGGTGATGGCAGTCTCTTGTGCTAAGGTACCAAAGATAACAATTATAACGGGTGCAAGC
TTTGGTGCTGGAAACTACGCTATGTGTGGACGTGCGTTCAGCCCAGACTTCATGTTCATG
TGGCCAAACGCTAGAATTGGCATCATGGGAGGCCCTCAGGCGGCTGGTGTTTTAAGTCAG
ATCGAAAGAGCTACCAAGAAGAGACGAGGAATAAAGTGGACAGAGGAAGAGGAGGTGTTC
AAGAAGAAAACGGTGGATGCGTATGAGAGAGAGGCAAATGCTTACTTCTCAACGGCGAGG
CTTTGGGGTGACGGAGTGATTGATCCATTTGATACAAGAAGGGTTCTGGGACTTTGTCTC
TCTGCTGCTTCAAACCGTCCTCTAGAAGATACTCGTTTTGGTGTGTTTAGAATGTAAAAA
CAACTTTGAATACATTTTACATTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BP18TF U 1
AF RR4BP18JQ C 409
BS 1 690 RR4BP18TF
BS 691 691 RR4BP18JQ
BS 692 707 RR4BP18TF
BS 708 708 RR4BP18JQ
BS 709 720 RR4BP18TF
BS 721 721 RR4BP18JQ
BS 722 742 RR4BP18TF
BS 743 1167 RR4BP18JQ

RD RR4BP18TF 742 0 0
GAGGAGAATTTCGGTAGAGTTTTCTACAACGAGTCTGTCATGTCATCACAAGGGATCCCA
CAGATCGCCATCGTGTTGGGCTCGTGCACTGCCGGTGGTGCTTATATCCCTGCCATGGCT
GATGAGAGTGTCATGGTGAAAGGGAACGGTACCATATTTTTGGCTGGACCTCCTCTTGTC
AAGGCTGCCACAGGAGAGGTGGTCTCAGCTGAGGATTTAGGAGGCGCAACGGTTCACTGT
AATGTGTCTGGCGTCTCTGATTATTTTGCTCAAGACGAGCTGCATTGACTCGCTATTGGA
AGAAACATTGTCAAGAATCTGCACATGGCGGCAAAACAAGGGAATGAAGGAAGCAAAAAC
GTTGAGTGCAAAGAACCGCTCTACGACATAACGGAGCTTAGGTCCATTGCTCCTGTAGAC
CACAAGCAGCAGTTCGATGTCCGGTCTATCATTGCTCGGATTGTTGATGGGAGTGAGTTT
GACGAGTTCAAGAAACAATACGGCACTACTCTTGTGACGGGTTTCGCTAGAATATATGGC
CAGACAGTGGGGATCATTGGGAACAATGGCATACTGTTCAATGAATCTGCACTAAAAGGA
GCTCACTTCATAGAGTTATGCTCTCAGCGTAAAATCCCTCTCGTTTTTCTACAGAACATC
ACAGGCTTTATGGTGGGCTCAAGAGCTGAG*CTAATGGAATTGCAAA*TCTGGAGCGAAA
*TGGTGATGGCAGTCTCTTGTG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4BP18JQ 759 0 0
GCTCCTGTAGACCACAAGCAGCAGTTCGATGTCCGGTCTATCATTGCTCGGATTGTTGAT
GGGAGTGAGTTTGACGAGTTCAAGAAACAATACGGCACTACTCTTGTGACGGGTTTCGCT
AGAATATATGGCCAGACAGTGGGGATCATTGGGAACAATGGCATACTGTTCAATGAATCT
GCACTAAAAGGAGCTCACTTCATAGAGTTATGCTCTCAGCGTAAAATCCCTCTCGTTTTT
CTACAGAACATCACAGGCTTTATGGTGGGCTCAAGAGCTGAGGCTAATGGAATTGCAAAA
TCTGGAGCGAAAATGGTGATGGCAGTCTCTTGTGCTAAGGTACCAAAGATAACAATTATA
ACGGGTGCAAGCTTTGGTGCTGGAAACTACGCTATGTGTGGACGTGCGTTCAGCCCAGAC
TTCATGTTCATGTGGCCAAACGCTAGAATTGGCATCATGGGAGGCCCTCAGGCGGCTGGT
GTTTTAAGTCAGATCGAAAGAGCTACCAAGAAGAGACGAGGAATAAAGTGGACAGAGGAA
GAGGAGGTGTTCAAGAAGAAAACGGTGGATGCGTATGAGAGAGAGGCAAATGCTTACTTC
TCAACGGCGAGGCTTTGGGGTGACGGAGTGATTGATCCATTTGATACAAGAAGGGTTCTG
GGACTTTGTCTCTCTGCTGCTTCAAACCGTCCTCTAGAAGATACTCGTTTTGGTGTGTTT
AGAATGTAAAAACAACTTTGAATACATTTTACATTTTCA

QA 1 759 1 759
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6698Contig1 695 2 3 U
GTTATAATTATCGTGAGCTTCACATGTATGGAACTAACTTCTCATATAGAGATTTAAAAT
ACAAAATTTTTGTTTTTCAACATTATTTGAAGATTACAACATTCGTATTCTAGTTTCATC
CGTATTGCAGGATTTTTTACTTTTTTGATAGCCTCTCAAAAATCCGACTCGAAAGGTTTG
TAAGTCTTGATTTTACTAACAATGCCAACTACTGATCCTGCTGCCGCGGCTAAAGAGACA
ATAAGACAAACCAAACTCAAGACTTGAAGACTAACCCATCTTGTGCTCCAGCTCGGCAAA
TTCTTCTGTGCAATGTACATTTCCACAGGGAAATAAACTGTTAGAGGCCAAAAACCAATG
GCTCCCAAGAGACCAACAACATCGTTAAAGAAAGGCATTAGCATTGAGATCGATGTTATT
ACAATCACAAAGACCGTCCTCCACACGAGCCTAAAGAGATTGAAATTGAAGGGCTTGGAT
CCAGAAAAGAATGGAATCTCGGTCTCTTTTGTGACAAACTTACTCTCTGGAAACATCTTG
GAAGCTTTTTTCTCGACAAAGGCAAAGATTGGTTGTGCATAGACTTGGTAAGCTCCGATT
AGATGGATCAATATGGCGACATTGGCTATGTTAAGCAACCAATATGGGTCTGTGAATCCT
CCAGCAGCGAGGAGGTTTCCTGGTGCAGACTCTCC


BQ
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AF RR4AX08JQ U 31
AF RR4AX08TF C 1
BS 1 30 RR4AX08TF
BS 31 544 RR4AX08JQ
BS 545 695 RR4AX08TF

RD RR4AX08JQ 514 0 0
GAACTAACTTCTCATATAGAGATTTAAAATACAAAATTTTTGTTTTTCAACATTATTTGA
AGATTACAACATTCGTATTCTAGTTTCATCCGTATTGCAGGATTTTTTACTTTTTTGATA
GCCTCTCAAAAATCCGACTCGAAAGGTTTGTAAGTCTTGATTTTACTAACAATGCCAACT
ACTGATCCTGCTGCCGCGGCTAAAGAGACAATAAGACAAACCAAACTCAAGACTTGAAGA
CTAACCCATCTTGTGCTCCAGCTCGGCAAATTCTTCTGTGCAATGTACATTTCCACAGGG
AAATAAACTGTTAGAGGCCAAAAACCAATGGCTCCCAAGAGACCAACAACATCGTTAAAG
AAAGGCATTAGCATTGAGATCGATGTTATTACAATCACAAAGACCGTCCTCCACACGAGC
CTAAAGAGATTGAAATTGAAGGGCTTGGATCCAGAAAAGAATGGAATCTCGGTCTCTTTT
GTGACAAACTTACTCTCTGGAAACATCTTGGAAG

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR4AX08TF 695 0 0
GTTATAATTATCGTGAGCTTCACATGTATGGAACTAACTTCTCATATAGAGATTTAAAAT
ACAAAATTTTTGTTTTTCAACATTATTTGAAGATTACAACATTCGTATTCTAGTTTCATC
CGTATTGCAGGATTTTTTACTTTTTTGATAGCCTCTCAGAAATCCGACTCGAAAGGTTTG
TAAGTCTTGATTTTACTAACAATGCCAACTACTGATCCTGCTGCCGCGGCTAAAGAGACA
ATAAGACAAACCAAACTCAAGACTTGAAGACTAACCCATCTTGTGCTCCAGCTCGGCAAA
TTCTTCTGTGCAATGTACATTTCCACAGGGAAATAAACTGTTAGAGGCCAAAAACCAATG
GCTCCCAAGAGACCAACAACATCGTTAAAGAAAGGCATTAGCATTGAGATCGATGTTATT
ACAATCACAAAGACCGTCCTCCACACGAGCCTAAAGAGATTGAAATTGAAGGGCTTGGAT
CCAGAAAAGAATGGAATCTCGGTCTCTTTTGTGACAAACTTACTCTCTGGAAACATCTTG
GAAGCTTTTTTCTCGACAAAGGCAAAGATTGGTTGTGCATAGACTTGGTAAGCTCCGATT
AGATGGATCAATATGGCGACATTGGCTATGTTAAGCAACCAATATGGGTCTGTGAATCCT
CCAGCAGCGAGGAGGTTTCCTGGTGCAGACTCTCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL6699Contig1 320 2 1 U
GGCATCTGATGCAAATTAGTAGGCGCTACCCCTAAGAAAGCTTTCTTTTTAGGGGTCAGG
TAAGCTGATTTCCATCCGCGGCATTGGATCGCTAAACCGGTGATTATATCCTCTACCGGG
CAACCGTATTTCACACCCATCTGCCACGGTAACAATGTTTACTTCCGGTACAAGAATCAG
ACTGAGTAAGTGAAGTGAAGTCTTATTAATTCACTGCCTTACCTCCTTTCCCCATTGAGA
ACCTTTCTCGTATGTGCAGCTTGCAAGAGACTTAATCTTCTCAGGCTCAACAATTTCTTG
AATTTCATCAGATTCTACTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4BW58TF U 1
AF RR4BW59TF U 1
BS 1 320 RR4BW58TF

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ACTGAGTAAGTGAAGTGAAGTCTTATTAATTCACTGCCTTACCTCCTTTCCCCATTGAGA
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AATTTCATCAGATTCTACTT

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR4BW59TF 320 0 0
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TAAGCTGATTTCCATCCGCGGCATTGGATCGCTAAACCGGTGATTATATCCTCTACCGGG
CAACCGTATTTCACACCCATCTGCCACGGTAACAATGTTTACTTCCGGTACAAGAATCAG
ACTGAGTAAGTGAAGTGAAGTCTTATTAATTCACTGCCTTACCTCCTTTCCCCATTGAGA
ACCTTTCTCGTATGTGCAGCTTGCAAGAGACTTAATCTTCTCAGGCTCAACAATTTCTTG
AATTTCATCAGATTCTACTT

QA 1 320 1 320
DS 



AS 1 2

CO CL6700Contig1 637 2 5 U
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ACTATTAATGTTTAGAATCTCTTAGAGCACTTAAAGAGATTGGCTTTCTCAAAGCTCTCA
TCTCTTTGTTTCTTTCCACGAAAGACCTCGAGGTCCTTTTCTAACTTTTCGAAAGAAGTT
TCCCACACGGCGTTAACCGGCTGATAGTAATCAGGGTGAGAATACATACAATTGAACAGC
ATCAACGCGGTTTGCTTGCAAACAGAGCTACGAGGTCCTTCACAATCCATCAGAGCGTTA
AAAGCATCTTTGCAACAACCTCCTCTCATGAACTCCATATACCTAGCTTCTGCGGCCTCA
TCAGTTGATGATTCTCCCGCTCTCGGTGGGAACAAGCCATAGAGGTTCTTCATCAACAAC
TCTGCATTAGCTGTCATCGGATATGGCCAATCACTGAAATCATCCGGTTTCTCTTGCTCC
GGTTTTGCCGGCGGAAATTGGATGGATGACGCGATCCCCATGATTCAGCGATTCAGGATG
CCAACAGAAGAACGATATCGAGAGGTTGATGAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CZ94JQ U 55
AF RR4CZ94TF C 1
BS 1 54 RR4CZ94TF
BS 55 144 RR4CZ94JQ
BS 145 145 RR4CZ94TF
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BS 355 637 RR4CZ94TF

RD RR4CZ94JQ 300 0 0
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AACAGCATCAACGCGGTTTGCTTGCAAACAGAGCTACGAGGTCCTTCACAATCCATCAGA

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR4CZ94TF 637 0 0
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ATCAAGTGAGAAAATAGCTAAAAAAAACATTCGTGGGCATCAACAAAATTAACAAAGAAA
ACTATTAATGTTTAGAATCTCTTAGAGCACTTAAAGAGATTGGCTTTCTCAAAGCTCTCA
TCTCTTTGTTTCTTTCCACGAAAGACCTCGAGGTCCTTTTCTAACTTTTCGAAAGAAGTT
TCCCACACGGCGTTAACCGGCTGATAGTAATCAGGGTGAGAATACATACAATTGAACAGC
ATCAACGCGGTTTGCTTGCAAACAGAGCTACGAGGTCCTTCACAATCCATCAGAGCGTTA
AAAGCATCTTTGCAACAACCTCCTCTCATGAACTCCATATACCTAGCTTCTGCGGCCTCA
TCAGTTGATGATTCTCCCGCTCTCGGTGGGAACAAGCCATAGAGGTTCTTCATCAACAAC
TCTGCATTAGCTGTCATCGGATATGGCCAATCACTGAAATCATCCGGTTTCTCTTGCTCC
GGTTTTGCCGGCGGAAATTGGATGGATGACGCGATCCCCATGATTCAGCGATTCAGGATG
CCAACAGAAGAACGATATCGAGAGGTTGATGAGATTC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL6701Contig1 1013 2 2 U
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GTGCATCTCCAATACATTCTCACCACCGGAACTCGATTCGAGGTCACCGCGGGAGGATAT
GGAGGGACGCGCTGCGGAAGATGTGTTTAAGGACTTCAGGGCTCGAAGAGCTGGTCTCAT
CAAGGCTCTCACTACTGATGTACGCAGGTTTTACGACAAGTGTAACCCTGCCGAGGAGAA
CTTGTGTCTTTACGGACTACCAAACGGGTCATGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGACGAGGT
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ACAAAACTGGGTTTCTTTGGTTGCAGTTCACTCTGACTCTTGGCTCATCGCTGTTGCCTT
TTACTTCGGTGCACGTTTCTCATTTGATAAAAACGAGAGGATGAGGCTGTTCAAGATGAT
AAATGATCTCCCAACCATTTACGAGGTTGTAACTGGCAATGCAAAGCCATCCAAGGATCA
ATCTGCTAACCACAACGGCAGTAGCAAAAGCAAGTCTAGTGGTGTCAAGGCTCGCCAATC
TGAATCTCAGATTAAGGCTTCGAAGAGATCCCCACCACCACCACCACCACCAAGAGAAGA
AAGTGAGAGCGGAGATGATGATGAGGAGGGGGAAGACGAGGAGGGGCAAGGAGAGTTCTG
TGGTGTGTGTGGAGAGAACGATGATGGAGGAGATGAGTTCTGGATATGGTGTGATACTTG
TGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGCGTGAAGATCACACCTGCAAGGGCGGAGCACATCAA
ACATTACAAATGCCCCAGTTGCTGCAATACCAACAAGAAACAGAGAGCTTGAAAAAGGAA
GGAGATGATGATGATATAACAGTTGCATTTGATTGTGTAGTCTGAATGTGATTTAAACAG
CTTTACAGTTTAGTAATGTCTCTTTTCTCTTGTTGATTTCAAAATGTTGCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DH12TF U 1
AF RR4DH12JQ C 319
BS 1 613 RR4DH12TF
BS 614 1013 RR4DH12JQ

RD RR4DH12TF 613 0 0
GGAGAGTTCCCTGAAAGAGAGGGAAAACAAAAAAAGCCGATCTTTTCTGGTTTCTTTCTC
GTGCATCTCCAATACATTCTCACCACCGGAACTCGATTCGAGGTCACCGCGGGAGGATAT
GGAGGGACGCGCTGCGGAAGATGTGTTTAAGGACTTCAGGGCTCGAAGAGCTGGTCTCAT
CAAGGCTCTCACTACTGATGTACGCAGGTTTTACGACAAGTGTAACCCTGCCGAGGAGAA
CTTGTGTCTTTACGGACTACCAAACGGGTCATGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGACGAGGT
CCCTCCTGAGCTTCCTGAACCAGCTTTAGGAATCAACTTCTCAAGGGACGGTATGTCGGA
ACAAAACTGGGTTTCTTTGGTTGCAGTTCACTCTGACTCTTGGCTCATCGCTGTTGCCTT
TTACTTCGGTGCACGTTTCTCATTTGATAAAAACGAGAGGATGAGGCTGTTCAAGATGAT
AAATGATCTCCCAACCATTTACGAGGTTGTAACTGGCAATGCAAAGCCATCCAAGGATCA
ATCTGCTAACCACAACGGCAGTAGCAAAAGCAAGTCTAGTGGTGTCAAGGCTCGCCAATC
TGAATCTCAGATT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4DH12JQ 695 0 0
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GGTTGCAGTTCACTCTGACTCTTGGCTCATCGCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCACGTTT
CTCATTTGATAAAAACGAGAGGATGAGGCTGTTCAAGATGATAAATGATCTCCCAACCAT
TTACGAGGTTGTAACTGGCAATGCAAAGCCATCCAAGGATCAATCTGCTAACCACAACGG
CAGTAGCAAAAGCAAGTCTAGTGGTGTCAAGGCTCGCCAATCTGAATCTCAGATTAAGGC
TTCGAAGAGATCCCCACCACCACCACCACCACCAAGAGAAGAAAGTGAGAGCGGAGATGA
TGATGAGGAGGGGGAAGACGAGGAGGGGCAAGGAGAGTTCTGTGGTGTGTGTGGAGAGAA
CGATGATGGAGGAGATGAGTTCTGGATATGGTGTGATACTTGTGAGAAATGGTTCCATGG
GAAATGCGTGAAGATCACACCTGCAAGGGCGGAGCACATCAAACATTACAAATGCCCCAG
TTGCTGCAATACCAACAAGAAACAGAGAGCTTGAAAAAGGAAGGAGATGATGATGATATA
ACAGTTGCATTTGATTGTGTAGTCTGAATGTGATTTAAACAGCTTTACAGTTTAGTAATG
TCTCTTTTCTCTTGTTGATTTCAAAATGTTGCGAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL6702Contig1 1138 2 2 U
GGGACACGATTCGGATCCTTAAACTCCGGGTGAAGAATGGAATCAGAAAAATGTCGAGAT
TGAACCCTAGTACCAAGCAATCGAAATCAAGCAGAGAATCGGGGGAGAGAACCGTCGATT
CGGGAAGCGAAGAACTAGCGAGCTAGAATCGATAGTCATCCCGCGAAATTAGTGATTTTC
TTGATTCCCTCGATTTTCCTCTGTTGTTTTCTGTAGACTTTCCCCATGGCGGATGGGTAC
TGGAACCAGCAGCGACACCAGCAGCAGCAGCATCCTCCAGGTGGTGCTCCTCCAAAACGT
CGCCGTTCCGATTTCGAAGCTCATGAGATGCACGGTGGTGGTGGTGGTTACTTCCCGCGT
GATGAGGATATTGATACAAGAACTATTGGATCAGCTTATGATCGGTACCTCCAAAGCGTG
CAAACAAGTTCTATGCCATTGGGAGAAGCAGGTCCTCCTCCACGTAATGGTGGTGTTGTT
GCCATGGATGAGTTTATGATGAGACGCGGTGGCGGCGTTGGTTTAAACGGTCGGGATATG
GGGTGGTGGTTTTGATCCATTAGATTCTGTTGACAGGCGTAGTAACCGTGAGCCGCTTCC
TCTCCCTCCAGATGCCTCCAACACTCTCTACGTTGAAAGTCTTCCTCCTAATTGCTCTAG
GAGGGAAGTTGCTCATATCTTTAGACCTTTTGTAGGATATAGAGAAGCCAGACTTGTGAC
CAAAGACTCCAAACACCGCAACGGAGATCCTGTTGTTTTTTGCTTTGTTGATTTTACAAG
CCCTGCCTGTGCTGCAACTGCTCTGACCACCTTACAAGGCTATCGAATGGATGAAAACGA
CCCTGATTCCAAGTTCTTACGGCTTCAGTTTTCAAGAAAACCAACTTCAAGACCGGGACA
ACGAGGAAGGAGGTGATGATGCACTGCATCAAAACCAAATGGTTATTTATTGTCTCTGCG
TGTCTGCTAAGTTTTAGCGAGAAGAGACATATACCTACTTCAATGAAACCGAACATTACA
TCACTCGTTTGTATCATTGTATTGTTAAAGCAACCGGAGTCAAGAGAAACAAATATGGAG
TGTAGAATCTGTGATAGAGATTTAAAAGGCTATTTAATATATTTGGTTCCTTTCCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ74TF U 1
AF RR4DZ74JQ C 353
BS 1 657 RR4DZ74TF
BS 658 1138 RR4DZ74JQ

RD RR4DZ74TF 657 0 0
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TGAACCCTAGTACCAAGCAATCGAAATCAAGCAGAGAATCGGGGGAGAGAACCGTCGATT
CGGGAAGCGAAGAACTAGCGAGCTAGAATCGATAGTCATCCCGCGAAATTAGTGATTTTC
TTGATTCCCTCGATTTTCCTCTGTTGTTTTCTGTAGACTTTCCCCATGGCGGATGGGTAC
TGGAACCAGCAGCGACACCAGCAGCAGCAGCATCCTCCAGGTGGTGCTCCTCCAAAACGT
CGCCGTTCCGATTTCGAAGCTCATGAGATGCACGGTGGTGGTGGTGGTTACTTCCCGCGT
GATGAGGATATTGATACAAGAACTATTGGATCAGCTTATGATCGGTACCTCCAAAGCGTG
CAAACAAGTTCTATGCCATTGGGAGAAGCAGGTCCTCCTCCACGTAATGGTGGTGTTGTT
GCCATGGATGAGTTTATGATGAGACGCGGTGGCGGCGTTGGTTTAAACGGTCGGGATATG
GGGTGGTGGTTTTGATCCATTAGATTCTGTTGACAGGCGTAGTAACCGTGAGCCGCTTCC
TCTCCCTCCAGATGCCTCCAACACTCTCTACGTTGAAAGTCTTCCTCCTAATTGCTC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4DZ74JQ 786 0 0
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AAAGCGTGCAAACAAGTTCTATGCCATTGGGAGAAGCAGGTCCTCCTCCACGTAATGGTG
GTGTTGTTGCCATGGATGAGTTTATGATGAGACGCGGTGGCGGCGTTGGTTTAAACGGTC
GGGATATGGG*TGGTGGTTTTGATCCATTAGATTCTGTTGACAGGCGTAGTAACCGTGAG
CCGCTTCCTCTCCCTCCAGATGCCTCCAACACTCTCTACGTTGAAGGTCTTCCTCCTAAT
TGCTCTAGGAGGGAAGTTGCTCATATCTTTAGACCTTTTGTAGGATATAGAGAAGCCAGA
CTTGTGACCAAAGACTCCAAACACCGCAACGGAGATCCTGTTGTTTTTTGCTTTGTTGAT
TTTACAAGCCCTGCCTGTGCTGCAACTGCTCTGACCACCTTACAAGGCTATCGAATGGAT
GAAAACGACCCTGATTCCAAGTTCTTACGGCTTCAGTTTTCAAGAAAACCAACTTCAAGA
CCGGGACAACGAGGAAGGAGGTGATGATGCACTGCATCAAAACCAAATGGTTATTTATTG
TCTCTGCGTGTCTGCTAAGTTTTAGCGAGAAGAGACATATACCTACTTCAATGAAACCGA
ACATTACATCACTCGTTTGTATCATTGTATTGTTAAAGCAACCGGAGTCAAGAGAAACAA
ATATGGAGTGTAGAATCTGTGATAGAGATTTAAAAGGCTATTTAATATATTTGGTTCCTT
TCCTAG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6703Contig1 1199 2 2 U
GCCGGTGGTCCAAGCGGATTCGGATCAAGATCCACGGCCGAACATGTCACTGCTAAATCT
GACCTACGATCTCTAACAGCAATTATCACTGGAGCGACGTCGGGGATAGGAGCAGAGACG
GCTCGTGTTCTGGCAAAGCGTGGAGCAAGGCTTGTGATTCCGGCTCGGAGTCTCAAAACC
GCCGAGGAAACAAAGTCACGTATCCTCTCAGAGTTTCCCGATGCGGAGATCATCGTCATG
CATCTCGATCTTAGCTCCCTCGCTTCCGTCCGTAGATTCGTAGACGATTTCGAATCTCTC
CATCTCCCTCTCAACATCCTCATCAACAACGCCGGAAAATACGCGCAGAAACACGCCATC
TCTGAGGACGGCGTGGAGATGACCTTCGCAACGAATTATCTCGGCCATTTTCTGCTGACT
AAACTGTTATTAAATAAGATGATTGAAACGGCGGAGATAACCGGCGTTCAAGGCCGTATC
GTCAACGTCACGTCGGTGATCCATAGCTGGTTCTCTGGCGATATGCTGAAATATGTCGCT
GATATCTCCCGAAGCAATAGAAACTACGATACGACCCGAGCTTACGCGCTGTCGAAGCTA
GCCAACGTTCTCCACACCACAGAGCTTTCCCGGATTCTCCATAAAATGGATGCTAATGTA
ACGGCCAACTGCGTTCATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACGGC
CTCATCACTGATTTAGTCTTCTTTTTGACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCTCAGGCA
GCAGCAACGACATGCTACGTAGCAACGAGTCCGAGATTGAGGAACGTGTGTGGCAAATAC
TTTTCAGACTGCAACGAAACTCGGACTTCCAAATCCGGATCATGCAATCTTAAAGCTCAG
AGACTGTGGACTGCTTCTGAGTTGTTGGTTTCTCCAGCTTCCACTCCCAACGTTTATCAA
ACCTTTAACTACTCTTTAATCAGCGATGCTGTGTATGTCTAAATCCCAAGCCCTGTTAAA
AGACCTAGATAGCACTACTTTATAATATATGTGTATATATAGCAATATATGTTCGTTTGT
GTGTGTAGTGTGTATAAGCCATGCCTCCATATTAATATTATATGTGGTTGTGTGTTTCTT
TATGTAAATATATATATAGTTGTAGGGTTTTGTAAAATCTAGCTGTGTCTTTGTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B987TF U 1
AF RR4B987JQ C 479
BS 1 774 RR4B987TF
BS 775 1199 RR4B987JQ

RD RR4B987TF 774 0 0
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GACCTACGATCTCTAACAGCAATTATCACTGGAGCGACGTCGGGGATAGGAGCAGAGACG
GCTCGTGTTCTGGCAAAGCGTGGAGCAAGGCTTGTGATTCCGGCTCGGAGTCTCAAAACC
GCCGAGGAAACAAAGTCACGTATCCTCTCAGAGTTTCCCGATGCGGAGATCATCGTCATG
CATCTCGATCTTAGCTCCCTCGCTTCCGTCCGTAGATTCGTAGACGATTTCGAATCTCTC
CATCTCCCTCTCAACATCCTCATCAACAACGCCGGAAAATACGCGCAGAAACACGCCATC
TCTGAGGACGGCGTGGAGATGACCTTCGCAACGAATTATCTCGGCCATTTTCTGCTGACT
AAACTGTTATTAAATAAGATGATTGAAACGGCGGAGATAACCGGCGTTCAAGGCCGTATC
GTCAACGTCACGTCGGTGATCCATAGCTGGTTCTCTGGCGATATGCTGAAATATGTCGCT
GATATCTCCCGAAGCAATAGAAACTACGATACGACCCGAGCTTACGCGCTGTCGAAGCTA
GCCAACGTTCTCCACACCACAGAGCTTTCCCGGATTCTCCATAAAATGGATGCTAATGTA
ACGGCCAACTGCGTTCATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACGGC
CTCATCACTGATTTAGTCTTCTTTTTGACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4B987JQ 721 0 0
TCGTCAACGTCACGTCGGTGATCCATAGCTGGTTCTCTGGCGATATGCTGAAATATGTCG
CTGATATCTCCCGAAGCAATAGAAACTACGATACGACCCGAGCTTACGCGCTGTCGAAGC
TAGCCAACGTTCTCCACACCACAGAGCTTTCCCGGATTCTCCATAAAATGGATGCTAATG
TAACGGCCAACTGCGTTCATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACG
GCCTCATCACTGATTTAGTCTTCTTTTTGACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCTCAGG
CAGCAGCAACGACATGCTACGTAGCAACGAGTCCGAGATTGAGGAACGTGTGTGGCAAAT
ACTTTTCAGACTGCAACGAAACTCGGACTTCCAAATCCGGATCATGCAATCTTAAAGCTC
AGAGACTGTGGACTGCTTCTGAGTTGTTGGTTTCTCCAGCTTCCACTCCCAACGTTTATC
AAACCTTTAACTACTCTTTAATCAGCGATGCTGTGTATGTCTAAATCCCAAGCCCTGTTA
AAAGACCTAGATAGCACTACTTTATAATATATGTGTATATATAGCAATATATGTTCGTTT
GTGTGTGTAGTGTGTATAAGCCATGCCTCCATATTAATATTATATGTGGTTGTGTGTTTC
TTTATGTAAATATATATATAGTTGTAGGGTTTTGTAAAATCTAGCTGTGTCTTTGTTATG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6704Contig1 931 2 2 U
CTCAACCACAAAACCAAAAAAAAATGATACTAATCCCAACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
ACTCTTGTTGTAGCCTTCCTCAAGCTTCCTTCAATTCTAATTCATATCCATCGAATCAGT
CTCTGTTCCTCTCCAAATCCGGTTATCCAATTCCACTTGGAAGCAGAAAGTTGAAGACTT
TACGTCTCAGAGCTAATTTCTGGGAGTCAATCCGATCTGGGTTTGTAAAGAATAATAACA
CGACCCAACTTGTGGAACCACCTTCTACAGTAGAAGAAGATGAAGATACGGAACCAGTAC
TTCCTGTTGAATTCACTTTGGTTGAGAGAACTCTTCAAGATGGTTTAGTTGAAGAGATCA
TATTTTCTTCTGGTGGTGAAATTGATGTCTATGATCTTCAAACCCTTTGTGACAAGGTGG
GATGGCCTCGGAGACCGCTAACGAAACTAGCAGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCTAATTGGA
ATGGCACGTGCGACGTCGGATCATGCCTTTAATGCTACAATTTGGGATGTTCTTGTTGAT
CCTGAGTATCAGGGTCAGGGGCTTGGTAAAGCTCTCGTGGAAAAGCTTGTAAGGGCTCTT
CTTCAGAGAGATATTGGTAATATATCTCTTTTTGCAGATAGTCAAGGTATCAAAATCACA
CCATATGATGCAAGCTTTTGTATTCAAATGTTTTAGATTTGTTACTTATGAGTTATCATG
CAGTTGTGGATTTCTATCAGAACTTGGGGTTTGAGGCTGATCCAGAAGGCATCAAAGGCA
TGTTTTGGTACCCAAAGTAGCAGTTTTTGGGTTTGCAAAAGAATGGGACTTTACTATTTG
GCTGTATGCTTTCTTATATGGATCAATAAGGAAGTTTACTAACTGTGCATTTTGTAAGTT
TATATTTGTCCTATTTAAGATTCAAAAAAAA


BQ
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AF RR4GT69TF U 1
AF RR4GT69JQ C 429
BS 1 727 RR4GT69TF
BS 728 931 RR4GT69JQ

RD RR4GT69TF 727 0 0
CTCAACCACAAAACCAAAAAAAAATGATACTAATCCCAACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
ACTCTTGTTGTAGCCTTCCTCAAGCTTCCTTCAATTCTAATTCATATCCATCGAATCAGT
CTCTGTTCCTCTCCAAATCCGGTTATCCAATTCCACTTGGAAGCAGAAAGTTGAAGACTT
TACGTCTCAGAGCTAATTTCTGGGAGTCAATCCGATCTGGGTTTGTAAAGAATAATAACA
CGACCCAACTTGTGGAACCACCTTCTACAGTAGAAGAAGATGAAGATACGGAACCAGTAC
TTCCTGTTGAATTCACTTTGGTTGAGAGAACTCTTCAAGATGGTTTAGTTGAAGAGATCA
TATTTTCTTCTGGTGGTGAAATTGATGTCTATGATCTTCAAACCCTTTGTGACAAGGTGG
GATGGCCTCGGAGACCGCTAACGAAACTAGCAGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCTAATTGGA
ATGGCACGTGCGACGTCGGATCATGCCTTTAATGCTACAATTTGGGATGTTCTTGTTGAT
CCTGAGTATCAGGGTCAGGGGCTTGGTAAAGCTCTCGTGGAAAAGCTTGTAAGGGCTCTT
CTTCAGAGAGATATTGGTAATATATCTCTTTTTGCAGATAGTCAAGGTATCAAAATCACA
CCATATGATGCAAGCTTTTGTATTCAAATGTTTTAGATTTGTTACTTATGAGTTATCATG
CAGTTGT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4GT69JQ 503 0 0
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TGGGACGTCGGATCATGCCTTTAATGCTACAATTTGGGATGTTCTTGTTGATCCTGAGTA
TCAGGGTCAGGGGCTTGGTAAAGCTCTCGTGGAAAAGCTTGTAAGGGCTCTTCTTCAGAG
AGATATTGGTAATATATCTCTTTTTGCAGATAGTCAAGGTATCAAAATCACACCATATGA
TGCAAGCTTTTGTATTCAAATGTTTTAGATTTGTTACTTATGAGTTATCATGCAGTTGTG
GATTTCTATCAGAACTTGGGGTTTGAGGCTGATCCAGAAGGCATCAAAGGCATGTTTTGG
TACCCAAAGTAGCAGTTTTTGGGTTTGCAAAAGAATGGGACTTTACTATTTGGCTGTATG
CTTTCTTATATGGATCAATAAGGAAGTTTACTAACTGTGCATTTTGTAAGTTTATATTTG
TCCTATTTAAGATTCAAAAAAAA

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL6705Contig1 1163 2 6 U
GGCTGTGATCTGCGTCTTGTCTCTCTTCTTTGCTGTCGCTCACTCTAAGACGTTGAAGCG
AGATGTGAAAGCTTTGAATGAAATCAAAGCCTCTTTGGGGTGGAGAGTGGTGTATTCATG
GGTGGGTGACGATCCTTGTGGAGATGGAGACCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACCTGTTC
TATTCAAGGTGACTATAGGGTTGTCGCTGAATTAGAAGTTTACGCGTTCGATCGTTGGAC
CCTATACGGAGGCGATCTTCATAGCCACAACAGATAGAGCTCTGGCGATCGCCGTTCATG
TTGGATGCTGCTCTCCGACTCCCCCTGGTCTTCGGTCTGCAGCATAGAAGCTGAACCGAC
AACACGTCTGAGCTTTGGCGATGGGTTCTTCTTTTCTTCCTCCTCGGGATTCTACTCTTC
AGATGAGGACGACAGGCATGTACAGAGCTTATACGGTGAAGTAAGTAATTCAGTAAACTT
CTGTAAGTAGTTCTTTGAAAGCAACTCATCTCCAGATGGCAAATGAGGGTGAAAATCAAG
GAGCAGCCCAACCTCTGAATGTCTTAGGTGTTCTTAATCCTTCCAAATGAATGGATCATT
GTGGTTCAAGTGTGATTCCCTAATCACTAATGAGATAAGAACAATCATCTGATCTGATTT
TCCTGGCCCGTGTCAAATTGGTCAACTACGCCGCAACATGTAAAAAATCGATGGTGGTTC
ACATTTAAGGTAGGTCACAGAAACTTTACATATACAAAAGGAGAAAACCGTGAGAATATA
TTTCTTGTTTTATGTTTGCTATGACTACTGCTCTTATGCCTAGTTTGCTTAGTGAAGTTT
CACTCAATGGTAAAATGCCTTTTACCATTGAAAGCCATTTAGAAAATGATGAGCTCAAGA
AAAAGGTACAAGACATATATGAAGAAATCAAAGAAAGGCTGAGCAAGCTTGAAGGCTTGG
AGAAGATGATTGTGCTCCTTTGTTCAGCCATTCTATCCATGGTGGCAACGACCAAGTTGC
TGCTTTTGTTTTTTTCTAACGTTTTATTAGTTTTTTTTTCTATTTTTAAATGATTGCTCA
ATTTTCTCGAATAATGAATGCGTTGTTGAATTTTCTTAACAGTTTTTTTTATTAAATAAA
ATTGGTCATTTGACTTTTTTATC


BQ
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AF RR4FV82TF U 1
AF RR4FV82JQ C 404
BS 1 676 RR4FV82TF
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BS 697 706 RR4FV82TF
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RD RR4FV82TF 706 0 0
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AGATGTGAAAGCTTTGAATGAAATCAAAGCCTCTTTGGGGTGGAGAGTGGTGTATTCATG
GGTGGGTGACGATCCTTGTGGAGATGGAGACCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACCTGTTC
TATTCAAGGTGACTATAGGGTTGTCGCTGAATTAGAAGTTTACGCGTTCGATCGTTGGAC
CCTATACGGAGGCGATCTTCATAGCCACAACAGATAGAGCTCTGGCGATCGCCGTTCATG
TTGGATGCTGCTCTCCGACTCCCCCTGGTCTTCGGTCTGCAGCATAGAAGCTGAACCGAC
AACACGTCTGAGCTTTGGCGATGGGTTCTTCTTTTCTTCCTCCTCGGGATTCTACTCTTC
AGATGAGGACGACAGGCATGTACAGAGCTTATACGGTGAAGTAAGTAATTCAGTAAACTT
CTGTAAGTAGTTCTTTGAAAGCAACTCATCTCCAGATGGCAAATGAGGGTGAAAATCAAG
GAGCAGCCCAACCTCTGAATGTCTTAGGTGTTCTTAATCCTTCCAAATGAATGGATCATT
GTGGTTCAAGTGTGATTCCCTAATCACTAATGAGATAAGAACAATCATCTGATCTGATTT
TCCTGGCCCGTGTCAA*TTGGTCAACTACGCCGCA*CATGTAAAAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FV82JQ 760 0 0
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AGTAATTCAGTAAACTTCTGTAAGTAGTTCTTTGAAAGCAACTCATCTCCAGATGGCAAA
TGAGGGTGAAAATCAAGGAGCAGCCCAACCTCTGAATGTCTTAGGTGTTCTTAATCCTTC
CAAATGAATGGATCATTGTGGTTCAAGTGTGATTCCCTAATCACTAATGAGATAAGAACA
ATCATCTGATCTGATTTTCCTGGCCCGTGTCAAATTGGTCAACTACGCCGCAACATGTAA
AAAATCGATGGTGGTTCACATTTAAGGTAGGTCACAGAAACTTTACATATACAAAAGGAG
AAAACCGTGAGAATATATTTCTTGTTTTATGTTTGCTATGACTACTGCTCTTATGCCTAG
TTTGCTTAGTGAAGTTTCACTCAATGGTAAAATGCCTTTTACCATTGAAAGCCATTTAGA
AAATGATGAGCTCAAGAAAAAGGTACAAGACATATATGAAGAAATCAAAGAAAGGCTGAG
CAAGCTTGAAGGCTTGGAGAAGATGATTGTGCTCCTTTGTTCAGCCATTCTATCCATGGT
GGCAACGACCAAGTTGCTGCTTTTGTTTTTTTCTAACGTTTTATTAGTTTTTTTTTCTAT
TTTTAAATGATTGCTCAATTTTCTCGAATAATGAATGCGTTGTTGAATTTTCTTAACAGT
TTTTTTTATTAAATAAAATTGGTCATTTGACTTTTTTATC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCAAGATCCAAGCACCAATGTAACTAAATATGAATCACATGTGAATGTTCTATAGATCTC
TCTATATAATTGGGATGTATCTTATGAAATATCATAGTTTTTTCTCAGTATATGTGAGCT
GAGTTTCTTGTTAGATGTGATTAATCAAAAAAGAGGGACTAAAACTAATCGCTAACTTTT
GGATTACTATATATTTTGTGTGATTGTGGATTAATGATAAAAACCTTGATTAGGC


BQ
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AF RR4GX56JQ C 1
AF RR4GX56TF U 1
BS 1 295 RR4GX56TF

RD RR4GX56JQ 295 0 0
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GCAAGATCCAAGCACCAATGTAACTAAATATGAATCACATGTGAATGTTCTATAGATCTC
TCTATATAATTGGGATGTATCTTATGAAATATCATAGTTTTTTCTCAGTATATGTGAGCT
GAGTTTCTTGTTAGATGTGATTAATCAAAAAAGAGGGACTAAAACTAATCGCTAACTTTT
GGATTACTATATATTTTGTGTGATTGTGGATTAATGATAAAAACCTTGATTAGGC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR4GX56TF 295 0 0
GGGACCGTGTGAATGCATGGAGTCAGAGGTAACTTGGAAATTAAGATGTGTGAGATGCGA
GCAAGATCCAAGCACCAATGTAACTAAATATGAATCACATGTGAATGTTCTATAGATCTC
TCTATATAATTGGGATGTATCTTATGAAATATCATAGTTTTTTCTCAGTATATGTGAGCT
GAGTTTCTTGTTAGATGTGATTAATCAAAAAAGAGGGACTAAAACTAATCGCTAACTTTT
GGATTACTATATATTTTGTGTGATTGTGGATTAATGATAAAAACCTTGATTAGGC

QA 1 295 1 295
DS 



AS 1 2

CO CL6708Contig1 982 2 2 U
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TAATTTTGTGTAATAGTGAGTTTCCTTAGCAACAAACAAAAAGAACTGTTTAGCAAAAAA
CAAAGAAACAAAGAACTGGATGATTTTGTACATAAACCAAAGTCCAGAACTTCTAAATCT
ACCATCTATTAAAGCAAACTACGGTTCCTATTAACGGAAAAATAATATTGGACATAAATT
TTAGTCAGACCTAAAGAAAAGAGAATATCATAGCCCCTTCCACATGCCCACATTTGGACT
TCTAGTTTCATGAATTCGACATCAATCATAGAAATTCAAGGTGGCTAGCTCTACTGCACA
TTCTAACAAATTACATACAAGTAATTCAATAGATTTACAAGCTTCACCGACTGTGTACGA
TGAGGGGACCAAGTGATACATACTAGTAACAGATTTTTTTTTTGTTTTTTGTAACACAAT
ACACTAGTAACAGATTTTCAATGATTTGTTATTGTAAAATCTCAATCAATAGAATTCCAG
AATTGTAAACTTGTTCTTTAAGAAACATTTCTGATGCTTAAATTGTCTAATATATTTTCT
TTCAAGTATATATCAGTTAATGTTGTCAAATATAATTAAGCAATAAGTTTTTACAATCCC
ACAGATACTAAACCAGTGAGAGAGAATGTTGGCAAGACTACCTAATCACTGTTATGGTAA
AAACGTCAGCATATACAATTTATAAAATCTAACAGAAATCAATAGCGTAAAATGCAAAGT
TGTGAAGGTTGTCATTTCACATGTTTACATTGATCAAAGAGGGTTTAGGAGCATAACACA
AAACAAAAACATTAAAGATTCAAGGAAACTACGACTGCAGTCTAGTAGTTTATTACCAAC
ATTGATCTACAAGAGACTCCAAGATAATGATATCTGATGACAAGGACGAGGCAGTGTATT
ACATTCAAGCACCAAACTAACT


BQ
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BS 694 982 RR4F314JQ

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TAATTTTGTGTAATAGTGAGTTTCCTTAGCAACAAACAAAAAGAACTGTTTAGCAAAAAA
CAAAGAAACAAAGAACTGGATGATTTTGTACATAAACCAAAGTCCAGAACTTCTAAATCT
ACCATCTATTAAAGCAAACTACGGTTCCTATTAACGGAAAAATAATATTGGACATAAATT
TTAGTCAGACCTAAAGAAAAGAGAATATCATAGCCCCTTCCACATGCCCACATTTGGACT
TCTAGTTTCATGAATTCGACATCAATCATAGAAATTCAAGGTGGCTAGCTCTACTGCACA
TTCTAACAAATTACATACAAGTAATTCAATAGATTTACAAGCTTCACCGACTGTGTACGA
TGAGGGGACCAAGTGATACATACTAGTAACAGATTTTTTTTTTGTTTTTTGTAACACAAT
ACACTAGTAACAGATTTTCAATGATTTGTTATTGTAAAATCTCAATCAATAGAATTCCAG
AATTGTAAACTTGTTCTTTAAGAAACATTTCTGATGCTTAAATTGTCTAATATATTTTCT
TTCAAGTATATATCAGTTAATGTTGTCAAATATAATTAAGCAATAAGTTTTTACAATCCC
ACAGATACTAAACCAGTGAGAGAGAATGTTGGC

QA 1 693 1 693
DS 

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TTTTTGTTTTTTGTAACACAATACACTAGTAACAGATTTTCAATGATTTGTTATTGTAAA
ATCTCAATCAATAGAATTCCAGAATTGTAAACTTGTTCTTTAAGAAACATTTCTGATGCT
TAAATTGTCTAATATATTTTCTTTCAAGTATATATCAGTTAATGTTGTCAAATATAATTA
AGCAATAAGTTTTTACAATCCCACAGATACTAAACCAGTGAGAGAGAATGTTGGCAAGAC
TACCTAATCACTGTTATGGTAAAAACGTCAGCATATACAATTTATAAAATCTAACAGAAA
TCAATAGCGTAAAATGCAAAGTTGTGAAGGTTGTCATTTCACATGTTTACATTGATCAAA
GAGGGTTTAGGAGCATAACACAAAACAAAAACATTAAAGATTCAAGGAAACTACGACTGC
AGTCTAGTAGTTTATTACCAACATTGATCTACAAGAGACTCCAAGATAATGATATCTGAT
GACAAGGACGAGGCAGTGTATTACATTCAAGCACCAAACTAACT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

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GGAGATTGCATTGATTTGGAGAAAAAAAATGGACAAGTATGAGGTTGTGAAGGATCTAGG
AACTGGAAACTTCGGCGTGGCTCGTCTTCTGAAGCACAAGGAGACCAATGAGCTCGTTGC
CATGAAATACATCGAGAGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAA
TCACAGATCACTTAAGCATCCTAATATCATCCGCTTCAAGGAGGTGATTCTGACACCTAC
TCATCTTGCTATCGTGATGGAGTATGCTGCTGGAGGAGAGCTCTTTGATCGAATCTGCAC
TTCTGGTAGATTCAGTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGT
CGACTACTGCCACTCCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTGCT
TGATGGGAGCCCTGCTCCGCTTTTGAAAATCTGTGACTTTGGTTACTCTAAGTCATCTAT
ACTACACTCTAGGCCTAAATCAACCGTTGGAACTCCAGCGTACATAGCACCTGAAGTTCT
TTCCCGGAGAGAATATGATGGCAAGCACGCTGATGTGTGGTCATGTGGAGTAACCCTTTA
TGTGATGCTGGTTGGAGCTTACCCATTTGAGGATCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAA
AACAATCCAACGTATAATGGCTACACAATACAAGATCCCGGACCACGTTCACTTATCTCA
GGAATGCAAACACCTTCTCTCTCGCATATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCT
TAAGGAGATCAAGAATCATCCATGGTACACGAAGAATCTGCCAAAGGAGCTGGTAGAGTC
GGCTCAAGCGGTGTATTACAAGAGAGACAACACGAGCTATTCTCTTCAGAGCATAGAGGA
CATAATGAAGATAGTTGGAGAAGCTAGGAATCTACCTTCATCTTCTAGTGTTAGCAAAAG
CTTGGGATCAGGGGCTGAAGATGAAGATGAAGAGGACGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
TGAATACGAGAAGCATGTCAAAGAGGCACATTCTTCTTGTCAAGAACCTGAGAAAGCTCA
AGAAGAAAGAAAGTGATCTGTTGCTCTAAACTACTTCGTACATGTTATTTCACTTTTCGA
TTTGATGTCTGCATACGTTCTCGTTTTCTTCAACTGTCTAGTGGTTCTGAACATAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G630TF U 1
AF RR4G630JQ C 387
BS 1 657 RR4G630TF
BS 658 659 RR4G630JQ
BS 660 696 RR4G630TF
BS 697 1199 RR4G630JQ

RD RR4G630TF 696 0 0
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AACTGGAAACTTCGGCGTGGCTCGTCTTCTGAAGCACAAGGAGACCAATGAGCTCGTTGC
CATGAAATACATCGAGAGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAA
TCACAGATCACTTAAGCATCCTAATATCATCCGCTTCAAGGAGGTGATTCTGACACCTAC
TCATCTTGCTATCGTGATGGAGTATGCTGCTGGAGGAGAGCTCTTTGATCGAATCTGCAC
TTCTGGTAGATTCAGTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGT
CGACTACTGCCACTCCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTGCT
TGATGGGAGCCCTGCTCCGCTTTTGAAAATCTGTGACTTTGGTTACTCTAAGTCATCTAT
ACTACACTCTAGGCCTAAATCAACCGTTGGAACTCCAGCGTACATAGCACCTGAAGTTCT
TTCCCGGAGAGAATATGATGGCAAGCACGCTGATGTGTGGTCATGTGGAGTAACCCTTTA
TGTGATGCTGGTTGGAGCTTACCCATTTGAGGATCCTAATGATCCAAAGAACTTCAG**A
AACAATCCAACGTATAATGGCTACACAATACAAGAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4G630JQ 813 0 0
GCCACAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTGCTTGATGGGAGCC*TGCTCCGCTTTTGA
AAATCTGTGACTTTGGTTACTCTAAGTCATCTATACTACACTCTAGGCCTAAATCAACCG
TTGGAACTCCAGCGTACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGGAGAGAATATGATGGCAAGC
ACGCTGATGTGTGGTCATGTGGAGTAACCCTTTATGTGATGCTGGTTGGAGCTTACCCAT
TTGAGGATCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAAAACAATCCAACGTATAATGGCTACAC
AATACAAGATCCCGGACCACGTTCACTTATCTCAGGAATGCAAACACCTTCTCTCTCGCA
TATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCTTAAGGAGATCAAGAATCATCCATGGT
ACACGAAGAATCTGCCAAAGGAGCTGGTAGAGTCGGCTCAAGCGGTGTATTACAAGAGAG
ACAACACGAGCTATTCTCTTCAGAGCATAGAGGACATAATGAAGATAGTTGGAGAAGCTA
GGAATCTACCTTCATCTTCTAGTGTTAGCAAAAGCTTGGGATCAGGGGCTGAAGATGAAG
ATGAAGAGGACGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAATACGAGAAGCATGTCAAAGAGG
CACATTCTTCTTGTCAAGAACCTGAGAAAGCTCAAGAAGAAAGAAAGTGATCTGTTGCTC
TAAACTACTTCGTACATGTTATTTCACTTTTCGATTTGATGTCTGCATACGTTCTCGTTT
TCTTCAACTGTCTAGTGGTTCTGAACATAACCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6710Contig1 1211 2 2 U
GCTTGGTGCGAGACGGTCGATCGTAGGGCTGAGCAGAAGAAAGGAAAGCTGGAGAACGAG
CTCAGTTCCTATCGGACGAATCTGATAAAGGAAAGCATAAGGATGGGATATAATGACTTT
GGTGACTTCTACTATGCTTGTGGTTTGCTTAACGATGCTTTCAAGAACTATATTCGGACG
CGGGACTACTGCACCACGGCTAAGCATATTATTCACATGTGTATGAATGCTATTCTCGTA
AGCATCGAGATGGGACAGTTCAGCCATGTTTCGAGCTATGTTAACAAGGTGGATCAGAAT
CCAGAGACGCTTGACCCTATTGTAGCTGCGAAGCTCCGGTGTGCTTCTGGGTTGGCTCAC
TTGGAGCTGAAGAAGTATAAGCTCGCTGCTCGTAAGTTTTTGGATGTTAATCCAGAGCTC
GGGAGTTCTTATAACGAGGTCATTGCTCCTCAAGATATTGCGACCTATGGAGGACTTTGT
GCCCTGGCTAGCTTTGACCGATCAGAATTAAAGGCAAAAGTGATTGACAACATCAACTTC
CGGAATTTTTTGGAGCTGGTACCTGAAGTGAGAGAGCTTATCAACGATTTTTATTCAAGC
CGCTATGCATCCTGTCTGGAATATCTTGGAAGTCTCAGAGCAAATTTGCTGCTGGACATC
CATCTTCATGATCACATTGACACGCTGTATGACCAGATAAGGAAGAAGGCGTTGATCCAG
TACACGCTGCCATTCGTGTCTGTTGTTGAGCAGGATGGCTGATGCGTTCAAAACCAGCGT
GTCTGGTCTAGAGAAGGAACTGGAAACCTTGATAACAGACGACCAGATACAGGCACGGAT
TGATTCACACAACAAAATCCTCTACGCAAGGCACGCGGATCAGAGGAACGCAACTTTCCA
GAAGGTGCTTCAGATGGGTAACGAATTCGATAGAGATGTGAGGTCAATGATGTTGAGAGC
CAACCTTCTCAAACATGAGTATCATGCCAGAAAGCCTTGAGATGGACAACATCTGTTTGG
CTAATTTGAGAGGTACTGGGCCTGATCCAAGATCCTAAAGATGTTTGTGAAAGTTTGATT
TTGGTCTAGTTATTGGTTAGATGTATGTCTAATCATCTCGGCGGCGCTCTTGTTATTACT
CTTGTTTATGAAAGTTTCTCATACTCTAAAACTTTTATATGAATTTTGGTGTCTAAAGCT
GAAGTTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP61TF U 1
AF RR4AP61JQ C 401
BS 1 698 RR4AP61TF
BS 699 1211 RR4AP61JQ

RD RR4AP61TF 698 0 0
GCTTGGTGCGAGACGGTCGATCGTAGGGCTGAGCAGAAGAAAGGAAAGCTGGAGAACGAG
CTCAGTTCCTATCGGACGAATCTGATAAAGGAAAGCATAAGGATGGGATATAATGACTTT
GGTGACTTCTACTATGCTTGTGGTTTGCTTAACGATGCTTTCAAGAACTATATTCGGACG
CGGGACTACTGCACCACGGCTAAGCATATTATTCACATGTGTATGAATGCTATTCTCGTA
AGCATCGAGATGGGACAGTTCAGCCATGTTTCGAGCTATGTTAACAAGGTGGATCAGAAT
CCAGAGACGCTTGACCCTATTGTAGCTGCGAAGCTCCGGTGTGCTTCTGGGTTGGCTCAC
TTGGAGCTGAAGAAGTATAAGCTCGCTGCTCGTAAGTTTTTGGATGTTAATCCAGAGCTC
GGGAGTTCTTATAACGAGGTCATTGCTCCTCAAGATATTGCGACCTATGGAGGACTTTGT
GCCCTGGCTAGCTTTGACCGATCAGAATTAAAGGCAAAAGTGATTGACAACATCAACTTC
CGGAATTTTTTGGAGCTGGTACCTGAAGTGAGAGAGCTTATCAACGATTTTTATTCAAGC
CGCTATGCATCCTGTCTGGAATATCTTGGAAGTCTCAGAGCAAATTTGCTGCTGGACATC
CATCTTCATGATCACATTGACACGCTGTATGACCAGAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AP61JQ 811 0 0
TGGATGTTAATCCAGAGCTCGGGAGTTCTTATAACGAGGTCATTGCTCCTCAAGATATTG
CGACCTATGGAGGACTTTGTGCCCTGGCTAGCTTTGACCGATCAGAATTAAAGGCAAAAG
TGATTGACAACATCAACTTCCGGAATTTTTTGGAGCTGGTACCTGAAGTGAGAGAGCTTA
TCAACGATTTTTATTCAAGCCGCTATGCATCCTGTCTGGAATATCTTGGAAGTCTCAGAG
CAAATTTGCTGCTGGACATCCATCTTCATGATCACATTGACACGCTGTATGACCAGATAA
GGAAGAAGGCGTTGATCCAGTACACGCTGCCATTCGTGTCTGTTGTTGAGCAGGATGGCT
GATGCGTTCAAAACCAGCGTGTCTGGTCTAGAGAAGGAACTGGAAACCTTGATAACAGAC
GACCAGATACAGGCACGGATTGATTCACACAACAAAATCCTCTACGCAAGGCACGCGGAT
CAGAGGAACGCAACTTTCCAGAAGGTGCTTCAGATGGGTAACGAATTCGATAGAGATGTG
AGGTCAATGATGTTGAGAGCCAACCTTCTCAAACATGAGTATCATGCCAGAAAGCCTTGA
GATGGACAACATCTGTTTGGCTAATTTGAGAGGTACTGGGCCTGATCCAAGATCCTAAAG
ATGTTTGTGAAAGTTTGATTTTGGTCTAGTTATTGGTTAGATGTATGTCTAATCATCTCG
GCGGCGCTCTTGTTATTACTCTTGTTTATGAAAGTTTCTCATACTCTAAAACTTTTATAT
GAATTTTGGTGTCTAAAGCTGAAGTTTTTGG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL6711Contig1 1022 2 2 U
GCTTGACGAAGAAGGTAACCTCAAGGTCACGGACTTCGGTCTCTCTGCTTTCACCGAGCA
TCTGAAGCAAGACGGGCTTCTCCACACGACGTGTGGAACTCCGGCGTACGTTGCGCCGGA
GGTTATACTTAGGAAAGGATACGACGGAGCTAAGGCGGATCTGTGGTCCTGCGGGGTTAT
CCTCTACGTGCTCCTCGCTGGTTACTTGCCGTTTCAGGATGATAATCTCGTGAACATGTA
TAGGAAGATCTACAGAGGAGACTTCAAGTGTCCCGGGTGGTTTTCTTCCGATGCGAGGAG
GCTCGTGACGAAGCTTCTGGATCCGAACCCGAATACCCGGATCACTATCGACAAGGTTAT
GGACTCGCACTGGTTCAAGAAGTCCTCAACTAGATCAAGGAACGAGCCAGTGGCGGTAAC
ACCAGAGGCTGAGGATCTTGATTTGTCCGTGCACAAGTCCAAGGAAGAGACGGAGACGCT
AAACGCGTTTCATATAATCGCGTTATCCGAAGGGTTTGATCTCTCGCCCTTGTTCGAGGA
GAAGAAGAAAGAGGAGAAGGTAGAGATGAGGTTCGCGACTTCCCGGCCGGCGATTAGCGT
GATATCGAGCCTTGAGGAAGCGGCCAAGGTCGGGAACAAGTTTGATGTGAGGAAGAGCGA
GTGTAGAGTGAGGATCGAAGGGAAACAGAATGGCAGGAAAGGGAAGTTGGCGGTTGAGGC
GGAGATATTCGCGGTGGCTCCGTCGTTTGTTGTTGTGGAGGTGAAGAAAGATCATGGGGA
CACTCTTGAGTACAATAACTTTTGCAGTACGGCTCTTAGACCAGCTCTCAAGGACGTCCT
CTGGACTTCTACTACACCTGCTTGATTTTTAATCTGTTTAATAAATCTTGTGTGTTTTTA
ATTCCTCTGTCTGTAAAATATTGTTGGGTTCTAGATTCGGTTCTTGATTCTTGTTCTTGT
TCTTGATTAATGAGTATCCCTTGAACTTTGATTAATCGTGTAAAAAAGGTTCGAGTCTTT
CC


BQ
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10 10 

AF RR4F931TF U 1
AF RR4F931JQ C 283
BS 1 579 RR4F931TF
BS 580 1022 RR4F931JQ

RD RR4F931TF 579 0 0
GCTTGACGAAGAAGGTAACCTCAAGGTCACGGACTTCGGTCTCTCTGCTTTCACCGAGCA
TCTGAAGCAAGACGGGCTTCTCCACACGACGTGTGGAACTCCGGCGTACGTTGCGCCGGA
GGTTATACTTAGGAAAGGATACGACGGAGCTAAGGCGGATCTGTGGTCCTGCGGGGTTAT
CCTCTACGTGCTCCTCGCTGGTTACTTGCCGTTTCAGGATGATAATCTCGTGAACATGTA
TAGGAAGATCTACAGAGGAGACTTCAAGTGTCCCGGGTGGTTTTCTTCCGATGCGAGGAG
GCTCGTGACGAAGCTTCTGGATCCGAACCCGAATACCCGGATCACTATCGACAAGGTTAT
GGACTCGCACTGGTTCAAGAAGTCCTCAACTAGATCAAGGAACGAGCCAGTGGCGGTAAC
ACCAGAGGCTGAGGATCTTGATTTGTCCGTGCACAAGTCCAAGGAAGAGACGGAGACGCT
AAACGCGTTTCATATAATCGCGTTATCCGAAGGGTTTGATCTCTCGCCCTTGTTCGAGGA
GAAGAAGAAAGAGGAGAAGGTAGAGATGAGGTTCGCGAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4F931JQ 740 0 0
TTCTTCCGATGCGAGGAGGCTCGTGACGAAGCTTCTGGATCCGAACCCGAATACCCGGAT
CACTATCGACAAGGTTATGGACTCGCACTGGTTCAAGAAGTCCTCAACTAGATCAAGGAA
CGAGCCAGTGGCGGTAACACCAGAGGCTGAGGATCTTGATTTGTCCGTGCACAAGTCCAA
GGAAGAGACGGAGACGCTAAACGCGTTTCATATAATCGCGTTATCCGAAGGGTTTGATCT
CTCGCCCTTGTTCGAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGAAGGTAGAGATGAGGTTCGCGACTTC
CCGGCCGGCGATTAGCGTGATATCGAGCCTTGAGGAAGCGGCCAAGGTCGGGAACAAGTT
TGATGTGAGGAAGAGCGAGTGTAGAGTGAGGATCGAAGGGAAACAGAATGGCAGGAAAGG
GAAGTTGGCGGTTGAGGCGGAGATATTCGCGGTGGCTCCGTCGTTTGTTGTTGTGGAGGT
GAAGAAAGATCATGGGGACACTCTTGAGTACAATAACTTTTGCAGTACGGCTCTTAGACC
AGCTCTCAAGGACGTCCTCTGGACTTCTACTACACCTGCTTGATTTTTAATCTGTTTAAT
AAATCTTGTGTGTTTTTAATTCCTCTGTCTGTAAAATATTGTTGGGTTCTAGATTCGGTT
CTTGATTCTTGTTCTTGTTCTTGATTAATGAGTATCCCTTGAACTTTGATTAATCGTGTA
AAAAAGGTTCGAGTCTTTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6712Contig1 708 2 3 U
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AATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGCTCATGATGATGATGGTGGAT
TGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCAC
CCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCTC
TCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACATC
GGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATGACTTTTGACTTGGCTG
GTAAACAGATTTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACGGTCAACGAAGGCCT
CTCCTGGCTGAAAGTTGAGAACGTGCGGTGGACACACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCA
AAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTACTCCACCGTATTTGATCTTGTCAAAAGGAGGAA
GAAGAGGATGAGGGAAGGCAAGCAACGGCGGGAGAGGAACGAAGAGAGAGTTTTTGGAGT
GAAGGTTGAGAAGGAGAAAGAGAGGTGAGGAAGAAGCCGGAGAGAGGAGCGGTCGACATT
TTCGGGTGAAGAGAAGTTAGTGAGAGTGAGATGTATTTTACAATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DJ01JQ U 235
AF RR4DJ01TF C 1
BS 1 234 RR4DJ01TF
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BS 534 708 RR4DJ01TF

RD RR4DJ01JQ 299 0 0
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QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4DJ01TF 708 0 0
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TGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCAC
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TCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACATC
GGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATGACTTTTGACTTGGCTG
GTAAACAGATTTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACGGTCAACGAAGGCCT
CTCCTGGCTGAAAGTTGAGAACGTGCGGTGGACACACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCA
AAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTACTCCACCGTATTTGATCTTGTCAAAAGGAGGAA
GAAGAGGATGAGGGAAGGCAAGCAACGGCGGGAGAGGAACGAAGAGAGAGTTTTTGGAGT
GAAGGTTGAGAAGGAGAAAGAGAGGTGAGGAAGAAGCCGGAGAGAGGAGCGGTCGACATT
TTCGGGTGAAGAGAAGTTAGTGAGAGTGAGATGTATTTTACAATATCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6713Contig1 1164 2 4 U
GGGAGAAAAGAAACCCACTCATAATCTTACCACATCAATTCTCTCAAACTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTTTCTACTATTACAGAGTCAGACTCCTAAGTTAGGTGAAGAAGAA
GAACAATGACGAAAGAAGTTGTTGGAGAGAAGGGATCCTTCTCAGGCAAAGATTATCAAG
ACCCACCCCCTGAGCCTCTGTTCGACGCTACTGAGCTTGGGAAATGGTCTTTCTACAGAG
CTCTCATCGCTGAGTTCATAGCCACTCTCCTCTTCCTATATGTCACCGTTATGACTGTCA
TTGGTTACAAGAGCCAGACCGATCCAACCCTTAGTCCAGACCAGTGTGCAGGTGTTGGAG
TCCTCGGCATCGCTTGGGCCTTTGGTGGCATGATCTTCATCCTTGTCTACTGCACTGCTG
GGATCTCTGGTGGACTCATAAATCCGGCGGTGACGTTTGGGCTGTTGCTGGCAAGAAAAG
TTACGTTGTTGAGAGCAGTAATGTACATGGTGGCTCAGTGCCTTGGTGCCATTTGCGGTG
TGGCTTTGGTTAAGTCCTTCCAGTCTTCTTACTACACCCGCTACGGTGGCGGGGCGAACG
GTCTCTCAGATGGTTATAGCGTCGGCACCGGTGTTGCCGCCGAGATCATCGGTACATTCG
TCTTAGTCTACACTGTCTTCTCTGCCACTGACCCCAAGAGGAGTGCGCGCGACTCTCACG
TCCCTGTATTGGCTCCATTGCCAATTGGATTTGCGGTGTTCATAGTTCACTTAGCTACAA
TCCCAATCACGGGCACTGGCATTAACCCTGCAAGAAGCCTCGGAGCTGCAATCATCTACA
ACAAGGACCAAGCTTGGGACCATCATTGGATATTTTGGGTGGGTCCGTTTGCGGGTGCAG
CCATTGCTGCTTTCTACCTTCAGTTTGTGTTGAGGGCTGGTGCGGTGAAGGCGCTCGGGT
CTTTCAGGAGCCAGTCTCGCGTTTAACTTAGATTCGCCCTCACTTATCAAAGAGAGTAGC
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GAAATGCTACTTCTCTTACATCTC


BQ
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AF RR4EY92TF U 1
AF RR4EY92JQ C 407
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BS 701 701 RR4EY92JQ
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RD RR4EY92TF 710 0 0
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CTCTCTCTCTCTCTCTTTCTACTATTACAGAGTCAGACTCCTAAGTTAGGTGAAGAAGAA
GAACAATGACGAAAGAAGTTGTTGGAGAGAAGGGATCCTTCTCAGGCAAAGATTATCAAG
ACCCACCCCCTGAGCCTCTGTTCGACGCTACTGAGCTTGGGAAATGGTCTTTCTACAGAG
CTCTCATCGCTGAGTTCATAGCCACTCTCCTCTTCCTATATGTCACCGTTATGACTGTCA
TTGGTTACAAGAGCCAGACCGATCCAACCCTTAGTCCAGACCAGTGTGCAGGTGTTGGAG
TCCTCGGCATCGCTTGGGCCTTTGGTGGCATGATCTTCATCCTTGTCTACTGCACTGCTG
GGATCTCTGGTGGACTCATAAATCCGGCGGTGACGTTTGGGCTGTTGCTGGCAAGAAAAG
TTACGTTGTTGAGAGCAGTAATGTACATGGTGGCTCAGTGCCTTGGTGCCATTTGCGGTG
TGGCTTTGGTTAAGTCCTTCCAGTCTTCTTACTACACCCGCTACGGTGGCGGGGCGAACG
GTCTCTCAGATGGTTATAGCGTCGGCACCGGTGTTGCCGCCGAGATCATCGGTACATTCG
TCTTAGTCTACACTGTCTTCTCTGCCACTGACCCCAAGAG*AGTGCGCGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4EY92JQ 758 0 0
CTACTGCACTGCTGGGATCTCTGGTGGACTCATAAATCCGGCGGTGACGTTTGGGCTGTT
GCTGGCAAGAAAAGTTACGTTGTTGAGAGCAGTAATGTACATGGTGGCTCAGTGCCTTGG
TGCCATTTGCGGTGTGGCTTTGGTTAAGTCCTTCCAGTCTTCTTACTACACCCGCTACGG
TGGCGGGGCGAACGGTCTCTCAGATGGTTATAGCGTCGGCACCGGTGTTGCCGCCGAGAT
CATCGGTACATTCGTCTTAGTCTACACTGTCTTCTCTGCCACTGACCCCAAGAGGAGTGC
GCGCGACTCTCACGTCCCTGTATTGGCTCCATTGCCAATTGGATTTGCGGTGTTCATAGT
TCACTTAGCTACAATCCCAATCACGGGCACTGGCATTAACCCTGCAAGAAGCCTCGGAGC
TGCAATCATCTACAACAAGGACCAAGCTTGGGACCATCATTGGATATTTTGGGTGGGTCC
GTTTGCGGGTGCAGCCATTGCTGCTTTCTACCTTCAGTTTGTGTTGAGGGCTGGTGCGGT
GAAGGCGCTCGGGTCTTTCAGGAGCCAGTCTCGCGTTTAACTTAGATTCGCCCTCACTTA
TCAAAGAGAGTAGCGAGAAGACAATAAAAAGCCGCTTTTTATGTAATGTAGATGGTTGGA
ACCCAGTGACATGTAGTATCTTAGTTCTAGCTTTGGTGAAGAGAGGTTTTGAGTGTGACT
TGTGGGTCAACTTTGAAATGCTACTTCTCTTACATCTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL6714Contig1 1096 2 4 U
GGAGAGAATCTTCCCCTCGCATATCGGCAGCAGATTGTTGAATTTATATTACAGAACTCT
GGGCAGAAGGACTTCAATTTTAATCCATCTTTTCGTGATCCCTTCACCGGCGCAAATGCT
TATGTACCTGGGCAATCATCTCATACAGCTGCAACTACGGCAAAACCCTACAAGCACATT
CCAAAAAGAGGTGTACTAGTTTTCGACGTTGCTCAATATGATGGGATAGTGAAAAAGATG
ACAGAGTTCAACAATACTCTACGATCTGATCCAGTACATACTGACAAGTCGCTGACAGAA
GTTGAAATATCTAGAGTTGGCGCAATGGTGAAAATACTCAAGGACACATCACATTACCAT
GCTACCAGTTTTACTGATATGGATATTTCTCTACTTTTGAAAGTGTTACAAACATGGCCC
CCTGCGATGATGTTTCCTGCTACTGATTTAGTTAGGATGCTCGTTTTGCATCCTCATGGA
GCAAGTCTACTTATTAAGCATGTGGAAAACAACAATGAATTGCTTCTGGATGTTATAAAG
AAAGTCACAGAAGATTCGGCTCTTCCTTCAAATCTTCTAACTACTGTTCGTGTCCTTGTC
AATCTATTCAAGAATCCTTCATTTCATTACTGGCTACAGAGGCATCATAGTCAAATTCTT
GATGCCTTCTCAAGCTGTTATTCATCCCCAAATAAGAATCTGCAGTTGGCATATTCGACG
TTGCTTCTCAATTATGCAGTGCTATTAATAGAAAAGAAGGATCAAGAAGGCCAAGCTCAA
GTCCTGTCAGCAGCGTTGCAGATTGCAGAAGAGGAGGCTGCAGATGTTGATTCCAAGTTC
CGAAGTTTGGTAGCAATCGGCTCGCTGATGCTTGAAGGCCTCGTGAAGAAGATAGCGATA
GATTTTGAGGTGGAGAGCATTGCGAAATCAGCAAAGGCATCTAAGGAAACTAAGATTGTG
GAAGTTGGTACTGATATCGATCTTGTAATTCGCCAGCCTTGAAAGAGAGACTTGTGAATG
TTGCCCTAGATTAGGATTCTTTTTCATATTGTTGTATTCACTTTTTATTATTTTAAACAC
ACAAAGCTGAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO19TF U 1
AF RR4BO19JQ C 424
BS 1 694 RR4BO19TF
BS 695 697 RR4BO19JQ
BS 698 729 RR4BO19TF
BS 730 1096 RR4BO19JQ

RD RR4BO19TF 729 0 0
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GGGCAGAAGGACTTCAATTTTAATCCATCTTTTCGTGATCCCTTCACCGGCGCAAATGCT
TATGTACCTGGGCAATCATCTCATACAGCTGCAACTACGGCAAAACCCTACAAGCACATT
CCAAAAAGAGGTGTACTAGTTTTCGACGTTGCTCAATATGATGGGATAGTGAAAAAGATG
ACAGAGTTCAACAATACTCTACGATCTGATCCAGTACATACTGACAAGTCGCTGACAGAA
GTTGAAATATCTAGAGTTGGCGCAATGGTGAAAATACTCAAGGACACATCACATTACCAT
GCTACCAGTTTTACTGATATGGATATTTCTCTACTTTTGAAAGTGTTACAAACATGGCCC
CCTGCGATGATGTTTCCTGCTACTGATTTAGTTAGGATGCTCGTTTTGCATCCTCATGGA
GCAAGTCTACTTATTAAGCATGTGGAAAACAACAATGAATTGCTTCTGGATGTTATAAAG
AAAGTCACAGAAGATTCGGCTCTTCCTTCAAATCTTCTAACTACTGTTCGTGTCCTTGTC
AATCTATTCAAGAATCCTTCATTTCATTACTGGCTACAGAGGCATCATAGTCAAATTCTT
GATGCCTTCTCAAGCTGTTATTCATCCCCAAATA**GATCTGCAGTTGGCATATTCGACG
TTGCTTCTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4BO19JQ 673 0 0
GCGATGATGTTTCCTGCTACTGATTTAGTTAGGATGCTCGTTTTGCATCCTCATGGAGCA
AGTCTACTTATTAAGCATGTGGAAAACAACAATGAATTGCTTCTGGATGTTATAAAGAAA
GTCACAGAAGATTCGGCTCTTCCTTCAAATCTTCTAACTACTGTTCGTGTCCTTGTCAAT
CTATTCAAGAATCCTTCATTTCATTACTGGCTACAGAGGCATCATAGTCAAATTCTTGAT
GCCTTCTCAAGCTGTTATTCATCCCCAAATAAGAATCTGCAGTTGGCATATTCGACGTTG
CTTCTCAATTATGCAGTGCTATTAATAGAAAAGAAGGATCAAGAAGGCCAAGCTCAAGTC
CTGTCAGCAGCGTTGCAGATTGCAGAAGAGGAGGCTGCAGATGTTGATTCCAAGTTCCGA
AGTTTGGTAGCAATCGGCTCGCTGATGCTTGAAGGCCTCGTGAAGAAGATAGCGATAGAT
TTTGAGGTGGAGAGCATTGCGAAATCAGCAAAGGCATCTAAGGAAACTAAGATTGTGGAA
GTTGGTACTGATATCGATCTTGTAATTCGCCAGCCTTGAAAGAGAGACTTGTGAATGTTG
CCCTAGATTAGGATTCTTTTTCATATTGTTGTATTCACTTTTTATTATTTTAAACACACA
AAGCTGAATTTTC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL6715Contig1 1193 2 6 U
GCCCTCTTCGGCGTCTCGATGTTCATCAACGACTGCCCCGAGAACTCGCCCAAGTGCTCG
GCTAGGTTTCTCGGGAGGTTCGCGTTTCAGCCTATGAGGGAGAACCCTCTTCTGGGTCCC
TCTTCCGCCACGTTGGGGAAGATGGGGGCTTTAGATGTACCGATGGTGGTGGATAAGCAC
CAAGTGTGGCGCTTGTTCACTTGCATATGGCTTCACGCTGGTGTTTTCCATGTCCTTGCC
AACATGTTGAGTCTTATCTTCATCGGCATTCGTCTCGAGCAAGAGTTTGGATTCCTACGG
ATTGGATTGCTCTATATGATATCTGGATTTGGTGGGAGTTTGTTATCATCTCTCTTTAAC
CGGGAAGGTATATCCGTTGGTGCCTCTGGTGCATTGTTCGGCTTGCTCGGCGCTATGCTC
TCTGAGCTTCTCACTAACTGGACTATATACGCTAATAAGTTTGCAGCTCTTTTGACACTC
ATCTTCATCATAGCCATTAATCTAGCAGTAGGTATTCTTCCACACGTAGACAACTTTGCC
CATCTCGGAGGATTCACTTCCGGGTTTCTTCTAGGCTTTGTTTTCTTGATCCGTCCTCAG
TACGGATACTTCAACCAGAGGAACAACCCTCGTGGCTACGCTGCACCTTCTGCTAAATCC
AAACACAAGCCGTACCAATACGTTCTCTGGATCACTTCCCTACTTCTTTTGATTGCAGGA
TATACCGTTGGGCTCATTGTACTTCTTCGAGGGACGGATTTGAACAAGCACTGTACATGG
TGCCATTATCTCAGTTGTATGCCTACGTCTCTATGGAACTGTAAATCTCAAAATATGTAC
TGTCAGTCGAGCCAGATAGGGAAGCAGATGAACTTGACGTGTATATCTAACGGGAGAACA
GAGATGTATACTCTTGGTAGCGAGAACCAGTCTCAGATTCAGCAAATGTGTTCCCAGTTA
TGCAGCTGATACACCCACACCACTAAACACCTAGTAATTGCTTTTTAGAGAGTAGGGAAT
GTCTTGGAAAGGGACAACAGACGGTTCACTTAAATTTGATTATTCTTGTTCGATCATATT
ATTGTCTGGTTCTACTTTTCTTTTTTCTTCATTGCAAATGTAAAGACCATTTTCAGATTA
TTTGAATTAGTAACAATGCTGAGGGTAAAAGACAACAACTCTCGTTTCGGTAC


BQ
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AF RR4FN08TF U 1
AF RR4FN08JQ C 499
BS 1 763 RR4FN08TF
BS 764 766 RR4FN08JQ
BS 767 783 RR4FN08TF
BS 784 784 RR4FN08JQ
BS 785 809 RR4FN08TF
BS 810 1193 RR4FN08JQ

RD RR4FN08TF 809 0 0
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GCTAGGTTTCTCGGGAGGTTCGCGTTTCAGCCTATGAGGGAGAACCCTCTTCTGGGTCCC
TCTTCCGCCACGTTGGGGAAGATGGGGGCTTTAGATGTACCGATGGTGGTGGATAAGCAC
CAAGTGTGGCGCTTGTTCACTTGCATATGGCTTCACGCTGGTGTTTTCCATGTCCTTGCC
AACATGTTGAGTCTTATCTTCATCGGCATTCGTCTCGAGCAAGAGTTTGGATTCCTACGG
ATTGGATTGCTCTATATGATATCTGGATTTGGTGGGAGTTTGTTATCATCTCTCTTTAAC
CGGGAAGGTATATCCGTTGGTGCCTCTGGTGCATTGTTCGGCTTGCTCGGCGCTATGCTC
TCTGAGCTTCTCACTAACTGGACTATATACGCTAATAAGTTTGCAGCTCTTTTGACACTC
ATCTTCATCATAGCCATTAATCTAGCAGTAGGTATTCTTCCACACGTAGACAACTTTGCC
CATCTCGGAGGATTCACTTCCGGGTTTCTTCTAGGCTTTGTTTTCTTGATCCGTCCTCAG
TACGGATACTTCAACCAGAGGAACAACCCTCGTGGCTACGCTGCACCTTCTGCTAAATCC
AAACACAAGCCGTACCAATACGTTCTCTGGATCACTTCCCTACTTCTTTTGATTGCAGGA
TATACCGTTGGGCTCATTGTACTTCTTCGAGGGACGGATTTGA**CAGCACTGTACATGG
TGC*ATTATCTCAGTTGTATGCCTACGTC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4FN08JQ 695 0 0
AATCTAGCAGTAGGTATTCTTCCACACGTAGACAACTTTGCCCATCTCGGAGGATTCACT
TCCGGGTTTCTTCTAGGCTTTGTTTTCTTGATCCGTCCTCAGTACGGATACTTCAACCAG
AGGAACAACCCTCGTGGCTACGCTGCACCTTCTGCTAAATCCAAACACAAGCCGTACCAA
TACGTTCTCTGGATCACTTCCCTACTTCTTTTGATTGCAGGATATACCGTTGGGCTCATT
GTACTTCTTCGAGGGACGGATTTGAACAAGCACTGTACATGGTGCCATTATCTCAGTTGT
ATGCCTACGTCTCTATGGAACTGTAAATCTCAAAATATGTACTGTCAGTCGAGCCAGATA
GGGAAGCAGATGAACTTGACGTGTATATCTAACGGGAGAACAGAGATGTATACTCTTGGT
AGCGAGAACCAGTCTCAGATTCAGCAAATGTGTTCCCAGTTATGCAGCTGATACACCCAC
ACCACTAAACACCTAGTAATTGCTTTTTAGAGAGTAGGGAATGTCTTGGAAAGGGACAAC
AGACGGTTCACTTAAATTTGATTATTCTTGTTCGATCATATTATTGTCTGGTTCTACTTT
TCTTTTTTCTTCATTGCAAATGTAAAGACCATTTTCAGATTATTTGAATTAGTAACAATG
CTGAGGGTAAAAGACAACAACTCTCGTTTCGGTAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6717Contig1 1111 2 2 U
GTGCTTCTTGATTCCCGGTATGAATATCAAACTCATTGGAGAGTCCAATGATTACGTAGG
AAAGGGAATGGCTGGTGGTGAGATAGTAGTAACTCCTGTGGATAAAATTGGGTTTGTGCC
TGAAGAAGCAACCATAGTTGGGAACACTTGCTTGTACGATGCAACGGGTGGTCAGATATT
CGCTAGAGGCAAAGCTGGGGAGAGGTTTGCAGTTAGAAACTCACTTGCTGAGGCAGTAGT
TGAAGGCACTGGTGATCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGTGTCGTCGTGCTTGG
AAAAGTGGGGAGAAACGTAGCTGCAGGTATGACAGGAGGGTTAGCTTATCTTCTTGATGA
AGACGACACTCTTCTTGATTCCCGGTATGAATATCAAACTCATTGGAGAGTCCAATGATT
ACGTAGGAAAGGGAATGGCTGGTGGTGAGATAGTAGTAACTCCTGTGGATAAAATTGGGT
TTGTGCCTGAAGAAGCAACCATAGTTGGGAACACTGGCTTGTACGGTGCAACGGGTGGTC
AGATATTCGCTAGAGGCAAAGCTGGGGAGAGGTTTGCAGTTAGAAACTCACTTGCTGAAG
CAGTAGTTGAAGGCACTGGTGATCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGTGTCGTCG
TGCTTGGAAAAGTGGGGAATTGCAGCTCAAGAGCTTAATCGAAGCCCATGTGGAAAAAAC
TGGAAGCAGCAAAGGGGAGACGATCCTGAAAGAATGGGAAAAGTATCTACCTCTCTTCTG
GCAACTGGTTCCACCGAGCGAGGAAGACACTCCTGAAGCTTCTGCTGCTTATGTAAGAAC
AGCCACCGGTGAAGTCACGTTTCAATCGGCATAGAGGATATGTTGCAGTCGAAACAAGAA
GGATTGATACATCAATGGTGGGCTACGGAGGAAAAATAGATCATTAATCACAGATCAATG
TGTGTGTGACAATATTCATATTGTCCTGTGATCTTAACAGTACCATGATTGCTATAAGAT
GTACAGTTATTCAGTTAAATAACTGCATTCAACTGCCATGAAAATTCCATAAAATTTGCA
ATATTATCTTTCATTGAATAAAGTTTGTAGC


BQ
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AF RR4AW03TF U 1
AF RR4AW03JQ C 278
BS 1 702 RR4AW03TF
BS 703 1111 RR4AW03JQ

RD RR4AW03TF 702 0 0
GTGCTTCTTGATTCCCGGTATGAATATCAAACTCATTGGAGAGTCCAATGATTACGTAGG
AAAGGGAATGGCTGGTGGTGAGATAGTAGTAACTCCTGTGGATAAAATTGGGTTTGTGCC
TGAAGAAGCAACCATAGTTGGGAACACTTGCTTGTACGATGCAACGGGTGGTCAGATATT
CGCTAGAGGCAAAGCTGGGGAGAGGTTTGCAGTTAGAAACTCACTTGCTGAGGCAGTAGT
TGAAGGCACTGGTGATCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGTGTCGTCGTGCTTGG
AAAAGTGGGGAGAAACGTAGCTGCAGGTATGACAGGAGGGTTAGCTTATCTTCTTGATGA
AGACGACACTCTTCTTGATTCCCGGTATGAATATCAAACTCATTGGAGAGTCCAATGATT
ACGTAGGAAAGGGAATGGCTGGTGGTGAGATAGTAGTAACTCCTGTGGATAAAATTGGGT
TTGTGCCTGAAGAAGCAACCATAGTTGGGAACACTGGCTTGTACGGTGCAACGGGTGGTC
AGATATTCGCTAGAGGCAAAGCTGGGGAGAGGTTTGCAGTTAGAAACTCACTTGCTGAAG
CAGTAGTTGAAGGCACTGGTGATCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGTGTCGTCG
TGCTTGGAAAAGTGGGGAATTGCAGCTCAAGAGCTTAATCGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4AW03JQ 834 0 0
GGTGGCTGTGTCGTCGTGCTTGGAAAAGTGGGGAGAAACGTAGCTGCAGGTATGACAGGA
GGGTTAGCTTATCTTCTTGATGAAGACGACACTCTTCTTGATTCCCGGTATGAATATCAA
ACTCATTGGAGAGTCCAATGATTACGTAGGAAAGGGAATGGCTGGTGGTGAGATAGTAGT
AACTCCTGTGGATAAAATTGGGTTTGTGCCTGAAGAAGCAACCATAGTTGGGAACACTGG
CTTGTACGGTGCAACGGGTGGTCAGATATTCGCTAGAGGCAAAGCTGGGGAGAGGTTTGC
AGTTAGAAACTCACTTGCTGAAGCAGTAGTTGAAGGCACTGGTGATCATTGCTGTGAGTA
CATGACTGGTGGCTGTGTCGTCGTGCTTGGAAAAGTGGGGAATTGCAGCTCAAGAGCTTA
ATCGAAGCCCATGTGGAAAAAACTGGAAGCAGCAAAGGGGAGACGATCCTGAAAGAATGG
GAAAAGTATCTACCTCTCTTCTGGCAACTGGTTCCACCGAGCGAGGAAGACACTCCTGAA
GCTTCTGCTGCTTATGTAAGAACAGCCACCGGTGAAGTCACGTTTCAATCGGCATAGAGG
ATATGTTGCAGTCGAAACAAGAAGGATTGATACATCAATGGTGGGCTACGGAGGAAAAAT
AGATCATTAATCACAGATCAATGTGTGTGTGACAATATTCATATTGTCCTGTGATCTTAA
CAGTACCATGATTGCTATAAGATGTACAGTTATTCAGTTAAATAACTGCATTCAACTGCC
ATGAAAATTCCATAAAATTTGCAATATTATCTTTCATTGAATAAAGTTTGTAGC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL6718Contig1 719 2 3 U
GGGGACATAATAAGAACTGAGAACATAGCGAAAAGAATACTTGCGTTGTTGCTGAAACTA
GCAGCGGTTTTCCGTTGTACCCCGTTTCAGCTTCTGAGGAGGAAGAATACAATTACTCTT
TCAAGTCCAACGCAACTTGAACGCAACCCAAGACATGCAGAGACCACAATGAAAGACAAG
ATTCGTCCATGTTTGGAACGTATACAGAAACTGGAGAAAGTGTACGAGGAAATCAGGAAC
AAACCGGTTGAAATTCCGTTAGAGAAGGAGAGAATGCTGATGGATTCTCTGGACAGAATC
AAATCGGTTGAGTTTGATCTCGTAAAAACAAAGGGGGTTTTGCACGCAACAGTGATGAAA
CAGATGGAAATAACTGAAATGCTGGAAAGTTTACGAGACTCGCAGCTTCACAGAAGAAGA
TTGTTCTGTTAGAATAAAAACCATAAGAGAACATCTTCTTGCTGAATTTTGCATAAATAC
AGCTTCAAAACTTCTGCACATACAGTGAGAAATAACAGATTTTACAAATGAAGAAACATC
CTTGCTCCTCCTCTAACTTGAGTGACACGCCATCTTTCTTTGTTTTTCATAGGTTCATCT
GCTTCCACTTTTTTTTTTAAGTTAAAAAGAAAAGAAGAAGATAAAGAGGATAGGGACAGA
AAATCTTTGATGGTTGGTGTAGATTTGAGATGAGAATTTGAGTATAAAAGCTGATATAC


BQ
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AF RR4BX35JQ C 1
AF RR4BX35TF U 1
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DS 

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GCAGCGGTTTTCCGTTGTACCCCGTTTCAGCTTCTGAGGAGGAAGAATACAATTACTCTT
TCAAGTCCAACGCAACTTGAACGCAACCCAAGACATGCAGAGACCACAATGAAAGACAAG
ATTCGTCCATGTTTGGAACGTATACAGAAACTGGAGAAAGTGTACGAGGAAATCAGGAAC
AAACCGGTTGAAATTCCGTTAGAGAAGGAGAGAATGCTGATGGATTCTCTGGACAGAATC
AAATCGGTTGAGTTTGATCTCGTAAAAACAAAGGGGGTTTTGCACGCAACAGTGATGAAA
CAGATGGAAATAACTGAAATGCTGGAAAGTTTACGAGACTCGCAGCTTCACAGAAGAAGA
TTGTTCTGTTAGAATAAAAACCATAAGAGAACATCTTCTTGCTGAATTTTGCATAAATAC
AGCTTCAAAACTTCTGCACATACAGTGAGAAATAACAGATTTTACAAATGAAGAAACATC
CTTGCTCCTCCTCTAACTTGAGTGACACGCCATCTTTCTTTGTTTTTCATAGGTTCATCT
GCTTCCACTTTTTTTTTTAAGTTAAAAAGAAAAGAAGAAGATAAAGAGGATAGGGACAGA
AAATCTTTGATGGTTGGTGTAGATTTGAGATGAGAATTTGAGTATAAA*GCTGATATAC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

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CTTTCGTGTGAAAAAAATATCCAAGACCAAAAAGTCCTAGTGATCCTGAAAAAAAGGACA
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AGCCACACAATGTGCTGATTCCAAGCAGCGATGGTGATTTCGAGAAAATTGCCCGTAGTG
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AGAAGAGAGATTCTTCAGAAAAGATGAAGAAGATTGCAGAGCGCGCCTGGATTTGGAGGG
ATTTGCTTATGCTTCCAAAAAGTCAATCTAATAAAGTTTATTTATTGAATTATTTTGATT
CACAGCATTGAGGTAAAAGAAGGCGATTTGTTTTTTTTTCAAGAGTTAACAAAGTTGAAG
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TTTCCTACGTTTGCTTGACACAGTTCAATGATATTGTAAATGTGCCCTTCTCTTTTTGTT
GGATACCATCGTTGGGACGAATTCATCTATCTTTCTGTTCC


BQ
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AF RR4E074TF U 1
AF RR4E074JQ C 321
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BS 613 1061 RR4E074JQ

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CTATCCACGGATGAAGAAAACACTTGAAGAAAATGGGTATGGTGGAGAGCTAGAGGTTGA
GATCGTTATGCCTTTTGCAGACGATGAAGTACCATCGGGTCTGCTCAAGACAATGAGGCT
CTTTCGTGTGAAAAAAATATCCAAGACCAAAAAGTCCTAGTGATCCTGAAAAAAAGGACA
ACCAGATCGTTGATACTTATATCAATAGGGATATCGATAGGTGTCTGTCTGAAAATCCAG
AGCCACACAATGTGCTGATTCCAAGCAGCGATGGTGATTTCGAGAAAATTGCCCGTAGTG
TGGAAGAGGCGGGCCATACTTTCTTGATGGCCTATGATGGCAATCGCACTGGCAAAGATC
AGAAGAGAGATTCTTCAGAAAAGATGAAGAAGATTGCAGAGCGCGCCTGGATTTGGAGGG
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CACAGCATTGAG
TAAAA

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DS 

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AAGATGAAGAAGATTGCAGAGCGCGCCTGGATTTGGAGGGATTTGCTTATGCTTCCAAAA
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CGGGTTTAAGCATTGGCCTGAGCCGATGAAACTTCTTTATTTTCCTACGTTTGCTTGACA
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ATTCATCTATCTTTCTGTTCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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GCTCTGATTACTACATTGTCGCAAGTGCTCGCATTGTTAATGAAACCATATGGAGAAGAG
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CTCCTGGACCACAAGACGAATTCGACAAAACTTTCTCCATGAATCAAGCGAGATCCATCA
GATGGAATGTCTCAGCAAGTGGAGCACGTCCTAACCCACAAGGCTCGTTTAAGTACGGTT
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CTGTCGGAATGGACTATGGAGAGTGGACAGAGAACAGTAGAGGAACTTACAACAAATGGG
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CGCCTGCTAATGTCCTGTACTGTGGTGCTTTCAGCAAATTACAGAAGCCACAGAAGATAT
CATCGTCGGCGACGAGGAGCATTGGATTCACGAATCTTTCAATGATAGTGATGGCTTTGG
TGATGTTGCTTCTGCGTTGAAGTGTAATTTGAGGGTTTGTTTGTATTTTTCTAGGGGTTT
GTTGATATCGAACAAGGGCTGATGAATCTTCTTTACGTTTCCCATAGTTCTATTTGATTT
CTGACCTGTTTTGTATTTTTATTTTTTTGGATTATCTGTTGTTTTATTCTTTTTTTTCCG
GTACTCTGAGAAGAACACAAATTATTCATAAAAATGTTGAAATATTTTTATAAGCTCTGG
TTGTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H664TF U 1
AF RR4H664JQB C 483
BS 1 686 RR4H664TF
BS 687 687 RR4H664JQB
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RD RR4H664TF 794 0 0
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GACA
GAACATATGT

QA 1 784 1 784
DS 

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GTCGGAATGGACTATGGAGAGTGGACAGAGAACAGTAGAGGAACTTACAACAAATGGGAC
GGTATTGCCCGCTCAACTATTCAGGTGTATCCAGGGGCATGGTCAGCGATCTTGATATCT
TTGGACAATCCTGGAGCTTGGAATCTAAGAACAGAGAATCTTGATTCTTGGTATCTTGGA
CAAGAAACATATGTTAGAGTCGTTAATCCAGACGAAAACAACAAAACAGAGTTCGGAGCG
CCTGCTAATGTCCTGTACTGTGGTGCTTTCAGCAAATTACAGAAGCCACAGAAGATATCA
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ATGTTGCTTCTGCGTTGAAGTGTAATTTGAGGGTTTGTTTGTATTTTTCTAGGGGTTTGT
TGATATCGAACAAGGGCTGATGAATCTTCTTTACGTTTCCCATAGTTCTATTTGATTTCT
GACCTGTTTTGTATTTTTATTTTTTTGGATTATCTGTTGTTTTATTCTTTTTTTTCCGGT
ACTCTGAGAAGAACACAAATTATTCATAAAAATGTTGAAATATTTTTATAAGCTCTGGTT
GTTGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6721Contig1 800 2 3 U
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AAAAAAGAACTTATAATGACGTAAATTTATATTGTTGAATTATCTTAAATCTCACTGCTC
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AATTATTATTCAATAATTATAATATTGCGAACAAACACCTACCATTAGCTTAATTCAGAA
GCTAGACACTGCAAAAATGGCCACTTCATACGTCCAGCTTCGATGAAACTAGTACTTTAG
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TTTTACTCCGACCAGATTGC


BQ
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AF RR4CA85JQ U 8
AF RR4CA85TF C 1
BS 1 7 RR4CA85TF
BS 8 726 RR4CA85JQ
BS 727 800 RR4CA85TF

RD RR4CA85JQ 719 0 0
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AGACTTGAACTGCTTGAGGTTTAAGGAATTGCACGACGTGAGAGATGAGACTACAGGAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4CA85TF 800 0 0
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AATTACTTGAACCAGTTATAATATTAATTTCATGTAAAAGAATGACGGTTGCCCAAAA*G
AAAAAAGAACTTATAATGACGTAAATTTATATTGTTGAATTATCTTAAATCTCACTGCTC
TTTTAAAAAATAAATATGAAATTTTTGTTTATAAATTTAAAGTTAAGCTTTAATAATTCC
AATTATTATTCAATAATTATAATATTGCGAACAAACACCTACCATTAGCTTAATTCAGAA
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CTCGGAAAGGTGACCAGGGCAAGAAGTTATGATCGGTGGCACGTTCCTCCCACAAACTGG
AGAATTTTTTTTGCGTCGATCCAGAAGCTGGATTCTCTGCCTGGTCCTGTGCGTGTGCAG
CTGAAGAAAGAACAGGTGATAACGGCAAGGCTTTGGTGTTGTTGACCTTAGGGTTTCCTG
ATTTTTCATGTGGAGCAGACCCTGTGACTGCAGAGAAAGAGCCACCACCACCAGATCTTC
CCTGTTGCGACTTCGATGGTGCTTCAAAAGAAATCTGAGTCTGTCCGTGTGTTCTTATCT
GCCGCTGAGACTTGAACTGCTTGAGGTTTAAGGAATTGCACGACGTGAGAGATGAGACTA
CAGGATTTTTCCGCTGGGATGAAGTGTTGGTAACTGAGTGAGCCTGAGATTGAGTCATCA
TTTTACTCCGACCAGATTGC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL6722Contig1 1200 2 2 U
GGCGTTTCTCAGGGAATTGCTAATGCTTCTGTTCCTTCTGCGCCAAAGCAACCCGGCCGT
TCAAACCCTAATCCAACACTAAACCACTCCCGCCAGATATCATTTAAACGGAATGGCGCT
TCTTCTGGATCCCCTGCTAATGGTACTGCTCCTCAACCATCACCACAAGGTTCACTTGCT
GAGTCGCACAACCCTTCTCCCAGAGGCCAGAACCAGAGGAACGGCTTTCCATCACAAACC
CATGGCGGTGGTGCTGTCGGTGTTGGTGGTGGGACTGACAACGTATCTCAACGAGACTCG
TACAGGAACCAAAACGGTAACCATCACCAAAGTCACGGCGGCAGGCGCAATCAGGAGCAC
GGGAATCAAAATTGGATTTTCAGCAGGAGCTTTAACGGGAGAGATGGGAATGCACAGTCA
CAAAGAGGTGCTCCAGCTTTTGTAAGACATCCACCTTCACCTGTGCAGCCAATTCCTCCT
CAGTATATGGCAGCTCAGCCTTTTGCCAGCCCTCTGCCTTTCCCTCCTGAATTGGCATCG
CAATATTATCAGCGTATGCCTTTCGTTGCTCCTCTCTCACCTGCACCAGTCTTCTACCAT
GTCCAGGATCCTCCTTTGAACATAAAACTTCAGGAGCAAATACATTATTATTTTAGTGAA
GAGAATTTGATTAAAGACATGTATCTTCGTCGGCAGATAGATGATCAGGGTTTTGTTCCA
CTGCCTGTGATTGCTGTTTTCAATAAGGTTGCAGAACTCACAGATAGTGTCCAGCAGATA
GCGGATGCTCTACAAGGTTCACCTGTTGTTGAAGTTCAGGGTGACAGAATAAGGAAGCGC
TTTAATTGGCAGCATTGGTTGATTCCTCAAGAACCGAACCCTGCGGTTTTGAGCCCCCAA
TCTGTTGGCGCAGTAGCAAGCCGAGTTGGAAACTTGGCTATTGGTGAGAGCTCGGCAGGT
CCAAATGGTGGGTCAAGCAGTCATCACCTGCAACCTGCGGGAGCAGAAAACGAAGCTGTT
TCAGATGGTCAGCAACAGTCTCCTGGTGGTGTTCCAGTGAGCAACCGCAATGACTCGGAT
GGTGCTAACCGTTGAAACCATCATGTTTGGAGCTGGTGGTTAGTGCTGGACATGAAATAT
TTATTATTTCGTCTCTGCCTAAAATCAGGGGAAAAAAAAACAATAATGAAGGGGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AB83TF U 1
AF RR4AB83JQ C 398
BS 1 689 RR4AB83TF
BS 690 1200 RR4AB83JQ

RD RR4AB83TF 689 0 0
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TCAAACCCTAATCCAACACTAAACCACTCCCGCCAGATATCATTTAAACGGAATGGCGCT
TCTTCTGGATCCCCTGCTAATGGTACTGCTCCTCAACCATCACCACAAGGTTCACTTGCT
GAGTCGCACAACCCTTCTCCCAGAGGCCAGAACCAGAGGAACGGCTTTCCATCACAAACC
CATGGCGGTGGTGCTGTCGGTGTTGGTGGTGGGACTGACAACGTATCTCAACGAGACTCG
TACAGGAACCAAAACGGTAACCATCACCAAAGTCACGGCGGCAGGCGCAATCAGGAGCAC
GGGAATCAAAATTGGATTTTCAGCAGGAGCTTTAACGGGAGAGATGGGAATGCACAGTCA
CAAAGAGGTGCTCCAGCTTTTGTAAGACATCCACCTTCACCTGTGCAGCCAATTCCTCCT
CAGTATATGGCAGCTCAGCCTTTTGCCAGCCCTCTGCCTTTCCCTCCTGAATTGGCATCG
CAATATTATCAGCGTATGCCTTTCGTTGCTCCTCTCTCACCTGCACCAGTCTTCTACCAT
GTCCAGGATCCTCCTTTGAACATAAAACTTCAGGAGCAAATACATTATTATTTTAGTGAA
GAGAATTTGATTAAAGACATGTATCTTCG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4AB83JQ 803 0 0
GGAGAGATGGGAATGCACAGTCACAAAGAGGTGCTCCAGCTTTTGTAAGACATCCACCTT
CACCTGTGCAGCCAATTCCTCCTCAGTATATGGCAGCTCAGCCTTTTGCCAGCCCTCTGC
CTTTCCCTCCTGAATTGGCATCGCAATATTATCAGCGTATGCCTTTCGTTGCTCCTCTCT
CACCTGCACCAGTCTTCTACCATGTCCAGGATCCTCCTTTGAACATAAAACTTCAGGAGC
AAATACATTATTATTTTAGTGAAGAGAATTTGATTAAAGACATGTATCTTCGTCGGCAGA
TAGATGATCAGGGTTTTGTTCCACTGCCTGTGATTGCTGTTTTCAATAAGGTTGCAGAAC
TCACAGATAGTGTCCAGCAGATAGCGGATGCTCTACAAGGTTCACCTGTTGTTGAAGTTC
AGGGTGACAGAATAAGGAAGCGCTTTAATTGGCAGCATTGGTTGATTCCTCAAGAACCGA
ACCCTGCGGTTTTGAGCCCCCAATCTGTTGGCGCAGTAGCAAGCCGAGTTGGAAACTTGG
CTATTGGTGAGAGCTCGGCAGGTCCAAATGGTGGGTCAAGCAGTCATCACCTGCAACCTG
CGGGAGCAGAAAACGAAGCTGTTTCAGATGGTCAGCAACAGTCTCCTGGTGGTGTTCCAG
TGAGCAACCGCAATGACTCGGATGGTGCTAACCGTTGAAACCATCATGTTTGGAGCTGGT
GGTTAGTGCTGGACATGAAATATTTATTATTTCGTCTCTGCCTAAAATCAGGGGAAAAAA
AAACAATAATGAAGGGGGAATCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6723Contig1 540 2 2 U
GAACCAAATATTCCGATGTATTCTTGTAGCATTTGGTGTAATCGTCAGTGTGGCAAGTGG
ATCGGGGGCCGCTAATTCATTTAAAGATGCTGGAATATTTTGGAGTCTTCTTATGGTATT
ATCTTTTATGCTTCAAGGAGCAGATACAGTAATGAAGGAAATCATCTTTCTAGATAGCAA
AAAGCGGTTGAAGGGTGCTTCACTTGATCTCTTTGTCGTAAACTCATATGGTTCAATGTT
CCAAGTCATATACATTGCGTTGCTTCTTCCTTTTCTTTCAAAACTTTGGGGCATACCGTT
TAACCAACTCAAGCTATCTCAGAGACGGAGGTGCTTGCTTTCTGAACATTGGTTCTAAAA
CAACAGGATGCGAAGGGGCGCCCCTTCTTCCTATAATGTTTGTCATGATGAATATGGCTT
ACAACATTTCTCTTCTACGCCTCATCAAGATCTCATCTGCTGTTGTGTCGTCTTTGGCAT
CCACCGTTTCAGTGCCCATAGCGGTTGACTTCTTCACGCTTCCCTTACCGTACCTGGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H902TF U 1
AF RR4H902JQB C 212
BS 1 534 RR4H902TF
BS 535 540 RR4H902JQB

RD RR4H902TF 534 0 0
GAACCAAATATTCCGATGTATTCTTGTAGCATTTGGTGTAATCGTCAGTGTGGCAAGTGG
ATCGGGGGCCGCTAATTCATTTAAAGATGCTGGAATATTTTGGAGTCTTCTTATGGTATT
ATCTTTTATGCTTCAAGGAGCAGATACAGTAATGAAGGAAATCATCTTTCTAGATAGCAA
AAAGCGGTTGAAGGGTGCTTCACTTGATCTCTTTGTCGTAAACTCATATGGTTCAATGTT
CCAAGTCATATACATTGCGTTGCTTCTTCCTTTTCTTTCAAAACTTTGGGGCATACCGTT
TAACCAACTCAAGCTATCTCAGAGACGGAGGTGCTTGCTTTCTGAACATTGGTTCTAAAA
CAACAGGATGCGAAGGGGCGCCCCTTCTTCCTATAATGTTTGTCATGATGAATATGGCTT
ACAACATTTCTCTTCTACGCCTCATCAAGATCTCATCTGCTGTTGTGTCGTCTTTGGCAT
CCACCGTTTCAGTGCCCATAGCGGTTGACTTCTTCACGCTTCCCTTACCGTACC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR4H902JQB 329 0 0
TTTGTCGTAAACTCATATGGTTCAATGTTCCAAGTCATATACATTGCGTTGCTTCTTCCT
TTTCTTTCAAAACTTTGGGGCATACCGTTTAACCAACTCAAGCTATTTCAGAGACGGAGG
TGCTTGCTTTTTGAACATTGGTTTTAAAACAACAGGATGGGAAGGGGCGCCCCTTCTTCC
TATAATGTTTGTCATGATGAATATGGCTTACAACATTTTTTTTTTACGCCTCATCAAGAT
TTCATCTGCTGTTGTGTCGTCTTTGGCATCCACCGTTTCAGTGCCCATAGCGGTTGACTT
CTTCACGCTTCCCTTACCGTACCTGGGGG

QA 1 329 1 329
DS 



AS 1 2

CO CL6724Contig1 764 2 4 U
GGATTAGTTACCATTATAGACTTTTGCATAATTTCAACCATGGCCAAGCTCACCGTTACC
GTCACCGTTCTCTTATTCACGTTGACTCTCTCCGTCGTTTCCTCCGAGCCCGAAAATGAA
ATCATCGCCGACAGCCATAACACTTTATCTGCGGAATCCGACCCGTTTACTACAAACCCA
ACCTTTCACGAACCGGAATCATCTGGACCCGAATCAACGTCTTCCGATGAGATCACTGTA
CCGATCAATTTCATGAATTTCCATCCAATCAATCGTCATTTCCCTAGACGTCCCTTGACT
TTCGGCCGCCGTCCGTGCCACCGCCGTCGACACGGCGAGCTGTTTGGACGAGGCCTCCAG
ATCCCTTTCGGCAACGACATGATCTTCTCCGGTGAAGAAGAAAAGACGACGACAGGTCCA
GATCCTTCCTCAGACAGCATAGTCGTGGATGTTCCGGCGATCAAGATGTTTGTCGGTCCC
ATCACGGTGGAGGAGACAAAACACCATGTCGAAGAAGCGGAGGATGATGGCTCCAGCATG
AAGATTACCGTGACTTTGATGAAGCGCAAAGAAGAAGGAGAGAGTATGTTCAGGACAAAG
ATTCGCAAGTTTCTAAACCATTTGGTCTGAACAACGAAGAAGACTCTAGTTTTGTCTTTT
AAATCTAGTAAAGAAGATAACAATAAAGCAAAGCCCTCTTATGTATGTATGTGCTCTTTC
TGGTAAACAAATAGCTTCCATAATGATATGAAGCTGATTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GO55TF U 1
AF RR4GO55JQ C 385
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ACCTTTCACGAACCGGAATCATCTGGACCCGAATCAACGTCTTCCGATGAGATCACTGTA
CCGATCAATTTCATGAATTTCCATCCAATCAATCGTCATTTCCCTAGACGTCCCTTGACT
TTCGGCCGCCGTCCGTGCCACCGCCGTCGACACGGCGAGCTGTTTGGACGAGGCCTCCAG
ATCCCTTTCGGCAACGACATGATCTTCTCCGGTGAAGAAGAAAAGACGACGACAGGTCCA
GATCCTTCCTCAGACAGCATAGTCGTGGATGTTCCGGCGATCAAGATGTTTGTCGGTCCC
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AAGATTACCGTGACTTTGATGAAGCGCAAAGAAGAAGGAGAGAGTATGTTCAGGACAAAG
ATTCGCAAGTTTCTAAACCATTTGGTCTGAACAACGAAGAAGACTCTAGTTTTGTCTTTT
AA*TCTAGTAAAGA
GATACAATAAAGCAAGCCC

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DS 

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TTT
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GATGTTCCGGCGATCAAGATGTTTGTCGGTCCCATCACGGTGGAGGAGACAAAACACCAT
GTCGAAGAAGCGGAGGATGATGGCTCCAGCATGAAGATTACCGTGACTTTGATGAAGCGC
AAAGAAGAAGGAGAGAGTATGTTCAGGACAAAGATTCGCAAGTTTCTAAACCATTTGGTC
TGAACAACGAAGAAGACTCTAGTTTTGTCTTTTAAATCTAGTAAAGAAGATAACAATAAA
GCAAAGCCCTCTTATGTATGTATGTGCTCTTTCTGGTAAACAAATAGCTTCCATAATGAT
ATGAAGCTGATTTTGTC

QA 4 380 4 380
DS 



AS 1 2

CO CL6725Contig1 1229 2 4 U
CTGCTCTCTCTCTTGCGTTTCGCGGCAATGGCGGCGGCGGCGGAAAATGACGACACCATC
CTCGACAACCAGCTCAAACCAGATTCCGAACCGGCTCCGGTCAAACCCTCCTCTCAACCC
GAAGAGAAACCTCTCTCTAAAAACGCCCAGAATAAGCAGCTGAAGCAGCAAAGATACGAG
GCGAAGAAGGCCGAGAAGAAGGCGCAGGAGAAGGAGCACAAGAGGAAAGAAGGCGAGAGA
AAGCACAAGGAGTGGGAAGAAACACTAGCCAACGCGACGGAGGAAGAGAGGCTGAAGCTG
ATCGAGTCGAGGAGGAGCCTAAGAAAGGAGAGAATGGAGAAGAGATCAGAGGAGAAAGAG
AAGAAGATGGAACGGCTCACTAAAGCTAAAGAAATCGGACAGAACATCGTCATAGATGTC
GACTTCCCGCATCTAATGTCCGAGTCTGAGATCTCCAGCCTCGTTCAGCAGATAATGTAT
TGTTATGCGGTGAATGGGAGGAGCACTTCTCCTTGTCATCTATGGCTAACGGGAGTGCAA
GGAGAGATGAGTACTCAGCTTGATAGGCTTCCAGGTTTTGAGAAATGGTTTATAGAGAAG
GAGAGTAGGTGTTACATTGAGGCCATGGCTGATCGGAAAGAGAATTTGGTGTACCTTACG
GCTGACTCCGAGACTGTTTTGGAGGATCTTGACCCTAAGGATATCTATATAATTGGGTGG
GTTGGTTGATCGGAACAGGTTCAAAGGGATCACCATGAACAAGGCACAAGAACAAGGGAT
TAAGACAGCTAAACTTCCTATAGGAGAGTATATGAAAATGTCCAGTTCTCAGGTTCTCAC
TGTGAACCAAGTTTTGGAGATACTCGTGAAGTTTCTTGAGACGAGGGACTGGAAAACATC
CTTCTTCACTGTGATTCCCCAGAGGAAAAGAAGTGGAGTTGATCCTGTAGACTCTTCGAA
ACTTGAACCTCTCTCTGAAGAGCATCAAGAGGAAGAACATGATGATTCTTCGGAGAGGAA
AAAGGTATGCGTTGAAGCTCCGCTGCAAAGTGGTAGTAGCTAGATGAAGATAAAATGCAT
GCTTCTGTTTCTGTTGAACGCTAGTTTCTGTAGCTGAGAATTTGAATTTTGGAATGTTAT
GTCCTTCCTTATTATTATTTCTATGTTGAGTCAAGACGCACTACAAGTCATTTCCCTATA
TTAAAGATCACACGTATGTTGTTTCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CL70TF U 1
AF RR4CL70JQ C 439
BS 1 699 RR4CL70TF
BS 700 700 RR4CL70JQ
BS 701 738 RR4CL70TF
BS 739 1229 RR4CL70JQ

RD RR4CL70TF 741 0 0
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CTCGACAACCAGCTCAAACCAGATTCCGAACCGGCTCCGGTCAAACCCTCCTCTCAACCC
GAAGAGAAACCTCTCTCTAAAAACGCCCAGAATAAGCAGCTGAAGCAGCAAAGATACGAG
GCGAAGAAGGCCGAGAAGAAGGCGCAGGAGAAGGAGCACAAGAGGAAAGAAGGCGAGAGA
AAGCACAAGGAGTGGGAAGAAACACTAGCCAACGCGACGGAGGAAGAGAGGCTGAAGCTG
ATCGAGTCGAGGAGGAGCCTAAGAAAGGAGAGAATGGAGAAGAGATCAGAGGAGAAAGAG
AAGAAGATGGAACGGCTCACTAAAGCTAAAGAAATCGGACAGAACATCGTCATAGATGTC
GACTTCCCGCATCTAATGTCCGAGTCTGAGATCTCCAGCCTCGTTCAGCAGATAATGTAT
TGTTATGCGGTGAATGGGAGGAGCACTTCTCCTTGTCATCTATGGCTAACGGGAGTGCAA
GGAGAGATGAGTACTCAGCTTGATAGGCTTCCAGGTTTTGAGAAATGGTTTATAGAGAAG
GAGAGTAGGTGTTACATTGAGGCCATGGCTGATCGGAAAGAGAATTTGGTGTACCTTACG
GCTGACTCCGAGACTGTTTTGGAGGATCTTGACCCTAAG*ATATCTATATAATTGGGTGG
GTTGGTTGATCGGAACAG
TTC

QA 1 738 1 738
DS 

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TCCGAGTCTGAGATCTCCAGCCTCGTTCAGCAGATAATGTATTGTTATGCGGTGAATGGG
AGGAGCACTTCTCCTTGTCATCTATGGCTAACGGGAGTGCAAGGAGAGATGAGTACTCAG
CTTGATAGGCTTCCAGGTTTTGAGAAATGGTTTATAGAGAAGGAGAGTAGGTGTTACATT
GAGGCCATGGCTGATCGGAAAGAGAATTTGGTGTACCTTACGGCTGACTCCGAGACTGTT
TTGGAGGATCTTGACCCTAAGGATATCTATATAATTGG*TGGGTTGGTTGATCGGAACAG
GTTCAAAGGGATCACCATGAACAAGGCACAAGAACAAGGGATTAAGACAGCTAAACTTCC
TATAGGAGAGTATATGAAAATGTCCAGTTCTCAGGTTCTCACTGTGAACCAAGTTTTGGA
GATACTCGTGAAGTTTCTTGAGACGAGGGACTGGAAAACATCCTTCTTCACTGTGATTCC
CCAGAGGAAAAGAAGTGGAGTTGATCCTGTAGACTCTTCGAAACTTGAACCTCTCTCTGA
AGAGCATCAAGAGGAAGAACATGATGATTCTTCGGAGAGGAAAAAGGTATGCGTTGAAGC
TCCGCTGCAAAGTGGTAGTAGCTAGATGAAGATAAAATGCATGCTTCTGTTTCTGTTGAA
CGCTAGTTTCTGTAGCTGAGAATTTGAATTTTGGAATGTTATGTCCTTCCTTATTATTAT
TTCTATGTTGAGTCAAGACGCACTACAAGTCATTTCCCTATATTAAAGATCACACGTATG
TTGTTTCATCG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL6726Contig1 977 2 12 U
GGAACACTGTCGTCCGTTGAGATCGCCGCTTAGGGCGTCTCCTCCGCAGTCCCTGTAAAT
CGAAGTTCTCTTCTTCCGCCGGAATCTGTCGCTTTCAATTCTCCCGATTGTATTAGCAGA
TGGGGAGAGTTAATGCAGATGGAGTCCATTATCGCTCTGGAGAAGGCCCGCACGCTCTCA
AGAATAGTAAAAAGACTATTAGCAAAAAAACCAAGAGAAGCGACAAAGGAAGGCTCAGAG
AGGAAATGCTTGGAAGGGTGTCACATGCCCTGTCTGTCTTGAGATCCCTCACAATTCGGT
CGTCCTCCTTTGCTCATCTTACCACAAAGGTTGCCGTCCCTACATGTGTGCCACAGGAAA
CCGGTTCTCAAATTGTCTAGATCAGTACAAAAAGGCATATGCGAAAGATGTCAAAAGCAG
CAATTCGCCAGAGCTTATGTGCCCGCTCTGTAGGGGTCAGGTGAAAGGTTGGACTGTTGT
GAAAGATGCGCGGAAGTATCTGAACTCAAAGAAAAGGGCATGCATGAAAGACAACTTTTT
GTTTTCTGGAAGCTATAGACAGCTCAAGAAACATGTTAAGGCGGTTCACCCGAGAGCTAA
ACCAAGAGCCATCGACCCTGTGATGGAGGAGAAAATGGAAGAAGCTTGAAGTTGAGAGGG
AGAGGAGCGATGTAATTAGCACAGTAATGTCGTCAACACCCGGAGCTATGGTTTTTGGAG
ACTATGTGATCGAGCCTTACAACGATGACTATGATGATGGCCTTGAGTCTGATGATTCGA
TGGAAGGTGGGTTTTTCGATCTTGGATCGCTAGCATTTGACATGAGACGTCTTCAACCGC
GTTCGGCCCCAGCCATCTCCAGCAGGGGACTTCGCAGTTACTTGATGAGCAACCGCCGAC
ACCGAAGCAGAGATGGGAACAGAAGGCGGCAAACGCAGGATTGATGATTGAAAACCAGAT
GATTTTGTGACTTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF51TF U 1
AF RR4CF51JQ C 459
BS 1 634 RR4CF51TF
BS 635 635 RR4CF51JQ
BS 636 695 RR4CF51TF
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BS 697 715 RR4CF51TF
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BS 762 762 RR4CF51JQ
BS 763 776 RR4CF51TF
BS 777 977 RR4CF51JQ

RD RR4CF51TF 776 0 0
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CGAAGTTCTCTTCTTCCGCCGGAATCTGTCGCTTTCAATTCTCCCGATTGTATTAGCAGA
TGGGGAGAGTTAATGCAGATGGAGTCCATTATCGCTCTGGAGAAGGCCCGCACGCTCTCA
AGAATAGTAAAAAGACTATTAGCAAAAAAACCAAGAGAAGCGACAAAGGAAGGCTCAGAG
AGGAAATGCTTGGAAGGGTGTCACATGCCCTGTCTGTCTTGAGATCCCTCACAATTCGGT
CGTCCTCCTTTGCTCATCTTACCACAAAGGTTGCCGTCCCTACATGTGTGCCACAGGAAA
CCGGTTCTCAAATTGTCTAGATCAGTACAAAAAGGCATATGCGAAAGATGTCAAAAGCAG
CAATTCGCCAGAGCTTATGTGCCCGCTCTGTAGGGGTCAGGTGAAAGGTTGGACTGTTGT
GAAAGATGCGCGGAAGTATCTGAACTCAAAGAAAAGGGCATGCATGAAAGACAACTTTTT
GTTTTCTGGAAGCTATAGACAGCTCAAGAAACATGTTAAGGCGGTTCACCCGAGAGCTAA
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AGAGGAGCGATGTAATTAGCACAGTAATGTCGTCA*CACCCGGAGCTATGGTTTT*GGAG
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QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4CF51JQ 519 0 0
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CATGCATGAAAGACAACTTTTTGTTTTCTGGAAGCTATAGACAGCTCAAGAAACATGTTA
AGGCGGTTCACCCGAGAGCTAAACCAAGAGCCATCGACCCTGTGATGGAGGAGAAAATGG
AAGAAGCTTGAAGTTGAGAGGGAGAGGAGCGATGTAATTAGCACAGTAATGTCGTCAACA
CCCGGAGCTATGGTTTTTGGAGACTATGTGATCGAGCCTTACAACGATGACTATGATGAT
GGCCTTGAGTTTGATGATTCGATGGAAGGTGGGTTTTTCGATCTTGGATCGCTAGCATTT
GACATGAGACGTCTTCAACCGCGTTCGGCCCCAGCCATCTCCAGCAGGGGACTTCGCAGT
TACTTGATGAGCAACCGCCGACACCGAAGCAGAGATGGGAACAGAAGGCGGCAAACGCAG
GATTGATGATTGAAAACCAGATGATTTTGTGACTTCGCC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL6727Contig1 1191 2 2 U
CTGGACAACTTTCGGGGCACATTCAGATGGCATATATGCTTTAATTTTGTCGTTCTGCGC
ATGATAAGTTTTGGATATGATTATCACTGGGGTCAACTGGATTCTCATTTTGATCACGAG
AAACACGTAACACGTTGTTCGTTATGTAAGTTGGGGAAGACTTGCTACGTAGTTCGACAG
GAGAAAGGTCTAGCAAGTGACAGCAGCTGCAGTTTTGCTTTATACCTTTGCTATTTGGTC
TATGCCCCCTTGTACCTTGCGGGGCCAATCATAAGCTTCAATGCCTTTGCTTCGCAGCTA
GATGTGCCACAGAGTACTCATTCAGTGAAAGATGTTGCACGATATGGATTCCGTTGGTTA
TTCAGCTTCTTGCTGATGGAACTTATGACACAATTCTTCTATTACAATGCCTTTGTGATC
AGTGGTCTTTGGAGAGAATTATCTCCTGTGGAAATATTTATCGTCGGATACGGAGTGCTA
AACTTCATGTGGCTCAAGTTCCTTCTTTTATGGAGATATTTCCGCTTCTGGTCTTTGGTG
AATGGCATTGAAACTGTTGAGAACATGCCGAATTGCATTAATAATTGCTATAGCCTGGAA
ACATTCTGGAAAACCTGGCATGCATCGTTTAATAGGTGGCTTATCACGTATATGTATATT
CCTCTCGGTGGATCACGAAGAAAGTTTCTGAATGTGTGGGTTGTGTTTACATTTGTTGTC
GTCTGGCATGATTTAGAATGGAAGCTTCTTTCATGGGCATGGTTAACATGTTTATTCTTC
ATGCCAGAAATGTTACTGAAATCAGCATCCAATGCATTTAAGAGTGCTTTTGGAGAATTC
CTCCTTCGTGAACTCAAGGCGTTGTCTGGCGCTGTGACAATCACATGCCTCATGATGGCA
AATCTTGCTGGCTATGTCATTGGACCATCAGGTCTAAGCCGGTTTGTCTCCAGCTTTCTT
AGCAGAGAAGGATTACCTGTTCTAGGCGCTGTGTTCTTTAGCTTTTACGTGGGTACAAAG
CTGATGTTCCACATCCAGGACTTGAGAAGTGGGGTATATAGCCCGAGGTAGCCGAAGCAA
AGAGTTGTAGTTTTCATTATTGATTGGTTAGGTACAGTCTCGTGTAAAATTTTGGCTGGA
GTAAGAAACTGTGTTTTTCCTTGAAAGATGCAAAACGAAATCAACTTTTAC


BQ
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AF RR4D629TF U 1
AF RR4D629JQ C 605
BS 1 737 RR4D629TF
BS 738 1191 RR4D629JQ

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ATGATAAGTTTTGGATATGATTATCACTGGGGTCAACTGGATTCTCATTTTGATCACGAG
AAACACGTAACACGTTGTTCGTTATGTAAGTTGGGGAAGACTTGCTACGTAGTTCGACAG
GAGAAAGGTCTAGCAAGTGACAGCAGCTGCAGTTTTGCTTTATACCTTTGCTATTTGGTC
TATGCCCCCTTGTACCTTGCGGGGCCAATCATAAGCTTCAATGCCTTTGCTTCGCAGCTA
GATGTGCCACAGAGTACTCATTCAGTGAAAGATGTTGCACGATATGGATTCCGTTGGTTA
TTCAGCTTCTTGCTGATGGAACTTATGACACAATTCTTCTATTACAATGCCTTTGTGATC
AGTGGTCTTTGGAGAGAATTATCTCCTGTGGAAATATTTATCGTCGGATACGGAGTGCTA
AACTTCATGTGGCTCAAGTTCCTTCTTTTATGGAGATATTTCCGCTTCTGGTCTTTGGTG
AATGGCATTGAAACTGTTGAGAACATGCCGAATTGCATTAATAATTGCTATAGCCTGGAA
ACATTCTGGAAAACCTGGCATGCATCGTTTAATAGGTGGCTTATCACGTATATGTATATT
CCTCTCGGTGGATCACGAAGAAAGTTTCTGAATGTGTGGGTTGTGTTTACATTTGTTGTC
GTCTGGCATGATTTAGA
T

QA 1 737 1 737
DS 

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TCGGTGGATCACGAAGAAAGTTTCTGAATGTGTGGGTTGTGTTTACATTTGTTGTCGTCT
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CAGAAATGTTACTGAAATCAGCATCCAATGCATTTAAGAGTGCTTTTGGAGAATTCCTCC
TTCGTGAACTCAAGGCGTTGTCTGGCGCTGTGACAATCACATGCCTCATGATGGCAAATC
TTGCTGGCTATGTCATTGGACCATCAGGTCTAAGCCGGTTTGTCTCCAGCTTTCTTAGCA
GAGAAGGATTACCTGTTCTAGGCGCTGTGTTCTTTAGCTTTTACGTGGGTACAAAGCTGA
TGTTCCACATCCAGGACTTGAGAAGTGGGGTATATAGCCCGAGGTAGCCGAAGCAAAGAG
TTGTAGTTTTCATTATTGATTGGTTAGGTACAGTCTCGTGTAAAATTTTGGCTGGAGTAA
GAAACTGTGTTTTTCCTTGAAAGATGCAAAACGAAATCAACTTTTAC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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TGTATGATTGAGCTGTGATTTCATCAAAGAGAACAAAAGCTCTTAGCTTTGTTTTTCTAT
TTGGATTGTAAATAGCATATGAAAAACTATGGAGAGCTTCTAAAGAAAATTGGGAGCTGG
ATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTTTGTTCACTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTTATCAC
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ATGGTTTACTGGAGAACCTTCTTCATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACAATGGA
GAAGAGTGGATGATTTCACACTTCCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTTTCTTCTCCT
AGTAATCAGTTTATGATTTATCTTTGAATTTCTGTTAGCCAAATAAAGAATAAAACATTA
TCCTTCTACTTTGATTGATTGTCTTCCTGGTTAATACAATCGTATGCTTTCCTACG


BQ
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AF RR4DG06JQ C 1
AF RR4DG06TF U 1
BS 1 714 RR4DG06TF
BS 715 716 RR4DG06JQ

RD RR4DG06JQ 716 0 0
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TGTATGATTGAGCTGTGATTTCATCAAAGAGAACAAAAGCTCTTAGCTTTGTTTTTCTAT
TTGGATTGTAAATAGCATATGAAAAACTATGGAGAGCTTCTAAAGAAAATTGGGAGCTGG
ATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTTTGTTCACTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTTATCAC
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CCATCGGCGAATCTTCTCCTCTATTTCCAAGACGATGTTTCGATTGTGGATCACTGGCTC
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ATAGTTGCAATAAGGGATATAATGGAAATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGG
ATGGTTTACTGGAGAACCTTCTTCATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACAATGGA
GAAGAGTGGATGATTTCACACTTCCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTTTCTTCTCCT
AGTAATCAGTTTATGATTTATCTTTGAATTTCTGTTAGCCAAATAAAGAATAAAACATTA
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QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4DG06TF 714 0 0
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ATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTTTGTTCACTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTTATCAC
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CCATCGGCGAATCTTCTCCTCTATTTCCAAGACGATGTTTCGATTGTGGATCACTGGCTC
CTAAACGTGAAGCATTACGCAAGGACCAGTGAAGAGTGGCTCAAAAGAATGGACAAGGAG
ATAGTTGCAATAAGGGATATAATGGAAATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGG
ATGGTTTACTGGAGAACCTTCTTCATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACAATGGA
GAAGAGTGGATGATTTCACACTTCCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTTTCTTCTCCT
AGTAATCAGTTTATGATTTATCTTTGAATTTCTGTTAGCCAAATAAAGAATAAAACATTA
TCCTTCTACTTTGATTGATTGTCTTCCTGGTTAATACAATCGTATGCTTTCCTA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6729Contig1 1144 2 2 U
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AGTCGGCGCCAAGAACGGCGGGAAGTCAAAGAACAAGAAGCAAAAGACACGACCTCCTTC
CTCCGACAGGTTCAAGCTCACTCAGAAGAACAAGAAGCTCTTCCAGAAGAGAGCGAGAGA
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TCTACGTGATAATTACATGTTAGCCAACCCAAAGCTGAAAGACTGGGACAAAAAACAGGA
AACAAACGAAGGAGATGATTTTGGCGCAATGTCAGGTGACGAGAGTTGTGAAGACTGAGC
ATGCAGCTTTTGTTTTATCAATATTAATGCAGTTTTTTTTTGGTAATGCAAACGGAACTT
GAAAGCAAGATAATGCAATATCAAAGATATGAAGAAGGGGTTATAATATATTTGTTGGCT
CTGG


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4FY91TF U 1
AF RR4FY91JQ C 383
BS 1 673 RR4FY91TF
BS 674 1144 RR4FY91JQ

RD RR4FY91TF 678 0 0
GGGAAAAAACTTCCACAGAGAGAGCAGCCGTCAGAAGAAAAAAAAACCGACTAAAAAAAT
GTCCACCGGAGATGAAACTCACGCGGCGGCGGTGCCTGAGAGAGGCAGAGGAAAGAGAAG
AGTCGGCGCCAAGAACGGCGGGAAGTCAAAGAACAAGAAGCAAAAGACACGACCTCCTTC
CTCCGACAGGTTCAAGCTCACTCAGAAGAACAAGAAGCTCTTCCAGAAGAGAGCGAGAGA
CTACAACTCAGACTCTGACGACGACGAGGAAGAAGAAGAAGAAGACGAATCGAAGAAGGT
AACCATCCGCGAGAAGATCTTCTCCGATGCTAACATGGGACCGAACTACGACGAAGTCGA
AGAGGAAGATGAAGGCTCCGACAAGGACGGGGACTCTGACGGGGAGGATCACGGGGAGAT
TCAGTCTGGTATCGCTAGGTTTGGTGATGATGATGGATGCAATGCGTTCAAGATGGCTTT
TAAATCTATTATGAAGAGTAAAGGAGATGATGCATTGGGACCTGTTTTATCAGCACATAA
GCATCTTATTGCTCAGAAGCTAGCTGATGAGGAAGCTGAGAAGAAGGCTAAGGGTCAAGC
CAGAAAGGCTAAACATTTGGTTGCTGAGAAAGGGCATGTTAAACCTGCAAACCATTTGGA
GTCTCGTGAGAAG
TTCTT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FY91JQ 762 0 0
AAGGACGGGGACTCTGACGGGGAGGATCACGGGGAGATTCAGTCTGGTATCGCTAGGTTT
GGTGATGATGATGGATGCAATGCGTTCAAGATGGCTTTTAAATCTATTATGAAGAGTAAA
GGAGATGATGCATTGGGACCTGTTTTATCAGCACATAAGCATCTTATTGCTCAGAAGCTA
GCTGATGAGGAAGCTGAGAAGAAGGCTAAGGGTCAAGCCAGAAAGGCTAAACATTTGGTT
GCTGAGAAAGGGCATGTTAAACCTGCAAACCATTTGGAGTCTCGTGAGAAGGTTCTTATA
GGTGTTGCAACTAAAGGAGTGGTCAAGCTTTTTAATGCTGTAAACAAGGCTCAACATGCT
CAGAAGGGTTTGAATGCTTTTAGGTCAAAGGACGCTAAAGTGTTAAAGAAGAGGAGAAAA
GAAGCATTCTTCTCGGAGTTGGGGAAACCACCTAGAACAGACTCCAAGGCTCAAAAGTCT
TCAAATACCAATGAAGACGAAGCTCCTGCTTGGGCTCCTCTACGTGATAATTACATGTTA
GCCAACCCAAAGCTGAAAGACTGGGACAAAAAACAGGAAACAAACGAAGGAGATGATTTT
GGCGCAATGTCAGGTGACGAGAGTTGTGAAGACTGAGCATGCAGCTTTTGTTTTATCAAT
ATTAATGCAGTTTTTTTTTGGTAATGCAAACGGAACTTGAAAGCAAGATAATGCAATATC
AAAGATATGAAGAAGGGGTTATAATATATTTGTTGGCTCTGG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6730Contig1 460 2 1 U
GGAAGCCTCGAACAAAACCCGGTGTTCATATTACAGGCTAAGCTTAGTGATCATCTTCGT
CTCTTGAACAAGATCTCTCTCTAAACCTTTCAACCTCGATTCGATTCGACTCAGCTACAG
AAACCATCATGGGATTCTGGACACTGATGGAAGGGTTGCTGCTATTCGCAAACGCACTTG
CTATCCTCAACGAAGACCGTTTCTTAGCTCCCAAAGGATGGACACTCGCAGAGCTCCACC
AAACCGGCAGAAGAAACTCTCTCAAAGGCCAAATCGTTGGTCTCATCCACGCCTGCCAGT
ACATGAGGCTTCCCCTCATGCTCTTCAACTTAATTGTCATCGTCTTTAAACTCTTCTCCG
GTTAAAGAAAAAAAACACAATTTCAAATACTTTCGATCCAACCACTTCTACAACTTTATT
GTTGATTCATCCATGTTCATTTTATAATGAATTTCAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D250TF U 1
AF RR4D250JQ C 161
BS 1 460 RR4D250TF

RD RR4D250TF 460 0 0
GGAAGCCTCGAACAAAACCCGGTGTTCATATTACAGGCTAAGCTTAGTGATCATCTTCGT
CTCTTGAACAAGATCTCTCTCTAAACCTTTCAACCTCGATTCGATTCGACTCAGCTACAG
AAACCATCATGGGATTCTGGACACTGATGGAAGGGTTGCTGCTATTCGCAAACGCACTTG
CTATCCTCAACGAAGACCGTTTCTTAGCTCCCAAAGGATGGACACTCGCAGAGCTCCACC
AAACCGGCAGAAGAAACTCTCTCAAAGGCCAAATCGTTGGTCTCATCCACGCCTGCCAGT
ACATGAGGCTTCCCCTCATGCTCTTCAACTTAATTGTCATCGTCTTTAAACTCTTCTCCG
GTTAAAGAAAAAAAACACAATTTCAAATACTTTCGATCCAACCACTTCTACAACTTTATT
GTTGATTCATCCATGTTCATTTTATAATGAATTTCAAATT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR4D250JQ 300 0 0
GCTATTCGCAAACGCACTTGCTATCCTCAACGAAGACCGTTTTTTAGCTCCCAAAGGATG
GACACTCGCAGAGCTCCACCAAACCGGCAGAAGAAACTCTCTCAAAGGCCAAATCGTTGG
TTTCATCCACGCCTGCCAGTACATGAGGCTTCCCCTCATGCTCTTCAACTTAATTGTCAT
CGTCTTTAAACTCTTCTCCGGTTAAAGAAAAAAAACACAATTTCAAATACTTTCGATCCA
ACCACTTCTACAACTTTATTGTTGATTCATCCATGTTCATTTTATAATGAATTTCAAATT

QA 1 300 1 300
DS 



AS 1 2

CO CL6731Contig1 707 2 4 U
GCGACGTGTGTGTATCTGTTTATGCAACTTATCAAGCTCACACCTCAAGAGGCTTCTGAA
GATCCTATGTACTACTTGTTACTCCGTGATTCCTTCAAGGATGGAGTGGGTCTCAGAGAC
AAGAAATCCCTTGTCGTCCCTGCAAGATTTGTCTTTGGTGCCTTAGGCTGTGTCATGCTC
GGAGCTTTGGTTTACACTTGCTTGACTGATGGTTCTCCTTTCCGCATGGACCTTCTTTAC
CCGTGGATGGTGGTTTTACTGGTTAGCTTCTACATTCATGTTGCGGTTTTATCAGTTTGG
GTTGTCTACAAAGAATCTAGCTGGATCATTGGAGTTCTCTGGGTTGCTCTATTACTATCT
CTTGGCAGCTTTGGGACGAGCGTAGTCATTGTCGTGCAGCTATTCCGTCTCTCTCCTCTT
GACCCGCTATACCTCGTTCTCGTGAAATACAGCAATCGGGCTGGAGATATGTATGAGCGC
ACTTATTCGGCGGTTCTGCGTATGTGAAGCTCCTTGATTTTATTTTTCCCACACATTTGG
AAAAAAAAAGTATTTCTTTATCCACCCACACAATACATGTTTGTATGATGCTTTTATGTA
TTCCTCAAAATATGTGGATGATTCTTCTGTATATCAGTCCTTTTATTTGACATACATAGA
AACCTTGCCGTTAACCTGTTTAATAAAATAGTGGTCGTTTTTGGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GF03TF U 1
AF RR4GF03JQ C 399
BS 1 692 RR4GF03TF
BS 693 693 RR4GF03JQ
BS 694 701 RR4GF03TF
BS 702 707 RR4GF03JQ

RD RR4GF03TF 706 0 0
GCGACGTGTGTGTATCTGTTTATGCAACTTATCAAGCTCACACCTCAAGAGGCTTCTGAA
GATCCTATGTACTACTTGTTACTCCGTGATTCCTTCAAGGATGGAGTGGGTCTCAGAGAC
AAGAAATCCCTTGTCGTCCCTGCAAGATTTGTCTTTGGTGCCTTAGGCTGTGTCATGCTC
GGAGCTTTGGTTTACACTTGCTTGACTGATGGTTCTCCTTTCCGCATGGACCTTCTTTAC
CCGTGGATGGTGGTTTTACTGGTTAGCTTCTACATTCATGTTGCGGTTTTATCAGTTTGG
GTTGTCTACAAAGAATCTAGCTGGATCATTGGAGTTCTCTGGGTTGCTCTATTACTATCT
CTTGGCAGCTTTGGGACGAGCGTAGTCATTGTCGTGCAGCTATTCCGTCTCTCTCCTCTT
GACCCGCTATACCTCGTTCTCGTGAAATACAGCAATCGGGCTGGAGATATGTATGAGCGC
ACTTATTCGGCGGTTCTGCGTATGTGAAGCTCCTTGATTTTATTTTTCCCACACATTTGG
AAAAAAAAAGTATTTCTTTATCCACCCACACAATACATGTTTGTATGATGCTTTTATGTA
TTCCTCAAAATATGTGGATGATTCTTCTGTATATCAGTCCTTTTATTTGACATACATAGA
AACCTTGCCGTTAACCTGTTTAATAAAATAGTTGTCGTTTT
GGGGC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4GF03JQ 309 0 0
GCTATTCCGTCTCTCTCCTCTTGACCCGCTATACCTCGTTTTCGTGAAATACAGCAATCG
GGCTGGAGATATGTATGAGCGCACTTATTCGGCGGTTCTGCGTATGTGAAGCTCCTTGAT
TTTATTTTTCCCACACATTTGGAAAAAAAAAGTATTTCTTTATCCACCCACACAATACAT
GTTTGTATGATGCTTTTATGTATTCCTCAAAATATGTGGATGATTTTTCTGTATATCAGT
CCTTTTATTTGACATACATAGAAACCTTGCCGTTAACCTGTTTAATAAAATAGTGGTCGT
TTTTGGGGC

QA 1 309 1 309
DS 



AS 1 2

CO CL6732Contig1 718 2 2 U
TTTTAGCATCAACGATACATCGCTTCGTTCTTAAAATGTTATACAATAAAAATGCTTACA
TTTGTTACTATTTTGTACCACGATATCCGTTAGTATAATAATATCTGAAAATTTAACTTC
CATCCCCACGTAATAATTATTGTTTATTTTTAAAAGTTGGATTGTTTATCTATCATCCTT
TGCTTATACCCACCGGTTCTTTTCATGTACTCGGTGCGGCTGCTGGTGAGGCTGCTGGTG
CGGCCGCTGGTGAGGCTGCTGTCTCGGCTTCTGGTTTTGCTGCCAGTTTAGCTGCATGAC
TAGTACCTCCACCCGGAAACACCTTTCTCAAGATTTTTGTCATGATTTTTGGCGGCTCCT
TGCCCGTTGCTCGCTTGAAGAGCCACAGGATGAGGGAGACAGCCATTGCACCGGTGCTAC
CGGTGGCTGCTAAACCCGTAGCCAGTAAACCAGTGGCAATACCCGCTGGTACGAGAACCG
GACTGAATACTATGAATAGCGGCATGGTGGCAATAAATGCGACGGCTGTGCCAGCGAGGG
ATACACCGGCGAGCAATAAGAGGAATATTGCGGCTTGTGTAGCCAGTACTGAGGTTAAAA
CACTCTAAACGACGGCCTTCGGGATTTTTTATCGTGTTTCTTTCTGATTATCCCCATTTT
TCACTAGTTTCAATTGTCAAAAGAGATGGATGTGATTCTTTGATCCGATCGTTGTGCC


BQ
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AF RR4EW64TF C 1
AF RR4EW64JQ U 5
BS 1 4 RR4EW64TF
BS 5 718 RR4EW64JQ

RD RR4EW64TF 718 0 0
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TGCTTATACCCACCGGTTCTTTTCATGTACTCGGTGCGGCTGCTGGTGAGGCTGCTGGTG
CGGCCGCTGGTGAGGCTGCTGTCTCGGCTTCTGGTTTTGCTGCCAGTTTAGCTGCATGAC
TAGTACCTCCACCCGGAAACACCTTTCTCAAGATTTTTGTCATGATTTTTGGCGGCTCCT
TGCCCGTTGCTCGCTTGAAGAGCCACAGGATGAGGGAGACAGCCATTGCACCGGTGCTAC
CGGTGGCTGCTAAACCCGTAGCCAGTAAACCAGTGGCAATACCCGCTGGTACGAGAACCG
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ATACACCGGCGAGCAATAAGAGGAATATTGCGGCTTGTGTAGCCAGTACTGAGGTTAAAA
CACTCTAAACGACGGCCTTCGGGATTTTTTATCGTGTTTCTTTCTGATTATCCCCATTTT
TCACTAGTTTCAATTGTCAAAAGAGATGGATGTGATTCTTTGATCCGATCGTTGTGCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EW64JQ 714 0 0
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CCCACGTAATAATTATTGTTTATTTTTAAAAGTTGGATTGTTTATCTATCATCCTTTGCT
TATACCCACCGGTTCTTTTCATGTACTCGGTGCGGCTGCTGGTGAGGCTGCTGGTGCGGC
CGCTGGTGAGGCTGCTGTCTCGGCTTCTGGTTTTGCTGCCAGTTTAGCTGCATGACTAGT
ACCTCCACCCGGAAACACCTTTCTCAAGATTTTTGTCATGATTTTTGGCGGCTCCTTGCC
CGTTGCTCGCTTGAAGAGCCACAGGATGAGGGAGACAGCCATTGCACCGGTGCTACCGGT
GGCTGCTAAACCCGTAGCCAGTAAACCAGTGGCAATACCCGCTGGTACGAGAACCGGACT
GAATACTATGAATAGCGGCATGGTGGCAATAAATGCGACGGCTGTGCCAGCGAGGGATAC
ACCGGCGAGCAATAAGAGGAATATTGCGGCTTGTGTAGCCAGTACTGAGGTTAAAACACT
CTAAACGACGGCCTTCGGGATTTTTTATCGTGTTTCTTTCTGATTATCCCCATTTTTCAC
TAGTTTCAATTGTCAAAAGAGATGGATGTGATTCTTTGATCCGATCGTTGTGCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6733Contig1 905 2 1 U
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ATCCTCGAGACTTTCTTGGTTTAAAGAATCACAGAACATCCATTCTTGTTTGCTTTCTTC
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TCTCTTTCTAGACTTTCCGATTATTCTATAGCTGGAAGTGATTATCCAGACGCCATACCC
AAACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTTCTTGTGTCATCATTGTTGACGATTG
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CAGCTGCTATGTCCATGGCTTCTTCTTCACCACCAGTCTCCAGGTTTGGTGGACTCGCTC
ACCGTACTACTACTCTCAGGTATGATCGACGTCCGCTTCCTTGTTCTTCGACTGGGATTC
AAAAGAAGATGAGGTACCCGATTACAACTGCCTCTGCTGACTCACCAAGACCCAAATCTT
ACAAAGAGGTCACTAAGCCCTTCCGCCAACTGTTTGCTCGCGAGATCTCTACTCATTCTA
AAGACTCTGATATTTCCATTGCTAAGGTCCTCTTGTACATTGCTGCTGAAGACGAAGCCT
TCTTGGCTTTCAACCGGGAGATAGACGCTCTGTCTTTCACGAGAGAGAGGGGAAACATCC
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TAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4EN25TF U 702
AF RR4A479TF U 1
BS 1 905 RR4A479TF

RD RR4EN25TF 111 0 0
G
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A

QA 2 110 2 110
DS 

RD RR4A479TF 905 0 0
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TCTCTTTCTAGACTTTCCGATTATTCTATAGCTGGAAGTGATTATCCAGACGCCATACCC
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ACAAAGAGGTCACTAAGCCCTTCCGCCAACTGTTTGCTCGCGAGATCTCTACTCATTCTA
AAGACTCTGATATTTCCATTGCTAAGGTCCTCTTGTACATTGCTGCTGAAGACGAAGCCT
TCTTGGCTTTCAACCGGGAGATAGACGCTCTGTCTTTCACGAGAGAGAGGGGAAACATCC
AAGACCAATCTGATCCGAGCGAGACAGATTCTGATGAGCAGCAGCTATTGTTGCAGTTAG
ATGGAAAGAGTATACCCGAATGGCTGAGCGACTAGATGCAATCTCCAAACAGTAGAGGCA
GAGTTAGTCTCACGAGGCATCATCAACAGCAGCTGCCACTCTCTCAAGTCCTCGAAGCTG
TAAAC

QA 1 905 1 905
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BA87JQ C 1
AF RR4BA87TF U 1
BS 1 292 RR4BA87TF

RD RR4BA87JQ 292 0 0
TTCATCTTGCCATAACTTTCCTGTCGCAAATGAGCTTCGAGAGCTTCTAATAATCTCCAT
CACACCCTCTTCTTTCTTTGCGATATTAAATAATAGTTTGATCTGTGTTCCTCTGTTCTT
CTCTGCTCTGCTCTCTGTTTCAGTTCTGTTTTGAATCACCAATTAATCGACCAAGATTTC
ATTTTTATGCTCCCAATTATGTTCAGTCTCGTGCAATTCTAAACCCCAGAGCTCCTGAGA
TAAACCCATCTCACAAATCGTTTGATCTCTCAATTGAGACTATAAACTTACC

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR4BA87TF 292 0 0
TTCATCTTGCCATAACTTTCCTGTCGCAAATGAGCTTCGAGAGCTTCTAATAATCTCCAT
CACACCCTCTTCTTTCTTTGCGATATTAAATAATAGTTTGATCTGTGTTCCTCTGTTCTT
CTCTGCTCTGCTCTCTGTTTCAGTTCTGTTTTGAATCACCAATTAATCGACCAAGATTTC
ATTTTTATGCTCCCAATTATGTTCAGTCTCGTGCAATTCTAAACCCCAGAGCTCCTGAGA
TAAACCCATCTCACAAATCGTTTGATCTCTCAATTGAGACTATAAACTTACC

QA 1 292 1 292
DS 



AS 1 2

CO CL6735Contig1 1127 2 6 U
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GGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAACGCGTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAG
GAGAAGGAGAGCTGGCAAGACTGACTACAGGGCGAGGATCCGTCTCATCAACCAGGACAA
GAACAAGTACAACACTCCCAAGTACCGTTTTGTTGTCAGGTTCACCAACAAGGACATAGT
CGCGCAGATTGTGTCCGCAAGCATTGCTGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCGCA
TGAGTTGCCTCAGTATGGTCTCTCTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCTGCTTACTGTAC
TGGGCTTCTTTTGGCTCGCCGTGTCCTGAAGATGTTGGAGATGGATGCGGAGTACGAGGG
AAACCTTGAGGCTACCGGGGAGGACTTCTCCGTTGAGCCAACTGAGTCAAGGAGACCATT
CCGTGCTCTTCTTGATGTTGGTCTCATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGC
ACTCAAGGGAGCCTTGGACGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGATTCGCTGG
TTTCAGCAAGGAGAACAAGAACCTCGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATCTATGGTGG
TCACGTCTCGAACTACATGAAGATGTTGAACGAGGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCA
CTTCAGTCAGTACTTGAAGAAGGGAGTCGATGCTGAGAAGATGGAGGAGTTGTACAAGAA
GGTTCATGCTGCCATCCGTGCTGACCCCAACCCTAAGAAGACTGTGAAACCTGCTCCCAA
GGCACACAAGAGGTACAACTTGAAGAAGTTGACCTATGAGGAGAGGAAGAACAAGTTGAT
CGAGAGAGTCAAGGCATTGAACGGAGCAGCTGGAGGTGACGATGATGATGAGGACGACGA
AGAGTGAAGCACTGGAAAGTTCAGCGTCTCCTGATGATGTCTCTTGTAGGAGCTTTTACT
TTTTTGCAAGACTTGAGCATTAAACTTTTGTTTTCACTTTTTAATTTCGTTTGAGGATTT
TGAGTATGAGGATGCTATTTTCTTTGAAGAAGTTAAATCTTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FG33TF U 1
AF RR4FG33JQ C 476
BS 1 743 RR4FG33TF
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BS 771 1127 RR4FG33JQ

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GAACAAGTACAACACTCCCAAGTACCGTTTTGTTGTCAGGTTCACCAACAAGGACATAGT
CGCGCAGATTGTGTCCGCAAGCATTGCTGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCGCA
TGAGTTGCCTCAGTATGGTCTCTCTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCTGCTTACTGTAC
TGGGCTTCTTTTGGCTCGCCGTGTCCTGAAGATGTTGGAGATGGATGCGGAGTACGAGGG
AAACCTTGAGGCTACCGGGGAGGACTTCTCCGTTGAGCCAACTGAGTCAAGGAGACCATT
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TCACGTCTCGAACTACATGAAGATGTTGAACGAGGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCA
CTTCAGTCAGTACTTGAAGAAGG*AGTCGATGCTGAGA*GATGGAGGAGT
GTACAGAAGTTCATGCT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4FG33JQ 652 0 0
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GCTGGTTTCAGCAAGGAGAACAAGAACCTCGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATCTAT
GGTGGTCACGTCTCGAACTACATGAAGATGTTGAACGAGGATGAGCCAGAGAAGTTTCAG
ACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAGGGAGTCGATGCTGAGAAGATGGAGGAGTTGTAC
AAGAAGGTTCATGCTGCCATCCGTGCTGACCCCAACCCTAAGAAGACTGTGAAACCTGCT
CCCAAGGCACACAAGAGGTACAACTTGAAGAAGTTGACCTATGAGGAGAGGAAGAACAAG
TTGATCGAGAGAGTCAAGGCATTGAACGGAGCAGCTGGAGGTGACGATGATGATGAGGAC
GACGAAGAGTGAAGCACTGGAAAGTTCAGCGTCTCCTGATGATGTCTCTTGTAGGAGCTT
TTACTTTTTTGCAAGACTTGAGCATTAAACTTTTGTTTTCACTTTTTAATTTCGTTTGAG
GATTTTGAGTATGAGGATGCTATTTTCTTTGAAGAAGTTAAATCTTTTTGAC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6736Contig1 1084 2 2 U
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AATGGACACTATCAACACTAACCGATGTTGAGGAAGTGAAACAGATCGTGCGGATGTTAC
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TCGCGCAGTCTGAGACGATGGACCGTCACATTGGGAGCTTTGAGATCCCTCCAGCCTCAA
TGGCCGTATTCTATATTGGTGGCCTCCTCCTAACCACCGCCGTCTACGACCGTATCGCGA
TTCCCCTATGCAAAAAGCTATTCAACTACCCCCACGGTCTGAGACCGCTTCAACGCATTG
GCTTGGGTCTTGTACTCGCAGCCACGGGTATGGCAGTAGCTGCTTTGGTAGAGATCAAAC
GTCTTAGAACCGCAAATGCCCACGGTCCAGCAGTCAAAACGCTTCTTCTAGGGTTTTCTC
TACTCATCCCACAATACCTTATTGTCGGTATCGGTGAGGCGTTGATCTACACAGGACAGT
TGGATTTTTTCTTGAGAGAATGTCCTAAAGGTATGAAAACAATGAGCACGGGTTTATTAT
TGAGCACATTGGCTTTAGGGTTTTTCTTCAGCTCGGTTCTTGTAACCATCGTTGAGAAAG
TCACTGATAAAGCGCATCCGTGGATCGCTGATGATCTCAACAAGGGCCGTCTATACAATT
TCTATTGGCTTGTGACCGTAATTGTTGCCTTGAACTTCCTCATTTTCCTCGTTTTCTCCA
AGTGGTACGTCTACAAGGAGAAGAGACTAGCTGACCTTGGGATTGAGTTGGAAGATGAGC
CAGACATTCCAATGGGGCATTGATCTAATGAAGATGAATAATGTGTTTATGTTGATATGT
TTGAACTTGATTTTGAATTTTGTGGTATATTTTATGATGTTTAATTCAGTTACATCTTGT
TTCCGAGTACAAATAATGGACCGACTGATAAGGGACAAAAGTTAAAGTTTTCCCATTTGG
TTCTGTATAAAAGCAGAAATTGTAAAATTTCTAAGATTTAACGCAATTAACGTCTTTTGG
TTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4F139TF U 1
AF RR4F139JQ C 410
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BS 702 1084 RR4F139JQ

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AATGGACACTATCAACACTAACCGATGTTGAGGAAGTGAAACAGATCGTGCGGATGTTAC
CAATTTGGGCAACATGCATCCTCTTTTGGACCGTCCATGCTCAACTGACGACATTATCTG
TCGCGCAGTCTGAGACGATGGACCGTCACATTGGGAGCTTTGAGATCCCTCCAGCCTCAA
TGGCCGTATTCTATATTGGTGGCCTCCTCCTAACCACCGCCGTCTACGACCGTATCGCGA
TTCCCCTATGCAAAAAGCTATTCAACTACCCCCACGGTCTGAGACCGCTTCAACGCATTG
GCTTGGGTCTTGTACTCGCAGCCACGGGTATGGCAGTAGCTGCTTTGGTAGAGATCAAAC
GTCTTAGAACCGCAAATGCCCACGGTCCAGCAGTCAAAACGCTTCTTCTAGGGTTTTCTC
TACTCATCCCACAATACCTTATTGTCGGTATCGGTGAGGCGTTGATCTACACAGGACAGT
TGGATTTTTTCTTGAGAGAATGTCCTAAAGGTATGAAAACAATGAGCACGGGTTTATTAT
TGAGCACATTGGCTTTAGGGTTTTTCTTCAGCTCGGTTCTTGTAACCATCGTTGAGAAAG
TCACTGATAAAGCGCATCCGTGGATCGCTGATGATCTCAAC

QA 1 701 1 701
DS 

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AGAGATCAAACGTCTTAGAACCGCAAATGCCCACGGTCCAGCAGTCAAAACGCTTCTTCT
AGGGTTTTCTCTACTCATCCCACAATACCTTATTGTCGGTATCGGTGAGGCGTTGATCTA
CACAGGACAGTTGGATTTTTTCTTGAGAGAATGTCCTAAAGGTATGAAAACAATGAGCAC
GGGTTTATTATTGAGCACATTGGCTTTAGGGTTTTTCTTCAGCTCGGTTCTTGTAACCAT
CGTTGAGAAAGTCACTGATAAAGCGCATCCGTGGATCGCTGATGATCTCAACAAGGGCCG
TCTATACAATTTCTATTGGCTTGTGACCGTAATTGTTGCCTTGAACTTCCTCATTTTCCT
CGTTTTCTCCAAGTGGTACGTCTACAAGGAGAAGAGACTAGCTGACCTTGGGATTGAGTT
GGAAGATGAGCCAGACATTCCAATGGGGCATTGATCTAATGAAGATGAATAATGTGTTTA
TGTTGATATGTTTGAACTTGATTTTGAATTTTGTGGTATATTTTATGATGTTTAATTCAG
TTACATCTTGTTTCCGAGTACAAATAATGGACCGACTGATAAGGGACAAAAGTTAAAGTT
TTCCCATTTGGTTCTGTATAAAAGCAGAAATTGTAAAATTTCTAAGATTTAACGCAATTA
ACGTCTTTTGGTTCG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6737Contig1 593 2 2 U
GGAACCACTGTAAAAGAAAAAAAAAAATGCTCTCTTCCTCCCTAAGAATGGAGTTACTCT
GTTTCTTCACTCTGCTTTTGATATCACAGTCTGTTGCATTGAATATGACAGAGGAAATGC
AGACTGCATGTGAAATGTGCTTAGAATGTGAGAATCCATGTGATCAGCCACCACCTCCGC
AAGAGCTACTCTGTCCTCCACCTCTTCCACCACCGCCTTCTCCTCCTCCGCCACCTCCAT
CACCACCACCGCCGTGTACGCACTGCCCACTACCGCTTCCACCACCGCAGCCGCTAGTTT
GTAACGAATGCGTTCATAATAAACCGAGACCGCCGATCATTATCACCGCAGCAGCAGCGT
CACTGGAGGTTTCAGCTTCTATAAGCTTCGCAACTGCTCTCGCCTTCCTCGTCTCTTCTC
TGCTTCGTTAATCTTCTGCTAGCGATCTTCGGCCTTTCATGTCTCAACATTATATTATTC
TTACAATCATCACTAAGTGGGGTTTTGAAGAAACTTGGTTGTATTATCCTCTATCCATTT
TGGTTGTTTCTCGAATTATCCGTCCTCAAATAAATATATTGACTTGTTGTTTG


BQ
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AF RR4E848TF U 1
AF RR4E848JQ C 107
BS 1 322 RR4E848TF
BS 323 593 RR4E848JQ

RD RR4E848TF 322 0 0
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GTTTCTTCACTCTGCTTTTGATATCACAGTCTGTTGCATTGAATATGACAGAGGAAATGC
AGACTGCATGTGAAATGTGCTTAGAATGTGAGAATCCATGTGATCAGCCACCACCTCCGC
AAGAGCTACTCTGTCCTCCACCTCTTCCACCACCGCCTTCTCCTCCTCCGCCACCTCCAT
CACCACCACCGCCGTGTACGCACTGCCCACTACCGCTTCCACCACCGCAGCCGCTAGTTT
GTAACGAATGCGTTCATAATAA

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR4E848JQ 487 0 0
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GCCACCACCTCCGCAAGAGCTACTCTGTCCTCCACCTCTTCCACCACCGCCTTCTCCTCC
TCCGCCACCTCCATCACCACCACCGCCGTGTACGCACTGCCCACTACCGCTTCCACCACC
GCAGCCGCTAGTTTGTAACGAATGCGTTCATAATAAACCGAGACCGCCGATCATTATCAC
CGCAGCAGCAGCGTCACTGGAGGTTTCAGCTTCTATAAGCTTCGCAACTGCTCTCGCCTT
CCTCGTCTCTTCTCTGCTTCGTTAATCTTCTGCTAGCGATCTTCGGCCTTTCATGTCTCA
ACATTATATTATTCTTACAATCATCACTAAGTGGGGTTTTGAAGAAACTTGGTTGTATTA
TCCTCTATCCATTTTGGTTGTTTCTCGAATTATCCGTCCTCAAATAAATATATTGACTTG
TTGTTTG

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL6738Contig1 1214 2 6 U
CAACTTTGGCCTCTGTATTATTGTTTGCTTTCTTCTATGTCCACTTTCTCCTCTTTTTCT
CCATTTCATACTTCCAAGCTTTTCTCTCACAAAGAGGACGAACAAAAAATGTATGCAGAT
TCATGGTTAATGCCCCGTTACATGCAAACTTGTTCTCCAGATATTCACCAATTTGAAGAC
CTCTTCAAATCATACAAGCTCTCGGATGAAGAAATGAGGATGGTTTTGCTGAACGATCAA
ACCTACCTGAGTATGATATTGGAGAAGAAGGATATCTCTTCAACGCTCCTGATTCAATTC
TTGAAGAGCCAATCTTAACCGTTGATCCGCTCTCAGCTGCCTTAACGATGATCTCTTGCG
GGGAAGACTCTTCCCAAGGGCTTTGTGATCTTCCTGACCTCGATCTCGGGTCGTTTCAGA
GCGATCAGCAGCTTCTTGACAATGCCTTCTATGAATGCGAGCAAGATCTCATGATGAAAT
CAGCTACGATGGAGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCAAGAACATCTCTGTCGTGA
CTACGGGGATCAACGAGAGCCAGGATGTGCAGAAGAGCGTAAGCTCGGGGGAACCTGCGC
TCTATGGATTGGTCACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTCAGAACTTCCCTGGTTTT
GCTCAGTTGGATTTTGGTTCTGATTATAGGATGCGACGAGCCTTTAGTGAAGGCGACATA
CAGAAACTAGGGACTGGTCATTTTCAGTCTCCGTTGGATATGATTATTGTGAGCTGTACT
TCAGAGGATCGACGTGAGAAGCTTTCTCGATACAGGAACAAGAAGAGCAGGCGAAATTTC
GGGCGTAAAATCAAGTATGCTTGTAGGAAAGCTCTTGCAGATAACCAACCGAGGATCCGA
GGAAGGTTTGCGAAAACAGAGGAGCGGAAATAGAATGGTTTCAAATGAATGGGGCTGAGT
AAAATGAAGAACTTGAAAACATAAGGAGATAAAGCCTATCGCATCAGAAACTAGTTTTGT
TTAATATATGTATAGAATTAAAATGTTATAAGCCTTTAGTTAGTGTTTTCTTGTGTATAA
AAATGGTTTATCTGAATAAGCTTTTTGTTGAAAGAAATGTAGGTACAGAAGTGTTAAGTA
ATGGAGGTGAAATATGTGAAAATGTATGAATGTATAAAATTCTGAATATTTATTATATAC
ATTAGATCATGTGG


BQ
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AF RR4FD42TF U 1
AF RR4FD42JQ C 450
BS 1 646 RR4FD42TF
BS 647 647 RR4FD42JQ
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RD RR4FD42TF 755 0 0
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CCATTTCATACTTCCAAGCTTTTCTCTCACAAAGAGGACGAACAAAAAATGTATGCAGAT
TCATGGTTAATGCCCCGTTACATGCAAACTTGTTCTCCAGATATTCACCAATTTGAAGAC
CTCTTCAAATCATACAAGCTCTCGGATGAAGAAATGAGGATGGTTTTGCTGAACGATCAA
ACCTACCTGAGTATGATATTGGAGAAGAAGGATATCTCTTCAACGCTCCTGATTCAATTC
TTGAAGAGCCAATCTTAACCGTTGATCCGCTCTCAGCTGCCTTAACGATGATCTCTTGCG
GGGAAGACTCTTCCCAAGGGCTTTGTGATCTTCCTGACCTCGATCTCGGGTCGTTTCAGA
GCGATCAGCAGCTTCTTGACAATGCCTTCTATGAATGCGAGCAAGATCTCATGATGAAAT
CAGCTACGATGGAGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCAAGAACATCTCTGTCGTGA
CTACGGGGATCAACGAGAGCCAGGATGTGCAGAAGAGCGTAAGCTCGGGGGAACCTGCGC
TCTATGGATTGGTCACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTCAGA*CTTCCCTGGTTTT
GCTCAGTTGGATTTTGGTTCTGATTATAGGATGCGACGAGCCTTTAGTGAAG*CGACATA
CAGAAACTAGGGACTGGTCATTTTCAGTCTCCGTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4FD42JQ 765 0 0
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GTTTTGGACGTCAAGAACATCTCTGTCGTGACTACGGGGATCAACGAGAGCCAGGATGTG
CAGAAGAGCGTAAGCTCGGGG*AACCTGCGCTCTATGGATTGGTCACATGCACAGCAAGA
GGCTGTTGTGGTTCAGAACTTCCCTGGTTTTGCTCAGTTGGATTTTGGTTCTGATTATAG
GATGCGACGAGCCTTTAGTGAAGGCGACATACAGAAACTAGGGACTGGTCATTTTCAGTC
TCCGTTGGATATGATTATTGTGAGCTGTACTTCAGAGGATCGACGTGAGAAGCTTTCTCG
ATACAGGAACAAGAAGAGCAGGCGAAATTTCGGGCGTAAAATCAAGTATGCTTGTAGGAA
AGCTCTTGCAGATAACCAACCGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCGAAAACAGAGGAGCGGAA
ATAGAATGGTTTCAAATGAATGGGGCTGAGTAAAATGAAGAACTTGAAAACATAAGGAGA
TAAAGCCTATCGCATCAGAAACTAGTTTTGTTTAATATATGTATAGAATTAAAATGTTAT
AAGCCTTTAGTTAGTGTTTTCTTGTGTATAAAAATGGTTTATCTGAATAAGCTTTTTGTT
GAAAGAAATGTAGGTACAGAAGTGTTAAGTAATGGAGGTGAAATATGTGAAAATGTATGA
ATGTATAAAATTCTGAATATTTATTATATACATTAGATCATGTGG

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6740Contig1 797 2 1 U
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ACTCAGAGACAACGACGTCAACGAATCAACCACTTTGCCCGAAGCCACGTCGTGTTTGTC
ATTCTCTTCCTGATTTCCTCAAACCTCTCTCATGTTCCCTACACTCTCCCAACTGCCAAC
AAAATTCGGAGGTTCAGCCGATAGAAGGTGGAACAGTAGAGTCAATGTGGTACGCAGGTT
TTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTGCACGACCGCCATTTCATTCACTGCCTTC
ATGACCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCCTCACATGCATATATAGCCG
TACATAACAAAAAGAAGAAAAAAAAAACACTTACGTCCACATTAATTGCCATATCGATCT
ATCTCGGCGTAAAGAACATCAACCTCATCAACTAGACGGTTTTTATACAAATATGCATCC
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GACTTGTGTTTCCTTTG


BQ
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AF RR4AI68TF U 1
AF RR4AI68JQ C 481
BS 1 797 RR4AI68TF

RD RR4AI68TF 797 0 0
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TTTACATAATTGCTAGCTGTTCTTCGGCTTTATATATAAAAGGAGAAAACATGCAACATC
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ATTCTCTTCCTGATTTCCTCAAACCTCTCTCATGTTCCCTACACTCTCCCAACTGCCAAC
AAAATTCGGAGGTTCAGCCGATAGAAGGTGGAACAGTAGAGTCAATGTGGTACGCAGGTT
TTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTGCACGACCGCCATTTCATTCACTGCCTTC
ATGACCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCCTCACATGCATATATAGCCG
TACATAACAAAAAGAAGAAAAAAAAAACACTTACGTCCACATTAATTGCCATATCGATCT
ATCTCGGCGTAAAGAACATCAACCTCATCAACTAGACGGTTTTTATACAAATATGCATCC
GTTACTCAAGAAGTTTGTAGTTTTTTCTTCGTCGGAATTTATTTGGATTGATATTATTGA
TCACCAAAATTCCACACTGAGGCCAGCAGAACACCACTAACATACGCAGAGACATATATA
CAGAAAACTTAAACAGGGATATTTTTATCAGGGTTTGGATTTTTCTATATAACATAGAAC
ATTTACTCTTTCTAGTTTGTAATGCTTTTTTATTTGAGACATTTCTATAGTTTTATGTAA
GACTTGTGTTTCCTTTG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4AI68JQ 317 0 0
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TCACCAAAATTCCACACTGAGGCCAGCAGAACACCACTAACATACGCAGAGACATATATA
CAGAAAACTTAAACAGGGATATTTTTATCAGGGTTTGGATTTTTCTATATAACATAGAAC
ATTTACTCTTTCTAGTTTGTAATGCTTTTTTATTTGAGACATTTTTATAGTTTTATGTAA
GACTTGTGTTTCCTTTG

QA 1 317 1 317
DS 



AS 1 2

CO CL6741Contig1 1222 2 10 U
GAACTGGGGAAGGGGTAACAGTTACTACTATGGAAGATAGCTTAGAGGTTAAGGAGCAGA
CTGGCGAATCAAATGTAGCTGTGGCTGTGGAGACGGAGAACACATGCATTGTTCCTGACA
GAGAGCAGTACAACAAAGAAGATTTCCCAGTGGATTATGAGAATGCTATGTTCTTTGTCA
TCAAGTCTTACAGTGAAGATGATGTGCACAAGAGCATCAAATATAATGTTTGGGCTAGTA
CACCAAATGGAAACAAGAAACTTGCTGCAGCATATCAGGCAGCTCAGCAGAAACCTGGCG
GCTGTCCTATCTTTCTCTTTTTCTCGGTCAATGCTAGTGGACAATTTGTTGGGCTTGCTG
AAATGACAGGACCAGTTGATTCCAACACAAATGTGGAGTACTGGCAGCAAGACAAGTGGA
CTGGCTCTTTCCCTCTCAAGTGGCATATCGTGAAGGACGTTCCAAACAGCTTGCTGAAAC
ACATTACCCTTGAGAACAATGAGAACAAGCCTGTTACCAACAGCAGAGACACACAAGAGG
TCAAGATGGAGCAAGGTTTGAAGATTGTGAAAGTTTTCAAGGAGCATACTAGCAAGACTT
GCATTTTGGATGACTTTTCCTTCTATGAGGTTAGGCAAAAGACTATCTTGGAGAAGAAGG
CAAAGCAGCAGCAAACCCAGAAACAGGAAAGTGAGGAGAAAACTGCAACAGATGAGAAAA
AGGAAACCGCAACTGCTGATTCAGCTAATAATAAGGAATCTCCTACCGCTGCTCAAACTG
CCAGTGATGTCAAGGCTGATGAGAATGGGTCTGTTGCTAAACCAGTCGGTGTGGTGGCAA
ATGGTTGCTAGAATAGGCGATGTAGCTCACGGCTGGAGAGCATAAAAACGAAACATGAGA
GAAGAAGATATGAACATTCCCGTTTACAGTTTCTCTTGAGAACCCAAGTGCCGTGAGCTT
TGAAGCATGGAAGGAAGAGTCTTAGTACCTGAGACCGAGATCCTGTTTTTATGCCCTTTA
GAAGTTAAATGTCCCTGTTTTTATTGTTTCTTCAATCATTTCGTGTTCTCTTTTTACCTT
GTCTTTACAGTTTTCAGTTTTTCTTTTCTTTTTTCATGTTCTGTTGATCCTCCTGCCTTG
TAAGATGCTTATAGGACCTACTACTAAATTGTGGGAAAAGTAAGAGAAAGATGATATAAT
AGCAGGGTGGGAGTTGTTTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D804TF U 1
AF RR4D804JQ C 347
BS 1 381 RR4D804TF
BS 382 382 RR4D804JQ
BS 383 629 RR4D804TF
BS 630 630 RR4D804JQ
BS 631 659 RR4D804TF
BS 660 660 RR4D804JQ
BS 661 674 RR4D804TF
BS 675 675 RR4D804JQ
BS 676 689 RR4D804TF
BS 690 1222 RR4D804JQ

RD RR4D804TF 691 0 0
GAACTGGGGAAGGGGTAACAGTTACTACTATGGAAGATAGCTTAGAGGTTAAGGAGCAGA
CTGGCGAATCAAATGTAGCTGTGGCTGTGGAGACGGAGAACACATGCATTGTTCCTGACA
GAGAGCAGTACAACAAAGAAGATTTCCCAGTGGATTATGAGAATGCTATGTTCTTTGTCA
TCAAGTCTTACAGTGAAGATGATGTGCACAAGAGCATCAAATATAATGTTTGGGCTAGTA
CACCAAATGGAAACAAGAAACTTGCTGCAGCATATCAGGCAGCTCAGCAGAAACCTGGCG
GCTGTCCTATCTTTCTCTTTTTCTCGGTCAATGCTAGTGGACAATTTGTTGGGCTTGCTG
AAATGACAGGACCAGTTGATTTCAACACAAATGTGGAGTACTGGCAGCAAGACAAGTGGA
CTGGCTCTTTCCCTCTCAAGTGGCATATCGTGAAGGACGTTCCAAACAGCTTGCTGAAAC
ACATTACCCTTGAGAACAATGAGAACAAGCCTGTTACCAACAGCAGAGACACACAAGAGG
TCAAGATGGAGCAAGGTTTGAAGATTGTGAAAGTTTTCAAGGAGCATACTAGCAAGACTT
GCATTTTGGATGACTTTTCCTTCTATGAG*TTAGGCAAAAGACTATCTTGGAGAAGAAG*
CAAAGCAGCAGCAA*CCCAGAAACAGGAA
GT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4D804JQ 876 0 0
TTTTTGGGC
TGCTGAAATGACAG*ACCAGTTGATTC**ACACAAATGTGGAGTACTG*CAGCAAGACAA
GTGGACTGGCTCTTTCCCTCTCAAGTGGCATATCGTGAAGGACGTTCCAAACAGCTTGCT
GAAACACATTACCCTTGAGAACAATGAGAACAAGCCTGTTACCAACAGCAGAGACACACA
AGAGGTCAAGATGGAGCAAGGTTTGAAGATTGTGAAAGTTTTCAAGGAGCATACTAGCAA
GACTTGCATTTTGGATGACTTTTCCTTCTATGAGGTTAGGCAAAAGACTATCTTGGAGAA
GAAGGCAAAGCAGCAGCAAACCCAGAAACAGGAAAGTGAGGAGAAAACTGCAACAGATGA
GAAAAAGGAAACCGCAACTGCTGATTCAGCTAATAATAAGGAATCTCCTACCGCTGCTCA
AACTGCCAGTGATGTCAAGGCTGATGAGAATGGGTCTGTTGCTAAACCAGTCGGTGTGGT
GGCAAATGGTTGCTAGAATAGGCGATGTAGCTCACGGCTGGAGAGCATAAAAACGAAACA
TGAGAGAAGAAGATATGAACATTCCCGTTTACAGTTTCTCTTGAGAACCCAAGTGCCGTG
AGCTTTGAAGCATGGAAGGAAGAGTCTTAGTACCTGAGACCGAGATCCTGTTTTTATGCC
CTTTAGAAGTTAAATGTCCCTGTTTTTATTGTTTCTTCAATCATTTCGTGTTCTCTTTTT
ACCTTGTCTTTACAGTTTTCAGTTTTTCTTTTCTTTTTTCATGTTCTGTTGATCCTCCTG
CCTTGTAAGATGCTTATAGGACCTACTACTAAATTGTGGGAAAAGTAAGAGAAAGATGAT
ATAATAGCAGGGTGGGAGTTGTTTTCG

QA 10 876 10 876
DS 



AS 1 2

CO CL6742Contig1 498 2 5 U
TCCAGCAGTTGCAGCTTCATTCACAGAAACAACAACAGCATCAACATCAGCAACAACAAC
AACAGCAGCAGTTTCAGTTTCAACAGCAACAGATACAACAGCTTATGCATCACCGTCTTC
GACAGCAGGAACAACAAAATGGAACTGCGGAGGTGAGAAAACAGAAGCCATTCCATGGCC
AGGATGAGAGCTGATGAACACGAATACAAATATTATGTAATGAGAGAGAGGGTACTGGCG
TTGTTGTGTACTAAGCAGTACATCACTGTTCAATACATTTGAATAGCCCAAAGAAAACAT
TCCGAGTTGTTTAGATTTTGTTATTGAGACTGTGTCTCGTGTCTTAGTACACATATTCAA
ATTGCTAATTTGTTGTTATAAATCATAAAAACATAACCGTTATTGCCAACACTATGCTTG
ATGCATATTTAAAATATTCTCAGATGCTTTTGTATTATAAACATGTAGACTGTTTGTTAT
ACATCAAAGTGAGCTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB54TF U 311
AF RR4DZ06JQ C 1
BS 1 311 RR4DZ06JQ
BS 312 441 RR4AB54TF
BS 442 442 RR4DZ06JQ
BS 443 456 RR4AB54TF
BS 457 498 RR4DZ06JQ

RD RR4AB54TF 146 0 0
G
TAGATTTTGTTATTGAGACTGTGTCTCGTGTCTTAGTACACATATTCAAATTGCTAATTT
GTTGTTATAAATCATAAAAACATAACCGTTATTGCCAACACTATGCTTGATGCATATTTA
AAATATTCTCGGATGCTTTTGTATT

QA 2 146 2 146
DS 

RD RR4DZ06JQ 498 0 0
TCCAGCAGTTGCAGCTTCATTCACAGAAACAACAACAGCATCAACATCAGCAACAACAAC
AACAGCAGCAGTTTCAGTTTCAACAGCAACAGATACAACAGCTTATGCATCACCGTCTTC
GACAGCAGGAACAACAAAATGGAACTGCGGAGGTGAGAAAACAGAAGCCATTCCATGGCC
AGGATGAGAGCTGATGAACACGAATACAAATATTATGTAATGAGAGAGAGGGTACTGGCG
TTGTTGTGTACTAAGCAGTACATCACTGTTCAATACATTTGAATAGCCCAAAGAAAACAT
TCCGAGTTGTTTAGATTTTGTTATTGAGACTGTGTCTCGTGTCTTAGTACACATATTCAA
ATTGCTAATTTGTTGTTATAAATCATAAAAACATAACCGTTATTGCCAACACTATGCTTG
ATGCATATTTAAAATATTCTCAGATGCTTTTGTATTATAAACATGTAGACTGTTTGTTAT
ACATCAAAGTGAGCTGCC

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL6743Contig1 926 2 10 U
GAACTCACATGGAAAAAAACTCTCTCTCTTCTTTTAGAGAGAGACTTTTCTCTCGAACTT
CCCTCTTACCAAATACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGTATCATATTTCGATCATTT
GATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTATGGCGGTTTTGTAGTGTT
TCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTTTTATCAGTTTTGTCGAAG
ATAAAATAAAGTCCGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTACTCTTTTGCGATTCTAAAT
CAAGATTCCAGTGTGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAGATAATTTTGGATTCCTTT
TCCTTAGAAATCAGTCTTACCCGAAGCCTGCCGAAAAATCGGCTTTTGGTTCAGCTTTCT
TCAGGTAAAGGATGAAGAGGGGTTAGATTAATTTCAATCACTTCAAAGGTGATTCAGTAG
AGTTTGCGCTCATTGAACGGTCCAACGAAGAGTCTACTTTTAGGTTGATTGAATAATCCT
TGAATTAATAACATCTAGAGATGCAAGATGCTCAGGTACAGGCGATGGCGAAAGACGAAA
GAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAGATC
GACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAGCTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTGAAG
TCTTTGTGTAGGCTCGACGCGTGTCCAACCACGTGTAAAACAAACGAGATAGTGGATAGC
ACGTGGCAAAGGTTGAAACTAGAGTCGGTTTTATTGTTTTTGGGCTAATATTTTGAATGA
TGTAATGTTTTTTGGGCCTTATCGTTGAAGTCCGAATACTTGTAATTTTGCCCATAGGCT
TCACTTTAATAGTGAATCAATTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB68TF U 1
AF RR4EB68JQ C 392
BS 1 644 RR4EB68TF
BS 645 645 RR4EB68JQ
BS 646 671 RR4EB68TF
BS 672 672 RR4EB68JQ
BS 673 678 RR4EB68TF
BS 679 679 RR4EB68JQ
BS 680 704 RR4EB68TF
BS 705 705 RR4EB68JQ
BS 706 714 RR4EB68TF
BS 715 926 RR4EB68JQ

RD RR4EB68TF 717 0 0
GAACTCACATGGAAAAAAACTCTCTCTCTTCTTTTAGAGAGAGACTTTTCTCTCGAACTT
CCCTCTTACCAAATACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGTATCATATTTCGATCATTT
GATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTATGGCGGTTTTGTAGTGTT
TCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTTTTATCAGTTTTGTCGAAG
ATAAAATAAAGTCCGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTACTCTTTTGCGATTCTAAAT
CAAGATTCCAGTGTGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAGATAATTTTGGATTCCTTT
TCCTTAGAAATCAGTCTTACCCGAAGCCTGCCGAAAAATCGGCTTTTGGTTCAGCTTTCT
TCAGGTAAAGGATGAAGAGGGGTTAGATTAATTTCAATCACTTCAAAGGTGATTCAGTAG
AGTTTGCGCTCATTGAACGGTCCAACGAAGAGTCTACTTTTAGGTTGATTGAATAATCCT
TGAATTAATAACATCTAGAGATGCAAGATGCTCAGGTACAGGCGATGGCGAAAGACGAAA
GAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAG*AAGAACATGAAGATC
GACTCTGGTAA*GATACG*CGGTGACGATGTAGCTCGGCGAAGT*ACAGCTTCG
TGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4EB68JQ 535 0 0
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TTTCAATCACTTCAAAGGTGATTCAGTAGAGTTTGCGCTCATTGAACGGTCCAACGAAGA
GTCTACTTTTAGGTTGATTGAATAATCCTTGAATTAATAACATCTAGAGATGCAAGATGC
TCAGGTACAGGCGATGGCGAAAGACGAAAGAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAAT
GATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAGATCGACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGT
AGCTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTGAAGTCTTTGTGTAGGCTCGACGCGTGTCCAACCA
CGTGTAAAACAAACGAGATAGTGGATAGCACGTGGCAAAGGTTGAAACTAGAGTCGGTTT
TATTGTTTTTGGGCTAATATTTTGAATGATGTAATGTTTTTTGGGCCTTATCGTTGAAGT
CCGAATACTTGTAATTTTGCCCATAGGCTTCACTTTAATAGTGAATCAATTTGGC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6745Contig1 913 2 2 U
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ATCAGTTATCTCGTGGACAGAATGAAGAAGTTACATGAGGGTAATCTTAAAAGCATTTCG
TCTTTCAACAAAAGTAGCTGTGACAACCTTGAAGAGAGTACCCATGGTACCTCGAAAGCC
TTTTTGGGGCCAGAATTCCATGAGCAAGATTTGAGATCTCAGATGGTACTTGTTGATAAA
GTTCTGATTTTCTCTCAATTTCTTGGGCATATTCACGTGATTGAACAACGGTTGGAATTT
GCTGGCATCAAGTTTGCTGGAATGTACAGTCCAATGCCTTCGTCTAAGAAGATGAAAAAT
CTGGCCATGTTCCAGAATGATGTTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGCTGCG
CTAGGTCTTGATTTGAGCTTTGTAACACATGTGTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAA
AGCATGGAAGAGCAAGTTATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGAAAAACGCCCTATTTAT
GTAGAAACGCTAACCATGCGTGGCACGATTGAAGAGCAGATGATGAGATTCCTAGAGGAT
GCTGAAAAGAGTGATAGATTATCCAGTGGGGATTACGTGAAAGTGGAGCAAGAGACAACA
ACACGAAGCAGCAGCAGGCGAACCCTACATGATTTGGCAGAGAGCAATTACTTGTTTCAT
CTTATCTTTGTTCGATCAGAGGGCAACACATAATGACTTCCATCTCTAAACTATCGTATT
TTCATAAGGGTTTTGCAGCTTTGCTTTTTGTAGGGCTTAAATATCACCATTATTATTATG
GTATCAGTAACACCTAGATTGATACGAACACTTGAGAGTTCAGAGAAATAAAAGTGTAAT
GTAGTTTTAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO23TF U 1
AF RR4FO23JQ C 339
BS 1 641 RR4FO23TF
BS 642 913 RR4FO23JQ

RD RR4FO23TF 641 0 0
GAACCTTCATATAATCAGGATGACTGAAATCCTGACTGGCAATCTACGTCTAGCAGTAAA
ATCAGTTATCTCGTGGACAGAATGAAGAAGTTACATGAGGGTAATCTTAAAAGCATTTCG
TCTTTCAACAAAAGTAGCTGTGACAACCTTGAAGAGAGTACCCATGGTACCTCGAAAGCC
TTTTTGGGGCCAGAATTCCATGAGCAAGATTTGAGATCTCAGATGGTACTTGTTGATAAA
GTTCTGATTTTCTCTCAATTTCTTGGGCATATTCACGTGATTGAACAACGGTTGGAATTT
GCTGGCATCAAGTTTGCTGGAATGTACAGTCCAATGCCTTCGTCTAAGAAGATGAAAAAT
CTGGCCATGTTCCAGAATGATGTTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGCTGCG
CTAGGTCTTGATTTGAGCTTTGTAACACATGTGTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAA
AGCATGGAAGAGCAAGTTATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGAAAAACGCCCTATTTAT
GTAGAAACGCTAACCATGCGTGGCACGATTGAAGAGCAGATGATGAGATTCCTAGAGGAT
GCTGAAAAGAGTGATAGATTATCCAGTGGGGATTACGTGAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4FO23JQ 575 0 0
TTCGTCTAAGAAGATGAAAAATCTGGCCATGTTCCAGAATGATGTTGATTGCATGGCACT
TTTGATGGATGGAAGTGCTGCGCTAGGTCTTGATTTGAGCTTTGTAACACATGTGTTCCT
GATGGAACCAATCTGGGATAAAAGCATGGAAGAGCAAGTTATCAGTCGTGCTCATCGGAT
GGGCGAAAAACGCCCTATTTATGTAGAAACGCTAACCATGCGTGGCACGATTGAAGAGCA
GATGATGAGATTCCTAGAGGATGCTGAAAAGAGTGATAGATTATCCAGTGGGGATTACGT
GAAAGTGGAGCAAGAGACAACAACACGAAGCAGCAGCAGGCGAACCCTACATGATTTGGC
AGAGAGCAATTACTTGTTTCATCTTATCTTTGTTCGATCAGAGGGCAACACATAATGACT
TCCATCTCTAAACTATCGTATTTTCATAAGGGTTTTGCAGCTTTGCTTTTTGTAGGGCTT
AAATATCACCATTATTATTATGGTATCAGTAACACCTAGATTGATACGAACACTTGAGAG
TTCAGAGAAATAAAAGTGTAATGTAGTTTTAGGCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL6746Contig1 591 2 2 U
GGCGGAACTGGGGGCTTTTCCGGTCTGATTTCTCTCCGGTTTACGACGTTGGTCTCCTCC
GAGGTGGGGGCCTTGGACGTCCAGCACCAGCATTGCCAGGGCCTAGTACTGCTGGTGGTA
AATGGTGTGTGGCAAATTCAGGCGCCACTAATGCGCAGTTGCAAGCGAATATTGATTGGG
TTTGTAGTCAGGGAGGCGTTGACTGTAAACCGATCCAAGCTGGTGGCTCGTGCTTTAATC
CTAACAGTTTAAGGATGCATGCTTCTTTTGTGATGAACGCTTATTTCCAGAAAAACGGTC
GCAGTGACGGTTCGTGTCATTTCAGTGGGACCGGTGTCGTTGTAACGAGCAACCCAAGCA
ATGGTGCGTGTAAGTTTTAAGTGACGCGTTTTAACTGATTTGTTCTGTGTAGCATTTGTT
TTGAAAGACCTAACATAACGGTTTTAAGGGACTGTCATGGATTGGAGAGATCATCAGCTT
TGTGTTTAGTTTCGGATGTTTTAATGTTAAGGTTTCTTTATTCATTCCTTTTTCCTTTTA
TTTGAATGAATAAGGGAACTTCTCATGATATTCGCTTTAGACATATATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H060TF U 1
AF RR4H060JQ C 37
BS 1 343 RR4H060TF
BS 344 591 RR4H060JQ

RD RR4H060TF 343 0 0
GGCGGAACTGGGGGCTTTTCCGGTCTGATTTCTCTCCGGTTTACGACGTTGGTCTCCTCC
GAGGTGGGGGCCTTGGACGTCCAGCACCAGCATTGCCAGGGCCTAGTACTGCTGGTGGTA
AATGGTGTGTGGCAAATTCAGGCGCCACTAATGCGCAGTTGCAAGCGAATATTGATTGGG
TTTGTAGTCAGGGAGGCGTTGACTGTAAACCGATCCAAGCTGGTGGCTCGTGCTTTAATC
CTAACAGTTTAAGGATGCATGCTTCTTTTGTGATGAACGCTTATTTCCAGAAAAACGGTC
GCAGTGACGGTTCGTGTCATTTCAGTGGGACCGGTGTCGTTGT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4H060JQ 555 0 0
CGGTTTACGACGTTGGTCTCCTCCGAGGTGGGGGCCTTGGACGTCCAGCACCAGCATTGC
CAGGGCCTAGTACTGCTGGTGGTAAATGGTGTGTGGCAAATTCAGGCGCCACTAATGCGC
AGTTGCAAGCGAATATTGATTGGGTTTGTAGTCAGGGAGGCGTTGACTGTAAACCGATCC
AAGCTGGTGGCTCGTGCTTTAATCCTAGCAGTTTAAGGATGCATGCTTCTTTTGTGATGA
ACGCTTATTTCCAGAAAAACGGTCGCAGTGACGGTTCGTGTCATTTCAGTGGGACCGGTG
TCGTTGTAACGAGCAACCCAAGCAATGGTGCGTGTAAGTTTTAAGTGACGCGTTTTAACT
GATTTGTTCTGTGTAGCATTTGTTTTGAAAGACCTAACATAACGGTTTTAAGGGACTGTC
ATGGATTGGAGAGATCATCAGCTTTGTGTTTAGTTTCGGATGTTTTAATGTTAAGGTTTC
TTTATTCATTCCTTTTTCCTTTTATTTGAATGAATAAGGGAACTTCTCATGATATTCGCT
TTAGACATATATGTG

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL6747Contig1 1032 2 2 U
GGGACATGACACAACTATCTCTTGTCTCCTCCTCTTGCCGTCTCTTCGTCAGCCTCGTTT
CAATCTTCTTCAGTCTCTTCATTGGGTATCTGAAACAAGTCCTCGATAACTGAACAACGC
CACCGCCACGCCTGAAATTCAAAATTTTCTTTGTTTTTTTTGTCCTGCCTCCATATTTTG
ATATGTTGTGTGTGAGAGCTTATCTATTAAACAAAAGCAAAGCATTCTCATGTTTTTTCG
TCTAATTGTCTCATTTCAGCATTGGATCTCTTCCTTTGTTATCTAGTTGGTTATATTTTG
AAAGCTCCTTCTCCTTACGTGATAGCAATTGTTAAAATTTATTGTAATTTATAAGCTTAC
ATATCACATTTTGTTCATAACATGAGGATTCTCTTTTAATTTCTAAAATAAGTAATGCTT
ACAATCAAACCCTAACTTGATGCAAAAGGTTTTAGAAGATCAAGGGACCTGACCTGAGGA
AACAATGATGTTTGGAAATTTTCAGCTGACTGGCTACTGAGTCTTATAAAGGAGGTTATG
ATGTCTAAAGTAGAGGCTAATAACAAACCAGCAAAGATTAGCTAGTGGCTCCACTGGAAA
ATACGGAATCCCTTCAAGCAATGGTGTCTATGAGCTTCTAGAATGTCTGGGCCCTAACGG
TCACACAATATTGTGTTCAAGCCGCAACACTGTGAGTGCACAACACATGCCCTACGTGCC
GCTACGAACTTGGCAACATAAGATGCTTGTGTTATTCTTGTGTTGCGAGTCACAGGAAGG
GTTTGCGAAGAGGAATAGCTGATGATGATGAAAGATGATGATTCATGATGCTAAAGCACC
AAGCTCTCTGATGATGATTTTGATTGAGAGCTTCTCTGTAATGTTAAACTCTTGTCGTGT
ATTTTTTTCCTGATTTGTTGGAAAATTAAATACAAGCTTTATTTTTGGTTCTGTTCTTGT
TATGAAAATTTGTTTTCATCTGTCAAGAAGTCATTTAGCGTACCAAAATGATATAAGATT
ATGAGTTCCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT58TF U 1
AF RR4AT58JQ C 475
BS 1 778 RR4AT58TF
BS 779 1032 RR4AT58JQ

RD RR4AT58TF 778 0 0
GGGACATGACACAACTATCTCTTGTCTCCTCCTCTTGCCGTCTCTTCGTCAGCCTCGTTT
CAATCTTCTTCAGTCTCTTCATTGGGTATCTGAAACAAGTCCTCGATAACTGAACAACGC
CACCGCCACGCCTGAAATTCAAAATTTTCTTTGTTTTTTTTGTCCTGCCTCCATATTTTG
ATATGTTGTGTGTGAGAGCTTATCTATTAAACAAAAGCAAAGCATTCTCATGTTTTTTCG
TCTAATTGTCTCATTTCAGCATTGGATCTCTTCCTTTGTTATCTAGTTGGTTATATTTTG
AAAGCTCCTTCTCCTTACGTGATAGCAATTGTTAAAATTTATTGTAATTTATAAGCTTAC
ATATCACATTTTGTTCATAACATGAGGATTCTCTTTTAATTTCTAAAATAAGTAATGCTT
ACAATCAAACCCTAACTTGATGCAAAAGGTTTTAGAAGATCAAGGGACCTGACCTGAGGA
AACAATGATGTTTGGAAATTTTCAGCTGACTGGCTACTGAGTCTTATAAAGGAGGTTATG
ATGTCTAAAGTAGAGGCTAATAACAAACCAGCAAAGATTAGCTAGTGGCTCCACTGGAAA
ATACGGAATCCCTTCAAGCAATGGTGTCTATGAGCTTCTAGAATGTCTGGGCCCTAACGG
TCACACAATATTGTGTTCAAGCCGCAACACTGTGAGTGCACAACACATGCCCTACGTGCC
GCTACGAACTTGGCAACATAAGATGCTTGTGTTATTCTTGTGTTGCGAGTCACAGGAA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4AT58JQ 558 0 0
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GTTATGATGTCTAAAGTAGAGGCTAATAACAAACCAGCAAAGATTAGCTAGTGGCTCCAC
TGGAAAATACGGAATCCCTTCAAGCAATGGTGTCTATGAGCTTCTAGAATGTCTGGGCCC
TAACGGTCACACAATATTGTGTTCAAGCCGCAACACTGTGAGTGCACAACACATGCCCTA
CGTGCCGCTACGAACTTGGCAACATAAGATGCTTGTGTTATTCTTGTGTTGCGAGTCACA
GGAAGGGTTTGCGAAGAGGAATAGCTGATGATGATGAAAGATGATGATTCATGATGCTAA
AGCACCAAGCTCTCTGATGATGATTTTGATTGAGAGCTTCTCTGTAATGTTAAACTCTTG
TCGTGTATTTTTTTCCTGATTTGTTGGAAAATTAAATACAAGCTTTATTTTTGGTTCTGT
TCTTGTTATGAAAATTTGTTTTCATCTGTCAAGAAGTCATTTAGCGTACCAAAATGATAT
AAGATTATGAGTTCCAAC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL6748Contig1 788 2 2 U
TAGAGAGTATGCCTGCCTCTAGGATCGGATTCATAATTGCAGCTTTCCGTGGACAGGTTG
CCACTCTTTCTACTCATCCTTATGGATGCCGAGTCATCCATAGAATCTTGGAGCATTGCT
CAGATGATGAGGAGACTCGTTGTATAATCGATGAAATCTTGGAGTCGGCTTTTGCCCTTG
CTCATGATCAGTATGGGAATTATGTCACTCAGCATGTCCTGGAGAGAGGGAAGCCTGACG
AAAGGAGACAGATCATTGAGAAGTTGACAGGGAATGTTGTTCAGATGAGTCAGCACAAAT
ACGCGTCAAACGTTGTGGAGAAGTGTCTGGAACATGCTGATAGTACCGAGAGAGAGTTGC
TGATTGAAGAGATAATGGGAAAATCCGAGGAAGACAATCACTTGCTGGCGATGATGAAAG
ATCAGTATGCAAATTATGTGGTCCAGAAAGTCTTGGAGATCAGTAAAGATGAGCAAAGGG
AGATTCTGGTGCAGAGAATGAAAATTCATCTCGAGAGTCTGAGGAAGTACACATATGGGA
AACACATAGTAGCCCGCTTCGAACAACTGTTTGGTGAAGAGAGTGAAGCTTCAGAAGGAG
GAACAGAAGGTTAGACAGGAGGTTTCATTTGGGTTTGCAGATTTGGACAATGTTGGGAGT
TGTTAGAAGAATAAATATGTATTTGGGAAATGCTTATGTGTATATATGTGCTTGTAACTA
TGAATGAAAGTGTGATGGTTTGTGTATATTATGTGTGGACATAATTTGTGATTAAAGTTG
ATTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK06TF U 1
AF RR4CK06JQ C 84
BS 1 390 RR4CK06TF
BS 391 788 RR4CK06JQ

RD RR4CK06TF 390 0 0
TAGAGAGTATGCCTGCCTCTAGGATCGGATTCATAATTGCAGCTTTCCGTGGACAGGTTG
CCACTCTTTCTACTCATCCTTATGGATGCCGAGTCATCCATAGAATCTTGGAGCATTGCT
CAGATGATGAGGAGACTCGTTGTATAATCGATGAAATCTTGGAGTCGGCTTTTGCCCTTG
CTCATGATCAGTATGGGAATTATGTCACTCAGCATGTCCTGGAGAGAGGGAAGCCTGACG
AAAGGAGACAGATCATTGAGAAGTTGACAGGGAATGTTGTTCAGATGAGTCAGCACAAAT
ACGCGTCAAACGTTGTGGAGAAGTGTCTGGAACATGCTGATAGTACCGAGAGAGAGTTGC
TGATTGAAGAGATAATGGGAAAATCCGAGG

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4CK06JQ 705 0 0
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ATAATCGATGAAATCTTGGAGTCGGCTTTTGCCCTTGCTCATGATCAGTATGGGAATTAT
GTCACTCAGCATGTCCTGGAGAGAGGGAAGCCTGACGAAAGGAGACAGATCATTGAGAAG
TTGACAGGGAATGTTGTTCAGATGAGTCAGCACAAATACGCGTCAAACGTTGTGGAGAAG
TGTTTGGAACATGCTGATAGTACCGAGAGAGAGTTGCTGATTGAAGAGATAATGGGAAAA
TCCGAGGAAGACAATCACTTGCTGGCGATGATGAAAGATCAGTATGCAAATTATGTGGTC
CAGAAAGTCTTGGAGATCAGTAAAGATGAGCAAAGGGAGATTCTGGTGCAGAGAATGAAA
ATTCATCTCGAGAGTCTGAGGAAGTACACATATGGGAAACACATAGTAGCCCGCTTCGAA
CAACTGTTTGGTGAAGAGAGTGAAGCTTCAGAAGGAGGAACAGAAGGTTAGACAGGAGGT
TTCATTTGGGTTTGCAGATTTGGACAATGTTGGGAGTTGTTAGAAGAATAAATATGTATT
TGGGAAATGCTTATGTGTATATATGTGCTTGTAACTATGAATGAAAGTGTGATGGTTTGT
GTATATTATGTGTGGACATAATTTGTGATTAAAGTTGATTTGCCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6749Contig1 803 2 4 U
GGAGACTCGATCTACGTGAAGTTTCATGACGAGGAGTGGGGTGCTCCAGTTCGTGACGAC
AAGAGACTCTTTGAGCTGCTTGTGTTCTCACAAGCATTGGCTGAGTTTAGCTGGCCTTCA
ATTCTATACAAACGAGAGGCCTTTAGGGAGCTATTTGAAGATTTTGATCCTTTAGCTGTA
TCAGAATTCACAGAGAAGAAGTTGATGTCTCTTAAAGTAAACGGATGCCTTGTTCTGTCC
GAACAGAAACTGCGAGCCATTGTTGATAACGCAAAATCAGTTCTCAAGGTCAAGCAAGAG
TTTGGATCATTCAGCAACTACTGTTGGAGATTTGTGAACCTCAAGCCACTAAGAAACGGA
TACCGCTATGGCCGTCAAGTACCCGTTAAGTCGCCAAAGGCGGAGTACATAAGCAAAGAC
ATGATGCAGAGAGGGTTCCGCTGCGTTGGCCCTACAGTTATTTATTCCTTCTTGCAGGTC
TCTGGCATTGTGAATGATCATCTCACAACTTGCTTCAGATACCAAGAATGTAATGCTGAG
ACTGATAAAGAACCCAAGACCGAACTGGATCTGCTTTCCATTGTTTAATCAGCAACATGA
ACTATGGGAGTATTAAGAAGATGATGATGATGACCAGAGTTTGTTTGTAATTCGTTATGA
AATTGTAGCATTTGTGGCTAATTGTGTTTTTTTTTTTCTTCTTCTAGCTAGCTTTGTCTA
ACTAGATATTTGATATGATGTGTTAGTTTTTTGACAAAAAAAGATATTGGATCGCAAGGA
AATAAAGAATTTTATCATTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G555TF U 1
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DS 

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QA 1 777 1 777
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6751Contig1 1247 2 8 U
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BQ
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AF RR4CH91TF U 1
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TCAGAACAATCCTCGAAGTCAGGAGTTGGTAATGGAAGCCAATGGGTTGGAGTTACTGCT
ATCGAACTTCACATCCGACGCAGATGTTCATGCTAGAACTCAAGCTCTCGGGGCAATATC
ATCTTTGATTCGCCATAACAAAGCTGGAGTCACTGCTTTCAAGCTTGCCAATGGTTATGC
TGGTTTAAGAGATGCTTTGGCATCTGATAGTGTGAGGTTTCAGAGGAA*GCATTAAACGT
GTTGCAGTATCTTCTGCAAGA*GATGAT*CAGACCGCAGTGTAGCCACTGAACTTGGATT
T
CAGAGTGCT

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4CH91JQ 751 0 0
AGTCAGGAGTTGGTAATGGAAGCCAATGGGTTGGAGTTACTGCTATCGAACTTCACATCC
GACGCAGATGTTCATGCTAGAACTCAAGCTCTCGGGGCAATATCATCTTTGATTCGCCAT
AACAAAGCTGGAGTCACTGCTTTCAAGCTTGCCAATGGTTATGCTGGTTTAAGAGATGCT
TTGGCATCTGATAGTGTGAGGTTTCAGAGGAAAGCATTAAACGTGTTGCAGTATCTTCTG
CAAGAAGATGATTCAGACCGCAGTGTAGCCACTGAACTTGGATTTTCCAGAGTGCTGATT
CATCTCGCGTCTAGTGACGATGCTGAGACGAGAGAAGCTGCTCTTTGCGGATTGCTCGAG
CTTGCAAGAGAGAAAAACGATGGAAATGGATGTAGTAGCAGCATAGCGAAAGTCGATGAG
AAACTGAGACAGCTACTAGAAGAGCGGGTTGAAGGAATCAGCTTGATGTCACAGGAGGAT
CTTGAAACGGTTAAAGAAGAGAGACGGCTTGTGGATGCACTGTGGAGGTTTTGCTACGAT
GAACCTTCTTCGTTGGGAGAGAAAGGGCTTCTTGTTCTTCCCGGTGAAGATGCGTTGGCT
CCTGATGTCGCAAGCAAGCTCTTCGAGCCTCTTCTCAGAGCTTCTGCAGCTTAACCTTGT
GCTTTTGTTTGTCTTGTAACATTTTAATTTTTCAGACAAAAAGACTGATAGATTTCAATA
TGAAGAATCTAGTGTTTATGTAATGGCAATT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL6752Contig1 895 2 2 U
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TAATAACAGTGTTGCTTCCTCTCCAAGAAACGGGTCATGGCAGAACAGAGTTAATTCTCT
GTCTCCACCCGCTCTTCAGCTCAATGGTGGAAGTAGATTGAAGTCTACACTGAGTGCTAG
AGATCTTGATATCGATATGGAGATGGAGCTGAGACTTAGAGGTTTCAACAATGTAGAAGA
GAGTTTTGGGTCTTATGTCTCCTCCCCAAGTAGGAACTCTCAGATGGGTCAGAACATGAA
CCAGCATTATCCTTCTTCCCCGGTGAGGCAACAGCCTCCTCCTCACCACTTTGACTCTTC
AGCGGCTGTGGCAGCTGCAGTGATGAACGCAAGATCATCTGCGTTTGCTAAACGCAGCTT
GAGTTTCAAGCCTCAAGTAGCATCATCACCATCGAATCTTTCCGATTGGGGATCACCTAG
TGGGAAGCTGGACTGGGGAGTGCAAGGAGATGAGCTGAGTAAGATGAGAAGAAGTGTTTC
ATTTGGAATCCGTGGAGACAACAACAGTAACAATGCAGGGAGAGATTATAGGAACGAGCC
AGATGTTTCGTGGGTTAACTCTTTGGTTAAAGACAGTGTTGTGTCTGAGAGAGGCTTTGG
GATGAATGAGAGGGTGAGGATAATGTCTTGGGCTGAGCAGATGTACAGAGAGAAGGAGCA
GACTGTTGTGTAAACACACACACACAGAAACTTTTTTATTCTTTAATCTTTTGTTACTTT
TTTTAATTGTTTCTGTTAGTATATGATTTGTAGTCACTATGAGAAAGATAACTGGACTAA
TAGCTTATTAGTCTCTATATTGGTCATTTTTTCTTGTAATTCCGAACTATGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F091TF U 1
AF RR4F091JQ C 379
BS 1 685 RR4F091TF
BS 686 895 RR4F091JQ

RD RR4F091TF 685 0 0
GGTTTTGTCTCCGCTTGCGTACTCTTCAGGTGTTTCGACACGTCCCGTCTCTCCGATGGG
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GTCTCCACCCGCTCTTCAGCTCAATGGTGGAAGTAGATTGAAGTCTACACTGAGTGCTAG
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GAGTTTTGGGTCTTATGTCTCCTCCCCAAGTAGGAACTCTCAGATGGGTCAGAACATGAA
CCAGCATTATCCTTCTTCCCCGGTGAGGCAACAGCCTCCTCCTCACCACTTTGACTCTTC
AGCGGCTGTGGCAGCTGCAGTGATGAACGCAAGATCATCTGCGTTTGCTAAACGCAGCTT
GAGTTTCAAGCCTCAAGTAGCATCATCACCATCGAATCTTTCCGATTGGGGATCACCTAG
TGGGAAGCTGGACTGGGGAGTGCAAGGAGATGAGCTGAGTAAGATGAGAAGAAGTGTTTC
ATTTGGAATCCGTGGAGACAACAACAGTAACAATGCAGGGAGAGATTATAGGAACGAGCC
AGATGTTTCGTGGGTTAACTCTTTGGTTAAAGACAGTGTTGTGTCTGAGAGAGGCTTTGG
GATGAATGAGAGGGTGAGGATAATG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4F091JQ 517 0 0
AGTGATGAACGCAAGATCATCTGCGTTTGCTAAACGCAGCTTGAGTTTCAAGCCTCAAGT
AGCATCATCACCATCGAATCTTTCCGATTGGGGATCACCTAGTGGGAAGCTGGACTGGGG
AGTGCAAGGAGATGAGCTGAGTAAGATGAGAAGAAGTGTTTCATTTGGAATCCGTGGAGA
CAACAACAGTAACAATGCAGGGAGAGATTATAGGAACGAGCCAGATGTTTCGTGGGTTAA
CTCTTTGGTTAAAGACAGTGTTGTGTCTGAGAGAGGCTTTGGGATGAATGAGAGGGTGAG
GATAATGTCTTGGGCTGAGCAGATGTACAGAGAGAAGGAGCAGACTGTTGTGTAAACACA
CACACACAGAAACTTTTTTATTCTTTAATCTTTTGTTACTTTTTTTAATTGTTTCTGTTA
GTATATGATTTGTAGTCACTATGAGAAAGATAACTGGACTAATAGCTTATTAGTCTCTAT
ATTGGTCATTTTTTCTTGTAATTCCGAACTATGAAAT

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL6753Contig1 307 2 1 U
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TGGAGAAGGAGCGGCCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATG
TTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGA
TGAAGAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EJ91JQ C 1
AF RR4EJ91TF U 1
BS 1 307 RR4EJ91TF

RD RR4EJ91JQ 307 0 0
GGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAGAACCAAAT
AAACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAAGTAGAGGCAGT
TTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGG
TGGAGAAGGAGCGGCCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATG
TTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGA
TGAAGAG

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR4EJ91TF 307 0 0
GGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAGAACCAAAT
AAACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAAGTAGAGGCAGT
TTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGG
TGGAGAAGGAGCGGCCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATG
TTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGA
TGAAGAG

QA 1 307 1 307
DS 



AS 1 2

CO CL6754Contig1 969 2 2 U
AGGGATGGTGGAGTATGAGAGCTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGCGACACAACGT
GGGAACACTAGCTCGAAGCGCGACGGCGTTCGGCGTGACGGAGCTGATACTCGTGGGCCG
CCGTGACTTCAACACCTTCGGAAGCCATGGTTCCGCTTCTCACGTCCGTTTCCGACACTT
TCACTCTTTAATCGAAGCTCGCGACTACCTCAAGGAGGAGAAAGAATGCGATATATGCGG
CGTTGAGATCGCAGATGGAGCTGCTCAGGTCAATGAACATCCTTTCAAAAGAAACACTGC
TTTTCTTCTGGGTAATGAGGGATCAGGGTTATCTGCCAAAGAGTATGAGATATGTGACTT
CTTTGTTTACATTCCTCAGTATGGCTGTGGCACTGCCTCTCTCAATGTTACTGTTGCAGC
TTCTATTGTCTTGCATCATTTTGGAGTTTGGGCGGGATTTTCTGAACGTGTCCGAGATGG
AAGCAAATTCATAGTGGCTGATAAACCAGCTAGGCAAGGAAGACGGAATTTCAGTGCTGG
TACAGAAGAATCCATCGTTGAAGAGCGGAAGCTGAGGAAAGAAAGTGCTGAAAAGGGCTT
CTTTGATGAAAACGGAAACGAAAGTTCATCCACCGAGCTTCTCAACGGTTTGTTCCTTAA
CGAATAGTTGTCTTTAAATTAAGGAACAAAGTCTTGGTTTTGGGGTTTTAAATTCTGGGG
CAACATCAAAAACATTCCCTTCCGTATTTTTTTTTTTTATCAAGCAGAGTCAGGTCCTTC
CTTAGTTACGAAAGCCTCTTCTAATATTTGTTTTGCAAGTAGAGATAGCATGATGTTTTA
AGGTGATAACAGTATCTCTCTGCTCTTGTGTTGTATTAGTATGGACATGTTTTGAAGATG
TTTTCAGTTGGTAGTAGTGTCTCTTTGCTCTTTTGTCTTTACATTAATCTTACTTAACAC
ATTTCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET92TF U 1
AF RR4ET92JQ C 286
BS 1 591 RR4ET92TF
BS 592 969 RR4ET92JQ

RD RR4ET92TF 591 0 0
AGGGATGGTGGAGTATGAGAGCTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGCGACACAACGT
GGGAACACTAGCTCGAAGCGCGACGGCGTTCGGCGTGACGGAGCTGATACTCGTGGGCCG
CCGTGACTTCAACACCTTCGGAAGCCATGGTTCCGCTTCTCACGTCCGTTTCCGACACTT
TCACTCTTTAATCGAAGCTCGCGACTACCTCAAGGAGGAGAAAGAATGCGATATATGCGG
CGTTGAGATCGCAGATGGAGCTGCTCAGGTCAATGAACATCCTTTCAAAAGAAACACTGC
TTTTCTTCTGGGTAATGAGGGATCAGGGTTATCTGCCAAAGAGTATGAGATATGTGACTT
CTTTGTTTACATTCCTCAGTATGGCTGTGGCACTGCCTCTCTCAATGTTACTGTTGCAGC
TTCTATTGTCTTGCATCATTTTGGAGTTTGGGCGGGATTTTCTGAACGTGTCCGAGATGG
AAGCAAATTCATAGTGGCTGATAAACCAGCTAGGCAAGGAAGACGGAATTTCAGTGCTGG
TACAGAAGAATCCATCGTTGAAGAGCGGAAGCTGAGGAAAGAAAGTGCTGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4ET92JQ 684 0 0
CAAAAGAAACACTGCTTTTCTTCTGGGTAATGAGGGATCAGGGTTATCTGCCAAAGAGTA
TGAGATATGTGACTTCTTTGTTTACATTCCTCAGTATGGCTGTGGCACTGCCTCTCTCAA
TGTTACTGTTGCAGCTTCTATTGTCTTGCATCATTTTGGAGTTTGGGCGGGATTTTCTGA
ACGTGTCCGAGATGGAAGCAAATTCATAGTGGCTGATAAACCAGCTAGGCAAGGAAGACG
GAATTTCAGTGCTGGTACAGAAGAATCCATCGTTGAAGAGCGGAAGCTGAGGAAAGAAAG
TGCTGAAAAGGGCTTCTTTGATGAAAACGGAAACGAAAGTTCATCCACCGAGCTTCTCAA
CGGTTTGTTCCTTAACGAATAGTTGTCTTTAAATTAAGGAACAAAGTCTTGGTTTTGGGG
TTTTAAATTCTGGGGCAACATCAAAAACATTCCCTTCCGTATTTTTTTTTTTTATCAAGC
AGAGTCAGGTCCTTCCTTAGTTACGAAAGCCTCTTCTAATATTTGTTTTGCAAGTAGAGA
TAGCATGATGTTTTAAGGTGATAACAGTATCTCTCTGCTCTTGTGTTGTATTAGTATGGA
CATGTTTTGAAGATGTTTTCAGTTGGTAGTAGTGTCTCTTTGCTCTTTTGTCTTTACATT
AATCTTACTTAACACATTTCCACC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6755Contig1 1010 2 2 U
GGATAGACAGAGCGCGTATACAAGTCTCCCGCTCTCTCTCTCCGGCAACCCGTCACAAAA
GTTTCAGTCTTTTTTTATCCGGTACGGTCTGGAATTAGGACGAAACCCTAACTGTTTCGA
GAGATTGCGATTTTAAAACATTGAGCAAGCAAATGAAAGGGATAGGGAGGATTGTGAACT
CTCTCTCCGAATCCTTCTTCTCTCATGTTCTATCCTGGAAAGCCAGTCATGGAGGTTGGA
AGTGCTGATTTTCCTAACGTTCGTTCAGCTTTAAATTCTCCATTAGCCAAGTCCATTTAC
TCCATCGATGGTGTGGTTCGAGTTTTCTTTGGGTCTGATTTTGTCACTGTCACCAAGTCA
GATGATTTATCATGGGATATACTCAAGCCTGAGATATTTGCAGCTGTCATGGATTTCTAC
TCTTCTGGTCAGCCTCTGTTTCTCGACTCGCAAGCTGCTGCTGCCAAGGATACTGCTATT
AACGAGGATGACACTGAAACCGTGGCAATGATCAAGGAACTTTTGGAAACACGCATCAGA
CCAGCAGTCCAAGATGATGGTGGGGACATTGAGTATTGTGGGTTTGATCCTGAAAGCGGA
ATAGTGAAGCTGAGGATGCAAGGAGCTTGTAGCGATTGTCCAAGCTCATCTCTTACATTA
AAATCTGGAATAGAAAACATGCTCATGCATTATGTACCCGAGGTGAAAGGTGTAGAACAA
GAGTTCGATGGGGAAGAAGAGGAGGGAACGTTGTCTGGAGAGGTGAGAGAGTAGAGTAAG
ACGTCTCCTCAAGCTTCTCTCTCCTCTTTTCCTCAATTAGTGTACAGAAGAATAAATTCC
AGTGAGTGAGTGAGTGAGTGCACTCTTTTCTGTCACTCTTTGAGTTGATTTGTTGGTGTT
TTGGGGCTTTTGAATTACAGTCAAGAATGTTCTGAGAGATCAATAGTTGATCTGGTTTGT
AACATTTGTTAACCTACATGAATAAGTTTTTTGAATGGTTTCTTGCAAGC


BQ
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AF RR4F543TF U 1
AF RR4F543JQ C 460
BS 1 614 RR4F543TF
BS 615 1010 RR4F543JQ

RD RR4F543TF 617 0 0
GGATAGACAGAGCGCGTATACAAGTCTCCCGCTCTCTCTCTCCGGCAACCCGTCACAAAA
GTTTCAGTCTTTTTTTATCCGGTACGGTCTGGAATTAGGACGAAACCCTAACTGTTTCGA
GAGATTGCGATTTTAAAACATTGAGCAAGCAAATGAAAGGGATAGGGAGGATTGTGAACT
CTCTCTCCGAATCCTTCTTCTCTCATGTTCTATCCTGGAAAGCCAGTCATGGAGGTTGGA
AGTGCTGATTTTCCTAACGTTCGTTCAGCTTTAAATTCTCCATTAGCCAAGTCCATTTAC
TCCATCGATGGTGTGGTTCGAGTTTTCTTTGGGTCTGATTTTGTCACTGTCACCAAGTCA
GATGATTTATCATGGGATATACTCAAGCCTGAGATATTTGCAGCTGTCATGGATTTCTAC
TCTTCTGGTCAGCCTCTGTTTCTCGACTCGCAAGCTGCTGCTGCCAAGGATACTGCTATT
AACGAGGATGACACTGAAACCGTGGCAATGATCAAGGAACTTTTGGAAACACGCATCAGA
CCAGCAGTCCAAGATGATGGTGGGGACATTGAGTATTGTGGGTTTGATCCTGAAAGCGGA
ATAGTGAAGCTGAG
ATG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4F543JQ 551 0 0
GCTGCCAAGGATACTGCTATTAACGAGGATGACACTGAAACCGTGGCAATGATCAAGGAA
CTTTTGGAAACACGCATCAGACCAGCAGTCCAAGATGATGGTGGGGACATTGAGTATTGT
GGGTTTGATCCTGAAAGCGGAATAGTGAAGCTGAGGATGCAAGGAGCTTGTAGCGATTGT
CCAAGCTCATCTCTTACATTAAAATCTGGAATAGAAAACATGCTCATGCATTATGTACCC
GAGGTGAAAGGTGTAGAACAAGAGTTCGATGGGGAAGAAGAGGAGGGAACGTTGTCTGGA
GAGGTGAGAGAGTAGAGTAAGACGTCTCCTCAAGCTTCTCTCTCCTCTTTTCCTCAATTA
GTGTACAGAAGAATAAATTCCAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGCACTCTTTTCTGTCACTCT
TTGAGTTGATTTGTTGGTGTTTTGGGGCTTTTGAATTACAGTCAAGAATGTTCTGAGAGA
TCAATAGTTGATCTGGTTTGTAACATTTGTTAACCTACATGAATAAGTTTTTTGAATGGT
TTCTTGCAAGC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL6756Contig1 1328 2 2 U
GGGAGAGCTACATGGAATTGGAGTAAACAAAAAAAAAAAAGCTTTGAGATTTCTTTCCTC
TTTATCAGCGAAGAATCGTTCGTTTGTTTCCTTCCTTCCTTGTTGTTCTGGAATCTGAGT
TTTTGTTTTCGGAGTCTTCGAGGTTTCTTCCTCATTCGTTTGCTGCTTCCCATCGAAACT
CTCTTCTGGTGGAATCTGAGTTCTAGTTTTGCGGTTTTTTCTGCTGGGATTTGAGCAGAA
AGCCAAGTTTGATGTTTTGTTGAAGTATCCACGAGTTTTATTCTGTTGGAAGCTCCTCTT
TGTGTGATTGAAACGGAGAGAGAGAGAATGATTTTACCAAAGCAGTATCGCTGCACACAC
TCCCCGACCTGCCAGTGCACGAGAGGCCATCTAAGCGAAGACGTGCTGTTACTAGTCTTC
CAGCATTTGAACTGGAACCCTAAACTAGTCGCAACACTCTCCTGCGTGTGCAAATGGTTC
GACGATTTCGCCAAACGTGTCCTATGGAAAGAGTTCTGCAAGACTCGCGCGCCAAGCTTC
TCATCTACTGCTCAGGATGCACACAAGGCGGTCTTTTCAACAGCACCGTTCAAATCCCTG
GCCACTTCGTTTACAGAACAAGATTCTCGAGAACATTAGGGAGAAGCCTACCGCCGCCTC
AGTGTAGAACTGGTGTTCTCTACGTTAGTGATCCGTGCGAGCATCTTGATCAAGGAGAAG
AAGGAGACGTGGGTTTGTTCCGTGGGATTTTCAAGTCGTTCCCAACGTCTAGAGTCAGGA
AAGTTATCATTAACAAGGCGGTTCCGTTTCATCCCTTTGAGGTTTGTCCGTACTGCAAAG
CTAAACTGTGGAGCATGCTCCAAGCTAAGATCATACCCCAGAGTGCTTGCGTTCGTTTGG
AAGCTTATGAGGACTGCATTGAGTATTTCGTTTGCCTTAATGGGCATTTGGTTGGTATTT
GCACTCTGGCTCCTTTGTCTGATTTTGAGGAGGCGGTTCCAAGTGAAGATAGCAATCACA
CAGAGAAGAAACAAGACAATTGCTTGGGTAAAGAGAATGGATTGAAAAGGAGACATTCTT
TATTGGGTGGAAGTGAGAATGGTGGACCTTCTCCTCAAAAACGGCTGACCATTTCGAATC
AATGTGACATTGATGTGTGAAAAACCGTCTGTAAATTTGTTGTTGTTTTGTGTGATTCTT
ACTAACTATATTTGCATCCTCAGAGATTCATTCATTTACAGTCAGGTTATGATCAACGGT
TACCATAATCTCTGGTTATGATTTTTTTTAACTCGCATTGAGATGAATGTTATCATTGTG
TTCTGTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB45TF U 1
AF RR4FB45JQ C 616
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BS 715 1328 RR4FB45JQ

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TTTTGTTTTCGGAGTCTTCGAGGTTTCTTCCTCATTCGTTTGCTGCTTCCCATCGAAACT
CTCTTCTGGTGGAATCTGAGTTCTAGTTTTGCGGTTTTTTCTGCTGGGATTTGAGCAGAA
AGCCAAGTTTGATGTTTTGTTGAAGTATCCACGAGTTTTATTCTGTTGGAAGCTCCTCTT
TGTGTGATTGAAACGGAGAGAGAGAGAATGATTTTACCAAAGCAGTATCGCTGCACACAC
TCCCCGACCTGCCAGTGCACGAGAGGCCATCTAAGCGAAGACGTGCTGTTACTAGTCTTC
CAGCATTTGAACTGGAACCCTAAACTAGTCGCAACACTCTCCTGCGTGTGCAAATGGTTC
GACGATTTCGCCAAACGTGTCCTATGGAAAGAGTTCTGCAAGACTCGCGCGCCAAGCTTC
TCATCTACTGCTCAGGATGCACACAAGGCGGTCTTTTCAACAGCACCGTTCAAATCCCTG
GCCACTTCGTTTACAGAACAAGATTCTCGAGAACATTAGGGAGAAGCCTACCGCCGCCTC
AGTGTAGAACTGGTGTTCTCTACGTTAGTGATCCGTGCGAGCATCTTGATCAAG
AG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4FB45JQ 713 0 0
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TTCTCTACGTTAGTGATCCGTGCGAGCATCTTGATCAAGGAGAAGAAGGAGACGTGGGTT
TGTTCCGTGGGATTTTCAAGTCGTTCCCAACGTCTAGAGTCAGGAAAGTTATCATTAACA
AGGCGGTTCCGTTTCATCCCTTTGAGGTTTGTCCGTACTGCAAAGCTAAACTGTGGAGCA
TGCTCCAAGCTAAGATCATACCCCAGAGTGCTTGCGTTCGTTTGGAAGCTTATGAGGACT
GCATTGAGTATTTCGTTTGCCTTAATGGGCATTTGGTTGGTATTTGCACTCTGGCTCCTT
TGTCTGATTTTGAGGAGGCGGTTCCAAGTGAAGATAGCAATCACACAGAGAAGAAACAAG
ACAATTGCTTGGGTAAAGAGAATGGATTGAAAAGGAGACATTCTTTATTGGGTGGAAGTG
AGAATGGTGGACCTTCTCCTCAAAAACGGCTGACCATTTCGAATCAATGTGACATTGATG
TGTGAAAAACCGTCTGTAAATTTGTTGTTGTTTTGTGTGATTCTTACTAACTATATTTGC
ATCCTCAGAGATTCATTCATTTACAGTCAGGTTATGATCAACGGTTACCATAATCTCTGG
TTATGATTTTTTTTAACTCGCATTGAGATGAATGTTATCATTGTGTTCTGTCG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTCCCCTCTCCTCCTCAATTCATAAAAAACCCAAAAAAGAAGAAATCTCTCTGCTTCGTT
CTCTTTATCTGCTCCGCATCAGTTGTTTCTCTCCGATTGCTTTGTTCTATCTTGATTGCT
CTGTAATAAACGAGAGGGGAGAGAAGAGTACAAATTAAAAAACCCCAAAAAAGAAGAAAA
AGTTTC


BQ
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AF RR4CB54JQ C 1
AF RR4CB54TF U 1
BS 1 306 RR4CB54TF

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GACATCGCACGCGCCGCCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAACTGCTTTTGTTACCCTCTTCGT
CTCCCCTCTCCTCCTCAATTCATAAAAAACCCAAAAAAGAAGAAATCTCTCTGCTTCGTT
CTCTTTATCTGCTCCGCATCAGTTGTTTCTCTCCGATTGCTTTGTTCTATCTTGATTGCT
CTGTAATAAACGAGAGGGGAGAGAAGAGTACAAATTAAAAAACCCCAAAAAAGAAGAAAA
AGTTTC

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR4CB54TF 306 0 0
GGCTCTTTCCTCTTCGCAGTTGTCTTCATTTCCCCAAATCTCTCACACAAAACTATCTTT
GACATCGCACGCGCCGCCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAACTGCTTTTGTTACCCTCTTCGT
CTCCCCTCTCCTCCTCAATTCATAAAAAACCCAAAAAAGAAGAAATCTCTCTGCTTCGTT
CTCTTTATCTGCTCCGCATCAGTTGTTTCTCTCCGATTGCTTTGTTCTATCTTGATTGCT
CTGTAATAAACGAGAGGGGAGAGAAGAGTACAAATTAAAAAACCCCAAAAAAGAAGAAAA
AGTTTC

QA 1 306 1 306
DS 



AS 1 2

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TCCAAATGTTGTCAAGTTTGTGGGAGTGAATACTGGAAACTGTATCATCACGGAGTATTT
AGCTAATGGGTCTTTGAGATCATATCTGCACAAGCTGGAGATAAAGTCCCTTCCTCTGCC
GCAGGTAGTCAAGTTTGGTCTAGACATTGCGAGAGGGATGGAGTATATCCACTCAAAGAA
GATAGTTCACCGGGACCTTAAGCCGGAGAACGTGTTGATTGACAAAGACTTCAACTTGAA
GGTTGCAGACTTTGGCATAGCGTGCGACGAGGAGGACTGTGATGTACCGGGGGCTGAGAC
GGGGACGTATAGGTGGATTGCGCCAGAAGTGCTGAGAAGGAAACCACACGGAGGTAAGTC
GGATGTATATAGTTTCGGACTCGTTTTATGGGAAATGGCAGCTGGAGCAGTCCCATTTGG
GGAGATGTCTCCTGTCCAAGCTGCTTTCAAAGTCATGCACAAGAACACAAGACCGGTGAT
ACCAAAGAAATGTCCAGCGGCGATGAAAGAGCTGATTGAGCAATGCTGGTCGGTGGAAAC
GGAAAAGAGACCAGAGTTCTGGCAGATTGTCAAAGTGTTGGAACACTTTGAAAAGTCACT
GAAAAACGAAGGGAGACTGACTCTTATGCCCAACCAGATATGTCCACAAGCTAAGAAAGG
TGGTAATAAATACTGGAGTCAGATCTTCGGGTTAGTCCACCACCATCACCACCACCACGA
CAGCAATGACAACGATACTGTATGCCCAGCCATGCCTAAGCCTAGATTCTCTTGAAAAGA
CTATTCATTTTGTGCATATATTTAAAAAGAAGGGTTAGTGGTTATGTCTTTTTATTGTTC
ATCCACTGTCTCTCTGTTTTCAATTTGATTTCGTTAGAGGACATACCTGTTACAGAAGCT
TCTTTATTTGTTTGGCTTGGTCATTTTGTGAAGCACTGTCTTCTTGATTTATATACATTT
GTAAGATTGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF91TF U 1
AF RR4DF91JQ C 359
BS 1 653 RR4DF91TF
BS 654 654 RR4DF91JQ
BS 655 666 RR4DF91TF
BS 667 1033 RR4DF91JQ

RD RR4DF91TF 666 0 0
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TCCAAATGTTGTCAAGTTTGTGGGAGTGAATACTGGAAACTGTATCATCACGGAGTATTT
AGCTAATGGGTCTTTGAGATCATATCTGCACAAGCTGGAGATAAAGTCCCTTCCTCTGCC
GCAGGTAGTCAAGTTTGGTCTAGACATTGCGAGAGGGATGGAGTATATCCACTCAAAGAA
GATAGTTCACCGGGACCTTAAGCCGGAGAACGTGTTGATTGACAAAGACTTCAACTTGAA
GGTTGCAGACTTTGGCATAGCGTGCGACGAGGAGGACTGTGATGTACCGGGGGCTGAGAC
GGGGACGTATAGGTGGATTGCGCCAGAAGTGCTGAGAAGGAAACCACACGGAGGTAAGTC
GGATGTATATAGTTTCGGACTCGTTTTATGGGAAATGGCAGCTGGAGCAGTCCCATTTGG
GGAGATGTCTCCTGTCCAAGCTGCTTTCAAAGTCATGCACAAGAACACAAGACCGGTGAT
ACCAAAGAAATGTCCAGCGGCGATGAAAGAGCTGATTGAGCAATGCTGGTCGGTGGAAAC
GGAAAAGAGACCAGAGTTCTGGCAGATTGTCAAAGTGTTGGAACACTTTGAAA*GTCACT
GAAAAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4DF91JQ 675 0 0
ACGGGGACGTATAGGTGGATTGCGCCAGAAGTGCTGAGAAGGAAACCACACGGAGGTAAG
TCGGATGTATATAGTTTCGGACTCGTTTTATGGGAAATGGCAGCTGGAGCAGTCCCATTT
GGGGAGATGTCTCCTGTCCAAGCTGCTTTCAAAGTCATGCACAAGAACACAAGACCGGTG
ATACCAAAGAAATGTCCAGCGGCGATGAAAGAGCTGATTGAGCAATGCTGGTCGGTGGAA
ACGGAAAAGAGACCAGAGTTCTGGCAGATTGTCAAAGTGTTGGAACACTTTGAAAAGTCA
CTGAAAAACGAAGGGAGACTGACTCTTATGCCCAACCAGATATGTCCACAAGCTAAGAAA
GGTGGTAATAAATACTGGAGTCAGATCTTCGGGTTAGTCCACCACCATCACCACCACCAC
GACAGCAATGACAACGATACTGTATGCCCAGCCATGCCTAAGCCTAGATTCTCTTGAAAA
GACTATTCATTTTGTGCATATATTTAAAAAGAAGGGTTAGTGGTTATGTCTTTTTATTGT
TCATCCACTGTCTCTCTGTTTTCAATTTGATTTCGTTAGAGGACATACCTGTTACAGAAG
CTTCTTTATTTGTTTGGCTTGGTCATTTTGTGAAGCACTGTCTTCTTGATTTATATACAT
TTGTAAGATTGTTCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6760Contig1 758 2 4 U
TCCTGTTTAATACAAATAATAATCCCATAAACAACATGAAAACAAATAATATCCTAAGGA
AGATGATACAAATCCAATAAATAAAAAAAGAATCCACTTAAGTTAAGCCTAAGCGTATGA
ACGTAAATATATAAAAATTACAAGAGAAAGCAAAGCATATATGAATCGACAAGTAAGCAG
CTTACTCACTGTGTTTTTGCCTACAAAGCTTAATAAACCCGAGCATTGAATATGGATCTG
AGCGGTGTGTGTAGAATAAATACCCAAGAAAAAGAATGGAGTGTGAGTTGGATTTAGCAT
TTTCAGTTAAGCTCTGTCTTCTGTTGAAGGACCGTAACCGAGAGGATTATTGCTTGCCCA
GTTCCATTGGTCCCTACACATCTCGTCTATTCCATACTTTGGCTTCCAGTTTAGTTCACG
TTCAGCTTTTTCGGTTGATGCGTACACCGTCTCTGCATCACCTGGTCTTCTTCCAACCCT
CACCACTGGGATTTTCATTCCCGAAGCTTTTTCAAATGCATCAACCATCTTTAGTGGTAT
AGTCGGTTCCATAAATCTTGAGGTTAGGAAGCCTGCCAACAACGACTTGCTGGACATAAG
GCATGAGGTTATTAGGAGTGCCACAAGGATCCTCACCAATGCGACCGCTAGGGTGAGCAC
CGACAGGGTTAAAGTATCTGAGCATAATGATTCTCCATTCAGGATCACCACGTTGTACAT
CACGACAAATGTCCTCAATGAAGAGCTTAGTTCTAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FF65JQ U 1
AF RR4DY22JQ U 32
BS 1 90 RR4FF65JQ
BS 91 91 RR4DY22JQ
BS 92 339 RR4FF65JQ
BS 340 758 RR4DY22JQ

RD RR4FF65JQ 339 0 0
TCCTGTTTAATACAAATAATAATCCCATAAACAACATGAAAACAAATAATATCCTAAGGA
AGATGATACAAATCCAATAAATAAAAAAAGGATCCACTTAAGTTAAGCCTAAGCGTATGA
ACGTAAATATATAAAAATTACAAGAGAAAGCAAAGCATATATGAATCGACAAGTAAGCAG
CTTACTCACTGTGTTTTTGCCTACAAAGCTTAATAAACCCGAGCATTGAATATGGATCTG
AGCGGTGTGTGTAGAATAAATACCCAAGAAAAAGAATGGAGTGTGAGTTGGATTTAGCAT
TTTCAGTTAAGCTCTGTCTTCTGTTGAAGGACCGTAACC

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR4DY22JQ 727 0 0
CAACATGAAAACAAATAATATCCTAAGGAAGATGATACAAATCCAATAAATAAAAAAAGA
ATCCACTTAAGTTAAGCCTAAGCGTATGAACGTAAATATATAAAAATTACAAGAGAAAGT
AAAGCATATATGAATCGACAAGTAAGCAGCTTACTCACTGTGTTTTTGCCTACAAAGCTT
AGTAAACCCGAGCATTGAATATGGATCTGAGCGGTGTGTGTAGAATAAATACCCAAGAAA
AAGAATGGAGTGTGAGTTGGATTTAGCATTTTCAGTTAAGCTCTGTCTTCTGTTGAAGGA
CCGTAACCGAGAGGATTATTGCTTGCCCAGTTCCATTGGTCCCTACACATCTCGTCTATT
CCATACTTTGGCTTCCAGTTTAGTTCACGTTCAGCTTTTTCGGTTGATGCGTACACCGTC
TCTGCATCACCTGGTCTTCTTCCAACCCTCACCACTGGGATTTTCATTCCCGAAGCTTTT
TCAAATGCATCAACCATCTTTAGTGGTATAGTCGGTTCCATAAATCTTGAGGTTAGGAAG
CCTGCCAACAACGACTTGCTGGACATAAGGCATGAGGTTATTAGGAGTGCCACAAGGATC
CTCACCAATGCGACCGCTAGGGTGAGCACCGACAGGGTTAAAGTATCTGAGCATAATGAT
TCTCCATTCAGGATCACCACGTTGTACATCACGACAAATGTCCTCAATGAAGAGCTTAGT
TCTAGCA

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6761Contig1 1206 2 2 U
GGACCATCACCCACACACACAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTTTCCTTCGT
TCTCTTGCAGTGTCATGGGAACCCTAGTATTGGGTTGCCTTCTGCTTCAAGCATCAAACT
CTGACGCTCAACCATTAACGCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGGGTGTCTTCGATA
TCATTTGGAGGACCATCGTCGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGTATCCTTCG
TCTTCACTTCCATGACTGTTTTGTTAATGGTCGTGACGCATCGATCCTGCTGGACAGTTC
CACATCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGA
CGTCATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATTGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGC
AGATGTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCC
GGTTCCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCT
TCCTTCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAA
CCGCCCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAGAGCACAATGTCA
ATTTGTGACACCTCGTCTCTACAACTTCAACGGTACCAATAGACCTGACTCTAGTCTCAA
CCCAACTTACCTCACCCAACTCCGTGGATTGTGCCCTCAAAACGGAAACGGCACTGTTTT
GGTCAACTTCGACCCTGTGACTCCAGATGGTTTCGATAATCAGTACTACACCAATCTTCG
TAATGGGGGAGGACTGATTCAGAGCGATCAAGAACTGTTTTCAACCCCAAGAGCATTTAC
GATTCCACTAGTGGAGCAATACAGCAACGACAGGTTCGTGTTCTTTCAAGCATTCACCGA
AGCAATGATTCGGATGGGAAATCTCAAACCTTTGACTGGAACTCAAGGCGAGATAAGACG
GAACTGTAGGGTTGTGAACTCAAGGATCAGGAGTGTGGAGAATGGGGATGATGGTGTTGT
GAGTTCGATTTGATCATGCTGGGGATATGAATATGTAAGAAAATATAAAAATGAGTGGGG
AACAATATATGTATTTCGACTAAATAAATGTTCACACTAGTTATGAGATTACTATGATAC
CTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4H593TF U 1
AF RR4H593JQB C 379
BS 1 683 RR4H593TF
BS 684 1206 RR4H593JQB

RD RR4H593TF 686 0 0
GGACCATCACCCACACACACAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTTTCCTTCGT
TCTCTTGCAGTGTCATGGGAACCCTAGTATTGGGTTGCCTTCTGCTTCAAGCATCAAACT
CTGACGCTCAACCATTAACGCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGGGTGTCTTCGATA
TCATTTGGAGGACCATCGTCGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGTATCCTTCG
TCTTCACTTCCATGACTGTTTTGTTAATGGTCGTGACGCATCGATCCTGCTGGACAGTTC
CACATCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGA
CGTCATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATTGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGC
AGATGTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCC
GGTTCCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCT
TCCTTCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAA
CCGCCCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAGAGCACAATGTCA
ATTTGTGACACCTCGTCTCTACA
CTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4H593JQB 828 0 0
AGCCGAGATTGAGATTGCGTGCCCAAGAACAGTTTCT*GTGCAGATGTTCTTACCATCGC
TTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCCGGTTCCATTGGGAAGGAG
AGACAGCTTACGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCTTCCTTCTCCATTTTTCAC
ACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGCCCCTCCGATCTAGT
CGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAGAGCACAATGTCAATTTGTGACACCTCGTCT
CTACAACTTCAACGGTACCAATAGACCTGACTCTAGTCTCAACCCAACTTACCTCACCCA
ACTCCGTGGATTGTGCCCTCAAAACGGAAACGGCACTGTTTTGGTCAACTTCGACCCTGT
GACTCCAGATGGTTTCGATAATCAGTACTACACCAATCTTCGTAATGGGGGAGGACTGAT
TCAGAGCGATCAAGAACTGTTTTCAACCCCAAGAGCATTTACGATTCCACTAGTGGAGCA
ATACAGCAACGACAGGTTCGTGTTCTTTCAAGCATTCACCGAAGCAATGATTCGGATGGG
AAATCTCAAACCTTTGACTGGAACTCAAGGCGAGATAAGACGGAACTGTAGGGTTGTGAA
CTCAAGGATCAGGAGTGTGGAGAATGGGGATGATGGTGTTGTGAGTTCGATTTGATCATG
CTGGGGATATGAATATGTAAGAAAATATAAAAATGAGTGGGGAACAATATATGTATTTCG
ACTAAATAAATGTTCACACTAGTTATGAGATTACTATGATACCTGGCC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL6762Contig1 1079 2 4 U
GTGCAGGACGGGCTTGTGTTCCGTCAGAATTTCTCCATTAGGTCTTATGAGATTGGTGCT
GATCGCTCTGCATCTATAGAAACCGTCATGAATCATTTACAGGAAACGGCCCTCAACCAT
GTGAAGTCTGCCGGACTGCTGGAAAATGGGTTTGGTTCCACCCCTGAGATGTTTAAGAAG
AACCTGATATGGGTCGTTGCTCGTATGCAGGTTGTGGTTGATAAATATCCTACTTGGGGA
GATGTTGTGGAAGTGGATACATGGGTTAGTCAGTCTGGAAAGAATGGTATGCGTCGTGAT
TGGCTGGTTAGGGATTGCAATACTGGAGAAATTGTAACACGAGTATCAAGTTTGTGGGTG
ATGATGAATAAACTCACACGGAGATTGTCAAAGATTCCTGAAGAGGTTCGCGGGGAAATA
GAGCCTTATTTTGTGAACTCTGATCCTGTCATTGCTGAAGACAGCAGAAAGTTAACCAAA
CTTGATGACAAGACCGCTGACTATGTTCGTTCTGGTCTCACTCCGAGGTGGAGTGACTTG
GATGTTAACCAGCATGTTAACAATGTAAAGTACATTGGGTGGATACTGGAGAGTGCTCCA
GCAGGGATGTTGGAGAGTCAGAAGCTGAAAAGCATGACTCTGGAGTATCGGAGGGAGTGC
GGAAGAGACAGTGTGCTTCAGTCTCTCACCGCGGTTTCTGGATGTGATGTCGGTAACCTC
GAGACAGGCGGGGAAGTGGAGTGTCAGCATTTGCTTCGACTCCAGGATGGAGCTGAAGTG
GTCAGAGGAAGAACAGAGTGGAGTTCCAAGACACCAACAACAACTTGGGACACTACTACA
TCGTAAGGGGTCCTTTGGTTCCTTTGTAAACTGTACCTGCTGCTGCTGCTACCTTCTTGC
AACCACCTTTGTATATCTCTTCTATTTTTTTTTTGCTTGATGGAGATATGTATTATTATT
TATTTAATCTTTCTATTTTTTTTTCTTATGGGAAATGGTGTCGTGTCTGATACGATTATG
TGATATATTATTTGTAAACCCATGTGCCAGCGCCAGACAAGGCAATAACTTTTTTATCC


BQ
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AF RR4CW11TF U 1
AF RR4CW11JQ C 403
BS 1 605 RR4CW11TF
BS 606 606 RR4CW11JQ
BS 607 708 RR4CW11TF
BS 709 1079 RR4CW11JQ

RD RR4CW11TF 708 0 0
GTGCAGGACGGGCTTGTGTTCCGTCAGAATTTCTCCATTAGGTCTTATGAGATTGGTGCT
GATCGCTCTGCATCTATAGAAACCGTCATGAATCATTTACAGGAAACGGCCCTCAACCAT
GTGAAGTCTGCCGGACTGCTGGAAAATGGGTTTGGTTCCACCCCTGAGATGTTTAAGAAG
AACCTGATATGGGTCGTTGCTCGTATGCAGGTTGTGGTTGATAAATATCCTACTTGGGGA
GATGTTGTGGAAGTGGATACATGGGTTAGTCAGTCTGGAAAGAATGGTATGCGTCGTGAT
TGGCTGGTTAGGGATTGCAATACTGGAGAAATTGTAACACGAGTATCAAGTTTGTGGGTG
ATGATGAATAAACTCACACGGAGATTGTCAAAGATTCCTGAAGAGGTTCGCGGGGAAATA
GAGCCTTATTTTGTGAACTCTGATCCTGTCATTGCTGAAGACAGCAGAAAGTTAACCAAA
CTTGATGACAAGACCGCTGACTATGTTCGTTCTGGTCTCACTCCGAGGTGGAGTGACTTG
GATGTTAACCAGCATGTTAACAATGTAAAGTACATTGGGTGGATACTGGAGAGTGCTCCA
GCAGG*ATGTTGGAGAGTCAGAAGCTGAAAAGCATGACTCTGGAGTATCGGAGGGAGTGC
GGAAGAGACAGTGTGCTTCAGTCTCTCACCGCGGTTTCTGGATGTGAT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4CW11JQ 677 0 0
GAGGTTCGCGGGGAAATAGAGCCTTATTTTGTGAACTCTGATCCTGTCATTGCTGAAGAC
AGCAGAAAGTTAACCAAACTTGATGACAAGACCGCTGACTATGTTCGTTCTGGTCTCACT
CCGAGGTGGAGTGACTTGGATGTTAACCAGCATGTTAACAATGTAAAGTACATTGGGTGG
ATACTGGAGAGTGCTCCAGCAGGGATGTTGGAGAGTCAGAAGCTGAAAAGCATGACTCTG
GAGTATCGGAGGGAGTGCGGAAGAGACAGTGTGCTTCAGTCTCTCACCGCGGTTTCTGGA
TGTGATGTCGGTAACCTCGAGACAGGCGGGGAAGTGGAGTGTCAGCATTTGCTTCGACTC
CAGGATGGAGCTGAAGTGGTCAGAGGAAGAACAGAGTGGAGTTCCAAGACACCAACAACA
ACTTGGGACACTACTACATCGTAAGGGGTCCTTTGGTTCCTTTGTAAACTGTACCTGCTG
CTGCTGCTACCTTCTTGCAACCACCTTTGTATATCTCTTCTATTTTTTTTTTGCTTGATG
GAGATATGTATTATTATTTATTTAATCTTTCTATTTTTTTTTCTTATGGGAAATGGTGTC
GTGTCTGATACGATTATGTGATATATTATTTGTAAACCCATGTGCCAGCGCCAGACAAGG
CAATAACTTTTTTATCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL6763Contig1 1245 2 2 U
GGTTCAACTCGCTAAAACACTGGGCGTGTCAAAGCTGGTGGTTGTTGTCAACAAGATGGA
TGACCCAACTGTTAACTGGTCGAAAGTGAGGTACGATGAAATAGAACAGAAAATGGTGCC
ATTTCTTAAATCCTCTGGCTATAACACAAAGAAAGATGCTATCTTCCTGCCTATATCTGG
TCTAATGGGGATTAATATAGACAAGAATATGGATCGGAACGTCTGTCCTTGGTTCAGCGG
CCCTAGCTTTTTTGAAGTCCTCAATGCTATTGAAGTTCCGCCACGGGGTCCTAATGGTCC
ATTCAGGATGCCCATTATTGATAAATTCAAAGACATGGGAACTGTTGTTATGGGAAAAGT
AGAATCTGGCAGCATTCGAGAGGGTGATTCCTTGATTGTATGCCAAACAAGGAACCGGTG
AAAGTTGTTGCTATATATTGCGATGAAGATAAAGTTAAGCGTGCTGGGCCGGGTGAGAAT
CTGAGAGTTCGTATAACTGGCATTGAAGACGAGGATATCCTTGCAGGTTTTGTTTTATCC
AGCACGGTAAAGCCTGTACCTACCGTTACTGAGTTCGTTGCCCAATTACAAATCCTTGAG
CTGCTTGACAATGCGATTTTTACAGCTGGTTACAAGGCTATTCTCCACATTCATGCGGTT
GTTGAGGAATGTGAGATAATTGAATTGATAAGCCAAATTGATATGAAGACGAGGAAACCC
ATGAAAAAGAAAATTCTATTTGTGAAGAATGGTGCTGCTGTTGTCTGCCGTATACAGGTT
AGCAATTCAATCTGTGTGGAAAAATTCTCAGATTTCCCACAACTTGGAAGATTCACTCTA
CGAACTGAAGGGAAAACAATTGCTGTTGGGAAAGTGACTGCGCTCTCAGGTGCTTCCTCA
AGCGCATGATCCCAATTTTGTGAGAAAAAGGAGACGGCTTTCGAGTTACACCGAGAGGGG
GCTTCAGGAAAATGCTTCTGACGAAGGAATCTGGAGTTCCATAACTCAAATCTTAGTTCC
ATCTGTATGGTGGGGTTTGAGAGTTACTGCTACAGAGGTGTAACCTGAGACCATTTTCTG
AAAAATTTAAAAGCTAGAAAGAGTATTATGATGAACATGAGTGAGAGTTTTTACTTCTTT
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TCCGGCTCATTGGAGTTTGCTGTTTAAATTGTTGAGGAAACACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A735TF U 1
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TCTAATGGGGATTAATATAGACAAGAATATGGATCGGAACGTCTGTCCTTGGTTCAGCGG
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AGAATCTGGCAGCATTCGAGAGGGTGATTCCTTGATTGTATGCCAAACAAGGAACCGGTG
AAAGTTGTTGCTATATATTGCGATGAAGATAAAGTTAAGCGTGCTGGGCCGGGTGAGAAT
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AGCACGGTAAAGCCTGTACCTACCGTTACTGAGTTCGTTGCCCAATTACAAATCCTTGAG
CTGCTTGACAATGCGATTTTTACAGCTGGTTACAAGGCTATTCTCCACATTCATGCGGTT
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QA 1 767 1 767
DS 

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AGACGAGGAAACCCATGAAAAAGAAAATTCTATTTGTGAAGAATGGTGCTGCTGTTGTCT
GCCGTATACAGGTTAGCAATTCAATCTGTGTGGAAAAATTCTCAGATTTCCCACAACTTG
GAAGATTCACTCTACGAACTGAAGGGAAAACAATTGCTGTTGGGAAAGTGACTGCGCTCT
CAGGTGCTTCCTCAAGCGCATGATCCCAATTTTGTGAGAAAAAGGAGACGGCTTTCGAGT
TACACCGAGAGGGGGCTTCAGGAAAATGCTTCTGACGAAGGAATCTGGAGTTCCATAACT
CAAATCTTAGTTCCATCTGTATGGTGGGGTTTGAGAGTTACTGCTACAGAGGTGTAACCT
GAGACCATTTTCTGAAAAATTTAAAAGCTAGAAAGAGTATTATGATGAACATGAGTGAGA
GTTTTTACTTCTTTTAAAGCTAAATTTTACAATTACTACTATTGTTATTACCCTTTTGGA
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QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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GTAACATAGCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FL73JQ C 1
AF RR4FL73TF U 1
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CATGGCAAGAAACAGGTTTTCAGTGAAGGAGGTGATACTGGAAACCGTCAAGACAAGATC
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CTTTTTTTTTTAAAATAACGGTATTGCAATTTTGATTAAAATAGGAAAATCATTCCCCAG
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GTAACATAGCG

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DS 

RD RR4FL73TF 311 0 0
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CATGGCAAGAAACAGGTTTTCAGTGAAGGAGGTGATACTGGAAACCGTCAAGACAAGATC
AACGATCTCATCATCAAAATGAACTAAGTTGTTTTCGTTTTTAGAAAAATCTGTATGAGA
CTTTTTTTTTTAAAATAACGGTATTGCAATTTTGATTAAAATAGGAAAATCATTCCCCAG
TTTGATTCTGATATCGTTGGCTTCAGAGCTTATATTATACACATATGTGACAGAAACAGA
GTAACATAGCG

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 2

CO CL6765Contig1 914 2 10 U
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GTGTATTTATTACTTATCGTTCGGATCTTACTCTGGTGAAGTAGTTTTTGATTGAAATAA
GGAACTCAGATGTATAGCATTGCTACCGATTTGACGTGAAGTAGTTGTGAATTGATTCTA
CGAGATATAGGTTGAGTTTCGTTCTATGTGTTTGTTACTTAATGGTTTTGATCTTGTGAA
ACAGGCTTTGGACAAGATCAGATTCGAGTCATTGACCGACAAGAGCAAGCTCGATGGACA
GCCAGAGCTTTTCATTCACGTCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACCATCATCGA
TAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCGATTTGGTCAACAACCTTGGAACCATTGCAAGGTC
TGGCACCAAGGAGTTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGTGCTGATGTTAGCATGATTGGGCA
GTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTCGCTGACAAGGTAATTGTGACCACCAA
GCATAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTTCACCGTTAC
CAGAGACACCTCTGGAGAGAGTCTTGGTAGGGGTACGAAGATGGTCCTTCACCTCAAGGA
GGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCTTAAGGATTTGGTTAAGAAGCACTCTGA
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GAAAGAAAAGGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ10TF U 1
AF RR4CJ10JQ C 114
BS 1 304 RR4CJ10TF
BS 305 305 RR4CJ10JQ
BS 306 392 RR4CJ10TF
BS 393 393 RR4CJ10JQ
BS 394 401 RR4CJ10TF
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BS 413 437 RR4CJ10TF
BS 438 914 RR4CJ10JQ

RD RR4CJ10TF 437 0 0
ACGATATCGAATCTGTCGTCTTAGATTTAGCGTTGCTGAGCTTCGATGAATTTGGTTTTC
GTCTTTTTAGATAAACGGATCTTCAATCTAATATGGATTCTGTTTGTTTGTATAAGTTCT
GTGTATTTATTACTTATCGTTCGGATCTTACTCTGGTGAAGTAGTTTTTGATTGAAATAA
GGAACTCAGATGTATAGCATTGCTACCGATTTGACGTGAAGTAGTTGTGAATTGATTCTA
CGAGATATAGGTTGAGTTTCGTTCTATGTGTTTGTTACTTAATGGTTTTGATCTTGTGAA
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TAGCGGTATCGGTATGA

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR4CJ10JQ 801 0 0
T
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AAATAAGGAACTCAGATGTATAGCATTGCTACCGATTTGACGTGAAGTAGTTGTGAATTG
ATTCTACGAGATATAGGTTGAGTTTCGTTCTATGTGTTTGTTACTTAATGGTTTTGATCT
TGTGAAACAGGCTTTGGACAAGATCAGATTCGAGTCATTGACCGACAAGAGCAAGCTCGA
TGGACAGCCAGAGCTTTTCATTCACGTCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACCAT
CATCGATAGCGGTATCGGTATGACCAAGGCCGATTTGGTCAACAACCTTGGAACCATTGC
AAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGTGCTGATGTTAGCATGAT
TGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTCGCTGACAAGGTAATTGTGAC
CACCAAGCATAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTTCAC
CGTTACCAGAGACACCTCTGGAGAGAGTCTTGGTAGGGGTACGAAGATGGTCCTTCACCT
CAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCTTAAGGATTTGGTTAAGAAGCA
CTCTGAGTTCATCAGCTACCCTATCTCCCTGTGGATCGAGGAGACCATTGAGAAGGAGAT
TTCTGATGACGAGGATGAGGAAGAGAAGAAGGACGAGGAAGGAAAGGTTGAGGAGGTAGA
TGAGGAGAAAGAAAAGGAGG

QA 2 801 2 801
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6767Contig1 999 2 2 U
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AATCAAGAAACAAGCCTCTTTGTTTCTTCATGACAAGTACAATGTTGCTAGACTTGTTCT
CACCGATGTTACCGAAATTGAGCTGTTAGTAGAAGAAGTGACAAACGATGATCCTTCTTC
TCCAGACGCTAAAACGATGACTAAAATAGCCGAGGCATCATTTAATACAGTGGATTACTG
GAGAATCGTGGATGTCCTTCACAGAAAAATAGGAAAAGGGGAAGGAGAGATGAAAAAATG
GAGAGAAGCTTACAAGGCCATGGTGTTGTCGGAGTTCTTATTAACACATGGTCCCCTTCA
TTTGCCTCATGATTTTCTTTACGACTTGGACCATATTCGCTTCCTCTCAACCTTCCAATA
CGTTGACGATAAAGGGTTTGATTGGGGAGCTAAGGTACAAAAGAAGGCTGATCAGATTCA
AACTCTTATTCTAGGGAAAGAAGAACTAAGAGAAGCTCGTGCTAAAGCTCTCAAGATCAC
CTCCCAAATCAATGGCTTCGGAAACTCCACATGTTTCTCCACTCCTCCTCCTCCGTCTCC
TTCACCGGTCTCACCCTCGAGCTCCGGTACAACACTTACCGAAAGAGAAGCTATGTCCGA
GTCAGATTCATTGATCAGCGTGGATGACAAGAGGAACCGAGCCGCCGGTGAAGAGACGCT
GATCAGCGGAATCTGCTCTAAGCTCGCCGGTTTTAGCCCTCTGAAGAAACTTCACGGTGG
TCATACGGCGGCCGGATTTCAAGCGTTGTCGAACGTTGAGAGAGTTTCAAGTAAATGTTA
CGACCGCCGCAATTCTATTGGCTACTGATTAATTTGATTCTTTGTAATAAAAAAAAAAGA
AAACGGTTCTGTTTTTTTTTTAATTTCATATTTACCGAATATCCGGTCAAAAACCGGTTT
AGGTAAACCTAATTACGATACAAGAAATTTCGCTTTTGC


BQ
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AF RR4FF91TF U 1
AF RR4FF91JQ C 391
BS 1 690 RR4FF91TF
BS 691 999 RR4FF91JQ

RD RR4FF91TF 690 0 0
GGAGTGATCATTCAAATTTGTTTTGTTGGAAAATTTGATGGGGACACTTTGGTTTGGAGA
AATCAAGAAACAAGCCTCTTTGTTTCTTCATGACAAGTACAATGTTGCTAGACTTGTTCT
CACCGATGTTACCGAAATTGAGCTGTTAGTAGAAGAAGTGACAAACGATGATCCTTCTTC
TCCAGACGCTAAAACGATGACTAAAATAGCCGAGGCATCATTTAATACAGTGGATTACTG
GAGAATCGTGGATGTCCTTCACAGAAAAATAGGAAAAGGGGAAGGAGAGATGAAAAAATG
GAGAGAAGCTTACAAGGCCATGGTGTTGTCGGAGTTCTTATTAACACATGGTCCCCTTCA
TTTGCCTCATGATTTTCTTTACGACTTGGACCATATTCGCTTCCTCTCAACCTTCCAATA
CGTTGACGATAAAGGGTTTGATTGGGGAGCTAAGGTACAAAAGAAGGCTGATCAGATTCA
AACTCTTATTCTAGGGAAAGAAGAACTAAGAGAAGCTCGTGCTAAAGCTCTCAAGATCAC
CTCCCAAATCAATGGCTTCGGAAACTCCACATGTTTCTCCACTCCTCCTCCTCCGTCTCC
TTCACCGGTCTCACCCTCGAGCTCCGGTACAACACTTACCGAAAGAGAAGCTATGTCCGA
GTCAGATTCATTGATCAGCGTGGATGACAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4FF91JQ 609 0 0
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AGAAGCTCGTGCTAAAGCTCTCAAGATCACCTCCCAAATCAATGGCTTCGGAAACTCCAC
ATGTTTCTCCACTCCTCCTCCTCCGTCTCCTTCACCGGTCTCACCCTCGAGCTCCGGTAC
AACACTTACCGAAAGAGAAGCTATGTCCGAGTCAGATTCATTGATCAGCGTGGATGACAA
GAGGAACCGAGCCGCCGGTGAAGAGACGCTGATCAGCGGAATCTGCTCTAAGCTCGCCGG
TTTTAGCCCTCTGAAGAAACTTCACGGTGGTCATACGGCGGCCGGATTTCAAGCGTTGTC
GAACGTTGAGAGAGTTTCAAGTAAATGTTACGACCGCCGCAATTCTATTGGCTACTGATT
AATTTGATTCTTTGTAATAAAAAAAAAAGAAAACGGTTCTGTTTTTTTTTTAATTTCATA
TTTACCGAATATCCGGTCAAAAACCGGTTTAGGTAAACCTAATTACGATACAAGAAATTT
CGCTTTTGC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6768Contig1 716 2 2 U
GGATGTTCTTCTCGCAGCATAGCGGTGGCGGGTGGGTTGATGTGTCTGATCTTGAGTTTG
TCAAAGGAAGTAATAAACCGGTTGTGTATTCGTCTAAGCACGGACACGCGAGTTTCCCTC
ACCCGGGGATGTATCTCCAAGGCTCGTCCAAGCTTGGGATTGGAGTGAGAAACGATGTTG
GGAAGAGTGAGTATGTGGTGGATTCTAGTGAGAGGTATAGAGTCGTGGCGGCTGAGTATT
TAGGGGAAGGAGTGGTTACGGAGCCGTGCTGGCTGCGGTATATGAGAGGGTGGGGACCGA
CTATAGTGTATGATTCTGCAGCTGAGATTGATAAGATCATTAATCTTTTGCCTTTGATTG
TGAGGTACTCTATTGAGAATCTGTTTCCTATTGCGCTTTATGGAGAGGAAGGTCCCACGG
GACCAAAGGAGAAGGATAACTGGGAGGGAGATGAGATGTGTTGAAGAAAGAAAAGCTTGT
CGCTGAGCTTAAACATGCCTTTGTGTGAAAACAGAGTGAAGTGTTGGTGTAATATTGTGT
AGATATGATGATGTGAAGTCTTCTTATTTGAACATTGGTTTACCCATTTCAGTCATATAT
TCAACTATTGTTGGCTTAATGCAATTCAGAACACAAGAAAAAACAGAGTTACATATAGAC
ACCTAAGTAATGTGAAAGTACTCATGATTTTCAATAAGAATTTGTCAATGGAGGCG


BQ
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AF RR4B483JQ C 1
AF RR4B483TF U 417
BS 1 416 RR4B483JQ
BS 417 716 RR4B483TF

RD RR4B483JQ 716 0 0
GGATGTTCTTCTCGCAGCATAGCGGTGGCGGGTGGGTTGATGTGTCTGATCTTGAGTTTG
TCAAAGGAAGTAATAAACCGGTTGTGTATTCGTCTAAGCACGGACACGCGAGTTTCCCTC
ACCCGGGGATGTATCTCCAAGGCTCGTCCAAGCTTGGGATTGGAGTGAGAAACGATGTTG
GGAAGAGTGAGTATGTGGTGGATTCTAGTGAGAGGTATAGAGTCGTGGCGGCTGAGTATT
TAGGGGAAGGAGTGGTTACGGAGCCGTGCTGGCTGCGGTATATGAGAGGGTGGGGACCGA
CTATAGTGTATGATTCTGCAGCTGAGATTGATAAGATCATTAATCTTTTGCCTTTGATTG
TGAGGTACTCTATTGAGAATCTGTTTCCTATTGCGCTTTATGGAGAGGAAGGTCCCACGG
GACCAAAGGAGAAGGATAACTGGGAGGGAGATGAGATGTGTTGAAGAAAGAAAAGCTTGT
CGCTGAGCTTAAACATGCCTTTGTGTGAAAACAGAGTGAAGTGTTGGTGTAATATTGTGT
AGATATGATGATGTGAAGTCTTCTTATTTGAACATTGGTTTACCCATTTCAGTCATATAT
TCAACTATTGTTGGCTTAATGCAATTCAGAACACAAGAAAAAACAGAGTTACATATAGAC
ACCTAAGTAATGTGAAAGTACTCATGATTTTCAATAAGAATTTGTCAATGGAGGCG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4B483TF 300 0 0
ACGGGACCAAAGGAGAAGGATAACTGGGAGGGAGATGAGATGTGTTGAAGAAAGAAAAGC
TTGTCGCTGAGCTTAAACATGCCTTTGTGTGAAAACAGAGTGAAGTGTTGGTGTAATATT
GTGTAGATATGATGATGTGAAGTCTTCTTATTTGAACATTGGTTTACCCATTTCAGTCAT
ATATTCAACTATTGTTGGCTTAATGCAATTCAGAACACAAGAAAAAACAGAGTTACATAT
AGACACCTAAGTAATGTGAAAGTACTCATGATTTTCAATAAGAATTTGTCAATGGAGGCG

QA 1 300 1 300
DS 



AS 1 2

CO CL6769Contig1 895 2 2 U
GATGTTTCCCTTTGATCTTTCAATTCCAACCCTTCAATGTGTCGACTCCATAATCTCACT
AACCCCGCAATCAAAACCTGGATTGCTCTGATACCACTTGTTAGGAATTATCGATCGTTT
GATTGCTTAACTAAACGACACAAGATTTTTAACCCAGTTCCCTTGCGGTACCTCTGGGGT
GGGAACCGTCTCCCACAACATCCACTATCAATCAAAGGGGTTTACACAAACGCTCTAAGC
GCTCTTCTCGTATAAACATGACATTAACAAAGAATAAGAAGATCAAAGAAACTCTATCCT
TTAGAGACATGACTCGAACAATATCTCTTAGTTTCTTCTACTCTTGATCTCTCTCTCTTA
ACTTCTCTTTGTCCTTGTGTTTAGGTTTTCTCGGATGATTCCTTAGGTCACATCTTCTTC
CTCTTATATATACGTCCCAGTATATATGCATGTTTCCTTTTTACGTAACGAGAACAAATA
CGTCACCGACTTGGGTGGATTTTTCTTTTGACTGATATGGATCAGAGAATCAGGCCTAAT
TCTCAAGCCCATATTTATGTGAAGATAAGCCCATCCTCGCTCATAGCTAACTTAACCCAT
GATTTAATTTTTGCTGGCTCTGCCACTGATCGTGACTGAAACCTGGACCACCATTTCTTA
GCTTGGAGGGGAAGGTTGCAGCCTGAGGCCATATGAAGCCTTTTGTTCATGTTTAGAGAG
GAGTGATGATCCGTTTTTCTCGAGTTCCCAAATACTTTTCTTTGAAGAATGTTCTGCTTT
GCTTGCTAAGACAACTAGAGCTCGAGGAGGGTGATCTGTCCAAAGCTGCAAAGGAATGAC
ATTCCTGGAAAGAAATCACTGTGAGTTATTTTCTTCCGTTCTTGGTTGTTTTTTG


BQ
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AF RR4AC25TF U 1
AF RR4AC25JQ C 36
BS 1 750 RR4AC25TF
BS 751 895 RR4AC25JQ

RD RR4AC25TF 750 0 0
GATGTTTCCCTTTGATCTTTCAATTCCAACCCTTCAATGTGTCGACTCCATAATCTCACT
AACCCCGCAATCAAAACCTGGATTGCTCTGATACCACTTGTTAGGAATTATCGATCGTTT
GATTGCTTAACTAAACGACACAAGATTTTTAACCCAGTTCCCTTGCGGTACCTCTGGGGT
GGGAACCGTCTCCCACAACATCCACTATCAATCAAAGGGGTTTACACAAACGCTCTAAGC
GCTCTTCTCGTATAAACATGACATTAACAAAGAATAAGAAGATCAAAGAAACTCTATCCT
TTAGAGACATGACTCGAACAATATCTCTTAGTTTCTTCTACTCTTGATCTCTCTCTCTTA
ACTTCTCTTTGTCCTTGTGTTTAGGTTTTCTCGGATGATTCCTTAGGTCACATCTTCTTC
CTCTTATATATACGTCCCAGTATATATGCATGTTTCCTTTTTACGTAACGAGAACAAATA
CGTCACCGACTTGGGTGGATTTTTCTTTTGACTGATATGGATCAGAGAATCAGGCCTAAT
TCTCAAGCCCATATTTATGTGAAGATAAGCCCATCCTCGCTCATAGCTAACTTAACCCAT
GATTTAATTTTTGCTGGCTCTGCCACTGATCGTGACTGAAACCTGGACCACCATTTCTTA
GCTTGGAGGGGAAGGTTGCAGCCTGAGGCCATATGAAGCCTTTTGTTCATGTTTAGAGAG
GAGTGATGATCCGTTTTTCTCGAGTTCCCA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AC25JQ 860 0 0
AATGTGTCGACTCCATAATCTCACTAACCCCGCAATCAAAACCTGGATTGCTCTGATACC
ACTTGTTAGGAATTATCGATCGTTTGATTGCTTAACTAAACGACACAAGATTTTTAACCC
AGTTCCCTTGCGGTACCTCTGGGGTGGGAACCGTCTCCCACAACATCCACTATCAATCAA
AGGGGTTTACACAAACGCTCTAAGCGCTCTTCTCGTATAAACATGACATTAACAAAGAAT
AAGAAGATCAAAGAAACTCTATCCTTTAGAGACATGACTCGAACAATATCTCTTAGTTTC
TTCTACTCTTGATCTCTCTCTCTTAACTTCTCTTTGTCCTTGTGTTTAGGTTTTCTCGGA
TGATTCCTTAGGTCACATCTTCTTCCTCTTATATATACGTCCCAGTATATATGCATGTTT
CCTTTTTACGTAACGAGAACAAATACGTCACCGACTTGGGTGGATTTTTCTTTTGACTGA
TATGGATCAGAGAATCAGGCCTAATTCTCAAGCCCATATTTATGTGAAGATAAGCCCATC
CTCGCTCATAGCTAACTTAACCCATGATTTAATTTTTGCTGGCTCTGCCACTGATCGTGA
CTGAAACCTGGACCACCATTTCTTAGCTTGGAGGGGAAGGTTGCAGCCTGAGGCCATATG
AAGCCTTTTGTTCATGTTTAGAGAGGAGTGATGATCCGTTTTTCTCGAGTTCCCAAATAC
TTTTCTTTGAAGAATGTTCTGCTTTGCTTGCTAAGACAACTAGAGCTCGAGGAGGGTGAT
CTGTCCAAAGCTGCAAAGGAATGACATTCCTGGAAAGAAATCACTGTGAGTTATTTTCTT
CCGTTCTTGGTTGTTTTTTG

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6770Contig1 1257 2 4 U
GATTTTGTCAAAACTAATGAATGATTGGAAATTGATGCACGAACTTGCGGTGTTGCGTGC
CATTTACTTGTTAGGTTCAGGGGACCTTCTGCAGCATTTTCTGACTGTCATATTCAACAA
GCTGGGCAAGGGAGAGTTAACAAATGATGATTTTGAGTTGAACATAATCCTTCAGGAATC
AATTAGAAATTCAGCTGATGCCATGCTGTTGAATAGTCCTGATTCATTGGTGGTATCCAT
TTCCAGAGATGGTTATTTAGACAAAGACAAAGATGACAAGGGTGACGTAGTACCTGTTTC
TTCAACTCGTAAAAGCCGCGTTAATAACTTTGGGATAGACTGCCTCGAGTCTCTCAAATT
CACTTATAAGGTGCCATGGCCGCTTGAGCTTATTGCCAACAGTGAGGCCATTAAGAAGTA
TAACCAGGTGATGGGATTTTTGCTGAAGGTCAAACGAGCAAAATATGTGCTTGATAAAGC
ACGAAGGTGGATGTGGAAGGGTAAAGGCTCTGCAACAAAAATCCGCAAGCACCATTGGTT
ACTGGAACAAAAGCTCCTCAATTTTGTGGATGCTTTTCATCAATACGTAATGGACAGGGT
ATATCACACGGCATGGCGCGAACTGTACGAAGCAATGGTAAAAGCAGGGTCTCTGGACGA
GGTCATATATGTACATGAGACCTACTTGTTATCGATTCAGAGGCAATGCTTTATGGTTCA
AGAAAAGCTGTGGGCAATCATAGCAAGTCGGATCAACATGATTCTGGGATTAGCTCTAGA
GTTCTACTCGATACAACAGACACTAAGCAGCGGTGGAGCAGTTTCAGCAGCGATCAAGGC
TAGATGCGAAATGGAAATAGACCGCATTGAGAAACAATTTGAAGACTGCATAGCTTTCCT
CCTTAGAGTACTGTCTTCGAAGCTGAATGTGGGACACTTTCCTCATTTGGCTGATTTAGT
AACCAGGATCAATTACAATTATCACTACATGTCCGGCACTGGAAGCTTGATGACTGTTTC
TGGAGCAGAGACCAGCTCATCCAGAACCTGAATCGAACAATCTGAGACCGGGGGGATGGT
CTCAGGCTTTTCTTGAGTTCTCTCATAGTAGTAGCTTTCAAAGTTTTAAAAATAGATATG
ATTGTAGTAAGATGTGGGTGGATGCATTATTAAGCTCAAAGACATTTCCAGTTTGTATAT
GTTTTATGTGCTTGTGATGTTTGAAACTCGAAAAAGTATGTAAAAGGTGCTGAGGCA


BQ
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AF RR4BF73TF U 1
AF RR4BF73JQ C 562
BS 1 838 RR4BF73TF
BS 839 839 RR4BF73JQ
BS 840 869 RR4BF73TF
BS 870 1257 RR4BF73JQ

RD RR4BF73TF 869 0 0
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CATTTACTTGTTAGGTTCAGGGGACCTTCTGCAGCATTTTCTGACTGTCATATTCAACAA
GCTGGGCAAGGGAGAGTTAACAAATGATGATTTTGAGTTGAACATAATCCTTCAGGAATC
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TTCCAGAGATGGTTATTTAGACAAAGACAAAGATGACAAGGGTGACGTAGTACCTGTTTC
TTCAACTCGTAAAAGCCGCGTTAATAACTTTGGGATAGACTGCCTCGAGTCTCTCAAATT
CACTTATAAGGTGCCATGGCCGCTTGAGCTTATTGCCAACAGTGAGGCCATTAAGAAGTA
TAACCAGGTGATGGGATTTTTGCTGAAGGTCAAACGAGCAAAATATGTGCTTGATAAAGC
ACGAAGGTGGATGTGGAAGGGTAAAGGCTCTGCAACAAAAATCCGCAAGCACCATTGGTT
ACTGGAACAAAAGCTCCTCAATTTTGTGGATGCTTTTCATCAATACGTAATGGACAGGGT
ATATCACACGGCATGGCGCGAACTGTACGAAGCAATGGTAAAAGCAGGGTCTCTGGACGA
GGTCATATATGTACATGAGACCTACTTGTTATCGATTCAGAGGCAATGCTTTATGGTTCA
AGAAAAGCTGTGGGCAATCATAGCAAGTCGGATCAACATGATTCTGGGATTAGCTCTAGA
GTTCTACTCGATACAACAGACACTAAGCAGCGGTGGAGCAGTTTCAGCAGCGATCAAG*C
TAGATGCGAAATGGAAATAGACCGCATTG

QA 1 869 1 869
DS 

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TTTTGTGGATGCTTTTCATCAATACGTAATGGACAGGGTATATCACACGGCATGGCGCGA
ACTGTACGAAGCAATGGTAAAAGCAGGGTCTCTGGACGAGGTCATATATGTACATGAGAC
CTACTTGTTATCGATTCAGAGGCAATGCTTTATGGTTCAAGAAAAGCTGTGGGCAATCAT
AGCAAGTCGGATCAACATGATTCTGGGATTAGCTCTAGAGTTCTACTCGATACAACAGAC
ACTAAGCAGCGGTGGAGCAGTTTCAGCAGCGATCAAGGCTAGATGCGAAATGGAAATAGA
CCGCATTGAGAAACAATTTGAAGACTGCATAGCTTTCCTCCTTAGAGTACTGTCTTCGAA
GCTGAATGTGGGACACTTTCCTCATTTGGCTGATTTAGTAACCAGGATCAATTACAATTA
TCACTACATGTCCGGCACTGGAAGCTTGATGACTGTTTCTGGAGCAGAGACCAGCTCATC
CAGAACCTGAATCGAACAATCTGAGACCGGGGGGATGGTCTCAGGCTTTTCTTGAGTTCT
CTCATAGTAGTAGCTTTCAAAGTTTTAAAAATAGATATGATTGTAGTAAGATGTGGGTGG
ATGCATTATTAAGCTCAAAGACATTTCCAGTTTGTATATGTTTTATGTGCTTGTGATGTT
TGAAACTCGAAAAAGTATGTAAAAGGTGCTGAGGCA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6771Contig1 929 2 2 U
AATAACATTAAGAAGAAGAGAGGTTGACAATGATGGGCACTGTCGAGCTGAATCTGAGAG
AGACTGAGCTGTGTCTTGGTCTTCCCGGCGGAGAAACGGTGGCTCCGGTGACTGGAACCA
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AGGAAGGATCTAAGACTCATGACGTCGCGACTTCTGTTTCCAAGGAAAAGAGTTCATCGC
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CATACCGGAAGAACGTGTTGGGTTCGTGCCAAAAATCAAGCGGTGGCACGGAGACAGCTG
CGTTTGTGAAGGTGTCGATGGACGGAGCACCGTACTTGAGGAAAGTCGACTTGAAGATGT
ATAAGAGCTGCGAAGAACTCTCTAATGCTTTGTCCAACATGTTCAGCTCTTTTACCATGG
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TGAATACTTGGGACTATGTTCCCTCTTATGAAGACAAAGACGGTGACTGGATGCTCGTCG
GCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCGTTGATACATGCAAGCGTTTACGTCTCATGAAAGGAT
CTGACGCCATTGGTCTCGCTCCGAGAGCAATGGAGAAGTGCAAGAGCAAAGCTTGAAGTT
AAGAGACTTAAGTGGTAATGATCATATATTTTGTTAACACAATGATGAGTGTTAATTGTG
TGTGTTTTTACAATGAAAAACATTATTCAATATCTACTCTTTTTAATTGTCTGTTTTGAT
CTGAATTATATGTGGTATATAGATACATTTTAAATGCTATTATGTGTAATGGACTTATTA
AGTTAAATATGTGAGACGTTTGTAACTTC


BQ
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AF RR4F014TF U 1
AF RR4F014JQ C 329
BS 1 631 RR4F014TF
BS 632 929 RR4F014JQ

RD RR4F014TF 631 0 0
AATAACATTAAGAAGAAGAGAGGTTGACAATGATGGGCACTGTCGAGCTGAATCTGAGAG
AGACTGAGCTGTGTCTTGGTCTTCCCGGCGGAGAAACGGTGGCTCCGGTGACTGGAACCA
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AGGAAGGATCTAAGACTCATGACGTCGCGACTTCTGTTTCCAAGGAAAAGAGTTCATCGC
CCAAAGATCCCGCCAAGCCTCCTGCCAAGGCACAAGTAGTGGGATGGCCACCTGTGAGGT
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CGTTTGTGAAGGTGTCGATGGACGGAGCACCGTACTTGAGGAAAGTCGACTTGAAGATGT
ATAAGAGCTGCGAAGAACTCTCTAATGCTTTGTCCAACATGTTCAGCTCTTTTACCATGG
GAAAATATGGAGGAGAAGAAGGAATGATAGACTTCATGAATGAGAGAAACATGGCTATAG
TGAATACTTGGGACTATGTTCCCTCTTATGAAGACAAAGACGGTGACTGGATGCTCGTCG
GCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCGTTGATAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4F014JQ 601 0 0
CCAAAAATCAAGCGGTGGCACGGAGACAGCTGCGTTTGTGAAGGTGTCGATGGACGGAGC
ACCGTACTTGAGGAAAGTCGACTTGAAGATGTATAAGAGCTGCGAAGAACTCTCTAATGC
TTTGTCCAACATGTTCAGCTCTTTTACCATGGGAAAATATGGAGGAGAAGAAGGAATGAT
AGACTTCATGAATGAGAGAAACATGGCTATAGTGAATACTTGGGACTATGTTCCCTCTTA
TGAAGACAAAGACGGTGACTGGATGCTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCGTTGA
TACATGCAAGCGTTTACGTCTCATGAAAGGATCTGACGCCATTGGTCTCGCTCCGAGAGC
AATGGAGAAGTGCAAGAGCAAAGCTTGAAGTTAAGAGACTTAAGTGGTAATGATCATATA
TTTTGTTAACACAATGATGAGTGTTAATTGTGTGTGTTTTTACAATGAAAAACATTATTC
AATATCTACTCTTTTTAATTGTCTGTTTTGATCTGAATTATATGTGGTATATAGATACAT
TTTAAATGCTATTATGTGTAATGGACTTATTAAGTTAAATATGTGAGACGTTTGTAACTT
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL6772Contig1 999 2 2 U
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GCCTTTTATGTTTATATTCTGAAACCGTCAAGTCTCAGAACTGCGGTTGTGCCTCGGGCT
TATGTTGTAGTCAGTACGGTTATTGCGGCAATGGACCAGACTACTGTGGTTCAGGTTGCC
GATCAGGTCCTTGCACTGGCACCCAAGGCGGTAGTCTTGGTACCATTGTGTCACAAGCTT
TCTTTAGCAATATCATCAACCGAGCTGATAATGGCTGCGCCGGAAAAAGATTCTACACAC
GTGATTCTTTCATTAGTGCCGCTAATACGTTCCCCCAACTTTGCTAACTCCGTTACTAGG
CGTGAAATTGCGACTATGTTTGCTCATTTCACCCAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATT
GAAGAGATAAACGGAGCGTCAAGAAACTATTGCTACGACAGGAATTATCCACAATACCCA
TGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGGTCCGATCCAGTTATCATGGAACTACAAT
TATGCACAGTGTGGTCAGAGTCTCGGTCTGGATTTTTACGTCAGCCAGAGCAAGTAAGCA
GCAATCCAACTCTAGCTTTCAGGACAGCTTTGTGGTTTTGGGTGAATAACGTAAGGCCGG
TACTGAACCAAGGATTTGGAGCCACCATTAGGGCCATCAGTGGAGACTTAGAGTGTAATG
GTAGGAGTCCAGATAAGGTTAACGCAAGGATTAGCTACTACAGAGACTACTGTGGGCAGC
TTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCCGCTAAAAAGCTCTTTAATTGGTGACTATTG
TTGGACCTTAGTGTTTATGCTGAAACAAATAAATGAGATGATAAAATTAAATCTCATGCA
TGTAATTTGTGTTGGGTTTCAATGTTTCCTGCTCCACAAGCAAAAAAAATTGTAGTTATC
TTATGTAAGTGAATTTTACATTAATAAATGTCTGAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GY93TF U 1
AF RR4GY93JQ C 213
BS 1 515 RR4GY93TF
BS 516 999 RR4GY93JQ

RD RR4GY93TF 515 0 0
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GCCTTTTATGTTTATATTCTGAAACCGTCAAGTCTCAGAACTGCGGTTGTGCCTCGGGCT
TATGTTGTAGTCAGTACGGTTATTGCGGCAATGGACCAGACTACTGTGGTTCAGGTTGCC
GATCAGGTCCTTGCACTGGCACCCAAGGCGGTAGTCTTGGTACCATTGTGTCACAAGCTT
TCTTTAGCAATATCATCAACCGAGCTGATAATGGCTGCGCCGGAAAAAGATTCTACACAC
GTGATTCTTTCATTAGTGCCGCTAATACGTTCCCCCAACTTTGCTAACTCCGTTACTAGG
CGTGAAATTGCGACTATGTTTGCTCATTTCACCCAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATT
GAAGAGATAAACGGAGCGTCAAGAAACTATTGCTACGACAGGAATTATCCACAATACCCA
TGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGGTCC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR4GY93JQ 787 0 0
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GGCTGCGCCGGAAAAAGATTCTACACACGTGATTCTTTCATTAGTGCCGCTAATACGTTC
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CCAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATTGAAGAGATAAACGGAGCGTCAAGAAACTATTG
CTACGACAGGAATTATCCACAATACCCATGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGG
TCCGATCCAGTTATCATGGAACTACAATTATGCACAGTGTGGTCAGAGTCTCGGTCTGGA
TTTTTACGTCAGCCAGAGCAAGTAAGCAGCAATCCAACTCTAGCTTTCAGGACAGCTTTG
TGGTTTTGGGTGAATAACGTAAGGCCGGTACTGAACCAAGGATTTGGAGCCACCATTAGG
GCCATCAGTGGAGACTTAGAGTGTAATGGTAGGAGTCCAGATAAGGTTAACGCAAGGATT
AGCTACTACAGAGACTACTGTGGGCAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCCGC
TAAAAAGCTCTTTAATTGGTGACTATTGTTGGACCTTAGTGTTTATGCTGAAACAAATAA
ATGAGATGATAAAATTAAATCTCATGCATGTAATTTGTGTTGGGTTTCAATGTTTCCTGC
TCCACAAGCAAAAAAAATTGTAGTTATCTTATGTAAGTGAATTTTACATTAATAAATGTC
TGAGTTG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6773Contig1 1026 2 2 U
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GATCAGTGATGTTGTGAAGATTACCAAAGGCCCATCTGAGGGTAAACAAGGAGTTGTAAG
GCAAGTGTACAGAGGGATCATATTTCTTTATGTTGAGGGTGAGGAAGAAAATGGAGGATA
TTTGTGTTGCAAATCACAGTCGTGTGAGAAAGTTAAGCTTTTTACCGAAGAGTCCAATGA
CAAGACTGGTGGATTTGACGCTTCTGCTTTTGGAGATTCTGCATCCTCTCCGAAATCGCC
ACTATCTCCTGAAAAAGAGTGGCAGCCACCCAAGGAGAAATACATTAACTCCAACCAAGG
AAACAGTGCAAAGCCATCATCAGCTGGTGGAAACTGGGGTAGCTGGGATACTAATTCCAA
GAAAGAAACCAATGCTGGTGGTGGCTGGGGTACCGACTCAAAGAAAGAAACCAATGCTGG
TGGTGGCTGGGGTACCGACTCAAAGAAAGAAACCAGTGCTGGTGGAGATTGGGGTACCGA
CTCAAAGAAAGAAACCAGTGCTGGTGGAGATTGGGGTACTAACTCAAAGAAAGAAACCAA
TGCTGGTGATGGTGACAAACCAAGCAATGAAAACAAAGCAGCAGCTTGGGGAACTGCTAA
CGTTCAGGAGAATACAGGAAACAGCAATGATGGTTGGAGCAAGAAGTCGAGTGATGATGT
TAAAACGAGTGGAGAAGCTGATGATAATGCATGGGGAGGCAAAACAAATGTAGGAACGTC
GTCATCTGGTGACTCGCCGTGGGGAACCGGAGCTAAAAAATCCGGATGGTAATAAAAAAA
AGACCTGAAGTGACTTTGTAATTAGGTCTCACTATCTCTCTATCTTAGTCTAAAGCGCAA
GTTTAGTTGAAACGCTGCGAAGTGTCTTTCCTTTTTAGTCTTTTGTGGGCTTTCTCATGG
TTTGAAAAACTCTTTAGGTTTGTTTATGGCCGTGACTAAAGGCTCATCAATAACTGATTT
TGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ33TF U 1
AF RR4DQ33JQ C 361
BS 1 663 RR4DQ33TF
BS 664 1026 RR4DQ33JQ

RD RR4DQ33TF 663 0 0
GCAAGAGGGACCATTCGATTCAAAATTTTCTGCCCTGGATCTGAATAACAAACAAGTTTC
GATCAGTGATGTTGTGAAGATTACCAAAGGCCCATCTGAGGGTAAACAAGGAGTTGTAAG
GCAAGTGTACAGAGGGATCATATTTCTTTATGTTGAGGGTGAGGAAGAAAATGGAGGATA
TTTGTGTTGCAAATCACAGTCGTGTGAGAAAGTTAAGCTTTTTACCGAAGAGTCCAATGA
CAAGACTGGTGGATTTGACGCTTCTGCTTTTGGAGATTCTGCATCCTCTCCGAAATCGCC
ACTATCTCCTGAAAAAGAGTGGCAGCCACCCAAGGAGAAATACATTAACTCCAACCAAGG
AAACAGTGCAAAGCCATCATCAGCTGGTGGAAACTGGGGTAGCTGGGATACTAATTCCAA
GAAAGAAACCAATGCTGGTGGTGGCTGGGGTACCGACTCAAAGAAAGAAACCAATGCTGG
TGGTGGCTGGGGTACCGACTCAAAGAAAGAAACCAGTGCTGGTGGAGATTGGGGTACCGA
CTCAAAGAAAGAAACCAGTGCTGGTGGAGATTGGGGTACTAACTCAAAGAAAGAAACCAA
TGCTGGTGATGGTGACAAACCAAGCAATGAAAACAAAGCAGCAGCTTGGGGAACTGCTAA
CGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4DQ33JQ 666 0 0
AAACAGTGCAAAGCCATCATCAGCTGGTGGAAACTGGGGTAGCTGGGATACTAATTCCAA
GAAAGAAACCAATGCTGGTGGTGGCTGGGGTACCGACTCAAAGAAAGAAACCAATGCTGG
TGGTGGCTGGGGTACCGACTCAAAGAAAGAAACCAGTGCTGGTGGAGATTGGGGTACCGA
CTCAAAGAAAGAAACCAGTGCTGGTGGAGATTGGGGTACTAACTCAAAGAAAGAAACCAA
TGCTGGTGATGGTGACAAACCAAGCAATGAAAACAAAGCAGCAGCTTGGGGAACTGCTAA
CGTTCAGGAGAATACAGGAAACAGCAATGATGGTTGGAGCAAGAAGTCGAGTGATGATGT
TAAAACGAGTGGAGAAGCTGATGATAATGCATGGGGAGGCAAAACAAATGTAGGAACGTC
GTCATCTGGTGACTCGCCGTGGGGAACCGGAGCTAAAAAATCCGGATGGTAATAAAAAAA
AGACCTGAAGTGACTTTGTAATTAGGTCTCACTATCTCTCTATCTTAGTCTAAAGCGCAA
GTTTAGTTGAAACGCTGCGAAGTGTCTTTCCTTTTTAGTCTTTTGTGGGCTTTCTCATGG
TTTGAAAAACTCTTTAGGTTTGTTTATGGCCGTGACTAAAGGCTCATCAATAACTGATTT
TGTGGC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL6774Contig1 914 2 2 U
GTGTGTTAGCCGTCTCCCTGTTCTCTCCGGGAAGCTCTGCGGCAAAACCATTGCTTCTAG
AGTTCAGCTCTCCGGCTGTTATCTTCTCTATGAAGTTGCTGGCTTTGCTCAAATTTCAGG
GATGGAGATGTTATTCAAGACATGTGGGAAGAACAACGTGGCCGGAACAGGGTTCGAAGA
AAGGAGAGACACTGCCTTTGGTGTAATGCAAAACGGAGTCGTTTCAGGGCACGGCTTCTA
CGCGACGACGTACGAATCTGTTTACGTTTTAGGACAATGCGAAGGCGATGTAGGAGATTC
AGATTGTAGCGGCTGCATCAAGAACGCGTTAGAGAAGGCTCAAGTGGAATGTGGAAGCTC
GAGTTCTGGTCAGATTTATCTTCACAAGTGTTTCATCGGTTATAAGTATTACCCTAATGG
TGTTCCCAGAGGAGCTTCTTCTTCTCCGTCAAGCTCTGGCTCTTCTTCGGGTTCTTCTTC
TTCAGGAACAACAGGCAAAACGGTGGCAATAATAGGAGGAACAGCTGGTCTTGGATTTCT
TATCATTTGTTTGCTTTTCGTCAAAAACTTGATGAGGAAGAAATATGATGATTATTGAAA
ATAAGGAGGGATGAAGCCAGCAAAAAGAGACCAACCCCGGAATAGAGGTAAAAGCTAATG
TGGATTCCGAGGTGCATGCAATTAATTTCCGATTCTGGATTCCTTCGGATTGATATTCTA
TTTGATTTTTTTTTTTTTTGCGGTGATGGATGAGGAAATGGGACCATTACATTATGTTAG
AGGGGACTCGAGTCTTCAAACATGTTTTCAAATTCTGTGGAAAAAAAAAAAAGAAAACTG
TAAATGAATCTGATCATCCGTAGCTGCTAAAGACGTTTGTCTAAATTTCCTATATTTTAA
GTTCGGTAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA76TF U 1
AF RR4AA76JQ C 442
BS 1 750 RR4AA76TF
BS 751 914 RR4AA76JQ

RD RR4AA76TF 750 0 0
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AGTTCAGCTCTCCGGCTGTTATCTTCTCTATGAAGTTGCTGGCTTTGCTCAAATTTCAGG
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AAGGAGAGACACTGCCTTTGGTGTAATGCAAAACGGAGTCGTTTCAGGGCACGGCTTCTA
CGCGACGACGTACGAATCTGTTTACGTTTTAGGACAATGCGAAGGCGATGTAGGAGATTC
AGATTGTAGCGGCTGCATCAAGAACGCGTTAGAGAAGGCTCAAGTGGAATGTGGAAGCTC
GAGTTCTGGTCAGATTTATCTTCACAAGTGTTTCATCGGTTATAAGTATTACCCTAATGG
TGTTCCCAGAGGAGCTTCTTCTTCTCCGTCAAGCTCTGGCTCTTCTTCGGGTTCTTCTTC
TTCAGGAACAACAGGCAAAACGGTGGCAATAATAGGAGGAACAGCTGGTCTTGGATTTCT
TATCATTTGTTTGCTTTTCGTCAAAAACTTGATGAGGAAGAAATATGATGATTATTGAAA
ATAAGGAGGGATGAAGCCAGCAAAAAGAGACCAACCCCGGAATAGAGGTAAAAGCTAATG
TGGATTCCGAGGTGCATGCAATTAATTTCCGATTCTGGATTCCTTCGGATTGATATTCTA
TTTGATTTTTTTTTTTTTTGCGGTGATGGA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AA76JQ 473 0 0
TTT
TCCGTCAAGCTCTGGCTCTTCTTCGGGTTCTTTTTCTTCAGGAACAACAGGCAAAACGGT
GGCAATAATAGGAGGAACAGCTGGTCTTGGATTTCTTATCATTTGTTTGCTTTTCGTCAA
AAACTTGATGAGGAAGAAATATGATGATTATTGAAAATAAGGAGGGATGAAGCCAGCAAA
AAGAGACCAACCCCGGAATAGAGGTAAAAGCTAATGTGGATTCCGAGGTGCATGCAATTA
ATTTCCGATTCTGGATTCCTTCGGATTGATATTCTATTTGATTTTTTTTTTTTTTGCGGT
GATGGATGAGGAAATGGGACCATTACATTATGTTAGAGGGGACTCGAGTCTTCAAACATG
TTTTCAAATTCTGTGGAAAAAAAAAAAAGAAAACTGTAAATGAATCTGATCATCCGTAGC
TGCTAAAGACGTTTGTCTAAATTTCCTATATTTTAAGTTCGGTAATGTCC

QA 4 473 4 473
DS 



AS 1 2

CO CL6775Contig1 1142 2 2 U
GCCGTGCTATTGGAGTCGGCGGGTTTGGTAGAGTGTACAAAGGAGTGCTTCAAGATGGGA
CGCAAGTAGCTGTCAAAAGAGGAAACCCTAAGTCTCAGCAAGGGTTTGCGGAGTTCAAGA
CGGAGATAGAAATGTTGTCTCAGTTCCGACACCGTCATTTGGTTTCTCTGATCGGTTACT
GCGACGAGAGCAAGGAGATGATTCTTGTTTACGAGTACATGAAGAACGGAACGTTGAAGA
GTCATCTCTACGGCTCTGGTTTACCTAGCTTGACTTGGAAGCAACGTCTTGAGATATGTA
TTGGATCGGCTAGAGGGTTGCATTATCTCCACACCGGTGACTCGAAATCTGTGATCCATA
GAGATGTTAAATCAGCAAACATATTGTTAGATGAGAATCTCATGGCAAAAGTTGCGGACT
TCGGACTGTCTAAGACCGGACCGGAGATAGACCGGACACATGTGAGTACCGCGGTTAAAG
GAAGTTTCGGTTATCTCGACCCTGAGTACTTTAGAAGACAGCAGCTCACTGAGAAGTCAG
ATGTTTACTCGTTCGGAGTCGTTATGTTCGAGGTTCTCTGCGCGAGACCGGTTATAGACC
CGACACTACCTAGAGAGATGGTGAACTTAGCTGAGTGGGCGATGAAGTGGCAGAAGAAAG
GACAGCTTGAGCATGTTATTGATCAGTCTTTGCGTGGTAAGATCGTACCTGATTCTCTCA
GGAAGTTTGGTGAGACAGGGGAGAAGTGTTTAGCTGATTATGGAGTCGATAGGCCGTCGA
TGGGAGGTGTGTTGTGGAATCTTGAGTATGCTTTGCAGCTTCAAGAAGCTGGCGTTGATT
GTGATCAAGAAGATGATAACAGTACCAACATGATCGGTGAGTTACCGCTAAGGTTTAATG
ATTATAATAGCCGTGGAGACACGAGTGTTAATGTTGGTGTAGTAGCTAGAGAGGGACGGT
TTGGAGAAGGAGAAGAGGAGTCGTGTGTTGATGATCTTTCAGGTGTTTCCATGAGTAAAG
TCTTCTCACAGCTCGTGAAATCTGAAGGAAGATAAAAGAATCTTTTGTTCTGCTCAAGAC
TTTTACTTATTTACATGATTAACGATTAGACTCTGGTTTAATTAACAGGTTCATTTCGGT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4H135TF U 1
AF RR4H135JQ C 351
BS 1 651 RR4H135TF
BS 652 1142 RR4H135JQ

RD RR4H135TF 651 0 0
GCCGTGCTATTGGAGTCGGCGGGTTTGGTAGAGTGTACAAAGGAGTGCTTCAAGATGGGA
CGCAAGTAGCTGTCAAAAGAGGAAACCCTAAGTCTCAGCAAGGGTTTGCGGAGTTCAAGA
CGGAGATAGAAATGTTGTCTCAGTTCCGACACCGTCATTTGGTTTCTCTGATCGGTTACT
GCGACGAGAGCAAGGAGATGATTCTTGTTTACGAGTACATGAAGAACGGAACGTTGAAGA
GTCATCTCTACGGCTCTGGTTTACCTAGCTTGACTTGGAAGCAACGTCTTGAGATATGTA
TTGGATCGGCTAGAGGGTTGCATTATCTCCACACCGGTGACTCGAAATCTGTGATCCATA
GAGATGTTAAATCAGCAAACATATTGTTAGATGAGAATCTCATGGCAAAAGTTGCGGACT
TCGGACTGTCTAAGACCGGACCGGAGATAGACCGGACACATGTGAGTACCGCGGTTAAAG
GAAGTTTCGGTTATCTCGACCCTGAGTACTTTAGAAGACAGCAGCTCACTGAGAAGTCAG
ATGTTTACTCGTTCGGAGTCGTTATGTTCGAGGTTCTCTGCGCGAGACCGGTTATAGACC
CGACACTACCTAGAGAGATGGTGAACTTAGCTGAGTGGGCGATGAAGTGGC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4H135JQ 792 0 0
GTGATCCATAGAGATGTTAAATCAGCAAACATATTGTTAGATGAGAATCTCATGGCAAAA
GTTGCGGACTTCGGACTGTCTAAGACCGGACCGGAGATAGACCGGACACATGTGAGTACC
GCGGTTAAAGGAAGTTTCGGTTATCTCGACCCTGAGTACTTTAGAAGACAGCAGCTCACT
GAGAAGTCAGATGTTTACTCGTTCGGAGTCGTTATGTTCGAGGTTCTCTGCGCGAGACCG
GTTATAGACCCGACACTACCTAGAGAGATGGTGAACTTAGCTGAGTGGGCGATGAAGTGG
CAGAAGAAAGGACAGCTTGAGCATGTTATTGATCAGTCTTTGCGTGGTAAGATCGTACCT
GATTCTCTCAGGAAGTTTGGTGAGACAGGGGAGAAGTGTTTAGCTGATTATGGAGTCGAT
AGGCCGTCGATGGGAGGTGTGTTGTGGAATCTTGAGTATGCTTTGCAGCTTCAAGAAGCT
GGCGTTGATTGTGATCAAGAAGATGATAACAGTACCAACATGATCGGTGAGTTACCGCTA
AGGTTTAATGATTATAATAGCCGTGGAGACACGAGTGTTAATGTTGGTGTAGTAGCTAGA
GAGGGACGGTTTGGAGAAGGAGAAGAGGAGTCGTGTGTTGATGATCTTTCAGGTGTTTCC
ATGAGTAAAGTCTTCTCACAGCTCGTGAAATCTGAAGGAAGATAAAAGAATCTTTTGTTC
TGCTCAAGACTTTTACTTATTTACATGATTAACGATTAGACTCTGGTTTAATTAACAGGT
TCATTTCGGTTT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6776Contig1 1190 2 4 U
GGAGAGCAAATGTGCCAAATGGAACCCAAAGAAACAAAGCCACCACCTAGAAAACAACCG
GGGCAGCATCCTTCTGTGCCTTTCGTTTGGGAAGAACTGCATGGCTTACCAAAGAAGAAC
TGGCAACCTTCACTAGCCGCTTTCGTGCCTTCTCCTCCTACACTTCCGCCACCTATCCCT
GTCCCAGTTAAACTGGTCACCTCCGTTCCTTTCTGTTGGGAAAAGACCCCTGGCAAACTG
CTACTCAAGCTTCCGCAACCACCACCACCGGAAACCGCCACGACTACTCCACTGCCACCT
CCGGTTCCAGTTCCGGTTAAGCTGGTTACGTCTGTTCCTTTTTGTTGGGAAGAAACTCCT
GGAAAACCGGCCCCATCTACCGCAAATGACCCACCTAAGCTTCCACAACCACCGTCTAAA
ACCGCCACGACTCCTCTATTACCACCTCCGGTTCCAGTTCCGGTTAAGCTGGTTACATCG
GTTCCATTCCATTGGGAAGAAACTCCTGGACAACCATACCCTTGCTTTGTTGATTTCGAC
CCAACTGACCCGCTTGACCGACCGCTGACACCACCTCCCATGTACGGTTGTGAGGCTGAA
ACCAGCAGTGATATTTATGATGACGCAAGTAGTGATTCCTTCAGCTTTGTGCCGATATCA
GGTGCTTTTACAGTGGATGAATTTGATGACAACCTGAATAGGGAGACGAGCTCGATACCA
ACATCGCCAGCCTATGATACTGATGACAGTACGAGCAGTTACATGACGGGAGCTTCGTTC
TTGGAAAAGCTTTTTCCACGTCTTCCACAGGAGAATTCTCACCATGTTCAGGTTACTACA
GCTCCTAATGACACCAACTTTGGCTTTCCTGAGAGGACGCAATATACACTCCGGGAGTTA
ATAATGATGAGCCGAAGGAGGAATTACATGAGAAAGCAGATTCCTTCCGTGGAATTTACA
AAATATGGAGCTGAGAGTTCCTGCCTCTTTGAGCTGGAAGGAAGTGAGTGGAAAAGATAC
CAACGAAGGATGAAGTTCCTTTAGAAGAAAACCGTATAAAAGTTCCTCTAGATTTGATCA
AAGAAACAGAACTCGTCGTAAAGTTGTTCTCTTTTCATAGAAGTAGAAACTTGTTTTTGT
ACAAAACAGAGCGTGAGTTTGAATACCAAACTCTTTCTTCTGCAAACGGT


BQ
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AF RR4FG09TF U 1
AF RR4FG09JQ C 459
BS 1 661 RR4FG09TF
BS 662 662 RR4FG09JQ
BS 663 764 RR4FG09TF
BS 765 1190 RR4FG09JQ

RD RR4FG09TF 764 0 0
GGAGAGCAAATGTGCCAAATGGAACCCAAAGAAACAAAGCCACCACCTAGAAAACAACCG
GGGCAGCATCCTTCTGTGCCTTTCGTTTGGGAAGAACTGCATGGCTTACCAAAGAAGAAC
TGGCAACCTTCACTAGCCGCTTTCGTGCCTTCTCCTCCTACACTTCCGCCACCTATCCCT
GTCCCAGTTAAACTGGTCACCTCCGTTCCTTTCTGTTGGGAAAAGACCCCTGGCAAACTG
CTACTCAAGCTTCCGCAACCACCACCACCGGAAACCGCCACGACTACTCCACTGCCACCT
CCGGTTCCAGTTCCGGTTAAGCTGGTTACGTCTGTTCCTTTTTGTTGGGAAGAAACTCCT
GGAAAACCGGCCCCATCTACCGCAAATGACCCACCTAAGCTTCCACAACCACCGTCTAAA
ACCGCCACGACTCCTCTATTACCACCTCCGGTTCCAGTTCCGGTTAAGCTGGTTACATCG
GTTCCATTCCATTGGGAAGAAACTCCTGGACAACCATACCCTTGCTTTGTTGATTTCGAC
CCAACTGACCCGCTTGACCGACCGCTGACACCACCTCCCATGTACGGTTGTGAGGCTGAA
ACCAGCAGTGATATTTATGATGACGCAAGTAGTGATTCCTTCAGCTTTGTGCCGATATCA
G*TGCTTTTACAGTGGATGAATTTGATGACAACCTGAATAGGGAGACGAGCTCGATACCA
ACATCGCCAGCCTATGATACTGATGACAGTACGAGCAGTTACAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4FG09JQ 732 0 0
TCCGGTTAAGCTGGTTACATCGGTTCCATTCCATTGGGAAGAAACTCCTGGACAACCATA
CCCTTGCTTTGTTGATTTCGACCCAACTGACCCGCTTGACCGACCGCTGACACCACCTCC
CATGTACGGTTGTGAGGCTGAAACCAGCAGTGATATTTATGATGACGCAAGTAGTGATTC
CTTCAGCTTTGTGCCGATATCAGGTGCTTTTACAGTGGATGAATTTGATGACAACCTGAA
TAGGGAGACGAGCTCGATACCAACATCGCCAGCCTATGATACTGATGACAGTACGAGCAG
TTACATGACGGGAGCTTCGTTCTTGGAAAAGCTTTTTCCACGTCTTCCACAGGAGAATTC
TCACCATGTTCAGGTTACTACAGCTCCTAATGACACCAACTTTGGCTTTCCTGAGAGGAC
GCAATATACACTCCGGGAGTTAATAATGATGAGCCGAAGGAGGAATTACATGAGAAAGCA
GATTCCTTCCGTGGAATTTACAAAATATGGAGCTGAGAGTTCCTGCCTCTTTGAGCTGGA
AGGAAGTGAGTGGAAAAGATACCAACGAAGGATGAAGTTCCTTTAGAAGAAAACCGTATA
AAAGTTCCTCTAGATTTGATCAAAGAAACAGAACTCGTCGTAAAGTTGTTCTCTTTTCAT
AGAAGTAGAAACTTGTTTTTGTACAAAACAGAGCGTGAGTTTGAATACCAAACTCTTTCT
TCTGCAAACGGT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL6777Contig1 729 2 3 U
GTACTAAGCTCTTTCTTGAAGACATAGCTAGAGATATCCAGGCGGCCGAGCCAGAGTGGA
GAATTGTGCTGCTGAGGTACTTCAATCCTGTGGGTGCACACGAGAGTGGTAGAATCGGCG
AGGATCCAAAGGGTATCCCCAATAACCTCATGCCTTACATACAGCAAGTAGCTGTTGGAC
GCCTACCTGAACTCAACGTCTATGGACATGACTATCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTGA
GGGGCTACATACATGTGATGGATTTGGCTGATGGACATATCGCTGCGCTAAGGAAGCTAT
TTGATGATCCAAAGATTGGCTGTACTGCTTACAATCTAGGGACTGGACGAGGAACGTCTG
TGTTAGAAATGGTTACTGCCTTTGAGAAAGCTTCTGACAAGAAAATACCAATCAAGCTTT
GTCCGAGAAGGCCAGGAGATGCAACGGCAGTTTATGCTTCAACAGAGAGAGCTGAGAAAG
AACTTGGCTGGAAGGCAAAGTATGGAGTGGACGAGATGTGCAGAGACCAGTGGAATTGGG
CAAACAACAATCCATGGGGTTACCAGAAGAGCATTGACTTTTCACTCTTTCTCTGATTCA
CTCAATATACAAAGAAAAGTGTTACATACACACATCATATAGTTTGCTTTGCTTTCCATG
TAACGAACGGGTCTTGTTACCTCTATGAATAAAACAGCTAGTTGACTGATGTATACTTTC
TATGGACCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A964TF U 127
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CTGAACTCAACGTCTATGGACATGACTATCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTGAGGGGCT
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AAATGGTTACTGCCTTTGAGAAAGCTTCTGACAAGAAAATACCAATCAAGCTTTGTCCGA
GA

QA 1 302 1 302
DS 

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GCCTACCTGAACTCAACGTCTATGGACATGACTATCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTGA
GGGGCTACATACATGTGATGGATTTGGCTGATGGACATATCGCTGCGCTAAGGAAGCTAT
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TGTTAGAAATGGTTACTGCCTTTGAGAAAGCTTCTGACAAGAAAATACCAATCAAGCTTT
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AACTTGGCTGGAAGGCAAAGTATGGAGTGGACGAGATGTGCAGAGACCAGTGGAATTGGG
CAAACAACAATCCATGGGGTTACCAGAAGAGCATTGACTTTTCACTCTTTCTCTGATTCA
CTCAATATACAAAGAAAAGTGTTACATACACACATCATATAGTTTGCTTTGCTTTCCATG
TAACGAACGGGTCTTGTTACCTCTATGAATAAAACAGCTAGTTGACTGATGTATACTTTC
TATGGACCG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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TTCATGCTTCCATCCCAAGGAGAACTTACAGAGATGCAATCCACAATTGATTGATCTAAC
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TCTTGGAGATTTGTTCCAAGCTTGTTCTTGTTTTAAATATAACTCTTTCTTGGTG


BQ
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AF RR4AF73JQ C 1
AF RR4AF73TF U 1
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AAAGGTAGAGAAAGCTAAGGTAGAATATGGCTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCT
TCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATCATGGACGAAGATGAACAGCTTA
ACTCTGTTTCACTCTCTTCCTCCTCCCCTCTCGGGTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAGGCT
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TCAACGCCAAGCAACAACGCTCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCAGCAGAATCATG
ACAACTTACGAAGTACCCTCACCACTCACAACAACAAGAGCAGCATGATCACTACTAATG
TTCATGCTTCCATCCCAAGGAGAACTTACAGAGATGCAATCCACAATTGATTGATCTAAC
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TCTTGGAGATTTGTTCCAAGCTTGTTCTTGTTTTAAATATAACTCTTTCTTGGTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4AF73TF 715 0 0
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ACTCTGTTTCACTCTCTTCCTCCTCCCCTCTCGGGTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAGGCT
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CTAAATCTTCTCAGACCGGAAGGAGACCTCAGCATCCTAAGCAAGGCAGGGTTAGTTCCT
TCAACGCCAAGCAACAACGCTCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCAGCAGAATCATG
ACAACTTACGAAGTACCCTCACCACTCACAACAACAAGAGCAGCATGATCACTACTAATG
TTCATGCTTCCATCCCAAGGAGAACTTACAGAGATGCAATCCACAATTGATTGATCTAAC
AAATATTCTGCAAGATTCATGGTTTTCTATGGAATTGATTTATTATATTATTTTATAGAT
GCATAAGATTTATTTGTTTGTAAATCAGGAAGAATAATGATTCTATACAAGGAAGGAAGT
TCTTGGAGATTTGTTCCAAGCTTGTTCTTGTTTTAAATATAACTCTTTCTTGGTG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGGACTCGGAAGAATAGTCAGTCTCCGGGACGCTTTAGGTTAGATCCGAATAAAAACACG
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TTTTGATAATCGAACTTATTATAGAATT


BQ
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AF RR4D893TF U 1
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BS 590 928 RR4D893JQ

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ACATCATCGTCTCTCTCCCTCTTTCTATCTCACATGGGTTGCTGCGTTAGCTCCGGTACT
GCTGATCGGACCAACGAGAACGTGTCCGACAACAAGAACACAGACATTGTCGAAGAAGAA
ACGGTCGTCAAAGAAGTCTTGTCGGAGACAACATTTCACAATAGTTCCCCTAATGTCCAA
AGCTCAGCCATGGATGATCCGTTGGACAGGAAGATCCAGGGAACAGAGGAAGAAAAATTC
AAAGTTGATCCGGACTTGTGTACGAACCGACCCGTTTCGATTGACCCGGAAGAAGGATCG
GAGGTTTCGGAGATATGTGTTTCTTCAATGAATGTGATGAATGGGTACGGTGAGGAAGAA
GAGAAGCAGACGAAATCTCAGAGATCTCCGGCAAAAACTCGGACACGGGTCACGGGTAAT
AATTATCCGACCCGAAGAACCGATCAATCTCCTCGTAAGAGAAACAACGGAGCGTGTAAT
ACTGGAGCGAGAGTCGGGTCGGGTATGAGAGACCCGGGTGAGAGATCCG

QA 1 589 1 589
DS 

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TCAGCCATGGATGATCCGTTGGACAGGAAGATCCAGGGAACAGAGGAAGAAAAATTCAAA
GTTGATCCGGACTTGTGTACGAACCGACCCGTTTCGATTGACCCGGAAGAAGGATCGGAG
GTTTCGGAGATATGTGTTTCTTCAATGAATGTGATGAATGGGTACGGTGAGGAAGAAGAG
AAGCAGACGAAATCTCAGAGATCTCCGGCAAAAACTCGGACACGGGTCACGGGTAATAAT
TATCCGACCCGAAGAACCGATCAATCTCCTCGTAAGAGAAACAACGGAGCGTGTAATACT
GGAGCGAGAGTCGGGTCGGGTATGAGAGACCCGGGTGAGAGATCCGGAAGAAGGTCGAGA
TCGCCGGCGACAAATAGATCCGTGATGGATTCGAATCAGAGTCGGGTGGGTGTGGCAAGG
ACTCGGAAGAATAGTCAGTCTCCGGGACGCTTTAGGTTAGATCCGAATAAAAACACGTCG
GATCAGCAACAATCTCAAAACTACGGTTATACCACTGAAGAACTGTTAGATAACCCTCTT
GTTTCATTAGAGTGTTTCATATTTCTCTGAAAAAAATATTCCGAGAAAGACGTCTCTCAT
TTTTTTAAAAAAGCTGGATATCCGTAATGCCACTTACCTTACCCCTGTATTTCATTTTTT
TGATAATCGAACTTATTATAGAATT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGTCGGCCGCATCATTGCTAGGGTTTTACATTTCGTAAGCGTCGTCCACGCTCCTTCGAC
ATCTGAAACAATTGTTGTCTGAATCACCATTTGCCATGGAATCGTCTAGTCAATAAGGTT
TTTCCCTCTCGAAAAATCCATCGGTCAATAAGCAGTGTGTCGTATTTTGATTCGCGTTAT
TACCCCGACCGAAGATGGCGACTTTGAACCCGTTCGATCTCTTAGATGTTGACGCTGAGG
ATCCAAGCCAGATTGTTGTGGCTTTACCGAAGAAGGTTGAGAAAGCAGCTCCTCTTCCGC
CTGCTAAGAACACTAAGTTGCAAACCAAACAGCCTCCTTCTCAACCTGTGAGGGAGTCAA
GGAATGCTCCTTCAGGAGCTCGTGGTGGTGCTGGAGGTCGTGACGGTCGTGGACAGAGAG
ATGGGGGAAACCAAAGGCATGGAGGAGCACTTGCTCCGGCTATCGGAGACAGTGCTCAGT
TCCCATCGTTGGGCAAGTAAAGACCCCTGTTGGTCCTTGAGCCTCTTATCAATCTCTACA
ACTTTATTTAGTTTGATTTTTGTTCTTAGTTCTATCAATTTTTGTTACACTTTCTCTACA
AAACGAGTTTGGAGACTTTTATGTTATGAAAAAAAAAACAGTATTGTGATCC


BQ
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AF RR4FL57TF U 1
AF RR4FL57JQ C 270
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BS 616 652 RR4FL57JQ

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ATCTGAAACAATTGTTGTCTGAATCACCATTTGCCATGGAATCGTCTAGTCAATAAGGTT
TTTCCCTCTCGAAAAATCCATCGGTCAATAAGCAGTGTGTCGTATTTTGATTCGCGTTAT
TACCCCGACCGAAGATGGCGACTTTGAACCCGTTCGATCTCTTAGATGTTGACGCTGAGG
ATCCAAGCCAGATTGTTGTGGCTTTACCGAAGAAGGTTGAGAAAGCAGCTCCTCTTCCGC
CTGCTAAGAACACTAAGTTGCAAACCAAACAGCCTCCTTCTCAACCTGTGAGGGAGTCAA
GGAATGCTCCTTCAGGAGCTCGTGGTGGTGCTGGAGGTCGTGACGGTCGTGGACAGAGAG
ATGGGGGAAACCAAAGGCATGGAGGAGCACTTGCTCCGGCTATCGGAGACAGTGCTCAGT
TCCCATCGTTGGGCAAGTAAAGACCCCTGTTGGTCCTTGAGCCTCTTATCAATCTCTACA
ACTTTATTTAGTTTGATTTTTGTTCTTAGTTCTATCAATTTTTGTTACACTTTCTCTACA
AAACGAGTTTGGAGA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4FL57JQ 383 0 0
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CAGCCTCCTTCTCAACCTGTGAGGGAGTCAAGGAATGCTCCTTCAGGAGCTCGTGGTGGT
GCTGGAGGTCGTGACGGTCGTGGACAGAGAGATGGGGGAAACCAAAGGCATGGAGGAGCA
CTTGCTCCGGCTATCGGAGACAGTGCTCAGTTCCCATCGTTGGGCAAGTAAAGACCCCTG
TTGGTCCTTGAGCCTCTTATCAATCTCTACAACTTTATTTAGTTTGATTTTTGTTCTTAG
TTCTATCAATTTTTGTTACACTTTCTCTACAAAACGAGTTTGGAGACTTTTATGTTATGA
AAAAAAAAACAGTATTGTGATCC

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 2

CO CL6783Contig1 1047 2 2 U
GGACTTCAGACTTATAAAAAAACCTCGTTCGTTCAACGCGACGAATCAGCAATGGATTCT
CCTCCTCTTCCTCCGACGAAGCTTGATTATCATGTAGACATGTTTAAACTTCAATCCCAA
GCCAGCTGACACCGGTTTAATCCAATTCCCCGGTTCCGATTTCAACTTCTCCGTTCAAGA
TGTTCGCTCCAAAGATGGAATCGTTCTCCATTACGGAGTTTTCGAGGGTTGTTCGAATCC
TGAAGATATTGAGAAGGGGAAACAAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAATCAAGGCGCAAACT
CAACTCCAGGTTGCACTCAGCTGGACACTTGCTAGATTTGTGTATGCAGAAGATTGGGTT
AGGACATTTGGAGCCTGGGAAAAGGCTACCATTTCCCTGACGGTCCTTTTGTGGAATACA
AAGGAGGCGTTCCACAGGCTGAACTACAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGGAGGCAGAGGCTA
ATGAACTGATATCCAAAGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATGAAGAGGCAT
CCGTGCTCTGTGGTGGCAGTCTTCCTGATTATATTCCCAAGGGCAGCACACCCCGAGTCT
TAAGGTTAGGTGAAAACCCTGGGTGTCCGTGTGGTGGAACCCATGTCTCCTATATATCTG
ATATCATAAGCATGAAGATCACACAGATAAGAACAAAGAAGGGAATGACAAAAGTTTTCT
ACACCATTGCATCTTAATTCCAGTATACAAAAGAAAAAGTCAAGGGAAGGAATTGAAGTG
ATGACGACTGTTTCAATCAGTTGGCTTCAACAGCAAGCAGCCTCTCCTGTGCTCAACAGC
CACGAATTAGTATTTTGTGGGTATTTATTTTTTATCAAAACTACTAAACGACTCTCCCTA
TCATTGATAAGTCGTATTAATGATATGATATTGATGTGATATGATCTTCCACTCACCCTC
TTAATTAGCATTACAATATTGACTCTTGGTTTGTATAATCATACCAAACATTTTGTCCGA
TAATTTTTATTGATGCATCACTTTGGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C128TF U 1
AF RR4C128JQ C 247
BS 1 599 RR4C128TF
BS 600 1047 RR4C128JQ

RD RR4C128TF 599 0 0
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CCTCCTCTTCCTCCGACGAAGCTTGATTATCATGTAGACATGTTTAAACTTCAATCCCAA
GCCAGCTGACACCGGTTTAATCCAATTCCCCGGTTCCGATTTCAACTTCTCCGTTCAAGA
TGTTCGCTCCAAAGATGGAATCGTTCTCCATTACGGAGTTTTCGAGGGTTGTTCGAATCC
TGAAGATATTGAGAAGGGGAAACAAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAATCAAGGCGCAAACT
CAACTCCAGGTTGCACTCAGCTGGACACTTGCTAGATTTGTGTATGCAGAAGATTGGGTT
AGGACATTTGGAGCCTGGGAAAAGGCTACCATTTCCCTGACGGTCCTTTTGTGGAATACA
AAGGAGGCGTTCCACAGGCTGAACTACAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGGAGGCAGAGGCTA
ATGAACTGATATCCAAAGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATGAAGAGGCAT
CCGTGCTCTGTGGTGGCAGTCTTCCTGATTATATTCCCAAGGGCAGCACACCCCGAGTC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4C128JQ 801 0 0
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GGGAAACAAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAATCAAGGCGCAAACTCAACTCCAGGTTGCAC
TCAGCTGGACACTTGCTAGATTTGTGTATGCAGAAGATTGGGTTAGGACATTTGGAGCCT
GGGAAAAGGCTACCATTTCCCTGACGGTCCTTTTGTGGAATACAAAGGAGGCGTTCCACA
GGCTGAACTACAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGGAGGCAGAGGCTAATGAACTGATATCCAA
AGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATGAAGAGGCATCCGTGCTCTGTGGTGG
CAGTCTTCCTGATTATATTCCCAAGGGCAGCACACCCCGAGTCTTAAGGTTAGGTGAAAA
CCCTGGGTGTCCGTGTGGTGGAACCCATGTCTCCTATATATCTGATATCATAAGCATGAA
GATCACACAGATAAGAACAAAGAAGGGAATGACAAAAGTTTTCTACACCATTGCATCTTA
ATTCCAGTATACAAAAGAAAAAGTCAAGGGAAGGAATTGAAGTGATGACGACTGTTTCAA
TCAGTTGGCTTCAACAGCAAGCAGCCTCTCCTGTGCTCAACAGCCACGAATTAGTATTTT
GTGGGTATTTATTTTTTATCAAAACTACTAAACGACTCTCCCTATCATTGATAAGTCGTA
TTAATGATATGATATTGATGTGATATGATCTTCCACTCACCCTCTTAATTAGCATTACAA
TATTGACTCTTGGTTTGTATAATCATACCAAACATTTTGTCCGATAATTTTTATTGATGC
ATCACTTTGGT

QA 11 801 11 801
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6785Contig1 769 2 3 U
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GACTCAAAATCTGCTAGTGGTGAAAACTCTGCCAAAGAAGTCGAAATTCAAACATCCAAA
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AATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCACACAACACTCAGAGCTTAAACAGGCACTCAGTAAA
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GAAGACAACTAGTACAGCCATATATGATAATTAGTACCAACTAGAGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP62TF U 1
AF RR4DQ79TF U 1
BS 1 671 RR4DP62TF
BS 672 672 RR4DQ79TF
BS 673 769 RR4DP62TF

RD RR4DP62TF 769 0 0
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GAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAATTCTGCTGTTAGTTCTGTGTCCGAAGCCGCATCT
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GAAGACAACTAGTACAGCCATATATGATAATTAGTACCAACTAGAGTTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4DQ79TF 721 0 0
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GAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAATTCTGCTGTTAGTTCTGTGTCCGAAGCCGCATCT
ACTGTTAGTTCAAAGTTAGCCAAATCACCAGAGGCGAAGAGCCGCATGAAATCTTCCAAA
GAACAATTGATGAAGACTTTCAAAGAACTAGAAGACCTTAACAGTAAAATAGTGAGCGAA
AATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCACACAACACTCAGAGCTTAAACAGGCACTCAGTAAA
TGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGAATCTTACCTCTTCAAGTTCTTCATCTTCA
TCTTCATCTTCCTCTCAGTCTCAGAAATCTCAACAGTCTAAACAATCTCATGAGTCTCAA
CAGTCTCAGCACGGCAGTACCATGAAGACTCAGACCAATTGATGCGACTCAAATCATCAA
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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GCTTCACCTTTCTGACAATGGCGACGTCTCTTTTTCACCACCACGAAGTAAAGGTGTATC
TTTGAGGAACGTTACCTTGGAGCTAGCTGTGGAGAAGGATGCTCTTGCTGCACTCTACGG
AAGAGATGGAGCCGGTCTAGATAATCTTCAACAGATTTCAGGAGCTAGAGTGGACGTGAA
GGATGATGCTGCCACAGAAGTTGAAACAATGGTCTTACTCTCTGGGAATCCTGAGCATAC
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GGCTTTTTTTTTGTTTGATTTCATTTACTTCATGCTTGTATTTAAAAGAACATAACATTT
GCACTGTGCAAACATATTACGTTTTACTCTTACGGTTAATAAATTAATGCTATAACGTCA
ATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI47TF U 1
AF RR4EI47JQ C 286
BS 1 657 RR4EI47TF
BS 658 786 RR4EI47JQ

RD RR4EI47TF 657 0 0
GCATGTTTCTTCTAAACTAAGGGAGAACCTATTGCCAACGAAGGACTTGGAAGAAATTAG
AGCTGCATATGAAAATGGAGGAGCAAATTATAATCTCTCGGTATCAGATGGTGAACAAGA
CGTGAAGATGGTCAGAAGCGGTACAGATGATCAATTGATGCACACTGAGGTAGGTAATGA
AGTGAACGGCTTTACACCACCGAGCTTGCTGGAGAATGGCCTGACACAGGGATTGAAACA
GCTTCACCTTTCTGACAATGGCGACGTCTCTTTTTCACCACCACGAAGTAAAGGTGTATC
TTTGAGGAACGTTACCTTGGAGCTAGCTGTGGAGAAGGATGCTCTTGCTGCACTCTACGG
AAGAGATGGAGCCGGTCTAGATAATCTTCAACAGATTTCAGGAGCTAGAGTGGACGTGAA
GGATGATGCTGCCACAGAAGTTGAAACAATGGTCTTACTCTCTGGGAATCCTGAGCATAC
TCGTACAGCCATGTCTTTGATCGTTTCAATCCTTGCTGATCATTGATATAAATACAGCAA
CAACACCAACGGACCAGAGATAACACATTCTATTGTCGCGTTTTGCAGCTACTGCTTTTT
TTTTGTAAATGGAGATCAGTTGTTCTCCACTTTACTTTTACACTACTTCGGAAACCA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4EI47JQ 501 0 0
AAGTAAAGGTGTATCTTTGAGGAACGTTACCTTGGAGCTAGCTGTGGAGAAGGATGCTCT
TGCTGCACTTTACGGAAGAGATGGAGCCGGTCTAGATAATCTTCAACAGATTTCAGGAGC
TAGAGTGGACGTGAAGGATGATGCTGCCACAGAAGTTGAAACAATGGTTTTACTTTTTGG
GAATCCTGAGCATATTCGTACAGCCATGTCTTTGATCGTTTCAATCCTTGCTGATCATTG
ATATAAATACAGCAACAACACCAACGGACCAGAGATAACACATTTTATTGTCGCGTTTTG
CAGCTACTGCTTTTTTTTTGTAAATGGAGATCAGTTGTTTTCCACTTTACTTTTACACTA
CTTCGGAAACCATCAGGCTTTTTTTTTGTTTGATTTCATTTACTTCATGCTTGTATTTAA
AAGAACATAACATTTGCACTGTGCAAACATATTACGTTTTACTCTTACGGTTAATAAATT
AATGCTATAACGTCAATATTT

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL6787Contig1 993 2 4 U
GGACACAAACACTTTCTTCCTTTCTCTTTCTCTGTGGGCAGCCATGGAAGTGTGTTGGCA
GATACAGACACCGACGAGTCTCAGACCCGGTTTCCAGCAAAAGGGTCGGCTCAAGATCAA
TACTTTTATTGGTTTTCTTCCTCGCCCCATTTCTAGTCTTGCTTCGTCGGAAAGCCAATA
CAACTCAAATGGGTTTCTGCATCAGATCACAGCAAGTTCAGATTTCTCAAGGAAGAAGCA
AGGAAGAATGGCAGCTTCAGGGCCCATAAGCTCATCTCCCAGAGGTTTTGGGAGAAGAAC
AACAGTAGGAAGTGCTCAGAAAAGAACTCAGAAGAAGAGCAATGAAAAAGATAGCAATGC
AACAACTTCCACAGTAACTAATGAGGGTTTAGGAGTCAGTAAGTTTCCCGAAGCTAAAGC
TGATGTACAGAAACAAGGTTCTGCTGTTTTGGACGAGAGCAATGTGTTAGATGGAAGTGA
CCAGGTGGGGAAGAAACCAATCGAGGATGACGTTTTGTTAGAACAAAAGCTAAAAGCTGA
AAGAGAGAATCTTCTTAGGAAGGAGATAGAAGCGCTTGCAGAGGAAACATTAGCAAGAGG
TGATAGAATGTTCGTGTATCCTCTTGTGGCCAAACCTGATGAAGGCATAGAAGTGTTTCT
CAACAGGACCCTGTCGTCTTTGAGCAACGAACCTGATGTTTTGATCATGGGGGCGTTTAA
CGACTGGAGATGGAAATCTTTCTCAAGGAGACTGGAAAAGACAGAGCTCCATGGAGATTG
GCTCTCATGTCTCCTTCACATCCCCAAAGAAGCTTATACGATGGACTTTGTGTTTTTCAA
CGGGCAAAGTGTTTATGACAACAATGACTCAAAAGACTTCTGTGTAGAGATCAAAGGTGG
GATGGACAGAGTTGAGTTTGAGAATTTTCTTCTCTTTGTAACGTTCCAAAGCATTCAAAG
ATCATATGGATTATTATGCCTTTGTAATTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C304TF U 1
AF RR4C304JQ C 291
BS 1 495 RR4C304TF
BS 496 496 RR4C304JQ
BS 497 640 RR4C304TF
BS 641 993 RR4C304JQ

RD RR4C304TF 640 0 0
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GATACAGACACCGACGAGTCTCAGACCCGGTTTCCAGCAAAAGGGTCGGCTCAAGATCAA
TACTTTTATTGGTTTTCTTCCTCGCCCCATTTCTAGTCTTGCTTCGTCGGAAAGCCAATA
CAACTCAAATGGGTTTCTGCATCAGATCACAGCAAGTTCAGATTTCTCAAGGAAGAAGCA
AGGAAGAATGGCAGCTTCAGGGCCCATAAGCTCATCTCCCAGAGGTTTTGGGAGAAGAAC
AACAGTAGGAAGTGCTCAGAAAAGAACTCAGAAGAAGAGCAATGAAAAAGATAGCAATGC
AACAACTTCCACAGTAACTAATGAGGGTTTAGGAGTCAGTAAGTTTCCCGAAGCTAAAGC
TGATGTACAGAAACAAGGTTCTGCTGTTTTGGACGAGAGCAATGTGTTAGATGGAAGTGA
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AAGAGAGAATCTTCTTAGGAAGGAGATAGAAGCGCTTGCAGAGGAAACATTAGCAAGAGG
TGATAGAATGTTCGTGTATCCTCTTGTGGCCAAACCTGAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4C304JQ 703 0 0
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ATGGAAGTGACCAGGTGGGGAAGAAACCAATCGAGGATGACGTTTTGTTAGAACAAAAGC
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TAGCAAGAGGTGATAGAATGTTCGTGTATCCTCTTGTGGCCAAACCTGATGAAGGCATAG
AAGTGTTTCTCAACAGGACCCTGTCGTCTTTGAGCAACGAACCTGATGTTTTGATCATGG
GGGCGTTTAACGACTGGAGATGGAAATCTTTCTCAAGGAGACTGGAAAAGACAGAGCTCC
ATGGAGATTGGCTCTCATGTCTCCTTCACATCCCCAAAGAAGCTTATACGATGGACTTTG
TGTTTTTCAACGGGCAAAGTGTTTATGACAACAATGACTCAAAAGACTTCTGTGTAGAGA
TCAAAGGTGGGATGGACAGAGTTGAGTTTGAGAATTTTCTTCTCTTTGTAACGTTCCAAA
GCATTCAAAGATCATATGGATTATTATGCCTTTGTAATTTTGG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL6788Contig1 732 2 2 U
GGACTGTTCTCTAATCTAATTTCACCTTTCATTAAGAAACCTAAACACTTTACCTTATTA
ACAAAGCCTCTTGAGTTTCTGAAAAATGTCGGAAGAATTCGACGAATCTGAGATCATTTT
CCCCGACAACTGCTTCCCAACTCGCCGGCGTGATGAAGAGAACGAGAAAGAGAATCTTCC
AGTTGACAACCGAGAAAACTCGAGAAGGAGACGGAGCAAAACGACGCCGTTGCCTTCACC
GGCGGCATTCTCGACGTCGCTTCCGGTTAATATTCCGGGTGATATGATGCGGAGGTACTC
GGAGGATGATGAAGAATCTGATGGAGGAAGGAAAATGATTCCGCCGCATCTCATCGTGGG
ACGGAGGACGGAAGGTTATCAAATGGCGTTTTCCGTTTGTACAGGTAACGGAAGAACACT
CAAAGGACGAGATCTGAGCCGGGTTCGTAATTCGGTTCTCAGGTTAACCGGTTTTTTGGA
GGCTTAGTTTCAGACCGGTTCCCTATTTATCAAAATTTTCCATTTTCCAATTTTTTTCTC
TCTTTAGCGGAAGAAATCAGCGGTCTTATTGTTTTATATAGTTTTATTTGAAGTTCAAAA
GGAAAATGTTAAAAAACATTTATTTCCTTGTTTATTTATTTAGATTCTTAATTTTGATTG
TTCTCAAATGTAATAGAGAAAAGCAGAAGAAAATAATTTCAGATTACTGTTCTTTTTTTG
GGGATCAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H728TF U 1
AF RR4H728JQB C 254
BS 1 597 RR4H728TF
BS 598 732 RR4H728JQB

RD RR4H728TF 597 0 0
GGACTGTTCTCTAATCTAATTTCACCTTTCATTAAGAAACCTAAACACTTTACCTTATTA
ACAAAGCCTCTTGAGTTTCTGAAAAATGTCGGAAGAATTCGACGAATCTGAGATCATTTT
CCCCGACAACTGCTTCCCAACTCGCCGGCGTGATGAAGAGAACGAGAAAGAGAATCTTCC
AGTTGACAACCGAGAAAACTCGAGAAGGAGACGGAGCAAAACGACGCCGTTGCCTTCACC
GGCGGCATTCTCGACGTCGCTTCCGGTTAATATTCCGGGTGATATGATGCGGAGGTACTC
GGAGGATGATGAAGAATCTGATGGAGGAAGGAAAATGATTCCGCCGCATCTCATCGTGGG
ACGGAGGACGGAAGGTTATCAAATGGCGTTTTCCGTTTGTACAGGTAACGGAAGAACACT
CAAAGGACGAGATCTGAGCCGGGTTCGTAATTCGGTTCTCAGGTTAACCGGTTTTTTGGA
GGCTTAGTTTCAGACCGGTTCCCTATTTATCAAAATTTTCCATTTTCCAATTTTTTTCTC
TCTTTAGCGGAAGAAATCAGCGGTCTTATTGTTTTATATAGTTTTATTTGAAGTTCA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4H728JQB 479 0 0
ACGTCGCTTCCGGTTAATATTCCGGGTGATATGATGCGGAGGTACTCGGAGGATGATGAA
GAATCTGATGGAGGAAGGAAAATGATTCCGCCGCATCTCATCGTGGGACGGAGGACGGAA
GGTTATCAAATGGCGTTTTCCGTTTGTACAGGTAACGGAAGAACACTCAAAGGACGAGAT
CTGAGCCGGGTTCGTAATTCGGTTCTCAGGTTAACCGGTTTTTTGGAGGCTTAGTTTCAG
ACCGGTTCCCTATTTATCAAAATTTTCCATTTTCCAATTTTTTTCTCTCTTTAGCGGAAG
AAATCAGCGGTCTTATTGTTTTATATAGTTTTATTTGAAGTTCAAAAGGAAAATGTTAAA
AAACATTTATTTCCTTGTTTATTTATTTAGATTCTTAATTTTGATTGTTCTCAAATGTAA
TAGAGAAAAGCAGAAGAAAATAATTTCAGATTACTGTTCTTTTTTTGGGGATCAGTTCC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL6789Contig1 710 2 2 U
GGGGTCCTTCACCTTATTCCTATCTTCCTTTTATCTCTGTTCTGTTTAAATAGCACTCTG
AAACATCGTCAGATTCACCTTATATCCTCTTCCAGAATGGATATCGTAATCGAACACAAC
CCTTCAAGCATAAAGTTATCTGAACTTGGAGTCATGTCATGGCCTAAATGGTCTTGTCAG
CCGGGGAGATATGCATTGGTGTTTGAAGAAAGAGAGACATGCTATTTGGTGAAGGGAAAG
GTGAAGGTGTATCCAAAAGGTTCATCATCAGAGTTTGTAGAGTTTGGTGCAGGTGACCTT
GTGACCATCCCAAAGGGGCTTAGCTGCACTTGGGAAGTATCTCTTTTCATCGACAAACAC
TACAAGTCCGATCCTCCTACTTAATTTTTCCTTACTTACGATCTAGGTTTGGGTTAGTCT
TTATCACCAGGAAGCATATAAGATTCTGTATTCAGACTAATAAAGTATAGAAGACAATGC
TTAGGATATGTACAAAAGCTCCTCCTAGAGTTATGTTTCTTTGTTTGCCAGAACTATAAT
CTCAAGAGTATAAGTCCTCTAGCTAGTTCAGAGAGACTAAGGTAAAGGGGGGTTTTAGCT
CATGGGAGTAACTGTATTCCTAAGCATCTGGAAATTCGTCTGAAGTATCACAGATAAGAG
TTCCATATTCGTGCTAATGAAAAGTTGCTAATGCTAACTTGAGGATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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AF RR4DY12TF U 1
AF RR4DY12JQ C 57
BS 1 402 RR4DY12TF
BS 403 710 RR4DY12JQ

RD RR4DY12TF 402 0 0
GGGGTCCTTCACCTTATTCCTATCTTCCTTTTATCTCTGTTCTGTTTAAATAGCACTCTG
AAACATCGTCAGATTCACCTTATATCCTCTTCCAGAATGGATATCGTAATCGAACACAAC
CCTTCAAGCATAAAGTTATCTGAACTTGGAGTCATGTCATGGCCTAAATGGTCTTGTCAG
CCGGGGAGATATGCATTGGTGTTTGAAGAAAGAGAGACATGCTATTTGGTGAAGGGAAAG
GTGAAGGTGTATCCAAAAGGTTCATCATCAGAGTTTGTAGAGTTTGGTGCAGGTGACCTT
GTGACCATCCCAAAGGGGCTTAGCTGCACTTGGGAAGTATCTCTTTTCATCGACAAACAC
TACAAGTCCGATCCTCCTACTTAATTTTTCCTTACTTACGAT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4DY12JQ 654 0 0
TCTGAAACATCGTCAGATTCACCTTATATCCTCTTCCAGAATGGATATCGTAATCGAACA
CAACCCTTCAAGCATAAAGTTATCTGAACTTGGAGTCATGTCATGGCCTAAATGGTCTTG
TCAGCCGGGGAGATATGCATTGGTGTTTGAAGAAAGAGAGACATGCTATTTGGTGAAGGG
AAAGGTGAAGGTGTATCCAAAAGGTTCATCATCAGAGTTTGTAGAGTTTGGTGCAGGTGA
CCTTGTGACCATCCCAAAGGGGCTTAGCTGCACTTGGGAAGTATCTCTTTTCATCGACAA
ACACTACAAGTCCGATCCTCCTACTTAATTTTTCCTTACTTACGATCTAGGTTTGGGTTA
GTCTTTATCACCAGGAAGCATATAAGATTCTGTATTCAGACTAATAAAGTATAGAAGACA
ATGCTTAGGATATGTACAAAAGCTCCTCCTAGAGTTATGTTTCTTTGTTTGCCAGAACTA
TAATCTCAAGAGTATAAGTCCTCTAGCTAGTTCAGAGAGACTAAGGTAAAGGGGGGTTTT
AGCTCATGGGAGTAACTGTATTCCTAAGCATCTGGAAATTCGTCTGAAGTATCACAGATA
AGAGTTCCATATTCGTGCTAATGAAAAGTTGCTAATGCTAACTTGAGGATTCCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL6790Contig1 1245 2 2 U
GGGACAGACTCCTCAGCTGAGACTGCCTCGCATTAAGGAAGTAGAGGTTAATGGGATTAC
GTTTAAGGTCAAGTACTGTGACACTTGCATGCTCTATAGGCCTCCTCGCTGCTCTCACTG
CTCCATCTGCAACAACTGCGTTGAAAAGTTTGACCATCACTGCCCTTGGGTTGGCCAATG
TATTGGCAGGAGGAACTATAGATTCTTCTTTATGTTTGTCTTCTCCACGACCCTTCTCTG
TATATATGTGTTTGCCTTCTGCTGGGTCTATATAAGGAAGATCACTGAATCAGAGCATAC
AACCATTTGGAAAGCAATGCTCAAAACTCCTGCCTCTATTGTTCTTATAATCTACACATT
CATATCAATGTGGTTTGTTGGTGGCTTAACAGCTTTCCATCTCTATCTCATCAGCACAAA
CCAGACTACTTATGAGAATTTCAGATACAGATATGATCGGAGAAGCAACCCACACAACAA
GGGAGTGGTTAACAGCTTCAAAGAAACGTTTTGCTCTGCAATCCCTCCTTCAAAGAACGA
CTTCAGAGCCATGGTCCATCGTGAACCTCCGTTGCCTCCTAGGTCTGTGGCAGGGGGTTT
CATGAGTCCAAACATGGGTAAAGCCAGTGATGACATCGAGATGGGGAGGAAGGCTGTTTG
GGCTGACATGGGTTCAGCGATGTCAGAACATGGTGATGGCAAACATGGTAACAACGAAAG
GTTACATGTTAAGGACGGTGAGTTAGGAGAGCTTTCACCAGACGTCAGGACGACGGTTGA
CGAACAGAGTGATAGGCCGAGTATGCACCCGAGACGCTCGAGCTGGGGAAGGAAAAGTGG
GAGCTGGGATATGTCGCCAGAAGTTATGGCCTTAGCAGCTAGAGTGGGAGGAGAACAAAA
CCAGAACGGTGGTGGAAGCAGCAGCGGAGCTGGTCTAGTGACTGAGAACAGGCCTACTTA
AGTCAGCTACACGATTTTAGCACGGAAGGAAGACAGAACAGAGCTGAGTATTTATTCAGC
TTAAAATCAGTTTATGCAGGCTTGTGGTTTGTTTGAGGCAAAAGAACTAGCAATGTTCTT
AATGTGGAAAGTGTTTTTTTGTGTTTGCTTTGTTGTCTTAAGCAAAGAGGTTGAATTGGT
GTGTTTGTGTTACTTGTGTGTATGAGTGAGCTTCTTGTGGATTGTTCAGACTGTTCTTAT
TTTAGCTGTGTTTATACATTTAACCAGAGACAAATGTTTTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BY20TF U 1
AF RR4BY20JQ C 534
BS 1 629 RR4BY20TF
BS 630 1245 RR4BY20JQ

RD RR4BY20TF 629 0 0
GGGACAGACTCCTCAGCTGAGACTGCCTCGCATTAAGGAAGTAGAGGTTAATGGGATTAC
GTTTAAGGTCAAGTACTGTGACACTTGCATGCTCTATAGGCCTCCTCGCTGCTCTCACTG
CTCCATCTGCAACAACTGCGTTGAAAAGTTTGACCATCACTGCCCTTGGGTTGGCCAATG
TATTGGCAGGAGGAACTATAGATTCTTCTTTATGTTTGTCTTCTCCACGACCCTTCTCTG
TATATATGTGTTTGCCTTCTGCTGGGTCTATATAAGGAAGATCACTGAATCAGAGCATAC
AACCATTTGGAAAGCAATGCTCAAAACTCCTGCCTCTATTGTTCTTATAATCTACACATT
CATATCAATGTGGTTTGTTGGTGGCTTAACAGCTTTCCATCTCTATCTCATCAGCACAAA
CCAGACTACTTATGAGAATTTCAGATACAGATATGATCGGAGAAGCAACCCACACAACAA
GGGAGTGGTTAACAGCTTCAAAGAAACGTTTTGCTCTGCAATCCCTCCTTCAAAGAACGA
CTTCAGAGCCATGGTCCATCGTGAACCTCCGTTGCCTCCTAGGTCTGTGGCAGGGGGTTT
CATGAGTCCAAACATGGGTAAAGCCAGTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4BY20JQ 712 0 0
AGAACGACTTCAGAGCCATGGTCCATCGTGAACCTCCGTTGCCTCCTAGGTCTGTGGCAG
GGGGTTTCATGAGTCCAAACATGGGTAAAGCCAGTGATGACATCGAGATGGGGAGGAAGG
CTGTTTGGGCTGACATGGGTTCAGCGATGTCAGAACATGGTGATGGCAAACATGGTAACA
ACGAAAGGTTACATGTTAAGGACGGTGAGTTAGGAGAGCTTTCACCAGACGTCAGGACGA
CGGTTGACGAACAGAGTGATAGGCCGAGTATGCACCCGAGACGCTCGAGCTGGGGAAGGA
AAAGTGGGAGCTGGGATATGTCGCCAGAAGTTATGGCCTTAGCAGCTAGAGTGGGAGGAG
AACAAAACCAGAACGGTGGTGGAAGCAGCAGCGGAGCTGGTCTAGTGACTGAGAACAGGC
CTACTTAAGTCAGCTACACGATTTTAGCACGGAAGGAAGACAGAACAGAGCTGAGTATTT
ATTCAGCTTAAAATCAGTTTATGCAGGCTTGTGGTTTGTTTGAGGCAAAAGAACTAGCAA
TGTTCTTAATGTGGAAAGTGTTTTTTTGTGTTTGCTTTGTTGTCTTAAGCAAAGAGGTTG
AATTGGTGTGTTTGTGTTACTTGTGTGTATGAGTGAGCTTCTTGTGGATTGTTCAGACTG
TTCTTATTTTAGCTGTGTTTATACATTTAACCAGAGACAAATGTTTTACCGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL6791Contig1 347 2 1 U
GAACTACCTCCACCGTATCGGAAGGAGTGGGAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAA
CTTTGTGACCAAGGATGATGAGAGGATGTTGTTTGATATTCAGAAGTTTTACAATGTCGT
TGTTGAGGAGCTTCCTTCTAACGTTGCTCATCTCCTGTGAGAAGGACAAGTTCGCTCTTG
CTGTTCTATAACACCGGAGAAGAAAGGTTTTCTTTGTTTTTTGAAAGGCACAACAACTAC
TCTTTGATTTGGTTTTGACACTTCTCTCTCTATTTACGAACATATCTCTCTCTATCTCTC
TTTTCCGACCATTTTTATATTTAGGATCATATGGAATGTTTATTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GF12JQ C 1
AF RR4GF12TF U 1
BS 1 347 RR4GF12TF

RD RR4GF12JQ 347 0 0
GAACTACCTCCACCGTATCGGAAGGAGTGGGAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAA
CTTTGTGACCAAGGATGATGAGAGGATGTTGTTTGATATTCAGAAGTTTTACAATGTCGT
TGTTGAGGAGCTTCCTTCTAACGTTGCTCATCTCCTGTGAGAAGGACAAGTTCGCTCTTG
CTGTTCTATAACACCGGAGAAGAAAGGTTTTCTTTGTTTTTTGAAAGGCACAACAACTAC
TCTTTGATTTGGTTTTGACACTTCTCTCTCTATTTACGAACATATCTCTCTCTATCTCTC
TTTTCCGACCATTTTTATATTTAGGATCATATGGAATGTTTATTTCC

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4GF12TF 347 0 0
GAACTACCTCCACCGTATCGGAAGGAGTGGGAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAA
CTTTGTGACCAAGGATGATGAGAGGATGTTGTTTGATATTCAGAAGTTTTACAATGTCGT
TGTTGAGGAGCTTCCTTCTAACGTTGCTCATCTCCTGTGAGAAGGACAAGTTCGCTCTTG
CTGTTCTATAACACCGGAGAAGAAAGGTTTTCTTTGTTTTTTGAAAGGCACAACAACTAC
TCTTTGATTTGGTTTTGACACTTCTCTCTCTATTTACGAACATATCTCTCTCTATCTCTC
TTTTCCGACCATTTTTATATTTAGGATCATATGGAATGTTTATTTCC

QA 1 347 1 347
DS 



AS 1 2

CO CL6792Contig1 1240 2 2 U
GGAAGATGGTAACGCCAGTTATAAGAACCGTTGATCTCCGGTCCGACACGGTGACCAAGC
CAACTAAGTCAATGCGTTCAGCTATGGCGAACGCGGAAGTAGACGACGACGTTTTGGGGA
GCGATCCAACGGCAGTGCTTTTGGAAAGAGAGGTGGCTGAGATCGCAGGAAAAGAAGCGG
CCATGTTTGTTCCGTCAGGGACAATGGGGAATCTGATAAGCGTTTTAGTCCATTGCGATG
AGAGAGGGAGCGAAGTGATTCTTGGAGATGATTCTCACATTCATATTTATGAAAACGGTG
GCGTTTCAAGCCTCGGTGGAGTGCACCCAAGAACGGTGAAGAATGAAGAGGATGGGACGA
TGGAGATTAGTTCTATTGAAGCTGCTATGAGGAGTCCCAAAGGAGATCTCCATTATCCGG
TTACTAAGCTTATATGTCTTGAGAACACTCAAGCAAATTGTGGAGGTAAATGCTTACCTA
TAGAATATATAGACAAGGTTGGAGAGTTAGCCAAGAAACATGGATTGAAGCTTCACATTG
ATGGAGCTCGTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTGAAGAGGATTGTTC
AAGCCGCTGACTCTGTATCGATTTGTTTGTCGAAAGGCATAGGTGCACCTGTCGGTTCGG
TAATCGTGGGAAGCAAAAGTTTCATCACCAAAGCAAGGTGGTTAAGGAAAACCTTGGGTG
GAGGAATGAGACAGATAGGTGTGCTCTGTGCCGCCGCATTGGTGGCTCTCCGTGATAACG
TCGCTAAGCTCGACGATGACCACAAGAAAGCCAAGATCTTGGCAGAAGGACTGAACCGGA
TTGAACGGTTAAGAGTGAACGTCGCGGCAGTGGAAACCAACATCATATACGTAGATCTAC
CAAAAGATCCCAAGTTTGGAGCTGAAGACGCATGTAAGAGTTTGGAAGTTCTAGGTGTGC
TTGTCATACCTCAAACTACATTCAGAATCAGGATTGTTCTGCACCACCAAATCTCAGATA
GCGACTTGGAATATGCGCTCTCTTGTTTTGAGAAACTGTTTAGCTCGGTGCCAGAAGAGA
AGGTTTGATTTGAAGTTATTCACGTGTTGGACTATGTCATAGTACTTGAATCTATTTTCT
TGCTTTACAAATTGAAATAGTTTGGTCAAGCAATAGACAACTATCTTTATTATAATCCAA
GTTATTGAACAATTTATGAAGTAAACTACTTTTACCTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G983TF U 1
AF RR4G983JQ C 474
BS 1 638 RR4G983TF
BS 639 1240 RR4G983JQ

RD RR4G983TF 638 0 0
GGAAGATGGTAACGCCAGTTATAAGAACCGTTGATCTCCGGTCCGACACGGTGACCAAGC
CAACTAAGTCAATGCGTTCAGCTATGGCGAACGCGGAAGTAGACGACGACGTTTTGGGGA
GCGATCCAACGGCAGTGCTTTTGGAAAGAGAGGTGGCTGAGATCGCAGGAAAAGAAGCGG
CCATGTTTGTTCCGTCAGGGACAATGGGGAATCTGATAAGCGTTTTAGTCCATTGCGATG
AGAGAGGGAGCGAAGTGATTCTTGGAGATGATTCTCACATTCATATTTATGAAAACGGTG
GCGTTTCAAGCCTCGGTGGAGTGCACCCAAGAACGGTGAAGAATGAAGAGGATGGGACGA
TGGAGATTAGTTCTATTGAAGCTGCTATGAGGAGTCCCAAAGGAGATCTCCATTATCCGG
TTACTAAGCTTATATGTCTTGAGAACACTCAAGCAAATTGTGGAGGTAAATGCTTACCTA
TAGAATATATAGACAAGGTTGGAGAGTTAGCCAAGAAACATGGATTGAAGCTTCACATTG
ATGGAGCTCGTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTGAAGAGGATTGTTC
AAGCCGCTGACTCTGTATCGATTTGTTTGTCGAAAGGC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4G983JQ 767 0 0
TTACCTATAGAATATATAGACAAGGTTGGAGAGTTAGCCAAGAAACATGGATTGAAGCTT
CACATTGATGGAGCTCGTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTGAAGAGG
ATTGTTCAAGCCGCTGACTCTGTATCGATTTGTTTGTCGAAAGGCATAGGTGCACCTGTC
GGTTCGGTAATCGTGGGAAGCAAAAGTTTCATCACCAAAGCAAGGTGGTTAAGGAAAACC
TTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGTGTGCTCTGTGCCGCCGCATTGGTGGCTCTCCGT
GATAACGTCGCTAAGCTCGACGATGACCACAAGAAAGCCAAGATCTTGGCAGAAGGACTG
AACCGGATTGAACGGTTAAGAGTGAACGTCGCGGCAGTGGAAACCAACATCATATACGTA
GATCTACCAAAAGATCCCAAGTTTGGAGCTGAAGACGCATGTAAGAGTTTGGAAGTTCTA
GGTGTGCTTGTCATACCTCAAACTACATTCAGAATCAGGATTGTTCTGCACCACCAAATC
TCAGATAGCGACTTGGAATATGCGCTCTCTTGTTTTGAGAAACTGTTTAGCTCGGTGCCA
GAAGAGAAGGTTTGATTTGAAGTTATTCACGTGTTGGACTATGTCATAGTACTTGAATCT
ATTTTCTTGCTTTACAAATTGAAATAGTTTGGTCAAGCAATAGACAACTATCTTTATTAT
AATCCAAGTTATTGAACAATTTATGAAGTAAACTACTTTTACCTCGT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6795Contig1 657 2 6 U
GGTTGAAACTTTGAAACCTTTTTATAATGAATGAAACAAATCTTTTAAGCGTCTGCGTTT
AACAAAGTAATAACGTTTGCGTTTTCAGGAGGCGGTTTAATATATTTGCCGATTGCTTTC
TGGCGGGGACTTTTTCTTCTCATTCTATTAAGCTTATCTTTACATCTCTTCTTCTGCTCC
TCTTTCTCTACGTTCTTTCTTTGCCTCTCTTTCTCTAATGACCCTTGCCACACCACCTCA
CCAGTCAACGGCCATAGCCAGTGACCCACACGACGGTCTGAATCTGCTTCCTCTGCAAAA
TCCTCGTCCATCGTATTCAAAGTTTTGTAACCGAACCAGTCCACCCACATTTTCCCTCTC
CGGTCTTTCTGTTTGTGTTGCTCCTCCATCAAACCCGTCACGGGATCTATGTAGACGATG
CGTCTTGCGCTGTGGTATGCCCATACGTTCACCAAAAGCTCTAGTACCCGTGAATAGCAA
TGCTTGTCTTTGGTTAAACTCAAATAGCAACGGTTTGTTCTATGATGCTCTTCATACATT
TGTGCATCCAAAGAATCCACAAACATTCGTGAGAACATGACAAACTCTACGAAGGATCTT
GTTGGCAACACCCAGCTCTGCATCACAGACCATGTATCTCCATTCTCAGGCATTGGA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CS65JQ U 1
AF RR4GB07JQ U 1
BS 1 92 RR4CS65JQ
BS 93 93 RR4GB07JQ
BS 94 123 RR4CS65JQ
BS 124 124 RR4GB07JQ
BS 125 384 RR4CS65JQ
BS 385 657 RR4GB07JQ

RD RR4CS65JQ 384 0 0
GGTTGAAACTTTGAAACCTTTTTATAATGAATGAAACAAATCTTTTAAGCGTCTGCGTTT
AACAAAGTAATAACGTTTGCGTTTTCAGGAGGGGGTTTAATATATTTGCCGATTGCTTTC
TGGGGGGGACTTTTTCTTCTCATTCTATTAAGCTTATCTTTACATCTCTTCTTCTGCTCC
TCTTTCTCTACGTTCTTTCTTTGCCTCTCTTTCTCTAATGACCCTTGCCACACCACCTCA
CCAGTCAACGGCCATAGCCAGTGACCCACACGACGGTCTGAATCTGCTTCCTCTGCAAAA
TCCTCGTCCATCGTATTCAAAGTTTTGTAACCGAACCAGTCCACCCACATTTTCCCTCTC
CGGTCTTTCTGTTTGTGTTGCTCC

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4GB07JQ 657 0 0
GA
TTGAGACTTTGAGACCTTTTTATAATGAATGAAACAAATCTTTTAAGCGTCTGCGTTTAA
CAAAGTAGTAACGTTTGCGTTTTCAGGAGGCGGTTTAATATATTTGCCGATTGCTTTCTG
GCGGTGACTTTTTCTTCTCATTCTATTAAGCTTATCTTTACTTCTCTTCTTCTGCTCCTC
TTTCTCTACGTTCTTTCTTTGCCTCTCTTTCTCTAATGACCCTTGCCACACCACCTCACC
AGTCAATGGCCATAGCCAGTGACCCACACGACGGTCTGAGTCTGCTTCCTCTGCAAGATC
CTCGTCCATCGTTTTCAGAGTTTTGTAACTGAACCAGTCCACCCACATTTTCCCTCTCCG
GTCTTTCTGTTTGTGTTGCTCCTCCATCAAACCCGTCACGGGATCTATGTAGACGATGCG
TCTTGCGCTGTGGTATGCCCATACGTTCACCAAAAGCTCTAGTACCCGTGAATAGCAATG
CTTGTCTTTGGTTAAACTCAAATAGCAACGGTTTGTTCTATGATGCTCTTCATACATTTG
TGCATCCAAAGAATCCACAAACATTCGTGAGAACATGACAAACTCTACGAAGGATCTTGT
TGGCAACACCCAGCTCTGCATCACAGACCATGTATCTCCATTCTCAGGCATTGGA

QA 3 657 3 657
DS 



AS 1 2

CO CL6796Contig1 1230 2 10 U
GGGACTCACAGACAGAGCTCTCTTGACTCACAGACGACTTCTCACTCTACAAAGATCTCT
CTCTCTGTCTCATCACTACATCTATATTCCTCGCTGCTCCTTGGTGTTCCTTTTCTGGAA
ATCAGTACATTTTGATACTCGACACTAGTGTGCTATTCAAAAAATGTTTCGCCGCAAGAC
TACTTCGCAAGCTGAACAAGAGAATAATGAGGCAGCTCTCAGAGAGGCAAAGATCAAAGA
GCTCAAGACTCTCATTGGCGAGCTCTCAGGAAGGAGTTCGCTCTACTGTTCAGATCCTTG
TCTTAGGAGATATCTCGAAGCTAGGAACTGGAATGTTGGCAAAGCCAAGAAGATGCTTGA
AGAGACGCTGAAATGGAGATCCACCTTTAAACCTGAGGAGATCCGATGGGATGAGGTTTC
AGGTGAAGGAGAGACTGGTAAAGTCTACAAAGCAGGATTCCATGACAGGAGTGGAAGAAC
GGTTCTTATACTCAGACCCGGTTTGCAGAACACCAAGTCGTTGGAGAACCAGATGAAACA
TTTGGTGTATCTCATTGAGAATGCTATCATGAATCTCCCGGATGATCAAGAACAGATGTC
TTGGCTCATTGATTTTACGGACTGGTCGCTGAGCACAAGTGTGCCTATCAAATCCGCCAG
AAAACCATCAACATACTGCAGAATCACTACCCTGAGAGACTCGCTGTCGCTTTCCTCTAT
AACCCTCCAAGGCTCTTTGAGGCATTCTGGAAGATAGTGAAGTACTTCATTGATGCAAAG
ACATTCACCAAGGTGAAGTTTGTTTACCCAAAGAACACTGAGAGCGTGGAGCTTATGAGC
TCGTTTTTCGACGAGGAGAACCTCCCAACGGAATTTGGAGGGAAAGCTTTGTTGCAGTAT
AACCATGAAGAGTTCTCCAAGCAAATGAGCCAAGACGATGCTAAAACTGCAGGCTTTTGG
GGACTGGTTCGTCATAGTAATAATAACAACAATCACCAGCAGCAGCAGTCGAGCAGCGGA
TTTTCTGGAGCAGAGATTGCTCCTGAGCCAATCCAAACCAACCCTTAAACTAGCTGGCTT
TGTAAGGCTATGTATTGTTCTTGTAACCAAACCCTTTACAAATGGGGGACTAATATAGCT
CTTTTGATGCTAAGAGGAGAGACTTAGAGAGAGAAGAGGTTGTAAGATTTTAGATATGGC
GTTTGATTAAATAAAAACAGATTTATGTGT


BQ
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AF RR4E362TF U 1
AF RR4E362JQ C 410
BS 1 651 RR4E362TF
BS 652 652 RR4E362JQ
BS 653 663 RR4E362TF
BS 664 664 RR4E362JQ
BS 665 731 RR4E362TF
BS 732 732 RR4E362JQ
BS 733 741 RR4E362TF
BS 742 742 RR4E362JQ
BS 743 778 RR4E362TF
BS 779 1230 RR4E362JQ

RD RR4E362TF 797 0 0
GGGACTCACAGACAGAGCTCTCTTGACTCACAGACGACTTCTCACTCTACAAAGATCTCT
CTCTCTGTCTCATCACTACATCTATATTCCTCGCTGCTCCTTGGTGTTCCTTTTCTGGAA
ATCAGTACATTTTGATACTCGACACTAGTGTGCTATTCAAAAAATGTTTCGCCGCAAGAC
TACTTCGCAAGCTGAACAAGAGAATAATGAGGCAGCTCTCAGAGAGGCAAAGATCAAAGA
GCTCAAGACTCTCATTGGCGAGCTCTCAGGAAGGAGTTCGCTCTACTGTTCAGATCCTTG
TCTTAGGAGATATCTCGAAGCTAGGAACTGGAATGTTGGCAAAGCCAAGAAGATGCTTGA
AGAGACGCTGAAATGGAGATCCACCTTTAAACCTGAGGAGATCCGATGGGATGAGGTTTC
AGGTGAAGGAGAGACTGGTAAAGTCTACAAAGCAGGATTCCATGACAGGAGTGGAAGAAC
GGTTCTTATACTCAGACCCGGTTTGCAGAACACCAAGTCGTTGGAGAACCAGATGAAACA
TTTGGTGTATCTCATTGAGAATGCTATCATGAATCTCCCGGATGATCAAGAACAGATGTC
TTGGCTCATTGATTTTACGGACTGGTCGCTGAGCACAAGTGTGCCTATCAA*TCCGCCAG
AAA*CCATCAACATACTGCAGAATCACTACCCTGAGAGACTCGCTGTCGCTTTCCTCTAT
AACCCTCCAAG*CTCTTTGAG*CATTCTGGAAGATAGTGAAGTACTTCATTGATGCAA
GACATCCCCAAGGTGAAGT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4E362JQ 821 0 0
GGATGAGG
TTCAGGTGAAG*AGAGACTGGTAAAGTCTACAAAGCAGGATTCCATGACAG*AGTGGAAG
AACGGTTCTTATACTCAGACCCGGTTTGCAGAACACCAAGTCGTTGGAGAACCAGATGAA
ACATTTGGTGTATCTCATTGAGAATGCTATCATGAATCTCCCGGATGATCAAGAACAGAT
GTCTTGGCTCATTGATTTTACGGACTGGTCGCTGAGCACAAGTGTGCCTATCAAATCCGC
CAGAAAACCATCAACATACTGCAGAATCACTACCCTGAGAGACTCGCTGTCGCTTTCCTC
TATAACCCTCCAAGGCTCTTTGAGGCATTCTGGAAGATAGTGAAGTACTTCATTGATGCA
AAGACATTCACCAAGGTGAAGTTTGTTTACCCAAAGAACACTGAGAGCGTGGAGCTTATG
AGCTCGTTTTTCGACGAGGAGAACCTCCCAACGGAATTTGGAGGGAAAGCTTTGTTGCAG
TATAACCATGAAGAGTTCTCCAAGCAAATGAGCCAAGACGATGCTAAAACTGCAGGCTTT
TGGGGACTGGTTCGTCATAGTAATAATAACAACAATCACCAGCAGCAGCAGTCGAGCAGC
GGATTTTCTGGAGCAGAGATTGCTCCTGAGCCAATCCAAACCAACCCTTAAACTAGCTGG
CTTTGTAAGGCTATGTATTGTTCTTGTAACCAAACCCTTTACAAATGGGGGACTAATATA
GCTCTTTTGATGCTAAGAGGAGAGACTTAGAGAGAGAAGAGGTTGTAAGATTTTAGATAT
GGCGTTTGATTAAATAAAAACAGATTTATGTGT

QA 9 821 9 821
DS 



AS 1 2

CO CL6797Contig1 768 2 2 U
GTAGTTATGATAACAGTGGAAGTCAATATAGCTCATCTATACAAGCCGATCAACTAGCTG
GACAATGGTACGCGAGAGCCTCCGGTCTTATGCCTATTGTAGATGAAGACAAGGCTAGAA
AGGCTTTGGAAAAAGTTTTCAACTTCAATGTGATGAAGATTAAAGATGGAAAACGCGGGG
CCGTAAACGGGATGCACCCTGATGGGAAAGTTGATACAGCATCGATGCAATCACGAGAGA
TATGGTCTGGTGTGACTTACGCGCTGTCTGCAACAATGATCCAAGAAGGTTTAGTTGACA
AGGCGTTTCAGACTGCGAGTGGGGTATATGAAGCTGCCTGGTCAGAAACCGGACTAGGTT
ACTCGTTTCAAACGCCTGAAGCTTGGAACACGAATGATCAGTATAGATCACTGACTTACA
TGCGTCCCCTTGCCATATGGGCTATGCAATGGGCGCTGACTAGAACCAGTAACAAACAGA
AACAATTTGGTCTGGAATCTGAAGTAGAACCAGAGCCTAGTTCCCTAATGAAACATGATA
TCGGTTTCTCCAGGGTTTCTAGGCTTCTTAACCTACCAAATGAAGCATCAGCGAAAGGCA
CAGTTCAGACTTTGTTCGAGTATGCTTGCCGGAGAATGATGTCATAAATTCATTTTGCAG
TTTATCATGCAAACATTGTTTCCAAAACTTAATTTGTTTTCCACATGTTCTTGTTGTATT
GTAAATAATGCAACCTATAGGGCTTACTACGCAACAGATTTATCCCCG


BQ
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AF RR4DV11JQ C 1
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ACTCGTTTCAAACGCCTGAAGCTTGGAACACGAATGATCAGTATAGATCACTGACTTACA
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QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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BS 687 997 RR4C283JQ

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G

QA 1 661 1 661
DS 



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TATGATCATGTGTATGATGTGAAATCAATATAATCTTTTAGTGTT


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BS 721 945 RR4EG86JQ

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TTTTAGTTTTTCCAGCCGACGATTGTGGGCTCTCACAGCCACATCGTCGGTCGGACTTTC
CTTTTCTATTTTCGTTTTGTCTTTTCGTGTTTCAAAACTTCAAGAGTCTACAAAATCAGA
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CTTGTTTTGCTTGCGATGGATTTCCTGTGGTTCTGTTCTCCATCTTTGGTCTTTTGGCTA
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CTGGCTCGTGGTTTCATCTCTTTATGAAGCAATATAATGAGTTCGTGTGTGATGTTAACC
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DS 

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TCTCAATGATAGAGGCTTCGGCCTTCTAATCATCCTGGCGTAGGTCGTCGAATGGTAAAA
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TCTCTTTATGAAGCAATATAATGAGTTCGTGTGTGATGTTAACCGGAATAAAGTTCGCCT
GAAGATGTTATCCTTCTTGTCTCTCTCAAAGCTCAGTTAAACTGCTTGCTAGGGTGTCTT
GTTCTTATGATTTAGATCTGTTCATTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTGTAGTTATCTTAGCT
TCTGGGGATTCTGTTTCATCCGCCAGCTTTACTTTCCAGAAAAATCTTATATTTTGTCTG
GCTTTGGACTCTGGGGGTTTTTGTTAAACTTGTCAGCTTCGATGTATGATCATGTGTATG
ATGTGAAATCAATATAATCTTTTAGTGTT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

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TTCAGGAGGAGTTCCAAAGTTGATACCTATGACAGCAGAGGAGCTCGAACAGAGGATGTT
GTTTTCATCTCTACAGAGACCTCTAATCTCCAAGCAAATCGAATGGCTTAGCGAAGGAAA
ATCTCTCAGCTTTTTCTTTGTGACCAGAGAAGGCAAGACAGCCTCTGGTTTGATGGTTAG
GACTATGATCACTTGTGCCTTAAAAATGGTGGGCTCAGCCAACAAATATTTCTGGGATCA
AGTATATATAAGCCCACATAGCCTTTATACTTGTGAAGACACTACCCAAAGCATATACTG
CCAATTGCTTTGTGGACTTCTACAACGAGACAATGTATCTCGCCTTGGTGCACCATTTGC
TTCTTCCTTCCTCAAAGTAATCAAGTTCTTGGAAGATCACTGGAATGAATTATGCTCCAA
CATAAGGACAGGTCGTGTCAGCGACTGGATCACAGACCCTCAATGCCTTTCTGAGATCGG
TCTGTATAGGTACCGTTTGGGAGATGTCTTACGAGTGACTGGTTTCTACAACAACGCGCC
AGAGTTTCAAGTCGTGGGAAGAAAAAAAGTTGTCCTGAGCACCGACATGGACAAGACCTA
CGAAGAAGATCTCCTCAAGGCCGTGACAAACGCTAAGCTCCTGCTCGAGCCACATGACAT
AATGCTCACTGACTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCCTCGTTTCCAGGACACTACGTGCT
CTACTGGGAACTCGGGAGCAAAGTCAAAGACGCTAAGCTCGAGCCTGACCCCGAGGTCAT
GGAGGAGTGCTGCTTCACCGTCGAGGAGTCTCTCGACTCTATTTATAGAAAAGGACGTAA
GAATGATAAGAACATCGGACCGCTCGAGATCAAGGTTGTCAAGAGGGGCGCGTTTGATGA
GCTGATGAACTTCTTTTTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAGTCAGTACAAGACGCCGAGATC
GGTGATGAATGAAGAAGCGGTGAAGATATTAGAGGAGAGTGTAGTTGCCAAGTTTGTTAG
CAAGAAGACTCCGTCTTGGGAGCTGCATGAGCTGCATTCCAGTCGATAAGACCGCTGTTA
CAATTTGCATAATCTATTTATATAAAGAAAAGCTACTCTCTTCTCTGGTGTTGCCACGTC
ACTAAATAAAGTGATTAGCGTTCGACACGTGATCATTTGTGTAATACGCTACGTTTCATT
TAAAAAATGTGTTCGTCATTTTCTTGGGC


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AF RR4DG52TF U 1
AF RR4DG52JQ C 458
BS 1 710 RR4DG52TF
BS 711 711 RR4DG52JQ
BS 712 762 RR4DG52TF
BS 763 763 RR4DG52JQ
BS 764 789 RR4DG52TF
BS 790 790 RR4DG52JQ
BS 791 807 RR4DG52TF
BS 808 808 RR4DG52JQ
BS 809 821 RR4DG52TF
BS 822 1289 RR4DG52JQ

RD RR4DG52TF 821 0 0
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TTCAGGAGGAGTTCCAAAGTTGATACCTATGACAGCAGAGGAGCTCGAACAGAGGATGTT
GTTTTCATCTCTACAGAGACCTCTAATCTCCAAGCAAATCGAATGGCTTAGCGAAGGAAA
ATCTCTCAGCTTTTTCTTTGTGACCAGAGAAGGCAAGACAGCCTCTGGTTTGATGGTTAG
GACTATGATCACTTGTGCCTTAAAAATGGTGGGCTCAGCCAACAAATATTTCTGGGATCA
AGTATATATAAGCCCACATAGCCTTTATACTTGTGAAGACACTACCCAAAGCATATACTG
CCAATTGCTTTGTGGACTTCTACAACGAGACAATGTATCTCGCCTTGGTGCACCATTTGC
TTCTTCCTTCCTCAAAGTAATCAAGTTCTTGGAAGATCACTGGAATGAATTATGCTCCAA
CATAAGGACAGGTCGTGTCAGCGACTGGATCACAGACCCTCAATGCCTTTCTGAGATCGG
TCTGTATAGGTACCGTTTGGGAGATGTCTTACGAGTGACTGGTTTCTACAACAACGCGCC
AGAGTTTCAAGTCGTGGGAAGAAAAAAAGTTGTCCTGAGCACCGACATGGACAAGACCTA
CGAAGAAGATCTCCTCAAGGCCGTGACAAACGCTAAGCTCCTGCTCGAGC*ACATGACAT
AATGCTCACTGACTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCCTCGTT*CCAGGACACTACGTGCT
CTACTGGGA*CTCGGGAGCAAAGTCAA*GACGCTAAGCTCG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4DG52JQ 832 0 0
CACTGGAATGAATTATGCTCCAACATAAGGACAGGTCGTGTCAGCGACTGGATCACAGAC
CCTCAATGCCTT*CTGAGATCGGTCTGTATAGGTACCGTTTGGGAGATGTCTTACGAGTG
ACTGGTTTCTACAACAACGCGCCAGAGTTTCAAGTCGTGGGAAGAAAAAAAGTTGTCCTG
AGCACCGACATGGACAAGACCTACGAAGAAGATCTCCTCAAGGCCGTGACAAACGCTAAG
CTCCTGCTCGAGCCACATGACATAATGCTCACTGACTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCC
TCGTTTCCAGGACACTACGTGCTCTACTGGGAACTCGGGAGCAAAGTCAAAGACGCTAAG
CTCGAGCCTGACCCCGAGGTCATGGAGGAGTGCTGCTTCACCGTCGAGGAGTCTCTCGAC
TCTATTTATAGAAAAGGACGTAAGAATGATAAGAACATCGGACCGCTCGAGATCAAGGTT
GTCAAGAGGGGCGCGTTTGATGAGCTGATGAACTTCTTTTTGTCTCGAGGCTCTTCTGTG
AGTCAGTACAAGACGCCGAGATCGGTGATGAATGAAGAAGCGGTGAAGATATTAGAGGAG
AGTGTAGTTGCCAAGTTTGTTAGCAAGAAGACTCCGTCTTGGGAGCTGCATGAGCTGCAT
TCCAGTCGATAAGACCGCTGTTACAATTTGCATAATCTATTTATATAAAGAAAAGCTACT
CTCTTCTCTGGTGTTGCCACGTCACTAAATAAAGTGATTAGCGTTCGACACGTGATCATT
TGTGTAATACGCTACGTTTCATTTAAAAAATGTGTTCGTCATTTTCTTGGGC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL6801Contig1 1029 2 2 U
GGGGACAACGGTGATGAGCGTTTGTATACTATTCTACCGAAAGCCAACCGCAATGGCCGA
CGCTTGGATCTTTTCCCTCGCATTCCCTCTATGCCTCGCGGTGGAAGCTTTGTCGCGGTT
GGTTGGAGGATTTACGTGTTTGGTGGGATCAACTATGATGACATGATGACATCGAGTGCT
TTCAGTATCGACTTTATATCCAACACTCGGCAAACACTCCCGAGCATGTCTGACACAGCT
GCTGAATTCATTGACGGGAGAATTTACGTCGTTGGGAATCGTTGCGGTGTTGATTCAAAG
GTGGTGGTGGTGTTCGATACCGAAACACAGACGTGGGAGCCTGAGATGAAGAAGCCAGAG
ATGGGGATGTATGGTTGTGTGGTGGCCATGGGTGGTAAGATTTACATGAGGGATATTAAC
AAGAGCTTTGTTTATGAGCCAAAGGAAAACAAATGGGAAACGGAAGAGGTACTGAGTTCC
AAGGAGTGGGAGAACGCGTGTGTCTTTGATGATGTTTTGTACTATCGCGATTATTGGAAG
AACAAGTTAAGATGGTTTGACCCAAAGCAGAGGTGTTGGGGAGTGGTGAAAGGCGTGGAT
AAATTGTTGGCTGAAACGAGACGGGTTGGTTGGTCGCAGACTGTTAGCTATGGTGGGAAA
CTGGTTTTGTTGTTTCCTAAAGGAAAATTTTCGGGGATAACGAGGGAGATTTGTTGTGCA
GAGATTTCGCTGGAAAGACCCGATGGAGGTGATTTGGGGTCATGTTGATCAGTCATATGA
TCTCCGTTTGACTGCGGGTGGTAATTTTCACATTACCAAAGCTCTTGCTGTTACGGTTTG
ATTGAGTAACCCTCTCCCTCCATTTAACCCTGTTGTGGTTTGAAGTTTGCTGCTGCTGTT
TGTGTTGTTATATTTTGTATTTTCCTGTATTTCTCAACCTTTCCTGCTTTGAATTTTCAA
TAATACAGTGTGTGGAATTTCTTGTAAAATAAATTACTGCTTTGAATTTTGCAATAATAG
AGTGTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D073TF U 1
AF RR4D073JQ C 345
BS 1 685 RR4D073TF
BS 686 1029 RR4D073JQ

RD RR4D073TF 685 0 0
GGGGACAACGGTGATGAGCGTTTGTATACTATTCTACCGAAAGCCAACCGCAATGGCCGA
CGCTTGGATCTTTTCCCTCGCATTCCCTCTATGCCTCGCGGTGGAAGCTTTGTCGCGGTT
GGTTGGAGGATTTACGTGTTTGGTGGGATCAACTATGATGACATGATGACATCGAGTGCT
TTCAGTATCGACTTTATATCCAACACTCGGCAAACACTCCCGAGCATGTCTGACACAGCT
GCTGAATTCATTGACGGGAGAATTTACGTCGTTGGGAATCGTTGCGGTGTTGATTCAAAG
GTGGTGGTGGTGTTCGATACCGAAACACAGACGTGGGAGCCTGAGATGAAGAAGCCAGAG
ATGGGGATGTATGGTTGTGTGGTGGCCATGGGTGGTAAGATTTACATGAGGGATATTAAC
AAGAGCTTTGTTTATGAGCCAAAGGAAAACAAATGGGAAACGGAAGAGGTACTGAGTTCC
AAGGAGTGGGAGAACGCGTGTGTCTTTGATGATGTTTTGTACTATCGCGATTATTGGAAG
AACAAGTTAAGATGGTTTGACCCAAAGCAGAGGTGTTGGGGAGTGGTGAAAGGCGTGGAT
AAATTGTTGGCTGAAACGAGACGGGTTGGTTGGTCGCAGACTGTTAGCTATGGTGGGAAA
CTGGTTTTGTTGTTTCCTAAAGGAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4D073JQ 685 0 0
GATGAAGAAGCCAGAGATGGGGATGTATGGTTGTGTGGTGGCCATGGGTGGTAAGATTTA
CATGAGGGATATTAACAAGAGCTTTGTTTATGAGCCAAAGGAAAACAAATGGGAAACGGA
AGAGGTACTGAGTTCCAAGGAGTGGGAGAACGCGTGTGTCTTTGATGATGTTTTGTACTA
TCGCGATTATTGGAAGAACAAGTTAAGATGGTTTGACCCAAAGCAGAGGTGTTGGGGAGT
GGTGAAAGGCGTGGATAAATTGTTGGCTGAAACGAGACGGGTTGGTTGGTCGCAGACTGT
TAGCTATGGTGGGAAACTGGTTTTGTTGTTTCCTAAAGGAAAATTTTCGGGGATAACGAG
GGAGATTTGTTGTGCAGAGATTTCGCTGGAAAGACCCGATGGAGGTGATTTGGGGTCATG
TTGATCAGTCATATGATCTCCGTTTGACTGCGGGTGGTAATTTTCACATTACCAAAGCTC
TTGCTGTTACGGTTTGATTGAGTAACCCTCTCCCTCCATTTAACCCTGTTGTGGTTTGAA
GTTTGCTGCTGCTGTTTGTGTTGTTATATTTTGTATTTTCCTGTATTTCTCAACCTTTCC
TGCTTTGAATTTTCAATAATACAGTGTGTGGAATTTCTTGTAAAATAAATTACTGCTTTG
AATTTTGCAATAATAGAGTGTGTGG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6802Contig1 448 2 1 U
AAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCTCGCTCGTAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGC
ATCGCAACTACAAGATCGTCTACAGGCGTTATGCATCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTG
ATGACGATGAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGG
ACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATT
TCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATAC
TTTCGCCTATACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAAATTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCT
TTTCACCACACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCA
TTCGAATCTAAAGAACAATTCGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A970TF U 1
AF RR4A970JQ C 107
BS 1 448 RR4A970TF

RD RR4A970TF 448 0 0
AAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCTCGCTCGTAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGC
ATCGCAACTACAAGATCGTCTACAGGCGTTATGCATCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTG
ATGACGATGAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGG
ACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATT
TCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATAC
TTTCGCCTATACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAAATTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCT
TTTCACCACACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCA
TTCGAATCTAAAGAACAATTCGTTTTCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR4A970JQ 342 0 0
CATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTT
GGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCT
GGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAG
CAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAAATTTCAAAAGA
CTTGTTCTTTTCCTTTTCACCACACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTC
ACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTCGTTTTCC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 2

CO CL6803Contig1 799 2 1 U
AGAAATTGATCTCTAGATCAAGGATTCAAAGTATTGTAACTGAATGCACATGTTTCAATG
CAAAAAAAGAACAGAAAAAAAAGAGTGACAAATGACTCCCAAAGTGTAACAGGGACAAAA
CTGGTCTCTCTTGTCTTGTCACGTTACTACTTAGTACCTCTCGAACTTAGTTCTACCACC
ACGAGCTCTACCACCACCACGAGCTCTGTTAAACTTATTATTAACAGGTTCTCTCTTGCT
CCTGTACCCGTCTCCTCCACGATGTATCTTCAGCAATACTGTGGGTGGTGATGAGAAACC
GAACGAAGCCGCAACATCCTTGAGAACGAGCCCGCGAGCATCAAAGACATCTTTCATAGA
GTGAGAATCGTATCCTGCTATGTAAGTCTTGTATGCTTCTTTTGCTGACACGCTCAATGC
ACTGTTTTTAGATATCGTCTTTTCCAGAAAAGCCTGCACATTGAGCAACTTCTCTTCCTC
GAATTCATGTTCTATAACAGGAATCTTAGCAGCCTTGAGATACTGAATAAACTGCAACTC
CTCTGGAGTTAGGACAAGCAGAGCATTCCCTTTTGCGCCCTCTCCACGAGCTGTTCTACC
TACTCTATGAATGTATTCCGTAGGATCATCTGGAGGATCATACTGCACAATCCAATCCAC
ATGTGGAAAGTCGAGACCGCGGGCACCTACATTAGTACACAATAACAGACCAGTTTCCAT
CTTTACGAACTGGAAAACGTTGAAGTCCTTTTGCTCTGCTCCATCACTCCGTGATGGCGA
GACATCTATTTTGATGTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H681JQB U 1
AF RR4H131JQ U 1
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RD RR4H681JQB 738 0 0
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CTTTACGAACTGGAAAA
A

QA 1 737 1 737
DS 

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CAAAAAAAGAACAGAAAAAAAAGAGTGACAAATGACTCCCAAAGTGTAACAGGGACAAAA
CTGGTCTCTCTTGTCTTGTCACGTTACTACTTAGTACCTCTCGAACTTAGTTCTACCACC
ACGAGCTCTACCACCACCACGAGCTCTGTTAAACTTATTATTAACAGGTTCTCTCTTGCT
CCTGTACCCGTCTCCTCCACGATGTATCTTCAGCAATACTGTGGGTGGTGATGAGAAACC
GAACGAAGCCGCAACATCCTTGAGAACGAGCCCGCGAGCATCAAAGACATCTTTCATAGA
GTGAGAATCGTATCCTGCTATGTAAGTCTTGTATGCTTCTTTTGCTGACACGCTCAATGC
ACTGTTTTTAGATATCGTCTTTTCCAGAAAAGCCTGCACATTGAGCAACTTCTCTTCCTC
GAATTCATGTTCTATAACAGGAATCTTAGCAGCCTTGAGATACTGAATAAACTGCAACTC
CTCTGGAGTTAGGACAAGCAGAGCATTCCCTTTTGCGCCCTCTCCACGAGCTGTTCTACC
TACTCTATGAATGTATTCCGTAGGATCATCTGGAGGATCATACTGCACAATCCAATCCAC
ATGTGGAAAGTCGAGACCGCGGGCACCTACATTAGTACACAATAACAGACCAGTTTCCAT
CTTTACGAACTGGAAAACGTTGAAGTCCTTTTGCTCTGCTCCATCACTCCGTGATGGCGA
GACATCTATTTTGATGTAC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL6804Contig1 975 2 10 U
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TCATGGCAGAAGCGTCTACTTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGAGATCAAAGCTT
CTGCTGGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTC
CAGGGAACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTG
TCATCTGGAAATACGTTCATGGCAAGCCAACTTTAAATATATAATCTATTTTTACAATAC
ATACAATGGATTTCGTACTAATGAAAAGAAATTGTTTAAGACAGAAATTACGTTATATAT
ACGTATACGTTTATGATTTTGAAAATAACATTCATGTTGATTCGTAAAAGACCAAACCTA
TACAAATAAAGTTTAAACAATTGGTGCAGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAGAGGGT
CGAGGCGGTGTAGCCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGTT
GAAAGAGTACAAAAGCTTTGTGATCACCATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGAGGGCCCGG
TAGTGTTGTGCATTGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAGGTTTCTCACCCTGA
AACTCTCCTCCAGTTCTGTGTTGAAATCTCAAAAGAGATCGATGAACATCTCTTGAACGA
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TTGGCGTGTGTCACGCGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCT
TAATTTGAATCGGTGTGTAATAGGAGTCAAGCTACAAGGCTACTTGAAGTTTATCTACAA
AAAAAGTTTTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EM51TF U 1
AF RR4EM51JQ C 338
BS 1 646 RR4EM51TF
BS 647 647 RR4EM51JQ
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RD RR4EM51TF 773 0 0
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TCATGGCAGAAGCGTCTACTTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGAGATCAAAGCTT
CTGCTGGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTC
CAGGGAACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTG
TCATCTGGAAATACGTTCATGGCAAGCCAACTTTAAATATATAATCTATTTTTACAATAC
ATACAATGGATTTCGTACTAATGAAAAGAAATTGTTTAAGACAGAAATTACGTTATATAT
ACGTATACGTTTATGATTTTGAAAATAACATTCATGTTGATTCGTAAAAGACCAAACCTA
TACAAATAAAGTTTAAACAATTGGTGCAGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAGAGGGT
CGAGGCGGTGTAGCCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGTT
GAAAGAGTACAAAAGCTTTGTGATCACCATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGAGGGCCCGG
TAGTGTTGTGCATTGGCACCTTGAGTACGAAAAAATTAGCGATGAG*TTTCTCACCCTGA
AACTCTCCTCCAGTTCTGTGTTGAAATCTCAAA*GAGATCGATGAACATCTCTTGAACGA
*GAATAAAG*ACCACTCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGTGGCCT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4EM51JQ 638 0 0
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TGATTCGTAAAAGACCAAACCTATACAAATAAAGTTTAAACAATTGGTGCAGATGGAGAG
GCAAAGGTGGCTAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGTAGCCAGAGAAGAACCTGATCACGTTC
AGGGTTATAGAAGGAGATCTGTTGAAAGAGTACAAAAGCTTTGTGATCACCATCCAGGTG
ACCCCTAAGCATGGAGGGCCCGGTAGTGTTGTGCATTGGCACCTTGAGTACGAAAAAATT
AGCGATGAGGTTTCTCACCCTGAAACTTTCCTCCAGTTCTGTGTTGAAATCTCAAAAGAG
ATCGATGAACATTTCTTGAACGAAGAATAAAGGACCACTCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTCAGTGTGGCCTCTTTCAGTATCTGATGAAACCAAAATATATAATGTGCTGGTGTC
CTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGTCACGCGTGTATGCATAATACTATTAT
GGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATCGGTGTGTAATAGGAGTCAAGCTACAA
GGCTACTTGAAGTTTATCTACAAAAAAAGTTTTATGCC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6805Contig1 981 2 2 U
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GCCGCATCGTCCTCTCGCGGTCGTCGGAGGCGCTCTTCGCTACTCCTTATATATCGTCTC
TGTTCTTTATCCGGTGATTCATGTCTCTTTCTCGGCGGAAGAGAGATCTTGCTATGCTCA
GATCTATGAGTCTTTGTGTTAGATCTAGCAGTTTTCGGTGGTTTGGCGGGCATGAAGATG
GTGTCCTCCTTCTCTCAGGTTTACTTCCTGGTCGCCTTGGTTCTCTGTTCGCTTTCTCGT
GTTGTGGTGATCCTCTCATGAACACGGGTGGTGTGGGCTGGTTTCTCCGGCATATGTCTC
GGCTTATGGGAGAACTCAGTGTTTATTAATGTTATGGTTCATTATGTCCGTTTCACTGTT
TCACTTATGTTTCCTCCGGGTGGTAGCGCATGGTGGACAGTGGTGAGGTGGTGAAGAAAT
TGTGCTTATTTTGGTCTTGGTGGCAACGGTTCAGTCATGGTGTTAATCGTAGTTAATGGA
AAACTATTGGCTGAGTTTCTCCGGCTCTAACACAACGGTTTGGTGTTTCAGTTCATGTTT
ACTTATATCTTGGGAAGTCACAAATGGACTTCCATAGCTTCGTACTATTATCATAATGGA
AGCAAATGGTTCTTAATGTTGTTTCTCAGTATAGAGATGATTTCAACTTCGGTTATGACC
GTAAACGCAAGTCTTCTCAAGATTCTATGCTGGTGTTTAGTCTCAGGGAGGAAGCAGTTT
CAAACTATGACCTGGCAGTGAGTGATGCATACGCTCAGCTGGCTCTTGGTTGGGAGCAGT
CTTTGTATTCCTGTTTCTTATTGTGAAGTTATCATATGGCATCTATTGATGTTACTTCTA
GACCTTATTGGAATTCTCTGTATGTGGAGAACATCCCCACTATTCTGTAACTCTTTTATT
TTGATATACAAACCCAGCGTT


BQ
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AF RR4ER24TF U 1
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RD RR4ER24TF 708 0 0
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GCCGCATCGTCCTCTCGCGGTCGTCGGAGGCGCTCTTCGCTACTCCTTATATATCGTCTC
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GTGTCCTCCTTCTCTCAGGTTTACTTCCTGGTCGCCTTGGTTCTCTGTTCGCTTTCTCGT
GTTGTGGTGATCCTCTCATGAACACGGGTGGTGTGGGCTGGTTTCTCCGGCATATGTCTC
GGCTTATGGGAGAACTCAGTGTTTATTAATGTTATGGTTCATTATGTCCGTTTCACTGTT
TCACTTATGTTTCCTCCGGGTGGTAGCGCATGGTGGACAGTGGTGAGGTGGTGAAGAAAT
TGTGCTTATTTTGGTCTTGGTGGCAACGGTTCAGTCATGGTGTTAATCGTAGTTAATGGA
AAACTATTGGCTGAGTTTCTCCGGCTCTAACACAACGGTTTGGTGTTTCAGTTCATGTTT
ACTTATATCTTGGGAAGTCACAAATGGACTTCCATAGCTTCGTACTATTATCATAATGGA
AGCAAATGGTTCTTAATGTTGTTTCTCAGTATAGAGATGATTTCAACT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4ER24JQ 613 0 0
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GTTTCCTCCGGGTGGTAGCGCATGGTGGACAGTGGTGAGGTGGTGAAGAAATTGTGCTTA
TTTTGGTCTTGGTGGCAACGGTTCAGTCATGGTGTTAATCGTAGTTAATGGAAAACTATT
GGCTGAGTTTCTCCGGCTCTAACACAACGGTTTGGTGTTTCAGTTCATGTTTACTTATAT
CTTGGGAAGTCACAAATGGACTTCCATAGCTTCGTACTATTATCATAATGGAAGCAAATG
GTTCTTAATGTTGTTTCTCAGTATAGAGATGATTTCAACTTCGGTTATGACCGTAAACGC
AAGTCTTCTCAAGATTCTATGCTGGTGTTTAGTCTCAGGGAGGAAGCAGTTTCAAACTAT
GACCTGGCAGTGAGTGATGCATACGCTCAGCTGGCTCTTGGTTGGGAGCAGTCTTTGTAT
TCCTGTTTCTTATTGTGAAGTTATCATATGGCATCTATTGATGTTACTTCTAGACCTTAT
TGGAATTCTCTGTATGTGGAGAACATCCCCACTATTCTGTAACTCTTTTATTTTGATATA
CAAACCCAGCGTT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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GGTTT


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AF RR4GV04TF U 1
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BS 341 365 RR4GV04JQ

RD RR4GV04TF 340 0 0
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TTGTTGTAACATGTATGGCAAATCAAAATTTTTTTTGTATAATCCATCAGAAACTCTGAG
TCGAAGCAACATCTTGGGGACACCGATTACTATGCAGACA

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DS 

RD RR4GV04JQ 365 0 0
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GATGCCATCTTCAGGAAGATATTCTTAAACGAAGATCAAGTTACAAAGCACATTCTGCAC
TAGTTCCCATTGTCTCTTGCGAAAAGCAACTACCAGCTACTACCACGACAGATTCTTTGA
CAAGTAAACGATGAACCAGACATGAAGAGAGTGAGAGAGAGATTCTGCTCTACGTCTCTC
TTGTTGTAACATGTATGGCAAATCAAAATTTTTTTTGTATAATCCATCAGAAACTCTGAG
TCGAAGCAACATCTTGGGGACACCGATTACTATGCAGACAAGATGTAAGCATGAACTTTT
GGTTT

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 2

CO CL6807Contig1 1085 2 2 U
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GACGACATCGAGTCTCAAAACGCTACTCTCGACTCAGGCAACCTCGATGAGTTCTTCGGA
TACGTGGAGAGTGTTAAAGAAGACATGAAAGCTGTTGACGAGATTCACAAGCGTCTACAA
GATGCTAACGAAGAGTCCAAGACAGTGCACGACTCCAAGGCCGTGAAGAAGCTCCGCGCT
CGTATGGACTCGAGTGTTACAGAGGTCTTGAAACGTGTCAAGATGATAAAGACGAAGCTC
GTGGCCTTGGAGAAATCAAATGCTGCTCAGAGGAAAGTCCCTGGTTGTGGACCTGGCTCC
TCTGCTGATCGGACAAGAACCTCTGTCGTGAGTGGGTTAGGGAAGAAGCTTAAAGACATG
ATGGATGATTTTCAGAGACTACGAACCAAAATGGCTAGTGAATACAAAGAAACTGTCGAG
AGACGGTACTTCACTGTAACGGGCCAAAAAGCAGACGAAGAGACGATAGAGAAGCTGATA
TCAAGCGGAGAGAGCGAACGTTTTCTCCAAAAGGCCATACAAGAGCAAGGCCGTGGACAG
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AGTCTGCTGGAGCTGCACCAGATTTTCCTAGACATGGCAGCTCTTGTTGAAGCTCAAGGG
AGTATACTCAACGACATCGAGTCAAACGTTTCAAAGGCGAGCTCTTTCGTCATGAGAGGG
ACTGAGCAGTTGCAGGGAGCTAAAGTGCTTCAGAGGAACTCGAGGAAGTGGACTTGTATC
GCCATCATACTCGCTATTGTTCTTGTCATTGTGATCCTCTTCCCTATCCTCTACACAAGT
TTGCTTAAACCTTGATTTCTAGAGAAACATTCTGCTTTCTACTGTTATTGCTTTGTATTA
GAAAACATGTGGCATACAAAATCTATCGAGTGTAATTCAAGCAATGTACAATTTTGAGTT
TCATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4D857TF U 1
AF RR4D857JQ C 289
BS 1 629 RR4D857TF
BS 630 1085 RR4D857JQ

RD RR4D857TF 629 0 0
TTTTTTTTCTCACAAAGAAACTTGCACACTTTCTCTGGTTTCTCTGGTTTGGTCGCCATG
AACGATCTAATCTCAAGCTCGTTCAAGAGATACACAGATCTAAACCACCAAGTCCAGCTC
GACGACATCGAGTCTCAAAACGCTACTCTCGACTCAGGCAACCTCGATGAGTTCTTCGGA
TACGTGGAGAGTGTTAAAGAAGACATGAAAGCTGTTGACGAGATTCACAAGCGTCTACAA
GATGCTAACGAAGAGTCCAAGACAGTGCACGACTCCAAGGCCGTGAAGAAGCTCCGCGCT
CGTATGGACTCGAGTGTTACAGAGGTCTTGAAACGTGTCAAGATGATAAAGACGAAGCTC
GTGGCCTTGGAGAAATCAAATGCTGCTCAGAGGAAAGTCCCTGGTTGTGGACCTGGCTCC
TCTGCTGATCGGACAAGAACCTCTGTCGTGAGTGGGTTAGGGAAGAAGCTTAAAGACATG
ATGGATGATTTTCAGAGACTACGAACCAAAATGGCTAGTGAATACAAAGAAACTGTCGAG
AGACGGTACTTCACTGTAACGGGCCAAAAAGCAGACGAAGAGACGATAGAGAAGCTGATA
TCAAGCGGAGAGAGCGAACGTTTTCTCCA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4D857JQ 797 0 0
AAGCTCCGCGCTCGTATGGACTCGAGTGTTACAGAGGTCTTGAAACGTGTCAAGATGATA
AAGACGAAGCTCGTGGCCTTGGAGAAATCAAATGCTGCTCAGAGGAAAGTCCCTGGTTGT
GGACCTGGCTCCTCTGCTGATCGGACAAGAACCTCTGTCGTGAGTGGGTTAGGGAAGAAG
CTTAAAGACATGATGGATGATTTTCAGAGACTACGAACCAAAATGGCTAGTGAATACAAA
GAAACTGTCGAGAGACGGTACTTCACTGTAACGGGCCAAAAAGCAGACGAAGAGACGATA
GAGAAGCTGATATCAAGCGGAGAGAGCGAACGTTTTCTCCAAAAGGCCATACAAGAGCAA
GGCCGTGGACAGATCATGGACACGTTATCAGAGATTCAAGAAAGGCACGACGCGGTTAAA
GACATAGAACGGAGTCTGCTGGAGCTGCACCAGATTTTCCTAGACATGGCAGCTCTTGTT
GAAGCTCAAGGGAGTATACTCAACGACATCGAGTCAAACGTTTCAAAGGCGAGCTCTTTC
GTCATGAGAGGGACTGAGCAGTTGCAGGGAGCTAAAGTGCTTCAGAGGAACTCGAGGAAG
TGGACTTGTATCGCCATCATACTCGCTATTGTTCTTGTCATTGTGATCCTCTTCCCTATC
CTCTACACAAGTTTGCTTAAACCTTGATTTCTAGAGAAACATTCTGCTTTCTACTGTTAT
TGCTTTGTATTAGAAAACATGTGGCATACAAAATCTATCGAGTGTAATTCAAGCAATGTA
CAATTTTGAGTTTCATT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL6808Contig1 831 2 12 U
GGAATCTCCTGCCTGATCCCTCATAAACTCTCCCAACCGTGGCCTCGAATATCTTACGCC
GTTTGTTCTCGGCTCGGACCCGAAGACCCACCCCAATCATCCCAGTGACCCGGCTGGAAA
TGAACCTATTCCGGTTCTGCTCCGGTCTGAAAGTCCTCGGCTATTTCATGATCCTTCTCG
TCTTCGCCGTCGTCGCCGTTTCTTACTACGCCGTTGTGGTCAACACATGGTGGCCGATCT
TAACCGAGAGCAGCCACGGAGCTCTCTCAACTCTCGCCTGCCTAATCATCTCCCTCTTCC
ACTTCCTGTTGTATACGTTTATAGAGACAATGTTGGATGTTGTAGTGTTGCTTCCAAGTT
TCATAAAGTTCTTCAGCCAAGCTATAAAGCATTCCTCTTCACCGGGTAAACTGACCTCCC
TCGTTCTGGCTTTCGTTCTTAACTTAGCGTTCGTTCTCAGCCTTCTCTGTTTCGTAGTCA
TGCACATCTCACTCCTCTCAACCAACACTACTTCAGTCGAGTTCATGAGAAAAACGGAGA
TGTCAGATGGAAATATGACTTGGGAAAAAAGAAAAACTTCGAGCAGGTTTTTGGGAAGAA
GAAAGCATTTTGGCTCCTCCCATTGTACTCAAACGATGATATCCAAAACATAACTTCGCT
CCAAGGCCTTGAGTTTCCAACTCGTTCTGACATCGATCCTTGAATTTAAACATCAAACAT
GGTTGTAAAGTTAGTTCTCAGCTTTCCCTCCAATGTAGATAACTGTCCTCTCAGAATGTA
ATCTGATCACATTGTTGTGAATTTGAGATATAGAGTATTTTGATTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG04TF U 1
AF RR4GG04JQ C 64
BS 1 731 RR4GG04TF
BS 732 732 RR4GG04JQ
BS 733 761 RR4GG04TF
BS 762 762 RR4GG04JQ
BS 763 775 RR4GG04TF
BS 776 776 RR4GG04JQ
BS 777 780 RR4GG04TF
BS 781 781 RR4GG04JQ
BS 782 800 RR4GG04TF
BS 801 801 RR4GG04JQ
BS 802 823 RR4GG04TF
BS 824 831 RR4GG04JQ

RD RR4GG04TF 823 0 0
GGAATCTCCTGCCTGATCCCTCATAAACTCTCCCAACCGTGGCCTCGAATATCTTACGCC
GTTTGTTCTCGGCTCGGACCCGAAGACCCACCCCAATCATCCCAGTGACCCGGCTGGAAA
TGAACCTATTCCGGTTCTGCTCCGGTCTGAAAGTCCTCGGCTATTTCATGATCCTTCTCG
TCTTCGCCGTCGTCGCCGTTTCTTACTACGCCGTTGTGGTCAACACATGGTGGCCGATCT
TAACCGAGAGCAGCCACGGAGCTCTCTCAACTCTCGCCTGCCTAATCATCTCCCTCTTCC
ACTTCCTGTTGTATACGTTTATAGAGACAATGTTGGATGTTGTAGTGTTGCTTCCAAGTT
TCATAAAGTTCTTCAGCCAAGCTATAAAGCATTCCTCTTCACCGGGTAAACTGACCTCCC
TCGTTCTGGCTTTCGTTCTTAACTTAGCGTTCGTTCTCAGCCTTCTCTGTTTCGTAGTCA
TGCACATCTCACTCCTCTCAACCAACACTACTTCAGTCGAGTTCATGAGAAAAACGGAGA
TGTCAGATGGAAATATGACTTGGGAAAAAAGAAAAACTTCGAGCAGGTTTTTGGGAAGAA
GAAAGCATTTTGGCTCCTCCCATTGTACTCAAACGATGATATCCAAAACATAACTTCGCT
CCAAGGCCTTGAGTTTCCAACTCGTTCTGACATCGATCCTTGAATTTAAACATCAAACAT
GGTTGTAAAGT*AGTTCTCAGCTTTCCCTCCAATGTAGATA*CTGTCCTCTCAGA*TGTA
*TCTGATCACATTGTTGTGA*TTTGAGATATAGAGTATTTTGA

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4GG04JQ 768 0 0
TGTTCTCGGCTCGGACCCGAAGACCCACCCCAATCATCCCAGTGACCCGGCTGGAAATGA
ACCTATTCCGGTTCTGCTCCGGTCTGAAAGTCCTCGGCTATTTCATGATCCTTCTCGTCT
TCGCCGTCGTCGCCGTTTCTTACTACGCCGTTGTGGTCAACACATGGTGGCCGATCTTAA
CCGAGAGCAGCCACGGAGCTCTCTCAACTCTCGCCTGCCTAATCATCTCCCTCTTCCACT
TCCTGTTGTATACGTTTATAGAGACAATGTTGGATGTTGTAGTGTTGCTTCCAAGTTTCA
TAAAGTTCTTCAGCCAAGCTATAAAGCATTCCTCTTCACCGGGTAAACTGACCTCCCTCG
TTCTGGCTTTCGTTCTTAACTTAGCGTTCGTTCTCAGCCTTCTCTGTTTCGTAGTCATGC
ACATCTCACTCCTCTCAACCAACACTACTTCAGTCGAGTTCATGAGAAAAACGGAGATGT
CAGATGGAAATATGACTTGGGAAAAAAGAAAAACTTCGAGCAGGTTTTTGGGAAGAAGAA
AGCATTTTGGCTCCTCCCATTGTACTCAAACGATGATATCCAAAACATAACTTCGCTCCA
AGGCCTTGAGTTTCCAACTCGTTCTGACATCGATCCTTGAATTTAAACATCAAACATGGT
TGTAAAGTTAGTTCTCAGCTTTCCCTCCAATGTAGATAACTGTCCTCTCAGAATGTAATC
TGATCACATTGTTGTGAATTTGAGATATAGAGTATTTTGATTTGATCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6809Contig1 1054 2 2 U
GGATGTGGAGTTATCCTCATCTCTACCAAAAATCTGAAAATATAGTCTCTGTTTTGCATG
TAATCCATCAACGGCGATTTCCCACTTTCTTCTTGCTGATTTGGAAGTTGGACGCTGACT
GCTAAGGAAAGCAGGAACGACGAGGATGGCTTCCTCAATGGGTTGTCTCACCGACTCGCT
CCCTCAACTCAACCCTTCCTTTCTTCAACTCTTCAACTGAAGCCCGAGTTATAGATAAGG
ATGATATTTAAGAGAAGCAGATGCCAAGCCCAAATTGCTAAGGTTATCTCTCTTTGAAAA
ACCCTTGCAACAACGTCTCACCCATTATGTTCACACAACAACGTAACGGAGAGCCGGTGC
TACAAGAACTGCTTGACAGACTCCGAGAGCTGTTCTTGCTGGTGGTGCAGCTGCAAAATC
TGAAGGACTGAAGGTTTGTCTCCAAAGAGACTGGGCTTCGGTCAGCAGCTCCACTTCTAA
GAGGACATGCCAAGGTTGAGAATCTGACTATATCTGAGCTTAACGAGTTTGTTGTAACTG
CTCCATCTCAGGGGAGTTTATTTGATCGAGCCCACCAACAGCAAATCCCGAGTGCTTGAA
CAAGTGTGAGTGTGGTCAGCCGAATATAATGTGTCTGACATGAGAGAGATAAATGTGAGA
AGGAAGGAGGATTGGCATTTGGGGTCCACCATCTAATGGTGTCGGCAACTGCATTCTCGC
AAAGCTCATTTTACTTATTGTCAAAGAAAAAGCCAAGCAGCTTCAACAATCCTAGGTTTC
AAAAAGAAGCTTGGCTTTGGAGGTTTTATAATATTTTTTTTTTTTTTATAAATCTATAAG
CTCTATGATGCATCACAATCAAATAAGAAGACATTGGCTTTAGCCAAATTTTGCTGAAGA
TTGCTTAACATTACATGGTGTACAAACTACTAACCATCTAAAGACATCAAGAGTGGTCAC
TACGAAGAGAGCATATAACATAATCTTCATTAACAAATTGGTTACCAAGCAAATTAACTA
TTGTAAATGAAAATTTATCCCTTTTGTTACTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CL18TF U 1
AF RR4CL18JQ C 312
BS 1 657 RR4CL18TF
BS 658 1054 RR4CL18JQ

RD RR4CL18TF 657 0 0
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TAATCCATCAACGGCGATTTCCCACTTTCTTCTTGCTGATTTGGAAGTTGGACGCTGACT
GCTAAGGAAAGCAGGAACGACGAGGATGGCTTCCTCAATGGGTTGTCTCACCGACTCGCT
CCCTCAACTCAACCCTTCCTTTCTTCAACTCTTCAACTGAAGCCCGAGTTATAGATAAGG
ATGATATTTAAGAGAAGCAGATGCCAAGCCCAAATTGCTAAGGTTATCTCTCTTTGAAAA
ACCCTTGCAACAACGTCTCACCCATTATGTTCACACAACAACGTAACGGAGAGCCGGTGC
TACAAGAACTGCTTGACAGACTCCGAGAGCTGTTCTTGCTGGTGGTGCAGCTGCAAAATC
TGAAGGACTGAAGGTTTGTCTCCAAAGAGACTGGGCTTCGGTCAGCAGCTCCACTTCTAA
GAGGACATGCCAAGGTTGAGAATCTGACTATATCTGAGCTTAACGAGTTTGTTGTAACTG
CTCCATCTCAGGGGAGTTTATTTGATCGAGCCCACCAACAGCAAATCCCGAGTGCTTGAA
CAAGTGTGAGTGTGGTCAGCCGAATATAATGTGTCTGACATGAGAGAGATAAATGTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4CL18JQ 743 0 0
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CTTGACAGACTCCGAGAGCTGTTCTTGCTGGTGGTGCAGCTGCAAAATCTGAAGGACTGA
AGGTTTGTCTCCAAAGAGACTGGGCTTCGGTCAGCAGCTCCACTTCTAAGAGGACATGCC
AAGGTTGAGAATCTGACTATATCTGAGCTTAACGAGTTTGTTGTAACTGCTCCATCTCAG
GGGAGTTTATTTGATCGAGCCCACCAACAGCAAATCCCGAGTGCTTGAACAAGTGTGAGT
GTGGTCAGCCGAATATAATGTGTTTGACATGAGAGAGATAAATGTGAGAAGGAAGGAGGA
TTGGCATTTGGGGTCCACCATCTAATGGTGTCGGCAACTGCATTCTCGCAAAGCTCATTT
TACTTATTGTCAAAGAAAAAGCCAAGCAGCTTCAACAATCCTAGGTTTCAAAAAGAAGCT
TGGCTTTGGAGGTTTTATAATATTTTTTTTTTTTTTATAAATCTATAAGCTCTATGATGC
ATCACAATCAAATAAGAAGACATTGGCTTTAGCCAAATTTTGCTGAAGATTGCTTAACAT
TACATGGTGTACAAACTACTAACCATCTAAAGACATCAAGAGTGGTCACTACGAAGAGAG
CATATAACATAATCTTCATTAACAAATTGGTTACCAAGCAAATTAACTATTGTAAATGAA
AATTTATCCCTTTTGTTACTAAA

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL6810Contig1 805 2 8 U
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CACTCAGTGAAATCCTGGAGGGAAAGGATGAGTTCTTCACCTCCTATGATGAGGTTTATG
AGAGTTTTGATGACATGGGTTTGCAAGAGAACCTTCTTAGGGGTATCTATGCTTATGGTT
TTGAAAAGCCTTCTGCTATTCAGCAAAGAGGAATCGTACCCTTTTGCAAGGGTCTTGATG
TGATCCAGCAGGCACAGTCTGGTACTGGAAAAACCGCAACTTTCTGCTCTGGTGTCTTGC
AGCAGCTTGACGTCACCCTTGTCCAGTGCCAAGCTCTGGTCTTGGCTCCCACCAGGGAGC
TTGCTCAGCAGATTGAGAAGGTCATGCGTGCTCTTGGAGACTACATTGGCGTCAAGGTTC
ATGCCTGTGTTGGTGGTACCAGTGTTCTTGACGATAAGCGTATCCTCCAAGCTGGTGTCC
AAGTTGTCGTTGGAACTCCAGGTCGTGTCTTTGACATGCTCCAAAGACAGTCTCTTCGCT
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AGCTACAATGCCACCAGAAGCTCTCGAGATCACAAGAAGTCATGAGCAACCAGTGAGATC
TTGGTGAACGTGACGAGCTACACTG


BQ
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AF RR4EB14TF U 1
AF RR4FM15TF U 6
BS 1 179 RR4EB14TF
BS 180 180 RR4FM15TF
BS 181 703 RR4EB14TF
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BS 705 727 RR4EB14TF
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BS 779 805 RR4FM15TF

RD RR4EB14TF 778 0 0
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CTCAAAGAGTCATGGCAGGATCGGCAACACAGTTTGATGATGCGCGTCAGTTTGATCAGG
CACTCAGTGAAATCCTGGAGGGAAAGGATGAGTTCTTCACCTCCTATGATGAGGTTTATT
AGAGTTTTGATGACATGGGTTTGCAAGAGAACCTTCTTAGGGGTATCTATGCTTATGGTT
TTGAAAAGCCTTCTGCTATTCAGCAAAGAGGAATCGTACCCTTTTGCAAGGGTCTTGATG
TGATCCAGCAGGCACAGTCTGGTACTGGAAAAACCGCAACTTTCTGCTCTGGTGTCTTGC
AGCAGCTTGACGTCACCCTTGTCCAGTGCCAAGCTCTGGTCTTGGCTCCCACCAGGGAGC
TTGCTCAGCAGATTGAGAAGGTCATGCGTGCTCTTGGAGACTACATTGGCGTCAAGGTTC
ATGCCTGTGTTGGTGGTACCAGTGTTCTTGACGATAAGCGTATCCTCCAAGCTGGTGTCC
AAGTTGTCGTTGGAACTCCAGGTCGTGTCTTTGACATGCTCCAAAGACAGTCTCTTCGCT
CTGACTGTATAAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTCTCCCGTGGTTTCA
AGGATCAGATCTATGACATATTCCAGCTTCTCCCACCAAAGAT*CAAGTAGAGTGTTCTC
AGCTACA*TGCCACCAGAAGCTCTCGAGATCACAAGAAGTCATGAGCAACCAGTGAGA

QA 1 778 1 778
DS 

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GG
AACTTAACCTCAATTCTCTTAAGAAAGATCTCTTACTTTTGCTCTTACTCAACCTCAAAG
AGTCATGGCAGGATCGGCAACACAGTTTGATGATGCGCGTCAGTTTGATCAGGCACTCAG
TGAAATCCTGGAGGGAAAGGATGAGTTCTTCACCTCCTATGATGAGGTTTATGAGAGTTT
TGATGACATGGGTTTGCAAGAGAACCTTCTTAGGGGTATCTATGCTTATGGTTTTGAAAA
GCCTTCTGCTATTCAGCGAAGAGGAATCGTGCCCTTTTGCAAGGGTCTTGATGTGATCCA
GCAGGCACAGTCTGGTACTGGAAAAACCGCAACTTTCTGCTCTGGTGTCTTGCAGCAGCT
TGACGTCACCCTTGTCCAGTGCCAAGCTCTGGTCTTGGCTCCCACCAGGGAGCTTGCTCA
GCAGATTGAGAAGGTCATGCGTGCTCTTGGAGACTACATTGGCGTCAAGGTTCATGCCTG
TGTTGGTGGTACCAGTGTTCTTGACGATAAGCGTATCCTCCAAGCTGGTGTCCATGTTGT
CGTTGGAACTCCAGGTCGTGTCTTTGACATGCTCCAAAGACAGTCTCTTCGCTCTGACTG
TATAAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCA
GATCTATGACATATTCCAGCTTCTCC*ACCAAAGATTCAAGTAGAGTGTTCTCAGCTACA
ATGCCACCAGAAGCTCTCGAGATCACAAGA*GTCATGAGCAACCAGTGAGATCTTGGTGA
ACGTGACGAGCTACACTG

QA 3 800 3 800
DS 



AS 1 2

CO CL6811Contig1 1221 2 2 U
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CGCCTGACCCCCAAAACAATGACAGAGGAAGAGGTGGCGATGGAGATGGAAGCCGTAGAA
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ATCAAGCCCCGTACCGCCGAGATCTCTTCTCAGCAGTTTGTGGAAGCTGTTGTGAGAATA
CAAGCAGGTTCTAAGTATCCAGAAGAGCCGCCGGAGATTAGCCTGATTGAATCCAAGGGT
CTTGATGAGCAAAGACAAAAGCTTTTGATTGGGTTTGTGCAAGAGAAAGCTTCTGAGCTA
TCATCTTCTCTGATGCTAGTTGCACTTTGTGAGCAGTTGAGAGGCTGACGATAATGAACC
ATCCGGATGGAGATTGTCCACTTTATTTGTATCCCTTATTCCCTGAGGATGGCGAGAGTA
ATCCAATGCCCTTTATGAAGCTCATGTCTTGCTTCCACTGTTTCCACTGTGAGTGCATCA
TTAGGTGGTGGAACTGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAAAACGGTAATACTT
TACGTCTTGGATCAGCAGATAAAAGCTTGGGAAACTGTCCAGTGTGCCGGAAAGTTGTTC
ATGCGAGTGATATTGAGCATGTTCTTGGCTTAGTAGTAGGTGCTCAGTCATCTCAACAGG
ATTCCGTTTTAGTACAAGGTGAGGACAAAGAAGACCCACTGCTCCAGTCAGAGTCAGAGA
ACATGAGAAGAGAGCGGTTTGAGGCGATTTTAAAGACGCAGGAAGAAAAGGGAGGTCTGG
TTCAACCAAAGAAAAACATATCGGTTGTGCCCGGTATGTATCTTCCTCCTCCACCAGCTC
CTGCATCATTTTCATCGAACCAAGAAGAAGCTCAAGAGCAAGGACAACAAGTGGAACACA
AAGAAGGTGAATCAGAGACAAACTCTAGCAGCTCCAACAACAGGAGAGGGAGAGGCAGAG
GCCGAGGAGGGCGGGGACATAGTAATGTCAACAGAAGGAAGCAGACCTCGCAAGATCCAA
GAAAACCTACGAAGCGGTGGGTGCAGAGGAGTTGACAAAACTCATGTATTATTTATATAT
ATCGAGAGAGAGAGAGAGAGATATCAAACTCAACTCAAAAACAGACTACAAATACAAAAA
AATAAATCCTCCGTTTTACCT


BQ
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CAAAAAAATAAATCCTCCGTTTTACCT

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BQ
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AF RR4DX89TF U 1
AF RR4DX89JQ C 641
BS 1 690 RR4DX89TF
BS 691 691 RR4DX89JQ
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BS 746 746 RR4DX89JQ
BS 747 771 RR4DX89TF
BS 772 1403 RR4DX89JQ

RD RR4DX89TF 771 0 0
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GAGGTTCACTCAGCTATCAAGCCACCCACTTCACAAGACCAACAAACCGGGCATTTGTTC
AATGGACATCCTACATTCTAAGGATGTCATTGCTACCGGAGGAGTGGATACAACTGCTGT
TATCTTTGATCGCCCTTCTGGACAAATCTTGTCAACACTTACTGGTCACTCGAAAAAGGT
TACAAGTGTAAAATTCGTAGGTGACAGTGATCTTGTTTTAACTGCTTCGGCTGACAAGAC
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TCATTCTGCAGAGGTGCGAGCTGTAACTGTGCATGCCACAAATAAATACTTCGTGTCGGC
ATCTCTTGACAGTACATGGTGCTTCTACGATCTTTCCTCTGGCTTATGCCTTGCAAAGGT
ATCGGATGATTCTGAGAGGGTGGATTACACGGCTGCTGCTTTTCATCCTGATGGTCTTAT
TCTCGGAACCGGTACTTCTCAATCTGTTGTTAAGATTTGGGATGTTAAGAGTCAGGCAAA
TGTGGCGAAGTTTGATGGACACACCGGTGAAGTTACCTCTATATCTTTCTCTGAGAATGG
TTATTTCCTCGCGGTGAGTTCTTTGAACAA*CTCCGAGAAGTAAA*GTGCA*CTACGATT
CATGTGTACATGAATGCTGTTTTTT*GGTTCTGCAATGTACAGACTGCTGC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4DX89JQ 763 0 0
TATATC
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GTGCAACTACGATTCATGTGTACATGAATGCTGTTTTTTTGGTTCTGCAATGTACAGACT
GCTGCCGAGGATGGTGTTAGGTTGTGGGACCTGCGCAAGTTAAGGAACTTCAAGTCATTC
TTATCCGCAGATGCAAACTCTGTGGAGTTTGACCCTAGCGGATCTTATCTTGGAGTTGCT
GCATCAGATATCAGGCTATACCAGACGGCGAGTGTGAAAGCTGAATGGAACCTTATTAAG
ACACTCCCTGATCTCTCCGGCACTGGTAAAGCTACATGCGTGAAGTTTGGTCCAGATGCA
CAATACGTTGCAGTTGGTTCCATGGACCGTAACCTACGAATATTTGGTCTTCCTGGTGAC
CAAACAGCCAATGCCGATGATGACTCTGCACAAGACTCTTGAAGAATTCGTTAGAAAACT
CGGCAAATTTTCGAATGTTCATCTCCGGTTTCTTCTCTCTCTTCTGTTGTATCCTACAGT
TTTCACAGCTATAAGGAGGATTTGTTAGTTGGCATAGTGATCTTCGTTACTTCTCTGAAC
GCAGACGATCACACTTGAGTTTTCTTACTCTTTTCATCTTATAGGTTCTTCCAAAGTTCT
AATCTCTATCTTCCTCTTTGTACCTTCGAAACATGTACCAAATTGTTCATTTTGCTGCTA
AGGATCGGATCTAAATGAAACTAAGACGTTTTATCGT

QA 7 763 7 763
DS 



AS 1 2

CO CL6813Contig1 344 2 1 U
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CACAAGGAGGGGGAGATAAAGAAAGAGTAACAAGAAGAGTCTTCAAAGAGAGAATGAATC
TTTTTTATGGTGTCAATTTGATGTTACTTCTGTATCCATCGATGATTATCTTTGTCAAAA
GAAGGCAAGATCATTAAGTTAAAATGTTGCATCCACTTCTTGATTTACATTCCTACTCAA
TCTTTATTTTTGCTTCATAAACGTATTCTAAATTAACTCGTTAATATGGGCGGCTATGGG
AACTGTTATACAGTTTGGTTTCTCATCAATCCATTTCAAATCCG


BQ
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AF RR4DD86JQ C 1
AF RR4DD86TF U 1
BS 1 344 RR4DD86TF

RD RR4DD86JQ 344 0 0
TTTTTGTTTCAGCTGCCTTGTTGCTCTTGCTTCTGTTTCGTCAAGTCAAAGAAGGGGAAA
CACAAGGAGGGGGAGATAAAGAAAGAGTAACAAGAAGAGTCTTCAAAGAGAGAATGAATC
TTTTTTATGGTGTCAATTTGATGTTACTTCTGTATCCATCGATGATTATCTTTGTCAAAA
GAAGGCAAGATCATTAAGTTAAAATGTTGCATCCACTTCTTGATTTACATTCCTACTCAA
TCTTTATTTTTGCTTCATAAACGTATTCTAAATTAACTCGTTAATATGGGCGGCTATGGG
AACTGTTATACAGTTTGGTTTCTCATCAATCCATTTCAAATCCG

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR4DD86TF 344 0 0
TTTTTGTTTCAGCTGCCTTGTTGCTCTTGCTTCTGTTTCGTCAAGTCAAAGAAGGGGAAA
CACAAGGAGGGGGAGATAAAGAAAGAGTAACAAGAAGAGTCTTCAAAGAGAGAATGAATC
TTTTTTATGGTGTCAATTTGATGTTACTTCTGTATCCATCGATGATTATCTTTGTCAAAA
GAAGGCAAGATCATTAAGTTAAAATGTTGCATCCACTTCTTGATTTACATTCCTACTCAA
TCTTTATTTTTGCTTCATAAACGTATTCTAAATTAACTCGTTAATATGGGCGGCTATGGG
AACTGTTATACAGTTTGGTTTCTCATCAATCCATTTCAAATCCG

QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 2

CO CL6814Contig1 934 2 2 U
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CTCTCGTACGAAGGAAAACATCAAAGTAACCGTAACGATGAGCGCAAAGAACTTCTCGTT
CGTAACGGAGACTCCCAGTGTGGATTCCAACGAAGGCACCAAAACCGATTCGGGTACCGG
CTTAAAGAAGGTAATCACCAAAGCTGGCGAAATCAGCAAAGCTGATTCCGGTTGCAACTC
TCCTGAATTGACTAAGCTCAGTGACGCTGACGAAAGAACCAAGGCTGATTCTGGATCTGG
ATCTCTTGCTTTGAAGACGGTATGTCTCAGGATCGCAAGCTTTGTTTATTGTATGAAATT
GTTGTTGTTATGTTGTGAATCAGGTAAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCATCAAG
CGGATTCCGGCTCTCCTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAGCTGGTGATGAAAGCAC
CGAGGCGGATTCCGGTTCTCCTGTGTTGACTAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGATGATGA
AAGCACCGAGGCGGATTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAGGGAAACAGAAGTTCTGCTCC
TTAACTATTTGTTGTTCCATACTTGGGTCGTGACTATTCTTCACTTAGACTTCACCGTAG
CAAAAGGATGAAGCTGGAAAGCGAATATTACATAGACGAAGCGAATGGAAACTGGCACCT
AAGACGGCAAGCGCAAGAGGGTTTATCAAAGTGACTACTAAATCTGAAGCCTTCCGTGAA
GTTGAACCATTTATGAACGACTCCAGACTGAATCTATTACTAAAAGTTGTGTGAGTTTCT
TAGACTAATTTTCTTGTATTACAAAGTGTCTGGATATGTAAAGACAAGTATAAAAACAGA
CATGGGAACAATTAATGTAGAGGGATTGTTTGAC


BQ
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AF RR4AL67TF U 1
AF RR4AL67JQ C 320
BS 1 662 RR4AL67TF
BS 663 934 RR4AL67JQ

RD RR4AL67TF 662 0 0
GGCTCTTCCTTTTCCTTCTAATTCTTCGTCGAAAACAGCTCTTGTTCTTTGTAAGAAAAT
CTCTCGTACGAAGGAAAACATCAAAGTAACCGTAACGATGAGCGCAAAGAACTTCTCGTT
CGTAACGGAGACTCCCAGTGTGGATTCCAACGAAGGCACCAAAACCGATTCGGGTACCGG
CTTAAAGAAGGTAATCACCAAAGCTGGCGAAATCAGCAAAGCTGATTCCGGTTGCAACTC
TCCTGAATTGACTAAGCTCAGTGACGCTGACGAAAGAACCAAGGCTGATTCTGGATCTGG
ATCTCTTGCTTTGAAGACGGTATGTCTCAGGATCGCAAGCTTTGTTTATTGTATGAAATT
GTTGTTGTTATGTTGTGAATCAGGTAAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCATCAAG
CGGATTCCGGCTCTCCTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAGCTGGTGATGAAAGCAC
CGAGGCGGATTCCGGTTCTCCTGTGTTGACTAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGATGATGA
AAGCACCGAGGCGGATTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAGGGAAACAGAAGTTCTGCTCC
TTAACTATTTGTTGTTCCATACTTGGGTCGTGACTATTCTTCACTTAGACTTCACCGTAG
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4AL67JQ 615 0 0
GTATGTCTCAGGATCGCAAGCTTTGTTTATTGTATGAAATTGTTGTTGTTATGTTGTGAA
TCAGGTAAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCATCAAGCGGATTCCGGCTCTCCTGT
GTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAGCTGGTGATGAAAGCACCGAGGCGGATTCCGGTTCT
CCTGTGTTGACTAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGATGATGAAAGCACCGAGGCGGATTCC
AGTTCTCCTGTGTTGACCAAGGGAAACAGAAGTTCTGCTCCTTAACTATTTGTTGTTCCA
TACTTGGGTCGTGACTATTCTTCACTTAGACTTCACCGTAGCAAAAGGATGAAGCTGGAA
AGCGAATATTACATAGACGAAGCGAATGGAAACTGGCACCTAAGACGGCAAGCGCAAGAG
GGTTTATCAAAGTGACTACTAAATCTGAAGCCTTCCGTGAAGTTGAACCATTTATGAACG
ACTCCAGACTGAATCTATTACTAAAAGTTGTGTGAGTTTCTTAGACTAATTTTCTTGTAT
TACAAAGTGTCTGGATATGTAAAGACAAGTATAAAAACAGACATGGGAACAATTAATGTA
GAGGGATTGTTTGAC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL6815Contig1 1031 2 2 U
GGCTCTTTGTTTTCATCTCAAAGCCCTTTCAATTTGATCTCTCCTCCGCCCGCTCTCTCT
CTCTCTCTTCCATGGCGATCGCTTCGGAGAAGGAGGCTTCAGATGTTTCTGCAGTAGCAC
AGAAGAGATGGAATCTGAATGATTTCGACATTGGAAAGCCTCTTGGAAGAGGCAAGTTTG
GCCACGTTTATCTTGCTCGAGAGAAGCGGAGCAACCACATTGTGGCCCTTAAGGTTCTAT
TCAAGACACAGCTTCAACAATCTCAAGTTGAGCATCAGTTAAGGAGAGAAGTTGAGATTC
AGTCTCATCTTCGTAACCCCAATATACTCCGCCTCTATGGTTACTTCTATGATCAGGAAA
GGGTTTATTTGATACTTGAGTATGCTGCTAGAGGCGAGCTTTACAAGGAGCTTCAGAAAT
GCAAATACTTTAGCGAGAGACGAGCTGCTACTTATGTTGCCTCGTTGGCGAGGGCTCTCA
TCTATTGCCATGGCAAGCATGTGATACACAGAGATATCAAACCAGAAAATCTGTTAATCG
GTGCTCAGGGAGAGCTCAAGATTGCAGACTTTGGTTGGTCAGTACACACATTTAACCGCA
GAAGGACAATGTGTGGCACTCTAGATTACCTTCCTCCTGAGATGGTTGAAAGCGTAGAAC
ATTGTGCAAGTCGACCTCAAGTTCCCTCCTAAACCAATTGTGTCTGCATCTGCAAAGGAT
CTAATTAGCCAGATGCTTGTCAAGGAGTCTGCACAACGTCTGCCATTGCACAAACTTCTT
GAGCACCCGTGGATTGTGCAGAACGCTGATCCTTCTGGAATCTACAGAGGTTGAAAACGA
AACAGCTTTGTGACGTCTCTGTTCTAACGCTTCTGTTCTTGGCAATCTCGAGCCAAACTG
TATTTTTTTTTTCAAATCACCATTGTGTAGGTGTAAGAATCTTCCATCTTCTTTTCCTAA
TTCATGTTTCAATACGTGTATCCTAAGCAAATTCATTTGTGTTATTATTATCAATTGATA
TTCTTCATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES24TF U 1
AF RR4ES24JQ C 353
BS 1 695 RR4ES24TF
BS 696 1031 RR4ES24JQ

RD RR4ES24TF 695 0 0
GGCTCTTTGTTTTCATCTCAAAGCCCTTTCAATTTGATCTCTCCTCCGCCCGCTCTCTCT
CTCTCTCTTCCATGGCGATCGCTTCGGAGAAGGAGGCTTCAGATGTTTCTGCAGTAGCAC
AGAAGAGATGGAATCTGAATGATTTCGACATTGGAAAGCCTCTTGGAAGAGGCAAGTTTG
GCCACGTTTATCTTGCTCGAGAGAAGCGGAGCAACCACATTGTGGCCCTTAAGGTTCTAT
TCAAGACACAGCTTCAACAATCTCAAGTTGAGCATCAGTTAAGGAGAGAAGTTGAGATTC
AGTCTCATCTTCGTAACCCCAATATACTCCGCCTCTATGGTTACTTCTATGATCAGGAAA
GGGTTTATTTGATACTTGAGTATGCTGCTAGAGGCGAGCTTTACAAGGAGCTTCAGAAAT
GCAAATACTTTAGCGAGAGACGAGCTGCTACTTATGTTGCCTCGTTGGCGAGGGCTCTCA
TCTATTGCCATGGCAAGCATGTGATACACAGAGATATCAAACCAGAAAATCTGTTAATCG
GTGCTCAGGGAGAGCTCAAGATTGCAGACTTTGGTTGGTCAGTACACACATTTAACCGCA
GAAGGACAATGTGTGGCACTCTAGATTACCTTCCTCCTGAGATGGTTGAAAGCGTAGAAC
ATTGTGCAAGTCGACCTCAAGTTCCCTCCTAAACC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4ES24JQ 679 0 0
TCAGGAAAGGGTTTATTTGATACTTGAGTATGCTGCTAGAGGCGAGCTTTACAAGGAGCT
TCAGAAATGCAAATACTTTAGCGAGAGACGAGCTGCTACTTATGTTGCCTCGTTGGCGAG
GGCTCTCATCTATTGCCATGGCAAGCATGTGATACACAGAGATATCAAACCAGAAAATCT
GTTAATCGGTGCTCAGGGAGAGCTCAAGATTGCAGACTTTGGTTGGTCAGTACACACATT
TAACCGCAGAAGGACAATGTGTGGCACTCTAGATTACCTTCCTCCTGAGATGGTTGAAAG
CGTAGAACATTGTGCAAGTCGACCTCAAGTTCCCTCCTAAACCAATTGTGTCTGCATCTG
CAAAGGATCTAATTAGCCAGATGCTTGTCAAGGAGTCTGCACAACGTCTGCCATTGCACA
AACTTCTTGAGCACCCGTGGATTGTGCAGAACGCTGATCCTTCTGGAATCTACAGAGGTT
GAAAACGAAACAGCTTTGTGACGTCTCTGTTCTAACGCTTCTGTTCTTGGCAATCTCGAG
CCAAACTGTATTTTTTTTTTCAAATCACCATTGTGTAGGTGTAAGAATCTTCCATCTTCT
TTTCCTAATTCATGTTTCAATACGTGTATCCTAAGCAAATTCATTTGTGTTATTATTATC
AATTGATATTCTTCATCAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6816Contig1 351 2 1 U
GTGATTTGGTGGTCAGCCAATCATCTTTGTGTGTTAATTGGTGGTTAGGCAACACACTAA
TCCGTTCTTTGGTGGTTAGCCTTAGATCGAGGGTATATCAAGAGCCATTCCGCACCTCTT
GACGATCCATTCATTCCATCCCAGTTCCGGAACTCGGAAGTGCCTCGACTTCTCGGTTCA
TATCCAACATCCGGCCAAAGCCATCCTTCCCGATTTTGGGCGTATCATTTGGTATCAGAG
CCACTTTGGCTGGTTTGTTTTCTATCTTCTTTTCACCTTCTCATCTCTTCATCATTTCTT
ATTTCTTTTTGGATCCGGGCTGTTCCTTTACTCCCTTGTGATCGCCATTTT


BQ
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AF RR4DB80JQ C 1
AF RR4DB80TF U 1
BS 1 351 RR4DB80TF

RD RR4DB80JQ 351 0 0
GTGATTTGGTGGTCAGCCAATCATCTTTGTGTGTTAATTGGTGGTTAGGCAACACACTAA
TCCGTTCTTTGGTGGTTAGCCTTAGATCGAGGGTATATCAAGAGCCATTCCGCACCTCTT
GACGATCCATTCATTCCATCCCAGTTCCGGAACTCGGAAGTGCCTCGACTTCTCGGTTCA
TATCCAACATCCGGCCAAAGCCATCCTTCCCGATTTTGGGGGTATCATTTGGTATCAGAG
CCACTTTGGCTGGTTTGTTTTCTATCTTCTTTTCACCTTCTCATCTTTTCATCATTTCTT
ATTTCTTTTTGGATCCGGGCTGTTCCTTTACTCCCTTGTGATCGCCATTTT

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4DB80TF 351 0 0
GTGATTTGGTGGTCAGCCAATCATCTTTGTGTGTTAATTGGTGGTTAGGCAACACACTAA
TCCGTTCTTTGGTGGTTAGCCTTAGATCGAGGGTATATCAAGAGCCATTCCGCACCTCTT
GACGATCCATTCATTCCATCCCAGTTCCGGAACTCGGAAGTGCCTCGACTTCTCGGTTCA
TATCCAACATCCGGCCAAAGCCATCCTTCCCGATTTTGGGCGTATCATTTGGTATCAGAG
CCACTTTGGCTGGTTTGTTTTCTATCTTCTTTTCACCTTCTCATCTCTTCATCATTTCTT
ATTTCTTTTTGGATCCGGGCTGTTCCTTTACTCCCTTGTGATCGCCATTTT

QA 1 351 1 351
DS 



AS 1 2

CO CL6817Contig1 343 2 1 U
GAAGGACGGGAAGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGACGA
TCTCGAGCGTCTCAAGAAAATCAGAAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTTCG
TGTCCATGGACAGCACACCAAGACAACTGGGCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCGAA
GAAGCGTTAAGCAAGATTACTTCTTTATCTGTTTTGATATATGTTTCTGCCTTTGAATTA
GTTTATGTGACACTTTTGGATCTTCGAAATAGTTTGCGTGATACTTTTGGATCTTTGTGC
TCTCTATCTCTCTTTTCCAGTGGTTTACATCTGTTTTAACTTT


BQ
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AF RR4GD78JQ C 1
AF RR4GD78TF U 1
BS 1 343 RR4GD78TF

RD RR4GD78JQ 343 0 0
GAAGGACGGGAAGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGACGA
TCTCGAGCGTCTCAAGAAAATCAGAAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTTCG
TGTCCATGGACAGCACACCAAGACAACTGGGCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCGAA
GAAGCGTTAAGCAAGATTACTTCTTTATCTGTTTTGATATATGTTTCTGCCTTTGAATTA
GTTTATGTGACACTTTTGGATCTTCGAAATAGTTTGCGTGATACTTTTGGATCTTTGTGC
TCTCTATCTCTCTTTTCCAGTGGTTTACATCTGTTTTAACTTT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4GD78TF 343 0 0
GAAGGACGGGAAGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGACGA
TCTCGAGCGTCTCAAGAAAATCAGAAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTTCG
TGTCCATGGACAGCACACCAAGACAACTGGGCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCGAA
GAAGCGTTAAGCAAGATTACTTCTTTATCTGTTTTGATATATGTTTCTGCCTTTGAATTA
GTTTATGTGACACTTTTGGATCTTCGAAATAGTTTGCGTGATACTTTTGGATCTTTGTGC
TCTCTATCTCTCTTTTCCAGTGGTTTACATCTGTTTTAACTTT

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 2

CO CL6818Contig1 343 2 1 U
GCAAAAAGTTACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAATGATCTACCGAAAGTGGAGTCTGC
TGTCCGGTCCACCGGTTATACTCGGAGGAGCCGTAGTTGCCGCCATCGCGGTCGGCATCC
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GGAAAAGATTGGGGAGAAGATGCTACAAATAAACTTTGTAGTGTGATTTTAGTTCATGCA
GTGTAAGCTCTCAATAATGCTTTTGTAAGCTTTTTCGAATGCACAGATCCTTTTTGGTGT
TTTTGGACTCTTATTGCCAATAATATTATCTCACTTTTTGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FC59TF U 1
AF RR4FF12TF U 1
BS 1 343 RR4FC59TF

RD RR4FC59TF 343 0 0
GCAAAAAGTTACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAATGATCTACCGAAAGTGGAGTCTGC
TGTCCGGTCCACCGGTTATACTCGGAGGAGCCGTAGTTGCCGCCATCGCGGTCGGCATCC
TCGTACAGAACGTTACGAAAGGGGAACAAAAGAAGAATGTCTCATCAAACAAGTGAAGGA
GGAAAAGATTGGGGAGAAGATGCTACAAATAAACTTTGTAGTGTGATTTTAGTTCATGCA
GTGTAAGCTCTCAATAATGCTTTTGTAAGCTTTTTCGAATGCACAGATCCTTTTTGGTGT
TTTTGGACTCTTATTGCCAATAATATTATCTCACTTTTTGCTC

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR4FF12TF 343 0 0
GCAAAAAGTTACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAATGATCTACCGAAAGTGGAGTCTGC
TGTCCGGTCCACCGGTTATACTCGGAGGAGCCGTAGTTGCCGCCATCGCGGTCGGCATCC
TCGTACAGAACGTTACGAAAGGGGAACAAAAGAAGAATGTCTCATCAAACAAGTGAAGGA
GGAAAAGATTGGGGAGAAGATGCTACAAATAAACTTTGTAGTGTGATTTTAGTTCATGCA
GTGTAAGCTCTCAATAATGCTTTTGTAAGCTTTTTCGAATGCACAGATCCTTTTTGGTGT
TTTTGGACTCTTATTGCCAATAATATTATCTCACTTTTTGCTC

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 2

CO CL6819Contig1 587 2 3 U
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ATTTATGTAGAGATGACTCTACTGATAAGTTCAATCTGACATTAAGCAGAACAAATCTGA
AGATTCTATAAGTGCAGAGATTTTATTAGAAAGATACTTTTTCTACTTGTTACGCTTGGC
AGCACGTCTTCCATGACCCTTTTTCGGTGGTCCTTTATCACGACGCTTCAACATCTCAAG
CTTCGATAAGCGCTCTTTTTCTTCTCTAGCCAAAACATTGGGATCCTCATTCTTGATGTC
GTATGGATACCATTCCGCAACCTTATCACCAAAAAGCTTCTTCCTTAAAATCTTATGAGG
AGATCTCTGTCCTGTTGGGTTAAGCATATGTCCGAAAATCCTAGCTCTTGCTTCTGTCAC
GCCAATAATGACTGCCGAAGTTACAAGCCTTTTCAAGCTACCACTAGCCATATTCCTTTA
AAACCACACCGACACGCCGACAGCGGTGGAGAGACAGGAGACGGCCC


BQ
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AF RR4AJ68TF C 1
AF RR4AJ68JQ U 223
BS 1 222 RR4AJ68TF
BS 223 578 RR4AJ68JQ
BS 579 587 RR4AJ68TF

RD RR4AJ68TF 587 0 0
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ATTTATGTAGAGATGACTCTACTGATAAGTTCAATCTGACATTAAGCAGAACAAATCTGA
AGATTCTATAAGTGCAGAGATTTTATTAGAAAGATACTTTTTCTACTTGTTACGCTTGGC
AGCACGTCTTCCATGACCCTTTTTCGGTGGTCCTTTATCACGACGCTTCAACATCTCAAG
CTTCGATAAGCGCTCTTTTTCTTCTCTAGCCAAGACATTGGGATCCTCATTCTTGATGTC
GTATGGATACCATTCCGCAACCTTATCACCAAAAAGCTTCTTCCTTAAAATCTTATGAGG
AGATCTCTGTCCTGTTGGGTTAAGCATATGTCCGAAGATCCTAGCTCTTGCTTCTGTCAC
GCCAATAATGACTGCCGAAGTTACAAGCCTTTTCAAGCTACCACTAGCCATATTCCTTTA
AAACCACACCGACACGCCGACAGCGGTGGAGAGACAGGAGACGGCCC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4AJ68JQ 356 0 0
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ACGCTTCAACATCTCAAGCTTCGATAAGCGCTCTTTTTCTTCTCTAGCCAAAACATTGGG
ATCCTCATTCTTGATGTCGTATGGATACCATTCCGCAACCTTATCACCAAAAAGCTTCTT
CCTTAAAATCTTATGAGGAGATCTCTGTCCTGTTGGGTTAAGCATATGTCCGAAAATCCT
AGCTCTTGCTTCTGTCACGCCAATAATGACTGCCGAAGTTACAAGCCTTTTCAAGCTACC
ACTAGCCATATTCCTTTAAAACCACACCGACACGCCGACAGCGGTGGAGAGACAGG

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 2

CO CL6820Contig1 1216 2 2 U
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TTATTATGTTATTGTGTGCGATATGCGTTCCTTCCTCTGGGTTGGCTTCATCATCGCCGG
TGAACATTTCCGTCTGCAATCACGAGTTCGAGCTCTTCCGGTTCGATCTACGCTCCAAAT
GTCCTCCTTCTACGCATCCACCTCCTCCTCCTATCCAGGTAGATGGAGACTCGCTGGACA
AGTTAATGATGTCTTTGAACCGTGGTGGGAATGCTGCTTATATGTCTGTGCTCTTTTATG
CTTCCTGGTGCCCTTTCTCACGTCCTCTCCGCCCTAAGTTTGACATTTTGAGCTCCATGT
TCCCTCAAATTCAGCACCTTGCTGTCGATCATTCTCAAGCACTCCCATCTGTCTTTTCAA
GGTATGGTATCCACAGCTTACCTTCAATCCTGATTGTAAACCAAACTTCAAAGGCACGAT
ACCAAGGTCGAAAGGATGATCTTACATCCCTGATTGAGTTTTATGAGGAATCTACAGGTC
TTAAACCTGTCCAGTATGTGGCCGAAGCTGAACCAACAACAAGCTTAGACGCCATCATCG
ATGGCAACCTGATCACATGGTTACGCAATGGGACATCTATCAGTGAAATATTCAGACGAG
ATCCATTCTTGGTACTCTCTCTGCTGTTTATCTGTTTACAAATGGCGATCCTCGTCTTCT
CCATAGCAGAATCACGCATGAAAGCGTTGTGGGCTTCTTACGTTTCCAGTCTGAACCTGG
AGAGATTTGGAGAGATCAGCCAACTTTTCAGCCGCGCTCTTCACATGGTGGATGTGAGGA
GGCTGTGGTTGAAACTGGGACTCGTCAAAACAAGGAACTTTCATGAGAGAGCAATGAACG
CTCAAGCCTGGGCTTCATCGCTTGCATCTGTCTCTCTTGGCCAACAAACTTCATCAGACC
AGTCCTGATCTCTCTTAAAGGCTACTTCTAGTATCTTGTCAGCATTGGAAAGAGATAAGG
TTTAAGTGTGTCCTTGAACTCTGAGAGTTCCCTTACATGTTGACTTCTGTGTTAATTTGT
CTGCATCAAAGATGTAAATCCAGGAACAGCTTTGCTTCTGTCTGTGAATATGTTTCTCTC
TTTTTTTTTGTTTTACAACTCTGAGATGTATGTTTTGACCTCATTTCTCTTACTGAATAA
TTTTATTGAGTCAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CA10TF U 1
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RD RR4CA10TF 570 0 0
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TTATTATGTTATTGTGTGCGATATGCGTTCCTTCCTCTGGGTTGGCTTCATCATCGCCGG
TGAACATTTCCGTCTGCAATCACGAGTTCGAGCTCTTCCGGTTCGATCTACGCTCCAAAT
GTCCTCCTTCTACGCATCCACCTCCTCCTCCTATCCAGGTAGATGGAGACTCGCTGGACA
AGTTAATGATGTCTTTGAACCGTGGTGGGAATGCTGCTTATATGTCTGTGCTCTTTTATG
CTTCCTGGTGCCCTTTCTCACGTCCTCTCCGCCCTAAGTTTGACATTTTGAGCTCCATGT
TCCCTCAAATTCAGCACCTTGCTGTCGATCATTCTCAAGCACTCCCATCTGTCTTTTCAA
GGTATGGTATCCACAGCTTACCTTCAATCCTGATTGTAAACCAAACTTCAAAGGCACGAT
ACCAAGGTCGAAAGGATGATCTTACATCCCTGATTGAGTTTTATGAGGAATCTACAGGTC
TTAAACCTGTCCAGTATGTGGCCGA
GCTGA

QA 1 565 1 565
DS 

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CATCTATCAGTGAAATATTCAGACGAGATCCATTCTTGGTACTCTCTCTGCTGTTTATCT
GTTTACAAATGGCGATCCTCGTCTTCTCCATAGCAGAATCACGCATGAAAGCGTTGTGGG
CTTCTTACGTTTCCAGTCTGAACCTGGAGAGATTTGGAGAGATCAGCCAACTTTTCAGCC
GCGCTCTTCACATGGTGGATGTGAGGAGGCTGTGGTTGAAACTGGGACTCGTCAAAACAA
GGAACTTTCATGAGAGAGCAATGAACGCTCAAGCCTGGGCTTCATCGCTTGCATCTGTCT
CTCTTGGCCAACAAACTTCATCAGACCAGTCCTGATCTCTCTTAAAGGCTACTTCTAGTA
TCTTGTCAGCATTGGAAAGAGATAAGGTTTAAGTGTGTCCTTGAACTCTGAGAGTTCCCT
TACATGTTGACTTCTGTGTTAATTTGTCTGCATCAAAGATGTAAATCCAGGAACAGCTTT
GCTTCTGTCTGTGAATATGTTTCTCTCTTTTTTTTTGTTTTACAACTCTGAGATGTATGT
TTTGACCTCATTTCTCTTACTGAATAATTTTATTGAGTCAGCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

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GAGTCTATAGCTAGGTTTCGATGCGTATCTAAAACATGGGCATCAATACTTCGTCGTCCT
GATTTCACTGAGTTGTTTCTGACAAAGTCTTTGACTCGTCCGCGGCTCTTTGTCACGGTA
AAATCTAAGGGCAAGTTGTTCTTCCACTCTTCACCCCAGCCTCATAATCTAAACAATAAT
TATTCTCTTGTAGCCACCTCTTATCACCCTATGTTGGTTCCTGATTATTGTCAAACTTAT
ATCTGTAAACCGGTTTTTGGATTGGTCTTGCTTCAGAGATGTGGAATAGAAAAAGGGCCG
ATGATTTGTAACCCTGCCAAGGGAAAAGTCCGAAACTTACCCAAAGTGCCTAGAAAAGGA
ATAAACACTCCCAAGGGAATATACTTAGGCTACGATCCGATCGGCAAACAGTTCAAAGTG
TTGTGTTTGAGTATGAACACCTCACTCTATAATACTCACTGGATTTTGACATTGGAATAT
GGAGAGTGTTCGTGGAGAAGTCTCGAACCCGAATTCAATTTTAAGGAGAAAAGAAGTGGT
GGAGTAGATCGTGATATTAATATATGCATAAATGGTGTCTTGTATTTCGAGGGTTGTTTG
GAATGGTCTTTTGTGATAGTTTGGTTTGATGTTAGGTCAGAGAAGTTCGGTTTTATTAAC
AAAAATGAAGACATGTTACCAAAGCCTTTTGCTTATGATTGTACTAGGCCTTCAACTTTG
TTCAACTACAAAGATAAACTAGGCATACATTGTCGGGTTAAACGAAACCTTGTGTTGTGG
GTTCTAGAAGATGCTGGAAATCATAAATGGTACAAGCATAGCTATGTACTTCCTCCTAGG
TGGTCCGCGGTACCTACGGAATGTATGTTTGTTGGAATGACTAGTACAGGTGAAATTGTC
TACTCGTGGAACTATTACATTTTCTTCTACAATTTGGAGAGGGACACTGTCAAAAGAGTC
AATATTCCCGGTCTGGAAGGGATTGAGCATCCTACATTTATCAACACCTTTGTAGACTAT
GCGGAGAATATGAATTTTATGTAACTGTGTTCGAAAGGCTTTCATTTATTATTTACTTAT
TAGTGACTATATTTTGGATTTCAACTCTTGACATTTTGTTCCTTTCAGGCTTTGTTTGGA
TTCAAACTTTATAATAGTTTTTGCTAC


BQ
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AF RR4A666TF U 1
AF RR4A666JQ C 414
BS 1 764 RR4A666TF
BS 765 1227 RR4A666JQ

RD RR4A666TF 764 0 0
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GAGTCTATAGCTAGGTTTCGATGCGTATCTAAAACATGGGCATCAATACTTCGTCGTCCT
GATTTCACTGAGTTGTTTCTGACAAAGTCTTTGACTCGTCCGCGGCTCTTTGTCACGGTA
AAATCTAAGGGCAAGTTGTTCTTCCACTCTTCACCCCAGCCTCATAATCTAAACAATAAT
TATTCTCTTGTAGCCACCTCTTATCACCCTATGTTGGTTCCTGATTATTGTCAAACTTAT
ATCTGTAAACCGGTTTTTGGATTGGTCTTGCTTCAGAGATGTGGAATAGAAAAAGGGCCG
ATGATTTGTAACCCTGCCAAGGGAAAAGTCCGAAACTTACCCAAAGTGCCTAGAAAAGGA
ATAAACACTCCCAAGGGAATATACTTAGGCTACGATCCGATCGGCAAACAGTTCAAAGTG
TTGTGTTTGAGTATGAACACCTCACTCTATAATACTCACTGGATTTTGACATTGGAATAT
GGAGAGTGTTCGTGGAGAAGTCTCGAACCCGAATTCAATTTTAAGGAGAAAAGAAGTGGT
GGAGTAGATCGTGATATTAATATATGCATAAATGGTGTCTTGTATTTCGAGGGTTGTTTG
GAATGGTCTTTTGTGATAGTTTGGTTTGATGTTAGGTCAGAGAAGTTCGGTTTTATTAAC
AAAAATGAAGACATGTTACCAAAGCCTTTTGCTTATGATTGTAC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4A666JQ 814 0 0
AAAAGGAATAAACACTCCCAAGGGAATATACTTAGGCTACGATCCGATCGGCAAACAGTT
CAAAGTGTTGTGTTTGAGTATGAACACCTCACTCTATAATACTCACTGGATTTTGACATT
GGAATATGGAGAGTGTTCGTGGAGAAGTCTCGAACCCGAATTCAATTTTAAGGAGAAAAG
AAGTGGTGGAGTAGATCGTGATATTAATATATGCATAAATGGTGTCTTGTATTTCGAGGG
TTGTTTGGAATGGTCTTTTGTGATAGTTTGGTTTGATGTTAGGTCAGAGAAGTTCGGTTT
TATTAACAAAAATGAAGACATGTTACCAAAGCCTTTTGCTTATGATTGTACTAGGCCTTC
AACTTTGTTCAACTACAAAGATAAACTAGGCATACATTGTCGGGTTAAACGAAACCTTGT
GTTGTGGGTTCTAGAAGATGCTGGAAATCATAAATGGTACAAGCATAGCTATGTACTTCC
TCCTAGGTGGTCCGCGGTACCTACGGAATGTATGTTTGTTGGAATGACTAGTACAGGTGA
AATTGTCTACTCGTGGAACTATTACATTTTCTTCTACAATTTGGAGAGGGACACTGTCAA
AAGAGTCAATATTCCCGGTCTGGAAGGGATTGAGCATCCTACATTTATCAACACCTTTGT
AGACTATGCGGAGAATATGAATTTTATGTAACTGTGTTCGAAAGGCTTTCATTTATTATT
TACTTATTAGTGACTATATTTTGGATTTCAACTCTTGACATTTTGTTCCTTTCAGGCTTT
GTTTGGATTCAAACTTTATAATAGTTTTTGCTAC

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL6822Contig1 1165 2 4 U
GGACAACCGAAAATTCTCTCTGCCGCCGCACAGGTAATAAAAAAGAAAAAGAAAAGAATT
CTTTAGCCGCCGATCTCTCTCCGTGGTGGGTCATAATTCTCACCGCCGCTATAAATCCTC
CCTCATCCTCTATAGTTTAATTTATGGTTTATATGGGTTCTTGTATTTTTGGCGTTTCTT
AGCTTCTTTCGAGATTTAGATTTTGCGTTGGTAAGGTTGTACGGTCTTGGAGGAGTCATC
TGGGGTTGAATCAGTGCTTGTATCCCTTTAGTATATGTCGATTAGGTGAGCAGTTGTAGA
AAAGACTTCTGTGGTTGTAGCTAGTGCCTAATCGTTCTGAGTTTCGTGGCTCCTCTTTGT
GTCTTTTCTTGACTGTGTTCTGCATCTGGAGTGTAGTTCCAGCTCAATTGCTTGTTTCAG
GTGAAGTTTTGGTTCAGAGAGTTGGGTTCAGTAATGAGTCTGGCGTCAGATGTCAGGCCG
AAGACCTGTTGATGGTGTGGTGTAGCTACTGGGAGCAGTGCAGGTGCTTTCGCTGACGTC
ATCTTTCGATTGTTTTCAACTCTAGCTCTTTTGCTGCTCATCGTTTCTGCAAGGAGTTTA
GTTTTCGTGTTGGTTCTTCAGTTGGTGCTTTCATGTTTGTGGCTTTTTCTAAATGGTTCT
GGTTTGGCGTGGAGTTATATGTTACTTTGGGTTTTTTCCTGCAACGAAGAAGCGTCCCGA
GGATCCTTGGTTTGCTTTTGATTTCTCTCTGGTGACAAGGTATGTATTAAAGTGTTGTTC
CTCGTTTTGCTGTGTATATGGCGGGTGGACCTGTTTCTGTCGTTTGGTTTGGTTGTCAAG
CATTTCAGGTGGTGGTGGTCTGTCCTCATGGAGTCCTATTCGCGTTTTGTCTGGTTGTCT
CCTTGTAATCTTCCGGTGGTTCTAAAATTCTTGGTTACTATCTTCTTCTTCCTCTCTTGA
ACTTTCAGTTACTCAGGAGATTTAAGTTTTGAATTTCAACTTGGTTCGGTTGCTTATATG
CCCTATGGATGGGCTTTAGTTTTTTTTTTATGGGATTTAAATTCCCTTCTTATGGGATGT
AGTTGCTAAGGATATTTCTTTTGCTTCAGTTTATGTATTAAACTTTGTATTCCACTTTGT
TATCCTAATATAAACCAATTTGACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BV04TF U 1
AF RR4BV04JQ C 339
BS 1 675 RR4BV04TF
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BS 677 696 RR4BV04TF
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AGCTTCTTTCGAGATTTAGATTTTGCGTTGGTAAGGTTGTACGGTCTTGGAGGAGTCATC
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CCTGCACGA

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GTGGCTTTTTCTAAATGGTTCTGGTTTGGCGTGGAGTTATATGTTACTTTGGGTTTTTTC
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GTCGTTTGGTTTGGTTGTCAAGCATTTCAGGTGGTGGTGGTCTGTCCTCATGGAGTCCTA
TTCGCGTTTTGTCTGGTTGTCTCCTTGTAATCTTCCGGTGGTTCTAAAATTCTTGGTTAC
TATCTTCTTCTTCCTCTCTTGAACTTTCAGTTACTCAGGAGATTTAAGTTTTGAATTTCA
ACTTGGTTCGGTTGCTTATATGCCCTATGGATGGGCTTTAGTTTTTTTTTTATGGGATTT
AAATTCCCTTCTTATGGGATGTAGTTGCTAAGGATATTTCTTTTGCTTCAGTTTATGTAT
TAAACTTTGTATTCCACTTTGTTATCCTAATATAAACCAATTTGACG

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

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AGAGTTCTTAGCCACAACATCAACTGATGGGTCAGCTAGGATATGGAAAGCAGAAGATGG
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TAAAGATGGAACAAAACCCTTTCTGTTCTGTGCTGCTCAAAGAGGTGATGTTCCTGTGGT
CGATGTTTACGACATTAGTACATGGAAGAAGCTTGGGTTCAAAAAGCTGTCAAGGAAGAA
TGCATCGACAATGGCAGTGAGCTTGGATGGCAAATATATTGCTTTGGGTGGCAAAGATGG
AGATATATCTGTAGCTGAAGTGAAGACAATGGAGATATACCATTACAGTAAGAGGCTGCA
TCTTGGTCAAACCATTGCTTCACTTGAGTTCTGCCCTAGTGAAAGGGTGATGCTGACAAC
ATCGAGTGAATGGGGTGAGATGGTGACCAAACTCACTGTACCAAAGGAGTGGAAAGAGTG
GCAGATATATGCGCTGTTGTTTTGCTTGTTCATGGCATCAGTGGTACTTGCATACGTGTT
CTTCGAGAACTCAGATTCGTTTTGGAAGTTACCAATGGGAAAAGATCAAAGAAGACCAAA
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GGACCTATAGATTGAAAGAGAGATTTATGTGTAAACTCCACACGGGACGTTTTCTGTCTT
TTTGTTTCTTTTCAAAACTTTGTCACATGTTTTTATTTTCCTCCTTTTCCTCAGCTCTGA
TTATCTGACAGTAACTCTTTCGGTTCTGGAATTAAAAATTAAAAATACGTTTTGGTTCC


BQ
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AF RR4DM73TF U 1
AF RR4DM73JQ C 444
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BS 651 1139 RR4DM73JQ

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TTGCAAGTTGTTTGAGATAGTGGGAGGAGCAACAGGTGTTACCATCTTAGCCAAAGAACT
CCCTCCTCTTCAAAATGCTGGACTACAAAAATGTATGGCCTTCAGCTTTGACGGGTCTAA
ACTAGCTACTGGAGGAGTGGATGGGTGTCTAAGAATCATGGAGTGGCCAAACCTAAGTGT
AATTTTGGATGAGCCAAAGGCACACAAATCCATCCGGGACATGGATTTTAGTCTTGACTC
AGAGTTCTTAGCCACAACATCAACTGATGGGTCAGCTAGGATATGGAAAGCAGAAGATGG
TTTTCCTTTGTCAACTTTGGAACGTAGTGGGGATGAAAATATTGAACTGTGCCGGTTCTC
TAAAGATGGAACAAAACCCTTTCTGTTCTGTGCTGCTCAAAGAGGTGATGTTCCTGTGGT
CGATGTTTACGACATTAGTACATGGAAGAAGCTTGGGTTCAAAAAGCTGTCAAGGAAGAA
TGCATCGACAATGGCAGTGAGCTTGGATGGCAAATATATTGCTTTGGGTGGCAAAGATGG
AGATATATCTGTAGCTGAAGTGAAGACAATGGAGATATACCATTACAGTA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DM73JQ 696 0 0
TGTTCTGTGCTGCTCAAAGAGGTGATGTTCCTGTGGTCGATGTTTACGACATTAGTACAT
GGAAGAAGCTTGGGTTCAAAAAGCTGTCAAGGAAGAATGCATCGACAATGGCAGTGAGCT
TGGATGGCAAATATATTGCTTTGGGTGGCAAAGATGGAGATATATCTGTAGCTGAAGTGA
AGACAATGGAGATATACCATTACAGTAAGAGGCTGCATCTTGGTCAAACCATTGCTTCAC
TTGAGTTCTGCCCTAGTGAAAGGGTGATGCTGACAACATCGAGTGAATGGGGTGAGATGG
TGACCAAACTCACTGTACCAAAGGAGTGGAAAGAGTGGCAGATATATGCGCTGTTGTTTT
GCTTGTTCATGGCATCAGTGGTACTTGCATACGTGTTCTTCGAGAACTCAGATTCGTTTT
GGAAGTTACCAATGGGAAAAGATCAAAGAAGACCAAAGATAAGCCTCTTTGGAGGTTCAT
CCTCTACGCCTGCCGAGGATCATAACAAGTGGAACTTGGACCTATAGATTGAAAGAGAGA
TTTATGTGTAAACTCCACACGGGACGTTTTCTGTCTTTTTGTTTCTTTTCAAAACTTTGT
CACATGTTTTTATTTTCCTCCTTTTCCTCAGCTCTGATTATCTGACAGTAACTCTTTCGG
TTCTGGAATTAAAAATTAAAAATACGTTTTGGTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6824Contig1 1092 2 2 U
GGGTTGTGAAGATACTTGCTGTTTAGCGAAGACAGGCGATAACTCCGAAGCAAAGAGATA
TTATTAAAAGACTTGTTGGTAGAAACGATCAGATGGAGACGGAGAAGAAAAATAGCAAGG
AGCTAGGTCTGAAACACCTAGGGTTCGTGAGAGTCGCGGCGATCCATGTTCTCGTTAGCC
TCTCGAGCCTCTACGGCTACGCGAAACAAAACTCTGGTCCTCTTAAACCGGCGGTGGGGA
AAGTGGAAGGAGCCGTCACCACCGTCGTCACCCCTGTCTGCAACAAACTCAAGGATGTTC
CAGATACTCTCCTCCTCTTTCTAGATCACAAGGTCGGTGAAGTTTCGGACAAGTTTGATA
AGCATGCTCCAACGATGGCTAAGAAGGTAGCAAGTCAAGCTAATGTGTTGATCCAGAAGG
CTCAATCCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACCGGTGGTCCCAGAGCTGCTTTTAACTATGCTG
CATCCGAGTACAAGTGTTTCCTTGTGAACACCTCTGTTAAAGTCTGGGCTAGACTCGACC
GGTATAAACCGATTCATGCAGTGGGGAACAAAGTTCTGCCCGTGGCTGCGCACGTGTCTG
GTATTTACAACGAGTTGGTGACGGACATGACTCAGATGGGTTACCCTGTGGTTGGTTATT
TCCCTTTAGTTCCTGTTGATGACATTGTCAAGGCTTATGAAAAGGAGGAAGGTGCAGCGC
AGAGGAAAGGAGATGCTGCTGCTGCTGATGGAAATAAATCGTCGTCCGATTCGGATACTG
ATTGAAAAACGCTTTGTGTGATTTAAAGCTGTTTGGTTTTTGGTTAGGTTTTGGTTACTT
GTGTAAATGATCTTATTAGGCCCTCTCTTGTTTTCCTTTTTGTTCACAGAACTTGGTCCT
GGTAGTTTTTTAGCAAGTGTTTTATTTCTTGGTGTGTGTGACAATGTGATGCGTTTAAAG
AATCGTATTAGGCCCTTTCTTGTTTTCCTTTTTGTTCACAGAACTTGGTCCTGTAGTTTT
TTAGCAAGTGTTTCATTTCTTTGTGGTGTGACAATGTGATACGTTTCTTTCTATGTTTTT
ATAAACCAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D832TF U 1
AF RR4D832JQ C 346
BS 1 692 RR4D832TF
BS 693 1092 RR4D832JQ

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TTATTAAAAGACTTGTTGGTAGAAACGATCAGATGGAGACGGAGAAGAAAAATAGCAAGG
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TCTCGAGCCTCTACGGCTACGCGAAACAAAACTCTGGTCCTCTTAAACCGGCGGTGGGGA
AAGTGGAAGGAGCCGTCACCACCGTCGTCACCCCTGTCTGCAACAAACTCAAGGATGTTC
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AGCATGCTCCAACGATGGCTAAGAAGGTAGCAAGTCAAGCTAATGTGTTGATCCAGAAGG
CTCAATCCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACCGGTGGTCCCAGAGCTGCTTTTAACTATGCTG
CATCCGAGTACAAGTGTTTCCTTGTGAACACCTCTGTTAAAGTCTGGGCTAGACTCGACC
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GTATTTACAACGAGTTGGTGACGGACATGACTCAGATGGGTTACCCTGTGGTTGGTTATT
TCCCTTTAGTTCCTGTTGATGACATTGTCAAG
CTTATGAA

QA 1 692 1 692
DS 

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CTTTTAACTATGCTGCATCCGAGTACAAGTGTTTCCTTGTGAACACCTCTGTTAAAGTCT
GGGCTAGACTCGACCGGTATAAACCGATTCATGCAGTGGGGAACAAAGTTCTGCCCGTGG
CTGCGCACGTGTCTGGTATTTACAACGAGTTGGTGACGGACATGACTCAGATGGGTTACC
CTGTGGTTGGTTATTTCCCTTTAGTTCCTGTTGATGACATTGTCAAGGCTTATGAAAAGG
AGGAAGGTGCAGCGCAGAGGAAAGGAGATGCTGCTGCTGCTGATGGAAATAAATCGTCGT
CCGATTCGGATACTGATTGAAAAACGCTTTGTGTGATTTAAAGCTGTTTGGTTTTTGGTT
AGGTTTTGGTTACTTGTGTAAATGATCTTATTAGGCCCTCTCTTGTTTTCCTTTTTGTTC
ACAGAACTTGGTCCTGGTAGTTTTTTAGCAAGTGTTTTATTTCTTGGTGTGTGTGACAAT
GTGATGCGTTTAAAGAATCGTATTAGGCCCTTTCTTGTTTTCCTTTTTGTTCACAGAACT
TGGTCCTGTAGTTTTTTAGCAAGTGTTTCATTTCTTTGTGGTGTGACAATGTGATACGTT
TCTTTCTATGTTTTTATAAACCAGGAG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL6825Contig1 1166 2 6 U
GGGAAGATTCCTTCTTTGATCGATCAAAGAGAGAAGAGAATCTCTGTGAGATATACACAA
AGGACAGAGACAAATCCTTTTGATCTCCAAAACAGAGAATAATTCTCTTCATACAGACTA
CAGAGACACAGAGATGCAAACCATCTCCAAAGCTTCTTCTGCTATCTCCTTCTTTCGATG
TTCCAGGAAGCTAACAAGTGAGCCATGTGTGAGGCAGCTTCACATCCGAAAGGGTCTCGT
CTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCTTCACCTCTTAGGACTCTCCGCGGTGCTGGCAAATC
TATTCGAGTCTCCAGTTTCTGCAGTGTCTCCTCCAATCCCTCCTCCTTGCAAATTGAGAT
GGTGCCTTGTCTTAAGGATAACTACGCTTACATTTTGCATGATGAGGATACTGGTACAGT
TGGGGTGGTTGACCCTTCTGAAGCTGAACCTGTGATAGATTCTTTGCAGAGGAGTGGTCG
TAACCTGACGTATATATTGAATACGCATCATCATTATGATCACACTGGTGGGAATCTTGA
ATTGAAAGACAGGTATGGTGCAAAGGTGATTGGCTCAGCTTTAGATAGAGATCGGATACC
TGGGATTGATATAGCCTTGAAGGATGGTGAGAAGTGGATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCA
TGTTATGGATACTCCTGGCCACACAAAACGCCATATCAGTTTATACTTTCCAGGATCAAG
AGCTATCTTCTCTGGGGACACCTTGTTTAGCTTATCTTGTGGTAAACTCTTTGAAGGTAC
CCCTAAGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGATCATTGCTTTACCAGACGACACAAGCAT
ATACTGTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCCAAGTTTGCATTGTCTATAGGGCCAAA
CAACGAAGTACTTCAGTCTTATGCAGCTCATGTTGCAGAGCTCCGTAAAAAGAAATTACC
TACGATTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGCTTGTAACCCATTCCTCCGCAGTTCGAA
TACAGATATTCGTCGGGCTTTAGGTATTTCAGAGACTGCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGC
TATTATCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGCTTAGGCTTTTTTCTTCTGAGGCAATTC
TTTGGTTTGCATCTGTTTCCTCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AX92TF U 1
AF RR4AX92JQ C 484
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CTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCTTCACCTCTTAGGACTCTCCGCGGTGCTGGCAAATC
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ATTGAAAGACAGGTATGGTGCAAAGGTGATTGGCTCAGCTTTAGATAGAGATCGGATACC
TGGGATTGATATAGCCTTGAAGGATGGTGAGAAGTGGATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCA
TGTTATGGATACTCCTGGCCACACAAAACGCCATATCAGTTTATACTTTCCAGGATCAAG
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ATACTG

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DS 

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GATTGATATAGCCTTGAAGGATGGTGAGAAGTGGATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCATGT
TATGGATACTCCTGGCCACACAAAAGGCCATATCAGTTTATACTTTCCAGGATCAAGAGC
TATCTTCTCTGGGGACACCTTGTTTAGCTTATCTTGTGGTAAACTCTTTGAAGGTACCCC
TAAGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGATCATTGCTTTACCAGACGACACAAGCATATA
CTGTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCCAAGTTTGCATTGTCTATAGGGCCAAACAA
CGAAGTACTTCAGTCTTATGCAGCTCATGTTGCAGAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTAC
GATTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGCTTGTAACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATAC
AGATATTCGTCGGGCTTTAGGTATTTCAGAGACTGCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTAT
TATCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGCTTAGGCTTTTTTCTTCTGAGGCAATTCTTT
GGTTTGCATCTGTTTCCTCCGAC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACCACCGTTTTTTTGAAGTCTTCGGACACAACAAAAAAACCAGTTCGATAGGCGTGACCA
ATATACTTTTTCGTACTTCAACACTTCAAACTCACTTTTTGTCTCTCCCCTTTGTAATAA
TAAACCCAAAATCACAGAGCAAGACAGCAAAAGTTACAAAAAAAATGGCAGAAGAATCTA
TCTCCACCACTCTCGCTATGCCTTCATCGGGACTCTCACCTCAACTCAAGAAGACTGAAA
CAACAGAGAAAGCTACTGAGACTATTCCACCGGAAACTGCAGTAACCGAGCACCATCCAC
CAAAAGTGACGGAAACAGAAACGGCGTCGTCGACGGATAAGAAAGAGCTAGGAGACGTAA
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GTACCTTTTGTTTTACACAGTGATTGGTCCGTTCATGACACCAAGATCAAAGAGCAAGTT
GGTGTTTGCTGGTCCGTCAAGATCAGCCGAAGCTCTTTTCAAATACATATCACCCGAACA
AGTCCCGGTACAGTACGGAGGATTGAGTGTAGATCCTTGTGACTTATCTTTGGAAGATCC
AGCCTCAGAGATCATTGTTAAGCCCGGAACAAAGCGAACTGTCGAGATCATAATCTATGA
GAAATGTGAGATTGTGTGGGAGATAAGGGTAATTGGATGGGAAGTGAGCTACAAGGCAGA
GTTTGTGCCTGAAGAGAAAGATGCTTATACGGTGGTTGTACAAAAACCAAGGAAGATGAA
ACCATCTGATGAACCGGTGCTAACCCAGAGCTTCAAAGTGAATGAGCTTGGCAAGGTTTT
ACTCACCGTAGACAACCCAACCTCTAAGAAGAAGAAGCTTGTTTACAGGTTCAATGTCAA
ACCTCTCTAAAGTGAGATGTCTTTTGTGTGTTTTGTATGTATATGTGAGTGTTTGGTTTA
CTTTTTTTTTAATCATATCATTTTGTATATGTGGTTTACACGATGGAGGTTCTGCATCTT
TTGCTCATGTAATCATTTGAGAATAATATATTTTACATGACCTTCTATGATAAAGATCTT
GAATAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D821TF U 1
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BS 725 742 RR4D821TF
BS 743 1147 RR4D821JQ

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QA 1 742 1 742
DS 

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GGGTAATTGGATGGGAAGTGAGCTACAAGGCAGAGTTTGTGCCTGAAGAGAAAGATGCTT
ATACGGTGGTTGTACAAAAACCAAGGAAGATGAAACCATCTGATGAACCGGTGCTAACCC
AGAGCTTCAAAGTGAATGAGCTTGGCAAGGTTTTACTCACCGTAGACAACCCAACCTCTA
AGAAGAAGAAGCTTGTTTACAGGTTCAATGTCAAACCTCTCTAAAGTGAGATGTCTTTTG
TGTGTTTTGTATGTATATGTGAGTGTTTGGTTTACTTTTTTTTTAATCATATCATTTTGT
ATATGTGGTTTACACGATGGAGGTTCTGCATCTTTTGCTCATGTAATCATTTGAGAATAA
TATATTTTACATGACCTTCTATGATAAAGATCTTGAATAGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6828Contig1 350 2 1 U
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GGAGCTGAGTGATGCGAGGATCTATTGGGCTATAGGGGAACCTCTTGGGGAAAGCACTCG
AGTATATAGCATGGAAGGAGAGCGTTGTGGTCATGGCATCTCATGAAGAGCTTATGAAGA
ACACAAGAAGCTTATAACGCCAAGCAAAAGCTCTCAAACTCAGGAAGATGATGACTGAAA
GGGACACTCAATTATCTTCTTCATCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGG


BQ
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AF RR4DV41JQ C 1
AF RR4DV41TF U 1
BS 1 350 RR4DV41TF

RD RR4DV41JQ 350 0 0
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AAGCTCGCAGATGTCTGTACTTTAAATGCCAATGAAGTAACAAAGCTGCTTAGAGTACTT
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QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4DV41TF 350 0 0
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AAGCTCGCAGATGTCTGTACTTTAAATGCCAATGAAGTAACAAAGCTGCTTAGAGTACTT
GGAGCTGAGTGATGCGAGGATCTATTGGGCTATAGGGGAACCTCTTGGGGAAAGCACTCG
AGTATATAGCATGGAAGGAGAGCGTTGTGGTCATGGCATCTCATGAAGAGCTTATGAAGA
ACACAAGAAGCTTATAACGCCAAGCAAAAGCTCTCAAACTCAGGAAGATGATGACTGAAA
GGGACACTCAATTATCTTCTTCATCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGG

QA 1 350 1 350
DS 



AS 1 2

CO CL6829Contig1 1112 2 2 U
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TCGAGGAACTTGCATCGGTATATCCACATTCTTACCCTTTTTTTTTTCTTAAATTATATC
TTCTCTTGATGTGTTTTTTTGCAAATGTGTGTTTGGTGACACAGGAACTTGGTCTTGGTC
CATCAGTCCCAGTTCATGTTGTTCTTCAGGATTGGATAAGACATTCTGATGGGAAGCTAA
GTTTCTTGGGTTTTGTCAGACTCTTACACGGTGTGTCCTCTCGGACATTGCAGAAAGCGT
AGAGAGAAGCTTCTTACCCTTAGCCTTGCCGCTAGGAAATGAACCTTACACCAAGTCTAG
ATATTATGACTGTAAAGGTAACTAGTGATCAGATCAACTGTTGCAGAGCTACCATATTTG
TCAGATGAAGTTGCAGCCTAGGGGATGTAGCTCTGGTTCGATATGTGTTCTTTTTGCTCT
TTTTTGGTTAAAGATAAAGAGTCTTTATGGTTTACGAATGATGTTAGTGATTTTAAAAGG
GGTTGTAAAGAAGACATATCTATTTCCCCTATTGAAGTTGTCTCTTTCTTCTTCTTTGTT
CCTTTGTAATAAGAACACACACCTCTGTTCTTACCTTAACAAAAGTATCAAACTTTTTAC
ATTGATGAACAAGTGATCTTGGTTTATAATCTGGACCGAGTTTACTGCCGATAACCGAAC
TTATGATCTGATCTGAATTAAAAAAAAAAGATTGCTTTATAGGACCTTTGTAATGGCTCA
ATCCAATACATAATAAAGAAATGTATACTTGATCGAGATGATAATAAAACTACAGAGGAA
GGGTGAGTTCTGTCACACTTGTTTGTCTTCTAGACTGATATGTCTTAACGTAAGGGTCAC
GTTTGGAGTTGCGCATGTTTTTATGGAGTTAGTCGCCAGAGAGTCTAACAGAGAGTCACT
ACTCAAAGGTATTGACCTTTAACCTAACCGCAAGTCCTCTTTCATGGTAATACACTTGCT
TTTATTCTCTTAGTCTCCTCTAAGCTACCTGTAGTCGTACCCTTTTAACTCCTTTGAGAT
TGTTGTGTAGGTTCGTTGAGTGCAAAGATAGA


BQ
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AF RR4B853TF U 1
AF RR4B853JQ C 727
BS 1 828 RR4B853TF
BS 829 1112 RR4B853JQ

RD RR4B853TF 834 0 0
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TTCTCTTGATGTGTTTTTTTGCAAATGTGTGTTTGGTGACACAGGAACTTGGTCTTGGTC
CATCAGTCCCAGTTCATGTTGTTCTTCAGGATTGGATAAGACATTCTGATGGGAAGCTAA
GTTTCTTGGGTTTTGTCAGACTCTTACACGGTGTGTCCTCTCGGACATTGCAGAAAGCGT
AGAGAGAAGCTTCTTACCCTTAGCCTTGCCGCTAGGAAATGAACCTTACACCAAGTCTAG
ATATTATGACTGTAAAGGTAACTAGTGATCAGATCAACTGTTGCAGAGCTACCATATTTG
TCAGATGAAGTTGCAGCCTAGGGGATGTAGCTCTGGTTCGATATGTGTTCTTTTTGCTCT
TTTTTGGTTAAAGATAAAGAGTCTTTATGGTTTACGAATGATGTTAGTGATTTTAAAAGG
GGTTGTAAAGAAGACATATCTATTTCCCCTATTGAAGTTGTCTCTTTCTTCTTCTTTGTT
CCTTTGTAATAAGAACACACACCTCTGTTCTTACCTTAACAAAAGTATCAAACTTTTTAC
ATTGATGAACAAGTGATCTTGGTTTATAATCTGGACCGAGTTTACTGCCGATAACCGAAC
TTATGATCTGATCTGAATTAAAAAAAAAAGATTGCTTTATAGGACCTTTGTAATGGCTCA
ATCCAATACATAATAAAGAAATGTATACTTGATCGAGATGATAATAAA
CTACAG

QA 1 828 1 828
DS 

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TACATAATAAAGAAATGTATACTTGATCGAGATGATAATAAAACTACAGAGGAAGGGTGA
GTTCTGTCACACTTGTTTGTCTTCTAGACTGATATGTCTTAACGTAAGGGTCACGTTTGG
AGTTGCGCATGTTTTTATGGAGTTAGTCGCCAGAGAGTCTAACAGAGAGTCACTACTCAA
AGGTATTGACCTTTAACCTAACCGCAAGTCCTCTTTCATGGTAATACACTTGCTTTTATT
CTCTTAGTCTCCTCTAAGCTACCTGTAGTCGTACCCTTTTAACTCCTTTGAGATTGTTGT
GTAGGTTCGTTGAGTGCAAAGATAGA

QA 1 386 1 386
DS 



AS 1 2

CO CL6830Contig1 756 2 2 U
TTTTTTGATGTAATGCACTAGAGTGTAAGTAAGCACATAACAAAGATTACAAAATGTTAC
AGTTTTGAACTCTCTGATCATCACTGACCAATACTGTATAATGTAATGGCCACCCCCATT
ATTCTCTTTTTTTATTTTATTTTAAGGAAACCAAAAAAAAAGCAAGTTCAATAACTCGCT
TAGGTCTTGAACCTCTGAGTGATCTTCCCAACGCCATCTCTACACTCCTCAGCCATTCTC
TTCACCTTGTCGCCTACCTGAACCGTCCCTTTCTCAACCTCCTTTGCTGCTCCTTTCGCA
CTAACAATGGCTGCCTCTCTCATTTCACCCGCTCGCTTCCCCAAGTTCTCTGCGTATTCC
TTCAAGACCACAATCCATAAACGTATCTTCTCCATCACCATGGAGATCACTTACCGGGAT
TTTCCAACCACTGATTCCGCCATCTCCTTCAGCTTATCCATAAGGGTTTGGGCTCTCTCC
TCGGTTCCTTCAATGGAAGATTGCTCTACGGTGTTTAGCAATACGCTTTGTTCTGCCTCT
ACATTCTCTTGAAGGTCTTTGTCAACAATAACTCTTAGTCCGTTTGTTTCCCATCGCTTT
CTAGCCTCTTCTAAGGCTCTAGCTTGCTCGCTAGCTCTCTTTCCTTCCTCCTCGGCCCAT
GATCTGGCCATGGAGAGAGCCTTACGCTCTACTTCCAATTCATATTGCAACTTCGAAATC
CGCTGGCTCTCTTCTTCAGCTTCTTTTCGAAGATTG


BQ
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AF RR4DM08TF C 1
AF RR4DM08JQ U 7
BS 1 6 RR4DM08TF
BS 7 756 RR4DM08JQ

RD RR4DM08TF 756 0 0
TTTTTTGATGTAATGCACTAGAGTGTAAGTAAGCACATAACAAAGAT*ACAAAATGTTAC
AGTTTTGAACTCTCTGATCATCACTGACCAATACTGTATAATGTAATGGCCACCCCCATT
AT*CTCTTTTTT*ATTTTATTTTAAGGAAACCAAAAAAAAAGCAAGTTCAATAACTCGCT
TAGGTCTTGAACCTCTGAGTGATCTTCCCAACGCCATCTCTACACTCCTCAGCCATTCTC
TTCACCTTGTCGCCTACCTGAACCGTCCCTTTCTCAACCTCCTTTGCTGCTCCTTTCGCA
CTAACAATGGCTGCCTCTCTCATTTCACCCGCTCGCTTCCCCAAGTTCTCTGCGTATTCC
TTCAAGACCACAATCCATAAACGTATCTTCTCCATCACCATGGAGATCACTTACCGGGAT
TTTCCAACCACTGATTCCGCCATCTCCTTCAGCTTATCCATAAGGGTTTGGGCTCTCTCC
TCGGTTCCTTCAATGGAAGATTGCTCTACGGTGTTTAGCAATACGCTTTGTTCTGCCTCT
ACATTCTCTTGAAGGTCTTTGTCAACAATAACTCTTAGTCCGTTTGTTTCCCATCGCTTT
CTAGCCTCTTCTAAGGCTCTAGCTTGCTCGCTAGCTCTCTTTCCTTCCTCCTCGGCCCAT
GATCTGGCCATGGAGAGAGCCTTACGCTCTACTTCCAATTCATATTGCAACTTCGAAATC
CGCTGGCTCTCTTCTTCAGCTTCTTTTCGAAGATTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4DM08JQ 750 0 0
GATGTAATGCACTAGAGTGTAAGTAAGCACATAACAAAGATTACAAAATGTTACAGTTTT
GAACTCTCTGATCATCACTGACCAATACTGTATAATGTAATGGCCACCCCCATTATTCTC
TTTTTTTATTTTATTTTAAGGAAACCAAAAAAAAAGCAAGTTCAATAACTCGCTTAGGTC
TTGAACCTCTGAGTGATCTTCCCAACGCCATCTCTACACTCCTCAGCCATTCTCTTCACC
TTGTCGCCTACCTGAACCGTCCCTTTCTCAACCTCCTTTGCTGCTCCTTTCGCACTAACA
ATGGCTGCCTCTCTCATTTCACCCGCTCGCTTCCCCAAGTTCTCTGCGTATTCCTTCAAG
ACCACAATCCATAAACGTATCTTCTCCATCACCATGGAGATCACTTACCGGGATTTTCCA
ACCACTGATTCCGCCATCTCCTTCAGCTTATCCATAAGGGTTTGGGCTCTCTCCTCGGTT
CCTTCAATGGAAGATTGCTCTACGGTGTTTAGCAATACGCTTTGTTCTGCCTCTACATTC
TCTTGAAGGTCTTTGTCAACAATAACTCTTAGTCCGTTTGTTTCCCATCGCTTTCTAGCC
TCTTCTAAGGCTCTAGCTTGCTCGCTAGCTCTCTTTCCTTCCTCCTCGGCCCATGATCTG
GCCATGGAGAGAGCCTTACGCTCTACTTCCAATTCATATTGCAACTTCGAAATCCGCTGG
CTCTCTTCTTCAGCTTCTTTTCGAAGATTG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL6831Contig1 1010 2 2 U
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GTGACCTCTAATCGATTACTAGAGGGTCCACAAAAAAAATTCACTTCTAATTAAGCATTA
GGTGAGATCTACCCAACAATATTAAATTGAGTAGCACAAATGATTCCTAAAGATGTATTT
AAATCTTTCCTCTTTGTTCTGATTAACATTTTAAATACGTTTCTCGAATCCTTTCCAAAA
CATGCTAATATAAAAGTAACTATATTATATAGCATTACTAGTTTTGGCTTCTGGTGTCAC
CTAATGGACACAGCACACAAGACACAACCAAGAGACAATCATGATGATGATGGTAAATGC
ACATAAAAGATGTTATAGTGTGTATTTACCTTGGCGTAATACCGACAACCCTTTTCACCG
AGAGTGACAAGCAAGAGCTTCAAGTTGGGATGCCACAAGGACATTGCGGTTTCATCGTCG
ATCTTGTTGCTTCCAGTGAGAAACTCGAGCTCAACGTCGCTTACCTTGATGATCTCAGCC
TTGTCTCAGATGCTCATGATCTGTGTCTTGGCTTCTTCCTTTGATGGCCACAGAGGCTCC
CTGAGGTTTGGGTCGTAGGAAAGAAGAGCTCCTGCTTCTTTGGCAACTTCCATGGCCTTT
AAGTGAGCTGACCTACATGGTTCCACTATTAAGCTAATTGATCCATAGTGAAACACTTTA
GCCTGCAAAAACACATCACATACGTATTTAAACCGGTGGACAAATTTCAAACTTAACATA
ATCAAGTAAAGGCCAGGTTGGTACACACCCAAACAAAAAACTCACAAAAGAGCACAGCTT
CGATCATAGGGAATAATTATTAAAGGGACCCATATTGATATTTTGATTCTTTGTGTTTTT
TTCATGTGAAACTACAATGGGGTCAATCATTATCAAACTGTTCAAGAAAAGCAAAAGGTT
CTCGCCATTGAGATTAGCTGTAAAGGTATGTCTTTTTACCAAAATTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GN64TF U 1
AF RR4GN64JQ C 262
BS 1 616 RR4GN64TF
BS 617 1010 RR4GN64JQ

RD RR4GN64TF 616 0 0
GACATGAAGCAAATTCGTCACGTTTGATAACACAAAGAACCTTAGAGATCACGACTTTTT
GTGACCTCTAATCGATTACTAGAGGGTCCACAAAAAAAATTCACTTCTAATTAAGCATTA
GGTGAGATCTACCCAACAATATTAAATTGAGTAGCACAAATGATTCCTAAAGATGTATTT
AAATCTTTCCTCTTTGTTCTGATTAACATTTTAAATACGTTTCTCGAATCCTTTCCAAAA
CATGCTAATATAAAAGTAACTATATTATATAGCATTACTAGTTTTGGCTTCTGGTGTCAC
CTAATGGACACAGCACACAAGACACAACCAAGAGACAATCATGATGATGATGGTAAATGC
ACATAAAAGATGTTATAGTGTGTATTTACCTTGGCGTAATACCGACAACCCTTTTCACCG
AGAGTGACAAGCAAGAGCTTCAAGTTGGGATGCCACAAGGACATTGCGGTTTCATCGTCG
ATCTTGTTGCTTCCAGTGAGAAACTCGAGCTCAACGTCGCTTACCTTGATGATCTCAGCC
TTGTCTCAGATGCTCATGATCTGTGTCTTGGCTTCTTCCTTTGATGGCCACAGAGGCTCC
CTGAGGTTTGGGTCGT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4GN64JQ 749 0 0
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ACACAACCAAGAGACAATCATGATGATGATGGTAAATGCACATAAAAGATGTTATAGTGT
GTATTTACCTTGGCGTAATACCGACAACCCTTTTCACCGAGAGTGACAAGCAAGAGCTTC
AAGTTGGGATGCCACAAGGACATTGCGGTTTCATCGTCGATCTTGTTGCTTCCAGTGAGA
AACTCGAGCTCAACGTCGCTTACCTTGATGATTTCAGCCTTGTCTCAGATGCTCATGATC
TGTGTCTTGGCTTCTTCCTTTGATGGCCACAGAGGCTCCCTGAGGTTTGGGTCGTAGGAA
AGAAGAGCTCCTGCTTCTTTGGCAACTTCCATGGCCTTTAAGTGAGCTGACCTACATGGT
TCCACTATTAAGCTAATTGATCCATAGTGAAACACTTTAGCCTGCAAAAACACATCACAT
ACGTATTTAAACCGGTGGACAAATTTCAAACTTAACATAATCAAGTAAAGGCCAGGTTGG
TACACACCCAAACAAAAAACTCACAAAAGAGCACAGCTTCGATCATAGGGAATAATTATT
AAAGGGACCCATATTGATATTTTGATTCTTTGTGTTTTTTTCATGTGAAACTACAATGGG
GTCAATCATTATCAAACTGTTCAAGAAAAGCAAAAGGTTCTCGCCATTGAGATTAGCTGT
AAAGGTATGTCTTTTTACCAAAATTACGC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6832Contig1 1009 2 10 U
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TCAGCGACAATTACTGCGAATTCCTCGTGTCTACCAAAAGCAGCTATGCCTAAAAGAGCA
GCAGAGTCGCCTCCTTCATCAGAAACCCAAGGAGTCAAACCTGCAGACTCTTTTGGTGAT
TACAGATCTCAAGTATCTCAACTCCCTGTCTCAAGAAAAAGAAGAAGATCTCGCTTCTTC
GCGATCAAGAAGAAGCCACTATGAGCCATTCCAGCACCGCGATAGGAGCTGGGATGTCAC
ATCTCAAGAAAGAGGATTTGAATGTCTTGTTAAGGCAGTGCGTGAGGGATCTAACTCCAG
AAGTTAATGAGATGCATATGCGTGTATGCAGCATGAAACTGTTTTCAGACAAGGCTACCA
AATGTAATAATGTTCCTGCAGAATCTAAAGAGGCAACTGTATCTGAAGATGATGTAGAAA
CTCTTCTGTGTAACCCTGATATTGTCAAGAAATTAACGTCCCAGTACTCAAATGTTCTTT
GTCATGAGCTGGAGGATATGCAGCAGCAACTCGAGAGCCTCCTTGATGATGTGGTAGCTA
CTTGCAGACCTATGAGTCGCGGTGAAAAGCGAGATCTTCAGAAAGCAATCGTGGAGTTAC
CTGGCGGAAACCGTGACCGTATCGCTGGGATAGTGGAAGAACATTGCAGAACATCTGGGA
AGGATTTCTCTGACGAGGTTATAGCCAACCTGGATCAGTCGGAGGACAACGTAATGCTAT
GGAGATTGCATTTCTATGTGGGAGCAGTCAAGAATGCTCAGAAGCTCGCTAGCTAAGCTT
AGACTGTGTATATGGATGATGGTTAGGGGATGTTGGAATGGTGTGAAGTGATGCTTTCAA
ACCGGTCTGGAATCCTCTATATACTGTTTTTTTTTTCTTCCTCATAAACGTGTTTAAACT
GGTTTTGATTTTGCAACACGTTGATCAAAGATTGAAAATTGGCTGGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX15TF U 1
AF RR4AX15JQ C 114
BS 1 205 RR4AX15TF
BS 206 206 RR4AX15JQ
BS 207 217 RR4AX15TF
BS 218 218 RR4AX15JQ
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BS 220 220 RR4AX15JQ
BS 221 810 RR4AX15TF
BS 811 811 RR4AX15JQ
BS 812 852 RR4AX15TF
BS 853 1009 RR4AX15JQ

RD RR4AX15TF 852 0 0
ATTTGTTCCTTCCACTCTCAATCTTTTCGGCTTCCCCGTCGATAACCATCTTCGCCTTTT
TCAGCGACAATTACTGCGAATTCCTCGTGTCTACCAAAAGCAGCTATGCCTAAAAGAGCA
GCAGAGTCGCCTCCTTCATCAGAAACCCAAGGAGTCAAACCTGCAGACTCTTTTGGTGAT
TACAGATCTCAAGTATCTCAACTCC*TGTCTCAAGAAGA*GAAGAAGATCTCGCTTCTTC
GCGATCAAGAAGAAGCCACTATGAGCCATTCCAGCACCGCGATAGGAGCTGGGATGTCAC
ATCTCAAGAAAGAGGATTTGAATGTCTTGTTAAGGCAGTGCGTGAGGGATCTAACTCCAG
AAGTTAATGAGATGCATATGCGTGTATGCAGCATGAAACTGTTTTCAGACAAGGCTACCA
AATGTAATAATGTTCCTGCAGAATCTAAAGAGGCAACTGTATCTGAAGATGATGTAGAAA
CTCTTCTGTGTAACCCTGATATTGTCAAGAAATTAACGTCCCAGTACTCAAATGTTCTTT
GTCATGAGCTGGAGGATATGCAGCAGCAACTCGAGAGCCTCCTTGATGATGTGGTAGCTA
CTTGCAGACCTATGAGTCGCGGTGAAAAGCGAGATCTTCAGAAAGCAATCGTGGAGTTAC
CTGGCGGAAACCGTGACCGTATCGCTGGGATAGTGGAAGAACATTGCAGAACATCTGGGA
AGGATTTCTCTGACGAGGTTATAGCCAACCTGGATCAGTCGGAGGACAACGTAATGCTAT
GGAGATTGCATTTCTATGTGGGAGCAGTCA*GAATGCTCAGAAGCTCGCTAGCTAAGCTT
AGACTGTGTATA

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR4AX15JQ 896 0 0
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TGGTGATTACAGATCTCAAGTATCTCAACTCCCTGTCTCAAGAAAAAGAAGAAGATCTCG
CTTCTTCGCGATCAAGAAGAAGCCACTATGAGCCATTCCAGCACCGCGATAGGAGCTGGG
ATGTCACATCTCAAGAAAGAGGATTTGAATGTCTTGTTAAGGCAGTGCGTGAGGGATCTA
ACTCCAGAAGTTAATGAGATGCATATGCGTGTATGCAGCATGAAACTGTTTTCAGACAAG
GCTACCAAATGTAATAATGTTCCTGCAGAATCTAAAGAGGCAACTGTATCTGAAGATGAT
GTAGAAACTCTTCTGTGTAACCCTGATATTGTCAAGAAATTAACGTCCCAGTACTCAAAT
GTTCTTTGTCATGAGCTGGAGGATATGCAGCAGCAACTCGAGAGCCTCCTTGATGATGTG
GTAGCTACTTGCAGACCTATGAGTCGCGGTGAAAAGCGAGATCTTCAGAAAGCAATCGTG
GAGTTACCTGGCGGAAACCGTGACCGTATCGCTGGGATAGTGGAAGAACATTGCAGAACA
TCTGGGAAGGATTTCTCTGACGAGGTTATAGCCAACCTGGATCAGTCGGAGGACAACGTA
ATGCTATGGAGATTGCATTTCTATGTGGGAGCAGTCAAGAATGCTCAGAAGCTCGCTAGC
TAAGCTTAGACTGTGTATATGGATGATGGTTAGGGGATGTTGGAATGGTGTGAAGTGATG
CTTTCAAACCGGTCTGGAATCCTCTATATACTGTTTTTTTTTTCTTCCTCATAAACGTGT
TTAAACTGGTTTTGATTTTGCAACACGTTGATCAAAGATTGAAAATTGGCTGGTCT

QA 1 896 1 896
DS 



AS 1 2

CO CL6833Contig1 832 2 9 U
GGATACACAGCCACATTTCCTGTTTCGCCATCCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCG
CACCCTCCTCTCTCATCAGCCTCCCCAGGCACAAATTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGC
TTCTCATTCAGTCCCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGATGAAGACGGCATCAC
GTGGAAGCGTAGCTGTGACTGCTGCTGCTACCTCCTCCGTCGAGGCGCTGCGAGAAGGAA
TAGCAGAATTCTACAACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGAGATTTGGGGAGATCATATGC
ATCACGGCTTCTACGATCCTGATTCCTCTGTGCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAG
CTCAGATCCGGATGATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCAGCGTTACAGAAGAGGAGAAAA
AGATAAAGAGAGTAGTGGATGTTGGTTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCT
CTAAATTTGGTGCCGAATGCGTTGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCA
ATGATCTCGCCGCCGCTCAATCACTCTCTCAGAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCAC
TGGAGCAACCATTTGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCATGGAAAGCGGTGAGCA
TATGCCTGACAAGCCAAGTTCGTGAAGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGAT
ATAATAGTGACATGGTGCCACAGAAATCTATCCCCAGGGGAGAGCTTTGCAGCCATGGGA
CAGACCTCTTGGAAGATCTGCAAACATTTATCTCCGGCTGTGCTCCCCTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FP50TF U 73
AF RR4BU13TF U 1
BS 1 238 RR4BU13TF
BS 239 239 RR4FP50TF
BS 240 244 RR4BU13TF
BS 245 245 RR4FP50TF
BS 246 397 RR4BU13TF
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BS 400 406 RR4BU13TF
BS 407 407 RR4FP50TF
BS 408 832 RR4BU13TF

RD RR4FP50TF 381 0 0
GG
ATCAGCCTCCCCAGGCACAAATTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTCC
CAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGATGAAGACGGCATCACGTGGAAGCGTAGCT
GTGACTGCTGCTGCTACCTCCTCCGTCGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCAGAATTCTAC
AACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGAGATTTGGGGAGATCATATGCATCACGGCTTCTAT
GATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGATG
ATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCAGCGTTACAGAAGAGGAGAAAAAGATAAAGAGAGTA
GTGGATGTTGGTTGTGGGA

QA 3 381 3 381
DS 

RD RR4BU13TF 832 0 0
GGATACACAGCCACATTTCCTGTTTCGCCATCCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCG
CACCCTCCTCTCTCATCAGCCTCCCCAGGCACAAATTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGC
TTCTCATTCAGTCCCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGATGAAGACGGCATCAC
GTGGAAGCGTAGCTGTGACTGCTGCTGCTACCTCCTCCGTCGAGGCGCTGCGAGAAGGGA
TAGCTGAATTCTACAACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGAGATTTGGGGAGATCATATGC
ATCACGGCTTCTACGATCCTGATTCCTCTGTGCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAG
CTCAGATCCGGATGATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCTGGCGTTACTGAAGAGGAGAAAA
AGATAAAGAGAGTAGTGGATGTTGGTTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCT
CTAAATTTGGTGCCGAATGCGTTGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCA
ATGATCTCGCCGCCGCTCAATCACTCTCTCAGAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCAC
TGGAGCAACCATTTGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCATGGAAAGCGGTGAGCA
TATGCCTGACAAGCCAAGTTCGTGAAGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGAT
ATAATAGTGACATGGTGCCACAGAAATCTATCCCCAGGGGAGAGCTTTGCAGCCATGGGA
CAGACCTCTTGGAAGATCTGCAAACATTTATCTCCGGCTGTGCTCCCCTCTG

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL6834Contig1 775 2 6 U
TTTTTGTCTTTAATCTGTGAAGATGGGTTCTGCGGCTCATTTTAGCAAGGAGAGGGTGTT
CAGAGGGTTTCTTGTTTGGTTCTGCTCTTGGGGATTGCTCTCTCTAACATGCGTAACAGG
GAGGCTCGGTGTCTCAAGTCAGAACTTGGAAGTGCACAAACACTTGAAACGATTGAACAA
ACCAGCCGTTAAGAGCATTCAGAGTCCAGATGGAGACATAATAGACTGTGTTCATATCTC
CAAGCAACCAGCTTTTGACCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAATCCTAG
TACAATCCCTAACCTGCTGTTCGGTGAGAACAAAGTGACTGAGAAACCAAAAGAGAGAAT
CAATCCAGTCACTCAGTTATGGCACCAGAGCGGATTGTGTTCCGAAGGGACAATACCAGT
GAGGAGGACAAAGAAAGAGGATGTTCTGAGAGCAAGTTCCGTTAAACGCTACGGTAAGAA
GAAGCACCGTACTGTTCCCCTGCCTCGTTCTGCTGATCCTGACCTCGCCAACCAAAGTGG
TCATCAGCACGCTATAGCTTATGTGGAAGGAGGCAAGTTTTACGGAGCCAAGGCGACGAT
AAATGTTTGGGAACCCAAAGTACAGAGCCCAAATGAGTTCAGCTTGTCTCAGCTGTGGAT
TCTTGGTGGTGCCTTTGGTCAAGATCTCAACAGCATTGAAGCTGGTTGGCAGGTTAGTCC
GGATCTATATGGTGATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAAGATTAAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C393TF U 1
AF RR4C393JQ C 9
BS 1 592 RR4C393TF
BS 593 593 RR4C393JQ
BS 594 632 RR4C393TF
BS 633 633 RR4C393JQ
BS 634 681 RR4C393TF
BS 682 775 RR4C393JQ

RD RR4C393TF 691 0 0
TTTTTGTCTTTAATCTGTGAAGATGGGTTCTGCGGCTCATTTTAGCAAGGAGAGGGTGTT
CAGAGGGTTTCTTGTTTGGTTCTGCTCTTGGGGATTGCTCTCTCTAACATGCGTAACAGG
GAGGCTCGGTGTCTCAAGTCAGAACTTGGAAGTGCACAAACACTTGAAACGATTGAACAA
ACCAGCCGTTAAGAGCATTCAGAGTCCAGATGGAGACATAATAGACTGTGTTCATATCTC
CAAGCAACCAGCTTTTGACCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAATCCTAG
TACAATCCCTAACCTGCTGTTCGGTGAGAACAAAGTGACTGAGAAACCAAAAGAGAGAAT
CAATCCAGTCACTCAGTTATGGCACCAGAGCGGATTGTGTTCCGAAGGGACAATACCAGT
GAGGAGGACAAAGAAAGAGGATGTTCTGAGAGCAAGTTCCGTTAAACGCTACGGTAAGAA
GAAGCACCGTACTGTTCCCCTGCCTCGTTCTGCTGATCCTGACCTCGCCAACCAAAGTGG
TCATCAGCACGCTATAGCTTATGTGGAAGGAGGCAAGTTTTACGGAGCCAAG*CGACGAT
AAATGTTTGGGAACCCAAAGTACAGAGCCCAA*TGAGTTCAGCTTGTCTCAGCTGTGGAT
TCTTGGTGGTGCCTTTGGTCA
GATCTCACAG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4C393JQ 767 0 0
TTTAATCTGTGAAGATGGGTTCTGCGGCTCATTTTAGCAAGGAGAGGGTGTTCAGAGGGT
TTCTTGTTTGGTTCTGCTCTTGGGGATTGCTCTCTCTAACATGCGTAACAGGGAGGCTCG
GTGTCTCAAGTCAGAACTTGGAAGTGCACAAACACTTGAAACGATTGAACAAACCAGCCG
TTAAGAGCATTCAGAGTCCAGATGGAGACATAATAGACTGTGTTCATATCTCCAAGCAAC
CAGCTTTTGACCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAATCCTAGTACAATCC
CTAACCTGCTGTTCGGTGAGAACAAAGTGACTGAGAAACCAAAAGAGAGAATCAATCCAG
TCACTCAGTTATGGCACCAGAGCGGATTGTGTTCCGAAGGGACAATACCAGTGAGGAGGA
CAAAGAAAGAGGATGTTCTGAGAGCAAGTTCCGTTAAACGCTACGGTAAGAAGAAGCACC
GTACTGTTCCCCTGCCTCGTTCTGCTGATCCTGACCTCGCCAACCAAAGTGGTCATCAGC
ACGCTATAGCTTATGTGGAAGGAGGCAAGTTTTACGGAGCCAAGGCGACGATAAATGTTT
GGGAACCCAAAGTACAGAGCCCAAATGAGTTCAGCTTGTCTCAGCTGTGGATTCTTGGTG
GTGCCTTTGGTCAAGATCTCAACAGCATTGAAGCTGGTTGGCAGGTTAGTCCGGATCTAT
ATGGTGATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAAGATTAAGTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL6835Contig1 790 2 2 U
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TCAGGCGGAGAACGCGACTAACATCAAGTTCAAGAACCCCAAGTATCTCTCCATGCTGAA
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CGACGATGTTGTAGTGCAGAAAGACGTGACTGGTTTATGGAAGATTAACTTGGATGGAAA
GGTGAATGGAGCTGTTGAGACGTGCTTTGGCTCTTTTCATCGGTATGGTCAGTACCTGAA
TTTCACTCATCCTCTGATCAAAGAAAGGTTTAACCCCAATGCTTGTGCTTGGGCCTTTGG
GATGAATATATTTGATCTCAACGCTTGGAGACGCGAGAAATGCACCGATCAATACCATTA
CTGGCAGAACTTGAATGAAGACAGAAGTCTCTGGGAATTGGGCACTCTGCCTCCGGGACT
GATGACATTCTATTCAAAGACGAAATCACTGGACAAGTCCTGGCATGTGCTTGGGTTACG
CTACAACCCGGGAGTGAGCATGGGATGAGATCAAGAACGCAGCAGTGATACATTACAATG
GAAACATGAAACCATGGCTAGACATTGCTATGAGCCAATACAAGTCTCTCTGGACTAAAT
ACGTGGATAACGAAATGGAGTTTGTGCAGATGTGCAATTTTGGTCTCTAGAGAGAGACAC
AGAGATGGAC


BQ
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AF RR4A975JQ C 1
AF RR4A975TF U 61
BS 1 60 RR4A975JQ
BS 61 790 RR4A975TF

RD RR4A975JQ 790 0 0
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TTATGCGCCGGTCATGAAGCAGCTGGAGTCTGCCAAGTTGCACAAGTTCTACTTTGAGAA
TCAGGCGGAGAACGCGACTAACATCAAGTTCAAGAACCCCAAGTATCTCTCCATGCTGAA
CCATCTCAGGTTTTACTTGCCTGAGATGTACCCGAAGCTGAACAAGATCTTGTTCTTGGA
CGACGATGTTGTAGTGCAGAAAGACGTGACTGGTTTATGGAAGATTAACTTGGATGGAAA
GGTGAATGGAGCTGTTGAGACGTGCTTTGGCTCTTTTCATCGGTATGGTCAGTACCTGAA
TTTCACTCATCCTCTGATCAAAGAAAGGTTTAACCCCAATGCTTGTGCTTGGGCCTTTGG
GATGAATATATTTGATCTCAACGCTTGGAGACGCGAGAAATGCACCGATCAATACCATTA
CTGGCAGAACTTGAATGAAGACAGAAGTCTCTGGGAATTGGGCACTCTGCCTCCGGGACT
GATGACATTCTATTCAAAGACGAAATCACTGGACAAGTCCTGGCATGTGCTTGGGTTAGG
CTACAACCCGGGAGTGAGCATGG*ATGAGATCAAGAAGGCAGCAGTGATACATTACAATG
GAAACATGAAACCATGGCTAGACATTGCTATGAGCCAATACAAGTCTCTCTGGACTAAAT
ACGTGGATAACGAAATGGAGTTTGTGCAGATGTGCAATTTTGGTCTCTAGAGAGAGACAC
AGAGATGGAC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4A975TF 730 0 0
TTATGCGCCGGTCATGAAGCAGCTGGAGTCTGCCAAGTTGCACAAGTTCTACTTTGAGAA
TCAGGCGGAGAACGCGACTAACATCAAGTTCAAGAACCCCAAGTATCTCTCCATGCTGAA
CCATCTCAGGTTTTACTTGCCTGAGATGTACCCGAAGCTGAACAAGATCTTGTTCTTGGA
CGACGATGTTGTAGTGCAGAAAGACGTGACTGGTTTATGGAAGATTAACTTGGATGGAAA
GGTGAATGGAGCTGTTGAGACGTGCTTTGGCTCTTTTCATCGGTATGGTCAGTACCTGAA
TTTCACTCATCCTCTGATCAAAGAAAGGTTTAACCCCAATGCTTGTGCTTGGGCCTTTGG
GATGAATATATTTGATCTCAACGCTTGGAGACGCGAGAAATGCACCGATCAATACCATTA
CTGGCAGAACTTGAATGAAGACAGAAGTCTCTGGGAATTGGGCACTCTGCCTCCGGGACT
GATGACATTCTATTCAAAGACGAAATCACTGGACAAGTCCTGGCATGTGCTTGGGTTACG
CTACAACCCGGGAGTGAGCATGGGATGAGATCAAGAACGCAGCAGTGATACATTACAATG
GAAACATGAAACCATGGCTAGACATTGCTATGAGCCAATACAAGTCTCTCTGGACTAAAT
ACGTGGATAACGAAATGGAGTTTGTGCAGATGTGCAATTTTGGTCTCTAGAGAGAGACAC
AGAGATGGAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6836Contig1 1473 2 8 U
GAGATTCGTCTTGAGCTGGAGGAGATTGTTAAGTTCTTCACTCATGGAGAGATGTACAGG
AGGAGAGGTGTCAAGATTCCAGGTGGCATTCTGTTGTGTGGGCCACCTGGCGTGGGGAAG
ACGTTACTGTCGAAAGCTGTGGCTGGTGAAGCGGGAGTGAACTTCTTCTCTATCTCTGCT
TCTCAGTTTGTTGAGATTTATGTTGGTGTTGGTGCATCTCGTGTCCGAGCACTGTACCAG
GAAGCTAGAGACAATGCGCCATCTGTGGCTTTCATTGATGAATTGGATGCTGTGGGAAGG
GAGCGTGGGTTGATAAAGGGCTCTGGAGGACAAGAAAGGGATGCCACTCTTAATCAGCTT
CTTGTTTCTTTAGATGGTTTTGAAGGAAGAGGAGAGGTGATTACCATCGCTTCCACAAAT
AGACCTGACATTCTAGATCCTGCGCTTGTGAGGCCTGGAAGGTTCGACCGCAAGATCTTC
ATTCCAAAGCCTGGTCTGATAGGACGGATGGAAATTCTGCAGGTTCATGCTCGTAAGAAG
CCGATGGCTGAAGATTTGGACTATATGGCAGTTGCTAGCATGACAGATGGCATGGTTGGA
GCAGAGCTTGCTAATATCTTTGAGATAGCGGCTATCAATATGATGCGTGATGGCAGAACT
GAGTTAACAACCGATGATCTGCTTCAAGCTGCACAAATAGAAGAAAGAGGAATGTTAGAT
AGGAAAGATAGGAGCTCTGAGACGTGGAGACAAGTTGCTATAAACGAAGCTGCTATGGCT
GTTGTGGCTGTCAACTTTCCTGATCTCAAGAATATTGAATTTCTGACAATCAATCCTAGA
GCTGGTAGAGAATTGGGTTATGTCCGTGTGAAGATGGATCACATCAAATTCAATGAAGGC
ATGCTTAGCCGACAATCCCTCTTGGATCACATAACTGTTCAACTAGCACCTCGTGCTGCA
GATGAACTATGGTACGGTGAGGATCAGTTAAGTACCATATGGGCTGAAACATCGGATAAT
GCAAGGTCAGCTGCTAGATCACTGGTTCTTGGTGGTCTCTCTGAGAAACATCATGGCTTG
AATAACTTCTGGATGACTGATCGAATCAACGATATTGATGTGGAGGCATTGCGGATACTG
AACATGTGTTACGACCGTGCCAAAGAGATTCTCCAAAAGAACCGGACGCTCATGGACGAG
GTGGTAGAGAAACTGGTTCAGAAGAAAAGTCTTTCGAAACAAGAGTTCTTCACTCTTGTT
GAGATATATGGCTCCATTGAACCTATGCCACCAAGCATTCTTGAACTCAGGAAAATCAAA
CGGCTCCAGCTCCAAGAGGCTGTGATGAAACAGGACATGACTACTGCAAGAAACAGTTCA
TAAGATGTTTGTGGCATACCTAGACAATGTTGTAATCTTAGACACGTGTGAAAATTCTTT
GAGCTTCAATAAAAAAAGTTATCAGTTTTGAAG


BQ
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CA

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CGAAGCTGCTATGGCTGTTGTGGCTGTCAACTTTCCTGATCTCAAGAATATTGAATTTCT
GACAATCAATCCTAGAGCTGGTAGAGAATTGGGTTATGTCCGTGTGAAGATGGATCACAT
CAAATTCAATGAAGGCATGCTTAGCCGACAATCCCTCTTGGATCACATAACTGTTCAACT
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CGTGTGAAAATTCTTTGAGCTTCAATAAAAAAAGTTATCAGTTTTGAAG

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DS 



AS 1 2

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ACCAAATCAAAACCTCTGGCCATGCTCAGATCCGGCCTCGCTTCGTTAATCGTCGATGTC
AATTTACGGCGCACGTTACTTCCCCTCTCATCCTTCTCTCCCCTTGCTCATCTTAGCCGT
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CTTACATTACCCACCGTTTTAACCATCGCTCGTGTGGCTGCCGTGCCACTTCTCGTCGCA
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GCCGTTACAGACTGGCTTGACGGCTATCTTGCACGAAAGATGAAGTTAGGTTCTGCGTTT
GGTGCCTTTCTGGATCCAGTTGCTGATAAGCTTATGGTTGCAGCTACTCTGATCTTACTC
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TCTATTGCAATCATTGGTCGGGAGATTACAATGTCTGCAGTAAGAGAATGGGCTGCATCT
CAAAATGGAAAGCTTTTAGAGGCCGTTGCTGTAAATAACTTGGGGAAGTGGAAAACCGCT
ACGCAGATGACAGCACTAACCATACTTCTCGCAGGCCGTGATAGCACTGTTGGATGGCTT
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BQ
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AF RR4GN62TF U 1
AF RR4GN62JQ C 508
BS 1 668 RR4GN62TF
BS 669 669 RR4GN62JQ
BS 670 691 RR4GN62TF
BS 692 692 RR4GN62JQ
BS 693 714 RR4GN62TF
BS 715 715 RR4GN62JQ
BS 716 746 RR4GN62TF
BS 747 747 RR4GN62JQ
BS 748 762 RR4GN62TF
BS 763 763 RR4GN62JQ
BS 764 767 RR4GN62TF
BS 768 768 RR4GN62JQ
BS 769 784 RR4GN62TF
BS 785 1305 RR4GN62JQ

RD RR4GN62TF 791 0 0
GGATCTTCTCCGATTTAACCTTTTACAGGTTTCTTCCGACAATTCCTCAAACAGACAGGA
ACCAAATCAAAACCTCTGGCCATGCTCAGATCCGGCCTCGCTTCGTTAATCGTCGATGTC
AATTTACGGCGCACGTTACTTCCCCTCTCATCCTTCTCTCCCCTTGCTCATCTTAGCCGT
TCCTCACGCTGCGTTCCTCCTTCCCACAGACCTCTAAGGTTTCGAATCCAGACATGTAAC
CACCTCCGTGTATCCTCGTATTCGTCTTCTTCGGAGAAACACGGACCATCTTCGTCCACC
CAACGATCAAGCCTCGCGGGTCAAGAAGACGCAGTCACGGCGGCTCAGAACAGCTTCAAC
GGTCATAGCCACCTTGATGGAGACGACAACTCTTCACCGCAGCAACCCTCTTCCAAAGTT
CTTACATTACCCACCGTTTTAACCATCGCTCGTGTGGCTGCCGTGCCACTTCTCGTCGCA
ACCTTCTACGCTGATAGTTCCTGGGGAACGACTGCGACTACAAGCATCTTCATTGCAGCC
GCCGTTACAGACTGGCTTGACGGCTATCTTGCACGAAAGATGAAGTTAGGTTCTGCGTTT
GGTGCCTTTCTGGATCCAGTTGCTGATAAGCTTATGGTTGCAGCTACTCTGATCTTACTC
TGTACAAA*CCTATAGAAGTTGCTGTATTAG*ATCAGTTCCATGGTTATTGACG*TTCCT
TCTATTGCAATCATTGGTCGGGAGAT*ACAATGTCTGCAGTA*GAGA*TGGGCTGCATCT
CAAA
TGGAAAG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4GN62JQ 798 0 0
ACGACTGCGACTACAAGCATCTTCATTGCAGCCGCCGTTACAGACTGGCTTGACGGCTAT
CTTGCACGAAAGATGAAGTTAGGTTCTGCGTTTGGTGCCTTTCTGGATCCAGTTGCTGAT
AAGCTTATGGTTGCAGCTACTCTGATCTTACTCTGTACAAAACCTATAGAAGTTGCTGTA
TTAGGATCAGTTCCATGGTTATTGACGGTTCCTTCTATTGCAATCATTGGTCGGGAGATT
ACAATGTCTGCAGTAAGAGAATGGGCTGCATCTCAAAATGGAAAGCTTTTAGAGGCCGTT
GCTGTAAATAACTTGGGGAAGTGGAAAACCGCTACGCAGATGACAGCACTAACCATACTT
CTCGCAGGCCGTGATAGCACTGTTGGATGGCTTGTAGCTTGTGGTGCTGGCTTGCTCTAT
GTATCAGCAGGGCTATCGGTTTGGTCTTTAGTGGTTTATATGAGGAAGATATGGAAAGTA
CTACTCAAGTAATCATATACCTATTGGTTTTTTTTTTTTTTGCTTTAACCTGCATTTGGA
TATAGAGAGGGTCTCAGTCACCACCTGCACAAAACTTGAATGATGCAGCACTTGGCTATA
ACCTCAGGGGAAATGCTTAAACCGCAAGCAGAGGAAAGTGTTGGTTGTCTGAGAATACCT
AGACGGTTCTGCTTTTCCCAACATAATATAAAGTATGGTAGTCTTGGTTCACAATCCTAA
TCATGGTGTATTGTAGATTGGTTTTGTACTGGTTCCAGTAAAACTTTCAGATTAATGCAT
CTATGTTCATTTTTACAG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL6838Contig1 842 2 2 U
TCTTGGCTCTCATCGGTCTCGTCAATGCCTTGAGGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCA
TTTCTCCACATTTCCAACATGATTCTCGCTATCGGCAGCATGCTCTACCATGCCCACTTT
TGCAGCACGTGCAACAGCAGAGCGATGAGACGCCCGATGGTGTGGGAGATACTTCTCTAC
ATGTACATCCTTTTACTCGCCGGACTGGCATTACAGAAGCACCATGCCCACTTTTCTCTT
CCTCTACGGTGCTGCTTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCCTCAGGTTTGGGGATCGGTTTCA
AGGTCCACTACGTGGTCCTCTGTCTTCTCTGCATCCCTCGGATGTACAAGTACTACATTC
ACACGGAGGACACCGCGGCTAAAAGGATTGCCAAGTGGTATGTCGCCACGATTCTTGTGG
GGAGTGTTTGCTGGTTCTGCGACCGTGTTTTCTGCGAGAGGATATCTCAGTGGCCTGTGA
ACCCTCAGGGGCATGCTCTGTGGCATGTGTTCATGAGTTTCAACTCCTACTGTGCAAACA
CGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAGCGTGGATGGAATCCGAAGGTTAAATACTTTC
TGGGAGTTCTTCCTTACGTCAAGATCGAGAAGCCAAAAGCAGAATGAGAAGCAGAATAGG
GGAGAAAAAGAGCCCAGAAGATCATAAATATAGTTTTTTGTTCATCGTTTTGTCAGAAAT
TTCAATGTTGGTTTTCTTTTTTTGGAAGTGAAAGTACTCTCTAGATACAGAGTCTAGAAT
TTTTTTGTTCTTGTATTAGTTTTCTTGGGGATGATGATCTTATGAAGAATTGATTTTTAA
CC


BQ
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10 10 

AF RR4BE20TF U 1
AF RR4BE20JQ C 4
BS 1 299 RR4BE20TF
BS 300 842 RR4BE20JQ

RD RR4BE20TF 299 0 0
TCTTGGCTCTCATCGGTCTCGTCAATGCCTTGAGGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCA
TTTCTCCACATTTCCAACATGATTCTCGCTATCGGCAGCATGCTCTACCATGCCCACTTT
TGCAGCACGTGCAACAGCAGAGCGATGAGACGCCCGATGGTGTGGGAGATACTTCTCTAC
ATGTACATCCTTTTACTCGCCGGACTGGCATTACAGAAGCACCATGCCCACTTTTCTCTT
CCTCTACGGTGCTGCTTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCCTCAGGTTTGGGGATCGGTTTC

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4BE20JQ 839 0 0
TGGCTCTCATCGGTCTCGTCAATGCCTTGAGGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCATT*
CTCCACATTTCCAACATGATTCTCGCTATCGGCAGCATGCTCTACCATGCC*ACTTT*GC
AGCACGTGCAACAGCAGAGCGATGAGACGCC*GATGGTGTGGGAGATACTTCTCTACATG
TACATCCTTT*ACTCGCCGGACTGGCATTACAGAAGCACCATGCCCACTTTTCTCTTCCT
CTACGGTGCTGCTTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCCTCAGGTTTGGG*ATCGGTTTCAAGG
TCCACTACGTGGTCCTCTGTCTTCTCTGCATCCCTCGGATGTACAAGTACTACATTCACA
CGGAGGACACCGCGGCTAAAAGGATTGCCAAGTGGTATGTCGCCACGATTCTTGTGGGGA
GTGTTTGCTGGTTCTGCGACCGTGTTTTCTGCGAGAGGATATCTCAGTGGCCTGTGAACC
CTCAGGGGCATGCTCTGTGGCATGTGTTCATGAGTTTCAACTCCTACTGTGCAAACACGT
TCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAGCGTGGATGGAATCCGAAGGTTAAATACTTTCTGG
GAGTTCTTCCTTACGTCAAGATCGAGAAGCCAAAAGCAGAATGAGAAGCAGAATAGGGGA
GAAAAAGAGCCCAGAAGATCATAAATATAGTTTTTTGTTCATCGTTTTGTCAGAAATTTC
AATGTTGGTTTTCTTTTTTTGGAAGTGAAAGTACTCTCTAGATACAGAGTCTAGAATTTT
TTTGTTCTTGTATTAGTTTTCTTGGGGATGATGATCTTATGAAGAATTGATTTTTAACC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL6839Contig1 957 2 2 U
GCAACGGGTGAGGAGATCAGTAACAGGAAGCAGCTGGATCAGTATCTCAAATCTCACCCT
GGAAACCCATCCGTCACTGAGTTTGATTGGACCACTAGTGGGACGCCTAGGAGATCTGCA
AGGATCAGTGATAAGAAGACTAAGTCGACTCCTTCACCAGACAAAGAGCCACCCAAGAAG
CGAGGTCGGACTAAATCTTCAGGTTCAAAGAAAGATGGAGAAGAAGGTGAGAAACCAGAG
GGAGGAGGAGTGGAGAACTCTCATGTCCAAGAAGAAGATACTGAGATGTCTGCTCTCAAG
GGAACGAAAGAGAACGAGAATGTAACTGTTAAGGATGGCTCTGGTGAAACAAAAGACGAC
GTGGTTGCAGAGGAGACTCCTGATCCTGCTCCGGTTCAAGAAGCTGGTGGTGAGTCTATC
GAGGAGCAAAAACATGATGTAGTTGGAGATATTAGTAAGGAGAGGGTGGAGTATAAGACT
GACAAAGAAGAGGAGACTGACTCGGTAGAAAAGAATGCAGAGATCAAGACTGCTGAAGCT
AACACCGAGCAGAAGAAGGAAGCTGCAGGCCAAGGCTCAGCTGAGGCTGAGTCTGAAGCT
AAGACCAGAAACCATGAGGGAAATGGTCTGACCTCAGAAGCTGAGGGGAAAGAGAAAGCA
GCTGAAGCGGAAGCAACTGAGTAACTCTGCCCTGTTCCCCTTTTGTTAGAGCATGAAATG
TAAGTCAGTTTGTTTATTTTCATGCTCTTTTTGTATCTAATTACATCGGTAAAAGATGAG
ATTATTAGGCTGAGCTGTGTACTATTTGAATGATTTCAGTATTATGACTATGCATGTTCT
CTTTGTAGAGTGTTTAACTCTTTCTACTGCTGCAGCTGCGGCCCTTTAGTTTCTTTTCTT
TTTTACATTTTTAAGATATAACCAAGCTATATAAATAACATATTAATATGATCAGCG


BQ
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AACACCGAGCAGAA

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DS 

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ACTGTTAAGGATGGCTCTGGTGAAACAAAAGACGACGTGGTTGCAGAGGAGACTCCTGAT
CCTGCTCCGGTTCAAGAAGCTGGTGGTGAGTCTATCGAGGAGCAAAAACATGATGTAGTT
GGAGATATTAGTAAGGAGAGGGTGGAGTATAAGACTGACAAAGAAGAGGAGACTGACTCG
GTAGAAAAGAATGCAGAGATCAAGACTGCTGAAGCTAACACCGAGCAGAAGAAGGAAGCT
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GGTCTGACCTCAGAAGCTGAGGGGAAAGAGAAAGCAGCTGAAGCGGAAGCAACTGAGTAA
CTCTGCCCTGTTCCCCTTTTGTTAGAGCATGAAATGTAAGTCAGTTTGTTTATTTTCATG
CTCTTTTTGTATCTAATTACATCGGTAAAAGATGAGATTATTAGGCTGAGCTGTGTACTA
TTTGAATGATTTCAGTATTATGACTATGCATGTTCTCTTTGTAGAGTGTTTAACTCTTTC
TACTGCTGCAGCTGCGGCCCTTTAGTTTCTTTTCTTTTTTACATTTTTAAGATATAACCA
AGCTATATAAATAACATATTAATATGATCAGCG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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TATAGGTGTTGCCACTAAAGGAGTGGTGAAGCTTTTTAATGCTGTGAACAAGGCTCAACA
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AAAAGAAGCATTCTTCTCTGAGTTGGGAAAAACATCGAAAACAGACTCCAAGACTCAAAA
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GTTAGCAAACCCAAAGCTTAAGGACTGGGACAAAAAACAGGAAACAAGTGAAGGAGATGA
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BQ
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AF RR4B845TF U 1
AF RR4B845JQ C 290
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TGCTCAGAAGGGTTTGAATGCTTTA

QA 1 745 1 745
DS 

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AAGACTCAAAAAGCTTCAAATTCCAATGAAGACGAAGCTCCTGCTTGGGCTCCTCTACGT
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GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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TCTCGGTATCAATATGTTCGGTCTTGGGTTTGTCACATCCACAACATTCATCTTTGTGGT
TGGTGTCTTCATGTCCTCGTGGCTAGGAGCTTCATTTCTCAGCATTGGAGAATGGTTTAT
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CTCCCCAGATCACAGCTCAGGTGCATTCAAGGAGGTAGCCATTATCAGGCATCCGCATAG
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AGAAGAGTTTTGCTGTGTCTATGTCCCCACCAATCATCTTTACCTTGGAGACATTTTCCT
CATTAGCTCAAAGGACCTCATAAGGCCTAATCTCTCAGTCCGTGAAGGCATAGAAATAGT
CATTTCTGGTGGCATGTCAATCCCAGAGGTACCAACAACGCTGGACGCAGAGACTATTCA
CAGGACAGTAGCAGGAAGCTTTGCTATTCCACCAGTGTAAAGAATGAATCATAGTTTCTT
TTTTTTTCTTTTTTAATCCGAAGGTTAACTAAGTCTCCAGTGGAGCCTCTGATTTTAGGT
GATTTTCAACGTTTGTTAATCCAAGAATATTGGAAAAGTTTTGAACTCGTTATGATATAT
ATATGAGTGTTTAAGCCC


BQ
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AF RR4F941TF U 1
AF RR4F941JQ C 426
BS 1 639 RR4F941TF
BS 640 1038 RR4F941JQ

RD RR4F941TF 642 0 0
GGACACACACGCGCAGGACAAGAGAGACATCAGAGATCAAAGAACCGATTCAGACAGAGA
TAGCAACAACGAAACTGAGATTTGGGGGTGAAAGAGAGAGATGGAAACGAGGGAGAGAGA
TCTGGAGCGGCTGATTCCGATGCATAAATCCGGAGAGGTCGTTCTCTCGGTTCCGCCGTC
TCCTCTCGCTTCGCCCATTCACGTCGCCGGAAGAGAGGCGGTTTACAAAGTCATCCGAAG
CTGGGCCTCCAAAAAGTCCATGACCGGATGTGTCATTCTTCTTCCAATCGCCGTCGCATT
CTACTTTACATGGTGGTTTATTCATTTCGTTGACGGTTTCTTCTCCCCAATCTACACTCA
TCTCGGTATCAATATGTTCGGTCTTGGGTTTGTCACATCCACAACATTCATCTTTGTGGT
TGGTGTCTTCATGTCCTCGTGGCTAGGAGCTTCATTTCTCAGCATTGGAGAATGGTTTAT
CAAGAAAATGCCTCTCATCAGCTACATCTACTCAGCTTCTAAACAAATCAGCGGAGCTAT
CTCCCCAGATCACAGCTCAGGTGCATTCAAGGAGGTAGCCATTATCAGGCATCCGCATAG
GGGAGAATACGCTTTTGGATTCATTACATCGACTGTGGT
CTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4F941JQ 613 0 0
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AAATGCCTCTCATCAGCTACATCTACTCAGCTTCTAAACAAATCAGCGGAGCTATCTCCC
CAGATCACAGCTCAGGTGCATTCAAGGAGGTAGCCATTATCAGGCATCCGCATAGGGGAG
AATACGCTTTTGGATTCATTACATCGACTGTGGTTCTCCGAGGCCGTGCTGGTGGAGAAG
AGTTTTGCTGTGTCTATGTCCCCACCAATCATCTTTACCTTGGAGACATTTTCCTCATTA
GCTCAAAGGACCTCATAAGGCCTAATCTCTCAGTCCGTGAAGGCATAGAAATAGTCATTT
CTGGTGGCATGTCAATCCCAGAGGTACCAACAACGCTGGACGCAGAGACTATTCACAGGA
CAGTAGCAGGAAGCTTTGCTATTCCACCAGTGTAAAGAATGAATCATAGTTTCTTTTTTT
TTCTTTTTTAATCCGAAGGTTAACTAAGTCTCCAGTGGAGCCTCTGATTTTAGGTGATTT
TCAACGTTTGTTAATCCAAGAATATTGGAAAAGTTTTGAACTCGTTATGATATATATATG
AGTGTTTAAGCCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL6842Contig1 776 2 1 U
CTTATTATTCTTTTCAATTTATTTCTCTGTGTTCATTAGATCTCTCCGCTATGTCATCGT
ATCGGAGTCTTTCCGATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCGATCCACGGATAGGCCTCG
TATCGGTATGGATATAGTGGCTTCGGTTTAATTCAAGCCAGAAGACGTATCTTAGCTGCT
GAGATCTCTCAGGATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATTGCGAGGTTCCTCGTTG
GATCTGTGATTTGCGTCTCGGAGATGATGAATCCGATTGGCAAGGAGGAGCGACTGGAGA
AGAAGAGAGAAGATGAGGAAGATATGTGAAGTGATATGAGTATTGAAGGATGTATGAGAT
GTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGAGAAAAGGCTTGAGTTCTGAATTAGCATC
TTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGATATATTTTGAATGGATCCAGATCTTACTATTA
TTGAGCAGATCTGGAGTCAGACGCACGGCCTAATCCAACTTACTCCATGGAGACCAAAGT
GTTGCAAATGGATTTGAAGACCGTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCTAAAACCTGCCCCC
AAAGGAACTTAATTTTCATGTTGTTTAAGCAAAAGGTATATTCCAAGGGAAGTTAATTTT
CATGTTGTTTAGGCAGAAAGTATATAAAAGAAGTTACTTTGTGCTTTTTGTGCAAATTGT
CAAAGTTCGAGCCCACAGCTCTTGTTTCTAAATCTGAATATTTCATTCTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AZ09TF U 1
AF RR4AZ09JQ C 40
BS 1 776 RR4AZ09TF

RD RR4AZ09TF 776 0 0
CTTATTATTCTTTTCAATTTATTTCTCTGTGTTCATTAGATCTCTCCGCTATGTCATCGT
ATCGGAGTCTTTCCGATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCGATCCACGGATAGGCCTCG
TATCGGTATGGATATAGTGGCTTCGGTTTAATTCAAGCCAGAAGACGTATCTTAGCTGCT
GAGATCTCTCAGGATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATTGCGAGGTTCCTCGTTG
GATCTGTGATTTGCGTCTCGGAGATGATGAATCCGATTGGCAAGGAGGAGCGACTGGAGA
AGAAGAGAGAAGATGAGGAAGATATGTGAAGTGATATGAGTATTGAAGGATGTATGAGAT
GTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGAGAAAAGGCTTGAGTTCTGAATTAGCATC
TTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGATATATTTTGAATGGATCCAGATCTTACTATTA
TTGAGCAGATCTGGAGTCAGACGCACGGCCTAATCCAACTTACTCCATGGAGACCAAAGT
GTTGCAAATGGATTTGAAGACCGTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCTAAAACCTGCCCCC
AAAGGAACTTAATTTTCATGTTGTTTAAGCAAAAGGTATATTCCAAGGGAAGTTAATTTT
CATGTTGTTTAGGCAGAAAGTATATAAAAGAAGTTACTTTGTGCTTTTTGTGCAAATTGT
CAAAGTTCGAGCCCACAGCTCTTGTTTCTAAATCTGAATATTTCATTCTTTGTTTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4AZ09JQ 737 0 0
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CGATTGCGAGGTTCCTCGTTGGATCTGTGATTTGCGTCTCGGAGATGATGAATCCGATTG
GCAAGGAGGAGCGACTGGAGAAGAAGAGAGAAGATGAGGAAGATATGTGAAGTGATATGA
GTATTGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGAGAAAAGG
CTTGAGTTCTGAATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGATATATTTTGAA
TGGATCCAGATCTTACTATTATTGAGCAGATCTGGAGTCAGACGCACGGCCTAATCCAAC
TTACTCCATGGAGACCAAAGTGTTGCAAATGGATTTGAAGACCGTTAAAGATTTTCCCCA
GCCATGCTAAAACCTGCCCCCAAAGGAACTTAATTTTCATGTTGTTTAAGCAAAAGGTAT
ATTCCAAGGGAAGTTAATTTTCATGTTGTTTAGGCAGAAAGTATATAAAAGAAGTTACTT
TGTGCTTTTTGTGCAAATTGTCAAAGTTCGAGCCCACAGCTCTTGTTTCTAAATCTGAAT
ATTTCATTCTTTGTTTC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL6843Contig1 1021 2 6 U
GGAAGTTCGGTGGTAATAAAGTCTCGCTTCCACTCTCTCTTTTTATCTCCTTCTCCTTCC
ATTGTTCTTCCCCTTCTCTCCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCCCGTCCTTCTACTAGGGTT
CCGTTCATTTCATCACATTCAATTCTTTCTCCTTTCATCTCAATTCTTCTCTGTTTTTTT
ATTTATCTTTAGTAACAATCAGAGGAGAATGGATTCCAATTCATGGATCAATCATCCATC
CGTTTTCTCATCGAGACGATGTCAACAATCCCGATCAGATTTGTACATAGGTGGAGGGTA
CGAGGATCTCGAAGGAGAAGACGAAACAAAGTCGGAGTTTATCTGCCCGTTTTGCGCGGA
GTTTTTCGACATTGTAGGGCTCTGTTGTCACATTGATGAAGAGCATCCTGTTGAGGCCAA
GAACGGGGTATGTCCTGTATGCACAAAGAGGGTGGGATCAGATATCGTCGGCCATATCAC
GACGCAACATGCCAACTTTTTTAAGGTGCAGCGAAGGAGAAGGTTGAGAAAAAGTGGTGG
ATACGGCTCTGCTTATCTCGCCTTGAAAAAAGAGCTACGGGAAGCTAACTTACAGTCTCT
TCTTCTTGGTGGATCTTCAAGATTCACTTCTCCAACCAATATAGAATCTGATCCGTTGCT
GTCATCCTTTATGTTTAGTTCTCCTTCTGCTACTAATGAGTCTGCTAGCAAATTTACTAC
AAAACTCTCGCAAAAGGAATCTCTCAAGAGAGGCATACAAGAAGCTCCACTAACGGTAGA
AGATCAAGAGAAGGCTAGAAAGAGTGAGTTTGTGAGAGGCTTATTGTTATCAACAATCCT
TGGAGATGGTTTGACGATGCATGCGTGAGTAAATCTAAGGTTGAAATTGTTATAGTAGAG
TGGTCTCAGTGTATGATGGAAAAGCTTGTAAGTTAAGTTGATGCAGAGTTAAATCCATAT
ACTATATATATATATATACCTTGAGACTTTCATCGATTCAAATAAATGAAGAGTTAGGAT
C


BQ
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10 

AF RR4GZ21TF U 1
AF RR4GZ21JQ C 382
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TCTCAAGAGAGGCATACAAGAAGCTCCACTAACGGTAGAAGATCAAGAGAAGGCTAGAAA
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TGAGACTTTCATCGATTCAAATAAATGAAGAGTTAGGATC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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AF RR4FJ69TF U 1
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CAACTTTGTGCGCCGTTGCCTGTACAAATCGATGGAGAACCTTGGTCTCAGCAACCATGT
ACCTTAACCATATCGCACCATGGCCAGGCTTTCATGCTAAAGAGAGCAGCGGAG*AGCCA
CTGGGTCACGCGGCGGCTATAATCACAGATGTTTTAGAGAATGCAGAAACCAATCAAGTG
ATCAACGCATCACAGAA*CGAGCTCTGCTTCA
GAATGCTGT

QA 1 692 1 692
DS 

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ATGGAGAACCTTGGTCTCAGCAACCATGTACCTTAACCATATCGCACCATGGCCAGGCTT
TCATGCTAAAGAGAGCAGCGGAGGAGCCACTGGGTCACGCGGCGGCTATAATCACAGATG
TTTTAGAGAATGCAGAAACCAATCAAGTGATCAACGCATCACAGAAACGAGCTTTGCTTC
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TATCTCGTCTCTCTGTCTAAACGTTTGGAATGTTAGACAAGTTAATCCGCTGAGTGCAAA
AAGCGGGTTCTGTGTGGAAGTAGGAAAAAGAAAACAAAGAAAATGGAATCTGGTTTCCAA
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ACAAAGCTTGTTAAAATTATCTCTTATCATATTGTTAGGAAGAATCATGTATGTATATTA
TTGTTTAGAGGAAGCACGTTCCTTTTTTCTTTGATGCA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

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AATGTTATCTACATCAAGAGGCAATTAGGGACTCACCTCTCTCAAGGATCATACAAGTTC
CGAACTCACAGTCTTTCTTCACGTGTATCTGTCTCTAATAGACAACCTTGTAGCTGGTCG
GTATTGATTAATCGATCAACTGGTCCTAAAGGAAAGCTCGAAGCTTCTTTCTTGAGGAGC
CCTGATGCGAAAATGTCCAGAAACCTTTATTGGTGTTCGAGATTTGCTTATACAGGTGTG
ATTGTCAGCTTGCTTGTTTGTTGTTCTTCGTCTCCTCAATCAACGTGTGCAGATGCTTCG
AGGGGTAAAGATGGTGATCACAGCAACAATGGGAAGAGAGTTTATAAAGATTACTCTGTC
ATTGGTATACCTGGAGATGGTAGATGTTTGTTTCGCTCGGTGGCTCATGGTTTGCTTACG
TTCTGGTAAACCTTCTCCGAGTGAGAAGGTACAGAGAGAGCTCGCTGATGAGTTACGTGC
AAGAGTTGCTGACGAATTTATCAATAGAAGACGAGAAACAGAATGGTTTGTAGAAGGGGA
TTTTGACACATACGTGAGTCAAATTCGGAAGTCACATGTGTGGGGAGGTGAACCTGAACT
CTTCATGGCTTCACACGTCCTCCAGATGCCAATCACAGTGTATATGAAGGACGAAAAGGC
TGGAGGATTGATAACCATAGCGGAATACGGTCAAGAATACAGTAAAGAAGATCCGATACG
GGTCCTATACCATGGTTTTGGTCACTACGACGCTCTCTTGATACACGAGTGTAAAGCTTT
AACTCACAAGTCCAAACTATAGCAAATGCCAAAAGCGTGGAAAGTTCTCTTGTTTTTGAA
TCTGGAATGCATGAATTGGCGGAAGTACCCTCCGTTAGTTGTCGTAGTCTTGTAGACAGC
AAGTGGGATCTTCACATGCATCTTTGTGTTGGTAACTTTTGTCAGGTGGTGATGATTTTA
TCTTATCTTTTTCTGACCCAACCACCAATCTATATAGACATGTCTTGTAGAATTTCACCC
TTTTATGTACTTTATACTTCAAAATTTGAATAAAATTTCAAATAATATGTTTGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN76TF U 1
AF RR4DN76JQ C 397
BS 1 709 RR4DN76TF
BS 710 710 RR4DN76JQ
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BS 757 757 RR4DN76JQ
BS 758 776 RR4DN76TF
BS 777 1138 RR4DN76JQ

RD RR4DN76TF 776 0 0
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AATGTTATCTACATCAAGAGGCAATTAGGGACTCACCTCTCTCAAGGATCATACAAGTTC
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TTTTGACACATACGTGAGTCAAATTCGGAAGTCACATGTGTGGGGAGGTGAACCTGAACT
CTTCATGGCTTCACACGTCCTCCAGATGCCAATCACAGTGTATATGAAG*ACGAAAAG*C
TGGAG*ATTGATAACCATAGCGGA*TACG*TCAAGA*TACAGTAAAGAAGATCCGA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4DN76JQ 742 0 0
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AGAGCTCGCTGATGAGTTACGTGCAAGAGTTGCTGACGAATTTATCAATAGAAGACGAGA
AACAGAATGGTTTGTAGAAGGGGATTTTGACACATACGTGAGTCAAATTCGGAAGTCACA
TGTGTGGGGAGGTGAACCTGAACTCTTCATGGCTTCACACGTCCTCCAGATGCCAATCAC
AGTGTATATGAAGGACGAAAAGGCTGGAGGATTGATAACCATAGCGGAATACGGTCAAGA
ATACAGTAAAGAAGATCCGATACGGGTCCTATACCATGGTTTTGGTCACTACGACGCTCT
CTTGATACACGAGTGTAAAGCTTTAACTCACAAGTCCAAACTATAGCAAATGCCAAAAGC
GTGGAAAGTTCTCTTGTTTTTGAATCTGGAATGCATGAATTGGCGGAAGTACCCTCCGTT
AGTTGTCGTAGTCTTGTAGACAGCAAGTGGGATCTTCACATGCATCTTTGTGTTGGTAAC
TTTTGTCAGGTGGTGATGATTTTATCTTATCTTTTTCTGACCCAACCACCAATCTATATA
GACATGTCTTGTAGAATTTCACCCTTTTATGTACTTTATACTTCAAAATTTGAATAAAAT
TTCAAATAATATGTTTGTTTCT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL6846Contig1 978 2 2 U
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AAAGTTAGGTTTTTTTGGGATCGGCTGATATGGCGGAGGAGAAGGAGATGAAAGGAGAGG
AGAAGAACAAGTATAGCATAATCATTCCCACGTACAACGAGCGCCTCAATATTGCTCTTA
TCGTCTACCTCATTTTCAAACATCTCCGGGATGTTGATTTTGAGATAATTGTTGTGGATG
ATGGGAGTCCTGACGGCACTCAAGAAATTGTCAAGCAGCTTCAGCACTTGTATGGTGAAG
ACCGCATTCTTTTAAGAGCGAGAGCCAAGAAGCTTGGTTTGGGAACTGCATATATCCATG
GTTTGAAGCATGCTACAGGTGATTTCGTTGTCATCATGGATGCTGATCTTTCACATCATC
CAAAGTATTTGCCAAGTTTCATCAAGAAACAACTAGAGACGAATGCAAGCATAGTGACAG
GTACACGATACGTAAAAGGAGGTGGTGTACACGGGTGGAACCTTATGCGGAAACTCACAA
GCAGAGGAGCAAATGTGCTAGCTCACACACTTTTATGGCCTGGTGTATCTGATTTAACCG
GATCATTTAGGCTATACAAGAAATCGGTTCTTGAGGACGTGATAAGCTCATGTGTGAGCA
AAGGTTATGTCTTTCAGATGGAAATGATCGTTCGTGCTACCAGAAAAGGATACCATATTG
AAGAGGTACCGATCACATTTGTGGATAGAGTCTTTGGAACTTCGAAGCTGGGAGGATCTG
AAATAGTGGAATATCTAAAAGGACTCGTCTATCTTCTTCTCACGACATAAAAGAGACGAG
AAACTAAACACAGCTCAACAACACATGAATCTCTCTATTTATACTCATTCATCTCTTAAC
ACTAGAACTCTGATCATGCCTGTTAGAAACTTCACTTTTACCTTCGACTACAGACATAAA
GTTGCGCATCATCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO91TF U 1
AF RR4CO91JQ C 257
BS 1 608 RR4CO91TF
BS 609 978 RR4CO91JQ

RD RR4CO91TF 608 0 0
GGGAGTCACAGAACGACGGTGGATTTCACAGGCGGATTAAGGAAGCTCTCTCCGTTTGTA
AAAGTTAGGTTTTTTTGGGATCGGCTGATATGGCGGAGGAGAAGGAGATGAAAGGAGAGG
AGAAGAACAAGTATAGCATAATCATTCCCACGTACAACGAGCGCCTCAATATTGCTCTTA
TCGTCTACCTCATTTTCAAACATCTCCGGGATGTTGATTTTGAGATAATTGTTGTGGATG
ATGGGAGTCCTGACGGCACTCAAGAAATTGTCAAGCAGCTTCAGCACTTGTATGGTGAAG
ACCGCATTCTTTTAAGAGCGAGAGCCAAGAAGCTTGGTTTGGGAACTGCATATATCCATG
GTTTGAAGCATGCTACAGGTGATTTCGTTGTCATCATGGATGCTGATCTTTCACATCATC
CAAAGTATTTGCCAAGTTTCATCAAGAAACAACTAGAGACGAATGCAAGCATAGTGACAG
GTACACGATACGTAAAAGGAGGTGGTGTACACGGGTGGAACCTTATGCGGAAACTCACAA
GCAGAGGAGCAAATGTGCTAGCTCACACACTTTTATGGCCTGGTGTATCTGATTTAACCG
GATCATTT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4CO91JQ 722 0 0
CACTCAAGAAATTGTCAAGCAGCTTCAGCACTTGTATGGTGAAGACCGCATTCTTTTAAG
AGCGAGAGCCAAGAAGCTTGGTTTGGGAACTGCATATATCCATGGTTTGAAGCATGCTAC
AGGTGATTTCGTTGTCATCATGGATGCTGATCTTTCACATCATCCAAAGTATTTGCCAAG
TTTCATCAAGAAACAACTAGAGACGAATGCAAGCATAGTGACAGGTACACGATACGTAAA
AGGAGGTGGTGTACACGGGTGGAACCTTATGCGGAAACTCACAAGCAGAGGAGCAAATGT
GCTAGCTCACACACTTTTATGGCCTGGTGTATTTGATTTAACCGGATCATTTAGGCTATA
CAAGAAATCGGTTCTTGAGGACGTGATAAGCTCATGTGTGAGCAAAGGTTATGTCTTTCA
GATGGAAATGATCGTTCGTGCTACCAGAAAAGGATACCATATTGAAGAGGTACCGATCAC
ATTTGTGGATAGAGTCTTTGGAACTTCGAAGCTGGGAGGATCTGAAATAGTGGAATATCT
AAAAGGACTCGTCTATCTTCTTCTCACGACATAAAAGAGACGAGAAACTAAACACAGCTC
AACAACACATGAATCTCTCTATTTATACTCATTCATCTCTTAACACTAGAACTCTGATCA
TGCCTGTTAGAAACTTCACTTTTACCTTCGACTACAGACATAAAGTTGCGCATCATCTTT
CG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6847Contig1 581 2 5 U
GGGACGGTGCCATAGATGGACACTTGAGGGAAGTGGGACTAACCTTCCATCTCCTCAAGG
ACGTCCCTGGACTCATCTCCAAGAACATTGAAAAGAGTTTGGACGAAGCTTTTAAACCGT
TGGGGATAAGTGACTGGAACTCCCTCTTCTGGATAGCTCACCCTGGTGGTCCAGCCATCC
TTGACGACGTTGAGAAAAAGCTAGGACTCAAGGCTGAGAAGATGAGAGCCACACGTCACG
TGTTGAGTGAGTATGGAAACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCTTTATCTTGGATGAGATGA
GGAGGAAGTCTGCGGAAGATGGTGTGGCCACGACAGATGAAGGGTTGGAGTGGGGTGTCT
TGTTTGGTTTCGGACCGGGTCTCACCGTGGAGACAGTTGTCCTACACAGCGTTCCTGTTT
AAACAGAAAGCTCTCTTCCTATAAATGCCTACCTACCCTCACATACTTACCATCATCATC
TTGTCTTTGTGTTTTTTTTTCCTATCAATTTAAGATAATATTTGTAATGCAATAATTAAG
GAAGCATTCATTTAATGTGAAACATGTGGACTTGCTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FO06TF U 1
AF RR4DV57TF U 198
BS 1 336 RR4FO06TF
BS 337 337 RR4DV57TF
BS 338 498 RR4FO06TF
BS 499 500 RR4DV57TF
BS 501 581 RR4FO06TF

RD RR4FO06TF 581 0 0
GGGACGGTGCCATAGATGGACACTTGAGGGAAGTGGGACTAACCTTCCATCTCCTCAAGG
ACGTCCCTGGACTCATCTCCAAGAACATTGAAAAGAGTTTGGACGAAGCTTTTAAACCGT
TGGGGATAAGTGACTGGAACTCCCTCTTCTGGATAGCTCACCCTGGTGGTCCAGCCATCC
TTGACGACGTTGAGAAAAAGCTAGGACTCAAGGCTGAGAAGATGAGAGCCACACGTCACG
TGTTGAGTGAGTATGGAAACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCTTTATCTTGGATGAGATGA
GGAGGAAGTCTGCGGAAGATGGTGTGGCCACGACAGGTGAAGGGTTGGAGTGGGGTGTCT
TGTTTGGTTTCGGACCGGGTCTCACCGTGGAGACAGTTGTCCTACACAGCGTTCCTGTTT
AAACAGAAAGCTCTCTTCCTATAAATGCCTACCTACCCTCACATACTTACCATCATCATC
TTGTCTTTGTGTTTTTTT**CCTATCAATTTAAGATAATATTTGTAATGCAATAATTAAG
GAAGCATTCATTTAATGTGAAACATGTGGACTTGCTTTTTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4DV57TF 362 0 0
G
AGCTAGGACTCAAGGCTGAGAAGATGAGAGCCACACGTCACGTGTTGAGTGAGTATGGAA
ACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCTTTATCTTGGATGAGATGAGGAGGAAGTCTGCGGAAG
ATGGTGTGGCCACGACAGATGAAGGGTTGGAGTGGGGTGTCTTGTTTGGTTTCGGACCGG
GTCTCACCGTGGAGACAGTTGTCCTACACAGCGTTCCTGTTTAAACAGAAAGCTCTCTTC
CTATAAATGCCTACCTACCCTCACATACTTACCATCATCATCTTGTCTTTGTGTTTTTTT
TTCCTATCAATTTAAGATAATATTTGTAATGCAATAATTAAGGAAGCATTCATTTAATGT
G

QA 2 362 2 362
DS 



AS 1 2

CO CL6848Contig1 889 2 4 U
GAATCATCATCTCTATGGAGGACAACAGTTTTCACCGTATATGGGACCTCCATCATCAGG
ATCAACAGGAATGTTCCATGGTTACTATCCTTACTATCCTCAATACAATCCAGCACAAAG
CAGCAATCAAGCTCAAGCTCAAGCTCAAGCTCATATTCATCATCAAGGTTTCACCTTTCA
ATACACTGCTCCTCCTGCTCCTCCTCTGTTGCAATACCCTTACTTGCCTCATCAGCAATT
CAGCTCTCAGCCTCCTCCGCCTCCAATCCTCTCCCTTCCAACCTCTTTGGCTCTATCATT
GGCATCTTCAGCTCCATCTTCCTCCTCTTCAGCCTCCACCTCAGCTGCAACAACTGCAAC
CAAAACAGTGGTTATTGCTACACCAGCAGCTGAAGCTAGCAGCAACAAAGATGGTCATGA
AGCAACTACTACATCATCATCCATCAAGATAGAGGATTGATTCAGTACCACAGTAGCGGA
GAAAGGGACTAACTCATCATCATCAATCTCTCCACCATGTTCTAGAAACATTTATTCATA
TCGTTTTTAGGATTCTAGAATCTAAATCAGTAGTACCTAGGAGGAGGAAGCTGAAGCAGA
AGAAGAAAGAAACAGCCATCAGTTACATTCTTTGTTTTGTTTAATTTTTCAAGATTCACA
TTGCATTTTAGGTTAAAAGTATCAAATAGAAGGCATTGGTGGCCTTTTCTTTGGTTCTTG
GATTGATGCAGAAAGCATCATTCAAAAATTACATTTATTTGGGGATTTATTTTCAGGTTC
AGAAGAATTTTTTTTATGTCTTCTTTTGAACCCAAACATGGATTTTGAAGCTTTGGATAA
GCTTAAAAGTCCCTTTTCACATTTGTAATTCTTGAAATTGTTTTACCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FW68TF U 1
AF RR4FW68JQ C 334
BS 1 671 RR4FW68TF
BS 672 672 RR4FW68JQ
BS 673 686 RR4FW68TF
BS 687 889 RR4FW68JQ

RD RR4FW68TF 686 0 0
GAATCATCATCTCTATGGAGGACAACAGTTTTCACCGTATATGGGACCTCCATCATCAGG
ATCAACAGGAATGTTCCATGGTTACTATCCTTACTATCCTCAATACAATCCAGCACAAAG
CAGCAATCAAGCTCAAGCTCAAGCTCAAGCTCATATTCATCATCAAGGTTTCACCTTTCA
ATACACTGCTCCTCCTGCTCCTCCTCTGTTGCAATACCCTTACTTGCCTCATCAGCAATT
CAGCTCTCAGCCTCCTCCGCCTCCAATCCTCTCCCTTCCAACCTCTTTGGCTCTATCATT
GGCATCTTCAGCTCCATCTTCCTCCTCTTCAGCCTCCACCTCAGCTGCAACAACTGCAAC
CAAAACAGTGGTTATTGCTACACCAGCAGCTGAAGCTAGCAGCAACAAAGATGGTCATGA
AGCAACTACTACATCATCATCCATCAAGATAGAGGATTGATTCAGTACCACAGTAGCGGA
GAAAGGGACTAACTCATCATCATCAATCTCTCCACCATGTTCTAGAAACATTTATTCATA
TCGTTTTTAGGATTCTAGAATCTAAATCAGTAGTACCTAGGAGGAGGAAGCTGAAGCAGA
AGAAGAAAGAAACAGCCATCAGTTACATTCTTTGTTTTGTTTAATTTTTCAAGATTCACA
TTGCATTTTAG*TTAAAAGTATCAAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4FW68JQ 556 0 0
CTCCACCTCAGCTGCAACAACTGCAACCAAAACAGTGGTTATTGCTACACCAGCAGCTGA
AGCTAGCAGCAACAAAGATGGTCATGAAGCAACTACTACATCATCATCCATCAAGATAGA
GGATTGATTCAGTACCACAGTAGCGGAGAAAGGGACTAACTCATCATCATCAATCTCTCC
ACCATGTTCTAGAAACATTTATTCATATCGTTTTTAGGATTCTAGAATCTAAATCAGTAG
TACCTAGGAGGAGGAAGCTGAAGCAGAAGAAGAAAGAAACAGCCATCAGTTACATTCTTT
GTTTTGTTTAATTTTTCAAGATTCACATTGCATTTTAGGTTAAAAGTATCAAATAGAAGG
CATTGGTGGCCTTTTCTTTGGTTCTTGGATTGATGCAGAAAGCATCATTCAAAAATTACA
TTTATTTGGGGATTTATTTTCAGGTTCAGAAGAATTTTTTTTATGTCTTCTTTTGAACCC
AAACATGGATTTTGAAGCTTTGGATAAGCTTAAAAGTCCCTTTTCACATTTGTAATTCTT
GAAATTGTTTTACCTC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL6849Contig1 1066 2 2 U
GGTCGCTTGACGTCCACGTTGGTCAGTCCGTGACCCTCCTAGTCACTTTGAAAGCATCAG
TGAGAGACTACTACATCGTGGCTTCGACCCGGTTTACTAAACCCATACTTAACACAGCCG
CGAGTCTTCGTTACCTAGGCTCCAAAAACGCCATATATGGTCCGCTTCCCGTTGGTCCTA
CCTACCATATCCACTGGTCCATGAAACAAGCAAGAACCACCAGGATGAATTTAACGGCGA
ATGCTGCAAGGCCAAACCCACAAGGATCATTTCATTATGGTACCATACCGATAAACCGAA
CTCTAATCCTATCCAATGCGGCTACGATGATCTACGGGAAGCTCCGGTACACGGTAAACC
GAGTCTCATACATTAATCCACCAACACCGCTGAAACTTGCCGATTGGTACGACATTTCCG
GCGTGTTTGATTTCAAGACAATGTTTAGCACTCCCACAATCGGACCAGCTCATTTTGGTA
CATCGGTTCTCGACGTTGAGCTCCACGAGTTCGTTGAAATTGTTTTCCAAAACGACGAGA
GATCAATTCAATCTTGGCACATGGATGGTACTAGCGCCTTTCTTGTCGGATACGGGTCAG
GGACATGGAATGTAAACATGAGGAAACGTTACAACTTGGTTGATGCTGTTGCAAGGCACA
CTTTTCAGGTGTATCCGTTATCATGGACAAGCATATTGGTGTCGTTGGATAACAAAGGTA
TGTGGAACTTAAGGTCGCAGATATGGTCGAGGAGATATTTAGGACAAGAGCTATACGTTC
GCGTTTGGAACGATGAGAAGTCTCTTTACACTGAAGCAGCGCCGCCTCTTAACGCTCTTT
ATTGCGGTCTAGCCAAACGCCCACTTTAAATATTTTCCACATATATTGTTGTTATATTTT
TATTTGTTCAACTAGGTGACAACTTTTTTTTACTAATTCAACTAGGTCACAGTTAAGACC
TTGATTTATATTTTATTTAAAGGGGGAAGTGAGAAAGAAAAAATACAAACGTAGTCGAAA
CGTAAACCTCAATGATTTTTCGATAAACAGACAAACAATTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FN39TF U 1
AF RR4FN39JQ C 335
BS 1 590 RR4FN39TF
BS 591 1066 RR4FN39JQ

RD RR4FN39TF 590 0 0
GGTCGCTTGACGTCCACGTTGGTCAGTCCGTGACCCTCCTAGTCACTTTGAAAGCATCAG
TGAGAGACTACTACATCGTGGCTTCGACCCGGTTTACTAAACCCATACTTAACACAGCCG
CGAGTCTTCGTTACCTAGGCTCCAAAAACGCCATATATGGTCCGCTTCCCGTTGGTCCTA
CCTACCATATCCACTGGTCCATGAAACAAGCAAGAACCACCAGGATGAATTTAACGGCGA
ATGCTGCAAGGCCAAACCCACAAGGATCATTTCATTATGGTACCATACCGATAAACCGAA
CTCTAATCCTATCCAATGCGGCTACGATGATCTACGGGAAGCTCCGGTACACGGTAAACC
GAGTCTCATACATTAATCCACCAACACCGCTGAAACTTGCCGATTGGTACGACATTTCCG
GCGTGTTTGATTTCAAGACAATGTTTAGCACTCCCACAATCGGACCAGCTCATTTTGGTA
CATCGGTTCTCGACGTTGAGCTCCACGAGTTCGTTGAAATTGTTTTCCAAAACGACGAGA
GATCAATTCAATCTTGGCACATGGATGGTACTAGCGCCTTTCTTGTCGGA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4FN39JQ 732 0 0
CGGGAAGCTCCGGTACACGGTAAACCGAGTCTCATACATTAATCCACCAACACCGCTGAA
ACTTGCCGATTGGTACGACATTTCCGGCGTGTTTGATTTCAAGACAATGTTTAGCACTCC
CACAATCGGACCAGCTCATTTTGGTACATCGGTTCTCGACGTTGAGCTCCACGAGTTCGT
TGAAATTGTTTTCCAAAACGACGAGAGATCAATTCAATCTTGGCACATGGATGGTACTAG
CGCCTTTCTTGTCGGATACGGGTCAGGGACATGGAATGTAAACATGAGGAAACGTTACAA
CTTGGTTGATGCTGTTGCAAGGCACACTTTTCAGGTGTATCCGTTATCATGGACAAGCAT
ATTGGTGTCGTTGGATAACAAAGGTATGTGGAACTTAAGGTCGCAGATATGGTCGAGGAG
ATATTTAGGACAAGAGCTATACGTTCGCGTTTGGAACGATGAGAAGTCTCTTTACACTGA
AGCAGCGCCGCCTCTTAACGCTCTTTATTGCGGTCTAGCCAAACGCCCACTTTAAATATT
TTCCACATATATTGTTGTTATATTTTTATTTGTTCAACTAGGTGACAACTTTTTTTTACT
AATTCAACTAGGTCACAGTTAAGACCTTGATTTATATTTTATTTAAAGGGGGAAGTGAGA
AAGAAAAAATACAAACGTAGTCGAAACGTAAACCTCAATGATTTTTCGATAAACAGACAA
ACAATTTTAAGG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL6850Contig1 1008 2 18 U
TTTTTCACCTCCACAGATCCAAACAATGCCTTCTCAAATTAGGGTTCCGATCATCGACGT
CTCTTCCCCTCTTCCTCCTCACCGAATTTAAGATCATCGCCGCGAATTTCCGGAGAACTT
TCCTCGATTTTTCTCTTTTCCAGCTAGGTTCTCCTGTGACGGCGTGTTATCCCATCAGTT
GACCTTCGCTTTCATCGCCAGATCATTCTTAGGGGCTCGTTTAGACGTTTCGGTGTTGAT
GAATCTCTGCCTAGTGGATACCAGCCGTGGGAACAGCGGTGCCTCAGGGCAGCAGCTTCT
TACTCCGACTCGCTTCGTGTGGCCTTATGGAGGTAGAAGGGTCTTCCTTAGCGGATCTTT
CACCAGTTGGACAGAACATGTGCCAATGTCACCACTTGAGGGCTGCCCTACTGTTTTTCA
AGTCATTTGCAACTTGACTCCCGGATATCATCAGTATAAGTTTTATGTTGATGGGGAATG
GCGGCACGATGAGCATCAGCCATTTGTAAACGCAAATGGTGGAGTAATGAATACAATATT
TATAACTGGACCAGATATGGTTCCCACTGCTTTTAGCCCATCGAACATGGATGTCGATGA
TTCCTCCCAGAGAGTGGCTGAATCTTCCCAGGATTCTATACCTAGGATGTCAGCGGTTGA
TTTGGAGGTGTCCCGTCACCGTATATCTGTTTTATTGTCAACCCGTACTGCATACGAGCT
TCTCCCAGAATCGGGCAAGGTTACTGCATTGGATGTGAATTTACCAGTAAAGCAAGCATT
CCATATACTCTATGAGCAGGGAATCCCTTTGGCTCCTCTGTGGGACTTTGGTAAAGGCCA
ATTTGTTGGAGTTCTTGGTCCATTGGACTTCATTCTAATACTGAGAGAGCTTGGAACGCA
TGGATCCAACTTGACAGAAGAAGAGCTTGAGACGCACACAGTAGCAGCCTGGAAAGAGGG
GAAGGCTCATATTAGCAGACAATATGATGGAATTGGGAGACCGTATCC


BQ
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AF RR4EQ06TF U 1
AF RR4CC03TF U 372
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BS 742 761 RR4EQ06TF
BS 762 1008 RR4CC03TF

RD RR4EQ06TF 775 0 0
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CTCTTCCCCTCTTCCTCCTCACCGAATTTAAGATCATCGCCGCGAATTTCCGGAGAACTT
TCCTCGATTTTTCTCTTTTCCAGCTAGGTTCTCCTGTGACGGCGTGTTATCCCATCAGTT
GACCTTCGCTTTCATCGCCAGATCATTCTTAGGGGCTCGTTTAGACGTTTCGGTGTTGAT
GAATCTCTGCCTAGTGGATACCAGCCGTGGGAACAGCGGTGCCTCAGGGCAGCAGCTTCT
TACTCCGACTCGCTTCGTGTGGCCTTATGGAGGTAGAAGGGTCTTCCTTAGCGGATCTTT
CACCAGTTGGACAGAACATGTGCCAATGTCACCACTTGAGGGCTGCCCTACTGTTTTTCA
AGTCATTTGCAACTTGACTCCCGGATATCATCAGTATAAGTTTTATGTTGATGGGGAATG
GCGGCACGATGAGCCTCAGCCATTTGTAAACGCAAATGGTGGAGTAATGAATACAATATT
TATAACTGGACCAGATATGGTTCCCACTGCTTTTAGCCCATCGAACATGGATGTCGATGA
TTCCTCCCAGAGAGTGGCTGAATCTTCCCAGGATTCTATACCTAG*ATGTCAGCGGTTGA
TTTGGAG*TGTCCCGTCACCGTATATCTGTTTTATTGTCA*CCCGTACTGCATACGAGCT
*CTCCCAGA*TCGGGCAGG**TACTGCATTGGATGTGAATT
ACCAGTAAGCAGCA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4CC03TF 637 0 0
G
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CTTGACTCCCGGATATCATCAGTATAAGTTTTATGTTGATGGGGAATGGCGGCACGATGA
GCATCAGCCATTTGTAAACGCAAATGGTGGAGTAATGAATACAATATTTATAACTGGACC
AGATATGGTTCCCACTGCTTTTAGCCCATCGAACATGGATGTCGATGATTTCTCCCAGAG
AGTGGCTGAATCTTCCCAGGATTCTATACCTAGGATGTCAGCGGTTGATTTGGAGGTGTC
CCGTCACCGTATATCTGTTTTATTGTCAACCCGTACTGCATACGAGCTTCTCCCAGAATC
GGGCAAGGTTATTGCATTGGATGTGAATTTACCAGTAAAGCAAGCATTCCATATACTCTA
TGAGCAGGGAATCCCTTTGGCTCCTCTGTGGGACTTTGGTAAAGGCCAATTTGTTGGAGT
TCTTGGTCCATTGGACTTCATTCTAATACTGAGAGAGCTTGGAACGCATGGATCCAACTT
GACAGAAGAAGAGCTTGAGACGCACACAGTAGCAGCCTGGAAAGAGGGGAAGGCTCATAT
TAGCAGACAATATGATGGAATTGGGAGACCGTATCC

QA 2 637 2 637
DS 



AS 1 2

CO CL6851Contig1 1331 2 4 U
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TCACATATCTTCTTCTCCTCGCTCTTACTTCCGCCCAGCGATCTCATTCCTCGGCGTCGT
CCTCCTGTTCCTTCTCGGTCTAACACTAGCCTCCCGAAAACTATCCGGTTCACCCCCGAA
CCGTATCCTAACCGGGAAACCAAACATCCCGAGGCTCGCGTACTTGGTCACGGGGACTAA
AGGAGACGCGAAACGGGTGAAGCGTCTCCTCAGGGCGATACACCATCCGAGAAACCACTA
TCTTCTCCATCTCGACCTTCAAGCTTCCGATGAAGAGAGGATGGATCTTGCGAAGTTCGT
AGGTCGGAGAAGGAGAAGATGAGGAACGTTATGGTGATGGGTTTGGCTGACTTGGTTACT
GAGAAAGGTCCGACGATGTTGGCTAGCACGCTCCACGGTGTTGCGATTCTGTTGAAGAAA
GCTGAGGATTGGGATTGGTTTATTAATCTTGGCTCATCTGATTATCCTCTCATGCCTCAA
GACGATATTTTGCATATCTTCTCATACTTGCCTCGTTACCTGAACTTCATTGAGCACACA
AGCAACATCGGTTGGAAAGAGAGTCAAAGAGCAAGACCTATCATTATCGACCCTGGCTTT
TACCATTCGAAGAAATCTGGTGTGTTTTGGGCTAAAGAACGAAGATCATTGCCTGCTTCC
TTCAAACTTTTCATGGGGTCAACAAGTGTAGCTCTAACAAGACCCTTCCTCGAGTTCTGC
ATCTGGGGATGGGACAACCTCCCAAGAACGCTATTGATGTACTACACTAACTTCCTTTTA
TCATCAGAAGGCTATTTTCAGACGGTTGTGTGCAACAACAAAGATTATCAGAACACAACT
GTTAACCATGACTTGCACTACACGCACTGGGATACGGTTCTCCAACAGCGAGCCCTGAAT
CTAACGGTTGAGGATTTTCATGACATGGTCCAGAGCGGGGCGCCGTTTGCAAGGGAGTTT
CGAGAGGATGATCTCGTACTTGATAAGATTGACGCCGAGCTGCTTGGTCAAACTGACGGT
GGATCCGGGTTGAAGACTCCGGAGATTGTTAAACCCACGGTGAGTTTTAAGAGGCTTGAG
AAGCTCATGGTTAAGCTTCTTGATCATGAGAACTTCAGGGCTAAGCAATGTAAATAGCTT
CTTTTTTTTACTTTCTCTTGGTTATTGATTTTTTTCTTTCAATCATTGATTTTCCATGGG
AAGTTTCTTTGGCCTTTGTAATATATTTGTAATATTTACTTCTATATGTTCATCTCATCA
TCTTATAATCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B075TF U 1
AF RR4B075JQ C 491
BS 1 802 RR4B075TF
BS 803 803 RR4B075JQ
BS 804 845 RR4B075TF
BS 846 1331 RR4B075JQ

RD RR4B075TF 845 0 0
GGAGATCTGACTTTCTCATGTCCCGAAGAATCGTAAAGCCATCACGATCATGAAAAGATC
TCACATATCTTCTTCTCCTCGCTCTTACTTCCGCCCAGCGATCTCATTCCTCGGCGTCGT
CCTCCTGTTCCTTCTCGGTCTAACACTAGCCTCCCGAAAACTATCCGGTTCACCCCCGAA
CCGTATCCTAACCGGGAAACCAAACATCCCGAGGCTCGCGTACTTGGTCACGGGGACTAA
AGGAGACGCGAAACGGGTGAAGCGTCTCCTCAGGGCGATACACCATCCGAGAAACCACTA
TCTTCTCCATCTCGACCTTCAAGCTTCCGATGAAGAGAGGATGGATCTTGCGAAGTTCGT
AGGTCGGAGAAGGAGAAGATGAGGAACGTTATGGTGATGGGTTTGGCTGACTTGGTTACT
GAGAAAGGTCCGACGATGTTGGCTAGCACGCTCCACGGTGTTGCGATTCTGTTGAAGAAA
GCTGAGGATTGGGATTGGTTTATTAATCTTGGCTCATCTGATTATCCTCTCATGCCTCAA
GACGATATTTTGCATATCTTCTCATACTTGCCTCGTTACCTGAACTTCATTGAGCACACA
AGCAACATCGGTTGGAAAGAGAGTCAAAGAGCAAGACCTATCATTATCGACCCTGGCTTT
TACCATTCGAAGAAATCTGGTGTGTTTTGGGCTAAAGAACGAAGATCATTGCCTGCTTCC
TTCAAACTTTTCATGGGGTCAACAAGTGTAGCTCTAACAAGACCCTTCCTCGAGTTCTGC
ATCTGGGGATGGGACAACCTCC*AAGAACGCTATTGATGTACTACACTAACTTCCTTTTA
TCATC

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4B075JQ 841 0 0
GGGATTGGTTTATTAATCTTGGCTCATCTGATTATCCTCTCATGCCTCAAGACGATATTT
TGCATATCTTCTCATACTTGCCTCGTTACCTGAACTTCATTGAGCACACAAGCAACATCG
GTTGGAAAGAGAGTCAAAGAGCAAGACCTATCATTATCGACCCTGGCTTTTACCATTCGA
AGAAATCTGGTGTGTTTTGGGCTAAAGAACGAAGATCATTGCCTGCTTCCTTCAAACTTT
TCATGGGGTCAACAAGTGTAGCTCTAACAAGACCCTTCCTCGAGTTCTGCATCTGGGGAT
GGGACAACCTCCCAAGAACGCTATTGATGTACTACACTAACTTCCTTTTATCATCAGAAG
GCTATTTTCAGACGGTTGTGTGCAACAACAAAGATTATCAGAACACAACTGTTAACCATG
ACTTGCACTACACGCACTGGGATACGGTTCTCCAACAGCGAGCCCTGAATCTAACGGTTG
AGGATTTTCATGACATGGTCCAGAGCGGGGCGCCGTTTGCAAGGGAGTTTCGAGAGGATG
ATCTCGTACTTGATAAGATTGACGCCGAGCTGCTTGGTCAAACTGACGGTGGATCCGGGT
TGAAGACTCCGGAGATTGTTAAACCCACGGTGAGTTTTAAGAGGCTTGAGAAGCTCATGG
TTAAGCTTCTTGATCATGAGAACTTCAGGGCTAAGCAATGTAAATAGCTTCTTTTTTTTA
CTTTCTCTTGGTTATTGATTTTTTTCTTTCAATCATTGATTTTCCATGGGAAGTTTCTTT
GGCCTTTGTAATATATTTGTAATATTTACTTCTATATGTTCATCTCATCATCTTATAATC
G

QA 1 841 1 841
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6854Contig1 350 2 1 U
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GCTAAACCAAGGCAGAAAGACTACTGGGTTATCTTAGGGAGCCAAGGAAGGAGGGAAGTT
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GTCTAGTATTTGTATATACTGAGTGTATGTTTGGTGGTTTTGTATAGCTAAGCTATCTTT
ATGTAGACTGTAAAGGGAGATCAAAACGAGTCCCAGAAACTTTGACTACTTCTGATCTTT
CTTGTATTTGATGTTAAGCTAGTTTTATGTGTGTGTGTGCTATTTGGATT


BQ
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AF RR4BK55JQ C 1
AF RR4BK55TF U 1
BS 1 350 RR4BK55TF

RD RR4BK55JQ 350 0 0
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QA 1 350 1 350
DS 

RD RR4BK55TF 350 0 0
GGGGAAGGCGCGATTCCTCCTCTCGTGGGTCTCTCTCAGAGCGGCGCCGTCAGCGTTAGA
GCTAAACCAAGGCAGAAAGACTACTGGGTTATCTTAGGGAGCCAAGGAAGGAGGGAAGTT
CATCATCAAGCCCTTGAAATGGTTCCCTAGAATGAAACCATTATGGACGTTTTTTTATCA
GTCTAGTATTTGTATATACTGAGTGTATGTTTGGTGGTTTTGTATAGCTAAGCTATCTTT
ATGTAGACTGTAAAGGGAGATCAAAACGAGTCCCAGAAACTTTGACTACTTCTGATCTTT
CTTGTATTTGATGTTAAGCTAGTTTTATGTGTGTGTGTGCTATTTGGATT

QA 1 350 1 350
DS 



AS 1 2

CO CL6855Contig1 1051 2 6 U
GAACCCACCTCTGCTTTTCTCTTTCCCGGTCAGGGAGCTCAAGCAATAGGGATGGGCAAA
GAGGCTCAGAGTGTTGCTGCAGCTGCTGACTTGTATACCAAAGCTAACCATATCTTAGGG
TATGATCTTCTGGACATTTGTGTTAATGGACCAAAAGAGAAGCTTGATTCCACTGTCATC
AGCCAGCCTGCTATTTATGTCACAAGTCTAGCAGCAGTTGAGTTACTTCGTGTCCGTGAA
GGCGGGGAGCAGATAATTAACTCCGTTGATGTCACTTGTGGTCTCAGCTTGGGAGAGTAC
ACTGCTCTCGCTTTTGCTGGAGCCTTCAGCTTCGAGGATGGGCTAAAGCTTGTAAAACTC
AGAGGAGAAGCCATGCAGGCGGCTGCGGATGCTGCTAAGAGTGCCATGGTTAGTATCATA
GGATTGGACTCTGAAAAAGTTCAGCAGTTGTGTGATGCAGCAAATCAAGAAGTAGAAGAA
GCTGACAAAGTTCAGATCGCTAACTACTTATGTCCGGGTAATTACGCAGTATCTGGAGGT
CTTAAGGGAATCGAGGTTGTTGAATCCAAAGCTAAGTCATTCAAGGCCCGCATGACGGTT
CGTCTAGCTGTTGCAGGTGCTTTCCACACTAGTTTCATGGAGCCAGCAGTGTCGAGACTA
GAAGCTGCATTGGCAGCAACGGAGATCAGAAGTCCGAGGATCCCAGTGATCTCCAATGTG
GATGCACAGCCTCATGCTGATCCAGACACTATCAAGAAGATACTTGCACGCCAGGTGACA
TCTCCAGTCCAATGGGAGACAACGGTGAAGACTCTCTTATCCAAAGGGCTTAAAAACAGC
TATGAACTGGGACCTGGAAAGGTGATTGCAGGGATATTCAAGAGAGTAGATAAAAGCGCC
AGTGTTGAAAACATCAGTGCTTGAGACACCCCTGCTGGCTTTTTTATTCATGTATTTGAG
TTGAGAATCCCTCTGGTGCTTTGGAATTTAAAGTTTTGTATCGAATATTTATGTAGCCAT
TATCATGATATGTCGTTGAGATATCTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E262TF U 1
AF RR4E262JQ C 330
BS 1 597 RR4E262TF
BS 598 598 RR4E262JQ
BS 599 616 RR4E262TF
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BS 618 687 RR4E262TF
BS 688 1051 RR4E262JQ

RD RR4E262TF 687 0 0
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GAGGCTCAGAGTGTTGCTGCAGCTGCTGACTTGTATACCAAAGCTAACCATATCTTAGGG
TATGATCTTCTGGACATTTGTGTTAATGGACCAAAAGAGAAGCTTGATTCCACTGTCATC
AGCCAGCCTGCTATTTATGTCACAAGTCTAGCAGCAGTTGAGTTACTTCGTGTCCGTGAA
GGCGGGGAGCAGATAATTAACTCCGTTGATGTCACTTGTGGTCTCAGCTTGGGAGAGTAC
ACTGCTCTCGCTTTTGCTGGAGCCTTCAGCTTCGAGGATGGGCTAAAGCTTGTAAAACTC
AGAGGAGAAGCCATGCAGGCGGCTGCGGATGCTGCTAAGAGTGCCATGGTTAGTATCATA
GGATTGGACTCTGAAAAAGTTCAGCAGTTGTGTGATGCAGCAAATCAAGAAGTAGAAGAA
GCTGACAAAGTTCAGATCGCTAACTACTTATGTCCGGGTAATTACGCAGTATCTGGAGGT
CTTAAGGGAATCGAGGTTGTTGAATCCAAAGCTAAGTCATTCAAGGCCCGCATGACG*TT
CGTCTAGCTGTTGCAG*TGCTTTCCACACTAGTTTCATGGAGCCAGCAGTGTCGAGACTA
GAAGCTGCATTGGCAGCAACGGAGATC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4E262JQ 722 0 0
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GTGTGATGCAGCAAATCAAGAAGTAGAAGAAGCTGACAAAGTTCAGATCGCTAACTACTT
ATGTCCGGGTAATTACGCAGTATCTGGAGGTCTTAAGGGAATCGAGGTTGTTGAATCCAA
AGCTAAGTCATTCAAGGCCCGCATGACGGTTCGTCTAGCTGTTGCAGGTGCTTTCCACAC
TAGTTTCATGGAGCCAGCAGTGTCGAGACTAGAAGCTGCATTGGCAGCAACGGAGATCAG
AAGTCCGAGGATCCCAGTGATCTCCAATGTGGATGCACAGCCTCATGCTGATCCAGACAC
TATCAAGAAGATACTTGCACGCCAGGTGACATCTCCAGTCCAATGGGAGACAACGGTGAA
GACTCTCTTATCCAAAGGGCTTAAAAACAGCTATGAACTGGGACCTGGAAAGGTGATTGC
AGGGATATTCAAGAGAGTAGATAAAAGCGCCAGTGTTGAAAACATCAGTGCTTGAGACAC
CCCTGCTGGCTTTTTTATTCATGTATTTGAGTTGAGAATCCCTCTGGTGCTTTGGAATTT
AAAGTTTTGTATCGAATATTTATGTAGCCATTATCATGATATGTCGTTGAGATATCTTTT
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6856Contig1 999 2 6 U
GGGCAAAAAAAAACAAAAAAAACACGCGATAAAAAGCGGGGAAATTCAGTTCACCGACTA
AAGCAAGTCTCCGTTGAAAACCCGATGCAATCTACTCACGGCGACGGCGGCGGTGAAGGA
GGAAGTGGAGAGGCGAGTAGAAGTGGGTTATCTAGGATCCGTTCAGCTCCGGCGACTTGG
ATTGAAACCCTACTCGAGGACGATGAAGAAGAAGACGATTTGAAACCTAACCTCTGTTTG
ACTGAGCTTCTTGCCGGAGTAACGACTCGTGACTCATTTGAGTTCCCGAGCTCCTCCTCC
GTTGAGCAGGGATTGTACAGTCACCAAGGCGGTGGCTTTCACCGTCAAAATAGCACTCCG
GCGGATTTTCTCAGTGGCTCTGGAGCTGGGAGCGATGGGTATTTCTCAAATTTTGGGATT
CCGGCGAATTACGATTACTTGACGCCGAACGTTGACATTGCTGCGGCGAGTAAACGGTCG
AGGGAAATTGAAGCTCACTTCTCTTCTCAGATGAAAGAAGAGCAAATGAGTGGTGGTGTG
TCAGGAATGGTGGATATCAACATGGATAAGTTTCTTGAGGACTCGGTTCCTTGTAGGGTT
CGTGCTAAACGTGGTTGTGCAACTCATCCTCGTAGCATTGCTGAACGGGTGAGGAGAACG
CGAATTAGTGATCGGATCGGGAAGCTGCAAGAACTTGTTCCTAACATGGATAAGCAAACC
AACACTGCAGACATGTTAGAAGAAGCTGTGGAGTATGTGAAAGCTCTTCAAAGCAAGATC
CAGGAGTTGACAGAGCAGCAGAGGAGGTGCATTTGCAAACCTAAGGAAGAACAATAAGGT
TTCCTATAGGATTGATATATAAGTATTTTTTTTTAATCTACAAATGGTGATGATCGGTTC
GAAAATTCGAAACATGATCCTATATGGAACTAGAAAAAATAGATTATATGATGTATGAAT
TTAAGCTGTAAAAGTTTTGTACAATAAGGAGAAAAGTCC


BQ
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AF RR4F988TF U 1
AF RR4F988JQ C 375
BS 1 657 RR4F988TF
BS 658 658 RR4F988JQ
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ATTGAAACCCTACTCGAGGACGATGAAGAAGAAGACGATTTGAAACCTAACCTCTGTTTG
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CCGGCGAATTACGATTACTTGACGCCGAACGTTGACATTGCTGCGGCGAGTAAACGGTCG
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TCAGGAATGGTGGATATCAACATGGATAAGTTTCTTGAGGACTCGGTTCCTTGTAGGGTT
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CGAATTAGTGATCGGATCGGGAAGCTGCAAGAACTTGTTCCTAACATGGATAAGCAAACC
A*CACTGCAGACATGTTAGA

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DS 

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TTGTGCAACTCATCCTCGTAGCATTGCTGAACGGGTGAGGAGAACGCGAATTAGTGATCG
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GTTAGAAGAAGCTGTGGAGTATGTGAAAGCTCTTCAAAGCAAGATCCAGGAGTTGACAGA
GCAGCAGAGGAGGTGCATTTGCAAACCTAAGGAAGAACAATAAGGTTTCCTATAGGATTG
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TGATCCTATATGGAACTAGAAAAAATAGATTATATGATGTATGAATTTAAGCTGTAAAAG
TTTTGTACAATAAGGAGAAAAGTCC

QA 1 625 1 625
DS 



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GCGGTGGTACTGGCTTATGTAGTGGTGATGCCAGTGCCGGGAGTGACCGCGAAGAAGTAT
ACCGTCGGTGACAACAAGTTCTGGAACCCAAACATCAACTACACCATCTGGGCTCAGGGA
AAGCATTTCTACCTCGGTGACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGTAACCAACACAACATT
CTCGAAGTAAACAAAACCGACTACGAAAACTGCAATTCCGACCATCCTCTCGTAAACTGG
ACACGTGGAGCAGGGAGAGACGTTGTCCCTCTCAACGTGACCAAGCACTACTATCTGCTC
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AATTGTTGAAACG


BQ
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AF RR4G918TF U 1
AF RR4G918JQ C 269
BS 1 617 RR4G918TF
BS 618 793 RR4G918JQ

RD RR4G918TF 617 0 0
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AGAGAGAGTGTGTGTCAATAGAGAGAGAGAAAAATGGCGAGATTGACGGTGCTGATTGCT
GCGGTGGTACTGGCTTATGTAGTGGTGATGCCAGTGCCGGGAGTGACCGCGAAGAAGTAT
ACCGTCGGTGACAACAAGTTCTGGAACCCAAACATCAACTACACCATCTGGGCTCAGGGA
AAGCATTTCTACCTCGGTGACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGTAACCAACACAACATT
CTCGAAGTAAACAAAACCGACTACGAAAACTGCAATTCCGACCATCCTCTCGTAAACTGG
ACACGTGGAGCAGGGAGAGACGTTGTCCCTCTCAACGTGACCAAGCACTACTATCTGCTC
GACGGAAAGGGTGGATGTTACGGAGGCATGAAGCTCGCTGTTAAAGTAGAGAAGCTCCCT
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GCTCAGTTCATGATTCCGTTTGCCCTGTTAAGGATGTGGTAAGTGACCAATCTCACAGTT
TTTTTGGATCACATCCA

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DS 

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TGAAGCTCGCTGTTAAAGTAGAGAAGCTCCCTCCTCCACCAAAATCCGCACCTGTCAAGA
ACATTGGATCAGTCTCCGTGGTCACAGGTCTCGCTCAGTTCATGATTCCGTTTGCCCTGT
TAAGGATGTGGTAAGTGACCAATCTCACAGTTTTTTTGGATCACATCCAAATTGCAAAAA
CAAAAACCTAAAATTCTTTTTCAGGGAAATCATTTAAGTTAGAAATGTCCAATCAGTTCA
ATTTTCTTTATTTTTGTAATGTTTTGTTTTGTTTGTGTGTTTGAATTAATTGTCTAAAAG
GGGCTGTACTTGATTTATTTTGCTGAAATATTAATTGTTGAAACG

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

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AGATTTCAACAAAGTGGTTGTCGCCTTGAGAGAGAGAACAGCTGATGGAGGAGATGCAAA
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AAGGCAGCGACTTAGTGAGATATCTTCATGGTTTGGTCCACATTCCCTTAACAATCACAA
CAACAGTAGCTCTGTTGCGGCTTCTCAGGCTACGCCAGAACAATCTTTAGGTGTTGTGAG
CTTTGGGGTCTTGCCTACGGAAAACCGTGCAACTAAATGGGCTGTGGAAGGTACTGGGTT
TCTACTTGCTACCGGTTTACTCACTGTTACTTTGGTCTGGCTCATTGCTCCTCGTGTTGG
AAAGAAAACTGCTAGGAGCGGACTTCATATCCTGCTTGGTGGTCTATGTGCTCTAACAAT
AGTCATCTTCTTCAGATTCGTGGTGCTGACTAGAATCAAGTATGGTCCTGCACGCTACTG
GGGCAATCTTATTCATCTTCTGGTTTCTTGTGTTTGGTATTTGGGGCTTCTCGTTCTTCT
CACGGTGACTCTTGACCCATCTTCACTATCTCTCTCCTCTCCCTCCCCTCTAGAGCTCTC
CTCTATGCTCACTCTTGTAATCTTCTTTTGGAGAAAAAATGTACATTGTGTCATCAAAGA
AAAATAAGCTTATGCTCATTGATTATGATGACTATATATATATATGATTTAC


BQ
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AF RR4B869TF U 1
AF RR4B869JQ C 18
BS 1 698 RR4B869TF
BS 699 699 RR4B869JQ
BS 700 723 RR4B869TF
BS 724 724 RR4B869JQ
BS 725 772 RR4B869TF

RD RR4B869TF 772 0 0
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AGATTTCAACAAAGTGGTTGTCGCCTTGAGAGAGAGAACAGCTGATGGAGGAGATGCAAA
CTCTGTATTACAAGTGAATACAGAATCAACCATAGATGCAGATGAAGCTGGTGCAATTCG
AAGGCAGCGACTTAGTGAGATATCTTCATGGTTTGGTCCACATTCCCTTAACAATCACAA
CAACAGTAGCTCTGTTGCGGCTTCTCAGGCTACGCCAGAACAATCTTTAGGTGTTGTGAG
CTTTGGGGTCTTGCCTACGGAAAACCGTGCAACTAAATGGGCTGTGGAAGGTACTGGGTT
TCTACTTGCTACCGGTTTACTCACTGTTACTTTGGTCTGGCTCATTGCTCCTCGTGTTGG
AAAGAAAACTGCTAGGAGCGGACTTCATATCCTGCTTGGTGGTCTATGTGCTCTAACAAT
AGTCATCTTCTTCAGATTCGTGGTGCTGACTAGAATCAAGTATGGTCCTGCACGCTACTG
GGGCAATCTTATTCATCTTCTGGTTTCTTGTGTTTGGTATTTGGGGCTTCTCGTTCTTCT
CACGGTGACTCTTGACCCATCTTCACTATCTCTCTCCTCTCCCTCCCCTCTAGAGCTCTC
CTCTATGCTCACTCTTGTAATCTTCTTTTGGAGAAAAA*TGTACATTGTGTCATCAAAGA
AAA*TAAGCTTATGCTCATTGATTATGATGACTATATATATATATGATTTAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4B869JQ 755 0 0
TGTGTGAAATCTGTGGGAATGCTGCGTAAAATATAAAAACTGCAGATTTCAACAAAGTGG
TTGTCGCCTTGAGAGAGAGAACAGCTGATGGAGGAGATGCAAACTCTGTATTACAAGTGA
ATACAGAATCAACCATAGATGCAGATGAAGCTGGTGCAATTCGAAGGCAGCGACTTAGTG
AGATATCTTCATGGTTTGGTCCACATTCCCTTAACAATCACAACAACAGTAGCTCTGTTG
CGGCTTCTCAGGCTACGCCAGAACAATCTTTAGGTGTTGTGAGCTTTGGGGTCTTGCCTA
CGGAAAACCGTGCAACTAAATGGGCTGTGGAAGGTACTGGGTTTCTACTTGCTACCGGTT
TACTCACTGTTACTTTGGTCTGGCTCATTGCTCCTCGTGTTGGAAAGAAAACTGCTAGGA
GCGGACTTCATATCCTGCTTGGTGGTCTATGTGCTCTAACAATAGTCATCTTCTTCAGAT
TCGTGGTGCTGACTAGAATCAAGTATGGTCCTGCACGCTACTGGG*CAATCTTATTCATC
TTCTGGTTTCTTGTGTTTGGTATTTGGG*CTTCTCGTTCTTCTCACGGTGACTCTTGACC
CATCTTCACTATCTCTCTCCTCTCCCTCCCCTCTAGAGCTCTCCTCTATGCTCACTCTTG
TAATCTTCTTTTGGAGAAAAAATGTACATTGTGTCATCAAAGAAAAATAAGCTTATGCTC
ATTGATTATGATGACTATATATATATATGATTTAC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6859Contig1 1021 2 2 U
GTTCCCTGCTGGTAAGGGGAGTGTGGGGGCGGAGCTGTGCTCTCTCCTAGGCGTCTAGTT
CAGAGTCGGCTCTGACCTCTTCTTCTTGAGAGCTTTGGAGTCCCTTTTCTCAAAGGCGTT
AGTAGCCTCTAGTAGCTGGCGTGTGTCAGGACTCGGGGTGTTCTTCCGTGAGGTGCTGTT
CCGGAGCGGTGTTGGATACGTCGTCTATGGCGTCTTCAAGGCGATGTTGTGGTCCTCCTT
TCAATCTCTGTTCTTCTTCCCGTCCTTTGGTTGCCGTCAATTGGAGAGTTGTGTCGACTT
GCTCCCGATTGTTTCACTCTTGTGTGTGTTTTTTTCAAAGCTTCTCCTTGCCACAAGATT
AGCTTCTGACGGCTTAGGCTATCTTTGTCCGGTTCTCGGATGAGACGATCGACGAGTGGT
TTGTGTGTCTCTATTTTGTCAGCAGAGTATCTCCTCCCTCGGTGGCTTGATCGGTGGTTG
TGACATTTCCCGACGCCGTGGGCATATTTGTGTTCGCGGTGGTGTCGTTACCCTTTGCTT
TTGCAGGTCTTAGAGTGTTCTTCGGCTTCGTTTGGTTGTGGCTGTCTCGTGCCCATTTTG
TAGTTATCCGCTTGGTCTTGTGAGCCCTTTCGGCTCCATGTTCCGAATGGCTTGGCGTGC
TAGAAGGTGCAGAGGGATTGGAGCGATTTTCACTTGGTATGACTCTAATCTCTTCTTCTA
TTGCGTCGATGTTAAATGGTGGTGAAAGTTATGAGTTCCAAGGAGATCCCTGAGAGCTAG
CTACACTAAAGACGGTATAGGAGTTCCGGGCATCCGAAGCAATGAGGAGAACCTTCACGG
TCCCATAAGCAACGTCAATGGTTGAGAACGGCAAACGGGTCTTAAGAATTTTAAAAACGG
GCTATCGGATTGTGCTTGGTTTAGTGGGTGGGCGAAGGTAGCTTGTAATATTGACTTAGG
AACTTTTGTTCGAGTTGGGCTTGTAACCGGATCCTAAATTCCCGTTTCAACGGGTTGAAA
T


BQ
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10 

AF RR4DP04TF U 1
AF RR4DP04JQ C 334
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BS 663 1021 RR4DP04JQ

RD RR4DP04TF 662 0 0
GTTCCCTGCTGGTAAGGGGAGTGTGGGGGCGGAGCTGTGCTCTCTCCTAGGCGTCTAGTT
CAGAGTCGGCTCTGACCTCTTCTTCTTGAGAGCTTTGGAGTCCCTTTTCTCAAAGGCGTT
AGTAGCCTCTAGTAGCTGGCGTGTGTCAGGACTCGGGGTGTTCTTCCGTGAGGTGCTGTT
CCGGAGCGGTGTTGGATACGTCGTCTATGGCGTCTTCAAGGCGATGTTGTGGTCCTCCTT
TCAATCTCTGTTCTTCTTCCCGTCCTTTGGTTGCCGTCAATTGGAGAGTTGTGTCGACTT
GCTCCCGATTGTTTCACTCTTGTGTGTGTTTTTTTCAAAGCTTCTCCTTGCCACAAGATT
AGCTTCTGACGGCTTAGGCTATCTTTGTCCGGTTCTCGGATGAGACGATCGACGAGTGGT
TTGTGTGTCTCTATTTTGTCAGCAGAGTATCTCCTCCCTCGGTGGCTTGATCGGTGGTTG
TGACATTTCCCGACGCCGTGGGCATATTTGTGTTCGCGGTGGTGTCGTTACCCTTTGCTT
TTGCAGGTCTTAGAGTGTTCTTCGGCTTCGTTTGGTTGTGGCTGTCTCGTGCCCATTTTG
TAGTTATCCGCTTGGTCTTGTGAGCCCTTTCGGCTCCATGTTCCGAATGGCTTGGCGTGC
TA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DP04JQ 688 0 0
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TCTCGGATGAGACGATCGACGAGTGGTTTGTGTGTCTCTATTTTGTCAGCAGAGTATCTC
CTCCCTCGGTGGCTTGATCGGTGGTTGTGACATTTCCCGACGCCGTGGGCATATTTGTGT
TCGCGGTGGTGTCGTTACCCTTTGCTTTTGCAGGTCTTAGAGTGTTCTTCGGCTTCGTTT
GGTTGTGGCTGTCTCGTGCCCATTTTGTAGTTATCCGCTTGGTCTTGTGAGCCCTTTCGG
CTCCATGTTCCGAATGGCTTGGCGTGCTAGAAGGTGCAGAGGGATTGGAGCGATTTTCAC
TTGGTATGACTCTAATCTCTTCTTCTATTGCGTCGATGTTAAATGGTGGTGAAAGTTATG
AGTTCCAAGGAGATCCCTGAGAGCTAGCTACACTAAAGACGGTATAGGAGTTCCGGGCAT
CCGAAGCAATGAGGAGAACCTTCACGGTCCCATAAGCAACGTCAATGGTTGAGAACGGCA
AACGGGTCTTAAGAATTTTAAAAACGGGCTATCGGATTGTGCTTGGTTTAGTGGGTGGGC
GAAGGTAGCTTGTAATATTGACTTAGGAACTTTTGTTCGAGTTGGGCTTGTAACCGGATC
CTAAATTCCCGTTTCAACGGGTTGAAAT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6860Contig1 1129 2 2 U
GGACTGAAACCTGAATCGTTATATTCCACTAAATCCTCAGCGACAATGCGCTCACTTCAC
CTAATCGCCTTCTTCTTCATCATCAGCATCAGTGTTTTTGTTAAAGCTTCGAAAAGCGAT
GACGGGTTTTGTTCAGCGCCTTCGATCACTGAATCAGACGAGGAGAAGCCGAAACCAATT
TACTGGAAAGTCACGAATCCAACACTCTCTCCTTCTCATCTCCAAGACTTGCCGGGTTAT
ACGCGGAGTGTATACAAACGAGATCATGCGTTGATAACACCGGAAAGTCATGTGTACAGC
CCTTTACCTGACTGGACAAACACATCAGGGGCGTATTTGATCACACCAGCAATGGGTTCC
CATTTTGTCATGTACTTTGCCAAAATGAAAGAAATATCAAGTTCAGGTTTACCTCCAAAA
GACATAGAGCGTCTTGTATTCGTGGTCGAGGGTGCTGTGGCACTGACTAACACTTCCTCC
AGTTCCTCAACAAAATTGACGGTTGATTCATATACATACCTACCTCCAAACTTTTATCAT
TCCTCGGACTGTGCAGAGTCTGCAACACTTGTTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCTA
GGGAGTCACACAACAGAGCTTATCGTTGGCTCCACAGACAAGCAACCACTACTTGAGACT
CCCGGTGAAGTTTTTGAGCTGCGGAAACTTCTTCCGGTCTCCCTTGCTTATGACTTCAAC
ATCCATATTATGGATTTTCAGCCTGGAGAGTTTCTCAATGTTAAGGAAGTTCATTATAAC
CAACATGGTTTGTTGCTTCTGGAAGGCCAAGGCATTTATCGCTTGGGTGATAACTGGTAT
CCAGTTCAGGCTGGTGATGTCATATGGATGGCTCCTTTTTGTTCCTCAGTGGTATGCTGC
GCTTGGAAAGACTAGGTCTCGGTATTTGTTGTACAAAGATGTGAATCGCAATCCGTTGTG
AATCAAAGATCCAAATGACTTGATGTGAAGAGTTCTTTGTTCTAGAAGCCAGAATCTTGT
TCTTTTAGCTTTCGGTCATAAAAATGGCCATAAGCCTCATGTGCATTCCATGTATCAGCA
GCTACTTTTGTTTGTATGAAGAAAACTAATTTGAAATGTCAGTTGCCTC


BQ
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AF RR4BW53TF U 1
AF RR4BW53JQ C 360
BS 1 688 RR4BW53TF
BS 689 1129 RR4BW53JQ

RD RR4BW53TF 688 0 0
GGACTGAAACCTGAATCGTTATATTCCACTAAATCCTCAGCGACAATGCGCTCACTTCAC
CTAATCGCCTTCTTCTTCATCATCAGCATCAGTGTTTTTGTTAAAGCTTCGAAAAGCGAT
GACGGGTTTTGTTCAGCGCCTTCGATCACTGAATCAGACGAGGAGAAGCCGAAACCAATT
TACTGGAAAGTCACGAATCCAACACTCTCTCCTTCTCATCTCCAAGACTTGCCGGGTTAT
ACGCGGAGTGTATACAAACGAGATCATGCGTTGATAACACCGGAAAGTCATGTGTACAGC
CCTTTACCTGACTGGACAAACACATCAGGGGCGTATTTGATCACACCAGCAATGGGTTCC
CATTTTGTCATGTACTTTGCCAAAATGAAAGAAATATCAAGTTCAGGTTTACCTCCAAAA
GACATAGAGCGTCTTGTATTCGTGGTCGAGGGTGCTGTGGCACTGACTAACACTTCCTCC
AGTTCCTCAACAAAATTGACGGTTGATTCATATACATACCTACCTCCAAACTTTTATCAT
TCCTCGGACTGTGCAGAGTCTGCAACACTTGTTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCTA
GGGAGTCACACAACAGAGCTTATCGTTGGCTCCACAGACAAGCAACCACTACTTGAGACT
CCCGGTGAAGTTTTTGAGCTGCGGAAAC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4BW53JQ 770 0 0
CCATTTTGTCATGTACTTTGCCAAAATGAAAGAAATATCAAGTTCAGGTTTACCTCCAAA
AGACATAGAGCGTCTTGTATTCGTGGTCGAGGGTGCTGTGGCACTGACTAACACTTCCTC
CAGTTCCTCAACAAAATTGACGGTTGATTCATATACATACCTACCTCCAAACTTTTATCA
TTCCTCGGACTGTGCAGAGTCTGCAACACTTGTTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCT
AGGGAGTCACACAACAGAGCTTATCGTTGGCTCCACAGACAAGCAACCACTACTTGAGAC
TCCCGGTGAAGTTTTTGAGCTGCGGAAACTTCTTCCGGTCTCCCTTGCTTATGACTTCAA
CATCCATATTATGGATTTTCAGCCTGGAGAGTTTCTCAATGTTAAGGAAGTTCATTATAA
CCAACATGGTTTGTTGCTTCTGGAAGGCCAAGGCATTTATCGCTTGGGTGATAACTGGTA
TCCAGTTCAGGCTGGTGATGTCATATGGATGGCTCCTTTTTGTTCCTCAGTGGTATGCTG
CGCTTGGAAAGACTAGGTCTCGGTATTTGTTGTACAAAGATGTGAATCGCAATCCGTTGT
GAATCAAAGATCCAAATGACTTGATGTGAAGAGTTCTTTGTTCTAGAAGCCAGAATCTTG
TTCTTTTAGCTTTCGGTCATAAAAATGGCCATAAGCCTCATGTGCATTCCATGTATCAGC
AGCTACTTTTGTTTGTATGAAGAAAACTAATTTGAAATGTCAGTTGCCTC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL6861Contig1 819 2 10 U
TGATAGGCTGGCAGGGTTTTACCGTGGCACACAAGTTCTTTTGAGGTCAATACTTGCGGA
GAAACCGGAGCTTTCTTTCTCCGTTGTTTCGCTGTTGTGGCACAAACTGATTGCTTCTCC
TGAAATCCAGCCCACCGCTGAAAGCACCTCTGCTCAACAAGGATGGAGACAGGTGGTTGA
TGCACTATGCAATGTTGTATCTGCAACGCCAGCAAAAGCAGCTGCAGCAGTTGTTCTTCA
GGCTGAGAGAGAGTTGCAGCCTTGGATAGTCAAAGATGATGAAGAAGGTCAGAAAATGTG
GAAAATCAACCAAAGGATAGTGAAAGTGATGGTGGAACTCATGAGAAATCATGACAGGCC
TGAGTCACTGGTGATCCTGGCAAGTGCATCGGATCTTCTTCTCAGGGCAACTGATGGAAT
GCTTGTTGATGGAGAAGCTTGTACTTTTACCTCAACTTTGAGCTACTTGAAGCAACGGCA
AGAGCAATACAGCCAGTGTTAGCTTTGGGGGCCATCTGGACTAGCAGTATTTTGACGGTT
TATCCAATCTATTGAAGTGTCGTCTGCCGGCAACAATACGGTGCCTATCACACCCAAGTG
CACACGTACGTGCCTTGAGCACATCAGTACTACGAGACATCATGAACCAAAGCGCTATAA
CCACCACCACCACCAAGGCAACTCCAAAACCACCACCGCCAACAATAACAACAGAGAAGA
ATGGAACGGACAGCCCGTCGTACAGTTCTTCAACGCGGGGGCAATAGACTGGAAGCAGAC
ATACAAAGTGTTTGAACTGGGAAGCTCACAGCTTGCTGT


BQ
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AF RR4A270TFB U 1
AF RR4A270TF U 395
BS 1 447 RR4A270TFB
BS 448 448 RR4A270TF
BS 449 458 RR4A270TFB
BS 459 459 RR4A270TF
BS 460 505 RR4A270TFB
BS 506 506 RR4A270TF
BS 507 532 RR4A270TFB
BS 533 533 RR4A270TF
BS 534 741 RR4A270TFB
BS 742 819 RR4A270TF

RD RR4A270TFB 741 0 0
TGATAGGCTGGCAGGGTTTTACCGTGGCACACAAGTTCTTTTGAGGTCAATACTTGCGGA
GAAACCGGAGCTTTCTTTCTCCGTTGTTTCGCTGTTGTGGCACAAACTGATTGCTTCTCC
TGAAATCCAGCCCACCGCTGAAAGCACCTCTGCTCAACAAGGATGGAGACAGGTGGTTGA
TGCACTATGCAATGTTGTATCTGCAACGCCAGCAAAAGCAGCTGCAGCAGTTGTTCTTCA
GGCTGAGAGAGAGTTGCAGCCTTGGATAGTCAAAGATGATGAAGAAGGTCAGAAAATGTG
GAAAATCAACCAAAGGATAGTGAAAGTGATGGTGGAACTCATGAGAAATCATGACAGGCC
TGAGTCACTGGTGATCCTGGCAAGTGCATCGGATCTTCTTCTCAGGGCAACTGATGGAAT
GCTTGTTGATGGAGAAGCTTGTACTTT*ACCTCAACTT*GAGCTACTTGAAGCAACGGCA
AGAGCAATACAGCCAGTGTTAGCTT*GGGGGCCATCTGGACTAGCAGTATTT*GACGGTT
TATCCAATCTATTGAAGTGTCGTCTGCCGGCAACAATACGGTGCCTATCACACCCAAGTG
CACACGTACGTGCCTTGAGCACATCAGTACTACGAGACATCATGAACCAAAGCGCTATAA
CCACCACCACCACCAAGGCAACTCCAAAACCACCACCGCCAACAATAACAACAGAGAAGA
ATGGAACGGACAGCCCGTCGT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4A270TF 425 0 0
CTTCTTCTCAGGGCAACTGATGGAATGCTTGTTGATGGAGAAGCTTGTACTTTTACCTCA
ACTTTGAGCTACTTGAAGCAACGGCAAGAGCAATACAGCCAGTGTTAGCTTTGGGGGCCA
TCTGGACTAGCAGTATTTTGACGGTTTATCCAATCTATTGAAGTGTCGTCTGCCGGCAAC
AATACGGTGCCTATCACACCCAAGTGCACACGTACGTGCCTTGAGCACATCAGTACTACG
AGACATCATGAACCAAAGCGCTATAACCACCACCACCACCAAGGCAACTCCAAAACCACC
ACCGCCAACAATAACAACAGAGAAGAATGGAACGGACAGCCCGTCGTACAGTTCTTCAAC
GCGGGGGCAATAGACTGGAAGCAGACATACAAAGTGTTTGAACTGGGAAGCTCACAGCTT
GCTGT

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 2

CO CL6862Contig1 1469 2 6 U
GGACAAAGAAATGACGCTCCTCAAGTTCGTTGATTCGAAGATGGGACCTATTGGTAGCTT
TAACTGGTTTGCAACTCATGGGACTTCCATGAGCAGGACTAACTCTTTGATTAGTGGTGA
TAACAAAGGCGCAGCTGCGCGTTTCATGGAGGACTGGTTTGAGAATGGACAGAAGATCCC
TCGCCGAGTATCAACCATTGTCTCTGATCTTAGACAAAACCACAGTAGGCTTTTGGATAT
TGCAGCGTCTTATAAGTCATCTAGAGGGCAAGATTTTGATGCTCAAAAAGTCCGAGTAAG
AAAGGCGTCATTCGTCTCTGCCTTCTGTCAATCAAACTGCGGTGACGTGAGTCCAAACGT
TCTTGGTACGTTTTGCATCGACACCGGACTGCCTTGTGATTTCAATCACAGTACATGCAA
TGGAAAGAACGAACTGTGCTATGGCCGTGGCCCTGGTTACCCTGATGAGTTTGAGAGCAC
ACGTATCATTGGAGAAAGGCAGTTCAAAATGGCGGTGGGACTATTCAACAAAGCTACTGA
GAAGTTAGAGGGGAAGATTGGTTACCAGCATGCTTATGTGGATTTCTCGAACCTTGAAGT
CACAGTTCCTAAAGCAGATGGTGGGGGGATCTGAGACGGTGAAGACATGTCCAGCTGCAA
TGGGGGTTTGGTTTTGCTGCTGGAACAACTGATGGTCCTGGTGCTTTTGATTTCAAACAA
GGAGATGATAAGGGTAATGCCTTTTGGAGGTTAGTGAGGAACGTGTTAACAACTCCTGGT
CCGGATCAGGTCCAATGCCAAAAACCAAAACCTATTTTACTTGACACTGGTGAGATGAAG
ACACCATATGACTGGGCGCCTTCGATTCTTCCAGTTCAGATGTTTCACATTGGCCAACTA
GTCATCCTCAGTGTCCCTGGAGAGTTCACCACAATGGCTGGAAGGCGTCTCCGTGATGCT
GTGAAGTCTTTTCTCATCTCTTTGGACAGCAAACAGTTTAGCAACAACCTCCATGTGGTA
ATCGCTGGTCTCACCAACACGTATTCTCAGTACATTACCACTTTCGAGGAGTCGAGGTTC
AAAGATATGAGGGAGCTTCAACGCTATACGGCCCACACACACTCAATGCTTATATCCAAG
AGTTCAAGAAACTAGCCACAGCTTTGGTCAACGGTCAAACACTCCCGCGTGGGCCCTTAC
CACCAGACCTTTTGGACAACCAGATCAGTTTACTTTCCCCTGTGGTCGTAGACTCCACTC
CTTTAGGAGTCAGCTTTGGATATGTTAAAGCCGACGTGCCTCCCAAGTCAACGTTCGTGA
AAGGCCAACAAGTCAACGCCACGTTTTGGTCGGGGATGTCCAAGAAACGACCTGATGACG
GAAAGATCTTTCGCTGTTGTGGAGACGCTGCGTGGAGAGAAATGGGTGCCAGTGTATGAT
GACGATGACTTCAGTGTGAGTTTAGTGTC


BQ
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AF RR4AI28TF U 1
AF RR4CP41TF U 756
BS 1 803 RR4AI28TF
BS 804 804 RR4CP41TF
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BS 840 855 RR4AI28TF
BS 856 1469 RR4CP41TF

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TAACTGGTTTGCAACTCATGGGACTTCCATGAGCAGGACTAACTCTTTGATTAGTGGTGA
TAACAAAGGCGCAGCTGCGCGTTTCATGGAGGACTGGTTTGAGAATGGACAGAAGATCCC
TCGCCGAGTATCAACCATTGTCTCTGATCTTAGACAAAACCACAGTAGGCTTTTGGATAT
TGCAGCGTCTTATAAGTCATCTAGAGGGCAAGATTTTGATGCTCAAAAAGTCCGAGTAAG
AAAGGCGTCATTCGTCTCTGCCTTCTGTCAATCAAACTGCGGTGACGTGAGTCCAAACGT
TCTTGGTACGTTTTGCATCGACACCGGACTGCCTTGTGATTTCAATCACAGTACATGCAA
TGGAAAGAACGAACTGTGCTATGGCCGTGGCCCTGGTTACCCTGATGAGTTTGAGAGCAC
ACGTATCATTGGAGAAAGGCAGTTCAAAATGGCGGTGGGACTATTCAACAAAGCTACTGA
GAAGTTAGAGGGGAAGATTGGTTACCAGCATGCTTATGTGGATTTCTCGAACCTTGAAGT
CACAGTTCCTAAAGCAGATGGTGGGGGGATCTGAGACGGTGAAGACATGTCCAGCTGCAA
TGGGGGTTTGGTTTTGCTGCTGGAACAACTGATGGTCCTGGTGCTTTTGATTTCAAACAA
GGAGATGATAAGGGTAATGCCTTTTGGAGGTTAGTGAGGAACGTGTTAACAACTCCTGGT
CCGGATCAGGTCCAATGCCAAAA*CCAAAACCTATTTTACTTGACACTGGTGAGATGA*G
ACACCATATGACTGG

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4CP41TF 714 0 0
GAGGAACGTGTTAACAACTCCTGGTCCGGATCAGGTCCAATGCCAAAAACCAAAACCTAT
TTTACTTGACACTGGTGAGATGAAGACACCATATGACTGGGCGCCTTCGATTCTTCCAGT
TCAGATGTTTCACATTGGCCAACTAGTCATCCTCAGTGTCCCTGGAGAGTTCACCACAAT
GGCTGGAAGGCGTCTCCGTGATGCTGTGAAGTCTTTTCTCATCTCTTTGGACAGCAAACA
GTTTAGCAACAACCTCCATGTGGTAATCGCTGGTCTCACCAACACGTATTCTCAGTACAT
TACCACTTTCGAGGAGTCGAGGTTCAAAGATATGAGGGAGCTTCAACGCTATACGGCCCA
CACACACTCAATGCTTATATCCAAGAGTTCAAGAAACTAGCCACAGCTTTGGTCAACGGT
CAAACACTCCCGCGTGGGCCCTTACCACCAGACCTTTTGGACAACCAGATCAGTTTACTT
TCCCCTGTGGTCGTAGACTCCACTCCTTTAGGAGTCAGCTTTGGATATGTTAAAGCCGAC
GTGCCTCCCAAGTCAACGTTCGTGAAAGGCCAACAAGTCAACGCCACGTTTTGGTCGGGG
ATGTCCAAGAAACGACCTGATGACGGAAAGATCTTTCGCTGTTGTGGAGACGCTGCGTGG
AGAGAAATGGGTGCCAGTGTATGATGACGATGACTTCAGTGTGAGTTTAGTGTC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6863Contig1 1034 2 2 U
TCTTATGGGCTATGCTCGTTGGAGTAGTCGCCATGGCCAGGGAACATCGTCTCTTTGAGC
GGACTAAAGGCATCAATGGTCTAGAAAAGATCATCATCCGCGATCGTCAAGGCAGATCTT
TCGAGGTTTACTTATATGGAGGTCAAGTGACTTCTTGGAAGAATGAGAAAGGAGAGGAGT
TACTTTTCATGAGTAGCAAGGCTATATTCAAGCCTCCAAGAGCGATCCGTGGAGGCATTC
CAGTATTGTTTCCACAATATAGTAACACAGGTCCGCTTCCCTCACATGGATTTGTTAGAA
ATAGGTTTTGGAAAATTGAGGCTCATCCTATTCCTGTACCATCGTCACATCATTCTTCTA
GTGCTCTCGTTGACCTCATCATAAGATCATCCCAAGATGATTTGAAGATCTGGCCTCATA
AGTTTATATATCGACTAAGAGTAGCATTGGGGCATAGAGGAGATTTGACGTTGACATCGC
GTGTTACGAACACTGATGTAAAACCGTTTAACTTCACATTTGCTCTTCACCCCTATTTCT
CTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCATGGTTTGAATTATCTTGACC
AACAAAAGAACAGAACACGTTTCATTGGTCATGACAAAGCTATAACTTTTAATTCCCAGC
TTGACAGGCTTTACCTAAACACTCCAAATAAAATCAGAATCGTGGACCACAAGAAAAGGA
AGACAATCGTGGTACACAAGGAAGGACAAATTGATGCTGTGGTGTGGAATCCATGGGAAA
AGAAAGTGTCCGACTTGGAAGTTGAAGATTACAGGCGTTTTGTTGCCGTGGAAAGCGCTG
CTGTCCATAAACCTATCATACTGGAACCTGGAAAAGAATGGAAAGGAATACTCCAAGTGT
CTGTGGTTCCTTCGAGTTGAAAGCTTGACATTTATGCGCTAGTTTTCTGCAAATAACTTA
ATTACTGTTTAACGATTTCTTTTTGAACATTGGTATTTTGTAACACTGTAGTAACTTAAT
AGAAGGACCTATGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV54TF U 1
AF RR4BV54JQ C 273
BS 1 606 RR4BV54TF
BS 607 1034 RR4BV54JQ

RD RR4BV54TF 611 0 0
TCTTATGGGCTATGCTCGTTGGAGTAGTCGCCATGGCCAGGGAACATCGTCTCTTTGAGC
GGACTAAAGGCATCAATGGTCTAGAAAAGATCATCATCCGCGATCGTCAAGGCAGATCTT
TCGAGGTTTACTTATATGGAGGTCAAGTGACTTCTTGGAAGAATGAGAAAGGAGAGGAGT
TACTTTTCATGAGTAGCAAGGCTATATTCAAGCCTCCAAGAGCGATCCGTGGAGGCATTC
CAGTATTGTTTCCACAATATAGTAACACAGGTCCGCTTCCCTCACATGGATTTGTTAGAA
ATAGGTTTTGGAAAATTGAGGCTCATCCTATTCCTGTACCATCGTCACATCATTCTTCTA
GTGCTCTCGTTGACCTCATCATAAGATCATCCCAAGATGATTTGAAGATCTGGCCTCATA
AGTTTATATATCGACTAAGAGTAGCATTGGGGCATAGAGGAGATTTGACGTTGACATCGC
GTGTTACGAACACTGATGTAAAACCGTTTAACTTCACATTTGCTCTTCACCCCTATTTCT
CTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCATGGTTTGAATTATCTTGACC
AACAAA
GACAG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4BV54JQ 762 0 0
CCGCTTCCCTCACATGGATTTGTTAGAAATAGGTTTTGGAAAAT*GAGGCTCATCCTATT
CCTGTACCATCGTCACATCATTCTTCTAGTGCTCTCGTTGACCTCATCATAAGATCATCC
CAAGATGATTTGAAGATCTGGCCTCATAAGTTTATATATCGACTAAGAGTAGCATTGGGG
CATAGAGGAGATTTGACGTTGACATCGCGTGTTACGAACACTGATGTAAAACCGTTTAAC
TTCACATTTGCTCTTCACCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAA
GGATTGCATGGTTTGAATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCATTGGTCAT
GACAAAGCTATAACTTTTAATTCCCAGCTTGACAGGCTTTACCTAAACACTCCAAATAAA
ATCAGAATCGTGGACCACAAGAAAAGGAAGACAATCGTGGTACACAAGGAAGGACAAATT
GATGCTGTGGTGTGGAATCCATGGGAAAAGAAAGTGTCCGACTTGGAAGTTGAAGATTAC
AGGCGTTTTGTTGCCGTGGAAAGCGCTGCTGTCCATAAACCTATCATACTGGAACCTGGA
AAAGAATGGAAAGGAATACTCCAAGTGTCTGTGGTTCCTTCGAGTTGAAAGCTTGACATT
TATGCGCTAGTTTTCTGCAAATAACTTAATTACTGTTTAACGATTTCTTTTTGAACATTG
GTATTTTGTAACACTGTAGTAACTTAATAGAAGGACCTATGT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6864Contig1 351 2 2 U
CCCAGACAATAACAACGGTTTTTGCAAGCAAATGTTAATGACCATCATATGTAGCAAAGT
AGCATAAACACACAAAAAAGTTACTAGCATCCAAAAAAACAAACAAAACCAAGAAAAAAA
GAACCATAAATATGCCAAAGTTTATGAAATGTTTGATGCTTTTTCTGTTTTCATATGAGT
CTCTTCTCTTTTTGGTTTTATGCCTTACCTTTCACTCTCTCTCTCTTTTTTGATTCCCCT
TCATTATTGTCTTTCCTGATTCCGTGCAGGACAAAATAATGTATTTCATGTCCAACACTA
ATCAGCAGCTCCAAACATGACGGTTCAACGGTTTACACCGTCGGATTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AR70TF C 1
AF RR4AR70JQ U 20
BS 1 19 RR4AR70TF
BS 20 351 RR4AR70JQ

RD RR4AR70TF 351 0 0
CCCAGACAATAACAACGGTTTTTGCAAGCAAATGTTAATGACCATCATATGTAGCAAAGT
AGCATAAACACACAAAAAAGTTACTAGCATCCAAAAAAACAAACAAAACCAAGAAGAAAA
GAACCATAAATATGCCAAAGTTTATGAAATGTTTGATGCTTTTTCTGTTTTCATATGAGT
CTCTTCTCTTTTTGGTTTTATGCCTTACCTTTCACTCTCTCTCTCTTTTTTGATTCCCCT
TCATTATTGTCTTTCCTGATTCCGTGCAGGACAAAATAATGTATTTCATGTCCAACACTA
ATCAGCAGCTCCAAACATGACGGTTCAACGGTTTACACCGTCGGATTGATC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR4AR70JQ 332 0 0
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GTTACTAGCATCCAAAAAAACAAACAAAACCAAGAAAAAAAGAACCATAAATATGCCAAA
GTTTATGAAATGTTTGATGCTTTTTCTGTTTTCATATGAGTCTCTTCTCTTTTTGGTTTT
ATGCCTTACCTTTCACTCTCTCTCTCTTTTTTGATTCCCCTTCATTATTGTCTTTCCTGA
TTCCGTGCAGGACAAAATAATGTATTTCATGTCCAACACTAATCAGCAGCTCCAAACATG
ACGGTTCAACGGTTTACACCGTCGGATTGATC

QA 1 332 1 332
DS 



AS 1 2

CO CL6865Contig1 688 2 7 U
CTGTTGTACCGTTCACGCTTGACCGTGACTTGTGTTTCCGCGTAAGTAGCGTTGCTATTG
GTCTGAACTTTTGTCTTCCAGTCGAGATAGCTAAGATTCGTTGGTCGGCGTCCTCCTCCA
GCGGAGCTCCGGGGTGTAAGCCAGACGCTTCCGTTGATGCCTGCTCGGAGTCACTTCGAT
AGTGAGGCGGGTTGATTTGAAACGTTCGTTGGCAGTTACCTTAACCACCGGTTTGGTTCT
TATGAGTTTGATCGCTGCAGTGAGGATGTTTCAGCTTGTGACCTACACTGTTGCCTATTT
CCAATGTAAGAGCCTCCAAGGCAAGGACGTTGAGTCGCTGAGGGATGTTGAATATACGAA
ACTAACCTCCACTGCGCTCATAGGAGCATTGCCTTGAAGTATTTGAATACAAGTATAAAT
ATATATGGTATAGTCTCGTGATTAAACTATACCTCTCATGAATCTTATTTTTTTTCTTCA
AAGTCTCGTGAATGGAATGTTTGTTTGCTTTGGGAATTGGTAAGATGTATATATTATCGA
TAATCAAGTGTTTGGTTGAATATCTGAGCAAATATTTGTGGGATATTTAAGTGATTTTTT
TCAACCATTAAAGTGAAGAAGTTTAGATGAACAATTGTAATTGTTTGTAATTATAACCAT
TAATGATGAACAATTGTAATTTTTGGTT


BQ
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AF RR4BP94TF U 255
AF RR4BP94JQ C 1
BS 1 254 RR4BP94JQ
BS 255 515 RR4BP94TF
BS 516 516 RR4BP94JQ
BS 517 559 RR4BP94TF
BS 560 560 RR4BP94JQ
BS 561 595 RR4BP94TF
BS 596 688 RR4BP94JQ

RD RR4BP94TF 341 0 0
CTGCAGTGAGGATGTTTCAGCTTGTGACCTACACTGTTGCCTATTTCCAATGTAAGAGCC
TCCAAGGCAAGGACGTTGAGTCGCTGAGGGATGTTGAATATACGAAACTAACCTCCACTG
CGCTCATAGGAGCATTGCCTTGAAGTATTTGAATACAAGTATAAATATATATGGTATAGT
CTCGTGATTAAACTATACCTCTCATGAATCTTATTTTTTTTCTTCAAAGTCTCGTGAATG
GAATGTTTGTTTGCTTTGGGATTTGGTAAGATGTATATATTATCGATAATCAAGTGTTTG
GTTGA*TATCTGAGCAAATATTTGTGGGATATTTAAGTGAT

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR4BP94JQ 688 0 0
CTGTTGTACCGTTCACGCTTGACCGTGACTTGTGTTTCCGCGTAAGTAGCGTTGCTATTG
GTCTGAACTTTTGTCTTCCAGTCGAGATAGCTAAGATTCGTTGGTCGGCGTCCTCCTCCA
GCGGAGCTCCGGGGTGTAAGCCAGACGCTTCCGTTGATGCCTGCTCGGAGTCACTTCGAT
AGTGAGGCGGGTTGATTTGAAACGTTCGTTGGCAGTTACCTTAACCACCGGTTTGGTTCT
TATGAGTTTGATCGCTGCAGTGAGGATGTTTCAGCTTGTGACCTACACTGTTGCCTATTT
CCAATGTAAGAGCCTCCAAGGCAAGGACGTTGAGTCGCTGAGGGATGTTGAATATACGAA
ACTAACCTCCACTGCGCTCATAGGAGCATTGCCTTGAAGTATTTGAATACAAGTATAAAT
ATATATGGTATAGTCTCGTGATTAAACTATACCTCTCATGAATCTTATTTTTTTTCTTCA
AAGTCTCGTGAATGGAATGTTTGTTTGCTTTGGGAATTGGTAAGATGTATATATTATCGA
TAATCAAGTGTTTGGTTGAATATCTGAGCAAATATTTGTTGGATATTTAAGTGATTTTTT
TCAACCATTAAAGTGAAGAAGTTTAGATGAACAATTGTAATTGTTTGTAATTATAACCAT
TAATGATGAACAATTGTAATTTTTGGTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6866Contig1 404 2 1 U
GGAACCATAAAGTTGCCTGAATCTTCTTCTTGACTCTAGTTCGACGCAGAGAGAACTCTC
AGGTAAAGAAGAGTCTTTGAGTTGAATCTTTTCTAACTTTCTGATATTGTGACAAAGGAA
TCAATATGGGACTAAAAGCTGGAACGTTGGCTATTTTCTTGCTGGGTTTGGCCTTGCTTT
CTGACGCCAAACCTTTCCTTCACTCTTCCCTCTTCCCTCGTCTCAAGTACGAATACTAAG
ACCAAAATATCGGTAAAAATATGGAATAGGATTGGAAATGCTCTCCGGACCGGCACTGAA
TATTAGGTTTATGTCTTCACAACATCATGTAGTGATTGCTCAATTTTCTTTTTGATCAAA
TATGAATACAAGTTTATAGTTTATAATATCATATTGCTTTGCAC


BQ
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AF RR4G242JQ C 1
AF RR4G242TF U 1
BS 1 404 RR4G242TF

RD RR4G242JQ 404 0 0
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TATGAATACAAGTTTATAGTTTATAATATCATATTGCTTTGCAC

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4G242TF 404 0 0
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AGGTAAAGAAGAGTCTTTGAGTTGAATCTTTTCTAACTTTCTGATATTGTGACAAAGGAA
TCAATATGGGACTAAAAGCTGGAACGTTGGCTATTTTCTTGCTGGGTTTGGCCTTGCTTT
CTGACGCCAAACCTTTCCTTCACTCTTCCCTCTTCCCTCGTCTCAAGTACGAATACTAAG
ACCAAAATATCGGTAAAAATATGGAATAGGATTGGAAATGCTCTCCGGACCGGCACTGAA
TATTAGGTTTATGTCTTCACAACATCATGTAGTGATTGCTCAATTTTCTTTTTGATCAAA
TATGAATACAAGTTTATAGTTTATAATATCATATTGCTTTGCAC

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL6867Contig1 759 2 2 U
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CCACTTGTTAGAGATGATCGTTCTTCAAAGAATAATAAGAAGTGTAGAAACGAAGGAGAG
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CAAAAGATGGAGAAGAAGCTAAAGGAGATACTGAGGAGCCAATGCTGCATAGTGAAGAAG
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BQ
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AF RR4E662TF U 1
AF RR4E662JQ C 481
BS 1 648 RR4E662TF
BS 649 759 RR4E662JQ

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QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4E662JQ 279 0 0
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QA 1 279 1 279
DS 



AS 1 2

CO CL6868Contig1 1092 2 2 U
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CCTTGTCTGATGTGATGGATTACCATCTTGATGAGGTGGTTCACTCTCAGGACTTGGTTC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ35TF U 1
AF RR4DJ35JQ C 279
BS 1 614 RR4DJ35TF
BS 615 1092 RR4DJ35JQ

RD RR4DJ35TF 614 0 0
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CTATGATTGAATGTCTGCATCCTGGTTTTAACCATCCCAATGGAATCAAAACCAAGATTG
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TTCCAGTAGAGGAAGTTCACAAGATATCTGTCCTGGATATTAGACTGGCCAACGCTGATA
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CAGAGGAAGATATC

QA 1 614 1 614
DS 

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CCAATGGATC
AAACCAAGATTGGATCACTTCAGATGTTTACCGAGAATGATGGCAGCTGTGAGGATATGG
GTCCAGCTTCATTTCCAGTAGAGGAAGTTCACAAGATATCTGTCCTGGATATTAGACTGG
CCAACGCTGATAGGCATGGTGGAAACATTTTAATGAGAAAGGACGAGAACGGAAAGATTG
TTCTGATTCCAATTGATCATGGATACAGCTTGCCTGAAAGCTTTGAGGATTGCACGTTCG
AGTGGCTTTATTGGTCGCAAGCTCGGAAACCATACTCTTCCGAGACACTGGACTACATAA
GATCACTGGACGCAGAGGAAGATATCAGCCTCCTAAAGTTCCATGGATGGAAGATGCCAT
TGGAAACGGCTAGAACACTCAGAATCTCAACGATGCTACTGAAGAAAGGAGCAGAGAGAG
GATTGACAGCATTTGAGATTGGAAACATGATGTGCAGAGAAACTCTGACCAAGAAATGTC
TAGTGGAGGAGATGGTAGAGGAAGCTCAAGAAGCGGTGCTTCCAGGGACGAGCGAGGCTG
CATTCATGGAAGCCTTGTCTGATGTGATGGATTACCATCTTGATGAGGTGGTTCACTCTC
AGGACTTGGTTCATGTGTGAATCGAATCCTTCTCTTAACTCGAAACTGTGGTACATATAC
TCTTTGGTTTGTCTCTATATGAATCTCTGGTGGCTTTTGTTAATTTCTGTCATTCTTTGG
ACATGTGCAATTTGTTTTTGTTGATTTCACTGTGACATATTTCCTGTTTTAAGACTATTC
CAGTGTTTACAGTAGCTTTCTGTT

QA 11 814 11 814
DS 



AS 1 2

CO CL6869Contig1 1103 2 2 U
GGAACCTTGAGCCACACAGTTCGTTTTAGTTTATCTTGGCTTTCAGGTTCTACTTCACCT
CTCTCTGCAATCTGCAGGAATCTGACACAAAGGTTTCATCCTTATCGATTTTCATTAGAA
ATTAAGATCAAAGTTTCGAACTTTACGCTTCTGGGTAGTTAAGTATGCGTCTTTGAACGT
TACCACTCTGTTTATGGAATGCTTTAGTGTATAGTTTGTTTCAGACGTGGCACTCTGCTA
GAGATAGATTTGATTTTTTCATGTATTAGATGGTGGATCGCTGTGTGATCAAAATTGCTT
GAAGAAATGGTTTTTGCGGTTTGTGTTGGTAGTAGCACTGTTGATATGAAGAAGCTGCGT
ATAGCTATCTCCCGCAGCGATGTTGTTGTCTCTGTGTTCTGCAAACCTCATCACGCGCTT
CTTGTTGAAGAGGGCACTAGTGCGAATAATGATGATGATGTTCCTGTTTTGTCTTCTTCC
TCTTTGTATCCTTCAGACTTGGGGAGACAAAACAAGGGTGAGGGTTCTCTTGGAGATATG
CTTCAGGACATGTTGCCTCTCACTCCTTCGAATGGTCAGCTTGTTGGGTTTGGTCGTGCT
TATTCTGATTATGGTTTGACCGCTTCTATCCACGATCTAATGGTTTTACCTTCACTACAT
GGATGGGGATTGGTAAACTGATTGTTAACAGGATCACCAGGCTTCTCACAAGTAGAGACA
TCTATGACATAGCCGCTCTTTGCTTCGAGCATGAAAGATGACAGAATGGGTTCCACAACG
ATGATGTTCACTAAAGAGCTTGGAGGCCTAATTTGAAGTGAGAAGAAGGACGTTGGATCT
TTTGCAACTTACCTGCAGGTCAAAGCAAGTTGAATGATCTTTAGACAAAAATCTTTTATG
AATCTCTTTCTTTGCGATGATCAGAGAAAGAAAAGCCAAAGATTCAGTGTCTTTTTTTTT
TGCATTTGGATTTGATGTCTCGTGACAACTCTTTTTCACTTCTATCTTGTCGTGTAAAAA
GCAACGAATATTGGTATACTATTACTCTGTTTCGAGTGGTAGAAATGTTTTATATCAAAA
ATTGAATACAAACTATTTTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D251TF U 1
AF RR4D251JQ C 361
BS 1 691 RR4D251TF
BS 692 1103 RR4D251JQ

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TACCACTCTGTTTATGGAATGCTTTAGTGTATAGTTTGTTTCAGACGTGGCACTCTGCTA
GAGATAGATTTGATTTTTTCATGTATTAGATGGTGGATCGCTGTGTGATCAAAATTGCTT
GAAGAAATGGTTTTTGCGGTTTGTGTTGGTAGTAGCACTGTTGATATGAAGAAGCTGCGT
ATAGCTATCTCCCGCAGCGATGTTGTTGTCTCTGTGTTCTGCAAACCTCATCACGCGCTT
CTTGTTGAAGAGGGCACTAGTGCGAATAATGATGATGATGTTCCTGTTTTGTCTTCTTCC
TCTTTGTATCCTTCAGACTTGGGGAGACAAAACAAGGGTGAGGGTTCTCTTGGAGATATG
CTTCAGGACATGTTGCCTCTCACTCCTTCGAATGGTCAGCTTGTTGGGTTTGGTCGTGCT
TATTCTGATTATGGTTTGACCGCTTCTATCCACGATCTAATGGTTTTACCTTCACTACAT
GGATGGGGATTGGTAAACTGATTGTTAACAG
ATCA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4D251JQ 743 0 0
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CTTGTTGAAGAGGGCACTAGTGCGAATAATGATGATGATGTTCCTGTTTTGTCTTCTTCC
TCTTTGTATCCTTCAGACTTGGGGAGACAAAACAAGGGTGAGGGTTCTCTTGGAGATATG
CTTCAGGACATGTTGCCTCTCACTCCTTCGAATGGTCAGCTTGTTGGGTTTGGTCGTGCT
TATTCTGATTATGGTTTGACCGCTTCTATCCACGATCTAATGGTTTTACCTTCACTACAT
GGATGGGGATTGGTAAACTGATTGTTAACAGGATCACCAGGCTTCTCACAAGTAGAGACA
TCTATGACATAGCCGCTCTTTGCTTCGAGCATGAAAGATGACAGAATGGGTTCCACAACG
ATGATGTTCACTAAAGAGCTTGGAGGCCTAATTTGAAGTGAGAAGAAGGACGTTGGATCT
TTTGCAACTTACCTGCAGGTCAAAGCAAGTTGAATGATCTTTAGACAAAAATCTTTTATG
AATCTCTTTCTTTGCGATGATCAGAGAAAGAAAAGCCAAAGATTCAGTGTCTTTTTTTTT
TGCATTTGGATTTGATGTCTCGTGACAACTCTTTTTCACTTCTATCTTGTCGTGTAAAAA
GCAACGAATATTGGTATACTATTACTCTGTTTCGAGTGGTAGAAATGTTTTATATCAAAA
ATTGAATACAAACTATTTTGGTG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL6870Contig1 951 2 2 U
GGTATATATTGTAAATAATATATGGAATAAGCACATGGCTTATAATGGCTATGTTCTTAA
TTTTTTCCATATAATGGCTATGTTCCCTAATTCCCCTAAATTTAATACTAAATCTGTTCT
TTTAAAACAGAAGTAGGTAACACTTCTTATGTGTAAATTTTAAGTTGAACTGCCACTTAA
AAATTGTATTTTTTTTTTTTAACTCTGGAAAATTCAATAATGAAAGAAGTATCGTACGAT
TTCGAGCAAGCCTGGCAAACACTCCTCCGTGTAGTTAATCTCCCTCCTACTGGCCTTGGA
TCGTGCCCTCTAGCTCCATGGCTGCTTTGGGCTATCTGGACTGCAAGAAACCAAAAAATG
TTTCAGAACAGAACGTTCTCACCCCAAGAAACTGTTACTAAAGCTATTCATGATGCAAGA
GAGTGGTCGGCAGCACAACTACCTGTAATAGCAAAGGTAAAAGCTCCAAAACCTCCTCAA
ACTAGATCCCCCTCCGAAGTGATCTGCAGATCGGATGCGGCTTGGAAGACAGAAGTACAA
GCAGCTGGCCTAGCTTGGAGTTTCTACCGTAACAATAACGAGCGAATCAGCTCTCATACC
CAATCAGAAGTGTGTGTGACCTCGTCCCTCTTGGCAGAAGGACTTGCAATCCGCGCAGCG
ATGGAACAAGCCATCACCTTTCAGTTACGACGTGTGGTGTTTGAATCGGACTCCCTGCAA
CTGGTGACAGCAATTGCGGATGGATCGAGTTTCTTTAAACTCCATGGTGTCCTAGCAGAT
ATCTATCTGTTGTCAATTTCTTTTGATTCTGTAATTTTTCGTTTCTGTCGTCGTGAGTCT
CTATGTTTTGAGGATTCTGTGGCAAAGAAAACCCTCTCAGACTTTGTAGCAAACCAGACC
ACTTAACCGGTCCGGTTTATTTTATTCTCTAATGAAATTCCGCTCGTGCAC


BQ
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AF RR4BP70TF U 1
AF RR4BP70JQ C 269
BS 1 603 RR4BP70TF
BS 604 951 RR4BP70JQ

RD RR4BP70TF 603 0 0
GGTATATATTGTAAATAATATATGGAATAAGCACATGGCTTATAATGGCTATGTTCTTAA
TTTTTTCCATATAATGGCTATGTTCCCTAATTCCCCTAAATTTAATACTAAATCTGTTCT
TTTAAAACAGAAGTAGGTAACACTTCTTATGTGTAAATTTTAAGTTGAACTGCCACTTAA
AAATTGTATTTTTTTTTTTTAACTCTGGAAAATTCAATAATGAAAGAAGTATCGTACGAT
TTCGAGCAAGCCTGGCAAACACTCCTCCGTGTAGTTAATCTCCCTCCTACTGGCCTTGGA
TCGTGCCCTCTAGCTCCATGGCTGCTTTGGGCTATCTGGACTGCAAGAAACCAAAAAATG
TTTCAGAACAGAACGTTCTCACCCCAAGAAACTGTTACTAAAGCTATTCATGATGCAAGA
GAGTGGTCGGCAGCACAACTACCTGTAATAGCAAAGGTAAAAGCTCCAAAACCTCCTCAA
ACTAGATCCCCCTCCGAAGTGATCTGCAGATCGGATGCGGCTTGGAAGACAGAAGTACAA
GCAGCTGGCCTAGCTTGGAGTTTCTACCGTAACAATAACGAGCGAATCAGCTCTCATACC
CAA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4BP70JQ 683 0 0
GTGTAGTTAATCTCCCTCCTACTGGCCTTGGATCGTGCCCTCTAGCTCCATGGCTGCTTT
GGGCTATCTGGACTGCAAGAAACCAAAAAATGTTTCAGAGCAGAACGTTCTCACCCCAAG
AAACTGTTACTAAAGCTATTCATGATGCAAGAGAGTGGTCGGCAGCACAACTACCTGTAA
TAGCAAAGGTAAAAGCTCCAAAACCTCCTCAAACTAGATCCCCCTCCGAAGTGATCTGCA
GATCGGATGCGGCTTGGAAGACAGAAGTACAAGCAGCTGGCCTAGCTTGGAGTTTCTACC
GTAACAATAACGAGCGAATCAGCTCTCATACCCAATCAGAAGTGTGTGTGACCTCGTCCC
TCTTGGCAGAAGGACTTGCAATCCGCGCAGCGATGGAACAAGCCATCACCTTTCAGTTAC
GACGTGTGGTGTTTGAATCGGACTCCCTGCAACTGGTGACAGCAATTGCGGATGGATCGA
GTTTCTTTAAACTCCATGGTGTCCTAGCAGATATCTATCTGTTGTCAATTTCTTTTGATT
CTGTAATTTTTCGTTTCTGTCGTCGTGAGTCTCTATGTTTTGAGGATTCTGTGGCAAAGA
AAACCCTCTCAGACTTTGTAGCAAACCAGACCACTTAACCGGTCCGGTTTATTTTATTCT
CTAATGAAATTCCGCTCGTGCAC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6871Contig1 997 2 10 U
GGATTGTCCCATATATCTCAAACAGAGAGAGATCTCAAAGATTCAGCAAGTAGTTACGTT
ATTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTAC
CGGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGAACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTCGGCTC
TAGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAATCCATCCGCGGTGTCCGTACAAGTCGGCAACTATT
TGCAGCTTGCCTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTA
AGGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCCCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAGCAGC
AATATGGGCTTGCAAAAAATGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTC
TCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAGTGGCGATTTCG
CCTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGTTGGTA
AGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATGTGGCATTTGCTGATGATCTTG
ATTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGGATGCTTTTACT
CAACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAATAAGATCACAGCCATTC
CTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCTACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTG
CAGATTGAGAATGAGAACTCTTAACAGAAAAAAAAAATAATGATGTAGAAAAAACAAGAA
GCTGTTCAATGAGCTTTAAAGCTATCAATGGTTGGTGATGATGTGTGTAGTGATGTATCT
CTCCCTTTGTCTTTTGCTTCTTTGTACAGCCAATGTCTGTCTCTTCTGGTTTTTTTAGTA
TCTTCGTGCCAATAAATTTGCTTTCTCTTGTGTTTGC


BQ
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AF RR4FE39TF U 1
AF RR4FE39JQ C 400
BS 1 648 RR4FE39TF
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BS 729 748 RR4FE39TF
BS 749 997 RR4FE39JQ

RD RR4FE39TF 748 0 0
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ATTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTAC
CGGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGAACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTCGGCTC
TAGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAATCCATCCGCGGTGTCCGTACAAGTCGGCAACTATT
TGCAGCTTGCCTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTA
AGGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCCCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAGCAGC
AATATGGGCTTGCAAAAAATGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTC
TCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAGTGGCGATTTCG
CCTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGTTGGTA
AGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATGTGGCATTTGCTGATGATCTTG
ATTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAG*ATGCTTTTACT
CAACTGCGTTAGGTGGGCTTAG*AGCTTTGAGAACCCTAAGAATA*GATCACAGCCATTC
CTGCTAA*GAGGAAGAAATTTGGGGAGC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4FE39JQ 598 0 0
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CACACCTAAGTGGCGATTTCGCCTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTG
TAGCCTCTGACCAAGTTGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATG
TGGCATTTGCTGATGATCTTGATTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTT
TCCCTCAAGGATGCTTTTACTCAACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACCCTA
AGAATAAGATCACAGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCTACCTTCAAGG
TGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGAGAACTCTTAACAGAAAAAAAAAATA
ATGATGTAGAAAAAACAAGAAGCTGTTCAATGAGCTTTAAAGCTATCAATGGTTGGTGAT
GATGTGTGTAGTGATGTATCTCTCCCTTTGTCTTTTGCTTCTTTGTACAGCCAATGTCTG
TCTCTTCTGGTTTTTTTAGTATCTTCGTGCCAATAAATTTGCTTTCTCTTGTGTTTGC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL6872Contig1 971 2 2 U
GCAGAGAAGTTTGAAGAACTCAAGGCGATTGAAAAGGCAAAGCTAGATGCCCAAACACTC
GAGCCTCTTCTTGTCTCTGGTGATCTCAACTACGTTCTTGGAAAAGATGGGTCTAAGGTG
CCTGTGACTGAGCTGGTGGGGAAGAACATTCTCTTGTACTTCTCAGCTCACTGGTGTCCT
CCATGTCGCGCTTTTACACCAAAACTTGTTGAAGTCTACAAGCAGATAAAGGAGAAGGAT
GAAGCGTTTGAGCTGATCTTCATCTCCAGTGACCGGGACCAGGAATCATTCGATGAGTAC
TACTCGCAGATGCCGTGGCTGGCTCTTCCATTTGGTGATCCTAGGAAAACGTCTCTGGCA
CGAACCTTTAAGGTCGGTGGCATCCCCATGCTAGCGGCTCTCGGACCAACTGGCAAAACC
GTTACAAAAGAAGCAAGGGACCTCGTGGGAGCCCATGGAGCCGATGCTTACCCGTTTACT
GAGGAACGTGTGAAGGAGATTGAGGCCAAGTACAATGAGATGGCAAAAGAGTGGCCTGAG
AAGGTGAAACATGCTCTTCATGAAGAGCATGAGCTAGAGTTGACTCGTGTCTCGGTTTAC
ATATGTGATAAGTGTGACGAAGAAGGGCAAATCTGGTCTTACCATTGTGACGAGTGCGAC
TTCGATCTTCATGCCAAGTGTGCTTTGAAAGAGGAGGATGCCAACGTAAACGGCGATGAT
GCTGTGAAAGAAGGTGATGGTGGCGAGTCCAAAGATGGTTGGGTCTGTGACGGAAACGTG
TGCACTAAGACCTAATATATTGGTTCTGGCCCAGTTATATGTATGCTGAGCTTATTTTTC
TGTCCCTTGTATAACAAATAAGAGTGAGAAAGTGTGGTATCAAATACTCGTTTATGTCTT
ATATCCATGAAAAAATTACCTTTTCAGACACATTATGACTTATGAATCAATACAATTAAA
ACAGCAGACTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE74TF U 1
AF RR4EE74JQ C 359
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BS 690 971 RR4EE74JQ

RD RR4EE74TF 689 0 0
GCAGAGAAGTTTGAAGAACTCAAGGCGATTGAAAAGGCAAAGCTAGATGCCCAAACACTC
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CCATGTCGCGCTTTTACACCAAAACTTGTTGAAGTCTACAAGCAGATAAAGGAGAAGGAT
GAAGCGTTTGAGCTGATCTTCATCTCCAGTGACCGGGACCAGGAATCATTCGATGAGTAC
TACTCGCAGATGCCGTGGCTGGCTCTTCCATTTGGTGATCCTAGGAAAACGTCTCTGGCA
CGAACCTTTAAGGTCGGTGGCATCCCCATGCTAGCGGCTCTCGGACCAACTGGCAAAACC
GTTACAAAAGAAGCAAGGGACCTCGTGGGAGCCCATGGAGCCGATGCTTACCCGTTTACT
GAGGAACGTGTGAAGGAGATTGAGGCCAAGTACAATGAGATGGCAAAAGAGTGGCCTGAG
AAGGTGAAACATGCTCTTCATGAAGAGCATGAGCTAGAGTTGACTCGTGTCTCGGTTTAC
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DS 

RD RR4EE74JQ 613 0 0
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CTGAGGAACGTGTGAAGGAGATTGAGGCCAAGTACAATGAGATGGCAAAAGAGTGGCCTG
AGAAGGTGAAACATGCTCTTCATGAAGAGCATGAGCTAGAGTTGACTCGTGTCTCGGTTT
ACATATGTGATAAGTGTGACGAAGAAGGGCAAATCTGGTCTTACCATTGTGACGAGTGCG
ACTTCGATCTTCATGCCAAGTGTGCTTTGAAAGAGGAGGATGCCAACGTAAACGGCGATG
ATGCTGTGAAAGAAGGTGATGGTGGCGAGTCCAAAGATGGTTGGGTCTGTGACGGAAACG
TGTGCACTAAGACCTAATATATTGGTTCTGGCCCAGTTATATGTATGCTGAGCTTATTTT
TCTGTCCCTTGTATAACAAATAAGAGTGAGAAAGTGTGGTATCAAATACTCGTTTATGTC
TTATATCCATGAAAAAATTACCTTTTCAGACACATTATGACTTATGAATCAATACAATTA
AAACAGCAGACTT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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CTCTCTCTCATCTATTCTCTCTAATCTCACCGGAACAAGAAAACACCAATAAAATACGAC
ACCGTTAGAACACGACCATGTTGGATCTCAGTCTTGGTATGTTCTCTAACTATGGAGAAG
ATCAAGATCGGAAAGTACCATTAGTCTCAGCGGCCGGTGAAGAAGAATCTAACATCTCTT
CCTCCTCCTCATCTTCCAAAGATTCCGCCGCCGGCTAAGCTTTCATCACCTTTGGAATTA
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CCGTGGCTGATGCTCGCCGGAACATTGAGTTCTCCTTAGACGACGGTCACTGGTTGAGAC
TGTCGTCTTTACAGAGTAACAAGCAGCAAGCGGTAAAGAAGAGCAGAAGAGGACCAAGGT
CACGAAGCTCCCAGTATCGTGGCGTCACTTTTTACCGTCGCACCGGTCGCTGGGAATCTC
ATATTTGGTATAACCAAAATTATACTATTATTTTTTAAAAAAATATTAATTAAAAATTAT
ATCAGTTTGTTATGTTTGTTTTTTGTTTAATAATCAATTTTACTCAATTATTGCTATATG
AATCTCTAATTTTGATTCTTGGACTTGACGATTTGTAGGGATTGCGGAAAGCAGGTTTAT
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BQ
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AF RR4DY60TF U 1
AF RR4DY60JQ C 254
BS 1 583 RR4DY60TF
BS 584 883 RR4DY60JQ

RD RR4DY60TF 583 0 0
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ATCAAGATCGGAAAGTACCATTAGTCTCAGCGGCCGGTGAAGAAGAATCTAACATCTCTT
CCTCCTCCTCATCTTCCAAAGATTCCGCCGCCGGCTAAGCTTTCATCACCTTTGGAATTA
TCAAACGTGACGATGATGTCGTTCCTCCTCCTCCTTCTAAAGAAACCGGAGATCTTTTCC
CCGTGGCTGATGCTCGCCGGAACATTGAGTTCTCCTTAGACGACGGTCACTGGTTGAGAC
TGTCGTCTTTACAGAGTAACAAGCAGCAAGCGGTAAAGAAGAGCAGAAGAGGACCAAGGT
CACGAAGCTCCCAGTATCGTGGCGTCACTTTTTACCGTCGCACCGGTCGCTGGGAATCTC
ATATTTGGTATAACCAAAATTATACTATTATTTTTTAAAAAAA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4DY60JQ 630 0 0
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TCGCCGGAACATTGAGTTCTCCTTAGACGACGGTCACTGGTTGAGACTGTCGTCTTTACA
GAGTAACAAGCAGCAAGCGGTAAAGAAGAGCAGAAGAGGACCAAGGTCACGAAGCTCCCA
GTATCGTGGCGTCACTTTTTACCGTCGCACCGGTCGCTGGGAATCTCATATTTGGTATAA
CCAAAATTATACTATTATTTTTTAAAAAAATATTAATTAAAAATTATATCAGTTTGTTAT
GTTTGTTTTTTGTTTAATAATCAATTTTACTCAATTATTGCTATATGAATCTCTAATTTT
GATTCTTGGACTTGACGATTTGTAGGGATTGCGGAAAGCAGGTTTATTTGCGTAAGTACA
TCAAAAAATAATTTAATTATTGGGTCTTCTTAAGTACGTGTGTGTGTCTATATGTAGCCA
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GACAACATCCGTTAACTAGTGCTAAATGCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGGAAATTTGTATGTCCCACTTTAGTTACAAAGAGGTAATCTTTCTAATTTTCCCCCAA
ATTCAAACACTTTAAATCCCAAAAAGCTCAATTTTTTTTTTTAAACTGCCTGTCACACTA
ACATTGTCGTCTCCAATCTCATTATTATTAAGGAAAAAAAATCTACGTGAAGCTCTTTTC
CCCCGGATTTTGACCGAAATCACGAGCTCAGCATCGGACTGGAGCACTCCCATATATTGC
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BQ
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AF RR4F658JQ U 1
AF RR4FD38JQ U 1
BS 1 330 RR4F658JQ

RD RR4F658JQ 330 0 0
GAGTGAAATCATTCTCTATATATATTGAAATAGTTCTCTCATATTTGAAGCGAGACTATA
GGGGAAATTTGTATGTCCCACTTTAGTTACAAAGAGGTAATCTTTCTAATTTTCCCCCAA
ATTCAAACACTTTAAATCCCAAAAAGCTCAATTTTTTTTTTTAAACTGCCTGTCACACTA
ACATTGTCGTCTCCAATCTCATTATTATTAAGGAAAAAAAATCTACGTGAAGCTCTTTTC
CCCCGGATTTTGACCGAAATCACGAGCTCAGCATCGGACTGGAGCACTCCCATATATTGC
CCATCAAAGCTTTGCCTGGGAATACAAAAA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4FD38JQ 330 0 0
GAGTGAAATCATTCTCTATATATATTGAAATAGTTCTCTCATATTTGAAGCGAGACTATA
GGGGAAATTTGTATGTCCCACTTTAGTTACAAAGAGGTAATCTTTCTAATTTTCCCCCAA
ATTCAAACACTTTAAATCCCAAAAAGCTCAATTTTTTTTTTTAAACTGCCTGTCACACTA
ACATTGTCGTCTCCAATCTCATTATTATTAAGGAAAAAAAATCTACGTGAAGCTCTTTTC
CCCCGGATTTTGACCGAAATCACGAGCTCAGCATCGGACTGGAGCACTCCCATATATTGC
CCATCAAAGCTTTGCCTGGGAATACAAAAA

QA 1 330 1 330
DS 



AS 1 2

CO CL6876Contig1 615 2 5 U
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CTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGACATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCC
TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGATAAAACTTCTCATCCTAATTCTCACACGGTTTATGACTGGATGTATA
GCAGCCAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTCATCAACGGATCGTCAAATTA
AAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAA
TCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTT
TTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTAACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAA
TCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGCATATTTGACATGAAATATAATACAAAGCATCTT
TTTTATCGTGTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DO11TF U 173
AF RR4E810TF U 1
BS 1 257 RR4E810TF
BS 258 258 RR4DO11TF
BS 259 305 RR4E810TF
BS 306 306 RR4DO11TF
BS 307 615 RR4E810TF

RD RR4DO11TF 338 0 0
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ATTTCATCCAGCAAGTAATGATAAAACTTCTCATCCTAATTCTCACACGGTTTATGACTG
GATGTATAGCAGCCAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTCATCAACGGATCG
TCAAATTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATTTCAAGATG
ATTAATAATCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTT
GAGCTTTTTTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTAACA

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR4E810TF 615 0 0
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CTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGACATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCC
TGAACAATACCAAAGAAGGAACAATGGTGGGCGGATCAGCCTCTCTACCAGTGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGATAAACCTTCTCATCCTAATTCTCACACGGTTTATGACTGGATGTATA
GCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTCATCAACGGATCGTCAAATTA
AAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAA
TCAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATTTGTTAAAAGATTTTGAGCTTTT
TTTGCCTTTGTTGGCTCTCACTTTTTAACATAAAAAACAGAACACAATATGTCAAGCCAA
TCAATAACGTTTTAATAATTTACAAGCATATTTGACATGAAATATAATACAAAGCATCTT
TTTTATCGTGTTTAA

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL6877Contig1 616 2 3 U
AAATCCACTATATAATATTATTAAGTACCAAGTAAGTTCTGAAGAGAAAATTCTCCACAA
AGTTACAATTGCTTATTACAACTCGAAACAAACTAAAGCCATCGAACAAGAAAGAACTCT
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TTGGTGTCGTTTTGTAGGGTCTTTAGGCTTCCTGGATTGTTGACCAGAAGATTTGTAACG
GCCAGAGTTGAATTCCTGGTACACAAATCCTTTCGCACCCGACATTTCACTCATCAGTCC
CTTCCTGCGCCTCGCCGCTTGCAGTGCCAGTCCGTCTGTGTCTTCTTCCAGTTGCTCTAA
ACCAACCAAGTCGTCTCCAGCATTCAACACCTTAGCGAGAAGGGATAACTGTTCTTCTTG
ACTGTGGTAGCTTAAGCTCGACCCAGCATCAGCTGGTGGAAGGCTTGTTATCACTTTAAA
GCTGTAACCTTGGTCGATCAAGAACTGTTGTCTTTTAGTTGAATAATACATTTCCTGCGT
ATCTGTAGAAACAAGTGAGTAGAAGAATGCATTGTACTCTTCTTTTCCACCAGCCATTCT
ATCTTCAATTTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E692JQ U 234
AF RR4E692TF C 1
BS 1 233 RR4E692TF
BS 234 563 RR4E692JQ
BS 564 616 RR4E692TF

RD RR4E692JQ 330 0 0
TGTAACGGCCAGAGTTGAATTCCTGGTACACAAATCCTTTCGCACCCGACATTTCACTCA
TCAGTCCCTTCCTGCGCCTCGCCGCTTGCAGTGCCAGTCCGTCTGTGTCTTCTTCCAGTT
GCTCTAAACCAACCAAGTCGTCTCCAGCATTCAACACCTTAGCGAGAAGGGATAACTGTT
CTTCTTGACTGTGGTAGCTTAAGCTCGACCCAGCATCAGCTGGTGGAAGGCTTGTTATCA
CTTTAAAGCTGTAACCTTGGTCGATCAAGAACTGTTGTCTTTTAGTTGAATAATACATTT
CCTGCGTATCTGTAGAAACAAGTGAGTAGA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR4E692TF 616 0 0
AAATCCACTATATAATATTATTAAGTACCAAGTAAGTTCTGAAGAGAAAATTCTCCACAA
AGTTACAATTGCTTATTACAACTCGAAACAAACTAAAGCCATCGAACAAGAAAGAACTCT
GAAACCCCTTTTTGGTTTACCTTGTGTGAGTGTGTGTTACACGAAACGTTTCTTGAAGAG
TTGGTGTCGTTTTGTAGGGTCTTTAGGCTTCCTGGATTGTTGACCAGAAGATTTGTAACG
GCCAGAGTTGAATTCCTGGTACACAAATCCTTTCGCACCCGACATTTCACTCATCAGTCC
CTTCCTGCGCCTCGCCGCTTGCAGTGCCAGTCCGTCTGTGTCTTCTTCCAGTTGCTCTAA
ACCAACCAAGTCGTCTCCAGCATTCAACACCTTAGCGAGAAGGGATAACTGTTCTTCTTG
ACTGTGGTAGCTTAAGCTCGACCCAGCATCAGCTGGTGGAAGGCTTGTTATCACTTTAAA
GCTGTAACCTTGGTCGATCAAGAACTGTTGTCTTTTAGTTGAATAATACATTTCCTGCGT
ATCTGTAGAAACAAGTGAGTAGAAGAATGCATTGTACTCTTCTTTTCCACCAGCCATTCT
ATCTTCAATTTTACCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6878Contig1 1014 2 2 U
GGGGACTCTCATCAATCAATACAGTCCTTTACTTCCAATCAATACATTCATAATGATTTC
GTTTCACCTCCCTCTTCTCCTCCTTCTTTATATACAGCTCCTCTTTCGTTTTTTCCAAAC
CAAACTCTAGATCTCCTCCAACCTCAATCCATGGTGATGAAGCCAAATGGATTAGCGAAA
CACCATGGCGTTTCATTTTTAATCCTTCATCCTGATTTCAATTACCGAAACACCATCGCA
GAACATATTGGTCAAAAGCTACAGCAGATGTGAATTGGTTGCAGCTGTTTCGAGACAGAG
TACATATTCTACTATGTCCAGTCGAGGTCATATAGAGCACCCGAAGTAATTTTTGGGACT
GGAACTCTTGGATGGCTTTGTTATCTCTCATCAGATGGCGTGGTATATTATAGTTTGTAT
TGCAGGTGTGAATGGAGATTATGGTGGTGCTTGAGTAAATGAAGAGATGCTCAATTGCTG
TCAACTCCCAAGCCAAACTGAGAATACCTGCAGAGGAAGGATGGTTGAGCTTTGGTCGTG
ATCTGGGATATAGACTCAAGTAATTTGACTTGGCAATATCTATGGACCTGGTCGCTGTCG
ACCTCTGCTTGTGCATATTATTGTATAAAAAGGGTTTTAAAACTGATCATCAAAAGGAAT
GCTTCTTGCTCCAGTGAGATCTTGAATGTTGAGCATTTGAAGCATGCATGTGTCTTAGAC
AACGAAGCACATACAGGAAAAAGGGAAATATGGGGATGCCGTGATTCCTGTGGCAAGGCG
TTAGGAGACTTAAAGTCGAAGCTACCACTATGCAGCCTCAATTGTTACAAGGTTATTTTA
GGGGAAGATGCAACCTTTGATTTGTTGCTAATTACTTTAACATATTTTATCAAAAAGTAG
CATTAACACGTAATTGTTTTTTACATTCCCAAATCTTTGTCAACCAGAGAAGGAACTCAA
TTGATATGTTTTTTTCTTTTGGTTTTCACTAAAAAAAAGACAACTATTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FU82TF U 1
AF RR4FU82JQ C 313
BS 1 629 RR4FU82TF
BS 630 1014 RR4FU82JQ

RD RR4FU82TF 629 0 0
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GTTTCACCTCCCTCTTCTCCTCCTTCTTTATATACAGCTCCTCTTTCGTTTTTTCCAAAC
CAAACTCTAGATCTCCTCCAACCTCAATCCATGGTGATGAAGCCAAATGGATTAGCGAAA
CACCATGGCGTTTCATTTTTAATCCTTCATCCTGATTTCAATTACCGAAACACCATCGCA
GAACATATTGGTCAAAAGCTACAGCAGATGTGAATTGGTTGCAGCTGTTTCGAGACAGAG
TACATATTCTACTATGTCCAGTCGAGGTCATATAGAGCACCCGAAGTAATTTTTGGGACT
GGAACTCTTGGATGGCTTTGTTATCTCTCATCAGATGGCGTGGTATATTATAGTTTGTAT
TGCAGGTGTGAATGGAGATTATGGTGGTGCTTGAGTAAATGAAGAGATGCTCAATTGCTG
TCAACTCCCAAGCCAAACTGAGAATACCTGCAGAGGAAGGATGGTTGAGCTTTGGTCGTG
ATCTGGGATATAGACTCAAGTAATTTGACTTGGCAATATCTATGGACCTGGTCGCTGTCG
ACCTCTGCTTGTGCATATTATTGTATAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR4FU82JQ 702 0 0
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TGGCTTTGTTATCTCTCATCAGATGGCGTGGTATATTATAGTTTGTATTGCAGGTGTGAA
TGGAGATTATGGTGGTGCTTGAGTAAATGAAGAGATGCTCAATTGCTGTCAACTCCCAAG
CCAAACTGAGAATACCTGCAGAGGAAGGATGGTTGAGCTTTGGTCGTGATCTGGGATATA
GACTCAAGTAATTTGACTTGGCAATATCTATGGACCTGGTCGCTGTCGACCTCTGCTTGT
GCATATTATTGTATAAAAAGGGTTTTAAAACTGATCATCAAAAGGAATGCTTCTTGCTCC
AGTGAGATCTTGAATGTTGAGCATTTGAAGCATGCATGTGTCTTAGACAACGAAGCACAT
ACAGGAAAAAGGGAAATATGGGGATGCCGTGATTCCTGTGGCAAGGCGTTAGGAGACTTA
AAGTCGAAGCTACCACTATGCAGCCTCAATTGTTACAAGGTTATTTTAGGGGAAGATGCA
ACCTTTGATTTGTTGCTAATTACTTTAACATATTTTATCAAAAAGTAGCATTAACACGTA
ATTGTTTTTTACATTCCCAAATCTTTGTCAACCAGAGAAGGAACTCAATTGATATGTTTT
TTTCTTTTGGTTTTCACTAAAAAAAAGACAACTATTTTTTTC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

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GGAAGTCGCTTGGTGGAGAACATCCTGTGGCTACTACAGAAGGAGATGATCTGGTTGCTC
AGATGTAATAGCAGCAAACAAAGAAACTGTGGTAGACTGTGTGTTGTGTAAACAATTTAC
GTTTCCTTCTGTAACTTGATCTCTAAAGAAAACTATATGTAGGGGTTGTACAGGTTCGTG
CAAGTCAAAACGCTTATGAACCAAAAACATATTTT


BQ
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AF RR4C356JQ C 1
AF RR4C356TF U 1
BS 1 322 RR4C356TF
BS 323 335 RR4C356JQ

RD RR4C356JQ 335 0 0
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GACACATGGTTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGAAAATGTTGGAGGGATGGATGA
GGAAGTCGCTTGGTGGAGAACATCCTGTGGCTACTACAGAAGGAGATGATTTGGTTGCTC
AGATGTAATAGCAGCAAACAAAGAAACTGTGGTAGACTGTGTGTTGTGTAAACAATTTAC
GTTTCCTTCTGTAACTTGATCTTTAAAGAAAACTATATGTAGGGGTTGTACAGGTTCGTG
CAAGTCAAAACGCTTATGAACCAAAAACATATTTT

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR4C356TF 322 0 0
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GACACATGGTTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGAAAATGTTGGAGGGATGGATGA
GGAAGTCGCTTGGTGGAGAACATCCTGTGGCTACTACAGAAGGAGATGATCTGGTTGCTC
AGATGTAATAGCAGCAAACAAAGAAACTGTGGTAGACTGTGTGTTGTGTAAACAATTTAC
GTTTCCTTCTGTAACTTGATCTCTAAAGAAAACTATATGTAGGGGTTGTACAGGTTCGTG
CAAGTCAAAACGCTTATGAACC

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 2

CO CL6880Contig1 166 2 1 U
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AGTTGAATGTTTAATTACATAATATGAAATTTGTGAAATTTTCTTCTCTTTACTATATTA
TTGAATTGGAATTATCTTCCAAAATTAATTGATTTTTTAAAAGAGT


BQ
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AF RR4FD37JQ C 1
AF RR4FD37TF U 1
BS 1 166 RR4FD37TF

RD RR4FD37JQ 166 0 0
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AGTTGAATGTTTAATTACATAATATGAAATTTGTGAAATTTTCTTCTCTTTACTATATTA
TTGAATTGGAATTATCTTCCAAAATTAATTGATTTTTTAAAAGAGT

QA 1 166 1 166
DS 

RD RR4FD37TF 166 0 0
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AGTTGAATGTTTAATTACATAATATGAAATTTGTGAAATTTTCTTCTCTTTACTATATTA
TTGAATTGGAATTATCTTCCAAAATTAATTGATTTTTTAAAAGAGT

QA 1 166 1 166
DS 



AS 1 2

CO CL6881Contig1 650 2 4 U
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GCGTATGAACTGACTGAGCAAAAGAAATTTGGGTTAGGCCTCATTGGGTTTGGTTTATCC
TTTTCGTTTCTTGGTGTCATCTTATACTTTGACCGAGGTTTGCTCGCTCTTGGAAACTTA
TTTTGGTTGATAGGTGTTGGCCTTTTACTTGGTTGGCAGTCAACTTGGAGACTGTTTACC
AACGTTAACAACTTGAAGGGCACAGTGTGTTTCGTGCTAGGACTCTTTCTTATATTTGTA
CGTTGGCCAATAATCGGCATTATCCTTGAGATGTATGGTTGCATCGTCCTATTCGGTGGA
TTTTGGTCGACGGTAAAGATGTTCCTTTCCCAGATTCCTTTTGTTGGATGGATGATACAG
TATCCTCTCATGGTTGTTGAGCAACTTGTACGAGGTTCTCGTTGAAAAAGATCCATCTCG
CTCCTCTTCATGCACCTCAAAAAAGGCCTCTCTCTAGAATTCCAAAACAACTGCTGATTT
ACTTTTTTTTTCTTTTAGAAACAGAATCAAATCCTTTTACCTTGTTTTTTTGGGGACATG
ACAGAGTCTTTGCTCTGTTTCACATTCTTACTTTCTTTCTATATATATCC


BQ
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AF RR4D817TF U 1
AF RR4D817JQ C 1
BS 1 298 RR4D817TF
BS 299 299 RR4D817JQ
BS 300 332 RR4D817TF
BS 333 650 RR4D817JQ

RD RR4D817TF 332 0 0
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GCGTATGAACTGACTGAGCAAAAGAAATTTGGGTTAGGCCTCATTGGGTTTGGTTTATCC
TTTTCGTTTCTTGGTGTCATCTTATACTTTGACCGAGGTTTGCTCGCTCTTGGAAACTTA
TTTTGGTTGATAGGTGTTGGCCTTTTACTTGGTTGGCAGTCAACTTGGAGACTGTTTACC
AACGTTAACAACTTGAAGGGCACAGTGTGTTTCGTGCTAGGACTCTTTCTTATATTTG*A
CGTTGGCCAATAATCGGCATTATCCTTGAGAT

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR4D817JQ 650 0 0
GGCTCGCTTCTCTTTGCATTCGCCCACTCACTTTGATCTCAGAGTGGAGTTACCAAGATG
GCGTATGAACTGACTGAGCAAAAGAAATTTGGGTTAGGCCTCATTGGGTTTGGTTTATCC
TTTTCGTTTCTTGGTGTCATCTTATACTTTGACCGAGGTTTGCTCGCTCTTGGAAACTTA
TTTTGGTTGATAGGTGTTGGCCTTTTACTTGGTTGGCAGTCAACTTGGAGACTGTTTACC
AACGTTAACAACTTGAAGGGCACAGTGTGTTTCGTGCTAGGACTCTTTCTTATATTTGTA
CGTTGGCCAATAATCGGCATTATCCTTGAGATGTATGGTTGCATCGTCCTATTCGGTGGA
TTTTGGTCGACGGTAAAGATGTTCCTTTCCCAGATTCCTTTTGTTGGATGGATGATACAG
TATCCTCTCATGGTTGTTGAGCAACTTGTACGAGGTTCTCGTTGAAAAAGATCCATCTCG
CTCCTCTTCATGCACCTCAAAAAAGGCCTCTCTCTAGAATTCCAAAACAACTGCTGATTT
ACTTTTTTTTTCTTTTAGAAACAGAATCAAATCCTTTTACCTTGTTTTTTTGGGGACATG
ACAGAGTCTTTGCTCTGTTTCACATTCTTACTTTCTTTCTATATATATCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6882Contig1 741 2 2 U
TTTGGTACAATGACTTAGTAGACGTTACTTACAAATCCGAATTTTAGAGAAATGAAACTT
ACATCAAACAAACACAAACGATGCAAAACTTAGGAATGGGACAGAGACGTGTGTCTGAAA
GCCCTGAGAATCTCTAGGACTTGTTCATAAGGAGGACTTAGATCTTTGACCACATCGGTT
ACGTTAATAGCATTGAGCCAACCATAGACACGAGGAACTGTCTCTGGGTCGACGATCTTC
ACACCCAAAACTTCTTCGTGTGCCTTGTAAGGGCTAAGCAAAGTGCACATCACAATGTCA
ACGAGGCTCATGGTCTCGTTTGTCACGGTAGGTTTACCATCAGTATCCGAGAAAATCTCC
TTGAGGCCTTCTTTCTCTATGATGCTCAGCTTCTCCTTCACTTCTACGAGAGCTCTCTCT
TGCTCTTCTCCTTCGGTTTTCACCACTTTCATCACCGCATCGAAAAGATGTAACTGGATG
TAGCTGGCCCAAAACCGGACTTTAGATCTTCTGTAAGGGTCTTGTGGCAATAGTTGTGGA
CCGTTTCTCCACGTTTCGTCGATGTATTCAATGATAAACAGGGATTCAGAGATCGGTTTA
CCTCTGTGGACGAGAACTGGAACCTTCTTGTGAACCGGGTTGTGTCGGAGAAGGGTTTGG
TTCTTGTTATGGAGATCTTCTTGCACGAATTGGTAAGGTATGGATTTAAGCTTGAGGGCT
AGCTCAACCCTTTTGCTGTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AQ40TF C 1
AF RR4AQ40JQ U 4
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BS 4 741 RR4AQ40JQ

RD RR4AQ40TF 741 0 0
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ACGTTAATAGCATTGAGCCAACCATAGACACGAGGAACTGTCTCTGGGTCGACGATCTTC
ACACCCAAAACTTCTTCGTGTGCCTTGTAAGGGCTAAGCAAAGTGCACATCACAATGTCA
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TGCTCTTCTCCTTCGGTTTTCACCACTTTCATCACCGCATCGAAAAGATGTAACTGGATG
TAGCTGGCCCAAAACCGGACTTTAGATCTTCTGTAAGGGTCTTGTGGCAATAGTTGTGGA
CCGTTTCTCCACGTTTCGTCGATGTATTCAATGATAAACAGGGATTCAGAGATCGGTTTA
CCTCTGTGGACGAGAACTGGAACCTTCTTGTGAACCGGGTTGTGTCGGAGAAGGGTTTGG
TTCTTGTTATGGAGATCTTCTTGCACGAATTGGTAAGGTATGGATTTAAGCTTGAGGGCT
AGCTCAACCCTTTTGCTGTCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4AQ40JQ 738 0 0
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TCAAACAAACACAAACGATGCAAAACTTAGGAATGGGACAGAGACGTGTGTCTGAAAGCC
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TTAATAGCATTGAGCCAACCATAGACACGAGGAACTGTCTCTGGGTCGACGATCTTCACA
CCCAAAACTTCTTCGTGTGCCTTGTAAGGGCTAAGCAAAGTGCACATCACAATGTCAACG
AGGCTCATGGTCTCGTTTGTCACGGTAGGTTTACCATCAGTATCCGAGAAAATCTCCTTG
AGGCCTTCTTTCTCTATGATGCTCAGCTTCTCCTTCACTTCTACGAGAGCTCTCTCTTGC
TCTTCTCCTTCGGTTTTCACCACTTTCATCACCGCATCGAAAAGATGTAACTGGATGTAG
CTGGCCCAAAACCGGACTTTAGATCTTCTGTAAGGGTCTTGTGGCAATAGTTGTGGACCG
TTTCTCCACGTTTCGTCGATGTATTCAATGATAAACAGGGATTCAGAGATCGGTTTACCT
CTGTGGACGAGAACTGGAACCTTCTTGTGAACCGGGTTGTGTCGGAGAAGGGTTTGGTTC
TTGTTATGGAGATCTTCTTGCACGAATTGGTAAGGTATGGATTTAAGCTTGAGGGCTAGC
TCAACCCTTTTGCTGTCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL6883Contig1 635 2 3 U
TACATTATCTCAATCCTTACATCAATGGGCATTGCAGACAAACAAACAAAAAAGGACATT
ACAACAAGATCATGTCCTCCTGTTTCAGACAACAGTACCTACTAGTATACAGTGTTTGCG
TTTTACATTTAAGACAAAAAGCAAAATACGTTAACTCTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTACT
TTAGGGTGTGGATTGCCGTGACAGACAAGACAAAGGAGAAGACACATACGAAGAACTCCC
CGAAGCACCCTCTCCCGAGAACAAATCAGACAAATGGTTCTCAACATCTTCAGGGGTAAA
TCGGACAACCGAGCTAAAGTCTCTCACACCATCACCAGCTCCTGCCACGACAACAGACCT
CCTCGTGTTGTAAAACTCCCGGTAAATCGGCACAAGCTTTCTCGCAATCGACAGTTTTAT
CTCCTCTCGAAGCTCTAGATCCGGTACGACGCACGCACTCTGCTTACCGTACACCCTCTC
GAAACTCTCGCTGAATTTTTCAAACCTCTCCTTAACTTCCTCCACCGACATCTCCACGGC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DD74JQ U 27
AF RR4DD74TF C 1
BS 1 26 RR4DD74TF
BS 27 353 RR4DD74JQ
BS 354 635 RR4DD74TF

RD RR4DD74JQ 327 0 0
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AGACAACAGTACCTACTAGTATACAGTGTTTGCGTTTTACATTTAAGACAAAAAGCAAAA
TACGTTAACTCTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTACTTTAGGGTGTGGATTGCCGTGACAGAC
AAGACAAAGGAGAAGACACATACGAAGAACTCCCCGAAGCACCCTCTCCCGAGAACAAAT
CAGACAAATGGTTCTCAACATCTTCAGGGGTAAATCGGACAACCGAGCTAAAGTCTCTCA
CACCATCACCAGCTCCTGCCACGACAA

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR4DD74TF 635 0 0
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ACAACAAGATCATGTCCTCCTGTTTCAGACAACAGTACCTACTAGTATACAGTGTTTGCG
TTTTACATTTAAGACAAAAAGCAAAATACGTTAACTCTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTACT
TTAGGGTGTGGATTGCCGTGACAGACAAGACAAAGGAGAAGACACATACGAAGAACTCCC
CGAAGCACCCTCTCCCGAGAACAAATCAGACAAATGGTTCTCAACATCTTCAGGGGTAAA
TCGGACAACCGAGCTAAAGTCTCTCACACCATCACCAGCTCCTGCCACGACAACAGACCT
CCTCGTGTTGTAAAACTCCCGGTAAATCGGCACAAGCTTTCTCGCAATCGACAGTTTTAT
CTCCTCTCGAAGCTCTAGATCCGGTACGACGCACGCACTCTGCTTACCGTACACCCTCTC
GAAACTCTCGCTGAATTTTTCAAACCTCTCCTTAACTTCCTCCACCGACATCTCCACGGC
ACGATTCTCTGGTAGGGTCGCCAACACTGGACCCCACGCGAGCCTCTTATAGCTGTCGGA
GAACTGCTTAATCTTACCAACGTGTTTCCTGACCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL6884Contig1 754 2 2 U
GGAAAAAAAGATCATTTCGTGTATTTGTCGCCGAAGGTGCTCCAAGGTATCAGGGCCATC
TATTAGCAAAAGAACTGGTAGCTAGAGGTCTGCAGACCACTGTGATCACTGACTCTGCAG
TGTTTGCTATGATATCTCGAGTGAATATGGTTATAATCGGAGCTCATGCAGTGATGGCTA
ATGGTGGGGTTATAGGACCTGTTGGAGTCAACATGGCTGCCCTGGCAGCAAAAAAACACG
CAGTCCCATTTGTGGTTCTAGCCGGTAGTCACAAGCTATGTCCACTGTATCCTCACAATC
CGGAGGTATTACTAAACGAGCTGAGATCTCCGTCTGAACTGTTGGATTTTGGCGAATTCT
CTGATTGCCTTGATTTTGGATCCGGTTCCGGGTCTCCCCTTCTTCAAGTTGTCAACCCAA
CCTTCGATTACGTCCCACCAAGCCTCGTCAGTCTCTTCATAACCGACACGGGAGGACACA
TCCCATCTTACATGTACCGTCTTATCGCTGACTACTACTCTGCCGATGATTTGGTGATGT
AGCATTTGGTCATTTGACCACACAACACTCACTTGGTTGGGGTCATTCACAAAGTGGAAG
GAAAGATACATGTACATTGCTCAATGGTAGTGAATGAGAAAAGAGAAACTTATCTTTCGC
GTCTGTGAAACTGGTCTGACCAAGTGTATTTTTTGCCGTGTTCTACTTATACTTCTGCTC
AATTGCAAACTCTCAATGGTGTTTTATTGTTACC


BQ
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AF RR4GR31TF U 1
AF RR4GR31JQ C 1
BS 1 637 RR4GR31TF
BS 638 754 RR4GR31JQ

RD RR4GR31TF 637 0 0
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TATTAGCAAAAGAACTGGTAGCTAGAGGTCTGCAGACCACTGTGATCACTGACTCTGCAG
TGTTTGCTATGATATCTCGAGTGAATATGGTTATAATCGGAGCTCATGCAGTGATGGCTA
ATGGTGGGGTTATAGGACCTGTTGGAGTCAACATGGCTGCCCTGGCAGCAAAAAAACACG
CAGTCCCATTTGTGGTTCTAGCCGGTAGTCACAAGCTATGTCCACTGTATCCTCACAATC
CGGAGGTATTACTAAACGAGCTGAGATCTCCGTCTGAACTGTTGGATTTTGGCGAATTCT
CTGATTGCCTTGATTTTGGATCCGGTTCCGGGTCTCCCCTTCTTCAAGTTGTCAACCCAA
CCTTCGATTACGTCCCACCAAGCCTCGTCAGTCTCTTCATAACCGACACGGGAGGACACA
TCCCATCTTACATGTACCGTCTTATCGCTGACTACTACTCTGCCGATGATTTGGTGATGT
AGCATTTGGTCATTTGACCACACAACACTCACTTGGTTGGGGTCATTCACAAAGTGGAAG
GAAAGATACATGTACATTGCTCAATGGTAGTGAATGA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4GR31JQ 754 0 0
GGAAAAAAAGATCATTTCGTGTATTTGTCGCCGAAGGTGCTCCAAGGTATCAGGGCCATC
TATTAGCAAAAGAACTGGTAGCTAGAGGTCTGCAGACCACTGTGATCACTGACTCTGCAG
TGTTTGCTATGATATCTCGAGTGAATATGGTTATAATCGGAGCTCATGCAGTGATGGCTA
ATGGTGGGGTTATAGGACCTGTTGGAGTCAACATGGCTGCCCTGGCAGCAAAAAAACACG
CAGTCCCATTTGTGGTTCTAGCCGGTAGTCACAAGCTATGTCCACTGTATCCTCACAATC
CGGAGGTATTACTAAACGAGCTGAGATCTCCGTCTGAACTGTTGGATTTTGGCGAATTCT
CTGATTGCCTTGATTTTGGATCCGGTTCCGGGTCTCCCCTTCTTCAAGTTGTCAACCCAA
CCTTCGATTACGTCCCACCAAGCCTCGTCAGTCTCTTCATAACCGACACGGGAGGACACA
TCCCATCTTACATGTACCGTCTTATCGCTGACTACTACTCTGCCGATGATTTGGTGATGT
AGCATTTGGTCATTTGACCACACAACACTCACTTGGTTGGGGTCATTCACAAAGTGGAAG
GAAAGATACATGTACATTGCTCAATGGTAGTGAATGAGAAAAGAGAAACTTATCTTTCGC
GTCTGTGAAACTGGTCTGACCAAGTGTATTTTTTGCCGTGTTCTACTTATACTTCTGCTC
AATTGCAAACTCTCAATGGTGTTTTATTGTTACC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL6885Contig1 1039 2 2 U
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GACTGAAGAGTATTAGCGGAAGTTATCAAACTTTTCTCTGTCCCTCTTTATCTTCTCCAT
CCTCTCTCATCTCCTGACCACAAACCAACCACCGCCTGCATTCTTTTCTCCGGCATCCGC
CGGAGGAGTCTCTCCTCCTCTCTCTCATCTTCTACTTTGCCGCTCCGGACCTCTCTCTTT
CCCGTGCGAGATCCTGGGCTGTCATGTCTCTCCGGCGAGTTCTCCATGTGCAAGGAGTGT
CTTTCTGGTGACGTTTGGCTTCTACTGGTTTCTTGGCGAGGCGGTGACAAGGTCTGTTCG
TGGTTTCGGTCTCCACCGTTCTCTGAGTCGGGTTCCAGATGTGTTGCTTGACATTGGAGG
CGAGCATAGAGTTTTCAGTACGCAGGCGGTAGATGGTGCAGAGCTCTTTCAGGTTCCTAT
GGGTTGGGTTCTAGATGCTGATGACAAGACATCTGATGCTGATGGAGAATTACGCGAGTC
TTGATCAAAGGTTTAAGCTTGTGGAAGGAATGAATGCGATGATGAAGCCGCATCTTCAGA
TTCAGAACCAATCTAAGGAATTGAGGCGGCAAATCTATGCTCGCTAATGGATCTCAAGAG
GGAGAGAAAGGAGAAGGAAGAGTACAAGAAGATGGTTGAGGAGATGAAGAGGACGAGCGA
GGAGCTTTTGATTGTGTTAGATAAACAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAGGGAGAGCAAGTA
TGATGAGTTGGCAAAGAGATGTGATGAGATTGGGGAGTGTTCGGATTTAAAAATGCTCTA
AGAAGATTCTAAGAAACTCAACTTTCGTCAAGGAAAGAACAATGTTGCTATGGAAGATGA
TACAATGTTTTGCTAGTAGACAAAGTTATGTCTTTGAAGTCTCTGTTCTAGTTATGGTTT
GTAATTTCTAATCTTTTTGGCATTGCTTTTCATTGTAAATGATGGTTACACATTGATGTG
TTTGCAGATATTTTTAACG


BQ
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AF RR4FV62TF U 1
AF RR4FV62JQ C 278
BS 1 603 RR4FV62TF
BS 604 1039 RR4FV62JQ

RD RR4FV62TF 603 0 0
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GACTGAAGAGTATTAGCGGAAGTTATCAAACTTTTCTCTGTCCCTCTTTATCTTCTCCAT
CCTCTCTCATCTCCTGACCACAAACCAACCACCGCCTGCATTCTTTTCTCCGGCATCCGC
CGGAGGAGTCTCTCCTCCTCTCTCTCATCTTCTACTTTGCCGCTCCGGACCTCTCTCTTT
CCCGTGCGAGATCCTGGGCTGTCATGTCTCTCCGGCGAGTTCTCCATGTGCAAGGAGTGT
CTTTCTGGTGACGTTTGGCTTCTACTGGTTTCTTGGCGAGGCGGTGACAAGGTCTGTTCG
TGGTTTCGGTCTCCACCGTTCTCTGAGTCGGGTTCCAGATGTGTTGCTTGACATTGGAGG
CGAGCATAGAGTTTTCAGTACGCAGGCGGTAGATGGTGCAGAGCTCTTTCAGGTTCCTAT
GGGTTGGGTTCTAGATGCTGATGACAAGACATCTGATGCTGATGGAGAATTACGCGAGTC
TTGATCAAAGGTTTAAGCTTGTGGAAGGAATGAATGCGATGATGAAGCCGCATCTTCAGA
TTC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4FV62JQ 762 0 0
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GAGGCGGTGACAAGGTCTGTTCGTGGTTTCGGTCTCCACCGTTCTCTGAGTCGGGTTCCA
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GCAGAGCTCTTTCAGGTTCCTATGGGTTGGGTTCTAGATGCTGATGACAAGACATCTGAT
GCTGATGGAGAATTACGCGAGTCTTGATCAAAGGTTTAAGCTTGTGGAAGGAATGAATGC
GATGATGAAGCCGCATCTTCAGATTCAGAACCAATCTAAGGAATTGAGGCGGCAAATCTA
TGCTCGCTAATGGATCTCAAGAGGGAGAGAAAGGAGAAGGAAGAGTACAAGAAGATGGTT
GAGGAGATGAAGAGGACGAGCGAGGAGCTTTTGATTGTGTTAGATAAACAAGAGGAGGAG
GAGAAGAAAAGGGAGAGCAAGTATGATGAGTTGGCAAAGAGATGTGATGAGATTGGGGAG
TGTTCGGATTTAAAAATGCTCTAAGAAGATTCTAAGAAACTCAACTTTCGTCAAGGAAAG
AACAATGTTGCTATGGAAGATGATACAATGTTTTGCTAGTAGACAAAGTTATGTCTTTGA
AGTCTCTGTTCTAGTTATGGTTTGTAATTTCTAATCTTTTTGGCATTGCTTTTCATTGTA
AATGATGGTTACACATTGATGTGTTTGCAGATATTTTTAACG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6886Contig1 1125 2 2 U
GGACTCTTCTCTCCCAAGTGAGGGGATTGAATTTTAATCTGGATCTGTTTTTTTTCTATT
TGAACTTGAGAATATTTTTGTTAAGGAAGAGTGTCGACTGTTTCTTGTTTACCTTTTCTG
CAGTTAGGTGAGAAGTGGAGTTTTGTAAGCTTTATAAAAACAATATGACAATTGATCACT
TCAATTACAACACAAAATGCAGAACAAATTCTGAAAGTAAGAAGATGGAAAAAGAAGAAG
AGAAGGAAGATCTGAGAACTGTGGAGTGTCTAAGAGGGAGACTACTTGCAGAGAGGCAAG
TTTCAAGGTCTGTAAAAGATGAAGCAGAGCTCATTGCCAGAAAGATGGAGGAGTTGGAGA
AAAATCTGAAAGAAGAGATCAGATTAAGGGAAAAAGCAGAGAAGAGACTGAAGTTTCTGA
TGAAAAAGCTTGAATTCATAAAAGAGTCACGCAGTTCTGAGGGATCAGAGCAACTGAGTT
CATCTGAAGTTTCTTGTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAGCATCCAAGCAAGAAGAAGAAA
CTCATGAAAATGGATTTGTGGAGGAAGAAAAAGTTGATCAAGCAACTGAACATGTTGCCT
CCATAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTCAAGTTCAAAGCTCAAAGATGTTTCTTCTGGTGAAG
AAAGTGTTGTTGCTCCAACCTCAAGTCATGGAGCAGAATCACAGGCTAGTAATGACTTTT
CTTAAAGAGTTTAAGAATCAAGAATATCCATCACTCATCTCCTTAATAACCTTGACTTAG
AACCGTTACTCTCAGGGTGAGCTCTTATTATAATACTTTTGTGGAAGTTATTGATGGGTG
CAAAGGAGAATGGAGGGAGATAGGAAGGAGAAGGGCATGTGATCATAAAGGGATTGATTC
GGCTTTACGACACCTTTGAGTTTGACAGTATTAAATTCAAAGTGTTAGGGGAGGACGACA
GGACACATACCTGTCTCTTTCTTCTTTTGTTATCAGTGAAAGAAAGTGACGTTTCTTGAA
AATTATGAATGTGATTGAACAAAGGAAGCAGTATACTTATTCTAACTGTATTATAAACTT
AAATGACTTTAATGCATTAGTATATGCAACTTATGATTTTTGAAT


BQ
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AF RR4AW36TF U 1
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BS 568 1125 RR4AW36JQ

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TGAACTTGAGAATATTTTTGTTAAGGAAGAGTGTCGACTGTTTCTTGTTTACCTTTTCTG
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CTCATGAAAATGGATTTGTGGAGGAAG

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DS 

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TTTCAAGGTCTGTAAAAGATGAAGCAGAGCTCATTGCCAGAAAGATGGAGGAGTTGGAGA
AAAATCTGAAAGAAGAGATCAGATTAAGGGAAAAAGCAGAGAAGAGACTGAAGTTTCTGA
TGAAAAAGCTTGAATTCATAAAAGAGTCACGCAGTTCTGAGGGATCAGAGCAACTGAGTT
CATCTGAAGTTTCTTGTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAGCATCCAAGCAAGAAGAAGAAA
CTCATGAAAATGGATTTGTGGAGGAAGAAAAAGTTGATCAAGCAACTGAACATGTTGCCT
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AAAGTGTTGTTGCTCCAACCTCAAGTCATGGAGCAGAATCACAGGCTAGTAATGACTTTT
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AACCGTTACTCTCAGGGTGAGCTCTTATTATAATACTTTTGTGGAAGTTATTGATGGGTG
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GGCTTTACGACACCTTTGAGTTTGACAGTATTAAATTCAAAGTGTTAGGGGAGGACGACA
GGACACATACCTGTCTCTTTCTTCTTTTGTTATCAGTGAAAGAAAGTGACGTTTCTTGAA
AATTATGAATGTGATTGAACAAAGGAAGCAGTATACTTATTCTAACTGTATTATAAACTT
AAATGACTTTAATGCATTAGTATATGCAACTTATGATTTTTGAAT

QA 1 885 1 885
DS 



AS 1 2

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CCATGAACGGTCCATTTCTCTCAGACGAAGACTTTTCTTATTACCCGTCAAAGCCACTAC
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CATCAACAAGAACGAGAAGAGATCAATCGGTGAAATGGAGCAAGAGTTTCTCCAAGCGAT
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AGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTCCCGCTAAGTTCCGATGAACAAAGATT
CCTTGAAGCTTCAATGGCTTATGTGTCTGGCAATCCAATCATGACTGATGAAGAATACGA
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CAGTCTTCGTAGTAAAAAGGTTTACAGTGATCTTGCAGTAGATTATTTCAAAATGTTCCT
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AGACTCCTTGATCTTGAAGGGAAAAACCATTTGATCTTCTCAGATCAGTTCTTGAACTTG
TAAAATAAAATTAGTAATAATACTCACGAAATGTTCTTGGAATATATCTTTAACAGGGCC
CTTGTCCAAACTGTGGAACAGAGAATACATCCTTCTTTGGAACAATACTATCCATCTCCA
ATGATGGTTCCACCAACAATGTTAAATGCTCCGGATGTGGAACGGCGATGGTCTATGACT
CAAGTACTCGTTTGATCACATTACCAGAAGGAGGCAATGCTTAAACCCTATGGGCCAAGG
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CTCATTGACTTTATTGTGTGTTGTAAGTAAATGTGAGGTGAAATC


BQ
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AF RR4AV31TF U 1
AF RR4AV31JQ C 503
BS 1 790 RR4AV31TF
BS 791 791 RR4AV31JQ
BS 792 838 RR4AV31TF
BS 839 1305 RR4AV31JQ

RD RR4AV31TF 838 0 0
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CGATCAGTCAGGTCAGGTGGGTGGGGAAGGAGTTGACAGCAAGATCTTACCTTACTGTAG
CATCAACAAGAACGAGAAGAGATCAATCGGTGAAATGGAGCAAGAGTTTCTCCAAGCGAT
GCAATCATTCTATTACGAAGGCAAGGCGGTTATGTCTAACGAAGAGTTTGATAACCTAAA
AGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTCCCGCTAAGTTCCGATGAACAAAGATT
CCTTGAAGCTTCAATGGCTTATGTGTCTGGCAATCCAATCATGACTGATGAAGAATACGA
CAAGCTGAAAATGAAACTAAAGATGGATGGAAGTGAGATTGTGTGTGAGGGTCCAAGATG
CAGTCTTCGTAGTAAAAAGGTTTACAGTGATCTTGCAGTAGATTATTTCAAAATGTTCCT
GTTGAATGTACCAGCAACCGTTGTTGCTCTCGGACTGTTTTTCTTCCTTGATGACCTTAC
TGGTTTTGAAATCACTTACTTGCTCGAGCTTCCCGAACCATTCAGTTTCATTTTCACATG
GTTTGCTGCG*TGCCTGCAATTGTGTATCTGGCGCTATCACTCACCAAGCTGATCATC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4AV31JQ 803 0 0
GTGTCTGGCAATCCAATCATGACTGATGAAGAATACGACAAGCTGAAAATGAAACTAAAG
ATGGATGGAAGTGAGATTGTGTGTGAGGGTCCAAGATGCAGTCTTCGTAGTAAAAAGGTT
TACAGTGATCTTGCAGTAGATTATTTCAAAATGTTCCTGTTGAATGTACCAGCAACCGTT
GTTGCTCTCGGACTGTTTTTCTTCCTTGATGACCTTACTGGTTTTGAAATCACTTACTTG
CTCGAGCTTCCGGAACCATTCAGTTTCATTTTCACATGGTTTGCTGCGGTGCCTGCAATT
GTGTATCTGGCGCTATCACTCACCAAGCTGATCATCAGAGACTCCTTGATCTTGAAGGGA
AAAACCATTTGATCTTCTCAGATCAGTTCTTGAACTTGTAAAATAAAATTAGTAATAATA
CTCACGAAATGTTCTTGGAATATATCTTTAACAGGGCCCTTGTCCAAACTGTGGAACAGA
GAATACATCCTTCTTTGGAACAATACTATCCATCTCCAATGATGGTTCCACCAACAATGT
TAAATGCTCCGGATGTGGAACGGCGATGGTCTATGACTCAAGTACTCGTTTGATCACATT
ACCAGAAGGAGGCAATGCTTAAACCCTATGGGCCAAGGTTTCATTCTTAGGGGAATGTAT
GTAAAATTGATACTAATAGATGAAGAAGGTGGAGAAATTAAGCAAAAGAGTTTGTTCTGT
GTGCTGTTTTCTATAATTGCAGATGTTTCCATGTACCTCTCATTGACTTTATTGTGTGTT
GTAAGTAAATGTGAGGTGAAATC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6888Contig1 747 2 10 U
TCTCGATCGCCCGTCAGGTTTTCCAACGCCGTTTCTCCACACTCCGTTCGTCGCGATACT
ACTCCGCGTTATCCAGCTCCGCCCGGTCGCTTATCGTCTCCAAACTCGATGCCGTCTCAG
ATCCCTAGAAACTCGTTGTTACCTTCCTCCACCTTCCTCTCGTCGTCCATTGAATCTAAC
TTCTCCACAACGCTTTTCCCCAGCCGGAGAAGCCTCTGCTCATCAGCTGGAGGTAGAAAT
GGTGTTGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTCATCAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGT
GGATCTTCACCTTCGATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTCATT
GCCCCTGTGATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACATATAAGATCGAC
ATTGATGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACA
CTGCAGTTGTTTAAAGAAGGCTCTAAAAAGGGCGAGATCGTGGGGGCAGATGTTACGAAG
CTGAAAAATCTCATGGAACAGCTCTACAAGTGATAATACCAATGTTGAATAGCTGCAACT
TGCAAGTGTAGTTTAAGACTCTCCAGTCCAATAAAATCAAGGGAAAGTACTTGTTTCTGC
CATGTTTCACAGTGAATTAAACCTTGACTTATTGGGGCTAGTATTGTTTTGTTGAGACTT
GAGAGCCCTATGTGGTCTTCCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP40TF U 1
AF RR4GP40JQ C 34
BS 1 508 RR4GP40TF
BS 509 509 RR4GP40JQ
BS 510 588 RR4GP40TF
BS 589 589 RR4GP40JQ
BS 590 635 RR4GP40TF
BS 636 636 RR4GP40JQ
BS 637 660 RR4GP40TF
BS 661 661 RR4GP40JQ
BS 662 675 RR4GP40TF
BS 676 747 RR4GP40JQ

RD RR4GP40TF 678 0 0
TCTCGATCGCCCGTCAGGTTTTCCAACGCCGTTTCTCCACACTCCGTTCGTCGCGATACT
ACTCCGCGTTATCCAGCTCCGCCCGGTCGCTTATCGTCTCCAAACTCGATGCCGTCTCAG
ATCCCTAGAAACTCGTTGTTACCTTCCTCCACCTTCCTCTCGTCGTCCATTGAATCTAAC
TTCTCCACAACGCTTTTCCCCAGCCGGAGAAGCCTCTGCTCATCAGCTGGAGGTAGAAAT
GGTGTTGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTCATCAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGT
GGATCTTCACCTTCGATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTCATT
GCCCCTGTGATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACATATAAGATCGAC
ATTGATGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACA
CTGCAGTTGTTTAAAGAAGGCTCTAAAA*GGGCGAGATCGTGGGGGCAGATGTTACGAAG
CTGAAAAATCTCATGGAACAGCTCTACAAGTGATAATACCAATGTTGA*TAGCTGCAACT
TGCAAGTGTAGTTTAAGACTCTCCAGTCCAATAAA*TCAAGGGAAAGTACTTGTTTCTGC
*ATGTTTCACAGTGA
TAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4GP40JQ 714 0 0
TCTCCACACTCCGTTCGTCGCGATACTACTCCGCGTTATCCAGCTCCGCCCGGTCGCTTA
TCGTCTCCAAACTCGATGCCGTCTCAGATCCCTAGAAACTCGTTGTTACCTTCCTCCACC
TTCCTCTCGTCGTCCATTGAATCTAACTTCTCCACAACGCTTTTCCCCAGCCGGAGAAGC
CTCTGCTCATCAGCTGGAGGTAGAAATGGTGTTGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTC
ATCAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGTGGATCTTCACCTTCGATCTTCTACTTCACTGCC
GCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTCATTGCCCCTGTGATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTAC
CCTGATGTAACAACATATAAGATCGACATTGATGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGC
AAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACACTGCAGTTGTTTAAAGAAGGCTCTAAAAAGGGC
GAGATCGTGGGGGCAGATGTTACGAAGCTGAAAAATCTCATGGAACAGCTCTACAAGTGA
TAATACCAATGTTGAATAGCTGCAACTTGCAAGTGTAGTTTAAGACTCTCCAGTCCAATA
AAATCAGGGGAAAGTACTTGTTTCTGCCATGTTTCACAGTGAATTAAACCTTGACTTATT
GGGGCTAGTATTGTTTTGTTGAGACTTGAGAGCCCTATGTGGTCTTCCTTGTTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6889Contig1 1150 2 4 U
GGAAAGCTTCAAAAAATTTGAGGTAAAAAACAAACCAGAAAAAAAGAAGAAGAAAGTTTA
ACGAAGTATCAAAAAAGTTGTAATACTTTCTTTGTCACGAGAGGAGATAAAGAAAAATGG
GTATCCAAGAAGTGGACCCGTTAGCCCAACTAAGCTTACCACCGGGGTTCCGGTTTTACC
CGACGGACGAAGAGCTGATGGTTGAATATCTATGCAGAAAAGCTGCCGGTCACGATTTTT
CTCTCCAGCTCATCGCCGAGATCGATCTCTATAAGTTCGACGCGTGGGTCTTACCGAGTA
AGGCGTTATTCGGAGAAAAAGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGGGATAGGAAGTATCCTA
ACGGGTCAAGACCTAACCGGGTTGCCGGGTCGGGTTACTGGAAAGCCACCGGTACGGATA
AGGTTATATCAACGGAGGGAAGGAGAGTTGGGATCAAGAAAGCTTTGGTGTTTTACGTTG
GAAAAGCACCAAAAGGCACCAAAACTAATTGGATCATGCATGAGTACCGTCTCATCGAAC
CCTCTCGTAGATACGGAAGCACCAAACTTGATGATTGGGTTTTATGCCGTATATACAAGA
AGCAATCAAGCGCACAAAAACAGGTTTATAGTAATCTAATGACGAGTGTAAGAGAATATA
GCAACGATGATTCGTCGACGTCATCTTCGTCTCATCAATACAATGATGTTCTCGAGTCGT
TACACGAGATCGATAACAGAAGTTTGGGGTTTGCGGCCGGTTCATCAAACGCACCTCCTC
ATCATAGTCAAAGAACAAGCCTGACCGAACAGAAAACCGGGTTTCTTAATTTAGCTAGGG
AGCCAAGCTTTGACTGGCCAAGTTATGGTGGACATACCTCGGTCCCTCAACTTACCCCGA
GTCATAACGTTCCTAGTTTCTGTTACGGCGAAGGTAGTGGTTATTTTCAAAGTGTCAAGA
CAAATGAAGAAGACGATAGGAATCAGCAACAAGCTGAGGGTTTCAGTGTTGACCCGGTTA
ACGGATTCCCGAACTCGTATCAACAACATGATGCTTTCGGTTTTATTTAGTTGTGTAGTG
GTGACATAATAAAAAAAAGAAACAATTGTAATTTTGTGTATCAGATTAATTAAGTAAGTG
TAGAAATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX81TF U 1
AF RR4BX81JQ C 392
BS 1 655 RR4BX81TF
BS 656 656 RR4BX81JQ
BS 657 724 RR4BX81TF
BS 725 1150 RR4BX81JQ

RD RR4BX81TF 724 0 0
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ACGAAGTATCAAAAAAGTTGTAATACTTTCTTTGTCACGAGAGGAGATAAAGAAAAATGG
GTATCCAAGAAGTGGACCCGTTAGCCCAACTAAGCTTACCACCGGGGTTCCGGTTTTACC
CGACGGACGAAGAGCTGATGGTTGAATATCTATGCAGAAAAGCTGCCGGTCACGATTTTT
CTCTCCAGCTCATCGCCGAGATCGATCTCTATAAGTTCGACGCGTGGGTCTTACCGAGTA
AGGCGTTATTCGGAGAAAAAGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGGGATAGGAAGTATCCTA
ACGGGTCAAGACCTAACCGGGTTGCCGGGTCGGGTTACTGGAAAGCCACCGGTACGGATA
AGGTTATATCAACGGAGGGAAGGAGAGTTGGGATCAAGAAAGCTTTGGTGTTTTACGTTG
GAAAAGCACCAAAAGGCACCAAAACTAATTGGATCATGCATGAGTACCGTCTCATCGAAC
CCTCTCGTAGATACGGAAGCACCAAACTTGATGATTGGGTTTTATGCCGTATATACAAGA
AGCAATCAAGCGCACAAAAACAGGTTTATAGTAATCTAATGACGAGTGTAAGAGA*TATA
GCAACGATGATTCGTCGACGTCATCTTCGTCTCATCAATACAATGATGTTCTCGAGTCGT
TACA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BX81JQ 759 0 0
GGGTTACTGGAAAGCCACCGGTACGGATAAGGTTATATCAACGGAGGGAAGGAGAGTTGG
GATCAAGAAAGCTTTGGTGTTTTACGTTGGAAAAGCACCAAAAGGCACCAAAACTAATTG
GATCATGCATGAGTACCGTCTCATCGAACCCTCTCGTAGATACGGAAGCACCAAACTTGA
TGATTGGGTTTTATGCCGTATATACAAGAAGCAATCAAGCGCACAAAAACAGGTTTATAG
TAATCTAATGACGAGTGTAAGAGAATATAGCAACGATGATTCGTCGACGTCATCTTCGTC
TCATCAATACAATGATGTTCTCGAGTCGTTACACGAGATCGATAACAGAAGTTTGGGGTT
TGCGGCCGGTTCATCAAACGCACCTCCTCATCATAGTCAAAGAACAAGCCTGACCGAACA
GAAAACCGGGTTTCTTAATTTAGCTAGGGAGCCAAGCTTTGACTGGCCAAGTTATGGTGG
ACATACCTCGGTCCCTCAACTTACCCCGAGTCATAACGTTCCTAGTTTCTGTTACGGCGA
AGGTAGTGGTTATTTTCAAAGTGTCAAGACAAATGAAGAAGACGATAGGAATCAGCAACA
AGCTGAGGGTTTCAGTGTTGACCCGGTTAACGGATTCCCGAACTCGTATCAACAACATGA
TGCTTTCGGTTTTATTTAGTTGTGTAGTGGTGACATAATAAAAAAAAGAAACAATTGTAA
TTTTGTGTATCAGATTAATTAAGTAAGTGTAGAAATTGC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL6890Contig1 838 2 8 U
GGGAGAAAAAAACCTTATAGGAAGATAACTTGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGA
GTCGGCAGATCCACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTT
TGAAGAACAAGAGGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCGTGGTCCGAGATTAAGAACAG
CTGTGGAAACGACGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCAAGTGTTGCTGGA
AGGTTACGTGGAGGGTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGA
TGACGATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGA
GATCCCTGAGCTCTGCAACACCCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAA
GTTCTTAGATGATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCTCCGCTGCCGCCACCGACGACCAC
GACCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAA
GCTAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACA
AGAATCATCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTTGGTTAACCAGAAAACATCTACTGA
TCAGACTTTTCTTTGTATGAATGAAGTCTCTGCCAACTTTAGCTGAGAATAGACCTGCAT
TGTGTCCATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTTTACTTTTTACTCCTATGTAAGTGTAGTAA
TAATCCTTAGCCTAACGTTTGTGATAATTAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4HA38TF U 1
AF RR4HA38JQB C 128
BS 1 708 RR4HA38TF
BS 709 709 RR4HA38JQB
BS 710 751 RR4HA38TF
BS 752 752 RR4HA38JQB
BS 753 758 RR4HA38TF
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BS 760 770 RR4HA38TF
BS 771 838 RR4HA38JQB

RD RR4HA38TF 786 0 0
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GTCGGCAGATCCACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTT
TGAAGAACAAGAGGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCGTGGTCCGAGATTAAGAACAG
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AGGTTACGTGGAGGGTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGA
TGACGATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGA
GATCCCTGAGCTCTGCAACACCCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAA
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GACCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAA
GCTAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACA
AGAATCATCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTTGGTTAACCAGAAAACATCTACTGA
TCAGACTTTTCTTTGTATGAATGAAGTCTCTGCCAACTTTAGCTGAGA*TAGACCTGCAT
TGTGTCCATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTT*ACTTTT*ACTCCTATGTA
GTGTAGTATAATCCTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4HA38JQB 711 0 0
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GTGGAGGGTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGATGACGAT
CTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCCCT
GAGCTCTGCAACACCCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCTTA
GATGATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCTCCGCTGCCGCCACCGACGACCACGACCAGT
CCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAGCTAGAC
TCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAAGAATCA
TCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTTGGTTAACCAGAAAACATCTACTGATCAGACT
TTTCTTTGTATGAATGAAGTTTCTGCCAACTTTAGCTGAGAATAGACCTGCATTGTGTCC
ATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTTTACTTTTTACTCCTATGTAAGTGTAGTAATAATCCT
TAGCCTAACGTTTGTGATAATTAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTACC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6892Contig1 850 2 2 U
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CATGGATAATGTTAAGTTCGTGAAGAATGGTGTTATGAGATTACCACCTGGATTCAGGTT
TCATCCCACTGATGAGGAGCTTGTGGTTCAGTATCTCAAGAGAAAAGTCCTTTCTTCTCC
ATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATTTTGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACC
TGGCAATTTGGAGAAAGAGAGGTACTTCTTTAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGG
GAACCGGTCTAATAGGGCAACCGGTTCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGTATTGATAAACG
GATTGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTTGTGTTCTACAA
AGGCAAACCACCTCATGGTTCAAGAACCGATTGGATCATGCATGAATATCGTCTCTCTTC
CTCTCCTCCGAGTTCCTTGGGCCCTACTGAGAACTGGGTTATTTGTCGTATCTTCCTTAA
GAAGAGAGCCAGTGACAACGATGACGACGGAGATAACCGGAATCTTGGTTATGGTAATGA
ACATATTGAAATTACTACAGCAAACCAAACCGAAGATAAGACCAAACCAATCTTCTTTGA
TTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACGGACTTGAACCTTTTGCCGGGCTCTCCTACTTCCGA
CCACGCTTCAAGTGGACTCACGACGGAGATTTTCTCTTCAGATGAAGAGTCCAGTAGTAG
TTGCAATAGTTTCAGACGAAATCTTTAATTTAATTTTACATGTTTTTGACTATCTTAATA
ATTTTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE28TF U 1
AF RR4EE28JQ C 308
BS 1 639 RR4EE28TF
BS 640 850 RR4EE28JQ

RD RR4EE28TF 639 0 0
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CATGGATAATGTTAAGTTCGTGAAGAATGGTGTTATGAGATTACCACCTGGATTCAGGTT
TCATCCCACTGATGAGGAGCTTGTGGTTCAGTATCTCAAGAGAAAAGTCCTTTCTTCTCC
ATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATTTTGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACC
TGGCAATTTGGAGAAAGAGAGGTACTTCTTTAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGG
GAACCGGTCTAATAGGGCAACCGGTTCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGTATTGATAAACG
GATTGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTTGTGTTCTACAA
AGGCAAACCACCTCATGGTTCAAGAACCGATTGGATCATGCATGAATATCGTCTCTCTTC
CTCTCCTCCGAGTTCCTTGGGCCCTACTGAGAACTGGGTTATTTGTCGTATCTTCCTTAA
GAAGAGAGCCAGTGACAACGATGACGACGGAGATAACCGGAATCTTGGTTATGGTAATGA
ACATATTGAAATTACTACAGCAAACCAAACCGAAGATAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4EE28JQ 543 0 0
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ACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTTGTGTTCTACAAAGGCAAA
CCACCTCATGGTTCAAGAACCGATTGGATCATGCATGAATATCGTCTTTCTTCCTCTCCT
CCGAGTTCCTTGGGCCCTACTGAGAACTGGGTTATTTGTCGTATCTTCCTTAAGAAGAGA
GCCAGTGACAACGATGACGACGGAGATAACCGGAATCTTGGTTATGGTAATGAACATATT
GAAATTACTACAGCAAACCAAACCGAAGATAAGACCAAACCAATCTTCTTTGATTTCATG
AGAAAAGAAAGGACTACGGACTTGAACCTTTTGCCGGGCTCTCCTACTTCCGACCACGCT
TCAAGTGGACTCACGACGGAGATTTTCTCTTCAGATGAAGAGTCCAGTAGTAGTTGCAAT
AGTTTCAGACGAAATCTTTAATTTAATTTTACATGTTTTTGACTATCTTAATAATTTTAT
ACC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL6893Contig1 953 2 2 U
TGGGATGAGCAGAAGCTACAGCTCAGCCCTGACGAGAAGCTCAACGCCCTGCTTCGAGAC
CATCCCCTGCCTCTGCTTTTCCCTCTCTCCTCTCCCTCTCAAGGTAACTAGATTCCCGGT
TTTACTTCCGATACTTTGTGTCCCGTCCGGTTTAGGTGCAGTTGTTCTCTTTGTGATGTG
TTCTTGAAAAGATCTTTGAATGTAACTTCTGGAAACTTCTTTTGAGGTTCTTACTTCTTC
AGAGCTATACAAGAACACCAAGGTGAATCTTCTCTGTCTTTTATTAAAGGGAAAAAATAA
ACCCCATAAGCTTTAAGCTGATGAGGAGAAAGAGAATCAGAGGCATACCCGTTATAGAAA
AAAAGTGGGAAGCCAGTACGCAATATCAGCCTTAGAGATGTTCACTTTCTCCTGACTGCT
CCAGAGATCTACCATGACTACAGGTTTTGATACTTAATAATAAATCCTACATCTTTCGGT
AGGCATTGGTCAATGCTTTCTCTTGTATCTTTTTTTTAATTAGGTCAATCACAACGAAGA
ACTTCTTAGTAGCGGTTAGAGAGCATCTGGAGAAGCGTGGGGATACATCAGCACCTATAC
TGAGTGGTGTTATCGCTTGCACTAAGAACCATACGCTGGAGGAACTGATTTTGATGCTGG
ACGCTGAGAAGATCCATAGACTATATGTGGTGGATGATGCAGGTGACCTGGAAGGACTCA
TCACTCTCAGGGACATCATCGCAAGACTTGTGTATGAGCCACCTGGCTATTTTGGGAATT
TCTTTGACGGTTTTATCCCTCTACCTCAAAACTACAGAGTCTAACAGATGGGTCTCTCTT
TCTTTGTGTAAATTTGTTCTTTGCTTTTTATGTCTGTTTGTGCCAAAGTTCTTGAATTTG
TGTTATAAAAGTTCAAACAGAAACAATAAAAGAGGAAAAAGAGCTAATCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B455TF U 1
AF RR4B455JQ C 113
BS 1 474 RR4B455TF
BS 475 953 RR4B455JQ

RD RR4B455TF 474 0 0
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TTTACTTCCGATACTTTGTGTCCCGTCCGGTTTAGGTGCAGTTGTTCTCTTTGTGATGTG
TTCTTGAAAAGATCTTTGAATGTAACTTCTGGAAACTTCTTTTGAGGTTCTTACTTCTTC
AGAGCTATACAAGAACACCAAGGTGAATCTTCTCTGTCTTTTATTAAAGGGAAAAAATAA
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AAAAGTGGGAAGCCAGTACGCAATATCAGCCTTAGAGATGTTCACTTTCTCCTGACTGCT
CCAGAGATCTACCATGACTACAGGTTTTGATACTTAATAATAAATCCTACATCT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4B455JQ 841 0 0
GATTCCGG
TTTACTTCCGATACTT*GTGTCC*GTCCGGTTTAGGTGCAGTTGTTCTCTTTGTGATGTG
TTCTTGAAA*GATCTTTGAATGTAACTTCTGGAAACTTCTTT*GAGGTTCTTACTTCTTC
AGAGCTATACAAGAACACCAAGGTGAATCTTCTCTGTCTTT*ATTAAAGGGAAAAAATAA
ACCCCATAAGCTTTAAGCTGATGAGGAGAAAGAGAATCAGAGGCATACCCGTTATAGAAA
AAAAGTGGGAAGCCAGTAGGCAATATCAGCCTTAGAGATGTTCACTTTCTCCTGACTGCT
CCAGAGATCTACCATGACTACAGGTTTTGATACTTAATAATAAATCCTACATCTTTCGGT
AGGCATTGGTCAATGCTTTCTCTTGTATCTTTTTTTTAATTAGGTCAATCACAACGAAGA
ACTTCTTAGTAGCGGTTAGAGAGCATCTGGAGAAGCGTGGGGATACATCAGCACCTATAC
TGAGTGGTGTTATCGCTTGCACTAAGAACCATACGCTGGAGGAACTGATTTTGATGCTGG
ACGCTGAGAAGATCCATAGACTATATGTGGTGGATGATGCAGGTGACCTGGAAGGACTCA
TCACTCTCAGGGACATCATCGCAAGACTTGTGTATGAGCCACCTGGCTATTTTGGGAATT
TCTTTGACGGTTTTATCCCTCTACCTCAAAACTACAGAGTCTAACAGATGGGTCTCTCTT
TCTTTGTGTAAATTTGTTCTTTGCTTTTTATGTCTGTTTGTGCCAAAGTTCTTGAATTTG
TGTTATAAAAGTTCAAACAGAAACAATAAAAGAGGAAAAAGAGCTAATCTTTG

QA 9 841 9 841
DS 



AS 1 2

CO CL6894Contig1 1148 2 4 U
GGCCGTCTTCATTTGGCAGAGAGATAGAAAGCTATGGCGGACGAAGAAGACGAGTTACAG
GAGACGGAACTAAGTTACGACCAGAAGAAAGAAATTGCGAAATGGTTTCTCCTCAACGCT
CCCGCTGGCGAGATCAATTACGTCGCCAAAGATTTGAAGGAGGTTTTGAGCGATGAGGAA
GTTTACAACGAGGCGGCTATGGAAGCGTTTCCAGTGTACAACAAGTCGCACATGATTTGC
CTTGAAATGCCCAGTAGAGCTGGTGATGTGATTGTTTCATCTTACAGTGAGGTTACTGAG
AATGAGTACATTGATCCAAGAACTGCTCAGGTTGCCATAGTTGATCACGTTAAACAGATT
TTCACAAAAGTACGACCTGCTTATGATGAAGAACTTCCATCTTCCTATATTGAGGAATTC
AGATCTGCTCTTGATGCTGAAATCCAGAGATACGTTGGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTG
TCTACCGTTAACTGTGTGAAAGGGAAAGATGCCGATGGTTCAGGGCCGGACTTTGAGCTT
GTCGTTATAATTACTGCTAGAAAACTCAGTCCTCAGAACTTCTGTAATGGTAGTTGGAGA
TCTGTATGGCACATTGATTTCCAGGATGAATCTCAGGTGCTTGATATAAAAGGGAAAGTG
CAGGTAGGAGCCCATTACTTCGAAGAGGGGAATGTGGAATTGGATGCAAAGAAAGAGTTC
CAGGATTCAACAATATTTCAGTCTGCGGATGACTGCGCGATAGCCATAGCCAATACCATC
AGGCACCATGAGACAGAGTACCTTGCAGCTCTAGAGGTAGCCTATTCTAAATTACCGGAT
AACACTTTCAAGGATCTGAGGAGGAAACTTCCAGTGACAAGAACTCTGTTCCCATGGCAG
AACACTTTACAGTTCAGCCTAACCAGAGAGGTAGAGAAAGAACTTGGACTTGGTGGCAAG
TGACTAATTATCAGACCTCAATCTCATTTTTTCCGTTTTGTTAGCAAGTTTCTGTGAAGG
GGAATAGTATCATCGATTATGTTTCTGTTGTGTCTGTATATCTGTTTCTTCGTTTGTGGG
TTATGTACAAAACTGCATGCAAGTGTTGAATCATTGATATTGTTAGTGGAGTTCAAGAAA
TGGGTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EK33TF U 1
AF RR4EK33JQ C 409
BS 1 636 RR4EK33TF
BS 637 637 RR4EK33JQ
BS 638 740 RR4EK33TF
BS 741 1148 RR4EK33JQ

RD RR4EK33TF 740 0 0
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GAGACGGAACTAAGTTACGACCAGAAGAAAGAAATTGCGAAATGGTTTCTCCTCAACGCT
CCCGCTGGCGAGATCAATTACGTCGCCAAAGATTTGAAGGAGGTTTTGAGCGATGAGGAA
GTTTACAACGAGGCGGCTATGGAAGCGTTTCCAGTGTACAACAAGTCGCACATGATTTGC
CTTGAAATGCCCAGTAGAGCTGGTGATGTGATTGTTTCATCTTACAGTGAGGTTACTGAG
AATGAGTACATTGATCCAAGAACTGCTCAGGTTGCCATAGTTGATCACGTTAAACAGATT
TTCACAAAAGTACGACCTGCTTATGATGAAGAACTTCCATCTTCCTATATTGAGGAATTC
AGATCTGCTCTTGATGCTGAAATCCAGAGATACGTTGGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTG
TCTACCGTTAACTGTGTGAAAGGGAAAGATGCCGATGGTTCAGGGCCGGACTTTGAGCTT
GTCGTTATAATTACTGCTAGAAAACTCAGTCCTCAGAACTTCTGTAATGGTAGTTGGAGA
TCTGTATGGCACATTGATTTCCAGGATGAATCTCAG*TGCTTGATATAAAAGGGAAAGTG
CAGGTAGGAGCCCATTACTTCGAAGAGGGGAATGTGGAATTGGATGCAAAGAAAGAGTTC
CAGGATTCAACAATATTTCA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4EK33JQ 740 0 0
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CCGAAAGGTGTGTCTACCGTTAACTGTGTGAAAGGGAAAGATGCCGATGGTTCAGGGCCG
GACTTTGAGCTTGTCGTTATAATTACTGCTAGAAAACTCAGTCCTCAGAACTTCTGTAAT
GGTAGTTGGAGATCTGTATGGCACATTGATTTCCAGGATGAATCTCAGGTGCTTGATATA
AAAGGGAAAGTGCAGGTAGGAGCCCATTACTTCGAAGAGGGGAATGTGGAATTGGATGCA
AAGAAAGAGTTCCAGGATTCAACAATATTTCAGTCTGCGGATGACTGCGCGATAGCCATA
GCCAATACCATCAGGCACCATGAGACAGAGTACCTTGCAGCTCTAGAGGTAGCCTATTCT
AAATTACCGGATAACACTTTCAAGGATCTGAGGAGGAAACTTCCAGTGACAAGAACTCTG
TTCCCATGGCAGAACACTTTACAGTTCAGCCTAACCAGAGAGGTAGAGAAAGAACTTGGA
CTTGGTGGCAAGTGACTAATTATCAGACCTCAATCTCATTTTTTCCGTTTTGTTAGCAAG
TTTCTGTGAAGGGGAATAGTATCATCGATTATGTTTCTGTTGTGTCTGTATATCTGTTTC
TTCGTTTGTGGGTTATGTACAAAACTGCATGCAAGTGTTGAATCATTGATATTGTTAGTG
GAGTTCAAGAAATGGGTTCG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

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CAGATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATCCCTCGGGAGAACATCTTTGCCAAC
AATCTTCTATTTGGAAAATCCGGTGAGTTTGTGGGCTTTGATGACAAGGAACCTACTTCA
AGAAGTTGAGGCAAATCCAAGGCAGTGCAGCAAATACGAAAGGGTCGTCTCTACAAGACT
ATGGCCATGATTGGAGACGGAGCTACTGATCTCGAAGCACGTCAACCAGGTGGGGCGGAC
TTGTTCATATGCTATGCTGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGCAGCACAAGCAGATTGG
CTTATCTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAACTCCTTGGACCAAAATTGATCAGTTCCACCA
TTGATCTTAACTCATTATTCATATCTCAAATTTTGTATTCTCTTTTGAAGTGTGAAATTC
CACTGAACCGATACATTTGTTTATAGCTGTTTCATCTGTTTATTCAAAG


BQ
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AF RR4FJ84TF U 1
AF RR4EX77TF U 1
BS 1 649 RR4EX77TF

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TCCAAAGTTGATGAATATCTCCAAAAGACACCCCCGAGGCTATCCCCTGGCATTGAAGAG
TTGGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATATCTGGAGGCTTTCGA
CAGATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATCCCTCGGGAGAACATCTTTGCCAAC
AATCTTCTATTTGGAAAATCCGGTGAGTTTGTGGGCTTTGATGACAAGGAACCTACTTCA
AGAAGTTGAGGCAAATCCAAGGCAGTG

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR4EX77TF 649 0 0
GGATCTGTTCCATTTGAAGAAGCTTTAGCCGCAATACTTTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTT
TCCAAAGTTGATGAATATCTCCAAAAGACACCCCCGAGGCTATCCCCTGGCATTGAAGAG
TTGGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATATCTGGAGGCTTTCGA
CAGATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATCCCTCGGGAGAACATCTTTGCCAAC
AATCTTCTATTTGGAAAATCCGGTGAGTTTGTGGGCTTTGATGACAAGGAACCTACTTCA
AGAAGTTGAGGCAAATCCAAGGCAGTGCAGCAAATACGAAAGGGTCGTCTCTACAAGACT
ATGGCCATGATTGGAGACGGAGCTACTGATCTCGAAGCACGTCAACCAGGTGGGGCGGAC
TTGTTCATATGCTATGCTGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGCAGCACAAGCAGATTGG
CTTATCTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAACTCCTTGGACCAAAATTGATCAGTTCCACCA
TTGATCTTAACTCATTATTCATATCTCAAATTTTGTATTCTCTTTTGAAGTGTGAAATTC
CACTGAACCGATACATTTGTTTATAGCTGTTTCATCTGTTTATTCAAAG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL6896Contig1 1028 2 4 U
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CGAGCGAGAGAGACATGGATCTTGATTGGGTATCAGCTTTTTTCAAGAACAACGAATGGC
TGATCGTGTATCTCAAAGGCATGTTGAAGCCCGCGGCGGCCCTCGCGGTGGTGCTTCTAG
CCGTAGCGCTCTCCTACTCTCAGAACCTCTCTCTGGAAGGTGAAATGATATACTCTGTTT
TCAGATCGTTTCTTCAGCTCTCTGTTATCGGATTCGTTCTTCAGTTCATCTTTAACCAAG
AAAACGCCGGCTGGATCATCCTCGCTTACCTCTTCATGGTCTCTGTCGCCGGTTACACCG
CCGGTCAACGTGTCAAGCACGTGCCGCGTGGAAAGTACGTGGCCGGAGTATCTATCCTCT
CCGGAACTTCTATCACAATGTTCCTCCTCATCGTCCTCGACGTCTTTCCTTTCACTCCTA
GGTATATCATCCCCGTGGCCGGGATGATGGTCGGAAACGCCATGACGGTCACCGGAGTCA
CCATGAAACAGCTACGAGATGACATCAAGATGCGACTAAACCTGGTTGAGACGGCATTGG
CACTAGGAGCGACGCCAAGACAAGCGACGTTGCAACAAGTGAAGAGAGCTCTGGTGATAT
CTCTATCTCCGGTTTTGGATAGCTGCAAAACGGTTGGATTGATTTCTTTGCCAGGAGCCA
TGACCGGTATGATAATGGGCGGTGCGTCGCCTCTTGAAGCTATTCAGCTACAGATAGTTG
TGATGAACATGCTGGTTGGAGCAGCAACCGTTAGTAGCATCATGTGTACATATCTTTGTT
GGCCATCTTTCTTCACAAAAGCTTACCAGTTACAAACTCAGGTCTTCTCAAGTTGAAGTT
TTAATTTTCCATATACTTTCACAACCTTTTGAAAATTTCTTAAACTGAAAAACCGACCAT
TAAGTCTTTAAATCATATTATTTCTGTTTCATAAATAATGTTATTTTAGCATTTTTATTG
TTGTACAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E938TF U 1
AF RR4E938JQ C 463
BS 1 689 RR4E938TF
BS 690 690 RR4E938JQ
BS 691 794 RR4E938TF
BS 795 1028 RR4E938JQ

RD RR4E938TF 794 0 0
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CGAGCGAGAGAGACATGGATCTTGATTGGGTATCAGCTTTTTTCAAGAACAACGAATGGC
TGATCGTGTATCTCAAAGGCATGTTGAAGCCCGCGGCGGCCCTCGCGGTGGTGCTTCTAG
CCGTAGCGCTCTCCTACTCTCAGAACCTCTCTCTGGAAGGTGAAATGATATACTCTGTTT
TCAGATCGTTTCTTCAGCTCTCTGTTATCGGATTCGTTCTTCAGTTCATCTTTAACCAAG
AAAACGCCGGCTGGATCATCCTCGCTTACCTCTTCATGGTCTCTGTCGCCGGTTACACCG
CCGGTCAACGTGTCAAGCACGTGCCGCGTGGAAAGTACGTGGCCGGAGTATCTATCCTCT
CCGGAACTTCTATCACAATGTTCCTCCTCATCGTCCTCGACGTCTTTCCTTTCACTCCTA
GGTATATCATCCCCGTGGCCGGGATGATGGTCGGAAACGCCATGACGGTCACCGGAGTCA
CCATGAAACAGCTACGAGATGACATCAAGATGCGACTAAACCTGGTTGAGACGGCATTGG
CACTAGGAGCGACGCCAAGACAAGCGACGTTGCAACAAGTGAAGAGAGCTCTGGTGATAT
CTCTATCTCCGGTTTTGGATAGCTGCAAA*CGGTTGGATTGATTTCTTTGCCAGGAGCCA
TGACCGGTATGATAATGGGCGGTGCGTCGCCTCTTGAAGCTATTCAGCTACAGATAGTTG
TGATGAACATGCTG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4E938JQ 566 0 0
TCTTTCCTTTCACTCCTAGGTATATCATCCCCGTGGCCGGGATGATGGTCGGAAACGCCA
TGACGGTCACCGGAGTCACCATGAAACAGCTACGAGATGACATCAAGATGCGACTAAACC
TGGTTGAGACGGCATTGGCACTAGGAGCGACGCCAAGACAAGCGACGTTGCAACAAGTGA
AGAGAGCTCTGGTGATATCTCTATCTCCGGTTTTGGATAGCTGCAAAACGGTTGGATTGA
TTTCTTTGCCAGGAGCCATGACCGGTATGATAATGGGCGGTGCGTCGCCTCTTGAAGCTA
TTCAGCTACAGATAGTTGTGATGAACATGCTGGTTGGAGCAGCAACCGTTAGTAGCATCA
TGTGTACATATCTTTGTTGGCCATCTTTCTTCACAAAAGCTTACCAGTTACAAACTCAGG
TCTTCTCAAGTTGAAGTTTTAATTTTCCATATACTTTCACAACCTTTTGAAAATTTCTTA
AACTGAAAAACCGACCATTAAGTCTTTAAATCATATTATTTCTGTTTCATAAATAATGTT
ATTTTAGCATTTTTATTGTTGTACAA

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL6897Contig1 682 2 2 U
GGATCTTAACTAGAAAAGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTCAAACCTTCA
TTTTCCAACTCATCCGATTCTCGATCAATATATTTGAAAACTCTCCCTTTGTTTTTAGAT
CTCTTTGTCCATCTGTTTATCCGTGTAGACTTGTCCCAAGAAAGCTTGTTTGTTATTTTG
CTGTTGTGTTTTAATCTGAATCGAAGATAAGATGGCTGGAAGAGGTGGAAACAGGAGAGA
CGAAGGATCGATTACAATCCAGAGCACGAATTTGTTTGCAGCTTTGGACACTCGCAAGAA
GAAGAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGAAGGTTCCTCCTCTAAGAGCACAAAGCCACA
CAAGGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCCCCTACGCCTTTGAAAGTGAAGTCTTGGGC
TGACATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTACGCTACCACCGCTCCTCCCACCTC
TGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTTGAGGAAAGTGAAAGTGAGGAAGA
TATTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGAGGAAGAGCAGGAGCATGAAACAGAGGTACA
AGTTCATCCGGAGCCAGAGCCAGAGGTGAAGAAAGCACCTGAAGTTCCTGCGCCTCCTAA
AGAGGCAGAGGGGCAACTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4ET60TF U 1
AF RR4ET60JQ C 338
BS 1 668 RR4ET60TF
BS 669 682 RR4ET60JQ

RD RR4ET60TF 668 0 0
GGATCTTAACTAGAAAAGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTCAAACCTTCA
TTTTCCAACTCATCCGATTCTCGATCAATATATTTGAAAACTCTCCCTTTGTTTTTAGAT
CTCTTTGTCCATCTGTTTATCCGTGTAGACTTGTCCCAAGAAAGCTTGTTTGTTATTTTG
CTGTTGTGTTTTAATCTGAATCGAAGATAAGATGGCTGGAAGAGGTGGAAACAGGAGAGA
CGAAGGATCGATTACAATCCAGAGCACGAATTTGTTTGCAGCTTTGGACACTCGCAAGAA
GAAGAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGAAGGTTCCTCCTCTAAGAGCACAAAGCCACA
CAAGGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCCCCTACGCCTTTGAAAGTGAAGTCTTGGGC
TGACATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTACGCTACCACCGCTCCTCCCACCTC
TGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTTGAGGAAAGTGAAAGTGAGGAAGA
TATTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGAGGAAGAGCAGGAGCATGAAACAGAGGTACA
AGTTCATCCGGAGCCAGAGCCAGAGGTGAAGAAAGCACCTGAAGTTCCTGCGCCTCCTAA
AGAGGCAG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4ET60JQ 345 0 0
TCCTTTAAGAGCACAAAGCCACACAAGGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCCCCTACG
CCTTTGAAAGTGAAGTCTTGGGCTGACATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTAC
GCTACCACCGCTCCTCCCACCTCTGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTT
GAGGAAAGTGAAAGTGAGGAAGATATTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGAGGAAGAG
CAGGAGCATGAAACAGAGGTACAAGTTCATCCGGAGCCAGAGCCAGAGGTGAAGAAAGCA
CCTGAAGTTCCTGCGCCTCCTAAAGAGGCAGAGGGGCAACTGTCC

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 2

CO CL6898Contig1 638 2 3 U
CGGGATATCAATACATTTTATCTGCACAAATGAATCATTTTGTTTCTTTTGTTTTTCCAA
ATTACATCAATTTAACAGAGCTCAGGAATGTAAAGAAAGCGCAGAAGTATGGAGAAAAAG
GGTAAACGTAGGAGAGGAAATGAAGAGTTAAAGAATGAAGCAGCCACATCCTTTTGCTTC
CGGAGGGCCTGCGAACCATTGGTCCCATGTTGCATTCACTGGCCCTATTGTTTCGGGAAA
AGGAGGATCTGGTTTGCTCTCAACACTATCTAAGAACTCTTTGCAAGAAGCTGATGCAGT
ATCCATCTTTTCAAGCTGCTCCAGCTCTTCCTCTAAGAATCGAGCTTCTTGTTCAAGCCT
TTTGAGTTCGGCGTGGATCCTGTGTTTGCCTCTTGTGTCAACGACACGCCCCGAAAGCTG
ACCCGACGAATTGGAGCTACCCGCTTCCATCAACCCCTCCCCCAAAACCAAAACTTTAAC
AACAACAGAGAAGCAAGACAACTTTCTTTTTGTTTGTACTCAAAAAAAGCTTTCAACAAG
ACAAAACCCAATGATAAGGATTGAGAAACAATCAGATCTCCAAAAAGGGATCCACAGAGA
GAGAAAGAGATAATTTTGAGAGGAGGAAGAAGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI10JQ U 169
AF RR4BI10TF C 1
BS 1 168 RR4BI10TF
BS 169 484 RR4BI10JQ
BS 485 638 RR4BI10TF

RD RR4BI10JQ 316 0 0
TCCTTTTGCTTCCGGAGGGCCTGCGAACCATTGGTCCCATGTTGCATTCACTGGCCCTAT
TGTTTCGGGAAAAGGAGGATCTGGTTTGCTCTCAACACTATCTAAGAACTCTTTGCAAGA
AGCTGATGCAGTATCCATCTTTTCAAGCTGCTCCAGCTCTTCCTCTAAGAATCGAGCTTC
TTGTTCAAGCCTTTTGAGTTCGGCGTGGATCCTGTGTTTGCCTCTTGTGTCAACGACACG
CCCCGAAAGCTGACCCGACGAATTGGAGCTACCCGCTTCCATCAACCCCTCCCCCAAAAC
CAAAACTTTAACAACA

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR4BI10TF 638 0 0
CGGGATATCAATACATTTTATCTGCACAAATGAATCATTTTGTTTCTTTTGTTTTTCCAA
ATTACATCAATTTAACAGAGCTCAGGAATGTAAAGAAAGCGCAGAAGTATGGAGAAAAAG
GGTAAACGTAGGAGAGGAAATGAAGAGTTAAAGAATGAAGCAGCCACATCCTTTTGCTTC
CGGAGGGCCTGCGAACCATTGGTCCCATGTTGCATTCACTGGCCCTATTGTTTCGGGAAG
AGGAGGATCTGGTTTGCTCTCAACACTATCTAAGAACTCTTTGCAAGAAGCTGATGCAGT
ATCCATCTTTTCAAGCTGCTCCAGCTCTTCCTCTAAGAATCGAGCTTCTTGTTCAAGCCT
TTTGAGTTCGGCGTGGATCCTGTGTTTGCCTCTTGTGTCAACGACACGCCCCGAAAGCTG
ACCCGACGAATTGGAGCTACCCGCTTCCATCAACCCCTCCCCCAAAACCAAAACTTTAAC
AACAACAGAGAAGCAAGACAACTTTCTTTTTGTTTGTACTCAAAAAAAGCTTTCAACAAG
ACAAAACCCAATGATAAGGATTGAGAAACAATCAGATCTCCAAAAAGGGATCCACAGAGA
GAGAAAGAGATAATTTTGAGAGGAGGAAGAAGAAATCC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6899Contig1 337 2 1 U
GATATTGGGACAGTCTTACGCAAAGGCGAAGCAGTCTTCTTCCGTGTTGAAGAAGTTAGC
GGTGAATGTTGTGTTTGCGTTTATGAGCACGAATTGCAGAGGGACAGATGTTGTGCTTAA
TGTTCCTCATACTTCTCTGCTTGAAGTTGGGATGGTTTATTACGTCTAAAAGAGAGAAAG
ATGTTTAGGTTTAACAGAAAGAAAAGAAGTAGATCAATACACTACAGTGTAGTAGAGAGA
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TACTTACAATTAATGAATGATATCTAAGAAATTATAT


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QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GJ64TF U 1
AF RR4GJ64JQ C 377
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BS 724 823 RR4GJ64JQ

RD RR4GJ64TF 723 0 0
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TCTTATCTCTTCTCGTTTCTGTTTCCCTATATCATCTATTGTCGTCTTCTGCTCTATTAC
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TCGATGGCTGTTGTTGGTGGCGTATGTTACGGTTTGGTGATTTCGTCTGTTCAGACGGAG
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GCTAGTTGGTCGCCAATGTTTCCCCTCGTGACTCTCGTCTTCTAACCTATCTGTCCGGCA
TGGTGGGCTGGTGGTTATGTCAAGCTCGAGTGTGGGTTGGGGTCGGAATTTTGTAGCATG
TGTGGCACACTGTCTTTTCCGTGCAGATCAATAGATCTTAGCCTTGGTGATGAAGAAGTG
TCCGCTCATCAGACATGTATCAAACAAGGACTTTACTTGGTTGGTTGTGCTATTGCTGCC
GTAGTTGAGATTCAATGCGAGAGAAGTTGAAAAGCAATACATGGATTTTGCTTTGTGTGT
TTGCTCTTTCTTACAATCTCATGATTCTCATTTGCTTTTACTATTACCCATAG*TGTATG
GGA

QA 1 723 1 723
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AAG
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TCAAACAAGGACTTTACTTGGTTGGTTGTGCTATTGCTGCCGTAGTTGAGATTCAATGCG
AGAGAAGTTGAAAAGCAATACATGGATTTTGCTTTGTGTGTTTGCTCTTTCTTACAATCT
CATGATTCTCATTTGCTTTTACTATTACCCATAGGTGTATGGGATTAATTTACGGAGCCT
ACTGGTTTCTTTTCTTTTGTGTTTTTGTTGCTAGACTGTTTGTCTCAACATTGTAACGAT
ACTTTTGAATGAATAACAAGCGTT

QA 4 447 4 447
DS 



AS 1 2

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GCATCCTGTCCTTACAATCGGTGTTGAACATAGACTTGATTCACACCTCTGGTTAAAGGC
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AGGAGAGGTCAGACCTGCCCATATGCCTAGAATTGGATTGGGGATTGCTCTAAGCTTCTG
AAAGGAACAACAAAGCAGCAAAAACAATTATGTCTAGTCTTTGTTTAGCATCTTGGTTTG
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ATTTTATTTTATTTGAATT


BQ
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AF RR4EU81JQ C 1
AF RR4EU81TF U 1
BS 1 373 RR4EU81TF
BS 374 379 RR4EU81JQ

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QA 1 379 1 379
DS 

RD RR4EU81TF 373 0 0
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AGGAGAGGTCAGACCTGCCCATATGCCTAGAATTGGATTGGGGATTGCTCTAAGCTTCTG
AAAGGAACAACAAAGCAGCAAAAACAATTATGTCTAGTCTTTGTTTAGCATCTTGGTTTG
ACAATTTGTTTTATATTGAGACTGATTCCTCACTTTGTCTAATAATCTTTTAAGGTGGAA
ATTTTATTTTATT

QA 1 373 1 373
DS 



AS 1 2

CO CL6904Contig1 1104 2 2 U
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CTTAATATATATATATATATCCTTTTAATTAGTTGCTTCTGTTTTCGCCATGATAGGATG
ATGGTACTGCTCGAGTGTATGTATGTGGTTACCAACTTACGGAAGGGTTTTATGATACAC
TAAAACAATACCACTCTCGTGAACCAGTTATTACATACTTTAAAACTTTGCTTCTGATCA
TGGAAAAGAAGTACTCATGCTTACTGATGATGTTTATTGTCGGAAGCGTCAGCAAGTTCT
TGAGATTGGCACGTATTTGACCGTTGTTGGTACGTCTGTGAGAGACAAAGATGGAGCTCT
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TGATCTTGAATTAGCATTAGAGGATAATGGGAATTTATCCTTATACTTAATAGCTCTGAG
TGCGGTTTTGGTCGCTCTGCACATGTTGCACACTTGATGCAGATGACATCTGACTCGTAA
AAGATGGCAATGAACAAGCTTTATATTACTGCCTTTTGTTTTTGTATTAAGATTCCATAA
TCTATTAGTCGCTGACTTTATATGTTATCAATCAGATTTATAATAAAGAACGTGGCTGTG
TTGGATATGATAAATGTAACCGAACATGTGTGTATATTGATCTTAATCTTATACGATAAA
TGTAACCGAACATGTTTATCATCC


BQ
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AF RR4DK81TF U 1
AF RR4DK81JQ C 345
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BS 686 1104 RR4DK81JQ

RD RR4DK81TF 685 0 0
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CGTGGAACAGTTGGATCAACCTCAACTGTGGATAAGAGCGCTTTGGGAGTTTTCATCGAG
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TCCGGAGGCGTGAGGAAGTTCCTTGGTATTTGGTAAAGATTTTTTCCCCAAATCCACAGA
CTTAATATATATATATATATCCTTTTAATTAGTTGCTTCTGTTTTCGCCATGATAGGATG
ATGGTACTGCTCGAGTGTATGTATGTGGTTACCAACTTACGGAAGGGTTTTATGATACAC
TAAAACAATACCACTCTCGTGAACCAGTTATTACATACTTTAAAACTTTGCTTCTGATCA
TGGAAAAGAAGTACTCATGCTTACTGATGATGTTTATTGTCGGAAGCGTCAGCAAGTTCT
TGAGATTGGCACGTATTTGACCGTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4DK81JQ 760 0 0
ATATCTAAAACCAATTTCCGGAGGCGTGAGGAAGTTCCTTGGTATTTGGTAAAGATTTTT
*CCCCAAATCCACAGACTTAATATATATATATATATCCTTTTAATTAGTTGCTTCTGTTT
TCGCCATGATAGGATGATGGTACTGCTCGAGTGTATGTATGTGGTTACCAACTTACGGAA
GGGTTTTATGATACACTAAAACAATACCACTCTCGTGAACCAGTTATTACATACTTTAAA
ACTTTGCTTCTGATCATGGAAAAGAAGTACTCATGCTTACTGATGATGTTTATTGTCGGA
AGCGTCAGCAAGTTCTTGAGATTGGCACGTATTTGACCGTTGTTGGTACGTCTGTGAGAG
ACAAAGATGGAGCTCTCACGATAGCAGACGCACATCGGTTCTTCAAGGGACATGTCGAAC
TTGAAGATTTTGTTAATGATCTTGAATTAGCATTAGAGGATAATGGGAATTTATCCTTAT
ACTTAATAGCTCTGAGTGCGGTTTTGGTCGCTCTGCACATGTTGCACACTTGATGCAGAT
GACATCTGACTCGTAAAAGATGGCAATGAACAAGCTTTATATTACTGCCTTTTGTTTTTG
TATTAAGATTCCATAATCTATTAGTCGCTGACTTTATATGTTATCAATCAGATTTATAAT
AAAGAACGTGGCTGTGTTGGATATGATAAATGTAACCGAACATGTGTGTATATTGATCTT
AATCTTATACGATAAATGTAACCGAACATGTTTATCATCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6905Contig1 560 2 6 U
GGAAGTTTCAACACTAAATCAATAAACTTCAATAACATATTCACCAGTTTACATTAGAGA
ATCCTAGATGGAAACCAAGCCATCCAAGTCCAGCGTCCTCCTATACGTTCTTGTTCTTGT
GCTGGTCATGTCTCCAATACTCCCATGTCAAGCAGCTAGTGTGCATCTAGGAGGTGGAGG
GCGTAAGTTGATGGCACCGTCACCACCACTTCTCACGTGTCCACACTGTGTGTGTTGCGC
AGCGGCTCAACCTGGCTTTTGCTGCCCATGTAGCTGTCCCGGTGGTCCATAATGATTGTG
ACTTGGCTATTGGAGGGGATGTGAAGTGTTTGATATGATGATATCATTGTAATATCTTAT
ATGTATGAATAAGTGAGTAATCAAGTACTCTGTGTTTTTAATAAGAAAACTTTTGGGTTC
CGTTGATATGTTATAAGTTGGTTTTGATGCCCTTCTCCTTGGATTTGATGAACCATAATA
AATCAAAAATTTGATCAAGTGAGTTCACAACAATGTTGAAATTCTTTCACGGTTTGGAAG
AAATGGCTAAAAGAGAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR52JQ C 1
AF RR4BK25TF U 73
BS 1 72 RR4CR52JQ
BS 73 81 RR4BK25TF
BS 82 82 RR4CR52JQ
BS 83 215 RR4BK25TF
BS 216 216 RR4CR52JQ
BS 217 560 RR4BK25TF

RD RR4CR52JQ 453 0 0
GGAAGTTTCAACACTAAATCAATAAACTTCAATAACATATTCACCAGTTTACATTAGAGA
ATCCTAGATGGAAACCAAGCCATCCAAGTCCAGCGTCCTCCTATACGTTCTTGTTCTTGT
GCTGGTCATGTCTCCAATACTCCCATGTCAAGCAGCTAGTGTGCATCTAGGAGGTGGAGG
GCGTAAGTTGATGGCACCGTCACCACCACTTCTCACGTGTCCACACTGTGTGTGTTGCGC
AGCGGCTCAACCTGGCTTTTGCTGCCCATGTAGCTGTCCCGGTGGTCCATAATGATTGTG
ACTTGGCTATTGGAGGGGATGTGAAGTGTTTGATATGATGATATCATTGTAATATCTTAT
ATGTATGAATAAGTGAGTAATCAAGTACTCTGTGTTTTTAATAAGAAAACTTTTGGGTTC
CGTTGATATGTTATAAGTTGGTTTTGATGCCCT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR4BK25TF 488 0 0
AACCAAGCCGTCCAAGTCCAGCGTCCTCCTATACGTTCTTGTTCTTGTGCTGGTCATGTC
TCCAATACTCCCATGTCAAGCAGCTAGTGTGCATCTAGGAGGTGGAGGGCGTAAGTTGAT
GGCACCGTCACCACCACTTCTCATGTGTCCACACTGTGTGTGTTGCGCAGCGGCTCAACC
TGGCTTTTGCTGCCCATGTAGCTGTCCCGGTGGTCCATAATGATTGTGACTTGGCTATTG
GAGGGGATGTGAAGTGTTTGATATGATGATATCATTGTAATATCTTATATGTATGAATAA
GTGAGTAATCAAGTACTCTGTGTTTTTAATAAGAAAACTTTTGGGTTCCGTTGATATGTT
ATAAGTTGGTTTTGATGCCCTTCTCCTTGGATTTGATGAACCATAATAAATCAAAAATTT
GATCAAGTGAGTTCACAACAATGTTGAAATTCTTTCACGGTTTGGAAGAAATGGCTAAAA
GAGAATTG

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL6906Contig1 997 2 4 U
GGAAAGGAGGAAGAGGAAGAAAAACTCTCTGACGACACGACCAGGAAATGGCGGTTGACT
ACTTACTGACAACATCGCCTTCGTCGCTGAGATTCTCCGATTTCATCTCTTCTTCCTTTT
CCCAAAACACCAACCACACATGTCTTCGCTTTTCACCGAGGATAACCTGCGGCGCGATTT
CTTCGAAGAGGAAACTCGCCGAGAGAGAGAGCGCGGAGAGAGAGAACAGAGTCCTCGTAC
GGAACCTGATGTCGAGGATCAGTGACAGAGAGCCACTTGTAAAGACGCTTGACAAGTACG
TGAAGGTGGTGAGATGTGGCATTGTTTCTTGCTCTTTGAAGAGCTTGGGAAGACCGACAA
GTGGCTCCAATGCCTCGAGGTGTTCAGGTGGATGCAGAAACAGCGCTGGTACATCGCTGA
TAACGGAGTGTACTCGAAATTGATCTCTGTAATGGGGAAAAAGGGCCAAACCCGAATGGC
AATGTGGCTCTTCTCCGAGATGAAAAACAGCGGTTGTCGTCCCGATGCTTCTGTTTACAA
CGCTCTCATAACGGCTCATCTTCACACGCGGGACAAGGCAAAAGCTTTGGAGAAAGTCCT
TGGTTACTTTGACAAAATGAAAGGCATGGAGCGTTGTCAACCCAATGTCGTGACTTATAA
CATCCTCTTGAGGGCTTTTGCTCAGTCTGGTAAAGTGGACCAAGTCAACGCTCTGTTTAA
AGACTTGGATATGAGTGCGGTTTCTCCAGACGTCTATACCTTTAATGGTGTGATGGATGC
GTATGGGAAAAACGGGATGATCAAGGAGATGGAATCTGTGCTTACTCGTATGAGGAGTAA
CGAGTGCAAGCCAGATATCATCACTTTCAATCTGCTTATTGACTCCTATGGTAAGAAGCA
AGAGTTTGAGAAGATGGAGCAGACTTTCAAGAGTTTGATACGGTCCAAGGAGAAGCCTAC
TCTTCCCACTTTCAACTCGATGATCATAAACTATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH20TF U 1
AF RR4EH20JQ C 258
BS 1 577 RR4EH20TF
BS 578 578 RR4EH20JQ
BS 579 603 RR4EH20TF
BS 604 997 RR4EH20JQ

RD RR4EH20TF 603 0 0
GGAAAGGAGGAAGAGGAAGAAAAACTCTCTGACGACACGACCAGGAAATGGCGGTTGACT
ACTTACTGACAACATCGCCTTCGTCGCTGAGATTCTCCGATTTCATCTCTTCTTCCTTTT
CCCAAAACACCAACCACACATGTCTTCGCTTTTCACCGAGGATAACCTGCGGCGCGATTT
CTTCGAAGAGGAAACTCGCCGAGAGAGAGAGCGCGGAGAGAGAGAACAGAGTCCTCGTAC
GGAACCTGATGTCGAGGATCAGTGACAGAGAGCCACTTGTAAAGACGCTTGACAAGTACG
TGAAGGTGGTGAGATGTGGCATTGTTTCTTGCTCTTTGAAGAGCTTGGGAAGACCGACAA
GTGGCTCCAATGCCTCGAGGTGTTCAGGTGGATGCAGAAACAGCGCTGGTACATCGCTGA
TAACGGAGTGTACTCGAAATTGATCTCTGTAATGGGGAAAAAGGGCCAAACCCGAATGGC
AATGTGGCTCTTCTCCGAGATGAAAAACAGCGGTTGTCGTCCCGATGCTTCTGTTTACAA
CGCTCTCATAACGGCTCATCTTCACACGCGGGACAAG*CAAAAGCTTTGGAGAAAGTCCT
TGG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4EH20JQ 740 0 0
ATCAGTGACAGAGAGCCACTTGTAAAGACGCTTGACAAGTACGTGAAGGTGGTGAGATGT
GGCATTGTTTCTTGCTCTTTGAAGAGCTTGGGAAGACCGACAAGTGGCTCCAATGCCTCG
AGGTGTTCAGGTGGATGCAGAAACAGCGCTGGTACATCGCTGATAACGGAGTGTACTCGA
AATTGATCTCTGTAATGGGGAAAAAGGGCCAAACCCGAATGGCAATGTGGCTCTTTTCCG
AGATGAAAAACAGCGGTTGTCGTCCCGATGCTTCTGTTTACAACGCTCTCATAACGGCTC
ATCTTCACACGCGGGACAAGGCAAAAGCTTTGGAGAAAGTCCTTGGTTACTTTGACAAAA
TGAAAGGCATGGAGCGTTGTCAACCCAATGTCGTGACTTATAACATCCTCTTGAGGGCTT
TTGCTCAGTCTGGTAAAGTGGACCAAGTCAACGCTCTGTTTAAAGACTTGGATATGAGTG
CGGTTTCTCCAGACGTCTATACCTTTAATGGTGTGATGGATGCGTATGGGAAAAACGGGA
TGATCAAGGAGATGGAATCTGTGCTTACTCGTATGAGGAGTAACGAGTGCAAGCCAGATA
TCATCACTTTCAATCTGCTTATTGACTCCTATGGTAAGAAGCAAGAGTTTGAGAAGATGG
AGCAGACTTTCAAGAGTTTGATACGGTCCAAGGAGAAGCCTACTCTTCCCACTTTCAACT
CGATGATCATAAACTATGGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6907Contig1 906 2 2 U
TTTTTCTTTTTGTTTTTGTCCTTTTGACAGATGGCTAGATTCCTTCTTCTCTGTTTCCTC
TTCGCGGCGGCGCTGACGTCATCACTAACGAAAGCCGGCGACGATAATAAAGTTTACTCG
CCTTGCTCAGACTCAACTGTCGCGATCGGCGATGGATTCACTTTCGGCATTGCCTTCGCG
GCGAGAGATTCTTTCTTCGGCACCAATCGTTCCGTTCAGTACTCTCCCTGCGATCATCGC
CGCCTCTCCCTCAACGGTAACTCCGAGCTCGCCGTATTCAGACCTAAAGTCGATGAGATC
ACACTCCTTACCATCAACACCTCCTCGAACTCCTCCAGTTTCCGCCCGGATTCCTCAAAG
GGATATATGGTAGCATTCGCTGGTGCAAAATACGCTGCAAGATCAGTTCCTATTATGGTT
GCAGACAACGATCACGTCGTCACAAGCTTCACCCTTGTTCTCGAGTTCCAGAAAGGCAGG
CTTGAGAACTTGTTCTGGAAGAAAGACGGATGCTCCAAATGTTCCGGAAATGCCAAATTC
GTGTGCCTCAACAAAGACCAATGCGCGATTAAAAGACAAAGCTGCAAGAATCAAGGAGGG
CAAGTAGATTGCAGCTTAGGGATCCAGTTGGCGTTCTCAGGCACGGATAAACACTACACC
GCGATGAACTCGTGGTACGAGGTTGCGAATCTGAAGCAGTACTCGCTTTATGGCTTATAC
TCTAATCTAAAGAATTCACTAAGCAGCCAATTCAATAACCTCTTCTGATGAATTTCTTTC
TTCTTATGTGGGTTGCTACTTTTGTAAGTTTGTATTATTACGTGGTCTCTTGCCCATGAT
ATATATTTACTGTATTTTATTACATGGCTTGTAACTTTTTCATGAATGATGATGATTTAC
GCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF43TF U 1
AF RR4DF43JQ C 281
BS 1 617 RR4DF43TF
BS 618 906 RR4DF43JQ

RD RR4DF43TF 617 0 0
TTTTTCTTTTTGTTTTTGTCCTTTTGACAGATGGCTAGATTCCTTCTTCTCTGTTTCCTC
TTCGCGGCGGCGCTGACGTCATCACTAACGAAAGCCGGCGACGATAATAAAGTTTACTCG
CCTTGCTCAGACTCAACTGTCGCGATCGGCGATGGATTCACTTTCGGCATTGCCTTCGCG
GCGAGAGATTCTTTCTTCGGCACCAATCGTTCCGTTCAGTACTCTCCCTGCGATCATCGC
CGCCTCTCCCTCAACGGTAACTCCGAGCTCGCCGTATTCAGACCTAAAGTCGATGAGATC
ACACTCCTTACCATCAACACCTCCTCGAACTCCTCCAGTTTCCGCCCGGATTCCTCAAAG
GGATATATGGTAGCATTCGCTGGTGCAAAATACGCTGCAAGATCAGTTCCTATTATGGTT
GCAGACAACGATCACGTCGTCACAAGCTTCACCCTTGTTCTCGAGTTCCAGAAAGGCAGG
CTTGAGAACTTGTTCTGGAAGAAAGACGGATGCTCCAAATGTTCCGGAAATGCCAAATTC
GTGTGCCTCAACAAAGACCAATGCGCGATTAAAAGACAAAGCTGCAAGAATCAAGGAGGG
CAAGTAGATTGCAGCTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4DF43JQ 626 0 0
GACCTAAAGTCGATGAGATCACACTCCTTACCATCAACACCTCCTCGAACTCCTCCAGTT
TCCGCCCGGATTCCTCAAAGGGATATATGGTAGCATTCGCTGGTGCAAAATACGCTGCAA
GATCAGTTCCTATTATGGTTGCAGACAACGATCACGTCGTCACAAGCTTCACCCTTGTTC
TCGAGTTCCAGAAAGGCAGGCTTGAGAACTTGTTCTGGAAGAAAGACGGATGCTCCAAAT
GTTCCGGAAATGCCAAATTCGTGTGCCTCAACAAAGACCAATGCGCGATTAAAAGACAAA
GCTGCAAGAATCAAGGAGGGCAAGTAGATTGCAGCTTAGGGATCCAGTTGGCGTTCTCAG
GCACGGATAAACACTACACCGCGATGAACTCGTGGTACGAGGTTGCGAATCTGAAGCAGT
ACTCGCTTTATGGCTTATACTCTAATCTAAAGAATTCACTAAGCAGCCAATTCAATAACC
TCTTCTGATGAATTTCTTTCTTCTTATGTGGGTTGCTACTTTTGTAAGTTTGTATTATTA
CGTGGTCTCTTGCCCATGATATATATTTACTGTATTTTATTACATGGCTTGTAACTTTTT
CATGAATGATGATGATTTACGCTATT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6908Contig1 334 2 1 U
TCGACAGTCACCCATTTCGCTAGACCCGACAACGCTGGAGATCTTCATCGAGACACACTC
GAGATCTCATCGCCGTCGGCATCTTTTTCAAACCGCTTCGTTTCACCGGGGAGCAACCAC
CGTTTACGCGAGATCTCATCCTGAAACCGAACCCAAACCCTACAGGCTTGTTACCAGTCG
TACTATTACGGAGGCAAAACAGAGCCTCTTCCAAAAACACAAACTAGAGCCGATTGTTCC
TCTTTAACGAAAAGGAACCACAACGGCGCACTGAAGCCGACCGTCCACCAAGAAAACAGT
GTGACGACGGACGCAAGAGATCTAACCTAAACCC


BQ
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AF RR4DT10JQ C 1
AF RR4DT10TF U 1
BS 1 334 RR4DT10TF

RD RR4DT10JQ 334 0 0
TCGACAGTCACCCATTTCGCTAGACCCGACAACGCTGGAGATCTTCATCGAGACACACTC
GAGATCTCATCGCCGTCGGCATCTTTTTCAAACCGCTTCGTTTCACCGGGGAGCAACCAC
CGTTTACGCGAGATCTCATCCTGAAACCGAACCCAAACCCTACAGGCTTGTTACCAGTCG
TACTATTACGGAGGCAAAACAGAGCCTCTTCCAAAAACACAAACTAGAGCCGATTGTTCC
TCTTTAACGAAAAGGAACCACAACGGCGCACTGAAGCCGACCGTCCACCAAGAAAACAGT
GTGACGACGGACGCAAGAGATCTAACCTAAACCC

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4DT10TF 334 0 0
TCGACAGTCACCCATTTCGCTAGACCCGACAACGCTGGAGATCTTCATCGAGACACACTC
GAGATCTCATCGCCGTCGGCATCTTTTTCAAACCGCTTCGTTTCACCGGGGAGCAACCAC
CGTTTACGCGAGATCTCATCCTGAAACCGAACCCAAACCCTACAGGCTTGTTACCAGTCG
TACTATTACGGAGGCAAAACAGAGCCTCTTCCAAAAACACAAACTAGAGCCGATTGTTCC
TCTTTAACGAAAAGGAACCACAACGGCGCACTGAAGCCGACCGTCCACCAAGAAAACAGT
GTGACGACGGACGCAAGAGATCTAACCTAAACCC

QA 1 334 1 334
DS 



AS 1 2

CO CL6909Contig1 611 2 7 U
GGATTGGCGGTGACGGTGATGTTCCTCACTCTGGTATCGGCCGTGCTAGAAGGATGCAAG
TTCCGAATGTGAATCTACAGCACGATGTTATGATTGAGGCGGTTGAGAATCATATGCCTG
AGACTATCATCATCGATGAGATAGGAACAGAGCTTGAGGCGTTAGCTGCTAGCACTATTG
CTCAGAGAGGAGTTCAGCTTGTTGCAACTGCTCATGGGATGACTATTGATAATATAATCA
AGAATCCTTCTTTGCAGCTACTTATTGGTGGTATCGAGAGTGTGACTCTTGGTGATGAAG
AAGCAAGGAAACGGAAAGTGCAGAAGACAATACTCGAAAGAAAAGGACCTCCAACGTTTA
CTTGTGCTGTAGAGATGATATCGAGAACCGAGTGCCGTGTTCATCAAAGGCTAGATGTAA
CCGTTGATGCTATACTAGCTGGGAAATCCGCTCCATGTGAGATCCGTAAAATTCGTGGTG
GAGAAGATGATGTTCCTCATAAGCTAGTGACTCCCATTCCTTTGGAGAATCTTGAAGAGG
AGCCTGCACCATTGCTCAACATAGACTTTGCAAGTGAAGTGCTGTCTGACGACGAAGATT
AAGACTTAGAC


BQ
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AF RR4CK16TF U 92
AF RR4DF72TF U 1
BS 1 216 RR4DF72TF
BS 217 217 RR4CK16TF
BS 218 259 RR4DF72TF
BS 260 260 RR4CK16TF
BS 261 412 RR4DF72TF
BS 413 413 RR4CK16TF
BS 414 611 RR4DF72TF

RD RR4CK16TF 368 0 0
GATTGAGGCGGTTGAGAATCATATGCCTGAGACTATCATCATCGATGAGATAGGAACAGA
GCTTGAGGCGTTAGCTGCTAGTACTATTGCTCAGAGAGGAGTTCAGCTTGTTGCAACTGC
TCATGGGATGACTATTGATAATATAATCAAGAATCCTTCTTTGCAGCTACTTATTGGTGG
TATCGAGAGTGTGACTCTTGGTGATGAAGAAGCAAGGAAACGGAAAGTGCAGAAGACAAT
ACTGGAAAGAAAAGGACCTCCAACGTTTACTTGTGCTGTAGAGATGATATCGAGAACCGA
GTGCCGTGTTCATCAGAGGCTAGATGTCACCGTTGATGCTATACTAGCTGGGAAATCCGC
TCCATGTG

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4DF72TF 611 0 0
GGATTGGCGGTGACGGTGATGTTCCTCACTCTGGTATCGGCCGTGCTAGAAGGATGCAAG
TTCCGAATGTGAATCTACAGCACGATGTTATGATTGAGGCGGTTGAGAATCATATGCCTG
AGACTATCATCATCGATGAGATAGGAACAGAGCTTGAGGCGTTAGCTGCTAGCACTATTG
CTCAGAGAGGAGTTCAGCTTGTTGCAACTGCTCATGTGATGACTATTGATAATATAATCA
AGAATCCTTCTTTGCAGCTTCTTATTGGTGGTATCGAGAGTGTGACTCTTGGTGATGAAG
AAGCAAGGAAACGGAAAGTGCAGAAGACAATACTCGAAAGAAAAGGACCTCCAACGTTTA
CTTGTGCTGTAGAGATGATATCGAGAACCGAGTGCCGTGTTCATCAAAGGCTTGATGTAA
CCGTTGATGCTATACTAGCTGGGAAATCCGCTCCATGTGAGATCCGTAAAATTCGTGGTG
GAGAAGATGATGTTCCTCATAAGCTAGTGACTCCCATTCCTTTGGAGAATCTTGAAGAGG
AGCCTGCACCATTGCTCAACATAGACTTTGCAAGTGAAGTGCTGTCTGACGACGAAGATT
AAGACTTAGAC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6910Contig1 942 2 4 U
GGAGCCGCCCTGGTCGCCGTCGCCGTGTTCTTGATCGGATACGCCGCGGACTTCGGCCAT
AAAATGGGGGACAAACTCGAGCAGGATACCGCGAGGGTCCGAGCCATCGGGATCTTCGCC
TTCGGGTTCTGGATCCTCGACGTGGCTAACAACACCCCTCCAAGGACCGTGCCGCGCTTT
CCTCGCCGACCTATCCGCCGGAGACGTTAAAAGAACTCGAGTCGCAAACGGGTTTTTCTC
CTTCTTTATGGCGGTTGGAAACGTTTTGGGATACGCCGCAGGTTCTTACAGTAACCTCCA
CAAGATGTTCCCGTTCGCAATGACCGAGGCTTGTGATATCTACTGCGCGAATCTCAAGTC
TTGTTTCTTCTTATCCATCACGCTCCTCCTAATCGTTACCGTCTCGTCCCTCTGGAGCGT
TGAGTCTCTTTGCTGTTCTTGGTATTCCATTAGCTATTACTTTCAGTATTCCATTTGCAC
TAGCCTCCATATTTTCAAATAGCTCCGGCGCTGGCCAAGGACTTTCTATCGGAGTTTTAA
ATTTGGCGATTGTGATACCACAAATGATAGTATCACTTGGAGGAGGATCTTTTGACGCCC
TCTTCGGTGGTGGAAACCTACCAGTATTCGTGGTTGGAGCAATCGCAGCGGCCGTTAGTG
GAGTATTAGCGTTAACCGTTTTACCTTCACCACCACCAGATGCACCTGCCTTGAAGTCAG
GAGCCATGGGCTTCCATTAGTGCACTCTATGTTTAACTTCTTGTAAAACTCATCAAATAC
AGTACTATTGTGCAAATCTGCAAACCTCTATAAGCAAAAAGAATGGTTAAATTAAGTGAT
AAAACCTAATAACCTTGGGTTGTCTGTATCTCACCCGTTCCTTTAGTTTTGTTGTTTTTG
TTACCGATTATCTATTTGAAATAGATTTTTTTTTTGGCCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AW90TF U 1
AF RR4AW90JQ C 94
BS 1 157 RR4AW90TF
BS 158 158 RR4AW90JQ
BS 159 818 RR4AW90TF
BS 819 942 RR4AW90JQ

RD RR4AW90TF 818 0 0
GGAGCCGCCCTGGTCGCCGTCGCCGTGTTCTTGATCGGATACGCCGCGGACTTCGGCCAT
AAAATGGGGGACAAACTCGAGCAGGATACCGCGAGGGTCCGAGCCATCGGGATCTTCGCC
TTCGGGTTCTGGATCCTCGACGTGGCTAACAACACCC*TCCAAGGACCGTGCCGCGCTTT
CCTCGCCGACCTATCCGCCGGAGACGTTAAAAGAACTCGAGTCGCAAACGGGTTTTTCTC
CTTCTTTATGGCGGTTGGAAACGTTTTGGGATACGCCGCAGGTTCTTACAGTAACCTCCA
CAAGATGTTCCCGTTCGCAATGACCGAGGCTTGTGATATCTACTGCGCGAATCTCAAGTC
TTGTTTCTTCTTATCCATCACGCTCCTCCTAATCGTTACCGTCTCGTCCCTCTGGAGCGT
TGAGTCTCTTTGCTGTTCTTGGTATTCCATTAGCTATTACTTTCAGTATTCCATTTGCAC
TAGCCTCCATATTTTCAAATAGCTCCGGCGCTGGCCAAGGACTTTCTATCGGAGTTTTAA
ATTTGGCGATTGTGATACCACAAATGATAGTATCACTTGGAGGAGGATCTTTTGACGCCC
TCTTCGGTGGTGGAAACCTACCAGTATTCGTGGTTGGAGCAATCGCAGCGGCCGTTAGTG
GAGTATTAGCGTTAACCGTTTTACCTTCACCACCACCAGATGCACCTGCCTTGAAGTCAG
GAGCCATGGGCTTCCATTAGTGCACTCTATGTTTAACTTCTTGTAAAACTCATCAAATAC
AGTACTATTGTGCAAATCTGCAAACCTCTATAAGCAAA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4AW90JQ 849 0 0
AGGGTCCGAGCCATCGGGATCTTCGC*TTCGGGTTCTGGATCCTCGACGTGGCTAACAAC
ACCCCTCCAAGGACCGTGCCGCGCTTTCCTCGCCGACCTATCCGCCGGAGACGTTAAAAG
AACTCGAGTCGCAAACGGGTTTTTCTCCTTCTTTATGGCGGTTGGAAACGTTTTGGGATA
CGCCGCAGGTTCTTACAGTAACCTCCACAAGATGTTCCCGTTCGCAATGACCGAGGCTTG
TGATATCTACTGCGCGAATCTCAAGTCTTGTTTCTTCTTATCCATCACGCTCCTCCTAAT
CGTTACCGTCTCGTCCCTCTGGAGCGTTGAGTCTCTTTGCTGTTCTTGGTATTCCATTAG
CTATTACTTTCAGTATTCCATTTGCACTAGCCTCCATATTTTCAAATAGCTCCGGCGCTG
GCCAAGGACTTTCTATCGGAGTTTTAAATTTGGCGATTGTGATACCACAAATGATAGTAT
CACTTGGAGGAGGATCTTTTGACGCCCTCTTCGGTGGTGGAAACCTACCAGTATTCGTGG
TTGGAGCAATCGCAGCGGCCGTTAGTGGAGTATTAGCGTTAACCGTTTTACCTTCACCAC
CACCAGATGCACCTGCCTTGAAGTCAGGAGCCATGGGCTTCCATTAGTGCACTCTATGTT
TAACTTCTTGTAAAACTCATCAAATACAGTACTATTGTGCAAATCTGCAAACCTCTATAA
GCAAAAAGAATGGTTAAATTAAGTGATAAAACCTAATAACCTTGGGTTGTCTGTATCTCA
CCCGTTCCTTTAGTTTTGTTGTTTTTGTTACCGATTATCTATTTGAAATAGATTTTTTTT
TTGGCCGCC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

CO CL6911Contig1 869 2 1 U
GAAGCGTGAATTTGCTTTCCACTCAGTCACAAAACCATAAATCGTTACAAATAGTGTTAA
TATATTTGTTTTTCAGAAATTATAAACATGCTCTAAGATGTGCATGCAAATTGATGTCAC
CAACTTTATAAAACCAACACAAAAGAAGCGTGGATTTGCTACTTGCAAGTTGCATACTTA
CACAAGCTCCAACCGCACAAGAAGTTTCACGGATGTACACTTGACCCCATCCTCGTTATA
CAGAGGAACGGTACGTATTCCTTGCCTCAGTTCCCAAACTGGCAAGCAAGTTTGACCTCC
GAAATCGTCTTTCTCCGACATGTCATAGTCAAGTACTTCTATCCGCAGAAGAGCAAGCTG
TGGAGCTGTTAACGGAAACTCAAAAACCTCTTCCCAAGCTGGCATCCAATCATCTTCTAA
GGTTTTAGTCTTCTTCATTACAGTATCCGCGGGAACTCCAGCGATTCCGACCCTCGCATA
GAAATCAGGTGGGGAATAACGATCGAAGTGTGTGCGGGGAAAATCATCGTACCATCCTTC
TCCCATGTATATAGTTACCCTTAGTGTTGTTTTTACAGGTAATGAAGCTTGAGGGTCAAA
TATAGCGTTGTTGTTTAGCAGAATATCGGGTTTCTTGACGTAGCCACATCCTCCGTTGGC
TCTAAACATTCCTCGCATTATCCACAATGATTTTCCTTGTCCCTGCATATTGAAAGCCAC
CATTTGAGCACCATGGCTCCAACCAACCAGGGGGTCGTAATTTGATGACATAATTCTAGT
TCCTTTTGGGTAATCCGAAGCACATTCTGCTGAGTAAACCTCACAATCTGTGTGCATATT
TTCTGATGCATCTTCAGTGTCTCACTCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CX15JQ U 1
AF RR4CS51JQ U 1
BS 1 869 RR4CS51JQ

RD RR4CX15JQ 737 0 0
GAAGCGTGAATTTGCTTTCCACTCAGTCACAAAACCATAAATCGTTACAAATAGTGTTAA
TATATTTGTTTTTCAGAAATTATAAACATGCTCTAAGATGTGCATGCAAATTGATGTCAC
CAACTTTATAAAACCAACACAAAAGAAGCGTGGATTTGCTACTTGCAAGTTGCATACTTA
CACAAGCTCCAACCGCACAAGAAGTTTCACGGATGTACACTTGACCCCATCCTCGTTATA
CAGAGGAACGGTACGTATTCCTTGCCTCAGTTCCCAAACTGGCAAGCAAGTTTGACCTCC
GAAATCGTCTTTCTCCGACATGTCATAGTCAAGTACTTCTATCCGCAGAAGAGCAAGCTG
TGGAGCTGTTAACGGAAACTCAAAAACCTCTTCCCAAGCTGGCATCCAATCATCTTCTAA
GGTTTTAGTCTTCTTCATTACAGTATCCGCGGGAACTCCAGCGATTCCGACCCTCGCATA
GAAATCAGGTGGGGAATAACGATCGAAGTGTGTGCGGGGAAAATCATCGTACCATCCTTC
TCCCATGTATATAGTTACCCTTAGTGTTGTTTTTACAGGTAATGAAGCTTGAGGGTCAAA
TATAGCGTTGTTGTTTAGCAGAATATCGGGTTTCTTGACGTAGCCACATCCTCCGTTGGC
TCTAAACATTCCTCGCATTATCCACAATGATTTTCCTTGTCCCTGCATATTGAAAGCCAC
CATTTGAGCACCATGGC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4CS51JQ 869 0 0
GAAGCGTGAATTTGCTTTCCACTCAGTCACAAAACCATAAATCGTTACAAATAGTGTTAA
TATATTTGTTTTTCAGAAATTATAAACATGCTCTAAGATGTGCATGCAAATTGATGTCAC
CAACTTTATAAAACCAACACAAAAGAAGCGTGGATTTGCTACTTGCAAGTTGCATACTTA
CACAAGCTCCAACCGCACAAGAAGTTTCACGGATGTACACTTGACCCCATCCTCGTTATA
CAGAGGAACGGTACGTATTCCTTGCCTCAGTTCCCAAACTGGCAAGCAAGTTTGACCTCC
GAAATCGTCTTTCTCCGACATGTCATAGTCAAGTACTTCTATCCGCAGAAGAGCAAGCTG
TGGAGCTGTTAACGGAAACTCAAAAACCTCTTCCCAAGCTGGCATCCAATCATCTTCTAA
GGTTTTAGTCTTCTTCATTACAGTATCCGCGGGAACTCCAGCGATTCCGACCCTCGCATA
GAAATCAGGTGGGGAATAACGATCGAAGTGTGTGCGGGGAAAATCATCGTACCATCCTTC
TCCCATGTATATAGTTACCCTTAGTGTTGTTTTTACAGGTAATGAAGCTTGAGGGTCAAA
TATAGCGTTGTTGTTTAGCAGAATATCGGGTTTCTTGACGTAGCCACATCCTCCGTTGGC
TCTAAACATTCCTCGCATTATCCACAATGATTTTCCTTGTCCCTGCATATTGAAAGCCAC
CATTTGAGCACCATGGCTCCAACCAACCAGGGGGTCGTAATTTGATGACATAATTCTAGT
TCCTTTTGGGTAATCCGAAGCACATTCTGCTGAGTAAACCTCACAATCTGTGTGCATATT
TTCTGATGCATCTTCAGTGTCTCACTCAG

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL6912Contig1 1135 2 10 U
GAATGATTACCTTGTCACCACTGCTCGCGCCGACAATTACCCGTATGGTATCGATTACCC
GACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCTAACGGCCTTAACATCCCTGGCATTATCAGTGA
GGCTATAGGCATGCCATCCACTCTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACCGGAGAAAATCT
TCTCGTCGGTGCTAATTTCGCCTCCGCCGGTATTGGAATCCTCAATGACACTGGAATTCA
ATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATACTTCGAACAGTACCAGCAACG
AGTGAGCGCATTGATTGGACCAGAGGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTT
AATCACACTCGGCGGCAACGATTTCGTCAACAACTATTATCTCATTCCTTTTTCTGCTCG
TTCGCGCCAATTCGCGTTACCCGACTACGTTGTTTATCTCATTTCGGAATACGGAAAGAT
CCTTAGGAAACTCTACGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAACTGGTGCGAT
GGGATGTGCACCTGCGGAATTGGCTCAGCATAGCCGCAATGGTGAATGCTATGGTGCCCT
CCAAGCAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCGATTAGTTGATTTGATCGCATCAGTCAATGC
TGAGATTGGCCAGGACGTTTTTGTAGCAGCTAATGCCTATCAAATGAACATGGATTATTT
ATCTAACCCAGAACAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGCTGTGGACAAGGACC
GTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTGTA
TGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAAAAAGCTAATAGGATCATTGTTAATCAGAT
CCTCACTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGCTCTTGGA
TTTTTCTAGAATATAATCTGTAATTTATTTCATTTAGATGTCAAGGTCTTGCCTTTTGCA
GTTTCCATTGTTGGTTAATTATTAGACTTTCTTGTCGGTGATGTGGTTTGATCTTTCTGC
CTGTTCTACCTTTGATAAGCTTTGTTTAGTCTTTATAATGGAGTCATTGTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EJ93TF U 1
AF RR4EJ93JQ C 431
BS 1 703 RR4EJ93TF
BS 704 704 RR4EJ93JQ
BS 705 732 RR4EJ93TF
BS 733 733 RR4EJ93JQ
BS 734 757 RR4EJ93TF
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BS 759 774 RR4EJ93TF
BS 775 775 RR4EJ93JQ
BS 776 788 RR4EJ93TF
BS 789 1135 RR4EJ93JQ

RD RR4EJ93TF 788 0 0
GAATGATTACCTTGTCACCACTGCTCGCGCCGACAATTACCCGTATGGTATCGATTACCC
GACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCTAACGGCCTTAACATCCCTGGCATTATCAGTGA
GGCTATAGGCATGCCATCCACTCTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACCGGAGAAAATCT
TCTCGTCGGTGCTAATTTCGCCTCCGCCGGTATTGGAATCCTCAATGACACTGGAATTCA
ATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATACTTCGAACAGTACCAGCAACG
AGTGAGCGCATTGATTGGACCAGAGGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTT
AATCACACTCGGCGGCAACGATTTCGTCAACAACTATTATCTCATTCCTTTTTCTGCTCG
TTCGCGCCAATTCGCGTTACCCGACTACGTTGTTTATCTCATTTCGGAATACGGAAAGAT
CCTTAGGAAACTCTACGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAACTGGTGCGAT
GGGATGTGCACCTGCGGAATTGGCTCAGCATAGCCGCAATGGTGAATGCTATGGTGCCCT
CCAAGCAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCGATTAGTTGATTTGATCGCATCAGTCAATGC
TGAGATTGGCCAGGACGTTTTTGTAGCAGCTAATGCCTATCAA*TGAACATGGATTATTT
ATCTAACCCAGA*CAATTCGGGTTTGTGACATCAAAG*TGGCATGCTGTGGACA*GGACC
GTACAATG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4EJ93JQ 705 0 0
TTCGCGTTACCCGACTACGTTGTTTATCTCATTTCGGAATACGGAAAGATCCTTAGGAAA
CTCTACGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAACTGGTGCGATGGGATGTGCA
CCTGCGGAATTGGCTCAGCATAGCCGCAATGGTGAATGCTATGGTGCCCTCCAAGCAGCA
GCCGCTTTGTTCAATCCGCGATTAGTTGATTTGATCGCATCAGTCAATGCTGAGATTGGC
CAGGACGTTTTTGTAGCAGCTAATGCCTATCAAATGAACATGGATTATTTATCTAACCCA
GAACAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGCTGTGGACAAGGACCGTACAATGGC
ATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTGTATGCGTTTTGG
GATGCGTTTCATCCGACAGAAAAAGCTAATAGGATCATTGTTAATCAGATCCTCACTGGT
TCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGCTCTTGGATTTTTCTAGA
ATATAATCTGTAATTTATTTCATTTAGATGTCAAGGTCTTGCCTTTTGCAGTTTCCATTG
TTGGTTAATTATTAGACTTTCTTGTCGGTGATGTGGTTTGATCTTTCTGCCTGTTCTACC
TTTGATAAGCTTTGTTTAGTCTTTATAATGGAGTCATTGTTATAT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6913Contig1 1295 2 8 U
GGAGCGTGGCAACAACATGAGACCGGATTTAGACCCCACGAGGAGCTTCAAATTTGGAGT
AGAAGAAAAGATCCTTTGTTCGTCTGGAAAGGTCTCATATAATAAGAGGGATGACTGTAT
TCTTTCTTTGAACATTCCATTGCAGGAAGCAACTAATAAAGATGAACTAGAAGCCTTTAA
CAACCAGAAAGCAGACAAAGGACTGGAAGAAAATAATATGTCAACTGATGAAATTGTACG
CCCACGAGTTCCTTTAGAAGCTTGTCTAGCAACCTTTTCATCACCTGAGCAGATTCGTGA
TTACTATAGCACTGCTCTGAAAGGGAAGACAACAGCTATCAAGACAACTAGTTTGACATC
GTTCCCAGATTATTTGGTGTTGCACATGCGAAAGTTTGTTATGGAGGCAGTCTGGGTGCC
AAAGAAACTTGATTTGTACATTGATGTTCCAGATGTAATTGATATCAGCCACATGCGCAG
CAAGGGCTTCAGCCTGGAGAGGAACTATTGCCAGACGATGTTGGAGAAGAAGCGATGGAA
TCAACACAGCCTGTGGCAAATGAAGAGATAGTTGCACAACTTGTCTCAATGGGATTCAGC
CAGCTTCACTGCCAGAAAGCCGCCATAAATACTTCTAATACTGGGGTGGAAGATGCGATG
ACCTGGTTGCTTTCTCACATGGATGATCCAGATATCGACGCACCAATCTCCCATCAGACA
TCTGACGTTGATCAATCAAGCGTTGATACCTTAATCTCCTTTGGATTTGCTGAAGAGGTT
GCTCGAAAGGCACTCAAAGCCTCGGGAGGAGATATCGAGAAAGCTACAGATTGGATATTC
AACAACCCTAATGCTTCTATCTCGGACATGGACGTTTCCTCAAGTAATTCAGCACAAACA
CCAGCTCAAAGTGAATTACCAGACGGAGGAGGAAGATACAAGTTATTTGGGATAGTAAGT
CACATGGGAACATCAACACACTGTGGTCACTATGTGGCACACATAATGAAAGAAGGCCGT
TGGGTTATCTTCAATGACAGCAAAGTAGGTGTCTCGACAAATCCTCCTAAAGACATGGGT
TACCTCTACTTCTTTCAGCGTTTGGACAATTGATATGGGAGAGGCCCGAGAGTGTTGACT
TCTATGGATCGAGCCAAGAAAGGAAAGACAGAAACTAGCCCGTTCTTCTTTCAATATGAA
TTTTAGGTCTAGGGTTTTAAGATTTGGATTGAGTTGTCCTGTGCATGGGTGACGACTTGG
GTTTCCAAATTTTACTTGTGGATTATGAAAAAGGA


BQ
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AF RR4DA14TF U 1
AF RR4DA14JQ C 567
BS 1 743 RR4DA14TF
BS 744 744 RR4DA14JQ
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BS 759 759 RR4DA14JQ
BS 760 777 RR4DA14TF
BS 778 1295 RR4DA14JQ

RD RR4DA14TF 794 0 0
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AGAAGAAAAGATCCTTTGTTCGTCTGGAAAGGTCTCATATAATAAGAGGGATGACTGTAT
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CAACCAGAAAGCAGACAAAGGACTGGAAGAAAATAATATGTCAACTGATGAAATTGTACG
CCCACGAGTTCCTTTAGAAGCTTGTCTAGCAACCTTTTCATCACCTGAGCAGATTCGTGA
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GTTCCCAGATTATTTGGTGTTGCACATGCGAAAGTTTGTTATGGAGGCAGTCTGGGTGCC
AAAGAAACTTGATTTGTACATTGATGTTCCAGATGTAATTGATATCAGCCACATGCGCAG
CAAGGGCTTCAGCCTGGAGAGGAACTATTGCCAGACGATGTTGGAGAAGAAGCGATGGAA
TCAACACAGCCTGTGGCAAATGAAGAGATAGTTGCACAACTTGTCTCAATGGGATTCAGC
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ACCTGGTTGCTTTCTCACATGGATGATCCAGATATCGACGCACCAATCTCCCATCAGACA
TCTGACGTTGATCAATCAAGCGT*GATACCTTA*TCTC*TTTGGATTTGCTGAAGAG
TGCTCGAAAGCACTCAA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4DA14JQ 729 0 0
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TCCAGATATCGACGCACCAATCTCCCATCAGACATCTGACGTTGATCAATCAAGCGTTGA
TACCTTAATCTCCTTTGGATTTGCTGAAGAGGTTGCTCGAAAGGCACTCAAAGCCTCGGG
AGGAGATATCGAGAAAGCTACAGATTGGATATTCAACAACCCTAATGCTTCTATCTCGGA
CATGGACGTTTCCTCAAGTAATTCAGCACAAACACCAGCTCAAAGTGAATTACCAGACGG
AGGAGGAAGATACAAGTTATTTGGGATAGTAAGTCACATGGGAACATCAACACACTGTGG
TCACTATGTGGCACACATAATGAAAGAAGGCCGTTGGGTTATCTTCAATGACAGCAAAGT
AGGTGTCTCGACAAATCCTCCTAAAGACATGGGTTACCTCTACTTCTTTCAGCGTTTGGA
CAATTGATATGGGAGAGGCCCGAGAGTGTTGACTTCTATGGATCGAGCCAAGAAAGGAAA
GACAGAAACTAGCCCGTTCTTCTTTCAATATGAATTTTAGGTCTAGGGTTTTAAGATTTG
GATTGAGTTGTCCTGTGCATGGGTGACGACTTGGGTTTCCAAATTTTACTTGTGGATTAT
GAAAAAGGA

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AD60TF C 1
AF RR4AD60JQ U 4
BS 1 3 RR4AD60TF
BS 4 342 RR4AD60JQ

RD RR4AD60TF 342 0 0
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ATCCACCTAGATAAACAATCTATGTGGATCATCGTCATAAACTAAAAACACAAGACTGAT
GAGGTTTGCTTCTAAAGAAGAGACTCATGTTCTCTTAGAGATGGCCATCACATTAAAGTT
GAGCGTGTCCGGATTCTTCTCAATAATCTTCTTTATCACTTTCGCCGCATCCTTCAACAG
GGTAGCTGGAGAGGAAGCACCATGTGAAACTGGTCCTGCTTTTCTTCCATCAAGTTCATA
GAGCTCCCCTGCAATATATAATTTAGTTCCAATTCGGAAGCC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR4AD60JQ 339 0 0
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GTTTGCTTCTAAAGAAGAGACTCATGTTCTCTTAGAGATGGCCATCACATTAAAGTTGAG
CGTGTCCGGATTCTTCTCAATAATCTTCTTTATCACTTTCGCCGCATCCTTCAACAGGGT
AGCTGGAGAGGAAGCACCATGTGAAACTGGTCCTGCTTTTCTTCCATCAAGTTCATAGAG
CTCCCCTGCAATATATAATTTAGTTCCAATTCGGAAGCC

QA 1 339 1 339
DS 



AS 1 2

CO CL6915Contig1 992 2 2 U
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ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGGTATGTTATA
TATAGTAAACTTTTCATCCAATACGTTATCATCATACCATTAAAACATAATCATTCTCTT
TATCATTTTCTTAAAATTTTAATTTATACAGATGTTAATTTAAAAGTTGGTGCGCGGAGA
CCATATTGCTATAGAGAAACTGATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCAAAACAGTGC
CGAAAGATCAAAGTGGATTGTAATGCGATTTGTAAACCCAAACGCCGTCTTTAATTTTCC
AGAAGAAATGTTCTTTTTTTCGTCATCAAATACACAGACTCATATAGATTCTGCACACCA
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TAAACGATCCGCCCTTGAATTCTCCGTTCGTGGTACATGAATGAGCTGTGAGCTATGGAA
ACTGCCTTGTAGACTCTTTATATCCTCCAGATAACTTGCGAACGCTGTCCACTCCTCTGG
TTCTGAAACCATCTTCACCAACTGAGAACAATCCGTTGCAAACGTAACCTGAAACTGTCG
TAAGTTTTTCATACACTCCATTGCCCAAATTAAAGCCTCCACCTCCGAGTGAAGGGGTGA
TATACTAGCTCGAACATCTCGCGTCCCCATTAGTCCCTCAAAACCTTCCAAAGTGCTATA
CCAGCCTTGTCCCGAGAAAACGTCCTTGTCCTTCCATGATCCATCTGTAAAACACCATCT
CTCTGGAATTGTTTTTTTGTTGAATAGCTTGTGGCGGTAGATTTCTTCTTACATCTAATT
CTTGTGCCGCTGTCCACATAGTAGATTCCGTTTCTGCTAATTTTAAAGTGTACATTGGAT
CCACATCCAGGTTACTAAACACCTTGTTGTAC


BQ
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AF RR4FI81TF U 1
AF RR4FI81JQ C 374
BS 1 712 RR4FI81TF
BS 713 992 RR4FI81JQ

RD RR4FI81TF 712 0 0
GGATCTCACAAACTAACAAAACATTTATTTGCAAAGAAGAAATACAATGTCAACATCCAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGGTATGTTATA
TATAGTAAACTTTTCATCCAATACGTTATCATCATACCATTAAAACATAATCATTCTCTT
TATCATTTTCTTAAAATTTTAATTTATACAGATGTTAATTTAAAAGTTGGTGCGCGGAGA
CCATATTGCTATAGAGAAACTGATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCAAAACAGTGC
CGAAAGATCAAAGTGGATTGTAATGCGATTTGTAAACCCAAACGCCGTCTTTAATTTTCC
AGAAGAAATGTTCTTTTTTTCGTCATCAAATACACAGACTCATATAGATTCTGCACACCA
AACTGGTAGCTCTGCATCCATGTGAACGACGAAAGACGATTGTTGTCTGGCACTACGTGC
TAAACGATCCGCCCTTGAATTCTCCGTTCGTGGTACATGAATGAGCTGTGAGCTATGGAA
ACTGCCTTGTAGACTCTTTATATCCTCCAGATAACTTGCGAACGCTGTCCACTCCTCTGG
TTCTGAAACCATCTTCACCAACTGAGAACAATCCGTTGCAAACGTAACCTGAAACTGTCG
TAAGTTTTTCATACACTCCATTGCCCAAATTAAAGCCTCCACCTCCGAGTGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4FI81JQ 619 0 0
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GCATCCATGTGAACGACGAAAGACGATTGTTGTCTGGCACTACGTGCTAAACGATCCGCC
CTTGAATTCTCCGTTCGTGGTACATGAATGAGCTGTGAGCTATGGAAACTGCCTTGTAGA
CTCTTTATATCCTCCAGATAACTTGCGAACGCTGTCCACTCCTCTGGTTCTGAAACCATC
TTCACCAACTGAGAACAATCCGTTGCAAACGTAACCTGAAACTGTCGTAAGTTTTTCATA
CACTCCATTGCCCAAATTAAAGCCTCCACCTCCGAGTGAAGGGGTGATATACTAGCTCGA
ACATCTCGCGTCCCCATTAGTCCCTCAAAACCTTCCAAAGTGCTATACCAGCCTTGTCCC
GAGAAAACGTCCTTGTCCTTCCATGATCCATCTGTAAAACACCATCTCTCTGGAATTGTT
TTTTTGTTGAATAGCTTGTGGCGGTAGATTTCTTCTTACATCTAATTCTTGTGCCGCTGT
CCACATAGTAGATTCCGTTTCTGCTAATTTTAAAGTGTACATTGGATCCACATCCAGGTT
ACTAAACACCTTGTTGTAC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL6916Contig1 1092 2 2 U
CTGCTCGCTGAGAAAGCTCACAACCTTAACTCATGGAGTCCATATCCCTCCCCATTCTAA
ATCCTCTGTTAGCTTCTGGTTCTAATCTTTACAGAAAACAGAGCTCGAGGATGACCTCTT
CAATGACATCTTCCCTTAATTTCGCAATGGGAAGCACATCCTTTTCCACTATTCGCCGCT
CTAGAGTAGGTGTTGTTAAGATGCAAGCTGTTGATGAAGATGTTGATCTGAAGCAAATGA
GAGACATGGCTGCTGCTAAAAAACGTTGGGATGGTTTGTTAAGGGAAGGAAAGGTGAAGC
TTCTGACACCAAGGGAAGCAGGCTATGCTATTCAGCTTTCAAATAAACCTCTACTCGATG
TCCGTCCCTCTAGCGAGCGAAACAAGGCATGGGTTAAAGGCTCAGACTGGGTTCCTATCT
TCGACAATGAAGACAACCTTGACGCTGGAACTCTTTCCAAAAAGGTCACCAGTTTTGCTA
TGGGTGGATGGTGGAGTGGTGCACCTACTTTATCTTTCAATAAGCTCTTCTTGTCAAAGG
TTGAGGAGAAATTCCCTAAAGAGACAGAGCTGATCGTTGCATGCCAAAAAGGATTGAGAT
CCTTAGCTGCTTGCGAGCTACTATATAATGCTGGATATCAGAATATTTTCTGGGTGCAAG
GTGGTTTAGAGTCAGCTGAAGAAGAGGATCTAGCCACAGAAAGTTCTCAGCCATTGAAGC
TTGCTGGGATTGGGGGCTTTTCAGAGTTCCTCGGTTGGACAGACCAGCAAAGAGCTCAAG
CAGCGAAAGAAGGTTGGGGTTACCGTTTAGTATTTACTGCTCGTCTGTTTGGAGTTATTT
TGGCCGCGGATGCCTTGTTCCTTGGTGCTCAGCAACTTGGTCATTACATTCAGGAGTTAA
GAGGCCACTAGGATCTCTCTCTCTCTATCTATCTATCCAAGCTCCAAGTGGTTATGCTGC
TTCTCTTCACAAACACAAAAAAAAAAACTGTAAATGTATGTTGAAGAATGTAGTTTTTGA
GGTAAAGTAGTTGAACTTGAGATAGTGAAAAAACATGTTTAAATTTTGAAAAAGCATCGA
TTTCTGTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AY43TF U 1
AF RR4AY43JQ C 433
BS 1 784 RR4AY43TF
BS 785 1092 RR4AY43JQ

RD RR4AY43TF 784 0 0
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ATCCTCTGTTAGCTTCTGGTTCTAATCTTTACAGAAAACAGAGCTCGAGGATGACCTCTT
CAATGACATCTTCCCTTAATTTCGCAATGGGAAGCACATCCTTTTCCACTATTCGCCGCT
CTAGAGTAGGTGTTGTTAAGATGCAAGCTGTTGATGAAGATGTTGATCTGAAGCAAATGA
GAGACATGGCTGCTGCTAAAAAACGTTGGGATGGTTTGTTAAGGGAAGGAAAGGTGAAGC
TTCTGACACCAAGGGAAGCAGGCTATGCTATTCAGCTTTCAAATAAACCTCTACTCGATG
TCCGTCCCTCTAGCGAGCGAAACAAGGCATGGGTTAAAGGCTCAGACTGGGTTCCTATCT
TCGACAATGAAGACAACCTTGACGCTGGAACTCTTTCCAAAAAGGTCACCAGTTTTGCTA
TGGGTGGATGGTGGAGTGGTGCACCTACTTTATCTTTCAATAAGCTCTTCTTGTCAAAGG
TTGAGGAGAAATTCCCTAAAGAGACAGAGCTGATCGTTGCATGCCAAAAAGGATTGAGAT
CCTTAGCTGCTTGCGAGCTACTATATAATGCTGGATATCAGAATATTTTCTGGGTGCAAG
GTGGTTTAGAGTCAGCTGAAGAAGAGGATCTAGCCACAGAAAGTTCTCAGCCATTGAAGC
TTGCTGGGATTGGGGGCTTTTCAGAGTTCCTCGGTTGGACAGACCAGCAAAGAGCTCAAG
CAGC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AY43JQ 660 0 0
ACAC
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TGGTGCACCTACTTTATCTTTCAATAAGCTCTTCTTGTCAAAGGTTGAGGAGAAATTCCC
TAAAGAGACAGAGCTGATCGTTGCATGCCAAAAAGGATTGAGATCCTTAGCTGCTTGCGA
GCTACTATATAATGCTGGATATCAGAATATTTTCTGGGTGCAAGGTGGTTTAGAGTCAGC
TGAAGAAGAGGATCTAGCCACAGAAGGTTTTCAGCCATTGAAGCTTGCTGGGATTGGGGG
CTTTTCAGAGTTCCTCGGTTGGACAGACCAGCAAAGAGCTCAAGCAGCGAAAGAAGGTTG
GGGTTACCGTTTAGTATTTACTGCTCGTCTGTTTGGAGTTATTTTGGCCGCGGATGCCTT
GTTCCTTGGTGCTCAGCAACTTGGTCATTACATTCAGGAGTTAAGAGGCCACTAGGATCT
CTCTCTCTCTATCTATCTATCCAAGCTCCAAGTGGTTATGCTGCTTCTCTTCACAAACAC
AAAAAAAAAAACTGTAAATGTATGTTGAAGAATGTAGTTTTTGAGGTAAAGTAGTTGAAC
TTGAGATAGTGAAAAAACATGTTTAAATTTTGAAAAAGCATCGATTTCTGTTAACC

QA 5 660 5 660
DS 



AS 1 2

CO CL6917Contig1 865 2 2 U
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AGACAAAATTAAATTTCCTTTTCTTTTCTTGTCACAGATTATTACAACTGAAGTTCCAAG
TTCTGCAGATCAAATCTTCTTGAGATCTTGGTGAAATAAAGTCTTAGTTCATCAGAACAT
GGAGAAGATTCTTAATCCGTACGAAAAGCAGTACATGAAAATGGCTATGCTTAAACATGA
AGAAACGTTCAAGCAACAGGTATATGAACCTCATAGGTTATATCAAGTCCAAAAGATTTT
GATGAAGAACATGCAGATCAACGAGGGGAGTAATGTAAGTTCAGGACTAGGGACGCTCAT
CAGAAGAGTTGATCAAGATATTGACCAACCGGCGAATTTTCCCGGCGGAGAAGGCTCCGG
TGGAAATAATAAGATTATGGACGAGAGTGAGATCGAGCTAACGCTTGGGCCCTCATGTTA
CGGTGGCGATTTGATGAGAATGAACAAGAAGATGAAAAATAATTCTTGGCCGGAGATAAT
GGACGAAAATTTAAATTCTGGCAGCCCGAGCTTCTCGTCGTCTTCGACAGGGTCAAGCAA
TAATAACCACAGCAATCTTGAAGAACAAGAGAGACAAGAGAGATTAATGAAACATCAGAA
GCAGAAGCAGCAATGGCTTCAAGCATTGACTTTGAATGTTATTTGATAATAATAAATAAC
ATTCATATTACACTATATTTTGAAATAGATTTCCATTTTTTTTTTCAGTTTAGTTTTTTT
TTAATCAGATGATCTTTTTAGTGCTTATCAGTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAACA
ACTATCAGTAAATTTCTTCTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY62TF U 1
AF RR4GY62JQ C 232
BS 1 586 RR4GY62TF
BS 587 865 RR4GY62JQ

RD RR4GY62TF 586 0 0
GGGTGCTCAGATTTATAACATTAGTGGCTAAAAATTGCAGAATCTAAATCGGGTACTAGC
AGACAAAATTAAATTTCCTTTTCTTTTCTTGTCACAGATTATTACAACTGAAGTTCCAAG
TTCTGCAGATCAAATCTTCTTGAGATCTTGGTGAAATAAAGTCTTAGTTCATCAGAACAT
GGAGAAGATTCTTAATCCGTACGAAAAGCAGTACATGAAAATGGCTATGCTTAAACATGA
AGAAACGTTCAAGCAACAGGTATATGAACCTCATAGGTTATATCAAGTCCAAAAGATTTT
GATGAAGAACATGCAGATCAACGAGGGGAGTAATGTAAGTTCAGGACTAGGGACGCTCAT
CAGAAGAGTTGATCAAGATATTGACCAACCGGCGAATTTTCCCGGCGGAGAAGGCTCCGG
TGGAAATAATAAGATTATGGACGAGAGTGAGATCGAGCTAACGCTTGGGCCCTCATGTTA
CGGTGGCGATTTGATGAGAATGAACAAGAAGATGAAAAATAATTCTTGGCCGGAGATAAT
GGACGAAAATTTAAATTCTGGCAGCCCGAGCTTCTCGTCGTCTTCG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4GY62JQ 634 0 0
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AAAGATTTTGATGAAGAACATGCAGATCAACGAGGGGAGTAATGTAAGTTCAGGACTAGG
GACGCTCATCAGAAGAGTTGATCAAGATATTGACCAACCGGCGAATTTTCCCGGCGGAGA
AGGCTCCGGTGGAAATAATAAGATTATGGACGAGAGTGAGATCGAGCTAACGCTTGGGCC
CTCATGTTACGGTGGCGATTTGATGAGAATGAACAAGAAGATGAAAAATAATTTTTGGCC
GGAGATAATGGACGAAAATTTAAATTTTGGCAGCCGGAGCTTCTCGTCGTTTTCGACAGG
GTCAAGCAATAATAACCACAGCAATCTTGAAGAACAAGAGAGACAAGAGAGATTAATGAA
ACATCAGAAGCAGAAGCAGCAATGGCTTCAAGCATTGACTTTGAATGTTATTTGATAATA
ATAAATAACATTCATATTACACTATATTTTGAAATAGATTTCCATTTTTTTTTTCAGTTT
AGTTTTTTTTTAATCAGATGATCTTTTTAGTGCTTATCAGTAAATTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTGAACAACTATCAGTAAATTTCTTCTATTCT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6918Contig1 869 2 2 U
GGCCACAACTTCCATTACCAATCTCACTTCACACCAACTTCTCTCTCCCTCAAACAACCC
ACTTCCACCGCCACATTCTCATCACTCATCTGCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGGCC
GTCGTCACCTCTGCTACCACCACAAACGCTTCCGACATAACCACCGAAACCACAACCGAG
TTCGATGTCCTAGCGACCCATCTGATCAACCAAGATTTCAAGAAAGCAGACGAAGAAACT
AGGAGACTTCTCATTCAGATAGCAGGAGAAGCAGCCATTAAACGCGGCTATGTTTTCTTC
TCTGAGGTGAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAA
CACAGCGATGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAA
GACTTCACAAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACGGAGGTGGTC
CAGTACAACTACAGAGCTTTCCCTGACGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCT
CTAGGACACTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTCTGAAATGCGTTTTA
AGCCATCCTGCGTTTGAGATAGCTGGCGATGATGATAATGAAGAAGGAGATGAGGCAGAG
ACAAAAGGTGGTGGTAAAGGACAGACAAAAGACACAAGAGTGTTTAAAACAGATTACAGC
TTCTGATGTCTTTGATTTTTATTTGGATTATGAATATGTATGAACAGTCAATTAGTTAAT
GAATATAAACCAAAAGTCTTTATTGGTTGATCAATGTAAGTTCCTGAAGATATTATCATT
TTCAGACAGATCAAATCCGAAACAACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB48TF U 1
AF RR4EB48JQ C 305
BS 1 644 RR4EB48TF
BS 645 869 RR4EB48JQ

RD RR4EB48TF 644 0 0
GGCCACAACTTCCATTACCAATCTCACTTCACACCAACTTCTCTCTCCCTCAAACAACCC
ACTTCCACCGCCACATTCTCATCACTCATCTGCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGGCC
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TTCGATGTCCTAGCGACCCATCTGATCAACCAAGATTTCAAGAAAGCAGACGAAGAAACT
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TCTGAGGTGAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAA
CACAGCGATGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAA
GACTTCACAAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACGGAGGTGGTC
CAGTACAACTACAGAGCTTTCCCTGACGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCT
CTAGGACACTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTCTGAAATGCGTTTTA
AGCCATCCTGCGTTTGAGATAGCTGGCGATGATGATAATGAAGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4EB48JQ 565 0 0
AGGTGAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAACACA
GCGATGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACT
TCACAAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACGGAGGTGGTCCAGT
ACAACTACAGAGCTTTCCCTGACGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCTTTAG
GACACTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTCTGAAATGCGTTTTAAGCC
ATCCTGCGTTTGAGATAGCTGGCGATGATGATAATGAAGAAGGAGATGAGGCAGAGACAA
AAGGTGGTGGTAAAGGACAGACAAAAGACACAAGAGTGTTTAAAACAGATTACAGCTTCT
GATGTCTTTGATTTTTATTTGGATTATGAATATGTATGAACAGTCAATTAGTTAATGAAT
ATAAACCAAAAGTCTTTATTGGTTGATCAATGTAAGTTCCTGAAGATATTATCATTTTCA
GACAGATCAAATCCGAAACAACTTC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL6919Contig1 721 2 3 U
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TCTAGAAAACCCTAGAACTGGGAAGATCGCCAAGATCGAGGGAAGATCAAAGTAGGGTTA
ATATTGATGGGGAGAGGCAAGATTGTGATCCAGAGGATCGATGATTCGACTAGTAGGCAA
GTCACTTTCTCCAAAAGAAGAAAGGGTCTCATAAAGAAAGCTAAAGAACTCGCGATTCTC
TGCGATGCAGAGGTGGGTCTCATCATTTTCTCCAATACCGACAAGCTCTATGACTTTGCC
AGCTCCAGTTTGAAATCGACTATAGAACGATTCAACAAGACCAGGATGGAGCAGCAACGA
CTATTGAACCCTGCATCAGAAGTTAAGTTTTGGCAGAGAGAGGCCACAACTCTAAGACAA
GAACTGCACTCATTGCAGGAAACTCATCGACAACTAACGGGACAGCAATTAAATGGTCTG
AGCGTCAAGGAGTTGCACAATATAGAAAGCCAACTTGAAATGAGTTTACGTGGAATTCGT
ATTAAAAAGGTAATATCTATCTCTCTACACACACACACATATATATATTAAAGTTCAATG
ATAGATGATGTACATGACGAGCGAGATGCCTTCCTGGGTCTTCAATAGAGCTAGATGTCC
AAATGAAATGACGTATGTTTAACTTATTCTTTTTTTTTGAACTAATGCGTATGTTTAACT
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4BX11JQ C 1
AF RR4BX11TF U 1
BS 1 697 RR4BX11TF
BS 698 698 RR4BX11JQ
BS 699 721 RR4BX11TF

RD RR4BX11JQ 721 0 0
GGTCTCATCTATTTCTCCTTATTCGTTCTTCTTTTTCTTCCTCCTTTGGTCTTGCTAAGA
TCTAGAAAACCCTAGAACTGGGAAGATCGCCAAGATCGAGGGAAGATCAAAGTAGGGTTA
ATATTGATGGGGAGAGGCAAGATTGTGATCCAGAGGATCGATGATTCGACTAGTAGGCAA
GTCACTTTCTCCAAAAGAAGAAAGGGTCTCATAAAGAAAGCTAAAGAACTCGCGATTCTC
TGCGATGCAGAGGTGGGTCTCATCATTTTCTCCAATACCGACAAGCTCTATGACTTTGCC
AGCTCCAGTTTGAAATCGACTATAGAACGATTCAACAAGACCAGGATGGAGCAGCAACGA
CTATTGAACCCTGCATCAGAAGTTAAGTTTTGGCAGAGAGAGGCCACAACTCTAAGACAA
GAACTGCACTCATTGCAGGAAACTCATCGACAACTAACGGGACAGCAATTAAATGGTCTG
AGCGTCAAGGAGTTGCACAATATAGAAAGCCAACTTGAAATGAGTTTACGTGGAATTCGT
ATTAAAAAGGTAATATCTATCTCTCTACACACACACACATATATATATTAAAGTTCAATG
ATAGATGATGTACATGACGAGCGAGATGCCTTCCTGGGTCTTCAATAGAGCTAGATGTCC
AAATGAAATGACGTATGTTTAACTTATTCTTTTTTTTTGAACTAATGCGTATGTTTAACT
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4BX11TF 721 0 0
GGTCTCATCTATTTCTCCTTATTCGTTCTTCTTTTTCTTCCTCCTTTGGTCTTGCTAAGA
TCTAGAAAACCCTAGAACTGGGAAGATCGCCAAGATCGAGGGAAGATCAAAGTAGGGTTA
ATATTGATGGGGAGAGGCAAGATTGTGATCCAGAGGATCGATGATTCGACTAGTAGGCAA
GTCACTTTCTCCAAAAGAAGAAAGGGTCTCATAAAGAAAGCTAAAGAACTCGCGATTCTC
TGCGATGCAGAGGTGGGTCTCATCATTTTCTCCAATACCGACAAGCTCTATGACTTTGCC
AGCTCCAGTTTGAAATCGACTATAGAACGATTCAACAAGACCAGGATGGAGCAGCAACGA
CTATTGAACCCTGCATCAGAAGTTAAGTTTTGGCAGAGAGAGGCCACAACTCTAAGACAA
GAACTGCACTCATTGCAGGAAACTCATCGACAACTAACGGGACAGCAATTAAATGGTCTG
AGCGTCAAGGAGTTGCACAATATAGAAAGCCAACTTGAAATGAGTTTACGTGGAATTCGT
ATTAAAAAGGTAATATCTATCTCTCTACACACACACACATATATATATTAAAGTTCAATG
ATAGATGATGTACATGACGAGCGAGATGCCTTCCTGGGTCTTCAATAGAGCTAGATGTCC
AAATGAAATGACGTATGTTTAACTTATTCTTTTTTTT*GAACTAATGCGTATGTTTAACT
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6920Contig1 1044 2 8 U
GATATACTGCACATCTCAGCTGGTTATAACCACTCTGCTGCTGTTACAGTGGATGGGGAA
CTCTACATGTGGGGAAAGAATACCAGTGGGCAGCTTGGACTTGGAAAAAACGCTGCAAGA
GTGGTACATGTTCCAACCAAAGTGGAGGCTCTGAATGGGATCACCGTCAAATCAGTGGCT
TTGGGTTCAGAGCATTCAGTTGCTGTTACTGATGGAGGTGAAGTCCTGAGTTGGGGAGGA
GGATCTGGGAGACTTGGCCACGGTCACGAGTCCAGTTTTTTTGGCATCTTAAAAAGTAAA
AGTGAGTTTACTCCAAGGCTTATCAAGGAACTTGAGGGGATTAAGGTTAACAACGTTGCT
GCTGGTCTACTGCATACAGCATGCACTGATGGGAATGGCTCTGCTTTCATGTTCGGAGAG
AGATCTATAAATAAGATGGGATTTGGAGGAGTAAGGAATGCTACAACACCATCCATTATC
AGTGATGTGCCGTACGCAGAAGAAGTTGCATGTGGTGGTTACCACACATGTGTTGTCACA
AGAAGTGGGGAACTTTACACCTGGGGTTCAAACGAAAATGGGTGCCTTGGCACAGAGTCA
ACATATGTCTCACACTCCCCCGTGAGAGTCGAAGGTCCTTTCTTGGAATCAGCTGTGACT
CATGTATCTTGTGGGTGGAAGCACACTGCAGCCATTTCAGATAACAAAGTTTTTACCTGG
GGCTGGGGAGGTTCTCACGGCACATTCTCTGTTGACGGGCACTCCTCCGGTGGACAACTG
GGACATGGTGATGATGTAGACTATGCAATACCAGCAATGGTGAACCTGGGAAAGAATGTA
GGAGCAGTGCATATATCTTGTGGCTTTAATCATACAGGAGCAGTTCTCGAACATTTTTGA
AGACTTCATGAAACACATTTCATTTCATATACATATGTTTTTGATTCGTTATACCTTCTT
AATGTTTTGTACATCAGAATCAACTCTAAAGGGAGAAACAAATGGATCTCTATTTGTAAG
AATAATATATATAATTCTTCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY30TF U 1
AF RR4GY30JQ C 277
BS 1 504 RR4GY30TF
BS 505 505 RR4GY30JQ
BS 506 567 RR4GY30TF
BS 568 568 RR4GY30JQ
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BS 583 620 RR4GY30TF
BS 621 1044 RR4GY30JQ

RD RR4GY30TF 625 0 0
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CTCTACATGTGGGGAAAGAATACCAGTGGGCAGCTTGGACTTGGAAAAAACGCTGCAAGA
GTGGTACATGTTCCAACCAAAGTGGAGGCTCTGAATGGGATCACCGTCAAATCAGTGGCT
TTGGGTTCAGAGCATTCAGTTGCTGTTACTGATGGAGGTGAAGTCCTGAGTTGGGGAGGA
GGATCTGGGAGACTTGGCCACGGTCACGAGTCCAGTTTTTTTGGCATCTTAAAAAGTAAA
AGTGAGTTTACTCCAAGGCTTATCAAGGAACTTGAGGGGATTAAGGTTAACAACGTTGCT
GCTGGTCTACTGCATACAGCATGCACTGATGGGAATGGCTCTGCTTTCATGTTCGGAGAG
AGATCTATAAATAAGATGGGATTTGGAGGAGTAAGGAATGCTACAACACCATCCATTATC
AGTGATGTGCCGTACGCAGAAGAA*TTGCATGTGGTGGTTACCACACATGTGTTGTCACA
AGAAGTGGGGAACTTTACACCTGGGGT*CAAACGAAAATGG*TGCCTTGGCACAGAGTCA
ACATATGTCTCACACTCCCC
GTGAG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4GY30JQ 768 0 0
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GGGATTAAGGTTAACAACGTTGCTGCTGGTCTACTGCATACAGCATGCACTGATGGGAAT
GGCTCTGCTTTCATGTTCGGAGAGAGATCTATAAATAAGATGGGATTTGGAGGAGTAAGG
AATGCTACAACACCATCCATTATCAGTGATGTGCCGTACGCAGAAGAAGTTGCATGTGGT
GGTTACCACACATGTGTTGTCACAAGAAGTGGGGAACTTTACACCTGGGGTTCAAACGAA
AATGGGTGCCTTGGCACAGAGTCAACATATGTCTCACACTCCCCCGTGAGAGTCGAAGGT
CCTTTCTTGGAATCAGCTGTGACTCATGTATCTTGTGGGTGGAAGCACACTGCAGCCATT
TCAGATAACAAAGTTTTTACCTGGGGCTGGGGAGGTTCTCACGGCACATTCTCTGTTGAC
GGGCACTCCTCCGGTGGACAACTGGGACATGGTGATGATGTAGACTATGCAATACCAGCA
ATGGTGAACCTGGGAAAGAATGTAGGAGCAGTGCATATATCTTGTGGCTTTAATCATACA
GGAGCAGTTCTCGAACATTTTTGAAGACTTCATGAAACACATTTCATTTCATATACATAT
GTTTTTGATTCGTTATACCTTCTTAATGTTTTGTACATCAGAATCAACTCTAAAGGGAGA
AACAAATGGATCTCTATTTGTAAGAATAATATATATAATTCTTCAACG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6921Contig1 845 2 2 U
GGGTCTTGCACCCACAATCAATGAGGCCAGCAAGAGAGGGTGAGATTCCTGTTAGGGTTA
AAAATTCTTATAACCCTAAAGCTCCTGGAACTATCATCACTAAAACTAGAGACATGACCA
AGACAGTTTTAACGAGCATTGTTCTGAAACGCAATGTGACCATGCTGGATATAGCAAGCA
CCCGTATGCTTGGTCAAGTTGGCTTTCTTGCAAAGGTATTTTCGATATTTGAGGACCTGG
AGATATCCGTAGATGTTGTTGCCACTAGTGAAGTCAGCTTATCTCTGACGTTGGACCCGT
CAAAACTCTGGAGCAGGGAACTGATTCAACAGGAACTTGATCATGTAGTTGAGGAACTGG
AGAAAATTGCAGTTGTGAATCTCTCAAAGGGGAGAGCTATGATCTCTTTAATTGGGAATG
TTCAACATTCCTCCCTGATTTTAGAGAGGGCGTTTCATGTTCTTCGGACAAAAGGTATCA
ATGTCCAGATGATATCACAAGGAGCATCCAAGGTAAACATTTCTCTTATAGTAAATGATG
ATGAAGCAGAAGGATGCGTTGAGGCTCTTCACAAATCTTTCTTTGAGAGCGGTGACCTCT
CAGAGTTACTGATACAACCCAGACTTGGCAACGGGTCACTCCTTAGGACAATGCAAGTAG
AAAATTGACTTTGAGCGAGCTTCATTACTTGATTTGCAATTTTTCTTTGTATTGCTTTTG
AGTTTTTATGTTCTGTTTGTTTGTCCACTACTTGTTTCATTTGGTATGAGAACGTTTTTC
TTGGACCATTTGTATGATTTATTTTATTTTTAACCAATAAGGGAAAGAAATATATTTGAG
ATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4FG79TF U 1
AF RR4FG79JQ C 287
BS 1 644 RR4FG79TF
BS 645 845 RR4FG79JQ

RD RR4FG79TF 644 0 0
GGGTCTTGCACCCACAATCAATGAGGCCAGCAAGAGAGGGTGAGATTCCTGTTAGGGTTA
AAAATTCTTATAACCCTAAAGCTCCTGGAACTATCATCACTAAAACTAGAGACATGACCA
AGACAGTTTTAACGAGCATTGTTCTGAAACGCAATGTGACCATGCTGGATATAGCAAGCA
CCCGTATGCTTGGTCAAGTTGGCTTTCTTGCAAAGGTATTTTCGATATTTGAGGACCTGG
AGATATCCGTAGATGTTGTTGCCACTAGTGAAGTCAGCTTATCTCTGACGTTGGACCCGT
CAAAACTCTGGAGCAGGGAACTGATTCAACAGGAACTTGATCATGTAGTTGAGGAACTGG
AGAAAATTGCAGTTGTGAATCTCTCAAAGGGGAGAGCTATGATCTCTTTAATTGGGAATG
TTCAACATTCCTCCCTGATTTTAGAGAGGGCGTTTCATGTTCTTCGGACAAAAGGTATCA
ATGTCCAGATGATATCACAAGGAGCATCCAAGGTAAACATTTCTCTTATAGTAAATGATG
ATGAAGCAGAAGGATGCGTTGAGGCTCTTCACAAATCTTTCTTTGAGAGCGGTGACCTCT
CAGAGTTACTGATACAACCCAGACTTGGCAACGGGTCACTCCTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4FG79JQ 559 0 0
GACGTTGGACCCGTCAAAACTCTGGAGCAGGGAACTGATTCAACAGGAACTTGATCATGT
AGTTGAGGAACTGGAGAAAATTGCAGTTGTGAATCTCTCAAAGGGGAGAGCTATGATTTC
TTTAATTGGGAATGTTCAACATTCCTCCCTGATTTTAGAGAGGGCGTTTCATGTTTTTCG
GACAAAAGGTATCAATGTCCAGATGATATCACAAGGAGCATCCAAGGTAAACATTTTTTT
TATAGTAAATGATGATGAAGCAGAAGGATGCGTTGAGGCTTTTCACAAATCTTTCTTTGA
GAGCGGTGACCTTTCAGAGTTACTGATACAACCCAGACTTGGCAACGGGTCACTCCTTAG
GACAATGCAAGTAGAAAATTGACTTTGAGCGAGCTTCATTACTTGATTTGCAATTTTTCT
TTGTATTGCTTTTGAGTTTTTATGTTCTGTTTGTTTGTCCACTACTTGTTTCATTTGGTA
TGAGAACGTTTTTCTTGGACCATTTGTATGATTTATTTTATTTTTAACCAATAAGGGAAA
GAAATATATTTGAGATGGT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL6922Contig1 1223 2 2 U
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AGATCCTTCTTACAAAGGCACTATTGACTGCTTCGTTAAAACTCTGAAGGCGGACGGTCC
TATGGCATTCTACAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAATGTCAT
CATGTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTCCAATAA
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GTATTTTGGAATAGACTGTACCG


BQ
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AF RR4B169TF U 1
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BS 759 1223 RR4B169JQ

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TGGGAAAGATCATGTAGGTGATGTTCCGTTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTTGACAAC
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TGAAGGGAAACTACCTGCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGCGTATTC
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CTTGAAGATTCCAGGTTTCACTGATAACGTTGTCACAC

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DS 

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AAGATTCCAGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTCTCTGGACTAGGAGCAGGA
TTCTTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCCGTTGACGTGGTTAAGTCGAGAATGATGGGAGAT
CCTTCTTACAAAGGCACTATTGACTGCTTCGTTAAAACTCTGAAGGCGGACGGTCCTATG
GCATTCTACAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAATGTCATCATG
TTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTCCAATAAACAC
TGAGAAACAGAACATTAAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATAAGAGCAACACTGTTTTCT
TCTTTAATTTCGGTGGTCGAGAGAGGCCGAAACTTCATTGAATATTGTTTTTGGAATAGA
GAGTCGTTTTCAAGCAAAACTGTGAAATAAATATATGTTGGTTGCTTAAAATAAATGTAT
TTTGGAATAGACTGTACCG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

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AATTCAACTTTGCTTCTTACATGCCTGTAACACTGAGCTGTGACCATCGCGTAGTAGACG
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TGTTGCTTTAAGGGAGAAGGAACCACACAATGACCAAAACACGTCAAATTTCATAGGAGT
TTTTGATCCCTCATTTTTTTGTTTTAAACACTATGTACCAATTTAATTTCGCTGTGTGTT
TTTTGTACCAATAAGTATGGAGGGTTTTAATTGATCATGGGGGATGGGTAAAATAAAACC
CCATTGTTTATTTTGTTAATCGAAATAATATTTTGAGTTTTATGAATCAATAAAAG


BQ
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AF RR4DZ92TF U 1
AF RR4DZ92JQ C 313
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BS 669 896 RR4DZ92JQ

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TAGCTCTCAGGAAAGTTCCTCAATGCAATAGTTCGTGGACTGATGATTACATTCGCCAGT
TCAGAAACGTAAACATCAACGTCGCAGTGCAGACAGAAAATGGGCTGTATGTTCCTGTGG
TGAAGGACGCAGACAAGAAAGGTCTGTCCACAATTGGAGAAGAAGTTCGGTCATTGGCTC
AAAAAGCAAAAGAGAACAGCTTAAAGCCAGAAGATTATGAGGGAGGGACATTTACAGTGT
CTAACTTGGGAGGACCTTTTGGAATCAAGCAGTTCTGTGCAGTGGTAAATCCCCCTCAAG
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AATTCAACTTTGCTTCTTACATGCCTGTAACACTGAGCTGTGACCATCGCGTAGTAGACG
GTGCCATTGGAGCTGAATGGTTGAAAGCATTCAAAGGCTACATTGAGAACCCTGAATCCA
TGTTGCTT

QA 1 668 1 668
DS 

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AGAACAGCTTAAAGCCAGAAGATTATGAGGGAGGGACATTTACAGTGTTTAACTTGGGAG
GACCTTTTGGAATCAAGCAGTTTTGTGCAGTGGTAAATCCCCCTCAAGCAGCCATTTTAG
CTGTTGGATTTGCTGAGAAGAGAGTTGTTCCTGGTAACGGTCCAGATGAATTCAACTTTG
CTTTTTACATGCCTGTAACACTGAGCTGTGACCATCGGGTAGTAGACGGTGCCATTGGAG
CTGAATGGTTGAAAGCATTCAAAGGCTACATTGAGAACCCTGAATCCATGTTGCTTTAAG
GGAGAAGGAACCACACAATGACCAAAACACGTCAAATTTCATAGGAGTTTTTGATCCCTC
ATTTTTTTGTTTTAAACACTATGTACCAATTTAATTTCGCTGTGTGTTTTTTGTACCAAT
AAGTATGGAGGGTTTTAATTGATCATGGGGGATGGGTAAAATAAAACCCCATTGTTTATT
TTGTTAATCGAAATAATATTTTGAGTTTTATGAATCAATAAAAG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL6924Contig1 967 2 4 U
TTCCCACCACGAATTTTAAAAAATTCTAGCTTTGGTGGCTCTTGTACTACTGCAATCTTG
TTTTCTGGTTTATTCATTGGAGCTTTGAGACTTGTTAACTTGGAGAGAGGACAGTCTTCA
TGAGACATGACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGATAACAATGAAAGTCATAAGAAGCAA
GAACGTCCAGATTCCCAAACCCCACCCCCGGCTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTATA
GATACAAGCTCCGTCTACTCAGAGCCGATGGCGCATGGGCTCTACCCGTATCCTGATCCT
TACTACAGAAGCGTCTTTGCACACCAAGCGTATCTTCCACATCCATATCCTGGGGTTCAA
ATGCAATTAATGGGAATGCATCAACAAGTGGTTCCATTACAGTGTGATGCAGTCGAGGAG
CCTGTTTTTGTTAACGCAAAGCAGTACCACGGTATACTCAGGCGTAGGCAATCCAGGGCA
AAACTTGAGGCTCGGAACAGAGCCATGAAGTCAAAGAAGCCGTATATGCATGAATCTCGG
CATTTGCATGCGATAAACCGGCCAAGAGGATGTGGAGGACGGTTTCTCAATGCCAAGAAG
AAGAATGGAGGCCGTAAGGAGGAGGAGGAGGCAACCTCTGATGAGAACACTTCAGAAGCA
AGTTCCAGCCTCAGGTCTGAGAAGTCAGCCATGGCTCCTAATGGTTGATCTTGAGTAAAA
GTTCATGCACAACAACCACATGTTTAGTTTTATATTTTGGGTGGATGTTTGTATCAGTAC
AATACTCTGTTTTGAACCCTCTCTGTAGACTGTGTATAGGTTATTTATTGCTTGGAACAG
ATAGGGTGGTGGCTTTGTTTTAGTTATCAGAAATGCAACTGGGCACAGAATGAATAGTGT
GATTGAAATGTATTGTCTGTACCAAAAACAAACCTCCTTTGCAATGAATTGATGTTTTGG
AAAACTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY39TF U 1
AF RR4GY39JQ C 425
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BS 720 967 RR4GY39JQ

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GAACGTCCAGATTCCCAAACCCCACCCCCGGCTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTATA
GATACAAGCTCCGTCTACTCAGAGCCGATGGCGCATGGGCTCTACCCGTATCCTGATCCT
TACTACAGAAGCGTCTTTGCACACCAAGCGTATCTTCCACATCCATATCCTGGGGTTCAA
ATGCAATTAATGGGAATGCATCAACAAGTGGTTCCATTACAGTGTGATGCAGTCGAGGAG
CCTGTTTTTGTTAACGCAAAGCAGTACCACGGTATACTCAGGCGTAGGCAATCCAGGGCA
AAACTTGAGGCTCGGAACAGAGCCATGAAGTCAAAGAAGCCGTATATGCATGAATCTCGG
CATTTGCATGCGATAAACCGGCCAAGAGGATGTGGAGGACGGTTTCTCAATGCCAAGAAG
AAGAATGGAGGCCGTAAGGAGGAGGAGGAGGCAACCTCTGATGAGAACACTTCAGAAGCA
AGTTCCAGCCTCAG*TCTGAGAAGTCAGCCATGGCTCCTAATGGTTGATCTTGAGTAAA
GTTCATG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4GY39JQ 543 0 0
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TTGAGGCTCGGAACAGAGCCATGAAGTCAAAGAAGCCGTATATGCATGAATCTCGGCATT
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ATGGAGGCCGTAAGGAGGAGGAGGAGGCAACCTTTGATGAGAACACTTCAGAAGCAAGTT
CCAGCCTCAGGTTTGAGAAGTCAGCCATGGCTCCTAATGGTTGATCTTGAGTAAAAGTTC
ATGCACAACAACCACATGTTTAGTTTTATATTTTGGGTGGATGTTTGTATCAGTACAATA
CTCTGTTTTGAACCCTCTCTGTAGACTGTGTATAGGTTATTTATTGCTTGGAACAGATAG
GGTGGTGGCTTTGTTTTAGTTATCAGAAATGCAACTGGGCACAGAATGAATAGTGTGATT
GAAATGTATTGTCTGTACCAAAAACAAACCTCCTTTGCAATGAATTGATGTTTTGGAAAA
CTT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL6925Contig1 778 2 2 U
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CAAGCAACATCTTCACTATTGAAGAATTATCTTGCATAAACAGAGGATCAGAGTATAGCA
GAGAACCAATGTTCGGTATTATACGAGTCGATGATGAACCGAGCATGGTAAGGTTACATT
CGTCTTTCGGCTCCGAGACGTGACTCTTGTCCTCAACGGTTGTTTGGTCGGAGAAGCAGG
TCACGTTAGACAACGATCCAGCGAAAGAGGAGTCCATCAGCGGAGGCAAACCAGCCGGCT
CGACTTGGTTAATCCCTGAACCGAGCCCCTGGTAGAGATGCATCTTCTTACCGTCTGCAC
CTTTCTGAAAAACCCTACTAATAACCCACTCGTTCTGGCATTCAACAAACAACACCGAAC
TCAAAAAACCAAAAAAAAAAAGCAGAGAACTCTTCCAGACACAGGTACTTATGTTTAAAT
AATATTTACCTTTGCGGTTTTAGGAAGATTGTCGGTTGAATATACGCCTTCTAAGCGATA
CTCGTGCATGACCCAGTTTGTTTTTGCTCCTTTAGGAGCTCTTCCTTCGTAGAAAACCAA
AGTTTTCTTCATACCAACAAGAGATTTTTCTTTGAAGATCTCTTTGTCTTTCCCTGTAGC
TTTCCAATAACCGGCCTTAGTAGCCCGGTTCGTCCTTAAACCGGTTGGGTATTTCCGATC
TCTCACGCAGAAGAAGTACCACTCTTTTTCGCCAATCTTAGCCTTCCCTGTTTCCACC


BQ
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AF RR4D753TF U 1
AF RR4D753JQ C 400
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BS 732 778 RR4D753JQ

RD RR4D753TF 731 0 0
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CAAGCAACATCTTCACTATTGAAGAATTATCTTGCATAAACAGAGGATCAGAGTATAGCA
GAGAACCAATGTTCGGTATTATACGAGTCGATGATGAACCGAGCATGGTAAGGTTACATT
CGTCTTTCGGCTCCGAGACGTGACTCTTGTCCTCAACGGTTGTTTGGTCGGAGAAGCAGG
TCACGTTAGACAACGATCCAGCGAAAGAGGAGTCCATCAGCGGAGGCAAACCAGCCGGCT
CGACTTGGTTAATCCCTGAACCGAGCCCCTGGTAGAGATGCATCTTCTTACCGTCTGCAC
CTTTCTGAAAAACCCTACTAATAACCCACTCGTTCTGGCATTCAACAAACAACACCGAAC
TCAAAAAACCAAAAAAAAAAAGCAGAGAACTCTTCCAGACACAGGTACTTATGTTTAAAT
AATATTTACCTTTGCGGTTTTAGGAAGATTGTCGGTTGAATATACGCCTTCTAAGCGATA
CTCGTGCATGACCCAGTTTGTTTTTGCTCCTTTAGGAGCTCTTCCTTCGTAGAAAACCAA
AGTTTTCTTCATACCAACAAGAGATTTTTCTTTGAAGATCTCTTTGTCTTTCCCTGTAGC
TTTCCAATAACCGGCCTTAGTAGCCCGGTTCGTCCTTAAACCGGTTGGGTATTTCCGATC
TCTCACGCAGA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4D753JQ 379 0 0
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CACAGGTACTTATGTTTAAATAATATTTACCTTTGCGGTTTTAGGAAGATTGTCGGTTGA
ATATACGCCTTCTAAGCGATACTCGTGCATGACCCAGTTTGTTTTTGCTCCTTTAGGAGC
TCTTCCTTCGTAGAAAACCAAAGTTTTCTTCATACCAACAAGAGATTTTTCTTTGAAGAT
CTCTTTGTCTTTCCCTGTAGCTTTCCAATAACCGGCCTTAGTAGCCCGGTTCGTCCTTAA
ACCGGTTGGGTATTTCCGATCTCTCACGCAGAAGAAGTACCACTCTTTTTCGCCAATCTT
AGCCTTCCCTGTTTCCACC

QA 1 379 1 379
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6927Contig1 340 2 2 U
GGGTCTCTCTTTCTCCTTCAATCGTCTTTCTCACCCTTCGTCTCTCTTTTCCGTCTGACA
GGTGTATTGAGAGATCAACTAGTTAAGAGATTTTGCTTTCGGAATCGAATCAAAGTCAGT
GGCAACCATGGCAGCTAAGAAGAATCAAGAATGCACTGGAAATCTAAAACGCCAGCTAGA
GAAGTTCTTTGATGCGTCTCTGAGATCAACGGTTCCTGATCAACCTGGTGTTAAGCCCGT
GTTTTCTACCTCCCCTCTTGACCGATCTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGTCT
CTGGTCTATGATTAAAGGAAAGGATTCTCAGTTCAAGGCT


BQ
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AF RR4E604JQ C 1
AF RR4E604TF U 9
BS 1 8 RR4E604JQ
BS 9 340 RR4E604TF

RD RR4E604JQ 340 0 0
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GGTGTATTGAGAGATCAACTAGTTAAGAGATTTTGCTTTCGGAATCGAATCAAAGTCAGT
GGCAACCATGGCAGCTAAGAAGAATCAAGAATGCACTGGAAATCTAAAACGCCAGCTAGA
GAAGTTCTTTGATGCGTCTCTGAGATCAACGGTTCCTGATCAACCTGGTGTTAAGCCCGT
GTTTTCTACCTCCCCTCTTGACCGATCTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGTCT
CTGGTCTATGATTAAAGGAAAGGATTCTCAGTTCAAGGCT

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR4E604TF 332 0 0
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GAGAGATCAACTAGTTAAGAGATTTTGCTTTCGGAATCGAATCAAAGTCAGTGGCAACCA
TGGCAGCTAAGAAGAATCAAGAATGCACTGGAAATCTAAAACGCCAGCTAGAGAAGTTCT
TTGATGCGTCTCTGAGATCAACGGTTCCTGATCAACCTGGTGTTAAGCCCGTGTTTTCTA
CCTCCCCTCTTGACCGATCTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGTCTCTGGTCTA
TGATTAAAGGAAAGGATTCTCAGTTCAAGGCT

QA 1 332 1 332
DS 



AS 1 2

CO CL6928Contig1 1012 2 6 U
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CGGTCTCATCGAGAAAGCTCGCCAGCTTTCCGTTCTCTGTGACGCATCCGTCGCTCTCCT
TGTCGTCTCCGCCTCCGGAAAACTCTACAGCTTCTCCTCCGGTGATAACCTGGTCAAGAT
CCTTGATCGCCATGGAAAGCAACATGACGATGATCTTAAAGCCTTGGAGCGTCAGTCAAA
TCCTCTGAACTGTGGTTCACACCATGAGCTACTGGAACTAGTGGAAAGCAAGCTTGAGGA
ATCAAATGTCGATAATGTAAGTGTCGGTTCCCTCGTTCAGCTGGAGGAACAACTTGAGAA
CGCCCTCTCCGTAACAAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCT
TAAAGAAAAGGAGAAATTGCTGGAAGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGGTAACCAA
AGTTTTTTTTGTTATGGTTGAAGTTTCGATCCGATGGCACAGTTCAAGTGTATAGTGCTA
CTTTTACTACTCAAGGGTAACTATATAACTTGAAAAAGGGAAGATTACATCATTCGGGGA
ACCTAAACCAAGATGAAGCTTTTAGGCTCGTAGAGAAAGCTATTTGCAGGTTGATACATG
CTTGCAAACTTAAAATTAAAAGCTCAAAAGTCAGAAACACATATAATGGAAGCAAGATTC
ATAATGTTTTTTTTTCAAAAAAGAAAAAAAACTCGTAATGGTTGTCAGTTTAAATTTGTG
GTAGGAAAAGAATATTCCTTGTGTAATTAATTAAATATGGGAAAGACAATGATAGATAGT
GTGAATACTAGTGTTTAAATTATTTCTAAAGAGACGGAAACTGGTTTGACCT


BQ
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AF RR4EL02TF U 1
AF RR4EL02JQ C 444
BS 1 745 RR4EL02TF
BS 746 746 RR4EL02JQ
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BS 773 786 RR4EL02TF
BS 787 1012 RR4EL02JQ

RD RR4EL02TF 786 0 0
GGAAAAAAAAGGAAGAAAAAATAAAACGCTCAGTATCTCCGGCTAGTTGAAACCAGACCT
CGAGATCAAATTAGGGCACAAAGCCCTGTCGGAGACAGAAGCTATGGGGAGGAAGAAACT
TGAAATCAAACGAATTGAGAACAAAAGTAGCCGACAAGTTACCTTCTCCAAACGACGCAA
CGGTCTCATCGAGAAAGCTCGCCAGCTTTCCGTTCTCTGTGACGCATCCGTCGCTCTCCT
TGTCGTCTCCGCCTCCGGAAAACTCTACAGCTTCTCCTCCGGTGATAACCTGGTCAAGAT
CCTTGATCGCCATGGAAAGCAACATGACGATGATCTTAAAGCCTTGGAGCGTCAGTCAAA
TCCTCTGAACTGTGGTTCACACCATGAGCTACTGGAACTAGTGGAAAGCAAGCTTGAGGA
ATCAAATGTCGATAATGTAAGTGTCGGTTCCCTCGTTCAGCTGGAGGAACAACTTGAGAA
CGCCCTCTCCGTAACAAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCT
TAAAGAAAAGGAGAAATTGCTGGAAGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGGTAACCAA
AGTTTTTTTTGTTATGGTTGAAGTTTCGATCCGATGGCACAGTTCAAGTGTATAGTGCTA
CTTTTACTACTCAAGGGTAACTATATAACTTGAAAAAGGGAAGATTACATCATTCGGGGA
ACCTAAACCAAGATGAAGCTTTTAG*CTCGTAGAGAAAGCTATTTGCAGGT*GATACATG
CTTGCA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4EL02JQ 569 0 0
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GGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCTTAAAGAAAAGGAGAAATTGCTGG
AAGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGGTAACCAAAGTTTTTTTTGTTATGGTTGAAG
TTTCGATCCGATGGCACAGTTCAAGTGTATAGTGCTACTTTTACTACTCAAGGGTAACTA
TATAACTTGAAAAAGGGAAGATTACATCATTCGGGGAACCTAAACCAAGATGAAGCTTTT
AGGCTCGTAGAGAAAGCTATTTGCAGGTTGATACATGCTTGCAAACTTAAAATTAAAAGC
TCAAAAGTCAGAAACACATATAATGGAAGCAAGATTCATAATGTTTTTTTTTCAAAAAAG
AAAAAAAACTCGTAATGGTTGTCAGTTTAAATTTGTGGTAGGAAAAGAATATTCCTTGTG
TAATTAATTAAATATGGGAAAGACAATGATAGATAGTGTGAATACTAGTGTTTAAATTAT
TTCTAAAGAGACGGAAACTGGTTTGACCT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6930Contig1 849 2 2 U
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TGATCGAGATTTAGACAGCCTAAAGCATGATATTTCTACTTCTCTAGTTAAAATACCAAA
TAGAAACGTATGTATGCTGTGATGCTTGAATCAAAAAGTTCTCAGTAACAAAACCAGCTA
ATCAGAGGGTCCAAAATTTTATTTTGCCCAAGGGCCCTTGGTAATATTGAGCCGGCCTTG
TATATACAAAATAAACTTTTAAAAATATAGGATAAATCATCAGGGACTCTAAACATTAAA
CAATATAGCCTTCCAAATGGCCTAAAACATTTTGAAGGCCTAACACCACACGATAAAAAT
GTAACTCTCTTTCAAACATGAGGATTTGTACATTAGTATATAGCTTTGGACATATCTAGT
TTACCCAAATACAAGTCATGGAAATCTTCAAAAGGATGTGTAACCTAAAAGTTTTACTAG
TGACATTATGGTAGCTAGAGAAGTTGTATTTTTGAATTGATTACTTATGGTGTAACTATT
CTTCATCTGGAACTATTCCTTGGAGGATGAATTCTACTCCTAGAAAAGATGAAAATCAAG
TTTGAAAAATATCAACGTTTAGGCAGAGAACCATATACCCAGATGGGAGATCATTCCAGC
ATCCCGCATTGCAATTCTGAGAGAAAGACTCTGACTATGACCTTAGTTATGAAAAGACGT
AAGACCATCATTATTGGCAGTTCTTAGGGTCAACCCTTAAAAGAGAGAGAGAGGGGACCG
AAGCGGCAAAGAATGAGGGAAAAGCCCCTAAATAAGAGCTGGCCCTTGAGTGCTTTAAGT
TTTCATGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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T

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DS 



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BQ
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AF RR4BG26TF U 1
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CAGTACTATTGTGACAGTGGCCAAATGGGGACGTTCGGTTTACATTAACATTCAGAAGTT
TGTGCAGTTCCGGCTAACGGTCAATGTTGTTGCCCTCATTGTTAACTTCTCTTCAGCTTG
CTTGACTGGAAGTGCTCCTCTAACTGCTGTTCAACTGCTTTGGATAAACATGATAATGGA
CACACTTGGAGCTCTTGCTCTAGCTACAGAGCCACCTAACAACGAGCTGATGAAACGCAT
GCCCGTTGGAAGGAAAGGGAATTTCATTACAAACGCAATGTGGAGGAACATCTTAG*ACA
AGCTGTGTATCAGTTCGTTATCATTTGGCTT
CT

QA 1 751 1 751
DS 

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CTTCAGCTTGCTTGACTGGAAGTGCTCCTCTAACTGCTGTTCAACTGCTTTGGATAAACA
TGATAATGGACACACTTGGAGCTCTTGCTCTAGCTACAGAGCCACCTAACAACGAGCTGA
TGAAACGCATGCCCGTTGGAAGGAAAGGGAATTTCATTACAAACGCAATGTGGAGGAACA
TCTTAGGACAAGCTGTGTATCAGTTCGTTATCATTTGGCTTTTACAGGCTAAAGGGAAGT
CACTGTTTGGTCTTGTTGGTCCTGATTCTACTCTTGTGTTGAACACACTTATCTTTAACT
GTTTCGTCTTCTGTCAGGTCTTCAATGAGATAAGCTCGCGAGAAATGGAAGAGATCGATG
TATTCAAAGGCATACTCGACAACTATGTGTTTGTGGTTGTCATCGGTATAACTGTTTTCT
TTCAGATCATAATCATTGAGTTCTTGGGGACATTTGCAAGCACCACACCTCTCACATTCG
TCCAGTGGTTCTTCAGCATATTTGTTGGCTTCTTAGGAATGCCGATCGCTGCTGGCTTGA
AGAAAATAGAAGTGTAATGCCACTGCTAAAAGTATCACTCTTATAGAACATAAGTTCCTT
TGGACACAAGCAAATATTTTGTCTTTTTTTTTTGGTGCAATTTTTTTTCCTTTACTGAAT
AAGGTTATTTATTTACCGACAGTTTTCAATTTTTTATAATTTAATTCCAAATTCACTCC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTCAGCTTTAACCAGATCCAGTTTTCCCTTTTGGAGATCTTCCGTTAAAGCTGTGTGACG
TCGGTGCGTTATGAGATGTGACAGTTCCTCCACCATGGATCTACCATTCTCCGGCGACGG
TGTGATTACGGGAGGGAGGATGTGACTGGCAGCAAAAAAGTGTTTCAATCCTCGAGATTG
ATGCGCGGATTGGATCTAAACGATGGATTCATCCTTCGGAGGAGAGGTCCTCGCCGGAGA
CGCGCGGTGGAGAAGTGCTTCATGGCGACGGTTTAGCCGGTGGCTGTTCCAATTTCTGAT
TTCTTCAATCTTTCAAGCTGTGATGTGTTCTTCTCATCCCGCTAGTCGATGTCAAGACCC
GCTTTTCATTCTGGACAGTTACGTTCAGCTTCAGGTTTAGGGTCGGGATGGTGTGACTGA
AGGGATGGATTTGCGGTTGGTATGCGCCTGTTAGGTGAGGTACTGTTAGTCCATGTACTG
AAATAAAAATCTATGGAGGCTAATAGTTTGGGAAGTTTACCGGATCCGACTGCGGTTCAT
AATCCGAAAGCTCACTTCCATCCTTGCGCTTTCAAGATATTATTGCTACGACGACCGCCC
TGTCAGTACCGTCTTTAGGCTTAGGAGCAGACCTTTTCAACCGGCAGTGACACATATAGT
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TTCTTGTCTCATAGGGTTTAATTAGTAAGTGCAAGGACATGCTCCTTATGTGTCTTAGTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RR4DU29JQ C 176
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BS 511 958 RR4DU29JQ

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QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4DU29JQ 783 0 0
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TTCATAATCCGAAAGCTCACTTCCATCCTTGCGCTTTCAAGATATTATTGCTACGACGAC
CGCCCTGTCAGTACCGTCTTTAGGCTTAGGAGCAGACCTTTTCAACCGGCAGTGACACAT
ATAGTAAAAGAATGCATCGAAAGGTGAGGAGTATTGGTCTCGTGCCCCATTCTTATCATA
TAGAGACCAATGCCATGTTTCAATCTAGGTCCTTGAATAGTGCTTGTCATCTAAGGGGCA
CAAAGTTCTTGTCTCATAGGGTTTAATTAGTAAGTGCAAGGACATGCTCCTTATGTGTCT
TAGTAGGGATGTTGTGATGGGCAAAATTACCCAGCCCGGCCCGAACCCGAAATGAACCCG
CCC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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TGAAATGGGGAATGCGTGTTGTGTTGCTGCTCGTGACAAAATGGTCCTCCTCGTGCCTAA
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TAATAGAGGCCGTGTTGCTGGTGAAGTCTCCTCCTCCTCTCTCACTTGCTTTTCTGATGC
TATTACCCGTAACAATGATGCCTCTCAACTCAAATTTGAATCTCCTTTTCTTTCATCTCA
ACCCTCTCCTTTGGACAGCTTTCAGACACAGACATCATCGCAGAAATCTCCGGCCGCAGA
TCTATCTTTTCCAAATAATTCTTCCATGCATACACTCTTCCAGCAGAAAGAAAATGATTC
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GCTCATCAAGAGAAGAAGAGTTTCGTAAAGAAGATTAAGGAGAAACTTTCGGGCCACCAT
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CACACTTTGTATTATTCGAACTTTTTTTGGTTGCTTATCTTTTTGTTCAAAAACAAAAAA
AAAGGTTTGTAATTATTCAATAACGTGAATTATTGAAGTCAGC


BQ
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AF RR4EF52TF U 1
AF RR4EF52JQ C 332
BS 1 642 RR4EF52TF
BS 643 643 RR4EF52JQ
BS 644 670 RR4EF52TF
BS 671 943 RR4EF52JQ

RD RR4EF52TF 670 0 0
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ATTTCATCTTCTAAGGCGGCGACTTTCAAGGACTCCCCGGGAACAGTTAAAAGGTTGTAG
CAAGAAGCGGGATATTTTTTATTCGGACAAAGAATTGATTCCTAGCAGTTGCGCGAGTTC
TGAAATGGGGAATGCGTGTTGTGTTGCTGCTCGTGACAAAATGGTCCTCCTCGTGCCTAA
TTCTGAGACTGATGAGAGGAGGAGAAGGCATTCTCCTACTTGGAGTTTCCGCTGGGATAA
TAATAGAGGCCGTGTTGCTGGTGAAGTCTCCTCCTCCTCTCTCACTTGCTTTTCTGATGC
TATTACCCGTAACAATGATGCCTCTCAACTCAAATTTGAATCTCCTTTTCTTTCATCTCA
ACCCTCTCCTTTGGACAGCTTTCAGACACAGACATCATCGCAGAAATCTCCGGCCGCAGA
TCTATCTTTTCCAAATAATTCTTCCATGCATACACTCTTCCAGCAGAAAGAAAATGATTC
AACACAACCTGTGGCACCTTCGTATCCATCTCCGTGTCACACAACCCTGTTGAAGAGCAC
GGCATATCTTTCTCCAACTCTAGGGATGAAGGATCAGGAGGG*AAGTTAATAGAATGGAT
GAAACTAAGA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4EF52JQ 612 0 0
TCCTCCTCTCTCACTTGCTTTTCTGATGCTATTACCCGTAACAATGATGCCTCTCAACTC
AAATTTGAATCTCCTTTTCTTTCATCTCAACCCTCTCCTTTGGACAGCTTTCAGACACAG
ACATCATCGCAGAAATCTCCGGCCGCAGATCTATCTTTTCCAAATAATTCTTCCATGCAT
ACACTCTTCCAGCAGAAAGAAAATGATTCAACACAACCTGTGGCACCTTCGTATCCATCT
CCGTGTCACACAACCCTGTTGAAGAGCACGGCATATCTTTCTCCAACTCTAGGGATGAAG
GATCAGGAGGGGAAGTTAATAGAATGGATGAAACTAAGACAAGGGTAGGGAGGCACGAGA
CATCAACTGCGAGCGTAGAATCAGTATCGGCTCATCAAGAGAAGAAGAGTTTCGTAAAGA
AGATTAAGGAGAAACTTTCGGGCCACCATAACGATTCGTAAAACTATGTTTAGTTTATAA
ATGATTATAACAAAGTTATATGTAAGTCACACACTTTGTATTATTCGAACTTTTTTTGGT
TGCTTATCTTTTTGTTCAAAAACAAAAAAAAAGGTTTGTAATTATTCAATAACGTGAATT
ATTGAAGTCAGC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL6935Contig1 1035 2 4 U
GGATCATCAAGTCTCTCAGCCTTTTAGACTACAGTCTTCTTCTATACAAACATCTACAAA
AAATGGCAATTATTCCATCTATTCTCCTTACCATTTTCCCTCTCTTTCTCCTCTTGAGCC
TTACCAAGGCTGCGATCCCCGGCGTCTACTCCGGTGGTTCCTGGCAGACCGCCCACGCCA
CTTTCTACGGTGGAGACGACGCTTCAGGAACCATGGGTGGCGCATGCGGTTACGGGAATT
TATACAGCCAAGGATACGGCACTAACACGGCGGCTCTGAGCACAGCACTTTTCAACAGTG
GCTTAACCTGTGGCGCATGCTTTGAAATCAAATGTGTCAATGATCCTATATGGTGTCATT
CAGGCAGTCCTTCTGTCTTCGTAACCGCGACCAACTTTTGTCCTCCCAACTTTGCCCAGC
CTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCGCATTTCGACCTAGCCATGCCAG
TTTTTCTCAAGATCGCCGAGTATCGTGCCGGCATTGTTCCTATCTCATACCGCAGGGTGG
CATGCAGGAAGAGTGGAGGGATAAAGTTTACGATCAACGGTCACCGTTACTTCAACTTGG
TGCTGATCACGAACGTGGCTGGAGCAGGAGACATCGCCAGGACGAGCGTGAAAGGATCAA
AGACTGGTTGGATGGGTTTGACTAGGAACTGGGGACAGAACTGGCAGTCTAATACCGTCC
TCGTTGGTCAGTCACTTTCCTTCCGTGTCACGGCCAGTGACCGTAGAACCTCGACTTCAT
GGAACATCGTACCTTCAAACTGGCAGTTTGGACAAACCTTTGTCGGAAAGAATTTCAGGG
TCTGAAGTGAATTTGTGAGTAAATCGAAGAAGCTCCTCCACCAAATTCGAGATCTATAAC
TTTGATTTTCTGTTATGTTTTCTATATTGTGATCTGAAGTGGCTGTTGAAGAAAAATGTA
AACAGCCCGCAGCGCTTAAGTTACATATAAGTTTGCTTGTAATGACGAATTACATTATAG
TACTAATTAAACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW24TF U 1
AF RR4GW24JQ C 312
BS 1 627 RR4GW24TF
BS 628 628 RR4GW24JQ
BS 629 654 RR4GW24TF
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RD RR4GW24TF 655 0 0
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AAATGGCAATTATTCCATCTATTCTCCTTACCATTTTCCCTCTCTTTCTCCTCTTGAGCC
TTACCAAGGCTGCGATCCCCGGCGTCTACTCCGGTGGTTCCTGGCAGACCGCCCACGCCA
CTTTCTACGGTGGAGACGACGCTTCAGGAACCATGGGTGGCGCATGCGGTTACGGGAATT
TATACAGCCAAGGATACGGCACTAACACGGCGGCTCTGAGCACAGCACTTTTCAACAGTG
GCTTAACCTGTGGCGCATGCTTTGAAATCAAATGTGTCAATGATCCTATATGGTGTCATT
CAGGCAGTCCTTCTGTCTTCGTAACCGCGACCAACTTTTGTCCTCCCAACTTTGCCCAGC
CTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCGCATTTCGACCTAGCCATGCCAG
TTTTTCTCAAGATCGCCGAGTATCGTGCCGGCATTGTTCCTATCTCATACCGCAGGGTGG
CATGCAGGAAGAGTGGAGGGATAAAGTTTACGATCAACGGTCACCGTTACTTCAACTTGG
TGCTGATCACGAACGTGGCTGGAGCAG*AGACATCGCCAGGACGAGCGTGAAAG
A

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4GW24JQ 724 0 0
GGCGCATGCTTTGAAATCAAATGTGTCAATGATCCTATATGGTGTCATTCAGGCAGTCCT
TCTGTCTTCGTAACCGCGACCAACTTTTGTCCTCCCAACTTTGCCCAGCCTAGCGACAAT
GGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCGCATTTCGACCTAGCCATGCCAGTTTTTCTCAAG
ATCGCCGAGTATCGTGCCGGCATTGTTCCTATCTCATACCGCAGGGTGGCATGCAGGAAG
AGTGGAGGGATAAGGTTTACGATCAACGGTCACCGTTACTTCAACTTGGTGCTGATCACG
AACGTGGCTGGAGCAGGAGACATCGCCAGGACGAGCGTGAAAGGATCAAAGACTGGTTGG
ATGGGTTTGACTAGGAACTGGGGACAGAACTGGCAGTCTAATACCGTCCTCGTTGGTCAG
TCACTTTCCTTCCGTGTCACGGCCAGTGACCGTAGAACCTCGACTTCATGGAACATCGTA
CCTTCAAACTGGCAGTTTGGACAAACCTTTGTCGGAAAGAATTTCAGGGTCTGAAGTGAA
TTTGTGAGTAAATCGAAGAAGCTCCTCCACCAAATTCGAGATCTATAACTTTGATTTTCT
GTTATGTTTTCTATATTGTGATCTGAAGTGGCTGTTGAAGAAAAATGTAAACAGCCCGCA
GCGCTTAAGTTACATATAAGTTTGCTTGTAATGACGAATTACATTATAGTACTAATTAAA
CTTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6936Contig1 774 2 3 U
GGGAAAAGCTTTGAGTCGATCTATCCCCCTGACTCTTACACTTCATCTTCATCGTTTCAT
ATCTCTGTAATAATCACAACCCACTCTCACCATTCAATTCCTTTATTTACTCCTTTCATT
ACAGATGTTGTTGTTCCATCTCCTACTTTTACCTCTCTTATATAATCATCTTTCTTGAAT
CGTTAGTTGGTCAATATCCAAAACCCTATAGAGAAGAACAACAAGCGATGGCCATGAAAT
CTGTTCTGAACTCCGCCAAGTCCAAGTCGCCGTGACGTCTCTCTGGGTCAGCGGATTGTG
AATTAGGCTTCTTTATGATCCACTTTTGGAAGGCTAGAAACACTGCAAAAGGGGGATTTT
TATTGGTTTTGAGATGCTACACATCTACGAACAGGTCAGTGCAAGGCTTCGTCTCCTCTA
ATCGTTCTCCACGATACGAGGCTCGCCTCAAACCAGGAACCACAGTCTCAGGAATTTCTC
TGCTACCAAAAGAAAAGCTATCTGTAGCGTTTCCGATTCACTCTTTGACCATTTGTTTCA
GACAGAGCTATTTTTTCTGCGACCTTGGCCAGATGAGCCTCTCTATTGATGGAGACCGGT
TCATGTATCACTTACATGAAGATTTTGAAGCCAAATGTGGACTCGGGGTTGCTCTTTATG
GTTAGCTGTTTAAAATTTTACATCATTTTTAACTTAATTGCTTATCTGTGTACTGTTTTT
TTTTTCTTTCTTCTCAATGTGCCTTGCTCGACCATCAAAAACGTCACACGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CS21TF U 33
AF RR4CS21JQ C 1
BS 1 32 RR4CS21JQ
BS 33 539 RR4CS21TF
BS 540 774 RR4CS21JQ

RD RR4CS21TF 507 0 0
CTCTTACACTTCATCTTCATCGTTTCATATCTCTGTAATAATCACAACCCACTCTCACCA
TTCAATTCCTTTATTTACTCCTTTCATTACAGATGTTGTTGTTCCATCTCCTACTTTTAC
CTCTCTTATATAATCATCTTTCTTGAATCGTTAGTTGGTCAATATCCAAAACCCTATAGA
GAAGAACAACAAGCGATGGCCATGAAATCTGTTCTGAACTCCGCCAAGTCCAAGTCGCCG
TGACGTCTCTCTGGGTCAGCGGATTGTGAATTAGGCTTCTTTATGATCCACTTTTGGAAG
GCTAGAAACACTGCAAAAGGGGGATTTTTATTGGTTTTGAGATGCTACACATCTACGAAC
AGGTCAGTGCAAGGCTTCGTCTCCTCTAATCGTTCTCCACGATACGAGGCTCGCCTCAAA
CCAGGAACCACAGTCTCAGGAATTTCTCTGCTACCAAAAGAAAAGCTATCTGTAGCGTTT
CCGATTCACTCTTTGACCATTTGTTTC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4CS21JQ 774 0 0
GGGAAAAGCTTTGAGTCGATCTATCCCCCTGACTCTTACACTTCATCTTCATCGTTTCAT
ATCTCTGTAATAATCACAACCCACTCTCACCATTCAATTCCTTTATTTACTCCTTTCATT
ACAGATGTTGTTGTTCCATCTCCTACTTTTACCTCTCTTATATAATCATCTTTCTTGAAT
CGTTAGTTGGTCAATATCCAAAACCCTATAGAGAAGAACAACAAGCGATGGCCATGAAAT
CTGTTCTGAACTCCGCCAAGTCCAAGTCGCCGTGACGTCTTTCTGGGTCAGCGGATTGTG
AATTAGGCTTCTTTATGATCCACTTTTGGAAGGCTAGAAACACTGCAAAAGGGGGATTTT
TATTGGTTTTGAGATGCTACACATCTACGAACAGGTCAGTGCAAGGCTTCGTCTCCTCTA
ATCGTTCTCCACGATACGAGGCTCGCCTCAAACCAGGAACCACAGTCTCAGGAATTTTTC
TGCTACCAAAAGAAAAGCTATCTGTAGCGTTTCCGAT*CACTCTTTGACCATTTGTTTCA
GACAGAGCTATTTTTTCTGCGACCTTGGCCAGATGAGCCTCTCTATTGATGGAGACCGGT
TCATGTATCACTTACATGAAGATTTTGAAGCCAAATGTGGACTCGGGGTTGCTCTTTATG
GTTAGCTGTTTAAAATTTTACATCATTTTTAACTTAATTGCTTATCTGTGTACTGTTTTT
TTTTTCTTTCTTCTCAATGTGCCTTGCTCGACCATCAAAAACGTCACACGTTGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL6937Contig1 196 2 2 U
GCACAACTCTCATGTTGTTACTTTTGTTTTAGAGAGTCACAAACCTTTAGATTTGAATCC
CAGCTTCCTGTACACAAGGCACTTCCGTCTGCTGACATCCCCAAACAGCTTATCCGATTC
TTGTGCGAATCCTGCAGTTCCCCTAAATCCAATACAATCTGCATGAAAAAAATACCCCCA
ACATTTAAACAAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4HA70JQB C 1
AF RR4HA70TF U 87
BS 1 86 RR4HA70JQB
BS 87 196 RR4HA70TF

RD RR4HA70JQB 196 0 0
GCACAACTCTCATGTTGTTACTTTTGTTTTAGAGAGTCACAAACCTTTAGATTTGAATCC
CAGCTTCCTGTACACAAGGCACTTCCGTCTGCTGACATCCCCAAACAGCTTATCCGATTC
TTGTGCGAATCCTGCAGTTCCCCTAAATCCAATACAATCTGCATGAAAAAAATACCCCCA
ACATTTAAACAAATAC

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR4HA70TF 110 0 0
GTCTGCTGACATCCCCAAACAGCTTATCCGATTCTTGTGCGAATCCTGCAGTTCCCCTAA
ATCCAATACAATCTGCATGAAAAAAATACCCCCAACATTTAAACAAATAC

QA 1 110 1 110
DS 



AS 1 2

CO CL6938Contig1 858 2 4 U
GGGCAGCCCAAAGAGGTATCCACCACCGATCTGAATATCATAGCCTCAACCAAATAAGAT
TTTCTCAATTTTGTAGAAGGAGAGTTGAGAGTGGATGTATATACCGTTAGAACAGAGGCA
GGAACAGCCAGAACTGTAAGAGGAATGTAGGCCACAGCTCTACACATATTACAAAAAAAA
AAAAGACAAGTTCAGTTAGGCCTCCTATAACTCTTAGTTCCTAAATTTCTATATAAGTTG
TGTCTTCCAAGCACATGGCTAAACATTTGTAATGTGAAACAGAATCAGCTTTTTTAAAAA
AAAAGAAGGAGAAGAGAGACACTTACAGGGCAAAAGGTCCCCAAGGCCCTAGATCTTGTT
CAACCCATAACAAAAAATCCCTCAAAAACTGAAAACACACACACAAAGAGATACGGTAAG
TTTCAGACCATAACTAGCCAATGCTACATTGGAAATAAAGGAATTGAAAAAGTAAAGATA
TCAATCTGAATAGGTTTTACACAACTTGCTCTCATAACCCATATGCAAAGGGTCTCAAAA
TGACCAATTAAAACGATGAAAAAAAATCTCAAAACTTCATTGCTAATGTAAACCTCAAAT
GAGACAATTCGGGCCCACATTTCACCAGAAAAGCTTATAAATTTCCAGACATCACAGAAA
GCCACAATTGAAACCCCCCAGTTGTGGCAATTTACGGACCTGCTCGACGGGGAGGAAATA
GAAAGCTAAGACAATTGCAGCTACAAGGATCAGAAGAACTGAAATACGGAGAGCAGATAA
CCACGTCAACGCCATTAACGGCGACCCTTAAATCGCCTCCGGTAACTCTTCCACGGATCT
ATTGGATTGTTGTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY56TF U 1
AF RR4CY56JQ C 176
BS 1 689 RR4CY56TF
BS 690 690 RR4CY56JQ
BS 691 705 RR4CY56TF
BS 706 858 RR4CY56JQ

RD RR4CY56TF 705 0 0
GGGCAGCCCAAAGAGGTATCCACCACCGATCTGAATATCATAGCCTCAACCAAATAAGAT
TTTCTCAATTTTGTAGAAGGAGAGTTGAGAGTGGATGTATATACCGTTAGAACAGAGGCA
GGAACAGCCAGAACTGTAAGAGGAATGTAGGCCACAGCTCTACACATATTACAAAAAAAA
AAAAGACAAGTTCAGTTAGGCCTCCTATAACTCTTAGTTCCTAAATTTCTATATAAGTTG
TGTCTTCCAAGCACATGGCTAAACATTTGTAATGTGAAACAGAATCAGCTTTTTTAAAAA
AAAAGAAGGAGAAGAGAGACACTTACAGGGCAAAAGGTCCCCAAGGCCCTAGATCTTGTT
CAACCCATAACAAAAAATCCCTCAAAAACTGAAAACACACACACAAAGAGATACGGTAAG
TTTCAGACCATAACTAGCCAATGCTACATTGGAAATAAAGGAATTGAAAAAGTAAAGATA
TCAATCTGAATAGGTTTTACACAACTTGCTCTCATAACCCATATGCAAAGGGTCTCAAAA
TGACCAATTAAAACGATGAAAAAAAATCTCAAAACTTCATTGCTAATGTAAACCTCAAAT
GAGACAATTCGGGCCCACATTTCACCAGAAAAGCTTATAAATTTCCAGACATCACAGAAA
GCCACAATTGAAACCCCCCAGTTGTGGCA*TTTACGGACCTGCTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4CY56JQ 683 0 0
AAAAAAAAAGACAAGTTCAGTTAGGCCTCCTATAACTCTTAGTTCCTAAATTTCTATATA
AGTTGTGTCTTCCAAGCACATGGCTAAACATTTGTAATGTGAAACAGAATCAGCTTTTTT
AAAAAAAAAGAAGGAGAAGAGAGACACTTACAGGGCAAAAGGTCCCCAAGGCCCTAGATC
TTGTTCAACCCATAACAAAAAATCCCTCAAAAACTGAAAACACACACACAAAGAGATACG
GTAAGTTTCAGACCATAACTAGCCAATGCTACATTGGAAATAAAGGAATTGAAAAAGTAA
AGATATCAATCTGAATAGGTTTTACACAACTTGCTCTCATAACCCATATGCAAAGGGTCT
CAAAATGACCAATTAAAACGATGAAAAAAAATCTCAAAACTTCATTGCTAATGTAAACCT
CAAATGAGACAATTCGGGCCCACATTTCACCAGAAAAGCTTATAAATTTCCAGACATCAC
AGAAAGCCACAATTGAAACCCCCCAGTTGTGGCAATTTACGGACCTGCTCGACGGGGAGG
AAATAGAAAGCTAAGACAATTGCAGCTACAAGGATCAGAAGAACTGAAATACGGAGAGCA
GATAACCACGTCAACGCCATTAACGGCGACCCTTAAATCGCCTCCGGTAACTCTTCCACG
GATCTATTGGATTGTTGTTGTCG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6939Contig1 933 2 2 U
GCGCATCACAGGTTCTTCTCATTTATAATATATACACACACTATGACAAACCTTACTTGA
TAACTGGTTTTGCTGTGTTTTAAACGCAGGGCTGAAACCGAGTACCGTCTATTACTATCG
ATGCGGCGATCCTTCACGACACGCTATGAGTAAGATACACCATTTCCGTACAATGCCGGT
TTCTAACCCGTCGAGTTACCCTAGCCGAATAGCTGTCGTGGGCGATCTTGGTCTCACTTA
CAACACAACAGATACAATCACTCATCTGCTTCAGAACTCTCCGGATCTTGTTTTATTAAT
CGGCGACGTGAGCTACGCGAACTTGTACCTAACGAACGGGACCAGCTCATACTGTTACTC
GTGCAGTTTCTCGGATACCCCTATACACGAGACGCATCAGCCGCGTTGGGACTACTGGGG
TAGGTTTATGGAGACTCTGACTTCGAAAGTTCCTCTGATGGTGATCGAAGGAAACCACGA
GATCGAGTTGCAAGCCGAGAGCAAGACGTTCGAAGCTTATAGCTCCAGATTCGCTTTCCC
TTTTAAAGAGAGCGGCTCTTCTTCTAAGCTTTATTATTCTTTTAACGCCGGATCCAGCCA
TGGGTGGAGAGTTTTGCGCTTGGAACTTCACCAAGACTGGTAGGTTCTGCTGGGATCAGC
AGCCTGCGTATAGTGCCTTGAGAGAAAGCAGTTTCGGCCATGGAATATTAGAGGTGAAGA
ATGAGACATGGGCACTGTGGACATGGTATAGGAACCAAGACTCGAGTAGTAAAGTTGGAG
ATCAGATTTATATCGTGAGAGAACCTGATCGATGTCCACGTCACAACCGTCTTGTTAACG
ATTGCTAAGCTCAAAGTTTGGTCTATTTTACACTGTTGATTGTAACAAGTATGAATAATG
ATAATCCAAGAAAATAAAATTAAAAATTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CL73TF U 1
AF RR4CL73JQ C 293
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TTCTAACCCGTCGAGTTACCCTAGCCGAATAGCTGTCGTGGGCGATCTTGGTCTCACTTA
CAACACAACAGATACAATCACTCATCTGCTTCAGAACTCTCCGGATCTTGTTTTATTAAT
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QA 1 641 1 641
DS 

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GAATAATGATAATCCAAGAAAATAAAATTAAAAATTTTCTC

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DS 



AS 1 2

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ATAAATGCATTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL58JQ C 1
AF RR4GL58TF U 1
BS 1 613 RR4GL58TF

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QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4GL58TF 613 0 0
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ATAAATGCATTTG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL6941Contig1 807 2 2 U
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GTTTATTTGCTTTTAGTGCTTTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GD76TF U 1
AF RR4GD76JQ C 65
BS 1 732 RR4GD76TF
BS 733 807 RR4GD76JQ

RD RR4GD76TF 732 0 0
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GCTATTTTCCGGCACCGGAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGATGGGTGTACAAGGGAACAA
ACATGTGATGTGGAAGAAAGTGTGTAACGTTTTTGGAAAATTCTGTCACCAAACTGCTGC
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TATGAAGCTTCCTTAATGCAATTGATATCTTCCTTAATGCAATTGATATTTCTGTTTCTT
CTTACAGCTCTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4GD76JQ 743 0 0
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TGTCGCAAAACAGACGAAGGTTGTGTCTATAACGCTTATTCCAACTTTGCCTCCTTTTGA
TGTGCCCGCAACAGCCAAAGCCTCTTACTTGTCTGCGTTTGTGTTCAACATTTCGGCAAA
CGCTATAGCTTGCGGTTACACAGCGATCTCAATAGTCATTTTGATGATCAGCAAGAAAGA
AGAAGCAAAGGCTTGATAATGGCGGTGTTGGTAGGTGATCTAGTGATGATGGCTTTGCTA
TTTTCCGGCACCGGAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGATGGGTGTACAAGGGAACAAACAT
GTGATGTGGAAGAAAGTGTGTAACGTTTTTGGAAAATTCTGTCACCAAACTGCTGCTTCG
GTTGCCATCACTCTTCTTGCTGCAATCGTGTTTATGGTTCTTGTTGTTCTTGATGCTATG
AAGCTTCCTTAATGCAATTGATATCTTCCTTAATGCAATTGATATTTCTGTTTCTTCTTA
CAGCTCTTCTGCTTCTTGTCGTGTTGTGTAAAGTCATTATCAACAATCATGTAATTGTTT
ATTTGCTTTTAGTGCTTTTCACT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL6942Contig1 949 2 2 U
GGGTTTAAGTTCAATGTCAAAGGCGTTGCCATTGGGAATCCACTTCTGGAGCTTGGGAGG
GACACTTCAGCTACGTACGAGTTCTACTGGTCGCATGGGATGATATCCGATGAAACGAGA
GGCACAATCATAACCCACTGTGATTTTTCCAATCTCAATAACCTCAGCAAAGTCTGTAGT
GATGCCATCAAGGAAGCCGAAACTATCAACGGATACGTCAACAGCTGCGACGTTCTCCTC
GACGTATGCTACCCTTCTATCGTCCAGCAAGAGCTGAGACCAAGCAAATGGCAACCAAGA
TGAGCATGGGGGTGGATGTTTGCATGACTTACGAGAGAAAGTTCTATTTCAATCTCCCAG
AGGTCCAACAAGCTCTTCACGCCAACCAAACTCATTTACCCTACCAATGGTCAATGTGCA
GCGGCCTGTTGAATTACAGTGACACCGACTCGAGCATCAACATGCTTCCGATTCTTAAGA
GAATTATACAGAACAAAACTCCTGTTTGGATCTTCAGTGGAGATCAAGATGCTGTTGTTC
CACTTCTTGGTTCAAGAAGTCTCGTACTAGAACTCCTCATCGTCTCAACTTCAGTACCAC
ACTTCCCTATAGACCCTGGTTCCACAAAGATCAGGTTGGTGGGTGGGTCACCGAGTATGG
AAAGCTGTTGACGTTTGCAACGGTGAGAGGGGCGGCTCATATGGTGCCGTATGCGCAGCC
TTCACGAGCCCTGCATATGTACAGTAGCTTTGTGCATGGCCGGAGACTGCCAAACAACAC
ACATCACTCTCCCGATGAATGATTGAAGAGATATCTTGTATTAGATGAGGCAGTTATGAT
TAGTATCAATTAGCTTGATGTATTCTGTTTTCTGCTTGCACGCTGTGGAATGATATAGAA
GTAACTTGACCATGGTACATTTACAAGGGAAACTATAGGTTTCACACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B264TF U 1
AF RR4B264JQ C 202
BS 1 863 RR4B264TF
BS 864 949 RR4B264JQ

RD RR4B264TF 869 0 0
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GACACTTCAGCTACGTACGAGTTCTACTGGTCGCATGGGATGATATCCGATGAAACGAGA
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GATGCCATCAAGGAAGCCGAAACTATCAACGGATACGTCAACAGCTGCGACGTTCTCCTC
GACGTATGCTACCCTTCTATCGTCCAGCAAGAGCTGAGACCAAGCAAATGGCAACCAAGA
TGAGCATGGGGGTGGATGTTTGCATGACTTACGAGAGAAAGTTCTATTTCAATCTCCCAG
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GCGGCCTGTTGAATTACAGTGACACCGACTCGAGCATCAACATGCTTCCGATTCTTAAGA
GAATTATACAGAACAAAACTCCTGTTTGGATCTTCAGTGGAGATCAAGATGCTGTTGTTC
CACTTCTTGGTTCAAGAAGTCTCGTACTAGAACTCCTCATCGTCTCAACTTCAGTACCAC
ACTTCCCTATAGACCCTGGTTCCACAAAGATCAGGTTGGTGGGTGGGTCACCGAGTATGG
AAAGCTGTTGACGTTTGCAACGGTGAGAGGGGCGGCTCATATGGTGCCGTATGCGCAGCC
TTCACGAGCCCTGCATATGTACAGTAGCTTTGTGCATGGCCGGAGACTGCCAAACAACAC
ACATCACTCTCCCGATGAATGATTGAAGAGATATCTTGTATTAGATGAGGCAGTTATGAT
TAGTATCAATTAGCTTGATGTAT
CTGTTT

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4B264JQ 748 0 0
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GTCCAGCAAGAGCTGAGACCAAGCAAATGGCAACCAAGATGAGCATGGGGGTGGATGTTT
GCATGACTTACGAGAGAAAGTTCTATTTCAATCTCCCAGAGGTCCAACAAGCTCTTCACG
CCAACCAAACTCATTTACCCTACCAATGGTCAATGTGCAGCGGCCTGTTGAATTACAGTG
ACACCGACTCGAGCATCAACATGCTTCCGATTCTTAAGAGAATTATACAGAACAAAACTC
CTGTTTGGATCTTCAGTGGAGATCAAGATGCTGTTGTTCCACTTCTTGGTTCAAGAAGTC
TCGTACTAGAACTCCTCATCGTCTCAACTTCAGTACCACACTTCCCTATAGACCCTGGTT
CCACAAAGATCAGGTTGGTGGGTGGGTCACCGAGTATGGAAAGCTGTTGACGTTTGCAAC
GGTGAGAGGGGCGGCTCATATGGTGCCGTATGCGCAGCCTTCACGAGCCCTGCATATGTA
CAGTAGCTTTGTGCATGGCCGGAGACTGCCAAACAACACACATCACTCTCCCGATGAATG
ATTGAAGAGATATCTTGTATTAGATGAGGCAGTTATGATTAGTATCAATTAGCTTGATGT
ATTCTGTTTTCTGCTTGCACGCTGTGGAATGATATAGAAGTAACTTGACCATGGTACATT
TACAAGGGAAACTATAGGTTTCACACTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6943Contig1 860 2 10 U
GATCCCCAAACAACATGGCTTATCATACCAAAACCGTATCACCAAAACCTCGAGTGTTTG
AACACAACGGCAAGAATGAAGCAGCCAGTGAGATTAGTGAATTCAATGTTGTAAGCCCTC
CAAGGTCTTACGTCAATGATGATGATGATTATGATGATGAGGAGGAAGGTGTAGAGCTCG
ACCTTCAGTCTGTTATGTCAGACACATGTGTTTCGGTTGGAAAATACCGTGTGAGCTCTG
GTGTCTCCACAATCCTACAGTCAATTATCGACAAACACGGAGACATAGCTGAAAACTGCA
GGCTAGAATCAGCATCGATGAGGTCCAGATACCTAGAATGCATGTGCTCATTGATGCAAG
AACTTGGATCAACTCCGGTCGCGCAGTTGACAGAACTAAAAGTCAAAGAGATGCTTGCGG
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AGTTTGCTCGGTTTCAAGAGAACGCAGAGGCAGAGAAAGAGAGACAAGGAGAAACAGTGA
GGTCTAAGAAACAAGAATTGGAGATTCGTGAAGCAGACTTAGCCAAGATAGAGGAGGAAG
CAAGGGAAGCGAGGTTGAGGGTGGAGGAGATGAAGGCGGAGCTGGCTGAGCTTGAGACAG
AGCGGTTGAGGATGGAAGAGATGGGATTCAAGGTTGAGAAATTTAAAGGGAGGTCGTTTC
TTGATGAGCTTCTTTGATGTTAATTAAACTCACTACTCCAAAAGTATAATGTATAAGTTT
GATATTTGTTCTTTAACAGTGATTAAAGGCGAACGATACTACAGTTTCTAATCAGTTGAT
TACTATTCACAGAGGGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS72TF U 1
AF RR4GS72JQ C 92
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RD RR4GS72TF 773 0 0
GATCCCCAAACAACATGGCTTATCATACCAAAACCGTATCACCAAAACCTCGAGTGTTTG
AACACAACGGCAAGAATGAAGCAGCCAGTGAGATTAGTGAATTCAATGTTGTAAGCCCTC
CAAGGTCTTACGTCAATGATGATGATGATTATGATGATGAGGAGGAAGGTGTAGAGCTCG
ACCTTCAGTCTGTTATGTCAGACACATGTGTTTCGGTTGGAAAATACCGTGTGAGCTCTG
GTGTCTCCACAATCCTACAGTCAATTATCGACAAACACGGAGACATAGCTGAAAACTGCA
GGCTAGAATCAGCATCGATGAGGTCCAGATACCTAGAATGCATGTGCTCATTGATGCAAG
AACTTGGATCAACTCCGGTCGCGCAGTTGACAGAACTAAAAGTCAAAGAGATGCTTGCGG
TTGTTAAGGACTTGGAGTCCGTGAACATCGATGTTGGTTGGCTACGTTCTGTTCTTGAGG
AGTTTGCTCGGTTTCAAGAGAACGCAGAGGCAGAGAAAGAGAGACAAGGAGAAACAGTGA
GGTCTAAGAAACAAGAATTGGAGATTCGTGAAGCAGACTTAGCCAAGATAGAGGAGGAAG
CAAGGGAAGCGAGGTTGAGGGTGGAGGAGATGAAGGCGGAGCTGGCTGAGCTTGAGACAG
AGCGGTTGAG*ATGGAAGAGATGGGATTCAAG*TTGAGAAATTTAAAGGGAGGTCGTT*C
TTGATGAGCTTCTTTGATGTTAATTAAACTCACTACTCCAAA*GTATAATGTA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4GS72JQ 769 0 0
GATTAGTGAATTCAATGTTGTAAGCCCTCCAAGGTCTTACGTCAATGATGATGATGATTA
TGATGATGAGGAGGAAGGTGTAGAGCTCGACCTTCAGTCTGTTATGTCAGACACATGTGT
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CAAACACGGAGACATAGCTGAAAACTGCAGGCTAGAATCAGCATCGATGAGGTCCAGATA
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GAAGGCGGAGCTGGCTGAGCTTGAGACAGAGCGGTTGAGGATGGAAGAGATGGGATTCAA
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AACGATACTACAGTTTCTAATCAGTTGATTACTATTCACAGAGGGTACT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGGTCTCCAAGGAGAATTTCCTCAGGGTTTAAATGACTGTTCTTCTTTGACAGGTCTAGA
TCTATCTAGGAACAACTTCTCTGGAGCTGTACCATCTAATATAGCCTCCTTGATTCCATT
CGTTACAACTCTCGACCTCTCTTACAATCAATTCTCCGGTGAAATTCCAACAGATTTATC
AAATGTTACCTTTCTGAACACTCTCATGCTTCAGCATAACCAGTTCACCGGTCAGCTTCC
TCCCGAGCTAGCGTCGCTTAAGCGGCTCAAAGAGTTCTCTGTGGCATACAATCACCTGAC
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CACTGGTTTATGTGGTTTGCCTATGGATTCTTGCATTGAGCAGGAAGAAAAAGTGATCCG
GTTTGGGAAGATGGGTGCAGTAATTGGTGCGGCTGTGTTTGCACCAGTAGGTGCGTTGTT
AGGCTGGTTTTTCTTCAAATGGTAAGAAGAGAAACAAGGAAATACAAGACACCGGAGATG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D975TF U 1
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AAATGTTACCTTTCTGAACACTCTCATGCTTCAGCATAACCAGTTCACCGGTCAGCTTCC
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QA 1 609 1 609
DS 



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BQ
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AF RR4BO45JQ C 1
AF RR4BO45TF U 1
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GAGGATCTCCGCAAGCTTAGCATCTCCTTATCATCACCATCCTAAATGCCTCTCTTTATT
ACCTTCTTCCAAGGTTGATTTCACAAGCAATGTCGCAAACAGTTTCTTGACACTCTCATT
GTATATATATGCGACTTCTCTCTTCAAAGTTCTATCAAAACCT

QA 1 283 1 283
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RD RR4BO45TF 283 0 0
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GAGGATCTCCGCAAGCTTAGCATCTCCTTATCATCACCATCCTAAATGCCTCTCTTTATT
ACCTTCTTCCAAGGTTGATTTCACAAGCAATGTCGCAAACAGTTTCTTGACACTCTCATT
GTATATATATGCGACTTCTCTCTTCAAAGTTCTATCAAAACCT

QA 1 283 1 283
DS 



AS 1 2

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GTTAAAGAATGGCTTGGCCTTGTATTGACTTTCTCTTCAAATATATAAATGTCCATTTTT
ATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4FH03TF U 1
AF RR4FH03JQ C 75
BS 1 610 RR4FH03TF
BS 611 724 RR4FH03JQ

RD RR4FH03TF 610 0 0
GGGTGAGTGTTTAAGGCATGAAGTAATCGGGTTGCACAATCTTCATCCAAATTTCACACT
GTCTCATTGCCTATGTGTCTCTGCATTTGAGTCACCAATCTTTGTCCTCCAGCAACGACG
GTGACAATGCCGGAGCTCTAGATCTCCATTTCATCTCCTTCTCCGGAGGTTTCAGGCCTC
TTCACCGTCAAACTCGTCTTCTCCAATTGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTTAAACA
AGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTGAGACGGAGGAGCTTAAGCTGCAAGAAGCAGT
TGCTGATGAGCATAGCCGTCATATGAACGTTACCTTCGCAGAAGCTAAGAGAGTTGCGTC
TCATTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAATCAGCTAA
GGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATTAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAG
AGCTCGGTAATCGGGTGGGAAGGTGAGTAAAAACTGATTGCCCACTTCTCATGTCTACCC
TCAAGTGTTTGAGTCTGAGAAACCGATTTTTTTTCTGCAACTTAGCTCCAGGAAAAGTCC
TTATCTTCCA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4FH03JQ 650 0 0
GTGTCTCTGCATTTGAGTCACCAATCTTTGTCCTCCAGCAACGACGGTGACAATGCCGGA
GCTCTAGATCTCCATTTCATCTCCTTCTCCGGAGGTTTCAGGCCTCTTCACCGTCAAACT
CGTCTTCTCCAATTGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTTAAACAAGAAATGGAGAAGC
AGTTTGTGGACCTTGAGACGGAGGAGCTTAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATGAGCATA
GCCGTCATATGAACGTTACCTTCGCAGAAGCTAAGAGAGTTGCGTCTCATTACCAAAAGG
AAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAATCAGCTAAGGAGAGAGCTGAAG
CTTTGTTGATTAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGTAATCGG
GTGGGAAGGTGAGTAAAAACTGATTGCCCACTTCTCATGTCTACCCTCAAGTGTTTGAGT
CTGAGAAACCGATTTTTTTTCTGCAACTTAGCTCCAGGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTT
TCTACATATATGTAGTCTTTTGTTTTTGACTTTGGATCTGAATGTAGTTAAAGAATGGCT
TGGCCTTGTATTGACTTTCTCTTCAAATATATAAATGTCCATTTTTATCT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6948Contig1 719 2 5 U
CTACTAAAACTACAGTCCCTCCAATCGTTATAGCTCAAGACAATGCTATGGACGAGGATG
ATTCATCATATGATTTGCATCAGAGGAAAACTCTTAGAAAGCTTGTCAGGAATGGTGACA
TTGATGCTGCTCTGGCTAATCTCCAAGCTTGGTATCCCCAAATTGTACAGGACGATAAAT
CTGTAGTTTGTTTCCTCCTTCACTGCCAAAAGTTCATTGAGCTCGTACGGGTAGGAAAAC
TTGCAGAAGGTGTGAAGTATGGCAGACTCGAGTTAGCTAAATTTGTTGGGTTAACAAAGT
TTCAAGACATAATCGAGGACTGCTTTGCTTTGCTTGTTTATCCAAAACCCGAGGAATCAC
CGGTGGGGTACTTCTTAGAAGACTCGCAGAGGGAACTAGTTGCTGATGCAGTGAATGCAG
CGATTTTGTCAAACAAGAAAGATGTGTGTCACTTGCATTCCCGTCTGGAGTTACTGCTGA
GACAGCTAACAGTTTGCTGTTTGGAAAGGCGGTCAATGAATGGAGACCAAGGCGAAACGT
TCCGGCTTCACCATGTTCTTAACAGTACGAGAAGATGAAATCTGATTTAGCCGCGTATTG
TTCTTTTGAAAACTCTGCTACTTCGTTTGTTTGGTTGTTTTCATCCTTACGTGGCTCTTG
TTCATACATGTGATATTATGCATAACTTTCCTATTCTGTGAAAAGAAAGTTCAAACCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DH35JQ C 1
AF RR4FP29TF U 28
BS 1 29 RR4DH35JQ
BS 30 623 RR4FP29TF
BS 624 624 RR4DH35JQ
BS 625 701 RR4FP29TF
BS 702 719 RR4DH35JQ

RD RR4DH35JQ 719 0 0
CTACTAAAACTACAGTCCCTCCAATCGTTATAGCTCAAGACAATGCTATGGACGAGGATG
ATTCATCATATGATTTGCGTCAGAGGAAAACTCTTAGAAAGCTTGTCAGGAATGGTGACA
TTGATGCTGCTCTGGCTAATCTCCAAGCTTGGTATCCCCAAATTGTACAGGACGATAAAT
CTGTAGTTTGTTTCCTCCTTCACTGCCAAAAGTTCATTGAGCTCGTACGGGTAGGAAAAC
TTGCAGAAGGTGTGAAGTATGGCAGACTCGAGTTAGCTAAATTTGTTGGGTTAACAAAGT
TTCAAGACATAATCGAGGACTGCTTTGCTTTGCTTGTTTATCCAAAACCCGAGGAATCAC
CGGTGGGGTACTTCTTAGAAGACTCGCAGAGGGAACTAGTTGCTGATGCAGTGAATGCAG
CGATTTTGTCAAACAAGAAAGATGTGTGTCACTTGCATTCCCGTCTGGAGTTACTGCTGA
GACAGCTAACAGTTTGCTGTTTGGAAAGGCGGTCAATGAATGGAGACCAAGGCGAAACGT
TCCGGCTTCACCATGTTCTTAACAGTACGAGAAGATGAAATCTGATTTAGCCGCGTATTG
TTCTTTTGAAAACTCTGCTACTTCGTTTGTTTGGTTGTTTTCATCCTTACGTGGCTCTTG
TTCATACATGTGATATTATGCATAACTTTCCTATTCTGTGAAAAGAAAGTTCAAACCGG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4FP29TF 674 0 0
GG
ATAGCTCAAGACAATGCTATGGACGAGGATGATTCATCATATGATTTGCATCAGAGGAAA
ACTCTTAGAAAGCTTGTCAGGAATGGTGACATTGATGCTGCTCTGGCTAATCTCCAAGCT
TGGTATCCCCAAATTGTACAGGACGATAAATCTGTAGTTTGTTTCCTCCTTCACTGCCAA
AAGTTCATTGAGCTCGTACGGGTAGGAAAACTTGCAGAAGGTGTGAAGTATGGCAGACTC
GAGTTAGCTAAATTTGTTGGGTTAACAAAGTTTCAAGACATAATCGAGGACTGCTTTGCT
TTGCTTGTTTATCCAAAACCCGAGGAATCACCGGTGGGGTACTTCTTAGAAGACTCGCAG
AGGGAACTAGTTGCTGATGCAGTGAATGCAGCGATTTTGTCAAACAAGAAAGATGTGTGT
CACTTGCATTCCCGTCTGGAGTTACTGCTGAGACAGCTAACAGTTTGCTGTTTGGAAAGG
CGGTCAATGAATGGAGACCAAGGCGAAACGTTCCGGCTTCACCATGTTCTTAACAGTACG
AGAAGATGAAATCTGATTTAGCCGCGTATTGTTCTTTTGAAAACTCTGCTACTTTGTTTG
TTTGGTTGTTTTCATCCTTACGTGGCTCTTGTTCATACATGTGATATTATGCATAACTTT
CCTATTCTGTGA

QA 3 674 3 674
DS 



AS 1 2

CO CL6949Contig1 1486 2 4 U
GGAACCAAAACAATAACATCTTGTTATAGTTCTCATTCAAAAATATTTTCTTGAAACAGT
GAGCCAAATGAATTCAAGATTCATCCCTTCGATTTCTTCCTCAAGGTGTAATGGGAAGAG
CGAAAATGAAATTAGCAAGTTCGATGAAGAGAAAAACCCTGGTGTTAATATCTTAGGTAT
GAGAGGAGGTGATGGACACAATAGTTACGCATCCAACTCTCCTTCAGAAAAGAGTTTTAT
CAATGAGCAAGTCCATATTGGTTAAAAACACAAAAGAAATGATGACGAACTTGGACTTTC
CTGAATGCATTAAACTAACTGATTTGGGCTGTTCTTCGGGACAAAACACGTTCTTGTTCA
TGTCTGAGATCATTAACACAATCAATGCGTTATGTCAAGAACGGAACCAGACCCCGCCAG
AGATTGATTGCTGTCTGAACGATCTCCCTGGTAATGACTTTAACACGACGTTCGAGTTCA
TAAGTTTCCTCAACGATAAGCTCACAAGCAAAACACCATGCTTTGTCTCTGGAGTACCTG
GTTCTTTTTACTCAAGGCTCTTTCCTCGCAATAGTCTCCATTTGATTCATTCAAATTACA
GCGTTCATTACCTCTCTAAGGTTCCGGACGGACTGGAGAAGACCAAGATTAGTGTGTACA
TAACAAGTTCAAGTTCTCAAAGTGATTACAAAGCTTATATGAATCAATTCCAAAAAGATT
TTACGACATTTCTAAGAATGCGCTCTGAAGAGATGGTATCTAATGGACGCATGGTTCTCA
CATTAATTGGCAGAAAGACTCTTGATGATCCATTATACAGGGACTGTTGTCATTTTATAA
CATTGTTATCAGATTCTCTCCGCGACCTAGTTTTTGAGGGTCATGTGAGTGCATCAAAGG
CGAATTCGTTCAAGATGCCGTATTATGATCCGACCGAAGAAGAAGTAAAAGATATTATTA
AAAATGAGGGGTCATTCCAAATAAACGACTTAGAGATACATGCATTTGATCTTGGCCATA
GTAAAGGAGAAAGTATCCTGGAATCATGTGGAGCTAAACCAGGGGAAAAAGAGGCAAATT
GCATGAGAGCAGCGACTGAAACGATACTTGTAGCTCACTTCCAAGATGCCATTAATATCG
ATACATTGTTTGAAAAATATGCACACCATGTTTCTCAGCGTGCTAGCTGCAGGATCAAAA
CGTCCGTCAATCTACTGGTTTCATTGGTTCGGAAATGATGCAGCCATCTTTCGTCTTCTG
CAAGTTTACCAAAGAGACGTATTTGTGGGCTTTACTAATCATTATTGGTTTTTAGCCTTT
TCGTTAAGTTTGGGTTTTGATTTCTTTTTTTTATAGATAATTATGATTATTTCCTTTCTA
GATTAAGTTTATGATATCTTTTTCTTATTAGGTTTGTCTAAAGGAATGTGCTATTTAAAC
ATAACTGTGACTTTATGTTTGAGATTTTAATAAAAAAGTTTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AE46TF U 1
AF RR4AE46JQ C 635
BS 1 860 RR4AE46TF
BS 861 861 RR4AE46JQ
BS 862 875 RR4AE46TF
BS 876 1486 RR4AE46JQ

RD RR4AE46TF 875 0 0
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GAGCCAAATGAATTCAAGATTCATCCCTTCGATTTCTTCCTCAAGGTGTAATGGGAAGAG
CGAAAATGAAATTAGCAAGTTCGATGAAGAGAAAAACCCTGGTGTTAATATCTTAGGTAT
GAGAGGAGGTGATGGACACAATAGTTACGCATCCAACTCTCCTTCAGAAAAGAGTTTTAT
CAATGAGCAAGTCCATATTGGTTAAAAACACAAAAGAAATGATGACGAACTTGGACTTTC
CTGAATGCATTAAACTAACTGATTTGGGCTGTTCTTCGGGACAAAACACGTTCTTGTTCA
TGTCTGAGATCATTAACACAATCAATGCGTTATGTCAAGAACGGAACCAGACCCCGCCAG
AGATTGATTGCTGTCTGAACGATCTCCCTGGTAATGACTTTAACACGACGTTCGAGTTCA
TAAGTTTCCTCAACGATAAGCTCACAAGCAAAACACCATGCTTTGTCTCTGGAGTACCTG
GTTCTTTTTACTCAAGGCTCTTTCCTCGCAATAGTCTCCATTTGATTCATTCAAATTACA
GCGTTCATTACCTCTCTAAGGTTCCGGACGGACTGGAGAAGACCAAGATTAGTGTGTACA
TAACAAGTTCAAGTTCTCAAAGTGATTACAAAGCTTATATGAATCAATTCCAAAAAGATT
TTACGACATTTCTAAGAATGCGCTCTGAAGAGATGGTATCTAATGGACGCATGGTTCTCA
CATTAATTGGCAGAAAGACTCTTGATGATCCATTATACAGGGACTGTTGTCATTTTATAA
CATTGTTATCAGATTCTCTCGGCGACCTAGTTTTT

QA 1 875 1 875
DS 

RD RR4AE46JQ 852 0 0
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TTATATGAATCAATTCCAAAAAGATTTTACGACATTTCTAAGAATGCGCTCTGAAGAGAT
GGTATCTAATGGACGCATGGTTCTCACATTAATTGGCAGAAAGACTCTTGATGATCCATT
ATACAGGGACTGTTGTCATTTTATAACATTGTTATCAGATTCTCTCCGCGACCTAGTTTT
TGAGGGTCATGTGAGTGCATCAAAGGCGAATTCGTTCAAGATGCCGTATTATGATCCGAC
CGAAGAAGAAGTAAAAGATATTATTAAAAATGAGGGGTCATTCCAAATAAACGACTTAGA
GATACATGCATTTGATCTTGGCCATAGTAAAGGAGAAAGTATCCTGGAATCATGTGGAGC
TAAACCAGGGGAAAAAGAGGCAAATTGCATGAGAGCAGCGACTGAAACGATACTTGTAGC
TCACTTCCAAGATGCCATTAATATCGATACATTGTTTGAAAAATATGCACACCATGTTTC
TCAGCGTGCTAGCTGCAGGATCAAAACGTCCGTCAATCTACTGGTTTCATTGGTTCGGAA
ATGATGCAGCCATCTTTCGTCTTCTGCAAGTTTACCAAAGAGACGTATTTGTGGGCTTTA
CTAATCATTATTGGTTTTTAGCCTTTTCGTTAAGTTTGGGTTTTGATTTCTTTTTTTTAT
AGATAATTATGATTATTTCCTTTCTAGATTAAGTTTATGATATCTTTTTCTTATTAGGTT
TGTCTAAAGGAATGTGCTATTTAAACATAACTGTGACTTTATGTTTGAGATTTTAATAAA
AAAGTTTTGACT

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

CO CL6950Contig1 916 2 6 U
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CCTCGTAATGCAGGTAATTATAATTACCTCTTTGAAGTGTCCCTGATACTAAGAATGCAA
ATGAGATTTTCCCACCTCAGTAAATCACTCAGGTTTCGATACCTGAGGCTGAGTTAAACA
CAAATGACCCTTGAATTGCTTAAGATCCTAATCACTCAAGATAAATAAAAGGCAAGAGAT
CAAAGGATTACTTGGGGTATCTGGTCAATTAAGTTACACACAAATGCCTCGGCCCAGATC
TAATGAAAATGATCAACCTAAAAGATAATACCGAGTTTCTAGAATGAGTTTGGGCTGCCT
CTTCAAATTACTCGGTTCTTAGTCAGCCACACAATCCTTCCCGGTTCCAAGTATCTTAAG
GGATGAGGTTGACCTCTGTAGTACAAATTCATCGTGTATACACACTATCGAGAATATCAT
AGAGAAGATCAACAAAATAGTTTCATGTTATTTTTTCCATTTGAACAAGCTGACAGATGT
CGTCTAACTCCACCTTTCTATCTTTCTTTGCATGTAGTTCTCCTCTGGGTTTCAAAGATC
ACGCCAAGAGTTTCAGAAACTTTTAGACACTACACCACTAGTGCTCGGCTTTGAAAACTG
TCTCCTACTGGATGTTTTGAATACAGCAACGACGCTGGCTTTCTGGATGCAAATGCACGT
GTAGGATCAGGTTGGATGATACAAAAAGAAGATTTATGACAGCAGGTGTATTTCACTTAT
TCAAAAGTGCCAATCCTCTGGAAGCAAAATATTTCAGCCAACTCCAGGCTCTACAAACGT
TATAGAATCGAGGTTTCAAATGGCTCATTATATTTATGTCGAAGAAATGACATAGCAATG
CTAAACTTGACCTCCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES59TF U 1
AF RR4ES59JQ C 215
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BS 658 677 RR4ES59TF
BS 678 916 RR4ES59JQ

RD RR4ES59TF 677 0 0
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CCTCGTAATGCAGGTAATTATAATTACCTCTTTGAAGTGTCCCTGATACTAAGAATGCAA
ATGAGATTTTCCCACCTCAGTAAATCACTCAGGTTTCGATACCTGAGGCTGAGTTAAACA
CAAATGACCCTTGAATTGCTTAAGATCCTAATCACTCAAGATAAATAAAAGGCAAGAGAT
CAAAGGATTACTTGGGGTATCTGGTCAATTAAGTTACACACAAATGCCTCGGCCCAGATC
TAATGAAAATGATCAACCTAAAAGATAATACCGAGTTTCTAGAATGAGTTTGGGCTGCCT
CTTCAAATTACTCGGTTCTTAGTCAGCCACACAATCCTTCCCGGTTCCAAGTATCTTAAG
GGATGAGGTTGACCTCTGTAGTACAAATTCATCGTGTATACACACTATCGAGAATATCAT
AGAGAAGATCAACAAAATAGTTTCATGTTATTTTTTCCATTTGAACAAGCTGACAGATGT
CGTCTAACTCCACCTTTCTATCTTTCTTTGCATGTAGTTCTCCTCTGGGTTTCAAAGATC
ACGCCA*GAGTTTCAGAAACTTTTAGACACTACACCACTAGTGCTCGGCTTTGAAA*CTG
TCTCCTACTGGATGTTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4ES59JQ 702 0 0
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TACACACAAATGCCTCGGCCCAGATCTAATGAAAATGATCAACCTAAAAGATAATACCGA
GTTTCTAGAATGAGTTTGGGCTGCCTCTTCAAATTACTCGGTTCTTAGTCAGCCACACAA
TCCTTCCCGGTTCCAAGTATCTTAAGGGATGAGGTTGACCTCTGTAGTACAAATTCATCG
TGTATACACACTATCGAGAATATCATAGAGAAGATCAACAAAATAGTTTCATGTTATTTT
TTCCATTTGAACAAGCTGACAGATGTCGTCTAACTCCACCTTTCTATCTTTCTTTGCATG
TAGTTCTCCTCTGGGTTTCAAAGATCACGCCAAGAGTTTCAGAAACTTTTAGACACTACA
CCACTAGTGCTCGGCTTTGAAAACTGTCTCCTACTGGATGTTTTGAATACAGCAACGACG
CTGGCTTTCTGGATGCAAATGCACGTGTAGGATCAGGTTGGATGATACAAAAAGAAGATT
TATGACAGCAGGTGTATTTCACTTATTCAAAAGTGCCAATCCTCTGGAAGCAAAATATTT
CAGCCAACTCCAGGCTCTACAAACGTTATAGAATCGAGGTTTCAAATGGCTCATTATATT
TATGTCGAAGAAATGACATAGCAATGCTAAACTTGACCTCCG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL6951Contig1 590 2 2 U
GGAAACCAAAATATCAACAGTTATATTTGGGGATCATCAGGGCTTCTTCTTCACCATGGA
TCCTTACAAGTATCGTCCTTCGAGCGCCTACAACGCTCTGTTCTACACCACAAACGGTGG
TGCTCCAGTCTCGAACAACAGGACCATTGATAACTTCTTTAATGAAACTGAGCAGCTTGC
TTTCAACCCTGGTCTTGTGGTTCCTGGGATCTACTACTCGGATGATAAGCTGCTTCAGTG
TAGGATCCTGTCAGAGCCGCGTCTCACTCATGAAATCCGTAGCATCTGGATCTCTTATTG
GTCTCAAGCTGATCGATCTTTGGGACAGAAACTGGCAAGCCGTCTCAATGTAAGGCCAAG
CATCTAGAGACCAATCTACAGATATGCTTGTCTCTCAAAGGTACAGTCATATGATATTCT
CATCGATCCATCATCGCTTGGTCGTTAAATCCTTCAAAAGATACTATTCCATGTATGGTT
GTTTCGTGTTTGTATAATAATGATGCTTGTAATCTTATAAACCGATGTTTTACTATCGCT
GTCTTTGTAATCTCCTTCACAATAAATCAATGTTTCTTGAGTATTAAGCT


BQ
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AF RR4E425JQ C 1
AF RR4E425TF U 59
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DS 

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QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AW64JQ U 1
AF RR4AZ95JQ U 1
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TCACTATA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B046JQ C 1
AF RR4B046TF U 1
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QA 1 516 1 516
DS 

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TGGATTTTTCCTGTAAAAGAAAAAAACAAAGAAGAC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL6954Contig1 843 2 2 U
GGGAACCGGATGAATATAGGGACTAATAGAGGTGATGCACATGCTTTCAAGCTAGACACA
CTCTTGAAACTGGTGGATATCAAAGGGGCTGATGGCAAAACCACCTTACTACACTTTGTG
GTTCAAGAGATTATAAAATCCGAAGGAGCTAGAGTTACTTCAACTCCCACTCAAAGCCCT
GTAGGAGATGATATAAATATAGCAGAGCAATCAGCATTCCAGGACGACCTAGAGCTAAAG
AAACTTGGGTTGCAAGTAGTCTCGGGTCTCAGTTCTCAGTTGATAAACGTCAAGAAAGCA
GCTGCGATGGATTCAACTTCCCTCAGCAAGGAGATAGCTGAAATCTCCAGCGGAATAACA
AAAGTCAAGGAAGTGGTCATGGAGCTAAAGCAAGAAACTGGTGTAGAGAGATTCTTGGAG
TCAATGAACTCGTTTTTGGACAAAGGGGAGAAAGTGATCACAGAGATACAATCTCATGGA
ATCAATGTCATGAAGATAGTTAAAGAAGTAACGGAGTATTTCCATGGGAACTCGGATTCT
CATCCTTTCCGCATTTTTACCGTGGTTAGAGACTTTCTGACGATTCTTGATCAAGTGTGT
AAAGAAGTTGGTCGTGTAAACGAGAGGACAGTGTACGGATCACGACCTTCACCGTCGAAC
CAGACCGTCACACCGCTGTTTCCGGTTGTTAACATTAACCACTCAGAGCTGAGTCACGAT
GATGATTCGTTCTAAGTGACAACGATTGGCTAAGTATATTTAAGTGGTTTTGGTTTTGTT
TGATCGTTCACTCGAGAACACATGTTACATGTATTTATTATTTATGAACATATTTATATT
GAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 

AF RR4B509TF U 1
AF RR4B509JQ C 68
BS 1 842 RR4B509TF
BS 843 843 RR4B509JQ

RD RR4B509TF 842 0 0
GGGAACCGGATGAATATAGGGACTAATAGAGGTGATGCACATGCTTTCAAGCTAGACACA
CTCTTGAAACTGGTGGATATCAAAGGGGCTGATGGCAAAACCACCTTACTACACTTTGTG
GTTCAAGAGATTATAAAATCCGAAGGAGCTAGAGTTACTTCAACTCCCACTCAAAGCCCT
GTAGGAGATGATATAAATATAGCAGAGCAATCAGCATTCCAGGACGACCTAGAGCTAAAG
AAACTTGGGTTGCAAGTAGTCTCGGGTCTCAGTTCTCAGTTGATAAACGTCAAGAAAGCA
GCTGCGATGGATTCAACTTCCCTCAGCAAGGAGATAGCTGAAATCTCCAGCGGAATAACA
AAAGTCAAGGAAGTGGTCATGGAGCTAAAGCAAGAAACTGGTGTAGAGAGATTCTTGGAG
TCAATGAACTCGTTTTTGGACAAAGGGGAGAAAGTGATCACAGAGATACAATCTCATGGA
ATCAATGTCATGAAGATAGTTAAAGAAGTAACGGAGTATTTCCATGGGAACTCGGATTCT
CATCCTTTCCGCATTTTTACCGTGGTTAGAGACTTTCTGACGATTCTTGATCAAGTGTGT
AAAGAAGTTGGTCGTGTAAACGAGAGGACAGTGTACGGATCACGACCTTCACCGTCGAAC
CAGACCGTCACACCGCTGTTTCCGGTTGTTAACATTAACCACTCAGAGCTGAGTCACGAT
GATGATTCGTTCTAAGTGACAACGATTGGCTAAGTATATTTAAGTGGTTTTGGTTTTGTT
TGATCGTTCACTCGAGAACACATGTTACATGTATTTATTATTTATGAACATATTTATATT
GA

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4B509JQ 776 0 0
AACTGGTGGATATCAAAGGGGCTGATGGCAAAACCACCTTACTACACTTTGTGGTTCAAG
AGATTATAAAATCCGAAGGAGCTAGAGTTACTTCAACTCCCACTCAAAGCCCTGTAGGAG
ATGATATAAATATAGCAGAGCAATCAGCATTCCAGGACGACCTAGAGCTAAAGAAACTTG
GGTTGCAAGTAGTCTCGGGTCTCAGTTCTCAGTTGATAAACGTCAAGAAAGCAGCTGCGA
TGGATTCAACTTCCCTCAGCAAGGAGATAGCTGAAATCTCCAGCGGAATAACAAAAGTCA
AGGAAGTGGTCATGGAGCTAAAGCAAGAAACTGGTGTAGAGAGATTCTTGGAGTCAATGA
ACTCGTTTTTGGACAAAGGGGAGAAAGTGATCACAGAGATACAATCTCATGGAATCAATG
TCATGAAGATAGTTAAAGAAGTAACGGAGTATTTCCATGGGAACTCGGATTCTCATCCTT
TCCGCATTTTTACCGTGGTTAGAGACTTTCTGACGATTCTTGATCAAGTGTGTAAAGAAG
TTGGTCGTGTAAACGAGAGGACAGTGTACGGATCACGACCTTCACCGTCGAACCAGACCG
TCACACCGCTGTTTCCGGTTGTTAACATTAACCACTCAGAGCTGAGTCACGATGATGATT
CGTTCTAAGTGACAACGATTGGCTAAGTATATTTAAGTGGTTTTGGTTTTGTTTGATCGT
TCACTCGAGAACACATGTTACATGTATTTATTATTTATGAACATATTTATATTGAG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL6955Contig1 919 2 2 U
GGTTATCTTAAGAACTCTAACGCCAAGATCCGAGCAAAAGCAGCAGATGTTTTGACCACG
GTTGTCCAAAACAATCCTCGTAGCCAGCAGCTTGTTATGGAAGCAAATGGCTTCGAGCCC
TTGTTAACAAACTTTATTACTTCCCGACGTTAGAGTCAGGACCAAAGCCCTCGGTGCTTT
ATCTTCTCTTATCCGTCACAACCAACAAGGGATTACAGCTTTCCGCCTAGCAAATGGTTA
CTCTGGCTTGCGAGACGCACTGGTCTCTGATACCGTTAGATTTCAAAGGAAAGCGTTGAA
TTTGATTCACTATCTTCTCCAAGAAAGCAACTCAGACTGTAGAATCGTTAGGGATCTTGG
ATTCCCTCGCATAATGATCCACCTAGCATCCAACCAAGACCTTGAAGTCCGTGAATTCGC
TCTTCGTGGTCTCCTAGAGCTTACCCGTGAAGAATCCGAGAGAAACCTCGACAGAGCGGA
TGTGAATCTAAGACAGCTTCTTGAAGAGAGAACAAGAAGAATCATTGCCATGTCGGACGA
AGATCTTTGTGCGGCTAGAGAAGAAAGAGAGCTAGTGGATATCCTTTGGACCGTGTGTTA
CGATGAACCGTCTCTTCTAAGAGAGAGAGGTCTGGTCTACCTCCCGTGTGATGACGAGAT
GGCTCCTGATGTGGTTAGAGACCGCTTTGAACCTCCGTTAAGGGCTTGGGCTGCAAGGCG
AGATGATAAAATGAATGAACCACCGGTTCCACTTCTTCTTGGTCCTCCTGCTCAGTGATC
TCATTGCTATGGGCCTTTGATCCCATCACAAATAAAAACTGTGTGGAACAGTTATTTTAA
ATGTTCTACCGTTTCTCTGTTCAGTTCTGCCAAGACCATAATGTTTCAGTCTATTTGAGA
TATCGAGAGAACATCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA37TF U 1
AF RR4HA37JQB C 198
BS 1 625 RR4HA37TF
BS 626 919 RR4HA37JQB

RD RR4HA37TF 625 0 0
GGTTATCTTAAGAACTCTAACGCCAAGATCCGAGCAAAAGCAGCAGATGTTTTGACCACG
GTTGTCCAAAACAATCCTCGTAGCCAGCAGCTTGTTATGGAAGCAAATGGCTTCGAGCCC
TTGTTAACAAACTTTATTACTTCCCGACGTTAGAGTCAGGACCAAAGCCCTCGGTGCTTT
ATCTTCTCTTATCCGTCACAACCAACAAGGGATTACAGCTTTCCGCCTAGCAAATGGTTA
CTCTGGCTTGCGAGACGCACTGGTCTCTGATACCGTTAGATTTCAAAGGAAAGCGTTGAA
TTTGATTCACTATCTTCTCCAAGAAAGCAACTCAGACTGTAGAATCGTTAGGGATCTTGG
ATTCCCTCGCATAATGATCCACCTAGCATCCAACCAAGACCTTGAAGTCCGTGAATTCGC
TCTTCGTGGTCTCCTAGAGCTTACCCGTGAAGAATCCGAGAGAAACCTCGACAGAGCGGA
TGTGAATCTAAGACAGCTTCTTGAAGAGAGAACAAGAAGAATCATTGCCATGTCGGACGA
AGATCTTTGTGCGGCTAGAGAAGAAAGAGAGCTAGTGGATATCCTTTGGACCGTGTGTTA
CGATGAACCGTCTCTTCTAAGAGAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4HA37JQB 722 0 0
ACAACCAACAAGGGATTACAGCTTTCCGC*TAGCAAATGGTTACTCTGGCTTGCGAGACG
CACTGGTCTCTGATACCGTTAGATTTCAAAGGAAAGCGTTGAATTTGATTCACTATCTTC
TCCAAGAAAGCAACTCAGACTGTAGAATCGTTAGGGATCTTGGATTCCCTCGCATAATGA
TCCACCTAGCATCCAACCAAGACCTTGAAGTCCGTGAATTCGCTCTTCGTGGTCTCCTAG
AGCTTACCCGTGAAGAATCCGAGAGAAACCTCGACAGAGCGGATGTGAATTTAAGACAGC
TTCTTGAAGAGAGAACAAGAAGAATCATTGCCATGTCGGACGAAGATCTTTGTGCGGCTA
GAGAAGAAAGAGAGCTAGTGGATATCCTTTGGACCGTGTGTTACGATGAACCGTCTCTTC
TAAGAGAGAGAGGTCTGGTCTACCTCCCGTGTGATGACGAGATGGCTCCTGATGTGGTTA
GAGACCGCTTTGAACCTCCGTTAAGGGCTTGGGCTGCAAGGCGAGATGATAAAATGAATG
AACCACCGGTTCCACTTCTTCTTGGTCCTCCTGCTCAGTGATCTCATTGCTATGGGCCTT
TGATCCCATCACAAATAAAAACTGTGTGGAACAGTTATTTTAAATGTTCTACCGTTTCTC
TGTTCAGTTCTGCCAAGACCATAATGTTTCAGTCTATTTGAGATATCGAGAGAACATCGA
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6956Contig1 1181 2 2 U
GGATATTGTAAAATACATCTCACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGC
TCCTCTCTCCGGCTTCTTCCTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACT
CTCTCTTCGTTCCTCTCCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCCTCCTCCCCCTCTCGTTCCGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGC
TCCTGCTCCTATCATCACCCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAATA
GGCCATTGAAGCTCTCAAGAAGCTTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGC
CGCTAAGGTGGAGCAGGTCACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGC
TTTTGACCCCGTCGAAAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGA
AACCAACCCTGCTTTGTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTT
TGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGC
CTTCGTTGTCCGTAACATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGATCAAATACGGTGG
AGTAGGAGCAGCCATCGAATACGCTGTTTTGCACCTTAAGGTGGAGAACATTGTGGTGAT
AGGACACAGCGCTTGTGGTGGGATCAAGGGACTCATGTCTTTTCCTTTGGATGGAAACAA
CTCCACTGATTTCATAGAGGACTGGGTCAAAATCTGTTTACCAGCCAAGTCAAAAGTCAT
ATCAGAACTTGGGGAGTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGT
GAATGTTTCACTAGCAAACTTGTTGACTTATCCATTCGCGAGAGAAGGACTTGTGAAAGG
AACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGG
ACTTGAGTTTGGCCTCTCCGAAACTAGCTCAGTATGAACCAATCCACCATCATCATCATG
AGCATCCATCATCATCATATATCTCATTTACATATGTAATTTGTAATGTGCTGAGTTGTT
TTCCAATCTTCATGGTATTCAACTTTCATATAAATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CTCTCTTCGTTCCTCTCCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCCTCCTCCCCCTCTCGTTCCGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGC
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TGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGC
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DS 

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ATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCATCGAATACGCTGTTTTGCACCTTAAGGTGGAGAACAT
TGTGGTGATAGGACACAGCGCTTGTGGTGGGATCAAGGGACTCATGTCTTTTCCTTTGGA
TGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGACTGGGTCAAAATCTGTTTACCAGCCAAGTC
AAAAGTCATATCAGAACTTGGGGAGTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAG
GGAGGCAGTGAATGTTTCACTAGCAAACTTGTTGACTTATCCATTCGCGAGAGAAGGACT
TGTGAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGA
GCTTTGGGGACTTGAGTTTGGCCTCTCCGAAACTAGCTCAGTATGAACCAATCCACCATC
ATCATCATGAGCATCCATCATCATCATATATCTCATTTACATATGTAATTTGTAATGTGC
TGAGTTGTTTTCCAATCTTCATGGTATTCAACTTTCATATAAATAAAAAA

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6957Contig1 1098 2 10 U
GGGACGCATACCAACGTCTACTTCAGAGATTCAGGGCTTGGTATGTGAGGACATCTCCAA
GGGGCTAGAATCTAAGCGCATCCCAGCCACCAATCGTGTGGATGAAACACCAGTTTCCCC
ATCAGAGTTCACATATATCACTGCTTTGAAGATTGAGCCCAATGCCAAAATTCCAAAGAG
CTCGGCTGGGTGTAACTGCCGAGGCAGCTGCACTGATCCAAAGAAATGTGCCTGTGCTAG
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AGACGTTGTATTTGAATGTGGTCCAAACTGTGGGTGTGGGCCTCAATGCGTCAACAGAAC
CTCTCAGAAACGATTAAGATTTCATCTGGAGGTCTTTCGTTCTCCAAAGAAGGGTTGGGC
AGTTAGATCATGGGATTACATACCAGCTGGATCACCAGTATGTGAGTACATAGGAGTCCT
CCGTAGAACTGACGATGTGGATACTCTTACTGACAACGACTACATATTTGAGATTGACTG
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AACGGATAGCAAAGCCAGTGAAAGCAATAGTGATGAGAATGTCCCAGAGTTCTGCATCGA
CGCTGGTTCGATAGGGAACTTTGCCAGGTTCATAAATCACAGCTGTGAACCAAATCTGTT
TGTCCAGTGCGTCCTGAGTTCTCACCACGATATCATGCTTGCTCGTGTGGTTCTTTTTGC
AGCGGACAACATTCCACCACTGCAGGAGCTGACATACGACTATGGATATACGCTTGATAG
CGTTCATGGGCCAGATGGGAAGGTGAAAATGCTTACTTGCTACTGTGGAGCAGGAAATTG
TAGAAAACGCCTCTACTAGCAAGGAGTAGAAGAATCTGTATTTGCTATTGGTAACATACT
TTGTAGTATGAAAAATCATAAAGACTACATGAACATATTTTTGGGGGAGTACGTGAACAA
AACTATCTCCCTAGCGGATCCCCGTAACAATGTTGTTTTAGGGACTTATTAAAGTATTAT
TTTTCTGCAGCGTACATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GG06TF U 1
AF RR4GG06JQ C 318
BS 1 586 RR4GG06TF
BS 587 587 RR4GG06JQ
BS 588 626 RR4GG06TF
BS 627 627 RR4GG06JQ
BS 628 638 RR4GG06TF
BS 639 639 RR4GG06JQ
BS 640 650 RR4GG06TF
BS 651 651 RR4GG06JQ
BS 652 665 RR4GG06TF
BS 666 1098 RR4GG06JQ

RD RR4GG06TF 679 0 0
GGGACGCATACCAACGTCTACTTCAGAGATTCAGGGCTTGGTATGTGAGGACATCTCCAA
GGGGCTAGAATCTAAGCGCATCCCAGCCACCAATCGTGTGGATGAAACACCAGTTTCCCC
ATCAGAGTTCACATATATCACTGCTTTGAAGATTGAGCCCAATGCCAAAATTCCAAAGAG
CTCGGCTGGGTGTAACTGCCGAGGCAGCTGCACTGATCCAAAGAAATGTGCCTGTGCTAG
GCTTAATGGTGGAAACTTTCCATATGTCGACCTTAATGATGGCAGATTAATTGAGCCTCG
AGACGTTGTATTTGAATGTGGTCCAAACTGTGGGTGTGGGCCTCAATGCGTCAACAGAAC
CTCTCAGAAACGATTAAGATTTCATCTGGAGGTCTTTCGTTCTCCAAAGAAGGGTTGGGC
AGTTAGATCATGGGATTACATACCAGCTGGATCACCAGTATGTGAGTACATAGGAGTCCT
CCGTAGAACTGACGATGTGGATACTCTTACTGACAACGACTACATATTTGAGATTGACTG
CCAACAGACAATGCAAGGTCTTGATGGAAGACAGAGAAGACTAAAG*ACGTAGCTGTACC
AACGGATAGCAAAGCCAGTGAAAGCA*TAGTGATGAGA*TGTCCCAGAGT*CTGCATCGA
CGCTG
TCGATAGGACTTGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4GG06JQ 781 0 0
TGT
GTCCAAACTGTGGGTGTGGGCCTCAATGCGTCAACAGAACCTCTCAGAAACGATTAAGAT
TTCATCTGGAGGTCTTTCGTTCTCCAAAGAAGGGTTGGGCAGTTAGATCATGGGATTACA
TACCAGCTGGATCACCAGTATGTGAGTACATAGGAGTCCTCCGTAGAACTGACGATGTGG
ATACTCTTACTGACAACGACTACATATTTGAGATTGACTGCCAACAGACAATGCAAGGTC
TTGATGGAAGACAGAGAAGACTAAAGGACGTAGCTGTACCAACGGATAGCAAAGCCAGTG
AAAGCAATAGTGATGAGAATGTCCCAGAGTTCTGCATCGACGCTGGTTCGATAGGGAACT
TTGCCAGGTTCATAAATCACAGCTGTGAACCAAATCTGTTTGTCCAGTGCGTCCTGAGTT
CTCACCACGATATCATGCTTGCTCGTGTGGTTCTTTTTGCAGCGGACAACATTCCACCAC
TGCAGGAGCTGACATACGACTATGGATATACGCTTGATAGCGTTCATGGGCCAGATGGGA
AGGTGAAAATGCTTACTTGCTACTGTGGAGCAGGAAATTGTAGAAAACGCCTCTACTAGC
AAGGAGTAGAAGAATCTGTATTTGCTATTGGTAACATACTTTGTAGTATGAAAAATCATA
AAGACTACATGAACATATTTTTGGGGGAGTACGTGAACAAAACTATCTCCCTAGCGGATC
CCCGTAACAATGTTGTTTTAGGGACTTATTAAAGTATTATTTTTCTGCAGCGTACATT

QA 4 781 4 781
DS 



AS 1 2

CO CL6958Contig1 623 2 9 U
GTTTATACGTTTCTCATTAATAGACTAGTAAAAAATCAAAAGATGATTTTATTGTAGGAT
TAGTATTAACTATTAATCATAAAAACTGAGCAAGTAAAATCTAAAATGTTTTCTACATGA
AACATGACTCTAGTTTCTTCTCTTCCGGCAACCTTGGCGTGATGGTCACCTTAAGACCGT
ACTTCATGTACAAGTTAGTCGTAACTCTCGGGACAACCACATGATCTTGAGCAACCTTGA
TTGAGTACTTCAACAAAACTGAAGCAGCTATCATCTTCATTTGCAAGTAAGCAAATGTTT
TCCCTATACACAACCTAGGTCCAGCATTGAACACAACATATTTGAACTGGTCGTCACTGA
CAAACTTCCCTCCTTGGATCCACCTCTCTGGTCTGAACATTTCACAGTCTTTCCCCCATA
TTGATTCCATCCTTCCCATGGCATAGATAGAGAAGTAAACCCTTGAACCCTTTTTTATAA
ATGTCCCATCTGGAAAAACATCATCTCCAATGGCTTGTTTCATCTCCATTGGGATTGGTG
GGTAAAGTCTTAAGGTTCTGAAATTGCTGCTTGAAGATAGACCATGTTGTTTAGTTCTCT
GACCGTGAAGAGACTACTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE92JQ U 192
AF RR4A994TF C 1
BS 1 191 RR4A994TF
BS 192 218 RR4EE92JQ
BS 219 219 RR4A994TF
BS 220 370 RR4EE92JQ
BS 371 371 RR4A994TF
BS 372 381 RR4EE92JQ
BS 382 382 RR4A994TF
BS 383 432 RR4EE92JQ
BS 433 623 RR4A994TF

RD RR4EE92JQ 241 0 0
AAGTTAGTCGTAACTCTCGGGACAACCCCATGATCTTGAGCAACCTTGATTGAGTACTTC
AACAAAACTGAAGCAGCTATCATCTTCATTTGCAAGTAAGCAAATGTTTTCCCTATACAC
AACCTAGGTCCAGCATTGAACACAACATATTTGAACTGGTCGTCACTGACAAACTTCCC*
CCTTGGATCCCCCTCTCTGGTCTGAACATTTCACAGTCTTTCCCCCATATTGATTCCATC
C

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR4A994TF 623 0 0
GTTTATACGTTTCTCATTAATAGACTAGTAAAAAATCAAAAGATGATTTTATTGTAGGAT
TAGTATTAACTATTAATCATAAAAACTGAGCAAGTAAAATCTAAAATGTTTTCTACATGA
AACATGACTCTAGTTTCTTCTCTTCCGGCAACCTTGGCGTGATGGTCACCTTAAGACCGT
ACTTCATGTACAAGTTAGTCGTAACTCTCGGGACAACCACATGATCTTGAGCAACCTTGA
TTGAGTACTTCAACAAGACTGAAGCAGCTATCATCTTCATTTGCAAGTAAGCAAATGTTT
TCCCTATACACAACCTAGGTCCAGCATTGAACACAACATATTTGAACTGGTCGTCACTGA
CAAACTTCCCTCCTTGGATCCACCTCTCTGGTCTGAACATTTCACAGTCTTTCCCCCATA
TTGATTCCATCCTTCCCATGGCATAGATAGAGAAGTAAACCCTTGAACCCTTTTTTATAA
ATGTCCCATCTGGAAAAACATCATCTCCAATGGCTTGTTTCATCTCCATTGGGATTGGTG
GGTAAAGTCTTAAGGTTCTGAAATTGCTGCTTGAAGATAGACCATGTTGTTTAGTTCTCT
GACCGTGAAGAGACTACTGTCTC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL6959Contig1 774 2 2 U
GGATCCACACACATGAACGTCATCCTCTGATCTTCTTTTCAAACACATCACCATGAGACT
CAGATCTCTCTTCTCTCTCCTCTTCCTCGTCCTCTTCACCTCATCGGCCTACGCTCGGTT
CGTCGCTGTACAACCATCTTCGACCGGTCTCATCTCCGACGGAATCAACGGTGGGAGTCT
CGACTCCGGATCGATTATCAAAACCGTGGTCTCTGCTCCTCCGGCTGAGGAGAAAGAGGA
GGCTTGCGAACAGACCTATGGGTTCATGCCGTGTACCAAGACGGCGCTTGGGAACGTGTT
CTTGATTTTGGTTTATGGGTTTCTCATGTACACGGCGGCGACGTATCTATCCGCCGGGAG
TGAGCTTTTGCTGGAGATCTTGGGACCTGGTATCGTCGGTGGTTTGTTTCTTCCCATGCT
CGGAGCTCTTCCTGACGCTATGCTTATTATGGGTAGGTCAAAGGTTGATTCTTTGTTGGT
GCTGTTTGAGTTTTGAGAGATAAAAAGTTAATTTTTATTAGTTTCTGCGGCTCATATAAT
AGTTAGTGATGATGATGGTAACTGAAAGGTTGATTCTTTTGTTTTACTGTTTGAGGTTTT
GAGAGATAAAAAGTGAATCTTTGTTAGGTTCTGTGAATCATGTAGTCAGTTATGATGATG
ATGATACTTTGATGGTAACTGATGATGAACTCATGTCTTGTCACCTTCTGTTTTTTTTAG
CCAATTTTTTTTTAATTTTTTGTGACAATAGAATCTTTGTTTCCAAATTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GM04TF U 1
AF RR4GM04JQ C 125
BS 1 506 RR4GM04TF
BS 507 774 RR4GM04JQ

RD RR4GM04TF 506 0 0
GGATCCACACACATGAACGTCATCCTCTGATCTTCTTTTCAAACACATCACCATGAGACT
CAGATCTCTCTTCTCTCTCCTCTTCCTCGTCCTCTTCACCTCATCGGCCTACGCTCGGTT
CGTCGCTGTACAACCATCTTCGACCGGTCTCATCTCCGACGGAATCAACGGTGGGAGTCT
CGACTCCGGATCGATTATCAAAACCGTGGTCTCTGCTCCTCCGGCTGAGGAGAAAGAGGA
GGCTTGCGAACAGACCTATGGGTTCATGCCGTGTACCAAGACGGCGCTTGGGAACGTGTT
CTTGATTTTGGTTTATGGGTTTCTCATGTACACGGCGGCGACGTATCTATCCGCCGGGAG
TGAGCTTTTGCTGGAGATCTTGGGACCTGGTATCGTCGGTGGTTTGTTTCTTCCCATGCT
CGGAGCTCTTCCTGACGCTATGCTTATTATGGGTAGGTCAAAGGTTGATTCTTTGTTGGT
GCTGTTTGAGTTTTGAGAGATAAAAA

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR4GM04JQ 650 0 0
GCTGTACAACCATCTTCGACCGGTCTCATCTCCGACGGAATCAACGGTGGGAGTCTCGAC
TCCGGATCGATTATCAAAACCGTGGTCTCTGCTCCTCCGGCTGAGGAGAAAGAGGAGGCT
TGCGAACAGACCTATGGGTTCATGCCGTGTACCAAGACGGCGCTTGGGAACGTGTTCTTG
ATTTTGGTTTATGGGTTTCTCATGTACACGGCGGCGACGTATCTATCCGCCGGGAGTGAG
CTTTTGCTGGAGATCTTGGGACCTGGTATCGTCGGTGGTTTGTTTCTTCCCATGCTCGGA
GCTCTTCCTGACGCTATGCTTATTATGGGTAGGTCAAAGGTTGATTCTTTGTTGGTGCTG
TTTGAGTTTTGAGAGATAAAAAGTTAATTTTTATTAGTTTCTGCGGCTCATATAATAGTT
AGTGATGATGATGGTAACTGAAAGGTTGATTCTTTTGTTTTACTGTTTGAGGTTTTGAGA
GATAAAAAGTGAATCTTTGTTAGGTTCTGTGAATCATGTAGTCAGTTATGATGATGATGA
TACTTTGATGGTAACTGATGATGAACTCATGTCTTGTCACCTTCTGTTTTTTTTAGCCAA
TTTTTTTTTAATTTTTTGTGACAATAGAATCTTTGTTTCCAAATTTTAGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6960Contig1 754 2 1 U
GGATTGCAGCTAAAGAGCATCTGAATCCTACCTAGGTTTATATACATCTCTCTCCCTCTC
TCTCTCTCTAATTAGCTACTCTCTGAATCTATATCTGAATCTTCACTTCTCCAAGATTGT
TGTCAACCCTTTCAATTTACAGCGAGAAGAAAAAGGATCGATCTTTATCGATTTTTGATT
TGAAAGTTTCCTTTTTGAGGTGTAGCGTTTGTTGGTATCTCGTCCACAATGACGACTTCT
GTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTGTCCCGACGACGCCTCTACTCGAAAACAAGGCGAAA
CTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAATCTGATCCCTCTGCTCGAAAACAAGCCGACA
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CTGAAAACGAAGGAAGAGTGAACAAGGAGGAATCTACTGATTCCGCAACGGTGCCTGCCA
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GTCTGTTGTGAACAGCACTGATAAAGAAGAGTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F627TF U 1
AF RR4EZ94TF U 1
BS 1 754 RR4EZ94TF

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QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4EZ94TF 754 0 0
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AGTGCCCGTTTGGTTATGACTCCCAGACGTTCAAGCTTGGGCCTTTTAGTTGTATGCTAT
GTCAAGCACTTCTTTATGATAGCAGTAGATGTGTTCCTTGCACACATGTGTTCTGCAAGG
TGTGCGTATCACGGTTTAAGGACTGCCCTTTATGTGGTGCTGACGTTGAGAGTATTGAAG
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GTCTGTTGTGAACAGCACTGATAAAGAAGAGTCG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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CTCCACGTTCGTTCCCTATCTTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCACCGGTTCCCGGATCC
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CCAAAATCAGAGTCAGTGATTGGTCCTCTCCCTGAGGTGGTCGCAAAGGGTGAGGAACCG
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TCTTCACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DN09JQ C 1
AF RR4DN09TF U 1
BS 1 668 RR4DN09TF

RD RR4DN09JQ 668 0 0
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TCTTCACG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4DN09TF 668 0 0
GGACAACACAATCCAAATCCAAAGCTCCAAACCTTTTTTCCAAGTTTTCAACACAAATGG
TGAGGAAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAGACGAGACCAAAGAGTCAATTTTCATGGGC
TCAGTCCGAGTCAACCTCAACTACTATCCCATCTGTCCTAACCCTGACTTAACCGTTGGC
GTTGGTCGTCACTCAGACGTCTCTTCCCTCACCATTCTCTTACAAGACCAAATCGGTGGC
CTCCACGTTCGTTCCCTATCTTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCACCGGTTCCCGGATCC
TTTGTGATCAACATCGGAGACGCTATGCAGATCTTGAGCAACGGTCGTTACAAGAGCGTG
GAGCATCGTGTCTTAGCTAACGGTAGCAACAACAGGATCTCGGTTCCTATCTTTGTGAAT
CCAAAATCAGAGTCAGTGATTGGTCCTCTCCCTGAGGTGGTCGCAAAGGGTGAGGAACCG
ATTTATAAAGACGTTGTGTACTCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCAAGAAAGCACATGAT
GGAAAGAAAACCGTTGACTTCGCCAAGATATGATCATAACCAGACCTCAAAAGAGTTTGG
TTTCTTTTGTTTTGTTTCATGTTTGTGTGTTGCATGCGTGTGAATTAATAAAGAAGACTC
TCTTCACG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6962Contig1 668 2 1 U
GAGAAAACTTTATTATTATTATTATTATTTGTTAACTGTTACAATCCTTTTATTCATTAT
TCAGTTGATAGTGTCTGTTTATTATATGGTGATTTCCATGACCAAACCAGTTTAAAGTTC
AAACTAGTAAAGTTCTATTCATTATTAACATTTAATCCATAAGCTCAGATATGCTGAAGG
GAGAAGTTGTGTTTCCGTCAAACGCTGCGACAGCTATCACAGTATTAATTATTCCCGTGG
TGTGCACGTTATCCCAAAAAATGTATTCGTTTCGGTTAGGACAAACCGGTCCGTTTTCTG
CACAAAGCTCTTCACCAGGATTAACGGTACAGCAACTCCTGTCACCAACAGTAATCCCTA
GAGCGGCGAAGTCTTCAGCATTTCCAGAGAAGAGGTCAACGTAAGTGAACTTAACACTAG
AAAGTCTGTCGTTGAAGTCTGCGACTAGGGCTTCGAGTTTATTGTTGAAGAGATCCACGG
CTTGGTTCACTTCTTCTGCGCAGCCAACACCACCACCAAGGCTAGCAATAATACGTGGTG
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GTTTCAAATAGATATTGTAGAGGCGTATGAGAGTTTCAGCAAACTGTTCAGGATTATAAC
GGCGACGA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4DT03JQ U 1
AF RR4E203JQ U 1
BS 1 668 RR4DT03JQ

RD RR4DT03JQ 668 0 0
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TCAGTTGATAGTGTCTGTTTATTATATGGTGATTTCCATGACCAAACCAGTTTAAAGTTC
AAACTAGTAAAGTTCTATTCATTATTAACATTTAATCCATAAGCTCAGATATGCTGAAGG
GAGAAGTTGTGTTTCCGTCAAACGCTGCGACAGCTATCACAGTATTAATTATTCCCGTGG
TGTGCACGTTATCCCAAAAAATGTATTCGTTTCGGTTAGGACAAACCGGTCCGTTTTCTG
CACAAAGCTCTTCACCAGGATTAACGGTACAGCAACTCCTGTCACCAACAGTAATCCCTA
GAGCGGCGAAGTCTTCAGCATTTCCAGAGAAGAGGTCAACGTAAGTGAACTTAACACTAG
AAAGTCTGTCGTTGAAGTCTGCGACTAGGGCTTCGAGTTTATTGTTGAAGAGATCCACGG
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TACACCCAATCTTACCGATTCCAAACAAAGCCACATTCCTCGCTCCTAGTAGGTAGAGTT
GTTTCAAATAGATATTGTAGAGGCGTATGAGAGTTTCAGCAAACTGTTCAGGATTATAAC
GGCGACGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4E203JQ 663 0 0
GAGAAAACTTTATTATTATTATTATTATTTGTTAACTGTTACAATCCTTTTATTCATTAT
TCAGTTGATAGTGTCTGTTTATTATATGGTGATTTCCATGACCAAACCAGTTTAAAGTTC
AAACTAGTAAAGTTCTATTCATTATTAACATTTAATCCATAAGCTCAGATATGCTGAAGG
GAGAAGTTGTGTTTCCGTCAAACGCTGCGACAGCTATCACAGTATTAATTATTCCCGTGG
TGTGCACGTTATCCCAAAAAATGTATTCGTTTCGGTTAGGACAAACCGGTCCGTTTTCTG
CACAAAGCTCTTCACCAGGATTAACGGTACAGCAACTCCTGTCACCAACAGTAATCCCTA
GAGCGGCGAAGTCTTCAGCATTTCCAGAGAAGAGGTCAACGTAAGTGAACTTAACACTAG
AAAGTCTGTCGTTGAAGTCTGCGACTAGGGCTTCGAGTTTATTGTTGAAGAGATCCACGG
CTTGGTTCACTTCTTCTGCGCAGCCAACACCACCACCAAGGCTAGCAATAATACGTGGTG
TACACCCAATCTTACCGATTCCAAACAAAGCCACATTCCTCGCTCCTAGTAGGTAGAGTT
GTTTCAAATAGATATTGTAGAGGCGTATGAGAGTTTCAGCAAACTGTTCAGGATTATAAC
GGC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6963Contig1 620 2 1 U
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GCTGACATAAGCAGTGCCAGTAACTTATGTACCAAGCTGTGTCTGAGACTTTCGCTTCTA
TTATGTGACAAAAAACCACCGTCTGTCTATTCCAGAATATGTATAAGTGCTGTTTTTAAT
ATAGATATAGCGTTAATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DI63JQ C 1
AF RR4DI63TF U 1
BS 1 620 RR4DI63TF

RD RR4DI63JQ 620 0 0
GTCTCTTAACCCAGCCATAGATATTGGGCAAATTGAAGGAGCATTCGTTCAAGGGTTAGG
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GAATCTACTCACTTGCGGACCTGGAAACTACAAGATACCTTCCATTAACGATATTCCCTT
CAACTTCAAGGTTTCTCTTCTCAAGGGGAATCCAAATTTAAAGGGGATACATTCATCAAA
AGCAGTTGGAGAGCCCCCGTTTTTCCTGGCATCATCGGTTTTATTTGCGATAAAAGATGC
CATAAAGGGGGCTAGAGCAGAGATGGGTCTTGGTAGCAAATGGTTCCCTTTGGACACTCC
TGTAACTCCGGAGCGTATCAGGATGGCTTGTTTCGATGAGTTTACTTCTCCTTTTGTGAG
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GCTGACATAAGCAGTGCCAGTAACTTATGTACCAAGCTGTGTTTGAGACTTTCGCTTTTA
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ATAGATATAGCGTTAATCTC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4DI63TF 620 0 0
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ATGGGTGGCTCTAGAAGAACTCAAATGGGGAGATGCAGCTCACAAATGGATTAAACCGGG
GAATCTACTCACTTGCGGACCTGGAAACTACAAGATACCTTCCATTAACGATATTCCCTT
CAACTTCAAGGTTTCTCTTCTCAAGGGGAATCCAAATTTAAAGGGGATACATTCATCAAA
AGCAGTTGGAGAGCCCCCGTTTTTCCTGGCATCATCGGTTTTATTTGCGATAAAAGATGC
CATAAAGGGGGCTAGAGCAGAGATGGGTCTTGGTAGCAAATGGTTCCCTTTGGACACTCC
TGTAACTCCGGAGCGTATCAGGATGGCTTGTTTCGATGAGTTTACTTCTCCTTTTGTGAG
TTTAGATTTCATCCCCAAGCTTAGTGTTTGAGACATGAGGAGGGTGATTTCACCGGTTTT
GCTGACATAAGCAGTGCCAGTAACTTATGTACCAAGCTGTGTCTGAGACTTTCGCTTCTA
TTATGTGACAAAAAACCACCGTCTGTCTATTCCAGAATATGTATAAGTGCTGTTTTTAAT
ATAGATATAGCGTTAATCTC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6964Contig1 728 2 2 U
GGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCCTGTCGCCAAGAT
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GCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACGGACATCATAACAACTCACATTGATATCTT
GCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGAGAAGAGTTCATGAG
TCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGATTCATAAAATTCCCTTGCT
TTCAAATACCATTAGCTTATTAATGTATACTAGACCGTTACCCATTGCGTATATATTTTT
ATTTTGTAAAATACTCTGTTTCTACTTGGACTGCATCCTTATGAATCAGCTTACGTAGTA
AGCCTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS20TF U 1
AF RR4DS20JQ C 18
BS 1 681 RR4DS20TF
BS 682 728 RR4DS20JQ

RD RR4DS20TF 681 0 0
GGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCCTGTCGCCAAGAT
TTCCATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCCCCCAGTGAAGAAAG
ACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAAATGGCTGTTGCACTTGG
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TGATTTCATTCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAA
AAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAAT
GTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGCTGAGGTGAGAGA
GCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACGGACATCATAACAACTCACATTGATATCTT
GCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGAGAAGAGTTCATGAG
TCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGATTCATAAAATTCCCTTGCT
TTCAAATACCATTAGCTTATTAATGTATACTAGACCGTTACCCATTGCGTATATATTTTT
ATTTTGTAAAATACTCTGTTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4DS20JQ 711 0 0
TAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCCTGTCGCCAAGATTTCCATCATTCCTCGTG
GCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCCCCCAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGT
ACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAAATGGCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGG
AGGTGATCTTCGGGGATGACAACGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATTCAGGTGT
CTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAG
CCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATT
ACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGCTGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGT
ACAAGAGAGCCACGGACATCATAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGC
TCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGAGAAGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCC
AAGCTGAGTTGTATGTTTCTTAGATTCATAAAATTCCCTTGCTTTCAAATACCATTAGCT
TATTAATGTATACTAGACCGTTACCCATTGCGTATATATTTTTATTTTGTAAAATACTCT
GTTTCTACTTGGACTGCATCCTTATGAATCAGCTTACGTAGTAAGCCTAGG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL6965Contig1 816 2 2 U
GGTCCCAAACCTTAAGGTTGGGACAGTTCTCCTCAGCTGTGCCTTCTTGTACGATATCTT
CTGGGTGTTTGTCTCCAAGAAGTTGTTCCACGAAAGCGTAATGATTGTCGTAGCTCGTGG
TGATAAAAGCGGAGAAGATGGCATCCCTATGCTACTGAAGATTCCACGCATGTTCGATCC
TTGGGGAGGCTACAGCATTATTGGATTCGGTGATATTCTTTTGCCCGGTTTGCTCATCGC
ATTTGCTCTCAGATATGACTGGTTAGCTAACAAGACTCTTCGAACCGGCTATTTTATATG
GGCAATGGTTGCCTACGGACTAGGTCTTTTGATTACTTACGTGGCTCTAAACCTTATGGA
TGGGCACGGCCAACCAGCATTACTCTACATTGTCCCTTTCACACTGGGAACGATGTTAAC
ACTAGCTCGAAAACGAGACGATCTTTGGATTCTATGGACGAAAGGAGAGCCAGAAAGGGC
ATGTCCTCACCACGTCAGGCTTGAACAGTGCTCTGAGTAATGAGACGACCTCACGGATTA
ATGGATTCAAGAGATATATATAAAAAAGCCTTTCGGGTTTGTAACCTATGTAACGTAAGC
TGTAAGATTCTTATCCTCTCCAGTCCTCTTTAATTTATGTTTGCATCGTCATCATTGAAG
AAGAATCCACGATCGTTCTGTGTCTATATGGTTTGTTTCTTCTGTAAGAGAAGAGTGTTG
TATATACACATAGTACAAACATGTTTAAGCTATCAATATCATCATTGTGTTGGACGATTT
TGTAATCTAATTAATCATTATTATCTTGCTGACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DT78TF U 1
AF RR4DT78JQ C 24
BS 1 655 RR4DT78TF
BS 656 816 RR4DT78JQ

RD RR4DT78TF 655 0 0
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CTGGGTGTTTGTCTCCAAGAAGTTGTTCCACGAAAGCGTAATGATTGTCGTAGCTCGTGG
TGATAAAAGCGGAGAAGATGGCATCCCTATGCTACTGAAGATTCCACGCATGTTCGATCC
TTGGGGAGGCTACAGCATTATTGGATTCGGTGATATTCTTTTGCCCGGTTTGCTCATCGC
ATTTGCTCTCAGATATGACTGGTTAGCTAACAAGACTCTTCGAACCGGCTATTTTATATG
GGCAATGGTTGCCTACGGACTAGGTCTTTTGATTACTTACGTGGCTCTAAACCTTATGGA
TGGGCACGGCCAACCAGCATTACTCTACATTGTCCCTTTCACACTGGGAACGATGTTAAC
ACTAGCTCGAAAACGAGACGATCTTTGGATTCTATGGACGAAAGGAGAGCCAGAAAGGGC
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ATGGATTCAAGAGATATATATAAAAAAGCCTTTCGGGTTTGTAACCTATGTAACGTAAGC
TGTAAGATTCTTATCCTCTCCAGTCCTCTTTAATTTATGTTTGCATCGTCATCAT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4DT78JQ 793 0 0
GACAGTCT
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CTACTGAAGATTCCACGCATGTTCGATCCTTGGGGAGGCTACAGCATTATTGGATTCGGT
GATATTCTTTTGCCCGGTTTGCTCATCGCATTTGCTCTCAGATATGACTGGTTAGCTAAC
AAGACTCTTCGAACCGGCTATTTTATATGGGCAATGGTTGCCTACGGACTAGGTCTTTTG
ATTACTTACGTGGCTCTAAACCTTATGGATGGGCACGGCCAACCAGCATTACTCTACATT
GTCCCTTTCACACTGGGAACGATGTTAACACTAGCTCGAAAACGAGACGATCTTTGGATT
CTATGGACGAAAGGAGAGCCAGAAAGGGCATGTCCTCACCACGTCAGGCTTGAACAGTGC
TTTGAGTAATGAGACGACCTCACGGATTAATGGATTCAAGAGATATATATAAAAAAGCCT
TTCGGGTTTGTAACCTATGTAACGTAAGCTGTAAGATTCTTATCCTCTCCAGTCCTCTTT
AATTTATGTTTGCATCGTCATCATTGAAGAAGAATCCACGATCGTTCTGTGTCTATATGG
TTTGTTTCTTCTGTAAGAGAAGAGTGTTGTATATACACATAGTACAAACATGTTTAAGCT
ATCAATATCATCATTGTGTTGGACGATTTTGTAATCTAATTAATCATTATTATCTTGCTG
ACTTG

QA 9 793 9 793
DS 



AS 1 2

CO CL6966Contig1 837 2 8 U
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GATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTATATTAACAGACATGGGATACCAATTCACTCTAA
TGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCATCCGTAAGCATAATCCTGAAGAGTTGGTTTTAG
CTTTAGCTGAGGCAAAGGCCGAAGCAATCATGCAACGGATGGCTGATGACGACGACATAA
AGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGTCGTCTATGCAAATGCCGTTAGGGAGA
AACCCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAGGGAATACATAAGAGGCTATTCCAAGGGACACACAG
CAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAACAAATACCAAAACAGGATTCAGAAAAGGAGGCGTCG
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TTTCTTATTTATTTACCAAACCAGGAAAGAACAAAAAAACAATGCTATATTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BP60TF U 1
AF RR4BP60JQ C 168
BS 1 658 RR4BP60TF
BS 659 659 RR4BP60JQ
BS 660 708 RR4BP60TF
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BS 710 727 RR4BP60TF
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BS 729 739 RR4BP60TF
BS 740 837 RR4BP60JQ

RD RR4BP60TF 739 0 0
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GATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTATATTAACAGACATGGGATACCAATTCACTCTAA
TGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCATCCGTAAGCATAATCCTGAAGAGTTGGTTTTAG
CTTTAGCTGAGGCAAAGGCCGAAGCAATCATGCAACGGATGGCTGATGACGACGACATAA
AGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGTCGTCTATGCAAATGCCGTTAGGGAGA
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AAGGCATGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATCGAACATCCCCTAATCTCGCCAT
GCGTCAAAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATGGGTCTGCCTAAAGAATTGACTG
AGAAACTCCTAAAGGAAGCAATGGCAAGCACACAGGAGAAAACGTCTGGTGTCTAAAA*T
GTTGGTTTATTATTTTAATGATCGATCTGCTTTTGCTACTTGTGAGAA*TTATGGATAAG
TTGTTTT*GACTTGTTTCT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4BP60JQ 670 0 0
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GACGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGTCGTCTATGCAAAT
GCCGTTAGGGAGAAACCCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAGGGAATACATAAGAGGCTATTCC
AAGGGACACACAGCAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAACAAATACCAAAACAGGATTCAGA
AAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGAGATCTATTTCAACGAAATATCGGAGGAGATTATCGCG
AAACTGATTGAGGAAGGCATGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATCGAACATCCC
CTAATCTCGCCATGCGTCAAAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATGGGTCTGCCT
AAAGAATTGACTGAGAAACTCCTAAAGGAAGCAATGGCAAGCACACAGGAGAAAACGTCT
GGTGTCTAAAAATGTTGGTTTATTATTTTAATGATCGATCTGCTTTTGCTACTTGTGAGA
AATTATGGATAAGTTGTTTTTGACTTGTTTCTAACAAAGTAACCAAACCTTTGGATTGTG
ATTGGTAGTTTGTTTTCTTATTTATTTACCAAACCAGGAAAGAACAAAAAAACAATGCTA
TATTATATAC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL6967Contig1 890 2 12 U
GGACAAACACAATATCTCTCTCCTCCCCCTGTTCTCTCCGCCTTCTCCTCACGCTCTCAG
TCTGAGTTTTTCCGATGGCCGGTGCGTGGCGGTTCCGTTAACGTCGGCGCCGGTCCCAAT
CTTCTTAGTTTTCCTTCTAGATTAACATATGTTCGGCGTGTGGCAATTGGAACCTATTTT
GATGGAGATTTTGGTTGGAAAGGCCTAGCTTTCCTTCTCAGATCTATGATAGTTTTGGGA
AGGGAAAGTACCGGATCTTTAGATCAACGGTTTGTTTCTCTATTCCTTTCTCTATCTTGT
TGTTGGTAGGATTCTGGATGGGCTTGTTCTATTTTTTGGAAGCTGCTGTGAATTCTTTCC
GGTTCTGCAGTGAACCATTCTTATGGGTTTGGTGTCTCTGAGTTCGGTTAGGCTTGGCTC
CTTGTTTCTCTGGCAGATCTAGGTGTGATCTGGTTTAAACTCCATCATTAGGCTGTCAAC
GGCTGTGATTGCCGTGCCGTTTCTGAAAGTGTGTGGTGAATCTGTTGATTCCAACTTGTC
GGAAGATGGAGTTTGGTTATTTGATCCTGAGGTTTTTCCTCGTTGTTCAAGGAGGAAGTG
ACTTATTGGTGGTTTGGCCGTGGGCAATCTCTATAAGTATCTTTCATGGAGTTCCGAATC
TGATGTTTCATGTTCGTGTGGAGTCCTTGCCAATGACTTTTGTTTCCAGTTGTTTTTATC
TTTCCTTGTTGTTGTGTATGTACCTGTTGGTATCCCTGGTATGGGTTTAGTTTCCAGGGT
AGGTTTCGTGTGACCGCTGGCTTGTGTACCGGGTGTAATCTTTTCGGTGTAAAGTGTAAG
AACGCTATCATGTAATGTTGCTTGTTTCTTCTTGATAAAATCATGTGACC


BQ
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AF RR4CV76TF U 1
AF RR4CV76JQ C 131
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BS 757 767 RR4CV76TF
BS 768 890 RR4CV76JQ

RD RR4CV76TF 776 0 0
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DS 

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QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C913TF U 1
AF RR4C913JQ C 62
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ATTCCAATTGAGGACTATCCATCAGTGGAGATTGAAAGGGATGGTACAGCCGCTGCTGCT
GCTGCTGCAAGTGGTGGGTCTAGTTCTTCTGGCAGCTCCAGTTCTAGTGGTGGATCTTCC
TCTAGTGATTCAGACTCGGGGAGTTCATCAGGAAGTGATTCAGATGCTGATAGTGTGCAG
TCACCATTTGTGGAAGCAAAAGGACAGTGATAAGTGGTTTGGTCGAATGAGAGAAGTGGA
AAAGTTTTTAGATTCCTAGGATGAAGATGGAGTGGAATAGTTTTCTTCTTTTTTCTCTTT
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TTTTGTACAA
GA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4C913JQ 702 0 0
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CTAGTGATTCAGACTCGGGGAGTTCATCAGGAAGTGATTCAGATGCTGATAGTGTGCAGT
CACCATTTGTGGAAGCAAAAGGACAGTGATAAGTGGTTTGGTCGAATGAGAGAAGTGGAA
AAGTTTTTAGATTCCTAGGATGAAGATGGAGTGGAATAGTTTTCTTCTTTTTTCTCTTTC
AAGTTAAGGTTCTTTAGTTCTTTTAGATTATATTGGTGACACGATGGACAGAGGTTGAGA
GTGACCTTAGCAAAAGATGAAGAGGATCACTTGGTGGTGGGTTTGTTCCTATTTGCCGCT
TTTGTACAAAGAATGAAGAAGGAATCTCTGTTCGTTTTCTTT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6970Contig1 614 2 2 U
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TCACGATCACTTCCGTGACTTGAGGCTCAACGTCGATGGCATGTCTTACGAGCAACTTTT
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TGCTTGTGGGTTAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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CTGGGGATTATTGCTCATGATTTGCTATTTTATGCTGATGAAAAACATTTGTATGAAGCA
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TGCTTGTGGGTTA

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G519JQ U 56
AF RR4G519TF C 1
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QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BV76JQ U 10
AF RR4BV76TF C 1
BS 1 9 RR4BV76TF
BS 10 150 RR4BV76JQ
BS 151 151 RR4BV76TF
BS 152 640 RR4BV76JQ
BS 641 744 RR4BV76TF

RD RR4BV76JQ 631 0 0
CACACAACTCATCATTTATAATCTTAATGCATCTTTTTATAGTAATGGATCACAATATTG
AAAGTTACCCATCTCTAAATAAACCAAAAACTACAACAAAAAGAAAAGAAATAAAGCTAA
CTATTCTTGACAACTACCAAA*CACATAGTTAGACAATCGTAAGATAACAGTAAACAGCA
AACAAACTTGATTAACGCTGCTGCTTTGCAGGAATGTATGTGAAAAGGTGTCACTACCAT
ATCTCATTTCTGTCGTCTTTATTATAAATAAGTGAAACATATTTCCTCATTGCCTCTGAC
TCTCAGTTATAAAACAGCTTCAAGCTTTAACGCAGCAGTTGAAGAAGCTGAAGATTACTC
TCCTGGTGGATGGAGGATGTCGCTGGTGTTGGGAAAACTCATTGTCGGTTATGTTGTTGT
CACTGTGGACATTCGTGAGGTTAGCCTTAGTTTTATCAACCGAAGTAGGTTGATTATGAA
AAGGGTTAATGAAGTCTTGTTCATTGCCAAGACTGACACGGGAAGGATCTCTCTTGTGCA
GTTTCCTCATATCTCTGATCTTTGAGAAATCCATTGAGTAATCAGGAACGGTTCCTCCTT
TCTGATCCCAGTCTCCAAACTGTGGTACTGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BV76TF 744 0 0
TTTTTTTTTCACACAACTCATCATTTATA*TCT*AATGCATCTTTT*ATAGTAATGGATC
ACAATATTGAAAGTTACCCATCTCTAAATAAACCAAAAACTACAACAAAAAGAAAAGAAA
TAAAGCTAACTATTCTTGACAACTACCAAAACACATAGTTAGACAATCGTAAGATAACAG
TAAACAGCAGACAAACTTGATTAACGCTGCTGCTTTGCAGGAATGTATGTGAAAAGGTGT
CACTACCATATCTCATTTCTGTCGTCTTTATTATAAATAAGTGAAACATATTTCCTCATT
GCCTCTGACTCTCAGTTATAAAACAGCTTCAAGCTTTAACGCAGCAGTTGAAGAAGCTGA
AGATTACTCTCCTGGTGGATGGAGGATGTCGCTGGTGTTGGGAAAACTCATTGTCGGTTA
TGTTGTTGTCACTGTGGACATTCGTGAGGTTAGCCTTAGTTTTATCAACCGAAGTAGGTT
GATTATGAAAAGGGTTAATGAAGTCTTGTTCATTGCCAAGACTGACACGGGAAGGATCTC
TCTTGTGCAGTTTCCTCATATCTCTGATCTTTGAGAAATCCATTGAGTAATCAGGAACGG
TTCCTCCTTTCTGATCCCAGTCTCCAAACTGTGGTACTGATAGCCATGGCGAGTTCTTGT
TCTCTTTTGGATCGTCCATATGATCAAAGCTGTAGAGAGAAGAGAGCCTTTCTTGTTTTT
ATTTTTTAAGAAGATGATCTTTCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6973Contig1 696 2 2 U
GGAACAAGGAACATGCTTGAGGCAATCGCTTCAGGGAAGCCTGTGGTGACAACACAATGG
ATTGAAAGCATTGATCAAGTCAACATATATGTTGACGAGGATCTTTACATACTCAGAGAC
TCAAAGAAAGAGAAGGAGTTCGGTTTCAACATGGGGGTTTCTTTGTCTCGTGCTCGGCAG
AACCCACTACTAAGGGGAGAAGAGTCTTTATCACTCCAAATACAAAGCCTGGTTTAAACA
CAATCACAACTTTGGTTAAGGCAGTTCATGGATAGCCTGTGGAAAGACTGGGAAGATCTG
TCCTAAGCGAAGATAAGGTCCCAGAGAATCTTCTAGTCTTATCATGTGAAGAGGATCGAG
ATATCAGCATACCATTTCTAGAAAGAGGGGCAGAGGTCTATAGCTCTGAGTTACTACTGA
ATGGGATAGTTACTCAAAAGCTAGAGTATGAGAGGTACCGTCTCTTCACAGATCATGTTA
GGAGAACGCGTTCAACTATATGGATCAGAGACGGCAAAGGAGAGTACCAACGCCGTAGAG
TGTAAAGGAGGATATGTGATCGAACTACTCCTTTTTATGAAAGCCTCCGTTTTATAGATT
CAGTTCAATAGAGTGTTTAGAAAGTGTTTGTATATGTAATATGTTGTAACACTATCTCAG
ACCCTTGTTTTCAGCTAATGTTCGTTCTTAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G673JQ C 1
AF RR4G673TF U 1
BS 1 664 RR4G673TF
BS 665 696 RR4G673JQ

RD RR4G673JQ 696 0 0
GGAACAAGGAACATGCTTGAGGCAATCGCTTCAGGGAAGCCTGTGGTGACAACACAATGG
ATTGAAAGCATTGATCAAGTCAACATATATGTTGACGAGGATCTTTACATACTCAGAGAC
TCAAAGAAAGAGAAGGAGTTCGGTTTCAACATGGGGGTTTCTTTGTCTCGTGCTCGGCAG
AACCCACTACTAAGGGGAGAAGAGTCTTTATCACTCCAAATACAAAGCCTGGTTTAAACA
CAATCACAACTTTGGTTAAGGCAGTTCATGGATAGCCTGTGGAAAGACTGGGAAGATCTG
TCCTAAGCGAAGATAAGGTCCCAGAGAATCTTCTAGTCTTATCATGTGAAGAGGATCGAG
ATATCAGCATACCATTTCTAGAAAGAGGGGCAGAGGTCTATAGCTCTGAGTTACTACTGA
ATGGGATAGTTACTCAAAAGCTAGAGTATGAGAGGTACCGTCTCTTCACAGATCATGTTA
GGAGAACGCGTTCAACTATATGGATCAGAGACGGCAAAGGAGAGTACCAACGCCGTAGAG
TGTAAAGGAGGATATGTGATCGAACTACTCCTTTTTATGAAAGCCTCCGTTTTATAGATT
CAGTTCAATAGAGTGTTTAGAAAGTGTTTGTATATGTAATATGTTGTAACACTATCTCAG
ACCCTTGTTTTCAGCTAATGTTCGTTCTTAAAAAAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4G673TF 664 0 0
GGAACAAGGAACATGCTTGAGGCAATCGCTTCAGGGAAGCCTGTGGTGACAACACAATGG
ATTGAAAGCATTGATCAAGTCAACATATATGTTGACGAGGATCTTTACATACTCAGAGAC
TCAAAGAAAGAGAAGGAGTTCGGTTTCAACATGGGGGTTTCTTTGTCTCGTGCTCGGCAG
AACCCACTACTAAGGGGAGAAGAGTCTTTATCACTCCAAATACAAAGCCTGGTTTAAACA
CAATCACAACTTTGGTTAAGGCAGTTCATGGATAGCCTGTGGAAAGACTGGGAAGATCTG
TCCTAAGCGAAGATAAGGTCCCAGAGAATCTTCTAGTCTTATCATGTGAAGAGGATCGAG
ATATCAGCATACCATTTCTAGAAAGAGGGGCAGAGGTCTATAGCTCTGAGTTACTACTGA
ATGGGATAGTTACTCAAAAGCTAGAGTATGAGAGGTACCGTCTCTTCACAGATCATGTTA
GGAGAACGCGTTCAACTATATGGATCAGAGACGGCAAAGGAGAGTACCAACGCCGTAGAG
TGTAAAGGAGGATATGTGATCGAACTACTCCTTTTTATGAAAGCCTCCGTTTTATAGATT
CAGTTCAATAGAGTGTTTAGAAAGTGTTTGTATATGTAATATGTTGTAACACTATCTCAG
ACCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6974Contig1 860 2 4 U
ACTTCAATTGGGTCAAATTTTTATTATTCAAAGGATACGAGAATAATGCTATGGAGCTCA
TATCAGATTACTTATTAAACATTTACATCAAATCAAACACAGGATAAAGTATTAAAAGCT
AACGAGCATGATCCATCTTGAATTGTCTTAAAGACAATAGACTGAATCTTGGACATTAGG
GATGAAAAGCTGAAACAATATGATCCCTTTATTTCTTTACGTCTCTCCTCAAGCGCTGCT
CACAAGCACGTTAGTAGCCTTCGTGGTCGCAGTCGCTGGGCCTCGGGTCAAAGCTTTTAC
GCTTAACGGACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCGGCCTTCAAATCGCAAACAGGGTA
CGCCTGAGGGCAGCAGCTAGAGCCATCCTCGCAGCAAGTAGCTGACTCTAGCGGACAGCA
TCCCCAGCTATAGCATTTGCTTTTATACTCATAGAGACAACAACAAGTGGACTTGGCTGG
ACAAGTGTAAGCTTTGTCACAAATAACTGGTGCAGGTGGTGGCGGTTTTGGTGGGTTTGA
GCTCGATGATTTGGTTGGGTACGAAGCCATCATCGCCACACCACATTTCCCTGACGAATC
TTTAATGTTACGTTCGAGCTTAACGTATCCACTCTCTCCCCAGTTTGATCCCCATGAGTT
ACGAATAATCCAATAGTCTTGGCCTCCTGAGGTTCCATACCCCACGGCTACAACACCATG
GTCCAAAGCTGTTCCACATGTTCCAGTGAACACACCGGATTTGTAAAGCTGGAAGCTCGG
CACAGCTTCGATGGCACACTAATAGTTGATAGCAACAGCTTTCTTCATGAATTCTCGTTT
CAGAACATCTCATAACCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF52JQ U 1
AF RR4DL51JQ U 10
BS 1 351 RR4GF52JQ
BS 352 352 RR4DL51JQ
BS 353 762 RR4GF52JQ
BS 763 860 RR4DL51JQ

RD RR4GF52JQ 762 0 0
ACTTCAATTGGGTCAAATTTTTATTATTCAAAGGATACGAGAATAATGCTATGGAGCTCA
TATCAGATTACTTATTAAACATTTACATCAAATCAAACACAGGATAAAGTATTAAAAGCT
AACGAGCATGATCCATCTTGAATTGTCTTAAAGACAATAGACTGAATCTTGGACATTAGG
GATGAAAAGCTGAAACAATATGATCCCTTTATTTCTTTACGTCTCTCCTCAAGCGCTGCT
CACAAGCACGTTAGTAGCCTTCGTGGTCGCAGTCGCTGGGCCTCGGGTCAAAGCTTTTAC
GCTTAACGGACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCGGCCTTCAAATCGCAGACAGGGTA
CGCCTGAGGGCAGCAGCTAGAGCCATCCTCGCAGCAAGTAGCTGACTCTAGCGGACAGCA
TCCCCAGCTATAGCATTTGCTTTTATACTCATAGAGACAACAACAAGTGGACTTGGCTGG
ACAAGTGTAAGCTTTGTCACAAATAACTGGTGCAGGTGGTGGCGGTTTTGGTGGGTTTGA
GCTCGATGATTTGGTTGGGTACGAAGCCATCATCGCCACACCACATTTCCCTGACGAATC
TTTAATGTTACGTTCGAGCTTAACGTATCCACTCTCTCCCCAGTTTGATCCCCATGAGTT
ACGAATAATCCAATAGTCTTGGCCTCCTGAGGTTCCATACCCCACGGCTACAACACCATG
GTCCAAAGCTGTTCCACATGTTCCAGTGAACACACCGGATTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4DL51JQ 851 0 0
GGGTCAAATTTTTATTATTCAAAGGATACGAGAATAATGCTATGGAGCTCATATCAGATT
ACTTATTAAACATTTACATCAAATCAAACACAGGATAAAGTATTAAAAGCTAACGAGCAT
GATCCATCTTGAATTGTCTTAAAGACAATAGACTGAATCTTGGACATTAGGGATGAAAAG
CTGAAACAATATGATCCCTTTATTTCTTTACGTCTCTCCTCAAGCGCTGCTCACAAGCAC
GTTAGTAGCCTTCGTGGTCGCAGTCGCTGGGCCTCGGGTCAAAGCTTTTACGCTTAACGG
ACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCGGCCTTCAAATCGCAAACAGGGTACGCCTGAGG
GCAGCAGCTAGAGCCATCCTCGCAGCAAGTAGCTGACTCTAGCGGACAGCATCCCCAGCT
ATAGCATTTGCTTTTATACTCATAGAGACAACAACAAGTGGACTTGGCTGGACAAGTGTA
AGCTTTGTCACAAATAACTGGTGCAGGTGGTGGCGGTTTTGGTGGGTTTGAGCTCGATGA
TTTGGTTGGGTACGAAGCCATCATCGCCACACCACATTTCCCTGACGAATCTTTAATGTT
ACGTTCGAGCTTAACGTATCCACTCTCTCCCCAGTTTGATCCCCATGAGTTACGAATAAT
CCAATAGTCTTGGCCTCCTGAGGTTCCATATCCCACGGCTACAACACCATGGTCCAAAGC
TGTTCCACATGTTCCAGTGAACACACCGGATTTGTAAAGCTGGAAGCTCGGCACAGCTTC
GATGGCACACTAATAGTTGATAGCAACAGCTTTCTTCATGAATTCTCGTTTCAGAACATC
TCATAACCATC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL6975Contig1 817 2 8 U
GGGCTAAATGATCTAAGTGATATGCTTGTAAAGGGACAGGATCTTCCTCAACTAGCTGTT
GTTGTTTCAGTACGGGGACAATTGGAGAAAAGCTCGGCTGCAAGAGAATCTCCCATCACG
AAAGCTGCTTTCTCCTTCTTGCAGGATCATGTCTCGTCCTCATTTTCCTTCACGGGATGG
AACGGAGGTCGCATAATGTGCCAGAGATCTCAGCTCAAGCAGTTGCTGTCTACTCAAGAA
CCAACTTCAGAAGAGTCTCCAAAAAGTAGCCTAGTCGCTTTAACAAACTCGCCAATTTTT
GGTGCTGGAACAAGAACTTCAACAAGCAGTGACACGAACCACAGCGGCGGTAACCCTTCC
CAAAGAAGAACTAAGATGAAAAAAGAACTAGCGGGAAGCCCAGCTTAACCTACAGGTTTG
GGTAATTTCCATTTTCCAATTTTCAGCTACCAAAGGCCTTTTCTGTCTTTCTCGATCTAG
ACCGGTTGGCTGAAAACCGTGCTTCTAGACATTCACCTGCCCTCCATGTCCATGATAAAT
ATGTTTTGGTGCCAAGCAGTAGTGTCAGCCTCTGATAGACAGAAGAGGCCATATAGGAAG
ATAAATGGTCGTCTTAGTTTATATGCAGAAGTGATGCTACAAAATGTCAAAAGTAAGTAG
CCAACTAAAACTTTTGATGGAATTGTTAGACAAACCCCTGATTTTGCAGCCATAGATTTG
TTGTTTATCAATTCATCTGCTTTTTTTTCTCTGGTTACTACTGTGAAGCTAAATGCTGCT
GTAATGTACCGAAGCTTTAGTGTTTGCTTGTCACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GQ42TF U 1
AF RR4GQ42JQ C 70
BS 1 643 RR4GQ42TF
BS 644 644 RR4GQ42JQ
BS 645 663 RR4GQ42TF
BS 664 664 RR4GQ42JQ
BS 665 669 RR4GQ42TF
BS 670 670 RR4GQ42JQ
BS 671 693 RR4GQ42TF
BS 694 817 RR4GQ42JQ

RD RR4GQ42TF 698 0 0
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GTTGTTTCAGTACGGGGACAATTGGAGAAAAGCTCGGCTGCAAGAGAATCTCCCATCACG
AAAGCTGCTTTCTCCTTCTTGCAGGATCATGTCTCGTCCTCATTTTCCTTCACGGGATGG
AACGGAGGTCGCATAATGTGCCAGAGATCTCAGCTCAAGCAGTTGCTGTCTACTCAAGAA
CCAACTTCAGAAGAGTCTCCAAAAAGTAGCCTAGTCGCTTTAACAAACTCGCCAATTTTT
GGTGCTGGAACAAGAACTTCAACAAGCAGTGACACGAACCACAGCGGCGGTAACCCTTCC
CAAAGAAGAACTAAGATGAAAAAAGAACTAGCGGGAAGCCCAGCTTAACCTACAGGTTTG
GGTAATTTCCATTTTCCAATTTTCAGCTACCAAAGGCCTTTTCTGTCTTTCTCGATCTAG
ACCGGTTGGCTGAAAACCGTGCTTCTAGACATTCACCTGCCCTCCATGTCCATGATAAAT
ATGTTTTGGTGCCAAGCAGTAGTGTCAGCCTCTGATAGACAGAAGAGGCCATATAGGAAG
ATAAATGGTCGTCTTAGTTTATATGCAGAAGTGATGCTACAAA*TGTCAAAAGTAAGTAG
CCA*CTAAA*CTTTTGATGGAATTGTTAGACAA
CCCCT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4GQ42JQ 748 0 0
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TTCTCCTTCTTGCAGGATCATGTCTCGTCCTCATTTTCCTTCACGGGATGGAACGGAGGT
CGCATAATGTGCCAGAGATCTCAGCTCAAGCAGTTGCTGTCTACTCAAGAACCAACTTCA
GAAGAGTCTCCAAAAAGTAGCCTAGTCGCTTTAACAAACTCGCCAATTTTTGGTGCTGGA
ACAAGAACTTCAACAAGCAGTGACACGAACCACAGCGGCGGTAACCCTTCCCAAAGAAGA
ACTAAGATGAAAAAAGAACTAGCGGGAAGCCCAGCTTAACCTACAGGTTTGGGTAATTTC
CATTTTCCAATTTTCAGCTACCAAAGGCCTTTTCTGTCTTTCTCGATCTAGACCGGTTGG
CTGAAAACCGTGCTTCTAGACATTCACCTGCCCTCCATGTCCATGATAAATATGTTTTGG
TGCCAAGCAGTAGTGTCAGCCTCTGATAGACAGAAGAGGCCATATAGGAAGATAAATGGT
CGTCTTAGTTTATATGCAGAAGTGATGCTACAAAATGTCAAAAGTAAGTAGCCAACTAAA
ACTTTTGATGGAATTGTTAGACAAACCCCTGATTTTGCAGCCATAGATTTGTTGTTTATC
AATTCATCTGCTTTTTTTTCTCTGGTTACTACTGTGAAGCTAAATGCTGCTGTAATGTAC
CGAAGCTTTAGTGTTTGCTTGTCACATC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6976Contig1 1235 2 16 U
GGGAGACAATTGAACAGGTGTCTACGGAAGTGGAGAGTCTGAGTAAACTGAAAGCTAGCA
AAATGAAGGAACTGGTGATGAAACGGAGGTCCGAGTTGGAGGATCTTTGCAGACTAACTC
ACATTCAACCTGATACAAGCACTTCGGCTGAGAAATCAAGTGCACTAATAGATTCTGGGT
TAGTGGAACCTTCGGAGCTTCTTGCAAATATAGAAATGGAAATAAACAAGATTAAAGAGG
AAGCACAGAGCCGTAAAGACATCATGGACAGAATTGACCGTTGGCTCTCTGCATGTGAAG
AGGAAAACTGGTTGGAAGAATATAATCTGGATGAGAACCGTTATAGTGCTGGAAGAGGTG
GACATGTAAACCTTAAGCGTGCAGAACGAGCCAGAGTTACAATCAATAAGATCCCAGCGA
TGGTTGACAATCTTATTAAGAAAACTCTAGTTTGGGAAGAGGAAACGCACAAGTCATTTC
TCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGAAGACTACAAGTTAACAAGGAAACAAC
AGGAAGAGGAAAAGAAAAGATACCGGGACCAAAAGAAGAGGCAAGATCTCCTACTAACCC
AAAGGGAATCCATATATGGATCAAAACCGAGTCCAAGGAGAAGCAGCAGCTTCAGGAAGC
CTAGTGGTTACAGCATTAGCAATGGGAATGGTTCAATGCCTCCCACACCTCGCAGAAGCT
CAGTGGGGACAACAACACCTGACCTTCTTCTGACCCCGAGATCTTACTCGGGTCATCATC
GCCAAAACGGGTATTTTAAAGAAGTTAGGAGACTCGCTTCTACTCCCTTAAACTATGTGG
CCATACAAAAGGAAGATACTGCTTCTACTACTTACACATCGATCTATAGCTTTGAGCCAG
ACTCACCTCTCCAAGGCTGACTTTGACTCTCCTTTGCACTGAGATTCATGTTAGAAGTTG
GATATATGTATGTGGTTAAGGATTTGGGAAGTAATCTTTAATAATGACGTTATCGTAAAG
AAGAAGTCAGTGATGGATGAAGATGCAGACTTGTGAATACAGAAAGGTGACTTGACTTGT
TTAGGGGAGATATGGTGAGACAATGAGTATAAAATAAAACTGTATCTGTAACTCTTTTTA
ATCTTGCAGTGAGAAAATACTATTTTTGCCGTGTGAAAGTGCGTGTGTGTTTGTGTACTT
ATTTTTGTGTATATAAAATATACGTATTTGTTTTG


BQ
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AF RR4CA26TF U 1
AF RR4CA26JQ C 450
BS 1 655 RR4CA26TF
BS 656 656 RR4CA26JQ
BS 657 695 RR4CA26TF
BS 696 696 RR4CA26JQ
BS 697 731 RR4CA26TF
BS 732 732 RR4CA26JQ
BS 733 743 RR4CA26TF
BS 744 744 RR4CA26JQ
BS 745 748 RR4CA26TF
BS 749 749 RR4CA26JQ
BS 750 756 RR4CA26TF
BS 757 757 RR4CA26JQ
BS 758 771 RR4CA26TF
BS 772 772 RR4CA26JQ
BS 773 781 RR4CA26TF
BS 782 1235 RR4CA26JQ

RD RR4CA26TF 781 0 0
GGGAGACAATTGAACAGGTGTCTACGGAAGTGGAGAGTCTGAGTAAACTGAAAGCTAGCA
AAATGAAGGAACTGGTGATGAAACGGAGGTCCGAGTTGGAGGATCTTTGCAGACTAACTC
ACATTCAACCTGATACAAGCACTTCGGCTGAGAAATCAAGTGCACTAATAGATTCTGGGT
TAGTGGAACCTTCGGAGCTTCTTGCAAATATAGAAATGGAAATAAACAAGATTAAAGAGG
AAGCACAGAGCCGTAAAGACATCATGGACAGAATTGACCGTTGGCTCTCTGCATGTGAAG
AGGAAAACTGGTTGGAAGAATATAATCTGGATGAGAACCGTTATAGTGCTGGAAGAGGTG
GACATGTAAACCTTAAGCGTGCAGAACGAGCCAGAGTTACAATCAATAAGATCCCAGCGA
TGGTTGACAATCTTATTAAGAAAACTCTAGTTTGGGAAGAGGAAACGCACAAGTCATTTC
TCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGAAGACTACAAGTTAACAAGGAAACAAC
AGGAAGAGGAAAAGAAAAGATACCGGGACCAAAAGAAGAGGCAAGATCTCCTACTAACCC
AAAGGGAATCCATATATGGATCAAAACCGAGTCCAAGGAGAAGCAGCAGCTTCAG*AAGC
CTAGTGGTTACAGCATTAGCAATGGGAATGGTTCA*TGCCTCCCACACCTCGCAGAAGCT
CAGTGGGGACA*CAACACCTGAC*TTCT*CTGACCC*GAGATCTTACTCGG*TCATCATC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4CA26JQ 786 0 0
AGTTT
GGAAGAGGAAACGCACAAGTCATTTCTCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGA
AGACTACAAGTTAACAAGGAAACAACAGGAAGAGGAAAAGAAAAGATACCGGGACCAAAA
GAAGAGGCAAGATCTCCTACTAACCCAAAGGGAATCCATATATGGATCAAAACCGAGTCC
AAGGAGAAGCAGCAGCTTCAGGAAGCCTAGTGGTTACAGCATTAGCAATGGGAATGGTTC
AATGCCTCCCACACCTCGCAGAAGCTCAGTGGGGACAACAACACCTGACCTTCTTCTGAC
CCCGAGATCTTACTCGGGTCATCATCGCCAAAACGGGTATTTTAAAGAAGTTAGGAGACT
CGCTTCTACTCCCTTAAACTATGTGGCCATACAAAAGGAAGATACTGCTTCTACTACTTA
CACATCGATCTATAGCTTTGAGCCAGACTCACCTCTCCAAGGCTGACTTTGACTCTCCTT
TGCACTGAGATTCATGTTAGAAGTTGGATATATGTATGTGGTTAAGGATTTGGGAAGTAA
TCTTTAATAATGACGTTATCGTAAAGAAGAAGTCAGTGATGGATGAAGATGCAGACTTGT
GAATACAGAAAGGTGACTTGACTTGTTTAGGGGAGATATGGTGAGACAATGAGTATAAAA
TAAAACTGTATCTGTAACTCTTTTTAATCTTGCAGTGAGAAAATACTATTTTTGCCGTGT
GAAAGTGCGTGTGTGTTTGTGTACTTATTTTTGTGTATATAAAATATACGTATTTGTTTT
G

QA 6 786 6 786
DS 



AS 1 2

CO CL6977Contig1 739 2 1 U
GGGAGCGATGGAGATCATCACTAACGAGAAGAAAATACTCTCGAGACAGTCTTCTTCATT
CAGACTAAGAAGTCCTAGTCTAAACGCCCTCCGTCTCCACCGTATCTTCGACTTATTCGA
CAAAAACAGCGACGGATTCATCACCATCGAAGAACTGAGCCAAGCCCTCTCTCGACTTGG
TCTCGACGCGGTTATCTCCGACCTCAAACTAACCATCGAATCTTTCATCAAACCGGACGA
AACCGGACTCCAGTTCGAAGACTTCGCAGCACTCCACAAAACACTGGATGAATCTTTCTT
TGCAAGAGACTGCGACTGCGACGGATCTCCGGAATCAGATCTAGAAGAAGCTTTCAAAGT
GTTTGACCAAGACGGGGACGGGTTTATCTCCGCCGTGGAGTTGCAAAATGTTTTGAGGAA
GCTAGGGCTTCCTGAAGCAGGAGAAATTGAGCAAGTGGAGAAGATGATTGTCTCTGCTGA
TACCAATCACGATGGTCGCGTTGACTTTTTTGAATTCAAGAACATGATGCGAACTGTTCT
TGTCCCTTCCTCTTGAATCGTTATTTAAACTTTCTCGTTTGATTTGTTTCCTTGAATGAA
AAACAATTTCAAGATAAATCTTCTGTAATGTTTGATTCCAAGAAAATCAAATTGTTTTCT
ACCTTTTGGTATTAGAGCATCAAAAGATCGCTTTGATGTTAAATATAATCAAACTAATAC
GTCATACAAGCTGGAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D749TF U 1
AF RR4D749JQ C 218
BS 1 739 RR4D749TF

RD RR4D749TF 739 0 0
GGGAGCGATGGAGATCATCACTAACGAGAAGAAAATACTCTCGAGACAGTCTTCTTCATT
CAGACTAAGAAGTCCTAGTCTAAACGCCCTCCGTCTCCACCGTATCTTCGACTTATTCGA
CAAAAACAGCGACGGATTCATCACCATCGAAGAACTGAGCCAAGCCCTCTCTCGACTTGG
TCTCGACGCGGTTATCTCCGACCTCAAACTAACCATCGAATCTTTCATCAAACCGGACGA
AACCGGACTCCAGTTCGAAGACTTCGCAGCACTCCACAAAACACTGGATGAATCTTTCTT
TGCAAGAGACTGCGACTGCGACGGATCTCCGGAATCAGATCTAGAAGAAGCTTTCAAAGT
GTTTGACCAAGACGGGGACGGGTTTATCTCCGCCGTGGAGTTGCAAAATGTTTTGAGGAA
GCTAGGGCTTCCTGAAGCAGGAGAAATTGAGCAAGTGGAGAAGATGATTGTCTCTGCTGA
TACCAATCACGATGGTCGCGTTGACTTTTTTGAATTCAAGAACATGATGCGAACTGTTCT
TGTCCCTTCCTCTTGAATCGTTATTTAAACTTTCTCGTTTGATTTGTTTCCTTGAATGAA
AAACAATTTCAAGATAAATCTTCTGTAATGTTTGATTCCAAGAAAATCAAATTGTTTTCT
ACCTTTTGGTATTAGAGCATCAAAAGATCGCTTTGATGTTAAATATAATCAAACTAATAC
GTCATACAAGCTGGAGAGG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4D749JQ 522 0 0
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AAAACACTGGATGAATCTTTCTTTGCAAGAGACTGCGACTGCGACGGATTTCCGGAATCA
GATCTAGAAGAAGCTTTCAAAGTGTTTGACCAAGACGGGGACGGGTTTATTTCCGCCGTG
GAGTTGCAAAATGTTTTGAGGAAGCTAGGGCTTCCTGAAGCAGGAGAAATTGAGCAAGTG
GAGAAGATGATTGTCTCTGCTGATACCAATCACGATGGTCGCGTTGACTTTTTTGAATTC
AAGAACATGATGCGAACTGTTCTTGTCCCTTCCTCTTGAATCGTTATTTAAACTTTCTCG
TTTGATTTGTTTCCTTGAATGAAAAACAATTTCAAGATAAATCTTCTGTAATGTTTGATT
CCAAGAAAATCAAATTGTTTTCTACCTTTTGGTATTAGAGCATCAAAAGATCGCTTTGAT
GTTAAATATAATCAAACTAATACGTCATACAAGCTGGAGAGG

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL6978Contig1 791 2 4 U
GTAAAGTTTGCATGTTCTAATAATATTTTATAGTAATAAAAACCAGACAAGCATTTTTAA
AACAAAATAGATTCGCCAAAGAAACAGATGAAAACCGAAATAACATTAAAAAAAAAACAC
AGTAACACAGCAAAAGAAACTCTCAAGCCTCCTCCTCCCCTTCGGTCTCAGACTCAGCGC
TCTGTAGCCACTCCACAAAAGGCTTCACATTCTTCCAAACAGGCGAACTCTTGTCCTCCC
CTGCCAGACCCTTCTGGTACCATTCCGACACAAACTCTTCCTCGAGTATGTCCTCGTCGT
ACAAGAACTTAAGAACCTGAGCCACCTCCTTAACCGCCTCTCCGTTTCCATCCTTGCCGC
AAAAGGATCCGATAGAGTTGAGCAGAAGCATCTGCGATCCTTCCTCCTGCGTTGCAGCCG
CCAAGTACTTCTTCTTCGTCGCTTCCTTGAGAAACTCCTTGCCAAAGCCGTCAAAGAGCG
CGTCGACGAGCGCGTCCATGACTTCTTGAGGAGGCTCAGAGCGAGAGGAGACGAAAGCTT
TGAGCTGGCTTATCGGTAAACCCTTCTTCAGATACTCTTTCATCTCCTGCACGAGACTCT
TCTTCAAATCCGAATTCCCATTCTCTTTGCTCTTGGGTGACTTCTTCTTCTTCTCCTCCT
CTTGCAGAGAGATCATCACCATCTCAGCAGTCGCAGCACTCAACTGCTCCTTCATTCTCT
TCTCAGCAGCTTCACGAGAAGTATCAGTCTGCCACTGAATCCCATCGTCTTCATCATCAT
CCTCTCCATCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ59JQ U 1
AF RR4BJ72JQ U 1
BS 1 223 RR4BJ59JQ
BS 224 224 RR4BJ72JQ
BS 225 754 RR4BJ59JQ
BS 755 791 RR4BJ72JQ

RD RR4BJ59JQ 754 0 0
GTAAAGTTTGCATGTTCTAATAATATTTTATAGTAATAAAAACCAGACAAGCATTTTTAA
AACAAAATAGATTCGCCAAAGAAACAGATGAAAACCGAAATAACATTAAAAAAAAAACAC
AGTAACACAGCAAAAGAAACTCTCAAGCCTCCTCCTCCCCTTCGGTCTCAGACTCAGCGC
TCTGTAGCCACTCCACAAAAGGCTTCACATTCTTCCAAACAGGGGAACTCTTGTCCTCCC
CTGCCAGACCCTTCTGGTACCATTCCGACACAAACTCTTCCTCGAGTATGTCCTCGTCGT
ACAAGAACTTAAGAACCTGAGCCACCTCCTTAACCGCCTCTCCGTTTCCATCCTTGCCGC
AAAAGGATCCGATAGAGTTGAGCAGAAGCATCTGCGATCCTTCCTCCTGCGTTGCAGCCG
CCAAGTACTTCTTCTTCGTCGCTTCCTTGAGAAACTCCTTGCCAAAGCCGTCAAAGAGCG
CGTCGACGAGCGCGTCCATGACTTCTTGAGGAGGCTCAGAGCGAGAGGAGACGAAAGCTT
TGAGCTGGCTTATCGGTAAACCCTTCTTCAGATACTCTTTCATCTCCTGCACGAGACTCT
TCTTCAAATCCGAATTCCCATTCTCTTTGCTCTTGGGTGACTTCTTCTTCTTCTCCTCCT
CTTGCAGAGAGATCATCACCATCTCAGCAGTCGCAGCACTCAACTGCTCCTTCATTCTCT
TCTCAGCAGCTTCACGAGAAGTATCAGTCTGCCA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4BJ72JQ 791 0 0
GTAAAGTTTGCATGTTCTAATAATATTTTATAGTAATAAAAACCAGACAAGCATTTTTAA
AACAAAATAGATTCGCCAAAGAAACAGATGAAAACCGAAATAACATTAAAAAAAAAACAC
AGTAACACAGCAAAAGAAACTCTCAAGCCTCCTCCTCCCCTTCGGTCTCAGACTCAGCGC
TCTGTAGCCACTCCACAAAAGGCTTCACATTCTTCCAAACAGGCGAACTCTTGTCCTCCC
CTGCCAGACCCTTCTGGTACCATTCCGACACAAACTCTTCCTCGAGTATGTCCTCGTCGT
ACAAGAACTTAAGAACCTGAGCCACCTCCTTAACCGCCTCTCCGTTTCCATCCTTGCCGC
AGAAGGATCCGATAGAGTTGAGCAGAAGCATCTGCGATCCTTCCTCCTGCGTTGCAGCCG
CCAAGTACTTCTTCTTCGTCGCTTCCTTGAGAAACTCCTTGCCAAAGCCGTCAAAGAGCG
CGTCGACGAGCGCGTCCATGACTTCTTGAGGAGGCTCAGAGCGAGAGGAGACGAAAGCTT
TGAGCTGGCTTATCGGTAAACCCTTCTTCAGATACTCTTTCATCTCCTGCACGAGACTCT
TCTTCAAATCCGAATTCCCATTCTCTTTGCTCTTGGGTGACTTCTTCTTCTTCTCCTCCT
CTTGCAGAGAGATCATCACCATCTCAGCAGTCGCAGCACTCAACTGCTCCTTCATTCTCT
TCTCAGCAGCTTCACGAGAAGTATCAGTCTGCCACTGAATCCCATCGTCTTCATCATCAT
CCTCTCCATCA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL6979Contig1 816 2 2 U
GGGAAGAGAAACGCGGCAACTCCGGTGAGCGAATCCTCAAATCCCTAGAGATTCTCGATT
TTCGTTCATCGGTCTCGTCGTCGGGGAACCATGGAGGATTGAGATCACACCTCGTTCCAT
CTCCCGAATCGCTCTAGACTGATGCTGATGATGGATACCGAACCTGATCAGCAACAGCAA
CACCACCACAAAAGCAAAAGCGACTGTCGAGAAGGAGATGGACACCGTCTCTCGACAAGG
TGTTGGCCGATCTGGTGGTTAAACAGATCCAACAAGGGAACAGACAGAACAACGGTTTCG
ACAGGAAGAGAGAAGAGAAGAGTTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTGA
TGGAAACTATGGCAGGCACTTTGTCGGAAATGGTGACAGCTCTAAGGTCAAGGATAAGTG
GTTTGGAGACGGAAGACGATAGGTTTAGCATCGCAAACTGCATCGGTGCGCTTGACGAGA
TTGAGAATGTGGATGAAGGTGTCTACTTTGCAGCTTTGGATCTTTTGAGAGTCCTGGTCT
TAGAGAGACGTTCATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTGCGCTTGACATGGTTGCAAGTTAA
GTGCAGGAACAAAGTTACTCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAACCTATATATTT
ATATATATTGATTTGGTCTTTTGTAGGTTTTTTTTTTTGATTGCTGATGATAAATAGTTG
AGGAGTGAAATAGTATCAGCTGTGTAAGTTTTAGTTTATCATGTTTGCTCATTATATCTT
TCAACTGTTTCAGTATCCAAAGTCATGAGTTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AN16TF U 1
AF RR4AN16JQ C 143
BS 1 809 RR4AN16TF
BS 810 816 RR4AN16JQ

RD RR4AN16TF 809 0 0
GGGAAGAGAAACGCGGCAACTCCGGTGAGCGAATCCTCAAATCCCTAGAGATTCTCGATT
TTCGTTCATCGGTCTCGTCGTCGGGGAACCATGGAGGATTGAGATCACACCTCGTTCCAT
CTCCCGAATCGCTCTAGACTGATGCTGATGATGGATACCGAACCTGATCAGCAACAGCAA
CACCACCACAAAAGCAAAAGCGACTGTCGAGAAGGAGATGGACACCGTCTCTCGACAAGG
TGTTGGCCGATCTGGTGGTTAAACAGATCCAACAAGGGAACAGACAGAACAACGGTTTCG
ACAGGAAGAGAGAAGAGAAGAGTTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTGA
TGGAAACTATGGCAGGCACTTTGTCGGAAATGGTGACAGCTCTAAGGTCAAGGATAAGTG
GTTTGGAGACGGAAGACGATAGGTTTAGCATCGCAAACTGCATCGGTGCGCTTGACGAGA
TTGAGAATGTGGATGAAGGTGTCTACTTTGCAGCTTTGGATCTTTTGAGAGTCCTGGTCT
TAGAGAGACGTTCATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTGCGCTTGACATGGTTGCAAGTTAA
GTGCAGGAACAAAGTTACTCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAACCTATATATTT
ATATATATTGATTTGGTCTTTTGTAGGTTTTTTTTTTTGATTGCTGATGATAAATAGTTG
AGGAGTGAAATAGTATCAGCTGTGTAAGTTTTAGTTTATCATGTTTGCTCATTATATCTT
TCAACTGTTTCAGTATCCAAAGTCATGAG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4AN16JQ 674 0 0
TGCTGATGATGGATACCGAACCTGATCAGCAACAGCAACACCACCACAAAAGCAAAAGCG
ACTGTCGAGAAGGAGATGGACACCGTCTCTCGACAAGGTGTTGGCCGATCTGGTGGTTAA
ACAGATCCAACAAGGGAACAGACAGAACAACGGTTTCGACAGGAAGAGAGAAGAGAAGAG
TTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTGATGGAAACTATGGCAGGCACTTT
GTCGGAAATGGTGACAGCTCTAAGGTCAAGGATAAGTGGTTTGGAGACGGAAGACGATAG
GTTTAGCATCGCAAACTGCATCGGTGCGCTTGACGAGATTGAGAATGTGGATGAAGGTGT
TTACTTTGCAGCTTTGGATCTTTTGAGAGTCCTGGTCTTAGAGAGACGTTCATCTCTCTT
AAAGCTAACAAGTTGCGCTTGACATGGTTGCAAGTTAAGTGCAGGAACAAAGTTACTCCT
TCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAACCTATATATTTATATATATTGATTTGGTCTTTT
GTAGGTTTTTTTTTTTGATTGCTGATGATAAATAGTTGAGGAGTGAAATAGTATCAGCTG
TGTAAGTTTTAGTTTATCATGTTTGCTCATTATATCTTTCAACTGTTTCAGTATCCAAAG
TCATGAGTTCTCAC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL6980Contig1 735 2 3 U
GACGTCATGATTCTCCCGCCAACCACACCAGATCTTTTTGTTTCATCCATCTCCTTCCGC
CTCCTCGCCTCTTCCGTGGTCTCACTCATTTTCATCGATAGGCACGAGAATGGCTTGTTT
TCGTTCGATAGGCTCTTTAACTTCTCTCACTCATTCTCCTCGTGATGTTCCACGCTCCTC
AGGCATTGTCTTAACTTCATGCTCTGTTATTCCCATCACGCGCTCCTCCTTCATTGGCTC
TCCCATCTCCCTCCCGCGAGTCCATCCACCATCATCTCAAACACCTCCAAGACCGCGTAA
CCTCCTCCTCCCAATCACGATGACGGTGAAACCAACGCTCCAGTTCATCCAAGGCACAGA
CGAGATGACCATCCCTGACGTGAAGCTGACTCGGTCAAGAGACGGATCCAACGGGATGGC
GCTCTTCAATTTCGACCAGCCATCGGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTAGGGGAGATAAC
CGGGCTGTACATGATCGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCAACGGACGTGAACGCGAGATT
CGTCAACGGGAAACCTGAAGGCATCGTGGCCAAGCACGTGATGCGCACGCCCAAGGAATG
GGATAGGTTCATGAGGTTTATGGAACGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAA
AAAGCAATGAGGTGGAGACATTGATTGTCCTATGAACAAAATGTTATTTTTAAATCATTC
ATTAGAGCTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DI45TF U 1
AF RR4DI45JQ C 73
BS 1 700 RR4DI45TF
BS 701 701 RR4DI45JQ
BS 702 735 RR4DI45TF

RD RR4DI45TF 735 0 0
GACGTCATGATTCTCCCGCCAACCACACCAGATCTTTTTGTTTCATCCATCTCCTTCCGC
CTCCTCGCCTCTTCCGTGGTCTCACTCATTTTCATCGATAGGCACGAGAATGGCTTGTTT
TCGTTCGATAGGCTCTTTAACTTCTCTCACTCATTCTCCTCGTGATGTTCCACGCTCCTC
AGGCATTGTCTTAACTTCATGCTCTGTTATTCCCATCACGCGCTCCTCCTTCATTGGCTC
TCCCATCTCCCTCCCGCGAGTCCATCCACCATCATCTCAAACACCTCCAAGACCGCGTAA
CCTCCTCCTCCCAATCACGATGACGGTGAAACCAACGCTCCAGTTCATCCAAGGCACAGA
CGAGATGACCATCCCTGACGTGAAGCTGACTCGGTCAAGAGACGGATCCAACGGGATGGC
GCTCTTCAATTTCGACCAGCCATCGGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTAGGGGAGATAAC
CGGGCTGTACATGATCGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCAACGGACGTGAACGCGAGATT
CGTCAACGGGAAACCTGAAGGCATCGTGGCCAAGCACGTGATGCGCACGCCCAAGGAATG
GGATAGGTTCATGAGGTTTATGGAACGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAA
AAAGCAATGAGGTGGAGACATTGATTGTCCTATGAACAAA*TGTTATTTTTAAATCATTC
ATTAGAGCTTTGATT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4DI45JQ 663 0 0
TCCGTGGTCTCACTCATTTTCATCGATAGGCACGAGAATGGCTTGTTTTCGTTCGATAGG
CTCTTTAACTTCTCTCACTCATTCTCCTCGTGATGTTCCACGCTCCTCAGGCATTGTCTT
AACTTCATGCTCTGTTATTCCCATCACGCGCTCCTCCTTCATTGGCTCTCCCATCTCCCT
CCCGCGAGTCCATCCACCATCATCTCAAACACCTCCAAGACCGCGTAACCTCCTCCTCCC
AATCACGATGACGGTGAAACCAACGCTCCAGTTCATCCAAGGCACAGACGAGATGACCAT
CCCTGACGTGAAGCTGACTCGGTCAAGAGACGGATCCAACGGGATGGCGCTCTTCAATTT
CGACCAGCCATCGGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTAGGGGAGATAACCGGGCTGTACAT
GATCGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCAACGGACGTGAACGCGAGATTCGTCAACGGGAA
ACCTGAAGGCATCGTGGCCAAGCACGTGATGCGCACGCCCAAGGAATGGGATAGGTTCAT
GAGGTTTATGGAACGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAAAAGCAATGAGG
TGGAGACATTGATTGTCCTATGAACAAAATGTTATTTTTAAATCATTCATTAGAGCTTTG
ATT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6981Contig1 511 2 1 U
GGTGGGCAGCGGAGGACGACGACGGCACGAGCCTTCACCGAAGAGCGAAAATGGTGAACA
TTCCCAAGACTAAGAAGACTTACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACA
AGGTCACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAGGGTAAACGTCGTTATG
ACCGCAAACAATCCGGTTACGGTGGTCAGACCAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGGCCAAGA
CAACCAAGAAGATTGTCTTGAGGCTCCAGTGCCAAACATGCAAGCATTTCTCTCAACACT
CGATTAAGAGGTGCAAGCACTTCGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTC
TCTTTTAAGTTTTCTCCTCCTATCTGCTTTCTTTTTTTTGTTTGTCACTTACTACTCTCT
TGCTTCGATACTTGAATACATTTTGAATCTTCCAGAAATGGTTATCAGGTTTAAGTTAGA
CAACATTTTCGTATGGAATATCTTTTAATCT


BQ
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BQ
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AF RR4AK69JQ C 1
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QA 1 746 1 746
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AS 1 2

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AF RR4G232JQ U 2
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QA 1 640 1 640
DS 

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ATGGTCCCACCTCTAAGCCTCAAGACCAAGTGAAGAGTTGACTCTTTCTGGATGTTGTAG
TCAGCTAGCGTCCGACCATCTTCAAGTTGTTTGCCAGCGAATATCAGCCTCTGTTGATCC
GGTGGTATTCCCTCCTTGTCCTGGATTTTGGCTTTGACATTGTCGATGGTGTCGCTGCTT
TCAACCTCTAGGGTTATGGTTTTCCCGGTCAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTCCTT
TTTTTCTTTCTTTGCTTAAAGATTTTTTTTTTATTTATCTCTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6984Contig1 728 2 5 U
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TAGGATGGATGATGGCGGTTGGATAGCTGGGCTTTCGTATTCCGGGAGTTTGAAGAGGCT
GAGAGTGTTGTCTTGCGGGAAGATTGATCCTTGTCCGGGCCCGGAGAAGATGCTTAGGTC
TTGCCCGGCTCTGGAGAGTTTGGAGATCGAGAGGTCTTGTTTGAGTGATAAAGAAGGGGT
GAGAGCTTTGTTTAAGGTGTGTGATGGAGTGAAGAAAGTTCGTATTCGGGATTGCTGGGG
GTTGGACGGTGATTCTTTCAGCTTGGCTAAAGCTTTCAGGAAGGTGAGGTTTCTGTCGCT
GGAAGGATGCTCAGTACTAACAACAGGGGGTTTAGAGTCGGTCATTTTGCACTGGGAAGA
GCTCGAGAGCATGAGAGTAGTGTCGTGTATGAATATAAAAGACAACGAGATTCCACCGGC
ACTCTCGTCTTTGTTCTCCCTTCTCAAAGAACTGACGTGGAGACCAGACACAAGGTCTCA
TCTCTCGTCCAAGCTCGAAGATGCTGGAGTTGGAAAGAGAGGCGGCAAATTCTTCAAGAA
GGGATGATGTATCTTATTATGTGCTCTGAGAACTCTTGTAGACAAAACTCTTTAGTTATC
TTCTTCTTGGGGCGGTATTACTCTGTTTGTAAAATATTCCTTTAGTAACAAATACGTAGT
GAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS16JQ C 1
AF RR4CS16TF U 173
BS 1 172 RR4CS16JQ
BS 173 646 RR4CS16TF
BS 647 647 RR4CS16JQ
BS 648 722 RR4CS16TF
BS 723 728 RR4CS16JQ

RD RR4CS16JQ 728 0 0
GGGGATTAAAGCCATTGGGTAGTGCTGTGAGGTGCTTGAGGAGCTTACGGTTTGTGACCA
TAGGATGGATGATGGCGGTTGGATAGCTGGGCTTTCGTATTCCGGGAGTTTGAAGAGGCT
GAGAGTGTTGTCTTGCGGGAAGATTGATCCTTGTCCGGGCCCGGAGAAGATGCTTAGGTC
TTGCCCGGCTCTGGAGAGTTTGGAGATCGAGAGGTCTTGTTTGAGTGATAAAGAAGGGGT
GAGAGCTTTGTTTAAGGTGTGTGATGGAGTGAAGAAAGTTCGTATTCGGGATTGCTGGGG
GTTGGACGGTGATTCTTTCAGCTTGGCTAAAGCTTTCAGGAAGGTGAGGTTTCTGTCGCT
GGAAGGATGCTCAGTACTAACAACAGGGGGTTTAGAGTCGGTCATTTTGCACTGGGAAGA
GCTCGAGAGCATGAGAGTAGTGTCGTGTATGAATATAAAAGACAACGAGATTCCACCGGC
ACTCTCGTCTTTGTTCTCCCTTCTCAAAGAACTGACGTGGAGACCAGACACAAGGTCTCA
TCTCTCGTCCAAGCTCGAAGATGCTGGAGTTGGAAAGAGAGGCGGCAAATTCTTCAAGAA
GGGATGATGTATCTTATTATGTGCTCTGAGAACTCTTGTAGACAAAACTCTTTAGTTATC
TTCTTCTTGGGGCGGTATTACTCTGTTTGTAAAATATTCCTTTAGTAACAAATACGTAGT
GAATGTTC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CS16TF 554 0 0
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GAAGGGGTGAGAGCTTTGTTTAAGGTGTGTGATGGAGTGAAGAAAGTTCGTATTCGGGAT
TGCTGGGGGTTGGACGGTGATTCTTTCAGCTTGGCTAAAGCTTTCAGGAAGGTGAGGTTT
CTGTCGCTGGAAGGATGCTCAGTACTAACAACAGGGGGTTTAGAGTCGGTCATTTTGCAC
TGGGAAGAGCTCGAGAGCATGAGAGTAGTGTCGTGTATGAATATAAAAGACAACGAGATT
CCACCGGCACTCTCGTCTTTGTTCTCCCTTCTCAAAGAACTGACGTGGAGACCAGACACA
AGGTCTCATCTCTCGTCCAAGCTCGAAGATGCTGGAGTTGGAAAGAGAGGCGGCAAATTC
TTCAAGAAGGGATGATGTATCTTATTATGTGCTCTGAGAACTCTTGTAGACAAA*CTCTT
TAGTTATCTTCTTCTTGGGGCGGTATTACTCTGTTTGTAAAATATTCCTTTAGTAACAAA
TACGTAGTGA
TGTT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL6985Contig1 615 2 1 U
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TCTCCTCATCATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCAGAAGAGCGGTAACAATGG
TTTAGGATTCGCCGGTGTGCCCGGATCCGGATATGCCGGGATACCCGGGTTTGGAAACGG
GTTTCCCGGTACTGGAGTCGGCGGTGGATACGGCGGAGGCTACGGTGGTCCGAGCGGCGG
GTACGGGAAAGGAGGCGTGGTGAGGCCGACGGTGACTTGCAAAGAGAAAGGACCTTGTAA
CGGCAAGAAGCTGAGGTGTCCTGCCAGGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCCGGGAAAGG
ATACGGCGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGATGTACCATGGATTGTAAGAAGAAGTGTGTCGC
TTATTGCTAATAAAAAAAATAATTAAAGCCCTATCTTTATAATATATAGTCATTTCAATG
ATTATATATTTGCTATGTTATTGTAGTTGATGATCATGAAGTTTCTTTTGTCTTGATTTG
ATTGTAGTAGTTTTTTATATGCATTATATATGGTTGTGAACTTTTGTCATTGAATAAATG
AGAAAACCTTACAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BN65JQ C 1
AF RR4BN65TF U 1
BS 1 615 RR4BN65TF

RD RR4BN65JQ 615 0 0
GGAACCCACTGAACCAAAAACAAAAATGTTTACAACAAAACCGATCCTTGTAGCTTCCCT
TCTCCTCATCATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCAGAAGAGCGGTAACAATGG
TTTAGGATTCGCCGGTGTGCCCGGATCCGGATATGCCGGGATACCCGGGTTTGGAAACGG
GTTTCCCGGTACTGGAGTCGGCGGTGGATACGGCGGAGGCTACGGTGGTCCGAGCGGCGG
GTACGGGAAAGGAGGCGTGGTGAGGCCGACGGTGACTTGCAAAGAGAAAGGACCTTGTAA
CGGCAAGAAGCTGAGGTGTCCTGCCAGGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCCGGGAAAGG
ATACGGCGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGATGTACCATGGATTGTAAGAAGAAGTGTGTCGC
TTATTGCTAATAAAAAAAATAATTAAAGCCCTATCTTTATAATATATAGTCATTTCAATG
ATTATATATTTGCTATGTTATTGTAGTTGATGATCATGAAGTTTCTTTTGTCTTGATTTG
ATTGTAGTAGTTTTTTATATGCATTATATATGGTTGTGAACTTTTGTCATTGAATAAATG
AGAAAACCTTACAGC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4BN65TF 615 0 0
GGAACCCACTGAACCAAAAACAAAAATGTTTACAACAAAACCGATCCTTGTAGCTTCCCT
TCTCCTCATCATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCAGAAGAGCGGTAACAATGG
TTTAGGATTCGCCGGTGTGCCCGGATCCGGATATGCCGGGATACCCGGGTTTGGAAACGG
GTTTCCCGGTACTGGAGTCGGCGGTGGATACGGCGGAGGCTACGGTGGTCCGAGCGGCGG
GTACGGGAAAGGAGGCGTGGTGAGGCCGACGGTGACTTGCAAAGAGAAAGGACCTTGTAA
CGGCAAGAAGCTGAGGTGTCCTGCCAGGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCCGGGAAAGG
ATACGGCGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGATGTACCATGGATTGTAAGAAGAAGTGTGTCGC
TTATTGCTAATAAAAAAAATAATTAAAGCCCTATCTTTATAATATATAGTCATTTCAATG
ATTATATATTTGCTATGTTATTGTAGTTGATGATCATGAAGTTTCTTTTGTCTTGATTTG
ATTGTAGTAGTTTTTTATATGCATTATATATGGTTGTGAACTTTTGTCATTGAATAAATG
AGAAAACCTTACAGC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL6986Contig1 1192 2 10 U
GGATAGTATTCATTTAAAAACTTACTTCCACAGTTCCACTTAAGGTTTGACTCGTTAGCA
CAAACACAAGCGCCGTAACCTAGCTCCGACACGCCCTTCCGGCGGCGTCGGAGGCGATCT
TCCACTCCTTCCCCTTCCCTCTTTTTCTTTTGCTTTCCTCTTCCTACCCTAATCCTGAGT
CGATATGTTCTTCCTCTCTGTCGTGATGGTGGTCTGTTTCTCGGATCGATGTAGATCTGC
CGGAATCGTCCATTGATTTCGTTTGGAGAGGCGACGAGACTATGGAGAGGTTCAGAAGAG
GAGATTCGGCTTTTAGGATCGAAGGTATACCAAGATTGATTTTCCCCTTTTCAGATCTAG
GGTTATACTTTCACGATGGTGACGCGTGAACGAGGTCAGACGACTCCAGTACCTCGGCTG
CTTCCTCCTACGGAGGTGATGCTAACAGGTAAAGAAGAGGTGCGAACCTAGAGGTTGTAA
GGAGCTTCAAACTGGTTTGAAGCTTGAAAGAGATCCACTTGCGTTCCTCACCGCCAAGGT
CCGACTTTCATTCCGGAGTCCTTTCCGGCTTGGCCTATGAAACGAGGTATTGATTGACAG
CAGCATAAACTCAACCTGTGATGCGCCTTGGGCGATTATGTTGTTGGTTCATGGACTCGA
CGCTCATCAATTGGAACCATCACGATACATGCCATAGAATACAGGTTGAGGTTATTGTTT
GCTTGTCCAGTTCCTACCTCGGCTTGTATGGCTTTTAGGTTTTAGGTTCAGTCGGACTAC
TGTCCGTAGATGGCTTAGGACTGGAGCAATGAACGCCGATTGATACAAACCGTCATCGAA
AATGCGCCTGTGGTGTTGATGCTAATGGGACAAGAGCATAAATCCTATCTTACGGGACCA
TAGCTAGGTGAAGACTGGAATGCTGATTGCTTGGATTGTGTCTTTGTGTTACTAGTTGTT
CTCATGTCATAGTGGTCGAATGTAGGGGTCAAAGAGATGATTCACTCCTGGTTGTGGGGT
GGATTCATTCTCGGTGTGGTCAAAAAATACATTGATAGCTTTGGTCAAGTAGCATTAAGT
CCAATCAAGTGACTTAGGGCAATACTAGATAGCTTCAATGTATTTGGTTAAAGTCTGTAG
TGGTGATAACCTTGTGTATCATGTTTGGTGAATTTGAAGTTTATGAAGAGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AM03TF U 1
AF RR4AM03JQ C 300
BS 1 758 RR4AM03TF
BS 759 759 RR4AM03JQ
BS 760 765 RR4AM03TF
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RD RR4AM03TF 881 0 0
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DS 

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A
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GGAGCTTCAAACTGGTTTGAAGCTTGAAAGAGATCCACTTGCGTTCCTCACCGCCAAGGT
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CAGCATAAACTCAACCTGTGATGCGCCTTGGGCGATTATGTTGTTGGTTCATGGACTCGA
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QA 2 893 2 893
DS 



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ATGCCTTGCCTTGCAC


BQ
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AF RR4DX78JQ C 1
AF RR4DX78TF U 1
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RD RR4DX78JQ 616 0 0
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TACTTTGATATTCTATTCATTGAAATATAGGATCTGTGATGAACTGTGTGTAACCCTATT
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ATGCCTTGCCTTGCAC

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DS 

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ACGTCTAAACGTTTCCTAAACTACACGCAGTGCGACAAGCAAAACGTACACGAGATGCTT
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ATGGCTCAGTTCTGTAAAGACACTGTTGTCACAATCTGGCACTATCATGGTGGTTGTCTT
GTGGGTAAAGTAGTGAGCCCTGACCGCAAAGTTCTCGGTGTTAACAGGCTCAGAGTTATT
GATGGTTCCACATTTGATGAGTCTCCTGGAACCAACCCTCAAGCCACAGTCATGATGATG
GGAAGATACATGGGAGTCAAGATTCTTCGAGAGAGACTTGGAAACAAGGCAGGTGTTTAA
TTTTCAAAGTGAGCTGTTATCATACAACATTACTCGTTGGATAATTTCTCCATCTCTGCT
TACTTTGATATTCTATTCATTGAAATATAGGATCTGTGATGAACTGTGTGTAACCCTATT
TAGGGCAATCGAATTTGTTTGCTTGTGTGAGAAGTTTATGGTTTCTGTCTGAATGTTATC
ATGCCTTGCCTTGCAC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6988Contig1 913 2 1 U
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GTTTCTGATTCTGTTGTGGTTGTGGTTGTTGTTGGTGCTTTCGAAACTTCAGATTTCCTA
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CCAGAAAATGACT


BQ
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AF RR4BO73JQ U 14
AF RR4DT65JQ U 1
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RD RR4BO73JQ 683 0 0
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AAGTGGATCCATATTTTCCTAAAATCATATCGCCAAGGCTGCAAACTGGGACTCGGGTTC
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TATAATATATGTGACTATACTTTGCTCAGGCATTCATTCCAGACTGCAAGCATTACTGGA
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GAAATTTAACTGGAAGTGGATCCATATTTTCCTAAAATCATATCGCCAAGGCTGCAAACT
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GTTTCTGATTCTGTTGTGGTTGTGGTTGTTGTTGGTGCTTTCGAAACTTCAGATTTCCTA
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CCAGACGTTGTTTCAAGGCTCTATTTTCCATACCAAGCATGACCAGCTGTTGATCCAAAT
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CCAGAAAATGACT

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DS 



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BQ
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AF RR4E004TF U 1
AF RR4E004JQ C 136
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TGTCTTGCTCTCGAATAACTATGCTTCGTCTACATGGTGCTTGAACGAGCTTTTTGAGAT
CATCAATTACCGAGAAGAGTTTGGTCACACGGTGATACCCATTTTCTTTCAAGTCAATCC
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AAAAAGAAAGGAAGAGATCCAAAGATGGAAACATGCTTTGACAGTAGTGGCCCAAATCGA
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DS 

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TTCTTCTTTAACTATGTTGGCTCCTCCGTCTTCTTTGCCTCGAAATCGGATACATCAGGT
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CGGTCCTGCGCTCATAGAGGCTATTAGAGGATCGAGGATTGTAATTGTCTTGCTCTCGAA
TAACTATGCTTCGTCTACATGGTGCTTGAACGAGCTTTTTGAGATCATCAATTACCGAGA
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GATCCAAAGATGGAAACATGCTTTGACGGTAGTGGCCCAAATCGAAGGTTACGATTCAGC
AAACTGGTTCGTTCTCTTGATTCCCACTTTCTCTTGAATCTTTCTACAACACCAACCTCT
ATATTTTTTGTAGCTTTTAAACAACAACCATCATGTATTGACAAGTAATGAGTATATGAC
AT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6990Contig1 687 2 3 U
GGATCAATCATCAATCATCAATCATCAATCATCATCACTCTCTCTTTCTCTCTCAAACCA
AAGAGAAAAGCTTCTTCTACAATTCTCGACTTTGCATCTGTACAGAGGATGTTGCTAAGT
TTCCGGCGAGACCAAGTTGACTCCAACGCAGCCAGTCACAACAACAACATGGAGGCCGAG
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TACCAAAAACAAGGTTACATGGTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK18JQ C 1
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QA 1 687 1 687
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AAA
CA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C344TF U 1
AF RR4C344JQ C 24
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DS 

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GTTAGTATATGTCAATAAGTAACTTTATTTGTTTTC

QA 1 336 1 336
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EP61TF C 1
AF RR4EP61JQ U 5
BS 1 4 RR4EP61TF
BS 5 672 RR4EP61JQ
BS 673 712 RR4EP61TF

RD RR4EP61TF 712 0 0
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TAAAATCTTTTT*CAAAGTCTTACACAAATCACTTAAATATTAAATCACCAGCCCTTTGT
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AGCTTCTTCAGCCTCCTCCACCTTGTTTAACTCAATTTCTTCTCCAACATGAGGCTTTAA
CAGGTAAGTCAGAGACTTTAGCTCTCATATCATCACACATTTTAGTCAAAACTGTGATCT
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GGTTTCATCTCGGCGGAGCTAAATCGCGTCGTCGTTGTAACCGCCATCGTCCTCTTCCTC
TGTCTTCTCCGTCTCCACTACCGAGGAAGAGAAGCTTTGCCGTGGGTTCGCTTCTCGCGA
ATGGTGGAGAGTCGTCAGGATTCTTCCCCGATCCGACCCAACTGAAATTAGGTCCGTTCA
CAACTCCGGTCATTCTCCTCTTGTCAATCTCGTTGTTATGTGGTGACTCACTTGTCGCAG
AAAATTAAAGAGGAAACTAGAATGGAAAAAGAGAATCACGGTTGCGTTTTAGGTTTCGAG
AGTGAGTTCACTCGATGACTCTTTTTTTTTCAAGTCTCTTTAGTGACACTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EP61JQ 668 0 0
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ATCTTTTTTCAAAGTCTTACACAAATCACTTAAATATTAAATCACCAGCCCTTTGTCTTC
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TCATCTCGGCGGAGCTAAATCGCGTCGTCGTTGTAACCGCCATCGTCCTCTTCCTCTGTC
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TCCGGTCATTCTCCTCTTGTCAATCTCGTTGTTATGTGGTGACTCACTTGTCGCAGAAAA
TTAAAGAGGAAACTAGAATGGAAAAAGAGAATCACGGTTGCGTTTTAGGTTTCGAGAGTG
AGTTCACT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6993Contig1 825 2 6 U
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TTCCCGGGGGATTCCGAATCTCCACCGTTTTGGTTCCATACAGATTCTCTTCTTGTCTTT
TTTTTTTCTTTTTTAATTTTCACACAGAATCCTAAAAAAAACCCTAATTTTGATACATTA
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AGGAAGATGCCTCCAAAGCAACAACCAAAGGCCGATTTGGCGAAAAAGCAGAAGCAAGTG
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AGTCAGCCTAAAGTTCCTGTAGGTGTGGATCCGAAGTCCATCCTGTGTGAGTTTTTCAAG
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AAGGGTGAGAAGATCGATATTTACAGCGATAAGCGTGATGAAGATGGAGATATGGAGGAA
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AACAGATATTGTTTGCAAGTATTTTCTGGATGCGTGGAAAGAAACAGTATGGGTGGTCTG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BQ68TF U 1
AF RR4D750TF U 10
BS 1 371 RR4BQ68TF
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BS 692 825 RR4D750TF

RD RR4BQ68TF 691 0 0
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TTCCCGGGGGATTCCGAATCTCCACCGTTTTGGTTCCATACAGATTCTCTTCTTGTCTTT
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AGGAAGATGCCTCCAAAGCAACAACCAAAGGCCGATTTGGCGAAAAAGCAGAAGCAAGTG
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AAGGGTGAGAAGATCGATATTTACAGCGATAAGCGTGATGAAGATGGAGATATGGAGGAA
TGGGATCAAGAAACGCTTGAAAAGGTGTAGA

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DS 

RD RR4D750TF 816 0 0
GG
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TTCCGAATCTCCACCGTTTTGGTTCCATACAGATTCTCTTCTTGTCTTTTTTTTTTCTTT
TTTAATTTTCACACAGAATCCTAAAAAAA*CCCTAATTTTGATACATTAAGCTTTAGAAC
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TCCAAAGCAACAACCAAGGGCCGATTTGGCGAAAAAGCAGAAGCAAGTGGAAGACAAAAC
ATTCGGTCTGAAAAACAAGAACAAGAGCAAGAATGTTCAGAAGTATGTCCAGAGTCTAAA
ACAATCTGTTCAGCCTAAACCCGATGCCTCTAAAGTTGCTGCCAAGAAAAAGAAAGAGGA
AGAGAAAGCGAGAGAACAGGAGTTGAATGAGTTGTTCAAGGTTGCCATTAGTCAGCCTAA
AGTTCCTGTAGGTGTGGATCCGAAGTCCATCCTGTGTGAGTTTTTCAAGGCGGGGCAGTG
TCAGAAGGGATTCAAGTGCAAATTCTCTCATGATTTGAACATTCAAAGGAAGGGTGAGAA
GATCGATATTTACAGCGATAAGCGTGATGAAGATGGAGATATGGAGGAATGGGATCAAGA
AACGCTTGAAAAGGTGTAGAATCGAAGAAAATGATATAACCAGACAACCAACAGATATTG
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GTGGCAAGAGTGTCATACAGCACGCTCTCTCTGG

QA 3 816 3 816
DS 



AS 1 2

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AGTTTGTTCGGTGCTCTCTCTCAATAAACCTGGTTCGTCTTCTCTGCTTCTGAATCGATC
GGATCTTGACGAACATGTCTTCTCCCGGCGAATACTACAACTCACTTCCTCCAATAACCA
AGGCTTATGGTACTTTGTGCCTCCTGGCTACAACTCTATCCCAGCTTGGCTTAGTTGCTC
CTATTCACATTGCTTTGATTCCTGAACTTGTCTTTAAGCACTTCCAGGTTTGGAGGCTGA
TAACGAACTTGTTTTTCCTTGGTGGCTTCTCTATCAATTTCGGGATACGTCTTTTGATGA
TAGCAAGGTATGGAGTTCTGCTCGAGAAAGGGCCTTTCGAAAGGCGGACAGCAGACTTTT
TGTGGATGATGATCTTTGGATCCCTGACTCTCTTGGTTTTATCAACCATACCGTTTTTCT
GGACACCCTTCCTTGGAGTTTCACTTGTGTTCATGCTTCTGTATCTCTGGAGCCGAGAGT
TTCCAAATGCCAACATCAGCCTCTACGGTCTTGTCAATCTTAAGGCTTTCTACCTCCCAT
GGGCAATGCTAGCACTCGACGTTATCTTCGGTTCTAAGATCATGCCAGATCTTCTTGGCA
TCATAGCTGGACATCTTTACTACTTCCTAACAGTCCTTCACCCTCTCGCCACCGGAAAGA
ACTACCTGAAAACCCCTAAATGGGTTAATAAACTGGTGGCAAGATTTCGAATTGGAGCTC
CAGTAGCAGCTGTTCGTCAAGCAGGTGGTGTAGGAGCAGTAGGATCCGGAACTGGAGGAG
GAGCTTATTCAAGCGCTCGTGCCCCACCAGAGAGCTCCACCAACACAGCATTCAGAGGTC
GATCATATCGTCTCACCGACTGAACTCTCCGATTCCTTCGTTTTTCAATCATCCCGTATG
TTTTGAAAAGAATGCCACTGACAAGTAGCAGTTAGCTTTATGTGTTTTATTAAGCAGGTA
CAGTATTTTTGAGTATATGACTTTGTAGGGGGAAAGAAATCTTTTGAGGGGTTTTTTTTA
AAACAATGTTGTGTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D075TF U 1
AF RR4D075JQ C 310
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BS 672 1038 RR4D075JQ

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GGATCTTGACGAACATGTCTTCTCCCGGCGAATACTACAACTCACTTCCTCCAATAACCA
AGGCTTATGGTACTTTGTGCCTCCTGGCTACAACTCTATCCCAGCTTGGCTTAGTTGCTC
CTATTCACATTGCTTTGATTCCTGAACTTGTCTTTAAGCACTTCCAGGTTTGGAGGCTGA
TAACGAACTTGTTTTTCCTTGGTGGCTTCTCTATCAATTTCGGGATACGTCTTTTGATGA
TAGCAAGGTATGGAGTTCTGCTCGAGAAAGGGCCTTTCGAAAGGCGGACAGCAGACTTTT
TGTGGATGATGATCTTTGGATCCCTGACTCTCTTGGTTTTATCAACCATACCGTTTTTCT
GGACACCCTTCCTTGGAGTTTCACTTGTGTTCATGCTTCTGTATCTCTGGAGCCGAGAGT
TTCCAAATGCCAACATCAGCCTCTACGGTCTTGTCAATCTTAAGGCTTTCTACCTCCCAT
GGGCAATGCTAGCACTCGACGTTATCTTCGGTTCTAAGATCATGCCAGATCTTCTTGGCA
TCATAGCTGGACATCTTTACTACTTCCTAACAGTCCTTCACCCTCTCGCCACCGGAAAGA
*CTACCTGAAA
CC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4D075JQ 729 0 0
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TGATCTTTGGATCCCTGACTCTCTTGGTTTTATCAACCATACCGTTTTTCTGGACACCCT
TCCTTGGAGTTTCACTTGTGTTCATGCTTCTGTATCTCTGGAGCCGAGAGTTTCCAAATG
CCAACATCAGCCTCTACGGTCTTGTCAATCTTAAGGCTTTCTACCTCCCATGGGCAATGC
TAGCACTCGACGTTATCTTCGGTTCTAAGATCATGCCAGATCTTCTTGGCATCATAGCTG
GACATCTTTACTACTTCCTAACAGTCCTTCACCCTCTCGCCACCGGAAAGAACTACCTGA
AAACCCCTAAATGGGTTAATAAACTGGTGGCAAGATTTCGAATTGGAGCTCCAGTAGCAG
CTGTTCGTCAAGCAGGTGGTGTAGGAGCAGTAGGATCCGGAACTGGAGGAGGAGCTTATT
CAAGCGCTCGTGCCCCACCAGAGAGCTCCACCAACACAGCATTCAGAGGTCGATCATATC
GTCTCACCGACTGAACTCTCCGATTCCTTCGTTTTTCAATCATCCCGTATGTTTTGAAAA
GAATGCCACTGACAAGTAGCAGTTAGCTTTATGTGTTTTATTAAGCAGGTACAGTATTTT
TGAGTATATGACTTTGTAGGGGGAAAGAAATCTTTTGAGGGGTTTTTTTTAAAACAATGT
TGTGTTCAG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL6995Contig1 803 2 10 U
TCCTTACTTGGATCAAAAAGGGGGTTATCGAGGTGGAGCATGATCAAAGCTTCAAACTTT
GAAATCGAATAAAAAGTGGAGATGCTAGGAGAATGTGGCAAGCCATCCAAGCCAGAGAAA
CCGGTCGAACCCCTCCCAATTCCTTCGCGAACCAACTCAAATCGCGTCGCATCTCATCTC
TCCAACTCTCTAATCGCAAAGATTTCGTTTCTCCTCACCGTGGCTCCGTCAACTCCCTTC
AGGTTGATTTGACGGAAGGGAGGTACTTGCTGTCAGGAGCATCGGATGGTTCGGCTGCCG
TGTTCGACACTCAGCGCGCGACTGATACCGAGGCAAGTGGTCTTATAGGGAAGCACAAGT
GTGTGTTTAGTGTGGACAAGGGACATGAACATGGGCATAAGTTTGCCGTTTCTTCTGCTG
TTTGGTATCCCATTGACACTGGCCTCTTCGTTACAGGTTCTTTTGATCATCTCGTCAAAG
TCTGGGATACCAATACTGCTCAGGCGGTTGTGGATTTTAAGATGCCTGGGAAGGTTTATA
GAACTGCCATGTCGTCTTTGGCTATGTCTCACACGCTTATCGCTGCTGGCACTGAGGATG
TCCAGGTTCGCCTCTGTGATATAGCTTCTGGAGCTTTCTCTCATACCTTATCTGGTCACC
GTGATGGTGTTATGTCGGTGGAATGGTCTACTTCCAGCGAGTGGGTTTGTACACTGGGGG
GTGTGATGGTGCTATACGCTTCTGGGACATCAGACGTGCTGGATGCTTCCGTGTTTAGAT
CAATCAGTACACAACTTGGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG90TF U 1
AF RR4FS64TF U 40
BS 1 553 RR4CG90TF
BS 554 554 RR4FS64TF
BS 555 580 RR4CG90TF
BS 581 581 RR4FS64TF
BS 582 601 RR4CG90TF
BS 602 602 RR4FS64TF
BS 603 638 RR4CG90TF
BS 639 639 RR4FS64TF
BS 640 673 RR4CG90TF
BS 674 803 RR4FS64TF

RD RR4CG90TF 673 0 0
TCCTTACTTGGATCAAAAAGGGGGTTATCGAGGTGGAGCATGATCAAAGCTTCAAACTTT
GAAATCGAATAAAAAGTGGAGATGCTAGGAGAATGTGGCAAGCCATCCAAGCCAGAGAAA
CCGGTCGAACCCCTCCCAATTCCTTCGCGAACCAACTCAAATCGCGTCGCATCTCATCTC
TCCAACTCTCTAATCGCAAAGATTTCGTTTCTCCTCACCGTGGCTCCGTCAACTCCCTTC
AGGTTGATTTGACGGAAGGGAGGTACTTGCTGTCAGGAGCATCGGATGGTTCGGCTGCCG
TGTTCGACACTCAGCGCGCGACTGATACCGAGGCAAGTGGTCTTATAGGGAAGCACAAGT
GTGTGTTTAGTGTGGACAAGGGACATGAACATGGGCATAAGTTTGCCGTTTCTTCTGCTG
TTTGGTATCCCATTGACACTGGCCTCTTCGTTACAGGTTCTTTTGATCATCTCGTCAAAG
TCTGGGATACCAATACTGCTCAGGCGGTTGTGGATTTTAAGATGCCTGGGAAGGTTTATA
GAACTGCCATGTCTTCTTTGGCTATGTCTCACACGCTTATTGCTGCTGGCACTGAGGATG
TTCAGGTTCGCCTCTGTGATATAGCTTCTGGAGCTTTC*CTCATACCTTATCTGGTCACC
GTGATGGTGTTAT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4FS64TF 764 0 0
GG
GATCAAAGCTTCAAACTTTGAAATCGAATAAAAAGTGGAGATGCTAGGAGAATGTGGCAA
GCCATCCAAGCCAGAGAAACCGGTCGAACCCCTCCCAATTCCTTCGCGAACCAGCTCAAA
TCGCGTCGCGTCTCATCTCTCCAACTCTCTAATCGCAAAGATTTCGTTTCTCCTCACCGT
GGCTCCGTCAACTCCCTTCAGGTTGATTTGACGGAAGGGAGGTACTTGCTGTCAGGAGCA
TCGGATGGTTCGGCTGCCGTGTTCGACACTCAGCGCGCGACTGATACTGAGGCAAGTGGT
CTTATAGGGAAGCACAAGTGTGTGTTTAGTGTGGACAAGGGACATGAACATGGGCATAAG
TTTGCCGTTTCTTCTGCTGTTTGGTATCCCATTGACACTGGCCTCTTCGTTACAGGTTCT
TTTGATCATCTCGTCAAAGTCTGGGATACCAATACTGCTCAGGCGGTTGTGGATTTTAAG
ATGCCTGGGAAGGTTTATAGAACTGCCATGTCGTCTTTGGCTATGTCTCACACGCTTATC
GCTGCTGGCACTGAGGATGTCCAGGTTCGCCTTTGTGATATAGCTTCTGGAGCTTTCTCT
CATACCTTATCTGGTCACCGTGATGGTGTTATGTCGGTGGAATGGTCTACTTCCAGCGAG
TGGGTTTGTACACTGGGGGGTGTGATGGTGCTATACGCTTCTGGGACATCAGACGTGCTG
GATGCTTCCGTGTTTAGATCAATCAGTACACAACTTGGGGTT

QA 3 764 3 764
DS 



AS 1 2

CO CL6996Contig1 702 2 4 U
GGTAAACAATGGAGTGAGTGTTGTTTCTTATCAAGTCCCTTGTCAGAATCAGTCTACTGG
TTTTACACAGTCTCAGCTTCAGCAGCAGTCAATGCTCTCTAATGGTGCTAAAATGACCCA
CCAGAACATGGTTTCCGCTGGGAATAAGGGCTCGTCTCAAATGACAGCGCAAGAATTGCA
GTTTCAGCAGCAACTGGAGTTGCACAACAGTACCCAATTATTGAGAAACCAGCAGGAACA
GTCGTCTATGCATCCGCTACAACAAACTCTGTCCCAGAATCCTCAGCAACTCCAGATGCA
ACAACAACAATCATCAAAACCAAGCCCCTCACAACAGCTACAGTTGCAGCTACTGCAGAA
ATTACAGCAACAGCAGCAGTCAACTCCTCCTCTGGTAAGCTCGTCCTTACAGCCACAGTT
ATCGCCTTTGCAACAAACACAAAGCCATCAGCTGCAACAACTTCTGTCGTCTCAGAATCA
ACAGCCCTTGCCACAGAGTAATAACAGCTTCATGCAGCCTCCACAGATTCAGGTGAGTCA
TCATCAGCAACAAGGATATATGAATAATAATAATAAGCCTGTTGTAGCCGCTGGAAGATC
ACAGTCTGGTCACATAGATGGAGAAGCTCCTTCTTGTTCAACCTCCCCATCCGCCAATAA
CACAGGACATGATAATGTTCCACCGACAAACTTCCTGAGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EW57TF U 1
AF RR4EW57JQ C 43
BS 1 640 RR4EW57TF
BS 641 641 RR4EW57JQ
BS 642 662 RR4EW57TF
BS 663 702 RR4EW57JQ

RD RR4EW57TF 662 0 0
GGTAAACAATGGAGTGAGTGTTGTTTCTTATCAAGTCCCTTGTCAGAATCAGTCTACTGG
TTTTACACAGTCTCAGCTTCAGCAGCAGTCAATGCTCTCTAATGGTGCTAAAATGACCCA
CCAGAACATGGTTTCCGCTGGGAATAAGGGCTCGTCTCAAATGACAGCGCAAGAATTGCA
GTTTCAGCAGCAACTGGAGTTGCACAACAGTACCCAATTATTGAGAAACCAGCAGGAACA
GTCGTCTATGCATCCGCTACAACAAACTCTGTCCCAGAATCCTCAGCAACTCCAGATGCA
ACAACAACAATCATCAAAACCAAGCCCCTCACAACAGCTACAGTTGCAGCTACTGCAGAA
ATTACAGCAACAGCAGCAGTCAACTCCTCCTCTGGTAAGCTCGTCCTTACAGCCACAGTT
ATCGCCTTTGCAACAAACACAAAGCCATCAGCTGCAACAACTTCTGTCGTCTCAGAATCA
ACAGCCCTTGCCACAGAGTAATAACAGCTTCATGCAGCCTCCACAGATTCAGGTGAGTCA
TCATCAGCAACAAGGATATATGAATAATAATAATAAGCCTGTTGTAGCCGCTGGAAGATC
ACAGTCTGGTCACATAGATGGAGAAGCTCCTTCTTGTTCA*CCTCCCCATCCGCCAATAA
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4EW57JQ 660 0 0
TCAGAATCAGTCTACTGGTTTTACACAGTCTCAGCTTCAGCAGCAGTCAATGCTCTCTAA
TGGTGCTAAAATGACCCACCAGAACATGGTTTCCGCTGGGAATAAGGGCTCGTCTCAAAT
GACAGCGCAAGAATTGCAGTTTCAGCAGCAACTGGAGTTGCACAACAGTACCCAATTATT
GAGAAACCAGCAGGAACAGTCGTCTATGCATCCGCTACAACAAACTCTGTCCCAGAATCC
TCAGCAACTCCAGATGCAACAACAACAATCATCAAAACCAAGCCCCTCACAACAGCTACA
GTTGCAGCTACTGCAGAAATTACAGCAACAGCAGCAGTCAACTCCTCCTCTGGTAAGCTC
GTCCTTACAGCCACAGTTATCGCCTTTGCAACAAACACAAAGCCATCAGCTGCAACAACT
TCTGTCGTCTCAGAATCAACAGCCCTTGCCACAGAGTAATAACAGCTTCATGCAGCCTCC
ACAGATTCAGGTGAGTCATCATCAGCAACAAGGATATATGAATAATAATAATAAGCCTGT
TGTAGCCGCTGGAAGATCACAGTCTGGTCACATAGATGGAGAAGCTCCTTCTTGTTCAAC
CTCCCCATCCGCCAATAACACAGGACATGATAATGTTCCACCGACAAACTTCCTGAGCAG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL6997Contig1 655 2 2 U
AAACACTGAAACATTATATTCATATGAGAACCATATTACACAAGAACAGCAAGTAAACAG
AGGATAAAGCACAACATCAGAACCAAAGCCGACAAGTTTTTTTTTTTTAAACACTGAAAC
ATTATATTCATATGAGAACCATATTACACAAGAACAGCAAGTAAACAGAGGATAAAGCAC
AACATCAGAACCAAAGCCGACAAGTTAAACAAAACCTCGGAGTCCAAAGCTAGTGGTTAA
ACAAACCACCAGAGTCCAAAGCCAGTGGATAAAGAACTATCCCTGGAAAATTATTACATG
CCGATTGAGAACTAAAAACCCAAAATATAAAGCTAGCTAACATAGATGAACACAATGATG
GAATATCCAAAGTAGCAAGACACCTCAATCTCCAAGTGGCTCTATCATGATAAGAACAGA
ACCAGATACCTTCCATAGTAAATTCGGAGTTGTTAATCTGTAGATCCTGATCTGGGTTGA
TCGGATCTGATTTTGGCTAGATTTGTGATGTAATTTCCAGATCTATTTGATTAACGGTAT
GGTGGTTCATATTCAAAACTGCATGTTCCTTTTTCTCCTTGATGGTCTCTTTAGCTTCAC
TCTGTCTCGATCCTTCTTCCGTCTTGGTTCTCAAGATTGTCTTTGGCCGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AO44TF C 1
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RD RR4AO44TF 655 0 0
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QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4AO44JQ 614 0 0
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TTTTTTTAAACACTGAAACATTATATTCATATGAGAACCATATTACACAAGAACAGCAAG
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TTTGGCCGGTGTCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

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TTATGATTATTACTTAGGC


BQ
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AF RR4F040JQ C 1
AF RR4F040TF U 1
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TTATGATTATTACT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GX52TF U 1
AF RR4GX52JQ C 1
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RD RR4GX52TF 735 0 0
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TTCCTCTCCCGCCTGAACAGGACACATTGCTTAGCCCAAACTACCAGCTAGTTATACCGA
AGAAGTCAGCTTCAACGGAACCCGAAGAAACAGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTG
CACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATCTGAGCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGG
TCTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATAAGTAGAGAGAGACA*CAGTAACAATTATG
TTGTGTATCA*GATGTAGAAAATGTTTTGTGA*TGAC*AGAT*ATCTCTCTTTATCTGGA
GTGAATCTCTTATCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GX52JQ 743 0 0
GGAGAGAGAGAGCAATTAACTCGGCGACGTTCTTAAATCTCCGCCGTGCATCTGTCGCCT
CCACCGACTTTCGCTCGTGTTAGTGAAAAACAAATGGCTGGAGAAGGTGAAGAAGATCTG
CCAAGAGACGCCAAGATTGTCAAGTCTCTGCTTAAGTCGATGGGCGTGGAGGACTACGAG
CCTCGCGTGGTGCACCAGTTTCTCGAATTATGGTACCGTTACGTGGTCGAAGTGTTGACC
GATGCTCAGGTTTACTCGGAGCATGCTACCAAATCCACCATTGACTGTGACGATGTGAAG
CTAGCTATTCAATCCAAAGTTAGTTTGGCTTCTCGCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTACTGC
TAGAGCTTGCTGCCAGCAGGAACAAGATTCCTTTGCCAAAATCGATAGCAGGACCAGGCA
TTCCTCTCCCGCCTGAACAGGACACATTGCTTAGCCCAAACTACCAGCTAGTTATACCGA
AGAAGTCAGCTTCAACGGAACCCGAAGAAACAGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTG
CACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATCTGAGCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGG
TCTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATAAGTAGAGAGAGACAACAGTAACAATTATG
TTGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTTTGTGAATGACCAGATTATCTCTCTTTATCTGGA
AGTGAAATCTCTTAATCTATTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7000Contig1 688 2 1 U
AGGGGAAGATTGCTAGTCACACTCTCTCCTCTCCTTCTCAATCTCTCCTGATCCTCTCCC
TCTTCTCCCAACCCCCCACATGGCATCCGTCGCCGCAAGTCCAGCTTTCTCACTCCTCAA
GTCAACCACCGGAGGAGCCACTTCTTCCTCCGCCGCAACTCGCGCGCGCGCCTCCCTTTC
CCCCATCCTCTCCAAATCCATCTCCAAATCCATTGGACCAGACTCGATAAAAACATTCGA
TGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGAT
GGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAA
AGGAGTGACGACTATAATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTGGGAGT
TGCGGGAGTCATGAGTCATATCTCTACTGGTGGTGGAGCTAGCTTGGAGCTCTTGGAAGG
TAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCGATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAA
GCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTTACTTTC
TTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCTGAG
ACTTACTATATCAATAAAAGTTATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FQ45TF U 1
AF RR4FQ45JQ C 165
BS 1 688 RR4FQ45TF

RD RR4FQ45TF 688 0 0
AGGGGAAGATTGCTAGTCACACTCTCTCCTCTCCTTCTCAATCTCTCCTGATCCTCTCCC
TCTTCTCCCAACCCCCCACATGGCATCCGTCGCCGCAAGTCCAGCTTTCTCACTCCTCAA
GTCAACCACCGGAGGAGCCACTTCTTCCTCCGCCGCAACTCGCGCGCGCGCCTCCCTTTC
CCCCATCCTCTCCAAATCCATCTCCAAATCCATTGGACCAGACTCGATAAAAACATTCGA
TGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGAT
GGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAA
AGGAGTGACGACTATAATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTGGGAGT
TGCGGGAGTCATGAGTCATATCTCTACTGGTGGTGGAGCTAGCTTGGAGCTCTTGGAAGG
TAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCGATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAA
GCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTTACTTTC
TTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCTGAG
ACTTACTATATCAATAAAAGTTATTTGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FQ45JQ 524 0 0
CGCGCGCCTCCCTTTCCCCCATCCTCTCCAAATCCATCTCCAAATCCATTGGACCAGACT
CGATAAAAACATTCGATGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTA
TGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATTGCGAATAAACTAG
CAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACTATAATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAG
TGGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGTCATATCTCTACTGGTGGTGGAGCTAGCT
TGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCGATCGCAG
TCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCATATGA
GTTTTTTTTTACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCAC
TACCTCCAAGTTTGAGACTTACTATATCAATAAAAGTTATTTGT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL7001Contig1 729 2 2 U
GCCGCAACCAATCTTTTCAAGCTCTTGTCTACTAAGTCCCATGTTCTTCTCTATCCCGGC
GGTGCCCGAGAGGCTCTCCATAACCGGGGTGAACAATACAAACTGATTTGGCCAGAGCAG
CAAGAGTTTGTAAGAATGGCAGCACGGTTTGGCGCAACTATAGTGCCATTTGGAACGGTT
GGTGAAGACGACATAGCTGAATTGGTTCTTGATTACAATGACCTGATGAAGATTCCGTTT
CTCAGTAACTATATCTCGGAAGTAACTCGCGATACAAAAGACTTTAAGTTGAGGGAAGAA
TCAAGTGGGGAGGTAGCAAACCAGCAACTCTACTTGCCAGGGCTCTTACCGAAAATCCCT
GGTCGGTTCTATTACCTATTCGGGAAACCGATACACACTAAAGGAAGACCAGAGCTTGTG
AAAGACAAAGAAGCAGCGAAACAGGTTTACTTGGAAGCGAAAGAGGAAGTGGAGAAAAGC
ATAGCCTACTTGTTGAAGAAACGTGAGGAAGATCCGTACAGAAGTGTTGTGGATAGATTA
AGTTACAGTTTGACACACCTTCCTGAGAATGATGTCCCTTCTTTCGAACCATGATTGGAA
CAGGAGCTGGTAAGCTTTAGTAAGTAAATCTCATAAAACAAAACAAGATGTCATGTCATT
GATTATGTTGTCTTAATAGAAAAATTCAGTGTATATCCCAAATTTTATATAAATGAAATT
GTTTAATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX36TF U 1
AF RR4DX36JQ C 1
BS 1 614 RR4DX36TF
BS 615 729 RR4DX36JQ

RD RR4DX36TF 614 0 0
GCCGCAACCAATCTTTTCAAGCTCTTGTCTACTAAGTCCCATGTTCTTCTCTATCCCGGC
GGTGCCCGAGAGGCTCTCCATAACCGGGGTGAACAATACAAACTGATTTGGCCAGAGCAG
CAAGAGTTTGTAAGAATGGCAGCACGGTTTGGCGCAACTATAGTGCCATTTGGAACGGTT
GGTGAAGACGACATAGCTGAATTGGTTCTTGATTACAATGACCTGATGAAGATTCCGTTT
CTCAGTAACTATATCTCGGAAGTAACTCGCGATACAAAAGACTTTAAGTTGAGGGAAGAA
TCAAGTGGGGAGGTAGCAAACCAGCAACTCTACTTGCCAGGGCTCTTACCGAAAATCCCT
GGTCGGTTCTATTACCTATTCGGGAAACCGATACACACTAAAGGAAGACCAGAGCTTGTG
AAAGACAAAGAAGCAGCGAAACAGGTTTACTTGGAAGCGAAAGAGGAAGTGGAGAAAAGC
ATAGCCTACTTGTTGAAGAAACGTGAGGAAGATCCGTACAGAAGTGTTGTGGATAGATTA
AGTTACAGTTTGACACACCTTCCTGAGAATGATGTCCCTTCTTTCGAACCATGATTGGAA
CAGGAGCTGGTAAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4DX36JQ 729 0 0
GCCGCAACCAATCTTTTCAAGCTCTTGTCTACTAAGTCCCATGTTCTTCTCTATCCCGGC
GGTGCCCGAGAGGCTCTCCATAACCGGGGTGAACAATACAAACTGATTTGGCCAGAGCAG
CAAGAGTTTGTAAGAATGGCAGCACGGTTTGGCGCAACTATAGTGCCATTTGGAACGGTT
GGTGAAGACGACATAGCTGAATTGGTTCTTGATTACAATGACCTGATGAAGATTCCGTTT
CTCAGTAACTATATCTCGGAAGTAACTCGCGATACAAAAGACTTTAAGTTGAGGGAAGAA
TCAAGTGGGGAGGTAGCAAACCAGCAACTCTACTTGCCAGGGCTCTTACCGAAAATCCCT
GGTCGGTTCTATTACCTATTCGGGAAACCGATACACACTAAAGGAAGACCAGAGCTTGTG
AAAGACAAAGAAGCAGCGAAACAGGTTTACTTGGAAGCGAAAGAGGAAGTGGAGAAAAGC
ATAGCCTACTTGTTGAAGAAACGTGAGGAAGATCCGTACAGAAGTGTTGTGGATAGATTA
AGTTACAGTTTGACACACCTTCCTGAGAATGATGTCCCTTCTTTCGAACCATGATTGGAA
CAGGAGCTGGTAAGCTTTAGTAAGTAAATCTCATAAAACAAAACAAGATGTCATGTCATT
GATTATGTTGTCTTAATAGAAAAATTCAGTGTATATCCCAAATTTTATATAAATGAAATT
GTTTAATGC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL7002Contig1 836 2 6 U
GAATGAATCTTCTTCTCCACCTATCTCTCGTCGCTCTGATCTCCCTCCTCTCTTTCCACA
ACCACCACAGTGTCCTCGCATCGTCCCACTTCGAAGGCTTCGATGCCGAAGACGACGATC
TCTCCGAGGATCCAACCGAGCTTCACCACTCCCTCACTCACTCCTCGCTGGGGATATGAT
CACTGATGTTGTTCTTGATCAGGTTTTTGGTGACAAATCGTTCGAGAAGTTTGGCAAGTA
TTTCATTTCAATGCATTTTTCGGACCAACATCCTGGCAAACACAGGAAGATGCTGCTTTT
CAAGTTCGCCTTACCTGATGCTAAGCACATGGATGATATGGTCCGCTTGATAGCGCTAAT
TCCGTATTACATTGACTTAATTGGCCGCTACAAGCTCAGCTCCCAGGCACGGAACAAAAC
TGACGGAGCTAGGCAAAAGGTGGCGCAGGAAGCGTACAAGGAACTTGAGAGTGTGAGGCA
AGAGGCATTGCAGAGAAAGAAAGCCGAGAAGAAGAGGTTACTGGAGGAGGCGGAGGCAAA
GCTTAGCGGTGAGGCTCTGAGGAAGAAAGAGGCAAAGGAACGTGCACGCCAGATGAAGAA
GTCAATGCCAAAAGTTAAGATGAGTCGTGGTCACTAGACTCGAAGCATAGAGGGACGTCT
CATTTAAGGTCGCACAATCCCATGTTTGCCATTGGAATAGCTATTCCTCTACACTCCCGT
TTTAGCCTTTTCGATTAGATCTTTTCTCTTTGCTTTCATGAACCTCCACTTGCGCCGAGG
CCTCGTTTCTACTTCACTGGAAGTAACATCCTTTATTCTCAGTTAGTCACTGCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP89TF U 1
AF RR4GP89JQ C 110
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BS 669 669 RR4GP89JQ
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BS 706 717 RR4GP89TF
BS 718 836 RR4GP89JQ

RD RR4GP89TF 735 0 0
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CACTGATGTTGTTCTTGATCAGGTTTTTGGTGACAAATCGTTCGAGAAGTTTGGCAAGTA
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GTTTAGCCTTTTCGATAG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4GP89JQ 727 0 0
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ATAGCGCTAATTCCGTATTACATTGACTTAATTGGCCGCTACAAGCTCAGCTCCCAGGCA
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CAGATGAAGAAGTCAATGCCAAAAGTTAAGATGAGTCGTGGTCACTAGACTCGAAGCATA
GAGGGACGTCTCATTTAAGGTCGCACAATCCCATGTTTGCCATTGGAATAGCTATTCCTC
TACACTCCCGTTTTAGCCTTTTCGATTAGATCTTTTCTCTTTGCTTTCATGAACCTCCAC
TTGCGCCGAGGCCTCGTTTCTACTTCACTGGAAGTAACATCCTTTATTCTCAGTTAGTCA
CTGCACT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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GAGGATGATCCCCGTTGGCGCTTATTCCCAATCCATTTACTTGGATGTTGTCCATACTTG
GAAATCTCTGCATCGTCATTTGTGGTGGAGCCCTTGAAGATGCTGCTACTTCCTCTGCAG
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A


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RR4F325JQ U 1
AF RR4F234JQ U 2
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GAGACGTAAACGAGGTGTTGAAGTTTCCGCTCCATGAAGCTGTTCTTCTGGAAGCAGGAG
GAGGATGATCCCCGTTGGCGCTTATTCCCAATCCATTTACTTGGATGTTGTCCATACTTG
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AGTTCTCCTCCTGTCATGTTTCAGTAGCAGCTGGTTCCGATGCATGGCCGTTTGA

QA 1 415 1 415
DS 

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AGACGTAAACGAGGTGTTGAAGTTTCCGCTCCATGAAGCTGTTCTTCTGGAAGCAGGAGG
AGGATGATCCCCGTTGGCGCTTATTCCCAATCCATTTACTTGGATGTTGTCCATACTTGG
AAATCTCTGCATCGTCATTTGTGGTGGAGCCCTTGAAGATGCTGCTACTTCCTCTGCAGA
GTTCTCCTCCTGTCATGTTTCAGTAGCAGCTGGTTCCGATGCATGGCCGTTTGAAGACGA

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 2

CO CL7004Contig1 722 2 2 U
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TACAAAACTCTTATAATAAAAGTATTAAAAGAGGAGAGGGAAGTTTGGGGTGTTTGTGTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4CX38TF C 1
AF RR4CX38JQ U 13
BS 1 25 RR4CX38TF
BS 26 722 RR4CX38JQ

RD RR4CX38TF 722 0 0
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GCTGACCAAAAAAAAATGGCATCAACTTAATAAAGAAGCTTCATCTAAAGTTTATCTAAT
ACTTGGATCCATAATAGTTAAATTCAAGAACTAGTTCTCAGGCTTGGGAGGGAGATTAAG
ATCCAAATCCAAGAACACGCGTGGACGTCTCTCTGAGCTTAGATCCATCACCACAGAGGA
CGAGTCCGACTCACTCCTCGCCGACTCTTCATCGAACACGATCACCCCAGACTTGACCTG
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TATCGAGGTTGGTGACTCGACGGTGCTGCTCTGGCTAGGGCTCTCGTTGCCGCCGACGAA
GAAAGGAAGAGGGAAGTTGGTTTTGGCTTTAGCGCCACGGAACTGAAAAGCGGCTTTGTC
GTAGGCACGAGCCGCTGCTTCGGGAGTGTCGAAAGTGCCGAGCCAGACTCGGGTTTTCTT
GGTCGGGTCTCTGATCTCGGCGGCGTAACGACCCCATGGCCTCCTTCTCACTCCTCTGTA
ACGGTTCTCTTTGTTTCCGCCGTCGCCGCCGTTGGGTTTAACTGTCGGTGCCATATCTAG
TACAAAACTCTTATAATAAAAGTATTAAAAGAGGAGAGGGAAGTTTGGGGTGTTTGTGTT
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CX38JQ 710 0 0
GGTGCTGAAAACA
AAACGTTCTCAACACAAAATTATTTTTAACTTTCTGCTGACCAAAAAAAAATGGCATCAA
CTTAATAAAGAAGCTTCATCTAAAGTTTATCTAATACTTGGATCCATAATAGTTAAATTC
AAGAACTAGTTCTCAGGCTTGGGAGGGAGATTAAGATCCAAATCCAAGAACACGCGTGGA
CGTCTCTCTGAGCTTAGATCCATCACCACAGAGGACGAGTCCGACTCACTCCTCGCCGAC
TCTTCATCGAACACGATCACCCCAAACTTGACCTGAATCTTGGGGAAAGGGAATCTCGAA
TCAGCAAAGGAAAAACATCCGAGGTTGAAATCGGGTATCGAGGTTGGTGACTCGACGGTG
CTGCTCTGGCTAGGGCTCTCGTTGCCGCCGACAAAAAAAGGAAAAGGGAAGTTGGTTTTG
GCTTTAGCGCCACGGAACTGAAAAGCGGCTTTGTCGTAGGCACGAGCCGCTGCTTCGGGA
GTGTCGAAAGTGCCGAGCCAGACTCGGGTTTTCTTGGTCGGGTCTCTGATCTCGGCGGCG
TAACGACCCCATGGCCTCCTTCTCACTCCTCTGTAACGGTTCTCTTTGTTTCCGCCGTCG
CCGCCGTTGGGTTTAACTGTCGGTGCCATATCTAGTACAAAACTCTTATAATAAAAGTAT
TAAAAGAGGAGAGGGAAGTTTGGGGTGTTTGTGTTCC

QA 14 710 14 710
DS 



AS 1 2

CO CL7005Contig1 742 2 24 U
CGCTTGATGTGATTTCAATGCCAAATTGGAATCAAATTATGTTTGTAAAACATTGTAATC
AAAGTTACAGAAGGAAATATCAAGTGTCTACATAAACACAGTCCACATTGTTTCTTTGGT
TGCTGCTATATAGATGTTTCTGCAATGTAAAAATAAGATGGGATCACATCTGAGCAACCA
GATCCTCTCCATCTGCAGTAGTACTAGTAGTAACAGCACCTCCACCACTAAGCGAATTCT
CCATCCATCCCTTCAACATTTCCAACGCAGCTTTTGGATGGTCCATTGGAACCATGTGTC
CCGCATCGTGCACCTTGAGGAAACTGAGTTTTCCATAACTCTTCAACTTGCCAGCTTCTT
TACCATCAACCACAAAGGGAACTTCCTTACTCGCCTTAAAGTTCTCTTTCCCTGACCACT
CCATTGCATTCACCCACCTCGAGTTACCAAGCCAGTTGCAGATGAAATCATATTCTCCTG
CGTACACAAAAAGGTTGATTCCATCTTCCAAGAGCGTGGGAATCCCAACCTCGAGATTCC
TCATCCAGTCTTGTAGCATTGCCTGATAGACACTAGTACTACACGAGACAAACTCTATGT
CCCCAACACCAAGCGACTTCCTCACCGATTGCAGATTCAAGAATTTCTCCATGTTTGAGA
AGTCATAGCACAAACTCCCTTCGCACTTCTTCCTGATGTCGTAATGGTTTATTCCACCAG
CATGCTTCATTATACCAGTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS79JQ U 1
AF RR4FH39JQ U 9
BS 1 17 RR4CS79JQ
BS 18 18 RR4FH39JQ
BS 19 32 RR4CS79JQ
BS 33 33 RR4FH39JQ
BS 34 47 RR4CS79JQ
BS 48 48 RR4FH39JQ
BS 49 50 RR4CS79JQ
BS 51 51 RR4FH39JQ
BS 52 77 RR4CS79JQ
BS 78 82 RR4FH39JQ
BS 83 155 RR4CS79JQ
BS 156 156 RR4FH39JQ
BS 157 211 RR4CS79JQ
BS 212 212 RR4FH39JQ
BS 213 232 RR4CS79JQ
BS 233 233 RR4FH39JQ
BS 234 255 RR4CS79JQ
BS 256 256 RR4FH39JQ
BS 257 361 RR4CS79JQ
BS 362 362 RR4FH39JQ
BS 363 587 RR4CS79JQ
BS 588 588 RR4FH39JQ
BS 589 735 RR4CS79JQ
BS 736 742 RR4FH39JQ

RD RR4CS79JQ 741 0 0
CGCTTGATGTGATTTCAGTGCCAAATTGGAATTAAATTATGTTTGTACAATATTGTAATC
AAAGTTACAGAAGGAAA*****AGTGTCTACATAAACACAGTCCACATTGTTTCTTTGGT
TGCTGCTATATAGATGTTTCTGCAATGTAAAAATACGATGGGATCACATCTGAGCAACCA
GATCCTCTCCATCTGCAGTAGTACTAGTAGTTACAGCACCTCCACCACTAAGTGAATTCT
CCATCCATCCCTTCAGCATTTCCAACGCAGCTTTTGGATGGTCCATTGGAACCATGTGTC
CCGCATCGTGCACCTTGAGGAAACTGAGTTTTCCATAACTCTTCAACTTGCCAGCTTCTT
TCCCATCAACCACAAAGGGAACTTCCTTACTCGCCTTAAAGTTCTCTTTCCCTGACCACT
CCATTGCATTCACCCACCTCGAGTTACCAAGCCAGTTGCAGATGAAATCATATTCTCCTG
CGTACACAAAAAGGTTGATTCCATCTTCCAAGAGCGTGGGAATCCCAACCTCGAGATTCC
TCATCCAGTCTTGTAGCATTGCCTGATAGACACTAGTACTACACGAGGCAAACTCTATGT
CCCCAACACCAAGCGACTTCCTCACCGATTGCAGATTCAAGAATTTCTCCATGTTTGAGA
AGTCATAGCACAAACTCCCTTCGCACTTCTTCCTGATGTCGTAATGGTTTATTCCACCAG
CATGCTTCATTATAC
AGTGAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4FH39JQ 734 0 0
GTGATTTCAATGCCAAATTGGAATCAAATTATGTT*GTAAAACATTGTAATCAA*GTTAC
AGAAGTAAATATCAAGTGTTTACATAAACACAGTCCACATTGTTTCTTTGGTTGCTGCTA
TATAGATGTTTCTGCAATGTAAAAATAAGATGGGATCACATCTGAGCAACCAGATCCTCT
CCATCTGCAGTAGTACTAGTGGTAACAGCATCTCCACCACTAAGCGAATTCTCCATCCAT
CCCTTCAACATTTCCAACGCAGCTTTTGGCTGGTCCATTGGAACCATGTGTCCCGCATCG
TGCACCTTGAGGAAACTGAGTTTTCCATAACTCTTCAACTTGCCAGCTTCTTTACCATCA
ACCACAAAGGGAACTTCCTTACTCGCCTTAAAGTTCTCTTTCCCTGACCACTCCATTGCA
TTCACCCACCTCGAGTTACCGAGCCAGTTGCAGATGAGATCATATTCTCCTGCGTACACA
AGAAGGTTGATTCCATCTTCCAAGAGCGTGGGAATCCCAACCTCGAGATTCCTCATCCAG
TCTTGTATCATTGCCTGATAGACACTAGTACTACACGAGACAAACTCTATGTCCCCAACA
CCAAGCGACTTCCTCACCGATTGCAGATTCAAGAATTTCTCCATGTTTGAGAAGTCGTAG
CACAAACTCCCTTCGCACTTCTTCCTGATGTCGTAATGGTTTATTCCACCAGCATGTTTC
ATTATACCAGTGAA

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL7006Contig1 891 2 4 U
GAAACTCTCTGATTGCTCATCAACAAATCCTGAAGAATCTGGTATATATATTGGCCAAAG
CATGAAAAAAATGTTGTTTGTATAATTCAGTAGCCCCATGCTAGTTCAGTTGAGTAGTGA
CGTATCTTTGCAATGTCTCTCTCCAGAGATTTTTATCGTGGAAGGAGATTCTGCTGGTGG
CAGTGCAAAACAGGGACGTGACAGACGTTTTCAGGCAATTCTTCCGTTGAGAGGTAAGAT
TCTGAACATTGAAAGAAAGGATGAAGCAGCCATGTATAAGAATGAAGAGATTCAAAATCT
GATTCGTGCCCTTGGCCTTGGTGTAAAGGTGATAGATATATCCATCTCATGTTTTTTCCT
TTCTTCTCTTTTGTATTTTTTTTTTTGGAAAAACACAAATGCGATAAACAAGTGTTTTTT
TTTTCAGGGAGAAGATTTCAAGTTGGAGAAGTTGCGGTACCACAAGATTATCATCTTAAC
AGACGCAGATGTTGATGGTGCACATATCCGGACGCTTCTGTTTACCTTTTTCTTCAGATA
CCAGGTAACTTAGTTTAGGATAGTTGGTTGAGTTTATCTATATTAGTTGTTAACTTAACT
TCAATATTTTTTTTTTTTTGACAGAGAGCCTTGTTTGATGCTGGTTGCATATATGTTGGT
ATTCCACCTCTTTTCAAGGTAAAATATATATATCTATATTATGATCTTCAGACCATGTTG
TGTGTTTAGATCCCTTTAAATGTTTTTTCTTATTGAAAAAAACGACCAGGTTGAGAGGGG
AAAGCAAGCACAATATTGCTATGACGATGCAGACCTTAAAAAGATTACAGCAGACTTCCC
TGCAAATGCATCCTACACCATTCAAAGGTTCAAAGGTAAAATGTTCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ90TF U 1
AF RR4EQ90JQ C 90
BS 1 739 RR4EQ90TF
BS 740 740 RR4EQ90JQ
BS 741 761 RR4EQ90TF
BS 762 891 RR4EQ90JQ

RD RR4EQ90TF 761 0 0
GAAACTCTCTGATTGCTCATCAACAAATCCTGAAGAATCTGGTATATATATTGGCCAAAG
CATGAAAAAAATGTTGTTTGTATAATTCAGTAGCCCCATGCTAGTTCAGTTGAGTAGTGA
CGTATCTTTGCAATGTCTCTCTCCAGAGATTTTTATCGTGGAAGGAGATTCTGCTGGTGG
CAGTGCAAAACAGGGACGTGACAGACGTTTTCAGGCAATTCTTCCGTTGAGAGGTAAGAT
TCTGAACATTGAAAGAAAGGATGAAGCAGCCATGTATAAGAATGAAGAGATTCAAAATCT
GATTCGTGCCCTTGGCCTTGGTGTAAAGGTGATAGATATATCCATCTCATGTTTTTTCCT
TTCTTCTCTTTTGTATTTTTTTTTTTGGAAAAACACAAATGCGATAAACAAGTGTTTTTT
TTTTCAGGGAGAAGATTTCAAGTTGGAGAAGTTGCGGTACCACAAGATTATCATCTTAAC
AGACGCAGATGTTGATGGTGCACATATCCGGACGCTTCTGTTTACCTTTTTCTTCAGATA
CCAGGTAACTTAGTTTAGGATAGTTGGTTGAGTTTATCTATATTAGTTGTTAACTTAACT
TCAATATTTTTTTTTTTTTGACAGAGAGCCTTGTTTGATGCTGGTTGCATATATGTTGGT
ATTCCACCTCTTTTCAAGGTAAAATATATATATCTATATTATGATCTTCAGACCATGTTG
TGTGTTTAGATCCCTTTAA*TGTTTTTTCTTATTGAAAAAA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4EQ90JQ 802 0 0
GTAGCCCCATGCTAGTTCAGTTGAGTAGTGACGTATCTTTGCAATGTCTCTCTCCAGAGA
TTTTTATCGTGGAAGGAGATTCTGCTGGTGGCAGTGCAAAACAGGGACGTGACAGACGTT
TTCAGGCAATTCTTCCGTTGAGAGGTAAGATTCTGAACATTGAAAGAAAGGATGAAGCAG
CCATGTATAAGAATGAAGAGATTCAAAATTTGATTCGTGCCCTTGGCCTTGGTGTAAAGG
TGATAGATATATCCATCTCATGTTTTTTCCTTTCTTCTCTTTTGTATTTTTTTTTTTGGA
AAAACACAAATGCGATAAACAAGTGTTTTTTTTTTCAGGGAGAAGATTTCAAGTTGGAGA
AGTTGCGGTACCACAAGATTATCATCTTAACAGACGCAGATGTTGATGGTGCACATATCC
GGACGCTTCTGTTTACCTTTTTCTTCAGATACCAGGTAACTTAGTTTAGGATAGTTGGTT
GAGTTTATCTATATTAGTTGTTAACTTAACTTCAATATTTTTTTTTTTTTGACAGAGAGC
CTTGTTTGATGCTGGTTGCATATATGTTGGTATTCCACCTCTTTTCAAGGTAAAATATAT
ATATCTATATTATGATCTTCAGACCATGTTGTGTGTTTAGATCCCTTTAAATGTTTTTTC
TTATTGAAAAAAACGACCAGGTTGAGAGGGGAAAGCAAGCACAATATTGCTATGACGATG
CAGACCTTAAAAAGATTACAGCAGACTTCCCTGCAAATGCATCCTACACCATTCAAAGGT
TCAAAGGTAAAATGTTCAAACC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7007Contig1 630 2 5 U
GGTTGATTCATTGGATACTAGAAGTCAGCAATCTACAGTCAGGCAAGTCTATTATCGAAC
ATCAAACTAGACTCCCTTTTTTTTTTTTTTTGTTGAACAGTAATGTGTGCTTAATGTAGG
TTCTTGTTTGTTCGTTTCGTTCTTCAGGTAGTTTTAAGTCAGAGAGCTGCAAGCAGTTAT
TTCTCAAAACACGTTCCTTTTTTGATAACGTTTGTACAACAGACTTAAACACACTGTAGC
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AAAGTAAAAAGCCATCTGTGTTGTTTTGATGTTGGAATTGGCAGAAAGGGTATGCTGTCC
TTGATCTACAGAGACTAAACCCTACACAAGTTTAAAGACGGCAGTATCTCACTGCGGTCC
TTAAGGGGTTGTTTTACATTTTGCTTTGGTATAGTTATCGCCTTTTTAGGTATGCTCTTG
ACTCTTGTTGATCTTTTGATTCTTCAGTAGTTTATCTCTCAACCGCAGAGGAAGCACTTG
GAAGTTGCTTTTTGGGTTACATCATCCGTGCAGGTTAATCTTCTCTTTCATGTTGGTTTG
CTCCTCCAGATTTTTTTGTTCTCTAGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A976JQ U 243
AF RR4A976TF C 1
BS 1 242 RR4A976TF
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RD RR4A976JQ 284 0 0
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AAGGGGTTGTTTTACATTTTGCTTTGGTATAGTTATCGCCTTTTTAGGTATGCTCTTGAC
TCTTGTTGATCTTTTGATTCTTCAGTAGTTTATCTCTCAACCGC

QA 1 284 1 284
DS 

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TTCTTGTTTGTTCGTTTCGTTCTTCAGGTAGTTTTAAGTCAGAGAGCTGCAAGCAGTTAT
TTCTCAAAACACGTTCCTTTTTTGATAACGTTTGTACAACAGACTTAAACACACTGTAGC
AGTAAGAGCTTTTCACACTTTAAACTCTCCATCTTATTTATATAGTTTCTGATTTGGTTA
AGAGTAAAAAGCCATCTGTGTTGTTTTGATGTTGGAATTGGCAGAAAGGGTATGCTGTCC
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CTCCTCCAGATTTTTTTGTTCTCTAGCTAC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 0 0

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GTAGGATAATTGCTGTGACTGCTGATTGTGCATTTGATGCTCTGAATACGGCGTCTTTGC
TTGAAAAAGAAGTAGATGATGCGTCAAGTCGGTGGGAAGTGCACTTGAAAAGAAAGTTAA
TGCGTTGAAGAGACGGTTAGATGAAGTAGTTATCCCAGCAGCCAAAAGGGCAGATATCAA
AGCCAAGATTGCTCAACTTCAGAATGAAGTGAGAAAAGCTCAAAAGAAAGTAGCGGAGGA
AAACCTGAAGAAATCTGTCCAAGTAGCAACGGAGGCAGCTGAGTCTGCGGCATCAGATGA
CAAAACCTTCTGCATTGTCCAGATTGATGTGAGCCTTGATGCAGCAGCCGTTCGAGAAGC
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TTCGAACAAGGCGGTTGTGTGTGCTGGAGTTCCAGACAAGTCTGATCAGTTCAAGCAATT
AGACGTTATTGAATGGCTGACAACTGCGTTGGGTCCCATAAAAGGGAAATGCGGGAAAGG
GAAAAGTGGTCTCGCTTCGGGACAGGGAACGGATGTTTCTCAGGTGAGTGCGGCTTTGGA
CCTGGCGGCATCATTTGCGTCGATGAAGCTCAACTGATTTGGTCGGGACTCGGGAGATTT
CATTATCTGTTAGGGCAGAACTAACTTACTCATTTGATATCATTGTATACTCCCATTTAC
ATATCTAAGTTATCGTTGGATGTTGTATTTCCTTTAACTTGTCGTTTTACTATATTAACT
TATTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN22TF U 1
AF RR4DN22JQ C 26
BS 1 643 RR4DN22TF
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QA 1 706 1 706
DS 

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GCAACGGAGGCAGCTGAGTCTGCGGCATCAGATGACAAAACCTTCTGCATTGTCCAGATT
GATGTGAGCCTTGATGCAGCAGCCGTTCGAGAAGCCGTTTCAAAAGTCATGCAAAAGAAG
GGAATGTCGGTAATGGTTTTCAGCACAGATGAGAATTCGAACAAGGCGGTTGTGTGTGCT
GGAGTTCCAGACAAGTCTGATCAGTTCAAGCAATTAGACGTTATTGAATGGCTGACAACT
GCGTTGGGTCCCATAAAAGGGAAATGCGGGAAAGGGAAAAGTGGTCTCGCTTCGGGACAG
GGAACGGATGTTTCTCAGGTGAGTGCGGCTTTGGACCTGGCGGCATCATTTGCGTCGATG
AAGCTCAACTGATTTGGTCGGGACTCGGGAGATTTCATTATCTGTTAGGGCAGAACTAAC
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TATTTCCTTTAACTTGTCGTTTTACTATATTAACTTATTACTCC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL7010Contig1 614 2 1 U
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AGCTGAACTCAGGCAAGGTGATAGCAGTGGGGCCCGGTTCGAGAGATAATGACGGGAAAT
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AGGTCAAGCTCGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGTGACGAGGATGTCTTGGGAACCT
TGCACGAGGATTGACAAGGCTAACTGGCTAAGCCAGTGTTCTTTCTTGTTGGCTTTTATA
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TTCCAAATGAGCATCAGTCTTGTGATTCTTAGCTTCTTTTTTTTGTGCGTGTGTTTTCCT
TGGACTGATGACGGCTTTGATTGAGCTTGCGTTTTCTTGATCAATCTATATTACTATAGC
TAAAGGTTTTATTC


BQ
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AF RR4FH21JQ C 1
AF RR4FH21TF U 1
BS 1 614 RR4FH21TF

RD RR4FH21JQ 614 0 0
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TAAAGGTTTTATTC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4FH21TF 614 0 0
GTGGAGTGAGAGAAGAAATGATGAAGCGTCTGGTCCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGC
AGAGAGTCATCCACCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTTCTCCCCGAGAAAGCCTCCA
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TGATTCCGGTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCGGAATACGGCGGTACTG
AGGTCAAGCTCGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGTGACGAGGATGTCTTGGGAACCT
TGCACGAGGATTGACAAGGCTAACTGGCTAAGCCAGTGTTCTTTCTTGTTGGCTTTTATA
AGAAACAAGTCGTTTATTTATAAGTTAATTATCCTTGAAGATGTGGTCGGATATTGTCGT
TTGTTTAATTGAAATTTTACGTTAATGGACTAATCTTGATCCCTTTCGAATTGTTCCGGT
TTCCAAATGAGCATCAGTCTTGTGATTCTTAGCTTCTTTTTTTTGTGCGTGTGTTTTCCT
TGGACTGATGACGGCTTTGATTGAGCTTGCGTTTTCTTGATCAATCTATATTACTATAGC
TAAAGGTTTTATTC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL7011Contig1 824 2 2 U
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GTAGAGAAACTCATGTTTACAACTTTGTACCTTTCCAAAATTGC


BQ
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AF RR4F011TF U 1
AF RR4F011JQ C 454
BS 1 644 RR4F011TF
BS 645 824 RR4F011JQ

RD RR4F011TF 644 0 0
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AATCAAATCTGTTATTAATCAACAAACTGAGGAATACAACCTGCGGAGGAAATGGAATAA
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TCCCAATGTCTTTCAGGTGCTGACTGCTCTCGCAAATGTCTTTGCCAATGGGTTTGAATC
CGTTCATGGACAAACCGCTACAGATGTTTCAAACACATCCCAAG

QA 1 644 1 644
DS 

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TGCGGTTTTTGTATATGAAAGACGACTGTAGAGAAACTCATGTTTACAACTTTGTACCTT
TCCAAAATTGC

QA 1 371 1 371
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7013Contig1 817 2 2 U
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TTGCAAAATTTAGAGGTAACTTGTAAGTTTTCTTTTCTTGTATGGTTTAAATCTTGAAAA
TTGTTGTTTGGAGCTTTCTTGTGAAAGTAGTCATTGTAGGTAGTGTGAGATTGTCTGGTC
AACCTCATTTTTAACTTATCAGTATACCAAACTTCGTATTACAACTTACATAAAAATGGT
TACTAAATACTATAATTTCCTTCTGGAAATAAGATAAAAAGAATAATCTTTCAATACAAT
ATAATGATCACATAGACCTTCATACAAGACGTTGTTC


BQ
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AF RR4C885TF U 1
AF RR4C885JQ C 53
BS 1 637 RR4C885TF
BS 638 817 RR4C885JQ

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TAGTTTTACTAGTATTAACTTTTTTAAAAAATCACTAGGACTCCAGAAATATACAAAATG
CGAAAATCTTTTCTTGGAGGAAACAAATTGTCACATGCTGGTAACTCGATTTACAATGGT
TGTAGGCTTTTTGTGTTAATAACAGTAATATATTAATGGTTGTAGTTCCTTTAGAAGGTG
GTGGTATTTGATTTTGAACCAGCCATGTATAAGATGTAAAACGTGTTAAAAATATAACTT
GATCAAACGAAGTCATTAGTTAATCACCTAATCTACAAAACTAGTATATTAATTGTATTT
TTGTTTCCAAATATTCTGTGATCATCAACATTTGTTATATCAGTAAAAAAAAACATTTGT
TATCTCAAATATTTATGGTATATTTTTTATTTCGCTGTTCGTCATTATGCTACTTAATAT
TTGCAAAATTTAGAGGTAACTTGTAAGTTTTCTTTTCTTGTATGGTTTAAATCTTGAAAA
TTGTTGTTTGGAGCTTTCTTGTGAAAGTAGTCATTGT

QA 1 637 1 637
DS 

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GC
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TAGAAATAGTTTTACTAGTATTAACTTTTTTAAAAAATCACTAGGACTCCAGAAATATAC
AAAATGCGAAAATCTTTTCTTGGAGGAAACAAATTGTCACATGCTGGTAACTCGATTTAC
AATGGTTGTAGGCTTTTTGTGTTAATAACAGTAATATATTAATGGTTGTAGTTCCTTTAG
AAGGTGGTGGTATTTGATTTTGAACCAGCCATGTATAAGATGTAAAACGTGTTAAAAATA
TAACTTGATCAAACGAAGTCATTAGTTAATCACCTAATCTACAAAACTAGTATATTAATT
GTATTTTTGTTTCCAAATATTCTGTGATCATCAACATTTGTTATATCAGTAAAAAAAAAC
ATTTGTTATCTCAAATATTTATGGTATATTTTTTATTTCGCTGTTCGTCATTATGCTACT
TAATATTTGCAAAATTTAGAGGTAACTTGTAAGTTTTCTTTTCTTGTATGGTTTAAATCT
TGAAAATTGTTGTTTGGAGCTTTCTTGTGAAAGTAGTCATTGTAGGTAGTGTGAGATTGT
CTGGTCAACCTCATTTTTAACTTATCAGTATACCAAACTTCGTATTACAACTTACATAAA
AATGGTTACTAAATACTATAATTTCCTTCTGGAAATAAGATAAAAAGAATAATCTTTCAA
TACAATATAATGATCACATAGACCTTCATACAAGACGTTGTTC

QA 3 765 3 765
DS 



AS 1 2

CO CL7014Contig1 792 2 1 U
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CCGACGTCGTCTGCAAGGGTTTGAGGACAACCCGATGTGGTGACTCACTTGCTTTTAGGT
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TTCATACCCTTGTGTTCATTGCTCCGACGAGTTGACTTAGTGTTCCTTCGGGTCTACGTT
GTATCCTCTGTGTCGTGTGGGTGGTGTTGGAGCCTGTTGTACCACCTATGCTTGACCGTA
ACTCGAGCTTCCGTGTAAGCAGCGTGGATTCGGCTGAACTTTTTGTCTCTCTGTTGAGAT
TACTAGGATTTGTTGGTCGAGGTCCTCCTCCAGCGGAGCTCCGGAGCGTAAGCCAGGCGC
TCTGTTGATGCCTGCTGGAGCCACTTAGGTGAGTTCTCGACGAAATATCTCTGGTCATTC
TCTTGTTTAATCCGGTTAGTTTCAGGTTCAGCAAGAAAGCTTTGAATAGGGTGATTATAA
TGTTGTTCTGCTCGATCTTTGCCCTATTAATTTCAAGTTTTCTGTGTTTGAAGCTTGGAA
TTAATCTTATGTATCCTAGTGGTTTTTTAATTTTTTTGCGGTCACTAAGATCAAATCAAC
TGTTGCAGATTGTGGTTTCAATTAATTTTGTAACCGAATTTTCATTTTCATTAATGATAT
TTACCATTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AL28TF U 1
AF RR4AL28JQ C 130
BS 1 792 RR4AL28TF

RD RR4AL28TF 792 0 0
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CCGACGTCGTCTGCAAGGGTTTGAGGACAACCCGATGTGGTGACTCACTTGCTTTTAGGT
GGGGTTCTTCATCGTCTCTGGACTGTCTGTTTTCAAGGAGAGTTATGCCTCCTTCTGTGC
TTCATACCCTTGTGTTCATTGCTCCGACGAGTTGACTTAGTGTTCCTTCGGGTCTACGTT
GTATCCTCTGTGTCGTGTGGGTGGTGTTGGAGCCTGTTGTACCACCTATGCTTGACCGTA
ACTCGAGCTTCCGTGTAAGCAGCGTGGATTCGGCTGAACTTTTTGTCTCTCTGTTGAGAT
TACTAGGATTTGTTGGTCGAGGTCCTCCTCCAGCGGAGCTCCGGAGCGTAAGCCAGGCGC
TCTGTTGATGCCTGCTGGAGCCACTTAGGTGAGTTCTCGACGAAATATCTCTGGTCATTC
TCTTGTTTAATCCGGTTAGTTTCAGGTTCAGCAAGAAAGCTTTGAATAGGGTGATTATAA
TGTTGTTCTGCTCGATCTTTGCCCTATTAATTTCAAGTTTTCTGTGTTTGAAGCTTGGAA
TTAATCTTATGTATCCTAGTGGTTTTTTAATTTTTTTGCGGTCACTAAGATCAAATCAAC
TGTTGCAGATTGTGGTTTCAATTAATTTTGTAACCGAATTTTCATTTTCATTAATGATAT
TTACCATTTAGC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4AL28JQ 663 0 0
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CATCGTCTCTGGACTGTCTGTTTTCAAGGAGAGTTATGCCTCCTTCTGTGCTTCATACCC
TTGTGTTCATTGCTCCGACGAGTTGACTTAGTGTTCCTTCGGGTCTACGTTGTATCCTCT
GTGTCGTGTGGGTGGTGTTGGAGCCTGTTGTACCACCTATGCTTGACCGTAACTCGAGCT
TCCGTGTAAGCAGCGTGGATTCGGCTGAACTTTTTGTCTCTCTGTTGAGATTACTAGGAT
TTGTTGGTCGAGGTCCTCCTCCAGCGGAGCTCCGGAGCGTAAGCCAGGCGCTCTGTTGAT
GCCTGCTGGAGCCACTTAGGTGAGTTCTCGACGAAATATCTCTGGTCATTCTCTTGTTTA
ATCCGGTTAGTTTCAGGTTCAGCAAGAAAGCTTTGAATAGGGTGATTATAATGTTGTTCT
GCTCGATCTTTGCCCTATTAATTTCAAGTTTTCTGTGTTTGAAGCTTGGAATTAATCTTA
TGTATCCTAGTGGTTTTTTAATTTTTTTGCGGTCACTAAGATCAAATCAACTGTTGCAGA
TTGTGGTTTCAATTAATTTTGTAACCGAATTTTCATTTTCATTAATGATATTTACCATTT
AGC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL7015Contig1 1086 2 2 U
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GTGCTTGTCCACGGGATCTGCCACGGCGCATGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCTC
GAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAGTAGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAACC
AGATTGGAAGAGATTCAAACACTAGAGGATTACTGCAAACCGTTGCTTGATGTTCTGAGC
TCGCCTGATGAAGATAAGGTGGTTCTCGTTGCTCATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGCG
TTTGCAGCTGACACCTTCCCTCATAAGATCGCTGCTATGGTCTTTGTGACATCGTTCATG
CCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCAAAAATGTAAATTATTAAATGATGATT
GTATTACAGGGTATCATCTCTTCTTACGAGTGATTTTCTGATAGATACTGAGTGAAATAT
GCAGATCAGGCCGAGCATGTCACCGCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAAGCTATGG
GAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAAGAATTT
GTATCAACTTTCACCAGTCGAGGTAAGTCTCCTAAGTCCTAAGCTTCTCTTTTTAAAGCG
ACAAACAAGAGTTTGCTAGTAACCTTTTTATTTGTTTAGGATCTTGAATTGGCGAAAACG
CTGGTGAGGGTAAACCCATCAGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTCACTGAG
GAAGGGTACGGATCTGTTACGCGTATCTACATCACATGCGGAAAGGATAATGTGATACGT
AATGATTACCAGCGTTGGATGATCAACAACTTTCCGGTAAAAGAAGTAATGGAAATCAAA
GCTGCGGATCATATGCCAATGAACTCCAAGCCTCGAGAACTCTGTGCTCGTCTCTTGGAG
ATTGCACATAGATATGCATGAATAAAAAAACATGAGATTGATTGCACATATATATGCATG
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ACTACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4D360TF U 1
AF RR4D360JQ C 475
BS 1 647 RR4D360TF
BS 648 1086 RR4D360JQ

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CCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCAAAAATGTAAATTATTAAATGATGATT
GTATTACAGGGTATCATCTCTTCTTACGAGTGATTTTCTGATAGATACTGAGTGAAATAT
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GAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAAGAATTT
GTATCAACTTTCACCAGTCGAGGTAAGTCTCCTAAGTCCTAAGCTTC

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DS 

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CTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAA
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AAAGCGACAAACAAGAGTTTGCTAGTAACCTTTTTATTTGTTTAGGATCTTGAATTGGCG
AAAACGCTGGTGAGGGTAAACCCATCAGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTC
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TTGGAGATTGCACATAGATATGCATGAATAAAAAAACATGAGATTGATTGCACATATATA
TGCATGCTAAAGACTTTATGCACAATGTAGATATTACACTTTTTATAATGCTACAATAAA
CGATTTACTACG

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL7016Contig1 860 2 1 U
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ACCAATACTCGGGCCATTTTCACTGCGAGAAAACACGAAGACCGGCCTCTAAATCCTCCA
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TCTCGGTCGTCTCTCTCTCAATCACTGAAGCTATCTCCTGCAGGGTGCAAGACTCATGCA
GCTTGAAACCATAGAAGAGAGTGTCCTCTCCCTGGCTGTTCATCTTGATGTGAAGTATCT
GCGCCAGTTCCTTTGCACTGAAGTCGCTGAAGCTGAAAAACTTTGTGACCCTTCTGCAAA
ACCCTTCGTTAGATGCAATCACACGCTTCATCGGCTCGCTGTATCCGGCGAATATCACCG
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TGTCGTCTGCCTTTTGCATTGGGATCAACCTGTATGCTTCATCCACAAAGAGGATTCCTC
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CCAAGTCTGTGCGCTGAACTTCTGTTACCTTGGTTGGTAAGATTCCAACAGTGTGAAGCA
ACTTCCCGAGAACTCGAGCA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AX21JQ U 2
AF RR4AV78JQ U 1
BS 1 860 RR4AV78JQ

RD RR4AX21JQ 666 0 0
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TGCGAAACATAAAGAATATGATATGTAAAGAATTGAATCAATACAATTTTGTAATACTAA
CCAATACTCGGGCCATTTTCACTGCGAGAAAACACGAAGACCGGCCTCTAAATCCTCCAA
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CTCCCTTGCGTTAACCAGCAACGTGTCCACCAACCCTCCGTTCATCTCCTTCCTCTTCTT
CTCGGTCGTCTCTCTCTCAATCACTGAAGCTATCTCCTGCAGGGTGCAAGACTCATGCAG
CTTGAAACCATAGAAGAGAGTGTCCTCTCCCTGGCTGTTCATCTTGATGTGAAGTATCTG
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CCCTTCGTTAGATGCAATCACACGCTTCATCGGCTCGCTGTATCCGGCGAATATCACCGC
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GTCGTC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4AV78JQ 860 0 0
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TTGCGAAACATAAAGAATATGATATGTAAAGAATTGAATCAATACAATTTTGTAATACTA
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ACCTGATGGTACAAATCTCTTCAGTGTCAACACAATCAAAGCTAAGTCGGAGATCAAGAT
TCTCCCTTGCGTTAACCAGCAACGTGTCCACCAACCCTCCGTTCATCTCCTTCCTCTTCT
TCTCGGTCGTCTCTCTCTCAATCACTGAAGCTATCTCCTGCAGGGTGCAAGACTCATGCA
GCTTGAAACCATAGAAGAGAGTGTCCTCTCCCTGGCTGTTCATCTTGATGTGAAGTATCT
GCGCCAGTTCCTTTGCACTGAAGTCGCTGAAGCTGAAAAACTTTGTGACCCTTCTGCAAA
ACCCTTCGTTAGATGCAATCACACGCTTCATCGGCTCGCTGTATCCGGCGAATATCACCG
CGATTTTCCCCGTGTCCATGACCGACATTATTTCTTCCAGAGCTTCTAGACCGTAGTCCT
TGTCGTCTGCCTTTTGCATTGGGATCAACCTGTATGCTTCATCCACAAAGAGGATTCCTC
CCTCAGCTTCTTGGATCTTTCTCCTGGTCTTTGGCCCTGTATGACCAACAAACTCACCAA
CCAAGTCTGTGCGCTGAACTTCTGTTACCTTGGTTGGTAAGATTCCAACAGTGTGAAGCA
ACTTCCCGAGAACTCGAGCA

QA 1 860 1 860
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGTTCGAATAACATTCGGTTTGTGACGCCTCTCCAATAATCTGAATTTTTCTCGGTTGAT
AAAATGTGATTTGAAAGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AT17TF U 1
AF RR4AT17JQ C 1
BS 1 624 RR4AT17TF
BS 625 681 RR4AT17JQ

RD RR4AT17TF 624 0 0
GGAGAAGCAAAGTCTTTGGTTCGATATTCTCTATAACCGCTTACTCTCTCTACTCTGGTC
TTCGTCAAATCTCAAAAGAGAAATGCTATATTGATGTCTCTTCAACGACCCAATGGGAAC
TCGAGTTCTTGTTCTTCCCCCAAGAAGCAAAAAACTGAGGAGAGTGATGAAGAGTTGTTG
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GGAGTCAACAATCCGGAGACTGAACAGACCCAAAATGAAACCTCCAACGCTAAGCGCCGC
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TGTTCGAATAACATTCGGTTTGTG

QA 1 624 1 624
DS 

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GGAGTCAACAATCCGGAGACTGAACAGACCCAAAATGAAACCTCCAACGCTAAGCGCCGC
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CATTGAGAGGAGCAACCTTCAATTAATTCAATGTTGCGTGATTTTTCTGTATACGATTTT
TGTTCGAATAACATTCGGTTTGTGACGCCTCTCCAATAATCTGAATTTTTCTCGGTTGAT
AAAATGTGATTTGAAAGTTGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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GATCTAGATATCAAATCTCCTAATAAATCTGGGCAAAATTTCAAGTCAGCGGAGGATATG
ATAGAAATGTATAAAGAACTTTGTGCTGAGTATCCAATTGTGTTTATAGAAGACCCGTTT
GACAAGGAAGATTGGGAACACACCAAGCATTTTTCCGGTCTCGGAATATGTCAGGTGGTA
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TCTGTTTGCAAGTTTGAAGAACAAAACAAGAAGAAAGTTGTAAACCTTTTTTTTCTCAAA
TTGCAAAACCAGTCGAACTTGTTTTTCACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ33TF U 1
AF RR4AQ33JQ C 89
BS 1 698 RR4AQ33TF
BS 699 930 RR4AQ33JQ

RD RR4AQ33TF 702 0 0
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GACAAGGAAGATTGGGAACACACCAAGCATTTTTCCGGTCTCGGAATATGTCAGGTGGTA
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CAAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4AQ33JQ 842 0 0
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AGTATAACCAGTTGCTTCGGATTGAGGAAGAGCTTGGGGAGCAAGCTGTGTATGCTGGAG
AAGACTGGAGGCAAACACTCTAAACAAGTGAACCGTGTGATATATAACTGTGACATTTTT
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CC

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AS71TF U 1
AF RR4AS71JQ C 192
BS 1 813 RR4AS71TF
BS 814 950 RR4AS71JQ

RD RR4AS71TF 822 0 0
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GATTTATGTTTTCCTCTTTACTCCCATTAATTCGCTCCCCCACGATGTGCGTTCAAAGCA
TTCTTCGATCTGAAAGGCGGTGTGGTTACTGTATAAATAGATGTGAGATTTATCCTTTCG
AACTCATCTTCTCTTCGTATCCCATAAAAGATACATTCGATTCAAATTGATCAAGCCTTC
TATTCTCCCTGACCGTATTTTCCTGTTGTTGTTCGACGGCTTTTACTATTCGTTTCACAG
ACAAAACTGTTTTCGTTAACCTGACTGAACCGTCTGTACCGATCCCAAAGGAGTGCTTCC
GGTTCTGTAATTACCAGCAACATATGACTCAGAGTACACAACACATGATGATCACCCTGA
GCCTTGAAAGACCTGCTTAGTAGGGGTCATGAACTGATGAACCAAAGGTGGTGGTTGCCA
CAGACATCAACCCTAAGTTAGTCGGCGGTCAACCCTTCCTCAATGCAACCTCCGATGGCC
TTAAGGGCACTGCCGTGGAGGATGGTGGCTTTGTTTCTTATGGTGATGCAGCATGTGGGA
GTGGTGAGCCAGTTTATCCAAGTAAGACCTCTGTTGATGGAAGGTCCAACAGCGAGGAAG
GAACAGAGCATGCAAGTGGGGTAGCTTTGGAAAGAAGCCACGCACTGAGTAATTTCTGAA
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TAAACTTCTTTAACACTACGAAGTCTACTTCAA
TATTTTGGG

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DS 

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ACCGTATTTTCCTGTTGTTGTTCGACGGCTTTTACTATTCGTTTCACAGACAAAACTGTT
TTCGTTAACCTGACTGAACCGTCTGTACCGATCCCAAAGGAGTGCTTCCGGTTCTGTAAT
TACCAGCAACATATGACTCAGAGTACACAACACATGATGATCACCCTGAGCCTTGAAAGA
CCTGCTTAGTAGGGGTCATGAACTGATGAACCAAAGGTGGTGGTTGCCACAGACATCAAC
CCTAAGTTAGTCGGCGGTCAACCCTTCCTCAATGCAACCTCCGATGGCCTTAAGGGCACT
GCCGTGGAGGATGGTGGCTTTGTTTTTTATGGTGATGCAGCATGTGGGAGTGGTGAGCCA
GTTTATCCAAGTAAGACCTCTGTTGATGGAAGGTCCAACAGCGAGGAAGGAACAGAGCAT
GCAAGTGGGGTAGCTTTGGAAAGAAGCCACGCACTGAGTAATTTTTGAAATACAA*GGGA
AACTTAAGTTACAAGTTTTGCTGGTATGTCCGTAGCATCAGTTTTTAAATAAACTTCTTT
AACACTACGAAGTCTACTTCAAATATTTTGGATATTTGGTTCTGTTAGTTTTTTTTTTTT
TTACAATTCCATTGTTTCCAACTCTATTAATAAGCAATTCATGCTTACATCGTGCTTCAT
CAACCATGCAGCTTATTTTTTAAAAAAAATATTTTCAGG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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TCTCTCAGATAACCCTAAAGCTCTCAACTTTCCTGAGAAAACTCTTCTCTATCGCTCAAT
CTCGATTCAATTATGTCGAACCCAGCTGAATCTTCAGACTCGAAATCGAAGAAAGACTTC
AGTACTGCTATTCTGGAGAGGAAGAAGTCTCCGAACAGACTTGTCGTCGATGAGGCAATC
AACGATGATAACTCCGTTGTTTCTCTCCACCCTGCCACCATGGAGAAGCTCCAGCTCTTC
CGTGGTGATACCATTCTCATCAAGGGTAAGAAGAGGAAGGACACTGTGTGCATTGCTCTT
GCTGATGAATCATGTGAGGAGCCAAAGATCAGGATGAACAAAGTAGTCAGGTCTAACTTG
AGAGTTAGACTCGGAGATGTCATCTCTGTTCACCAGTGCCCTGATGTCAAGTACGGGAAG
CGTGTTCACATCTTGCCTGTTGATGATACCGTTGAAGGAGTCACTGGAAACCTCTTTGAT
GCTTACCTCAAACCTTATTTCTTGGAGGCATACCGCCCGGTGAGGAAGGGAGATCTCTTC
CTGGTGAGAGGAGGAATGAGGAGTGTGGAGTTCAAGGTTATTGAGACAGATCCTGCTGAG
TACTGTGTTGTTGCTCCGGACACCGAGATTTTCTGTGAGGGTGAACCGGTCAAGAGGGAG
GACGAGGAAAGGCTAGACGAAGTGGGTTATGATGATGTTGGTGGTGTCAGGAAGCAGATG
GCTCAGATCAGGGAGCTTGTTGAGCTTCCCTTGAGGCATCCACAGCTGTTCAAGTCGATT
GGTGTTAAGCCACCGAAGGGGATCCTGCTCTACGGACCTCCTGGGTCCGGAAAGACTTTG
ATTGCTCGTGCCGTAGCTAACGAAACCGGTGCCTTTTTCTTCTGTATCAATGGTCCTGAG
ATCATGTCGAAGCTGGCTGGTGAGAGTGAGAGTAACCTCAGGAAAGCGTTTGAGGAGGCT
GAGAAGAACGCTCCTTCGATCATATTTATTGATGAGATTGACTCTATTGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B709TF U 1
AF RR4B709JQ C 288
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BS 769 1074 RR4B709JQ

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GCTGATGAATCATGTGAGGAGCCAAAGATCAGGATGAACAAAGTAGTCAGGTCTAACTTG
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GACGAGGAAAGGCTAGACGAAGTGGGTTATGATGATGTTGGTGGTGTC

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DS 

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AAACCTCTTTGATGCTTACCTCAAACCTTATTTCTTGGAGGCATACCGCCCGGTGAGGAA
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AGATCCTGCTGAGTACTGTGTTGTTGCTCCGGACACCGAGATTTTCTGTGAGGGTGAACC
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GTTCAAGTCGATTGGTGTTAAGCCACCGAAGGGGATCCTGCTCTACGGACCTCCTGGGTC
CGGAAAGACTTTGATTGCTCGTGCCGTAGCTAACGAAACCGGTGCCTTTTTCTTCTGTAT
CAATGGTCCTGAGATCATGTCGAAGCTGGCTGGTGAGAGTGAGAGTAACCTCAGGAAAGC
GTTTGAGGAGGCTGAGAAGAACGCTCCTTCGATCATATTTATTGATGAGATTGACTCTAT
TGCACCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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TGATGAGGCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DN45TF C 1
AF RR4DN45JQ U 5
BS 1 4 RR4DN45TF
BS 5 670 RR4DN45JQ

RD RR4DN45TF 670 0 0
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AAGAGATAGAGAACTTATTTGGTGAAGCCTCCTCCTTCATCAGTTGTTAACTTAGAGATC
TCCTTTCTAAACTTCAACGGAGGCTAACGAATAACTATAAACCACTTTACCACCGACCCG
ACCAGGACTGGACTTTGTTTTGCTTCTGTTTTTTCTTTTTATCACAATACCAATTGCAAC
ATTTTGACTTACGGTGTGCGACTCACTCACCTTGCTTGTGAGTTGTCATGGGTGTATACA
GAGACGAATGAGTCCGCAGCTCCAGCTGCAAGTAGAACCTGGTACGGATGAAAAGTGAGG
CAACTCACTGAACCAATCTTCTGGGCCATGAAGGATGGGTAGTAGCGGATTATCCCCAGT
TGTTCTCCCTGAAGGCTGAACACTTTAATTAGCTGCTTTGCAGATCCGCTCGCAATTATT
GGAGCGTGTCTGTGAACAGCTAAGGCCGTGAGCGAGCCCCTGTGTGCATCAATCGTCAGG
TATGTGTCCTTTGTTGTTCTGAGGTCAAGGAACTGTATGTCACCGGCCTGTGATGTACTC
ACCACCTTTGCGAGATCAAGTCCAGGCAGGAAACTGAGTCCAATTACTCTTTCAACTTTC
TGATGAGGCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4DN45JQ 666 0 0
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GATAGAGAACTTATTTGGTGAAGCCTCCTCCTTCATCAGTTGTTAACTTAGAGATCTCCT
TTCTAAACTTCAACGGAGGCTAACGAATAACTATAAACCACTTTACCACCGACCCGACCA
GGACTGGACTTTGTTTTGCTTCTGTTTTTTCTTTTTATCACAATACCAATTGCAACATTT
TGACTTACGGTGTGCGACTCACTCACCTTGCTTGTGAGTTGTCATGGGTGTATACAGAGA
CGAATGAGTCCGCAGCTCCAGCTGCAAGTAGAACCTGGTACGGATGAAAAGTGAGGCAAC
TCACTGAACCAATCTTCTGGGCCATGAAGGATGGGTAGTAGCGGATTATCCCCAGTTGTT
CTCCCTGAAGGCTGAACACTTTAATTAGCTGCTTTGCAGATCCGCTCGCAATTATTGGAG
CGTGTCTGTGAACAGCTAAGGCCGTGAGCGAGCCCCTGTGTGCATCAATCGTCAGGTATG
TGTCCTTTGTTGTTCTGAGGTCAAGGAACTGTATGTCACCGGCCTGTGATGTACTCACCA
CCTTTGCGAGATCAAGTCCAGGCAGGAAACTGAGTCCAATTACTCTTTCAACTTTCTGAT
GAGGCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL7023Contig1 1070 2 2 U
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CTGCTGCTTCTATGCCAACTTGTAGAGAACATGGGAGAGTCTAAGGGTTATGGGAAAGGA
GGAGGACGAATGATTCCAACCGACAAATCTGCAAATTCTTACAGCGTCTCCCTTAAGTTG
TCTCCAGTTGTTTCTTTTTGGGATTGTATTGTCCGCACCATGAGGTATATTCCTATATAT
CCGAGTGGGTGTAGTAGTAGTTCTTGACATCCCTTCACCACAGCATCAGCGAGTTTTTAG
TTCAGTTATCTTAGTTATAGATATATATAGAGAGAGAGAAAGCAAGCAAGTAATGGACCA
TCACGTGGTGTGCAAGCAAGTTCAGCCATTAGCTAGGAAAGGGAAGAAGAAACATAACGG
TAAAGATGAATTTGATCGTGTCAAACAAGCTGAGAAGAGAAGAGACGTCTCGAGAAAGCT
CTTGCTACTTCTGCTGCCATCAGGGCTGAGCTGGAAAAGAAGAAGCAGAGGAAGCTTGAA
GAGCAACAGAGGTTAGATGACGAAGGTGCTGCTATTGCAGAAGCTGCTGCTCTCCACGTC
CTACTGGGCGAAGACTCTGAAGATAATTTCTTGCTTGGAGAGGGAGAGTGTTACAAGATC
GATCTGTTTAGAGATCAAAGAACCAACTATGTTCCAAGGCAAAGTTGCGCGAGCTATGCG
GTTCAAGGGATTGGGCTTGACTCGAATGTCTATGAACGTGGAGATAGTAACTGGTCTGTG
CCTTTCATGAGGTGTGCTTGGGACAACAACAACAACAACATGGGAGTATCTGTGGATTTG
ATTGCTGCTCAGGCAGTCTCGTCGCTGCACATATCTGAGAACAATGATAGGAACGCTTTT
GTCTTCTTTAAATAAATTGTTTCAGGGATGATTATTGGCAGCTTGGTGCCAAATACAGCT
GCTATTGTTCTGCTTTCTTTTCTTGTAACACTGCAAAGTTTGTTCGGAGTTGTACACACA
TGATACCATTTTTAATTGTCATACCTAATGTCACATTTTTTCTCAAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT91TF U 1
AF RR4GT91JQ C 299
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RD RR4GT91TF 723 0 0
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CTACTGGGCGAAGACTCTGAAGATAATTTCTTGCTTGGAGAGGGAGAGTGTTACAAGATC
GATCTGTTTAGAGATCAAAGAACCAACTATGTTCCAAGGCAAAGTTGCGCGAGCTATGCG
GT
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4GT91JQ 772 0 0
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CGGTTCAAGGGATTGGGCTTGACTCGAATGTCTATGAACGTGGAGATAGTAACTGGTCTG
TGCCTTTCATGAGGTGTGCTTGGGACAACAACAACAACAACATGGGAGTATCTGTGGATT
TGATTGCTGCTCAGGCAGTCTCGTCGCTGCACATATCTGAGAACAATGATAGGAACGCTT
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CTGCTATTGTTCTGCTTTCTTTTCTTGTAACACTGCAAAGTTTGTTCGGAGTTGTACACA
CATGATACCATTTTTAATTGTCATACCTAATGTCACATTTTTTCTCAAAGCG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7024Contig1 610 2 1 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AI27JQ C 1
AF RR4AI27TF U 1
BS 1 610 RR4AI27TF

RD RR4AI27JQ 610 0 0
GAACTCTAACAAAAATTACATTTGTAATGATGATATTACGTTATTTTTAAATAAATCGAA
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TGAAATAAAAAAAAATACCATGATTAATAGGATTAATCATTAACTACATCTATATCTTAA
TTAATCCTTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTCTGCAGT
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TCGTAAACAACACCGAGGAAGACTAAAAGGAATATCCTCTCGTGGGAATCGTATTTGTTT
TGGCAGATATGCTCTTCAAACACTTGAACCCGCTTGGATTACATCTAGACAAATAGAAGC
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TCCAGACAAGCCAGTTACAGTAAGACCCGCGGAAACGCGTATGGGTTCTGGGAAAGGATC
CCCAGAGTACTGGGTAGCTGTGGTTAAACCAGGTAAAATCCTTTATGAAATGGGTGGTGT
ACCAGAAAAG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4AI27TF 610 0 0
GAACTCTAACAAAAATTACATTTGTAATGATGATATTACGTTATTTTTAAATAAATCGAA
ATAAAATTGATCTTTGATTCTATTTAAAAAAAGACATACACAAATTTAGAAGAGATAAGA
TGAAATAAAAAAAAATACCATGATTAATAGGATTAATCATTAACTACATCTATATCTTAA
TTAATCCTTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTCTGCAGT
AGAGATGGAATTTCTCATTTAGAAAAAACCCATCAACTATAACCCAAAAAGAACCAAATT
TCGTAAACAACACCGAGGAAGACTAAAAGGAATATCCTCTCGTGGGAATCGTATTTGTTT
TGGCAGATATGCTCTTCAAACACTTGAACCCGCTTGGATTACATCTAGACAAATAGAAGC
AGGGCGACGAGCAATGATACGAAATATACGACGTGGTGGAAAAATTTGGGTACGTATATT
TCCAGACAAGCCAGTTACAGTAAGACCCGCGGAAACGCGTATGGGTTCTGGGAAAGGATC
CCCAGAGTACTGGGTAGCTGTGGTTAAACCAGGTAAAATCCTTTATGAAATGGGTGGTGT
ACCAGAAAAG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7025Contig1 900 2 6 U
GATCCCATATACAGCTCAAGGATCTTTCCGCATGGGTTCTCTCGACTTGCCTCACGCTTC
ACCATTCAAGGGAGGAAGCGAAACATTTCTTAGGAACGTGTTTGAGAACATACTGAAGAC
GTATCTGAGGAAGAACCCGGCCGCGAAGACAATATGGGAACTGGTTCAATCGGTGGACAG
TGAGAAGATCTTCTATGATCACTTTACTTTCAGGACACTAAAGGTAGATGGATATGGAAT
AGATTCCTTGTCGAGTTTCTTCATGGATTATGGATAGTCACGGTATAGCCAACGGTCCTT
TGCCACGACTTGTTATAGCTGAGGTTCTTGTGGACGAACTAAACGTTGAATCGCAGCGAC
ATCAAATGTGTCAGAGAGTACCTTGAAGAAAAGGGATTCAAACTCAATAGTGACGGTGGA
ATTCTCAAAGTGAGTCAAGATGGTCTACTACTACAAGTCTCCTCCATATCGGAAAGGCTT
GCGGTTGAATTTTTTGATGGAGTAACTAAAATAATCCCGGCTTCATACATTGAGTTCACT
CAACGTCTAGTTCTTCCACAGTTCAAAGATATGCCAGTTGATGAGATCAAAGAATATCAT
AGACGTGAGGCCTTTGAACTCGATAGTGCTAACCACGCAATGGAAAGCTCACGTTTAGCA
ACACAATTCTAAAACCAAACTTGTCTTGTTCGGCTCCGTATGTCAAATTGGTGCACGTGT
GTGCTTGTATGCAATATGTTCGAATGTGTGAGTGTTTTCGATAAGATCTTTATGTTGTTC
TCTATTTTGGAGTGAACAATGTTATAGCGCGTGATGGTTATATATATCATTGATTAGTGA
CCAATTTGTAAACTGGATCATATGGTTGATGAATATGGTTTGTAATATTTGTTTGGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F716TF U 1
AF RR4F716JQ C 240
BS 1 273 RR4F716TF
BS 274 274 RR4F716JQ
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BS 326 900 RR4F716JQ

RD RR4F716TF 328 0 0
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ACCATTCAAGGGAGGAAGCGAAACATTTCTTAGGAACGTGTTTGAGAACATACTGAAGAC
GTATCTGAGGAAGAACCCGGCCGCGAAGACAATATGGGAACTGGTTCAATCGGTGGACAG
TGAGAAGATCTTCTATGATCACTTTACTTTCAGGACACTAAAGGTAGATGGATATGGAAT
AGATTCCTTGTCGAGTTTCTTCATGGATTATGG*TAGTCACGGTATAGCCAACGGTCCTT
TGCCACGACTTGT*ATAGCTGAGGT
CTT

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR4F716JQ 661 0 0
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TTGCCACGACTTGTTATAGCTGAGGTTCTTGTGGACGAACTAAACGTTGAATCGCAGCGA
CATCAAATGTGTCAGAGAGTACCTTGAAGAAAAGGGATTCAAACTCAATAGTGACGGTGG
AATTCTCAAAGTGAGTCAAGATGGTCTACTACTACAAGTCTCCTCCATATCGGAAAGGCT
TGCGGTTGAATTTTTTGATGGAGTAACTAAAATAATCCCGGCTTCATACATTGAGTTCAC
TCAACGTCTAGTTCTTCCACAGTTCAAAGATATGCCAGTTGATGAGATCAAAGAATATCA
TAGACGTGAGGCCTTTGAACTCGATAGTGCTAACCACGCAATGGAAAGCTCACGTTTAGC
AACACAATTCTAAAACCAAACTTGTCTTGTTCGGCTCCGTATGTCAAATTGGTGCACGTG
TGTGCTTGTATGCAATATGTTCGAATGTGTGAGTGTTTTCGATAAGATCTTTATGTTGTT
CTCTATTTTGGAGTGAACAATGTTATAGCGCGTGATGGTTATATATATCATTGATTAGTG
ACCAATTTGTAAACTGGATCATATGGTTGATGAATATGGTTTGTAATATTTGTTTGGGTT
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

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GTCTACTGTCGGAGAAGTTCCTTCATGCCAATCTAACCATCCCTTTTGCTAGCCCTGGTC
TGAATACTCCTTCTCTCCAAAAGTACAAAAGGATGGTTGATGCATGGGGAGGGTGGAATC
TATTCCAAGGTTTGCTTCGCACGATGAAAAGCATTGCCACAAAACATGGAGTTTCTATTC
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TGAGGCTAGGGTGAGCGGAACACATACAAGATGCAAACGCTATATTATCATTGGTATTGG
ATGATGAAGATGCGAATAGCATACAAGAGGCTACCAAGAAAGGTAAAAATCTTCTTCAAG
TGATTGGTGACTGTGGAGACGAGTACTGACGTGTAGAATACCGTTTACATGCATTCAAGA
CACAAGATCTGTGTTGGGATTCGTATATATGAGTTCAATACTTGACCAAATTTGAGATGG
TTTAAATGGAGGCATTACCCTATTTTGACTCGAACTGTTTCAAAAACTAAAATATGTATT
GTACTATTGT


BQ
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AF RR4DJ25JQ C 1
AF RR4DJ25TF U 1
BS 1 610 RR4DJ25TF

RD RR4DJ25JQ 610 0 0
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TATTCCAAGGTTTGCTTCGCACGATGAAAAGCATTGCCACAAAACATGGAGTTTCTATTC
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TGATTGGTGACTGTGGAGACGAGTACTGACGTGTAGAATACCGTTTACATGCATTCAAGA
CACAAGATCTGTGTTGGGATTCGTATATATGAGTTCAATACTTGACCAAATTTGAGATGG
TTTAAATGGAGGCATTACCCTATTTTGACTCGAACTGTTTCAAAAACTAAAATATGTATT
GTACTATTGT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4DJ25TF 610 0 0
GCACACATCATCGAAGGTCTTTTCGAGTGTAGATAACTAGATATGGGACAGTAATGGGTG
GTCTACTGTCGGAGAAGTTCCTTCATGCCAATCTAACCATCCCTTTTGCTAGCCCTGGTC
TGAATACTCCTTCTCTCCAAAAGTACAAAAGGATGGTTGATGCATGGGGAGGGTGGAATC
TATTCCAAGGTTTGCTTCGCACGATGAAAAGCATTGCCACAAAACATGGAGTTTCTATTC
CGACCGTGGCCGTGAGATACGTACTAGATCAGCAAGGAGTTGGCGGATCAATGATTGGGG
TGAGGCTAGGGTGAGCGGAACACATACAAGATGCAAACGCTATATTATCATTGGTATTGG
ATGATGAAGATGCGAATAGCATACAAGAGGCTACCAAGAAAGGTAAAAATCTTCTTCAAG
TGATTGGTGACTGTGGAGACGAGTACTGACGTGTAGAATACCGTTTACATGCATTCAAGA
CACAAGATCTGTGTTGGGATTCGTATATATGAGTTCAATACTTGACCAAATTTGAGATGG
TTTAAATGGAGGCATTACCCTATTTTGACTCGAACTGTTTCAAAAACTAAAATATGTATT
GTACTATTGT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7027Contig1 1122 2 2 U
GGAACATACACTTGACCAGAGAGAGTGAAAGAAGAAAAGATTTTTTAAAAAATGGCGACA
TTTAAGGTTTCTTCTTCGGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAGTTGAAAACCGCC
TTTGAAGGATGGGGTACCAACGAGGACCTGATCATATCAATCTTGGCGCACAGAAACGCG
GAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGACCTTCTCAAGAGTCTTGACAAGGAACTCTCAA
GCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGGACTATGGAGCCCGGCGAGCGTGATGCTTTAT
TGGCTAACGAAGCAACCAAAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGTGCTAATGGAAGTAGCTT
GCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCTTACCATGCTCGTTTCAAGA
AGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCGGCGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTT
CTCTTATCAACTCATACAGGTACGAAGGAGAGGAGGTGAACATGACATTGGCAAAGCAAG
AAGCTAAGATAATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAACGATGATGAGGTCATTA
GGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATG
CTCATGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATGGGGACGACAAGTTCCTTC
AACTGTTGAGGTCAACGATTCAGTGCTTGACAAGACCAGAGCTTTACTTTGTGGATGTTC
TTCGCTCTGCAATCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTCTCACTAGAATTGTGACTA
CAAGAGCTGAGATTGATTTGAAGGTTATTGGACAAGAGTTTCAGAGAAGGAACAGCATTT
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CTCTCTTTTTCTTGAAACCGTTTGATGTTGTTCTTTTAAAACTTTGTTTGTTTGTGTTTT
GAGTTTCCAAATAATGCAAAAGAGAGAAAAAAAAGAGGCTTT


BQ
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AF RR4DC72TF U 1
AF RR4DC72JQ C 509
BS 1 598 RR4DC72TF
BS 599 1122 RR4DC72JQ

RD RR4DC72TF 598 0 0
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TTTAAGGTTTCTTCTTCGGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAGTTGAAAACCGCC
TTTGAAGGATGGGGTACCAACGAGGACCTGATCATATCAATCTTGGCGCACAGAAACGCG
GAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGACCTTCTCAAGAGTCTTGACAAGGAACTCTCAA
GCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGGACTATGGAGCCCGGCGAGCGTGATGCTTTAT
TGGCTAACGAAGCAACCAAAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGTGCTAATGGAAGTAGCTT
GCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCTTACCATGCTCGTTTCAAGA
AGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCGGCGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTT
CTCTTATCAACTCATACAGGTACGAAGGAGAGGAGGTGAACATGACATTGGCAAAGCAAG
AAGCTAAGATAATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAACGATGATGAGGTCAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4DC72JQ 614 0 0
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GACAAGACCAGAGCTTTACTTTGTGGATGTTCTTCGCTCTGCAATCAACAAAACCGGAAC
AGACGAAGGAGCTCTCACTAGAATTGTGACTACAAGAGCTGAGATTGATTTGAAGGTTAT
TGGACAAGAGTTTCAGAGAAGGAACAGCATTTCTCTCGAGAAAGCCATTACCAAAGACAC
TCGTGGAGATTACGAGAAGATGCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAATCAA
ATCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTTTTCTTGAAACCGTTTGATGT
TGTTCTTTTAAAACTTTGTTTGTTTGTGTTTTGAGTTTCCAAATAATGCAAAAGAGAGAA
AAAAAAGAGGCTTT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AH46JQ C 1
AF RR4AH46TF U 1
BS 1 776 RR4AH46TF

RD RR4AH46JQ 776 0 0
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TCACAAATTCATGTATGCTGAGTGGTTTTCTGTACGAATATATGAATAGCTAGGAGAAAA
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QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4AH46TF 776 0 0
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TCACAAATTCATGTATGCTGAGTGGTTTTCTGTACGAATATATGAATAGCTAGGAGAAAA
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TGTAAAGTTTTAACATGATGTTTTGTTTGGACTATTAAGTGGTTATATTCCTTTTCGGTA
TGATATGGTTTTGATTCTTTAGTTTAGCATGCCACAAACGTCACTGGAGATGGAGAGTTT
GATAAACATCCCAGAGGATTCGGTGCCTTGGAAGGTCAGGGCCAAGCGTGGATGTGCTAC
TCACCCGCGCAGCATCGCTGAAAGGGAGAGAAGAACGAGAATAAGTGGGAAGCTGAAGAA
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AGCTGTTGAGCATATCAAAGGTCTTCAACACCATATAGAGTCGCTGGAAAAGGGGATGGA
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TGATCCAAGACAGTATGTAAGAAAAAGAGACTAAGTGAATCAATTTTTTTTTGAGC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL7029Contig1 631 2 2 U
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TACCGTCACTGCCGACAACGGAAAGTCTTTCACTTGCACAGTCCGCTTTGACACTGAGGT
TGAATTGGCATATTTCAACCATGGGGGCATTCTTCCATATGTCATCAGAAACTTGAGCAA
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TGGGAAATAATAAAAAAAAGCGTTTACAAGG


BQ
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AF RR4DX27JQ C 1
AF RR4DX27TF U 1
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QA 1 631 1 631
DS 

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TACCGTCACTGCCGACAACGGAAAGTCTTTCACTTGCACAGTCCGCTTTGACACTGAGGT
TGAATTGGCATATTTCAACCATGGGGGCATTCTTCCATATGTCATCAGAAACTTGAGCAA
GCAGCAGTCAGCGGTGAAAGGAACTGACAGAAATCTTTTTAAATAAAGAGAAGAGGATCT
TTACGCTCTGTTTTTCAAATGTCATTTAAAAAAAAAGGCGGATACGTCTGTCCGAGGATA
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QA 1 618 1 618
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4AV49TF U 1
AF RR4AV49JQ C 110
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BS 792 836 RR4AV49JQ

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TTTGTATAATT

QA 1 791 1 791
DS 

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CTGTCACCTGCGGGTACCTCAAAAAGAAATGTCGGAAAGTCAGGGTTCCCTCCGGAAACC
TCAAATGCTGGATATGACAGTGGGAAAAGAACTGGCGGCTGGACTTCATCATACATGTCT
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AGTCATGCCCTTGGAAGATTAAAAAAGGTGTTAGTGACACCAAGTTTTGATTTTTGCTGT
ATATTATTTGAGATGTGTGTGGACAGACAGGCAGCTATAGAGGATGGTGTTTTTCCATGA
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TTTAGTG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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TCCATCTTGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTC
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CGATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EJ89TF U 1
AF RR4EJ89JQ C 243
BS 1 559 RR4EJ89TF
BS 560 907 RR4EJ89JQ

RD RR4EJ89TF 559 0 0
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TGACTGACGAACACAAACACGACGAACCTGTAACCGTTTTCGGAGCCAGCTGTTGAGATT
GTGGAGAGGGAACCGCTGATGGACAAGATATCGGAGAAGCTCCACCACGGTGGTGGTTCG
TCGTCGTCAGATGACGAAGACGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTTCGGAGAGCTCTCCTTCT
TCGATGGAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTC
GGCGGTGGAAAACCGGCGGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTA
CTCGGTGGTGCTACAGCCGCTTGGGTTCTCTTTGAGTCGATGGAGTATCACCTTCTCACT
CTGCTCTGCCACGTCATGATTGTTGTGCTCGCTGTGTTGTTTCTCTGGTCTAACGCCACT
GTGTTTATTAACAAGTCTCCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATT
CTCCAGCTTGCGTCTGGGC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4EJ89JQ 665 0 0
GATGGAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGG
CGGTGGAAAACCGGCGGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTACT
CGGTGGTGCTACAGCCGCTTGGGTTCTCTTTGAGTCGATGGAGTATCACCTTCTCACTCT
GCTCTGCCACGTCATGATTGTTGTGCTCGCTGTGTTGTTTCTCTGGTCTAACGCCACTGT
GTTTATTAACAAGTCTCCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATTCT
CCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATCGAGATCAATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGAT
TGCCTCTGGGAGGGATCTCAAGAAGTTTGTTACGGCTATTGCTGGCTTGTGGGTTCTCTC
CATCTTGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTT
CACGGTGCCTCTTGCCTACGACAAGTATGAAGACAAAGTCGACCCGTTGGGTGAGAAAGC
AATGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCC
ATTGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAGGGATTAGGTTTTTACAGAAATTGTAATTCGTCG
ATAGC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7033Contig1 1114 2 2 U
GGAAACATGTACATTGCTAGGAGGAGGAATTTGAAACGCAAGACTGTGGCTGATGTTGTA
GAATCACTTATTGGTGCATATCTTAGCGAGGGAGGTGAACTAGCTGCGTTAGCGTTCATG
AACTGGGTCGGTATAAAAGTAGATCTCACTTCTACGGTGATCCAAAGAGAGCCATCAATA
CAAGCTGAGAAGCTTGTGAATGTAAGCTACATGGAGTCTCTGTTGAACTATAAATTCAAG
GATAAGTCTCTTCTAGTGGAGGCATTGACTCATGGCTCATACATGATTCCTGAAATTCCA
AGATGCTATCGGCGGTTGGAGTTTCTCGGCGACTCTGTGTTGGATTATCTCATAACGAAG
CACTTGTACGGCGAATATCCTAATCTTTCTCCTGGACTACTAACCGACATGCGCTCTGCT
TCTGTGAACAATGAATGTTATGCTCAAGTAGCGGTGAAATCAAACCTGCACAAACACGTT
CTCCATGCCTCTCATGATCTCCACAAGCATATCTCCAGAACAGTCAGTGAGTTTGAACGT
TTGTCGTCTGTGCAATCCAGTTTTGGATGGGAATCCGAAATAGTTTTCCCGAAGGTTCTT
GGAGATGTGATAGAATCTTTAGCTGGTGCGATACATGTTGACTCGGGTTACAACAAGGAA
GTAGTGTTTGCGAGTATAAGACCGCTTTTGGGCTGTATGATAACTCCAGAGACTGTCAAG
TTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAGTATTGCCAGAAAGCTCAGTTCGAGTTGAGTAAA
GCTAAAGGTTACGAGAAGGGTGAAGCTTACTTCAAGGTTGAGGTGAAAGCCAAGGAAATG
AGTTTTGCTCACACATCAAAGGCATTTGATAAGAAAATGGCCAAGAAATTGGCTTACAAA
GAAGTCTTGAATTTACTTAAGAAGAGTCTTGACTCTTAAGTTTCTCATTCTTGTGGAATC
GAGTTGGAATAGAAACTCTATTAGACATAAGATTATTGAGATGATTAGTATTTTGTTTAA
TACAGCTGCTGATATTTTAGCAAAGCATGTTTAGTTGTTCAGGAAGACTTTATTGCTTCC
ACCCAAGTCAAGTTAATGAAAAGTTAATGATTCG


BQ
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AF RR4AI95TF U 1
AF RR4AI95JQ C 517
BS 1 774 RR4AI95TF
BS 775 1114 RR4AI95JQ

RD RR4AI95TF 774 0 0
GGAAACATGTACATTGCTAGGAGGAGGAATTTGAAACGCAAGACTGTGGCTGATGTTGTA
GAATCACTTATTGGTGCATATCTTAGCGAGGGAGGTGAACTAGCTGCGTTAGCGTTCATG
AACTGGGTCGGTATAAAAGTAGATCTCACTTCTACGGTGATCCAAAGAGAGCCATCAATA
CAAGCTGAGAAGCTTGTGAATGTAAGCTACATGGAGTCTCTGTTGAACTATAAATTCAAG
GATAAGTCTCTTCTAGTGGAGGCATTGACTCATGGCTCATACATGATTCCTGAAATTCCA
AGATGCTATCGGCGGTTGGAGTTTCTCGGCGACTCTGTGTTGGATTATCTCATAACGAAG
CACTTGTACGGCGAATATCCTAATCTTTCTCCTGGACTACTAACCGACATGCGCTCTGCT
TCTGTGAACAATGAATGTTATGCTCAAGTAGCGGTGAAATCAAACCTGCACAAACACGTT
CTCCATGCCTCTCATGATCTCCACAAGCATATCTCCAGAACAGTCAGTGAGTTTGAACGT
TTGTCGTCTGTGCAATCCAGTTTTGGATGGGAATCCGAAATAGTTTTCCCGAAGGTTCTT
GGAGATGTGATAGAATCTTTAGCTGGTGCGATACATGTTGACTCGGGTTACAACAAGGAA
GTAGTGTTTGCGAGTATAAGACCGCTTTTGGGCTGTATGATAACTCCAGAGACTGTCAAG
TTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAGTATTGCCAGAAAGCTCAGTTCGAGTTG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4AI95JQ 598 0 0
AGAACAGTCAGTGAGTTTGAACGTTTGTCGTCTGTGCAATCCAGTTTTGGATGGGAATCC
GAAATAGTTTTCCCGAAGGTTCTTGGAGATGTGATAGAATCTTTAGCTGGTGCGATACAT
GTTGACTCGGGTTACAACAAGGAAGTAGTGTTTGCGAGTATAAGACCGCTTTTGGGCTGT
ATGATAACTCCAGAGACTGTCAAGTTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAGTATTGCCAG
AAAGCTCAGTTCGAGTTGAGTAAAGCTAAAGGTTACGAGAAGGGTGAAGCTTACTTCAAG
GTTGAGGTGAAAGCCAAGGAAATGAGTTTTGCTCACACATCAAAGGCATTTGATAAGAAA
ATGGCCAAGAAATTGGCTTACAAAGAAGTCTTGAATTTACTTAAGAAGAGTCTTGACTCT
TAAGTTTCTCATTCTTGTGGAATCGAGTTGGAATAGAAACTCTATTAGACATAAGATTAT
TGAGATGATTAGTATTTTGTTTAATACAGCTGCTGATATTTTAGCAAAGCATGTTTAGTT
GTTCAGGAAGACTTTATTGCTTCCACCCAAGTCAAGTTAATGAAAAGTTAATGATTCG

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL7034Contig1 672 2 2 U
GGGAGAATAAATCAAACGGCTGGGTTCACGGGGTGTTCTCGCGGCTGACGGCTGCGGTGT
GAACCGGTGTCATTGGTGGTGATGATGATAGCGGCGTGACGTTCTGTTGGTGGATGTCTC
TTCGATTAGTAACAATTTTAAACAGGAAATTATTCAGTTTTGTGGTTGATTGGTCTTGTA
CTTGTCTCTCTCGATTATATCTTTTTTTTTTTTTGAACAATCTCTCTCGATTATATCATT
TCCCGTTTTGTGGCAGGTGTTATGACTAACTAGCTTAGTAGTTGCATAGAGTTGGAATCT
TCCATGTTAGGGAAGAAACCCAACTTCTGGGTTTTGATTCAATATTAAAGTTTGTTCCTT
TTGTCTCAGGCCTCTGAATCCTTCGTGTGTTCTGTGTCTCTGGTTCTCAGAAGCAGCAAG
AAGGATACAATAATGAGAGAAAACAATTATTCCTATATTGATCAAGTGTATGTTTCAATT
TTGTTCCTATAGTTGACTTCCCACTTGTCTTTAGAGATTGCAAACAATTTCACATCTTTA
AAACTCCTAAAATATGTTTCTTTTCTTTAAACAAAAGGTGTACATTTAAACGGAGAAAAC
ATGTGGATAGCTTTATAGTGTACATGTGGATAATTTTAATGGTGTACATTATATAACACG
ATTTGACTCACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AL94JQ C 1
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AS 0 0

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BQ
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AF RR4EC77TF U 1
AF RR4ED55TF U 1
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QA 1 706 1 706
DS 



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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C250TF C 1
AF RR4C250JQ U 3
BS 1 2 RR4C250TF
BS 3 677 RR4C250JQ

RD RR4C250TF 677 0 0
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TGATGGCGTCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAATCGAAGATGTT
TTGCGATTTCCGCGTTCTTAATGGTCATAACTTCCGATACAGTTTTGCCCTTGATCCATT
CAGAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCGCCGCAGCCAAAGGTCTTGAATCGAGAAT
CAGTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCCCCGCAGGCAG
GAGATCCAACCAATCCTGTGCCTACGTCAGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCCAACATTCC
TAGGATTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGGTAGAATCGGCGCCCCGCCGTCGAAC
TCCGGAGCCCTAGAAAAGTCTTTTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATTGGCGGAGTCTTAT
TTAGGGTTTCGTTTCCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4C250JQ 675 0 0
GAAAAAAAGTAAATTTTATTTATACTTCAGTATGATGATCAAGATCATACTGCAACGTTC
CATTAAAAAAAAACTCAGGACATGCCAGTCTAATAGCTAATAAACATTGTGAGTTAGCTG
TTGGAAGCAAGTAATTAAACAGTACACATGTAAGAAATCATAGATCATCATCCGTAGAAT
CAAGCCACGGAGGCATCGACAATTGCTTTCTTCTCCTTGTAGTTTTGGACGGCGGACTTG
ATGGCGTCCTCAGCAAGCATACTGCAATGCAGCTTGACGGGAGGCAATCGAAGATGTTTT
GCGATTTCCGCGTTCTTAATGGTCATAACTTCCGATACAGTTTTGCCCTTGATCCATTCA
GAAGCGACGGAAGAAGCGGCGATGGCGGCGCCGCAGCCAAAGGTCTTGAATCGAGAATCA
GTGATGTGACCGGACTCATCGACCTTAATCTGGAGGGTCATCAAGTCCCCGCAGGCAGGA
GATCCAACCAATCCTGTGCCTACGTCAGGATCGTCCCTCTTGAAGGACCCAACATTCCTA
GGATTTTCAAAGTGATCTATCACATTCTCGTGGTAGAATCGGCGCCCCGCCGTCGAACTC
CGGAGCCCTAGAAAAGTCTTTTTCGCAGTTTGCTTCAGCATCATTGGCGGAGTCTTATTT
AGGGTTTCGTTTCCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL7038Contig1 714 2 2 U
AATAGATACTGAAATTTAAATATCAAAATATAGTATTAAAAGAGTGAAATACATTACATT
TGTACCAAGTATATAACAACAACAACAGCAAAAAGACAAAATTCAAGGGACATTTCTAAT
TATAAAAGATATGTAATACACATTGAGGCTACAGCTAAAACAACATCAAATTACTACCAG
ACCATTTAGAAACCTTACAGACAAGAAAAAGACTCTTATTTGTTGAGGGATTTGCTAAGA
CGAATCTAAACAAAGTTAATGTAAAAAAGTCTCTCCTGGTTTGTGTGTCCATATGAATTT
TGTACAGCTGAGTTGAGTGATGACCAAAACACAAATGTCACTCTCTAGGCCGAGCAAGCC
ATAAAGAGCTGAGAGCTCGTAGCCTCGAGGAGTAATCATGTATCGCAAGTAAAGCACGCG
CTGACTGTCTCGTTGTTAATACTCCTATCATCTGTTGCAATGTTTGCAGTCTCAAGTTAT
CCGCCTGGCGGATAAAACCTTCGAGGGTACCTAACTTCCCCATCGCCATGGCCATTTGAC
CCATGTAGCTCGCTACATTACCTGATGAGCTAGAACCAAGAGTCCCGCTAGATAAAGTAT
CAGCTAAGGACTGTTGTAAGCTCTCCATCCCTTGAGACAAAGCATCTTCCGCCTGCTGTG
ATGTCTCTTGCAAGCTATTTATTCCCATCACCTGTCTCTCTGTCATTGGCTCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E087JQ U 1
AF RR4E193JQ U 1
BS 1 609 RR4E087JQ
BS 610 714 RR4E193JQ

RD RR4E087JQ 609 0 0
AATAGATACTGAAATTTAAATATCAAAATATAGTATTAAAAGAGTGAAATACATTACATT
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TATAAAAGATATGTAATACACATTGAGGCTACAGCTAAAACAACATCAAATTACTACCAG
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TGTACAGCTGAGTTGAGTGATGACCAAAACACAAATGTCACTCTCTAGGCCGAGCAAGCC
ATAAAGAGCTGAGAGCTCGTAGCCTCGAGGAGTAATCATGTATCGCAAGTAAAGCACGCG
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CCGCCTGGCGGATAAAACCTTCGAGGGTACCTAACTTCCCCATCGCCATGGCCATTTGAC
CCATGTAGCTCGCTACATTACCTGATGAGCTAGAACCAAGAGTCCCGCTAGATAAAGTAT
CAGCTAAGG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4E193JQ 714 0 0
AATAGATACTGAAATTTAAATATCAAAATATAGTATTAAAAGAGTGAAATACATTACATT
TGTACCAAGTATATAACAACAACAACAGCAAAAAGACAAAATTCAAGGGACATTTCTAAT
TATAAAAGATATGTAATACACATTGAGGCTACAGCTAAAACAACATCAAATTACTACCAG
ACCATTTAGAAACCTTACAGACAAGAAAAAGACTCTTATTTGTTGAGGGATTTGCTAAGA
CGAATCTAAACAAAGTTAATGTAAAAAAGTCTCTCCTGGTTTGTGTGTCCATATGAATTT
TGTACAGCTGAGTTGAGTGATGACCAAAACACAAATGTCACTCTCTAGGCCGAGCAAGCC
ATAAAGAGCTGAGAGCTCGTAGCCTCGAGGAGTAATCATGTATCGCAAGTAAAGCACGCG
CTGACTGTCTCGTTGTTAATACTCCTATCATCTGTTGCAATGTTTGCAGTCTCAAGTTAT
CCGCCTGGCGGATAAAACCTTCGAGGGTACCTAACTTCCCCATCGCCATGGCCATTTGAC
CCATGTAGCTCGCTACATTACCTGATGAGCTAGAACCAAGAGTCCCGCTAGATAAAGTAT
CAGCTAAGGACTGTTGTAAGCTCTCCATCCCTTGAGACAAAGCATCTTCCGCCTGCTGTG
ATGTCTCTTGCAAGCTATTTATTCCCATCACCTGTCTCTCTGTCATTGGCTCCA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL7039Contig1 573 2 1 U
GCTCGTAATGTTTTTGTATTTATTACCGAGACTATGTCAAACAAAACAGTACAATTGTCC
TACTAATATCCCCGATTAAAGGAGAACAATTATGAATTGATTAAAGCTCCCTCTCCAAAA
GGACCACATCATCAGCCAGATAGCTTACATAAATGTGACATGTGTGTAAAATGGCCATCA
CAAGAATGTTAAAAAGTTGTTCTTAAAAGAAAGGCCCGTCAGATAGCGAGTGAACCACTT
CCTTCGATGATCGGGTTCTCCTCACTTGCATCCGACGTTTGAGTTTTAGGCTTAGTCATC
GTTGCCGTCCTCGAAAAACCATACCCCAGAGAGCTTCCGCTTGCTTCACATAGCTCCGTT
AGTTCAGACAGGTGACGGGTTCTGAACTCGTTTATCGTATTTGCTATTTCTGATGTCGGT
AATTTGACCTGAGCAAGAACAGCAGCTGCCAACTGTAGACTTGGCTCCAGCGTCTCCGGT
ACAACAGCAGTAGCACCAGCTTTTTCTAGATTAAGACCATGAACAACGTCGTGTGCACGG
ACAAATGTCTTCACATTAGGGTAGTACTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FU50JQ U 39
AF RR4G189JQ U 1
BS 1 573 RR4G189JQ

RD RR4FU50JQ 265 0 0
AAACAAAACAGTACAATTGTCCTACTAATATCCCCGATTAAAGGAGAACAATTATGAATT
GATTAAAGCTCCCTCTCCAAAAGGACCACATCATCAGCCAGATAGCTTACATAAATGTGA
CATGTGTGTAAAATGGCCATCACAAGAATGTTAAAAAGTTGTTCTTAAAAGAAAGGCCCG
TCAGATAGCGAGTGAACCACTTCCTTCGATGATCGGGTTCTCCTCACTTGCATCCGACGT
TTGAGTTTTAGGCTTAGTCATCGTT

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR4G189JQ 573 0 0
GCTCGTAATGTTTTTGTATTTATTACCGAGACTATGTCAAACAAAACAGTACAATTGTCC
TACTAATATCCCCGATTAAAGGAGAACAATTATGAATTGATTAAAGCTCCCTCTCCAAAA
GGACCACATCATCAGCCAGATAGCTTACATAAATGTGACATGTGTGTAAAATGGCCATCA
CAAGAATGTTAAAAAGTTGTTCTTAAAAGAAAGGCCCGTCAGATAGCGAGTGAACCACTT
CCTTCGATGATCGGGTTCTCCTCACTTGCATCCGACGTTTGAGTTTTAGGCTTAGTCATC
GTTGCCGTCCTCGAAAAACCATACCCCAGAGAGCTTCCGCTTGCTTCACATAGCTCCGTT
AGTTCAGACAGGTGACGGGTTCTGAACTCGTTTATCGTATTTGCTATTTCTGATGTCGGT
AATTTGACCTGAGCAAGAACAGCAGCTGCCAACTGTAGACTTGGCTCCAGCGTCTCCGGT
ACAACAGCAGTAGCACCAGCTTTTTCTAGATTAAGACCATGAACAACGTCGTGTGCACGG
ACAAATGTCTTCACATTAGGGTAGTACTTGCTC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL7040Contig1 1282 2 2 U
GGGTACATTAATGGCGGTTCTGTCGTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCGGCGATGCAGAAAGG
CATTGTTGTTACGGTACCAGTTCTGGTTCTAACCGCTTCGTTATCGGCGGTTTTCTTCTT
CATCCTATCGTCTTCATTATCCTCCTGCTCATGTCCATCATCTATATCTGATGCCATCGT
CGGTGATGTGAGGTCTGAGGAGAGAGTTTCGACGTCTCGTGAAGACATAGATTGGGTTAA
AGATCTGATTAGATCGAACGGTTTGCATATGCACGAGAATGTTCTCCGGAAAGGGATTAG
TCCTCGCACAAGGGAGCAGCAACTCCAGGATCTGATTCAGTACAAAGGTATATCGCATTA
TGTAGGAGATGAAGCAAGCAACCACACAGCGCTTCCATGCCCTGGTGAGTTACTTGTTGA
GGAGCATCACAGCAACTACGGTGAGCCTTGGGCTGGTGGGCGTGACGTCTTTGAGTTCTT
AGCCGAAGCGTCCCGGCTAAAACCCAACGCCAGAGTCCTCGAGATAGGGTGCGGTACGCT
CCGTGTTGGTCTGCATTTCATCCGTTACCTCGACCCTGGGAACTTCCACTGCCTCGAAAA
AGACGAGCTCTCTCTGATGGCTGCGTTGAGGTACGAGCTTCCTTCTCAAGTCTTCTGCAT
AAGCGGCCTCTTATACTCAGAGGGGAAGATATGGAGTTCAGCAAGTTCGGTTCGGATGTG
GGCTATGATCTGATATACGCTAGTGCGGTGTTCTTGCACATGCCTGACGAGCTGGTTTGG
AGTGGAGTCGAGAGGCTGGTTGATAAGTTGAAGCCGTACAAGGGGAGAATGTTTGTGTCG
CATAACATAAAGTTTTGTACGCGTTTAGGAGGAGAGAAATGCGCAGAGAGACTAGCGAGG
TTGGGACTCGAGTCCCTGGGGAGACAGACGCATGACAGTTTGTTGTTTAATCACTACGAG
ATCTGGTTCGGGTTTAGACGGATCAAAGGATAAAGTTTAGTTTATGATTTTGATCCCGCG
GCATGTAACGGCTCCATCCTAACAGAAGACTGGTTCGATAGATGATTGTGTTGTGGAGTA
AGTTACTACGAGTCTTTGGAGCAAGAGAGCTCACAAAGCATGAAGTACGCGAATGGTTAT
GGAGACTCATGTATTGATATATTAGCCAATTGATTTTTTATTTGTTTGTTTCAAAGAGTT
GTTATATTGTTGTGTGTTTGTAGTTCGAGTTACGTTTTGTTATACTTGAGTATATTGCTG
TTTGAATGTTTGGTGGTTGTCT


BQ
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AF RR4GM22TF U 1
AF RR4GM22JQ C 657
BS 1 767 RR4GM22TF
BS 768 1282 RR4GM22JQ

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TGTAGGAGATGAAGCAAGCAACCACACAGCGCTTCCATGCCCTGGTGAGTTACTTGTTGA
GGAGCATCACAGCAACTACGGTGAGCCTTGGGCTGGTGGGCGTGACGTCTTTGAGTTCTT
AGCCGAAGCGTCCCGGCTAAAACCCAACGCCAGAGTCCTCGAGATAGGGTGCGGTACGCT
CCGTGTTGGTCTGCATTTCATCCGTTACCTCGACCCTGGGAACTTCCACTGCCTCGAAAA
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AAGCGGCCTCTTATACTCAGAGGGGAAGATATGGAGTTCAGCAAGTTCGGTTCGGATGTG
GGCTATGATCTGATATACGCTAGTGCGGTGTTCTTGCACATGCCTGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4GM22JQ 626 0 0
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TGTGGGCTATGATCTGATATACGCTAGTGCGGTGTTCTTGCACATGCCTGACGAGCTGGT
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GTCGCATAACATAAAGTTTTGTACGCGTTTAGGAGGAGAGAAATGCGCAGAGAGACTAGC
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CGCGGCATGTAACGGCTCCATCCTAACAGAAGACTGGTTCGATAGATGATTGTGTTGTGG
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TTATGGAGACTCATGTATTGATATATTAGCCAATTGATTTTTTATTTGTTTGTTTCAAAG
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GCTGTTTGAATGTTTGGTGGTTGTCT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

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GAGTTC


BQ
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AF RR4E914JQ C 1
AF RR4E914TF U 1
BS 1 666 RR4E914TF

RD RR4E914JQ 666 0 0
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CACAGTGGTGTTTAAGTGCTTTCTATTTCTCTTCTATGTTATAAGTTTTCTCTACCGAAT
CACTTTTGTGGCCTCTTTACGATAATTTAAGATTCTGAGTGTAAGTATAGGTTTGCTTTG
GAGTTC

QA 1 666 1 666
DS 

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TCCTGTTCCTGACTCCGAGCCTAAAAAAAAGAAGAGGTGGTCGCCGTCTAAGGAAAATGA
AAGAAAGGTATGCAGTGACAGACATGAGGAAGCTTGCAAACAGGATGGCGTTTGGTACAC
CCGAAGAGAGCTCTCTTGGTGATGGATTAGGTGAAGGATATGGAATGCTTGGCCAGGCTG
GGAGCAACAGGCTGCGTATATCCAGTGTTCCCAGCAAGCTGAAGATTAATCCCACCATTG
CCAAAAAGCTGAAAGAAAGAAACTATGTAAGTGGTGCCACTACTTCTGGATTGACTTCGA
GTCTGGCTTTTACTCCTGTGCAGGGAATAGAGCTGTGCAATCCTCAACAGGCTTTAGGAT
TAGGCAGTGGGACTCAAAGCACTTACTTTTCAGAGTCAGGTACCTTCTCTAAGCTCAAGA
AATAAATTTGTGAGAGCAAACATTTCAAAGTGTTGAAAGAAGATGAGCGTGTGAGTGAGA
CACAGTGGTGTTTAAGTGCTTTCTATTTCTCTTCTATGTTATAAGTTTTCTCTACCGAAT
CACTTTTGTGGCCTCTTTACGATAATTTAAGATTCTGAGTGTAAGTATAGGTTTGCTTTG
GAGTTC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL7042Contig1 305 2 1 U
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TGAGC


BQ
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AF RR4A705JQ C 1
AF RR4A705TF U 1
BS 1 305 RR4A705TF

RD RR4A705JQ 305 0 0
GGACATATCATCTCTCTAACTATCAGACTCTCTCTCTCTAGATTTTGTTATCGTAGACGT
ACGAAGACCGTCCGTGTGCAAAAAGATGAGGTGGAGAGGGCAAAGTTGTGGATGTGAGGA
AGATAGATAATCCTTATTACTACTATTATTACCAACCACCGCGTGTGGCGGTTCCGCCTA
TGGAAATGCCGCCTCATGCTTACCCGCCTCAACTGTTCAGCGACGAGAATCCAAACTCAT
GTTCCATAATGTAAGACAAGAAACTGATGAAACGCTAAAGGGTTTATATGGAGAATATTT
TGAGC

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR4A705TF 305 0 0
GGACATATCATCTCTCTAACTATCAGACTCTCTCTCTCTAGATTTTGTTATCGTAGACGT
ACGAAGACCGTCCGTGTGCAAAAAGATGAGGTGGAGAGGGCAAAGTTGTGGATGTGAGGA
AGATAGATAATCCTTATTACTACTATTATTACCAACCACCGCGTGTGGCGGTTCCGCCTA
TGGAAATGCCGCCTCATGCTTACCCGCCTCAACTGTTCAGCGACGAGAATCCAAACTCAT
GTTCCATAATGTAAGACAAGAAACTGATGAAACGCTAAAGGGTTTATATGGAGAATATTT
TGAGC

QA 1 305 1 305
DS 



AS 1 2

CO CL7043Contig1 710 2 2 U
GCCTCAAAGCTGGGAGCATATATTGCATAATGCGAACTTGGATGACTTCACAGTGAATGG
TTTCGAACCATGGGATGTTGATGCTGACCTTATCGATGTTCTGCCAGAGGCTGTCAGGCC
TGATGCCTACTCGCTTCCACCCAATGCTCGCAAAAGCTCTTTCCAAGACCATATGTGGTT
TGAGGAACAGTCAGTGCTCAACTCCGAGATGCAAAGGACAGAAAGCTGCATGACCAGAGG
TGATTCCAGAAGCTCCAATCAGGACAAAGCTGAGATGCCTCCAGGTCCAAGACCAGATAT
TGACGACGCAAATATTGATTCTCAGGAAACATTGAAAGAGTTGGTGAATTGGAAAGCCAA
AGCGGAGCAGCAGCTAATGGAAATGTCAGACGTTGTCCGTGTTTGCAGGGATAGAGTCAG
AAACACACACACTAGGTACATGAATTGATGGATTCACTTTACATAGATTCCCTTGGAGAC
TTGTACAGGGTTTCTGCTATAAAAAGAAAAGGAAAAACAAAGAGAGTAGAGATCAAATAG
GCATCTGGAAAGTTTATTTAGGAAGAAGAGGTAGAGAAGTGATCCTCTCTACATGAAAAG
TGATATTTGAAGGTAGAGACGCTTTTTTAAAACAGTGTTAGTGGTTTTGCTGTATATTCT
CTCTGACTAATTCAACAACCAAGTTTTTGAGTAATCATCTTTGCTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4EH37TF U 1
AF RR4EH37JQ C 103
BS 1 707 RR4EH37TF
BS 708 710 RR4EH37JQ

RD RR4EH37TF 710 0 0
GCCTCAAAGCTGGGAGCATATATTGCATAATGCGAACTTGGATGACTTCACAGTGAATGG
TTTCGAACCATGGGATGTTGATGCTGACCTTATCGATGTTCTGCCAGAGGCTGTCAGGCC
TGATGCCTACTCGCTTCCACCCAATGCTCGCAAAAGCTCTTTCCAAGACCATATGTGGTT
TGAGGAACAGTCAGTGCTCAACTCCGAGATGCAAAGGACAGAAAGCTGCATGACCAGAGG
TGATTCCAGAAGCTCCAATCAGGACAAAGCTGAGATGCCTCCAGGTCCAAGACCAGATAT
TGACGACGCAAATATTGATTCTCAGGAAACATTGAAAGAGTTGGTGAATTGGAAAGCCAA
AGCGGAGCAGCAGCTAATGGAAATGTCAGACGTTGTCCGTGTTTGCAGGGATAGAGTCAG
AAACACACACACTAGGTACATGAATTGATGGATTCACTTTACATAGATTCCCTTGGAGAC
TTGTACAGGGTTTCTGCTATAAAAAGAAAAGGAAAAACAAAGAGAGTAGAGATCAAATAG
GCATCTGGAAAGTTTATTTAGGAAGAAGAGGTAGAGAAGTGATCCTCTCTACATGAAAAG
TGATATTTGAAGGTAGAGACGCTTTTTTAAAACAGTGTTAGTGGTTTTGCTGTATATTCT
CTCTGACTAATTCAACAACCAAGTTTTTGAGTAATCATCTTTGCTAT
CTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EH37JQ 608 0 0
GCCAGAGGCTGTCAGGCCTGATGCCTACTCGCTTCCACCCAATGCTCGCAAAAGCTCTTT
CCAAGACCATATGTGGTTTGAGGAACAGTCAGTGCTCAACTCCGAGATGCAAAGGACAGA
AAGCTGCATGACCAGAGGTGATTCCAGAAGCTCCAATCAGGACAAAGCTGAGATGCCTCC
AGGTCCAAGACCAGATATTGACGACGCAAATATTGATTTTCAGGAAACATTGAAAGAGTT
GGTGAATTGGAAAGCCAAAGCGGAGCAGCAGCTAATGGAAATGTCAGACGTTGTCCGTGT
TTGCAGGGATAGAGTCAGAAACACACACACTAGGTACATGAATTGATGGATTCACTTTAC
ATAGATTCCCTTGGAGACTTGTACAGGGTTTTTGCTATAAAAAGAAAAGGAAAAACAAAG
AGAGTAGAGATCAAATAGGCATCTGGAAAGTTTATTTAGGAAGAAGAGGTAGAGAAGTGA
TCCTCTTTACATGAAAAGTGATATTTGAAGGTAGAGACGCTTTTTTAAAACAGTGTTAGT
GGTTTTGCTGTATATTCTTTCTGACTAATTCAACAACCAAGTTTTTGAGTAATCATCTTT
GCTATTTG

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL7044Contig1 739 2 2 U
GGAGAAAGCAGTTGCTAGAATCCGAAATCGAAGAAGAACACATTGTAAACCCTAAAAAAG
AAGAAGAGGGCGTGAAATCGATCGACAACCAATCTCGAATCAAATGAGTTCATCGAAATC
TCATTACAAGGAAAAGATTGCTGCTCGTCGGAAGGAGGAGAAAGCAGAAGAGTCAGATAG
TCAAAAGTACAGAGACCGAGCCAAGGAACGAAGAGAGAATCAGAATCCTGATTATGATCC
CTCCGAGCTTGGTTCTTTCCACGCCGTTGCTCCTCCCGGCGCTGTTGATATCCGTGCTGC
GGATGCACTTAAGCTCTCTATAGAGAACAGCAATTATCTTGGAGGTGATGTTGAACATAC
ACATTTGGTTGAGGGGTTGGATTATGCTCTCCTCAACAAAGTCAGGAGCGTTCCAGTTTG
GGGTAAAGATGCAAGACGGTAGAAAGACAAAGAAGCAGAACCGTGACCAGAAACTTAACA
ACGAGCTTAACCAGATCAATAAAATAATGACGAGAAAGAAGATGGAGAAGGAGGGCGGGG
ATGTTGGTTCTTTGGATGCCTACGCTTCACCGACTCCCAAGAGACCCAAGCATTGAGTTT
ATTTTCTCAACTATGTAACTCCAGCTCTCTCGGTTTTATTTTGGATTGTTTGTATTTTAT
CTTTAGTTTCAGAGTTTAAAAGGATTTTACATCTCAACAACAACTACTTGTAAACTCTTT
GATTTTGAGAGTCCAACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FQ87TF U 1
AF RR4FQ87JQ C 148
BS 1 404 RR4FQ87TF
BS 405 739 RR4FQ87JQ

RD RR4FQ87TF 404 0 0
GGAGAAAGCAGTTGCTAGAATCCGAAATCGAAGAAGAACACATTGTAAACCCTAAAAAAG
AAGAAGAGGGCGTGAAATCGATCGACAACCAATCTCGAATCAAATGAGTTCATCGAAATC
TCATTACAAGGAAAAGATTGCTGCTCGTCGGAAGGAGGAGAAAGCAGAAGAGTCAGATAG
TCAAAAGTACAGAGACCGAGCCAAGGAACGAAGAGAGAATCAGAATCCTGATTATGATCC
CTCCGAGCTTGGTTCTTTCCACGCCGTTGCTCCTCCCGGCGCTGTTGATATCCGTGCTGC
GGATGCACTTAAGCTCTCTATAGAGAACAGCAATTATCTTGGAGGTGATGTTGAACATAC
ACATTTGGTTGAGGGGTTGGATTATGCTCTCCTCAACAAAGTCA

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4FQ87JQ 592 0 0
TCGGAAGGAGGAGAAAGCAGAAGAGTCAGATAGTCAAAAGTACAGAGACCGAGCCAAGGA
ACGAAGAGAGAATCAGAATCCTGATTATGATCCCTCCGAGCTTGGTTCTTTCCACGCCGT
TGCTCCTCCCGGCGCTGTTGATATCCGTGCTGCGGATGCACTTAAGCTCTCTATAGAGAA
CAGCAATTATCTTGGAGGTGATGTTGAACATACACATTTGGTTGAGGGGTTGGATTATGC
TCTCCTCAACAAAGTCAGGAGCGTTCCAGTTTGGGGTAAAGATGCAAGACGGTAGAAAGA
CAAAGAAGCAGAACCGTGACCAGAAACTTAACAACGAGCTTAACCAGATCAATAAAATAA
TGACGAGAAAGAAGATGGAGAAGGAGGGCGGGGATGTTGGTTCTTTGGATGCCTACGCTT
CACCGACTCCCAAGAGACCCAAGCATTGAGTTTATTTTCTCAACTATGTAACTCCAGCTC
TCTCGGTTTTATTTTGGATTGTTTGTATTTTATCTTTAGTTTCAGAGTTTAAAAGGATTT
TACATCTCAACAACAACTACTTGTAAACTCTTTGATTTTGAGAGTCCAACCA

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL7045Contig1 778 2 1 U
GGGAAGAATATTTGTGTAGGTGCAAACGGTTTCACTCTCAGATCCTTGTTTCTTCTCTCG
ATTCAATTCTTAATTCTTCTAAATCTCATCTTCTTAAATACGTTTGTTATTACTGTTCAA
GATTCCCCGAATTTCTTCATTGGCTTCGGATACCAGTATAGTTTCGGATTCTGATTTGAA
TTTGATATCAGCTAATTTCTTTTTTTTTTCTGGGATTTGGTTCTTGTCTCTTCCAAACCA
AGCAGAGTTCAAGTTTCAAAGTTTTGTGCAAATCTGCTGCGTACCGAACATGGATCATGA
TTTAGATGAGAACGAGAGCCTAAGGGCTCGGGTTAAACAACTCGAACATGAGCGTAATGA
ACTGCAGAAAGATATTGAACAGTTGTGCATGCAACAAGCTGGACCTAGCATTCTTGGTGT
GGCTACTCGAATGCATTTCCAGAGGACAGCTAGCTTGGAGCAGGAGATAGAGAGCCTAAA
AATGAAGTTAGCTAATTGCACAAGGGAGAAACACAATCTTCAGGAGGAACTTACAGAAGC
TTACCGGGTCAAAGCTCAGTTAGCAGATTTACATGCTGGAGAAGTAGCAAAGAATTTGGA
AGCAGAGAAGCAGGTTAGGTTTTTCCAGGGCTCGGTGGCAGCTGCTTTTTCTGAAAGGGA
TAAATCAGTTATGGAGGCTGAGAAAGCTAAAGAGAAGCTGAAAGATGTCAGAGAGACTTG
GTGATTGAGATGCGGTTAGAGACTCAGCTCCGATTGTCTTGTACAAAGAGACTAAATG


BQ
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AF RR4G819TF U 1
AF RR4FY79TF U 1
BS 1 778 RR4FY79TF

RD RR4G819TF 609 0 0
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TTTAGATGAGAACGAGAGCCTAAGGGCTCGGGTTAAACAACTCGAACATGAGCGTAATGA
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QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4FY79TF 778 0 0
GGGAAGAATATTTGTGTAGGTGCAAACGGTTTCACTCTCAGATCCTTGTTTCTTCTCTCG
ATTCAATTCTTAATTCTTCTAAATCTCATCTTCTTAAATACGTTTGTTATTACTGTTCAA
GATTCCCCGAATTTCTTCATTGGCTTCGGATACCAGTATAGTTTCGGATTCTGATTTGAA
TTTGATATCAGCTAATTTCTTTTTTTTTTCTGGGATTTGGTTCTTGTCTCTTCCAAACCA
AGCAGAGTTCAAGTTTCAAAGTTTTGTGCAAATCTGCTGCGTACCGAACATGGATCATGA
TTTAGATGAGAACGAGAGCCTAAGGGCTCGGGTTAAACAACTCGAACATGAGCGTAATGA
ACTGCAGAAAGATATTGAACAGTTGTGCATGCAACAAGCTGGACCTAGCATTCTTGGTGT
GGCTACTCGAATGCATTTCCAGAGGACAGCTAGCTTGGAGCAGGAGATAGAGAGCCTAAA
AATGAAGTTAGCTAATTGCACAAGGGAGAAACACAATCTTCAGGAGGAACTTACAGAAGC
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TAAATCAGTTATGGAGGCTGAGAAAGCTAAAGAGAAGCTGAAAGATGTCAGAGAGACTTG
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QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL7046Contig1 984 2 10 U
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ACTTCAACTTCTCTCACCCTCTCATAGCAAAGCATTTGGATCCGGAAGAATGTGCTTGGG
CTTATGGAATGAATATCTTTGATCTACGGACTTGGAGGAAGACAGATATCAGAGAAACGT
ATCATTCTTGGCTAAAAGCGAATCTGAAGTCGAATCTAACAATGTGGAAACTGGGGACAT
TGCCTCCAGCTCTGATTGCATTTAAAGGTCATGTTCAGGCAATAGATTCGTCTTGGCATA
TGCTTGGATTAGGATACCAGAGCAATACCAACATAGAAAATGTGAAGAAAGCTGCAGTGA
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TCTGGACAAAATATGTGAACTACTACAATGATTTCATTAGGAATTGTCATATCTTGGAAT
AGCAAACGGGAAGCTTTCAGGTAATCTTGAAGAAGAGAAGTGGAGATTTGGCGGATGGGT
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ATTTGCTCCACATGTGTTTTTTTCTTCTTTCTTTCAAAATTTGTTGGTTCGTAATTTTTG
ACAAGTTACAATTCCAATTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E113TF U 1
AF RR4E113JQ C 242
BS 1 640 RR4E113TF
BS 641 641 RR4E113JQ
BS 642 680 RR4E113TF
BS 681 681 RR4E113JQ
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BS 746 789 RR4E113TF
BS 790 984 RR4E113JQ

RD RR4E113TF 793 0 0
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GAATATATCTACCAGAGCTGTTTCCAAACTTGGACAAGGTGGTTTTCTTAGATGATGATA
TAGTGATTCAGAGAGATCTATCTCCTCTTTGGGATATTGATCTTCACGGGAAGGTAAATG
GAGCTGTGGAGACTTGTAGAGGAGAAGACGAATGGGTTATGTCAAAGCGTCTCAGGAACT
ACTTCAACTTCTCTCACCCTCTCATAGCAAAGCATTTGGATCCGGAAGAATGTGCTTGGG
CTTATGGAATGAATATCTTTGATCTACGGACTTGGAGGAAGACAGATATCAGAGAAACGT
ATCATTCTTGGCTAAAAGCGAATCTGAAGTCGAATCTAACAATGTGGAAACTGGGGACAT
TGCCTCCAGCTCTGATTGCATTTAAAGGTCATGTTCAGGCAATAGATTCGTCTTGGCATA
TGCTTGGATTAGGATACCAGAGCAATACCAACATAGAAAATGTGAAGAAAGCTGCAGTGA
TCCACTACAATGGCCAATCAAAGCCGTGGCTGGAGATAGGTTTTGAGCATCTGAGGCCGT
TCTGGACAAAATATGTGAACTACTACAATGATTTCATTAG*AATTGTCATATCTTGGAAT
AGCAAACGGGAAGCTTTCAG*TAATCTTGAAGA*GAGAAGTGGAGATTTGGCGGATGGGT
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AGTAAAGAT
GATC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4E113JQ 743 0 0
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TTATGGAATGAATATCTTTGATCTACGGACTTGGAGGAAGACAGATATCAGAGAAACGTA
TCATTCTTGGCTAAAAGCGAATCTGAAGTCGAATCTAACAATGTGGAAACTGGGGACATT
GCCTCCAGCTCTGATTGCATTTAAAGGTCATGTTCAGGCAATAGATTCGTCTTGGCATAT
GCTTGGATTAGGATACCAGAGCAATACCAACATAGAAAATGTGAAGAAAGCTGCAGTGAT
CCACTACAATGGCCAATCAAAGCCGTGGCTGGAGATAGGTTTTGAGCATCTGAGGCCGTT
CTGGACAAAATATGTGAACTACTACAATGATTTCATTAGGAATTGTCATATCTTGGAATA
GCAAACGGGAAGCTTTCAGGTAATCTTGAAGAAGAGAAGTGGAGATTTGGCGGATGGGTT
TCTGGAGATATACATGGGATTTTTGCTGGAAGATGAAACTAGTTACAGAGCTCTGCAGCA
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ACAGCAGAAATTGGATTTTTTTTTGGTCATGATCAGTCAACAACACCAAACTCTGTTACA
TTTGCTCCACATGTGTTTTTTTCTTCTTTCTTTCAAAATTTGTTGGTTCGTAATTTTTGA
CAAGTTACAATTCCAATTTTTAC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7047Contig1 759 2 2 U
GGATCATATCAAACCACACCCACTCTCTTTCTTCTTCTGTATTTTCCTTACAAAGAAAGG
TTTCTCTAAGCTTTAGGCCTAAGCCCAGTTTTAAGTTTCTACCGTTAAACCTTCATCACC
ATCATCTTCTTCTCGCTGAAGTAGTCTGGCTAGTTCCACCATTGGAGTTATTCAAGAAAG
CTACATTGTAAACATTTTTAGATGATCCGTGAGATCCCCAGTCTACAAAACGACAACGTA
AGCATTGAAGACCGTACTCGGAACAACATCAAGAACAGAAACACCATGGACATGAGAAGA
GATAACCGAAAAGACATGACCTTTCGTGGACCAACTCAAGCTCCTCAGATGATGAGTAAG
CAAGAATATTTACAGACATTGTCGTCTCAGAACAGTACGAGGAGGCTAATAACTAAATCG
AGTTACTTCAGTTTGGAGTCAATGGTTGTCCTTGTTGGTCTCACAGCATCGCTCTTGTTC
CTTCCTTTGATTCTTCCACCGTTGCCTCCTCCTCCTTCTATGCTGCTTCTGATTCCTATT
GTGATTATGGTCTTGCTTATGGTTCTTGCTTTAATGCCTTCTTCTAATGCCAGTCATGTA
ACAACCACTAATTACATGTAACGCTCAAAAGTTTTGTTGTTTTGTCTTATTATTAATTTG
TCATTACCAAAAGGTTTCAGGTTAATAGATTTTGTATGTTTATTATAATTTGTTAAAACA
TGTTATATGATGTATAGTAGTACTATATAATGATTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CJ87TF U 1
AF RR4CJ87JQ C 140
BS 1 656 RR4CJ87TF
BS 657 759 RR4CJ87JQ

RD RR4CJ87TF 656 0 0
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AGCATTGAAGACCGTACTCGGAACAACATCAAGAACAGAAACACCATGGACATGAGAAGA
GATAACCGAAAAGACATGACCTTTCGTGGACCAACTCAAGCTCCTCAGATGATGAGTAAG
CAAGAATATTTACAGACATTGTCGTCTCAGAACAGTACGAGGAGGCTAATAACTAAATCG
AGTTACTTCAGTTTGGAGTCAATGGTTGTCCTTGTTGGTCTCACAGCATCGCTCTTGTTC
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GTGATTATGGTCTTGCTTATGGTTCTTGCTTTAATGCCTTCTTCTAATGCCAGTCATGTA
ACAACCACTAATTACATGTAACGCTCAAAAGTTTTGTTGTTTTGTCTTATTATTAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4CJ87JQ 620 0 0
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AGATGATCCGTGAGATCCCCAGTCTACAAAACGACAACGTAAGCATTGAAGACCGTACTC
GGAACAACATCAAGAACAGAAACACCATGGACATGAGAAGAGATAACCGAAAAGACATGA
CCTTTCGTGGACCAACTCAAGCTCCTCAGATGATGAGTAAGCAAGAATATTTACAGACAT
TGTCGTCTCAGAACAGTACGAGGAGGCTAATAACTAAATCGAGTTACTTCAGTTTGGAGT
CAATGGTTGTCCTTGTTGGTCTCACAGCATCGCTCTTGTTCCTTCCTTTGATTCTTCCAC
CGTTGCCTCCTCCTCCTTCTATGCTGCTTCTGATTCCTATTGTGATTATGGTCTTGCTTA
TGGTTCTTGCTTTAATGCCTTCTTCTAATGCCAGTCATGTAACAACCACTAATTACATGT
AACGCTCAAAAGTTTTGTTGTTTTGTCTTATTATTAATTTGTCATTACCAAAAGGTTTCA
GGTTAATAGATTTTGTATGTTTATTATAATTTGTTAAAACATGTTATATGATGTATAGTA
GTACTATATAATGATTCCTT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL7048Contig1 1112 2 2 U
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GGTGGAGCTGTTTTCCAGGTTAATGGGAACCATGAGACGATGAACGTTGAAGGAGATTTC
AGATACGTAGACACGAGAGCATTTGATGAGTGTATAGACTTTCTCGACTACTTGGAGGAC
TATGCACAAGACTGGGACAAAGCTTTTAAGAATTGGATTTCGAGTCAAAACAATTTAAAG
AAGATAGGAAGAGTTCTCAGACCTATTGGGATCAATGGAATATAGTGAAGAGGCAAAAGG
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GTCATGGAGTTATTTTGAGGGTTAATAACTGGGTTTTCTGCCACGGTGGTCTCCTTCCTC
ACCACGTTGCATACGGCGTTGAGAGGATTAACAGAGAAGTCTCTGCATGGATGAAGAGCT
CCAGTGACGACGAAGACAGTCCTGAGATGCCATTCATTGCAACTCGTGGTTATGACAGTG
TGGTCTGGAGCAGACTTTACTCAAGAGAGACCTCTGATCTGAATGAATATCAAATTGAAC
AGGTAAGTACAATTCTCCGGGACTCTCTCGAAGCTGTTGGTGCCAAAGCGATGGTGGTTG
GACATACTCCTCAGTTATCAGGCGTAAACTGTGAATATGGTTGTGGCATATGGAGAGTTG
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ATGAACTTCAAGTTGCAGATTACATTTAAAAAAGCTCTTAGTGACAAGAAACAGACTCCA
AATGGCCTGGAACTTTGAACTCTTTAGGCATGAAGAAATAAAAAACAGCAGAAGTTTCAG
ATGAGAGACAGATACGGCTGAAGTGAGGCCAAAACATTCAATTCTATGTATGTATTGTGT
ATATACATGTTTGTGAATCATGAGAAACATACAGTATTCATCAAGTTTGTATAGCAAAAG
ACTATATATAGATAATGAGATGCTTTTATTAT


BQ
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AF RR4AA71TF U 1
AF RR4AA71JQ C 285
BS 1 664 RR4AA71TF
BS 665 1112 RR4AA71JQ

RD RR4AA71TF 664 0 0
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GGTGGAGCTGTTTTCCAGGTTAATGGGAACCATGAGACGATGAACGTTGAAGGAGATTTC
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AAGATAGGAAGAGTTCTCAGACCTATTGGGATCAATGGAATATAGTGAAGAGGCAAAAGG
GAGTGGTTGCAAGGTCGGTCCTTTTCAGACCAGGTGGTCGATTAGCATGTGAGTTGTCCC
GTCATGGAGTTATTTTGAGGGTTAATAACTGGGTTTTCTGCCACGGTGGTCTCCTTCCTC
ACCACGTTGCATACGGCGTTGAGAGGATTAACAGAGAAGTCTCTGCATGGATGAAGAGCT
CCAGTGACGACGAAGACAGTCCTGAGATGCCATTCATTGCAACTCGTGGTTATGACAGTG
TGGTCTGGAGCAGACTTTACTCAAGAGAGACCTCTGATCTGAATGAATATCAAATTGAAC
AGGTAAGTACAATTCTCCGGGACTCTCTCGAAGCTGTTGGTGCCAAAGCGATGGTGGTTG
GACA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4AA71JQ 828 0 0
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GCATGTGAGTTGTCCCGTCATGGAGTTATTTTGAGGGTTAATAACTGGGTTTTCTGCCAC
GGTGGTCTCCTTCCTCACCACGTTGCATACGGCGTTGAGAGGATTAACAGAGAAGTCTCT
GCATGGATGAAGAGCTCCAGTGACGACGAAGACAGTCCTGAGATGCCATTCATTGCAACT
CGTGGTTATGACAGTGTGGTCTGGAGCAGACTTTACTCAAGAGAGACCTCTGATCTGAAT
GAATATCAAATTGAACAGGTAAGTACAATTCTCCGGGACTCTCTCGAAGCTGTTGGTGCC
AAGGCGATGGTGGTTGGACATACTCCTCAGTTATCAGGCGTAAACTGTGAATATGGTTGT
GGCATATGGAGAGTTGATGTGGGAATGTCCAGTGGTGTTCTTGACTCTAGACCAGAGTGT
TGTTTGTGCTTCCTTCAGGTTCTTGAGATAAGAGGGGACAAAGCTAGAGTTATAAGGAGC
AACCGAGACAGACTTCATGAACTTCAAGTTGCAGATTACATTTAAAAAAGCTCTTAGTGA
CAAGAAACAGACTCCAAATGGCCTGGAACTTTGAACTCTTTAGGCATGAAGAAATAAAAA
ACAGCAGAAGTTTCAGATGAGAGACAGATACGGCTGAAGTGAGGCCAAAACATTCAATTC
TATGTATGTATTGTGTATATACATGTTTGTGAATCATGAGAAACATACAGTATTCATCAA
GTTTGTATAGCAAAAGACTATATATAGATAATGAGATGCTTTTATTAT

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL7049Contig1 581 2 1 U
TGGCGACAAGCGCATCTGCTTTGCTTACACCAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGA
AAAACCCCAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTTCTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCT
CCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCACCACCTACGGGAGAAGATCTTCCTCCGCCGTCG
TGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCC
TTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAGCAGGTGCCGGAGC
AAAACGGAAAAACCCACTTCGAAGCCGGAGACGATCGCGCCAAGGAGTACGTAAGCCTCT
TGAAATCGAACGACCCTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTG
GCCACATCGTTGCTTATTATGTCTTGGCCACTTCTAGCGATGGCTACGATCCTAGCTTCT
TTGGCTGATTCTTTCTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCA
AGCTGCCAAATATGTCCTCTTATCTATGTTTCTCCCACCTC


BQ
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AF RR4F221TF U 1
AF RR4F221JQ C 15
BS 1 581 RR4F221TF

RD RR4F221TF 581 0 0
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AAAACCCCAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTTCTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCT
CCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCACCACCTACGGGAGAAGATCTTCCTCCGCCGTCG
TGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCC
TTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAGCAGGTGCCGGAGC
AAAACGGAAAAACCCACTTCGAAGCCGGAGACGATCGCGCCAAGGAGTACGTAAGCCTCT
TGAAATCGAACGACCCTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTG
GCCACATCGTTGCTTATTATGTCTTGGCCACTTCTAGCGATGGCTACGATCCTAGCTTCT
TTGGCTGATTCTTTCTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCA
AGCTGCCAAATATGTCCTCTTATCTATGTTTCTCCCACCTC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4F221JQ 567 0 0
TCTGCTTTGCTTACACCAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCCAACTCC
ATCTCATTCCACGGCCTCCGTTCTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTACCC
AAGCTATCCACCACCACCTACGGGAGAAGATCTTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTC
AGCCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTC
TTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAGCAGGTGCCGGAGCAAAACGGAAAAACC
CACTTCGAAGCCGGAGACGATCGCGCCAAGGAGTACGTAAGCCTCTTGAAATCGAACGAC
CCTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGCT
TATTATGTCTTGGCCACTTCTAGCGATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTT
CTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGCTGCCAAATATG
TCCTCTTATCTATGTTTCTCCCACCTC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL7050Contig1 1074 2 2 U
GGACGTTTATCATAATCTGCAAACCTAATGATTTGCAAACAGAAACGTCGACATCACCGT
TTCTGTACCCAAACTCTAACACTGTCTTTCCCACCTCTTTCGGCGTCCTGAAGCCGCCCC
GGAATCCACAGCTCTGTTTCGGCTGGCGAGATCACAAAAGGATCCATCGACGATGTCCTG
ACATATCAGATTCGACATTAGAGAGGGAGAATTCGTCGCGTCTCAGAACCTAAGAAAATG
AGAGAATCTTCTCTTCGTTCCTCCTTCTCTTATAATCAGTGCTGATACCGTGTGTACCAA
TGGTGAGGCTGGTGAAGTGATGAAACGTGATGAGGTTCCGGATTGACCTTTGCAAACTAC
TTATCTTATAAGTGAAGCGTCTTCAGAAAGATTCTAGATGGTTTAACTACATCTCTGCTC
TTCCGAGAAAACCTCGCTTTATAGTGGACTCGGACAGAAATTGATATGTACTTAGAAGCT
TCACAGATTCGAGAGAACAGGCAATCGAAAGAATCACTAATGTTGTTTGAATGTGAGATA
TTGTATTCTCTTTCCTTCTCTTAACTGCTATTTGTTGTGAAGAACTTTACCAAGTTCACG
AGCAGTGGAAACCTTTCTGTTGTCTTTATCAGCAACCGCACCAGTGGAACTAGCACCATC
ACAAACATCGTCTACAAAGAGGCATTCAATGACCTACCAGAAACAACCGGTATTGATGAT
GAAGGCCAAGATGTGGAAGAAAATCAGTGGGTTGAGCGTAACACAAATGAGCAAAGGCAA
AGGAGAAAAAAATCAGACACTTTTCCGACCTATACAAGGGCGGGAACTTCACGAAGAACA
CTTCACTTACGTCTCATATGGATTTGGGCTTCCAGGCCCACCGTCGAGCAAACTAAAATA
GTTAGTTTTCTAGGAATAATATAACTTCTTTTTAAGTCCGTAGATGCCCAAACAAACTCA
TCTCACTTGTGTAGAATGCGACAGAGGCATTTAAAAAGATAATCAATATCTTATTTTCTT
TTATTTTCAAACTTTATTATAAAATGATATTTATTAATCGCATGTTTCATTATT


BQ
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AF RR4DE67TF U 1
AF RR4DE67JQ C 448
BS 1 502 RR4DE67TF
BS 503 1074 RR4DE67JQ

RD RR4DE67TF 502 0 0
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TTCTGTACCCAAACTCTAACACTGTCTTTCCCACCTCTTTCGGCGTCCTGAAGCCGCCCC
GGAATCCACAGCTCTGTTTCGGCTGGCGAGATCACAAAAGGATCCATCGACGATGTCCTG
ACATATCAGATTCGACATTAGAGAGGGAGAATTCGTCGCGTCTCAGAACCTAAGAAAATG
AGAGAATCTTCTCTTCGTTCCTCCTTCTCTTATAATCAGTGCTGATACCGTGTGTACCAA
TGGTGAGGCTGGTGAAGTGATGAAACGTGATGAGGTTCCGGATTGACCTTTGCAAACTAC
TTATCTTATAAGTGAAGCGTCTTCAGAAAGATTCTAGATGGTTTAACTACATCTCTGCTC
TTCCGAGAAAACCTCGCTTTATAGTGGACTCGGACAGAAATTGATATGTACTTAGAAGCT
TCACAGATTCGAGAGAACAGGC

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR4DE67JQ 627 0 0
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AAAGAATCACTAATGTTGTTTGAATGTGAGATATTGTATTCTCTTTCCTTCTCTTAACTG
CTATTTGTTGTGAAGAACTTTACCAAGTTCACGAGCAGTGGAAACCTTTCTGTTGTCTTT
ATCAGCAACCGCACCAGTGGAACTAGCACCATCACAAACATCGTCTACAAAGAGGCATTC
AATGACCTACCAGAAACAACCGGTATTGATGATGAAGGCCAAGATGTGGAAGAAAATCAG
TGGGTTGAGCGTAACACAAATGAGCAAAGGCAAAGGAGAAAAAAATCAGACACTTTTCCG
ACCTATACAAGGGCGGGAACTTCACGAAGAACACTTCACTTACGTCTCATATGGATTTGG
GCTTCCAGGCCCACCGTCGAGCAAACTAAAATAGTTAGTTTTCTAGGAATAATATAACTT
CTTTTTAAGTCCGTAGATGCCCAAACAAACTCATCTCACTTGTGTAGAATGCGACAGAGG
CATTTAAAAAGATAATCAATATCTTATTTTCTTTTATTTTCAAACTTTATTATAAAATGA
TATTTATTAATCGCATGTTTCATTATT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7051Contig1 674 2 4 U
CGGTGAGCGAACCAGACAGCTCGATGGAGCTCATGTAGAGTTCTTAAGAGGTGTTGCTAA
TCCTCTTGGAATCAAGGTGAGTGATAAGATGGATCCAAAGGAGCTAGTGAAGCTGATTGA
GATCTTGAATGCTGATAATAAGCCTGGAAGGATCACGATTATCACAAATGGGAGCAGAGA
ATATGAGAGTGAAGCTTCCTCATTTGATCAGAGCTGTGAGACGTGCTGGACAGATTGTGA
CTTGGGTCAGTGATCCAATGCACGTAAACACCATTAAGGCTCCTTGTGGTCTAAAGACTC
GTCCCTTTGACTCCATCTTGGCTGAAGTGAGAGCGTTTTTCGACGTGCACGAGCAAGAGG
GAAGCCACCCGGGAGGTGTTCACCTAGAGATGACTTGGGGTCGCGATACCACACGCACTG
TGACCCTCGCCTCAACGCCTCGCAGTCTCTCGAGCTCTCTTTCATCATCGCTGAACGCCT
TAGAAAGGGACGCATCAAGTCCCAACAGGCTTTTTCTATCTAATTCAGACATGTGTTGTG
TTATATCTTTATAATAAATGTTTGCGTGTGTGAACTCAATACGGTTACGGTCTCGTTTAT
ATTTGATTCAGATGCTGGGTCAACAGAACGCGTAAGGTTTTGTTTTATCGTTGTTAATGA
GTTTTATTATTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ42TF U 1
AF RR4CZ42JQ C 1
BS 1 206 RR4CZ42TF
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BS 208 222 RR4CZ42TF
BS 223 674 RR4CZ42JQ

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ATATGAGAGTGAAGCTTCCTCATTTG*TCAGAGCTGTGAGAC
TGCTGGAC

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4CZ42JQ 674 0 0
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TCCTCTTGGAATCAAGGTGAGTGATAAGATGGATCCAAAGGAGCTAGTGAAGCTGATTGA
GATCTTGAATGCTGATAATAAGCCTGGAAGGATCACGATTATCACAAATGGGAGCAGAGA
ATATGAGAGTGAAGCTTCCTCATTTGATCAGAGCTGTGAGACGTGCTGGACAGATTGTGA
CTTGGGTCAGTGATCCAATGCACGTAAACACCATTAAGGCTCCTTGTGGTCTAAAGACTC
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TGACCCTCGCCTCAACGCCTCGCAGTCTCTCGAGCTCTCTTTCATCATCGCTGAACGCCT
TAGAAAGGGACGCATCAAGTCCCAACAGGCTTTTTCTATCTAATTCAGACATGTGTTGTG
TTATATCTTTATAATAAATGTTTGCGTGTGTGAACTCAATACGGTTACGGTCTCGTTTAT
ATTTGATTCAGATGCTGGGTCAACAGAACGCGTAAGGTTTTGTTTTATCGTTGTTAATGA
GTTTTATTATTTCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7052Contig1 613 2 1 U
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GTTTGATGTGTCACCGTTCTTGCTACTAGAATCATCTGCAGATTCCGATACCTATCGCTG
CGACGGAGGCGAACAGATCGAGGGTGCCCACGACGGCGAACCCAACGTTAACAATAACTA
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TATGACGACCTGGAGACCGAGTTTCGACCCGGAGGATCCGGTGACAGAAGAAATAGTTCT
CACAGCAGGAGAGGAAGAAGATGAGGACGGAGAGGTGAACAGCTACATCATAAGATATAG
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CTATTTTATTTTTGTTTGTTTGGGATTTTTGCTTGTAAAGGTATCTATTAAATCACATCT
ACCCATCAGTTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H039JQ C 1
AF RR4H039TF U 1
BS 1 613 RR4H039TF

RD RR4H039JQ 613 0 0
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CACAGCAGGAGAGGAAGAAGATGAGGACGGAGAGGTGAACAGCTACATCATAAGATATAG
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AAATCGAATGTTCTGGGAAGCTTGTCTTGCTTCCTGATCTGTCTTTCCTGTTTCACGGAG
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CTATTTTATTTTTGTTTGTTTGGGATTTTTGCTTGTAAAGGTATCTATTAAATCACATCT
ACCCATCAGTTTC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4H039TF 613 0 0
GGGTCACAATCCTCAGTTAAGACATAAGAGAAAAAATAATATGAACACAACCAAGGAGGT
GTTTGATGTGTCACCGTTCTTGCTACTAGAATCATCTGCAGATTCCGATACCTATCGCTG
CGACGGAGGCGAACAGATCGAGGGTGCCCACGACGGCGAACCCAACGTTAACAATAACTA
TTACGCGGATCGAGATGAAATTGATGAGTCTTGTACCGCCAATTTTTATGAGACGTCTTC
TATGACGACCTGGAGACCGAGTTTCGACCCGGAGGATCCGGTGACAGAAGAAATAGTTCT
CACAGCAGGAGAGGAAGAAGATGAGGACGGAGAGGTGAACAGCTACATCATAAGATATAG
GACAAGTCAACGTGAAAATCTGACCGTTGATTCTATTCCTGTGGTGAGTGAGATGGATAA
AAATCGAATGTTCTGGGAAGCTTGTCTTGCTTCCTGATCTGTCTTTCCTGTTTCACGGAG
AGGGAAAAACGAACAACGTCTTCTTGTCTAGCTAACTATATAGGTTTAATACATGTCTAT
CTATTTTATTTTTGTTTGTTTGGGATTTTTGCTTGTAAAGGTATCTATTAAATCACATCT
ACCCATCAGTTTC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL7053Contig1 494 2 1 U
TTTTTTTATCAATTTCTTAAATCATGAAGTATGTTATTTCAGTTGTTGTTCTGTGCGTTC
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AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ACTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTTTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAGTAATTATTTC


BQ
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AF RR4GD89TF U 1
AF RR4GD89JQ C 309
BS 1 494 RR4GD89TF

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TCATGTCTCGCGTTTCGAATATAGCCCAAGTGAATGGCCTAGACCCTTTGTGTAAATGGT
ACAGTCGACGTCCTGGAAAATGCAGCCCTGATGGAAACATGAAGTGCCATGCCGAAGTAC
AGGTAGAACGCACAAATCAAAAATTTGAGCGTTGCGAGTGTACAAACCATATTATTAAAA
AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ACTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTTTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAGTAATTATTTC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4GD89JQ 186 0 0
TTT
TTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACCCCATTACAAATCAAATAGATTTACCA
ATAGATAAGAGGGGGGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATATACTGCCAGTTT
ATATGATTTTAAATGTAATTGTTTTTACTATAGGAACTAATAAATTTATGAAGTAATTAT
TTC

QA 4 186 4 186
DS 



AS 1 2

CO CL7054Contig1 818 2 3 U
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GCTCTTCAGGCTGCATATTCTCTTCTTCCTTCTACCGTCTCAATCCGAAAAGAGGGTAAG
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TCCACCGTTATTCGCGCACAGACCGTTACAGCAACGCCTCCATCTAACGAAGCCTCGCCG
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ACGGTGATGCATCTCGATCTCGCCTCGCTCGAAAGCGTGAAACAGTTTGTTGATAGTTTC
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GCTAAAGAACCTTCTTTCACGGCCGAAGGGTTTGAGCTCAGCGTTGGAACCAATCATATA
GACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGCTTCTTGATGACTTGAACAGTCTGATTATCCTTCTAA
ACGTATGATCATCGTAGATCTATACAGAAACAACACTTTGGCTGGGATGTACGCCAAGCG
ACTCGAGACTAGAGCTAGCATCGGACTGACGGCAAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4H312TF U 42
AF RR4D275TF U 1
BS 1 118 RR4D275TF
BS 119 119 RR4H312TF
BS 120 818 RR4D275TF

RD RR4H312TF 616 0 0
GG
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TTTCAAACCATCTTAAAGCCGACAATATCTCCAACCTGTTAACCATCAAGGAACAGAGAA
GACAAAGTCCACGTTTTTCCACCGTTATTCGCGCACAGACCGTTACAGCAACGCCTCCAT
CTAACGAAGCCTCGCCGGAGCAAAAGAAGACACAGAGAAAAGGCACAGCAGTGATCACCG
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ACGTGATCATGGCTTGCAGGAACTTCCTCAAAGCCGAGAAAGCTGCGAAGTCCGTAGGGA
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TTGGAACCAATCAT

QA 3 616 3 616
DS 

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TCCACCGTTATTCGCGCACAGACCGTTACAGCAACGCCTCCATCTAACGAAGCCTCGCCG
GAGCAAAAGAAGACACAGAGAAAAGGCACAGCAGTGATCACCGGAGCTTCCTCTGGTCTA
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AGGAGAACAGAACGGCCGTTAGATGTTCTTGTCTGTAACGCAGCTGTTTACCAGCCGACT
GCTAAAGAACCTTCTTTCACGGCCGAAGGGTTTGAGCTCAGCGTTGGAACCAATCATATA
GACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGCTTCTTGATGACTTGAACAGTCTGATTATCCTTCTAA
ACGTATGATCATCGTAGATCTATACAGAAACAACACTTTGGCTGGGATGTACGCCAAGCG
ACTCGAGACTAGAGCTAGCATCGGACTGACGGCAAACA

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

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TGGCGATCGGAGAGTTTGTCTCTGTTTACTCTCAGTACGACATAGAGGTGGCTCAGATGA
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CTGCGTCTGCGTTAGCGTTTTCTGTTGGAGCGATTGTGCCTTTATTGGCGGCTGCGTTTG
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TGTTTGGGTGGTTAGGAGCGGTTTTGGGGAAAGCACCGGTGGTTAAGTCATCGGCTAGGG
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CACATGGTATGTGATAGTTTGTGTGTGTGTTTTACATACGTGACCGAACACTTCTTCATG
TTTCATGCAACACACTTTAAGCGGTTACGTTTCTTTTTTATGTAAGAAACTTTGG


BQ
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AF RR4EH74JQ C 1
AF RR4EH74TF U 1
BS 1 775 RR4EH74TF

RD RR4EH74JQ 775 0 0
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ATCAAGAAAAGGCTCTTGACTTCTCCAAAAGAGCTCAATGGCTACGAGCCGCCGTCCTCG
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GAGACGTTAAAACCATGATGTTATCTGGTTTTGCCGGTTTAGTCGCCGGGGCTTGTAGCA
TGGCGATCGGAGAGTTTGTCTCTGTTTACTCTCAGTACGACATAGAGGTGGCTCAGATGA
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TGAAAGAGTATAAAGTGAGGGTTGGAGTGATTCTGGCGGCGGTGACGTTGGCTTTGGTTA
TGTTTGGGTGGTTAGGAGCGGTTTTGGGGAAAGCACCGGTGGTTAAGTCATCGGCTAGGG
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QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4EH74TF 775 0 0
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ATCAAATCACTATGGAGTCCCACAACGTGAACAACAGCTTGAACGTAGACATGGAGAAAG
ATCAAGAAAAGGCTCTTGACTTCTCCAAAAGAGCTCAATGGCTACGAGCCGCCGTCCTCG
GTGCCAACGATGGTCTTGTCTCCACGGCTTCGCTTATGATGGGTGTCGGTGCGGTTAAGG
GAGACGTTAAAACCATGATGTTATCTGGTTTTGCCGGTTTAGTCGCCGGGGCTTGTAGCA
TGGCGATCGGAGAGTTTGTCTCTGTTTACTCTCAGTACGACATAGAGGTGGCTCAGATGA
AGAGAGAGAGCGGAGGGGAGATCGAGAAAGAAAAGCTTCCTAGCCCGATGCAAGCGGCTG
CTGCGTCTGCGTTAGCGTTTTCTGTTGGAGCGATTGTGCCTTTATTGGCGGCTGCGTTTG
TGAAAGAGTATAAAGTGAGGGTTGGAGTGATTCTGGCGGCGGTGACGTTGGCTTTGGTTA
TGTTTGGGTGGTTAGGAGCGGTTTTGGGGAAAGCACCGGTGGTTAAGTCATCGGCTAGGG
TTTTGATTGGAGGATGGTTAGCTATGGCCGTTACGTTTGGTTTGACCAAACTGGTCGGAT
CACATGGTATGTGATAGTTTGTGTGTGTGTTTTACATACGTGACCGAACACTTCTTCATG
TTTCATGCAACACACTTTAAGCGGTTACGTTTCTTTTTTATGTAAGAAACTTTGG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL7056Contig1 636 2 1 U
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TGGAGTGAAGAGTTTGCATTCACGAAACTCTTCGAAGGATGATGAAGACAGAGAGGGCAT
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ATGCGATTTCTCATTGCGACATTTTCAATCTACAATACAACAATACAGTTAGTATTTTGA
GTGTCATTTTGTTTGCATATACGCATTTAAGACACG


BQ
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AF RR4DM19JQ C 1
AF RR4DM19TF U 1
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RD RR4DM19JQ 636 0 0
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DS 

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TCTTCAAATAAAGTACAATGAGCTTTTTGCTAAACATCAAGAAACGTTGAGAGAGTTAGA
TGGAGTGAAGAGTTTGCATTCACGAAACTCTTCGAAGGATGATGAAGACAGAGAGGGCAT
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ATGCGATTTCTCATTGCGACATTTTCAATCTACAATACAACAATACAGTTAGTATTTTGA
GTGTCATTTTGTTTGCATATACGCATTTAAGACACG

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B448TF U 1
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BS 712 893 RR4B448JQ

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DS 

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TCTGCTGGTTCAATGCGTAGAGGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAGAATACATATTAAGAC
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QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A751TF U 1
AF RR4A751JQ C 103
BS 1 771 RR4A751TF
BS 772 871 RR4A751JQ

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CTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATCGTAGAAGACAGAAAAACGAC
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GAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGTAGGA
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CGTGATCTCGCTGTTTCCTGCAGTGCTGGATACTTGAACAGTACTCCACTTCTTGATCTG
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GGCTTCTGAAAGCTGCAAGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTTCTTCAAGAAAACAC
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DS 

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AATGGTCATGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATCGT
AGAAGACAGAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTCAGACAATG
GAAGCTTGCATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTC
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GACGCTGGAATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTTTCCTGCAGTGCTGGATACTTGAACAGT
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ACTTTCCCAAACTCAAAAGTTAGTAATGCAAAACATACTGTGTTTGGCT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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ATTGCACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BC26JQ C 1
AF RR4BC26TF U 1
BS 1 788 RR4BC26TF

RD RR4BC26JQ 788 0 0
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QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4BC26TF 788 0 0
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TGAGGTTGAAGGGAAGCGTAGAAGGTGTTGAGAAGGTAGTGAAGGCTCTGAGAGCTAAAT
CTGTGGAATGTCGGGTTAAGAAGAAAGGAAACGTTTTCTGGATTGGACTTCAGGGAACGA
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TAAGACCCGCTTATGATGCAGTGGACAGTGATGGGGACTACGAAGAATAAATCATAAACT
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AACAATGTTGATTTGAGCTTTTTTGGTTTGATAACATTTGTTGAATTCCTTTACTCCAAA
CAAAGGAGGGGACTTGGTATCTATAATATTTTTGGACATAGAAGTAAAATTTAATAATAT
ATTGCACG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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AATCAAGGTTTTTGGTCAATACTTTTTTAAGCTCTC


BQ
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AF RR4FC83TF U 1
AF RR4FC83JQ C 26
BS 1 636 RR4FC83TF

RD RR4FC83TF 636 0 0
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ATCTTCGTTTTGATCCCCTGGAGGAATCGCGACAATGGCGGAAAAGGCAGTGACGATCAG
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TCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGCTAGCAAGGATGTA
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TAAATCATCCGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAAGTTCGAACC
CAAGTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGACACCAAGATCGAGAAATCAAGGAAACAAAT
TAAGGAAAGGAAGAACCGTGCTAAGAAGATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGA
TCCCAAGAAGAAGTGAGAGATCACAAGCTAGTATCAACCATTTTCTGTTCTTCATAATCA
AAACTTTTATGTTTTCTTTGTTTGCAATTAGTTTTTCTCTGCAACTTGACATCTAAACAT
AATCAAGGTTTTTGGTCAATACTTTTTTAAGCTCTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FC83JQ 611 0 0
TCGAACTCAAAAGCTTTGCAGAGAGAGAGAGAGAGATCTTCGTTTTGATCCCCTGGAGGA
ATCGCGACAATGGCGGAAAAGGCAGTGACGATCAGAACCCGAAAATTCATGACTAACAGA
CTTCTCTCAAGGAAGCAGTTCGTTATTGATGTTCTTCACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCA
AAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGCTAGCAAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAACGCCATA
TTTGTTTTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCCGGGTTTGGTTTGATC
TATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAAGTTCGAACCCAAGTACAGACTTATCAGGAATGGT
CTTGACACCAAGATCGAGAAATCAAGGAAACAAATTAAGGAAAGGAAGAACCGTGCTAAG
AAGATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGATCCCAAGAAGAAGTGAGAGATCACA
AGCTAGTATCAACCATTTTCTGTTCTTCATAATCAAAACTTTTATGTTTTCTTTGTTTGC
AATTAGTTTTTCTCTGCAACTTGACATCTAAACATAATCAAGGTTTTTGGTCAATACTTT
TTTAAGCTCTC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL7061Contig1 902 2 2 U
GTCTAATGGCCTTGATGAGTTCCGGACCAATAGATACTCCTCTTTTGATTTCATTATCGC
TGAAAGGAGTGATTCCTTTTCTTTCGAACTCCATCTGAATGTGACTTAGAAAGTGTTTGC
GTACATCTTCCCCGCGGAAGCTTGGAAAGACATCATGCGTCCAGATGTGAGAAGAAGAAG
AAGAAGATGGATGAACCGTTGAAGGAGACAAAGAAGATGAAGGCGATGAAGAAGAAGGAT
CCTTTTCTCTGTTATCTTCTTGATGGAGTCTAAGTTTTCTCATCAGAAGAGTTAAGAGAC
CTATTGCAGCAGCAACAATGGTAAGAAAAAAAGAAGAATCCATTAATGGTATGATGAAAA
GAGGATCAATATTTTAGAGCTATATAGAGGGAGCCTATGAGGCCTTGTATAACATTGAAC
ACAGAACGTTGACAGGGAATGTTAAACTACTAGCAATAAAAAAGTGGACTGGCTGGCTGG
TGCTTTTCTTCGTATATATCTACTTCCTTTAATTTTCCTCACAGAAAATTAAAATAACGA
CAGTAACAGTGGTAACAGAGAGGTCCTACAAGCGCAGCCAGCAAGAGCAGAAGCTTCTAA
ATAATGATATCCGAGAAAAAATACACAAGCAACTCTCAAATATATAGAAATAAAGAATCA
GAAAGCACAAACATCAACCCTTTTTGTTTGTTTGTAAGAAAACAGTAAAAAGGAAGGAAC
GTAAGAATCATACAAACACAGCAATCTTTCAAGAAAGCAGTGATCAAAAGCAATGTCGAG
AGAAAAGTCTTTAATCAAGTATTCGAAATCGTAAGGCATAGTAATCAAAAATCATATATC
ATACAACAAAAATAACATTTGAACTATAAAATGATATCCAAGAAATAGCACAACCAACTC
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4H607TF U 1
AF RR4H607JQB C 242
BS 1 580 RR4H607TF
BS 581 902 RR4H607JQB

RD RR4H607TF 580 0 0
GTCTAATGGCCTTGATGAGTTCCGGACCAATAGATACTCCTCTTTTGATTTCATTATCGC
TGAAAGGAGTGATTCCTTTTCTTTCGAACTCCATCTGAATGTGACTTAGAAAGTGTTTGC
GTACATCTTCCCCGCGGAAGCTTGGAAAGACATCATGCGTCCAGATGTGAGAAGAAGAAG
AAGAAGATGGATGAACCGTTGAAGGAGACAAAGAAGATGAAGGCGATGAAGAAGAAGGAT
CCTTTTCTCTGTTATCTTCTTGATGGAGTCTAAGTTTTCTCATCAGAAGAGTTAAGAGAC
CTATTGCAGCAGCAACAATGGTAAGAAAAAAAGAAGAATCCATTAATGGTATGATGAAAA
GAGGATCAATATTTTAGAGCTATATAGAGGGAGCCTATGAGGCCTTGTATAACATTGAAC
ACAGAACGTTGACAGGGAATGTTAAACTACTAGCAATAAAAAAGTGGACTGGCTGGCTGG
TGCTTTTCTTCGTATATATCTACTTCCTTTAATTTTCCTCACAGAAAATTAAAATAACGA
CAGTAACAGTGGTAACAGAGAGGTCCTACAAGCGCAGCCA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR4H607JQB 661 0 0
T
TTTTCTCTGTTATCTTCTTGATGGAGTCTAAGTTTTCTCATCAGAAGAGTTAAGAGACCT
ATTGCAGCAGCAACAATGGTAAGAAAAAAAGAAGAATCCATTAATGGTATGATGAAAAGA
GGATCAATATTTTAGAGCTATATAGAGGGAGCCTATGAGGCCTTGTATAACATTGAACAC
AGAACGTTGACAGGGAATGTTAAACTACTAGCAATAAAAAAGTGGACTGGCTGGCTGGTG
CTTTTCTTCGTATATATCTACTTCCTTTAATTTTCCTCACAGAAAATTAAAATAACGACA
GTAACAGTGGTAACAGAGAGGTCCTACAAGCGCAGCCAGCAAGAGCAGAAGCTTCTAAAT
AATGATATCCGAGAAAAAATACACAAGCAACTCTCAAATATATAGAAATAAAGAATCAGA
AAGCACAAACATCAACCCTTTTTGTTTGTTTGTAAGAAAACAGTAAAAAGGAAGGAACGT
AAGAATCATACAAACACAGCAATCTTTCAAGAAAGCAGTGATCAAAAGCAATGTCGAGAG
AAAAGTCTTTAATCAAGTATTCGAAATCGTAAGGCATAGTAATCAAAAATCATATATCAT
ACAACAAAAATAACATTTGAACTATAAAATGATATCCAAGAAATAGCACAACCAACTCAC

QA 2 661 2 661
DS 



AS 1 2

CO CL7062Contig1 879 2 4 U
GGCTCCTCCTACCTACACAGAGAAACAGATCGTATCCATTGCCGATAAGCGAGCGAGAGA
AAGAAAGAGAGAGAGATAGAATGTCTGGAATGGTAGGTGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGT
TGGTAAGGATCTCGCCGTATACTTTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCT
CTGTCCTCGGCGCCGCCTGGGGGATTTACATAACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCA
TTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAG
CTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATTTTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTT
CAAAGACGTATGACGCCGAGTCTCTTAGAGCTGGATGTGCAATCTTCGCATCTGGAATCA
TAGTTGTATTCGCCAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCG
CATTGTCAGATGCTCAGAACTCCACACTGTTTGTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCTTCG
GAAGCGCTCTCGGGCTGTTTGGAGTTATTGTTGGGATCATCATGTCCGCACAAGCTACGT
GGCCGACCAAATAGAGAGCATACAACCTTGTCTGAAACTCTGGAAAGAAGATGTTTTCTT
GATTATCTTCATTGTTATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAAAAAGCCAGTGTAAGAAC
TGAGGACTTCTTTGTATCCCTGATTGTTTTTTATATATTGTTTTAATACTTTGTAATAAG
TCTCTTTGGAGAACATCTTCTTGTTTGTATTCTCTTTTAATCAAAGACGAGAGTTTGTAT
ATATGACTCCTTTTGAAATTGAAAGTTCTATTCAGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX17TF U 1
AF RR4BX17JQ C 85
BS 1 636 RR4BX17TF
BS 637 637 RR4BX17JQ
BS 638 703 RR4BX17TF
BS 704 879 RR4BX17JQ

RD RR4BX17TF 703 0 0
GGCTCCTCCTACCTACACAGAGAAACAGATCGTATCCATTGCCGATAAGCGAGCGAGAGA
AAGAAAGAGAGAGAGATAGAATGTCTGGAATGGTAGGTGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGT
TGGTAAGGATCTCGCCGTATACTTTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCT
CTGTCCTCGGCGCCGCCTGGGGGATTTACATAACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCA
TTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAG
CTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATTTTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTT
CAAAGACGTATGACGCCGAGTCTCTTAGAGCTGGATGTGCAATCTTCGCATCTGGAATCA
TAGTTGTATTCGCCAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCG
CATTGTCAGATGCTCAGAACTCCACACTGTTTGTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCTTCG
GAAGCGCTCTCGGGCTGTTTGGAGTTATTGTTGGGATCATCATGTCCGCACAAGCTACGT
GGCCGACCAAATAGAGAGCATACAACCTTGTCTGAA*CTCTGGAAAGAAGATGTTTTCTT
GATTATCTTCATTGTTATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4BX17JQ 795 0 0
TCTGGAAT
GTAGGTGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGTTGGTAAGGATCTCGCCGTATACTTTCTCCGCA
ATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCTGTCCTCGGCGCCGCCTGGGGGATTTACATA
ACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTC
ATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATTTTG
CAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTTCAAAGACGTATGACGCCGAGTCTCTTAGAGCT
GGATGTGCAATCTTCGCATCTGGAATCATAGTTGTATTCGCCAACCTTGTATGCGGGTTA
TGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCGCATTGTCAGATGCTCAGAACTCCACACTGTTT
GTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCTCGGGCTGTTTGGAGTTATTGTT
GGGATCATCATGTCCGCACAAGCTACGTGGCCGACCAAATAGAGAGCATACAACCTTGTC
TGAAACTCTGGAAAGAAGATGTTTTCTTGATTATCTTCATTGTTATATGGATACTTTCAT
GTCTAGAGAAAAAAGCCAGTGTAAGAACTGAGGACTTCTTTGTATCCCTGATTGTTTTTT
ATATATTGTTTTAATACTTTGTAATAAGTCTCTTTGGAGAACATCTTCTTGTTTGTATTC
TCTTTTAATCAAAGACGAGAGTTTGTATATATGACTCCTTTTGAAATTGAAAGTTCTATT
CAGTTAG

QA 9 795 9 795
DS 



AS 1 2

CO CL7063Contig1 564 2 5 U
ATTGGAATACTAGTATTATATTCAGAGAATTATTCAACTCCATTCCATAGAAGTACAAAC
TGACTCATCCGTCACACATGGCAGAGACATCCAGATATCACGTCAACATAAACGAAAACC
ATTACAGGCTAAAAGACAAAAGGCTGCAGCCATTATTACACTATAAACCAAACCTAGAAC
ATCATTTGGGTTACTTTAATATAATCTCTGATAATCTCTGCCTTCTTAAAAAGGTTCCTT
TATTCATTTACAAGTGCATGGGTCACACTTGCAGTCGGATCCACACTTGCATGCATCGTT
CTCAGCGCTGCCCTCTCCAGAAGCCTCATACTGATTCTTCATCGCCGGTGCAACGCCAAA
GACAAAAGTCTCAGCTGCGGTCGTCTCACCGGAGAATCCCAAATCTGGGTACATTTTGCA
ACCTCCGCAACCGTTGCCGCACTTGCAGCCAGATCCACAACCACAGTTTCCTCCACAGCA
AGACATTTTCTCTCAAGAAAGACCGAATAAATAGTAGAGAACGTTTTAAATTAGATTGAT
CGTTTATAGAAAGTTAAATCACCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B490JQ U 4
AF RR4B711TF C 1
BS 1 3 RR4B711TF
BS 4 157 RR4B490JQ
BS 158 158 RR4B711TF
BS 159 287 RR4B490JQ
BS 288 564 RR4B711TF

RD RR4B490JQ 285 0 0
GGAATACTAGTATTATATTCAGAGAATTATTCAACTCCATTCCATAGAAGTACAAACTGA
CTCATCCGTCACACATGGCAGAGACATCCAGATATCACGTCAACATAAACGAAAACCATT
ACAGGCTAAAAGACAAAAGGCTGCAGCCATTATTGCACTATAAACCAAACCTAGAACATC
ATTTGGGTTACTTTAATATAATCTCTGATAATCTCTGCCTTCTTAAAAAGGTTCCTTTAT
TCATTTACAAGTGCATGGGTCACACTTGCAGTCGGATCCACACT
C

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR4B711TF 564 0 0
ATTGGAATACTAGTATTATATTCAGAGAATTATTCAACTCCATTCCATAGAAGTACAAAC
TGACTCATCCGTCACACATGGCAGAGACATCTAGATATCACGTCAACATAAACGAAAACC
ATTACAGGCTAAAAGACAAAAGGCTGCAGCCATTATTACACTATAAACCAAACCTAGAAC
ATCATTTGGGTTACTTTAATATAATCTCTGATAATCTCTGCCTTCTTAAAAAGGTTCCTT
TATTCATTTACAAGTGCATGGGTCACACTTGCAGTCGGATCCACACTTGCATGCATCGTT
CTCAGCGCTGCCCTCTCCAGAAGCCTCATACTGATTCTTCATCGCCGGTGCAACGCCAAA
GACAAAAGTCTCAGCTGCGGTCGTCTCACCGGAGAATCCCAAATCTGGGTACATTTTGCA
ACCTCCGCAACCGTTGCCGCACTTGCAGCCAGATCCACAACCACAGTTTCCTCCACAGCA
AGACATTTTCTCTCAAGAAAGACCGAATAAATAGTAGAGAACGTTTTAAATTAGATTGAT
CGTTTATAGAAAGTTAAATCACCC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL7064Contig1 777 2 12 U
GCAGCAGCTTATTATCAGGACATCCCCAGAGGTTTGTGAGGAATGCATAGGAGAGAGGGA
GAGCTGTGAGTTGATGCAGAAGCTCACTTATTCTGAAGGAGATGTATATGTCTGCCTGGT
GCGCGGAAAGGAAGCTCCAAAGTCAATGTTAAATGCATCTGACACGAGCTTTGAGGTGGA
CCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAACTAACTATGGGAAGCATACCAGCCTGAAAGT
TTCTGCAACGACCACTGTATACCAGCTAAAGATGATGATATGGCAACTACTTGGGGTGAT
GAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCACACAAGTGATTGATCAGGAATCTGCAACCCT
TGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAGCTTTGGGTGAGAGATACCGAGATGCATGA
ACACCGCGATATTGCTGATGAGCTCTGCGATACAAATTCAGGGCCTCAAGATATAGAGGA
AGGTTTTCGCGGCACACTTTTGACTGGAGATATCACTTTTGAAGCCTGCTAGTTATTCTC
AGTTAGTTGTGCAGGAGATGATGGATGACAGTTTTTTTTTTGTAAAGGCAAGGGCTTTGA
AGCTTTATTTTGTGCGCAAAAGATATTTGATGAAAGCTTGCAAATGCCTGAATCCGTAGA
TGTTTAGGCGTGGATGGATTTGAAGCTTTTTTCTGTGTGTGTTTCTGGTGTGCGGTCTAT
TTTAATGTGACATTTGTGTTACAAAACTTCTTTTAAGTGCATATTGGAAGTTCATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH54TF U 1
AF RR4CH54JQ C 38
BS 1 651 RR4CH54TF
BS 652 652 RR4CH54JQ
BS 653 683 RR4CH54TF
BS 684 684 RR4CH54JQ
BS 685 691 RR4CH54TF
BS 692 692 RR4CH54JQ
BS 693 714 RR4CH54TF
BS 715 715 RR4CH54JQ
BS 716 724 RR4CH54TF
BS 725 725 RR4CH54JQ
BS 726 739 RR4CH54TF
BS 740 777 RR4CH54JQ

RD RR4CH54TF 746 0 0
GCAGCAGCTTATTATCAGGACATCCCCAGAGGTTTGTGAGGAATGCATAGGAGAGAGGGA
GAGCTGTGAGTTGATGCAGAAGCTCACTTATTCTGAAGGAGATGTATATGTCTGCCTGGT
GCGCGGAAAGGAAGCTCCAAAGTCAATGTTAAATGCATCTGACACGAGCTTTGAGGTGGA
CCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAACTAACTATGGGAAGCATACCAGCCTGAAAGT
TTCTGCAACGACCACTGTATACCAGCTAAAGATGATGATATGGCAACTACTTGGGGTGAT
GAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCACACAAGTGATTGATCAGGAATCTGCAACCCT
TGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAGCTTTGGGTGAGAGATACCGAGATGCATGA
ACACCGCGATATTGCTGATGAGCTCTGCGATACAAATTCAGGGCCTCAAGATATAGAGGA
AGGTTTTCGCGGCACACTTTTGACTGGAGATATCACTTTTGAAGCCTGCTAGTTATTCTC
AGTTAGTTGTGCAGGAGATGATGGATGACAGTTTTTTTTTTGTAAAGGCAAGGGCTTTGA
AGCTTTATTTTGTGCGCAAAAGATATTTGATGAAAGCTTGCAAATGCCTGA*TCCGTAGA
TGTTTAGGCGTGGATGGATTTGA*GCTTTTT*CTGTGTGTGTTTCTGGTGTGCG*TCTAT
TTTA*TGTGACATTTGTGT
ACAAACT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4CH54JQ 740 0 0
GAGGAATGCATAGGAGAGAGGGAGAGCTGTGAGTTGATGCAGAAGCTCACTTATTCTGAA
GGAGATGTATATGTCTGCCTGGTGCGCGGAAAGGAAGCTCCAAAGTCAATGTTAAATGCA
TCTGACACGAGCTTTGAGGTGGACCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAACTAACTAT
GGGAAGCATACCAGCCTGAAAGTTTTTGCAACGACCACTGTATACCAGCTAAAGATGATG
ATATGGCAACTACTTGGGGTGATGAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCACACAAGTG
ATTGATCAGGAATTTGCAACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAGCTTTGG
GTGAGAGATACCGAGATGCATGAACACCGCGATATTGCTGATGAGCTTTGCGATACAAAT
TCAGGGCCTCAAGATATAGAGGAAGGTTTTCGCGGCACACTTTTGACTGGAGATATCACT
TTTGAAGCCTGCTAGTTATTTTCAGTTAGTTGTGCAGGAGATGATGGATGACAGTTTTTT
TTTTGTAAAGGCAAGGGCTTTGAAGCTTTATTTTGTGCGCAAAAGATATTTGATGAAAGC
TTGCAAATGCCTGAATCCGTAGATGTTTAGGCGTGGATGGATTTGAAGCTTTTTTCTGTG
TGTGTTTCTGGTGTGCGGTCTATTTTAATGTGACATTTGTGTTACAAAACTTCTTTTAAG
TGCATATTGGAAGTTCATCT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7065Contig1 869 2 3 U
AGGTGAGAGGGGTCCACTCCGGGACGGCTACTCTGAAGGACGCGACGTCCGAAGCTATAA
GGGATTGGGTGACGAACGTGGAGACGACTCATTACATATTGGGATCTGTGGCGGGTCCTC
ATCCTTACCCTATGATGGTTAGAGATTTTCATGCGGTGATTGGTAAAGAGACGAGGAGAC
AAGCGATGGAGAAATGGGGTGGGAAGCCTGATGTATTGGTGGCTTGTGTTGGTGGTGGCT
CGAATGCCATGGGACTCTTTCATGAGTTTGTTGATGATGCTGAGGTTCGGATGATTGGTG
TTGAAGCTGCTGGATTTGGATTGGATAGTGGTAAACACGCTGCCACGTTGACGAAAGGAG
ATGTCGGTGTACTCCACGGAGCTATGAGTTACTTGCTGCAAGATGATGATGGACAAATCA
TTGAACCACACTCCATCAGTGCCGGTTTGGACTACCCTGGAGTTGGACCTGAGCATAGTT
TCCTTAAAGACATGGGACGTGCTGAATACTATAGTGTTACCGATGAAGAAGCCTTGGAAG
CGTTCAAGAGAGTGTCTCGGTTGGAGGGAATAATCCCTGCTTTGGAGACGTCACATGCAC
TGGCTCATCTCGAGAAGCTTTGTCCGACGTTACCTGATGGAGCCGGAGTTGTTTTAAACT
TCAGCGGGAGAGGTGATAAGGATGTTCAGACTGCCATCAAGTATCTTGAAGTTTAAAGAG
AATAATACTTTCGTTTTCAGATAGTGACATTTTCTTTTAGTGGTTTTGTCAGTTCTTGCT
TCTGGTTTGGGAAACTCAAAATAGGAACAAAGTATCAAGAAGAGAACGAAAATTTTAAGA
ATGTAATCCTATAAATAAGACTTATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA83TF U 6
AF RR4HA83JQB C 1
BS 1 5 RR4HA83JQB
BS 6 674 RR4HA83TF
BS 675 869 RR4HA83JQB

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TGGGTGACGAACGTGGAGACGACTCATTACATATTGGGATCTGTGGCGGGTCCTCATCCT
TACCCTATGATGGTTAGAGATTTTCATGCGGTGATTGGTAAAGAGACGAGGAGACAAGCG
ATGGAGAAATGGGGTGGGAAGCCTGATGTATTGGTGGCTTGTGTTGGTGGTGGCTCGAAT
GCCATGGGACTCTTTCATGAGTTTGTTGATGATGCTGAGGTTCGGATGATTGGTGTTGAA
GCTGCTGGATTTGGATTGGATAGTGGTAAACACGCTGCCACGTTGACGAAAGGAGATGTC
GGTGTACTCCACGGAGCTATGAGTTACTTGCTGCAAGATGATGATGGACAAATCATTGAA
CCACACTCCATCAGTGCCGGTTTGGACTACCCTGGAGTTGGACCTGAGCATAGTTTCCTT
AAAGACATGGGACGTGCTGAATACTATAGTGTTACCGATGAAGAAGCCTTGGAAGCGTTC
AAGAGAGTGTCTCGGTTGGAGGGAATAATCCCTGCTTTGGAGACGTCACATGCACTGGCT
CATCTCGAGAAGCTTTGTCCGACGTTACCTGATGGAGCCGGAGTTGTTTTAAACTTCAGC
GGGAGAGGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4HA83JQB 869 0 0
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GGGATTGGGTGACGAACGTGGAGACGACTCATTACATATTGGGATCTGTGGCGGGTCCTC
ATCCTTACCCTATGATGGTTAGAGATTTTCATGCGGTGATTGGTAAAGAGACGAGGAGAC
AAGCGATGGAGAAATGGGGTGGGAAGCCTGATGTATTGGTGGCTTGTGTTGGTGGTGGCT
CGAATGCCATGGGACTCTTTCATGAGTTTGTTGATGATGCTGAGGTTCGGATGATTGGTG
TTGAAGCTGCTGGATTTGGATTGGATAGTGGTAAACACGCTGCCACGTTGACGAAAGGAG
ATGTCGGTGTACTCCACGGAGCTATGAGTTACTTGCTGCAAGATGATGATGGACAAATCA
TTGAACCACACTCCATCAGTGCCGGTTTGGACTACCCTGGAGTTGGACCTGAGCATAGTT
TCCTTAAAGACATGGGACGTGCTGAATACTATAGTGTTACCGATGAAGAAGCCTTGGAAG
CGTTCAAGAGAGTGTCTCGGTTGGAGGGAATAATCCCTGCTTTGGAGACGTCACATGCAC
TGGCTCATCTCGAGAAGCTTTGTCCGACGTTACCTGATGGAGCCGGAGTTGTTTTAAACT
TCAGCGGGAGAGGTGATAAGGATGTTCAGACTGCCATCAAGTATCTTGAAGTTTAAAGAG
AATAATACTTTCGTTTTCAGATAGTGACATTTTCTTTTAGTGGTTTTGTCAGTTCTTGCT
TCTGGTTTGGGAAACTCAAAATAGGAACAAAGTATCAAGAAGAGAACGAAAATTTTAAGA
ATGTAATCCTATAAATAAGACTTATGTTG

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

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CTTATCTACCGAGGTGGATTGGGTACGGGTTCGGATCGCTTCTTCTCCTCAATCACTTCT
CTGCTTCACCTCCAATCAGCGAATCGCAGCTGAGATCAGAGGCTTTAGGGTTATCACTTG
CTGCCTTCTCCATAGCTTTACCTTACTTTGGCAAGTTCCTCAAGGGTTCTGAAGTAGAGA
AGAGAAGCTTACCTGAAGAGGGAGAACAGGTTTTTGTGATATCATCAAGTATTGGGGACT
CTTTGAAGGAGGACTTGGCTTGGGCTACTTATGTTCTGTTGAGGAATACAAGTACCGCTG
CTGTGATGATATCGATTCAAGGTGAGCTTTGCGTTCGTGGGTACTGGAACTGCCCTGGTC
AAATGTCAAAGGCTCAACTACACGACTGGTTCAAGAGAAAGGTTGATGAGATAGGCCTGG
CTGATGTGAAGGAGACTCTTTATTTCCCTCAATATGCAGGTTCTGGATTGTCGTGGGATG
TTCTTCCTGATGGGACGCGTTCTGTTTTTGTGCAACCTCTGCTACGAAATGTAAATGAAT
CGGAGAAAGTGGATGGGTTTTTGATGGTGGCTTCTACTGCTGGATATGCATATAGCGATA
AAGATAGAGCCTGGATTGGAGCCATGGCTGATAAATTCAGAGGTTAGCTAGTTCTTATTG
GATGTATATGATAATAAGGATTTGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTTTTTTGTGCGTTTTTGT
TAAATCGACAAAACTTTCTCATGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4HA39TF U 1
AF RR4HA39JQB C 21
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CTTATCTACCGAGGTGGATTGGGTACGGGTTCGGATCGCTTCTTCTCCTCAATCACTTCT
CTGCTTCACCTCCAATCAGCGAATCGCAGCTGAGATCAGAGGCTTTAGGGTTATCACTTG
CTGCCTTCTCCATAGCTTTACCTTACTTTGGCAAGTTCCTCAAGGGTTCTGAAGTAGAGA
AGAGAAGCTTACCTGAAGAGGGAGAACAGGTTTTTGTGATATCATCAAGTATTGGGGACT
CTTTGAAGGAGGACTTGGCTTGGGCTACTTATGTTCTGTTGAGGAATACAAGTACCGCTG
CTGTGATGATATCGATTCAAGGTGAGCTTTGCGTTCGTGGGTACTGGAACTGCCCTGGTC
AAATGTCAAAGGCTCAACTACACGACTGGTTCAAGAGAAAGGTTGATGAGATAGGCCTGG
CTGATGTGAAGGAGACTCTTTATTTCCCTCA*TATGCAG*TTCTGGATTGTCGTGGGATG
TTCTTCCTGATGGGACGCGTTCTGTTTT*GTGCA*CCTCTGCTAC*AAATGTAAATGAAT
CG
AGAA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4HA39JQB 846 0 0
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GTCCTTCGCTTCACTTTCGGGATTCCTGGTCTAGACGAGTCTTATCTACCGAGGTGGATT
GGGTACGGGTTCGGATCGCTTCTTCTCCTCAATCACTTCTCTGCTTCACCTCCAATCAGC
GAATCGCAGCTGAGATCAGAGGCTTTAGGGTTATCACTTGCTGCCTTCTCCATAGCTTTA
CCTTACTTTGGCAAGTTCCTCAAGGGTTCTGAAGTAGAGAAGAGAAGCTTACCTGAAGAG
GGAGAACAGGTTTTTGTGATATCATCAAGTATTGGGGACTCTTTGAAGGAGGACTTGGCT
TGGGCTACTTATGTTCTGTTGAGGAATACAAGTACCGCTGCTGTGATGATATCGATTCAA
GGTGAGCTTTGCGTTCGTGGGTACTGGAACTGCCCTGGTCAAATGTCAAAGGCTCAACTA
CACGACTGGTTCAAGAGAAAGGTTGATGAGATAGGCCTGGCTGATGTGAAGGAGACTCTT
TATTTCCCTCAATATGCAGGTTCTGGATTGTCGTGGGATGTTCTTCCTGATGGGACGCGT
TCTGTTTTTGTGCAACCTTTGCTACGAAATGTAAATGAATCGGAGAAAGTGGATGGGTTT
TTGATGGTGGCTTCTACTGCTGGATATGCATATAGCGATAAAGATAGAGCCTGGATTGGA
GCCATGGCTGATAAATTCAGAGGTTAGCTAGTTCTTATTGGATGTATATGATAATAAGGA
TTTGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTTTTTTGTGCGTTTTTGTTAAATCGACAAAACTTTCTC
ATGGTG

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

CO CL7067Contig1 684 2 3 U
GCTTCTTAAAAGTAATATAGATTCAATTTATTCGGAAGTTTATGACAGATTCTGATACAA
TAAGAGAAAACAAACAAGCCTTTCTAGTCTTTCTTCAATTCTCAAAACAAGATACAAAAT
GTACCAAGAAACATAGTTGGAGATGTGAGCTTTAGGGACATGGTTTCTAAGTATGAGAAA
TGTTCTTGCCAAAGAGACCAGCTATGCCTTTCTCAGGGTCGTTTTGCTTCACAATGGACT
CACCAACCAATACCGCTTTAACTCCAGCGGCTTGTACATAGGCAATATCATCAGGTGTAA
ACAGACCAGATTCACCAACCACAATCATGTCTTTCTCGCGGATTTGTCTACCATGCTCCC
CTTCAAGAAGCTTCTTTGTATTACTAATGTCCACCTTAAATGTTTCAAGACTGCGGTTAT
TGATGCCAACAAGCTCGATCCCTTCTATTCCAAGAACACGACCCATCTCTCTCTCATCGT
GCAACTCAACAAGGGCAGCCAAACCAAGCTTCTTGGAGAGCTTAAGCAAGTAGGTTATTT
CCAGGTCAGTAAGTATTGCAGCAATGAGCAGTACTACGTCCGCACCTTTAGTCCGAGCAT
AGTAGATCTGCCATGGATCTACAACAAACTCTTTGCATAATAGGGGACACTTCACACCAG
CGCTTCTTATTGCTTCCAAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F811JQ U 1
AF RR4GA12JQ U 8
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TGATGCCAACAAGCTCGATCCCTTCTATTCCAAGAACACGACCCATCTCTCTCTCATCGT
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AGTAGATCTGCCATGGATCTACAACAAACTCTTTGCATAATAGGGGACACTTCACACCAG
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DS 

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GAAACATAGTTGGAGATGTGAGCTTTAGGGACATGGTTTCTAAGTATGAGAAATGTTCTT
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CAATACCGCTTTAACTCCAGCGGCTTGTACATAGGCAATATCATCAGGTGTAAACAGACC
AGATTCACCAACCACAATCATGTCTTTCTCGCGGATTTGTCTACCATGCTCCCCTTCAAG
AAGCTTCTTTGTATTACTAATGTCCACCTTAAATGTTTCAAGACTGCGGTTATTGATGCC
AACAAGCTCGATCCCTTCTATTCCAAGAACACGACCCATCTCTCTCTCATCGTGCAACTC
AACAAGGGCAGCCAAACCAAGCTTCTTGGAGAGCTTAAGCAAGTAGGTTATTTCCAGGTC
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CTGCCATGGATCTACAACAAACTCTTTGCATAATAGGGGACACTTCACACCAGCGCTTCT
TATTGCTTCCAA

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DS 



AS 1 2

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TCAGGGCAAGTTGGTGATTGTTGTAGATGATGAGGATAGAGAGAACGAAGGAGACTTGAT
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BQ
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AF RR4A037TF U 497
AF RR4A037TFB U 1
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DS 

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GGTGACTCGTAAGGAGAACGAGGAGAAACTCCGCACCGCCTTCACGGTTTCTGTGGATGC
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TGCGTCAAAAGATTCAAAGCCT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

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CCTTTTCCTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F758JQ C 1
AF RR4F758TF U 1
BS 1 611 RR4F758TF

RD RR4F758JQ 611 0 0
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GGCAAGATTGAGCTGCCACCGTGGACAGACATATTGAAGACTGGTAAACTCAAGGAGCTT
GCTCCTTATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCATCGATGGCGAGGAAAGTGTAC
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CAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGGAGGAAGATCACATCG
AGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTTGCGGGAAGGATCGCTGCTGCCGTTTAAAAATCA
AGATCGCAATGAACTGATTGTCATTTTTGAGATTAAGTTAAAATGGAATGAGTTGCCTTT
TGAAACTAATAGTGGATATAGACTTTGTTCTCATTTTTTGTTTTGACGAGTTATTTATTT
CCTTTTCCTGC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4F758TF 611 0 0
GGCCGACGTCGAAAGCAGAAGATCGGAGGGCGAGAGAACATAATGGCGACAGGGAAAACA
GTGAAGGATGTGTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTACGCTGCCCATCTCAAACGCTCC
GGCAAGATTGAGCTGCCACCGTGGACAGACATATTGAAGACTGGTAAACTCAAGGAGCTT
GCTCCTTATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCATCGATGGCGAGGAAAGTGTAC
TTGAGAGGTGGGCTTGGAGTCGGTGCCTTCCGCAGGATCTATGGAGGAAGCAAGAGGAAC
GGAAGCCGTCCTCCTCATTTCTGTAAGAGCAGTGGTGGTGTCGCTCGTCACATTCTTCAG
CAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGGAGGAAGATCACATCG
AGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTTGCGGGAAGGATCGCTGCTGCCGTTTAAAAATCA
AGATCGCAATGAACTGATTGTCATTTTTGAGATTAAGTTAAAATGGAATGAGTTGCCTTT
TGAAACTAATAGTGGATATAGACTTTGTTCTCATTTTTTGTTTTGACGAGTTATTTATTT
CCTTTTCCTGC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL7070Contig1 876 2 10 U
GTTTGATACAGAACAACATCCCATGAATACATCATTAATAATACAGAACAACATACAGTA
ACTGAAAGGTATCAGTTATACATCATATAAATAAGCTTTGGCTTATAGATAAAGCTCCCA
ATCACATCGTGGAAGATTACAAACTTACACTATACAACAAACGGTGGGTAACGTGGGATT
GATTTTCTACAGTTTTGACATGGTTTAAATACTTTTTGACAACAAGTATATCACAAAGTT
TTACCTTATGCCATATGATGAAAGAGACCCATCAGAGAGATTAAGGAAGCGGCTACATAT
TTCTCCCATGTACCGTATTTTGAGCTGAAAGTTCCACCGCCAAACTGCTGTGCGTACTCG
CAGATCACCGTCCGAGCGCAAGAGTCCCATGGCTTGGCTATGTCTTTGAGCGACATCGGC
TGTGACAAACTTCTTAGCAATATGTTGAATCTCGCCATTGCTTTGGATGAGAGGTCCTCG
TTCTCTTTGCTGGTTTCGACCGGGAGTTTATCCAGGAGAGATGGAGAGCCGTTGGGGTAG
CTACAAGGGACTAGCAGACGCAATGGTTGAATAGGAGACATTTGGGTTGATGAGAGATGA
GCCTTCAATGCTGGGCTGAGAGAAACAGCTATAAACGAAAATTTTACTGTTGTTCCTTCA
CACCCTTTCCTTGCTGTTGCTCCCTCACTCAGATCAGTACCATCTTCACCATCACTAATC
TCAACAACTGTATCTATCAGCCGCTGGTTTATTTCCTTGATTTCCTCCAATAGGGCATGC
TCGGTCTCAGTTCTTGCCTTCTTGCCATCAGAAGTCAGTAGATTCTAGATCTGATGTTCC
CGAACATGCAAACTGCTTGTAGTTGTCACCAACGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS20TF C 1
AF RR4AH69JQ U 89
BS 1 90 RR4FS20TF
BS 91 124 RR4AH69JQ
BS 125 125 RR4FS20TF
BS 126 391 RR4AH69JQ
BS 392 392 RR4FS20TF
BS 393 708 RR4AH69JQ
BS 709 709 RR4FS20TF
BS 710 776 RR4AH69JQ
BS 777 777 RR4FS20TF
BS 778 876 RR4AH69JQ

RD RR4FS20TF 784 0 0
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ATCACATCGTGGACGATTACAAACTTACACTATACAACAAACGGTGGGTAACGTGGGATT
GATTTTCTACAGTTTTGACATGGTTTAAATACTTTTTGACAACAAGTATATCACAAAGTT
TTACCTTATGCCATATGATGAAAGAGACCCATCAGAGAGATTCAGGAAGCGGCTACATAT
TTCTCCCATGTACCGTATTTTGAGCTGAAAGTTCCACCGCCAAACTGCTGTGCGTACTCG
CAGATCACCGTCCGAGCGCAAGAGTCCCATGGCTTGGCTATGTCTTTGAGCGACATCGGC
TGTGACAAACTTCTTAGCAATATGTTGAATCTCGCCATTGCTTTGGATGAGAGGTCCTCG
TTCTCTTTGCTGGTTTCGACCGGGAGTTTATCCAGGAGAGATGGAGAGCCGTTGGGGTAG
CTACAAGGGACTAGCAGACGCAATGGTTGAATAGGAGACATTTGGGTTGATGAGAGATGA
GCCTTCAATGCTGGGCTGAGAGGAACAGCTATAAACGAAAATTTTACTGTTGTTCCTTCA
CACCCTTTCCTTGCTGTTGCTCCCTCACTCAGATCAGTACCATCTTCACCATCACTAATC
TCAACAACTGTATCTATCAGCCGCTGGTTTATTTCCTTGATTTCCTCCAATAGGGCATGC
TCG
C

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4AH69JQ 788 0 0
AG
ATAAGCTTTGGCTTATAGATAAAGCTCCCAATCATATCGTGGAAGATTACAAACTTACAC
TATACAACAAACGGTGGGTAACGTGGGATTGATTTTCTACAGTTTTGACATGGTTTAAAT
ACTTTTTGACAACAAGTATATCACAAAGTTTTACCTTATGCCATATGATGAAAGAGACCC
ATCAGAGAGATTAAGGAAGCGGCTACATATTTCTCCCATGTACCGTATTTTGAGCTGAAA
GTTCCACCGCCAAACTGCTGTGCGTACTCGCAGATCACCGTCCGAGCGCAAGAGTCCCAT
GTCTTGGCTATGTCTTTGAGCGACATCGGCTGTGACAAACTTCTTAGCAATATGTTGAAT
CTCGCCATTGCTTTGGATGAGAGGTCCTCGTTCTCTTTGCTGGTTTCGACCGGGAGTTTA
TCCAGGAGAGATGGAGAGCCGTTGGGGTAGCTACAAGGGACTAGCAGACGCAATGGTTGA
ATAGGAGACATTTGGGTTGATGAGAGATGAGCCTTCAATGCTGGGCTGAGAGAAACAGCT
ATAAACGAAAATTTTACTGTTGTTCCTTCACACCCTTTCCTTGCTGTTGCTCCCTCACTC
AGATCAGTACCATCTTCATCATCACTAATCTCAACAACTGTATCTATCAGCCGCTGGTTT
ATTTCCTTGATTTCCTCCAATAGGGCGTGCTCGGTCTCAGTTCTTGCCTTCTTGCCATCA
GAAGTCAGTAGATTCTAGATCTGATGTTCCCGAACATGCAAACTGCTTGTAGTTGTCACC
AACGCT

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 2

CO CL7071Contig1 766 2 3 U
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CCTCCTCCTCATCAAGAATCGAGAGACCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGGCCGACTCCAG
AAACTCAAAGCTGTCTGTGAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGGAGCTGCTGCTGG
TAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTT
CCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGC
TGGTGGAGAGAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCTCCCTACGTAGCTAAGGC
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AGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAGTCTCTGACGTTAGTGAAGAGGA
GGATGCTGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGGCTAACAAGTTGAAGTTGGCA
GCATATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAATTGTTAACGAGGC
TGCTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTAAGCTATCACTATCTCCCACTGATTCTG
ATTCTGATTCTGATTCTGATTCTACGGGTAATGGAAAAGTTGTGCTATCTTCATGTTTGC
AGCTAAGTTTTTATGGCTCTATGTTTGTTATGATCATAGATTCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A574JQ C 1
AF RR4A574TF U 1
BS 1 35 RR4A574TF
BS 36 36 RR4A574JQ
BS 37 766 RR4A574TF

RD RR4A574JQ 766 0 0
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CCTCCTCCTCATCAAGAATCGAGAGACCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGGCCGACTCCAG
AAACTCAAAGCTGTCTGTGAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGGAGCTGCTGCTGG
TAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTT
CCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGC
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TGCTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTAAGCTATCACTATCTCCCACTGATTCTG
ATTCTGATTCTGATTCTGATTCTACGGGTAATGGAAAAGTTGTGCTATCTTCATGTTTGC
AGCTAAGTTTTTATGGCTCTATGTTTGTTATGATCATAGATTCTTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4A574TF 766 0 0
GGACAAACACGCAGTATTCCCTTTTACTCCTCCCC*TAATTTCAAACCCTAGCTCTTCCT
CCTCCTCCTCATCAAGAATCGAGAGACCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGGCCGACTCCAG
AAACTCAAAGCTGTCTGTGAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGGAGCTGCTGCTGG
TAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTT
CCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGC
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TGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAGGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGA
AGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAGTCTCTGACGTTAGTGAAGAGGA
GGATGCTGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGGCTAACAAGTTGAAGTTGGCA
GCATATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAATTGTTAACGAGGC
TGCTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTAAGCTATCACTATCTCCCACTGATTCTG
ATTCTGATTCTGATTCTGATTCTACGGGTAATGGAAAAGTTGTGCTATCTTCATGTTTGC
AGCTAAGTTTTTATGGCTCTATGTTTGTTATGATCATAGATTCTTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL7072Contig1 674 2 1 U
TCGGCACGGATTCCACCTGAGTTCTCTTCCTCAGTGCTTCACTAACTGAATCTCTCTCAC
GACTCAGAACCCTAATTTTGTCAAAAAACTCCTTCGATTTGGAGACTTTGCATTCCGATG
GGGACGTTTCACCGGAGCGGTGCTCCGAGAAGAAGTAATGAAAATGCAAAGCTTATCATC
ACGACAATCGTGGCAATGGTGTTTGGTTTTTTCATCGGTATCACTTTACCATCTGTTTCC
TTTACTAAGATTAACTTACCCTCAGGACTTATATCATCTTTTGATCTGTCCCTCTCTGGT
GGCGGCAGATCCCCTGAAGACTTTGGTTCTAGACAGTTTCCTAAGATATTTGTTCCAACC
AATCCTCATGGTGCTGAGCTACTCCCTCCTGGTATTATTGTAGCGGAATCAGATTTCTAC
TTGCGCAGATTATGGGGTGAACCTAGTGAGGATTTGAAGAAGAAACCAAAATATCTTGTA
ACGTTTACTGTTGGGTTTGAGCAGAGGAACAATATCAATGCAGCTGTTAAGAAGTTTTCT
GAAGATTTCCAAATTTTGCTGTTTCATTATGATGGCCGGACGACTGAGTGGGACCAGTTT
GAGTGGTCAAAGAAAGCAATCCATATCAGCGCCAAAAAGCAAACGAAATGGTGGTATGCA
AAGAGATTTTTGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E286TF U 1
AF RR4DT08TF U 1
BS 1 674 RR4DT08TF

RD RR4E286TF 611 0 0
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GACTCAGAACCCTAATTTTGTCAAAAAACTCCTTCGATTTGGAGACTTTGCATTCCGATG
GGGACGTTTCACCGGAGCGGTGCTCCGAGAAGAAGTAATGAAAATGCAAAGCTTATCATC
ACGACAATCGTGGCAATGGTGTTTGGTTTTTTCATCGGTATCACTTTACCATCTGTTTCC
TTTACTAAGATTAACTTACCCTCAGGACTTATATCATCTTTTGATCTGTCCCTCTCTGGT
GGCGGCAGATCCCCTGAAGACTTTGGTTCTAGACAGTTTCCTAAGATATTTGTTCCAACC
AATCCTCATGGTGCTGAGCTACTCCCTCCTGGTATTATTGTAGCGGAATCAGATTTCTAC
TTGCGCAGATTATGGGGTGAACCTAGTGAGGATTTGAAGAAGAAACCAAAATATCTTGTA
ACGTTTACTGTTGGGTTTGAGCAGAGGAACAATATCAATGCAGCTGTTAAGAAGTTTTCT
GAAGATTTCCAAATTTTGCTGTTTCATTATGATGGCCGGACGACTGAGTGGGACCAGTTT
GAGTGGTCAAA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4DT08TF 674 0 0
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GACTCAGAACCCTAATTTTGTCAAAAAACTCCTTCGATTTGGAGACTTTGCATTCCGATG
GGGACGTTTCACCGGAGCGGTGCTCCGAGAAGAAGTAATGAAAATGCAAAGCTTATCATC
ACGACAATCGTGGCAATGGTGTTTGGTTTTTTCATCGGTATCACTTTACCATCTGTTTCC
TTTACTAAGATTAACTTACCCTCAGGACTTATATCATCTTTTGATCTGTCCCTCTCTGGT
GGCGGCAGATCCCCTGAAGACTTTGGTTCTAGACAGTTTCCTAAGATATTTGTTCCAACC
AATCCTCATGGTGCTGAGCTACTCCCTCCTGGTATTATTGTAGCGGAATCAGATTTCTAC
TTGCGCAGATTATGGGGTGAACCTAGTGAGGATTTGAAGAAGAAACCAAAATATCTTGTA
ACGTTTACTGTTGGGTTTGAGCAGAGGAACAATATCAATGCAGCTGTTAAGAAGTTTTCT
GAAGATTTCCAAATTTTGCTGTTTCATTATGATGGCCGGACGACTGAGTGGGACCAGTTT
GAGTGGTCAAAGAAAGCAATCCATATCAGCGCCAAAAAGCAAACGAAATGGTGGTATGCA
AAGAGATTTTTGCA

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7073Contig1 868 2 2 U
GGATTCATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAATGAAATTCTTCATTTGTA
TTCTTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCTAGATTTCGATTTCTTCTACT
TTGTTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAA
CCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTG
GATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGA
TGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACT
TTTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACG
ATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCA
ATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCA
AAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGAATTCGTCGCATAATAGCC
AACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTG
TTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGC
TGATTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTC
TGCAACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATGATACCGTTTAATTATTTGCTTG
GTAACAGAATTATATATGTGATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CD82TF U 1
AF RR4CD82JQ C 405
BS 1 728 RR4CD82TF
BS 729 868 RR4CD82JQ

RD RR4CD82TF 731 0 0
GGATTCATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAATGAAATTCTTCATTTGTA
TTCTTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCTAGATTTCGATTTCTTCTACT
TTGTTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAA
CCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTG
GATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGA
TGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACT
TTTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACG
ATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCA
ATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCA
AAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGAATTCGTCGCATAATAGCC
AACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTG
TTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGC
TGATTTTT
ATT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CD82JQ 464 0 0
GAGCTCGACCAACACGATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTC
CTTCATGCCCTTACCAATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGAT
ATTGAGAGAGTGATCAAAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGAAT
TCGTCGCATAATAGCCAACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAAT
TTCATCAACTGTCCTGTTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAG
TTCTAGATCTCGCGGCTGATTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGG
TTTCTGTTTGTGTTTCTGCAACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATGATACCG
TTTAATTATTTGCTTGGTAACAGAATTATATATGTGATTTAAGC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7075Contig1 690 2 4 U
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AAGAAACTAAACTCCAGAACCTGCTTCCGTTTCTTGCACCTCTTTTAAGAAATTCAAGTG
AAGCACACAGGAACTTTTCGGTTATCAAGAGTTTGAGGCAGAGTGAAAACTTGCAGGTGA
AAGAAGAAATGTACAGACATAGGAAAGGAGTGGTGCAAGTAACAAGCGAGAGCATGTGTA
CGTTGTGCAATAAGAAGATTGGGACAAGCGTCTTTGCTATTTATCCCAACGGGAAAACGT
TAGTTCATTTTATCTGCTTCGAAGATTCTCAAGGCATGAAAGCTGTCTCTAAGACATCAC
ATGGAAGAAGACAGATGAGATAAAATTCATTACAGGTTTAAGATACTAAACCATCTTTCT
CTTTGTTTGTTGGTTTGTAGAGTTTTTGAGCTTATCTTGGCGGATGTGGTTTAACGAATG
AAGCTTTCTGTCACAAAATTAAACCAAATTAAACCAAAAATAAGATTTTAACTTTTAAAA
AAAGCTTTTAACAAAAGACAAAAAAAAAACTTCATTTCTTTGATTTCGTTACAAGTAAGT
AAAATGTCAACAAAGATTTCAACTAGATTGTTTTTCTTTTGGGTCAAAGGAGTAGTTAGA
ATCTTCAGAAACTCGTCTTTCCTACTCTCA


BQ
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AF RR4DQ95TF U 1
AF RR4DV20TF U 1
BS 1 296 RR4DQ95TF
BS 297 297 RR4DV20TF
BS 298 614 RR4DQ95TF
BS 615 690 RR4DV20TF

RD RR4DQ95TF 614 0 0
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AAGAAACTAAACTCCAGAACCTGCTTCCGTTTCTTGCACCTCTTTTAAGAAATTCAAGTG
AAGCACACAGGAACTTTTCGGTTATCAAGAGTTTGAGGCAGAGTGAAAACTTGCAGGTGA
AAGAAGAAATGTACAGACATAGGAAAGGAGTGGTGCAAGTAACAAGCGAGAGCATGTGTA
CGTTGTGCAATAAGAAGATTGGGACAAGCGTCTTTGCTATTTATCCCAACGGGAAAGCGT
TAGTTCATTTTATCTGCTTCGAAGATTCTCAAGGCATGAAAGCTGTCTCTAAGACATCAC
ATGGAAGAAGACAGATGAGATAAAATTCATTACAGGTTTAAGATACTAAACCATCTTTCT
CTTTGTTTGTTGGTTTGTAGAGTTTTTGAGCTTATCTTGGCGGATGTGGTTTAACGAATG
AAGCTTTCTGTCACAAAATTAAACCAAATTAAACCAAAAATAAGATTTTAACTTTTAAAA
AAAGCTTTTAACAAAAGACAAAAAAAAAACTTCATTTCTTTGATTTCGTTACAAGTAAGT
AAAATGTCAACAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4DV20TF 690 0 0
GAGAAGGACAATGATGGGAGAGGATCAATGGTGCTGCACAAGCCCTCAAGCTTTTACCTA
AAGAAACTAAACTCCAGAACCTGCTTCCGTTTCTTGCACCTCTTTTAAGAAATTCAAGTG
AAGCACACAGGAACTTTTCGGTTATCAAGAGTTTGAGGCAGAGTGAAAACTTGCAGGTGA
AAGAAGAAATGTACAGACATAGGAAAGGAGTGGTGCAAGTAACAAGCGAGAGCATGTGTA
CGTTGTGCAATAAGAAGATTGGGACAAGCGTCTTTGCTATTTATCCCAACGGGAAAACGT
TAGTTCATTTTATCTGCTTCGAAGATTCTCAAGGCATGAAAGCTGTCTCTAAGACATCAC
ATGGAAGAAGACAGATGAGATAAAATTCATTACAGGTTTAAGATACTAAACCATCTTTCT
CTTTGTTTGTTGGTTTGTAGAGTTTTTGAGCTTATCTTGGCGGATGTGGTTTAACGAATG
AAGCTTTCTGTCACAAAATTAAACCAAATTAAACCAAAAATAAGATTTTAACTTTTAAAA
AAAGCTTTTAACAAAAGACAAAAAAAAAACTTCATTTCTTTGATTTCGTTACAAGTAAGT
AAAATGTCAACAAAGATTTCAACTAGATTGTTTTTCTTTTGGGTCAAAGGAGTAGTTAGA
ATCTTCAGAAACTCGTCTTTCCTACTCTCA

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL7076Contig1 926 2 4 U
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TAGGGGTTTGCCTGCAAATGATGAGCTTACTTGTGCTGCAAGCCAACGCCAGGGCTTTCC
TAGTGTTTGGAGATTCCCTCGTAGACAATGGTCTTAACATTCCAGATCTCATCAGTGAGC
ATTTGGGTCAAGCTTCTCCATTGCCTTACCTGAGTCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCC
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TTCTGAACATAATTCGGATCACGAAGCAGTTGGAGTACTTCGAGCAGTACAAAGTAAGGG
TGAGTGGATTGGTCGGAGAAGAAGAGATGGAGCGGCTCGTTAACGGAGCACTGGTTCTAA
TAACACTAGGAGGCAACGATTTCGTCAACAACTACTACTTGGTCCCTTTCTCTTCGCCTT
TTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCTAGTAGAATCATTGCTCAACAAATCCTCAA
CGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAACCTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCAC
AACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTCCCACTCTATGTTCTCTTTTAATTGTTTGA
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TGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAATCGCCAATTGTTACTTCAGAAGTAATATCT
GTTTTCTAGCATTCTTTCCAATGTTCTTTCCATCTTTTCATTTTTATTTGTAATCAAATT
AAATGGTAACAGATATTTTCTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BY89TF U 1
AF RR4BY89JQ C 184
BS 1 689 RR4BY89TF
BS 690 690 RR4BY89JQ
BS 691 707 RR4BY89TF
BS 708 926 RR4BY89JQ

RD RR4BY89TF 707 0 0
GGATCCCATCTCCAAGCAAACACCTAAACAGAGTTCACAGCCTCATATACATACAGATTA
TACAATTCTTTAGCCGTTTGAGTACAACAATGACGAACTCGGTGGCTAATGTTGCACTAC
TAGGGGTTTGCCTGCAAATGATGAGCTTACTTGTGCTGCAAGCCAACGCCAGGGCTTTCC
TAGTGTTTGGAGATTCCCTCGTAGACAATGGTCTTAACATTCCAGATCTCATCAGTGAGC
ATTTGGGTCAAGCTTCTCCATTGCCTTACCTGAGTCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCC
TGATTGGCGCCAACTTTGCTTCCGCTGGTATCGGAATCCTTAACGACACCGGTATCCAGT
TTCTGAACATAATTCGGATCACGAAGCAGTTGGAGTACTTCGAGCAGTACAAAGTAAGGG
TGAGTGGATTGGTCGGAGAAGAAGAGATGGAGCGGCTCGTTAACGGAGCACTGGTTCTAA
TAACACTAGGAGGCAACGATTTCGTCAACAACTACTACTTGGTCCCTTTCTCTTCGCCTT
TTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCTAGTAGAATCATTGCTCAACAAATCCTCAA
CGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAACCTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCAC
AACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAAT*CCCACTCTATGTTCTCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4BY89JQ 743 0 0
TGTTTGGAGATTCCCTCGTAGACAATGGTCTTAACATTCCAGATCTCATCAGTGAGCATT
TGGGTCAAGCTTCTCCATTGCCTTACCTGAGTCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCCTGA
TTGGCGCCAACTTTGCTTCCGCTGGTATCGGAATCCTTAACGACACCGGTATCCAGTTTC
TGAACATAATTCGGATCACGAAGCAGTTGGAGTACTTCGAGCAGTACAAAGTAAGGGTGA
GTGGATTGGTCGGAGAAGAAGAGATGGAGCGGCTCGTTAACGGAGCACTGGTTCTAATAA
CACTAGGAGGCAACGATTTCGTCAACAACTACTACTTGGTCCCTTTCTTTTCGCCTTTTG
GGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCTAGTAGAATCATTGCTCAACAAATCCTCAACGG
TTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAACCTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCACAAC
TTAATTTTCTGTTCATCTCTCCAAATTCCCACTCTATGTTCTCTTTTAATTGTTTGATTT
TCTCTTTAATTATGTATTCGACATGGCTGCTTTAAATAGTTTCCATGAGTTATGTTGTGT
GTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAATCGCCAATTGTTACTTCAGAAGTAATATCTGTT
TTCTAGCATTCTTTCCAATGTTCTTTCCATCTTTTCATTTTTATTTGTAATCAAATTAAA
TGGTAACAGATATTTTCTTTTCG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7077Contig1 884 2 2 U
GTCATTGTTGAGGAAAGCACTAAATCCAATGTTTCCGTAAAGCATGTTACCATTCAAATA
GCTAAAAGAACACGTTGAAACAAATACTCCCTCCGTTTCATATTAAGTGTCGTTTTAGAG
AATTTTTTTTCGTTGCAAAATAAGTGTCGTTTTAAAGTTTCAATGCAAAATTTATTAACT
TTATTCTCCATTCTATTTTTCTATTGGTTGAATTGTATCGGTAATGATGTTTTTATATTG
AAAATATGCAAAATTAAATGCTTTCTTAAACCGTGTGCACAAGTCTAAAACGACACTCAT
AATGAAGCTGAGGGAGTATATTATTCGTCGGTAGTCATGTGTTATGATCACATTAAAAGC
TCTTCAACTCTTTAAAACTCTTGATCTTAGTAGAGTACTTACGTATGTTCAGGTGCTTTT
CCTAGTGACTGAACTTCACCACTCAAATTGTTAAACGATAAATCACTGCAGCAAACACCA
TCTTAAAAACTAAATAAATGGATTTTTTTTTAGTATATATATAAAGCTGACACGGCGAAA
TTGCAATTAACCAGGTTGAGATATTAATCAGTTGAATAAGTTTCAACATGTATTAAAAAT
ACTCTTCCAGGCTGGATAGACAGGCATATCAACCAATCAAATAGATTTCGACAATAATGG
CATCATAAAAAAGTGTTTGCATTCTTCTAAAAAAATATTACTCTAATTCAACAAGTGGTA
AAGATGAGGACAGATGATAATAATAAAGCGCAAATGACTAACATATAGACAAGAAATATG
GGAAAACATGAAATAAACTAGAAAAAGATATTAAATAGCAGAGTTAATGGTGTTTGGTTT
TGAAGATCAAACCATATAACACAATCCTCTTAACATTTACGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GD42TF U 1
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TCTTAAAAACTAAATAAATGGATTTTTTTTTAGTATATATATAAAGCTGACACGGCGAAA
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CATCATAAAAAAGTGTTTGCATTCTTCTAAAAAA

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DS 



AS 1 2

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AATGAGAATATACCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H271JQ U 1
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DS 

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CC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H072JQ C 1
AF RR4H072TF U 1
BS 1 610 RR4H072TF

RD RR4H072JQ 610 0 0
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ATGGAACAGC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4H072TF 610 0 0
GGCCTTGCTCCTCAAAAGTAGGGTTTTGCGAGCTTAGAAAGGAGGAAGCAGCGGCGCATC
AGTTCAACACCACCAGAAAAGCTCACGATGGCTAGGATTAAGGTTCACGAGCTTAGAGAG
AGATCGAAGACCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGAATTCAAGGCCGAGCTCGCCCTCCTC
CGTGTAGCTAAAGTCACCGGAGGCGCCCCTAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTCGTGAGG
AAATCGATTGCTCAGGTGCTGACAGTGATCTCACAGAAACAGAAGCTTGCACTAAGGGAA
GCATACAAGAGCAAGAAGTTCTTGCCTCTCGATCTCCGTCCCAATAAGACTCGTGCTATC
CGCAGACGTCTTACCAAGCATCAGGCGTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAG
ATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTAGTTTCGTTTCTACTTGCTT
AGTTAGCTACCAGAAATGATGATTCAACTCTTTTTGATTATTCGCTTATGTATTAACCAT
TTTTATTTTTGTTTCTCGCTCAAGTTTTGTTATGGAATTTTAGCAAAAAGAAAGTTTGTT
ATGGAACAGC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7081Contig1 832 2 2 U
AGACTGATCTTTATGGTATGTTTATTTCACATGAATACGTTCTATTTTGATTTTTGGACA
TGCTCTTCACCGACATAATTATGATTGAGGAGGACTTTCAGAAAATGATGGAGCTTAAAG
CTCGTGCAGAGGCTGCTGATATCGCAAAGTCATAATTCCTAGCCACTGTTTCTCATGAGA
TACGTACTCCAATGGTTAGTGTTCTAGGGATGCTGAAGTTGCTGATGGACACTGATCTTG
ACGCTAAACAAATGGACTCTGCTGAAACCGCTCACGGCAGTGGGAAAGATCTCATATCGT
TGATAAACGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAGTCAGGAAGGATTGAGCTCGAAAACG
TGCCTTTTGATCTCCGCTTTTTCCTGGATAATGTGTCATCACTCCTCTCTGGCAAGGTTG
CTGAAAAAAGGAATCGAGTCTTTTCACCGGCAGCATCTATTTGGTTCCATGACCAAGCTT
GGATTGTTACTGCAGAGGTGGCTACTTTCAAGCTATGAAGCACGGGGACGGCAATTCACT
ACCGTATCACGTACCAGCGGCGTTTCAGGGACGGGGACGTGGTGAGGACGGTGTGAGAAC
GTTTCCGAAACGTTTCAGAGTCGGTGGGGACGGCAAAGATTTGTGGAGACGGCGTAGTTA
GGTTTGGAAAACGTTTCTGAAACGTTTCTAACTTAAACTCAGTATATTATTTTGTAAAAG
ATTTGGTTATTTGCTTTTTTTTTTATGTCTTTAGTTTTGGAAAACAATTGAAAAAGGAAA
TACGTCCTTAGTTAAGCGTAGTTAAACAACTAGGATTACAAAGTTTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO94TF U 1
AF RR4AO94JQ C 56
BS 1 720 RR4AO94TF
BS 721 832 RR4AO94JQ

RD RR4AO94TF 720 0 0
AGACTGATCTTTATGGTATGTTTATTTCACATGAATACGTTCTATTTTGATTTTTGGACA
TGCTCTTCACCGACATAATTATGATTGAGGAGGACTTTCAGAAAATGATGGAGCTTAAAG
CTCGTGCAGAGGCTGCTGATATCGCAAAGTCATAATTCCTAGCCACTGTTTCTCATGAGA
TACGTACTCCAATGGTTAGTGTTCTAGGGATGCTGAAGTTGCTGATGGACACTGATCTTG
ACGCTAAACAAATGGACTCTGCTGAAACCGCTCACGGCAGTGGGAAAGATCTCATATCGT
TGATAAACGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAGTCAGGAAGGATTGAGCTCGAAAACG
TGCCTTTTGATCTCCGCTTTTTCCTGGATAATGTGTCATCACTCCTCTCTGGCAAGGTTG
CTGAAAAAAGGAATCGAGTCTTTTCACCGGCAGCATCTATTTGGTTCCATGACCAAGCTT
GGATTGTTACTGCAGAGGTGGCTACTTTCAAGCTATGAAGCACGGGGACGGCAATTCACT
ACCGTATCACGTACCAGCGGCGTTTCAGGGACGGGGACGTGGTGAGGACGGTGTGAGAAC
GTTTCCGAAACGTTTCAGAGTCGGTGGGGACGGCAAAGATTTGTGGAGACGGCGTAGTTA
GGTTTGGAAAACGTTTCTGAAACGTTTCTAACTTAAACTCAGTATATTATTTTGTAAAAG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AO94JQ 777 0 0
GGACATGCTCTTCACCGACATAATTATGATTGAGGAGGACTTTCAGAAAATGATGGAGCT
TAAAGCTCGTGCAGAGGCTGCTGATATCGCAAAGTCATAATTCCTAGCCACTGTTTCTCA
TGAGATACGTACTCCAATGGTTAGTGTTCTAGGGATGCTGAAGTTGCTGATGGACACTGA
TCTTGACGCTAAACAAATGGACTCTGCTGAAACCGCTCACGGCAGTGGGAAAGATCTCAT
ATCGTTGATAAACGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAGTCAGGAAGGATTGAGCTCGA
AAACGTGCCTTTTGATCTCCGCTTTTTCCTGGATAATGTGTCATCACTCCTCTCTGGCAA
GGTTGCTGAAAAAAGGAATCGAGTCTTTTCACCGGCAGCATCTATTTGGTTCCATGACCA
AGCTTGGATTGTTACTGCAGAGGTGGCTACTTTCAAGCTATGAAGCACGGGGACGGCAAT
TCACTACCGTATCACGTACCAGCGGCGTTTCAGGGACGGGGACGTGGTGAGGACGGTGTG
AGAACGTTTCCGAAACGTTTCAGAGTCGGTGGGGACGGCAAAGATTTGTGGAGACGGCGT
AGTTAGGTTTGGAAAACGTTTCTGAAACGTTTCTAACTTAAACTCAGTATATTATTTTGT
AAAAGATTTGGTTATTTGCTTTTTTTTTTATGTCTTTAGTTTTGGAAAACAATTGAAAAA
GGAAATACGTCCTTAGTTAAGCGTAGTTAAACAACTAGGATTACAAAGTTTTAAACC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL7082Contig1 805 2 8 U
GGAGCATGAAATCGTTCGCCGGAGTAAGCTCTCGAAACGTCGTTCACCTCTTTTTTTCCC
TTTTCCCTTTTCTCTATTTTTTTCTCTCAAACACGTGAATCTCCCCATCTTCTTCTTCTA
TCTCTCTCTCTCTCCTCGTGATTCTTTCAGGTTAGACGAACATCCCGAGCAGATTAACCT
TTTGAATTTTTTAGAGGAAGAAAAGTTATGGGATATCTGGATTTGGCGGTGTCGTGTTCA
AACCCGACGCAGACCGTTGAAACTCCGGCAAGCGGCGGAGGTCTCAGCCAGAACGGAAAA
TTCAGCTATGGATATGCGAGCTCCACGGGGAAGAGATCGTCCATGGAAAACTTGTGGGAG
AAGCAATAAAGAGAGGAAGCGCAGACAACATCACATGTGTCGTCGTTCGTTTCTTGGAGA
CGGCTTCGTCAAGCCACGTCAGCTCCTTGTCATCCGATAAAGCCAATTTGATGATGATGC
CGCCAGTTGGAGACCTCAAGCTCTCATCCAGTGAAAGTAAGCAAGTCCAGACAGAGGAAT
GTAGCGAGTCGAAGACCAGACCCTGCAAGTAGTGAAATGAACGTTAGTGGTTTAGGAGAT
GAGAGCGGCTGAAACACGCTTTTCTGAGTTTCCAGAGGAGATTAGTGACCGATAAGGTAA
ATAGCGTTCCCTCAAAGACAGCAAACAAAAACTTACAGATCCTTGATTGTGGTTGCATTG
CATTTTAGGATTACATGTGTATTTAATATGAAATGTATGTTTATGATTACATCTATTTGT
ATTTGGTTATGTATAGTTCATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G825TF U 1
AF RR4G825JQ C 108
BS 1 690 RR4G825TF
BS 691 691 RR4G825JQ
BS 692 728 RR4G825TF
BS 729 729 RR4G825JQ
BS 730 743 RR4G825TF
BS 744 744 RR4G825JQ
BS 745 786 RR4G825TF
BS 787 805 RR4G825JQ

RD RR4G825TF 786 0 0
GGAGCATGAAATCGTTCGCCGGAGTAAGCTCTCGAAACGTCGTTCACCTCTTTTTTTCCC
TTTTCCCTTTTCTCTATTTTTTTCTCTCAAACACGTGAATCTCCCCATCTTCTTCTTCTA
TCTCTCTCTCTCTCCTCGTGATTCTTTCAGGTTAGACGAACATCCCGAGCAGATTAACCT
TTTGAATTTTTTAGAGGAAGAAAAGTTATGGGATATCTGGATTTGGCGGTGTCGTGTTCA
AACCCGACGCAGACCGTTGAAACTCCGGCAAGCGGCGGAGGTCTCAGCCAGAACGGAAAA
TTCAGCTATGGATATGCGAGCTCCACGGGGAAGAGATCGTCCATGGAAAACTTGTGGGAG
AAGCAATAAAGAGAGGAAGCGCAGACAACATCACATGTGTCGTCGTTCGTTTCTTGGAGA
CGGCTTCGTCAAGCCACGTCAGCTCCTTGTCATCCGATAAAGCCAATTTGATGATGATGC
CGCCAGTTGGAGACCTCAAGCTCTCATCCAGTGAAAGTAAGCAAGTCCAGACAGAGGAAT
GTAGCGAGTCGAAGACCAGACCCTGCAAGTAGTGAAATGAACGTTAGTGGTTTAGGAGAT
GAGAGCGGCTGAAACACGCTTTTCTGAGTTTCCAGAGGAGATTAGTGACCGATAAGGTAA
ATAGCGTTCCCTCAAAGACAGCAAACAAAA*CTTACAGATCCTTGATTGTGGTTGCATTG
CATTTTAG*ATTACATGTGTATT*AATATGAAATGTATGTTTATGATTACATCTATTTGT
ATTTGG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4G825JQ 698 0 0
TCTTCTTCTTCTATCTCTCTCTCTCTCCTCGTGATTCTTTCAGGTTAGACGAACATCCCG
AGCAGATTAACCTTTTGAATTTTTTAGAGGAAGAAAAGTTATGGGATATCTGGATTTGGC
GGTGTCGTGTTCAAACCCGACGCAGACCGTTGAAACTCCGGCAAGCGGCGGAGGTCTCAG
CCAGAACGGAAAATTCAGCTATGGATATGCGAGCTCCACGGGGAAGAGATCGTCCATGGA
AAACTTGTGGGAGAAGCAATAAAGAGAGGAAGCGCAGACAACATCACATGTGTCGTCGTT
CGTTTCTTGGAGACGGCTTCGTCAAGCCACGTCAGCTCCTTGTCATCCGATAAAGCCAAT
TTGATGATGATGCCGCCAGTTGGAGACCTCAAGCTCTCATCCAGTGAAAGTAAGCAAGTC
CAGACAGAGGAATGTAGCGAGTCGAAGACCAGACCCTGCAAGTAGTGAAATGAACGTTAG
TGGTTTAGGAGATGAGAGCGGCTGAAACACGCTTTTCTGAGTTTCCAGAGGAGATTAGTG
ACCGATAAGGTAAATAGCGTTCCCTCAAAGACAGCAAACAAAAACTTACAGATCCTTGAT
TGTGGTTGCATTGCATTTTAGGATTACATGTGTATTTAATATGAAATGTATGTTTATGAT
TACATCTATTTGTATTTGGTTATGTATAGTTCATCTCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7083Contig1 804 2 5 U
GGACCAAAAAACAACAAAGAAGCTCTGTCCTCGTTGCAGCGAAAGCTCTACCAACAAGAC
GATGATTATCTCAGAGACCAACCTCAGAGAGATCTGCAAGTACCTCTTCAAAGAAGGAGT
ATTGTTTGCGAAGAAGGATTTCAACCTCGCAAAGCATCCGTTGATCGAGTCAGTACCAAA
CTTGCAAGTGATTAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTAGGGAGACGTT
CGCATGGATGCATTATTATTGGTTTTTGACCAATGAAGGCATTGAGTTCTTGAGAACTTA
TCTTAACCTTCCGTCAGATGTTGTACCTGCGACTTTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGG
CCGTCCTTTTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCACCCCGCTTTGAGGGAGA
CCGTCCCAGATATGGTGACCGTGATGGTTACCGTGCAGGGCCACGTGGTGGTGATGTTGA
AGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCCGCTGATTACCAGCCTTCTTTCCAAGGAAGTGGTGGTAG
GCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGTGGTTACAGCGCTGCAGCTCCATCTGGTTCCGGTTT
ACCCTGAAAGAGCTGTGCTTATCGTTAAGCAACTGAAAGACAGTTTTCAGTTTTGGCTTT
AGTTTTGTTTTTGTAATCCAAATCCGGAATCTATAATCTATCTATTTCTCTGACTTTTGG
TTTAAAGAAACAAATCCTATAATTTTCCAGTGTCAGTGTTAAATTCCACGTTTTTCTTAC
ATGAGTAAAACGGGTGCTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP25TF U 89
AF RR4CP25JQ C 1
BS 1 88 RR4CP25JQ
BS 89 688 RR4CP25TF
BS 689 689 RR4CP25JQ
BS 690 703 RR4CP25TF
BS 704 804 RR4CP25JQ

RD RR4CP25TF 615 0 0
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GCAAAGCATCCGTTGATCGAGTCAGTACCAAACTTGCAAGTGATTAAGCTCATGCAGAGT
TTCAAGTCCAAGGAGTACGTTAGGGAGACGTTCGCATGGATGCATTATTATTGGTTTTTG
ACCAATGAAGGCATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTTCCGTCAGATGTTGTACCT
GCGACTTTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGGCCGTCCTTTTGGTGGCCCACCTGGTGAT
CGCCCAAGAGGACCACCCCGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATATGGTGACCGTGATGGT
TACCGTGCAGGGCCACGTGGTGGTGATGTTGAAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCCGCTGAT
TACCAGCCTTCTTTCCAAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGTGGT
TACAGCGCTGCAGCTCCATCTGGTTCCGGTTTACCCTGAAAGAGCTGTGCTTATCGTTAA
GCAACTGAAAGACAGTTTTCAGTTTTGGCTTTAGTTTTGTTTTTGTAATCCAAATCCGGA
*TCTATAATCTATCT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4CP25JQ 804 0 0
GGACCAAAAAACAACAAAGAAGCTCTGTCCTCGTTGCAGCGAAAGCTCTACCAACAAGAC
GATGATTATCTCAGAGACCAACCTCAGAGAGATCTGCAAGTACCTCTTCAAAGAAGGAGT
ATTGTTTGCGAAGAAGGATTTCAACCTCGCAAAGCATCCGTTGATCGAGTCAGTACCAAA
CTTGCAAGTGATTAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTAGGGAGACGTT
CGCATGGATGCATTATTATTGGTTTTTGACCAATGAAGGCATTGAGTTCTTGAGAACTTA
TCTTAACCTTCCGTCAGATGTTGTACCTGCGACTTTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGG
CCGTCCTTTTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCACCCCGCTTTGAGGGAGA
CCGTCCCAGATATGGTGACCGTGATGGTTACCGTGCAGGGCCACGTGGTGGTGATGTTGA
AGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCCGCTGATTACCAGCCTTCTTTCCAAGGAAGTGGTGGTAG
GCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGTGGTTACAGCGCTGCAGCTCCATCTGGTTCCGGTTT
ACCCTGAAAGAGCTGTGCTTATCGTTAAGCAACTGAAAGACAGTTTTCAGTTTTGGCTTT
AGTTTTGTTTTTGTAATCCAAATCCGGAATCTATAATCTATCTATTTCTCTGACTTTTGG
TTTAAAGAAACAAATCCTATAATTTTCCAGTGTCAGTGTTAAATTCCACGTTTTTCTTAC
ATGAGTAAAACGGGTGCTTTGTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL7084Contig1 1031 2 6 U
GGACAAGAAAAAGCACTCTCACAGAGATAAGAAATCTGAAGCTTCTACTCTTCAAATGGC
ATCTTTCTCTTATTTCCAACACTATCCTCATTCTCTTCTTGATCCTCTTCTCTTCTCCAC
ACCCAACTCCTCTGTTAGGCTCTCTGGTTTCATAGACCAGAATCCTTTCGAATCACTACC
AAACACTTCTACCATCGTAGATACTTCCTTGAACCCGTTTCTTGAATCATATAATGTTGA
GAAAACCGAAAGCTCTGATGTTAAGAAACAGATCAACACTAATGCAACCGAAGCACTCAC
AGGCGACCAGCTTAGCGAAGGACCATTCACTACGTCCGCAGGAAGAAAACATCGTAGGAA
GACCAAAAATGGGTCTAAGTCCAAGGAAGGAGTTGAGGTAAGAAAAAACAAAAAACCAAG
AAATGGTAGCTCAAGCGAAAAAGAGAAGAGAGCGAGTGAACAAGAGCCTCCAAAAGATTA
CATTCACGTTAGACTAGAAGAGGCCAAGCTACTGATAGCCACAGCCTCGCTGAGAGGGCG
AGAAGGGAAAAGATAAGTGAACGGATGAGGACTCTGCAAAACCTTGTCCCAGGATGTGAT
AAGGTAACAGGGAAAGCCCTCATGTTGGATGAGATTATAAATTATGTACAGTCCTTGCAG
AATCAAGTTGAGCTAGCTTGCATAAGTCCAGTGGCCTATGACTTCGGTTCGGACCTTGAT
GGCATCATAGTTAGACCTGAGATGGAATCCGCAAACGTTGGAACGTCTTTTGCTAATGCA
ATACCAACAACTACTACTAATTTTTTTTCACTGTTGGATGATTCTATAATACCCGCACAG
GCACATTTTCAGGAAGATGGAGGGGAAAGGGAGCAGTTTGTAGACAGAAGTGGGTTCAAC
AACAACAACTTTTGTTCTTTCTTTTAATTAATCACATGTCGACACAAACACAAAAGCCTG
CTTTCGTTGATTCAATATCCTCAAATATGCAGGGAGGGGATAATATTTACGTAACCAGGG
CTGGTTTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FL48TF U 1
AF RR4FL48JQ C 359
BS 1 603 RR4FL48TF
BS 604 604 RR4FL48JQ
BS 605 706 RR4FL48TF
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BS 708 754 RR4FL48TF
BS 755 1031 RR4FL48JQ

RD RR4FL48TF 755 0 0
GGACAAGAAAAAGCACTCTCACAGAGATAAGAAATCTGAAGCTTCTACTCTTCAAATGGC
ATCTTTCTCTTATTTCCAACACTATCCTCATTCTCTTCTTGATCCTCTTCTCTTCTCCAC
ACCCAACTCCTCTGTTAGGCTCTCTGGTTTCATAGACCAGAATCCTTTCGAATCACTACC
AAACACTTCTACCATCGTAGATACTTCCTTGAACCCGTTTCTTGAATCATATAATGTTGA
GAAAACCGAAAGCTCTGATGTTAAGAAACAGATCAACACTAATGCAACCGAAGCACTCAC
AGGCGACCAGCTTAGCGAAGGACCATTCACTACGTCCGCAGGAAGAAAACATCGTAGGAA
GACCAAAAATGGGTCTAAGTCCAAGGAAGGAGTTGAGGTAAGAAAAAACAAAAAACCAAG
AAATGGTAGCTCAAGCGAAAAAGAGAAGAGAGCGAGTGAACAAGAGCCTCCAAAAGATTA
CATTCACGTTAGACTAGAAGAGGCCAAGCTACTGATAGCCACAGCCTCGCTGAGAGGGCG
AGAAGGGAAAAGATAAGTGAACGGATGAGGACTCTGCAAAACCTTGTCCCAGGATGTGAT
AAG*TAACAGGGAAAGCCCTCATGTTGGATGAGATTATAAATTATGTACAGTCCTTGCAG
AATCAAGTTGAGCTAGCTTGCATAAGTCCAGTGGCCTATGACTTCG*TTCGGACCTTGAT
GGCATCATAGTTAGACCTGAGATGGAATCCGCAA
C

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4FL48JQ 673 0 0
AAGACCAAAAATGGGTCTAAGTCCAAGGAAGGAGTTGAGGTAAGAAAAAACAAAAAACCA
AGAAATGGTAGCTCAAGCGAAAAAGAGAAGAGAGCGAGTGAACAAGAGCCTCCAAAAGAT
TACATTCACGTTAGACTAGAAGAGGCCAAGCTACTGATAGCCACAGCCTCGCTGAGAGGG
CGAGAAGGGAAAAGATAAGTGAACGGATGAGGACTCTGCAAAACCTTGTCCCAGGATGTG
ATAAGGTAACAGGGAAGGCCCTCATGTTGGATGAGATTATAAATTATGTACAGTCCTTGC
AGAATCAAGTTGAGCTAGCTTGCATAAGTCCAGTGGCCTATGACTTCGGTTCGGACCTTG
ATGGCATCATAGTTAGACCTGAGATGGAATCCGCAAACGTTGGAACGTCTTTTGCTAATG
CAATACCAACAACTACTACTAATTTTTTTTCACTGTTGGATGATTCTATAATACCCGCAC
AGGCACATTTTCAGGAAGATGGAGGGGAAAGGGAGCAGTTTGTAGACAGAAGTGGGTTCA
ACAACAACAACTTTTGTTCTTTCTTTTAATTAATCACATGTCGACACAAACACAAAAGCC
TGCTTTCGTTGATTCAATATCCTCAAATATGCAGGGAGGGGATAATATTTACGTAACCAG
GGCTGGTTTAGAG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL7085Contig1 518 2 1 U
GGAAGTTCTCACGTTCTGCAGTAAAGCATTAGACTTTAAATACAAAGAAACAAAGACAAT
CCATGGCGATCAGGGTTCCTCGCATGCTACAATCATCGAAGCAGATTCTCCGTCAATCAA
AAATGTTCTCACCCTCTTCCACCTCTAGCTATCTTGAAGTTCCAAAAGGCTACATGGCGG
TTTACGTAGGAGAAAGAAAGATGAAGAGATTTGTAGTTCCCATCTCGTACTTGAACCAAC
CTTCATTCCAAGATCTCCTAAGAAGGGCAGAGGAAGAATTTGGATATGATCATCCAATGG
GTGGCCTCACTATTTCTTGCAGTGAAGAAACCTTTATCGATCTTGCTTCTCGCCTCAACT
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AF RR4FC70TF U 1
AF RR4FC70JQ C 214
BS 1 648 RR4FC70TF
BS 649 814 RR4FC70JQ

RD RR4FC70TF 648 0 0
GGATCAGAATCTGTCTCTCTTGAGGCAGAAACTGAAGCAACAGTTTCTCTCTCTCCTCCC
TTTGCGTTAACAACAACACCTAATCCTGAACTGTGAAGGGCAATCCAAGTAGCCTTCCCT
TGATCACATGGCTTCCTTTGACGGACCAAAGTTCAAGATGACCGACGGCACTTACGTTCA
GACAAAATCCATCTATGTCGGATCATCAACAGACATCTCCCCTTACCCTCCCTCATAATA
GAAGACTCCATCACCAACTCAAACATAGCAGTAATCTTCGACGTTAACTGGGAGACATCG
ACCGAAGCATCAAAGTGGAGTCTCTCCTCAGTGAAGCTCAGCACTCGAAACCTCTGCCTC
TTCCTCAAACTCCCCAACCCTCCTTTTCACGGCAACAACCTCAACGATCTCCACCGTTTC
TTCGCTTCCAAGTTCGTGACCTTCGTCGGTGTCCAGATCGAGGAGGACTTGAACTTGCTC
AGAGAGAACCACGGTCTCGTAATAAGAAACGTGATCGAGGTCGGGAAGCTAGCTGCGGTG
GCTCGCGGGACTCTGCTGCTCGAGTATCTTGGGACTAGAGAGTTGGCTCACAGAGTGTTG
TGGTCTGATTTGAGCACGCTTGATTCGATCGAGTCTAAATGGGAGGAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4FC70JQ 601 0 0
CATCTCCCCTTACCCTCCCTCATAATAGAAGACTCCATCACCAACTCAAACATAGCAGTA
ATCTTCGACGTTAACTGGGAGACATCGACCGAAGCATCAAAGTGGAGTCTCTCCTCAGTG
AAGCTCAGCACTCGAAACCTCTGCCTCTTCCTCAAACTCCCCAACCCTCCTTTTCACGGC
AACAACCTCAACGATCTCCACCGTTTCTTCGCTTCCAAGTTCGTGACCTTCGTCGGTGTC
CAGATCGAGGAGGACTTGAACTTGCTCAGAGAGAACCACGGTCTCGTAATAAGAAACGTG
ATCGAGGTCGGGAAGCTAGCTGCGGTGGCTCGCGGGACTCTGCTGCTCGAGTATCTTGGG
ACTAGAGAGTTGGCTCACAGAGTGTTGTGGTCTGATTTGAGCAGGCTTGATTCGATCGAG
TCTAAATGGGAGGAGAAAGGTTCTGAAGAACGTCTCGAGGCTGCAGCTATCGAAGGTTGG
CTTATCTTCAATGTTTGGGATCAGTTATCCCAGTGAGATTCTACTACTTTGATTTGTGTC
TTTGTGATCTTTGTGATCTTGTGTATGTTTTGTTTGGTATGAATAAAACGAACGTTGCAC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL7088Contig1 784 2 3 U
ACAGCTGTAAGTCAAGTATCTGGTAAACAGATCGTAGTAATTGTTGAAAGCTTTAAAATA
TTGAATTACCCTTATTTCTGGAGTGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCA
GCTCAACCGTTCGTATACTCTTAGCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAAATTTTTGGAGG
TTTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGTAGATTAAACGGAGGATACA
GCTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATTTTGACGCAATCCTTCCTTGGTCACCACTACATT
TTTTGTATTCTTCTAAACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAATCGTTCTTGATCTATAT
ATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCT
TATATTTTCCCGTAAAATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATGAAATGTAACGGGATAGGTA
TAGACGTCAGCGATAAAAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCG
GACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCTATCATCTCCTGTTTTTCATCA
TAAACATATTCTTTCTTCTTCTTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCTTCCTCTGAC
ACCGACTTAGATTCGTCATTTTCAGATCTCTTGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAGTG
TTCTTACTGATCCAGCTACCAAATCCAGGGAATATACCCATTTTCTATTACCTGATGAGA
ACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RR4CO49JQ U 35
AF RR4CO49TF C 1
BS 1 51 RR4CO49TF
BS 52 698 RR4CO49JQ
BS 699 784 RR4CO49TF

RD RR4CO49JQ 664 0 0
AATTTGTTTGAAAAGCT
TTTAAAATATTGAATTACCCTTATTTCTGGAGTGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGT
CTTCGGGCAGCTCAACCGTTCGTATACTCTTAGCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAAAT
TTTTGGAGGTTTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGTAGATTAAACG
GAGGATACAGCTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATTTTGACGCAATCCTTCCTTGGTCAC
CACTACATTTTTTGTATTCTTCTAAACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAATCGTTCTT
GATCTATATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTT
TCTCTTTCTTATATTTTCCCGTAAAATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATGAAATGTAACG
GGATAGGTATAGACGTCAGCGATAAAAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGA
CCCGCCTCGGACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCTATCATCTCCTGT
TTTTCATCATAAACATATTCTTTCTTCTTCTTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCT
TCCTCTGACACCGACTTAGATTCGTCATTTTCAGATCTCTTGGACTC

QA 18 664 18 664
DS 

RD RR4CO49TF 784 0 0
ACAGCTGTAAGTCAAGTATCTGGTAAACAGATCGTAGTAATTGTTGAAAGCTTTAAAATA
TTGAATTAGC*TTATTTCTGGAGTGCATCTTT*CTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCA
GCTCAACCGTTCGTATACTCTTAGCCGTGT*CTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGG
TTTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGTAGATTAAACGGAGGATACA
GCTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATTTTGACGCAATCCTTCCTTGGTCACCACTACATT
TTTTGTATTCTTCTAGACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAATCGTTCTTGATCTATAT
ATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCT
TATATTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATGAGATGTAACGGGATAGGTA
TAGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCG
GACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCTATCATCTCCTGTTTTTCATCA
TAAACATATTCTTTCTTCTTCTTGTTAGCAGGAGCATTATTATTAGTGTCTTCCTCTGAC
ACCGACTTAGATTCGTCATTTTCAGATCTCTTGGACTCGGCCTTAAGAAGCTGTTGAGTG
TTCTTACTGATCCAGCTACCAAATCCAGGGAATATACCCATTTTCTATTACCTGATGAGA
ACCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL7089Contig1 610 2 1 U
GGGCTTTAAAACCACGGCCAAACGCGCTTTTCTACTCTTCAATCTCTCTTTTGCTTCTTC
CGAAATTTGTTGTTTTTTTTTTTTGGGTTAAGAAATGGCGGAATCAAAGACAAAAATCGC
AGAAATCAGGGAATGGATTGTAGAACACAAGCTTCGTACCGTTGGTTGTTTATGGCTGAG
TGGGATCTCTGGTTCAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCG
AATCATCCACGCCAGGCTACACGCTCAGGCGCTGACATTAGCCGCTTTAGCTGGAGCAGC
TGCTATGGAGTACTACGATCACAAAACTGGAGCCACCGATCGCTACCCCAAGTTTCTCAA
GCCCGACAACTTGACTAAAGACTAAAAAACTCTTTTATCATTGATCATGCCTATTCTCTT
ATTCTAGGCTATATTATAGCTACTAGTGACATTTTTTTCATGTTTTTTATATATCCTTCT
TTTTACTACTTTGAATGAAATGAATTCATTCTGGTTATATAATAATGCCCACGACTTGCA
GATTGTTTCGGGATGCGAAAATGTAAGAGGTACCTACAGAAAATTATATGAATAAAATTG
GACTTACACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C737JQ C 1
AF RR4C737TF U 1
BS 1 610 RR4C737TF

RD RR4C737JQ 610 0 0
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CGAAATTTGTTGTTTTTTTTTTTTGGGTTAAGAAATGGCGGAATCAAAGACAAAAATCGC
AGAAATCAGGGAATGGATTGTAGAACACAAGCTTCGTACCGTTGGTTGTTTATGGCTGAG
TGGGATCTCTGGTTCAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCG
AATCATCCACGCCAGGCTACACGCTCAGGCGCTGACATTAGCCGCTTTAGCTGGAGCAGC
TGCTATGGAGTACTACGATCACAAAACTGGAGCCACCGATCGCTACCCCAAGTTTCTCAA
GCCCGACAACTTGACTAAAGACTAAAAAACTCTTTTATCATTGATCATGCCTATTCTCTT
ATTCTAGGCTATATTATAGCTACTAGTGACATTTTTTTCATGTTTTTTATATATCCTTCT
TTTTACTACTTTGAATGAAATGAATTCATTCTGGTTATATAATAATGCCCACGACTTGCA
GATTGTTTCGGGATGCGAAAATGTAAGAGGTACCTACAGAAAATTATATGAATAAAATTG
GACTTACACC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4C737TF 610 0 0
GGGCTTTAAAACCACGGCCAAACGCGCTTTTCTACTCTTCAATCTCTCTTTTGCTTCTTC
CGAAATTTGTTGTTTTTTTTTTTTGGGTTAAGAAATGGCGGAATCAAAGACAAAAATCGC
AGAAATCAGGGAATGGATTGTAGAACACAAGCTTCGTACCGTTGGTTGTTTATGGCTGAG
TGGGATCTCTGGTTCAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCG
AATCATCCACGCCAGGCTACACGCTCAGGCGCTGACATTAGCCGCTTTAGCTGGAGCAGC
TGCTATGGAGTACTACGATCACAAAACTGGAGCCACCGATCGCTACCCCAAGTTTCTCAA
GCCCGACAACTTGACTAAAGACTAAAAAACTCTTTTATCATTGATCATGCCTATTCTCTT
ATTCTAGGCTATATTATAGCTACTAGTGACATTTTTTTCATGTTTTTTATATATCCTTCT
TTTTACTACTTTGAATGAAATGAATTCATTCTGGTTATATAATAATGCCCACGACTTGCA
GATTGTTTCGGGATGCGAAAATGTAAGAGGTACCTACAGAAAATTATATGAATAAAATTG
GACTTACACC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7090Contig1 757 2 1 U
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GCGTCATTCTCCGCCGCTCTGAGACTCTCCGTCTCCCACACCCTCGCTCTCGCATCACCT
CCTTCCCATCCCCGCCGCTTCTCGACGTTCTCTCGTTCACTTTTAGGCAGACACATCTCT
TCGCTCCGAGTCCGACCACGCGTTTCTTCCATGTACCCTATGAGACTCTCTGGCTTCTCT
GCTCTCAAAGCGAGAGCTTCGTTTAGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTCAAAGCAGA
GAGATTCTGGTGCAGCATGTGCTTGTTAAGGAGGGTGACTCTGAGCTCTTTGCTGAACTC
CAGAAGCGAATCTTGGATGGAGAGGATATGAGTGATCTTGCAGCTGAGTACTCGATTTGT
CCATCTAAAAAGGAGGGTGGTATACTTGGATGGGTTAAACTTGGTCAAATGGTACCAGAG
TTTGAGGAAGCTGCGTTTAAAGCAGAGCCGAATCATGTGGTCAGGTGTAAAACCCAATTT
GGCTGGCACTTGTTGCAAGTTCTATCTGAGAGGGAACCTGTGAAAGACATCCAGGTGGAG
GAGCTGCATTCCAAAATGCAAGATCCAGTTTTCATGGACGAGCTCAGTTGATTGATGTCA
GAGAACCTGACGAGATCGCCACAGCATCCTTGCCAGGATTTAAAGTGTTTCCGCTCCGTC
AATTCGGACCTGGGCACAGACATCACCTCAAAGCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EF53TF U 1
AF RR4ED92TF U 1
BS 1 757 RR4ED92TF

RD RR4EF53TF 637 0 0
GGAAGACCAAACATGTTTAGAATCACCGGCAACCTCTCTGCGGTATCATCTCCAGCGGCG
GCGTCATTCTCCGCCGCTCTGAGACTCTCCGTCTCCCACACCCTCGCTCTCGCATCACCT
CCTTCCCATCCCCGCCGCTTCTCGACGTTCTCTCGTTCACTTTTAGGCAGACACATCTCT
TCGCTCCGAGTCCGACCACGCGTTTCTTCCATGTACCCTATGAGACTCTCTGGCTTCTCT
GCTCTCAAAGCGAGAGCTTCGTTTAGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTCAAAGCAGA
GAGATTCTGGTGCAGCATGTGCTTGTTAAGGAGGGTGACTCTGAGCTCTTTGCTGAACTC
CAGAAGCGAATCTTGGATGGAGAGGATATGAGTGATCTTGCAGCTGAGTACTCGATTTGT
CCATCTAAAAAGGAGGGTGGTATACTTGGATGGGTTAAACTTGGTCAAATGGTACCAGAG
TTTGAGGAAGCTGCGTTTAAAGCAGAGCCGAATCATGTGGTCAGGTGTAAAACCCAATTT
GGCTGGCACTTGTTGCAAGTTCTATCTGAGAGGGAACCTGTGAAAGACATCCAGGTGGAG
GAGCTGCATTCCAAAATGCAAGATCCAGTTTTCATGG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4ED92TF 757 0 0
GGAAGACCAAACATGTTTAGAATCACCGGCAACCTCTCTGCGGTATCATCTCCAGCGGCG
GCGTCATTCTCCGCCGCTCTGAGACTCTCCGTCTCCCACACCCTCGCTCTCGCATCACCT
CCTTCCCATCCCCGCCGCTTCTCGACGTTCTCTCGTTCACTTTTAGGCAGACACATCTCT
TCGCTCCGAGTCCGACCACGCGTTTCTTCCATGTACCCTATGAGACTCTCTGGCTTCTCT
GCTCTCAAAGCGAGAGCTTCGTTTAGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTCAAAGCAGA
GAGATTCTGGTGCAGCATGTGCTTGTTAAGGAGGGTGACTCTGAGCTCTTTGCTGAACTC
CAGAAGCGAATCTTGGATGGAGAGGATATGAGTGATCTTGCAGCTGAGTACTCGATTTGT
CCATCTAAAAAGGAGGGTGGTATACTTGGATGGGTTAAACTTGGTCAAATGGTACCAGAG
TTTGAGGAAGCTGCGTTTAAAGCAGAGCCGAATCATGTGGTCAGGTGTAAAACCCAATTT
GGCTGGCACTTGTTGCAAGTTCTATCTGAGAGGGAACCTGTGAAAGACATCCAGGTGGAG
GAGCTGCATTCCAAAATGCAAGATCCAGTTTTCATGGACGAGCTCAGTTGATTGATGTCA
GAGAACCTGACGAGATCGCCACAGCATCCTTGCCAGGATTTAAAGTGTTTCCGCTCCGTC
AATTCGGACCTGGGCACAGACATCACCTCAAAGCTGA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL7091Contig1 671 2 5 U
GGCTCTTTCTCTTGCTCTGTAACCGAGCTCAAGTATAAGGTAGACAAAGAACGTAAGCAA
CATGCACAAGGAAAATGCTAGTGATGCTCCATCATCCCCTACCCCTCGTGGTCGTCATCA
CCGGAAGCGAAACAGTGATGTTGTTGCAGGAGCAGGGAAAAATGGAAGTCATTTACTTGT
CAATGACAGTAGCAAATACAAATCGTTTCTCATCCGAGCTTACTCCACTCTCTGGATGAT
TGGTGGTTTCGTTCTAATAGTCTACCTTGGTCATCTCTACATCACAGCCATGGTGGTTGT
TATCCAGATATTCATGGCAAGAGAACTTTTCAATTTGCTAAGAAGAACTCATGAAGATAA
GCAGCTCCCTGGGTTTAGATTACTCAATTGACACTTCTTTTTCACAGCAATGCTTTTTGT
ATATGGTCGAATACTTAGTCAGCGGTTAGTCAACACCGTGACTCCAGACAAAGTCATGTA
TAGACTGGTCACCAGCCTCATCAAATACCACATGGCAATCTGTTACTCCTTGTATATATC
CGGCTTTGTTTGGTTCATCCTGACATTGAAAAAGAAGATGTACAAATATCAGTTTAGCCA
ATATGCATGGACGCATATGATCTTGATTGTGGTGTTTACTCAATCCTCATTCACCGTAGC
CAACATCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL39TF U 1
AF RR4CO40TF U 27
BS 1 390 RR4EL39TF
BS 391 391 RR4CO40TF
BS 392 442 RR4EL39TF
BS 443 443 RR4CO40TF
BS 444 671 RR4EL39TF

RD RR4EL39TF 671 0 0
GGCTCTTTCTCTTGCTCTGTAACCGAGCTCAAGTATAAGGTAGACAAAGAACGTAAGCAA
CATGCACAAGGAAAATGCTAGTGATGCTCCATCATCCCCTACCCCTCGTGGTCGTCATCA
CCGGAAGCGAAACAGTGATGTTGTTGCAGGAGCAGGGAAAAATGGAAGTCATTTACTTGT
CAATGACAGTAGCAAATACAAATCGTTTCTCATCCGAGCTTACTCCACTCTCTGGATGAT
TGGTGGTTTCGTTCTAATAGTCTACCTTGGTCATCTCTACATCACAGCCATGGTGGTTGT
TATCCAGATATTCATGGCAAGAGAACTTTTCAATTTGCTAAGAAGAACTCATGAAGATAA
GCAGCTCCCTGGGTTTAGATTACTCAATTGGCACTTCTTTTTCACAGCAATGCTTTTTGT
ATATGGTCGAATACTTAGTCAGTGGTTAGTCAACACCGTGACTCCAGACAAAGTCATGTA
TAGACTGGTCACCAGCCTCATCAAATACCACATGGCAATCTGTTACTCCTTGTATATATC
CGGCTTTGTTTGGTTCATCCTGACATTGAAAAAGAAGATGTACAAATATCAGTTTAGCCA
ATATGCATGGACGCATATGATCTTGATTGTGGTGTTTACTCAATCCTCATTCACCGTAGC
CAACATCTTTG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4CO40TF 642 0 0
TTTCATTTCTC
AGGTAGACAAAGAACGTAAGCAACATGCACAAGGAAAATGCTAGTGATGCTCCATCATCC
CCTACCCCTCGTGTTCGTCATCACCGGAAGCGAAACAGTGATGTTGTTGCAGGAGCAGGG
AAAAATGGAAGTCATTTACTTGTCAATGACAGTAGCAAATACAAATCGTTTCTCATCCGA
GCTTACTCCACTCTCTGGATGATTGGTGGTTTCGTTCTAATAGTCTACCTTGGTCATCTC
TACATCACAGCCATGGTGGTTGTTATCCAGATATTCATGGCAAGAGAACTTTTCAATTTG
CTAAGAAGAACTCATGAAGATAAGCAGCTCCCTGGGTTTAGATTACTCAATTGACACTTC
TTTTTCACAGCAATGCTTTTTGTATATGGTCGAATACTTAGTCAGCGGTTAGTCAACACC
GTGACTCCAGACAAAGTCATGTATAGACTGGTCACCAGCCTCATCAAATACCACATGGCA
ATCTGTTACTCCTTGTATATATCCGGCTTTGTTTGGTTCATCCTGACATTGAAAAAGAAG
ATGTACAGATATCAGTTTAGCCAATATGCATGGACGCATATGATCTTGATTGTGGTGTTT
ACTCAATCCTCATTCACCGTAGCCA
CATCTT

QA 12 636 12 636
DS 



AS 1 2

CO CL7092Contig1 626 2 1 U
GCACCTAGTGCACCAATGGCTGCGGAAGGTGAAGCAAAACCCAAACCACCAGATGAAACC
GAGGCTTCTCAGCCTGTAGCTGAAACTCCTGATGATGATGTCACAGTAGGGAATGGATCA
GACGGCGGCACGATTGACAACAACGAAAACAATAACAGCGACTCGAGTGGCGGCTCGCAT
GAAGAAGAGTGGCTCCCAGGAGACCAATCTCTACCTAACTCAAACTCAGCAAGTAGCAGC
CCTGGTACTACCAAGGTCCTTGCCTACACGAGAAGAGGAAGGGGGCGAGGTAGGGGAAGA
GGTCGAGGAGGAGTTCGAGGCAAAGGACGGGCCAAATAAACTGTACACAACAACCAAATG
GAGTAGGAGAGTAATATGCAGGTAGTATTATGTGAAACATCTCTTGTAGATTTCAATCCC
ACACTGTTTTTGTCTACCAAAGTCTTTGTCATTTTGTCATATCTCTTTAGGTTCTTTTTT
GTAGTCAAACTGTGTCTCCGTTTATTTTTTTTCTGGATCTTTTATGTTTATGTTGCAAGA
TTGAAACTTGGTTTCATTCTAGCTGGCAAACCTTTCTATGTTGCACTAGAACTCGTCTTC
AATCCTATAAATAGATCATTTGTATG


BQ
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AF RR4H489JQB C 1
AF RR4H489TF U 1
BS 1 626 RR4H489TF

RD RR4H489JQB 626 0 0
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QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4H489TF 626 0 0
GCACCTAGTGCACCAATGGCTGCGGAAGGTGAAGCAAAACCCAAACCACCAGATGAAACC
GAGGCTTCTCAGCCTGTAGCTGAAACTCCTGATGATGATGTCACAGTAGGGAATGGATCA
GACGGCGGCACGATTGACAACAACGAAAACAATAACAGCGACTCGAGTGGCGGCTCGCAT
GAAGAAGAGTGGCTCCCAGGAGACCAATCTCTACCTAACTCAAACTCAGCAAGTAGCAGC
CCTGGTACTACCAAGGTCCTTGCCTACACGAGAAGAGGAAGGGGGCGAGGTAGGGGAAGA
GGTCGAGGAGGAGTTCGAGGCAAAGGACGGGCCAAATAAACTGTACACAACAACCAAATG
GAGTAGGAGAGTAATATGCAGGTAGTATTATGTGAAACATCTCTTGTAGATTTCAATCCC
ACACTGTTTTTGTCTACCAAAGTCTTTGTCATTTTGTCATATCTCTTTAGGTTCTTTTTT
GTAGTCAAACTGTGTCTCCGTTTATTTTTTTTCTGGATCTTTTATGTTTATGTTGCAAGA
TTGAAACTTGGTTTCATTCTAGCTGGCAAACCTTTCTATGTTGCACTAGAACTCGTCTTC
AATCCTATAAATAGATCATTTGTATG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7093Contig1 896 2 14 U
GGGAGGTATCTTGTTGATCCTGTTGACATGTGGTGGCCATCCAACCTTGCTCAAGTCTCT
CTTTTCAGGGCGTTGCACGAGAAGGAGCACAAGTCAAAAAGCTTGACGAGGATGCAGTTC
TTTCTTGTGGCACTAGGTGCTAGCTTCCTCTACTATGCGCTTCCAGGCTACCTATTCCCA
ATCTTGACTTTCTTCTCATGGGTCTGTTGGGCTTGGCCTAATAGCATCACGGCTCAGCAA
GTTGGGTCAGGGTACCATGGTCTCGGTGTTGAAGCCTTCACTCTTGACTGGGCTGGTATC
TCTGCTTACCATGGCAGCCCTTTGGTGGCTCCTTGGTCCTCTATCCTCAACGTTGGTGTT
GGCTTCATCATGTTTATTTACATCATAGTTCCTGTTTGTTACTGGAAGTTCGACACTTTC
GACGCAAGAAAGTTCCCCATTTTCTCCAACCAGCTGTTCACTTCCGCTGGCCAGAAGTAT
GACACAACCAAGATCTTGACTCCTCGGTTTGATCTTGACATTAATGCTTATAACAACTAC
GGGAAGCTTTACCTCAGCCCTCTTTTCGCGCTCTCCATAGGTTCCGGTTTTGCGAGGTTT
ACTGCAACGCTAACTCATGTAGCATTGTTCAACGGCAGGGACATATGGAGGCAGACTTGG
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ATGGCCTTTATCGTCACTCTCCCTATTGGTGTCATTCAAGCAACTACTAATCAGCA


BQ
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AF RR4E976TF U 1
AF RR4FN75TF U 217
BS 1 271 RR4E976TF
BS 272 272 RR4FN75TF
BS 273 639 RR4E976TF
BS 640 640 RR4FN75TF
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BS 720 745 RR4E976TF
BS 746 896 RR4FN75TF

RD RR4E976TF 750 0 0
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CTTTTCAGGGCGTTGCACGAGAAGGAGCACAAGTCAAAAAGCTTGACGAGGATGCAGTTC
TTTCTTGTGGCACTAGGTGCTAGCTTCCTCTACTATGCGCTTCCAGGCTACCTATTCCCA
ATCTTGACTTTCTTCTCATGGGTCTGTTGGGCTTGGCCTAATAGCATCACGGCTCAGCAA
GTTGGGTCAGGGTACCATGGTCTCGGTGTTGGAGCCTTCACTCTTGACTGGGCTGGTATC
TCTGCTTACCATGGCAGCCCTTTGGTGGCTCCTTGGTCCTCTATCCTCAACGTTGGTGTT
GGCTTCATCATGTTTATTTACATCATAGTTCCTGTTTGTTACTGGAAGTTCGACACTTTC
GACGCAAGAAAGTTCCCCATTTTCTCCAACCAGCTGTTCACTTCCGCTGGCCAGAAGTAT
GACACAACCAAGATCTTGACTCCTCGGTTTGATCTTGACATTAATGCTTATAACAACTAC
GGGAAGCTTTACCTCAGCCCTCTTTTCGCGCTCTCCATAGGTTCCGGTTTTGCGAGGTTT
ACTGCAACGCTAACTCATGTAGCATTGTTCAACGGCAGG*ACATATGGAGGCAGACTTGG
TCAGCAGTGAAGACG*TGAAGCTTGACATACACGGGAA*CTGATGCAA*GATACAAC**A
GTGCCAGAGTGGTGGTTTTATGTGT
GCTGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4FN75TF 680 0 0
G
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TCACTCTTGACTGGGCTGGTATCTCTGCTTACCATGGCAGCCCTTTGGTGGCTCCTTGGT
CCTCTATCCTCAACGTTGGTGTTGGCTTCATCATGTTTATTTACATCATAGTTCCTGTTT
GTTACTGGAAGTTCGACACTTTCGACGCAAGAAAGTTCCCCATTTTCTCCAACCAGCTGT
TCACTTCCGCTGGCCAGAAGTATGACACAACCAAGATCTTGACTCCTCGGTTTGATCTTG
ACATTAATGCTTATAACAACTACGGGAAGCTTTACCTCAGCCCTCTTTTCGCGCTCTCCA
TAGGTTCCGGTTTTGCGAGGTTTACTGCAACGCTAACTCATGTAGTATTGTTCAACGGCA
GGGACATATGGAGGCAGACTTGGTCAGCAGTGAAGACGGTGAAGCTTGACATACATGGGA
AACTGATGCAAAGATACAAACAAGTGCCAGAGTGGTGGTTTTATGTGTTGCTGATTGGAA
GTGTAGCGTTGTCTCTACTCATGTCTTTTGTGTGGAAAGAGTCAGTGCAGCTTCCATGGT
GGGGAATGCTCTTTGCTTTTGCTATGGCCTTTATCGTCACTCTCCCTATTGGTGTCATTC
AAGCAACTACTAATCAGCA

QA 2 680 2 680
DS 



AS 1 2

CO CL7094Contig1 773 2 4 U
GCGACTGGATCACTCTCCATCTTATCAATTCAACGAGAAGCAACCGGTTCAATCATGAAC
TAGTTAACACCGATGACAAATTCGCTGATGTCTTGCCTAACGAACGTGCCGGTCCACCAC
CGGCATCTCCATTCGCCATTGAGGCTGTAAATACGGTGACGATCTCGGAAGAGAATTTGG
CAAAAGAGAAGGTTTGTGCGATATGCAAGGAGGAGTTTGAGGTTGGAGAAGAAGGAAAAG
AGTTGAAATGTTTGCATTTGTACCATCCAAGCTGCACTGTGTCTTGGTTGAATATTCATA
ATACTTGTCCCATTTGTCGCTCCGAGGTTAGCATAGGCGTTTCCCGTAGTCACATTGACG
AAGGACGGTCTCACAACCTCGATAATGTTCGATCAAATCGCGTTCGAACTCGGGTTTGTT
CTTTGTGGCCTCTCCAAATGATGTTTGACTGGGTACATAATCTCCTCGATGTAAGAATAA
CAAACAGTACCTGAAAAACATCAAAGATATTGCAAACAAGAATATTGTGTGAAAATAGTA
ATTGTATATAGACTAAAATTAGGTTAATGTGAGAGAATGGAGTAAAAATGCACATCAAGA
AGAAAAATTAATAAAGAGGCAACGAGCATTAAAGGGGAAAATAGGCGTTTATGGATTCGT
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GAAGTGGTACGTAATTCGTAGAAGCAAAGCTGATCCTTGAATTTGAAAGACGG


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AF RR4FP22JQ C 1
AF RR4FP22TF U 1
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DS 

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CAAACAGTACCTGAAAAACATCAAAGATATTGCAAACAAGAATATTGTGTGAAAATAGTA
ATTGTATATAGACTAAAATTAGGTTAATGTGAGAGAATGGAGTAAAAATGCACATCAAGA
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QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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CATTGTGTATTGTTTTTGGAAGCC


BQ
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AF RR4DX80JQ U 41
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DS 

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QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4G940TF U 1
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QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DH86JQ U 1
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QA 1 687 1 687
DS 



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BQ
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AF RR4B049JQ C 1
AF RR4B049TF U 1
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RD RR4B049JQ 794 0 0
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CTTTTCTTTTTGGTTAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACGTTCA
AAGAAATCATGGAATGGAAGAAGAATCCTCAAGGAAAAGGAAGGGACGAGTTCAACAATG
CCCTACGCAATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAAGAGTATTTTTCTATGTA
TCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATC
AGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATTTTGTGGATTGTATTATTTTGTGCTTATATG
GGATTTTGGTATCT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4B049TF 794 0 0
GGAAAATAAAGAGAAAAAAAAACCTGAGTAAAAAAAGAAAAATGAGTGGCTCCGGTGCGC
AGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGTCTGAGGTCGTCAAGGTCATGC
TTAATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTCA
AAGGACGCTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTAC
TAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATGCTGCTGAGGGTAATCAATATG
AGAGAGTGACAGTTGGTGTTGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAAAACAT
ATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGTGTTTG
ACCCCTTTCTTGTTGACTCATACTCAGTAAGAAATGAAATTCGATTTGGATGTTGTTTTT
CTTTTCTTTTTGGTTAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACGTTCA
AAGAAATCATGGAATGGAAGAAGAATCCTCAAGGAAAAGGAAGGGACGAGTTCAACAATG
CCCTACGCAATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAAGAGTATTTTTCTATGTA
TCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATC
AGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATTTTGTGGATTGTATTATTTTGTGCTTATATG
GGATTTTGGTATCT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7099Contig1 620 2 1 U
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CGGGACGAGGAAGGTCGGAAAGCTGTCGATAAATTCGAGCTGAAGACTCGAAACCCCGAC
ACGATCAAGCAAGTTGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACGGATGGAGAGACAC
CCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCACGGCGGGAAGTAC
ACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCGCCGGCGATG
GACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGTTCGCGGAAGGTGGTGGTGGTGACGTG
GCGGTGGAGGTTGTGAAAGGGGAGGTTGAGGTGGCGAAAGAAGCGCCGGGAGGTGTGGCT
AGGGTGGAGGTTGATCCTCTCGCTTGATCAGTTCTACTTGAGTTGCTAGGGACATGGAAG
AAAGTGTTGGGGCGAATGTGAGAAGAAAGGGAAACTTTGGGGAGTGGTTTTTAATTTTTT
ACTTTGCGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTATTTGTGTAAAGAAATAA
TAATATTACTGCATTGAAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DL86JQ C 1
AF RR4DL86TF U 1
BS 1 620 RR4DL86TF

RD RR4DL86JQ 620 0 0
GCGATGAAGACTGTATCGGTTGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCTACGAGCCGAGCAC
CGGGACGAGGAAGGTCGGAAAGCTGTCGATAAATTCGAGCTGAAGACTCGAAACCCCGAC
ACGATCAAGCAAGTTGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACGGATGGAGAGACAC
CCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCACGGCGGGAAGTAC
ACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCGCCGGCGATG
GACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGTTCGCGGAAGGTGGTGGTGGTGACGTG
GCGGTGGAGGTTGTGAAAGGGGAGGTTGAGGTGGCGAAAGAAGCGCCGGGAGGTGTGGCT
AGGGTGGAGGTTGATCCTCTCGCTTGATCAGTTCTACTTGAGTTGCTAGGGACATGGAAG
AAAGTGTTGGGGCGAATGTGAGAAGAAAGGGAAACTTTGGGGAGTGGTTTTTAATTTTTT
ACTTTGCGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTATTTGTGTAAAGAAATAA
TAATATTACTGCATTGAAGT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4DL86TF 620 0 0
GCGATGAAGACTGTATCGGTTGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCTACGAGCCGAGCAC
CGGGACGAGGAAGGTCGGAAAGCTGTCGATAAATTCGAGCTGAAGACTCGAAACCCCGAC
ACGATCAAGCAAGTTGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACGGATGGAGAGACAC
CCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCACGGCGGGAAGTAC
ACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCGCCGGCGATG
GACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGTTCGCGGAAGGTGGTGGTGGTGACGTG
GCGGTGGAGGTTGTGAAAGGGGAGGTTGAGGTGGCGAAAGAAGCGCCGGGAGGTGTGGCT
AGGGTGGAGGTTGATCCTCTCGCTTGATCAGTTCTACTTGAGTTGCTAGGGACATGGAAG
AAAGTGTTGGGGCGAATGTGAGAAGAAAGGGAAACTTTGGGGAGTGGTTTTTAATTTTTT
ACTTTGCGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTATTTGTGTAAAGAAATAA
TAATATTACTGCATTGAAGT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL7100Contig1 893 2 4 U
GGATCATCGTATCTCTCGAAATAACCAAAAAAACATAAAATGGTTGAGCAAAAGAGATTC
GCTCTGTTTCTAGCAACGTGCGATTCAACATTGGTTAAGAAGACGTATGGAGGTTATTTC
AACGTGTTCGTGTCGACATTTGGTGAAGAAGGAGAGCATTGGGATCTCTTTAGGGTGATC
GAAGGCGAGTTTCCGGAGGAGAAAGATCTGGACAAGTACGATGGTTTCATTATCAGCGGT
AGTCTCCATGACGCTTTCGGAGATGATGATTGGATCATTAAGCTTTGTACGCTTTGTCAA
AAACTCGACGACATGAAGAAGAAGGTTTTAGGTATCTGCTTTGGCCATCAGATACTAAGT
AGAATCAAAGGAGGAAAAATCGGAAGAGCGAGAAGAGGTGCAGACATGGGACTAAGAAGC
ATAACAATAGCTACAGACTCGGTGAAACCAGGCGGTTATTTCGGAGACAAGACTCCCAAT
TCACTAGCCATCATAAAATGTCACCAAGACGAAGTTTTGGAACTCCCCGAGTCAGCTACA
TTGCTTGCTTACTCAGACAAATACAACGTCGAGATGGCCTCCTTTGGAGATCACTTCCTC
TCCATCCAAGGCCATCCTGAGTACAACAAAGAGATTCTCTTCGAGATCATCGACCGTGTC
GTCAGTCTAAAGTTGATGGAGCAAGAACTTGCGGATAAGGCCAAAGCAACGATGGAAGAC
GCCGAACCAGATAGGAATCAGTGGCAGACTCTCTGCAAAAACTTTCTCAAAGGAAGAACC
GATCAACTTTAGTCTTAAAAATAACTTGAAAAAAAAACAATTTCTGTCGAATGAATGAAT
ATTCGGAATAATCTTTTTTACATTATAACTTCTTTGTGATTGTGTACAAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV46TF U 1
AF RR4DV46JQ C 52
BS 1 610 RR4DV46TF
BS 611 611 RR4DV46JQ
BS 612 683 RR4DV46TF
BS 684 893 RR4DV46JQ

RD RR4DV46TF 691 0 0
GGATCATCGTATCTCTCGAAATAACCAAAAAAACATAAAATGGTTGAGCAAAAGAGATTC
GCTCTGTTTCTAGCAACGTGCGATTCAACATTGGTTAAGAAGACGTATGGAGGTTATTTC
AACGTGTTCGTGTCGACATTTGGTGAAGAAGGAGAGCATTGGGATCTCTTTAGGGTGATC
GAAGGCGAGTTTCCGGAGGAGAAAGATCTGGACAAGTACGATGGTTTCATTATCAGCGGT
AGTCTCCATGACGCTTTCGGAGATGATGATTGGATCATTAAGCTTTGTACGCTTTGTCAA
AAACTCGACGACATGAAGAAGAAGGTTTTAGGTATCTGCTTTGGCCATCAGATACTAAGT
AGAATCAAAGGAGGAAAAATCGGAAGAGCGAGAAGAGGTGCAGACATGGGACTAAGAAGC
ATAACAATAGCTACAGACTCGGTGAAACCAGGCGGTTATTTCGGAGACAAGACTCCCAAT
TCACTAGCCATCATAAAATGTCACCAAGACGAAGTTTTGGAACTCCCCGAGTCAGCTACA
TTGCTTGCTTACTCAGACAAATACAACGTCGAGATGGCCTCCTTTGGAGATCACTTCCTC
TCCATCCAAG*CCATCCTGAGTACAACAAAGAGATTCTCTTCGAGATCATCGACCGTGTC
GTCAGTCTAAAGTTGATGGAGCA
GACTTGCG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4DV46JQ 842 0 0
AAAGAGA
TCGCTCTGTTTCTAGCAACGTGCGATTCAACATTGGTTAAGAAGACGTATGGAGGTTATT
TCAACGTGTTCGTGTCGACATTTG*TGAAGAAGGAGAGCATTGGGATCTCTTTAGGGTGA
TCGAAGGCGAGTTTCCGGAGGAGAAAGATCTGGACAAGTACGATGGTTTCATTATCAGCG
GTAGTCTCCATGACGCTTTCGGAGATGATGATTGGATCATTAAGCTTTGTACGCTTTGTC
AAAAACTCGACGACATGAAGAAGAAGGTTTTAGGTATCTGCTTTGGCCATCAGATACTAA
GTAGAATCAAAGGAGGAAAAATCGGAAGAGCGAGAAGAGGTGCAGACATGGGACTAAGAA
GCATAACAATAGCTACAGACTCGGTGAAACCAGGCGGTTATTTCGGAGACAAGACTCCCA
ATTCACTAGCCATCATAAAATGTCACCAAGACGAAGTTTTGGAACTCCCCGAGTCAGCTA
CATTGCTTGCTTACTCAGACAAATACAACGTCGAGATGGCCTCCTTTGGAGATCACTTCC
TCTCCATCCAAGGCCATCCTGAGTACAACAAAGAGATTCTCTTCGAGATCATCGACCGTG
TCGTCAGTCTAAAGTTGATGGAGCAAGAACTTGCGGATAAGGCCAAAGCAACGATGGAAG
ACGCCGAACCAGATAGGAATCAGTGGCAGACTCTCTGCAAAAACTTTCTCAAAGGAAGAA
CCGATCAACTTTAGTCTTAAAAATAACTTGAAAAAAAAACAATTTCTGTCGAATGAATGA
ATATTCGGAATAATCTTTTTTACATTATAACTTCTTTGTGATTGTGTACAAGTGG

QA 8 842 8 842
DS 



AS 1 2

CO CL7101Contig1 885 2 8 U
GGACCTTCTTCTTCTTCTTCTTATCGTTCTTCGATCTCCATGGCGAATCTAACAACAACG
AAAAACGCGAAAGCTCGCCTGAGAGGCGTCGTTTTCGATATGGACGGAACCTTAACGGTT
CCGGTCATCGATTTCGCGGCAATGTACAGGACTGTCCTCGGTGAAGACGAGTACAAGCGA
ATCAGGTCCGAGAGCCCTACCGGAATCGATATTCTTCACCATATCGAGTCGTGGAGCCCC
GATAAGCAGCAGAATGCGTTCGAAATCATCGCCGATTACGAGCAACAGGGGATTGATAAG
CTCCAAATCATGCCCGGTGTTGTTGAGCTATGCGGCTTTCTTGATTCCAAGAAGATAAAG
AGGGGGCTGATTACACGCAATGTTAAGAGAGGAATCGACATATTCCACCAACGTTTTGAG
GTTATCTTTTCTCCGGCACTAGGCAGAGAGTTTCGTCCATATAAACCAAACCCAGACCCG
CTGCTGCATATATGTTCTGCATGGGACATCCAACCTAATGAAGTCATGATGGTTGGTGAC
AGCTTGAAAGATGATATAGCTTGTGGGAAAGGAGCTGGAGCTTTCACATGCTTGCTTGAT
GAAACCGGAAGGTATGGACCAGATGACTTTTCTGTCTCTGGACTGCTTCCTGATTTTAAG
GTTAATTCTCTGTCCAAAATTCAGAACATATTGGAGACGAACTTCGACCTTAACCCATAG
TTTTTTTCATTCTCCAAGTTCCTCATTTTATAGTCTCAGTGAACCTACTCAATACAAAAG
GCTGTAGTTTGCAACAAGATTATTATTGTAAGAGAGATAATGCATTACAAACTATCTGTT
CAGGATAGCCATTGATTATAAATTACAGAGTTCTATTCGTCTGCC


BQ
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AF RR4E322TF U 1
AF RR4E322JQ C 141
BS 1 660 RR4E322TF
BS 661 661 RR4E322JQ
BS 662 678 RR4E322TF
BS 679 679 RR4E322JQ
BS 680 726 RR4E322TF
BS 727 727 RR4E322JQ
BS 728 774 RR4E322TF
BS 775 885 RR4E322JQ

RD RR4E322TF 774 0 0
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AAAAACGCGAAAGCTCGCCTGAGAGGCGTCGTTTTCGATATGGACGGAACCTTAACGGTT
CCGGTCATCGATTTCGCGGCAATGTACAGGACTGTCCTCGGTGAAGACGAGTACAAGCGA
ATCAGGTCCGAGAGCCCTACCGGAATCGATATTCTTCACCATATCGAGTCGTGGAGCCCC
GATAAGCAGCAGAATGCGTTCGAAATCATCGCCGATTACGAGCAACAGGGGATTGATAAG
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GTTATCTTTTCTCCGGCACTAGGCAGAGAGTTTCGTCCATATAAACCAAACCCAGACCCG
CTGCTGCATATATGTTCTGCATGGGACATCCAACCTAATGAAGTCATGATGGTTGGTGAC
AGCTTGAAAGATGATATAGCTTGTGGGAAAGGAGCTGGAGCTTTCACATGCTTGCTTGAT
GAAACCGGAAGGTATGGACCAGATGACTTTTCTGTCTCTGGACTGCTTCCTGATTTTAAG
*TTAATTCTCTGTCCAAA*TTCAGAACATATTGGAGACGAACTTCGACCTTAACCCATAG
TTTTTT*CATTCTCCAAGTTCCTCATTTTATAGTCTCAGTGAACCTACTCAATA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4E322JQ 745 0 0
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CGAAATCATCGCCGATTACGAGCAACAGGGGATTGATAAGCTCCAAATCATGCCCGGTGT
TGTTGAGCTATGCGGCTTTCTTGATTCCAAGAAGATAAAGAGGGGGCTGATTACACGCAA
TGTTAAGAGAGGAATCGACATATTCCACCAACGTTTTGAGGTTATCTTTTCTCCGGCACT
AGGCAGAGAGTTTCGTCCATATAAACCAAACCCAGACCCGCTGCTGCATATATGTTCTGC
ATGGGACATCCAACCTAATGAAGTCATGATGGTTGGTGACAGCTTGAAAGATGATATAGC
TTGTGGGAAAGGAGCTGGAGCTTTCACATGCTTGCTTGATGAAACCGGAAGGTATGGACC
AGATGACTTTTCTGTCTCTGGACTGCTTCCTGATTTTAAGGTTAATTCTCTGTCCAAAAT
TCAGAACATATTGGAGACGAACTTCGACCTTAACCCATAGTTTTTTTCATTCTCCAAGTT
CCTCATTTTATAGTCTCAGTGAACCTACTCAATACAAAAGGCTGTAGTTTGCAACAAGAT
TATTATTGTAAGAGAGATAATGCATTACAAACTATCTGTTCAGGATAGCCATTGATTATA
AATTACAGAGTTCTATTCGTCTGCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL7102Contig1 691 2 1 U
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ACCGAGACTAAATACGCGCAGCAGCAGGGGGAATGCATCCAATCTCGTAGAGTAAAAACT
TTTCTCAGGTTTGATGGCAATGACATCCAGGCTACATATTATACAAGGAAGTCAATGAGA
TCTCAAAGAGCGTTAAAGCAAAGAAGAATTCATGCCCAGATATATCTTGTTTCTCTCTGG
AAAACTGAAGCAATCAATCTAAATGACTTTCAAAGCGTCTCTGTAAACTTCTCCATTTTT
TGTTGAAGTTGTGGGTTTTTTTCATTCGTTAATGATATGCTGTAATGGCAGAGAGAGTTA
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TTTGAGAAATACCACAAAGTACCTTTCTCCG


BQ
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AF RR4FC95TF U 1
AF RR4FC95JQ C 27
BS 1 691 RR4FC95TF

RD RR4FC95TF 691 0 0
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AGCTTGTCGCTCATCAAGCCGAATCGGATCTGGCGTCTCTCGTATTCGAGATGTCACAGC
AAGTTCAGGTTGGGATGGAGAATATGCTCAAGCTGATCAATGAGATCGATGGGAACTCTG
TTGGAATCAAGGAAGATATTGAGAAATCAAAGGAGTTTGCAATGGAGAAGAAGAGGGTTC
TCGAGGAAGAGAAAGAACAGTTTCAGAAAGCTGCTTACACTATTCTAGACATGCTCAGCA
ACCGAGACTAAATACGCGCAGCAGCAGGGGGAATGCATCCAATCTCGTAGAGTAAAAACT
TTTCTCAGGTTTGATGGCAATGACATCCAGGCTACATATTATACAAGGAAGTCAATGAGA
TCTCAAAGAGCGTTAAAGCAAAGAAGAATTCATGCCCAGATATATCTTGTTTCTCTCTGG
AAAACTGAAGCAATCAATCTAAATGACTTTCAAAGCGTCTCTGTAAACTTCTCCATTTTT
TGTTGAAGTTGTGGGTTTTTTTCATTCGTTAATGATATGCTGTAATGGCAGAGAGAGTTA
TCATCAAGCAAAGCTTTGTCTTTAGCTGCTATTGGAGAGATGATTGAGACGTACTCATTG
TTTGAGAAATACCACAAAGTACCTTTCTCCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4FC95JQ 665 0 0
ATAATGGCGGAATCACCGTCGCAGAGTGGTGCGCAGCTTGTCGCTCATCAAGCCGAATCG
GATCTGGCGTCTCTCGTATTCGAGATGTCACAGCAAGTTCAGGTTGGGATGGAGAATATG
CTCAAGCTGATCAATGAGATCGATGGGAACTCTGTTGGAATCAAGGAAGATATTGAGAAA
TCAAAGGAGTTTGCAATGGAGAAGAAGAGGGTTCTCGAGGAAGAGAAAGAACAGTTTCAG
AAAGCTGCTTACACTATTCTAGACATGCTCAGCAACCGAGACTAAATACGCGCAGCAGCA
GGGGGAATGCATCCAATCTCGTAGAGTAAAAACTTTTCTCAGGTTTGATGGCAATGACAT
CCAGGCTACATATTATACAAGGAAGTCAATGAGATCTCAAAGAGCGTTAAAGCAAAGAAG
AATTCATGCCCAGATATATCTTGTTTCTCTCTGGAAAACTGAAGCAATCAATCTAAATGA
CTTTCAAAGCGTCTCTGTAAACTTCTCCATTTTTTGTTGAAGTTGTGGGTTTTTT*CATT
CGTTAATGATATGCTGTAATGGCAGAGAGAGTTATCATCAAGCAAAGCTTTGTCTTTAGC
TGCTATTGGAGAGATGATTGAGACGTACTCATTGTTTGAGAAATACCACAAAGTACCTTT
CTCCG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7103Contig1 702 2 1 U
GGATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTAGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTC
TTTATTGGAAATTCAACAAGGGTTTCGTTGGATCCACTCGTAAGAGCTCTGTTTGCCTTC
CTTGCGTCTGTGATTGCCCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGACATCGCTCCTGGGCTTGCAA
ATCTCACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGC
AGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAGCTGAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATGAGCATA
GCCGTCATATGAACGTTACCCTCGCAGAAGCTAAGAGAGTCGCGTCTCAGTACCAAAAGG
AAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAGTCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAG
CTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAGATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCAATCAG
GTTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCCCTTCTCATGTCTACCCCTCAAGTGTTTGTG
TCTGAGAAACTCATTTTTTTCGCAACTTCGCTCAAGGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTTT
CTCCATATATGTAGTCTTTTGTTTTTACCTTTGGATCTGAATGTAGCTAAAGAATGTCTT
ATGATGGCCTTGTATTGACTTCTACTCAAATATATAATATAT


BQ
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AF RR4EU58TF U 1
AF RR4EO96TF U 1
BS 1 702 RR4EO96TF

RD RR4EU58TF 620 0 0
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CTTGCGTCTGTGATTGCCCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGACATCGCTCCTGGGCTTGCAA
ATCTCACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGC
AGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAGCTGAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCTGATGAGCATA
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GTTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCCCTTCTCATGTCTACCCCTCAAGTGTTTGTG
TCTGAGAAACTCATTTTTTTCGCAACTTCGCTCAAGGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTTT
CTCCATATATGTAGTCTTTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4EO96TF 702 0 0
GGATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTAGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTC
TTTATTGGAAATTCAACAAGGGTTTCGTTGGATCCACTCGTAAGAGCTCTGTTTGCCTTC
CTTGCGTCTGTGATTGCCCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGACATCGCTCCTGGGCTTGCAA
ATCTCACTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGC
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GCCGTCATATGAACGTTACCCTCGCAGAAGCTAAGAGAGTCGCGTCTCAGTACCAAAAGG
AAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACTGAGATCTGTGAGTCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAG
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GTTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCCCCCTTCTCATGTCTACCCCTCAAGTGTTTGTG
TCTGAGAAACTCATTTTTTTCGCAACTTCGCTCAAGGAAAAGTCCTTATCTTCCACGTTT
CTCCATATATGTAGTCTTTTGTTTTTACCTTTGGATCTGAATGTAGCTAAAGAATGTCTT
ATGATGGCCTTGTATTGACTTCTACTCAAATATATAATATAT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7104Contig1 794 2 1 U
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GCACGCTTGGCGTCAGTCTGTACAAGATGTCACCACTGCTGCTGTCTAAAACTCTCTCTT
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GATTCTCTCACATC


BQ
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AF RR4AZ70JQ C 1
AF RR4AZ70TF U 1
BS 1 794 RR4AZ70TF

RD RR4AZ70JQ 794 0 0
GGAAGGAAGGAACTGAGGAACAGATCTGAAGAAGATGGAGTGCGTGTTCGGTCTCGTTGG
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CACTGCTTTGCGAAAGAATCCTTACTCTGTGAACATCCTGATGGCTGGCTACGACAAGGA
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GATTCTCTCACATC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4AZ70TF 794 0 0
GGAAGGAAGGAACTGAGGAACAGATCTGAAGAAGATGGAGTGCGTGTTCGGTCTCGTTGG
TAATGGATTCGCTATCGTTGCGGCGGATACATCGGCGGTACACAGCATCCTTGTCCACAA
GAACAACAAGGACAAGATCATGGCCCTTGACTCTCACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGCGA
GCCTGGTGACCGGGTTCAGTTCACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTT
CCGGAACGGGATCCCTTTGACCACCGCTGCTGCTGCTAACTTCACCCGTGGTGAGCTCGC
CACTGCTTTGCGAAAGAATCCTTACTCTGTGAACATCCTGATGGCTGGCTACGACAAGGA
AGCAGGGGCATCTCTTTACTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACAAGGTTGACAAGGG
AGCTTTCGGTTACGGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACTATGGACAGGCACTTCCGCACCGA
CATGTCTGTCCAAGAAGCCATCGAGTTGGTCGACAAGTGCATACTCGAGATCAGGTCGAG
GCTGGTCATTGCGCCACCCAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGCGA
GCACGCTTGGCGTCAGTCTGTACAAGATGTCACCACTGCTGCTGTCTAAAACTCTCTCTT
ATGTTTGTTTGGTTGACATTTGCTTTAATGTTTGAACTTGTTAAATTAGTTCCCTTTTAA
ACTTTGAATTGAAAACGTTTTTACTTGCTAAGTTGTGTATAGGAAGCAAAAACGTAATCA
GATTCTCTCACATC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7105Contig1 703 2 2 U
GAAAGTGTACATAATGTCTACTTCTTTGAGAAAATCAGCTTTGCAGGCGCTTGCCAAGAC
ATTAACTGTACCACAATTAGCTTATCTGAGGGAGCAGTTTACATTGTTGGGGCCAAGCAA
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BQ
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AF RR4EF67TF U 1
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ATCATGATTGAAGAACTTGCATCGGAACTTGGACTGGGGCCATCAGTTCCGGTGCACGTT
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DS 

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ATGTGTGTGGGTTTCAGATAAAAGAGGAATGTTACATCC

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

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TGCCCCTAATCCTATATATGA


BQ
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AF RR4FS76JQ C 1
AF RR4FS76TF U 1
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TGCCCCTAATCCTATATATGA

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL7107Contig1 621 2 1 U
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GTACTTTTCTTGGTTTATAGT


BQ
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AF RR4B689JQ C 1
AF RR4B689TF U 1
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QA 1 621 1 621
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TTTGTTTTCTGCATCTGAGATTATAGTTTCCAATGTAACCATAACTAGCTTTTAATAGAT
GTACTTTTCTTGGTTTATAGT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7109Contig1 868 2 16 U
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ATTCCTGGGAAGAAGAATCATCGGATGATTCAGTCAAAGATGTAGATGAAACAGAAGTGG
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AGAAACAAGCTGTGAAGCGAGAGACTAGAGAACAGGAGTTAGAGACACCTCTAGTTTCAT
TCCAGGCGGTGAGTAAATCCTGGGAAGCTGTGGCAGAAGCACATGTGGATGATGATGATG
ATGGTGATGAACACGATAGGTCTGATGAAGAAGAGGAAGTTGCTGAAGAGACACTTGAAC
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AGCTGAAGCTTCTAGGTAGAGAAAAGCTATTGGGTGGAGGTGCCGGCTCTGATAAACCAG
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TTATTGTGAAAGGGAAGAAGTCCTCAACAATAGAGATTCCTGGATCTTCAAAGAGGTTAA
AGATGAAGGAGAAAGCTCTGTTAACTGGGGTCTTAGTCAAGTATGCAGCAAAAGCTGCTT
CAACCTCAAATGAAGAATGATCACTAGGAGCAGAGTGAATCTTTTAATTGTTTAGTCTCA
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CATGCTCAAGCAAACTTGGGTACAGATCTCTGTGGTTTAGAATCCTTTTGGACCCTTTTT
CACTTATATGGTTTGTGATGTGTATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX40TF U 1
AF RR4GX40JQ C 81
BS 1 676 RR4GX40TF
BS 677 677 RR4GX40JQ
BS 678 686 RR4GX40TF
BS 687 687 RR4GX40JQ
BS 688 698 RR4GX40TF
BS 699 699 RR4GX40JQ
BS 700 712 RR4GX40TF
BS 713 713 RR4GX40JQ
BS 714 740 RR4GX40TF
BS 741 741 RR4GX40JQ
BS 742 745 RR4GX40TF
BS 746 746 RR4GX40JQ
BS 747 754 RR4GX40TF
BS 755 756 RR4GX40JQ
BS 757 788 RR4GX40TF
BS 789 868 RR4GX40JQ

RD RR4GX40TF 791 0 0
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ATTCCTGGGAAGAAGAATCATCGGATGATTCAGTCAAAGATGTAGATGAAACAGAAGTGG
AAGAAGAAGAAGATGAACGTGTCATAGAATCTCCCAAAGTAAAAGCCAATGTAAGGTCTC
AGAAACAAGCTGTGAAGCGAGAGACTAGAGAACAGGAGTTAGAGACACCTCTAGTTTCAT
TCCAGGCGGTGAGTAAATCCTGGGAAGCTGTGGCAGAAGCACATGTGGATGATGATGATG
ATGGTGATGAACACGATAGGTCTGATGAAGAAGAGGAAGTTGCTGAAGAGACACTTGAAC
CTTTGAGCAGTTCAGTGTCATCCTCAGATGAGGAAAGGATTGAGAGAATCCGTAGGCTGG
AGCTGAAGCTTCTAGGTAGAGAAAAGCTATTGGGTGGAGGTGCCGGCTCTGATAAACCAG
AAGCAAAAACTGGTGGTGGAGTGGAAGGAGAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAAAAGA
TTATTGTGAAAGGGAAGAAGTCCTCAACAATAGAGATTCCTGGATCTTCAAAGAGGTTAA
AGATGAAGGAGAAAGCTCTGTTAACTGGGGTCTTAGTCAAGTATGCAGCAAAAGCTGCTT
CAACCTCAAATGAAGA*TGATCACTATGAGCAGAGTGA*TCTTTTAATTGTT*AGTCTCA
TCATGTCTTCTTTTGACGTT*CAAT*CTCCTTAG**ATGCATCACTGATGCGCATGCATG
CATGCTCA
GCA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4GX40JQ 788 0 0
TCGGATGATTCAGTCAAAGATGTAGATGAAACAGAAGTGGAAGAAGAAGAAGATGAACGT
GTCATAGAATCTCCCAAAGTAAAAGCCAATGTAAGGTCTCAGAAACAAGCTGTGAAGCGA
GAGACTAGAGAACAGGAGTTAGAGACACCTCTAGTTTCATTCCAGGCGGTGAGTAAATCC
TGGGAAGCTGTGGCAGAAGCACATGTGGATGATGATGATGATGGTGATGAACACGATAGG
TCTGATGAAGAAGAGGAAGTTGCTGAAGAGACACTTGAACCTTTGAGCAGTTCAGTGTCA
TCCTCAGATGAGGAAAGGATTGAGAGAATCCGTAGGCTGGAGCTGAAGCTTTTAGGTAGA
GAAAAGCTATTGGGTGGAGGTGCCGGTTCTGATAAACCAGAAGCAAAAACTGGTGGTGGA
GTGGAAGGAGAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAAAAGATTATTGTGAAAGGGAAGAAG
TCCTCAACAATAGAGATTCCTGGATCTTCAAAGAGGTTAAAGATGAAGGAGAAGGCTCTG
TTAACTGGGGTCTTAGTCAAGTATGCAGCAAAAGCTGCTTCAACCTCAAATGAAGAATGA
TCACTAGGAGCAGAGTGAATCTTTTAATTGTTTAGTCTCATCATGTCTTCTTTTGACGTT
TCAATTCTCCTTAGGAATGCATCACTGATGCGCATGCATGCATGCTCAAGCAAACTTGGG
TACAGATCTCTGTGGTTTAGAATCCTTTTGGACCCTTTTTCACTTATATGGTTTGTGATG
TGTATTAC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL7110Contig1 877 2 4 U
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CATCCACATTCGTCCTGTGTTCAAGTATAAAACAAAGGCAATCGAAAACAACCTAAATCC
TGTTTGGGACCAAACATTTGAATTGATTGCAGAGGACAAAGAAACCCAGTCGCTCACTAT
TGAGGTATTTGATAAAGACGTAGGCCAAGACGAGCGTCTAGGACTTGTGAAACTTCCTTT
AAGCAGTTTGGAAGTCGGGGTAACAAAGGAAATGGAGCTAAACCTGTTGTCTTCACTTGA
TACTCTGAAAGTAAAAGATAAGAAAGATAGAGGAAGTATAACCCTAAAGGTACACTACCA
GGAGTTCAACAAAGAGGAGCAAATGGCTGCGTTAGAAGAAGAGAAGAAAATCATGGAAGA
GAGGAAGAGACTGAAGGAAGCAGGAGTGATAGGTAGCACAATGGATGCAGTAGGGATGGT
GGGAAGTGGGCTCGGTGCTGGTGTAGGAATGGTTGGGTCTGGCATTGGTGCAGGAGTCGG
TTTGGTTGGAACTGGGGTGACCTCGGGTGTTGGGATGGTTGGTAGCGGGTTTGGAGCCAT
GGGTAGTGGATTGAGCAAAGCAGGGAGGTTCATGGGTAGAACTATTACAGGTCAGTCCAG
TAAGCGTAGTGGCTCCTCCACACCTGTGAATAGCGAGACCGATAATTCGAAACAACAGTA
AGTAAACTTTCGGACTTTAAGCAAAGATTTGTGAGTGCAATATTCTCTAAGCCTAGTCAT
ACGATGTGACTTTGTGTTCTTTATTACTTGTTTACTTGTTTCTATATTTTGAATTCACTC
TTTCAATTCTCTTAATCGGAAAAAGTGTTCAAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE09TF U 1
AF RR4BA34JQ C 55
BS 1 354 RR4EE09TF
BS 355 355 RR4BA34JQ
BS 356 619 RR4EE09TF
BS 620 877 RR4BA34JQ

RD RR4EE09TF 619 0 0
GGTGAAAGCAACTAACTTGAAGAATAAGGAACTGATTGGAAAATCAGACCCTTATGCTAC
CATCCACATTCGTCCTGTGTTCAAGTATAAAACAAAGGCAATCGAAAACAACCTAAATCC
TGTTTGGGACCAAACATTTGAATTGATTGCAGAGGACAAAGAAACCCAGTCGCTCACTAT
TGAGGTATTTGATAAAGACGTAGGCCAAGACGAGCGTCTAGGACTTGTGAAACTTCCTTT
AAGCAGTTTGGAAGTCGGGGTAACAAAGGAAATGGAGCTAAACCTGTTGTCTTCACTTGA
TACTCTGAAAGTAAAAGATAAGAAAGATAGAGGAAGTATAACCCTAAAGGTACATTACCA
GGAGTTCAACAAAGAGGAGCAAATGGCTGCGTTAGAAGAAGAGAAGAAAATCATGGAAGA
GAGGAAGAGACTGAAGGAAGCAGGAGTGATAGGTAGCACAATGGATGCAGTAGGGATGGT
GGGAAGTGGGCTCGGTGCTGGTGTAGGAATGGTTGGGTCTGGCATTGGTGCAGGAGTCGG
TTTGGTTGGAACTGGGGTGACCTCGGGTGTTGGGATGGTTGGTAGCGGGTTTGGAGCCAT
GGGTAGTGGATTGAGCAAA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BA34JQ 823 0 0
TGCTACCATCCACATTCGTCCTGTGTTCAAGTATAAAACAAAGGCAATCGAAAACAACCT
AAATCCTGTTTGGGACCAAACATTTGAATTGATTGCAGAGGACAAAGAAACCCAGTCGCT
CACTATTGAGGTATTTGATAAAGACGTAGGCCAAGACGAGCGTCTAGGACTTGTGAAACT
TCCTTTAAGCAGTTTGGAAGTCGGGGTAACAAAGGAAATGGAGCTGAATCTGTTGTCTTC
ACTTGATACTCTGAAAGTAAAAGATAAGAAAGATAGAGGAAGTATAACCCTAAAGGTACA
CTACCAGGAGTTCAACAAAGAGGAGCAAATGGCTGCGTTAGAAGAAGAGAAGAAAATCAT
GGAAGAGAGGAAGAGACTGAAGGAAGCAGGAGTGATAGGTAGCACAATGGATGCAGTAGG
GATGGTGGGAAGTGGGCTCGGTGCTGGTGTAGGAATGGTTGGGTCTGGCATTGGTGCAGG
AGTCGGTTTGGTTGGAACTGGGGTGACCTCGGGTGTTGGGATGGTTGGTAGCGGTTTTGG
AGCCATGGGTAGTGGATTGAGCAAAGCAGGGAGGTTCATGGGTAGAACTATTACAGGTCA
GTCCAGTAAGCGTAGTGGCTCCTCCACACCTGTGAATAGCGAGACCGATAATTCGAAACA
ACAGTAAGTAAACTTTCGGACTTTAAGCAAAGATTTGTGAGTGCAATATTCTCTAAGCCT
AGTCATACGATGTGACTTTGTGTTCTTTATTACTTGTTTACTTGTTTCTATATTTTGAAT
TCACTCTTTCAATTCTCTTAATCGGAAAAAGTGTTCAAGACCC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL7111Contig1 897 2 2 U
GGAGATCTCATCGGAAGAGACACACAGTTCACGACGAGGCGATGGCTTCAGGTTTCAGCG
GCGATGAAACTACTCCGTTCTTCGGATTCCTCGGCGCTGCCGCCGCTCTCGTCTTCTCCT
GTATGGGGGCAGCGTACGGGACAGCGAAGAGCGGGGTCGGTGTAGCGTCGATGGGTGTGA
TGAGGCCAGAGCTTGTAATGAAATCGATTGTTCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTA
TCTATGGTCTCATCATTGCTGTCATCATCAGTACTGGTATCAACCCTAAGGCCAAGTCTT
ACTATCTCTTCGATGGCTATGCTCATCTCTCTTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCTGGTC
TCTCCGCCGGTATGGCTATTGGCATCGTCGGCGATGCCGGTGTTCGGTAATTGAAACAAA
CTATATTTGAGATGTTGTTTAGAGCTAAAAAAGATGTTTGAATTTTTTTTACTTTAGGTT
GAATGATAGATGATGTTATGTGTTTGCTTTTTAGTCTAAGTTAGAGGGATGTTTGACTTT
GTGATCTGATGTCGTTTGTGCGTTGCAGAGCGAATGCACAACAACCAGAGCTGTTTGTGG
GGATGATATTGATTCTCATCTTTGCTGAAGCACTTGCGCTGTATGGTCTCATTGTTGGTA
TCATCCTCTCTTCTCGTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAAGTCTTTTCAT
ATGTTCATGTTTTTTTTTATATATTTCACTTCCTTTTGTGGCATTGTGAGTTTTTTTTGC
TTTTCTCATGATAAACAAGCAAACAATCATTTGAATTTGGTTCTAATATTTTTTTTTAAT
TGGCACACTGTAAAAAATACACCAATAAGTAATATAATAAAATGATTCAATGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G575TF U 1
AF RR4G575JQ C 124
BS 1 710 RR4G575TF
BS 711 897 RR4G575JQ

RD RR4G575TF 710 0 0
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GTATGGGGGCAGCGTACGGGACAGCGAAGAGCGGGGTCGGTGTAGCGTCGATGGGTGTGA
TGAGGCCAGAGCTTGTAATGAAATCGATTGTTCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTA
TCTATGGTCTCATCATTGCTGTCATCATCAGTACTGGTATCAACCCTAAGGCCAAGTCTT
ACTATCTCTTCGATGGCTATGCTCATCTCTCTTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCTGGTC
TCTCCGCCGGTATGGCTATTGGCATCGTCGGCGATGCCGGTGTTCGGTAATTGAAACAAA
CTATATTTGAGATGTTGTTTAGAGCTAAAAAAGATGTTTGAATTTTTTTTACTTTAGGTT
GAATGATAGATGATGTTATGTGTTTGCTTTTTAGTCTAAGTTAGAGGGATGTTTGACTTT
GTGATCTGATGTCGTTTGTGCGTTGCAGAGCGAATGCACAACAACCAGAGCTGTTTGTGG
GGATGATATTGATTCTCATCTTTGCTGAAGCACTTGCGCTGTATGGTCTCATTGTTGGTA
TCATCCTCTCTTCTCGTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4G575JQ 774 0 0
AT
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CCAGAGCTTGTAATGAAATCGATTGTTCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATCTAT
GGTCTCATCATTGCTGTCATCATCAGTACTGGTATCAACCCTAAGGCCAAGTCTTACTAT
CTCTTCGATGGCTATGCTCATCTCTCTTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCC
GCCGGTATGGCTATTGGCATCGTCGGCGATGCCGGTGTTCGGTAATTGAAACAAACTATA
TTTGAGATGTTGTTTAGAGCTAAAAAAGATGTTTGAATTTTTTTTACTTTAGGTTGAATG
ATAGATGATGTTATGTGTTTGCTTTTTAGTCTAAGTTAGAGGGATGTTTGACTTTGTGAT
CTGATGTCGTTTGTGCGTTGCAGAGCGAATGCACAACAACCAGAGCTGTTTGTGGGGATG
ATATTGATTCTCATCTTTGCTGAAGCACTTGCGCTGTATGGTCTCATTGTTGGTATCATC
CTCTCTTCTCGTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAAGTCTTTTCATATGTT
CATGTTTTTTTTTATATATTTCACTTCCTTTTGTGGCATTGTGAGTTTTTTTTGCTTTTC
TCATGATAAACAAGCAAACAATCATTTGAATTTGGTTCTAATATTTTTTTTTAATTGGCA
CACTGTAAAAAATACACCAATAAGTAATATAATAAAATGATTCAATGGTTTT

QA 3 774 3 774
DS 



AS 1 2

CO CL7112Contig1 877 2 4 U
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TTGAAGAACTTGAAAAGACTTTGAAAAAATTCGAAGCTCAGTTGAAAGAAGAGGTCGAAA
ATGCAACGGCTGCGTCTGTAAAAGTGGCCGAACTGACCTCAAAGCTACAGGAAGACGAAC
ATATCGCTAGTGACCGAGATGTGCTCAATGAGAAAGTACTTCAGCTTCAGAAAGAGCTTC
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AATTTGAATCGATGGTCAAAGATCTTGAACAGAAAGTGCAGCTCGCGGATGCTAAAGCTA
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TGATAAAAATCTCTCAGAAGCTTCATGAGAGATGTAATGTTTAGCAGAATATGGGAAGCT
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TTGATACTCTTAAATTAAATGAAGGTGAAGTTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F975TF U 1
AF RR4F975JQ C 33
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BS 649 649 RR4F975JQ
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BS 717 877 RR4F975JQ

RD RR4F975TF 724 0 0
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ATGCAACGGCTGCGTCTGTAAAAGTGGCCGAACTGACCTCAAAGCTACAGGAAGACGAAC
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AAGCGGCTCAGAGTTCTATTGCTGAACAGAAACAAGCACACTCCCAGAAGCATTCAGAGC
TGGAGGCTGCACTAAAGCAGTCACAAGAAGAGATTGAAACTAAGAAAAAGGCAGTCACTG
AATTTGAATCGATGGTCAAAGATCTTGAACAGAAAGTGCAGCTCGCGGATGCTAAAGCTA
AGGAAACGGAGGCAAAGGATGTAGTTATTAAATCTCGAGACGTTGACTTGTCCTTTTCAT
CTCCAACGAAACGTACGAGCAAGAAGAAGTCAGAGGCGTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCGA
GCAACGTAACCGCTACTCAGACGGCGACAACTTCTCATCTCATGACACTGAAGATCGTCT
CTGGAGTAGCTTTGATCTCCGTTATCATCGGTATAATTCTTGGGAAAA*GTACTAGTGTT
CTTGTTTGGTGTGATGTTCATATGTGAAGATCTCTCCTTTTATTTGTTTTTTTTTA
TTTTGATA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4F975JQ 845 0 0
TGCTG
AAAATCTGTTTTAGAAGCACATGTTGAAGAACTTGAAAAGACTTTGAAAAA*TTCGAAGC
TCAGTTGAAAGAAGAGGTCGAAAATGCAACGGCTGCGTCTGTAAAAGTGGCCGAACTGAC
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ACTTCAGCTTCAGAAAGAGCTTCAAGCGGCTCAGAGTTCTATTGCTGAACAGAAACAAGC
ACACTCCCAGAAGCATTCAGAGCTGGAGGCTGCACTAAAGCAGTCACAAGAAGAGATTGA
AACTAAGAAAAAGGCAGTCACTGAATTTGAATCGATGGTCAAAGATCTTGAACAGAAAGT
GCAGCTCGCGGATGCTAAAGCTAAGGAAACGGAGGCAAAGGATGTAGTTATTAAATCTCG
AGACGTTGACTTGTCCTTTTCATCTCCAACGAAACGTACGAGCAAGAAGAAGTCAGAGGC
GTCTCCTTTTTTTTTTTTTTCGAGCAACGTAACCGCTACTCAGACGGCGACAACTTCTCA
TCTCATGACACTGAAGATCGTCTCTGGAGTAGCTTTGATCTCCGTTATCATCGGTATAAT
TCTTGGGAAAAAGTACTAGTGTTCTTGTTTGGTGTGATGTTCATATGTGAAGATCTCTCC
TTTTATTTGTTTTTTTTTAATTTTGATAAAAATCTCTCAGAAGCTTCATGAGAGATGTAA
TGTTTAGCAGAATATGGGAAGCTTTGCTTCTCTCTGCAGATTGTTTTTGGTTTTTAATTG
TGGCTTGTTGGTCAAGCAATGTTTTGATACTCTTAAATTAAATGAAGGTGAAGTTATTTG

QA 6 845 6 845
DS 



AS 1 2

CO CL7113Contig1 1062 2 4 U
GGGTACAGTGCATGAGACAGAAGAGGAGTTCAATACATGGGGCATAAGAAAAAAATAACA
ACTTACTTTCTCAAAGCAGGAATGGTAGGAAGATGGACTGCAAAGCATAAAGGGATCCTT
TCTGATGCTCCAGGATCGCTCTTGTTGATAGATTCAACCTAATAGAGGACAATTATCAAA
ACTAGGCTGATAGATGTGACGAGATAATGCCTACTAAGCGAGTGAGAAATACAATGCGAA
AAGAAGAACAAACTAATTTGATAATGCACACATACCAATTTATCCATCATCTCCAGGGCA
CGTCCCTTTGTACGACTCCGAGTTGATTCCCATCGAACACGTAGTAAGTCACACAAACGC
CGTAGCTAATAGCATGTCCATAGAACAAAAGTCAGTTAGTTTGTTTCACTTGCATTGGCT
AAGACGAAATGAAAAACCAACATTTTTAAACTAGTCAACTGAGATAACTGAAAAGATAGT
AGCTTACAGTAAAATATGTTGACTTTTGAGAATCAATTGCCTCAATATAGGGAGCCATAT
CCCATCCTGCAGGGAAAAAAAAGTATTAAAATATATAAATAAAACTAACGGACATAGTTT
AATTCAGACACAAAAACATGAGCAGACATCTTCTTCACGCATTTTTAAATGCAGTCACAA
CTTAGGTGTGGTGAGTCTGGTGACTTAATTTACTATCAAAGCTCTCTACAGAACATAATT
GCAGTCACAACTTGGGTTTACTTACTTTGCATCTCGTCGTTCCGACTAGCCTTCTCAATT
AAAAGGCAATGAGCCAAAATCATTGCCTGTTCGACTGGTTTTAAGGCCACAGAATCTTTG
CCAGCTTCACTCTCATCGTTCACTAGTTTTGGAGTCATGTATACTTCAGGAGCTTCCCCT
CCCCAAGCTTCATAATAAGATCCAACATCAGCTTTCTCAGTGGCCAGCCTCACGGCCCCA
TTGGATGAGCTAGTATTCGCTATCAATACCATTTGTGCCTTTGGCTCGACCTGCAACAAA
GACCAGAGGTACTTAGAATAACAAAGTTGAATACATATAGCC


BQ
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AATACATATAGCC

QA 1 733 1 733
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AS 1 2

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AAATGGAAGATATTTTTCCAAAATGTTTTTAGATATTTTATATAACTATGTTAACTTGAT
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AACATTCTC


BQ
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AA*TGGAAGATATTTTT

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GAGAAGAAATGATTTAGCTTCCATTTTCTTCTTTGTAATTTGTTAGAGAATTTGAGGTTT
TGGTGTGGAAAGAGAGGTATTTATAGAGCATGGCGTTGTTTTTTATTTATTTCTAACCAA
TTAATCGTGTCAAGATAAATGGAAGATATTTTTCCAAAATGTTTTTAGATATTTTATATA
ACTATGTTAACTTGATATGTTTCCTAAGTTAAAAATATGGAATATTAAGAAGACAAAAAT
CCTAGTAATATAAAAAAACATTCTC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL7115Contig1 781 2 4 U
GGAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGAGCAAATGATGGGAGAAGA
ACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGCACTGCA
TTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAAT
TTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCT
ATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGA
CTTGTTTTTGCACTCTTCCTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTC
TCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGAAAGTATGGTAGTACACACGCCGGTTGGCTA
CCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCC
TTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCAT
TTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATGATTTTT
CAAGCTTTCTTATACTACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATTGTATC
CTTCCGTGAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAAGTCTCGTCTTC
ATTTGGGACTCTTGTTACGTGTGCATTTCAATACTAATCAACCCCTCTCTATATTCAAAT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4F508TF U 1
AF RR4F508JQ C 23
BS 1 750 RR4F508TF
BS 751 751 RR4F508JQ
BS 752 774 RR4F508TF
BS 775 781 RR4F508JQ

RD RR4F508TF 775 0 0
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TTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAAT
TTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCT
ATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGA
CTTGTTTTTGCACTCTTCCTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTC
TCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGAAAGTATGGTAGTACACACGCCGGTTGGCTA
CCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCC
TTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCAT
TTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATGATTTTT
CAAGCTTTCTTATACTACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATTGTATC
CTTCCGTGAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAAGTCTCGTCTTC
ATTTGGGACTCTTGTTACGTGTGCATTTCA*TACTAATCAACCCCTCTCTATAT
C

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4F508JQ 759 0 0
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TTCAAGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGA
TCACTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACT
CATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTA
CGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCCTCT
TTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTT
ACATCGGAAAGTATGGTAGTACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATA
ATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGT
TCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGT
TTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATACTACTTAC
TATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATTGTATCCTTCCGTGAAATGTTTGTCCTT
GAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAAGTCTCGTCTTCATTTGGGACTCTTGTTACGTGT
GCATTTCAATACTAATCAACCCCTCTCTATATTCAAATG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL7116Contig1 680 2 4 U
GGTCCTAAGAAAGGGGTAAAATTTATAATAATTTAGTTCTTAGACACTGTAAGAATCATT
GTCATATGTATGGTAAACATCGATACAACATCGATCATCTACTTGTTGGTTTTGGAACTC
ATCTCAACATTAGCAATACTCTTATCCTCCTTCAAATCTCCCATCTGTGAACCAAACTTG
TACCGGTATCCCCGAGCACAAAACCAAAAGTAAACCAGATTAACCACACCCAAAACCGCG
ATCAGATAATAGAAGTAATCCAATTTCCCCTCGTTGAGATTCTTGTTTAGCCAATCAGGA
CGTTCATGACCACCGGAAAACTTATGAACAACCGTGACTAGAACACTGCTAAGATAGCTC
GAACCGGCAAAGGATAAAGAGAAGAGAGCATTAGCTATGCTTCTCATGTGTCCCGGAAAC
TGACTGTTGAAGAACTCTATCTGTCCTATTATATTGAATGCTTCACATAGTCCCATCAGA
ATTAGCTGCGGCGAGAGCCAAAACACGGACATGGGAGTCATACCGGTCGGATCACCTGCC
TTGATGGAGCGTGTGCGTCTCACGCCCTCCACGAGGCCGGCAACAATCATGGAAAGGATT
GCGAAAACGATCCCTGTCCCGATACGTTGGAGGAGTGTGATACCGGATTTATGGCCGGTG
ATGCGGCGGAGGAACGGGAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX50JQ U 1
AF RR4FA05JQ U 2
BS 1 411 RR4FX50JQ
BS 412 412 RR4FA05JQ
BS 413 590 RR4FX50JQ
BS 591 680 RR4FA05JQ

RD RR4FX50JQ 590 0 0
GGTCCTAAGAAAGGGGTAAAATTTATAATAATTTAGTTCTTAGACACTGTAAGAATCATT
GTCATATGTATGGTAAACATCGATACAACATCGATCATCTACTTGTTGGTTTTGGAACTC
ATCTCAACATTAGCAATACTCTTATCCTCCTTCAAATCTCCCATCTGTGAACCAAACTTG
TACCGGTATCCCCGAGCACAAAACCAAAAGTAAACCAGATTAACCACACCCAAAACCGCG
ATCAGATAATAGAAGTAATCCAATTTCCCCTCGTTGAGATTCTTGTTTAGCCAATCAGGA
CGTTCATGACCACCGGAAAACTTATGAACAACCGTGACTAGAACACTGCTAAGATAGCTC
GAACCGGCAAAGGATAAAGAGAAGAGAGCATTAGCTATGCTTCTCATGTGTTCCGGAAAC
TGACTGTTGAAGAACTCTATCTGTCCTATTATATTGAATGCTTCACATAGTCCCATCAGA
ATTAGCTGCGGCGAGAGCCAAAACACGGACATGGGAGTCATACCGGTCGGATCACCTGCC
TTGATGGAGCGTGTGCGTCTCACGCCCTCCACGAGGCCGGCAACAATCAT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4FA05JQ 679 0 0
GTCCTAAGAAAGGG*TAAAATTTATAATAATTTAGTTCTTAGACACTGTAAGAATCATTG
TCATATGTATGGTAAACATCGATACAACATCGATCATCTACTTGTTGGTTTTGGAACTCA
TCTCAACATTAGCAATACTCTTATCCTCCTTCAAATCTCCCATCTGTGAACCAACCTTGT
ACCGGTATCCCCGAGCACAAAACCAAAAGTAAACCAGATTAACCACACCCAAAACCGCGA
TCAGATAATAGAAGTAATCCAATTTCCCCTCGTTGAGATTCTTGTTTAGCCAATCAGGAC
GTTCATGACCACCGGAAAACTTATGAACAACCGTGACTAGAACACTGCTAAGATAGCTCG
AACCGGCAAAGGATAAAGAGAAGAGAGCATTAGCTATGCTTCTCATGTGTCCCGGAAACT
GACTGTTGAAGAACTCTATCTGTCCTATTATATTGAATGCTTCACATAGTCCCATCAGAA
TTAGCTGCGGCGAGAGCCAAAACACGGACATGGGAGTCATACCGGTCGGATCACCTGCTT
TGATGGAGCGTGTGCGTCTCACGCCCTCCACGAGGCCGGCAACAATCATGGAAAGGATTG
CGAAAACGATCCCTGTCCCGATACGTTGGAGGAGTGTGATACCGGATTTATGGCCGGTGA
TGCGGCGGAGGAACGGGAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL7117Contig1 874 2 2 U
GCTTGAAGGAGCACGTAGAGACTCTCCCTCCTGCTTCTCCAGAGATTGGAGGAGTGAGGC
TTTTTGTTGACATCTCTGTTCCGAGAAACGTTGGTTCTTGTGTGAATGAAGTAGAAACCG
CACGGGTTTACAATGTGGACGACCTCAAGGAAGTAGTTGCGGCTAATAAAGAAGACAGGT
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GGAGGGATTCGCTAGAGACGGTTCCTACGATCAAGAAGTTAAGAGCTTATGCAGAGAGAA
TCAGGATGGCAGAGCTGGAGAAGCGCATGTCCAAAATGGGAGATGACATCAACAAGAAAA
CGACGAGAGCTGTTGATGACTTAAGCCGAGGTATCGTGAACAGGTTCTTACATGGTCCAA
TGCAGCATCTGAGATGTGATGGGAGTGACAGTAGAACGCTAAGCGAGACACTTGAGAATA
TGCATGCTTTGAACAGAATGTATGGTCTCGAAAAGGACATTTTGGAGGAGAAGCTCAAGG
CGATGACATCTGGACAACAAAAGTAAAAGATAGGGGTCTGGTCCATCTCTTTTGACAGAC
AATATTACATGGATATGGCTTCCCTGCAAATCCGAGTAAATTGCATATATATCATTAAGC
TGAGGATCTATATGATTCATTTAATTTGTGTACAAGAGACAGGTTTCTTTTGCTAACATT
TTATGTCGTCTAAAGTGCAAGTGTTTGTGAAGCTAAGCAAGCCTTTTTGCATGTTTTTTG
CTTCATAAACTCGAATATAACGGTACTGATCCAAGTACTGTTACTCTTTTGTAATATATA
AACTTTGGTTAGTATGATATAGAGATGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AG23TF U 1
AF RR4AG23JQ C 179
BS 1 839 RR4AG23TF
BS 840 874 RR4AG23JQ

RD RR4AG23TF 839 0 0
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TTTTTGTTGACATCTCTGTTCCGAGAAACGTTGGTTCTTGTGTGAATGAAGTAGAAACCG
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TGCAGCATCTGAGATGTGATGGGAGTGACAGTAGAACGCTAAGCGAGACACTTGAGAATA
TGCATGCTTTGAACAGAATGTATGGTCTCGAAAAGGACATTTTGGAGGAGAAGCTCAAGG
CGATGACATCTGGACAACAAAAGTAAAAGATAGGGGTCTGGTCCATCTCTTTTGACAGAC
AATATTACATGGATATGGCTTCCCTGCAAATCCGAGTAAATTGCATATATATCATTAAGC
TGAGGATCTATATGATTCATTTAATTTGTGTACAAGAGACAGGTTTCTTTTGCTAACATT
TTATGTCGTCTAAAGTGCAAGTGTTTGTGAAGCTAAGCAAGCCTTTTTGCATGTTTTTTG
CTTCATAAACTCGAATATAACGGTACTGATCCAAGTACTGTTACTCTTTTGTAATATAT

QA 1 839 1 839
DS 

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GTGGAGGGATTCGCTAGAGACGGTTCCTACGATCAAGAAGTTAAGAGCTTATGCAGAGAG
AATCAGGATGGCAGAGCTGGAGAAGCGCATGTCCAAAATGGGAGATGACATCAACAAGAA
AACGACGAGAGCTGTTGATGACTTAAGCCGAGGTATCGTGAACAGGTTCTTACATGGTCC
AATGCAGCATCTGAGATGTGATGGGAGTGACAGTAGAACGCTAAGCGAGACACTTGAGAA
TATGCATGCTTTGAACAGAATGTATGGTCTCGAAAAGGACATTTTGGAGGAGAAGCTCAA
GGCGATGACATCTGGACAACAAAAGTAAAAGATAGGGGTCTGGTCCATCTCTTTTGACAG
ACAATATTACATGGATATGGCTTCCCTGCAAATCCGAGTAAATTGCATATATATCATTAA
GCTGAGGATCTATATGATTCATTTAATTTGTGTACAAGAGACAGGTTTCTTTTGCTAACA
TTTTATGTCGTCTAAAGTGCAAGTGTTTGTGAAGCTAAGCAAGCCTTTTTGCATGTTTTT
TGCTTCATAAACTCGAATATAACGGTACTGATCCAAGTACTGTTACTCTTTTGTAATATA
TAAACTTTGGTTAGTATGATATAGAGATGTTTTTTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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TCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCAAATCCTTCCTCCTCGTCGCACGCGCACGCCCA
CGCGCTTCAATCCTCATCAGCCTCGATTCAAGTTTGAGGAGCATTGTGGTGCTAGGATGG
GTGTGAAGCAGGCTCTAAGGAGCATCGATGCGTTCCCAAGAGCTGAGGATCATCTCCTTC
AGAAAACTCAATCTGGTGCCGTTGTATCCATTGTTGGGCTCTTTATAATGGTTACATTGT
TCTTGAGCGAGCTGAGTTTCTATCTTAACACACTTACCGTGCATCAGATGTCAGTGGACT
TAAAGCGTGGAGAAACTCTTCCTATTCATGTAAATATGACGTTCCCATCTTTGCCTTGTG
ATGTATTGAGCATGGATGCTATCGACATGTCAGGGAAGCATGAAGTTGATCTTGATACAA
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CGGAAGCTTTAAATATACTTGGGTTTGATGAAGCTGCTGAGACGTTGATTAAAAGGTGAA
GCAAGCATTGGCGGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH34TF U 1
AF RR4BM25TF U 34
BS 1 207 RR4GH34TF
BS 208 208 RR4BM25TF
BS 209 653 RR4GH34TF
BS 654 677 RR4BM25TF

RD RR4GH34TF 653 0 0
GGGTTCAAACATCGATTTTGTCTCTCCGGACCTGGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCAAATCCTTCCTCCTCGTCGCACGCGCACGCCCA
CGCGCTTCAATCCTCATCAGCCTCGATTCAAGTTTGAGGAGCATTGTGGTGCTAGGATGG
GTGTGAAGCAGGCTCTAAGGAGCATCGGTGCGTTCCCAAGAGCTGAGGATCATCTCCTTC
AGAAAACTCAATCTGGTGCCGTTGTATCCATTGTTGGGCTCTTTATAATGGTTACATTGT
TCTTGAGCGAGCTGAGTTTCTATCTTAACACACTTACCGTGCATCAGATGTCAGTGGACT
TAAAGCGTGGAGAAACTCTTCCTATTCATGTAAATATGACGTTCCCATCTTTGCCTTGTG
ATGTATTGAGCATGGATGCTATCGACATGTCAGGGAAGCATGAAGTTGATCTTGATACAA
ACATTTGGAAGCTCCGTCTCAATAGTCATGGTCATATCATTGGCACGGAATATATATCTG
ATCTTGTTGAAAAGGAGCATGATCACTCATCTCACAAGCACGATGAACACAAGAATGAGA
CGGAAGCTTTAAATATACTTGGGTTTGATGAAGCTGCTGAGACGTTGATTAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4BM25TF 644 0 0
GGGGAGA
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCAAATCCTTCCTCC
TCGTCGCACGCGCACGCCCACGCGCTTCAATCCTCATCAGCCTCGATTCAAGTTTGAGGA
GCATTGTGGTGCTAGGATGGGTGTGAAGCAGGCTCTAAGGAGCATCGATGCGTTCCCAAG
AGCTGAGGATCATCTCCTTCAGAAAACTCAATCTGGTGCCGTTGTATCCATTGTTGGGCT
CTTTATAATGGTTACATTGTTCTTGAGCGAGCTGAGTTTCTATCTTAACACACTTACCGT
GCATCAGATGTCAGTGGACTTAAAGCGTGGAGAAACTCTTCCTATTCATGTAAATATGAC
GTTCCCATCTTTGCCTTGTGATGTATTGAGCATGGATGCTATCGACATGTCAGGGAAGCA
TGAAGTTGATCTTGATACAAACATTTGGAAGCTCCGTCTCAATAGTCATGGTCATATCAT
TGGCACGGAATATATATCTGATCTTGTTGAAAAGGAGCATGATCACTCATCTCACAAGCA
CGATGAACACAAGAATGAGACGGAAGCTTTAAATATACTTGGGTTTGATGAAGCTGCTGA
GACGTTGATTAAAAGGTGAAGCAAGCATTGGCGGATG

QA 8 644 8 644
DS 



AS 1 2

CO CL7119Contig1 823 2 8 U
GCGCAGCGCTCATAACCGTTGCCAAGAACTGTCCAAATTTCATCCGGTTCAGACTCTGCA
TCCTCGAGCCACACAAACCCGACCACGTCACATCTCAGCCTCTAGACGAAGGCTTTGGAG
CAATCGTGCAAGCATGCAAGAACTTGAAGCGGCTTTCAGTCTCTGGTCTCCTTACAGACC
AAGTCTTTCTCTACATCGGCATGTTTGCAACTCAGCTTGAGATGCTCTCCATAGCTTTTG
CTGGCGATACGGATAAAGGCATGTTGTATGTGTTGAACGGTTGCAAAAAGATGAGGAAGC
TAGAGATTAGGGATAGTCCTTTTGGGGACACGGCGCTTCTTGCTGATGTGAACAAGTATG
AAACAATGCGATCCCTTTGGATGTCTTCATGTGAAGTCACTCTTGGGGGATGCAAAAGGC
TTGCACAGAAAGCGCCATGGCTCAATGTAGAGATCATAAACGAGAACGATAATAACCGGA
TGGAGGAAAATGGATATGAGGGAAGACAGAAGGTGGATAAAATGTATCTGTACCGGACCG
TGGTTGGGACAAGGGTTGATGCGCCGCCACTTGTGTGGATTCTCTAGTTTTCTTTTTTGG
TTCCGACCAAACATGGAACTAGTTCGATGCTTCTGAGATTCTGATTGGTCGGCTTGCGTT
CGTGGTCCTTTCCGAAATTAGGTGTACTTTTTATGTTTTATTTAAGACAGAAAACTGATT
CTTTTGTGAAAGCCTTTCTGTTTTTTCTTTCCTCTTTTGACTTTCCCCTGGTGGTTTATT
GTTTTTTTACGAATGCTACTGCTTGATTTTTGATTAGTTTGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX73TF U 1
AF RR4BX73JQ C 1
BS 1 681 RR4BX73TF
BS 682 682 RR4BX73JQ
BS 683 704 RR4BX73TF
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BS 745 823 RR4BX73JQ

RD RR4BX73TF 744 0 0
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CTTTTGTGAAAGCCTTTCTGTTTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4BX73JQ 823 0 0
GCGCAGCGCTCATAACCGT*GCCAAGAACTGTCCAAATT*CATCCGGTTCAGACTCTGCA
TCCTCGAGCCACACAAACCCGACCACGTCACATCTCAGCCTCTAGACGAAGGCTTTGGAG
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CTGGCGATACGGATAAAGGCATGTTGTATGTGTTGAACGGTTGCAAAAAGATGAGGAAGC
TAGAGATTAGGGATAGTCCTTTTGGGGACACGGCGCTTCTTGCTGATGTGAACAAGTATG
AAACAATGCGATCCCTTTGGATGTCTTCATGTGAAGTCACTCTTGGGGGATGCAAAAGGC
TTGCACAGAAAGCGCCATGGCTCAATGTAGAGATCATAAACGAGAACGATAATAACCGGA
TGGAGGAAAATGGATATGAGGGAAGACAGAAGGTGGATAAAATGTATCTGTACCGGACCG
TGGTTGGGACAAGGGTTGATGCGCCGCCACTTGTGTGGATTCTCTAGTTTTCTTTTTTGG
TTCCGACCAAACATGGAACTAGTTCGATGCTTCTGAGATTCTGATTGGTCGGCTTGCGTT
CGTGGTCCTTTCCGAAATTAGGTGTACTTTTTATGTTTTATTTAAGACAGAAAACTGATT
CTTTTGTGAAAGCCTTTCTGTTTTTTCTTTCCTCTTTTGACTTTCCCCTGGTGGTTTATT
GTTTTTTTACGAATGCTACTGCTTGATTTTTGATTAGTTTGCT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL7120Contig1 699 2 3 U
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GTTGTGAAAGCTCCTTTTTGAAGTTATATTATATAGTCATCATCCAAGGACTTTCTGATT
GTACTTTGGAACAATTATTATATGTAACAATTTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BO22TF U 1
AF RR4BO22JQ C 34
BS 1 648 RR4BO22TF
BS 649 649 RR4BO22JQ
BS 650 699 RR4BO22TF

RD RR4BO22TF 699 0 0
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GAGGATGCCATCGTTCGATCCTGAGCTTATTTGGGAAGTTCTCGCTAATTAAATCACAAA
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GTTCGAAAGTTGTTTTAGGGTTCTTAATTAAAATTTTAAGCCTCGTGGTTTTTGAGAGAG
GTTGTGAAAGCTCCTTTTTGAAGTTATATTATATAGTCATCATCCAAG*ACTTTCTGATT
GTACTTTGGAACAATTATTATATGTAACAATTTTTATTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4BO22JQ 666 0 0
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CTCGCCGGGAACTCTGTCTTCTCCGGCGACAACCGCCACTGCGGTAAATTCAGAGGATAG
CTACCGGAATTCGCAGATGGGTGTGTGGAATAGCAAGAATAGTTCTCCTGCTTCGGTTTC
TGTCTCCGATGAAATTCCGGCGACGGCAACATCGACGGCGGAGGAGGAGGAAGACACGAT
GATGGATACTGATGGGTTTTTACTTGCGAGGATGCCATCGTTCGATCCTGAGCTTATTTG
GGAAGTTCTCGCTAATTAAATCACAAAACTTGGGTATCAAGGAATATGATGAGAAGATTA
GGGTTTTAGGTGTGAATTAAGGTCTTCGTTCGAAAGTTGTTTTAGGGTTCTTAATTAAAA
TTTTAAGCCTCGTGGTTTTTGAGAGAGGTTGTGAAAGCTCCTTTTTGAAGTTATATTATA
TAGTCATCATCCAAGGACTTTCTGATTGTACTTTGGAACAATTATTATATGTAACAATTT
TTATTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL7121Contig1 625 2 2 U
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GAGATGGTTTAGGCGGAGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGCCGGTGGAC
TTGGTGGCGGTGGTGGCTTTCCTTGAACGTGTAGTCAAGTGTTTGTGTGTGTGTCTGAGC
TCATTCACAGCTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCCATTGTCATAATAAATTTAGAGTGG
TTTAATCACATTCACGTCTTTTATTTCAACATCAATGTTTTAATCGAGAAAGGCCTTAGC
TAATAGCTACTACTTCTAGCGGTTATGGTCGGACTCGTAGTATGTGTAACGTCAAATATT
ATTATTAATTAGTGAAAAATTTCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS74JQ C 1
AF RR4DS74TF U 1
BS 1 619 RR4DS74TF
BS 620 625 RR4DS74JQ

RD RR4DS74JQ 625 0 0
GGACACACCTCCATCATAAACAAAAAAAATAATCTCTACCATCAAAGCAAAACATGAGAG
CCACTTTCACTAACTTGCTTGTGCTTCTCTTCATTGCACTTGTTTGCGTAAATGTCGGTG
CTAGGAAACTTATTTCCGGAGATACCCAATTCAAAGATGAAAAATTCCTTGGCGGCGGTG
GAGCCGGTGGTGGCCTTGGTGGGCTAGGGATTGGAGCTAATATCAATGTTGGAGCTGGGT
TAGGGCTAGGTGTTGGACTTGGCGGTGGTGGTGGACTCCTAGGCGGAGGTGGTTTAGGCG
GAGATGGTTTAGGCGGAGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGCCGGTGGAC
TTGGTGGCGGTGGTGGCTTTCCTTGAACGTGTAGTCAAGTGTTTGTGTGTGTGTCTGAGC
TCATTCACAGCTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCCATTGTCATAATAAATTTAGAGTGG
TTTAATCACATTCACGTCTTTTATTTCAACATCAATGTTTTAATCGAGAAAGGCCTTAGC
TAATAGCTACTACTTCTAGCGGTTATGGTCGGACTCGTAGTATGTGTAACGTCAAATATT
ATTATTAATTAGTGAAAAATTTCCG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4DS74TF 619 0 0
GGACACACCTCCATCATAAACAAAAAAAATAATCTCTACCATCAAAGCAAAACATGAGAG
CCACTTTCACTAACTTGCTTGTGCTTCTCTTCATTGCACTTGTTTGCGTAAATGTCGGTG
CTAGGAAACTTATTTCCGGAGATACCCAATTCAAAGATGAAAAATTCCTTGGCGGCGGTG
GAGCCGGTGGTGGCCTTGGTGGGCTAGGGATTGGAGCTAATATCAATGTTGGAGCTGGGT
TAGGGCTAGGTGTTGGACTTGGCGGTGGTGGTGGACTCCTAGGCGGAGGTGGTTTAGGCG
GAGATGGTTTAGGCGGAGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGCCGGTGGAC
TTGGTGGCGGTGGTGGCTTTCCTTGAACGTGTAGTCAAGTGTTTGTGTGTGTGTCTGAGC
TCATTCACAGCTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCCATTGTCATAATAAATTTAGAGTGG
TTTAATCACATTCACGTCTTTTATTTCAACATCAATGTTTTAATCGAGAAAGGCCTTAGC
TAATAGCTACTACTTCTAGCGGTTATGGTCGGACTCGTAGTATGTGTAACGTCAAATATT
ATTATTAATTAGTGAAAAA

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL7122Contig1 767 2 7 U
CATAAACAAATTCTGTTTAAAAATGCAGAGTAAATAATATATCTACAGATTGCACCTTTT
TTTTTACTTTTCCTCAACATTACAGTTACCCATGTGAATATTCAAAGGAGACAGAGCATA
GGAGTTGTAACATACATTGCAAATGAGTAACAAACTAACAATGACCACAACATTAACATA
TTACTTACACTGAATGTACAAATATTCACGAGTGTCTGCAATGTTGTATAGATAGGATCC
ATATGCTTGAGTCAGTGACGTCAATCCTTGAGGAAAGGAAGACGAGTAGCGGTATTCCCC
ATGTTATCATCATCTGCTGCCTTCTTTGCGGATGTAGATGGCAACATTTTCTTGGTGGAA
CGACGAGGAAGTATCTGAAGCCGCGGGTTAAGGTGAGTGCCGAGATTCTCCACCGCGAGT
TGGTAACTCTCTACCAGATCTAGCTGTCGGACTATTATGTCTGACCGTCTAGGAAGTAGC
TCCACTGGTTCACCTCCCGGGATTACAATGTATTCAATAGCTAGACGGACCTCCTCGAGG
GCATCAAGTTCTTCTAAACTGGGTTTGCTCTCTGGAGCATCATCTTTGATCTCGATATCA
TCAACGGAAGATTTCTCTATGGTTATAGGGGCTGAGCCAAACGATTCTCTCCCAAGGATC
ATTCGAACTGCCTTGACCATCTGAGCCATTGTAGTTGACTTAATGACAAATATCGGTAGC
TTGTGTAATTTGGCAACACGACGGATTGATGGATTCTGTTTCAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK16JQ U 1
AF RR4DF72JQ U 72
BS 1 102 RR4CK16JQ
BS 103 103 RR4DF72JQ
BS 104 359 RR4CK16JQ
BS 360 360 RR4DF72JQ
BS 361 437 RR4CK16JQ
BS 438 438 RR4DF72JQ
BS 439 767 RR4CK16JQ

RD RR4CK16JQ 767 0 0
CATAAACAAATTCTGTTTAAAAATGCAGAGTAAATAATATATCTACAGATTGCACCTTTT
TTTTTACTTTTCCTCAACATTACAGTTACCCATGTGAATATTTAAAGGAGACAGAGCATA
GGAGTTGTAACATACATTGCAAATGAGTAACAAACTAACAATGACCACAACATTAACATA
TTACTTACACTGAATGTACAAATATTCACGAGTGTCTGCAATGTTGTATAGATAGGATCC
ATATGCTTGAGTCAGTGACGTCAATCCTTGAGGAAAGGAAGACGAGTAGCGGTATTCCCC
ATGTTATCATCATCTGCTGCCTTCTTTGCGGATGTAGATGGCAACATTTTCTTGGTGGAT
CGACGAGGAAGTATCTGAAGCCGCGGGTTAAGGTGAGTGCCGAGATTCTCCACCGCGAGT
TGGTAACTCTCTACCAGCTCTAGCTGTCGGACTATTATGTCTGACCGTCTAGGAAGTAGC
TCCACTGGTTCACCTCCCGGGATTACAATGTATTCAATAGCTAGACGGACCTCCTCGAGG
GCATCAAGTTCTTCTAAACTGGGTTTGCTCTCTGGAGCATCATCTTTGATCTCGATATCA
TCAACGGAAGATTTCTCTATGGTTATAGGGGCTGAGCCAAACGATTCTCTCCCAAGGATC
ATTCGAACTGCCTTGACCATCTGAGCCATTGTAGTTGACTTAATGACAAATATCGGTAGC
TTGTGTAATTTGGCAACACGACGGATTGATGGATTCTGTTTCAGTTC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4DF72JQ 677 0 0
CCTCAACATTACAGTTACCCATGTGAATATTCAAAGGAGACAGAGCATAGGAGTTGTAAC
ATACATTGCAAATGAGTAACAAACTAACAATGACCACAACATTAACATATTACTTACACT
GAATGTACAAATATTCACGAGTGTCTGCAATGTTGTATAGATAGGATCCATATGCTTGAG
TCAGTGACGTCAATCCTTGAGGAAAGGAAGACGAGTAGCGGTATTCCCCATGTTATCATC
ATCTGCTGCCTTCTTTGCGGATGTAGATGGCAACATTTTCTTGGTGGAACGACGAGGAAG
TATCTGAAGCCGCGGGTTAAGGTGAGTGCCGAGATTCTCCACCGCGAGTTGGTAACTCTC
TACCAGATCTAGCTGTCGGACTATTATGTCTGACCGTCTAGGAAGTAGCTCCACTGGTTC
ACCTCCCGGGATTACAATGTATTCAATAGCTAGACGGACCTCCTCGAGGGCATCAAGTTC
TTCTAAACTGGGTTTGCTCTCTGGAGCATCATCTTTGATCTCGATATCATCAACGGAAGA
TTTCTC*ATGGTTATAGGGGCTGAGCCAAACGATTCTCTCCCAAGGATCATTCGAACTGC
CTTGACCATCTGAGCCATTGTAGTTGACTTAATGACAAATATCGGTAGCTTGTGTAATTT
GGCAACACGACGGATTG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL7123Contig1 653 2 2 U
GGCCTGCTGGAAGGATCGTGATGGAGCTGTACACGGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGA
ATTTCAGAGCTCTCTGCACCGGAGAGAAAGGAGTAGGACGCAGCGGCAAGCCTCTCCACT
TCAAGGGGTCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCA
CCGCCGGGAACGGGACGGGAGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATT
TCGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCA
ATGGATCTCAGTTCTTTATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGG
TGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGG
CGTCTGGGAAGATGTCGAAGCCTGTGGTCGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCG
CATGAGATCTATCCTCAGTTTTAAAATTAGCGTCGTGGTCGTACTCTAGTGAGTGGTGTT
GGGTCCTCATCGTGTGTCTCTGCTTTTGCTTTTGTGTTCTTTTTTTTTTGATCAAAGCTT
TTGTGTTCTTTTCATTTGGTGTAGTCATGAAAGCTTGGTGTGTGTTCGGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4E536TF U 1
AF RR4E536JQ C 78
BS 1 651 RR4E536TF
BS 652 653 RR4E536JQ

RD RR4E536TF 651 0 0
GGCCTGCTGGAAGGATCGTGATGGAGCTGTACACGGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGA
ATTTCAGAGCTCTCTGCACCGGAGAGAAAGGAGTAGGACGCAGCGGCAAGCCTCTCCACT
TCAAGGGGTCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCA
CCGCCGGGAACGGGACGGGAGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATT
TCGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCA
ATGGATCTCAGTTCTTTATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGG
TGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGG
CGTCTGGGAAGATGTCGAAGCCTGTGGTCGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCG
CATGAGATCTATCCTCAGTTTTAAAATTAGCGTCGTGGTCGTACTCTAGTGAGTGGTGTT
GGGTCCTCATCGTGTGTCTCTGCTTTTGCTTTTGTGTTCTTTTTTTTTTGATCAAAGCTT
TTGTGTTCTTTTCATTTGGTGTAGTCATGAAAGCTTGGTGTGTGTTCGGTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4E536JQ 576 0 0
ACCGGAGAGAAAGGAGTAGGACGCAGCGGCAAGCCTCTCCACTTCAAGGGGTCTTCCTTC
CACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCACCGCCGGGAACGGGACG
GGAGGCGAGTCCATTTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATTTCGAGAGGAAGCACACC
GGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAATGGATTTCAGTTCTTT
ATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTG
GAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGGCGTCTGGGAAGATGTCG
AAGCCTGTGGTCGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCGCATGAGATCTATCCTCA
GTTTTAAAATTAGCGTCGTGGTCGTACTCTAGTGAGTGGTGTTGGGTCCTCATCGTGTGT
CTCTGCTTTTGCTTTTGTGTTCTTTTTTTTTTGATCAAAGCTTTTGTGTTCTTTTCATTT
GGTGTAGTCATGAAAGCTTGGTGTGTGTTCGGTCTC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL7124Contig1 891 2 2 U
CTCCGTCCATACAAAAACACAATGAACACTCCAATCATACATATATTATTTTTCTCTTCT
TAGCCGTCACCGCATCTGCAGCCGCTACACCAGCCAGACGCACAAACTACCTTTTCACAC
CGCACGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTAATCCAATCAAACACAAGTCTATGCT
GCAAAACCCTTAAGCCCGTTCCTACCAATGACCCCATTGAATTGATCCGCGCATTAGCGG
TTGCGGCTGAATCTTCCGTGAAAAATAGTGTGGCTTTCCTCTCAGAAATCAAACCAAAAA
ATGCATCAAACTCAACCGCAGCGATCAGCAGCTGCGAGAAAAACTTGAAGTACGCGTTGG
AAGATTTCACCGAGTTTTGGAAAGCTACGGGAAAAGATGTAACGACGTTGGCTCATAACT
ATTTCACGTGTAAGAAGGAGTTAATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTTTGGATG
ATATTGATGATAAGAGGTTGTTAAAGGAAGTGGAGAGTGTGATTGGAGTTGGGAAGAATC
TAAGCAGTGATTCGTATGATGTGTTTAATGGTTTGAATACTATTTTTAAGACTTTTGGTA
TTAAGGTGAAGCTGAACGAGGAAGACACTTCGCCCCGACCGCCACCATTGTCATCTTATT
ACTACTGATGAAAGGATGGAGATGTAATTATTACTTGATGTCGTGTAATGCCTAAAACGA
TCGCTAATGGAATCATTTTTAGGTTCTGTCATGTATGATTGTATGCTATAGGTTCTATAT
ATACATGTATGGACGGGATTCGAGGAAAGGATATATTAATGGAATATTATATTTATTTTT
TGTTAACGATTTGTTAGATATTTATTTGACGATGTGATTATTTGTTTCTCC


BQ
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AF RR4AD43TF U 1
AF RR4AD43JQ C 115
BS 1 734 RR4AD43TF
BS 735 891 RR4AD43JQ

RD RR4AD43TF 734 0 0
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TAGCCGTCACCGCATCTGCAGCCGCTACACCAGCCAGACGCACAAACTACCTTTTCACAC
CGCACGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTAATCCAATCAAACACAAGTCTATGCT
GCAAAACCCTTAAGCCCGTTCCTACCAATGACCCCATTGAATTGATCCGCGCATTAGCGG
TTGCGGCTGAATCTTCCGTGAAAAATAGTGTGGCTTTCCTCTCAGAAATCAAACCAAAAA
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AAGATTTCACCGAGTTTTGGAAAGCTACGGGAAAAGATGTAACGACGTTGGCTCATAACT
ATTTCACGTGTAAGAAGGAGTTAATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTTTGGATG
ATATTGATGATAAGAGGTTGTTAAAGGAAGTGGAGAGTGTGATTGGAGTTGGGAAGAATC
TAAGCAGTGATTCGTATGATGTGTTTAATGGTTTGAATACTATTTTTAAGACTTTTGGTA
TTAAGGTGAAGCTGAACGAGGAAGACACTTCGCCCCGACCGCCACCATTGTCATCTTATT
ACTACTGATGAAAGGATGGAGATGTAATTATTACTTGATGTCGTGTAATGCCTAAAACGA
TCGCTAATGGAATC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4AD43JQ 777 0 0
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TATGCTGCAAAACCCTTAAGCCCGTTCCTACCAATGACCCCATTGAATTGATCCGCGCAT
TAGCGGTTGCGGCTGAATCTTCCGTGAAAAATAGTGTGGCTTTCCTCTCAGAAATCAAAC
CAAAAAATGCATCAAACTCAACCGCAGCGATCAGCAGCTGCGAGAAAAACTTGAAGTACG
CGTTGGAAGATTTCACCGAGTTTTGGAAAGCTACGGGAAAAGATGTAACGACGTTGGCTC
ATAACTATTTCACGTGTAAGAAGGAGTTAATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTT
TGGATGATATTGATGATAAGAGGTTGTTAAAGGAAGTGGAGAGTGTGATTGGAGTTGGGA
AGAATCTAAGCAGTGATTCGTATGATGTGTTTAATGGTTTGAATACTATTTTTAAGACTT
TTGGTATTAAGGTGAAGCTGAACGAGGAAGACACTTCGCCCCGACCGCCACCATTGTCAT
CTTATTACTACTGATGAAAGGATGGAGATGTAATTATTACTTGATGTCGTGTAATGCCTA
AAACGATCGCTAATGGAATCATTTTTAGGTTCTGTCATGTATGATTGTATGCTATAGGTT
CTATATATACATGTATGGACGGGATTCGAGGAAAGGATATATTAATGGAATATTATATTT
ATTTTTTGTTAACGATTTGTTAGATATTTATTTGACGATGTGATTATTTGTTTCTCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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TTGGTGGACCACAACTATACAAAAGTAAAAAAGCTTTCAATAGGGAAAGATTCTCAAGCT
CTTCTTCTTCATCTGTTCTAACATTCTAGAACTAGACTGAATGTGTTTTGTTTTGCAAAG
TCGACGGATAATTGCAGTTTCTACCGAACAAGATTCAAGAACGAGGTCAGAAAATCAACA
TCTCTCTTCTCTGATGGATACTTGATTGGTCTCGAAGAGTTCTTTGGGAACACAAGTATC
GTCGGGAAGCTCCCAAGCTGCAACTCCCTTTTAGCAAACTCCTTTTGGTCACCATCAGCT
CTAAACTTACCCACCTTCACGCCACTCCCACCCAACTTATCCGCCAACTCATCAAACGAA
CCTTCCATCGCTTGACAAAACGGGCACCAAGGTGCATAAAGCACCACGATCCAAGCCTCT
CTACGATTCTCCAGCTTCATCAAATTCTCAATCCCTTGCCTGCTCAAGCTCACAACATTC
TCGCTTTTGAAGATATCAGCAACCGTGGATGATGATGATGATGTCCCATTGACACTAGCT
GCTGCGCTGTTCTCCTTGATGTTCCCTTTGTGAAGTCCACACTCTTTAGCCTTGGCATCT
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TCACACCCGATGGAAACATACCCCGCAGCGTGAAGAGTGTTGACGGGAACATCCATAGTC
CTCAAGAAGTTCCAAACATCGTTCCCTT


BQ
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AF RR4DG49JQ U 1
AF RR4H627JQB U 5
BS 1 231 RR4DG49JQ
BS 232 232 RR4H627JQB
BS 233 761 RR4DG49JQ
BS 762 808 RR4H627JQB

RD RR4DG49JQ 761 0 0
CGATGTTTGAAAACTTGCTCATATCATCACAAATGCAAAAGTTTTACAAAAGGATAAGTT
TTGGTGGACCACAACTATACAAAAGTAAAAAAGCTTTCAATAGGGAAAGATTCTCAAGCT
CTTCTTCTTCATCTGTTCTAACATTCTAGAACTAGACTGAATGTGTTTTGTTTTGCAAAG
TCGACGGATAATTGCAGTTTCTACCGAACAAGATTCAAGAACGAGGTCAGAGAATCAACA
TCTCTCTTCTCTGATGGATACTTGATTGGTCTCGAAGAGTTCTTTGGGAACACAAGTATC
GTCGGGAAGCTCCCAAGCTGCAACTCCCTTTTAGCAAACTCCTTTTGGTCACCATCAGCT
CTAAACTTACCCACCTTCACGCCACTCCCACCCAACTTATCCGCCAACTCATCAAACGAA
CCTTCCATCGCTTGACAAAACGGGCACCAAGGTGCATAAAGCACCACGATCCAAGCCTCT
CTACGATTCTCCAGCTTCATCAAATTCTCAATCCCTTGCCTGCTCAAGCTCACAACATTC
TCGCTTTTGAAGATATCAGCAACCGTGGATGATGATGATGATGTCCCATTGACACTAGCT
GCTGCGCTGTTCTCCTTGATGTTCCCTTTGTGAAGTCCACACTCTTTAGCCTTGGCATCT
TCCCACCACCATCTCCCTTCTCTCTCGTGCTGACCAGGCAAAACCGCTCTCGTGCACGGC
TCACACCCGATGGAAACATACCCCGCAGCGTGAAGAGTGTT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4H627JQB 804 0 0
GC
TTGAAAACTTGCTCATATCATCACAAATGCAAAAGTTTTACAAAAGGATAAGTTTTGGTG
GACCACAACTATACAAAAGTAAAAAAGCTTTCAATAGGGAAAGATTCTCAAGCTCTTCTT
CTTCATCTGTTCTAACATTCTAGAACTAGACTGAATGTGTTTTGTTTTGCAAAGTCGACG
GATAATTGCAGTTTCTACCGAACAAGATTCAAGAACGAGGTCAGAAAATCAACATCTCTC
TTCTCTGATGGATACTTGATTGGTCTCGAAGAGTTCTTTGGGAACACAAGTATCGTCGGG
AAGCTCCCAAGCTGCAACTCCCTTTTAGCAAACTCCTTTTGGTCACCATCAGCTCTAAAC
TTACCCACCTTCGCGCCACTCCCACCCAACTTATCCGCCAACTCATCAAACGAACCTTCC
ATCGCTTGACAAAACGGGCACCAAGGTGCATAAAGCACCACGATCCAAGCCTCTCTACGA
TTCTCCAGCTTCATCAAATTCTCAATCCCTTGCCTGCTCAAGCTCACAACATTCTCGCTT
TTGAAGATATCAGCAACCGTGGATGATGATGATGATGTCCCATTGACACTAGCTGCTGCG
CTGTTCTCCTTGATGTTCCCTTTGTGAAGTCCACACTCTTTAGCCTTGGCATCTTCCCAC
CACCATCTCCCTTCTCTCTCGTGCTGACCAGGCAAAACCGCTCTCGTGCACGGCTCACAC
CCGATGGAAACATACCCCGCAGCGTGAAGAGTGTTGACGGGAACATCCATAGTCCTCAAG
AAGTTCCAAACATCGTTCCCTT

QA 3 804 3 804
DS 



AS 1 2

CO CL7126Contig1 712 2 4 U
TCATCGGCCTTGTTCTGGTAAAGAACTTACTGACTATCAATCCAGATGATGAAACACCCG
TCAAGAATGTCACAATAAGAAGGATTCCGAGAGTACCAGAAACCTTGCCTTTATATGACA
TATTGAATGAGTTCCAGAAAGGACTCAGCCATATGGCTGTTGTGGTGAGGCAGTGCGACA
AAATCCACCCATTACCTAGTAAAGATGTTAAAGACGAGAGGGTTAAGGAAGTACAAGTGG
ATGTGGATGGTGAAGGAACTCCTCAAGAGAGAATGCTAAGGACAAAGAGATCGCTACAGA
AGTGGAAGAGCTTTCCAAATCGAGCAAGTTCGTTCAAGAGAAGTAAGACCAAGAAGTGGT
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AGGAGATTTTTGATGAAACGGATCACCATTTTGAAGACTCGTGACAGTGCATGACCACTG
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GTAATTTTTTTTAGAAAGTACTACAATGGTTGGTTTTGATCGGTGTGATATATGTAGAGT
AATGGAGGGGTTAAAGACGTCAAAAGTTTATATATTGAACATACATTATCGT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AW01JQ C 1
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AGGAAGAAGAAGCTGTTGGAATCATTACAATGGAAGATGTTATTGAGGAACTTTTGCAGG
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CC

QA 1 679 1 679
DS 

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G
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DS 



AS 1 2

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GT


BQ
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10 10 

AF RR4G154TF U 1
AF RR4G154JQ C 34
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RD RR4G154TF 698 0 0
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GTCTACAATGCTCTCACCTGGTGGGAACAGATGGACAATGGTCAGCAACTTACCCGCAAC
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TACAGACATCCATGGCTATTCCTCAACACACTCGCTGTGATGGTTCTAGTTGTGGCCAAG
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AGCATACTCAGATCCATTTCTTTTTATGGCAACAGAAAGGTGGATATGAAGCAAAACATA
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ATCAACGGTGATAAGTAGGGCTTCTTTAGCATACTCAGATCCATTTCTTTTTATGGCAAC
AGAAAGGTGGATATGAAGCAAAACATATTTGTATAAAATGTTGATATGAGTTGGTTTTGA
GTTGTCGGATATTTTGTAAGTAACTTTGAAGCTTTGAATTTCTTCTCTCTTTTTAAAAAA
ACATAGACACGAAGTTGATAATTTCTAGT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL7128Contig1 984 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AZ08TF U 1
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BS 777 984 RR4AZ08JQ

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DS 

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QA 1 828 1 828
DS 



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BQ
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AF RR4EH21JQ C 1
AF RR4EH21TF U 1
BS 1 660 RR4EH21TF

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ACCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAATAGTGATCGTTCTTGGGCTCTATTCCGTTTTGTGGG
GCAAGAGCAAAGACGAACCAGCTAATTCATTTTCAGATATGGACAATGAGCTCCCAGTTA
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CAAATGTTATGACCTCGAGGCCTACCACCAATGATTCAGTCTAAAGTAAACAAAGCACTA
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CGGTGCTGATTTGTAGATTCAAGAGTGATGTTATTTTAATGCTAATTTTGGCTTTGTTAA
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QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GA59JQ C 1
AF RR4GA59TF U 1
BS 1 669 RR4GA59TF

RD RR4GA59JQ 669 0 0
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DS 

RD RR4GA59TF 669 0 0
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GTCTGCATCGTCCTACGTTGTTCGATTACATTGTTTCCTCCAAGATTAAAACTCCAGCAC
AATTGGATGCTGCAGTTTCGTTTTTTGACAAGAACGCTCCAGAGGATTTCAAGCTAAATG
AGTTTGAGGAGGCGTGTGGTGTTGGGGGTTGAAGTTTCTGCAGAAGATATCGAGGAAGCA
GCTAAAGAAGTTTTTGAAGAGCATAAGAGTGCAATATTGGAGCAGCGCTACTGAACTAAT
GTGGGTCAGTTGCTTGGACATGTCCGGAAAAGTTTGCCATGGGCAGATCCTAAGATTGTA
AAGGACGTCATAGACAGAAAAATGTATGAACTGCTTGGTGAGAAAACTGCTGCGGATAAT
GAAAAACCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AU67JQ U 1
AF RR4GF49JQ U 24
BS 1 502 RR4AU67JQ
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BS 661 766 RR4GF49JQ

RD RR4AU67JQ 660 0 0
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TCGGAAATATTATCCCCGATGCTCCCGAGATTAATTTGGCTCCAAGCCACATGCGTTTTG
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QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4GF49JQ 743 0 0
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QA 1 743 1 743
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4BK21TF U 1
AF RR4BK21JQ C 446
BS 1 671 RR4BK21TF
BS 672 672 RR4BK21JQ
BS 673 680 RR4BK21TF
BS 681 681 RR4BK21JQ
BS 682 769 RR4BK21TF
BS 770 1173 RR4BK21JQ

RD RR4BK21TF 769 0 0
CCTCTCATACATATACGGAAACTAAAAAATGGGCTTTTGTTTCTGTTTATCCTCAGGAGG
ATCAACAGATCGAAACCAGATTTATGAGATAAAAGATTATGGACAAGAAAATGCAGTTTT
ACACTCTGAACAGCAAGATGTTCATCAAGGCTTTGGCTCTGTCTCTTCTTTAGCTGGAGG
CAAGGGATACAATCAAGATGCTGCCATTCTCCACCTGGGCTATGGAACAGAAGAAGGAGC
GTTGTGTGGAGTGTTTGATGGCCATGGTGAGAAAGGTGAATTGGTGAGCAAGATAGTAAG
AAACCAATTGCCATCTTTATTGTTAGGTCATATGAATAACCATTCAGTGACACGAGACTG
GAAACTCATTTGTGAAACTACGTTTTTGTTGATGGACAAAAGAATTCTTAAACTCAAAAA
CACCCTTGATTGCTCTTCCTCCGGAACTACTGCTGTTCTCGCCGTTACACACGGAAATCA
AGTGATGGTGGCAAATCTAGGAGATTCAAGGGCTGTGATGATTGGAACAAGTGAGGATGG
AGAAATCAAGGTGGTTCAATTAACCACTGACCTGAAGCCAAGTGTTCCAAGCGAAGCCGA
CAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCATTAGAGTCAGAGCCACATATTCTAAG
AGTATGGCTTC*ACATGAAA*CCGGCCCGGTCTAGCCATGTCTAGGTCTTTGGGGTGATT
TTGTTCTTAAGAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTCAAGTATCTGCGCA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4BK21JQ 728 0 0
ACTACTGCTGTTCTCGCCGTTACACACGGAAATCAAGTGATGGTGGCAAATCTAGGAGAT
TCAAGGGCTGTGATGATTGGAACAAGTGAGGATGGAGAAATCAAGGTGGTTCAATTAACC
ACTGACCTGAAGCCAAGTGTTCCAAGCGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGG
GTCTTGGCATTAGAGTCAGAGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATGAAAACCGG
CCCGGTCTAGCCATGTCTAGGTCTTTGGG*TGATTTTGTTCTTAAGAGCTATGGTGTCAT
TGCGACTCCTCAAGTATCTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGC
TTCCGATGGGGTCTGGGATGTTCTTAGTAACGAAGAAGTCGCTATGGTGGTAATGAATTC
AGAGAATGAGGCAGCAGCGGCCAACGCAGTGACAGAGGCGGCGGCTAATGCATGGAGACA
GAAATATCCGACGGTCAAGGTTGATGATATTTCTGTCGTGTGCCTCTTTCTCAACAAGAG
GTTTCATCCTCAGCTACGTATGTAATCAAACAAACAAACTTGCGAAGAAAACAAATAACG
ACTAATCAAAGATGGATGCCACGTACGATTGTTTACTCAGACTTCTGACTTCTGTGTGTT
TGCCTTTGAGTGTGAATGTATGCGTGTTTATATTACATTTGTATGTTAAGTCGTGTGATT
ATTAATAG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7134Contig1 821 2 14 U
GGGATCGAGTCACACCAGTAACAACACAAATTGGAGTCGGGAAGGAGTTCCGAAATGCAG
CCGGATGATCCGAAACTCTCAGAAGAGGCGATTCAGCTTCCAACGTCAACGATTGAGCAG
TCGCCTTCGTTATCGGAGCGTTTATTGATCCCCACTCTTCTCGCAGGAGTAACAGGGGGA
GGAGTTGGTTTACTCTCAAAACGTAGGAAAGCTCATCCCAATATACCAGCTACCTATGCT
ACTAATTCTGCCATCGTTGCTGCTTGCTATTGCGGGGTTCGTGAATTGGTTAGAGTAACT
AGAAAATCACAAGACGATGACTTAATGAATTCAGCCATTGGTGGTCTTTTCAGTGGTGCT
TTATTAGGACGACTTCAAGGAGGGCCTCGCGGTACATTTCGATACTCTATAGCTTTTGCT
ACGTTTGGCACAGCATTTGATTACGCTAGCCTTAAATCCAAACCTTTATTAGAGAGAGTG
CGTAACATGGATTCTATCACGTTACCTGTGTGGTTTCCTATACAAATTCTCGACGAAGAA
GCCCTTGCTAAAAAGAAAGCCAAGGAACAGAAACTCTTCACAAGATTGAACAAAGAAGAA
TCTTGACATCCGATCAAAACAGTTTATTTCGGCGTCGTAATTCCGTTTTTTTAGATGACT
TTGAAGAGGAACCTTGATATTTTTGTTTCTTATTTGTTACACTATAAAAGTAGTTGTAAA
CACCTACGAAGTGTTCACTTCTCGGGTTGCTTTTACTTGTTTGTTGTTGTGGTTTTTGAA
TTAAGGGTCGCTATAGTCAACTTCAACACCCTTCTTGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C181TF U 1
AF RR4C181JQ C 55
BS 1 651 RR4C181TF
BS 652 652 RR4C181JQ
BS 653 670 RR4C181TF
BS 671 671 RR4C181JQ
BS 672 687 RR4C181TF
BS 688 688 RR4C181JQ
BS 689 708 RR4C181TF
BS 709 709 RR4C181JQ
BS 710 719 RR4C181TF
BS 720 720 RR4C181JQ
BS 721 729 RR4C181TF
BS 730 730 RR4C181JQ
BS 731 741 RR4C181TF
BS 742 821 RR4C181JQ

RD RR4C181TF 741 0 0
GGGATCGAGTCACACCAGTAACAACACAAATTGGAGTCGGGAAGGAGTTCCGAAATGCAG
CCGGATGATCCGAAACTCTCAGAAGAGGCGATTCAGCTTCCAACGTCAACGATTGAGCAG
TCGCCTTCGTTATCGGAGCGTTTATTGATCCCCACTCTTCTCGCAGGAGTAACAGGGGGA
GGAGTTGGTTTACTCTCAAAACGTAGGAAAGCTCATCCCAATATACCAGCTACCTATGCT
ACTAATTCTGCCATCGTTGCTGCTTGCTATTGCGGGGTTCGTGAATTGGTTAGAGTAACT
AGAAAATCACAAGACGATGACTTAATGAATTCAGCCATTGGTGGTCTTTTCAGTGGTGCT
TTATTAGGACGACTTCAAGGAGGGCCTCGCGGTACATTTCGATACTCTATAGCTTTTGCT
ACGTTTGGCACAGCATTTGATTACGCTAGCCTTAAATCCAAACCTTTATTAGAGAGAGTG
CGTAACATGGATTCTATCACGTTACCTGTGTGGTTTCCTATACAAATTCTCGACGAAGAA
GCCCTTGCTAAAAAGAAAGCCAAGGAACAGAAACTCTTCACAAGATTGAACAAAGAAGAA
TCTTGACATCCGATCAAAACAGTTTATTTCGGCGTCGTAATTCCGTTTTTT*AGATGACT
TTGAAGAGGA*CCTTGATATTTTTGTT*CTTATTTGTTACACTATAAA*GTAGTTGTAA*
CACCTACGA*GTGTTCACTTC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4C181JQ 767 0 0
ATGCAGCCGGATGATCCGAAACTCTCAGAAGAGGCGATTCAGCTTCCAACGTCAACGATT
GAGCAGTCGCCTTCGTTATCGGAGCGTTTATTGATCCCCACTCTTCTCGCAGGAGTAACA
GGGGGAGGAGTTGGTTTACTCTCAAAACGTAGGAAAGCTCATCCCAATATACCAGCTACC
TATGCTACTAATTCTGCCATCGTTGCTGCTTGCTATTGCGGGGTTCGTGAATTGGTTAGA
GTAACTAGAAAATCACAAGACGATGACTTAATGAATTCAGCCATTGGTGGTCTTTTCAGT
GGTGCTTTATTAGGACGACTTCAAGGAGGGCCTCGCGGTACATTTCGATACTCTATAGCT
TTTGCTACGTTTGGCACAGCATTTGATTACGCTAGCCTTAAATCCAAACCTTTATTAGAG
AGAGTGCGTAACATGGATTCTATCACGTTACCTGTGTGGTTTCCTATACAAATTCTCGAC
GAAGAAGCCCTTGCTAAAAAGAAAGCCAAGGAACAGAAACTCTTCACAAGATTGAACAAA
GAAGAATCTTGACATCCGATCAAAACAGTTTATTTCGGCGTCGTAATTCCGTTTTTTTAG
ATGACTTTGAAGAGGAACCTTGATATTTTTGTTTCTTATTTGTTACACTATAAAAGTAGT
TGTAAACACCTACGAAGTGTTCACTTCTCGGGTTGCTTTTACTTGTTTGTTGTTGTGGTT
TTTGAATTAAGGGTCGCTATAGTCAACTTCAACACCCTTCTTGAAGG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7135Contig1 622 2 1 U
GGATGGCTGTCACCCCCAATGTCTATGTCTTCATCATTAGCCATGAAAGCACCACCCACA
AGCTTCTTCCTTTTCAACAACTCGGTTGCGTCTCTTTTGATTCACAACCACATCGAAACT
CAATCCGCGAATCATAAAACTTCTTCCTCGACACAAATTCACTGTGGTGGCCGTTCGGAG
TCGTCGTCGCTTCATTCTTCATGTCAGAGAGGGAAAATCGAGCAACAATGGTGATTTATC
TTTGTTTTGTGTATTTAGTCTCCAATTTTTAGTTATTCTCAATTTTGCTTCAGACTTTCA
GAATTGCATATAAATCTTTGTGAATTAAAATCATACTTCTAAATATGCATTCTAGCCCTT
ACTTATATTACAAGATTGATCCTTCACTCAGGTCTGATCTCACTTTGGTTCAAAACTCAA
GAAATTGCCCAATATTAATTGGGTTTATGTAAGATATGGTGGAGAGCAAAACAGTATGTT
TGTTGTTATGTAAGTTATGGAGGAGAATATTTTGTGATGAAAATATTGGTGTTTTGACTG
ATGATGTAAGGAATTGTGTTTTATGGTTTCTTATTGGTTTTGTGAACTTGACGAGCTGGG
GATGTATAAAAGTGCAGTTATT


BQ
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AF RR4BP73JQ C 1
AF RR4BP73TF U 1
BS 1 622 RR4BP73TF

RD RR4BP73JQ 622 0 0
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ACTTATATTACAAGATTGATCCTTCACTCAGGTCTGATCTCACTTTGGTTCAAAACTCAA
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TGTTGTTATGTAAGTTATGGAGGAGAATATTTTGTGATGAAAATATTGGTGTTTTGACTG
ATGATGTAAGGAATTGTGTTTTATGGTTTCTTATTGGTTTTGTGAACTTGACGAGCTGGG
GATGTATAAAAGTGCAGTTATT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4BP73TF 622 0 0
GGATGGCTGTCACCCCCAATGTCTATGTCTTCATCATTAGCCATGAAAGCACCACCCACA
AGCTTCTTCCTTTTCAACAACTCGGTTGCGTCTCTTTTGATTCACAACCACATCGAAACT
CAATCCGCGAATCATAAAACTTCTTCCTCGACACAAATTCACTGTGGTGGCCGTTCGGAG
TCGTCGTCGCTTCATTCTTCATGTCAGAGAGGGAAAATCGAGCAACAATGGTGATTTATC
TTTGTTTTGTGTATTTAGTCTCCAATTTTTAGTTATTCTCAATTTTGCTTCAGACTTTCA
GAATTGCATATAAATCTTTGTGAATTAAAATCATACTTCTAAATATGCATTCTAGCCCTT
ACTTATATTACAAGATTGATCCTTCACTCAGGTCTGATCTCACTTTGGTTCAAAACTCAA
GAAATTGCCCAATATTAATTGGGTTTATGTAAGATATGGTGGAGAGCAAAACAGTATGTT
TGTTGTTATGTAAGTTATGGAGGAGAATATTTTGTGATGAAAATATTGGTGTTTTGACTG
ATGATGTAAGGAATTGTGTTTTATGGTTTCTTATTGGTTTTGTGAACTTGACGAGCTGGG
GATGTATAAAAGTGCAGTTATT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL7136Contig1 621 2 2 U
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ATTCTTCTTCATAGAAACAAAACGACTTGACTTTGATATTGGAGGTTTAGTTGGAGATGA
AGAGTCTTGTAGAGGAGACATGACTCCTCTGTATAATAGTCACTGTAACAAAACGTCTCC
GCACCTGTCTTATGTACGCGTCCTCTCAATTTTCCATGGAGAAGCCGACCAGGAGACGAA
GAGAAAGCCTCGTGGAGAGGAGACAATGACGACGAAGACCAAGGTGCTGGATGCGACGAC
CAACGAGTACGCCACCTCTCTGCAACTTGCCTCTCAAATCCCACGACGAAGAAGAATAAT
CATGGCTGGGTACACGGAGGTCATGGAAGAACACGACGAGACGACGAAGGTGGTGGTGCG
GCGGGTGAGGATTGGAAGATGAAGAAGACAACGAAGTGGTGGTGGTGCGTCGGCGACGTT
TAGTTAGTATTAGGTTAAAGCTTGGTTTACTTTTTGGTTTATTTGGTTTGTTGGTTTATT
ATTTAATTAGATATTTTTGTATTTTTGTAAACAAGTTTAATTATAGATAAATTTAAGTAA
TAAAGAAAATTTGATTCTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BX37TF U 1
AF RR4BX37JQ C 62
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RD RR4BX37TF 404 0 0
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GCACCTGTCTTATGTACGCGTCCTCTCAATTTTCCATGGAGAAGCCGACCAGGAGACGAA
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CATGGCTGGGTACACGGAGGTCATGGAAGAACACGACGAGACGA

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR4BX37JQ 560 0 0
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CACCTGTTTTATGTACGCGTCCTCTCAATTTTCCATGGAGAAGCCGACCAGGAGACGAAG
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AACGAGTACGCCACCTTTTTGCAACTTGCCTCTCAAATCCCACGACGAAGAAGAATAATC
ATGGCTGGGTACACGGAGGTCATGGAAGAACACGACGAGACGACGAAGGTGGTGGTGCGG
CGGGTGAGGATTGGAAGATGAAGAAGACAACGAAGTGGTGGTGGTGCGTCGGCGACGTTT
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TTTAATTAGATATTTTTGTATTTTTGTAAACAAGTTTAATTATAGATAAATTTAAGTAAT
AAAGAAAATTTGATTCTATG

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL7137Contig1 678 2 2 U
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TGCTGATTTTGAGAGAAGAAGCCATGGAAATTAGATCAAATTGGTGATATAGAATAGTCT
CTTAGAGAGATGTATATCATACATTAACTATATGAGTTGTCATTATTGTTGATGTTTCAA
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AAGTTTTGCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F305TF U 1
AF RR4F305JQ C 452
BS 1 669 RR4F305TF
BS 670 678 RR4F305JQ

RD RR4F305TF 669 0 0
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AAGGATTAACTTGCATGAAAAGGTAATTACCAGTAAATAGATCACCAAAGTGAGTTTGAC
TCTCCTTCAACCTCTTCAATATCTTTAAAACTCCAATTTTAACCTTACTCGCTTTCTTCC
TCACAAATCCCCTAAGTCTCCGGATCTTAACTCTAATTCTAATCCTCCTCCTTCCTCTCA
GTGACAGCACTCTCTTGAACCTATATATACAAGAAAACCTTATTACAGAAAACTCTTTCA
TGCAATACTTCTATGTATATATCATGGGATTGTGATGATGACGATTGTGTACATATTCAT
TAGTATTCCTAAATTTATAAAAAATCGATCCAAACCTGTGAGGATATGATGATGATGAGG
GTCTTGTTGTTGTTTCTTCCAAGACATCATCTTCTAGAGAAAGCCTCTGGTATGGAAGAC
TGCTGATTTTGAGAGAAGAAGCCATGGAAATTAGATCAAATTGGTGATATAGAATAGTCT
CTTAGAGAGATGTATATCATACATTAACTATATGAGTTGTCATTATTGTTGATGTTTCAA
TGTGTATAGTTGGTGGGTGGTTAGGTTGTGGTACATGAATTTAATGCGATACCTCAATCT
AAGTTTTGC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4F305JQ 227 0 0
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TAGATCAAATTGGTGATATAGAATAGTTTCTTAGAGAGATGTATATCATACATTAACTAT
ATGAGTTGTCATTATTGTTGATGTTTCAATGTGTATAGTTGGTGGGTGGTTAGGTTGTGG
TACATGAATTTAATGCGATACCTCAATTTAAGTTTTGCAAAAAAAAA

QA 1 227 1 227
DS 



AS 1 2

CO CL7138Contig1 737 2 3 U
GATCACCAGAGCATACACTTTTCTCTAGCAACGTAGCTTTTAATCACATAACATCACATG
GGATACAAGTCAATCACACAATCATTAGCCACATCAATACAAAGCAGTCCATTAAGTCTC
ATTTAACAGTGTGAAGGTTCTTATGTAGTATTATCCATCCATCTAACACCCTAACTTTCA
TCATGAACTAACACTTTAACTTTCAAACAAAGACTAATTAATCCTAGATCCAACATAAGG
CAATATAGAGTTCAAGGGAGCAAGATGGGTTCAAGACACCTCACCTTAATCTAGATCTGG
ATCTGGATTTGGAACAAGAGGCAAAGGGGAAAACAAGATCTGATCCGGTCACCACCACAC
CACCACACCACACGGCGATCACCACCACCACCACCGATCGACCGCCGGCAAGGAGAGAGA
GAGCGCCGAGGTGAGAGAGAGAGAGATCGGATGGCGAGGAGGGAGAGAGGAGAGAGACGG
CGCGGGAGAGAGAAGGGAGGCGACGGCTAGAACTTCCAATTTCCAGAAATTTCTGCAGAG
CTCTGCTGCAAATTTTGTGATGAGGAAAGAAGGAGGGGCTGCAGTTCTATTTATAAAAAT
CTGTAGAGAACCCTAGATTTATGTCAAATGGACCGTAGGGAGGCCCGTTATACTAAAAAA
AAATCCAAACCCGGAATTGGGATGTTACAGAAATGTTTGGAAAATAATGTTTTTGGTATT
TTAAAAAGAGGGAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FV41TF U 1
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CAGATATGAATCCAGGCTCCACGCGAGCCCTAAGGGGTTTCAACCTTCTAAAAACTCTGA
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TTTAACCAAGTATGGAACACCTTTTTATTTTGGTACGAAGAGAAATAACCAATATGACTA
CGTACTGTATTTGG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B802JQ C 1
AF RR4B802TF U 1
BS 1 660 RR4B802TF

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CGCGAGAAGTCCACTAAACCTTATCATTTAGAGGAAAGAGAGAAGACACTAATCGATCGA
TCTCACAGAGAATGGTAGTAGATAAATCATTGAGCATAAAGATGACAGAGGTGAAGTCGA
AGACACGCGGGGACACACGTTGTTGCATGTGCTTCGACCCGGTGTCGATAAGAGGGGACA
CCGTGGTGGTCTTCTTTTGCTGTCATGCTTACCACATGACGTGTCTCATGGATGCTGCCT
TCAGCGACAGCAACAATAAGACAGCCAAAGGTTCTCCGGGGTACGGATACGGCTATGATA
ACGGTGTGGAGGAGGAAGATACTGAGGATGAGGAAGAAGATGACAGTAATGATGGAGACA
GGTCTGGGAGGTCTCGGTTACGGTGCATATTATGTACTACTGCCGCTGCTGCGTCCGCTC
GGTAGCGACTGCACTACATGTGTTTGTGAAATATTTTTTTGGTGTGCTTTGATTTTTTTG
TTTCTTTTTAAGAAAGAAGGAAAATTTCCTTGATTGTAGTCTAAATTATAACAACAAAAG
TAAAGAGAGGCGAGAGATATACATTGACCCAATAATTTAATGTGTGCCAGAGTTTTTGAG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4B802TF 660 0 0
GGAATGATCCGGTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGACGTGGGTGGTTCGCCGTCTGCGACGT
CGCGAGAAGTCCACTAAACCTTATCATTTAGAGGAAAGAGAGAAGACACTAATCGATCGA
TCTCACAGAGAATGGTAGTAGATAAATCATTGAGCATAAAGATGACAGAGGTGAAGTCGA
AGACACGCGGGGACACACGTTGTTGCATGTGCTTCGACCCGGTGTCGATAAGAGGGGACA
CCGTGGTGGTCTTCTTTTGCTGTCATGCTTACCACATGACGTGTCTCATGGATGCTGCCT
TCAGCGACAGCAACAATAAGACAGCCAAAGGTTCTCCGGGGTACGGATACGGCTATGATA
ACGGTGTGGAGGAGGAAGATACTGAGGATGAGGAAGAAGATGACAGTAATGATGGAGACA
GGTCTGGGAGGTCTCGGTTACGGTGCATATTATGTACTACTGCCGCTGCTGCGTCCGCTC
GGTAGCGACTGCACTACATGTGTTTGTGAAATATTTTTTTGGTGTGCTTTGATTTTTTTG
TTTCTTTTTAAGAAAGAAGGAAAATTTCCTTGATTGTAGTCTAAATTATAACAACAAAAG
TAAAGAGAGGCGAGAGATATACATTGACCCAATAATTTAATGTGTGCCAGAGTTTTTGAG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7141Contig1 1008 2 2 U
GGGGCATCTGAAAGTGTTGTACTAAACATGTCAACTCTTACATGGTCGGTAGTGGCTTCA
GTTCAAGGACGTGTACCTCTTGCTAGCGAGGGATTAAGTTTAGTCGTTAGTTCATACTAT
GGTGAAGATGTGCTAGTTGCTTTCGGAGGATACAATGGACGTTACAACAACGAGATTAAT
CTGCTTAAGCCAAGCCACAAATCAACACTGCAACCAAAGACTCTAGAAGCGTCTTTGCCA
GTTAGTCTTTCTGCTGTTAACAACGCCACGACAAGAGACATCGAGTCAGAGGTGGAGGTG
AGCCAAGAAGGCAGGGTACGGGAAATTGTCATGGACAACGTTAACCCTGGATCAAAGGTT
GAAGGAAACAATGAACGCATTATTGAGACTCTTAAAGCCGAGAAGGAAGAACTTGAGTTA
TCACTGAACAAGGAGAAGATGCAGACTCTCCAACTAAGGCAAGAGCTAGCAGATGGAGAA
TCACGAAATGCAGATTTGTACAAGGAACTTCATTCTGTCCGTAGCCAACTTGCAACCGAA
CAATCAAGATGCTTCAAACTGGAGGTTGATGTTGCGGAGCTAAGGCAAAAGCTTCAAACA
CTGGAAACACTACAAAAGGAACTAGAACTCCTCCAGCGCCAAAAGGCTGCCTCTGAACAA
GCCGCGATGAATGCTAAACGACAGATCTCGGGTGGTGTCTGGGGCTGGCTCGCTGGAAGC
CCTCAGGAGAAAGATGATTCGCCATGATTATTTGTTTTTTCCTCTTCCCGTATACTCGCT
CCATATTTGCCTTCAAGTAAAGAAAGATATATTACTATGTATTTTTTTGTCCGAGTCTCA
CGCATGGTTTCTTCTTCCCATAAATATTTCAGCACTCTTCCTCTTTGAGCTTTTAAAGTA
CTACAAGATGTTTTACCTTTTTATATATTACTTATGATTCGTGTTAGTTCTCTGTAATAC
AAAAGTATTCGTGCTCCTTTTTGGAACAATTAAACCAGATTTATAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN95TF U 1
AF RR4DN95JQ C 392
BS 1 641 RR4DN95TF
BS 642 1008 RR4DN95JQ

RD RR4DN95TF 641 0 0
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GTTCAAGGACGTGTACCTCTTGCTAGCGAGGGATTAAGTTTAGTCGTTAGTTCATACTAT
GGTGAAGATGTGCTAGTTGCTTTCGGAGGATACAATGGACGTTACAACAACGAGATTAAT
CTGCTTAAGCCAAGCCACAAATCAACACTGCAACCAAAGACTCTAGAAGCGTCTTTGCCA
GTTAGTCTTTCTGCTGTTAACAACGCCACGACAAGAGACATCGAGTCAGAGGTGGAGGTG
AGCCAAGAAGGCAGGGTACGGGAAATTGTCATGGACAACGTTAACCCTGGATCAAAGGTT
GAAGGAAACAATGAACGCATTATTGAGACTCTTAAAGCCGAGAAGGAAGAACTTGAGTTA
TCACTGAACAAGGAGAAGATGCAGACTCTCCAACTAAGGCAAGAGCTAGCAGATGGAGAA
TCACGAAATGCAGATTTGTACAAGGAACTTCATTCTGTCCGTAGCCAACTTGCAACCGAA
CAATCAAGATGCTTCAAACTGGAGGTTGATGTTGCGGAGCTAAGGCAAAAGCTTCAAACA
CTGGAAACACTACAAAAGGAACTAGAACTCCTCCAGCGCCA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4DN95JQ 617 0 0
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AACTAAGGCAAGAGCTAGCAGATGGAGAATCACGAAATGCAGATTTGTACAAGGAACTTC
ATTCTGTCCGTAGCCAACTTGCAACCGAACAATCAAGATGCTTCAAACTGGAGGTTGATG
TTGCGGAGCTAAGGCAAAAGCTTCAAACACTGGAAACACTACAAAAGGAACTAGAACTCC
TCCAGCGCCAAAAGGCTGCCTCTGAACAAGCCGCGATGAATGCTAAACGACAGATCTCGG
GTGGTGTCTGGGGCTGGCTCGCTGGAAGCCCTCAGGAGAAAGATGATTCGCCATGATTAT
TTGTTTTTTCCTCTTCCCGTATACTCGCTCCATATTTGCCTTCAAGTAAAGAAAGATATA
TTACTATGTATTTTTTTGTCCGAGTCTCACGCATGGTTTCTTCTTCCCATAAATATTTCA
GCACTCTTCCTCTTTGAGCTTTTAAAGTACTACAAGATGTTTTACCTTTTTATATATTAC
TTATGATTCGTGTTAGTTCTCTGTAATACAAAAGTATTCGTGCTCCTTTTTGGAACAATT
AAACCAGATTTATAGGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL7142Contig1 780 2 4 U
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ATATCAGAGATGAGATCAGCGGTGCAGATCCATCACGGCTCCGATGCCCCCAACGGCTTC
CACACGCTGCAGACTCACGACCAAACCGATGGTCTGATCAGACGAGTGTGTCTCACGCGC
GGTATGCATGTGCCTGAGCACGTGGCGATGCACCACACATACGACGTTGGTCCGGATCAG
TGCTGCTCCTCGGTGGTGAAGACGATCCACGCGCCACCCGAGTCCGTATGGGCCCTCCTG
CGTCGTTTCGACAACCCTAGAGCTTACAAGAACTTCATCAGGCAGTGCCGTATCATGCAA
GGCGACGGGCTACACGCCGGGGATCTCCGGGAAGTCATGGTCGTGTCGGGACTCCCTGCT
GTCTCGAGCACCGAGAGGCTAGAGATCTTGGACGACGAGCGTCACGTGATCAGCTTTAGC
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AGAAGTACCAACCGGCAATAATATCGTCTTTTTATTATTGTTGCAGTTATGTATCTATTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G576TF U 1
AF RR4G576JQ C 107
BS 1 677 RR4G576TF
BS 678 678 RR4G576JQ
BS 679 731 RR4G576TF
BS 732 780 RR4G576JQ

RD RR4G576TF 736 0 0
GGGAACGAGAGCTAGATACAAAAAACAAGAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAAGAAGAAGAAT
ATATCAGAGATGAGATCAGCGGTGCAGATCCATCACGGCTCCGATGCCCCCAACGGCTTC
CACACGCTGCAGACTCACGACCAAACCGATGGTCTGATCAGACGAGTGTGTCTCACGCGC
GGTATGCATGTGCCTGAGCACGTGGCGATGCACCACACATACGACGTTGGTCCGGATCAG
TGCTGCTCCTCGGTGGTGAAGACGATCCACGCGCCACCCGAGTCCGTATGGGCCCTCCTG
CGTCGTTTCGACAACCCTAGAGCTTACAAGAACTTCATCAGGCAGTGCCGTATCATGCAA
GGCGACGGGCTACACGCCGGGGATCTCCGGGAAGTCATGGTCGTGTCGGGACTCCCTGCT
GTCTCGAGCACCGAGAGGCTAGAGATCTTGGACGACGAGCGTCACGTGATCAGCTTTAGC
GTCGTGGGTGGGGACCACCGGCTCGAGAACTACCGATCGGTGACGACACTGCATGCGTCG
GATGAAGAAGGAACCGTCGTGGTGGAGTCTTATATCGTGGATGTGCCGCCGGGAAACACG
GAGGAGGAGACAGTTAGCTTCGTTGATACTATAGTCCGGTGCAATCTTCAGTCTCTGGCT
AGAAGTACCAACCGGCA*TAATATCGTCTTTTTATTATTGTTGCAGTTATGTATCTATTT
TTCTCTCTTGT
ATATT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4G576JQ 674 0 0
CCCCCAACGGCTTCCACACGCTGCAGACTCACGACCAAACCGATGGTCTGATCAGACGAG
TGTGTCTCACGCGCGGTATGCATGTGCCTGAGCACGTGGCGATGCACCACACATACGACG
TTGGTCCGGATCAGTGCTGCTCCTCGGTGGTGAAGACGATCCACGCGCCACCCGAGTCCG
TATGGGCCCTCCTGCGTCGTTTCGACAACCCTAGAGCTTACAAGAACTTCATCAGGCAGT
GCCGTATCATGCAAGGCGACGGGCTACACGCCGGGGATCTCCGGGAAGTCATGGTCGTGT
CGGGACTCCCTGCTGTCTCGAGCACCGAGAGGCTAGAGATCTTGGACGACGAGCGTCACG
TGATCAGCTTTAGCGTCGTGGGTGGGGACCACCGGCTCGAGAACTACCGATCGGTGACGA
CACTGCATGCGTCGGATGAAGAAGGAACCGTCGTGGTGGAGTCTTATATCGTGGATGTGC
CGCCGGGAAACACGGAGGAGGAGACAGTTAGCTTCGTTGATACTATAGTCCGGTGCAATC
TTCAGTCTCTGGCTAGAAGTACCAACCGGCAATAATATCGTCTTTTTATTATTGTTGCAG
TTATGTATCTATTTTTCTCTCTTGTTATATTTTATTTTGGATCTTTTCATCGATCAGCAC
AAGGATGAAAATTT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7143Contig1 792 2 1 U
GGGAGAACACAAAACAGAGGTTCTCTCTGTACACAAAGAAGGGCGGCCTCTTTTTCGTGT
GTGTGTGTGTTTTGCAGAGAGAAGATGGCTAGTACGTTAGATGTATCGAGAGCAGAGGCA
AGGGATAAGTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCGTGAGCGGTGGACAACCT
GGTACTGCTCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGGAAAGTCTTCTGTCTTTTC
AAGTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACTTCCT
CTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAA
ATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGA
CGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGT
GAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAAC
AAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCT
ACCAGTTGCTTCCAACACGACCCAAGATCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTG
GCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTGTGTAATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTAATTTGCTGC
TGTTATTAGTCCTTGCATAAATACTTATCTGCATGAATGATGATTATAATTAAAAATAAT
AATGCCTCAGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AP14JQ C 1
AF RR4AP14TF U 1
BS 1 792 RR4AP14TF

RD RR4AP14JQ 792 0 0
GGGAGAACACAAAACAGAGGTTCTCTCTGTACACAAAGAAGGGCGGCCTCTTTTTCGTGT
GTGTGTGTGTTTTGCAGAGAGAAGATGGCTAGTACGTTAGATGTATCGAGAGCAGAGGCA
AGGGATAAGTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCGTGAGCGGTGGACAACCT
GGTACTGCTCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGGAAAGTCTTCTGTCTTTTC
AAGTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACTTCCT
CTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAA
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AAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCT
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GCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTGTGTAATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTAATTTGCTGC
TGTTATTAGTCCTTGCATAAATACTTATCTGCATGAATGATGATTATAATTAAAAATAAT
AATGCCTCAGAT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4AP14TF 792 0 0
GGGAGAACACAAAACAGAGGTTCTCTCTGTACACAAAGAAGGGCGGCCTCTTTTTCGTGT
GTGTGTGTGTTTTGCAGAGAGAAGATGGCTAGTACGTTAGATGTATCGAGAGCAGAGGCA
AGGGATAAGTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCGTGAGCGGTGGACAACCT
GGTACTGCTCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGGAAAGTCTTCTGTCTTTTC
AAGTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCCAAAGGGACTCCACTTCCT
CTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAA
ATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACAAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGA
CGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCCGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGT
GAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAAC
AAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCT
ACCAGTTGCTTCCAACACGACCCAAGATCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTG
GCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTGTGTAATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTAATTTGCTGC
TGTTATTAGTCCTTGCATAAATACTTATCTGCATGAATGATGATTATAATTAAAAATAAT
AATGCCTCAGAT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL7144Contig1 659 2 1 U
GGAATCACACTCAGCTGTGTCCAAATACATTGTTCGAGTCTCTTCTTTAACCATTTTACT
CTCAAAGACGACAACATTTCTCTGTCTTCATGGCCACGGATCAAGAAAATTTACTCTCAG
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AAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAGTGGAAAGAAGAAGATCAGAAGAGATGTGGATTTCA
CGTACGATCTCAAAAACTACAGTCTTAATTTTGACGACGGCGGCGCCGGCGAAAGTCCTT
CACCGGAGAGATATATAGCTCCTCCGGCTGTTGTAAAAGTTTGATATATTTATCTCTCCT
TTTTGTATTATTTTTATTGATCGTGTTATAAATGTTAATACCAAACATAGAGAAAGTGGT
TATAAAATAATTTAGGCGTTACTTGTTGTTCAATCGCCACTCAGTTAGATTATGTCTAGT
GTTTTCTACTTGTAACCTTTTCAAACCAAACAAAGCTTTTATACATTTCTTAGAAGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H552JQB C 1
AF RR4H552TF U 1
BS 1 659 RR4H552TF

RD RR4H552JQB 659 0 0
GGAATCACACTCAGCTGTGTCCAAATACATTGTTCGAGTCTCTTCTTTAACCATTTTACT
CTCAAAGACGACAACATTTCTCTGTCTTCATGGCCACGGATCAAGAAAATTTACTCTCAG
ATGATTACCAAGAAACGGCGGCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCTGTAACTTCTGGTGGA
AAAGAAGAGGAGATGGTGGCTGGAGCGGTAACTTGCAGGAATAGAAAGGAGAAAGTTGGT
GGAGCAGGACACTGAAGGGGCCAAAAGAGATTTCTGAGAAACTTGCGGGGCCAAAATGGA
AAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAGTGGAAAGAAGAAGATCAGAAGAGATGTGGATTTCA
CGTACGATCTCAAAAACTACAGTCTTAATTTTGACGACGGCGGCGCCGGCGAAAGTCCTT
CACCGGAGAGATATATAGCTCCTCCGGCTGTTGTAAAAGTTTGATATATTTATCTCTCCT
TTTTGTATTATTTTTATTGATCGTGTTATAAATGTTAATACCAAACATAGAGAAAGTGGT
TATAAAATAATTTAGGCGTTACTTGTTGTTCAATCGCCACTCAGTTAGATTATGTCTAGT
GTTTTCTACTTGTAACCTTTTCAAACCAAACAAAGCTTTTATACATTTCTTAGAAGATC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4H552TF 659 0 0
GGAATCACACTCAGCTGTGTCCAAATACATTGTTCGAGTCTCTTCTTTAACCATTTTACT
CTCAAAGACGACAACATTTCTCTGTCTTCATGGCCACGGATCAAGAAAATTTACTCTCAG
ATGATTACCAAGAAACGGCGGCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCTGTAACTTCTGGTGGA
AAAGAAGAGGAGATGGTGGCTGGAGCGGTAACTTGCAGGAATAGAAAGGAGAAAGTTGGT
GGAGCAGGACACTGAAGGGGCCAAAAGAGATTTCTGAGAAACTTGCGGGGCCAAAATGGA
AAAACTTTATAAGAAGTTTTAGCAGTGGAAAGAAGAAGATCAGAAGAGATGTGGATTTCA
CGTACGATCTCAAAAACTACAGTCTTAATTTTGACGACGGCGGCGCCGGCGAAAGTCCTT
CACCGGAGAGATATATAGCTCCTCCGGCTGTTGTAAAAGTTTGATATATTTATCTCTCCT
TTTTGTATTATTTTTATTGATCGTGTTATAAATGTTAATACCAAACATAGAGAAAGTGGT
TATAAAATAATTTAGGCGTTACTTGTTGTTCAATCGCCACTCAGTTAGATTATGTCTAGT
GTTTTCTACTTGTAACCTTTTCAAACCAAACAAAGCTTTTATACATTTCTTAGAAGATC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL7145Contig1 635 2 2 U
GGAAAAACGCAAAGTTCTTTCTCTCCTCGTCTTCCTCCATATGCATAGCTCTTAAAGACA
CGTTCACCTCTATTCAAAATGGCCGTTGCTGTCAACGCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCAT
AACAGATCCCACCCCGTTGTAAGATTCTCAACTCAATTCACAACGTTAAAGCATTCACCT
TTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAGATCCTGGAG
GTGCTCAAGGAGAGTGACAAGAAATCGAATAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCACCGACC
AACATGCTTGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCG
GGAAGCGCAGATATACTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTTATAAGCACCGTGATGTTC
GCTACCACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATAA
GATATTTGGACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACCTATTGAACAGAGAGTGAGAGAGTTGTA
GTTGAAATGTATACTTGGGGGAAGGTTTATCACTTGGGAAAAGATGGTTTCATTGTATAC
TGTGTAGTTAATAGTACACATAATTTTCTTTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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TTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAGATCCTGGAG
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GTTGAAATGTATACTTGGGGGAAGGTTT

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DS 

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TTCACCTTTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAGAT
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ACCGACCAACATGCTTGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCTTACCTTTGA
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GATGTTCGCTACCACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTA
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DS 



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BQ
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AF RR4H169TF U 1
AF RR4H169JQ C 65
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QA 1 762 1 762
DS 



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BQ
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AF RR4DH44JQ C 1
AF RR4DH44TF U 1
BS 1 622 RR4DH44TF

RD RR4DH44JQ 622 0 0
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CCTTCTCACCGGGTACATTCTCTTACTCGACAAATCCGGGAGAATAAGATGGCAAGGTTT
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AGATCAATGTGAGATCACTGCTTAAACCAGAGGCTATCTAAAAAGGACAATTGCTCCTTT
ACAGAAGGTCTTCCAGAAGACAATAAACTCTTCAGTTCTTTCTCTTTCAATCTGCATTGG
TGTTCAAAGAGAGCACTCTTCAGTTCTTCCTCTTTCAGATACTTTTGTTGTATTCATATG
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TAAAGACTTAACATTCTTCGTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4DH44TF 622 0 0
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TCTTCAGTTGTTCGAGGTTTCATTTATAGACAAATGGCTTCTGGGGTTAGCTCCCATAAG
GAAACTACTTCTCCGAGTCTTGCAAAAACCGAAAAACAGCGAAACCAGTGTCCTCCAGAG
GCAGATTGTTTACTCATTTGGGGACCATTATCACTTCCGAAAACAAATGAAAGTTCTGAA
CCTTCTCACCGGGTACATTCTCTTACTCGACAAATCCGGGAGAATAAGATGGCAAGGTTT
TGGAACAGCAACTCCAGAGGAAGTATCTCAACTTCTCTCTTGCACCTCATTTCTCTTGAA
AGATCAATGTGAGATCACTGCTTAAACCAGAGGCTATCTAAAAAGGACAATTGCTCCTTT
ACAGAAGGTCTTCCAGAAGACAATAAACTCTTCAGTTCTTTCTCTTTCAATCTGCATTGG
TGTTCAAAGAGAGCACTCTTCAGTTCTTCCTCTTTCAGATACTTTTGTTGTATTCATATG
AGAACACAACCTAATGGCCAAAGGCTTTTTGTCTTATACTATTAGAGAAAAAAAAAAGAA
TAAAGACTTAACATTCTTCGTC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL7148Contig1 503 2 1 U
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GCTTCTTATATGCCTAGTCTTTCAGGTTCATGTCACAGAGGCTAGACCCTTCCATGACAT
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AGCTGCTCCAAGAGGAAGTGGAGTTACGGGAATCATGAACACGAAGTGTCGAACGATTCG
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GATTATTGCTTAATTGAGATATTTTCTATTCTCTTATAAAAATCATGTGAACATGGTAAA
AATAAAGTTTACAGTATTTGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GQ39JQ C 1
AF RR4GQ39TF U 1
BS 1 503 RR4GQ39TF

RD RR4GQ39JQ 503 0 0
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AATAAAGTTTACAGTATTTGATC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4GQ39TF 503 0 0
GGAGAACAAACTGACAATGAAGAAAACAACACATGCTTTTCTTCTTCTACTACGTTTGCT
GCTTCTTATATGCCTAGTCTTTCAGGTTCATGTCACAGAGGCTAGACCCTTCCATGACAT
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TTGATATGCAGTCAGAAGTCCACCACTTTATATTCAGTCAGAAGTCCACCACGAATAAAA
ACTCGACTGTTCAGTTTCGTTATCATATCATTCCAAATAATTGTTTTACGCTTTGCTAAA
GATTATTGCTTAATTGAGATATTTTCTATTCTCTTATAAAAATCATGTGAACATGGTAAA
AATAAAGTTTACAGTATTTGATC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL7149Contig1 881 2 4 U
GGGAGGGGTCTGAGTTAGGACCGGAGCAGAGAAGGATTCTGCAGACTAGCGCTTTATGTC
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TAATGATGAAGAGTAACGGAAAGAGCGTTAGGATAACAAATGATACAGGAGAAGAAGTGA
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TCATGTCTGTTAACTTTACACCGTCCGGAGGAGAGCTAACTGTCACAGCTTCCTTGAGGA
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AAGTAGTCTCCCCTAAAGAAAATAAAAAGGGGTTATGGCTTTTGATATTTTCTCCCACTG
GTTTCTCTCTATGTTTGCAACTTTCCTTATTGCTTTTGTTTCTGATTTTCAACTTCCAAT
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AACATGGATGGATGCATATCTAATTCCTTCTCGAGTGTTTTTGGTTTCATGATGTATTAT
GAGAAATAAAAGCTAATTTACAGTTTATCAATGATGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GK92TF U 1
AF RR4GK92JQ C 124
BS 1 735 RR4GK92TF
BS 736 736 RR4GK92JQ
BS 737 750 RR4GK92TF
BS 751 881 RR4GK92JQ

RD RR4GK92TF 750 0 0
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AGAAGCAACTCAGCAAGATCCTGGATGATTCTGATCTGGAAAGCATCATTGAAGGGTGCT
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TAATGATGAAGAGTAACGGAAAGAGCGTTAGGATAACAAATGATACAGGAGAAGAAGTGA
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TCATGTCTGTTAACTTTACACCGTCCGGAGGAGAGCTAACTGTCACAGCTTCCTTGAGGA
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AGCTGGGCTACCAGAGTTTTTGCTGAACCAAATGTTTGGAACTGAGGAAGATGTGTCGGA
GGAAGGACTAAGCTTGATGGTTAGCCGGAAACTAGTGAAGCTGATGAATGGAGATGTTCA
GTACTTGAGACAAGCTGGGAAATCGAGTTTTATTATCACTCAGAACTCGCTGCAGCAAAC
AAGTAGTCTCCCCTAAAGAAAATAAAAAGGGGTTATGGCTTTTGATATTTTCTCCCACTG
GTTTCTCTCTATGTTTGCAACTTTCCTTATTGCTTTTGTTTCTGATTTTCAACTTCCAAT
AACGAAGAAAATATC*ATCCATTTACGTCT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4GK92JQ 758 0 0
ATCTGGAAATGAAAGAGTTCAGCTTGAATGAAGTGTTGACTGCTTCCACAAGTCAAGTAA
TGATGAAGAGTAACGGAAAGAGCGTTAGGATAACAAATGATACAGGAGAAGAAGTGATGT
CTGATACTTTGTATGGAGACAGTATCAGGCTTCAACAAGTCTCGGCAGATTTCATGCTCA
TGTCTGTTAACTTTACACCGTCCGGAGGAGAGCTAACTGTCACAGCTTCCTTGAGGAAAG
ATCAGCTCGGGAGATCTGTGCATCTTGCTATTTAGAGATCAGAATAACGCATACAGGAGC
TGGGCTACCAGAGTTTTTGCTGAACCAAATGTTTGGAACTGAGGAAGATGTGTCGGAGGA
AGGACTAAGCTTGATGGTTAGCCGGAAACTAGTGAAGCTGATGAATGGAGATGTTCAGTA
CTTGAGACAAGCTGGGAAATCGAGTTTTATTATCACTCAGAACTCGCTGCAGCAAACAAG
TAGTCTCCCCTAAAGAAAATAAAAAGGGGTTATGGCTTTTGATATTTTCTCCCACTGGTT
TCTCTCTATGTTTGCAACTTTCCTTATTGCTTTTGTTTCTGATTTTCAACTTCCAATAAC
GAAGAAAATATCCATCCATTTACGTCTTCTGCTATCTCTGTTTGTTCTGAAGCTGTAAAC
ATGGATGGATGCATATCTAATTCCTTCTCGAGTGTTTTTGGTTTCATGATGTATTATGAG
AAATAAAAGCTAATTTACAGTTTATCAATGATGATTAC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7150Contig1 743 2 8 U
GGGACGTGTGATGTGACGTCCCCAAGGGGGAAAAAAACTTTAGCTGGCCTATTCAGGTCT
AGCAGACAGCATCTCAAGTCCACAAGTTCTCAGAAAAAAGTATAAGCTTTGTCATTCATT
CATATTTCATAGAATACTGAGGGCTTTGAACAAACATTGTTTGTAAAAGAGTAATTGCTT
TTGCAGGAGAGGAGCTTCCTGCTAAAAACACACTCGGGATAGAGTCTACATCTCCATGTC
CAAATTCTAATCCTTCACAACCACCCCCTTGGCAAACGTGTCATTCTCCAACTTTAGGTG
CTGCAGCCCATATCGGCCAGGAAGTTTTCTGTGAAGCCGGCATGCCATGATCTGCATTCC
ATCCTTCTTTCTTGGTTCCTACAATGTTAATGGTGACATGTCTTAGCCCCAACAAAGAAA
ACTATCAAGAATCTGCATCATACTCAGGTTCAAATTTCCTTTTTCTTTTCTTACTAAACA
CATAAGGAAGCCATCTACGACGGAAGGCAGCAGTGTGTCCTAAAGAAAAACAAAATTATT
TACTTTGTCTCTAAAACAAAACATTATTTGCTTTGCAGTCGGATACATCATCTGCGCATT
AACCCTTGATTTCTTGTTTTGTTTTCTTCAATTATCTTTGTACAGAGTCCCTATCACACA
TAATATATAAAAAAAAACATTTTTCCTTCTAGGATATTGTATTTTCTTTTTAAGATATTG
TATTTCAGAATGTAAAGACATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4GL69TF U 1
AF RR4GL69JQ C 93
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BS 677 677 RR4GL69JQ
BS 678 710 RR4GL69TF
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CATATTTCATAGAATACTGAGGGCTTTGAACAAACATTGTTTGTAAAAGAGTAATTGCTT
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TACTTTGTCTCTAAAACAAAACATTATTTGCTTTGCAGTCGGATACATCATCTGCGCATT
AACCCTTGATTTCTTGTTTTGTTTTCTTCAATTATCTTTGTACAGAGTCCCTATCACACA
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TATTTCAGA*TGTAAAGACA

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DS 

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CAAACGTGTCATTCTCCAACTTTAGGTGCTGCAGCCCATATCGGCCAGGAAGTTTTCTGT
GAAGCCGGCATGCCATGATCTGCATTCCATCCTTCTTTCTTGGTTCCTACAATGTTAATG
GTGACATGTCTTAGCCCCAACAAAGAAAACTATCAAGAATCTGCATCATACTCAGGTTCA
AATTTCCTTTTTCTTTTCTTACTAAACACATAAGGAAGCCATTTACGACGGAAGGCAGCA
GTGTGTCCTAAAGAAAAACAAAATTATTTACTTTGTCTCTAAAACAAAACATTATTTGCT
TTGCAGTCGGATACATCATCTGCGCATTAACCCTTGATTTCTTGTTTTGTTTTCTTCAAT
TATCTTTGTACAGAGTCCCTATCACACATAATATATAAAAAAAAACATTTTTCCTTTTAG
GATATTGTATTTTCTTTTTAGGATATTGTATTTCAGAATGTAAAGACATAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC48TF U 1
AF RR4DC48JQ C 426
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BS 652 996 RR4DC48JQ

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QA 1 651 1 651
DS 

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CCAAACCAAAGAAAAAAACTACTATGTCCTATATGTATTTTATATATCTTTACGTTCGTA
CAGCTCTGAAAATATTCTCTTCTTTGTTTCATTCTTTGCTATAATAATTGTAAATATTGC
AAACTCTTTTTATTCAATAAAAGCATTTGTC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

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AGGGACACTGAACTGATTCAATCCGACAACACGGCTTGACTCAGAGAGGCTAAGGATCCC
GAGTCATGCAGTATCTATCGAACTCTCGTAGAATCGTTCGGGTTCTAAAACCCCTCGAAC
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ATCGATCTACTTCAGTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTCTCCT
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GCCTCTACAACCCGGTA


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB88TF U 1
AF RR4GV69TF U 8
BS 1 15 RR4CB88TF
BS 16 16 RR4GV69TF
BS 17 541 RR4CB88TF
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BS 543 646 RR4CB88TF
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RD RR4CB88TF 646 0 0
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GAGTCATGCAGTATCTATCGAACTCTCGTAGAATCGTTCGGGTTCTAAAACCCCTCGAAC
TCTTCAAGTCTGATGTGAGATTTGCTTCTCATGTTGTTGACTCTGCCCAATCGCAGAACC
ATCGATCTACTTCAGTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTCTCCT
CTGAAGCAAAACTTGTCGAAGATCCTACAGAGGCTGTCAAGGAGCTACACGGTAAGATAC
TTGACTCTGTGAATGTCAAGAGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCACTGATTG
AGAATTGCCGGAAGGAGGATGACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCCCAGGA
GATTTAGGTTGTCTAATCTCCGCATACATGACAACTTTAATTGCAATCTATGCCGGGAAG
TTGCTAAGACTTGTGTCCGTGTGGGAGCAATCAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAAC
ATAATGTTCATGGTTTGACTCCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGT
TGGAGCACAAGAACGCTAACCTCATGGACGAAGTGATGAAACTCCT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4GV69TF 670 0 0
GG
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AGTATCTATCGAACTCTCGTAGAATCGTTCGGGTTCTAAAACCCCTTGAACTCTTCAAGT
CTGATGTGAGATTTGCTTCTCATGTTGTTGACTCTGCCCAATCGCAGAACCATCGATCTA
CTTCAGTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTCTCCTCTGAAGCAA
AACTTGTCGAAGATCCTACAGAGGCTGTCAAGGAGCTACACGGTAAGATACTTGACTCTG
TGAATGTCAAGAGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCACTGATTGAGAATTGCC
GGAAGGAGGATGACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCTCAGGAGATTTAGGT
TGTCTAATCTCCGCATACATGACAACTTTAATTGCAATCTATGCCGGGAAGTTGCTAAGA
CTTGTGTCCGTGTGGGAGCAATCAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACACAATGTTC
ATGGTTTGACTCCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTTGGAGCACA
AGAACGCTAACCTCATGGACGAAGTGATGAAACTCCTGAAGCCAATGACCTGCCTCTACA
ACCCGGTA

QA 3 670 3 670
DS 



AS 1 2

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TGTTTACTATTTAGACTTCAGTTTAATTTTAAACTAGTTTCTTTACGTG


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4ES33TF U 1
AF RR4ES33JQ C 1
BS 1 625 RR4ES33TF
BS 626 709 RR4ES33JQ

RD RR4ES33TF 625 0 0
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TGGTGGTAGCATCACCAGTAGAGGACTATTTCTTGTATATAGATGATCTTCCAGACGCTG
AAAAGGACGAAGCTGAGGAAATCACAAGACCCTTTCTAGATGCTCTTGGTGATGAGTATT
CAGACTGTTGCCAAGGAACGGCATTCTTCCCTCTGCAGAGCTGTATGAACCTCATGTTGC
CCCAATGCAAAAGCCTTCAAAAGAGAAGAGGATAGAGACGGACAAGCAGTTATTATTGCG
TTAAGACGCATCAGCAAGAACGAAGAGGTGACAATTTCATATATAGACGAGGAGCTTCCG
TACAAAGAGAGACAAGCATTACTTGCAGATTACGGTTTCACCTGCAAGTGCCCTAAATGT
CTGGAAGATTCATCAGTTGCCTAGTTTTATGTTTTTGAGGTCATAAGAACATGAACCTTC
CCAATTTTTGCTAGTTAAACCCTGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4ES33JQ 709 0 0
GGTTGCCAGATGATGTTGATCCGTCAGATGAAGGTGCCTTCAGAATGCAGATAAAGGATC
TTGCATGCGCGTCTTTGGAGCTTCTGAAGACAGCCATATTTGACAAAGAATGTGAACCCC
TATTCTCGTTTGAAATATATGGGAACATCATCGGCATGTTTGAGCTTAATAACCTAGACT
TGGTGGTAGCATCACCAGTAGAGGACTATTTCTTGTATATAGATGATCTTCCAGACGCTG
AAAAGGACGAAGCTGAGGAAATCACAAGACCCTTTCTAGATGCTCTTGGTGATGAGTATT
CAGACTGTTGCCAAGGAACGGCATTCTTCCCTCTGCAGAGCTGTATGAACCTCATGTTGC
CCCAATGCAAAAGCCTTCAAAAGAGAAGAGGATAGAGACGGACAAGCAGTTATTATTGCG
TTAAGACGCATCAGCAAGAACGAAGAGGTGACAATTTCATATATAGACGAGGAGCTTCCG
TACAAAGAGAGACAAGCATTACTTGCAGATTACGGTTTCACCTGCAAGTGCCCTAAATGT
TTGGAAGATTCATCAGTTGCCTAGTTTTATGTTTTTGAGGTCATAAGAACATGAACCTTC
CCAATTTTTGCTAGTTAAACCCTGATTAGGGAAACTTTCCCGGTTTAAGGAACAAGTGTT
TGTTTACTATTTAGACTTCAGTTTAATTTTAAACTAGTTTCTTTACGTG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL7154Contig1 1001 2 2 U
GGAGGAACTGTCCGCGCTCCAGCTGAAGCCATGGGAAGGAGCTGCCACGGAACGCTGTAC
AGAGCGGTGCTCGGTTCTGATAACACCGTGTTAGCTGTCAAATGGTTAAGGGAAGGGACT
GCAAAAGGCAAGACGGAGTTCGCCAGGGAGATAAAGAAACTTGGCAACATCAAACACCCG
AATCTTGTTTCTCTTCAGGCTTACTATTGGGGACCCAAAGAACACGAGAAGCTTATCATA
TCAAGATACATTGATGCACCCTGCTTAGCTTTCTATCTCCAAGAGGCTGGATTGCTAAAC
CTCCCACCATTGCTGCTAGAAAACCGTCTTAAAATCACTCTAGACATAGCCACTTGTCTT
AGTCACCTGCACAACGAAGAATCAATCCCACACGGGAACCTAAAATCAACCAACGTTCTC
CTAAAACCACCCGAGCTCACTGCACTCCTAACAGACTACAGTCTCCACCGGTTGATCACA
CCGGAAGCCACGTCAGAGCAAGTTGAACGCAGCCACTCTCGGCTACTGCCCTCCGGAGTT
TGCTAGCTCCACCAAACCCTACCCTTCTCTCAAAAGCGATGTGTACGCCTTTGGGGTCAT
CTTGTTAGAGCTTCTCACGGGGAAAGTGTCGGGAGATGTTATAGATGATGAACAAGGGGT
TGTTGATTGGGTTGTTACGCTCGTGGGACAAAACCGTGCTGCCGAGTGTTTTGACCCGTC
CATTGTTAAGACACATGCCTCTGGAGTTGGAGTTCTTATTGATGTGTTGGAGATTGCTCT
GAGCTGTATCTCACAGGCACCGGAGAGGCCTGACATGAAATCTGTCTGTCAAGAGCTCTT
TAGAATTGTTCTCAAAGGGACAAACTAGAAGAGAGATCATCACACTCTTCTTTGTAAGAA
AATGTATAATCTTAAATCGATTAGTAACCCACTTAAAAGCATCAAACTGTATAACAACTA
TCTTCCACATTCATGCTTTGAAGCAATCTTCTCATAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AY90TF U 1
AF RR4AY90JQ C 95
BS 1 847 RR4AY90TF
BS 848 1001 RR4AY90JQ

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AATCTTGTTTCTCTTCAGGCTTACTATTGGGGACCCAAAGAACACGAGAAGCTTATCATA
TCAAGATACATTGATGCACCCTGCTTAGCTTTCTATCTCCAAGAGGCTGGATTGCTAAAC
CTCCCACCATTGCTGCTAGAAAACCGTCTTAAAATCACTCTAGACATAGCCACTTGTCTT
AGTCACCTGCACAACGAAGAATCAATCCCACACGGGAACCTAAAATCAACCAACGTTCTC
CTAAAACCACCCGAGCTCACTGCACTCCTAACAGACTACAGTCTCCACCGGTTGATCACA
CCGGAAGCCACGTCAGAGCAAGTTGAACGCAGCCACTCTCGGCTACTGCCCTCCGGAGTT
TGCTAGCTCCACCAAACCCTACCCTTCTCTCAAAAGCGATGTGTACGCCTTTGGGGTCAT
CTTGTTAGAGCTTCTCACGGGGAAAGTGTCGGGAGATGTTATAGATGATGAACAAGGGGT
TGTTGATTGGGTTGTTACGCTCGTGGGACAAAACCGTGCTGCCGAGTGTTTTGACCCGTC
CATTGTTAAGACACATGCCTCTGGAGTTGGAGTTCTTATTGATGTGTTGGAGATTGCTCT
GAGCTGTATCTCACAGGCACCGGAGAGGCCTGACATGAAATCTGTCTGTCAAGAGCTCTT
TAGAATT

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR4AY90JQ 907 0 0
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AGAAACTTGGCAACATCAAACACCCGAATCTTGTTTCTCTTCAGGCTTACTATTGGGGAC
CCAAAGAACACGAGAAGCTTATCATATCAAGATACATTGATGCACCCTGCTTAGCTTTCT
ATCTCCAAGAGGCTGGATTGCTAAACCTCCCACCATTGCTGCTAGAAAACCGTCTTAAAA
TCACTCTAGACATAGCCACTTGTCTTAGTCACCTGCACAACGAAGAATCAATCCCACACG
GGAACCTAAAATCAACCAACGTTCTCCTAAAACCACCCGAGCTCACTGCACTCCTAACAG
ACTACAGTCTCCACCGGTTGATCACACCGGAAGCCACGTCAGAGCAAGTTGAACGCAGCC
ACTCTCGGCTACTGCCCTCCGGAGTTTGCTAGCTCCACCAAACCCTACCCTTCTCTCAAA
AGCGATGTGTACGCCTTTGGGGTCATCTTGTTAGAGCTTCTCACGGGGAAAGTGTCGGGA
GATGTTATAGATGATGAACAAGGGGTTGTTGATTGGGTTGTTACGCTCGTGGGACAAAAC
CGTGCTGCCGAGTGTTTTGACCCGTCCATTGTTAAGACACATGCCTCTGGAGTTGGAGTT
CTTATTGATGTGTTGGAGATTGCTCTGAGCTGTATCTCACAGGCACCGGAGAGGCCTGAC
ATGAAATCTGTCTGTCAAGAGCTCTTTAGAATTGTTCTCAAAGGGACAAACTAGAAGAGA
GATCATCACACTCTTCTTTGTAAGAAAATGTATAATCTTAAATCGATTAGTAACCCACTT
AAAAGCATCAAACTGTATAACAACTATCTTCCACATTCATGCTTTGAAGCAATCTTCTCA
TAATATC

QA 1 907 1 907
DS 



AS 1 2

CO CL7155Contig1 1043 2 2 U
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GTCTATGAATACCAGCTGCTGGAGTCTGGAACAAACAAGTTCAGCGATGGTAATGTGTTG
AGCAGAGGTGGTCGTGGATGTCTTTATAGCGCTTGTCTTGATGGAAAGTCTTATGTCACC
GTGAAGAAGCTTGATGGTGGTGGAGAGACCGACATTGAAAAACAGTTTGAGAATGAGGTA
GATTGGTTGGCTAAGATCAAGCATCAGAACACAGTCTCCCTTTTGGGGTTTAGCGTGTAC
CGCCAAACGAGATGCATTGTGTATGAGATGATGCAGAATGGTTCTTTGGAGAGTCAGCTG
CATGGGCCTAGTCAAGGTGCAGGATTAACTTGGCAGCTTAGGATGAAAATTGCGGTTGAT
ATTGCACGAGGATTAGAGTATCTTCATGAGCATTGCCATCCTCCGGTAGTTCACAGAGAT
TTGAAATCGTCTAACATCCTTCTTGACTCTGATTTCAACGCAAAGATATCAGATTTTGGG
TATGCCACAGTGTTGATGACTCAGAACAAAAATCTGAACAGACCTTCAGAGTATCTTCTT
GATGGGAAAGTAACAGACAAGAATGATGTATACTCATTTGGGGTGATTCTCCTACAACTT
CTCCTAGGGAAGAGATCCGTGGAGAAACCATCAACTGAACCAGAATCTGTTGTCACTTGG
GCTGTACCAAAGCTGAGTGACAGAGCAAATCTTCCAAACATATTGGACCCTGCAATCAAA
GGAACAATGGATTTGAAGCATCTTTATCAGGTAGCAGCGGTGGCAGTGTTGTGTGTGCAG
CCAGAGCCAAGTTACAGACCGCTAATAACCGATGTGTTGCACTCACTCATCCCTCTTCTA
CCACTAGAACTCGGCGGATCATTGCGAATTTTATGAAACCCCACATTTTCATTTCCTTAT
TTGTAATCTTTTTACATTTTGAAAAATTGAATCTTTGTTGGTTCTTTCGTTGTGCAAATT
CCACTTTTATCTGTTTTATTTTC


BQ
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AF RR4DK83TF U 1
AF RR4DK83JQ C 296
BS 1 765 RR4DK83TF
BS 766 1043 RR4DK83JQ

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GATTGGTTGGCTAAGATCAAGCATCAGAACACAGTCTCCCTTTTGGGGTTTAGCGTGTAC
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TATGCCACAGTGTTGATGACTCAGAACAAAAATCTGAACAGACCTTCAGAGTATCTTCTT
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GCTGTACCAAAGCTGAGTGACAGAGCAAATCTTCCAAACATATTG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4DK83JQ 748 0 0
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TTGGGTATGCCACAGTGTTGATGACTCAGAACAAAAATCTGAACAGACCTTCAGAGTATC
TTCTTGATGGGAAAGTAACAGACAAGAATGATGTATACTCATTTGGGGTGATTCTCCTAC
AACTTCTCCTAGGGAAGAGATCCGTGGAGAAACCATCAACTGAACCAGAATCTGTTGTCA
CTTGGGCTGTACCAAAGCTGAGTGACAGAGCAAATCTTCCAAACATATTGGACCCTGCAA
TCAAAGGAACAATGGATTTGAAGCATCTTTATCAGGTAGCAGCGGTGGCAGTGTTGTGTG
TGCAGCCAGAGCCAAGTTACAGACCGCTAATAACCGATGTGTTGCACTCACTCATCCCTC
TTCTACCACTAGAACTCGGCGGATCATTGCGAATTTTATGAAACCCCACATTTTCATTTC
CTTATTTGTAATCTTTTTACATTTTGAAAAATTGAATCTTTGTTGGTTCTTTCGTTGTGC
AAATTCCACTTTTATCTGTTTTATTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7156Contig1 772 2 2 U
GCTAGCCTTTGGACTCATCGCCGACTTCCTCTGGGCTTCTTCTCATCGCTTCTCCTCCTC
CGCCATGTTGTCCCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTTGTCGGAAAACTCCCTCCTACTCC
TCCCATTGAGAAAGATAGTAGTAATAATAAGAAGAATAAGAAGAAGGACGATAATGGTAG
AGAAAGGAAGCTTTCTGCAACGTTTCAATATCTGCCTGCTCCTCAGCTACATTGGGAGAA
GATGTCAGCTTCACCTGTGCCTCGTCTAGACGGAGCTGCCATTCAGATTAGAAACTTTCT
ATACGTCTTTGCTGGTTACGGCAACATTAATCTCGTGCATTCGCATGTTGATGTATACAA
CTTCGTGGATAACACATGGGGAGGAAGATTCGATATGCCTAAAGAGATGGCTCATTCTCA
TTTAGGGATGGTAACCGATGGGAGATTCATCTACATCGTCACTGGTCAGTATGGTCCTCA
ATGCAGAGGCCCTACGGCTAAGACATTTGTGCTGGACACTGATACAAATACCTGGAGTGA
CTTCATTCCTTTACCAGTTCCTAGGTATGCTCCAGCTACTCAGCTATGGAGAGGTAGACT
CCACGTGATGGGTGGGAGCAAAGAGAATCGGCATACACCGGGGCTTGAACACTGGAGTAT
CGCTGTTAAAGATGGCAAAGCGTTGGAGAAAGAGTGGAGAAGTGAAGTCCTATCCCTCGT
GGAGGACTCACAGAGCATGTGTAGTAGTGGATGACAGCTTTTTGTGATGGTG


BQ
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AF RR4CH61TF U 1
AF RR4CY13TF U 1
BS 1 621 RR4CH61TF
BS 622 772 RR4CY13TF

RD RR4CH61TF 621 0 0
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CGCCATGTTGTCCCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTTGTCGGAAAACTCCCTCCTACTCC
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AGAAAGGAAGCTTTCTGCAACGTTTCAATATCTGCCTGCTCCTCAGCTACATTGGGAGAA
GATGTCAGCTTCACCTGTGCCTCGTCTAGACGGAGCTGCCATTCAGATTAGAAACTTTCT
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TTTAGGGATGGTAACCGATGGGAGATTCATCTACATCGTCACTGGTCAGTATGGTCCTCA
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CCACGTGATGGGTGGGAGCAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4CY13TF 772 0 0
GCTAGCCTTTGGACTCATCGCCGACTTCCTCTGGGCTTCTTCTCATCGCTTCTCCTCCTC
CGCCATGTTGTCCCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTTGTCGGAAAACTCCCTCCTACTCC
TCCCATTGAGAAAGATAGTAGTAATAATAAGAAGAATAAGAAGAAGGACGATAATGGTAG
AGAAAGGAAGCTTTCTGCAACGTTTCAATATCTGCCTGCTCCTCAGCTACATTGGGAGAA
GATGTCAGCTTCACCTGTGCCTCGTCTAGACGGAGCTGCCATTCAGATTAGAAACTTTCT
ATACGTCTTTGCTGGTTACGGCAACATTAATCTCGTGCATTCGCATGTTGATGTATACAA
CTTCGTGGATAACACATGGGGAGGAAGATTCGATATGCCTAAAGAGATGGCTCATTCTCA
TTTAGGGATGGTAACCGATGGGAGATTCATCTACATCGTCACTGGTCAGTATGGTCCTCA
ATGCAGAGGCCCTACGGCTAAGACATTTGTGCTGGACACTGATACAAATACCTGGAGTGA
CTTCATTCCTTTACCAGTTCCTAGGTATGCTCCAGCTACTCAGCTATGGAGAGGTAGACT
CCACGTGATGGGTGGGAGCAAAGAGAATCGGCATACACCGGGGCTTGAACACTGGAGTAT
CGCTGTTAAAGATGGCAAAGCGTTGGAGAAAGAGTGGAGAAGTGAAGTCCTATCCCTCGT
GGAGGACTCACAGAGCATGTGTAGTAGTGGATGACAGCTTTTTGTGATGGTG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7157Contig1 986 2 2 U
GGCCTATCTTTCCACCGCTTCTTAATCTTCCACCTGATAAGTTCCAACTCGCACTTGCTC
ATATATTACAGGGTTCTGCTCACACTGGCCCTGCCCTAACACCTGCCGAGGTATTGATAG
CTATTCACGATGTTGTTCCTGATAAAGATGGGCCAACACTGAAAAAGATAACAGATGCAT
GTTCAGCTTGCTTTGAACAACGCACAGTTTTCACGCAGCAAGTCTTAGCAAAGGCCCTCG
GTCAGATGGTTGATCGAACACCTCTTCCTTTACTCTTCATGAGAACAGTTATTCAGGCAA
TCGATGCTTTTCCAACACTGGTTGACTTTGTCATGGGAATCCTTTCGAAGTTGGTGAGTA
GGCAGATATGGAGACTACCAAAACTGTGGCCTGGCTTCTTGAAATGTGTGTCTCAGACAC
AGCCACATTCTTTCCCTGTCTTGTTGGAGTTACCAATGCCGCAACTTGAAAGTATCATGA
AGAAGTTTCCTGATCTAAGACCTTCTCTTACTGCTTATGCGAATCAGCCAACCATCAGAG
CTTCTCTACCAAATTCAGCTCTTTCAGTTCTAGGGCTTGACAATGGGCAAGATTCGCGGT
CACAAGTGCACCCTTCAGATGCAGCTTCTTCTGCTCACGGGACAGCCTTAACGTGACGCT
CTCTGGAAGAATAGCCGACAAGTTGAAATGTTTGAAGGAGACAAAGCATAGTACTGAAAT
CTTGTGACGACCACTCGTATATGCACTAACTACATGTACGGCTGTGTTTGCGATTACCAG
TGTGGTAGGCCAGCGTGTGTGGTCATTCACATTTTCTTATCTGTCACCCTTTTTCTATGT
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GATGTACAATCGCTTCAACTTTGTTTCCTATATAGAGAAGATAAAAAGAGTTTTTAAAGG
CCATAATATATCATTTGGCCATTAGG


BQ
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AF RR4B789TF U 1
AF RR4B789JQ C 164
BS 1 784 RR4B789TF
BS 785 986 RR4B789JQ

RD RR4B789TF 784 0 0
GGCCTATCTTTCCACCGCTTCTTAATCTTCCACCTGATAAGTTCCAACTCGCACTTGCTC
ATATATTACAGGGTTCTGCTCACACTGGCCCTGCCCTAACACCTGCCGAGGTATTGATAG
CTATTCACGATGTTGTTCCTGATAAAGATGGGCCAACACTGAAAAAGATAACAGATGCAT
GTTCAGCTTGCTTTGAACAACGCACAGTTTTCACGCAGCAAGTCTTAGCAAAGGCCCTCG
GTCAGATGGTTGATCGAACACCTCTTCCTTTACTCTTCATGAGAACAGTTATTCAGGCAA
TCGATGCTTTTCCAACACTGGTTGACTTTGTCATGGGAATCCTTTCGAAGTTGGTGAGTA
GGCAGATATGGAGACTACCAAAACTGTGGCCTGGCTTCTTGAAATGTGTGTCTCAGACAC
AGCCACATTCTTTCCCTGTCTTGTTGGAGTTACCAATGCCGCAACTTGAAAGTATCATGA
AGAAGTTTCCTGATCTAAGACCTTCTCTTACTGCTTATGCGAATCAGCCAACCATCAGAG
CTTCTCTACCAAATTCAGCTCTTTCAGTTCTAGGGCTTGACAATGGGCAAGATTCGCGGT
CACAAGTGCACCCTTCAGATGCAGCTTCTTCTGCTCACGGGACAGCCTTAACGTGACGCT
CTCTGGAAGAATAGCCGACAAGTTGAAATGTTTGAAGGAGACAAAGCATAGTACTGAAAT
CTTGTGACGACCACTCGTATATGCACTAACTACATGTACGGCTGTGTTTGCGATTACCAG
TGTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4B789JQ 823 0 0
AAAGATAACAGATGCATGTTCAGCTTGCTTTGAACAACGCACAGTTTTCACGCAGCAAGT
CTTAGCAAAGGCCCTCGGTCAGATGGTTGATCGAACACCTCTTCCTTTACTCTTCATGAG
AACAGTTATTCAGGCAATCGATGCTTTTCCAACACTGGTTGACTTTGTCATGGGAATCCT
TTCGAAGTTGGTGAGTAGGCAGATATGGAGACTACCAAAACTGTGGCCTGGCTTCTTGAA
ATGTGTGTCTCAGACACAGCCACATTCTTTCCCTGTCTTGTTGGAGTTACCAATGCCGCA
ACTTGAAAGTATCATGAAGAAGTTTCCTGATCTAAGACCTTCTCTTACTGCTTATGCGAA
TCAGCCAACCATCAGAGCTTCTCTACCAAATTCAGCTCTTTCAGTTCTAGGGCTTGACAA
TGGGCAAGATTCGCGGTCACAAGTGCACCCTTCAGATGCAGCTTCTTCTGCTCACGGGAC
AGCCTTAACGTGACGCTCTCTGGAAGAATAGCCGACAAGTTGAAATGTTTGAAGGAGACA
AAGCATAGTACTGAAATCTTGTGACGACCACTCGTATATGCACTAACTACATGTACGGCT
GTGTTTGCGATTACCAGTGTGGTAGGCCAGCGTGTGTGGTCATTCACATTTTCTTATCTG
TCACCCTTTTTCTATGTATATTATTTTATAAGACTTCACCGTGGCCGTGAGAAGGGGGTC
ACCTGTAGACTGTAGTGGATGTACAATCGCTTCAACTTTGTTTCCTATATAGAGAAGATA
AAAAGAGTTTTTAAAGGCCATAATATATCATTTGGCCATTAGG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL7158Contig1 1096 2 18 U
GGGGAGCCGCTTCACTATTATTCTCCCCTCTTCTTCTCCTCCTCGACCTTTTGATTCTTC
TTCTTGAATTTTGCAGATTTTTTTCCCTCGTTAAATTTATAATAAATCTGCAAAAAAAAT
CTCTTCGATCCAAATGGGAAAATTTTTCTGCTTCACTTCCCCTTCCGAGGTTGTGGGAGG
ACAATCATCATCACGATCTGGCAAAGGAAGAAGCGATGAAGGGCTGATCAAGTACGGTTT
CAGTCTAGTGAAAGGCAAAGCTAATCACCCCATGGAGGATTATCACGTCGCTAACTTCAT
CAACACCCAAGGCCACGAGCTAGGTCTCTTCGCTATCTACGACGGTCACATGGGTGATAC
TGTCCCCGCTTACTTGCAGAAGCACCTCTTCTCCAACATCCTCAAGGAGGGAGAGTTCTG
GGTCGATCCACGAAGGTCTATAGCAAAGGCCTACGAGAAGACGGACCAGGCCATTCTATC
TAATAGTTCCGACTTGGGACGTGGCGGGTCCACGGCTGTTACTGCTATATTGATCAACGG
GAGGAAGCTGTGGGTAGCTAACGTTGGAGACTCGCGAGCGGTTCTTTCGAGAGGAGGTTC
GGTAATGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCTCGTGCCGAACGGTCGAGTATTGAGGATAG
AGGTGGATTTGTATCCAATCTACCAGGTGATGTTCCTCGGGTGAATGGTCAGTTAGCTGT
GTCTCGTGCCTTTGGAGATAAGGGACTTAAGACACATCTGAGTTCAGAACCTGATATTAG
AGATGTTACTGTAGATAGCCAGACTGATGTTCTTGTCTTGGCCAGTGATGGGATTTGGAA
GGTGATGACAAATGAGGAGGCGATGGAGATAGCTAAAAGGGTGAAAGATCCACAGAAGGC
GGCTAAGGAGTTAACAGCTGAAGCATTGAGAAGAGAGAGCAAAGACGACATATCTTGTGT
CGTGGTCCGTTTCAGATGACAAACTCTGGGATCATCAAGAGACACAAAAAAAGCTGGATT
TCTGACTCTGATAAATTTTGGTCCGGTTGGACGGTCTAAAGTTTGGTTTCTGACAGCTTT
CTTGCTATATAGCGCT


BQ
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AF RR4GD53TF U 1
AF RR4GW04TF U 276
BS 1 305 RR4GD53TF
BS 306 306 RR4GW04TF
BS 307 342 RR4GD53TF
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BS 344 366 RR4GD53TF
BS 367 367 RR4GW04TF
BS 368 423 RR4GD53TF
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BS 688 740 RR4GD53TF
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BS 755 768 RR4GD53TF
BS 769 1096 RR4GW04TF

RD RR4GD53TF 768 0 0
GGGGAGCCGCTTCACTATTATTCTCCCCTCTTCTTCTCCTCCTCGACCTTTTGATTCTTC
TTCTTGAATTTTGCAGATTTTTTTCCCTCGTTAAATTTATAATAAATCTGCAAAAAAAAT
CTCTTCGATCCAAATGGGAAAATTTTTCTGCTTCACTTCCCCTTCCGAGGTTGTGGGAGG
ACAATCATCATCACGATCTGGCAAAGGAAGAAGCGATGAAGGGCTGATCAAGTACGGTTT
CAGTCTAGTGAAAGGCAAAGCTAATCACCCCATGGAGGATTATCACGTCGCTAACTTCAT
CAACATCCAAGGCCACGAGCTAGGTCTCTTCGCTATCTACGATGGTCACATGGGTGATAC
TGTCCCTGCTTACTTGCAGAAGCACCTCTTCTCCAACATCCTCAAGGAGGGAGAGTTCTG
GGTGGATCCACGAAGGTCTATAGCAAAGGCCTACGAGAAGACGGACCAGGCCATTCTATC
TAATAGTTCCGACTTGGGACGTGGCGGGTCCACGGCTGTTACTGCTATATTGATCAACGG
GAGGAAGCTGTGGGTAGCTAACGTTGGAGACTCGCGAGCGGTTCTTTCGAGAGGAGGTTC
GGTAGTGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCTCGTGCCGAACGGTCGAGTATTGAGGATAG
AGGTGGATTTGTATCCAATCTACCAG*TGATGTTCCTCGGGTGAATGGTCAGTTAGCTGT
GTCTCGTGCCTTTGGAGATA**GGACTTAAGACGCATCTGAGTTCAGA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4GW04TF 821 0 0
G
GGATTATCACGTCGCTAACTTCGTCAACACCCAAGGCCACGAGCTAGGTCTCTTCGCTAT
CTACGACGGTCACATGGGTGATACTGTCCCCGCTTACTTGCAGAAGCACCTCTTCTCCAA
CATCCTCAAGGAGGGAGAGTTTTGGGTCGATCCACGAAGGTCTATAGCAAAGGCCTACGA
GAAGACGGACCAGGCCATTCTATCTAATAGTTCCGACTTGGGACGTGGCGGGTCCACGGC
TGTTACTGCTATATTGATCAACGGGAGGAAGCTGTGGGTAGCTAACGTTGGGGACTCGCG
AGCGGTTCTTTCGAGAGGAGGTTTGGTAATGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCTCGTGC
TGAACGGTCGAGTATTGAGGATAGAGGTGGATTTGTATCCAATCTACCAGGTGATGTTCC
TCGGGTGAATGGTCAGTTAGCTGTGTCTCGTGCCTTTGGAGATAAGGGTCTTAAGACACA
TCTGAGTTCAGAACCTGATATTAGAGATGTTACTGTAGATAGCCAGACTGATGTTCTTGT
CTTGGCCAGTGATGGGATTTGGAAGGTGATGACAAATGAGGAGGCGATGGAGATAGCTAA
AAGGGTGAAAGATCCACAGAAGGCGGCTAAGGAGTTAACAGCTGAAGCATTGAGAAGAGA
GAGCAAAGACGACATATCTTGTGTCGTGGTCCGTTTCAGATGACAAACTCTGGGATCATC
AAGAGACACAAAAAAAGCTGGATTTCTGACTCTGATAAATTTTGGTCCGGTTGGACGGTC
TAAAGTTTGGTTTCTGACAGCTTTCTTGCTATATAGCGCT

QA 2 821 2 821
DS 



AS 1 2

CO CL7159Contig1 646 2 2 U
GGAAGGATTCAAGAATTCGAAAGAGCTGTCTCTCCTTCGATTCCAGAATCATTTGTAGAT
CAATAAGGTTGTATCACTGGTGGCTAAGTTAAAATTATGTCCGATCATCTGAGTTTATGT
ACGGATCGTCTCATAACTGCTGAGAGCCTGAAGTCAGAAAAAAATGCTGATTCTTCTGGA
GAGACTTGCGCGAACTTGGCTTCTTCTTCTTCATCTACGAATGAAGCTGAGGTAGTAGCG
AGGCAGAACTATGCTGCCGTTGAGGAAGAGGAACCACTTCTCCGGTCTGTTGAGTGCCGT
ATTTGCCAGGAGGAAGATACCACTAAGAACCTGGAGGCTCCTTGTAGTTGTAATGGCAGT
TTGAAGTATGCCCATCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACT
TGCGAAATATGCCACCAGGTAACCAATAATCTGCTAACTTCTGCGTGTGTTTTTTTTTGT
GTCAAGAAAACCAACCTAGGCTTCATAGAGAGATACTAATGCAAATTAGAACTTAAATTT
TTTGGATGGTGAAAGGAATCCACTTGTAACTATGCTGCTCTATCCGTCTTGCTAAAACGT
TACATTTTTTATTTATGTCATAGCTTTTTATAGTGTACCATAACTG


BQ
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AF RR4E294JQ C 1
AF RR4E294TF U 22
BS 1 21 RR4E294JQ
BS 22 646 RR4E294TF

RD RR4E294JQ 646 0 0
GGAAGGATTCAAGAATTCGAAAGAGCTGTCTCTCCTTCGATTCCAGAATCATTTGTAGAT
CAATAAGGTTGTATCACTGGTGGCTAAGTTAAAATTATGTCCGATCATCTGAGTTTATGT
ACGGATCGTCTCATAACTGCTGAGAGCCTGAAGTCAGAAAAAAATGCTGATTCTTCTGGA
GAGACTTGCGCGAACTTGGCTTCTTTTTCTTCATCTACGAATGAAGCTGAGGTAGTAGCG
AGGCAGAACTATGCTGCCGTTGAGGAAGAGGAACCACTTCTCCGGTCTGTTGAGTGCCGT
ATTTGCCAGGAGGAAGATACCACTAAGAACCTGGAGGCTCCTTGTAGTTGTAATGGCAGT
TTGAAGTATGCCCATCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACT
TGCGAAATATGCCACCAGGTAACCAATAATCTGCTAACTTCTGCGTGTGTTTTTTTTTGT
GTCAAGAAAACCAACCTAGGCTTCATAGAGAGATACTAATGCAAATTAGAACTTAAATTT
TTTGGATGGTGAAAGGAATCCACTTGTAACTATGCTGCTCTATCCGTCTTGCTAAAACGT
TACATTTTTTATTTATGTCATAGCTTTTTATAGTGTACCATAACTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4E294TF 625 0 0
AGAGCTGTCTCTCCTTCGATTCCAGAATCATTTGTAGATCAATAAGGTTGTATCACTGGT
GGCTAAGTTAAAATTATGTCCGATCATCTGAGTTTATGTACGGATCGTCTCATAACTGCT
GAGAGCCTGAAGTCAGAAAAAAATGCTGATTCTTCTGGAGAGACTTGCGCGAACTTGGCT
TCTTCTTCTTCATCTACGAATGAAGCTGAGGTAGTAGCGAGGCAGAACTATGCTGCCGTT
GAGGAAGAGGAACCACTTCTCCGGTCTGTTGAGTGCCGTATTTGCCAGGAGGAAGATACC
ACTAAGAACCTGGAGGCTCCTTGTAGTTGTAATGGCAGTTTGAAGTATGCCCATCGCAAG
TGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACTTGCGAAATATGCCACCAGGTA
ACCAATAATCTGCTAACTTCTGCGTGTGTTTTTTTTTGTGTCAAGAAAACCAACCTAGGC
TTCATAGAGAGATACTAATGCAAATTAGAACTTAAATTTTTTGGATGGTGAAAGGAATCC
ACTTGTAACTATGCTGCTCTATCCGTCTTGCTAAAACGTTACATTTTTTATTTATGTCAT
AGCTTTTTATAGTGTACCATAACTG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL7160Contig1 643 2 2 U
GCGCAGCTGGTCTGAATGGTTACATGGCAACAGTGACCAACCTAAAAAGTCCTGTAAACA
AGTGGAAATGTGGTGCTGCACCCATTACAGCAATGATGACGGTAAAGAACTGGTCCCAAA
ACGCTGGTTCTGCATCAACTTCAATTGGTAGACCTGCAATTCATCCCGCAATGGTGGATC
TGAAAGGCAAAGCATACGAGCTTTTGAGACAGAACGCAGATAAATTCTTGATGGAAGATC
TGTACAGAAACCCAGGACCGCTTCAGCACGATGGACCTGGTGCAGATGCTAAAGCAGTGA
GTCTCTGTGTTGAAGATCAAGATTACATGGGACGTATCAAGAAGCTGCAGGAATATCTAG
ACCAGGTGAGGAGGATAGTGAAGCCAGGATGTTCGCAAGACGTACTGAAAGCAGCACTGA
GCGTGATGGCTTCGGTGACCGATGTTCTCACTACCATTTCTTCATCTTCAAATGGTGGTC
AACAAACTGCTTAGAACTCAAGAGAGAGAGAGAGAACCAACCAACTCTTTAGAAAGCTTC
AAATGTTCTTTCAATATCCCCACATTTCGTGTTTTGGTTTTGTTTAGAAAGGGAGATGAA
CAAACAAGTTTTGGATTTTTACGCTATTCGACAGACTTTACGC


BQ
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AF RR4G685JQ C 1
AF RR4G685TF U 1
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DS 

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AGTGGAAATGTGGTGCTGCACCCATTACAGCAATGATGACGGTAAAGAACTGGTCCCAAA
ACGCTGGTTCTGCATCAACTTCAATTGGTAGACCTGCAATTCATCCCGCAATGGTGGATC
TGAAAGGCAAAGCATACGAGCTTTTGAGACAGAACGCAGATAAATTCTTGATGGAAGATC
TGTACAGAAACCCAGGACCGCTTCAGCACGATGGACCTGGTGCAGATGCTAAAGCAGTGA
GTCTCTGTGTTGAAGATCAAGATTACATGGGACGTATCAAGAAGCTGCAGGAATATCTAG
ACCAGGTGAGGAGGATAGTGAAGCCAGGATGTTCGCAAGACGTACTGAAAGCAGCACTGA
GCGTGATGGCTTCGGTGACCGATGTTCTCACTACCATTTCTTCATCTTCAAATGGTGGTC
AACAAACTGCTTAGAACTCAAGAGAGAGAGAGAGAACCAACCAACTCTTTAGAAAGCTTC
AAATGTTCTTTCAATATCCCCACATTTCGTGTTTTGGTTTTGTTTAGAAAGGGAGATGAA
CAAACAAGTTTTGGATTTTTA

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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GTTTGCGAGTAGCCGCTTCTCCGC


BQ
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AF RR4FW18TF C 1
AF RR4FW18JQ U 3
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BS 3 744 RR4FW18JQ

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ACAAGCAGGCCTACAAAACTCTTTGAATTTCGGGTGATACAATGTGTCTTTGACAATGGT
AGCTGCGAGCTCCCGGTTAATCTCGAACCACTGAGACCCTTTCCGCCATTTGGTGATGGG
AACTTCAGGTTCCATGTTCTCGTTGTAGCGGCCGCGCCCGAACGGTCCAGGGTCATCAAA
AGCACCCATGAAGCTGTGTTTTGATCGGCTTAAGTAGCTGTAGATGGTCGTGAAGTTGTA
GAGTGGTATGCATGACTCCGAGACGAGAACAAACCATTCGTTGGAGATATCGAGAAGTGC
GTTTGCGAGTAGCCGCTTCTCCGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FW18JQ 742 0 0
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GACACTCCTCTCTAACTCAAAATCCCATAATCTTGGGAGCTATGTGAAGCAAAGGCTCCA
AAGCACTTGGAGCAAACTTCCTCGCAAAGAGATAACACATGGAAGTGTTATGACCATTAT
AAGCGCAGTTCTTTCCATCAAAGATCTTCTCAAAGAACTTCTCCGTAATGTCCGATCGCC
CAAACGTAGCCGGGTGGGGGCCGCCTCTAGACCAGTCCACCCACGTCAAGCTCCAGTTAG
CCAACGCCATTGGTTTCTCAATCGTCAACATCGTAGGGAAGTAATGCTCGTCCACATAAC
AAGCAGGCCTACAAAACTCTTTGAATTTCGGGTGATACAATGTGTCTTTGACAATGGTAG
CTGCGAGCTCCCGGTTAATCTCGAACCACTGAGACCCTTTCCGCCATTTGGTGATGGGAA
CTTCAGGTTCCATGTTCTCGTTGTAGCGGCCGCGCCCGAACGGTCCAGGGTCATCAAAAG
CACCCATGAAGCTGTGTTTTGATCGGCTTAAGTAGCTGTAGATGGTCGTGAAGTTGTAGA
GTGGTATGCATGACTCCGAGACGAGAACAAACCATTCGTTGGAGATATCGAGAAGTGCGT
TTGCGAGTAGCCGCTTCTCCGC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL7162Contig1 863 2 2 U
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AACTTGTGGCCTTCACAGGAAATGAAGATCCTAAAAAACACTACTTTTATGGCGAAATCA
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AGGCTGAAGGATTCCCTACAATTCTCTTCTTCCCTGCAGGAAACAAGACCTCTGAACCGA
TAACGGTAGATGCAGACCGAACTGTGGTTGCATTTTACAAGTTTATGAGGAAACACGCAA
CGATTCCATTCAAACTGGAGAAACCTGCATCAACTGAATCCCCTAAAGCTGCCGAGTCCA
CACCAAAAGTAGAAACTACTGAGAGCACCACAAAGAATACAGCAAGTGATTCCAAGGACG
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TATATTGTATGATCAAGTTATATTTAGTTCGAGTTAAAGACAATTTCAACACTTGAATCT
TGTTTCAAAGGCCAGTTTGTAGAATTGTCTCACACCGAATTATGGTAACACAAAACCAAC
TTAATAAAAAAATCTTGCCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H783TF U 1
AF RR4H783JQB C 468
BS 1 637 RR4H783TF
BS 638 863 RR4H783JQB

RD RR4H783TF 637 0 0
ATAACGAGGAGTATGGGCAGCCAGTTGCTGACTACTTTGGTGCGTCTAACAATAGTCCGA
AACTTGTGGCCTTCACAGGAAATGAAGATCCTAAAAAACACTACTTTTATGGCGAAATCA
AGTCAGATGAAATTAAGACATTTGGGGAAGAGTTCTTGAGCGACAAGCTAAAGCCTTTCT
ATAAGTCAGACCCCATTCCTGAAAAGAATGATGGAGATGTGAAAATCGTGGTTGGTGATA
ACTTTGATGAAATTGTCCTGGACGAGTCTAAGGATGTTCTTCTCGAGATCTATGCTCCAT
GGTGTGGGCATTGCGAAGCCCTTGAGCCAATCTATAACAAGCTTGCCAAACATTTAAGAA
GCATTGATTCTCTTGTTATAGCTAAGATGGATGGAACAACCAATGAACACCCCAAGGCAA
AGGCTGAAGGATTCCCTACAATTCTCTTCTTCCCTGCAGGAAACAAGACCTCTGAACCGA
TAACGGTAGATGCAGACCGAACTGTGGTTGCATTTTACAAGTTTATGAGGAAACACGCAA
CGATTCCATTCAAACTGGAGAAACCTGCATCAACTGAATCCCCTAAAGCTGCCGAGTCCA
CACCAAAAGTAGAAACTACTGAGAGCACCACAAAGAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4H783JQB 396 0 0
ACT
TCTGAACCGATAACGGTAGATGCAGACCGAACTGTGGTTGCATTTTACAAGTTTATGAGG
AAACACGCAACGATTCCATTCAAACTGGAGAAACCTGCATCAACTGAATCCCCTAAAGCT
GCCGAGTCCACACCAAAAGTAGAAACTACTGAGAGCACCACAAAGAATACAGCAAGTGAT
TCCAAGGACGAATTGTGATCCCAAAGCTAAAGCAAAAGGGTATGAGTTATAGAAATACAT
CTCCTTAAGTTATATTGTATGATCAAGTTATATTTAGTTCGAGTTAAAGACAATTTCAAC
ACTTGAATCTTGTTTCAAAGGCCAGTTTGTAGAATTGTCTCACACCGAATTATGGTAACA
CAAAACCAACTTAATAAAAAAATCTTGCCGTGC

QA 4 396 4 396
DS 



AS 1 2

CO CL7163Contig1 672 2 2 U
AAAAAGGGAATATTGATCGGATATAAATATCTACACAAGATCAGATAGATATAAGAGTGT
TATAGTGGAATTTATACAGAAAACACCAATACTGCCGACACAGAAAAATCAACACCCATC
ATTACAAGTTGGTAATGGTACTTTCCGATTCATCATTATACCAAACAAAACCAAGACCCG
AACCCATCCGCGAGTAACTTTCGGTCGGTAAAAACCGATCCCGGCAAACCGGACACGTCA
CCTTGCAGTAGTCAACGATCCAACGGTCCAAACAACGGTGATGAAACACGTGTCGACAAT
TCGGAAGCTGCCTAATGTCATCATCGAATTCAAAATCAGAGAGACACACCGTACAGCAGT
CTTCAATATCGGTCTGGATATCCGAGAAACGAACCACCGGGGAAATCTCGTCAGCGAGAC
TCACGGCTCTGGAGTTGTCGGGTTGGATAAGGACCAAAGGGTCCGGTCGAGGAATCTCGT
GGTCTAGAAACTGTGGTAAACCGATGTAAGGAAAAAGCGCATCGACCATGTCTCTGAAGA
AACCGATGACGTAAGGAGTCTTAAGTACGTATCCAGGAATCTGAAGCCCCCTGAAATCTG
TAGGAAGACCCATAGGAGAGAGAGATAGAAGAGATAACGCCAGAGATGTGGAGTTTACAG
AGATAAGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H833TF C 1
AF RR4H833JQB U 13
BS 1 12 RR4H833TF
BS 13 672 RR4H833JQB

RD RR4H833TF 633 0 0
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TATAGTGGAATTTATACAGAAAACACCAATACTGCCGACACAGAAAAATCAACACCCATC
ATTACAAGTTGGTAATGGTACTTTCCGATTCATCATTATACCAAACAAAACCAAGACCCG
AACCCATCCGCGAGTAACTTTCGGTCGGTAAAAACCGATCCCGGCAAACCGGACACGTCA
CCTTGCAGTAGTCAACGATCCAACGGTCCAAACAACGGTGATGAAACACGTGTCGACAAT
TCGGAAGCTGCCTAATGTCATCATCGAATTCAAAATCAGAGAGACACACCGTACAGCAGT
CTTCAATATCGGTCTGGATATCCGAGAAACGAACCACCGGGGAAATCTCGTCAGCGAGAC
TCACGGCTCTGGAGTTGTCGGGTTGGATAAGGACCAAAGGGTCCGGTCGAGGAATCTCGT
GGTCTAGAAACTGTGGTAAACCGATGTAAGGAAAAAGCGCATCGACCATGTCTCTGAAGA
AACCGATGACGTAAGGAGTCTTAAGTACGTATCCAGGAATCTGAAGCCCCCTGAAATCTG
TAGGAAGACCCATAGGAGAGAGAGATAGAAGAG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4H833JQB 660 0 0
TTGATCGGATATAAATATCTACACAAGATCAGATAGATATAAGAGTGTTATAGTGGAATT
TATACAGAAAACACCAATACTGCCGACACAGAAAAATCAACACCCATCATTACAAGTTGG
TAATGGTACTTTCCGATTCATCATTATACCAAACAAAACCAAGACCCGAACCCATCCGCG
AGTAACTTTCGGTCGGTAAAAACCGATCCCGGCAAACCGGACACGTCACCTTGCAGTAGT
CAACGATCCAACGGTCCAAACAACGGTGATGAAACACGTGTCGACAATTCGGAAGCTGCC
TAATGTCATCATCGAATTCAAAATCAGAGAGACACACCGTACAGCAGTCTTCAATATCGG
TCTGGATATCCGAGAAACGAACCACCGGGGAAATCTCGTCAGCGAGACTCACGGCTCTGG
AGTTGTCGGGTTGGATAAGGACCAAAGGGTCCGGTCGAGGAATCTCGTGGTCTAGAAACT
GTGGTAAACCGATGTAAGGAAAAAGCGCATCGACCATGTCTCTGAAGAAACCGATGACGT
AAGGAGTCTTAAGTACGTATCCAGGAATCTGAAGCCCCCTGAAATCTGTAGGAAGACCCA
TAGGAGAGAGAGATAGAAGAGATAACGCCAGAGATGTGGAGTTTACAGAGATAAGTATCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7164Contig1 511 2 1 U
GGGGCTGTAATCGAAACCATCGGAGAAGAAGTTTCACACAATGTCCGGCGAGGAAGACGC
CACCGTAAGGGAGCCACTAGATCTGATTCGTCTAAGCCTCGGCGAGAGAATCTATGTCAA
GCTCCGCTCAGACCGCGAACTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAACAT
GATTCTGGGTGATGTCGAAGAAGTAATCACAACTGTAGAAATCGATGACGAGACCTACGA
AGAGATTGCCAGGACGATAAAGCGCAATATTCAGTATCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGT
GATATTGGTGTCTCCACCTCTGAGGACAACTTGAGTTTTAGCAACTCAAATCTGAAGTCT
TAACTTAAGGAAGACTCTTTTTTTCTAAACAAAAAAGTCTCGTGTGTCCTCTATATATCA
AGGAAGGCCTTTGTTGGCCAGTGATGTATTTTATTCAGTCGATTGTTGTTTAAAAAACTC
AGAAAGCATCTATTATATTACTTCGATTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H252JQ C 1
AF RR4H252TF U 1
BS 1 511 RR4H252TF

RD RR4H252JQ 511 0 0
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CACCGTAAGGGAGCCACTAGATCTGATTCGTTTAAGCCTCGGCGAGAGAATTTATGTCAA
GCTCCGCTCAGACCGCGAACTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAACAT
GATTCTGGGTGATGTCGAAGAAGTAATCACAACTGTAGAAATCGATGACGAGACCTACGA
AGAGATTGCCAGGACGATAAAGCGCAATATTCAGTATCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGT
GATATTGGTGTCTCCACCTCTGAGGACAACTTGAGTTTTAGCAACTCAAATCTGAAGTCT
TAACTTAAGGAAGACTCTTTTTTTCTAAACAAAAAAGTCTCGTGTGTCCTCTATATATCA
AGGAAGGCCTTTGTTGGCCAGTGATGTATTTTATTCAGTCGATTGTTGTTTAAAAAACTC
AGAAAGCATCTATTATATTACTTCGATTCAC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR4H252TF 511 0 0
GGGGCTGTAATCGAAACCATCGGAGAAGAAGTTTCACACAATGTCCGGCGAGGAAGACGC
CACCGTAAGGGAGCCACTAGATCTGATTCGTCTAAGCCTCGGCGAGAGAATCTATGTCAA
GCTCCGCTCAGACCGCGAACTTCGCGGCAAGCTTCACGCGTTTGATCAGCATTTGAACAT
GATTCTGGGTGATGTCGAAGAAGTAATCACAACTGTAGAAATCGATGACGAGACCTACGA
AGAGATTGCCAGGACGATAAAGCGCAATATTCAGTATCTGTTTGTGAGAGGAGATGGAGT
GATATTGGTGTCTCCACCTCTGAGGACAACTTGAGTTTTAGCAACTCAAATCTGAAGTCT
TAACTTAAGGAAGACTCTTTTTTTCTAAACAAAAAAGTCTCGTGTGTCCTCTATATATCA
AGGAAGGCCTTTGTTGGCCAGTGATGTATTTTATTCAGTCGATTGTTGTTTAAAAAACTC
AGAAAGCATCTATTATATTACTTCGATTCAC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL7165Contig1 884 2 2 U
TCATTTAGAAAAAAATATACTCAAAATCATATAAGTGATGCGCACATTACAACATACCAT
TAGGAATATCCCTGAGCAGTGTTCCACGACCCTGAGATTTATTAACATATAAAAACCATA
ATTAACTAATTGAAGAGAACATTATACCAAAAAAATAATAAAAAATTACCTTTTCGATAG
AAAGGGACTTGGTTGGTGTAGGACGCAGGGGAGTAGAGAGGGAGAAAAGCTCCGCCTTCT
TTCTCTCCCTCGTTGGTCTATCACTATTCCTCTGAGTCTCAACAGACTTCTTACTTACAC
TTCCTTCTTCCTCTTTCTCTTCCAACTGGTCCTCCTCCTTCTCCGCCTCGTCTTTGCTGG
CGAAATTCACTTCTTTCGGGGAGGAGGATTCGACTCCCAGTGTTTTTCCTTCTACGGTTT
CCATCGCCATCTGAGGTTTTTCTTTTTTGGATGTTTTTCGCGAGATACTCAAAAACCCTA
AATCAGGAAATTGAGCTAACGATTAAGACGACGAAACAGAGAACTAATAAGTTCGGGGTG
GTTTTTCAACAAATTTGGCGCCAAATATTGGAACATAAAGGCGGGCTCTCTCTCTCTCTC
TGGTCGACAAAAGCAACTCGCGCCAAAACTACTTACTATAATACACCTAACTCGGCCCAG
TAATATAATAAGCCGAATCCCATCTCCTAACGGGCCTCTTTAACATTCCCATTGTGAAAA
CAATTCTTCTTTTTTTAGCAAATACCGTTTACGGTTTACCCAACAAATTTGCATAGTACC
ACCTTTTGAGCAAATAGCAAGTAGATTAGGCGCGTATTTGTTCTCTAGGTTCTTAGAGCA
TATCACAAACTTGAATTTTAATACGAGTTGAATCGGCGGCTGAC


BQ
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AF RR4FH95TF U 1
AF RR4FH95JQ C 437
BS 1 524 RR4FH95TF
BS 525 884 RR4FH95JQ

RD RR4FH95TF 524 0 0
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TAGGAATATCCCTGAGCAGTGTTCCACGACCCTGAGATTTATTAACATATAAAAACCATA
ATTAACTAATTGAAGAGAACATTATACCAAAAAAATAATAAAAAATTACCTTTTCGATAG
AAAGGGACTTGGTTGGTGTAGGACGCAGGGGAGTAGAGAGGGAGAAAAGCTCCGCCTTCT
TTCTCTCCCTCGTTGGTCTATCACTATTCCTCTGAGTCTCAACAGACTTCTTACTTACAC
TTCCTTCTTCCTCTTTCTCTTCCAACTGGTCCTCCTCCTTCTCCGCCTCGTCTTTGCTGG
CGAAATTCACTTCTTTCGGGGAGGAGGATTCGACTCCCAGTGTTTTTCCTTCTACGGTTT
CCATCGCCATCTGAGGTTTTTCTTTTTTGGATGTTTTTCGCGAGATACTCAAAAACCCTA
AATCAGGAAATTGAGCTAACGATTAAGACGACGAAACAGAGAAC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4FH95JQ 448 0 0
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TAACGATTAAGACGACGAAACAGAGAACTAATAAGTTCGGGGTGGTTTTTCAACAAATTT
GGCGCCAAATATTGGAACATAAAGGCGGGCTCTCTCTCTCTCTCTGGTCGACAAAAGCAA
CTCGCGCCAAAACTACTTACTATAATACACCTAACTCGGCCCAGTAATATAATAAGCCGA
ATCCCATCTCCTAACGGGCCTCTTTAACATTCCCATTGTGAAAACAATTCTTCTTTTTTT
AGCAAATACCGTTTACGGTTTACCCAACAAATTTGCATAGTACCACCTTTTGAGCAAATA
GCAAGTAGATTAGGCGCGTATTTGTTCTCTAGGTTCTTAGAGCATATCACAAACTTGAAT
TTTAATACGAGTTGAATCGGCGGCTGAC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL7166Contig1 657 2 1 U
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ATGGATCATAGAGTCACTCAAGGCAGTTAAATTCATAGACTCCAAGTACTTCAATGTCCC
CTTTGGAGAAGCAGCCATCGAGCTCGTTGCGGGGAAAGAAAGTGCCATTGCACAAGTCAT
TAGGACTTCACCAGGTCAAACCTACAGCCTCTCCTTTGCCGTTGGAGATGCTAAAAACGA
CTGCCATGGATCCATGATGGTTGAGGCTTTTGCAGCCAGAGATACGCTGAAAGTGCCACA
CACTTCAGTTGGTGGAGGTCACTTTAAGATGGCAAGTTTCAAGTTCAAGGCGATTGGAGC
AAGAACTAGGATTACTTTCTTCAGTACTTATTACCATATGAAGAGAATGGATATGGGACC
TCTCTGCGGACCTGTCATTGATCAGGTTGTGGTTTCTCATGTCGCTTAGATCGATTGTAA
GCTTTGTGACCACTGTATCCTGTGCTCTTTATTCTCGGCTTTATCCTGCTCATGGACTTG
GTTATTTGCTTTGTATGTCTTGCTCCTTTTGGAATTAAATTATAGTTAATCAATGATATA
TTGTGATACGATAAGTTTTGAGTTAAATAAAAAGTAGTAAAGTGCTACAAAACCATT


BQ
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AF RR4FH06TF U 1
AF RR4FH06JQ C 29
BS 1 657 RR4FH06TF

RD RR4FH06TF 657 0 0
GTCAACACAAGGAGTCCTCCTCCCACCTAAACAAGAAGATGTCACATCACCTTTACCAGG
ATGGATCATAGAGTCACTCAAGGCAGTTAAATTCATAGACTCCAAGTACTTCAATGTCCC
CTTTGGAGAAGCAGCCATCGAGCTCGTTGCGGGGAAAGAAAGTGCCATTGCACAAGTCAT
TAGGACTTCACCAGGTCAAACCTACAGCCTCTCCTTTGCCGTTGGAGATGCTAAAAACGA
CTGCCATGGATCCATGATGGTTGAGGCTTTTGCAGCCAGAGATACGCTGAAAGTGCCACA
CACTTCAGTTGGTGGAGGTCACTTTAAGATGGCAAGTTTCAAGTTCAAGGCGATTGGAGC
AAGAACTAGGATTACTTTCTTCAGTACTTATTACCATATGAAGAGAATGGATATGGGACC
TCTCTGCGGACCTGTCATTGATCAGGTTGTGGTTTCTCATGTCGCTTAGATCGATTGTAA
GCTTTGTGACCACTGTATCCTGTGCTCTTTATTCTCGGCTTTATCCTGCTCATGGACTTG
GTTATTTGCTTTGTATGTCTTGCTCCTTTTGGAATTAAATTATAGTTAATCAATGATATA
TTGTGATACGATAAGTTTTGAGTTAAATAAAAAGTAGTAAAGTGCTACAAAACCATT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4FH06JQ 629 0 0
AAACAAGAAGATGTCACATCACCTTTACCAGGATGGATCATAGAGTCACTCAAGGCAGTT
AAATTCATAGACTCCAAGTACTTCAATGTCCCCTTTGGAGAAGCAGCCATCGAGCTCGTT
GCGGGGAAAGAAAGTGCCATTGCACAAGTCATTAGGACTTCACCAGGTCAAACCTACAGC
CTCTCCTTTGCCGTTGGAGATGCTAAAAACGACTGCCATGGATCCATGATGGTTGAGGCT
TTTGCAGCCAGAGATACGCTGAAAGTGCCACACACTTCAGTTGGTGGAGGTCACTTTAAG
ATGGCAAGTTTCAAGTTCAAGGCGATTGGAGCAAGAACTAGGATTACTTTCTTCAGTACT
TATTACCATATGAAGAGAATGGATATGGGACCTTTCTGCGGACCTGTCATTGATCAGGTT
GTGGTTTCTCATGTCGCTTAGATCGATTGTAAGCTTTGTGACCACTGTATCCTGTGCTCT
TTATTTTCGGCTTTATCCTGCTCATGGACTTGGTTATTTGCTTTGTATGTCTTGCTCCTT
TTGGAATTAAATTATAGTTAATCAATGATATATTGTGATACGATAAGTTTTGAGTTAAAT
AAAAAGTAGTAAAGTGCTACAAAACCATT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL7167Contig1 826 2 1 U
GGGAGGAAAGGCTTACTACATTCATTCATCCATCAACAACAATTACATCATTACACACAA
GTCTTGCTGAACAAATAAAAATCAATAATTACCGGAATGGGTTCGGTTCCAAACGTGTGT
GTGGCTTTCACGTTAAAATTATACATTCTTTTATACCAACAAAGAGTGATAGATAGATAT
ATAAATATTTTTGTAAATAACTACAAAAGATGGGGAACCTAAAGCGTGGGAGTGAGTAGC
TTTAGAGTTTCTTGGGGAAAGTCATACCGCGGCCTCGGATAGAAAGAGAGGGTCCTTTGG
CAGAGCTGACTACATTGGTATCAAGGTAGATGACTACCACAGTGATGTCATCGTGGAAAT
GCCTCCTCACGCCTCTCTCTATCTTCATCAGATCAGAGTATCTCATTTCTCTCTTCTTCG
CTGCCGCTTGCATTGCCATCTTCACCAGTCTACGTGCTATCCCGTTTCGTGGGTGGTTCT
GAACGATGTCAACAGCTTCTTGATTGCTAAGCTGTTCCCATAGTCAATCAGAAGCAAATA
TAAGAAACTAATCCTGTGGTTGGAGCTCATGCTCTGTTATCGACGGTTCCCCACTCAAGA
TTGGTCTCTTGATCGGCTCTCTGAATCTATACTTCGTGTACAACGGTTCCCTGTTGAACT
CCGCCTTCTTAAGATACATGTCTCCTATGGATCTAGATACCTGAATAAGGCCCTTAACGC
GCCATACATTGTGCTTTAACACGACAATATGCGAGTCATCCGGGTGCAAGGAGTGCATCT
CCTGCCTAACAGACTCGATGCTCACATTATGTTCAGCTGAGAGCTG


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AF RR4A110JQD U 1
AF RR4A110JQ U 1
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QA 1 752 1 752
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QA 1 826 1 826
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4CB27TF U 1
AF RR4CB27JQ C 117
BS 1 775 RR4CB27TF
BS 776 939 RR4CB27JQ

RD RR4CB27TF 791 0 0
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ACAAATAATCAGTCTAGAGATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAG
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TGGATGCATAATCGTTTCTAGGACCGAGACATGTCCTCAGGGATATCCATATGACATTCT
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ATAATCTTTTTTTTTAAATCCTTTAATCTGCTTTTCATTAAAAAAACACAGTTTCTTGAA
TTTTTCCGTTAATCCTTTCATAAAACTTATTTGTTTTAAGTTTTAACTAAAAAAAATATT
TTAAATGTTTTTAGATAATTGTAAAACAATCAAATTTTTGTAAAAACTATAAAGTAAATA
CTTTTTCACTTTAACTTCTAAAATATAAAATGTTTTGTAACTTACTTACCTAATACATGT
CTTCAACCTTCGCTAGGTTTGCTCTAGAACAGATATATCAAAAATTTGTTGATCCCTCGA
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TCTGCAGCAAATCCTC

QA 1 775 1 775
DS 

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TTCTCGAAAACTCTGGTAAATTAGTTTCTTTGGTTTTATTAAGTTACTAGTATGAACCCA
GTGCTACGCACTGGTCAATTAAACGTTTAGAAAGTATTTGATCGTTGTTATAATTTTCAA
TCAAATAATCTTTTTTTTTAAATCCTTTAATCTGCTTTTCATTAAAAAAACACAGTTTCT
TGAATTTTTCCGTTAATCCTTTCATAAAACTTATTTGTTTTAAGTTTTAACTAAAAAAAA
TATTTTAAATGTTTTTAGATAATTGTAAAACAATCAAATTTTTGTAAAAACTATAAAGTA
AATACTTTTTCACTTTAACTTCTAAAATATAAAATGTTTTGTAACTTACTTACCTAATAC
ATGTCTTCAACCTTCGCTAGGTTTGCTCTAGAACAGATATATCAAAAATTTGTTGATCCC
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AATTCAAACTCGATCACAGTCCAATTAAAGCTTTGAAAGAGGTTCAAGGACGACTGTATT
CCACGATCTTCATCTAAAGCTTGTCAATAATAAAATTTTAAGG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTCGATCTTGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGA
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ATTCCTCCGCAAACTCGGAAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGCG
TCTCCACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATAT
ATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAATGCCTCATGGAGACCGTGATATGGCCTTC
CGATGACTCGAACTCAGAGGTTATTGGCTGAAGAAGGCTGTGTCACAAACGCAGCATTTA
CTTTGCTTTCGTCAACTCGCTTCACAATTTTAGGATCTTGAGTCTCTTTTAGTTTGATTT
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BQ
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AF RR4EQ32TF U 1
AF RR4EQ32JQ C 5
BS 1 676 RR4EQ32TF
BS 677 830 RR4EQ32JQ

RD RR4EQ32TF 676 0 0
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TTTCGATCTTGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGA
TGGATTCATGTTTATGTCTGGATGCTCACACTAGGACCAGGAGCAAGAAGAAGATCCTTG
GCAGTGCCAGTGCAAGAAAGATGGAACTAGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTT
TCAGGATTTCTTCCAAGAAGCGTGTCCCAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAACTCTTGA
TTGTGAGTGAGGACGTTGCTGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGGTCAAAACGAACCTT
GTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAAT
CCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACACCAACCGATGGTAAACG
ATTCCTCCGCAAACTCGGAAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGCG
TCTCCACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATAT
ATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAATGCCTCATGGAGACCGTGATATGGCCTTC
CGATGACTCGAACTCA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4EQ32JQ 826 0 0
ACTGTTTCTTGATTC
TGAAGTTCGCTTTCCC*TTTCATCCCAAAAAGAGGGAAAAGTTTCGATCTTGTTGTTTGG
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GGATGCTCACACTAGGACCAGGAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTGCCAGTGCAAGAAA
GATGGAACTAGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCCAAGAA
GCGTGTCCCAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAACTCTTGATTGTGAGTGAGGACGTTGC
TGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACATACA
AAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACTTGGT
TCTATAATTACGTCGTATCGAACACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGA
AAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGCGTCTCCACTTGTATGGCAAG
TGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCG
TTGATGCGTGAATGCCTCATGGAGACCGTGATATGGCCTTCCGATGACTCGAACTCAGAG
GTTATTGGCTGAAGAAGGCTGTGTCACAAACGCAGCATTTACTTTGCTTTCGTCAACTCG
CTTCACAATTTTAGGATCTTGAGTCTCTTTTAGTTTGATTTACATATAATGAATCATTAA
TGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAG

QA 16 826 16 826
DS 



AS 1 2

CO CL7171Contig1 1011 2 2 U
GGACATTCATCATCTCTCTTTTCTTGATTACCTATTAGCTCAACCAATAAAACCAATATT
AGTAACAATCACAAACTATCATTGTGATCCTGTGTTTCTCTCTCAATAACACACACAAAA
TGTCAATTTCTGTTTGTCAACCTCAAGATAAACTCATCACCAAAAGTTTCTCCCAAAAAG
GGGACATGGGTGGGTTGAGTTTCCTGCAATCTATGTCCGATATCACTGCCATTGTCCGAA
ACAGAGAGGACAAAGCTTATGTTTACCCGACCGAGAAGCGCTCTGTTTCTAAGCTGAATG
AGGAAGGCCTAGAGATGTGCACTGAGAGTCTTGGAGCCGAAACAGGAAGCGAGAGCGGTG
ACGAGTTGTCCTTACTTGCGCTTGAAGCAACCGCTATCTCTAGGGCTCATTCTCTTTCTC
CTAAGCCGAAACCCCAAGAAGAAGAAAAGGACACTGACTTTCACGCCAAGAAATCAACGA
TGAGTCGCAGCAAAAGTTTCCCACCACCGATAAAGTTCGTTAAAGAATCAAGGTATAATC
GTATAGTGAGGTCGTTAGGAGAAGATGGTCGTGTCGTTGTTCAAGCAATTAGGGTTTCAT
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CGGAAAGTTCTTTACTTAGGCACAATCATGAGGAAGTGGAAGAAGAAACAGAGGAGGGCA
TGGCCGAGGAGAATAGTGAGAACTTGGAGGGTAAAAATGGAAATAAAAAGATTAGCAGGC
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ATATGAGTTTCTTAATTTTATAACGTATGCTTTTGTATGATTTCTCGAGGGTACTGGGAG
TTGTTTTCCAATTCTATTTGATGTAGTGTTAAATGAGACTTTGTTATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BJ06TF U 1
AF RR4BJ06JQ C 213
BS 1 732 RR4BJ06TF
BS 733 1011 RR4BJ06JQ

RD RR4BJ06TF 732 0 0
GGACATTCATCATCTCTCTTTTCTTGATTACCTATTAGCTCAACCAATAAAACCAATATT
AGTAACAATCACAAACTATCATTGTGATCCTGTGTTTCTCTCTCAATAACACACACAAAA
TGTCAATTTCTGTTTGTCAACCTCAAGATAAACTCATCACCAAAAGTTTCTCCCAAAAAG
GGGACATGGGTGGGTTGAGTTTCCTGCAATCTATGTCCGATATCACTGCCATTGTCCGAA
ACAGAGAGGACAAAGCTTATGTTTACCCGACCGAGAAGCGCTCTGTTTCTAAGCTGAATG
AGGAAGGCCTAGAGATGTGCACTGAGAGTCTTGGAGCCGAAACAGGAAGCGAGAGCGGTG
ACGAGTTGTCCTTACTTGCGCTTGAAGCAACCGCTATCTCTAGGGCTCATTCTCTTTCTC
CTAAGCCGAAACCCCAAGAAGAAGAAAAGGACACTGACTTTCACGCCAAGAAATCAACGA
TGAGTCGCAGCAAAAGTTTCCCACCACCGATAAAGTTCGTTAAAGAATCAAGGTATAATC
GTATAGTGAGGTCGTTAGGAGAAGATGGTCGTGTCGTTGTTCAAGCAATTAGGGTTTCAT
CTCCGCCACGTAACTTTGTAGCGGAACGTGAGGAAGGAAGGCTCCGTCTCTGTTTATCGA
CGGAAAGTTCTTTACTTAGGCACAATCATGAGGAAGTGGAAGAAGAAACAGAGGAGGGCA
TGGCCGAGGAGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4BJ06JQ 799 0 0
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GAGAAGCGCTCTGTTTCTAAGCTGAATGAGGAAGGCCTAGAGATGTGCACTGAGAGTCTT
GGAGCCGAAACAGGAAGCGAGAGCGGTGACGAGTTGTCCTTACTTGCGCTTGAAGCAACC
GCTATCTCTAGGGCTCATTCTCTTTCTCCTAAGCCGAAACCCCAAGAAGAAGAAAAGGAC
ACTGACTTTCACGCCAAGAAATCAACGATGAGTCGCAGCAAAAGTTTCCCACCACCGATA
AAGTTCGTTAAAGAATCAAGGTATAATCGTATAGTGAGGTCGTTAGGAGAAGATGGTCGT
GTCGTTGTTCAAGCAATTAGGGTTTCATCTCCGCCACGTAACTTTGTAGCGGAACGTGAG
GAAGGAAGGCTCCGTCTCTGTTTATCGACGGAAAGTTCTTTACTTAGGCACAATCATGAG
GAAGTGGAAGAAGAAACAGAGGAGGGCATGGCCGAGGAGAATAGTGAGAACTTGGAGGGT
AAAAATGGAAATAAAAAGATTAGCAGGCTAAGCAGCAGATGCAAGTAGAATGGTCGTGAG
CCTCAACCAATGCTTACTTGGAAGCAGCAGCAGTTTTGGGTCGCCACTTAAAAAGACTTC
ATTAAGCTTCTAATCAAATAAGTTAAAAATATGAGTTTCTTAATTTTATAACGTATGCTT
TTGTATGATTTCTCGAGGGTACTGGGAGTTGTTTTCCAATTCTATTTGATGTAGTGTTAA
ATGAGACTTTGTTATTATG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL7172Contig1 786 2 12 U
GACCAAATAGGTATCTTCATTACATTTGCATTTGTATACATATACAAGCAACACTCATAT
GCTGGTACAAAACCAGAAGCAAGCAAAAGTCCTCTTTAAAACAACAACAAATGGTACAGC
TTACCACATGTAGAAGATGAGTCTCGTCTTCTTGATTTATTACTATATTTTACATAAGCA
GTGAAGATGAAAAAAAACGGTTTGTTTCCTTTCATCCAAAAACACACCGAACTGCACATT
TCACTCACGAGGTGCGTTCTTCTTGAACAACGCATAAGCATCGCTGTAAATAGCGATCGC
ATTGGACAACACCGCAAGAACAATCATGAAAACAGCTAAACTCGTGTCCCGGCTCGTTGC
TCTGCTATGACGATCCTTTAGAATGATAGAAGCTGGGAAGATGAAGCCGAGACAAACAGC
AGCAGTAGCCCCAGTGAACTGGAAAGCATCCCAGATGCTTGGGATGAAGTTTGCACCCAA
GAAGACTACAGAGATGAGACCTGCGGTGAGGCAACCGAACCTTACATTCGAGGAAGTCAA
CGATGGAGCAGAAGGGAACAAGAGGCCGTCGATGTTGATCCTCAACGGGTAGAAAACAAT
GGGGAACACCAGCATAAGATGAAGCGCGTAGCTGACTCTAACCGCGTCGTTAAGGACAGA
GCCTAAAGGGATGCCGAGGTCTGTGTCAAAGTTTGCAAGTACATCATCGAGAGTATCGTC
TCCAAACAAGAGGAACCCGAAGATGCTTGTCATTATGTACACTGATGAGCAGAGCATAAG
AGCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DP29JQ U 1
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BS 1 69 RR4DP29JQ
BS 70 70 RR4FZ78JQ
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RD RR4DP29JQ 695 0 0
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GGGGAACACCAGCATAAGATGAAGCGCGTAGCTGACTCTAACCGCGTCGTTAAGGACAGA
GCCTAAAGGGATGCCGAGGTCTGTGTCAAAGTTTG

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DS 

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AAAA*CGGTTTGTTTCCTTTCATCCAAAAACACACCGAACTGCACATTTCACTCACGAGG
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QA 9 782 9 782
DS 



AS 1 2

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ACAAATTTATGGAACAAGGAGGTCGTGGTGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGAC
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BQ
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AF RR4AE78TF U 1
AF RR4AE78JQ C 50
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BS 796 823 RR4AE78JQ

RD RR4AE78TF 799 0 0
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TCTTTATATTTAAATAATATTTAAAAGGAAGAATTTCAATGCGTAAGAAAATTCTAACAC
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GAAAAACACACAAACACGTATTCGAGTTAGCACATACGCAAGACACAATCCTTGTTTATT
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ACAAATTTATGGAACAAGGAGGTCGTGGTGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGAC
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GCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGT
CTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGAGAATCCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTC
ATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAGAGAAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATTAA
GCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCTGCCCCTCTTTATACAAGAAGCTTTTTTAAGA
GGTTTTTTTCTTCTATGGTTCTCAACCATCTTTATGGTCGACGCAATCGCATATTGTTGG
GATATAATTTCTGAA
CAGA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4AE78JQ 774 0 0
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TTAGTTAGGACCCATATTTGTCTCGCCGCCTATAAATTTCCCAAATCAAATCCCGTAAAA
CACATGTAGCAGAAAAACACACAAACACGTATTCGAGTTAGCACATACGCAAGACACAAT
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TGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATATTGGTGAACATATTCGGTGGAATAATGAAAT
GTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAG
TGGTGGTTCGTCTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGAGAATCCTCAAGGAAAGTG
GAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAGAGAAAGCTGTCAAAGCAT
TAGCTAATTAAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCTGCCCCTCTTTATACAAGAAG
CTTTTTTAAGAGGTTTTTTTCTTCTATGGTTCTCAACCATCTTTATGGTCGACGCAATCG
CATATTGTTGGGATATAATTTCTGAAACAGATCAAATAATGAACTGGTCTCTCT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7174Contig1 680 2 3 U
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TTTTATCAAACAGTTTTGGTAAAACAGAAATGGTGTTTTCTTTTATACAAAGCAGCTGGA
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TCATTTTAAGTGAGTATGGACCAGGAGGAGTATAACCGGGTAGAATTTGCGAGTGTGCTA
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AATGAATATGCCATCCAAAATATGAAACTTCAATCACCAGCTTTCCCTTTGAGATCACGT
TGTCTGTTTTAGAAGCAAGGCTGAAAGTGACTGGCTCGCCTCTAGGTATAGGATAAGGCG
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AAACGTTCGACATGACTGATAGATTCTCGACGAAGAAAGAAACGAATGTTTTAGAGTTTG
AGATGATGATTGGAGGACCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF36JQ U 4
AF RR4EF36TF C 1
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RD RR4EF36JQ 624 0 0
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TATCAAACAGTTTTGGTAAAACAGAAATGGTGTTTTCTTTTATACAAAGCAGCTGGAACG
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ATCCAATATCAAATGAGAATTTGATGCAGGTTAACTCCTTGTGCCCATCAAGCATCTTCA
TTTTAAGTGAGTATGGACCAGGAGGAGTATAACCGGGTAGAATTTGCGAGTGTGCTACCA
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GAATATGCCATCCAAAATATGAAACTTCAATCACCAGCTTTCCCTTTGAGATCACGTTGT
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TATCAACTCCTTGAACTTTTACTTGATACTGTTCGTTATCATCACAGTACTTGACATCGG
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CGTTCGACATGACTGATAGATTCT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4EF36TF 680 0 0
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TTTTATCAAACAGTTTTGGTAAAACAGAAATGGTGTTTTCTTTTATACAAAGCAGCTGGA
ACGATTCCATGATAAACATTCCAGCAAACAAATGTCTCTACATGTCGGCCACTGATGATC
CAAATCCAATATCAAATGAGAATTTGATGCAGGTTAACTCCTTGTGCCCATCAAGCATCT
TCATTTTAAGTGAGTATGGACCAGGAGGAGTATAACCGGGTAGAATTTGCGAGTGTGCTA
CCAAGAAATCTCCAATTGCAACGGGACAGTTGGTCTCATCACAAAGATTATGTGTCTCAG
AATGAATATGCCATCCAAAATATGAAACTTCAATCACCAGCTTTCCCTTTGAGATCACGT
TGTCTGTTTTAGAAGCAAGGCTGAAAGTGACTGGCTCGCCTCTAGGTATAGGATAAGGCG
ATATATCAACTCCTTGAACTTTTACTTGATACTGTTCGTTATCATCACAGTACTTGACAT
CGGTTGCTTTGACAAGAGCTGAGACAAACAGAACATAAGAGATAGCGAGTAAAAATCTCA
AAACGTTCGACATGACTGATAGATTCTCGACGAAGAAAGAAACGAATGTTTTAGAGTTTG
AGATGATGATTGGAGGACCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL7175Contig1 695 2 4 U
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AGATTTGAATTCTCAAACTTCCATTGTTTTGTTTCTTCGCTTGCTCGCAGTTATCGTTCT
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CTACAAAATGCTTCTTAACCTTCTCATTGAAGTGACTTTACATGTTATATACAGGCTCAT
CGATCTCTTATAATTTGCTTGGACCCTCACAAACA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX11TF U 1
AF RR4BS87TF U 3
BS 1 371 RR4FX11TF
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BS 679 695 RR4BS87TF

RD RR4FX11TF 678 0 0
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AATTCTCTAAATCATAAATGGATAAAGCTCACACTCTCTTATCAGTTCGAGATTTTCCAG
ACATTGCTGTTTCGTGTGTATGATATTGACACTCAGTTTTGAAACTCAAGGGATGAGATA
CTTAAGCTCGATGAGCAGCAGTTCCTCGGCGAGGCAACATGTACATTGTCTGAGGTGCAA
CTACAAAATGCTTCTTAACCTTCTCATTGAAGTGACTTTACATGTTATATACAGGCTCAT
CGATCTCTTATAATTTGC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4BS87TF 693 0 0
GG
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TTCCAATTTACGAGACCGCGACTTGATGTCAAAGAGCGATTAAATGGTTGTTGTGTATAC
TAAAAAAAGAAAGAGATGGAACACTTTCTGAACTCTTCCGCAGTGAAGTTGTTTTGAATT
CTCTAAATCATAAATGGATAAAGCTCACACTCTCTTATCAGTTCGAGATTTTCCAGACAT
TGCTGTTTCGTGTGTATGATATTGACACTCAGTTTTGAAACTCAAGGGATGAGATACTTA
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AAAATGCTTCTTAACCTTCTCATTGAAGTGACTTTACATGTTATATACAGGCTCATCGAT
CTCTTATAATTTGCTTGGACCCTCACAAACA

QA 3 693 3 693
DS 



AS 1 2

CO CL7176Contig1 624 2 1 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FD46JQ C 1
AF RR4FD46TF U 1
BS 1 624 RR4FD46TF

RD RR4FD46JQ 624 0 0
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AACTTAGCTGTGTATAAATAAGCTAGCGAGATCATGACCATCATCATAACTGTAATGAGT
TGCTAAATATATAATTTTGCTTTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4FD46TF 624 0 0
GGACCGCTAGATTCCATCTTTCGAAGATAAGATCAACCAAAACTATTATAGTACCGTCAA
TTATTGTCACTAAAGTGATTCGAACGTGAGAAGTTATTGTTCTTTTCATTGGTTGATACA
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AGGAAGCAAGTGTGGGCTGGAGTTCTCAGTATCTCTTCCGCCTCCTCTAACAAATAATAT
TTTCTCTTTTGGCAAAAATTGTTGGTGGTAATTGTAATGCTTTTGATCATTGTTCTTGTT
AACTTAGCTGTGTATAAATAAGCTAGCGAGATCATGACCATCATCATAACTGTAATGAGT
TGCTAAATATATAATTTTGCTTTC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL7177Contig1 890 2 2 U
AAGATAAAATCTTCAAGCACTTGGCCAACAAACAACGATGTGACTTTATAAGTGATATTG
TCAGTTCATATATACATCTTACACAAACCAACACCACTCAAATCATCCTTACAAAAGTAG
CCGGAGCAGCAAAAAAGAAAAAAAAGAAGCTCGTAAACAAAGCAAGTAACAGGTTGTCCC
AAAAGATCATTCATTCTTCGTACATCAGTTTCCAGCTTTCTTCGCTTCGTTGTTCGTCCA
GACTACATTCTCCAGAGAATTAGATAGCTTCTTATAAAACTTGTGGAATTCGAGAGTGTC
CCCTTTTGATTTCGAGACTTGAACCATATGAAGACTTGACGCTACTTGGAATATCTCTGT
TGCCACATTGAGATTCCCTTTTCTCCCAGCCTTCACATTCTCAAGCCTCATCTTGTAGTT
CTTCTTTTGCACATCAAAACCAAGAGGCTTTGCAGCTTCTTCTATCTTGTCGATGATTTC
GTTCGCGCCTCCTCTCAGAGTTATCCTTGTTTCTCTCTTAAATTCCTGTTCTGGATCAAT
CAGGTTTTCCAAGTTAAGCCCCCTTGACATTGAAATGATCTCAAATGCATTGATTGCAGC
TGGCTGCTCTTCCTTTTTCTCGGTTACATGATGTTCCTCGGAGTCCTTGAAAACAGCATC
AACATCGTCCATGTTTGAATCATCGTTCTCCTCAAACACTGGAGGCTTGTAATCTTTCTT
GAACCATTCATCTTCGAAGACCTCTTGTAGTGTTACACGAGTCATGGGGTTAGGATCTAA
GATTCGAGTGATCAGTTTCATGGCGCCGAGTGATAGCCATGGAGGACAGTCGATTCACCA
GATGAAATTTTTTATAAAGATCATAGATAGATCATCAAAGCAGTACTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DX53JQ U 1
AF RR4DU64JQ U 7
BS 1 779 RR4DX53JQ
BS 780 890 RR4DU64JQ

RD RR4DX53JQ 779 0 0
AAGATAAAATCTTCAAGCACTTGGCCAACAAACAACGATGTGACTTTATAAGTGATATTG
TCAGTTCATATATACATCTTACACAAACCAACACCACTCAAATCATCCTTACAAAAGTAG
CCGGAGCAGCAAAAAAGAAAAAAAAGAAGCTCGTAAACAAAGCAAGTAACAGGTTGTCCC
AAAAGATCATTCATTCTTCGTACATCAGTTTCCAGCTTTCTTCGCTTCGTTGTTCGTCCA
GACTACATTCTCCAGAGAATTAGATAGCTTCTTATAAAACTTGTGGAATTCGAGAGTGTC
CCCTTTTGATTTCGAGACTTGAACCATATGAAGACTTGACGCTACTTGGAATATCTCTGT
TGCCACATTGAGATTCCCTTTTCTCCCAGCCTTCACATTCTCAAGCCTCATCTTGTAGTT
CTTCTTTTGCACATCAAAACCAAGAGGCTTTGCAGCTTCTTCTATCTTGTCGATGATTTC
GTTCGCGCCTCCTCTCAGAGTTATCCTTGTTTCTCTCTTAAATTCCTGTTCTGGATCAAT
CAGGTTTTCCAAGTTAAGCCCCCTTGACATTGAAATGATCTCAAATGCATTGATTGCAGC
TGGCTGCTCTTCCTTTTTCTCGGTTACATGATGTTCCTCGGAGTCCTTGAAAACAGCATC
AACATCGTCCATGTTTGAATCATCGTTCTCCTCAAACACTGGAGGCTTGTAATCTTTCTT
GAACCATTCATCTTCGAAGACCTCTTGTAGTGTTACACGAGTCATGGGGTTAGGATCTA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4DU64JQ 884 0 0
AAATCTTCAAGCACTTGGCCAACAAACAACGATGTGACTTTATAAGTGATATTGTCAGTT
CATATATACATCTTACACAAACCAACACCACTCAAATCATCCTTACAAAAGTAGCCGGAG
CAGCAAAAAAGAAAAAAAAGAAGCTCGTAAACAAAGCAAGTAACAGGTTGTCCCAAAAGA
TCATTCATTCTTCGTACATCAGTTTCCAGCTTTCTTCGCTTCGTTGTTCGTCCAGACTAC
ATTCTCCAGAGAATTAGATAGCTTCTTATAAAACTTGTGGAATTCGAGAGTGTCCCCTTT
TGATTTCGAGACTTGAACCATATGAAGACTTGACGCTACTTGGAATATCTCTGTTGCCAC
ATTGAGATTCCCTTTTCTCCCAGCCTTCACATTCTCAAGCCTCATCTTGTAGTTCTTCTT
TTGCACATCAAAACCAAGAGGCTTTGCAGCTTCTTCTATCTTGTCGATGATTTCGTTCGC
GCCTCCTCTCAGAGTTATCCTTGTTTCTCTCTTAAATTCCTGTTCTGGATCAATCAGGTT
TTCCAAGTTAAGCCCCCTTGACATTGAAATGATCTCAAATGCATTGATTGCAGCTGGCTG
CTCTTCCTTTTTCTCGGTTACATGATGTTCCTCGGAGTCCTTGAAAACAGCATCAACATC
GTCCATGTTTGAATCATCGTTCTCCTCAAACACTGGAGGCTTGTAATCTTTCTTGAACCA
TTCATCTTCGAAGACCTCTTGTAGTGTTACACGAGTCATGGGGTTAGGATCTAAGATTCG
AGTGATCAGTTTCATGGCGCCGAGTGATAGCCATGGAGGACAGTCGATTCACCAGATGAA
ATTTTTTATAAAGATCATAGATAGATCATCAAAGCAGTACTGCA

QA 1 884 1 884
DS 



AS 1 2

CO CL7178Contig1 660 2 2 U
GAGGACCTTTCTGGTCTTTGGTCAGTTGATCTGAAGGGTAATGTCAACGGTGCTGTTGAG
ACTTGTGGGGAAAGCTTTCATCGCTTCGACCGTTACCTGAACTTCTCAAATCCACTCATC
TCCAAGAATTTTGACCCTCGAGCTTGTGGATGGGCGTATGGTATGAATGTTTTTGATCTG
GAGGAGTGGAAGAAGCAAAACATTACAGAGGTTTACCATCGATGGCAGAACCTGAATCAA
GACCGAGATTTGTGGAAGCTAGGGACGCTGCCGCCTGGTCTCATCACATTTTGGAAACGA
ACATACCCATTAGACCGGAAATGGCACGTGCTGGGTCTTGGATACAACCCAAGTGTGAAC
CAGAGGGATATTGAGAGGGCAGCCGTCGTGCACTATAATGGCAACCTCAAACCATGGCTA
GAGATTGGGATCCCAAAATATCGAGGTCTCTGGTCAAAGCACGTCGACTACGAGCACGTT
TACCTCAGAGATTGCAACATCAATCCTTAGAACTAGAGTCTCTCTATTGAAGAGCACTGT
AATATGTTCGGAATCTTTATTCCTTTTGTTATTTTTTGATATCTTCATTACATGAAAACA
AAATTGTAGATGATACGGTAAACTACATTTGTTCTGATGTTATTATTGAAATATATCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FK93JQ C 1
AF RR4FK93TF U 1
BS 1 616 RR4FK93TF
BS 617 660 RR4FK93JQ

RD RR4FK93JQ 660 0 0
GAGGACCTTTCTGGTCTTTGGTCAGTTGATCTGAAGGGTAATGTCAACGGTGCTGTTGAG
ACTTGTGGGGAAAGCTTTCATCGCTTCGACCGTTACCTGAACTTCTCAAATCCACTCATC
TCCAAGAATTTTGACCCTCGAGCTTGTGGATGGGCGTATGGTATGAATGTTTTTGATCTG
GAGGAGTGGAAGAAGCAAAACATTACAGAGGTTTACCATCGATGGCAGAACCTGAATCAA
GACCGAGATTTGTGGAAGCTAGGGACGCTGCCGCCTGGTCTCATCACATTTTGGAAACGA
ACATACCCATTAGACCGGAAATGGCACGTGCTGGGTCTTGGATACAACCCAAGTGTGAAC
CAGAGGGATATTGAGAGGGCAGCCGTCGTGCACTATAATGGCAACCTCAAACCATGGCTA
GAGATTGGGATCCCAAAATATCGAGGTCTCTGGTCAAAGCACGTCGACTACGAGCACGTT
TACCTCAGAGATTGCAACATCAATCCTTAGAACTAGAGTCTCTCTATTGAAGAGCACTGT
AATATGTTCGGAATCTTTATTCCTTTTGTTATTTTTTGATATCTTCATTACATGAAAACA
AAATTGTAGATGATACGGTAAACTACATTTGTTCTGATGTTATTATTGAAATATATCAGC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4FK93TF 616 0 0
GAGGACCTTTCTGGTCTTTGGTCAGTTGATCTGAAGGGTAATGTCAACGGTGCTGTTGAG
ACTTGTGGGGAAAGCTTTCATCGCTTCGACCGTTACCTGAACTTCTCAAATCCACTCATC
TCCAAGAATTTTGACCCTCGAGCTTGTGGATGGGCGTATGGTATGAATGTTTTTGATCTG
GAGGAGTGGAAGAAGCAAAACATTACAGAGGTTTACCATCGATGGCAGAACCTGAATCAA
GACCGAGATTTGTGGAAGCTAGGGACGCTGCCGCCTGGTCTCATCACATTTTGGAAACGA
ACATACCCATTAGACCGGAAATGGCACGTGCTGGGTCTTGGATACAACCCAAGTGTGAAC
CAGAGGGATATTGAGAGGGCAGCCGTCGTGCACTATAATGGCAACCTCAAACCATGGCTA
GAGATTGGGATCCCAAAATATCGAGGTCTCTGGTCAAAGCACGTCGACTACGAGCACGTT
TACCTCAGAGATTGCAACATCAATCCTTAGAACTAGAGTCTCTCTATTGAAGAGCACTGT
AATATGTTCGGAATCTTTATTCCTTTTGTTATTTTTTGATATCTTCATTACATGAAAACA
AAATTGTAGATGATAC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL7179Contig1 447 2 1 U
GGGGAACTCCTATTCTTCCTGTTATTTTAAAATACCCCTACGAGCGTTTCAGCGTGGCAT
GGGATACAATATCCGGTCCACGTCACGTTCTCTTCCTTCTCTGTCAATTTGTAAACCACT
TGGAGGTGATACGGTTACCTGTATACTACCCGTCACAAGAAGAGAAGGATAATCCAAAAC
TCTATGCTAGCAATGTCCGGAAACTAATGGCCAGCGAGGGTAACATGATACTGTCGGATT
TGGGACTTGGCGACAAAAGGATATATCACGCGACCCTCAATGGTAATCTTAGTCAACTCC
GTGTTTTCCATCAGAAAGAAGAATGATAAATTTTTACTGGCCTTGACAGTATCTGTATTT
GTAGTAAGTCATTTACCAAAGAATAATAAAACCATGACCATGACTGAATAATGGGATCTG
TGAGAATAATAAAACAAAAGTTTGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F628JQ C 1
AF RR4F628TF U 1
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GGGATACAATATCCGGTCCACGTCACGTTCTTTTCCTTCTCTGTCAATTTGTAAACCACT
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TCTATGCTAGCAATGTCCGGAAACTAATGGCCAGCGAGGGTAACATGATACTGTCGGATT
TGGGACTTGGCGACAAAAGGATATATCACGCGACCCTCAATGGTAATCTTAGTCAACTCC
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TGAGAATAATAAAACAAAAGTTTGGTT

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DS 

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GGGATACAATATCCGGTCCACGTCACGTTCTCTTCCTTCTCTGTCAATTTGTAAACCACT
TGGAGGTGATACGGTTACCTGTATACTACCCGTCACAAGAAGAGAAGGATAATCCAAAAC
TCTATGCTAGCAATGTCCGGAAACTAATGGCCAGCGAGGGTAACATGATACTGTCGGATT
TGGGACTTGGCGACAAAAGGATATATCACGCGACCCTCAATGGTAATCTTAGTCAACTCC
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GTAGTAAGTCATTTACCAAAGAATAATAAAACCATGACCATGACTGAATAATGGGATCTG
TGAGAATAATAAAACAAAAGTTTGGTT

QA 1 447 1 447
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4B231TF U 1
AF RR4B231JQ C 22
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BS 639 640 RR4B231JQ

RD RR4B231TF 638 0 0
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AAGAAACAACAAAGTGAAGTTTGATCCTGACCGGATCGTCATGAGCGGCGGCGCAACCGG
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DS 

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GTTTTCGTTTGATTTCAGG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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TCAAATCAATAGTAAAAGTTTTAAGACTTTCAAACTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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AF RR4H914TF U 1
AF RR4H914JQB C 119
BS 1 623 RR4H914TF
BS 624 878 RR4H914JQB

RD RR4H914TF 623 0 0
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AGTGAAGAAACATCTATCTAGAA

QA 1 623 1 623
DS 

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AAGCTACTTAGTAGTAGTGATAATATTAGCTTAGCGAGGAAGAGTTTTGGCTGTTTTGAC
GTTACCAAAAGTACCCCACCTGGCTCTACTAGGTATCTTCTGGGGACCGACGCGGTTACT
TTATCCGGTTCTTCTACGGGTAAGGATGTGTTTGTAACGGAGGAAGGTGAACCTTCTGAG
GCAAGAAAAAGCTCTGGTGCTGCAGTGGAAGAGAAGAAGAAGAAGACTTCTTCTGGTTCA
GACCAGCAGGTGGTTGTTCTGAGAGTGTCTCTTCACTGTCAGTGCAGAGGCTGTGAAGGC
AAAGTGAAGAAACATCTATCTAGAATGCAAGGTGTGACATCCTTCAACATAGATTTGGCC
TCAAAGAAGGTGACTGTGACTGGAGACATCACTCCCGTACAAGTATTGGGTTGCCTCTCA
AAGGTCAAAAATGCCCAGTTCTGGACACCACCACCTCCATCATCACTCTCAAGTACCAAT
CCGGAGAACTAAATAAACACATTTTTGTGTATTTGTATTCTCTTTCTCTCATGTGTTATG
AATCAAATCAATAGTAAAAGTTTTAAGACTTTCAAACTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7183Contig1 623 2 1 U
GGACACCCAACCAACCAACCTTGATCTCTCTCTCTCAAAACACAAATCCTTGGCAAAGAA
AATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTT
CGACAAGGACGGAGATGGTTGTATCACAACGAAAGAGCTAGGCACAGTGATGAGGTCACT
CGGACAGAACCCGACAGAGGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGG
GAACGGGACCATAGACTTCCCCGAGTTCCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACAC
GGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTT
CATCTCCGCCGCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATGA
AGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAGGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAATTATGA
AGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAACCATTTTCCTAATCTCTCTGTTT
TTTTTTGATTTTCAAAAGAAAAAGTCTTTATGCTACTTTTTTTTTAATTGAATTTGAACA
ATTGTGATTTTGTTTTCCTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BJ40JQ C 1
AF RR4BJ40TF U 1
BS 1 623 RR4BJ40TF

RD RR4BJ40JQ 623 0 0
GGACACCCAACCAACCAACCTTGATCTCTCTCTCTCAAAACACAAATCCTTGGCAAAGAA
AATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTT
CGACAAGGACGGAGATGGTTGTATCACAACGAAAGAGCTAGGCACAGTGATGAGGTCACT
CGGACAGAACCCGACAGAGGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTGGATGCCGACGG
GAACGGGACCATAGACTTCCCCGAGTTCCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACAC
GGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTT
CATCTCCGCCGCGGAGGTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATGA
AGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAGGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAATTATGA
AGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAACCATTTTCCTAATCTCTCTGTTT
TTTTTTGATTTTCAAAAGAAAAAGTCTTTATGCTACTTTTTTTTTAATTGAATTTGAACA
ATTGTGATTTTGTTTTCCTTTTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4BJ40TF 623 0 0
GGACACCCAACCAACCAACCTTGATCTCTCTCTCTCAAAACACAAATCCTTGGCAAAGAA
AATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTT
CGACAAGGACGGAGATGGTTGTATCACAACGAAAGAGCTAGGCACAGTGATGAGGTCACT
CGGACAGAACCCGACAGAGGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGG
GAACGGGACCATAGACTTCCCCGAGTTCCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACAC
GGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTT
CATCTCCGCCGCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATGA
AGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAGGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAATTATGA
AGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAACCATTTTCCTAATCTCTCTGTTT
TTTTTTGATTTTCAAAAGAAAAAGTCTTTATGCTACTTTTTTTTTAATTGAATTTGAACA
ATTGTGATTTTGTTTTCCTTTTC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7184Contig1 836 2 9 U
ACCACATCAAGCATAAACCGTTGCAAGAAGAATTCAGAACCCCATATTGAAAACAGAGTA
AAATATTCAACACTAAAAGGAAATACAATCATCACATACCAGAATTATTGTCAAAATACA
TTAAGAAAAACAGAGAGCAGCAAAAGCAAGCAAAAGAGTTTAGAATATAAACTCCGTTGG
TTTATTGTCTTTAGCTGAAGAAACACAAACACTGAGCAGGCTTTTATTGGAAACAGGGTT
CACTAACGGTTCACTCACTCTTCTTCCTCTGCCTCTTCAAGCCAATTCACAAATGGCTCA
AGGCTCTTGACAAAGGTTTGCCTGCCCTTCGGGTTAGTTCCTTTACGGAACCAGTGGAGG
ATGGTATCCTCAGCGAGGACATCCAGATCATAGAGCGACCTCACTACTTCTGGAAATACT
TTCATAAGCTTAGCGTCCTCATAGCATTGCATTTGGACCTTGTAAATCAGCTCCAGCTCT
AGCTTTCCACTGCTGCAGACTGTGTTCAGAAGTGGAGCCCATGCTTTCACCTGGCGCAGA
ACAGAATTAGCATTTTGCTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTAAACCA
TCCCAAACAACACGCACAACCTCGATCTCTGGGAGCTTAGCATCTCTGACAAGCTGCTTC
ACCGTTTCAATGACTTCATCTACACTACTTTCCTCAGTGACCTTGCTTGTAAGAACGGTT
TTGATTTCCTTCAGCTTCACCTCAAACATTTTCTTTGAATGGTACTCTACTAGATCAGTC
AACCCCTCTTTCGTGAAATGCTCTGAGAAACTTTCAGCAGTCCGCCTTACAGTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG38JQ U 1
AF RR4BX12JQ U 17
BS 1 130 RR4CG38JQ
BS 131 131 RR4BX12JQ
BS 132 244 RR4CG38JQ
BS 245 245 RR4BX12JQ
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BS 610 734 RR4CG38JQ
BS 735 735 RR4BX12JQ
BS 736 836 RR4CG38JQ

RD RR4CG38JQ 836 0 0
ACCACATCAAGCATAAACCGTTGCAAGAAGAATTCAGAACCCCATATTGAAAACAGAGTA
AAATATTCAACACTAAAAGGAAATACAATCATCACATACCAGAATTATTGTCAAAATACA
TTAAGAAAAAGAGAGAGCAGCAAAAGCAAGCAAAAGAGTTTAGAATATAAACTCCGTTGG
TTTATTGTCTTTAGCTGAAGAAACACAAACACTGAGCAGGCTTTTATTGGAAACAGGGTT
CACTCACGGTTCACTCACTCTTCTTCCTCTGCCTCTTCAAGCCAATTCACAAATGGCTCA
AGGCTCTTGACAAAGGTTTGCCTGCCCTTCGGGTTAGTTCCTTTACGGAACCAGTGGAGG
ATGGTATCCTCAGCGAGGACATCCAGATCATAGAGCGACCTCACTACTTCTGGAAATACT
TTCATAAGCTTAGCGTCCTCATAGCATTGCATTTGGACCTTGTAAATCAGCTCCAGCTCT
AGCTTTCCACTGCTGCAGACTGTGTTCAGAAGTGGAGCCCATGCTTTCACCTGGCGCAGA
ACAGAATTAGCATTTTGCTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTAAACCA
TCCCAAACGACACGCACAACCTCGATCTCTGGGAGCTTAGCATCTCTGACAAGCTGCTTC
ACCGTTTCAATGACTTCATCTACACTACTTTCCTCAGTGACCTTGCTTGTAAGAACGGTT
TTGATTTCCTTCAGTTTCACCTCAAACATTTTCTTTGAATGGTACTCTACTAGATCAGTC
AACCCCTCTTTCGTGAAATGCTCTGAGAAACTTTCAGCAGTCCGCCTTACAGTGGT

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR4BX12JQ 806 0 0
G
CCGTTGCGAGAAGAATTCAGAACCCCATATTGAAAACAGAGTAAAATATTCAACACTAAA
AGGAAATACAATCATCACATACCAGAATTATTGTCAAAATACATTAAGAAAAACAGAGAG
CAGCAAAAGCAAGCAAAAGAGTTTAGAATATAAACTCCGTTGGTTTATTGTCTTTAGCTG
AAGAAACACAAACACTGAGCAGGCTTTTATTGGAAACAGGGTTCACTAACGGTTCACTCA
CTCTTCTTCCTCTGCCTCTTCAAGCCAATTCACAAATGGCTCAAGGCTCTTGACAAAGGT
TTGCCTGCCCTTCGGGTTAGTTCCTTTACGGAACCAGTGGAGGATGGTATCCTCAGCGAG
GACATCCAGATCATAGAGCGACCTCACTACTTCTGGAAATACTTTCATAAGCTTGGCGTC
CTCATAGCATTGCATTTGGACCTTGTACATCAGCTCCAGCTCTAGCTTTCCACTGCTGCA
GACTGTGTTCAGAAGTGGAGCCCATGCTTTCACCTGGCGCAGAACAGAATTAGCATTTTG
CTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTAAACCATCCCAAACAACACGCAC
AACCTCGATCTCTGGGAGTTTAGCATCTCTGACAAGCTGCTTCACCGTTTCAATGACTTC
ATCTACACTACTTTCCTCAGTGACCTTGCTTGTAAGAACGGTTTTGATTTCCTTCAGCTT
CACCTCAAACATTTTCTTTGAATGGTACTCTACTAGATCAGTCAACCCCTCTTTCGTGAA
ATGCTCTGAGAAACTTTCAGCAGTC

QA 2 806 2 806
DS 



AS 1 2

CO CL7185Contig1 800 2 2 U
GGCTTCTCTTCCAACCTTCCTGATCATCCATCATCTCTTCCTCTGGATCGGCTATACTTC
TCCTTTTCATACTCTGCCTCTGAATGTTCTGATTCTTGATGACGCCTTCCACTTCTCTCT
GGCGTCTTAGACCGACCATCTTCCCTCACTGTCTCTGAACGACTATCTCTATCTCTATCA
TCTTCTTTAGTGCCACGTGTCTTACCCTTCTCCTCTTTGCTACTTGATTTCAAACCTCTA
TCTGACTTTTCTCCGACAGAATCAGAAACCTTACTGCTTTTGCTGTGATCCCCTCTTTCA
CTGTCGGTAGCAGCTTCATCCCATCTCCTCCTCTTGCTCGAATCAGAAGAAGACCCATGA
GTCCGATCCCGACCACCAATCTAGTTCTGTCTCACCTCAGGATAGACGATACGAGAAAGA
GAGGTCATACTCTCTCGCTCAACACCTAAAATGGTTCGCAGTGGAAGTCATGGGAGGGTG
AGAAGAGCCACAGCAGGAGCCGTAGCCTGAGAAGAAGTGTAAGCCCGAGAAGAAACAGGA
GCTACACGCCTGAAATGGAGACTGTTCTCCCAGCCAGTGATTTATTTCACAAAACCCATG
TATCTCTCTACACACCAGTTCTCTACAGTCTTGTTTGTTAGCTAGCTAGCTCTACGTTAT
CAGACACTTGTTTGCCACTATCCACTAGGTTGAATTCTCTTTACTTTTTAAGACATGAAC
TGAAGGTTATTGTTTTATGTTTGCCTAATGAATGAACTTAAAAGACATGACAATGAGGTT
GTATGTGCTTTTTTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F194TF U 1
AF RR4F194JQ C 67
BS 1 723 RR4F194TF
BS 724 800 RR4F194JQ

RD RR4F194TF 723 0 0
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TCCTTTTCATACTCTGCCTCTGAATGTTCTGATTCTTGATGACGCCTTCCACTTCTCTCT
GGCGTCTTAGACCGACCATCTTCCCTCACTGTCTCTGAACGACTATCTCTATCTCTATCA
TCTTCTTTAGTGCCACGTGTCTTACCCTTCTCCTCTTTGCTACTTGATTTCAAACCTCTA
TCTGACTTTTCTCCGACAGAATCAGAAACCTTACTGCTTTTGCTGTGATCCCCTCTTTCA
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GTCCGATCCCGACCACCAATCTAGTTCTGTCTCACCTCAGGATAGACGATACGAGAAAGA
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GCTACACGCCTGAAATGGAGACTGTTCTCCCAGCCAGTGATTTATTTCACAAAACCCATG
TATCTCTCTACACACCAGTTCTCTACAGTCTTGTTTGTTAGCTAGCTAGCTCTACGTTAT
CAGACACTTGTTTGCCACTATCCACTAGGTTGAATTCTCTTTACTTTTTAAGACATGAAC
TGA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4F194JQ 734 0 0
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TTAGACCGACCATCTTCCCTCACTGTCTCTGAACGACTATCTCTATCTCTATCATCTTCT
TTAGTGCCACGTGTCTTACCCTTCTCCTCTTTGCTACTTGATTTCAAACCTCTATCTGAC
TTTTCTCCGACAGAATCAGAAACCTTACTGCTTTTGCTGTGATCCCCTCTTTCACTGTCG
GTAGCAGCTTCATCCCATCTCCTCCTCTTGCTCGAATCAGAAGAAGACCCATGAGTCCGA
TCCCGACCACCAATCTAGTTCTGTCTCACCTCAGGATAGACGATACGAGAAAGAGAGGTC
ATACTCTCTCGCTCAACACCTAAAATGGTTCGCAGTGGAAGTCATGGGAGGGTGAGAAGA
GCCACAGCAGGAGCCGTAGCCTGAGAAGAAGTGTAAGCCCGAGAAGAAACAGGAGCTACA
CGCCTGAAATGGAGACTGTTCTCCCAGCCAGTGATTTATTTCACAAAACCCATGTATCTC
TCTACACACCAGTTCTCTACAGTCTTGTTTGTTAGCTAGCTAGCTCTACGTTATCAGACA
CTTGTTTGCCACTATCCACTAGGTTGAATTCTCTTTACTTTTTAAGACATGAACTGAAGG
TTATTGTTTTATGTTTGCCTAATGAATGAACTTAAAAGACATGACAATGAGGTTGTATGT
GCTTTTTTTTTGTC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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GTCAGGAGGAGAGGTACAAGTAGCTCTTAGTGATATCCTTCAGAGATCAATGGGACCTGT
TCTCCTCCACTCTTGCTCCTGATAATTTTATCTCTCTAAGGTTTGTATACTCTTCTTGTT
CATTTTCTATTACCATCCATCCCCCTTCGGTTTTCGATTTGCATCTCTCTCTTAATTTTT
TTCTATTACATTTGCTACTGCTTTTTTCTTTCTTTCTTTCAATGTTTGGCAGCAATGGGC
AGAGATTAGCGTTCACGAGTTGTGGTCGGATATGTTGTTTTTCGTTTTATGTAAATTTGT
AATTTTAGACGGCCTATGATTATGACACATTGCAAAATAAGTCTTAAAGC


BQ
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AF RR4H872JQB C 1
AF RR4H872TF U 169
BS 1 168 RR4H872JQB
BS 169 470 RR4H872TF

RD RR4H872JQB 470 0 0
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GTCAGGAGGAGAGGTACAAGTAGCTCTTAGTGATATCCTTCAGAGATCAATGGGACCTGT
TCTCCTCCACTCTTGCTCCTGATAATTTTATCTCTCTAAGGTTTGTATACTCTTCTTGTT
CATTTTCTATTACCATCCATCCCCCTTCGGTTTTCGATTTGCATCTCTCTCTTAATTTTT
TTCTATTACATTTGCTACTGCTTTTTTCTTTCTTTCTTTCAATGTTTGGCAGCAATGGGC
AGAGATTAGCGTTCACGAGTTGTGGTCGGATATGTTGTTTTTCGTTTTATGTAAATTTGT
AATTTTAGACGGCCTATGATTATGACACATTGCAAAATAAGTCTTAAAGC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4H872TF 302 0 0
AATGGGACCTGTTCTCCTCCACTCTTGCTCCTGATAATTTTATCTCTCTAAGGTTTGTAT
ACTCTTCTTGTTCATTTTCTATTACCATCCATCCCCCTTCGGTTTTCGATTTGCATCTCT
CTCTTAATTTTTTTCTATTACATTTGCTACTGCTTTTTTCTTTCTTTCTTTCAATGTTTG
GCAGCAATGGGCAGAGATTAGCGTTCACGAGTTGTGGTCGGATATGTTGTTTTTCGTTTT
ATGTAAATTTGTAATTTTAGACGGCCTATGATTATGACACATTGCAAAATAAGTCTTAAA
GC

QA 1 302 1 302
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7188Contig1 1155 2 4 U
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AGTCCGAACAGCCCTAGAAGAGTACGGATGTTTCGAGGCCTTGTTCAACGGAGCTTCTGT
GGAGCTACGGAAGGCACTGTTCGAGGCATCGGAAGAATTTTTCGATTTACCTCTGGAAAC
CAAACTGAGAATAAAGTCTGACGAACTCTACAAAGGATATGCTGGTCAGCATCCCACGCT
GCCTTTATACGAGGCTATTGGCTGTGACGCAGATAATCCTCAAACTGTCGACGAATTAAC
CTACAAGCTTTGGCCTCAAGGCAACATCACCTTCAGCAATAACGTTCAGTCATTCGCGGT
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GAAATACCTCGTCGAGGAGAACCTTAACTCAGCGAGGAAACGCTTTGGTCTCATCAAATA
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TGGTGAAGAGTGGATCAAAGTTAAGCCATCTCAAGACTCTTCTTTCCTCGTAATGGCCGG
AGCTTCACTTCATGTACTACTGAATGGTAGGGTGTTTCCTCCGTATCACCGTGTGGTAAT
AACCGGAAAGAAAGATCGGCACGTGGCTGGACTGTTCGTGCTTCCCAAAGAAGGACTGAT
GGTAAATGCACTCGATGAGATGGTTGATGATGAACATCCTCGTCTTTATAAGCCTTTTAA
TTATGATGCTTACTTTAAGTTCAACATCACCAATACGTCCGATACCCATAAGAGGGATTT
ATCTGCTCTCAAGGCTTACTGCTCTCTCTAAATAAGATTGATTCCCTGCAAATAAATAAA
GCTACGTATATATGTATCATTTGATCACTAGCTAGCTGTGCTTGTTTCCTATGATCTTGT
GGTGGTTTGTTATTATTTTAAGTTTGTCTTGTTGGCTCTTGAGCTTGTAATAAACCCTTG
ACTTACTGAAACTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI77TF U 1
AF RR4EI77JQ C 529
BS 1 656 RR4EI77TF
BS 657 657 RR4EI77JQ
BS 658 675 RR4EI77TF
BS 676 1155 RR4EI77JQ

RD RR4EI77TF 675 0 0
GGAAACATAACTAATGACAATAAGTTCGAATACCCAATCTCACCTAACCCTTCCGGTCAT
CGACTTCTCGATTCCAAACCTCAAACCGGAAACTCAAGAGTGGGAGTCGGTGAGAGCCCA
AGTCCGAACAGCCCTAGAAGAGTACGGATGTTTCGAGGCCTTGTTCAACGGAGCTTCTGT
GGAGCTACGGAAGGCACTGTTCGAGGCATCGGAAGAATTTTTCGATTTACCTCTGGAAAC
CAAACTGAGAATAAAGTCTGACGAACTCTACAAAGGATATGCTGGTCAGCATCCCACGCT
GCCTTTATACGAGGCTATTGGCTGTGACGCAGATAATCCTCAAACTGTCGACGAATTAAC
CTACAAGCTTTGGCCTCAAGGCAACATCACCTTCAGCAATAACGTTCAGTCATTCGCGGT
GAATTTAATAGCATTAGACATGAAGGTGAGGACGATGATCATGGAGAGCTTCGGTCTCCA
GAAATACCTCGTCGAGGAGAACCTTAACTCAGCGAGGAAACGCTTTGGTCTCATCAAATA
TAGAGGGCTTGACGAGAACGAAGAGAAGCGGCCAGGCCTCAACCCTCATATCGATAGCCA
TTTCCTTACAATACTTTGTCAAAATGACGTAGTAGATGGCGTGGAGATCAAAGCCA*GGA
TGGTGAAGAGTGGAT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EI77JQ 627 0 0
TCTCATCAAATATAGAGGGCTTGACGAGAACGAAGAGAAGCGGCCAGGCCTCAACCCTCA
TATCGATAGCCATTTCCTTACAATACTTTGTCAAAATGACGTAGTAGATGGCGTGGAGAT
CAAAGCCAAGGATGGTGAAGAGTGGATCAAAGTTAAGCCATCTCAAGACTCTTCTTTCCT
CGTAATGGCCGGAGCTTCACTTCATGTACTACTGAATGGTAGGGTGTTTCCTCCGTATCA
CCGTGTGGTAATAACCGGAAAGAAAGATCGGCACGTGGCTGGACTGTTCGTGCTTCCCAA
AGAAGGACTGATGGTAAATGCACTCGATGAGATGGTTGATGATGAACATCCTCGTCTTTA
TAAGCCTTTTAATTATGATGCTTACTTTAAGTTCAACATCACCAATACGTCCGATACCCA
TAAGAGGGATTTATCTGCTCTCAAGGCTTACTGCTCTCTCTAAATAAGATTGATTCCCTG
CAAATAAATAAAGCTACGTATATATGTATCATTTGATCACTAGCTAGCTGTGCTTGTTTC
CTATGATCTTGTGGTGGTTTGTTATTATTTTAAGTTTGTCTTGTTGGCTCTTGAGCTTGT
AATAAACCCTTGACTTACTGAAACTCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7189Contig1 789 2 2 U
GGAACGTCGCCGGAACCAAAATGAAGCTGAACGAAAGGAAAGTGAGACTCACGGAGCTGA
TTCTGAGGTGTTTAGTGTGTGCCCTCGCTCTCGTCGCTGCGGTTCTCATTGTTACGGACA
CTCAAGTTAGAGAGATCTTCACCATCCAGAAGAAGGCAAAGTACACCGACATGAAGGCGC
TCGTGTTCTTGGTGGTCGTCAATGGTATAGCCGCGGCTTATCCTTTGGTGCATGCGGTTC
GTTGCGTGGTGGGTATGATGAAAGGAAGCGTTTTGTTTAGTAAGCCTCTGGCTTGGGCTA
TTTTCTCTGGAGATCAGGCGATAGCGTACTTGACTGTGGCGGGCCTTGCAGCAGCGGCGC
AGTCTGCAGCCTTTGCGAAGCTAGGTCAGCCAGAGCTCCAGTGGATGAAGATATGCACAA
TGTATGGGAAGTTCTGTAACCAAGTTGGTGAAGGAATTGGGGTCGCCTTGCTTGCTAGCA
TTGGAATGGTTTTGATCTCTTGCGTTTCAGCTTTGGGTCTCTTTCGTTTGTATGGCGGTA
ACAAAGCCCTGCAAAGCTCACGGTGGTGAAGGCAAGGGCGAAGGCTCATAGGTCTTGGGA
TTACACTTATTTGTGGAAATTGTGTGAAATTATTGTGGTGTGTTCTCATCTCACTTCCTC
TCAGTGTGTATACTGTCTATCACTATTGTCATGATCTCATGCACAAATAAACATCAAACT
GTAGTTTAATAACGAGCCTATAACCATGTTTAGTTGTTCAACAACACAATGAATGACATT
GTTTAGCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG04TF U 1
AF RR4CG04JQ C 1
BS 1 571 RR4CG04TF
BS 572 789 RR4CG04JQ

RD RR4CG04TF 578 0 0
GGAACGTCGCCGGAACCAAAATGAAGCTGAACGAAAGGAAAGTGAGACTCACGGAGCTGA
TTCTGAGGTGTTTAGTGTGTGCCCTCGCTCTCGTCGCTGCGGTTCTCATTGTTACGGACA
CTCAAGTTAGAGAGATCTTCACCATCCAGAAGAAGGCAAAGTACACCGACATGAAGGCGC
TCGTGTTCTTGGTGGTCGTCAATGGTATAGCCGCGGCTTATCCTTTGGTGCATGCGGTTC
GTTGCGTGGTGGGTATGATGAAAGGAAGCGTTTTGTTTAGTAAGCCTCTGGCTTGGGCTA
TTTTCTCTGGAGATCAGGCGATAGCGTACTTGACTGTGGCGGGCCTTGCAGCAGCGGCGC
AGTCTGCAGCCTTTGCGAAGCTAGGTCAGCCAGAGCTCCAGTGGATGAAGATATGCACAA
TGTATGGGAAGTTCTGTAACCAAGTTGGTGAAGGAATTGGGGTCGCCTTGCTTGCTAGCA
TTGGAATGGTTTTGATCTCTTGCGTTTCAGCTTTGGGTCTCTTTCGTTTGTATGGCGGTA
ACAAAGCCCTGCAAAGCTCACGGTGGTGAAG
CAAGGGC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4CG04JQ 789 0 0
GGAACGTCGC*GGAACCAAAATGAAGCTGAACGAAAGGAAAGTGAGACTCACGGAGCTGA
TTCTGAGGTGTTTAGTGTGTGCCCTCGCTCTCGTCGCTGCGGTTCTCATTGTTACGGACA
CTCAAGTTAGAGAGATCTTCACCATCCAGAAGAAGGCAAAGTACACCGACATGAAGGCGC
TCGTGTTCTTGGTGGTCGTCAATGGTATAGCCGCGGCTTATCCTTTGGTGCATGCGGTTC
GTTGCGTGGTGGGTATGATGAAAGGAAGCGTTTTGTTTAGTAAGCCTCTGGCTTGGGCTA
TTTTCTCTGGAGATCAGGCGATAGCGTACTTGACTGTGGCGGGCCTTGCAGCAGCGGCGC
AGTCTGCAGCCTTTGCGAAGCTAGGTCAGCCAGAGCTCCAGTGGATGAAGATATGCACAA
TGTATGGGAAGTTCTGTAACCAAGTTGGTGAAGGAATTGGGGTCGCCTTGCTTGCTAGCA
TTGGAATGGTTTTGATCTCTTGCGTTTCAGCTTTGGGTCTCTTTCGTTTGTATGGCGGTA
ACAAAGCCCTGCAAAGCTCACGGTGGTGAAGGCAAGGGCGAAGGCTCATAGGTCTTGGGA
TTACACTTATTTGTGGAAATTGTGTGAAATTATTGTGGTGTGTTCTCATCTCACTTCCTC
TCAGTGTGTATACTGTCTATCACTATTGTCATGATCTCATGCACAAATAAACATCAAACT
GTAGTTTAATAACGAGCCTATAACCATGTTTAGTTGTTCAACAACACAATGAATGACATT
GTTTAGCCT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL7190Contig1 789 2 2 U
GGACCATCAACAAGTCTCTCAGCTTTGTAGTATACACTTCAAGCACCTCCATTTGAATAG
TATCACTCGTAAATATCTACGAAAATGACAACTAATCCATCCATTTTCCTAACCATATTA
CCTATCTTGCTCCTCCTGAACCCCACCAACGCTGGGATCCCTGGTGTCTACACCGGCAGC
TCTTGGCAAACCGCTCACGCCACTTTTTACGGTGGGGACGACGCTTCAGGAACCATGGGT
GGTGCATGCGGTTACGGTAACTTATACAGTCAAGGATATGGTACGAACACGGCGGCTCTC
AGCACGGCGCTTTTCAACAGTGGATTAACTTGTGGTGCTTGCTTTGAAATCAAATGTGTC
AATGATCCTAAGTGGTGTCACTCAGGCAGCCCTTCAGTCTTTGTAACTGCAACAAACTTC
TGTCCTCCGAATTTAGCTCAACCTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCT
CACTTCGACCTAGCTATGCCAGTTTTCCTCAAGATCGCTGAGTACCGTGCTGGCATTGTC
CCAATCCCCTACCGCAGGGTGGCATGTAGGAAGAGTGGAGGGATGAGATTCACGATAAAC
GGTCACCGTTACTTCAACTTGGTGCTGATAACGAACGTGGCTGGAGCAGAGACATCGTGA
GGACGAGCATGAAAGGATCAAAGACTGGTTGGATGGGTTTGACTAGGAACTGGGGACAGA
ACTGGCAGTCTAATGCTGTTCTCGTTGGTCAGTCACTCTCCTTCCGTGTCACAACCAGTG
ACCGTAGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D161TF U 1
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BS 759 789 RR4D161JQ

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TCTTGGCAAACCGCTCACGCCACTTTTTACGGTGGGGACGACGCTTCAGGAACCATGGGT
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AATGATCCTAAGTGGTGTCACTCAGGCAGCCCTTCAGTCTTTGTAACTGCAACAAACTTC
TGTCCTCCGAATTTAGCTCAACCTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCT
CACTTCGACCTAGCTATGCCAGTTTTCCTCAAGATCGCTGAGTACCGTGCTGGCATTGTC
CCAATCCCCTACCGCAGGGTGGCATGTAGGAAGAGTGGAGGGATGAGATTCACGATAAAC
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GGACGAGCATGAAAGGATCAAAGACTGGTTGGATGGGTTTGACTAGGAACTGGGGACAGA
ACTGGCAGTCTAATGCTGTTCTCGTTGGTCAGTCACTC

QA 1 758 1 758
DS 

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GTGACCGTAGAA

QA 1 132 1 132
DS 



AS 1 2

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TGTGTAACTTCATGCCGCATGTATATTTGTTTTTGTTAAAACTTTGTATGTGGAAGATAC
AAGTAGTAGTCTATGTATATTCCTCACAC


BQ
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AF RR4D846TF U 1
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GAC

QA 1 603 1 603
DS 

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AGGCTTCAGTCGAATAAATGTCCGATTTGTAGACACCCTATCGAGGAGCTCTTAGAGATC
AACGTGAACAGTAGTAGTGATGAATAGCATTTTACTTGAAGAAGAAGGTTTTCCTTTTCT
TTTATTGGAAGTCTTCCATGTCCGAATATGTATTTTTGGATCATTGTTGTGTAACTTCAT
GCCGCATGTATATTTGTTTTTGTTAAAACTTTGTATGTGGAAGATACAAGTAGTAGTCTA
TGTATATTCCTCACAC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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CAATGAAATCTAGCAAATCAACCTGTCCCTTAGGAATATCGCTGGCTAATTCGGCGGACA
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BQ
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AF RR4DL59JQ U 78
AF RR4DL59TF C 1
BS 1 77 RR4DL59TF
BS 78 410 RR4DL59JQ
BS 411 650 RR4DL59TF

RD RR4DL59JQ 333 0 0
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ATCTTCTGAACCTTTGTGAGCTCAAAACCCGATTGGTTGTCTTCAATGAAAATCGTCAAG
CTACGAACATTCTGAAACTTAACATATTTAAGGACCACCGGTTTTCCCTTAAGGTTTTCT
TCAGTTAGTTCAGCGGTGTCAATTGGAGGAAAATCATTGACATTGCTGAAGCACATGTGC
TCTTTGTTTGAAAAAAACTTGACAGTTTTAGGACCATCCTCTTCAGGGCCTTTGATAGCA
AAAGAATGCAGTTTGACAACTTGGTTAAAAGGA

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR4DL59TF 650 0 0
AAGAAAGAAACCAACAACAGAATAGTAGAAATCAAAGTGATCATATGATTATAACTTTTT
TGTTTGCTGCTCAGTGATCTTCAATCTTCTTCAACCCCTTCATATCAGTAGTCTCAACCG
TTGAGCCGTAAAGAGCGATCTTCTGAACCTTTGTGAGCTCAGAACCCGATTGGTTGTCTT
CAATGAAGATCGTCAAGCTACGAACATTCTGAAACTTAACATATTTAAGGACCACCGGTT
TTCCCTTAAGGTTTTCTTCAGTTAGTTCAGCGGTGTCAATTGGAGGAAAATCATTGACAT
TGCTGAAGCACATGTGCTCTTTGTTTGAGAAAAACTTGACAGTTTTAGGACCATCCTCTT
CAGGGCCTTTGATAGCAAAAGAATGCAGTTTGACAACTTGGTTAAAAGGAATATAGATTA
GTAGCTGTTCATCAGCATCACTCTCTAGGTTTAACCCCGTATCTTCTCTATACCCCTGCT
TGAGAGCATTGGGCAAGGAGTGACTCGAGCTTTGGTTAAGGCATTCAACACCAGACCAGT
CAATGAAATCTAGCAAATCAACCTGTCCCTTAGGAATATCGCTGGCTAATTCGGCGGACA
TCGTAGAAGCTTTTTTCGTTTCGTTCTTACAAAGAAATCTGAGAATCTCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7193Contig1 1064 2 2 U
GGGGTATTGCTCAAAATGAAGAGGCAAATTACTCAACTGCTGCCATTAACCATCCACTGC
ATATGTCAGGGCATTCGTCCTCAGTGCCGGCTAATCAACCTCCAGTGCTTTCTGATTTTT
CTGTTGGAGGGTATGATCAAACTATGGCGACAAGGTATCCTCCGCATCCGCAGCTTGTAG
TCTCCAATCCAAGAGCACAGTTTGAGGTTGCTTCGGTCGCAACAACTCAGGATCAGCTCA
TGGGAAATCTACATCAGGGTCAAAGCTCCATGAACGGTATGCTTGCTCTCGGTCCTCCAC
AGGCATCCACGAGTGGATACCAAAACGTCAACTCTTCTCAAGTTCATCAGGCGAATCTCA
ATCCTTTCGAAGACTGGTCAAACCACCGCGAGAGAGGAGCAGAAGATTTCTTCTCAGAGG
AAGAGATCCGTATGAGAAGCCATGAAATGCTCGAGAACGAGGACATGCAACAGTTCCTCC
GCCTATTCAGCATGGGAGGAGGAGGTAATGGCTCTGCTTCACATTTGGCTGAAGATGGGT
ATACTTTCCCGTCGTTTCTGCACACGCCTATGCAAGGTTATGACGAAGACCGTGGTCGAT
CGGGCAGAGCTGTTGTTGGGTGGCTTAAGATAAAGGCAGCAATGAGATGGGGTTTCTTCA
TCAGGAGGAAAGCTGCTGAAAGGCGAGCACAGATTGTAGAGCTGGATGATGATGACGAAG
AATAGTCTGGTCTTTATTCATCATGATTGTACCCCCATATACCCTCATGATGATGGTAAC
AACACTAATGACTCAAAACAGTGTTTACCAAATGGAAACTGAATCTTGAGGGCAACGAGG
CAGCAGCAGCGCGAATGGAGGTGAAGTGGCCCTGGTATTGTATAAAAAGGAGTGTCAGAT
AGATTCAGTGGATGTGTTGTGTTTATGGAGCAGGAGACTTCTAATATGTTGGTTGACTCA
TTTAGACATTAGCATTCTTAAGAACTGATTTTGCAGTCTTAACAAGTAGAATGTATGTCT
TCGTGACTTTGTCTTTTTTTCTTTTTTCTTCTATTTGATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B415TF U 1
AF RR4B415JQ C 235
BS 1 660 RR4B415TF
BS 661 1064 RR4B415JQ

RD RR4B415TF 660 0 0
GGGGTATTGCTCAAAATGAAGAGGCAAATTACTCAACTGCTGCCATTAACCATCCACTGC
ATATGTCAGGGCATTCGTCCTCAGTGCCGGCTAATCAACCTCCAGTGCTTTCTGATTTTT
CTGTTGGAGGGTATGATCAAACTATGGCGACAAGGTATCCTCCGCATCCGCAGCTTGTAG
TCTCCAATCCAAGAGCACAGTTTGAGGTTGCTTCGGTCGCAACAACTCAGGATCAGCTCA
TGGGAAATCTACATCAGGGTCAAAGCTCCATGAACGGTATGCTTGCTCTCGGTCCTCCAC
AGGCATCCACGAGTGGATACCAAAACGTCAACTCTTCTCAAGTTCATCAGGCGAATCTCA
ATCCTTTCGAAGACTGGTCAAACCACCGCGAGAGAGGAGCAGAAGATTTCTTCTCAGAGG
AAGAGATCCGTATGAGAAGCCATGAAATGCTCGAGAACGAGGACATGCAACAGTTCCTCC
GCCTATTCAGCATGGGAGGAGGAGGTAATGGCTCTGCTTCACATTTGGCTGAAGATGGGT
ATACTTTCCCGTCGTTTCTGCACACGCCTATGCAAGGTTATGACGAAGACCGTGGTCGAT
CGGGCAGAGCTGTTGTTGGGTGGCTTAAGATAAAGGCAGCAATGAGATGGGGTTTCTTCA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4B415JQ 830 0 0
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CTCCACAGGCATCCACGAGTGGATACCAAAACGTCAACTCTTCTCAAGTTCATCAGGCGA
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CAGAGGAAGAGATCCGTATGAGAAGCCATGAAATGCTCGAGAACGAGGACATGCAACAGT
TCCTCCGCCTATTCAGCATGGGAGGAGGAGGTAATGGCTCTGCTTCACATTTGGCTGAAG
ATGGGTATACTTTCCCGTCGTTTCTGCACACGCCTATGCAAGGTTATGACGAAGACCGTG
GTCGATCGGGCAGAGCTGTTGTTGGGTGGCTTAAGATAAAGGCAGCAATGAGATGGGGTT
TCTTCATCAGGAGGAAAGCTGCTGAAAGGCGAGCACAGATTGTAGAGCTGGATGATGATG
ACGAAGAATAGTCTGGTCTTTATTCATCATGATTGTACCCCCATATACCCTCATGATGAT
GGTAACAACACTAATGACTCAAAACAGTGTTTACCAAATGGAAACTGAATCTTGAGGGCA
ACGAGGCAGCAGCAGCGCGAATGGAGGTGAAGTGGCCCTGGTATTGTATAAAAAGGAGTG
TCAGATAGATTCAGTGGATGTGTTGTGTTTATGGAGCAGGAGACTTCTAATATGTTGGTT
GACTCATTTAGACATTAGCATTCTTAAGAACTGATTTTGCAGTCTTAACAAGTAGAATGT
ATGTCTTCGTGACTTTGTCTTTTTTTCTTTTTTCTTCTATTTGATTTTCC

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL7194Contig1 740 2 2 U
GGGGCTCGCTGTACCAAAGTTTGAATATGGTGCACATCAGCTGTTCGACCAAATGTCTGA
AGGGGCTTTTAAAATGTTGTTTTGTTTATTTTTAAGTCTCTGCTTTTTTTTTTGCTTGCA
ACAAATAATACATTTTTGTGGGTTTGCAGTTTTCATTGTTTAAGTGCGCTACTATTTCTG
AGGCATAATGAAAGTTCGGACGTTTGGGATAATTTTGCTGCTATCTCCTTTATTTATCTC
TCATAAAGACACTAGTGGCACGTTTTGATTTAAAGGTAAGCTTCTGAAGGATTCTTGGTT
TTATTTGTTGCGTATTATAAACAGACAATGAATCTCTTTGGAGTTTGAAAGAGTGAAACA
TATAGTTTTTGGAGAGGGGTGGAACTAGTTTTATACACTATGGTTAGTTAAAAGTGTATG
ATTGAAAAAGAGGTTTTGGGGGAGTTGGTGAACGGTATTGTTGGCTGAGACAAAACGTGT
AGTAGGGTGGTCAGGGACACGGCGTTTTGCAGAGTTTGGCGTTTTGAAGAGGGAAACTGG
TTCTCTGGAAAGACGCCAAGGAGTGAAGATTTAGGGTAAAACCTGATGGTGTGTGGATCA
TTAATTATTTGACTGCTGGGAAATTTTCGCATTATGATATCTCTAGCTGTTATGTTTTGA
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ACAGAGTGTCTGTGTTTCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CC84TF U 1
AF RR4CC84JQ C 2
BS 1 663 RR4CC84TF
BS 664 740 RR4CC84JQ

RD RR4CC84TF 663 0 0
GGGGCTCGCTGTACCAAAGTTTGAATATGGTGCACATCAGCTGTTCGACCAAATGTCTGA
AGGGGCTTTTAAAATGTTGTTTTGTTTATTTTTAAGTCTCTGCTTTTTTTTTTGCTTGCA
ACAAATAATACATTTTTGTGGGTTTGCAGTTTTCATTGTTTAAGTGCGCTACTATTTCTG
AGGCATAATGAAAGTTCGGACGTTTGGGATAATTTTGCTGCTATCTCCTTTATTTATCTC
TCATAAAGACACTAGTGGCACGTTTTGATTTAAAGGTAAGCTTCTGAAGGATTCTTGGTT
TTATTTGTTGCGTATTATAAACAGACAATGAATCTCTTTGGAGTTTGAAAGAGTGAAACA
TATAGTTTTTGGAGAGGGGTGGAACTAGTTTTATACACTATGGTTAGTTAAAAGTGTATG
ATTGAAAAAGAGGTTTTGGGGGAGTTGGTGAACGGTATTGTTGGCTGAGACAAAACGTGT
AGTAGGGTGGTCAGGGACACGGCGTTTTGCAGAGTTTGGCGTTTTGAAGAGGGAAACTGG
TTCTCTGGAAAGACGCCAAGGAGTGAAGATTTAGGGTAAAACCTGATGGTGTGTGGATCA
TTAATTATTTGACTGCTGGGAAATTTTCGCATTATGATATCTCTAGCTGTTATGTTTTGA
TGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CC84JQ 739 0 0
GGGCTCGCTGTACCAAAGTTTGAATATGGTGCACATCAGCTGTTCGACCAAATGTCTGAA
GGGGCTTTTAAAATGTTGTTTTGTTTATTTTTAAGTCTCTGCTTTTTTTTTTGCTTGCAA
CAAATAATACATTTTTGTGGGTTTGCAGTTTTCATTGTTTAAGTGCGCTACTATTTCTGA
GGCATAATGAAAGTTCGGACGTTTGGGATAATTTTGCTGCTATCTCCTTTATTTATCTCT
CATAAAGACACTAGTGGCACGTTTTGATTTAAAGGTAAGCTTCTGAAGGATTCTTGGTTT
TATTTGTTGCGTATTATAAACAGACAATGAATCTCTTTGGAGTTTGAAAGAGTGAAACAT
ATAGTTTTTGGAGAGGGGTGGAACTAGTTTTATACACTATGGTTAGTTAAAAGTGTATGA
TTGAAAAAGAGGTTTTGGGGGAGTTGGTGAACGGTATTGTTGGCTGAGACAAAACGTGTA
GTAGGGTGGTCAGGGACACGGCGTTTTGCAGAGTTTGGCGTTTTGAAGAGGGAAACTGGT
TCTCTGGAAAGACGCCAAGGAGTGAAGATTTAGGGTAAAACCTGATGGTGTGTGGATCAT
TAATTATTTGACTGCTGGGAAATTTTCGCATTATGATATCTCTAGCTGTTATGTTTTGAT
GATGCAGGAACCCTTCTTCATATAAACTTTGTGCTTGTAACAAGATATAATATAAAGAGA
CAGAGTGTCTGTGTTTCCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7195Contig1 778 2 3 U
GCGAGCAAGAGCCGTTGGCGACTCTTGTTGTTAATAATCTTCGTGGTACGATAAAGGTTG
CTGCTTTGAAAGCTCCTGGATTTGGAGAGAGGAAGAGTCAGTACCTTGATGACATTGCTG
CTCTTACAGGAGCTACTGTGATTAGAGAAGAAGTTGGACTTCAGTTGGAGAAAGTTGGAC
CAGAAGTTTTGGGTAATGCTGGTAAAGTGGTTCTCACTAAAGACACTACCACAATTGTTG
GTGATGGAAGTACTGAAGAGGTTGTGAAGAAGAGAGTTGAACAGATCAAGAATCTTATCG
AGGCTGCTGAGCAAGACTATGAGAAGGAGAAGCTTAATGAGAGAATCGCTAAATTATCAG
GCGGTGTTGCTGTAATTCAGGTTGGTGCACAAACTGAGACAGAGCTTAAGGAGAAGAAAC
TGAGAGTTGAAGATGCTTTGAATGCTACAAAGGCGGCTGTGGAAGAAGGTATTGTTGTTG
GAGGTGGATGCACTCTGCTAAGACTTGCATCCAAAGTGGACGCGATCAAAGAGACTCTAG
CAAATGATGAAGAAAAGGTTGGAGCTGACATTGTTAAGAAAGCGTTGAGCTACCCATTGA
AGTTAATCGCCAAGAACGCTGGTGTTAATGGGTAGCGTTGTCAGCGAAAAGGTACTCTCT
AGCGACAACGCAAAGCACGGCTACAACGCAGCAACAGGCAATACGAAGATCTAATGGCTG
CAGAATCATTGATCCACCAAAGTTGTGAGATGTTGCTTAGAGCATGCATCATCTGTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F976TF U 1
AF RR4EK27TF U 1
BS 1 631 RR4EK27TF
BS 632 632 RR4F976TF
BS 633 778 RR4EK27TF

RD RR4F976TF 678 0 0
GCGAGCAAGAGCCGTTGGCGACTCTTGTTGTTAATAATCTTCGTGGTACGATAAAGGTTG
CTGCTTTGAAAGCTCCTGGATTTGGAGAGAGGAAGAGTCAGTACCTTGATGACATTGCTG
CTCTTACAGGAGCTACTGTGATTAGAGAAGAAGTTGGACTTCAGTTGGAGAAAGTTGGAC
CAGAAGTTTTGGGTAATGCTGGTAAAGTGGTTCTCACTAAAGACACTACCACAATTGTTG
GTGATGGAAGTACTGAAGAGGTTGTGAAGAAGAGAGTTGAACAGATCAAGAATCTTATCG
AGGCTGCTGAGCAAGACTATGAGAAGGAGAAGCTTAATGAGAGAATCGCTAAATTATCAG
GCGGTGTTGCTGTAATTCAGGTTGGTGCACAAACTGAGACAGAGCTTAAGGAGAAGAAAC
TGAGAGTTGAAGATGCTTTGAATGCTACAAAGGCGGCTGTGGAAGAAGGTATTGTTGTTG
GAGGTGGATGCACTCTGCTAAGACTTGCATCCAAAGTGGACGCGATCAAAGAGACTCTAG
CAAATGATGAAGAAAAGGTTGGAGCTGACATTGTTAAGAAAGCGTTGAGCTACCCATTGA
AGTTAATCGCCA*GAACGCTGGTGTTAATGGGTAGCGTTGTCAGCGAAAAGGTACTCTCT
AGCGACA
CGCAAGCACGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EK27TF 778 0 0
GCGAGCAAGAGCCGTTGGCGACTCTTGTTGTTAATAATCTTCGTGGTACGATAAAGGTTG
CTGCTTTGAAAGCTCCTGGATTTGGAGAGAGGAAGAGTCAGTACCTTGATGACATTGCTG
CTCTTACAGGAGCTACTGTGATTAGAGAAGAAGTTGGACTTCAGTTGGAGAAAGTTGGAC
CAGAAGTTTTGGGTAATGCTGGTAAAGTGGTTCTCACTAAAGACACTACCACAATTGTTG
GTGATGGAAGTACTGAAGAGGTTGTGAAGAAGAGAGTTGAACAGATCAAGAATCTTATCG
AGGCTGCTGAGCAAGACTATGAGAAGGAGAAGCTTAATGAGAGAATCGCTAAATTATCAG
GCGGTGTTGCTGTAATTCAGGTTGGTGCACAAACTGAGACAGAGCTTAAGGAGAAGAAAC
TGAGAGTTGAAGATGCTTTGAATGCTACAAAGGCGGCTGTGGAAGAAGGTATTGTTGTTG
GAGGTGGATGCACTCTGCTAAGACTTGCATCCAAAGTGGACGCGATCAAAGAGACTCTAG
CAAATGATGAAGAAAAGGTTGGAGCTGACATTGTTAAGAAAGCGTTGAGCTACCCATTGA
AGTTAATCGCCAAGAACGCTGGTGTTAATGG*TAGCGTTGTCAGCGAAAAGGTACTCTCT
AGCGACAACGCAAAGCACGGCTACAACGCAGCAACAGGCAATACGAAGATCTAATGGCTG
CAGAATCATTGATCCACCAAAGTTGTGAGATGTTGCTTAGAGCATGCATCATCTGTGG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL7196Contig1 802 2 16 U
CTTCAAAGTAACATCCGATTACGTACGTGTACAACAAAGCTAACCAAAGAACTGTCCCCT
ACTACTACTATACAATAGGTTTCAAATATTTCTCTATCCCCCCACCAAAAAAAAAAAGGA
AACAATTCTCCGTAACCAAGATTTTTTGGTCAGCGGAAAAGATCTTGGAATGACCACATA
ATGAATCTGGCAAAGATATCAGACTCCAGGAACTCGATGTGAGCAGCTCGACCGATGAAC
GAGTTGAGGTTACGACCGTACAAGGTTGTGTCGAAGTTGACGTCACAGCGCATGAACACT
CTCTGGTGGTGAGGAGGAGTTTCCGGGGTCGGCCCACGTATTTGGTCCATACAGTTATTA
AGCATCTCCAAGAAAGCGACGCCTCTTTTTGAGTTGTCGGAAGAAGCTGGTTGGCACGAC
TCGATCCGAGCTGAGTGATACGGAACATACCCATCCTGAGGCGAAGACAGGAGAATTATA
TTCTTGAAACTGTCCAGCGTCTTTTGCTTGCAGAGCTTGTAAAAGAAAGTATTCTGGAGA
TCAGGATCATCAGTGAGGGTGAGCTGATGAATAACCTGAGTACTCTTCAACTTCTTCAGG
AGCCAAAGTCCAGAATTAAACAAGGAATTTGGGCTGTATAGATAACCCAAGTGCGGACCC
GAAAGGGATAGATATGTGTGTAGATATTTCCTGTACGGTTCCATCAATCTATCTGCTAGT
GCGGTTCTTATGATGACATTGCCGATTGAATGTCCAACAAAACTCAGCTTTATGTTTTTC
AAGCGACCGTATTTGGCATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FR26JQ U 1
AF RR4CE51TF C 143
BS 1 188 RR4FR26JQ
BS 189 189 RR4CE51TF
BS 190 326 RR4FR26JQ
BS 327 327 RR4CE51TF
BS 328 329 RR4FR26JQ
BS 330 330 RR4CE51TF
BS 331 428 RR4FR26JQ
BS 429 429 RR4CE51TF
BS 430 443 RR4FR26JQ
BS 444 444 RR4CE51TF
BS 445 461 RR4FR26JQ
BS 462 462 RR4CE51TF
BS 463 494 RR4FR26JQ
BS 495 495 RR4CE51TF
BS 496 595 RR4FR26JQ
BS 596 802 RR4CE51TF

RD RR4FR26JQ 595 0 0
CTTCAAAGTAACATCCGATTACGTACGTGTACAACAAAGCTAACCAAAGAACTGTCCCCT
ACTACTACTATACAATAGGTTTCAAATATTTCTCTATCCCCCCACCAAAAAAAAAAAGGA
AACAATTCTCCGTAACCAAGATTTTTTGGTCAGCGGAAAAGATCTTGGAATGACCACATA
ATGAATCTTGCAAAGATATCAGACTCCAGGAACTCGATGTGAGCAGCTCGACCGATGAAC
GAGTTGAGGTTACGACCGTACAAGGTTGTGTCGAAGTTGACGTCACAGCGCATGAACACT
CTCTGGTGGTGAGGAGGAGTTTCCGGTGTTGGCCCACGTATTTGGTCCATACAGTTATTA
AGCATCTCCAAGAAAGCGACGCCTCTTTTTGAGTTGTCGGAAGAAGCTGGTTGGCACGAC
TCGATCCGTGCTGAGTGATACGGTACATACCCATCCTGAGGTGAAGACAGGAGAATTATA
TTCTTGAAACTGTCGAGCGTCTTTTGCTTGCAGAGCTTGTAAAAGAAAGTATTCTGGAGA
TCAGGATCATCAGTGAGGGTGAGCTGATGAATAACCTGAGTACTCTTCAACTTCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4CE51TF 660 0 0
TTTTTGGTCAGCGGAAAAGATCTTGGAATGACCACATAATGAATCTGGCAAAGATATCAG
ACTCGAGGAACTCGATGTGAGCAGCTCGACCGATGAACGAGTTGAGGTTACGACCGTACA
AGGTTGTGTCGAAGTTGACGTCACAGCGCATGAACACTCTCTGGTGGTGAGGAG***TTT
CCGGGGTCGGCCCACGTATTTGGTCCATACAGTTATTAAGCATCTCCAAGAAAGCGACGC
CTCTTTTTGAGTTGTCGGAAGAAGCTGGTTGGCACGACTCGATCCTAGCTGAGTGATATG
GAACATATCCATCCTGAGGCGAAGACAGGAGAATTATATTCTTGAAACTGTCCAGCGTCT
TTTGCTTGCAGAGCTTGTAAAAGAAAGTATTCTGGAGATCAGGATCATCAGTGAGGGTGA
GCTGATGAATAACCTGAGTACTCTTCAACTTCTTCAGGAGCCAAAGTCCAGAATTAAACA
AGGAATTTGGGCTGTATAGATAACCCAAGTGCGGACCCGAAAGGGATAGATATGTGTGTA
GATATTTCCTGTACGGTTCCATCAATCTATCTGCTAGTGCGGTTCTTATGATGACATTGC
CGATTGAATGTCCAACAAAACTCAGCTTTATGTTTTTCAAGCGACCGTATTTGGCATGTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7197Contig1 672 2 1 U
GCAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCTAAAATTGGCTAAGTGGGAAACGAAGTGGGAAG
GCTAAAACAGTCAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAAAGCGTAATAGCT
CACTGATCGAGTCGTCCTGCGCGGAAGATGTAACGGGGCTAAGCCAGTTACCGAAGCTGC
GGATGTGCAATTTATTGCACGTGGTAGGAGAGCGTTCTGTAGGCCTGTGAAGGTGTCTGG
TAACGGATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATGAGTAGCGTTAAAGGGGGTG
AAAAGCCCCCTCGCCGTAAGCGCAAGGTTTTCTACGCAACGTTCATCGGCGTAGAGCGAG
TCGGCCCCTAAGGCGAGGCAGAGATGCGTAGCTGATGGGAAACAGGTCAATATTCCTGTA
CCGATCAATAGTGCGATGTGGGGACGGAGAAGGTTAGCTCAGCCAACTGTTGGATATGTT
GGTTCAAGCCTGTAGTCGTGCCTGGTAGGCAAATCCGCCGGGCTTAGATGAGGGGTGATA
ACGAGTCTGCTTGCAGACGAAGTGAGTGATACCCTGCTTCCAGGAAAAGCCACTAAGCTT
CAGCTATTGACGACCGTACCGCAAACCGACACTGGTGCGCGAGATGAGTATTCTAAGGCG
CTTGAGAGAACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4D336TF U 1
AF RR4DI56TF U 1
BS 1 672 RR4D336TF

RD RR4D336TF 672 0 0
GCAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCTAAAATTGGCTAAGTGGGAAACGAAGTGGGAAG
GCTAAAACAGTCAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAAAGCGTAATAGCT
CACTGATCGAGTCGTCCTGCGCGGAAGATGTAACGGGGCTAAGCCAGTTACCGAAGCTGC
GGATGTGCAATTTATTGCACGTGGTAGGAGAGCGTTCTGTAGGCCTGTGAAGGTGTCTGG
TAACGGATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATGAGTAGCGTTAAAGGGGGTG
AAAAGCCCCCTCGCCGTAAGCGCAAGGTTTTCTACGCAACGTTCATCGGCGTAGAGCGAG
TCGGCCCCTAAGGCGAGGCAGAGATGCGTAGCTGATGGGAAACAGGTCAATATTCCTGTA
CCGATCAATAGTGCGATGTGGGGACGGAGAAGGTTAGCTCAGCCAACTGTTGGATATGTT
GGTTCAAGCCTGTAGTCGTGCCTGGTAGGCAAATCCGCCGGGCTTAGATGAGGGGTGATA
ACGAGTCTGCTTGCAGACGAAGTGAGTGATACCCTGCTTCCAGGAAAAGCCACTAAGCTT
CAGCTATTGACGACCGTACCGCAAACCGACACTGGTGCGCGAGATGAGTATTCTAAGGCG
CTTGAGAGAACT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4DI56TF 667 0 0
GCAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCTAAAATTGGCTAAGTGGGAAACGAAGTGGGAAG
GCTAAAACAGTCAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAAAGCGTAATAGCT
CACTGATCGAGTCGTCCTGCGCGGAAGATGTAACGGGGCTAAGCCAGTTACCGAAGCTGC
GGATGTGCAATTTATTGCACGTGGTAGGAGAGCGTTCTGTAGGCCTGTGAAGGTGTCTGG
TAACGGATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATGAGTAGCGTTAAAGGGGGTG
AAAAGCCCCCTCGCCGTAAGCGCAAGGTTTTCTACGCAACGTTCATCGGCGTAGAGCGAG
TCGGCCCCTAAGGCGAGGCAGAGATGCGTAGCTGATGGGAAACAGGTCAATATTCCTGTA
CCGATCAATAGTGCGATGTGGGGACGGAGAAGGTTAGCTCAGCCAACTGTTGGATATGTT
GGTTCAAGCCTGTAGTCGTGCCTGGTAGGCAAATCCGCCGGGCTTAGATGAGGGGTGATA
ACGAGTCTGCTTGCAGACGAAGTGAGTGATACCCTGCTTCCAGGAAAAGCCACTAAGCTT
CAGCTATTGACGACCGTACCGCAAACCGACACTGGTGCGCGAGATGAGTATTCTAAG*CG
CTTGAGA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL7198Contig1 839 2 4 U
ACTTGAAAAGAGTTTTTTTTTGTTGGTTCTCTCTTTAGTTGTAACGTTACATTTTCATGT
GGGAAACAACATAAGAAAAGCAATCAGTCAAATGTTCCTAACAAAATCATCACTATACCA
ATAACACATCATCATCTCTGCTTTGAGGCTTCTTCTTCTTCTTAGGTGCTCGCATCAAAC
AGTGGGATGATAAAAAAAATCTCAGGAGGATACTTTTTCGGAGGTGGAGCTCAAACCAGA
TCCTGAACTGGTGAAGACAGGATTGTCTCTAGGCGTAAAGGGAGCTCCACGACCACTTGC
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ACCGCACAGTTCTGTCGCTATCTTTAACCCGCTCTGCGAAGCCCAATCCTTGAACATGAT
CATACTAGCTATGATGGTGAAAGTTGTGAACATAACGAAGTAAACCGGAAAAATAACCGC
TGTGTTGAACGTATCCAATGCCTTTTGCCAAAAATACAACAGAGAAACTCAGAGATAATA
GAGTGATAACCAGTGAAAGTTGGAAAGCTTTTTGTTTACCTTGTTCAAGTAATTGATTTG
CAGAATGCAACAAACCGTGACTACTATAATAAAAATCCAAGTTTGGAAGTATTTGAACTG
ATTCATCTCTGAAAATGTCAGCTTTATGGCGATGGCCACAGCTTTCACACTCATAACAGT
AAGAGAACCCATTAAAGAGCAGATTCCAACATAAACTATCAAGTGAGTCTTCCCATAGCG
AGGTTCATAGTAGAAGATGAGTACAAGCACCGCAATCACATCACAGCAGAGTACACTAG


BQ
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AF RR4C241JQ U 1
AF RR4CM48JQ U 1
BS 1 277 RR4C241JQ
BS 278 278 RR4CM48JQ
BS 279 750 RR4C241JQ
BS 751 839 RR4CM48JQ

RD RR4C241JQ 750 0 0
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GGGAAACAACATAAGAAAAGCAATCAGTCAAATGTTCCTAACAAAATCATCACTATACCA
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TCCTGAACTGGTGAAGACAGGATTGTCTCTAGGCGTAGAGGGAGCTCCACGACCACTTGC
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ACCGCACAGTTCTGTCGCTATCTTTAACCCGCTCTGCGAAGCCCAATCCTTGAACATGAT
CATACTAGCTATGATGGTGAAAGTTGTGAACATAACGAAGTAAACCGGAAAAATAACCGC
TGTGTTGAACGTATCCAATGCCTTTTGCCAAAAATACAACAGAGAAACTCAGAGATAATA
GAGTGATAACCAGTGAAAGTTGGAAAGCTTTTTGTTTACCTTGTTCAAGTAATTGATTTG
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ATTCATCTCTGAAAATGTCAGCTTTATGGCGATGGCCACAGCTTTCACACTCATAACAGT
AAGAGAACCCATTAAAGAGCAGATTCCAAC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4CM48JQ 839 0 0
ACTTGAAAAGAGTTTTTTTTTGTTGGTTCTCTCTTTAGTTGTAACGTTACATTTTCATGT
GGGAAACAACATAAGAAAAGCAATCAGTCAAATGTTCCTAACAAAATCATCACTATACCA
ATAACACATCATCATCTCTGCTTTGAGGCTTCTTCTTCTTCTTAGGTGCTCGCATCAAAC
AGTGGGATGATAAAAAAAATCTCAGGAGGATACTTTTTCGGAGGTGGAGCTCAAACCAGA
TCCTGAACTGGTGAAGACAGGATTGTCTCTAGGCGTAAAGGGAGCTCCACGACCACTTGC
ACTGTTTCCCATATCTTTAGTCTTATGAAGCAAAAACGTTCCTGACAAAATGGTGACAAA
ACCGCACAGTTCTGTCGCTATCTTTAACCCGCTCTGCGAAGCCCAATCCTTGAACATGAT
CATACTAGCTATGATGGTGAAAGTTGTGAACATAACGAAGTAAACCGGAAAAATAACCGC
TGTGTTGAACGTATCCAATGCCTTTTGCCAAAAATACAACAGAGAAACTCAGAGATAATA
GAGTGATAACCAGTGAAAGTTGGAAAGCTTTTTGTTTACCTTGTTCAAGTAATTGATTTG
CAGAATGCAACAAACCGTGACTACTATAATAAAAATCCAAGTTTGGAAGTATTTGAACTG
ATTCATCTCTGAAAATGTCAGCTTTATGGCGATGGCCACAGCTTTCACACTCATAACAGT
AAGAGAACCCATTAAAGAGCAGATTCCAACATAAACTATCAAGTGAGTCTTCCCATAGCG
AGGTTCATAGTAGAAGATGAGTACAAGCACCGCAATCACATCACAGCAGAGTACACTAG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL7199Contig1 835 2 3 U
GGGGCTTTTCACATTTAGGGGCTCTGTAGGAGTTGCCTCTCCTCGAACGCAAGAAACACT
CTCTGGAAGATCCTCCCTCTTAAACCAAATAAAAGATTCAATTTTGAGAGAATCAAGGAT
CGAACAAATGAAGCGACAAGTCGGCGGAGGAGTACAGCGGATGAGATCCGCAAGACCCAC
CACAATTCACGATTGCGCTCTCTCCGGCGATCTCATCTCGTTGCAGAAGCTTCTCAAAGA
CAACCCTTCTCTCCTCAACGAACGCAATCCCGTCATGTACCACACGCCACTTCATGTCTC
TGCTGGTAATGGCAATGTTGATATTGTCAAGTATCTCTTAGATTGGCCTGGATCCGATAA
AGTTGAGTTGGAAGCCATGAACACTTATGGTGAAACCCCATTGCACATGGCAGCCAAGAA
CGGCTGCAATGAAGCCGCTAAGCTACTCCTTGAGCGTGGTGCTTTTATCGAAGCCAAAGC
CAGCAACGGTATGACACCGTTGCATCTTGCCGTATGGTATTCTATTACCTCCAAAGACAT
CTCTACTGTTAAGACATTGCTGGATAATAACGCTGATTGCAGCGCTAAAGATAACGAAGG
GATGACACCGTTGGACCATCTACCACAAGGACAGAGCAGCGAGAAGTTGCGTGAACTGTT
GCGTTGGTTTCTCCAAGAGCAGAGGAAAAAAAGCGCTCTAGAGTCTTGCGGTAAGACCAA
AGCCAAGATGGATCTACTTGAGGAAGAGCTGTCCAATATCGTTGGACTAAACGAGCTCAG
ACACAGCTGCGGAATGGGCTAAAGGATGCTTTTAGATGAGAGCGTAGGCTCTTGG


BQ
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AF RR4AX21TF U 1
AF RR4AV78TF U 1
BS 1 691 RR4AV78TF
BS 692 692 RR4AX21TF
BS 693 835 RR4AV78TF

RD RR4AX21TF 782 0 0
GGGGCTTTTCACATTTAGGGGCTCTGTAGGAGTTGCCTCTCCTCGAACGCAAGAAACACT
CTCTGGAAGATCCTCCCTCTTAAACCAAATAAAAGATTCAATTTTGAGAGAATCAAGGAT
CGAACAAATGAAGCGACAAGTCGGCGGAGGAGTACAGCGGATGAGATCCGCAAGACCCAC
CACAATTCACGATTGCGCTCTCTCCGGCGATCTCATCTCGTTGCAGAAGCTTCTCAAAGA
CAACCCTTCTCTCCTCAACGAACGCAATCCCGTCATGTACCACACGCCACTTCATGTCTC
TGCTGGTAATGGCAATGTTGATATTGTCAAGTATCTCTTAGATTGGCCTGGATCCGATAA
AGTTGAGTTGGAAGCCATGAACACTTATGGTGAAACCCCATTGCACATGGCAGCCAAGAA
CGGCTGCAATGAAGCCGCTAAGCTACTCCTTGAGCGTGGTGCTTTTATCGAAGCCAAAGC
CAGCAACGGTATGACACCGTTGCATCTTGCCGTATGGTATTCTATTACCTCCAAAGACAT
CTCTACTGTTAAGACATTGCTGGATAATAACGCTGATTGCAGCGCTAAAGATAACGAAGG
GATGACACCGTTGGACCATCTACCACAAGGACAGAGCAGCGAGAAGTTGCGTGAACTGTT
GCGTTGGTTTCTCCAAGAGCAGAGGAAAAAAAGCGCTCTAGAGTCTTGCGGTAAGACCAA
AGCCAAGATGGATCTACTTGAGGAAGAGCTGTCCAATATCGTTGGACTAAACGAGCTCA
AGA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4AV78TF 835 0 0
GGGGCTTTTCACATTTAGGGGCTCTGTAGGAGTTGCCTCTCCTCGAACGCAAGAAACACT
CTCTGGAAGATCCTCCCTCTTAAACCAAATAAAAGATTCAATTTTGAGAGAATCAAGGAT
CGAACAAATGAAGCGACAAGTCGGCGGAGGAGTACAGCGGATGAGATCCGCAAGACCCAC
CACAATTCACGATTGCGCTCTCTCCGGCGATCTCATCTCGTTGCAGAAGCTTCTCAAAGA
CAACCCTTCTCTCCTCAACGAACGCAATCCCGTCATGTACCACACGCCACTTCATGTCTC
TGCTGGTAATGGCAATGTTGATATTGTCAAGTATCTCTTAGATTGGCCTGGATCCGATAA
AGTTGAGTTGGAAGCCATGAACACTTATGGTGAAACCCCATTGCACATGGCAGCCAAGAA
CGGCTGCAATGAAGCCGCTAAGCTACTCCTTGAGCGTGGTGCTTTTATCGAAGCCAAAGC
CAGCAACGGTATGACACCGTTGCATCTTGCCGTATGGTATTCTATTACCTCCAAAGACAT
CTCTACTGTTAAGACATTGCTGGATAATAACGCTGATTGCAGCGCTAAAGATAACGAAGG
GATGACACCGTTGGACCATCTACCACAAGGACAGAGCAGCGAGAAGTTGCGTGAACTGTT
GCGTTGGTTTCTCCAAGAGCAGAGGAAAAAA*GCGCTCTAGAGTCTTGCGGTAAGACCAA
AGCCAAGATGGATCTACTTGAGGAAGAGCTGTCCAATATCGTTGGACTAAACGAGCTCAG
ACACAGCTGCGGAATGGGCTAAAGGATGCTTTTAGATGAGAGCGTAGGCTCTTGG

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL7200Contig1 972 2 2 U
GGCTGCTCTCACATCTTTCGGGTCACCTGTTATATCGTCGCCGTAGAAGTGATGGAGTCA
CCTAGAGATGGGAAGTCTAATTTCGCCAAAGAGCTTTACGGCGAAAGTTTGGAGGTTTCA
AAACCTGGAACAGAATCATCGCTTGGTTTAGGCAATCTTGAGAATGGAGATGGATCCTTT
TATGGAAGTTCAGATGAAGAACCAAGTGAATCTTACTCTATGAACAATGATACTGAGAAC
AGACGTGAAAAATTCCACATGCTTGGATACCGTGATGGGATTTCTGCTGGACAAGAAGCT
GCTGCTCAAGAAGGTTATAATGTCGGCTATAAGGAATCAGTTCTTGCTGGCTACAAGTTT
GGTATTGTTAGAGGTGTTTCCAGTGCGCTGGCCTTTCTCCCAGATGACTTAAGAGAAAAG
CTGATCGATGAACAAGAAACTAGAGACAAGTTTAAGAAATTACACGCTTCTGTGCATGAT
CTCTCAACTGAAACCGCATTGAAACTGTTTTACGGAGCTTTGACTACAAAGCAAGGGGAA
GAGAAGAGTGGAGAAGAAGGTCCTGGCTCTAGTCTTGGTTCTGGTTCTGGTTCGTGCTGT
GTTTCAGCCACAAATGACTTGGGAAGCTATGTTACTGAGCTAAGCTCTCTTCTTGACAAA
TCTCCTAAGATTAAAGTTAGATTGGACGCATAAACGAAGATACGAGTGGAGGAAAAGGAA
CTCTAGTCCTAATTTTGGTTTGGGCACGACAAGCTACTAGCTAAGCTCTCTTCTGGACCA
GTATCTTATGATTGATGATGCATAGAGGAGGCTTGTTACCTCAAGTTATTGCCTAGCAGG
AGCATGGGGGAGGCTTGTTCCCGATTCTGTTTTGTATCTGAATTAAATATTTTTGTATTA
GTATCAAAAGAACAAATGTGACTTAATTAAACATTGGCAGTAGACTGCTCAAATTGAGTT
TAGTTTGCCCGC


BQ
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AF RR4DB11TF U 1
AF RR4DB11JQ C 236
BS 1 480 RR4DB11TF
BS 481 972 RR4DB11JQ

RD RR4DB11TF 480 0 0
GGCTGCTCTCACATCTTTCGGGTCACCTGTTATATCGTCGCCGTAGAAGTGATGGAGTCA
CCTAGAGATGGGAAGTCTAATTTCGCCAAAGAGCTTTACGGCGAAAGTTTGGAGGTTTCA
AAACCTGGAACAGAATCATCGCTTGGTTTAGGCAATCTTGAGAATGGAGATGGATCCTTT
TATGGAAGTTCAGATGAAGAACCAAGTGAATCTTACTCTATGAACAATGATACTGAGAAC
AGACGTGAAAAATTCCACATGCTTGGATACCGTGATGGGATTTCTGCTGGACAAGAAGCT
GCTGCTCAAGAAGGTTATAATGTCGGCTATAAGGAATCAGTTCTTGCTGGCTACAAGTTT
GGTATTGTTAGAGGTGTTTCCAGTGCGCTGGCCTTTCTCCCAGATGACTTAAGAGAAAAG
CTGATCGATGAACAAGAAACTAGAGACAAGTTTAAGAAATTACACGCTTCTGTGCATGAT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR4DB11JQ 737 0 0
AGAACAGACGTGAAAAATTCCACATGCTTGGATACCGTGATGGGATTTCTGCTGGACAAG
AAGCTGCTGCTCAAGAAGGTTATAATGTCGGCTATAAGGAATCAGTTCTTGCTGGCTACA
AGTTTGGTATTGTTAGAGGTGTTTCCAGTGCGCTGGCCTTTCTCCCAGATGACTTAAGAG
AAAAGCTGATCGATGAACAAGAAACTAGAGACAAGTTTAAGAAATTACACGCTTCTGTGC
ATGATCTCTCAACTGAAACCGCATTGAAACTGTTTTACGGAGCTTTGACTACAAAGCAAG
GGGAAGAGAAGAGTGGAGAAGAAGGTCCTGGCTCTAGTCTTGGTTCTGGTTCTGGTTCGT
GCTGTGTTTCAGCCACAAATGACTTGGGAAGCTATGTTACTGAGCTAAGCTCTCTTCTTG
ACAAATCTCCTAAGATTAAAGTTAGATTGGACGCATAAACGAAGATACGAGTGGAGGAAA
AGGAACTCTAGTCCTAATTTTGGTTTGGGCACGACAAGCTACTAGCTAAGCTCTCTTCTG
GACCAGTATCTTATGATTGATGATGCATAGAGGAGGCTTGTTACCTCAAGTTATTGCCTA
GCAGGAGCATGGGGGAGGCTTGTTCCCGATTCTGTTTTGTATCTGAATTAAATATTTTTG
TATTAGTATCAAAAGAACAAATGTGACTTAATTAAACATTGGCAGTAGACTGCTCAAATT
GAGTTTAGTTTGCCCGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL7201Contig1 1349 2 2 U
TTTTTATATCTCTAATTCTCTACCGCCCACGAAATCGAGACGACAAAAGAACGCCTTTCG
TTTACCTGTGGATCAATTGAAACCATTCTTCTTGTGACATGCCGTGGTCCAAGGCATGTA
GAGGTACTCGGTTTTATTCATATTTACACAACATTCATCGAACAACGTCGAGGTAGAAAA
TGAATCCTCCCTCTCTCCCTGATATGCATACTAACTGTTTGTTGAAATTCCTCAGAGAAA
GATGGTTGTGTAGGAGGACTGTGCCTCTTCTTGTTCCGTGCTCTCGTTATGGAGCTTGTA
AGGAAGGCAATCCGCATAATCTCCTAAGCAAGAGAGCGTTTTGGGGAAGCTCGCCTTCGT
TTCTCCTCCGCTCTGCTACTTGTAAATCCATGTTACTCGGTGGTGCTCATCGCCAGTATT
CTACTCACTCGATAACAGAAACCAAATCGAAGAAAATGCTCTACTATCTCACTGCTCTTG
TCTTTGGCATGGTTGGCCTCACTTACGCTGCTGTTCCATTGTATAGAACTTTCTGTCAAG
CCACTGGTTATGGAGGTACTGTTCAACGCAAAGAGGTAGGTATATATAACCATTTGTTAT
ATTCCTTTCACAATTATTCTTACTCTCTGTCTTGATCTTTGCGACTTGTACTACTACAAA
CTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGCATTCAGAATCTGGCACCGTCACTGAAAGGTGGTGTT
AAGACACCCCCATTCATCAATCAGTCATCTTTGTTTTTTTTTTAATCTTTTTGTATTATG
CGTGTAAGGTGAACGTGCTTAGCTTGTTATAATCACACGCTGTCACTTTTTTTTGACTCT
GTAAACAGGGAGATTGTGGTGCAGTTCAATGCTGATGTTGCAGATGGGATGCAGTGGAAG
TTCACTCCAACTCAAAGAGAGGTGAGAGTAAAGCCAGGAGAAAGCGCGCTCGCCTTTTAC
ACGGCTGAAAACAAAAGTTCAGCTCCAATAACCGGAGTGTCGACGTACAATGTCACTCCC
ATGAAGGCAGGGGTTTATTTCAACAATATACAATGTTTTTGCTTTGAGAAGCAACGACTT
CTTCCAGGAGAACATATCGACATGCCGGTGTTTTTCTACATAGATCCAGAGTTTGAGACA
GATCCAAGGATGGAGGGAATCAACATCCTGATATTGTCTTACACATTCTTCAAAGTGTCG
GAGGAAACTACTAAGGATTCGGTCGACAATAAAAGCTCTGTTCTAGTTGAAGAAACCAAG
TAAAAAATTGTTAATTTTTCTGGAGTGAAAATAATGTTTTGACACAGCCTTAAGCAAGAC
GAGGGAGAGTCTTCCAAGTTTTTTTTGTT


BQ
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AF RR4E371TF U 1
AF RR4E371JQ C 580
BS 1 687 RR4E371TF
BS 688 1349 RR4E371JQ

RD RR4E371TF 687 0 0
TTTTTATATCTCTAATTCTCTACCGCCCACGAAATCGAGACGACAAAAGAACGCCTTTCG
TTTACCTGTGGATCAATTGAAACCATTCTTCTTGTGACATGCCGTGGTCCAAGGCATGTA
GAGGTACTCGGTTTTATTCATATTTACACAACATTCATCGAACAACGTCGAGGTAGAAAA
TGAATCCTCCCTCTCTCCCTGATATGCATACTAACTGTTTGTTGAAATTCCTCAGAGAAA
GATGGTTGTGTAGGAGGACTGTGCCTCTTCTTGTTCCGTGCTCTCGTTATGGAGCTTGTA
AGGAAGGCAATCCGCATAATCTCCTAAGCAAGAGAGCGTTTTGGGGAAGCTCGCCTTCGT
TTCTCCTCCGCTCTGCTACTTGTAAATCCATGTTACTCGGTGGTGCTCATCGCCAGTATT
CTACTCACTCGATAACAGAAACCAAATCGAAGAAAATGCTCTACTATCTCACTGCTCTTG
TCTTTGGCATGGTTGGCCTCACTTACGCTGCTGTTCCATTGTATAGAACTTTCTGTCAAG
CCACTGGTTATGGAGGTACTGTTCAACGCAAAGAGGTAGGTATATATAACCATTTGTTAT
ATTCCTTTCACAATTATTCTTACTCTCTGTCTTGATCTTTGCGACTTGTACTACTACAAA
CTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGCATT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4E371JQ 770 0 0
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TGCGACTTGTACTACTACAAACTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGCATTCAGAATCTGGCA
CCGTCACTGAAAGGTGGTGTTAAGACACCCCCATTCATCAATCAGTCATCTTTGTTTTTT
TTTTAATCTTTTTGTATTATGCGTGTAAGGTGAACGTGCTTAGCTTGTTATAATCACACG
CTGTCACTTTTTTTTGACTCTGTAAACAGGGAGATTGTGGTGCAGTTCAATGCTGATGTT
GCAGATGGGATGCAGTGGAAGTTCACTCCAACTCAAAGAGAGGTGAGAGTAAAGCCAGGA
GAAAGCGCGCTCGCCTTTTACACGGCTGAAAACAAAAGTTCAGCTCCAATAACCGGAGTG
TCGACGTACAATGTCACTCCCATGAAGGCAGGGGTTTATTTCAACAATATACAATGTTTT
TGCTTTGAGAAGCAACGACTTCTTCCAGGAGAACATATCGACATGCCGGTGTTTTTCTAC
ATAGATCCAGAGTTTGAGACAGATCCAAGGATGGAGGGAATCAACATCCTGATATTGTCT
TACACATTCTTCAAAGTGTCGGAGGAAACTACTAAGGATTCGGTCGACAATAAAAGCTCT
GTTCTAGTTGAAGAAACCAAGTAAAAAATTGTTAATTTTTCTGGAGTGAAAATAATGTTT
TGACACAGCCTTAAGCAAGACGAGGGAGAGTCTTCCAAGTTTTTTTTGTT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

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GCCCTAAAGTGAGAGTCTACCTTTGTTTTTCTCCGATTCTAAGGAGGAAAAAAAAACTAA
AAACGAGATCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAACATGGAAGGAGTTGTAGAG
ATGGAACTAGAGAGAAGAAGCACGTTCTTGAACAGTTTGATGCAACAAAAGAAGAAGGCT
AAAGAGCAGCAGGACCTTAAAGAAGAGTTCAATGTCCGTGTTAGAGCTTCAGATATGCCT
CTCCCTGTTCAGAACAGGGCTTTCAGTTTGTCCCGTGAGATATTGAATGCCACGCCCGGT
AAAGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTTGATTCTGCATATGGT
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GGGTTCATATATTTCCAGATTGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAA
CCCCTAGATCACCAATGAGAAAGTTCATCCAATCTTTTTTTTTTTAAAAAAGACCATCTT
CAATTACTCCTTCCCCTTCGATTCCTCTGTCCTGTATTCACACTATTTATTTCGAGTTCA
ATGTGTTATATT


BQ
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AF RR4G313TF U 1
AF RR4G313JQ C 519
BS 1 672 RR4G313TF

RD RR4G313TF 672 0 0
GGACACGACTCTACTCAGAGACATTTCCACAAACAGATGGTGCTCGCTCCGAACTAACCA
GCCCTAAAGTGAGAGTCTACCTTTGTTTTTCTCCGATTCTAAGGAGGAAAAAAAAACTAA
AAACGAGATCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAACATGGAAGGAGTTGTAGAG
ATGGAACTAGAGAGAAGAAGCACGTTCTTGAACAGTTTGATGCAACAAAAGAAGAAGGCT
AAAGAGCAGCAGGACCTTAAAGAAGAGTTCAATGTCCGTGTTAGAGCTTCAGATATGCCT
CTCCCTGTTCAGAACAGGGCTTTCAGTTTGTCCCGTGAGATATTGAATGCCACGCCCGGT
AAAGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTTGATTCTGCATATGGT
CCTGCGTGGCACTGCATTGTTGGGACCAGCTTTGGTTCGTACGTCACTCATTCCATCGGA
GGGTTCATATATTTCCAGATTGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAA
CCCCTAGATCACCAATGAGAAAGTTCATCCAATCTTTTTTTTTTTAAAAAAGACCATCTT
CAATTACTCCTTCCCCTTCGATTCCTCTGTCCTGTATTCACACTATTTATTTCGAGTTCA
ATGTGTTATATT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4G313JQ 154 0 0
TCTATTCAAGACTGCTGTGGAACCCCTAGATCACCAATGAGAAAGTTCATCCAATTTTTT
TTTTTTTAAAAAAGACCATCTTCAATTACTCCTTCCCCTTCGATTCCTCTGTCCTGTATT
CACACTATTTATTTCGAGTTCAATGTGTTATATT

QA 1 154 1 154
DS 



AS 1 2

CO CL7203Contig1 864 2 12 U
GGTGTTAACGCCGACAGCTGCACACTTCAACCTGAGAAGTTTGACTGAGAAAGAATGGAA
GCTTGAAGCACCATACATGGAAAACGTTTCATATGCGAGTGCTGTAGGGAGCTTAATGTA
TATGCTATGGTCGGCTCAAGGCCAGACCTAGGCTTCGCAGTGGGGTTTATCAGAAGGTTC
ATAAGTAAACCAAGCAGAGAGCATTGGGAGGCAGTTAAGTGGGTGTTAAAGTACCTAAAG
GGAGCATCTAAGGTCAACCAAACATTCAGGAAGCATACAAGGTTTATTATTGAAGGTTAC
TCAGATTCAGACTACTCTACTGACAGGGACATGAGAAGATCAGTTACAGGATATATCTTC
AAAGTTGGAGGAAACACGGTTTCATGGAAATCTTGTCTGCAGTCTGTGGTTGCTCTCTCT
ACCACAAAGGGAGAGTACATGGCGATACATGAGGCAGCGAAGGAAGGTTTATGGCTAAAG
GGTTTATGTGCATAGTTGGGGTTCAAGCAAGGCAGTTTTCACTTGCATTGTGATCCACAG
AGTGCTATATCTCTAAAAAGGAACCCAGTTCATCACGAAAGGACAAAGCACATTGATAAT
AAGTTCCACTTCATCAGGGACCTGATAGCAGATGGAACTACAGTCCTAAACAAGATGCAC
ACGTCAGTTAATCCAGCAGATTTTCTGACTAAGACCGTACCTGGTCAGAAGTTCCAGCTA
TGCTGCGAGCTTGTGAACCTTCACTGAGACAGGAACGGCTACGCCAGGTAACTCCAGAGT
ATACAAGATGACCTCACAAGACACGTCACAGAACAGAGGGTCAGCATGTTGTTGGGCCCG
AATATGGCCCGGTAGCTGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F942JQ C 154
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ATACAAGATGAC

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DS 

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AGAAGATCAGTTACAGGATATATCTTCAAAGTTGGAGGAAACACGGTTTCATGGAAATCT
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AGTTTTCACTTGCATTGTGATCCACAGAGTGCTATATCTCTAAAAAGGAACCCAGTTCAT
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DS 



AS 1 2

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TGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RR4DJ71TF U 1
AF RR4DJ71JQ C 101
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BS 763 785 RR4DJ71JQ

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AGTTAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTGGAGTACGATGAGTCTGTTGTGATAAGAGT
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GAGTTTCATGGATAAGGTGAAGGTTCACGACTTTGAGAAAGTCTTCGAGCCATTGTTTTA
TCACTGGAAAGTCGAGAGACAAACTAAAGAATCGTTTGGAGAATTCACAACTCGCATGGG
ATTCGAGAAACTCAAGGAGCTAATAGACACGTATAAAGGAGGTCCTCAGTAAGGAGGAAT
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TTTGTTTGTTTCCAATATCGTTTTGTCTTGTGTTATAGACTATATTAGCAACATCAATAA
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QA 1 762 1 762
DS 

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GAGCTCGGTCTTGTCGGTGATGGACCCAACAGCTATCAGGTTTGGCTAGGAGGAACACCG
AACCAGACACAGATAGCGAGGAGTTTCATGGATAAGGTGAAGGTTCACGACTTTGAGAAA
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GGTCCTCAGTAAGGAGGAATCAGCTTTGATCTATAACTCTTGTGATGGAGAAACTTCTTC
TTCTTTTGTACCCGCCTTTTTTTGTTTGTTTCCAATATCGTTTTGTCTTGTGTTATAGAC
TATATTAGCAACATCAATAAGCATCTCTTTCACTTTCTTTAATGTGATTGGATCTCCCTT
CTTTTTAAAAATGGCTTCTTTGCCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7205Contig1 848 2 1 U
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GCTTCTGAAAGCAACCGATGATCCCTATTACAAAAACTTCATAGAATCTCTAGGAGGTGG
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CACAACCTACGCCAAGTACATGAAAGCCACACAACACACGTTCTACTGCGGAAACTCCAA
CATCATCGTCGCCGACACCTTGATAAGCGTATCGAGCGACAAGTGGATTACATACTCGGC
GAAAACCC


BQ
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AF RR4AG32TF U 1
AF RR4AG32JQ C 233
BS 1 848 RR4AG32TF

RD RR4AG32TF 848 0 0
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TCTTCTAACCCCGGTTCTGATGTAGCAGCTGAAACCGCAGCCGCTCTGGCTTCAGCTTCT
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CTGTCCTTTCTACTGTTCCTACTCTGGTTACAAGGACGAGCTTATGTGGGGTGCGGCGTG
GCTTCTGAAAGCAACCGATGATCCCTATTACAAAAACTTCATAGAATCTCTAGGAGGTGG
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ACAGAGAGCACTACTAAACAAAGACATCAACTTTGAAGTATACAAGCAAGAAGCTGAGAG
TTTCATATGCAAGATCCTCCCAAACACTCCTTCTTCGTCTACAAGTCACACTCCAGGAGG
CTTGATATACAAGTTACCTCATAGCAACCTTCAGCACGTAACCGCCATAACATTCTTGCT
CACAACCTACGCCAAGTACATGAAAGCCACACAACACACGTTCTACTGCGGAAACTCCAA
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DS 

RD RR4AG32JQ 616 0 0
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CTAAGAGTGTGATGCAGTTTGCCACTCAGTACAGAGGGAATTACAGTGATTCCCTTTTCT
TCTTCTGTCTGTCCTTTCTACTGTTCCTACTCTGGTTACAAGGACGAGCTTATGTGGGGT
GCGGCGTGGCTTCTGAAAGCAACCGATGATCCCTATTACAAAAACTTCATAGAATCTCTA
GGAGGTGGAGATCATCCTGACAACTTCAGCTGGGACAGCAAATATGCGGGGGCCTATGTT
CTTCTTTCACAGAGAGCACTACTAAACAAAGACATCAACTTTGAAGTATACAAGCAAGAA
GCTGAGAGTTTCATATGCAAGATCCTCCCAAACACTCCTTCTTCGTCTACAAGTCACACT
CCAGGAGGCTTGATATACAAGTTACCTCATAGCAACCTTCAGCACGTAACCGCCATAACA
TTCTTGCTCACAACCTACGCCAAGTACATGAAAGCCACACAACACACGTTCTACTGCGGA
AACTCCAACATCATCGTCGCCGACACCTTGATAAGCGTATCGAGCGACAAGTGGATTACA
TACTCGGCGAAAACCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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AACCCCCAAAAAAGTTAAGAAATGAGAAGGAACGTTATAAAGTAACCAAAAGAGAGACCT
ATGCTCATGTCTTCTTCCAAGCTTCAGCCAAAAACAAGATCCCAAAAAGAAACCAACATC
TCTCCTGAGTTAAAATTGTATTTGATTGTTTTGAACCTAAACCTGTTTCGGCTTTCCTTA
TTATTATACTTTCTTCTTCTTCTCCAGATTAGCAGTGACACTTCTCTGCTTATGCTTCCA
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BQ
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AF RR4GV54JQ U 286
AF RR4FL16JQ U 1
BS 1 711 RR4FL16JQ

RD RR4GV54JQ 189 0 0
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TTTCGGCTTTCCTTATTATTATACTTTCTTCTTCTTCTCCAGATTAGCAGTGACACTTCT
CTGCTTATGCTTCCACGAAGGAATCTTACCTGGGAAAGCCCACCTGAGCAACCTCTCCCA
CGAGTAGCA

QA 1 189 1 189
DS 

RD RR4FL16JQ 711 0 0
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CTAAACGAAACGAAATAAAATGGAAACAAGGAAAGACGTAGAGACTGACTAATAATGTAA
CCCTCTTAACATTTTAATTCAAGTATATGAGAAATGTGTGCTTCTTCCTTCTTGGAGAGT
AACCCCCAAAAAAGTTAAGAAATGAGAAGGAACGTTATAAAGTAACCAAAAGAGAGACCT
ATGCTCATGTCTTCTTCCAAGCTTCAGCCAAAAACAAGATCCCAAAAAGAAACCAACATC
TCTCCTGAGTTAAAATTGTATTTGATTGTTTTGAACCTAAACCTGTTTCGGCTTTCCTTA
TTATTATACTTTCTTCTTCTTCTCCAGATTAGCAGTGACACTTCTCTGCTTATGCTTCCA
CGAAGGAATCTTACCTGGGAAAGCCCACCTGAGCAACCTCTCCCACGAGTAGCAGATGAC
GAACATAAGTAAAGCCCAAAGGAGGAGATTATCCCTCATGCCTTCAGGCAGGGGAACCAG
CTTCAGCGAATCGTTCAGGTCCCTGAACAGATCAGATGCAATCACCGTGAAGAACCCTGC
TCCAGCAATGAGCGCGTAGAAGAAAGGTTTGTTCTCCCTTATACTCTGGTTAAACGGGTG
TCCCATGTAGTTCACAGCAAAAGTTGCCACCTGGAGCATCATGCTCACCAT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7207Contig1 469 2 2 U
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CCTCTCCGTTCATCTCCTCTTCCTTCTTCTCCTCTCTGGTGGTGCAAGGCAGTGTGGCAG
TTCAGTCTCTGGTCATCTCCTTGGTGGTTGTAGACTCGCAGTCCAATCTCTTTTCTTCTC
CTCTGCAGTCATGTATCCTCTCTGCTCCTCTGAAGTCCAGGCTTCTCTCTGCTCTTACAC
AGTCCAATCTCCTCACTGATTCATGGTGGCAGCTACATCTCAGCATCTCCAACAGAAGTT
TTTCTTATGCCTTTAGTTTTCACTTATTAGATCTAGCTCTTTGTTTGGATACTAGAATTT
TCAGAATCGACATTTCTGTTACATTTGGGAATTTCAGATTTTTTTCTTACAGTACTCTAA
TGTTGTAAAAAAATTTAAGCAATCTCATATTCTGAAGAAGAAAAAAAAA


BQ
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AF RR4DL31TF U 1
AF RR4DM28TF U 1
BS 1 454 RR4DL31TF
BS 455 469 RR4DM28TF

RD RR4DL31TF 454 0 0
TTTTTTCCCCTCTGCGAATCTCCTCTCCTCTTTCTTCTCCGATAGTGCAAGGTGTGGTGT
CCTCTCCGTTCATCTCCTCTTCCTTCTTCTCCTCTCTGGTGGTGCAAGGCAGTGTGGCAG
TTCAGTCTCTGGTCATCTCCTTGGTGGTTGTAGACTCGCAGTCCAATCTCTTTTCTTCTC
CTCTGCAGTCATGTATCCTCTCTGCTCCTCTGAAGTCCAGGCTTCTCTCTGCTCTTACAC
AGTCCAATCTCCTCACTGATTCATGGTGGCAGCTACATCTCAGCATCTCCAACAGAAGTT
TTTCTTATGCCTTTAGTTTTCACTTATTAGATCTAGCTCTTTGTTTGGATACTAGAATTT
TCAGAATCGACATTTCTGTTACATTTGGGAATTTCAGATTTTTTTCTTACAGTACTCTAA
TGTTGTAAAAAAATTTAAGCAATCTCATATTCTG

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4DM28TF 469 0 0
TTTTTTCCCCTCTGCGAATCTCCTCTCCTCTTTCTTCTCCGATAGTGCAAGGTGTGGTGT
CCTCTCCGTTCATCTCCTCTTCCTTCTTCTCCTCTCTGGTGGTGCAAGGCAGTGTGGCAG
TTCAGTCTCTGGTCATCTCCTTGGTGGTTGTAGACTCGCAGTCCAATCTCTTTTCTTCTC
CTCTGCAGTCATGTATCCTCTCTGCTCCTCTGAAGTCCAGGCTTCTCTCTGCTCTTACAC
AGTCCAATCTCCTCACTGATTCATGGTGGCAGCTACATCTCAGCATCTCCAACAGAAGTT
TTTCTTATGCCTTTAGTTTTCACTTATTAGATCTAGCTCTTTGTTTGGATACTAGAATTT
TCAGAATCGACATTTCTGTTACATTTGGGAATTTCAGATTTTTTTCTTACAGTACTCTAA
TGTTGTAAAAAAATTTAAGCAATCTCATATTCTGAAGAAGAAAAAAAAA

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL7208Contig1 1020 2 2 U
GGGGGCCAAGACCAAATCCATACGAGAGCGAATCAGCTTACGTAGCACAGATATGCATAA
CATGGGAAGCTCTAAGTTGGAGCTACAAAAGCTTCGAGAGAAAAAGATCATCCACGCAGC
GAATCAGCTTCAGCGACATCGGATGTCCCGCAGCAATCGCGGACCAGTTCCGTACGTTTC
ATATTCTATTACAAAGATACGTGGAGAACGAGCCTTATGAAAATGGAAGGAGACCTGAGA
TTTATGCTCGAATGAGAACCCTTGCTCCAAAGTTGCTTCTTGTTCCTGAATATCATGATT
ACGAGGAGGAAAAAGAGAAAGAAGAGGAAGAGGAGGGTTTCAAATCGAGGATAACGTCAG
CTGCGTTCTTGATGATAATGGAAGAACATTCATGAACTTTCTCAAAGCTGATAAAGTGAA
GCCTTGTCAAAAGATCATCAAAGCCTTTTTTGGCAGAAATAAACGAGGCTCTGTTGATCC
AACCCATGTCCTTCTAGTGAAGAAAGTCAACACAAAGAAAAAGATGAAGCTGAAAGAGAT
ACGTAAAGGAGGAAAATACGTGAAGAAGAAAAAGTTGAGTATAGAGGAGGAAATGGAGAT
ACTAATGGGATTAATTGACTTGAAAGTGGTGTCAAGAGTGTTGAGGATGAAAGAAATGAA
TGAAGAGAAGTTACATCGGTGTGAAGAGAAGATGAGCAAAGTTAAAATTATTCAAGATGG
AAAAGCGTTTCAAAGAGATTCGACTCCCCCTTTTTTTCCTCCACATTGACCCCACTATTT
TATTTCAACTTTCGTGAATATACCCTTTATTCTTTCCCCACCCACATCCTTTGGTTTTAC
ACGTCATATTGGAGGAGATTTTTTAGACTAAACTACGAATAAAGAGCCATAAAGTTTTAA
TTTGAATAAATAGATAGGGATATACTGTAGATTGCTTTAGTTCTTTTTTACTTTGCTTTT
CCTTTTCTTGTTTTGTATCTTTTTAACTTTTTGAAAATAAAATTTCAGCCTTTATTAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G505TF U 1
AF RR4G505JQ C 492
BS 1 607 RR4G505TF
BS 608 1020 RR4G505JQ

RD RR4G505TF 610 0 0
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TTTATGCTCGAATGAGAACCCTTGCTCCAAAGTTGCTTCTTGTTCCTGAATATCATGATT
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GCCTTGTCAAAAGATCATCAAAGCCTTTTTTGGCAGAAATAAACGAGGCTCTGTTGATCC
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ACGTAAAGGAGGAAAATACGTGAAGAAGAAAAAGTTGAGTATAGAGGAGGAAATGGAGAT
ACTAATG
AGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4G505JQ 529 0 0
TTT
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AATACGTGAAGAAGAAAAAGTTGAGTATAGAGGAGGAAATGGAGATACTAATGGGATTAA
TTGACTTGAAAGTGGTGTCAAGAGTGTTGAGGATGAAAGAAATGAATGAAGAGAAGTTAC
ATCGGTGTGAAGAGAAGATGAGCAAAGTTAAAATTATTCAAGATGGAAAAGCGTTTCAAA
GAGATTCGACTCCCCCTTTTTTTCCTCCACATTGACCCCACTATTTTATTTCAACTTTCG
TGAATATACCCTTTATTCTTTCCCCACCCACATCCTTTGGTTTTACACGTCATATTGGAG
GAGATTTTTTAGACTAAACTACGAATAAAGAGCCATAAAGTTTTAATTTGAATAAATAGA
TAGGGATATACTGTAGATTGCTTTAGTTCTTTTTTACTTTGCTTTTCCTTTTCTTGTTTT
GTATCTTTTTAACTTTTTGAAAATAAAATTTCAGCCTTTATTAGGT

QA 4 529 4 529
DS 



AS 1 2

CO CL7209Contig1 648 2 3 U
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ATGGCTATGACCATCGAAGTACTTGCTGGACTTGCCTTCATGTTTTCATCTAGTATCCTC
CTTCAGATCCTGGCGTGTGCTCTATATAGTAACTGGTGGCCAATGCTTTCAGCACTCATG
TATGTGGTAGTGCCTATGCCTTGTATGTTCTTTGGAGGAGGCTCAACGCAGTTCCTAATT
AGTCGAGATGGTGGAGGGTGGATAGATGCAGCAAAGTTCTTGACAGGAGCATCAACAGTA
GGAAGCCTGGCGATTCCAATCATATTAAGGCATGCGGGAATGATCGAGACGGGTGCAATG
CTCATAGAGTTCACATCGTTCTTCGTATTCATCTGCACTGTCACATGTTTTCACCGGGCT
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TGATCAAAAGAGAGGAGAGAGTTTAAGTGTTTGTATGATTCAGTGTTTGTAAAAAAGTTT
TAATTCATCATAGTGTACCTGATGCTTCTGTTTTTTTTTTCTTATCTCACTCTTGAAACA
AGTAAACAAGACGTGGTTGCACATGTTCAATTCTCTATCTATCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FF63TF U 1
AF RR4FF63JQ C 128
BS 1 579 RR4FF63TF
BS 580 580 RR4FF63JQ
BS 581 648 RR4FF63TF

RD RR4FF63TF 648 0 0
CGTCTCTTTCCAGTCCACCGCCGAGGAGTCGATCAAGAGTTCGATCTCCGTTGATCACAC
ATGGCTATGACCATCGAAGTACTTGCTGGACTTGCCTTCATGTTTTCATCTAGTATCCTC
CTTCAGATCCTGGCGTGTGCTCTATATAGTAACTGGTGGCCAATGCTTTCAGCACTCATG
TATGTGGTAGTGCCTATGCCTTGTATGTTCTTTGGAGGAGGCTCAACGCAGTTCCTAATT
AGTCGAGATGGTGGAGGGTGGATAGATGCAGCAAAGTTCTTGACAGGAGCATCAACAGTA
GGAAGCCTGGCGATTCCAATCATATTAAGGCATGCGGGAATGATCGAGACGGGTGCAATG
CTCATAGAGTTCACATCGTTCTTCGTATTCATCTGCACTGTCACATGTTTTCACCGGGCT
AGCCTCGATGATTATGATTGGTAACAGCTAACTTGTTGGTGGTGATTTACTAATTGATCA
TGATCAAAAGAGAGGAGAGAGTTTAAGTGTTTGTATGATTCAGTGTTTGTAAAAAAGTTT
TAATTCATCATAGTGTACCTGATGCTTCTGTTTTTTTTT*CTTATCTCACTCTTGAAACA
AGTAAACAAGACGTGGTTGCACATGTTCAATTCTCTATCTATCTTATT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4FF63JQ 521 0 0
TCCTGGCGTGTGCTCTATATAGTAACTGGTGGCCAATGCTTTCAGCACTCATGTATGTGG
TAGTGCCTATGCCTTGTATGTTCTTTGGAGGAGGCTCAACGCAGTTCCTAATTAGTCGAG
ATGGTGGAGGGTGGATAGATGCAGCAAAGTTCTTGACAGGAGCATCAACAGTAGGAAGCC
TGGCGATTCCAATCATATTAAGGCATGCGGGAATGATCGAGACGGGTGCAATGCTCATAG
AGTTCACATCGTTCTTCGTATTCATCTGCACTGTCACATGTTTTCACCGGGCTAGCCTCG
ATGATTATGATTGGTAACAGCTAACTTGTTGGTGGTGATTTACTAATTGATCATGATCAA
AAGAGAGGAGAGAGTTTAAGTGTTTGTATGATTCAGTGTTTGTAAAAAAGTTTTAATTCA
TCATAGTGTACCTGATGCTTCTGTTTTTTTTTTCTTATCTCACTCTTGAAACAAGTAAAC
AAGACGTGGTTGCACATGTTCAATTCTCTATCTATCTTATT

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL7210Contig1 661 2 1 U
GGTGGATTGATTGGAACATATCACGACTGATGTGAAGCTTTTTCGACGTATCCAAGAACT
TACGATCTTCTTCATGTTGATGGTCTGTTTACATCTGAGAACCAAAGGTGTGATATGAAA
TATGTAATGTTGGAAATGGATAGGATCTTGCGTCCTAATGGGTATGCGATTATACGCGAG
TCGAGCTATTTCGTGGAGAATATAGCATCGGTTGCTAAATGACTGAGATGGAGTTGCCGT
AAGGAGAAAACTGAGTCTGAGTCTGAGAATGAGAAGCTCTTGATTTGCCAGAAGAAGCTT
TGGTATTCATCTAACGCAGCAACGTCAGAAACAAAATAGTAGAAAAGGCTTGAGCTTAAA
GCTTTTGTCTTGTCCGGAGGTTTCTTGAGAACAAAGTCACTACAACAAAGCATAGGTTCT
TTGTATCGCTTTAAAGCCAAGAAAGCTTTTTAAAAGCGGCTGCCAATTATTATTTTGTTA
TCCCAGCATATTTATCAACTTTTTCGATTTTTCTTATAGTATATGCTTGGTGAGATATAT
ATTATTGATCTTTTGTTTAAACTGTAATTTTAAATTGTCGAGATTTCTCCAACGTTAGGT
ATATTGATTTGTGATACAGTTGTATTGTTTTACACGTTAATGAGTTGGTGGTCCATTAAT
C


BQ
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20 

AF RR4A591JQ C 1
AF RR4A591TF U 1
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C

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DS 

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TACGATCTTCTTCATGTTGATGGTCTGTTTACATCTGAGAACCAAAGGTGTGATATGAAA
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AAGGAGAAAACTGAGTCTGAGTCTGAGAATGAGAAGCTCTTGATTTGCCAGAAGAAGCTT
TGGTATTCATCTAACGCAGCAACGTCAGAAACAAAATAGTAGAAAAGGCTTGAGCTTAAA
GCTTTTGTCTTGTCCGGAGGTTTCTTGAGAACAAAGTCACTACAACAAAGCATAGGTTCT
TTGTATCGCTTTAAAGCCAAGAAAGCTTTTTAAAAGCGGCTGCCAATTATTATTTTGTTA
TCCCAGCATATTTATCAACTTTTTCGATTTTTCTTATAGTATATGCTTGGTGAGATATAT
ATTATTGATCTTTTGTTTAAACTGTAATTTTAAATTGTCGAGATTTCTCCAACGTTAGGT
ATATTGATTTGTGATACAGTTGTATTGTTTTACACGTTAATGAGTTGGTGGTCCATTAAT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL7211Contig1 931 2 4 U
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BQ
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AF RR4FB38TF U 1
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AAGAAAGTGGGAAGATACTTAATTTAGTCTTCGTGTGGGCTAATGATGGAGAGCAGCTGA
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GCAATCTACGGTCAATGCGAAGCACTCTGAAGCTTCTAGGCCCAGCGGAGCACATTCCAT
CGAAAATCGAAGTAGACGTGAGCAAACTCGACATAGAGGACAAAGTCTTGATGCAAGAAG
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G

QA 1 731 1 731
DS 

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GAGTCGGGTCGTGTACTTCCCCTCAAGATTCATAGAGATGAAGAAAGTGGGAAGATACTT
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TTTTTGCGTCG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

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AF RR4AN57JQ C 1
AF RR4AN57TF U 1
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RD RR4AN57JQ 494 0 0
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AGTTTCTTGAAAAG

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4AN57TF 494 0 0
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TCATCGACTTCGTTCTTGGCAGTTTGACGAAGCAAGATCAGTTTTACGAGACCGATCCTC
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AGTTTCTTGAAAAG

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

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GGCTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW29TF C 1
AF RR4FW29JQ U 83
BS 1 82 RR4FW29TF
BS 83 210 RR4FW29JQ
BS 211 211 RR4FW29TF
BS 212 667 RR4FW29JQ

RD RR4FW29TF 509 0 0
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QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4FW29JQ 585 0 0
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QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A951JQ C 1
AF RR4A951TF U 1
BS 1 747 RR4A951TF

RD RR4A951JQ 747 0 0
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QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4A951TF 747 0 0
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AGCTCAACAACTTGGTGTCACATGTCTTGCTGGCTATACTGCTGGAGCCGTAGGTACAGT
CATCTCTAACCCTGCAGATGTGGTTGTTTCGTCTCTTTACAACAACAAAGCCAAGAATGT
GTTGCAGGCTGTGAGAAACATTGGGTTTGTTGGTCTCTTCACCAGAAGTCTTCCTGTTCG
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CGTATTATGGTATTATGTAAGATTCTCTTACGTTTCCCAATTGTATAACAACTTAAGCTG
ATAACACGACAACAATATATTGTCTGC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL7215Contig1 799 2 4 U
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ATGGCCAATTCCCTCCTCCTGATGCTGAAGCATTGCATTCCAAGGTGGACGAGGACGAGA
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TGCTTTTGATGTGTTTTAGTTTATGGTAATTGAGGAAGAAGATGTGGTGAAGAGATTGGC
CACGTATGTGACTTATAAATAGAAGAGTTAGATACATATACAAAGCCTTTTTGGGGTCAA
ATATTTAGCGAACTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GK20TF U 1
AF RR4GK20JQ C 140
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BS 749 749 RR4GK20JQ
BS 750 774 RR4GK20TF
BS 775 799 RR4GK20JQ

RD RR4GK20TF 774 0 0
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AATTGGACAGAGCCTTACGTACAGACGAAATCGGACAGAGTTCGGATCGATAACACGGAG
TCGTACGAATTACTTCGTCGGCCGCATGTTTCATGCAGAGAATCATAAGACGAGAAGATT
CCCAGAGAGAGAGGTTCTTTTACAACGTATGTGAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTGTAAACC
CTAACCGCAAGAACGATGCCAGGTCCCTGAAACGAGCTCTCGATCTCGTCTCCCCTGTCC
ATGGCCAATTCCCTCCTCCTGATGCTGAAGCATTGCATTCCAAGGTGGACGAGGACGAGA
AGAATCTCGTTACCAAACCCGCCGTCGTCAAGGGCGTTCTCCTTCAGCAGACTCTTCGGG
CCATCGTCTCCGTTATTCTCTTCAAGAGAGCAGAAAAGAAAAGCAGTAGTTTTAATGGAG
ATGAGGACTTCAGGAGGAGTAACCAGTGCTCCTTGAGTTATCGGGACGAAACGAATCATT
TGGGTTTCTAAATTGTCGAAGACTAACAACAGCTGAACAAAAATGGGCTTAGAAAGACGC
GGGAAGTGCGTCTTTTGAAAACACACGACACTTTTTGTTTTTTGAAAACACGCAACACTC
TGCTTTTGATGTGTTTTAGTTTATGGTAATTGAGGAAGAAGATGTGGTGAAGAGATTGGC
CACGTATGTGACTTATAAATAGAAGAGT*AGATACATATACAAAGCCTTTTTGG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4GK20JQ 660 0 0
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TTACAACGTATGTGAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTGTAAACCCTAACCGCAAGAACGATGC
CAGGTCCCTGAAACGAGCTCTCGATCTCGTCTCCCCTGTCCATGGCCAATTCCCTCCTCC
TGATGCTGAAGCATTGCATTCCAAGGTGGACGAGGACGAGAAGAATCTCGTTACCAAACC
CGCCGTCGTCAAGGGCGTTCTCCTTCAGCAGACTTTTCGGGCCATCGTTTCCGTTATTCT
CTTCAAGAGAGCAGAAAAGAAAAGCAGTAGTTTTAATGGAGATGAGGACTTCAGGAGGAG
TAACCAGTGCTCCTTGAGTTATCGGGACGAAACGAATCATTTGGGTTTTTAAATTGTCGA
AGACTAACAACAGCTGAACAAAAATGGGCTTAGAAAGACGCGGGAAGTGCGTCTTTTGAA
AACACACGACACTTTTTGTTTTTTGAAAACACGCAACACTCTGCTTTTGATGTGTTTTAG
TTTATGGTAATTGAGGAAGAAGATGTGGTGAAGAGATTGGCCACGTATGTGACTTATAAA
TAGAAGAGTTAGATACATATACAAAGCCTTTTTGGGGTCAAATATTTAGCGAACTTTCTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7216Contig1 623 2 1 U
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CAATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGG
CTTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGTGGTTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAAT
ACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACA
TAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTA
ACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGCAACAGGACAGGCCAGCCAGCAA
TATTGCAGACGAATGTGTTTACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCT
GGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTG
TATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCTAAGGATCTAGGAGTAC
GTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATGTTTCTTGTATGTTACGTGATTTATAAAAC
TTACAAGTCTTTTTGTTGGCACC


BQ
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AF RR4BF20JQ C 1
AF RR4BF20TF U 1
BS 1 623 RR4BF20TF

RD RR4BF20JQ 623 0 0
GGACTCACCACATCATTCACCATCATCACATCTCTCTCTCTCTCTCTTCTACTGTAATGG
CAATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGG
CTTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGTGGTTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAAT
ACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACA
TAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTA
ACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGCAACAGGACAGGCCAGCCAGCAA
TATTGCAGACGAATGTGTTTACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCT
GGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTG
TATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCTAAGGATCTAGGAGTAC
GTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATGTTTCTTGTATGTTACGTGATTTATAAAAC
TTACAAGTCTTTT*GTTGGCACC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4BF20TF 623 0 0
GGACTCACCACATCATTCACCATCATCACATCTCTCTCTCTCTCTCTTCTACTGTAATGG
CAATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGG
CTTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGTGGTTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAAT
ACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACA
TAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTA
ACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGCAACAGGACAGGCCAGCCAGCAA
TATTGCAGACGAATGTGTTTACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCT
GGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTG
TATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCTAAGGATCTAGGAGTAC
GTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATGTTTCTTGTATGTTACGTGATTTATAAAAC
TTACAAGTCTTTTTGTTGGCACC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7217Contig1 621 2 4 U
GATTGTTGTCTTCTCTTGTCGCTCGGAATTCACAGGAGAGAGAGAGGAGGGGATCGAGAA
AGGTAAATCGAAGAAAGAAGGATGGGTGGAGGAATGGAGACGAACAAGAACAAGTTCATA
GAGGATTGGGGATCCGCGAGGGAGAATCTGGAGCATAACTTCCGATGGACACGTCGCAAC
TTTGCTCTCATCGGCATCTTCGGCATCGCCCTCCCCATCCTCGTCTACAAGGGCATCGTC
AAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCTGGCAGACCACATAGAAAGTTCCTCTGAGGT
TTCTTTGCAAGCTACTACACTCTCTTCTTCATAAAGTCTCAGCAGTGTGAAATTTTCAAG
AAGCTGATGCTACAACTCTCCTTTTTCTTTTTGCATTGTATTCAGAATAAAAGAATAACA
TCTCAATGATTATAACTTCTGTTTTGTAAAAGTTTGTTTTTATTTTTGACATTACTTTTG
AGCTCAAGTTAGCATCTTGCAGGATTTTAACATTTTGTAAGTGGGTGAGAACTTTTGAGC
CACACCAAAGGAAAAACAAAAGGTTTGTGAAAAAAATCCAAAACAAAAATAAAATGGTTG
TTCTGGAAGCAAAGTTTGATT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4DQ40JQ C 1
AF RR4DQ40TF U 1
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GAGGATTGGGGATCCGCGAGGGAGAATCTGGAGCATAACTTCCGATGGACACGTCGCAAC
TTTGCTTTCATCGGCATTTTCGGCATCGCCCTCCCCATCCTCGTCTACAAGGGCATCGTC
AAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCTGGCAGACCACATAGAAAGTTCCTTTGAGGT
TTCTTTGCAAGCTACTACACTCTTTTCTTCATAAAGTCTCAGCAGTGTGAAATTTTCAAG
AAGCTGATGCTACAACTCTCCTTTTTCTTTTTGCATTGTATTCAGAATAAAAGAATAACA
TCTCAATGATTATAACTTCTGTTTTGTAAAAGTTTGTTTTTATTTTTGACATTACTTTTG
AGCTCAAGTTAGCATCTTGCAGGATTTTAACATTTTGTAAGTGGGTGAGAACTTTTGAGC
CACACCAAAGGAAAAACAAAAGGTTTGTGAAAAAAATCCAAAACAAAAATAAAATGGTTG
TTCTGGAAGCAAAGTTTGATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DQ40TF 620 0 0
GATTGTTGTCTTCTCTTGTCGCTCGGAATTCACAGGAGAGAGAGAGGAGGGGATCGAGAA
AGGTAAATCGAAGAAAGAAGGATGGGTGGAGGAATGGAGACGAACAAGAACAAGTTCATA
GAGGATTGGGGATCCGCGAGGGAGAATCTGGAGCATAACTTCCGATGGACACGTCGCAAC
TTTGCTCTCATCGGCATCTTCGGCATCGCCCTCCCCATCCTCGTCTACAAGGGCATCGTC
AAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCTGGCAGACCACATAGAAAGTTCCTCTGAGGT
TTCTTTGCAAGCTACTACACTCTCTTCTTCATAAAGTCTCAGCAGTGTGAAATTTTCAAG
AAGCTGATGCTACAACTCTCCTTTTTCTTTTTGCATTGTATTCAGAATAAAAGAATAACA
TCTCAATGATTATAACTTCTGTTTTGTAAAAGTTTGTTTTTATTTTTGACATTACTTTTG
AGCTCAAGTTAGCATCTTGCAGGATTTTAACATTTTGTAAGTGGGTGAGAACTTTTGAGC
CACACCAAAGGAAAAACAAAAGGTTTGTGAAAAAA*TCCAAAACAAAAATAAAATGGTTG
TTCTGGAAGCAAAGTTTGAT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL7218Contig1 633 2 2 U
GGCGCTTGGAGAAAACTAGTGGAGCCTCGTGCAGGTCCTGATCTCCGTAAAGGGTTTGAG
CTATTAGACCTAGACGGAGGGATCGGATGGGAGCTTCTTACATCGATGGTCCGGTTCAAA
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TTGCTTGCGCTGTCCGTCATGCAGAACGTGAGGATGCAGTACTTCAGGGCTACGCAACAA
GACTACAGCGAAGCTGCAAACTGGGTGATTCAGTTGATGGCAAGGTCCGGGACGGAAAAA
GATGGAGGGTTCACAGAAACGCAGCTTCAGGAACTTAGGGAGAAAGAGCCACGGAAGAAA
GCGAGTGCGCAGAGAAACGCTCTCGCATCAGCGCTTAGGCTTAAGAGGAAGCTTGTGAAA
ACAGTTGCGGAGACTATTGATGAGATTGCCGATGGCCGCAAGACCGTGTGGTGGAACAGG
TGGATCCCCAGAGAGGAGTGAGGACTTGCGGTATCATCTATCAATGTTTCCATTTTCATC
CTAATAGTGTAAATCTCAATGTATATCTTATTAGCCTTTAGTAAATTATCACTACTTGTA
AAGCAAGTAACCGTAAATAAAAACATTGTACCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A538JQ C 1
AF RR4A538TF U 1
BS 1 618 RR4A538TF
BS 619 633 RR4A538JQ

RD RR4A538JQ 633 0 0
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CTATTAGACCTAGACGGAGGGATCGGATGGGAGCTTCTTACATCGATGGTCCGGTTCAAA
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TTGCTTGCGCTGTCCGTCATGCAGAACGTGAGGATGCAGTACTTCAGGGCTACGCAACAA
GACTACAGCGAAGCTGCAAACTGGGTGATTCAGTTGATGGCAAGGTCCGGGACGGAAAAA
GATGGAGGGTTCACAGAAACGCAGCTTCAGGAACTTAGGGAGAAAGAGCCACGGAAGAAA
GCGAGTGCGCAGAGAAACGCTCTCGCATCAGCGCTTAGGCTTAAGAGGAAGCTTGTGAAA
ACAGTTGCGGAGACTATTGATGAGATTGCCGATGGCCGCAAGACCGTGTGGTGGAACAGG
TGGATCCCCAGAGAGGAGTGAGGACTTGCGGTATCATCTATCAATGTTTCCATTTTCATC
CTAATAGTGTAAATCTCAATGTATATCTTATTAGCCTTTAGTAAATTATCACTACTTGTA
AAGCAAGTAACCGTAAATAAAAACATTGTACCT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4A538TF 618 0 0
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CTATTAGACCTAGACGGAGGGATCGGATGGGAGCTTCTTACATCGATGGTCCGGTTCAAA
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TTGCTTGCGCTGTCCGTCATGCAGAACGTGAGGATGCAGTACTTCAGGGCTACGCAACAA
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GATGGAGGGTTCACAGAAACGCAGCTTCAGGAACTTAGGGAGAAAGAGCCACGGAAGAAA
GCGAGTGCGCAGAGAAACGCTCTCGCATCAGCGCTTAGGCTTAAGAGGAAGCTTGTGAAA
ACAGTTGCGGAGACTATTGATGAGATTGCCGATGGCCGCAAGACCGTGTGGTGGAACAGG
TGGATCCCCAGAGAGGAGTGAGGACTTGCGGTATCATCTATCAATGTTTCCATTTTCATC
CTAATAGTGTAAATCTCAATGTATATCTTATTAGCCTTTAGTAAATTATCACTACTTGTA
AAGCAAGTAACCGTAAAT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL7219Contig1 262 2 2 U
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ACAAAAGGCCTGTTCTCAGGCAAATGACCTTTGCCCAAAACCTTGAAGAACCCGTGCTGC
GTCACATCGATCATCGGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CF47TF C 1
AF RR4CF47JQ U 24
BS 1 23 RR4CF47TF
BS 24 262 RR4CF47JQ

RD RR4CF47TF 262 0 0
GCTTAAAAGATGTCTCATTCCAAAATATCCAAAAAGCGATGAGTTCAACAACAAAGAAGA
CATAACAAACAAAAACCAAAACGAAACTCGACCTAACCCCATTAGGCTGTAAGCACGACA
GCCCCACCAGCCTCCTTAATCTTCTTCTCAGCAGTCTTCGAAATAAGCTTCGCCTTCACA
ACAAAAGGCCTGTTCTCAGGCAAATGACCTTTGCCCAAAACCTTGAAGAACCCGTGCTGC
GTCACATCGATCATCGGCACCC

QA 1 262 1 262
DS 

RD RR4CF47JQ 239 0 0
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CTTCTCAGCAGTCTTCGAAATAAGCTTCGCCTTCACAACAAAAGGCCTGTTCTCAGGCAA
ATGACCTTTGCCCAAAACCTTGAAGAACCCGTGCTGCGTCACATCGATCATCGGCACCC

QA 1 239 1 239
DS 



AS 1 2

CO CL7220Contig1 849 2 2 U
GGCTTACTGTGAGGGAGGGAACATGGCTAATGCTATCAAGAAAGCCAGAGGAAAGTTATT
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TTCAAACCGTGTACTTCACATGGACCTTACGTGCTCAAACATTTTCCTTCCAAAACATGA
TCACGTCCAGCTTGGTAACTATGGTTTGGCAAAACTCATCAATCCAGAAGGAAGAGAGTG
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TTGATGTGGAGATTGTGAGTGCGCAAGAAGGTTTATGTTTCACTCAAGAAGAAGCTGAAA
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GCAAGCTCAGGAATCTAGGACCACCGCAGAGCAAAGAAAGAGCAGATGCGTTGGAGTGTT
TGCTGGAGAAATGCGCAGGGCTTGTGAAGCAAGAGAAGTATGAAGAACTCGCTGGTTTGC
TCACACCGTTTGGTGAAGACGGTGTTTCGGCTAGGGACACTGCTATTTGGTTTGCAAAGA
CACTCCTGTCTTCTTCTTCTGACAAACTCAACCAAGGAACCTGATTTGAGTTTGAGTTTG
AGAAACAACATTTTTCTTTTATTTGTCAAATATGTAAAAATCTTCATTTTTTTTTCTCAT
TGCTTCTCCAATTTAGTTTGTGAACACTCTGCTTTTTTCTATGTAATATCTACTGCAACT
AAGTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH48TF U 1
AF RR4AH48JQ C 60
BS 1 720 RR4AH48TF
BS 721 849 RR4AH48JQ

RD RR4AH48TF 720 0 0
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TCCAGAGGAGAGAATCTTTAAATGGTTAGCACAGTTGTTACTGGCTGTTAACTATTTGCA
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TCACGTCCAGCTTGGTAACTATGGTTTGGCAAAACTCATCAATCCAGAAGGAAGAGAGTG
ATGATGTGCCAAAAGAATGGGAAAATATGCTCTCCTCAGGAGTGTCTCAGTTACTTGATG
TTGATGTGGAGATTGTGAGTGCGCAAGAAGGTTTATGTTTCACTCAAGAAGAAGCTGAAA
CTCAGGAGGCAGTTCCGGAACCAAAGGATCAGCTAAAGCTGGCTGAAGTTGTAGCAGAAA
GTGAGGTTGATGAAGCAAAGACGGTGAAGCTAACGGCGAGTGAAATGTCTTCTGTACTGA
GCAAGCTCAGGAATCTAGGACCACCGCAGAGCAAAGAAAGAGCAGATGCGTTGGAGTGTT
TGCTGGAGAAATGCGCAGGGCTTGTGAAGCAAGAGAAGTATGAAGAACTCGCTGGTTTGC
TCACACCGTTTGGTGAAGACGGTGTTTCGGCTAGGGACACTGCTATTTGGTTTGCAAAGA
CACTCCTGTCTTCTTCTTCTGACAAACTCAACCAAGGAACCTGATTTGAGTTTGAGTTTG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4AH48JQ 790 0 0
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ATTCAAACCGTGTACTTCACATGGACCTTACGTGCTCAAACATTTTCCTTCCAAAACATG
ATCACGTCCAGCTTGGTAACTATGGTTTGGCAAAACTCATCAATCCAGAAGGAAGAGAGT
GATGATGTGCCAAAAGAATGGGAAAATATGCTCTCCTCAGGAGTGTCTCAGTTACTTGAT
GTTGATGTGGAGATTGTGAGTGCGCAAGAAGGTTTATGTTTCACTCAAGAAGAAGCTGAA
ACTCAGGAGGCAGTTCCGGAACCAAAGGATCAGCTAAAGCTGGCTGAAGTTGTAGCAGAA
AGTGAGGTTGATGAAGCAAAGACGGTGAAGCTAACGGCGAGTGAAATGTCTTCTGTACTG
AGCAAGCTCAGGAATCTAGGACCACCGCAGAGCAAAGAAAGAGCAGATGCGTTGGAGTGT
TTGCTGGAGAAATGCGCAGGGCTTGTGAAGCAAGAGAAGTATGAAGAACTCGCTGGTTTG
CTCACACCGTTTGGTGAAGACGGTGTTTCGGCTAGGGACACTGCTATTTGGTTTGCAAAG
ACACTCCTGTCTTCTTCTTCTGACAAACTCAACCAAGGAACCTGATTTGAGTTTGAGTTT
GAGAAACAACATTTTTCTTTTATTTGTCAAATATGTAAAAATCTTCATTTTTTTTTCTCA
TTGCTTCTCCAATTTAGTTTGTGAACACTCTGCTTTTTTCTATGTAATATCTACTGCAAC
TAAGTTATAT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL7221Contig1 880 2 4 U
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AAAAATCGACACTGCGGCGGAGAGAGGTCATCTTTCAAAAACCCTTTTACATTGACTTTC
GATTCACCAAGTGTCGGTGATGGCCTCGATCTCGACATGGTTCAGATACATGGCGCACAA
GCTTGAGTATTCTCTCACCCTCAGTCTCAAGAGTCATAGGAGAGAAAAACTGAGTGACCG
AGAACTCATTCAAATCATCTTCAAGAATCTATTCCATGGGAAGATAACCTACTTACATTC
GGGCAAAGGACCAGAAATGTCCCCAACCATGGCAGCACACGAGAACACGCTTCTTGTCCG
CAAAATACCAATTGCTAACACGAGGTATCTGTACGTTGGAGATGCTGTGGTCTTAAAAGA
CCCAAACGATTCAGACAAATATCTGGTGAGAAGATTAGCAGCTGTGGAAGGGTTCGAAAT
GGTATCAGGTGATGCAAAAGAGGAGCCTTTTGTTCTCGACAAGGATCAGTGTTGGGTTGT
TGCTGAAAACAAGGATATCAAACCCAGGGAAGCATACGATAGTCGAACGTTTGGTCCAGT
TTCAACAGCAGACATTGTTGGAAGAGCTATATATTGTCTGAGAACCGCCGTGGATCATGG
TCCCGTCCGAAACAGTCACACTGCGATGGGACAAGATTCTCCAATCCTGGCAGTAGAATT
GGACGTGGACGAGATGGCTAAAAACCACAAGGCACAATAAAGAGTGACACTTGCTTGTTT
TTTTTGTGCCAAAGCTTAAATTGCGTTATTTGTTTTGAGATATGAGTAAAACAAATAAAC
CATACAATGATGATGATGAATCAGAAAATTTCACGTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EF45TF U 1
AF RR4EF45JQ C 294
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BS 694 694 RR4EF45JQ
BS 695 743 RR4EF45TF
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AGAACTCATTCAAATCATCTTCAAGAATCTATTCCATGGGAAGATAACCTACTTACATTC
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TGCTGAAAACAAGGATATCAAACCCAGGGAAGCATACGATAGTCGAACGTTTGGTCCAGT
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TCCCGTCCGAAACAGTCACACTGCGATGGGACA*GATTCTCCAATCCTGGCAGTAGAATT
GGACGTGGACGAGATGGCTAAAA
CC

QA 1 743 1 743
DS 

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GGGTTGTTGCTGAAAACAAGGATATCAAACCCAGGGAAGCATACGATAGTCGAACGTTTG
GTCCAGTTTCAACAGCAGACATTGTTGGAAGAGCTATATATTGTCTGAGAACCGCCGTGG
ATCATGGTCCCGTCCGAAACAGTCACACTGCGATGGGACAAGATTCTCCAATCCTGGCAG
TAGAATTGGACGTGGACGAGATGGCTAAAAACCACAAGGCACAATAAAGAGTGACACTTG
CTTGTTTTTTTTGTGCCAAAGCTTAAATTGCGTTATTTGTTTTGAGATATGAGTAAAACA
AATAAACCATACAATGATGATGATGAATCAGAAAATTTCACGTTCCG

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL7222Contig1 651 2 2 U
ATATGAATATTATTAACTTTAATTTTATTAAATTTTGGGGACGTTTATATATATAATTTT
TCCCCAAATTTTTGTGGGTAATAGACCAATGCTTCACTAGCCTATACACTCAGGACCGGC
CATGCTTCACGCTAGTATAAAAAAAACCGCGCACATGAATCAAAATTCAACATACTTTCT
TATCTTTGCTCTTCCTTGAAGAATGATCATCTTTTCTACGCTTTCCATTTTCCTTTTTAG
TCATCCATCTACAACGTAAAGCAACATCTCTAACAGTTTTATCCTTCATTTTCATCGAAA
TCTTGGCATAACGAACAATTGTAGGCTCTGACGCGTACTTTGCGAGCAAATCTTCCAATA
GAGATTGCTCCTCATGAGTCCAATCCACAGAGATCCCTGGATTATGCCTCAACGCGCTTA
TCGTCTCTGAATTATCCGCCGCCGCCTTATTACCACCGTTATCCACAGCACCATTCGTAG
CCACCACCGCCGCCGGAGATGAAGACGTCACCTTATGAGCCGCCGACGTACCTTCCTGAT
TGTTCCCCGGCGGATTCGCACTCGCCGCCATAAAAAATTCGCTTCCTTTCTTAAAAAAAC
TACACCGAAGAGTCTCGAATTCGGACAAATCCGGGATTCAGACCGGGACCC


BQ
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AF RR4C190TF C 1
AF RR4C190JQ U 33
BS 1 32 RR4C190TF
BS 33 651 RR4C190JQ

RD RR4C190TF 651 0 0
ATATGAATATTATTAACTTTAATTTTATTAAATTTTGGGGACGTTTATATATATAATTTT
TCCCCAAATTTTTGTGGGTAATAGACCAATGCTTCACTAGCCTATACACTCAGGACCGGC
CATGCTTCACGCTAGTATAAAAAAAACCGCGCACATGAATCAAAATTCAACATACTTTCT
TATCTTTGCTCTTCCTTGAAGAATGATCATCTTTTCTACGCTTTCCATTTTCCTTTTTAG
TCATCCATCTACAACGTAAAGCAACATCTCTAACAGTTTTATCCTTCATTTTCATCGAAA
TCTTGGCATAACGAACAATTGTAGGCTCTGACGCGTACTTTGCGAGCAAATCTTCCAATA
GAGATTGCTCCTCATGAGTCCAATCCACAGAGATCCCTGGATTATGCCTCAACGCGCTTA
TCGTCTCTGAATTATCCGCCGCCGCCTTATTACCACCGTTATCCACAGCACCATTCGTAG
CCACCACCGCCGCCGGAGATGAAGACGTCACCTTATGAGCCGCCGACGTACCTTCCTGAT
TGTTCCCCGGCGGATTCGCACTCGCCGCCATAAAAAATTCGCTTCCTTTCTTAAAAAAAC
TACACCGAAGAGTCTCGAATTCGGACAAATCCGGGATTCAGACCGGGACCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4C190JQ 619 0 0
TTTTGGGGACGTTTATATATATAATTTTTCCCCAAATTTTTGTGGGTAATAGACCAATGC
TTCACTAGCCTATACACTCAGGACCGGCCATGCTTCACGCTAGTATAAAAAAAACCGCGC
ACATGAATCAAAATTCAACATACTTTCTTATCTTTGCTCTTCCTTGAAGAATGATCATCT
TTTCTACGCTTTCCATTTTCCTTTTTAGTCATCCATCTACAACGTAAAGCAACATCTCTA
ACAGTTTTATCCTTCATTTTCATCGAAATCTTGGCATAACGAACAATTGTAGGCTCTGAC
GCGTACTTTGCGAGCAAATCTTCCAATAGAGATTGCTCCTCATGAGTCCAATCCACAGAG
ATCCCTGGATTATGCCTCAACGCGCTTATCGTCTCTGAATTATCCGCCGCCGCCTTATTA
CCACCGTTATCCACAGCACCATTCGTAGCCACCACCGCCGCCGGAGATGAAGACGTCACC
TTATGAGCCGCCGACGTACCTTCCTGATTGTTCCCCGGCGGATTCGCACTCGCCGCCATA
AAAAATTCGCTTCCTTTCTTAAAAAAACTACACCGAAGAGTCTCGAATTCGGACAAATCC
GGGATTCAGACCGGGACCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL7223Contig1 902 2 2 U
GGGCAAAAGAAATCGAGAAAACGCCTTTGTCGAATAGAAACCCTAGCGAGAGCGGAAGGA
AGGAAGGAAGGGGACAAGAGCCGAGGAAAACTAGAGAGGGGGCAGATTTGAATTGGATTC
GAGATTATTCAATAAAACACAGAGGAGGAGAAGGGTATCGACCACCACAACAACTCTTTC
CTGTTCATGGTATGGGGATGAATATGCCAACATCATCTCCTGCTCCTCCTGGGATTCTTC
AACCATCATCTCCCGCTATGCCGGTTTCTCAGCCTCTGTTCCCTGTTGTGAATAGCATCA
CCCCTTCTCAAGCTTCACCGTTTTCTGCTGGCGGGGCTCAGCAACTGCCTAATGCCAATG
CCACCGTAGGATCAGCAAATCCATATCCGCCTAACAACTCATTTCCAGTGGGTGGGAATA
ATTCTCATTCGTATGCTTCTGGTCCAAACACTAGTGGTCCTTCAATTGGTCCACCTCCTG
TGATTGCAAATAAAGCTCCTAGCTCTCAGCCTAATGAAGTGTATCTTGTATGGGATGATG
AAGCCATGTCTATGGAGGAAAGAAGAATGTCCTTACCGAAGTACAAAGTCCATGATGAAA
CAAGCCAGATGAACTCGATAAATGCAGCCATAGACAGACGTATATCAGAGAGTAGGCTCG
CTGGACGGATGGCGTTTTAGAGTTTTGGCACCAAACATGAGTCGAGGAAACCAAACCAAG
AAAAGAGATGATGATGGTGTTTCGCTTTGACTCACATTTACAGAAGCTGAACTTGTGATC
TGAATTTTGAGTTGATTCCTATCTTATATGTTGTATTGTCAGTGACCATTGCATTGTTTT
AGAGATCTCAGAGATGTTTTTGTAGCAAAGGCTTAGTCATTATTTTAAATCTTTTACCGG
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4AE39TF U 1
AF RR4AE39JQ C 73
BS 1 866 RR4AE39TF
BS 867 902 RR4AE39JQ

RD RR4AE39TF 866 0 0
GGGCAAAAGAAATCGAGAAAACGCCTTTGTCGAATAGAAACCCTAGCGAGAGCGGAAGGA
AGGAAGGAAGGGGACAAGAGCCGAGGAAAACTAGAGAGGGGGCAGATTTGAATTGGATTC
GAGATTATTCAATAAAACACAGAGGAGGAGAAGGGTATCGACCACCACAACAACTCTTTC
CTGTTCATGGTATGGGGATGAATATGCCAACATCATCTCCTGCTCCTCCTGGGATTCTTC
AACCATCATCTCCCGCTATGCCGGTTTCTCAGCCTCTGTTCCCTGTTGTGAATAGCATCA
CCCCTTCTCAAGCTTCACCGTTTTCTGCTGGCGGGGCTCAGCAACTGCCTAATGCCAATG
CCACCGTAGGATCAGCAAATCCATATCCGCCTAACAACTCATTTCCAGTGGGTGGGAATA
ATTCTCATTCGTATGCTTCTGGTCCAAACACTAGTGGTCCTTCAATTGGTCCACCTCCTG
TGATTGCAAATAAAGCTCCTAGCTCTCAGCCTAATGAAGTGTATCTTGTATGGGATGATG
AAGCCATGTCTATGGAGGAAAGAAGAATGTCCTTACCGAAGTACAAAGTCCATGATGAAA
CAAGCCAGATGAACTCGATAAATGCAGCCATAGACAGACGTATATCAGAGAGTAGGCTCG
CTGGACGGATGGCGTTTTAGAGTTTTGGCACCAAACATGAGTCGAGGAAACCAAACCAAG
AAAAGAGATGATGATGGTGTTTCGCTTTGACTCACATTTACAGAAGCTGAACTTGTGATC
TGAATTTTGAGTTGATTCCTATCTTATATGTTGTATTGTCAGTGACCATTGCATTGTTTT
AGAGATCTCAGAGATGTTTTTGTAGC

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR4AE39JQ 830 0 0
GACAAGAGCCGAGGAAAACTAGAGAGGGGGCAGATTTGAATTGGATTCGAGATTATTCAA
TAAAACACAGAGGAGGAGAAGGGTATCGACCACCACAACAACTCTTTCCTGTTCATGGTA
TGGGGATGAATATGCCAACATCATCTCCTGCTCCTCCTGGGATTCTTCAACCATCATCTC
CCGCTATGCCGGTTTCTCAGCCTCTGTTCCCTGTTGTGAATAGCATCACCCCTTCTCAAG
CTTCACCGTTTTCTGCTGGCGGGGCTCAGCAACTGCCTAATGCCAATGCCACCGTAGGAT
CAGCAAATCCATATCCGCCTAACAACTCATTTCCAGTGGGTGGGAATAATTCTCATTCGT
ATGCTTCTGGTCCAAACACTAGTGGTCCTTCAATTGGTCCACCTCCTGTGATTGCAAATA
AAGCTCCTAGCTCTCAGCCTAATGAAGTGTATCTTGTATGGGATGATGAAGCCATGTCTA
TGGAGGAAAGAAGAATGTCCTTACCGAAGTACAAAGTCCATGATGAAACAAGCCAGATGA
ACTCGATAAATGCAGCCATAGACAGACGTATATCAGAGAGTAGGCTCGCTGGACGGATGG
CGTTTTAGAGTTTTGGCACCAAACATGAGTCGAGGAAACCAAACCAAGAAAAGAGATGAT
GATGGTGTTTCGCTTTGACTCACATTTACAGAAGCTGAACTTGTGATCTGAATTTTGAGT
TGATTCCTATCTTATATGTTGTATTGTCAGTGACCATTGCATTGTTTTAGAGATCTCAGA
GATGTTTTTGTAGCAAAGGCTTAGTCATTATTTTAAATCTTTTACCGGAG

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL7224Contig1 749 2 13 U
GGGATCTAGGGTTGGATCGAGGGGGTAACTCACCGGCGATTTTGCGAGATGGGAAGAGAC
CGCGACGACTCTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGACGAGGATAAAGACTACAGAAGA
GAATCATCCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAAGAAGCCGGTCGAAGAAGAAGTGAGT
CGGCGCGAATCAAAGAGAAAATCAAAAGACGGCAGAGACTCCGATTCTGGTTCGGGACTG
GAGAGTGGTAGCGAGTCCGAATCGGAGAAGGAAGAGAGACGTAGAAGTAGAAAGTCGAGA
GAGAAAAGGAAATCAGATCGGAGATCTCGTAGTAGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGC
TACGATGATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTATTCGGACTCTGAG
AGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGGAG
AGGGAGGAGAAAGAGAGAAAGAGAAGGAAGAGAGAGAAAGAGAAGAAAAAGAAGAGAAGG
ATGGAGAAAGGAGCTGATGGAGATAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGTCTGAG
AAGGCCAAGAAAGGAGCTGTGACTGAATCTTGGGGGAAATATGGAGTCATCAGAGAGACT
GATATGTGGAATAAACGACCAGAGTTCACAGCATGGCTGCTTGAAGTAAAAGAGGTCAAC
TTGGAAAGCTTGCCACCATGGGAAGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AB22TF U 1
AF RR4D134TF U 6
BS 1 97 RR4AB22TF
BS 98 98 RR4D134TF
BS 99 221 RR4AB22TF
BS 222 222 RR4D134TF
BS 223 260 RR4AB22TF
BS 261 261 RR4D134TF
BS 262 282 RR4AB22TF
BS 283 283 RR4D134TF
BS 284 433 RR4AB22TF
BS 434 439 RR4D134TF
BS 440 484 RR4AB22TF
BS 485 485 RR4D134TF
BS 486 749 RR4AB22TF

RD RR4AB22TF 749 0 0
GGGATCTAGGGTTGGATCGAGGGGGTAACTCACCGGCGATTTTGCGAGATGGGAAGAGAC
CGCGACGACTCTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGTCGAGGATAAAGACTACAGAAGA
GAATCATCCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAAGAAGCCGGTCGAAGAAGAAGTGAGT
CGGCGCGAATCAAAGAGAAAATCAAAAGACGGCAGAGACTCTGATTCTGGTTCGGGACTG
GAGAGTGGTAGCGAGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGAGAGACGTGGAAGTAGAAAGTCGAGA
GAGAAAAGGAAATCAGATCGGAGATCTCGTAGTAGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGC
TACGATGATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTATTCGGACTCTGAG
AGTGAGAGTGAGA******GTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGGAG
AGGGGGGAGAAAGAGAGAAAGAGAAGGAAGAGAGAGAAAGAGAAGAAAAAGAAGAGAAGG
ATGGAGAAAGGAGCTGATGGAGATAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGTCTGAG
AAGGCCAAGAAAGGAGCTGTGACTGAATCTTGGGGGAAATATGGAGTCATCAGAGAGACT
GATATGTGGAATAAACGACCAGAGTTCACAGCATGGCTGCTTGAAGTAAAAGAGGTCAAC
TTGGAAAGCTTGCCACCATGGGAAGAGAA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4D134TF 743 0 0
GG
AGGGTTGGATCGAGGGGGTAACTCACCGGCGATTTTGCGAGATGGTAAGAGACCGCGACG
ACTCTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGACGAGGATAAAGACTACAGAAGAGAATCAT
CCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAAGAAGCCGGTCGAAGAAGAAGTGAGTCGGCGCG
AATCGAAGAGAAAATCAAAAGACGGCAGAGACTCCGATTCTGGTTCGGGACTGGAGAGTG
GTAGCGGGTCCGAATCGGAGAAGGAAGAGAGACGTAGAAGTAGAAAGTCGAGAGGGAAAA
GGAAATCAGATCGGAGATCTCGTAGTAGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGCTACGATG
ATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTATTCGGACTCTGAGAGTGAGA
GTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGG
AGAAAGAGAGAAAGAGAAGGAAGAGAGAGAAAGAGAAGAAAAAGAAGAGAAGGATGGAGA
AAGGAGTTGATGGAGATAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGTCTGAGAAGGCCA
AGAAAGGAGCTGTGACTGAATCTTGGGGGAAATATGGAGTCATCAGAGAGACTGATATGT
GGAATAAACGACCTGAGTTCACAGCATGGCTGCTTGAAGTAAA*GAG*TCAACTTGGAAA
GCTTGCCACCATGGGAAGAGA

QA 3 743 3 743
DS 



AS 1 2

CO CL7225Contig1 782 2 2 U
GGGAATCCACAGAGAGTTGGTTTGTTGGATTCATCAATTTCGAATCAATCTTCAATCTCG
ACTATCAATCGAGGGAGAAGAGAAGAGAAGGGATCTTTCGGTGGGAGAAGCTAAGCGAGC
GAAGCGATGATAACAAGATCGAATCTGGCGGAGCAGCTGAGGGAATACCAGATTCGATCG
AAGCACGATTGGGCGTCCGTCTCCTTCTTCTCGTCAACCTCGAGCTTTTCTTCGTCTAGG
GTGGATGTTGTAGTGTTTGTCATCTGGGAGCTAGTCATCTTAGCCTTCTTAGTCTTCTCT
GCCGTTTCTTTGTACTTCAAACGATTGCAGCTCGCCTTCGTCTTGGTATGCGTCACTTTG
CTACTTCTTGTTTGCATGAAGGTCACCAAGCAGGTGAGATCAGCCAGGAAGAAGAAGCGA
AGGATGCTTCTTCCACTTTCTATGTAAAGAAACACCAACCAAACCCCCATCGATCATGAG
AGAAGTTGCAACTCTCTTTTTTTTTCTTCTTCACAAAAACTCACCTCCTGGTTCACAATT
ATAACGGATGAAGATGACAGTTATGCTTACGGCAGGAGGATTGAGTCATGTCAGGGTGAC
TCAGCCCGGCAATCTTAGGCTTTAGGGTTTTTAGAGTCTGGCTTATCATTTTTTTTCTGA
TTAGCATTTTGGCTTTGTTCAGGGGAAATAATGTGTTGAAAATTAAAGAGTTATTATGTT
TCATGTGTAATTGTGGTTGTGAAATTCAGACAAATGAGAAAAATAATATCGAAGCTTTCA
TT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BN74TF U 1
AF RR4BN74JQ C 2
BS 1 665 RR4BN74TF
BS 666 782 RR4BN74JQ

RD RR4BN74TF 665 0 0
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AGGATGCTTCTTCCACTTTCTATGTAAAGAAACACCAACCAAACCCCCATCGATCATGAG
AGAAGTTGCAACTCTCTTTTTTTTTCTTCTTCACAAAAACTCACCTCCTGGTTCACAATT
ATAACGGATGAAGATGACAGTTATGCTTACGGCAGGAGGATTGAGTCATGTCAGGGTGAC
TCAGCCCGGCAATCTTAGGCTTTAGGGTTTTTAGAGTCTGGCTTATCATTTTTTTTCTGA
TTAGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4BN74JQ 781 0 0
GGG
ATCCACAGAGAGTTGGTTTGTTGGATTCATCAATTTCGAATCAATCTTCAATCTCGACTA
TCAATCGAGGGAGAAGAGAAGAGAAGGGATCTTTCGGTGGGAGAAGCTAAGCGAGCGAAG
CGATGATAACAAGATCGAATCTGGCGGAGCAGCTGAGGGAATACCAGATTCGATCGAAGC
ACGATTGGGCGTCCGTCTCCTTCTTCTCGTCAACCTCGAGCTTTTCTTCGTCTAGGGTGG
ATGTTGTAGTGTTTGTCATCTGGGAGCTAGTCATCTTAGCCTTCTTAGTCTTCTCTGCCG
TTTCTTTGTACTTCAAACGATTGCAGCTCGCCTTCGTCTTGGTATGCGTCACTTTGCTAC
TTCTTGTTTGCATGAAGGTCACCAAGCAGGTGAGATCAGCCAGGAAGAAGAAGCGAAGGA
TGCTTCTTCCACTTTCTATGTAAAGAAACACCAACCAAACCCCCATCGATCATGAGAGAA
GTTGCAACTCTCTTTTTTTTTCTTCTTCACAAAAACTCACCTCCTGGTTCACAATTATAA
CGGATGAAGATGACAGTTATGCTTACGGCAGGAGGATTGAGTCATGTCAGGGTGACTCAG
CCCGGCAATCTTAGGCTTTAGGGTTTTTAGAGTCTGGCTTATCATTTTTTTTCTGATTAG
CATTTTGGCTTTGTTCAGGGGAAATAATGTGTTGAAAATTAAAGAGTTATTATGTTTCAT
GTGTAATTGTGGTTGTGAAATTCAGACAAATGAGAAAAATAATATCGAAGCTTTCATT

QA 4 781 4 781
DS 



AS 1 2

CO CL7226Contig1 813 2 1 U
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CTCTGGCGTAGGGTTTTGACGTGCCTTTTGATCTTCTTATTAGAAATACGAAACGTTCCC
ACTTTCAGATTTATCGCTGTTAGACCTCTTCTTAAAGCCATCAAATATAGATAGGTAGAC
ATCGTCTTCATGTATTATCGATTCAGAGCCCTGGCCACCGAAGAACTCCTTCTATTCTTC
CAACTGCTATGAAGATCCATTAATTCCGACCAATCTCTGTTGGAGGCCGCCGTCTGTGAC
TAATCGATTTGAGCTCTTCTCATGGTCAAACGAAATCATGTGGCTTTAGGAGTTGTTTCA
TCGCACCGTTACGACCGCATTCAAGCATCACCATTAAGGCTCCCATTAACCCCAATCACT
ATGCCCTCATCTATTCCATTGTGTGAATCCAAGCTATAATTATAATCCAGCGGTCGAGTT
TGTGTGGGTGGTGAACGCAATAGAAAAAGCTGTAAAGAAACGATGCATCATCTCACGCCG
GAGATCATTGGGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTATGAAGCAAAATTGTGGGTGAAGCCAAGG
TTGAAACTTCAAGGAGTTCAAGCATGCCGGTGATGATGCCCCTGCCATTACTCCCTCCTA
TCTTGGCTGAAAATAAGGTGTTACTACAAACGGTACATATATGTATGCAGGACATAAATT
AATCTTAAGAAAAACTTTGATCCTGAAAATTTTGTTTTTGTGGACCGATGAGCATGAATC
TAGATGAAGTTCCATGAGATGGTCATTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BE61TF U 1
AF RR4BE61JQ C 19
BS 1 813 RR4BE61TF

RD RR4BE61TF 813 0 0
GGACTTTTGGTCTTCACTGTTCGTTCGAGAGCTCGATATGATGAAGTCGACTTCAAGAAT
CTCTGGCGTAGGGTTTTGACGTGCCTTTTGATCTTCTTATTAGAAATACGAAACGTTCCC
ACTTTCAGATTTATCGCTGTTAGACCTCTTCTTAAAGCCATCAAATATAGATAGGTAGAC
ATCGTCTTCATGTATTATCGATTCAGAGCCCTGGCCACCGAAGAACTCCTTCTATTCTTC
CAACTGCTATGAAGATCCATTAATTCCGACCAATCTCTGTTGGAGGCCGCCGTCTGTGAC
TAATCGATTTGAGCTCTTCTCATGGTCAAACGAAATCATGTGGCTTTAGGAGTTGTTTCA
TCGCACCGTTACGACCGCATTCAAGCATCACCATTAAGGCTCCCATTAACCCCAATCACT
ATGCCCTCATCTATTCCATTGTGTGAATCCAAGCTATAATTATAATCCAGCGGTCGAGTT
TGTGTGGGTGGTGAACGCAATAGAAAAAGCTGTAAAGAAACGATGCATCATCTCACGCCG
GAGATCATTGGGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTATGAAGCAAAATTGTGGGTGAAGCCAAGG
TTGAAACTTCAAGGAGTTCAAGCATGCCGGTGATGATGCCCCTGCCATTACTCCCTCCTA
TCTTGGCTGAAAATAAGGTGTTACTACAAACGGTACATATATGTATGCAGGACATAAATT
AATCTTAAGAAAAACTTTGATCCTGAAAATTTTGTTTTTGTGGACCGATGAGCATGAATC
TAGATGAAGTTCCATGAGATGGTCATTCTTTTC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4BE61JQ 795 0 0
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ACGTGCCTTTTGATCTTCTTATTAGAAATACGAAACGTTCCCACTTTCAGATTTATCGCT
GTTAGACCTCTTCTTAAAGCCATCAAATATAGATAGGTAGACATCGTCTTCATGTATTAT
CGATTCAGAGCCCTGGCCACCGAAGAACTCCTTCTATTCTTCCAACTGCTATGAAGATCC
ATTAATTCCGACCAATCTCTGTTGGAGGCCGCCGTCTGTGACTAATCGATTTGAGCTCTT
CTCATGGTCAAACGAAATCATGTGGCTTTAGGAGTTGTTTCATCGCACCGTTACGACCGC
ATTCAAGCATCACCATTAAGGCTCCCATTAACCCCAATCACTATGCCCTCATCTATTCCA
TTGTGTGAATCCAAGCTATAATTATAATCCAGCGGTCGAGTTTGTGTGGGTGGTGAACGC
AATAGAAAAAGCTGTAAAGAAACGATGCATCATCTCACGCCGGAGATCATTGGGGCTGGG
AAGAAGAAGCTTTATGAAGCAAAATTGTGGGTGAAGCCAAGGTTGAAACTTCAAGGAGTT
CAAGCATGCCGGTGATGATGCCCCTGCCATTACTCCCTCCTATCTTGGCTGAAAATAAGG
TGTTACTACAAACGGTACATATATGTATGCAGGACATAAATTAATCTTAAGAAAAACTTT
GATCCTGAAAATTTTGTTTTTGTGGACCGATGAGCATGAATCTAGATGAAGTTCCATGAG
ATGGTCATTCTTTTC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL7227Contig1 619 2 1 U
GGATTTTCAACCCTAGCCGCTCCCTCTCTCTATCGATCTCAGTGATGGCGAGTCGACGGA
TCTTATCATCGCTCCTCCGCTCATCTCAGAACTACAAGAATCTGCAAGATATTATTGCCA
TTCTGGGTATGGATGAGCTAAGTGAAGATGACAAGCTTACTGTTGCCCGTGCCCGTAAGA
TCCAGAGATTCTTGAGTCAGCCATTCCATGTCGCTGAGATCTTCACGGGTGCCCCCGGAA
AATACGTCGACCTGAAGGAAAACATCAACAGTTTCCAGGGTTTACTCGATGGTAAGTACG
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CAGAGAAGATCTCCAAGGAGGCAGCAGCTTAAGAAATTGGTTCACCTCTGTCGGATGCTT
AATACTTTTTACATCTTCATTTTTTTTGTTGACAATAACGAAAAGAAAAACAAATGCAAT
TTCTTAAGCCGAGCTGCGAATGCATTTGGATTCCCATTATTGTGAGTGTGAGAGATAGGA
GGAGAAGAAGAAAAAAGAAAACATTACAATGAAAGACACATTATGACTTCTCAAATAATG
AGAAACACTTTCTGGTGCT


BQ
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AF RR4EG93JQ C 1
AF RR4EG93TF U 1
BS 1 619 RR4EG93TF

RD RR4EG93JQ 619 0 0
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TCTTATCATCGCTCCTCCGCTCATCTCAGAACTACAAGAATCTGCAAGATATTATTGCCA
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QA 1 619 1 619
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4E435TF U 1
AF RR4E435JQ C 39
BS 1 681 RR4E435TF
BS 682 682 RR4E435JQ
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BS 701 713 RR4E435TF
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RD RR4E435TF 713 0 0
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QA 1 713 1 713
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RD RR4E435JQ 797 0 0
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TCAGATTGTTTACGAAGAGAGAATCGTGAAATGTTACGAGGATGTTTGCGAGGCTATCAA
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GGGGCTAAACGTGGTAAGAAGCGACACGCCGGAGCTTGGTCCTGTCGGGAACTTGTTAAC
TTCAAGTGAAAGTGTTTCGACGGTGGCGTCGGTGCTGGTGGTGCAACAGTACGTAGCAAG
ATGTGATTCTCCGGTCGTCGGAGTTTTGAAGAACCTCATGGAGGAAGAGTCGCCGGTTAA
GGATACCGAGAGTCCTTAGGGAAAATTCTCTTTGGGATTCTGAGACTTGAAAGGTCAAAA
CATTGGCTGTGTATAATAACATCTGTTTCATGTTGTAACTTGTAACTAAAAATTTGAATA
TATGATTTCTATGTTTT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL7230Contig1 695 2 2 U
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AF RR4DV95TF U 1
AF RR4DV95JQ C 1
BS 1 599 RR4DV95TF
BS 600 695 RR4DV95JQ

RD RR4DV95TF 599 0 0
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QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4DV95JQ 695 0 0
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AAAAACATGATGTGCGCAGCTGATCCGCGCCACGGACGTTACTTGACAGCTTCTGCTGTC
TTCCGTGGGAAGATGAGCACTAAAGAGGTTGATGAACAGATGATGAATGTCCAGAACAAT
AACTCGTCGTACTTCGTTGAGTGGATTCCAAACAACGTGAAATCAAGCGTCTGCGATATA
GCTCCCACGGGTTTGAAAATGGCTTCGACTTTCATAGGAAACTCCACGTCTATCCAGGAG
ATGTTCAGGCGTGTGAGTGAGCAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCGTTCTTGCAT
TGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGCAACATGAAT
GATCTTGTTGCGGAGTACCAGCAATATCAGGATGCTACGGTTGGTGAAGGAGAGTATGAG
GAGGACGAAGAAGAGGAAGAAGAAGCTTAAAGAAACCATACGATTGATTGATTACTACTT
CTGTAAGAGGCTTCACTCATTTCTTTTTATATCTTTTTTTTATACGTTTCTTCCTTGGAA
TCGAATCTTTTCTCTTTTTTTCTGCTTCGTGCGTTTTTTATTGAACTTCCCCTCTCTGAG
TGTAATCCCATATGCCTATGCTTCTTTTGTTGTGT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL7231Contig1 720 2 2 U
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BQ
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AF RR4FY83TF U 1
AF RR4G895TF U 1
BS 1 661 RR4FY83TF
BS 662 720 RR4G895TF

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T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4G895TF 720 0 0
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CAAACCTACGATGGGTCGACCTCCCAGTAACGGCAGTCCAGCGTTCCGATTCAACCTTGC
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GCCGCCACTTCAGCTCAGCCTAGCTCCAACGCAGCAGCCATTGTCCCCGCTGGTTCTGCA
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QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7232Contig1 877 2 6 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH04TF U 1
AF RR4EH04JQ C 77
BS 1 702 RR4EH04TF
BS 703 703 RR4EH04JQ
BS 704 725 RR4EH04TF
BS 726 726 RR4EH04JQ
BS 727 746 RR4EH04TF
BS 747 877 RR4EH04JQ

RD RR4EH04TF 746 0 0
GGATCCAAAGTACACGCTTCTTCCATCTTCCTCGCTGAGTCTCGGTTTTACAGTTGGATT
CACATATCAGCCTTTTTTTTACTCGATAACTACTAGCAATTATGGATGATTGGGAGGATG
AGCAGCTTGCACCACTTCCAGCTAAAGTTGGGCTCAAAAGCAATTGGGATGACGAGGATG
TAGATGAGAATGACATTAAGGACTCTTGGGAGGATGATGATGATGACGACGAACCTGCTC
CGGTAAAGCCTGCTACGGACAAGGCTCCTCCTAAGAAAGCAGCAGCCAAAGCTGTCGAAA
AGAAGGGTAAAGCAGCCGATGTTCCCAAAAAAGCACCAAAGGAAGAACCTTTGGATCCTA
TCTCTGAGAAACTTCGCATGCAGAGGCTTGTTGAAGAAGCTGACTACAAGGCAACCGCTG
AACTCTTTGGAACCAAGGGTGAAGAGACAAAACTTGATGTGTTCATCCCCAAGTCTGAAA
GCGATTTTTTGGAATATGCTGAAATGATTTCTCATAGGCTTAAACCATATGAGAAAAGTT
ATCATTATATTGCGCTACTCAAAGCAGTGATGAGACTTTCCGTGACCAACATGAAGGCAG
CAGATGTTAAAGATGTTGCTTCGTCCATTACAGCAATAGCAGATGAAAAACTTAAGGCGG
AGAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACTGGTGGGAAAA*GAAACAGCTGATTGTAG
ATAAG*CCAATGACGATCTAGTGGCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4EH04JQ 801 0 0
TTTTACTCGATAACTACTAGCAATTATGGATGATTGGGAGGATGAGCAGCTTGCACCACT
TCCAGCTAAAGTTGGGCTCAAAAGCAATTGGGATGACGAGGATGTAGATGAGAATGACAT
TAAGGACTCTTGGGAGGATGATGATGATGACGACGAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTAC
GGACAAGGCTCCTCCTAAGAAAGCAGCAGCCAAAGCTGTCGAAAAGAAGGGTAAAGCAGC
CGATGTTCCCAAAAAAGCACCAAAGGAAGAACCTTTGGATCCTATCTCTGAGAAACTTCG
CATGCAGAGGCTTGTTGAAGAAGCTGACTACAAGGCAACCGCTGAACTCTTTGGAACCAA
GGGTGAAGAGACAAAACTTGATGTGTTCATCCCCAAGTCTGAAAGCGATTTTTTGGAATA
TGCTGAAATGATTTCTCATAGGCTTAAACCATATGAGAAAAGTTATCATTATATTGCGCT
ACTCAAAGCAGTGATGAGACTTTCCGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGT
TGCTTCGTCCATTACAGCAATAGCAGATGAAAAACTTAAGGCGGAGAAAGAAGCTGCTGC
TGGTAGAAAGAAGACTGGTGGGAAAAAGAAACAGCTGATTGTAGATAAGGCCAATGACGA
TCTAGTGGCTGGTCCTTATGATGCCATGGACGATTTCGACTTCATGTAGCTTATAAGAGC
TTTTTTGAGAGCATGTAATTTGGATTTGTCTATTTCATCATTTTATCACTCAGAAGAAGA
ACAAAAGTTTATTATTTCTGG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL7233Contig1 815 2 1 U
GATTCTCTGGATCGCTGAGACTCGGCCCCACCTCCCAGCCAGTGCGCGTGAAGTACACGC
AGCTCCTGAGAAACCCGAGGAGGTCTTCTTTGTATTACGTCAACCTCGTTGCGATCCGCG
TCGCTAAGAAAGTCGTCAATATACCGCCGGCAGCTATTGCTTTTAATCCCACCACCGGCG
CTGGAACCATCTTTGATTCCGGGACTGTCTACACGCGGCTGTCTAAGCCGGTTTACGAGG
CGGTGAGGAACGAGTTCAGGAAGCGCGTGAAGCCACGTACCGCAGTAGTGACGTCACTGG
GAGGTTTCGACACGTGTTACTCAGGGAAAATCACGGTGCCGACAATAACATTCATGTTCA
AGGGAGTGAACATGACGATGCCAGCGGATAACCTGATGTTACACAGCAGCGCCGGGAGCC
TGTCGTGTCTCGCCATTGCGTCGTCGCCGGAAAACGTGGACTCTGTCGTCAACGTGATCG
CGAGCATGCAGCAGCAGAACCATCGTGTCCTGATCGACGTTCCCAATGGACGCTTAGGGT
TGGCACGTGAACGATGCTCTTAAGAAAGATGAATGAGACAATAATTAATTAAGAGCGTAC
TAGTAGTGTTTTGAGCAGAGACTTGTTTGTTTGTGTGTTTTTGTGTGTTTTCGTTTTTGT
CTTTCCTCTTTCTGTCTGCTTCACCACCTTCATGTGTTTGTTAGAGGACTGTGGTGTGTA
GCACTTGTCTTATCAAGTCATTTGTATGTGGTTTTAACCTTTGTTAAATTCTCTGGAGAC
TCGGGTCAAAATTAATAGAATAAACTATTACCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A526TF U 1
AF RR4A526JQ C 69
BS 1 815 RR4A526TF

RD RR4A526TF 815 0 0
GATTCTCTGGATCGCTGAGACTCGGCCCCACCTCCCAGCCAGTGCGCGTGAAGTACACGC
AGCTCCTGAGAAACCCGAGGAGGTCTTCTTTGTATTACGTCAACCTCGTTGCGATCCGCG
TCGCTAAGAAAGTCGTCAATATACCGCCGGCAGCTATTGCTTTTAATCCCACCACCGGCG
CTGGAACCATCTTTGATTCCGGGACTGTCTACACGCGGCTGTCTAAGCCGGTTTACGAGG
CGGTGAGGAACGAGTTCAGGAAGCGCGTGAAGCCACGTACCGCAGTAGTGACGTCACTGG
GAGGTTTCGACACGTGTTACTCAGGGAAAATCACGGTGCCGACAATAACATTCATGTTCA
AGGGAGTGAACATGACGATGCCAGCGGATAACCTGATGTTACACAGCAGCGCCGGGAGCC
TGTCGTGTCTCGCCATTGCGTCGTCGCCGGAAAACGTGGACTCTGTCGTCAACGTGATCG
CGAGCATGCAGCAGCAGAACCATCGTGTCCTGATCGACGTTCCCAATGGACGCTTAGGGT
TGGCACGTGAACGATGCTCTTAAGAAAGATGAATGAGACAATAATTAATTAAGAGCGTAC
TAGTAGTGTTTTGAGCAGAGACTTGTTTGTTTGTGTGTTTTTGTGTGTTTTCGTTTTTGT
CTTTCCTCTTTCTGTCTGCTTCACCACCTTCATGTGTTTGTTAGAGGACTGTGGTGTGTA
GCACTTGTCTTATCAAGTCATTTGTATGTGGTTTTAACCTTTGTTAAATTCTCTGGAGAC
TCGGGTCAAAATTAATAGAATAAACTATTACCTAT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR4A526JQ 747 0 0
AGAAACCCGAGGAGGTCTTCTTTGTATTACGTCAACCTCGTTGCGATCCGCGTCGCTAAG
AAAGTCGTCAATATACCGCCGGCAGCTATTGCTTTTAATCCCACCACCGGCGCTGGAACC
ATCTTTGATTCCGGGACTGTCTACACGCGGCTGTCTAAGCCGGTTTACGAGGCGGTGAGG
AACGAGTTCAGGAAGCGCGTGAAGCCACGTACCGCAGTAGTGACGTCACTGGGAGGTTTC
GACACGTGTTACTCAGGGAAAATCACGGTGCCGACAATAACATTCATGTTCAAGGGAGTG
AACATGACGATGCCAGCGGATAACCTGATGTTACACAGCAGCGCCGGGAGCCTGTCGTGT
CTCGCCATTGCGTCGTCGCCGGAAAACGTGGACTCTGTCGTCAACGTGATCGCGAGCATG
CAGCAGCAGAACCATCGTGTCCTGATCGACGTTCCCAATGGACGCTTAGGGTTGGCACGT
GAACGATGCTCTTAAGAAAGATGAATGAGACAATAATTAATTAAGAGCGTACTAGTAGTG
TTTTGAGCAGAGACTTGTTTGTTTGTGTGTTTTTGTGTGTTTTCGTTTTTGTCTTTCCTC
TTTCTGTCTGCTTCACCACCTTCATGTGTTTGTTAGAGGACTGTGGTGTGTAGCACTTGT
CTTATCAAGTCATTTGTATGTGGTTTTAACCTTTGTTAAATTCTCTGGAGACTCGGGTCA
AAATTAATAGAATAAACTATTACCTAT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL7234Contig1 1315 2 2 U
GGCAAGACTCTAGGATGACGTCTCTAGATTCTCCTCCACTGATGAAGAAGCTCCTTAGTT
TCTTTTTATCTACTCTTTTTCTCATTATCGTCAACTCGGAAACCAAATGCCGGAATTTCA
AATCCATCATCAGCTTCGGCGATTCCATTGCCGACACTGGAAACTTGCTCGGTCTCTCTG
ATCCTGACGATCTTCCTAAAGTAGCGTTTCTGCCGTATGGAGAAACATTCTTCCATCATC
CCACGGGCCGTTTCTCAAACGGTCGACTCATCATCGATTTCATTGCTGAATTCTTGAGGT
TTCCGCTTGTGCCACCTTTTTATGGATCTCAAAATGCAAACTTCGAGAAGGGAGTTAATT
TCGCGGTCGGGGGAGCAACGGCACTTGAACCATCAATTCTCAAGGAGAGAGGGATTAACT
TTGCTTACACCAATGTTAGTTTAGGAGTTCAGCTTAAGAGCTTCAAGGATGCTTTGCCTA
ACCTTGGCTCCCCTACAGACTGCAGAAATATGATCGAAAATGCTTTAATTCTCATGGGAG
AAATTGGAGGGAATGACTATAATTACCCACTCTTTCTTGGCAAACCCATTGAAGAGATCA
GAGAGCTGGTTCCACTTGTGACCACGACTATCTCTTCTGCAATCACGGAGTTGATTGGTA
TGGGGGGAAGAACATTTCTGGTGCCAGGAGAGTTCCCGCTCGGATGCTCAGTAATCTACT
CGACATTATATAAAACAACAAACAAGGAAGCATACGATTCTTCAGGTTGTTTGAAATGGC
TAAACGAGTTTGGGGTATACCACGATGACCAGCTTCAGGCAGAACTCAACAAGCTCCGGA
AGTTGTACCCTCATGTCAACATCATATACGCAGACTACTTCAACGCTCTTCTACGCCTTT
CCCAAGAACCAACCAAAATTTGGGTTCATAGACAGACGCTTGCCTGCTTGCTGCGGTTCT
GGAGGACCGCACAACTTCACATTCGGTGGGCAAGGGATGGGATGTTGTAGCGATCCTTCA
AAGTATGTGAGTTGGGACACTGTTCATATGACTGAGGCTGCGTACAAATTGATGGCTGAG
GGTGTTCTTAAGGGACCCTATGCCATTCCACCATTCGATTGGTCTTGCCTCAGCTATAAA
ATAAGGAACAATGTATCATCTGACAAGTATTCTTTGATGAACCACTAATATAACTTGGTC
TGAAAACTGATACTGATAAAAACGTTTATGCTCTTCAGTGCTTGTCTTGGTTCATGTATT
GTCCTAATAGACCGTTTGTATTCTTGTTATGGGTAATGCAAGGATTAATACGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AN05TF U 1
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BS 740 1315 RR4AN05JQ

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TCTTTTTATCTACTCTTTTTCTCATTATCGTCAACTCGGAAACCAAATGCCGGAATTTCA
AATCCATCATCAGCTTCGGCGATTCCATTGCCGACACTGGAAACTTGCTCGGTCTCTCTG
ATCCTGACGATCTTCCTAAAGTAGCGTTTCTGCCGTATGGAGAAACATTCTTCCATCATC
CCACGGGCCGTTTCTCAAACGGTCGACTCATCATCGATTTCATTGCTGAATTCTTGAGGT
TTCCGCTTGTGCCACCTTTTTATGGATCTCAAAATGCAAACTTCGAGAAGGGAGTTAATT
TCGCGGTCGGGGGAGCAACGGCACTTGAACCATCAATTCTCAAGGAGAGAGGGATTAACT
TTGCTTACACCAATGTTAGTTTAGGAGTTCAGCTTAAGAGCTTCAAGGATGCTTTGCCTA
ACCTTGGCTCCCCTACAGACTGCAGAAATATGATCGAAAATGCTTTAATTCTCATGGGAG
AAATTGGAGGGAATGACTATAATTACCCACTCTTTCTTGGCAAACCCATTGAAGAGATCA
GAGAGCTGGTTCCACTTGTGACCACGACTATCTCTTCTGCAATCACGGAGTTGATTGGTA
TGGGGGGAAGAACATTTCTGGTGCCAGGAGAGTTCCCGCTCGGATGCTCAGTAATCTACT
CGACATTATATAAAACAAC

QA 1 739 1 739
DS 

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CTATAATTACCCACTCTTTCTTGGCAAACCCATTGAAGAGATCAGAGAGCTGGTTCCACT
TGTGACCACGACTATCTCTTCTGCAATCACGGAGTTGATTGGTATGGGGGGAAGAACATT
TCTGGTGCCAGGAGAGTTCCCGCTCGGATGCTCAGTAATCTACTCGACATTATATAAAAC
AACAAACAAGGAAGCATACGATTCTTCAGGTTGTTTGAAATGGCTAAACGAGTTTGGGGT
ATACCACGATGACCAGCTTCAGGCAGAACTCAACAAGCTCCGGAAGTTGTACCCTCATGT
CAACATCATATACGCAGACTACTTCAACGCTCTTCTACGCCTTTCCCAAGAACCAACCAA
AATTTGGGTTCATAGACAGACGCTTGCCTGCTTGCTGCGGTTCTGGAGGACCGCACAACT
TCACATTCGGTGGGCAAGGGATGGGATGTTGTAGCGATCCTTCAAAGTATGTGAGTTGGG
ACACTGTTCATATGACTGAGGCTGCGTACAAATTGATGGCTGAGGGTGTTCTTAAGGGAC
CCTATGCCATTCCACCATTCGATTGGTCTTGCCTCAGCTATAAAATAAGGAACAATGTAT
CATCTGACAAGTATTCTTTGATGAACCACTAATATAACTTGGTCTGAAAACTGATACTGA
TAAAAACGTTTATGCTCTTCAGTGCTTGTCTTGGTTCATGTATTGTCCTAATAGACCGTT
TGTATTCTTGTTATGGGTAATGCAAGGATTAATACGAAT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

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TCACGGTTGAGCACCACCCAGAATCCTCGTAGCCTATCCCTTCTTCTCCTTCGTCCTCCT
GTTCTTCCGTTTCGGCGTCGTTTCGTCTCCATCGTTCATCGTCGTCCTCTGCTTTGGATT
CGATCATCTCCTCCTCTATCCTCAATGGCATCTCAGGCTGAATCTGGGGCTCCTCAACAA
TCCGATTGTTCAAAAACGGTGAGGATGGTGATAAAGGGAAGAGTACAGGGAGTTTGCTAC
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GAGATTCATTACACGATAC


BQ
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AF RR4E186TF U 1
AF RR4E186JQ C 32
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TCACGGTTGAGCACCACCCAGAATCCTCGTAGCCTATCCCTTCTTCTCCTTCGTCCTCCT
GTTCTTCCGTTTCGGCGTCGTTTCGTCTCCATCGTTCATCGTCGTCCTCTGCTTTGGATT
CGATCATCTCCTCCTCTATCCTCAATGGCATCTCAGGCTGAATCTGGGGCTCCTCAACAA
TCCGATTGTTCAAAAACGGTGAGGATGGTGATAAAGGGAAGAGTACAGGGAGTTTGCTAC
AGGAACTGGACCGTTGGGAATGCGGAGAAGCTCGGGATCAAGGGATGGGTCAGGAACCGC
AGGGACGGTTCAGTGGAAGCGCTCTTCTCTGGACCAACTGAAGCTGTCGAAGAGATGCAG
CAGAGGTGCCGCCGTGGTCCTCCTGCAGCCATGGTTACTGGATTAGAGGCTTTCCCATCC
ACTGAAGAACCAAAACAGGTTTCGAATACAGATCAACTGTCTGATTCGAGGGTTCCTTGA
ATGTTGCAGTGGTTACTTATGGATATAATAAAGTTGTAACAAGGCTTAGATTGACACACG
TATTTTGATCAATTTGCTCTGGCCTGGGTCGTGTTTTAAAA*CTTGATAGCAA

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DS 

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GCCTATCCCTTCTTCTCCTTCGTCCTCCTGTTCTTCCGTTTCGGCGTCGTTTCGTCTCCA
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TAAAGGGAAGAGTACAGGGAGTTTGCTACAGGAACTGGACCGTTGGGAATGCGGAGAAGC
TCGGGATCAAGGGATGGGTCAGGAACCGCAGGGACGGTTCAGTGGAAGCGCTCTTCTCTG
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ATCAACTGTCTGATTCGAGGGTTCCTTGAATGTTGCAGTGGTTACTTATGGATATAATAA
AGTTGTAACAAGGCTTAGATTGACACACGTATTTTGATCAATTTGCTCTGGCCTGGGTCG
TGTTTTAAAAACTTGATAGCAACAATAAAGAGATTCATTACACGATAC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL7236Contig1 951 2 2 U
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AGTATCACTTTCCAGGAATATGGAGTGACGTTATATCTATATAGAACACCATACATAGTG
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AATGCTTGGAAAAACATGGACGTTCTTGTCTTCAATTCTTGTATTGGTGGACTCACAAAG
GCAGTTCTCAAGGGTGGGACTACATTAGAGATGGGTCGTCTTTGGTGAGGGACATGAACC
GTCTTGACGCATTCTACAAAGGACTTAGCACTTGGGGTCGATGGGTTGACCAAAACGTCG
ATACCACCAAAACCAAAGTTTTCTTCCAAGGCATATCTCCCACTCACTACGAGGGAAGGG
AATGGAACGAGCCAAGAAAGAGTTGTACTGGACAAATGCAACCGTTGAGTGGATCCAACT
ACCCAAGTGGCCAGCCTGAATCTGCAGGAGTTGTGTCCAAAGTGTTGGGAGCGATGAAAA
CGCGGGTGTCCTTGCTTGATATCACCACTCTGTCTCAGCTGAGAAAAGATGCTCATCCTT
CTACTTATGGTGGCGATGGTGGGAATGATTGCAGTCATTGGTGCCTCCCTGGGTTGCCTG
ATACTTGGAACCAACTTCTCTACGCAGCTCTGTCGATGTGAATTTAAGCAATAAATCTTT
ACAAAGAAAGTGCAAACACACCGTTGTTCTGTAATTACATTCTTGGAGGTGCAAAGAAGC
TGACCGTTTTACTTTGGGGGTGGTCTTTAAGTGAAGACTAGAAGCATAAAGAAGATGGAT
TGTAAAGTGTCTTTATATTCTTTTCCTATGGGATGAATCAATAAATCTAAAAATTTGTCT
AATATTCTGTGATGTTATAGAAAGATATTATTAATAAACAAACAGATTACC


BQ
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AF RR4A516TF U 1
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AATGGAACGAGCCAAGAAAGAGTTGTACTGGACAAATGCAACCGTTGAGTGGATCCAACT
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CGCGGGTGTCCTTGCTTGATATCACCACTCTGTCTCAGCTGAGAAAAGATGCTCATCCTT
CTACTTATGGTGGCGATGGTGGGAATGATTGCAGTCATTGGTGCCTCCCTGGGTTGCCTG
ATACTTGGAACCAACTTCTCTACGCAGCTCTGTCGATGTGAATTTAAGCAATAAATCTTT
ACAAAGAAAGTGCAAACACACCGTTGTTCTGTAATTACATTCTTGGAGGTGCAAAGAAGC
TGACCGTTTTACTTTGGGGGTGGTCTTTAAGTGAAGACTAGAAGCATAAA

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DS 

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ATGGGTTGACCAAAACGTCGATACCACCAAAACCAAAGTTTTCTTCCAAGGCATATCTCC
CACTCACTACGAGGGAAGGGAATGGAACGAGCCAAGAAAGAGTTGTACTGGACAAATGCA
ACCGTTGAGTGGATCCAACTACCCAAGTGGCCAGCCTGAATCTGCAGGAGTTGTGTCCAA
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GAGAAAAGATGCTCATCCTTCTACTTATGGTGGCGATGGTGGGAATGATTGCAGTCATTG
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AACAGATTACC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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TTTTAAAATAAAAGACACTAATTTGATTATTGTTTTT


BQ
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AF RR4GR20JQ C 1
AF RR4GR20TF U 1
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RD RR4GR20JQ 637 0 0
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TTTTAAAATAAAAGACACTAATTTGATTATTGTTTTT

QA 1 637 1 637
DS 

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GGGAGATAAATAAGAAGCCAAGTTTTGTACGTAGAGAATTAAAGAAAGCTCCAAGCGATG
GAAGATCAAGAACTGCAGAAGAATTCACGAGTTGTTAAAGTCGATTCTGCAGAATCATGG
AACTTTTATGTGAGTCAAGCCAAGAGTCAGGCTTGTCCCATTGTGGCTCATTTCACAGCA
TCATGGTGTATTCCTTCTGTGTTTATGAACTCGTTCTTCGAAGATATTGCATCTAGCTAT
AAGGATGCTCTGTTTCTTATAGTTGATGTTGATGAAGTCAAGGAAGTGGCGAGACGGCTA
GAGGTAAAGGCCATGCCGACTTTTATGTTCTTGAAGGATGGTAATACGATGGAAAAACTG
GTCGGCGCAAACCCTGATGAGATCAAGAAAAGGGTCGATTGTTTCGTTCAGTCCTCACGC
CTTGTTCATATTGCTTAGAATTATATTGATATACATGGTAAGAAATCTCAATCCTAATAA
AGTTTGTGTAAAAGTGTATTTTAGTTTGTGTAAAGTGTACTCATAGCTTGTGTAAAGTGT
ATTTGTAGGTTGTGTAACTTGTATGATTACTCTTTTGGTTTGTGAATTTGTAGATAAA*T
TTTTAAAATAAA*GACACTAATTTGA

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7238Contig1 1047 2 8 U
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TGAACACGACCTTTGCTGTGATTGTTTTTCTTTGTCAAATAACAGTCCTCTGTTTAAAAC
ACAGTTTATGCTAAACATTTGAGTGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FF74TF U 1
AF RR4FF74JQ C 425
BS 1 629 RR4FF74TF
BS 630 630 RR4FF74JQ
BS 631 635 RR4FF74TF
BS 636 636 RR4FF74JQ
BS 637 644 RR4FF74TF
BS 645 645 RR4FF74JQ
BS 646 663 RR4FF74TF
BS 664 1047 RR4FF74JQ

RD RR4FF74TF 671 0 0
GATTCATTCAAGTGAACCTCGTGCTGGTGATTGTACTGAAGTGAAAGATGTCAGCAAGGA
GCGTCTTCTCCCAGTGGCCATTAACAGGGCTCTATATGAGAGTGCATTACCACTTTCTGA
TTCTGCAAGCAAGCAGGAAGTCACTGAGATCAATGAAACTAATAAGCTAGATGAGGAAGC
CCTAGATAAAGCTCAGTTTGTGTCTTTTGTGGACTGTAGCTCCACAAGGCTCACATCTGT
CTTTAACAAGATCAACTCGGTGAAGGGTTGCTGGCTAAGGATGTGCATGGATATAACAGA
CCTTTTCTCTGGTGTGGATGAGGAACGTTTGGGATCACTGGAGACACTGTCTATTACAAA
CCTTCCATTGTTGGAGACTATAAGCTGTGGTGGTAGCTTCAAGAACCTGAAGAACCTAAG
CATAGATTGCTGCCCAAATATCATAACGCTTTTCCCGGAGCCAGATCAGACGCCTAACGG
CCTAGAAGTCCTCCATATAAAGTTTTGTGAGAAGCTGGAGAAAGTGTTCAAAGAAGGCGA
AGTGTCAACTCTCACTACCCTGCACCTTCATGAGTTGCCTATGTTATCAGCTGTTGGAGC
CAAACTACCCAGTCTCGACACGTTTAAAA*GAGGA*CTGCCCAA*GCTTCCAGCTGAAAA
GGA
GATCTCAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FF74JQ 623 0 0
GATTGCTGCCCAAATATCATAACGCTTTTCCCGGAGCCAGATCAGACGCCTAACGGCCTA
GAAGTCCTCCATATAAAGTTTTGTGAGAAGCTGGAGAAAGTGTTCAAAGAAGGCGAAGTG
TCAACTCTCACTACCCTGCACCTTCATGAGTTGCCTATGTTATCAGCTGTTGGAGCCAAA
CTACCCAGTCTCGACACGTTTAAAAAGAGGAACTGCCCAAAGCTTCCAGCTGAAAAGGAA
GATCTCAAAGTCCCTGGCTGGGTTTACGTAGAGGACTCTGAAGTTTCTGCGTCACCACAA
GGTTGAAGATAGATGGAGGAGCAGTTAGATCTACCTAACTCTGCATTAAGCATCTGGATC
GTTGCCTTTATTAATTCTACCTACTTTTCTTTTGTCTGTGTGTGTCTGAACTGTTGCGTG
TTGAATAAAGACCGGCTTTGAAACATTATCTTTACCGGCTTTCTTTCTTTTGTTTTCTGT
TGTAAGATGGTTTCTGAAGTAAAATCCCAGTGCATGGTGTTCTGTTCTTGTCTGGGTGAA
CACGACCTTTGCTGTGATTGTTTTTCTTTGTCAAATAACAGTCCTCTGTTTAAAACACAG
TTTATGCTAAACATTTGAGTGAC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7239Contig1 868 2 2 U
GCAAATGGGAGGAAAACAAGATCCGACGACGGCGAATGGGAGCCCGAAATCGGAACCAAC
GGCGACGAAGAACACCACCCCAGATCTGCTCAACAGCTTCTCCTCATTCAAATCCCTAAA
GCTGAAGACGAAGCAGCAGGAGCTACTTCTCCGCGTCTCGATCCTCGGCCTAGTCTACGT
CCTAGCCTTCATCGCTCGCCTCTTCAGCGTCCTCCGCTACGAATCCATGATCCACGAGTT
CGATCCCTATTTCAACTACCGAACCACGCTCTTCCTCACGGAGAAAGGCTTCCACGAGTT
CTGGAGCTGGTTCGATTCCGAGTCCTGGTACCCTCTCGGTAGGATCATCGGCGGCACGCT
TTATCCAGGTCTCATGGTCACCGCCGCTCTGATCTACTGGGCGCTGAGGTGGAGTATACC
CAGTGATCAAGGAACCTGATTACCTTGTGAATGGCGAGTTCCGTGTAGACAAGGGCGCAT
CACCAAAGATGCTGAACTGTCTCATGTACAAGTTATGCTATTACAGGTTCGGCGAGCTGG
TCACAGAATATGGCAAGCCAGCCGGGTATGATAGAGCAAGAGGGGTGGAGATAGGGAACA
AAGACATCAAACTGGAACACTTGGAAGAAGCCTACACAACATCAAACTGGATTGTCCGTA
TTTACAGAGTCAAGCCTCCCACAAACAGGGTGTGACTCTTTTAAGAGCTTCCATCATCAG
AGAATGTGGCTTTAGATAGTTTGGTAGTTTTAAGGAGGAAACATATAATTTCGGATTTTT
GTTGGACATGGTTTTGTTTTCTTGCAGAGACAACTTTTTGGGACTTATTATCGCTTATAA
GTATGAAACATATTTGCACTGGTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CR23TF U 1
AF RR4CR23JQ C 49
BS 1 684 RR4CR23TF
BS 685 868 RR4CR23JQ

RD RR4CR23TF 684 0 0
GCAAATGGGAGGAAAACAAGATCCGACGACGGCGAATGGGAGCCCGAAATCGGAACCAAC
GGCGACGAAGAACACCACCCCAGATCTGCTCAACAGCTTCTCCTCATTCAAATCCCTAAA
GCTGAAGACGAAGCAGCAGGAGCTACTTCTCCGCGTCTCGATCCTCGGCCTAGTCTACGT
CCTAGCCTTCATCGCTCGCCTCTTCAGCGTCCTCCGCTACGAATCCATGATCCACGAGTT
CGATCCCTATTTCAACTACCGAACCACGCTCTTCCTCACGGAGAAAGGCTTCCACGAGTT
CTGGAGCTGGTTCGATTCCGAGTCCTGGTACCCTCTCGGTAGGATCATCGGCGGCACGCT
TTATCCAGGTCTCATGGTCACCGCCGCTCTGATCTACTGGGCGCTGAGGTGGAGTATACC
CAGTGATCAAGGAACCTGATTACCTTGTGAATGGCGAGTTCCGTGTAGACAAGGGCGCAT
CACCAAAGATGCTGAACTGTCTCATGTACAAGTTATGCTATTACAGGTTCGGCGAGCTGG
TCACAGAATATGGCAAGCCAGCCGGGTATGATAGAGCAAGAGGGGTGGAGATAGGGAACA
AAGACATCAAACTGGAACACTTGGAAGAAGCCTACACAACATCAAACTGGATTGTCCGTA
TTTACAGAGTCAAGCCTCCCACAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4CR23JQ 820 0 0
ATCGGAACCAACG*CGACGAAGA*CACCACCCCAGATCTGCTCAACAGCTTCTC*TCAT*
CAAATCCCTAAAGCTGAAGACGAAGCAGCAGGAGCTACTTCTCCGCGTCTCGATCCTCGG
CCTAGTCTACGTCCTAGCCTTCATCGCTCGCCTCTTCAGCGTCCTCCGCTACGAATCCAT
GATCCACGAGTTCGATCCCTATTTCAACTACCGAACCACGCTCTTCCTCACGGAGAAAGG
CTTCCACGAGTTCTGGAGCTGGTTCGATTCCGAGTCCTGGTACCCTCTCGGTAGGATCAT
CGGCGGCACGCTTTATCCAGGTCTCATGGTCACCGCCGCTCTGATCTACTGGGCGCTGAG
GTGGAGTATACCCAGTGATCAAGGAACCTGATTACCTTGTGAATGGCGAGTTCCGTGTAG
ACAAGGGCGCATCACCAAAGATGCTGAACTGTCTCATGTACAAGTTATGCTATTACAGGT
TCGGCGAGCTGGTCACAGAATATGGCAAGCCAGCCGGGTATGATAGAGCAAGAGGGGTGG
AGATAGGGAACAAAGACATCAAACTGGAACACTTGGAAGAAGCCTACACAACATCAAACT
GGATTGTCCGTATTTACAGAGTCAAGCCTCCCACAAACAGGGTGTGACTCTTTTAAGAGC
TTCCATCATCAGAGAATGTGGCTTTAGATAGTTTGGTAGTTTTAAGGAGGAAACATATAA
TTTCGGATTTTTGTTGGACATGGTTTTGTTTTCTTGCAGAGACAACTTTTTGGGACTTAT
TATCGCTTATAAGTATGAAACATATTTGCACTGGTTTGTT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL7240Contig1 782 2 4 U
GGGAAACTCGAGAGCATTTATAAATTTGGAGAGATCGTGAGATATGAGAAGTTTAAACCG
AGAAAATAAGAGAAGAAAGAGGGATTTGGTCACCCGTAGTGTGTGTGACTATATATATAT
CATCAGAGCTGCGATTTGGAACCGGAATCTGATCTGTAGTAATGGAGGAAATAAGATCTG
CGATGGAGCAACAAATGGATCTGAGGGCGGATCTGGTCCAGAAGCTCTCCGGTGAGCTCC
GAACCGGATTACAACCTGCCTACGCTAATTTCATTGGATTTTTCCACGCCATCGATTGGA
AGGAACCATGGATAATGGGATTAATGGCGTTTCATGCTCTGTTTCTATTGGTTACTCTTC
TTTCTAGAAGGCATCTCAACTTCCATATGTTCCTCTTCTTATTCTCATTGTGTGGAGTGT
ACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGGAAAAACTGGAAGAGCTTCTCTACTCAAA
ACTACTTTGACCCCCACGGAGTCTTCCTCTCGGTTCTCTGGTCTGGACCCCTTCTTGTCA
TTGCAATGATAATTCTGATAAACACACTCTTTTCGCTTTGCTACCTAATTGTAAAATGGA
AAAGAGCTGAACTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTACCAAGCAGGAATAGGACCCAA
AGCTCTCTCTTATTAGCGTATCCTTAGTATACTCTCGCATTGCACCAAACTATTTTCTAT
TTGATTTGTGTTTCATTTTGAACTGAACGAACCAAACCAGATTAAACCAAGCCTGTATTC
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4EN42TF U 1
AF RR4E728JQ C 63
BS 1 142 RR4EN42TF
BS 143 143 RR4E728JQ
BS 144 691 RR4EN42TF
BS 692 782 RR4E728JQ

RD RR4EN42TF 697 0 0
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AGAAAATAAGAGAAGAAAGAGGGATTTGGTCACCCGTAGTGTGTGTGACTATATATATAT
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CGATGGAGCAACAAATGGATCTGAGGGCGGATCTGGTCCAGAAGCTCTCCGGTGAGCTCC
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TTTCTAGAAGGCATCTCAACTTCCATATGTTCCTCTTCTTATTCTCATTGTGTGGAGTGT
ACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGGAAAAACTGGAAGAGCTTCTCTACTCAAA
ACTACTTTGACCCCCACGGAGTCTTCCTCTCGGTTCTCTGGTCTGGACCCCTTCTTGTCA
TTGCAATGATAATTCTGATAAACACACTCTTTTCGCTTTGCTACCTAATTGTAAAATGGA
AAAGAGCTGAACTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTACCAAGCAGGAATAGGACCCAA
AGCTCTCTCTTATTAGCGTATCCTTAGTATA
TCTCTC

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DS 

RD RR4E728JQ 720 0 0
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GAACCATGGATAATGGGATTAATGGCGTTTCATGCTCTGTTTCTATTGGTTACTCTTCTT
TCTAGAAGGCATCTCAACTTCCATATGTTCCTCTTCTTATTCTCATTGTGTGGAGTGTAC
TTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGGAAAAACTGGAAGAGCTTCTCTACTCAAAAC
TACTTTGACCCCCACGGAGTCTTCCTCTCGGTTCTCTGGTCTGGACCCCTTCTTGTCATT
GCAATGATAATTCTGATAAACACACTCTTTTCGCTTTGCTACCTAATTGTAAAATGGAAA
AGAGCTGAACTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTACCAAGCAGGAATAGGACCCAAAG
CTCTCTCTTATTAGCGTATCCTTAGTATACTCTCGCATTGCACCAAACTATTTTCTATTT
GATTTGTGTTTCATTTTGAACTGAACGAACCAAACCAGATTAAACCAAGCCTGTATTCTG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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AACAATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW80TF U 1
AF RR4DW80JQ C 2
BS 1 637 RR4DW80TF
BS 638 638 RR4DW80JQ
BS 639 671 RR4DW80TF
BS 672 727 RR4DW80JQ

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AAAAAACCGTTTCTCTTTCTTTTCTTTCTATTGTTTGAAGACATGTTGTGCAACAGTTGA
GAGCAGTTGCATGCCCCATAAAACTTCCTTTCTTTCTCATTTTCCCGATCTTCGCATTAA
TCATCATACTCCTGGGATCTCAATAAACCAAAAACCCAGCTTAAAAGAAGAAGAAGATCT
ACTTGTTGAAACGACACCTTGTACTGTCGTTTTAGTTAAAGCTCGAGATCTACGTTTCCT
TCTTGGCTTCTGAGCTTCTGGCGGTGGTGGGTTTTCTATAGGAGTAATCAAAGTTGTTGT
CTTTTTTTCTTTTTTTTTTTATATATACAATTATTTTAATGGGAGTAAACGGTGGGTAGT
TTACAAAGTAATGAAGGAGTGGAAGATTAGGAGAAGCGGCTTTGAGGTCGGCGAGACAAA
GATTGCGAGCTTATTTGGCTGATGTGTGTTCTGTAAG*AAGAAAGTAGAAGAAATCTGTT
TTCTTTTTTTC

QA 1 671 1 671
DS 

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GAAAACAGCCATTGTCGTCCCTTCTGATTCAAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGTA
AGTAGCTTTCGAGCAGAGAATAACAATAATAATAATAGCAGCAGAGGCTCAGCTCCGCCA
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AAAAACCGTTTCTCTTTCTTTTCTTTCTATTGTTTGAAGACATGTTGTGCAACAGTTGAG
AGCAGTTGCATGCCCCATAAAACTTCCTTTCTTTCTCATTTTCCCGATCTTCGCATTAAT
CATCATACTCCTGGGATCTCAATAAACCAAAAACCCAGCTTAAAAGAAGAAGAAGATCTA
CTTGTTGAAACGACACCTTGTACTGTCGTTTTAGTTAAAGCTCGAGATCTACGTTTCCTT
CTTGGCTTTTGAGCTTCTGGCGGTGGTGGGTTTTCTATAGGAGTAATCAAAGTTGTTGTC
TTTTTTTCTTTTTTTTTTTATATATACAATTATTTTAATGGGAGTAAACGGTGGGTAGTT
TACAAAGTAATGAAGGAGTGGAAGATTAGGAGAAGCGGCTTTGAGGTCGGCGAGACAAAG
ATTGCGAGCTTATTTGGCTGATGTGTGTTCTGTAAGGAAGAAAGTAGAAGAAATCTGTTT
TCTTTTTTTCTTAGGGTTTTTGTGAAAAGATTTGGTGGGTGGGGGGGAGGTGGGAGGGTA
ACAATT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL7242Contig1 1124 2 2 U
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CATGGACGTTCTTGTCGAGACGACACTACGTTGACTAGGCATAAACAGTTTGTCTCCGCT
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TCTTCTCAGACGTCCGAGAGTCTCAGCGGTGAAAGCGTCGGCTTGAGTAGGTGTTACGGT
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TTGAGGGTTGATGTTCGTGTTTATGCCAAAGAAGAGGATTATGTGTCAGACATCGAAGCT
ACTCCTAAAGAAAAAGGTTATAGACCTCTGTTTTGGATGCAGAGATGTCGTGATTATAAC
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TAGTCTTGACAGATTCTTGCGTGTTGGTCACACAACATACATGCTAAATGATTCAACATT
CCCCAAGCAGGGTGAGAGATTTAAAAAGGCTTTGTCAAGAAGAACAAGCCTGCTTTTTTT
TTTTTTTTTAATTTCACTCTTATCCTCAGGGAACATGATATACGAACCTGTAAAGTTTTA
TACCTATTTGTAAAACTTGAACCTATGTTTTGTGAGGTTTTAGACGTGTTTCTAAAGAAA
ACCAATGCGTGGTGTGTTCAATGATAGTATATTGGTTTGGAACT


BQ
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AF RR4G144TF U 1
AF RR4G144JQ C 360
BS 1 671 RR4G144TF
BS 672 1124 RR4G144JQ

RD RR4G144TF 671 0 0
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GCCGAGGAGGTTCAACAATCTGCCGATACGATGGAGTCTGCATATAGGATGTGGATTAAA
GAGAAGAGAGAAGGTCGAGTCTCTGTAGAATCAGACCACCTCTGTAATGAACTTCAAGCA
GCTTTGAGCACAGCTAAATGGCAGTTGGAAGAGTTTGAGAGGGCAGTGAGGTTGAGCCAC
CATGGACGTTCTTGTCGAGACGACACTACGTTGACTAGGCATAAACAGTTTGTCTCCGCT
ATCGAAAACCAGATTCACCGAGTGCAATCTGCTTTAAGCGAGAACGGGGAGCAGCCTCTG
CGCTGGGTGGTGGATCTCAACAGAGAGGAGCGTGATGACCTTGCCATGTTTCTGTCTGGA
TCTTCTCAGACGTCCGAGAGTCTCAGCGGTGAAAGCGTCGGCTTGAGTAGGTGTTACGGT
GAGAGTCCTGACTGTGTGATAGACATTGACGGCGAGAGAGGAGGTAGCCCTGAGAGTGAT
GGCAAGAAACTCGGTACGAGAAGGACGTGGAGCTCACCTAATGTTCCTGATATTAGCGCG
TTGAGGGTTGATGTTCGTGTTTATGCCAAAGAAGAGGATTATGTGTCAGACATCGAAGCT
ACTCCTAAAGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4G144JQ 765 0 0
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ATCTTCTCAGACGTCCGAGAGTCTCAGCGGTGAAAGCGTCGGCTTGAGTAGGTGTTACGG
TGAGAGTCCTGACTGTGTGATAGACATTGACGGCGAGAGAGGAGGTAGCCCTGAGAGTGA
TGGCAAGAAACTCGGTACGAGAAGGACGTGGAGCTCACCTAATGTTCCTGATATTAGCGC
GTTGAGGGTTGATGTTCGTGTTTATGCCAAAGAAGAGGATTATGTGTCAGACATCGAAGC
TACTCCTAAAGAAAAAGGTTATAGACCTCTGTTTTGGATGCAGAGATGTCGTGATTATAA
CCAGCTCTTTGACGGAGTCAGATACTATCAAAGGCGGTTCGGGGTTCCATTTAACCGGCC
GGTTCAGCTCATTGTTTCCTTGACGCTACTCTTGTTTCTTCTATTACTCTTTCGAGCTTA
TTAGTCTTGACAGATTCTTGCGTGTTGGTCACACAACATACATGCTAAATGATTCAACAT
TCCCCAAGCAGGGTGAGAGATTTAAAAAGGCTTTGTCAAGAAGAACAAGCCTGCTTTTTT
TTTTTTTTTTAATTTCACTCTTATCCTCAGGGAACATGATATACGAACCTGTAAAGTTTT
ATACCTATTTGTAAAACTTGAACCTATGTTTTGTGAGGTTTTAGACGTGTTTCTAAAGAA
AACCAATGCGTGGTGTGTTCAATGATAGTATATTGGTTTGGAACT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL7243Contig1 626 2 1 U
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ATACAATCCCCATTTCGTTTCACCCTTAATTCTCATTTATTGATTCTCTTCAAGCTTTCT
CCTTCTGATTCTTCATATAAAACACATAATCACATGAGTTTTATTCCGATCCAACTTCGT
TCTATATTCTCTCCTACCACACTGCAATGAGTTCGAACGGAAAATCCATGGTATCTGGTG
CTTCTAAGTCGGAGAAACCAAAAGGCGCTGCCGCTGGCTCGAGACCAACAAGAGACATGG
GGTGGAGAATAGTGTCCTGAAAGAAAGCAACACGGGCTGAAGCATAAAAACGAGGGCTTA
TTGTATGTTTCTTTATCTCTATGACTATGTTCTGTACTGAGCGATATTGGATTCGAAAGG
TTCTGAGTTTTCTAAAAAAGTGTATCTTCGCATACAGGAACTTGTGTGTTTGTACTTGCT
GAGCATGCTATTGACTTCTCACTTGCTAGGCTTAATCTGTATAAACACAGAAATCTACTT
TAATCCGAAGTGGTTTGATTGATGTT


BQ
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AF RR4B806JQ C 1
AF RR4B806TF U 1
BS 1 626 RR4B806TF

RD RR4B806JQ 626 0 0
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ATACAATCCCCATTTCGTTTCACCCTTAATTCTCATTTATTGATTCTCTTCAAGCTTTCT
CCTTCTGATTCTTCATATAAAACACATAATCACATGAGTTTTATTCCGATCCAACTTCGT
TCTATATTCTCTCCTACCACACTGCAATGAGTTCGAACGGAAAATCCATGGTATCTGGTG
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GGTGGAGAATAGTGTCCTGAAAGAAAGCAACACGGGCTGAAGCATAAAAACGAGGGCTTA
TTGTATGTTTCTTTATCTCTATGACTATGTTCTGTACTGAGCGATATTGGATTCGAAAGG
TTTTGAGTTTTCTAAAAAAGTGTATCTTCGCATACAGGAACTTGTGTGTTTGTACTTGCT
GAGCATGCTATTGACTTCTCACTTGCTAGGCTTAATCTGTATAAACACAGAAATCTACTT
TAATCCGAAGTGGTTTGATTGATGTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4B806TF 626 0 0
GGGCAGACACGATTCCCCCCCCCCATTTCGTCAATCTCTAATCTCCTAGATTGATCGTGT
AACCTTTGCTCGCCCTCTTCTCTGTTCGGTTTCGCGATCGATCTGATCGACGATCATTCA
ATACAATCCCCATTTCGTTTCACCCTTAATTCTCATTTATTGATTCTCTTCAAGCTTTCT
CCTTCTGATTCTTCATATAAAACACATAATCACATGAGTTTTATTCCGATCCAACTTCGT
TCTATATTCTCTCCTACCACACTGCAATGAGTTCGAACGGAAAATCCATGGTATCTGGTG
CTTCTAAGTCGGAGAAACCAAAAGGCGCTGCCGCTGGCTCGAGACCAACAAGAGACATGG
GGTGGAGAATAGTGTCCTGAAAGAAAGCAACACGGGCTGAAGCATAAAAACGAGGGCTTA
TTGTATGTTTCTTTATCTCTATGACTATGTTCTGTACTGAGCGATATTGGATTCGAAAGG
TTCTGAGTTTTCTAAAAAAGTGTATCTTCGCATACAGGAACTTGTGTGTTTGTACTTGCT
GAGCATGCTATTGACTTCTCACTTGCTAGGCTTAATCTGTATAAACACAGAAATCTACTT
TAATCCGAAGTGGTTTGATTGATGTT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7244Contig1 1260 2 4 U
GATCCTTATAAACCTCTTGTAGAAGCAATAAAGAAATTTAAGGTCGCACAGAATGCTCTG
GCCCAAGTTGCATGGAATTTTGTTAACGATGGTCTGCGGACGTCACTCTGCCTGCAATTT
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GGAAGCCAAGTCGAAAGTAGTGTAGGTGGAGGATCGGCTCAACAAGTTGGTTCTAGGCCA
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ATACTGAAACTCATCAAGCCGATCAGTCTAGAACGAAAGTTGAGGCACATGGGAAGGAGG
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GTGTTGTTAAGTCAGGTGATGCCCCGGTGAGTCAATCGCCGATAGATATAAAGTTTTTTA
GAGATAAGGTGAAGGCTAAACTAGAGGCTAAGAAGATCCAAGGTGAGAAGACGAAGAAAA
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AGCAACACATGGACAAGAGCGAGGATGCTGAAGGAGGTGAAAAGACAAGCCATAATAGTC
ATGGTGACCGGGAGGTAAGAAGACACTCCCAAGAGAGGTAAAAGTGATCTGTTTGTTTTT
TTTTTCGGAACATTCTCATGGGTCTCTAAGAGACATTTGGCAAACTTTGATTCCCAGCCA
TGGTGTAGAACGAGCTGAGTGTATTTATATTGCTGGATTTATATTCTCTCCCTTATTCTT
TGGTACTTGTACTACAAACATAATCCAACAGTTGAGAAACTAAATCAGCTTTACATCACC


BQ
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AF RR4FI20TF U 1
AF RR4FI20JQ C 412
BS 1 658 RR4FI20TF
BS 659 659 RR4FI20JQ
BS 660 693 RR4FI20TF
BS 694 1260 RR4FI20JQ

RD RR4FI20TF 699 0 0
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GCCCAAGTTGCATGGAATTTTGTTAACGATGGTCTGCGGACGTCACTCTGCCTGCAATTT
AAGCCTCACCACATTGCGACTGGTGCAATTTTTCTTGCTGCCAAGTTCCTTAAAGTGAAA
TTACCAGCGGATGGGGATAAGGTTTGGTGGCAAGAATTTGATGTCACACCTCGACAACTG
GAGGATGTGAGCAACCAAATGCTTGAGCTCTATGAGCAAAATAGTGTTCCTCCATCTCAA
GGAAGCCAAGTCGAAAGTAGTGTAGGTGGAGGATCGGCTCAACAAGTTGGTTCTAGGCCA
ATATCAGCTCGTCCAGCTCATGAACATTCAAATTCTGACAACCCCGGGGGCTGTCAAAAG
CTACACAAAACCAGAGCAATGATAATGGGAGTGGTGAGGCAGGTAGTGTCATTACCGGGC
ATACTGAAACTCATCAAGCCGATCAGTCTAGAACGAAAGTTGAGGCACATGGGAAGGAGG
AAACAGAGAAAATAGGTGCACATCTCCCAGATGATAGCGTCGCTCTTGATAAATCTAGGA
GTGTTGTTAAGTCAGGTGATGCCCCGGTGAGTCAATCGCCGATAGATATAAAGTTTTT*A
GAGATAAGGTGAAGGCTAAACTAGAGGCTAAGA
GATCCA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4FI20JQ 849 0 0
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TTACCGGGCATACTGAAACTCATCAAGCCGATCAGTCTAGAACGAAAGTTGAGGCACATG
GGAAGGAGGAAACAGAGAAAATAGGTGCACATCTCCCAGATGATAGCGTCGCTCTTGATA
AATCTAGGAGTGTTGTTAAGTCAGGTGATGCCCCGGTGAGTCAATCGCCGATAGATATAA
AGTTTTTTAGAGATAAGGTGAAGGCTAAACTAGAGGCTAAGAAGATCCAAGGTGAGAAGA
CGAAGAAAAAGGATGTGATAGATGAGGATGATTTGATAGAAAGAGAACTGGAAGATGTGG
AAGTAGCTGTTGACGATGCCAAAGACAACCAGAAGAAGATTGGTACAGTGCACGGCGAGA
TTCTTGATGGAAACAACTTGGTGGGCAACACCGAGGAAGGTGAGATGGTAGATGATGTTT
CTTCGACGGAGCCTAGTCGGAAGAGAAAAATGGAAAGTCCTTGTGAAAAACAGTTAGGAG
AAGGAAAGAAGCAACACATGGACAAGAGCGAGGATGCTGAAGGAGGTGAAAAGACAAGCC
ATAATAGTCATGGTGACCGGGAGGTAAGAAGACACTCCCAAGAGAGGTAAAAGTGATCTG
TTTGTTTTTTTTTTCGGAACATTCTCATGGGTCTCTAAGAGACATTTGGCAAACTTTGAT
TCCCAGCCATGGTGTAGAACGAGCTGAGTGTATTTATATTGCTGGATTTATATTCTCTCC
CTTATTCTTTGGTACTTGTACTACAAACATAATCCAACAGTTGAGAAACTAAATCAGCTT
TACATCACC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

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ATAAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGAGATGGGACACGTAATCCGACAGCTGCTGATAAACCC
TCCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGCCCCTTCTCAGGTGCCGGACTACTCTCGACTCAAACTA
TGTCTTCTCTCTGCGAACTTCAATTACCAAAAGCAAGGCCAGATTCTCTTGTCTTTTCTC
CGGCGGCAACCAGAGGGAGGAGCAAGCTCGTAAAGCATTGGAAAGCGCTCTTGGCGGTAA
GAAAAATGAGTTCGACAAATGGGACCAAGAAATCAAGAAAAGACAAGAATCCGTTGGTGA
CGGTAATGCTGCCAATGGTGGAGGAGGAGGAGGCTGGTTTGGAGGCTGGTTCAGTGGCGA
TCATTTCTGGAATGAAGCACAGCAGATCACCATTACTCTCTTAGCAATTCTTTTCGTGTA
TATGATAGTTGCGAAAGGTGAAGTAATGGCTGCATTTGTGCTAAACCCCTTGTTGTACGC
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TTCGAAGGTGAACGGTGATAACTCAGAGGAGATGTGGAAGAATGAAGGTTTGGTCTCTGC
TAAAGAAAGCGTTGTCCGAAAATGGGGAAGTGACTGAATCAGAGTTCAAGAAGAAAGACT
TTGAATGTTTTTCTTTGAATGTTTTTTTCTTCTTCCGGTTTGTTTTGAAACGCCAAGATG
AGATCAAACCCTCTTTTCAGTTCTGTAATAAAGGATAGGTACATTTTTTC


BQ
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AF RR4F145TF U 1
AF RR4F145JQ C 166
BS 1 602 RR4F145TF
BS 603 830 RR4F145JQ

RD RR4F145TF 602 0 0
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ATAAGGGAGAGGGAGAGGGAGAGAGATGGGACACGTAATCCGACAGCTGCTGATAAACCC
TCCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGCCCCTTCTCAGGTGCCGGACTACTCTCGACTCAAACTA
TGTCTTCTCTCTGCGAACTTCAATTACCAAAAGCAAGGCCAGATTCTCTTGTCTTTTCTC
CGGCGGCAACCAGAGGGAGGAGCAAGCTCGTAAAGCATTGGAAAGCGCTCTTGGCGGTAA
GAAAAATGAGTTCGACAAATGGGACCAAGAAATCAAGAAAAGACAAGAATCCGTTGGTGA
CGGTAATGCTGCCAATGGTGGAGGAGGAGGAGGCTGGTTTGGAGGCTGGTTCAGTGGCGA
TCATTTCTGGAATGAAGCACAGCAGATCACCATTACTCTCTTAGCAATTCTTTTCGTGTA
TATGATAGTTGCGAAAGGTGAAGTAATGGCTGCATTTGTGCTAAACCCCTTGTTGTACGC
GTTGCGAGGAACACGAGAAGGTCTGACTTCTCTAAGCTCCAAGCTCATGGGAAGACAAGC
TT

QA 1 602 1 602
DS 

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CTCTTGTCTTTTCTCCGGCGGCAACCAGAGGGAGGAGCAAGCTCGTAAAGCATTGGAAAG
CGCTCTTGGCGGTAAGAAAAATGAGTTCGACAAATGGGACCAAGAAATCAAGAAAAGACA
AGAATCCGTTGGTGACGGTAATGCTGCCAATGGTGGAGGAGGAGGAGGCTGGTTTGGAGG
CTGGTTCAGTGGCGATCATTTCTGGAATGAAGCACAGCAGATCACCATTACTCTCTTAGC
AATTCTTTTCGTGTATATGATAGTTGCGAAAGGTGAAGTAATGGCTGCATTTGTGCTAAA
CCCCTTGTTGTACGCGTTGCGAGGAACACGAGAAGGTCTGACTTCTCTAAGCTCCAAGCT
CATGGGAAGACAAGCTTCGAAGGTGAACGGTGATAACTCAGAGGAGATGTGGAAGAATGA
AGGTTTGGTCTCTGCTAAAGAAAGCGTTGTCCGAAAATGGGGAAGTGACTGAATCAGAGT
TCAAGAAGAAAGACTTTGAATGTTTTTCTTTGAATGTTTTTTTCTTCTTCCGGTTTGTTT
TGAAACGCCAAGATGAGATCAAACCCTCTTTTCAGTTCTGTAATAAAGGATAGGTACATT
TTTTC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7246Contig1 589 2 1 U
TTTTTTTGTTCCGAGTTATCGTGTCCTTTTGTCTCAGGGAGATTAGTCCTTTTCTTGTTC
ATGGATTCGCTGATGGGTAAACTCGTGATGGGTTTGGTTGTGGTGGTTGCGATCTTCGGG
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GCCGATTCTTCGATCGGACCAGAAGATCATGTCCTTGAAGGAGCTGAAGTTGCGGTACTC
TGCATAACCAAATCTGGAGAAGTTGTGAACTACCAAGCTTTCACAAACACAAAAGGTGTC
TACACAGTAGCGGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCTTGCCTTGCAAGACCC
ATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACCACCTAAACCAGGCCAATAATGGGATCAAATTC
AGTTATAACCGCCCTTTGGGTTACTTTCATGCCGTGAAACCATTTGTGTATCGACACCAA
TACGCACCTTCTTATTGCTGAACTGAAAGAGCCTTTATACCCCCCTTTCTAAGTTGTGTA
AACTTGTAGTAATAATTTGAAATATGAAATAGTTTGGATATTTTTGTAT


BQ
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AF RR4FC50JQ C 1
AF RR4FC50TF U 1
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TACGCACCTTCTTATTGCTGAACTGAAAGAGCCTTTATACCCCCTTTT*TAAGTTGTGTA
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DS 

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ATGGATTCGCTGATGGGTAAACTCGTGATGGGTTTGGTTGTGGTGGTTGCGATCTTCGGG
GTTTCTGGTGTCGACGCGTGGACTGGAGAGATTCGCGGCAGAGTAGTATGCGATGTCTGT
GCCGATTCTTCGATCGGACCAGAAGATCATGTCCTTGAAGGAGCTGAAGTTGCGGTACTC
TGCATAACCAAATCTGGAGAAGTTGTGAACTACCAAGCTTTCACAAACACAAAAGGTGTC
TACACAGTAGCGGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCTTGCCTTGCAAGACCC
ATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACCACCTAAACCAGGCCAATAATGGGATCAAATTC
AGTTATAACCGCCCTTTGGGTTACTTTCATGCCGTGAAACCATTTGTGTATCGACACCAA
TACGCACCTTCTTATTGCTGAACTGAAAGAGCCTTTATACCCCCCTTTCTAAGTTGTGTA
AACTTGTAGTAATAATTTGAAATATGAAATAGTTTGGATATTTTTGTAT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FK63JQ U 5
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QA 1 467 1 467
DS 

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QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AE67JQ C 1
AF RR4AE67TF U 1
BS 1 779 RR4AE67TF

RD RR4AE67JQ 779 0 0
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CCTTGCCCTTTCTATAACCTATGAAAGTCATATAGTTTAATCCCTCCCAGTTACGCTGG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4AE67TF 779 0 0
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ACCACCGGGTTCCACTTCCACAACTGGCCCTCTTGAAGGTGTTGCAGGAGTAATGGAGGT
AGCTTCATCAAATAACACAACTCAGTCCCGTGAAGGACTCGCGATCGCGCCACAATATAA
GGAAAGTAGTGGCTTCGTTGCAAAGGGGGGTGAAAGTGAACACCGGGATGAGATTCCTGT
CACGGCAAGCAGAATGTCGGTGGCACTTGTTACTAGGAGCACTCTTGAAATTGTCTTACC
AGACGAGGTTATTCCTAAGCTTGTTACCAAATCAAGAAACAAGCTTGCACAAGTCAGTGA
GTGGTCTGGAGCTAGTGTAACATTAGTTGAAGACCGACCAGAGGAAACACAGAATGTCAT
TCGAATTTCGGGTACGCCAGAGCAGGCAGAGAGAGCACAGAGCTTGCTTCAAGGCTTCAT
CTTGAGCATACAAGACGATGGACCGTGAACTTTGAATTAACGGTGGGAGGGATTCAATCA
AGAAACTGTGAAATGTGGAGTTTGTATGAGTTGTTGAGTATTAGGATTTGAGTAACGGAT
AGAGGTTTAGATACATTCTGAAGCTGACGCCTTGGTTTTTATGTTGTCTATTAGTCGTTT
CCTTGCCCTTTCTATAACCTATGAAAGTCATATAGTTTAATCCCTCCCAGTTACGCTGG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL7249Contig1 604 2 1 U
GGGTCTCTTCAAGACGAATACTTGAGAATCATCTGAAAGTTTAGATACCATTTCGTAGAT
CTTGAATCTCTTGGGGGTGGCTGAATCACGTTTTTCTATCGGATTTACCTGGAAATTGGA
TCAGATATGAACTGGGTTCAACGCAAAATCTATCTTTACAATGTCACGTTCGGACTATAT
ATGCTTGATTGGTGGGAACGATACCTCTTCAATGGTTTGGTGGTAGTCTTGATGTGGTTC
GTAGCTTACAACGGTACACGCTACTTTTCAGAACTCTTCAAAAGATTCCGGTCTGAGTGG
ATTTGAGATACAAGTCTTTAGTTTGCCTGATGAATAGTCTGCTGCTGCTTGGCTTTTGAC
ATAAAATCAGACTCTGTTCCTCACATGGTAGAGCAAGAAATGCATATGCAAACCTCCACT
GGCACGGCGTTTAGTTTCAATTCTGAGATGTATGCCTGACAAAACCTTTATGCTGTTTCA
CCTCCCTTTCCGGCATCTCTCTGATTATGTTAGCTTTCCTTCAAAGTTTATTGTCAATTG
TATCATTTGTTTCTATGTTTTTGGAATTGACAGTACTTATTTATTGATGCAAAGTCTTTC
TGCT


BQ
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20 20 20 20 

AF RR4CK03JQ C 1
AF RR4CK03TF U 1
BS 1 604 RR4CK03TF

RD RR4CK03JQ 604 0 0
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CTTGAATCTCTTGGGGGTGGCTGAATCACGTTTTTCTATCGGATTTACCTGGAAATTGGA
TCAGATATGAACTGGGTTCAACGCAAAATCTATCTTTACAATGTCACGTTCGGACTATAT
ATGCTTGATTGGTGGGAACGATACCTCTTCAATGGTTTGGTGGTAGTCTTGATGTGGTTC
GTAGCTTACAACGGTACACGCTACTTTTCAGAACTCTTCAAAAGATTCCGGTCTGAGTGG
ATTTGAGATACAAGTCTTTAGTTTGCCTGATGAATAGTCTGCTGCTGCTTGGCTTTTGAC
ATAAAATCAGACTCTGTTCCTCACATGGTAGAGCAAGAAATGCATATGCAAACCTCCACT
GGCACGGCGTTTAGTTTCAATTTTGAGATGTATGCCTGACAAAACCTTTATGCTGTTTCA
CCTCCCTTTCCGGCATCTCTCTGATTATGTTAGCTTTCCTTCAAAGTTTATTGTCAATTG
TATCATTTGTTTCTATGTTTTTGGAATTGACAGTACTTATTTATTGATGCAAAGTCTTTC
TGCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4CK03TF 604 0 0
GGGTCTCTTCAAGACGAATACTTGAGAATCATCTGAAAGTTTAGATACCATTTCGTAGAT
CTTGAATCTCTTGGGGGTGGCTGAATCACGTTTTTCTATCGGATTTACCTGGAAATTGGA
TCAGATATGAACTGGGTTCAACGCAAAATCTATCTTTACAATGTCACGTTCGGACTATAT
ATGCTTGATTGGTGGGAACGATACCTCTTCAATGGTTTGGTGGTAGTCTTGATGTGGTTC
GTAGCTTACAACGGTACACGCTACTTTTCAGAACTCTTCAAAAGATTCCGGTCTGAGTGG
ATTTGAGATACAAGTCTTTAGTTTGCCTGATGAATAGTCTGCTGCTGCTTGGCTTTTGAC
ATAAAATCAGACTCTGTTCCTCACATGGTAGAGCAAGAAATGCATATGCAAACCTCCACT
GGCACGGCGTTTAGTTTCAATTCTGAGATGTATGCCTGACAAAACCTTTATGCTGTTTCA
CCTCCCTTTCCGGCATCTCTCTGATTATGTTAGCTTTCCTTCAAAGTTTATTGTCAATTG
TATCATTTGTTTCTATGTTTTTGGAATTGACAGTACTTATTTATTGATGCAAAGTCTTTC
TGCT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL7250Contig1 1249 2 6 U
GGAATCGTTCTCTGAGGCTCTTGGAAGCAAGCAAGCAAAGCCAACAAGAGAGGATTGTTT
CTGGGGATTGAAGAAGAAGACATACAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCGATGGGCAGCACAAG
CACGGCTTCTGCTGCTCTATTTCACCATTTCCAGCTCACCAGTATCAACCTTGATTCCCC
TAGAAAGCCTCCGTACAACACCGTGAGTTTCAGCAATTCGTGGAAGGAAAGTGGACTCCT
CCGACACGGTGTGACGCGACGCCGTAGCCAAAGGTTAGACCCGGTGGGCCGCTTTTCAGC
TCGGTGAAAATTCCGGAGACTCACCAACGGAAACCACTCCAGGCGTTGGCTCTGCTGTAG
AAGATAGACCAGCTGTGGAAGATGCGTCCTTTGAGCAAGAAGACAAAACAAGTTCCATCT
ATGGATTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCCCTGATGACAAAGAGATGACTATATTCG
ATCATCTTGAGGAGCTCCGTGAGAGAATATTCGTCTCCGTTTTAGCTGTTGGAGCTGCAA
TCTTGGGATGCTTCGCCTACTCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTCGAAGCTCCCGTCAAAA
CACAAGGCGTACGGTTTCTGCAGCTAGCTCCAGGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGG
TCTCGGGTTATTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTT
TTTGTACTTCCTGGTTTGACACGAGCTGAGAGAAGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGT
TCCTCCTTGTTGTTCTATGCTGGACTTGCCTTCTCCTACTGGGTTTTAGCCCCTGCTGCC
TTGAATTTCTTTGTCAACTACGCTGAAGGGGTGGTTGAATCTCTCTGGTCTATCGACCAG
TACTTTGAGTTTGTACTTGTGCTTATGTTCAGCACCGGCCTGTCTTTCCAGGTTCCAGTA
ATTCAGTTACTCCTGGGACAAGTAGGGGTGGTGTCAGGAGATCAAATGCTTTCAATATGG
AGATATGTAGTTGTGGGTGCGGTGGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCTTCGACAGACCCT
GTCACTCAGATGCTCCTAGCAACACCGCTTCTGGGCCTCTACTTAGGTGGTGCTTGGATG
GTCAAGCTCACAGGTCGGTGAAGAACTTGGCTGTTCAAAGAAAGACAAAAAAAATCATGT
GTATCTTGTATAGTATATCACTTTTCCATGCAAGAAACCACAGTTTGGT


BQ
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AF RR4FN70TF U 1
AF RR4FN70JQ C 462
BS 1 642 RR4FN70TF
BS 643 643 RR4FN70JQ
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RD RR4FN70TF 751 0 0
GGAATCGTTCTCTGAGGCTCTTGGAAGCAAGCAAGCAAAGCCAACAAGAGAGGATTGTTT
CTGGGGATTGAAGAAGAAGACATACAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCGATGGGCAGCACAAG
CACGGCTTCTGCTGCTCTATTTCACCATTTCCAGCTCACCAGTATCAACCTTGATTCCCC
TAGAAAGCCTCCGTACAACACCGTGAGTTTCAGCAATTCGTGGAAGGAAAGTGGACTCCT
CCGACACGGTGTGACGCGACGCCGTAGCCAAAGGTTAGACCCGGTGGGCCGCTTTTCAGC
TCGGTGAAAATTCCGGAGACTCACCAACGGAAACCACTCCAGGCGTTGGCTCTGCTGTAG
AAGATAGACCAGCTGTGGAAGATGCGTCCTTTGAGCAAGAAGACAAAACAAGTTCCATCT
ATGGATTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCCCTGATGACAAAGAGATGACTATATTCG
ATCATCTTGAGGAGCTCCGTGAGAGAATATTCGTCTCCGTTTTAGCTGTTGGAGCTGCAA
TCTTGGGATGCTTCGCCTACTCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTCGAAGCTCCCGTCAAAA
CACAAGGCGTACGGTTTCTGCAGCTAGCTCCAGGCGAGTTTT*CTTCACAACTTTAAAGG
TCTCGGGTTATTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGAT*ATAGCTT
TTTGTACTTCCTGGTTTGACACGAGCTGAGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4FN70JQ 788 0 0
AAAGAGATGACTATATTCGATCATCTTGAGGAGCTCCGTGAGAGAATATTCGTCTCCGTT
TTAGCTGTTGGAGCTGCAATCTTGGGATGCTTCGCCTACTCCAAAGATCTAATCGTGTTT
CTCGAAGCTCCCGTCAAAACACAAGGCGTACGGTTTCTGCAGCTAGCTCCAGGCGAGTTT
TTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATA
CTGTATGAGATTATAGCTTTT*GTACTTCCTGGTTTGACACGAGCTGAGAGAAGGTTTCT
GGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTTGTTCTATGCTGGACTTGCCTTCTCCTACTG
GGTTTTAGCCCCTGCTGCCTTGAATTTCTTTGTCAACTACGCTGAAGGGGTGGTTGAATC
TCTCTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTTTGTACTTGTGCTTATGTTCAGCACCGGCCT
GTCTTTCCAGGTTCCAGTAATTCAGTTACTCCTGGGACAAGTAGGGGTGGTGTCAGGAGA
TCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTAGTTGTGGGTGCGGTGGTTGTAGCAGCTGTGGT
CACGCCTTCGACAGACCCTGTCACTCAGATGCTCCTAGCAACACCGCTTCTGGGCCTCTA
CTTAGGTGGTGCTTGGATGGTCAAGCTCACAGGTCGGTGAAGAACTTGGCTGTTCAAAGA
AAGACAAAAAAAATCATGTGTATCTTGTATAGTATATCACTTTTCCATGCAAGAAACCAC
AGTTTGGT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7252Contig1 1164 2 2 U
GAATTTATTTATCTCAAATATTATTGGTTAAACAAATATACTCTACAAACAAATTTTAAT
CATTTTCTTATTTTTTGTAAAAAAATATCAAAATGAAACTTCATAAAACTGAAGGAATAT
TATATATATACTAAAAAGACTAACTAAGCAAAACTCTCTTTTGATCGATGCTTATTTATT
ATTTATGCAGAGGAAGTTGAGCATTCCAATGACTGTAGCGGGAGTGGTGAAGTATATACC
AGAGCAGAAGCAAGAACTTGAACGTTTGTCTAGGAGGAAAGAAGAGCTCATGAAGACAAT
CTCCAGTAAGACAGCGACTTTGAGTCATCAACAAGAACAGCTGAGACATAGAGCAATGAT
GGACTCAGTAGATTCTTCTCCACAAAAGATTGCAGCAAATTGGATCACAGACACAGAGAT
AGCTGTCCAGATTGCTACATGGAAATGGGCATCTATCTCAGACATGTTGCTTAGGTTAGA
AGAAAACGGGCTTAATGTCACAAGCGTCTCTTCTTCTGTTTCTTCCACCGCAAGGATCTT
CTACACGATGCATCTTCAGGTAACTTGACCAAAGAGATCTAAAGATGTTCTTGATAAATA
CATGAAGTTTAAGAGAGAATCTAATTAAAAACTGATCTCTTGTGCAGATGAGAGGAGATT
GCAGAGTGAGGTTGGAGGAACTCAGCGATATGCTATTCGGATTACGCCAATCTTACTGAG
GGATGAGAGTTGCAAGAAGTTAATCTTTTTAGTTAATGTTATAGACTTTTATCAGATTTT
AGAACTGTACTCTTTTGTAAGGTTTTCTTGTTATACTCTTTTTCTTATTGTTAAATTAAT
GATATTATTTGACTTCAGAAATTTTATTCAATGATCATGCAACTTTTATGATCAGTTGAA
TGCAGTTTTTTTTTGGTATGACAATGTCCCCACACATTGATCTACGAATGATAATGACTA
AACCGGATTGAAACATACATACTTGTGATTTGTTTTATAGTGATGGGCTCCAAAATTATA
TAAGCCCATACAAAAGCCAGCCCAAGTCTCTCTGCCTGCTTTGGAAACGGCGCCAAATTT
TCTGCTTTTCGTAATTTGAGTCAAGGAAAAATACTTTTAGGGTTTTAGCGTAAAATAGAT
TTTCGACGAAATACAAAAGGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DG83TF U 1
AF RR4DG83JQ C 548
BS 1 772 RR4DG83TF
BS 773 1164 RR4DG83JQ

RD RR4DG83TF 772 0 0
GAATTTATTTATCTCAAATATTATTGGTTAAACAAATATACTCTACAAACAAATTTTAAT
CATTTTCTTATTTTTTGTAAAAAAATATCAAAATGAAACTTCATAAAACTGAAGGAATAT
TATATATATACTAAAAAGACTAACTAAGCAAAACTCTCTTTTGATCGATGCTTATTTATT
ATTTATGCAGAGGAAGTTGAGCATTCCAATGACTGTAGCGGGAGTGGTGAAGTATATACC
AGAGCAGAAGCAAGAACTTGAACGTTTGTCTAGGAGGAAAGAAGAGCTCATGAAGACAAT
CTCCAGTAAGACAGCGACTTTGAGTCATCAACAAGAACAGCTGAGACATAGAGCAATGAT
GGACTCAGTAGATTCTTCTCCACAAAAGATTGCAGCAAATTGGATCACAGACACAGAGAT
AGCTGTCCAGATTGCTACATGGAAATGGGCATCTATCTCAGACATGTTGCTTAGGTTAGA
AGAAAACGGGCTTAATGTCACAAGCGTCTCTTCTTCTGTTTCTTCCACCGCAAGGATCTT
CTACACGATGCATCTTCAGGTAACTTGACCAAAGAGATCTAAAGATGTTCTTGATAAATA
CATGAAGTTTAAGAGAGAATCTAATTAAAAACTGATCTCTTGTGCAGATGAGAGGAGATT
GCAGAGTGAGGTTGGAGGAACTCAGCGATATGCTATTCGGATTACGCCAATCTTACTGAG
GGATGAGAGTTGCAAGAAGTTAATCTTTTTAGTTAATGTTATAGACTTTTAT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4DG83JQ 617 0 0
ATGCATCTTCAGGTAACTTGACCAAAGAGATCTAAAGATGTTCTTGATAAATACATGAAG
TTTAAGAGAGAATCTAATTAAAAACTGATCTCTTGTGCAGATGAGAGGAGATTGCAGAGT
GAGGTTGGAGGAACTCAGCGATATGCTATTCGGATTACGCCAATCTTACTGAGGGATGAG
AGTTGCAAGAAGTTAATCTTTTTAGTTAATGTTATAGACTTTTATCAGATTTTAGAACTG
TACTCTTTTGTAAGGTTTTCTTGTTATACTCTTTTTCTTATTGTTAAATTAATGATATTA
TTTGACTTCAGAAATTTTATTCAATGATCATGCAACTTTTATGATCAGTTGAATGCAGTT
TTTTTTTGGTATGACAATGTCCCCACACATTGATCTACGAATGATAATGACTAAACCGGA
TTGAAACATACATACTTGTGATTTGTTTTATAGTGATGGGCTCCAAAATTATATAAGCCC
ATACAAAAGCCAGCCCAAGTCTCTCTGCCTGCTTTGGAAACGGCGCCAAATTTTCTGCTT
TTCGTAATTTGAGTCAAGGAAAAATACTTTTAGGGTTTTAGCGTAAAATAGATTTTCGAC
GAAATACAAAAGGCACC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL7253Contig1 775 2 2 U
GGGAGAACAACTGAGACCGAAACATTTGATATATTCTTGACAATCAACTACAGTGACGGT
TGTGACTCTCTCTCCACCAAAATTACCATTCCCTTCAAATATGAGGTTAGTTAAGCTCTT
TGTTATATTTGACTTATGAGCATTTTTGAAAAAAAACTTGATGTAGGTTTCAAGAGAAGA
GCATGAGGAGACTATTGACAAGGAGGCTGTGCTGCAGAGCCTGAGAGAGAAAGCGGTTGA
AGAATCCAGCTGCGGGCAAAGCGGTGTGGTGGAGAGAAGAGTGGTTTCTGAACCGAGAAG
TGAAGTCATTGTGTACGCGACTGTGACCAATCTCAGGACGTTCCATTGTCAACAGACTGT
GCTTGCTAATGGTGACCTCAAGTGGAAGATGGAAGGTTGTGGAACGTCTCGTAAACGTTC
TAGAACCGGGAAACGTAAGCCGAGGGCATAGGAAGAACGAAGAAAGAAGAGAGCTGTCTT
CTTTTGTATATAAACAACAACCTCTTAAGTCTAACCGGAAAATTGGGAATATGGGAAGTT
TATCGGCGTTTTGAAAGGGCTGAGTGAATTTTGTGTGCTTTTTACCCACACTCGGTTCTC
TTAAACCGGAATTGGCCAAATTTTAGGGAGATAAGGTTGCTCCGGTTTGGTTCAGTTTCG
GCTAAACTTTGTTAGTAGGTATTTGTAACTTTGAGATACTCGGTTTGCATTCGATTGAAT
CGGATGTATACTATAGTTGCAAGATAATCCAAAATGGTCCGATTTTCGTTTAAAG


BQ
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AF RR4AA83JQ C 1
AF RR4AA83TF U 1
BS 1 760 RR4AA83TF
BS 761 775 RR4AA83JQ

RD RR4AA83JQ 775 0 0
GGGAGAACAACTGAGACCGAAACATTTGATATATTCTTGACAATCAACTACAGTGACGGT
TGTGACTCTCTCTCCACCAAAATTACCATTCCCTTCAAATATGAGGTTAGTTAAGCTCTT
TGTTATATTTGACTTATGAGCATTTTTGAAAAAAAACTTGATGTAGGTTTCAAGAGAAGA
GCATGAGGAGACTATTGACAAGGAGGCTGTGCTGCAGAGCCTGAGAGAGAAAGCGGTTGA
AGAATCCAGCTGCGGGCAAAGCGGTGTGGTGGAGAGAAGAGTGGTTTCTGAACCGAGAAG
TGAAGTCATTGTGTACGCGACTGTGACCAATCTCAGGACGTTCCATTGTCAACAGACTGT
GCTTGCTAATGGTGACCTCAAGTGGAAGATGGAAGGTTGTGGAACGTCTCGTAAACGTTC
TAGAACCGGGAAACGTAAGCCGAGGGCATAGGAAGAACGAAGAAAGAAGAGAGCTGTCTT
CTTTTGTATATAAACAACAACCTCTTAAGTCTAACCGGAAAATTGGGAATATGGGAAGTT
TATCGGCGTTTTGAAAGGGCTGAGTGAATTTTGTGTGCTTTTTACCCACACTCGGTTCTC
TTAAACCGGAATTGGCCAAATTTTAGGGAGATAAGGTTGCTCCGGTTTGGTTCAGTTTCG
GCTAAACTTTGTTAGTAGGTATTTGTAACTTTGAGATACTCGGTTTGCATTCGATTGAAT
CGGATGTATACTATAGTTGCAAGATAATCCAAAATGGTCCGATTTTCGTTTAAAG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4AA83TF 760 0 0
GGGAGAACAACTGAGACCGAAACATTTGATATATTCTTGACAATCAACTACAGTGACGGT
TGTGACTCTCTCTCCACCAAAATTACCATTCCCTTCAAATATGAGGTTAGTTAAGCTCTT
TGTTATATTTGACTTATGAGCATTTTTGAAAAAAAACTTGATGTAGGTTTCAAGAGAAGA
GCATGAGGAGACTATTGACAAGGAGGCTGTGCTGCAGAGCCTGAGAGAGAAAGCGGTTGA
AGAATCCAGCTGCGGGCAAAGCGGTGTGGTGGAGAGAAGAGTGGTTTCTGAACCGAGAAG
TGAAGTCATTGTGTACGCGACTGTGACCAATCTCAGGACGTTCCATTGTCAACAGACTGT
GCTTGCTAATGGTGACCTCAAGTGGAAGATGGAAGGTTGTGGAACGTCTCGTAAACGTTC
TAGAACCGGGAAACGTAAGCCGAGGGCATAGGAAGAACGAAGAAAGAAGAGAGCTGTCTT
CTTTTGTATATAAACAACAACCTCTTAAGTCTAACCGGAAAATTGGGAATATGGGAAGTT
TATCGGCGTTTTGAAAGGGCTGAGTGAATTTTGTGTGCTTTTTACCCACACTCGGTTCTC
TTAAACCGGAATTGGCCAAATTTTAGGGAGATAAGGTTGCTCCGGTTTGGTTCAGTTTCG
GCTAAACTTTGTTAGTAGGTATTTGTAACTTTGAGATACTCGGTTTGCATTCGATTGAAT
CGGATGTATACTATAGTTGCAAGATAATCCAAAATGGTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7254Contig1 860 2 2 U
GCTACGTATGATACTCAAGTTCAGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCAGCTTGCGCTCT
CATCAACGTGACCTGCTGTCACCAGATTAGAAAAAAGAAAACAAAACAACATTAGAACTC
TTTATGTTTCAGCCAAGAACAACATTTGCTCCACTTGTTTTACTTTTTTTTTGTGAATTC
TATAGTATCTTAATAACAGCACTTAATGTATGTTTCAGCACCCAAATCTAGTTATTTTCC
ACAGTATTGTTTCAGATGTTCTTCAGTAAAGAACGAACAAAAAGTAGCAATGCCTTTTAC
TTCAACGCCATAATCTCATTCATAAGGAGACTGGTAGTCAACTATAAGCTGCAACCATTT
CTTGATGCATTCACCTACCTAGCCGAGGGTTAAATATCTATTTCTACCGACCAGAGTTCA
GACTTCAGACCAGACCCTGAGTACTACAAGTGCTATAATTTATCTAACCAACTTTGGGTA
GCTATTGATTCCAAAGGAAACCCATACTGAGTGGTGGGTAAGTAGACTACACTTGAATCA
AGAAACATACCAGCTCATCTAAGAAGTTCTTCTGAAACTGGGCTTCTGACCCAATTTCTT
TAGCAATCTGCATCAACAAAATAAGAAATCAACAGAGAAAGTATATTACACTTGATTCAT
CATTTAACCATGGTTCAAAAAGCAAGGACGGGTTCATAATGGATTTTAATTGGTAAGTCA
GCTAATTAATCTATGAAGATGAGTAAACGAATTGTAAGTTATCATACCAAGCACTAAAAC
TAATTGTAGATTTTTAAAGAAAGAACAGAAACTTTCAATTACTTTAGACATAGACCCCAC
ATTGTATGATCAACTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH81TF U 1
AF RR4GH81JQ C 76
BS 1 680 RR4GH81TF
BS 681 860 RR4GH81JQ

RD RR4GH81TF 680 0 0
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TATAGTATCTTAATAACAGCACTTAATGTATGTTTCAGCACCCAAATCTAGTTATTTTCC
ACAGTATTGTTTCAGATGTTCTTCAGTAAAGAACGAACAAAAAGTAGCAATGCCTTTTAC
TTCAACGCCATAATCTCATTCATAAGGAGACTGGTAGTCAACTATAAGCTGCAACCATTT
CTTGATGCATTCACCTACCTAGCCGAGGGTTAAATATCTATTTCTACCGACCAGAGTTCA
GACTTCAGACCAGACCCTGAGTACTACAAGTGCTATAATTTATCTAACCAACTTTGGGTA
GCTATTGATTCCAAAGGAAACCCATACTGAGTGGTGGGTAAGTAGACTACACTTGAATCA
AGAAACATACCAGCTCATCTAAGAAGTTCTTCTGAAACTGGGCTTCTGACCCAATTTCTT
TAGCAATCTGCATCAACAAAATAAGAAATCAACAGAGAAAGTATATTACACTTGATTCAT
CATTTAACCATGGTTCAAAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GH81JQ 785 0 0
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ATGTTCTTCAGTAAAGAACGAACAAAAAGTAGCAATGCCTTTTACTTCAACGCCATAATC
TCATTCATAAGGAGACTGGTAGTCAACTATAAGCTGCAACCATTTCTTGATGCATTCACC
TACCTAGCCGAGGGTTAAATATCTATTTCTACCGACCAGAGTTCAGACTTCAGACCAGAC
CCTGAGTACTACAAGTGCTATAATTTATCTAACCAACTTTGGGTAGCTATTGATTCCAAA
GGAAACCCATACTGAGTGGTGGGTAAGTAGACTACACTTGAATCAAGAAACATACCAGCT
CATCTAAGAAGTTCTTCTGAAACTGGGCTTCTGACCCAATTTCTTTAGCAATCTGCATCA
ACAAAATAAGAAATCAACAGAGAAAGTATATTACACTTGATTCATCATTTAACCATGGTT
CAAAAAGCAAGGACGGGTTCATAATGGATTTTAATTGGTAAGTCAGCTAATTAATCTATG
AAGATGAGTAAACGAATTGTAAGTTATCATACCAAGCACTAAAACTAATTGTAGATTTTT
AAAGAAAGAACAGAAACTTTCAATTACTTTAGACATAGACCCCACATTGTATGATCAACT
TAAGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL7255Contig1 600 2 1 U
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TCTCCTCTTCGGTTACGACCTTGGAATCTCAGGAGGAGTAACATCAATGGAGGAGTTTCT
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CTGCAAATTCGACAACCAGTTACTCCAGTTGTTCACTTCCTCACTCTACCTCGCGGCTCT
CGTCTCTTCCTTTGCAGCTTCGGCTGTCACAAGGAAGCACGGACGCAAAATCTCCATGTT
TGTTGGTGGTGTTGCTTTCCTCATAGGTGCTCTATTCAACGCATTCGCAACGAACGTCGC
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TCAACATAGTTCATATGTGGTTTAGAATTATAAATACAAGTAAAAAATATAATAATCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DW44JQ C 1
AF RR4DW44TF U 1
BS 1 600 RR4DW44TF

RD RR4DW44JQ 600 0 0
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CAAGAATAACGTAATAATGGCTGGAGGAGCATTTGTACCAGAGGGTAGTAGAGGAGGAAG
CTATGAAGGTGGAGTAACCGGTTTCGTCATCATGACATGTATCGTGGCTGCCATGGGAGG
TCTCCTCTTCGGTTACGACCTTGGAATCTCAGGAGGAGTAACATCAATGGAGGAGTTTCT
GAGCAAGTTTTTCCCGGAGGTTGATAGGCAAATGCACAAGGCTAAGGGCGAGACGGCATA
CTGCAAATTCGACAACCAGTTACTCCAGTTGTTCACTTCCTCACTCTACCTCGCGGCTCT
CGTCTCTTCCTTTGCAGCTTCGGCTGTCACAAGGAAGCACGGACGCAAAATCTCCATGTT
TGTTGGTGGTGTTGCTTTCCTCATAGGTGCTCTATTCAACGCATTCGCAACGAACGTCGC
AATGCTCATCATCGGTAGATTGTTGCTTGGAGTCGGTGTTGGGTTCGCTAATCAGGTGAC
TCAACATAGTTCATATGTGGTTTAGAATTATAAATACAAGTAAAAAATATAATAATCTCC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4DW44TF 600 0 0
TTTTTGTTTGAATAACAAAGCGAAAGGCAATAAGTAATAACTAACGACTAACTAATAAGT
CAAGAATAACGTAATAATGGCTGGAGGAGCATTTGTACCAGAGGGTAGTAGAGGAGGAAG
CTATGAAGGTGGAGTAACCGGTTTCGTCATCATGACATGTATCGTGGCTGCCATGGGAGG
TCTCCTCTTCGGTTACGACCTTGGAATCTCAGGAGGAGTAACATCAATGGAGGAGTTTCT
GAGCAAGTTTTTCCCGGAGGTTGATAGGCAAATGCACAAGGCTAAGGGCGAGACGGCATA
CTGCAAATTCGACAACCAGTTACTCCAGTTGTTCACTTCCTCACTCTACCTCGCGGCTCT
CGTCTCTTCCTTTGCAGCTTCGGCTGTCACAAGGAAGCACGGACGCAAAATCTCCATGTT
TGTTGGTGGTGTTGCTTTCCTCATAGGTGCTCTATTCAACGCATTCGCAACGAACGTCGC
AATGCTCATCATCGGTAGATTGTTGCTTGGAGTCGGTGTTGGGTTCGCTAATCAGGTGAC
TCAACATAGTTCATATGTGGTTTAGAATTATAAATACAAGTAAAAAATATAATAATCTCC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7257Contig1 832 2 2 U
GGACCCTCTGTTTCTGAGCGAATCGATCGTCTTTTGAGCGACGAGGCTTCTACTTCCGAA
AATCCCTTTAGATTTGTGCTTTTCAGAGGATGGGAGAAGTGGGACGTTTATGATTGGAGA
CGAAGAGTTCCCAGCTTCTCTACTGGATCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTA
TGATGATTGTGCATTAGTCAAAACTGCTGATATTGGGCAGATGATCATGGTTAGGGAGCC
AGGTGATCCCTCGCCTAATACAGTAGAATACAGACATGGTCTAACTCCTCCAATGAAGGA
TGCTCGGAAGAGAAGATTCCGTCGAGAGCCTGACCTTAATCCGGAGCTTGTTCAGCGTGT
TGAGAGAGACTTACTGAACATCTTGAGTGGTGGAACAATCGGAAACGTAAATGAGCAGCA
AGAGGAAACAGTTGCGAACGAGAATACTAGTAATAATAATGCAAACAAGAAAGTGTCTTC
TTCTTCACCTGCTGATACACCTGGTGAAAAGCCTGAAGAAGCTCTTGAGACAGCGACTAA
TAATAATAATAATGTAACCGAAGTTGAGCCGGAGAGAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGA
TTCAATGTGAGAGGTTATTTATGTAATGGCGAAAGCTATAGGATATGCCTAAAAGGGTCT
TTAGAGAAACGAACCCAGCGATGATAGTGTATGTCAAGAATTTGCCGCTATATTTACCAC
TTATTATTTATTTGGTTCTTTGTCAGCAAGAGAAGAGTGTTCCGGTCTGGTAATAGTAAC
CTCTATGAGTTTGTTGATTCTAGCTTTTGAGCCATAGGCATCATATATTAAA


BQ
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AF RR4EY72TF U 1
AF RR4EY72JQ C 64
BS 1 663 RR4EY72TF
BS 664 832 RR4EY72JQ

RD RR4EY72TF 663 0 0
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TTA

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DS 

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TGATCCCTCGCCTAATACAGTAGAATACAGACATGGTCTAACTCCTCCAATGAAGGATGC
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GAGAAACGAACCCAGCGATGATAGTGTATGTCAAGAATTTGCCGCTATATTTACCACTTA
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TATGAGTTTGTTGATTCTAGCTTTTGAGCCATAGGCATCATATATTAAA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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GTGTGTTATAAGCT


BQ
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AF RR4B831TF U 1
AF RR4BJ44TF U 1
BS 1 619 RR4B831TF
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RD RR4B831TF 794 0 0
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GTGTGTTATAAGCT

QA 1 794 1 794
DS 

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CATCTCGACATTAATTCTCTGAGTTATCATCCCACAGAAGACGAGGAAAGCAAGACCAGT
CTCTTCTTTGCATTGGTTGATGATTCTGAATCAACAAGACTAAGAAATGGGAGCATGAAA
AGACAATACAGCGACATTGGAGATCTCTACGACAAACTTTTCAAAGAACATCTTGATAAT
GATGACAAGGGTTCGAGGATGGACATGAGAGTCTTGACGGTAGTAGAGTATATGAGAGAG
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TTCTTGGTTTCTTTAACAAAATCAGAGACACTATGTCCCAATTCAAACAAGTTTCTCGTC
CTTCTACAAAGTCAATGACTATGCAGAGGAGTCTCAGCGCTGGTTCGCCACGAGTCACCA
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TCGACGCAGGAGGTGGTGGGAGATGGGTAAAGGTGGCTCGGCAGCTGGGTCAAGGCCAGA
CCAAGAAATAGCCATCGATTTGTGACGTGTGGCCATGGATGAGCAAATCTTATGACATTT
TTAGGTGTTGCATTACACAAGACGTTACTTTTTGCTA*TGACTGGAATGACATGTGATGC
GTGTGT
ATAA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL7259Contig1 315 2 1 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GL73JQ C 1
AF RR4GL73TF U 1
BS 1 315 RR4GL73TF

RD RR4GL73JQ 315 0 0
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TTGAAAATTTAGGTACTTGTGTCGGATCATCTTTCTTCTTGTTGCTGTTGTTGTCGTCGT
GTATGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGGTGCTTGTAATGTGATGAATAGTACAAGTGCAAT
ACATATGAGATGTTTCATAGATCTATCAACGTTTGTATTTATCCAATTAGCTTTGATGAA
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TGATGTTTTGTGGCA

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR4GL73TF 315 0 0
GTATTGCAGTGATAATCCTGAGACCAATGAGTGTCGTACTTATGATAATTAAAACATGTT
TTGAAAATTTAGGTACTTGTGTCGGATCATCTTTCTTCTTGTTGCTGTTGTTGTCGTCGT
GTATGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGGTGCTTGTAATGTGATGAATAGTACAAGTGCAAT
ACATATGAGATGTTTCATAGATCTATCAACGTTTGTATTTATCCAATTAGCTTTGATGAA
TTGCCTTACGAGTCTGTGGAGCTAGTTAAAAATGTTATTTATTTTCTGAGTTTAAGTGGA
TGATGTTTTGTGGCA

QA 1 315 1 315
DS 



AS 1 2

CO CL7260Contig1 786 2 6 U
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TGGGCTCAGCGGTCTGATAAGGTTTACCTAACCGTCGCCTTACCTGACGCAAAGGACGTT
TCAGTCAAATGTGAGCCTCAGGGACTATTCACTTTCTCTGCTCTTGGCGCACAAGGCAAG
CTCTTCGAGTTCAGCTTGGAGCTATATGGGAAGGTCGTGCCAGAATATAGAAAGAACGTT
GGGCTAAGGAACATTATATTTTCGATTCAGAAAGAAGAGAGAAGCTGGTGGCCACGAATC
CTGAAATCAGAAGAGAAGCCTGCGCCTTACATCAAAGTAGACTGGAACAAATGGTGTGAT
GAGGATGAGGAGGTCAACTCTGAAACAGCCTCTGATGATGAGAGTGCATTTGTTGATGAA
GATTGTGAAAGCAGCGATGATGATGGATTGCTATATCTTCCGGATCTGGAGAAGGCAAGA
AACAACTAGCTAACCATCAACAACCAACCAACCAACTCTGTTTAGGAAGATGAAGAAAAA
AGAAGCCAAAAAGATTCAGAAGTGAAGCAGAGTTGTTTAGGATGATCCTGTTTTGCTTTG
TACTTCACTAAAACCAAACACAGTAGTCCTTGCGGTTTACCTCTGATTTACGTTTGTTTA
GGGGAGTCATCTTTAGTCTGAATATTGTGACACACTTTATCGAATGGTTAAGGCTTAATA
GGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO95TF U 1
AF RR4GO95JQ C 105
BS 1 600 RR4GO95TF
BS 601 601 RR4GO95JQ
BS 602 723 RR4GO95TF
BS 724 724 RR4GO95JQ
BS 725 760 RR4GO95TF
BS 761 786 RR4GO95JQ

RD RR4GO95TF 760 0 0
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TCAGTCAAATGTGAGCCTCAGGGACTATTCACTTTCTCTGCTCTTGGCGCACAAGGCAAG
CTCTTCGAGTTCAGCTTGGAGCTATATGGGAAGGTCGTGCCAGAATATAGAAAGAACGTT
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GAGGATGAGGAGGTCAACTCTGAAACAGCCTCTGATGATGAGAGTGCATTTGTTGATGAA
GATTGTGAAAGCAGCGATGATGATGGATTGCTATATCTTCCGGATCTGGAGAAGGCAAGA
AACAACTAGCTAACCATCAACAACCAACCAACCAACTCTGTTTAGGAAGATGAAGAAAAA
*GAAGCCAAAAAGATTCAGAAGTGAAGCAGAGTTGTTTAGGATGATCCTGTTTTGCTTTG
TACTTCACTAAAACCAAACACAGTAGTCCTTGCGGTTTACCTCTGATTTACGTTTGTTTA
GGG*AGTCATCTTTAGTCTGAATATTGTGACACACTTTAT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GO95JQ 682 0 0
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QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL7261Contig1 867 2 10 U
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GTTACAGTCGGGAGTTTGTTGGGGATGGTGGTGGACGGAGGAAGCTCGAAGACGGAGGCG
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TTTTTTTTTTTGCTTCCTTTTGCCAAAGACAGAGACACGAGCTTTTCTCTTTTAATATCA
ATGCGATCAAGAGTTTTGGGTAGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D144TF U 1
AF RR4D144JQ C 171
BS 1 726 RR4D144TF
BS 727 727 RR4D144JQ
BS 728 745 RR4D144TF
BS 746 746 RR4D144JQ
BS 747 753 RR4D144TF
BS 754 754 RR4D144JQ
BS 755 777 RR4D144TF
BS 778 778 RR4D144JQ
BS 779 789 RR4D144TF
BS 790 867 RR4D144JQ

RD RR4D144TF 790 0 0
GGGAGAAAGAGAGGAAGTGGTAGTTCGTTCACATTTGTTTGGTTTAAGTTTAGGTCACAC
GTTACAGTCGGGAGTTTGTTGGGGATGGTGGTGGACGGAGGAAGCTCGAAGACGGAGGCG
TTTAAGTCGATGAAAGAGTGGTTGAAGGAGACAGGAGGGTATGGGATAATAGACGGAGGG
CTAGCAACGGAGTTGGAGAGACATGGAGCGGATCTCAACGATCCTCTCTGGAGCGCCAAA
TGTTTACTTACCTCTCCTCACCTCATTCACACCGTGCATCTGGATTACCTTGAAGCTGGT
GCTGATATCATCTCCAGCGCTTCTTACCAGGCCACGATTCAGGGGTTTGAAGCTTGTGAC
AAAGTGGTGGCTGTTGGGATCAACTGTACTCCTCCAAGATTCATAGAAGGCCTAGTAAAG
GAGATTGCAAAGGTGACGAGGAAGCCAATACTAGTGTATCCAAACAGCGGAGAAAGATAT
GATCCAGAACGGAAGGAGTGGGTGGAAAACACAGGAGTTGGGAATGAAGACTTTGTGTCG
TACGTAGAGACATGGATGGATGCAGGAGTGTCTTTGCTTGGAGGTTGCTGCCGCACAACA
CCTACCACCATCAGAGCCATTCACAAGCGACTTGTCTCCCGCAGATCTCTCTTCTCCTCT
TCTTCTTCTTCCCACCATTAAGCCTTTCTTCCTCACACCTTTACCCCACGTTCTCTCTAC
TTTTTT*GCTCAATTAGATCTTTGT*GTACCAA*CATATGAATGTTATTTGTTTCTT*CT
TTTTTTTTT
G

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4D144JQ 697 0 0
AGACGGAGGGCTAGCAACGGAGTTGGAGAGACATGGAGCGGATCTCAACGATCCTCTCTG
GAGCGCCAAATGTTTACTTACCTCTCCTCACCTCATTCACACCGTGCATCTGGATTACCT
TGAAGCTGGTGCTGATATCATCTCCAGCGCTTCTTACCAGGCCACGATTCAGGGGTTTGA
AGCTTGTGACAAAGTGGTGGCTGTTGGGATCAACTGTACTCCTCCAAGATTCATAGAAGG
CCTAGTAAAGGAGATTGCAAAGGTGACGAGGAAGCCAATACTAGTGTATCCAAACAGCGG
AGAAAGATATGATCCAGAACGGAAGGAGTGGGTGGAAAACACAGGAGTTGGGAATGAAGA
CTTTGTGTCGTACGTAGAGACATGGATGGATGCAGGAGTGTCTTTGCTTGGAGGTTGCTG
CCGCACAACACCTACCACCATCAGAGCCATTCACAAGCGACTTGTCTCCCGCAGATCTCT
CTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCCCACCATTAAGCCTTTCTTCCTCACACCTTTACCCCACG
TTCTCTCTACTTTTTTTGCTCAATTAGATCTTTGTTGTACCAAACATATGAATGTTATTT
GTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGCTTCCTTTTGCCAAAGACAGAGACACGAGCTTTTCTCT
TTTAATATCAATGCGATCAAGAGTTTTGGGTAGACTC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL7262Contig1 681 2 3 U
GAAAAAAGGAATCATAATCACTTCAAATCTTAAATTCTCACAAAGTCTCTTATATAAACA
TCTCCACTTCTCAAAGATTACAAACAATGCCTTTAATTTTTGGATCGGTCCCTATCTTGA
CCGCGGTAGCCATTCAACTCCTTATATCCAGCGTTTCTTCCCTCAACATTACCAATGAGT
ATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGCAAATACAAGCCAGGGAGTGTGTTCGAGA
AAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCTCCTCTAGTCTGCACAAAGGTTTCGCCC
TTGACTCCAATATGGATAGACCCTACAAAAATATACCTCCTGATACCGCCTTCGTCATGC
TCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGTCACTCTTGCCTCGCCGAAGCCCTCT
CTGGGCTTCGTAAGAAATGTCCGAGAAACAAAGCAGGAACAATATGGTATGACCAATGCA
CTCTAGATATTTCTACATACAGTGCCGATGACACCAGAGTCCTCTACGATAATTATTTAT
GTACGACCAACCCAAAGGACTTGAGCGGAGATAAGAAGATGTTCGATAAGAGAAAGCAGG
ATTTCGCCAAAAGCTAATGTCTGAGCCAGCAAGTCAGCACAACAGTAAGGGGCACTGTAC
GCACGGGAGAGACGATGATGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DC41TF U 1
AF RR4CP04TF U 1
BS 1 127 RR4CP04TF
BS 128 128 RR4DC41TF
BS 129 681 RR4CP04TF

RD RR4DC41TF 452 0 0
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CCGCGGTAGCCATTCAACTCCTTATATCCAGCGTTTCTTCCCTCAACATTACCAATGAGT
ATCTCCACCACGCATGCAGCAACACCCAAGGCAAATACAAGCCAGGGAGTGTGTTCGAGA
AAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCTCCTCTAGTCTGCACAAAGGTTTCGCCC
TTGACTCCAATATGGATAGACCCTACAAAAATATACCTCCTGATACCGCCTTCGTCATGC
TCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGTCACTCTTGCCTCGCCGAAGCCCTCT
CTGGGCTTCGTAAGAAATGTCCGAGAAACAAA

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4CP04TF 681 0 0
GAAAAAAGGAATCATAATCACTTCAAATCTTAAATTCTCACAAAGTCTCTTATATAAACA
TCTCCACTTCTCAAAGATTACAAACAATGCCTTTAATTTTTGGATCGGTCCCTATCTTGA
CCGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGCGTTTCTTCCCTCAACATTACCAATGAGT
ATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAAGGCAAATACAAGCCAGGGAGTGTGTTCGAGA
AAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCTCCTCTAGTCTGCACAAAGGTTTCGCCC
TTGACTCCAATATGGATAGACCCTACAAAAATATACCTCCTGATACCGCCTTCGTCATGC
TCCAATGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGTCACTCTTGCCTCGCCGAAGCCCTCT
CTGGGCTTCGTAAGAAATGTCCGAGAAACAAAGCAGGAACAATATGGTATGACCAATGCA
CTCTAGATATTTCTACATACAGTGCCGATGACACCAGAGTCCTCTACGATAATTATTTAT
GTACGACCAACCCAAAGGACTTGAGCGGAGATAAGAAGATGTTCGATAAGAGAAAGCAGG
ATTTCGCCAAAAGCTAATGTCTGAGCCAGCAAGTCAGCACAACAGTAAGGGGCACTGTAC
GCACGGGAGAGACGATGATGA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL7263Contig1 787 2 5 U
TTAAAAAATCTAAAAATCGCGAATGTGGAGTTTGCTGATTATTTTAAAATTTGTTTAATA
TTAAAGCAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTATATTAACAGACATG
GGATACCAATTCACTCTAATGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCATCCGTAAGCAGAAT
CCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAGCTGAGGCAAAGGCTGAAGCAATCATGCAGCGGATG
GCTGATGACGACGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGTCGTC
TATGAAAATTTGGTTAGAGAGAAACCATCGAGTGTGGAGGAAGCAAGGGAATACATAAGA
GGCTATTCCAAGGGACACACTGCAACTGTCAGTTCTGTTGTTGTAACAAATCCCAAAACA
GGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGATATCTATTTCAACGAAATATCGGAGGAG
ATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCACGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATC
GAACATCCTTTAATATCGCCATGCGTCAAAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATG
GGTCTGCCTAAAAAATTGACCGAGAAACTTCTAAAGGAAGCAATGGCAAGCACACAGGAG
AAAATGTCTGGTGTCTAAAAATGTTGGTTTATTATTTAATGATCGATCTGCTTTTGCTAC
TTGTGAGAATTTATGGATAACTTGTTTCGACTTTGTCTCTAACAAGTAACCAAACCTTTT
GGATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GA71TF U 28
AF RR4GA71JQ C 1
BS 1 27 RR4GA71JQ
BS 28 614 RR4GA71TF
BS 615 615 RR4GA71JQ
BS 616 675 RR4GA71TF
BS 676 787 RR4GA71JQ

RD RR4GA71TF 648 0 0
GAGTTTGCTGATTATTTTAAAATTTGTTTAATATTAAAGCAGGTGGTTTTGGGATCTTCA
TCGATTGCTCGACGAAGTATATTAACAGACATGGGATACCAATTCACTCTAATGAGTGCT
GATATTGACGAGAAAAGCATCCGTAAGCAGAATCCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAGCT
GAGGCAAAGGCTGAAGCAATCATGCAGCGGATGGCTGATGACGACGACGACATAAAGGAG
ACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGTCGTCTATGAAAATTTGGTTAGAGAGAAACCA
TCGAGTGTGGAGGAAGCAAGGGAATACATAAGAGGCTATTCCAAGGGACACACTGCAACT
GTCAGTTCTGTTGTTGTAACAAATCCCAAAACAGGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGA
GTGGATATCTATTTCAACGAAATATCGGAGGAGATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGC
ACGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATCGAACATCCTTTAATATCGCCATGCGTC
AAAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATGGGTCTGCCTAAAAA*TTGACCGAGAAA
CTTCTAAAGGAAGCAATGGCAAGCACACAGGAGAAAATGTCTGGTGTC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4GA71JQ 787 0 0
TTAAAAAATCTAAAAATCGCGAATGTGGAGTTTGCTGATTATTTTAAAATTTGTTTAATA
TTAAAGCAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTATATTAACAGACATG
GGATACCAATTCACTCTAATGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCATCCGTAAGCAGAAT
CCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAGCTGAGGCAAAGGCTGAAGCAATCATGCAGCGGATG
GCTGATGACGACGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGTCGTC
TATGAAAATTTGGTTAGAGAGAAACCATCGAGTGTGGAGGAAGCAAGGGAATACATAAGA
GGCTATTCCAAGGGACACACTGCAACTGTCAGTTCTGTTGTTGTAACAAATCCCAAAACA
GGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGATATCTATTTCAACGAAATATCGGAGGAG
ATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCACGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATC
GAACATCCTTTAATATCGCCATGCGTCAAAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATG
GGTCTGCCTAAAAAATTGACCGAGAAACTTCTAAAGGAAGCAATGGCAAGCACACAGGAG
AAAATGTCTGGTGTCTAAAAATGTTGGTTTATTATTTAATGATCGATCTGCTTTTGCTAC
TTGTGAGAATTTATGGATAACTTGTTTCGACTTTGTCTCTAACAAGTAACCAAACCTTTT
GGATTGG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL7264Contig1 888 2 2 U
GGACAAACCAATCTTACAAGAGAGAGAGAGAGAGACAAACGAAAGAAGAAGAACAAAAAA
TATAATCTCCTCCACGAAAAATATATATAAAATGGAAACTTCTGTCCCAAAGAGAGACTT
ATTCACAGAAATGGAACAAAACGCTCAAATCGCAGCCAAGAGACTTTGGAAAGTCGTGCG
GATCGTATTCTGCGTTTTGAAAACCGGTACGGTCAAAAACAAGCTCATGCTTGACTTAAA
CCTAATGCTCAAGAGAGGCAACAAAGCCATCACTAACCTCCGCCGCCGTCGTTCTAGCTT
CACCGGCGGCGCTGACGTTACCTCCTCCGCACGCGTCCGTGACTACGAGTTCGGCTGCAG
CAACACCCAGCGAATGACCCTTTTTCCTACATGTGCAAACGCAAGCGCCGCGTCCACGGC
GGTATTGACAAGGAAGACGCTGTGACCGAAGCGGTTAAGAAGGTTTTTGAGTTGTTAGGC
GAGAATGATACGAGCTAAGCGGCTGGAGAGTCTCCGTTGGTGGCGTTTCCGGCGGTGAGA
CAGCTTAGAGTGACGGATTCGCCGTTTCCATTAGACGACGGTGGAGATCATGATCACGTG
GTGGATAAAGCCGCGGAGGAGTTTATAAAGAAGTTTTATAAGAACCTTAAGCTGCAAAAG
AAGATGGGGAACGCATTAGATTCGCCGTACCACGACGGATGGGTTAGGGTGATGCGTGCG
TTTAGAGACCAACGCGACTTGAGACTTGACTTGAGTCAGCTATATTTCCCTTTAAGAGTG
TTGTTGTATACTTGAATTTGACTTGTGTTTATCTCTTCGGTAAAAAGATGTAAAACATGG
CTGTGTAAATATTTTCTTATCATATTGAAAAATACTATATTGGTGAGT


BQ
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AF RR4BN34TF U 1
AF RR4BN34JQ C 117
BS 1 727 RR4BN34TF
BS 728 888 RR4BN34JQ

RD RR4BN34TF 727 0 0
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TATAATCTCCTCCACGAAAAATATATATAAAATGGAAACTTCTGTCCCAAAGAGAGACTT
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CCTAATGCTCAAGAGAGGCAACAAAGCCATCACTAACCTCCGCCGCCGTCGTTCTAGCTT
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AAGATGGGGAACGCATTAGATTCGCCGTACCACGACGGATGGGTTAGGGTGATGCGTGCG
TTTAGAG

QA 1 727 1 727
DS 

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AGACTA
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TAATGCTCAAGAGAGGCAACAAAGCCATCACTAACCTCCGCCGCCGTCGTTCTAGCTTCA
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ACACCCAGCGAATGACCCTTTTTCCTACATGTGCAAACGCAAGCGCCGCGTCCACGGCGG
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TAGAGACCAACGCGACTTGAGACTTGACTTGAGTCAGCTATATTTCCCTTTAAGAGTGTT
GTTGTATACTTGAATTTGACTTGTGTTTATCTCTTCGGTAAAAAGATGTAAAACATGGCT
GTGTAAATATTTTCTTATCATATTGAAAAATACTATATTGGTGAGT

QA 7 772 7 772
DS 



AS 1 2

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TGTTGGAGAATAAACGTGAATTGTCCAACTTGATGGTGATCTCGCGAAACGGTATGGAGT
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AGATATGGGTTTGGGAGACCTTAGCTGCCGGAGGAGACCCTCTCCTCAAAACCAAAAGAG
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GATGTTTCTAAGTAGCTATGTATTGTTTTGGTAGTTAATTTTTATAAGATGATGCTGCAT
ATTATTTCT


BQ
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AF RR4D959TF U 1
AF RR4D959JQ C 86
BS 1 617 RR4D959TF
BS 618 849 RR4D959JQ

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CGTTTGGGGACAGGAACCAGATCCCTGGTTACTACGAATCTGCTGGAATCGAAATATTTC
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TGTTGGAGAATAAACGTGAATTGTCCAACTTGATGGTGATCTCGCGAAACGGTATGGAGT
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TACACGGTCCCAGAATGTGCGAGTGCAAATACGAATTTAAGTCGTACGACCTTACCACCG
AGATATGGGTTTGGGAGACCTTAGCTGCCGGAGGAGACCCTCTCCTCAAAACCAAAAGAG
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QA 1 617 1 617
DS 

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GTTTTTAAGTTGTTACATAGTATTGCTTAGTAGTTGATGTTTCTAAGTAGCTATGTATTG
TTTTGGTAGTTAATTTTTATAAGATGATGCTGCATATTATTTCT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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GTTGTAGTTAGTTGTATAATGTTTATGTACTTATATAATAACAGATGATTATCCTTTG


BQ
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AF RR4C320JQ C 1
AF RR4C320TF U 1
BS 1 358 RR4C320TF

RD RR4C320JQ 358 0 0
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QA 1 358 1 358
DS 

RD RR4C320TF 358 0 0
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TGCAGCTTATCACTTGTTCTTCAACGCTTCGCGGTTATGTTATCTTCTTGTTTTGGTTGT
CTTTGTCTTTCTCAGATTCTCTTCTATTTTCCATGATACATCAATGGTTAATCACGTTGG
CGAATCCAGAAGGGCCTCGTTTTTGTCGATCTCTGATACACAGCAAGCTCAGGGAGAACT
GAATGTAACGTTTTCTGGTGCTTTCATAGGATCTGTAATCCAAGATATTGCTGACAAAGT
GTTGTAGTTAGTTGTATAATGTTTATGTACTTATATAATAACAGATGATTATCCTTTG

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

CO CL7267Contig1 784 2 6 U
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TGGATATTTTGGAGTATAATTTGTACCCCATCCCTATATTATAAGATTTTGGTTTGGTTT
CGGTTTGGATTTACTCGTGTTCAGTTTGAATTTAGTAAATCATGTATTTAAACAATAATT
CTTAACCTCTTAACCTTAAGAGTATATTTGTCTTTTTTCTTTTTAATGAAGTTATTTTGT
TATTTTTATTTGTAAGCTATTTTATAGACATGGATTTTGGGTGTCCAATCGAGTTCGGTT
CAAAGTTAATTTGGGTTTGAATATTTTGGAGTATAATTTATACCCATTCCTATATTATAA
GATTTTGGTTTGGTTTCGGTTTGGATTTACTTGTATTCAGTTTGAATTTAGTAAATCATG
TGAAAATCGGTTATACCTGATCAGAACTTTCAAGTTGGTTTCGACTAAGTTTAAGAAATT
CCAAAAAATCTTTTCTACATTAAGTATACTCACTACCTTGGACGAGTGACTTTAGATTTT
TTTTCAATTATTGGAATAACTAAGCTAAAATAGAGACTTGGTCGTAGAAGAACTTCTGCA
AAAAAACCATAACTATTAAAGATAATTCATATAGAAAAATCATTATGCTTACAATAAAGA
AGAACAAAACTCATATGTAAAGATAACAATCATAACTCTTAACGATATCTCATATACAAA
AACACTATTCTAACAAAAAGAAGTATATCAACAAAGAAGAACAAACTTGAGTATAGGTTT
TTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4E326TF U 1
AF RR4E326JQ C 98
BS 1 605 RR4E326TF
BS 606 606 RR4E326JQ
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RD RR4E326TF 656 0 0
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TGGATATTTTGGAGTATAATTTGTACCCCATCCCTATATTATAAGATTTTGGTTTGGTTT
CGGTTTGGATTTACTCGTGTTCAGTTTGAATTTAGTAAATCATGTATTTAAACAATAATT
CTTAACCTCTTAACCTTAAGAGTATATTTGTCTTTTTTCTTTTTAATGAAGTTATTTTGT
TATTTTTATTTGTAAGCTATTTTATAGACATGGATTTTGGGTGTCCAATCGAGTTCGGTT
CAAAGTTAATTTGGGTTTGAATATTTTGGAGTATAATTTATACCCATTCCTATATTATAA
GATTTTGGTTTGGTTTCGGTTTGGATTTACTTGTATTCAGTTTGAATTTAGTAAATCATG
TGAAAATCGGTTATACCTGATCAGAACTTTCAAGTTGGTTTCGACTAAGTTTAAGAAATT
CCAAAAAATCTTTTCTACATTAAGTATACTCACTACCTTGGACGAGTGACTTTAGATTTT
TTTTCAATTATTGGAATAACTAAGCTAAAATAGAGACTTGGTCGTAGAAGAACTTCTGCA
AAAAA*CCATAACTATTAAAGATAATTCATATAGAAAA*TCATTATGCTTACA
TAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4E326JQ 687 0 0
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AATCATGTATTTAAACAATAATTCTTAACCTCTTAACCTTAAGAGTATATTTGTCTTTTT
TCTTTTTAATGAAGTTATTTTGTTATTTTTATTTGTAAGCTATTTTATAGACATGGATTT
TGGGTGTCCAATCGAGTTCGGTTCAAAGTTAATTTGGGTTTGAATATTTTGGAGTATAAT
TTATACCCATTCCTATATTATAAGATTTTGGTTTGGTTTCGGTTTGGATTTACTTGTATT
CAGTTTGAATTTAGTAAATCATGTGAAAATCGGTTATACCTGATCAGAACTTTCAAGTTG
GTTTCGACTAAGTTTAAGAAATTCCAAAAAATCTTTTCTACATTAAGTATACTCACTACC
TTGGACGAGTGACTTTAGATTTTTTTTCAATTATTGGAATAACTAAGCTAAAATAGAGAC
TTGGTCGTAGAAGAACTTCTGCAAAAAAACCATAACTATTAAAGATAATTCATATAGAAA
AATCATTATGCTTACAATAAAGAAGAACAAAACTCATATGTAAAGATAACAATCATAACT
CTTAACGATATCTCATATACAAAAACACTATTCTAACAAAAAGAAGTATATCAACAAAGA
AGAACAAACTTGAGTATAGGTTTTTCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7268Contig1 720 2 4 U
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AAGTGTTCTACGCAACTCCTCTCTCTTACGCCATGGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTG
GTCATGTTCTTGTCTGTCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATG
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ATGCATCTTCTCTCACATTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGGATAGTGTTCCACAT
GTGCACATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTAC
GATGCAATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGT
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TGCTAGTTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTAAGCCTTTTTAATAACACCATTGT
GACAAGCGTCTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTCAGACTTCAATTCCAACTTGTAATCTCT
TTCTTATGTTACCCAACTAGAATCATCTATGTGTTTATTTGAAGAACCAACATGACATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DA23TF U 1
AF RR4DA23JQ C 98
BS 1 681 RR4DA23TF
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BS 683 701 RR4DA23TF
BS 702 720 RR4DA23JQ

RD RR4DA23TF 701 0 0
GGGAGATGATGCTGAAGCTACAAGTAAGCGGGAAGGCGATCTTGTCTAGTGTTCGTTGTA
AGAGACAGATGTCGACTTCTTCTTCCTTTGTCTTTGGTCCTTACAAGATCGATCCGCGTG
AAGTGTTCTACGCAACTCCTCTCTCTTACGCCATGGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTG
GTCATGTTCTTGTCTGTCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATG
AGACCAGTGATCTGTGGCTTACTGCTCAGAAGGTTGGCTCTCGGATTGAGACCTTCCACA
ATGCATCTTCTCTCACATTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGGATAGTGTTCCACAT
GTGCACATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTAC
GATGCAATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGT
GTTGATAGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGAT
TGCTAGTTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTAAGCCTTTTTAATAACACCATTGT
GACAAGCGTCTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTCAGACTTCAATTCCAACTTGTAATCTCT
TTCTTATGTTACCCAACTAGA*TCATCTATGTGTTTATTTG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4DA23JQ 623 0 0
TCCTTACAAGATCGATCCGCGTGAAGTGTTCTACGCAACTCCTCTCTCTTACGCCATGGT
TAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTGGTCATGTTCTTGTCTGTCCAAGACGCCTTGTGCCGCG
CTTTACTGATCTCACAGCTGATGAGACCAGTGATCTGTGGCTTACTGCTCAGAAGGTTGG
CTCTCGGATTGAGACCTTCCACAATGCATCTTCTCTCACATTAGCCATCCAAGATGGTCC
TCAGGCGGGATAGTGTTCCACATGTGCACATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACT
TTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCAATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGA
AGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGATAGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTT
CTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTA
AGCCTTTTTAATAACACCATTGTGACAAGCGTCTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTCAGAC
TTCAATTCCAACTTGTAATCTCTTTCTTATGTTACCCAACTAGAATCATCTATGTGTTTA
TTTGAAGAACCAACATGACATAG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7269Contig1 916 2 2 U
TCTCTGTGTGTTTATTTTCAGCCGGTAAAAGAAATGGTTGACCAGAAGAAGTTCGCTTTG
TTTCTAGCGACTCCTGATTCAGAGTTCGTCAAGAAAGCATACGGAGGGTACCACAACGTG
TTCGTGGAGACGTTCGGAGACGAGGGAGAGCACTGGGACTCGTTTAGGGTCGTGGAAGGC
GAGTTCCCCGACGAGAAAGATCTTGAGAAGTACGATGGTTTCGTTATCAGTGGAAGCTCT
CATGATTCTTTTGAGAATGATGAGTGGACCCTTAGGCTATGCGAGATCGTCAAGAAACTT
GATGAGATGAAGAAGAAAGTTCTTGGCATCTGCTTCGGTCACCAGATCATAGCCAGAGTT
AGAGGAGGAACAGTTGGAAGAGCAAGGAAGGGACCAGAGCTTACACTTGGAAAGATAACC
ATCGTCAGGGATGCAATCACACCAGGAAGCTACTTCGGAGACGAGATTCCAGACAGCATA
TCCATCATAAAACTACACCAGGACGAAGTGTTGGTGTTGCCGGAAGGAGCCAAAGTACTA
GCTTATTCAGACAAGTACGAGGTGGAGATGTTCTCCATAGAAGATCATTTGTTCTGTATT
CAAGGACATCCCGAGTATAACAAAGAGATTCTCTTCGAGATCGTAGATCGTGTTCTTCGT
CTTGGCTTCATCAAGCAAGAAATGGCTGATGCGGCAAAGGCATCGGGATAATAAGGGAGC
TGACAGGAAACTTTTGGAGACGATTTGAAGAACTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAAC
TAGTTGTTTCACTCCCAAGTTATCTATTTGTCTCCTGTTATATTGGAAACATTTATGGAT
TTATGATCTTTGCATTATTATTCCTAATCGATGTATAACCTATAAATTAATCTCAAGCGT
GACATTTATTTAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A902TF U 1
AF RR4A902JQ C 93
BS 1 695 RR4A902TF
BS 696 916 RR4A902JQ

RD RR4A902TF 695 0 0
TCTCTGTGTGTTTATTTTCAGCCGGTAAAAGAAATGGTTGACCAGAAGAAGTTCGCTTTG
TTTCTAGCGACTCCTGATTCAGAGTTCGTCAAGAAAGCATACGGAGGGTACCACAACGTG
TTCGTGGAGACGTTCGGAGACGAGGGAGAGCACTGGGACTCGTTTAGGGTCGTGGAAGGC
GAGTTCCCCGACGAGAAAGATCTTGAGAAGTACGATGGTTTCGTTATCAGTGGAAGCTCT
CATGATTCTTTTGAGAATGATGAGTGGACCCTTAGGCTATGCGAGATCGTCAAGAAACTT
GATGAGATGAAGAAGAAAGTTCTTGGCATCTGCTTCGGTCACCAGATCATAGCCAGAGTT
AGAGGAGGAACAGTTGGAAGAGCAAGGAAGGGACCAGAGCTTACACTTGGAAAGATAACC
ATCGTCAGGGATGCAATCACACCAGGAAGCTACTTCGGAGACGAGATTCCAGACAGCATA
TCCATCATAAAACTACACCAGGACGAAGTGTTGGTGTTGCCGGAAGGAGCCAAAGTACTA
GCTTATTCAGACAAGTACGAGGTGGAGATGTTCTCCATAGAAGATCATTTGTTCTGTATT
CAAGGACATCCCGAGTATAACAAAGAGATTCTCTTCGAGATCGTAGATCGTGTTCTTCGT
CTTGGCTTCATCAAGCAAGAAATGGCTGATGCGGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4A902JQ 824 0 0
GAAAGCATACGGAGGGTACCACAACGTGTTCGTGGAGACGTTCGGAGACGAGGGAGAGCA
CTGGGACTCGTTTAGGGTCGTGGAAGGCGAGTTCCCCGACGAGAAAGATCTTGAGAAGTA
CGATGGTTTCGTTATCAGTGGAAGCTCTCATGATTCTTTTGAGAATGATGAGTGGATCCT
TAGGCTATGCGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAGTTCTTGGCATCTG
CTTCGGTCACCAGATCATAGCCAGAGTTAGAGGAGGAACAGTTGGAAGAGCAAGGAAGGG
ACCAGAGCTTACACTTGGAAAGATAACCATCGTCAGGGATGCAATCACACCAGGAAGCTA
CTTCGGAGACGAGATTCCAGACAGCATATCCATCATAAAACTACACCAGGACGAAGTGTT
GGTGTTGCCGGAAGGAGCCAAAGTACTAGCTTATTCAGACAAGTACGAGGTGGAGATGTT
CTCCATAGAAGATCATTTGTTCTGTATTCAAGGACATCCCGAGTATAACAAAGAGATTCT
CTTCGAGATCGTAGATCGTGTTCTTCGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGAAATGGCTGATGC
GGCAAAGGCATCGGGATAATAAGGGAGCTGACAGGAAACTTTTGGAGACGATTTGAAGAA
CTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAACTAGTTGTTTCACTCCCAAGTTATCTATTTGTC
TCCTGTTATATTGGAAACATTTATGGATTTATGATCTTTGCATTATTATTCCTAATCGAT
GTATAACCTATAAATTAATCTCAAGCGTGACATTTATTTAAAAG

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL7270Contig1 738 2 2 U
AGGGGAAATGGGAAGCGACGACTACTGAGACTCATCTCCTCCTCCACCACCGCTTCTTCC
TTAGGTTTCTGAGCTCTGAAACCCCCATCGGATACTAATTGCAATTTGATTACTTTTGGG
GAGGTTATCGATCACCCTCTTATCTCTGTTGATCTTTCTACTTATCCAAGAGATTCCGTG
TGTTTCTTTCATGATGTCTTCCAGCTCAAATCCACTAGTTTCTGGGCGTATGAAGCTCTA
AGGTGCATGTTGGAGTAATTGAAAGGACTCGGTCAGACATAAGACTAGATTAGGGAAAGG
ATGCTTGAGGGACCTAAGTTCGATATGCACGCTCTTGGCAACCACCACAACAACAACTAC
GATGCCTTTACACAAGACTTTTATCAAAAGCTAGGTGAAGAAGGTACAAACATGTCCACG
GACAGTATGCAGACGAGTAACGCTGGAGGGTCTGTGTCTATGTCTGTGGACAACTGCAGC
GTTGGTTCTAGCGATGCTCTCATTGGCCATCCCGGTTTGAGGCCAATGCGTCATCCTTAC
TCTCTCTCCGTTGGACAGAGCGTGTTTCGCCCAGGGAGAGTCACGCATGCGCTTAACGAT
GATGCCTTGGCACAAGGGTTGATGGATAGTACGTATCCGAGTCAGGACTGGCTAACTACG
AAGAGTGGACGATAGATCTGAAACTTCACATGGGTCCTGCCTTGCGCAAGGGCGTTTGGT
AGTTATACAGAGGACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX68TF U 1
AF RR4BT19TF U 33
BS 1 631 RR4BX68TF
BS 632 738 RR4BT19TF

RD RR4BX68TF 634 0 0
AGGGGAAATGGGAAGCGACGACTACTGAGACTCATCTCCTCCTCCACCACCGCTTCTTCC
TTAGGTTTCTGAGCTCTGAAACCCCCATCGGATACTAATTGCAATTTGATTACTTTTGGG
GAGGTTATCGATCACCCTCTTATCTCTGTTGATCTTTCTACTTATCCAAGAGATTCCGTG
TGTTTCTTTCATGATGTCTTCCAGCTCAAATCCACTAGTTTCTGGGCGTATGAAGCTCTA
AGGTGCATGTTGGAGTAATTGAAAGGACTCGGTCAGACATAAGACTAGATTAGGGAAAGG
ATGCTTGAGGGACCTAAGTTCGATATGCACGCTCTTGGCAACCACCACAACAACAACTAC
GATGCCTTTACACAAGACTTTTATCAAAAGCTAGGTGAAGAAGGTACAAACATGTCCACG
GACAGTATGCAGACGAGTAACGCTGGAGGGTCTGTGTCTATGTCTGTGGACAACTGCAGC
GTTGGTTCTAGCGATGCTCTCATTGGCCATCCCGGTTTGAGGCCAATGCGTCATCCTTAC
TCTCTCTCCGTTGGACAGAGCGTGTTTCGCCCAGGGAGAGTCACGCATGCGCTTAACGAT
GATGCCTTGGCACAAGGGTTGATGGATAGTA
TGT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BT19TF 706 0 0
CATCTCCTCCTCCACCACCGCTTCTTCCTTAGGTTTCTGAGCTCTGAAACCCCCATCGGA
TACTAATTGCAATTTGATTACTTTTGGGGAGGTTATCGATCACCCTCTTATCTCTGTTGA
TCTTTCTACTTATCCAAGAGATTCCGTGTGTTTCTTTCATGATGTCTTCCAGCTCAAATC
CACTAGTTTCTGGGCGTATGAAGCTCTAAGGTGCATGTTGGAGTAATTGAAAGGACTCGG
TCAGACATAAGACTAGATTAGGGAAAGGATGCTTGAGGGACCTAAGTTCGATATGCACGC
TCTTGGCAACCACCACAACAACAACTACGATGCCTTTACACAAGACTTTTATCAAAAGCT
AGGTGAAGAAGGTACAAACATGTCCACGGACAGTATGCAGACGAGTAACGCTGGAGGGTC
TGTGTCTATGTCTGTGGACAACTGCAGCGTTGGTTCTAGCGATGCTCTCATTGGCCATCC
CGGTTTGAGGCCAATGCGTCATCCTTACTCTCTCTCCGTTGGACAGAGCGTGTTTCGCCC
AGGGAGAGTCACGCATGCGCTTAACGATGATGCCTTGGCACAAGGGTTGATGGATAGTAC
GTATCCGAGTCAGGACTGGCTAACTACGAAGAGTGGACGATAGATCTGAAACTTCACATG
GGTCCTGCCTTGCGCAAGGGCGTTTGGTAGTTATACAGAGGACTAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7271Contig1 599 2 1 U
GGCCGAAACATGACGGCGAGACCTGAAGGAAGTCCGCCGGAGGTTACACTGGAGGCATCC
ATGGGTCCTTTCACCGTCGAGATGTATTACAAACACTCACCGAGAACGTGCCGGAACTTC
GTGGAGCTATCGCGGAGAGGTTACTATGACAACGTTCTCTTCCACAGAATCATCAAGGAC
TTCATCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAACTGGAAGAGGTGGCCAGTCCATTTATGGT
TCCAAGTTTGAGGACGAGATAAAGGCAGAGTTGAAGCACACAGGAGCTGGGATTTTGTCT
ATGGCAAACGCTGGTCCTAACACTAATGGGAGTCAGTTCTTCATCACTTTAGCACCTGCT
CCTTCCTTGGATGGAAAGCATACTATATTTGGCAGAGTTTGCCGTGGTATGGAGGTGATC
AAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACACCGACAGACCAATACATGAAGTGAAGATT
CTGAGGACCAAAGTGATTGATTAGTAAACCAAATATGTCATTGATTAAGAACTATAACTC
TGTACTGATCCTTGTTATTACTATGCACTAGTTTTTGTCAATCTTGATTTTAATGAGTC


BQ
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AF RR4G637TF U 1
AF RR4G637JQ C 206
BS 1 669 RR4G637TF
BS 670 929 RR4G637JQ

RD RR4G637TF 669 0 0
GGGTCCGCAGAATAAAACGAGAGGAGAGAGAAGGAAGTAAGAGATAAGGACAGGACCAAA
CGCGCACACACACACACACACACACAAAAGAAGCAAGAAAACTATTTTGATATAGAGAGA
GAGGGAAGAGAGATGGAGAAGATGAAGTGTGAGCTATGCGACGGTGTGGCGTGGATGTTC
TGTGAATCAGACCAGGCGAGTTTATGCTGGGACTGCGACGGTTACGTTCACGGAGCTAAC
TTTCTGGTGGCTAAACACGCGCGCTGCCTTCTTTGTAGCGTTTGCCAGTCTCCTACGCCT
TGGAAAGCTTCGGGTCTTCGACTATGCCCAACAGTTTCCAACTGCGAGCCTTGCCTTGCT
CGTAAGAATAGTAACCGAGAAGACGACGGCGCAGAATCTTATGATGAGGATGAGGAGGAA
GAAGAAGAAGAAAGTGATGATGAGGAAGAAGAAGGGGAGAATCAGGTGGTACCGTGGGAT
GAGGCTGCGGCGGTGCAAGAACCTCCGGTGATGAGTTCGTGGTGTTCCGTTAGCACCGGA
GGAGAGGAACGTTTCAGTTTGGTAGAGAAAAGGACGCGACAAGATTCAGATCTTAACTCC
TCCCATGATGAATCAAACGAGTCACGACCGTTGAAACGGCTAGCGAGAGATGAAACCTAG
CCAAGATCA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4G637JQ 724 0 0
GCTGGGACTGCGACGGTTACGTTCACGGAGCTAACTTTCTGGTGGCTAAACACGCGCGCT
GCCTTCTTTGTAGCGTTTGCCAGTCTCCTACGCCTTGGAAAGCTTCGGGTCTTCGACTAT
GCCCAACAGTTTCCAACTGCGAGCCTTGCCTTGCTCGTAAGAATAGTAACCGAGAAGACG
ACGGCGCAGAATCTTATGATGAGGATGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAAGTGATGATGAGG
AAGAAGAAGGGGAGAATCAGGTGGTACCGTGGGATGAGGCTGCGGCGGTGCAAGAACCTC
CGGTGATGAGTTCGTGGTGTTCCGTTAGCACCGGAGGAGAGGAACGTTTCAGTTTGGTAG
AGAAAAGGACGCGACAAGATTCAGATCTTAACTCCTCCCATGATGAATCAAACGAGTCAC
GACCGTTGAAACGGCTAGCGAGAGATGAAACCTAGCCAAGATCAACGGCTATGATGAAAT
CAACCTTAAAAATCAAACGACTGTGATACACGCCACCAACATAAAATAGAAATGTCAGCC
GTTGATTTCTCTGCTTATTCAGATTAGATTAATCATCACTGTTCATTGCAAACAATTCAT
CTTTAGTTAATTGAGTTTAGCTCCCTTTATGGCTTAGTCGGCTTACTGTGTTTTCTGAAA
CCAAATGTACTGGTTGAACCCTTTTTGCTTAGCTGCTTACGATTTCGTATTTTTTGGTTG
TATT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7274Contig1 803 2 2 U
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CTTTCGATTTCCCGTTTTTGTGAGTGTTTTGTCGATTTCGTTTCCCATTCTCTGTTCGTG
ATCGATATTATTGTCTTCTCCCATTCTGTTCGTGACTAAAGGATTATTGTCTTCTCCCAT
TCTTGGAAACTTCAACCGCTGGACCTATGACGACTGCTCGGTATCCGTTCTTGCCCCAAA
CATACCGGCCGTATATGAGATGCACTTTGCTGTCCCCATGGCTGGAGCTGTCCTTAACCC
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GCCTATGTTTCATTGCAACGGATGGAATCTCACATGATCGGTGGCGGCACGTGGGGGCAC
CAACGTCTGTATCAGCATGTGTC


BQ
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AF RR4AG87TF U 1
AF RR4AG88TF U 27
BS 1 791 RR4AG87TF
BS 792 803 RR4AG88TF

RD RR4AG87TF 791 0 0
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CTTTCGATTTCCCGTTTTTGTGAGTGTTTTGTCGATTTCGTTTCCCATTCTCTGTTCGTG
ATCGATATTATTGTCTTCTCCCATTCTGTTCGTGACTAAAGGATTATTGTCTTCTCCCAT
TCTTGGAAACTTCAACCGCTGGACCTATGACGACTGCTCGGTATCCGTTCTTGCCCCAAA
CATACCGGCCGTATATGAGATGCACTTTGCTGTCCCCATGGCTGGAGCTGTCCTTAACCC
TATCAACACCCGCCTCGACGCAAAATCCGTCGCAACAATCTTCCGCCACGCACAGCCCAC
GATATTATTCGTAGACCGCAACTTAGAGACCTTAGCTAGAGCCGCGCTCCATCTACTACC
CCAGGAAGAACAGCTGAACCTGCTGGTCATATTCATTGACGAGCCCGATTGCCCTAAGAG
GGTTTCGTCCAATGAGTTAGACTACGAGGGGCTCATCCTGACGGGAGAACCTTCGTCCTC
CTTGGTTGCACGTATGTTCCGTATTCAAAACGAGCAGGATCCCATCTCGTTAAACTACAC
ATCGGGTACTACGAGCGAACCAAAAGGTGTGGTGGTTAGCCACCGTGGAGTGTATTTGAA
CTCTCTGAGCGTGGTTATTGGCTGGGAAATGGGGACCTTCCCGGTCTACCTTTGGACTCT
GCCTATGTTTCATTGCAACGGATGGAATCTCACATGATCGGTGGCGGCACGTGGGGGCAC
CAACGTCTGTA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR4AG88TF 777 0 0
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TTTTGTCGATTTCGTTTCCCATTCTCTGTTCGTGATCGATATTATTGTCTTCTCCCATTC
TGTTCGTGACTAAAGGATTATTGTCTTCTCCCATTCTTGGAAACTTCAACCGCTGGACCT
ATGACGACTGCTCGGTATCCGTTCTTGCCCCAAACATACCGGCCGTATATGAGATGCACT
TTGCTGTCCCCATGGCTGGAGCTGTCCTTAACCCTATCAACACCCGCCTCGACGCAAAAT
CCGTCGCAACAATCTTCCGCCACGCACAGCCCACGATATTATTCGTAGACCGCAACTTAG
AGACCTTAGCTAGAGCCGCGCTCCATCTACTACCCCAGGAAGAACAGCTGAACCTGCTGG
TCATATTCATTGACGAGCCCGATTGCCCTAAGAGGGTTTCGTCCAATGAGTTAGACTACG
AGGGGCTCATCCTGACGGGAGAACCTTCGTCCTCCTTGGTTGCACGTATGTTCCGTATTC
AAAACGAGCAGGATCCCATCTCGTTAAACTACACATCGGGTACTACGAGCGAACCAAAAG
GTGTGGTGGTTAGCCACCGTGGAGTGTATTTGAACTCTCTGAGCGTGGTTATTGGCTGGG
AAATGGGGACCTTCCCGGTCTACCTTTGGACTCTGCCTATGTTTCATTGCAACGGATGGA
ATCTCACATGATCGGTGGCGGCACGTGGGG*CACCAACGTCTGTATCAGCATGTGTC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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GGGTAGAATGTCCTATGACAGGGACCGGACTAGAGCAGAGCAGTTCTTGGTGAGGTGGGC
AATCCCTCAGCTTCATGATATCGATGCATTGGGCAAAATGGTTGATCCATCTCTTAGTAG
ACAATACCCTGCAAAGTCATTGTCACACTTTGCTGATATAATCTCCCGGTGTGTTCAGTC
TGAACCAGAGTTTAGACCATTGATGTCTGAAGTAGTGCAAGACCTTCTAGATATGATCAG
AAGAGAGCGTCATGGTTCAGGAGAGCCTAGCGTAGACTAGTGAATTGTAAAGAAACATTT
ATCTCGATGATCTCTGTGAACTTGCTGAAACAAGAGATGTTCAGTTCTCAGAAGCAACAA
CAACAAAAGGGAGCAGTCTACATAAAATGAGTCATAATCACGAGGAAGCTTATTCTGCAG
CTATAAAGAGATGAAGCTTACTTCATGTAAATTGGCTCAAGGGAAAGATCAGTGTGCTCG
CTTCCAATCTCAGATGATTTGATTGGTGGGGAGCTTGTTATTTTTTTCTTTCTTTTGTGA
ATTTCTAGATTATCTTTGTTTGTTGAAGACCTCCTCTAGTATAAATTGTGTGCTTACTTG
ATTCTTTGAACCTGTGTGTACTTAAGAAAAGATATAATAATTTGCTTTGTGTTTGAG


BQ
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AF RR4F912TF U 1
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ATTCTTTGAACCTGTGTGTACTTAAGAAAAGATATAATAATTTGCTTTGTGTTTGAG

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DS 

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AAGCTTACTTCATGTAAATTGGCTCAAGGGAAAGATCAGTGTGCTCGCTTCCAATCTCAG
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CTTTGTTTGTTGAAGACCTCCTCTAGTATAAATTGTGTGCTTACTTGATTCTTTGAACCT
GTGTGTACTTAAGAAAAGATATAATAATTTGCTTTGTGTTTGAG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4E802JQ C 1
AF RR4E802TF U 1
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QA 1 599 1 599
DS 

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TGTTCTTTCATCATCACCCCATTAAATAAGGGTGAAACGTGACTACTATTCGGTGGTATT
AATTATGTTAAACGCATTTCGCCAAGTTTGTGAAATTACCAGTGTATTCGTGTTTTAAAA
TGCTGCGTTTTGTGGAGCTCTTTGTAGAATCATGTAGCGGCAATCGTAATTTGAGAATT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

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TAAAGTAACCTATTTAACAAATCTCACATTTTAGATAAATCGTTTTCTTGACATTGCCCT
TTTTCTTCAAAGTTTAAAACTCAAAACTTTACTGCATGTGTTTCCTTGGATTCACTAATC
TTTTTTCCTGTAGATTTGGTATGTATGTAACGGAGTTGTACCGTAATTAATTATATCAAA
TCTTTTAAAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F338TF U 1
AF RR4F338JQ C 124
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BS 728 853 RR4F338JQ

RD RR4F338TF 727 0 0
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TAAAGTAACCTATTTAACAAATCTCACATTTTAGATAAATCGTTTTCTTGACATTGCCCT
TTTTCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4F338JQ 730 0 0
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TGCAGCTCCCCTGCAGAAAAGAAGTGGCGGGCGATACAAGTCCAGATGATGTTTCTAAGA
GCTTGTACCGGAATGGGTATTTGAGAGAAAGATCATCAAGTGGAGATTTTTTACTACATA
AACAAATTGGCATCTCCACGAACGGTCCGATCGCAACTAGAAGAAGAGAACAAGAAAGCT
GTGGCTACATGATGTAGCCTACATCGTGCCCTTGAGATTATTTTCAGGACAACTTACATT
ATGAAGTTCAAGTGTAGTTTAAGAGCTCTAGTGGATGTGTAGTAAATAGAATGATAGTAA
AGTAACCTATTTAACAAATCTCACATTTTAGATAAATCGTTTTCTTGACATTGCCCTTTT
TCTTCAAAGTTTAAAACTCAAAACTTTACTGCATGTGTTTCCTTGGATTCACTAATCTTT
TTTCCTGTAGATTTGGTATGTATGTAACGGAGTTGTACCGTAATTAATTATATCAAATCT
TTTAAAGCCG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7278Contig1 644 2 1 U
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GTGGTCGTGATGTTCATTTGATATCCGAGGCCTCCACTGATCCAAAGACCTGGAACGGAG
ACTGTGCTGTTTACTCCCAAAGCAGAGGAGAACTCAGCGTTATGCCATACAATGTGTCTC
TACCGATCTCACTGAAGATCCGCGAGCATGAGATCTTCACTGTGAGTCCCATTACTCACC
TAGCTAGTGATGGTGTCTCATTTGCTCCGCTCGGTCTTGTAAACATGTACAATTCGGGAG
GAGCTATCGGGACTTAGATATGACGTTGAGGAGATGAAAGTGGTAATGGAAGTCAAAGGG
TGTGGTAAATTTGGAGCTTACTCATCTGTGAAGCCAAAGAGATGTGTTGTTGAGTCAAAT
GAAGTTGCATTTGAGTATGATGCCTCCTCTGGTTTGGTCACTTTTGAGTTGGAAAAGATG
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AF RR4G502JQ U 1
AF RR4G572JQ U 1
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AGATTACAAAAGAACAAAGAAAATCGTTTTGGTGGGTAAGCTTTTGCTTCTCTACCTAAA
CGACACCGTCTGTATTTCACATTACAGAGTAGCTCCGTTACTTTTTCTTTATCTCACATT
CTCACGTCCGCTCATTTTTAAACGCCGTCTCTTTCGTAATAAAAGAAACGTCCCAAGGAT
CTGGCATTGATCGCCGCGTGGATACTCAAAAACGCCACGTGTCTTCACCCCGCCATATAT
CGGGTCGTGAAGACTCCGAATTCTTGCCCACGCAGTTCCGGATTCCCCGGGTTACCCGGT
CGGATTCTTTAGTATCCGAAAATTCTTTTTGAATAATCAAATACTCCATAGCCTTTCAGT
AAATTCGACCCGTTTTCTCCGGGTAGACCCGAGTTAGAAGCGTCCAATTCTCTGGGAATC
TCAACAACTATACCGACTAAATCAATCGGTTCCCTCTCACACGCTTCCGTCGGAAACCTC
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4G572JQ 650 0 0
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ACCGTTGATTTGTTTCAGTTTATTTAATCACACTTAACTTATGTAACCAAACCATTAAAG
AGATTACAAAAGAACAAAGAAAATCGTTTTGGGGGGTAAGCTTTTGCTTCTCTACCTAAA
CGACACCGTCTGTATTTCACATTACAGAGTAGCTCCGTTACTTTTTCTTTATCTCACATT
CTCACGTCCGCTCATTTTTAAACGCCGTCTCTTTCGTAATAAAAGAAACGTCCCAAGGAT
CTGGCATTGATCGCCGCGTGGATACTCAAAAACGCCACGTGTCTTCACCCCGCCATATAT
CGGGTCGTGAAGACTCCGAATTCTTGCCCACGCAGTTCCGGATTCCCCGGGTTACCCGGT
CGGATTCTTTAGTATCCGAAAATTCTTTTTGAATAATCAAATACTCCATAGCCTTTCAGT
AAATTCGACCCGTTTTCTCCGGGTAGACCCGAGTTAGAAGCGTCCAATTCTCTGGGAATC
TCAACAACTATACCGACTAAATCAATCGGTTCCCTCTCACACGCTTCCGTCGGAAACCTC
ACCGGCGAACCAGAGGACGAAGACGGCGTGGAGGATTCTGATTCGTCCGA

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7281Contig1 732 2 2 U
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TTGCTGGAATCATGTGTGGACAATTCGAGAAACCATTTTGGGAGTTTTTCCTTGCAACGT
TGATTGGAAAGGCAATCATCAAAACGCATATACAGACGGTCTTCATTATATGTGTCTGTA
ACAATCAGCTTCTTGACTGGGTAGAGAACGAGCTGATATATATATTGAGCTTTGTGCCTG
GTCTTGCTGCTGCTTTGCCTGCGCTCGCAGCGAAACTCCGCTTAATGAAAGAGAAGTACT
TGGTTGCTTCACCTCCAGTGACTTCTGATATCAATGTGAAGAAATGGGATCTTTCATTTG
CATCGGTGTGGAATGGAGTCGTGTGGCTGATGCTTTTGAATTTCTTCGGCCAGATTGTGA
CTACAACTGCGCAGAGATGCCTCAAGAAGCAACAAGAAAAAGAATTAGATGCCTTGACCA
AGAAGAAGTCGTCGCCAGTTTCAAAGAAATCTAATTAGTCCAAGAAGTTCATTGTTAATT
TCTAACTTTTGTTTTTTTCTTTTCTACAGAAACCATATAAGCTTGTGCTGCTTTTTTCAT
CTTAGAACCAAAGAAAGAAAAAAAAAAATATGTGTCCTGAGAAGAAAACATAGAAGAGAA
AAGTTGAGACTTTAAAAATAGTTCTAACTGTGGTTTGTTTCATGATAGAATCGCTTATTA
TCATTATTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B658JQ C 1
AF RR4B658TF U 133
BS 1 132 RR4B658JQ
BS 133 732 RR4B658TF

RD RR4B658JQ 732 0 0
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TTGCTGGAATCATGTGTGGACAATTCGAGAAACCATTTTGGGAGTTTTTCCTTGCAACGT
TGATTGGAAAGGCAATCATCAAAACGCATATACAGACGGTCTTCATTATATGTGTCTGTA
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GTCTTGCTGCTGCTTTGCCTGCGCTCGCAGCGAAACTCCGCTTAATGAAAGAGAAGTACT
TGGTTGCTTCACCTCCAGTGACTTCTGATATCAATGTGAAGAAATGGGATCTTTCATTTG
CATCGGTGTGGAATGGAGTCGTGTGGCTGATGCTTTTGAATTTCTTCGGCCAGATTGTGA
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TCTAACTTTTGTTTTTTTCTTTTCTACAGAAACCATATAAGCTTGTGCTGCTTTTTTCAT
CTTAGAACCAAAGAAAGAAAAAAAAAAATATGTGTCCTGAGAAGAAAACATAGAAGAGAA
AAGTTGAGACTTTAAAAATAGTTCTAACTGTGGTTTGTTTCATGATAGAATCGCTTATTA
TCATTATTATTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4B658TF 600 0 0
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CTTTGCCTGCGCTCGCAGCGAAACTCCGCTTAATGAAAGAGAAGTACTTGGTTGCTTCAC
CTCCAGTGACTTCTGATATCAATGTGAAGAAATGGGATCTTTCATTTGCATCGGTGTGGA
ATGGAGTCGTGTGGCTGATGCTTTTGAATTTCTTCGGCCAGATTGTGACTACAACTGCGC
AGAGATGCCTCAAGAAGCAACAAGAAAAAGAATTAGATGCCTTGACCAAGAAGAAGTCGT
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TAAAAATAGTTCTAACTGTGGTTTGTTTCATGATAGAATCGCTTATTATCATTATTATTT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL7282Contig1 894 2 2 U
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CTGTAGTTGAGAAGGTTCAATCTTTCTTTACGTCGTTAAAGTCTTTGTCACGTAAAGAAG
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ATTATGTGCAGGTGAATGCTGCGGGCGACCTGTGTGCTATTTGCCAGGAGAAGATGCACA
CCCCAGTTCTTCTTCGCTGCAAGCACGTGTTCTGCGAAGATTGCGTTTCAGAATGGTTTG
AGAGAGAGAGGACTTGTCCTCTGTGCAGGGCCTTGGTGAAACCAGCGGATCTGAAATCAT
TTGGTGATGGATCCACCAGCCTTTTCTTTCAGATATTCTGATTAAACATGCATACAAAAG
TACAAATAGTGATTACAACTCCCAAGCCCCTTGATAGAGAGTATTGCCCGTTTAAGTTGT
GCACGAAAGACACCACTGATGATGATGCCTTGAAGATGTGTATACAATGTCATTTGTTAA
TATGAAATTGCCTTTTATATTTCTTAGTCCAGAAAAAAAAAAGAATTCAGTAACCAGAAA
TCGTATTTATTCAATATGAAAAAAGTTCTTACTACAATTTTCAACATTTTTAATTTTTTT
ACAATGGGGAAGGAGATTTAACTTCACCCGATTTACAAGACCAAATCAAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ29TF U 1
AF RR4AZ29JQ C 101
BS 1 752 RR4AZ29TF
BS 753 894 RR4AZ29JQ

RD RR4AZ29TF 752 0 0
GCAGTAGGGGTCGAAACTATCGTAAACAGGGTCAATTGCTAACTTTGGTTGAATATATGA
TGCTTCTGTATCGCTCTTTGCTGCCTACCCCCGTGTGGTACCGTTTCTTCTTGAACAAGG
ATTACGGAAGCCTATTCTCCTCTCTCATGACAGGACTGTATCTCACTTTCAAGCTCACTT
CTGTAGTTGAGAAGGTTCAATCTTTCTTTACGTCGTTAAAGTCTTTGTCACGTAAAGAAG
TGCATTATGGATCATATGCAACTACGGAGCAGGTCAGTGTTTTAGAAAGATTCATATTTT
TAGATAATGCCTCTTTTAAGATTCAAGCCTAAACAAGCAAGAGAAATGGCTTTTCTTTTT
ATTATGTGCAGGTGAATGCTGCGGGCGACCTGTGTGCTATTTGCCAGGAGAAGATGCACA
CCCCAGTTCTTCTTCGCTGCAAGCACGTGTTCTGCGAAGATTGCGTTTCAGAATGGTTTG
AGAGAGAGAGGACTTGTCCTCTGTGCAGGGCCTTGGTGAAACCAGCGGATCTGAAATCAT
TTGGTGATGGATCCACCAGCCTTTTCTTTCAGATATTCTGATTAAACATGCATACAAAAG
TACAAATAGTGATTACAACTCCCAAGCCCCTTGATAGAGAGTATTGCCCGTTTAAGTTGT
GCACGAAAGACACCACTGATGATGATGCCTTGAAGATGTGTATACAATGTCATTTGTTAA
TATGAAATTGCCTTTTATATTTCTTAGTCCAG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4AZ29JQ 794 0 0
CCGTTTCTTCTTGAACAAGGATTACGGAAGCCTATTCTCCTCTCTCATGACAGGACTGTA
TCTCACTTTCAAGCTCACTTCTGTAGTTGAGAAGGTTCAATCTTTCTTTACGTCGTTAAA
GTCTTTGTCACGTAAAGAAGTGCATTATGGATCATATGCAACTACGGAGCAGGTCAGTGT
TTTAGAAAGATTCATATTTTTAGATAATGCCTCTTTTAAGATTCAAGCCTAAACAAGCAA
GAGAAATGGCTTTTCTTTTTATTATGTGCAGGTGAATGCTGCGGGCGACCTGTGTGCTAT
TTGCCAGGAGAAGATGCACACCCCAGTTTTTTTTCGCTGCAAGCACGTGTTCTGCGAAGA
TTGCGTTTCAGAATGGTTTGAGAGAGAGAGGACTTGTCCTCTGTGCAGGGCCTTGGTGAA
ACCAGCGGATCTGAAATCATTTGGTGATGGATCCACCAGCCTTTTCTTTCAGATATTCTG
ATTAAACATGCATACAAAAGTACAAATAGTGATTACAACTCCCAAGCCCCTTGATAGAGA
GTATTGCCCGTTTAAGTTGTGCACGAAAGACACCACTGATGATGATGCCTTGAAGATGTG
TATACAATGTCATTTGTTAATATGAAATTGCCTTTTATATTTCTTAGTCCAGAAAAAAAA
AAGAATTCAGTAACCAGAAATCGTATTTATTCAATATGAAAAAAGTTCTTACTACAATTT
TCAACATTTTTAATTTTTTTACAATGGGGAAGGAGATTTAACTTCACCCGATTTACAAGA
CCAAATCAAGAGCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7283Contig1 921 2 2 U
GGGGATCGGGTTTTGTTACATCCTCTCGACTCTGTTGAGATCATCGGAGATTGAAAAAAA
TGGCGATGGACAGAGCCCAATTGATACTCTTGGGTTTACCGATATTCTTATTTTGTTCGG
ATCTGTTCAACCTATTCACTCCTCCGCCTCCAAAACCTCCTACTCATCAGGCACCACCAC
CGCATGTCCCTCACCACCACCACCAGCGTCCGGCTGGATTCACACCCGAAACCCTAGATT
TCCCTTTTTCTCAGAAGAAACAGAGTGGATTAGGAGGAGCTGTTGGATATGGAAACACCG
TTGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACAGCAGTGACCATGAAGAAGA
TGTTAGAGGCGGAGTTTCCAGGTTTGGATGTGATTCTCGCAAACTACCCAGCACCAGCAC
CAAAGCGCCTTCTAGCTAAGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTTATCGGTATGATCG
TTGCAGGTGACCGCGTCTTCCCCATGATTGGAATCATGCAGCCACCTGCTTGGTTCAACT
CCCTGAGGGCCAATAGGTTTGGTTCCATGGCTTCTACTTGGCTTCTCGGAAACTTTCTCC
AGTCTTACCTTCAAAGCTCACGGGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGGGAACTGGTGTTTT
CTAAATTGAAAGAAGGTAGATTCCCGGGAGAGATCGAGATGAGAGATCTCATCAGTAAGA
AGTTGACAAGGACCTAGCATCGTCGCAGCAGGAGGTAGCTACTGAAGCAGAGTATCATCA
GCAGAAAGATATATGTCGATATGAAAGGTATATATAGGAGAATGTGTAAACCTTTCCACA
AGCAGTGTTTCGATCTCATGTGCTTAAAAAAGCTGCTTATGTAAGCAAAACCTTGTTCAT
TTGGTTTTACTCTTTTGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D770TF U 1
AF RR4D770JQ C 275
BS 1 672 RR4D770TF
BS 673 921 RR4D770JQ

RD RR4D770TF 672 0 0
GGGGATCGGGTTTTGTTACATCCTCTCGACTCTGTTGAGATCATCGGAGATTGAAAAAAA
TGGCGATGGACAGAGCCCAATTGATACTCTTGGGTTTACCGATATTCTTATTTTGTTCGG
ATCTGTTCAACCTATTCACTCCTCCGCCTCCAAAACCTCCTACTCATCAGGCACCACCAC
CGCATGTCCCTCACCACCACCACCAGCGTCCGGCTGGATTCACACCCGAAACCCTAGATT
TCCCTTTTTCTCAGAAGAAACAGAGTGGATTAGGAGGAGCTGTTGGATATGGAAACACCG
TTGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACAGCAGTGACCATGAAGAAGA
TGTTAGAGGCGGAGTTTCCAGGTTTGGATGTGATTCTCGCAAACTACCCAGCACCAGCAC
CAAAGCGCCTTCTAGCTAAGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTTATCGGTATGATCG
TTGCAGGTGACCGCGTCTTCCCCATGATTGGAATCATGCAGCCACCTGCTTGGTTCAACT
CCCTGAGGGCCAATAGGTTTGGTTCCATGGCTTCTACTTGGCTTCTCGGAAACTTTCTCC
AGTCTTACCTTCAAAGCTCACGGGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGGGAACTGGTGTTTT
CTAAATTGAAAG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4D770JQ 647 0 0
AGGAGCTGTTGGATATGGAAACACCGTTGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAA
GGGAACAGCAGTGACCATGAAGAAGATGTTAGAGGCGGAGTTTCCAGGTTTGGATGTGAT
TCTCGCAAACTACCCAGCACCAGCACCAAAGCGCCTTCTAGCTAAGGTTGTACCGGTTGC
TCAGATGGGAGTTATCGGTATGATCGTTGCAGGTGACCGCGTCTTCCCCATGATTGGAAT
CATGCAGCCACCTGCTTGGTTCAACTCCCTGAGGGCCAATAGGTTTGGTTCCATGGCTTC
TACTTGGCTTCTCGGAAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGGGCCTTTGAAGT
TCTCTGCAACGGGGAACTGGTGTTTTCTAAATTGAAAGAAGGTAGATTCCCGGGAGAGAT
CGAGATGAGAGATCTCATCAGTAAGAAGTTGACAAGGACCTAGCATCGTCGCAGCAGGAG
GTAGCTACTGAAGCAGAGTATCATCAGCAGAAAGATATATGTCGATATGAAAGGTATATA
TAGGAGAATGTGTAAACCTTTCCACAAGCAGTGTTTCGATCTCATGTGCTTAAAAAAGCT
GCTTATGTAAGCAAAACCTTGTTCATTTGGTTTTACTCTTTTGATTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7284Contig1 1144 2 2 U
GTGCTAATATGCCTCCACAGAATCAAGTCCAAGATGCAGTACCTATAAATGCCCCACCAA
TCAATCAGCCGGTTCTGAACAGAGCAAACAGGGATCTTGGACTTGGTGGTGATGACATGG
ACATCCCATGGTGTGATCTTAATATAAAAGAGAAGATTGGAGCAGGTTCCTTTGGTACTG
TTCATCGTGCTGAGTGGCATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACT
TCCATGCTGAGCGTGTCAATGAGTTCTTGAGAGAGGTGCACAAACTAATTTTTCTCGTTT
TTTTTGGTAACGAACTTGGTGTGCTAATGCCCTTCCTGATCTTTGATTCGCCGCTAGGTT
GCAATAATGAAACGCCTTCGCCACCCTAATATTGTTCTCTTCATGGGGGCTGTCACTCAA
CCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAGGTAGTTTATTCAGACTTTTG
CATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAACTGGATGAGAGACGCCGCTTGAGTATGGCATATGAC
GTGGCTAAAGGAATGAATTATCTTCATAATCGCAATCCTCCAATTGTACATAGAGATCTA
AAATCTCCAAACTTGTTGGTCGACAAAAAATACACTGTCAAGGTTTGTGATTTTGGTCTC
TCGCGGTTAAAGGCCAGCACGTTCCTTTCATCAAAGTCGGCAGCTGGAACCCCTGAGTGG
ATGGCACCAGAGGTCCTGCGGGATGAGCAATCTAATGAGAAGTCAGACGTGTACAGCTTT
GGGGTCATCTTGTGGGAGCTTGCTACATTGCAGCAACCATGGGGTAATTTGAATCCTGCT
CAGGTTGTAGCTGTGGTTGGTTTCAAGAATAAACGGCTTGAAATCCCACGCAACCTGAAC
CCTCAAGTTGCAGCAATAATCGAGGGTTGTTGGACAAATGAGCCGCGGAAGCGTCCATCA
TTTGCAACTATAATGGACTTGCTAAGACCATTGATCAAATCAGCGGTTCCTCCACCCAAC
CGCTTGGATCTGTGAGACACCGGCCCACTTGGAAACACGGTATTAATAATTGATGATGTG
CACATATACTCTCATCATTATTTTGCTGCCTAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATAGCTGT
AAGG


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10 10 10 10 

AF RR4FD60TF U 1
AF RR4FD60JQ C 495
BS 1 670 RR4FD60TF
BS 671 1144 RR4FD60JQ

RD RR4FD60TF 670 0 0
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TCAATCAGCCGGTTCTGAACAGAGCAAACAGGGATCTTGGACTTGGTGGTGATGACATGG
ACATCCCATGGTGTGATCTTAATATAAAAGAGAAGATTGGAGCAGGTTCCTTTGGTACTG
TTCATCGTGCTGAGTGGCATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACT
TCCATGCTGAGCGTGTCAATGAGTTCTTGAGAGAGGTGCACAAACTAATTTTTCTCGTTT
TTTTTGGTAACGAACTTGGTGTGCTAATGCCCTTCCTGATCTTTGATTCGCCGCTAGGTT
GCAATAATGAAACGCCTTCGCCACCCTAATATTGTTCTCTTCATGGGGGCTGTCACTCAA
CCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAGGTAGTTTATTCAGACTTTTG
CATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAACTGGATGAGAGACGCCGCTTGAGTATGGCATATGAC
GTGGCTAAAGGAATGAATTATCTTCATAATCGCAATCCTCCAATTGTACATAGAGATCTA
AAATCTCCAAACTTGTTGGTCGACAAAAAATACACTGTCAAGGTTTGTGATTTTGGTCTC
TCGCGGTTAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4FD60JQ 650 0 0
AAGGGAGCAACTGGATGAGAGACGCCGCTTGAGTATGGCATATGACGTGGCTAAAGGAAT
GAATTATCTTCATAATCGCAATCCTCCAATTGTACATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTT
GTTGGTCGACAAAAAATACACTGTCAAGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGGTTAAAGGC
CAGCACGTTCCTTTCATCAAAGTCGGCAGCTGGAACCCCTGAGTGGATGGCACCAGAGGT
CCTGCGGGATGAGCAATCTAATGAGAAGTCAGACGTGTACAGCTTTGGGGTCATCTTGTG
GGAGCTTGCTACATTGCAGCAACCATGGGGTAATTTGAATCCTGCTCAGGTTGTAGCTGT
GGTTGGTTTCAAGAATAAACGGCTTGAAATCCCACGCAACCTGAACCCTCAAGTTGCAGC
AATAATCGAGGGTTGTTGGACAAATGAGCCGCGGAAGCGTCCATCATTTGCAACTATAAT
GGACTTGCTAAGACCATTGATCAAATCAGCGGTTCCTCCACCCAACCGCTTGGATCTGTG
AGACACCGGCCCACTTGGAAACACGGTATTAATAATTGATGATGTGCACATATACTCTCA
TCATTATTTTGCTGCCTAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATAGCTGTAAGG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7285Contig1 827 2 6 U
GGATTCACGACCATTGCAGTAAGAGATAGAAGAATGTCTGGAATGGGGGTAGATGCGAGC
TCGTGGGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCCCCGTACACATTCTCCGCAATCGGAATCGCC
ATCTCGATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCTTGGGGAATTTACATAACGGGAAGTAGT
TTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATC
TTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTG
GAGAGTGTCCCAACTTCAAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATC
TTCGCATCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAACCTTGTTTGCGGGTTATGTGTAGGAATC
ATTGGAAGCAGCTGCGCATTGTCGGATGCTCAGAACTCAACACTCTTTGTGAAGATTCTT
GTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGTGTTATTGTTGGGATCATTATG
TCCGCACAAGCAACATGGCCAACCAAATAGATATGAACCTGTTGTGATCTCTGGTATCTT
CATTGTTATATGGATACTCTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAAATCTGTGTGAGGACTCAGA
ATCTTTTTTTTGGGATTCCTGATTTTTTTTTGTATTGTTTAAAACTTTGTAATAATTGGA
GAACATCTTCTTCATCATGTTTGTATTTTCTTTGTTTTTTTCTTTGAAACAAAGACAAGA
GTTTGTATATGATTTGTTGTTGGTTAATTATTGAAATTTAATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC51TF U 1
AF RR4EC51JQ C 244
BS 1 641 RR4EC51TF
BS 642 642 RR4EC51JQ
BS 643 670 RR4EC51TF
BS 671 671 RR4EC51JQ
BS 672 690 RR4EC51TF
BS 691 827 RR4EC51JQ

RD RR4EC51TF 698 0 0
GGATTCACGACCATTGCAGTAAGAGATAGAAGAATGTCTGGAATGGGGGTAGATGCGAGC
TCGTGGGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCCCCGTACACATTCTCCGCAATCGGAATCGCC
ATCTCGATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCTTGGGGAATTTACATAACGGGAAGTAGT
TTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATC
TTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTG
GAGAGTGTCCCAACTTCAAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATC
TTCGCATCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAACCTTGTTTGCGGGTTATGTGTAGGAATC
ATTGGAAGCAGCTGCGCATTGTCGGATGCTCAGAACTCAACACTCTTTGTGAAGATTCTT
GTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGTGTTATTGTTGGGATCATTATG
TCCGCACAAGCAACATGGCCAACCAAATAGATATGAACCTGTTGTGATCTCTGGTATCTT
CATTGTTATATGGATACTCTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAA*TCTGTGTGAGGACTCAGA
ATCTTTTTTT*GGGATTCCTGATTTTTTTT
GTATTGTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4EC51JQ 584 0 0
TGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTGGAG
AGTGTCCCAACTTCAAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATCTTC
GCATCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAACCTTGTTTGCGGGTTATGTGTAGGAATCATT
GGAAGCAGCTGCGCATTGTCGGATGCTCAGAACTCAACACTCTTTGTGAAGATTCTTGTG
ATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGTGTTATTGTTGGGATCATTATGTCC
GCACAAGCAACATGGCCAACCAAATAGATATGAACCTGTTGTGATCTCTGGTATCTTCAT
TGTTATATGGATACTCTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAAATCTGTGTGAGGACTCAGAATC
TTTTTTTTGGGATTCCTGATTTTTTTTTGTATTGTTTAAAACTTTGTAATAATTGGAGAA
CATCTTCTTCATCATGTTTGTATTTTCTTTGTTTTTTTCTTTGAAACAAAGACAAGAGTT
TGTATATGATTTGTTGTTGGTTAATTATTGAAATTTAATGTTCC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL7286Contig1 740 2 4 U
GTTCGAGGGAGTTGATGATTTTCTTTACAAAGTCGCCACCCGTAAGGGGTAAGCTTAAGA
AGGGTGGTCTTGTGGATATCGAAGCTGCTGCAAGGATTGTTTTACATGACTGGAATGAAG
GTAAGATTCCATTCTATACAATGCCGCCAAAGAGGGACCAAGGTGAACACGCAGAGTCAA
AGATTGTGAACGAGTTGGCTAAGGAGTTCAACATCGATGAGGTTTACAGTGGCGAATCCT
CTTTCATCGGGAGTTTGAGGACTGTTAACGAGTTCAACCCTGTTGAGATTCCTCCGAATA
GTCCTCTCAGTTTCGATGAAACTATGGTCGAGGATGAGTCTAAGACTCAGACCGAAGGAG
AAGAAGAGGCTGGTGTCGACAGTAATGATTATGATGAGTCTATGGGAGGGGAAGAGGAGG
AAGAAACAGGAAAGTCTAAATCAGAGACGAGCAGGCAGAACAGGAAGCTAGACGCAGCTG
AAAGCATGCTGAACACAAAGATGCAGAAAGCAGAGAAGGATAAGAGGAAGAAGGCTAAGA
AAGCAGCAGGCGGTGAGGATCCAATGGATGGAGATTATGATTTCAAAGTAGATTACGCTA
AGAACAACGGTGCAGCCATGGATGAAGGAGGAGACGGAATCCAAATTGAGGCTAAAGTAC
CAATGGCTGAACTAGTTGATGTGTCTGAAAATAAATGAACTCCTTAAAACAAGTTTTTTT
TAATAACTTTTATGATAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN34TF U 1
AF RR4GN34JQ C 1
BS 1 40 RR4GN34TF
BS 41 41 RR4GN34JQ
BS 42 648 RR4GN34TF
BS 649 740 RR4GN34JQ

RD RR4GN34TF 648 0 0
GTTCGAGGGAGTTGATGATTTTCTTTACAAAGTCGCCACC*GTAAGGGGTAAGCTTAAGA
AGGGTGGTCTTGTGGATATCGAAGCTGCTGCAAGGATTGTTTTACATGACTGGAATGAAG
GTAAGATTCCATTCTATACAATGCCGCCAAAGAGGGACCAAGGTGAACACGCAGAGTCAA
AGATTGTGAACGAGTTGGCTAAGGAGTTCAACATCGATGAGGTTTACAGTGGCGAATCCT
CTTTCATCGGGAGTTTGAGGACTGTTAACGAGTTCAACCCTGTTGAGATTCCTCCGAATA
GTCCTCTCAGTTTCGATGAAACTATGGTCGAGGATGAGTCTAAGACTCAGACCGAAGGAG
AAGAAGAGGCTGGTGTCGACAGTAATGATTATGATGAGTCTATGGGAGGGGAAGAGGAGG
AAGAAACAGGAAAGTCTAAATCAGAGACGAGCAGGCAGAACAGGAAGCTAGACGCAGCTG
AAAGCATGCTGAACACAAAGATGCAGAAAGCAGAGAAGGATAAGAGGAAGAAGGCTAAGA
AAGCAGCAGGCGGTGAGGATCCAATGGATGGAGATTATGATTTCAAAGTAGATTACGCTA
AGAACAACGGTGCAGCCATGGATGAAGGAGGAGACGGAATCCAAATTG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4GN34JQ 740 0 0
GTTCGAGGGAGTTGATGATTTTCTTTACAAAGTCGCCACCCGTAAGGGGTAAGCTTAAGA
AGGGTGGTCTTGTGGATATCGAAGCTGCTGCAAGGATTGTTTTACATGACTGGAATGAAG
GTAAGATTCCATTCTATACAATGCCGCCAAAGAGGGACCAAGGTGAACACGCAGAGTCAA
AGATTGTGAACGAGTTGGCTAAGGAGTTCAACATCGATGAGGTTTACAGTGGCGAATCCT
CTTTCATCGGGAGTTTGAGGACTGTTAACGAGTTCAACCCTGTTGAGATTCCTCCGAATA
GTCCTCTCAGTTTCGATGAAACTATGGTCGAGGATGAGTCTAAGACTCAGACCGAAGGAG
AAGAAGAGGCTGGTGTCGACAGTAATGATTATGATGAGTCTATGGGAGGGGAAGAGGAGG
AAGAAACAGGAAAGTCTAAATCAGAGACGAGCAGGCAGAACAGGAAGCTAGACGCAGCTG
AAAGCATGCTGAACACAAAGATGCAGAAAGCAGAGAAGGATAAGAGGAAGAAGGCTAAGA
AAGCAGCAGGCGGTGAGGATCCAATGGATGGAGATTATGATTTCAAAGTAGATTACGCTA
AGAACAACGGTGCAGCCATGGATGAAGGAGGAGACGGAATCCAAATTGAGGCTAAAGTAC
CAATGGCTGAACTAGTTGATGTGTCTGAAAATAAATGAACTCCTTAAAACAAGTTTTTTT
TAATAACTTTTATGATAATT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7287Contig1 764 2 1 U
GGAATAGAAAAAATCTGATCCAGTAACAGAGATTGGATTGTCTGGTTAGAAGCAGTGGAG
CCCCTTTCCTTCTCTTTCGCCTTTCCTCTCAGAGAGAGAGTCTCAGACACCACCAAGCAA
AGCCCTTCTTCTTCCTCCTGGATCCAACTCAGATCCATCTCTGTTTCTTACCACACTTCG
ATCCTTTCAGATCTCCACCGTTCCTTCTCTTTTCTTGTATGTCTTTCTGATCTTCTCTCT
CGTTACTACAAAACCCTTGTCTAAGATCAAGATTGCTTTGAGTCTCGATTCTGGAGTTCC
TGTTTGATGAGCGTCATCTTTCGTATCTGTTGACTTCTCCCTGTTACATCTGCTTGATCC
ATAAAGCTTAATCCTTTCCACTTGTTTGACGGATGTGGAGGAAGAGAAAGAGGGTTTCCC
TGATGGCATGAGGGGGATATGTTAATAACAACTTTGATGAAACTTTTGAGCGCTTGTCTG
TGGCCTTCTTCATCATCGGGCAGGTCCGTTGATTCCACTGGAAAACATGATGGACTCCTC
TGGTACAAAGACTCTGGTCAGCACCTCCTCGGTGACTTCTCTATGGCCGTTGTTCAGGCC
AACAATCTCCTCGAGGATCAGAGCCAAGTTGAGTCTGGCCCTTTGAGCACCCTTGACTCT
GGTTCTGGTCCTTATGGTACTTTTATCGGAATCTATGACGGTCATGGCGGGCCTGAGACC
TCCCGCTTTGTTAATGATCATCTCTTTCAGCATTTAAAGAGTTT


BQ
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AF RR4A110TF U 1
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CCCCTTTCCTTCTCTTTCGCCTTTCCTCTCAGAGAGAGAGTCTCAGACACCACCAAGCAA
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ATCCTTTCAGATCTCCACCGTTCCTTCTCTTTTCTTGTATGTCTTTCTGATCTTCTCTCT
CGTTACTACAAAACCCTTGTCTAAGATCAAGATTGCTTTGAGTCTCGATTCTGGAGTTCC
TGTTTGATGAGCGTCATCTTTCGTATCTGTTGACTTCTCCCTGTTACATCTGCTTGATCC
ATAAAGCTTAATCCTTTCCACTTGTTTGACGGATGTGGAGGAAGAGAAAGAGGGTTTCCC
TGATGGCATGAGGGGGATATGTTAATAACAACTTTGATGAAACTTTTGAGCGCTTGTCTG
TGGCCTTCTTCATCATCGGGCAGGTCCGTTGATTCCACTGGAAAACATGATGGACTCCTC
TGGTACAAAGACTCTGGTCAGCACCTCCTCGGTGACTTCTCTATGGCCGTTGTTCAGGCC
AACAATCTCCTCGAGGATCAGAGCCAAGTTGAGTCTGGCCCTTTGAGCACCCTTGACTCT
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TCCCGCTTTGTTAATGATCATCTCTTTCAGCATTTAAAGAG
GT

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BQ
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TGATTCTCTCCTTTTCTGCTCATTTCTTGTTTTTAAAATATTTTTTTTTTGTATTTGTGA
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TCGTGGAAGTGATACGAGAATCTTTCTTTCTTTCTTTGCGTCAGAGAACGAATCAGTTCT
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GATATGTTGGTTTTGTATGGACTAAAATAATGCGATCAAACCATTTTATAAAGGTAAAAC
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GTCTTAGTAATTAGATACTTAGAAACGTGAAAGTGTGTTGTTTCGACGTTTACCACTAAT
AAGAGAACCTGAGGATTTTAATGATGTCAATATC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GL07TF U 1
AF RR4GL07JQ C 522
BS 1 650 RR4GL07TF
BS 651 651 RR4GL07JQ
BS 652 717 RR4GL07TF
BS 718 1252 RR4GL07JQ

RD RR4GL07TF 720 0 0
GGTAGAATTGGGAAGCAATGTCGAGAGAGGTGGCACAACCATTTGAATCCTGGCATCAAC
AAGGATGCTTGGACTCCAGAGGAAGAGTTAGCTCTCATGAATGCTCATCGAGTCCACGGA
AACAAATGGGCTGATATTGCTAAGGTCTTACCCGGCAGAACCGACAATTCGATAAAGAAC
CACTGGAACAGTTCACTAAAGAAGAAGTCAGAGTTCTTCTTAGCTAACGGTGGCTTACCA
ACGAACAGAGTTGCTGATAGTGCAACTAAACGTCCAGTGTATCTTCACAGAAGGGATTCT
GTTCCAGTTGCTCAGACCTCTTCTGGAACTACGCAGATAAACAAGCTCGATGGAGAAAGA
AAAGAGCAGTTAAACTCTTCTGTTCCGCTTGAAGAAGTTTCACCAATGGCCGGTTTTGAA
GAGTACGTTCGTTCTTCTCAGCTGCCTAAACCAGAGCCATCGCCAGAGAATGGTTATCAT
CTTAAGGACAAGAAGCCTCAAAGAGAGGATCATATGGCTTCAGAAGTGGATAAGCAGCGT
ATGTATGGGTATGAATGTGGTTGCAGTCCAAGCGCATCATCACCTGTTATATTCTTCACT
CCACCACCGCCTAGTAGAAAAGAGTACAGTAGTAACGGTTCAGCTCCAAG*AGTCCTGAG
TCTTTCTTGAGAGAAGCTGCTAGAACATTCCCAAACACACCTTCTATATTCAGAAAA
GAC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4GL07JQ 731 0 0
AGAAGTGGATAAGCAGCGTATGTATGGGTATGAATGTGGTTGCAGTCCAAGCGCATCATC
ACCTGTTATATTCTTCACTCCACCACCGCCTAGTAGAAAAGAGTACAGTAGTAACGGTTC
AGCTCCAAGGAGTCCTGAGTCTTTCTTGAGAGAAGCTGCTAGAACATTCCCAAACACACC
TTCTATATTCAGAAAAAGACGACGGAAGGTGGTTGTTGTTGAGGATAACAACAGAACAGA
CGAAGTAGAAGAAGCTGCTAAAGAGGTTGTTGATGATGGAAAGGTTAATGGTATCTCAGA
GAGGGCTGATTGTGAAGAAGAGAAGGAGAATAGTGGATCAAATGCTTACAACTTATCTCC
TCCGTACCGGATAAGATCCAAAAGAACAGCTGTTTTCAAGTCGAGACAGCTTGAGTTCAT
CTCTCCGGAGGAAGAGAAGACTGATGATGAAATTAAATCATCTGAGAAAGATAAGTTGCT
TGATGGAGGAGGAGATTCTCAAGTCTCAGGCCAAGAAAAATGAGATGTTTTCTCCATTAC
ACGCTGAAATTTTTTTTTATTGGTTAATTTTGTAGTATCATCTTTGGTGCTAACGTAAAA
ACTGTACTTAAATTGATTCCTCCGTGAGTTAGGTTCGGGTTAATGATACCCACACAAAAA
AAATGTAATAGTATGTTGTAACAAAAAATGGAGATCAGTTTCATTCATATATAATATTCC
TCTGTTTTCCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL7290Contig1 750 2 2 U
GGAGATCTGTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCATAGAAATGGTGAAACACAGAAGCTCATCTC
GATATTCTTCTTCTTCTTCAGCTAGATTCTTCTCCGTAAAAGCTATATCTGTCTACTTGA
TCTTAATATTCGCTTTCACCATCTGGGTCTTCGTCTTCAGCTCCATAAACATACAAACCG
ATGACCACCAAACCCAAGATCACCAGCAGCATCAACGTCCAGATCCAAGGAAGAATTTGT
AGAAACCGAGTGAAGATTTAGATTCTCAGCTCCGGACTCCTCCTTTTAGCTATGGTCTGC
ATCCTTGTCTCAAACCTACTCCTAGATCCAAAGAATTTGTAGAATCAGATCGTTATATAA
CAGTGAGAAGTAATGGTGGATTGAATCAAATGCGTACTGGTATAGCGGATATGGTGGCTG
TTGCACATATTATGAATGCAACTTTGGTGATTCCTGAGCTGGATAAGCGGTCGTTCTGGA
GAGACTCAAGTGTTTTCTCAGATATTTTCGACGAGGAGCGTTTCATCGAATCTCTGGGGA
GAGATGTGAAGGTTGTGAAAAAGCTCCCAAAGGAAGTGGAGTCTCTACCTAGGGCGAGGA
AGCATTTCAGTTCATGGGCTAGTGTTGGATACTACGAAGAAATGAGACACTTGTGGAAAG
AGTACAAGTCATCCACGTGGCTAAGTCAGATTCTCGCCTTGCAACAATGACCTGCCTATT
GATGTTCAGAGGCTGAGATGTCGCGTTCTG


BQ
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AF RR4GZ12TF U 1
AF RR4H434TF U 1
BS 1 601 RR4GZ12TF
BS 602 750 RR4H434TF

RD RR4GZ12TF 601 0 0
GGAGATCTGTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCATAGAAATGGTGAAACACAGAAGCTCATCTC
GATATTCTTCTTCTTCTTCAGCTAGATTCTTCTCCGTAAAAGCTATATCTGTCTACTTGA
TCTTAATATTCGCTTTCACCATCTGGGTCTTCGTCTTCAGCTCCATAAACATACAAACCG
ATGACCACCAAACCCAAGATCACCAGCAGCATCAACGTCCAGATCCAAGGAAGAATTTGT
AGAAACCGAGTGAAGATTTAGATTCTCAGCTCCGGACTCCTCCTTTTAGCTATGGTCTGC
ATCCTTGTCTCAAACCTACTCCTAGATCCAAAGAATTTGTAGAATCAGATCGTTATATAA
CAGTGAGAAGTAATGGTGGATTGAATCAAATGCGTACTGGTATAGCGGATATGGTGGCTG
TTGCACATATTATGAATGCAACTTTGGTGATTCCTGAGCTGGATAAGCGGTCGTTCTGGA
GAGACTCAAGTGTTTTCTCAGATATTTTCGACGAGGAGCGTTTCATCGAATCTCTGGGGA
GAGATGTGAAGGTTGTGAAAAAGCTCCCAAAGGAAGTGGAGTCTCTACCTAGGGCGAGGA
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4H434TF 750 0 0
GGAGATCTGTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCATAGAAATGGTGAAACACAGAAGCTCATCTC
GATATTCTTCTTCTTCTTCAGCTAGATTCTTCTCCGTAAAAGCTATATCTGTCTACTTGA
TCTTAATATTCGCTTTCACCATCTGGGTCTTCGTCTTCAGCTCCATAAACATACAAACCG
ATGACCACCAAACCCAAGATCACCAGCAGCATCAACGTCCAGATCCAAGGAAGAATTTGT
AGAAACCGAGTGAAGATTTAGATTCTCAGCTCCGGACTCCTCCTTTTAGCTATGGTCTGC
ATCCTTGTCTCAAACCTACTCCTAGATCCAAAGAATTTGTAGAATCAGATCGTTATATAA
CAGTGAGAAGTAATGGTGGATTGAATCAAATGCGTACTGGTATAGCGGATATGGTGGCTG
TTGCACATATTATGAATGCAACTTTGGTGATTCCTGAGCTGGATAAGCGGTCGTTCTGGA
GAGACTCAAGTGTTTTCTCAGATATTTTCGACGAGGAGCGTTTCATCGAATCTCTGGGGA
GAGATGTGAAGGTTGTGAAAAAGCTCCCAAAGGAAGTGGAGTCTCTACCTAGGGCGAGGA
AGCATTTCAGTTCATGGGCTAGTGTTGGATACTACGAAGAAATGAGACACTTGTGGAAAG
AGTACAAGTCATCCACGTGGCTAAGTCAGATTCTCGCCTTGCAACAATGACCTGCCTATT
GATGTTCAGAGGCTGAGATGTCGCGTTCTG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7291Contig1 605 2 1 U
GCTCACGCCGTCGTTCACTCTAAAAACCCCTCTCAATCAAGTTATTCAATCTTCTTCGCT
TCGCTGTAAACCATGTCATTCGAAGATGATTTTGTGGAAGATGTCGACTGGACTCATAAG
CTCACCGTTGAGATCGAGCAAGGACTAGCCGTTGATGTAAACGACGACCTCGCTAGAGAG
ATGGCGTTCTACACTCAAGCCCTCGAAGGGACGAGGCAGGCTTTCGAGAAGCTCCAAGAG
ATGGGACTGCCTTTCCTCAGGCCGGCTGATTACTACGCGGAGATGGTGATCGATCAGGAG
GTAAAGGAAAGCCTACTTCGAGGATGAACAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGACTCCAAGT
TTGGTCATGGTGGAAGGAAAGGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACGACGAATGATT
TCAAAGGTGGGTTTCGTGGTGGCAAAGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGGTAAACAA
AGTTTGGTTATTTAAACCTATCTACAGTTTCAACACTAAAAACTATTATGTCATGCTGGA
TTATGTTTTTGAGAGAATGTTTCTTTAGTTACAATGTTGTAGCAATGATTACTTGGATTA
AAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 

AF RR4BU35TF U 1
AF RR4FP67TF U 1
BS 1 605 RR4BU35TF

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AAAAA

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DS 

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ATGGGACTGCCTTTCCTCAGGCCGGCTGATTACTACGCGGAGATGGTGATCGATCAGGAG
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TTGGTCATGGTGGAAGGAAAGGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACGACGAATGATT
TCAAAGGTGGGTTTCGTGGTGGCAAAGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGGTAAACAA
AGTTTGGTTATTTAAACCTATCTACAGTTTCAACACTAAAAACTATTATGTCATGCTGGA
TTATGTTTTTGAGAGAATGTTTCTTTAGTTACAATGTTGTAGCAATGATTACTTGGATTA
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

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TTGAAAGACCCTAAATGGGATAAATTTGGATCCGGATAAATACGTTCGAAGTAAACATTT
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AAAAAATGACAGTGGCATTTGGTTGTAATTAACTTGAAAAGGCAGGGGCAGAATTCCTGG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DK21TF U 1
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CTATAATAATCAAAG
TTTCTGA

QA 1 735 1 735
DS 

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AATTTGATGGGCTGAACAATCATTGCTGATTGGATTTTCAAACGAAAAAGGTAGTCTGCA
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GTTTGGTTATTTACGATTTTCATTAAAAAAAAGAAAAAAATGACAGTGGCATTTGGTTGT
AATTAACTTGAAAAGGCAGGGGCAGAATTCCTGGGATTCTGCTTTAATAGTATAGATAAT
GTTTTGAGTTTTAG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

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AGCTAGCAGATTCATGACCGCAACGCTAGTTTTCATCTGTGGATTCTCTTGTTTCATACT
TAGTTTCACAGATTCTTACAAGGACTTGAATGGGAACTCTTGCTATGGATTTGCTACGTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BW68TF U 1
AF RR4BW68JQ C 138
BS 1 722 RR4BW68TF
BS 723 723 RR4BW68JQ
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RD RR4BW68TF 789 0 0
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AGGGATCAGTGAAGCTCGTCGCATGATCCAAGAAGAAGAGGAAGTTCCACTTCTGGAGGA
GGATCGAATTCTAATCCAAACTCGAGAGTTTCCTGCAATAGAAAGGAACACATGGATACA
AAAGGCAATAGGTCAAACTTTTCAAACCACAGCTCATCTAGCTAACCTCTTACCAACAGG
GACGGTTCTTGCATACCAAATCTTATCACCAATCTTCACAAACGCTGGAAGCTGCAGTTT
AGCTAGCAGATTCATGACCGCAACGCTAGTTTTCATCTGTGGATTCTCTTGTTTCATACT
TAGTTTCACAGATTCTTACAAGGACTTGAATGGGAACTCTTGCTATGGATTTGCTACGTT
CAATGGCTTCTGGATCATCGATGGCTCAGCTACTCTTCCTGAAGACCGTGCCAGAACTTA
TAAGTTAAGGTTTATAGACTTTGCACACGCTATCATGTCGTTTCTGGTGTTTGGAGCAGT
GGTTATGTTTGATCAGAATGCGGTCAAGTGTTTCATCCCTGAACCATCATCTGAAGAAGC
TGAGATTCTCACAGCTTTGCCCGTAGGAATAGGTGTGTTTTGTAGTATGATGTTTGCTAC
ATTTCCTACTACACGTCATGGTATCGGTTTCTCCATATCTTGATAAATGATGCCCTGATT
CA*TCATTTCACAGCTTTGGAT*CTGTACTTATTCGTTGTTGTATTTGAGATGATCTTCT
GAATAGAGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4BW68JQ 668 0 0
AAACTCGAGAGTTTCCTGCAATAGAAAGGAACACATGGATACAAAAGGCAATAGGTCAAA
CTTTTCAAACCACAGCTCATCTAGCTAACCTCTTACCAACAGGGACGGTTCTTGCATACC
AAATCTTATCACCAATCTTCACAAACGCTGGAAGCTGCAGTTTAGCTAGCAGATTCATGA
CCGCAACGCTAGTTTTCATCTGTGGATTCTCTTGTTTCATACTTAGTTTCACAGATTCTT
ACAAGGACTTGAATGGGAACTCTTGCTATGGATTTGCTACGTTCAATGGCTTCTGGATCA
TCGATGGCTCAGCTACTCTTCCTGAAGACCGTGCCAGAACTTATAAGTTAAGGTTTATAG
ACTTTGCACACGCTATCATGTCGTTTCTGGTGTTTGGAGCAGTGGTTATGTTTGATCAGA
ATGCGGTCAAGTGTTTCATCCCTGAACCATCATCTGAAGAAGCTGAGATTCTCACAGCTT
TGCCCGTAGGAATAGGTGTGTTTTGTAGTATGATGTTTGCTACATTTCCTACTACACGTC
ATGGTATCGGTTTCTCCATATCTTGATAAATGATGCCCTGATTCAATCATTTCACAGCTT
TGGATTCTGTACTTATTCGTTGTTGTATTTGAGATGATCTTCTGAATAGAGTATCTCAAT
GTTTGTGC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL7294Contig1 834 2 8 U
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TTCCTCTTATCCGTCCTTTTTGCTCTGTCCACGGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCC
AACCTGAAACGCGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATACGTCCCATTCATGTCAAA
GCCAAGGACTTCGTCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGC
GCTGCGGTCACACCAGGTTTTGTCGCTCAGTTCCCTGGTCTGAACGGTCTAGAACTCTCT
ACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCAAAAGGTGTGATCCCAATGCCCACACACCCGGGTGCC
TCTGAGGTTCTGTTTGTTCTTGACGGTGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAAC
TCTGTCTACGTACAGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTT
CATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCT
AGTCCTGGTCTACAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTC
GTCTCGGGTACTACTTTCCTTGAGCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTTAAGGGTGTTCTTGGA
GGAACTGGCTAAATCAAGACTTGACTATAAAACAACAAGGCCTGTTTTTCTATTCTCTTT
TAATGGATTATTTTCTCATTTGTTTTGTGTTCCTTGTAGTTCTTCAAAACATGTCAACAT
TATTACATTGTATGTGAGTTTTTCAATTAAGATCCTGAGTACGTCAGACCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ13TF U 1
AF RR4DQ13JQ C 129
BS 1 691 RR4DQ13TF
BS 692 692 RR4DQ13JQ
BS 693 708 RR4DQ13TF
BS 709 709 RR4DQ13JQ
BS 710 768 RR4DQ13TF
BS 769 769 RR4DQ13JQ
BS 770 785 RR4DQ13TF
BS 786 834 RR4DQ13JQ

RD RR4DQ13TF 785 0 0
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GCCAAGGACTTCGTCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGC
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ACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCAAAAGGTGTGATCCCAATGCCCACACACCCGGGTGCC
TCTGAGGTTCTGTTTGTTCTTGACGGTGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAAC
TCTGTCTACGTACAGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTT
CATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCT
AGTCCTGGTCTACAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTC
GTCTCGGGTACTACTTTCCTTGAGCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTTAAGGGTGTTCTTGGA
GGAACTGGCTAAATCAAGACTTGACTATAAA*CAACAAGGCCTGTTTT*CTATTCTCTTT
TAATGGATTATTTTCTCATTTGTTTTGTGTTCCTTGTAGTTCTTCAAA*CATGTCAACAT
TATTA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4DQ13JQ 706 0 0
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CTTCGTCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGCGCTGCGGT
CACACCAGGTTTTGTCGCTCAGTTCCCTGGTCTGAACGGTCTAGAACTCTCTACAGCTAG
ACTTGACCTAGCTCCAAAAGGTGTGATCCCAATGCCCACACACCCGGGTGCCTCTGAGGT
TCTGTTTGTTCTTGACGGTGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACTCTGTCTA
CGTACAGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCA
GATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGG
TCTACAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTCGTCTCGGG
TACTACTTTCCTTGAGCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTTAAGGGTGTTCTTGGAGGAACTGG
CTAAATCAAGACTTGACTATAAAACAACAAGGCCTGTTTTTCTATTCTCTTTTAATGGAT
TATTTTCTCATTTGTTTTGTGTTCCTTGTAGTTCTTCAAAACATGTCAACATTATTACAT
TGTATGTGAGTTTTTCAATTAAGATCCTGAGTACGTCAGACCGTTC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7295Contig1 997 2 2 U
GGATCTTTTGATCTTTATGACTCTCAACCGACGTCCCGCTTCCTCTTCCTGTAAAGGAAT
TCTCCATCCTCCTATATAGATGTCGCCTATAGTGCTCCCGTCGTTAACGCCGCCGCCGTC
TACTCCAGTTTCAACGCTCTTCGTCTCGGCAGATCAGCTCAGACCGTCCTTGGACGCCTA
CGTCAACAAGAACGGCGAGTATAGGGATAACATCCTTCTCCTCGATGAACTGGACTCTGT
GATTCACGGGTTCATACCCGCTAATCGGGCCAACCACTACCGGAACGACTTGAAAGGCGG
ATCTATTGTCAGATTGGAGCGTTTTGAAGTTGCACGTGTTGCTAAAAGATCACAGAGCAT
CAGTTCGACACAAGAAGCTACTGTTCTGGCGGAGGCCCAAAAGGTGGTGAGGAGGAACTC
CCAGGTTGTCTTGAAGAACTCAAGGGAAAGGAGTTTTTGTTTCAGATCCGTATCACACCT
TTCAACTTCACACCCAACCACCGTACCTTCACTGAAGATGTAGCCATAGAGAACCATGGC
AAGGTCTTGTAGGTAGGTTTGCTGTTTGCACCTTCTTTACACCACACGTTCATGTATTTC
AGGAACATGGTGAGAACATTCTTCCCTGCGGTGAAGGTGACGTTGGGTTGACAGTATCGT
CTTCGGGACCCTCTGTTTTTGGATACAAGATCGGTGAGGAATGTGCTGCAGCATATGGTC
CTGGGATTCCAGCCGCTCAGAACAAACGCAAACGCTCACGTGAGTAACTGGAACTATCAA
ATCCTTTCGGCCCCGTCAACCGTTTAATCTATGTTTTTAAAGACTACTTCTTGCTTTGTT
TCCCATTTACAACTTTTGTGTTTCTCTTTTTCGTTTTCTTCTGCTCTGATGTTTTTATCT
CTGTTTTGGAATATTAATTAGTCTTTGACGGGTTTTAAAAGATTATAAACGTAGCAGTAG
TTTGTTATTTAACTTTTAAATTTAATCCCTAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GZ80TF U 1
AF RR4GZ80JQ C 265
BS 1 597 RR4GZ80TF
BS 598 997 RR4GZ80JQ

RD RR4GZ80TF 600 0 0
GGATCTTTTGATCTTTATGACTCTCAACCGACGTCCCGCTTCCTCTTCCTGTAAAGGAAT
TCTCCATCCTCCTATATAGATGTCGCCTATAGTGCTCCCGTCGTTAACGCCGCCGCCGTC
TACTCCAGTTTCAACGCTCTTCGTCTCGGCAGATCAGCTCAGACCGTCCTTGGACGCCTA
CGTCAACAAGAACGGCGAGTATAGGGATAACATCCTTCTCCTCGATGAACTGGACTCTGT
GATTCACGGGTTCATACCCGCTAATCGGGCCAACCACTACCGGAACGACTTGAAAGGCGG
ATCTATTGTCAGATTGGAGCGTTTTGAAGTTGCACGTGTTGCTAAAAGATCACAGAGCAT
CAGTTCGACACAAGAAGCTACTGTTCTGGCGGAGGCCCAAAAGGTGGTGAGGAGGAACTC
CCAGGTTGTCTTGAAGAACTCAAGGGAAAGGAGTTTTTGTTTCAGATCCGTATCACACCT
TTCAACTTCACACCCAACCACCGTACCTTCACTGAAGATGTAGCCATAGAGAACCATGGC
AAGGTCTTGTAGGTAGGTTTGCTGTTTGCACCTTCTTTACACCACACGTTCATGTAT
CTC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4GZ80JQ 733 0 0
TCGGGCCAACCACTACCGGAACGACTTGAAAGGCGGATCTATTGTCAGATTGGAGCGTTT
TGAAGTTGCACGTGTTGCTAAAAGATCACAGAGCATCAGTTCGACACAAGAAGCTACTGT
TCTGGCGGAGGCCCAAAAGGTGGTGAGGAGGAACTCCCAGGTTGTCTTGAAGAACTCAAG
GGAAAGGAGTTTTTGTTTCAGATCCGTATCACACCTTTCAACTTCACACCCAACCACCGT
ACCTTCACTGAAGATGTAGCCATAGAGAACCATGGCAAGGTCTTGTAGGTAGGTTTGCTG
TTTGCACCTTCTTTACACCACACGTTCATGTATTTCAGGAACATGGTGAGAACATTCTTC
CCTGCGGTGAAGGTGACGTTGGGTTGACAGTATCGTCTTCGGGACCCTCTGTTTTTGGAT
ACAAGATCGGTGAGGAATGTGCTGCAGCATATGGTCCTGGGATTCCAGCCGCTCAGAACA
AACGCAAACGCTCACGTGAGTAACTGGAACTATCAAATCCTTTCGGCCCCGTCAACCGTT
TAATCTATGTTTTTAAAGACTACTTCTTGCTTTGTTTCCCATTTACAACTTTTGTGTTTC
TCTTTTTCGTTTTCTTCTGCTCTGATGTTTTTATCTCTGTTTTGGAATATTAATTAGTCT
TTGACGGGTTTTAAAAGATTATAAACGTAGCAGTAGTTTGTTATTTAACTTTTAAATTTA
ATCCCTAGAAAAA

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL7296Contig1 602 2 1 U
GGAACCGTCGATATAACTCTAATCTAATGGACATAATACATTCAATATTTTATTCCATTT
CTGCTTTATCTTTTTTATCTCCTTTTTCTCAGATCTGTCGATCTTCATCTCTATTGCTCA
TTTCTTCTTTCCTATCTAAGAATCTCATCTCCTCTTTCTTCTCGGGTGGTTCAAGGGCGT
GGTTTCCTCTCCGTTCATCTCCTCTCCACCGGTGCAAGGTCGTCTGGCAGTCCAGTCTCC
GGCCGTCTCCTCCGTGGTCGCAGACTCGAAGTCCAATCTCTTTTTTTCTCCTCTGCAGTC
CAGTCTCCTCTCTTCTCCTCTCCAGTTCAGGCTTCTCTCTACTGATTCACAGTGGTAGCT
ACATCTCGTCCATCTGAGCATCCCCCCCTCACAAGCATCTCCAACAGAAGTTTTTCTTCT
GCCTTAGTTTTCACATATTAGATCTAGCTTTTTGTTTGGATACTAGAAGTTTCAGATCTA
CATTTTTGTTATATTTCGGAATTTCAGATTTTTTCTTTTAATATTTAATGTTGTTCATAT
CTACAAAATAAAAGTCAACAATGGATTTGTTCATTAATGTGCTAAATCATAATTTTACTA
CG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4D613JQ C 1
AF RR4D613TF U 1
BS 1 602 RR4D613TF

RD RR4D613JQ 602 0 0
GGAACCGTCGATATAACTCTAATCTAATGGACATAATACATTCAATATTTTATTCCATTT
CTGCTTTATCTTTTTTATCTCCTTTTTCTCAGATCTGTCGATCTTCATCTCTATTGCTCA
TTTCTTCTTTCCTATCTAAGAATCTCATCTCCTCTTTCTTCTCGGGTGGTTCAAGGGCGT
GGTTTCCTCTCCGTTCATCTCCTCTCCACCGGTGCAAGGTCGTCTGGCAGTCCAGTCTCC
GGCCGTCTCCTCCGTGGTCGCAGACTCGAAGTCCAATCTCTTTTTTTCTCCTCTGCAGTC
CAGTCTCCTCTCTTCTCCTCTCCAGTTCAGGCTTCTCTCTACTGATTCACAGTGGTAGCT
ACATCTCGTCCATCTGAGCATCCCCCCCTCACAAGCATCTCCAACAGAAGTTTTTCTTCT
GCCTTAGTTTTCACATATTAGATCTAGCTTTTTGTTTGGATACTAGAAGTTTCAGATCTA
CATTTTTGTTATATTTCGGAATTTCAGATTTTTTCTTTTAATATTTAATGTTGTTCATAT
CTACAAAATAAAAGTCAACAATGGATTTGTTCATTAATGTGCTAAATCATAATTTTACTA
CG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4D613TF 602 0 0
GGAACCGTCGATATAACTCTAATCTAATGGACATAATACATTCAATATTTTATTCCATTT
CTGCTTTATCTTTTTTATCTCCTTTTTCTCAGATCTGTCGATCTTCATCTCTATTGCTCA
TTTCTTCTTTCCTATCTAAGAATCTCATCTCCTCTTTCTTCTCGGGTGGTTCAAGGGCGT
GGTTTCCTCTCCGTTCATCTCCTCTCCACCGGTGCAAGGTCGTCTGGCAGTCCAGTCTCC
GGCCGTCTCCTCCGTGGTCGCAGACTCGAAGTCCAATCTCTTTTTTTCTCCTCTGCAGTC
CAGTCTCCTCTCTTCTCCTCTCCAGTTCAGGCTTCTCTCTACTGATTCACAGTGGTAGCT
ACATCTCGTCCATCTGAGCATCCCCCCCTCACAAGCATCTCCAACAGAAGTTTTTCTTCT
GCCTTAGTTTTCACATATTAGATCTAGCTTTTTGTTTGGATACTAGAAGTTTCAGATCTA
CATTTTTGTTATATTTCGGAATTTCAGATTTTTTCTTTTAATATTTAATGTTGTTCATAT
CTACAAAATAAAAGTCAACAATGGATTTGTTCATTAATGTGCTAAATCATAATTTTACTA
CG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL7297Contig1 634 2 1 U
GGAGGAGGTTGTTATTGACAACTGCTGTATGATGCTTGTGAAAAACCCAGCGCTGTTTGA
TGTATTGGTGATGCCAAACCTGTACGGTGACATTATCAGCGACTTGTGTGCTGGATTGGT
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AGCAGTTCATGGTTCTGCACCTGATATCGCCGGAAAGAACTTGGCGAACCCAACGGCGTT
GCTACTGAGCGGAGTGATGATGTTACGACACCTGAAGCTGAACGAACAAGCAGAACAGAT
CCACAGCGCAATCATCAACACCATAGCGGAGGGGAAATACAGAACCGCGGATCTTGGAGG
TAGTTCGACCACCACAGAATTCACAAAGGCAATCTGTGACCATCTCTGAACGAACACTCG
TAAAAATCTTCAAAATTCTTTTACCGAATCTTTCCATTTGGGGGCTAAACTTAGGCCTCT
CTATTAGTCATTGTTTTCTCTGATTACGATTAGAAGAATAAAAAGAAAAAGTGTCGGCTT
TCTCCCTCTTGATGAAGTTTTATTACCTGCCTCCAAAACATATTTTGAAACTTGTCTCTG
CCTTAAGGCAAAGATTCATAACACATCAGAAGAT


BQ
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AF RR4GL16JQ C 1
AF RR4GL16TF U 1
BS 1 634 RR4GL16TF

RD RR4GL16JQ 634 0 0
GGAGGAGGTTGTTATTGACAACTGCTGTATGATGCTTGTGAAAAACCCAGCGCTGTTTGA
TGTATTGGTGATGCCAAACCTGTACGGTGACATTATCAGCGACTTGTGTGCTGGATTGGT
GGGAGGACTAGGATTGACTCCAAGTTGCAATATTGGAGAAGATGGTGTAGCACTTGCTGA
AGCAGTTCATGGTTCTGCACCTGATATCGCCGGAAAGAACTTGGCGAACCCAACGGCGTT
GCTACTGAGCGGAGTGATGATGTTACGACACCTGAAGCTGAACGAACAAGCAGAACAGAT
CCACAGCGCAATCATCAACACCATAGCGGAGGGGAAATACAGAACCGCGGATCTTGGAGG
TAGTTCGACCACCACAGAATTCACAAAGGCAATCTGTGACCATCTCTGAACGAACACTCG
TAAAAATCTTCAAAATTCTTTTACCGAATCTTTCCATTTGGGGGCTAAACTTAGGCCTCT
CTATTAGTCATTGTTTTCTCTGATTACGATTAGAAGAATAAAAAGAAAAAGTGTCGGCTT
TCTCCCTCTTGATGAAGTTTTATTACCTGCCTCCAAAACATATTTTGAAACTTGTCTCTG
CCTTAAGGCAAAGATTCATAACACATCAGAAGAT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GL16TF 634 0 0
GGAGGAGGTTGTTATTGACAACTGCTGTATGATGCTTGTGAAAAACCCAGCGCTGTTTGA
TGTATTGGTGATGCCAAACCTGTACGGTGACATTATCAGCGACTTGTGTGCTGGATTGGT
GGGAGGACTAGGATTGACTCCAAGTTGCAATATTGGAGAAGATGGTGTAGCACTTGCTGA
AGCAGTTCATGGTTCTGCACCTGATATCGCCGGAAAGAACTTGGCGAACCCAACGGCGTT
GCTACTGAGCGGAGTGATGATGTTACGACACCTGAAGCTGAACGAACAAGCAGAACAGAT
CCACAGCGCAATCATCAACACCATAGCGGAGGGGAAATACAGAACCGCGGATCTTGGAGG
TAGTTCGACCACCACAGAATTCACAAAGGCAATCTGTGACCATCTCTGAACGAACACTCG
TAAAAATCTTCAAAATTCTTTTACCGAATCTTTCCATTTGGGGGCTAAACTTAGGCCTCT
CTATTAGTCATTGTTTTCTCTGATTACGATTAGAAGAATAAAAAGAAAAAGTGTCGGCTT
TCTCCCTCTTGATGAAGTTTTATTACCTGCCTCCAAAACATATTTTGAAACTTGTCTCTG
CCTTAAGGCAAAGATTCATAACACATCAGAAGAT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7298Contig1 606 2 1 U
GGATATATAAGAGAAACACAAAGCAAACATAATTTTTCATCCATAAGTGGAAAATGAGGA
ACATTACTAAAAACCAGACCATGTTACTGCTTGTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGT
ACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGTTCACAGATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGT
CTTATGTAAAAGGTGGAGGAAACCCGCCTCCTCCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAA
GAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAG
CTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATG
TTGATCTGGGCGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCGTAAACTGAAAAGAGG
ACTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACG
CATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATAC
ATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCCC
AATCCC


BQ
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AF RR4ER34JQ C 1
AF RR4ER34TF U 1
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AATCCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4ER34TF 606 0 0
GGATATATAAGAGAAACACAAAGCAAACATAATTTTTCATCCATAAGTGGAAAATGAGGA
ACATTACTAAAAACCAGACCATGTTACTGCTTGTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGT
ACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGTTCACAGATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGT
CTTATGTAAAAGGTGGAGGAAACCCGCCTCCTCCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAA
GAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAG
CTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATG
TTGATCTGGGCGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCGTAAACTGAAAAGAGG
ACTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACG
CATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATAC
ATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCCC
AATCCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7299Contig1 713 2 7 U
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CTCTCAGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAG
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GATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGT
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TTTTCATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGTTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DN23TF U 1
AF RR4E468TF U 54
BS 1 115 RR4DN23TF
BS 116 116 RR4E468TF
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RD RR4DN23TF 713 0 0
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GATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGT
CTCCGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACGGTTGGTGTC
TCTAAGAAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTCTGACAGTCCCG
TTTTCATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGTTGT
TATGTAAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTGTTGTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4E468TF 623 0 0
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CGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGAT
TATGTTTGCTCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAATATTGTCTGCAA
GAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGATAA
CCTCATGACCATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAG
ACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAA
GCTGAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGTGACACTA
CTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCACAGAGGAAAGACGGT
TGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTCTGAC
AGTCCCGTTTTCATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTT
TAGT*GTTATGTAAGACATCCTT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7300Contig1 901 2 3 U
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TGGAGGAGATAAAGGCGGAGAAGAGGAGGGTGAGGAAGAAGCTTCTCTTGAAGGTGGAGG
AGGGTCAGAGTCGCACCAGGATGATCATGGATGGTTAGAAGCTAGTGCTTAAAGAATGTT
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CATTACTCAGGTTTTGAGTTTTGATCAATGCCGAAAAAGTCCTGTAATAAACGGTTTACA
CCGATCTCTATTTGCCTGTTTCACATATGGACATATGGTATATCAACTTTCTTTCGAGAT
T


BQ
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10 

AF RR4CL08TF U 103
AF RR4CL08JQ C 1
BS 1 103 RR4CL08JQ
BS 104 347 RR4CL08TF
BS 348 901 RR4CL08JQ

RD RR4CL08TF 245 0 0
T
TCAAAAGTCGTGATGGGGAGAGCTAAACGCGGTCTCTACGCCGGCCGCCATATCCAGTAC
GGAAACCGCGTCAGTGAAGACGGTGGCAACAAGTCAAGAAGGTGTTGGAAACCGAACGTA
CAGGAGAAGCGATTGTTCAGTTACATATTCGACCGTCACATTAAAGTCAAAGTCACAACG
CACGCTCTCCGCTGCATCGACAAAGCAGGAGGGATAGACGAGTACTTGCTGAAAACACCC
TACC

QA 2 245 2 245
DS 

RD RR4CL08JQ 901 0 0
AAATGGCGTTAGAGGGAAAGAGATGATGAAGAAGATAGTGAAGAAGGTCGGAGCGGAGAC
TCTGACGCTGAGCTGAAAGAGAAGCTCAAGGCTGCGTTCCCGATCAAAAGTCGTGATGGG
GAGAGCTAAACGCGGTCTCTACGCCGGCCGCCATATCCAGTACGGAAACCGCGTCAGTGA
AGACGGTGGCAACAAGTCAAGAAGGTGTTGGAAACCGAACGTACAGGAGAAGCGATTGTT
CAGTTACATATTCGACCGTCACATTAAAGTCAAAGTCACAACGCACGCTCTCCGCTGCAT
CGACAAAGCAGGAGGGATAGACGAGTACTTGCTGAAAACACCCTACCAGAAGATGGACAC
TGAGATGGGTCTTTTCTGGAAAACCAAAGTGGAGCAAAGATACGCTGAGCTAGGTCAGAT
GGAAGTAGCCTTCTTCACTCCTGAGGATGAGGCCAAGTTTGAGCAAGGGTTCAAGGATTT
GAATATAGCTAAGAAAGAGGCTCGTAGGGAAGCTCGTAAGGAAGCTAGGAGAAAGATGTA
TGGAGGAGATAAAGGCGGAGAAGAGGAGGGTGAGGAAGAAGCTTCTCTTGAAGGTGGAGG
AGGGTCAGAGTCGCACCAGGATGATCATGGATGGTTAGAAGCTAGTGCTTAAAGAATGTT
GGTTGGTTCTCTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTGCTGAGTTTCTTCTTGAACGTTTTGGA
AGATGAGAATGATAAGTGATGTTGTAGGTCATAGGGTTCGATTCCTCCCTTTACGAATCC
CATTACTCAGGTTTTGAGTTTTGATCAATGCCGAAAAAGTCCTGTAATAAACGGTTTACA
CCGATCTCTATTTGCCTGTTTCACATATGGACATATGGTATATCAACTTTCTTTCGAGAT
T

QA 1 901 1 901
DS 



AS 1 2

CO CL7301Contig1 660 2 3 U
GGAACAAAAACTTGAAGAACAACAACAAGAAGAGAAGATGAAGAAAGTTATGGTGATTAT
CGACGAGAGCAACTCAAGTTATGATTTACTCATTTGTGTCATCACAAATCTAAAAGATGT
CATTGACAGCTCCAAAGTTGTGATCTTCGCAAAACAGCCACAAAACTCCTTCACTCCTCC
TACCGCACTTTCTACGTCGGTTGGCTTTGCTCAGATTTTCTGTCCATTTTCACCCAATGC
AGAACTCATGAGATTGGCTCAACAAAGGAATACAAAAATTGCGTTGGGTATATTACAGAA
AGCCAAGAAATTATGTGAAAATAATGGGGTTAAAGCAGAGACATTTACTGATGTTGGAGA
CTTGAAAGATACAATCCACAAAATAATTCAAGAGCAAAAGATCAACTTAATAGCTATCAG
CGATGAACAAAACAGAAATCTTAAAAAGTGTTTACCTACTACAGAGTGTTCTCTTTTTGG
TCGTGAAGTGAAGCAAGGAGATTTGCCAAACATTCAGATGGTACAATTCAGTATATGTAG
TATTGTATGCGATTGTCATTATGTAAAATATATGATTACGTTAGTTTTGGGTTGTACTTG
AACATTTGGTTGTATGTATATAAATAAATAATATATAAATTAGAAAATTTATTGTTTACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CV49JQ C 1
AF RR4CV49TF U 1
BS 1 338 RR4CV49TF
BS 339 339 RR4CV49JQ
BS 340 660 RR4CV49TF

RD RR4CV49JQ 660 0 0
GGAACAAAAACTTGAAGAACAACAACAAGAAGAGAAGATGAAGAAAGTTATGGTGATTAT
CGACGAGAGCAACTCAAGTTATGATTTACTCATTTGTGTCATCACAAATCTAAAAGATGT
CATTGACAGCTCCAAAGTTGTGATTTTCGCAAAACAGCCACAAAACTCCTTCACTCCTCC
TACCGCACTTTTTACGTCGGTTGGCTTTGCTCAGATTTTCTGTCCATTTTCACCCAATGC
AGAACTCATGAGATTGGCTCAACAAAGGAATACAAAAATTGCGTTGGGTATATTACAGAA
AGCCAAGAAATTATGTGAAAATAATGGGGTTAAAGCAGAGACATTTACTGATGTTGGAGA
CTTGAAAGATACAATCCACAAAATAATTCAAGAGCAAAAGATCAACTTAATAGCTATCAG
CGATGAACAAAACAGAAATCTTAAAAAGTGTTTACCTACTACAGAGTGTTCTCTTTT*GG
TCGTGAAGTGAAGCAAGGAGATTTGCCAAACATTCAGATGGTACAATTCAGTATATGTAG
TATTGTATGCGATTGTCATTATGTAAAATATATGATTACGTTAGTTTTGGGTTGTACTTG
AACATTTGGTTGTATGTATATAAATAAATAATATATAAATTAGAAAATTTATTGTTTACG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4CV49TF 660 0 0
GGAACAAAAACTTGAAGAACAACAACAAGAAGAGAAGATGAAGAAAGTTATGGTGATTAT
CGACGAGAGCAACTCAAGTTATGATTTACTCATTTGTGTCATCACAAATCTAAAAGATGT
CATTGACAGCTCCAAAGTTGTGATCTTCGCAAAACAGCCACAAAACTCCTTCACTCCTCC
TACCGCACTTTCTACGTCGGTTGGCTTTGCTCAGATTTTCTGTCCATTTTCACCCAATGC
AGAACTCATGAGATTGGCTCAACAAAGGAATACAAAAATTGCGTTGGGTATATTACAGAA
AGCCAAGAAATTATGTGAAAATAATGGGGTTAAAGCAGTGACATTTACTGATGTTGGAGA
CTTGAAAGATACAATCCACAAAATAATTCAAGAGCAAAAGATCAACTTAATAGCTATCAG
CGATGAACAAAACAGAAATCTTAAAAAGTGTTTACCTACTACAGAGTGTTCTCTTTTTGG
TCGTGAAGTGAAGCAAGGAGATTTGCCAAACATTCAGATGGTACAATTCAGTATATGTAG
TATTGTATGCGATTGTCATTATGTAAAATATATGATTACGTTAGTTTTGGGTTGTACTTG
AACATTTGGTTGTATGTATATAAATAAATAATATATAAATTAGAAAATTTATTGTTTACG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7302Contig1 713 2 1 U
GATTTCAAGGGTGAGAAGTTGGTCCCTGAAGTTCCCGTCGACGTCAATGAGGTGTTAAAG
ATTCTACCTTTGAGGTCGTTGAGTAGTGGAAGAGTAGAGAAGAGGTCTGATTTATCTATG
GAGGGGTTTCTGCGTGATTATTTTCAGACAGGTACACCTGTTGTTATAACCAACTGTATG
GCTCATTGGCCTGCTAGGACCAAGTGGAACCACTTGGACTATCTCAACACTGTCGCTGGT
AACCGTACCGTTCCCGTCGAGGTGGGGAAAAACTATTTGTGTTCTGATTGGAAGCAAGAG
CTTGTGACTTTCTCCAAGTTCCTTGAACGGATGAGGACCAATAGTTCCACGTCGTCTGTG
GAGCCTACTTATCTTGCTCAGCATCCCTTGTTTGACCAGATAAATGAACTGAGAGATGAT
ATATGTATTCCTGATTACTGTTTTGTCGGTGGAGGGGAACTCCAATCTCTTAATGCTTGG
TTTGGCCCGGCTGGGACAGTCACCCCATTACACCATGATCCACATCATAATATACTTGCT
CAGGTTGTTGGTAAGAAGTATATAAGGCTTTACCCATCCTCGTTGCAAGACGAACTTTAC
CCTTATTCCGAGACAATGCTTTGCAACTCTAGCCAGGTTGATCTTGACAACATTTACAAG
AACGAGTTCCCAAAGGCGGTGGAGCTAGAGTTTATGGATTGTATCCTAGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4A775TF U 1
AF RR4AK82TF U 57
BS 1 713 RR4A775TF

RD RR4A775TF 713 0 0
GATTTCAAGGGTGAGAAGTTGGTCCCTGAAGTTCCCGTCGACGTCAATGAGGTGTTAAAG
ATTCTACCTTTGAGGTCGTTGAGTAGTGGAAGAGTAGAGAAGAGGTCTGATTTATCTATG
GAGGGGTTTCTGCGTGATTATTTTCAGACAGGTACACCTGTTGTTATAACCAACTGTATG
GCTCATTGGCCTGCTAGGACCAAGTGGAACCACTTGGACTATCTCAACACTGTCGCTGGT
AACCGTACCGTTCCCGTCGAGGTGGGGAAAAACTATTTGTGTTCTGATTGGAAGCAAGAG
CTTGTGACTTTCTCCAAGTTCCTTGAACGGATGAGGACCAATAGTTCCACGTCGTCTGTG
GAGCCTACTTATCTTGCTCAGCATCCCTTGTTTGACCAGATAAATGAACTGAGAGATGAT
ATATGTATTCCTGATTACTGTTTTGTCGGTGGAGGGGAACTCCAATCTCTTAATGCTTGG
TTTGGCCCGGCTGGGACAGTCACCCCATTACACCATGATCCACATCATAATATACTTGCT
CAGGTTGTTGGTAAGAAGTATATAAGGCTTTACCCATCCTCGTTGCAAGACGAACTTTAC
CCTTATTCCGAGACAATGCTTTGCAACTCTAGCCAGGTTGATCTTGACAACATTTACAAG
AACGAGTTCCCAAAGGCGGTGGAGCTAGAGTTTATGGATTGTATCCTAGAGGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4AK82TF 652 0 0
AAAGATTCTACCTTTGAGGTCGTTGAGTAGTGGAAGAGTAGAGAAGAGGTCTGATTTATC
TATGGAGGGGTTTCTGCGTGATTATTTTCAGACAGGTACACCTGTTGTTATAACCAACTG
TATGGCTCATTGGCCTGCTAGGACCAAGTGGAACCACTTGGACTATCTCAACACTGTCGC
TGGTAACCGTACCGTTCCCGTCGAGGTGGGGAAAAACTATTTGTGTTCTGATTGGAAGCA
AGAGCTTGTGACTTTCTCCAAGTTCCTTGAACGGATTAGGACCAATAGTTCCACGTCGTC
TGTGGAGCCTACTTATCTTGCTCAGCATCCCTTGTTTGACCAGATAAATGAACTGAGAGA
TGATATATGTATTCCTGATTACTGTTTTGTCGGTGGAGGGGAACTCCAATCTCTTAATGC
TTGGTTTGGCCCGGCTGGGACAGTCACCCCATTACACCATGATCCACATCATAATATACT
TGCTCAGGTTGTTGGTAAGAAGTATATAAGGCTTTACCCATCCTCGTTGCAAGACGAACT
TTACCCTTATTCCGAGACAATGCTTTGCAACTCTAGCCAGGTTGATCTTGACAACATTTA
CAAGAACGAGTTCCCAAAG*CGGTGGAGCTAGAGTTTATGGATTGTATCCTA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL7303Contig1 635 2 1 U
GGTTGTAGAGAACAGAGGAAGAAGCCTAAGCCGACGCGAGAGACGACGACGACGAGGAAG
AATATGAGGGAGACGGTGAAGTTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGG
GAAGCCGCCATGGTTTCTCATACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCG
GAATCGAAAGATGGTGTGGTGACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATC
TGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATC
GAGCCTGAACTGACTCTGGAGCTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACCTGAAAGACT
AACATAAACATGTAAAATCCCTGGAGCACTTATGTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAA
TTGAGTTCTTGAAGAACTATTGAATAGCTCTAAGGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAG
TTAATGACTATTTAATGCAAACATCAAAGTTCCTGTGGCGTTATTCGTTGCTTATGTTCA
AATAGCTTACATTGCTTTTGTAATAAGCAACAAAAATTATGTCCTAACAACGATTGGTTT
TGGTGCCGAATAGGTATGTGCCGTTTGATATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D669TF U 1
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GAAGCCGCCATGGTTTCTCATACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCG
GAATCGAAAGATGGTGTGGTGACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATC
TGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATC
GAGCCTGAACTGACTCTGGAGCTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACCTGAAAGACT
AACATAAACATGTAAAATCCCTGGAGCACTTATGTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAA
TTGAGTTCTTGAAGAACTATTGAATAGCTCTAAGGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAG
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AATAGCTTACATTGCTTTTGTAATAAGCAACAAAAATTATGTCCTAACAACGATTGGTTT
TGGTGCCGAATAGGTATGTGCCGTTTGATATGACG

QA 1 635 1 635
DS 

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GCTAATTATCTTCACACCTGAAAGACTAACATAAACATGTAAAATCCCTGGAGCACTTAT
GTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGAAGAACTATTGAATAGCTCTAA
GGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAGTTAATGACTATTTAATGCAAACATCAAAGTTCC
TGTGGCGTTATTCGTTGCTTATGTTCAAATAGCTTACATTGCTTTTGTAATAAGCAACAA
AAATTATGTCCTAACAACGATTGGTTTTGGTGCCGAATAGGTATGTGCCGTTTGATATGA
CG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

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GGATGAGCTTGAGGCTTTGAAGCTTGATAAGTGCTCGGGTTTCTCTACTGATGGGCTTTT
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GA


BQ
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20 20 

AF RR4BA94JQ C 1
AF RR4BA94TF U 1
BS 1 602 RR4BA94TF

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GGATGAGCTTGAGGCTTTGAAGCTTGATAAGTGCTCGGGTTTCTCTACTGATGGGCTTTT
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TCATTACCTACTTTGTTTGAAGATCTCTTGTGTCTTTAGTAGAAGAAACTTTGGTGCTTT
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GA

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DS 

RD RR4BA94TF 602 0 0
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GGATGAGCTTGAGGCTTTGAAGCTTGATAAGTGCTCGGGTTTCTCTACTGATGGGCTTTT
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TGATTCTTAAGGTTTTAATGTATACTTTTGCAACTCTCTTTATATTCATAAGGACAGTTC
TCATTACCTACTTTGTTTGAAGATCTCTTGTGTCTTTAGTAGAAGAAACTTTGGTGCTTT
ATTTGATTTCTTACTACACTTTACACAGCTTGTGGTTATGCATAAACAGTAAAAGTATTC
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ATACCTGCAACCTAAGAAAAGTATCAATTGGGGCTGTAGAAATAATTTAGCTACAAGCTT
GA

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL7305Contig1 954 2 10 U
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ATACCGTTGTTAAATGTCTTCTTTGATTTGGATTTGAGCTCTCTGGCTATGGAAACGAAT
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ACAGAATCACCGCCGCTAAAATTCATAATCCGATCCAAGCGATCACAAGAATGAGGTTAT
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GTGTGTCGGAATACTTTTGATATAATTATATACTTCCATCAGAGTTGAGTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT74TF U 1
AF RR4DT74JQ C 112
BS 1 629 RR4DT74TF
BS 630 630 RR4DT74JQ
BS 631 639 RR4DT74TF
BS 640 640 RR4DT74JQ
BS 641 711 RR4DT74TF
BS 712 712 RR4DT74JQ
BS 713 717 RR4DT74TF
BS 718 718 RR4DT74JQ
BS 719 753 RR4DT74TF
BS 754 954 RR4DT74JQ

RD RR4DT74TF 753 0 0
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ATTCGGCTGGAGTTCTTCTCACAGGTAATGGAAACCGAAACCGTTACGGATACAAGCGTC
GTCATTAACGTTTTCCTTAACTCATTTCACATTCAATGCTCTCCTCTTCTTTCAGTCGGT
GAATCTGAAGCTATAAATAGTTGAGTTTGTATTCGTGTAATTCATCATTCCATGCTTCAC
ATACCGTTGTTAAATGTCTTCTTTGATTTGGATTTGAGCTCTCTGGCTATGGAAACGAAT
CCATGGATGTTTTTCTGTGAGCAAGTTGGATTGCAAGCTTATGGGACGTCGAGGATAATG
GTTTTCTTCCCGGTAATTAGGTAGGAGAGAGTGGAGTCGGAGTTCGTCTCTGACAGAAAA
TGGCGGAGGAGATGGTTGTTGAGAAGGATCTGGTGGTTGAATTGGAGTTGCGACGGCCGC
TGAATTGAGGGAGCGATTAGGAGAGACATATACGGTGTGAAGGAAAGAGGCCATGAATGT
GGAGGTTGGGAAGGGGATTGGAATGGTTTGGCGACGAAAACGGCGGTGGATGCAGAGGAG
CAGATGAGCCTAGAGACGGAGAGAGAATCTCTAGCTGAG*CTCTTTGTCTTCTTTGTAAC
TTGCTCCTGGAAATGCAGATACCATCTATGGAATTTGGCGAGAGAGGAAAA*TAGGT*AC
AGTGGCACATCCACAGACCACCGGAGACCCTCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4DT74JQ 843 0 0
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TCAGTCGGTGAATCTGAAGCTATAAATAGTTGAGTTTGTATTCGTGTAATTCATCATTCC
ATGCTTCACATACCGTTGTTAAATGTCTTCTTTGATTTGGATTTGAGCTCTCTGGCTATG
GAAACGAATCCATGGATGTTTTTCTGTGAGCAAGTTGGATTGCAAGCTTATGGGACGTCG
AGGATAATGGTTTTCTTCCCGGTAATTAGGTAGGAGAGAGTGGAGTCGGAGTTCGTCTCT
GACAGAAAATGGCGGAGGAGATGGTTGTTGAGAAGGATCTGGTGGTTGAATTGGAGTTGC
GACGGCCGCTGAATTGAGGGAGCGATTAGGAGAGACATATACGGTGTGAAGGAAAGAGGC
CATGAATGTGGAGGTTGGGAAGGGGATTGGAATGGTTTGGCGACGAAAACGGCGGTGGAT
GCAGAGGAGCAGATGAGCCTAGAGACGGAGAGAGAATCCCTAGCTGAGGCTCTTTGTCTT
CTTTGTAACTTGCTCCTGGAAATGCAGATACCATCTATGGAATTTGGCGAGAGAGGAAAA
ATAGGTTACAGTGGCACATCCACAGACCACCGGAGACCCTCCTTTAGGGGATCAAGCTTA
TGATTTAAAACAGAATCACCGCCGCTAAAATTCATAATCCGATCCAAGCGATCACAAGAA
TGAGGTTATGACTCTCCCTCATGTGACTTCTTCAACACCATCATCTCTTCAATTGTATTT
CAGTTTCCCGTGTGTCGGAATACTTTTGATATAATTATATACTTCCATCAGAGTTGAGTT
CTC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 2

CO CL7306Contig1 621 2 2 U
TTTTTAAACAAATCACAGAAAATATATTTGAGTTCTTTCACAACAATTAGAATATTACAT
GAAATTTTACAATGATCTATATATCAAGAGATCGGATTTTAACAAAATTTACAAAATGTA
TTGACAAGGACCATGCATGCACGCTATAAACTATTGAACTTATGAAAGCTTGTATGAGGA
TAGACTAGATCTGATCCCTTTGATTTCATAGAGAATTATGGACGGTTTGAGATTCAAAGT
CCATCGTAGTAACCTCCAAAAGATATCTGAGCTCTCACGACAGGAACACCTTTCATTGCA
AGATTGCTTCATTAACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCATTCATCCTCTACAAGTAAA
TAATTAAATAAGTAAAACATTCTAATCAATAAGTTTGCTACGTGTTTCATTAAAAAAAAA
TAAGTTTGATACGTGTTATAGGTTTTAGGGATTATTGTTAGTATCTCTTTAATAAACGAA
GAAATTTTCTTCTTGAAAGTAAACTTTGACGTTTGGCACAAGCTATAAAGTTAGAAACAA
TCGGTTTACGAAACGTATAAAGCTACAAAGAAGAATCAGTCCTTTTCAACTACAGAGATC
GTTCACTTAAACACGTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DW76TF C 1
AF RR4DW76JQ U 21
BS 1 20 RR4DW76TF
BS 21 621 RR4DW76JQ

RD RR4DW76TF 621 0 0
TTTTTAAACAAATCACAGAAAATATATTTGAGTTCTTTCACAACAATTAGAATATTACAT
GAAATTTTACAATGATCTATATATCAAGAGATCGGATTTTAACAAAATTTACAAAATGTA
TTGACAAGGACCATGCATGCACGCTATAAACTATTGAACTTATGAAAGCTTGTATGAGGA
TAGACTAGATCTGATCCCTTTGATTTCATAGAGAATTATGGACGGTTTGAGATTCAAAGT
CCATCGTAGTAACCTCCAAAAGATATCTGAGCTCTCACGACAGGAACACCTTTCATTGCA
AGATTGCTTCATTAACCTTTGTTGCATGATTCACAGCTTCATTCATCCTCTACAAGTAAA
TAATTAAATAAGTAAAACATTCTAATCAATAAGTTTGCTACGTGTTTCATTAAAAAAAAA
TAAGTTTGATACGTGTTATAGGTTTTAGGGATTATTGTTAGTATCTCTTTAATAAACGAA
GAAATTTTCTTCTTGAAAGTAAACTTTGACGTTTGGCACAAGCTATAAAGTTAGAAACAA
TCGGTTTACGAAACGTATAAAGCTACAAAGAAGAATCAGTCCTTTTCAACTACAGAGATC
GTTCACTTAAACACGTAAGCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DW76JQ 601 0 0
AATATATTTGAGTTCTTTCACAACAATTAGAATATTACATGAAATTTTACAATGATCTAT
ATATCAAGAGATCGGATTTTAACAAAATTTACAAAATGTATTGACAAGGACCATGCATGC
ACGCTATAAACTATTGAACTTATGAAAGCTTGTATGAGGATAGACTAGATCTGATCCCTT
TGATTTCATAGAGAATTATGGACGGTTTGAGATTCAAAGTCCATCGTAGTAACCTCCAAA
AGATATCTGAGCTCTCACGACAGGAACACCTTTCATTGCAAGATTGCTTCATTAACCTTT
GTTGCATGATTCACAGCTTCATTCATCCTCTACAAGTAAATAATTAAATAAGTAAAACAT
TCTAATCAATAAGTTTGCTACGTGTTTCATTAAAAAAAAATAAGTTTGATACGTGTTATA
GGTTTTAGGGATTATTGTTAGTATCTCTTTAATAAACGAAGAAATTTTCTTCTTGAAAGT
AAACTTTGACGTTTGGCACAAGCTATAAAGTTAGAAACAATCGGTTTACGAAACGTATAA
AGCTACAAAGAAGAATCAGTCCTTTTCAACTACAGAGATCGTTCACTTAAACACGTAAGC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL7307Contig1 714 2 1 U
GGAAGCACTATTATCCAGATGCAGGACTGATCGTGTCGGATGAGGAACTCCAAGAATGGT
GGAGTGAAGTGAGGAACATAGGGCACGGAGACAAGAAAGACGAACCATGGTGGCCTGAGC
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ACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTACTTTCCCAACCGACCAA
CCACTACAAGGATAAAAACGCCAGTGGAAGAGCCGACAGCGGAAGAGCTTACAGAGTTCT
ATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCGACGCAAG
TGATGGTGACTCTGGATCTACTGTCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAG
AGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGCATATGAACGATTCAAAG
GCAGGCTCCAATATCTAGAAGGTGTGATAGATGAGAGGAACGTGAATGTTTCTCCAAAGA
ACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCATCTCTGAACCTGGTC
TTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAGAACATGTATTTACTT
GCTAAGTCATTTGAGTGTCAACAATAAGAAATAAAACAACCAGATCTTTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F389TF U 1
AF RR4F389JQ C 68
BS 1 714 RR4F389TF

RD RR4F389TF 714 0 0
GGAAGCACTATTATCCAGATGCAGGACTGATCGTGTCGGATGAGGAACTCCAAGAATGGT
GGAGTGAAGTGAGGAACATAGGGCACGGAGACAAGAAAGACGAACCATGGTGGCCTGAGC
TCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATTGCGTGGGTGGCTTCAGGTC
ACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTACTTTCCCAACCGACCAA
CCACTACAAGGATAAAAACGCCAGTGGAAGAGCCGACAGCGGAAGAGCTTACAGAGTTCT
ATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCGACGCAAG
TGATGGTGACTCTGGATCTACTGTCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAG
AGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGCATATGAACGATTCAAAG
GCAGGCTCCAATATCTAGAAGGTGTGATAGATGAGAGGAACGTGAATGTTTCTCCAAAGA
ACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCATCTCTGAACCTGGTC
TTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAGAACATGTATTTACTT
GCTAAGTCATTTGAGTGTCAACAATAAGAAATAAAACAACCAGATCTTTTGCTT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4F389JQ 647 0 0
AGTGAGGAACATAGGGCACGGAGACAAGAAAGACGAACCATGGTGGCCTGAGCTCAAAAC
ACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATTGCGTGGGTGGCTTCAGGTCACCATGC
AGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTACTTTCCCAACCGACCAACCACTAC
AAGGATAAAAACGCCAGTGGAAGAGCCGACAGCGGAAGAGCTTACAGAGTTCTATGAGGA
ACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCGACGCAAGTGATGGT
GACTCTGGATCTACTGTCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGA
AGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATTTTTGCTGCATATGAACGATTCAAAGGCAGGCT
CCAATATCTAGAAGGTGTGATAGATGAGAGGAACGTGAATGTTTCTCCAAAGAACAGAGC
TGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCATCTCTGAACCTGGTCTTACCGG
AATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAGAACATGTATTTACTTGCTAAGT
CATTTGAGTGTCAACAATAAGAAATAAAACAACCAGATCTTTTGCTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7308Contig1 509 2 1 U
TTTTTAGCTTAAGACATGAAAAGATCAGTTTTCTTCTTTTTGTTCTTCGCTGTCTCTCTT
CTGCTTCTTCTTGTGGCGGCTTCTGCAACCGCATCTTCAGGGAACGCCACAAGTGGGTTT
AGTTACGGGGGATGTGCTTCCGGAGAAACCGTTGGAGAATGCATAACGGCGGTGGTTGAA
GATGAGGAGGGAGTTGAGGCGGTGGTGAGGAGGATTCTGTAACAACAGAGGAGGAAACTA
AGCTACGCAGCTCTGCAGAAGCAGCCAACTTGTAATGGTAAGATCGCAGGTAACTGCATA
GGAACAGCTAACGGGGGAAACGCACCATGCACTTACTACAACAGATGCAAACGTGCCACT
TAGCTAACTTTTTGTTAGTTTTTTTCCCCTTTTATTTGTTGTATATGTTGTTTTGTTTCA
TCTCTTCTTAACTATGTGTTTTTTGTTATCTTCCTATTTTCCCTTGTTTGAGAGTTTAAT
ATTTACAATAAGATACATTGTATTTGGTC


BQ
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AF RR4FH87TF U 1
AF RR4FH87JQ C 46
BS 1 509 RR4FH87TF

RD RR4FH87TF 509 0 0
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CTGCTTCTTCTTGTGGCGGCTTCTGCAACCGCATCTTCAGGGAACGCCACAAGTGGGTTT
AGTTACGGGGGATGTGCTTCCGGAGAAACCGTTGGAGAATGCATAACGGCGGTGGTTGAA
GATGAGGAGGGAGTTGAGGCGGTGGTGAGGAGGATTCTGTAACAACAGAGGAGGAAACTA
AGCTACGCAGCTCTGCAGAAGCAGCCAACTTGTAATGGTAAGATCGCAGGTAACTGCATA
GGAACAGCTAACGGGGGAAACGCACCATGCACTTACTACAACAGATGCAAACGTGCCACT
TAGCTAACTTTTTGTTAGTTTTTTTCCCCTTTTATTTGTTGTATATGTTGTTTTGTTTCA
TCTCTTCTTAACTATGTGTTTTTTGTTATCTTCCTATTTTCCCTTGTTTGAGAGTTTAAT
ATTTACAATAAGATACATTGTATTTGGTC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR4FH87JQ 464 0 0
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GCCACAAGTGGGTTTAGTTACGGGGGATGTGCTTCCGGAGAAACCGTTGGAGAATGCATA
ACGGCGGTGGTTGAAGATGAGGAGGGAGTTGAGGCGGTGGTGAGGAGGATTCTGTAACAA
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GCAGGTAACTGCATAGGAACAGCTAACGGGGGAAACGCACCATGCACTTACTACAACAGA
TGCAAACGTGCCACTTAGCTAACTTTTTGTTAGTTTTTTTCCCCTTTTATTTGTTGTATA
TGTTGTTTTGTTTCATCTCTTCTTAACTATGTGTTTTTTGTTATCTTCCTATTTTCCCTT
GTTTGAGAGTTTAATATTTACAATAAGATACATTGTATTTGGTC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL7309Contig1 824 2 4 U
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CACTGCAACCCTATCTCTCACGGATTCTTCTATCTCTCACGATTCAAAGGGAATCGAAAA
CCTAAAACCAAAAGTCACAAGATCTACAAACAGGAGCTTGACTCGAATCAACCTCACCAT
TCAACCCTCTCACTCTCTCGGCCAAGCTTCGTCGACAACCCTTGACTCGAGTCAGATTCG
AGCCACAAACAGAGATGGCGGAGCAGCGCAAGGCGGAAGACGGCTGTCCTTCATTACCAG
AAGAGGAGAAGTGGCTTCGATGGTTCAGCTCGCCGGAGATGAATAATGAGGGAGCTCAGC
CTCTCTTTGCCATGAATATCGCCGGTCAAGCGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCC
CTCTCTCCGTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTTTGATTTTTGTTTTGATATTGGTACAGGAA
GGGGGATCGTGAGCTTGAGAAGGGGTGACAAGGCGGATCAGCGTCGAAGGCGGCGGCAGC
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GGGACTAAATTTGTGTAGTGCTTGTGGCAAGTGGGAGTTTCAATCCGCTTACGTTCATGC
ATTTACGCATGTTTCGTGAGTTATTACAAGAACAGCTCTAGATTTCAATGTATGTACTCT
GACCCACCTTGTCACTGAGTTTGACCAAGTGGTTTAAGACCCAAGATCAGCTATAAGACT
GCTAATGTGCTAGAAGAAGATAATCTTTCTTTGGTCCTTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F375TF U 1
AF RR4BU48TF U 135
BS 1 722 RR4F375TF
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BS 724 731 RR4F375TF
BS 732 824 RR4BU48TF

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CACTGCAACCCTATCTCTCACGGATTCTTCTATCTCTCACGATTCAAAGGGAATCGAAAA
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CTCTCTCCGTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTTTGATTTTTGTTTTGATATTGGTACAGGAA
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GGGACTAAATTTGTGTAGTGCTTGTGGCAAGTGGGAGTTTCAATCCGCTTACGTTCATGC
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GATCCACCTTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4BU48TF 690 0 0
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AATATCGCCGGTCAAGCGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCTCTCTCCGTTTCT
CCCTCTCTCTCTCTCTTTGATTTTTGTTTTGATATTGGTACAGGAAGGGGGATCGTGAGC
TTGAGAAGGGGTGACAAGGCGGATCAGCGTCGAAGGCGGCGGCAGCGAATCCCGTTGTAG
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GTAGTGCTTGTGGCAAGTGGGAGTTTCAATCCGCTTACGTTCATGCATTTACGCATGTTT
CGTGAGTTATTACAAGAACAGCTCTAGATTTCAATGTATGTACTCTGACCCACCTTGTCA
CTGAGTTTGACCAAGTGGTTTAAGACCCAAGATCAGCTATAAGACTGCTAATGTGCTAGA
AGAAGATAATCTTTCTTTGGTCCTTCAAGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

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TTTTTTTGGAACAACAACCAAACCCTAATCTTCACATATGTTCTAACATTTGTGAATGAA
AAAAACGAAAATATAAGATACCTATGTCAAAGTTTCATGTTTATTTTGCTGGTCCTAGGA
CAGAGGGCATAACGCTCATCAAGCAACCATCCACTGCTACTAAAATCACAAGATCAAGCA
CTCCATTGATTCACAGTCCGGAAAGACAAAAGCTTGTTTCAAACAGCCCGGTAACTTTAA
CCAGTTTGGTTAAGTTCATTCAAACTTCCTCTCGACAGGGCCGAGAGAGATCGTTATCCA
CATCCTCTTCCAAAGAGAGAATTATTCCATCAAACTCCCTCTTCACAAGAGGTGATCCTC
TACTATTATCATCCTCTCCTCTGGGAGAGAGAATCACTCTTCCATGTTCCCTCTACTATA
GAGGTGAGACGTATACTCTGTTCTTGCAAGTCTTGAAAAGCTCAGCCTTGGTTTTAACCT
TGCGTGTGTTTTATGACCATATTATGGTTTTGGGTCAAAAGAAAGTTGATTTCAACTCTA
TCTCCCTCCAAATCTCAACTTACGGAAGCTTTGGGGACTAGCTTTTGATTGTTTATGACT
TGGTGGTTGCTGGGGTTTTGTTTACTACTTGGAACCCATCGATAAAGAGTGCAGAACTTT
CTTAGATCATCGAGGATGCATGTTCATCCTTTTTTATTCAGCGACAGTCTCCTTTGTGGC
ATCGCTTTTTACTGCGGAAGCTTTGGCGTTGAGAAACGCCATGATCTCTACTCGTCAGTG
TGGGATTCCCGTGAATCTTTGGATGCATTTGAGCAGTGTCTCGTTTTCGCTGTCAATCTC
TTCGGAGAATCTATATGCTTTAACTTATGTTGTTCTTGATTTTCATTGTTGTAATCAAAG
AGAATGGATAATTCTCTGTAATTATTGTATGTTTGAAGTTTAAGTTAAAGAAATGAAAAG
TTGCAAGAAAAAAAAAAAGAAGAAACCTATGTCAACATCGGAGGTGCCAAGTTTCATATT
CACATGACAAAATGTTTAAGGAAGACGACACC


BQ
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AF RR4D076TF U 1
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BQ
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AF RR4DK95TF U 1
AF RR4DL08TF U 1
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BQ
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AF RR4EI50JQ C 1
AF RR4EI50TF U 1
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AGGAAACGGACGGCTCAGATGCGTGGAGACTGGTCACGAAGTTGTAGCCGGAGACGAAGA
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GCTTACTGGGGATACTGTGAACAAGAACGAGGAACATATCTGGAAACACGTGAATGGGAA
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AAAAAAGAAAGAAATGAAACCTTTATCCG

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DS 

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AGGAAACGGACGGCTCAGATGCGTGGAGACTGGTCACGAAGTTGTAGCCGGAGACGAAGA
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GAGATTTCTACAAAAATTAGAGCAAGTGGAAAGAGGAGCTGGAACAAGCGGTAAGACAGA
GGAAATACAAGTAACCAAACACAGACGCGTTAAGGAAGAAACTGACTCCGATGAATCAGA
TTTTTGGATGCTCAAGTCAAGTTCTGGTTCAGAGTCAGAGCATGAGAGTGATGAAGAAAA
CTGCAAAGGTTCTCGTTGTGATGCCAAAGAATCTGAGGAGCTCTCAGATAGAACAAAGAG
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TAATGAGTCATGTTAG**AAAGATTGTTGCGATAAGCAGATACAGTTT*GTTTATAAATA
AAAAA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

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CTACAATCTCCAATATGTCCCCTTTCTGTCGCAGCGTCAGTGCCCAATTGATAAGGGAGA
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TCTTCTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF47JQ U 85
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BS 1 84 RR4BF47TF
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BS 694 790 RR4BF47TF

RD RR4BF47JQ 609 0 0
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CTTCTTTGCTGTTGAAATCACCTTCCAGCAATGGATCTACAATCTCCAATATGTCCCCTT
TCTGTCGCAGCGTCAGTGCCCAATTGATAAGGGAGACTTGATCATCACTTCCCCTGTGTT
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CCATCCGGA

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DS 

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CTACAATCTCCAATATGTCCCCTTTCTGTCGCAGCGTCAGTGCCCAATTGATAAGGGAGA
CTTGATCATCACTTCCCCTGTGTTTAGTATTACTCTGTCCACTAACAATCTCCATTACCA
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GAGCCATATATCCCATGGTTCCGGCGACTTTGGTACTAATGTGACTGCGTTCTTCTTCAT
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TACTGGTTTTAATGTCACGGTGAACCATCCGGATCGTCGATCCTTCATGGAGGAACTCAA
GGCCTTTTGCGATTCCAACACATATTTTTCTTCTTGCTACCCAATCTAGTTTCAGGGACC
TCTTCTCGTC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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ATCGTCCTCTTTCACTCGAACACTTAAGTCTTTGGAAATGGCAACGGCGTCGCTTAACAT
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CGCCGGAAACTTCCCTAATCTCAAGAGGAAGTTTCCTGTAGGAGTGAGATGCATGGCTGA
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CTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAGAGAATAAATGGCCGTTTAGCGATGGTTGG
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AAAACTTTTGGTTATATAACATATGTATAATCATCTTAGCAAAAAAATATCATTTTTATA
ACAGTAAAAACGAAAAAACAAGTACATTGTCCATTTGCG


BQ
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE42TF U 1
AF RR4DE42JQ C 186
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BS 784 786 RR4DE42JQ
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BS 793 793 RR4DE42JQ
BS 794 798 RR4DE42TF
BS 799 799 RR4DE42JQ
BS 800 822 RR4DE42TF
BS 823 879 RR4DE42JQ

RD RR4DE42TF 822 0 0
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ATCGTCCTCTTTCACTCGAACACTTAAGTCTTTGGAAATGGCAACGGCGTCGCTTAACAT
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CTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAGAGAATAAATGGCCGTTTAGCGATGGTTGG
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CGACGGTGGAGTCTCGTGGTTCCTTGGCACGACAGCTATCTTGACACTTGCGTCGCTTGT
GCCACACTTCCAAGGCGTCACCGTTGAGTCGAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCAAACGC
TGAGCTTTGGAATGGGCGATTCGCAATGCTTGGTTTAGTCGCTTTGGCGTTCACTGAGTT
CGTCAAGGGTGGAACCCTCATCTGAG*AAATATAATTTTGGTTTGCCCCTGAATTCTGTA
A*GTAAAATCTGGCTTGCTCTTTATGTTCAGT*ATGTACTAGTGAGTTTGGGT*ATATGA
AAAC**TTTGGT*ATATA*CATATGTATAATCATCTTAGCAA

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4DE42JQ 694 0 0
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CGTCCCCACCACCACCTCCTCCTACTAAGCCTAAGGTGAGCACCAAGTTTAGCGACTTGC
TAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAGAGAATAAATGGCCGTTTAGCGATGGTTGGATTCG
TGGCTACGTTGGCAGTTGAACTTTCCAAAGGAGAAAATGTTTTCGCCCAGATCTCCGACG
GTGGAGTCTCGTGGTTCCTTGGCACGACAGCTATCTTGACACTTGCGTCGCTTGTGCCAC
ACTTCCAAGGCGTCACCGTTGAGTCGAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCAAACGCTGAGC
TTTGGAATGGGCGATTCGCAATGCTTGGTTTAGTCGCTTTGGCGTTCACTGAGTTCGTCA
AGGGTGGAACCCTCATCTGAGGAAATATAATTTTGGTTTGCCCCTGAATTCTGTAAAGTA
AAATCTGGCTTGCTCTTTATGTTCAGTTATGTACTAGTGAGTTTGGGTTATATGAAAAAC
TTTTGGTTATATAACATATGTATAATCATCTTAGCAAAAAAATATCATTTTTATAACAGT
AAAAACGAAAAAACAAGTACATTGTCCATTTGCG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7315Contig1 672 2 3 U
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GACTGCGTTTGGCCTAACTCCCATCCGCTCAAACTCATGGAAAAACTTAATAGCCTCGTC
CACTTTCCCTTCCCTGCTCAAACCTCCAACAAGAGAGGAATAAGTGATAGTGTCAGGCTT
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CTCTACCGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF46JQ U 75
AF RR4CF46TF C 1
BS 1 74 RR4CF46TF
BS 75 421 RR4CF46JQ
BS 422 672 RR4CF46TF

RD RR4CF46JQ 347 0 0
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QA 1 347 1 347
DS 

RD RR4CF46TF 672 0 0
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CACTTTCCCTTCCCTGCTCAAACCTCCAACAAGAGAGGAATAAGTGATAGTGTCAGGCTT
CAGATCTTTCGCACGCATCTCGTCCAGCAGTTTTATCGCCTTCCCTGTCTTCCCTGCTTT
CGCAAGCCCGTCGATAACAGTATTATAAGTGATCAACACAGGCGAACACCCCTTGCTACT
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CTCTACCGCCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7316Contig1 646 2 2 U
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TTTGCAACACCTAATCATATTATTACCAGAAACAGAATCTTCTCACCAAGGCAAAAAAAA
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AGCTTCATAATGATATCACATCCTCCAACCAACTCACCTTTATAGTAAAGCTGAGGAAAC
GTGGGCCAGTTCGAGAAACTCTTGATCCCTTGTCTCACCTCTTCATCACTCAATATATCA
AACGACCCGAAACTCACATCTTCTCCTCTCAGTGCCTTCACAACTTTGGAGCTAAACCCG
CACTTTGGTTCATCTGGTGAGCCTTTCATGAAAAGCATAACCTTCTCAGAGTTAATCAAT
GACTTCAACCTATCTTCAAGACTCTGTTTTCCAAGGATCCCTTTCTCAGACAAGACTTGT
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TCATCATCCAAGAGTATATCAAAACTTCCAAACTCGATCTTCTCTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DQ93TF C 1
AF RR4DQ93JQ U 4
BS 1 3 RR4DQ93TF
BS 4 646 RR4DQ93JQ

RD RR4DQ93TF 646 0 0
TTTCGAAAAAATGTTTCATCAATCATATAAATACCACACAAACCTTAAGTAACAACAATG
TTTGCAACACCTAATCATATTATTACCAGAAACAGAATCTTCTCACCAAGGCAAAAAAAA
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AGCTTCATAATGATATCACATCCTCCAACCAACTCACCTTTATAGTAAAGCTGAGGAAAC
GTGGGCCAGTTCGAGAAACTCTTGATCCCTTGTCTCACCTCTTCATCACTCAATATATCA
AACGACCCGAAACTCACATCTTCTCCTCTCAGTGCCTTCACAACTTTGGAGCTAAACCCG
CACTTTGGTTCATCTGGTGAGCCTTTCATGAAAAGCATAACCTTCTCAGAGTTAATCAAT
GACTTCAACCTATCTTCAAGACTCTGTTTTCCAAGGATCCCTTTCTCAGACAAGACTTGT
TTCAGCTCGCCGCTCTTCTGCATCTCCAAGACAATGTCTGATCCACCTAGAAGCTCGCCT
TTGACGTAAAGCTGAGGGTAGCTAGACCAGTTTGAGTACACTTTAAGCCCTTGACGAACT
TCATCATCCAAGAGTATATCAAAACTTCCAAACTCGATCTTCTCTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DQ93JQ 643 0 0
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GCAACACCTAATCATATTATTACCAGAAACAGAATCTTCTCACCAAGGCAAAAAAAAAGG
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TTCATAATGATATCACATCCTCCAACCAACTCACCTTTATAGTAAAGCTGAGGAAACGTG
GGCCAGTTCGAGAAACTCTTGATCCCTTGTCTCACCTCTTCATCACTCAATATATCAAAC
GACCCGAAACTCACATCTTCTCCTCTCAGTGCCTTCACAACTTTGGAGCTAAACCCGCAC
TTTGGTTCATCTGGTGAGCCTTTCATGAAAAGCATAACCTTCTCAGAGTTAATCAATGAC
TTCAACCTATCTTCAAGACTCTGTTTTCCAAGGATCCCTTTCTCAGACAAGACTTGTTTC
AGCTCGCCGCTCTTCTGCATCTCCAAGACAATGTCTGATCCACCTAGAAGCTCGCCTTTG
ACGTAAAGCTGAGGGTAGCTAGACCAGTTTGAGTACACTTTAAGCCCTTGACGAACTTCA
TCATCCAAGAGTATATCAAAACTTCCAAACTCGATCTTCTCTC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL7317Contig1 836 2 6 U
GAATTCGGTTCAATAGTGTGACTATATATCCATATTAGTCCACGGCAGTCAAATAACAAT
CATACAATCCAAGTTGCAAACCATTCAATACCTGATAAAGGTCTTAGCAAGCTTCATCCG
GACGGATTTGAATAGATATGTTCAATTTGTTTTCCATATTACAAAATAAAAACATTCTAA
TCAGTAACTACGTAATATTTCAAATTTTATTTTTAACTTCAATTATGTGTTATCGTTAGT
TAGTCTTGTGTAAAGTATTTTGAATCAATTATGTAACTTTTTTTTTTGTAACTAGCTAAT
GCAAAATAAATAAATACAGAAAATACAACCCGGTTTATAAAAATATTGGGCCCTTATACT
TTTTAAAGAGCCGAACAAATAAAATTATTTCGGGCCGAAACATCAGGCCCACGTGTTTAT
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TGTTCGTATAATACGAGATTGATCCGTACTGAGGTAAGAGAAAGAAGGACAGGCAGAGAG
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BQ
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AF RR4FB62TF U 1
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C

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AF RR4BQ42TF U 1
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20 

AF RR4AR44JQ C 1
AF RR4AR44TF U 1
BS 1 601 RR4AR44TF

RD RR4AR44JQ 601 0 0
GGATGTTCGGCTGTTGGCAATATTGGGATGGTAAACCAAGATATGGAAGCTGATGATGAG
CTTAAATCATGCTCTTGTTCCTTTTGCCTGAACGCTGCATATATCTGGTCAGATCTCCAC
TACCAGGATATCAAAGGTCGATTATCGGTAAGTGTTCTCATTACGGTCTAAAATTCATAG
TTGATTTATAATGGTAATTTCATGATGAGCTTGTGTTTGAGTGCAGTACTGAAGAAGAGC
CAGAAAGAAGCTAGTAGCTTGATTCGAGGGAATGGTAAAGGAAGGCCAACAACGGATGTT
TATGGATCTGAAAACTCCAATCACTCCACAAATGTAGAGTTTGATGTCATGGGTCAGTGG
ACATCTCTCTTTCTTAACATGGAGGGTATCCTGGCTCGTGAAAGCAGCCACCTTCGGGAT
AGCTTCATAACCATGAAAGAGTTGAGAGAAAATTGCAAGATTGATTTGGAGAGAGCGACG
AAAACACTTCAACAGAACAACAGTTAGATATTGTTGGTGTTTTTAAAATTACTGTTTGCA
CTTTGGAAGAGGCTCTGTAACCTTTGAAGCAACTCATGTATGTATCATAACTTCTAGTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR4AR44TF 601 0 0
GGATGTTCGGCTGTTGGCAATATTGGGATGGTAAACCAAGATATGGAAGCTGATGATGAG
CTTAAATCATGCTCTTGTTCCTTTTGCCTGAACGCTGCATATATCTGGTCAGATCTCCAC
TACCAGGATATCAAAGGTCGATTATCGGTAAGTGTTCTCATTACGGTCTAAAATTCATAG
TTGATTTATAATGGTAATTTCATGATGAGCTTGTGTTTGAGTGCAGTACTGAAGAAGAGC
CAGAAAGAAGCTAGTAGCTTGATTCGAGGGAATGGTAAAGGAAGGCCAACAACGGATGTT
TATGGATCTGAAAACTCCAATCACTCCACAAATGTAGAGTTTGATGTCATGGGTCAGTGG
ACATCTCTCTTTCTTAACATGGAGGGTATCCTGGCTCGTGAAAGCAGCCACCTTCGGGAT
AGCTTCATAACCATGAAAGAGTTGAGAGAAAATTGCAAGATTGATTTGGAGAGAGCGACG
AAAACACTTCAACAGAACAACAGTTAGATATTGTTGGTGTTTTTAAAATTACTGTTTGCA
CTTTGGAAGAGGCTCTGTAACCTTTGAAGCAACTCATGTATGTATCATAACTTCTAGTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL7320Contig1 848 2 2 U
CCGCAGGTTTTCTGATGGGAGCTACTGCAATCTGGGTGCTTTTCGAGTGGATCAACTTCC
ATTTTCCTATCTCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGCTTGGTATGATCGGTCAGTTCGTTTGG
TGCAATGCCTCAGGGTTCCTAAACCGGTAAATTCTTAAACCGCTCACAGTCTAGAGTGCC
TCGCCTTGTTCTTCAAAGGTTTCTTTGCTGATGTGGGTGTGACCATTGGCACAGAGGTTA
ACCGCGGTTTGTTGTTTCTTCAGGACTTGTCTTGTAGAGGGAACTTAAAACAGTCCCTCA
TGGCTGTGCTTGGACTGTGGGTAGCTGCAATAATAGGGAGCTGTTGCAACTTCCTAACTG
TTCTGTACATTGGTGAGTATGTAGTAAGTTTTTTGTTAGTGACTCTTTTAAAAAAAGATT
TGAGAGTTCAGTTTATAAAGAGATGATGTTTTTTGTTTTTTGAAGGGTTTGTGGGAGCTC
ACACAATGCCGGTAGTGTATGAGAGATATGAAGACGAAGTGGATGGTTTTGTGGACTCTC
TTCTAATGAAGTTTCATAGTCACTACAAGAAGATTGATTCTGGTTTTCTCAGTCGAATCC
CAAGTGGAAAGTTCGGGTTGAAGAAGCATGACTAAGATCAAACTATTTATCTCTCTGTCT
TTGATGTTTTTGTCTAGTGACTAAATCAACTTTCTTGTCTTTCTTTCATTGTCATGTTAA
TGTGTTCTTCTGTATTCGTTGAGACCTTTGAAAACAAAATCGACTGTCAAACAAGAAGAT
GAGATGACTCTTTTATGTATGGGATGGGATCCACCAATAGCCACATATTGGACACGTGGC
AGTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C483TF U 1
AF RR4C483JQ C 37
BS 1 299 RR4C483TF
BS 300 848 RR4C483JQ

RD RR4C483TF 299 0 0
CCGCAGGTTTTCTGATGGGAGCTACTGCAATCTGGGTGCTTTTCGAGTGGATCAACTTCC
ATTTTCCTATCTCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGCTTGGTATGATCGGTCAGTTCGTTTGG
TGCAATGCCTCAGGGTTCCTAAACCGGTAAATTCTTAAACCGCTCACAGTCTAGAGTGCC
TCGCCTTGTTCTTCAAAGGTTTCTTTGCTGATGTGGGTGTGACCATTGGCACAGAGGTTA
ACCGCGGTTTGTTGTTTCTTCAGGACTTGTCTTGTAGAGGGAACTTAAAACAGTCCCTC

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4C483JQ 812 0 0
GTGC
TTTCGAGTGGATCAACTTCCATTT*CCTATCTCTCGTTTGTTACGGTCTCTTGCTTGGTA
TGATCGGTCAGTTCGTTTGGTGCAATGCCTCAGGGTTCCTAAACCGGTAAATTCTTAAAC
CGCTCACAGTCTAGAGTGCCTCGCCTTGTTCTTCAAAGGTTTCTTTGCTGATGTGGGTGT
GACCATTGGCACAGAGGTTAACCGCGGTTTGTTGTTTCTTCAGGACTTGTCTTGTAGAGG
GAACTTAAAACAGTTCCTCATGGCTGTGCTTGGACTGTGGGTAGCTGCAATAATAGGGAG
CTGTTGCAACTTCCTAACTGTTCTGTACATTGGTGAGTATGTAGTAAGTTTTTTGTTAGT
GACTCTTTTAAAAAAAGATTTGAGAGTTCAGTTTATAAAGAGATGATGTTTTTTGTTTTT
TGAAGGGTTTGTGGGAGCTCACACAATGCCGGTAGTGTATGAGAGATATGAAGACGAAGT
GGATGGTTTTGTGGACTCTCTTCTAATGAAGTTTCATAGTCACTACAAGAAGATTGATTC
TGGTTTTCTCAGTCGAATCCCAAGTGGAAAGTTCGGGTTGAAGAAGCATGACTAAGATCA
AACTATTTATCTCTCTGTCTTTGATGTTTTTGTCTAGTGACTAAATCAACTTTCTTGTCT
TTCTTTCATTGTCATGTTAATGTGTTCTTCTGTATTCGTTGAGACCTTTGAAAACAAAAT
CGACTGTCAAACAAGAAGATGAGATGACTCTTTTATGTATGGGATGGGATCCACCAATAG
CCACATATTGGACACGTGGCAGTTTCCC

QA 5 812 5 812
DS 



AS 1 2

CO CL7321Contig1 806 2 2 U
GAAGCACGTTTTGATTTTATTACTGTTTTCCCACACTTAAACGTCTGTCTATTATACCAG
AGAAAAAACAAGAACAATCACTCACACTTTTAAATGAAACATAACAAACTGGCGAAACCT
AAGACATAGAAACTCCCAGTTCGGTCTTTGGACTGACAGTAAATCCGTAATTTACGTAGA
AAACAAAAAATCAATCAACCATAGTAAGGAGGATGACCAGAAGAAGGTGAAGCCCCTGTG
GGATCAGCTGATGGGTACATATATGGACTTCCACCATAACCTGCGTATTGAGTTTGCACC
TGCCCATTCTGCCAACCACCTGTTGTTGCCGCCGAAGCTTCAGCCACTCCGGGAACTTTT
TGGCCCACGAGTAGGCTCAGATCAGGTAGTGTGTAGTCTCTGCTTTTGTCGCTAAATGCC
TTTACATTGAGATCAGTATGACGAGAGTATGATAGTCGAAGCTTACAGTAGCCACCGTCA
TATATACAGTGTCCTTCCAGTGCTTCTTTCGCTATTGCCGCCGTTGCTATATCTACAGAG
TGTCATGAAGCAAACCATGACTGTCTGTATTCAATTACTTAGCATACCCATAAGCTAATT
TATAAAATACCGGAAACGTTCATAAAGGGGTTTGGATCAGATCACAATCAAATATCAAAG
CAGATCATCAAGGTCGTGTACCAGAGTATTGAATTAAGGCTTGTGTTGAACCATTCTTCT
CAAATATAGCAATCTTCTGGACAGTTCCATACGCGGAAAAGACCGTGTGAAGAACATCCA
CAGTGACAGCATACTGCATGTTCTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL61JQ U 1
AF RR4CY38JQ U 1
BS 1 643 RR4BL61JQ
BS 644 806 RR4CY38JQ

RD RR4BL61JQ 643 0 0
GAAGCACGTTTTGATTTTATTACTGTTTTCCCACACTTAAACGTCTGTCTATTATACCAG
AGAAAAAACAAGAACAATCACTCACACTTTTAAATGAAACATAACAAACTGGCGAAACCT
AAGACATAGAAACTCCCAGTTCGGTCTTTGGACTGACAGTAAATCCGTAATTTACGTAGA
AAACAAAAAATCAATCAACCATAGTAAGGAGGATGACCAGAAGAAGGTGAAGCCCCTGTG
GGATCAGCTGATGGGTACATATATGGACTTCCACCATAACCTGCGTATTGAGTTTGCACC
TGCCCATTCTGCCAACCACCTGTTGTTGCCGCCGAAGCTTCAGCCACTCCGGGAACTTTT
TGGCCCACGAGTAGGCTCAGATCAGGTAGTGTGTAGTCTCTGCTTTTGTCGCTAAATGCC
TTTACATTGAGATCAGTATGACGAGAGTATGATAGTCGAAGCTTACAGTAGCCACCGTCA
TATATACAGTGTCCTTCCAGTGCTTCTTTCGCTATTGCCGCCGTTGCTATATCTACAGAG
TGTCATGAAGCAAACCATGACTGTCTGTATTCAATTACTTAGCATACCCATAAGCTAATT
TATAAAATACCGGAAACGTTCATAAAGGGGTTTGGATCAGATC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4CY38JQ 806 0 0
GAAGCACGTTTTGATTTTATTACTGTTTTCCCACACTTAAACGTCTGTCTATTATACCAG
AGAAAAAACAAGAACAATCACTCACACTTTTAAATGAAACATAACAAACTGGCGAAACCT
AAGACATAGAAACTCCCAGTTCGGTCTTTGGACTGACAGTAAATCCGTAATTTACGTAGA
AAACAAAAAATCAATCAACCATAGTAAGGAGGATGACCAGAAGAAGGTGAAGCCCCTGTG
GGATCAGCTGATGGGTACATATATGGACTTCCACCATAACCTGCGTATTGAGTTTGCACC
TGCCCATTCTGCCAACCACCTGTTGTTGCCGCCGAAGCTTCAGCCACTCCGGGAACTTTT
TGGCCCACGAGTAGGCTCAGATCAGGTAGTGTGTAGTCTCTGCTTTTGTCGCTAAATGCC
TTTACATTGAGATCAGTATGACGAGAGTATGATAGTCGAAGCTTACAGTAGCCACCGTCA
TATATACAGTGTCCTTCCAGTGCTTCTTTCGCTATTGCCGCCGTTGCTATATCTACAGAG
TGTCATGAAGCAAACCATGACTGTCTGTATTCAATTACTTAGCATACCCATAAGCTAATT
TATAAAATACCGGAAACGTTCATAAAGGGGTTTGGATCAGATCACAATCAAATATCAAAG
CAGATCATCAAGGTCGTGTACCAGAGTATTGAATTAAGGCTTGTGTTGAACCATTCTTCT
CAAATATAGCAATCTTCTGGACAGTTCCATACGCGGAAAAGACCGTGTGAAGAACATCCA
CAGTGACAGCATACTGCATGTTCTCA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL7322Contig1 1040 2 2 U
GGTACAGATATGGGATGCGTCGCGTTGCAAGAGAACAAGAACAATGGAAGGTCATAGACT
AAGAGTTGGAGCACTGGCGTGGGGATCATCTGTTCTGTCATCTGGTAGTAGAGACAAGAG
TATTCTTCAGAGAGACATACGTTGTCAAGAGGATCATGTCAGTAAACTGGCAGGTCACAA
ATCAGAAGTATGCGGCCTCAAGTGGTCTTATGACAACAGAGAGCTAGCTTCTGGTGGAAA
CGACAATCGGCTTTTTGCATGGAACCAACATTCAACACAACCGGTTTTGAAATACAGTGA
ACACACAGCAGCGGTTAAAGCAATAGCTTGGTCACCTCATGTTCACGGGCTGCTTGCTTC
TGGTGGTGGGACTGCTGATAGATGCATACGGTTTTGGAATACAACGACGAATACTCATTT
AAGTTCCATAGATACTTGCAGTCAGGTATGCAATCTAGCTTGGTCTAAGAACGTAAACGA
GCTGGTTAGCACGCACGGATACTCCCAAAACCAAATCATAGTCTGGAAATACCCAACCAT
GTCCAAAATTGCAACTCTTACAGGTCACACGTACCGTGTTCTGTACCTAGCGGTCTCACC
AGATGGACAGACGATTGTAACCGGAGCAGGAGATGAAACCTTAAGGTTTTGGAACGTCTT
CCCATCCCCAAAATTTCAGAACACGGATAGTGAAATCGGATCCTCATTCTTTGGTAGAAC
AACAATTCGTTGAAAATTTCTTTCAGAACACACACAGAGACACAAAAGACAGATATACAT
GTTTCTTTTCATTATTACTTCAACAGCCGCAGCAGCAGCAGCCTTTAAGTTGGTTTTTTC
AACCAACATTTTTTACACACACGGAGTCGGAACAAAATTATATTTATCACACGGATGCAA
AGAAGATCTAACCCTTTGATACAAAATGGGTTCGTCAAGATGCACATCAAAATTTTCAAA
AAAGTGTATATCTTTATTTTTAATTCATACAAGAAGTTTTGTTGAACACATTTACCATTT
ATAAAATGAGGAGGTCCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EG40TF U 1
AF RR4EG40JQ C 284
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BS 626 1040 RR4EG40JQ

RD RR4EG40TF 625 0 0
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AAGAGTTGGAGCACTGGCGTGGGGATCATCTGTTCTGTCATCTGGTAGTAGAGACAAGAG
TATTCTTCAGAGAGACATACGTTGTCAAGAGGATCATGTCAGTAAACTGGCAGGTCACAA
ATCAGAAGTATGCGGCCTCAAGTGGTCTTATGACAACAGAGAGCTAGCTTCTGGTGGAAA
CGACAATCGGCTTTTTGCATGGAACCAACATTCAACACAACCGGTTTTGAAATACAGTGA
ACACACAGCAGCGGTTAAAGCAATAGCTTGGTCACCTCATGTTCACGGGCTGCTTGCTTC
TGGTGGTGGGACTGCTGATAGATGCATACGGTTTTGGAATACAACGACGAATACTCATTT
AAGTTCCATAGATACTTGCAGTCAGGTATGCAATCTAGCTTGGTCTAAGAACGTAAACGA
GCTGGTTAGCACGCACGGATACTCCCAAAACCAAATCATAGTCTGGAAATACCCAACCAT
GTCCAAAATTGCAACTCTTACAGGTCACACGTACCGTGTTCTGTACCTAGCGGTCTCACC
AGATGGACAGACGATTGTAACCGGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4EG40JQ 757 0 0
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ACGACGAATACTCATTTAAGTTCCATAGATACTTGCAGTCAGGTATGCAATCTAGCTTGG
TCTAAGAACGTAAACGAGCTGGTTAGCACGCACGGATACTCCCAAAACCAAATCATAGTC
TGGAAATACCCAACCATGTCCAAAATTGCAACTCTTACAGGTCACACGTACCGTGTTCTG
TACCTAGCGGTCTCACCAGATGGACAGACGATTGTAACCGGAGCAGGAGATGAAACCTTA
AGGTTTTGGAACGTCTTCCCATCCCCAAAATTTCAGAACACGGATAGTGAAATCGGATCC
TCATTCTTTGGTAGAACAACAATTCGTTGAAAATTTCTTTCAGAACACACACAGAGACAC
AAAAGACAGATATACATGTTTCTTTTCATTATTACTTCAACAGCCGCAGCAGCAGCAGCC
TTTAAGTTGGTTTTTTCAACCAACATTTTTTACACACACGGAGTCGGAACAAAATTATAT
TTATCACACGGATGCAAAGAAGATCTAACCCTTTGATACAAAATGGGTTCGTCAAGATGC
ACATCAAAATTTTCAAAAAAGTGTATATCTTTATTTTTAATTCATACAAGAAGTTTTGTT
GAACACATTTACCATTTATAAAATGAGGAGGTCCATT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL7323Contig1 671 2 6 U
GAGGGTGAAGAAGCTGCTGAGGAAGAAGCCTCCACAGAGCCCCAGAGTAAGAAAGCTAAG
ACAGGCAAGCAAACAAAGATGGGATCATCAGGGAAGAAGGGTGGGGGAGCTGGTTCCAGC
AAGTCTAAAGCTACTCCTGCTTCCAAGTCCGGCAAGAAGTCCCAGGATGACAAAACAGAG
AGCAAACCAAAGGATTCAAAGGCGGCTAAAGGCAAGGCCAAATCAACACCTGCTTCTAAG
AGCAAGGAGAGCGATGTGGAGTCAGAGTCGGAAGAGACGCCCAAGGCACCAGAACCAGCA
ACAAAAGGGAAATCAGTCGGTTCAGGCAAGTCGCAGGCAAGTCAGTCCAAGTCCGGTAAG
AAGAGGAAGCGATGAGTCTGGCTTCAAGATAGGGCTTTATGTAATTTACAGTGGAAAGCT
AAGCGCAACGGCGGTCGTAGTGGTTGGTGGTTGCCGTGGCCGTAGATTGGTGGGACTTGA
CGTCGTTTGGGCACTAGAAGTGTAGAATTGTTTTTATTTAAGACAAGAAGCGTAGTAATG
AGTGGCTTTTCACTTAGGCTTTGATTTCAGCTTATGTAGTAGCGTTAATGGGGGGATACA
TAAGATGGCTTTGGTTATTTTCATTATTCTTTTTCAAGTTACATACTTCCTGTCATCTTT
TCATTTTGGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI87TF U 1
AF RR4AA66JQ C 529
BS 1 590 RR4GI87TF
BS 591 591 RR4AA66JQ
BS 592 592 RR4GI87TF
BS 593 593 RR4AA66JQ
BS 594 634 RR4GI87TF
BS 635 671 RR4AA66JQ

RD RR4GI87TF 634 0 0
GAGGGTGAAGAAGCTGCTGAGGAAGAAGCCTCCACAGAGCCCCAGAGTAAGAAAGCTAAG
ACAGGCAAGCAAACAAAGATGGGATCATCAGGGAAGAAGGGTGGGGGAGCTGGTTCCAGC
AAGTCTAAAGCTACTCCTGCTTCCAAGTCCGGCAAGAAGTCCCAGGATGACAAAACAGAG
AGCAAACCAAAGGATTCAAAGGCGGCTAAAGGCAAGGCCAAATCAACACCTGCTTCTAAG
AGCAAGGAGAGCGATGTGGAGTCAGAGTCGGAAGAGACGCCCAAGGCACCAGAACCAGCA
ACAAAAGGGAAATCAGTCGGTTCAGGCAAGTCGCAGGCAAGTCAGTCCAAGTCCGGTAAG
AAGAGGAAGCGATGAGTCTGGCTTCAAGATAGGGCTTTATGTAATTTACAGTGGAAAGCT
AAGCGCAACGGCGGTCGTAGTGGTTGGTGGTTGCCGTGGCCGTAGATTGGTGGGACTTGA
CGTCGTTTGGGCACTAGAAGTGTAGAATTGTTTTTATTTAAGACAAGAAGCGTAGTAATG
AGTGGCTTTTCACTTAGGCTTTGATTTCAGCTTATGTAGTAGCGTTAATGTGTGGATACA
TAAGATGGCTTTGGTTATTTTCATTATTCTTTTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4AA66JQ 143 0 0
AGCGTAGTAATGAGTGGCTTTTCACTTAGGCTTTGATTTCAGCTTATGTAGTAGCGTTAA
TGGGGGGATACATAAGATGGCTTTGGTTATTTTCATTATTCTTTTTCAAGTTACATACTT
CCTGTCATCTTTTCATTTTGGAT

QA 1 143 1 143
DS 



AS 1 2

CO CL7324Contig1 1236 2 2 U
GGGAGAACCAAAGAAGAAGAAGGCCAATCATGTCTAGGCAAGTCGCAGCAAGGCTTCTGG
GATCTCTGTCTCGCCGTTGCTCAAGCACCAGCAACAGCAGCAGCTCTTAATTGTTTCCGA
CTCTCAGCTCATTGACTCAATCTCGCTCATTCGCGTCTGATCCTCCGCCTCCAGCTGCCG
TATTCGTTGACAAAAACACCAGAGTCATGTGTCAAGGCATCACCGGAAAGAACGGAACTT
TCCACACCGAGCAAGCCATTGAGTACGGCACCAAAATGGTGGCAGGAGTGACACCAAAGA
AGGGTGGAACAGAGCACTTAGGTCTCCCCGTGTTCAACTCTGTTGCTGAAGCCAAGGCTG
AGACCAAAGCCAATGCCTCTGTCATTTATGTTCCCGCGCCTTTCGCTGCTGCTGCTATTA
TGGAGGGTATACAAGCTGAGTTGGATCTTATCGTCTGCATTACTGAAGGAATCCCTCAAC
ATGACATGGTACGTGTAAAGCATGCACTCAACAGTCAATCAAAAACTAGGCTGATTGGTC
CAAACTGCCCTGGGATCATCAAGCCTGGTGAATGCAAGATTGGTATTATGCCGGGGTACA
TCCACAAGCCTGGCAAGATTGGGATTGTTTCTCGTTCTGGAACCTTGACTTATGAAGCTG
TTTTCCAAACAACTGCAGTTGGTCTAGGACAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTGGAGATC
TTTTAATGGGACCAACTTTGTCGACTGCTTGGAGAAATTTTTTGTTGATCCTCAAACAGA
AGGTATCGTTCTCATTGGAGAAATCGGAGGCACTGCAGAAGAAGATGCTGCAGCTTTGAT
AAAAGAAAGTGGTACTGATAAGCCTGTTGTTGCTTTCATTGCCGGACTCACTGCACCACC
GGGTCGTCGAATGGGTCATGCAGGAGCCATTGTTTCCGGTGGCAAAGGTACAGCTCAGGA
CAAGATTAAGAGCCTAAATGATGCAGGTGTGAAGGTTGTTGAATCTCCAGCTAAGATAGG
AGCGGCCATGTATGATCTCTTCAAAGAAAGAGGTCTTTTGAAGCAGTGAAGTGAATTTCA
CTTGCTCACTTTTTTTTTCCATCTTGAAACCTTTCAAGAAGTAAACAAAAAAAAGAAACG
TAAGCCCTCGCCATTGATGGGTTGCACACCATTTTAGGGTTGTTTTTCTAAATCTATTTT
GTTTTTGCAATTAAAGAGTGATAAATCAAAAGATTG


BQ
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AF RR4DN17TF U 1
AF RR4DN17JQ C 381
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TATTCGTTGACAAAAACACCAGAGTCATGTGTCAAGGCATCACCGGAAAGAACGGAACTT
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TGGAGGGTATACAAGCTGAGTTGGATCTTATCGTCTGCATTACTGAAGGAATCCCTCAAC
ATGACATGGTACGTGTAAAGCATGCACTCAACAGTCAATCAAAAACTAGGCTGATTGGTC
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TCCACAAGCCTGGCAAGATTGGGATTGTTTCTCGTTCTGGAACCTTGACTTATGAAGCTG
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ACATCTACTTGTGTA

QA 1 687 1 687
DS 

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CAAAAACTAGGCTGATTGGTCCAAACTGCCCTGGGATCATCAAGCCTGGTGAATGCAAGA
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TGAATCTCCAGCTAAGATAGGAGCGGCCATGTATGATCTCTTCAAAGAAAGAGGTCTTTT
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TTGTTTTTCTAAATCTATTTTGTTTTTGCAATTAAAGAGTGATAAATCAAAAGATTG

QA 20 856 20 856
DS 



AS 1 2

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GCCATGAGATCAAGCCCAAGACGAAAACCGACTCCAAAGGCCTTGAGTTTGAAACGCCCG
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BQ
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AF RR4CX22JQ C 1
AF RR4CX22TF U 1
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DS 

RD RR4CX22TF 597 0 0
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AATTCTTAGCCATTGCAGCAGAAGCTAATGTGCGCACGCAGGTACGCACAGATCAACCAT
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GCCATGAGATCAAGCCCAAGACGAAAACCGACTCCAAAGGCCTTGAGTTTGAAACGCCCG
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AGAAGATGACGACTGAAGATATTAATGGATTGAAGCTGTCAAATCGTTTTGCAGCCCTTG
ATCTCTAGATATCACCCGATTGTGCCATCTGTCTTAAGGCTTAGGGTTTTCAGCTTTGAG
TATAAATATATGAACCTTGTAAACATTGCAAATCATCAGAAATAAATGAAGTTCAGC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

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TCCCGTTGATAGCCTTGGGTATCTTTATCTGGACGTTTATAGAATACACTCTTCACCGCT
TCCTTTTCCACATCAAGACCAAGAGTTACTGGGGGAACACGGCACACTATCTTCTTCACG
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CGGTTTTATGCTTTCCCTTCTGGAACCTTGTGAAGCTTTTCGCAACACCTTCAACCACAC
CTGCCTTGTTTGGAGGCGGCATGCTTGGGTACGTGATGTACGATATTACTCACTACTACC
TTCACCATGCACAACCAACTAGAGCAGTGACCAAGAATCTCAAGAAATATCATTTGAACC
ATCACTTCACGATTCAAGACAAGGGATTTGGTATAACATCGTCGCTATGGGACATAGTGT
TTGGGACACTACCTACCACAAAAGCCCCTAAAAGAGAGCAGTAGTGTACTAAAGATGCAA
AACTAAAAGGATATTTGCGACACAGTTAAATTATTGATCATCCCTCATGGGTTTTGAGAT
GTTTGTCTGAGGTTTCATTTGGATCACAGTCTTTGTAAATCAATGTTACACGTCCTACTT
AATAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS46TF U 1
AF RR4AS46JQ C 116
BS 1 692 RR4AS46TF
BS 693 693 RR4AS46JQ
BS 694 721 RR4AS46TF
BS 722 846 RR4AS46JQ

RD RR4AS46TF 724 0 0
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CTTACGAGGAATGGGTTCACCAACCCACTGTGACAAAGGAAGGCCCTCGTTTTTTCCAGA
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CGGTTGCGGTATGGTGCATCTCCAAGTCAGTAACCATGGGCCTTTCACTTCTAGAAATCG
TCCCGTTGATAGCCTTGGGTATCTTTATCTGGACGTTTATAGAATACACTCTTCACCGCT
TCCTTTTCCACATCAAGACCAAGAGTTACTGGGGGAACACGGCACACTATCTTCTTCACG
GATGCCATCACAAACACCCAATGGACCACCTTCGACTCGTCTTTCCTCCTGCTGCAACAG
CGGTTTTATGCTTTCCCTTCTGGAACCTTGTGAAGCTTTTCGCAACACCTTCAACCACAC
CTGCCTTGTTTGGAGGCGGCATGCTTGGGTACGTGATGTACGATATTACTCACTACTACC
TTCACCATGCACAACCAACTAGAGCAGTGACCAAGAATCTCAAGAAATATCATTTGAACC
ATCACTTCACGATTCAAGACAAGGGATTTGGTATAACATCGTCGCTATGGGACATAGTGT
TTGGGACACTACCTACCACAAAAGCCCCTAAA*GAGAGCAGTAGTGTACTAAAGATGCAA
A
CTA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4AS46JQ 731 0 0
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GTTTCCGGTTGCGGTATGGTGCATCTCCAAGTCAGTAACCATGGGCCTTTCACTTCTAGA
AATCGTCCCGTTGATAGCCTTGGGTATCTTTATCTGGACGTTTATAGAATACACTCTTCA
CCGCTTCCTTTTCCACATCAAGACCAAGAGTTACTGGGGGAACACGGCACACTATCTTCT
TCACGGATGCCATCACAAACACCCAATGGACCACCTTCGACTCGTCTTTCCTCCTGCTGC
AACAGCGGTTTTATGCTTTCCCTTCTGGAACCTTGTGAAGCTTTTCGCAACACCTTCAAC
CACACCTGCCTTGTTTGGAGGCGGCATGCTTGGGTACGTGATGTACGATATTACTCACTA
CTACCTTCACCATGCACAACCAACTAGAGCAGTGACCAAGAATCTCAAGAAATATCATTT
GAACCATCACTTCAGGATTCAAGACAAGGGATTTGGTATAACATCGTCGCTATGGGACAT
AGTGTTTGGGACACTACCTACCACAAAAGCCCCTAAAAGAGAGCAGTAGTGTACTAAAGA
TGCAAAACTAAAAGGATATTTGCGACACAGTTAAATTATTGATCATCCCTCATGGGTTTT
GAGATGTTTGTCTGAGGTTTCATTTGGATCACAGTCTTTGTAAATCAATGTTACACGTCC
TACTTAATAGT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL7327Contig1 868 2 8 U
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CTGTAGCTATAGGGCTCTACGGTTACTGCTACTCAGGACATGCTGTTTTCCCCAATATTT
ATACTTCTATGGCTAAACCAACTCAATACCCAGCTGTTCTCTTGACATGCTTTGGTATTT
GTACTCTGATGTATGCCGGTGTTGCTGTTATGGGTTATACAATGTTTGGAGAAGCAACAG
AATCACAGTTTACTCTCAACTTGCCTCAAGATTTGGTTGCAACTAAGATTGCTGTGTGGA
CTACGGTGGTGAATCCATTTACCAAATATGCTTTGACCATATCTCCAGTAGCACTGAGTC
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CGTTGGTCTTCTCTACTCTGCTTGTCGGTCTTTCCATTCCCTTCTTTGGTCTCGTCATGT
CATTGATTGGATCCTTGCTGACAATGCTCGTCACGCTAATACTTCCACCAGCTTGTTTCT
TGAGCATCGTACAGGGAAAAGTTACCCGGACACAGATGCTGCTGTGTGTCTTAATCATCA
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TATTTTTTCTGAGGGATGGATGATGATGATCTGCTCATCTGCATGTTTAGACTGGTTTGA
AACAAATACGTTAATGATGTATTTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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AF RR4CB66TF U 1
AF RR4CB66JQ C 40
BS 1 743 RR4CB66TF
BS 744 744 RR4CB66JQ
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BS 796 837 RR4CB66TF
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RD RR4CB66TF 844 0 0
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AATCACAGTTTACTCTCAACTTGCCTCAAGATTTGGTTGCAACTAAGATTGCTGTGTGGA
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CATTGATTGGATCCTTGCTGACAATGCTCGTCACGCTAATACTTCCACCAGCTTGTTTCT
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TAGTAGGAGGCATATCTTCTGTTATTGGCTCATATTCAGCTCTCTCCAAGATCATTGAGA
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TCTTCTTGGGAACACCTTTTTTT*CATATAGCAAACTCATTCTTGCACACACAGCTTTTG
TATTTTT*CTGAGG*ATGGATGATGATGATCTGCTCATCTGCATGTTTAGACTGGTT
GAAAAAA

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4CB66JQ 829 0 0
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ATGCTGTTTTCCCCAATATTTATACTTCTATGGCTAAACCAACTCAATACCCAGCTGTTC
TCTTGACATGCTTTGGTATTTGTACTCTGATGTATGCCGGTGTTGCTGTTATGGGTTATA
CAATGTTTGGAGAAGCAACAGAATCACAGTTTACTCTCAACTTGCCTCAAGATTTGGTTG
CAACTAAGATTGCTGTGTGGACTACGGTGGTGAATCCATTTACCAAATATGCTTTGACCA
TATCTCCAGTAGCACTGAGTCTTGAGGAACTGATACCAGAAAGACATAACAAGTCACATT
ACGCCATTGCCATTAGAACTGCGTTGGTCTTCTCTACTCTGCTTGTCGGTCTTTCCATTC
CCTTCTTTGGTCTCGTCATGTCATTGATTGGATCCTTGCTGACAATGCTCGTCACGCTAA
TACTTCCACCAGCTTGTTTCTTGAGCATCGTACAGGGAAAAGTTACCCGGACACAGATGC
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TTCTTGCACACACAGCTTTTGTATTTTTTCTGAGGGATGGATGATGATGATCTGCTCATC
TGCATGTTTAGACTGGTTTGAAACAAATACGTTAATGATGTATTTGAGT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL7328Contig1 721 2 2 U
GGGACGACGCGCAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAGTCTTTGTAGTATCAT
ATATCATGAATCCAGGGTTTCGTTATCTCTCTCAACCCTAGATTATAGATTTCATCGATC
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CGACGACGACGTCGGAAGGGAATATGATATCAGCAGCAGCGTTTGTGGAAGGGGGAATCC
AAGAGGCTTGTGATGATGCTTGTAGCATCTGTCTCGAACCCTTCTGCGATTCCGATCCTT
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GGAGTTCACAGTGCCCTATGTGTTGGCAATCTATTAGTCTCAAAGACCCCACTGGTCAGG
AATTGCTTGAGGCTGTTGTACAGGAGAGGACTCTCCGCTTCAATCCGTCTAGAAACGCCA
ACATAGGAAGAGTTTCTGATTCTTCAAGAAAATAATAAGAAAGGTTATATGACCAAAAGG
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AAAAACTAAAATGAAAAAGAGTAAAGACTGTTGTTGTGCGTTGGTTCAGTGTGTTGTAAA
TTGACAGTTGTCGTTCACATTACTGTTCTCGACCAGTTCTACTTAATTGCCATTTGTTAT
G


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10 

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G

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DS 



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AF RR4G364TF U 1
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QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GS84JQ C 1
AF RR4GS84TF U 1
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TTCAAAAGACGG

QA 1 672 1 672
DS 

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TTCAAAAGACGG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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GGCCTAGACACTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AL95JQ C 1
AF RR4AL95TF U 1
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GGCCTAGACACTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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TTGAT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4AX17TF U 1
AF RR4AX17JQ C 1
BS 1 776 RR4AX17TF
BS 777 777 RR4AX17JQ
BS 778 797 RR4AX17TF
BS 798 845 RR4AX17JQ

RD RR4AX17TF 797 0 0
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GGACTGGGGGAATCCTGATGGTATACTATGCGCATTAGAGACAACACCGATCCTAAACAA
GTCCATGGTGTTCAACGTTGGGACGAAGTACAGGCTGTTTTCGGAGATAGGAACGGACTA
CAGACTGTTTTCATCTGTTGAAAACGTCACGCAGTCTATGAAAGTTCCTATACGTTTCCT
CAACATCACTGGGTTGTCTGAGTATCGTAAAGATGCACATACTTCAGTTTACACGATCAA
GCAAGGTAAACTGCTGACGCAGGAACAGCAAAATGATCCAGCCACTTATGCGGACTGTAT
CCACTGGTGCTTGCCTGGCCTGCCTGATACTTGGAATGAGATTCTTTATACATATATCAT
CTCAAAATCGTCATGACCCAATGGAACCTCTCATCCTTTTTTTGTTGTTTTATCAA*TTC
TTGTGATGTATTTTTTT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4AX17JQ 845 0 0
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AAGAAAGCATAGTATAATCGATCGTATAATAATGCCAGAGTCCATTGAGAAGCATGGAGT
CAACTGGAAAGACGTTGACTTTCTTGTCTTCAATAGTTACATCTGGTGGATGAACACTGT
CTCCATCAAAGTCTTACGAGGATCGTTCGATGAAGGTGACACAGAGTATGATGAGATCAG
ACGGCCAATAGCGTATGAGAGAGTGTTGAGGACATGGGGAGATTGGGTGGACCACCACAT
TGATCCTTTACGTACAACTGTTTTCTTCATGAGCATGTCTCCACTACACATTAGGAGTTC
GGACTGGGGGAATCCTGATGGTATACTATGCGCATTAGAGACAACACCGATCCTAAACAA
GTCCATGGTGTTCAACGTTGGGACGAAGTACAGGCTGTTTTCGGAGATAGGAACGGACTA
CAGACTGTTTTCATCTGTTGAAAACGTCACGCAGTCTATGAAAGTTCCTATACGTTTCCT
CAACATCACTGGGTTGTTTGAGTATCGTAAAGATGCACATACTTCAGTTTACACGATCAA
GCAAGGTAAACTGCTGACGCAGGAACAGCAAAATGATCCAGCCACTTATGCGGACTGTAT
CCACTGGTGCTTGCCTGGCCTGCCTGATACTTGGAATGAGATTCTTTATACATATATCAT
CTCAAAATCGTCATGACCCAATGGAACCTTTCATCCTTTTTTTGTTGTTTTATCAAATTC
TTGTGATGTATTTTTTTTTTGGATCAAATTCTTGTGATGTATATAAAGGGACATCATGTT
TTGAT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL7333Contig1 757 2 2 U
GGGTGTATCTTAAACCTAAAATCAAATCTCAGAACACAAGTCGCCTCTTTCTCTCTGATC
ACATCTCTATCTTTAAAAGAGAGATCGAGAGAGCGATTTCTGGCACATCGGAATTTCTTC
CGACCATAGCCGGACTGTTTTGTTTTATATTTCGATCCATGATCGATTTTATGTTGTGAT
TTTCAATTTTCCATAAGTTCAAGTTTATATTTCTTTCATCGGTTGAAATTGATTAAATAA
AGTTTCAGTCTTTTTCTTTCTTGACTAAAGTTTCAGTCTTTTGGAATGGGTTTTGTTTGT
AATATATTTCTCTCGGTTAAAACTAATTTTCAATTCCGATCTTAGATTAGATTTAATGGC
ATCTCACCGGTTTCAATTGATTTTATTCCTTTACTTTTCTTGGTGAATCTCTTCTGTTTC
TAGGGAGTGATATCAGCAACATCCCTTTGCTGTCAGTACTGAGTGTGGTGGTCTTAATAT
CCTCGCGGTGGTTTTTTCTGATGAGGGTTGTGCTTCTCAAGCAGTTGAGCATAACCGATG
AAGAGGAGGATTTAAGCGACGAAGGTGAAACGGCCGGAGTTTTAGGTCAAGATTCAGATG
CATGAGATTTGAACGGTGGTGATCGTCAGAGTCGAAGACTGTTCGAAGCGATGGGTGACA
TGTCCAACTTGCTTCCTCACATTGTGTTTTCGTTTTGGGCCTTGGTCCAATTGTGGTATA
ATTGACCCAACACATTAATAAAACTTCTATTGCCGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF87TF U 1
AF RR4DF87JQ C 52
BS 1 718 RR4DF87TF
BS 719 757 RR4DF87JQ

RD RR4DF87TF 718 0 0
GGGTGTATCTTAAACCTAAAATCAAATCTCAGAACACAAGTCGCCTCTTTCTCTCTGATC
ACATCTCTATCTTTAAAAGAGAGATCGAGAGAGCGATTTCTGGCACATCGGAATTTCTTC
CGACCATAGCCGGACTGTTTTGTTTTATATTTCGATCCATGATCGATTTTATGTTGTGAT
TTTCAATTTTCCATAAGTTCAAGTTTATATTTCTTTCATCGGTTGAAATTGATTAAATAA
AGTTTCAGTCTTTTTCTTTCTTGACTAAAGTTTCAGTCTTTTGGAATGGGTTTTGTTTGT
AATATATTTCTCTCGGTTAAAACTAATTTTCAATTCCGATCTTAGATTAGATTTAATGGC
ATCTCACCGGTTTCAATTGATTTTATTCCTTTACTTTTCTTGGTGAATCTCTTCTGTTTC
TAGGGAGTGATATCAGCAACATCCCTTTGCTGTCAGTACTGAGTGTGGTGGTCTTAATAT
CCTCGCGGTGGTTTTTTCTGATGAGGGTTGTGCTTCTCAAGCAGTTGAGCATAACCGATG
AAGAGGAGGATTTAAGCGACGAAGGTGAAACGGCCGGAGTTTTAGGTCAAGATTCAGATG
CATGAGATTTGAACGGTGGTGATCGTCAGAGTCGAAGACTGTTCGAAGCGATGGGTGACA
TGTCCAACTTGCTTCCTCACATTGTGTTTTCGTTTTGGGCCTTGGTCCAATTGTGGTA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4DF87JQ 706 0 0
TCTCTGATCACATCTCTATCTTTAAAAGAGAGATCGAGAGAGCGATTTCTGGCACATCGG
AATTTCTTCCGACCATAGCCGGACTGTTTTGTTTTATATTTCGATCCATGATCGATTTTA
TGTTGTGATTTTCAATTTTCCATAAGTTCAAGTTTATATTTCTTTCATCGGTTGAAATTG
ATTAAATAAAGTTTCAGTCTTTTTCTTTCTTGACTAAAGTTTCAGTCTTTTGGAATGGGT
TTTGTTTGTAATATATTTCTCTCGGTTAAAACTAATTTTCAATTCCGATCTTAGATTAGA
TTTAATGGCATCTCACCGGTTTCAATTGATTTTATTCCTTTACTTTTCTTGGTGAATCTC
TTCTGTTTCTAGGGAGTGATATCAGCAACATCCCTTTGCTGTCAGTACTGAGTGTGGTGG
TCTTAATATCCTCGCGGTGGTTTTTTCTGATGAGGGTTGTGCTTCTCAAGCAGTTGAGCA
TAACCGATGAAGAGGAGGATTTAAGCGACGAAGGTGAAACGGCCGGAGTTTTAGGTCAAG
ATTCAGATGCATGAGATTTGAACGGTGGTGATCGTCAGAGTCGAAGACTGTTCGAAGCGA
TGGGTGACATGTCCAACTTGCTTCCTCACATTGTGTTTTCGTTTTGGGCCTTGGTCCAAT
TGTGGTATAATTGACCCAACACATTAATAAAACTTCTATTGCCGGT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7334Contig1 780 2 1 U
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GGACGTGTAGCTCGGCCTTTCTCAAGTGACGCGGTGGTGGAGTCAGATTACAAGAGGGGC
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TCACCAGCAAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAAT
TTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGCTGGACTTCTACAGGTGACCCT
TATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGACTCCGAGGAGGCTGCTAAGTCTTTT
GCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGGAGCCCAAAACACCTTTATTGAAGGCT
AAGTCTTACTCTGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCACTA
CATTATCTTCGTCCATCTCTCGGCCAAAAGGAGACACTTCGCTTTGAAGGCTCTCATTTT
TATTCGTTATTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCACTGAACTATATCCATGGTTGGATTTTA
CTTTTATTTTTTTCCTATTTTCCCTTATTACTACTACACAATAATATGATGATGATGATG
ATGACAAACACACCTCCTTGGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGATCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AI74JQ C 1
AF RR4AI74TF U 1
BS 1 780 RR4AI74TF

RD RR4AI74JQ 780 0 0
GGGAGGAGACAGGACAAGCTTATAAGCTCCAGAGAGATATTTCCCAGATTTCCAAATTTC
TACGTGACGATGGCGCTTCGTGCTACTACTCAAGCGACTGCTCGCATCGCGACGAATCTG
GGACGTGTAGCTCGGCCTTTCTCAAGTGACGCGGTGGTGGAGTCAGATTACAAGAGGGGC
GAGATCGGTAAAGTCTCCGGAATCCCAGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATAC
TCACCAGCAAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAAT
TTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGCTGGACTTCTACAGGTGACCCT
TATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGACTCCGAGGAGGCTGCTAAGTCTTTT
GCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGGAGCCCAAAACACCTTTATTGAAGGCT
AAGTCTTACTCTGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCACTA
CATTATCTTCGTCCATCTCTCGGCCAAAAGGAGACACTTCGCTTTGAAGGCTCTCATTTT
TATTCGTTATTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCACTGAACTATATCCATGGTTGGATTTTA
CTTTTATTTTTTTCCTATTTTCCCTTATTACTACTACACAATAATATGATGATGATGATG
ATGACAAACACACCTCCTTGGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGATCT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AI74TF 780 0 0
GGGAGGAGACAGGACAAGCTTATAAGCTCCAGAGAGATATTTCCCAGATTTCCAAATTTC
TACGTGACGATGGCGCTTCGTGCTACTACTCAAGCGACTGCTCGCATCGCGACGAATCTG
GGACGTGTAGCTCGGCCTTTCTCAAGTGACGCGGTGGTGGAGTCAGATTACAAGAGGGGC
GAGATCGGTAAAGTCTCCGGAATCCCAGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATAC
TCACCAGCAAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAAT
TTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGCTGGACTTCTACAGGTGACCCT
TATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGACTCCGAGGAGGCTGCTAAGTCTTTT
GCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGGAGCCCAAAACACCTTTATTGAAGGCT
AAGTCTTACTCTGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCACTA
CATTATCTTCGTCCATCTCTCGGCCAAAAGGAGACACTTCGCTTTGAAGGCTCTCATTTT
TATTCGTTATTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCACTGAACTATATCCATGGTTGGATTTTA
CTTTTATTTTTTTCCTATTTTCCCTTATTACTACTACACAATAATATGATGATGATGATG
ATGACAAACACACCTCCTTGGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGATCT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL7335Contig1 746 2 2 U
GGAAGGTTGTGACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGTAGAATAAAAGAAAAATTCTG
CGCTGTTATTCTAAATTTATCTAATCAAGTTAAAATAGTTTTTTGTTATTTTTTTACTTT
AAAATATGCTAAAAATGGAGTAATATATCACTCCATTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATTC
TCATTTTCACTTTTTCCGATTTCAAGTTTTTTCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAA
GCTTAAAAGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGTGGAGGCGACGAGAAAGGAGGCCTAA
CCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATATCTCAGTTTTGAGGTTCAA
TGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTACAGTTTGGATCAGTCTGTTATTGTGGTTT
CAAATACAAGAGAGAGAAAGATTTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAA
AACTCAAAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCAGATCCATAACCCGTTAGGATT
AAATCTGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTAGGGTTGGGCATA
AGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTGATTTGCCTTGTACGAATAATAC
ATTTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAAAAATGAGTATGTGTTATTTCGAGTACTTTAT
CAAAAATGAATTACTTGAAAGTTATT


BQ
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ATTTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTA

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GAAAGTTATT

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AF RR4FG54JQ C 1
AF RR4FG54TF U 1
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QA 1 597 1 597
DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A011TFB U 1
AF RR4A011TF U 1
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DS 

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AATCATATGGTTGACCAAGCTATATTTTCTCTGTTCTTGAAATATTCACACATGAAAAGT
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AAACTCGTTCAGCGCTTCTAATTCCCGCGTTCTTGTCGAATTCGTCTGAAGGAACAACGT
CCGCGATAATCTTCTCTTGACCACGCCAAAGAATCTGGTATAAAAAGGTTTCGAACTTTT
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GACTAATAGTCAAAGAATCAAATTAGACAGTCCACTGGAAATTTGAATCACCCAAAAAAA
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AACTAGCC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

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AAGTGTCCACGTGGATTCTGTTTT


BQ
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AF RR4DY68TF U 1
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TGAGTTCAAGAACATGATGCGCACCGTGAAACAAATTTCATGAACAAATTTCTCATCTTC
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AAGTGTCCACGTG

QA 1 733 1 733
DS 

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TTATCTATGTAATACTATCAAGTTTCAGATAGATTTATCTATGTAATGATTTTTAATAAA
GTGTCCACGTGGATTCTGTTTT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

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TGTTGATGCTACTTGTGTTATATAAAAAATCGTTAATTAT


BQ
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AF RR4F087JQ C 1
AF RR4F087TF U 1
BS 1 676 RR4F087TF
BS 677 700 RR4F087JQ

RD RR4F087JQ 700 0 0
GGATCCATATCATTAAAAACTAAGACAAGTATATATATAAGAAAAATGAACGGGTACGGC
CGAAAGGATCGCAGAAACAGCAGCTACATGAGCTCTGATGACTCAGACTCAGACTGCGAG
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CCGTTTGAAATAGCAACAAAGATGGTGGTGAACCCATTATTCAATTTTCTCTTTTCTCCT
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AGGATGCAGCACAATGGCTCGCATGGGAAAAAGTACCAAGACAGGTTTATGGCTCCCCAG
GTTCCACCAAATTGTGACAGTGTGAATCCCAGCCATGGCAATGGCCGTGCAGTAGTGCAG
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AATAAGTTGCATATATGTGTGCCAAGAAACTCTTTCAGTATATCGTACCATAATCAGACA
TGGGGCTTTTACAAAAAAAAGTGTTCTTGTTTGATGAACTTAATTATGATTACTAAGTAG
TGTTGATGCTACTTGTGTTATATAAAAAATCGTTAATTAT

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DS 

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GCTCAGCCTGACCACATGGTTTCGAGGTTCGTAGGTAATGTGGCAGAGACGGTGGTGCAG
CCGTTTGAAATAGCAACAAAGATGGTGGTGAACCCATTATTCAATTTTCTCTTTTCTCCT
CCCAAGCATGAAAAGAAGACTAAGCATGGGCGGCATGAAGATGCATACTATGGCGGGCAC
AGGATGCAGCACAATGGCTCGCATGGGAAAAAGTACCAAGACAGGTTTATGGCTCCCCAG
GTTCCACCAAATTGTGACAGTGTGAATCCCAGCCATGGCAATGGCCGTGCAGTAGTGCAG
GCCAGTAACATCTGCCAGGGCCAATACTAGGGCGGATGAGTGAAAGGACGACTCTGACTG
CAGCCAAATACCTTACCGGTTTCAGTTCTTAAAAAAGTAATGATTGTGTCCCGAATAATA
AATAAGTTGCATATATGTGTGCCAAGAAACTCTTTCAGTATATCGTACCATAATCAGACA
TGGGGCTTTTACAAAAAAAAGTGTTCTTGTTTGATGAACTTAATTATGATTACTAAGTAG
TGTTGATGCTACTTGT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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AGCATTCCCGCCAAGATCCTTCAACTATCTCCCGCGTTCACTACTCAAGCGTTCATCTGT
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TGTCGTAGAAGGTCTTGACCGCAGCGGCAAATCAACGCAGTGCGCAAAGCTACGCTCTTT
CCTGGAGAGTTCAGGTCATCCGACAGAACTCTGGAGGTTTCCCGACAGAGAGACAAGTGT
CGGTCAGATGATATCCGCCTACTTATCCAACAAGTCTCAGTTAGATGATCACACCATTCA
CCTCCTCTTCAGCGCCAACCGTTGGGAGAAGAGGTCGTTGATGGAGGAGAAGCTTAAGAC
GGGAACTACGCTTATCGTTGATCGTTACTCGTATTCTGGTGTGGCTTTCTCATCGGCTAA
AGGGCTCGGGATCGAGTGGTGCAAGGCGCCGGAAGTCGGGTTGCTGGCTCCGGATTCTGT
GGTTTACCTTGACATTTCACCTGAGAGAGCTGCTGAGAGAGGTGGGTATGGAGATGAGAG
GTACGAGCGAGTTGATTTTCAGAGGAAAGTCGCTGGCTTTTATCAAACTCTACGTGATTC
TTCCCGGAAGATTATCGATGCGGGGGAGAGTATGGAGGAAGTAGAGAAGAAGATTCAACA
GGTGGTGTTAGATAAAGTTCAAGAGTGTGCTCATGGAAAGTCTCTTTCTCTCCTCTGGTC
ATCTTGATGATTTTTTTAACAAATCCAAGTCTTGTAGAATGTTTGTGTCATGGTGTTGAT
TATACCAACTTTGTGTGATTTTGAAAGACTACTATTATATCAACTTAATACGTATTTTGC
ATAATTGATTCCATTGAGGGAGATTATATCACAAAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A774TF U 1
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BS 1 813 RR4A774TF
BS 814 997 RR4A774JQ

RD RR4A774TF 813 0 0
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TTCCCGGAAGATTATCGATGCGGGGGAGAGTATGGAGGAAGTAGAGAAGAAGATTCAACA
GGTGGTGTTAGATAAAGTTCAAGAGTGTGCTCA

QA 1 813 1 813
DS 

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TCAGTTAGATGATCACACCATTCACCTCCTCTTCAGCGCCAACCGTTGGGAGAAGAGGTC
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TGGTGTGGCTTTCTCATCGGCTAAAGGGCTCGGGATCGAGTGGTGCAAGGCGCCGGAAGT
CGGGTTGCTGGCTCCGGATTCTGTGGTTTACCTTGACATTTCACCTGAGAGAGCTGCTGA
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CTTTTATCAAACTCTACGTGATTCTTCCCGGAAGATTATCGATGCGGGGGAGAGTATGGA
GGAAGTAGAGAAGAAGATTCAACAGGTGGTGTTAGATAAAGTTCAAGAGTGTGCTCATGG
AAAGTCTCTTTCTCTCCTCTGGTCATCTTGATGATTTTTTTAACAAATCCAAGTCTTGTA
GAATGTTTGTGTCATGGTGTTGATTATACCAACTTTGTGTGATTTTGAAAGACTACTATT
ATATCAACTTAATACGTATTTTGCATAATTGATTCCATTGAGGGAGATTATATCACAAAA
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

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AAAGAGATTGATGATTCGATTGATAGGATTGTAGCTGGGATGGAAGGAACTGTCATGACA
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TTGACTCCAGGGCATGATGCTGTTCAAAAGGTCACGTTGATATCAAGAGGACAAGCGAGA
GGTTTGACTTGGTTCATTCCCTCAGATGATCCAACTCTAATCTCAAAACAGCAACTGTTT
GCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCTGCTGAAGAAGTTATCTTTGGTGACTCT
GAGGTGACAACTGGCGCAGTTGGTGATTTGCAACAGATCCCCGGTTTGGCTAAGCAGATG
GTGACAACATTTGGGATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGCTAATGGACTCGTCAGCTCAA
AGCGATGTCATAATGAGGATGATGGCAAGAAACTCCATGTCTGAGAAGCTTGCAAATGAC
ATCGATTCAGCGGTGAAGGCCCTATCAGACAAAGCATACGAGATAGCGCTGGCACACATA
AGGAACAACCGTGAAGCCATGGACAAGATTGTTGAAGTACTACTCGAGAAAGAGACGATG
TCAGGAGATGAGTTCCGAGCAATCCTATCAGAATTTACAGAAATTCCACCTGAGAACCGT
GTTGCTTCTTCCTCATCGTCAACATCAACACCAACACCAGCTTCTGTTTGAGTAAAAGAG
ACCTTGTGTATATCCTAAAGATACTACTTCCCATACTGTGTGACAAGTATGTTTAGTTTG
GAGTATATAGACGAACTCAGTTATATATATAAAAGGAAAGTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW70TF U 1
AF RR4FW70JQ C 173
BS 1 673 RR4FW70TF
BS 674 674 RR4FW70JQ
BS 675 681 RR4FW70TF
BS 682 682 RR4FW70JQ
BS 683 741 RR4FW70TF
BS 742 886 RR4FW70JQ

RD RR4FW70TF 746 0 0
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AAAGAGATTGATGATTCGATTGATAGGATTGTAGCTGGGATGGAAGGAACTGTCATGACA
GATGGGAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATGAAGTTGGACATGCCGTCTGTGGAACA
TTGACTCCAGGGCATGATGCTGTTCAAAAGGTCACGTTGATATCAAGAGGACAAGCGAGA
GGTTTGACTTGGTTCATTCCCTCAGATGATCCAACTCTAATCTCAAAACAGCAACTGTTT
GCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCTGCTGAAGAAGTTATCTTTGGTGACTCT
GAGGTGACAACTGGCGCAGTTGGTGATTTGCAACAGATCCCCGGTTTGGCTAAGCAGATG
GTGACAACATTTGGGATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGCTAATGGACTCGTCAGCTCAA
AGCGATGTCATAATGAGGATGATGGCAAGAAACTCCATGTCTGAGAAGCTTGCAAATGAC
ATCGATTCAGCGGTGAAGGCCCTATCAGACAAAGCATACGAGATAGCGCTGGCACACATA
AGGAACAACCGTGAAGCCATGGACAAGATTGTTGAAGTACTACTCGAGAAAGAGACGATG
TCAGGAGATGAGT*CCGAGCA*TCCTATCAGAATTTACAGAAATTCCACCTGAGAACCGT
GTTGCTTCTTCCTCATCGTCA
CATCA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4FW70JQ 714 0 0
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AAGCGAGAGGTTTGACTTGGTTCATTCCCTCAGATGATCCAACTCTAATCTCAAAACAGC
AACTGTTTGCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCTGCTGAAGAAGTTATCTTTG
GTGACTCTGAGGTGACAACTGGCGCAGTTGGTGATTTGCAACAGATCCCCGGTTTGGCTA
AGCAGATGGTGACAACATTTGGGATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGCTAATGGACTCGT
CAGCTCAAAGCGATGTCATAATGAGGATGATGGCAAGAAACTCCATGTCTGAGAAGCTTG
CAAATGACATCGATTCAGCGGTGAAGGCCCTATCAGACAAAGCATACGAGATAGCGCTGG
CACACATAAGGAACAACCGTGAAGCCATGGACAAGATTGTTGAAGTACTACTCGAGAAAG
AGACGATGTCAGGAGATGAGTTCCGAGCAATCCTATCAGAATTTACAGAAATTCCACCTG
AGAACCGTGTTGCTTCTTCCTCATCGTCAACATCAACACCAACACCAGCTTCTGTTTGAG
TAAAAGAGACCTTGTGTATATCCTAAAGATACTACTTCCCATACTGTGTGACAAGTATGT
TTAGTTTGGAGTATATAGACGAACTCAGTTATATATATAAAAGGAAAGTTTACC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL7342Contig1 772 2 9 U
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TTCAAATCCGATTACAAAAGCCCAACTTTTTTTACAGTGGACTTTTCCTCTGCAGCACAC
GAAAAGGTGTTCGTTTTTCAAGTTTCAATCTGTGCAAACAAGAGAAGTCTCAAGAATCTT
GTACTGCAAGAGAGGCCGCCATAAAGTGGATATTATCTTTGGCCATCGAGTGTGTTAGTA
CTGAAAGTAGTATGGCTGATATGAGTCCAATAACCGATGTCTCAACAGATGGAGACAGAG
ATCTTGGGTCTGAGGGAGCACTAGTGAACACTGCTGCTTCTGATTCTAGTGAACGATCCA
AGAACAAGTTGGATCAAAAGACCGTTCGTAGGCTTGCTCAAAACCGTGAGGCAGCTAGGA
AAAGCAGACTGAGGAAGAAGGCGTATGTTCAGCAGCTTGAGAACAGCCGCTTGAAGCTTA
CACAGCTTGAGCAGGAGCTGCAAAGAGCAAGACAGCAGGGTGTCTTCACTTCAAGCACAG
GAGACCAAGCCCATTCTACTGGTGGAAATGGGGGCGTTGGCGTTTGATGCTGAATACTCA
CGGTGGCTGGAAGAAAAGAACAAGAGAATGAACGAGCTGAGGTCTGCACTAAATGCGCAT
GCAGGTGATGGTGAGCTTCGAATAATAGTAGACGTGTGATGGCTCACTACGAGAGCTTTT
CAGATAAAAAGCACGCAGCTAAGACGATGTCTTCACTTGCTATACGGTATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E193TF U 1
AF RR4E087TF U 1
BS 1 573 RR4E087TF
BS 574 574 RR4E193TF
BS 575 602 RR4E087TF
BS 603 603 RR4E193TF
BS 604 641 RR4E087TF
BS 642 642 RR4E193TF
BS 643 664 RR4E087TF
BS 665 665 RR4E193TF
BS 666 772 RR4E087TF

RD RR4E193TF 690 0 0
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GAAAAGGTGTTCGTTTTTCAAGTTTCAATCTGTGCAAACAAGAGAAGTCTCAAGAATCTT
GTACTGCAAGAGAGGCCGCCATAAAGTGGATATTATCTTTGGCCATCGAGTGTGTTAGTA
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CGGTGGCTGGAAGAAAAGAACAAGAGAATGAACGAGCTGAGGTCTGCACTAAATGCGCAT
GCAGGTGATGGTGAGCTTCGAATAATAGTA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4E087TF 772 0 0
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TTCAAATCCGATTACAAAAGCCCAACTTTTTTTACAGTGGACTTTTCCTCTGCAGCACAC
GAAAAGGTGTTCGTTTTTCAAGTTTCAATCTGTGCAAACAAGAGAAGTCTCAAGAATCTT
GTACTGCAAGAGAGGCCGCCATAAAGTGGATATTATCTTTGGCCATCGAGTGTGTTAGTA
CTGAAAGTAGTATGGCTGATATGAGTCCAATAACCGATGTCTCAACAGATGGAGACAGAG
ATCTTGGGTCTGAGGGAGCACTAGTGAACACTGCTGCTTCTGATTCTAGTGAACGATCCA
AGAACAAGTTGGATCAAAAGACCGTTCGTAGGCTTGCTCAAAACCGTGAGGCAGCTAGGA
AAAGCAGACTGAGGAAGAAGGCGTATGTTCAGCAGCTTGAGAACAGCCGCTTGAAGCTTA
CACAGCTTGAGCAGGAGCTGCAAAGAGCAAGACAGCAGGGTGTCTTCACTTCAAGCACAG
GAGACCAAGCCCATTCTACTGGTGGAAATGGGG*CGTTGGCGTTTGATGCTGAATACTCA
CG*TGGCTGGAAGAAAAGAACAAGAGAATGAACGAGCTGAG*TCTGCACTAAATGCGCAT
GCAG*TGATGGTGAGCTTCGAATAATAGTAGACGTGTGATGGCTCACTACGAGAGCTTTT
CAGATAAAAAGCACGCAGCTAAGACGATGTCTTCACTTGCTATACGGTATGT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7343Contig1 675 2 1 U
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AGGACCAACCTTGATCCTTTAGGTGTTTACTCCGACGATGATATATGGAAGGCTCTCGAG
AAGTGTCAGCTTAAGGCAACGATTAGCAATCTACCTAATAAACTTGATTCTTCAGTGAGT
GATGAAGGAGAGAACTGGAGCGTGGGACAGAGGCAGCTGTTCTGTCTTGGAAGAGTATTG
CTGAAGAGAAGCAAAATATTGGTGCTGGACGAAGCTACGGCTTCCATTGATTCAGCCACT
GATGCAATCATCCAGAGAATCATAAGAGAGGAGTTCGCAGATTGCACGGTGGTAACCGTT
GCACATAGAGTACCAACGGTCATAGATAGTGACATGGTCATGGTGCTCTCCTTTGGTGAT
CTGGTGGAGTATAACGAGCCTTCAAAGCTGATGGAGACTGATTCTTACTTCTCCAAGCTC
GTTGCTGAGTATTGGGCAAGTTGCAGAGGAAACTCTTCTCAGAATCTACAAGTTCACATC
TAAACTATATCGTTTAAGTCTATGGAAAGAAAGATCATTTCATAAAACCCATCAAGGAAA
ATGATTCATAATTAAGTTTTTTTCCGATGTAGTTCTCCAAACTCTCTGATTGAATCAGAT
ATTACCGTTTCACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4GC56TF U 1
AF RR4GL23TF U 1
BS 1 675 RR4GC56TF

RD RR4GC56TF 675 0 0
GACCTGAGGATGAAACTGAGCATCATTCCTCAAGAGCCAACTCTTTTCCGTGGCTGCATA
AGGACCAACCTTGATCCTTTAGGTGTTTACTCCGACGATGATATATGGAAGGCTCTCGAG
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GATGAAGGAGAGAACTGGAGCGTGGGACAGAGGCAGCTGTTCTGTCTTGGAAGAGTATTG
CTGAAGAGAAGCAAAATATTGGTGCTGGACGAAGCTACGGCTTCCATTGATTCAGCCACT
GATGCAATCATCCAGAGAATCATAAGAGAGGAGTTCGCAGATTGCACGGTGGTAACCGTT
GCACATAGAGTACCAACGGTCATAGATAGTGACATGGTCATGGTGCTCTCCTTTGGTGAT
CTGGTGGAGTATAACGAGCCTTCAAAGCTGATGGAGACTGATTCTTACTTCTCCAAGCTC
GTTGCTGAGTATTGGGCAAGTTGCAGAGGAAACTCTTCTCAGAATCTACAAGTTCACATC
TAAACTATATCGTTTAAGTCTATGGAAAGAAAGATCATTTCATAAAACCCATCAAGGAAA
ATGATTCATAATTAAGTTTTTTTCCGATGTAGTTCTCCAAACTCTCTGATTGAATCAGAT
ATTACCGTTTCACCG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4GL23TF 672 0 0
GACCTGAGGATGAAACTGAGCATCATTCCTCAAGAGCCAACTCTTTTCCGTGGCTGCATA
AGGACCAACCTTGATCCTTTAGGTGTTTACTCCGACGATGATATATGGAAGGCTCTCGAG
AAGTGTCAGCTTAAGGCAACGATTAGCAATCTACCTAATAAACTTGATTCTTCAGTGAGT
GATGAAGGAGAGAACTGGAGCGTGGGACAGAGGCAGCTGTTCTGTCTTGGAAGAGTATTG
CTGAAGAGAAGCAAAATATTGGTGCTGGACGAAGCTACGGCTTCCATTGATTCAGCCACT
GATGCAATCATCCAGAGAATCATAAGAGAGGAGTTCGCAGATTGCACGGTGGTAACCGTT
GCACATAGAGTACCAACGGTCATAGATAGTGACATGGTCATGGTGCTCTCCTTTGGTGAT
CTGGTGGAGTATAACGAGCCTTCAAAGCTGATGGAGACTGATTCTTACTTCTCCAAGCTC
GTTGCTGAGTATTGGGCAAGTTGCAGAGGAAACTCTTCTCAGAATCTACAAGTTCACATC
TAAACTATATCGTTTAAGTCTATGGAAAGAAAGATCATTTCATAAAACCCATCAAGGAAA
ATGATTCATAATTAAGTTTTTTTCCGATGTAGTTCTCCAAACTCTCTGATTGAATCAGAT
ATTACCGTTTCA

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7344Contig1 761 2 2 U
GGTCGATCCTCTCTTCACAAACTAATTAAGAATTATCATCTTCATTGATTCTCCTCCAGA
GTACATTCCTCTTTCCCAGAGGACAATCATATTCACACAAAACAACTTAACAAACCTTTC
TTCCTCGAGCCTTACCGCAGAAACTGAACATAAGCAATGGCGAACGCGGCGTCGGGGATA
GCAGTGGAGGACAACTGCAAACTGAAGTTTATGGAACTAAAGAAAAGAACCTATCGGTTC
ATAATATTCAGGATAGATGGGCAGCAAGTGGTGGTTGAAAAGTTAGGCAACCCGCAGGAG
ACTTACGACGATTTCACCAATTCCCTCCCTGCCGACGAGTGCCGCTATGCGGTTTTCGAT
TTAGATTTTACCACCAATGAAAACTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCATCGCCTGGTCA
CCGGATTCATCTAGAGTGAGGATGAAGATGGTGTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAG
AGATCATTGGATGGAATTCAGGTTGAGTTACAAGCCACTGATCCTAGCGAAATGAGCTTT
GACATCGTCAAAAGCCGAGCTCTCTAGACATTTTCCTTGTATTCATCAAGCCCTTTATAT
ATCATCTTTCGTATTTTCTGATATTAAAAACAAAATCAAAACACTTTCCATGTTATGTAA
TTTTCTTGGTTAAGATCTGAATTCTTCAATGTCGTCTCTACTCTTTTTTTTCACTTCCCT
TTTGTAAACATATTCCTATGAAATGTTAAAAACATGTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H685TF U 1
AF RR4H685JQB C 122
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BS 707 761 RR4H685JQB

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TCATCTTTCGTATTTTCTGATATTAAAAACAAAATCAAAACACTTTCCATGTTATGTAAT
TTTCTTGGTTAAGATCTGAATTCTTCAATGTCGTCTCTACTCTTTTTTTTCACTTCCCTT
TTGTAAACATATTCCTATGAAATGTTAAAAACATGTTTCC

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G431JQ U 44
AF RR4G431TF C 1
BS 1 43 RR4G431TF
BS 44 639 RR4G431JQ
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QA 1 729 1 729
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4AT44TF U 1
AF RR4AT44JQ C 201
BS 1 850 RR4AT44TF
BS 851 851 RR4AT44JQ
BS 852 886 RR4AT44TF
BS 887 1068 RR4AT44JQ

RD RR4AT44TF 886 0 0
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CGAAAACACAACGAACCGTCAAGTCACTTTCTGCAAACGTAGAAATGGTTTGCTCAAGAA
AGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATCGTCTTCTCTAGCCG
TGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTCAAAGGCACAATTGAGAGGTACAAGAA
GGCTATATCGGATAATTCTAACACTGGATCGGTGGCAGAAATTAATGCACAGTATTATCA
ACAAGAATCGGCCAAGTTGCGTCAACAGATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGCAATT
AATGGGTGAGACGATAGGGTCAATGTCTCCCAAGGAACTTAAAAATTTGGAAGGCAGATT
AGACAAAAGTGTCAACCGAATACGATCCAAAAAGAATGAACTCTTATTCGCCGAAATTGA
CTACATGAAGAAGAAAGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCAAAGAT
AGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATCCTACCAAGTATGAATCTGATGCCAGGAGT
ATCTAACTACGAGCAGATTATGCGACCACCTCAAACGCACTCTCAGCCGTTTGATTCACG
GAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATAAACATTACTCATCCGCTGGTCG
CCAAGACCAA*CAGCTCTTCAGTTAGTGTAATATGGGCTGAAGCAT

QA 1 886 1 886
DS 

RD RR4AT44JQ 868 0 0
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TTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATCGTCTTCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACT
CAAACAACAGTGTCAAAGGCACAATTGAGAGGTACAAGAAGGCTATATCGGATAATTCTA
ACACTGGATCGGTGGCAGAAATTAATGCACAGTATTATCAACAAGAATCGGCCAAGTTGC
GTCAACAGATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGCAATTAATGGGTGAGACGATAGGGT
CAATGTCTCCCAAGGAACTTAAAAATTTGGAAGGCAGATTAGACAAAAGTGTCAACCGAA
TACGATCCAAAAAGAATGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGAAGAAGAAAGAAG
TTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCAAAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACA
ATCCAAGTATCCTACCAAGTATGAATCTGATGCCAGGAGTATCTAACTACGAGCAGATTA
TGCGACCACCTCAAACGCACTTTCAGCCGTTTGATTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGG
CATTGCAACCTAACAATAAACATTACTCATCCGCTGGTCGCCAAGACCAAACAGCTCTTC
AGTTAGTGTAATATTGGCTGAAGCATGAAGGGATGATGAGTGAATAAGAACCAGGTGTGG
TCAAGGAATAAGGAAGATGAAGCTAATCTAATGTTATATAAAAAGTGTGCCAAATTTATA
TTTTTTTCCACAATATTTGTGTCAATGATTTCTATACTTACTTAAATATCTTATGTTAAT
GAGAAAATAATATGCTTAAAGACGTCAT

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 2

CO CL7347Contig1 715 2 2 U
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TTGTTGTTGTCTGCTGCTGATCTTGCCTACTGCAAGGAGATTCTGGTTGGAGGCAAACCC
AGTGCTTGGAAAATCCCTTCTTCACCCTCTGATTCACTCAACAAATGGGCTGAGAGTTTG
CGGTTTCATGTTGGAGACTCTCTCGTATGGAGGTACGATGGGGAAAAGGACTCGGTTCTG
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TTCGTTGGCTTGGCAATTCTTTTGCTCTGAGTTTCTCTGTTATATAGATTCTTTTATCTG
TGAGATTGTTTTAAAAATTCTTTTAGCTCTTCTGAATGAAATCAGTTACTAAACC


BQ
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AF RR4H061TF U 1
AF RR4H061JQ C 71
BS 1 670 RR4H061TF
BS 671 715 RR4H061JQ

RD RR4H061TF 670 0 0
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TAACTCTTAATGGCTCAGAGAACTCTTGTTGAATCTTGCTGTCCGTTATTCTCCTTCCTC
TTGTTGTTGTCTGCTGCTGATCTTGCCTACTGCAAGGAGATTCTGGTTGGAGGCAAACCC
AGTGCTTGGAAAATCCCTTCTTCACCCTCTGATTCACTCAACAAATGGGCTGAGAGTTTG
CGGTTTCATGTTGGAGACTCTCTCGTATGGAGGTACGATGGGGAAAAGGACTCGGTTCTG
CAAGTGACGAAAGAGGCGTACATTAACTGCAACACCACAAATCCAGTAGCTAGTTACAGC
AGTGGAGACACTAAGGTGAAGCTAGAGAGATCTGGACCTTTCTTCTTCATCAGCGGCTCT
AAAAGCAACTGTGTCCAAGGCGAGAAGCTTCACATTGTTGTCATGTCATCTCGTGGTGGT
GGTTTCTTCACTGGCTCTGCTCCTTCTCCGGCACCTTCTTCTGCTCTTTTGGAAGCTCAA
GCTGTTCCTCCTGCAACTGGTTCCGCTTCTTATTTGACCAGTCGAGTTGGGGTTTTGGGA
TTCGTTGGCTTGGCAATTCTTTTGCTCTGAGTTTCTCTGTTATATAGATTCTTTTATCTG
TGAGATTGTT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4H061JQ 645 0 0
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TTGGAGACTCTCTCGTATGGAGGTACGATGGGGAAAAGGACTCGGTTCTGCAAGTGACGA
AAGAGGCGTACATTAACTGCAACACCACAAATCCAGTAGCTAGTTACAGCAGTGGAGACA
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GTGTCCAAGGCGAGAAGCTTCACATTGTTGTCATGTCATCTCGTGGTGGTGGTTTCTTCA
CTGGCTCTGCTCCTTTTCCGGCACCTTCTTCTGCTCTTTTGGAAGCTCAAGCTGTTCCTC
CTGCAACTGGTTCCGCTTCTTATTTGACCAGTCGAGTTGGGGTTTTGGGATTCGTTGGCT
TGGCAATTCTTTTGCTCTGAGTTTCTCTGTTATATAGATTCTTTTATCTGTGAGATTGTT
TTAAAAATTCTTTTAGCTCTTCTGAATGAAATCAGTTACTAAACC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7348Contig1 1056 2 6 U
GGACCGGTTGATCGCCAAAAGTGAAACCGACGGAGAAAAATAAAAGAAAAACATTTGCCG
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CTTCCCGACGGACGTCAAGGTTTACGCATCCATGACTGGGAGATCGAAACCATCCGCGGC
ACGATTCTCACTTCTCTCGCTCACTAACAGTGGGAAGAGAAGCTTAAGACCTCTCACTTA
CCTGAAATGGTGTTTGGAGAGAATGCGTTGGTTCTTAAACACTTGAGGAGCGACACTAAG
ATTCATTTCAACGCGTTTGATGCACTTGCTGGTTGGAAGCAAGAAGGGCTTCCTCCTGTT
GAAGTTCCTGCTGCAGCACAATGGAAGTTCAGGAGCAAGCCGTCCCAGCAGGTGATACTG
GATTATGATTACACCTTTACTACGCCGTACTGTGGGAGTGGAGTTGTTGAGAAAGACCAA
GAAACGGTTGAGGGGGATGCTAGTCTTAAGTGGGAGAACTGTGAAGAGCAGATTGATTTG
GCTGCTCTCTCACTTAAAGAACCTATTCTCTTCTATGATGAGGTAGTTTTGTATGAAGAT
GAACTGGCTGACAATGGAGTGTCACTTCTGACTGTGAAAGTGAGAGTCATGCCAAGTTCA
TGGTTTCTCCTCTTACGATTTTGGCTTAGAGTTGATGGTGTACTTTATGAGGTTGAGAGA
GACGAGAATGCATTATATCTTTGGCAAAGGGGAGACACCCACAGTTCTTCGTGAAAGCTG
TTGGAGGGAAACAACATTTAAGTCTCTATCTGCGAAAGGGTATCCAGTTGATTTAGCATT
CTATAGCGACCCAGGTCCCATCAGTCAGAGGCTTCCGGTGATTAAGCAGATAACACAGAA
ACTGAAGATTCCTCGTAAAGTGTGAGCAGCTAAAAAGAAAACACTTTCTCAATTATTCTA
TCGAGTTTGTCGTTGTAAGGAGTTACTTAGCTGATTCATGGATTTCATTTTAACGTGAAC
ACTCGAACCCTTTCATGTTATACTATCTTTTTCCCT


BQ
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AF RR4BF77TF U 1
AF RR4BF77JQ C 258
BS 1 751 RR4BF77TF
BS 752 752 RR4BF77JQ
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BS 792 850 RR4BF77TF
BS 851 1056 RR4BF77JQ

RD RR4BF77TF 850 0 0
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CTTCCCGACGGACGTCAAGGTTTACGCATCCATGACTGGGAGATCGAAACCATCCGCGGC
ACGATTCTCACTTCTCTCGCTCACTAACAGTGGGAAGAGAAGCTTAAGACCTCTCACTTA
CCTGAAATGGTGTTTGGAGAGAATGCGTTGGTTCTTAAACACTTGAGGAGCGACACTAAG
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GAAGTTCCTGCTGCAGCACAATGGAAGTTCAGGAGCAAGCCGTCCCAGCAGGTGATACTG
GATTATGATTACACCTTTACTACGCCGTACTGTGGGAGTGGAGTTGTTGAGAAAGACCAA
GAAACGGTTGAGGGGGATGCTAGTCTTAAGTGGGAGAACTGTGAAGAGCAGATTGATTTG
GCTGCTCTCTCACTTAAAGAACCTATTCTCTTCTATGATGAGGTAGTTTTGTATGAAGAT
GAACTGGCTGACAATGGAGTGTCACTTCTGACTGTGAAAGTGAGAGTCATGCCAAGTTCA
TGGTTTCTCCTCTTACGATTTTGGCTTAGAGTTGATGGTGTACTTTATGAGGTTGAGAGA
GACGAGAATGCATTATATCTTTGGCAAAGGG*AGACACCCACAGTTCTTCGTGAAAGCTG
TTGGAGGGAA*CAACATTTAAGTCTCTATCTGCGAAAGGGTATCCAGTTGATTTAGCATT
CTATAGCGAC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4BF77JQ 799 0 0
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TGATGCACTTGCTGGTTGGAAGCAAGAAGGGCTTCCTCCTGTTGAAGTTCCTGCTGCAGC
ACAATGGAAGTTCAGGAGCAAGCCGTCCCAGCAGGTGATACTGGATTATGATTACACCTT
TACTACGCCGTACTGTGGGAGTGGAGTTGTTGAGAAAGACCAAGAAACGGTTGAGGGGGA
TGCTAGTCTTAAGTGGGAGAACTGTGAAGAGCAGATTGATTTGGCTGCTCTCTCACTTAA
AGAACCTATTCTCTTCTATGATGAGGTAGTTTTGTATGAAGATGAACTGGCTGACAATGG
AGTGTCACTTCTGACTGTGAAAGTGAGAGTCATGCCAAGTTCATGGTTTCTCCTCTTACG
ATTTTGGCTTAGAGTTGATGGTGTACTT*ATGAGGTTGAGAGAGACGAGAATGCATTATA
TCTTTGGCAAAGGGGAGACACCCACAGTTCTTCGTGAAAGCTGTTGGAGGGAAACAACAT
TTAAGTCTCTATCTGCGAAAGGGTATCCAGTTGATTTAGCATTCTATAGCGACCCAGGTC
CCATCAGTCAGAGGCTTCCGGTGATTAAGCAGATAACACAGAAACTGAAGATTCCTCGTA
AAGTGTGAGCAGCTAAAAAGAAAACACTTTCTCAATTATTCTATCGAGTTTGTCGTTGTA
AGGAGTTACTTAGCTGATTCATGGATTTCATTTTAACGTGAACACTCGAACCCTTTCATG
TTATACTATCTTTTTCCCT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL7349Contig1 867 2 4 U
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AAATTCAAATTCCCAGGAAAAACTCTGCGCGCTCATCTGATCCTGCAACGAAGAGACTCA
TCAAGGATCCTGAGATGAAGAATCGGAAGGTTACGGAGAAGAGACAGAGCGCGACGTTCT
CCTACGTGTCAGTGGAAAGCACGAAGGATCCGCCGGTGGAATCCACTCCGATCTCTCAGA
TTTCCGGCGCGATCTCCGATTCCGAAGCTGAGAGTTTTGTGCAAGGATCGAGCGTAGACC
TGTTATTATCAACGCCAGAGATTTCTCTTCCGGCTGATGAGTCTCCAGTTTCGACGGTTG
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AATCTGAAGAAAGCAACTGGATCGATGGAGCTCTTACTCGCAAATCCCACCGCATTGTGC
TGTTGATTTGTATCCTTTGGGCTGTCTTAGCTGCGATCGTGGTCTCCGTCAGGTCAGGGG
AGAAGATTGCTTACTATGGACCACTTCCAACTTGAAGGATTCAATTCAAACCACTTCACA
TGGATGTAAGGACTTGGCTACTATCACACTGAGAAACAAGGGACCAAAAACTCAACTACT
TATCTAGAAGTTAAGCATAGTGTTTTCGTAAATTTCTCTAATGAATTGTTTAGTCGATAT
TAAAATTACCAAAAACATATAATTACTGATTTACTATCGGAAATTATCCGTGATCTCATC
AATTATCCATCTTATATTAGTTACATC


BQ
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AF RR4AX04TF U 1
AF RR4AX04JQ C 23
BS 1 592 RR4AX04TF
BS 593 593 RR4AX04JQ
BS 594 623 RR4AX04TF
BS 624 867 RR4AX04JQ

RD RR4AX04TF 623 0 0
GGAGTTGCGAAAAATTTAACTCCAAATTTTAAAACCGCTCTGGAGAGAGAGAGATGAAGG
AAATTCAAATTCCCAGGAAAAACTCTGCGCGCTCATCTGATCCTGCAACGAAGAGACTCA
TCAAGGATCCTGAGATGAAGAATCGGAAGGTTACGGAGAAGAGACAGAGCGCGACGTTCT
CCTACGTGTCAGTGGAAAGCACGAAGGATCCGCCGGTGGAATCCACTCCGATCTCTCAGA
TTTCCGGCGCGATCTCCGATTCCGAAGCTGAGAGTTTTGTGCAAGGATCGAGCGTAGACC
TGTTATTATCAACGCCAGAGATTTCTCTTCCGGCTGATGAGTCTCCAGTTTCGACGGTTG
CTGATAAGGATTTTCACATCGACGCTGATCGGATTCAGTCGATCGTCGACTTGCCTGCTT
CTGTGGAGTCCTTGCGCGCGGAGATCAGTGACCTGAAGAAGTTCATCTGTTCAGTTGAGA
AATCTGAAGAAAGCAACTGGATCGATGGAGCTCTTACTCGCAAATCCCACCGCATTGTGC
TGTTGATTTGTATCCTTTGGGCTGTCTTAGCTGCGATCGTGGTCTCCGTCAG*TCAGGGG
AGAAGATTGCTTACTATGGACCA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4AX04JQ 845 0 0
CAAATTTTAAAACCGCTCTGGAGAGAGAGAGATGAAGGAAATTCAAATTCCCAGGAAAAA
CTCTGCGCGCTCATCTGATCCTGCAACGAAGAGACTCATCAAGGATCCTGAGATGAAGAA
TCGGAAGGTTACGGAGAAGAGACAGAGCGCGACGTTCTCCTACGTGTCAGTGGAAAGCAC
GAAGGATCCGCCGGTGGAATCCACTCCGATCTCTCAGATTTCCGGCGCGATCTCCGATTC
CGAAGCTGAGAGTTTTGTGCAAGGATCGAGCGTAGACCTGTTATTATCAACGCCAGAGAT
TTCTCTTCCGGCTGATGAGTCTCCAGTTTCGACGGTTGCTGATAAGGATTTTCACATCGA
CGCTGATCGGATTCAGTCGATCGTCGACTTGCCTGCTTCTGTGGAGTCCTTGCGCGCGGA
GATCAGTGACCTGAAGAAGTTCATCTGTTCAGTTGAGAAATCTGAAGAAAGCAACTGGAT
CGATGGAGCTCTTACTCGCAAATCCCACCGCATTGTGCTGTTGATTTGTATCCTTTGGGC
TGTCTTAGCTGCGATCGTGGTCTCCGTCAGGTCAGGGGAGAAGATTGCTTACTATGGACC
ACTTCCAACTTGAAGGATTCAATTCAAACCACTTCACATGGATGTAAGGACTTGGCTACT
ATCACACTGAGAAACAAGGGACCAAAAACTCAACTACTTATCTAGAAGTTAAGCATAGTG
TTTTCGTAAATTTCTCTAATGAATTGTTTAGTCGATATTAAAATTACCAAAAACATATAA
TTACTGATTTACTATCGGAAATTATCCGTGATCTCATCAATTATCCATCTTATATTAGTT
ACATC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL7350Contig1 789 2 3 U
GCGAGAGAATCAGTATATTCCCCTAAATATCGTAACTAAACAACTGAATGTTGGTAGTCT
AACATTATGCACATTAATAATCATGATTTTATGAAACATTCGTACATGGATCGAGGCATT
ATTCCATTTTTAAAGATTGTTCTGATATAAATCACTTCACACTTTTCAGAATAACCTCAG
GCTCCAAACGAAGGATTTCTTGATCAGAAAGTAACTTTGACATCTCTTCCTCCAGCAAAG
TCACCGAAACTGTCCTCCCAAACCCTTTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACCCCTT
CTCCGCCATCGTTTCCAATCCGGTAACTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCAAACA
CGGCCTGGTACATCAACGGCTCTCCTTCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATCGTCA
GGTCCTTACCATACATCTTCTCTTGGGACCTAGCCCGTTTCAGACCGGACCTGATTTTCT
CCACGTTCAGACTCGACACATGTTCGTTGAGTAAACGTGCGACGTGTCCTATCCCTACTT
CCACCACGTTAGCCATCTCAAGAGACGAAAAGTTCAAAGCGTTACCGAAGAAACCGTAAG
GAAGCGGATTAGACAAGAGCCTCCTGAAGTCCACACATAAGCAAACTCGATCACTCTTGT
CCTTCACCAGAGCGACACGTGTCCAGAAAAGAGCGGCGAACACATCAAACGGCGTCGCTT
TCGGGGATATCTCGTGGATGGAGTGTTCATTGATACATCTCGTGAGGCGGAGCCAGAGAA
TCTAAAAGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS95JQ U 56
AF RR4DM84JQ U 1
BS 1 109 RR4DM84JQ
BS 110 110 RR4DS95JQ
BS 111 789 RR4DM84JQ

RD RR4DS95JQ 686 0 0
G
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CATTATTCCATTTTTAAAGATTGTTCTGATATAAATCACTTCACACTTTTCAGAATAACC
TCAGGCTCCAAGCGAAGGATTTCTTGATCAGAAAGTAACTTTGACATCTCTTCCTCCGGC
AAAGTCACCGAAACTGTCCTCCCAAACCCTTTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACC
CCTTCTCCGCCATCGTTTCCAATCCGGTAACTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCA
AACACGGCCTGGTACATCAACGGCTCTCCTTCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATC
GTCAGGTCCTTACCATACATCTTCTCTTGGGACCTAGCCCGTTTCAGACCGGACCTGATT
TTCTCCACGTTCAGACTCGACACATGTTCGTTGAGTAAACGTGCGACGTGTCCTATCCCT
ACTTCCACCACGTTAGCCATCTCAAGAGACGAAAAGTTCAAAGCGTTACCGAAGAAACCG
TAAGGAAGCGGATTAGACAAGAGCCTCCTGAAGTCCACACATAAGCAAACTCGATCACTC
TTGTCCTTCACCAGAGCGACACGTGTCCAGAAAAGAGCGGCGAACACATCAAACGGCGTC
GCTTTCGGGGATATCTCGTGGATGG

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR4DM84JQ 789 0 0
GCGAGAGAATCAGTATATTCCCCTAAATATCGTAACTAAACAACTGAATGTTGGTAGTCT
AACATTATGCACATTAATAATCATGATTTTATGAAACATTCGTACATGGTTCGAGGCATT
ATTCCATTTTTAAAGATTGTTCTGATATAAATCACTTCACACTTTTCAGAATAACCTCAG
GCTCCAAACGAAGGATTTCTTGATCAGAAAGTAACTTTGACATCTCTTCCTCCAGCAAAG
TCACCGAAACTGTCCTCCCAAACCCTTTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACCCCTT
CTCCGCCATCGTTTCCAATCCGGTAACTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCAAACA
CGGCCTGGTACATCAACGGCTCTCCTTCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATCGTCA
GGTCCTTACCATACATCTTCTCTTGGGACCTAGCCCGTTTCAGACCGGACCTGATTTTCT
CCACGTTCAGACTCGACACATGTTCGTTGAGTAAACGTGCGACGTGTCCTATCCCTACTT
CCACCACGTTAGCCATCTCAAGAGACGAAAAGTTCAAAGCGTTACCGAAGAAACCGTAAG
GAAGCGGATTAGACAAGAGCCTCCTGAAGTCCACACATAAGCAAACTCGATCACTCTTGT
CCTTCACCAGAGCGACACGTGTCCAGAAAAGAGCGGCGAACACATCAAACGGCGTCGCTT
TCGGGGATATCTCGTGGATGGAGTGTTCATTGATACATCTCGTGAGGCGGAGCCAGAGAA
TCTAAAAGT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL7351Contig1 375 2 1 U
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TAAAACTATTCTTTTAATCATACATAATAAAAACGTACACGACCTTCAAGCAATAACGGA
GACACTAACTGGAAGTGGATGCAGTTCTGTCTCCTGCAACTGAGCCTTATCGATAATTCT
CTTGCCAGATTTAAACTCGCCGTAAAAGTAAGAGACAAACCCCCACAGAGAGAGAAGGAG
AGCAACACCTTTCTCCGCTTGAAACTTCTCGTGAAAACACACGACGGCCAAAACTTCCGT
GACCGGAAGAAGAGCACTGATGAGAACACCAGAAGCTAGAGAGGACGCACAGAACACAAC
CCCTATGGCTCCTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C047JQ U 58
AF RR4BP25JQ U 1
BS 1 375 RR4BP25JQ

RD RR4C047JQ 110 0 0
CAGTAAAACTATTCTTTTAATCATACATAATAAAAACGTACACGACCTTCAAGCAATAAC
GGAGACACTAACTGGAAGTGGATGCAGTTCTGTCTCCTGCAACTGAGCCT

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR4BP25JQ 375 0 0
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TAAAACTATTCTTTTAATCATACATAATAAAAACGTACACGACCTTCAAGCAATAACGGA
GACACTAACTGGAAGTGGATGCAGTTCTGTCTCCTGCAACTGAGCCTTATCGATAATTCT
CTTGCCAGATTTAAACTCGCCGTAAAAGTAAGAGACAAACCCCCACAGAGAGAGAAGGAG
AGCAACACCTTTCTCCGCTTGAAACTTCTCGTGAAAACACACGACGGCCAAAACTTCCGT
GACCGGAAGAAGAGCACTGATGAGAACACCAGAAGCTAGAGAGGACGCACAGAACACAAC
CCCTATGGCTCCTAA

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL7352Contig1 683 2 2 U
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CTTCCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCGTCACTCTCTCTC
TTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTCATTCTTC
GAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCATATCGACGCATTCGACATCGACGAAGAGG
GAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTTGGGGATAGACGGTCATTGTACTGGC
ATAGGAAGAGATACTACATATCGTACGGTGCATTGTCTGCGAACAGAGTCCCCTGTCCTC
CAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCCGGTGCATC
CGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGCAGATAATTAGAAGAAAAGGCTT
TGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTAATTTCGTATCAACGATCTCTGTTTGTAGTGTT
CCGTTCGATTTCAATGTATCGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAACTTAAT
TAAACCCGGGGATTATTATTCGAGTGCAATCTATCTACATGTATTACTGCTACTTATTAT
CTCGTGTCTATTTGTCGGTGGGC


BQ
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AF RR4DI72TF U 1
AF RR4DI72JQ C 1
BS 1 596 RR4DI72TF
BS 597 683 RR4DI72JQ

RD RR4DI72TF 596 0 0
GGGGTATGTGACTTACTAGTTGCTCTACTCTCTTCAATTATTATTTTTCCTTCTTCTTTG
CTTCCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCGTCACTCTCTCTC
TTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTCATTCTTC
GAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCATATCGACGCATTCGACATCGACGAAGAGG
GAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTTGGGGATAGACGGTCATTGTACTGGC
ATAGGAAGAGATACTACATATCGTACGGTGCATTGTCTGCGAACAGAGTCCCCTGTCCTC
CAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCCGGTGCATC
CGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGCAGATAATTAGAAGAAAAGGCTT
TGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTAATTTCGTATCAACGATCTCTGTTTGTAGTGTT
CCGTTCGATTTCAATGTATCGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAACT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4DI72JQ 683 0 0
GGGGTATGTGACTTACTAGTTGCTCTACTCTCTTCAATTATTATTTTTCCTTCTTCTTTG
CTTCCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCGTCACTCTCTCTC
TTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTCATTCTTC
GAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCATATCGACGCATTCGACATCGACGAAGAGG
GAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTTGGGGATAGACGGTCATTGTACTGGC
ATAGGAAGAGATACTACATATCGTACGGTGCATTGTCTGCGAACAGAGTCCCCTGTCCTC
CAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCCGGTGCATC
CGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGCAGATAATTAGAAGAAAAGGCTT
TGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTAATTTCGTATCAACGATCTCTGTTTGTAGTGTT
CCGTTCGATTTCAATGTATCGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAACTTAAT
TAAACCCGGGGATTATTATTCGAGTGCAATCTATCTACATGTATTACTGCTACTTATTAT
CTCGTGTCTATTTGTCGGTGGGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL7353Contig1 736 2 3 U
GCACCAATATCCTCGACTCCTCTTTTACTTCCACCATCACTATCAGGTGAACCTTCTGGG
TCCTCTCAAGCCAATGTACCACATCACAAACAAAACATCACAGAACCATCGTCCTCCGAG
CCAATCATAGTTCCATCTCTTCAAGAAGATTCTGTGGTAGCAGCAGAACCATCTGAAGCA
CCAAAGCCAAGTCTAGAGGAAGTCACTGGTACGACAAGATCTGTATCGCCAGAGAGCAAA
ATCTCTGAACCAAAATCTACCAACGAGGATGGAGACTCAGATTTAGAAACCTGTGATAAA
AATGAGGCTGATCAACTTATGATTCATTCAGACGATAAGCATTTGGATGCGAAGCAAGAG
GAACAACAGTCTGAGAATGCCTCAAACAAGCAATGTGAGCCCACAGAGGCTGAAACTCCA
AACATGGACACAGAACAAGAAGATAAAGGAGAATCCGTAAAGATGGTGATTGACATTTCT
CCAGGTGGCGATTGAAGTCTACAATCGAATTGCATTGAAAATATACCAGTGTTGCTTTTG
TTTAGGTCCTTGCGATCAAAATGGGTACTATATGGCTATTAAGTTTTGTAGGTATGACGC
AACTCAGTGAAGAAGCAGTATATGTACTGGGACTTTCACCATTTTTATCTTTTTAAATTC
TTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGAATGACGAAGCCTATTTTAATGATCTAACTAG
TTGGTTTGGATTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CY24TF U 1
AF RR4CY24JQ C 60
BS 1 289 RR4CY24TF
BS 290 290 RR4CY24JQ
BS 291 736 RR4CY24TF

RD RR4CY24TF 736 0 0
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TCCTCTCAAGCCAATGTACCACATCACAAACAAAACATCACAGAACCATCGTCCTCCGAG
CCAATCATAGTTCCATCTCTTCAAGAAGATTCTGTGGTAGCAGCAGAACCATCTGAAGCA
CCAAAGCCAAGTCTAGAGGAAGTCACTGGTACGACAAGATCTGTATCGCCAGAGAGCAAA
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CCAGGTGGCGATTGAAGTCTACAATCGAATTGCATTGAAAATATACCAGTGTTGCTTTTG
TTTAGGTCCTTGCGATCAAAATGGGTACTATATGGCTATTAAGTTTTGTAGGTATGACGC
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TTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGAATGACGAAGCCTATTTTAATGATCTAACTAG
TTGGTTTGGATTGTGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4CY24JQ 677 0 0
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GCCAATCATAGTTCCATCTCTTCAAGAAGATTCTGTGGTAGCAGCAGAACCATCTGAAGC
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AAATGAGGCTGATCAACTTATGATTCATTCAGACGATAAGCATTTGGATGCGAAGCAAGA
GGAACAACAGTCTGAGAATGCCTCAAACAAGCAATGTGAGCCCACAGAGGCTGAAACTCC
AAACATGGACACAGAACAAGAAGATAAAGGAGAATCCGTAAAGATGGTGATTGACATTTC
TCCAGGTGGCGATTGAAGTCTACAATCGAATTGCATTGAAAATATACCAGTGTTGCTTTT
GTTTAGGTCCTTGCGATCAAAATGGGTACTATATGGCTATTAAGTTTTGTAGGTATGACG
CAACTCAGTGAAGAAGCAGTATATGTACTGGGACTTTCACCATTTTTATCTTTTTAAATT
CTTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGAATGACGAAGCCTATTTTAATGATCTAACTA
GTTGGTTTGGATTGTGT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL7354Contig1 800 2 2 U
GGAATCCATACTCATTCTCACCTTCCATATCTCCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCT
CTTCTTGTCTGATGGGGGCTCAGGAGAAGCGGCGTCGTTTTGAGCCAATAACAAACTATG
AGATTAAGGACCGGTCGAATCAAACCGTGGCTGCTGATCTCGATGGGACGTTACTAATCT
CTCGTAGCGCATTTCCTTACTATTTCCTCGTGGCACTCGAAGCAGGGAGCTTGCTCCGCG
CTTTGATCCTACTTGTGTCTGTACCATTCGTTTACCTCACGTACCTCACAGTCTCCGAGA
CACTAGCCACCAACGTTTTCATCTTTATCACCTTCGCTGGTCTCAAGATCCGAGAGGTTG
AGCTCGTGGTCCGTTCCGTCCTCCCGAGGTTTTACGCGGAGGACGTGAGACCTGACGCAT
GGAGTATCTTCAACACGTTTGGGAAACGGTACATAGTAACAGCGAGTCCGCGGATCATGG
TCGAACCGTTCGTGAAGACATACCTAGGAGTCGATAAAGTTCTTGGAACAGAACTCGAAG
TCTCCAAATCGGGTCGTGCAACCGGTTTTGTAAGAAGACCAGGTGTTCTCGTTGGTCAAC
ACAAACGCGACGGTATTTTGAGAGAGTTCGGTGGCGTTGCGTCTGGTTTACCTGATTTGG
GGCTTGGCGATAGTAAGACAGATCACGATTTCATGTCAATTTGCAAGGTTATTTCCGTAA
ATCCTCTTCTTTTTACATGATATGTCATTTTTGAATCTTTTATTACTGCTATCTAACACA
ATAAATACTATATTCACGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG62TF U 1
AF RR4DG62JQ C 27
BS 1 622 RR4DG62TF
BS 623 800 RR4DG62JQ

RD RR4DG62TF 622 0 0
GGAATCCATACTCATTCTCACCTTCCATATCTCCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCT
CTTCTTGTCTGATGGGGGCTCAGGAGAAGCGGCGTCGTTTTGAGCCAATAACAAACTATG
AGATTAAGGACCGGTCGAATCAAACCGTGGCTGCTGATCTCGATGGGACGTTACTAATCT
CTCGTAGCGCATTTCCTTACTATTTCCTCGTGGCACTCGAAGCAGGGAGCTTGCTCCGCG
CTTTGATCCTACTTGTGTCTGTACCATTCGTTTACCTCACGTACCTCACAGTCTCCGAGA
CACTAGCCACCAACGTTTTCATCTTTATCACCTTCGCTGGTCTCAAGATCCGAGAGGTTG
AGCTCGTGGTCCGTTCCGTCCTCCCGAGGTTTTACGCGGAGGACGTGAGACCTGACGCAT
GGAGTATCTTCAACACGTTTGGGAAACGGTACATAGTAACAGCGAGTCCGCGGATCATGG
TCGAACCGTTCGTGAAGACATACCTAGGAGTCGATAAAGTTCTTGGAACAGAACTCGAAG
TCTCCAAATCGGGTCGTGCAACCGGTTTTGTAAGAAGACCAGGTGTTCTCGTTGGTCAAC
ACAAACGCGACGGTATTTTGAG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4DG62JQ 774 0 0
ATATCTCCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTTCTTGTCTGATGGGGGCTCAGGAG
AAGCGGCGTCGTTTTGAGCCAATAACAAACTATGAGATTAAGGACCGGTCGAATCAAACC
GTGGCTGCTGATCTCGATGGGACGTTACTAATCTCTCGTAGCGCATTTCCTTACTATTTC
CTCGTGGCACTCGAAGCAGGGAGCTTGCTCCGCGCTTTGATCCTACTTGTGTCTGTACCA
TTCGTTTACCTCACGTACCTCACAGTCTCCGAGACACTAGCCACCAACGTTTTCATCTTT
ATCACCTTCGCTGGTCTCAAGATCCGAGAGGTTGAGCTCGTGGTCCGTTCCGTCCTCCCG
AGGTTTTACGCGGAGGACGTGAGACCTGACGCATGGAGTATCTTCAACACGTTTGGGAAA
CGGTACATAGTAACAGCGAGTCCGCGGATCATGGTCGAACCGTTCGTGAAGACATACCTA
GGAGTCGATAAAGTTCTTGGAACAGAACTCGAAGTCTCCAAATCGGGTCGTGCAACCGGT
TTTGTAAGAAGACCAGGTGTTCTCGTTGGTCAACACAAACGCGACGGTATTTTGAGAGAG
TTCGGTGGCGTTGCGTCTGGTTTACCTGATTTGGGGCTTGGCGATAGTAAGACAGATCAC
GATTTCATGTCAATTTGCAAGGTTATTTCCGTAAATCCTCTTCTTTTTACATGATATGTC
ATTTTTGAATCTTTTATTACTGCTATCTAACACAATAAATACTATATTCACGAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7355Contig1 847 2 4 U
GGGATCATGACTCAAACAGATCTCAATCAGCCGAAAGTCGATATGACTAAGGAGGAGAAA
GAGAGGTTGAAGTACTTGGAGTTCGTGCAAGCTGCCGCTGTGGAAGCAGTGCTACGCTTT
GCTCTTATCTACGCAAAGGCGAAGGACAAGTCTGGTCCTTTGAAGCCAGGTGTTGAATCC
GTTGAAGGAGCTGTCAAGACTGTCGTCGGTCCTGTCTACCAGAAGTACCACGACGTCCCC
GTCGAGGTTCTCAAATACATGGACCAGAAGGTTGACATGTCAGTGACTGAACTCGACCGC
CGTGTCCCACCAGTGGTCAAACAAGTCTCTGCCCACGCCATCTCAGCCGCTCAGATCGCA
CCCGTAGTGGAGACCGCCTCCGGGATGGCGAAATCCGTCTACACCAAGTACGAGCCCGCA
GCTAAGGAGCTGTACGCGAGCTACGAGCCAAAAGCAGAGCAGTGCGCCGTTTCGGCTTGG
AAGAAGCTGAACCAGCTTCCTCTGTTCCCAAGGCTTGCTCAAGTCGCTGTGCCGACGGCC
GCTTTCTGCTCCGAGAAGTACAATGACACGGTGGTGAAGGCTGCTGAGAAAGGGTACAGG
GTCTCATCGTACATGCCATTGGTTCCGACAGAGAGGATCTCGAAGATCTTCAGCGAGGAG
AAGACTGAGACGGCCAAGCCTGTGGAGTTTCAGCCACTCAATTGATTTGGAGGGGTTTGG
TAGTTTGTTGTTGTTTGGTTTGATGTGAACCGGATCTTGGTTAGCGATGGTTCTGGTTCT
TTTGTTTCTTTGTCTTTCTTCTCCTTCGTTTCTATGAATTTTCGCTTTAATAACACAAAA
CTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW48TF U 1
AF RR4BW48JQ C 36
BS 1 689 RR4BW48TF
BS 690 690 RR4BW48JQ
BS 691 714 RR4BW48TF
BS 715 847 RR4BW48JQ

RD RR4BW48TF 720 0 0
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AAGACTGAGACGGCCAAGCCTGTGGAGTT*CAGCCACTCAATTGATTTGGAGGG
TTTGGT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4BW48JQ 812 0 0
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CTACCAGAAGTACCACGACGTCCCCGTCGAGGTTCTCAAATACATGGACCAGAAGGTTGA
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ACTCAATTGATTTGGAGGGGTTTGGTAGTTTGTTGTTGTTTGGTTTGATGTGAACCGGAT
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GAATTTTCGCTTTAATAACACAAAACTTCTGC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BH71JQ C 1
AF RR4BH71TF U 1
BS 1 673 RR4BH71TF

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CTCTTCTCCTGCTGTCTTTCTTTTCCCTTAATGGTCAACCCATTGGTGCTCAAAGTAAAT
AATAGTCAGTCTACCCAGCTGGAGAATCATTGATTTTACTGCTTTTGTGTTCGGTCCTTA
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TGTTGCAATTAAG

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DS 

RD RR4BH71TF 673 0 0
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CTCTTCTCCTGCTGTCTTTCTTTTCCCTTAATGGTCAACCCATTGGTGCTCAAAGTAAAT
AATAGTCAGTCTACCCAGCTGGAGAATCATTGATTTTACTGCTTTTGTGTTCGGTCCTTA
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GGTTGGTGATGGAACTTTTGGTACCGTTTGGAGAGCTATCAATAAGCAGACGGGTGAAGT
TGTTGCAATTAAG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL7357Contig1 693 2 2 U
AAGAAGCTTTAAGATTATAATTACCAAAGTAACGTGCTCTGCTCCTTGTAAAGCATATCG
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BJ62TF C 1
AF RR4BJ62JQ U 13
BS 1 12 RR4BJ62TF
BS 13 693 RR4BJ62JQ

RD RR4BJ62TF 693 0 0
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AAATAAATAAATATAAATGTATCTATTCAAAGTCGTCCAGACAAAATAAACTTCAAAGAA
CAAGACATCTGAAACACGTCCCAATCTAGTTGAAAAAGAGCATAAAATTGATTTGATAAA
AATTATAACCCTCAGGGCAAAAGGAAACTCCTTAACGATTAGCCTTGGCAACTCTCTCAA
TCTCATCCTTCTTTTTGATGGCATAGCTGTTGGAGGGGCCCTTGGCTGCGTTGATCAATT
CATCAGCAAGGCACTCAGCAATGGTCTTAATGTTCCTGAAAGCAGCCTCACGAGCACCGG
TTGTAAGCAAGAAGATAGCCTGGTTCACACGTCTTAGAGGGGAGATATCAACGGCTTGTC
TCCTAACAACACCAGCGGATCCAATTCTTGTAGCATCTTCACGAGGACCACTGTTAACAA
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CGTGCTTGATGATCCTCACCGCCATCAACTTCTTTCCGTTGTTTCTCCCGTGCATCATGA
GAGAGTTTGTGAGCCTCTCGACGATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAATCTCTTCACAGAGT
ATCTTCCGGCTGTGTGGGGGACGAAGGTGGCCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4BJ62JQ 681 0 0
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ATAAATGTATCTATTCAAAGTCGTCCAGACAAAATAAACTTCAAAGAACAAGACATCTGA
AACACGTCCCAATCTAGTTGAAAAAGAGCATAAAATTGATTTGATAAAAATTATAACCCT
CAGGGCAAAAGGAAACTCCTTAACGATTAGCCTTGGCAACTCTCTCAATCTCATCCTTCT
TTTTGATGGCATAGCTGTTGGAGGGGCCCTTGGCTGCGTTGATCAATTCATCAGCAAGGC
ACTCAGCAATGGTCTTAATGTTCCTGAAAGCAGCCTCACGAGCACCGGTTGTAAGCAAGA
AGATAGCCTGGTTCACACGTCTTAAAGGGGAGATATCAACGGCTTGTCTCCTAACAACAC
CAGCGGATCCAATTCTTGTAGCATCTTCACGAGGACCACTGTTAACAATGGCATCAATGA
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TCCTCACCGCCATCAACTTCTTTCCGTTGTTTCTCCCGTGCATCATGAGAGAGTTTGTGA
GCCTCTCGACGATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAATCTCTTCACAGAGTATCTTCCGGCTG
TGTGGGGGACGAAGGTGGCCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL7358Contig1 639 2 3 U
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CTCTGCTGTTGCTGGCTATTCCAATGTTGCGCAGAGGTGGTACTTTAATTGCAAGAGAGT
GTTTGCAACACAAGAACCTTGGTTGGAATTAAAACAAATTGCTGGATATATTCTCTCGTC
TATTTTATTTCCTTTCTGTTTGCATGCTCTTCGGTTAAAAAACTATCGTCTATCGACGTT
CTAGCTCGACTTGGATTTGAGAAAAATGGGAATGTAAACTGGTGTAGTGACATTAGTCCT
TTGCCTCATTCCGCCTTTTGTTTTTAACATACCTCACTCAGTCTATTGATTTCTCTCTTT
GTGTTCATAGTTCGTATGATCATATCTCAACGATTTTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY76TF U 1
AF RR4H476TF U 1
BS 1 44 RR4FY76TF
BS 45 45 RR4H476TF
BS 46 639 RR4FY76TF

RD RR4FY76TF 639 0 0
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CTCTGCTGTTGCTGGCTATTCCAATGTTGCGCAGAGGTGGTACTTTAATTGCAAGAGAGT
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TATTTTATTTCCTTTCTGTTTGCATGCTCTTCGGTTAAAAAACTATCGTCTATCGACGTT
CTAGCTCGACTTGGATTTGAGAAAAATGGGAATGTAAACTGGTGTAGTGACATTAGTCCT
TTGCCTCATTCCGCCTTTTGTTTTTAACATACCTCACTCAGTCTATTGATTTCTCTCTTT
GTGTTCATAGTTCGTATGATCATATCTCAACGATTTTTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4H476TF 608 0 0
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AGAAGAGAAACAACAATGACTGAGTACAATCAACATCCCGTCGGGGTTCCTCCTCCTCAA
GGTTATCCACCGGAGGGGTATCCACCGCAGGGTTATCCGCCGCAAGCCTACCCACAGCAG
GGTTACCCTCAGCAAGGTTATCCTCCTCCGTATGCGTCCCAATATCCTCCACCACAGCAG
AATCAGCAGCCGCAACAACAGAGCAGTACTACTGGGTGTCTAGAAGGATGTCTTGCTGCT
CTCTGCTGTTGCTGGCTATTCCAATGTTGCGCAGAGGTGGTACTTTAATTGCAAGAGAGT
GTTTGCAACACAAGAACCTTGGTTGGAATTAAAACAAATTGCTGGATATATTCTCTCGTC
TATTTTATTTCCTTTCTGTTTGCATGTTCTTCGGTTAAAAAACTATCGTCTATCGACGTT
CTGGCTCGACTTGGATTTGAGAAAAATGGGAATGTAAACTGGTGTAGTGACATTAGTCCT
TTGCCTCATTCCGCCTTTTGTTTTTAACATACCTCACTCAGTCTATTGATTTCTCTCTTT
GTGTTCAT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7360Contig1 820 2 4 U
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CCACATATTTCTAGAGCTCAAGTTTTGACAGTACAAATGTACAGAAAAATCAGAAGTATA
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TATGTGGCTTAAAGCTATCTCGTATGCACTGTCTGACAGTTTCTTCACCGCAAAGTCAAT
GTCCTCTGCGAGCTTCTCGGACATGGAGTTTCTTGCCATCATCCTCATGATCACATCGCT
TTGTGCCGATGAATCCATCAACGACCATGGTCCAATTTCAGACATTCCAAATGTTGTTAC
CATCTGCTTAGCCAAACCGGTGATCTGTTGCAAGTCACCAACCGCGCCAGTAGTAACCTC
AGGCTCACCGAACATGATTTCTTCAGCGGCTCTACCACCGAGTCCACCAACGATTCTTGC
AAAGAGTTGTTGCTTGGAGATGAGAGTAGGGTCATCTGATGGAATGAATCAGGTCAGACC
TCTCGCTTGTCCTCTTGGTACCAACGTTACCCTTTGCACAGCGTCATGTCCTGGAGTCAA
TGCTCCACACACGGCATGACCAACTTCATGGTAAGCAACCAAGCTTTTGCCCTTGCTATC
AGTCATCACAGTTCCTTCCATGCCAGCAACGATTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ED71JQ U 1
AF RR4A660TF C 25
BS 1 39 RR4ED71JQ
BS 40 40 RR4A660TF
BS 41 562 RR4ED71JQ
BS 563 820 RR4A660TF

RD RR4ED71JQ 562 0 0
CGGTGAATATACCAATTCCACTTATAACATTTACTTGTGTTACACAGTATTGGGACATCA
CCACATATTTCTAGAGCTCAAGTTTTGACAGTACAAATGTACAGAAAAATCAGAAGTATA
CAGATTCATTACCTAGACAGAAGCTGGCGTTGGTGTAAATGTTGGGATTGAGGCAGGAAC
TCGGTTTTCCGGCGGGATCTCAGTGAACTCGGAGAGAATTGCTCGGAACTCGTCGCCTCC
GATAGTTTCTTTCTCTAGAAGCACTTCAACTATCTTATCCATGGCCTCACGGTTGTTCCT
TATGTGGCTTAAAGCTATCTCGTATGCACTGTCTGACAGTTTCTTCACCGCAAAGTCAAT
GTCCTCTGCGAGCTTCTCGGACATGGAGTTTCTTGCCATCATCCTCATGATCACATCGCT
TTGTGCCGATGAATCCATCAACGACCATGGTCCAATTTCAGACATTCCAAATGTTGTTAC
CATCTGCTTAGCCAAACCGGTGATCTGTTGCAAGTCACCAACCGCGCCAGTAGTAACCTC
AGGCTCACCGAACATGATTTCT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4A660TF 796 0 0
TAACATTTACTTGTGCTACACAGTATTGGGACATCACCACATATTTCTAGAGCTCAAGTT
TTGACAGTACAAATGTACAGAAAAATCAGAAGTATACAGATTCATTACCTAGACAGAAGC
TGGCGTTGGTGTAGATGTTGGGATTGAGGCAGGAACTCGGTTTTCCGGCGG*ATCTCAGT
GAACTCGGAGAGAATTGCTCGGAACTCGTCGCCTCCGATAGTTTCTTTCTCTAGAAGCAC
TTCAACTATCTTATCCATGGCCTCACGGTTGTTCCTTATGTGGCTTAGAGCTATCTCGTA
TGCACTGTCTGACAGTTTCTTCACCGCAGAGTCAATGTCCTCTGCGAGCTTCTCGGACAT
GGAGTTTCTTGCCATCATCCTCATGATCACATCGCTTTGTGCCGATGAATCCATCAACGA
CCATGGTCCAATTTCAGACATTCCAAATGTTGTTACCATCTGCTTAGCCAAACCGGTGAT
CTGTTGTAAGTCACCAACCGCGCCAGTAGTAACCTCAGGCTCACCGAATATGATTTCTTC
AGCGGCTCTACCACCGAGTCCACCAACGATTCTTGCAAAGAGTTGTTGCTTGGAGATGAG
AGTAGGGTCATCTGATGGAATGAATCAGGTCAGACCTCTCGCTTGTCCTCTTGGTACCAA
CGTTACCCTTTGCACAGCGTCATGTCCTGGAGTCAATGCTCCACACACGGCATGACCAAC
TTCATGGTAAGCAACCAAGCTTTTGCCCTTGCTATCAGTCATCACAGTTCCTTCCATGCC
AGCAACGATTCTGTCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL7361Contig1 808 2 12 U
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TGCACCACAGATTTCCGGTGCCTCGACGAAGGATTCGGCGGCAAAACCACCAAACGCAAA
CGCGAATCTCAGGAACAAGCCGCCGCCGACGCCGATGAAGCCTCGATGGACATCGATTCG
GTCAATCCTCCATCCGCGAAACGCAGCGCCGTCGCCTCCTCCGAGGATCCAGACAAACCC
GTGGCCGCCGCCGTGTCCATCGGGAGACCGACGTACGACGGCGTGATCACCGGGAAAGTG
TCGGGGCGTAACTGGAAGACGCCGCGGACGCACAGGTCGTCTGGGAGGTTCGTGAGGAAC
AAGGGGCCGGATCTGGAGGATATGAAGAGGCAGAGGGAGATCAAGAGGGCGTACAAGGAG
AGGAAGAACGAGCTCAAGGAGGAGATTAGGAGCCACAAGGTGGAGAAGAGGAAGAAGAAG
GAGGAGAGGGAGAAGAGGAAGGCGGAGAATGTTTTGAGGACGGGGACGAAGCTGCAGAAG
ATTACGAACCCTAAGACGTTGAAGAAGATCGCCAAGTCTAAGCAGAGGAAGCATCTTAAA
GTGATTCCTGATGAGGTTATGAATGGGAACAACAAGAAGAGTATTATTAATTAGTGAAAT
TTATAATTTGGAAAAAAGATATGTGTTTTTTTGAGTTTTTGTATTATCTCGTGACGTTTA
GTCAAATTCGTCTAAGAAACAACTTTAATACCGACTTTGCGAGATTGAGTTCTGTTCTCA
GTTATCTTGTCTGAATTGCCTCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED80TF U 1
AF RR4ED80JQ C 193
BS 1 676 RR4ED80TF
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BS 743 765 RR4ED80TF
BS 766 808 RR4ED80JQ

RD RR4ED80TF 766 0 0
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GTGGCCGCCGCCGTGTCCATCGGGAGACCGACGTACGACGGCGTGATCACCGGGAAAGTG
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GTGATTCCTGATGAGGTTATGAATGGGAACAACAAGAAGAGTATTATTAATTAGTGAAAT
TTATAATTTGGAAAAA*GATATGTGTTTTTT*GAGTTTT*GTATTATCTCGTGACGTTTA
GTCAAATTCGTCTAG**AACA*CTTTAATACCGACTTTGCGAGAT
G

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4ED80JQ 616 0 0
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GTGTCCATCGGGAGACCGACGTACGACGGCGTGATCACCGGGAAAGTGTCGGGGCGTAAC
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CTGGAGGATATGAAGAGGCAGAGGGAGATCAAGAGGGCGTACAAGGAGAGGAAGAACGAG
CTCAAGGAGGAGATTAGGAGCCACAAGGTGGAGAAGAGGAAGAAGAAGGAGGAGAGGGAG
AAGAGGAAGGCGGAGAATGTTTTGAGGACGGGGACGAAGCTGCAGAAGATTACGAACCCT
AAGACGTTGAAGAAGATCGCCAAGTCTAAGCAGAGGAAGCATCTTAAAGTGATTCCTGAT
GAGGTTATGAATGGGAACAACAAGAAGAGTATTATTAATTAGTGAAATTTATAATTTGGA
AAAAAGATATGTGTTTTTTTGAGTTTTTGTATTATCTCGTGACGTTTAGTCAAATTCGTC
TAAGAAACAACTTTAATACCGACTTTGCGAGATTGAGTTCTGTTCTCAGTTATCTTGTCT
GAATTGCCTCTTGTTT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL7362Contig1 992 2 4 U
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TCTGACTCCGCCACTGCGCCTCCGACTACTCTGCGCTGCATCTCCTCCTTTGCGAGCGGG
TCCATATCTCCTCCTCGGCCTCATTATCATATGCGACTCCAGATTTCTTTTCCTTCTCTT
ACTATCTCCTGAAATCATGGTTAATTCTCTTGGATCCGCTCTAAGGTTAAAGAGACGAAA
ACTGGAGCATCTAGAAACCGTGGATGAAGATGAGATTGAGGATGTAGCTTCTGTTAAGTT
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TTGTTGATGACTTTCGAACTTGCTATTGCTTGCAGAAGCATCCAACTCCTCAAGCAAGTT
ACCATGCCAACACCCAGGGACCTTAGGAAACATGTGCATTGTTTGTGGCCAAAACGTTGA
AGAAGAAGAAACTGGTCTTTCATTCACTTACATACACAAGTTTCATCATGATGAAGTAAC
CCGGATGCGTGATATAGATATGAAAATGTTGCAAAGCCAACGGAAGTTATGTTTAGTTCT
TGATCTAGACCACTATTTGCTTAACTCAACCGTACTTAGAGACTTGAAACCAGAGGAGGA
ATACTTGAAAAGCGTTACACACTCTTCAAGATGTTTCTGGGTGGTGATCTCTTCATGCTT
GAGTTCATGCATATGATGACCAAATTAAAGCCGTTTGTTCATTCGTTTCTGAAAGGAGCC
AGCAAGATGTTTGTATTGTATATATACACAATGGGAGATAGGCCATATGCATCACAGATG
GCGAAGCTGCTAGACCCAAAAGTAGAGTACCTCGGTGAACGGCCTAATTGATTTATTGAT
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CTCGAAAAATAAACATATCAAAAAAGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB88TF U 1
AF RR4AB88JQ C 193
BS 1 823 RR4AB88TF
BS 824 824 RR4AB88JQ
BS 825 878 RR4AB88TF
BS 879 992 RR4AB88JQ

RD RR4AB88TF 878 0 0
GGTTCTCTATCGAGTTCTGCTTCTCACTCCGTCTAAGACCTCTCTCGATGCCGCTGCGTC
TCTGACTCCGCCACTGCGCCTCCGACTACTCTGCGCTGCATCTCCTCCTTTGCGAGCGGG
TCCATATCTCCTCCTCGGCCTCATTATCATATGCGACTCCAGATTTCTTTTCCTTCTCTT
ACTATCTCCTGAAATCATGGTTAATTCTCTTGGATCCGCTCTAAGGTTAAAGAGACGAAA
ACTGGAGCATCTAGAAACCGTGGATGAAGATGAGATTGAGGATGTAGCTTCTGTTAAGTT
TTCAGAAGAAATCTCCGGTGGAAGTCTCTTCCTTTAGCCTTACTTTGAATGTTGTGTTAT
TTGTTGATGACTTTCGAACTTGCTATTGCTTGCAGAAGCATCCAACTCCTCAAGCAAGTT
ACCATGCCAACACCCAGGGACCTTAGGAAACATGTGCATTGTTTGTGGCCAAAACGTTGA
AGAAGAAGAAACTGGTCTTTCATTCACTTACATACACAAGTTTCATCATGATGAAGTAAC
CCGGATGCGTGATATAGATATGAAAATGTTGCAAAGCCAACGGAAGTTATGTTTAGTTCT
TGATCTAGACCACTATTTGCTTAACTCAACCGTACTTAGAGACTTGAAACCAGAGGAGGA
ATACTTGAAAAGCGTTACACACTCTTCAAGATGTTTCTGGGTGGTGATCTCTTCATGCTT
GAGTTCATGCATATGATGACCAAATTAAAGCCGTTTGTTCATTCGTTTCTGAAAGGAGCC
AGCAAGATGTTTGTATTGTATATATACACAATGGGAGATAGGC*ATATGCATCACAGATG
GCGAAGCTGCTAGACCCAAAAGTAGAGTACCTCGGTGA

QA 1 878 1 878
DS 

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AGAAACCGTGGATGAAGATGAGATTGAGGATGTAGCTTCTGTTAAGTTTTCAGAAGAAAT
CTCCGGTGGAAGTCTCTTCCTTTAGCCTTACTTTGAATGTTGTGTTATTTGTTGATGACT
TTCGAACTTGCTATTGCTTGCAGAAGCATCCAACTCCTCAAGCAAGTTACCATGCCAACA
CCCAGGGACCTTAGGAAACATGTGCATTGTTTGTGGCCAAAACGTTGAAGAAGAAGAAAC
TGGTCTTTCATTCACTTACATACACAAGTTTCATCATGATGAAGTAACCCGGATGCGTGA
TATAGATATGAAAATGTTGCAAAGCCAACGGAAGTTATGTTTAGTTCTTGATCTAGACCA
CTATTTGCTTAACTCAACCGTACTTAGAGACTTGAAACCAGAGGAGGAATACTTGAAAAG
CGTTACACACTCTTCAAGATGTTTCTGG*TGGTGATCTCTTCATGCTTGAGTTCATGCAT
ATGATGACCAAATTAAGGCCGTTTGTTCATTCGTTTCTGAAAGGAGCCAGCAAGATGTTT
GTATTGTATATATACACAATGGGAGATAGGCCATATGCATCACAGATGGCGAAGCTGCTA
GACCCAAAAGTAGAGTACCTCGGTGAACGGCCTAATTGATTTATTGATTGTACGAAGGAA
AAGGTCTTCTATGTCGTTGTCGTATTTTAATTTTTAGCTGATATTTAACTCGAAAAATAA
ACATATCAAAAAAGTTATCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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AGACTGCCGCCACTGCCCAGGTTCCAAATAATTCAGACCCGAATAAGGCGACGTCGCATA
TAAAAGATGAGCTTGACAAGGTGTTTACTGTTGAGGAAGTTGGGCACAAGTGCGACTTAT
GCGGGATAGACATAGCCTCGGATCCAGAACGGCCTAATGCATCTTTGCGCAGCTTACAAG
AGGCGTGCGTGCTGGATTGTGGTCACGTCTACCACTTTAAGTGTTTAAAAGGCTCCACTC
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TCAACTTTAAAGATTTTAATATTTTTTTTGTTCTTATATTGTAAGAACGTGTTCTCAAAC
AATGACAATGGTTTTTACATACAAACTGATTATGTTCTCAATAATCAGTTTCTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BN72JQ C 1
AF RR4BN72TF U 1
BS 1 597 RR4BN72TF

RD RR4BN72JQ 597 0 0
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TAAAAGATGAGCTTGACAAGGTGTTTACTGTTGAGGAAGTTGGGCACAAGTGCGACTTAT
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AGGCGTGCGTGCTGGATTGTGGTCACGTCTACCACTTTAAGTGTTTAAAAGGCTCCACTC
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TCAACTTTAAAGATTTTAATATTTTTTTTGTTCTTATATTGTAAGAACGTGTTCTCAAAC
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QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4BN72TF 597 0 0
GGACAGAACAGAACAGGGAATACGTATTTAACATGGATCCGAAAGAAAAAGAAGACCTAG
AAAGTTTAGGCAAGGCTAGAGAGTTGCTCTCGAAGCTTCAACAGCACATTGAGAAAGGCA
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TAAAAGATGAGCTTGACAAGGTGTTTACTGTTGAGGAAGTTGGGCACAAGTGCGACTTAT
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AGGCGTGCGTGCTGGATTGTGGTCACGTCTACCACTTTAAGTGTTTAAAAGGCTCCACTC
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TCAACTTTAAAGATTTTAATATTTTTTTTGTTCTTATATTGTAAGAACGTGTTCTCAAAC
AATGACAATGGTTTTTACATACAAACTGATTATGTTCTCAATAATCAGTTTCTTTTT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL7364Contig1 1005 2 2 U
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GGAAGAAATCAAGATCAAGCACGGAGATGCACTACTCAAATCTTTCGTAGTTGACATGTC
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ACCACTCGCTAATGGCTATGACAGGATGATGACTACAAACTATATTGGTCCATTCACTAT
GACCAAACTTCTTTTACCACTTCTGAAAAACAGCTCTGTGCCATCACGGGTCGTGAACGT
TGCATCTTTCTCACATCGTTATGCTTCTATTGGGAAGCTTGACAAGGATTATGTAACTGG
AGAACATTTCACGACATTTGACGAATATCCTCATGCTCATGTCTACGAGTACTCTAAATT
ATGTCTTCTACTTTTCTCCTATGAATTGCACAGACAGCTTCGCCTCAAAGATGATTCACA
CCATGTCTCTGTTATAGCTGCAGATCCTGGATTTGTGAAAACAAATCTACTGCGCGAGTT
TCCTAAATACTCATCTGCTTCTGCGTTTCTCTTTTTCAAACTTATTGGCCTCCTCCAAAC
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CGTTTACTATTTTGGAGGAAAAGGAAGGACCATTAAATCGTCAAAAGCTTCTAGAGATCC
CAAACTTGGTAAAGAACTTTGGGAAACTTCTTGTGGTTTGTTCAAGGAGTTGCAGTCATA
CAACGACTAAATCAAAAACTCGCATGGTTCATAGATTCTCATTTCAACAGTAAACGGTGG
TACACATAAACTGAAATCAGATAAGAGTTTCTATTTTTTTTGTTTGTAACATGTATTGTA
TCCTTCCAAGGTTTAAATTTAATGATAAAACATATACTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP67TF U 1
AF RR4AP67JQ C 444
BS 1 739 RR4AP67TF
BS 740 1005 RR4AP67JQ

RD RR4AP67TF 739 0 0
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GACCAAACTTCTTTTACCACTTCTGAAAAACAGCTCTGTGCCATCACGGGTCGTGAACGT
TGCATCTTTCTCACATCGTTATGCTTCTATTGGGAAGCTTGACAAGGATTATGTAACTGG
AGAACATTTCACGACATTTGACGAATATCCTCATGCTCATGTCTACGAGTACTCTAAATT
ATGTCTTCTACTTTTCTCCTATGAATTGCACAGACAGCTTCGCCTCAAAGATGATTCACA
CCATGTCTCTGTTATAGCTGCAGATCCTGGATTTGTGAAAACAAATCTACTGCGCGAGTT
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CGTTTACTATTTTGGAGGA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AP67JQ 562 0 0
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CGTTTCTCTTTTTCAAACTTATTGGCCTCCTCCAAACCCCTGATGATGGAGCTGAATCTT
CTGTCGATGCAGCTTTAGCTCCACCAGAAACATCAGGCGTTTACTATTTTGGAGGAAAAG
GAAGGACCATTAAATCGTCAAAAGCTTCTAGAGATCCCAAACTTGGTAAAGAACTTTGGG
AAACTTCTTGTGGTTTGTTCAAGGAGTTGCAGTCATACAACGACTAAATCAAAAACTCGC
ATGGTTCATAGATTCTCATTTCAACAGTAAACGGTGGTACACATAAACTGAAATCAGATA
AGAGTTTCTATTTTTTTTGTTTGTAACATGTATTGTATCCTTCCAAGGTTTAAATTTAAT
GATAAAACATATACTTTTTTCC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

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GACTTACTCACCTGAGATGAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTC
TGATTTCGTAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGT
TCGTTGTATCGACAAGTGGCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCT
GGTTGAGACATGTCAAAAGATATTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAAC
ACCAAGGGAGAGCATAGAGGTGAGAATTGATCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAGCAC
TTTTAGAGAAAGCAGCTAGAGAGTATGTGCGAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAGT
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CAATGGAGCCTTTTTGTTTATTTTTTATTTTGCCCTGAAGCTCAAAATGTAAAGAGAATA
TATCTTAAGCTTTTCATGGCATCATAAGTTCATC


BQ
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AF RR4FH77TF U 1
AF RR4FH77JQ C 97
BS 1 694 RR4FH77TF

RD RR4FH77TF 694 0 0
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CGCATTTAGACGTTCCTCGAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACC
ACGAGGCTCAGCAGCTAACAAAGGCATCAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGT
GACTTACTCACCTGAGATGAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTC
TGATTTCGTAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGT
TCGTTGTATCGACAAGTGGCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCT
GGTTGAGACATGTCAAAAGATATTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAAC
ACCAAGGGAGAGCATAGAGGTGAGAATTGATCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAGCAC
TTTTAGAGAAAGCAGCTAGAGAGTATGTGCGAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAGT
TCGTCAACAACATTGGAACAGAGTTTATGTCTCTAGCCAGTAGGATTCCAAAATCAAACA
CAATGGAGCCTTTTTGTTTATTTTTTATTTTGCCCTGAAGCTCAAAATGTAAAGAGAATA
TATCTTAAGCTTTTCATGGCATCATAAGTTCATC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4FH77JQ 598 0 0
TCCCATCCCAATCCCGTCCACACCACGAGGCTCAGCAGCTAACAAAGGCATCAAGAAGAA
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CGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCC
AAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAAGTGGCTTACACAACATATGAC
TTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGTTGAGACATGTCAAAAGATATTAGGAGATTGCGA
TGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAACACCAAGGGAGAGCATAGAGGTGAGAATTGATCCTGT
AGAACCTGAAGCAAGAGTCAGCACTTTTAGAGAAAGCAGCTAGAGAGTATGTGCGAATAA
ACAACTAGATTTCAAGATTTTAGTTCGTCAACAACATTGGAACAGAGTTTATGTCTCTAG
CCAGTAGGATTCCAAAATCAAACACAATGGAGCCTTTTTGTTTATTTTTTATTTTGCCCT
GAAGCTCAAAATGTAAAGAGAATATATCTTAAGCTTTTCATGGCATCATAAGTTCATC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL7366Contig1 862 2 4 U
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TGTTCTCCGGCGAAGTAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTT
CAAAACATGCTTGGAACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAAT
CACACTTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCCATCCTCGAGTGGATTGCTTCA
GTCGCAGCCATATACTTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACA
TCACTATTGATTCCTTACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCTGTCATCTTTAGCCTTTTCAGA
GGAGAAGTTGGTAAATGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAA
CACTTCCGAGGTTTGTTACCATTCTAAACTTCATTAGCTTCATGTCTGATTGGCTTATCT
CTCTGTTGTTGTTGTTTATCAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGGTCCTACTCATC
GTGGTGGCTCCGAATCTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCTATTTATA
TGCTTAGGGATTGGAGGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGTTTCTGGTGGATTCAAA
AACGCATTCACTAAAGCTAATGGCATCTCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTC
TACCCCGTTTGGGCTATCACCTTTTAAGCAAAAGATCATTTCACAACTCTCTGTATCTTT
GTACCCCATTTGTTTTATGTAAAAGTGAGTTTGTATGATTCCGCCCCTAATAACTTGTCA
ACCAATGTTTTGTTTTAGTTTT


BQ
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AF RR4DU59TF U 1
AF RR4DU59JQ C 76
BS 1 691 RR4DU59TF
BS 692 692 RR4DU59JQ
BS 693 751 RR4DU59TF
BS 752 862 RR4DU59JQ

RD RR4DU59TF 751 0 0
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TGTTCTCCGGCGAAGTAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTT
CAAAACATGCTTGGAACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAAT
CACACTTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCCATCCTCGAGTGGATTGCTTCA
GTCGCAGCCATATACTTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACA
TCACTATTGATTCCTTACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCTGTCATCTTTAGCCTTTTCAGA
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CACTTCCGAGGTTTGTTACCATTCTAAACTTCATTAGCTTCATGTCTGATTGGCTTATCT
CTCTGTTGTTGTTGTTTATCAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGGTCCTACTCATC
GTGGTGGCTCCGAATCTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCTATTTATA
TGCTTAGGGATTGGAGGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGTTTCTGGTGGATTCAAA
AACGCATTCACTAAAGCTAATGGCATCTCCA*CACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTC
TACCCCGTTTGGGCTATCACCTTTTAAGCAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR4DU59JQ 787 0 0
TAAATGACTTTCACGGCGATGAGGAGGAGTGACCATGGAACCCTTCAAAACATGCTTGGA
ACAGATCTCAACGAGCTCGCCACAGCTGCTAAGAACCTTGCTAATCACACTTTCATGCTC
ACTGGTTTAGGCTTTGGTACTTCCATCCTCGAGTGGATTGCTTCAGTCGCAGCCATATAC
TTGTTGGTCTTGGACCGAACTAACTGGAAGACCAATATGCTCACATCACTATTGATTCCT
TACATCTTCTTCAGCCTTCCTTCTGTCATCTTTAGCCTTTTCAGAGGAGAAGTTGGTAAA
TGGATTGCGATTGTAGCTGTTGTTCTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGGTTTG
TTACCATTCTAAACTTCATTAGCTTCATGTCTGATTGGCTTATCTCTCTGTTGTTGTTGT
TTATCAGAATGGTTTGAGTTACCGGCTGCTGCGGTCCTACTCATCGTGGTGGCTCCGAAT
CTAATAGCCTACACATTCAGAGACAACTGGGTTGGCCTATTTATATGCTTAGGGATTGGA
GGTTACTTGCTTCAAGAACACATTAGAGTTTCTGGTGGATTCAAAAACGCATTCACTAAA
GCTAATGGCATCTCCAACACCCTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTACCCCGTTTGGGCT
ATCACCTTTTAAGCAAAAGATCATTTCACAACTCTCTGTATCTTTGTACCCCATTTGTTT
TATGTAAAAGTGAGTTTGTATGATTCCGCCCCTAATAACTTGTCAACCAATGTTTTGTTT
TAGTTTT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL7367Contig1 640 2 3 U
TGAGAGAAAGCCATCAAAATAAACCAGAAAACTACATAGTAAGTAGAGATCATAAAGAAG
AAAAAGTAAATCCTAAGTTCAAAAAAAACAACAAAGAAGCATAGACATTGGCAGTAAAAC
CAGATCAAATCTATCATTCTACTGGCTTGTTCTTTTAGATGCTTCAGCGATCATAGATGT
CAGATCACGCAAAATCTCAGTCTTCTGTAACACAAACTCAATCTCCTTAGCCTGCAACAC
CTTAACCTTCTCTTCAACTTTCTTCCTAGTCTCAACCGGAACCAACCTCCACCTCTGCTT
CACATAACTCTCATCGACACCGAAACCCGCAATCCCTCGAACGAAAAACGACTTCTCAAA
CCAATCAAACCTCTCATCACCATTGGGAGGAGAAGAAGCAAAAGACAGCTCTTTCTTCCC
AGAGTCATCAACAACCTTCTTCTTGGTCTTGTTTTTCGAAACGACGCCGTTGGACTTAAC
AGCAGAATCAAGACCCATCCCATCAGGTCCCCATATGTACTTGCACAACCTGTAAGACTT
GTGTTCATGAGGCTTGGTGAAAGAAGTCCTCTTATCTTTACCCATATACTTCTTCTTTAA
ACTCCTGAGCTTATCCATGAACTGGTTCTTGCTAACCTCC


BQ
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AF RR4EI45TF C 1
AF RR4EI45JQ U 2
BS 1 1 RR4EI45TF
BS 2 607 RR4EI45JQ
BS 608 640 RR4EI45TF

RD RR4EI45TF 640 0 0
TGAGAGAAAGCCATCAAAATAAACCAGAAAACTACATAGTAAGTAGAGATCATAAAGAAG
AAAAAGTAAATCCTAAGTTCAAAAAAAACAACAAAGAAGCATAGACATTGGCAGTAAAAC
CAGATCAAATCTATCATTCTACTGGCTTGTTCTTTTAGATGCTTCAGCGATCATAGATGT
CAGATCACGCAAAATCTCAGTCTTCTGTAACACAAACTCAATCTCCTTAGCCTGCAACAC
CTTAACCTTCTCTTCAACTTTCTTCCTAGTCTCAACCGGAACCAACCTCCACCTCTGCTT
CACATAACTCTCATCGACACCGAAACCCGCAATCCCTCGAACGAGAAACGACTTCTCAAA
CCAATCAAACCTCTCATCACCATTGGGAGGAGAAGAAGCAAAAGACAGCTCTTTCTTCCC
AGAGTCATCAACAACCTTCTTCTTGGTCTTGTTTTTCGAAACGACGCCGTTGGACTTAAC
AGCAGAGTCAAGACCCATCCCATCAGGTCCCCATATGTACTTGCACAACCTGTAAGACTT
GTGTTCATGAGGCTTGGTGAAAGAAGTCCTCTTATCTTTACCCATATACTTCTTCTTTAA
ACTCCTGAGCTTATCCATGAACTGGTTCTTGCTAACCTCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4EI45JQ 606 0 0
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AAAAGTAAATCCTAAGTTCAAAAAAAACAACAAAGAAGCATAGACATTGGCAGTAAAACC
AGATCAAATCTATCATTCTACTGGCTTGTTCTTTTAGATGCTTCAGCGATCATAGATGTC
AGATCACGCAAAATCTCAGTCTTCTGTAACACAAACTCAATCTCCTTAGCCTGCAACACC
TTAACCTTCTCTTCAACTTTCTTCCTAGTCTCAACCGGAACCAACCTCCACCTCTGCTTC
ACATAACTCTCATCGACACCGAAACCCGCAATCCCTCGAACGAAAAACGACTTCTCAAAC
CAATCAAACCTCTCATCACCATTGGGAGGAGAAGAAGCAAAAGACAGCTCTTTCTTCCCA
GAGTCATCAACAACCTTCTTCTTGGTCTTGTTTTTCGAAACGACGCCGTTGGACTTAACA
GCAGAATCAAGACCCATCCCATCAGGTCCCCATATGTACTTGCACAACCTGTAAGACTTG
TGTTCATGAGGCTTGGTGAAAGAAGTCCTCTTATCTTTACCCATATACTTCTTCTTTAAA
CTCCTG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7368Contig1 407 2 2 U
GGAGACTTCTTAAATTTTTTTCATCAACGAGTGAGTTTGAACAAAACAGATTATTATTCT
TTAACAGAGATAAGGGAACAAGATTCATTACATATCAAGGGATTACATGAAAATGAGAAG
AAAAAAAGAAGCCAGTCTTGTTAATCAAGAGATTAAGTTTGGAGATACAATGAGGAGGAG
GAATTAACCACCTCTAGCTTCTCTTCTAGCGGCATCATGAAGTAGATCAACATCGACTCC
ATCAGGAGGTAACTGTACGTACCTCACCACTGATCCTCTGATGAAACAGTTTCTCACCGA
AAGCATGTGAGGGAACTTGTCCTGATCAACAACCCTAGTGTTCTCGAGCTTGATGTTGAG
GTACTGATCAACTGAATGAAGAGTCCCTCTGATTGCTAGATCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E745TF C 1
AF RR4E745JQ U 2
BS 1 7 RR4E745TF
BS 8 407 RR4E745JQ

RD RR4E745TF 224 0 0
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TTAACAGAGATAAGGGAACAAGATTCATTACATATCAAGGGATTACATGAAAATGAGAAG
AAAAAAAGAAGCCAGTCTTGTTAATCAAGAGATTAAGTTTGGAGATACAATGAGGAGGAG
GAATTAACCACCTCTAGCTTCTCTTCTAGCGGCATCATGAAGTA

QA 1 224 1 224
DS 

RD RR4E745JQ 406 0 0
GGAGAC
TCTTAAATTTTTTTCATCAACGAGTGAGTTTGAACAAAACAGATTATTATTCTTTAACAG
AGATAAGGGAACAAGATTCATTACATATCAAGGGATTACATGAAAATGAGAAGAAAAAAA
GAAGCCAGTCTTGTTAATCAAGAGATTAAGTTTGGAGATACAATGAGGAGGAGGAATTAA
CCACCTCTAGCTTCTCTTCTAGCGGCATCATGAAGTAGATCAACATCGACTCCATCAGGA
GGTAACTGTACGTACCTCACCACTGATCCTCTGATGAAACAGTTTCTCACCGAAAGCATG
TGAGGGAACTTGTCCTGATCAACAACCCTAGTGTTCTCGAGCTTGATGTTGAGGTACTGA
TCAACTGAATGAAGAGTCCCTCTGATTGCTAGATCGTTCC

QA 7 406 7 406
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7370Contig1 671 2 1 U
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AAATTGCCAAACTACGTAATCCCTGATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTATCT
CAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAA
TATGTCCCGAGTCTTAATAAGCTTGAGCAATGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTATTTCT
TTAGTCCTTTTTCTGTTTTTACAAGAACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATG
ATACATATAAGGATTGTTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCCATTGTTCTCCACTCC
AGTTTCCTTTCTTCATTGTATCTTATTGTTATCAGAGTCGGAGAACAAGTTGCAGACATT
TTATTACGGCCATCGTCACTACTTGTTTGGTCCCCTGGCAACTATAATTTATGCAAAGTT
ATTACTTGCAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G042JQ C 1
AF RR4G042TF U 1
BS 1 671 RR4G042TF

RD RR4G042JQ 671 0 0
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CGGATAGCGAGGATGACGCTAGGGTTGTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTCCGACGGAAG
AGAGCGTCGTCACTTGATATTCTCTCTCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGC
AAAAACTGCAAGCCTACTGGTTTCAACACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGAT
AAATTGCCAAACTACGTAATCCCTGATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTATCT
CAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAA
TATGTCCCGAGTCTTAATAAGCTTGAGCAATGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTATTTCT
TTAGTCCTTTTTCTGTTTTTACAAGAACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATG
ATACATATAAGGATTGTTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCCATTGTTCTCCACTCC
AGTTTCCTTTCTTCATTGTATCTTATTGTTATCAGAGTCGGAGAACAAGTTGCAGACATT
TTATTACGGCCATCGTCACTACTTGTTTGGTCCCCTGGCAACTATAATTTATGCAAAGTT
ATTACTTGCAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4G042TF 671 0 0
GGGCACACTCTCTCTGAACAGTCCACACCGTTCTTCTCCTCCCAAATTCTCCGACGGCGA
CGGATAGCGAGGATGACGCTAGGGTTGTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTCCGACGGAAG
AGAGCGTCGTCACTTGATATTCTCTCTCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGC
AAAAACTGCAAGCCTACTGGTTTCAACACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGAT
AAATTGCCAAACTACGTAATCCCTGATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTATCT
CAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAA
TATGTCCCGAGTCTTAATAAGCTTGAGCAATGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTATTTCT
TTAGTCCTTTTTCTGTTTTTACAAGAACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATG
ATACATATAAGGATTGTTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCCATTGTTCTCCACTCC
AGTTTCCTTTCTTCATTGTATCTTATTGTTATCAGAGTCGGAGAACAAGTTGCAGACATT
TTATTACGGCCATCGTCACTACTTGTTTGGTCCCCTGGCAACTATAATTTATGCAAAGTT
ATTACTTGCAC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL7371Contig1 1082 2 2 U
GGAACTCAAGAAGTCTTCGAAACTCAAAATTCAACGGAGAAGGAGGAGGAAGAGAGAAGA
GATGACGAGCAAGATTCTGGTGATCGGGGCGACGGGTTACATAGGAAAAGTCTTCGTGGA
GGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACGCCACTTTCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTCCGA
TCCCGTTAAGGCCGAACTCGTCCAGAGTTTCAAAGACCTTGGCGTCACCATACTCTACGG
AAGCATAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAGCGATCAAACAAGTAGATGTCGTGATATC
TGCTCTTGGTCGAACTCAGATTCTAGATCAGGTCAACATCATTGATGCAATCAAAGAAGC
TGGAAATGCCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGGAATGACGTGGACCGTACGGTGGC
CATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGAAAGCTCAAATACGTCGTGCCATAGAAGC
CGCGGGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTACCTAG
TTTGGGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTCCTCCTACTGACAAAGTTTCCATCTACGA
CAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACAGAAGAAGACATTGTTGCGTATACAATGAA
AGCTGTTGATGACTCGAGAACACTCAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACAT
TGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATAGGTAAGACTCTGGAGAA
GATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGA
TTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGTGCAAGGTGATCTCACCTCCTTCACTAT
AGACCCTTCTGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCTTTACCCTGACGTCAAGTACACCAGTGT
CGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGAAACAAACAAACCTCCTTTTATTTTGCATGT
ACTGTTTTAATAAATCTGAGATCCATTACATTCGAATTTTTTAGACGCTAATCTTTTAAC
CC


BQ
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10 10 

AF RR4AL52TF U 1
AF RR4AL52JQ C 270
BS 1 792 RR4AL52TF
BS 793 1082 RR4AL52JQ

RD RR4AL52TF 792 0 0
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GATGACGAGCAAGATTCTGGTGATCGGGGCGACGGGTTACATAGGAAAAGTCTTCGTGGA
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GATTTATGTTTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4AL52JQ 813 0 0
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AATTTGGGAATGACGTGGACCGTACGGTGGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCA
TGAAAGCTCAAATACGTCGTGCCATAGAAGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTTGTCA
CAGGTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAA
CTCCTCCTACTGACAAAGTTTCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACA
CAGAAGAAGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCTGTTGATGACTCGAGAACACTCAACA
AGATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGT
GGGAGAGAAAGATAGGTAAGACTCTGGAGAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCA
AAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTAC
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AAACAAACAAACCTCCTTTTATTTTGCATGTACTGTTTTAATAAATCTGAGATCCATTAC
ATTCGAATTTTTTAGACGCTAATCTTTTAACCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGTGCTTACGTTTTCTTTTATGTTTGTTTCTTTACAAAACCGTTTATTAAGATATAAAGT
TACATGTAGAGAGGG


BQ
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AF RR4C969JQ C 1
AF RR4C969TF U 1
BS 1 675 RR4C969TF

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GGCGAGAGGAGGCAGTACATGCACACATGAGCGCATGTTCCCGGTTTAATAGACTAGGCC
GGAGTTATCCGGCGTTGTACCAAGCAGAAGCGGTTAATGAGATTCTGAAGAAGAGGTCTA
ACAAGATGGTCAGAGCTACCAAGTCTGAAAAAGGTGGTCTCACTAGGAGCTCTAGCTGCA
TGCCTGCTTTGGCTAAGGAGCTAAAAGATCGTACATTTGTTAATAAGTAGCATATATATG
TGTGCTTACGTTTTCTTTTATGTTTGTTTCTTTACAAAACCGTTTATTAAGATATAAAGT
TACATGTAGAGAGGG

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DS 

RD RR4C969TF 675 0 0
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CGATATCCGAAGTGGAAGATGCAAAGTGTGAGTGTTGTGGCATGTCTGAAGAGTGCACGC
CGGAGTACATAGACCGTGTGCGTTCAAAATTCTCAGGGAAGCTGATTTGCGGGTTGTGCG
CAGAAGCAGTGGAGCAAGAGATGGAGAAGATGAACAATAGTGAATTGGTGATGGAGAAAC
GGCGAGAGGAGGCAGTACATGCACACATGAGCGCATGTTCCCGGTTTAATAGACTAGGCC
GGAGTTATCCGGCGTTGTACCAAGCAGAAGCGGTTAATGAGATTCTGAAGAAGAGGTCTA
ACAAGATGGTCAGAGCTACCAAGTCTGAAAAAGGTGGTCTCACTAGGAGCTCTAGCTGCA
TGCCTGCTTTGGCTAAGGAGCTAAAAGATCGTACATTTGTTAATAAGTAGCATATATATG
TGTGCTTACGTTTTCTTTTATGTTTGTTTCTTTACAAAACCGTTTATTAAGATATAAAGT
TACATGTAGAGAGGG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL7374Contig1 682 2 8 U
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GGTAAGACCACTAAGTGTCCTCAAACTCCTCATCACTATCCCCATAAACATTCACATCCT
CCTCTGCATAACCATCAAAGAACTCCTCATCGTCATCAAGGGCCATTCTCACATGTCTCT
CTAATGTCTCCTCGTCTTTTGATTCATCGTCAGAGGCTTCACTCTTCTCTTCTTCATCTT
CATCTTCATCTTCCTCTTCCTCATCACCTTCTTCTTTTTCTGTTTTCTTCTTCCTCCTCC
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GAGTCACAGTCTGATTCATCATCAGGTCCATCCCAGAACTCTTCTTCCTCCTCCACTGTG
ACAAGAGGAAACTGGTGCTTAGAACTGTCTTCACTGATATCCATCTCTTCGTTTACAGCA
TAGAAATCATAAACGTATTCTTCAGCATGACTGGAATGGATATCAGCTTCAATCTCTTCA
GCTGCTGTTGGAATACATTCTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK79JQ U 1
AF RR4D740JQ U 53
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BS 675 682 RR4D740JQ

RD RR4GK79JQ 674 0 0
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GGTAAGACCACTAAGTGTCCTCAAACTCCTCATCACTATCCCCATAAACATTCACATCCT
CCTCTGCATAACCGTCAAAGAACTCCTCATCGTCATCAAGGGCCATTCTCACATGTCTCT
CTAATGTCTCCTCGTCTTTTGATTCATCGTCAGAGGCTTCACTCTTCTCTTCTTCATCTT
CATCTTCATCTTCCTCTTCCTCATCACCTTCTTCTTTTTCTGTTT*CTTCTTCCTCCTCC
TCTTCAGAGATCTCGTCTGGGTAATCATTCCTCGGATGATCTTCAGCGTTCGAATCATCA
GAGTCACAGTCTGATTCATCATCAGGTCCATCCCAGAACTCTTCTTCCTCCTCCACTGTG
ACAAGAGGAAACTGGTGCTTAGAACTGTCTTCACTGATATCCATCTCTTCGTTTACAGCA
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GCTGCTGTTGGAAT

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DS 

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GC
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ATCCCCGGTAAGACCACTAAGTGTCCTCAAACTCCTCATCGCTATCCCCATAAACATTCA
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GTCTCTCTAATGTCTCCTCGTCTTTTGATTCATCGTCAGAGGCTTCACTCTTCTCTTCTT
CATCTTCATCTTCATCTTCCTCTTCCTCATCACCTTCTTCTTTTTCTGTTTTCTTCTTCC
TCCTCCTCTTCAGAGATCTCGTCTGGGTAATCATTCCTCGGATGATCTTCAGCGTTCGAA
TCATCAGAGTCACAGTCTGATTCATCATCAGGTCCATCCCAGAACTCTTCTTCCTCCTCC
ACTGTGACAAGAGGAAACTGGTGCTTAGAACTGTCTTCACTGATATCCATCTCTTCGTTT
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TCTTCAGCTGCTGTTGGAATACATTCTC

QA 3 630 3 630
DS 



AS 1 2

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TGCTGAATGAGTGTATTAATTTGTTCTCACAAATATGTCGTTATGGACAACTCATGTATT
GTTAAAATTACATTTTACATTGTTAAAGATTACATGGTCTCCCCACATATTTCCATGCC


BQ
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AF RR4AI37JQ C 1
AF RR4AI37TF U 1
BS 1 599 RR4AI37TF

RD RR4AI37JQ 599 0 0
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TGATTGGAGGAACTTGTTATATCAAAACTCTAAGGAGGGTTTTTTTCGTAACATAGTCAC
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GTTAAAATTACATTTTACATTGTTAAAGATTACATGGTCTCCCCACATATTTCCATGCC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4AI37TF 599 0 0
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TATGAAAATGTGGGAATCAAAGCTGATCATGAAGGTGTTTACTTTTCTTCTTTTTGTAGG
GACATAAGATTACGGCATCTGTTATTATATGCTTTACATCTTCTGGAAGCTCAGGAAGGT
TGATTGGAGGAACTTGTTATATCAAAACTCTAAGGAGGGTTTTTTTCGTAACATAGTCAC
ATATACGTACAGGTTTAAGGGAGAATCAACAAGTGCCACGAACGAGGTAGTCCTCAAGGA
TCATCTAGCTAAAGGATTTGATAAAATGAGAGGTATACTCTTTTTTCTTTATCAATCCAA
TGCTGAATGAGTGTATTAATTTGTTCTCACAAATATGTCGTTATGGACAACTCATGTATT
GTTAAAATTACATTTTACATTGTTAAAGATTACATGGTCTCCCCACATATTTCCATGCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL7376Contig1 917 2 8 U
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TTGGTGTGGTGAAGTCGTGCACTGAGGGACAGAGGAGTTACGATATCCCTGTGCCGGTTT
CTAACTTGGGCCAACAGTTTGGGAGTCTTTTGGAAAGTGGGAAAGGTTGCGATGTTAGTT
TTGGAGTCGATGGAGAAACATTCTCTGCGCATAAGCTGGTTCTCGCGACGCGTTCTCCAG
TTTTCAGGGCACAGCTTTTTGGCCCGTTGAGAGACAGTAACACTGACCGGATAGAGATAG
AAGACATGGAGCCTTCCATTTTCAAGGTTCTGCTCCATTTTATCTACTGGGACGAGTTGC
CTGACATGGAAGAGTTAATGGGCATAACAGACTCTAGATCAGCTTCTACTCTTGTGGCTC
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CGAAACTTTGTGAAGGAATTACAATAAACACGGTTGCAACCACCTTGGCCTTAGCGGTGC
TGGTAGCGGAGAAGGTGGTGGTGGCTATTTACCGTAAAATTATATCTATGTGGAGCGTAA
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ACGAAGATGAAAATACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB42TF U 1
AF RR4FB42JQ C 117
BS 1 698 RR4FB42TF
BS 699 699 RR4FB42JQ
BS 700 724 RR4FB42TF
BS 725 725 RR4FB42JQ
BS 726 735 RR4FB42TF
BS 736 736 RR4FB42JQ
BS 737 769 RR4FB42TF
BS 770 917 RR4FB42JQ

RD RR4FB42TF 781 0 0
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GCGGGCCTTATACTCTCAAGTATCGTGGAAGCATGTGGGGATACAAGAGGTTTTTCAAGA
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TTGGTGTGGTGAAGTCGTGCACTGAGGGACAGAGGAGTTACGATATCCCTGTGCCGGTTT
CTAACTTGGGCCAACAGTTTGGGAGTCTTTTGGAAAGTGGGAAAGGTTGCGATGTTAGTT
TTGGAGTCGATGGAGAAACATTCTCTGCGCATAAGCTGGTTCTCGCGACGCGTTCTCCAG
TTTTCAGGGCACAGCTTTTTGGCCCGTTGAGAGACAGTAACACTGACCGGATAGAGATAG
AAGACATGGAGCCTTCCATTTTCAAGGTTCTGCTCCATTTTATCTACTGGGACGAGTTGC
CTGACATGGAAGAGTTAATGGGCATAACAGACTCTAGATCAGCTTCTACTCTTGTGGCTC
AGCATTTGCTTGCAGCGGCAGACCGTTACGCTCTTGAGCGGCTTAAAGTGATCTGCGAGT
CGAAACTTTGTGAAGGAATTACAATAAACACGGTTGCAACCACCTTGGCCTTAGCGGTGC
TGGTAGCGGAGAAGGTGGTGGTGGCTATTTACCGTAAA*TTATATCTATGTGGAGCGTAA
GGGC*ACTGAGTCAG*TGTCATGTATAACTCGCAAGAGACTATGTATTT
CACATATATGCA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4FB42JQ 801 0 0
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CGTGTTGGTGTGGTGAAGTCGTGCACTGAGGGACAGAGGAGTTACGATATCCCTGTGCCG
GTTTCTAACTTGGGCCAACAGTTTGGGAGTCTTTTGGAAAGTGGGAAAGGTTGCGATGTT
AGTTTTGGAGTCGATGGAGAAACATTCTCTGCGCATAAGCTGGTTCTCGCGACGCGTTCT
CCAGTTTTCAGGGCACAGCTTTTTGGCCCGTTGAGAGACAGTAACACTGACCGGATAGAG
ATAGAAGACATGGAGCCTTCCATTTTCAAGGTTCTGCTCCATTTTATCTACTGGGACGAG
TTGCCTGACATGGAAGAGTTAATGGGCATAACAGACTCTAGATCAGCTTCTACTCTTGTG
GCTCAGCATTTGCTTGCAGCGGCAGACCGTTACGCTCTTGAGCGGCTTAAAGTGATCTGC
GAGTCGAAACTTTGTGAAGGAATTACAATAAACACGGTTGCAACCACCTTGGCCTTAGCG
GTGCTGGTAGCGGAGAAGGTGGTGGTGGCTATTTACCGTAAAATTATATCTATGTGGAGC
GTAAGGGCCACTGAGTCAGGTGTCATGTATAACTCGCAAGAGACTATGTATTTTCAACAT
ATATGCATGTGGTAATAAGTACGCAAATCCTCTGTACAATAAGGCCTAAAACGGCTATTG
TTGAAGTTTTTAATTGTACCAAAGTTGTATGCTGCTTCGTGTCGCGTGTGTCAAGTTTAT
ATGAACGAAGATGAAAATACC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL7377Contig1 936 2 2 U
GGCGACCGGGAAGGATAAGGAGATCTTCAAAGGCAAAGGTTGTCTCGTTGGGATGAAGAA
AACACTTGTGTTTTATAGAGGACGAGCTCCACGAGGTGAAAAGACGAATTGGGTCATGCA
TGAATATCGTCTTGAAGGCATATATTCTTATCACAATCTCCCCAAAACCGCAAGGGACGA
GTGGGTCGTGTGTAGGGTTTTTCACAAGAACAATCCTTCCACTACAACTCAACAAATGAC
GAGAATACCCACTGGAGATCTCACAAGAACGGATTCTCTAAAGAACATTGATCATTTCCT
AGACTTCTCATCTCTACCTCCTCTCATAGATCCGAGTTTCACGGGTCAACCCAACTTCAA
ACCTATCAACCCTCCCACCTACGACACCCCGTCACCAATCCAACTACATCAGTTCAATTC
TAGCCACCAACCAATCTTTAACCACCAGGGTTTTGGTTCTGCCTCTGGTTCTGGCTCTAC
ATACTACAACAACAGGGAGATGATCAAGATGGAGCAGTCTCTTGTTAGTGTATCTCAAGA
AACATGCCTAAGCTCAGATGTGAACGCGACCACGACCACGGAGGTGTCTTCTGGTCCGGT
AATGAAGCAAGAGATGAGTATGATGGGAATGGTGAACGGTAGCAAGTCTTATGAAGATCT
ATGTGACTTGAGGGGGATCTTGTGGGACTACTGAATAATTTTACCTAGCTTTGGGATAAT
TATGGTTATTTTATTATTTAATTGTGGTGAAAGAGTATATTTGTTGGTAGTTATTACATA
TACATATAGGATTTACTAGGGGATTTATCCTAATTATGTTTGCTTCATTGATCTTATTTA
GTTGATTGGTTAATTAGGGGTTGTGATTATTTGGGATTTTTAGTGCATAGGTAATATATA
TTTCTTGTACACTGTATAATACATATACTTTCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AJ47TF U 1
AF RR4AJ47JQ C 226
BS 1 824 RR4AJ47TF
BS 825 936 RR4AJ47JQ

RD RR4AJ47TF 824 0 0
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TGAATATCGTCTTGAAGGCATATATTCTTATCACAATCTCCCCAAAACCGCAAGGGACGA
GTGGGTCGTGTGTAGGGTTTTTCACAAGAACAATCCTTCCACTACAACTCAACAAATGAC
GAGAATACCCACTGGAGATCTCACAAGAACGGATTCTCTAAAGAACATTGATCATTTCCT
AGACTTCTCATCTCTACCTCCTCTCATAGATCCGAGTTTCACGGGTCAACCCAACTTCAA
ACCTATCAACCCTCCCACCTACGACACCCCGTCACCAATCCAACTACATCAGTTCAATTC
TAGCCACCAACCAATCTTTAACCACCAGGGTTTTGGTTCTGCCTCTGGTTCTGGCTCTAC
ATACTACAACAACAGGGAGATGATCAAGATGGAGCAGTCTCTTGTTAGTGTATCTCAAGA
AACATGCCTAAGCTCAGATGTGAACGCGACCACGACCACGGAGGTGTCTTCTGGTCCGGT
AATGAAGCAAGAGATGAGTATGATGGGAATGGTGAACGGTAGCAAGTCTTATGAAGATCT
ATGTGACTTGAGGGGGATCTTGTGGGACTACTGAATAATTTTACCTAGCTTTGGGATAAT
TATGGTTATTTTATTATTTAATTGTGGTGAAAGAGTATATTTGTTGGTAGTTATTACATA
TACATATAGGATTTACTAGGGGATTTATCCTAATTATGTTTGCT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4AJ47JQ 711 0 0
AACTCAACAAATGACGAGAATACCCACTGGAGATCTCACAAGAACGGATTCTCTAAAGAA
CATTGATCATTTCCTAGACTTCTCATCTCTACCTCCTCTCATAGATCCGAGTTTCACGGG
TCAACCCAACTTCAAACCTATCAACCCTCCCACCTACGACACCCCGTCACCAATCCAACT
ACATCAGTTCAATTCTAGCCACCAACCAATCTTTAACCACCAGGGTTTTGGTTCTGCCTC
TGGTTCTGGCTCTACATACTACAACAACAGGGAGATGATCAAGATGGAGCAGTCTCTTGT
TAGTGTATCTCAAGAAACATGCCTAAGCTCAGATGTGAACGCGACCACGACCACGGAGGT
GTCTTCTGGTCCGGTAATGAAGCAAGAGATGAGTATGATGGGAATGGTGAACGGTAGCAA
GTCTTATGAAGATCTATGTGACTTGAGGGGGATCTTGTGGGACTACTGAATAATTTTACC
TAGCTTTGGGATAATTATGGTTATTTTATTATTTAATTGTGGTGAAAGAGTATATTTGTT
GGTAGTTATTACATATACATATAGGATTTACTAGGGGATTTATCCTAATTATGTTTGCTT
CATTGATCTTATTTAGTTGATTGGTTAATTAGGGGTTGTGATTATTTGGGATTTTTAGTG
CATAGGTAATATATATTTCTTGTACACTGTATAATACATATACTTTCATAT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7378Contig1 891 2 6 U
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TGGAGCGACGCTCAGAACTTGGCTACCTTTTTGGGACAACAACTACGCAACCTTCATCAA
CTGCCATATCCTCCAGTCACACGTCCTGAGTTATTAAATGCAAACGATGTTCATGAGGAG
TTGAAGATTCCACCAGAATGGAAAGTCTTTGTCGATGATCTGTGCCAAAAGAAGAAAGAC
GTCACTAATCGTCTAAAAAACTGGGGAAATCCTATCCCTAAGACTTTGATGAACAAAATA
GACGAATACATGCCTGATGAGTTCTTTGTAGATTTACTCCATGTTTTCAAGGACATTGAT
GTTGGAGACGAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAACATC
CACATGGAACCATACGCAGATGATGATTCGGTTGATGGTCTACACAACTCATGGCGTCCC
GGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTACAACTTGATACCT
ATACACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTGATCTTTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGCTAC
GGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACACTACGACGAAGAAAGTACTG
TCTCCTTCCCCGCACAATGTGTTATTGTATATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAAT
GTTTAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAGCTGAATCATGGGAACAGGTTGAACTCACTGT
TTGGAGTCTACTCAACTCGTACTAATCTCTTTCCAACCAATAATTTATATTACACATCAC
CAAACTAAATGTGTCTAAAATAAATCAATGCCGTAAAAGAACTTTATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G352TF U 1
AF RR4G352JQ C 252
BS 1 699 RR4G352TF
BS 700 700 RR4G352JQ
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BS 705 705 RR4G352JQ
BS 706 740 RR4G352TF
BS 741 891 RR4G352JQ

RD RR4G352TF 740 0 0
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TTGAAGATTCCACCAGAATGGAAAGTCTTTGTCGATGATCTGTGCCAAAAGAAGAAAGAC
GTCACTAATCGTCTAAAAAACTGGGGAAATCCTATCCCTAAGACTTTGATGAACAAAATA
GACGAATACATGCCTGATGAGTTCTTTGTAGATTTACTCCATGTTTTCAAGGACATTGAT
GTTGGAGACGAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAACATC
CACATGGAACCATACGCAGATGATGATTCGGTTGATGGTCTACACAACTCATGGCGTCCC
GGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTACAACTTGATACCT
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GTTTAGTATCTGGGATGAAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4G352JQ 640 0 0
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AACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACC
ATACGCAGATGATGATTCGGTTGATGGTCTACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCT
TGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTACAACTTGATACCTATACACTTGGA
CGTGTTCAGAGGAGACACTGATCTTTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGCTACGGCCTTCCTTT
AATCAGAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACACTACGACGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCCC
GCACAATGTGTTATTGTATATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTTAGTATCT
GGGATGAACTTCGGACAGCTGAATCATGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGTCTAC
TCAACTCGTACTAATCTCTTTCCAACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTAAATG
TGTCTAAAATAAATCAATGCCGTAAAAGAACTTTATAACC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7379Contig1 599 2 1 U
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CTTGATCTTACGCTGAATGTTTAATATAATAACCTATATAAGTGTGGTTCTTGTTCCTCG
ATAATATGATATAAGACACTATTATTATATTGTTGATATAGAGTATTTTTCATACTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FK12TF U 1
AF RR4FK12JQ C 115
BS 1 599 RR4FK12TF

RD RR4FK12TF 599 0 0
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TCTGAATCTGCTTTACTTTCGTTCAAACATGAACAACATCGACGATACGACGTCTCCCGC
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AAATCAAGAAAACGAGAGAGCGGTCACTGGGAGAGAGAAACTAAAGAAGCACAGGAGAGA
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QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4FK12JQ 485 0 0
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GAGAGAGATGGCAGGAAGAGTTTGGATACCAGAGATATGGGGACAAGAAGACCTTCTTAA
GGACTGGATCGACTGTTCGACGTTTGATACGTGTTTAGTCCCTAACGGGATCTCGTCAGC
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TCCTCGATAATATGATATAAGACACTATTATTATATTGTTGATATAGAGTATTTTTCATA
CTACT

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL7380Contig1 671 2 1 U
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TATACTTGTAAAAATTGTTCTTATTTGTTTAACTGTATTTAAAATTTATAAATTAAACTT
AGGTGTTATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F875JQ C 1
AF RR4F875TF U 1
BS 1 671 RR4F875TF

RD RR4F875JQ 671 0 0
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CACACCATTTATTTGTTATACTTGTAATGACCAATGATATATTTGTAAATATATCAATGA
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AGGTGTTATTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4F875TF 671 0 0
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AAAAATGAAAAATATTTCAATCTTTCTATTTGTTTTTACACTTTTCATGATCGACAGTGT
ATATGGTGCCAATTTATTGAAAGGGCAGAAGACAACACTCTATTTCAGGAACAGCCTTAG
TTACAAGAAATGGCTCAAGGTACATTGCAAATCAGGGAACGACGATATGGGTGCCCACTA
TCTGAAACCGGGTGGAATCGATTACACATTCAGTGTCTACGATAACGTTTTGGGGGGTAC
GCTTATCTGGTGTACCCTGAGCAAAGGACCTGATTATAAGATCTCTTCTAGGTTTGATGC
CTATAAACAGAACAATGACAAGCCTCACGGAATCTCATATAACTATGTTGCTAAAGATGA
TGGCATCTATCACAGTAATTTTGTGGAATTTAGACTTCACAAGAAGTTTGACTGGAAATA
GAGATCGCAAACTAAATCTCCCGTGTTATCAGATGTTTTCAATATATGTACTTATATATT
CACACCATTTATTTGTTATACTTGTAATGACCAATGATATATTTGTAAATATATCAATGA
TATACTTGTAAAAATTGTTCTTATTTGTTTAACTGTATTTAAAATTTATAAATTAAACTT
AGGTGTTATTC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL7381Contig1 696 2 3 U
GGGTAGAATCGATCTCTTCTGAAACTGACTCGTGTGACTCGTGAAGCCTCTCTCGAACGG
AACCCTAAATCAGAAATCGATGGCGTCCTTGGCTCGCCGAGCAATGAGCCTAGCTCAGAT
TCCATCTGCACGCGTGCCCGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGCGGTCTCGCAGGCGCCGCTGA
TCAGCATGAATCTACCAAGGTAGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCCAGGAAACTGGAA
AGAGGAGCATTTTGTGCTTATTTCGCTCTCTGGCTGGGACTTGCTTTTCTACAGTGGATA
CAAACTCTTCACCGGCGGTAAAGGAGAGGAGAAGCAGCAGCCTGCACAGTGAATTTAGCC
CCGGGAAATATGACAAGAGACCTCTCCTTCTCTTTCAGCACCCATTTTGACTGGTCTTTT
GTATCAAAGCCATCAATTACTTTGTTTGCTTTCTTTTTAAATAATAATAATATGTATCAG
AAACACTTTTGAGATCCTAAACGCTTGTGCGTTTCATTATTTCCCTATGCTTTGAAACAT
GTCAAGATTTTAGCAGTGTGATATGCTTGGGATCATTTTACTTGTATGGTCTGGATACCA
TTTTTTTTTGTTTCTTCCCTCCATGTAGATAGAGATTACGAATCAGTTCCTTGGTTAGCA
CTAGTTAAACTACATATCTTCCACCTTGTTTGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A130TFB U 1
AF RR4A130JQD C 22
BS 1 188 RR4A130TFB
BS 189 189 RR4A130JQD
BS 190 696 RR4A130TFB

RD RR4A130TFB 696 0 0
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AACCCTAAATCAGAAATCGATGGCGTCCTTGGCTCGCCGAGCAATGAGCCTAGCTCAGAT
TCCATCTGCACGCGTGCCCGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGCGGTCTCGCAGGCGCCGCTGA
TCAGCATGGATCTACCAAGGTAGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCCAGGAAACTGGAA
AGAGGAGCATTTTGTGCTTATTTCGCTCTCTGGCTGGGACTTGCTTTTCTACAGTGGATA
CAAACTCTTCACCGGCGGTAAAGGAGAGGAGAAGCAGCAGCCTGCACAGTGAATTTAGCC
CCGGGAAATATGACAAGAGACCTCTCCTTCTCTTTCAGCACCCATTTTGACTGGTCTTTT
GTATCAAAGCCATCAATTACTTTGTTTGCTTTCTTTTTAAATAATAATAATATGTATCAG
AAACACTTTTGAGATCCTAAACGCTTGTGCGTTTCATTATTTCCCTATGCTTTGAAACAT
GTCAAGATTTTAGCAGTGTGATATGCTTGGGATCATTTTACTTGTATGGTCTGGATACCA
TTTTTTTTTGTTTCTTCCCTCCATGTAGATAGAGATTACGAATCAGTTCCTTGGTTAGCA
CTAGTTAAACTACATATCTTCCACCTTGTTTGACTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4A130JQD 675 0 0
AAACTGACTCGTGTGACTCGTGAAGCCTCTCTCGAACGGAACCCTAAATCAGAAATCGAT
GGCGTCCTTGGCTCGCCGAGCAATGAGCCTAGCTCAGATTCCATCTGCACGCGTGCCCGC
CTCTGTTTGTCAGCGTCGCGGTCTCGCAGGCGCCGCTGATCAGCATGAATCTACCAAGGT
AGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCCAGGAAACTGGAAAGAGGAGCATTTTGTGCTTAT
TTCGCTCTCTGGCTGGGACTTGCTTTTCTACAGTGGATACAAACTCTTCACCGGCGGTAA
AGGAGAGGAGAAGCAGCAGCCTGCACAGTGAATTTAGCCCCGGGAAATATGACAAGAGAC
CTCTCCTTCTCTTTCAGCACCCATTTTGACTGGTCTTTTGTATCAAAGCCATCAATTACT
TTGTTTGCTTTCTTTTTAAATAATAATAATATGTATCAGAAACACTTTTGAGATCCTAAA
CGCTTGTGCGTTTCATTATTTCCCTATGCTTTGAAACATGTCAAGATTTTAGCAGTGTGA
TATGCTTGGGATCATTTTACTTGTATGGTCTGGATACCATTTTTTTTTGTTTCTTCCCTC
CATGTAGATAGAGATTACGAATCAGTTCCTTGGTTAGCACTAGTTAAACTACATATCTTC
CACCTTGTTTGACTC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL7382Contig1 758 2 3 U
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GGTGTTTACATGAGTGTTTACAAAGTATATTGGTTAAGTTACGCAAGAATACAGAACAAA
TGAAACAAGTATGTGAATTATCTGAGAACAAAGCAGCACACACAAGTAAAAGCCAAATAC
TTTCAATCATGTTCATCATGTTATCGAACAATCCAAGAACCAAACCTATCACTAACTTCA
CTCATATTCAAAACAACATTTGCTCCTTCTAGAGAAATAGATGAACATAATAAAAGAAAA
AAGAAACTTTAAAGAATTCAACTGTTGCTCTCCGAACAAGTGGAAAAAGACAAACAAGCT
ATTACTACCAAAAACCAAACTTAGAAACACCAGTAGCCATGACAATTCAAAAACAATAAT
CTACAGGTTCATGCCAAAAAAAATACTGAATTTTCAGTAAAGGTCTATCTTTGTCTTAAA
AGCCACCTTGTGATACATGTGAAAACAACACACGAGCAAGCTGGTTACAGCCAGAATCCA
ACTTAGACATACACCAGTAGCCATGACAATTCACAAAACAAGAATCAAGTTGTTAACTTT
GATCTCACATATAGCTTTGAACATTGACTTAAACTCTCATTAAACGTTTCTACATGTCAA
AAGGGAAGCAAACCTGAATTGATTTGGGACTGTATTTGAACAAAACTCCGTGAAATTGGT
TCTTCCCTTTGATTGTTCCACCGTAATCTCCGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F614JQ U 30
AF RR4F614TF C 1
BS 1 29 RR4F614TF
BS 30 413 RR4F614JQ
BS 414 758 RR4F614TF

RD RR4F614JQ 384 0 0
GAATAGAAAGTATATTCGCGACTCGACCATTGGTGTTTACATGAGTGTTTACAAAGTATA
TTGGTTAAGTTACGCAAGAATACAGAACAAATGAAACAAGTATGTGAATTATCTGAGAAC
AAAGCAGCACACACAAGTAAAAGCCAAATACTTTCAATCATGTTCATCATGTTATCGAAC
AATCCAAGAACCAAACCTATCACTAACTTCACTCATATTCAAAACAACATTTGCTCCTTC
TAGAGAAATAGATGAACATAATAAAAGAAAAAAGAAACTTTAAAGAATTCAACTGTTGCT
CTCCGAACAAGTGGAAAAAGACAAACAAGCTATTACTACCAAAAACCAAACTTAGAAACA
CCAGTAGCCATGACAATTCAAAAA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR4F614TF 758 0 0
ACACAAGTGGACAAAGACCCTTGACGCAAGAATAGAAAGTATATTCGCGACTCGACCATT
GGTGTTTACATGAGTGTTTACAAAGTATATTGGTTAAGTTACGCAAGAATACAGAACAAA
TGAAACAAGTATGTGAATTATCTGAGAACAAAGCAGCACACACAAGTAAAAGCCAAATAC
TTTCAATCATGTTCATCATGTTATCGAACAATCCAAGAACCAAACCTATCACTAACTTCA
CTCATATTCAAAACAACATTTGCTCCTTCTAGAGAAATAGATGAACATAATAAAAGAAAA
AAGAAACTTTAAAGAATTCAACTGTTGCTCTCCGAACAAGTGGAAAAAGACAAACAAGCT
ATTACTACCAAAAACCAAACTTAGAAACACCAGTAGCCATGACAATTCAAAAACAATAAT
CTACAGGTTCATGCCAAAAAAAATACTGAATTTTCAGTAAAGGTCTATCTTTGTCTTAAA
AGCCACCTTGTGATACATGTGAAAACAACACACGAGCAAGCTGGTTACAGCCAGAATCCA
ACTTAGACATACACCAGTAGCCATGACAATTCACAAAACAAGAATCAAGTTGTTAACTTT
GATCTCACATATAGCTTTGAACATTGACTTAAACTCTCATTAAACGTTTCTACATGTCAA
AAGGGAAGCAAACCTGAATTGATTTGGGACTGTATTTGAACAAAACTCCGTGAAATTGGT
TCTTCCCTTTGATTGTTCCACCGTAATCTCCGCTTCCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7383Contig1 814 2 4 U
GAGACCATGATTTCTTGATCGACAAAGAGAATCTCATCAGATACAGTAACCATGCTCCCA
CCTACAGGATTGTCGACCGAATCTTTTCTCAGGTACCAAGGAAGTTTACTAGTAAAACCG
AAGGAAAGATGTGTTATGAGGATTTTGTTTATTTCATTTTGGCTGAAGAAGACAATTCAT
CAGAACCTAGTCTAGAGTATTGGTTCAAGTGCATAGATTTGGATGCAAATGGAGTCTTGA
CACGGAATGAGCTGCAATTCTTTTATGAGGAGCAGCTGCATAGAATGGAATGCATGGCGC
AAGAGGCGGTGCTGTTTGAGGATATTTTGTGCCAATTATTTGATATGGTCAAACCAGAAG
ACGAAGGGTACATTTGTCTGAATGATTTGAAGGGTTCTAAACTTTCCGGAAATGTTTTCA
ATATACTTTTCAACCTTAACAAGTTCATGGCGTTCGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTC
GCCAGGAGCGCGCAAATCCTACATGGACCGAATGGGATCGTTTTGCTCATAGGGAATACA
CTAGGCTATCTATGGAAGAAGACGTCGAAGATGCTTCTAACGGAAGCACTGAAGCATGGG
ACGACTCGCTTGAGGTCTCATTTTGAGCGAATTAATATGGTAAAAGAGTGACGGCTGGTT
TAAAAACAATTCAGGTTATGAGATATATGAGGGAACTGAAACTGCAAGCTATTATTGATA
TTGTTTTGATTTTGATCTGGATTCAGTTTGACATTAACTATAATCTCTAAAGAACATTGA
GTTTTTACTTGGTATATTTCCCTCTGGGGGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EA49TF U 1
AF RR4GT22TF U 318
BS 1 540 RR4EA49TF
BS 541 541 RR4GT22TF
BS 542 661 RR4EA49TF
BS 662 814 RR4GT22TF

RD RR4EA49TF 661 0 0
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CCTACAGGATTGTCGACCGAATCTTTTCTCAGGTACCAAGGAAGTTTACTAGTAAAACCG
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CAGAACCTAGTCTAGAGTATTGGTTCAAGTGCATAGATTTGGATGCAAATGGAGTCTTGA
CACGGAATGAGCTGCAATTCTTTTATGAGGAGCAGCTGCATAGAATGGAATGCATGGCGC
AAGAGGCGGTGCTGTTTGAGGATATTTTGTGCCAATTATTTGATATGGTCAAACCAGAAG
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ATATACTTTTCAACCTTAACAAGTTCATGGCGTTCGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTC
GCCAGGAGCGCGCAAATCCTACATGGACCGAATGGGATCGTTTTGCTCATAGGGAATACA
TTAGGCTATCTATGGAAGAAGACGTCGAAGATGCTTCTAACGGAAGCACTGAAGCATGGG
ACGACTCGCTTGAGGTCTCATTTTGAGCGAATTAATATGGTAAAAGAGTGACGGCTGGTT
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4GT22TF 497 0 0
GAGT
ATATTTTGTGCCAATTATTTGATATGGTCAAACCAGAAGACGAAGGGTACATTTGTCTGA
ATGATTTGAAGGGTTCTAAACTTTCCGGAAATGTTTTCAATATACTTTTCAACCTTAACA
AGTTCATGGCGTTTGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTCGCCAGGAGCGCGCAAATCCTA
CATGGACCGAATGGGATCGTTTTGCTCATAGGGAATACACTAGGCTATCTATGGAAGAAG
ACGTCGAAGATGCTTCTAACGGAAGCACTGAAGCATGGGACGACTCGCTTGAGGTCTCAT
TTTGAGCGAATTAATATGGTAAAAGAGTGACGGCTGGTTTAAAAACAATTCAGGTTATGA
GATATATGAGGGAACTGAAACTGCAAGCTATTATTGATATTGTTTTGATTTTGATCTGGA
TTCAGTTTGACATTAACTATAATCTCTAAAGAACATTGAGTTTTTACTTGGTATATTTCC
CTCTGGGGGGTTC

QA 5 497 5 497
DS 



AS 1 2

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ACTGATGCTGGGGTTCTTTGCCTTCGCCAAGACTTTTGACATAAACGTATATAAAGAAGA
GTTAGAAGATGCTCAATGGCACAGTAGAGAAGATGTGAAGAAAGCGCTGGCGTTTGCAGA
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CATCCCGGGGCCATTTGCCATTGCTCATCACCTGATCTCAACATGGGTAGATCAGGGTTC
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TCACGACTTTGGTGCTTTAGAGAAATCAAACAGATTGTTATAGCAGATTTGATGCTTAAT
CTGAACTGCAGAGTTCACAGTCTTTGCGTACAGACTTGAAAACTTAAGATGTGTTTATGG
AGAGTTTATTGATTTACTTATATAAATGGAAGGCCTTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BB93TF U 1
AF RR4BB93JQ C 52
BS 1 820 RR4BB93TF
BS 821 822 RR4BB93JQ

RD RR4BB93TF 820 0 0
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GGAAAGCTTAGAAGAGGCTGTGAGGCGAGAAACATGGGAAGAGACAGGCATTGAAGTAGG
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GTTAGAAGATGCTCAATGGCACAGTAGAGAAGATGTGAAGAAAGCGCTGGCGTTTGCAGA
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CATCCCGGGGCCATTTGCCATTGCTCATCACCTGATCTCAACATGGGTAGATCAGGGTTC
TGGCAATGTTCACTCAAAACCGCAAGCCGGTGTGTCTCTCTCGAGTTTGTAGCTAGAATG
TCACGACTTTGGTGCTTTAGAGAAATCAAACAGATTGTTATAGCAGATTTGATGCTTAAT
CTGAACTGCAGAGTTCACAGTCTTTGCGTACAGACTTGAAAACTTAAGATGTGTTTATGG
AGAGTTTATTGATTTACTTATATAAATGGAAGGCCTTTTA

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4BB93JQ 771 0 0
TTATCCCCGGGTTGACCCGGTGGTTATAATGTTAGTTATTGATCGAGAGAATGATAGTGC
GCTTTTAAGCAGACAGTCTAGATATGTACCCAGGATGTGGAGTTGCTTAGCTGGATTTAT
TGAGCCAGGGGAAAGCTTAGAAGAGGCTGTGAGGCGAGAAACATGGGAAGAGACAGGCAT
TGAAGTAGGAGATGTTGTCTATCACAGCTCTCAGCCTTGGCCTGTGGGACCAAGTAGCAT
GCCATGCCAACTGATGCTGGGGTTCTTTGCCTTCGCCAAGACTTTTGACATAAACGTATA
TAAAGAAGAGTTAGAAGATGCTCAATGGCACAGTAGAGAAGATGTGAAGAAAGCGCTGGC
GTTTGCAGAATACAGGAAGGCCCAAAGAACAGCTGCTTCAAAGATAGAGCAAATCTGTAA
AGGTGTGGAGAAAAGCCAGGGTCTCTCAACCGATTTCAATGTGGAAAGCGGTGAGCTGGC
TCCTATGTTCATCCCGGGGCCATTTGCCATTGCTCATCACCTGATCTCAACATGGGTAGA
TCAGGGTTCTGGCAATGTTCACTCAAAACCGCAAGCCGGTGTGTCTCTCTCGAGTTTGTA
GCTAGAATGTCACGACTTTGGTGCTTTAGAGAAATCAAACAGATTGTTATAGCAGATTTG
ATGCTTAATCTGAACTGCAGAGTTCACAGTCTTTGCGTACAGACTTGAAAACTTAAGATG
TGTTTATGGAGAGTTTATTGATTTACTTATATAAATGGAAGGCCTTTTAAT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL7385Contig1 964 2 2 U
GGAAAAGAGTCTATCTTCCTCTCTTCCCAAAAAATGCCTTTAAGCAACAATGTAATCGGT
TGCATAAACTTCATCTCCGTCCTCCTCTCAGTTCCGGTCATCGGCGCCGGGATCTGGCTT
GCCACCGGAGAAGTAAACTCCTGTGTGAAGCTCCTTCAGTGGCCAGTAATAATCCTCGGA
GTCTTGATCCTTCTTGTCGGTCTTGCTGGTTTCATAGGAGGGTTCTGGAGAATCACTTGG
CTTCTCATTGTTTACTTGATGGCCATGCTTGTTCTCATAGTACTTTTAGGTATTCTTGTC
GGATTTATTTACATGGTCACCACTAAAGGCTCTGGTCATCCGGAACCAAGCAGAGCTTAT
CTTGAGTATAGTCTTCAAGATTTCTCTGGTTACTTGCGTCGACGTGTTCAGAGATCTTAC
AAATGGGATAGGATCCGTACTTGTTTGAGTACTACTAGTATTTGTCCTGAACTGAATCAG
ACATATACTTCGGCTCTAGATTTCTTCAATGCTCATCTTAGTCCCATTCAAATATTAATG
CAGATATGGATTGTCTACAGTGGAGCAATGACCAAAACGCTTTGTGCTACGCTTGTGATT
CGTGCAAAGCCGTTTGCTTCAAAATCTTAAAGTTGATTGGTTAAAGGCGGATATCTTTCT
TCTGCTGGCGTTAATCGGGTTGATAATCGTTTATATAATTGGCTGCTGCGCGTTCCGAAA
CGCGGAAACCGAGGATATTTTCAGAAAATATAGGCAGGGTTATACATGATCAGGTTGAGA
AGTTTAGAGGCAAAAGCGGGGAGAATGTTTCAAATTATTGGGTTCCTCTATTTTTAGTTT
CTTGATTTTTCGACCCTTGTAGTCTTCTCTTTTATTGCACGCATTACCAGAACATTTGGT
GTAACTGGAAGAATGTTTGGTGTACCTCCTTAGTTTGGGTTTGCAAAACTTTCCATTGTT
AATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4FI91TF U 1
AF RR4FI91JQ C 229
BS 1 723 RR4FI91TF
BS 724 964 RR4FI91JQ

RD RR4FI91TF 723 0 0
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TGCATAAACTTCATCTCCGTCCTCCTCTCAGTTCCGGTCATCGGCGCCGGGATCTGGCTT
GCCACCGGAGAAGTAAACTCCTGTGTGAAGCTCCTTCAGTGGCCAGTAATAATCCTCGGA
GTCTTGATCCTTCTTGTCGGTCTTGCTGGTTTCATAGGAGGGTTCTGGAGAATCACTTGG
CTTCTCATTGTTTACTTGATGGCCATGCTTGTTCTCATAGTACTTTTAGGTATTCTTGTC
GGATTTATTTACATGGTCACCACTAAAGGCTCTGGTCATCCGGAACCAAGCAGAGCTTAT
CTTGAGTATAGTCTTCAAGATTTCTCTGGTTACTTGCGTCGACGTGTTCAGAGATCTTAC
AAATGGGATAGGATCCGTACTTGTTTGAGTACTACTAGTATTTGTCCTGAACTGAATCAG
ACATATACTTCGGCTCTAGATTTCTTCAATGCTCATCTTAGTCCCATTCAAATATTAATG
CAGATATGGATTGTCTACAGTGGAGCAATGACCAAAACGCTTTGTGCTACGCTTGTGATT
CGTGCAAAGCCGTTTGCTTCAAAATCTTAAAGTTGATTGGTTAAAGGCGGATATCTTTCT
TCTGCTGGCGTTAATCGGGTTGATAATCGTTTATATAATTGGCTGCTGCGCGTTCCGAAA
CGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4FI91JQ 736 0 0
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GGTATTCTTGTCGGATTTATTTACATGGTCACCACTAAAGGCTCTGGTCATCCGGAACCA
AGCAGAGCTTATCTTGAGTATAGTCTTCAAGATTTCTCTGGTTACTTGCGTCGACGTGTT
CAGAGATCTTACAAATGGGATAGGATCCGTACTTGTTTGAGTACTACTAGTATTTGTCCT
GAACTGAATCAGACATATACTTCGGCTCTAGATTTCTTCAATGCTCATCTTAGTCCCATT
CAAATATTAATGCAGATATGGATTGTCTACAGTGGAGCAATGACCAAAACGCTTTGTGCT
ACGCTTGTGATTCGTGCAAAGCCGTTTGCTTCAAAATCTTAAGGTTGATTGGTTAAAGGC
GGATATCTTTCTTCTGCTGGCGTTAATCGGGTTGATAATCGTTTATATAATTGGCTGCTG
CGCGTTCCGAAACGCGGAAACCGAGGATATTTTCAGAAAATATAGGCAGGGTTATACATG
ATCAGGTTGAGAAGTTTAGAGGCAAAAGCGGGGAGAATGTTTCAAATTATTGGGTTCCTC
TATTTTTAGTTTCTTGATTTTTCGACCCTTGTAGTCTTCTCTTTTATTGCACGCATTACC
AGAACATTTGGTGTAACTGGAAGAATGTTTGGTGTACCTCCTTAGTTTGGGTTTGCAAAA
CTTTCCATTGTTAATT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL7386Contig1 992 2 6 U
GGCCTTGGTTGTTTTCCTTGAACCGGCTGATGCACGTTCAGCTATTAAGAAGATGGCATA
CAAGCGTTACAAAGATGCTCCCCTGTATCTGGAGTGGGCTCCCGCAGATATCCTTGAGCC
GAAAGCACTTCCCGAGAAGAATGAAGAGAAGAGCGTTACTGGAGGAAATGATGTGAGAAG
AGTCAACTTGGAACAGGAGGTTAACCTCGATCCTGACGTAACTGAGTCAAATGTCCTTCA
TGTTACTAATCTGAGCTTCGAGACGACGGATGAGGGTTTGAAGACGCATTTGGAAGCCCT
GGTGAAACATGGAAAGATTCTGAGTGTGAAGATAATGAAGCATGTAAAGAAAGGGAAGAA
TGTTTCAAGCGGTTATGGTTTTCTCGAATTCGACTCTGTAGAGACAGCGACCAGTGTCTG
TAGAGATCTTCAGGGAACTTCTGTGGATGGGCATGCTTTGAAGTTGAGGTTTACAGAACG
CAAGCGGAGGGACACGGTTGCGAAAGGCTCAGAAAAAATTTCAACGAAGCTAAATGTGAA
AAATGTACCTTTTGAGGCAACCGAGAAGGAACTAAGACAGCTTTTCAGTCCATTTGGACA
GATCAAGGGCCTCAGGTATCCAAAGAGGAATTTTGGACAGCACGCAGGTTTTGCTTTCGT
TGAATACATGACAAAGCAAGAAGCTTCAAACGCTAGGAAAGCATTGGCCAGTACACATTT
GTACGGACGTCATTTGGTGACCGAATTTGCCAAAGATGACAATAGCATGGAAGAGAAGAG
GCGTCGTTCTGCTGCTAAGTATGAGGAAAACGAAACTCCAAAGAGAAGGAAAACAGCTGA
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CACTGTGATTCTCCATGGTTGAAATTTTGCTCTGTACTGCCGTCATCTACTTGTTTGATT
TTATTTGTGTTTTTAATAGAGAAAAATGTGCG


BQ
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AF RR4AJ33TF U 1
AF RR4AJ33JQ C 225
BS 1 647 RR4AJ33TF
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RD RR4AJ33TF 842 0 0
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GAAAGCACTTCCCGAGAAGAATGAAGAGAAGAGCGTTACTGGAGGAAATGATGTGAGAAG
AGTCAACTTGGAACAGGAGGTTAACCTCGATCCTGACGTAACTGAGTCAAATGTCCTTCA
TGTTACTAATCTGAGCTTCGAGACGACGGATGAGGGTTTGAAGACGCATTTGGAAGCCCT
GGTGAAACATGGAAAGATTCTGAGTGTGAAGATAATGAAGCATGTAAAGAAAGGGAAGAA
TGTTTCAAGCGGTTATGGTTTTCTCGAATTCGACTCTGTAGAGACAGCGACCAGTGTCTG
TAGAGATCTTCAGGGAACTTCTGTGGATGGGCATGCTTTGAAGTTGAGGTTTACAGAACG
CAAGCGGAGGGACACGGTTGCGAAAGGCTCAGAAAAAATTTCAACGAAGCTAAATGTGAA
AAATGTACCTTTTGAGGCAACCGAGAAGGAACTAAGACAGCTTTTCAGTCCATTTGGACA
GATCAAGGGCCTCAGGTATCCAAAGAGGAATTTTGGACAGCACGCAG*TTTTGCTTTCGT
TGAATACATGACAAAGCAAGAAGCTTCAAACGCTAGGAAAGCATTGGCCAGTACACATTT
GTACGGACGTCATTTGGTGACCGAATTTGCCAAAGATGACAATAGCATGGAAGAGAAGAG
GCGTCGTTCTGCTGCTAAGTATGAG*AAAACGAAACTCCAAAGAGA
GAAAACAGCTGATAGC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4AJ33JQ 768 0 0
AGTCAAATGTCCTTCATGTTACTAATCTGAGCTTCGAGACGACGGATGAGGGTTTGAAGA
CGCATTTGGAAGCCCTGGTGAAACATGGAAAGATTCTGAGTGTGAAGATAATGAAGCATG
TAAAGAAAGGGAAGAATGTTTCAAGCGGTTATGGTTTTCTCGAATTCGACTCTGTAGAGA
CAGCGACCAGTGTCTGTAGAGATCTTCAGGGAACTTCTGTGGATGGGCATGCTTTGAAGT
TGAGGTTTACAGAACGCAAGCGGAGGGACACGGTTGCGAAAGGCTCAGAAAAAATTTCAA
CGAAGCTAAATGTGAAAAATGTACCTTTTGAGGCAACCGAGAAGGAACTAAGACAGCTTT
TCAGTCCATTTGGACAGATCAAGGGCCTCAGGTATCCAAAGAGGAATTTTGGACAGCACG
CAGGTTTTGCTTTCGTTGAATACATGACAAAGCAAGAAGCTTCAAACGCTAGGAAAGCAT
TGGCCAGTACACATTTGTACGGACGTCATTTGGTGACCGAATTTGCCAAAGATGACAATA
GCATGGAAGAGAAGAGGCGTCGTTCTGCTGCTAAGTATGAGGAAAACGAAACTCCAAAGA
GAAGGAAAACAGCTGAATAGCCCAACAACCCCTCTGTTAAAAAGTTGTGTTGAACCATGG
TGTGATGAAGTCTGTCCACTGTGATTCTCCATGGTTGAAATTTTGCTCTGTACTGCCGTC
ATCTACTTGTTTGATTTTATTTGTGTTTTTAATAGAGAAAAATGTGCG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7387Contig1 973 2 4 U
GGGCGGTATTGATACCGAAGAGGATTATCCATACAAAGCTGCTGATGGTCGTTGTGATCA
GAACAGGAAAAACTCAAAGGTTGTCACAATTGATGCTTACGAAGATGTGCCTGAGAACAA
CGAGGCTGCGCTTAAGAAAGCTTTGGCTAACCAGCCTATTAGTGTTGCCATTGAAGCTGG
TGGTCGCGCTTTCCAGCTCTATTCTTCGGGTGTATTTGATGGAACATGCGGTACGGAGCT
AGACCACGGAGTTGTAGCGGTTGGTTACGGGACTGAGAACGGAAAGGACTACTGGATTGT
GAGGAACTCATGGGGAGGAAGCTGGGGAGAGAGCGGATACATAAAGATGGCACGTAACAT
TGCTGAGGCAACTGGAAAGTGTGGAATCGCCATGGAGGCTTCGTATCCGATCAAGAAGGG
TCAGAACCCGCCACACCCTGGACCGTCACCACCGTCTCCCATCAAGCCACCGACCCAGTG
TGACAAATACTACTCTTGCCCTGAAGGGAACACTTGCTGTTGTCTCTTCAAGTACGGCAA
GTACTGCTTCGGTTGGGGATGTTGCCCTCTCGAAGCTGCTACTTGCTGCGATGATAACAC
TAGCTGTTTTCCTCATGAGTACCCGGTTTGCAATGGCGATTCCTGTTTGATGAGCAAGAA
CAGTCCGTTTAGCGTTAAGGCCTTGAAGCGCACACCGGCTAAACCGTTCTGGGCACATAG
CAGAAAGAACATTGCTTAAGAGAACACTGAAGAGATTCATTCCTCTTGACAGAGGAAAGA
CAATGAGACATCAAAAAGCTTTCTCATTATTGTTGTTGTTCTAATTATTTTAAAATTGCT
GATTCTGCTGTTTGGGGGGTTTTCTGTACATATAAAACCTCTTCCCTAAGTTTCATTCAG
TTTCATCACTGTCAAATTAACAACTCATGCAAATGGGTTTGGCTATTTTATCTTAAAACA
TTGGTAATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB21TF U 1
AF RR4AB21JQ C 204
BS 1 796 RR4AB21TF
BS 797 797 RR4AB21JQ
BS 798 806 RR4AB21TF
BS 807 973 RR4AB21JQ

RD RR4AB21TF 806 0 0
GGGCGGTATTGATACCGAAGAGGATTATCCATACAAAGCTGCTGATGGTCGTTGTGATCA
GAACAGGAAAAACTCAAAGGTTGTCACAATTGATGCTTACGAAGATGTGCCTGAGAACAA
CGAGGCTGCGCTTAAGAAAGCTTTGGCTAACCAGCCTATTAGTGTTGCCATTGAAGCTGG
TGGTCGCGCTTTCCAGCTCTATTCTTCGGGTGTATTTGATGGAACATGCGGTACGGAGCT
AGACCACGGAGTTGTAGCGGTTGGTTACGGGACTGAGAACGGAAAGGACTACTGGATTGT
GAGGAACTCATGGGGAGGAAGCTGGGGAGAGAGCGGATACATAAAGATGGCACGTAACAT
TGCTGAGGCAACTGGAAAGTGTGGAATCGCCATGGAGGCTTCGTATCCGATCAAGAAGGG
TCAGAACCCGCCACACCCTGGACCGTCACCACCGTCTCCCATCAAGCCACCGACCCAGTG
TGACAAATACTACTCTTGCCCTGAAGGGAACACTTGCTGTTGTCTCTTCAAGTACGGCAA
GTACTGCTTCGGTTGGGGATGTTGCCCTCTCGAAGCTGCTACTTGCTGCGATGATAACAC
TAGCTGTTTTCCTCATGAGTACCCGGTTTGCAATGGCGATTCCTGTTTGATGAGCAAGAA
CAGTCCGTTTAGCGTTAAGGCCTTGAAGCGCACACCGGCTAAACCGTTCTGGGCACATAG
CAGAAAGAACATTGCTTAAGAGAACACTGAAGAGATTCATTCCTCTTGACAGAGGAAAGA
CAATGAGACATCAAAA*GCTTTCTCA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4AB21JQ 770 0 0
CTTCGGGTGTATTTGATGGAACATGCGGTACGGAGCTAGACCACGGAGTTGTAGCGGTTG
GTTACGGGACTGAGAACGGAAAGGACTACTGGATTGTGAGGAACTCATGGGGAGGAAGCT
GGGGAGAGAGCGGATACATAAAGATGGCACGTAACATTGCTGAGGCAACTGGAAAGTGTG
GAATCGCCATGGAGGCTTCGTATCCGATCAAGAAGGGTCAGAACCCGCCACACCCTGGAC
CGTCACCACCGTCTCCCATCAAGCCACCGACCCAGTGTGACAAATACTACTCTTGCCCTG
AAGGGAACACTTGCTGTTGTCTCTTCAAGTACGGCAAGTACTGCTTCGGTTGGGGATGTT
GCCCTCTCGAAGCTGCTACTTGCTGCGATGATAACACTAGCTGTTTTCCTCATGAGTACC
CGGTTTGCAATGGCGATTCCTGTTTGATGAGCAAGAACAGTCCGTTTAGCGTTAAGGCCT
TGAAGCGCACACCGGCTAAACCGTTCTGGGCACATAGCAGAAAGAACATTGCTTAAGAGA
ACACTGAAGAGATTCATTCCTCTTGACAGAGGAAAGACAATGAGACATCAAAAAGCTTTC
TCATTATTGTTGTTGTTCTAATTATTTTAAAATTGCTGATTCTGCTGTTTGGGGGGTTTT
CTGTACATATAAAACCTCTTCCCTAAGTTTCATTCAGTTTCATCACTGTCAAATTAACAA
CTCATGCAAATGGGTTTGGCTATTTTATCTTAAAACATTGGTAATTTATC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL7388Contig1 1058 2 4 U
GATGGCTCTTTTAAGAGTAACTTGCTACCTCCAACCACTCTCCAGTTCTTGGAAGCATCT
TTCACACATAGCTAGAATATGAACACAACATGAAGAATCATTAAACGAATAGAATGAATA
TTTGACCTATTATTAACTTCATCAAAAAAAAATTTCATCAAGTAAACGATACTCTCAAAT
GGCAAAGAAGCTATACTGGTGTAGAGTAATATATGTTCCTTACTTAATTGACTAACATCT
AAATCTCATATCTTTCTCATTAGAAATACCAGTCCTTTGAAATCTCTTCCACTTGCAGGA
CCGGTCCTTGACCAAGCCGGATAAAACATTAGACTAAAATCCCCAATTTTTTTTTTAAAT
TCATATATAAATAAGTCCTCAAATTCATTTAATAATTTTTTTAGCCCCCAAATTTATAAA
ATATTTCGTTAACCGTCTATATCTTCCGAAATTTCAGGGCTGACTCGCTGGAGTAAGGTG
GATTAGAACAAGTAGTCGCAAAGTAATCGAGAGAGAGTGACGTTCTGAGATCAGACTTTT
TTTGGTTTGTTTGTTTAGTGACAGTGGAACCGAATCTGGGTTGACCCGAATTTATACCGG
ATTGCCCAATTTCATCAGATTTTTTTCTTAATCGAATTGAATTTTATGAGATTTCGTTAT
GGTTGAGTTATTTCGTGCACTTCAAAGAATGTTACCTGAACAACACTAGCAAATTTGTTA
TTCTTTTTTTCATAATAAGTGTTATTTTAACATTTTTTGTTATATAAAAAGTGTTACTTT
ATAATTTCAATGCAAATTATAATTATTTTCAGCTGAAAATTAATTACAAATTGCATTAAT
TTTATAAATAATTTTATTTATCTCAAATTATTTTGGTCTCATAGATATAATTAATAACAA
CTTATATATATTTTCGTAGCTTTTTTAATTTGTGTGAAAAATAAAGTGACATTTATATAA
AAATAGAGGGAGTAAAAATTAATAAGGGTTATTCTATACTTAACCGGAATTAAAAACCAA
ACGAAAAATTAAACGGTTGCAAAATTTTAGCTTTTGTC


BQ
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AF RR4BK74TF U 1
AF RR4BK74JQ C 356
BS 1 702 RR4BK74TF
BS 703 703 RR4BK74JQ
BS 704 724 RR4BK74TF
BS 725 1058 RR4BK74JQ

RD RR4BK74TF 724 0 0
GATGGCTCTTTTAAGAGTAACTTGCTACCTCCAACCACTCTCCAGTTCTTGGAAGCATCT
TTCACACATAGCTAGAATATGAACACAACATGAAGAATCATTAAACGAATAGAATGAATA
TTTGACCTATTATTAACTTCATCAAAAAAAAATTTCATCAAGTAAACGATACTCTCAAAT
GGCAAAGAAGCTATACTGGTGTAGAGTAATATATGTTCCTTACTTAATTGACTAACATCT
AAATCTCATATCTTTCTCATTAGAAATACCAGTCCTTTGAAATCTCTTCCACTTGCAGGA
CCGGTCCTTGACCAAGCCGGATAAAACATTAGACTAAAATCCCCAATTTTTTTTTTAAAT
TCATATATAAATAAGTCCTCAAATTCATTTAATAATTTTTTTAGCCCCCAAATTTATAAA
ATATTTCGTTAACCGTCTATATCTTCCGAAATTTCAGGGCTGACTCGCTGGAGTAAGGTG
GATTAGAACAAGTAGTCGCAAAGTAATCGAGAGAGAGTGACGTTCTGAGATCAGACTTTT
TTTGGTTTGTTTGTTTAGTGACAGTGGAACCGAATCTGGGTTGACCCGAATTTATACCGG
ATTGCCCAATTTCATCAGATTTTTTTCTTAATCGAATTGAATTTTATGAGATTTCGTTAT
GGTTGAGTTATTTCGTGCACTTCAAAGAATGTTACCTGAACA*CACTAGCAAATTTGTTA
TTCT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BK74JQ 703 0 0
TAAATTCATATATAAATAAGTCCTCAAATTCATTTAATAATTTTTTTAGCCCCCAAATTT
ATAAAATATTTCGTTAACCGTCTATATCTTCCGAAATTTCAGGGCTGACTCGCTGGAGTA
AGGTGGATTAGAACAAGTAGTCGCAAAGTAATCGAGAGAGAGTGACGTTCTGAGATCAGA
CTTTTTTTGGTTTGTTTGTTTAGTGACAGTGGAACCGAATCTGGGTTGACCCGAATTTAT
ACCGGATTGCCCAATTTCATCAGATTTTTTTCTTAATCGAATTGAATTTTATGAGATTTC
GTTATGGTTGAGTTATTTCGTGCACTTCAAAGAATGTTACCTGAACAACACTAGCAAATT
TGTTATTCTTTTTTTCATAATAAGTGTTATTTTAACATTTTTTGTTATATAAAAAGTGTT
ACTTTATAATTTCAATGCAAATTATAATTATTTTCAGCTGAAAATTAATTACAAATTGCA
TTAATTTTATAAATAATTTTATTTATCTCAAATTATTTTGGTCTCATAGATATAATTAAT
AACAACTTATATATATTTTCGTAGCTTTTTTAATTTGTGTGAAAAATAAAGTGACATTTA
TATAAAAATAGAGGGAGTAAAAATTAATAAGGGTTATTCTATACTTAACCGGAATTAAAA
ACCAAACGAAAAATTAAACGGTTGCAAAATTTTAGCTTTTGTC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7389Contig1 686 2 2 U
GTGTGATTTTGATTTTCCGTGATAAAGTCTATCTTCATCCTCATAAGGTGGTGGAGTTGA
TTAGAAAGGCAGTGCCTTTAGGTTTAAATCTAGAGGATGATCCAGCGAAAGTCGAGTTCG
ATAAGCTTAGGAGAATGAAGGAAGAGATTGATGTGTTAGCACATAAGCAAGTGAGGAAGA
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GK67JQ C 1
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QA 1 672 1 672
DS 



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BQ
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AF RR4BQ81TF U 58
AF RR4A402TF U 1
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GCAGCTAGAAGAAGACTCGCGTTGCTTAGAGCATCTGCAGCTTCAGCTGCTACAAGAGAG
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QA 1 822 1 822
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AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4AV29JQ C 1
AF RR4AV29TF U 1
BS 1 598 RR4AV29TF

RD RR4AV29JQ 598 0 0
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GTCTAGTAAGGGTTAGTTGGTCACGCACACCCTTGAATGTTCCCCTACTGAGACTTTGAA
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CTTTCTGGATGTTTGCTAATGGGATGTACATTATGGGTCTCTCTGTTGTCCCTTGGCTGG
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TTCTGTAAAGCCCGATCTTTGTTTACTCCCGGCATTTATGAAGGCTGTGTTCCCATTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4AV29TF 598 0 0
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AAACCAAGAGGTGATGATGAACAGCTTGGTGATTGTGTAATTCAATTCCCGTTGAAGTTT
CAAAGAGTTGTCAAATAGTTGAAATTTGGTCTAGTCTTTGAAGCTCCTTCGTTTTATTAA
TGATGATGACTGACAAACGGATATGTTTTTTTGTTAATGACTGTAATGCAAAAATGTGGC
GTCTAGTAAGGGTTAGTTGGTCACGCACACCCTTGAATGTTCCCCTACTGAGACTTTGAA
AGACTACACGCTTTGTTGCTTTTACTGGTGTTGAAAGTGGAGCAACCAGAGAAGATCTAA
CTTTCTGGATGTTTGCTAATGGGATGTACATTATGGGTCTCTCTGTTGTCCCTTGGCTGG
CTCAGAAGATTAATAACTGACTGTGGTTCTGCGGAGAAGATGAACGGGAGTTGCATGATG
ATCGATTAATAGCTGACAATTGTTTTTTAAACAGTCATTCCGGTGGATTTTTTTTTCCAG
TTCTGTAAAGCCCGATCTTTGTTTACTCCCGGCATTTATGAAGGCTGTGTTCCCATTT

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL7393Contig1 836 2 6 U
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TATCAAGCGACAAGGGGACTGTTCACATTTTCTCTCTTAGAGTTAGAGTAGTTGGGGAGG
ATTCTCATCCCACTGAAATTGCACCTCTCCTTACACAACGAACTGATTGTAACTCCCTGC
AAGGCCTTGTTTCTCCAGCCGCTGGTACCAATCCTGGTTCGTCATTGTCATTTATGAGAG
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TCACGCAATTCTTCGCAGCATTTGGCAGTCACAACACGGTTGCTATCACCGGCATGGATG
GAAGTTTCTACAGATGCAGCTTTGATCCTGTGAATGGAGGAGAGATGGTGCAGCTAGAAT
ATATCCACTTTCTAAAGACGGAGAACGGACCGAGATAAGTCAAATTCGTTGCTTCGACCA
CTCGTCTAAGCCTCTGTACATAACCATGTCTATGCAAGTAGATTTGGTGAGACACTGCAA
TAAGATTTGATTCATTGAATATTTGCTACTTCGAGTGAAAGACCCGCACTATTGATTGGG
ACTATGTACATAGCTACAGCTACATATTAAGATTCATACATAGCTACAATGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E404TF U 1
AF RR4E404JQ C 82
BS 1 647 RR4E404TF
BS 648 648 RR4E404JQ
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BS 671 692 RR4E404TF
BS 693 836 RR4E404JQ

RD RR4E404TF 692 0 0
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GAGTGGACAGAGCAGAGATTTATAGCATTGCACTTTCACCAAACGTGCAGTGGCTGGCAG
TATCAAGCGACAAGGGGACTGTTCACATTTTCTCTCTTAGAGTTAGAGTAGTTGGGGAGG
ATTCTCATCCCACTGAAATTGCACCTCTCCTTACACAACGAACTGATTGTAACTCCCTGC
AAGGCCTTGTTTCTCCAGCCGCTGGTACCAATCCTGGTTCGTCATTGTCATTTATGAGAG
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ATATCCACTTTCTAAAGACGGAGAACGGACCGAGATAAGTCAAATTCTTTGCTTCGACCA
CTCGTCTAA*CCTCTGTACATAACCATGTCTA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4E404JQ 755 0 0
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CTGGTACCAATCCTGGTTCGTCATTGTCATTTATGAGAGGTGTTCTACCAAAGTATTTCA
GCTCGGAATGGTCATTTGCACAGTTCCATGTATCAGAAGTCACGCAATTTTTCGCAGCAT
TTGGCAGTCACAACACGGTTGCTATCACCGGCATGGATGGAAGTTTCTACAGATGCAGCT
TTGATCCTGTGAATGGAGGAGAGATGGTGCAGCTAGAATATATCCACTTTCTAAAGACGG
AGAACGGACCGAGATAAGTCAAATTCGTTGCTTCGACCACTCGTCTAAGCCTCTGTACAT
AACCATGTCTATGCAAGTAGATTTGGTGAGACACTGCAATAAGATTTGATTCATTGAATA
TTTGCTACTTCGAGTGAAAGACCCGCACTATTGATTGGGACTATGTACATAGCTACAGCT
ACATATTAAGATTCATACATAGCTACAATGTTTCG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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AATCGAACTGGTCGGTGTGGTTTGTGATGCTTATCTCGCCGTAGCACGAGGCATACGGAG
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TGCTAATGCATTTCCAAAGTATTGTGAGCTTGTTGATAACTCTAGGCTTTACTGCACAAA
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CATTTACGATCTTTATTCGGATTCGAGCCTGTTGAGCAAGCCTGGTTCAGTTTGGAATGA
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TCTTTTGCTATATGTGATTTGTTTTCACCATGTCTTTTGATGTTTTTTTGTATTAGTCTG
AATAAGTTTTTCTAAAACGATTAAAATGAGTTTTCACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BJ69TF U 1
AF RR4BJ69JQ C 15
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BS 731 731 RR4BJ69JQ
BS 732 764 RR4BJ69TF
BS 765 766 RR4BJ69JQ
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BS 780 785 RR4BJ69TF
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BS 787 804 RR4BJ69TF
BS 805 805 RR4BJ69JQ
BS 806 817 RR4BJ69TF
BS 818 878 RR4BJ69JQ

RD RR4BJ69TF 822 0 0
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TGCTGCATCGTCCTTACTAGTAACAGCATTAAACGACGGACGTGATGTGATAATGGATGG
AACCTTATCATGGGAGCCGTTCGTGGAACAAATGATCACAATGGCAAAGGACGTCCACAA
ACAGAGATATAGAATGGGCGTAGGCTACAAAGTGGCCGCGGACGGTACAACAACAGAGGA
GTACTGGAGAAAAGAAGAAACTGAACAAAATGGGAAACAACAAAACTTGAAACCTTATAG
AATCGAACTGGTCGGTGTGGTTTGTGATGCTTATCTCGCCGTAGCACGAGGCATACGGAG
AGCTCTAATGGTGAAGAGAGCTGTAAGAGTAAAATCTCAGCTCAAATCACACAAGAGTTT
TGCTAATGCATTTCCAAAGTATTGTGAGCTTGTTGATAACTCTAGGCTTTACTGCACAAA
TGCCGTTGGTGGTCCTCCAAAGCTTATAGCGTGGAAAGCCGGAAATAGTAACCTTCTGGT
GGATCCGGAGGATATTGAGTGTCTAAAACGAGTCAGCAGTCTTAACCCGGATGCTGAATC
CATTTACGATCTTTATTCGGATTCGAGCCTGTTGAGCAAGCCTGGTTCAGTTTGGAATGA
TGTTGTTTTAGTCCCATCGAGGCCCAAGGTCCAGAACGAACTTACCGATACCATCAAGAA
AATTGAAAAA*CCCAAGCGAAAAGTTAATGATATTGTCAACAAG**CCCTAAAA*TAT*G
TCTTT*GCTATATGTGATTTGTTT*CACCATGTCTTT
GATGT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4BJ69JQ 864 0 0
ACGATATGCTTCAAACTGCTGAATTGGTTCACCAATCATCTACCGATGCTGCATCGTCCT
TACTAGTAACAGCATTAAACGACGGACGTGATGTGATAATGGATGGAACCTTATCATGGG
AGCCGTTCGTGGAACAAATGATCACAATGGCAAAGGACGTCCACAAACAGAGATATAGAA
TGGGCGTAGGCTACAAAGTGGCCGCGGACGGTACAACAACAGAGGAGTACTGGAGAAAAG
AAGAAACTGAACAAAATGGGAAACAACAAAACTTGAAACCTTATAGAATCGAACTGGTCG
GTGTGGTTTGTGATGCTTATCTCGCCGTAGCACGAGGCATACGGAGAGCTCTAATGGTGA
AGAGAGCTGTAAGAGTAAAATCTCAGCTCAAATCACACAAGAGTTTTGCTAATGCATTTC
CAAAGTATTGTGAGCTTGTTGATAACTCTAGGCTTTACTGCACAAATGCCGTTGGTGGTC
CTCCAAAGCTTATAGCGTGGAAAGCCGGAAATAGTAACCTTCTGGTGGATCCGGAGGATA
TTGAGTGTCTAAAACGAGTCAGCAGTCTTAACCCGGATGCTGAATCCATTTACGATCTTT
ATTCGGATTCGAGCCTGTTGAGCAAGCCTGGTTCAGTTTGGAATGATGTTGTTTTAGTCC
CATCGAGGCCCAAGGTCCAGAAGGAACTTACCGATACCATCAAGAAAATTGAAAAAACCC
AAGCGAAAAGTTAATGATATTGTCAACAAGGCCCCTAAAAATATTGTCTTTTGCTATATG
TGATTTGTTTTCACCATGTCTTTTGATGTTTTTTTGTATTAGTCTGAATAAGTTTTTCTA
AAACGATTAAAATGAGTTTTCACC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL7395Contig1 813 2 6 U
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GGCTGCTGCTATAGGTGCTGCAGTCTCTTTTCCATCCTCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTC
AAGAGATTGGTTTACACTAACGAAAGTGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTC
TTGTGTGACTTGAAACCGGGTGATGAGGCAAAGATCACTGGACCAGTTGGCAAGGAAATG
CTTATGCCTAAAGACCCAAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGGAACTGGAATTGCT
CCATTTAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGAGCACGAGGACTACAAGTTCAAC
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TATGGAGAAGGGTATCGATGAGATCATGGTCTCACTTGCTGCTAAAGATGGGATCGATTG
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CCAATTATTCATTTTCTGCATCCTTCCTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GB62TF U 1
AF RR4GB62JQ C 63
BS 1 611 RR4GB62TF
BS 612 612 RR4GB62JQ
BS 613 699 RR4GB62TF
BS 700 700 RR4GB62JQ
BS 701 742 RR4GB62TF
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RD RR4GB62TF 742 0 0
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TGAGAAGATGAAGGAGAAGAACCCGGAAAACTTCAGGTTGGACTTTGCGGTGAGCAGAGA
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TTGCTAGTTGCTAGTGAGAGGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4GB62JQ 751 0 0
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GAGATTGGTTTACACTAACGAAAGTGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTT
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TATGCCTAAAGACCCAAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGGAACTGGAATTGCTCC
ATTTAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGAGCACGAGGACTACAAGTTCAACGG
TTTGGCATGGCTCTTCTGGTGTACCCACAAGCAGCTCACTACTCTACAAGGAGGAGTTTG
AGAAGATGAAGGAGAAGAACCCGGAAAACTTCAGGTTGGACTTTGCGGTGAGCAGAGAGC
AGACAAACGAGAAGGGAGAGAAAATGTACATACAGACAAGAATGGCAGAGTATGCAGAAG
AGCTGTGGGAGTTGCTGAAGAAAGACAACACTTTTGTTTACATGTGTGGTCTCAAGGGTA
TGGAGAAGGGTATCGATGAGATCATGGTCTCACTTGCTGCTAAAGATGGGATCGATTGGT
TGGAGTACAAGAAGCAATTGAAGAAGAGTGAGCAGTGGAACGTGGAAGTCTACTAAGCTT
GCTAGTTGCTAGTGAGAGGTTTATTACTATATGTAGATAAAAGGAGCTGATGCCATTGCC
AATTATTCATTTTCTGCATCCTTCCTTTTTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7396Contig1 1319 2 2 U
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TGTCAATGCATTTCATTTTACTTTGGTGTTTATAAACCCAGATATCAAGGAAGCAGAATC
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TTTATGATTTCTTATGTGGTTTCTTTTATTTTTCTTATATTACATGGTGATGCAACAACT
CTTGAAAAGAACCAAAACATCTGTGCCAAGTTACAGATCCAGGAAAAGCGCCAGAAATGG
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AGAGTGATATGTTCAGTTTATGCTATCGATACATTGAATGGATGGTGGTTTTGTGCTTGT
GTGGTCTGTCAGAATAAGGTAGTCAAATCGCCTATATGTTTTTCTGAATCAGATGTCCAG
AGGTGGTGGTGTGAGTTTTGTCATAGTAATGTTACCCATGTTTATCCAAGGTACAAGTTA
GATTGTATGGTGCAGGATCAGACAGGTGAATCAAAAATCACACTTCTAGACTCGGTTGCA
ACATATATTGTGAAAAAATCAGCAAATAAATTGGTTAATGTTTTGGTTGATGAGATTGAA
GTTCAAGATATGTTACCACCTGAGATTGTGGACATCGTTGGCAAAACTTATGGTTTTGGA
ATTTCAATTGATGGAAACAATTCTTCTGTAATGGTCACATTCAATGCAATGAAAGTTTGG
AGTTTGAACGATGCTATATGGAAAAGAACCAAGTTTCTGCATCAGAACTCTATTGCTTCA
AGGAAGAAGCAATGCAAAGTGTTGAAAAATGTGGATGAAAGTGGCTGATATTATTTTCGG
ATCCTTAGATGTTTTTTTCTTAGGTTTGCCTTATTATTTCTGTTTGCCCCTTTTTGGGTT
TTTATTTTACAGGATGCTTTTTGTCCTGGGTTTTTATCTTTATTCTATGATTCTAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BT06TF U 1
AF RR4BT06JQ C 578
BS 1 699 RR4BT06TF
BS 700 1319 RR4BT06JQ

RD RR4BT06TF 699 0 0
GTACAAAATGGAGTTCATGGTTCACACATCAATAACCGACTGTGAGTTCACATGCTGCGA
CAACATGTTCATTGATCTAAAAGATTTTGCCACCACTATAGATGGTTCACTTAACAGTTG
TTTTCTTATTGATGTGATTGGAGTAATCATAGACTTTGGAGATAACAGTATTATTCAATC
TGCAAGGAAAGAAGTGTCCAATTTGGTGTTTACTCTCCGTGATAGCAATGACCAGCGCCT
ACAGTGCTGCGTTTCCGGTAGATTAGCTGATCTACTTAACCAAAAGGGCAAACCAAAAAG
TGGTGATATTTGTCTCATTCGATTTGCTAAAATTGTCAAATGCAATGAACAATGGAGAAT
TGTCAATGCATTTCATTTTACTTTGGTGTTTATAAACCCAGATATCAAGGAAGCAGAATC
ACTTAAACAAAAGTAAGAATCTCATATAGGCTTATTTTAAAATATTCTATAGGAATACAG
TTTATGATTTCTTATGTGGTTTCTTTTATTTTTCTTATATTACATGGTGATGCAACAACT
CTTGAAAAGAACCAAAACATCTGTGCCAAGTTACAGATCCAGGAAAAGCGCCAGAAATGG
TCCCAAAATCCTTTCATAACCATTCAAGAGATGAAACACTTTGAAAAGGGTGGAAAATGC
AGAGTGATATGTTCAGTTTATGCTATCGATACATTGAAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4BT06JQ 742 0 0
TCCAGGAAAAGCGCCAGAAATGGTCCCAAAATCCTTTCATAACCATTCAAGAGATGAAAC
ACTTTGAAAAGGGTGGAAAATGCAGAGTGATATGTTCAGTTTATGCTATCGATACATTGA
ATGGATGGTGGTTTTGTGCTTGTGTGGTCTGTCAGAATAAGGTAGTCAAATCGCCTATAT
GTTTTTCTGAATCAGATGTCCAGAGGTGGTGGTGTGAGTTTTGTCATAGTAATGTTACCC
ATGTTTATCCAAGGTACAAGTTAGATTGTATGGTGCAGGATCAGACAGGTGAATCAAAAA
TCACACTTCTAGACTCGGTTGCAACATATATTGTGAAAAAATCAGCAAATAAATTGGTTA
ATGTTTTGGTTGATGAGATTGAAGTTCAAGATATGTTACCACCTGAGATTGTGGACATCG
TTGGCAAAACTTATGGTTTTGGAATTTCAATTGATGGAAACAATTCTTCTGTAATGGTCA
CATTCAATGCAATGAAAGTTTGGAGTTTGAACGATGCTATATGGAAAAGAACCAAGTTTC
TGCATCAGAACTCTATTGCTTCAAGGAAGAAGCAATGCAAAGTGTTGAAAAATGTGGATG
AAAGTGGCTGATATTATTTTCGGATCCTTAGATGTTTTTTTCTTAGGTTTGCCTTATTAT
TTCTGTTTGCCCCTTTTTGGGTTTTTATTTTACAGGATGCTTTTTGTCCTGGGTTTTTAT
CTTTATTCTATGATTCTAATAA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL7397Contig1 851 2 2 U
GGAAGAGAGATCGATGATCCAAGAGACGAATCTCTCTCTCTAGATCGTATGATCTGATCT
CGAAGACGAAGCTCAGGAAGAGAAGATGGGAATCGTGTTCACCAAGCTGTTTTCTTCCGT
TTTCGGAAACAAAGAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCCGGAAAAACCAC
CATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAGGTCGTCTCCACTATTCCCGCTATTGGATTTAA
CGTGGAGACTGTGCAGTACAATAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAAAC
GAGTATCAGTCCATATTGGAGATGCTATTTCCCAAATACGCAAGCAGTGATTTATGTTGT
TGATTCGAGTGATACTGATAGAATTGGAGTGGCCAAAGAAGAGTTCCATGCAATTCTGGA
GGAAGAGGAACTGAAAGGTGCAATGGTTCTTATATTTGCAAACAAGCAGGATCTACCAGG
CGCTCTCAACGATGCAGCTGTGACAGAGGCCTTGGAGTTGCACAAGATAAAGAGTCGTCA
ATGGGCAATATTCAAAACTTGTGCGGTGAAAGGCGAAGGACTTTTTCGAAGGCCTAGACT
GGTTGAGTAATACGCTCAAATCAGGGACTGGCTAACATTCATCGCTCACCACAAAGCAGC
AGCGTGCGTGTATCATCTTTTCTACTGTTAGCTTTACATTCTTCGACAAAGAGTTGATAG
CGTATCAGTTATTGACCTCTTGTGTTTTTTGTCCGAAGAAGATCAGACTTGTGGAGTTGT
TGTTGTGACATTTAAGACGTCATTTTTAACATAAAATTGAACATATAAAGATTACCAATA
ACATTTGCTCC


BQ
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AF RR4DF92TF U 1
AF RR4DF92JQ C 189
BS 1 620 RR4DF92TF
BS 621 851 RR4DF92JQ

RD RR4DF92TF 620 0 0
GGAAGAGAGATCGATGATCCAAGAGACGAATCTCTCTCTCTAGATCGTATGATCTGATCT
CGAAGACGAAGCTCAGGAAGAGAAGATGGGAATCGTGTTCACCAAGCTGTTTTCTTCCGT
TTTCGGAAACAAAGAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCCGGAAAAACCAC
CATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAGGTCGTCTCCACTATTCCCGCTATTGGATTTAA
CGTGGAGACTGTGCAGTACAATAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAAAC
GAGTATCAGTCCATATTGGAGATGCTATTTCCCAAATACGCAAGCAGTGATTTATGTTGT
TGATTCGAGTGATACTGATAGAATTGGAGTGGCCAAAGAAGAGTTCCATGCAATTCTGGA
GGAAGAGGAACTGAAAGGTGCAATGGTTCTTATATTTGCAAACAAGCAGGATCTACCAGG
CGCTCTCAACGATGCAGCTGTGACAGAGGCCTTGGAGTTGCACAAGATAAAGAGTCGTCA
ATGGGCAATATTCAAAACTTGTGCGGTGAAAGGCGAAGGACTTTTTCGAAGGCCTAGACT
GGTTGAGTAATACGCTCAAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4DF92JQ 663 0 0
ATCGGCTTCAGATGGGGGAGGTCGTCTCCACTATTCCCGCTATTGGATTTAACGTGGAGA
CTGTGCAGTACAATAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAAACGAGTATCA
GTCCATATTGGAGATGCTATTTCCCAAATACGCAAGCAGTGATTTATGTTGTTGATTCGA
GTGATACTGATAGAATTGGAGTGGCCAAAGAAGAGTTCCATGCAATTCTGGAGGAAGAGG
AACTGAAAGGTGCAATGGTTCTTATATTTGCAAACAAGCAGGATCTACCAGGCGCTCTCA
ACGATGCAGCTGTGACAGAGGCCTTGGAGTTGCACAAGATAAAGAGTCGTCAATGGGCAA
TATTCAAAACTTGTGCGGTGAAAGGCGAAGGACTTTTTCGAAGGCCTAGACTGGTTGAGT
AATACGCTCAAATCAGGGACTGGCTAACATTCATCGCTCACCACAAAGCAGCAGCGTGCG
TGTATCATCTTTTCTACTGTTAGCTTTACATTCTTCGACAAAGAGTTGATAGCGTATCAG
TTATTGACCTCTTGTGTTTTTTGTCCGAAGAAGATCAGACTTGTGGAGTTGTTGTTGTGA
CATTTAAGACGTCATTTTTAACATAAAATTGAACATATAAAGATTACCAATAACATTTGC
TCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL7398Contig1 1200 2 4 U
GGGGGTTCCCAAAGACCCAGGAGAAGCCTCGGTTGATCCCGAGCCTGACGATTTGTCGGT
TTCTCGGAGGTTTTTGCAGAACGTTGCCGTGAACTGGATGGATACGACTCTGAAGAAGCC
GGTCGGGGAGAGTTTGATGGATAAGCTTCGAGAGATGGATGTGAACAAGGGCCGGATTCG
ATTAGACGGACTTTCGCCTCCGACGAAACCCGCAAAGGAAGAGACGATGGCTTTGGGGCT
TACCTTGCAAGACGCCAAGAAGTCGCTTAGAGCTGCGCAGATTGAAGTTGTGAAAACGAA
GTTGATGGAGACAGGGAAAAGCTGGATCCCTTACTCAGAGTTTGTTCATCTCTGCAGTGA
TTCTTCTTTGGGTCCTGATCATGGAACTTGGATAGCGAAGATGCTTGATGATTCAGGAAA
CGTCATTGTTTTGGGAGATTCTGTTTGCTTAAAACCTGATCAGGTAACCAAATCCATCGA
GGGCCTGCTTCCTTTACCACAGATCCGTAACCCAAACGACCCAAGAAGAAAGGAGCTAAA
CGAGCTTGAAGCCATAAAGAAGGTCATTGACCAGAAATCACATTCACTGGTGAGAATAGA
GCTTCAGGCTGGTCTGGGTTACATGATCCTCCAGACCGCATTGTTCATGAGGCTAACCTT
CTGGGAACTCACATGGGACGTTATGGAGCCAATCTGCTTCTATGTCACCTCTATATACTT
CATGGCCGGTTACTCTTTTTTCCTTAGGACCTCGAAAGAGCCTTCCTTTGAAGGGTTTTA
CCAAAGCAGGTTTGAGGCTAAACAGAGGAAACTGATGGAGACTCAAGATTTTGATGTTGG
TAGGTACGATGAGCTGAAGAAGCTGTTTAATCCTAAACCTTCTTCAGCTGCTGCTTCCAA
GATTCTTGGAACTATACATAATTAATCTTTGATGAAGGACAACTTTTTACATTCCGTTAT
GGTGGCTCGTTGTCCTAACCTGAGAAAGATATACTATTAACAACCCAAAAAAATTGTGAA
AGAAAACAAAATAAAGAGTTGTCAAAAAAAAAAGTGTTCGAATAGGTGCGGCTTATGTTA
ACTTTTGGAAGAGTAGATAATATATCGAGTATAATGTATACTACACTTTTGGAAGTGTAT
GGACTTTCATTTCTTAAGTTTTAGGTTCTTAATGTTTAATTGTATACTATCATTGGTTGT


BQ
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AF RR4DJ16TF U 1
AF RR4DJ16JQ C 379
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BS 749 749 RR4DJ16JQ
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BS 762 1200 RR4DJ16JQ

RD RR4DJ16TF 762 0 0
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CTGGGAACTCACATGGGACGTTATGGAGCCAATCTGCTTCTATGTCACCTCTATATACTT
CATGGCCGGTTACTCTTTTTTCCTTAGG*CCTCGAAAGAGC
T

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4DJ16JQ 822 0 0
TCATGGAACTTG*ATAGCGAAGATGCTTGATGATTCAGGAAACGTCATTGTTTTGGGAGA
TTCTGTTTGCTTAAAACCTGATCAGGTAACCAAATCCATCGAGGGCCTGCTTCCTTTACC
ACAGATCCGTAACCCAAACGACCCAAGAAGAAAGGAGCTAAACGAGCTTGAAGCCATAAA
GAAGGTCATTGACCAGAAATCACATTCACTGGTGAGAATAGAGCTTCAGGCTGGTCTGGG
TTACATGATCCTCCAGACCGCATTGTTCATGAGGCTAACCTTCTGGGAACTCACATGGGA
CGTTATGGAGCCAATCTGCTTCTATGTCACCTCTATATACTTCATGGCCGGTTACTCTTT
TTTCCTTAGGACCTCGAAAGAGCCTTCCTTTGAAGGGTTTTACCAAAGCAGGTTTGAGGC
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GAAGCTGTTTAATCCTAAACCTTCTTCAGCTGCTGCTTCCAAGATTCTTGGAACTATACA
TAATTAATCTTTGATGAAGGACAACTTTTTACATTCCGTTATGGTGGCTCGTTGTCCTAA
CCTGAGAAAGATATACTATTAACAACCCAAAAAAATTGTGAAAGAAAACAAAATAAAGAG
TTGTCAAAAAAAAAAGTGTTCGAATAGGTGCGGCTTATGTTAACTTTTGGAAGAGTAGAT
AATATATCGAGTATAATGTATACTACACTTTTGGAAGTGTATGGACTTTCATTTCTTAAG
TTTTAGGTTCTTAATGTTTAATTGTATACTATCATTGGTTGT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL7399Contig1 1019 2 6 U
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CCTTCTTTAACTCGATTTCCAGACCAAGTAGTGCTCCGCGACAGAGAACCAACCCTCCGG
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GCGTGTGCCTTCAGGAGCATCAGAGAACCTGAGGAAGACCTCTTCGGCTACAAACATTGT
GGATGATCTCAGTTCAATATTTGGAGCTTCAGCAGCAACCCAGTCCGGTGGGTTTCAAGA
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CCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCGACATGCTCAAAGGAAGCATGGAACAAGT
TCAACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTGTGTGT
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TGTTAATTTTTTTCCCTCTCACTTTCACTGTCCAGTCTTTGTAAGAGTACGATGGAAAAT
TTGTTGATGTTGATTTCCTGTAACTGAACTATTTATACATATATAAATGTTTCTTGAGC


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AF RR4B585TF U 1
AF RR4B585JQ C 213
BS 1 788 RR4B585TF
BS 789 789 RR4B585JQ
BS 790 812 RR4B585TF
BS 813 813 RR4B585JQ
BS 814 824 RR4B585TF
BS 825 1019 RR4B585JQ

RD RR4B585TF 824 0 0
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CCTTCTTTAACTCGATTTCCAGACCAAGTAGTGCTCCGCGACAGAGAACCAACCCTCCGG
TGGATCCTTTCCAAGATTCATGGAACAGGGAGGGTCTTACGAATCTAGCAGAGCATCTTC
GCGTGTGCCTTCAGGAGCATCAGAGAACCTGAGGAAGACCTCTTCGGCTACAAACATTGT
GGATGATCTCAGTTCAATATTTGGAGCTTCAGCAGCAACCCAGTCCGGTGGGTTTCAAGA
TATTGAAGGAGAAACTGAAGAGAGACGGCGTGCCCGGCTGGAACGCCACCAGAGAACACA
GGAGCGAGCTGCGAAAGCACTTGCTGAGAAAAATGATCGTGATCTTCAAGTACAAAGAGA
ACAAGCTGAGAAAAATAGGATTGGTGAGACCCTGGATGTTGAGATAAAACGTTGGGGTGC
GGGGAAGGAAGGAAACTTGCGTGCCCTGCTTTCCACGCTACAATATGTTCTTTGGCCAGA
ATGCGGTTGGCAGCCTGTTTCGTTGACCGATTTAATTACAGCCGCTTCTGTCAAGAAATT
TTACAGGAAGGCCACTCTCTGTATACATCCTGACAAAGTTCAGCAAAAAGGTGCTAATCT
CCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCGACATGCTCAAAGGAAGCATGGAACAAGT
TCAACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTGTGTGT
TGCCAAAA*GATGAAGCAAGTTCATTCACTAA*CTGCCCAAAAC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4B585JQ 807 0 0
GGAAGACCTCTTCGGCTACAAACATTGTGGATGATCTCAGTTCAATATTTGGAGCTTCAG
CAGCAACCCAGTCCGGTGGGTTTCAAGATATTGAAGGAGAAACTGAAGAGAGACGGCGTG
CCCGGCTGGAACGCCACCAGAGAACACAGGAGCGAGCTGCGAAAGCACTTGCTGAGAAAA
ATGATCGTGATCTTCAAGTACAAAGAGAACAAGCTGAGAAAAATAGGATTGGTGAGACCC
TGGATGTTGAGATAAAACGTTGGGGTGCGGGGAAGGAAGGAAACTTGCGTGCCCTGCTTT
CCACGCTACAATATGTTCTTTGGCCAGAATGCGGTTGGCAGCCTGTTTCGTTGACCGATT
TAATTACAGCCGCTTCTGTCAAGAAATTTTACAGGAAGGCCACTCTCTGTATACATCCTG
ACAAAGTTCAGCAAAAAGGTGCTAATCTCCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCG
ACATGCTCAA*GGAAGCATGGAACAAGTTCAACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTA
TGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTGTGTGTTGCCAAAAAGATGAAGCAAGTTCATTCACTAA
ACTGCCCAAAACGTGGTGCCCAAGTTGGATTACCCAAATATTGCATCACTGTAGCCATTG
CAGCAATTGGGCAGTCTTATTTTTTTGTTGTTAATTTTTTTCCCTCTCACTTTCACTGTC
CAGTCTTTGTAAGAGTACGATGGAAAATTTGTTGATGTTGATTTCCTGTAACTGAACTAT
TTATACATATATAAATGTTTCTTGAGC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL7400Contig1 607 2 1 U
GTATAAGGCGCTTAATGGAAACAAGTCTAAACTAGGAGGGGCTTTAACATAAATTACTGG
TCTGAAATTTCATAATCCAAAACAAACCAATGAGAGAATGCCACATAATCCTATCCTCAC
ATGAAAAATCTTGTATCGTCTCCTCCTCCAACGAAGCCAAAAGCTGATCATAAATCCAAA
ACCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTCTGT
CTCGTTATATGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTGTCT
ATTGGCTTCTCTCTTTCGTTTGCAACATTTTTATATTTCGTGATCTACAAAGAGCGGTTT
GCAGCGTTAATACTTAATAAGAAGAACATACATAATAGTTACATACAAAGATGACTTTTA
GATGCTTAAATTTCTCGATTATTTTTCACGATAACAATGAACTCTCTCGATGTTCATCTA
CTTTGTTATTCGCCTTGTACTCGAAAAAAGGTTCCGTTTGGACCAAACATTGAAATATTC
TGAATATTTGCAGAACTCAGTTGAGTTCAGTAAGATTTTGTGCAAATTGAACTAATTAGG
CCATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D442TF U 1
AF RR4D442JQ C 65
BS 1 607 RR4D442TF

RD RR4D442TF 607 0 0
GTATAAGGCGCTTAATGGAAACAAGTCTAAACTAGGAGGGGCTTTAACATAAATTACTGG
TCTGAAATTTCATAATCCAAAACAAACCAATGAGAGAATGCCACATAATCCTATCCTCAC
ATGAAAAATCTTGTATCGTCTCCTCCTCCAACGAAGCCAAAAGCTGATCATAAATCCAAA
ACCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTCTGT
CTCGTTATATGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTGTCT
ATTGGCTTCTCTCTTTCGTTTGCAACATTTTTATATTTCGTGATCTACAAAGAGCGGTTT
GCAGCGTTAATACTTAATAAGAAGAACATACATAATAGTTACATACAAAGATGACTTTTA
GATGCTTAAATTTCTCGATTATTTTTCACGATAACAATGAACTCTCTCGATGTTCATCTA
CTTTGTTATTCGCCTTGTACTCGAAAAAAGGTTCCGTTTGGACCAAACATTGAAATATTC
TGAATATTTGCAGAACTCAGTTGAGTTCAGTAAGATTTTGTGCAAATTGAACTAATTAGG
CCATGCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4D442JQ 543 0 0
AAATTTCATAATCCAAAACAAACCAATGAGAGAATGCCACATAATCCTATCCTCACATGA
AAAATCTTGTATCGTCTCCTCCTCCAACGAAGCCAAAAGCTGATCATAAATCCAAAACCA
CTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTCTGTCTCG
TTATATGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTGTCTATTG
GCTTCTCTCTTTCGTTTGCAACATTTTTATATTTCGTGATCTACAAAGAGCGGTTTGCAG
CGTTAATACTTAATAAGAAGAACATACATAATAGTTACATACAAAGATGACTTTTAGATG
CTTAAATTTCTCGATTATTTTTCACGATAACAATGAACTCTCTCGATGTTCATCTACTTT
GTTATTCGCCTTGTACTCGAAAAAAGGTTCCGTTTGGACCAAACATTGAAATATTCTGAA
TATTTGCAGAACTCAGTTGAGTTCAGTAAGATTTTGTGCAAATTGAACTAATTAGGCCAT
GCC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7401Contig1 765 2 3 U
TTTTTTTTTCTAAACTAAAGAACAATTATCATATACATGTTCTAAACTGTGATGTTCATC
AAACAGATCTTAGCTGGTGATGAACACTCACCCAGGACTCTGTAAATATCAGAACAAAAC
TCAAACGAGTTTGGTTCTGTGGGTACAGACTCGATCCACTCTTTCTCGACCATCTGAACG
TGTGAGTTCATCTTCATCACAGCTTCAAACTCAATTTTGCCCCTCAATCTCTTAAGAAAC
TTCAATGTCAAAATCATTTCCAAGTTCTTGACTTCAGATTCTTCGGTCACCTGAACCCCA
ATCTCCCCTCCTTTTGCGCTCACGAATCCAACTAGCATCGGGTTGATGTAATGCTGCGGA
GTTTGTGATCTTAAATCAATGCTGTGTACCTATGAAAGCAGAAGATAATCGATTCCTAGG
CTGGAAAGAGAGTCTGTGATTCCATGTGAAGCAAGGACGCTCAAGACTCCTCCAGAGCCA
ACAGGGGACTTGAGTATTTCCCATGGAGATTTCATCAAAATCTTGTGCTTTTTCGGTTCC
TCTGGTGAGCTACAACACACTACAGGAAGTGTTTCTTCTTTAAGGAACCATACCTTTTCT
GATTCAAATCCAAAATAATCATTTTCCTCAAAAAGGTTCCGCACATCTTCAATGGCATGT
TCAGGAGAGATAATGACAAGTGGCACACAAGCACGTTCTTCTTCCTTTAGGAACCTCTGC
TCATCATCAAGTAGCGTCTGAAGGTACGAGACTGCACCATTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ02JQ U 8
AF RR4CZ02TF C 1
BS 1 19 RR4CZ02TF
BS 20 687 RR4CZ02JQ
BS 688 765 RR4CZ02TF

RD RR4CZ02JQ 680 0 0
CTAAAACTAAAG
GAACAATTATCATATACATGTTCTAAACTGTGATGTTCATCAAACAGATCTTAGCTGGTG
ATGAACACTCACCCAGGACTCTGTAAATATCAGAACAAAACTCAAACGAGTTTGGTTCTG
TGGGTACAGACTCGATCCACTCTTTCTCGACCATCTGAACGTGTGAGTTCATCTTCATCA
CAGCTTCAAACTCAATTTTGCCCCTCAATCTCTTAAGAAACTTCAATGTCAAAATCATTT
CCAAGTTCTTGACTTCAGATTCTTCGGTCACCTGAACCCCAATCTCCCCTCCTTTTGCGC
TCACGAATCCAACTAGCATCGGGTTGATGTAATGCTGCGGAGTTTGTGATCTTAAATCAA
TGCTGTGTACCTATGAAAGCAGAAGATAATCGATTCCTAGGCTGGAAAGAGAGTCTGTGA
TTCCATGTGAAGCAAGGACGCTCAAGACTCCTCCAGAGCCAACAGGGGACTTGAGTATTT
CCCATGGAGATTTCATCAAAATCTTGTGCTTTTTCGGTTCCTCTGGTGAGCTACAACACA
CTACAGGAAGTGTTTCTTCTTTAAGGAACCATACCTTTTCTGATTCAAATCCAAAATAAT
CATTTTCCTCAAAAAGGTTCCGCACATCTTCAATGGCATGTTCAGGAGAGATAATGACAA
GTGGCACA

QA 13 680 13 680
DS 

RD RR4CZ02TF 765 0 0
TTTTTTTTTCTAAACTAAAGAACAATTATCATATACATGTTCTAAACTGTGATGTTCATC
AAACAGATCTTAGCTGGTGATGAACACTCACCCAGGACTCTGTAAATATCAGAACAAAAC
TCAAACGAGTTTGGTTCTGTGGGTACAGACTCGATCCACTCTTTCTCGACCATCTGAACG
TGTGAGTTCATCTTCATCACAGCTTCAAACTCAATTTTGCCCCTCAATCTCTTAAGAAAC
TTCAATGTCAAAATCATTTCCAAGTTCTTGACTTCAGATTCTTCGGTCACCTGAACCCCA
ATCTCCCCTCCTTTTGCGCTCACGAATCCAACTAGCATCGGGTTGATGTAATGCTGCGGA
GTTTGTGATCTTAAATCAATGCTGTGTACCTATGAAAGCAGAAGATAATCGATTCCTAGG
CTGGAAAGAGAGTCTGTGATTCCATGTGAAGCAAGGACGCTCAAGACTCCTCCAGAGCCA
ACAGGGGACTTGAGTATTTCCCATGGAGATTTCATCAAAATCTTGTGCTTTTTCGGTTCC
TCTGGTGAGCTACAACACACTACAGGAAGTGTTTCTTCTTTAAGGAACCATACCTTTTCT
GATTCAAATCCAAAATAATCATTTTCCTCAAAAAGGTTCCGCACATCTTCAATGGCATGT
TCAGGAGAGATAATGACAAGTGGCACACAAGCACGTTCTTCTTCCTTTAGGAACCTCTGC
TCATCATCAAGTAGCGTCTGAAGGTACGAGACTGCACCATTCTCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL7402Contig1 602 2 1 U
GCCCAAGTAAAAGGTGGATCATTGGAATAGATCCGATCAGCATCAAGTTGGCTCCACCAT
TTGTATGCTTCTCCAACTAAGGTATCTCTTGCATAAGATGGTTGTAACTTCTCTGGAATT
CTCCAAGCTATAAACCATTGCTCCATTTCGTCCTCCCACCTTAGGTATGAACTTGGTCCT
TGGTGTGGAATCACTAAGACCGTGGCTTGTGAGTTGTATCAAAGGCCATCCGCAACCTTT
GTGGTGCTCCTCAATCCATCAAGTTACTTCCATCCAGATTCCTTTGGTTGATTAGATCAG
CCCAATTGAGTCACCCTTGTGCTAGATCGGCTCCTCCTCTCCTGCTTGGGATCTTACAGC
CTTTGTCAGCTTAGGCTTGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAG
GTCATATCTATCCTTGTCTCTTTTATTGCATTTTTAGTTTCATTAGTTTTTGCATTCATA
AATCAAAAGCCATAAAAATCATTTGTTCTTTGTTTCATCTAGTTCCTCTTTTCATAAAAC
CATAAAACCCATAAAAAGAAATCGTTTTGTTTCTTGTTGCATTTAGTTGTTTCATTTCTT
TC


BQ
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20 20 

AF RR4FC78JQ C 1
AF RR4FC78TF U 1
BS 1 602 RR4FC78TF

RD RR4FC78JQ 602 0 0
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TC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4FC78TF 602 0 0
GCCCAAGTAAAAGGTGGATCATTGGAATAGATCCGATCAGCATCAAGTTGGCTCCACCAT
TTGTATGCTTCTCCAACTAAGGTATCTCTTGCATAAGATGGTTGTAACTTCTCTGGAATT
CTCCAAGCTATAAACCATTGCTCCATTTCGTCCTCCCACCTTAGGTATGAACTTGGTCCT
TGGTGTGGAATCACTAAGACCGTGGCTTGTGAGTTGTATCAAAGGCCATCCGCAACCTTT
GTGGTGCTCCTCAATCCATCAAGTTACTTCCATCCAGATTCCTTTGGTTGATTAGATCAG
CCCAATTGAGTCACCCTTGTGCTAGATCGGCTCCTCCTCTCCTGCTTGGGATCTTACAGC
CTTTGTCAGCTTAGGCTTGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAG
GTCATATCTATCCTTGTCTCTTTTATTGCATTTTTAGTTTCATTAGTTTTTGCATTCATA
AATCAAAAGCCATAAAAATCATTTGTTCTTTGTTTCATCTAGTTCCTCTTTTCATAAAAC
CATAAAACCCATAAAAAGAAATCGTTTTGTTTCTTGTTGCATTTAGTTGTTTCATTTCTT
TC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL7403Contig1 818 2 2 U
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CCCAAACACAGTTGTTAGACTCGAACCCAGCTCCCATACTCATCATTAGGATCTTGTCAC
CTTTCTTTAGCCTCTTCTTAGCTTCCATGTAACCAAGAACATACCATAAACCACCAGATG
ACGTATTACCGAACCTATGAAGCGCCATTCTCGACGGTTCTATGTCGAACTCCGTGAGCC
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TTCTTCGTTTAAGCGCACGTACTATCGCGTACCTGATCAGTTCCTTGACAGGCAAGACTC
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BQ
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AF RR4DZ93JQ U 1
AF RR4E332JQ U 8
BS 1 778 RR4DZ93JQ
BS 779 818 RR4E332JQ

RD RR4DZ93JQ 778 0 0
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TATTTCATAAATATATTTCTCCTCGCTTACTTGTTATGGATCAAACACGAATAAAGCTCA
TGGTATCGTCATTGATCCAGTCATACTTCTCAACAAACGGATTAGGGATCTTGGACAGTT
CCGGATATCGATCCATGGAATCTTCCCAAACATTTTTACCATCAAGATTCTTAAGAACCT
CCCAAACACAGTTGTTAGACTCGAACCCAGCTCCCATACTCATCATTAGGATCTTGTCAC
CTTTCTTTAGCCTCTTCTTAGCTTCCATGTAACCAAGAACATACCATAAACCACCAGATG
ACGTATTACCGAACCTATGAAGCGCCATTCTCGACGGTTCTATGTCGAACTCCGTGAGCC
CTAAGCTTGTTCCCACCCCTTCGATAATAGCTCTTCCTCCAGGGTGAATACAAAAATGTT
GCAACCCTGTCTTCAGGTCTAGACCTATTCCAGAGCTCGTAGACTCTCTTTTTGTGGTGG
TTCTTCGTTTAAGCGCACGTACTATCGCGTACCTGATCAGTTCCTTGACAGGCAAGACTC
TTGGGAGGAGGACTTGGAGGTTCTTGGTTAGGGCACGAGCAGCTGATTTTTTAAGGTACT
TGGTTAGGAGGAAACCTGGGTGACCATCTTTGTCCTCCATCCGCATGCAGCACGAGTAAG
CCTCGTCTTCAGACCCCACGTGTGCACGTACCACGGTCACTAGCTTCATCAAAGCCCT

QA 1 778 1 778
DS 

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GTCATTGATCCAGTCATACTTCTCAACAAACGGATTAGGGATCTTGGACAGTTCCGGATA
TCGATCCATGGAATCTTCCCAAACATTTTTACCATCAAGATTCTTAAGAACCTCCCAAAC
ACAGTTGTTAGACTCGAACCCAGCTCCCATACTCATCATTAGGATCTTGTCACCTTTCTT
TAGCCTCTTCTTAGCTTCCATGTAACCAAGAACATACCATAAACCACCAGATGACGTATT
ACCGAACCTATGAAGCGCCATTCTCGACGGTTCTATGTCGAACTCCGTGAGCCCTAAGCT
TGTTCCCACCCCTTCGATAATAGCTCTTCCTCCAGGGTGAATACAAAAATGTTGCAACCC
TGTCTTCAGGTCTAGACCTATTCCAGAGCTCGTAGACTCTCTTTTTGTGGTGGTTCTTCG
TTTAAGCGCACGTACTATCGCGTACCTGATCAGTTCCTTGACAGGCAAGACTCTTGGGAG
GAGGACTTGGAGGTTCTTGGTTAGGGCACGAGCAGCTGATTTTTTAAGGTACTTGGTTAG
GAGGAAACCTGGGTGACCATCTTTGTCCTCCATCCGCATGCAGCACGAGTAAGCCTCGTC
TTCAGACCCCACGTGTGCACGTACCACGGTCACTAGCTTCATCAAAGCCCTGTTCTTGAC
CTAGCCGCGTTGGTTAACAGCACAGAGCTTC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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TCCTGGTTTTGAAGGCCCTCTTCCTTTCGAGCTTGAGACAGGGTATATTGGTGTTGGTGA
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CGAGAATGGGCCTGTGACATTTAACCTTGACGAGGGTTACAATGAAGGTAGTAGACCTGC
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TATTGGTACTGGCTTTTCCTACGCAACAACTGAGCTTCTTGATACACCTAGTGACTCGGG
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CTCGAACCCTTTTTATGTCGCTGGAAATTCGTATTCTGGTAAGACTATTCCTGCCACCGT
TCAAGAAATCTCCAAAGGAAATGATCTTGGGTTTAAACCTCAAGTGAATCTTAAGGGTTA
CATACTAGGAAACCCGGTAACCGACTTCGAATATGACCATAACTATGGCATTCCATTTGC
TCATGGAATGGCATTGATCTCTGATGAACTCTACGAGTCGTTGAAGAGAAGTTGTAAAGG
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CTATAAACAAAAACAAACAGATTTACTATCTTCCCTCTGGGCCAATGATGAGAGTGTACG
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GCCTTACGATTTTGATATCAAAAGCAGCGTACCATACCATATGAATAATAGCATCAAAGG
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GACTTATGCCAATAACATGACATATGCTACTGTCAAAGGAGGTGGGCATACACTTGATTT
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TCCCAATAAAGATTCCGCTGGTGTATTCGTAACCAGTTTAGTAGTACGTGTTTTGTATTA
CTACCAGTACCACTTTTGTTACGAAGTTTCTGTATCAATTTTATTGTATGTTACAAATTT
CATGTACCATTTCTCAGTTTGTGAAATATCGGATCCCCTCCGTTTGACACTAC


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AF RR4D193TF U 1
AF RR4D193JQ C 646
BS 1 762 RR4D193TF
BS 763 763 RR4D193JQ
BS 764 794 RR4D193TF
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TCCTCTTCTTCTCTGGTTAACTGGAGGACCTGGCTGTTCTTCTTTCTCTGCTCTCTTTTT
CGAGAATGGGCCTGTGACATTTAACCTTGACGAGGGTTACAATGAAGGTAGTAGACCTGC
CTTACTTTCTACAACATATTCATGGACGAAGGTGGCAAACATAATCTTTTTGGACCAGCC
TATTGGTACTGGCTTTTCCTACGCAACAACTGAGCTTCTTGATACACCTAGTGACTCGGG
ACAAGCTAAGCAGATCCAGGAATTTATTCGGAAGTGGTTAAGTAAGCATACAGAGTTTAT
CTCGAACCCTTTTTATGTCGCTGGAAATTCGTATTCTGGTAAGACTATTCCTGCCACCGT
TCAAGAAATCTCCAAAGGAAATGATCTTGGGTTTAAACCTCAAGTGAATCTTAAGGGTTA
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TCATGGAATGGCATTGATCTCTGATGAACTCTACGAGTCGTTGAAGAGAAGTTGTAAAGG
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AAAGTGCATTTCTG

QA 1 794 1 794
DS 

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GAGAAGTTGTAAAGGAAACTATGAGTATATAGATCCACATAACACAGAGTGCTTGAAATA
TCATGACGAGTTTCTAAAGTGCATTTCTGGCCTAAATATTGATCATATTCTAATGCCACG
GTGCGAGCCCCCCGTGTGGCAAAGAAGATCTCTTCGCCTTAGAGACGTTTCGGCTCCGAT
AATTGCAGATGGATGCTATAAACAAAAACAAACAGATTTACTATCTTCCCTCTGGGCCAA
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GTGTTCTTCAGGCAAGCCTTACGATTTTGATATCAAAAGCAGCGTACCATACCATATGAA
TAATAGCATCAAAGGATACCGATCGCTCATATTCAGGCCATGGATTATAAACAATCAAGT
TGCTGGATACACTCAGACTTATGCCAATAACATGACATATGCTACTGTCAAAGGAGGTGG
GCATACACTTGATTTCAAACCAAATGAAAGCTCTATCATGTTTCAGAGGTGGATTAGTGG
TCAACCTCTCTAAAATCCCAATAAAGATTCCGCTGGTGTATTCGTAACCAGTTTAGTAGT
ACGTGTTTTGTATTACTACCAGTACCACTTTTGTTACGAAGTTTCTGTATCAATTTTATT
GTATGTTACAAATTTCATGTACCATTTCTCAGTTTGTGAAATATCGGATCCCCTCCGTTT
GACACTAC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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GTCGAGTTTCATTGGCGCCGTTTGGCACGATCAATCATTCAAAGATTATTATCACTCTTG
AGGCGGTGAATAATTCCTATAAAAATGAGACAGAGCCATAACCATGAACTCCTTCAGATC
TACTCTACCGGAAAGATCTTCCGAGCATCTCACGGTTCCGGCGATTCTTGCTTGGCTTAA
CAACGGCGGCAGTGAAGATTGCGGTTCTTGCTTGGCTCAACGGCAGGGATTGACGGATGA
ATTGAGAGTGGTTCGGGCATGATGATGGGTTCGGGTTAAAGCTCTGACTAGGCGATGCTG
ATAAATAGTGACATCAAATCATTCCGGCGACCTACTATAACATTACCAGTGATCCTACAA
AGCTTTTTAATATTACCAGATTTTAAAGATTTGCTTTGTTGATCAAATTATTTCGATACT
GGTTTCATATTTACAATTACATCTCGTACTCCTACAGGCATCTCCCATCCAAGCCTCTGT
AACCGTCCATCTGCTGAACACATTCAGCTAACTTCTTAAGGAGAGAATTTGATGGTAACA
AGAATTTGTAGCGTTAGATGTCCAGGAGACTTTCAGCTAAGGCAAGATTGATCATATGTT
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CAGATTCCATTGCCCGCCGCATTTTACTAATAACTGTAGCTCTTAACAAGGAGGCTCAAG
TACTCAACCTTTCTTTTGCTAGCTAATGCGTGGAAAACTGGTGTACCCACAAGGGTTCAA
GCTATGGACTTCTGTTTTTCTTTGTGTGTGTACGAGAACATTATCAGTTTAGGAGATCTC
CTCAAAAAATGCTTTGTGAGAAGAGCTTAGCTTTGGGAAAGATAAGGGCCTAAGGGAGAG
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TTAATTATAATTGTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ19TF U 1
AF RR4CQ19JQ C 270
BS 1 641 RR4CQ19TF
BS 642 642 RR4CQ19JQ
BS 643 684 RR4CQ19TF
BS 685 685 RR4CQ19JQ
BS 686 711 RR4CQ19TF
BS 712 712 RR4CQ19JQ
BS 713 725 RR4CQ19TF
BS 726 726 RR4CQ19JQ
BS 727 744 RR4CQ19TF
BS 745 1037 RR4CQ19JQ

RD RR4CQ19TF 761 0 0
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GTCGAGTTTCATTGGCGCCGTTTGGCACGATCAATCATTCAAAGATTATTATCACTCTTG
AGGCGGTGAATAATTCCTATAAAAATGAGACAGAGCCATAACCATGAACTCCTTCAGATC
TACTCTACCGGAAAGATCTTCCGAGCATCTCACGGTTCCGGCGATTCTTGCTTGGCTTAA
CAACGGCGGCAGTGAAGATTGCGGTTCTTGCTTGGCTCAACGGCAGGGATTGACGGATGA
ATTGAGAGTGGTTCGGGCATGATGATGGGTTCGGGTTAAAGCTCTGACTAGGCGATGCTG
ATAAATAGTGACATCAAATCATTCCGGCGACCTACTATAACATTACCAGTGATCCTACAA
AGCTTTTTAATATTACCAGATTTTAAAGATTTGCTTTGTTGATCAAATTATTTCGATACT
GGTTTCATATTTACAATTACATCTCGTACTCCTACAGGCATCTCCCATCCAAGCCTCTGT
AACCGTCCATCTGCTGAACACATTCAGCTAACTTCTTAAGGAGAGAATTTGATGGTAACA
AGAATTTGTAGCGTTAGATGTCCAGGAGACTTTCAGCTAAG*CAAGATTGATCATATGTT
GATCATATTTACGTTCCTCATTCA*CAAGATGGAGAGGCCGGGATGAGAAG*TGATACCG
CAGAT*CCATTGCCCGCCGCATTT
ACTATACTGTAGCTCTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4CQ19JQ 768 0 0
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TTCGGGTTAAAGCTCTGACTAGGCGATGCTGATAAATAGTGACATCAAATCATTCCGGCG
ACCTACTATAACATTACCAGTGATCCTACAAAGCTTTTTAATATTACCAGATTTTAAAGA
TTTGCTTTGTTGATCAAATTATTTCGATACTGGTTTCATATTTACAATTACATCTCGTAC
TCCTACAGGCATCTCCCATCCAAGCCTCTGTAACCGTCCATCTGCTGAACACATTCAGCT
AACTTCTTAAGGAGAGAATTTGATGGTAACAAGAATTTGTAGCGTTAGATGTCCAGGAGA
CTTTCAGCTAAGGCAAGATTGATCATATGTTGATCATATTTACGTTCCTCATTCAACAAG
ATGGAGAGGCCGGGATGAGAAGGTGATACCGCAGATTCCATTGCCCGCCGCATTTTACTA
ATAACTGTAGCTCTTAACAAGGAGGCTCAAGTACTCAACCTTTCTTTTGCTAGCTAATGC
GTGGAAAACTGGTGTACCCACAAGGGTTCAAGCTATGGACTTCTGTTTTTCTTTGTGTGT
GTACGAGAACATTATCAGTTTAGGAGATCTCCTCAAAAAATGCTTTGTGAGAAGAGCTTA
GCTTTGGGAAAGATAAGGGCCTAAGGGAGAGGAAACATTGTTTGTGATTTGATGGAAAAT
GAGCGTTTGATATGCAAGACATTGTTTTAGCTTAATTATAATTGTTAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7406Contig1 526 2 1 U
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TTTTAAAAAAAAATCATATTTCAGAAGCAAAAAGCAGAAATGGCTTTGGTGAGAAGTCTA
TTGGGTGCAAAGAAGATTCTTGGCCGATCCGTCACAGCAGCTTCCACGAGCAAAAGAACA
GCCTCAGCAGCACCAAAAGGGTTTCTTGCGGTGTACGTAGGAGAGAGCCAGAAGAAGAGA
TATGTGGTGCCAATCTCATACTTGAGCCAGCCTTCCTTTCAAGCACTTCTCAGTAAATCC
GAGGAAGAGTTTGGGTTTGATCATCCAATGGGTGGCTTAACAATCCCCTGTCCTGAAGAT
ATCTTCATCAACGTAACATCTAGGCTCCAATGATGAATTATCCAAATGTTTTATTGTTCT
TGAGTTAGCAAGAGACTTATTCATTGTAAAGTATAGGACATTTTTTTCATTTTCTCTCTC
CCTTGGAAGAGTTGTTACACGATCATGTCAAATACATTTTGGGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G585JQ C 1
AF RR4G585TF U 1
BS 1 526 RR4G585TF

RD RR4G585JQ 526 0 0
GGGATCACCAACAACAAAGCAATCCAATAACTTTAATCTTTACATACATCTCTTCAAAAC
TTTTAAAAAAAAATCATATTTCAGAAGCAAAAAGCAGAAATGGCTTTGGTGAGAAGTCTA
TTGGGTGCAAAGAAGATTCTTGGCCGATCCGTCACAGCAGCTTCCACGAGCAAAAGAACA
GCCTCAGCAGCACCAAAAGGGTTTCTTGCGGTGTACGTAGGAGAGAGCCAGAAGAAGAGA
TATGTGGTGCCAATCTCATACTTGAGCCAGCCTTCCTTTCAAGCACTTCTCAGTAAATCC
GAGGAAGAGTTTGGGTTTGATCATCCAATGGGTGGCTTAACAATCCCCTGTCCTGAAGAT
ATCTTCATCAACGTAACATCTAGGCTCCAATGATGAATTATCCAAATGTTTTATTGTTCT
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CCTTGGAAGAGTTGTTACACGATCATGTCAAATACATTTTGGGTCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4G585TF 526 0 0
GGGATCACCAACAACAAAGCAATCCAATAACTTTAATCTTTACATACATCTCTTCAAAAC
TTTTAAAAAAAAATCATATTTCAGAAGCAAAAAGCAGAAATGGCTTTGGTGAGAAGTCTA
TTGGGTGCAAAGAAGATTCTTGGCCGATCCGTCACAGCAGCTTCCACGAGCAAAAGAACA
GCCTCAGCAGCACCAAAAGGGTTTCTTGCGGTGTACGTAGGAGAGAGCCAGAAGAAGAGA
TATGTGGTGCCAATCTCATACTTGAGCCAGCCTTCCTTTCAAGCACTTCTCAGTAAATCC
GAGGAAGAGTTTGGGTTTGATCATCCAATGGGTGGCTTAACAATCCCCTGTCCTGAAGAT
ATCTTCATCAACGTAACATCTAGGCTCCAATGATGAATTATCCAAATGTTTTATTGTTCT
TGAGTTAGCAAGAGACTTATTCATTGTAAAGTATAGGACATTTTTTTCATTTTCTCTCTC
CCTTGGAAGAGTTGTTACACGATCATGTCAAATACATTTTGGGTCC

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL7407Contig1 766 2 6 U
GGCTAAAAACTAATCTCAAGTTTGATCAAGAAATTCAAGAAAGATGCCTAAAGATAGGAA
GATCGGAATCGCGATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAATGCACTGAAATGGGCATTTGA
GAACTTAGCTGATAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACACGTTATCAACCTCTGACGT
TGACTCTCATAACTCTGCCTGGCTCCAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTT
TAGGGGACCGGAGATCATGGAGAAATATGGTGTAAAGATTGATATCCCAGTTCTTGACAT
GCTTGACACTGGTTCAAGGCAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACGAAATTATACTGGGGAGA
TGCAAGAGAGGCGCTGGTCGATGCTGTTGAAGATCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGG
AAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCGAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTCGTGAT
TCAGCATGCTCCTTGCCCCGTCACCGTTGTCAAGGATAACGACTCTCACTAAATTATGAT
GTCTTTATCTCATATGTTTTTACAAAATCCATCATCGCTGCTTATGCTTTTTAATTAAAG
AATAAAAGTACCTTTTTCTCGGTTGTATTTTGTTTCGGTATTCGAATTCATATGAATACG
TTATTGCTTCGTATATTTGTCAAGTATCTTAGGTGTGTTTGGTGGACTCACTCTTATGTG
ATTTACATATCAACATGTCGTGAGATCATTTAAATAATTTGTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EA74TF U 1
AF RR4EA74JQ C 66
BS 1 682 RR4EA74TF
BS 683 683 RR4EA74JQ
BS 684 692 RR4EA74TF
BS 693 693 RR4EA74JQ
BS 694 745 RR4EA74TF
BS 746 766 RR4EA74JQ

RD RR4EA74TF 745 0 0
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GATCGGAATCGCGATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAATGCACTGAAATGGGCATTTGA
GAACTTAGCTGATAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACACGTTATCAACCTCTGACGT
TGACTCTCATAACTCTGCCTGGCTCCAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTT
TAGGGGACCGGAGATCATGGAGAAATATGGTGTAAAGATTGATATCCCAGTTCTTGACAT
GCTTGACACTGGTTCAAGGCAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACGAAATTATACTGGGGAGA
TGCAAGAGAGGCGCTGGTCGATGCTGTTGAAGATCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGG
AAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCGAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTCGTGAT
TCAGCATGCTCCTTGCCCCGTCACCGTTGTCAAGGATAACGACTCTCACTAAATTATGAT
GTCTTTATCTCATATGTTTTTACAAAATCCATCATCGCTGCTTATGCTTTTTAATTAAAG
AATAAAAGTACCTTTTTCTCGGTTGTATTTTGTTTCGGTATTCGAATTCATATGAATACG
TTATTGCTTCGTATATTTGTCA*GTATCTTAG*TGTGTTTGGTGGACTCACTCTTATGTG
ATTTACATATCAACATGTCGTGAGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EA74JQ 701 0 0
GAATCGCGATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAATGCACTGAAATGGGCATTTGAGAACT
TAGCTGATAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACACGTTATCAACCTCTGACGTTGACT
CTCATAACTCTGCCTGGCTCCAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGGG
GACCGGAGATCATGGAGAAATATGGTGTAAAGATTGATATCCCAGTTCTTGACATGCTTG
ACACTGGTTCAAGGCAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACGAAATTATACTGGGGAGATGCAA
GAGAGGCGCTGGTCGATGCTGTTGAAGATCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCA
GAGGACTCAGTGCCCTTCGAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTCGTGATTCAGC
ATGCTCCTTGCCCCGTCACCGTTGTCAAGGATAACGACTCTCACTAAATTATGATGTCTT
TATCTCATATGTTTTTACAAAATCCATCATCGCTGCTTATGCTTTTTAATTAAAGAATAA
AAGTACCTTTTTTTCGGTTGTATTTTGTTTCGGTATTCGAATTCATATGAATACGTTATT
GCTTCGTATATTTGTCAAGTATCTTAGGTGTGTTTGGTGGACTCACTCTTATGTGATTTA
CATATCAACATGTCGTGAGATCATTTAAATAATTTGTATAT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7408Contig1 662 2 2 U
ATCGATCGATTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGATGAATAACGCTGGCGGCCAATATCCAGAGTTTCCGGCGGTGCAAACGCACGGAGGAC
AGTTCATAAGCTATGATATCTTCGGTAGTTTATTCGAGATCACATCCAAGTACCGTCCTC
CGATTGTACCAATCGGTCGAGGCGCATACGGCATCGTTTGCTCTGTTTTGGATTCGGAGA
CGAACGAGCTAGTGGCGATGAAGAAGATAGCCAACGCCTTCGATAATCACATGGACGCCA
AGCGTACACTTCGCGAGATCAAGCTTCTTCGTCATCTCGATCATGAAAACATCATAGCTA
TAAGAGATGTGGTTCCTCCACCACTTAGAAGACAGTTCAGTGATGTTTATATTGCCACTG
AGTTAATGGACACTGATCTTCATCAAATCATCAGATCTAACCAGGGTTTGTCTGAGGAAC
ACTGTCAGTACTTCTTGTACCAGCTTCTTCGAGGGCTCAAGTACATCCACTCGGCTAAAG
TTATCCACAGGGATCTAAAACCGAGCAATCTTCTCCTGAACGCCAACTGCGATTTAAAGA
TCTGTGACTTCGGTCTTGCTCGACCGACTTCGGAGAACGAGTTTATGACCGAGTATGTTG
TT


BQ
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10 10 

AF RR4CT57TF U 1
AF RR4GU65TF U 109
BS 1 232 RR4CT57TF
BS 233 662 RR4GU65TF

RD RR4CT57TF 232 0 0
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QA 1 232 1 232
DS 

RD RR4GU65TF 554 0 0
AAACGCAC
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GCCAAGCGTACACTTCGCGAGATCAAGCTTCTTCGTCATCTCGATCATGAAAACATCATA
GCTATAAGAGATGTGGTTCCTCCACCACTTAGAAGACAGTTCAGTGATGTTTATATTGCC
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GAACACTGTCAGTACTTCTTGTACCAGCTTCTTCGAGGGCTCAAGTACATCCACTCGGCT
AAAGTTATCCACAGGGATCTAAAACCGAGCAATCTTCTCCTGAACGCCAACTGCGATTTA
AAGATCTGTGACTTCGGTCTTGCTCGACCGACTTCGGAGAACGAGTTTATGACCGAGTAT
GTTGTT

QA 9 554 9 554
DS 



AS 1 2

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AAGAAGCTACACATAAAGATGATGATTTTGGGTATATCTCAACAAAGAAGGCGAATCAAA
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AGCATGAAAATAATTCCAATACAAGCGAATTGTTTTATCTGCATTTGCTTTTAAACAAGA
GCAAAACATCGACCAGCTTCACAGATTTACGAACTGTTAATGGAGTTTTGTATCCTACTT
TTGAAGATGCTTATAATGCTCTTTTTATTTGAACTACTGTTTTATCTTTATGGGTTTTTC
AATTTCTTTTTTCTTAAGCTTCTTATGTATTTCCTACTTTCGATTTTATTCATGTTTACG
TACTGAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AC93JQ C 1
AF RR4AC93TF U 1
BS 1 427 RR4AC93TF

RD RR4AC93JQ 427 0 0
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CTTCGCAATATCAAGATTGGATGGAAATTAACAGTAAGAACAAAGAGAAAACAATTAGTA
AGCATGAAAATAATTCCAATACAAGCGAATTGTTTTATCTGCATTTGCTTTTAAACAAGA
GCAAAACATCGACCAGCTTCACAGATTTACGAACTGTTAATGGAGTTTTGTATCCTACTT
TTGAAGATGCTTATAATGCTCTTTTTATTTGAACTACTGTTTTATCTTTATGGGTTTTTC
AATTTCTTTTTTCTTAAGCTTCTTATGTATTTCCTACTTTCGATTTTATTCATGTTTACG
TACTGAC

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR4AC93TF 427 0 0
CAATCATCAACAACTACCAGTATTCAAAGATGGAGAGAAAAAATATGAAAAAAAGTGACA
AAGAAGCTACACATAAAGATGATGATTTTGGGTATATCTCAACAAAGAAGGCGAATCAAA
CTTCGCAATATCAAGATTGGATGGAAATTAACAGTAAGAACAAAGAGAAAACAATTAGTA
AGCATGAAAATAATTCCAATACAAGCGAATTGTTTTATCTGCATTTGCTTTTAAACAAGA
GCAAAACATCGACCAGCTTCACAGATTTACGAACTGTTAATGGAGTTTTGTATCCTACTT
TTGAAGATGCTTATAATGCTCTTTTTATTTGAACTACTGTTTTATCTTTATGGGTTTTTC
AATTTCTTTTTTCTTAAGCTTCTTATGTATTTCCTACTTTCGATTTTATTCATGTTTACG
TACTGAC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 2

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CCAGATATTAGTAACTAGTTTTACTCGTCGGTACCAAAGTAGCGATCGCCATACTCACCC
AAGCCTGGTATAACCCGAAAGTCTTCATTCAGACGCTGATCTATTTCCGATGTCACAATC
TTCAACAGTGGAAACCGTTTGCAGACGCAATGGATTCCTTCCGGAGCCGAGATAAGATTG
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GCACAGTTACCTGTGCCTAAAACGGGATCTAGAAGCAGGACATGGCGCTCGGAGATGTCA
CTTGGAAGCTTCTCATATATAAGCTGCATTCCGTTGTCGCCTTCTCGATGAATAAGAATC
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CGAATGATTGAGACCCCACAAAGTTTCTTGCAGAAATCAACACCGCTATACACAGATCCT
GTTGGAGTAATTACTTGTTTCTCCGTAAATGGCAAATGGCCAAGACCATGCTCTACAACC
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ATAAGTGTATGCATGCCTCTTATCTGAAATGTTGATTGGATAACAAAAAGATTTGGGTAG
ATTTTGTAGAGATCATGTTGCCCAAGTTTGTGTGGATATGTTGCACAATCAAATCAACTG
CAACGTGATTGTCACCTCCTCGAGGAATGATCACA


BQ
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AF RR4DA70JQ U 1
AF RR4D965JQ U 1
BS 1 875 RR4D965JQ

RD RR4DA70JQ 769 0 0
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CGAATGATTGAGACCCCACAAAGTTTCTTGCAGAAATCAACACCGCTATACACAGATCCT
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ATAAGTGTATGCATGCCTCTTATCTGAAATGTTGATTGGATAACAAAAA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4D965JQ 875 0 0
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ATGTTTTGATAACATTGTCGCAATTTTATGCTCACACAACCATTACGCCGGGTTTTGAAA
CCAGATATTAGTAACTAGTTTTACTCGTCGGTACCAAAGTAGCGATCGCCATACTCACCC
AAGCCTGGTATAACCCGAAAGTCTTCATTCAGACGCTGATCTATTTCCGATGTCACAATC
TTCAACAGTGGAAACCGTTTGCAGACGCAATGGATTCCTTCCGGAGCCGAGATAAGATTG
AGGAATATTATGTGAGATTCAGGGACTCCTTTACGTATGAGTAGTTCTATCGCCTGACTT
GCACAGTTACCTGTGCCTAAAACGGGATCTAGAAGCAGGACATGGCGCTCGGAGATGTCA
CTTGGAAGCTTCTCATATATAAGCTGCATTCCGTTGTCGCCTTCTCGATGAATAAGAATC
TTCCCAATTTTAATTCCTTTGCAACATGCACGTAACGCGTTTTCCATGCTTTCACCACTT
CGAATGATTGAGACCCCACAAAGTTTCTTGCAGAAATCAACACCGCTATACACAGATCCT
GTTGGAGTAATTACTTGTTTCTCCGTAAATGGCAAATGGCCAAGACCATGCTCTACAACC
AGACGAATGAGGCGATCTGAGTAAAACACAAAGGCATGTTTTGATATGTCCTTCTCCCGA
ATAAGTGTATGCATGCCTCTTATCTGAAATGTTGATTGGATAACAAAAAGATTTGGGTAG
ATTTTGTAGAGATCATGTTGCCCAAGTTTGTGTGGATATGTTGCACAATCAAATCAACTG
CAACGTGATTGTCACCTCCTCGAGGAATGATCACA

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL7411Contig1 856 2 2 U
TGCTTCTCTCATCTTCTACCGCCTCTATCTCTCAAAAGCCACGAGAGATTCAATATGCCT
TCATTAGCTTTATCCGAGGAGAAGAAGATGAAGAAGAAGCGGACAGCCATGGAGATGGAG
ACAACCACACCAGAGCACGACTCCAAGAAGAAGAAAGCGAAGAAGCTGAAGCTCTCCGAC
TCCTCCGACGGAGAAGACTCCGAGAAGAAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGCGCAAGGCCTCT
GCTGAGGAGAGCAGCGATTCGGGCTCTGAGCTCGTGGAGCCGTTGGAGAGTTCTAAGAAG
AAGAGCAGTAAGAAGGCGAAGCTGAGCGTTGAGGAAGACGATGTCAAAGTTTCATAACCC
CAACGCCGTTTCGAATTTCAGAATCTCGGATCCGTTGAAGGAGAAGCTTAAGGAGAAGGG
TATCGAAGCTCTTTTCCCCATTCAGGCGAGCACTTTTGATATGGTTCTCGATGGTGCTGA
TCTTGTCGGAAGGGCTCGTACTGGTCAGGGTAAAACATTGGCTTTCGTGTTACCTATACT
TGAGTCATTGATCAATGGACCTTCGAAGAACAAGAGGAAGAACGGATACGGAAGGCCACC
AAGTGTTTTGGTGCTTTTACCAACCAGAGAATTGGCCAAGCAGGTGTTTGCCGACTTTGA
TGCATACGGAGGATCCGTTGGGTTAACTTCTTGCTGTGTCTATGGAGGTGATCCTTACCC
TCCTCAGCAGAGTAAACTCAAGAGAGGTGTTGACATTGTAGTTGGAACACCGGTTCGTGT
CAAGGATCATATCGAAAGGCAAAACCTTGACCTGACCTATCTTCAGTTCCGTGTTCTCGA
TGAAGCTGATGAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ15TF U 1
AF RR4C285TF U 275
BS 1 378 RR4CQ15TF
BS 379 856 RR4C285TF

RD RR4CQ15TF 390 0 0
TGCTTCTCTCATCTTCTACCGCCTCTATCTCTCAAAAGCCACGAGAGATTCAATATGCCT
TCATTAGCTTTATCCGAGGAGAAGAAGATGAAGAAGAAGCGGACAGCCATGGAGATGGAG
ACAACCACACCAGAGCACGACTCCAAGAAGAAGAAAGCGAAGAAGCTGAAGCTCTCCGAC
TCCTCCGACGGAGAAGACTCCGAGAAGAAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGCGCAAGGCCTCT
GCTGAGGAGAGCAGCGATTCGGGCTCTGAGCTCGTGGAGCCGTTGGAGAGTTCTAAGAAG
AAGAGCAGTAAGAAGGCGAAGCTGAGCGTTGAGGAAGACGATGTCAAAGTTTCATAACCC
CAACGCCGTTTCGAATTT
TCAGAGATCTCG

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR4C285TF 582 0 0
G
GGAGCCGTTGGAGAGTTCTAAGAAGAAGAGCAGTAAGAAGGCGAAGCTGAGCGTTGAGGA
AGACGATGTCAAAGTT*CATAACCCCAACGCCGTTTCGAATTTCAGAATCTCGGATCCGT
TGAAGGAGAAGCTTAAGGAGAAGGGTATCGAAGCTCTTTTCCCCATTCAGGCGAGCACTT
TTGATATGGTTCTCGATGGTGCTGATCTTGTCGGAAGGGCTCGTACTGGTCAGGGTAAAA
CATTGGCTTTCGTGTTACCTATACTTGAGTCATTGATCAATGGACCTTCGAAGAACAAGA
GGAAGAACGGATACGGAAGGCCACCAAGTGTTTTGGTGCTTTTACCAACCAGAGAATTGG
CCAAGCAGGTGTTTGCCGACTTTGATGCATACGGAGGATCCGTTGGGTTAACTTCTTGCT
GTGTCTATGGAGGTGATCCTTACCCTCCTCAGCAGAGTAAACTCAAGAGAGGTGTTGACA
TTGTAGTTGGAACACCGGTTCGTGTCAAGGATCATATCGAAAGGCAAAACCTTGACCTGA
CCTATCTTCAGTTCCGTGTTCTCGATGAAGCTGATGAAATG

QA 2 582 2 582
DS 



AS 1 2

CO CL7412Contig1 807 2 25 U
GAGAGAACTAAAGTTGGATGATTTATTATGCATATAACTGAAAATGTGCATGTGCAAGAT
AAAGGCAAACAGTTCAAGAAGAGAGAGAGGAGATTCTAGACAACAACTTTTGGTTTATTT
GCTTCTCACTTCTTTTGCTGAGTCTTGAGTTCTTTTACCCTCTCTTCTGTAGCTTTCAGT
GCTTCCCCGTAGATAGTTATCAACTCATCGATCTCTTCAGGTGAGATAATGAGCGGTGGA
GAAATCATTATGCTATCCCCTGCAACGCGGACTAACATCCCGCGCTTCTGGCACTCGGCT
CCAAAGTATGCGCCAACACCCCATTCTGGTGGAAATGGTTCGTTTGGTGACTTGTTGTCA
GTAAACTCAGTCCCAAGAATCAAACCAGTTCCCCTTATCTCTCCAATAATAGGACTAGTC
TTGGCAAAGGCATTAAGACCATCTTGAAACCTTGGGGCAACTCTGGCAACATGCTCTGGC
GCGTTCCTCTCTTTGTAGATCTTTAACGCTTCAATTGCTACAGCACATGAAACTGGATGA
CCAGAATAAGTAAATCCATGCGAGAAAGCACCTAGCTTGTTGCTTTGAGAATAAATGACA
TCTGCTACTTCTTGACTCATAAGAATGGCTCCAATCGGCATATATGCTGAAGACAATGCC
TTAGCTAAAGACACAAGATCTGGCTTGATGTTGTATTTGCCACAGCCAAACATTGTCCCA
AGCCTTCCAAATGCACATATCACTTCATCCGCGATGAACAGGATATCATACTTCTTAACA
ACAGCTTGAATCTTCTCAAAGTAAGTA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI12JQ U 1
AF RR4DN56JQ U 1
BS 1 69 RR4DN56JQ
BS 70 71 RR4GI12JQ
BS 72 242 RR4DN56JQ
BS 243 243 RR4GI12JQ
BS 244 359 RR4DN56JQ
BS 360 360 RR4GI12JQ
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BS 376 467 RR4DN56JQ
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BS 483 506 RR4DN56JQ
BS 507 507 RR4GI12JQ
BS 508 650 RR4DN56JQ
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BS 656 656 RR4GI12JQ
BS 657 659 RR4DN56JQ
BS 660 660 RR4GI12JQ
BS 661 662 RR4DN56JQ
BS 663 663 RR4GI12JQ
BS 664 807 RR4DN56JQ

RD RR4GI12JQ 701 0 0
CC
GAGAACTAAAGTTGGATGATTTATTATGCATATAACTGAAAATGTGCATGTGCAAGATAA
AGGCAAACAGTTCAAGAAGAGAGATAGGAGATTCTAGACAACAACTTTTGGTTTATTTGC
TTCTCACTTCTTTTGCTGAGTCTTGAGTTCTTTTACCCTCTCTTCTGTAGCTTTCAGTGC
TTCCCCGTAGATAGTTATCAACTCATCGATCTCTTCAGGTGAGATAATGAGCGGTGGAGA
AATCATTATGCTATCCCCTGCAACGCGGACTAACATCCCGCGCTTCTGGCACTCGGCTCC
AAAGTATGCGTCAACACCCCATTCTGG*GGAAATGGTTCGTTTGGTGATTTGTTGTCAGT
AAACTCAGTCCCAAGAATCAAACCCGTTCCTCTTATCTCTCCAATAATAGGACTAGTCTT
GGCAAAGGCTTTAAGACCATCTTGAAACCTTGGGGCAACTGTGGCAACGTGCTCTGGCGC
GTTCCTCTCTTTGTATATCTTTAACGCTTCAATTGCTACAGCACATGAAACTGGATGACC
AGAATAAGTAAATCCATGCGAGAAAGCACCTAGCTTGTTGCTTTGAGAATAAATGACATC
TGCTACTTCTTGACTCATAAGAATGGCTCCAATCGGCATATATGCTGAAGACAATGCCTT
AGCTAAGGACACAAGATCTGGCTTGATGTTGTATTTG
TC

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR4DN56JQ 807 0 0
GAGAGAACTAAAGTTGGATGATTTATTATGCATATAACTGAAAATGTGCATGTGCAAGAT
AAAGGCAAA**GTTCAAGAAGAGAGAGAGGAGATTCTAGACAACAACTTTTGGTTTATTT
GCTTCTCACTTCTTTTGCTGAGTCTTGAGTTCTTTTACCCTCTCTTCTGTAGCTTTCAGT
GCTTCCCCGTAGATAGTTATCAACTCATCGATCTCTTCAGGTGAGATAATGAGCGGTGGA
GACATCATTATGCTATCCCCTGCAACGCGGACTAACATCCCGCGCTTCTGGCACTCGGCT
CCAAAGTATGCGCCAACACCCCATTCTGGTGGAAATGGTTCGTTTGGTGACTTGTTGTCT
GTAAATTCAGTCCCGAGAATCAAACCAGTTCCCCTTATCTCTCCAATAATAGGACTAGTC
TTGGCAAAGGCATTAAGACCATCTTGAAACCTTGGGGCAACTCTGGCGACATGCTCTGGC
GTGTTCCTCTCTTTGTAGATCTTTAATGCTTCAATTGCTACAGCACATGAAACTGGATGA
CCAGAATAAGTAAATCCATGCGAGAAAGCACCTAGCTTGTTGCTTTGAGAATAAATGACA
TCTGCTACTTCTTGACTCATAAGAATGGCTCCAATCGGCATATATGCTGATGACAGTGCT
TTGGCTAAAGACACAAGATCTGGCTTGATGTTGTATTTGCCACAGCCAAACATTGTCCCA
AGCCTTCCAAATGCACATATCACTTCATCCGCGATGAACAGGATATCATACTTCTTAACA
ACAGCTTGAATCTTCTCAAAGTAAGTA

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL7413Contig1 796 2 16 U
GGTATGGAAGCCGTAGGGGAAACGATGAAGTGATGGCTCGTGGTACCTTTGCCAACATTC
GTCTTGTTAACAAGCTCTTGAAAGGAGAAGTTGGTCCCAAGACTGTTCATGTTCCCACTG
GTGAAAAACTTAGCGTTTTTGATGCAGCAAGTAGATACATGAACGCTGGACAGGACACGG
TCATCCTGGCTGGTGCTGAGTATGGAAGTGGTAGCTCTAGGGATTGGGCTGCAAAGGGTC
CTTTGCTTTTGGGAGTGAAAGCTGTGATTGCAAAGAGCTTTGAGAGAATCCACCGCAGCA
ACTTGGCTGGTATGAGAATCATTCCTCTGTGTTTCAAGGCCGGGGAGGACGCAGACACCC
TTGGACTGACTGGTCATGAACGCTACACGGTCCACCTTCCTACCAAAGTCAGTGACATTA
AGCCTGGTCAAGACGTCACTGTGACCACTGACACTGGCAAATCCTTTGTTTGCACTCTTC
GGTTTGATACAGAGGTGGAACTGGCATACTATGACCATGGTGGCATTCTTCCCTACGTCA
TTCGAAGCTTGAGCGCCAAGTGATCAAAGTTTTTCTCAAGTTTTTGTCTTTCTTCATTTT
CTAAAAAAAGAGTTTCCTTAGTTCCAAATAAAAGCAATTTTTGTGAGCAACTTTTATTCT
TTCAGGTTACACTGAACCGTTTTCAGACAACGAGTTGTTTACGGAAAAACTTCATTACAT
TATATAACATTGGTTTTGTACCACTTTAAATGGTCGCATTACACCTTGTATCTCAAAAGC
AAACTTTTGTTCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4FO39TF U 1
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*ATATAACATTGGTTT*GTAC*ACTTTAAATGGTCGCAT*ACACCTTGTATCTCAAA*GC
AAACTTTTGTTCGT
C

QA 1 794 1 794
DS 

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ATTGCAAAGAGCTTTGAGAGAATCCACCGCAGCAACTTGGCTGGTATGAGAATCATTCCT
CTGTGTTTCAAGGCCGGGGAGGACGCAGACACCCTTGGACTGACTGGTCATGAACGCTAC
ACGGTCCACCTTCCTACCAAAGTCAGTGACATTAAGCCTGGTCAAGACGTCACTGTGACC
ACTGACACTGGCAAATCCTTTGTTTGCACTCTTCGGTTTGATACAGAGGTGGAACTGGCA
TACTATGACCATGGTGGCATTCTTCCCTACGTCATTCGAAGCTTGAGCGCCAAGTGATCA
AAGTTTTTCTCAAGTTTTTGTCTTTCTTCATTTTCTAAAAAAAGAGTTTCCTTAGTTCCA
AATAAAAGCAATTTTTGTGAGCAACTTTTATTCTTTCAGGTTACACTGAACCGTTTTCAG
ACAACGAGTTGTTTACGGAAAAACTTCATTACATTATATAACATTGGTTTTGTACCACTT
TAAATGGTCGCATTACACCTTGTATCTCAAAAGCAAACTTTTGTTCGTTC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL7414Contig1 698 2 2 U
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CTTCTTGAGATATTTCGATAATCCTCCAACTCCTCCAAACCCTCTCCTTATTTTCTTCTT
CCTCAGTTTGATCCTTTTCTTGTTTATCATCCATAGTAATAGCTCTGTTTATAAAGAAGC
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TTTTTTTAGCTATTATGGTGGTTTTCATGAATTTGATTATGAAGATGATATATGGAATGA
TGATGAAGACTATAGCCAGTGGAATGAAGATGATGTTGATGATGGTATTGAAAACCATGA
TAACGATGATCATGAGCAGGGTGATAATGATGGTGATACCTTGACGAATAGGATTGAAGA
TTACATCGCAAGTGTTTACAATGGATGGAGAGAAGAAAGACGAGCAGATAAACTCTTTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM12TF U 1
AF RR4AM12JQ C 64
BS 1 609 RR4AM12TF
BS 610 698 RR4AM12JQ

RD RR4AM12TF 609 0 0
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CTTCTTGAGATATTTCGATAATCCTCCAACTCCTCCAAACCCTCTCCTTATTTTCTTCTT
CCTCAGTTTGATCCTTTTCTTGTTTATCATCCATAGTAATAGCTCTGTTTATAAAGAAGC
CCAAGAGTTTAATGTTCTGTGCACGTTTGAAGAAGACAGTACTACGCTTGATAATTACAC
CATAGACAAGAGCAAAGATTGTTGTTCTTTCACAAAATATTGCTATGGTAATGAAGTTGA
TTTTTTTAGCTATTATGGTGGTTTTCATGAATTTGATTATGAAGATGATATATGGAATGA
TGATGAAGACTATAGCCAGTGGAATGAAGATGATGTTGATGATGGTATTGAAAACCATGA
TAACGATGATCATGAGCAGGGTGATAATGATGGTGATACCTTGACGAATAGGATTGAAGA
TTACATCGCAAGTGTTTACAATGGATGGAGAGAAGAAAGACGAGCAGATAAACTCTTTGT
CTAATATTTTATAAACTTTGTTTTACTTTTACTTTCTCACTGTACATTATGAAAGAAACT
GTTGTGGTG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4AM12JQ 635 0 0
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CAGTTTGATCCTTTTCTTGTTTATCATCCATAGTAATAGCTCTGTTTATAAAGAAGCCCA
AGAGTTTAATGTTCTGTGCACGTTTGAAGAAGACAGTACTACGCTTGATAATTACACCAT
AGACAAGAGCAAAGATTGTTGTTCTTTCACAAAATATTGCTATGGTAATGAAGTTGATTT
TTTTAGCTATTATGGTGGTTTTCATGAATTTGATTATGAAGATGATATATGGAATGATGA
TGAAGACTATAGCCAGTGGAATGAAGATGATGTTGATGATGGTATTGAAAACCATGATAA
CGATGATCATGAGCAGGGTGATAATGATGGTGATACCTTGACGAATAGGATTGAAGATTA
CATCGCAAGTGTTTACAATGGATGGAGAGAAGAAAGACGAGCAGATAAACTCTTTGTCTA
ATATTTTATAAACTTTGTTTTACTTTTACTTTCTCACTGTACATTATGAAAGAAACTGTT
GTGGTGTGTGGTAAGTTTGAAAAAGAAAATCCCACGGCTGCCTTTCATTTCATGAGATAA
TAAGTTATCGATATCACACACACATATATATATCA

QA 1 635 1 635
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7416Contig1 590 2 5 U
TTCATGTGGATATGTGATATAATCTTTCTTGCTTTGTATTCGTTCAACATAAGCACTCTA
TATAACAGGGAACGAGATGAACCAACCACAGACTAAAAAGAAATTTCTACAACTTTCCGA
CATTTCATCAAGTATGTTTCAGGAGGAGTCGTCTCTCATCTTTTGAACATTTTGGACCAC
ATGTAGAGGATAAAAAAGCAAAGGAAAACGAAAAGAACAACGTGCATGATGTGGTTGTTC
CCACTACGTATGATGCTCAAGTTCAGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCGGCCTGCGCT
CTCATCAATGTCACTTGCAGTTCATCCAAAAAATCCCTCTGAAACTTACCCTCTGACCCA
ATTTCTTGAGCAATATTTTTCAATTGCCTGACTTGGCCATGGAAACCAGTGATCTCATCA
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CTAGTGCTAAGCCCATCTCTGGATCTGTACGGAGCGGCGCCTCCGTAAAGCGAACCACCC
GCACCGCCTCTGTGAGGGTTCGATGCCATCGACGCCCAAATCAAAAGGAG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4AM39TF C 1
AF RR4AM39JQ U 3
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RD RR4AM39TF 590 0 0
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CATTTCATCAAGTATGTTTCAGGAGGAGTCGTCTCTCATCTTTTGAACATTTTGGACCAC
ATGTAGAGGATAAAGAAGCAGAGGAGAACGAAAAGAACAACGTGCATGATGTGGTTGTTC
CCACTACGTATGATGCTCAAGTTCAGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCGGCCTGCGCT
CTCATCAATGTCACTTGCAGTTCATCCAAGAAATCCCTCTGAAACTTAGCCTCTGACCCA
ATTTCTTGAGCAATATTTTTCAATTGCCTGACTTGGCCATGGAGACCAGTGATCTCATCA
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CTAGTGCTAAGCCCATCTCTGGATCTGTACGGAGCGGCGCCTCCGTAAAGCGAACCACCC
GCACCGCCTCTGTGAGGGTTCGATGCCATCGACGCCCAAATCAAAAGGAG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4AM39JQ 586 0 0
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TAACAGGGAACGAGATGAACCAACCACAGACTAAAAAGAAATTTCTACAACTTTCCGACT
TTTCATCAAGTATGTTTCAGGAGGAGTCGTCTCTCATCTTTTGAACATTTTGGACCACAT
GTAGAGGATAAAAAAGCAAAGGAAAACGAAAAGAACAACGTGCATGATGTGGTTGTTCCC
ACTACGTATGATGCTCAAGTTCAGTTTCCTTATGTTGTTCTTCACCCCGGCCTGCGCTCT
CATCAATGTCACTTGCAGTTCATCCAAAAAATCCCTCTGAAACTTACCCTCTGACCCAAT
TTCTTGAGCAATATTTTTCAATTGCCTGACTTGGCCATGGAAACCAGTGATCTCATCATC
GAAATCAAAGTGCATGGGATCAATCCTAAGCCGGATTTCCTCTGAACCTGTAGCTGTTCT
AGTGCTAAGCCCATCTCTGGATCTGTACGGAGCGGCGCCTCCGTAAAGCGAACCACCCGC
ACCGCCTCTGTGAGGGTTCGATGCCATCGACGCCCAAATCAAAAGG

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL7417Contig1 675 2 2 U
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TATCATCACAAATTCTGAAGCTCCAACGTTAGATTAAGCACACTACATATTCACACAAAA
ACCATTGAACAGGTTACTAAAAACGATTAACAAACGTAATTAACCATCCCACTTTCTTCC
ATTAAGCCCTAATCTCCTTGGTTGCTCTGTAAATACTCTCGAGAGATCGAAATTTCTTTT
CCTTCATCTTCTTCATCTTCACGGCAAGATCACGATTCCCTTTTACGCCGTCGTTTTGCT
CGTCTCCGGCTCTCGAGCTAACATCTTCATGCCTTCTCTTGCATCCTCTTCCTTCTCCTA
CTCCTCCTGCGCCACCTCCGCCGGTGCTGCTGCTGCTGCTCCCCGTTTCTTCTTCGCTCA
GCTGCATAAGCAGTTCTGCCGCCGCCATCTCCGTCTCCGAGAAGACGATCTCGCCAGATT
CTCTAGAAAATCCAGTTTCTCCCATTGGATCGTTCATGTTAATCAATCTGAAAACAAGAA
AATTAATATTCTCAAGAAAAACAAGAAAATTAATGAACAAGAAATAAATCGCGAGTCGAT
TTATATTTGTCTTTTTTATTGTTTCTTTTTGTTATATTGTCGTTTTTTTGGTTTTGTGCA
ATGGAGGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EK64TF C 1
AF RR4EK64JQ U 9
BS 1 8 RR4EK64TF
BS 9 675 RR4EK64JQ

RD RR4EK64TF 675 0 0
TTTTTTTTCTCACAACATCTCATTATTTGTTACAATTTTCATCTTAAAAGCTTCAAAAAC
TATCATCACAAATTCTGAAGCTCCAACGTTAGATTAAGCACACTACATATTCACACAAAA
ACCATTGAACAGGTTACTAAAAACGATTAACAAACGTAATTAACCATCCCACTTTCTTCC
ATTAAGCCCTAATCTCCTTGGTTGCTCTGTAAATACTCTCGAGAGATCGAAATTTCTTTT
CCTTCATCTTCTTCATCTTCACGGCAAGATCACGATTCCCTTTTACGCCGTCGTTTTGCT
CGTCTCCGGCTCTCGAGCTAACATCTTCATGCCTTCTCTTGCATCCTCTTCCTTCTCCTA
CTCCTCCTGCGCCACCTCCGCCGGTGCTGCTGCTGCTGCTCCCCGTTTCTTCTTCGCTCA
GCTGCATAAGCAGTTCTGCCGCCGCCATCTCCGTCTCCGAGAAGACGATCTCGCCAGATT
CTCTAGAAAATCCAGTTTCTCCCATTGGATCGTTCATGTTAATCAATCTGAAAACAAGAA
AATTAATATTCTCAAGAAAAACAAGAAAATTAATGAACAAGAAATAAATCGCGAGTCGAT
TTATATTTGTCTTTTTTATTGTTTCTTTTTGTTATATTGTCGTTTTTTTGGTTTTGTGCA
ATGGAGGAAAAAAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EK64JQ 667 0 0
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CTAATCTCCTTGGTTGCTCTGTAAATACTCTCGAGAGATCGAAATTTCTTTTCCTTCATC
TTCTTCATCTTCACGGCAAGATCACGATTCCCTTTTACGCCGTCGTTTTGCTCGTCTCCG
GCTCTCGAGCTAACATCTTCATGCCTTCTCTTGCATCCTCTTCCTTCTCCTACTCCTCCT
GCGCCACCTCCGCCGGTGCTGCTGCTGCTGCTCCCCGTTTCTTCTTCGCTCAGCTGCATA
AGCAGTTCTGCCGCCGCCATCTCCGTCTCCGAGAAGACGATCTCGCCAGATTCTCTAGAA
AATCCAGTTTCTCCCATTGGATCGTTCATGTTAATCAATCTGAAAACAAGAAAATTAATA
TTCTCAAGAAAAACAAGAAAATTAATGAACAAGAAATAAATCGCGAGTCGATTTATATTT
GTCTTTTTTATTGTTTCTTTTTGTTATATTGTCGTTTTTTTGGTTTTGTGCAATGGAGGA
AAAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL7418Contig1 407 2 2 U
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GCCGTTGCGCTTGGTTAATGGTTTTATAACCAAAAACTTACAAAGGGCAATGCTTGCTTG
TAGCTACAATGTGGAGAGAAGAGAGCTTCGTTTCTTCAAAATTATTTTGTTTTTGATTTT
TATCTGTTTTGATATTATATTGGTGTAACGTAGAGTAAGAGTATGGTGGCCTTTTTACTA
TATTCATGGACCTCACTACAGTTTAAGAAATACTTGTCTTTTGCAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ31TF U 1
AF RR4CX52TF U 1
BS 1 282 RR4CJ31TF
BS 283 407 RR4CX52TF

RD RR4CJ31TF 282 0 0
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GCCGTTGCGCTTGGTTAATGGTTTTATAACCAAAAACTTACAAAGGGCAATGCTTGCTTG
TAGCTACAATGTGGAGAGAAGAGAGCTTCGTTTCTTCAAAAT

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4CX52TF 407 0 0
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CCCTCTCATGGTCAAAGACTTCCGTCAACGTGTCTTTGGTGACAGGAAGGAAGGCTCCTC
CGCTACTGAAACCACCACCAAAACAACCTCAGCTTGAGCAAAAGGCAGTTGCAGGTAGCG
GCCGTTGCGCTTGGTTAATGGTTTTATAACCAAAAACTTACAAAGGGCAATGCTTGCTTG
TAGCTACAATGTGGAGAGAAGAGAGCTTCGTTTCTTCAAAATTATTTTGTTTTTGATTTT
TATCTGTTTTGATATTATATTGGTGTAACGTAGAGTAAGAGTATGGTGGCCTTTTTACTA
TATTCATGGACCTCACTACAGTTTAAGAAATACTTGTCTTTTGCAGT

QA 1 407 1 407
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7420Contig1 1035 2 4 U
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AAGGTGTGGTGCTATTACTGCGAGAGAGAGTTCGAGGACGAGAAGATTCTAGTGCAGCAC
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ATGGTCATTCATGTCCTTCAAGTTCATAAAGAGAACGTCACAAAGGTTCCTAATGCTAAA
GACGGTCGAGATTCAACTGATATTGAAGTATACGGAATGCAAGGGATTCCACCTGATGTC
TTGGCTGCTCACTACGGAGAAGAAGAGGAAGAGTCTGCAGCCAAAGTTGCAAAAGTTGAG
ATTCCTTCCGCCCCTCTTGATACTGCAGTTCCTAGACCATACGGAATGGTATATCAACCT
CAACAAGTCCCTGCTGCTGTCCGACCTATGTATTATCCTGCTGGTCCTATGCGTCCTCCT
GGTCCTGGGTGGCCCATGCCTCCTCCACGCCCACAACAATGGTATCCACATAATCCAGCT
GTCTCTGTTCATCCACCTACCCATTTAGGGTATCAACCGCAACAGCTCTTTCCTGTTCAT
GGTATGGGGATGACTGTGCCAACACCATCTCATCTAGTCAATGGAGTCACTCCAGTAAAT
CCTTCATCATCTCCCGCAATGCCGGTTTCTCAACCTCTGTTCCCTGTTGTGAGTAGCATC
ACTCCTTCCCAAGCTTCACCTTTTTCTGCTCCCCTTCCCGTAGGATCAGTGAACGCATAT
CCACCTAATTACTCTTTTCCAGTGGGTGGTGGGACTAATCCTCATTCGTATGCTTCTGGC
CCAGACACTAGTGGTCCTTCAATCGGTCCACCTCCTGTGATTGCAAACAAAGCTCCTAGC
TCTCTGCCTAATGAGGTTTATCTTGTATGGGATGATGAAGCAATGTCTATGGAAGAAAGA
AGAATGTCCTTACCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE35TF U 1
AF RR4CE35JQ C 259
BS 1 718 RR4CE35TF
BS 719 719 RR4CE35JQ
BS 720 809 RR4CE35TF
BS 810 1035 RR4CE35JQ

RD RR4CE35TF 809 0 0
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AAGAAGAGAAACTAGAACCGATCAATCGTGATGGGGAAGAAGAAGAAGAGAACGGCGGAG
AAGGTGTGGTGCTATTACTGCGAGAGAGAGTTCGAGGACGAGAAGATTCTAGTGCAGCAC
CAGAAAGCCAAACACTTCAAGTGCCATGCCTGCCACAAGAAGCTCTCTACTGCTAGCGGC
ATGGTCATTCATGTCCTTCAAGTTCATAAAGAGAACGTCACAAAGGTTCCTAATGCTAAA
GACGGTCGAGATTCAACTGATATTGAAGTATACGGAATGCAAGGGATTCCACCTGATGTC
TTGGCTGCTCACTACGGAGAAGAAGAGGAAGAGTCTGCAGCCAAAGTTGCAAAAGTTGAG
ATTCCTTCCGCCCCTCTTGATACTGCAGTTCCTAGACCATACGGAATGGTATATCAACCT
CAACAAGTCCCTGCTGCTGTCCGACCTATGTATTATCCTGCTGGTCCTATGCGTCCTCCT
GGTCCTGGGTGGCCCATGCCTCCTCCACGCCCACAACAATGGTATCCACATAATCCAGCT
GTCTCTGTTCATCCACCTACCCATTTAGGGTATCAACCGCAACAGCTCTTTCCTGTTCAT
GGTATGGGGATGACTGTGCCAACACCATCTCATCTAGTCAATGGAGTCACTCCAGTAA*T
CCTTCATCATCTCCCGCAATGCCGGTTTCTCAACCTCTGTTCCCTGTTGTGAGTAGCATC
ACTCCTTCCCAAGCTTCACCTTTTTCTGC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4CE35JQ 777 0 0
CAAGTTCATAAAGAGAACGTCACAAAGGTTCCTAATGCTAAAGACGGTCGAGATTCAACT
GATATTGAAGTATACGGAATGCAAGGGATTCCACCTGATGTCTTGGCTGCTCACTACGGA
GAAGAAGAGGAAGAGTCTGCAGCCAAAGTTGCAAAAGTTGAGATTCCTTCCGCCCCTCTT
GATACTGCAGTTCCTAGACCATACGGAATGGTATATCAACCTCAACAAGTCCCTGCTGCT
GTCCGACCTATGTATTATCCTGCTGGTCCTATGCGTCCTCCTGGTCCTGGGTGGCCCATG
CCTCCTCCACGCCCACAACAATGGTATCCACATAATCCAGCTGTCTCTGTTCATCCACCT
ACCCATTTAGGGTATCAACCGCAACAGCTCTTTCCTGTTCATGGTATGGGGATGACTGTG
CCAACACCATCTCATCTAGTCAATGGAGTCACTCCAGTAAATCCTTCATCATCTCCCGCA
ATGCCGGTTTCTCAACCTCTGTTCCCTGTTGTGAGTAGCATCACTCCTTCCCAAGCTTCA
CCTTTTTCTGCTCCCCTTCCCGTAGGATCAGTGAACGCATATCCACCTAATTACTCTTTT
CCAGTGGGTGGTGGGACTAATCCTCATTCGTATGCTTCTGGCCCAGACACTAGTGGTCCT
TCAATCGGTCCACCTCCTGTGATTGCAAACAAAGCTCCTAGCTCTCTGCCTAATGAGGTT
TATCTTGTATGGGATGATGAAGCAATGTCTATGGAAGAAAGAAGAATGTCCTTACCG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL7421Contig1 942 2 4 U
GGGTCATCCCCACCACCAAGATCGGCATTCTCCAGCCGCTCGAAGACATCTTCCTCCACT
CCTGGGCTTACCCTTTCTTCCTAGTCGCCGGAGATTACAAGAAGCTCTACGACTTCATCA
GCGAGAACGCGGGAGACGTCATCCGGTTGGGTGACGAGGAGTACGGGTTGACCCGGGACG
AGACTGTCCATAACCTCCTCTTCAACTTGGGTTTCAACGCGTACGGGGGATTTTCCATCT
TTTTACCGTCTCTGATCGGAAAAATCGCCGGAGATACCACCGGTCTCCAGGAGAGGCTGA
GGACCGAGGTGAGGAAGGTCTGCGGGTCCGGTTCGGTTCTGAATTTCAGGACGGTTAACG
AGATGGAGCTGGTTAAGTCCGTGGTTTACGAAACGCTGCGTTTAAACCCGCCGGTTCCGT
TGCAGTACGCGCGCGCGAGGGATGATTTCAAGATAAGCTCGCACGACGCGGTTTACGAGG
TCAAGAAAGGAGAGCTTCTCTGCGGTTACCAGCCGCTGGTGATGAGAGACGCTAGCATCT
TTGACGACCCGGAGGAGTTTAAACCGGATCGGTTTGTAGGTGAGACCGGGTCCAAGTTGC
TTAATTATCTGTTCTGGTCTAATGGTCCACAAACCGGTACGCCGAGCGCGTCGAACAAAC
AGTGTGCAGCCAAAGAGATGGTTACTATCACGGCTCCCTTGATCATCGCCAATTTATTTT
TCCGGTAGGATAAAATAACCGGTGACGCCGGGAGTATCAAGACCGTTGTTAAAGTTACAT
GAGGAAGACTCATCACTTCCTCCACGGTCTCATATCATATGTTTATGTTTGGAGTGTCGA
ATAAGATTTAAACTAAAATAATGCGAACTGTAACAGAAATTGCCAGAGGTATTTTCTGTT
AAGTTTATCTGGTAAGCGATATATAATATTTTTCATTTGGTC


BQ
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AF RR4H201TF U 1
AF RR4H201JQ C 621
BS 1 695 RR4H201TF
BS 696 696 RR4H201JQ
BS 697 709 RR4H201TF
BS 710 942 RR4H201JQ

RD RR4H201TF 709 0 0
GGGTCATCCCCACCACCAAGATCGGCATTCTCCAGCCGCTCGAAGACATCTTCCTCCACT
CCTGGGCTTACCCTTTCTTCCTAGTCGCCGGAGATTACAAGAAGCTCTACGACTTCATCA
GCGAGAACGCGGGAGACGTCATCCGGTTGGGTGACGAGGAGTACGGGTTGACCCGGGACG
AGACTGTCCATAACCTCCTCTTCAACTTGGGTTTCAACGCGTACGGGGGATTTTCCATCT
TTTTACCGTCTCTGATCGGAAAAATCGCCGGAGATACCACCGGTCTCCAGGAGAGGCTGA
GGACCGAGGTGAGGAAGGTCTGCGGGTCCGGTTCGGTTCTGAATTTCAGGACGGTTAACG
AGATGGAGCTGGTTAAGTCCGTGGTTTACGAAACGCTGCGTTTAAACCCGCCGGTTCCGT
TGCAGTACGCGCGCGCGAGGGATGATTTCAAGATAAGCTCGCACGACGCGGTTTACGAGG
TCAAGAAAGGAGAGCTTCTCTGCGGTTACCAGCCGCTGGTGATGAGAGACGCTAGCATCT
TTGACGACCCGGAGGAGTTTAAACCGGATCGGTTTGTAGGTGAGACCGGGTCCAAGTTGC
TTAATTATCTGTTCTGGTCTAATGGTCCACAAACCGGTACGCCGAGCGCGTCGAACAAAC
AGTGTGCAGCCAAAGAGATGGTTACTATCACGGCTGCCTTGATCATCGC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4H201JQ 322 0 0
AATGGTCCACAAACCGGTACGCCGAGCGCGTCGAACAAACAGTGTGCAGCCAAAGAGATG
GTTACTATCACGGCTCCCTTGATCATCGCCAATTTATTTTTCCGGTAGGATAAAATAACC
GGTGACGCCGGGAGTATCAAGACCGTTGTTAAAGTTACATGAGGAAGACTCATCACTTCC
TCCACGGTCTCATATCATATGTTTATGTTTGGAGTGTCGAATAAGATTTAAACTAAAATA
ATGCGAACTGTAACAGAAATTGCCAGAGGTATTTTCTGTTAAGTTTATCTGGTAAGCGAT
ATATAATATTTTTCATTTGGTC

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 2

CO CL7422Contig1 544 2 1 U
ATCAGTGTAGGTGTGGTGATTACTTCTCTGTTGATTCCTCTGAGCTAGAGACTATGGGGT
TTGCCTTGGTGAGAGACGAGGGCTATTGTGTTGTTCGAGTTCGGAGATTAGGTGCTTTTG
TTTCCTCTTCTGTTGTTCTTCCTTGTGGATCTTGTTCTTTGAAAACCCGTGTTTGGGTTG
CTTCCGACATGAAGATTCCTCTAGCTATGTGACCATCAGGGTTTGGTTCTGGTTCATTAT
GATCATGTCTTGGTTGATTCATAATTGAATTAAGGGATCTATCTTTAGACTAATGCTTGA
GGACGATCTTGATTCTTTTTGGGGAAGTATCTCCGCCGGAGACAAAGATTTTTTTTGGAC
CAATGTGATCTTTGTTTGGCTCAAAGATTTGGAAAATGTCTGACAAGCTTTTGACTTTTG
TACTCATTTTTTTAATTCTAGCTCTAGAACTTTAGTTCTATAAGAAACTTATAATGGGAA
ATGAAAAAAGCCAATTGGATTTACTTCTCGTTCTTACCTCTATAGCTAATCAATCTTTGT
GACG


BQ
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20 20 20 20 

AF RR4BE49JQ C 1
AF RR4BE49TF U 1
BS 1 544 RR4BE49TF

RD RR4BE49JQ 544 0 0
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TTGCCTTGGTGAGAGACGAGGGCTATTGTGTTGTTCGAGTTCGGAGATTAGGTGCTTTTG
TTTCCTCTTCTGTTGTTCTTCCTTGTGGATCTTGTTCTTTGAAAACCCGTGTTTGGGTTG
CTTCCGACATGAAGATTCCTCTAGCTATGTGACCATCAGGGTTTGGTTCTGGTTCATTAT
GATCATGTCTTGGTTGATTCATAATTGAATTAAGGGATCTATCTTTAGACTAATGCTTGA
GGACGATCTTGATTCTTTTTGGGGAAGTATCTCCGCCGGAGACAAAGATTTTTTTTGGAC
CAATGTGATCTTTGTTTGGCTCAAAGATTTGGAAAATGTCTGACAAGCTTTTGACTTTTG
TACTCATTTTTTTAATTCTAGCTCTAGAACTTTAGTTCTATAAGAAACTTATAATGGGAA
ATGAAAAAAGCCAATTGGATTTACTTCTCGTTCTTACCTCTATAGCTAATCAATCTTTGT
GACG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4BE49TF 544 0 0
ATCAGTGTAGGTGTGGTGATTACTTCTCTGTTGATTCCTCTGAGCTAGAGACTATGGGGT
TTGCCTTGGTGAGAGACGAGGGCTATTGTGTTGTTCGAGTTCGGAGATTAGGTGCTTTTG
TTTCCTCTTCTGTTGTTCTTCCTTGTGGATCTTGTTCTTTGAAAACCCGTGTTTGGGTTG
CTTCCGACATGAAGATTCCTCTAGCTATGTGACCATCAGGGTTTGGTTCTGGTTCATTAT
GATCATGTCTTGGTTGATTCATAATTGAATTAAGGGATCTATCTTTAGACTAATGCTTGA
GGACGATCTTGATTCTTTTTGGGGAAGTATCTCCGCCGGAGACAAAGATTTTTTTTGGAC
CAATGTGATCTTTGTTTGGCTCAAAGATTTGGAAAATGTCTGACAAGCTTTTGACTTTTG
TACTCATTTTTTTAATTCTAGCTCTAGAACTTTAGTTCTATAAGAAACTTATAATGGGAA
ATGAAAAAAGCCAATTGGATTTACTTCTCGTTCTTACCTCTATAGCTAATCAATCTTTGT
GACG

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL7423Contig1 821 2 2 U
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ATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGCCACCCCGTCTCGCTCCGACGGCTGGGTCGCCTGGGC
TATCAACCCGACGATGACCGGAATGAACGGTTCTCAGGCCTTCCTCGCCTACAGTCCCGG
AGCCGGCGCGGCTCCCGTCGTGAGATCGTACAACATCAGCGGCTACGTCCTCAACGAAGG
GAGACTCGCCTTCGAGTTCTGGAACCTACGCGCCGAATCCATGGCCGGCAACATGATCGT
GATTCGCACGTCGGTTAAGGTTCCGCCGGGAGCCGAGAGCGTGAACCAGGTGTGGCAGAT
CGGCGGGAATGTGACCAGCGGTCGTCCTATGGTGCATCCTTTCAATCCGGCGAACTTGGC
CTCTAGAGGGGTGTTGAGACTTGTCGGCTCTGACGCTCCGAGCTCAGCTCCGGGGTCTGC
TCCGGGGTCTGTCCCTGGCGCTGCTCAGGGCCCGACCACTCCTGGTGCCTCGACCACTCC
TGGACAGGCGGCTGGTCCAAGGAGCGCGGGTTCGATGACGAGTAGCGTAAATTTCGGGGT
CAATTTTGGAATTTTGGTTATGTTGGCTACAGTCTTCATCTTCTGAGTATGATTTCATTA
TCTTTTTACATTACTTTTTGTATCCGCAATAATGGAGATTCATACTGTTTTACTTTCTAG
TCTTAGAGTCATTTACTCTTTTTTGTTTTCCACCTATCTCCTCTCACCCACATTATTCTG
AGTTTGTTATTGGATTGTATGGACCATTGTATTTTTATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F052TF U 1
AF RR4F052JQ C 165
BS 1 712 RR4F052TF
BS 713 821 RR4F052JQ

RD RR4F052TF 712 0 0
GTGCCTGAACCTTCCCTCACTAGACTCCTACCTCCACTACACATACAATGCAACCAACTC
ATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGCCACCCCGTCTCGCTCCGACGGCTGGGTCGCCTGGGC
TATCAACCCGACGATGACCGGAATGAACGGTTCTCAGGCCTTCCTCGCCTACAGTCCCGG
AGCCGGCGCGGCTCCCGTCGTGAGATCGTACAACATCAGCGGCTACGTCCTCAACGAAGG
GAGACTCGCCTTCGAGTTCTGGAACCTACGCGCCGAATCCATGGCCGGCAACATGATCGT
GATTCGCACGTCGGTTAAGGTTCCGCCGGGAGCCGAGAGCGTGAACCAGGTGTGGCAGAT
CGGCGGGAATGTGACCAGCGGTCGTCCTATGGTGCATCCTTTCAATCCGGCGAACTTGGC
CTCTAGAGGGGTGTTGAGACTTGTCGGCTCTGACGCTCCGAGCTCAGCTCCGGGGTCTGC
TCCGGGGTCTGTCCCTGGCGCTGCTCAGGGCCCGACCACTCCTGGTGCCTCGACCACTCC
TGGACAGGCGGCTGGTCCAAGGAGCGCGGGTTCGATGACGAGTAGCGTAAATTTCGGGGT
CAATTTTGGAATTTTGGTTATGTTGGCTACAGTCTTCATCTTCTGAGTATGATTTCATTA
TCTTTTTACATTACTTTTTGTATCCGCAATAATGGAGATTCATACTGTTTTA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4F052JQ 657 0 0
TCGCCTACAGTCCCGGAGCCGGCGCGGCTCCCGTCGTGAGATCGTACAACATCAGCGGCT
ACGTCCTCAACGAAGGGAGACTCGCCTTCGAGTTCTGGAACCTACGCGCCGAATCCATGG
CCGGCAACATGATCGTGATTCGCACGTCGGTTAAGGTTCCGCCGGGAGCCGAGAGCGTGA
ACCAGGTGTGGCAGATCGGCGGGAATGTGACCAGCGGTCGTCCTATGGTGCATCCTTTCA
ATCCGGCGAACTTGGCCTCTAGAGGGGTGTTGAGACTTGTCGGTTCTGACGCTCCGAGCT
CAGCTCCGGGGTCTGCTCCGGGGTCTGTCCCTGGCGCTGCTCAGGGCCCGACCACTCCTG
GTGCCTCGACCACTCCTGGACAGGCGGCTGGTCCAAGGAGCGCGGGTTCGATGACGAGTA
GCGTAAATTTCGGGGTCAATTTTGGAATTTTGGTTATGTTGGCTACAGTCTTCATCTTCT
GAGTATGATTTCATTATCTTTTTACATTACTTTTTGTATCCGCAATAATGGAGATTCATA
CTGTTTTACTTTCTAGTCTTAGAGTCATTTACTCTTTTTTGTTTTCCACCTATCTCCTCT
CACCCACATTATTCTGAGTTTGTTATTGGATTGTATGGACCATTGTATTTTTATTAT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7424Contig1 958 2 4 U
AACTAAGCTACACATCATCGACTTTGGTGTCCTCTACGGCTTTCAATGGCCTTGTCTGTT
ACTAGCCTTGTCTAAACGTCCCGGAGGACCACCGATGCTACGTGTCACTGGAATCGAGCT
GCCTCAGTCTGGTTTCCGACCTTCGGACAGAGTTGAAGAGACTGGTCGGAGATTAAAAAG
GTTCTGCGACATGTTCAACGTTCCCTTTGAGTTCAACTTCATAGCCAAGAAATGGGAAAG
CATCACTCTCGACGAGATAACCATCAATCCAGGAGAGACAACGGTCGTTAACCGCATCCA
CAGGTTACAGTACACTCCCGACGAGACGGTCTCGCTAGGCTCGCCGAGAGACACAGTTCT
GAAGCTGTTCAGAGACATCAACCCTGACCTCTTCGTCTTCGCTGAGATCAACGGAACCTA
CAACTCTCCTTTCTTCATGACGAGGTTCAAAGAAGCGCTCTTCCATTTCTCCTCCCTCTT
CGACATGTTCGACACCACGATACAAGCCGAGGACGAGTACAAGAACAGGGCGCTGCTGGA
GAGAGAGCTGCTGGTGAGAGACGCCATGAGCGTGATATCCAGCGAAGGAGCTGAGCGGTT
CGCGAGGCCTGAGACGTACAAGCAGTGGAGGGTTAGGATACTGAGAGCAGGGTTTAAGCC
TGCATCGGTGAGCAGAGAGATCTTGAAAGGTGCTAAAGAGATTGTGAGGAAACGTTACCA
TAAAGACTTCTTGATAGATAGTGATGGTCACTGGATGCTTCAGGGGTGGAAAGGGAGAGT
CATCTATGCTTTTTCTTGCTGGAAACCTGCAGAGAAGTCAACGAGAGATGATCATATAAT
AATCATTTGAAAAGTTGTTACTTCTGCTGCTCTCTGTTGCTTCATTTTTTGTTTGTTTGA
CAATGGTATTGTAGAATCTGTTTGTTTCCAATGAATGGAATGCATCTCATCTTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B040TF U 1
AF RR4B040JQ C 148
BS 1 689 RR4B040TF
BS 690 690 RR4B040JQ
BS 691 765 RR4B040TF
BS 766 958 RR4B040JQ

RD RR4B040TF 768 0 0
AACTAAGCTACACATCATCGACTTTGGTGTCCTCTACGGCTTTCAATGGCCTTGTCTGTT
ACTAGCCTTGTCTAAACGTCCCGGAGGACCACCGATGCTACGTGTCACTGGAATCGAGCT
GCCTCAGTCTGGTTTCCGACCTTCGGACAGAGTTGAAGAGACTGGTCGGAGATTAAAAAG
GTTCTGCGACATGTTCAACGTTCCCTTTGAGTTCAACTTCATAGCCAAGAAATGGGAAAG
CATCACTCTCGACGAGATAACCATCAATCCAGGAGAGACAACGGTCGTTAACCGCATCCA
CAGGTTACAGTACACTCCCGACGAGACGGTCTCGCTAGGCTCGCCGAGAGACACAGTTCT
GAAGCTGTTCAGAGACATCAACCCTGACCTCTTCGTCTTCGCTGAGATCAACGGAACCTA
CAACTCTCCTTTCTTCATGACGAGGTTCAAAGAAGCGCTCTTCCATTTCTCCTCCCTCTT
CGACATGTTCGACACCACGATACAAGCCGAGGACGAGTACAAGAACAGGGCGCTGCTGGA
GAGAGAGCTGCTGGTGAGAGACGCCATGAGCGTGATATCCAGCGAAGGAGCTGAGCGGTT
CGCGAGGCCTGAGACGTACAAGCAGTGGAGGGTTAGGATACTGAGAGCAGGGTTTAAGCC
TGCATCGGTGAGCAGAGAGATCTTGAAAG*TGCTAAAGAGATTGTGAGGAAACGTTACCA
TAAAGACTTCTTGATAGATAGTGATGGTCACTGGATGCTTCAGGG
TGG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4B040JQ 811 0 0
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TGAGTTCAACTTCATAGCCAAGAAATGGGAAAGCATCACTCTCGACGAGATAACCATCAA
TCCAGGAGAGACAACGGTCGTTAACCGCATCCACAGGTTACAGTACACTCCCGACGAGAC
GGTCTCGCTAGGCTCGCCGAGAGACACAGTTCTGAAGCTGTTCAGAGACATCAACCCTGA
CCTCTTCGTCTTCGCTGAGATCAACGGAACCTACAACTCTCCTTTCTTCATGACGAGGTT
CAAAGAAGCGCTCTTCCATTTCTCCTCCCTCTTCGACATGTTCGACACCACGATACAAGC
CGAGGACGAGTACAAGAACAGGGCGCTGCTGGAGAGAGAGCTGCTGGTGAGAGACGCCAT
GAGCGTGATATCCAGCGAAGGAGCTGAGCGGTTCGCGAGGCCTGAGACGTACAAGCAGTG
GAGGGTTAGGATACTGAGAGCAGGGTTTAAGCCTGCATCGGTGAGCAGAGAGATCTTGAA
AGGTGCTAAAGAGATTGTGAGGAAACGTTACCATAAAGACTTCTTGATAGATAGTGATGG
TCACTGGATGCTTCAGGGGTGGAAAGGGAGAGTCATCTATGCTTTTTCTTGCTGGAAACC
TGCAGAGAAGTCAACGAGAGATGATCATATAATAATCATTTGAAAAGTTGTTACTTCTGC
TGCTCTCTGTTGCTTCATTTTTTGTTTGTTTGACAATGGTATTGTAGAATCTGTTTGTTT
CCAATGAATGGAATGCATCTCATCTTTCCTC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL7425Contig1 774 2 2 U
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ACAGCCTTATCCCCAGACTCAGGGAAGCAGGGAGATATCCCAATGCCATCACTCGAAGAT
CTTAAAAGCAATCATGGAGCCCTGTAGTTGTGAATCAACCCCATTGATACTTCCCTAGAT
GAGTTGCTACAAATTGCACTGGATTGTCCTTCCAGCTGTGTTGACGTGCTGGTACAGAGG
CTGGTTGAACTTGTCACAGGGCATATGGGTGGATCTTCGGAAGATTCCAGTATAGTATTG
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TATTGGTCTCTCCATGCATCGTTGCTCTGCTTTTCAAGAGATCCGAATCTGCGGCCGTCC
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AGATTTGAGGAATGTAAAATGAAATCAATTTTTTATGTTTTGATGTATTTGTTTGAGCAA
AGCCTCCATACTGTGCTATATATGGGTATAAACTGGGTCTCCTTTGCATGGCCA


BQ
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AF RR4ET51TF U 1
AF RR4EV67TF U 1
BS 1 544 RR4ET51TF
BS 545 774 RR4EV67TF

RD RR4ET51TF 544 0 0
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GGAAGCCGTCAAATGGTTGGAGTCAAGGAGAGATTCATCGGAGGTGGTTGCCGAGAGAGG
GATTGTGGTGTGCTTGACTTCACTATGAGGAGAATGTTGTTGATGGTTTCTACGACGTTT
ACAGCCTTATCCCCAGACTCAGGGAAGCAGGGAGATATCCCAATGCCATCACTCGAAGAT
CTTAAAAGCAATCATGGAGCCCTGTAGTTGTGAATCAACCCCATTGATACTTCCCTAGAT
GAGTTGCTACAAATTGCACTGGATTGTCCTTCCAGCTGTGTTGACGTGCTGGTACAGAGG
CTGGTTGAACTTGTCACAGGGCATATGGGTGGATCTTCGGAAGATTCCAGTATAGTATTG
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TATTGGTCTCTCCATGCATCGTTGCTCTGCTTTTCAAGAGATCCGAATCTGCGGCCGTCC
TTTG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4EV67TF 774 0 0
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GGAAGCCGTCAAATGGTTGGAGTCAAGGAGAGATTCATCGGAGGTGGTTGCCGAGAGAGG
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ACAGCCTTATCCCCAGACTCAGGGAAGCAGGGAGATATCCCAATGCCATCACTCGAAGAT
CTTAAAAGCAATCATGGAGCCCTGTAGTTGTGAATCAACCCCATTGATACTTCCCTAGAT
GAGTTGCTACAAATTGCACTGGATTGTCCTTCCAGCTGTGTTGACGTGCTGGTACAGAGG
CTGGTTGAACTTGTCACAGGGCATATGGGTGGATCTTCGGAAGATTCCAGTATAGTATTG
ACAAGGTGGACTGAGAAAATCACTGCGTTCAAGGCAGCACTGAACACTTGCGTTGATTTG
TATTGGTCTCTCCATGCATCGTTGCTCTGCTTTTCAAGAGATCCGAATCTGCGGCCGTCC
TTTGTTCAGCAGACGTAAGTGTTGAAGCCTTTGAACCAGCTCCTGCTTCCTTCACCACGA
TAGTTTTCAACTGTAAGTATATGAAAGACAGTTAATCATATTACCATGCTTCATAAGTCT
AGATTTGAGGAATGTAAAATGAAATCAATTTTTTATGTTTTGATGTATTTGTTTGAGCAA
AGCCTCCATACTGTGCTATATATGGGTATAAACTGGGTCTCCTTTGCATGGCCA

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7426Contig1 913 2 2 U
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GATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGGCCACGTGTCCAT
CATCAAGGACTACAGAGGGAAGATCGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGTGATGGGATTTT
GAACCTTCTTGATTCGCACCTTGTCCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCCAAAGTGTTTTA
TCTTAAGATGAAGGGAGATTACCATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAG
GAAGGATGCTGCTGAGAACACTCTCGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGATATTGCCCTTGC
TGATTTACCTCCAACTCATCCGATTAGATTGGTACTGGCTCTTAACTTCTCTGTCTCTAC
TATGAGATTCTCAACTCACCTGATCGTGCTTGCAATCTTGCCAAACAGGCTTTTGATGAA
GCAATCTCTGAGCTGGACACATTAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATG
CAACTTCTCCGTGACAATCCGACTCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGTGGT
GATGAGATCAAGGAGGCGTCAAAGGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCTTAAAACCTT
GAAATGACCAAAGCGAGCGAGGGCATTACTTATGGGATTTGGCTGTTGTAGTTTCTTAAA
AACATATGATATGGGGTTTGTTGTTTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTC
TCCTTTGCAAACTCTGAACTCTGGTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTT
TTGAGTCTTTGGTTTTACTCCGTTGCTTGTTATTATTGATTTCTTAGGAAGCGAAGAAAC
AAAACTTTCAATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS32TF U 1
AF RR4DS32JQ C 51
BS 1 503 RR4DS32TF
BS 504 913 RR4DS32JQ

RD RR4DS32TF 503 0 0
GGGGAACCTCCTGTCCGTCGCTTACAAGAACGTGATCGGCGCTAGGAGAGCTTCCTGGAG
GATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGGCCACGTGTCCAT
CATCAAGGACTACAGAGGGAAGATCGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGTGATGGGATTTT
GAACCTTCTTGATTCGCACCTTGTCCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCCAAAGTGTTTTA
TCTTAAGATGAAGGGAGATTACCATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAG
GAAGGATGCTGCTGAGAACACTCTCGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGATATTGCCCTTGC
TGATTTACCTCCAACTCATCCGATTAGATTGGTACTGGCTCTTAACTTCTCTGTCTCTAC
TATGAGATTCTCAACTCACCTGATCGTGCTTGCAATCTTGCCAAACAGGCTTTTGATGAA
GCAATCTCTGAGCTGGACACATT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4DS32JQ 863 0 0
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ACGTGTCCATCATCAAGGACTACAGAGGGAAGATCGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGTG
ATGGGATTTTGAACCTTCTTGATTCGCACCTTGTCCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCCA
AAGTGTTTTATCTTAAGATGAAGGGAGATTACCATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTG
GTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAACACTCTCGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGATA
TTGCCCTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGATTAGATTGGTACTGGCTCTTAACTTCT
CTGTCTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTGATCGTGCTTGCAATCTTGCCAAACAGGC
TTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACACATTAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCAC
GCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCCGACTCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGA
GGCGGGTGGTGATGAGATCAAGGAGGCGTCAAAGGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGC
TTAAAACCTTGAAATGACCAAAGCGAGCGAGGGCATTACTTATGGGATTTGGCTGTTGTA
GTTTCTTAAAAACATATGATATGGGGTTTGTTGTTTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCA
TTTGATTTTCTCCTTTGCAAACTCTGAACTCTGGTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCT
TCTAGTGTTTTTGAGTCTTTGGTTTTACTCCGTTGCTTGTTATTATTGATTTCTTAGGAA
GCGAAGAAACAAAACTTTCAATC

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 2

CO CL7427Contig1 631 2 2 U
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AGAGTCCAAGACATTTCATCATCCGCCCTCCGCACCGAAGCCATCCCTTTGGAGTTCATC
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GCCGTCGATCTGAGCGATCCCGACGAAGAGAGCGTCGCGCGCGCGGTGGTTAAGGCGAGC
GAAGAGTGGGGGATTTTCCAGGTGGTTAACCACGGGATCCCCGCTGAGCTGATAAAACGG
TTGCAGGAAGTCGGGAGAACGTTCTTCGAGCTTCCTTCGTCGGAGAAAGAGTCCGTCGCG
AAGCCGGTTGATGCGAAGGACATCGAAGGATACGGGACGAAGCTGCAGAAAGAAGTAGAA
GGTAAGAAAGCATGGGTTGATCATCTCTTCCATAGGATCTGGCCACCGTCGTGCGTTAAC
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TGGAGTTACATGATATTATTATTTTTTATTTTTCTTTACATAATATTATTATATGTGGGA
CTAAACTAATATTACATTGTGTTTTTTTTTG


BQ
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AF RR4H705TF U 1
AF RR4H705JQB C 1
BS 1 508 RR4H705TF
BS 509 631 RR4H705JQB

RD RR4H705TF 508 0 0
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AGAGTCCAAGACATTTCATCATCCGCCCTCCGCACCGAAGCCATCCCTTTGGAGTTCATC
AGATCGGAGAAAGAACAGCCGGCGATCACAACTTTCCGAGGTCCGACGCCGGCGATCCCC
GCCGTCGATCTGAGCGATCCCGACGAAGAGAGCGTCGCGCGCGCGGTGGTTAAGGCGAGC
GAAGAGTGGGGGATTTTCCAGGTGGTTAACCACGGGATCCCCGCTGAGCTGATAAAACGG
TTGCAGGAAGTCGGGAGAACGTTCTTCGAGCTTCCTTCGTCGGAGAAAGAGTCCGTCGCG
AAGCCGGTTGATGCGAAGGACATCGAAGGATACGGGACGAAGCTGCAGAAAGAAGTAGAA
GGTAAGAAAGCATGGGTTGATCATCTCTTCCATAGGATCTGGCCACCGTCGTGCGTTAAC
TACAGTTTCTGGCCAAAGAACCCTCCAG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4H705JQB 631 0 0
GGAGAACTATCATCATCATCCTCCATTGTTCCCGGCAAAACGAAAGCCATGGAGTTCGAG
AGAGTCCAAGACATTTCATCATCCGCCCTCCGCACCGAAGCCATCCCTTTGGAGTTCATC
AGATCGGAGAAAGAACAGCCGGCGATCACAACTTTCCGAGGTCCGACGCCGGCGATCCCC
GCCGTCGATCTGAGCGATCCCGACGAAGAGAGCGTCGCGCGCGCGGTGGTTAAGGCGAGC
GAAGAGTGGGGGATTTTCCAGGTGGTTAACCACGGGATCCCCGCTGAGCTGATAAAACGG
TTGCAGGAAGTCGGGAGAACGTTCTTCGAGCTTCCTTCGTCGGAGAAAGAGTCCGTCGCG
AAGCCGGTTGATGCGAAGGACATCGAAGGATACGGGACGAAGCTGCAGAAAGAAGTAGAA
GGTAAGAAAGCATGGGTTGATCATCTCTTCCATAGGATCTGGCCACCGTCGTGCGTTAAC
TACAGTTTCTGGCCAAAGAACCCTCCAGAGTATAGGTACATGCCGAGAACATAACTCTTG
TGGAGTTACATGATATTATTATTTTTTATTTTTCTTTACATAATATTATTATATGTGGGA
CTAAACTAATATTACATTGTGTTTTTTTTTG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL7428Contig1 836 2 6 U
TGTTGAGGTTGTTTGGAGAAAAAGTGGAGAAAATGGAGGAGCTAAACCAAGGGAACATTC
TGAAGGAAGTTCAACGAGCAGCAGAGGAACTTCAGATGAAGATAGACAGCAACTCATTCC
TTCTCGTCAACTCGGAAAGCTGGGCTGCTATGAAAGAGAAAGCAGATGCTGAAGAAGCGC
AACAGAACTATCACGAAGAAGCCAAAGACGACGAAGAGACCAAAGTGATCCAATCTCTCA
GCCAGATTTGGGACGCTAACAACAACAACCTCAACCATCATCATCAGAGTCCACATACTG
GTAATGATTCTCGGCTTTGGAGGTCAACGGAGAGTATGATGATGTTTAGGAACCGAGAAC
ACTGGCCGAGCGTCTCATTCATAGGCGGATCTATGATCAATGAGATAGAATCCAAAGTAT
ATGAGAGTGCAAGTTCCTTGTCGCTGGCCACATTTGCGTCTCTTCTTATCGAGTTTGTTG
CGAGGCTACAGAACGTGGTTAACGCGTTTGAGGAGCTTAGCACCAAAGCCTGTTTCAAAG
AGCCAGATAGTGAGACAGAGAAGAACATAGTTAAATATGGGTTTTGGACAAGACTAAGGA
GCTGCTTTAGCTCCAGGGATTTTGCAGTTTAACCATTAGGTGCATAGTTTTGATTTGTAT
AGACAATTTGATATAGTTCTTTTGTTGTTGTCTTGACATGAGATGCTAATTCCATTTTTG
GAAAGTTATAAAGGTCAACTTGAAGTTTTGTTGTATGATGATGCTTGTTTGTTGAAATAC
AAATTTCACTTTCAGTTGGATCATTTAGTGTAAGCTGGTGTCCAATCATATGTTAG


BQ
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW36TF U 1
AF RR4FW36JQ C 231
BS 1 665 RR4FW36TF
BS 666 666 RR4FW36JQ
BS 667 733 RR4FW36TF
BS 734 734 RR4FW36JQ
BS 735 782 RR4FW36TF
BS 783 836 RR4FW36JQ

RD RR4FW36TF 785 0 0
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TTCTCGTCAACTCGGAAAGCTGGGCTGCTATGAAAGAGAAAGCAGATGCTGAAGAAGCGC
AACAGAACTATCACGAAGAAGCCAAAGACGACGAAGAGACCAAAGTGATCCAATCTCTCA
GCCAGATTTGGGACGCTAACAACAACAACCTCAACCATCATCATCAGAGTCCACATACTG
GTAATGATTCTCGGCTTTGGAGGTCAACGGAGAGTATGATGATGTTTAGGAACCGAGAAC
ACTGGCCGAGCGTCTCATTCATAGGCGGATCTATGATCAATGAGATAGAATCCAAAGTAT
ATGAGAGTGCAAGTTCCTTGTCGCTGGCCACATTTGCGTCTCTTCTTATCGAGTTTGTTG
CGAGGCTACAGAACGTGGTTAACGCGTTTGAGGAGCTTAGCACCAAAGCCTGTTTCAAAG
AGCCAGATAGTGAGACAGAGAAGAACATAGTTAAATATGGGTTTTGGACAAGACTAAGGA
GCTGCTTTAGCTCCAGGGATTTTGCAGTTTAACCATTAGGTGCATAGTTTTGATTTGTAT
AGACA*TTTGATATAGTTCTTTTGTTGTTGTCTTGACATGAGATGCTAATTCCATTTTTG
GAAAGTTATAAAG*TCAACTTGAAGTTTTGTTGTATGATGATGCTTGTTTGTTGAAATAC
AA
TTT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4FW36JQ 606 0 0
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CCACATACTGGTAATGATTCTCGGCTTTGGAGGTCAACGGAGAGTATGATGATGTTTAGG
AACCGAGAACACTGGCCGAGCGTCTCATTCATAGGCGGATCTATGATCAATGAGATAGAA
TCCAAAGTATATGAGAGTGCAAGTTCCTTGTCGCTGGCCACATTTGCGTCTCTTCTTATC
GAGTTTGTTGCGAGGCTACAGAACGTGGTTAACGCGTTTGAGGAGCTTAGCACCAAAGCC
TGTTTCAAAGAGCCAGATAGTGAGACAGAGAAGAACATAGTTAAATATGGGTTTTGGACA
AGACTAAGGAGCTGCTTTAGCTCCAGGGATTTTGCAGTTTAACCATTAGGTGCATAGTTT
TGATTTGTATAGACAATTTGATATAGTTCTTTTGTTGTTGTCTTGACATGAGATGCTAAT
TCCATTTTTGGAAAGTTATAAAGGTCAACTTGAAGTTTTGTTGTATGATGATGCTTGTTT
GTTGAAATACAAATTTCACTTTCAGTTGGATCATTTAGTGTAAGCTGGTGTCCAATCATA
TGTTAG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7429Contig1 548 2 1 U
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ATCACAGCTGAGAGTCTAAGGAGGAACTCAGGGGTACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAG
GAAGATGCACAAGGGATGATTAGAGAAGGAGACCTCGACGGTGATGGAGCTCTTAACCAA
ACCGAGTTCTGCGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCCTGAAATGATGGAAGATGCAGAAACT
TGGCTGGAGAAAGCAATCAGCCAAGAACTCTGCAGTCACAATCACTCTTCTCTGCCTTGA
TGATGAAGAAACTTTTCTTGTGTATTATCTTTCTTTCTCCTATACTTATAAATGTTTCTG
TTATACAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AN50JQ C 1
AF RR4AN50TF U 1
BS 1 548 RR4AN50TF

RD RR4AN50JQ 548 0 0
GGAAAACAGTTCACAAAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCCTTCATCATCTTCAT
CCTCTAATGGAGCAACCAAGCAAGAAATCTTGTGTACTAGAAACAACTACTGATGCTATG
GAGATGGAGACGAAATACGAAGATATGTTACCGATCATGGCGGATAAAATGGACGTAGAA
GAGTTTGTATCAGAGTTATGCAAAGGTTTCAGTTTGCTTGCGGATCCAGAGAGAGATGTG
ATCACAGCTGAGAGTCTAAGGAGGAACTCAGGGGTACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAG
GAAGATGCACAAGGGATGATTAGAGAAGGAGACCTCGACGGTGATGGAGCTCTTAACCAA
ACCGAGTTTTGCGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCCTGAAATGATGGAAGATGCAGAAACT
TGGCTGGAGAAAGCAATCAGCCAAGAACTCTGCAGTCACAATCACTCTTCTCTGCCTTGA
TGATGAAGAAACTTTTCTTGTGTATTATCTTTCTTTCTCCTATACTTATAAATGTTTCTG
TTATACAG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR4AN50TF 548 0 0
GGAAAACAGTTCACAAAGTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCCTTCATCATCTTCAT
CCTCTAATGGAGCAACCAAGCAAGAAATCTTGTGTACTAGAAACAACTACTGATGCTATG
GAGATGGAGACGAAATACGAAGATATGTTACCGATCATGGCGGATAAAATGGACGTAGAA
GAGTTTGTATCAGAGTTATGCAAAGGTTTCAGTTTGCTTGCGGATCCAGAGAGAGATGTG
ATCACAGCTGAGAGTCTAAGGAGGAACTCAGGGGTACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAG
GAAGATGCACAAGGGATGATTAGAGAAGGAGACCTCGACGGTGATGGAGCTCTTAACCAA
ACCGAGTTCTGCGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCCTGAAATGATGGAAGATGCAGAAACT
TGGCTGGAGAAAGCAATCAGCCAAGAACTCTGCAGTCACAATCACTCTTCTCTGCCTTGA
TGATGAAGAAACTTTTCTTGTGTATTATCTTTCTTTCTCCTATACTTATAAATGTTTCTG
TTATACAG

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL7430Contig1 888 2 2 U
GGCTCCCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCCGTTGATCGATGGCAGCTTCGGTTG
ATCCTTTGGTGGTTGGAAGAGTGATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCTCCAACA
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CAGTCAACCCTCCTAGAGTCACTATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGA
TGACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGA
TTGTCGTAGATATCCCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATA
CGGAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGT
CACCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGT
TCGCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAA
GAGCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGCATA
TTCAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGAACCATATT
TTATAATTCCGGTGCTCGCAATATATCTGTATATGTAGTATAGTTTACATAGTCATACAA
ATATGTTTGTGTGCTTGTGTTACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTTTTCGTTTG
TGTGATCTTTGAAAATTAAAATTGTAAATGAACATATACATACTAGAATGTTAACAATGA
GGCAGACAAGAGATTACACATCAATTGTAAACGAACTATATATTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ65TF U 1
AF RR4AZ65JQ C 183
BS 1 848 RR4AZ65TF
BS 849 888 RR4AZ65JQ

RD RR4AZ65TF 854 0 0
GGCTCCCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCCGTTGATCGATGGCAGCTTCGGTTG
ATCCTTTGGTGGTTGGAAGAGTGATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCTCCAACA
TGTCTGTCTACGTTGGCCCCAAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCCTCAGCCG
CAGTCAACCCTCCTAGAGTCACTATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGA
TGACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGA
TTGTCGTAGATATCCCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATA
CGGAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGT
CACCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGT
TCGCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAA
GAGCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGCATA
TTCAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGAACCATATT
TTATAATTCCGGTGCTCGCAATATATCTGTATATGTAGTATAGTTTACATAGTCATACAA
ATATGTTTGTGTGCTTGTGTTACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTTTTCGTTTG
TGTGATCTTTGAAAATTAAAATTGTAAATGAACATATACATACTAGAATGTTAACAATGA
GGCAGACA
GAGATT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR4AZ65JQ 706 0 0
GTCAACCCTCCTAGAGTCACTATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGATG
ACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGATT
GTCGTAGATATCCCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATACG
GAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGTCA
CCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGTTC
GCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAAGA
GCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGCATATT
CAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGAACCATATTTT
ATAATTCCGGTGCTCGCAATATATCTGTATATGTAGTATAGTTTACATAGTCATACAAAT
ATGTTTGTGTGCTTGTGTTACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTTTTCGTTTGTG
TGATCTTTGAAAATTAAAATTGTAAATGAACATATACATACTAGAATGTTAACAATGAGG
CAGACAAGAGATTACACATCAATTGTAAACGAACTATATATTACGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7431Contig1 788 2 1 U
GTAGACAGCGGCAAACTTGCCTCTGTTCATATAACTTCCAAAAATCAACACACTACGTGA
GTCTGTTCTCAGATATAAGTACAATAAAGGAAGTGTAAGAAAAGATAAAGAAGATATCCA
TTGCTCATGTGTTCTTTTTTTAAGTTTCTAAGGAATCATCTTCTTCAATAACTGTTGGGA
GTGTCCCCTGTTTAGCAAAACCTGGACTCAAGAACTTTGCCACGAAACTCCATAATCTGT
ATACATCTTCGAAGTTTGTCAAGAACCCAAGGGATGCTGTGACAACCTCAACTCTTATGA
ACTCGTTGCTTTTGCCATGTGGATCCACCTGTTTCCAAGAACTTGAATCAATGATCTTTA
TGTGACTGAGGTAACCAATGCCTAAAGATATTCCTTCTCTTTCAGCTAGTTTCTGCACTA
TCTCAGGATGCACCATTCCACTTTTCAAATCCCTTACATTGAATGCCACCGAAGATCCTC
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CTTCTTCTTCTTCTTCATCCACAAGATTGATCACCGATGCTTCTCCATGATCTACTGATC
TAAACGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A305JQD U 1
AF RR4A305JQ U 1
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QA 1 775 1 775
DS 

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GTAGACAGCGGCAAACTTGCCTCTGTTCATATAACTTCCAAAAATCAACACACTACGTGA
GTCTGTTCTCAGATATAAGTACAATAAAGGAAGTGTAAGAAAAGATAAAGAAGATATCCA
TTGCTCATGTGTTCTTTTTTTAAGTTTCTAAGGAATCATCTTCTTCAATAACTGTTGGGA
GTGTCCCCTGTTTAGCAAAACCTGGACTCAAGAACTTTGCCACGAAACTCCATAATCTGT
ATACATCTTCGAAGTTTGTCAAGAACCCAAGGGATGCTGTGACAACCTCAACTCTTATGA
ACTCGTTGCTTTTGCCATGTGGATCCACCTGTTTCCAAGAACTTGAATCAATGATCTTTA
TGTGACTGAGGTAACCAATGCCTAAAGATATTCCTTCTCTTTCAGCTAGTTTCTGCACTA
TCTCAGGATGCACCATTCCACTTTTCAAATCCCTTACATTGAATGCCACCGAAGATCCTC
GTTCATATTTAATCTTTGGACCATAGATTTGGACAAGGTTCTTGTGCTCTCCACCTGGAG
GATCTGAGCTCGGCAGCCTTAGTTGGAGCAGAGATGCCACAAGCCAGTTAATGAGGTACC
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CAATCTCTGGTTCTCTCTGATCATCATCATCATCCCATTCTGCTCCTCCATTGCTTCCAT
CTTCTTCTTCTTCTTCATCCACAAGATTGATCACCGATGCTTCTCCATGATCTACTGATC
TAAACGAT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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GGATTCATTGGTTTGTCTCTCTGTGGATCATGCACTGCAGAACCAACTGGAGGGCTTATC
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GGTGAAACTGAACTCGCTGGCCTACTACAACTCTGTTCAGAGTTTCAGCAACAGGTTGTA
TGATCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGGTTTGTTCTGTTT
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AAAAAATGTTAAGGGACTT


BQ
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AF RR4CU65TF U 1
AF RR4CU65JQ C 62
BS 1 606 RR4CU65TF
BS 607 619 RR4CU65JQ

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AAAAAA

QA 1 606 1 606
DS 

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AATAATCTACAGTTTTACTAATGTATCTTAGTTTTGTCTCTTAAATTTCAAATATTAATA
AAAAATGTTAAGGGACTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL7433Contig1 820 2 2 U
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GGTACACTAGATCCTAAGATCGCTAAGAAAATGAGTTTCATCTCGACTTTTGGTGAATCT
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TTGAAAAGACTCAAGACAAATGATGAACCGAAAGAAGAAACCAGCGGGAAAGTTAGTGAG
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TAAGATCAAATGAACGTATCTATATGTATGTATGTTGTAACTTGTAAGTGTGACCAATGC
GTAACTTACTTGAATATATATATATGCACACTTCTATTTT


BQ
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AF RR4F050TF U 1
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BS 680 820 RR4F050JQ

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GCCAATTCAGGAGAGATGGTTTACTTTTTCTTCGATCATTTCCTTTGGTTATCAAGAATC
GGTACACTAGATCCTAAGATCGCTAAGAAAATGAGTTTCATCTCGACTTTTGGTGAATCT
TTTGGCTACGTTTTCTTTATCATCATCGATTGCATTTTCATAAGGCAGAGACCCAGATCC
TTGAAAAGACTCAAGACAAATGATGAACCGAAAGAAGAAACCAGCGGGAAAGTTAGTGAG
ATTCAAGGAGATATAGTGATGAGATTGATGGGAATTTCAGCTAACGTTGCGGATTCGATT
ATCGCATTGGCGGAAATTCAACCGAACCCGTTTTGTAACCACACGGTTACACTCGGTATA
AGCGGTTTAGTTTCGGCTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4F050JQ 618 0 0
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ACTTTTTCTTCGATCATTTCCTTTGGTTATCAAGAATCGGTACACTAGATCCTAAGATCG
CTAAGAAAATGAGTTTCATCTCGACTTTTGGTGAATCTTTTGGCTACGTTTTCTTTATCA
TCATCGATTGCATTTTCATAAGGCAGAGACCCAGATCCTTGAAAAGACTCAAGACAAATG
ATGAACCGAAAGAAGAAACCAGCGGGAAAGTTAGTGAGATTCAAGGAGATATAGTGATGA
GATTGATGGGAATTTCAGCTAACGTTGCGGATTCGATTATCGCATTGGCGGAAATTCAAC
CGAACCCGTTTTGTAACCACACGGTTACACTCGGTATAAGCGGTTTAGTTTCGGCTTGGG
CTGGTTGGTATAGGAATTGGCCATCGTGAGAGATATACTAAGATCAAATGAACGTATCTA
TATGTATGTATGTTGTAACTTGTAAGTGTGACCAATGCGTAACTTACTTGAATATATATA
TATGCACACTTCTATTTT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

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ATTCAAATCTAAAGAGTTTCAGCGATTACAACCGGAGGTAAGCTCGACGGTAAGATAAAA
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TGTCCCGGGAGGCTAGGTAAATCTCAACGGTTCCGGGAAGCAAAAGATCGGTAAGCGAAA
TGATAAGTCTGTTGAAACTCTTTTCTTCACCGACGCCATTGATGAACTTTGCGTTGAAAT
CGAGCATACTTGCTGGCAACGTCGGAGGGGATTGTCGGATGAAGCCGTAAGATTGAGGCT
TAAAATACCTTAAGACCTTAGAACCTCTCAAATTATAATTGTAGCCCAACAATTGTAACC
AAGCCCAAGCCCATAACTTACCCAAAATTTTGC


BQ
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AF RR4D118JQ U 45
AF RR4DY83JQ U 1
BS 1 633 RR4DY83JQ

RD RR4D118JQ 169 0 0
G
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GACGGTAAGATAAAAACAAAGACAACAAAGCAGCAAAACAAGGGATAGAAGTGTTGCAAG
GAGAGGCTAGCTCGAAGTAGAGAGATCCGCAGATATTCTTCACTAGAA

QA 2 169 2 169
DS 

RD RR4DY83JQ 633 0 0
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ATTCAAATCTAAAGAGTTTCAGCGATTACAACCGGAGGTAAGCTCGACGGTAAGATAAAA
ACAAAGACAACAAAGCAGCAAAACAAGGGATAGAAGTGTTGCAAGGAGAGGCTAGCTCGA
AGTAGAGAGATCCGCAAATATTCTTCACTAGAATCCTTGAAACCACAGCTCGGAAGAGCT
TCAAATAGTCTGAAAAGACGTTGGAATTCCCTAATGAAAGGGGTTGGAAGAGGGTTAGGA
AGCCAATATAGACTGTGTTACCCGTCAAACGAAAGAGGTCAGCTCTACAACCGTCTAATA
TGTCCCGGGAGGCTAGGTAAATCTCAACGGTTCCGGGAAGCAAAAGATCGGTAAGCGAAA
TGATAAGTCTGTTGAAACTCTTTTCTTCACCGACGCCATTGATGAACTTTGCGTTGAAAT
CGAGCATACTTGCTGGCAACGTCGGAGGGGATTGTCGGATGAAGCCGTAAGATTGAGGCT
TAAAATACCTTAAGACCTTAGAACCTCTCAAATTATAATTGTAGCCCAACAATTGTAACC
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QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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CGAGGTAGTCGCAAGAAAGAGTTCAAAGACCCCAACAGTGATCTCAAGGGCACAAAGATG
CCGTATAGCTTCTTCTTGAAGAACGGCACAAAGGAAGAGCCAAGTGAATGGCGAATGGAG
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GAAATGGTTGAGCAGACAACTACACCTCAAGTGAATCTTCAAGGAGAGATCCCATCATCT
TCCTCTGATGATGAAGATGCTACCAGTTTGCTCAGGATCCCACAAGCACAACTATGATAA
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TTTCAATGTAAAAGATTATTATCTGGTTAAACCTCTGGGCCTTCTGTTTAGGGCTTTCTT
TCTAAGTAAAAAGATTATGATCTGG


BQ
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AF RR4E145TF U 1
AF RR4E145JQ C 203
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BS 696 696 RR4E145JQ
BS 697 756 RR4E145TF
BS 757 865 RR4E145JQ

RD RR4E145TF 756 0 0
GGATCGGAAAAAGAAATACTCTTTCTCTACAACCCTGCGCAGATGGAGCCTGAATATGAA
GCTAATCCCGTGTCTTTGCCGCCGATGGACGTAGCTGATCCCGTTTCGACGCAGCCGCCG
CCGCCGGTAAACATTTCCTCAGCGGAAGAGACTTTCCAGTTGACAGTATCACTTCCTCCA
GGGTTCCTTTTTCGACCTACTGATGAGCAAACGCTGTTCTATTACCTCAAGGGGAAAGTC
TTGAGCGAAGAGGTGACTGATGCCATTGCAGATCTTGACATCTACAAGCACGATCCCTGG
GACTTAGCAGGTCATTCCAAGCTCAAATCCACAGAGGAGTGGTACTTTTTTACCAACCTA
CAGAGTAGGTACAAAAGTGGCCCTCGTACCAAGCGCGACACTCCCCACGGGAGATGGAGA
CGAGGTAGTCGCAAGAAAGAGTTCAAAGACCCCAACAGTGATCTCAAGGGCACAAAGATG
CCGTATAGCTTCTTCTTGAAGAACGGCACAAAGGAAGAGCCAAGTGAATGGCGAATGGAG
GAATTCAAGCTGGAAAACCATTCTGAGATGTGTGTCTCCAAGGTTTTTAGGAAGAAGAAA
GAAATGGTTGAGCAGACAACTACACCTCAAGTGAATCTTCAAGGAGAGATCCCATCATCT
TCCTCTGATGATGAAGATGCTACCAGTTTGCTCAG*ATCCCACAAGCACAACTATGATAA
CATATTTATTCCCACGAAATATTAGCTAATCTTATT

QA 1 756 1 756
DS 

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CCATTGCAGATCTTGACATCTACAAGCACGATCCCTGGGACTTAGCAGGTCATTCCAAGC
TCAAATCCACAGAGGAGTGGTACTTTTTTACCAACCTACAGAGTAGGTACAAAAGTGGCC
CTCGTACCAAGCGCGACACTCCCCACGGGAGATGGAGACGAGGTAGTCGCAAGAAAGAGT
TCAAAGACCCCAACAGTGATCTCAAGGGCACAAAGATGCCGTATAGCTTCTTCTTGAAGA
ACGGCACAAAGGAAGAGCCAAGTGAATGGCGAATGGAGGAATTCAAGCTGGAAAACCATT
TTGAGATGTGTGTCTCCAAGGTTTTTAGGAAGAAGAAAGAAATGGTTGAGCAGACAACTA
CACCTCAAGTGAATCTTCAAGGAGAGATCCCATCATCTTCCTCTGATGATGAAGATGCTA
CCAGTTTGCTCAGGATCCCACAAGCACAACTATGATAACATATTTATTCCCACGAAATAT
TAGCTAATCTTATTTGGGCCTTCTGTTTAGGGTATTTCTTTCAATGTAAAAGATTATTAT
CTGGTTAAACCTCTGGGCCTTCTGTTTAGGGCTTTCTTTCTAAGTAAAAAGATTATGATC
TGG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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CGTCTTCGAGTTCTCTAGCTATTTGTCCGAGGAAGTTCCGGCCAGACCTTTACTCATACT
CTTACCAAGACGGTTCCAACACACCACTCGTTATCTCTTTCTCTCATCTCTTATAGAACG
AACGGTAGCTCGGAACGAGAGAATTAGCCGGAGCTACGGTGGTTTTGGTAAGACATGTGT
CTTCGATTGCATGGAAGTTCCTGACATGACGATCCAATCGTACTTAGAGAGGATTTTCCG
GTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTACATTGTGGCTTATGTATACATTGACCGGTTCTG
TCAGAATAATCAAGGTTTTAGAATCAGCATCACTAATGTACATCGTCTACTTATGACAAC
CATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGAACTACAGAAACTCGTACTTTGCCAA
GGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGACTTGAACAACTTGGAGTTGGAGTTCTTGTTCTTGAT
GAGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGTGTGTTCGAGAGTTACTGTTGTCACCTTGAGAG
AGAAGTAAGTATCGGGGGAGGTTATCAGATCGAGAAGGCATTACGTTGCGCTGAGGAAAT
CAAATCAAGACAAATTGTTCAAGATCCTAAAGATCGTCATCACCATCAATTTTCACGAAT
CTTGTTGTAGTCAAGAAGAACTCTGTTTTTTCTTTGTTTTGTCGCTTTGCTTTTGAGAGT
CTTTGACTTTCTAATTACCTTGTCGTATGGGCTTTTCTTGAAAAATAAATGTAAATACAC
AAATCTCACTAGAATCTCTATAAATTAATATTCAATAAATTAATAATTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H910TF U 1
AF RR4H910JQB C 103
BS 1 637 RR4H910TF
BS 638 638 RR4H910JQB
BS 639 653 RR4H910TF
BS 654 893 RR4H910JQB

RD RR4H910TF 653 0 0
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CTTCGATTGCATGGAAGTTCCTGACATGACGATCCAATCGTACTTAGAGAGGATTTTCCG
GTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTACATTGTGGCTTATGTATACATTGACCGGTTCTG
TCAGAATAATCAAGGTTTTAGAATCAGCATCACTAATGTACATCGTCTACTTATGACAAC
CATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGAACTACAGAAACTCGTACTTTGCCAA
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GAGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGTGTGTTCGAGAGTTACTGTTGTCACCTTGAGAG
AGAAGTAAGTATCGGGGGAGGTTATCAGATCGAGAAG*CATTACGTTGCGCTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4H910JQB 791 0 0
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CTTAGAGAGGATTTTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTACATTGTGGCTTATGT
ATACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTTAGAATCAGCATCACTAATGTACA
TCGTCTACTTATGACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGAACTACAG
AAACTCGTACTTTGCCAAGGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGACTTGAACAACTTGGAGTT
GGAGTTCTTGTTCTTGATGAGGTTTAAGTTGCATGTGAATGTGAGTGTGTTCGAGAGTTA
CTGTTGTCACCTTGAGAGAGAAGTAAGTATCGGGGGAGGTTATCAGATCGAGAAGGCATT
ACGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCAAGACAAATTGTTCAAGATCCTAAAGATCGTCATCA
CCATCAATTTTCACGAATCTTGTTGTAGTCAAGAAGAACTCTGTTTTTTCTTTGTTTTGT
CGCTTTGCTTTTGAGAGTCTTTGACTTTCTAATTACCTTGTCGTATGGGCTTTTCTTGAA
AAATAAATGTAAATACACAAATCTCACTAGAATCTCTATAAATTAATATTCAATAAATTA
ATAATTTTTAC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL7437Contig1 907 2 2 U
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GAACAAAACCCTAATCTCAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATTGTGGGACTTC
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ACAAAGGCCAAAGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTG
GGTGTGAACAGGCGGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTG
GATGTGTGGGAGCAAGAGGGCTTGTATGATTGATTTTGCAACTCTTTCAAACTTACTTTT
CCTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTATATATGTGTGTAATATCTGAATTATAGCATC
TTTTGAGTCTTATTATGTACGTATAAATGATTAATGGTGTGTACTGATTTTGAAGAAAAA
TCCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX65TF U 1
AF RR4AX65JQ C 192
BS 1 735 RR4AX65TF
BS 736 907 RR4AX65JQ

RD RR4AX65TF 735 0 0
GGATTCCTTGCAGAACCACCACACACGCAGAACACGAGTTGGAGAACACAAAAAAAAGTG
GAATAAAGAAGAAGACACTTCTGTTCTGTAATAATCAATCAAGCTGCTGGGGAGGTGGCT
GAACAAAACCCTAATCTCAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATTGTGGGACTTC
TGCTGCCCGGGATCAGGATTTTGATTAGAAGGTCGCTACTTTGGTTGCTGTAGATAGATG
CATATCCGTGAATATATTCCTTCTTGGATCTACCAGTTATTTGGTTGCATGGGAGGTTGT
TTTGGGAGCTGTAATAAACCACCACCGCTTATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGG
TTAAGGATTCAAGGTCGTTTAGTGAAGAAGCCAAGCGTATCAGACGACTTCTGGAGCACG
AGCACCTGCGATATGGATAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTCTCTTCTATT
AGCTTCACTAACAACACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTAAAC
ACCGGATTGAACCGGTGGAACCAGACTAGACAACAGCGGCTTGCAAGCGGGTCTTCTCAA
ACAAAGGCCAAAGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTG
GGTGTGAACAGGCGGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTG
GATGTGTGGGAGCAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4AX65JQ 716 0 0
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ATATATTCCTTCTTGGATCTACCAGTTATTTGGTTGCATGGGAGGTTGTTTTGGGAGCTG
TAATAAACCACCACCGCTTATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCA
AGGTCGTTTAGTGAAGAAGCCAAGCGTATCAGACGACTTCTGGAGCACGAGCACCTGCGA
TATGGATAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTCTCTTCTATTAGCTTCACTAA
CAACACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTAAACACCGGATTGAA
CCGGTGGAACCAGACTAGACAACAGCGGCTTGCAAGCGGGTCTTCTCAAACAAAGGCCAA
AGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTGGGTGTGAACAG
GCGGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTGGGA
GCAAGAGGGCTTGTATGATTGATTTTGCAACTCTTTCAAACTTACTTTTCCTCTTTTCTT
TTCTTTCTTTCTTTCTTATATATGTGTGTAATATCTGAATTATAGCATCTTTTGAGTCTT
ATTATGTACGTATAAATGATTAATGGTGTGTACTGATTTTGAAGAAAAATCCTACC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7438Contig1 834 2 4 U
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TAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGCAGTCAGTCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTC
GCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGCAAACTTCCCAAATCTCAAGAGGAATT
ATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGAACCCATGAAAGATGAGTCTGCACCTT
CCACCTCCGCTGCTCAGCCCTTGTCTAGTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTA
CTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAG
AAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTT
CCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTA
CGACTGCGATCTTGACACTTGCGTCCCTTGTACCCCTTTTCAAAGGTATCACCGCCGAGT
CTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCGACGCTGAGCTCTGGAACGGGCGTTTCGCGATGC
TTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACCGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGGAA
TGGAACTTTCTTATTGGGGGGAGAATGCTATATTACAGTTTTGCCCCTGAATTCTGTGAA
GTAATCTTGCTTGATATGTGTGGTTAAGCCTATGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGT
CACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGTGATGTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E460TF U 1
AF RR4E460JQ C 155
BS 1 657 RR4E460TF
BS 658 658 RR4E460JQ
BS 659 707 RR4E460TF
BS 708 834 RR4E460JQ

RD RR4E460TF 707 0 0
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TAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGCAGTCAGTCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTC
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AAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTT
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QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4E460JQ 680 0 0
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ACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTT
GCTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGGTTGGGTT
CGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGA
CGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACACTTGCGTCCCTTGTACC
CCTTTTCAAAGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCGACGCTGA
GCTCTGGAACGGGCGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACCGAGTTTGT
CAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGGAATGGAACTTTCTTATTGGGGG*AGAATGCTATATT
ACAGTTTTGCCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGCTTGATATGTGTGGTTAAGCCTATG
GTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGT
AAAATCAGTGATGTTTCTCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL7439Contig1 940 2 12 U
GCATCAGGCCTCCCTTCAACCACCATGCGAACTGGGGGCAATGTCCCCTCTGTTTCAAAA
GTCAATGCCCCTTCGTCGCCATTTCCAGGTATTGAACTGTCAGAGTGCAAAGGAGAAACT
GTGGATCTTCTTGTTCGCCTTGGCCTCTTAAAAATGGTGAGCGAAATTGGTGGTCTTACT
TTAGAAACTATCCCCGAAGCATTTCAACTCAACCTCACCAGACTGAGAGCTATTCAATCC
CAAATCCAGAAAGTCATTCTTGTCTCCATCAGTGTGTTGATCCTTCAGCAAACACTTGCA
AGCCCTAACGCATCTGACGTGGAGACCATTACATGGACCTGCATTAACCGACTCTACGAG
ATGTTAGATGCCAAAGCCGATGCGGGTCTTTCAGAAATCATGGAAACATTCTCCGAGCTT
CTCGAGTCTGACGATGCAGAGACAAAGAAACAAGTGATTGCAAATATGCTTGTGAAAAGC
TTACAAGCTGGAGACCCAGTGTTCACACGTGTGTCACAGACCATATACCTAGCGACACGG
GCCGCGGTTATGGCGGGTAACAACACGAAGAGAAAGCAGTTGGTGGAGACAATGCTAAGA
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GTGGCGAACGTTTCGCGTAGTGTTCATGGATTCTGGTATGAGGAATTGCTGAAGAAACCG
AATTGAAATTTGAAGATTGTGAACGGTTTGGTGTGTTTATGGTTTGATCAAGATTTAAGT
GCTTGTAGACGAAAGTGAGAATACCACGTTTGTATTTACTGAATACTTACATTGGAACAT
AAATTATAGACTCTGGTATTTGTGTAGTATACGCAGGAAGACATAATATGTTTACAATAT
TTTAACTTTTGAATAATACTTAAGATAACTATACTATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E992TF U 1
AF RR4E992JQ C 234
BS 1 704 RR4E992TF
BS 705 705 RR4E992JQ
BS 706 712 RR4E992TF
BS 713 713 RR4E992JQ
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BS 735 737 RR4E992TF
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BS 750 804 RR4E992TF
BS 805 940 RR4E992JQ

RD RR4E992TF 804 0 0
GCATCAGGCCTCCCTTCAACCACCATGCGAACTGGGGGCAATGTCCCCTCTGTTTCAAAA
GTCAATGCCCCTTCGTCGCCATTTCCAGGTATTGAACTGTCAGAGTGCAAAGGAGAAACT
GTGGATCTTCTTGTTCGCCTTGGCCTCTTAAAAATGGTGAGCGAAATTGGTGGTCTTACT
TTAGAAACTATCCCCGAAGCATTTCAACTCAACCTCACCAGACTGAGAGCTATTCAATCC
CAAATCCAGAAAGTCATTCTTGTCTCCATCAGTGTGTTGATCCTTCAGCAAACACTTGCA
AGCCCTAACGCATCTGACGTGGAGACCATTACATGGACCTGCATTAACCGACTCTACGAG
ATGTTAGATGCCAAAGCCGATGCGGGTCTTTCAGAAATCATGGAAACATTCTCCGAGCTT
CTCGAGTCTGACGATGCAGAGACAAAGAAACAAGTGATTGCAAATATGCTTGTGAAAAGC
TTACAAGCTGGAGACCCAGTGTTCACACGTGTGTCACAGACCATATACCTAGCGACACGG
GCCGCGGTTATGGCGGGTAACAACACGAAGAGAAAGCAGTTGGTGGAGACAATGCTAAGA
AGAATCGGAGCAGCTTCTCTCTCGGACAAGGTTGTAGAGGTTTCAGACATTCTGGTTCTT
GTGGCGAACGTTTCGCGTAGTGTTCATGGATTCTGGTATGAGGA*TTGCTGA*GAAACCG
AATTGAAATTTGA*GAT*GTGAACGGTT*GGTGTGTTTATGGTTTGATCAAGATTTAAGT
GCTTGTAGACGAAAGTGAGAATAC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4E992JQ 707 0 0
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ACTTGCAAGCCCTAACGCATCTGACGTGGAGACCATTACATGGACCTGCATTAACCGACT
CTACGAGATGTTAGATGCCAAAGCCGATGCGGGTCTTTCAGAAATCATGGAAACATTCTC
CGAGCTTCTCGAGTCTGACGATGCAGAGACAAAGAAACAAGTGATTGCAAATATGCTTGT
GAAAAGCTTACAAGCTGGAGACCCAGTGTTCACACGTGTGTCACAGACCATATACCTAGC
GACACGGGCCGCGGTTATGGCGGGTAACAACACGAAGAGAAAGCAGTTGGTGGAGACAAT
GCTAAGAAGAATCGGAGCAGCTTCTCTTTCGGACAAGGTTGTAGAGGTTTCAGACATTCT
GGTTCTTGTGGCGAACGTTTCGCGTAGTGTTCATGGATTCTGGTATGAGGAATTGCTGAA
GAAACCGAATTGAAATTTGAAGATTGTGAACGGTTTGGTGTGTTTATGGTTTGATCAAGA
TTTAAGTGCTTGTAGACGAAAGTGAGAATACCACGTTTGTATTTACTGAATACTTACATT
GGAACATAAATTATAGACTCTGGTATTTGTGTAGTATACGCAGGAAGACATAATATGTTT
ACAATATTTTAACTTTTGAATAATACTTAAGATAACTATACTATGGT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL7440Contig1 760 2 2 U
GGATCTTCTTCACGATCAGATCGACGAAGAGTGAGCTTTGAGTTTTAGAGATCTGAGGAG
GACAAAGCCGAAACACAACAAAACGATGTCGTTTACAGGAACACAGCAGAAATGCAGAGC
GTGTAAGAAGACGGTGTACCCAATGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGAGTGACATTTCACAA
GTCTTGCTTCAAGTGCTCTCACTGCAAAACCACTCTTCAACTGAGCAATTACTCATCAAT
GGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTTTGAGCAGCTCTTCAAGGAGACTGGTAGCTT
CAACAAGAACTTTCAGTCACCTTCAAAGCCACTAACTGACAAGCCAACTCCTGAGCTGAC
AAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGAATGTTCTCTGGAACTCAAGACAATGTGCTACTTGC
AGTAAAACCGTGTATCCTATCGAAAAGGTGACAGTGGAGAGTCAGTGTTACCATAAATCT
TGCTTCAAATGTTCACATGGAGGCTGTGCGCTTTCTCCATCCAACTACGCAGCGCTCGAG
GGGATATTGTACTGCAAACACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAAGGAAGTTACAAT
CACCTCATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCTGCTGCTGTAGAAGCTGTACCTGAA
TCTTAAAAATTTGAATTTACCAACCAATGTCAACTTTAAAAAAAAGGGTTACTACCAAAC
TGGTTTCACTTTGTCTTGGTGTATGTGATATGTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR51TF U 1
AF RR4BR51JQ C 5
BS 1 665 RR4BR51TF
BS 666 760 RR4BR51JQ

RD RR4BR51TF 665 0 0
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GTGTAAGAAGACGGTGTACCCAATGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGAGTGACATTTCACAA
GTCTTGCTTCAAGTGCTCTCACTGCAAAACCACTCTTCAACTGAGCAATTACTCATCAAT
GGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTTTGAGCAGCTCTTCAAGGAGACTGGTAGCTT
CAACAAGAACTTTCAGTCACCTTCAAAGCCACTAACTGACAAGCCAACTCCTGAGCTGAC
AAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGAATGTTCTCTGGAACTCAAGACAATGTGCTACTTGC
AGTAAAACCGTGTATCCTATCGAAAAGGTGACAGTGGAGAGTCAGTGTTACCATAAATCT
TGCTTCAAATGTTCACATGGAGGCTGTGCGCTTTCTCCATCCAACTACGCAGCGCTCGAG
GGGATATTGTACTGCAAACACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAAGGAAGTTACAAT
CACCTCATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCTGCTGCTGTAGAAGCTGTACCTGAA
TCTTA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4BR51JQ 756 0 0
CTTCTTCACGATCAGATCGACGAAGAGTGAGCTTTGAGTTTTAGAGATCTGAGGAGGACA
AAGCCGAAACACAACAAAACGATGTCGTTTACAGGAACACAGCAGAAATGCAGAGCGTGT
AAGAAGACGGTGTACCCAATGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGAGTGACATTTCACAAGTCT
TGCTTCAAGTGCTCTCACTGCAAAACCACTCTTCAACTGAGCAATTACTCATCAATGGAA
GGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTTTGAGCAGCTCTTCAAGGAGACTGGTAGCTTCAAC
AAGAACTTTCAGTCACCTTCAAAGCCACTAACTGACAAGCCAACTCCTGAGCTGACAAGG
ACACCTAGCCGAGTTGCTGGAATGTTCTCTGGAACTCAAGACAATGTGCTACTTGCAGTA
AAACCGTGTATCCTATCGAAAAGGTGACAGTGGAGAGTCAGTGTTACCATAAATCTTGCT
TCAAATGTTCACATGGAGGCTGTGCGCTTTCTCCATCCAACTACGCAGCGCTCGAGGGGA
TATTGTACTGCAAACACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAAGGAAGTTACAATCACC
TCATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCTGCTGCTGTAGAAGCTGTACCTGAATCTT
AAAAATTTGAATTTACCAACCAATGTCAACTTTAAAAAAAAGGGTTACTACCAAACTGGT
TTCACTTTGTCTTGGTGTATGTGATATGTTTGTTTT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL7441Contig1 746 2 1 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AX61JQ C 1
AF RR4AX61TF U 1
BS 1 746 RR4AX61TF

RD RR4AX61JQ 746 0 0
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QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4AX61TF 746 0 0
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CAAGGTATCTGGAAGTTCCCCACCGGAGTAGTCAATGAGGGTGAATATATCCATGATGGC
TCGGTCAGAGAGGTGAAAGAAGAGACAGGAGTGGATACAGAATTTGTCCAAGTATTGGCT
TTCAGACAGACCCACAAAGCTTTCTTTGAAAAGTCAGATTTGTTCTTCGTGTGCATGTTA
AACCCCCTTTCTTTGGAGATCAACGCACAGGAGACTGAGATAGAGGCTGCTCAGTGGATG
CCGTGGGAGGAATACACAAAGCAACCATTCGTACAGAACCATGAGCTACTAAGATATATG
ACAGCCATTTGCTCTGCTAAAACCAAAGGAGACTACGAAGGCTTCACTCCTCTCCGTGTC
TCTGCACCTGATCAACAAGGCAACTTGTACTTCAACACCCGCGACCTCCGTTCCCGCCAT
TAACCCCTCTTTCTCACAACAAGCAAAGCAAGTCCCCTACAGTTTTCATCAAACCTGGTT
TCTTTGCTGCATCTCTATGTAAGCATTATGACACTTGAATCTGAAAACATTTGCATTCAA
TGTGATCCAAATCCAATAGTTTAAAC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL7442Contig1 679 2 2 U
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GAGAATCTGAGGAGAAAAGGAAGCCATGGACGAGCAAGAGTTTCGCAGCCGTCTCCAACT
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AGACTTAAAAGATCGGAAGACCAATCAAGATACGTTCTGGGATAAGCTGAAAGCGGCTGC
TGAGAAGAAGGTTGGTAAGGTTGAAGCAGGGAGATTTTGCAAGGCTTTCGAGAAACTTCA
CAAGAAACTTGTGTATTAAGAGCTGGATCCAGAAGCTGCAAAGCGATACTTATTAAACTC
TTAAAAAATTCATGTCTTCAGTTTTACTATATGCTTCCAAAGGTTTGTTTTGCGTAGAGA
TACTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTGCTTTTTAATTATCGCAATTAGGTATGAGTGGTCAA
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ATATTTAGTCGTGTTATTT


BQ
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AF RR4GO46TF U 1
AF RR4GO46JQ C 70
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BS 677 679 RR4GO46JQ

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ATATTTAGTCGTGTTA

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DS 

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CGTGTTATTT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

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TTATTGTATCTGCTTTAAAAATTGTGCTAATGCATAATTTAAATTAATTAACCGGTTTCT
TGTTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4FY67JQ C 1
AF RR4FY67TF U 1
BS 1 666 RR4FY67TF

RD RR4FY67JQ 666 0 0
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GTCAAGCCTTGTTGTTCACTCCTTAAGGGTTTGGTTGATCTTGAGGCTGCTGCTTGTCTC
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CTTCTTCTCAATGCTTGTGGCAGGAAGACCCCCCGTGGATTCATATGCGCTTGATTTACC
CATCAATGCTTAAATTGGAGAATATATATCCTCTCTTTTTAATATTCATCAATCATTATA
TCATTCTTTGAAATTTCCTATTTTCAGTTCTTAATCGAATAAATATTACTTCTATTTCTA
TTATTGTATCTGCTTTAAAAATTGTGCTAATGCATAATTTAAATTAATTAACCGGTTTCT
TGTTTC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4FY67TF 666 0 0
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ATCTTTGGAAAGATGGCTTCAAAAATCTCAGCCTCCCTTATAATTCTCCTCACATTCAAC
ATCCTATTTTTCACGCTAACTACTGCTTGTGGCGGTGGCTGCGATTCTATTCCCAAACCT
AAACCCAAGCCTACCCCAACTCCATCCTCCTCAGGAAGCTGCCCAAGAAAAACCCTCAAA
CTTGGCGTTTGTGCCAATGTACTCAAGGGTCTTCTCAAAATCGAATTGGGCACACCACCA
GTCAAGCCTTGTTGTTCACTCCTTAAGGGTTTGGTTGATCTTGAGGCTGCTGCTTGTCTC
TGTACTGCCTTAAAGGCAAATGTCCTAGGAGTTAAGCTTAATGTTCCTGTCTCTCTCAGT
CTTCTTCTCAATGCTTGTGGCAGGAAGACCCCCCGTGGATTCATATGCGCTTGATTTACC
CATCAATGCTTAAATTGGAGAATATATATCCTCTCTTTTTAATATTCATCAATCATTATA
TCATTCTTTGAAATTTCCTATTTTCAGTTCTTAATCGAATAAATATTACTTCTATTTCTA
TTATTGTATCTGCTTTAAAAATTGTGCTAATGCATAATTTAAATTAATTAACCGGTTTCT
TGTTTC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL7444Contig1 725 2 10 U
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GAAAGGGAAAGGGCTGATCATACGCGGGTGGGCTCCGCAGGTGCTTATACTTGACCACAA
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GGGGTTGCCTATGGTAACTTGGCCAATGGGAGCGGAGCAGTTCTACAACGAGAAGCTATT
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GTTGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 

AF RR4D421TF U 1
AF RR4CI36JQ C 32
BS 1 407 RR4D421TF
BS 408 408 RR4CI36JQ
BS 409 658 RR4D421TF
BS 659 659 RR4CI36JQ
BS 660 692 RR4D421TF
BS 693 693 RR4CI36JQ
BS 694 711 RR4D421TF
BS 712 712 RR4CI36JQ
BS 713 723 RR4D421TF
BS 724 725 RR4CI36JQ

RD RR4D421TF 723 0 0
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ACTGTTAGAGATCGCTGCTGGTCTTGAAGGCTCTGAACAAAACTTCATCTGGGTGGTTAG
GAAAAATGATAACAAAGGTGAAAATGAGGAGTGGTTGCCTGAAGGGTTTGAGGAAAGAAC
GAAAGGGAAAGGGCTGATCATACGCGGGTGGGCTCCGCAGGTGCTTATACTTGACCACAA
AGCGGTTGGAGGATTTGTGACGCATTGCGGATGGAACTCGGCTATTGAGGGCATTGCTGC
GGGGTTGCCTATGGTAACTTGGCCAATGGGAGCGGAGCAGTTCTACAACGAGAAGCTATT
GACAAAAGTGTTGAAAACAGGAGTAAATGTAGGAGCTACCGAGTTGGTGAAAAAAGGAAA
GTTGATTAGTAGAGAGGAAGTTGAGAAGGCAGTGAGAGAAGTGATAGTTGGGGAAGAAGC
AGAAGAAAGACGGGAACGGGCCAAGAAGCTAGGCGAGATGGCTAAAGCTGCTGTCGAGGA
AGGAGGATCTTCTTATAAGGATTTGAACAAGTTCATGGAAGAGGTTAATGGTAGAAAGAA
GTAGAAGACAGACAGAACATGTGTTATGGGGGTGAGTTCTTAACTTTGTTTGCTTTAG*T
ACTATCGTTGAGTTTGTTGAGATAAGTCTATATTGTACCTTGCATAATAAA*TTATAATT
GTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4CI36JQ 694 0 0
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TCTGAACAAAACTTCATCTGGGTGGTTAGGAAAAATGATAACAAAGGTGAAAATGAGGAG
TGGTTGCCTGAAGGGTTTGAGGAAAGAACGAAAGGGAAAGGGCTGATCATACGCGGGTGG
GCTCCGCAGGTGCTTATACTTGACCACAAAGCGGTTGGAGGATTTGTGACGCATTGCGGA
TGGAACTCGGCTATTGAGGGCATTGCTGCGGGGTTGCCTATGGTAACTTGGCCAATGGGA
GCGGAGCAGTTCTACAACGAGAAGCTATTGACAAAAGTGTTGAAAACAGGAGTGAATGTA
GGAGCTACCGAGTTGGCGAAAAAAGGAAAGTTGATTAGTAGAGAGGAAGTTGAGAAGGCA
GTGAGAGAAGTGATAGTTGGGGAAGAAGCAGAAGAAAGACGGGAACGGGCCAAGAAGCTA
GGCGAGATGGCTAAAGCTGCTGTCGAGGAAGGAGGATCTTCTTATAAGGATTTGAACAAG
TTCATGGAAGAGGTTAATGGTAGAAAGAAGTAGAAGACAGACAGAACATGTGTTATGGGG
*TGAGTTCTTAACTTTGTTTGCTTTAGGTACTATCGTTGAGTTTGTTGAGATAAGTCTAT
AGTGTACCTTGCATAATAAAATTATAATTGTTGG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7445Contig1 692 2 2 U
TTTTTTAATAACTGACGAACATGAAATTATAATGAATGAAAACCACAAAATACACATACA
CAGTTACAGACTTACATTAACTCAAAAAACTTCTCTCTCATCATTTAGGGTTCAAAGAAC
TACATCATACAATCTCTGTCTATCTAATGTTCCTTGAGGGGCAAGACTCCTCAACAAAAT
AGACCAAGTTCTACAATTCGGAACAAACCCTTCTTCAACACCTTCCTCCAAAAAAAAACA
AGCATCCTCAACAAAACCTCCTTTGCACAACCAACTCATCAAAGTGTTATACGTCACCGT
ATCAGGCGATATACCTTCATCCCGAAGCTTCTTAAACATCGCCACACCATCTCCGATCCT
CCCAGCCCTGCACAGACCGTTTATCAAACTGTTAAACGTCACAATGTCCGGCGTGGTCCC
TCTGTGAACCATCTCTCTCTGAAACTCAACCGCTTCTTCCACCTTCCCGTTTCTGCACAG
CCCGTTTATAAGTATGTTGCATGAAACATTGCTCGGCGCAACCCCGTCTCTCAACATCTT
CTCGAACAAGCTCCTCGCCTTATCAACCTCCCCAGCTCTGCACAGACCATCTATCAGACC
ATTATACGTTATCTCGTCAAGAGGGGATCCCTGGAAAACCATCTCATTGACCAGCTTACG
AGCTTCTTTGATCTCGCCTCTTCTGAGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F840TF C 1
AF RR4F840JQ U 7
BS 1 6 RR4F840TF
BS 7 692 RR4F840JQ

RD RR4F840TF 692 0 0
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CAGTTACAGACTTACATTAACTCAAAAAACTTCTCTCTCATCATTTAGGGTTCAGAGAAC
TACATCATACAATCTCTGTCTATCTAATGTTCCTTGAGGGGCAAGACTCCTCAACAAAAT
AGACCAAGTTCTACAATTCGGAACAAACCCTTCTTCAACACCTTCCTCCAGAAGAAAACA
AGCATCCTCAACAAAACCTCCTTTGCACAACCAACTCATCAGAGTGTTATACGTCACCGT
ATCAGGCGATATACCTTCATCCCGAAGCTTCTTAAACATCGCCACACCATCTCCGATCCT
CCCAGCCCTGCACAGACCGTTTATCAAACTGTTAAACGTCACAATGTCCGGCGTGGTCCC
TCTGTGAACCATCTCTCTCTGAAACTCAACCGCTTCTTCCACCTTCCCGTTTCTGCACAG
CCCGTTTATAAGTATGTTGCATGAGACATTGCTCGGCGCAACCCCGTCTCTCAACATCTT
CTCGAACAAGCTCCTCGCCTTATCAACCTCCCCAGCTCTGCACAGACCATCTATCAGACC
ATTATACGTTATCTCGTCAAGAGGGGATCCCTGGAAAACCATCTCATTGACCAGCTTACG
AGCTTCTTTGATCTCGCCTCTTCTGAGAAAGC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4F840JQ 686 0 0
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CAGACTTACATTAACTCAAAAAACTTCTCTCTCATCATTTAGGGTTCAAAGAACTACATC
ATACAATCTCTGTCTATCTAATGTTCCTTGAGGGGCAAGACTCCTCAACAAAATAGACCA
AGTTCTACAATTCGGAACAAACCCTTCTTCAACACCTTCCTCCAAAAAAAAACAAGCATC
CTCAACAAAACCTCCTTTGCACAACCAACTCATCAAAGTGTTATACGTCACCGTATCAGG
CGATATACCTTCATCCCGAAGCTTCTTAAACATCGCCACACCATCTCCGATCCTCCCAGC
CCTGCACAGACCGTTTATCAAACTGTTAAACGTCACAATGTCCGGCGTGGTCCCTCTGTG
AACCATCTCTCTCTGAAACTCAACCGCTTCTTCCACCTTCCCGTTTCTGCACAGCCCGTT
TATAAGTATGTTGCATGAAACATTGCTCGGCGCAACCCCGTCTCTCAACATCTTCTCGAA
CAAGCTCCTCGCCTTATCAACCTCCCCAGCTCTGCACAGACCATCTATCAGACCATTATA
CGTTATCTCGTCAAGAGGGGATCCCTGGAAAACCATCTCATTGACCAGCTTACGAGCTTC
TTTGATCTCGCCTCTTCTGAGAAAGC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL7446Contig1 558 2 2 U
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TAGAAGATAAGGAGGTAATAAATAGTAAATGGCTGATCAAAATCCAAGAATCATCGTCGA
GAAAAATCCATCTCAAGATCGTCTTGATGAACTGAAGATCAAGTCATGGCCCAAGTGGGG
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GGGTAAAGTTAAGGTTTACCCTAAATCATCATCATCATCAACAGCAGCATCATCGTCATT
GGATACAGGATTAGAGTGGTGTGTAGAGTTTGGAGCAGGTGATATCGTCACTTTTCCCAA
GGAATTTTCTTGTACTTTGGGATGTATCTCTTTCCGTTGACAAACATTACATATTTCCGC
CCCAATTAGTTCTTCACTTCTTTGTTTTGATTTGTTACCATTGTTGTATTTTATGTTCAT
TTTGTTTTGGGGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E525JQ C 1
AF RR4E525TF U 285
BS 1 284 RR4E525JQ
BS 285 558 RR4E525TF

RD RR4E525JQ 558 0 0
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GTGATTCTCATGTTTCTCCTCTCTCTTTTTTAATTTTATTGAAAATACCAAATATTTGAT
TAGAAGATAAGGAGGTAATAAATAGTAAATGGCTGATCAAAATCCAAGAATCATCGTCGA
GAAAAATCCATCTCAAGATCGTCTTGATGAACTGAAGATCAAGTCATGGCCCAAGTGGGG
ATGTTCACCAGGGAAGTACCATTTGAAATACGAAGCAGAAGAGATATGTTACATTGTGAA
GGGTAAAGTTAAGGTTTACCCTAAATCATCATCATCATCAACAGCAGCATCATCGTCATT
GGATACAGGATTAGAGTGGTGTGTAGAGTTTGGAGCAGGTGATATCGTCACTTTTCCCAA
GGAATTTTCTTGTACTT*GGGATGTATCTCTTTCCGTTGACAAACATTACATATT*CCGC
CCCAATTAGTTCTTCACTTCTTTGTTTTGATTTGTTACCATTGTTGTATTTTATGTTCAT
TTTGTTT*GGGGTTTTAC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4E525TF 274 0 0
TATGTTACATTGTGAAGGGTAAAGTTAAGGTTTACCCTAAATCATCATCATCATCAACAG
CAGCATCATCGTCATTGGATACAGGATTAGAGTGGTGTGTAGAGTTTGGAGCAGGTGATA
TCGTCACTTTTCCCAAGGAATTTTCTTGTACTTTGGGATGTATCTCTTTCCGTTGACAAA
CATTACATATTTCCGCCCCAATTAGTTCTTCACTTCTTTGTTTTGATTTGTTACCATTGT
TGTATTTTATGTTCATTTTGTTTTGGGGTTTTAC

QA 1 274 1 274
DS 



AS 1 2

CO CL7447Contig1 840 2 6 U
GGGCCGTCTATGTGTACTATCTTCCTAGCAGCAAGTCTTTGAAGCCATTCTCAGATTCAC
GACAGCAGTTCGGTAATAAAACCTCCCTCGAGCCAAGGTCGGAAAAAAATTGGAACTTAG
TTTTTTTTTGTGGAAGATAATAGGGAATCCTGTAATTCAAGTCCCCTCATCACTAATGCC
ATCGTCTTCAATGATGGCTCGCCCTCGAGTTTCTCCCAATGGGATTCCTTATCTCCCACC
CAAACCTAGAACCAGGCATTTAGTGGTCAGAGCTGCATCCAATTCACACGGTCAACCATC
GTCTGATGAAGAAGGGAAGAGTCCTCTCACCGTTGTTTTGGATGTCCCGAGGAATATCTG
GAGACAGACTTTGAAACCTCTGAGCGATTTTGGGTTTGGTAAGAGAAGTGTTTGGGAAGG
TGGGGTCGGTTTGTTTATCGTCTCTGGAGCTACGCTTCTTGCACTTACTTGGGCTTGGAT
GCGAGGTTTTCAAATGCGGTCCAAGTTCAGGAAGTATCAGACCGTCTTTGAGCTTAGTCA
AGCCTCTGGTATTTGCACGGGGACGCCGGTTAGGATCCGTGGTGTGACTGTCGGTACGGT
TATCCGTGTGAATCCTTCCTTGAAGAACATTGAAGCTGTTGCTGAGATTGAAGATGATAA
GATCATCATCCCTAAGAATTCACTGGTTGAGGTGAATCAGTCTGGTCTTCTGATGGAAAC
CATGATCGATATCACGCCGAGGAATCCTATACCGGAACCTTCTGTTGGGCCTCTGGATCC
GGATGTGGTAAAGAAGTCTGATTGTTTGTGATAGCAGAGATAAGGAGAGCAAGGGTGAGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4F615TF U 1
AF RR4FK57TF U 39
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QA 1 506 1 506
DS 

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GG
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GGAAAAAAATTGGAACTTAGTTTTTTTTTGTGGAAGATAATAGGGAATCCTGTAATTCAA
GTCCCCTCATCACTAATGCCATCGTCTTCAATGATGGCTCGCCCTCGAGTTTCTCCCAAT
GGGATTCCTTATCTCCCACCCAAACCTAGAACCAGGCATTTAGTGGTCAGAGCTGCATCC
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GATGTCCCGAGGAATATCTGGAGACAGACTTTGAAACCTCTGAGTGATTTTGGGTTTGGT
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GGTGTGACTGTCGGTACGGTTATCCGTGTGAATCCTTCCTTGAAGAACATTGAAGCTGTT
GCTGAGATTGAAGATGATAAGATCATCATCCCTAAGAATTCACTGGTTGAGGTGAATCAG
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QA 3 802 3 802
DS 



AS 1 2

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BQ
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CGAAGAAGGTGATGCACTTAGGTTTATGATGAACTTGGAGAACCCAAACGATGATGAAGA
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DS 



AS 1 2

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AATCAACATTCTTGTGGGAAGTTACATCAGTAACATGTTTGAAGACAGGCAAATCCTTTT
GACATCTGAGATCATCGTCTTTATCGGGATTCTCTTCAGTTTTAATCTGTTTGTTCCATA
CACGTTACCGCAATACGTGATCTCTGGTCTAGTAATGTTCGTCGCTGCTGAAGTACTCGA
AGGTGTGAACCTATCGTTGTTATCGAGGGTAATGTCATCGAGGCTATCAAAAGGAACTTA
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CATAACATTGGGAGGATACTTGGGAAGAAACCATCTCTTGAATGCAACTCTTCTACCATC
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ATATGTTTTTAAGAGATTTTGCTACCAAATTTTACAATATAGAATAAAAAAAGGGACAGT
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GAAGTTT


BQ
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AF RR4BB89JQ C 1
AF RR4BB89TF U 1
BS 1 667 RR4BB89TF

RD RR4BB89JQ 667 0 0
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GTGTGTGTATGATCCTCTCTTTATTTGATTATTTGTGATCATCTACTATGTGATGGTTTA
GAAGTTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BB89TF 667 0 0
GCTCAAATACGCCATGGAGATATTACTGTCGGAGTCTAGTGTGGTTACTTCATACTATTT
TGGCTGGACAACAAGCTCAGTTGCCATCTTTCTGGCCTGCCTTGGCCTCACGGTGCTACC
AATCAACATTCTTGTGGGAAGTTACATCAGTAACATGTTTGAAGACAGGCAAATCCTTTT
GACATCTGAGATCATCGTCTTTATCGGGATTCTCTTCAGTTTTAATCTGTTTGTTCCATA
CACGTTACCGCAATACGTGATCTCTGGTCTAGTAATGTTCGTCGCTGCTGAAGTACTCGA
AGGTGTGAACCTATCGTTGTTATCGAGGGTAATGTCATCGAGGCTATCAAAAGGAACTTA
CAACGGAGGATTGCTGTCGACGGAAGCTGGAACGTTGGCTAGGGTTGTGGCGGATGCAAC
CATAACATTGGGAGGATACTTGGGAAGAAACCATCTCTTGAATGCAACTCTTCTACCATC
ACTTGTCATCTGCGTTGGCTCCATTGTTGCTACTTGCTGTACTTATAACTCTCTCTATTG
ATATGTTTTTAAGAGATTTTGCTACCAAATTTTACAATATAGAATAAAAAAAGGGACAGT
GTGTGTGTATGATCCTCTCTTTATTTGATTATTTGTGATCATCTACTATGTGATGGTTTA
GAAGTTT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL7450Contig1 900 2 6 U
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CATCCTCCACTACTGTATATATCGTTGCTGGTGAAATCTATGGAAGCAAGAGTATGGATG
CTCTCCGTGCAGAGTACCCAAATGTCTTCTCTCATTCAACTCTTGCGACTGAAGAAGAGT
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AAAGCGATGTTTTTGTGTATACATACGATGGAAATATGGCTAAGGCAGTACAAGGGCACA
GAAGGTTTGAAGGGTTTAGAAAGTCGATAAATCCAGACAGGTTGAATTTTGTTAGACTGA
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TAAACAGATACAGGATTGGAGCGCCATATGCGAGACTGCCTGCTGCACTTCCTAGGCTAG
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GATCACAGCTATAGAGCATTTTTGGGGACTCTGCACGGTTATCTGAGCAGAACCAAACAT
AGACTTCATTAGGGTATCATGTTCTCACCACCCTCTCACATTGTTGTTATCAGTGAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AK29TF U 1
AF RR4AK29JQ C 255
BS 1 704 RR4AK29TF
BS 705 705 RR4AK29JQ
BS 706 831 RR4AK29TF
BS 832 832 RR4AK29JQ
BS 833 868 RR4AK29TF
BS 869 900 RR4AK29JQ

RD RR4AK29TF 878 0 0
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GATCACAGCTATAGAGCATTTTTGGGGACTCTGCACGGTTATCTGAGCAGA*CCAAACAT
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ACCTCTCACA

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR4AK29JQ 646 0 0
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GGGAATCCACAACCCGATTGCATCTGTACCAAGTTTCATTTTGGCAGCTTTGGAAAAAAA
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TATCATGTTCTCACCACCCTCTCACATTGTTGTTATCAGTGAACAC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7451Contig1 1011 2 2 U
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GACCTCAGAAAGCGTTGTTGCTCCTCAGAGCTTGACTATATTGCCTCGCTTAGCCGTTGT
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AAAGGCGCTCTACACGCTCGGTTTACGGCTACTTCTGCTAATGGCTCGGAAGATGTTCTG
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ATGGACTACTCGTTGCTGGTTGGAGTAGATGATGAGAGTCATGAGCTAGTGTGTGGGATA
ATAGACTACTTGAGGCAATACACATGGGACAAGCAGTTAGAGACGTGGGTGAAATCGTCT
TTGGTGGTTCCAAAGAATGTGCAGCCGACAGTGATCAGCCCTATTGATTACAAGACGAGG
TTCAGGAAATTCATGAAGACTCATTTTTTATGCGTCCCTGACCAATGGTGTGTTCAACCC
AAGGAGTGTGACTCTTGAAGAAGGGACAAAGCTTGAAAAAACATTAATAGCTATTATTAT
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TGATATTTGTAAATAGAGACAGGTTCAGTTGCTATTCACCCTGTTATTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC41TF U 1
AF RR4AC41JQ C 165
BS 1 772 RR4AC41TF
BS 773 1011 RR4AC41JQ

RD RR4AC41TF 773 0 0
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GACCTCAGAAAGCGTTGTTGCTCCTCAGAGCTTGACTATATTGCCTCGCTTAGCCGTTGT
AAGCCGTGGGATGCCAAGGGCGGGAAGAGCAAATCAGTGTTCGCTAAGACTTTGGATGAT
AGGTTCATTGTAAAAGAGATCAAGAAGACAGAGTACGAATCGTTTGAGACGTTTGCTCCG
GAATATTTCAAGTACATGAAGGATTCGTATGATCTAGGCAACCAGACTTGTCTTGCCAAA
GTTCTTGGGATCTATCAGGTAACTGTAAGGCAGCCGAAGAGCGGGAAAGAGACAAGGCAC
GACCTGATGGTAATGGAGAATCTCAGTTTTGGCAGAAACATTACTCGCCAATACGATCTC
AAAGGCGCTCTACACGCTCGGTTTACGGCTACTTCTGCTAATGGCTCGGAAGATGTTCTG
TTGGATCAGAACTTTGTCAACGACATGAACAAATCCCCGCTTTACGTTAGCAAAACATCA
AAGCAGAATCTTCAAAGAGCGGTTTACAACGACACAGCCTTCCTAACCAGTATAAACGTG
ATGGACTACTCGTTGCTGGTTGGAGTAGATGATGAGAGTCATGAGCTAGTGTGTGGGATA
ATAGACTACTTGAGGCAATACACATGGGACAAGCAGTTAGAGACGTGGGTGAAATCGTCT
TTGGTGGTTCCAAAGAATGTGCAGCCGACAGTGATCAGCCCTATTGATTACA
G

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4AC41JQ 847 0 0
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TGAGACGTTTGCTCCGGAATATTTCAAGTACATGAAGGATTCGTATGATCTAGGCAACCA
GACTTGTCTTGCCAAAGTTCTTGGGATCTATCAGGTAACTGTAAGGCAGCCGAAGAGCGG
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TCGCCAATACGATCTCAAAGGCGCTCTACACGCTCGGTTTACGGCTACTTCTGCTAATGG
CTCGGAAGATGTTCTGTTGGATCAGAACTTTGTCAACGACATGAACAAATCCCCGCTTTA
CGTTAGCAAAACATCAAAGCAGAATCTTCAAAGAGCGGTTTACAACGACACAGCCTTCCT
AACCAGTATAAACGTGATGGACTACTCGTTGCTGGTTGGAGTAGATGATGAGAGTCATGA
GCTAGTGTGTGGGATAATAGACTACTTGAGGCAATACACATGGGACAAGCAGTTAGAGAC
GTGGGTGAAATCGTCTTTGGTGGTTCCAAAGAATGTGCAGCCGACAGTGATCAGCCCTAT
TGATTACAAGACGAGGTTCAGGAAATTCATGAAGACTCATTTTTTATGCGTCCCTGACCA
ATGGTGTGTTCAACCCAAGGAGTGTGACTCTTGAAGAAGGGACAAAGCTTGAAAAAACAT
TAATAGCTATTATTATTTGATTATCATACTCAAAAAAAAAAAGAAAATCAAATCTCGTAT
TTATGATTCTTTCATTTGATATTTGTAAATAGAGACAGGTTCAGTTGCTATTCACCCTGT
TATTGTG

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 2

CO CL7452Contig1 745 2 8 U
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TCTTCCTCTTCGTCTTCACAATTATGGATCTCAGCCACTCTACTTCGGATTAATTAAGAA
GATATTTGTTTCCTGTTGTTGGATCTGAAACGGAAAATCAATCAATCAAACAAGGAAGGA
AGGGGAAGATGGGGTTCTTCAGCACAGTACTAGGGTTTTGCGGATTTGGGATAGGGATAT
CCATGGGGCTCGTCATCGGTTACTTCCTTTTCATCTACCTCCAGCCCAACGACGTCAAGG
ATCCAAAAATTGAACCGATAGCAGAGCAAGATCCCAAATCCATGCTCCGTATGTTCCCCG
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TCACTCTCGGCTCTCTCCCTCCCACTCTCCAAGGCATGAAAGTCTACCTCACCGACGAGA
AAGAGCTGATCATGGAGCCTTGCTTGAAATGGGCCGCTAACCCCAATGTCTTGGCTGCTA
TCAAGCTTTGGACTCAAGTTACTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG23TF U 1
AF RR4C240TF U 29
BS 1 236 RR4BG23TF
BS 237 237 RR4C240TF
BS 238 518 RR4BG23TF
BS 519 519 RR4C240TF
BS 520 714 RR4BG23TF
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BS 716 725 RR4BG23TF
BS 726 745 RR4C240TF

RD RR4BG23TF 736 0 0
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TCTTCCTCTTCGTCTTCACAATTATGGATCTCAGCCACTCTACTTCGGATTAATTAAGAA
GATATTTGTTTCCTGTTGTTGGATCTGAAACGGAAAATCAATCAATCAAACAAGGATGGA
AGGGGAAGATGGGGTTCTTCAGCACAGTACTAGGGTTTTGCGGATTTGGGATAGGGATAT
CCATGGGGCTCGTCATCGGTTACTTCCTTTTCATCTACCTCCAGCCCAACGACGTCAAGG
ATCCAAAAATTGAACCGATAGCAGAGCAAGATCCCAAATCCATGCTCCGTATGTTCCCCG
AGATCCCTCTCTGGGTCAAGAACCCCGACTTCGACCGTGTTGACTGGATAAACAAATTCC
TCGAGTACATGTGGCCTTACCTCGACAAGGCAATCTGCGAAACCGCACGCAACATAGCCA
AGCCCATCATCGAGGAGCAGATCCCCAAGTACAAGATCGACTCCGTCGATTTCGAAACCC
TCACTCTCGGCTCTCTCCCTCCCACTCTCCAAGGCATGAAAGTCTACCTCACCGACGAGA
AAGAGCTGATCATGGAGCCTTGCTTGAAATGGGCCGCTAACCCCAATGTCTTGGTTGCTA
TCAAG
GCTTTTGGACT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4C240TF 717 0 0
GGGG
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GAAAATCAATCAATCAAACAAGGAAGGAAGGGGAAGATGGGGTTCTTCAGCACAGTACTA
GGGTTTTGCGGATTTGGGATAGGGATATCCATGGGGCTCGTCATCGGTTACTTCCTTTTC
ATCTACCTCCAGCCCAACGACGTCAAGGATCCAAAAATTGAACCGATAGCAGAGCAAGAT
CCCAAATCCATGCTCCGTATGTTCCCCGAGATCCCTCTCTGGGTCAAGAACCCCGACTTC
GACCGTGTTGACTGGATAAACAAATTCCTCGAGTACATGTGGCCTTACCTCGACAAGGCA
ATCTGCAAAACCGCACGCAACATAGCCAAGCCCATCATCGAGGAGCAGATCCCCAAGTAC
AAGATCGACTCCGTCGATTTCGAAACCCTCACTCTCGGCTCTCTCCCTCCCACTCTCCAA
GGCATGAAAGTCTACCTCATCGACGAGAAGGAGCTGATCATGGAGCCTTGCTTGAA*TGG
GCCGCTAACCCCAATGTCTTGGCTGCTATCAAGCTTTGGACTCAAGTTACTGT

QA 5 717 5 717
DS 



AS 1 2

CO CL7453Contig1 572 2 1 U
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AAGATGAGATGAGAATCGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATGTTA
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AAATGAAACGATGCCATCCTTAAAAGTTACAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E278JQ C 1
AF RR4E278TF U 1
BS 1 572 RR4E278TF

RD RR4E278JQ 572 0 0
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TCAAGGAAGAGCTGTTGAACAGAATCCAAAACTTCATTCGATCAGCCGCTCTTTAAATTG
ATCCAAGATCATTTACTACGAAGATGATGGTGGTTTTTACTTGTAACCAACACTACTAAC
CAATGTATCATCTTTGCTGTTGTAGAATTAGCTTTTCCTGTCTCAACTCTTTTATGTACC
AAATGAAACGATGCCATCCTTAAAAGTTACAG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4E278TF 572 0 0
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TATTTCGTGATTTATCGATTATGAAACAACACTCGGTGAATCGGTCTCCAACGCCTGATG
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GTGGAGAGAAAGAGAATCTGATGGAGCTCGTGAGAGATAGATTGTTGGAGTCTGGTTGGA
AAGATGAGATGAGAATCGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATGTTA
CAGTCGATGAACTGATACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATGCTG
TCAAGGAAGAGCTGTTGAACAGAATCCAAAACTTCATTCGATCAGCCGCTCTTTAAATTG
ATCCAAGATCATTTACTACGAAGATGATGGTGGTTTTTACTTGTAACCAACACTACTAAC
CAATGTATCATCTTTGCTGTTGTAGAATTAGCTTTTCCTGTCTCAACTCTTTTATGTACC
AAATGAAACGATGCCATCCTTAAAAGTTACAG

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL7454Contig1 777 2 2 U
GGAGATAAACAATGGTTGGTGACTACAGAGATAACTATAGCAAGAGCTTCGACGATTCTT
CTTCTTCTGTAGGGGAAGAGACTACTTCTTCAATGTATTCTGCGGGAAAAGAAGATACGC
ACACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTTTGTATCTTAAATCAATGGAAGCCTCCTTCG
TTGATCAGCTCTACAACTCCCTCGGTTTGCTCGGTTCCAAAAACAACAAGGATACTGTCA
GACCATCATCGAGACGGTTCGTTAACGGTGGAAAACCTTCTGAAGAACAGTTCAAGGTTC
TTCGTGATGGTTTCTGGCAGAAGATGAACGTGAGACAACCTGAGTATCGTCTCAGTGGAA
GACACGGTCGTAGTTCTCACGAGTTTCTTAGGAGCCCATGGATCAAGCACTATAAGCCTT
CACCAAAGACCCTTGAAAATCAAGTTGTTAGCTCAAAGGGTATAGTCATATGCAGCTCTG
GTTTACGAGAAGGCTGCTCTCATTCACGTGACCGGGATCAAATCAGCGTGGGAGAAGAAG
AAGTATCTGACCAAAGCTTTGTCAATGAAGTAACAAAATGCCAAAACGGAAGCTCCAAGA
AGATGAAGATAGTGATGAGTGGATCGTCTAGTAATGATCAGGTGAATTTCTTCCACCAAT
TAGTTTTTTTTATCATGAATGTGTGTTGTGTTCCGAGTTTATTTTTCTAAAAGTATTATC
TTGTACCTTGACGTATAGGTTGTTCCACTCAGAAAAAATCATGCAAACATGATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F887TF U 1
AF RR4F887JQ C 62
BS 1 637 RR4F887TF
BS 638 777 RR4F887JQ

RD RR4F887TF 637 0 0
GGAGATAAACAATGGTTGGTGACTACAGAGATAACTATAGCAAGAGCTTCGACGATTCTT
CTTCTTCTGTAGGGGAAGAGACTACTTCTTCAATGTATTCTGCGGGAAAAGAAGATACGC
ACACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTTTGTATCTTAAATCAATGGAAGCCTCCTTCG
TTGATCAGCTCTACAACTCCCTCGGTTTGCTCGGTTCCAAAAACAACAAGGATACTGTCA
GACCATCATCGAGACGGTTCGTTAACGGTGGAAAACCTTCTGAAGAACAGTTCAAGGTTC
TTCGTGATGGTTTCTGGCAGAAGATGAACGTGAGACAACCTGAGTATCGTCTCAGTGGAA
GACACGGTCGTAGTTCTCACGAGTTTCTTAGGAGCCCATGGATCAAGCACTATAAGCCTT
CACCAAAGACCCTTGAAAATCAAGTTGTTAGCTCAAAGGGTATAGTCATATGCAGCTCTG
GTTTACGAGAAGGCTGCTCTCATTCACGTGACCGGGATCAAATCAGCGTGGGAGAAGAAG
AAGTATCTGACCAAAGCTTTGTCAATGAAGTAACAAAATGCCAAAACGGAAGCTCCAAGA
AGATGAAGATAGTGATGAGTGGATCGTCTAGTAATGA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4F887JQ 716 0 0
TTCTTCTGTAGGGGAAGAGACTACTTCTTCAATGTATTCTGCGGGAAAAGAAGATACGCA
CACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTTTGTATCTTAAATCAATGGAAGCCTCCTTCGT
TGATCAGCTCTACAACTCCCTCGGTTTGCTCGGTTCCAAAAACAACAAGGATACTGTCAG
ACCATCATCGAGACGGTTCGTTAACGGTGGAAAACCTTCTGAAGAACAGTTCAAGGTTCT
TCGTGATGGTTTCTGGCAGAAGATGAACGTGAGACAACCTGAGTATCGTCTCAGTGGAAG
ACACGGTCGTAGTTCTCACGAGTTTCTTAGGAGCCCATGGATCAAGCACTATAAGCCTTC
ACCAAAGACCCTTGAAAATCAAGTTGTTAGCTCAAAGGGTATAGTCATATGCAGCTCTGG
TTTACGAGAAGGCTGCTCTCATTCACGTGACCGGGATCAAATCAGCGTGGGAGAAGAAGA
AGTATCTGACCAAAGCTTTGTCAATGAAGTAACAAAATGCCAAAACGGAAGCTCCAAGAA
GATGAAGATAGTGATGAGTGGATCGTCTAGTAATGATCAGGTGAATTTCTTCCACCAATT
AGTTTTTTTTATCATGAATGTGTGTTGTGTTCCGAGTTTATTTTTCTAAAAGTATTATCT
TGTACCTTGACGTATAGGTTGTTCCACTCAGAAAAAATCATGCAAACATGATCACC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7455Contig1 847 2 12 U
ACTTAATAATTCACTTCATTTCTTCGCCAAAAAAGTTCCAAATATTCAGAGTCGATATTG
TGTTACAGACGGAGAAGATACTGAAGAAAAGAAACCCTACACAAATGGCCGATCAAACCC
ACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTACTATAGTAACTAAAGAAATTTACCACAACA
TAACGCATGGTAAAATGGTAATTACATTCATACGAGATGCACATATTTCAAACCTTTCTT
TATCCAAGGGGGAAATTATCACCATCCTGTCCTTTCTCCTTTCTTTTTTACTTGTTCCCC
CTAAAGTAGAGGTAAATTTTCTGAAGAACCCATAGACTCAAAAGTGACTCCAAGCAGAAA
AGACCAAAGCCGATAAAGTAAAAGATCCCGGCTAATAAACTGTCTGAAATGACATCAATT
GCTGCAAACACACCCGTTAATGATTTTCCCTGGAAAAAAATCGGAGGGGCAATGGCGGCA
ACGATGCAAAAGCCAATGTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAACCAAACTTCAAAGCA
CTGTCAGTCCTCATGGCTCGGTAGAGAGGCCTGTACCATACAACATAAGAGAGTGGACAT
CCCATCAACGCATATATTGTGGCAAGGAAAAAGATCTTTACTCCTCCGCCTTTGATCCAG
CAGACCATGGTTGCAATCACATTGAATACCAGACACAAAACAATACCCAACCAACTAGCG
AAAGCCAGATACTGCAGCTTTTGTGCATGGACTGGTATCTCATTAGCAATGTCATGGTGA
ATGATTGGAAAAACGGCGGCCAGTTTTTATCATGTATCTGAACGCCAGATTAGCATAGCA
TCCTCTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C619JQ U 1
AF RR4CS08JQ U 5
BS 1 340 RR4C619JQ
BS 341 341 RR4CS08JQ
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BS 591 663 RR4C619JQ
BS 664 847 RR4CS08JQ

RD RR4C619JQ 663 0 0
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TGTTACAGACGGAGAAGATACTGAAGAAAAGAAACCCTACACAAATGGCCGATCAAACCC
ACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTACTATAGTAACTAAAGAAATTTACCACAACA
TAACGCATGGTAAAATGGTAATTACATTCATACGAGATGCACATATTTCAAACCTTTCTT
TATCCAAGGGGGAAATTATCACCATCCTGTCCTTTCTCCTTTCTTTTTTACTTGTTCCCC
CTAAAGTAGAGGTAAATTTTCTGAAGAACCCATAGACTCAGAAGTGACTCCAAGCAGAAA
AGACCAAAGCCGATAAAGTAAAAGATCCCGGCTAATAAACTGTCTGAGATGACATCAATT
GCTGCAAGTACACCCGTTAATGATTTTCCCTGGAAAAAAATCGGAGGGGCAATGGCGGCA
ACGATGCAGAAGCCAATGTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAACCAAACTTCAAAGCA
CTGTCAGTCCTCATGGCTCGGTAGAGAGGCCTGTACCATACAACATAAGGGAGTGGACAT
CCCATCAACGCATATATTGTGGCAAGGAAAAAGATCTTTACTCCTCCGCCTTTGATCCAG
CAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4CS08JQ 843 0 0
AATAATTCACTTCATTTCTTCGCCAAAAAAGTTCCAAATATTCAGAGTCGATATTGTGTT
ACAGACGGAGAAGATACTGAAGAAAAGAAACCCTACACAAATGGCCGATCAAACCCACAC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTACTATAGTAACTAAAGAAATTTACCACAACATAAC
GCATGGTAAAATGGTAATTACATTCATACGAGATGCACATATTTCAAACCTTTTTTTATC
CAAGGGGGAAATTATCACCATCCTGTCCTTTCTCCTTTCTTTTTTACTTGTTCCCCCTAA
AGTAGAGGTAAATTTTCTGAAGAACCCATAGACTCAAAAGTGACTCCAAGCAGAAAAGAC
CAAAGCCGATAAAGTAGAAGATCCCGGCTAATAAACTGTCTGAAATGACATCAATTGCTG
CAAACACACCCGTTAATGATTTTCCCTGGAAAAAAATCGGAGGGGCAATGGCGGCAACGA
TGCAAAAGCCAATGTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAACCAAACTTCAAAGCACTGT
CAGTCCTCATGGCTCGGTAGAGAGGCCTGTACCATACAACATAAGAGAGTGGACATCCCA
TCAACGCATATATTGTGGCAAGGAAAAAGATCTTTACTCCTCCGCCTTTGATCCAGCAGA
CCATGGTTGCAATCACATTGAATACCAGACACAAAACAATACCCAACCAACTAGCGAAAG
CCAGATACTGCAGCTTTTGTGCATGGACTGGTATCTCATTAGCAATGTCATGGTGAATGA
TTGGAAAAACGGCGGCCAGTTTTTATCATGTATCTGAACGCCAGATTAGCATAGCATCCT
CTC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7458Contig1 772 2 1 U
GCGGAAGCACGTGACCAGATTTGCAGATATTTGTTTTTTTTTTCCTAAAAAAAAGAAGTT
TATAGCACGTTCTTATCCAGACTTTATATGCAAGTAGTTCTATAGCTTGACTTCCATCAA
CTGACCAAAGCAAGAATCTTTACGCAGAGAGGATCATATGGATAATCGCAGCTTAGATCT
CTGCCTATCTCCATTGTCCTCTTCACTTCGATCTTGTTACCGAGATTCCAAGGCTAGTCA
ATCTTTAGCCACAAGAACTAAGAAGAACAATGCATTCTATAATGGGGAAGTACGGGAATA
CGATCTTGTAGAGACCCAGATAAGGAGGGTCATAGAGATGGCGAGGAGTAAGGAGCATGA
CATAACGGCGTTGGAGTTAGCACCGGTTAGACTGGAATCGCCGTTAGTGTTCTCGGTGAA
GAGATCTGTGGAGAGGTTTTTGGAGAAGAGAAAGAGAAGAAGCAAATGTGTTACGCCTTA
CAGTTACACTTGCAGCTCCACGTCCTCTTCCTCATCTTCGCATCATCATTTCTAAAACCC
TATTTATATTTAGTTTACGTTTTTTTCTTGATTTTTCCGTATACTCGACGATGAACTTCG
AGTCTTTTTTTTTCTTTTTCCCATCTTGTTTCTTAAATCAAGATGTTGCATCTGTATAAA
ACTCGGATCATTTGGATCGCTTGTGTTAGTTTTTCTTCTCTCTCTCATCATCTACTTTGT
ATTTCTCATATATATAGCAAATTTAGCAAAATAAGAAAATGCACACTTTAAC


BQ
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AF RR4AO18JQ C 1
AF RR4AO18TF U 1
BS 1 772 RR4AO18TF

RD RR4AO18JQ 772 0 0
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QA 1 772 1 772
DS 

RD RR4AO18TF 772 0 0
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CTGACCAAAGCAAGAATCTTTACGCAGAGAGGATCATATGGATAATCGCAGCTTAGATCT
CTGCCTATCTCCATTGTCCTCTTCACTTCGATCTTGTTACCGAGATTCCAAGGCTAGTCA
ATCTTTAGCCACAAGAACTAAGAAGAACAATGCATTCTATAATGGGGAAGTACGGGAATA
CGATCTTGTAGAGACCCAGATAAGGAGGGTCATAGAGATGGCGAGGAGTAAGGAGCATGA
CATAACGGCGTTGGAGTTAGCACCGGTTAGACTGGAATCGCCGTTAGTGTTCTCGGTGAA
GAGATCTGTGGAGAGGTTTTTGGAGAAGAGAAAGAGAAGAAGCAAATGTGTTACGCCTTA
CAGTTACACTTGCAGCTCCACGTCCTCTTCCTCATCTTCGCATCATCATTTCTAAAACCC
TATTTATATTTAGTTTACGTTTTTTTCTTGATTTTTCCGTATACTCGACGATGAACTTCG
AGTCTTTTTTTTTCTTTTTCCCATCTTGTTTCTTAAATCAAGATGTTGCATCTGTATAAA
ACTCGGATCATTTGGATCGCTTGTGTTAGTTTTTCTTCTCTCTCTCATCATCTACTTTGT
ATTTCTCATATATATAGCAAATTTAGCAAAATAAGAAAATGCACACTTTAAC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7460Contig1 958 2 10 U
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TACAGAGCCTCTCCAACTCCTGATCGTTCTCCTTATCGCTTGAGTGATAGGAGTGACCGT
GACAGATTTCGAAGTCACAGAAGGTACTCTCCAAGACGGTTCAGAAGCCCATTAAGAGTA
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CCATCCCCTGCTAGCCGCAGCCCAAGTCCTTCAGGGTCGAGATCAAGATCATATTCAAAA
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TCTTCATCCTCAGCTGATAGCTCAGGTGGGCATAAGCCATTAGTAGCCTATGATTAGCGA
CCCACGTGTCCTTTTGTTCTATTACTCAAGAGAGTGAAGAGACTAAGCACTAAGCAGTTC
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CAGCCTTTGTTATAAGTTCACGTTGATGTTTGCCGACATTCTTTTAATTTTTTTTTGGTT
TTTCGACCGTAACTTTTAAACTTAACAATTTGGACCTTAATCACACAATATAACTAGG


BQ
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AF RR4CN88TF U 1
AF RR4CN88JQ C 214
BS 1 685 RR4CN88TF
BS 686 686 RR4CN88JQ
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BS 809 839 RR4CN88TF
BS 840 958 RR4CN88JQ

RD RR4CN88TF 839 0 0
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CCTGATGGACGCATAAGGAGAGGAAGAGGATTTAGCCAGAGATACTCTTACGCTCGTAGA
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CCCACGTGTCCTTTTGTTCTAT*ACTCAAGAGAGTGAAGAGACTAAGCACTAAGCAGTTC
TAGTAAA*CGTCTGGATTGTCTGTCTT*GTCTTTGTAGTCGTGTCTTCTACTTGACTCT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4CN88JQ 745 0 0
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TCTGTATCGCCTAGTCCACGTCATTGCCGGCGTTACAGCCGCAGCCCTATCCGTAGCCGT
TCCCCACCGTATAGGAAGAGAAGGTCACCATCCCCTGCTAGCCGCAGCCCAAGTCCTTCA
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AAGCCATTAGTAGCCTATGATTAGCGACCCACGTGTCCTTTTGTTCTATTACTCAAGAGA
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CGACATTCTTTTAATTTTTTTTTGGTTTTTCGACCGTAACTTTTAAACTTAACAATTTGG
ACCTTAATCACACAATATAACTAGG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL7461Contig1 859 2 2 U
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TCTTTGTTGATGCTTAGGTTCATCTCCGAGCTCTCTCATCTTGTCTCTCATCTCATCTCG
CAAGCTCTCCCAAGCTTCGTCTCTCAAGCTCTCCCTAGCTCTCCTAAGCTTCGTCTCTCA
CTCTCTCGTTAAAGTCCTCCTCTTGTTGATGATACAGTTCACTACGTTTTGGGTTTCTTT
GTTGTCTTGTGTTGTCTTTACTTTAGGTTGTCTTTGATTTGGTCTCTGTTCCTTTTATCA
TTTAGGATATGTAATGCATTAAATGGGTTTGTGTCTGATGTTGATGTTTTACTGATGCTT
ATTCTGACTGTATTTTGCAGACTCTCTGAGCTCATCTCATCTCAACCAAACCCATCTCTT
CCTTTTGTAAGCACGGCTGTGTCTGTGTGTCTCAAGCTCTATTCTCCAAACCACTTGCCG
AGCTCAGACTGCCATGCAGAAACAGGGTGATTTCAAGCTTCCTCAGTTCTTCAACTATCC
TCCATACTTTCTCGGAATTATCTGATAAATGATCAGATCAGCAACTGAGTTAAATACAGC
ATGATAGGACAATTCTAATGAAGGCCTTGAAACTGCTAAGGAACAAGGGCAAGCTTGCAT
TGTTCAAAGGAACATCGGCTGATGATGAAGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGTTACTCT
CTGTATAAACGTTTTGGAAGTGTGAAATATCAGATAAACAACTTTTTTAAATAATAACAT
TCTTTTCTAGTCACACTTTTGAGTTCTGTAAAATGAGAATGATTCTCTTTATATGAAAGA
ATCACTAGATATCCACAAG


BQ
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AF RR4DZ41TF U 1
AF RR4DZ41JQ C 176
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BS 619 859 RR4DZ41JQ

RD RR4DZ41TF 618 0 0
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GTTGTCTTGTGTTGTCTTTACTTTAGGTTGTCTTTGATTTGGTCTCTGTTCCTTTTATCA
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ATTCTGACTGTATTTTGCAGACTCTCTGAGCTCATCTCATCTCAACCAAACCCATCTCTT
CCTTTTGTAAGCACGGCTGTGTCTGTGTGTCTCAAGCTCTATTCTCCAAACCACTTGCCG
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ATGATAGGACAATTCTAA

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DS 

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TCTTTGTTGTCTTGTGTTGTCTTTACTTTAGGTTGTCTTTGATTTGGTCTCTGTTCCTTT
TATCATTTAGGATATGTAATGCATTAAATGGGTTTGTGTCTGATGTTGATGTTTTACTGA
TGCTTATTCTGACTGTATTTTGCAGACTCTCTGAGCTCATCTCATCTCAACCAAACCCAT
CTCTTCCTTTTGTAAGCACGGCTGTGTCTGTGTGTCTCAAGCTCTATTCTCCAAACCACT
TGCCGAGCTCAGACTGCCATGCAGAAACAGGGTGATTTCAAGCTTCCTCAGTTCTTCAAC
TATCCTCCATACTTTCTCGGAATTATCTGATAAATGATCAGATCAGCAACTGAGTTAAAT
ACAGCATGATAGGACAATTCTAATGAAGGCCTTGAAACTGCTAAGGAACAAGGGCAAGCT
TGCATTGTTCAAAGGAACATCGGCTGATGATGAAGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGTT
ACTCTCTGTATAAACGTTTTGGAAGTGTGAAATATCAGATAAACAACTTTTTTAAATAAT
AACATTCTTTTCTAGTCACACTTTTGAGTTCTGTAAAATGAGAATGATTCTCTTTATATG
AAAGAATCACTAGATATCCACAAG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BR04JQ U 12
AF RR4GH12JQ U 1
BS 1 216 RR4GH12JQ
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RD RR4BR04JQ 563 0 0
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TCTTATAATTATATCAGGTTTAACCAGAAAATAAACACGATGGATCAAAATGTAACCACA
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DS 

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ATGTAACCACAGATAAACTAAACATCCAGTTCAGAGAAACTCTTTGCCTTTTCACTTCTC
TGTATGGATTCTGTTTGTCTTGAGAACATCGTGAAATACAGCAGGTTTCTTGGTAACTGG
AGCCAGCTCCTCAACAGCAGCAGCTAGAGAAAGAACTGTAGCTTCAGCCCAAGGTCTTCC
CATTATTTGTAATCCTATTGGCATCCCTTCTTTATCATACCCAACAGGGACAGATATGGC
AGGGAAGCCAAGGAGATTTGCAGCTACAACAAACCGCATTAGATAAGCTGCCACTTGAAA
ATTGGTTTCTCCATTTTCCACA**CTCAAGTGGTATCACAGGAGCTGTCATACCACATGT
AGGAGTCACAATAACATCAACGTTTTTGAAAATATCCAAGTGATACTCCATCAACCTTCG
CCTAAGACACTGAGCAGCAATATAGTCTGAAGCAGAGAATGACTTGAAGATCGCAAAGCT
GGTGCGTGTATCATAAGATAACTTTGAGTTTTTCCCAGCTTCACAGTAAGGAGTAAGAGA
ACACAAAGTTGCAGACCCAATCGACACAACATGAGCTGCACGCATCTCTTCCAG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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TATGCCAGCTCGAAGGACAGGTTCAAAAGAGAATTGGATGGAATTCAAGTGGAGTTACAA
GCCACGGACCCGAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGCCGAGCTCCCTAGATTCAT
TTATGTCTGATTCTTATAATATATCCATTCATAAATGATACATCATCATCATTTAAATTA
AAAAGCTGATCTCCATGAAATTTCGTAACTTTCTTGCATGGTTTCATTCATTCTTGTTCA
TCTTAAATATTTCCTTTCTTTTCTTTTACATTTTACATGACATGTGTTTAATACATTGGC
TTTGGAGAGCTCAAACCATGTAGGTTTTGTGTATAGTTGCATACTTTTGTTGTAAA


BQ
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AF RR4BX18TF U 9
AF RR4G551TF U 1
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BS 591 776 RR4G551TF

RD RR4BX18TF 712 0 0
GG
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GAAAACAAAACAAAAAGTCCCATCTCTCTTGCCTCCATCAACCAAACGCAATGGCGAACG
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TGGGAAGTCCTGAGGAAAACTACGACGATTTCTCCAATTCCCTACCTGCCAACGAGTGTC
GCTATGCTGTCTTTGACTTTGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCT
TCTTCATAGCATGGTCACCAGATTCATCGAGGGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCT
CGAAGGACAGGTTCAAAAGAGAATTGGATGGAATTCAAGTGGAGTTACAAGCCACGGACC
CGAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGCCGAGCTCCCTAGATTCATTTATGTCTGA
TTCTTATAATATATCCATTCATAAATGATACATCATCATCATTTAAATTAAAAAGCTGAT
CTCCATGAAATTTTGTAACTTTCTTGCATGGTTTCATTCATTCTTGTTCATCTTAAATAT
TTCCTTTCTTTTCTTTTACATTT**CATGACATGTGTTTAATACATTGGC

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR4G551TF 776 0 0
GGATTGGCCTATTCAAATCAAACTATAGAATCTGTGCTCCCACAAACGAGGACAAAAAAC
AAAAACAAAA*AAAACAAAACAAAAAGTCCCATCTCTCTTGCCTCCATCAACCAAACGCA
ATGGCGAACGCGGCGTCGGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAATCTCAAGTTTTTGGAG
CTAAAATCGAAAAGAAACTATAGGTTCATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGTG
GTGGAAAAGCTGGGAAGTCCTGAGGAAAACTACGACGATTTCTCCAATTCCCTACCTGCC
AACGAGTGTCGCTATGCTGTCTTTGACTTTGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAAG
AGCAAGATCTTCTTCATAGCATGGTCACCAGATTCATCGAGGGTGAGGATGAAGATGGTG
TATGCCAGCTCGAAGGACAGGTTCAAAAGAGAATTGGATGGAATTCAAGTGGAGTTACAA
GCCACGGACCCGAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGCCGAGCTCTCTAGATTCAT
TTATGTCTGATTCTTATAATATATCCATTCATAAATGATACGTCATC***ATTTAAATTA
AAAAGCTGATCTCCATGAAATTTCGTAACTTTCTTGCATGGTTTCATTCATTCTTGTTCA
TCTTAAATATTTCCTTTCTTTTCTTTTACATTTTACATGACATGTGTTTAATACATTGGC
TTTGGAGAGCTCAAACCATGTAGGTTTTGTGTATAGTTGCATACTTTTGTTGTAAA

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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AGAAGGTGTTTCTGGTGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGT
TCCGACCGGAGAAGATCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAGGCCAAGAAACC
CTAAGGTCAAGCCTGTTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTA
GATTTCAGGAACCTGGGAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCTAAGAAGAGTTC
TGAGGAACATCTTCACAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCT
TTGGAGGAAACCCTAACCCTAACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGAATGGTTTTCAAAAG
AGGACCTCGATTTCTATGTCTCCAAATTCGAGAAGGCATGATTTACCGGTGGACTGAACT
ACTACAGAGCCATGGATCTGACATGGGAACTCACTACACTATGGACCGGGGCAAAGATTC
AAGTTCCGGTGAAGTTCATGACCGGCGATTTGGACATGGTCTACACCACGCCGGGGGTTA
AAGAGTACATTCACGGTGGTGGGTTTGCTGCAGATGTTCCAGATCTTCTAGAGGTAGTTG
TGATTGAAGATGCTGGTCACTTTGTCAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGTCACTGCTCACA
TCAATGACTTCTTTATCAAGCTTCAGGACAAGTACAAAAGCTTTTAGGGTTCTTGGTGAA
GTCTGTATTTCATTGACTCTCAAATAACAATCCGTTCTTGCAAGTGTTTTGTACTTCGAA
CAGATTATGAATAAGACTTCGATATTATTAAAGCCT


BQ
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AF RR4BG11TF U 1
AF RR4BG11JQ C 86
BS 1 742 RR4BG11TF
BS 743 876 RR4BG11JQ

RD RR4BG11TF 742 0 0
GGTGTCTTCACCTCGTTGGTGACCTCGTGGCTCTTCTTTACAGTGTTGCTGGAGATCAAG
AGAAGGTGTTTCTGGTGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGT
TCCGACCGGAGAAGATCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAGGCCAAGAAACC
CTAAGGTCAAGCCTGTTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTA
GATTTCAGGAACCTGGGAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCTAAGAAGAGTTC
TGAGGAACATCTTCACAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCT
TTGGAGGAAACCCTAACCCTAACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGAATGGTTTTCAAAAG
AGGACCTCGATTTCTATGTCTCCAAATTCGAGAAGGCATGATTTACCGGTGGACTGAACT
ACTACAGAGCCATGGATCTGACATGGGAACTCACTACACTATGGACCGGGGCAAAGATTC
AAGTTCCGGTGAAGTTCATGACCGGCGATTTGGACATGGTCTACACCACGCCGGGGGTTA
AAGAGTACATTCACGGTGGTGGGTTTGCTGCAGATGTTCCAGATCTTCTAGAGGTAGTTG
TGATTGAAGATGCTGGTCACTTTGTCAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGTCACTGCTCACA
TCAATGACTTCTTTATCAAGCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4BG11JQ 791 0 0
CTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGTTCCGACCGGAGAAGATCAAGGGCTT
TGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAGGCCAAGAAACCCTAAGGTCAAGCCTGTTGAAGGTTT
TAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTAGATTTCAGGAACCTGGGAAGGCTGA
AAGAGAGATTGCATGTGCGGATCTAAGAAGAGTTCTGAGGAACATCTTCACAGGGAGGGA
ACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCTTTGGAGGAAACCCTAACCCTAACTG
CGAACAAGTTGAACTTCCTGAATGGTTTTCAAAAGAGGACCTCGATTTCTATGTCTCCAA
ATTCGAGAAGGCATGATTTACCGGTGGACTGAACTACTACAGAGCCATGGATCTGACATG
GGAACTCACTACACTATGGACCGGGGCAAAGATTCAAGTTCCGGTGAAGTTCATGACCGG
CGATTTGGACATGGTCTACACCACGCCGGGGGTTAAAGAGTACATTCACGGTGGTGGGTT
TGCTGCAGATGTTCCAGATCTTCTAGAGGTAGTTGTGATTGAAGATGCTGGTCACTTTGT
CAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGTCACTGCTCACATCAATGACTTCTTTATCAAGCTTCA
GGACAAGTACAAAAGCTTTTAGGGTTCTTGGTGAAGTCTGTATTTCATTGACTCTCAAAT
AACAATCCGTTCTTGCAAGTGTTTTGTACTTCGAACAGATTATGAATAAGACTTCGATAT
TATTAAAGCCT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7466Contig1 687 2 2 U
GGTGGCTGAGCGGAAAAAGAGAGTTACCGACGCAGATATAATAGCTTTGGTTTCTGATGA
GGTTTTCCAGCCAGAAGCTCTGTGGAAACTCCTGGACATTCAGATAACTTGTGGAACTCT
GGGACTCTCAACAGCAACTGTTAAACTTGCTGATGCTGCTGGCAAAGAGCATGCCGCCTG
CTCTATGGGAGCTGGGCCTGTCGATTCAGCTTATAAGGCAATCGATCTTATTGTCAAGGA
ACCAGCGACTCTGCTTGAGTACTCAATGAATGCAGTAACAGAAGGCATCGATGCCATTGC
AACCACAAGAGTTCTTATCCGAGGAAACAACATTTACTCAACTACAAACGCACTCACTGG
TGAAGAAGTTCAAAGAACCTTTAGTGGAACTGGAGCAGGAATGGACATTTGTGGTGTCAA
GCGTCAAAGCTTATGTTGGAGCTTTGAACAAAATGCTCGATTTCAAGGATAACTCGACAA
CAAAAGTTCCTTCTCAAAACAACAATGTACCTGCCTGAATCAAAATCGATTCTGAGTCAG
ACCAGAGTTAAGTCTTTTCTGGTATACATAGTTTGGTAATAATAACGAGAGTTCAAGTTT
GCATATTGTTTTCTAATGAAGTATGTTGCCGAAAGAGTTTGTTTACTGTAAAATATCTAT
ATAACTTCAATCTCTATATTTAGAAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AV65TF U 1
AF RR4AV65JQ C 1
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BS 492 687 RR4AV65JQ

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ACCAGCGACTCTGCTTGAGTACTCAATGAATGCAGTAACAGAAGGCATCGATGCCATTGC
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GCGTCAAAGCTTATGTTGGAGCTTTGAACAAAATGCTCGATTTCAAGGATAACTCGACAA
CAAAAGTTCCT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR4AV65JQ 687 0 0
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GGGACTCTCAACAGCAACTGTTAAACTTGCTGATGCTGCTGGCAAAGAGCATGCCGCCTG
CTCTATGGGAGCTGGGCCTGTCGATTCAGCTTATAAGGCAATCGATCTTATTGTCAAGGA
ACCAGCGACTCTGCTTGAGTACTCAATGAATGCAGTAACAGAAGGCATCGATGCCATTGC
AACCACAAGAGTTCTTATCCGAGGAAACAACATTTACTCAACTACAAACGCACTCACTGG
TGAAGAAGTTCAAAGAACCTTTAGTGGAACTGGAGCAGGAATGGACATT*GTGGTGTCAA
GCGTCAAAGCTTATGTTGGAGCTTTGAACAAAATGCTCGATTTCAAGGATAACTCGACAA
CAAAAGTTCCTTCTCAAAACAACAATGTACCTGCCTGAATCAAAATCGATTCTGAGTCAG
ACCAGAGTTAAGTCTTTTCTGGTATACATAGTTTGGTAATAATAACGAGAGTTCAAGTTT
GCATATTGTTTTCTAATGAAGTATGTTGCCGAAAGAGTTTGTTTACTGTAAAATATCTAT
ATAACTTCAATCTCTATATTTAGAAAT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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ATTTTGGTTCGAGACATTTGGTCATTTTTTAAATCTTTCCTTACCGATTTCCACGAAATA
AAATAGCCTTTATG


BQ
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AF RR4DF83JQ C 1
AF RR4DF83TF U 1
BS 1 554 RR4DF83TF

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AAATAGCCTTTATG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4DF83TF 554 0 0
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ACGACTTTAAGACTCCGGTGTGGCGGGTCTCGTGGTCCTTGACGGGTAACTTGTTGGCTG
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CTGAATAAAAGACTCTTTTTATCCTTTTCTCAGGCCGATTTGGTGGATGTGGTTTACTTA
ATTTTGGTTCGAGACATTTGGTCATTTTTTAAATCTTTCCTTACCGATTTCCACGAAATA
AAATAGCCTTTATG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL7468Contig1 901 2 2 U
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GAGAAGATGAATCCTAACAACCGAGACGCGCACCATTTCCTCATCAGCTTGTACGCTGGA
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CTTGATAACGCAGTGAAGAAGTGCAAAGGGCCTTTTTCGAAGTCGAGACAGCTTCTGATG
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TTTTTCCTTGGCTTTGAGAAAGCTAAAGATGTGGATGGAGTAGAGGAGTTGTGCAGGATC
TTGTCCAAGTGGAGACCTCTCGACTCCGAAACTGTGAGTTTTCTGATAAAGACTTACGCA
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AGCGAGGAGATACAAGACTTGCTTGAAACGGTTTGTCCTTAGAAATTAAACCTGCATTAG
TTTGGTGGATACTACTCTAGTGTTATGTCTCTTTTATTTATGAGTCTAAGCTTCTTGTCA
AACAATAGATTGTGTTTTGTTTTGTTTAACCAAATCCAATAACGGACCTAATCCGTTTCC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4DJ30TF U 1
AF RR4DJ30JQ C 135
BS 1 680 RR4DJ30TF
BS 681 901 RR4DJ30JQ

RD RR4DJ30TF 683 0 0
GGGATCTACACTAAAGCTGGTCTTCACGAGAAGGCGGAGTCGGCTCTGAGAACCATGGAG
GAGAAGATGAATCCTAACAACCGAGACGCGCACCATTTCCTCATCAGCTTGTACGCTGGA
ATCTCGAAGCCTTCCGAGGTTGAACGGGTTTGGGAGTCGCTGAAGAAGGCTCGTCCTGAA
GTCAACAACATGAGCTACCTCGTCATGTTGCAAGCTCTGAGTAAGCTCGGGGACGTAGAC
GGGGTTAAGAAGGTCTTCGCAGAGTGGGAATCGAGATGCTACGCTTACGATACGAGGCTG
GCGAATATCGCAATCAACGCGTACTTGAAAAGAGATATGTATCAAGAAGCAGAAGCGATT
CTTGATAACGCAGTGAAGAAGTGCAAAGGGCCTTTTTCGAAGTCGAGACAGCTTCTGATG
GTTCATCTGTTGGAGAAGGGTGAAGGTGATTTGGCGATGAAGCATTTGGAAGCAGCGGCT
TGTGATCTGGAAGAGAAGAGAGACGACGAGTGGACCTGGAGCTCGGAGCTAGTGAGCTTG
TTTTTCCTTGGCTTTGAGAAAGCTAAAGATGTGGATGGAGTAGAGGAGTTGTGCAGGATC
TTGTCCAAGTGGAGACCTCTCGACTCCGAAACTGTGAGTTTTCTGATAAAGACTTACGCA
GCAGCTGGGAAGACTTGTCC
AGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4DJ30JQ 767 0 0
CGAGGTTGAACGGGTTTGGGAGTCGCTGAAGAAGGCTCGTCCTGAAGTCAACAACATGAG
CTACCTCGTCATGTTGCAAGCTCTGAGTAAGCTCGGGGACGTAGACGGGGTTAAGAAGGT
CTTCGCAGAGTGGGAATCGAGATGCTACGCTTACGATACGAGGCTGGCGAATATCGCAAT
CAACGCGTACTTGAAAAGAGATATGTATCAAGAAGCAGAAGCGATTCTTGATAACGCAGT
GAAGAAGTGCAAAGGGCCTTTTTCGAAGTCGAGACAGCTTCTGATGGTTCATCTGTTGGA
GAAGGGTGAAGGTGATTTGGCGATGAAGCATTTGGAAGCAGCGGCTTGTGATCTGGAAGA
GAAGAGAGACGACGAGTGGACCTGGAGCTCGGAGCTAGTGAGCTTGTTTTTCCTTGGCTT
TGAGAAAGCTAAAGATGTGGATGGAGTAGAGGAGTTGTGCAGGATCTTGTCCAAGTGGAG
ACCTCTCGACTCCGAAACTGTGAGTTTTCTGATAAAGACTTACGCAGCAGCTGGGAAGAC
TTGTCCGGATATGCGCGAGAGATTGTTCCGACAGCAGATTGAAGTGAGCGAGGAGATACA
AGACTTGCTTGAAACGGTTTGTCCTTAGAAATTAAACCTGCATTAGTTTGGTGGATACTA
CTCTAGTGTTATGTCTCTTTTATTTATGAGTCTAAGCTTCTTGTCAAACAATAGATTGTG
TTTTGTTTTGTTTAACCAAATCCAATAACGGACCTAATCCGTTTCCT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7469Contig1 937 2 2 U
GGACACTGTGTGTCGCACACCTAACCAGAGACTTCAGCTCATGGCTTCATCTGATCAAAC
GGCGAAGATAATCGGTGGGAAGGCGATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGA
AGTTCGCGATCTATCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTTGG
GGCACGGAAAGATTCACAGACATATGTGACTATGAAGAGGAAAGCGTGTGCTGAGGTTGG
GATCAAATCATTTGATGTGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAA
AGTTCATCTACTCAATTCAGATCCTGATGTTCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCC
GAAACATATTAATGAGGAGAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGG
CTTCCATCCTCTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCC
ATGCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCA
ACGAGCTGTTGTAGTAGGTCGGAGCAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTACTGCT
CAAGGCTGATGCTACTGTTACCACCGTACATTCCCACACCAATGCAGTGAGCGACCCGAG
CAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGC
AGGGTTCGTAACTCCGGTCCCTGGTGGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAG
GAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCATTGGCCAGTAAGATATCTATCCTACTGTATG
TTATAAATGAATCTCAAGTTTATCCATTATATAATTAAGCTCTCCCTTTCATAACACAAT
TATTCCTCTAAAATAAATTGAAGTTTACCTGTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FZ53TF U 1
AF RR4FZ53JQ C 174
BS 1 663 RR4FZ53TF
BS 664 937 RR4FZ53JQ

RD RR4FZ53TF 666 0 0
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GGCGAAGATAATCGGTGGGAAGGCGATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGA
AGTTCGCGATCTATCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTTGG
GGCACGGAAAGATTCACAGACATATGTGACTATGAAGAGGAAAGCGTGTGCTGAGGTTGG
GATCAAATCATTTGATGTGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAA
AGTTCATCTACTCAATTCAGATCCTGATGTTCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCC
GAAACATATTAATGAGGAGAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGG
CTTCCATCCTCTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCC
ATGCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCA
ACGAGCTGTTGTAGTAGGTCGGAGCAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTACTGCT
CAAGGCTGATGCTACTGTTACCACCGTACATTCCCACACCAATGCAGTGAGCGACCCGAG
CAG
AAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FZ53JQ 764 0 0
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AGGTTGGGATCAAATCATTTGATGTGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTA
TAACCAAAGTTCATCTACTCAATTCAGATCCTGATGTTCATGGTATATTAGTTCAACTCC
CATTGCCGAAACATATTAATGAGGAGAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATG
TAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCT
TCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAA
AAGGGCAACGAGCTGTTGTAGTAGGTCGGAGCAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTC
TACTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACCACCGTACATTCCCACACCAATGCAGTGAGCG
ACCCGAGCAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTA
AAGTTGCAGGGTTCGTAACTCCGGTCCCTGGTGGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGC
TGCTGAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCATTGGCCAGTAAGATATCTATCCTA
CTGTATGTTATAAATGAATCTCAAGTTTATCCATTATATAATTAAGCTCTCCCTTTCATA
ACACAATTATTCCTCTAAAATAAATTGAAGTTTACCTGTCCTTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7470Contig1 1002 2 2 U
GGACGTCATCGGCAACGTGCACCCTCTCCCTTTCTCGCTCTCCGTTTCTCTCGGTTTCGG
AAAAAGAAAAAACAGTTATCGTCGTCGAGTCTCCTCCGTCTTCTGGTCAACGATGAATAT
CTTTAGATTCGCCGGCGATATGACTCACTTGATGAGTATCTTAATCCTTCTCCTCAAAAT
CTACGCCACGAAATCCTGCGCTGGAATCTCTCTGAAGACGCAGGAGCTATATGCGCTTGT
GTTCTTGACTCGGTACCTGGATCTGTTCACGGATTACGTCTCTCTCTACAACAGCGTGAT
GAAGGTCGTCTTCGTTGCTAGCTCGCTGGCTATCGTTTGGTGTATGCGTAGGCATCCACT
TGTGCGGAAGTCGTACGATAAGGACCTTGATACGTTTCGTCATCAGTACGTTGTGTTGGC
ATGTTTCGTGTTGGGGCTTCTCCTGCATGAGAGTTTCACATTTCAAGAGGTGTTATGGGC
CTTTTCTATATACTTGGAGGCAGTTGCTATCCTTCCTCAGTTGGTTCTGCTACAAAGAAG
TGGGAATGTGGACAATTTGACTGGACAATATGTTATCTTTCTCGGGGCGTATCGTGGATT
ATATATCATCAACTGGATCTATCGCTATTTCACAGAAGATCATTTCACTAGATGGATCGC
TTGTGTATCCGGTCTTGTCCAAACTGCTCTCTATGCTGATTTCTTCTTCTACTACTACTT
GAGCTGGAAAACTAATACTAAACTGAAGCTTCCGGCTTGAGCAGAACCAGACAAATTTTG
CATGAGTGTTAGAAAAACAAGAGACATGGTTAGTATTTGGTTTCTCCCTGTTGTTTCAAT
CTAACAAGAGTTGAACGATGCAGAACTGTTGTGTATCACATTGTAACTTTCCCGAGTATG
AATTTCACGTAGAGATTGAAATCAAATCTATTCGTTTTAGTGTTGTTCAAAACTGTAGCT
CAGATTACAAGAGCAAAAGTACAACAGCAATGTTTTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF12TF U 1
AF RR4AF12JQ C 225
BS 1 770 RR4AF12TF
BS 771 1002 RR4AF12JQ

RD RR4AF12TF 770 0 0
GGACGTCATCGGCAACGTGCACCCTCTCCCTTTCTCGCTCTCCGTTTCTCTCGGTTTCGG
AAAAAGAAAAAACAGTTATCGTCGTCGAGTCTCCTCCGTCTTCTGGTCAACGATGAATAT
CTTTAGATTCGCCGGCGATATGACTCACTTGATGAGTATCTTAATCCTTCTCCTCAAAAT
CTACGCCACGAAATCCTGCGCTGGAATCTCTCTGAAGACGCAGGAGCTATATGCGCTTGT
GTTCTTGACTCGGTACCTGGATCTGTTCACGGATTACGTCTCTCTCTACAACAGCGTGAT
GAAGGTCGTCTTCGTTGCTAGCTCGCTGGCTATCGTTTGGTGTATGCGTAGGCATCCACT
TGTGCGGAAGTCGTACGATAAGGACCTTGATACGTTTCGTCATCAGTACGTTGTGTTGGC
ATGTTTCGTGTTGGGGCTTCTCCTGCATGAGAGTTTCACATTTCAAGAGGTGTTATGGGC
CTTTTCTATATACTTGGAGGCAGTTGCTATCCTTCCTCAGTTGGTTCTGCTACAAAGAAG
TGGGAATGTGGACAATTTGACTGGACAATATGTTATCTTTCTCGGGGCGTATCGTGGATT
ATATATCATCAACTGGATCTATCGCTATTTCACAGAAGATCATTTCACTAGATGGATCGC
TTGTGTATCCGGTCTTGTCCAAACTGCTCTCTATGCTGATTTCTTCTTCTACTACTACTT
GAGCTGGAAAACTAATACTAAACTGAAGCTTCCGGCTTGAGCAGAACCAG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4AF12JQ 778 0 0
AGCTATATGCGCTTGTGTTCTTGACTCGGTACCTGGATCTGTTCACGGATTACGTCTCTC
TCTACAACAGCGTGATGAAGGTCGTCTTCGTTGCTAGCTCGCTGGCTATCGTTTGGTGTA
TGCGTAGGCATCCACTTGTGCGGAAGTCGTACGATAAGGACCTTGATACGTTTCGTCATC
AGTACGTTGTGTTGGCATGTTTCGTGTTGGGGCTTCTCCTGCATGAGAGTTTCACATTTC
AAGAGGTGTTATGGGCCTTTTCTATATACTTGGAGGCAGTTGCTATCCTTCCTCAGTTGG
TTCTGCTACAAAGAAGTGGGAATGTGGACAATTTGACTGGACAATATGTTATCTTTCTCG
GGGCGTATCGTGGATTATATATCATCAACTGGATCTATCGCTATTTCACAGAAGATCATT
TCACTAGATGGATCGCTTGTGTATCCGGTCTTGTCCAAACTGCTCTCTATGCTGATTTCT
TCTTCTACTACTACTTGAGCTGGAAAACTAATACTAAACTGAAGCTTCCGGCTTGAGCAG
AACCAGACAAATTTTGCATGAGTGTTAGAAAAACAAGAGACATGGTTAGTATTTGGTTTC
TCCCTGTTGTTTCAATCTAACAAGAGTTGAACGATGCAGAACTGTTGTGTATCACATTGT
AACTTTCCCGAGTATGAATTTCACGTAGAGATTGAAATCAAATCTATTCGTTTTAGTGTT
GTTCAAAACTGTAGCTCAGATTACAAGAGCAAAAGTACAACAGCAATGTTTTTTCCCC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL7471Contig1 816 2 2 U
GAAATATACAATAAACTATAGCTAGAGAAGTCATAGCAGCACGTCAGAATCGAAGAAGAC
GAGCCGAAGTGTTCTTCTCGATCATCTCTCTCAAAAAAAAACCCGAACTCTGATCGATCC
AACTCACCAGCGCGAGTTAATGGCCAACGGTAATCTACCGAGAAGAATCATAAAGGAAAC
TCAACGTCTGCTCAGTGAACCGGCTCCCGGTATAAGTGCATCGCCATCTGAGGATAACAT
GAGGTACTTCAACGTTATGGTTCTTGGTCCTTCACAATCACCTTATGAAGGAGGGGTTTT
TAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCCATATCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCT
CACCAAGATATACCATCCTAACATTGATAAGCTTGGAAGAATCTGTCTTGATATTCTGAA
AGACAAATGGAGCCCTGCTCTCCAAATACGAACAGTGCTCCTAAGTATCCAAGCCCTTCT
AAGCGCACCAAACCCTGATGATCCATTGTCTGAGAACATCGCTAAGCATTGGAAAACTAA
TGAGGCCGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAATGGACCCGTCTTTACGCAAGCGGGGCATG
ATGGATTGGAGAGTGAAAAGAAGATCTCATTCATCCAAAATAACATCAAAGTATGTTATA
AAAGGCTTATATTTTGCTGGTTGTCCTCCCCTCAGAATGGTAAAAAATGTGTGTTTCGGC
ACATGGAGTTGTAATCTCTCTCAAAATATTGTATCATTACCAGTAGGGTTAAGACTCGTT
TACCTATAGTTGAAACTTTGCCAAGCTTTGAACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX92TF U 1
AF RR4DX92JQ C 15
BS 1 622 RR4DX92TF
BS 623 816 RR4DX92JQ

RD RR4DX92TF 622 0 0
GAAATATACAATAAACTATAGCTAGAGAAGTCATAGCAGCACGTCAGAATCGAAGAAGAC
GAGCCGAAGTGTTCTTCTCGATCATCTCTCTCAAAAAAAAACCCGAACTCTGATCGATCC
AACTCACCAGCGCGAGTTAATGGCCAACGGTAATCTACCGAGAAGAATCATAAAGGAAAC
TCAACGTCTGCTCAGTGAACCGGCTCCCGGTATAAGTGCATCGCCATCTGAGGATAACAT
GAGGTACTTCAACGTTATGGTTCTTGGTCCTTCACAATCACCTTATGAAGGAGGGGTTTT
TAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCCATATCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCT
CACCAAGATATACCATCCTAACATTGATAAGCTTGGAAGAATCTGTCTTGATATTCTGAA
AGACAAATGGAGCCCTGCTCTCCAAATACGAACAGTGCTCCTAAGTATCCAAGCCCTTCT
AAGCGCACCAAACCCTGATGATCCATTGTCTGAGAACATCGCTAAGCATTGGAAAACTAA
TGAGGCCGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAATGGACCCGTCTTTACGCAAGCGGGGCATG
ATGGATTGGAGAGTGAAAAGAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4DX92JQ 802 0 0
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TTCTCGATCATCTCTCTCAAAAAAAA*CCCGAACTCTGATCGATCCAACTCACCAGCGCG
AGTTAATGGCCAACGGTAATCTACCGAGAAGAATCATAAAGGAAACTCAACGTCTGCTCA
GTGAACCGGCTCCCGGTATAAGTGCATCGCCATCTGAGGATAACATGAGGTACTTCAACG
TTATGGTTCTTGGTCCTTCACAATCACCTTATGAAGGAGGGGTTTTTAAGTTGGAGCTCT
TTTTGCCTGAAGAATACCCCATATCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACC
ATCCTAACATTGATAAGCTTGGAAGAATCTGTCTTGATATTCTGAAAGACAAATGGAGCC
CTGCTCTCCAAATACGAACAGTGCTCCTAAGTATCCAAGCCCTTCTAAGCGCACCAAACC
CTGATGATCCATTGTCTGAGAACATCGCTAAGCATTGGAAAACTAATGAGGCCGAAGCTG
TGGAGACAGCTAAGGAATGGACCCGTCTTTACGCAAGCGGGGCATGATGGATTGGAGAGT
GAAAAGAAGATCTCATTCATCCAAAATAACATCAAAGTATGTTATAAAAGGCTTATATTT
TGCTGGTTGTCCTCCCCTCAGAATGGTAAAAAATGTGTGTTTCGGCACATGGAGTTGTAA
TCTCTCTCAAAATATTGTATCATTACCAGTAGGGTTAAGACTCGTTTACCTATAGTTGAA
ACTTTGCCAAGCTTTGAACCCT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7472Contig1 813 2 3 U
GGCCCAACCAACCCCTCCACCACAAAACCAGAGAATATCGAGAAGAAGATCACTTGAAAC
TCCTGTCTTTCGACCCAAACTTCCTACCATGGGAAACGCACCAAGCAACCTTAAGCCCCA
GGTTATGGATCTAAGTGGTCCAGAGGCTTTTAGTGATACTGCGTCTTCGAGAAGACACAG
CTTAGATCTCCATGAGCTAATGAAATCTTCTATTCCGTCGTGGTCGAGGCAAACTCTCGA
CACAAAAGAAGAGGATAGAGAATTTAAGTCAGGGGAGTGGATAGATAAGCACACAGAGTT
GAATCAAGATGATAACTTACTTTCTCCGGATAAATTCTACCCACTACAACAATCGCTAAA
CGGTGGGAAACAAGATTTCGAAGTGCAGAGTATTACAGATAACGAATCTGATGGCGTAGC
TAGCGACTGCTCAGATTCTGATCTGATGTGGCGACTGAACGTTCAAGTGAATGTGCCTAG
AGTTTCTAATAAACAAAGTTCAGCAAACCCCAAACCAAAGAAAGTTAAGCCAAAAACTAC
CAAAGTCTCAGAAACCAGAAGTTTAATTCCATCGCTGATACCAGCACCAAGCAAGAGACC
TCCTAACACCGTGAGTTCGCAGCCGCAACGACCAACCAGAGATGGAAGACGCAGACTGAG
TTTAGGCAAGTGAACATGTTTTCACCAGTTTTTTTTTTGTAAAGAGTTAAATCAAGGAGA
CAACAACAAAAAAAATATTTTTTTTTGTATATTGTGAGCAAACTCTTTCTGTTTGTTCAA
AAGACATAATCTCAAATATGCTGTGTTGAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B738TF U 1
AF RR4B738JQ C 37
BS 1 795 RR4B738TF
BS 796 796 RR4B738JQ
BS 797 813 RR4B738TF

RD RR4B738TF 813 0 0
GGCCCAACCAACCCCTCCACCACAAAACCAGAGAATATCGAGAAGAAGATCACTTGAAAC
TCCTGTCTTTCGACCCAAACTTCCTACCATGGGAAACGCACCAAGCAACCTTAAGCCCCA
GGTTATGGATCTAAGTGGTCCAGAGGCTTTTAGTGATACTGCGTCTTCGAGAAGACACAG
CTTAGATCTCCATGAGCTAATGAAATCTTCTATTCCGTCGTGGTCGAGGCAAACTCTCGA
CACAAAAGAAGAGGATAGAGAATTTAAGTCAGGGGAGTGGATAGATAAGCACACAGAGTT
GAATCAAGATGATAACTTACTTTCTCCGGATAAATTCTACCCACTACAACAATCGCTAAA
CGGTGGGAAACAAGATTTCGAAGTGCAGAGTATTACAGATAACGAATCTGATGGCGTAGC
TAGCGACTGCTCAGATTCTGATCTGATGTGGCGACTGAACGTTCAAGTGAATGTGCCTAG
AGTTTCTAATAAACAAAGTTCAGCAAACCCCAAACCAAAGAAAGTTAAGCCAAAAACTAC
CAAAGTCTCAGAAACCAGAAGTTTAATTCCATCGCTGATACCAGCACCAAGCAAGAGACC
TCCTAACACCGTGAGTTCGCAGCCGCAACGACCAACCAGAGATGGAAGACGCAGACTGAG
TTTAGGCAAGTGAACATGTTTTCACCAGTTTTTTTTTTGTAAAGAGTTAAATCAAGGAGA
CAACAACAAAAAAAATATTTTTTTTTGTATATTGTGAGCAAACTCTTTCTGTTTGTTCAA
AAGACATAATCTCAA*TATGCTGTGTTGAGTGT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4B738JQ 777 0 0
ATCGAGAAGAAGATCACTTGAAACTCCTGTCTTTCGACCCAAACTTCCTACCATGGGAAA
CGCACCAAGCAACCTTAAGCCCCAGGTTATGGATCTAAGTGGTCCAGAGGCTTTTAGTGA
TACTGCGTCTTCGAGAAGACACAGCTTAGATCTCCATGAGCTAATGAAATCTTCTATTCC
GTCGTGGTCGAGGCAAACTCTCGACACAAAAGAAGAGGATAGAGAATTTAAGTCAGGGGA
GTGGATAGATAAGCACACAGAGTTGAATCAAGATGATAACTTACTTTCTCCGGATAAATT
CTACCCACTACAACAATCGCTAAACGGTGGGAAACAAGATTTCGAAGTGCAGAGTATTAC
AGATAACGAATCTGATGGCGTAGCTAGCGACTGCTCAGATTCTGATCTGATGTGGCGACT
GAACGTTCAAGTGAATGTGCCTAGAGTTTCTAATAAACAAAGTTCAGCAAACCCCAAACC
AAAGAAAGTTAAGCCAAAAACTACCAAAGTCTCAGAAACCAGAAGTTTAATTCCATCGCT
GATACCAGCACCAAGCAAGAGACCTCCTAACACCGTGAGTTCGCAGCCGCAACGACCAAC
CAGAGATGGAAGACGCAGACTGAGTTTAGGCAAGTGAACATGTTTTCACCAGTTTTTTTT
TTGTAAAGAGTTAAATCAAGGAGACAACAACAAAAAAAATATTTTTTTTTGTATATTGTG
AGCAAACTCTTTCTGTTTGTTCAAAAGACATAATCTCAAATATGCTGTGTTGAGTGT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL7473Contig1 427 2 8 U
GGACCATCACAATAATGCGGAGACCAGTTCCCCGTAAGGACAGCGCCGAGGCGGATAGGT
TATTTCCGTGGCTGTTACCCAGCAGACGTTTTATATCTACTAGCCTTACGAGACGTCCCA
ATATTGTGGTGACCAAGAAGAAAAAAAGAATCTCCAAGCATAAGTCAAGATCATCTGGAA
AACATGTTAATGTTCTGCTCAAGAAGACAAAAGACATCACCCAAATCCCCCACCTGAGTG
AGCAAGAAGAAAAAGAAAGTGAGCAAGAAGAAAAATAAGATGTTGTTTTAGCTTAAAAAA
AAACTTGCTTTTGCTATCCTTTATCAGGACTCGAAAACCTTGTTTTTATGTTATATGTGT
GGTTTTGAGAAATCTTTGTCATGATGATATGGTAATGTGGTGATAATATAACTACTTTTT
TCAACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ET55TF U 1
AF RR4ET55JQ C 1
BS 1 26 RR4ET55TF
BS 27 27 RR4ET55JQ
BS 28 60 RR4ET55TF
BS 61 61 RR4ET55JQ
BS 62 258 RR4ET55TF
BS 259 259 RR4ET55JQ
BS 260 275 RR4ET55TF
BS 276 427 RR4ET55JQ

RD RR4ET55TF 275 0 0
GGACCATCACAATAATGCGGAGACCA*TTCCCCGTAAGGACAGCGCCGAGGCGGATAGGT
*ATTTCCGTGGCTGTTACCCAGCAGACGTTTTATATCTACTAGCCTTACGAGACGTCCCA
ATATTGTGGTGACCAAGAAGAAAAAAAGAATCTCCAAGCATAAGTCAAGATCATCTGGAA
AACATGTTAATGTTCTGCTCAAGAAGACAAAAGACATCACCCAAATCCCCCACCTGAGTG
AGCAAGAAGAAAAAGAAA*TGAGCAAGAAGAAAAA

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR4ET55JQ 427 0 0
GGACCATCACAATAATGCGGAGACCAGTTCCCCGTAAGGACAGCGCCGAGGCGGATAGGT
TATTTCCGTGGCTGTTACCCAGCAGACGTTTTATATTTACTAGCCTTACGAGACGTCCCA
ATATTGTGGTGACCAAGAAGAAAAAAAGAATCTCCAAGCATAAGTCAAGATCATCTGGAA
AACATGTTAATGTTTTGCTCAAGAAGACAAAAGACATCACCCAAATCCCCCACCTGAGTG
AGCAAGAAGAAAAAGAAAGTGAGCAAGAAGAAAAATAAGATGTTGTTTTAGCTTAAAAAA
AAACTTGCTTTTGCTATCCTTTATCAGGACTCGAAAACCTTGTTTTTATGTTATATGTGT
GGTTTTGAGAAATCTTTGTCATGATGATATGGTAATGTGGTGATAATATAACTACTTTTT
TCAACAC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 2

CO CL7474Contig1 662 2 2 U
GAATCCGCAGCTATGAAGCTGCAGCAGTATTATGTCACGATCAGAGAGGATATGAAGAGA
AGTGCACATGAAACAGGAGAGGCTGCCCCAATACCTATCACAGTCAGACAACTCGAAGCT
ATTGTCAGACTGAGTGAGTCGCTTGCAAAAATGAGACTGTCACACGACGCCACAGAAGAT
GATGTAGAAAAAGCTTATAAACTTTTCAAAACCGCAACAATGGATGCAGCAAAGTCAGGG
ATAAATCAACAGATTAACATAACAAGCGAGATGGCGAAGGAGATAAAGCAAGCGGAAACA
CAGATCAAGAGAAGAATGGGGATCGGGGCAAGGTTATCAGAGAGAAGACTTATTGAGGAT
TTGGCTAGAATGGGAATGAACGAGTCAATGGTGAGGAGAGCTCTGTTGATAATGCATCAG
AGAGGTGAAGTTGAGTACCAGCGAGAGAGACGTTCCATTGTCCGCAAAGCTTGATCTCTC
TTCTTCGCTCACAGTCTCTCTTCTTTAGTTTCAGGATATTCAAAAAGACATATTTAGTAT
TGTTACTTTAATCGGAACGAACAGAAACTTGCGTATGTGTTTTTGTTGAAGACCCTTCCT
TAAACTTTTATGCCCTCTTGAAACTATTATTTTCTCATCCAATGTTTTCTTGTCTTGCAA
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR4GP65JQ C 1
AF RR4GP65TF U 95
BS 1 94 RR4GP65JQ
BS 95 662 RR4GP65TF

RD RR4GP65JQ 662 0 0
GAATCCGCAGCTATGAAGCTGCAGCAGTATTATGTCACGATCAGAGAGGATATGAAGAGA
AGTGCACATGAAACAGGAGAGGCTGCCCCAATACCTATCACAGTCAGACAACTCGAAGCT
ATTGTCAGACTGAGTGAGTCGCTTGCAAAAATGAGACTGTCACACGACGCCACAGAAGAT
GATGTAGAAAAAGCTTATAAACTTTTCAAAACCGCAACAATGGATGCAGCAAAGTCAGGG
ATAAATCAACAGATTAACATAACAAGCGAGATGGCGAAGGAGATAAAGCAAGCGGAAACA
CAGATCAAGAGAAGAATGGGGATCGGGGCAAGGTTATCAGAGAGAAGACTTATTGAGGAT
TTGGCTAGAATGGGAATGAACGAGTCAATGGTGAGGAGAGCTCTGTTGATAATGCATCAG
AGAGGTGAAGTTGAGTACCAGCGAGAGAGACGTTCCATTGTCCGCAAAGCTTGATCTCTC
TTCTTCGCTCACAGTCTCTCTTCTTTAGTTTCAGGATATTCAAAAAGACATATTTAGTAT
TGTTACTTTAATCGGAACGAACAGAAACTTGCGTATGTGTTTTTGTTGAAGACCCTTCCT
TAAACTTTTATGCCCTCTTGAAACTATTATTTTCTCATCCAATGTTTTCTTGTCTTGCAA
TT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4GP65TF 568 0 0
CTATCACAGTCAGACAACTCGAAGCTATTGTCAGACTGAGTGAGTCGCTTGCAAAAATGA
GACTGTCACACGACGCCACAGAAGATGATGTAGAAAAAGCTTATAAACTTTTCAAAACCG
CAACAATGGATGCAGCAAAGTCAGGGATAAATCAACAGATTAACATAACAAGCGAGATGG
CGAAGGAGATAAAGCAAGCGGAAACACAGATCAAGAGAAGAATGGGGATCGGGGCAAGGT
TATCAGAGAGAAGACTTATTGAGGATTTGGCTAGAATGGGAATGAACGAGTCAATGGTGA
GGAGAGCTCTGTTGATAATGCATCAGAGAGGTGAAGTTGAGTACCAGCGAGAGAGACGTT
CCATTGTCCGCAAAGCTTGATCTCTCTTCTTCGCTCACAGTCTCTCTTCTTTAGTTTCAG
GATATTCAAAAAGACATATTTAGTATTGTTACTTTAATCGGAACGAACAGAAACTTGCGT
ATGTGTTTTTGTTGAAGACCCTTCCTTAAACTTTTATGCCCTCTTGAAACTATTATTTTC
TCATCCAATGTTTTCTTGTCTTGCAATT

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL7475Contig1 669 2 9 U
GGGTACATCTGATCTCAAGTAGCTTCAAGTGGTTGGTCTTCTCGTCCCGATCGAGTTTCT
TTGGTTCTCAGAAAAGTCTTACCTTTTTCTTCTACCTTAAAAGAGATGGGGACTTACCTG
AGTTCTCCCAAAACTGAAAAGATATCAGAAGAAGGTGAAAATGATACGCTTAGATATGGT
TCGTCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGATGCGCATGCTGCAATTCTTGAT
CTGGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTGTACGATGGTCATGGAGGCAAAGTTGTAGCA
AAGTTCTGTGCAAAGTATCTACACCAGCAGGTTCTCAGTAACCAAGCATATGGAGCTGGA
GACGTTGAAACATCTCTTCAAAGAGCATTCTTTAGAATGGATGACATGATGCAAGGACAG
AGAGGATGGCGAGAGTTAGCTGCGCTCGGCGACAAGATGAATAAGTTTAGCGGCATGATT
GAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGTGGTGACGTCAATAACCAGCCTGATAATTGG
CCTCTTGAGGATGGTCCTCACTCGGATTTCGCCGGACCTACTTGCGGGTGCACAGCGTGT
GTAGCTCTTATTAAAGATAAGAAGCTCTTTGTTGCAAATGCTGGTGACTCACGTTGTGTG
ATATCGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4G511TF U 1
AF RR4BP35TF U 29
BS 1 80 RR4G511TF
BS 81 81 RR4BP35TF
BS 82 425 RR4G511TF
BS 426 426 RR4BP35TF
BS 427 560 RR4G511TF
BS 561 561 RR4BP35TF
BS 562 563 RR4G511TF
BS 564 564 RR4BP35TF
BS 565 669 RR4G511TF

RD RR4G511TF 669 0 0
GGGTACATCTGATCTCAAGTAGCTTCAAGTGGTTGGTCTTCTCGTCCCGATCGAGTTTCT
TTGGTTCTCAGAAAAGTCTTTCCTTTTTCTTCTACCTTAAAAGAGATGGGGACTTACCTG
AGTTCTCCCAAAACTGAAAAGATATCAGAAGAAGGTGAAAATGATACGCTTAGATATGGT
TCGTCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGATGCGCATGCTGCAATTCTTGAT
CTGGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTGTACGATGGTCATGGAGGCAAAGTTGTAGCA
AAGTTCTGTGCAAAGTATCTACACCAGCAGGTTCTCAGTAACCAAGCATATGGAGCTGGA
GACGTTGAAACATCTCTTCAAAGAGCATTCTTTAGAATGGATGACATGATGCAAGGACAG
AGAGGGTGGCGAGAGTTAGCTGCGCTCGGCGACAAGATGAATAAGTTTAGCGGCATGATT
GAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGTGGTGACGTCAATAACCAGCCTGATAATTGG
CCTCTTGAGGATGGTCCTCATTCTGATTTCGCCGGACCTACTTGCGGGTGCACAGCGTGT
GTAGCTCTTATTAAAGATAAGAAGCTCTTTGTTGCAAATGCTGGTGACTCACGTTGTGTG
ATATCGAGG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4BP35TF 637 0 0
GG
GGTTGGTCTTCTCGTCCCGATCGAGTTTCTTTGGTTCTCAGAAAAGTCTTACCTTTTTCT
TCTACCTTAAAAGAGATGGGGACTTACCTGAGTTCTCCCAAAACTGAAAAGATATCAGAA
GAAGGTGAGAATGATACGCTTAGATATGGTTCGTCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACC
ATGGAAGATGCGCATGCTGCAATTCTTGATCTGGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTG
TACGATGGTCATGGAGGCAAAGTTGTAGCAAAGTTCTGTGCAAAGTATCTACACCAGCAG
GTTCTCAGTAATCAAGCATATGGAGCTGGAGACGTTGAAACATCTCTTCAAAGAGCATTC
TTTAGAATGGATGACATGATGCAAGGACAGAGAGGATGGCGAGAGTTGGCTGCGCTCGGC
GACAAGATGAATAAGTTTAGCGGCATGATTGAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGT
GGTGACGTCAATAACCAGCCTGATAATTGGCCTCTTGAGGATGGTCCTCACTCGGATTTC
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GTTGCAAATGCTGGTGACTCACGTTGTGTGATATC

QA 3 637 3 637
DS 



AS 1 2

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AAAGATGAAGATGGTGTCGAACCGGGTGAGGAGATGGTGGAAAGGATCTTCTTCTTCGAA
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ACCTTCATTAAC


BQ
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AF RR4A411JQ C 1
AF RR4A411TF U 1
BS 1 492 RR4A411TF

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ACCTTCATTAAC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR4A411TF 492 0 0
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AAAGATGAAGATGGTGTCGAACCGGGTGAGGAGATGGTGGAAAGGATCTTCTTCTTCGAA
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AGCTGTCTTTGTTTAGTTTCTTATCTATCTTTTCAAGAGAAAAGTGTTGAGAGAGACATC
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ATGAATTCAAGTTTGAAGCAAAAGGGGAATGTTTGCAAAACAATTTTTTTTATTTACTTC
ACCTTCATTAAC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL7477Contig1 818 2 3 U
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TTACGTCAAATCCAAGCGATGGAGGATAAACAGCTAGGGGTTATGAGAGTTTACGTGAAA
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GAACAACTGGCCCTTACCATCAAAGATGTGACTGATCCAATCCGTATGACGGTGTATGAT
AAAGACAGATTCTCGGGAGATGACAAGATGGGTGATGCGGAAATAGACATGAGACCGTTC
CTAGAAGCGCATCAGATGGAGTTGGACTTCAAGAAGCTCCCCAATGGTTGTGCAATCAAG
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GGGAAGATCATACAAGACATGATTCTTAGATTAAGAATGTGGAGTGTGGGGAATTGGAAA
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TTGAAGATGTGGTTGTTTTTTTTCTGTTCATGCAAAGACTAGTTCGTCTTTGTCTCATTA
GATATTTTGTATTTTTTTTTAAAAAGCTCTGCTTGGTCTTTAGTTGTACATCTCGAATCT
AACCCTAAACTCTTAATATATATATATTATGTTCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FM89TF U 15
AF RR4FM89JQ C 1
BS 1 14 RR4FM89JQ
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BS 682 818 RR4FM89JQ

RD RR4FM89TF 667 0 0
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TGCGATTCGCGACTCCACGACCAGTGATCCTTATGTTGTTGTCACATTGGCTAATCAGAA
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TACCATCAAAGATGTGACTGATCCAATCCGTATGACGGTGTATGATAAAGACAGATTCTC
GGGAGATGACAAGATGGGTGATGCGGAAATAGACATGAGACCGTTCCTAGAAGCGCATCA
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GTTTTTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4FM89JQ 818 0 0
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TTACGTCAAATCCAAGCGATGGAGGATAAACAGCTAGGGGTTATGAGAGTTTACGTGAAA
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GAACAACTGGCCCTTACCATCAAAGATGTGACTGATCCAATCCGTATGACGGTGTATGAT
AAAGACAGATTCTCGGGAGATGACAAGATGGGTGATGCGGAAATAGACATGAGACCGTTC
CTAGAAGCGCATCAGATGGAGTTGGACTTCAAGAAGCTCCCCAATGGTTGTGCAATCAAG
AGGATCCGTCCAGGGAGGACCAACTGTTTGGCCGAAGAAAGCAGCATCACTTGGAGCAAC
GGGAAGATCATACAAGACATGATTCTTAGATTAAGAATGTGGAGTGTGGGGAATTGGAAA
TCATGCTAGAGTTGACTGATGGTCCAGGCTGCAAGGGTCTTGGACGAGAAGGATCGAAGA
AGACATCATGGATGCAAACAAAACAATTGGACTAAGATGCAGTAATGATAAACAGAGACG
TTGAAGATGTGGTTGTTTTTTTTCTGTTCATGCAAAGACTAGTTCGTCTTTGTCTCATTA
GATATTTTGTATTTTTTTTTAAAAAGCTCTGCTTGGTCTTTAGTTGTACATCTCGAATCT
AACCCTAAACTCTTAATATATATATATTATGTTCTACT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL7478Contig1 614 2 2 U
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TTTAATGAAAAACAGTCCAACATAATACTATGTATCGCCCTTTTGTTACAAACAAAACAC
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ATCGCCTGTAACGATGTCGTTTAAAGTTGATGTACAAGTGCAGAATCCCACGCTCAAACG
TGCATTTGAAACCCTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTATTCACAATACGGAACGCAA
TGTCTTCATAAGGTGGACCAGCATGGAACCGGATCATACAAGTTTCAGCGCTTGTCCCAT
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TAAACTTGTACCCTTGAACGATCTTTGGAGGCGGGTTGTCGTGATCATAGTGCGTTTGGT
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ACACAGCATCACCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CC63TF C 1
AF RR4CC63JQ U 8
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BS 8 614 RR4CC63JQ

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TTTAATGAAAAACAGTCCAACATAATACTATGTATCGCCCTTTTGTTACAAACAAAACAC
CTGCCAAAGTATTACAACTGCCAACTTCGTAGTAGTCTCCGTCCAAACTCCGATGAGTTT
ATCGCCTGTAACGATGTCGTTTAAAGTTGATGTACAAGTGCAGAATCCCACGCTCAAACG
TGCATTTGAAACCCTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTATTCACAATACGGAACGCAA
TGTCTTCATAAGGTGGACCAGCATGGAACCGGATCATACAAGTTTCAGCGCTTGTCCCAT
CTTTTTCTATAGTGTAAGTGGGAGCCTTGATCTTGTCTACCGAATCCGGGTAGAAGATGT
TAAACTTGTACCCTTGAACGATCTTTGGAGGCGGGTTGTCGTGATCATAGTGCGTTTGGT
TATACTTGTTCCACTCGTAACCCGTGTGAACTCTGTTGAAATACTTCGGTTTTCTTGGCC
GGTACTTGTCATGCCACCAGTATACCTCAGAATCAAGGTTCACTTCAGCATTAGAGCCAA
ACACAGCATCACCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4CC63JQ 607 0 0
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AAAAACAGTCCAACATAATACTATGTATCGCCCTTTTGTTACAAACAAAACACCTGCCAA
AGTATTACAACTGCCAACTTCGTAGTAGTCTCCGTCCAAACTCCGATGAGTTTATCGCCT
GTAACGATGTCGTTTAAAGTTGATGTACAAGTGCAGAATCCCACGCTCAAACGTGCATTT
GAAACCCTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTATTCACAATACGGAACGCAATGTCTTC
ATAAGGTGGACCAGCATGGAACCGGATCATACAAGTTTCAGCGCTTGTCCCATCTTTTTC
TATAGTGTAAGTGGGAGCCTTGATCTTGTCTACCGAATCCGGGTAGAAGATGTTAAACTT
GTACCCTTGAACGATCTTTGGAGGCGGGTTGTCGTGATCATAGTGCGTTTGGTTATACTT
GTTCCACTCGTAACCCGTGTGAACTCTGTTGAAATACTTCGGTTTTCTTGGCCGGTACTT
GTCATGCCACCAGTATACCTCAGAATCAAGGTTCACTTCAGCATTAGAGCCAAACACAGC
ATCACCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL7479Contig1 771 2 12 U
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GAGCAAATCCCCCAACAAGCATAACCGTCCCTACATGGAGGCCAGACCCTTGGAGGACGG
TCTTGCAGAGGCAATTGATGATGGCCGTATCGGTCCAAGAGATGACCCCAAGATCCGATC
CAAGATCTTGGCAGAGGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTAGCAAAGAAGATCTGGGCGTT
TGGACCTGAAACCACAGGGCCCAACATGGTTGTCGACATGTGCAAGGGAGTTCAGTACCT
AAATGAAATCAAGGATTCAGTTGTTGCTGGGTTCCAGTGGGCTTCCAAGGAAGGTCCTCT
ATGTGACGAAAACATGAGAGGTATCTGCTTTGAGGTGTGTGATGTGGTGCTCCATTCTGA
TGCAATTCACAGAGGTGGTGGTCAAGTTATCCCTACAGCTAGGAGGGTTATCTATGCCTC
GCAGCTCACTGCCAAGCCCAGACTGTTGGAGCCGGTGTATATGGTAGAAATCCAAGCACC
AGAAGGAGCACTTGGTGGAACCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTGTTTGA
GGAGATGCAGAGGCCAGGAACACCATTGTACAACATCAAGGCTTACTTGCCAGTCGTTGA
GTCATTTGGATTCTCGAGTCAGCTTAGGGCAGCAACCTCAGGACAGGCATTCCCGCAGTG
TGTGTTTGATCATTGGGAGATGATGTCGTCTGACCCTCTGGAGGCAGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV79TF U 1
AF RR4FM08TF U 128
BS 1 282 RR4FV79TF
BS 283 283 RR4FM08TF
BS 284 529 RR4FV79TF
BS 530 530 RR4FM08TF
BS 531 560 RR4FV79TF
BS 561 561 RR4FM08TF
BS 562 640 RR4FV79TF
BS 641 641 RR4FM08TF
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BS 689 689 RR4FM08TF
BS 690 701 RR4FV79TF
BS 702 771 RR4FM08TF

RD RR4FV79TF 701 0 0
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TCTTGCAGAGGCAATTGATGATGGCCGTATCGGTCCAAGAGATGACCCCAAGATCCGATC
CAAGATCTTGGCAGAGGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTAGCAAAGAAGATCTGGGCGTT
TGGACCTGAAACCACAGGGCCCAACATGGTTGTCGACATGTGTAAGGGAGTTCAGTACCT
AAATGAAATCAAGGATTCAGTTGTTGCTGGGTTCCAGTGGGCTTCCAAGGAAGGTCCTCT
ATGTGACGAAAACATGAGAGGTATCTGCTTTGAGGTGTGTGATGTGGTGCTCCATTCTGA
TGCAATTCACAGAGGTGGTGGTCAAGTTATCCCTACAGCTAGGAGGGTTATCTATGCCTC
GCAGCTCACTGCCAAGCCCAGACTGTTGGAGCCGGTGTATATGGTAGAA*TCCAAGCACC
AGAAGGAGCACTTGGTGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTGTTTGA
GGAGATGCAGAGGCCAGGAACACCATTGTACAACATCAAG*CTTACTTGCCAGTCGTTGA
GTCATTTGGATTCTCGAGTCAGCTTAGG*CAGCAACCTCAG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4FM08TF 644 0 0
AG
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GGCAGAGGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTAGCAAAGAAGATCTGGGCGTTTGGACCTGA
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CAAGGATTCAGTTGTTGCTGGGTTCCAGTGGGCTTCCAAGGAAGGTCCTCTATGTGACGA
GAACATGAGAGGTATCTGCTTTGAGGTGTGTGATGTGGTGCTCCATTCTGATGCAATTCA
CAGAGGTGGTGGTCAAGTTATCCCTACAGCTAGGAGGGTTATCTATGCCTCGCAGCTCAC
TGCCAAGCCCAGACTGTTGGAGCCGGTGTATATGGTAGAAATCCAAGCACCAGAAGGAGC
ACTTGGTGGAACCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTGTTTGAGGAGATGCA
GAGGCCAGGAACACCATTGTACAACATCAAGGCTTACTTGCCAGTCGTTGAGTCATTTGG
ATTCTCGAGTCAGCTTAGGGCAGCAACCTCAGGACAGGCATTCCCGCAGTGTGTGTTTGA
TCATTGGGAGATGATGTCGTCTGACCCTCTGGAGGCAGTATC

QA 3 644 3 644
DS 



AS 1 2

CO CL7480Contig1 810 2 1 U
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TTCCATGTTTGTTAAATAACGAAACATACGCAGCATAACAGATCGTTCACAGCGACACAC
TGTAGAGAGAAGAAAGAAGCTTACAGAAGTTACAATGGCGTCAAGAAGAGTATCTTCACT
GCTCTCTCGCTCCTTCATGTCCTCCTCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCAGAGGCAAGGAACC
TCTCATGATGAACAGAGGAGCTCACAGATACAGCAACCACGCTGAAGACACGATCACTCC
GCCTGTGAAAGTGGAGCACACACAGCTCTTAATCAACGGAAAGTTCGTTGATGCCGCCTC
AGGAAAGACTTTCCCCACTTTGGATCCAAGAACTGGAGAGGTGATCGCTCAGGTGGCTGA
AGGTGATGTGGAAGACGTGAACCGTGCCGTTTCAGCTGCACGCAAGGCCTTTGATGAGGG
TCCATGGCCTCGAATGACTGCTTATGAGAGATCAAAGATACTACTTCGTTTCGCTGACTT
GGTCGACAAACACAACGACGAGATCGCTGCTCTCGAGACTTGGGACAATGGGAAGCCTTT
TGAACAGTCTGCCAAGGTTGAAGTCCCTATGCTCGCCAGGGTGTTTCGTTACTATGCTGG
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CTCCATGAGCCTATTGGAGTCGCTGGACAGATCATCCCTTGGAACTTCCCTCTTCTCATG
CTTTCTTGGAAGCTTGGACCAGCTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU96TF U 103
AF RR4AQ59TF U 1
BS 1 810 RR4AQ59TF

RD RR4DU96TF 546 0 0
GG
GTTCACAGCGACACACTGTAGAGAGAAGAAAGAAGCTTACAGAAGTTACAATGGCGTCAA
GAAGAGTATCTTCACTGCTCTCTCGCTCCTTCATGTCCTCCTCGCCTTCTCTTCTCGCTC
TCAGAGGCAAGGAACCTCTCATGATGAACAGAGGAGCTCACAGATACAGCAACCACGCTG
AAGACACGATCACTCCGCCTGTGAAAGTGGAGCACACACAGCTCTTAATCAACGGAAAGT
TCGTTGATGCCGCCTCGGGAAAGACTTTCCCCACTTTGGATCCAAGAACTGGAGAGGTGA
TCGCTCAGGTGGCTGAAGGTGATGTGGAAGACGTGAACCGTGCCGTTTCAGCTGCACGCA
AGGCCTTTGATGAGGGTCCATGGCCTCGAATGACTGCTTATGAGAGATCAAAGATACTAC
TTCGTTTCGCTGACTTGGTCGACAAACACAACGACGAGATCGCTGCTCTCGAGACTTGGG
ACAATGGGAAGCCTTTTGAACAGTCTGCCAAGGTTGAAGTCCCTATGCTCGCCAGGGTGT
TTCG

QA 3 546 3 546
DS 

RD RR4AQ59TF 810 0 0
GGGTTGATCTGACACTTGTTTCCTTCTCTTCTGGTAGACATTAATTACTTAAATAGGTCT
TTCCATGTTTGTTAAATAACGAAACATACGCAGCATAACAGATCGTTCACAGCGACACAC
TGTAGAGAGAAGAAAGAAGCTTACAGAAGTTACAATGGCGTCAAGAAGAGTATCTTCACT
GCTCTCTCGCTCCTTCATGTCCTCCTCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCAGAGGCAAGGAACC
TCTCATGATGAACAGAGGAGCTCACAGATACAGCAACCACGCTGAAGACACGATCACTCC
GCCTGTGAAAGTGGAGCACACACAGCTCTTAATCAACGGAAAGTTCGTTGATGCCGCCTC
AGGAAAGACTTTCCCCACTTTGGATCCAAGAACTGGAGAGGTGATCGCTCAGGTGGCTGA
AGGTGATGTGGAAGACGTGAACCGTGCCGTTTCAGCTGCACGCAAGGCCTTTGATGAGGG
TCCATGGCCTCGAATGACTGCTTATGAGAGATCAAAGATACTACTTCGTTTCGCTGACTT
GGTCGACAAACACAACGACGAGATCGCTGCTCTCGAGACTTGGGACAATGGGAAGCCTTT
TGAACAGTCTGCCAAGGTTGAAGTCCCTATGCTCGCCAGGGTGTTTCGTTACTATGCTGG
TTGGGCAGACAAGATCCATGGAATGACGGTTCCAGGAGATGGTTCACACCATGTCAGACA
CTCCATGAGCCTATTGGAGTCGCTGGACAGATCATCCCTTGGAACTTCCCTCTTCTCATG
CTTTCTTGGAAGCTTGGACCAGCTTTGGCT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

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CTTTTCTTGACAGATCATTTTCACCCTATCCTTGTATGTTTTTAGTGACAGAAGAACTGA
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CTTATCTACTAATGTATTGTATTCAGTTACATAATAAGTGAACTCCTTTGAAGGGAAAAC
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AB31JQ C 1
AF RR4AB31TF U 1
BS 1 540 RR4AB31TF

RD RR4AB31JQ 540 0 0
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TTGTGTTATAGTTTTTACGTTAACATCCTCCTTCAAGAAGAGATAACTATACAATTTCTT
CTTTTCTTGACAGATCATTTTCACCCTATCCTTGTATGTTTTTAGTGACAGAAGAACTGA
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QA 1 540 1 540
DS 

RD RR4AB31TF 540 0 0
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GGTTCTAAAGATCTTGTATTCAATCTTAAGAAGTGTGAGGTTAAGAGCAAAAAATCGAAA
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ATATTAGTATATATACATATCTTTGTAGAAATATTCTCTCGTATACTATGTGTTTTACGT
TTGTGTTATAGTTTTTACGTTAACATCCTCCTTCAAGAAGAGATAACTATACAATTTCTT
CTTTTCTTGACAGATCATTTTCACCCTATCCTTGTATGTTTTTAGTGACAGAAGAACTGA
AGATCAATTCTGAAACCTTTCTACAAAATGGACTTTTATCTTTGAACTAAATTGTTTTAG
CTTATCTACTAATGTATTGTATTCAGTTACATAATAAGTGAACTCCTTTGAAGGGAAAAC
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QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL7482Contig1 723 2 13 U
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TGAACTTGAGAGAAGAAGATTTAACCGAAGAGACCAAGACTCTAATCTCTTCACTTCCTT
CGGAGAAAGAGTACCTTGGTGGAAACCTCTGCAAGTACCAAGGTTCTTGGTATTACTACA
ACTTTCTCCAAGGTGTCCTCAATGTCCAGAGAGGTTTTCAGCCTCAAGACACCGATGTCA
TCGTCGCATCATTCCCCAAATGCGGCACCTTATGGCTCAAGGCACTCACCGTGGCGCTCT
TCGAGAGATCCAAGAACCGTTCTTCCGAGGATCAACATCCACTTTTCTCCAACAACCCTC
ATAACCTCGTACCGGTTCTTGAGATGAATCTGTACCGCGACACCCCAGAACCGGACTTGA
CCAAGCTCTTATCGTCATCTCCAAGGCTCTTCTCTACTCACATGCCGTTCCTTACGCTGA
AAGAAGCTCTCAAAGACTCTCCTTGCAAGGTAGTGTACATTTGCAGGGATGCTAAGGATT
CTCTGGTGTCACGTTGGCATATCATTTGCAGGTGTCTCAATAAAGAAGAGGACAGAAGCA
TTCTCGAGTCTATGTTCGAGTCTTTCTGCAGTGGGGTTTGCTTGTTTGGTCCGTTTTGGG
ATCAGATCTTGAGTTACTGGAAAGCTAGCTTGGAAAACCCTAAGCGTGTTCTGTTTATGA
AGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR4CO78TF U 98
AF RR4AY24TF U 1
BS 1 147 RR4AY24TF
BS 148 148 RR4CO78TF
BS 149 196 RR4AY24TF
BS 197 197 RR4CO78TF
BS 198 206 RR4AY24TF
BS 207 207 RR4CO78TF
BS 208 244 RR4AY24TF
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BS 350 350 RR4CO78TF
BS 351 723 RR4AY24TF

RD RR4CO78TF 582 0 0
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CCAAGGTTCTTGGTATTACTACAACTTTCTCCAAGGTGTCCTCAATGTCCAGAGAGGTTT
TCAGCCTCAAGACACCGATGTCATCGTCGCATCATTCCCCAAATGCGGCACCTTATGGCT
CAAGGCACTCACCGTGGCGCTCTTCGAGAGATCCAAGAACCGTTCTTCCGAGGATCAACA
TCCACTTTTCTCCAACAACCCTCATAACCTCGTACCGGTTCTTGAGATGAATCTGTACCG
CGACACCCCAGAACCGGACTTGACCAAGCTCTTATCGTCATCTCCAAGGCTCTTCT*TAC
TCACATGCCGTTCCTTACGCTGAAAGAAGCTCTCAAAGACTCTCCTTGCAAGGTAGTGTA
CATTTGCAGGGATGCTAAGGATTCTCTGGTGTCACGTTGGCATATCATTTGCAGGTGTCT
CAATAAAGAAGAGGACAGAAGCATTCTCGAGTCTATGTTCGAG*CTTTCTGCAGTGGGGT
TTGCTTGTTTGGTCCGTTT*GGGATCAGATCTTGAGT
ACTGG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4AY24TF 723 0 0
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TGAACTTGAGAGAAGAAGATTTAACCGAAGAGACCAAGACTCTAATCTCTTCACTTCCTT
CGGAGAAAGAGTACCTTGGTGGAAACC*CTGCAAGTACCAAGGTTCTTGGTATTACTACA
ACTTTCTCCAAGGTGTTCTCAATGTCTAGAGAGGTTTTCAGCCTCAAGACACCGATGTCA
TCGTTGCATCATTCCCCAAATGCGGCACCTTATGGCTCAAGGCACTCACCTTGGCGCTCT
TCGAGAGATCCAAGAACCGTTCTTCCGAGGATCAACATCCACTTTTCTCTAACAACCCTC
ATAACCTCGTACCGGTTCTTGAGATGAATCTGTACCGCGACACCCCAGAACCGGACTTGA
CCAAGCTCTTATCGTCATCTCCAAGGCTCTTCTCTACTCACATGCCGTTCCTTACGCTGA
AAGAAGCTCTCAAAGACTCTCCTTGCAAGGTAGTGTACATTTGCAGGGATGCTAAGGATT
CTCTGGTGTCACGTTGGCATATCATTTGCAGGTGTCTCAATAAAGAAGAGGACAGAAGCA
TTCTCGAGTCTATGTTCGAGTCTTTCTGCAGTGGGGTTTGCTTGTTTGGTCCGTTTTGGG
ATCAGATCTTGAGTTACTGGAAAGCTAGCTTGGAAAACCCTAAGCGTGTTCTGTTTATGA
AGT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7483Contig1 764 2 8 U
GGATCTGAAACAACAACAAACCTCTCTGAGATTTCGCCAGAGTTAAAGAGAGAGAGAGAG
AACGATCCAGCGGTTGAGATGTTCTTACGGGCAATCGGACGGCCACTGTTGGCCAAAGTG
AAGCAGACGACAGGGATCGTCGGGCTCGACGTTGTGCCGAACGCGAGGGCGGTGCTGATC
GATCTCTACAGCAAAACCCTAAAGGAGATCCAAGCCGTGCCGGAGGACGAAGGATACCGA
AAAGCGGTGGAATCGTTCACGCGCCACCGTCTCAGTGTCTGCAAAGAGGAAGAAGACTGG
GAGGCGATCGAGAAGCGTCTTGGCTGCGGTCAGGTGGAGGAGCTCATCGAAGAGGCGCGA
GACGAGCTCATACTCATTGCCAAAATGATCGAATGGGACCCTTGGGGTGTTCCGGATGAC
TACGAGTGTGAAGTGATTGAAAACGATGCACCGATTCCAAAGCACGTTCCTCAGCACCGA
CCTGGTCCTCTTCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTTCTCTCGGAGTCCAAA
ACAAAGATCCCAGCTGCTAGCTCTGCTGATGCGCAGCTGAAGGAGTAACTTCCAGTATTA
CTTTGTTTTGTACTTCTTGCTTTTTTTTTTGGGCTAGTGTTTGTTTCTGAGGCCAACTAA
GAAAATTGCGTAATAATTTTGGAAAACAATAGCAATGTCACTCTTTTCATAAATGTTTTA
TCATTCTTCTCAAAAACCAATGATAATACAAATGATGTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GB74TF U 1
AF RR4GB74JQ C 76
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BS 652 652 RR4GB74JQ
BS 653 685 RR4GB74TF
BS 686 686 RR4GB74JQ
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BS 714 731 RR4GB74TF
BS 732 764 RR4GB74JQ

RD RR4GB74TF 731 0 0
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AACGATCCAGCGGTTGAGATGTTCTTACGGGCAATCGGACGGCCACTGTTGGCCAAAGTG
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GATCTCTACAGCAAAACCCTAAAGGAGATCCAAGCCGTGCCGGAGGACGAAGGATACCGA
AAAGCGGTGGAATCGTTCACGCGCCACCGTCTCAGTGTCTGCAAAGAGGAAGAAGACTGG
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TACGAGTGTGAAGTGATTGAAAACGATGCACCGATTCCAAAGCACGTTCCTCAGCACCGA
CCTGGTCCTCTTCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTTCTCTCGGAGTCCAAA
ACAAAGATCCCAGCTGCTAGCTCTGCTGATGCGCAGCTGAAGGAGTAACTTCCAGTATTA
CTTTGTTTTGTACTTCTTGCTTTTTTTTTTGGGCTAGTGTTTGTTTCTGAG*CCAACTAA
GAAAATTGCGTAATAATTTTGGAAA*CAATAGCAATGTCACTCTTTTCATAA*TGTTTTA
TCATTCTTCTC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4GB74JQ 689 0 0
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ACCCTAAAGGAGATCCAAGCCGTGCCGGAGGACGAAGGATACCGAAAAGCGGTGGAATCG
TTCACGCGCCACCGTCTCAGTGTCTGCAAAGAGGAAGAAGACTGGGAGGCGATCGAGAAG
CGTCTTGGCTGCGGTCAGGTGGAGGAGCTCATCGAAGAGGCGCGAGACGAGCTCATACTC
ATTGCCAAAATGATCGAATGGGACCCTTGGGGTGTTCCGGATGACTACGAGTGTGAAGTG
ATTGAAAACGATGCACCGATTCCAAAGCACGTTCCTCAGCACCGACCTGGTCCTCTTCCT
GAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTTCTCTCGGAGTCCAAAACAAAGATCCCAGCT
GCTAGCTCTGCTGATGCGCAGCTGAAGGAGTAACTTCCAGTATTACTTTGTTTTGTACTT
CTTGCTTTTTTTTTTGGGCTAGTGTTTGTTTCTGAGGCCAACTAAGAAAATTGCGTAATA
ATTTTGGAAAACAATAGCAATGTCACTCTTTTCATAAATGTTTTATCATTCTTCTCAAAA
ACCAATGATAATACAAATGATGTTTCTCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL7484Contig1 676 2 2 U
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ATACATGGGAGAGTCACGTCGGAGATTCATCACCAGAGAAAACAAACTGGTTAATACGTC
ACCGTATCGCTATTGGAGTTGCACGTGGTCTAGCCTATCTACATCATGTTGGTACTACTC
ATGGTCACTTAGTTGCTACCAACATCCTCCTAACCGAAACCCTAGAGCCACGAATATCTG
ATTTTGGTATCAACAACATCGCAAAAACAGGAAACGATGCTGATAATAACAATTTAGACT
TCGATGTGTATTGTTTTGGAGTGATTTTGTTTGAGCTTTTGACCGGTAAGCAAGGGAGTG
AGGAACATGTGAAATCAGTTCGACGGTTGTTTAAGGAGAGGAGAGGAGAGGAAGCTCTTT
GACTCGAGATTTGCGGTTAGCTTCTGGAGAATCGGTTAATGAGATGGTCGAGAGTCTTAG
AATTGGTTATTTCTGTACGGCGGAGACGCCAGGGAAACGGCCAACAATGCAACAAGTGTT
GGGTCTGCTTAAAGACATTCGTAGTGTTTCTCGTTGAGTTAGGAAACAAAGTGTATTAGA
TTTTCGGATGTTGTTAATTATGGACATATTGTGCGAGATAAATGCGTTTTGTCAAGCTAT
TATATGTTTTTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AH64JQ C 1
AF RR4AH64TF U 143
BS 1 142 RR4AH64JQ
BS 143 676 RR4AH64TF

RD RR4AH64JQ 676 0 0
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ATACATGGGAGAGTCACGTCGGAGATTCATCACCAGAGAAAACAAACTGGTTAATACGTC
ACCGTATCGCTATTGGAGTTGCACGTGGTCTAGCCTATCTACATCATGTTGGTACTACTC
ATGGTCACTTAGTTGCTACCAACATCCTCCTAACCGAAACCCTAGAGCCACGAATATCTG
ATTTTGGTATCAACAACATCGCAAAAACAGGAAACGATGCTGATAATAACAATTTAGACT
TCGATGTGTATTGTTTTGGAGTGATTTTGTTTGAGCTTTTGACCGGTAAGCAAGGGAGTG
AGGAACATGTGAAATCAGTTCGACGGTTGTTTAAGGAGAGGAGAGGAGAGGAAGCTCTT*
GACTCGAGATT*GCGGTTAGCTTCTGGAGAATCGGTTAATGAGATGGTCGAGAGTCTTAG
AATTGGTTATTTCTGTACGGCGGAGACGCCAGGGAAACGGCCAACAATGCAACAAGTGTT
GGGTCTGCTTAAAGACATTCGTAGTGTTTCTCGTTGAGTTAGGAAACAAAGTGTATTAGA
TTTTCGGATGTTGTTAATTATGGACATATTGTGCGAGATAAATGCGTTTTGTCAAGCTAT
TATATGTTTTTGAGCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4AH64TF 534 0 0
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AAAAACAGGAAACGATGCTGATAATAACAATTTAGACTTCGATGTGTATTGTTTTGGAGT
GATTTTGTTTGAGCTTTTGACCGGTAAGCAAGGGAGTGAGGAACATGTGAAATCAGTTCG
ACGGTTGTTTAAGGAGAGGAGAGGAGAGGAAGCTCTTTGACTCGAGATTTGCGGTTAGCT
TCTGGAGAATCGGTTAATGAGATGGTCGAGAGTCTTAGAATTGGTTATTTCTGTACGGCG
GAGACGCCAGGGAAACGGCCAACAATGCAACAAGTGTTGGGTCTGCTTAAAGACATTCGT
AGTGTTTCTCGTTGAGTTAGGAAACAAAGTGTATTAGATTTTCGGATGTTGTTAATTATG
GACATATTGTGCGAGATAAATGCGTTTTGTCAAGCTATTATATGTTTTTGAGCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL7485Contig1 686 2 4 U
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AACAAGAAGAAAGTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTTTCTCTCTTTCAAGAAACAA
CATACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTT
CTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGG
CCTGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAAT
CGACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTT
GTTCAAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAAT
GAAAAAAAGAAACAAGCAGTGATGAAATTAACCGAAAAGAAGCTCTTTTCCTGTTAATTA
TTTGTTGTTAGTTTTAACGTCTTGGGGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTA
TGTTTGTCTGTCTGCACGTGCAATTCTGCAATTAATAACATAGAGAAGTCTTTTTGGTTC
CTCTACACTTTGTAACAAAATGATCGATGGATGTATGATGTATGATGTATTCTGTAATAA
TTATACAAGTTTTTTACTTGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E526JQ C 1
AF RR4E526TF U 139
BS 1 138 RR4E526JQ
BS 139 384 RR4E526TF
BS 385 385 RR4E526JQ
BS 386 686 RR4E526TF

RD RR4E526JQ 686 0 0
GGACATCCTTCAAAGCCATTTCGAACCCATTCTTGTATTGAGAGAGAGTACACAGACGAA
AACAAGAAGAAAGTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTTTCTCTCTTTCAAGAAACAA
CATACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTT
CTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGG
CCTGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAAT
CGACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTT
GTTCAAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAAT
GAAAAAAAGAAACAAGCAGTGATGAAATTAACCGAAAAGAAGCTCTTTTCCTGTTAATTA
TTTGTTGTTAGTTTTAACGTCTTGGGGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTA
TGTTTGTCTGTCTGCACGTGCAATTCTGCAATTAATAACATAGAGAAGTCTTTT*GGTTC
CTCTACACTTTGTAACAAAATGATCGATGGATGTATGATGTATGATGTATTCTGTAATAA
TTATACAAGTTTTTTACTTGTTTGCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4E526TF 548 0 0
CTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTTCTCAAGAACTCTCCAATG
CAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGGCCTGTGTGAAAGGTGGAG
CCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATCGACCCAAAAGATTGCTT
GGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGTTCAAAAGAGATAGACC
CAGCAGTGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAATGAAAAAAAGAAACAAGCA
GTGATGAAATTAACCGAAAAGAAGCTCTTTTCCTGTTAATTATTTGTTGTTAGTTTTAAC
GTCTTGGGGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTATGTTTGTCTGTCTGCACG
TGCAATTCTGCAATTAATAACATAGAGAAGTCTTTTTGGTTCCTCTACACTTTGTAACAA
AATGATCGATGGATGTATGATGTATGATGTATTCTGTAATAATTATACAAGTTTTTTACT
TGTTTGCC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7487Contig1 876 2 2 U
GCGTCAAGATGTTAAACAAGTGATTTGCTCTGTTTGCGATACAGAGCAGCCGGTGACTAA
AGTTTGCACCAACTGTGGTGTCAACATGGGAGAATACTTCTGCGATATCTGCAAGTTCTA
TGATGATAATACTGAAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCAGGGTTGG
TGGGCGTGAGAACTTCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTGGGCTGCG
CAACAACCATCGCTGCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTTACGAGTA
TCTCTTTGACTCTCTTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGCACTGTGA
ATGCTATCAGGAGATGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCTATTTGCTCGAGGTCAGT
GATTGATATGTCAAAAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCTACTTCTATGCC
TTCAGATTACCGCGATAAGAAGGTTTGGATACTGTGCAACGACTGTAACGACACAACAGA
GGTATACTTCCATATAATCGGTCAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGC
CGTCGCACCTCCTGTCCTTCCTCAATGAAAACACCAAACATCTTTCATGTATTGCCACCA
GAAAGCAACCAAAGAAAAAAAACTCTGATCAATGATTCAATATGATCATTGGTCACAAAA
GCAAGACTCACATTTGTCTTCTTCATGATTCTATTTGTTGTTGTTCTTATATGATTATGT
TTATTACCATTTATATTTATGTGTGAGAAAGCCAGGATAATGTATAATATATATATTCTT
GATCCAGGAAAAAAATTACCTGTGATTATATGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO01TF U 1
AF RR4EO01JQ C 137
BS 1 675 RR4EO01TF
BS 676 876 RR4EO01JQ

RD RR4EO01TF 675 0 0
GCGTCAAGATGTTAAACAAGTGATTTGCTCTGTTTGCGATACAGAGCAGCCGGTGACTAA
AGTTTGCACCAACTGTGGTGTCAACATGGGAGAATACTTCTGCGATATCTGCAAGTTCTA
TGATGATAATACTGAAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCAGGGTTGG
TGGGCGTGAGAACTTCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTGGGCTGCG
CAACAACCATCGCTGCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTTACGAGTA
TCTCTTTGACTCTCTTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGCACTGTGA
ATGCTATCAGGAGATGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCTATTTGCTCGAGGTCAGT
GATTGATATGTCAAAAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCTACTTCTATGCC
TTCAGATTACCGCGATAAGAAGGTTTGGATACTGTGCAACGACTGTAACGACACAACAGA
GGTATACTTCCATATAATCGGTCAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGC
CGTCGCACCTCCTGTCCTTCCTCAATGAAAACACCAAACATCTTTCATGTATTGCCACCA
GAAAGCAACCAAAGA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4EO01JQ 740 0 0
AAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCAGGGTTGGTGGGCGTGAGAACTTC
TTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTGGGCTGCGCAACAACCATCGCTGC
GTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTCTT
AAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGCACTGTGAATGCTATCAGGAGATG
CTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCTATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCAAAA
ACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCTACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCGAT
AAGAAGGTTTGGATACTGTGCAACGACTGTAACGACACAACAGAGGTATACTTCCATATA
ATCGGTCAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGCCGTCGCACCTCCTGTC
CTTCCTCAATGAAAACACCAAACATCTTTCATGTATTGCCACCAGAAAGCAACCAAAGAA
AAAAAACTCTGATCAATGATTCAATATGATCATTGGTCACAAAAGCAAGACTCACATTTG
TCTTCTTCATGATTCTATTTGTTGTTGTTCTTATATGATTATGTTTATTACCATTTATAT
TTATGTGTGAGAAAGCCAGGATAATGTATAATATATATATTCTTGATCCAGGAAAAAAAT
TACCTGTGATTATATGTTTC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7488Contig1 669 2 13 U
GGCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCATCGATTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGC
CATCACTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGTAAGGATGTCTGCAAC
ACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGT
CAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAA
GCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTT
TGATGGGCGTCGTTTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGA
TGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGTTGGTATTGGTGGAGGTGGCCT
GACATTTATCCGGGTTTAGGGTTTCGTGATGTGTGATAAGAATGGTTTAAGGAGTAATCG
GCATTAGGAATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAATCGTGACCATTGGCGTTA
AAAAAGCTAATATGGTCATGAAGGCTTAAGAAAAACCTTTTGTTAAATTGTTGGTCTTGT
TCCTTTGGTATTGGATCCTTCTATGTTATGACAATGTTTGCGCTTAAGATTGTTATTTAA
CCTTGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS11TF U 26
AF RR4B530JQ C 1
BS 1 27 RR4B530JQ
BS 28 94 RR4AS11TF
BS 95 95 RR4B530JQ
BS 96 416 RR4AS11TF
BS 417 417 RR4B530JQ
BS 418 427 RR4AS11TF
BS 428 428 RR4B530JQ
BS 429 458 RR4AS11TF
BS 459 459 RR4B530JQ
BS 460 518 RR4AS11TF
BS 519 520 RR4B530JQ
BS 521 616 RR4AS11TF
BS 617 669 RR4B530JQ

RD RR4AS11TF 591 0 0
GG
ATCGATTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCACTGTTTCGAAGGCATTAACTCT
CGGAGAA*CATAAAAAGTAAGGATGTCTGCAACACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGG
TGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTT
CTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCA
ATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTTGATGGGCGTCGTTTGCGTGCTGAGCA
GACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGAC
TGGTGGCTGTGTTGGTATTGGTGGAGGTGTCCTGACATTTGTCCGGGTTTAGGGTTTCGT
GATGTGTGATAGGAATGGTTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAATTGCAGACTTGTTTTTC
TTTTTTTTTTT**AATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAAGCTAATATGGTCATGAAGGCTT
AAGAAAAACCTTTTGTTAAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTATTGGAT

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR4B530JQ 669 0 0
GGCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCATCGATTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGC
CATCACTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGTAAGGATGTTTGCAAC
ACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACGTCAATTTTAAGGT
CAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAA
GCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTT
TGATGGGCGTCGTTTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGA
TGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGTTTGTATTGGTGGAGGTGGCCT
GACATTTATCCGGGTTTAGGGTTTCGTGATGTGTGATAAGAATGGTTTAAGGAGTAATCG
GCTTTAGGAATTGCAGACTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCGTGACCATTGGCGTTA
AAAAAGCTAATATGGTCATGAAGGCTTAAGAAAAACCTTTTGTTAAATTGTTGGTCTTGT
TCCTTTGGTATTGGATCCTTCTATGTTATGACAATGTTTGCGCTTAAGATTGTTATTTAA
CCTTGTTCG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL7489Contig1 334 2 3 U
GGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAGGGGAGATGTTACGATTTCTGGATGGATTT
CAGCGAGTGTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTTTTTTTTTCGTGAAGACTA
CCTCGAGTGTCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACAGGATATACAAGGAAGA
ACAGCGTAAACTAAGAGCAGCTTCAAGGAAAGGTGAAGAAACTGGTGATGCTTCTCATAC
TCATCACTAATCAAAATATTTTTCTCCTTCTACTCCAAGTATGCATCTCTCGCATTGGAG
AAGAAAGATAAGGAAAAGTTTCGTCAAGTTTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CS48JQ C 1
AF RR4CS48TF U 102
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BS 108 316 RR4CS48TF
BS 317 334 RR4CS48JQ

RD RR4CS48JQ 334 0 0
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CAGCGAGTGTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTTTTTTTTTCGTGAAGACTA
CCTCGAGTGTTTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACAGGATATACAAGGAAGA
ACAGCGTAAATTAAGAGCAGCTTCAAGGAAAGGTGAAGAAACTGGTGATGCTTTTCATAC
TCATCACTAATCAAAATATTTTTTTCCTTTTACTCCAAGTATGCATCTCTCGCATTGGAG
AAGAAAGATAAGGAAAAGTTTCGTCAAGTTTTTG

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR4CS48TF 215 0 0
CTCTTC
TTCGTGAAGACTACCTCGAGTGTCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACAGGA
TATACAAGGAAGAACAGCGTAAACTAAGAGCAGCTTCAAGGAAAGGTGAAGAAACTGGTG
ATGCTTCTCATACTCATCACTAATCAAAATATTTTTCTCCTTCTACTCCAAGTATGCATC
TCTCGCATTGGAGAAGAAAGATAAGGAAA

QA 7 215 7 215
DS 



AS 1 2

CO CL7490Contig1 644 2 2 U
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ATCTCGATTTTAGATTGTTTTGGTGGTTTTAATAAAAACATGGATACATAGAGGATATAT
CTTTGCTCATTTTTTTTCTCTTTGATTCCAAAGCCATGTTTGGTTCCTTCTTTATCTTAG
GTTTTTGATTGTCTTTGTGGTTGGTTACACAGGAAACGCCGATGGTTGCAGGTGCTGCTG
TAGCTGCTGCTGCTCTAGCTGGTAGGTATAGTATACTCGCTTGGCAAGCCTTTAAGGCCA
GGCCACCCGTGGCTAGAATGCGCAGGTTTTACGAAGGTGGTTTCCAAACTGCAATGACAC
GGCGAGAAGCTGCTCTCATTCTTGGAGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCCGAGAAGGTGAAAG
AAGCTCACAGGAGAGTTATGGTTGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTAGCCACTATCTCG
CTTCCAAGATCAATGAAGCCAAAGACATTTTGCTTGGCAAGTCCAGTAACTCCGGCTCTG
CTTTTTGATTCTCACATTAGTTTTTTTTTATACAAACCCAATATGAAACTCTTTTGTCTT
TTCATTTGATTATGTTTTTTCAATGTACCACCATTTCTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H563TF U 1
AF RR4H563JQB C 68
BS 1 619 RR4H563TF
BS 620 644 RR4H563JQB

RD RR4H563TF 619 0 0
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CTTTGCTCATTTTTTTTCTCTTTGATTCCAAAGCCATGTTTGGTTCCTTCTTTATCTTAG
GTTTTTGATTGTCTTTGTGGTTGGTTACACAGGAAACGCCGATGGTTGCAGGTGCTGCTG
TAGCTGCTGCTGCTCTAGCTGGTAGGTATAGTATACTCGCTTGGCAAGCCTTTAAGGCCA
GGCCACCCGTGGCTAGAATGCGCAGGTTTTACGAAGGTGGTTTCCAAACTGCAATGACAC
GGCGAGAAGCTGCTCTCATTCTTGGAGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCCGAGAAGGTGAAAG
AAGCTCACAGGAGAGTTATGGTTGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTAGCCACTATCTCG
CTTCCAAGATCAATGAAGCCAAAGACATTTTGCTTGGCAAGTCCAGTAACTCCGGCTCTG
CTTTTTGATTCTCACATTAGTTTTTTTTTATACAAACCCAATATGAAACTCTTTTGTCTT
TTCATTTGATTATGTTTTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4H563JQB 577 0 0
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CATTTTTTTTCTCTTTGATTCCAAAGCCATGTTTGGTTCCTTCTTTATCTTAGGTTTTTG
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TGCTGCTCTAGCTGGTAGGTATAGTATACTCGCTTGGCAAGCCTTTAAGGCCAGGCCACC
CGTGGCTAGAATGCGCAGGTTTTACGAAGGTGGTTTCCAAACTGCAATGACACGGCGAGA
AGCTGCTTTCATTTTTGGAGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCCGAGAAGGTGAAAGAAGCTCA
CAGGAGAGTTATGGTTGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTAGCCACTATCTCGCTTCCAA
GATCAATGAAGCCAAAGACATTTTGCTTGGCAAGTCCAGTAACTCCGGCTTTGCTTTTTG
ATTCTCACATTAGTTTTTTTTTATACAAACCCAATATGAAACTCTTTTGTCTTTTCATTT
GATTATGTTTTTTCAATGTACCACCATTTCTTGTTTG

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL7491Contig1 957 2 8 U
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AGAGTTGAGTCTTATATGTTTAGTTTCAACGGTGATCAGTCTTCTTCTGAGTCTTTCTCT
TCTTCTTCGGCGTCTTCTTCAATTGGGAGGAACAGCGACGAGGAAGAAGAGTTTCACGGC
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AAGTCTTTCACGAACTTAGCGGCGGCTGCCTCGGCGTTGAGTTCCTCCTCGTCGATGAAA
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GGATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGGGAGGAGATTCATCTTCTTCGCCGAGATCTTCAAGT
CCGACGACGTCGGGATCTCCTCCGAGGCAGAGACGTGGTGGTAGCAGTAGTCAGATGACG
ATGATGCTTCCTCCGCTGTATCCTAGTAGAAGTCGAGAGTCTTTTGGGGATTTAAAGTCG
ACTCAGTCGTCGTCTTCGACGGGTTTTTGTGCGTGGAGATCGTACTCGGTGGCGGATATT
CCGAGGTGTTTTCCGGCGACGGCTAGTGGTGTTGGGTCCAGCGACTCGTAGGGATGTTAA
CAGTTGTTTTATTAATCAAATCTTATGTTTTAAAGTTTAACACTTTTTAGTTTTTTTTCT
TTTTGGAGTAACGTCCGGAGAATGTATATACGAGTTTCAATCAAATCTTTGAAATGG


BQ
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AF RR4FA87TF U 1
AF RR4FA87JQ C 217
BS 1 704 RR4FA87TF
BS 705 705 RR4FA87JQ
BS 706 712 RR4FA87TF
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BS 769 957 RR4FA87JQ

RD RR4FA87TF 769 0 0
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AGAGTTGAGTCTTATATGTTTAGTTTCAACGGTGATCAGTCTTCTTCTGAGTCTTTCTCT
TCTTCTTCGGCGTCTTCTTCAATTGGGAGGAACAGCGACGAGGAAGAAGAGTTTCACGGC
GACGGAGAAGAGAACAACGAAGCTGAGTCTTCCTACAAAGGTCCTCTTGATTTGATGGAA
TCTCTCGAAGAAGTCTTGCCCGTTAGGAAAGGGATATCGAACTATTACAGCGGGAAGTCC
AAGTCTTTCACGAACTTAGCGGCGGCTGCCTCGGCGTTGAGTTCCTCCTCGTCGATGAAA
GACTTGGCGAAGCCGGAGAATCCATACAGCCGTCGTCGGAGGAATCTCCTCTGCCATCAG
ATCTGGGAGAACAGCAAAACGACTCCACGTGGCGGGATCTCGAAGAAACACGTCATGAGC
TCGAGCAGGAGCGCTTTGACGCTGGCCATGGCGGTCGCTGCTGGGGTGATGGCGAGAGAA
GGATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGGGAGGAGATTCATCTTCTTCGCCGAGATCTTCAAGT
CCGACGACGTCGGGATCTCCTCCGAGGCAGAGACGTGGTGGTAGCAGTAGTCAGATGACG
ATGATGCTTCCTCCGCTGTATCCTAGTAGAAGTCGAGAGTCTTT*GGGGATT*AAAGTCG
ACTCAGTCGTCGTCTTCGACGG**TTTTGTGCGTGGAGATCGTACTCG
T

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4FA87JQ 741 0 0
AAAGGTCCTCTTGATTTGATGGAATCTCTCGAAGAAGTCTTGCCCGTTAGGAAAGGGATA
TCGAACTATTACAGCGGGAAGTCCAAGTCTTTCACGAACTTAGCGGCGGCTGCCTCGGCG
TTGAGTTCCTCCTCGTCGATGAAAGACTTGGCGAAGCCGGAGAATCCATACAGCCGTCGT
CGGAGGAATCTCCTCTGCCATCAGATCTGGGAGAACAGCAAAACGACTCCACGTGGCGGG
ATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAGCAGGAGCGCTTTGACGCTGGCCATGGCGGTC
GCTGCTGGGGTGATGGCGAGAGAAGGATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGGGAGGAGATTCA
TCTTCTTCGCCGAGATCTTCAAGTCCGACGACGTCGGGATCTCCTCCGAGGCAGAGACGT
GGTGGTAGCAGTAGTCAGATGACGATGATGCTTCCTCCGCTGTATCCTAGTAGAAGTCGA
GAGTCTTTTGGGGATTTAAAGTCGACTCAGTCGTCGTCTTCGACGGGTTTTTGTGCGTGG
AGATCGTACTCGGTGGCGGATATTCCGAGGTGTTTTCCGGCGACGGCTAGTGGTGTTGGG
TCCAGCGACTCGTAGGGATGTTAACAGTTGTTTTATTAATCAAATCTTATGTTTTAAAGT
TTAACACTTTTTAGTTTTTTTTCTTTTTGGAGTAACGTCCGGAGAATGTATATACGAGTT
TCAATCAAATCTTTGAAATGG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7492Contig1 613 2 2 U
GGAACCGTCTCAGACCTCTTCGTAACCCGATTTCTCTCTCTCTCTCTGAAGTTCACAGAG
AACGTTTACAGTGACCACCAGTTGGGATTACAAATCTTTTCGCCCGAATAATCAGGAAGA
TGAGTGGTGGTGAAGTTGTCCTAACTGCTGCTAGAGTCTACCGTGAGCTTCTTAAAGGAG
TTGCGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCACAGATTTTGTAAAGAACG
AGTTTCGGAAGGATGCACACTCAGTCGAGAAAATCACCCTTGCCCGGAACTACACTTATC
TTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTCTCATACAACATTGCAGTTGATA
GAACTGAAGAAATGAAGCGAGTGCTTGGCAAATCTGCAGCTAGTGTTGGGCTTCGTCTTC
CCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATCATCCCACTTTCCTCCTTGTCTTTCCTCTTTGTTTC
CTTTACAGATCTTAGGTAACTTTGGAATAAGTTTGTCACTCTTTGTAGCCAGACAGATCT
GAGATGCATGGATCACAATTTCTTTTTATTTTGTTACCACATTCGTTCTGGGATAAAAAA
AAACGGTACCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H704TF U 1
AF RR4H704JQB C 48
BS 1 595 RR4H704TF
BS 596 613 RR4H704JQB

RD RR4H704TF 595 0 0
GGAACCGTCTCAGACCTCTTCGTAACCCGATTTCTCTCTCTCTCTCTGAAGTTCACAGAG
AACGTTTACAGTGACCACCAGTTGGGATTACAAATCTTTTCGCCCGAATAATCAGGAAGA
TGAGTGGTGGTGAAGTTGTCCTAACTGCTGCTAGAGTCTACCGTGAGCTTCTTAAAGGAG
TTGCGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCACAGATTTTGTAAAGAACG
AGTTTCGGAAGGATGCACACTCAGTCGAGAAAATCACCCTTGCCCGGAACTACACTTATC
TTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTCTCATACAACATTGCAGTTGATA
GAACTGAAGAAATGAAGCGAGTGCTTGGCAAATCTGCAGCTAGTGTTGGGCTTCGTCTTC
CCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATCATCCCACTTTCCTCCTTGTCTTTCCTCTTTGTTTC
CTTTACAGATCTTAGGTAACTTTGGAATAAGTTTGTCACTCTTTGTAGCCAGACAGATCT
GAGATGCATGGATCACAATTTCTTTTTATTTTGTTACCACATTCGTTCTGGGATA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4H704JQB 566 0 0
GAAGTTCACAGAGAACGTTTACAGTGACCACCAGTTGGGATTACAAATCTTTTCGCCCGA
ATAATCAGGAAGATGAGTGGTGGTGAAGTTGTCCTAACTGCTGCTAGAGTCTACCGTGAG
CTTCTTAAAGGAGTTGCGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCACAGAT
TTTGTAAAGAACGAGTTTCGGAAGGATGCACACTCAGTCGAGAAAATCACCCTTGCCCGG
AACTACACTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTTTCATACAAC
ATTGCAGTTGATAGAACTGAAGAAATGAAGCGAGTGCTTGGCAAATCTGCAGCTAGTGTT
GGGCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATCATCCCACTTTCCTCCTTGTCTT
TCCTCTTTGTTTCCTTTACAGATCTTAGGTAACTTTGGAATAAGTTTGTCACTCTTTGTA
GCCAGACAGATTTGAGATGCATGGATCACAATTTCTTTTTATTTTGTTACCACATTCGTT
CTGGGATAAAAAAAAACGGTACCAGT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL7493Contig1 831 2 4 U
GGACACACACACAACCCTTCAAAAAAAGAAAGAAAGAACAGGCAAAAGATCTAAAGAATA
AACAAGAACCTTACTACAATCAAATCAAGACCGAACCAAGAAGCTGAAAGGTAGATATGA
AAATCTGCAACGTCAGCAGAGAAATCTACTTGGAGAGGACCTTGGACCTCTGAATTCAAA
GGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGACAACTAGACGGCTCTCTTAATCAAGTTCGCTGCATCAA
GACGCAGTATATGCTTGATCAGCTCACTGACCTCCAAGGCAAAGAGCATATCTTGCTTGA
AGCCAATAGAGCTTTGTCAATGAAGCTGGAAGATATGATCGGTGTGAGAAGTCACCATAT
AGGAGGGGCGTGGGAAGGTGGTAGTGATCAACAAAATGTTGCCTATGGACACCATCAGGC
TCAGTCTCAGTCTCAGGGACTATTCCACTCTCTTGAATGTGATCCCACTTTGCAAATGGG
ATATAACCATCCAGTGTGTTCTGAGCAAATGGCTGTAACTGCGCAAGGTCAGTCCTCCCA
ACCAGGAAACAACGGCTACATCCCTGGCTGGATGCTGTGAGAGTGATAATTCTATCCCCA
CCTCAATAAGGATCTTTAAGCATGCAAGTAGTGGGTTCTTGATGATGAGGATGAGATGGA
TTCTATGAATAAGTATGATTTTGTGTTTATGTATGCTGCATAATTAAGACTTTTGATTTA
TAGACATAAGTGGCTATAGCTGTAATAGCCTTCGACATCTCTCTTCTGTTTCAGAAGATG
TTTGTGCGCGCCTTTTGAAACCTTTTGCTTATATATAAACGGATGGATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G769TF U 1
AF RR4G769JQ C 220
BS 1 744 RR4G769TF
BS 745 745 RR4G769JQ
BS 746 764 RR4G769TF
BS 765 831 RR4G769JQ

RD RR4G769TF 764 0 0
GGACACACACACAACCCTTCAAAAAAAGAAAGAAAGAACAGGCAAAAGATCTAAAGAATA
AACAAGAACCTTACTACAATCAAATCAAGACCGAACCAAGAAGCTGAAAGGTAGATATGA
AAATCTGCAACGTCAGCAGAGAAATCTACTTGGAGAGGACCTTGGACCTCTGAATTCAAA
GGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGACAACTAGACGGCTCTCTTAATCAAGTTCGCTGCATCAA
GACGCAGTATATGCTTGATCAGCTCACTGACCTCCAAGGCAAAGAGCATATCTTGCTTGA
AGCCAATAGAGCTTTGTCAATGAAGCTGGAAGATATGATCGGTGTGAGAAGTCACCATAT
AGGAGGGGCGTGGGAAGGTGGTAGTGATCAACAAAATGTTGCCTATGGACACCATCAGGC
TCAGTCTCAGTCTCAGGGACTATTCCACTCTCTTGAATGTGATCCCACTTTGCAAATGGG
ATATAACCATCCAGTGTGTTCTGAGCAAATGGCTGTAACTGCGCAAGGTCAGTCCTCCCA
ACCAGGAAACAACGGCTACATCCCTGGCTGGATGCTGTGAGAGTGATAATTCTATCCCCA
CCTCAATAAGGATCTTTAAGCATGCAAGTAGTGGGTTCTTGATGATGAGGATGAGATGGA
TTCTATGAATAAGTATGATTTTGTGTTTATGTATGCTGCATAATTAAGACTTTTGATTTA
TAGACATAAGTGGCTATAGCTGTA*TAGCCTTCGACATCTCTCT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4G769JQ 612 0 0
TAATCAAGTTCGCTGCATCAAGACGCAGTATATGCTTGATCAGCTCACTGACCTCCAAGG
CAAAGAGCATATCTTGCTTGAAGCCAATAGAGCTTTGTCAATGAAGCTGGAAGATATGAT
CGGTGTGAGAAGTCACCATATAGGAGGGGCGTGGGAAGGTGGTAGTGATCAACAAAATGT
TGCCTATGGACACCATCAGGCTCAGTCTCAGTCTCAGGGACTATTCCACTCTCTTGAATG
TGATCCCACTTTGCAAATGGGATATAACCATCCAGTGTGTTCTGAGCAAATGGCTGTAAC
TGCGCAAGGTCAGTCCTCCCAACCAGGAAACAACGGCTACATCCCTGGCTGGATGCTGTG
AGAGTGATAATTCTATCCCCACCTCAATAAGGATCTTTAAGCATGCAAGTAGTGGGTTCT
TGATGATGAGGATGAGATGGATTCTATGAATAAGTATGATTTTGTGTTTATGTATGCTGC
ATAATTAAGACTTTTGATTTATAGACATAAGTGGCTATAGCTGTAATAGCCTTCGACATC
TCTCTTCTGTTTCAGAAGATGTTTGTGCGCGCCTTTTGAAACCTTTTGCTTATATATAAA
CGGATGGATTAT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL7494Contig1 611 2 2 U
TAAAATACTAAATCTCTCTCAAACCACCCCTCTTGTGATAATTTCTCCGTCTTCCCAAAC
ACACCATCTTTATCATTCTGGTTCTCAGAAATGCGAGATATGGTCCTCATTTATGACAAC
CAGTGATTTCTGGCTTGGGAGAAGATAACAAACCCTTCACATGCACCATGGACTCCATTG
AAGCCAAGTAAACGCATATCATCCTCGTCAAATCGACAGAAGACAAACCAGACGATTGCC
AGCGGCGTGTGGATTGAGGAGCAGCTTCCCCGAGGTGGTAAGTGTACAACTCAACGATTG
CACTTTGAGTTGTTCTTCCTGAGTAAACTCAGAAGTTCTAGTGACGATTATCTCAAGCTT
TCTTTCTCTCTCTCTATCTATTGGAGGAAGATGATAGATTTGACTACACTTGTTTTGTGG
ATGTGGATACAATTTTATAGATAAATTTTCATATACAAATCCTTGTCCACAACTTTTGTT
TTTCTATCCATGTATTTTCCATCTTTTGTATTAATGTCCACAATCTTCATTTTCCATAAA
CTTTCTTTTTTCCTCCATAAACTTTGTTTTATTTTTCCTGAACTTGTACGTGGATGTTAT
TGGTTTGAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G484TF U 1
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TGGTTTGAACC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DP62JQ U 1
AF RR4DQ79JQ U 1
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QA 1 563 1 563
DS 



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BQ
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AF RR4FM59TF U 1
AF RR4FM59JQ C 128
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BS 668 778 RR4FM59JQ

RD RR4FM59TF 667 0 0
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CCAAATGTGTTGGTGAGGTTTACCTGTTTAGAGTCGGTTTTGAGTTATGCAGTCTTCGAA
TGTCCCTTCTTTATGTTGGTTGGTAGGTTGCTGTACTAGCTGTGCTGTACGTGTTAAATC
TGGAGAG

QA 1 667 1 667
DS 

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ACGAGGAGTCGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAGCTGA
ATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTACTCCCTTCTCTCTCTTCAC
CCCCTCTTTTTTTTTTGGTTTCCTAAGAAAGTCGTTTGCATATCTTTTACTGTCTTCTTT
TACCACATTTGAAATTTTCAAGGGTAATTTAGATAGTTAGGGTTTGTTAGTATGCTGATG
ATATGCATGACGTGTAGTTTACATGTTTCTGTGAGATTTAATGCCTTGGCAGTCCAAATG
TGTTGGTGAGGTTTACCTGTTTAGAGTCGGTTTTGAGTTATGCAGTCTTCGAATGTCCCT
TCTTTATGTTGGTTGGTAGGTTGCTGTACTAGCTGTGCTGTACGTGTTAAATCTGGAGAG
TTAAGGCAGCCACAAGCATTAGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAGGTAATAATATCC
CTTTACCTTGTGCTTCAGGGAGGCCACAACTTCATTGACTTAGCTGTCTGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

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GAAGAATCCAGAGAAAGGAACAAAGAAAGTTATACAGACCAGTCTCAGTTTCTCAAAGAA
GACTGAAACAAACGAGTTGCAAGTTGAGTCATAGCCTGTCATAGTCTAAGACTCTATATC
CGGTTCATTTTCTTCTTGTTTCACTTTACATCACATGATAGAAAAATATGGAAATGTCAA
ATTCCTGCAAAAGAAATGTTTGTCCCCCAAACCCTTTTACTCAATAGCAATTTTGTCTAA
GCAAATAATAGTTAACGGATTATACATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4E755JQ C 1
AF RR4E755TF U 39
BS 1 38 RR4E755JQ
BS 39 389 RR4E755TF

RD RR4E755JQ 389 0 0
GAGGAAACTCGAGGATGGTGGATACTCATCCGATGATGAGTCTTCTTGTTACAAAAGACA
CAAGAAGATGGAGGAGGCTAAGTATGAAGATTGGAAATCAACAGTTGTTGATTCGATCAA
GAAGAATCCAGAGAAAGGAACAAAGAAAGTTATACAGACCAGTCTCAGTTTCTCAAAGAA
GACTGAAACAAACGAGTTGCAAGTTGAGTCATAGCCTGTCATAGTCTAAGACTCTATATC
CGGTTCATTTTCTTCTTGTTTCACTTTACATCACATGATAGAAAAATATGGAAATGTCAA
ATTCCTGCAAAAGAAATGTTTGTCCCCCAAACCCTTTTACTCAATAGCAATTTTGTCTAA
GCAAATAATAGTTAACGGATTATACATAT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4E755TF 351 0 0
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CAACAGTTGTTGATTCGATCAAGAAGAATCCAGAGAAAGGAACAAAGAAAGTTATACAGA
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TCATAGTCTAAGACTCTATATCCGGTTCATTTTCTTCTTGTTTCACTTTACATCACATGA
TAGAAAAATATGGAAATGTCAAATTCCTGCAAAAGAAATGTTTGTCCCCCAAACCCTTTT
ACTCAATAGCAATTTTGTCTAAGCAAATAATAGTTAACGGATTATACATAT

QA 1 351 1 351
DS 



AS 1 2

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ATTTATGTCCCAAAAAAGTCAATTTATCTAGAACCCCTCTCTGTTCTTGTTATCTCCATG
TTTTTAACGTCATCGATTGTTTTTTTCTTCTGTTGGATCAACCTCTCGAGTATATTCCTA
TCCGCGTCTGGAAGTGTACAAGGTCGGTCCAGAGACAGTACAGCTCTGGATTTTTCGAGT
AGGTCCCTCTCTTTTTGCTCTGCGAAGCAAAGCAGTGATCCTTCACAAACCTCTTTAGCA
GAATACGGCTTCTCTGGTTTAAACTTCTGAAGCTTTGAGTACTCAGTGATGAGATGGAAC
ATGTAGTCATACACCCGGTTCATGCTAATGCTTTCCATGTAACTCTGTCCCCTTTTTCCT
ATTGCTTCAGCATCAGCAGGGTTGGCATTGCCCCAGTCCACAGCGAATTTAATGGACCGA
CATAGATCAGTGGTAGAGACGGGCCAGTAGTTTTCCTTGGGAAGGAGGCCTCTGCTGAAG
AAATCTTCATACTCTGGTGAGATTATGAGTGTCATGGAGCCACATGACATGATATACTTT
AGAGAAACTGACCACGCGCAACCCTCAGCATATATCTTGTACCTGTGATTACATTGGTTG
GAGAGCTTGGACTGTTCAAACCCACCTTTTGCCTCTTCTGCCCAGTTCTGGCGCATAATC
TGTGCTCCCCATAACCTTGAATGATTGCATTTCATCAGCTCCATTCTTATAGGCGATACA
ACATCCGGATTCCCTTTCCAGTAAGCTCTAGGTTGCTTGCTGCCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B505JQ U 1
AF RR4AO77JQ U 7
BS 1 445 RR4B505JQ
BS 446 446 RR4AO77JQ
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BS 597 601 RR4AO77JQ
BS 602 813 RR4B505JQ
BS 814 826 RR4AO77JQ

RD RR4B505JQ 820 0 0
GGTCATAATCAAGTATTATCTCGTGCTAAAGCTGATGATGAAAAAAAAAGACAACCAAAA
ATTTATGTCCCAAAAAAGTCAATTTATCTAGAACCCCTCTCTGTTCTTGTTATCTCCATG
TTTTTAACGTCATCGATTGTTTTTTTCTTCTGTTGGATCAACCTCTCGAGTATATTCCTA
TCCGCGTCTGGAAGTGTACAAGGTCGGTCCAGAGACAGTACAGCTCTGGATTTTTCGAGT
AGGTCCCTCTCTTTTTGCTCTGCGAAGCAAAGCAGTGATCCTTCACAAACCTCTTTAGCA
GAATACGGCTTCTCTGGTTTAAACTTCTGAAGCTTTGAGTACTCAGTGATGAGATGGAAC
ATGTAGTCATACACCCGGTTCATGCTAATGCTTTCCATGTAACTCTGTCCCCTTTTTCCT
ATTGCTTCAGCATCAGCAGGGTTGGTATTGCCCCAGTCCACAGCGAATTTAATGGACCGA
CATAGATCAGTGGTAGAGACGGGCCAGTAGTTTTCCTTGGGAAGGAGGCCTCTGCTGAAG
AAATCTTCATACTCTGGTGAGATTATGAGTGTCATGGAGCCACATGACATGATATA****
*GAGAAACTGACCACGCGCAACCCTCAGCATATATCTTGTACCTGTGATTACATTGGTTG
GAGAGCTTGGACTGTTCAAACCCACCTTTTGCCTCTTCTGCCCAGTTCTGGCGCATAATC
TGTGCTCCCCATAACCTTGAATGATTGCATTTCATCAGCTCCATTCTTATAGGCGATACA
ACATCCGGATTCCCTTTCCAGTAAGCTCTAGGT
GCTTGCT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4AO77JQ 820 0 0
AC
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CCCAAAAAAGTCAATTTATCTAGAACCCCTCTCTGTTCTTGTTATCTCCATGTTTTTAAC
GTCTTCGATTGTTTTTTTCTTCTGTTGGATCAACCTCTCGAGTATATTCCTATCCGCGTC
TGGAAGTGTACAAGGTCGGTCCAGAGACGGTACAGCTCTGGATTTTTCGAGTAGGTCCCT
CTCTTTTTGCTCTGCGAAGCAAAGCAGTGATCCTTCACAAACCTCTTTAGCAGAATACGG
CTTCTCTGGTTTAAACTTCTGAAGCTTTGAGTACTCAGTGATGAGATGGAACATGTAGTC
ATACACCCGGTTCATGCTAATGCTTTCCATGTAACTCTGTCCCCTTTTTCCTATTGCTTC
AGCATCAGCAGGGTTGGCATTGCCCCAGTCCACAGCGAATTTAATGGACCGACATAGATC
AGTGGTAGAGACGGGCCAGTAGTTTTCCTTGGGAAGGAGGCCTCTGCTGAAGAAATCTTC
ATACTCTGGTGAGATTATGAGTGTCATGGAGCCACATGACATGATATACTTTAGAGAAAC
TGACCACGCGTAACCCTCAGCATATATCTTGTACCTGTGATTACATTGGTTGGAGAGCTT
GGACTGTTCAAACCCACCTTTTGCCTCTTCTGCCCAGTTCTGGCGCATAATCTGTGCTCC
CCATAACCTTGAATGATTGCATTTCATCAGCTCCATTCTTATAGGCGATACAACATCCGG
ATTCCCTTTCCAGTAAGCTCTAGGTTGCTTGCTGCCCC

QA 3 820 3 820
DS 



AS 1 2

CO CL7499Contig1 606 2 1 U
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CTCGGATTAGAGAGAAGTATCCAGATAGGATTCCGGTGATTGTTGAGAAGGCTGAGAAGA
GTGATACACCAACCATCGACAAGAAAAAATACCTAGTCCCGGCGGATTTGACAGTAGGGC
AATTTGTGTATGTGGTTCGCAAAAGAATCAAACTGAGCGCAGAGAAGGCTATCTTTATAT
TTGTCGACAATGTTCTTCCTCCAACAGGTGCGTTGATGTCTGCAGTGTACGAAGATAAAA
AGGAGGAGGATGGGTTCCTCTATGTCACTTACAGCGGGGAGAACCCATTTGGATAATGGA
TCTCCATAGAAGCTCTCTCTCTTGCTGGATAATTTCATTCTACCTTCTTTCTGTTCTGTA
CTTCGCATATCATCTTCTTAATTAGTTATTTAAGCAAGCAAACAAGCCTATGTACTTCCC
TAAAGACGTTCGATTGGGCGTTGATGTGTACAGAAAACATGAAATAATGTATATAAACTA
TGCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4ET79JQ C 1
AF RR4ET79TF U 1
BS 1 606 RR4ET79TF

RD RR4ET79JQ 606 0 0
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GTGATACACCAACCATCGACAAGAAAAAATACCTAGTCCCGGCGGATTTGACAGTAGGGC
AATTTGTGTATGTGGTTCGCAAAAGAATCAAACTGAGCGCAGAGAAGGCTATCTTTATAT
TTGTCGACAATGTTCTTCCTCCAACAGGTGCGTTGATGTCTGCAGTGTACGAAGATAAAA
AGGAGGAGGATGGGTTCCTCTATGTCACTTACAGCGGGGAGAACCCATTTGGATAATGGA
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CTTCGCATATCATCTTCTTAATTAGTTATTTAAGCAAGCAAACAAGCCTATGTACTTCCC
TAAGGACGTTCGATTGGGCGTTGATGTGTACAGAAAACATGAAATAATGTATATAAACTA
TGCTCT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4ET79TF 606 0 0
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TAATGGCAAAAAGCACGTTCAAGCAAGAGCATGACCTAGAGAAGAGAAGCGCAGAGGCTG
CTCGGATTAGAGAGAAGTATCCAGATAGGATTCCGGTGATTGTTGAGAAGGCTGAGAAGA
GTGATACACCAACCATCGACAAGAAAAAATACCTAGTCCCGGCGGATTTGACAGTAGGGC
AATTTGTGTATGTGGTTCGCAAAAGAATCAAACTGAGCGCAGAGAAGGCTATCTTTATAT
TTGTCGACAATGTTCTTCCTCCAACAGGTGCGTTGATGTCTGCAGTGTACGAAGATAAAA
AGGAGGAGGATGGGTTCCTCTATGTCACTTACAGCGGGGAGAACCCATTTGGATAATGGA
TCTCCATAGAAGCTCTCTCTCTTGCTGGATAATTTCATTCTACCTTCTTTCTGTTCTGTA
CTTCGCATATCATCTTCTTAATTAGTTATTTAAGCAAGCAAACAAGCCTATGTACTTCCC
TAAAGACGTTCGATTGGGCGTTGATGTGTACAGAAAACATGAAATAATGTATATAAACTA
TGCTCT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7501Contig1 902 2 4 U
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CTTTGTTTCTTTTCTTCTCCATGGTTACTTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTGTGTAAGG
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ATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAGAAAGTTTCCACTGGTGCAACGTGTGACTTTA
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CTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAACTCCAACCACCGGAAATTTTACCACCGGAA
CTCCATCCACCGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACTGGAGTGCCGA
CTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCAGTACCGGTTTCGATC
CCAGCGGTGGTGAGGAGCTCTCTATCCGAACCAAGACCGTCATAGTACTAACCACTATCG
TCGCTGTGGCATTGCAAGTTTAGGTGTGACATCATCTCAGACTAAGGGGTTTTACTTGCT
ATGGACGGCATAGGTTTTGCCAACGGTGTGTTTACGTAGGTGAAAAGCTAGAGCTGTCTC
TTTTGCTTCCCGCTTTCTTTTCTGGTTTGTTTTAAAACTCTTTTTAGGGTTTGGATTTAC
TTCTTTAATTAGTATTTTGTTATATATATAAAGTTTAAAAAATAAAGAGCTTTTCTTGCT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4DP33TF U 1
AF RR4DP33JQ C 212
BS 1 683 RR4DP33TF
BS 684 684 RR4DP33JQ
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BS 709 902 RR4DP33JQ

RD RR4DP33TF 710 0 0
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CTTTGTTTCTTTTCTTCTCCATGGTTACTTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTGTGTAAGG
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ATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAGAAAGTTTCCACTGGTGCAACGTGTGACTTTA
ACGGTGCCGCCGCCATCTCCATTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTT
CTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAACTCCAACCACCGGAAATTTTACCACCGGAA
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CTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCAGTACCGGTTTCGATC
CCAGCGGTGGTGAGGAGCTCTCTATCCGAACCAAGACCGTCATAGTACTAACCACTATCG
TCGCTGTGGCATTGCAAGTTTAG*TGTGACATCATCTCAGACTAAGGG
TT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4DP33JQ 691 0 0
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CCAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGTGATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAGAA
AGTTTCCACTGGTGCAACGTGTGACTTTAACGGTGCCGCCGCCATCTCCATTTCCCCTCC
TTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAAC
TCCAACCACCGGAAATTTTACCACCGGAACTCCATCCACCGGAAATTCAACCTTGGGGAT
GCCAACCAATCCCACCACTGGAGTGCCGACTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGG
ACCATCAGGGAGCAGTACCGGTTTCGATCCCAGCGGTGGTGAGGAGCTCTCTATCCGAAC
CAAGACCGTCATAGTACTAACCACTATCGTCGCTGTGGCATTGCAAGTTTAGGTGTGACA
TCATCTCAGACTAAGGGGTTTTACTTGCTATGGACGGCATAGGTTTTGCCAACGGTGTGT
TTACGTAGGTGAAAAGCTAGAGCTGTCTCTTTTGCTTCCCGCTTTCTTTTCTGGTTTGTT
TTAAAACTCTTTTTAGGGTTTGGATTTACTTCTTTAATTAGTATTTTGTTATATATATAA
AGTTTAAAAAATAAAGAGCTTTTCTTGCTTT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7502Contig1 705 2 3 U
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GGCTTCATAGAGAATATCGGAAGGTTTTAAGTGGTTATCGAAGAGCAAATCTTCATCTTT
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CGAGATCTTTGACTCTATCCCGTCGAGGGGAAGTTTCCGCACGCATCTCTCAATCGCGAG
ATTGCGGTCGTATGATTCTCGTTCCCATTAAAACGAAATCGCAAGATCTAGGAAATGGGA
ATCATAGTGTAGAGGAGGATGTAATGGATCTTGATGAAAATCGGATTGATGTAGATGGCA
ATGAAAAGGTCATTAGTGGTGATGAGGAGTTTATAGGTATCATCGGCTTCAAAGATTTGT
GGTGCGAGTGTTTGGTCAGCTTCGGTGTTTTTATTTTTGTTTTTTCAATAAGCTCTGTGA
GCATATTATTTTGTAGTACTGATGAGGTCTCTTGGCTTTATTTTGGCCTTTTGTTTCTGG
TATGTCTTCATGTTAAGGTTCTGAACTGGAATAAATTTGGTTTCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GV43TF U 4
AF RR4GV43JQ C 1
BS 1 3 RR4GV43JQ
BS 4 645 RR4GV43TF
BS 646 705 RR4GV43JQ

RD RR4GV43TF 642 0 0
AACTTCGAGTCGACATAGTCAATAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCTCTACTATGGCGACGG
CGATGGCGACTTTCTAGGGTTTCATGGTTTCTCAAGGTTGGGATCCCGGAGATCTATGGC
TTCATAGAGAATATCGGAAGGTTTTAAGTGGTTATCGAAGAGCAAATCTTCATCTTTATG
AAAGTTGCAGTGGTGGATGGAAGCAGAAAGAGGTTACTGTAAGGAAATATCTTATGGATT
CTCGGAGGATATTATGGAGACTTGAAAAGTCCAGGAAGGCAAGGCAAGGCGATTCGACGA
GATCTTTGACTCTATCCCGTCGAGGGGAAGTTTCCGCACGCATCTCTCAATCGCGAGATT
GCGGTCGTATGATTCTCGTTCCCATTAAAACGAAATCGCAAGATCTAGGAAATGGGAATC
ATAGTGTAGAGGAGGATGTAATGGATCTTGATGAAAATCGGATTGATGTAGATGGCAATG
AAAAGGTCATTAGTGGTGATGAGGAGTTTATAGGTATCATCGGCTTCAAAGATTTGTGGT
GCGAGTGTTTGGTCAGCTTCGGTGTTTTTATTTTTGTTTTTTCAATAAGCTCTGTGAGCA
TATTATTTTGTAGTACTGATGAGGTCTCTTGGCTTTATTTTG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4GV43JQ 705 0 0
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CGGCGATGGCGACTTTCTAGGGTTTCATGGTTTCTCAAGGTTGGGATCCCGGAGATCTAT
GGCTTCATAGAGAATATCGGAAGGTTTTAAGTGGTTATCGAAGAGCAAATCTTCATCTTT
ATGAAAGTTGCAGTGGTGGATGGAAGCAGAAAGAGGTTACTGTAAGGAAATATCTTATGG
ATTCTCGGAGGATATTATGGAGACTTGAAAAGTCCAGGAAGGCAAGGCAAGGCGATTCGA
CGAGATCTTTGACTCTATCCCGTCGAGGGGAAGTTTCCGCACGCATCTCTCAATCGCGAG
ATTGCGGTCGTATGATTCTCGTTCCCATTAAAACGAAATCGCAAGATCTAGGAAATGGGA
ATCATAGTGTAGAGGAGGATGTAATGGATCTTGATGAAAATCGGATTGATGTAGATGGCA
ATGAAAAGGTCATTAGTGGTGATGAGGAGTTTATAGGTATCATCGGCTTCAAAGATTTGT
GGTGCGAGTGTTTGGTCAGCTTCGGTGTTTTTATTTTTGTTTTTTCAATAAGCTCTGTGA
GCATATTATTTTGTAGTACTGATGAGGTCTCTTGGCTTTATTTTGGCCTTTTGTTTCTGG
TATGTCTTCATGTTAAGGTTCTGAACTGGAATAAATTTGGTTTCT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7504Contig1 1037 2 2 U
GTGGAGCCAGCCGTAAGGACTCTGTTCTCTCTCGCTAGAGCCAAACCCTAGACACATCCA
CCAATCCACCGAGAGCAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGGAGAAAGCTTTTCTCTGTTTCGC
AGAGATCTACCAATGCGACCTCCTTCGTCCTCTCCAGAGACCATACCCTCTCCGGTGGCG
GCGGCGACTCCTCTCTCCCCTCTGCAGATATTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTA
GCCTTGTAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACTCAAGGAGGAAATGAGATAGGTTTCG
GCTCGGAACCAGCCACCGTAGAGGCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACA
ACCATAACCACGAGCGTTACCCGCCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCATTCGCGTATTTCG
TCCTGTCTGGTGGGAGGTTTGTGTACGCATCAGTTCTCCGTCTTCTTGTTCTGAAGCTCA
TTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGACGTCCTTTCTCTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCG
GGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACAGTCGAGTGGCGCGGGAAGCCTGTCTTCATCA
GGAGAAGAACAGAGGATGATATCAAGCTGGTCAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGG
ATCCGCAGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAATCCGGAGTGGTTAGTGGTTGTTGGAGTGT
GCACTCACCTGGGGTGCATCCCTTTGCCTAATGCTGGTGACTACGGTGGTTGGTTTTGTC
CGTGTCACGGCTCGCATTATGACATCTCAGGAAGGATTAGGAAAGGTCCTGCACCGTATA
ACCTGGAAGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAAGAGAATAAGTTACTCATTGGTTAATAAC
GAATAAAAGCACCACAACAGACGGTTGTCTGTGTCTCAAAGATTCTCGTCTGTTATAATT
TTTTTCTTAAATACTCTGGCAATTTACAGCAAGATTGTCTTGGTTTTTTGCTGAATAATA
AAAACTTGTTCACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DU14TF U 1
AF RR4DU14JQ C 275
BS 1 598 RR4DU14TF
BS 599 1037 RR4DU14JQ

RD RR4DU14TF 598 0 0
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AGAGATCTACCAATGCGACCTCCTTCGTCCTCTCCAGAGACCATACCCTCTCCGGTGGCG
GCGGCGACTCCTCTCTCCCCTCTGCAGATATTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTA
GCCTTGTAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACTCAAGGAGGAAATGAGATAGGTTTCG
GCTCGGAACCAGCCACCGTAGAGGCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACA
ACCATAACCACGAGCGTTACCCGCCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCATTCGCGTATTTCG
TCCTGTCTGGTGGGAGGTTTGTGTACGCATCAGTTCTCCGTCTTCTTGTTCTGAAGCTCA
TTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGACGTCCTTTCTCTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCG
GGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACAGTCGAGTGGCGCGGGAAGCCTGTCTTCAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4DU14JQ 763 0 0
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ACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACAACCATAACCACGAGCGTTACCCGCCTGGTGACCC
TAGCAAGCGTGCATTCGCGTATTTCGTCCTGTCTGGTGGGAGGTTTGTGTACGCATCAGT
TCTCCGTCTTCTTGTTCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGACGTCCTTTC
TCTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACAGTCGA
GTGGCGCGGGAAGCCTGTCTTCATCAGGAGAAGAACAGAGGATGATATCAAGCTGGTCAA
TAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGATCCGCAGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAATCC
GGAGTGGTTAGTGGTTGTTGGAGTGTGCACTCACCTGGGGTGCATCCCTTTGCCTAATGC
TGGTGACTACGGTGGTTGGTTTTGTCCGTGTCACGGCTCGCATTATGACATCTCAGGAAG
GATTAGGAAAGGTCCTGCACCGTATAACCTGGAAGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAAGA
GAATAAGTTACTCATTGGTTAATAACGAATAAAAGCACCACAACAGACGGTTGTCTGTGT
CTCAAAGATTCTCGTCTGTTATAATTTTTTTCTTAAATACTCTGGCAATTTACAGCAAGA
TTGTCTTGGTTTTTTGCTGAATAATAAAAACTTGTTCACATTT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7505Contig1 751 2 2 U
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AATTCTCCATCACAAATTCATCTTCTAGTGATAACAATATTAGTTATCATCACAACTCTT
TTAACCCCGATCACAACCAACACATCATCACTACCATGGAGTATCCTTTCCAATGACAAC
TTCGCCGGAACTCACCACCGCATCCTCCTCCGTCGAGTCAGCTTCCACTGATTTCGGCCA
CATCACCATAGTCTTTCCCTCTGCCGTCTTAAACCCTTCCTCCGTCCAAGATATCACCGA
TCTTATAAAGCTTTCTTTCGATTCTCAATCCTCTTTTCCTCTAGCCGCTCGTGGCCACGG
ACATTGCCACCGTGGTCAAGCCGCTGCTAAAGACGGAGTCGTGGTCAACATGCGGTCAAT
GGTAAACAGGGACCGAGGCATCAAGGTGTCTAGGACCGGTTTATACGTTGACGTGGACAG
CGCGTGGCTATGGATCGAGGTGTTGAATAAAACTTTGGAGTTAGGGCTGACGCCGGTTTC
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TATGTACATCTTTTTACATGCATTCTAAATATGTGAAAACAGTAATGATTTTTACTTCGT
ACATTTGCCAATAAAAATAAACTTTCGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F093TF U 1
AF RR4F093JQ C 69
BS 1 670 RR4F093TF
BS 671 751 RR4F093JQ

RD RR4F093TF 670 0 0
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AATTCTCCATCACAAATTCATCTTCTAGTGATAACAATATTAGTTATCATCACAACTCTT
TTAACCCCGATCACAACCAACACATCATCACTACCATGGAGTATCCTTTCCAATGACAAC
TTCGCCGGAACTCACCACCGCATCCTCCTCCGTCGAGTCAGCTTCCACTGATTTCGGCCA
CATCACCATAGTCTTTCCCTCTGCCGTCTTAAACCCTTCCTCCGTCCAAGATATCACCGA
TCTTATAAAGCTTTCTTTCGATTCTCAATCCTCTTTTCCTCTAGCCGCTCGTGGCCACGG
ACATTGCCACCGTGGTCAAGCCGCTGCTAAAGACGGAGTCGTGGTCAACATGCGGTCAAT
GGTAAACAGGGACCGAGGCATCAAGGTGTCTAGGACCGGTTTATACGTTGACGTGGACAG
CGCGTGGCTATGGATCGAGGTGTTGAATAAAACTTTGGAGTTAGGGCTGACGCCGGTTTC
TTGGACGGATTATTTGTATTTAACGGTCGGTGGAACGTTATCTAACGGCGGTATAAGCGG
ACAAACGTTTCGGTATGGTCCACAAATCAGTAATGTTTTAGAGATGGATGTTATTACTGG
TATGTACATC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4F093JQ 683 0 0
ATCACAAATTCATCTTCTAGTGATAACAATATTAGTTATCATCACAACTCTTTTAACCCC
GATCACAACCAACACATCATCACTACCATGGAGTATCCTTTCCAATGACAACTTCGCCGG
AACTCACCACCGCATCCTCCTCCGTCGAGTCAGCTTCCACTGATTTCGGCCACATCACCA
TAGTCTTTCCCTCTGCCGTCTTAAACCCTTCCTCCGTCCAAGATATCACCGATCTTATAA
AGCTTTCTTTCGATTCTCAATCCTCTTTTCCTCTAGCCGCTCGTGGCCACGGACATTGCC
ACCGTGGTCAAGCCGCTGCTAAAGACGGAGTCGTGGTCAACATGCGGTCAATGGTAAACA
GGGACCGAGGCATCAAGGTGTCTAGGACCGGTTTATACGTTGACGTGGACAGCGCGTGGC
TATGGATCGAGGTGTTGAATAAAACTTTGGAGTTAGGGCTGACGCCGGTTTCTTGGACGG
ATTATTTGTATTTAACGGTCGGTGGAACGTTATCTAACGGCGGTATAAGCGGACAAACGT
TTCGGTATGGTCCACAAATCAGTAATGTTTTAGAGATGGATGTTATTACTGGTATGTACA
TCTTTTTACATGCATTCTAAATATGTGAAAACAGTAATGATTTTTACTTCGTACATTTGC
CAATAAAAATAAACTTTCGTACG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

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ATCAAGATTAGGAATAAAAGATGAGTTATTTAGGAGTTGGAGTCAGTCCCGGGAACGTCG
CCGGAGCCACAATGAAGCTGAACGATCGCAAAGCGAGACTCACGGAGCTGATTCTGAGAT
GTTCTGTTTGTGCCCTCGCTCTCGTAGCTGCGGTTCTCATTGCTACAGACACTCAAGTCA
AAGAGATTTTCACCATCCAGAAGAAGGCCAAGTACACCGACATGAAGGCGCTTGTGTTAT
TGGTGGTCGTCAATGGGATAGCCGCGGCTTATTCTTTGGTGCATGGTGTTCGTTGCGTTG
TGGGTATGATGAAAGGAAGCGTTTTGTTCAGTAAGCCTCTGGCTTGGGCCATTTTCTCCG
GTGATCAGGCAATAGCGTATTTGACTGTGGCGGCCGTTGCAACAGCAGCGCAGTCTGCAG
CCTTTGCAAAGCTGGGTGAGCCAGAGCTTCAATGGATGAAGATATGCACAATGTATGGGA
AGTTCTGTAACCAAGTAGGTGAAGGGATTGCGACCGCCTTGCTTGCTAGCATTGGTATGG
TTTTGGTCTCTTGCATTTCAGCTTTGGGTCTCTTTCGTTTGTATGGGGGTAACAAAGCCA
GGCAAAGCCCACGGTGGTAGGCCATGGCTCATACCGGTCTTGGACTATCTTGTTTGTGTT
AAATAAATTGTGGTGTGTGCTCTCACTCTGTCTTTCAATGTGTATACCGTCTGTTACTAC
TTTCACGGTCTCGTTTGGTCAATAATAATCGAAATTGTAGTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 1 785 RR4B357TF
BS 786 825 RR4B357JQ

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GGCAAAGCCCACGGTGGTAGGCCATGGCTCATACCGGTCTTGGACTATCTTGTTTGTGTT
AAATAAATTGTGGTGTGTGCTCTCACTCTGTCTTTCAATGTGTATACCGTCTGTTACTAC
TTTCA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4B357JQ 650 0 0
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GTTATTGGTGGTCGTCAATGGGATAGCCGCGGCTTATTCTTTGGTGCATGGTGTTCGTTG
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TTCCGGTGATCAGGCAATAGCGTATTTGACTGTGGCGGCCGTTGCAACAGCAGCGCAGTT
TGCAGCCTTTGCAAAGCTGGGTGAGCCAGAGCTTCAATGGATGAAGATATGCACAATGTA
TGGGAAGTTCTGTAACCAAGTAGGTGAAGGGATTGCGACCGCCTTGCTTGCTAGCATTGG
TATGGTTTTGGTCTCTTGCATTTCAGCTTTGGGTCTCTTTCGTTTGTATGGGGGTAACAA
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GTGTTAAATAAATTGTGGTGTGTGCTCTCACTCTGTCTTTCAATGTGTATACCGTCTGTT
ACTACTTTCACGGTCTCGTTTGGTCAATAATAATCGAAATTGTAGTTTGG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7507Contig1 1182 2 2 U
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CTCGCCTCCAACGTAAGTCCAGCTTTTGAATAAGCTTTGACAAGTGTACTCCCGCAAACT
AGGTCAAAACCAAGACCAGACACAATTGCATTTCCATGGATACACCTCAACCCCTCTGTA
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AACTTCGTTTGAAATTTTCTCGAGAACTCGTTGATTATCAAACGTAATTGCGACTGCGAT
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CCTAAAATCCAATTTGAATTAATATAAACTGAAGTAGTTTAAATTATATAATAATAGTTA
TGCAAATTTACAAATTCGTCTAATTTTTTCTTTTGTATATGTAGTTTTATAATTTCATCA
ACATAATTTTATAATTAAACTCAAAAATTAAAACTAAATATATTTTTATAATACTATATA
GCTTTACAATTCATCAAAAGATTTTTTGTAATTCATTAAAATAATTTTATAATCAAAAGA
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GACTTGTCGGAAAACCTTTTGTCTTAATATAAGATTCTTCCC


BQ
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AF RR4EM72TF U 1
AF RR4EM72JQ C 503
BS 1 773 RR4EM72TF
BS 774 1182 RR4EM72JQ

RD RR4EM72TF 773 0 0
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TAAGAATGAGAGTCTAAACCCACTTTCAGACAAAACCCATGAACAGACCGAGCAACGAAC
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TCAGAGCTAAGCATCTGAGAGAAGAGTGACAAAGCGGGACGGAGTCGATGAGGGGATTTA
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DS 

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CATCGTTTAGCGAATAGTATCTGACCAGCTGCGTAGCGAAATAGGGATCCCGCGCGAGTT
GGGACTTGGTGACGAAGCTGTGCAGCTTCTGGGTATTCAACTTCGTTTGAAATTTTCTCG
AGAACTCGTTGATTATCAAACGTAATTGCGACTGCGATGACATTAGCAGAAGCTAGCAAA
AGTGAACTACTCTGCGGCAAACCTATTTTTAGAACATTCCTAAAATCCAATTTGAATTAA
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ATTTTTTCTTTTGTATATGTAGTTTTATAATTTCATCAACATAATTTTATAATTAAACTC
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TTACACAACAAAAATATTAAAGAATTGAAACTAAAGTTGACTTGTCGGAAAACCTTTTGT
CTTAATATAAGATTCTTCCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

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TCATTGCACAACACCTGTAGTGCCTCCCCAATCTCTCCCCAAGACGGAGGTTAGGAGTTT
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GTGGGATTGTTACGATGAATGGAGTGCCTACGGAGCTGGTGTTCCCATTCGTCTCACTAA
CGGCGAATCTCTTGTTCAATACTACGTTCCTTATCTCTCTGCGATTCAGATCTTCATCTC
TCGCTCTTCACTGATCCGCTTAAGGGATGAGTCTGAGTATGGGGAGAGCGAGACGAGAGA
TTCGTTTAGTGATTCATATAGTGAAGAGAGCGAAAGTGATAAGCTTTCAAGAAGTGCTGC
TTCTGATGAAGGACTTGAGCATGACGCTGTTATACATCCTAACGATCGTTTGGGCTATCT
TTATCTTCAACACTTTGAGGAGATCAGCTCCTTTATGCTCGAGTTCCTCTCATGGATAAG
ATCAATGAGTTGGCTCGAAGGTACCCTGGATTGATGTCGCTGAGAAGCGTAGATCTTTCC
TCGGCGAGCTGGATGGCTGTAGCGTGGTACCCTATTTACCATATACCAATGGGAAGGACC
ATCAAAGATTTGTCTACTTGTTTCCTCACTTATCACACTCTTTCATCTTCTTTCCAAGAT
ATGGAGCCAGAAGAGAATGGCGGGGAGAAGGAGAGGGCTCGGAAGGAAGGGGAAGGTGTA
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GACCATCATGGTCAAGATCAAGAACGAGTTCTGTCGCTTCTAAGTGTTGCTGATTCTTGG
CTAAAACAGCTGAGAGTCCAACACCATGACTTCAACTACTTTTCAAGAATGGCTCACCGA
TGATTTACAACTGTAGATTTGTTTTTATATATCTCATCTCTTTTTTTTTGTTTTACATGT
TTCTCTCAAGTGAAAAGGAGATTACTTTTTTTCCTTGGTCGCAATAACCATGTTTGAAGC
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TGAAGTGTTGATAAAGAGTGCTTCTTGTTTCTTGATAACATTGGGTCTTGTTCTTGTACT
TCAGTAACATTTTAATGAAATAGTAATAACCATCTGATT


BQ
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AF RR4GS85TF U 1
AF RR4GS85JQ C 547
BS 1 559 RR4GS85TF
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RD RR4GS85TF 774 0 0
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TCATTGCACAACACCTGTAGTGCCTCCCCAATCTCTCCCCAAGACGGAGGTTAGGAGTTT
GAATCGGATTTGGCATCAATCAGAGAGAGAAAAGGTTGAGTTTTTCAGATTGAGTGATCT
GTGGGATTGTTACGATGAATGGAGTGCCTACGGAGCTGGTGTTCCCATTCGTCTCACTAA
CGGCGAATCTCTTGTTCAATACTACGTTCCTTATCTCTCTGCGATTCAGATCTTCATCTC
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TTATCTTCAACACTTTGAG*AGATCAGCTCCTT*ATGCTCGAGTTCCTCTCATGGATAAG
ATCAATGAGTTGGCTCGAAGGTACCCTGGATTGATGTCGCTGAGAAGCGTAGATCTTTCC
TCGGCGAGCTGGATGGCTGTAGCGTGGTACCCTATTTACCATATACCAATGGGAAGGAC*
ATCAAAGATTTGTCTACTTGTTTCCTCACTTATCACACTCTTTCATCTTCTTTC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4GS85JQ 813 0 0
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GAGTTGGCTCGAAGGTACCCTGGATTGATGTCGCTGAGAAGCGTAGATCTTTCCTCGGCG
AGCTGGATGGCTGTAGCGTGGTACCCTATTTACCATATACCAATGGGAAGGACCATCAAA
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CCAGAAGAGAATGGCGGGGAGAAGGAGAGGGCTCGGAAGGAAGGGGAAGGTGTAACTTTG
CTTCCTTTCGGGTTAGCCACTTACAAGATGCAAGGCAATGTTTGGCTCTCGGAGGACCAT
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CAGCTGAGAGTCCAACACCATGACTTCAACTACTTTTCAAGAATGGCTCACCGATGATTT
ACAACTGTAGATTTGTTTTTATATATCTCATCTCTTTTTTTTTGTTTTACATGTTTCTCT
CAAGTGAAAAGGAGATTACTTTTTTTCCTTGGTCGCAATAACCATGTTTGAAGCAGCAGT
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TTTGGGTGTAGAATAGGTTTTGTGTCCTATCTATGGGAGATGTCGTATATCATATGAAGT
GTTGATAAAGAGTGCTTCTTGTTTCTTGATAACATTGGGTCTTGTTCTTGTACTTCAGTA
ACATTTTAATGAAATAGTAATAACCATCTGATT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

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AATATCAAATTCATTTCTCTGATGCCCTTTATTCCCATTAAGTCCCACCACCAAACAAAC
TTTGCCCACAAAAAAAAAAAAAACAATTTGACTTACAAAAACTACAGCAACAAACACAGG
GGCAACGAATATTAATGCAAAAAAAAGAATTACACACATACAAACACACCAAAAATATGC
TCTCGACCAGAAGTTTTCCGAAAGTTCAACTTCTTGATTGACCAGAACCTAAGAACCACA
TATACATTGTTTGAATTCATGTAAGGTGGGGAAAGATATGCAACGTACCGTACTGTCTCC
GATGATGACACGAGCTCTTAGGCTCGCTGCGACTGTCTTTGTCCTCGAACCACAACAGTC
TTAGACAAAATCTCTTCAAGATATTCACAGCGACCTCTATGGTGGTCGATCCACACACAT
AATTGCCTTATAGCTTCTCTTTTCTCTTCTCCAAGTCCCATCAAAGTCTCCTTCATCGTC
TCCTTCTCCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E395JQ U 9
AF RR4E395TF C 1
BS 1 8 RR4E395TF
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BS 47 47 RR4E395TF
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BS 107 107 RR4E395TF
BS 108 109 RR4E395JQ
BS 110 110 RR4E395TF
BS 111 198 RR4E395JQ
BS 199 551 RR4E395TF

RD RR4E395JQ 190 0 0
CAACAAAATTAATCATTCGTTCTGTTCTGTACAATCCCCCCCTCCAAAGTAAAATATCAA
ATTCATTTCTCTGATGCCCTTTATTCCCATTAAGTCCCCCCCCCAAACAAACTTTGCCCA
CAAAAAAAAAAAAAACAATTTGACTTACAAAAACTACAGCAACAAACACAGGGGCAACGA
ATATTAATGC

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR4E395TF 551 0 0
TATCACACCAACAACATTAATCATTCGTTCTGTTCTGTACAATCCCACCCTCCAAAGTAA
AATATCAAATTCATTTCTCTGATGCCCTTTATTCCCATTAAGTCCCACCACCAAACAAAC
TTTGCCCACAAAGAAAAAAAGAACAATTTGACTTACAAAAACTACAGCAACAAACACAGG
GGCAACGAATATTAATGCAAAAAAAAGAATTACACACATACAAACACACCAAAAATATGC
TCTCGACCAGAAGTTTTCCGAAAGTTCAACTTCTTGATTGACCAGAACCTAAGAACCACA
TATACATTGTTTGAATTCATGTAAGGTGGGGAAAGATATGCAACGTACCGTACTGTCTCC
GATGATGACACGAGCTCTTAGGCTCGCTGCGACTGTCTTTGTCCTCGAACCACAACAGTC
TTAGACAAAATCTCTTCAAGATATTCACAGCGACCTCTATGGTGGTCGATCCACACACAT
AATTGCCTTATAGCTTCTCTTTTCTCTTCTCCAAGTCCCATCAAAGTCTCCTTCATCGTC
TCCTTCTCCTC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL7510Contig1 899 2 2 U
GTTAAAGTTGATTATTGAGGTAACAGATCCCTGTGAGCCAATCCCCAAGGAGTACTTCAG
GTTCACTTGCCAATAGCAAAACTCAATTGACAGATAAGTATTGCTAAACATCCTGTACAG
TACAGGTTCTCAATATAGTAAATATATGTTTCACTGAAAGTAGCGCCAACGATTGTTTAG
GTTTGCAGATATCATTGGAGAGGTTAGAGGGTTCAAAGACATTTACAACCCAGCCAGCCA
GAGCAGTCAACGCCTCATCGCAACCCTAAAGTTTGATACCTTAATAGATTCAACGCTGCT
TGGAAATTCGTCATAGATTGCTCTTCATCATCTTCTGGTACAATGAAAAGCGTACACACT
GGCTCCATACGAAGTAGTGTTCGACAATAGCTTCGACGTCTTGCATAAATGGCGGCTCTT
TTAGGCATATGCGTAGATACAATGAATGTTATTGATGCAACTATTATGTGAAATCGTTGA
ATTTTTACGCTGCTATCAATCAAGCTCTTCACATCGCAGTCGATGTAAGGTTCTTGGTCT
TAAAGTCCACTGAAATTTCCAACGAGGATAGTTTCAGAAGCATACCGAGCAATGATGATT
TATAAAGATGATCAAGATGAGGTTCAATTGATTACATCAGCGAATCAGGTTGGATGGGAA
TGCACACTCGCGTCAACGCAACTCAGTTCCTGCAACAAAGAAGGGGCATTGAGACAGGTG
AAACATGGACTCCAGTTCTGAACATGTTCTGCAGCAGCGAGCTAGAGCTGGAGCAGATGT
ACAAAGTCCAAATGCATTTCTATAAAGTTTCAAAGCTTATGAAAGCTTTTTCATAAGTAG
TGCATACTGTTCGAAACATGTACTATTCTCTTTTACCGTAACTGAAGTTACTACTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C712TF U 1
AF RR4C712JQ C 233
BS 1 570 RR4C712TF
BS 571 899 RR4C712JQ

RD RR4C712TF 570 0 0
GTTAAAGTTGATTATTGAGGTAACAGATCCCTGTGAGCCAATCCCCAAGGAGTACTTCAG
GTTCACTTGCCAATAGCAAAACTCAATTGACAGATAAGTATTGCTAAACATCCTGTACAG
TACAGGTTCTCAATATAGTAAATATATGTTTCACTGAAAGTAGCGCCAACGATTGTTTAG
GTTTGCAGATATCATTGGAGAGGTTAGAGGGTTCAAAGACATTTACAACCCAGCCAGCCA
GAGCAGTCAACGCCTCATCGCAACCCTAAAGTTTGATACCTTAATAGATTCAACGCTGCT
TGGAAATTCGTCATAGATTGCTCTTCATCATCTTCTGGTACAATGAAAAGCGTACACACT
GGCTCCATACGAAGTAGTGTTCGACAATAGCTTCGACGTCTTGCATAAATGGCGGCTCTT
TTAGGCATATGCGTAGATACAATGAATGTTATTGATGCAACTATTATGTGAAATCGTTGA
ATTTTTACGCTGCTATCAATCAAGCTCTTCACATCGCAGTCGATGTAAGGTTCTTGGTCT
TAAAGTCCACTGAAATTTCCAACGAGGATA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4C712JQ 667 0 0
GCCAGCCAGAGCAGTCAACGCCTCATCGCAACCCTAAAGTTTGATACCTTAATAGATTCA
ACGCTGCTTGGAAATTCGTCATAGATTGCTCTTCATCATCTTCTGGTACAATGAAAAGCG
TACACACTGGCTCCATACGAAGTAGTGTTCGACAATAGCTTCGACGTCTTGCATAAATGG
CGGCTCTTTTAGGCATATGCGTAGATACAATGAATGTTATTGATGCAACTATTATGTGAA
ATCGTTGAATTTTTACGCTGCTATCAATCAAGCTCTTCACATCGCAGTCGATGTAAGGTT
CTTGGTCTTAAAGTCCACTGAAATTTCCAACGAGGATAGTTTCAGAAGCATACCGAGCAA
TGATGATTTATAAAGATGATCAAGATGAGGTTCAATTGATTACATCAGCGAATCAGGTTG
GATGGGAATGCACACTCGCGTCAACGCAACTCAGTTCCTGCAACAAAGAAGGGGCATTGA
GACAGGTGAAACATGGACTCCAGTTCTGAACATGTTCTGCAGCAGCGAGCTAGAGCTGGA
GCAGATGTACAAAGTCCAAATGCATTTCTATAAAGTTTCAAAGCTTATGAAAGCTTTTTC
ATAAGTAGTGCATACTGTTCGAAACATGTACTATTCTCTTTTACCGTAACTGAAGTTACT
ACTATAG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL7511Contig1 772 2 2 U
GGATATAATATATAGTCAGTCGAACTTGATAATCATTAATCTGTCACACATCAATGGCGA
ACGAAATGTCGAGACTATCATCTCAAATCTGCAACCAGATCTCATCCGTCTTCTCCAACC
CCACCGATCCACACCCACAGCCGCTGGATCTCCTCGTTACAGAGCTCGCCGGAATCTCCC
GCCGCGGCGCACGCGTCTTCCTCCACGGCGTCGGACACGAAGGCCTCATGCTCAGAGCCT
TCGCGATGCGTCTCTTCCACCTCGGCCTCTCCTCCCACTTGGTCTCCGACGTGACCACGC
CTCCGATCTCGTCTCCCGATCTCCTCATCGCCTCCGCCGGTCCCGGAGGATTCTCCACCG
TCGACGCGATTTGCTCCGTCGCGAAATGTGCCGGCGCTAAGGTCGTGCTCGTCACCGCGC
AGCCGGAGAGAGGTTCGTGTGTGAAGCACGCGACGGATGTGTGTTATGTACCGGCGCAGA
CCATGGCGAGCGACGGCGGAGGTGCGACGGAGAAGGGGGAGAGGCCGTTGTTGCCGATGG
GGAGTGTTTACGAAGGAGCGTTGTTCGTGTTGTTCGAGATGGTTGTTTACAAACTGGGTG
AGGTTTTGGGTGAGTCACCTGAGTCGATACGGTGTCGTCACACCAATCTCGAGTAGGGAC
GTTGCGTCGTTTTCGCATTTCAGTGTATAAAATGCTTGTTGTTTTTTTTTTGTAATTTTA
TGCCACGAGTTGTTTTGCCATTCATGTTGTACCCACCAAGATGTTTAATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DD28TF U 1
AF RR4DD28JQ C 176
BS 1 628 RR4DD28TF
BS 629 772 RR4DD28JQ

RD RR4DD28TF 628 0 0
GGATATAATATATAGTCAGTCGAACTTGATAATCATTAATCTGTCACACATCAATGGCGA
ACGAAATGTCGAGACTATCATCTCAAATCTGCAACCAGATCTCATCCGTCTTCTCCAACC
CCACCGATCCACACCCACAGCCGCTGGATCTCCTCGTTACAGAGCTCGCCGGAATCTCCC
GCCGCGGCGCACGCGTCTTCCTCCACGGCGTCGGACACGAAGGCCTCATGCTCAGAGCCT
TCGCGATGCGTCTCTTCCACCTCGGCCTCTCCTCCCACTTGGTCTCCGACGTGACCACGC
CTCCGATCTCGTCTCCCGATCTCCTCATCGCCTCCGCCGGTCCCGGAGGATTCTCCACCG
TCGACGCGATTTGCTCCGTCGCGAAATGTGCCGGCGCTAAGGTCGTGCTCGTCACCGCGC
AGCCGGAGAGAGGTTCGTGTGTGAAGCACGCGACGGATGTGTGTTATGTACCGGCGCAGA
CCATGGCGAGCGACGGCGGAGGTGCGACGGAGAAGGGGGAGAGGCCGTTGTTGCCGATGG
GGAGTGTTTACGAAGGAGCGTTGTTCGTGTTGTTCGAGATGGTTGTTTACAAACTGGGTG
AGGTTTTGGGTGAGTCACCTGAGTCGAT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4DD28JQ 597 0 0
CTCCCGCCGCGGCGCACGCGTCTTCCTCCACGGCGTCGGACACGAAGGCCTCATGCTCAG
AGCCTTCGCGATGCGTCTCTTCCACCTCGGCCTCTCCTCCCACTTGGTCTCCGACGTGAC
CACGCCTCCGATCTCGTCTCCCGATCTCCTCATCGCCTCCGCCGGTCCCGGAGGATTCTC
CACCGTCGACGCGATTTGCTCCGTCGCGAAATGTGCCGGCGCTAAGGTCGTGCTCGTCAC
CGCGCAGCCGGAGAGAGGTTCGTGTGTGAAGCACGCGACGGATGTGTGTTATGTACCGGC
GCAGACCATGGCGAGCGACGGCGGAGGTGCGACGGAGAAGGGGGAGAGGCCGTTGTTGCC
GATGGGGAGTGTTTACGAAGGAGCGTTGTTCGTGTTGTTCGAGATGGTTGTTTACAAACT
GGGTGAGGTTTTGGGTGAGTCACCTGAGTCGATACGGTGTCGTCACACCAATCTCGAGTA
GGGACGTTGCGTCGTTTTCGCATTTCAGTGTATAAAATGCTTGTTGTTTTTTTTTTGTAA
TTTTATGCCACGAGTTGTTTTGCCATTCATGTTGTACCCACCAAGATGTTTAATACT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL7512Contig1 834 2 2 U
GGGCTCAACACTTTCTTCATTGTCATGACTCTGATATTTGTATTTGTCTTTGCTGTTGTG
GTTTTGCATCCCGCTGTCGGTGGAAGCATTTTGCCAGCATCAGCTATATCTTTCTACTGC
ATGTACCTCTGCTACAGTGGACTTGCAAGTGAACCCCGAGATTACGAATGCAATGGTCTC
CACAAACACTCCAAAGCTGTTTCAACAGGCACCATGACCATTGGGTTACTCACGACTGTT
CTCTCTGTCGTTTATTCCGCAGTTCGTGCTGGTTCGTCCACTACGCTTCTCTCCTCTCCT
GATTCTCCCTGTGCAGAGAAGCCACTGCTTCCACTAGACGTGAAAGCAGAAGAAAAGGAA
GAGAAGGAGCAGAAGAAGGCAGTGACATACTCATACGCATTCTTCCACATTATCTTCTCC
CTCGCGAGCATGTACTCTGCAATGCTCTTAACTGGCTGGTCAACTTCAGTTGGTGAAAGT
GGTAAACTGGTCGATGTTGGGTGGCCGTCTGTGTGGGTTCGTGTTGTCACCAGCTGGGCC
ACTGCTGGTCTATTCATCTGGTCACTCGTTGCTCCGATTCTCTTCCCTGACCGTGAGTTC
TGAGCTTAATAAATCTACTAATGATTCTGAAAACTTTTCATGAATCTTGAATATGTAAGA
AAAAAAAAGAGATCTATCATCTCATTCAGCTATAAATAGAATCTCGTGGTTGCTGTTATC
TCGCGCTTGGCCTTTGTTGGTCCATTTGTAAAATAAATATATATAAATATTTCAGTTCTC
CTAAATTCCAATTGTCTTGTGTAAAAAAAATATTTGGTTAAATAAATCAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN06TF U 1
AF RR4EN06JQ C 17
BS 1 667 RR4EN06TF
BS 668 834 RR4EN06JQ

RD RR4EN06TF 667 0 0
GGGCTCAACACTTTCTTCATTGTCATGACTCTGATATTTGTATTTGTCTTTGCTGTTGTG
GTTTTGCATCCCGCTGTCGGTGGAAGCATTTTGCCAGCATCAGCTATATCTTTCTACTGC
ATGTACCTCTGCTACAGTGGACTTGCAAGTGAACCCCGAGATTACGAATGCAATGGTCTC
CACAAACACTCCAAAGCTGTTTCAACAGGCACCATGACCATTGGGTTACTCACGACTGTT
CTCTCTGTCGTTTATTCCGCAGTTCGTGCTGGTTCGTCCACTACGCTTCTCTCCTCTCCT
GATTCTCCCTGTGCAGAGAAGCCACTGCTTCCACTAGACGTGAAAGCAGAAGAAAAGGAA
GAGAAGGAGCAGAAGAAGGCAGTGACATACTCATACGCATTCTTCCACATTATCTTCTCC
CTCGCGAGCATGTACTCTGCAATGCTCTTAACTGGCTGGTCAACTTCAGTTGGTGAAAGT
GGTAAACTGGTCGATGTTGGGTGGCCGTCTGTGTGGGTTCGTGTTGTCACCAGCTGGGCC
ACTGCTGGTCTATTCATCTGGTCACTCGTTGCTCCGATTCTCTTCCCTGACCGTGAGTTC
TGAGCTTAATAAATCTACTAATGATTCTGAAAACTTTTCATGAATCTTGAATATGTAAGA
AAAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4EN06JQ 818 0 0
TCATTGTCATGACTCTGATATT*GTATTTGTCTTTGCTGTTGTGGTTT*GCATCCCGCTG
TCGGTGGAAGCATTTTGCCAGCATCAGCTATATCTTTCTACTGCATGTACCTCTGCTACA
GTGGACTTGCAAGTGAACCCCGAGATTACGAATGCAATGGTCTCCACAAACACTCCAAAG
CTGTTTCAACAGGCACCATGACCATTGGGTTACTCACGACTGTTCTCTCTGTCGTTTATT
CCGCAGTTCGTGCTGGTTCGTCCACTACGCTTCTCTCCTCTCCTGATTCTCCCTGTGCAG
AGAAGCCACTGCTTCCACTAGACGTGAAAGCAGAAGAAAAGGAAGAGAAGGAGCAGAAGA
AGGCAGTGACATACTCATACGCATTCTTCCACATTATCTTCTCCCTCGCGAGCATGTACT
CTGCAATGCTCTTAACTGGCTGGTCAACTTCAGTTGGTGAAAGTGGTAAACTGGTCGATG
TTGGGTGGCCGTCTGTGTGGGTTCGTGTTGTCACCAGCTGGGCCACTGCTGGTCTATTCA
TCTGGTCACTCGTTGCTCCGATTCTCTTCCCTGACCGTGAGTTCTGAGCTTAATAAATCT
ACTAATGATTCTGAAAACTTTTCATGAATCTTGAATATGTAAGAAAAAAAAAGAGATCTA
TCATCTCATTCAGCTATAAATAGAATCTCGTGGTTGCTGTTATCTCGCGCTTGGCCTTTG
TTGGTCCATTTGTAAAATAAATATATATAAATATTTCAGTTCTCCTAAATTCCAATTGTC
TTGTGTAAAAAAAATATTTGGTTAAATAAATCAGTTTG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL7513Contig1 945 2 4 U
GATCATCGGGTACTTGTACCCGGGGAAGCCACTTGCTAACGTAGCTTTCAAGACATACGG
TTACATGTATGTCCCAAGCACTGTACTTTGTTGGAGACTTCAAACTTGGTCACTACATGA
AGATCCCTCCGAGATCTACGTTCCTTGTTCAGCTTGTTGCGACAATGGTTTCTTCAACCG
TCTGCTTTGGGACAACTTGGTGGCTGCTTTCTTCCATAGATAACATTTGTAGCAAAGATA
AGCTCCCAGTGGGTAGTCCATGGACTTGCCCCGGGGACGAAGTGTTCTACAACGCGTCGA
TCATATGGGGAATCATTGGACCTGGAAGGATGTTCACTAGCAAAGGTGTATACCCTGGGA
TGAACTGGTTCTTCCTAATCGGTTTGCTTGCTCCTGTACCGGTCTGGTTCTTTGCAAGGA
AGTTCCCGGAGAAGAAGTGGATAAAGAAGATTCACATTCCTTTGATCTTTTCAGCGACTA
CAGCGATGCCAGTGGCCAAGGCTGTGCACTACTGGTCGTGGGGTTTTGTTGGGGTCGTGT
TCAACTACTATATCTTCAGGAGGTACAAGGCGTGGTGGGCAAGGCATAACTATATTCTTT
CTGCGGCTCTTGATGCAGGCACAGCGATCATGGGAGTGTTGATCTACTTTGCGTTACAGA
ACAACAACATATATTTTCCTGATTGGTGGGGGAGTGAGAACACAGACCATTGCCCCTTGG
CTCAATGCCCTACGGAGAAAGGGATTGTCATTAAGGGCTGCCCGGTGTTCTAAAGAGTAT
CTGCTCTGAATAGAGCTCCAGGTGAGTGACGATAGCTGCCAAATGATTTTGGTGGCAATA
ATATTGTTGTCTAAAGACATTTGTGAGTTTAAGAAAGAACTCAAACAATATGTAAACAAT
TGTTTTAGAATATGTTTCTCAATGAATAAGCAATTAAGGATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BR18TF U 1
AF RR4BR18JQ C 183
BS 1 683 RR4BR18TF
BS 684 684 RR4BR18JQ
BS 685 724 RR4BR18TF
BS 725 945 RR4BR18JQ

RD RR4BR18TF 729 0 0
GATCATCGGGTACTTGTACCCGGGGAAGCCACTTGCTAACGTAGCTTTCAAGACATACGG
TTACATGTATGTCCCAAGCACTGTACTTTGTTGGAGACTTCAAACTTGGTCACTACATGA
AGATCCCTCCGAGATCTACGTTCCTTGTTCAGCTTGTTGCGACAATGGTTTCTTCAACCG
TCTGCTTTGGGACAACTTGGTGGCTGCTTTCTTCCATAGATAACATTTGTAGCAAAGATA
AGCTCCCAGTGGGTAGTCCATGGACTTGCCCCGGGGACGAAGTGTTCTACAACGCGTCGA
TCATATGGGGAATCATTGGACCTGGAAGGATGTTCACTAGCAAAGGTGTATACCCTGGGA
TGAACTGGTTCTTCCTAATCGGTTTGCTTGCTCCTGTACCGGTCTGGTTCTTTGCAAGGA
AGTTCCCGGAGAAGAAGTGGATAAAGAAGATTCACATTCCTTTGATCTTTTCAGCGACTA
CAGCGATGCCAGTGGCCAAGGCTGTGCACTACTGGTCGTGGGGTTTTGTTGGGGTCGTGT
TCAACTACTATATCTTCAGGAGGTACAAGGCGTGGTGGGCAAGGCATAACTATATTCTTT
CTGCGGCTCTTGATGCAGGCACAGCGATCATGGGAGTGTTGATCTACTTTGCGTTACAGA
ACAACAACATATATTTTCCTGAT*GGTGGGGGAGTGAGAACACAGACCATTGCCCCTTGG
CTCA
TGCCC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BR18JQ 763 0 0
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CTCCCAGTGGGTAGTCCATGGACTTGCCCCGGGGACGAAGTGTTCTACAACGCGTCGATC
ATATGGGGAATCATTGGACCTGGAAGGATGTTCACTAGCAAAGGTGTATACCCTGGGATG
AACTGGTTCTTCCTAATCGGTTTGCTTGCTCCTGTACCGGTCTGGTTCTTTGCAAGGAAG
TTCCCGGAGAAGAAGTGGATAAAGAAGATTCACATTCCTTTGATCTTTTCAGCGACTACA
GCGATGCCAGTGGCCAAGGCTGTGCACTACTGGTCGTGGGGTTTTGTTGGGGTCGTGTTC
AACTACTATATCTTCAGGAGGTACAAGGCGTGGTGGGCAAGGCATAACTATATTCTTTCT
GCGGCTCTTGATGCAGGCACAGCGATCATGGGAGTGTTGATCTACTTTGCGTTACAGAAC
AACAACATATATTTTCCTGATTGGTGGGGGAGTGAGAACACAGACCATTGCCCCTTGGCT
CAATGCCCTACGGAGAAAGGGATTGTCATTAAGGGCTGCCCGGTGTTCTAAAGAGTATCT
GCTCTGAATAGAGCTCCAGGTGAGTGACGATAGCTGCCAAATGATTTTGGTGGCAATAAT
ATTGTTGTCTAAAGACATTTGTGAGTTTAAGAAAGAACTCAAACAATATGTAAACAATTG
TTTTAGAATATGTTTCTCAATGAATAAGCAATTAAGGATTTTT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7514Contig1 874 2 6 U
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ATGATCTCCTTGTTTCAAATAACCAACAACATTTAAGGTGGTAAACAGTATGAGGACTTG
TAAAGTAAACAAGAGAGTGAGAGAGAAAAGTAGGTATCAGCAATGTGGAAGAGTTGGATC
AGAGACGGCTAGTGTCACGGCCGAAAACGAAAGTGGTGATCCAGTTAATAAAGACGTAGA
AACGGTTTCTCCAGCTGACGACTCGAGTCAGATACGCTGACCTCCATATGAAAAAGCTCA
GAAAACCACCCATTGATATCCCTTTTCCTTGCTTGCTCTCACGAAGATCAACGAGAGCTT
TGTATCTCCCAATAGTAGCCATACTTCCCAAATGCTTGTACACAAACGGTTCTCCGAGTT
CAGTGTCCTTTGCGCTCCAGGCTCTTCCTCCTCCAGCTTTCCCCATCACGTTCAGTAGAT
TCGCCAAGTACTTGCCTTCTCTCTCAGCCACCTGTGCAAGAGCAGGAAGTGTTGACTTCC
CTGTGCTCTCAAGATATCCACTACAGTCAACAATTGCAAACACGTCTTGTACAGAAGGCA
CACGCATCCACTCATCAATCCCAATCCTTCCACCTGGATCTTTTGGAAGATCGAGAGACC
TTACAAATGAAGATGGACCAACACCAGTTGACCAGACTAAGAGACCGTATGGAACTTCGG
TTCCATCGTCAAGTATTAGCCTTTGAGGCTTCACTTCTTTCACAATCCCACGTACTAGCT
TCACTCCAGACTTGTTTAGCTGCTTGATTGCATACTGTCTGAGCCCATCGTCAAAAGAAG
AAAGTATATCTCTTGCCTCGATCAAAGTAACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G238JQ U 1
AF RR4FH71TF C 161
BS 1 478 RR4G238JQ
BS 479 479 RR4FH71TF
BS 480 569 RR4G238JQ
BS 570 570 RR4FH71TF
BS 571 715 RR4G238JQ
BS 716 874 RR4FH71TF

RD RR4G238JQ 715 0 0
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GAAAACCACCCATTGATATCCCTTTTCCTTGCTTGCTCTCACGAAGATCAACGAGAGCTT
TGTATCTCCCAATAGTAGCCATACTTCCCAAATGCTTGTACACAAACGGTTCTCCGAGTT
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CTGTGCTCTCAAGATATCCACTACAGTCACCAATTGCAAACACGTCTTGTACAGAAGGCA
CACGCATCCACTCATCAATCCCAATCCTTCCACCTGGATCTTTTGGAAGATCGAGAGACC
TTACAAATGAAGATGGACCAACACCAGTTGACCAGACTAAGAGACCGTATGGAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4FH71TF 714 0 0
GCAATGT
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ATAAAGACGTAGAAACGGTTTCTCCAGCTGACGACTCGAGTCAGATACGCTGACCTCCAT
ATGAAAAAGCTCAGAAAACCACCCATTGATATCCCTTTTCCTTGCTTGCTCTCACGAAGA
TCAACGAGAGCTTTGTATCTCCCAATAGTAGCCATACTTCCCAAATGCTTGTACACAAAC
GGTTCTCCGAGTTCAGTGTCCTTTGCGCTCCAGGCTCTTCCTCCTCCAGCTTTCCCCATC
ACGTTCAGTAGATTCGCCAAGTACTTGCCTTCTCTCTCAGCCACCTGTGCAAGAGCAGGA
AGTGTTGACTTCCCTGTGCTCTCAAGATATCCACTACAGTCAACAATTGCAAACACGTCT
TGTACAGAAGGCACACGCATCCACTCATCAATCCCAATCCTTCCACCTGGATCTTTTGGA
AGATCGAGAGACCTTACAAATGAAGATGGACCAACACCAGTTGACCAGACTAAGAGACCG
TATGGAACTTCGGTTCCATCGTCAAGTATTAGCCTTTGAGGCTTCACTTCTTTCACAATC
CCACGTACTAGCTTCACTCCAGACTTGTTTAGCTGCTTGATTGCATACTGTCTGAGCCCA
TCGTCAAAAGAAGAAAGTATATCTCTTGCCTCGATCAAAGTAACACC

QA 8 714 8 714
DS 



AS 1 2

CO CL7515Contig1 611 2 1 U
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GACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAATTCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGG
AGGAATGTGCCCTGATACTAATTATTTATTTAGGGGAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCAC
CATACGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGATGATCACCC
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ATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATA
TACTCTTTTAATAGCAGAGTATTCGCTATTCCTGAACTAAATTATATGATGAACTATAAC
ATTTCAACACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CV33JQ C 1
AF RR4CV33TF U 1
BS 1 611 RR4CV33TF

RD RR4CV33JQ 611 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGGAATCGAATCCAAAGCCTTGTTCTGTTTTCCCGATCTG
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GCAGATCTTTCAGCTTATGCAGTGCAAGCCTCTTTCCGAGCAACAGGTTAGAGCCTTATG
CGAGAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGAAAGCAATGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGT
GACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAATTCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGG
AGGAATGTGCCCTGATACTAATTATTTATTTAGGGGAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCAC
CATACGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGATGATCACCC
AACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATA
ATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATA
TACTCTTTTAATAGCAGAGTATTCGCTATTCCTGAACTAAATTATATGATGAACTATAAC
ATTTCAACACC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4CV33TF 611 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGGAATCGAATCCAAAGCCTTGTTCTGTTTTCCCGATCTG
ATCAGAAGACGCGGTAATGGGTTCGGCGGCTCCGAAGGACGCAACTGTGGATCTGGATGA
GCAGATCTCTCAGCTTATGCAGTGCAAGCCTCTCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCCTTATG
CGAGAAAGCTAAGGAGATCTTGATGGATGAAAGCAATGTTCAGCCTGTCAAAAGCCCAGT
GACAATCTGTGGTGATATTCATGGACAATTCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGG
AGGAATGTGCCCTGATACTAATTATTTATTTAGGGGAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCAC
CATACGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGATGATCACCC
AACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAATCAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATA
ATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATCTTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATA
TACTCTTTTAATAGCAGAGTATTCGCTATTCCTGAACTAAATTATATGATGAACTATAAC
ATTTCAACACC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL7516Contig1 642 2 1 U
GGGAATCAGAAGTTGCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGATTA
TCAGATCCTCGAAACCCTACTCGTCGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTATCCTTTTTTTCTG
CCCAACAGTTCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCAACTGCCTTCGA
CCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGTAGTACGTCCACAT
TCGTGTGCAGCAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGAAGAAAGA
GTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGT
CGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGGGACCAGAGGAAGAACGT
CTCCACGTTCTTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGAACAACATCAAGATCCATGGTTT
CTGAGCTTGCTTTATTACTCTACTGTTGTCACTACTGTTTTCAAAACACACCCAAGTTCC
TCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGTCTATAGTATGTTCTTTGTGTTACAACATCTTGCT
GCTTGTGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FK92JQ C 1
AF RR4FK92TF U 1
BS 1 642 RR4FK92TF

RD RR4FK92JQ 642 0 0
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GTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGT
CGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGGGACCAGAGGAAGAACGT
CTCCACGTTCTTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGAACAACATCAAGATCCATGGTTT
CTGAGCTTGCTTTATTACTCTACTGTTGTCACTACTGTTTTCAAAACACACCCAAGTTCC
TCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGTCTATAGTATGTTCTTTGTGTTACAACATCTTGCT
GCTTGTGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTGC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4FK92TF 642 0 0
GGGAATCAGAAGTTGCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGATTA
TCAGATCCTCGAAACCCTACTCGTCGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTATCCTTTTTTTCTG
CCCAACAGTTCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCAACTGCCTTCGA
CCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGTAGTACGTCCACAT
TCGTGTGCAGCAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGAAGAAAGA
GTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGT
CGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGGGACCAGAGGAAGAACGT
CTCCACGTTCTTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGAACAACATCAAGATCCATGGTTT
CTGAGCTTGCTTTATTACTCTACTGTTGTCACTACTGTTTTCAAAACACACCCAAGTTCC
TCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGTCTATAGTATGTTCTTTGTGTTACAACATCTTGCT
GCTTGTGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTGC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7517Contig1 508 2 1 U
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AGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGA
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TGGTTTGTGTGTTATGAGCTTTTATGTAATATTATTTCTAATGAATGAATGATAACTGCA
GACTTGATAATATAAACATTATGAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FQ91TF U 1
AF RR4FQ91JQ C 129
BS 1 508 RR4FQ91TF

RD RR4FQ91TF 508 0 0
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GAAGTTTTCGATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCGTTGCTGC
AGGGATGGGTCCAATAACAGTGGAAGCACGCACATGTGAGTCACAGAGCCATAGGTTCAA
GGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTTTTGGCGG
AGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGA
ATCCTAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTTCTTTCTACATCTTCC
GTACAGTACCATGTCGTATCGTACGCGTGTGCATCTCTAGCGTGTTCTCGAATAAGTCTT
TGGTTTGTGTGTTATGAGCTTTTATGTAATATTATTTCTAATGAATGAATGATAACTGCA
GACTTGATAATATAAACATTATGAAATT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR4FQ91JQ 380 0 0
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GCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGAATCCTAAC
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AATATAAACATTATGAAATT

QA 1 380 1 380
DS 



AS 1 2

CO CL7518Contig1 702 2 3 U
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GAGAATGTGGAATCTAAAGACAGTAACGATGCCAAAGATGATGAAAAGCAAGAGACTGAA
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AAAGATGAAGGTGAAAAAGCAAACGGAACAAAACAAGGGAATACAGGAGACATCAAGGAG
GAAGAGAAGCTGGTAGATGGAGACAAAGAGACAGAAAAGATCGAGGAGGTTGAGACCGTG
GATGAAAAGAAAAAGGAGGATAATGAGGAGGATATGATTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS89JQ C 1
AF RR4BS89TF U 24
BS 1 23 RR4BS89JQ
BS 24 667 RR4BS89TF
BS 668 702 RR4BS89JQ

RD RR4BS89JQ 702 0 0
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AGTTTTTGCGGTGGAAGAGACCTAACAATGGGAGAAGAGGATTCAAAGGCAGCCGTTGAG
CCAACAGCAACAGAGTCTAGTTTTCTGGAAAAGACATCAGAGGCTGTGGCAGGAAACAAG
GAGGAGGAGGAGAATGCTGGAGGTAAGGGAACACCTGAACTTAAGAAAGATGAGGAGATG
GCTGAGCCAGAGAAAATGGAGATAGATGCTGAGACTGAAAAAGCAGAAGAAGATGTTGCG
GTCACCAAAGATGAGGGACAAGCAGAGGCTACCAGCATGGAAGAAGATGCAGATGGAAAG
AAAGAGAAAACTGATGGTGGTGTATCTGGGGGTGGTACAGTTGTAGATGCTGTTATGGAG
GAGAATGTGGAATCTAAAGACAGTAACGATGCCAAAGATGATGAAAAGCAAGAGACTGAA
GAGGCAGACGTTACTGAAGCAGACCAAAAGAAAGCTGGGAAAGAATCAGAGGGGGACGTA
AAAGATGAAGGTGAAAAAGCAAACGGAACAAAACAAGGGAATACAGGAGACATCAAGGAG
GAAGAGAAGCTGGTAGATGGAGACAAAGAGACAGAAAAGATCGAGGAGGTTGAGACCGTG
GATGAAAAGAAAAAGGAGGATAATGAGGAGGATATGATTGAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4BS89TF 650 0 0
AGTCTTGAGACAGTGAGGCTTTGGTAAGACAACGAGAAGTTTTTGCGGTGGAAGAGACCT
AACAATGGGAGAAGAGGATTCAAAGGCAGCCGTTGAGCCAACAGCAACAGAGTCTAGTTC
TCTGGAAAAGACATCAGAGGCTGTGGCAGGAAACAAGGAGGAGGAGGAGAATGCTGGAGG
TAAGGGAACACCTGAACTTAAGAAAGATGAGGAGATGGCTGAGCCAGAGAAAATGGAGAT
AGATGCTGAGACTGAAAAAGCAGAAGAAGATGTTGCGGTCACCAAAGATGAGGGACAAGC
AGAGGCTACCAGCATGGAAGAAGATGCAGATGGAAAGAAAGAGAAAACTGATGGTGGTGT
ATCTGGGGGTGGTACAGTTGTAGATGCTGTTATGGAGGAGAATGTGGAATCTAAAGACAG
TAACGATGCCAAAGATGATGAAAAGCAAGAGACTGAAGAGGCAGACGTTACTGAAGCAGA
CCAAAAGAAAGCTGGGAAAGAATCAGAGGGGGACGTAAAAGATGAAGGTGAAAAAGCAAA
CGGAACAAAACAAGGGAATACAGGAGACATCAAGGAGGAAGAGAAGCTGGTAGATGGAGA
CAAAGAGACAGAAAAGATCGAGGAGGTTGAGACCGTGGATGAAA
GAAAAA

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL7519Contig1 1108 2 2 U
GGGTAGTAGCTTCACACAATACGGTGAAGTTCTCTGCTTGAATCGTCTTCTTCGAGAGAG
ACATCACACGCTAGTTTCCAATCAGAAATGGTTGACTTGTCAACTCTATCTCCTTCGGAG
ATCACGGTGATGGGATCCGTGTTCTGCGTTCTCCTCTCTATGCACTTCACGATGCAGCTC
ATCTCCCAGCATCTCTTCTACTGGAAGAACCCTAAAGAACAGAGAGCCATTCTCTTCATT
GTACTCATGGCTCCTGTTTACGCCGTCAGCTCTTTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGA
AGCAAACCCTTGTTCATGTTCCTAGACGCCGTTAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATT
GCTAAGTTCTTGGAGTTGATGTATAGCTACATCAACATATCCATGAGTGGAATGATTATC
CCTGATGAGATCAAAGGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCC
CGGACCACGCATCTGGATCACCGCACGCTGACTCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTC
TGTGTTATTCGCCCTGTGTGTTCATTCTTGATGATAGCGCTGCAGCTTCTCGGGGTTTAT
CCACCGTGGCTGAGCTGGATCTTCACTGTTATTCTGAACGTTTCGGTGTCACTGGCTTTG
TATTCTTTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCGCTT
ACGAAGTTTATGTGCATTCAAAGGGATAGTCTTCTTCTGCTTTTGGCAGGGAGTAGTGCT
GGAGGTATTGGTGGGGTTGGGGTTAGTTAAGGCGCATCATTTCTGGTTGGAGGTGGAGCA
GCTTGGGGAAGCTCTGCAAAACGTGCTTGTGGTTCTTGAGATGATCGTCTTCTCCGTTAT
GCAGCAATACGCTTTTCATGTTGCTCCCTACATTGGAGAAACCGAAGCTAAGATGAGAAT
GAGCAAGAGGAATTGACTCTAAAAGAGGATTTAGACCAGAGAAGATTTTGTTTTTTTTTG
GTTGTTTATGTTTAATGTGAATGTTACTGATTTTCTCTTACGAACATTTGGATAGTGATT
AATAAATGTATCAGTCTTTTGTTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B026TF U 1
AF RR4B026JQ C 216
BS 1 763 RR4B026TF
BS 764 1108 RR4B026JQ

RD RR4B026TF 778 0 0
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ATCTCCCAGCATCTCTTCTACTGGAAGAACCCTAAAGAACAGAGAGCCATTCTCTTCATT
GTACTCATGGCTCCTGTTTACGCCGTCAGCTCTTTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGA
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GCTAAGTTCTTGGAGTTGATGTATAGCTACATCAACATATCCATGAGTGGAATGATTATC
CCTGATGAGATCAAAGGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCC
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TGTGTTATTCGCCCTGTGTGTTCATTCTTGATGATAGCGCTGCAGCTTCTCGGGGTTTAT
CCACCGTGGCTGAGCTGGATCTTCACTGTTATTCTGAACGTTTCGGTGTCACTGGCTTTG
TATTCTTTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCGCTT
ACGAAGTTTATGTGCATTCAAAGGGATAGTCTTCTTCTGCTTT
GGCAGGAGTAGTGCT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4B026JQ 893 0 0
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TTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAACCCTTGTTCATGTTCCTAGACGCCGTTAA
AGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAAGTTCTTGGAGTTGATGTATAGCTACATCAA
CATATCCATGAGTGGAATGATTATCCCTGATGAGATCAAAGGGAGAGAGATCCACCATTC
GTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCCCGGACCACGCATCTGGATCACCGCACGCTGACTCA
GCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTGTTATTCGCCCTGTGTGTTCATTCTTGATGAT
AGCGCTGCAGCTTCTCGGGGTTTATCCCCCGTGGCTGAGCTGGATCTTCACTGTTATTCT
GAACGTTTCGGTGTCACTGGCTTTGTATTCTTTGGTGAAGTTTTTCCATGTTTTTGCTAA
AGAGTTGGAGCCTCATAAGCCGCTTACGAAGTTTATGTGCATTCAA*GGGATAGTCTTCT
TCTGCTTTTGGCAGGGAGTAGTGCTGGAGGTATTGGTGGGGTTGGGGTTAGTTAAGGCGC
ATCATTTCTGGTTGGAGGTGGAGCAGCTTGGGGAAGCTCTGCAAAACGTGCTTGTGGTTC
TTGAGATGATCGTCTTCTCCGTTATGCAGCAATACGCTTTTCATGTTGCTCCCTACATTG
GAGAAACCGAAGCTAAGATGAGAATGAGCAAGAGGAATTGACTCTAAAAGAGGATTTAGA
CCAGAGAAGATTTTGTTTTTTTTTGGTTGTTTATGTTTAATGTGAATGTTACTGATTTTC
TCTTACGAACATTTGGATAGTGATTAATAAATGTATCAGTCTTTTGTTTTCTG

QA 1 893 1 893
DS 



AS 1 2

CO CL7520Contig1 636 2 2 U
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GTAGACTGGAGGAATATAAAAAAGAGAGCAAGAAGGGTAAGGAGAGAGAGCTTTGAAATG
GGAACTTGGAAGCATCCGGTTTTATATCTAAGACATCTATCAAAAAGTGCAACATTGGTG
GTAGAGAAACCATGGATGGAAGTTATCAAGGGTTTAGATTCACAGCCAGTTCACAGACAT
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CCTCTCAATTAGTCTATTTTTGACTTTGTTTAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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AF RR4AH50TF U 1
AF RR4AH50JQ C 57
BS 1 635 RR4AH50TF
BS 636 636 RR4AH50JQ

RD RR4AH50TF 635 0 0
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CACCAAGTTCATCATCTGTAATCATTTACAGCTCCAGAGCAAAGTGTTTGATTGAGTTCG
GGAAGCCGACAGAAGAAGGCGAAGAGATGGATTTGACATTCGGCAGCAACCTGTCTGATA
AGGTGGAAGGGAGAATTGCGAGCATTGGGTTGGAGAAACTGGGAAGCGGGAACAGAAAGC
GTAGACTGGAGGAATATAAAAAAGAGAGCAAGAAGGGTAAGGAGAGAGAGCTTTGAAATG
GGAACTTGGAAGCATCCGGTTTTATATCTAAGACATCTATCAAAAAGTGCAACATTGGTG
GTAGAGAAACCATGGATGGAAGTTATCAAGGGTTTAGATTCACAGCCAGTTCACAGACAT
ATATTCGGAACATAAGGCCACAGCAGGAGGGAGAAAAAAGAGAGAGTCTCTCTTGTCAAT
GTTCGAGGTTAAGCTTTACGCATTAGAGAAGTTGGAGAGTGTCAGAGGTGGAACTTGGAA
GAAGTATATTTGCTTTCTATATGTGTGCAGTATTATATGCTTCTAAGAATTTTGTAATAG
CCTCTCAATTAGTCTATTTTTGACTTTGTTTAAAA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4AH50JQ 580 0 0
CCATCACCAAGTTCATCATCTGTAATCATTTACAGCTCCAGAGCAAAGTGTTTGATTGAG
TTCGGGAAGCCGACAGAAGAAGGCGAAGAGATGGATTTGACATTCGGCAGCAACCTGTTT
GATAAGGTGGAAGGGAGAATTGCGAGCATTGGGTTGGAGAAACTGGGAAGCGGGAACAGA
AAGCGTAGACTGGAGGAATATAAAAAAGAGAGCAAGAAGGGTAAGGAGAGAGAGCTTTGA
AATGGGAACTTGGAAGCATCCGGTTTTATATTTAAGACATTTATCAAAAAGTGCAACATT
GGTGGTAGAGAAACCATGGATGGAAGTTATCAAGGGTTTAGATTCACAGCCAGTTCACAG
ACATATATTCGGAACATAAGGCCACAGCAGGAGGGAGAAAAAAGAGAGAGTTTTTTTTGT
CAATGTTCGAGGTTAAGCTTTACGCATTAGAGAAGTTGGAGAGTGTCAGAGGTGGAACTT
GGAAGAAGTATATTTGCTTTTTATATGTGTGCAGTATTATATGCTTTTAAGAATTTTGTA
ATAGCCTTTCAATTAGTCTATTTTTGACTTTGTTTAAAAG

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL7521Contig1 543 2 1 U
GGGCCGGCCAGAAGCTACTCCACATCTGTTCATCTCCGAGAGAAATGGCGTTAAGACAGA
TGTTAGGATGGTCAGAAGGAGATCTAATGAGATCAGATGCAAAGCCATGTTCAAGACTCA
TGAGACAAACTGCTGCTATTTTCACTGTTGGTGGAGCTCTTGGTTTCTGGGTTCTCTGCA
GACTTCACTATGGTCCGAGGGTTACAGTACCAAGAAGTCTACGATGGGCTGGTTGTGGAG
CTGTGTCCATGAGTGCTTCTACTGCAACACTTGTCCGTCTCCTGAGCCCTGAATGTGAAC
CCCAAAACATTACTGCATACGACCAACCCAAAGCCCCTCAAGCTTCACTCCCTTAGACCA
TCAGTTTCTGACTTGATCTGTTATGTGTATGTACCTTTTTTTTGCAGTACACAGAATTTA
GCTATCTATTCCTAAATACTACTGTCTTTTTATTTGGATTTTGTTCCTATTTCTTTAGGA
GTGTTCAAGATGAGCTACTTCAAGATAAGCTATTGGGCTCAACTTGGAGCTCAGCATATT
ATT


BQ
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20 20 20 

AF RR4BW12JQ C 1
AF RR4BW12TF U 1
BS 1 543 RR4BW12TF

RD RR4BW12JQ 543 0 0
GGGCCGGCCAGAAGCTACTCCACATCTGTTCATCTCCGAGAGAAATGGCGTTAAGACAGA
TGTTAGGATGGTCAGAAGGAGATCTAATGAGATCAGATGCAAAGCCATGTTCAAGACTCA
TGAGACAAACTGCTGCTATTTTCACTGTTGGTGGAGCTCTTGGTTTCTGGGTTCTCTGCA
GACTTCACTATGGTCCGAGGGTTACAGTACCAAGAAGTCTACGATGGGCTGGTTGTGGAG
CTGTGTCCATGAGTGCTTCTACTGCAACACTTGTCCGTCTCCTGAGCCCTGAATGTGAAC
CCCAAAACATTACTGCATACGACCAACCCAAAGCCCCTCAAGCTTCACTCCCTTAGACCA
TCAGTTTCTGACTTGATCTGTTATGTGTATGTACCTTTTTTTTGCAGTACACAGAATTTA
GCTATCTATTCCTAAATACTACTGTCTTTTTATTTGGATTTTGTTCCTATTTCTTTAGGA
GTGTTCAAGATGAGCTACTTCAAGATAAGCTATTGGGCTCAACTTGGAGCTCAGCATATT
ATT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4BW12TF 543 0 0
GGGCCGGCCAGAAGCTACTCCACATCTGTTCATCTCCGAGAGAAATGGCGTTAAGACAGA
TGTTAGGATGGTCAGAAGGAGATCTAATGAGATCAGATGCAAAGCCATGTTCAAGACTCA
TGAGACAAACTGCTGCTATTTTCACTGTTGGTGGAGCTCTTGGTTTCTGGGTTCTCTGCA
GACTTCACTATGGTCCGAGGGTTACAGTACCAAGAAGTCTACGATGGGCTGGTTGTGGAG
CTGTGTCCATGAGTGCTTCTACTGCAACACTTGTCCGTCTCCTGAGCCCTGAATGTGAAC
CCCAAAACATTACTGCATACGACCAACCCAAAGCCCCTCAAGCTTCACTCCCTTAGACCA
TCAGTTTCTGACTTGATCTGTTATGTGTATGTACCTTTTTTTTGCAGTACACAGAATTTA
GCTATCTATTCCTAAATACTACTGTCTTTTTATTTGGATTTTGTTCCTATTTCTTTAGGA
GTGTTCAAGATGAGCTACTTCAAGATAAGCTATTGGGCTCAACTTGGAGCTCAGCATATT
ATT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7522Contig1 881 2 2 U
TCCTCACTTCGATTCCAAGCGCTAAGATCGCAACGACGACGGTTGAAAACGCAGCTTCCT
GGATCGAGGACGCGATGCGTCAGGCGCTCGTGTACCAGAACACGATCCTGGAGACGCTGG
ATTCCAAAATCGACGCATCGAAGTCTCGATTGAGCCAAATTCGAGATACTTCAATCGCTC
ACACCAGCCAAACAATCGATTCTATTAGAGAGATTGCTTCTGAGTATAACGTATACGAGC
ATATGGTGTTTGCGAAGATCAAAGATGGTGTGAACGTTGCTGCATCTCATCCTCTTATAT
CAGGAGGTTTAGCTTTTGGTGTTGGGATCTTTGCTTTGAAAAAGACGAGAAGATTTGTAT
ACTACAATGCTGTACGCATGTTTTCAAGCGAAGAGGCGTTGCTTTCTAGAGCGGATCTTA
GAGTAAAAGAGCTGAGACAATCGCTGGATCGTCTTACAGCCGAAAGTGAAAAGTTAGAGC
GAGTTGCAACTGTGGCAGAAGATGAGCTGATCAGAGGAAGGATGAAACTCAGACAAGCAG
GCAAACAGATACGAGGTGTTGTTAACTCAGCTTATAAGATTGAAAAGCAAGCAGCAGGTT
TAAAAGATGTACTTAAAGAATTACCCACGAGAGAAGCTTCTCGGTTCCGTTCTCAAATAT
CGAACCGTGCTTCTGAGGTAAAGCAAGAGAGAAAGGCTTTGACAAAGGAAGTGAACAAGA
TCAGCAACTATGGTATCTCCGTATGAGGAAAATCAAAACCCATTTTTCTAGTTACGGATT
TGAATACACTCTTGAGTTCTTAGATGATGGAGCAATATTATATACACTATTAATAATAAT
GTCTAAAACATGATTAAGACTAATCTTTTTGTTTGGTTTCG


BQ
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AF RR4EM30TF U 1
AF RR4EM30JQ C 47
BS 1 301 RR4EM30TF
BS 302 881 RR4EM30JQ

RD RR4EM30TF 301 0 0
TCCTCACTTCGATTCCAAGCGCTAAGATCGCAACGACGACGGTTGAAAACGCAGCTTCCT
GGATCGAGGACGCGATGCGTCAGGCGCTCGTGTACCAGAACACGATCCTGGAGACGCTGG
ATTCCAAAATCGACGCATCGAAGTCTCGATTGAGCCAAATTCGAGATACTTCAATCGCTC
ACACCAGCCAAACAATCGATTCTATTAGAGAGATTGCTTCTGAGTATAACGTATACGAGC
ATATGGTGTTTGCGAAGATCAAAGATGGTGTGAACGTTGCTGCATCTCATCCTCTTATAT
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR4EM30JQ 835 0 0
AAACGCAGCTTCCTG*ATCGAGGACGCGATGCGTCAGGCGCTCGTGTACCAGAACACGAT
CCTGGAGACGCTGGATTCCAAAATCGACGCATCGAAGTCTCGATTGAGCCAAATTCGAGA
TACTTCAATCGCTCACACCAGCCAAACAATCGATTCTATTAGAGAGATTGCTTCTGAGTA
TAACGTATACGAGCATATGGTGTTTGCGAAGATCAAAGATGGTGTGAACGTTGCTGCATC
TCATCCTCTTATATCAGGAGGTTTAGCTTTTGGTGTTGGGATCTTTGCTTTGAAAAAGAC
GAGAAGATTTGTATACTACAATGCTGTACGCATGTTTTCAAGCGAAGAGGCGTTGCTTTC
TAGAGCGGATCTTAGAGTAAAAGAGCTGAGACAATCGCTGGATCGTCTTACAGCCGAAAG
TGAAAAGTTAGAGCGAGTTGCAACTGTGGCAGAAGATGAGCTGATCAGAGGAAGGATGAA
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GCAAGCAGCAGGTTTAAAAGATGTACTTAAAGAATTACCCACGAGAGAAGCTTCTCGGTT
CCGTTCTCAAATATCGAACCGTGCTTCTGAGGTAAAGCAAGAGAGAAAGGCTTTGACAAA
GGAAGTGAACAAGATCAGCAACTATGGTATCTCCGTATGAGGAAAATCAAAACCCATTTT
TCTAGTTACGGATTTGAATACACTCTTGAGTTCTTAGATGATGGAGCAATATTATATACA
CTATTAATAATAATGTCTAAAACATGATTAAGACTAATCTTTTTGTTTGGTTTCG

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL7523Contig1 1159 2 4 U
CGGGGAACAACATGGAAGACGATACGGACCTGAAAAGAGGTCCATGGACCGCAGAAGAAG
ATTGTAAGCTCATAAATTACATTGCTAGTAATGGAGAAGGTCGATGGAACTCGCTTTCTC
GTTGCGCTGGACTCCAACGCACTGGTAAAAGCTGTAGGCTACGGTGGTTGAACTATCTCC
GCCCTGACGTCCGCCGTGGAAACATTACCCTCGAAGAACAACTCTTGATCCTCGAACTTC
ATTCCCGTTGGGGCAATCGATGGTTAAAAATCGCACAATATCTACCAGGAAGAACAGGCA
ATGAGATCAAGAACTACTGGAGAACGCTAGTGCAAAAACATGCAAAACAGCTTAAATGTG
ATGTAAACAGCCAACAATTCAAAGACACAATGAAGTACTTGTGGATGCCTCGGCTCGTCG
AGAGGATCCAATCTGCCTCAGCGGCAGCCCTAACCACAGGATCTGCCGCAACGTCATCTT
GCATCACAACCTCTAACAATCAATTCATGACGTATGATTACAACATGGGATAACAATCTG
GTGTAATGAACAACAACGACTATATCACCCCGGAAAATTCCAGCGTGGCGTTGTCTCCGG
TGTCAGACTTGACGGAGTACTACAGTGCTCCAAACCCGAACCCAGAATACTACTCGGGTC
AAGTGGGTAATAGTTATTACCCTGATCAGAACTTGGTGGGTCCACAAATGCTACCGGAGA
ATTATTTCGATTATTCTAGGTTACTAGACGAAGATGTACCGGCTATGCAGGAGCAGAGTA
ACCTTAACTGGTTTGAAAATATTAATGGAGCTGCTTCTTCTTCGGACAGTTTATGGGACA
TAGGAGAAAGCGATGAAGACTTCTGGTTTTTACAGCAGCAACAACAGTTCAACAATAATG
GCAACTTCTGAATACAATTAAAAAATCGTTAAGTACTTTATTTAACACGAAATATACGTG
TGAAAGGCATTTGTTCAATTTAATAATTAAAGAAAAGTAATGGGTTTATAATATTATCTT
AGGATATATGATCAGCTTTTTTATTATAAGCTCGATCATATGTCATGGCGTTTCTAAAAA
TCGCTGAATTTGATTGGTTTTGTCTGTTTTGGGATTGTAATTATATTTTGTAGTTTATTC
ATAAATATAGATGCAATTA


BQ
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AF RR4C724TF U 1
AF RR4C724JQ C 465
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BS 709 726 RR4C724TF
BS 727 1159 RR4C724JQ

RD RR4C724TF 726 0 0
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GTTGCGCTGGACTCCAACGCACTGGTAAAAGCTGTAGGCTACGGTGGTTGAACTATCTCC
GCCCTGACGTCCGCCGTGGAAACATTACCCTCGAAGAACAACTCTTGATCCTCGAACTTC
ATTCCCGTTGGGGCAATCGATGGTTAAAAATCGCACAATATCTACCAGGAAGAACAGGCA
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ATGTAAACAGCCAACAATTCAAAGACACAATGAAGTACTTGTGGATGCCTCGGCTCGTCG
AGAGGATCCAATCTGCCTCAGCGGCAGCCCTAACCACAGGATCTGCCGCAACGTCATCTT
GCATCACAACCTCTAACAATCAATTCATGACGTATGATTACAACATGGGATAACAATCTG
GTGTAATGAACAACAACGACTATATCACCCCGGAAAATTCCAGCGTGGCGTTGTCTCCGG
TGTCAGACTTGACGGAGTACTACAGTGCTCCAAACCCGAACCCAGAATACTACTCGGGTC
AAGTGGGTAATAGTTATTACCCTGATCAGAACTTGGTGGGTCCACAA*TGCTACCGGAGA
ATTATT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4C724JQ 695 0 0
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ATGGGATAACAATCTGGTGTAATGAACAACAACGACTATATCACCCCGGAAAATTCCAGC
GTGGCGTTGTCTCCGGTGTCAGACTTGACGGAGTACTACAGTGCTCCAAACCCGAACCCA
GAATACTACTCGGGTCAAGTGGGTAATAGTTATTACCCTGATCAGAACTTGGTGGGTCCA
CAAATGCTACCGGAGAATTATTTCGATTATTCTAGGTTACTAGACGAAGATGTACCGGCT
ATGCAGGAGCAGAGTAACCTTAACTGGTTTGAAAATATTAATGGAGCTGCTTCTTCTTCG
GACAGTTTATGGGACATAGGAGAAAGCGATGAAGACTTCTGGTTTTTACAGCAGCAACAA
CAGTTCAACAATAATGGCAACTTCTGAATACAATTAAAAAATCGTTAAGTACTTTATTTA
ACACGAAATATACGTGTGAAAGGCATTTGTTCAATTTAATAATTAAAGAAAAGTAATGGG
TTTATAATATTATCTTAGGATATATGATCAGCTTTTTTATTATAAGCTCGATCATATGTC
ATGGCGTTTCTAAAAATCGCTGAATTTGATTGGTTTTGTCTGTTTTGGGATTGTAATTAT
ATTTTGTAGTTTATTCATAAATATAGATGCAATTA

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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TCCATGTCTTCATCACTTATAGGCTGCTTGCATCCACAGCAGAGTTTATGCATTCCTTGA
GCTAAGCCATGTTCCACTGACACACGTTTGTCGAACACAAAGCATTCCCCTTCCCACAAG
CTCTCTGTTCTAGGGACTTGCTCTAGGTACTTCAGTATCCCACCTTTCAGATGATACACC
TCTTCGAAGCCTTGGCTAAGAAGAAAGCTTGAAGCTTTCTCACATCTGATTCCTCCAGTG
CAGTACATAGCAATCTTTGGCAGCGCCTTTGGTTTCTCAGCTTTCTCTTCTTTCTCCACC
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TCCATTCCTCAGGCTCACATATGTTCCAACTCTTTCGATAGGCGACACACTCGGCAT


BQ
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AF RR4F360TF C 1
AF RR4CW46JQ U 13
BS 1 12 RR4F360TF
BS 13 336 RR4CW46JQ
BS 337 337 RR4F360TF
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BS 353 624 RR4CW46JQ
BS 625 625 RR4F360TF
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RD RR4F360TF 676 0 0
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ACAAAAAATATCTATCAGAGATAGAACTTAACATCAAAAATCTATATTGAAGAACCAAGC
TTGGGACTCCTCTTTCTTGGACTATCCGGTTTATTGTCAGGTCGACGACCCTTGTCCGGA
CCACCGATCACACCCCATTCCTGAAACTGACTCTGCCTTGCTCTTGCCCTTTCTTTCTCC
TCTTCTGATTTTTCAGAGTAACAGTAAGGACAAGAGACTCCACACTCATACTCTGGAGCT
TCCATGTCTTCATCACTTATAGGCTGCTTGCATCCACAGCAGAGTTTATGCATTCCTTGA
GCTAAGCCATGTTCCACTGACACACGTTTGTCGAACACAAAGCATTCCCCTTCCCACAAG
CTCTCTGTTCTAGGGACTTGCTCTAGGTACTTCAGTATCCCACCTTTCAGATGATACACC
TCTTCGAAGCCTTGGCTAAGAAGAAAGCTTGAAGCTTTCTCACATCTGATTCCTCCAGTG
CAGTACATAGCAATCTTTGGCAGCGCCTTTGGTTTCTCAGCTTTCTCTTCTTTCTCCACC
TTTGCTTGAGTCTCATCATTGCCTA*TTCTTGCTTCAACGCAAACTGACTCTCCACCCAA
GATGGGAAGTGTCTG
C

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4CW46JQ 825 0 0
ATAACAATGGTTTTATGAATTATGATGGAGACCACAAGAAGAAGAACAACAAAAAATATC
TATCAGAGATAGAACTTAACATCAAAAATCTATATTGAAGAACCAAGCTTGGGACTCCTC
TTTCTTGGACTATCCGGTTTATTGTCAGGTCGACGACCCTTGTCCGGACCACCGATCACA
CCCCATTCCTGAAACTGACTCTGCCTTGCTCTTGCCCTTTCTTTCTCATCTTCTGATTTT
TCAGAGTAACAGTAAGGACAAGAGACTCCACACTCATACTCTGGAGCTTCCATGTCTTCA
TCACTTATAGGCTGCTTGCATCCATAGCAGAGTTTATGCGTTCCTTGAGCTAAGCCATGT
TCCACTGACACACGTTTGTCGAACACAAAGCATTCCCCTTCCCACAAGCTCTCTGTTCTA
GGGACTTGCTCTAGGTACTTCAGTATCCCACCTTTCAGATGATACACCTCTTCGAAGCCT
TGGCTAAGAAGAAAGCTTGAAGCTTTCTCACATCTGATTCCTCCAGTGCAGTACATAGCA
ATCTTTGGCAGCGCCTTTGGTTTCTCAGCTTTCTCTTCTTTCTCCACCTTTGCTTGAGTC
TCATCATTGCCTTCTTCTTGCTTCAACGCAAACTGACTCTCCACCCAAGATGGGAAGTGT
CTGAAAGCTGTGGTGCATGGATCCACAGCTCCTTTGAACTTCCCGATCCTAGTCTCATAT
GTGTTCCTCACACCAATCACTACAGTTTCAGATCACTGATCAGTTCATTCCATTCCTCAG
GCTCACATATGTTCCAACTCTTTCGATAGGCGACACACTCGGCAT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL7525Contig1 642 2 1 U
GCCGACAGAGCTGAAGCTGATGATACTTGAGTCGCTTCCAGGGGCGAGCGTTGCGAAGAT
GGCTTGCGTTTGTACGGAGATTCGGTACCTGGCGTCGGACAACGACTTGTGAAAACAAAA
GTGTTTGGAGGAAGCTAAGCATCTTGTTGTTGTGGGTGGAGCTGCTGGTGGTGATTCGGT
TAACTGGAAGGAAAAGTTTGCTGCGTTTTGGAGGCAGCACCAACGGCAGGCTTCCTCATC
TAGGCAGCAAGCCTTACGGAGATCTGCCATGGGTAGACAACGCTTTCCTTTTCCAAGGAT
CATTCCGGACCCTGACCCTTTCGGATGGATTAATGGGGATGACTTCTCTGGTCCATTCAT
TATGCACCCTGGACAATCGGCACGGCGACTTGGGGGACGGAGATTTGGACGTCCCAGATG
CAATCTTGGAGGAAACAACTATCAACAGTAAATGGTGAGTGATGAATGATCATATGGAGG
AGGGCGAGAAGAAGTATATGGCTTTCGAAATCAGCAAATAAATGGCCTGGATACTTGTTT
ATATGTTTCTATCTATAGATATTTCTTTGGTTTTTGGATGATTTTCTCTTTGTTCTTGCC
ATGCTTTTTATGCCATCTTATAATAATAATTTCGCTACTATG


BQ
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TATGCACCCTGGACAATCGGCACGGCGACTTGGGGGACGGAGATTTGGACGTCCCAGATG
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ATATGTTTCTATCTATAGATATTTCTTTGGTTTTTGGATGATTTTCTCTTTGTTCTTGCC
ATGCTTTTTATGCCATCTTATAATAATAATTTCGCTACTATG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

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TTGAGG


BQ
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QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CM79TF U 1
AF RR4CM79JQ C 116
BS 1 680 RR4CM79TF
BS 681 681 RR4CM79JQ
BS 682 719 RR4CM79TF
BS 720 720 RR4CM79JQ
BS 721 727 RR4CM79TF
BS 728 728 RR4CM79JQ
BS 729 753 RR4CM79TF
BS 754 754 RR4CM79JQ
BS 755 758 RR4CM79TF
BS 759 759 RR4CM79JQ
BS 760 776 RR4CM79TF
BS 777 777 RR4CM79JQ
BS 778 783 RR4CM79TF
BS 784 785 RR4CM79JQ
BS 786 804 RR4CM79TF
BS 805 940 RR4CM79JQ

RD RR4CM79TF 805 0 0
AGGGGGGAAACCCGTCGCCTCTTTCTGTTGCGGTGATGCTTTCTGCGTCATCTCCTCCGC
TTACATCTCTTCTCTACCCAAAAGCTTGTAAATTTGGTCAATCAAAATCGAACTCAAAAA
GATTATTCTCTCTTCGTGCTTCCTCATTGGCTGTATATGATACCAAGCTTAAAGCTGAGT
ACACACCATGGCTTATCGTCGGACTCGGTAACCCTGGATAAAGTACTACGGAACAAGACA
CAATATTGGTTTTGAGATGATTGATCATATAGCTCGAACGACAGACATTTCTATGAACAC
AATTCAATCCAAGGGTTTGGTCGGAATAGGTGCGGTTGGAGAAGTGCCGATTTTGTTGGT
TAAACCTCAAGCTTACATGAATTTTAGTGGCGAATCGGTTGGGCCATTAGCTGCTTATTA
TCAAGTACCCTTACACCACATTCTGATGATATATGATGACATGGGTTTGCCTAATGGTGT
CTTGAAGCTTCAACCAAAAGGAGGACATAGCCACCACAACGGGTTGAAGAATGTGACAGA
ACATCTAAATGGCTGTCGTAGCTTCCCCCGCTTATCAATTGGAATTGGGAATCCACCGGG
TAGCATGGACATGAAAGCGTTTCTTCTCCAGAAATTCAGCCGCTCGGAGCGTAAGCAGAT
TGACGCCGGAATGGAACAAG*TGTTGATGCCGTGAAGACACTTGTTGAATATGGATTCA*
TGAGACA*TATCTCGATTCAATTTGGGGCAGAA*TACA*GTTCCATACAGTTTGAT*ATC
TTA**CTTTACATCACCTCCATAC
T

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4CM79JQ 825 0 0
TCAAAAAGATA
TCTCTCTTCGTGCTTCCTCATTGGCTGTATATGATACCAAGCTTAAAGCTGAGTACACAC
CATGGCTTATCGTCGGACTCGGTAACCCTGGATAAAGTACTACGGAACAAGACACAATAT
TGGTTTTGAGATGATTGATCATATAGCTCGAACGACAGACATTTCTATGAACACAATTCA
ATCCAAGGGTTTGGTCGGAATAGGTGCGGTTGGAGAAGTGCCGATTTTGTTGGTTAAACC
TCAAGCTTACATGAATTTTAGTGGCGAATCGGTTGGGCCATTAGCTGCTTATTATCAAGT
ACCCTTACACCACATTCTGATGATATATGATGACATGGGTTTGCCTAATGGTGTCTTGAA
GCTTCAACCAAAAGGAGGACATAGCCACCACAACGGGTTGAAGAATGTGACAGAACATCT
AAATGGCTGTCGTAGCTTCCCCCGCTTATCAATTGGAATTGGGAATCCACCGGGTAGCAT
GGACATGAAAGCGTTTTTTCTCCAGAAATTCAGCCGCTCGGAGCGTAAGCAGATTGACGC
CGGAATGGAACAAGGTGTTGATGCCGTGAAGACACTTGTTGAATATGGATTCAATGAGAC
AATATCTCGATTCAATTTGGGGCAGAAATACAAGTTCCATACAGTTTGATTATCTTAACT
TTTACATCACCTCCATACCTGCCACAATAGCAAGGAACACCGTTAGTCAAACATTATATT
GTTAGTATCATTAGACTTTTGTCTTAGGGGTAGGTTATTTTGTAAACTGAAGATCAGTTT
AAAGTGTTATCCCTACATTATTCGTTTTTTATTT

QA 12 825 12 825
DS 



AS 1 2

CO CL7528Contig1 785 2 3 U
GGGCGATCAATCTCAAACCCTAGCGATTCTGATCATAGGAAGTGGAGAAATGCTAGATCA
CAGCGAGAAGGTGACTGATCCGATCTCTGTTTCCGGGAGATGATCTGTTTGTTAAAGCTG
ATCGCTCTTTGTTGAATGATCTTCTTGTTTTTTCAGGATTCGGAGAGAAGAATAGGTGGA
GAGGATGTGATCGAACAGAACAAGGCTTGTTGTAACGACAAGAAGACTTGCGCCGATTGT
GGTACAAGCAAAACTCCTTTCTGGCGTGGCGGTCCCGCCGGTCCAAAGGTCAGAGAACCA
ATAATAAACCCTAACCGAGTTTGATCTGATCCGATCTGATCTGATGTTTGGTTCTTTTCT
TCTTGTGTAGTCGCTTTGTAACGCGTGTGGGATCAGAAACAGGAAGAAAAGAAGAGGAGG
AGGGGAAGACAAGAAGCAGCCGAAGAAACCAAACTCCTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGG
CGATCTGAAAAGAAACCCTAAATTTGGTGAATCACTGAGGATGATGGATTTGGGGATGAC
GAAACGATCGACGGTGGAGAAGCAGCTGCGGAAGCTCGGGGAGGAAGAGCAAGCGGCGGT
GCTTCTCATGGCTCTCTCTTATGGTTCAGTTTACGCTTAGGTGGTTTTGAGAGCAGTTAT
GATTGATGATAACTAACAAAAAGAATGTTGTAATCTTTCATCTCTTTTTTTTTTGTCGGA
AATTGTTTGGCTTTGTGTTCTTTCAAATTCTGGTTCTCTCTGTGCTGTGATAGTGTGTGA
TCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4B463TF U 607
AF RR4B463JQ C 1
BS 1 606 RR4B463JQ
BS 607 713 RR4B463TF
BS 714 785 RR4B463JQ

RD RR4B463TF 107 0 0
CATGGCTCTCTCTTATGGTTCAGTTTACGCTTAGGTGGTTTTGAGAGCAGTTATGATTGA
TGATAACTAACAAAAAGAATGTTGTAATCTTTCATCTCTTTTTTTTT

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR4B463JQ 785 0 0
GGGCGATCAATCTCAAACCCTAGCGATTCTGATCATAGGAAGTGGAGAAATGCTAGATCA
CAGCGAGAAGGTGACTGATCCGATCTCTGTTTCCGGGAGATGATCTGTTTGTTAAAGCTG
ATCGCTCTTTGTTGAATGATCTTCTTGTTTTTTCAGGATTCGGAGAGAAGAATAGGTGGA
GAGGATGTGATCGAACAGAACAAGGCTTGTTGTAACGACAAGAAGACTTGCGCCGATTGT
GGTACAAGCAAAACTCCTTTCTGGCGTGGCGGTCCCGCCGGTCCAAAGGTCAGAGAACCA
ATAATAAACCCTAACCGAGTTTGATCTGATCCGATCTGATCTGATGTTTGGTTCTTTTCT
TCTTGTGTAGTCGCTTTGTAACGCGTGTGGGATCAGAAACAGGAAGAAAAGAAGAGGAGG
AGGGGAAGACAAGAAGCAGCCGAAGAAACCAAACTCCTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGG
CGATCTGAAAAGAAACCCTAAATTTGGTGAATCACTGAGGATGATGGATTTGGGGATGAC
GAAACGATCGACGGTGGAGAAGCAGCTGCGGAAGCTCGGGGAGGAAGAGCAAGCGGCGGT
GCTTCTCATGGCTCTCTCTTATGGTTCAGTTTACGCTTAGGTGGTTTTGAGAGCAGTTAT
GATTGATGATAACTAACAAAAAGAATGTTGTAATCTTTCATCTCTTTTTTTTTTGTCGGA
AATTGTTTGGCTTTGTGTTCTTTCAAATTCTGGTTCTCTCTGTGCTGTGATAGTGTGTGA
TCTGG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL7529Contig1 700 2 2 U
GGAAGGTGCACCAGTTTCTGTTTGGACTGGATGGTGCGACGCAGATTGGGCAAGCTGTCC
TATCCGGAAAAAGCTGTATGTGTGATTACTGGATTACCTGCCAAGTACCGAGATCCAGAA
ACTGGTCTTGCTTATGCAACTCTAGACCCCTTCAAAGCAATACGAGAAAGGTTCATGGAA
GAACACAATGGCTTGAGAAAGAAAATGGAGATGGGAGATCTGTTTGACACACTTACTTCT
GCTAACGGCTTTTCTGCAAAACGAAAGGGAACAATGGTTCCAAAGACAAGCAGATCATTT
TCTCTCAGAAACTCGGCTCGTTTCTGTAATTTGGAGACTCCAGAAGCGAGTGAAGTTTCA
GACTCAGATTCAGACTAATAACAACCTTCCCTGATTGGCTCGTATCTAGGAAAAAAGGTT
TTACTTTCAATCAACATCATGAACTAACATTTATTTGGACCACATATTGAGCGGCTGCTC
TGTGTATTAAATAAATCATCGAGTGGTTTTGTGGTTGAGAGATGATGAAGATCATGGATG
AAGTTTTTTCATGATCAGAGCTTGAACTGGAAACAACACACTCCTTGTAATTGATCCTCC
CGACCACAACCTAGTAACCTACTACACCATCTTAGAACCAGAGAGTGTAATTTTCACTAT
TTTGTTGACCTTTGCAATCGAATGAATTTCTTTTTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN33TF U 1
AF RR4FN33JQ C 1
BS 1 543 RR4FN33TF
BS 544 700 RR4FN33JQ

RD RR4FN33TF 543 0 0
GGAAGGTGCACCAGTTTCTGTTTGGACTGGATGGTGCGACGCAGATTGGGCAAGCTGTCC
TATCCGGAAAAAGCTGTATGTGTGATTACTGGATTACCTGCCAAGTACCGAGATCCAGAA
ACTGGTCTTGCTTATGCAACTCTAGACCCCTTCAAAGCAATACGAGAAAGGTTCATGGAA
GAACACAATGGCTTGAGAAAGAAAATGGAGATGGGAGATCTGTTTGACACACTTACTTCT
GCTAACGGCTTTTCTGCAAAACGAAAGGGAACAATGGTTCCAAAGACAAGCAGATCATTT
TCTCTCAGAAACTCGGCTCGTTTCTGTAATTTGGAGACTCCAGAAGCGAGTGAAGTTTCA
GACTCAGATTCAGACTAATAACAACCTTCCCTGATTGGCTCGTATCTAGGAAAAAAGGTT
TTACTTTCAATCAACATCATGAACTAACATTTATTTGGACCACATATTGAGCGGCTGCTC
TGTGTATTAAATAAATCATCGAGTGGTTTTGTGGTTGAGAGATGATGAAGATCATGGATG
AAG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR4FN33JQ 700 0 0
GGAAGGTGCACCAGTTTCTGTTTGGACTGGATGGTGCGACGCAGATTGGGCAAGCTGTCC
TATCCGGAAAAAGCTGTATGTGTGATTACTGGATTACCTGCCAAGTACCGAGATCCAGAA
ACTGGTCTTGCTTATGCAACTCTAGACCCCTTCAAAGCAATACGAGAAAGGTTCATGGAA
GAACACAATGGCTTGAGAAAGAAAATGGAGATGGGAGATCTGTTTGACACACTTACTTCT
GCTAACGGCTTTTCTGCAAAACGAAAGGGAACAATGGTTCCAAAGACAAGCAGATCATTT
TCTCTCAGAAACTCGGCTCGTTTCTGTAATTTGGAGACTCCAGAAGCGAGTGAAGTTTCA
GACTCAGATTCAGACTAATAACAACCTTCCCTGATTGGCTCGTATCTAGGAAAAAAGGTT
TTACTTTCAATCAACATCATGAACTAACATTTATTTGGACCACATATTGAGCGGCTGCTC
TGTGTATTAAATAAATCATCGAGTGGTTTTGTGGTTGAGAGATGATGAAGATCATGGATG
AAGTTTTTTCATGATCAGAGCTTGAACTGGAAACAACACACTCCTTGTAATTGATCCTCC
CGACCACAACCTAGTAACCTACTACACCATCTTAGAACCAGAGAGTGTAATTTTCACTAT
TTTGTTGACCTTTGCAATCGAATGAATTTCTTTTTTTTTT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL7530Contig1 462 2 1 U
GGGATCGTCGACATCAGAAGGCGATTCAGTTAGCTAAACAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA
AGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCTGCTGCTAGCATGCGA
AGGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGTGGAGGAGCCTCTGGTGGTGGTGGTGCTGCAGGATCT
ATGCTTCAGTTCTACACGGATGACGCACCTGGTCTCATATCTCTCCTAATGTTGTCCTTG
TCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTTGCTGTCCTTCATGTCATGGGCAAGCTCTACT
TTGTCAAGTGATGAGACTAGAGAGGTAGAGTGAGCGAGAGAGAGAGCTTAAGTACCACCC
AAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTGGACAGTGGTTTCAACTCATGTTTTCATTTTTG
TGAGAGACTAATATCTATAAAAAAAAATCCAGTTTCTTGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GB44JQ C 1
AF RR4GB44TF U 1
BS 1 462 RR4GB44TF

RD RR4GB44JQ 462 0 0
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AAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTGGACAGTGGTTTCAACTCATGTTTTCATTTTTG
TGAGAGACTAATATCTATAAAAAAAAATCCAGTTTCTTGATC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR4GB44TF 462 0 0
GGGATCGTCGACATCAGAAGGCGATTCAGTTAGCTAAACAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA
AGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCTGCTGCTAGCATGCGA
AGGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGTGGAGGAGCCTCTGGTGGTGGTGGTGCTGCAGGATCT
ATGCTTCAGTTCTACACGGATGACGCACCTGGTCTCATATCTCTCCTAATGTTGTCCTTG
TCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTTGCTGTCCTTCATGTCATGGGCAAGCTCTACT
TTGTCAAGTGATGAGACTAGAGAGGTAGAGTGAGCGAGAGAGAGAGCTTAAGTACCACCC
AAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTGGACAGTGGTTTCAACTCATGTTTTCATTTTTG
TGAGAGACTAATATCTATAAAAAAAAATCCAGTTTCTTGATC

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

CO CL7531Contig1 775 2 2 U
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TAAAGAGCTACAATCAATCTCCCTCAAAAAGTCATCCATTAACAAGGACAGAAACTCACT
TTGAAAGTCTTGATATAATTGTTGGTCTGTCACGTTGGATCATATCAACATGACCTAGTT
GACCTTTCTGAAACACACACCAAAATTTCAGAAACCCTGAACAAAATATAAGTAGAAAAG
AAATACAAAAGTAAAAGGGTTAAGATAAAGTAGGAGCTAGATAAAACAGAAAAAAAATAA
TTGTGAGATTTGCATTTAGTCTATTTACCGAGAATATACATTATTTTTAATTCGTTATAT
TTTCTTCCCCTTTTTGTGTGTAACGTTTGTCTTTCTGAGGAAAGATTAAATACAAAGTTT
ATATCTTAAAAAGGAATAAAAACATATATCTCCTTTTATTCCATATCTTTTCTGAAATAA
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TACCAAACAGTTATAATACAATTACATACAAACTCATTCTATAATAAAAGCTATTTTTGA
AAGAATATAAAAGATATTTTGATGATGATATCTTATTCTTCACTGATATATTCAGCAGAG
ATGCTTTACTTTTCAAAAATCATACGAGTTTTGGAAACTTCAATTTGAAGTCCATGAGTC
AAGTCTATTCCATTTGAATAATAGTTTTTAACTTAATTTCATATTAAATTGCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EG72TF U 1
AF RR4EG72JQ C 279
BS 1 710 RR4EG72TF
BS 711 775 RR4EG72JQ

RD RR4EG72TF 710 0 0
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TAAAGAGCTACAATCAATCTCCCTCAAAAAGTCATCCATTAACAAGGACAGAAACTCACT
TTGAAAGTCTTGATATAATTGTTGGTCTGTCACGTTGGATCATATCAACATGACCTAGTT
GACCTTTCTGAAACACACACCAAAATTTCAGAAACCCTGAACAAAATATAAGTAGAAAAG
AAATACAAAAGTAAAAGGGTTAAGATAAAGTAGGAGCTAGATAAAACAGAAAAAAAATAA
TTGTGAGATTTGCATTTAGTCTATTTACCGAGAATATACATTATTTTTAATTCGTTATAT
TTTCTTCCCCTTTTTGTGTGTAACGTTTGTCTTTCTGAGGAAAGATTAAATACAAAGTTT
ATATCTTAAAAAGGAATAAAAACATATATCTCCTTTTATTCCATATCTTTTCTGAAATAA
GTAAACTTTTTTGTTTTATCATATGCTGACATGATGACATCAAAAAGGTCTTTGATGTTC
TACCAAACAGTTATAATACAATTACATACAAACTCATTCTATAATAAAAGCTATTTTTGA
AAGAATATAAAAGATATTTTGATGATGATATCTTATTCTTCACTGATATATTCAGCAGAG
ATGCTTTACTTTTCAAAAATCATACGAGTTTTGGAAACTTCAATTTGAAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4EG72JQ 497 0 0
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CATTATTTTTAATTCGTTATATTTTCTTCCCCTTTTTGTGTGTAACGTTTGTCTTTCTGA
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TTCCATATCTTTTTTGAAATAAGTAAACTTTTTTGTTTTATCATATGCTGACATGATGAC
ATCAAAAAGGTCTTTGATGTTTTACCAAACAGTTATAATACAATTACATACAAACTCATT
CTATAATAAAAGCTATTTTTGAAAGAATATAAAAGATATTTTGATGATGATATTTTATTC
TTCACTGATATATTCAGCAGAGATGCTTTACTTTTCAAAAATCATACGAGTTTTGGAAAC
TTCAATTTGAAGTCCATGAGTCAAGTCTATTCCATTTGAATAATAGTTTTTAACTTAATT
TCATATTAAATTGCAGG

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL7532Contig1 703 2 3 U
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AAGGTCTATTCCGATTTTGGGCTCGTGTGCTCATTCCGTATGTGGCGAGTCTCTTATTCG
TATTTCTCTCCTCCACGATTCACAGATTCGTAAAGTTCCACCATTGAGTTGGGTCAAGAT
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CTACGGCGAACCACCTCTGCATCACTCCCGCCTCATTCGTCAACGAGGAATCACCTACGA
ATCACTCCGGAGCACTCAAATCCATTGGTGTGGTCGTCTGGAGTCCTTGTGGCTCGTCCT
CTCCACGAGAATGAAAGGTGAAGAGCAACAATGGTCAAGTTTGGATTTTTATGTGCGATT
GGAAGAACTAGCAAAGAAGAATAAAAGGTTTTGAGAAGATTATTAGTCAATTGTAATTCT
TGTCCATTTATCTATCATATGAGGGTGTGAGTTATATACTTATATTTATCTAAAGCCTTG
ATCTTTGTATATCAGTTTCATTTGTTAAGAGTATGTATATGAGACTTGTTCAAAGTCGAT
CGCTTTGATCCTATTATCAGTTTCATATGTATGTACACGAGACTTGTGAAGACTCTGTTT
TGTTCTTTATGTGCATAATATTAAGATATGAGGTTCTTTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DA20JQ C 1
AF RR4DA20TF U 1
BS 1 692 RR4DA20TF
BS 693 693 RR4DA20JQ
BS 694 703 RR4DA20TF

RD RR4DA20JQ 703 0 0
TGAAGCTGCTGAAAAGGAGAAACTCGAGACCAGAAATTATATGGGTTATCATCCAAATCA
AAGGTCTATTCCGATTTTGGGCTCGTGTGCTCATTCCGTATGTGGCGAGTCTCTTATTCG
TATTTCTCTCCTCCACGATTCACAGATTCGTAAAGTTCCACCATTGAGTTGGGTCAAGAT
CTTTCAGCGACCTCCTCCGCCATCGGGTAACAGTGAGAGGCTGAGAGCAACTGCGAGCTC
CTACGGCGAACCACCTCTGCATCACTCCCGCCTCATTCGTCAACGAGGAATCACCTACGA
ATCACTCCGGAGCACTCAAATCCATTGGTGTGGTCGTCTGGAGTCCTTGTGGCTCGTCCT
CTCCACGAGAATGAAAGGTGAAGAGCAACAATGGTCAAGTTTGGATTTTTATGTGCGATT
GGAAGAACTAGCAAAGAAGAATAAAAGGTTTTGAGAAGATTATTAGTCAATTGTAATTCT
TGTCCATTTATCTATCATATGAGGGTGTGAGTTATATACTTATATTTATCTAAAGCCTTG
ATCTTTGTATATCAGTTTCATTTGTTAAGAGTATGTATATGAGACTTGTTCAAAGTCGAT
CGCTTTGATCCTATTATCAGTTTCATATGTATGTACACGAGACTTGTGAAGACTCTGTTT
TGTTCTTTATGTGCATAATATTAAGATATGAGGTTCTTTGGCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4DA20TF 703 0 0
TGAAGCTGCTGAAAAGGAGAAACTCGAGACCAGAAATTATATGGGTTATCATCCAAATCA
AAGGTCTATTCCGATTTTGGGCTCGTGTGCTCATTCCGTATGTGGCGAGTCTCTTATTCG
TATTTCTCTCCTCCACGATTCACAGATTCGTAAAGTTCCACCATTGAGTTGGGTCAAGAT
CTTTCAGCGACCTCCTCCGCCATCGGGTAACAGTGAGAGGCTGAGAGCAACTGCGAGCTC
CTACGGCGAACCACCTCTGCATCACTCCCGCCTCATTCGTCAACGAGGAATCACCTACGA
ATCACTCCGGAGCACTCAAATCCATTGGTGTGGTCGTCTGGAGTCCTTGTGGCTCGTCCT
CTCCACGAGAATGAAAGGTGAAGAGCAACAATGGTCAAGTTTGGATTTTTATGTGCGATT
GGAAGAACTAGCAAAGAAGAATAAAAGGTTTTGAGAAGATTATTAGTCAATTGTAATTCT
TGTCCATTTATCTATCATATGAGGGTGTGAGTTATATACTTATATTTATCTAAAGCCTTG
ATCTTTGTATATCAGTTTCATTTGTTAAGAGTATGTATATGAGACTTGTTCAAAGTCGAT
CGCTTTGATCCTATTATCAGTTTCATATGTATGTACACGAGACTTGTGAAGACTCTGTTT
TGTTCTTTATGTGCATAATATTAAGATATGAG*TTCTTTGGCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7533Contig1 647 2 1 U
GCGCCAAATGGTTTTCTTTGGCGGTCAAGGGAGACAATCAATCAGCGCGTTCAGAACATT
TGGTTAACGGTGGCTCCTCAGGTTCCTCTCATGATAAATGGTCAGGAGAAGAAAACTGCC
AACAGATATTGCTATTTAACTGCATGTCAGTTCGGGACCCAAATCTGCTGCTTCCACATC
TAAGGAATGCATGCGCAAACAATGGTGTCCGTTTCAAGAAGGCATTGTTTGTACCAAACA
TGTCGGTGTATCACAAGGTTGGTACAGCGGCGGACTTGTCAGAGAATGATCCACATGTTG
ACTTGTCATGGCAGTTGACACTCCAGAAAGTTTGGGAAGGCCTTGTCCACAGCGAAAGAG
AAGGAGAAGAAGATATAGAAAATAATGATAAAAGTAGAAATAGTGAGGTGTTTACTTCAC
TCCCTATGGCAATAAAATGGCTAAGGGATAGTGTACATGAGAGTAGCTCAGCCACACGTT
TCCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGTTACATCTTGTAGGTGATGTATTGAGATTAATCAGAA
AATGAAGGGTTCGATACACCAACACTGAATCATCACTTGTGCTATTTGGATTTTTCTTTT
AACATAGATTATTTATTTCTTTATAACCAAAAGTAAAATGTTATTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4CG78TF U 1
AF RR4CY01TF U 1
BS 1 647 RR4CG78TF

RD RR4CG78TF 647 0 0
GCGCCAAATGGTTTTCTTTGGCGGTCAAGGGAGACAATCAATCAGCGCGTTCAGAACATT
TGGTTAACGGTGGCTCCTCAGGTTCCTCTCATGATAAATGGTCAGGAGAAGAAAACTGCC
AACAGATATTGCTATTTAACTGCATGTCAGTTCGGGACCCAAATCTGCTGCTTCCACATC
TAAGGAATGCATGCGCAAACAATGGTGTCCGTTTCAAGAAGGCATTGTTTGTACCAAACA
TGTCGGTGTATCACAAGGTTGGTACAGCGGCGGACTTGTCAGAGAATGATCCACATGTTG
ACTTGTCATGGCAGTTGACACTCCAGAAAGTTTGGGAAGGCCTTGTCCACAGCGAAAGAG
AAGGAGAAGAAGATATAGAAAATAATGATAAAAGTAGAAATAGTGAGGTGTTTACTTCAC
TCCCTATGGCAATAAAATGGCTAAGGGATAGTGTACATGAGAGTAGCTCAGCCACACGTT
TCCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGTTACATCTTGTAGGTGATGTATTGAGATTAATCAGAA
AATGAAGGGTTCGATACACCAACACTGAATCATCACTTGTGCTATTTGGATTTTTCTTTT
AACATAGATTATTTATTTCTTTATAACCAAAAGTAAAATGTTATTTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4CY01TF 646 0 0
GCGCCAAATGGTTTTCTTTGGCGGTCAAGGGAGACAATCAATCAGCGCGTTCAGAACATT
TGGTTAACGGTGGCTCCTCAGGTTCCTCTCATGATAAATGGTCAGGAGAAGAAAACTGCC
AACAGATATTGCTATTTAACTGCATGTCAGTTCGGGACCCAAATCTGCTGCTTCCACATC
TAAGGAATGCATGCGCAAACAATGGTGTCCGTTTCAAGAAGGCATTGTTTGTACCAAACA
TGTCGGTGTATCACAAGGTTGGTACAGCGGCGGACTTGTCAGAGAATGATCCACATGTTG
ACTTGTCATGGCAGTTGACACTCCAGAAAGTTTGGGAAGGCCTTGTCCACAGCGAAAGAG
AAGGAGAAGAAGATATAGAAAATAATGATAAAAGTAGAAATAGTGAGGTGTTTACTTCAC
TCCCTATGGCAATAAAATGGCTAAGGGATAGTGTACATGAGAGTAGCTCAGCCACACGTT
TCCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGTTACATCTTGTAGGTGATGTATTGAGATTAATCAGAA
AATGAAGGGTTCGATACACCAACACTGAATCATCACTTGTGCTATTTGGATTTTTCTTTT
AACATAGATTATTTATTTCTTTATAACCAAA*GTAAAATGTTATTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7534Contig1 942 2 2 U
GTACCAACAGAAGGTGGTCAGAGAAGTGTATTGCTTATGCTGAGAGTCACCATCAAGCTC
TTGTCGGTGATAAAACAATTGCCTTCTGGTTAATGGACAAGGATATGTATGATTTCATGG
CAGTAGACAGGCCATCAACTCCTCTGGTCGATAGAGGAATAGCTTTGCATAAAATGATCA
GGCTTATAACCATGGGATTAGGCGGTGAAGGCTACTTAAATTTTATGGGGAACGAGTTCG
GACATCCAGAATGGATCGATTTTCCCAGAGGCGAGCAGCGTCTTTCTGATGGGAGTGTGA
TTCCTGGGAACAACAACAGTTATGACAAATGCAGGCGCAGATTTGATCTTGGGGATGCGG
ACCATCTTAGATACCACGGACTGCAAGAATTTGATCGGGCAATGCAACATCTTGAGGAGA
AATACGGTTTTATGACATCGGATCATCAATTCATATCAAGAAAAGACGAAGGAGATAGAG
TAATCGTGTTCGAAAGAGGTGATCTGGTCTTCGTCTTCAACTTCCACTGGACCAGCAGCT
ACTTTGATTACCGCATTGGTTGCTCCAAGCCAGGCAAATACAAGATCGTATTGGATTCGG
ACGGTCCTCTGTTCGGTGGATTCGGCAGGCTCGATCCCAAGTCAGAGTATTTCACATTTG
AGGGCTCTTATGACGTACGACCCTCCTCTTTCATGGTCTACACACCATGCAGAACAGCAG
TGGTTTACGCTTTAACAGACCGTGATGATGGTCTCGAGACTTTGGATCCAAAATCGTAAG
CAGATAATAAGAGAGAGAGAGTATGAACATATGTAATGTCACTGAGGATGTAAAGTCTGT
AAACGAAAATATCTAAAACACTACCGGAGAAATAGCTCCTGATTAACTTAAGAAAGCCAG
TTTGTAATAACCGGAATAAACGGATGTTGGACCGTGAACGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DN44TF U 1
AF RR4DN44JQ C 510
BS 1 658 RR4DN44TF
BS 659 942 RR4DN44JQ

RD RR4DN44TF 658 0 0
GTACCAACAGAAGGTGGTCAGAGAAGTGTATTGCTTATGCTGAGAGTCACCATCAAGCTC
TTGTCGGTGATAAAACAATTGCCTTCTGGTTAATGGACAAGGATATGTATGATTTCATGG
CAGTAGACAGGCCATCAACTCCTCTGGTCGATAGAGGAATAGCTTTGCATAAAATGATCA
GGCTTATAACCATGGGATTAGGCGGTGAAGGCTACTTAAATTTTATGGGGAACGAGTTCG
GACATCCAGAATGGATCGATTTTCCCAGAGGCGAGCAGCGTCTTTCTGATGGGAGTGTGA
TTCCTGGGAACAACAACAGTTATGACAAATGCAGGCGCAGATTTGATCTTGGGGATGCGG
ACCATCTTAGATACCACGGACTGCAAGAATTTGATCGGGCAATGCAACATCTTGAGGAGA
AATACGGTTTTATGACATCGGATCATCAATTCATATCAAGAAAAGACGAAGGAGATAGAG
TAATCGTGTTCGAAAGAGGTGATCTGGTCTTCGTCTTCAACTTCCACTGGACCAGCAGCT
ACTTTGATTACCGCATTGGTTGCTCCAAGCCAGGCAAATACAAGATCGTATTGGATTCGG
ACGGTCCTCTGTTCGGTGGATTCGGCAGGCTCGATCCCAAGTCAGAGTATTTCACATT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4DN44JQ 433 0 0
TTCGTCTTCAACTTCCACTGGACCAGCAGCTACTTTGATTACCGCATTGGTTGCTCCAAG
CCAGGCAAATACAAGATCGTATTGGATTCGGACGGTCCTCTGTTCGGTGGATTCGGCAGG
CTCGATCCCAAGTCAGAGTATTTCACATTTGAGGGCTCTTATGACGTACGACCCTCCTCT
TTCATGGTCTACACACCATGCAGAACAGCAGTGGTTTACGCTTTAACAGACCGTGATGAT
GGTCTCGAGACTTTGGATCCAAAATCGTAAGCAGATAATAAGAGAGAGAGAGTATGAACA
TATGTAATGTCACTGAGGATGTAAAGTCTGTAAACGAAAATATCTAAAACACTACCGGAG
AAATAGCTCCTGATTAACTTAAGAAAGCCAGTTTGTAATAACCGGAATAAACGGATGTTG
GACCGTGAACGAC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 2

CO CL7535Contig1 1043 2 8 U
GAGTTCTCTTACAATTGGGGAACAAATCTGCGCCGTCTTCGTACCTTTCGTTGTCATTAT
TGATGTCATCTTCTCCACCTTCGGACAATGCTTCGATTGCCGCCGCCGCCGATCGCCTCA
GATATGTCAGCACCCCGATCTGACTCGTCTTGCCCATGAATCTCAATTTTCAGTCAATGA
AGTTGAAGCATTGTATGAGTTATTCAAGAAACTCAGCTGTTCAATTCATTGATGACGGCT
TGATTCACAAGGAAGAGCTTCGGCTAGCGCTTGTCCAAGCTCCAAACCTGTTTCTTGATA
GGGTTTTTGATTTGTTCGATGAGAAGAAGAATGGGGTTATCGAGTTTGAGGAGTTTATCC
ATGCCTTGAGTGTGTTTCATCCCTCTGCACCAATCGAGGAGAAGATCGACTGTAAGGATC
AGTGCCCTACTAATACTGTAATGTAATATCTGTGGATGAGCCTTCTTAAGCATGTGTTTT
TGTAATCTGTGGCAGTTGCATTTAGGCTCTATGATCTTAGACAAACCGGATTTATAGAGC
GAGAAGAGGTGCATCAAATGGTGGCTGCTATTTTGAAAGAGTCTGATATGATGCTGTCTG
ATGAACTTCTGAACATGATTATTGATAAAACATTTGCTGATGCTGATTCCGATAGAGATG
GTAAAATAAGCAAGGAGGAATGGAGAGTGTATGTGCTTAAGCATCCCAGCTTGTTGAAGA
ATATGACTCTTCCTTACCTTAAGTAACAAAATCTTCTTCTCTTTGTTAGATTAACTCTTC
AATCTAAGATAGCCTTTTGCTTTATGATCATCAACATATCTGTTTGAATTTTGAAGGGAT
GTGACGACGGCATTCCCAAGTTTTATATTCAACACTGAGGTTGAAGACTGAGGCAACAAC
ACCTACAATCTTTTTCTGCGTATGAAACCAGTTTCTTTGTTGTATTTTTTTCCCCAAATT
AGTTGGTGATCAATTGTTAGCTGTAAGTAAAAATGTATCTTTTGATGCATACATTTTGAG
ACTGTTCCATTGAAAGGGATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C658TF U 1
AF RR4C658JQ C 304
BS 1 392 RR4C658TF
BS 393 393 RR4C658JQ
BS 394 416 RR4C658TF
BS 417 417 RR4C658JQ
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BS 441 441 RR4C658JQ
BS 442 461 RR4C658TF
BS 462 1043 RR4C658JQ

RD RR4C658TF 461 0 0
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TGATGTCATCTTCTCCACCTTCGGACAATGCTTCGATTGCCGCCGCCGCCGATCGCCTCA
GATATGTCAGCACCCCGATCTGACTCGTCTTGCCCATGAATCTCAATTTTCAGTCAATGA
AGTTGAAGCATTGTATGAGTTATTCAAGAAACTCAGCTGTTCAATTCATTGATGACGGCT
TGATTCACAAGGAAGAGCTTCGGCTAGCGCTTGTCCAAGCTCCAAACCTGTTTCTTGATA
GGGTTTTTGATTTGTTCGATGAGAAGAAGAATGGGGTTATCGAGTTTGAGGAGTTTATCC
ATGCCTTGAGTGTGTTTCATCCCTCTGCACCA*TCGAGGAGAAGATCGACTGTAAG*ATC
AGTGCCCTACTAATACTGTA*TGTAATATCTGTGGATGAGC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR4C658JQ 740 0 0
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CCTTGAGTGTGTTTCATCCCTCTGCACCAATCGAGGAGAAGATCGACTGTAAGGATCAGT
GCCCTACTAATACTGTAATGTAATATCTGTGGATGAGCCTTCTTAAGCATGTGTTTTTGT
AATCTGTGGCAGTTGCATTTAGGCTCTATGATCTTAGACAAACCGGATTTATAGAGCGAG
AAGAGGTGCATCAAATGGTGGCTGCTATTTTGAAAGAGTCTGATATGATGCTGTCTGATG
AACTTCTGAACATGATTATTGATAAAACATTTGCTGATGCTGATTCCGATAGAGATGGTA
AAATAAGCAAGGAGGAATGGAGAGTGTATGTGCTTAAGCATCCCAGCTTGTTGAAGAATA
TGACTCTTCCTTACCTTAAGTAACAAAATCTTCTTCTCTTTGTTAGATTAACTCTTCAAT
CTAAGATAGCCTTTTGCTTTATGATCATCAACATATCTGTTTGAATTTTGAAGGGATGTG
ACGACGGCATTCCCAAGTTTTATATTCAACACTGAGGTTGAAGACTGAGGCAACAACACC
TACAATCTTTTTCTGCGTATGAAACCAGTTTCTTTGTTGTATTTTTTTCCCCAAATTAGT
TGGTGATCAATTGTTAGCTGTAAGTAAAAATGTATCTTTTGATGCATACATTTTGAGACT
GTTCCATTGAAAGGGATAAA

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7536Contig1 727 2 2 U
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CATTCCTTCGGTAAATGTCTCAACAACGTCGGTGGTGGCTTGAACTCAGCCCTCTCTATG
TATCCGGAATGCGTCGCGGACTCCAACGCCGAGCCTAAATGGTACGACCATCTACACTGC
GCTATGTCACACTACAAGTTCGTCCTCGCGATCGAGAACACGGCAACTGAGTCGTACGTG
ACCGAGAAGCTTTTCTATGCGCTGGATTCTGGCTCCGTTCCTATCTACTTCGGAGCTCCT
AACGTGCAAGACTTTGTCCCTCCTCACTCTGTGATAGACGGTAGCATGTTCGGTTCGATG
AAGGAACTTGCGGCTTACGTGAAGCGGCTCGGTGATGATCCTGTGGCGTACTCGGAGTAT
CACGCGTGGAGGCGGTGTGGAGTAGTAGGGAACTATGGTAGAACACGCGCGGTGAGTCTA
GATACGTTGCCGTGTAGGTTGTGTGAAGAGGTTAGCAGAAGAGGTGGTAAGAACGCTGGA
GTTTGATGTTTTACAGCTGTGGGATTATTACATTTTAGAGTGGTTCTGTTGATGTGGTTT
CTTGATATGTTACTGATGCCATATGTAATCACTCTAAAGCAATTGATACACAGATTACAA
CCTCTCTCCGAACATTTGGAAACATTGCAATGACTTTGCAAACTTAATGCTAATAGTGTT
TATAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F267TF U 1
AF RR4F267JQ C 124
BS 1 666 RR4F267TF
BS 667 727 RR4F267JQ

RD RR4F267TF 666 0 0
GCAAGATGCCTCTCTCACCGAGACCGTCTCGCTAAGACCCTCCTCGATCTGATTCCTCAC
CATTCCTTCGGTAAATGTCTCAACAACGTCGGTGGTGGCTTGAACTCAGCCCTCTCTATG
TATCCGGAATGCGTCGCGGACTCCAACGCCGAGCCTAAATGGTACGACCATCTACACTGC
GCTATGTCACACTACAAGTTCGTCCTCGCGATCGAGAACACGGCAACTGAGTCGTACGTG
ACCGAGAAGCTTTTCTATGCGCTGGATTCTGGCTCCGTTCCTATCTACTTCGGAGCTCCT
AACGTGCAAGACTTTGTCCCTCCTCACTCTGTGATAGACGGTAGCATGTTCGGTTCGATG
AAGGAACTTGCGGCTTACGTGAAGCGGCTCGGTGATGATCCTGTGGCGTACTCGGAGTAT
CACGCGTGGAGGCGGTGTGGAGTAGTAGGGAACTATGGTAGAACACGCGCGGTGAGTCTA
GATACGTTGCCGTGTAGGTTGTGTGAAGAGGTTAGCAGAAGAGGTGGTAAGAACGCTGGA
GTTTGATGTTTTACAGCTGTGGGATTATTACATTTTAGAGTGGTTCTGTTGATGTGGTTT
CTTGATATGTTACTGATGCCATATGTAATCACTCTAAAGCAATTGATACACAGATTACAA
CCTCTC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4F267JQ 604 0 0
CCGGAATGCGTCGCGGACTCCAACGCCGAGCCTAAATGGTACGACCATCTACACTGCGCT
ATGTCACACTACAAGTTCGTCCTCGCGATCGAGAACACGGCAACTGAGTCGTACGTGACC
GAGAAGCTTTTCTATGCGCTGGATTCTGGCTCCGTTCCTATCTACTTCGGAGCTCCTAAC
GTGCAAGACTTTGTCCCTCCTCACTCTGTGATAGACGGTAGCATGTTCGGTTCGATGAAG
GAACTTGCGGCTTACGTGAAGCGGCTCGGTGATGATCCTGTGGCGTACTCGGAGTATCAC
GCGTGGAGGCGGTGTGGAGTAGTAGGGAACTATGGTAGAACACGCGCGGTGAGTCTAGAT
ACGTTGCCGTGTAGGTTGTGTGAAGAGGTTAGCAGAAGAGGTGGTAAGAACGCTGGAGTT
TGATGTTTTACAGCTGTGGGATTATTACATTTTAGAGTGGTTCTGTTGATGTGGTTTCTT
GATATGTTACTGATGCCATATGTAATCACTCTAAAGCAATTGATACACAGATTACAACCT
CTCTCCGAACATTTGGAAACATTGCAATGACTTTGCAAACTTAATGCTAATAGTGTTTAT
AGTC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL7537Contig1 803 2 2 U
CGGAAAGATGAATACAAATAGGATTCAAAAAGATGTATTGCAAAGAGATTGCATATGAAA
CTAGAACATATGCCTCATCATCATACTTCTCTTAATGTGTAACTCAGCCATTAGATTTAG
ATCATTGGTGCCGATACATGAAAAAATGGTTTACAGATTACAGAGCTAACAGAGATGACT
ACTTGCCTTTCCTCTTACCACCTCCTTTCTTACCTTTCTTCCCTTTCTTCTTTCCCTTCT
TCTTCATGTCTCCTCCTCCTCCACCACCACCTCCTCCTAGCTCTCCTCCCATGCCTCTGG
ACTTCTTACCGTAACTGTAATCTCCGGTATTACTTCTTGAAAAAAAAAAACCAAAACGTA
GTAAATCCTTAACATCGAGAACACCACCCCTGAAATTCCCGAAAGTTGATTTCAAGACTC
TCTCCTCGGGCGTACGCTTCTTCTTCTCTGCGGGTTTCTTCGTAATCCCACCACCCAACT
GTCCTCCAAATCTACCAAAAATCCTATTCTGTTCCAACATCTTCTCCTCTCTTTCTTTCT
GTTTCTTCATCTGAACTCTCGCTACACTGAGTGGTAGCCTTTGTTTCTTTTGAGCCTTTC
CACCAAGTTGAGTGACTTTCTGATTCTCCAAAGCTTTCTTATCCTTACATGTCATATGTT
TTGTAGCAAATTGCTGAACATCTTCCATAATCTTGCTAAATCTCATGTTGGGATCAATTT
CATGATCCACGCCTTGTTTTTTCTTCACCATTGGCTTCCGATTAGACATGTTTTTTTTGG
TTCGTTTATTTGGAGAAATCTGA


BQ
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AF RR4A188JQD U 1
AF RR4A188JQ U 270
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BS 764 803 RR4A188JQ

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TCTTCATGTCTCCTCCTCCTCCACCACCACCTCCTCCTAGCTCTCCTCCCATGCCTCTGG
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TCTCCTCGGGCGTACGCTTCTTCTTCTCTGCGGGTTTCTTCGTAATCCCACCACCCAACT
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CATGATCCACGCCTTGTTTTTTCTTCACCATTGGCTTCCGATT

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DS 

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ATTGGCTTCCGATTAGACATGTTTTTTTTGGTTCGTTTATTTGGAGAAATCTGA

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

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T


BQ
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20 

AF RR4HB94JQB C 1
AF RR4HB94TF U 1
BS 1 541 RR4HB94TF

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T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4HB94TF 541 0 0
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CCAACACTCTTGTGGTGGTTGATTTTACGGCTTCCTGGTGTGGACCATGTCGTTTCATAG
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TTGACGAACTGGAGACAGTGGCGAGTGACTGGGCGATTGAGGCGATGCCAACCTTCATGT
TCATGAAATAAGGGAAGATTGTGGACAAAGTTGTTGGGGCCAAGAAAGATGAGCTTCAGT
CTACTATTGCCAAACACTTGGCTTAACTAAACCTTTTACATGCCTTCTGTCTTAAGATAT
TGGATTAATTGCTTTTTACTAACTGTTGAGATATTATGACTTGTTCCTTCTTTGATATGA
TGATTCCTGTTTAATCTCGTCTAATGAGATTGTGACTTGCTAGTGAGTTTGTTGAATTAT
T

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL7539Contig1 766 2 2 U
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GTTTCGGTATTGGAAGCCTTTGAGGATATTGGGCTTAACGTTCTCGAAGCTAGGATTTCA
TGTACCGACTCCTTTAGCTTGCATGCCAATGGAGTCGAGAATGAAGATGGAGATGGTATG
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GCAAAATATAATAACACAATTTCTATAGTAATTTTACTTCTTAGTTTCTCTGTTCAACTT
GTATCCCAGAATTTTCCCTTATAAAAGGGATAATGAAGAAAAATCAATTGTATGTTACTA
CTATTTATTTCGCATAATTAAGCAATAGTAAACACGTATTTAAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H773TF U 1
AF RR4H773JQB C 126
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GCAAAATATAATAACACAATTTCTATAGTAATTTTACTTCTTAGTTTCTCTGTTCAACTT
GTATCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4H773JQB 641 0 0
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CCAGAATTTTCCCTTATAAAAGGGATAATGAAGAAAAATCAATTGTATGTTACTACTATT
TATTTCGCATAATTAAGCAATAGTAAACACGTATTTAAAGT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BR54JQ C 1
AF RR4BR54TF U 1
BS 1 529 RR4BR54TF

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QA 1 529 1 529
DS 

RD RR4BR54TF 529 0 0
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QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL7541Contig1 787 2 2 U
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TTATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ69TF U 1
AF RR4CZ69JQ C 1
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BS 651 787 RR4CZ69JQ

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QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4CZ69JQ 787 0 0
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CAATGAAAAAGTGTACTTGCGGTGTTCACGAGGGTAAAATGGTAGTTTCTCAGGATGATA
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GAGAGCCAACAACAAGCCACTAAGCTTTTCTTTCTAGCTTTCTTTTTTTTTCTTCCTTTT
TGAGAGCTCTCTGGGAAATTTTCCTTCATATGTTTACTTGGAATGTAAACTCTACTAGAG
AGCAAAATTTTGAGTTTTACTTTGGCTTGTAATGTTTTATCTTTTTCTATACTAAATATT
TTATTCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL7542Contig1 807 2 2 U
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TGCATGCAATAGAAACTTTGGTTACAC


BQ
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AF RR4DU49TF U 1
AF RR4DU49JQ C 69
BS 1 714 RR4DU49TF
BS 715 807 RR4DU49JQ

RD RR4DU49TF 714 0 0
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GTAGACAATCTGAAGGTTATAGCACCCAAGATTCTTCCTGTAACAGAGCTCTTGAGGTTC
ATGTCAAAGCTTTTCATCAAGAAAATCAAGATGCGTCAAAACCCTAGCAAGGGCTCCACG
AATATCCTACCGGGGACTCCTATAAAGGCATGGATCAACTTTAAGACCGGGATTGAACAT
TTTTGCATTCATACAGGAGGAAAAGCTGTGATTGATGGGATTCAACATAGCTTGGACTTA
GCCGACTATGATATTAAACCGGCGAGGATGACTCTCTACAGGTTTGGGAACACCTCGGCT
AGTAGTTTGTGGTATGTTCTGGCTTACATGGAGGCTAAGAAGAGACTGAAGAGAGGAGAT
AGAGTGTTTATGATAAGCTTTGGAGCTGGGTTTAAGCGTAATAGCTGCGTTTGGGAAGTT
TTGAGAGATCTAACCATTGGAGAATCAAAAGAGAATGTGTGGAATCATTGCATTAATGAT
TATCCACCTAAATCGATTTCGAATCCTTTTACGAAGATGTATGGTTGGCTTCAAGATGAC
GATCCCGAAACTTTCAAGATCCCTGAGACTTTCAAGATCCCTGACGAGTATATGTAAAAC
GTTTCCGCACAGAAACGGAAACACAAAGACAACACAAAGGTGATGATATTCTCT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DU49JQ 739 0 0
TCTGAAGGTTATAGCACCCAAGATTCTTCCTGTAACAGAGCTCTTGAGGTTCATGTCAAA
GCTTTTCATCAAGAAAATCAAGATGCGTCAAAACCCTAGCAAGGGCTCCACGAATATCCT
ACCGGGGACTCCTATAAAGGCATGGATCAACTTTAAGACCGGGATTGAACATTTTTGCAT
TCATACAGGAGGAAAAGCTGTGATTGATGGGATTCAACATAGCTTGGACTTAGCCGATTA
TGATATTAAACCGGCGAGGATGACTCTCTACAGGTTTGGGAACACCTCGGCTAGTAGTTT
GTGGTATGTTCTGGCTTACATGGAGGCTAAGAAGAGACTGAAGAGAGGAGATAGAGTGTT
TATGATAAGCTTTGGAGCTGGGTTTAAGCGTAATAGCTGCGTTTGGGAAGTTTTGAGAGA
TCTAACCATTGGAGAATCAAAAGAGAATGTGTGGAATCATTGCATTAATGATTATCCACC
TAAATCGATTTCGAATCCTTTTACGAAGATGTATGGTTGGCTTCAAGATGACGATCCCGA
AACTTTCAAGATCCCTGAGACTTTCAAGATCCCTGACGAGTATATGTAAAACGTTTCCGC
ACAGAAACGGAAACACAAAGACAACACAAAGGTGATGATATTCTCTTTCTTTTCTTTTTA
TTTTTCCCTTTAATATTTACGTGTTTGAATTGGATTGAAAATGGGATATGAATGCATGCA
ATAGAAACTTTGGTTACAC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7543Contig1 830 2 2 U
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AAGAGAGGGGTGATCGACACGTGGCTTGATAAACACCGTTCGTTATACACTGCGGCTACA
CGCCATGACTTCGTCGTCTCCATCCGCGACGGATCCGTTGATCTCTCCTCCTTCAAAACT
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ATCAGAGCCGGCAAAGAATCCGGCGAGACTTCAGACATGGAAGTGGTTCTTGGTGGTTAG
CGTCGTTGAATGATGAGATAGAATGGTTTAAAAGTGAAGGGTCGAAATGGGGTGTTGACT
TCTCGACTGTTGTGGCTCAAAAGGCGAATCAAGAATATCGCAGGTTTCTTGAAGGTCTGA
TGAGTAGTGAAGTGAAGTATGGGGTGATGATGACGGCTTTCTGGGCGATCGAAGCGGTGT
ATCAAGAGAGCTTTGCTCACTGTTTGGAGAATGGGAACAAAACTCCGGGGGGAGCTTACC
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ATTGCTGAACGTTGTCTGGAGAATAATGCCTCAGGGGAAGCTTTGGTTGAGGCTTAAGAT
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TAGTAAATGCTTTGGTTCAGATATCTCATTTTGCTATGTTATTTTTTTACTAATGTGTAT
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BQ
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AF RR4DB24TF U 1
AF RR4DB24JQ C 242
BS 1 565 RR4DB24TF
BS 566 830 RR4DB24JQ

RD RR4DB24TF 565 0 0
GGGATTGATCGTTGAAGAAGAATCTTGAGAGAAGCAGCAACTTCGATGGAGAAACCGGAG
AAGAGAGGGGTGATCGACACGTGGCTTGATAAACACCGTTCGTTATACACTGCGGCTACA
CGCCATGACTTCGTCGTCTCCATCCGCGACGGATCCGTTGATCTCTCCTCCTTCAAAACT
TGGCTGGGGCAAGATTACCTCTTCGTGAGGGAGTTCGCGCCGTTTGTAGCGAATGTTCTG
ATCAGAGCCGGCAAAGAATCCGGCGAGACTTCAGACATGGAAGTGGTTCTTGGTGGTTAG
CGTCGTTGAATGATGAGATAGAATGGTTTAAAAGTGAAGGGTCGAAATGGGGTGTTGACT
TCTCGACTGTTGTGGCTCAAAAGGCGAATCAAGAATATCGCAGGTTTCTTGAAGGTCTGA
TGAGTAGTGAAGTGAAGTATGGGGTGATGATGACGGCTTTCTGGGCGATCGAAGCGGTGT
ATCAAGAGAGCTTTGCTCACTGTTTGGAGAATGGGAACAAAACTCCGGGGGGAGCTTACC
GGAGCTTGCAATCGGTGGGGAAACG

QA 1 565 1 565
DS 

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GTCGTTGAATGATGAGATAGAATGGTTTAAAAGTGAAGGGTCGAAATGGGGTGTTGACTT
CTCGACTGTTGTGGCTCAAAAGGCGAATCAAGAATATCGCAGGTTTCTTGAAGGTCTGAT
GAGTAGTGAAGTGAAGTATGGGGTGATGATGACGGCTTTCTGGGCGATCGAAGCGGTGTA
TCAAGAGAGCTTTGCTCACTGTTTGGAGAATGGGAACAAAACTCCGGGGG*AGCTTACCG
GAGCTTGCAATCGGTGGGGAAACGACGGGTTTAGAGTGTACTGTTCAGCTGTGAAGAATA
TTGCTGAACGTTGTCTGGAGAATAATGCCTCAGGGGAAGCTTTGGTTGAGGCTTAAGATG
TTTTGGTACGTGTTCTTGAACATGAAGTTGCCTTTTGGGAGATGAGCCGTGGTGGACAGT
AGTAAATGCTTTGGTTCAGATATCTCATTTTGCTATGTTATTTTTTTACTAATGTGTATG
AAAGACGAACTATGTGGTTGTGATCCCGTGAAACTCTGCTTTTGAATCT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL7544Contig1 1053 2 2 U
GATGGAACCCAAATTTTCACTGAAATCCGTGGAGCGCTCGGATCTGTGAACCAGTTGTTC
ATTTGTATAGGAATACTTGCTGCCTTGATAGCTGGTTTACCCCTTGCAGCAAACCCTCTT
TGGTGGAGGACGATGTTTGGTGTTGCGGTTATCCCTTCCGTTTTATTAGCCATAGGAATG
GCTTTTTCTCCAGAAAGCCCAAGGTGGCTCGTTCAGCAAGGAAAACTTACTCAAGCCGAA
AAGGCTATCAAAACTCTTTATGGTAAAGAAAAAGTGGTTGAATTAGTTCGTGACTTGTCA
ACCTCTGGCCAAGGTACTTCTGAGCCAGAAGCAGGATGGTTTGATCTATTCAGCAGCCGC
TACTGGAAAGTTGTCAGCGTAGGTGCGGCGCTCTTCTTGTTTCAACAGTTAGCTGGGATA
AATGCAGTTGTATACTACTCTACATCTGTGTTCCGCAGCGCCGGAATCCAATCTGATGTC
GCAGCTAGTGCTCTTGTTGGAGCATCAAACGTGTTTGGAACTGCTGTTGCTCTCTTTGTC
CTTCACATGGAAAGCTCTAGCTGCATATTCAGGCCCTCTCGCTGTTGTTGGAACTGTTCT
ATATGTCCTGTCATTCTCACTTGGTGCGGGCCCAGTACCAGCTCTTCTTCTTCCAGAGAT
ATTCGCATCCCGGATCAGAGCAAAAGCCGTTGCTCTTTCTCTCGGCATGCACTGGATCTC
AAACTTTGTGATTGGACCTACTTCTTAAGTGTTGTGACTAAATTTGGAATCAGCAGTGTC
TACTTGGGTTTCGCCGGAGTGTGTGTCCTTGCGGTCATGTACATCGCAGGAAACGTGGTG
GAGACTAAAGGACGATCGCTCGAGGAAATAGAGCTTGCTCTTACCTCCGGTGCTTGAAAT
TAAACCAAAAGAATATCAATACCACTTTGTTTCATCATTGATCCTGTATTCCTGTTAGTC
TCTATCTCTCTTTCGGTCAACTTTTCTTGTTCTTTAATAACTTGTACAATGGACTAAGTA
ATCAATCAATAACGAGAAATCGGTTCATTCACC


BQ
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AF RR4E088TF U 1
AF RR4E088JQ C 316
BS 1 568 RR4E088TF
BS 569 1053 RR4E088JQ

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QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GB65TF C 1
AF RR4GB65JQ U 8
BS 1 7 RR4GB65TF
BS 8 750 RR4GB65JQ
BS 751 754 RR4GB65TF

RD RR4GB65TF 754 0 0
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CATATCTAT*ATCAGAAGAAACTCTTTGTCTTTGTCTTTTGGTTTTGTAACTTCTTTAAA
AAGAAAAAAAAGAGAGAGAGATTGAGAGTGTCTATTTAGAGTTTAAGAGCAATGCTAAAG
CTCTTCTCTAGTCCTATCTTCACTTGACCTCCCTCCCGTCATGCTTCCCTTTTGCATCAT
CGCCACAAACTCCTTATAGTCTATTCTCCCGTCATTGTCTTGATCAACATCACGCATCAT
TTCTTCTATCCGGACATCCTCTACACCAAACTCCTCACACGCCTGTTGAAGCTCGTCCGG
TGTTATATAACCGCTCCCATCTTTGTCGAAATACGTAAACGCTGCAAACAAATGGTCCTC
TCTCTCTATTTTGTTTAGATGCAACGTCGAGAATCTCAGACTCTTTGAGATTAGCACCTA
CTCGTTTTAGTCCTGCTTTCAGTTCTTCGAATGTTATCTGTCCGCTTTTGTCCGCATCTA
TCTGTTAAACATCTCTTTCAACCCTGCTATTTCTTCTTCAGACAAGCTCTCCGCAATCAC
TCTAAGAGCCATTTTCTTGAACGTTCATTGCAGAGAACTGCTTCATACGGCTCAGTACAG
CAGAATCCAGAGGTTTGTCTGGAGCCACACCGTCCACTTGTACCCACGGGTGACATAGTA
CTTGGTGTGCAGTTAGTCTTCTCTTGGGATCCCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4GB65JQ 743 0 0
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AAAAGAGAGAGAGATTGAGAGTGTCTATTTAGAGTTTAAGAGCAATGCTAAAGCTCTTCT
CTAGTCCTATCTTCACTTGACCTCCCTCCCGTCATGCTTCCCTTTTGCATCATCGCCACA
AACTCCTTATAGTCTATTCTCCCGTCATTGTCTTGATCAACATCACGCATCATTTCTTCT
ATCCGGACATCCTCTACACCAAACTCCTCACACGCCTGTTGAAGCTCGTCCGGTGTTATA
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ATTTTGTTTAGATGCAACGTCGAGAATCTCAGACTCTTTGAGATTAGCACCTACTCGTTT
TAGTCCTGCTTTCAGTTCTTCGAATGTTATCTGTCCGCTTTTGTCCGCATCTATCTGTTA
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GCCATTTTCTTGAACGTTCATTGCAGAGAACTGCTTCATACGGCTCAGTACAGCAGAATC
CAGAGGTTTGTCTGGAGCCACACCGTCCACTTGTACCCACGGGTGACATAGTACTTGGTG
TGCAGTTAGTCTTCTCTTGGGAT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7546Contig1 541 2 1 U
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GTTTATCCTAAAGGGCCATCACCTCCTGTGAAACCGAAGCTGCTGAGTCTTGTGGATATG
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TCATCAGGTGTTGTTTGGATTTTTGAAAAGATTTATTCAATCTGTTGATGTAAATGTATA
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T


BQ
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20 

AF RR4FD80JQ C 1
AF RR4FD80TF U 1
BS 1 541 RR4FD80TF

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T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4FD80TF 541 0 0
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TTAGGTCCAAACCAGCCAACAGCTAATAAGCCAGTGTCTAAGATCGATATAAACTCGGCG
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AAAGAGGTGGTGAGAGGTCCGGAAGTACCGCCTGGGTATTGGGTTGTGACTGGTGCTAAG
CTTTGTGTTAAGGCAGGGAAGATCTCAATCAAAGCTAAGTATTCGCTGCTCACTGTTATA
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AGCGTGTCGTGTTGGATTTTTGCAGGTTTTTTCAGTTTGTGATTAGGCTTTGTGGTTATC
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TCATTGTTTATGTATATTGTTGAATTCACTACTTTTACATAATATATATTTGTTTTGTGG
T

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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20 

AF RR4BK83JQ C 1
AF RR4BK83TF U 1
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C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR4BK83TF 481 0 0
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C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 2

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TCTAT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4CI10TF U 1
AF RR4CI10JQ C 1
BS 1 546 RR4CI10TF
BS 547 725 RR4CI10JQ

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QA 1 546 1 546
DS 

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GTAGTTCTTCTAGAGCTTCTCACAGGGAGAAAATCATTAGACAAGTCACGGCCTACACGT
GAGCAAAACCTCATAGACTGGGCTCTTCCTCTGCTGAAAGAGAAGAAGAAAGTGTTGAAC
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TAGATCACTTGGTTTCTTTTATTTTCTTTAACATACAGATTCAAAAGTCAAAACTAGATT
GTGTTTGTGTGTATCTTACAAAATACAAATTAAAGGTTTGATTGGTTGAAGCTATGACTT
TCTAT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7549Contig1 701 2 1 U
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TATCATGAACCTTCTCAGATAAATCCAGAATTGTGTTTTCT


BQ
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AF RR4BI79TF U 1
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DS 

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QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BQ30TF U 1
AF RR4BQ30JQ C 1
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TATCAATAAATCAAGAAATCTCTCTTTATATGTTGCAATTTAAAAGGAATGAAAAAGTTA
CTGTATAC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4AD36JQ C 1
AF RR4AD36TF U 1
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GCATTGATTCATAGATACTTGCCTCAGTCCCCAACGCTTGTGTATATCAGTAATTGTAGG
ACATACATTATACAGACGTATTAATGGATGGACTGTTATGGATTTTGGCTGATAATTTTG
AACACTATTACAAATTATGAGAATTATGAAATCGACTGTTTATAATCGATAACTTTTAAT
TGTCGT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4AD36TF 546 0 0
GACAAGCGGGAACAGCACTGATAGGTCTAAGCTCCGGGTTCATATTCGCAGCAGCGGTTT
CCATCACATCAGAGCTTTTTGGACCGAACAGTGTTGGCGTTAACCACAACATCTTGATCA
CAAACATACCGATAGGATCGTTGATCTATGGATTCTTGGCTGCATTGGTCTATGACTCGC
ATGGTTTGACTGGGATCAGATCGATGAAAGATTCCGTCGTGTGTATGGGACGGGGTTGCT
ATTACTTGACCTTCGTGTGGTGGGGATGCTTGTCGGTTCTTGGACTTGCTTCGAGTCTTG
TGTTGTATATTAGGACCAGAAGAGCTTATCAACGGTTTGAACAAGCTCGGATAAGTTCAA
GCATTGATTCATAGATACTTGCCTCAGTCCCCAACGCTTGTGTATATCAGTAATTGTAGG
ACATACATTATACAGACGTATTAATGGATGGACTGTTATGGATTTTGGCTGATAATTTTG
AACACTATTACAAATTATGAGAATTATGAAATCGACTGTTTATAATCGATAACTTTTAAT
TGTCGT

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL7552Contig1 870 2 2 U
GAGATTTGGAACTTAAGTAATCAGAATTGCTAGATCACATCATGGAGGATGCAACTCAAG
TAGCCAGCTCTGAGGTCCCTGTAGTGAAAGGTGATGCTGTTGACCTTAAGACAGTTGATG
TTTCCGTCAAGGCTGTGAATGGAGATGTGACAAAGGAAGGGAAAGAAGAAGAAGATACAA
CATTTGATGGAGAATTCATAAAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTGATGCCAAGGATGATGCTG
AGAAAGCAGTGCATATTCCTGTTCAAGATCAAACGCAAGTCTCAGTTGAAAGAAGCTCGG
GTGGTTCAGATAGAGAACTACATGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAACTAGAGGTCGAAT
TGGAAAGGGTAGCAGGGGAACTGAAACGGTATGAATCCGAGAATACCCACTTGAAGGATG
AGCTCTTGTCTGCGAAAGAGAAGTTAGAAGAAACGGAAAAGAAGCATGTAGAGCTTGAAG
CTGCCCAAAAGAAGCAGCAAGAGAAGATTGTTGAAGGAGAAGAAAGATACAGCTCTCAGT
TGAAGTCCTTGGAAGATGCTTTGCAGTCCCATGATGCCAAAGGCAAGGAACTAACTGAAG
TTAAGGAAGCTTTTGATGCACTGGGCCTAGAACTCGAGAACTCACGAAAGAAGCTGATAG
AGTTGGATGAGGGGCTAAAACGTTCAGCTGAAGAGGCTCAGAAATTTGAAGAGCTGCATA
AGCAAAGCGCTTCTCATGCTAACTTTGAGACTCAGAAGGCTTTGGAATTTGCACAGTTGC
TTGAATCGACGAAAGTGAGTGCCAAGGAAATGGAGGAAAAAATGGCGTCCTTGCAACAAG
AAATCAAGGAGCTGAATAATAAGATTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CA31TF U 1
AF RR4CA31JQ C 110
BS 1 741 RR4CA31TF
BS 742 870 RR4CA31JQ

RD RR4CA31TF 752 0 0
GAGATTTGGAACTTAAGTAATCAGAATTGCTAGATCACATCATGGAGGATGCAACTCAAG
TAGCCAGCTCTGAGGTCCCTGTAGTGAAAGGTGATGCTGTTGACCTTAAGACAGTTGATG
TTTCCGTCAAGGCTGTGAATGGAGATGTGACAAAGGAAGGGAAAGAAGAAGAAGATACAA
CATTTGATGGAGAATTCATAAAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTGATGCCAAGGATGATGCTG
AGAAAGCAGTGCATATTCCTGTTCAAGATCAAACGCAAGTCTCAGTTGAAAGAAGCTCGG
GTGGTTCAGATAGAGAACTACATGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAACTAGAGGTCGAAT
TGGAAAGGGTAGCAGGGGAACTGAAACGGTATGAATCCGAGAATACCCACTTGAAGGATG
AGCTCTTGTCTGCGAAAGAGAAGTTAGAAGAAACGGAAAAGAAGCATGTAGAGCTTGAAG
CTGCCCAAAAGAAGCAGCAAGAGAAGATTGTTGAAGGAGAAGAAAGATACAGCTCTCAGT
TGAAGTCCTTGGAAGATGCTTTGCAGTCCCATGATGCCAAAGGCAAGGAACTAACTGAAG
TTAAGGAAGCTTTTGATGCACTGGGCCTAGAACTCGAGAACTCACGAAAGAAGCTGATAG
AGTTGGATGAGGGGCTAAAACGTTCAGCTGAAGAGGCTCAGAAATTTGAAGAGCTGCATA
AGCAAAGCGCTTCTCATGCTA
CTCTGAGACTC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4CA31JQ 761 0 0
GACAGTTGATGTTTC*GTCAAGGCTGTGAATGGAGATGTGACAAAGGAAGGGAAAGAAGA
AGAAGATACAACATTTGATGGAGAATTCATAAAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTGATGCCAA
GGATGATGCTGAGAAAGCAGTGCATATTCCTGTTCAAGATCAAACGCAAGTCTCAGTTGA
AAGAAGCTCGGGTGGTTCAGATAGAGAACTACATGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAACT
AGAGGTCGAATTGGAAAGGGTAGCAGGGGAACTGAAACGGTATGAATCCGAGAATACCCA
CTTGAAGGATGAGCTCTTGTTTGCGAAAGAGAAGTTAGAAGAAACGGAAAAGAAGCATGT
AGAGCTTGAAGCTGCCCAAAAGAAGCAGCAAGAGAAGATTGTTGAAGGAGAAGAAAGATA
CAGCTCTCAGTTGAAGTCCTTGGAAGATGCTTTGCAGTCCCATGATGCCAAAGGCAAGGA
ACTAACTGAAGTTAAGGAAGCTTTTGATGCACTGGGCCTAGAACTCGAGAACTCACGAAA
GAAGCTGATAGAGTTGGATGAGGGGCTAAAACGTTCAGCTGAAGAGGCTCAGAAATTTGA
AGAGCTGCATAAGCAAAGCGCTTCTCATGCTAACTTTGAGACTCAGAAGGCTTTGGAATT
TGCACAGTTGCTTGAATCGACGAAAGTGAGTGCCAAGGAAATGGAGGAAAAAATGGCGTC
CTTGCAACAAGAAATCAAGGAGCTGAATAATAAGATTTCTG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7553Contig1 1010 2 4 U
TTGAAAGCGTAAATCTTTTGATGTCCTCTAAAGGTAATGTTCTTCGTTGTGATGTGACGG
GGAAAGTTCTAATGAAATGTTTCCTTTCGGGAATGCCTGATCTGAATTTGGGATTGAATG
ATAAACTTGGGCTTGAGAAGGAATCGGAAATGAAATCTCGTCCAGCCAAGAGTGGCAAAA
CCATTGAGCTTGATGATGTCACATTTCACCAGTGTGTGAACCTGACAAGATTCAACTCCG
AGAAGACCGTTAGCTTTGTACCCCCGGACGGTGAATTTGAACTGATGAAGTATCGAATAA
CAGAGGGTGTGAATCTGCCTTTCCGCGTATTACCGACAATCAAAGAGCTTGGTCGTACAC
GCATGGAAGTAAATGTCAAGGTGAAAAGTGTGTTTGGTGCGAAAATGTTTGCCCTCGGCG
TCGTAGTTAAAATTCCAGTGCCAAAACAAACAGCAAAGACTAACTTCCAAGTGACATCTG
GTCGCGCTAAGTACAATCCATCAATTGATTGCTTGGTTTGGAAGATAAGAAAATTTCCAG
GACAAACAGAGTCCACACTAAGTGCAGAGATTGAGTTGATTTCAACAATGGGAGAAAAGA
AATCTTGGACAAGGCCACCAATCCAAATGGAGTTTCAGGTGCCAATGTTCACAGCATTTG
GTTTGCGAGTTCGTTTTCTCAAGGTGTGGGAGAAGAGCGGTTACAACACGGTCGAGTGGG
TTAGATACATAACCAAAGCGGGATCTTATGAGATCAGATGCTGAACTTAAGATCACAGTT
CAAGTTCAGTGACATCAGTCCTGAGGCTCATGGCTTCTAGCTTTTGTTCCTTATGCAGAA
CAAGAAACAAAGAGTTGAATATATTTTATCTTTCGTTTATGTTTGTCTTTTTTTCCCGTT
AAGAGATATTCTTGTGTTAATATGATTTCTTATGTCTTGGTATTGGATTTGTTTTCATTT
CTTTGTTTGTGGGTTATCTTCGAGTTATAAATTTGATTAATTTGGTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C446TF U 1
AF RR4C446JQ C 235
BS 1 584 RR4C446TF
BS 585 585 RR4C446JQ
BS 586 597 RR4C446TF
BS 598 1010 RR4C446JQ

RD RR4C446TF 603 0 0
TTGAAAGCGTAAATCTTTTGATGTCCTCTAAAGGTAATGTTCTTCGTTGTGATGTGACGG
GGAAAGTTCTAATGAAATGTTTCCTTTCGGGAATGCCTGATCTGAATTTGGGATTGAATG
ATAAACTTGGGCTTGAGAAGGAATCGGAAATGAAATCTCGTCCAGCCAAGAGTGGCAAAA
CCATTGAGCTTGATGATGTCACATTTCACCAGTGTGTGAACCTGACAAGATTCAACTCCG
AGAAGACCGTTAGCTTTGTACCCCCGGACGGTGAATTTGAACTGATGAAGTATCGAATAA
CAGAGGGTGTGAATCTGCCTTTCCGCGTATTACCGACAATCAAAGAGCTTGGTCGTACAC
GCATGGAAGTAAATGTCAAGGTGAAAAGTGTGTTTGGTGCGAAAATGTTTGCCCTCGGCG
TCGTAGTTAAAATTCCAGTGCCAAAACAAACAGCAAAGACTAACTTCCAAGTGACATCTG
GTCGCGCTAAGTACAATCCATCAATTGATTGCTTGGTTTGGAAGATAAGAAAATTTCCAG
GACAAACAGAGTCCACACTAAGTGCAGAGATTGAGTTGATTTCA*CAATGGGAGAAA
GAATCT

QA 1 597 1 597
DS 

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GAATAACAGAGGGTGTGAATCTGCCTTTCCGCGTATTACCGACAATCAAAGAGCTTGGTC
GTACACGCATGGAAGTAAATGTCAAGGTGAAAAGTGTGTTTGGTGCGAAAATGTTTGCCC
TCGGCGTCGTAGTTAAAATTCCAGTGCCAAAACAAACAGCAAAGACTAACTTCCAAGTGA
CATCTGGTCGCGCTAAGTACAATCCATCAATTGATTGCTTGGTTTGGAAGATAAGAAAAT
TTCCAGGACAAACAGAGTCCACACTAAGTGCAGAGATTGAGTTGATTTCAACAATGGGAG
AAAAGAAATCTTGGACAAGGCCACCAATCCAAATGGAGTTTCAGGTGCCAATGTTCACAG
CATTTGGTTTGCGAGTTCGTTTTCTCAAGGTGTGGGAGAAGAGCGGTTACAACACGGTCG
AGTGGGTTAGATACATAACCAAAGCGGGATCTTATGAGATCAGATGCTGAACTTAAGATC
ACAGTTCAAGTTCAGTGACATCAGTCCTGAGGCTCATGGCTTCTAGCTTTTGTTCCTTAT
GCAGAACAAGAAACAAAGAGTTGAATATATTTTATCTTTCGTTTATGTTTGTCTTTTTTT
CCCGTTAAGAGATATTCTTGTGTTAATATGATTTCTTATGTCTTGGTATTGGATTTGTTT
TCATTTCTTTGTTTGTGGGTTATCTTCGAGTTATAAATTTGATTAATTTGGTGTCG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL7554Contig1 1551 2 6 U
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TTAGAGAGAAAATCATGGCGAGGAAGATGCTTTCTGATGGAGAGCTTAACAAGGCCGCAG
GTGCGGAGAAAGCCACCGAGGCTCACTATGATTTTGATTTGTTTGTCATCGGTGCCGGGA
GCGGCGGTGTTCGTGCTGCTAGGTTCTCTGCCAATAATGGTGCCAAGGTTGGTATTTGTG
AGCTTCCCTTTCACCCTATTAGCTCCGAGGAGATTGGAGGTGTTGGTGGCACGTGTGTTA
TTCGTGGTTGTGTTCCCAAAAAGATTCTAGTCTATGGTGCCACTTATGGTAGTGAACTTG
AGGATGCTAGAAACTATGGGTGGGAAATCAATGACAAAGTCGACTTCACTTGGAAGAAGC
TTCTTCAAAAGAAGACTGATGAGATATTAAGACTGAACAATATTTACAAGCGGATGTTGG
CGAATGCTGCTGTCAAGTTGTATGAAGGTGAAGGAAGAATAGTTGGTCCCAACGAAGTGG
AGGTCAGACAAATCGATGGCACCAAAATAAGTTACACTGCGAAGCACATTTTGATTGCTA
CTGGTAGTCGAGCACAGAAGCCCAACATTCCTGGACATGAGCTGGCTATTACATCTGATG
AAGCTTTAAGTTTGGAAGAATTTCCTAAGCGTGCTATAGTGCTTGGAGGAGGGTACATTG
CTGTGGAGTTTGCATCAATTTGGCGCGGAATGGGTGCTACTGTTGATTTATTCTTCAGGA
AGGAACTTCCACTAAGGGGATTTGATGACGAAATGAGGGCACTCGTGGCTAGAAATCTTG
AAGGAAGGGGTATCAATCTGCATCCACAGACAAGTTTGGCTGAGTTGATAAAAACAGACG
AGGGAATAAAAGTAATATCCTCTCATGGAGAAGAATTCGTGGCAGATGTTGTACTATTTG
CTACTGGAAGAGCTCCTAATACCAAGAGATTGAATTTAGAAGCTGTTGGTGTTGAACTTG
ATCAGGCTGGAGCTGTTAAGGTTGATGAGTACTCACGCACTAATATACCTAGCATATGGG
CTGTGGGAGATGCTACAAACCGAATTAACCTTACACCTGTTGCGTTAATGGAGGCCACCT
GCTTTGCGAACACTGTCTTTGGTGAGAAGCCTACTAAAGCAGACTACACAAATGTAGCTT
GTGCTGTATTTTGCATACCACCACTAGCTGTGGTGGGTCTCAGCGAAGACGAGGCAGTTG
AAAAAGCGACCGGGGATATTTTGGTTTTCACCTCAGTTTTTAACCCTATGAAGAACACCA
TTTCAGGACGGCAGGAAAAGACATTAATGAAGCTTATAGTTGATGAGAAGACTGATAAGT
TATGGAGCATCCATGTGCGGTCAGATGCAGCTGAGATCATGCAGGGATGCATTGCGCTCA
GTGTGAGCACCAAGCACAGTTGACAGCACGGTGGGATACATCATCTTCTGCAGAGGATCG
TACATGCACACTGTGACAGACGCATGCTACAAGCAACTAGACGAGTCTATG


BQ
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AF RR4FL62TF U 1
AF RR4EO68TF U 701
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BS 746 746 RR4EO68TF
BS 747 768 RR4FL62TF
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BS 770 778 RR4FL62TF
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RD RR4FL62TF 779 0 0
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TTAGAGAGAAAATCATGGCGAGGAAGATGCTTTCTGATGGAGAGCTTAACAAGGCCGCAG
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GCGGCGGTGTTCGTGCTGCTAGGTTCTCTGCCAATAATGGTGCCAAGGTTGGTATTTGTG
AGCTTCCCTTTCACCCTATTAGCTCCGAGGAGATTGGAGGTGTTGGTGGCACGTGTGTTA
TTCGTGGTTGTGTTCCCAAAAAGATTCTAGTCTATGGTGCCACTTATGGTAGTGAACTTG
AGGATGCTAGAAACTATGGGTGGGAAATCAATGACAAAGTCGACTTCACTTGGAAGAAGC
TTCTTCAAAAGAAGACTGATGAGATATTAAGACTGAACAATATTTACAAGCGGATGTTGG
CGAATGCTGCTGTCAAGTTGTATGAAGGTGAAGGAAGAATAGTTGGTCCCAACGAAGTGG
AGGTCAGACAAATCGATGGCACCAAAATAAGTTACACTGCGAAGCACATTTTGATTGCTA
CTGGTAGTCGAGCACAGAAGCCCAACATTCCTGGACATGAGCTGGCTATTACATCTGATG
AAGCTTTAAGTTTGGAAGAATTTCCTAAGCGTGCTATAGTGCTTGGAGGAGGGTACATTG
CTGTGGAGTTTGCATCAATTTGGCGTGGAATGGGTGCTACTGTTGATT*ATTCTTCAG
A

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4EO68TF 851 0 0
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TGTTGATTTATTCTTCAGGAAGGAACTTCCACTAAGGGGATTTGATGACGAAATGAGGGC
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TGAGTTGATAAAAACAGACGAGGGAATAAAAGTAATATCCTCTCATGGAGAAGAATTCGT
GGCAGATGTTGTACTATTTGCTACTGGAAGAGCTCCTAATACCAAGAGATTGAATTTAGA
AGCTGTTGGTGTTGAACTTGATCAGGCTGGAGCTGTTAAGGTTGATGAGTACTCACGCAC
TAATATACCTAGCATATGGGCTGTGGGAGATGCTACAAACCGAATTAACCTTACACCTGT
TGCGTTAATGGAGGCCACCTGCTTTGCGAACACTGTCTTTGGTGAGAAGCCTACTAAAGC
AGACTACACAAATGTAGCTTGTGCTGTATTTTGCATACCACCACTAGCTGTGGTGGGTCT
CAGCGAAGACGAGGCAGTTGAAAAAGCGACCGGGGATATTTTGGTTTTCACCTCAGTTTT
TAACCCTATGAAGAACACCATTTCAGGACGGCAGGAAAAGACATTAATGAAGCTTATAGT
TGATGAGAAGACTGATAAGTTATGGAGCATCCATGTGCGGTCAGATGCAGCTGAGATCAT
GCAGGGATGCATTGCGCTCAGTGTGAGCACCAAGCACAGTTGACAGCACGGTGGGATACA
TCATCTTCTGCAGAGGATCGTACATGCACACTGTGACAGACGCATGCTACAAGCAACTAG
ACGAGTCTATG

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL7555Contig1 736 2 1 U
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AAGATTCGATCTTTCAATGAAATAAACAAAGATTCTTTCTGGTCATAAAAACCGAACCTT
TAATTCATCTTTCATCATCTCTTCTTCTTCTTCTTTTATGGTTTTGATTCCTTCGATAAT
CTCATACTTTCTATTCCTGAGTTTGATTCATCCGCTTCTTTCCGAGAAACCCGACCCGGA
GGAAGCCATGAGAGTCCATCCAATCCACAACAACAACAACACCTTGATCCACCACCACCA
TCGCCATAACCCGACCCGAGAACCCGGAAAGAATCTCCGTCGTTTACCGCACATCTTCAA
CCGCGTTCTCGAGCTTCCGTTGAGGTCCGAAGCGGATGTCACCGTGGAAGAGAGACCCGA
TTGTTTCAGATTCGTGGCGGAGACGGAGGGCGTCTGCGGAGAGATGAGGGCGTACGTGGT
GGATATCCATCCGGGTATAACCAAGATCGTTGTGAGGACGAATGGGTTGTCTTTGGGCTT
GTCGTTGGACGAGTTGGAGCTTGATGTCTGGCGTTTTAGGCTTCCGGAGACGACGAGGGC
CGAGCTTGTTACGGTGGTTTGTGTTGACGGGTTTTGGTTGTTACCGTTCCGAGATGGACG
ATCGTGGTGGTTTGGA


BQ
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AF RR4FM24TF U 1
AF RR4EW38TF U 1
BS 1 736 RR4EW38TF

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QA 1 736 1 736
DS 



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TC


BQ
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AF RR4EQ77JQ C 1
AF RR4EQ77TF U 1
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TC

QA 1 542 1 542
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GGCATGTTTTAATTTTATCTTGCAATAAATGATATATCTATCATGTCATATGGTTAATTA
TC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL7557Contig1 1090 2 2 U
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AGTTACATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC20TF U 1
AF RR4BC20JQ C 294
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BS 738 1090 RR4BC20JQ

RD RR4BC20TF 737 0 0
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GAATCGCCTACGGCGGCGGAGGCGGAGGAGAGAAGCTGGAGACTTTCGAAGACGCTGGTG
CTGCTACAGTGATCAATCTCGGCAAACAGAAACCATCCATGTCGCCATCAGTTCCCTCGT
CCTCTGTCTCTTCATCACCGGAGAGAGTTGAGCCGGTGATTGATTCGCTGAACTGTGAGG
AGGAGGAGGATGAGTTTGAGTGGGTGGCTGTTGAAAGAGAGGATAAATCTCCGGAGATTG
AGGAAGTTGAGGATGCTTTCTCTGCACTTCAACTGATGTTCAATGATGATGATGAAGATA
AAGAGCAAGTTTCAGATCAGTCGGAGTTTGTAGATTGGATTGAGCCTCCATTGCAGCTGT
GTAATACCAGTCTTCTGCAGCCTTATATGCTGGACAGATTCTACGACGCCTTTCATATGT
TTCAGACCGATCAATCAGTTCAGAGAATGGTTATGTCATTGGCTTCAGACAGGGCTGTTT
GGGATGCGGTGATGAACAATGAGGTTGTCCGGGAGCTCATTACCGTTACCAATGCTGAGG
AGAGGTCAGAAGAAGAAGACACTGGTATATCCGTGAACTTCATAAGGAAGTTGCTTCAGA
GAAGTGCCATCAAAATCATGGATGCAATGGGAAGGAGTCACAAAGTACGTCACTGACCTC
TTCAATGGAGATAAGAC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4BC20JQ 797 0 0
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GAAGATAAAGAGCAAGTTTCAGATCAGTCGGAGTTTGTAGATTGGATTGAGCCTCCATTG
CAGCTGTGTAATACCAGTCTTCTGCAGCCTTATATGCTGGACAGATTTTACGACGCCTTT
CATATGTTTCAGACCGATCAATCAGTTCAGAGAATGGTTATGTCATTGGCTTCAGACAGG
GCTGTTTGGGATGCGGTGATGAACAATGAGGTTGTCCGGGAGCTCATTACCGTTACCAAT
GCTGAGGAGAGGTCAGAAGAAGAAGACACTGGTATATCCGTGAACTTCATAAGGAAGTTG
CTTCAGAGAAGTGCCATCAAAATCATGGATGCAATGG*AAGGAGTCACAAAGTACGTCAC
TGACCTCTTCAATGGAGATAAGACGGTTGTTCCTGGAGATGAGTCGGTCGTGTTAGTCAC
AGGTGCTGCGCCAGCGATGGAGAAGCTTCAGATGACGGTTCTGCTCGCCATTGTTGTTTT
GCTTATTGTCTTCGTAAATCGTAACCAGGGCAACGAGAGCTAGATAGTTATTAAACATCC
ACAGCCAAACTAATGAACTCATGGCCTGCGTTAAAAGAGATCTCTGCAGCTGTGTGATCC
TTGTGCTACTATTGTGTAATAAAAGAAAAAAACATCAGAATAGATACGTCATTTGAAACA
TTAATCCCAACTTTGCCATAAGCAAGAGTGTACCAAAAACACACTATTAAATTAGATGTG
AGAATAGAGTTACATCC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL7558Contig1 802 2 2 U
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AGACAATTGGGTCCATGATATTTGGTGTGTTCGTGATCCCGAAAGCCTCGCTGGCTGTAA
TTTTTGTGGATAAATGGGGAAGACGACCACTCCTATTGGTTTCTGCTGCTGGAGTTTCCA
TTGCGTCCTTGCTTATTGGGGTCTGCTTCACGTTACAGGAAATGAATATTATTCCTGAAC
TGACTGGTGTGTTCATCTTCATATTCATTCTGGCCTACTTTGGATGTTTTGCCATCGGTG
TAGGAGGACTGCCCTGGGTCATTATGTCCGAGATTTTTCCAATCAATATTAAAGTTTCAG
CTGGGACAGTAGTAGCATTAACCTCATGGACCAGTGGGTGGTTCGTGAGTTACGCTTTCG
ACTTATGTTTGAATGGAGCGCACAAGGAACATTTTACATATTTGGGGTTGTCGGAGGGGC
ATCATTGGTTTTTATTTGGTTTCTCGTCCCGGAAACCAAAGGACAGTCACTGGAAGAATT
ACAAGCTTCGCTTACGGGGACAACTTAAACACATATTTATGTCGTAATTGCTATTAAATT
TGTTTTTAGCAACCTTATAGCGATCCAAGTGGCTTTATACAAAATATTTTGCTTGTACTT
ATTACAAGCATAATGCTTGATAGTATACCCTCTTCTTCTAAAAAGGGTACAACTTGTATT
GTTAATTACAAAGTTCATTTTTGTGAAAGGGTTTGTAATAACAAATTTAATCCTCATGAT
GAAGTATTTTATTTGCCGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H082TF U 1
AF RR4H082JQ C 62
BS 1 703 RR4H082TF
BS 704 802 RR4H082JQ

RD RR4H082TF 707 0 0
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TGACTGGTGTGTTCATCTTCATATTCATTCTGGCCTACTTTGGATGTTTTGCCATCGGTG
TAGGAGGACTGCCCTGGGTCATTATGTCCGAGATTTTTCCAATCAATATTAAAGTTTCAG
CTGGGACAGTAGTAGCATTAACCTCATGGACCAGTGGGTGGTTCGTGAGTTACGCTTTCG
ACTTATGTTTGAATGGAGCGCACAAGGAACATTTTACATATTTGGGGTTGTCGGAGGGGC
ATCATTGGTTTTTATTTGGTTTCTCGTCCCGGAAACCAAAGGACAGTCACTGGAAGAATT
ACAAGCTTCGCTTACGGGGACAACTTAAACACATATTTATGTCGTAATTGCTATTAAATT
TGTTTTTAGCAACCTTATAGCGATCCAAGTGGCTTTATACAAAATATTTTGCTTGTACTT
ATTACAAGCATAATGCTTGATAGTATACCCTCTTCTTCTAAAA
GGTA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4H082JQ 741 0 0
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TTTTGTGGATAAATGGGGAAGACGACCACTCCTATTGGTTTCTGCTGCTGGAGTTTCCAT
TGCGTCCTTGCTTATTGGGGTCTGCTTCACGTTACAGGAAATGAATATTATTCCTGAACT
GACTGGTGTGTTCATCTTCATATTCATTCTGGCCTACTTTGGATGTTTTGCCATCGGTGT
AGGAGGACTGCCCTGGGTCATTATGTCCGAGATTTTTCCAATCAATATTAAAGTTTCAGC
TGGGACAGTAGTAGCATTAACCTCATGGACCAGTGGGTGGTTCGTGAGTTACGCTTTCGA
CTTATGTTTGAATGGAGCGCACAAGGAACATTTTACATATTTGGGGTTGTCGGAGGGGCA
TCATTGGTTTTTATTTGGTTTCTCGTCCCGGAAACCAAAGGACAGTCACTGGAAGAATTA
CAAGCTTCGCTTACGGGGACAACTTAAACACATATTTATGTCGTAATTGCTATTAAATTT
GTTTTTAGCAACCTTATAGCGATCCAAGTGGCTTTATACAAAATATTTTGCTTGTACTTA
TTACAAGCATAATGCTTGATAGTATACCCTCTTCTTCTAAAAAGGGTACAACTTGTATTG
TTAATTACAAAGTTCATTTTTGTGAAAGGGTTTGTAATAACAAATTTAATCCTCATGATG
AAGTATTTTATTTGCCGTACG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7559Contig1 665 2 2 U
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AGGTTGGCAAGATTAGAAGAAAGATCACGTCACGTGCAGATAAATGACGAGAGCCTCTGT
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GTGTGTTACAAGTGTTACCGACGCCTAGGTGAATCAAAGTCAGTAACGGGCCGTGACTTC
AAGCGAGATGTTCTGATAAAACCCGGTTGGTTAGTGAACCGGTAGCAGAAGCCCTCTTGT
TGACCTCTAATCTCTCACAAACACATAGAAGACTGTACAGTACAGATACTTAAAGAACAA
CATAAGGAGATTCCATGAAGTTCTTCTCTATGCTTGTGAAGAGAGATTCGAATCTGCAAT
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GGGCATTTCTTACTTTGTGACAGTTAAAAATGGGCAAATGTTGCAAATAATTTTATATAG
TACCTTGTTGTTACTTTCTTATCAAGAGGAAGGACCTGTTTGGTTAATAAATGAAAATAA
TAAAT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4BD90TF U 1
AF RR4BD90JQ C 1
BS 1 649 RR4BD90TF
BS 650 665 RR4BD90JQ

RD RR4BD90TF 649 0 0
CCTGACATGCCTTTAAAACTGGCGTCAGATACAATTTTGAGAGTGCTGAGGGCTCGGGTT
CATCATCATCGTCAAGGCCAAATCGTACACAATGTCTCTCGTGCATTGGATGTGGATTCA
AGGTTGGCAAGATTAGAAGAAAGATCACGTCACGTGCAGATAAATGACGAGAGCCTCTGT
GGTTCTTGCTTCGCCCGCCTGGGAACTAAGCTATTTGCTATGTACCCTGATGATACCATT
GTGTGTTACAAGTGTTACCGACGCCTAGGTGAATCAAAGTCAGTAACGGGCCGTGACTTC
AAGCGAGATGTTCTGATAAAACCCGGTTGGTTAGTGAACCGGTAGCAGAAGCCCTCTTGT
TGACCTCTAATCTCTCACAAACACATAGAAGACTGTACAGTACAGATACTTAAAGAACAA
CATAAGGAGATTCCATGAAGTTCTTCTCTATGCTTGTGAAGAGAGATTCGAATCTGCAAT
GTTTCGACAGATTCTTCATGCAACGAGTAGTGGTAAATGTTGTAGGGGGGCATAGTATAT
GGGCATTTCTTACTTTGTGACAGTTAAAAATGGGCAAATGTTGCAAATAATTTTATATAG
TACCTTGTTGTTACTTTCTTATCAAGAGGAAGGACCTGTTTGGTTAATA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4BD90JQ 665 0 0
CCTGACATGCCTTTAAAACTGGCGTCAGATACAATTTTGAGAGTGCTGAGGGCTCGGGTT
CATCATCATCGTCAAGGCCAAATCGTACACAATGTCTCTCGTGCATTGGATGTGGATTCA
AGGTTGGCAAGATTAGAAGAAAGATCACGTCACGTGCAGATAAATGACGAGAGCCTCTGT
GGTTCTTGCTTCGCCCGCCTGGGAACTAAGCTATTTGCTATGTACCCTGATGATACCATT
GTGTGTTACAAGTGTTACCGACGCCTAGGTGAATCAAAGTCAGTAACGGGCCGTGACTTC
AAGCGAGATGTTCTGATAAAACCCGGTTGGTTAGTGAACCGGTAGCAGAAGCCCTCTTGT
TGACCTCTAATCTCTCACAAACACATAGAAGACTGTACAGTACAGATACTTAAAGAACAA
CATAAGGAGATTCCATGAAGTTCTTCTCTATGCTTGTGAAGAGAGATTCGAATCTGCAAT
GTTTCGACAGATTCTTCATGCAACGAGTAGTGGTAAATGTTGTAGGGGGGCATAGTATAT
GGGCATTTCTTACTTTGTGACAGTTAAAAATGGGCAAATGTTGCAAATAATTTTATATAG
TACCTTGTTGTTACTTTCTTATCAAGAGGAAGGACCTGTTTGGTTAATAAATGAAAATAA
TAAAT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7560Contig1 853 2 1 U
GGAGCCAAGCCGAAAACAAATCAAAATGTCTACCACCACTGCAGCTGCAGCCTCTGGTAT
CTTTGGAATCCGGATTCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTTCAA
TTTCAGCTTCGGGAAAAAGAAAGCAGCTCCACCGCCGAAGAAAACCAAGCAGGTCCAAAA
CGAAGGAGACCGGCTAGTTTGGTTCCCCGGCGCAAACCCGCCGGAATGGCTAGACGGATC
GATGATCGGAGACCGTGGATTCGACCCCTTCGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCTTCA
GTACGATTTCGACGGGCTTGATCAAAACCTCGCGAAGAACGTGGCGGGTGAAATCCTTGG
GGTCAGGCAGGAATCGAAGGAGATCAACCCGACGCCGTTTCAGCCATACACTGAAGTGTT
CGGGATCGAACGTTTCAGAGAATGCGAGCTTATCCATGGAAGGTGGGCCATGCTTGGTGT
TCTTGGGGCTCTTGCCGTCGAAGGTCTCACCGGCATCGCCTGGCAAGACGCCGGGAAGGT
GGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCATTCTCCTTGACGACGTT
GATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTTGGCTACATCGAGTTCCAGCGTAACGCTGAGCTGGA
TCCGGAGAAACGTATTTACCCGGGTGGGTATTTTGACCCGTTGGGACTCGCGGCTGACCC
AGCGAAGTTGGATACCTTGAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTCGTCTCGCATGATCGCAT
TCCTCATCTTTTCACTTCAGCGGCTTTACTGGCAAAGCCCATCAGCTTCCTCGCTACTTT
AGCAGCTAAATGA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM72TF U 2
AF RR4CN38TF U 1
BS 1 853 RR4CN38TF

RD RR4CM72TF 638 0 0
GG
GCCAAGCCGAAAACAAATCAAAATGTCTACCACCACTGCAGCTGCAGCCTCTGGTATCTT
TGGAATCCGGATTCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTTCAATTT
CAGCTTCGGGAAAAAGAAAGCAGCTCCACCGCCGAAGAAAACCAAGCAGGTCCAAAACGA
AGGAGACCGGCTAGTTTGGTTCCCCGGCGCAAACCCGCCGGAATGGCTAGACGGATCGAT
GATCGGAGACCGTGGATTCGACCCCTTCGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCTTCAGTA
CGATTTCGACGGGCTTGATCAAAACCTCGCGAAGAACGTGGCGGGTGAAATCCTTGGGGT
CAGGCAGGAATCGAAGGAGATCAACCCGACGCCGTTTCAGCCATACACTGAAGTGTTCGG
GATCGAACGTTTCAGAGAATGCGAGCTTATCCATGGAAGGTGGGCCATGCTTGGTGTTCT
TGGGGCTCTTGCCGTCGAAGGTCTCACCGGCATCGCCTGGCAAGACGCCGGGAAGGTGGA
ACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCATTCTCCTTGACGACGTTGAT
ATGGATCGAGGTGTTAGTGGTTGGCTACATCGAGTT

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR4CN38TF 853 0 0
GGAGCCAAGCCGAAAACAAATCAAAATGTCTACCACCACTGCAGCTGCAGCCTCTGGTAT
CTTTGGAATCCGGATTCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTTCAA
TTTCAGCTTCGGGAAAAAGAAAGCAGCTCCACCGCCGAAGAAAACCAAGCAGGTCCAAAA
CGAAGGAGACCGGCTAGTTTGGTTCCCCGGCGCAAACCCGCCGGAATGGCTAGACGGATC
GATGATCGGAGACCGTGGATTCGACCCCTTCGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCTTCA
GTACGATTTCGACGGGCTTGATCAAAACCTCGCGAAGAACGTGGCGGGTGAAATCCTTGG
GGTCAGGCAGGAATCGAAGGAGATCAACCCGACGCCGTTTCAGCCATACACTGAAGTGTT
CGGGATCGAACGTTTCAGAGAATGCGAGCTTATCCATGGAAGGTGGGCCATGCTTGGTGT
TCTTGGGGCTCTTGCCGTCGAAGGTCTCACCGGCATCGCCTGGCAAGACGCCGGGAAGGT
GGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCATTCTCCTTGACGACGTT
GATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTTGGCTACATCGAGTTCCAGCGTAACGCTGAGCTGGA
TCCGGAGAAACGTATTTACCCGGGTGGGTATTTTGACCCGTTGGGACTCGCGGCTGACCC
AGCGAAGTTGGATACCTTGAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTCGTCTCGCATGATCGCAT
TCCTCATCTTTTCACTTCAGCGGCTTTACTGGCAAAGCCCATCAGCTTCCTCGCTACTTT
AGCAGCTAAATGA

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL7561Contig1 642 2 2 U
TTTTTCCGTCGAAAATGAATAAAGCTTTACAATTACAAACCATAACACAAATTAAGTCCG
AAACTAATGTAATGACTCCTTATTAAAAAAAATAAGAAACTAATTAGCAGAAACAAACAC
TACCATAAAACCACCAACCAAAGGAATCATCATCGGTAGAGAGAAGCCACCAAAACCAAG
AACACATTTCAGATTTCATGCAAAATATTTTATGAAACCGAAGTGATGATGATTTTTAGT
CTACCAACCGTGGAAGAAAGAACAAGAAGGAAGACTTACTACTAACAAACTACACTTAGA
CTGGGATTGCGTCTACGTTTGATGAGTCTTCACATCTCAGCACAATGCCTTCAAGACTTG
CACGGAACGTGCACTTGCTCCATTGCCAACCAGCTACTAACGGCTCTGTCGTTGGGACTA
TCATCAACACGCTTTCGTTTCTCTGCACCACTCCAATCACACTTACTGTGCTTCCTTCTT
TGATATACCCTTCTTTAAGCCGCATAACTCGCTCGCCATTGGATAGATTCTTCTGACCCA
ACCACCTTACGAAATCTGGAGACGCTTGCTCGCTTCCTGGCTTGAAATCGATGACAACAG
AGTCATCAACAATAGGTGTTACCTTTGCACCGTTTCCGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G460TF C 1
AF RR4G460JQ U 6
BS 1 5 RR4G460TF
BS 6 642 RR4G460JQ

RD RR4G460TF 642 0 0
TTTTTCCGTCGAAAATGAATAAAGCTTTACAATTACAAACCATAACACAAATTAAGTCCG
AAACTAATGTAATGACTCCTTATTAAAAAAAATAAGAAACTAATTAGCAGAAACAAACAC
TACCATAAAACCACCAACCAAAGGAATCATCATCGGTAGAGAGAAGCCACCAAAACCAAG
AACACATTTCAGATTTCATGCAAAATATTTTATGAAACCGAAGTGATGATGATTTTTAGT
CTACCAACCGTGGAAGAAAGAACAAGAAGGAAGACTTACTACTAACAAACTACACTTAGA
CTGGGATTGCGTCTACGTTTGATGAGTCTTCACATCTCAGCACAATGCCTTCAAGACTTG
CACGGAACGTGCACTTGCTCCATTGCCAACCAGCTACTAACGGCTCTGTCGTTGGGACTA
TCATCAACACGCTTTCGTTTCTCTGCACCACTCCAATCACACTTACTGTGCTTCCTTCTT
TGATATACCCTTCTTTAAGCCGCATAACTCGCTCGCCATTGGATAGATTCTTCTGACCCA
ACCACCTTACGAAATCTGGAGACGCTTGCTCGCTTCCTGGCTTGAAATCGATGACAACAG
AGTCATCAACAATAGGTGTTACCTTTGCACCGTTTCCGGTTC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4G460JQ 637 0 0
CCGTCGAAAATGAATAAAGCTTTACAATTACAAACCATAACACAAATTAAGTCCGAAACT
AATGTAATGACTCCTTATTAAAAAAAATAAGAAACTAATTAGCAGAAACAAACACTACCA
TAAAACCACCAACCAAAGGAATCATCATCGGTAGAGAGAAGCCACCAAAACCAAGAACAC
ATTTCAGATTTCATGCAAAATATTTTATGAAACCGAAGTGATGATGATTTTTAGTCTACC
AACCGTGGAAGAAAGAACAAGAAGGAAGACTTACTACTAACAAACTACACTTAGACTGGG
ATTGCGTCTACGTTTGATGAGTCTTCACATCTCAGCACAATGCCTTCAAGACTTGCACGG
AACGTGCACTTGCTCCATTGCCAACCAGCTACTAACGGCTCTGTCGTTGGGACTATCATC
AACACGCTTTCGTTTCTCTGCACCACTCCAATCACACTTACTGTGCTTCCTTCTTTGATA
TACCCTTCTTTAAGCCGCATAACTCGCTCGCCATTGGATAGATTCTTCTGACCCAACCAC
CTTACGAAATCTGGAGACGCTTGCTCGCTTCCTGGCTTGAAATCGATGACAACAGAGTCA
TCAACAATAGGTGTTACCTTTGCACCGTTTCCGGTTC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL7562Contig1 641 2 1 U
GGGAACCAGGTGCTTCTTCGATCACACCGCCTCCGGACCATCCAATGTGTAACGTCTGCG
AAAGGACAACCTCTTTCAAGCACCAACTCCAACAATAGCGAAGTTGTACACCTTCTAGCG
TCCTTGGCCGATGATTCTCAGAAGAAAAATCAGATTCAGGTTTCTAACATTAAGAAACCA
TTGTTCTTTTACGCCAATCTCGCCAAGCAGTACGATGATGTTGAACTGTCTGCCCTTGGG
ATGGGTACACATGATCTTAATCGCTCTCTCTCCTATACTTTCTTCTGTGTATTGAAATGA
TTGTACTTGACAATAGAACCTGAATCAGCATGCTGAATCAACACAGTCAAAAGAACCTGT
TTCATTTTTCTTCTGGAGTTCGCAAGTGTCATGCAAAAACATCTTCAGATAAAGAGGCAT
TGATAAAAAAAAAAGAAGATGGAATCTTTTCGGTTTGGCATCGGTTAAACCATATGTACC
GATCTATAGTTATTTCTAAACCCGAAAATTGAGTATGGGAACACTAAGTAGCTCTGCTGT
GTATATTTTTGTTTGACTCGAGTGTAACTTTAATGATCGAAGTATTGTTACTCTGAGTAA
ATTTGATTCATACCAATATACCATATCGACAAATGTTTTTC


BQ
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AS 1 2

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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EJ38TF U 1
AF RR4EJ38JQ C 272
BS 1 614 RR4EJ38TF
BS 615 938 RR4EJ38JQ

RD RR4EJ38TF 614 0 0
AGGGGAGAACATAGTTTCCTCTCTTCTCGTGTAGCTCTAGTCTTGTACTTCTAGTATTTC
TTTATAACCTCCGTAAACCTCTGTATAGGTTATAGGTAATTGTAAAGATTTGATCTTTGT
CTGGGTTTTATTTGTAGTTTTGAATGCCGGTGATGGTATTAAATATACTTTGAGGGCTAA
GTCCCTAGGAAAAAAGAAACAACTCTGAGGCATTATTTATTTAATCTGTTTATTCTTGTT
AGATATTTTCCTCTGCGTCAGCTTAGTGTTGTATTAGAGGATAGTATTCTTGTTTACGTA
GATTATTGTTGAATATGATGTTTTGCTCTTGTTTGGTTTTCTAGTGTTTTATGGGTTGTA
TTGTGCAAGTGACGATAAAAAGACAGGGACATCAGATTCTCCTTAGGGAGAAGTAGAATG
ATGATGAATGTCTAAATGGGAATCTCTCTGATGCACATACCCAAAATCTAAAATATGTTT
TTTTGAAGCTTTCTTAATTGTGCCGATGATGTATATCTATTGATGTGTTTTCATCAGATT
TTTATAGTGATGAATATAATCACAATTGTCACTACCTCTGAGGCACATTCTCTTTTCGTT
TTGTATCTGATTTA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4EJ38JQ 667 0 0
TATTAGAGGATAGTATTCTTGTTTACGTAGATTATTGTTGAATATGATGTTTTGCTCTTG
TTTGGTTTTCTAGTGTTTTATGGGTTGTATTGTGCAAGTGACGATAAAAAGACAGGGACA
TCAGATTCTCCTTAGGGAGAAGTAGAATGATGATGAATGTCTAAATGGGAATCTCTTTGA
TGCACATACCCAAAATCTAAAATATGTTTTTTTGAAGCTTTCTTAATTGTGCCGATGATG
TATATCTATTGATGTGTTTTCATCAGATTTTTATAGTGATGAATATAATCACAATTGTCA
CTACCTCTGAGGCACATTCTCTTTTCGTTTTGTATTTGATTTATTAGGCCTAGTAATTGC
ATCTAAGAACGGAGATATGAAGTGTTTTGTTTTGTTGCTACCTAACATTTAGTTCGGCTA
AGGCCCTCTTTGTTTAGATTTTGTTCTTGGTAAATGGTAATGGATGCAGGTTGCTCTCAT
ACTTTTTCTTCAACGCGATGCTGTCTAGAGTTGTAGGGGTGTGTGCTCCCTTGATGCTTG
AAGTTGAGACGAGCTCTTTCAAGCTCCTCAGAACTTTATTCGATTAAGCTTCGTAGAAGA
CGAGTTCTCATTCAAATTAACAAGTGTACCGTTATTCGATTTTAGTAAAAATAGATACTT
GTGTTAG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL7565Contig1 903 2 6 U
GGGCTATTCTCTCTCTCTCAAGCCTTCTTGAAGTTGCTCACATTTCGATGGGATCGCTGG
TCCGTCAAGAGCTCAGCCCTACATCTTCTCTCTACAAGCAGATTGCTAGTTCTGTTAATG
AAGGAAAGCATGCTCCCAAGGGTCTTGTGTTTGCTCTGCTATCAAAGCGTCTTGAAGAAG
GCTATGCAAGGGGAGAATCAGGTTTCATTCTCGATGGCATTCCCCGCACTCTTCTTCAAG
CTGAAACTCTTGATCAAATCGCTCACATTGACCTCGTTGTGAATCTTAAATGCTCTGAGG
ACCATCTGGTAAACCGATCTGCTCTTAGCGAAACACCTCTACCTCGCCAGGAGTTCCTCG
GCTCTAACTTACACTCAGCTGTTGCAATCAAAGCCCGGAGGGAGAGCCTGAGTGTCTACG
CTGAGGAGGTGAAGCCCCTGGAAGATTACTACAGGAAGCAGAGGAAACTTCTGGACTTTC
ATGTCGGCCGTGCTACATCAGCAGAAACATGGCAGGGCTTATTGTTAGCCTTGCATCTGA
AGCAGGCTAATTTGGCGACTTCACAGAAGCTGACTCTGTGATGATGAACACAAGCATCGT
CTAAGCTTTGCTTTATAAATTTTGATCCTTTTTCTTTTCATTTTTGATGGGTCTGTGTCT
CGGGCACTACCTGATTTTTTCTTTTGCTTTCACAATATATATGCAACTCAAAAAGTTTTG
CGAGGGATCTCCAAAAGTGATGAGGATGAAACACATAAAGCTTGTAATGAGTCTAAAATA
TAGAGTGTAATAATTTCCCTATAACCAAATATTGTCAATGATTGGTATTTAGTAGTGTAA
GTCTGTTAGAATAGGTATAAATATGTAACAAGTCTAGATTTGCTTTACTTGATACGTCTA
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4A056TFB U 1
AF RR4A056JQD C 209
BS 1 777 RR4A056TFB
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BS 779 798 RR4A056TFB
BS 799 799 RR4A056JQD
BS 800 870 RR4A056TFB
BS 871 903 RR4A056JQD

RD RR4A056TFB 870 0 0
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TCCGTCAAGAGCTCAGCCCTACATCTTCTCTCTACAAGCAGATTGCTAGTTCTGTTAATG
AAGGAAAGCATGCTCCCAAGGGTCTTGTGTTTGCTCTGCTATCAAAGCGTCTTGAAGAAG
GCTATGCAAGGGGAGAATCAGGTTTCATTCTCGATGGCATTCCCCGCACTCTTCTTCAAG
CTGAAACTCTTGATCAAATCGCTCACATTGACCTCGTTGTGAATCTTAAATGCTCTGAGG
ACCATCTGGTAAACCGATCTGCTCTTAGCGAAACACCTCTACCTCGCCAGGAGTTCCTCG
GCTCTAACTTACACTCAGCTGTTGCAATCAAAGCCCGGAGGGAGAGCCTGAGTGTCTACG
CTGAGGAGGTGAAGCCCCTGGAAGATTACTACAGGAAGCAGAGGAAACTTCTGGACTTTC
ATGTCGGCCGTGCTACATCAGCAGAAACATGGCAGGGCTTATTGTTAGCCTTGCATCTGA
AGCAGGCTAATTTGGCGACTTCACAGAAGCTGACTCTGTGATGATGAACACAAGCATCGT
CTAAGCTTTGCTTTATAAATTTTGATCCTTTTTCTTTTCATTTTTGATGGGTCTGTGTCT
CGGGCACTACCTGATTTTTTCTTTTGCTTTCACAATATATATGCAACTCAAAAAGTTTTG
CGAGGGATCTCCAAAAGTGATGAGGATGAAACACATAAAGCTTGTAATGAGTCTAAA*TA
TAGAGTGTAATAATTTCC*TATAACCAAATATTGTCAATGATTGGTATTTAGTAGTGTAA
GTCTGTTAGAATAGGTATAAATATGTAACA

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4A056JQD 695 0 0
TCTCGATGGCATTCCCCGCACTCTTCTTCAAGCTGAAACTCTTGATCAAATCGCTCACAT
TGACCTCGTTGTGAATCTTAAATGCTCTGAGGACCATCTGGTAAACCGATCTGCTCTTAG
CGAAACACCTCTACCTCGCCAGGAGTTCCTCGGCTCTAACTTACACTCAGCTGTTGCAAT
CAAAGCCCGGAGGGAGAGCCTGAGTGTTTACGCTGAGGAGGTGAAGCCCCTGGAAGATTA
CTACAGGAAGCAGAGGAAACTTCTGGACTTTCATGTCGGCCGTGCTACATCAGCAGAAAC
ATGGCAGGGCTTATTGTTAGCCTTGCATCTGAAGCAGGCTAATTTGGCGACTTCACAGAA
GCTGACTCTGTGATGATGAACACAAGCATCGTCTAAGCTTTGCTTTATAAATTTTGATCC
TTTTTCTTTTCATTTTTGATGGGTCTGTGTCTCGGGCACTACCTGATTTTTTCTTTTGCT
TTCACAATATATATGCAACTCAAAAAGTTTTGCGAGGGATCTCCAAAAGTGATGAGGATG
AAACACATAAAGCTTGTAATGAGTCTAAAATATAGAGTGTAATAATTTCCCTATAACCAA
ATATTGTCAATGATTGGTATTTAGTAGTGTAAGTCTGTTAGAATAGGTATAAATATGTAA
CAAGTCTAGATTTGCTTTACTTGATACGTCTATGC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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ATTTGCGATTATTGTAAAGAAAGAGTAAGAGACATGAGTAAGCTTTTCTTGTTAGGGGTT
GTGGTGACAGGACTGGTTCTAGGGACTAAGACAAATGAGTATCTAGAGTTCAATGTCACT
GAGTTAGATCGCATTGAGGAATTAGAGTATGGTTTCTCCAAATCTAGCTCTAACCTTAAC
CCATTAATGGTCGGCCTTACACTTATCAGAGGAGCTGGTGCCAAAGGAGCTGTATGTTTG
GATGGAACATTGCCTGGATATCACTTACATCGTGGACATGGATTCGGAGCAAATAGCTGG
CTAATTCAACTAGAGGGAGGAGGATGGTGTGACAACATAAGGAACTGTGTATACCGAAAG
AAGAGTCGTCGTGGTTCCTCTAACTACATGGAGAAACAGATTCAGTTTACAGGAATACTT
AGCGATAAAGCTCAAGAAAATCCAGATTTTTTCAACTGGAATAGAGTCTTCGTTACTGCG
ATGGTGGTTCCTTTAGTGGTGATAGTCAGAACAGGGCGGCACGGCTTCAGTTTAGAGGAG
AACGGATATGGAGAGCAGCAATGGACGATTTGAAATCAAAGGGAATGCGATATGCCAAAC
ACGCACTTCTATCTGGATACTCTGCTGGTGGTTTAGCAGTGATCTTACGATGTGATGAAT
TCAGAAACTTGTTTCCAGGATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO59TF U 1
AF RR4GM80TF U 1
BS 1 637 RR4FO59TF
BS 638 742 RR4GM80TF

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CCATTAATGGTCGGCCTTACACTTATCAGAGGAGCTGGTGCCAAAGGAGCTGTATGTTTG
GATGGAACATTGCCTGGATATCACTTACATCGTGGACATGGATTCGGAGCAAATAGCTGG
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AAGAGTCGTCGTGGTTCCTCTAACTACATGGAGAAACAGATTCAGTTTACAGGAATACTT
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ATGGTGGTTCCTTTAGTGGTGATAGTCAGAACAGGGCGGCACGGCTTCAGTTTAGAGGAG
AACGGATATGGAGAGCAGCAATGGACGATTTGAAATC

QA 1 637 1 637
DS 

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ATTTGCGATTATTGTAAAGAAAGAGTAAGAGACATGAGTAAGCTTTTCTTGTTAGGGGTT
GTGGTGACAGGACTGGTTCTAGGGACTAAGACAAATGAGTATCTAGAGTTCAATGTCACT
GAGTTAGATCGCATTGAGGAATTAGAGTATGGTTTCTCCAAATCTAGCTCTAACCTTAAC
CCATTAATGGTCGGCCTTACACTTATCAGAGGAGCTGGTGCCAAAGGAGCTGTATGTTTG
GATGGAACATTGCCTGGATATCACTTACATCGTGGACATGGATTCGGAGCAAATAGCTGG
CTAATTCAACTAGAGGGAGGAGGATGGTGTGACAACATAAGGAACTGTGTATACCGAAAG
AAGAGTCGTCGTGGTTCCTCTAACTACATGGAGAAACAGATTCAGTTTACAGGAATACTT
AGCGATAAAGCTCAAGAAAATCCAGATTTTTTCAACTGGAATAGAGTCTTCGTTACTGCG
ATGGTGGTTCCTTTAGTGGTGATAGTCAGAACAGGGCGGCACGGCTTCAGTTTAGAGGAG
AACGGATATGGAGAGCAGCAATGGACGATTTGAAATCAAAGGGAATGCGATATGCCAAAC
ACGCACTTCTATCTGGATACTCTGCTGGTGGTTTAGCAGTGATCTTACGATGTGATGAAT
TCAGAAACTTGTTTCCAGGATC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL7567Contig1 755 2 29 U
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GAGTAAGCCTGCACTACAAGGATCAAGATTTGACGACGCGGAGGAACGTGGTGGAGCAGA
TCAGAGAAGCGTCTGCGAATTGGGGTTTCTTCCGAGTGACAAATCACGGGTTCTCGAAGG
ATTTGCAGGAGAGGATGCTTGAAGGGCTTCGTCGGTTTCACGCGCAAGACCCATCAGTTA
AGAGACAGTACTACACACGTGATCACACTCGGAACTTTCTTTACTACACCAACGTCGATC
TCTTCACCTCTGACTCCGCCAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGCCCCGGATA
CTCCCCGACCCGAGGACCTGCCCGCCGTTTTGGGGGAGGTTATATTGGAGTACTCAAAGG
AAATGACGAGTTTAGGTGAATTGATCTTTGAGCTTCTATCAGAGGCTTCGGGATTAGACA
CTAATTATTTCAAGGATATGGATTGCGTCAAGTCTCAGATGATGTTGGGCCAATATTATC
CACCTTGCCCTCAGCCTGACCTTACTTTAGCTTAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A475TF U 1
AF RR4DU11TF U 1
BS 1 29 RR4A475TF
BS 30 30 RR4DU11TF
BS 31 43 RR4A475TF
BS 44 46 RR4DU11TF
BS 47 66 RR4A475TF
BS 67 67 RR4DU11TF
BS 68 70 RR4A475TF
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BS 72 253 RR4A475TF
BS 254 254 RR4DU11TF
BS 255 281 RR4A475TF
BS 282 282 RR4DU11TF
BS 283 340 RR4A475TF
BS 341 341 RR4DU11TF
BS 342 424 RR4A475TF
BS 425 425 RR4DU11TF
BS 426 531 RR4A475TF
BS 532 532 RR4DU11TF
BS 533 562 RR4A475TF
BS 563 563 RR4DU11TF
BS 564 625 RR4A475TF
BS 626 626 RR4DU11TF
BS 627 648 RR4A475TF
BS 649 649 RR4DU11TF
BS 650 655 RR4A475TF
BS 656 656 RR4DU11TF
BS 657 712 RR4A475TF
BS 713 713 RR4DU11TF
BS 714 755 RR4A475TF

RD RR4A475TF 755 0 0
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TCTTCACCTCTGACTCCGCCAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGTCCCGGATA
CTCCCCGACCCGAGGACCTGCCTGCCGTTTTGGGGGAGGTTATATTGGAGTACTCAAAGG
AAATGACGAGTTTAGGTGAATTGATTTTTGAGCTTCTATCAGAGGCTTTGGGATTGGACA
CTAATTATTTCAAGGATATGGATTGCGTCAAGTCTCAGATGATGTTGGGCCAGTATTATC
CACCTTGCCCTCAGCCTGACCTTACTTTAGCTTAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4DU11TF 743 0 0
GGT
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ATGGTTCGAATGAAAGAAAAGTTTTCGACGAAAAGAAAATGGGCGTAAAAGCCCTGGCGG
ATGCAGGAATCAAAGAGCTCCCAGCCATGTTCCGTGCACCTCCGAGTATTTTAGAAAGCC
TGAAAGCAGCACGAGCTTCTCAGGATGCGAACCTCTTCCCGACCATTGATCTGAAAGGAG
TGAGCCTGCACTACAAGGATCAAGATTTGACGACGCGGAGGAACGTGGTGGAGCAGATCA
GAGAAGCGTCTGCGAATTGGGGTTTCTTCCGAGTGACAAATCACGGGTTCTCGAAGGATT
TGCAGGAGAGGATGCTTGAAGGGCTTCGTCGGTTTCACGCGCAAGACCCATCAGTTAAGA
GACAGTACTACACACGTGATCACACTCGGAACTTTCTTTACTACACCAATGTCGATCTCT
TCACCTCTGACTCCGCTAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGCCCCGGATACTC
CTCGACCTGAGGACCTGCCCGCCGTTTTGGGTGAGGTTATATTGGAGTACTCAAAGGAAA
TGACGAGTTTAGGTGAATTGATCTTTGAGCTTCTATCAGAGGCTTCGGGATTAGACACTA
ATTATTTCAAGGATTTGGATTGCGTCAAGTCTCAGATGATGTTGGGCCAATATTATCCAC
CTTGCCCTCAGCCTGACCTT

QA 4 743 4 743
DS 



AS 1 2

CO CL7568Contig1 638 2 1 U
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ACCAACTCGCTGACGACAAGGCCCGGTATGAACTCCGACAGCTTCTCGTAATCAGTCAAC
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GTCAAGCATTCAACCAAATAATCATCCCTTTCACTCTCATCCTCCTCCTCATAATAATAA
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ATTGATACACTGGAGGTAGTGGTGGTGGCTAATGCGGCGGCGCGTGGGTGGCGGAAGGCG
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CTGGCTATGAACTATAGGCTTTTATTTGGGCCTCCCAATTTTTCTTATTTTCATAATGGG
CCCATGATATGGTTTTATAAACAAACAAACCGTTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AG55JQ C 1
AF RR4AG55TF U 1
BS 1 638 RR4AG55TF

RD RR4AG55JQ 638 0 0
GGAAATGAGAGGTGCAAGAAAGAGACCTGGAAAAGACGAACACGGTTTCCTTCCTTCTCC
ACCAACTCGCTGACGACAAGGCCCGGTATGAACTCCGACAGCTTCTCGTAATCAGTCAAC
ACGCTCCACACGGATTCAAGGCTAGCTTCCATTCCGATCTTCGAACGGATTCGCCGCGAG
CTCTTCTCCTCGAGCTTCTCCACCGAGATGAGAGCCCCATCCTCCACCGTCTTCCCATCT
GTCAAGCATTCAACCAAATAATCATCCCTTTCACTCTCATCCTCCTCCTCATAATAATAA
TAATAATCTTCGTCGCCAAATCGGCAGGTGAGACATCTACGAGAAGAATAAGCTAGCGGT
AGTGTCGAGGAAGGCGAATAGAAGGATGGAGTGTGAAATTTTATCGCTGGAGAATGTGAA
ATTGATACACTGGAGGTAGTGGTGGTGGCTAATGCGGCGGCGCGTGGGTGGCGGAAGGCG
GAGGAGAAGTCTAATGCGAGCTGCATTGTTTTCTATAGATCTGGAAGTCTAAAAACAGGG
CTGGCTATGAACTATAGGCTTTTATTTGGGCCTCCCAATTTTTCTTATTTTCATAATGGG
CCCATGATATGGTTTTATAAACAAACAAACCGTTTGAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4AG55TF 638 0 0
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ACCAACTCGCTGACGACAAGGCCCGGTATGAACTCCGACAGCTTCTCGTAATCAGTCAAC
ACGCTCCACACGGATTCAAGGCTAGCTTCCATTCCGATCTTCGAACGGATTCGCCGCGAG
CTCTTCTCCTCGAGCTTCTCCACCGAGATGAGAGCCCCATCCTCCACCGTCTTCCCATCT
GTCAAGCATTCAACCAAATAATCATCCCTTTCACTCTCATCCTCCTCCTCATAATAATAA
TAATAATCTTCGTCGCCAAATCGGCAGGTGAGACATCTACGAGAAGAATAAGCTAGCGGT
AGTGTCGAGGAAGGCGAATAGAAGGATGGAGTGTGAAATTTTATCGCTGGAGAATGTGAA
ATTGATACACTGGAGGTAGTGGTGGTGGCTAATGCGGCGGCGCGTGGGTGGCGGAAGGCG
GAGGAGAAGTCTAATGCGAGCTGCATTGTTTTCTATAGATCTGGAAGTCTAAAAACAGGG
CTGGCTATGAACTATAGGCTTTTATTTGGGCCTCCCAATTTTTCTTATTTTCATAATGGG
CCCATGATATGGTTTTATAAACAAACAAACCGTTTGAT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL7569Contig1 642 2 1 U
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CTTGAGAGAAGCGCCGAACGAGCAAGCAATCCTGAACGTCTACGAATCCATGAGGTCAGT
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GTCATCAACGCCATCCAGCCTCTCGACCAAACCAGAAAATGCTTCCGAATGATCGGAGGC
GTTCTGGTGGAGAGAACCGTCAACGAGGTCCTCCCGGCTGTCCACCGCAACAAGGAAGGG
CTCGGCGAGGTTGTCAAGAAGCTGCACGAGACGTTGGACAAGAAGAAGAAAGACATGACG
GAGTTCGAAGCTAAGTATAAGATCAGGCTAAGGAAACAGGACGAGTCCAAGGAAGAAGGT
AATAAAAAGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTTGGAGCTGCTGCTAGTACGATCCAG
TAAACACTCTTCTTCTTTCTTGCTTGTGATGTTGTTACAAAATATTTATTTATTAGATCA
GTTTGTTGTTATGATTCCCCTTAAAGCTAGAGTTGCATAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BG20JQ C 1
AF RR4BG20TF U 1
BS 1 642 RR4BG20TF

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CTCGGCGAGGTTGTCAAGAAGCTGCACGAGACGTTGGACAAGAAGAAGAAAGACATGACG
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GTTTGTTGTTATGATTCCCCTTAAAGCTAGAGTTGCATAACC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4BG20TF 642 0 0
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GCAAAGCTTCTTTGATCTTCCTCGTGTTTCTAAAAGACACTACCAGAAAGCAATGGCGAG
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GTCATCAACGCCATCCAGCCTCTCGACCAAACCAGAAAATGCTTCCGAATGATCGGAGGC
GTTCTGGTGGAGAGAACCGTCAACGAGGTCCTCCCGGCTGTCCACCGCAACAAGGAAGGG
CTCGGCGAGGTTGTCAAGAAGCTGCACGAGACGTTGGACAAGAAGAAGAAAGACATGACG
GAGTTCGAAGCTAAGTATAAGATCAGGCTAAGGAAACAGGACGAGTCCAAGGAAGAAGGT
AATAAAAAGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTTGGAGCTGCTGCTAGTACGATCCAG
TAAACACTCTTCTTCTTTCTTGCTTGTGATGTTGTTACAAAATATTTATTTATTAGATCA
GTTTGTTGTTATGATTCCCCTTAAAGCTAGAGTTGCATAACC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7570Contig1 672 2 1 U
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TGACCCTGGCACTCCTGGAACCCCCTTCCTTCCTGCTCCTTTTCCGCCAATCACTGGAAC
ATGCGATTACTGGAGAAATCACCCTACGTTGATATGGGGTCTTCTTGGATGGTGGGGCAC
TGTTGGAGGAGCTTTTGGTACACTCAGTACTCCCAGTATCATTCCAGGGTTTGATCCTCA
CATGAACCTTCTTCAAGCACTTTCCAACACCCGCACGGATGCCATTGGATCTCTCTACCG
TGAAGGCACAGCTTCTTGGTTAAACTCAATGGTCAACAGTCAGTTCCCTTTCACGACCCC
TCAAGTCAGAGACCACTTTCTCGCAGGGCTTTCCTCAACCAAGGCAGCCACAAAACAGGC
CCAGACCTTCAAACTTGCCAATGAAGGTCGTCTAAAGCCCAGAGACTGAAAAGAAGAGAG
TTTCATTTCTCAGTTGTCTGTTGGTTTGCATTAAAACAATCTTAGTTAATATATCCTATG
CAGCGTGTGTGCTCAGTAGAGTGTTCTATAGTTTCTAGTAATATTTATGATGTACACCCC
TTTATATTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BP43TF U 1
AF RR4BP43JQ C 25
BS 1 672 RR4BP43TF

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TCCAGTCATTGAGACTCCACCAACACCCATCATTGGAGGAACCCCACCAACTCCTTTTAT
TGACCCTGGCACTCCTGGAACCCCCTTCCTTCCTGCTCCTTTTCCGCCAATCACTGGAAC
ATGCGATTACTGGAGAAATCACCCTACGTTGATATGGGGTCTTCTTGGATGGTGGGGCAC
TGTTGGAGGAGCTTTTGGTACACTCAGTACTCCCAGTATCATTCCAGGGTTTGATCCTCA
CATGAACCTTCTTCAAGCACTTTCCAACACCCGCACGGATGCCATTGGATCTCTCTACCG
TGAAGGCACAGCTTCTTGGTTAAACTCAATGGTCAACAGTCAGTTCCCTTTCACGACCCC
TCAAGTCAGAGACCACTTTCTCGCAGGGCTTTCCTCAACCAAGGCAGCCACAAAACAGGC
CCAGACCTTCAAACTTGCCAATGAAGGTCGTCTAAAGCCCAGAGACTGAAAAGAAGAGAG
TTTCATTTCTCAGTTGTCTGTTGGTTTGCATTAAAACAATCTTAGTTAATATATCCTATG
CAGCGTGTGTGCTCAGTAGAGTGTTCTATAGTTTCTAGTAATATTTATGATGTACACCCC
TTTATATTTGAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4BP43JQ 648 0 0
TTCTGGTGGATACTACTCATCTCCTCCACCAAGTACTCCAGTCATTGAGACTCCACCAAC
ACCCATCATTGGAGGAACCCCACCAACTCCTTTTATTGACCCTGGCACTCCTGGAACCCC
CTTCCTTCCTGCTCCTTTTCCGCCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAATCACCC
TACGTTGATATGGGGTCTTCTTGGATGGTGGGGCACTGTTGGAGGAGCTTTTGGTACACT
CAGTACTCCCAGTATCATTCCAGGGTTTGATCCTCACATGAACCTTCTTCAAGCACTTTC
CAACACCCGCACGGATGCCATTGGATCTCTCTACCGTGAAGGCACAGCTTCTTGGTTAAA
CTCAATGGTCAACAGTCAGTTCCCTTTCACGACCCCTCAAGTCAGAGACCACTTTCTCGC
AGGGCTTTCCTCAACCAAGGCAGCCACAAAACAGGCCCAGACCTTCAAACTTGCCAATGA
AGGTCGTCTAAAGCCCAGAGACTGAAAAGAAGAGAGTTTCATTTCTCAGTTGTCTGTTGG
TTTGCATTAAAACAATCTTAGTTAATATATCCTATGCAGCGTGTGTGCTCAGTAGAGTGT
TCTATAGTTTCTAGTAATATTTATGATGTACACCCCTTTATATTTGAT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL7571Contig1 638 2 1 U
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GGTTACAAATGATCACCTGCCAGATCATAGTCTCAGTGATCTTAGGATTGAAACTAGGAG
ACAACCAAGAGCTATCAAAAGGATACTCAATCATGTTGGTCATCTTCTTTTCACTATTTG
TTCTCGGGTATGGATGGTCATGGGGTCCTCTTGGCTACACAGTACCGAGTGAAGTGTTTC
CCTTGGCCATCCGTTCCGCAGGTCAGAGTATCACCGTTGCTGTCAATCTCCTCTTCACCT
TCATCGTGGCTCAAGCTTTTCTTTACCTCCTGTGTGCACTGAAGTTTGGTATTTTTCTTT
TGTTTGCTTGTTGCGTTTTTGTGATGACCATCTTTGTCTACTTCATGTTGCCTGAGACCA
AAGGAGTCCCAATTGATGAAATGTCACTCATATGGACCAAACATTGGTTCTGGAAGAAAA
TGTTGCCTGAAACCTAGGTATAAGACCAGCCATGCACATACCAGATTGCTTCAAAACTAC
AGTAAGGAACACCACTTCCATCTAACCAAATAATTGATTATGTTCAAATGCTTTCAAATT
CATTACAGTTTCTGAATAGTTTTTGCATAATTTGCATC


BQ
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AF RR4B345JQ C 1
AF RR4B345TF U 1
BS 1 638 RR4B345TF

RD RR4B345JQ 638 0 0
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TTCTCGGGTATGGATGGTCATGGGGTCCTCTTGGCTACACAGTACCGAGTGAAGTGTTTC
CCTTGGCCATCCGTTCCGCAGGTCAGAGTATCACCGTTGCTGTCAATCTCCTCTTCACCT
TCATCGTGGCTCAAGCTTTTCTTTACCTCCTGTGTGCACTGAAGTTTGGTATTTTTCTTT
TGTTTGCTTGTTGCGTTTTTGTGATGACCATCTTTGTCTACTTCATGTTGCCTGAGACCA
AAGGAGTCCCAATTGATGAAATGTCACTCATATGGACCAAACATTGGTTCTGGAAGAAAA
TGTTGCCTGAAACCTAGGTATAAGACCAGCCATGCACATACCAGATTGCTTCAAAACTAC
AGTAAGGAACACCACTTCCATCTAACCAAATAATTGATTATGTTCAAATGCTTTCAAATT
CATTACAGTTTCTGAATAGTTTTTGCATAATTTGCATC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4B345TF 638 0 0
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GGTTACAAATGATCACCTGCCAGATCATAGTCTCAGTGATCTTAGGATTGAAACTAGGAG
ACAACCAAGAGCTATCAAAAGGATACTCAATCATGTTGGTCATCTTCTTTTCACTATTTG
TTCTCGGGTATGGATGGTCATGGGGTCCTCTTGGCTACACAGTACCGAGTGAAGTGTTTC
CCTTGGCCATCCGTTCCGCAGGTCAGAGTATCACCGTTGCTGTCAATCTCCTCTTCACCT
TCATCGTGGCTCAAGCTTTTCTTTACCTCCTGTGTGCACTGAAGTTTGGTATTTTTCTTT
TGTTTGCTTGTTGCGTTTTTGTGATGACCATCTTTGTCTACTTCATGTTGCCTGAGACCA
AAGGAGTCCCAATTGATGAAATGTCACTCATATGGACCAAACATTGGTTCTGGAAGAAAA
TGTTGCCTGAAACCTAGGTATAAGACCAGCCATGCACATACCAGATTGCTTCAAAACTAC
AGTAAGGAACACCACTTCCATCTAACCAAATAATTGATTATGTTCAAATGCTTTCAAATT
CATTACAGTTTCTGAATAGTTTTTGCATAATTTGCATC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7573Contig1 1195 2 2 U
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GCTCGTGTTGGTATTAATAGCTGTCCAAGCGCACGCAACAAAGCAAAGAAAGAATGCTAA
AATCCCTGCATTAATAGTTTTCGGAGATTCAATAATGGATACTGGTAACAACAACAATCT
CTCTACTCTTCTTAAGTCCAACTTCCCTCCTTACGGCAAAGACTTTCCCGGTGGATTGGC
TACTGGAAGATTTTCTGATGGAAGAGTTCCTACTGATCTAATTGCGGAAAATTTGGGGTT
GGCTAAGACAATACCAGCATACCTGAGCCCAAATTTGAAGCCTAGAGATCTTTTGAAAGG
TGTATCATTTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGTCGGT
GGTATCAGTGTCGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAGAAACA
TTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTTCTAG
TAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTACAAATATAACTCTACATCGTA
TGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAGTTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAGCTTGGAGC
TCGAAAAATTGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGATCAGT
GCGTGGAAGTGTATTAACAAGAGAATGTGTTAAACCCTTAAACAATATGGCAAAACAATT
CAACGCTAGACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTTGGACGGTATTATCCT
CTATGTTGATGTTTATGAGACTTTTCTTGACATGATCCAAAAGCCTAAAAAATACGGTTT
CGAGGTAGCTGATAGAGCTTGTTGCGGTACTGGTTTTCTCGAAATTTCTTATATGTGCAA
CTCATTTAATCCATTCACATGCTCTAATTCGTCGGCCTATATATTTTGGGATAGCTACCA
TCCAACTGAAAGAGCTTATCAAGTTATGGTTGATAAGTTACTCAGCAAATACTTAAGCAA
ACTCTTTTGATGTTAAACATTACTTACTTCTTTGCGTTTCATTGTGTATTTATCCTTCTT
ATTGTTTTATGTATGTGAATAATTCATTATTGAATGTTCAACGTCTTGTGCACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BB25TF U 1
AF RR4BB25JQ C 346
BS 1 826 RR4BB25TF
BS 827 1195 RR4BB25JQ

RD RR4BB25TF 826 0 0
GGAAACCAAATCTCGACAGAAAACTAAACAAAACCAAACAATGAAGCTTCACATGTTATG
GCTCGTGTTGGTATTAATAGCTGTCCAAGCGCACGCAACAAAGCAAAGAAAGAATGCTAA
AATCCCTGCATTAATAGTTTTCGGAGATTCAATAATGGATACTGGTAACAACAACAATCT
CTCTACTCTTCTTAAGTCCAACTTCCCTCCTTACGGCAAAGACTTTCCCGGTGGATTGGC
TACTGGAAGATTTTCTGATGGAAGAGTTCCTACTGATCTAATTGCGGAAAATTTGGGGTT
GGCTAAGACAATACCAGCATACCTGAGCCCAAATTTGAAGCCTAGAGATCTTTTGAAAGG
TGTATCATTTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGTCGGT
GGTATCAGTGTCGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAGAAACA
TTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTTCTAG
TAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTACAAATATAACTCTACATCGTA
TGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAGTTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAGCTTGGAGC
TCGAAAAATTGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGATCAGT
GCGTGGAAGTGTATTAACAAGAGAATGTGTTAAACCCTTAAACAATATGGCAAAACAATT
CAACGCTAGACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTTG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4BB25JQ 850 0 0
AGATCTTTTGAAAGGTGTATCATTTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGC
TCAAACTATGTCGGTGGTATCAGTGTCGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATC
AACGATCAAGAAACATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTT
TCTCGTGGTTTCTAGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTACAAATA
TAACTCTACATCGTATGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAGTTAAATTCGTAAGAGAATT
ACACAAGCTTGGAGCTCGAAAAATTGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACC
ACTTCAAAGATCAGTGCGTGGAAGTGTATTAACAAGAGAATGTGTTAAACCCTTAAACAA
TATGGCAAAACAATTCAACGCTAGACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTT
GGACGGTATTATCCTCTATGTTGATGTTTATGAGACTTTTCTTGACATGATCCAAAAGCC
TAAAAAATACGGTTTCGAGGTAGCTGATAGAGCTTGTTGCGGTACTGGTTTTCTCGAAAT
TTCTTATATGTGCAACTCATTTAATCCATTCACATGCTCTAATTCGTCGGCCTATATATT
TTGGGATAGCTACCATCCAACTGAAAGAGCTTATCAAGTTATGGTTGATAAGTTACTCAG
CAAATACTTAAGCAAACTCTTTTGATGTTAAACATTACTTACTTCTTTGCGTTTCATTGT
GTATTTATCCTTCTTATTGTTTTATGTATGTGAATAATTCATTATTGAATGTTCAACGTC
TTGTGCACTG

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 2

CO CL7574Contig1 1240 2 4 U
GGGTATCCGTTTACGCCATTGAAGAAAGATCTCACTTTTCTTCATCACTACTCTAAACCC
TTTGATTGAATGAACCCATTTTAAGAATCATCGTCGTCAGAGTAGAAAGTTTAGATCTTT
TTTAATATTCTCATTTTCCCCCAGTCGGTGCGGTGCTTCTGAGATCTCTCGCTTATCTTT
TATAGCGCAAAACAAGACAAGAATGGCGGATCGGATCGAGATCTCGTTCCTTGAAACTTT
CATTTGCAGCGCTTTCGCTGCTTGTTTCGCTGAGTTATTTACTGTGCCTTTGGACACAGC
CAAAGTAAGGCTTCAGCTCCAAAAAAAATCCCCACCGGAGACGGCGATAGTTTGCCCAAG
TACAGAGGCTCTTTTGCTACTCTATCCACCATTGCTAGAGAAGAAGGTATCTCTGGTCTT
TGGAAAGGCGTTATCGCTGGTCTCCATCGTCAGTGTATCTATGGTGGTTTAAGGATTGGT
TTATATGACCCTGTCAAGACGTTTTTGGTTGGAAGTGACTTTATTGGGGATATTCCACTT
TATCAAAAGATTCTTGCAGCTTTGCTAACCGGAGCAATAGCGATTATAGTAGCTAATCCA
ACTGATCTTGTGAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAAGAAAGTTACCGGCTGGGGTTCCTAGG
CGTTATGCTGGAGCTGTTGATGCTTATTACACCATTGTCAAGCTTGTTAGAAGGAGTTGG
TGCGCTTTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGGAACGCTATTGTAAACGCTGCAGA
GCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAGGAGATAATTATGAAAATTCCAGGCTTCGGAGACAG
TTTTCTAACTCATATGTTAGCTGGTTTAGCTGCAGGATTCTTTGCTGTCTGTATCGGTTC
CCCAATTGATATGGTGAAATCTAGAATGATGGGAGACTCTACTTACCGAAACACAATCGA
TTGCTTCATCAAAACCATGAAGACTGAGGGAATCATGGCCTTTTACAAAGGATTCCTCCC
GAATTTTACACGACTTGGAACTTGGAATGTTGTTATGTTCCTCACACTAGAACAAGTGAA
GAAAGTGTTTTTAAGAGAAGCGTTGTACGATTGATTCCGTAATTCCTCGTTTAAAAAAAA
AAAAATACATTTGTTGTTACATATAAATTGATTCTAAAAAAACCTCGAATTGTTAGAGCA
TATATATTATACATACTGAATGAGACAGCAGGGGGTTTAC


BQ
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AF RR4F140TF U 1
AF RR4F140JQ C 518
BS 1 713 RR4F140TF
BS 714 714 RR4F140JQ
BS 715 730 RR4F140TF
BS 731 1240 RR4F140JQ

RD RR4F140TF 730 0 0
GGGTATCCGTTTACGCCATTGAAGAAAGATCTCACTTTTCTTCATCACTACTCTAAACCC
TTTGATTGAATGAACCCATTTTAAGAATCATCGTCGTCAGAGTAGAAAGTTTAGATCTTT
TTTAATATTCTCATTTTCCCCCAGTCGGTGCGGTGCTTCTGAGATCTCTCGCTTATCTTT
TATAGCGCAAAACAAGACAAGAATGGCGGATCGGATCGAGATCTCGTTCCTTGAAACTTT
CATTTGCAGCGCTTTCGCTGCTTGTTTCGCTGAGTTATTTACTGTGCCTTTGGACACAGC
CAAAGTAAGGCTTCAGCTCCAAAAAAAATCCCCACCGGAGACGGCGATAGTTTGCCCAAG
TACAGAGGCTCTTTTGCTACTCTATCCACCATTGCTAGAGAAGAAGGTATCTCTGGTCTT
TGGAAAGGCGTTATCGCTGGTCTCCATCGTCAGTGTATCTATGGTGGTTTAAGGATTGGT
TTATATGACCCTGTCAAGACGTTTTTGGTTGGAAGTGACTTTATTGGGGATATTCCACTT
TATCAAAAGATTCTTGCAGCTTTGCTAACCGGAGCAATAGCGATTATAGTAGCTAATCCA
ACTGATCTTGTGAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAAGAAAGTTACCGGCTGGGGTTCCTAGG
CGTTATGCTGGAGCTGTTGATGCTTATTACACCATTGTCAAGCTTGTTAGAAG*AGTTGG
TGCGCTTTGG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4F140JQ 723 0 0
ACTTTATTGGGGATATTCCACTTTATCAAAAGATTCTTGCAGCTTTGCTAACCGGAGCAA
TAGCGATTATAGTAGCTAATCCAACTGATCTTGTGAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAGGAA
AGTTACCGGCTGGGGTTCCTAGGCGTTATGCTGGAGCTGTTGATGCTTATTACACCATTG
TCAAGCTTGTTAGAAGGAGTTGGTGCGCTTTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGG
AACGCTATTGTAAACGCTGCAGAGCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAGGAGATAATTATG
AAAATTCCAGGCTTCGGAGACAGTTTTCTAACTCATATGTTAGCTGGTTTAGCTGCAGGA
TTCTTTGCTGTCTGTATCGGTTCCCCAATTGATATGGTGAAATCTAGAATGATGGGAGAC
TCTACTTACCGAAACACAATCGATTGCTTCATCAAAACCATGAAGACTGAGGGAATCATG
GCCTTTTACAAAGGATTCCTCCCGAATTTTACACGACTTGGAACTTGGAATGTTGTTATG
TTCCTCACACTAGAACAAGTGAAGAAAGTGTTTTTAAGAGAAGCGTTGTACGATTGATTC
CGTAATTCCTCGTTTAAAAAAAAAAAAATACATTTGTTGTTACATATAAATTGATTCTAA
AAAAACCTCGAATTGTTAGAGCATATATATTATACATACTGAATGAGACAGCAGGGGGTT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7575Contig1 689 2 2 U
GGGATTCTGTGGTAAATAAAGAAGTCGAAGACACATGGACTTTGGGTGATCAATGCTGTT
TTCTTGGTCTATCAATGGACTCACATTGCTCGCCTAGTCGACTGGTTCTCGTCGCCTTCT
GCTTACTCTTCTTCTTCTTCGCCGAAGACTCATCCGCCACAAGGCCTGGTATCTTCTACA
CCAGACACAGAGGACGATGCACGCCGCAGTACTGGAGCAGCAGGAGGGAGGCATGGCCGA
GGATGGTGCCCGAGAGATCCACGGTGGAGAAAATGTTCGGAGTGATGGTGGCGAAGGAGC
GTTGGAGATCTGATCTGACGCTGGTGGAATCGACGGCCAGGAATGACGAGGAAGGGAATG
CTTACGGTGCGCTGCTGAAGCAGGGGACCGCTGCTCTGCTCAACTCTTACGCGAGAAGAA
GCTTTTCTTACGCGCCTTGGGAGGTGAAGACTATGCTCATTCAGGCCATGATCTCTGAGC
CGGCTGCTCGCCGGCAAGCACAGAAGTTCAAAGCCGCTAACGTGGCTTGTGACTAAAACC
TTGAGAATCAGATCAAAAGATTAGTAGTAGTCACTTTGTTGTACTTGTTTTATGTGGTGT
TGTTGCCTTGGTGGATACGTATTCGTTCTTTGTTAATCTTGAACACAAAGAATCTAAGGA
AGAACATTTAATATGACTACGTTCTGTTT


BQ
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AF RR4F265TF U 1
AF RR4F265JQ C 176
BS 1 645 RR4F265TF
BS 646 689 RR4F265JQ

RD RR4F265TF 645 0 0
GGGATTCTGTGGTAAATAAAGAAGTCGAAGACACATGGACTTTGGGTGATCAATGCTGTT
TTCTTGGTCTATCAATGGACTCACATTGCTCGCCTAGTCGACTGGTTCTCGTCGCCTTCT
GCTTACTCTTCTTCTTCTTCGCCGAAGACTCATCCGCCACAAGGCCTGGTATCTTCTACA
CCAGACACAGAGGACGATGCACGCCGCAGTACTGGAGCAGCAGGAGGGAGGCATGGCCGA
GGATGGTGCCCGAGAGATCCACGGTGGAGAAAATGTTCGGAGTGATGGTGGCGAAGGAGC
GTTGGAGATCTGATCTGACGCTGGTGGAATCGACGGCCAGGAATGACGAGGAAGGGAATG
CTTACGGTGCGCTGCTGAAGCAGGGGACCGCTGCTCTGCTCAACTCTTACGCGAGAAGAA
GCTTTTCTTACGCGCCTTGGGAGGTGAAGACTATGCTCATTCAGGCCATGATCTCTGAGC
CGGCTGCTCGCCGGCAAGCACAGAAGTTCAAAGCCGCTAACGTGGCTTGTGACTAAAACC
TTGAGAATCAGATCAAAAGATTAGTAGTAGTCACTTTGTTGTACTTGTTTTATGTGGTGT
TGTTGCCTTGGTGGATACGTATTCGTTCTTTGTTAATCTTGAACA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4F265JQ 514 0 0
CTACACCAGACACAGAGGACGATGCACGCCGCAGTACTGGAGCAGCAGGAGGGAGGCATG
GCCGAGGATGGTGCCCGAGAGATCCACGGTGGAGAAAATGTTCGGAGTGATGGTGGCGAA
GGAGCGTTGGAGATCTGATCTGACGCTGGTGGAATCGACGGCCAGGAATGACGAGGAAGG
GAATGCTTACGGTGCGCTGCTGAAGCAGGGGACCGCTGCTCTGCTCAACTCTTACGCGAG
AAGAAGCTTTTCTTACGCGCCTTGGGAGGTGAAGACTATGCTCATTCAGGCCATGATCTT
TGAGCCGGCTGCTCGCCGGCAAGCACAGAAGTTCAAAGCCGCTAACGTGGCTTGTGACTA
AAACCTTGAGAATCAGATCAAAAGATTAGTAGTAGTCACTTTGTTGTACTTGTTTTATGT
GGTGTTGTTGCCTTGGTGGATACGTATTCGTTCTTTGTTAATCTTGAACACAAAGAATCT
AAGGAAGAACATTTAATATGACTACGTTCTGTTT

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL7576Contig1 649 2 1 U
GGAAATGAAGGGAGTCCCTATAAGGATTGAGATTGGTCCACGCGATGTATCCAGCAACTG
TGTTGTTGTCTCGAGGAGCGACATACCAGGGAAGGCAGGAAAAGTATTTGGAATATCAAT
GGAGCCATCAACGTTAGTAGCATACGTGAAAGAGAATTTAGATGAGATCCAATCATCACT
TCTTGAGAAGGCAATATCATTCAGGGATAGTAACATAGTGGATGTGAACTCATACGAGGA
GCTCAAAGCTGCGATTGCTTCAGGGAAATGGGCAAGAGGTCCATGGTCAGCCAGTGACTC
AGATGAGCAAAGAGTAAAGGAGGAAACTGGTGCTACCATTCGGTGTTTCCCGTTTGAACA
GATTCTAGGGAGCAAAACATGTCTGATGACTGGTAATCCAGCAGAGGAAGTTGCTATCTT
TGCCAAGTCTTACTAAAGACTTGTTCCTCATTTCTTACACACATTACCATATTATATCCA
AAGATTTTGTTTCCGTGGCTGTCGGAGTGGAGTGATTGTAGTCGGATCCTTGGACACCTC
ACTGGTTATTTCTGCTGCATTTACCCCCAATAACATTCTTATATGTTTAATTTTGTAAAG
GAAAATATCGAATGATTGAGGATTTCAAATGACAAATTCCTTTTATTGC


BQ
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AF RR4AY60JQ C 1
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BS 1 649 RR4AY60TF

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TGTTGTTGTCTCGAGGAGCGACATACCAGGGAAGGCAGGAAAAGTATTTGGAATATCAAT
GGAGCCATCAACGTTAGTAGCATACGTGAAAGAGAATTTAGATGAGATCCAATCATCACT
TCTTGAGAAGGCAATATCATTCAGGGATAGTAACATAGTGGATGTGAACTCATACGAGGA
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AGATGAGCAAAGAGTAAAGGAGGAAACTGGTGCTACCATTCGGTGTTTCCCGTTTGAACA
GATTCTAGGGAGCAAAACATGTCTGATGACTGGTAATCCAGCAGAGGAAGTTGCTATCTT
TGCCAAGTCTTACTAAAGACTTGTTCCTCATTTCTTACACACATTACCATATTATATCCA
AAGATTTTGTTTCCGTGGCTGTCGGAGTGGAGTGATTGTAGTCGGATCCTTGGACACCTC
ACTGGTTATTTCTGCTGCATTTACCCCCAATAACATTCTTATATGTTTAATTTTGTAAAG
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QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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TGCACATGTGCTAACGAAGGAGGGTGCTTGAGGTCTAACAAAGGACCATGGAATGATCCA
GAAATGCTGAGCTTGTACATCACATGGAAGTGAGTCCCATACCACAAACTACAAAAGCTC
CTCTTCATACAAGCGATCATGATTCTTCCACTCGCATTATCACTGTGGAATCTCTAGAAC
CGGCTCAAGGAGATTGGTCTCAACCCCAATTACTTAATACAAACACTAAAAACTCTTCTT
CGGCAAATACATCCACAAGAGAAGATATCACGGTTTGGTGTTGTTAGAGAGAAAATAAAA
GGGGAGGACACTGTTCACTTGGTGAAGATACTAATAGCCTTTCCACTAAAGCTATTAATT
TGCTTTTTTAAGTTTTTTATTGTTAGGACACTGGCAAAGACATAACTATTTCGATGTCCC
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GAAAGAATGCACAGAGATTAGTAGAATCCCTGAAATGAGAAGCTATTAACTGGAACTCTC
GAGAGGATAAAGTCTCTAGAACTTGATCTCGACAAAACCCAATCAGTATTACATTTAACG
TTAGCAAAACAACTTCACATCACAGAACAGCGTGACTCTCATTACGAAGAACAAAGAAAG
CGATGCTGCATTTGAAGCTTTGGGACGTAACCTTACGGAGACATTTTGTTACTATAATTT
ATTTACAGCACTAAGAGAATGAAAAAAAATCTATACACAGATATTTGGGGATTTTTTCTT
CCTACAACTTGTAAACAAATTTTTCAACATTCCGTGTGCGTGAAGTAATATAAACATTTA
AATTTGT


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AF RR4CX80JQ C 539
BS 1 597 RR4CX80TF
BS 598 1147 RR4CX80JQ

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CGGCAAATACATCCACAAGAGAAGATATCACGGTTTGGTGTTGTTAGAGAGAAAATA

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DS 

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TTCCTACAACTTGTAAACAAATTTTTCAACATTCCGTGTGCGTGAAGTAATATAAACATT
TAAATTTGT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

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TTATGCACATCAGGTGTATGACGAAATGCCTGAACGAAATTTAGAGACTTGGCTCTGTTT
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TTTTTCACTAGTTTGCTTGTTGGAGTCGTTGTTGAACTGTACGGTAAACTTGTTGACTCA
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AF RR4FH20TF U 1
AF RR4FM82TF U 1
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BS 702 702 RR4FM82TF
BS 703 719 RR4FH20TF
BS 720 720 RR4FM82TF
BS 721 759 RR4FH20TF

RD RR4FH20TF 759 0 0
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QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4FM82TF 750 0 0
GGGATTCCTTTTGGGTTCGGTCTCTTTTCAATCGTAGTTGCTCTTGAGAACCTAGTTATC
TTATGCACATCAGGTGTATGACGAAATGCCTGAACGAAATTTAGAGACTTGGCTCTGTTT
CTAAGGTTAGTTATAAAGTTTCTTCCTTTTTTATTCAGAGTTGGTGGAGTCTGCTTAATT
ATACCTTCTTGTGTAAGCTTTAGCCACATGAGTTGCTGAGTCCTTCCAAATTGAATAATG
GAAAAGCGAAAGCCTTTCGTTGCGTCCTTACACGAAGTAGAGAACCAGCTCGAACTGTCA
CTGCGTCAAGCCTTTGTGAGTCTCGAGCCGAAGTTACAGCCACCCTTCTCTCAGGATATC
CCAGACCAGCAGGAGTTTCTTGAGCTCTGTAGAGCGATCGTTTATGCCGTGTTATGCGAT
TCTAATCACTCTAAAACCCACATTAAGCACCTACATGCTCTAGTCACTGATGGGTATGCG
TTTTTCACTAGTTTGCTTGTTGGAGTCGTTGTTGAACTGTACGGTAAACTTGTTGACTCA
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GATGTGCCCTTGGTCTTGACTAGTGCTCTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7579Contig1 776 2 7 U
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TTGTTCTTCAGAAAGCAACCGTTCCTAGGCAGAAACTGTTAGCTACCATATCTCAAGACA
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ATTATGAGCTTCTAGAGGGAAACTGGCAAATGATTTGGAGTTCACAGATGTATACTGATA
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GAATAAAGTTTGAAGTTAACATCATACCAGCATTTAGATTCTCAATGAAAGGCAAATTCT
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AGAAGATGAGAATAAGTCGTGGGTTTGATAACATTATCTTTGTGCACATCCGAGAAGTTT
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BQ
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AF RR4GU59JQ C 1
AF RR4GU59TF U 3
BS 1 8 RR4GU59JQ
BS 9 731 RR4GU59TF
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BS 748 764 RR4GU59TF
BS 765 776 RR4GU59JQ

RD RR4GU59JQ 776 0 0
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ATTATGAGCTTCTAGAGGGAAACTGGCAAATGATTTGGAGTTCACAGATGTATACTGATA
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GAATAAAGTTTGAAGTTAACATCATACCAGCATTTAGATTCTCAATGAAAGGCAAATTCT
TGAAATCAGGAGGTAGCACCTATGAGTTAAAGATGGACGATGCAGCAATTATAGGTGGTC
CGTTTGGATATCCGATCGAATTGACAAACAATATCAAGCTTCAAGTTCTCTACACAGATG
AGAAGATGAGAATAAGTCGTGGGTTTGATAACATTATCTTTGTGCACATCCGAGAAGTTT
AGCTAAGTCTAGAAGATTTAAAATTGTTATACTGCTCCTCCTGTATGAATATGCATGTAA
AGAAAATAAAAACTGTAAACTGTTCAAGTTAATATATAGTTTTTTCAGAAAAAAAA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4GU59TF 762 0 0
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TATCCAGTTCCTTTTAGACTTCTTGGTGATGAAGCAAAAGGTTGGTTAGATACTACGTAT
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CAGAAAGCAACCGTTCCTAGGCAGAAACTGTTAGCTACCATATCTCAAGACAAAGGAGTA
GCAGAGGCTATAGATGAGTTTCTTGCTTCTAATACTAACTCCAAGGAAGATGATTATGAG
CTTCTAGAGGGAAACTGGCAAATGATTTGGAGTTCACAGATGTATACTGATAGTTGGCTT
GAAAATGCAGCAAATGGTCTTATGGGAAGGCAGATCATTGAGAAGGATGGAAGAATAAAG
TTTGAAGTTAACATCATACCAGCATTTAGATTCTCAATGAAAGGCAAATTCTTGAAATCA
GGAGGTAGCACCTATGAGTTAAAGATGGACGATGCAGCAATTATAGGTGGTCCGTTTGGA
TATCCGATCGAATTGACAAACAATATCAAGCTTCAAGTTCTCTACACAGATGAGAAGATG
AGAATAAGTCGTGGGTTTGATAACATTATCTTTGTGCACATCCGAGAAGTTTAGCTAAGT
CTAGAAGATTTAAAATTGTTATACTGCTCCTCCTGTATGAATATGCATGTAAAGAAAATA
AAA*CTGTAAACTGTTCA*GTTAATATATAGTTTTT

QA 7 762 7 762
DS 



AS 1 2

CO CL7580Contig1 701 2 8 U
AATAGAAGAGTAATTTATTCAATGATAGATGCATTATCCACGAGACAATATATAACCAAC
ATGCCAATATCATCATATCAAATCAGGGGGTTCATATGAAGTCCAAAACACAATCAGAGA
AAAGATGATAAATATTTCAAATATAGATAAGAAGAGAAAGATACATGTTTTGATTTCAAA
CACAACCACCAACCCTAAGAGCAAGAACCAAATGAAGAACAGAGCCACCCTCTATGTTGT
AGTCTTTGGCAGTTTTGTCATCAGCAAGCTGCTTCCCTGCATAGATAAGCCGTTGTTGGA
CGGGAGGGATGCCTTCTTTCTCTTCGACACGTTCCTTGATACGGTCAATAGTGTCGGTTG
GTTCGATATCAATCTCGATTTCTTTGCCGGTGAGAGTCTTGACCTTGATCATGGTGCCAC
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TTCGGCCGTCTTCAAGCTGCTTACCGGCGAAGATGAGCCTTTGTTGGTCTGGTGGTATAC
CTTCTTTGTCCTGGATTTTGGCTTTGACATTGTCGATGGTGTCGCTGCTCTCCACCTCTA
GGGTTATCGTTTTTCCGGTGAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATCTTTCTCTATCTCTTGT
TTTGCCCTGAGTGTTAACAAATCTTCGCCTCCTCTTTTTCC


BQ
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AF RR4GZ53TF C 1
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CC

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DS 

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G
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DS 



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BQ
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AF RR4H676JQB C 1
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DS 



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BQ
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DS 

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CAAGGAGAAACACCACTAGATTGTGCTCCTGCAACACTGCAATATAAGATGCGGGAAAAG
ATGAAGTCCACTTAATATGAATTCAGGCTGAGTTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTA
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GCAATTTCTCCGTCTTGTGTGAACTTTGAAACGTCGGCTTCTTCCACTCTTGTAAGTCTT
TATGTGTTATCCGCTGAGTCATTGTTGTCAACAAA

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

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TGAACGATGGTGTCTAAGAACGTTTTGGTAACCGGCGGTGCTGGATATATCGGAAGTCAC
ACCGTGCTTCAACTTCTCACCGGCGGTTACTCCGCTGTAGTTGTCGATAACCTCGACAAT
TCCTCCGCCGTTTCGCTCCAGCGCGTGAAGAAACTCGCCGCAGAACACGGCGAACGCCTC
TCCTTCCACCAGGTTGATCTCAGGGATAGACCTGTCCTTGAGAAGATCTTCTCAGAAACA
AAGTTTGATGCAGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGCAGTCGGTGAGAGTGTAGACAAG
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CAACACAACTGTAAAAATCTTGTGTTTTCATCATCAGCAACTGTGTATGGCTCACCAAAA
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CTATTCATTGAGGAGATCTGTCGTGATGTATATGGCTCTGACCCGGAATGGAAGATCGTA
TTGCTTAGGTATTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTGGTGACATTGGTGAAGATCCT
CGGGGTATTCCAAACAATCTCATGCCTTTTGTACAACAAGTCGCTGTTGGAAGGAGACCT
CATCTCACTGTCTATGGAAATGACTACAACACAACAGACGGAACAGGGGTTCGAGATTAC
ATTCATGTAATGGATTTAGCTGATGGACACATAGCCGCTCTCCGCAAGCTAGAGGATTGC
AAAATCGGTTGTGAAGTGTACAATCTTGGAACTGGAAATGGAACATCTGTTCTTGAAATG
GTTGATGCCTTTGAAAAAGCGTCTGGGAAGAAAATCCCTCTGGTGACTGCTGGACGTCGT
CCGGGAGATGCTGAAGTTGTCTATGCATCAACGGAGAGAGCAGAAAGCGAATTGAATTGG
AAAGCCAAATACGGGATTGAGGAGATGTGCAGGGACTCGTGGAACTGGACTAGTAATAAT
CCTTATGGATATGATTCCTCTGATGCCTGAAGATTTCTCATTAACCCTCGTTATTCTTAT
TTTCTTTAACTTATTTGTCTACCTATACCATGTGTTAAACACTCACAGGAAAAAGCTGAT
TTAAAGAAAATATTGAAGTTGCGTTGTATATTATTATCATTTTAATAATAATAATAATAA
TCATATCTTTACTGTTTC


BQ
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AF RR4GH55TF U 1
AF RR4GH55JQ C 503
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RD RR4GH55TF 690 0 0
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TGAACGATGGTGTCTAAGAACGTTTTGGTAACCGGCGGTGCTGGATATATCGGAAGTCAC
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TCCTTCCACCAGGTTGATCTCAGGGATAGACCTGTCCTTGAGAAGATCTTCTCAGAAACA
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CAACACAACTGTAAAAATCTTGTGTTTTCATCATCAGCAACTGTGTATGGCTCACCAAAA
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CTATTCATTGAGGAGATCTGTCGTGATGTATATGGCTCTGACCCGGAATGGAAGATCGTA
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CGGGGTAT*CCAAACAATCTCATGCCTTT
G

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DS 

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AGATGTGCAGGGACTCGTGGAACTGGACTAGTAATAATCCTTATGGATATGATTCCTCTG
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CTATACCATGTGTTAAACACTCACAGGAAAAAGCTGATTTAAAGAAAATATTGAAGTTGC
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QA 1 776 1 776
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGCCACGATTCCCGCTGTGAGAAACCGTTGCCTAGATGATTTCATGACGGACAATCTTG
ATCTTGATGATGACATGGACGACTTTGATTCCGAGTCTGAAATCGATATTGACAGTAGCG
GAGAGATAGTTTATGCTATGTGATAGAAAAAAAAAAGATTGTTCTTTTTGTCTTGTGACG
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GTATTGGGCTCATTGTCTGTTTGTTTGTCCGTCTTTTCTTCTTACATACATATATGCAAT
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BQ
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AF RR4DJ86JQ C 1
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DS 

RD RR4DJ86TF 578 0 0
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GAGAGATAGTTTATGCTATGTGATAGAAAAAAAAAAGATTGTTCTTTTTGTCTTGTGACG
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GTAAAATATCATTATCTATATAAATATATTTTCCAAGC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

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AAATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC41TF U 1
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DS 

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QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AC76JQ C 1
AF RR4AC76TF U 10
BS 1 9 RR4AC76JQ
BS 10 444 RR4AC76TF

RD RR4AC76JQ 444 0 0
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TTCTCTTGATATTCTCTCTCCCAACGAGCTCCCAGAGATTTCTACAAGGGCAAAAACTGC
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AACTACGTAATCCCTGATCTCACCGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTGTCTCAGTGCCCT
ATAGAGGTCAACAAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAAGAAAATATGTTTCGAGCCTTAAT
AATAAGCTTAAAGTTAAGCAATGTGTGTTTGTTGCGAAATTCGTATTTTTTTTTCTTCAA
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ATAAGAATTTTTAAATTTGATAAG

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DS 

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GGTTTCCACACCAAAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCCTGATAAATTACCAAACTACGTA
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AACAAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAAGAAAATATGTTTCGAGCCTTAATAATAAGCTT
AAAGTTAAGCAATGTGTGTTTGTTGCGAAATTCGTATTTTTTTTTCTTCAAGGACTTCAA
GCAACTTGTGACAAATTTTGAATTATTAATGTTTTGCTCTCTCTCTCCCATATAAGAATT
TTTAAATTTGATAAG

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

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AAAACATCAGTACGAAAGCCAACTCTAAGCTTCTTGT


BQ
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AF RR4G245JQ C 1
AF RR4G245TF U 1
BS 1 637 RR4G245TF

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QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4G245TF 637 0 0
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GCCATGAGCTTAGGGCTTGTCTTCGCTGCCGACTCGTCAAGACCTATGACCAGTTCAGGG
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CGGCTAGGTGGTTAAGAATCGGTAAGTTTGCTCCTGGTCGCTACACTCTCGCTGTCTCCG
AGCCACTCACAGAGGAAATGCAGCACATATGCCAAGAAGAGCGTGTACAATACGTTCCTC
CGAAACGCATGTAAAAGCAAATACATCAAGACAAAGAACGCAAGTAGTACTCTTTTTTAT
GTTTAGCTTCATGTTAACAATACCAGGTGCTTATATGTGTCTTCATGTTGACAGTTTCCA
AGATGTCGTTGCTTCTTTGAGTACCTTAGGTTTCTATCTATGTAAGGTCGTTATGTATAA
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AAAACATCAGTACGAAAGCCAACTCTAAGCTTCTTGT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL7589Contig1 657 2 2 U
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ATCGTAACTTTGCAAGAGTTTCTACATAAGACAAGAGCACAAAAACAGAGAAGGAAATAA
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CGACAGGGGAGGGAGAACTCTTCTTCCCTCGACCTCTCAAACGCGAAGAGACATTATCAA
TAGCCGAGTTAAGCTGTCCGATCTTCTCGTTCAAAGTCTCCCTTGTTTTCTCCAAACCTT
CATCGTAGTAACTTGGTTGCTCTGGCTTCTTGAATCCATACTCATCTTCTTCACTCATTA
TCGATCTTCGTATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGCACCTCCAA
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BQ
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AF RR4DO23TF C 1
AF RR4DO23JQ U 9
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BS 9 657 RR4DO23JQ

RD RR4DO23TF 657 0 0
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TCGATCTTCGTATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGCACCTCCAA
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QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4DO23JQ 649 0 0
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GAGGGAGAACTCTTCTTCCCTCGACCTCTCAAACGCGAAGAGACATTATCAATAGCCGAG
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CGTATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGCACCTCCAAGAAGAAAA
CCAGCTACGAAATCACCACCACCACCACCGCTTCCTCTCCTTCTCCCATACTCTGCAGAT
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CCTGAGAGAGAAGGGTGAGGAACACAAGAGGACGCCATTGGAAATGTCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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CTTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 

AF RR4CM26TF U 24
AF RR4BT03TF U 1
BS 1 664 RR4BT03TF

RD RR4CM26TF 637 0 0
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GGAAGCTCTGACACAACAACCGCAACAGAAACAGAAACCCTCTCCAGCTCCTCCAAATAC
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ACTTCTTCTGGAGTCACCGAGACTCTCACAGGTGAATGGTGGTGACCATGCTTCCCTTGT
TGCAGCTGCAATGGCCGAGAGTGCATTACGGAAAAGAGAGTTCAATGGGAAGTCTTCTTC
TCTTCCTCGTCGTTCCAAGCTACCTAGAGGAAATCTGCCTCATTCCAAGAACAGTCCAGA
TACTTTGGGTAATGTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCACTGGAAGGTTAGAGTCCATGAAATA
TATGGCTTCTTTCATCTCAAATATTTCACTTTATTTTATCTAACCAAAAAAAAAAAGGCT
TTAATAACTACTGAGAAGGCTATGAGTGTTTGTTGCTAACAATCATTCAAAAGTTACTTA
GGAGAGAACAACATAATGATTTCATGAATTGCGTTGTAGGCAGTTTAAGAATTGTTGACA
TAACTGGCGTCTTCATGCGAATATCTTGTTTGAAACA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4BT03TF 664 0 0
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TTACCTGCTGCGGCGGAGCACAAGGAAGCTCTGACACAACAACCGCAACAGAAACAGAAA
CCCTCTCCAGCTCCTCCAAATACACGGAGATCTATAATGGAGAAGGAAAAAAGCGAAGAG
CTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTACTTCTTCTGGAGTCACCGAGACTCTCACAGGTGAAT
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GAGTTCAATGGGAAGTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTTCCAAGCTACCTAGAGGAAATCTG
CCTCATTCCAAGAACAGTCCAGATACTTTGGGTAATGTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCACT
GGAAGGTTAGAGTCCATGAAATATATGGCTTCTTTCATCTCAAATATTTCACTTTATTTT
ATCTAACCAAAAAAAAAAAGGCTTTAATAACTACTGAGAAGGCTATGAGTGTTTGTTGCT
AACAATCATTCAAAAGTTACTTAGGAGAGAACAACATAATGATTTCATGAATTGCGTTGT
AGGCAGTTTAAGAATTGTTGACATAACTGGCGTCTTCATGCGAATATCTTGTTTGAAACA
CTTA

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

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ATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCC
TCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAA
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TATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BM14JQ C 1
AF RR4BM14TF U 1
BS 1 637 RR4BM14TF

RD RR4BM14JQ 637 0 0
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TGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTGCCGGCCTTGTCGATAAC
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TCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAA
TCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGT
CCATCGGCTAGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGCACCTTATTCTCTTCTTCTCAGT
ATCTTCTGCATTTTATCTATAATCCTGATTTTCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTG
TATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4BM14TF 637 0 0
GAAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTGCAGCATTGTTATC
AGCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCTTCGGTTGAACCAGA
CTGCATGACGAATCTGTTGAACATGGCGGACTGTCTTTCTTACGTGCAGGTAGGAAACCG
TGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTGCCGGCCTTGTCGATAAC
TCGCCACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAG
ATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCC
TCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAA
TCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGT
CCATCGGCTAGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGCACCTTATTCTCTTCTTCTCAGT
ATCTTCTGCATTTTATCTATAATCCTGATTTTCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTG
TATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL7592Contig1 784 2 10 U
GGCCTCACTCTTTGTTCTTCAACTCTCAAGCATCGCTCTGCTTGAGAGAGATTTTCTCTT
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CCAAATCTAATGGACTTGCCCTTCCCGCAAGAGCCTCTTCTTCCCCCTACTGGGTTGTTG
CAAAATCCTTCATTAATCTCACTCCCCAAAAGGGACACCATCAAAGAGTATCTTGAATCA
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GGTTCGTCGACTATGCCTGTCCCGGTGATTACACCAGCACCGACCATCTCTCAAGGAGTT
TTCTTATGCACTTACTGCAACCTTCTCCGACAATTAGTCCATGCCAATGGTCTGGAGATG
ATGAGACTTGATCTCTATGGAGGGATTGGATACTTCTGCCATGCGATTATCGAGACTCGT
CGATTCGATGGTTCTAACGAACTTCGATACCAAACGTGTCATTTGATGGATTTACTGATG
GAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RR4CR12TF U 1
AF RR4AJ11TF U 13
BS 1 101 RR4CR12TF
BS 102 102 RR4AJ11TF
BS 103 336 RR4CR12TF
BS 337 337 RR4AJ11TF
BS 338 459 RR4CR12TF
BS 460 460 RR4AJ11TF
BS 461 572 RR4CR12TF
BS 573 573 RR4AJ11TF
BS 574 692 RR4CR12TF
BS 693 784 RR4AJ11TF

RD RR4CR12TF 692 0 0
GGCCTCACTCTTTGTTCTTCAACTCTCAAGCATCGCTCTGCTTGAGAGAGATTTTCTCTT
CTCCTTTTTGGTCTCGTCCAAAACAAGAAGAGAAAGCAATTTGAAGAAGAGTGCAAACAC
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CCAAATCTAATGGACTTGCCCTTCCCGCAAGAGCCTCTTCTTCCCCCTACTGGGTTGTTG
CAAAATCCTTCATTAATCTCACTCCCCAAAAGGGAC*CCATCAAAGAGTATCTTGAATCA
CTTAAAATCGGTGATGATTCATTTACTTTGGACACGTCAGATTTACTAAGTGATGGTCTC
AGCGACTGCATCGATTATACTGTCCCAGGAGAGTTTGGTGATGATAATGTCGGAGAGAGC
GGTATCCTTGAGGCGAGTACTCATGTTTTTGTGGAAAATGCTTACAACTCTGAAATTGGT
GGTTCGTCGACTATGCCTGTCCCGGTGATTACGCCAGCACCGACCATCTCTCAAGGAGTT
TTCTTATGCACTTACTGCAACCTTCTCCGACAATTAGTCCATGCCAATGGTCTGGAGATG
ATGAGACTTGATCTCTATGGAGGGATTGGATA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4AJ11TF 772 0 0
G
GTTCTTCAACTCTCAAGCATCGCTCTGCTTGAGAGAGATTTTCTCTTCTCCTTT**GGTC
TCGTCCAAAACAAGAAGAGAAAGCAATTAGAAGAAGAGTGCAAACACAACACAAAAATGG
CGGGTGATGGTCCAAAACCGATGGCTCCTCAAGTCAACGAAGATGAAGATTTGTACTATG
ATGCTTACTCTGAAGAAGATCTTATAAACTTCATGTCTAACCCTAATCCAAATCTAATGG
ACTTGCCCTTCCCGCAAGAGCCTCTTCTTCCCCCTACTGGGTTGTTGCAAAATCCTTCAT
TAATCTCACTCCCCAAAAGGGACACCATCAAAGAGTATCTTGAATCACTTAAAATCGGTG
ATGATTCATTTACTTTGGACACGTCAGATTTACTAAGTGATGGTCTCAGCGACTGCATCG
ATTATACTGTCCCAGGAGAGTTTGGTAATGATAATGTCGGAGAGAGCGGTATCCTTGAGG
CGAGTACTCATGTTTTTGTGGAAAATGCTTACAACTCTGAAATTGGTGGTTCGTTGACTA
TGCCTGTCCCGGTGATTACACCAGCACCGACCATCTCTCAAGGAGTTTTCTTATGCACTT
ACTGCAACCTTCTCCGACAATTAGTCCATGCCAATGGTCTGGAGATGATGAGACTTGATC
TCTATGGAGGGATTGGATACTTCTGCCATGCGATTATCGAGACTCGTCGATTCGATGGTT
CTAACGAACTTCGATACCAAACGTGTCATTTGATGGATTTACTGATGGAGG

QA 2 772 2 772
DS 



AS 1 2

CO CL7593Contig1 775 2 9 U
GTGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCGCTTCCAGGTGACAACGTGGGGTTCAATG
TCAAGAACGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATG
ATCCTGCTAAAGGTGCTGCTAACTTTACTTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTC
AGATTGGTAACGGTTACGCTCCGGTTCTTGATTGCCACACGTCCCACATTGCTGTCAAGT
TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA
AGTTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTG
TTGAGACTTTCTCAGAGTACCCACCGCTCGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA
CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGA
CCAAGGCTGCCGTTAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTACCTTGAGCAAATCTCTATCATCCC
AAGACAATTTTAGTTCTTTTACATTAGTTTGGTGTTTGGTCGCTTGTTTGCGTTGTTATA
GCTTCGTCTCTTGTCCGTCAGAACTATGTTCACGTAATTGGGTTCTTGATAGGAGGTAGC
GGAGCTACGTTGAACTCTAGCATGCTGTTTTTTTTTGTTTTACTTTTGCTATGGGATTAT
GAACTATTTTGGATGTTATGTTATTCTGAATATGGCATGAGGTTGTTGTGTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL17TF U 7
AF RR4CI17JQ C 1
BS 1 7 RR4CI17JQ
BS 8 266 RR4CL17TF
BS 267 267 RR4CI17JQ
BS 268 581 RR4CL17TF
BS 582 582 RR4CI17JQ
BS 583 657 RR4CL17TF
BS 658 658 RR4CI17JQ
BS 659 689 RR4CL17TF
BS 690 775 RR4CI17JQ

RD RR4CL17TF 683 0 0
G
GCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCGCTTCCAGGTGACAACGTGGGGTTCAATGTCAAGAA
CGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGATCCTGC
TAAAGGTGCTGCTAACTTTACTTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGG
TAACGGTTACGCTCCGGTTCTTGATTGCCACACGTCCCACATTGCTGTCAAGTTCTCTGA
GATCTTGACCAAGATTGACTGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAAGTTTTT
GAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTTGAGAC
TTTCTCAGAGTACCCACCGCTCGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACTGTTGC
AGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGC
TGCCGTTAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTACCTTGAGCAAATCTCTATCATCCCAAGACAA
TTTTAGTTCTTTTACATTAGTTTGGTGTTTGGTC*CTTGTTTGCGTTGTTATAGCTTCGT
CTCTTGTCCGTCAGAACTATGTTCACGTAATTGGGTTCTTGATAGGAGGTGGCGGAGCTA
CGTTGAACTCTAGCATGCTGTT

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR4CI17JQ 775 0 0
GTGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCGCTTCCAGGTGACAACGTGGGGTTCAATG
TCAAGAACGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATG
ATCCTGCTAAAGGTGCTGCTAACTTTACTTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTC
AGATTGGTAACGGTTACGCTCCGGTTCTTGATTGCCACACGTCCCACATTGCTGTCAAGT
TCTTTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTTTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA
AGTTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTG
TTGAGACTTTTTCAGAGTACCCACCGCTCGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA
CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAATCGGAGCCAAGGTGA
CCAAGGCTGCCGTTAAGAAGGGTGCCAAGTAAAGTACCTTGAGCAAATCTCTATCATCCC
AAGACAATTTTAGTTCTTTTACATTAGTTTGGTGTTTGGTCGCTTGTTTGCGTTGTTATA
GCTTCGTCTCTTGTCCGTCAGAACTATGTTCTCGTAATTGGGTTCTTGATAGGAGGTAGC
GGAGCTACGTTGAACTCTAGCATGCTGTTTTTTTTTGTTTTACTTTTGCTATGGGATTAT
GAACTATTTTGGATGTTATGTTATTCTGAATATGGCATGAGGTTGTTGTGTCGTC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL7594Contig1 713 2 9 U
TTTTTCTAAGATTCTTCAAGGAGGAATTCGATCTCGTCTGGAAGCATGAGTAGGCCGGTG
TTCGTGGGGAACTTCGAGTATGAGACTCGCCAATCGGATCTGGAACGGTTGTTCAGCAAG
TACGGGAGAGTGGAGCGAGTTGACATGAAGTCTGGTTATGCTTTCGTGTATTTTGAGGAT
GAGCGTGATGCTGAAGATGCTATCCGTGGGATTGACAATATCCCTTTTGGCTATGAGAAA
CGCAAGCTCTCTGTCGAATGGGCTAAGGGTGAACGTGGGAAGCCTCACGGAAAGGCAGCT
TCCAATCAGAGGCCTACAAAGACACTCTTTGTCATCAACTTTGACCCTATCCGCACTAAA
GAGCGTGATATTGAGAGGCACTTTGAGCCGTATGGTAAAGTTCTCAATGTCCGCATAAGA
CGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGCAACTCAGGAAGATGCAACCAAGGCCCTTGAGTCT
ACACAAAACAGCAAATTAATGGACAGGGTTGTTTCTATTGAGTACGCTTTGAGGGATGAT
GATGAAAGAGATGATCGATATGCTCCTAGTCCCAGAAGGAGATCTCCTAGTCCTGTCTAC
AGGAGGCGTCCCAGTCCTGATTACGGCCGTCCTCGCAGTCCTGAGTATGACAGGTACAAA
GGGTCCAGCTCCTTATGAAAGCGTAGAGCCAGATTACGGTCGTCGCAGTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY40TF U 1
AF RR4AX68TF U 20
BS 1 164 RR4GY40TF
BS 165 165 RR4AX68TF
BS 166 625 RR4GY40TF
BS 626 626 RR4AX68TF
BS 627 627 RR4GY40TF
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BS 629 659 RR4GY40TF
BS 660 660 RR4AX68TF
BS 661 713 RR4GY40TF

RD RR4GY40TF 713 0 0
TTTTTCTAAGATTCTTCAAGGAGGAATTCGATCTCGTCTGGAAGCATGAGTAGGCCGGTG
TTCGTGGGGAACTTCGAGTATGAGACTCGCCAATCGGATCTGGAACGGTTGTTCAGCAAG
TACGGGAGAGTGGAGCGAGTTGACATGAAGTCTGGTTATGCTTTTGTGTATTTTGAGGAT
GAGCGTGATGCTGAAGATGCTATCCGTGGGATTGACAATATCCCTTTTGGCTATGAGAAA
CGCAAGCTCTCTGTCGAATGGGCTAAGGGTGAACGTGGGAAGCCTCACGGAAAGGCAGCT
TCCAATCAGAGGCCTACAAAGACACTCTTTGTCATCAACTTTGACCCTATCCGCACTAAA
GAGCGTGATATTGAGAGGCACTTTGAGCCGTATGGTAAAGTTCTCAATGTCCGCATAAGA
CGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGCAACTCAGGAAGATGCAACCAAGGCCCTTGAGTCT
ACACAAAACAGCAAATTAATGGACAGGGTTGTTTCTATTGAGTACGCTTTGAGGGATGAT
GATGAAAGAGATGATCGATATGCTCCTAGTCCCAGAAGGAGATCTCCTAGTCCTGTCTAC
AGGAGGCGTCCCAGTCCTGATTACG*CGGTCCTCGCAGTCCTGAGTATGACAGGTACAA*
GGGTCCAGCTCCTTATGAAAGCGTAGAGCCAGATTACGGTCGTCGCAGTCTGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4AX68TF 658 0 0
GGAGGAATTCGATCTCGTCTGGAAGCATGAGTAGGCCGGTGTTCGTGGGGAACTTCGAGT
ATGAGACTCGCCAATCGGATCTGGAACGGTTGTTCAGCAAGTACGGGAGAGTGGAGCGAG
TTGACATGAAGTCTGGTTATGCTTTCGTGTATTTTGAGGATGAGCGTGATGCTGAAGATG
CTATCCGTGGGATTGACAATATCCCTTTTGGCTATGAGAAACGCAAGCTCTCTGTCGAAT
GGGCTAAGGGTGAACGTGGGAAGCCTCATGGAAAGGCAGCTTCCAATCAGAGGCCTACAA
AGACACTCTTTGTCATCAACTTTGACCCTATCCGCACTAAAGAGCGTGATATTGAGAGGC
ACTTTGAGCCGTATGGTAAAGTTCTCAATGTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTC
AGTTTGCAACTCAGGAAGATGCAACCAAGGCCCTTGAGTCTACACAAAACAGCAAATTAA
TGGACAGGGTTGTTTCTATTGAGTACGCTTTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGAT
ATGCTCCTAGTCCCAGAAGGAGATCTCCTAGTCCTGTCTACAGGAGGCGTCCCAGTCCTG
ATTACGGCCGTCCTCGCAGTCCTGAGTATGACAGGTACAAAGGGTCCAGCTCCTTATG

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL7595Contig1 1261 2 8 U
GGATCTTTATTGTTTCTTTTGTTCTTATTCGATGGTTCAGACAGATACAGATAAGATGGG
GCTTAATTTGAATCTGTCGATGTACTCCTTAGCAAAACCATTGTCTCAATTTCTCGACCA
AGTGTCGAGGATCAAAGACCACGACTCGAAACTGTCTGAAATCGATGATTATGTCGGAAA
ATTAGAGGAAGAGAGGAGGAAGATCGATGTTTTTAAACGGGAGCTACCTCTATGCATGCT
CCTATTGAACGAAGCGATTGAGAGGTTAAAGGAAGAGGCTTCATCAGTGATGATGATGGC
ATCAAATGGTAAATTAGATGTGGGTGAAGGGGTAATATTGGAAAGTGACAATAATAAGAA
GAACTGGATGAGCTCTGCCCAGTTATGGATCTCCAATCCTAACTCTCATTTGCAATCGAC
AAATGAAGAAGAGGATGGGTGTGTGACTCAGAAGCCTATTCAGACATGTAATAATCAGGG
AGGAGCATTTCCACCACCATATAACCCTCCACCACCGCCTCCTTCGGCTCCTCTGTCTCT
CAGGACTCCAACATCAGAAATACTGATGGATTATAGGAGAATTGAGCAGAATCATCCTCA
ATTCAGCAAACCTATTATACAGAGCCATCACGTTCCGAAGAAAGATCAGAGAAGGAGATG
GTCACAGGAACTTCACCGTAAATTCGTTGATGCTCTTCACAGCCTTGGAGGGCCACAAGT
GGCAACACCAAAGCAGATTAGAGAAATGATGAGAGTTGATGGTTTAACCAATGATGAAGT
CAAGAGCCATTTACAAAAATATAGAATGCATATCCGTAAGCATCCGCTGCATCCAGCAAA
GATTCTGCCATCCTCGGATCAGCCTGTTTTGTTAGATAGGGAAACACATAGCTTAATAAG
TTTGACGAGGTTTGATTCACCACAGAGCCCGCTTGTTGTTGATAGAGGTTGTTTGTTCAG
TAATAATTGTCATAGCTCAGAGGATGAAGAGAAATTTGATGGACGTAGTAGCTGGAAAAG
TGTGTCAGATAAGAAGAGACAATCGTTGGATCTTGAGCTTTGAAGACATGCATAGATAAA
AGTTACCATTATATGTTGTCATATGCTCAAAAACTTTGAAGTTTTGCTCGGGAGTTTTGG
TAGATGTATAACATGAGAGAGGGAATATAGATAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGATCAAACT
CCTCAGGCTTGTGTTTTAGTTTTTTTGTTACTTCATAAGAAAGTGAAACTGATAAATCAA
A


BQ
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10 

AF RR4CQ10TF U 1
AF RR4CQ10JQ C 528
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BS 655 655 RR4CQ10JQ
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RD RR4CQ10TF 795 0 0
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CCTATTGAACGAAGCGATTGAGAGGTTAAAGGAAGAGGCTTCATCAGTGATGATGATGGC
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AAATGAAGAAGAGGATGGGTGTGTGACTCAGAAGCCTATTCAGACATGTAATAATCAGGG
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CAGGACTCCAACATCAGAAATACTGATGGATTATAGGAGAATTGAGCAGAATCATCCTCA
ATTCAGCAAACCTATTATACAGAGCCATCACGTTCCGAAGAAAGATCAGAGAAG*AGATG
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CA
GAGCATTACAAAA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4CQ10JQ 734 0 0
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TGCATCCAGCAAAGATTCTGCCATCCTCGGATCAGCCTGTTTTGTTAGATAGGGAAACAC
ATAGCTTAATAAGTTTGACGAGGTTTGATTCACCACAGAGCCCGCTTGTTGTTGATAGAG
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GTAGCTGGAAAAGTGTGTCAGATAAGAAGAGACAATCGTTGGATCTTGAGCTTTGAAGAC
ATGCATAGATAAAAGTTACCATTATATGTTGTCATATGCTCAAAAACTTTGAAGTTTTGC
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ACTGATAAATCAAA

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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ACTTGGGAGATCTCCATATGAACATTATCTTGCGTGGT


BQ
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AF RR4CM86JQ C 1
AF RR4CM86TF U 1
BS 1 638 RR4CM86TF

RD RR4CM86JQ 638 0 0
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AGAGCCTGCACTGTGGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGAC
ACTTGGGAGATCTCCATATGAACATTATCTTGCGTGGT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4CM86TF 638 0 0
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AACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAA
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CTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCAACATTATGGCTGATAAAGCTGGTTACATCAT
TCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCC
TGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCA
AGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCC
CGATCTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAA
CATGGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTA
AGAGCCTGCACTGTGGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGAC
ACTTGGGAGATCTCCATATGAACATTATCTTGCGTGGT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL7597Contig1 721 2 6 U
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GCACCGGAGATAAACATCATCCTCACACCAGCAAAGACGGAGACTCACAAGAAGAACAGG
ATCCAAGTCTCCAACACGAAGAAGCCACTGTTCTTCTACGTTAATCTCGCCAAGAGGTAC
ATTCAGCAACACAATGAGGTTGAACTCTCTGCACTCGGGATGGCAATCACGACGGTTGTA
ACAATCTCTGAGATCTTGAAGAACAATGGATTGGCTACAGAGAAGAAAGTGTTGACATCC
ACTGTGGGAATGAAGGATGAGACCAAAGGAAAGATGGTTCAGAAAGCAAAGATTGAGATT
GTGTTGGGGAAATCAGACAAGTTCGACTCTTTGGTGCCACCTGTGACCAATGGCAAGACT
CCTGAGGAAGTAGCTAAAGCAGAGACGGAGGCTGCTGTTGAAGCACAAGAATCTGCAGCC
ACTCAAGTCTAGGACTGATCCTGCTAACCACATAAGAATGATTGTTCCATTTTTTTTCTT
AAATATGTTTGTTTGTTTTTGTTTCAGTTGTGACAATTCGAACATAATACTACTCTAGAT
ATGTAATATAATAAGTAAAATGATGGTTGACAACGATATCATTTGTTTTGGAACAGAAAG
G


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RR4BZ27TF U 1
AF RR4BZ27JQ C 2
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RD RR4BZ27TF 681 0 0
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AAATATGTTTGTTTGTTTTTGTTTCAGTTGTGACAATTCGAACATAATACTACTCTAGAT
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QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BZ27JQ 720 0 0
GGA
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TGGGGAAATCAGACAAGTTCGACTCTTTGGTGCCACCTGTGACCAATGGCAAGACTCCTG
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AAGTCTAGGACTGATCCTGCTAACCACATAAGAATGATTGTTCCATTTTTTTTTTTAAAT
ATGTTTGTT*GTTTTTGTTTCAGTTGTGACAATTCGAACATAATACTACTCTAGATATGT
AATATAATAAGTAAAATGATGGTTGACAACGATATCATTTGTTTTGGAACAGAAAGG

QA 4 720 4 720
DS 



AS 1 2

CO CL7598Contig1 762 2 4 U
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TATATTTTAGTCGTCTAAGATATATCATTCGGATTGGATCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CP57TF U 1
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RD RR4CP57TF 704 0 0
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CAATGGATATGAAGGAGAAGAAACTAACTGTGATCGGAAGCGTGGATCCGGTAAATGTAG
TAAGTAAGCTAAGAAAGTATTGGCCGATGACAGATATCTTACTAGTTGGACCTGCAAAAG
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AAGAAGGGGAAGCTCCAAAGGAAGAAGGGAAAAAGGAAGGAGAAGCGCCAAAGAAGGAAG
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AACCGCAGCCTCAGCCACAGCCACAACCTCCACCACCAGATCATGTGTTGGAGCTTGTAA
AGGCGTATAAAGCATACAATCCTCATCTAACAACGTATTACTACGCCCCAAGCATGGAAG
AGAACCCTAACGCTTGCGTTATATGTTGAAAAAAA*CATGTATGATATAATATAAGTGTA
AAATTGCGAAAGAGATGGACAGATCTATAATGAGGAAGA
GAATA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4CP57JQ 714 0 0
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AACCACAACCACAACCGCAGCCTCAGCCACAGCCACAACCTCCACCACCAGATCATGTGT
TGGAGCTTGTAAAGGCGTATAAAGCATACAATCCTCATCTAACAACGTATTACTACGCCC
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AATATAAGTGTAAAATTGCGAAAGAGATGGACAGATCTATAATGAGGAAGAAGAATAAGA
ACCAGAGCAGCATATATTTTAGTCGTCTAAGATATATCATTCGGATTGGATCGG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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GAACTTGTGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU50TF U 1
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RD RR4DU50TF 286 0 0
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QA 1 286 1 286
DS 

RD RR4DU50JQ 312 0 0
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AACCAATGTTTACTTTAAACTCTCTCTTTAATCGATTAATGTAAAAAACGTTGTATGGAC
GGTGAAGCCCAAGTAGGTTGTCTGTGGACAGAATATTTCTTAAAAAGATTCGAATATATT
GAACTTGTGACC

QA 1 312 1 312
DS 



AS 1 2

CO CL7600Contig1 766 2 3 U
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TAAGATATATATAAAAAAGGATAAACAAAAGGTTTTTCAAGGAGAAGAGAGACACGAAAC
AGTTAGTGTAAAAGTCTGCCTCCACAAGTGAATGTGACGATGCATGAGTCGTCCACAAAG
ACTGTATAGTTATGAGCAGGTTTTGATAGCAATGGCGGAAGCGTAACCAGAAGGTCGCAC
ACGCACTCGTTGTCTATTTGCCTCAACCACTTGCAGCAATCTTGTTGATCATACGTCTCA
TCTCCGTGTCGGTGATGATGGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTCGTCGTCATTATCGTGG
TGGTCGTGGTCATCGTGATCATGGTCATCATGATCGTGGTCGTGGTCATCGTAATCATGG
CCGTGGTCATCGTCATCATGGTGGTGGTGGTGGTCATCGTCATCATGGTCGTGATCATCG
TCATCATCGTGGTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATCGTCATCATCATGG
TCATGGTCATCGTCATCATCATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATCATCATCATGGTCG
TGGTCATGGTGGTCATGATGATCATCGTCATGGGGATGGTGGTCATGGTCATGGTCATGG
TCGTGGTCATGGTCATGGTCATGGTCATCATCATGGTCATGGTCAGGAGAAGGTGGGACA
GTGGGGGAAGAAGGTAGGACAGTGGTCACTGGGACACGTGCGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 
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AF RR4H347JQ U 113
AF RR4H347TF C 1
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AATCATGGCCGTGGTCATCGTCATCATGGTGGTGGTGGTGGTCATCGTCATCATGGTCGT
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CAT

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR4H347TF 766 0 0
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TCATCATCGTGGTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATCGTCATCATCATGG
TCATGGTCATCGTCATCATCATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATCATCATCATGGTCG
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GTGGGGGAAGAAGGTAGGACAGTGGTCACTGGGACACGTGCGCAGC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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GTCTCACACGGTGATGAAAGACTGTGGAGCATGTTCGTCGAAAGCGGCGGAGACGGGTCT
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BQ
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AF RR4AX36TF U 1
AF RR4AX36JQ C 4
BS 1 656 RR4AX36TF
BS 657 757 RR4AX36JQ

RD RR4AX36TF 656 0 0
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GTGGAGACTAAGGTCGGAGCCTCCGTCTATCGATGGATATGGTGATCATCGGATTGTTAC
AGGAGTTCCTGTTTTGGTGTGTGCTTCAACGGCCAACGTAAATTTTGGTGGTGTTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4AX36JQ 754 0 0
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TTTGTATACAACAATGACAAAGACAATTGAGATTGACATAAGATCCGCAGAAGGGCTTAA
GTTAAACCGGAGACTCTTAAACAAAAAGACATTCGCCGTCGCAAAAATCGGCGAGAAGTC
TCGGAAGTCGCATCCTGACGTATCGAGAGGAAGCAGTCCAACGTGGAACTGCAAGTTGGA
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TGGACGTGAGAAGAAGATCGGAGAAGCTAAGATCCCAACGTCAGACTTCATGGGAAGGTA
TTCACCTGAAGGCCATTTGAATTTCTTGAGCTATAGGTTAAGAGATGAATATGGGGATAA
GTGTGGAATCGTGAATGTTTCAATCATGGTTAAACCTAATTCCACAGATGAGTTCAAGTC
TCACACGGTGATGAAAGACTGTGGAGCATGTTCGTCGAAAGCGGCGGAGACGGGTCTGTG
GAGACTAAGGTCGGAGCCTCCGTCTATCGATGGATATGGTGATCATCGGATTGTTACAGG
AGTTCCTGTTT*GGTGTGTGCTTCAACGGCCAACGTAAATTTTGGTGGTGTTTGGCTGCA
CAAAGACTTGTGATATTTATTTTTTGTTACTATACAAAAAAAGAAAAACTTATTTGATGT
TTGGAAACAAAAAAGGATTACAAGGTTCAGTATT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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TCTTCTGTTGGATTTCTTTGTATCAGAAGTGAACGGGTTTATGTTTGGAGTTACGGTCTG
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TCCTTCTCCTTGGTCTTCTTCCTCCTCCATAGAACTTCTCAAAAGAGTGACAGCCTTAGA
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BQ
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AF RR4DI38JQ C 1
AF RR4DI38TF U 1
BS 1 648 RR4DI38TF
BS 649 660 RR4DI38JQ

RD RR4DI38JQ 660 0 0
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TTCCTTGGATGTTTTGAATGAATGGCTCAATGTGCTTCAGTCTGTACAGATTCCCTTCGC
TCTTCTCCCTCTTCTAACGTTGGTATCCAAGGAAGAAGTTATGGGAGACTTCAAGATTGG
CCCTATTCTCCAGAGAATAGCATGGACAGTGGCTGCACTTGTAATGATCATCAATGGGTA
TCTTCTGTTGGATTTCTTTGTATCAGAAGTGAACGGGTTTATGTTTGGAGTTACGGTCTG
CGTCTGGACAACTGCTTATGTTGCGTTCATAGTCTACCTCATTTCACACAGCAACTTTTT
TCCTTCTCCTTGGTCTTCTTCCTCCTCCATAGAACTTCTCAAAAGAGTGACAGCCTTAGA
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GTAAACAAACTACATCCTCTCTATATACATACCGATATGCCAAAGTGTGGGTAAAGATTT
ATTTAGTATAGCTTTTGCGAATGTGACAACACAACCAATCTTTGTTGTACCTTTTTGTTT
TGTTTTTAAGAGGATGGGCCAGTAAAGTGATGCTCCAATATGATCTAAAGAGGCTTTTGC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4DI38TF 648 0 0
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TTCCTTGGATGTTTTGAATGAATGGCTCAATGTGCTTCAGTCTGTACAGATTCCCTTCGC
TCTTCTCCCTCTTCTAACGTTGGTATCCAAGGAAGAAGTTATGGGAGACTTCAAGATTGG
CCCTATTCTCCAGAGAATAGCATGGACAGTGGCTGCACTTGTAATGATCATCAATGGGTA
TCTTCTGTTGGATTTCTTTGTATCAGAAGTGAACGGGTTTATGTTTGGAGTTACGGTCTG
CGTCTGGACAACTGCTTATGTTGCGTTCATAGTCTACCTCATTTCACACAGCAACTTTTT
TCCTTCTCCTTGGTCTTCTTCCTCCTCCATAGAACTTCTCAAAAGAGTGACAGCCTTAGA
TAGCTAGCTGCACAAGAAATAACTGCTCTCTGGGACCATTTCATACATTTTGAAGATACG
GTAAACAAACTACATCCTCTCTATATACATACCGATATGCCAAAGTGTGGGTAAAGATTT
ATTTAGTATAGCTTTTGCGAATGTGACAACACAACCAATCTTTGTTGTACCTTTTTGTTT
TGTTTTTAAGAGGATGGGCCAGTAAAGTGATGCTCCAATATGATCTAA

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL7603Contig1 835 2 2 U
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CTAGCAACACTTTCCCCACGGATTACGTGCCTACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCAAATG
TGATTGTGGATGGAAACACTATCAACTTGGGATTGTGGGATACTGCAGGACAAGAAGACT
ACAATAGACTAAGACCTTTGAGCTATCGCGGTGCAGATGTCTTCTTACTTGCCTTCTCTC
TCTTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGATTCTAAAAAGTGGGTACCTGAACTGAGACATT
ATGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTCGTTGGAACCAAGCTTGATCTTCGAGATGACAAGC
AATTCTTGGTTGAGCACCCTGGTGCTGTGCCTATCTCTACTCCTCAGGGTGAAGAACTGA
AGAAGCTCATTGGGGCACCTGCTTATATTGAATGCAGTGCAAAAACACAACAGAATGTAA
AAGCGGTGTTTGATGCGGCTATCAAGGTCGTTCTCCAACCACCCAAGAACAAGAAGAGGA
AGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCATAGTGAAACCAACATGA
GGATTGAATTGAAGTAGCTCTCACCACTTGTTTGTTTTCCTCAGGAAAGGAGGAAGAATT
TGTTGTTTGTAGTCTTTAAAAAAAAAAAAACAGAAGAAGTAGTAACCAAGTATTTGTATT
CTTGTTTGCATTTTGATCTGTATATATATTCCACGATTACTCTATTTCTTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H459TF U 1
AF RR4H459JQB C 423
BS 1 697 RR4H459TF
BS 698 835 RR4H459JQB

RD RR4H459TF 699 0 0
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TAAAGTGTGTCACAGTCGGCGACGGCGCTGTTGGAAAGACTTGTCTGCTCATCTCCTACA
CTAGCAACACTTTCCCCACGGATTACGTGCCTACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCAAATG
TGATTGTGGATGGAAACACTATCAACTTGGGATTGTGGGATACTGCAGGACAAGAAGACT
ACAATAGACTAAGACCTTTGAGCTATCGCGGTGCAGATGTCTTCTTACTTGCCTTCTCTC
TCTTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGATTCTAAAAAGTGGGTACCTGAACTGAGACATT
ATGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTCGTTGGAACCAAGCTTGATCTTCGAGATGACAAGC
AATTCTTGGTTGAGCACCCTGGTGCTGTGCCTATCTCTACTCCTCAGGGTGAAGAACTGA
AGAAGCTCATTGGGGCACCTGCTTATATTGAATGCAGTGCAAAAACACAACAGAATGTAA
AAGCGGTGTTTGATGCGGCTATCAAGGTCGTTCTCCAACCACCCAAGAACAAGAAGAGGA
AGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCATAGTGAAACCAACATGA
GGATTGAATTGAAGTAGCTCTCACCACTTGTTTGTTT
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4H459JQB 413 0 0
TTT
TTGGTTGAGCACCCTGGTGCTGTGCCTATCTTTACTCCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAG
CTCATTGGGGCCCCTGCTTATATTGAATGCAGTGCAAAAACACAACAGAATGTAAAAGCG
GTGTTTGATGCGGCTATCAAGGTCGTTTTCCAACCACCCAAGAACAAGAAGAGGAAGAAG
AGAAAGTTTCAGAAAGGCTGTTTTATATTGTGATTCCATAGTGAAACCAACATGAGGATT
GAATTGAAGTAGCTCTCCCCACTTGTTTGTTTTCCTCAGGAAAGGAGGAAGAATTTGTTG
TTTGTAGTCTTTAAAAAAAAAAAAACAGAAGAAGTAGTAACCAAGTATTTGTATTCTTGT
TTGCATTTTGATCTGTATATATATTCCACGATTACTCTATTTCTTTTGCT

QA 4 413 4 413
DS 



AS 1 2

CO CL7604Contig1 435 2 2 U
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GGTGTTGGCTAAGGGAAAAGGGTTACATCAGCGAATAACCCATGTGTTAATCCTAATTAA
TTCCCAGCCGATGTTGCTGTTGCAGAGATGAGCGAAGTAGTGTACTGGTGCGTAGTCAAA
GAAGATAAGTAACACAAAAAAGTTAAAGTTTCAACTTCTGTTTTTGTTTGTTTGTTATTG
AAAACAAGCAATTGCAATCTCTGTGTCTGAGTTTCTGCGGTGGGGTTGCAGAACATAAGT
TTATGGGTCAGGGTGAGATTGTGATTATAGGCGTACATGAAATTTTTATACTAAACATAA
GTTTATGGGTCAGGGGTAAGATTGTGATTAAGGTGTACATGAAATTTCTATACTATATGA
GCCCAAGTTAATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C447JQ C 1
AF RR4C447TF U 221
BS 1 220 RR4C447JQ
BS 221 435 RR4C447TF

RD RR4C447JQ 435 0 0
GCAGAAAACCCGTTCTTGCATGTGCCGAAGAAGATGGAATTGCAGAGAATCAACTGAGTC
GGTGTTGGCTAAGGGAAAAGGGTTACATCAGCGAATAACCCATGTGTTAATCCTAATTAA
TTCCCAGCCGATGTTGCTGTTGCAGAGATGAGCGAAGTAGTGTACTGGTGCGTAGTCAAA
GAAGATAAGTAACACAAAAAAGTTAAAGTTTCAACTTCTGTTTTTGTTTGTTTGTTATTG
AAAACAAGCAATTGCAATCTCTGTGTCTGAGTTTCTGCGGTGGGGTTGCAGAACATAAGT
TTATGGGTCAGGGTGAGATTGTGATTATAGGCGTACATGAAATTTTTATACTAAACATAA
GTTTATGGGTCAGGG*TAAGATTGTGATTAAGGTGTACATGAAATTTCTATACTATATGA
GCCCAAGTTAATAGC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR4C447TF 215 0 0
TTTTTGTTTGTTTGTTATTGAAAACAAGCAATTGCAATCTCTGTGTCTGAGTTTCTGCGG
TGGGGTTGCAGAACATAAGTTTATGGGTCAGGGTGAGATTGTGATTATAGGCGTACATGA
AATTTTTATACTAAACATAAGTTTATGGGTCAGGGGTAAGATTGTGATTAAGGTGTACAT
GAAATTTCTATACTATATGAGCCCAAGTTAATAGC

QA 1 215 1 215
DS 



AS 1 2

CO CL7605Contig1 764 2 2 U
GGATGAGAGTAAAGCCGGTGCATGTCTATGGATTACCAACCGCAGGGGTTTGGAGTATTG
GCCGACTCCAATGGAACAGGCAAAGTACTTGGTGGGTTCAAGTTCCAGCAAAAATACTTC
TTTCAAAGTAACTTCAAATATCAAACTTCCTCAAAGCTTGGAGAAGATAATTGTACATGC
CCTGTCTCATAATTTCCGCAGTGCTACCCGCATAGTACGGGCACCACTAAAGTTACCCAT
TGGACCACACCAAGTTCTTCTGAAAATCATCTATGCCGGTGTCAACGCAAGTGATGTAAA
CTTCAGCTCAGGTCGTTACTTTAGTGGTGACTCACCGAAGCTTCCCTTTGATGCTGGATT
TGAGGGAGTTGGACTAATTGCGGCAGTGGGAGAGTCTGTTAAGAATTTACAAGTTGGGAC
TCCAGCTGCTGTTATGACATTTGGAGCATATGCTGAATACATGATAGTATGAGAGTTCCT
AAACTATTTTGAGATTCTTCTGAGGATTCAATGGTAATGTGATCCTATCTTTTGGTAATT
TAGGTTTCTTCTAAGCACGTGCTTCCTGTTCCAAGGCCAGATCCTGAAGTTGTCGCCATG
CTTACCTCAGGATTAACTGCTTTGATCGCCCTTGAAAAGGCAGGACAGATGAAATCAGGT
GAAACAGTACTTGTGACTGCTGCTGCTGGAGGGACTGGACAATTCGCAGTCCAGCTTGCT
AAGTTGGCTGGAAATAAAGTGATTGCTACTTGCGGGGGAACAGA


BQ
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AF RR4A248TF U 1
AF RR4A248TFB U 1
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TGGACCACACCAAGTTCTTCTGAAAATCATCTATGCCGGTGTCAACGCAAGTGATGTAAA
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AAGTTGGCTGGAAATAAAGTGATTGCTACTTG

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DS 

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TGGACCACACCAAGTTCTTCTGAAAATCATCTATGCCGGTGTCAACGCAAGTGATGTAAA
CTTCAGCTCAGGTCGTTACTTTAGTGGTGACTCACCGAAGCTTCCCTTTGATGCTGGATT
TGAGGGAGTTGGACTAATTGCGGCAGTGGGAGAGTCTGTTAAGAATTTACAAGTTGGGAC
TCCAGCTGCTGTTATGACATTTGGAGCATATGCTGAATACATGATAGTATGAGAGTTCCT
AAACTATTTTGAGATTCTTCTGAGGATTCAATGGTAATGTGATCCTATCTTTTGGTAATT
TAGGTTTCTTCTAAGCACGTGCTTCCTGTTCCAAGGCCAGATCCTGAAGTTGTCGCCATG
CTTACCTCAGGATTAACTGCTTTGATCGCCCTTGAAAAGGCAGGACAGATGAAATCAGGT
GAAACAGTACTTGTGACTGCTGCTGCTGGAGGGACTGGACAATTCGCAGTCCAGCTTGCT
AAGTTGGCTGGAAATAAAGTGATTGCTACTTGCGGGGGAACAGA

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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TTTGGTAATC


BQ
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AF RR4AD85JQ C 1
AF RR4AD85TF U 1
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TTTGGTAATC

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DS 

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ACCTTACCCTTTTATCATTTGCACTCTGTTCAGGTCAAAGACCTTTTCAAGCCCCTACCA
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AAAATGTTCCGTTCGCAAGTTCGGTTCGGTTCATCAACTGAAAAAGTTTCGGTTTTTCGA
TTTGGTAATC

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 2

CO CL7607Contig1 888 2 2 U
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GAGTTCGCTCGTAAACACAAGAATGACATTCGTAAAAATCCAGCCTTTAGAGCTCAGTTC
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GGTCAAGGCTTCGTGACTGTTGAAGAGGTGCAAAGACGGCTCTCGTGGACATCTGGTCGG
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TCTGACACTTAAAACTGTTAGGTGCTCTCTTTTGTACTCATGTTTTGTACTCAATACACT
TACTCTGTATTGCATATAAATTACCAAAAAAAATAATCTTATCAATAT


BQ
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AF RR4GF04TF U 1
AF RR4GF04JQ C 50
BS 1 695 RR4GF04TF
BS 696 888 RR4GF04JQ

RD RR4GF04TF 695 0 0
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GAGTTCGCTCGTAAACACAAGAATGACATTCGTAAAAATCCAGCCTTTAGAGCTCAGTTC
CATGAGATGTGTGCTAAAGTTGGTGTAGATCCACTAGCTTCAAACAAGGGCTTCTGGGCT
GAGCTCCTGGGAATTGGTGACTTCTACTATGAACTTGGAGTTCAGATTATTGAAGTTTGC
ATGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTGATCAGCTTGCAAGAGCTTTGCAACCATCTT
CGACAGAGAAGGAAAAAAGACCGTGAAGCTGTCACCGAAGATGATTGTCTTCGAGCTATT
AGCAAGCTAAAGGTTTTGGGAAGTGGATTTGAAGTAATCACAATTGGCAAGAAAAAGCTT
GTCCGTTCAGTCCCCACCGAGCTCAACAAAGACCATAACCAAATCTTGGAGTTGGCTCGG
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GTCATAGATGCTCTCGAAACTTTGTTAGAGGAGGG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GF04JQ 839 0 0
ACGACCAGAATC
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CCAAGTTACGAACTGATATGATGAAAGAACAGCTTGCCACTTTCAAGTCCCAGCTTGAAG
AGTTCGCTCGTAAACACAAGAATGACATTCGTAAAAATCCAGCCTTTAGAGCTCAGTTCC
ATGAGATGTGTGCTAAAGTTGGTGTAGATCCACTAGCTTCAAACAAGGGCTTCTGGGCTG
AGCTCCTGGGAATTGGTGACTTCTACTATGAACTTGGAGTTCAGATTATTGAAGTTTGCA
TGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTGATCAGCTTGCAAGAGCTTTGCAACCATCTTC
GACAGAGAAGGAAAAAAGACCGTGAAGCTGTCACCGAAGATGATTGTCTTCGAGCTATTA
GCAAGCTAAAGGTTTTGGGAAGTGGATTTGAAGTAATCACAATTGGCAAGAAAAAGCTTG
TCCGTTCAGTCCCCACCGAGCTCAACAAAGACCATAACCAAATCTTGGAGTTGGCTCGGG
GTCAAGGCTTCGTGACTGTTGAAGAGGTGCAAAGACGGCTCTCGTGGACATCTGGTCGGG
TCATAGATGCTCTCGAAACTTTGTTAGAGGAGGGCCTTGCAATGATCGACAATGGCAGTA
AAGACGGAAAATGTCAGTACTGGTTCCCCTGTGTCTCTTCTGTCTACTCATTCGTTGGAT
CTGACACTTAAAACTGTTAGGTGCTCTCTTTTGTACTCATGTTTTGTACTCAATACACTT
ACTCTGTATTGCATATAAATTACCAAAAAAAATAATCTTATCAATAT

QA 13 839 13 839
DS 



AS 1 2

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TCTTCTTCCATCTTCTTTCCGAGATTATTAAATAAAACCTAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CP48JQ C 1
AF RR4CP48TF U 1
BS 1 643 RR4CP48TF

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CAAAGATTTTTATTTATGCATTTATCTACAGACAGTAATTGAACAAATACAAAATCTGTG
TCTTTTTCCATCTTCTTTCCGAGATTATTAAATAAAACCTAAA

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DS 

RD RR4CP48TF 643 0 0
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CCCACAACCACTTCCTCCTCGATAACTCCCGCCGCTCACCACCGCTATTTTAAGCTCAAA
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ATTCGAGGAAGAATCAAGACGGAGGAGTTTGATAGCAAAAAGATTAATGTAATCGATGTC
GCTGATATGGATCCGCCTTTGCCAGTGATTAAGAAGAAGGATAACGATTGTGGCGGTGGC
GCTGGAGCAGAGAATCTGTGGAAGAGGAGATCTGGTGGTGGTGATTGTCAACTACGGACT
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CAAAGATTTTTATTTATGCATTTATCTACAGACAGTAATTGAACAAATACAAAATCTGTG
TCTTCTTCCATCTTCTTTCCGAGATTATTAAATAAAACCTAAA

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL7609Contig1 452 2 1 U
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BQ
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AF RR4E560JQ C 1
AF RR4E560TF U 1
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TCTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTTCAT
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ATTCCCAGCTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAAT
TTGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTA
AATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTAGTGTCATTAAAATAAA
GTATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR4E560TF 452 0 0
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TCTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTTCAT
CATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAAAAAAAACTATGTCCTTC
TCCAATCAAGTTAGGCCGCTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAA
ATTCCCAGCTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAAT
TTGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTA
AATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTAGTGTCATTAAAATAAA
GTATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTT

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL7610Contig1 795 2 7 U
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TCTTCAGATTTGGAACTTAAGTAATCAGAATTGCTAGATCACATCATGGAGGATGCAACT
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GATGTTTCCGTCAAGGCTGTGAATGGAGATGTGACAAAGGAAGGGAAAGAAGAAGAAGAT
ACAACATTTGATGGAGAATTCATAAAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTGATGCCAAGGATGAT
GCTGAGAAAGCAGTGCATAAGCATAAGCAAAGCTAAGGAAACGGAGGCAAAGGATGTAGT
TATTAAATCTCGAGACGTTGACTTGTCCTTTTCATCTCCAACGAAACGTACGAGCAAGAA
GAAGTCAGAGGCGTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCGAGCAACGTAACCGCTACTCAGACGGC
GACAACTTCTCATCTCATGACACTGAAGATCGTCTCTGGAGTAGCTTTGATCTCCGTTAT
CATCGGTATAATTCTTGGGAAAAAGTACTAGTGTTCTTGTTTGGTGTGATGTTCATATGT
GAAGATCTCTCCTTTTATTTGTTTTTTTTTTTTAATTTTGATAAAAATCTCTCAGAAGCT
TCATGAGAGATGTAATGTTTAGCAGAATATGGGAAGCTTTGCTTCTCTCTGCAGATTGTT
TTTGGTTCTTAATTGTGGCTTGTTGGTCAAGCAATGTTTTGATACTCTTAAATTAAATGA
AGGTGAAGTTATTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BE12JQ U 1
AF RR4EL46JQ U 77
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QA 1 735 1 735
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QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EU45TF U 1
AF RR4EU45JQ C 24
BS 1 568 RR4EU45TF
BS 569 569 RR4EU45JQ
BS 570 653 RR4EU45TF
BS 654 746 RR4EU45JQ

RD RR4EU45TF 653 0 0
GGCCGGCCGAACGAAATCTGAGAAAGTGACAGGCGAGGAAGAGAGAGAATGTGGTTCACC
GGCGGAGGAGGAGGAGGACTAAGGAAGCTCTGTAGGGCCTCCGCGGCTGTTTTAGAGAAT
GAGATGGTCTCTAACTCTCTGTTGGTGAGATACATGTCAAGAGAACGAGCTGTTAACGTC
CGAAAGATAAACCCAAAGGTTTCGATCCAAGAAGCTCACATCATCTCCACTTCTCTCTAC
GATGTCTTCAAGAAACATGGTCCTCTTTCCGTTCCCAATACTTGGCTCCGCGCTCAGGAA
GCTGGGGTTAGTGGAATAAACAGCAAAACTCATATGAAGCTGTTGCTGAAATGGATGAGA
GGAAGAAAGATGCTCAAGTTAATCTGCAACCAAGTTGGTTCCTCTAAAAAGTTTTTTCAC
ACCATTTTACCTGAAGATCCTCAACAAGAAACACCACAAGTTGCTGCTGCTGCTGCGACT
GAGAACAAGAAACAAACCTTCAAGAGAAGAAGCAAATAAATGGATATGGTTTTTCACATA
AACTTGATAGAGCTAATCTCTGTGGGGGGCACAATGTGCTGTTTGTTTGTTTTTTGTGTC
TGTCTACATGGAGTTTCTGTCTCGTTTGATCTGGTTTTAGTCCCAGGGAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4EU45JQ 723 0 0
AAGTGACAGGCGAGGAAGAGAGAGAATGTGGTTCACCGGCGGAGGAGGAGGAGGACTAAG
GAAGCTCTGTAGGGCCTCCGCGGCTGTTTTAGAGAATGAGATGGTCTCTAACTCTCTGTT
GGTGAGATACATGTCAAGAGAACGAGCTGTTAACGTCCGAAAGATAAACCCAAAGGTTTC
GATCCAAGAAGCTCACATCATCTCCACTTCTCTCTACGATGTCTTCAAGAAACATGGTCC
TCTTTCCGTTCCCAATACTTGGCTCCGCGCTCAGGAAGCTGGGGTTAGTGGAATAAACAG
CAAAACTCATATGAAGCTGTTGCTGAAATGGATGAGAGGAAGAAAGATGCTCAAGTTAAT
CTGCAACCAAGTTGGTTCCTCTAAAAAGTTTTTTCACACCATTTTACCTGAAGATCCTCA
ACAAGAAACACCACAAGTTGCTGCTGCTGCTGCGACTGAGAACAAGAAACAAACCTTCAA
GAGAAGAAGCAAATAAATGGATATGGTTTTTCACATAAACTTGATAGAGCTAATCTCTGT
GGGGGCCACAATGTGCTGTTTGTTTGTTTTTTGTGTCTGTCTACATGGAGTTTCTGTCTC
GTTTGATCTGGTTTTAGTCCCAGGGAAAAACATTATAGTTGCTGGTGTAGGAATACTTGA
GAAACTCATGGCTTGTTTTGATCCTTTTGCTGAGCTCCCTTTGAATAAAAGTAACATCAA
TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7614Contig1 701 2 3 U
TTTTTTTGTGATAAACTAAGAACATGATTGATGATCATATATGCCACAAAAGCTGTCATT
TTTACTCAGAATATGCAACAACACGATTTATAAGAAAGATTGAAGAAAGCTTTTACTCAA
ATCCTATGATTCTCTTCAAACCAGGAAACAACCCAGAAAACGAAGACATCGAAGAAGAAG
GCTCTGTTGTTGTTTTGTCAGAAACCAAACACTCTTCTTCCACCATTTCCTTAACAGATC
TAACAGACAAAGGCTGAAAATCAACACCCCACTCATCCACAAACTCTCTCACCATAACCA
CTTTCTCCTCTTCTCCAACCTTCCTCCACTTAACCCTCACCTCCTCTTCTTTCAAACCCA
CATGCTTACAGAACTCTCCCACAGTATCTCGCCGCTCTTCTTCATCGCTTCTCGTCTCTG
TTCCGACACCGTGTTCGCCTTCCCGATCTCTCTCGCCAAATCCTTCGCCAGCTCCGCATC
GCTCATCGTTTTCTTCTTCTTCTTGCCCTTCCTCGTCCTCCTGTTGCTCATCATGCCATC
GTCTTCATCCTCCTCTCTCCTTATGCACTGAATCCTGGTTGCGGGTCGGGTCAGCACACG
GCTAAACTCCAGATTCCGATTAAAGGATGTGTTTTGGGGTAGAAGATGAAGTAACCTCAG
CGCCATCTCTTTCTGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTGACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F433JQ U 8
AF RR4F433TF C 1
BS 1 7 RR4F433TF
BS 8 646 RR4F433JQ
BS 647 701 RR4F433TF

RD RR4F433JQ 639 0 0
GTGATAAACTAAGAACATGATTGATGATCATATATGCCACAAAAGCTGTCATTTTTACTC
AGAATATGCAACAACACGATTTATAAGAAAGATTGAAGAAAGCTTTTACTCAAATCCTAT
GATTCTCTTCAAACCAGGAAACAACCCAGAAAACGAAGACATCGAAGAAGAAGGCTCTGT
TGTTGTTTTGTCAGAAACCAAACACTCTTCTTCCACCATTTCCTTAACAGATCTAACAGA
CAAAGGCTGAAAATCAACACCCCACTCATCCACAAACTCTCTCACCATAACCACTTTCTC
CTCTTCTCCAACCTTCCTCCACTTAACCCTCACCTCCTCTTCTTTCAAACCCACATGCTT
ACAGAACTCTCCCACAGTATCTCGCCGCTCTTCTTCATCGCTTCTCGTCTCTGTTCCGAC
ACCGTGTTCGCCTTCCCGATCTCTCTCGCCAAATCCTTCGCCAGCTCCGCATCGCTCATC
GTTTTCTTCTTCTTCTTGCCCTTCCTCGTCCTCCTGTTGCTCATCATGCCATCGTCTTCA
TCCTCCTCTCTCCTTATGCACTGAATCCTGGTTGCGGGTCGGGTCAGCACACGGCTAAAC
TCCAGATTCCGATTAAAGGATGTGTTTTGGGGTAGAAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4F433TF 701 0 0
TTTTTTTGTGATAAACTAAGAACATGATTGATGATCATATATGCCACAAAAGCTGTCATT
TTTACTCAGAATATGCAACAACACGATTTATAAGAAAGATTGAAGAAAGCTTTTACTCAA
ATCCTATGATTCTCTTCAAACCAGGAAACAACCCAGAAAACGAAGACATCGAAGAAGAAG
GCTCTGTTGTTGTTTTGTCAGAAACCAAACACTCTTCTTCCACCATTTCCTTAACAGATC
TAACAGACAAAGGCTGAAAATCAACACCCCACTCATCCACAAACTCTCTCACCATAACCA
CTTTCTCCTCTTCTCCAACCTTCCTCCACTTAACCCTCACCTCCTCTTCTTTCAAACCCA
CATGCTTACAGAACTCTCCCACAGTATCTCGCCGCTCTTCTTCATCGCTTCTCGTCTCTG
TTCCGACACCGTGTTCGCCTTCCCGATCTCTCTCGCCAAATCCTTCGCCAGCTCCGCATC
GCTCATCGTTTTCTTCTTCTTCTTGCCCTTCCTCGTCCTCCTGTTGCTCATCATGCCATC
GTCTTCATCCTCCTCTCTCCTTATGCACTGAATCCTGGTTGCGGGTCGGGTCAGCACACG
GCTAAACTCCAGATTCCGATTAAAGGATGTGTTTTGGGGTAGAAGATGAAGTAACCTCAG
CGCCATCTCTTTCTGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTGACCTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7615Contig1 656 2 1 U
GGAGATTTACACCAACTCTCTACGTAACAAAGATTAAACAACATAATTTTGTGAGACCAT
GTCAGGTGTTTGGGTGTTCAAAAACAACGGAGTTCAACGTCTGGTGGAGAATCCAAACCA
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GGTGAAGTAATCTCTTCTTACTCGTCACTCGAAGAGATCCTAAAGAGCCTTGGGTGGGAA
ATATACCACGAAGGAGACGTAGATCTCATCCAGTACCGAAAACACTCCTCCATCGACCTC
ATCTCATTACCAAGAGACTTCTCCAAGTTCAAATCCATTTACATGTACGACATCGTCGTC
AAGAACCCTAATTCCTTCCAAGTCCGTGATTCAACTGAATAATTGCACGGTTTCATTTTC
GACCAATAGGTCTAGGTTGTGTTTGTTTAATCTGTTCCAACCAATAAATTCCAGACAGGA
CGATCTGCAGTAATCATGACTTCGTTTTTTTTCCCAATTTGCATCATCACCTTTTTTTCT
CCAAGTTTGTTGCATGCGTTTGCTTCTATCTTCATCATCTTTGTGTGGCTGCATTTTATA
ATCGTGTTGATCGATGTAATAAAGGTGTGTTTCTTTTGGGTTTAAGCTTTATATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BX56JQ C 1
AF RR4BX56TF U 1
BS 1 656 RR4BX56TF

RD RR4BX56JQ 656 0 0
GGAGATTTACACCAACTCTCTACGTAACAAAGATTAAACAACATAATTTTGTGAGACCAT
GTCAGGTGTTTGGGTGTTCAAAAACAACGGAGTTCAACGTTTGGTGGAGAATCCAAACCA
GACCGATGGAGACGCCACCCAGTCGCACGGACAAAGGAAAGTTTGGTTTACTTGCCGACC
GGTGAAGTAATCTCTTCTTACTCGTCACTCGAAGAGATCCTAAAGAGCCTTGGGTGGGAA
ATATACCACGAAGGAGACGTAGATTTCATCCAGTACCGAAAACACTCCTCCATCGACCTC
ATCTCATTACCAAGAGACTTCTCCAAGTTCAAATCCATTTACATGTACGACATCGTCGTC
AAGAACCCTAATTCCTTCCAAGTCCGTGATTCAACTGAATAATTGCACGGTTTCATTTTC
GACCAATAGGTCTAGGTTGTGTTTGTTTAATCTGTTCCAACCAATAAATTCCAGACAGGA
CGATCTGCAGTAATCATGACTTCGTTTTTTTTCCCAATTTGCATCATCACCTTTTTTTCT
CCAAGTTTGTTGCATGCGTTTGCTTCTATCTTCATCATCTTTGTGTGGCTGCATTTTATA
ATCGTGTTGATCGATGTAATAAAGGTGTGTTTCTTTTGGGTTTAAGCTTTATATAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4BX56TF 656 0 0
GGAGATTTACACCAACTCTCTACGTAACAAAGATTAAACAACATAATTTTGTGAGACCAT
GTCAGGTGTTTGGGTGTTCAAAAACAACGGAGTTCAACGTCTGGTGGAGAATCCAAACCA
GACCGATGGAGACGCCACCCAGTCGCACGGACAAAGGAAAGTTTGGTTTACTTGCCGACC
GGTGAAGTAATCTCTTCTTACTCGTCACTCGAAGAGATCCTAAAGAGCCTTGGGTGGGAA
ATATACCACGAAGGAGACGTAGATCTCATCCAGTACCGAAAACACTCCTCCATCGACCTC
ATCTCATTACCAAGAGACTTCTCCAAGTTCAAATCCATTTACATGTACGACATCGTCGTC
AAGAACCCTAATTCCTTCCAAGTCCGTGATTCAACTGAATAATTGCACGGTTTCATTTTC
GACCAATAGGTCTAGGTTGTGTTTGTTTAATCTGTTCCAACCAATAAATTCCAGACAGGA
CGATCTGCAGTAATCATGACTTCGTTTTTTTTCCCAATTTGCATCATCACCTTTTTTTCT
CCAAGTTTGTTGCATGCGTTTGCTTCTATCTTCATCATCTTTGTGTGGCTGCATTTTATA
ATCGTGTTGATCGATGTAATAAAGGTGTGTTTCTTTTGGGTTTAAGCTTTATATAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL7616Contig1 905 2 6 U
GGCTCTTAAAGCGTTTTGTTCTCACTCTCTGCCGTCTCTCTCTCACTCTCTGTAGCTTTG
ACCCATACTCTCTGTTTCTCTTACAATCATGGCCGCCACCGTAGAAATCGACGCCGAGAT
TCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTACGACGACGTTTC
GGTGACAGACATCAGTCTTGTTGACTACATCGGAGTCCAGGCAGCTAAACACGCCACCTT
TGTCCCCCACACCGCCGGAAGATACTCTGTAAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCAT
CGTCGAGAGGCTAACAAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAATTGAT
GGCTGTGAGAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACCGACGCCAACCC
TATCCAGGTCATCATCGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAAT
TGGATCTGCTGGTGTTGTGAGGAGACAAGCGGTTGATATCTCCCCTCTAAGACGTGTGAA
CCAAGCTATCTTCCTTCTTACCACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGAC
AATTGCCGAGTGCCTTGCTGATGAATTGATCAACGCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTA
TGCCATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGGCCAATCGTTAAGGATGTTC
CTGGTGGTGTCCTGAGTGTTACAATCTTATCAATGAAGTTATTGTTTTCTTTATCGGTAG
ATTGGATGGAATATGTTTAAGATGTTTTACTCTGTTGTTTTATGAAAATTTGATTTCGTC
TAGACTTTTGAAAAGATAAATTTTGAATGCTTAAATGAAGAAATCTAAAGAGTTTGTTTT
TGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RR4BG65TF U 1
AF RR4BG65JQ C 95
BS 1 676 RR4BG65TF
BS 677 677 RR4BG65JQ
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BS 791 867 RR4BG65TF
BS 868 905 RR4BG65JQ

RD RR4BG65TF 867 0 0
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TGTCCCCCACACCGCCGGAAGATACTCTGTAAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCAT
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TATCCAGGTCATCATCGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAAT
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QA 1 867 1 867
DS 

RD RR4BG65JQ 811 0 0
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GGAAGAAACAACGGAAAGAAATTGATGGCTGTGAGAATCATCAAGCACGCCATGGAGATC
ATCCACCTCTTGACCGACGCCAACCCTATCCAGGTCATCATCGATGCCATTGTCAACAGT
GGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAATTGGATCTGCTGGTGTTGTGAGGAGACAAGCGGTT
GATATCTCCCCTCTAAGACGTGTGAACCAAGCTATCTTCCTTCTTACCACCGGTGCTCGT
GAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACAATTGCCGAGTGCCTTGCTGATGAATTGATCAAC
GCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTT
GCCAAGGCCAATCGTTAAGGATGTTCCTGGTGGTGTCCTGAGTGTTACAATCTTATCAAT
GAAGTTATTGTTTTCTTTATCGGTAGATTGGATGGAATATGTTTAAGATGTTTTACTCTG
TTGTTTTATGAAAATTTGATTTCGTCTAGACTTTTGAATAGATAAATTTTGAATGCTTAA
ATGAAGAAATCTAAAGAGTTTGTTTTTGTCG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL7617Contig1 1082 2 6 U
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ACAGTACTTCCTAATGCTGCTTCTGACGATAAGGCGTGCACTTTTGTCGGAACTGCTGCT
TATGTTCCTCCTGAAGTTCTCAACTCTTCTCCCGCAACTTTTGGAAATGATCTCTGGGCT
CTCGGCTGCACTATCTACCAAATGCTTTCAGGGACTTCTCCTTTCAAAGACGCTAGTGAA
TGGCTGATTTTCCAAAGAATTATAGCCAGAGATATTAAGTTCCCAAGTCACTTCTCAGAA
GCAGCAAGAGACCTCATCGACCGGTTGCTGGATACTGATCCAAGCAGAAGACCGGGTGCT
GGATCAGAAGGTTATGCTGCTCTTAAGCGACATCCTTTCTTTATGGGAGTTGACTGGAAG
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TGAGAGGGATGACGCTCATGGTTCTCCATGGAACCCGACTCATATTGGAGATTCTTCAGC
CGCACATAACGATGGGCACAGTGCTCCTTCCACACCTTCTGAATCATCGGGTTCCATAAC
ACGGCTTGCTTCAATAGACTCTTTTGATTCGAGATGGCAACAGTTTCTGGAGCCGGGAGA
ATCGGTCCTGATGATATCAGCAGTGAAGAAGCTTCAGAAAATAACGAGCAAGAAGGTGCA
GCTAATACTAACCAACAAACCCAAGCTAATCTATGTAGACCCATCAAAGCTAGTTGTAAA
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TCACTTCAAGATTTGCACGCCAAAGAAGGTTTTGTCATTTGAAGAGGTGAAACAGAGAGC
TTTGGTGTGGAAAAAAGCAATCGAGACTCTACAGAATCGCTGAGAGAAGCGCTCCTGTTG
GGAAGTACAATGGTTCTGTTGTTTCTACATTTCTTTGTGTTTCTTTTCTTTTAAAGATAT
GAACTGAACAAACTCGATTCATCAGATGTTCTATACCATAGCCGACAAAAGAAATGTTTA
CC


BQ
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10 10 

AF RR4G195TF U 1
AF RR4G195JQ C 492
BS 1 714 RR4G195TF
BS 715 715 RR4G195JQ
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RD RR4G195TF 773 0 0
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ACAGTACTTCCTAATGCTGCTTCTGACGATAAGGCGTGCACTTTTGTCGGAACTGCTGCT
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CTCGGCTGCACTATCTACCAAATGCTTTCAGGGACTTCTCCTTTCAAAGACGCTAGTGAA
TGGCTGATTTTCCAAAGAATTATAGCCAGAGATATTAAGTTCCCAAGTCACTTCTCAGAA
GCAGCAAGAGACCTCATCGACCGGTTGCTGGATACTGATCCAAGCAGAAGACCGGGTGCT
GGATCAGAAGGTTATGCTGCTCTTAAGCGACATCCTTTCTTTATGGGAGTTGACTGGAAG
AATCTAAGGTCTCAGACTCCTCCAAAGCTAGCCCCAGATCCTGCGTCTCATAGCATCTCC
TGAGAGGGATGACGCTCATGGTTCTCCATGGAACCCGACTCATATTGGAGATTCTTCAGC
CGCACATAACGATGGGCACAGTGCTCCTTCCACACCTTCTGAATCATCGGGTTCCATAAC
ACGGCTTGCTTCAATAGACTCTTTTGATTCGAGATGGCAACAGTTTCTGGAGCCGGGAGA
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GCTAATACTAACCAACAAACCCAAGCTAATCTATGTAGACC*ATCAAAGCTAG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4G195JQ 591 0 0
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CAATAGACTCTTTTGATTCGAGATGGCAACAGTTTCTGGAGCCGGGAGAATCGGTCCTGA
TGATATCAGCAGTGAAGAAGCTTCAGAAAATAACGAGCAAGAAGGTGCAGCTAATACTAA
CCAACAAACCCAAGCTAATCTATGTAGACCCATCAAAGCTAGTTGTAAAAGGGAACATCA
TCTGGTCTGATAACTCGAATGACCTCAACGTTGTAGTCACTAGCCCTTCTCACTTCAAGA
TTTGCACGCCAAAGAAGGTTTTGTCATTTGAAGAGGTGAAACAGAGAGCTTTGGTGTGGA
AAAAAGCAATCGAGACTCTACAGAATCGCTGAGAGAAGCGCTCCTGTTGGGAAGTACAAT
GGTTCTGTTGTTTCTACATTTCTTTGTGTTTCTTTTCTTTTAAAGATATGAACTGAACAA
ACTCGATTCATCAGATGTTCTATACCATAGCCGACAAAAGAAATGTTTACC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL7618Contig1 1022 2 16 U
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TGCCGTTGCTGCTGCCCCCGAGAATAGTAATAAGAGGTATGTAATACATATTAAAGCAGG
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CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

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AF RR4CS63JQ C 151
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DS 

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CAGAG
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TCTTTACGTTCACTCCAACCGTCGGTTCTTTGTCAAATGCCTCATTGCCGGAACCGTCGA
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AAACTCCGGCCAGAAAAACATGGTCACGGCCCAAGGACGGACAGACCCTAACCAAAACAC
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TTATGAATAAATCAAAATATCTACTCG

QA 6 872 6 872
DS 



AS 1 2

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GATGTTGTAGTGAACCAATAACTGTTACATTTCCAAGCTTGCTGAATGGATTTGGGAATG
ACACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4GA49TF U 1
AF RR4GA49JQ C 267
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BS 666 1025 RR4GA49JQ

RD RR4GA49TF 665 0 0
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TTCAATCCCATTAAATCCCTTCTTCATGATGTGTCTTTAAGCGTTGATTGGATCTGAGAG
GCTGTATGGGTTCCGTATAAATATGCGTAAGATTTCTCCTACTCGGTGGCTTAAAAGTCA
GATTTTTTTTGCAGTTTTTAATTCCAAGTGTCTCCCTGCAAATTTGATATTTTCTCAATT
TATTAAAGATGGGTTCTGAGAAAAGGAAATAACTTTATAAGAGTAGTGGTCTCTACGATC
TTCACCTTTCAAGTGTTTCAATCATCATCGGCATCTCATAAGAGAGGAGAGATACTTAGC
AAAGCAAACGTTAAAAGCTTCACGTTCAACAAACACAGACTTGCAACCAGAAACTTTAGA
TCAAACTGTCTTGGTCACACTGAATCCCGATCAAGAAATGTTAAGAGAAGCGGTGAGCTT
ATGGGTGTCGACATGCTCGGAGCCGTTGTACAACTCAGCTATACTTCGACGGATGTCCTG
ATGATGAAACAACAACGACGTACAATCTAGCCAGTGAAAAAAAAAACAAGAGATTGGCTT
CTCCTCTCGGAGTTCATCAACAGGTTTTGTTCTTCTATTCATTCGTTTGGAATCTTTTTT
TTTTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4GA49JQ 759 0 0
AAATAACTTTATAAGAGTAGTGGTCTCTACGATCTTCACCTTTCAAGTGTTTCAATCATC
ATCGGCATCTCATAAGAGAGGAGAGATACTTAGCAAAGCAAACGTTAAAAGCTTCACGTT
CAACAAACACAGACTTGCAACCAGAAACTTTAGATCAAACTGTCTTGGTCACACTGAATC
CCGATCAAGAAATGTTAAGAGAAGCGGTGAGCTTATGGGTGTCGACATGCTCGGAGCCGT
TGTACAACTCAGCTATACTTCGACGGATGTCCTGATGATGAAACAACAACGACGTACAAT
CTAGCCAGTGAAAAAAAAAACAAGAGATTGGCTTCTCCTCTCGGAGTTCATCAACAGGTT
TTGTTCTTCTATTCATTCGTTTGGAATCTTTTTTTTTTTTTGCTGTTATCTGATCTTCTA
AGCGTTCGTGAAGTAATTCTCATGCCCTGGATTTTTCTCAGTCGTATATTATAGTTTAAG
CATATTTGATCCGTTTTGTTCCTTGCAAGTTATATCAATCAATGGAAATTCAGGCCCTGT
GATTAAAGCTGCCACAAACTACCATGTTGGTGTTAACATTGTTTGGACGAGCCTCTTCTG
TTCACTTGGTGATCATCTTTATGGATGTTTTATCTTCTCTGGTTCTCTATTTTAGTTATG
ATATAGTGTTAATTGCATATTATAGTTTATTTAAGATGTTGTAGTGAACCAATAACTGTT
ACATTTCCAAGCTTGCTGAATGGATTTGGGAATGACACC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7621Contig1 811 2 8 U
GGATCACAAGTTCACACAAACACGCTGCAGACGAAAAGCTCTCTTCTTCTTCACTCACTC
TCTCTCGGAGAAGAATGCCCTAAAAACCCACCGCGAAAGAAGAAGAAGATGGATCGTAAG
GGAAAGGGAAAACAGATCGCCGGAAGTGGATCGTCTTCCGCCGGAAAGAAACGCAAAGGA
GGAGTCGAGTTTAGAGACGAAGGCTTGAGGATCAACAGTAAACGAAAAAAACCAGGAGTT
CTTCAGTTCTTCGAGGAATCCGCCGAGGTTGGTTACTATGGAGGTAGCTCCGACGAAGAC
TGCGACGTCGATGATCTCTTTAACGATATGGAAGATGAACCTGAGCTGGAGACAAGTGGA
AAGGATGACAAGGGGGGAAAGGGAAGCTCTTCGTTTGTGTTTCCTAAAGAGGAGGATATG
AACGAGGATGATTTTGATAGAATGATGGAAGAAAGATACAAACCTGGCTCTGGGTTTGTT
AGATATGCAGCTGATGATGTTAAAAGTTCCATCGAGATGGATGCTCTTGTTCCTACGGCC
CATGATCCTCCGATTTGGAAAATAAAGTGTGCGATTGGACGGGAGAAGCATTCAGTCTTC
TGTCTCATGCACAAATTTGTGGAGCTGCGGAAGATAGGCACTAAGCTACGGATCTTGTCG
GTATTTTTTGTGGAGCATATCAAGGGGTTTATCTTCATTGAAGCTGACAAGGAACAGGAT
GTTCTTGAGGCATGCTTGAGTTTAAACGGCATCTATGCCACTCGGATGGTGCTACTTCCT
AAATCTGAAGCTCCACATCTTCTTACTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN53TF U 1
AF RR4GN53JQ C 38
BS 1 637 RR4GN53TF
BS 638 638 RR4GN53JQ
BS 639 650 RR4GN53TF
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BS 652 668 RR4GN53TF
BS 669 669 RR4GN53JQ
BS 670 680 RR4GN53TF
BS 681 811 RR4GN53JQ

RD RR4GN53TF 680 0 0
GGATCACAAGTTCACACAAACACGCTGCAGACGAAAAGCTCTCTTCTTCTTCACTCACTC
TCTCTCGGAGAAGAATGCCCTAAAAACCCACCGCGAAAGAAGAAGAAGATGGATCGTAAG
GGAAAGGGAAAACAGATCGCCGGAAGTGGATCGTCTTCCGCCGGAAAGAAACGCAAAGGA
GGAGTCGAGTTTAGAGACGAAGGCTTGAGGATCAACAGTAAACGAAAAAAACCAGGAGTT
CTTCAGTTCTTCGAGGAATCCGCCGAGGTTGGTTACTATGGAGGTAGCTCCGACGAAGAC
TGCGACGTCGATGATCTCTTTAACGATATGGAAGATGAACCTGAGCTGGAGACAAGTGGA
AAGGATGACAAGGGGGGAAAGGGAAGCTCTTCGTTTGTGTTTCCTAAAGAGGAGGATATG
AACGAGGATGATTTTGATAGAATGATGGAAGAAAGATACAAACCTGGCTCTGGGTTTGTT
AGATATGCAGCTGATGATGTTAAAAGTTCCATCGAGATGGATGCTCTTGTTCCTACGGCC
CATGATCCTCCGATTTGGAAAATAAAGTGTGCGATTGGACGGGAGAAGCATTCAGTCTTC
TGTCTCATGCACAAATTTGTGGAGCTGCGGAAGATAG*CACTAAGCTACG*ATCTTGTCG
GTATTTTT*GTGGAGCATAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4GN53JQ 774 0 0
GCTCTCTTCTTCTTCACTCACTCTCTCTCGGAGAAGAATGCCCTAAAAACCCACCGCGAA
AGAAGAAGAAGATGGATCGTAAGGGAAAGGGAAAACAGATCGCCGGAAGTGGATCGTCTT
CCGCCGGAAAGAAACGCAAAGGAGGAGTCGAGTTTAGAGACGAAGGCTTGAGGATCAACA
GTAAACGAAAAAAACCAGGAGTTCTTCAGTTCTTCGAGGAATCCGCCGAGGTTGGTTACT
ATGGAGGTAGCTCCGACGAAGACTGCGACGTCGATGATCTCTTTAACGATATGGAAGATG
AACCTGAGCTGGAGACAAGTGGAAAGGATGACAAGGGGGGAAAGGGAAGCTCTTCGTTTG
TGTTTCCTAAAGAGGAGGATATGAACGAGGATGATTTTGATAGAATGATGGAAGAAAGAT
ACAAACCTGGCTCTGGGTTTGTTAGATATGCAGCTGATGATGTTAAAAGTTCCATCGAGA
TGGATGCTCTTGTTCCTACGGCCCATGATCCTCCGATTTGGAAAATAAAGTGTGCGATTG
GACGGGAGAAGCATTCAGTCTTCTGTCTCATGCACAAATTTGTGGAGCTGCGGAAGATAG
GCACTAAGCTACGGATCTTGTCGGTATTTTTTGTGGAGCATATCAAGGGGTTTATCTTCA
TTGAAGCTGACAAGGAACAGGATGTTCTTGAGGCATGCTTGAGTTTAAACGGCATCTATG
CCACTCGGATGGTGCTACTTCCTAAATCTGAAGCTCCACATCTTCTTACTGTGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7622Contig1 822 2 2 U
GGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGG
ATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGG
AGCCTGAGAAACGGCTACGATGATTGATGTGGATGCTATTGAAGATGATGTTATCGAATC
ATCCGCAAGTGCTTTTGCTGAAGCTAAGAGCAAATCAACAGGTGCACGTCGGAGGTCGTT
GATGGTTGATGTAGAGTCAGGTGGTTTGACGAGATTGTCTGCCAACAAACGCAGAAGGAT
TCCTCCTAACCAACCTGTCATCGACTGTGAGCATGTCTCTGTAGATGTGAGAGAGTCTAG
CCCAAAGCCTCCACCACCACCACCAGAGGAGCCAAAGTTTTCTTGTCCGATTTGTATGTG
CCCGTTCACCGAGGAGACGTCAACCAAATGCGGTCACATCTTCTGCAAGGGATGTATAAA
GACGGCAATATCTCGCCAAGCCAAATGCCCTACTTGTAGGAAAAGGGTGACTGTTAAAGA
GCTGATTCGCGTATTCCTTCCAACCACCAGATGAATATACATCAAAGTCACCAGTCACCT
TGTCTAACAGCTCTATCCTCGAATTCGCCTTGGAACATATGGAGGGACTTCAGTGACTTG
GTGTTTTAGTTCGAATGTTTCACTTTATTGGAAGAGAAATATTCATTGTTTAAGAAGGCC
CTATCATTTAATGGATATCATTGGTAATATTGGATTTGTTCTGTTTCCTAGTTGTTGTTT
ATGTAATTTAGGTACCTGCAAACATTTCAGACGATGCCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DE70TF U 1
AF RR4DE70JQ C 283
BS 1 685 RR4DE70TF
BS 686 822 RR4DE70JQ

RD RR4DE70TF 685 0 0
GGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGG
ATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGG
AGCCTGAGAAACGGCTACGATGATTGATGTGGATGCTATTGAAGATGATGTTATCGAATC
ATCCGCAAGTGCTTTTGCTGAAGCTAAGAGCAAATCAACAGGTGCACGTCGGAGGTCGTT
GATGGTTGATGTAGAGTCAGGTGGTTTGACGAGATTGTCTGCCAACAAACGCAGAAGGAT
TCCTCCTAACCAACCTGTCATCGACTGTGAGCATGTCTCTGTAGATGTGAGAGAGTCTAG
CCCAAAGCCTCCACCACCACCACCAGAGGAGCCAAAGTTTTCTTGTCCGATTTGTATGTG
CCCGTTCACCGAGGAGACGTCAACCAAATGCGGTCACATCTTCTGCAAGGGATGTATAAA
GACGGCAATATCTCGCCAAGCCAAATGCCCTACTTGTAGGAAAAGGGTGACTGTTAAAGA
GCTGATTCGCGTATTCCTTCCAACCACCAGATGAATATACATCAAAGTCACCAGTCACCT
TGTCTAACAGCTCTATCCTCGAATTCGCCTTGGAACATATGGAGGGACTTCAGTGACTTG
GTGTTTTAGTTCGAATGTTTCACTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4DE70JQ 540 0 0
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AGATGTGAGAGAGTCTAGCCCAAAGCCTCCACCACCACCACCAGAGGAGCCAAAGTTTTC
TTGTCCGATTTGTATGTGCCCGTTCACCGAGGAGACGTCAACCAAATGCGGTCACATCTT
CTGCAAGGGATGTATAAAGACGGCAATATCTCGCCAAGCCAAATGCCCTACTTGTAGGAA
AAGGGTGACTGTTAAAGAGCTGATTCGCGTATTCCTTCCAACCACCAGATGAATATACAT
CAAAGTCACCAGTCACCTTGTCTAACAGCTCTATCCTCGAATTCGCCTTGGAACATATGG
AGGGACTTCAGTGACTTGGTGTTTTAGTTCGAATGTTTCACTTTATTGGAAGAGAAATAT
TCATTGTTTAAGAAGGCCCTATCATTTAATGGATATCATTGGTAATATTGGATTTGTTCT
GTTTCCTAGTTGTTGTTTATGTAATTTAGGTACCTGCAAACATTTCAGACGATGCCTTAC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL7623Contig1 817 2 4 U
TCTTCACACGCTATTTGCATTTACTCTCTCTCTCTCTCTCACTAACAAAAGAATCTTTCT
TTGTCTCTCTCTCACTAACAACGATGGCTCAAGAAGACGTTGCTGCTGCTGCGAATGGTG
CCACGGTGGTGGAGAAGTCCGTTACCTTCACGGCGTACAAGCCTCAGCTGATCGTGGAGG
CACAGAAGGTCGGTGACGCCGTTGCTTTCTACAAGGCGGTGTTCGACGCGACGGAGACTG
GTGGACACTCTCTTTACCCTAAGCGCAAGGCTGACCAAGAGCTCCCTCACGTTGTCTCCG
CTGAGCTCAACCTCGCTGGCACTACCGTCGTTGTTTCCGACGTCTCTGTCCACTCTGGTT
CTAATGCAAAGACGGGGACTGTGTCTGCACTCCTCGAGACCGATGACGTGGAAGCTGCCG
TTTCGAAGGCCGTGGCCGCCGGAGCTGTGAAAGTCGAGGAGGTCTCCGAGGGCGAAGCCG
ACGGTGGAGTGAAGGGAAAAGTGACGGATCCGTTCGGTTTCACCTGGATCTTCGTTTCAC
CGGCGGAGAAGAAGAGTGACGAGGAAGAAAACAAAGAGGTTTAACTGTCGCCGTCGGATC
TGGTCGTTCGTCGGTTTCTGATCTATTGTCCTTTCTTTTTTAAAATGCTTCTGTAGTTTG
TCTTTTGTGGAATCTCCGGTATCAGTAAACCGGATCGGTTAAACTAATGACTTTTGTTGA
GTTTTGATTTCACCCTTTTGACATAAGACTTGGTGAAATAAAACGGAAATCATCTCGGAT
ATTTAATGCTTTTCTTCATTATGTTTATCTATTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB46TF U 1
AF RR4GB46JQ C 28
BS 1 644 RR4GB46TF
BS 645 645 RR4GB46JQ
BS 646 674 RR4GB46TF
BS 675 817 RR4GB46JQ

RD RR4GB46TF 674 0 0
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CGGCGGAGAAGAAGAGTGACGAGGAAGAAAACAAAGAGGTTTAACTGTCGCCGTCGGATC
TGGTCGTTCGTCGGTTTCTGATCTATTGTCCTTTCTTTTTTAAA*TGCTTCTGTAGTTTG
TCTTTTGTGGAATC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GB46JQ 790 0 0
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TCACGGCGTACAAGCCTCAGCTGATCGTGGAGGCACAGAAGGTCGGTGACGCCGTTGCTT
TCTACAAGGCGGTGTTCGACGCGACGGAGACTGGTGGACACTCTCTTTACCCTAAGCGCA
AGGCTGACCAAGAGCTCCCTCACGTTGTTTCCGCTGAGCTCAACCTCGCTGGCACTACCG
TCGTTGTTTCCGACGTCTCTGTCCACTCTGGTTCTAATGCAAAGACGGGGACTGTGTCTG
CACTCCTCGAGACCGATGACGTGGAAGCTGCCGTTTCGAAGGCCGTGGCCGCCGGAGCTG
TGAAAGTCGAGGAGGTCTCCGAGGGCGAAGCCGACGGTGGAGTGAAGGGAAAAGTGACGG
ATCCGTTCGGTTTCACCTGGATCTTCGTTTCACCGGCGGAGAAGAAGAGTGACGAGGAAG
AAAACAAAGAGGTTTAACTGTCGCCGTCGGATCTGGTCGTTCGTCGGTTTCTGATCTATT
GTCCTTTCTTTTTTAAAATGCTTCTGTAGTTTGTCTTTTGTGGAATCTCCGGTATCAGTA
AACCGGATCGGTTAAACTAATGACTTTTGTTGAGTTTTGATTTCACCCTTTTGACATAAG
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TCTATTTTGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7625Contig1 686 2 2 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EY67TF U 1
AF RR4EY67JQ C 1
BS 1 658 RR4EY67TF
BS 659 686 RR4EY67JQ

RD RR4EY67TF 658 0 0
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AATCTATTTGGAGGAGCCAAGAGTAGACAGAAGAGCTTTTCCAGACTTGGATGTTTTGGG
TTATTGGAAGGACAATCATCAACGATTTGGTGATTTGGCTGATATGGCGTGTGATTTGCT
CACCATCCCTATTACTACAGTTGCTTCTGAGTCGGCTTTAGCGTTGGAGGTAGAGTTTTG
ACTCCATACCGAAACCGGCTGCTTCCAAAAAATGTTCAAGCTTTGCTCTGCGCACGTAAT
TGGCTTCGAGGATATGCAGAATTTCAAGGTACCACTGAAGATGATGATGGCATTGACCTT
GAAGATGTCAAAAAGACAGCGAGCAGTTCTGGAGTAGAAAGTTCAAGATCAGGAGGTTCA
AACATGCCATGAGAATGAGCATGAGTGTCACAGTGAAGAGAGCATGGGTCATTTGTAGAA
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TTATTTCAAACCCAAGCTTGATGCAAAACTATTTCTATTGAGATTGTGCACTATCTAGTT
CATTTGAGATTTGTTTATTATTGTTGTGTCATGTAGAACTATGAGATACACAGAAAAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4EY67JQ 686 0 0
GATTTTCGAGTTAGAAAGAAGCATAGCAGCTGATGTGGGCAACCCTAAGACACATTTGGA
AATCTATTTGGAGGAGCCAAGAGTAGACAGAAGAGCTTTTCCAGACTTGGATGTTTTGGG
TTATTGGAAGGACAATCATCAACGATTTGGTGATTTGGCTGATATGGCGTGTGATTTGCT
CACCATCCCTATTACTACAGTTGCTTTTGAGTCGGCTTTAGCGTTGGAGGTAGAGTTTTG
ACTCCATACCGAAACCGGCTGCTTCCAAAAAATGTTCAAGCTTTGCTTTGCGCACGTAAT
TGGCTTCGAGGATATGCAGAATTTCAAGGTACCACTGAAGATGATGATGGCATTGACCTT
GAAGATGTCAAAAAGACAGCGAGCAGTTTTGGAGTAGAAAGTTCAAGATCAGGAGGTTCA
AACATGCCATGAGAATGAGCATGAGTGTCACAGTGAAGAGAGCATGGGTCATTTGTAGAA
GGACTGATGGAGAAGGGGTCACTTGTTTGATGCAAAACTGTTTTGTTGTTTTTGATGTTT
TTATTTCAAACCCAAGCTTGATGCAAAACTATTTTTATTGAGATTGTGCACTATTTAGTT
CATTTGAGATTTGTTTATTATTGTTGTGTCATGTAGAACTATGAGATACACAGAAAAAAC
TCAAAAAATTAGTCATTTTAAGCAGG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL7626Contig1 804 2 3 U
TTGTCCACATACAAATATTTAATAGGCAAGGCATAAAGAGTAGTATCATATAGCACAAGT
TGATTTCGCTTTTAGAGTTTTATTCATGTGACTAAACATATTTGATTCTTTAGTTTTTTT
TTTTTCATAATTGGTCACACAAGCTGTGATCTCTTTCTCCATTAATATTCCTCCCATTTC
ACAGGATCGTGCAACCCGGTTCCTGATTGTAAACTGGTTCCCCTATGTAACTGTTGGGGT
TGCACGGGTAGGGAAAGGCGGAAGGCACACCGTATCCTTGAGGAGATGGATAACAGGGAG
GAGGAGGACATGGATTAAATGGCGGCGGGCATGGTTTACATGGCGGCGGGCATGGTTTAC
AACATGGCGCGGGCTTCTTCTCATCTTCCTTCTTCTTGTCTCCATCTTTCTTATCGCCAT
CCTTTTTGTCACCATCTTTCTTGTCACCATCTTTTTTGTCACCGTCCTTTTTGTCCCCAT
CCTTCTTCTCATCTGGTTTCTTTGGAGGTTCGACTTTGCTTACGCTTACAAGCTCTGCAA
AGGCTACCTTCTTTCTCAGCCTTTTGGTGAGGCCGATCATATCAACTTCAGTACCGGTCA
CCTCTATCTGGTTCCTATGATCGCCTTTTATCTCCACGGCTGACACACCTTTAAACTGAA
CTGCTTTGGTCATAGCTTTTGCTCGGGTCTTGTCATCAGTCATAGTCACTCTAAACAAGA
TCTTTTGCTTCATCTTCTTGCTTGCTTGAAGAGGATTGACTACAAGTCTTGAGTTTTGGA
TCTTGTAGAATACTACAAGTCTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A832JQ U 3
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DS 



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AF RR4BJ55JQ C 1
AF RR4BJ55TF U 1
BS 1 648 RR4BJ55TF

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CCCAATTGCTCTTGAGGTTCTTGTCGCCTGTGGAAAGACTCCACCGCCTGGCTTCAAATG
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TGTGAAACGGTAACTTTTTCTAAATATTAAACAAGTTTGTATCTGCGG

QA 1 648 1 648
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AS 1 2

CO CL7628Contig1 917 2 14 U
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ61TF U 1
AF RR4CQ61JQ C 164
BS 1 733 RR4CQ61TF
BS 734 734 RR4CQ61JQ
BS 735 753 RR4CQ61TF
BS 754 754 RR4CQ61JQ
BS 755 780 RR4CQ61TF
BS 781 781 RR4CQ61JQ
BS 782 796 RR4CQ61TF
BS 797 797 RR4CQ61JQ
BS 798 803 RR4CQ61TF
BS 804 804 RR4CQ61JQ
BS 805 824 RR4CQ61TF
BS 825 825 RR4CQ61JQ
BS 826 842 RR4CQ61TF
BS 843 917 RR4CQ61JQ

RD RR4CQ61TF 842 0 0
GGGCTTGAGGAGGTGGCTGAAATGGGCTACGACCCACTTGGTGAAAATCCAGCAGGCGAG
ATCTGTATAAGAGGAAAATGCCTGTTTTCTGGTTATTACAAGAATCCCGAGCTTACTCAA
GAAGTCATGAAAGACGGATGGTTCCATACAGGAGATATTGGTGAGATTCAATCAAATGGA
GTACTTAAGATAATTGATCGTAAAAAGAATCTTATCAAACTCTCTCAAGGAGAATACGTT
GCTCTTGAGAACTTGGAAAATATCTACGGTCAAAACTCTCTTGTCCAAGATATATGGGTT
TATGGAGACAGCTTCAAATCGATGCTTGTCGCGGTGATTGTTCCAAACCAAGAAACCGTT
AAACGTTGGGCTAAAGAACTTGGTTTTACTAAACCATTCGAAGAACTATGTTCTCTCTCT
GAGTTACAAGAGCACATCATTTCAGAACTGAAGTCCACGGCAGAGAAGAACAAGCTAAGA
AAGTTTGAGTACATCAAAGCAGTGACGGTGGAGACAAAACCTTTCGATGTAGCAAGAGAC
TTAGTGACTGCAACGCTCAAAAACCGGAGGAACAACCTGCTCAAGTATTATCAGGTACAC
GTCGACGAGATGTACCGAAAATTGGCGTCAAAGAAAATCTGAAAGTGTTGCGATGAGGTG
TGTGCGCTACTATTGATAATTATGTTATATATAATACCAATAATTGATAGACATGAGCCT
TATGGTTTCTGTA*TGAAGATAAAGATGAGAAA*CTCCTATCTTCGTTTGATACAGTTTA
*TACGTCATGCATGTA*GTTGTA*CAAGGGTAGTTGATGAAGCA*CTTATTCATAAGAGT
CT

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR4CQ61JQ 754 0 0
AGATTCAATCAAATGGAGTACTTAAGATAATTGATCGTAAAAAGAATCTTATCAAACTCT
CTCAAGGAGAATACGTTGCTCTTGAGAACTTGGAAAATATCTACGGTCAAAACTCTCTTG
TCCAAGATATATGGGTTTATGGAGACAGCTTCAAATCGATGCTTGTCGCGGTGATTGTTC
CAAACCAAGAAACCGTTAAACGTTGGGCTAAAGAACTTGGTTTTACTAAACCATTCGAAG
AACTATGTTCTCTTTCTGAGTTACAAGAGCACATCATTTCAGAACTGAAGTCCACGGCAG
AGAAGAACAAGCTAAGAAAGTTTGAGTACATCAAAGCAGTGACGGTGGAGACAAAACCTT
TCGATGTAGCAAGAGACTTAGTGACTGCAACGCTCAAAAACCGGAGGAACAACCTGCTCA
AGTATTATCAGGTACACGTCGACGAGATGTACCGAAAATTGGCGTCAAAGAAAATCTGAA
AGTGTTGCGATGAGGTGTGTGCGCTACTATTGATAATTATGTTATATATAATACCAATAA
TTGATAGACATGAGCCTTATGGTTTCTGTAATGAAGATAAAGATGAGAAAACTCCTATCT
TCGTTTGATACAGTTTAATACGTCATGCATGTAAGTTGTAACAAGGGTAGTTGATGAAGC
AACTTATTCATAAGAGTCTATGGTAGTACACATTTGGTTCACTTTGTTAATGAACGTAAA
AGGAAGGGTTAAGGTATTAACAAGTTAACTAGAC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL7629Contig1 977 2 6 U
GGACAGCGACGCTTTTCCTGTTGTTCTATCGCAGCCGTTCGTCGCTACCGACCTTCGTTC
TCCGATAGAGAAGTTGAAGCTTGTTTCAATGATGGGAGGAGCTACACTCCGTCACCACCG
AGTGGTTAGAGGTCGTAGTGTGGACCTCCCGACTAGTCTTTTGGTTCGCAATCTACGCCA
TAAACCAAAATTAGCCTCCATTTTATTTCATAGCTTTCTATGGGATAAAGATCTTCATTT
GACGGATCCTGCTGATGCAAAGTATCAGATGGATGGTTATCAACTACGTGGGGGTGAGCT
GACTGTTGTGTTTGCAGAAGAGAAACCGAGCAAGGGAGCGTGGTGGAGGAAGGAGCATAT
CAGCTCTCGAGAAAGGAGGCGTAGTCCACCTCGTTACTACTCTCGCTCTCCTCCCCCCCT
CGACGTGGTGATTATTATTCTCCTCCCTCTAGAAGACATCACTCAAGGTCTATCTCTCAC
AGGGAAGAACGATATGATATGGGGAGGTCATACTCACGATCACTCGCCTACATTGCCTCC
AGGGGTCGCAGTGTAACTCCAGCCTAAGAGCCGCAGTATAATTAAGCCGCAGCCCGAGTC
CAAGAAGAAGCCTTAGCCCTAGTCGAGAAGAAACATAAGCAGGAGCAACACACCTGTACC
AGCCAGAAACCGGGTCTCGAGCCCTAGGAGCAGCAACACACCTTTACCAGCCAGAGGCCG
CAGCCCGCCTGAGGAGCAGTACGAAGACCGTTCACTAAGCCAGTGATTGGTTATTCACTC
TCTTAATAGTCTTTTCTCTAGTTGGCTGTTCTGTCTCATTTTTTCTTATCTAAGACAAAG
TTAATTATAATGATCTGAAAAGATGAGATCTATGCAGGGATCGAATCTTGGCTTTTTATG
TCTATGGTCTATGGAGTATTTTGGGAGCCCTTAGCGTTACTGTGCGTCTCATTAAGATGA
TATGTGAGTTATTATGG


BQ
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AF RR4E083TF U 1
AF RR4E083JQ C 256
BS 1 642 RR4E083TF
BS 643 643 RR4E083JQ
BS 644 687 RR4E083TF
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BS 689 707 RR4E083TF
BS 708 977 RR4E083JQ

RD RR4E083TF 707 0 0
GGACAGCGACGCTTTTCCTGTTGTTCTATCGCAGCCGTTCGTCGCTACCGACCTTCGTTC
TCCGATAGAGAAGTTGAAGCTTGTTTCAATGATGGGAGGAGCTACACTCCGTCACCACCG
AGTGGTTAGAGGTCGTAGTGTGGACCTCCCGACTAGTCTTTTGGTTCGCAATCTACGCCA
TAAACCAAAATTAGCCTCCATTTTATTTCATAGCTTTCTATGGGATAAAGATCTTCATTT
GACGGATCCTGCTGATGCAAAGTATCAGATGGATGGTTATCAACTACGTGGGGGTGAGCT
GACTGTTGTGTTTGCAGAAGAGAAACCGAGCAAGGGAGCGTGGTGGAGGAAGGAGCATAT
CAGCTCTCGAGAAAGGAGGCGTAGTCCACCTCGTTACTACTCTCGCTCTCCTCCCCCCCT
CGACGTGGTGATTATTATTCTCCTCCCTCTAGAAGACATCACTCAAGGTCTATCTCTCAC
AGGGAAGAACGATATGATATGGGGAGGTCATACTCACGATCACTCGCCTACATTGCCTCC
AGGGGTCGCAGTGTAACTCCAGCCTAAGAGCCGCAGTATAATTAAGCCGCAGCCCGAGTC
CAAGAAGAAGCCTTAGCCCTAGTCGAGAAGAAACATAAGCAG*AGCAACACACCTGTACC
AGCCAGAAACCGGGTCTCGAGCCCTAG*AGCAGCAACACACCTTTAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4E083JQ 722 0 0
TGCAAAGTATCAGATGGATGGTTATCAACTACGTGGGGGTGAGCTGACTGTTGTGTTTGC
AGAAGAGAAACCGAGCAAGGGAGCGTGGTGGAGGAAGGAGCATATCAGCTCTCGAGAAAG
GAGGCGTAGTCCACCTCGTTACTACTCTCGCTCTCCTCCCCCCCTCGACGTGGTGATTAT
TATTCTCCTCCCTCTAGAAGACATCACTCAAGGTCTATCTCTCACAGGGAAGAACGATAT
GATATGGGGAGGTCATACTCACGATCACTCGCCTACATTGCCTCCAGGGGTCGCAGTGTA
ACTCCAGCCTAAGAGCCGCAGTATAATTAAGCCGCAGCCCGAGTCCAAGAAGAAGCCTTA
GCCCTAGTCGAGAAGAAACATAAGCAGGAGCAACACACCTGTACCAGCCAGAAACCGGGT
CTCGAGCCCTAGGAGCAGCAACACACCTTTACCAGCCAGAGGCCGCAGCCCGCCTGAGGA
GCAGTACGAAGACCGTTCACTAAGCCAGTGATTGGTTATTCACTCTCTTAATAGTCTTTT
CTCTAGTTGGCTGTTCTGTCTCATTTTTTCTTATCTAAGACAAAGTTAATTATAATGATC
TGAAAAGATGAGATCTATGCAGGGATCGAATCTTGGCTTTTTATGTCTATGGTCTATGGA
GTATTTTGGGAGCCCTTAGCGTTACTGTGCGTCTCATTAAGATGATATGTGAGTTATTAT
GG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7630Contig1 1422 2 2 U
GGATATTATCTCTCTGTCATTACACATTAAAGAGAATCTCCTTTCTCTACCAAAATAACT
TTGAAACTCTTCTTGTTCTTTGAAAAAAAGTCAAGGATCATATTATAATTATCCTCAGAG
GTTGGATCTTCTAGTGTGGAGCAATGAGCAGATGCAATAAACGTAACCAGCAACCGACGT
ATATTGCTGATCACTTCAACAGCTTGGATCAGGTGATAACTTCTCTGAGAGAAGCTGGAC
TTGAATCTTCAAATCTGATTTTAGGAATTGACTTCACCAAGAGCAATGAGTGGACAGGAA
GATACTCATTCAATAGAAAAAGCCTTCACGCCATTGGTAAAAGACAGAATCCTTATGAAC
AAGCTATATCCATCATTGGCCGCACTTTGTCTCCCTTTGATGAAGATGATCTTATACCTT
GTTTTGGTTTTGGCGATTCGACAACACGAGATCAGTATGTGTTCAGCTTTTACCCTGACA
ACAAAAGCTGCGAGGGATTGGACAAAGCTGTGAAAAGATACAGAGAGATTGTTCCTCATT
TGAAGCTGTCTGGTCCCACCTCATTTGCACCGGTTATTGATGCGGCCATAGACATAGTTG
AGCAGAACAACATGCAGTACCATGTTCTTGTCATTATAGCAGATGGTCAGGTCACAAGGA
ATCCAGATGTGCCACCTGGCCGGCTTAGTCCACAGGAAGAAGCTACTATGAACTCCATAA
TGGCAGCTAGCCATTATCCCTTGTCTATAGTCTTGGTTGGAGTAGGAGATGGACCATGGG
ACACAATGAAACAATTTGATGACAATATCCCTCACCGAGAATTCGATAACTTTCAGTTTG
TGAACTTCACAGAGATAATGTCACAGCACAAAGATGCAGCTAAGAAGGAGGCTGCTTTTG
CATTAGCAGCTCTCATGGAGATTCCTTTTCAGTACAAAGCCACATTAAGTCTCGATAGAA
AACAAGTGCGTGGTTCTCGTTTGCGTCACAAGCCGCTCCCACCACCACCAGAGGTCTTAG
AGCGTGACAATGCTGTTAGAGCAGTGCCAAATCCAGTTACAGAAACTGCAGAGAAGAGTG
AGAGAACGGCTCCAGTAACACAACCTGTATGTCCGATTTGCTTGACGAAACCGAAGGACA
TGGCTTTTAGCTGCGGTCACACGACGTGCAAGGAATGTGGTGTGGTTGTCAAGACATGTC
CGATGTGCAGACAACCTATAACAACGAGGATAAGGCTGTACACTTGATGATGAAGAGACT
ACATGGTGTAAGCACTTAAGCTTCATGTAGCAAATTGTACAGTCCAAGCAAAAGAATAAA
TAATGGTTACCTAAGAGACTTTGAGCTGTAATGTATATGTATTGCATTAGCTGTGAGGGT
CTCTGCAAAGAACTTTTATAGATTGATGAATAACCGAACTTT


BQ
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AF RR4G812TF U 1
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TTGAATCTTCAAATCTGATTTTAGGAATTGACTTCACCAAGAGCAATGAGTGGACAGGAA
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TGAAGCTGTCTGGTCCCACCTCATTTGCACCGGTTATTGATGCGGCCATAGACATAGTTG
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ATCCAGATGTGCCACCTGGCCGGCTTAGTCCACAGGAAGAAGCTACTATGAACTCCATAA
TGGCA

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CAATGCTGTTAGAGCAGTGCCAAATCCAGTTACAGAAACTGCAGAGAAGAGTGAGAGAAC
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CAGACAACCTATAACAACGAGGATAAGGCTGTACACTTGATGATGAAGAGACTACATGGT
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TACCTAAGAGACTTTGAGCTGTAATGTATATGTATTGCATTAGCTGTGAGGGTCTCTGCA
AAGAACTTTTATAGATTGATGAATAACCGAACTTT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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AAGAGGATCAAGTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGCTAGGGGAGCCAAAGCCA
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TGGTTCAAATAACGCAAAAGGCTATAGTTATGTTTGAAGCCTATAGCATCAAAACTGAGT
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BQ
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AF RR4FF28TF U 1
AF RR4FF28JQ C 57
BS 1 680 RR4FF28TF
BS 681 681 RR4FF28JQ
BS 682 709 RR4FF28TF
BS 710 768 RR4FF28JQ

RD RR4FF28TF 709 0 0
GGGTGTCTCGTGCTTGTCAAAATCCTTGGAAAATGTTGGGTAGGCTAGCTGCGAAGCGTT
CTGGAGATCCGTCAAGTTTTCCGTCAACCACCGTCTCAGGCGTCTCGCAGCTTTTCAACA
GCATTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAACCGGATCTTCCATGGGAGTTTTCA
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TCTGCAGTGATCCCTCTTCTTGATCTTGCTCAACAACAGCATGGCGGCTGGCTCCCTGTT
TCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTTACAAAAGATGGTTTGTTCTCTGTT
GGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGATCACTGTGGCTGATTAT
TCCAGCGGATCAGAGGGATATACATACAACTATTTCGAAGACGTTACTCCTGAGAAAGTT
GTAGAGATCGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAAACTCA
AAGAGGATCAAGTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGCTAGGGGAGCCAAAGCCA
CCGCAGTTCCGTGATCTTGACTCTTGCTAAGCTAAGTTCTTTAAGCCCGGTGGGTTTATG
TGGTTCAAATAACGCAAAAG*CTATAGTTATGTTTGAAGCCTATAGCAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4FF28JQ 712 0 0
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AACAGCATTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAACCGGATCTTCCATGGGAGTT
TTCAGAAGCCAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACTCTCTTACTATCCATCAAACTACAA
GCAGTCTGCAGTGATCCCTCTTCTTGATCTTGCTCAACAACAGCATGGCGGCTGGCTCCC
TGTTTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTTACAAAAGATGGTTTGTTCTC
TGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGATCACTGTGGCTGA
TTATTCCAGCGGATCAGAGGGATATACATACAACTATTTCGAAGACGTTACTCCTGAGAA
AGTTGTAGAGATCGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAAA
CTCAAAGAGGATCAAGTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGCTAGGGGAGCCAAA
GCCACCGCAGTTCCGTGATCTTGACTCTTGCTAAGCTAAGTTCTTTAAGCCCGGTGGGTT
TATGTGGTTCAAATAACGCAAAAGGCTATAGTTATGTTTGAAGCCTATAGCATCAAAACT
GAGTTTGCATACTCTTTGTAGTCTTCTTGATTTGAAATTTAGACTCCATTTT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL7632Contig1 831 2 2 U
GCTTAGTTAGTAAATTGAACCTCTTGTCTGCTCTCGTACAGATCCGTGCTTGAAATCTTC
CCTCTCATCGTCCTTCTCCTCGTCTGATCTCTTTTCTCTTTTTGCAATAGAAGATGGCTA
GTGAGAAGGGAGAAATCAGCATCGTATGCAGCCACTGTGAGAGAGACATTCCATCACCAA
ACATGGATCTGCATCGTGCACATTGTGCTCGGAATCTAGAAAAATGTAACATCTGTGGTG
ATATGGTTCCCAAAAAACATGCCGAGGAACACTTCTTGAACACACATGCTCCGGTACCAT
GCTCGATGTGCAAAGAGACCATAGAACGTGACGTTTACGATACTCATATAGGAGAAACTT
GCCCCAAGAGGACTGTAGCATGCGAGTTCTGTGATTTTCCCTTGCCTGCACTTGATCTCC
CTGATCATCAGGAAGTATGTGGCAACCGCACGGAGCTCTGTTATCAATGCAACAGCTACG
TTAGATTGCGAGAAACATTTAACCATGTCACCAAATGCCCTGGTTCTTCTGAATCATCAT
CCAGAAGGAACACAAGAGCAGGAGCACAAGGAGATGGAAACGGGAGGAGGCGGAGAGATG
TGAACGGTGTTGCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACTGTAGCAGTAACGGGAATAGCTGTCT
TAATGGGATCGCTCTTCTTCCAGAGGAAGCCTTAGGATGAGACATAGCTCCTGTGTTAGT
TCTGTAAATTTGCGCAAAAATACTTCAGAGAGATTTTACATTTTAATGCTTACTGAGACA
GAGACTTGTCCCCCCGCAGAAGATTTGATGATTACCATGACACTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ61TF U 1
AF RR4AQ61JQ C 213
BS 1 690 RR4AQ61TF
BS 691 831 RR4AQ61JQ

RD RR4AQ61TF 690 0 0
GCTTAGTTAGTAAATTGAACCTCTTGTCTGCTCTCGTACAGATCCGTGCTTGAAATCTTC
CCTCTCATCGTCCTTCTCCTCGTCTGATCTCTTTTCTCTTTTTGCAATAGAAGATGGCTA
GTGAGAAGGGAGAAATCAGCATCGTATGCAGCCACTGTGAGAGAGACATTCCATCACCAA
ACATGGATCTGCATCGTGCACATTGTGCTCGGAATCTAGAAAAATGTAACATCTGTGGTG
ATATGGTTCCCAAAAAACATGCCGAGGAACACTTCTTGAACACACATGCTCCGGTACCAT
GCTCGATGTGCAAAGAGACCATAGAACGTGACGTTTACGATACTCATATAGGAGAAACTT
GCCCCAAGAGGACTGTAGCATGCGAGTTCTGTGATTTTCCCTTGCCTGCACTTGATCTCC
CTGATCATCAGGAAGTATGTGGCAACCGCACGGAGCTCTGTTATCAATGCAACAGCTACG
TTAGATTGCGAGAAACATTTAACCATGTCACCAAATGCCCTGGTTCTTCTGAATCATCAT
CCAGAAGGAACACAAGAGCAGGAGCACAAGGAGATGGAAACGGGAGGAGGCGGAGAGATG
TGAACGGTGTTGCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACTGTAGCAGTAACGGGAATAGCTGTCT
TAATGGGATCGCTCTTCTTCCAGAGGAAGC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4AQ61JQ 619 0 0
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GTTTACGATACTCATATAGGAGAAACTTGCCCCAAGAGGACTGTAGCATGCGAGTTTTGT
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AAATGCCCTGGTTTTTTTGAATCATCATCCAGAAGGAACACAAGAGCAGGAGCACAAGGG
GATGGAAACGGGAGGGGGGGGAGAGATGTGAACGGTGTTGCTAACAAAAGGCTTTTTTTC
ACTGTAGCAGTAACGGGAATAGCTGTTTTAATGGGATCGCTTTTTTTCCAGAGGAAGCCT
TAGGATGAGACATAGCTCCTGTGTTAGTTCTGTAAATTTGCGCAAAAATACTTCAGAGAG
ATTTTACATTTTAATGCTTACTGAGACAGAGACTTGTCCCCCCGCAGAAGATTTGATGAT
TACCATGACACTTTTTTTT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL7633Contig1 792 2 2 U
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GATGAAACATGGTTCTCTAATCCTGAGATATGCCAAGCCTCAAAGATGTGGTATGGTCTA
TCCAAGACCTTGGCGGAAGATGCTGCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTAGACATT
GTTACTATTAACCCTGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTCAACACTAGT
GCTGCTGCTATACTAAACTTAATAAATGGTGCAAAAACATTCCCCAACGCTAGTTTCGGA
TGGGTTAACGTAAAGGACGTAGCCAATGCGCACATCCAAGCATATGAGGACCCTTCAGCT
AATGGACGTTATTGTATGGTCGAGAGTGTTGTTCACCTCTCCGAGATTGTTAACATTTTG
CGTGAGCTTTACCCAAATCTCCCACTCCCTGAAAGGTGTGTAGATGAGAATCCGTATGTC
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AAGGTTAGCATCAAGGAGACCGTCGAGTCCTTGAAGGGGAAAGGCTTCATACACTTCTGA
GAAAGCATTTGAGCCCACGGTTTTAAACAAGATTTGATAAAGTATTTGGAACAAGTCATC
TTTCTTTCAAGGTGATGTTTCAATATTGAAAACAATGTCAGAAAATTTAAGATAACATCT
TCATATCGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC32TF U 1
AF RR4EC32JQ C 280
BS 1 641 RR4EC32TF
BS 642 792 RR4EC32JQ

RD RR4EC32TF 641 0 0
GGAACACTTAACGTTTTGAACTCGTCCACCAAAGCATCTTCTGTTAAAAGAGTTGTTGTG
ACTTCCTCCATGGCAGCCGTTTCTTTCAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTAACCATA
GATGAAACATGGTTCTCTAATCCTGAGATATGCCAAGCCTCAAAGATGTGGTATGGTCTA
TCCAAGACCTTGGCGGAAGATGCTGCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTAGACATT
GTTACTATTAACCCTGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTCAACACTAGT
GCTGCTGCTATACTAAACTTAATAAATGGTGCAAAAACATTCCCCAACGCTAGTTTCGGA
TGGGTTAACGTAAAGGACGTAGCCAATGCGCACATCCAAGCATATGAGGACCCTTCAGCT
AATGGACGTTATTGTATGGTCGAGAGTGTTGTTCACCTCTCCGAGATTGTTAACATTTTG
CGTGAGCTTTACCCAAATCTCCCACTCCCTGAAAGGTGTGTAGATGAGAATCCGTATGTC
CCGACGTTTGAAGTGTCCAAGGAGAAAACGAGGAGCCTTGGCATAGACTACATACCCTTG
AAGGTTAGCATCAAGGAGACCGTCGAGTCCTTGAAGGGGAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4EC32JQ 513 0 0
CAGCCAACTCTCAACACTAGTGCTGCTGCTATACTAAACTTAATAAATGGTGCAAAAACA
TTCCCCAACGCTAGTTTCGGATGGGTTAACGTAAAGGACGTAGCCAATGCGCACATCCAA
GCATATGAGGACCCTTCAGCTAATGGACGTTATTGTATGGTCGAGAGTGTTGTTCACCTC
TCCGAGATTGTTAACATTTTGCGTGAGCTTTACCCAAATCTCCCACTCCCTGAAAGGTGT
GTAGATGAGAATCCGTATGTCCCGACGTTTGAAGTGTCCAAGGAGAAAACGAGGAGCCTT
GGCATAGACTACATACCCTTGAAGGTTAGCATCAAGGAGACCGTCGAGTCCTTGAAGGGG
AAAGGCTTCATACACTTCTGAGAAAGCATTTGAGCCCACGGTTTTAAACAAGATTTGATA
AAGTATTTGGAACAAGTCATCTTTCTTTCAAGGTGATGTTTCAATATTGAAAACAATGTC
AGAAAATTTAAGATAACATCTTCATATCGATCT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL7634Contig1 648 2 1 U
GTATTGCTTTCCAAACAAGTTTGAAGACTGCACATTTGAGTGGCTATACTGGCCTCAAGC
AAAAGAGCCATACTCTTCAGAGACACTTGAATACATTAAAACCTTGGACGCTGAGCAAAA
TATTGAGCTTCTTAGATTCCACGGTTGGGAGATTCCGTCTTCATGCGCCCGTGTCTTCCG
CATCTCGACAATGCTTCTCAAGAAAGGTGCTGCGAAGGGTCTCACACCTTTTGCCATCGG
AAGCATAATGTGCAGAGAAACACTCGAGAAAGAATCTGTGATCGAACGAATCATCTGTGA
TGCTGAAGCAATGGTGTCCCCAGAGACGACCGAAGAGGAGTTTATAAGCACAGTCTCTGC
TATTATGGATCGATGCCTCGACCAGTATTCTCTGAACTGAAAATATCACAACCCCAAGAT
TCCACTCATGACTGTATATTCGGTGTCCATAACAATAAATAAGCGTCACGCTCTTTGGAC
TCAATCTTAGCTTTTGGAAACAGTGATTTGGTAATGATGATTGGGTTTATAGAATCGTCA
TGCTTCTGTGGTTTGTTGGGTTTGATAACCTTCATGTGTTACTTATTTCAGTTCTGGATG
ATGAACAAGTCTTTTACATATAAATATATTATACTACGGTTTCAAAAC


BQ
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CTTCATATCC


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AF RR4BI89TF U 1
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AAGAGGCAGAGTTTGATGCAGAAGGGCGGCTTATCATTTACGAAGGAGAGAGAGCTAAAA
GGAAGGAAGTTTCCGATGCAGATTCGGATGCCAAGAGCAGCAGGTTCTCTGTGAACTCGT
GGAGGAAGAACCAAAAGAGGTTAAAGACATCAGAGTCTGGATACGCCTACACAGGGAAAG
AGTATGCAAGCAAAAAGGCGAGTGGGGATCTTAAGAGGAAAGACAAGCTTGAACCGTATG
CGTATTGGCCACTTGATCGTAAGATGATGAGCCGCAGACCAGATCAGAGGGCGGTTGCAG
TCAGAGGTATGTTTAGTGTGGTTAAGCTCACAAAGAGGTTGGAAGGCAAGAGCGCTGCGG
AAGCGCTTGCAACCACTAAGGTAAAAAATTACAAGAAGAGTAGTCGGAAGAAATCGGCTG
GGAAGAAGAAAAGCAAGTAAACAAGTGGCAAGTAAGCTTCTCGCAATGTTTTAAGATATA
AGAGAAGTTATAGTTAATTCAAAACCACATTTTTGACTTAGACTTTAGATACCCTTTTGT
TCATTTTTTTACTTGTAAACAGATCTTGAACTTCTTTTTTTTCAAAGTTAAACTTCATAT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL7636Contig1 784 2 2 U
GACAGTTCCATCAAGAAAGCTGTGCAATACATAGAGAACATACAGATGCTTGATGGTTCA
TGGTATGGAAGCTGGGGAGTTTGCTTCACATACAGTACTTGGTTTGCTTTGGGAGGCCCC
GCAGCTGCTGGAAAGACGTATAGTAACTGTTTGGCTATGCGTAAGGGAGTTCACTTCCTT
CTCACAATTCAGAAAGATAATGGAGGTTGGGGTGAAAGCTACTTGTCATGCTCCAAAAAG
AGATACATTCCAAGTGAAGGGGAGAAAACAAACTTGGTGCAAACCTCTTGGGCAATGATG
GGTCTACTTCATGCAGGACAGGCTGAGAGAGATCCTACTCCTCTTCACCGAGCTGCAAAA
CTCTTAATCAATTCCCAACTAGAGAATGGTGATTTTCCTCAGCAGGAGATAACTGGAGCT
TTCATGAAGACCTGCTTGTTACACTATGCAGCTTACAGAAACATCTTCCCAGTGTGGGCG
CTCGCAGAGTATAGTAGACTAGTTCCATTGCCATATGAAAAACCTTGAAAAGAGAGAAGA
TAAGAAGAAGATTCATCAGCATAACTTCTCAAAATTAAAGGGTCACTTATGCTTATAAGC
TATTAATTATATGCAAGTGGTTGGAGTTTTCTACTAAATAAGCAAACTAATTAAGGATCT
TATCTAGATCTATAGTTTATATGTGTACGTATACACATTATTACTATATGTTAATATGTA
TTATATATGTATGTAATGTATACAAAACATTAACCAAATCTCTTGACCAACAAGTAATCT
CTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4H884TF U 1
AF RR4GY88TF U 72
BS 1 714 RR4H884TF
BS 715 784 RR4GY88TF

RD RR4H884TF 714 0 0
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TGGTATGGAAGCTGGGGAGTTTGCTTCACATACAGTACTTGGTTTGCTTTGGGAGGCCCC
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CTCACAATTCAGAAAGATAATGGAGGTTGGGGTGAAAGCTACTTGTCATGCTCCAAAAAG
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TTCATGAAGACCTGCTTGTTACACTATGCAGCTTACAGAAACATCTTCCCAGTGTGGGCG
CTCGCAGAGTATAGTAGACTAGTTCCATTGCCATATGAAAAACCTTGAAAAGAGAGAAGA
TAAGAAGAAGATTCATCAGCATAACTTCTCAAAATTAAAGGGTCACTTATGCTTATAAGC
TATTAATTATATGCAAGTGGTTGGAGTTTTCTACTAAATAAGCAAACTAATTAAGGATCT
TATCTAGATCTATAGTTTATATGTGTACGTATACACATTATTACTATATGTTAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4GY88TF 713 0 0
G
TGGGGAGTTTGCTTCACATACAGTACTTGGTTTGCTTTGGGAGGCCTCGCAGCTGCTGGA
AAGACGTATAGTAACTGTTTGGCTATGCGTAAGGGAGTTCATTTCCTTCTCACAATTCAG
AAAGATAATGGAGGTTGGGGTGAAAGCTACTTGTCATGCTCCAAAAAGAGATACATTCCA
AGTGAAGGGGAGAAAACAAACTTGGTGCAAACCTCTTGGGCAATGATGGGTCTACTTCAT
GCAGGACAGGCTGAGAGAGATCCTACTCCTCTTCACCGAGCTGCAAAACTCTTAATCAAT
TCCCAACTAGAGAATGGTGATTTTCCTCAGCAGGAGATAACTGGAGCTTTCATGAAGACC
TGCTTGTTACACTATGCAGCTTACAGAAACATCTTCCCAGTGTGGGCGCTCGCAGAGTAT
AGTAGACTAGTTCCATTGCCATATGAAAAACCTTGAAAAGAGAGAAGATAAGAAGAAGAT
TCATCAGCATAACTTCTCAAAATTAAAGGGTCACTTATGCTTATAAGCTATTAATTATAT
GCAAGTGGTTGGAGTTTTCTACTAAATAAGCAAACTAATTAAGGATCTTATCTAGATCTA
TAGTTTATATGTGTACGTATACACATTATTACTATATGTTAATATGTATTATATATGTAT
GTAATGTATACAAAACATTAACCAAATCTCTTGACCAACAAGTAATCTCTTC

QA 2 713 2 713
DS 



AS 1 2

CO CL7637Contig1 657 2 2 U
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CATCTCTCACAAGTCACAAGTTATAAACAAAAGACAAAAAATGATGTTTCTTCTTTTTAA
GAATCTTGTCAACAACATCAAACCCATTCTCATTCCTCCCTCTTCAAACTATTATTGCTG
ATCCATGTGACGAAGCAGCTTGATCTCACGGAGAGTCCTCTTAGCATCAATCTTGTTATC
GAAAGCGTTTGCGATTTTCTTAATAGCAACGCTTTCATTCGTTTCAGAGTTCATAGCAGA
GCAAACGATGCCGTAACCACCCTTGCCAATAGGCATGATGGGAGGCTTATACTTAGAGGT
GACCTCGAAGAGGTCCCCGAGTATGCTAAACTGAATAAATCTCCCTCCGTGGCTAAGAGT
CGCCGGAATATTCTCTATCCCCGTCGCCACTTGAGATATTAATGGAGCCGCGGAAGAGCC
TGTAGATTCCAGCATCTCGGTATCATGATCAGCAGGTGGTTGACCCGTGCCACCGTCCAT
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CGTTTTGAGTCAAAGACAGAAATTCATGTCCGGTGTGAAAGGAACAGTCATTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BW75TF C 1
AF RR4BW75JQ U 23
BS 1 22 RR4BW75TF
BS 23 657 RR4BW75JQ

RD RR4BW75TF 657 0 0
GCACAAAAGACTTTTAAAAAAGTAATAGTTTCAGCCCCCACACAATCCCATACAAGCAAG
CATCTCTCACAAGTCACAAGTTATAAACAAAAGACAAAAAATGATGTTTCTTCTTTTTAA
GAATCTTGTCAACAACATCAAACCCATTCTCATTCCTCCCTCTTCAAACTATTATTGCTG
ATCCATGTGACGAAGCAGCTTGATCTCACGGAGAGTCCTCTTAGCATCAATCTTGTTATC
GAAAGCGTTTGCGATTTTCTTAATAGCAACGCTTTCATTCGTTTCAGAGTTCATAGCAGA
GCAAACGATGCCGTAACCACCCTTGCCAATAGGCATGATGGGAGGCTTATACTTAGAGGT
GACCTCGAAGAGGTCCCCGAGTATGCTAAACTGAATAAATCTCCCTCCGTGGCTAAGAGT
CGCCGGAATATTCTCTATCCCCGTCGCCACTTGAGATATTAATGGAGCCGCGGAAGAGCC
TGTAGATTCCAGCATCTCGGTATCATGATCAGCAGGTGGTTGACCCGTGCCACCGTCCAT
GAACGCCGGTGAAGAAGAAGTAGAGGAGGAGAGAGGAAAGTGATATGTTCCTCTTTCGTT
CGTTTTGAGTCAAAGACAGAAATTCATGTCCGGTGTGAAAGGAACAGTCATTTGCCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4BW75JQ 635 0 0
TAATAGTTTCAGCCCCCACACAATCCCATACAAGCAAGCATCTCTCACAAGTCACAAGTT
ATAAACAAAAGACAAAAAATGATGTTTCTTCTTTTTAAGAATCTTGTCAACAACATCAAA
CCCATTCTCATTCCTCCCTCTTCAAACTATTATTGCTGATCCATGTGACGAAGCAGCTTG
ATCTCACGGAGAGTCCTCTTAGCATCAATCTTGTTATCGAAAGCGTTTGCGATTTTCTTA
ATAGCAACGCTTTCATTCGTTTCAGAGTTCATAGCAGAGCAAACGATGCCGTAACCACCC
TTGCCAATAGGCATGATGGGAGGCTTATACTTAGAGGTGACCTCGAAGAGGTCCCCGAGT
ATGCTAAACTGAATAAATCTCCCTCCGTGGCTAAGAGTCGCCGGAATATTCTCTATCCCC
GTCGCCACTTGAGATATTAATGGAGCCGCGGAAGAGCCTGTAGATTCCAGCATCTCGGTA
TCATGATCAGCAGGTGGTTGACCCGTGCCACCGTCCATGAACGCCGGTGAAGAAGAAGTA
GAGGAGGAGAGAGGAAAGTGATATGTTCCTCTTTCGTTCGTTTTGAGTCAAAGACAGAAA
TTCATGTCCGGTGTGAAAGGAACAGTCATTTGCCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL7638Contig1 704 2 3 U
CTTCTTCGATCACCCACTCACTTCATTCTCTCTAAATTATTTCGTCTTTCCTTTCACTCT
CTCTCTCCCTAAAACAATGGGCATAGTTGATGACCATAGCAAGACACTGTGGGAAGCATG
ACCCCTGGACCTTCCTCACGTTACTCCCTCAACGGCAAGATCATGCTCGCTTCCGTGATC
GTCCTCTTCGTCGCCGTCATTCTAATCCTCTGTTTCCACAGCTACGCCAGATGGTTGTTC
CGTCGTCAAAACCGCCGTATTCGCCGCCGTATCAGTGCTCACCTCCGATCTCTGTCAGCC
GCTCGGGACCCCACCCAGTCCTCCTCCCTCTCTCCTCTCGATCCGACGGTGCTCGAGAAG
ATCCCGGTCTTCGTCTACTCCGTTAAAACCCATAAAACCCCGCTCGAGGATTGCTCCGTT
TGCTTGTCGGAATTCGAGGAAGAAGACGAAGGACGTGTCCTTCCCAAATGTGGCCACGTG
TTCCACGTGGAGTGTATTGACACGTGGTTCCGGTCGAGATCTAGCTGTCCGCTTTGCAGA
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GCTCCCGTGTTTCACCCGGTTAAGCCAATTGAGGATACCGAAGCTGGAAGCTCGTCTTCG
TCGGACGAATCAGAATCCTCCACGCCGTCTTCGTCCTCTGGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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BQ
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AF RR4C224JQ U 1
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QA 1 765 1 765
DS 

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CACTTCAAACACAAGTAACAAATAAAAACCCCGAAACCAAACCTAGAAACCTAGAAGAAA
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CCGCTTCCCATTTGTGTGGTCGTGTGGTGACCGTCTTCTTCCATGTTCACCACTTCTCCG
CCCCATTCCACTATGGATGCACTGTCTGCTAAGTAGGAGAACAGAAAGCTTGGCCAGTAT
CCCAACACGTACCCATCTCCAAACTGCATCCACCAGTGTCCTTCCTTTGGATCCTTCCAA
ATGGTAATGCTGATATCGTATTGCGGGTTATGGAAGCCAGACACAGGAGAGATACTTGCT
CCCATTGCTATTTGACTGTTGACTTGTATAAAACCGGA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7642Contig1 1424 2 2 U
GGGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCCAACCAAATTTCTGATCGATT
CCGCCATCGCGTAAACCAGCTCCGGCGTAGTGCTCTGCTCGTTTTGTTCTTCGGAAAGAT
ACGATTGATGATTTCTAGGTGAAAGAAAGAAAGGAAGAAAGAAAGAGTGTCTCCTCCGGC
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TCGATCGCGGCATGGCATTTCCAGATTGCAGTCTATTTCGCCTTCGGATTCTTCTTTTTG
AGGCTCTTCCTCGATAGATTCGTCTTTCAAAGGATAGCTGTATGGCTTTTGACTACTGGT
TCTACGCCGATTAAAATGAAGGATGCTGCTACTCGTGCAAAGCTCATCAAATGCAAGGAG
TCTCTCTGGAAACTGCTCTACTTTGGTGCTTGTGAGGTTTTCGTTCTCAATGCCCTTTAT
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AAGCTTCCAATAAAGCTTTACTATATGTGCCAGTGCGGTTTCTATGTGTATGGTGTTGCT
GCCTTGCTTGCATGGGAGACCAGAAGAAAGGATTTTGCTGTTATGATGTCTCACCATGTC
ATCACTATCATCCTCATTGCCTACTCATACCTTACCAGCTTTTTCCAGATTGGAGCTATC
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TCTGAAAAGGAATTTGGAGCAAGTGTGTGTTTTGCACTTTTTGCTGTCTCCTGGCTATTG
CTACGATTGATTTACTTTCCATTTTGGATCATAAGGGCCACAAGCATTGAACTCCTGGAT
TATTTGGACATGACATCACTTGAAGGCACCATCATGTACTATTCCTTCAACACAATGTTA
CTAATGCTTCTTGTTTTCCACATATACTGGTGGTATCTCATATGCGCCATGATTGTAAGA
CTACTTAAAAACAGAGGAAAAGTTGGAGAAGACATAAGATCCGATTCAGAGGATGATGAT
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GCTGCTGATGAATATGTTTTCAGCTTCATTACCTTACTGATTAGAGTTGGAGGTCTTAAA
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TTGTTCTATGCTGTATACAACAATGTGGAAGTCACTTTGTAAAGGCAATTTTCTCTTTGT
ATTGATACCATAGCCTTATTGTGGAGCTCATAAACTATTCTACC


BQ
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AF RR4DT93TF U 1
AF RR4DT93JQ C 637
BS 1 789 RR4DT93TF
BS 790 1424 RR4DT93JQ

RD RR4DT93TF 789 0 0
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CCGCCATCGCGTAAACCAGCTCCGGCGTAGTGCTCTGCTCGTTTTGTTCTTCGGAAAGAT
ACGATTGATGATTTCTAGGTGAAAGAAAGAAAGGAAGAAAGAAAGAGTGTCTCCTCCGGC
GATTTCGACATGGAATCCGTATATTCCAGCGGCGGCGGCGTAATGAAGCTAGAACCATCG
TCGATCGCGGCATGGCATTTCCAGATTGCAGTCTATTTCGCCTTCGGATTCTTCTTTTTG
AGGCTCTTCCTCGATAGATTCGTCTTTCAAAGGATAGCTGTATGGCTTTTGACTACTGGT
TCTACGCCGATTAAAATGAAGGATGCTGCTACTCGTGCAAAGCTCATCAAATGCAAGGAG
TCTCTCTGGAAACTGCTCTACTTTGGTGCTTGTGAGGTTTTCGTTCTCAATGCCCTTTAT
CACGAGCCTTGGGCCACTGATATTAAACTCTTCTTTCGCGGTTGGCCTAACCAAGACCTC
AAGCTTCCAATAAAGCTTTACTATATGTGCCAGTGCGGTTTCTATGTGTATGGTGTTGCT
GCCTTGCTTGCATGGGAGACCAGAAGAAAGGATTTTGCTGTTATGATGTCTCACCATGTC
ATCACTATCATCCTCATTGCCTACTCATACCTTACCAGCTTTTTCCAGATTGGAGCTATC
ATCCTAGCCCTTCATGATGCAAGTGACGTTTTTATGGAAACTGCTAAAATTTTCAAGTAC
TCTGAAAAG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4DT93JQ 788 0 0
GCTGTTATGATGTCTCACCATGTCATCACTATCATCCTCATTGCCTACTCATACCTTACC
AGCTTTT*CCAGATTGGAGCTATCATCCTAGCCCTTCATGATGCAAGTGACGTTTTTATG
GAAACTGCTAAAATTTTCAAGTACTCTGAAAAGGAATTTGGAGCAAGTGTGTGTTTTGCA
CTTTTTGCTGTCTCCTGGCTATTGCTACGATTGATTTACTTTCCATTTTGGATCATAAGG
GCCACAAGCATTGAACTCCTGGATTATTTGGACATGACATCACTTGAAGGCACCATCATG
TACTATTCCTTCAACACAATGTTACTAATGCTTCTTGTTTTCCACATATACTGGTGGTAT
CTCATATGCGCCATGATTGTAAGACTACTTAAAAACAGAGGAAAAGTTGGAGAAGACATA
AGATCCGATTCAGAGGATGATGATTAGGCTTTTAAAGCATGGCATATACGGAACATGTTT
CCATTTCCCCAACCAAACCATTCAGCTGCTGATGAATATGTTTTCAGCTTCATTACCTTA
CTGATTAGAGTTGGAGGTCTTAAAAAGAAGGGAAGGTTATAGTTTTTTTTTCTCAATTTT
GTATTGGTGGAGTCCATTTGGACGTTATTAGACTGCATATTCTCTTTGACAAATATAAGA
AAACAGAAGCTCAGATTTCTTGTGTTGTTCTATGCTGTATACAACAATGTGGAAGTCACT
TTGTAAAGGCAATTTTCTCTTTGTATTGATACCATAGCCTTATTGTGGAGCTCATAAACT
ATTCTACC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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AGCTTACATCGTCACCAGTGACTGTGTCAGCGAGGAGCTTAGCCTCACTGGAAGGTCTCC
GTGCTGCTTCGACTGCAAAGTTTTCATCTTTTGGAACTTTGAAAGCAGGGAACTTTAGGC
AGAGTCACTTCCGTCCTTTGGTTGTTAAAGCTGCTTCTGTGGTTGCTCCTAAGTACACAT
CGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTA
TGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAAGAAGGTGAAGTCGTTG
CTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAATCGATATCACTGTCCCTACTGGAG
CACAGATTATTTACTCAAAATACGCAGGAACTGAGGTGGAGTTTAACGATGTGAAACATC
TCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTCGAGACAGATGACATCAAAGATCTCA
AACCCTTGAATGACCGAGTCTTCATCAAGGTTGCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGGGA
GGGTTGTTGCTAACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGAACGGTTATTGCGGTT
GGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAACTTCAGCCGTTACCTATATCGACTGGAAGC
ACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTAC
ATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATCCTTTCTTAGTTTTTTCTTTTTTCTTTG
TAACCTGCAACTTGTATCCCAATTGTGGAAATTTTTTCATCAACGGCCTGAGCATAATCT
TGAATAAAAAAGACTTGAGAGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW21TF U 1
AF RR4BW21JQ C 119
BS 1 590 RR4BW21TF
BS 591 591 RR4BW21JQ
BS 592 626 RR4BW21TF
BS 627 627 RR4BW21JQ
BS 628 667 RR4BW21TF
BS 668 925 RR4BW21JQ

RD RR4BW21TF 672 0 0
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CGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTA
TGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAAGAAGGTGAAGTCGTTG
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AACCCTTGAATGACCGAGTCTTCATCAAGGTTGCTGAGGCAGAGGAGAAA*CAGCTGGGA
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GGACCAG
TTCTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4BW21JQ 807 0 0
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ATCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAG
TATGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAAGAAGGTGAAGTCGT
TGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAATCGATATCACTGTCCCTACTGG
AGCACAGATTATTTACTCAAAATACGCAGGAACTGAGGTGGAGTTTAACGATGTGAAACA
TCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTCGAGACAGATGACATCAAAGATCT
CAAACCCTTGAATGACCGAGTTTTCATCAAGGTTGCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGG
*AGGGTTGTTGCTAACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGAACGGTTATTGCGG
TTGGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAACTTCAGCCGTTACCTATATCGACTGGAA
GCACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACT
ACATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATCCTTTCTTAGTTTTTTCTTTTTTCTT
TGTAACCTGCAACTTGTATCCCAATTGTGGAAATTTTTTCATCAACGGCCTGAGCATAAT
CTTGAATAAAAAAGACTTGAGAGTTTT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL7644Contig1 1250 2 2 U
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TTTCCCTCTTTTTTTTCGGTAATGAAATGGGAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAG
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GCTCTCACTTCCTCAAATCCGTCAAACCACTCCTAGATCCGAGGAGAAGAAGAAGAGGAA
CAGCCACCACTCCGCCGCCGAAGAGAAGCCGCAGCAGGGATACGTCTTCATCAAAGGCTT
CCCCGTCAACGACAACGATTCAGCGATTCAAGAGGCCAAGAGTCTTAACGCGATTCGAAC
CGCGCTTGAGAACCTCGAAGACCAGCTCGAGTTCTTCCATACTATACACACACAGCAACG
AACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAGCAGGATGTTACTAGCAAAGAG
ACTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAGCTCTTGCCTTTGTTGG
GAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAGCTCTTCTCCAAACCCAGCCGGGGCTAA
CTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCTTTGCGTGGACTTTCGGGTTTGC
TAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTTCTAGGAAACGCTGCTATATTCGC
TATAAGCATGGTCGCTATGCCACATCTTCAGCAAGTTGCTTCGTCTAGTGAGCATCATCG
TCTAAGAGCGAAGAAAGAAGAGAGATACCAACTGAGGAAAACATACAGAGGAGAGATGTC
TTCGTCTGACATAAGCTTGGACCACTTGGACGTGATGATGGCTCGTGGTTAAAAGAGTAT
AGACCAGATTTCCAACTTGTCTACACGTGATACTCACACCTGCAGCAATGGGAATATAAG
ACAAAAAAAGATGTGAAAAACAAGAAGAGAAGAGATAGTTCCTTTCTTCTCGATATAATG
AGCGAAAGGATAAGAACTTTGAGGCGAAGTATTGGAATTTTCTGAGCTGAGCTAATCATT
CTTTTTCTTTCAGATGCAAATATTTTCCCTTTCTTCTCGTTTTCTTAATTTCAATTACTG
TGTTTTAAGTTTTGCTTGTAGTTAGCTTGCGTGGTACGTTTTTTTGATTACAAGTGTGGT
ACGTTTTTTTGTAATCACAAGTGTCTGAGTCAATATCTCTTGGGTTGCCC


BQ
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AF RR4AR69TF U 1
AF RR4AR69JQ C 448
BS 1 833 RR4AR69TF
BS 834 1250 RR4AR69JQ

RD RR4AR69TF 833 0 0
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TTTCCCTCTTTTTTTTCGGTAATGAAATGGGAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAG
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GCTCTCACTTCCTCAAATCCGTCAAACCACTCCTAGATCCGAGGAGAAGAAGAAGAGGAA
CAGCCACCACTCCGCCGCCGAAGAGAAGCCGCAGCAGGGATACGTCTTCATCAAAGGCTT
CCCCGTCAACGACAACGATTCAGCGATTCAAGAGGCCAAGAGTCTTAACGCGATTCGAAC
CGCGCTTGAGAACCTCGAAGACCAGCTCGAGTTCTTCCATACTATACACACACAGCAACG
AACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAGCAGGATGTTACTAGCAAAGAG
ACTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAGCTCTTGCCTTTGTTGG
GAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAGCTCTTCTCCAAACCCAGCCGGGGCTAA
CTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCTTTGCGTGGACTTTCGGGTTTGC
TAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTTCTAGGAAACGCTGCTATATTCGC
TATAAGCATGGTCGCTATGCCACATCTTCAGCAAGTTGCTTCGTCTAGTGAGCATCATCG
TCTAAGAGCGAAGAAAGAAGAGAGATACCAACTGAGGAAAACATACAGAGGAG

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR4AR69JQ 803 0 0
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CGGAGTTCTAGATGAAGCTCTTGCCTTTGTTGGGAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGT
TTACAGCTCTTCTCCAAACCCAGCCGGGGCTAACTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGT
AGTCAACGCCTTTGCGTGGACTTTCGGGTTTGCTAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGT
GAGAGGCGTTCTAGGAAACGCTGCTATATTCGCTATAAGCATGGTCGCTATGCCACATCT
TCAGCAAGTTGCTTCGTCTAGTGAGCATCATCGTCTAAGAGCGAAGAAAGAAGAGAGATA
CCAACTGAGGAAAACATACAGAGGAGAGATGTCTTCGTCTGACATAAGCTTGGACCACTT
GGACGTGATGATGGCTCGTGGTTAAAAGAGTATAGACCAGATTTCCAACTTGTCTACACG
TGATACTCACACCTGCAGCAATGGGAATATAAGACAAAAAAAGATGTGAAAAACAAGAAG
AGAAGAGATAGTTCCTTTCTTCTCGATATAATGAGCGAAAGGATAAGAACTTTGAGGCGA
AGTATTGGAATTTTCTGAGCTGAGCTAATCATTCTTTTTCTTTCAGATGCAAATATTTTC
CCTTTCTTCTCGTTTTCTTAATTTCAATTACTGTGTTTTAAGTTTTGCTTGTAGTTAGCT
TGCGTGGTACGTTTTTTTGATTACAAGTGTGGTACGTTTTTTTGTAATCACAAGTGTCTG
AGTCAATATCTCTTGGGTTGCCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL7645Contig1 635 2 1 U
GATTCTTAAACCAGACGAACGGGACCTTGACGGTTTACGACGAACCGGATTTCGTTTTCC
AAGGGACCATGGATTTGTGTTACTTGATTTCGCCGGTTCTGATTCGGACCGGTATCCTCC
ACCGGTTACCGTTGGTTTCACTGGTTTTTGAAGGAGCTGAGATAGCGGTTTCTGGTCAGC
CTCTACTGTACCGAGTCCCACATCTGACGGTTGGGAACGATTCGGTTTATTGTTTCACGT
TTGGGAACTCCGATCTTATGGGAATGGAGGCGTACGTGATTGGACACCATCATCAGCAGA
ACATGTGGATCGAATTTGATTTGCAGAGATCAAGAATCGGTTTGGCTCCAGTACAATGTG
ATGTATCTGGACAGAGACTAGGAATCGTGTCCTAAACCGTAGATAACCGACCCGGGTAAA
ATCGTCAATACCTGTGTAATTATTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTGCTGTACGTAGAAATGG
TTATATAGTAGAAGGTGCGCAGGATGCACGTGACTATAGTGAGTGAGTGGGCTTCGTTTA
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BQ
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AF RR4G711JQ C 635
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QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4G711JQ 768 0 0
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TTCAAGAAGTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCCTGATGACC
GTTGTGGTTGGGGCATCTCTCCTCGTGGTGCTGGATATACATTTGGTCAGGACATATCCG
AACAGTTCAACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGATCGCCAGAGCCCATCAGCTGGTTATGG
ATGGATACAACTGGGCTCATGAGCAAAAAGTGGTAACCATCTTCAGTGCACCAAACTATT
GTTACCGTTGTGGAAACATGGCTTCGATTCTCGAAGTTGATGACTGCAGGAACCACACCT
TTATTCAGTTTGAACCAGCACCGAGGAGAGGAGAACCAGACGTTACTCGGAGAACACCAG
ACTACTTCCTGTATCACTGGATACAGAGTCACCTCTCAGCAGCTGCAACCAACAACTGAA
AAGTCCCAGTTAAGATTGCTGTGTGTTTTTTTAAGTTCCAACTTAGTCCCACCACCGAAA
GTATAGTGTGTGTTATAGGCGAAGAAGACCCTCTCTTTACCTTCCTCGATAACCAAGAAG
AAGAGAAAAGAGGTCAATGGACTCTCTACAGTACCCATTATGCACAATTGTTTATTAACT
TCTTTTTCTGCATCAGAATGTCTTTTTCATGTGAGAGATCTGTTTAATTTGATTTCTTGT
AATTCTTCTCTTAAATTTCTTCTATTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7647Contig1 751 2 2 U
GGATTATCAAACACACACAACGAAAAGACAGAAACACACAGAATCAAGAAGAAAAATGAC
AAAAGTTCACCCAAAGTTCTCAAACACTTACGAGAAAAGCTTGTGTGATAGTAAAGCAAC
TGTAGCTTTAACGGTGTGGAAGAAGTCTCTTCTCTTCAACTGTGATGGATTCACAGTTTA
CAACTCTAATGGAGATCTCGTCTTTAGGGTTGACAACTACATGAACTCACCTAGAGACAA
CATCGTCCTTATGGATGCTTCCGGCTTGCCCCTTCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAG
CTTGGGAGATTGTTGGGGGGTATACGACGGAGAAACACAAAGAGATCCATTATTTACGGC
AAAGAAAAACGTTAACATACTAACAAACAAGAGGAGCTTGGTGTGGGTTAGCACGAAGAA
AACAGTGCTATACGAGATTGAAGGATCATATGGGCAGAGAAGCTGCAAAATAGTGGACGT
GAGGAGAAACAAGAAGAAAACAGCAGAGATCAAGAAGAAAGATGCAATGGTTGGAGGAGG
TTCCTTTGGCAAAGATGTGTTTAAGCTTATAGTTGAAGCGGAGATGGAGCCTCGTGTGGC
CATGGCATTGACCATCATTCTCGACTAAATGTCAAGATCTTATTGATTTTTCAAGCTTTT
GTAAGTATATATTAGTGTTCCCTTTTTGTTATGTAATTTATGCATGTGTGTTCTTATATG
TTACACATGAACAGAAACAACTTTTGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF35TF U 1
AF RR4DF35JQ C 80
BS 1 671 RR4DF35TF
BS 672 751 RR4DF35JQ

RD RR4DF35TF 671 0 0
GGATTATCAAACACACACAACGAAAAGACAGAAACACACAGAATCAAGAAGAAAAATGAC
AAAAGTTCACCCAAAGTTCTCAAACACTTACGAGAAAAGCTTGTGTGATAGTAAAGCAAC
TGTAGCTTTAACGGTGTGGAAGAAGTCTCTTCTCTTCAACTGTGATGGATTCACAGTTTA
CAACTCTAATGGAGATCTCGTCTTTAGGGTTGACAACTACATGAACTCACCTAGAGACAA
CATCGTCCTTATGGATGCTTCCGGCTTGCCCCTTCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAG
CTTGGGAGATTGTTGGGGGGTATACGACGGAGAAACACAAAGAGATCCATTATTTACGGC
AAAGAAAAACGTTAACATACTAACAAACAAGAGGAGCTTGGTGTGGGTTAGCACGAAGAA
AACAGTGCTATACGAGATTGAAGGATCATATGGGCAGAGAAGCTGCAAAATAGTGGACGT
GAGGAGAAACAAGAAGAAAACAGCAGAGATCAAGAAGAAAGATGCAATGGTTGGAGGAGG
TTCCTTTGGCAAAGATGTGTTTAAGCTTATAGTTGAAGCGGAGATGGAGCCTCGTGTGGC
CATGGCATTGACCATCATTCTCGACTAAATGTCAAGATCTTATTGATTTTTCAAGCTTTT
GTAAGTATATA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4DF35JQ 672 0 0
TCAAACACTTACGAGAAAAGCTTGTGTGATAGTAAAGCAACTGTAGCTTTAACGGTGTGG
AAGAAGTCTCTTCTCTTCAACTGTGATGGATTCACAGTTTACAACTCTAATGGAGATCTC
GTCTTTAGGGTTGACAACTACATGAACTCACCTAGAGACAACATCGTCCTTATGGATGCT
TCCGGCTTGCCCCTTCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAGCTTGGGAGATTGTTGGGGG
GTATACGACGGAGAAACACAAAGAGATCCATTATTTACGGCAAAGAAAAACGTTAACATA
CTAACAAACAAGAGGAGCTTGGTGTGGGTTAGCACGAAGAAAACAGTGCTATACGAGATT
GAAGGATCATATGGGCAGAGAAGCTGCAAAATAGTGGACGTGAGGAGAAACAAGAAGAAA
ACAGCAGAGATCAAGAAGAAAGATGCAATGGTTGGAGGAGGTTCCTTTGGCAAAGATGTG
TTTAAGCTTATAGTTGAAGCGGAGATGGAGCCTCGTGTGGCCATGGCATTGACCATCATT
CTCGACTAAATGTCAAGATCTTATTGATTTTTCAAGCTTTTGTAAGTATATATTAGTGTT
CCCTTTTTGTTATGTAATTTATGCATGTGTGTTCTTATATGTTACACATGAACAGAAACA
ACTTTTGTTTTC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7648Contig1 614 2 1 U
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CTCGCCATGGCGTCTGATCCGGTGGTCTCAGGTATGAAGCTCCTGGGTTATGTTTGCCCG
TCTCTGCGCTTAAATGGAAGTTAAGATTGCGAGTGTGAGGCAATCGTCATGATCTAGCTA
CATCGGTGATGGCTTAGATGAACCGGCAACCTCGGAAACGAGGTGAACGCCACCCTCGAA
CGCTTTTCATTACTGGTCGAGAACGGGGATTGACAGTCGGATGTTGACGGATCTATCTAG
CGGAATGCGCCGGTTTAGAGGTGGTTGAGCGAAGCTAGGGATGAAACGTTTGGCATTAGA
CTATTTTGTTCAAATCAAACTTGTAATCAATGCTTCAATTCCCGGTTTTCGGGTTGATAT
ATAATATAAATATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H164JQ C 1
AF RR4H164TF U 1
BS 1 614 RR4H164TF

RD RR4H164JQ 614 0 0
GATGGAGTGCGTGGGCGTTTGTTGTGGTCCGAGAGTCTCCAGTGCGTGGGCGTTTGTTGT
GGTCCGAGAGTTTCCGGAACATTACTCACTGTCCGTGGCGGCGCGCTGGATTGGCGTCTT
TCGCGATATCGGAGTTTGGACTTTTCAAGCTTCGGTAGGATGTCCTCCTTCTTTTTGCTG
GTACCCCTTCCACAAGACAGAGTGTCACAGCTCAACCGGCCTTTGTTCTAGATGGGTGAA
CTCGCCATGGCGTCTGATCCGGTGGTCTCAGGTATGAAGCTCCTGGGTTATGTTTGCCCG
TCTCTGCGCTTAAATGGAAGTTAAGATTGCGAGTGTGAGGCAATCGTCATGATCTAGCTA
CATCGGTGATGGCTTAGATGAACCGGCAACCTCGGAAACGAGGTGAACGCCACCCTCGAA
CGCTTTTCATTACTGGTCGAGAACGGGGATTGACAGTCGGATGTTGACGGATCTATCTAG
CGGAATGCGCCGGTTTAGAGGTGGTTGAGCGAAGCTAGGGATGAAACGTTTGGCATTAGA
CTATTTTGTTCAAATCAAACTTGTAATCAATGCTTCAATTCCCGGTTTTCGGGTTGATAT
ATAATATAAATATT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4H164TF 614 0 0
GATGGAGTGCGTGGGCGTTTGTTGTGGTCCGAGAGTCTCCAGTGCGTGGGCGTTTGTTGT
GGTCCGAGAGTCTCCGGAACATTACTCACTGTCCGTGGCGGCGCGCTGGATTGGCGTCTT
TCGCGATATCGGAGTTTGGACTTTTCAAGCTTCGGTAGGATGTCCTCCTTCTTTTTGCTG
GTACCCCTTCCACAAGACAGAGTGTCACAGCTCAACCGGCCTTTGTTCTAGATGGGTGAA
CTCGCCATGGCGTCTGATCCGGTGGTCTCAGGTATGAAGCTCCTGGGTTATGTTTGCCCG
TCTCTGCGCTTAAATGGAAGTTAAGATTGCGAGTGTGAGGCAATCGTCATGATCTAGCTA
CATCGGTGATGGCTTAGATGAACCGGCAACCTCGGAAACGAGGTGAACGCCACCCTCGAA
CGCTTTTCATTACTGGTCGAGAACGGGGATTGACAGTCGGATGTTGACGGATCTATCTAG
CGGAATGCGCCGGTTTAGAGGTGGTTGAGCGAAGCTAGGGATGAAACGTTTGGCATTAGA
CTATTTTGTTCAAATCAAACTTGTAATCAATGCTTCAATTCCCGGTTTTCGGGTTGATAT
ATAATATAAATATT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL7649Contig1 795 2 12 U
AGGCATAAGAAGAGACAGCTTGAAGATACTCTCAAAATGGTTGAGAAGAAAAGAAAGGAA
TATGAGGAGAAAAGGAAGGAGCAAGGAGAGGCCACAACCTCTGTTATGTTCAGTCATCTG
CCTCCTCAACGAAGAACAGCCGGTGAAGAGGAATTAAAGCCAGAGGACTCTGTTTATTAT
CACCCTACTTTGAACCCCACTGGTGCACCACCGCCTGGAAAGCCACCGATGTATCATTCA
TCCATAGGAACTAGAATCTCCTCAGATGGTGCTTCATCTAGCAGTGCTACATTGTCTTCT
ATTACCGAGTCAGAAGACTCCGCATTGGTTGCTCCTCCTCCACCTCCTCCACTGCCTCCT
CTACCGGATGGGACTAATGCCTTATCTAGTTCTTTGCCGCTTCCCCCTCCACCTCCTTTG
CCACCAACTACAGGCCTTGCTTTACCCCATCCACAATTTCCACCACCGCCCCCGGGTCCC
CCACCAAAAGAGCATGATATGGCTCTTGTTCGTCCTCCTCTTCCCCCACTTCCTCAATCT
TCCCAACTCCCTCCTCCTGGTCTAAGTGGAAGTGAAGGCGATGGTAGGTTCCCTGAATCA
TCAGTTCAAACCTTCGACGAGGGCAAGAATGCTAATATAATTTCCATCCCTCCGCCTCCA
CCACCTGCCCTTCCCTCCAGGCCTCCAAACAACGAATCAGAGACTGGTCCCCCAGAACCT
AACTCTAGTAGTTTTCCAAATCCTAGCGTATCTCAGATGGTTGCACCACCACCCCTCTAC
ATCAGCACATCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A685TF U 1
AF RR4CN18TF U 19
BS 1 50 RR4A685TF
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BS 52 136 RR4A685TF
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BS 650 650 RR4CN18TF
BS 651 728 RR4A685TF
BS 729 795 RR4CN18TF

RD RR4A685TF 728 0 0
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CACCCTACTTTGAACCCCACTGGTGCACCACCGCCTGGAAAGCCACCGATGTATCATTCA
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CCACCAACTACAGGCCTTGCTTTACCCCATCCACAATTTCCACCACCGCCCCCGGGTCCC
CCACCAAAAGAGCATGATATGGCTCTTGTTCGTCCTCCTCTTCCCCCACTTCCTCAATCT
TCCCAACTCCCTCCTCCTGGTCTAAGTGGAAGTGAAGGCGATGGTAGGTTCCCTGAATCA
TCAGTTCAAACCTTCGACGAGGGCAAGAATGCTAATATAATTTCCATCC*TCCGCCTCCA
CCACCTGCCCTTCCCTCCAGGCCTCCAAACAACGAATCAGAGACTGGTCCCCCAGAACCT
AACTCTAG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CN18TF 777 0 0
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GCCGGTGACGAGGACTTAAAGCCAGAGGACTCTGTTTATTATCACCCTACTTTGAACCCG
ACTGGTGCACCACCGCCTGGAAAGCCACCGATGTATCATTCATCCATAGGAACTAGAATC
TCCTCAGATGGTGCTTCATCTAGCAGTGCTACATTGTCTTCTATTACCGAGTCAGAAGAC
TCCGCATTGGTTGCTCCTCCTCCACCTCCTCCACTGCCTCCTCTACCGGATGGGACTAAT
GCCTTATCTAGTTCTTTGCCGCTTCCCCCTCCACCTCCTTTGCCACCAACTACAGGCCTT
GCTTTACC**ATCCACAATTTCCACCACCGCCCCCGGGTCCCCCACCAAAAGAGCATGAT
ATGGCTCTTGTTCGTCCTCCTCTTCCCCCACTTCCTCAATCTTCCCAACTCCCTCCTCCT
GGTCTAAGTGGAAGTGAAGGCGATGGTAGGTTCCCTGAATCATCAGTTCAAACCTTCGAC
GAGGGCAAGAATGCT**TATAATTTCCATCCCTCCGCCTCCACCACCTGCCCTTCCCTCC
AGGCCTCCAAACAACGAATCAGAGACTGGTCCCC*AGAACCTAACTCTAGTAGTTTTCCA
AATCCTAGCGTATCTCAGATGGTTGCACCACCACCCCTCTACATCAGCACATCAATC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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GGTGTTTGCCAAAATCCCAGAGAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
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TTGGAGTCATGAAGGTCGGAGGAGGAGTTGGATATTACTAGAATCTATTATCCACCCCTG
AAGATACTAGAAAAATGTGGAATCTAGCCTCGAGTTACCTCACCGGACCAAGAAACGAAG
CAAGAAGGCCACCACCAGTCCATCATCCTCATGTAGACTGTTGTTCAGACGACGACGACG
ATGCTTCATCTCAAGGCAGTAGCAAAGAAGAAGGTCTCGAGTGTCCTATCTGCTGGGAAT
CATTCAACATCGTCGAAAACGTTCCCTACGTCCTTTGGTGTGGCCACACCATGTGCAAAA
CTGCATCCTCGGACTTCAGTGGGCCATTGTGAAGTTACCTACTCACCCTGTTCAGCTCCC
TCTCTTCATCTCCTGCCCCTGGTGCAACCTCCTCTCCTTCCGTCTCGTCTTCAGAGGAGC
TCTTAGGTTCCCTCGCAAGAACTACTTTGTGCTTTGGATGGTCGAGAGGATGAATGGGGA
GAGACGCAGTTCTCCAGGGACAGATCAAACCGATGCGAGAGAGCAGCCGCAGCCTCCTTG
TCTCCACCATCGCGCTCAACCTGAGCCACCATCAGGTGATCGTCGCGTTCGAAGGGACAA
CAACATACAAACTTCGCTGAGGAAGTCTCTGGTCTTCTTTGTTCAGCTGACAGCGAAGTT
CCCGTTGGTTGTTATATTTCTGCTGATAATACTCTATGCGATACCGACCAGTGCAGCCAT
ATTGGCTATGTACATTCTAGTCACTCTCTTGCTGGCGCTACCGTCGTTTCTCATCCTCTA
CTTCGCTTATCCTTGTCTCGACTGGCTCGTCAGGGAGATTGTCACTTGAAAGTGGTGTTT
CTCTATTTATTCGACGACTCTTCTTCCTCTATGTAAGTATGATGATTTGGTAATTACCAG
TCTTCCTTATCTTTATATGTAGATGTAGTTTCTTTTGGTTTGCATTGTTGCTCTATGGGA
GTTTGGAGAAAGGACATGTCCATGTGTTGTAAGGGCTGTTCTTTGTAGGAGTTCAATAGT
ATTTGTAATATTTTGAGGATCTGCCTTCC


BQ
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AF RR4A323TFB U 1
AF RR4A323JQD C 389
BS 1 845 RR4A323TFB
BS 846 1169 RR4A323JQD

RD RR4A323TFB 853 0 0
GGTGTTTGCCAAAATCCCAGAGAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGCTTGAATCTTTCGCGGCCCAGAATCTCCTGGAAGAGAATCAGAATCGTATATGCATTT
TTGGAGTCATGAAGGTCGGAGGAGGAGTTGGATATTACTAGAATCTATTATCCACCCCTG
AAGATACTAGAAAAATGTGGAATCTAGCCTCGAGTTACCTCACCGGACCAAGAAACGAAG
CAAGAAGGCCACCACCAGTCCATCATCCTCATGTAGACTGTTGTTCAGACGACGACGACG
ATGCTTCATCTCAAGGCAGTAGCAAAGAAGAAGGTCTCGAGTGTCCTATCTGCTGGGAAT
CATTCAACATCGTCGAAAACGTTCCCTACGTCCTTTGGTGTGGCCACACCATGTGCAAAA
CTGCATCCTCGGACTTCAGTGGGCCATTGTGAAGTTACCTACTCACCCTGTTCAGCTCCC
TCTCTTCATCTCCTGCCCCTGGTGCAACCTCCTCTCCTTCCGTCTCGTCTTCAGAGGAGC
TCTTAGGTTCCCTCGCAAGAACTACTTTGTGCTTTGGATGGTCGAGAGGATGAATGGGGA
GAGACGCAGTTCTCCAGGGACAGATCAAACCGATGCGAGAGAGCAGCCGCAGCCTCCTTG
TCTCCACCATCGCGCTCAACCTGAGCCACCATCAGGTGATCGTCGCGTTCGAAGGGACAA
CAACATACAAACTTCGCTGAGGAAGTCTCTGGTCTTCTTTGTTCAGCTGACAGCGAAGTT
CCCGTTGGTTGTTATATTTCTGCTGATAATACTCTATGCGATACCGACCAGTGCAGCCAT
ATTGG
GCTATGTA

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4A323JQD 781 0 0
CGTCCTTTGGTGTGGCCACACCATGTGCAAAACTGCATCCTCGGACTTCAGTGGGCCATT
GTGAAGTTACCTACTCACCCTGTTCAGCTCCCTCTCTTCATCTCCTGCCCCTGGTGCAAC
CTCCTCTCCTTCCGTCTCGTCTTCAGAGGAGCTCTTAGGTTCCCTCGCAAGAACTACTTT
GTGCTTTGGATGGTCGAGAGGATGAATGGGGAGAGACGCAGTTCTCCAGGGACAGATCAA
ACCGATGCGAGAGAGCAGCCGCAGCCTCCTTGTCTCCACCATCGCGCTCAACCTGAGCCA
CCATCAGGTGATCGTCGCGTTCGAAGGGACAACAACATACAAACTTCGCTGAGGAAGTCT
CTGGTCTTCTTTGTTCAGCTGACAGCGAAGTTCCCGTTGGTTGTTATATTTCTGCTGATA
ATACTCTATGCGATACCGACCAGTGCAGCCATATTGGCTATGTACATTCTAGTCACTCTC
TTGCTGGCGCTACCGTCGTTTCTCATCCTCTACTTCGCTTATCCTTGTCTCGACTGGCTC
GTCAGGGAGATTGTCACTTGAAAGTGGTGTTTCTCTATTTATTCGACGACTCTTCTTCCT
CTATGTAAGTATGATGATTTGGTAATTACCAGTCTTCCTTATCTTTATATGTAGATGTAG
TTTCTTTTGGTTTGCATTGTTGCTCTATGGGAGTTTGGAGAAAGGACATGTCCATGTGTT
GTAAGGGCTGTTCTTTGTAGGAGTTCAATAGTATTTGTAATATTTTGAGGATCTGCCTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7652Contig1 751 2 3 U
TTTTTTTTTGAGGAATCACCAACAAGTTAACAAATGTGTTTTTGAGTTTTGATTACAAGT
ATGGTGTCAGATATTTAAAACATTTCACCAATAACACTAATCAGACAACTTTAATAGTTG
ATTGTAGAAAAGCTAAAGATATGAATTCAGAAAGTCAATGGAAACGATATGTTACACTTT
GAGAAGAGACTGTATACTTTATAAGAGATATATATAACTATCTGGGTCACTTACTCCCTC
TAGTGGGAGCTCTGGCGCAGCTTAGCATCAATTCTCTTCCTCATCAATGCAAGCTCCGCA
GCAGAAACAACAGAAGCAGCAAGAGAGAACCATGGCAAGATCTCCGCAGACAACACCAAA
CCAGCTATCAGATGGAATCTCAGGGCCAGATTCTAGGAGCCTCTGTTGATTGCTTTGGCT
GTTTTGCCCGCTGCTGTTAGTCCTCTGATATCTCTTCTTGCTAGTGCTCTTGAAAGAGTT
TCGAAGTTTCAATGACGGCCACAGATGCATTTTTTCTTTTTCTCAGAATGTTGAAGATGC
TAAAGCCGGTTTTTGGGTTTTAACAAGAGGGAACTAAAGACCCATTTGCTTTTAGTATCT
TGGGAGGGAACTACACCAAAACACACACACCTCGCCCTCTTGTCCAAAGGCTAACAAAGA
AATCAACAGTCCACCACAGAGATTGAAAGGCGAAGACTTTGCTGGATATCACCTCCTCAT
GCGCTTTCTATTCAAGACTCTGTGCAGTCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H527JQB U 10
AF RR4H527TF C 1
BS 1 9 RR4H527TF
BS 10 685 RR4H527JQB
BS 686 751 RR4H527TF

RD RR4H527JQB 676 0 0
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GCTGCTGTTAGTCCTCTGATATCTCTTCTTGCTAGTGCTCTTGAAAGAGTTTCGAAGTTT
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TTTTTGGGTTTTAACAAGAGGGAACTAAAGACCCATTTGCTTTTAGTATCTTGGGAGGGA
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TCCACCACAGAGATTG

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GCAGAAACAACAGAAGCAGCAAGAGAGAACCATGGCAAGATCTCCGCAGACAACACCAAA
CCAGCTATCAGATGGAATCTCAGGGCCAGATTCTAGGAGCCTCTGTTGATTGCTTTGGCT
GTTTTGCCCGCTGCTGTTAGTCCTCTGATATCTCTTCTTGCTAGTGCTCTTGAAAGAGTT
TCGAAGTTTCAATGACGGCCACAGATGCATTTTTTCTTTTTCTCAGAATGTTGAAGATGC
TAAAGCCGGTTTTTGGGTTTTAACAAGAGGGAACTAAAGACCCATTTGCTTTTAGTATCT
TGGGAGGGAACTACACCAAAACACACACACCTCGCCCTCTTGTCCAAAGGCTAACAAAGA
AATCAACAGTCCACCACAGAGATTGAAAGGCGAAGACTTTGCTGGATATCACCTCCTCAT
GCGCTTTCTATTCAAGACTCTGTGCAGTCCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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TCCATGAACTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A281TFB U 85
AF RR4A281TF U 1
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TATCTACAAGTTTGATTGTGATTTCAATTCAAAACAAAAAGGACTTATAAACAGTGCAGA
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AGTTTTTTCGACGGGTCGGTTACTGGGACGAATGTGGAGCTTGAAGAAGGGAAGTTGATT
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TTCGAGGAACCTGAACCTGGAGTCACCGTTGTCAATCTTACTCACACTGACGTTCCTGAA
GAAGACAGATACGGGAATGCGACTGTGGTGGAAAACACGGAGAGAGGATGGAGAGACCTC
ATCTTCCATAGGATCCGTGCCGTTTTCGGGTTTGGAATGTGATTTGTGATTTTGCTTAAT
CAAATAACAAAATCAGCATTGCTTTATCTACAAGTTTGATTGTGATTTCAATTCAAAACA
AAAAGGACTTATAAACAGTGCAGAAGAGTGTATGGATTTTTAATTTTAGTCTATGCATTT
TCCATGAACTCT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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GCTTCTTGTAAGAAACGTTGGACTTCC


BQ
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AF RR4D088TF C 1
AF RR4D088JQ U 238
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BS 363 387 RR4D088TF

RD RR4D088TF 387 0 0
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ACTTAGACGAAACTAAAAAGATACGACATTGACGACTTCACGCATCATTCTCCTTATGCA
GATAGGTTTCTAGGAAATGTCTACTACACATAGCTTATACATATATAGCTTTTTAGCCTA
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GCTTCTTGTAAGAAACGTTGGACTTCC

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR4D088JQ 125 0 0
GCAA
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ATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCCCCATCATCTCTGATCTCTATCCCCGG
C

QA 5 125 5 125
DS 



AS 1 2

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TCTCCAGATCTCGAATCGGTTGGTGGCTTAAACTATGGTTCTTGATGGGATTGTAACATC
ACCATTACGAAGGCCACACGCGCTGAAGAAGCAATGGGAGGACTTGGGTAGCTTCTCTAC
TGTTTTCCGGAGGCATCGCTTTCTTTTAACCGCTATGCTCCTTTTGGCCTTACTCTGCAC
CATCTATATCTACTTCGCCGTCACTTTAGGCGCTAGGCACTTGTCGTGTTCGGACATGAC
CGGGAAAGAGAAGGCAATCTGTCAAATGGAACACGTCCATGCCAGTTTCTCTAAAGTGAG
GAAACTGAAATTCTTTTAACGAGTGTCAGCCAAAGCTTGATACTCATTATTATGCAATGT
GTGTGTAACAACAACATCCTAAAGAAATTGGTTATGTTTAAATCATAATGTAAACTTTTT
GTATTGTTATTTGTATTATTTGATTATATGTCCCCAAGATGATGATTCCACAAACATTGT
ATAAATGAATCTTTGTAATGGAATTGTAATACTGAAAGGTTTTTGGTAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CP72JQ C 1
AF RR4CP72TF U 1
BS 1 641 RR4CP72TF
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GTATTGTTATTTGTATTATTTGATTATATGTCCCCAAGATGATGATTCCACAAACATTGT
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QA 1 650 1 650
DS 

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TGTTTTCCGGAGGCATCGCTTTCTTTTAACCGCTATGCTCCTTTTGGCCTTACTCTGCAC
CATCTATATCTACTTCGCCGTCACTTTAGGCGCTAGGCACTTGTCGTGTTCGGACATGAC
CGGGAAAGAGAAGGCAATCTGTCAAATGGAACACGTCCATGCCAGTTTCTCTAAAGTGAG
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GTGTGTAACAACAACATCCTAAAGAAATTGGTTATGTTTAAATCATAATGTAAACTTTTT
GTATTGTTATTTGTATTATTTGATTATATGTCCCCAAGATGATGATTCCACAAACATTGT
ATAAATGAATCTTTGTAATGGAATTGTAATACTGAAAGGTT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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TTATTCATATTTCACGTTTTATTTGTATTTTTATGAGATATCGTTATCGACTTTCACAAC
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BQ
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AF RR4AK17JQ C 1
AF RR4AK17TF U 1
BS 1 634 RR4AK17TF

RD RR4AK17JQ 634 0 0
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CCAGCAACCTCTGTGGACAGATACCTCAATGCTAATGGCTCCGGCCAGTGCCCTTTATAG
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QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4AK17TF 634 0 0
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TGGAGAAGTGCCGGTGATGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGAAGCGAGTGTGTTAAG
GTACAAAGAGAAGAGACAGAGTAGGCTCTTCTCTAAGAAGATAAGGTATCAGGTCCGAAA
ACTCAACGCTGATAAACGACCTCGTTTCAAGGGTCGGTTCGTGAAAAGGGACACTTAAAA
GGGGAAATAAATATCAGGAAGAAAAATATCTTCAGTCTTCGATGTGTCTTTTTATTAGTA
TTATTCATATTTCACGTTTTATTTGTATTTTTATGAGATATCGTTATCGACTTTCACAAC
TTTGTCAAATTTGAAACGAAAATATCTCCTTCAC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7657Contig1 1125 2 2 U
GGAGACCCTTCGCTCTTTCAGGAAGAAATATAATACTATGCCGATCTTTAACTGGGTGCA
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AGTGGATGCTCTTGATAACTGGTTTGATGGAGTTCTCACCATCGGCACTTTCGGTTTTGA
CACTTTGAAATTTCAAGAAGAAGCCGAAATAGATGATGGTAATGAATGCGAGAGTGTGGG
TATCGACTATGTTGTAGTCGATGGTAGCATCATCAAGAACGTCAACCAAGAGTCAGACCC
TCTTATCTCCAATGAAAATAAGGTTTATGATCATCATGAGGATTTAGGGGTATTGGACAT
TGACCACTCTGACTCAGTCAAAACGGTTGAAAATTCCGTGGTCGTGGCCGCGGTGGAGGC
CGAGGTGGATCCGGAGAAGAAGAGGACAACCCTAGCTGAACTCTTCATGGAAGACCAAGA
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ATATGTGGTTTCTATTTTTCTTTTTGCAAACATGTTTCTATTTTTTTGTTATTTGAGAAT
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TATGCGTATTTTATTTTATTACAATGTGTTATCACTTTTAAATTT


BQ
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AF RR4AO42TF U 1
AF RR4AO42JQ C 230
BS 1 816 RR4AO42TF
BS 817 1125 RR4AO42JQ

RD RR4AO42TF 816 0 0
GGAGACCCTTCGCTCTTTCAGGAAGAAATATAATACTATGCCGATCTTTAACTGGGTGCA
GAAGAAGCTGCACCAAAATGTCATCAGAGATGGTATGACGAAAAGCGAGAAAAAGAAGAG
AGGTGAAGGAACAAGTGAGATAGAGAAGAACACGAAAGCTATATTGGATCAGGTTGGGTT
AGTGGATGCTCTTGATAACTGGTTTGATGGAGTTCTCACCATCGGCACTTTCGGTTTTGA
CACTTTGAAATTTCAAGAAGAAGCCGAAATAGATGATGGTAATGAATGCGAGAGTGTGGG
TATCGACTATGTTGTAGTCGATGGTAGCATCATCAAGAACGTCAACCAAGAGTCAGACCC
TCTTATCTCCAATGAAAATAAGGTTTATGATCATCATGAGGATTTAGGGGTATTGGACAT
TGACCACTCTGACTCAGTCAAAACGGTTGAAAATTCCGTGGTCGTGGCCGCGGTGGAGGC
CGAGGTGGATCCGGAGAAGAAGAGGACAACCCTAGCTGAACTCTTCATGGAAGACCAAGA
CCATGATACAAAGCATGACAAGGAGAAACAAAAGAACCCTAATCTTAATGTTGATGGTCA
GAAGGTTAAATATCATAAACAAAACGGGTCAAAGCTGTGTAGTAAGTTCACGTTTGCTAA
GAGGATGGTCACTTCAAAGTCCAAAGATAAAGAACAAGACTCGCGTCCAACCAAGAAAGT
GCATGACTCGCGTCCAATCAAGAAAGTGCATCAGATAATAAAGAGGATGTTAAAGAAGAA
GATTCATCCAGATGTAGATGCGACTAGGGCTTCTAA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AO42JQ 896 0 0
TTCGGTTTTGACACTTTGAAATTTCAAGAAGAAGCCGAAATAGATGATGGTAATGAATGC
GAGAGTGTGGGTATCGACTATGTTGTAGTCGATGGTAGCATCATCAAGAACGTCAACCAA
GAGTCAGACCCTCTTATCTCCAATGAAAATAAGGTTTATGATCATCATGAGGATTTAGGG
GTATTGGACATTGACCACTCTGACTCAGTCAAAACGGTTGAAAATTCCGTGGTCGTGGCC
GCGGTGGAGGCCGAGGTGGATCCGGAGAAGAAGAGGACAACCCTAGCTGAACTCTTCATG
GAAGACCAAGACCATGATACAAAGCATGACAAGGAGAAACAAAAGAACCCTAATCTTAAT
GTTGATGGTCAGAAGGTTAAATATCATAAACAAAACGGGTCAAAGCTGTGTAGTAAGTTC
ACGTTTGCTAAGAGGATGGTCACTTCAAAGTCCAAAGATAAAGAACAAGACTCGCGTCCA
ACCAAGAAAGTGCATGACTCGCGTCCAATCAAGAAAGTGCATCAGATAATAAAGAGGATG
TTAAAGAAGAAGATTCATCCAGATGTAGATGCGACTAGGGCTTCTAAAAAGGACGGTCCA
TACAGGCCAGCCCTGAAATGTGAAGCTCTCGAGACACTTTATCTTCTTAATGTTCCAGAT
TGCGTTGCTTAGAAGTCTGAGAAGAACGACAACACAGAGCAATTACTGGACTTGTGCTTT
TCATATTATATATATGTGGTTTCTATTTTTCTTTTTGCAAACATGTTTCTATTTTTTTGT
TATTTGAGAATGTGTTGTGGGTTAAGAATGATTGTAGAACGAGAATGTGTTGTCACTGTT
TGTTTATGTCTTATGCGTATTTTATTTTATTACAATGTGTTATCACTTTTAAATTT

QA 1 896 1 896
DS 



AS 1 2

CO CL7658Contig1 926 2 4 U
GGAGGGTGCGGAAGTTCCTGAAGTTGAATGGTGTGTGCCTGGAGAGGATGCGGGGATGGA
AGTACTGATGGGGAACCGAGAGGGGTTTTTGACGAAAAGGTTGAGGAACTATTCAACAGA
CAGGAATAATCCTGTGAAGCCGAAAGCACTCTCTGGTCTATCTCCTTATCTACATTTTGG
ACAGATCTCAGCTCAAAGGTGTGCCTTGGAGGCACGTAAAGTCAGGAATGCTTACCCTCA
GGAGGTTGATACGTTCTTGGAAGAGTTGATTGTACGAAGAGAACTCTCCGACAATTTCTG
CTACTATCAACCTCACTATGATTCTTTGGAGGGAGCTTGGGAGTGGGCACGCAAATCATT
GACGGATCATGCTTCAGATAAGAGAGAACGCACTTACTCGTTGGAGCAGTTAGAGAAGGG
GCAGACAGCAGATCCTCTATGGAATGCTTCACAGTTAGAGATGGTTTATCAGGGGAAAAT
GCACGGTTTCATGCGAATGTATTGGGCAAAGAGGATTCTGGAATGGACCAAAGGACCTGA
AGAGGCTCTCTCAATATCCATCTATCTAAATAACAAGTATGAGTTAGATGGTCGTGACCC
GAGTGGATATGTTGGGTGTATGTGGTCCATATGCGGCGTTCACGATCAGGGATGGAAAGA
GAGACAGGTGTTTGGGAAGATACGGTACATGAACTACGCGGGTTGCAAACGGAAGTTCGA
TGTGGATAGTTACATCTCTTATGTCAAGAGTTTGGTGTCAGTAACAAAGAAGAAGAGGAA
AGCTGAAGAACAGCTCACAAGAGACTCTATTGACCACCGCAAAGCTAATTAGTACTTACT
ATTAAATCTAAACTTCTTTATGTTGTTGTTATGCAATCTTGCTCTGTGTTTGGCATTTAA
TTTTTATTCAAGTGACTGATTGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET75TF U 1
AF RR4ET75JQ C 180
BS 1 533 RR4ET75TF
BS 534 534 RR4ET75JQ
BS 535 632 RR4ET75TF
BS 633 926 RR4ET75JQ

RD RR4ET75TF 632 0 0
GGAGGGTGCGGAAGTTCCTGAAGTTGAATGGTGTGTGCCTGGAGAGGATGCGGGGATGGA
AGTACTGATGGGGAACCGAGAGGGGTTTTTGACGAAAAGGTTGAGGAACTATTCAACAGA
CAGGAATAATCCTGTGAAGCCGAAAGCACTCTCTGGTCTATCTCCTTATCTACATTTTGG
ACAGATCTCAGCTCAAAGGTGTGCCTTGGAGGCACGTAAAGTCAGGAATGCTTACCCTCA
GGAGGTTGATACGTTCTTGGAAGAGTTGATTGTACGAAGAGAACTCTCCGACAATTTCTG
CTACTATCAACCTCACTATGATTCTTTGGAGGGAGCTTGGGAGTGGGCACGCAAATCATT
GACGGATCATGCTTCAGATAAGAGAGAACGCACTTACTCGTTGGAGCAGTTAGAGAAGGG
GCAGACAGCAGATCCTCTATGGAATGCTTCACAGTTAGAGATGGTTTATCAGGGGAAAAT
GCACGGTTTCATGCGAATGTATTGGGCAAAGAGGATTCTGGAATGGACCAAAG*ACCTGA
AGAGGCTCTCTCAATATCCATCTATCTAAATAACAAGTATGAGTTAGATGGTCGTGACCC
GAGTGGATATGTTGGGTGTATGTGGTCCATAT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4ET75JQ 747 0 0
GACAGATCTCAGCTCAAAGGTGTGCCT*GGAGGCACGTAAAGTCAGGAATGCTTACCCTC
AGGAGGTTGATACGTTCTTGGAAGAGTTGATTGTACGAAGAGAACTCTCCGACAATTTCT
GCTACTATCAACCTCACTATGATTCTTTGGAGGGAGCTTGGGAGTGGGCACGCAAATCAT
TGACGGATCATGCTTCAGATAAGAGAGAACGCACTTACTCGTTGGAGCAGTTAGAGAAGG
GGCAGACAGCAGATCCTCTATGGAATGCTTCACAGTTAGAGATGGTTTATCAGGGGAAAA
TGCACGGTTTCATGCGAATGTATTGGGCAAAGAGGATTCTGGAATGGACCAAAGGACCTG
AAGAGGCTCTCTCAATATCCATCTATCTAAATAACAAGTATGAGTTAGATGGTCGTGACC
CGAGTGGATATGTTGGGTGTATGTGGTCCATATGCGGCGTTCACGATCAGGGATGGAAAG
AGAGACAGGTGTTTGGGAAGATACGGTACATGAACTACGCGGGTTGCAAACGGAAGTTCG
ATGTGGATAGTTACATCTCTTATGTCAAGAGTTTGGTGTCAGTAACAAAGAAGAAGAGGA
AAGCTGAAGAACAGCTCACAAGAGACTCTATTGACCACCGCAAAGCTAATTAGTACTTAC
TATTAAATCTAAACTTCTTTATGTTGTTGTTATGCAATCTTGCTCTGTGTTTGGCATTTA
ATTTTTATTCAAGTGACTGATTGCTGG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL7659Contig1 1215 2 4 U
GGATGAGCAAATCTCACGGATGTTTTAGCTCTCGAGAGATTCCGCCATGGATGTCGCTTC
TGCTCGGGGCATCATCTCTTCACATCCTCCTCCATATTATAGTAAACCAATTTGTTCATC
ACAGTCATCGTTGATTCGCATTACGATCAATAAAGGATGTTTATTTGGTCGTGTTTCGAG
CTTGAGTACTACTTCCCTTCATGCTGCTCCTAGAGGAGAAACAAGGCGTACTGGTTGTGT
ACAGTGGTGTAACCGCTCTATAAGATGTGACAAGAACTCACGGAGGCTAGTTAGTGTGAG
GTCGGATCTTTCAGGAGCTGCTGCAACCCCTGAATCTACTACTTATCCAGAACCAGAGAT
TAAGTTGAGCTCAAGACTCAGAGGGATATGCTTTTGCCTCGTCGCTGGCGTTTCCGCCAT
CGTTCTCATCGTCCTGATGATTATTGGCCATCCTTTTGTACTTCTCTCTGACCGCTATAG
GAGAAAGTTCCATCACTTCGTTGCTAAACTCTGGGCATCCATAAGCATCTACCCGTTCTA
CAAAACCGACATCCAGGGTTTGGAGAATCTGCCGTCATCGGACACTCCTTGTGTATATGT
TTCAAACCACCAGAGTTTTCTGGATATATACACGCTTCTCAGCCTTGGCCAAAGCTATAA
GTTCATCAGCAAGACGGGGATATTCGTTATTCCTGTTATTGGTTGGGCTATGTCCATGAT
GGGCGTTGTTCCCTTGAAGCGGATGGACCCAAGAAGCCAAGTGGATTGCTTGAAACGATG
CATGGAGCTAGTGAAGAAGGGAGCATCTGTGTTTTTCTTCCCGGAAGGAACGCGGAGTAA
GGATGGTCGGTTAGGTCCTTTCAAGAAAGGTGCGTTTACGGTAGCAGCTAAGACAGGAGT
TCCAGTAGTGCCAATAACGCTGATGGGAACAGGGAAGATCATGCCTACGGGTAGTGAAGG
TATACTGAATCATGGGAATGTGAGAGTGATCATCCACAAGCCGATATACGGAAGCAAAGC
TGATGTTCTTTGTGACGAGGCCAGGAACAAGATAGCTGAATCTATAAATCTCTTAAGCTG
AAACCTTGTTTTTACTTGTTTTTCTAATCAGTGGCTCTGATGAAACAATGAGAAAGGCTA
TGTCAATTTTTACATGTGGAAGAACAAAACATGTTCGGAATTATTGTTTTAAAAATAAAA
TTAGGCTTTTCTATT


BQ
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AF RR4GL82TF U 1
AF RR4GL82JQ C 489
BS 1 678 RR4GL82TF
BS 679 679 RR4GL82JQ
BS 680 692 RR4GL82TF
BS 693 1215 RR4GL82JQ

RD RR4GL82TF 692 0 0
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TGCTCGGGGCATCATCTCTTCACATCCTCCTCCATATTATAGTAAACCAATTTGTTCATC
ACAGTCATCGTTGATTCGCATTACGATCAATAAAGGATGTTTATTTGGTCGTGTTTCGAG
CTTGAGTACTACTTCCCTTCATGCTGCTCCTAGAGGAGAAACAAGGCGTACTGGTTGTGT
ACAGTGGTGTAACCGCTCTATAAGATGTGACAAGAACTCACGGAGGCTAGTTAGTGTGAG
GTCGGATCTTTCAGGAGCTGCTGCAACCCCTGAATCTACTACTTATCCAGAACCAGAGAT
TAAGTTGAGCTCAAGACTCAGAGGGATATGCTTTTGCCTCGTCGCTGGCGTTTCCGCCAT
CGTTCTCATCGTCCTGATGATTATTGGCCATCCTTTTGTACTTCTCTCTGACCGCTATAG
GAGAAAGTTCCATCACTTCGTTGCTAAACTCTGGGCATCCATAAGCATCTACCCGTTCTA
CAAAACCGACATCCAGGGTTTGGAGAATCTGCCGTCATCGGACACTCCTTGTGTATATGT
TTCAAACCACCAGAGTTTTCTGGATATATACACGCTTCTCAGCCTTGGCCAAAGCTATAA
GTTCATCAGCAAGACGGG*ATATTCGTTATTC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4GL82JQ 727 0 0
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ACATCCAGGGTTTGGAGAATCTGCCGTCATCGGACACTCCTTGTGTATATGTTTCAAACC
ACCAGAGTTTTCTGGATATATACACGCTTCTCAGCCTTGGCCAAAGCTATAAGTTCATCA
GCAAGACGGGGATATTCGTTATTCCTGTTATTGGTTGGGCTATGTCCATGATGGGCGTTG
TTCCCTTGAAGCGGATGGACCCAAGAAGCCAAGTGGATTGCTTGAAACGATGCATGGAGC
TAGTGAAGAAGGGAGCATCTGTGTTTTTCTTCCCGGAAGGAACGCGGAGTAAGGATGGTC
GGTTAGGTCCTTTCAAGAAAGGTGCGTTTACGGTAGCAGCTAAGACAGGAGTTCCAGTAG
TGCCAATAACGCTGATGGGAACAGGGAAGATCATGCCTACGGGTAGTGAAGGTATACTGA
ATCATGGGAATGTGAGAGTGATCATCCACAAGCCGATATACGGAAGCAAAGCTGATGTTC
TTTGTGACGAGGCCAGGAACAAGATAGCTGAATCTATAAATCTCTTAAGCTGAAACCTTG
TTTTTACTTGTTTTTCTAATCAGTGGCTCTGATGAAACAATGAGAAAGGCTATGTCAATT
TTTACATGTGGAAGAACAAAACATGTTCGGAATTATTGTTTTAAAAATAAAATTAGGCTT
TTCTATT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7660Contig1 556 2 2 U
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TTCCACCACTGCCAAGATAAACCATGTTAAGGAAAGTGTGAGAGAGGCCCTCCTTTCATG
GGAAAGGATTTCTAAAAAGATTGATGAGGAGTTGTCAAAGATTTCATCTGATGTTCAGCT
TGGAACAGAGAAGAACGTGGAGAAAAGGTCTGAATCTTTCCAGACCGTGGAAGTAGTGTT
GCTTTGTAGACGTGAAAACAATGATGAGGAGGAAGAATCCGAAGTCGATGATCTCAACAG
TGCCATGGGATCTTCAAAACGCATCCAAGTAGATGAACATGAATTTTCAGATTCCAAGTT
CCAAGACACGGCAAAGGACGAACTTACCGGCGAGGATGTCGGGGATGTCGATATATCCAA
ATAAATGAGAGCTTATAATTGACTTTGTTCACTTAAAGCATGCCGTAGGTGTCCAAGCAA
ATCTATAAACTAAATCTATAATTGATTTTCTGGAGGAGACCATTTTTCTAGTATTATATT
ACCATCAGATATTCAC


BQ
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AF RR4BD16JQ C 1
AF RR4BD16TF U 170
BS 1 169 RR4BD16JQ
BS 170 556 RR4BD16TF

RD RR4BD16JQ 556 0 0
GAAGGCCTCCTTGACTGCATTGGCATCACAATTAAGAAGTTTGATTAAGGACCAAATAGA
TTCCACCACTGCCAAGATAAACCATGTTAAGGAAAGTGTGAGAGAGGCCCTCCTTTCATG
GGAAAGGATTTCTAAAAAGATTGATGAGGAGTTGTCAAAGATTTCATCTGATGTTCAGCT
TGGAACAGAGAAGAACGTGGAGAAAAGGTCTGAATCTTTCCAGACCGTGGAAGTAGTGTT
GCTTTGTAGACGTGAAAACAATGATGAGGAGGAAGAATCCGAAGTCGATGATCTCAACAG
TGCCATGGGATCTTCAAAACGCATCCAAGTAGATGAACATGAATTTTCAGATTCCAAGTT
CCAAGACACGGCAAAGGACGAACTTACCGGCGAGGATGTCGGGGATGTCGATATATCCAA
ATAAATGAGAGCTTATAATTGACTTTGTTCACTTAAAGCATGCCGTAGGTGTCCAAGCAA
ATCTATAAACTAAATCTATAATTGATTTTCTGGAGGAGACCATTTTTCTAGTATTATATT
ACCATCAGATATTCAC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4BD16TF 387 0 0
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GAAGTAGTGTTGCTTTGTAGACGTGAAAACAATGATGAGGAGGAAGAATCCGAAGTCGAT
GATCTCAACAGTGCCATGGGATCTTCAAAACGCATCCAAGTAGATGAACATGAATTTTCA
GATTCCAAGTTCCAAGACACGGCAAAGGACGAACTTACCGGCGAGGATGTCGGGGATGTC
GATATATCCAAATAAATGAGAGCTTATAATTGACTTTGTTCACTTAAAGCATGCCGTAGG
TGTCCAAGCAAATCTATAAACTAAATCTATAATTGATTTTCTGGAGGAGACCATTTTTCT
AGTATTATATTACCATCAGATATTCAC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

CO CL7661Contig1 720 2 3 U
GGGAGAAACCAGTGGAGTTCCGGTCTTTTTTCCTGTCTCGGCCGAAACGATGAGTTCTGC
AGCAGCGATCTCGAAGGTTTGTCTCCTTGGAAGTGTGGCTCCATGTGTGTTGTATGGAAG
CAATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCCGGAACGTTTTCCAATCACTGCTTGACGTACTT
AGGGTTGTACTTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTC
TTATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTGAGGCGAT
GAACAGGTCATGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGGGAGCATAT
GGAGACGACTTGTGACTTTGTGACACATGTTCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGA
AGGCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTACTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACTGTGGT
CGTGCTTCCACCAAGTGAGCAAACCATGGGACGCAAGTGAAAAGCTTGCGTTGAGTCACG
TGTCCTAAATAACACTTGTATACGCACAGTGAAGTGTGAACTAATGTTTGTCTCTTGCTT
GCTTTTGTCGCATGTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTTTCTTCAACGCATGCAACACATATG
TATATCTTTATTGTTACGCACTTTGTTTTGATATGGTAATGTAATATTCAATAAAGTTTT


BQ
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AF RR4GS61JQ C 1
AF RR4GS61TF U 71
BS 1 70 RR4GS61JQ
BS 71 703 RR4GS61TF
BS 704 720 RR4GS61JQ

RD RR4GS61JQ 720 0 0
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CAATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCCGGAACGTTTTCCAATCACTGCTTGACGTACTT
AGGGTTGTACTTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTC
TTATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTGAGGCGAT
GAACAGGTCATGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGGGAGCATAT
GGAGACGACTTGTGACTTTGTGACACATGTTCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGA
AGGCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTACTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACTGTGGT
CGTGCTTCCACCAAGTGAGCAAACCATGGGACGCAAGTGAAAAGCTTGCGTTGAGTCACG
TGTCCTAAATAACACTTGTATACGCACAGTGAAGTGTGAACTAATGTTTGTCTCTTGCTT
GCTTTTGTCGCATGTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTTTCTTCAACGCATGCAACACATATG
TATATCTTTATTGTTACGCACTTTGTTTTGATATGGTAATGTAATATTCAATAAAGTTTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4GS61TF 636 0 0
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AGGCTTGGGTCTGCTCCCGGAACGTTTTCCAATCACTGCTTGACGTACTTAGGGTTGTAC
TTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTTATTCCAGC
CGCTCTGCCATTCGCCGAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTGAGGCGATGAACAGGTCA
TGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGGGAGCATATGGAGACGACT
TGTGACTTTGTGACACATGTTCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGAAGGCCGTGAG
ATCCGCAGGAAGGTACTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACTGTGGTCGTGCTTCCA
CCAAGTGAGCAAACCATGGGACGCAAGTGAAAAGCTTGCGTTGAGTCACGTGTCCTAAAT
AACACTTGTATACGCACAGTGAAGTGTGAACTAATGTTTGTCTCTTGCTTGCTTTTGTCG
CATGTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTTTCTTCAACGCATGCAACACATATGTATATCTTTA
TTGTTACGCACTTTGTTTTGATATGGTAATGTA
TAT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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GAATCTTTCCGATAACTTCTGCTGAATATCCTCTTGGTGCAGGATTATAGTCTTCACCAT
ATAAGATGTTTCCTGGTAGTTAGCTAGCTATGTGTGACTCTATTTGTAGCTTGTGGCATT
GGAAATGATGTACTTAGCACATATGTGAGTCCTTACTGAATGAATCCCAATGATTCGATG
TCCGTTAGATGTAATATGATCAATTAGCATTGTAAATCATTTTGTAAATCCAAGAACTTT
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CGTGCTGAGATTTTGGTTTTTCTCTGTGGGGTCTGTCTCCAGGGTGTTGGTGTTTTAGCA
AAGAGCACCACTTTTGCCAAGAATCCACGGCAACTGCAATACGAAGCCGATATTAACAAG
CTTTTTATGTTTACAAGCTATAACCGTTTGGTACGATATGCTGAGGAGGCTGATGCAGAA
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GATAATATTCCACTGCAGACAG


BQ
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AF RR4EA33TF U 1
AF RR4E685TF U 1
BS 1 802 RR4E685TF

RD RR4EA33TF 759 0 0
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ATAAGATGTTTCCTGGTAGTTAGCTAGCTATGTGTGACTCTATTTGTAGCTTGTGGCATT
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GATGTAATAAATGTTTCTGAGACTCTGAAAACATCAGTCTGCTCCAAATACTATATCAAA
CGTGCTGAGATTTTGGTTTTTCTCTGTGGGGTCTGTCTCCAGGGTGTTGGTGTTTTAGCA
AAGAGCACCACTTTTGCCAAGAATCCACGGCAACTGCAATACGAAGCCGATATTAACAAG
CTTTTTATGTTTACAAGCTATAACCGTTTGGTACGATATGCTGAGGAGGCTGATGCAGAA
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QA 1 759 1 759
DS 

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GGAAATGATGTACTTAGCACATATGTGAGTCCTTACTGAATGAATCCCAATGATTCGATG
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GATGTAATAAATGTTTCTGAGACTCTGAAAACATCAGTCTGCTCCAAATACTATATCAAA
CGTGCTGAGATTTTGGTTTTTCTCTGTGGGGTCTGTCTCCAGGGTGTTGGTGTTTTAGCA
AAGAGCACCACTTTTGCCAAGAATCCACGGCAACTGCAATACGAAGCCGATATTAACAAG
CTTTTTATGTTTACAAGCTATAACCGTTTGGTACGATATGCTGAGGAGGCTGATGCAGAA
GAGATCATTGAGATGGCTGGCAAAGCCGCTTTATCTGAACAACAGAAGCAAGTACAAGAG
AACATTCACTACCAGCTCCAAAACTTTTGTGCTTCGATGGACGAGATTCTTCTTCTTCCT
CATAACGACAAACAGAGGAGCTATACGAGTCAGATCAGAAGCTTTCGCCATTGGTAAAAT
GATAATATTCCACTGCAGACAG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTTTTTGGCAAATTGTGTCGCAAATCACAGATGTATATTTATTATTTATTACAAGATG
TTGACATTGGGTTTCATTTTGTTATCGTAGTTTGTAAAAAAAAGTTGACAAAATTACACA
AAAGATTAAATAAAGCAGAAAAATGTATTACACAGTTCATGCTGACACGCCTCAAAGGAC
GAAGATGACTTTCACACCCCACCCGGATCCGAATCCGTTTTAGTTCTGTATTGTTCTTCT
ACGCCTGGGACAACCATACCAGGTTGATGATGATACATCTGAACCGGACCGGATGCATTC
ATACCATAATAAGCAGTACGGTTGACTCCATCAACTGCCATCATAACCGGCCTACCCGTT
TCACCATATACTTGACCCAGACCAGGAATCTGATGAGGCTGTGGTTGGTGATGGTATCCC
ATCGGTACATGCTGGTATTGTGGAATACGCTGACCCGGCATTAGAACCGGTTGAACCATA
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ATATAAACCGGTGGTTGGTAATGAAACTGTGGGCCAGGGGCAACGTACTGCCATTGCGAG
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BQ
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AF RR4DK87TF C 1
AF RR4DK87JQ U 9
BS 1 8 RR4DK87TF
BS 9 646 RR4DK87JQ

RD RR4DK87TF 646 0 0
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TTGACATTGGGTTTCATTTTGTTATCGTAGTTTGTAAAAAAAAGTTGACAAAATTACACA
AAAGATTAAATAAAGCAGAGAAATGTATTACACAGTTCATGCTGACACGCCTCAAAGGAC
GAAGATGACTTTCACACCCCACCCGGATCCGAATCCGTTTTAGTTCTGTATTGTTCTTCT
ACGCCTGGGACAACCATACCAGGTTGATGATGATACATCTGAACCGGACCGGATGCATTC
ATACCATAATAAGCAGTACGGTTGACTCCATCAACTGCCATCATAACCGGCCTACCCGTT
TCACCATATACTTGACCCAGACCAGGAATCTGATGAGGCTGTGGTTGGTGATGGTATCCC
ATCGGTACATGCTGGTATTGTGGAATACGCTGACCCGGCATTAGAACCGGTTGAACCATA
TGATTATTCTGTTGAACCATATGATTACCTGGTTGAACCATATGACTGCCCGGTTGAACC
ATATAAACCGGTGGTTGGTAATGAAACTGTGGGCCAGGGGCAACGTACTGCCATTGCGAG
TTAACCGGAATCTGTTGAATTACTCGCTCCGGTTGAGGATCGGCTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DK87JQ 638 0 0
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GGGTTTCATTTTGTTATCGTAGTTTGTAAAAAAAAGTTGACAAAATTACACAAAAGATTA
AATAAAGCAGAAAAATGTATTACACAGTTCATGCTGACACGCCTCAAAGGACGAAGATGA
CTTTCACACCCCACCCGGATCCGAATCCGTTTTAGTTCTGTATTGTTCTTCTACGCCTGG
GACAACCATACCAGGTTGATGATGATACATCTGAACCGGACCGGATGCATTCATACCATA
ATAAGCAGTACGGTTGACTCCATCAACTGCCATCATAACCGGCCTACCCGTTTCACCATA
TACTTGACCCAGACCAGGAATCTGATGAGGCTGTGGTTGGTGATGGTATCCCATCGGTAC
ATGCTGGTATTGTGGAATACGCTGACCCGGCATTAGAACCGGTTGAACCATATGATTATT
CTGTTGAACCATATGATTACCTGGTTGAACCATATGACTGCCCGGTTGAACCATATAAAC
CGGTGGTTGGTAATGAAACTGTGGGCCAGGGGCAACGTACTGCCATTGCGAGTTAACCGG
AATCTGTTGAATTACTCGCTCCGGTTGAGGATCGGCTC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL7665Contig1 818 2 2 U
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GGAGAGAAGCCTTCTTTATTCAAAGAGTGGAATGCATCACTCAGTCCCTGAATCTGTGGA
AAACAATGGTGGTTCAGTCCCTGTTGATCATCATGAGGTTGTGAATCACAGATCATCTGC
AAATGGATCACCTCAACGATCGGACAGCGTTGATAGTTTAAAGGTCGAAACTCCGACGAG
GAAAGGTTTTGGTTTGAAGAAATGGAGAAGGATCAAAAGAGATGGTCCTGTGAAGGACGA
GGCTACTACTACTACTACTACACCTGCTGGTGATGATGGTAGTAAATTGCTGAAGCGTGG
ATTGACTGGTTTGGTGAATCCTCCTTTGAAACATGTAGACTTGTCTTCCGTTGAAGCTAG
GCAGAGTAGTGAAGGCTCTGTTGGGTCTGTGAACATGGCGGTCCATCATCATCTTCAAGG
TTTAGCTGCAAACGGATTTAGTACCGGTCCAGGTTTTATGGTTAATGTAGGCCAAGGTTT
TGAGAAGAGTGAAGAAGAGCTTAGTGGTAACTCCATAGCTGCAAAGAATGTAGGAGGAGA
GAAGATTCTGAACCAAACCGTGGAAACATGTTGGGGAAAGCATGCAAGTCCAGTTTCTAT
TTCTTGACACAGTTGATCTTGCTCGTCTTCATACTTCGGCTATTGCTCCTCCAGGGCTCT
CCTGCTTCACGATTAGTTATACCAACTTGAAAACAGTCCCTAGACTTCACCGTTCATGTT
GTGTTACCAAACCTTTTTATTTACCCAGATTTCCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FC06TF U 1
AF RR4FC06JQ C 145
BS 1 782 RR4FC06TF
BS 783 818 RR4FC06JQ

RD RR4FC06TF 782 0 0
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GGAGAGAAGCCTTCTTTATTCAAAGAGTGGAATGCATCACTCAGTCCCTGAATCTGTGGA
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AAATGGATCACCTCAACGATCGGACAGCGTTGATAGTTTAAAGGTCGAAACTCCGACGAG
GAAAGGTTTTGGTTTGAAGAAATGGAGAAGGATCAAAAGAGATGGTCCTGTGAAGGACGA
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GCAGAGTAGTGAAGGCTCTGTTGGGTCTGTGAACATGGCGGTCCATCATCATCTTCAAGG
TTTAGCTGCAAACGGATTTAGTACCGGTCCAGGTTTTATGGTTAATGTAGGCCAAGGTTT
TGAGAAGAGTGAAGAAGAGCTTAGTGGTAACTCCATAGCTGCAAAGAATGTAGGAGGAGA
GAAGATTCTGAACCAAACCGTGGAAACATGTTGGGGAAAGCATGCAAGTCCAGTTTCTAT
TTCTTGACACAGTTGATCTTGCTCGTCTTCATACTTCGGCTATTGCTCCTCCAGGGCTCT
CCTGCTTCACGATTAGTTATACCAACTTGAAAACAGTCCCTAGACTTCACCGTTCATGTT
GT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4FC06JQ 674 0 0
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TGCTGGTGATGATGGTAGTAAATTGCTGAAGCGTGGATTGACTGGTTTGGTGAATCCTCC
TTTGAAACATGTAGACTTGTCTTCCGTTGAAGCTAGGCAGAGTAGTGAAGGCTCTGTTGG
GTCTGTGAACATGGCGGTCCATCATCATCTTCAAGGTTTAGCTGCAAACGGATTTAGTAC
CGGTCCAGGTTTTATGGTTAATGTAGGCCAAGGTTTTGAGAAGAGTGAAGAAGAGCTTAG
TGGTAACTCCATAGCTGCAAAGAATGTAGGAGGAGAGAAGATTTTGAACCAAACCGTGGA
AACATGTTGGGGAAAGCATGCAAGTCCAGTTTCTATTTCTTGACACAGTTGATCTTGCTC
GTCTTCATACTTCGGCTATTGCTCCTCCAGGGCTCTCCTGCTTCACGATTAGTTATACCA
ACTTGAAAACAGTCCCTAGACTTCACCGTTCATGTTGTGTTACCAAACCTTTTTATTTAC
CCAGATTTCCAGTT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7666Contig1 1289 2 2 U
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CTTTCTCTCTGCTCTGCTCAAACCCTGGCGTAGAAGAGACTAATAACTGAAGCAGATCTA
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GCTCGCCGGCGATGACGATCTCCGTCTGTCTCCTCACCAATCTGCCGCCGGCAACGAGAA
TCTAGATCGGCGTCTTTTGAAAGATCTCGTTGAGATGGTTCCCCTCATCGAGCAATTCAT
GGAACAGAAAGAAAAGAGTTCGTTTAAGCGGCGAGGGTCCATGGTCTACACCAAGATGCC
TTCCAAAGAATCCTTGTCCAGAAGGGGAGAAATTCTTCTCAAACAAACCCAGGAAGGAAG
AAGAGAGAGGCAGAGGGGAATAACGACGCTGTGAACGATGCTAAGGAAGTTGGTGATAAC
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GACTTGCAGACAAAACTGTCCGAGAAAGAAGAGGTTTTAAAGTCAGTGGAACTATCAAAG
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AAGGATACGTTGATCAAGTCTATGCAGTTACAATTATCAGACGCAAAGATCAAACTTGCA
GACAGGCAAGCCGCACTTGAGAAGACTCAATGGGAAGCAAAGACAACAGGAACGAAAGCA
ATCAAGCTTCAAGAACAGCTAGATGCTGTTGAAGGAGAAATCTCTTCCTTCGCATGTGTA
TTTGAAACTTTGGCCAAACCAGAATCCAAGAAACTCGACAGGGATTATGATCCAACCCCA
TACCAATTTGATCATCTTCCATATCTAGACGATGTAGATGACACTGAACTGAGGAAAATG
GAAGACGCAAGACTAGCTTATGTTGCAGCTGTGACTACCGCAAAGGAAAGAGAAGATGAG
GAATCTCTAGCCATGGCTGCTAAAGCTCGAGCCTACTTACAATCTTTAGCCTTTAAATAT
TAATCATCTCCAGATACTTTCTTTTTTAGTATTCTCTGTCGTTGATTTACTAAGGTGTAT
GTAGGTTTGTACCATGAAAGAATCGGAGAGAAAAACAAACAGAAAGTAATGGTTTCTACT
AAATCACGAATGCATTTCGAGTTTTTGTT


BQ
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AF RR4A691TF U 1
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BS 1 815 RR4A691TF
BS 816 1289 RR4A691JQ

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CTTTCTCTCTGCTCTGCTCAAACCCTGGCGTAGAAGAGACTAATAACTGAAGCAGATCTA
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GCAGCAGCGGCATTTCGTGGATTTGCAAAGCGATTCTGGATTTGGGGATGATAGCTCGTG
GCTCGCCGGCGATGACGATCTCCGTCTGTCTCCTCACCAATCTGCCGCCGGCAACGAGAA
TCTAGATCGGCGTCTTTTGAAAGATCTCGTTGAGATGGTTCCCCTCATCGAGCAATTCAT
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TTCCAAAGAATCCTTGTCCAGAAGGGGAGAAATTCTTCTCAAACAAACCCAGGAAGGAAG
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GCAACGGCGTCGGCTGGTGCAGAAAAGGACGAACTTACAAGACTTAGAGAGCAAGTGAAC
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CGAGAAAGAAGAGGTTTTAAAGTCAGTGGAACTATCAAAGAGAAACCAGGTTAACGAGGT
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TATGCAGTTACAATTATCAGACGCAAAGATCAAACTTGCAGACAGGCAAGCCGCACTTGA
GAAGACTCAATGGGAAGCAAAGACAACAGGAACGAAAGCAATCAAGCTTCAAGAACAGCT
AGATGCTGTTGAAGGAGAAATCTCTTCCTTCGCATGTGTATTTGAAACTTTGGCCAAACC
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ATATCTAGACGATGTAGATGACACTGAACTGAGGAAAATGGAAGACGCAAGACTAGCTTA
TGTTGCAGCTGTGACTACCGCAAAGGAAAGAGAAGATGAGGAATCTCTAGCCATGGCTGC
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CTTTTTTAGTATTCTCTGTCGTTGATTTACTAAGGTGTATGTAGGTTTGTACCATGAAAG
AATCGGAGAGAAAAACAAACAGAAAGTAATGGTTTCTACTAAATCACGAATGCATTTCGA
GTTTTTGTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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TCTCCACCATCAGTAGAGTTTAGAGATGGAGATTTGTTTCCTGAACTGGAGGGGAGGATG
TCTGGGTTCCTGTTCCGTCTCCTGATCTGTCTGGCTGTGAAAGGGAGGCTGAAAGCTAGG
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CTGCAGCCAGCTATTGCTCCTCTAGTTAGAACTTCAGTCACTTTCTTCATGAACCTAGCA
GAAGCTTGTGCTTGCCTCTTCATGGCCTTGCTGAGCTCCTTGCATTTGGTCTTGAGCTTG
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BQ
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AF RR4G143JQ U 7
AF RR4G143TF C 1
BS 1 6 RR4G143TF
BS 7 649 RR4G143JQ
BS 650 768 RR4G143TF

RD RR4G143JQ 643 0 0
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TCAAATGCTTGGTACCTCCCCCAAACTTAAATCACACAGTCTCTGTGTTATTAAGCTGAA
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TTCCTGTTCCGTCTCCTGATCTGTCTGGCTGTGAAAGGGAGGCTGAAAGCTAGGAGACCA
GGATGAGGCTGAGGCTGAGGAGCGGAAGTGTCTCCTAGGTCGAAGTCTGCTGCACTGCAG
CCAGCTATTGCTCCTCTAGTTAGAACTTCAGTCACTTTCTTCATGAACCTAGCAGAAGCT
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GTTCTGTCCTGATGCTTGTTCCATCGCTCAAGCTTTCCAATGTGCTCGTGAGCGTCACGG
AGAGGACCGGGGGCTAAGGCTCCAGCATATGGCTGAAAGTGGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4G143TF 768 0 0
GGTTTTCTATGCAAATAGATATGTACAATGCATGGACTCAATGCAATAACAACAAGGCAA
ACATGATCAAATGCTTGGTAC*TCCCCCAAACTTAAATCACACAGTCTCTGTGTTATTAA
GCTGAAGGAGATACCCAAAAACAAAGCTAAATGCAAAGAAAAACTGATATATACAAGGAA
AGAGTGCAGGGGTACCTCTATGGAGTGTGAGTAGAGGCTGTGGCCTCTTCCTCGGAGTCT
TCTCCACCATCAGTAGAGTTTAGAGATGGAGATTTGTTTCCTGAACTGGAGGGGAGGATG
TCTGGGTTCCTGTTCCGTCTCCTGATCTGTCTGGCTGTGAAAGGGAGGCTGAGAGCTAGG
AGACCAGGATGAGGCTGAGGCTGAGGAGCGGAAGTGTCTCCTAGGTCGAAGTCTGCTGCA
CTGCAGCCAGCTATTGCTCCTCTAGTTAGAACTTCAGTCACTTTCTTCATGAACCTAGCA
GAAGCTTGTGCTTGCCTCTTCATGGCCTTGCTGAGCTCCTTGCATTTGGTCTTGAGCTTG
AAGATTGTTCTGTCCTGATGCTTGTTCCATCGCTCAAGCTTTCCAATGTGCTCGTGAGCG
TCACGGAGAGGACCGGGGGCTAAGGCTCCAGCATATGGCTGAAAGTGGTATCGACGAGGA
CCATAGACTACTTCAGTGGTGTCCTCAGCAATCTCATCTTTGTGCGAGCGTGCATATTGA
GCTGCTGACATACTCTGCCTCCTCTTGCTTGAAGCCATGGGGCCTAGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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AGATCTCTCTCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATG
CAAGCTACTTCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTC
TCCTTCAACCTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATATCTTGCGCGGCCAAACCA
GAGACAGTAGAGAAAGTGTCTAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAA
AAGGTCGTTGCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAG
ATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAG
ATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAA
TTTTAGTATGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCTTTTG
ATAAAAGAATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAATTAGTATCTGTATGCCATGGATATC
TCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACATATGATGAAGGAAAGCTTGTTTCCT


BQ
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AF RR4CU93JQ C 1
AF RR4CU93TF U 20
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BS 644 644 RR4CU93JQ
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AGATCTCTCTCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATG
CAAGCTACTTCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTC
TCCTTCAACCTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATATCTTGCGCGGCCAAACCA
GAGACAGTAGAGAAAGTGTCTAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAA
AAGGTCGTTGCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAG
ATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAG
ATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAA
TTTTAGTATGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCTTTTG
ATAAAAGAATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAATTAGTATCTGTATGCCATGGATATC
TCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACATATGATGAAGGAAAGCTTGTTTCCT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4CU93TF 639 0 0
TCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTCTCGTGAATAT
CGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATGCAAGCTACTTCTCTGGCAA
CATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTCTCCTTCAACCTGCGCCGTT
CGATCCCCACTCGCTTCTCAATATCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGAGAAAGTGT
CTAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGCAGAAACCA
AATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTGGAGG
AAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAAG
CTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATGGCTTTGTTG
GGTTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCTTTTGATAAAAGAATGTGTCATGC
GACTCTGTTGGTTTAATTAGTATCTGTATGCCATGGATATCTCTCTATTTGTCGACTGAA
AACTTTTGGTTACATATGATGAAG*AAAGCTTGTTTCCT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

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AAGGAAAGTGATGATGAATGCAGATAATGACAGTGGAGAATCGTGCGGAACATTTTGCTC
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AAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGC
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GCTTGTTCACTTTGATCGACCTCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGCCTCTCTTTGTTTTCA
CTTCTTTTTATTTTCCTTGTTTTCCAGATGAGAACTTGCTTAGGTTTTCCTCTTGCGTTC
TTTCTTTAATCTTATATTAATGTTGTAACTTAATGGTTAATTCTCTTGTGAGTGGGGCAT
TAACAACTGAGTTTCAATGGCTATATTTCAGACGGTG


BQ
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AF RR4C928JQ C 1
AF RR4C928TF U 1
BS 1 634 RR4C928TF
BS 635 637 RR4C928JQ

RD RR4C928JQ 637 0 0
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AAGGAAAGTGATGATGAATGCAGATAATGACAGTGGAGAATCGTGCGGAACATTTTGCTC
AGAAGAAGATAGTTCATATTACGACAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATC
AAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGC
TTGTTTCATGTACTTCATGGTTCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCA
GCTTGTTCACTTTGATCGACCTCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGCCTCTCTTTGTTTTCA
CTTCTTTTTATTTTCCTTGTTTTCCAGATGAGAACTTGCTTAGGTTTTCCTCTTGCGTTC
TTTCTTTAATCTTATATTAATGTTGTAACTTAATGGTTAATTCTCTTGTGAGTGGGGCAT
TAACAACTGAGTTTCAATGGCTATATTTCAGACGGTG

QA 1 637 1 637
DS 

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GCAGATCGTCAACTCGACCGAAGAGAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCGATCTCAGACAG
AACACTGGAGCTTAACTCTCACATATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCT
CAAGACAGGAGAGATTTACTACATAAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCC
AAGGAAAGTGATGATGAATGCAGATAATGACAGTGGAGAATCGTGCGGAACATTTTGCTC
AGAAGAAGATAGTTCATATTACGACAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATC
AAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGC
TTGTTTCATGTACTTCATGGTTCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCA
GCTTGTTCACTTTGATCGACCTCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGCCTCTCTTTGTTTTCA
CTTCTTTTTATTTTCCTTGTTTTCCAGATGAGAACTTGCTTAGGTTTTCCTCTTGCGTTC
TTTCTTTAATCTTATATTAATGTTGTAACTTAATGGTTAATTCTCTTGTGAGTGGGGCAT
TAACAACTGAGTTTCAATGGCTATATTTCAGACG
TG

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7670Contig1 1077 2 2 U
GGGGGGAGGTTGAAATGTCGGCAAAGTTGCCTCTATCTCCTATTAGCCATCAGTTATGTC
GGAGCAGCTCCAGGTTCTTGAACACCGCCACGACACCCCGGTTCTGTTCTCCGGTTTCTT
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CGGTTACAAAGGGTACTCTATTGCATGACCTCGGAGCCACCGGGGCAGTTCTTGGTGGAG
CCTACGCGCTCGTCTTGACCTTCGAGAGTCTCACGAAGCGAAACGTGGTTTCACGGAGAT
TGAGTAGAAAGCTTGTGCACATACTCTCAGGTCTGCTTTTTGTACTCTCGTGGCCAATCT
TCAGCGCATCGAAGGAGGCTAGATACTTTGCTGCTTTAGTTCCACTAGTGAATTGCGTAA
AGCTTGTTGTCAATGGATTATCCGTCTCTCCCAATTCCACGCTAATCAAATCCGTCACTA
GAGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAGAGGACCATTGTTCTACGTTCTAGCGCTTCTCG
TCTCTGCAGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTATCGGTATGATCTCGTTGGCAATGATGT
GTGGTGGTGACGGAATAGCTGATGTCATGGGACGTAAATTTGGATCACAGAAGATACCTT
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CCATCGGGTTACTTTACTTTTACTCAAGCATTGGGTACCTTCACGTGAACTGGGAAACAA
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CCGATCAATTAGACGACAATGTCTCGGTTCCTCTGGCTACTATTTTTGCTGCTTATGTAA
GTTTTGGATATTAGATTGCATCAACATCCCTCATAAACCGAACAAAATGCGTCTGTATCA
CTTTGTGCATCTGACCTAGGAGTTTAGGCATGTAGCCAACACATATGCTAGTAGTTGTAT
TACTTGTATTTCTTTTAGCTCTGCATCATTTACATAACTGCTCAAAGATTCATAATT


BQ
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AF RR4DA37TF U 1
AF RR4DA37JQ C 296
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GGAGCAGCTCCAGGTTCTTGAACACCGCCACGACACCCCGGTTCTGTTCTCCGGTTTCTT
ATCCTTACCTCATCGGCTCGTCCAGTCAGTTACGGGCTCACCACCCTCTGATCTCTTTCG
CGGTTACAAAGGGTACTCTATTGCATGACCTCGGAGCCACCGGGGCAGTTCTTGGTGGAG
CCTACGCGCTCGTCTTGACCTTCGAGAGTCTCACGAAGCGAAACGTGGTTTCACGGAGAT
TGAGTAGAAAGCTTGTGCACATACTCTCAGGTCTGCTTTTTGTACTCTCGTGGCCAATCT
TCAGCGCATCGAAGGAGGCTAGATACTTTGCTGCTTTAGTTCCACTAGTGAATTGCGTAA
AGCTTGTTGTCAATGGATTATCCGTCTCTCCCAATTCCACGCTAATCAAATCCGTCACTA
GAGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAGAGGACCATTGTTCTACGTTCTAGCGCTTCTCG
TCTCTGCAGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTATCGGTATGATCTCGTTGGCAATGATGT
GTGGTGGT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4DA37JQ 782 0 0
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AATCTTCAGCGCATCGAAGGAGGCTAGATACTTTGCTGCTTTAGTTCCACTAGTGAATTG
CGTAAAGCTTGTTGTCAATGGATTATCCGTCTCTCCCAATTCCACGCTAATCAAATCCGT
CACTAGAGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAGAGGACCATTGTTCTACGTTCTAGCGCT
TCTCGTCTCTGCAGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTATCGGTATGATCTCGTTGGCAAT
GATGTGTGGTGGTGACGGAATAGCTGATGTCATGGGACGTAAATTTGGATCACAGAAGAT
ACCTTACAACCCAAGGAAGAGCATAGCGGGAAGCATCTCCATGTTCATATTCGGCTTCTT
CGTCTCCATCGGGTTACTTTACTTTTACTCAAGCATTGGGTACCTTCACGTGAACTGGGA
AACAACCTTTACCAAAGTCGCGATAGTCTCAATGGTCGCTACGTTGGTCGAGTCATTACC
CATCACCGATCAATTAGACGACAATGTCTCGGTTCCTCTGGCTACTATTTTTGCTGCTTA
TGTAAGTTTTGGATATTAGATTGCATCAACATCCCTCATAAACCGAACAAAATGCGTCTG
TATCACTTTGTGCATCTGACCTAGGAGTTTAGGCATGTAGCCAACACATATGCTAGTAGT
TGTATTACTTGTATTTCTTTTAGCTCTGCATCATTTACATAACTGCTCAAAGATTCATAA
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL7671Contig1 482 2 1 U
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GGATGATGGCGAAGAGAATCGGTGGAACCGGGAAAAATAGGGGGGAAGACTCAACCATCT
TGGGGAGGATCTCCAACTCCGAGATCGTATCTCACGGAGGACGCGCCGCCGGAGAAGCCG
TCGGAGTGTCGAAGAAATTGCTGTGGAGCACGGGAAAAGCGGCGTGGATCGCTGGTACGA
CGTTTCTCATCCTCGTTGTTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCGCAGCTCAACG
AAATAGATCTTCAACAGGCTAGTCTCCTCGGAGCTCCGGCGCAGCCTATGCAGAGGGGTT
TCTAGTTTAAACCCTATGAACTGAGGGTTCTTGCTGTTTTGTCTGATTTTTTTTCTTTAT
TACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATATTTATAACATGTTGTGATTTCTTT
CG


BQ
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20 20 

AF RR4AZ91JQ C 1
AF RR4AZ91TF U 1
BS 1 482 RR4AZ91TF

RD RR4AZ91JQ 482 0 0
GGGTCGCCCGCTCTCACCTCCTCCTTTCCGCAAAGCCAAATAAAAAAAGTCAATATCAGT
GGATGATGGCGAAGAGAATCGGTGGAACCGGGAAAAATAGGGGGGAAGACTCAACCATCT
TGGGGAGGATCTCCAACTCCGAGATCGTATCTCACGGAGGACGCGCCGCCGGAGAAGCCG
TCGGAGTGTCGAAGAAATTGCTGTGGAGCACGGGAAAAGCGGCGTGGATCGCTGGTACGA
CGTTTCTCATCCTCGTTGTTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCGCAGCTCAACG
AAATAGATCTTCAACAGGCTAGTCTCCTCGGAGCTCCGGCGCAGCCTATGCAGAGGGGTT
TCTAGTTTAAACCCTATGAACTGAGGGTTCTTGCTGTTTTGTCTGATTTTTTTTCTTTAT
TACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATATTTATAACATGTTGTGATTTCTTT
CG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR4AZ91TF 482 0 0
GGGTCGCCCGCTCTCACCTCCTCCTTTCCGCAAAGCCAAATAAAAAAAGTCAATATCAGT
GGATGATGGCGAAGAGAATCGGTGGAACCGGGAAAAATAGGGGGGAAGACTCAACCATCT
TGGGGAGGATCTCCAACTCCGAGATCGTATCTCACGGAGGACGCGCCGCCGGAGAAGCCG
TCGGAGTGTCGAAGAAATTGCTGTGGAGCACGGGAAAAGCGGCGTGGATCGCTGGTACGA
CGTTTCTCATCCTCGTTGTTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCGCAGCTCAACG
AAATAGATCTTCAACAGGCTAGTCTCCTCGGAGCTCCGGCGCAGCCTATGCAGAGGGGTT
TCTAGTTTAAACCCTATGAACTGAGGGTTCTTGCTGTTTTGTCTGATTTTTTTTCTTTAT
TACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATATTTATAACATGTTGTGATTTCTTT
CG

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL7672Contig1 1092 2 2 U
GGATCGATTCCCCTTTCCCCTTTTAAAACACATTTCCTTTTTTTCTCACCGTCTCCTCGT
TTATACCAAACACTGTTCTTTACCTTTTCATCTTCTCTCCCTGTCCGAATCATAACCATA
AAACACACACAGATTGAATGGGAGCTGGTACGACTGTGGGAGATCGAGTACGGAAAGATC
TCTCTGAGATTTCAAACAAACCGAATATTCCAACGACAAAAACCATCGTTTCCGCCTCTC
GGAAGAAGATCCACCGGCGGAGCAAGAAGGCTGTGATCTCTCCGGTGCAGAAGCTGTTCG
AAACTTGCAAGAAAGTTTTCGCTAATGGCAAATCCGGAGCCGTCCCGTCTCAAGTACACA
TTAACATGCTTCGAGCCGTTCTGGACGAAATCAAGCCTGAAGATGTTGATGTGAGCCCTA
AGATGCCGTATTTTCGATCTAAATCGATCGGACGGCCTCCAGTGACGTATCTCCACATCT
ACAAATGTCATAGCTTCTCGATGGGCATTTTCTGTTTACCACCGTCTGGTGTAATCCCAC
TTCACAATCACCCGGAGATGACTGTGTTTAGTAAGCTCTTGTTTGGTACAATGCACATCA
AATCATATGACTGGGTCGCTGATTCTCCCCAGCCGAGTTCGGATACTCGTTTGGCGAAAG
TGAAAGTAGATTCAGACTTCACGGCACCTTGTGACACTTCTATACTCTACCCTGCCGATG
GAGGGAATATGCATTGCTTCACCGCGATAACGGCTTGTGCGGTTCTTGATGTTCTTGGTC
CTCCATACTCCGATCCTGCAGGACGTCACTGTACTTACTACTTCGATCACCCCTTCTCAA
GCTTTTCAGTTGATGGAGTTGAGGTTGGGGAAGAGGAGAAGGAAGAGTATGAGTGGTTGA
AGGAGAGGGAAGAGGAGCCTGAGGATTTGACGGTTACGGCGATGATGTATAGTGGACCAA
TCATCAAAGAATGAATGTGTAGGAAGAAAAAAAAAGTCTCTTTTTTTGTTGTTTTTTAAC
TTTTCTCTGTGTGGTTTTCGGGTTTCTGTTGTTGGGTTTTGTCTGTATATAAAAAGAAGT
CTTTGAAAGTAC


BQ
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AF RR4G204TF U 1
AF RR4G204JQ C 398
BS 1 479 RR4G204TF
BS 480 1092 RR4G204JQ

RD RR4G204TF 479 0 0
GGATCGATTCCCCTTTCCCCTTTTAAAACACATTTCCTTTTTTTCTCACCGTCTCCTCGT
TTATACCAAACACTGTTCTTTACCTTTTCATCTTCTCTCCCTGTCCGAATCATAACCATA
AAACACACACAGATTGAATGGGAGCTGGTACGACTGTGGGAGATCGAGTACGGAAAGATC
TCTCTGAGATTTCAAACAAACCGAATATTCCAACGACAAAAACCATCGTTTCCGCCTCTC
GGAAGAAGATCCACCGGCGGAGCAAGAAGGCTGTGATCTCTCCGGTGCAGAAGCTGTTCG
AAACTTGCAAGAAAGTTTTCGCTAATGGCAAATCCGGAGCCGTCCCGTCTCAAGTACACA
TTAACATGCTTCGAGCCGTTCTGGACGAAATCAAGCCTGAAGATGTTGATGTGAGCCCTA
AGATGCCGTATTTTCGATCTAAATCGATCGGACGGCCTCCAGTGACGTATCTCCACATC

QA 1 479 1 479
DS 

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TCCAGTGACGTATCTCCACATCTACAAATGTCATAGCTTCTCGATGGGCATTTTCTGTTT
ACCACCGTCTGGTGTAATCCCACTTCACAATCACCCGGAGATGACTGTGTTTAGTAAGCT
CTTGTTTGGTACAATGCACATCAAATCATATGACTGGGTCGCTGATTCTCCCCAGCCGAG
TTCGGATACTCGTTTGGCGAAAGTGAAAGTAGATTCAGACTTCACGGCACCTTGTGACAC
TTCTATACTCTACCCTGCCGATGGAGGGAATATGCATTGCTTCACCGCGATAACGGCTTG
TGCGGTTCTTGATGTTCTTGGTCCTCCATACTCCGATCCTGCAGGACGTCACTGTACTTA
CTACTTCGATCACCCCTTCTCAAGCTTTTCAGTTGATGGAGTTGAGGTTGGGGAAGAGGA
GAAGGAAGAGTATGAGTGGTTGAAGGAGAGGGAAGAGGAGCCTGAGGATTTGACGGTTAC
GGCGATGATGTATAGTGGACCAATCATCAAAGAATGAATGTGTAGGAAGAAAAAAAAAGT
CTCTTTTTTTGTTGTTTTTTAACTTTTCTCTGTGTGGTTTTCGGGTTTCTGTTGTTGGGT
TTTGTCTGTATATAAAAAGAAGTCTTTGAAAGTAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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CTCATTACTTCTTGGTTTTTATTAAGAAAGTGGTGGAAATTAGGTTCTTT


BQ
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AF RR4EP67JQ C 1
AF RR4EP67TF U 1
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BS 640 650 RR4EP67JQ

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QA 1 650 1 650
DS 

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CCGCTTAATTTGATTCATAATTCACAAGAATCGAAATGTTGCAGAGTAGAGGGCAACAAA
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GGAACTAGCTAAGTGGCATATTGCTTATCTGAAGATTTTTAGATCTCAATCTTATCACAA
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CTCATTACTTCTTGGTTTTTATTAAGAAAGTGGTGGAAA

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL7674Contig1 1288 2 2 U
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TATGTATAAATGGTGCTTACATTGATCT


BQ
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AF RR4EQ09TF U 1
AF RR4EQ09JQ C 602
BS 1 656 RR4EQ09TF
BS 657 1288 RR4EQ09JQ

RD RR4EQ09TF 656 0 0
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AAAGAGTTTGGTCCTCTTCTTCGTCTTCCCTCTGCAGTAGGGATTGTCTTTCAGGAAAAG
ATCGAAACTTTATTAGATTTCCTGAAAGATGGGTAACGCTCTCGGATATCTCTACGGAAA
ATGCTGCAAACCCACCACGGACGACGACTCTCTCGGCCCTCACGGCGTCTCCACCGTCGG
TCTTTCAGCTCTCGCTCACGATCTCTTCAACTTCGAGATCACTTCCCAAGTTCCTGAAGG
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TGAGGCATGGAAGCAAGCAAAACCTCCACCACAGACAGCAGAGGATGCTTCTAGGCTTGT
GATTGAGATATTGAAAAGGCATCAGAAAGCAGATGTTGAGGGACTTTTGTCTTTCTATGG
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CGAAGGAGTTCTTTTTGAGTTTCAAACACTCCCGGTGGATCCAAAAGCTGTGGCAGATGG
AGACACCATCACAGTCTATGTTAGTAGTTCAGACCCGGTTGTGTCATCTTCTGTTC

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DS 

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GAAGAAGTGCTTGCTCGCAAGTTCAGAATTAGACTAAGGGGAATAGATGCACCAGAAAGC
CAGATGCCGTTTGGGAAAGAGGCACAAGAAGAGCTTCTTAAGATTGTTCAATGGAAAAGC
TTGAAGGTGTTAGTTTATGGAGAAGATCGGTATGGGCGGTGTGTTGGAGATTTATACTGC
AATGGAGTTTTTGTTCAGGAGGCAATGCTAAAGAAAGGTCTTGCTTGGCATTATGTAGCT
TATGACAAGCGTATGGTTCTTGCAAAGTGGGAGAAAGAAGCAAGACAGAAGCGTATTGGC
TTGTGGGCTTCTTCAAATCCCGAAAAGCCATGGGACTGGAGAAAGAACAGGCGTGAGCAA
AACAACTGATTAAACTAGAAATCAGAGTTTAAAACAGTTGTGATTTTATGATTATTGAAG
GTTTTTTTTCTGATTTAGACTTGTCTGATTCTATTGTAAGATGTTTACAAATGCTAAACT
ATGTATAAATGGTGCTTACATTGATCT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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GTGAAGAAAAATAAGTTGAGTAAACTCTCCTTTGAAAAGTTGATTAGCTTTAAAGCTGAG
CAGTAATGGAAGATTCAGAGAAAAGAAAAGAAATGTTAAAAGCAATGCGGATGGAAGCTG
CTGCTGCTGCTTCTCAGAATGATGTTTCTACAGAGCTTGAAACCTCTATGAACACAAGTC
ACCTCTCAAATCCCTTGGCTGATGCATCAACTCACCAGCAGGAATCGTATGATAAGCCAA
GGTTTGATTTTACACCGACCCGATGGCAGCTTATTCTAGTTTCAAGAGGAACAAGAGCCC
TAAGCAACAGTACATCTCATCTCCTAGTCATCAAATGAGCCCTCCTGTACCGCAGTTTCC
ACCGTCTGTTCCAGGATCTATGGGGAATGACTATCAGGTACATCCCAATCATGGCGGTTT
TCAAGAAGCTCATTACGGTGGTGATAATCAGCATACCCAACCAAGAGGGATGGCACCCTC
GTACAGAGGTCCACCCGCCCCTTGGAATAACAACTTTAGGCCTCCACCACCAGTTAACCA
TTTAGGTCCACCTCAATGGGTGCCTCGCCCTTATCCATTCATTCAGGGTAACCATGATAT
GGGGAATAACAGATATGGTGGTCGAGGTCCTCGAGTAGGCGGCTATAACAATAACCCTCC
ACAATTTCCCCATTACGGACGACAAAATTCTAACTGGGCTGGAAACACATATCCTAACTC
AGGAAGAGGCAGAGGCGGGGGAGGACGCGGTATGAACACAAGCTTTGGGCGAGGTGGAGG
AAGAAGACCTATGGAACAAGGTGCAGAACGATTCTACTCCAACTCCATGGCTGAAGATCC
ATGGAAGCATCTTAAGCCAGTCTTATGGAAGAGCTTCTCAGATGCTTCAAGCAGCAACTC
AACAGGTCAAACCTGGCGTCCCAGTTCTATAGCACCAAAGAAACCTATGATATCAGAAGC
TTCCCACAAACCTAGCAATAATCAACAGAGCCTTGCTGAGTACCTTGCTGCTTCTCTTGA
TGAGGCTACGTGCGATGACCCAAGCAATTGATCAAAGAGAATTTGAGCAAATGGGAAAAT
ACCAAATCCAAGCTTCTGGACTACCGTCATCATTGATGACTCTTTGGAACAGGTGTTGTT
ACGTGTCTTGTAACAAGACGCAACAGAGAATGATGGTCATCTTTAGGAACAGAGTAGAAT
GGTTGGCAAACGTGGTGTTCAATCAGGATCCCGATTGAGTTTAAGTTCAAGTTTGTACGC
TTTGGGTTTGGTTTCTTAACCAAATTTATGTTGAAAGAAATTTTTTAATTTTGGATAGTT
TGTTTTTCTTGTTTGGCTTGGTTTAGAAAACATGAATCTACCTCAAATCATATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D003TF U 1
AF RR4D003JQ C 635
BS 1 698 RR4D003TF
BS 699 699 RR4D003JQ
BS 700 737 RR4D003TF
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BS 748 782 RR4D003TF
BS 783 1434 RR4D003JQ

RD RR4D003TF 789 0 0
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GTGAAGAAAAATAAGTTGAGTAAACTCTCCTTTGAAAAGTTGATTAGCTTTAAAGCTGAG
CAGTAATGGAAGATTCAGAGAAAAGAAAAGAAATGTTAAAAGCAATGCGGATGGAAGCTG
CTGCTGCTGCTTCTCAGAATGATGTTTCTACAGAGCTTGAAACCTCTATGAACACAAGTC
ACCTCTCAAATCCCTTGGCTGATGCATCAACTCACCAGCAGGAATCGTATGATAAGCCAA
GGTTTGATTTTACACCGACCCGATGGCAGCTTATTCTAGTTTCAAGAGGAACAAGAGCCC
TAAGCAACAGTACATCTCATCTCCTAGTCATCAAATGAGCCCTCCTGTACCGCAGTTTCC
ACCGTCTGTTCCAGGATCTATGGGGAATGACTATCAGGTACATCCCAATCATGGCGGTTT
TCAAGAAGCTCATTACGGTGGTGATAATCAGCATACCCAACCAAGAGGGATGGCACCCTC
GTACAGAGGTCCACCCGCCCCTTGGAATAACAACTTTAGGCCTCCACCACCAGTTAACCA
TTTAGGTCCACCTCAATGGGTGCCTCGCCCTTATCCATTCATTCAGGGTAACCATGATAT
GGGGAATAACAGATATGGTGGTCGAGGTCCTCGAGTAG*CGGCTATAACAATAACCCTCC
ACAATTTCCCCATTACG*ACGACAAA*TTCTAACTGGGCTGGAAACACATATCCTAACTC
AG
AGAGCAG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4D003JQ 800 0 0
TCCA
TCATTCAGGGTAACCATGATATGGGGAATAACAGATATGGTGGTCGAGGTCCTCGAGTAG
GCGGCTATAACAATAACCCTCCACAATTTCCCCATTACGGACGACAAAATTCTAACTGGG
CTGGAAACACATATCCTAACTCAGGAAGAGGCAGAGGCGGGGGAGGACGCGGTATGAACA
CAAGCTTTGGGCGAGGTGGAGGAAGAAGACCTATGGAACAAGGTGCAGAACGATTCTACT
CCAACTCCATGGCTGAAGATCCATGGAAGCATCTTAAGCCAGTCTTATGGAAGAGCTTCT
CAGATGCTTCAAGCAGCAACTCAACAGGTCAAACCTGGCGTCCCAGTTCTATAGCACCAA
AGAAACCTATGATATCAGAAGCTTCCCACAAACCTAGCAATAATCAACAGAGCCTTGCTG
AGTACCTTGCTGCTTCTCTTGATGAGGCTACGTGCGATGACCCAAGCAATTGATCAAAGA
GAATTTGAGCAAATGGGAAAATACCAAATCCAAGCTTCTGGACTACCGTCATCATTGATG
ACTCTTTGGAACAGGTGTTGTTACGTGTCTTGTAACAAGACGCAACAGAGAATGATGGTC
ATCTTTAGGAACAGAGTAGAATGGTTGGCAAACGTGGTGTTCAATCAGGATCCCGATTGA
GTTTAAGTTCAAGTTTGTACGCTTTGGGTTTGGTTTCTTAACCAAATTTATGTTGAAAGA
AATTTTTTAATTTTGGATAGTTTGTTTTTCTTGTTTGGCTTGGTTTAGAAAACATGAATC
TACCTCAAATCATATT

QA 5 800 5 800
DS 



AS 1 2

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GGATTGTGCTCTCTCGTATCCAAGCTTTGGACCCAGCTAACGCATCAAAGACCATGGGTC
TTCTCCTTCTCCAAGATCACGGTGAGAAAGAGATGATAAGACTAGCTTTTGGCCCGGAGA
ATCTTGTTCACTCAGTGATAGCGAAAGCCAAGAAAGAGTTGGGTCTCATGAGCTGTTCAA
GGCCTCTTTGGTGTCAAGAGGAGTTGATAAGCCCTAAGAACAACGGCCGTGGCTCTTCTC
TCAACCCGGCCTCTCTGCCCTTCTACGCTAACGGAGGAGGAAGATCTTTTACGGATATGA
CCAACGAGTTCGAGTTCATTGATGATGTGAACTTGGGCTCTGTGCATGCCAGAAGTGGTA
GCTGCGGTCTTGACGGTTTAGGGTTTGGTGATTCTGAGTTAGGGTTTGGAGGTGTACCCT
GTTCTTATTTCGCTAGAGGCTTCTGCAAAAACGGAAGTAGCTGCAGATTCGTCCACAGTG
ATGGAGGAGGTGAACTTGTTGGCTCCCCAAGCAGAATGGAGCTTCTTAGGTCTAACTCGG
TACCTCCAAGACTCGCTCACCAGTTCATGACTCGCTCTTCTTTCTCTCCTAAAGGTGTTA
ACATGCAGAACACCGATGCTCAAAGAGCTGCTGCTGCTGCTTTGATGATGGGAGATGAAC
TGCAGAAGCTTGGAGATGGAGACTGAGAGGATGATCTTTCTGCATGGCTTGTCTGCTTCA
GACGATCTATTTGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B232TF U 1
AF RR4CU62TF U 70
BS 1 111 RR4B232TF
BS 112 112 RR4CU62TF
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TTCTCCTTCTCCAAGATCACGGTGAGAAAGAGATGATAAGACTAGCTTTTGGCCCGGAGA
ATCTTGTTCACTCAGTGATAGCGAAAGCCAAGAAAGAGTTGGGTCTCATGAGCTGTTCAA
GGCCTCTTTGGTGTCAAGAGGAGTTGATAAGCCCTAAGAACAACGGCCGTGGCTCTTCTC
TCAACCCGGCCTCTCTGCCCTTCTACGCTAACGGAGGAGGAAGATCTTTTACGGATATGA
CCAACGAGTTCGAGTTCATTGATGATGTGAACTTGGGCTCTGTGCATGCCAGAAGTGGTA
GCTGCGGTCTTGACGGTTTAGGGTTTGGTGATTCTGAGTTAGGGTTTGGAGGTGTACCCT
GTTCTTATTTCGCTAGAGGCTTCTGCAAAAACGGAAGTAGCTGCAGATTCGTCCACAGTG
ATGGAGGAGGTGAACTTGTTGGCTCCCCAAGCAGAATGGAGCTTCTTAGGTCTAACTCGG
TACCTCCAAGACTCGCTCACCAGTTCATGACTCGCTCTTCTTTCTCTCCTAAAGGTGTTA
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TGCAGAAGCTTG

QA 1 732 1 732
DS 

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TCCAAGATCACGGTGAGAAAGAGATGATAAGACTAGCTTTTGGCCCGGAGAATCTTGTTC
ACTCAGTGATAGCGAAAGCCAAGAAAGAGTTGGGTCTCATGAGCTGTTCAAGGCCTCTTT
GGTGTCAAGAGGAGTTGATAAGCCCTAAGAACAACGGCCGTGGCTCTTCTCTCAACCCGG
CCTCTCTGCCCTTCTACGCTAACGGAGGAGGAAGATCTTTTACGGATATGACCAACGAGT
TCGAGTTCATTGATGATGTGAACTTGGGCTCTGTGCATGCCAGAAGTGGTAGCTGCGGTC
TTGACGGTTTAGGGTTTGGTGATTCTGAGTTAGGGTTTGGAGGTGTACCCTGTTCTTATT
TCGCTAGAGGCTTCTGCAAAAACGGAAGTAGCTGCAGATTCGTCCACAGTGATGGAGGAG
GTGAACTTGTTGGCTCCCCAAGCAGAATGGAGCTTCTTAGGTCTAACTCGGTACCTCCAA
GACTCGCTCACCAGTTCATGACTCGCTCTTCTTTCTCTCCTAAAG*TGTTAACATGCAGA
ACACCGATGCTCAAAGAGCTGCTGCTGCTGCTTTGATGATGGGAGATGA*CTGCAGAAGC
TTGGAGATGGAGACTGAGAGGATGATCTTTCTGCATGGCTTGTCTGCTTCAGACGATCTA
TTTGACAT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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CACCACCATGCTCATGGAGTGGTTTGGTGAGACGGCGTGCTTTCCGTTTTCGGTTTCTCT
CGACAGACGGAGACGGCGTGGTTGGTCAAGAGCTGTGTTTTTAGGGTATCCAGTTAGTAT
TGGGCTCGGTTGTGGGCCTTGTTTTAATGCTCTATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATG
GGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGGTCCCTTTCTAATATCAAGATGG


BQ
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AF RR4DO18TF U 1
AF RR4DO18JQ C 9
BS 1 658 RR4DO18TF

RD RR4DO18TF 658 0 0
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CTTACTTTGCTAGAGACAATGCTAAACAATTGTGGGGAGCTTATTCACATGCAACTTGCC
GAGAAGGACATTCTTCATAAGATGGTGAAGATGGAAACCAAAACCAACCCTTTTCACCTA
CCTTTAGCCCGCCAGTCTCACCTCACTATGGTGGACAAAACAACAATGTTTTAGCACTGC
CACCACCATGCTCATGGAGTGGTTTGGTGAGACGGCGTGCTTTCCGTTTTCGGTTTCTCT
CGACAGACGGAGACGGCGTGGTTGGTCAAGAGCTGTGTTTTTAGGGTATCCAGTTAGTAT
TGGGCTCGGTTGTGGGCCTTGTTTTAATGCTCTATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATG
GGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGGTCCCTTTCTAATATCAAGATGG

QA 1 658 1 658
DS 

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GGTGCATCCTTTGGTTGATAGAGCCACCAGCGATATGCTTATTGGTCCTGATTGGGCCAT
GAACCTTGAGATATGTGACATGCTTAATCATGAGCCTGGGCAATATAGAGAAGTTGTGAG
TGGAATAAAGAAAAGGCTTACTAGCAAGACTACCAAGGTTCAGCTTTTGGCTCTTACTTT
GCTAGAGACAATGCTAAACAATTGTGGGGAGCTTATTCACATGCAACTTGCCGAGAAGGA
CATTCTTCATAAGATGGTGAAGATGGAAACCAAAACCAACCCTTTTCACCTACCTTTAGC
CCGCCAGTCTCACCTCACTATGGTGGACAAAACAACAATGTTTTAGCACTGCCACCACCA
TGCTCATGGAGTGGTTTGGTGAGACGGCGTGCTTTCCGTTTTCGGTTTCTCTCGACAGAC
GGAGACGGCGTGGTTGGTCAAGAGCTGTGTTTTTAGGGTATCCAGTTAGTATTGGGCTCG
GTTGTGGGCCTTGTTTTAATGCTCTATGTTATGGTTTTTGTAATTTCGTATGGGCTTTGC
CCTTTGGGCTTTGCCCTTTGGGCTTTGGTCCCTTTCTAATATCAAGATGG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7678Contig1 797 2 2 U
GCAACAGTAGCAATGCTGATGTGGAAGATGATGGACATTCGATTTATGTCCGAAACTTAC
CTTTTGACACCACGCCAACACAGCTTGAAGAGGTGTTCAAGAGCTTTGGTGCTGTCAAGC
ATGAAGGGATTCAAGTCAGAAGCAATAAGCAGCAAGGTTTCTGTTTTGGTTTTGTGGAGT
TCGAAACGTCTAGTGGAAGGCAGAGTGCGCTTGAGGCCTCACCGATTACAATTGGTGATC
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GGGGAGGAGGAGGAGGACGTGGTGGTCCTCGCGGTGGTGGTGTTTCATCTTAGACTTTGC
ATCTAATGGGGGCACCACCTGCATAAGAGAGTAGTTTGTTATTTTTGTTTTTGCATCGTT
TTTTTCTTTTCTTTTGGCCTTACTACTTGAGTTTAGTTTGATTTTCAAGTCGTTTTGGCT
GTTTTTGGTGGGTTTAGTTTCTCCATATTCTTGCTTTCTTTTTTTGTATTTTCACCCTTT
TAAATCCTTCTTTGGAAACTTCTTCATAAACATTCAATTTCATAAGAAAGCCATTATAGA
GTTGTGTTCTTTGATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ53TF U 1
AF RR4EQ53JQ C 65
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RD RR4EQ53TF 700 0 0
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GTGTTGGAGGAGGAAGAGGAGGGTATGGAAGAGGCGAATATTCAGGTAGACCAAAGAGTT
CAAACCCTCGGAGTGGCGGAGAAGGTTATCAGAGAGTTCCACAAAACGGTGGCAGTGGAA
GGGGAGGAGGAGGAGGACGTGGTGGTCCTCGCGGTGGTGGTGTTTCATCTTAGACTTTGC
ATCTAATGGGGGCACCACCTGCATAAGAGAGTAGTTTGTTATTTTTGTTTTTGCATCGTT
TTTTTCTTTTCTTTTGGCCTTACTACTTGAGTTTAGTTTGATTTTCAAGTCGTTTTGGCT
GTTTTTGGTGGGTTTAGTTTCTCCATATTCTTGCTTTCTT

QA 1 700 1 700
DS 

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AATGGGGGCACCACCTGCATAAGAGAGTAGTTTGTTATTTTTGTTTTTGCATCGTTTTTT
TCTTTTCTTTTGGCCTTACTACTTGAGTTTAGTTTGATTTTCAAGTCGTTTTGGCTGTTT
TTGGTGGGTTTAGTTTCTCCATATTCTTGCTTTCTTTTTTTGTATTTTCACCCTTTTAAA
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TGTTCTTTGATGC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL7679Contig1 636 2 1 U
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BQ
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AF RR4DT91JQ C 1
AF RR4DT91TF U 1
BS 1 636 RR4DT91TF

RD RR4DT91JQ 636 0 0
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TGGAAGATTTACTCTGTTTTTTCTTTGAACTGAAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4DT91TF 636 0 0
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TGGAAGATTTACTCTGTTTTTTCTTTGAACTGAAGA

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL7680Contig1 743 2 2 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A865JQ C 1
AF RR4A865TF U 1
BS 1 741 RR4A865TF
BS 742 743 RR4A865JQ

RD RR4A865JQ 743 0 0
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GAATGTCTTCCTGCTCTTACAGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4A865TF 741 0 0
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ATCGGTATAAAAGATCAATTGACGGAGGAGAACCAAGCTTAGATAACGGTGTCACTCGCC
CATTGTTCTTCCACCGTGCAACTGTTTCAACTCTTGGGAAGCAAGGAAAGTTAATTGCTG
TGGCGAGTTGATGTCTGAGACTTATACTCAGGCTTAACTACAAACACCAGCAACGTCCTC
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GAAAAAGGGTGATTTGTTATTGTATATATAAAACTAAAATTTAGGGTAATGGAAAGGGAC
GAATGTCTTCCTGCTCTTACA

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7681Contig1 666 2 1 U
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ACATAAGATGTTGATGTAGCTAGTTGAACTTTGTCTTAGTGGTTAATTAAAGTGGTATGA
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TTATTG


BQ
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CACATCATCCCATCAATACTTGTGGTTCAGCAACACAACAAAGCTCATGTGGAGGAGATG
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TCTTGTGAGATGTAATTAATAGTGATTGTAGATAATGATTATGCAGTATAATGTGAATAA
TTATTG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DP17TF C 1
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QA 1 643 1 643
DS 

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AGGTTTCCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTAATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGC
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CATGATCCCCCTCCCCTCTTCTGCGAAATTCCTTCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL7683Contig1 783 2 2 U
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10 10 10 

AF RR4F958TF U 1
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TATTTTAAGAGGATGAAAATGCTATCATGCAAACAAGAATTGTCTTCTAGGGTCAGGTTC
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ATATATGTACCTTTTTTTGTTTACGTACAAAAAAAGGTTGCAGTTGCACGTTCGTAGCAT
GCCTCCTTACTCCATTTGGTGTAAGAAAAA

QA 1 690 1 690
DS 

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ATCCAGAAGTTGCTCGGGTATTATCAGGTGGATCCACATGAAGAAAACATAGAAGCTCTG
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AGGTTCATGTTAATGAATGCCATCGATCTGAGAAAGAACAAATGGCAAGGGAGAATGAAT
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TGGCTTATATATGTACCTTTTTTTGTTTACGTACAAAAAAAGGTTGCAGTTGCACGTTCG
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TTGTGTTTTATATTAAGAGCCTATTTTATGTACAATAGAAACTCCATATATTAATAAATT
TTACCGGTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4F124JQ C 1
AF RR4F124TF U 1
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QA 1 653 1 653
DS 

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QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7685Contig1 576 2 1 U
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GACTAATTAATACTTGTTTCATCTAAATGTATTAAT


BQ
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AF RR4FU92JQ C 1
AF RR4FU92TF U 1
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DS 

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TCAGAGTTTTCTTCTTCTTCTTGGATGTCTTTCTGTGTTAGCTGCTACAAACTCGCCAAC
GACTAATTAATACTTGTTTCATCTAAATGTATTAAT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL7686Contig1 684 2 2 U
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CACTATGAAAAAAACAAATTGGAGCCAAAAAGCTGTTTGGCTTGTTAAAATCTTGCAAGA
AGGGAAAAAATTTATAGTTTTCGT


BQ
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AF RR4B274TF U 1
AF RR4B274JQ C 101
BS 1 664 RR4B274TF
BS 665 684 RR4B274JQ

RD RR4B274TF 664 0 0
GGATCATCGTCTCCTCTCTCTCTCGCTCGCTATTGAAACCCTAAAAATCAAAGCTTGAAT
TTCACATCTTTAACAGCCGTCTCCTCGAGGAGACGACTACTATGAGCAGCAGAGATCATC
ATCATCATCCACCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGAACTGTTGAGGATGTTGGATCTT
GGCTTGAGGAAATCAACCTTGGGAGCTACCGCTTGATTTTCAAAGAAAACGGCGTCAATG
GAGAATATCTAGAAAGCATGTCTGTGTTTACAACCGAACAGATCCTTCATTTCATAAGGA
GGCATCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACTCTCTGTAAAGAACTCCGAAGGATCAAAG
TGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCGTGGTGGGCACCGTCTTGTCTCT
CGGTAGTCTTTGTGAAGGCAGCCAAGCGCAATCGACAGTCTCGAGTTGTATCTCTAAAGC
TTGAATCTTGACAATTACACGTTGGCTCTCTCTTTATGTACCTACTTGTCTCTCTTCTCA
TCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTGGGTTGAGTTTGTTTGTAGAGATAAAGCTATATATG
CACTATGAAAAAAACAAATTGGAGCCAAAAAGCTGTTTGGCTTGTTAAAATCTTGCAAGA
AGGG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4B274JQ 584 0 0
TATGAGCAGCAGAGATCATCATCATCATCCACCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGAAC
TGTTGAGGATGTTGGATCTTGGCTTGAGGAAATCAACCTTGGGAGCTACCGCTTGATTTT
CAAAGAAAACGGCGTCAATGGAGAATATCTAGAAAGCATGTCTGTGTTTACAACCGAACA
GATCCTTCATTTCATAAGGAGGCATCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACTCTCTGTAA
AGAACTCCGAAGGATCAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCGTG
GTGGGCACCGTCTTGTCTCTCGGTAGTCTTTGTGAAGGCAGCCAAGCGCAATCGACAGTC
TCGAGTTGTATCTCTAAAGCTTGAATCTTGACAATTACACGTTGGCTCTCTCTTTATGTA
CCTACTTGTCTCTCTTCTCATCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTGGGTTGAGTTTGTTTG
TAGAGATAAAGCTATATATGCACTATGAAAAAAACAAATTGGAGCCAAAAAGCTGTTTGG
CTTGTTAAAATCTTGCAAGAAGGGAAAAAATTTATAGTTTTCGT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL7687Contig1 881 2 2 U
GTCAGCTATTTCAGTTATGTCTGAATTATCGACGTGGAGTCCGCCGGAATCTTGCCACTT
AACGGCCGCGGCGGTGGCAGCAGCTTGAATGTCTTTGGGAGAATTAGTGACCGGACGAGG
AAGCTCGCCGGATAATTCAGGAAAATTGAGATAAGCCGTTGTACCTTTAATGGCTAAAGC
AGCTACGTCATGAGCTCGTGCAGCCATATCAGCCGTTGGATAAGTCCCGAGCCAGATTCT
TGATTTCTTCCTCGGCTCTCTGATCTCGGACACCCATTTTCCCCAGCTCCTCATCCGCAC
TCCTCTGTACGTCGGATGCTTATCTCCGCCGTTGGTCTTTCGCCGTTTCCCTCCTTGATC
ATCAAGATCTTCGACGGCTAATGATGATAATGATCTTCGATATGCTTTTCTTTTAGGGTT
TTCTAAGTTAGAAGTTGTTGCTGATGATGACGAGGAAGAAGATGTTGTACTTGTGGATGA
ATTGGATAATGAGGCGGTGGCTGAGGAGGAGGACACGGCGGAGATGGTGGAGGTTATAAA
GGTGACTTGAGAAGCACTCTTCTCTAAGTTGATCTGTGTTTCCATTGTTAGAGAGAAGCT
TTAGAAAAGAGAGTTGCACAGAAATAGATGTGGAGTGGGCTATTAATATTCCTCCACAAT
CTTGTTTTTTCCTTTGGCTTTTTCATATTATAAGGAAAAAATACTATAATGAAAAAGAAA
AAAAAAATATAATGGTATTTGGTTATTAATAAAATGAATGAGGGAGGATGAAACTGGGTC
CATGCCTCCATGTAACAAAGAAGATATTATTGTGATTCACCGTTTTAACGAACCAGTTTT
GTTCCATGCGAAAATAAATAGAAACAACATGGTTTCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AR09TF U 1
AF RR4AR09JQ C 51
BS 1 780 RR4AR09TF
BS 781 881 RR4AR09JQ

RD RR4AR09TF 780 0 0
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AGCTACGTCATGAGCTCGTGCAGCCATATCAGCCGTTGGATAAGTCCCGAGCCAGATTCT
TGATTTCTTCCTCGGCTCTCTGATCTCGGACACCCATTTTCCCCAGCTCCTCATCCGCAC
TCCTCTGTACGTCGGATGCTTATCTCCGCCGTTGGTCTTTCGCCGTTTCCCTCCTTGATC
ATCAAGATCTTCGACGGCTAATGATGATAATGATCTTCGATATGCTTTTCTTTTAGGGTT
TTCTAAGTTAGAAGTTGTTGCTGATGATGACGAGGAAGAAGATGTTGTACTTGTGGATGA
ATTGGATAATGAGGCGGTGGCTGAGGAGGAGGACACGGCGGAGATGGTGGAGGTTATAAA
GGTGACTTGAGAAGCACTCTTCTCTAAGTTGATCTGTGTTTCCATTGTTAGAGAGAAGCT
TTAGAAAAGAGAGTTGCACAGAAATAGATGTGGAGTGGGCTATTAATATTCCTCCACAAT
CTTGTTTTTTCCTTTGGCTTTTTCATATTATAAGGAAAAAATACTATAATGAAAAAGAAA
AAAAAAATATAATGGTATTTGGTTATTAATAAAATGAATGAGGGAGGATGAAACTGGGTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AR09JQ 831 0 0
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TGGCTAAAGCAGCTACGTCATGAGCTCGTGCAGCCATATCAGCCGTTGGATAAGTCCCGA
GCCAGATTCTTGATTTCTTCCTCGGCTCTCTGATCTCGGACACCCATTTTCCCCAGCTCC
TCATCCGCACTCCTCTGTACGTCGGATGCTTATCTCCGCCGTTGGTCTTTCGCCGTTTCC
CTCCTTGATCATCAAGATCTTCGACGGCTAATGATGATAATGATCTTCGATATGCTTTTC
TTTTAGGGTTTTCTAAGTTAGAAGTTGTTGCTGATGATGACGAGGAAGAAGATGTTGTAC
TTGTGGATGAATTGGATAATGAGGCGGTGGCTGAGGAGGAGGACACGGCGGAGATGGTGG
AGGTTATAAAGGTGACTTGAGAAGCACTCTTCTCTAAGTTGATCTGTGTTTCCATTGTTA
GAGAGAAGCTTTAGAAAAGAGAGTTGCACAGAAATAGATGTGGAGTGGGCTATTAATATT
CCTCCACAATCTTGTTTTTTCCTTTGGCTTTTTCATATTATAAGGAAAAAATACTATAAT
GAAAAAGAAAAAAAAAATATAATGGTATTTGGTTATTAATAAAATGAATGAGGGAGGATG
AAACTGGGTCCATGCCTCCATGTAACAAAGAAGATATTATTGTGATTCACCGTTTTAACG
AACCAGTTTTGTTCCATGCGAAAATAAATAGAAACAACATGGTTTCGTTTC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL7688Contig1 693 2 3 U
TAGCTTGATAAGGCATCAAAGAAAGTAAGAGTTTAAAGGTATGAAAGAACAAAGATATAA
GAAACTTCTTATACTCTCTATACATATCTTTTGCGTAAATAGTAAAGAGAATGCAATACA
TGGGAGTGTACTAATAGATACAATACAATCATTCACTAGCTGTGAACATCACCAACAATA
CACAACGTAAAAAAAGAATGAACTTATGTGTGTAACTCGGACATAGAGGCAGCTTCGTAT
TCAGAGACCAGCTGAAACCAAACCATGCAATGTTACAATTCCAATCAAGGTGTTGTCTTC
AGTGACCACAGGTAGAAACTGTACAGGTGATGGCGGTGACTCCATTTTCTTCATCGCTTC
AACTGCCATTGTTTCCGGTCCAATTGTTCTCGGCTTCCTGTTGCACATTTCTCCAACACT
GAGTTTGAAGATAGCTTCTCCACTTGCTTTAAGAGTTCGGCGAAGATCTCCATCTGTGAA
TGTACCGATCAAGCGATGATGTTCATCAACCACAAGCAAACACCCACATCCTTTGCTGGT
TAGCTCAACTAGTTGATCCATTATCAAGTCTCCTTCTCTACAAACCGGAAGCTCTTCTTT
CTTCTTCATAACATCCTTTACCTTGAAAATCAAGCTCTTGCCGATCCTACCAGCGGGATG
GTTAGCTCCATACTCATCCTTCGTTAGATTCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FC25JQ U 2
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AAACTTCTTATACTCTCTATACATATCTTTTGCGTAAATAGTAAAGAGAATGCAATACAT
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GTGACCACAGGTAGAAACTGTACAGGTGATGGCGGTGACTCCATTTTCTTCATCGCTTCA
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GTACCGATCAAGCGATGATGTTCATCAACCACAAGCAAACACCCACATCCTTTGCTGGTT
AGCTCAACTAGTTGATCCATTATCAAGTCTCCTTCTCTACAAACCGGAAGCTCTTCTTTC
TTCTTCATAACATCCTTTACCTTGAAAATCAAGCTCTTGC

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DS 

RD RR4FC25TF 693 0 0
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GAAACTTCTTATACTCTCTATACATATCTTTTGCGTAAATAGTAAAGAGAATGCAATACA
TGGGAGTGTACTAATAGATACAATACAATCATTCACTAGCTGTGAACATCACCAACAATA
CACAACGTAAAAAAAGAATGAACTTATGTGTGTAACTCGGACATAGAGGCAGCTTCGTAT
TCAGAGACCAGCTGAAACCAAACCATGCAATGTTACAATTCCAATCAAGGTGTTGTCTTC
AGTGACCACAGGTAGAAACTGTACAGGTGATGGCGGTGACTCCATTTTCTTCATCGCTTC
AACTGCCATTGTTTCCGGTCCAATTGTTCTCGGCTTCCTGTTGCACATTTCTCCAACACT
GAGTTTGAAGATAGCTTCTCCACTTGCTTTAAGAGTTCGGCGAAGATCTCCATCTGTGAA
TGTACCGATCAAGCGATGATGTTCATCAACCACAAGCAAACACCCACATCCTTTGCTGGT
TAGCTCAACTAGTTGATCCATTATCAAGTCTCCTTCTCTACAAACCGGAAGCTCTTCTTT
CTTCTTCATAACATCCTTTACCTTGAAAATCAAGCTCTTGCCGATCCTACCAGCGGGATG
GTTAGCTCCATACTCATCCTTCGTTAGATTCCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TTTTTTTGTTCTCCTTTCTCTGTTTCCCCGCGCTAGATCTATGGCCGTTTTAGTCGAAAG
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TAGTCTGAGCAAATGGGTTGTGTCTATTCTGTTTGCTTCCATCGTTCTTTTGCGTCATGA
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TGCGCTAGCTTTTGCAACCCATGTTGTACTTGACTGGTTCAGAAACGATAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D220TF U 1
AF RR4D220JQ C 179
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TTTTTTTGTTCTCCTTTCTCTGTTTCCC*GCGCTAGATCTATGGCCGTTTTAGTCGAAAG
ATTTGCTCGCAGAGACGGAAGCGAACACTCTGGGTCGGTCGAGCAAGAAGCTTCCATCAA
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TAGTCTGAGCAAATGGGTTGTGTCTATTCTGTTTGCTTCCATCGTTCTTTTGCGTCATGA
TGGAACCGCCTTGTGGGGAATCATTGGATCCGTTTCGAACGCGGCTCTCTCTGTAGTACT
CAAACGTATACTTAACCAAGCGAGACCTGCTACGACCTCGCGTACTGATCCCGGGATGCC
ATCTACTCACGCCTAGTCTATCTCTTTCATATCTGTTTTTGCTGTTTTGTCTGTTATGGA
ATGGCTTGGAGCCACTAAAGTCTCTATGTTCCTTAGCTGCCTCATACTCGCGTCGTGTTC
ATATTTTATACGGTTAAGG*TTTCTCAGAAGCTTCACACAAGCAGTCAAGTGGTGGTTGG
TGCAATCGTGGGTTCTGTTTTCTGCATCTTCTGGTACACAACGTGGAACTCGCTTCTC*T
TGAAGCCTTCGAGTCATCTCTATCACTC**AATATCTGTATT*CTGGTTGCAGCTGCTCT
TGCGCTAGCTTT
GCACCATGTTGTAC

QA 1 852 1 852
DS 

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AATAGTCTGAGCAAATGGGTTGTGTCTATTCTGTTTGCTTCCATCGTTCTTTTGCGTCAT
GATGGAACCGCCTTGTGGGGAATCATTGGATCCGTTTCGAACGCGGCTCTCTCTGTAGTA
CTCAAACGTATACTTAACCAAGCGAGACCTGCTACGACCTCGCGTACTGATCCCGGGATG
CCATCTACTCACGCCTAGTCTATCTCTTTCATATCTGTTTTTGCTGTTTTGTCTGTTATG
GAATGGCTTGGAGCCACTAAAGTCTCTATGTTCCTTAGCTGCCTCATACTCGCGTCGTGT
TCATATTTTATACGGTTAAGGGTTTCTCAGAAGCTTCACACAAGCAGTCAAGTGGTGGTT
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CTTGAAGCCTTCGAGTCATCTCTATCACTCCAAATATCTGTATTTCTGGTTGCAGCTGCT
CTTGCGCTAGCTTTTGCAACCCATGTTGTACTTGACTGGTTCAGAAACGATAATTG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7690Contig1 858 2 6 U
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CGGCGAACCTAAGCCTCTTCGTCGTTCACCGTCGTACCTTCCGACACTCCACACTCGCAG
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AGGATTCAACTTTAGATTCTACAAGGAAGAATGATTCAAAGGGTTTCACTTTAGAGCCAA
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TACGTCCTGTTCAATGGTATCCAGGACACATAATGAAAACTGAAAAGGAACTTAGGGAAC
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AAAGCTTATGACTTCACTGATGTTGCTGGAATCCTTGTGCAGATGCTAGCACGGATTCCA
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AAAAAATTTGTGAAGACGCTTGGTCTAGACTTGTTTGGTGGAGATAGTCATCAAGCTGCA
TTTAGAATACTTTCGGATTTTCGCAAAGGCAAATTTGGTTATATCTCGTTGGAGAGACCT
CCACTGTGATCAGGACTCTGTGTATAGAGTTTAATCCTTAAACTTATGAAGTATAAATGC
CTAAATATGATGCATGTGTGCATTTTAGATTTGCTTAAATGCTGAATATGAATGGTATAT
AACACTTGTTCCAAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BM09TF U 1
AF RR4BM09JQ C 136
BS 1 688 RR4BM09TF
BS 689 689 RR4BM09JQ
BS 690 718 RR4BM09TF
BS 719 719 RR4BM09JQ
BS 720 780 RR4BM09TF
BS 781 858 RR4BM09JQ

RD RR4BM09TF 780 0 0
GGGTAATGCATTTTCAGTCAGTCATGTTTGCCCAGTTAGCCCCATCGCCGTCTCCTTCTC
CGGCGAACCTAAGCCTCTTCGTCGTTCACCGTCGTACCTTCCGACACTCCACACTCGCAG
TCTCCGCTTCTCCTCCCACTGCAAACTCCTCTCGTCCACCAATTCAGATTATTGGAGGAA
AGGATTCAACTTTAGATTCTACAAGGAAGAATGATTCAAAGGGTTTCACTTTAGAGCCAA
ACGAAGAGGAAATTGATTGGATGAATCTTGAATCTGATATTCGTCTATGGACTAGAGCGT
TACGTCCTGTTCAATGGTATCCAGGACACATAATGAAAACTGAAAAGGAACTTAGGGAAC
AGCTTAAGCTGATGGATGTTGTGATTGAAGTCAGAGATGCTAGGATTCCCTTATCCACAA
CTCATCCAAAGATGGATGCGTGGCTTGGGAATAGGAAAAGAATATTGGTGTTGAACAGAG
AAAGCTTATGACTTCACTGATGTTGCTGGAATCCTTGTGCAGATGCTAGCACGGATTCCA
GAAGTAGGCTCGAGGGCGCTTTACAACCGGTACAAGATTCAGCTTGACGGAGGCTGCGGT
AAAAAATTTGTGAAGACGCTTGGTCTAGACTTGTTTGGTGGAGATAGTCATCAAGCTGCA
TTTAGAATACTTTCGGATTTTCGCAAAG*CAAATTTGGTTATATCTCGTTGGAGAGAC*T
CCACTGTGATCAGGACTCTGTGTATAGAGTTTAATCCTTAAACTTATGAAGTATAAATGC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4BM09JQ 723 0 0
CCACTGCAAACTCCTCTCGTCCACCAATTCAGATTATTGGAGGAAAGGATTCAACTTTAG
ATTCTACAAGGAAGAATGATTCAAAGGGTTTCACTTTAGAGCCAAACGAAGAGGAAATTG
ATTGGATGAATCTTGAATCTGATATTCGTCTATGGACTAGAGCGTTACGTCCTGTTCAAT
GGTATCCAGGACACATAATGAAAACTGAAAAGGAACTTAGGGAACAGCTTAAGCTGATGG
ATGTTGTGATTGAAGTCAGAGATGCTAGGATTCCCTTATCCACAACTCATCCAAAGATGG
ATGCGTGGCTTGGGAATAGGAAAAGAATATTGGTGTTGAACAGAGAAAGCTTATGACTTC
ACTGATGTTGCTGGAATCCTTGTGCAGATGCTAGCACGGATTCCAGAAGTAGGCTCGAGG
GCGCTTTACAACCGGTACAAGATTCAGCTTGACGGAGGCTGCGGTAAAAAATTTGTGAAG
ACGCTTGGTCTAGACTTGTTTGGTGGAGATAGTCATCAAGCTGCATTTAGAATACTTTCG
GATTTTCGCAAAGGCAAATTTGGTTATATCTCGTTGGAGAGACCTCCACTGTGATCAGGA
CTCTGTGTATAGAGTTTAATCCTTAAACTTATGAAGTATAAATGCCTAAATATGATGCAT
GTGTGCATTTTAGATTTGCTTAAATGCTGAATATGAATGGTATATAACACTTGTTCCAAA
GGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7691Contig1 944 2 2 U
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TGTTACCGACATTGTCATTGACTATGGTGGCTGCAATGCTTTTATTGTTTCTGCTTCAGA
AGATGGGACTTGCAAGGTTTGGAGCTTGTCCAAGGGGAGATTGTTGAGAAACATCATCTT
TCCTGCAGCCATCAATGCACTTGCATTAGACCCTGGCGGCTCTGTTTTCTATGCTGGTAG
TACAGATAGCAAAATTTATGTTGGTGCCATGAATTCCTCAAGTGACTATGCGACTCAAAG
TCTTGGTTCAGTATCTGAACAAGGCAAAGCTGTTACTTGCTTGGCATATTGCGCAGGCGG
AAACCTTTTGATTTCTGGATCGGAAGATGGTGTGATTTGTTTTTGGGATCCCAAATCACG
TCGCCTTGTTCGTACTTTCAGCCATGGAAAAGGACCAAAAGGACCTGTGAACAACATTCA
AGTTGTCAGAAGAATGGTTGTTGGTAATTCCAACAAAGCACAATCTTCATGGAAAAGAAA
TGTGTCGTCACTACCTCCTCCTTTGGAAAAATACGAAAGAACAGGAGACGATACTATGGA
TGGTATAGTTATCGTTGACCCGCCGCCGGTATCTGATGTTCCTGTTTACTCCTCTTACCA
CAGTGTTGACCTTATCAACGAGCAAGTTAGAGAGCTTCAGCAACAAGGTTCTGCAACAAC
GGAGATCGAGATGGAAAGATTGAAACTTGAGTACAAGAAATCTTTACAGATGAATGATCA
ATGGCAGAAGAATTATGAGAACTTGCTCCAGGTGGTTATGGAGGAAGAGCTAAACGGTAG
TTCCAATTGAAAGCTTTTATCTATTGTTGTTGTTTTTAAGCATTTTTGAAATTGTGTTAC
CAAAAAAAAAAAATTTGAAGTTATATCGAGAGATATATTATGCC


BQ
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AF RR4H987TF U 1
AF RR4H987JQB C 400
BS 1 571 RR4H987TF
BS 572 944 RR4H987JQB

RD RR4H987TF 571 0 0
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TGTTACCGACATTGTCATTGACTATGGTGGCTGCAATGCTTTTATTGTTTCTGCTTCAGA
AGATGGGACTTGCAAGGTTTGGAGCTTGTCCAAGGGGAGATTGTTGAGAAACATCATCTT
TCCTGCAGCCATCAATGCACTTGCATTAGACCCTGGCGGCTCTGTTTTCTATGCTGGTAG
TACAGATAGCAAAATTTATGTTGGTGCCATGAATTCCTCAAGTGACTATGCGACTCAAAG
TCTTGGTTCAGTATCTGAACAAGGCAAAGCTGTTACTTGCTTGGCATATTGCGCAGGCGG
AAACCTTTTGATTTCTGGATCGGAAGATGGTGTGATTTGTTTTTGGGATCCCAAATCACG
TCGCCTTGTTCGTACTTTCAGCCATGGAAAAGGACCAAAAGGACCTGTGAACAACATTCA
AGTTGTCAGAAGAATGGTTGTTGGTAATTCCAACAAAGCACAATCTTCATGGAAAAGAAA
TGTGTCGTCACTACCTCCTCCTTTGGAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4H987JQB 545 0 0
TTTTTGGGATCCCAAATCACGTCGCCTTGTTCGTACTTTCAGCCATGGAAAAGGACCAAA
AGGACCTGTGAACAACATTCAAGTTGTCAGAAGAATGGTTGTTGGTAATTCCAACAAAGC
ACAATTTTCATGGAAAAGAAATGTGTCGTCACTACCTCCTCCTTTGGAAAAATACGAAAG
AACAGGAGACGATACTATGGATGGTATAGTTATCGTTGACCCGCCGCCGGTATCTGATGT
TCCTGTTTACTCCTCTTACCACAGTGTTGACCTTATCAACGAGCAAGTTAGAGAGCTTCA
GCAACAAGGTTCTGCAACAACGGAGATCGAGATGGAAAGATTGAAACTTGAGTACAAGAA
ATCTTTACAGATGAATGATCAATGGCAGAAGAATTATGAGAACTTGCTCCAGGTGGTTAT
GGAGGAAGAGCTAAACGGTAGTTCCAATTGAAAGCTTTTATCTATTGTTGTTGTTTTTAA
GCATTTTTGAAATTGTGTTACCAAAAAAAAAAAATTTGAAGTTATATCGAGAGATATATT
ATGCC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL7692Contig1 852 2 4 U
GGGTTCGTCTTCTTGCTACTGCAATGCGTTCTCTTCAGTACTTCCCCTCCGTCTCAATTT
CTTTCAGAACACAAAAAGACGTGAATACCCCTCTCGTTTCTCGCTTATCTCCCATTAGTA
AAAACCGTAATTATCATCTACCCTTGAGGGCAGCGACGTCGACTGACGAAATCCCCCCTA
ACGCCGTTCGCCGGAAAACAGACAGCAACTGGAGAGGAGGGTTCAGTCTCGGCGTAGACT
TAGGGTTGTCGAAGACAGGAATCGCAATCAGTAAAGGCTACACCTTTCGTCCTCTCACGG
TTTTGAAATCGAGAGGGCAGAAGCTCGAGACTAGGCTGTTGGAAATTGCAGAAGAAGAGG
AGGTTGATGAGTTCATAATTGGGTTACCGAGATCTTCTGACGGTAAAGAGACGGTTCAGT
CTAATAAAGTTCGATCTGTCGCCGGAAGGCTTGCGGTTCAAGCAGCCGAGGGGTTGGAGG
GTTTATGTATTGGATGAACATGGGACGTCAACAGAAGCTTCAGACAGAATGATTGTAATG
GGACTTGGCAAGAGTGAAAGACAGAACAGAGAAGACGCGTACGCCGCTGTGATATTGTTG
GAGAGGTATTTCTCTACACAAGGTCTAGGAGCCGAGATTATACTTCCCAAGAGTTTACAC
CTCCAAGAGAAGATCAAAAACACTGCACCTAAAGACCCTGACTTCTTACCTGGAAAGCTC
GAAGAGTTTTATAAGTTCTAGACTAGTTTGCTTTCGCTATCCTCCTTGTGTAACACCTGC
CATTTCTATGGTTTGATTTTTTAATACAGACATCAGTAAATAAACACAACAAATAAGTTT
TATTTGCGTATG


BQ
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AF RR4DN27TF U 1
AF RR4DN27JQ C 130
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GTTTATGTATTGGATGAACATGGGACGTCAACAGAAGCTTCAGACAGAATGATTGTAATG
GGACTTGGCAAGAGTGAAAGACAGAACAGAGAAGACGCGTACGCCGCTGTGATATTGTTG
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QA 1 770 1 770
DS 

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TTGGATGAACATGGGACGTCAACAGAAGCTTCAGACAGAATGATTGTAATGGGACTTGGC
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AAGATCAAAAACACTGCACCTAAAGACCCTGACTTCTTACCTGGAAAGCTCGAAGAGTTT
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ATG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AY62JQ C 1
AF RR4AY62TF U 1
BS 1 616 RR4AY62TF

RD RR4AY62JQ 616 0 0
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GTTACTTCTACATTTC

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DS 

RD RR4AY62TF 616 0 0
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GTTACTTCTACATTTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7695Contig1 1014 2 2 U
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CTACTCTGTGAAATCAGATCAGACTTCCAAACTTGGAATCCTACTCAGTTTCTCATCCCC
ATCACACGAAACTGAATCAATACTTGTGGTGCCACAAGAACCTACCCCCAGCTTAGATCA
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AACTATTAATCGATTAATAATGTATATTACAAATCTATTATCTAAAATGTGGGG


BQ
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AF RR4AG01TF U 1
AF RR4AG01JQ C 302
BS 1 699 RR4AG01TF
BS 700 1014 RR4AG01JQ

RD RR4AG01TF 699 0 0
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ACTCCTAGAGTTCAAGGAAGACAACACAGATATCATCCAGGTCACTGTTGATGCTCTAGA
GGCATCTTATAACGGAGGAGGGAACATCGTTTTTAGAGGAAGACTCGAGGGAGAAGAGTA
TTTCACGGCAAGGCTCTTCAAACCCCTTCTTCACCTTTCTTCTTCCCCCATCACAGTCTC
CTACTCTGTGAAATCAGATCAGACTTCCAAACTTGGAATCCTACTCAGTTTCTCATCCCC
ATCACACGAAACTGAATCAATACTTGTGGTGCCACAAGAACCTACCCCCAGCTTAGATCA
CATGTTCTTGAAGTGCCTCGTCACATCAGAGCAGACTGTATCCGAGTGGACGGTACACGA
GACAAGCCTTGTCATGGATGGACACACACTGACTGAAATCTCTGCCTTTTGCTACAGAGC
AGAGAACTCGACAAAGACATCAGAGTACGTTGCATTGCTCGGTCACATCTCAATCAAAGA
CCATGTTCAGCTGCTCCAGCAAAACCTTGTTTCCTTGCTACCTCCAGCGTCATCATGGGT
CATCGAGGCTCATAACTAGAGCTTGTACCGGGTAATTCCGGTTCAAAGATCCTCAGGGTT
AAGTTAGAATGGAGACAGAAACAGCTTGAAGATTATGTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4AG01JQ 713 0 0
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ATGTTCTTGAAGTGCCTCGTCACATCAGAGCAGACTGTATCCGAGTGGACGGTACACGAG
ACAAGCCTTGTCATGGATGGACACACACTGACTGAAATCTCTGCCTTTTGCTACAGAGCA
GAGAACTCGACAAAGACATCAGAGTACGTTGCATTGCTCGGTCACATCTCAATCAAAGAC
CATGTTCAGCTGCTCCAGCAAAACCTTGTTTCCTTGCTACCTCCAGCGTCATCATGGGTC
ATCGAGGCTCATAACTAGAGCTTGTACCGGGTAATTCCGGTTCAAAGATCCTCAGGGTTA
AGTTAGAATGGAGACAGAAACAGCTTGAAGATTATGTTCTCCCAGCGTACAATGTGTATG
CAGAGAATGTGAAGTCGACTAATGTATCAAGAAAGGTTCTAGAGAAACCAAGAGGCGGGA
GAGTGTTCCTAGGAATCTCTCACGTGCCAGCCTATTATGTTTCGGAACTGGTGGTAGATT
CGGACGTGAAAGGAGTCAGCTTCGTGGTTCAACCGTGTGGCGAAGATGGTTCATGGAGAA
AGCTGGATGATTCCCCTAACGTTCTTGTTGAACTAGAAGGTCTCTCGTAGGTTGCTTGAA
ACTATTAATCGATTAATAATGTATATTACAAATCTATTATCTAAAATGTGGGG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7696Contig1 1229 2 2 U
GGGTTGACACTCCTCAACACACACTCGAATCTGTTTCTCCTTCGACTCCTCCTCTGTGAC
CGTCTCCGCCGCTCAAAATCTCCCCCTAACTCGCTAACTACACCGTCTCCGCTTTTGGCT
TGGGGAATCAAGAGCATGGCCAAGTACTATGACATTGACGACATACCTACAGAGGAAGAG
TTTGCTCCTGTGTTGTTCCATAAGCCAGCAAATGGAGTGACTATTGATCCAAGTGCTGAG
ACAAACTCTGTTGAGCAAGGCGCTAAAGTGGAGTTACCCTTCTGGCTTGCTCACGAGTTG
CATTTGAGACAAGCTGTCTCCATTAACCTTCCTGCCTGTTTCGACCAGAAGACGAGGTTG
GAGATACAGGCTGATGCAGCATGTGTGGATCTTAGATCACGATGTCCTTACTTCTACGAG
TTGGGTTGCAAGTTACAGCCCTTGTGAGTCCTTCCTTCCTTCCTTACTTCCCCCCATTTC
TATTATCATTCATCTTTCACTTGGTTTTTCCAAAAGAGTAAGATTTGTTTTTTCCCTGGT
GTCGATATGTTCTTTGATCATCTAGTAAGCTTATGTTTTGGCGCATTTAGTTCTTATTTA
CAATAGTTCTTTGTGTTTCAAAAGAGTCATCATAAGTTTCAATCTCCCACATGAGATTTT
TTGCATTGGAAAATAACTAATTGGTTTGAGGTTCACTGTCGTTTCATTGCAAAGTTGCAA
ACTGTATTACAAATTTATGCAACTATATTTATTCAAATATTTGCCAGTGATCTCTCTCTA
GTCTGTTCATATGTTTGTCTCTTTTAACTGGAAACAGAGTTGCAGATAGAACGATTGGGA
TCTTGCTGTCGACTGCGTTTAAGATCAGATACAAGGAGAGGCTGACAAAAGTTTTCACCG
CAACTCATCTAACAGCTTCCAAGTTCTTGCCATTCTTGACTATTGAAGAAGCAAACTTGT
ACGAAGCAGCTAACTTGTCTATGACAGCCTTCAAGAAGTGGAGAACAGGAGGTCCTCGTT
TCCAGAGAGCTTCGATACTCGGAAGAAAACGCAAGGAATCTTGATTAACTTTGACGACCC
TAAAAACGCTTTATTGCTTCATCATCTTTGTTTGTATCTTTATTGCCCTGAGTTTGGTCT
GTATCTCCTTAACACGTACATGAAAATCATATTTCACTGGTGGTGGACAAGAATGCATAT
CAGAATCTGTGGAGGTATTTTCATCCGAA


BQ
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AF RR4GP73TF U 1
AF RR4GP73JQ C 469
BS 1 687 RR4GP73TF
BS 688 1229 RR4GP73JQ

RD RR4GP73TF 687 0 0
GGGTTGACACTCCTCAACACACACTCGAATCTGTTTCTCCTTCGACTCCTCCTCTGTGAC
CGTCTCCGCCGCTCAAAATCTCCCCCTAACTCGCTAACTACACCGTCTCCGCTTTTGGCT
TGGGGAATCAAGAGCATGGCCAAGTACTATGACATTGACGACATACCTACAGAGGAAGAG
TTTGCTCCTGTGTTGTTCCATAAGCCAGCAAATGGAGTGACTATTGATCCAAGTGCTGAG
ACAAACTCTGTTGAGCAAGGCGCTAAAGTGGAGTTACCCTTCTGGCTTGCTCACGAGTTG
CATTTGAGACAAGCTGTCTCCATTAACCTTCCTGCCTGTTTCGACCAGAAGACGAGGTTG
GAGATACAGGCTGATGCAGCATGTGTGGATCTTAGATCACGATGTCCTTACTTCTACGAG
TTGGGTTGCAAGTTACAGCCCTTGTGAGTCCTTCCTTCCTTCCTTACTTCCCCCCATTTC
TATTATCATTCATCTTTCACTTGGTTTTTCCAAAAGAGTAAGATTTGTTTTTTCCCTGGT
GTCGATATGTTCTTTGATCATCTAGTAAGCTTATGTTTTGGCGCATTTAGTTCTTATTTA
CAATAGTTCTTTGTGTTTCAAAAGAGTCATCATAAGTTTCAATCTCCCACATGAGATTTT
TTGCATTGGAAAATAACTAATTGGTTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4GP73JQ 761 0 0
TCCCCCCATTTCTATTATCATTCATCTTTCACTTGGTTTTTCCAAAAGAGTAAGATTTGT
TTTTTCCCTGGTGTCGATATGTTCTTTGATCATCTAGTAAGCTTATGTTTTGGCGCATTT
AGTTCTTATTTACAATAGTTCTTTGTGTTTCAAAAGAGTCATCATAAGTTTCAATCTCCC
ACATGAGATTTTTTGCATTGGAAAATAACTAATTGGTTTGAGGTTCACTGTCGTTTCATT
GCAAAGTTGCAAACTGTATTACAAATTTATGCAACTATATTTATTCAAATATTTGCCAGT
GATCTCTCTCTAGTCTGTTCATATGTTTGTCTCTTTTAACTGGAAACAGAGTTGCAGATA
GAACGATTGGGATCTTGCTGTCGACTGCGTTTAAGATCAGATACAAGGAGAGGCTGACAA
AAGTTTTCACCGCAACTCATCTAACAGCTTCCAAGTTCTTGCCATTCTTGACTATTGAAG
AAGCAAACTTGTACGAAGCAGCTAACTTGTCTATGACAGCCTTCAAGAAGTGGAGAACAG
GAGGTCCTCGTTTCCAGAGAGCTTCGATACTCGGAAGAAAACGCAAGGAATCTTGATTAA
CTTTGACGACCCTAAAAACGCTTTATTGCTTCATCATCTTTGTTTGTATCTTTATTGCCC
TGAGTTTGGTCTGTATCTCCTTAACACGTACATGAAAATCATATTTCACTGGTGGTGGAC
AAGAATGCATATCAGAATCTGTGGAGGTATTTTCATCCGAA

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7697Contig1 532 2 1 U
GGCTTCACGGTGATGTACAAAGGCTTGCCGCTGGGGAGAGCGACGGTGCCTGGTTTCTAC
CAAGACGCGCATACCACTAGGAACGTGGAGGCGACCATTACTGTTGATAGAGTGAATCTT
ATGCAAGGCAACGCGGCTGATCTAGTCAGAGACGCTTCGTTAAACGACCGAGTTGCGCTC
ACTGTTAAAGGAGACGTTAGCGCTAAGATCCGGGTCATGAACTTCGATTCCCCGGGCGTT
CAGGTATCAGTGAATTGCGGGATAGGCATTAGTCCGAGGAAGCAGGCTCTGATTTACAAG
CAATGTGGCTTTGATGGACTCAGCGTATAACTTCAATTTATAACAATAGTACTGACCACT
CCCTAAAACATTGTGGAGTTGCGGAAAAAAGTTAAAACTGGTAAAAAAACGGAACAGGAT
CCATATCGGATTTTTTCTTTTGTTTTGTTTTATTATGTTCCTTTGTATTCTGGCCCCAAA
AAAATGTTCCTTTGTACACGCGATATTTGAAGTAGTAACAGTGTTGTTTACC


BQ
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AF RR4DJ38JQ C 1
AF RR4DJ38TF U 1
BS 1 532 RR4DJ38TF

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CCATATCGGATTTTTTCTTTTGTTTTGTTTTATTATGTTCCTTTGTATTCTGGCCCCAAA
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QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4DJ38TF 532 0 0
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CAAGACGCGCATACCACTAGGAACGTGGAGGCGACCATTACTGTTGATAGAGTGAATCTT
ATGCAAGGCAACGCGGCTGATCTAGTCAGAGACGCTTCGTTAAACGACCGAGTTGCGCTC
ACTGTTAAAGGAGACGTTAGCGCTAAGATCCGGGTCATGAACTTCGATTCCCCGGGCGTT
CAGGTATCAGTGAATTGCGGGATAGGCATTAGTCCGAGGAAGCAGGCTCTGATTTACAAG
CAATGTGGCTTTGATGGACTCAGCGTATAACTTCAATTTATAACAATAGTACTGACCACT
CCCTAAAACATTGTGGAGTTGCGGAAAAAAGTTAAAACTGGTAAAAAAACGGAACAGGAT
CCATATCGGATTTTTTCTTTTGTTTTGTTTTATTATGTTCCTTTGTATTCTGGCCCCAAA
AAAATGTTCCTTTGTACACGCGATATTTGAAGTAGTAACAGTGTTGTTTACC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL7698Contig1 1086 2 4 U
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GAGCTCAGATAGTATCTATTCATACTGGTGATATGGATGAGATGGATTGGTCTGAATTTG
ACATGGACTTCCCTAAGGCAGAGATACTAATTCTGAACTTCTCTTCAGACAAGTATGTTC
TGCCTCCTTTCATCACAAAGGTGAAACGGCTCAAGGTCTTAGTGATCATCAACAACGGCA
TGTCCCCTGCTGTTCTCCATGACTTTTCGATTTTCGCCAACTTGTCGAACCTAAGGAGTC
TCTGGCTCGAGAGAGTTCACGTCCCTGAGCTCTCCAACACAACCATCCCCTTGAGAAAAC
TCCGCAAGATGTCTTTGATCCTCTGCAAGATCAACAACAGTTTCGATCAGACAGGAGTTG
ACATCTCCACCCTCTTCCCAAAGTTAGCCGACCTGACGATAGATCACTGCGATGATCTCG
TCTCTCTACCTCCCAGCATCTGCGGTATGACCTCTCTCAGCTCCTTGAGCATAACAAACT
GTCCACGCCTCAGTGAGTTGCCCAAGAACCTCAGTAAGCTACAAGCTCTTGAGATTCTGA
GACTGTACGCTTGTCTCGAGCTAAAGGCACTGCCTGTGGAGGTCTGTGAGCTTCCTGAGC
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GGGAGGAGGTTGAGAAGGCTGTGCCAGGGTTGAAGATTGAAGCTGCTGAGAAATGTTTCA
ACTTAGATTGGCTCAACGAGTAAAGATCATAAACCCATAGAGGAGGAGGCCTTGTATCAA
TTGTAAATAGTGTTGAGGGATTAGTGTTAGGCTCCTCTTCTTTGTTAGTTTATATCATGC
TTTGTAGTAAAGATCTCTCTGTACAGTTTCTACAAACTCAATCGGTCAAGTCTCTTTTTT
TTGCCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4GX94TF U 1
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BS 721 721 RR4GX94JQ
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GAGCTCAGATAGTATCTATTCATACTGGTGATATGGATGAGATGGATTGGTCTGAATTTG
ACATGGACTTCCCTAAGGCAGAGATACTAATTCTGAACTTCTCTTCAGACAAGTATGTTC
TGCCTCCTTTCATCACAAAGGTGAAACGGCTCAAGGTCTTAGTGATCATCAACAACGGCA
TGTCCCCTGCTGTTCTCCATGACTTTTCGATTTTCGCCAACTTGTCGAACCTAAGGAGTC
TCTGGCTCGAGAGAGTTCACGTCCCTGAGCTCTCCAACACAACCATCCCCTTGAGAAAAC
TCCGCAAGATGTCTTTGATCCTCTGCAAGATCAACAACAGTTTCGATCAGACAGGAGTTG
ACATCTCCACCCTCTTCCCAAAGTTAGCCGACCTGACGATAGATCACTGCGATGATCTCG
TCTCTCTACCTCCCAGCATCTGCGGTATGACCTCTCTCAGCTCCTTGAGCATAACAAACT
GTCCACGCCTCAGTGAGTTGCCCAAGAACCTCAGTAAGCTACAAGCTCTTGAGATTCTGA
GACTGTACGCTTGTCTCGAGCTAAAGGCACTGCCTGTGGAGGTCTGTGAGCTTCCTGAGC
TTAAGTACCTAGACATCTCGCAGTGTGTTAACCTGAGTTGTCTTCCGGAGGAGATAGGAA
*GCTAAAGACGCTTGAGA
GATAGACA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4GX94JQ 758 0 0
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GATCAACAACAGTTTCGATCAGACAGGAGTTGACATCTCCACCCTCTTCCCAAAGTTAGC
CGACCTGACGATAGATCACTGCGATGATCTCGTCTCTCTACCTCCCAGCATCTGCGGTAT
GACCTCTCTCAGCTCCTTGAGCATAACAAACTGTCCACGCCTCAGTGAGTTGCCCAAGAA
CCTCAGTAAGCTACAAGCTCTTGAGATTCTGAGACTGTACGCTTGTCTCGAGCTAAAGGC
ACTGCCTGTGGAGGTCTGTGAGCTTCCTGAGCTTAAGTACCTAGACATCTCGCAGTGTGT
TAACCTGAGTTGTCTTCCGGAGGAGATAGGAAAGCTAAAGACGCTTGAGAAGATAGACAT
GAGGGAATGTTTTTTCTCTGATAGACTTAGTTCTGCTGTCTCTTTAGAGTCTCTGCGACA
TGTGATTTGTGATAAGGACGTTGCGTTTATATGGGAGGAGGTTGAGAAGGCTGTGCCAGG
GTTGAAGATTGAAGCTGCTGAGAAATGTTTCAACTTAGATTGGCTCAACGAGTAAAGATC
ATAAACCCATAGAGGAGGAGGCCTTGTATCAATTGTAAATAGTGTTGAGGGATTAGTGTT
AGGCTCCTCTTCTTTGTTAGTTTATATCATGCTTTGTAGTAAAGATCTCTCTGTACAGTT
TCTACAAACTCAATCGGTCAAGTCTCTTTTTTTTGCCG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

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ATATGGATCCTTGTGTCCCCGAGACCTCCATGTTCCAGTGGTCTCGGAGTCGCCGGAAGA
TTCATATCCGCCGTCGTAAGACACGGGTGGTGCGTCTTGGCGGGAAGAACAATGTGGTGT
CACGTGGTGGATTCTCGTTGAAGAAGATGGTGAGGAGGATGAAGCTGAGATGGTTGAGAC
TTCATTACGTGAGACTCGTGAAGAAGATCAAAGGGTTTTATAGTAATTTGGTAAAAGAGT
TCGTAGACGCAGGAGTTGAGCTCGAAGCGATTCAGACGCAAATGGCGGTTGAAGCGGCTG
CGTTTGCGGTTCCGGGTTTAGGTCTCTCTTTCTCCTCTCTGTCAGCTCATGACCGAGCAC
GGTCTATAACTCGTCCACGGCTCTTGTTCACCTTCAAAGTAGAGGACAAGTTATTCATCT
TCTCTGCAACTCAACCTCAAAACCTAGGCGGTGGCAACTGTTCTATTGTAGCTACACGTT
ATAAAGATTTTCCCAAACATTTTCCAACCGAAACCCTTGACGACTTGTCCAGGGGATATA
TTGTTATGTCTTCATGGACCGGGAAGAATAAGAGCAAGGAGTCCAGTAGTTTGTAACCTC
GTCACGGGAGAGTTCATAGACTTGGCCAAAGTGAAAGCGACGGATACTAAAAGGAGCTAC
ATTGGCTACGATCCGATCAGCAAACAGTTTAAAGTGTTGTTTCTAACCAGTTATGGAAGA
CAAAACCGTGTTTTGACATTGGAGACTGGAAAGCCTTTACGGATGAGGTACACCATGGAA
TGTGAACACCATGCTGGTGAATATGGTGAAGTATGCATCGATGGCGTTTTGTATTACGAA
GCTTACTTTAAAAAATCAGCATCTCATATGATAGTTTGCTTTGACTTTAGCTTTGAAAAG
TTCAGTTTTAATGAGACAAATCGTGAAATGGAGAACGTCTCTTTATTCAACT


BQ
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AF RR4DL13TF U 1
AF RR4DL13JQ C 528
BS 1 634 RR4DL13TF
BS 635 1012 RR4DL13JQ

RD RR4DL13TF 634 0 0
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TTCATTACGTGAGACTCGTGAAGAAGATCAAAGGGTTTTATAGTAATTTGGTAAAAGAGT
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ATAAAGATTTTCCCAAACATTTTCCAACCGAAACCCTTGACGACTTGTCCAGGGGATATA
TTGTTATGTCTTCATGGACCGGGAAGAATAAGAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4DL13JQ 485 0 0
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CAACT

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

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TCTGTTCCAACGGTGAATGGAAGGAAAGTGATGGAGATAACAGTGGACTCGTGGTTATTG
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TAAAAAAAAAAACACTTTAGTTTTTGATTTGCCTTTCTTTGTTTTCAGTTTAGATCGTAA
AACGAATCGTTTCTAGTGACTTTTGTCTATTAATTATTATGTATGCTTGAATTAGTGACC


BQ
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AF RR4F725TF U 1
AF RR4F725JQ C 418
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AATTGATGGAGAAAGTGGGCAAGAGACCGCTTTTTAGTTTTCTGGACCCAAGTGATCATT
GCGGCTTCACTTGTTATAACATGGTTGTTAAGGTCTATTCCAAAGTGTTGTTTAATTTTG
AACTAGTCTATCACGGATATCGTTCTTGAAAGATATTTCCAGTGTCTTCCGTGGGACGAG
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TTTGCTCAGATGGAGGATCAAGATTTTTATCATTTTATGGGGAACCTTCATCATCCGCAT
GTGTACCCTTTTCATGATCAGACCTCTCTAGTT

QA 1 753 1 753
DS 

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TTGAACTAGTCTATCACGGATATCGTTCTTGAAAGATATTTCCAGTGTCTTCCGTGGGAC
GAGGAAAAGGATGAGCTTAAAGATTTGGATGATTTGTATTCTTTTGTGGAATGTGTAGAC
TCTTTTGCTCAGATGGAGGATCAAGATTTTTATCATTTTATGGGGAACCTTCATCATCCG
CATGTGTACCCTTTTCATGATCAGACCTCTCTAGTTCATAGTCGAGCACATATGTTGTGC
CCTTTTCATCATGAGACTTCTCCAGCAAATGTTCAGGAGGAGGGTTCTTCTAGTGTCGAG
GTTTCTGTTCCAACGGTGAATGGAAGGAAAGTGATGGAGATAACAGTGGACTCGTGGTTA
TTGGAAAAGGTGGCGAGTTTGAAGGAGAAGATAGCCAAGATGATGCAAATGCAAGCTAAG
GAACTGAAGTTAATGAGAAAATCAGGAGGTGTTTTAAAGGAGGACAAGTCACTTGCAGAT
AACAACGTTGAAGCAGGACAAATGTTAACAGCGACTTGGCGCTTTTCTAGATGGGAAGAA
TATTAAAAAAAAAAACACTTTAGTTTTTGATTTGCCTTTCTTTGTTTTCAGTTTAGATCG
TAAAACGAATCGTTTCTAGTGACTTTTGTCTATTAATTATTATGTATGCTTGAATTAGTG
ACC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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AGCCGCAACAGTTTCTGACGATGAACGCGAAGCTCTACTCTCTGGAGAGGTTCCGAGCAG
ATTTTGTTGATGTCTCGGTAAAGGAGGTAGATCTGCTCAACGAGTTGGAGGTATCCAAAG
TATATCACTGCGACGGGTTGGTGTTATGCGTGGCTAAGGACAAGAAGGAGGAACCGAAGC
TGGTGTTGTGGAACCCTTATCTGTGTCAAACAAGGTGGATCGAACCGAGAGAGACTTTCA
ACAAAAATAACAGGTTCGCGATCGGATATGACGACGGCTCAGGCTCAGGCTCAGACTCGC
AGCGCAACCACAAAATCCTGAGGTTAGCGGATGCTTACACCTTTGGACCAGAACGCAAAC
ACGAGTTTGTGTGCGAAATCTATGAAATTAGGTCTAATTCATGGAGGGTTCTCGATGTGG
TGAAGGATAATCCCAAGTGGTCGATAGATATGGATCAGCGAGGCGTGTCTGTCAAGGGAA
ACACCTACTTTTTTGCTCATCATCTTGCAGAAAGAGTTTTTAGAGGACTCGTCCTTAAAC
AGGAGGAAATTTTCTTAATCTGTTTTGATTCTGCC


BQ
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AF RR4A488JQ C 1
AF RR4A488TF U 1
BS 1 635 RR4A488TF

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TGGTGTTGTGGAACCCTTATCTGTGTCAAACAAGGTGGATCGAACCGAGAGAGACTTTCA
ACAAAAATAACAGGTTCGCGATCGGATATGACGACGGCTCAGGCTCAGGCTCAGACTCGC
AGCGCAACCACAAAATCCTGAGGTTAGCGGATGCTTACACCTTTGGACCAGAACGCAAAC
ACGAGTTTGTGTGCGAAATCTATGAAATTAGGTCTAATTCATGGAGGGTTCTCGATGTGG
TGAAGGATAATCCCAAGTGGTCGATAGATATGGATCAGCGAGGCGTGTCTGTCAAGGGAA
ACACCTACTTTTTTGCTCATCATCTTGCAGAAAGAGTTTTTAGAGGACTCGTCCTTAAAC
AGGAGGAAATTTTCTTAATCTGTTTTGATTCTGCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR4A488TF 635 0 0
GGACGATGAGCAATGTCGGTGAGAAATTGGTTGGGGAGAAGAAAGTAGCAGCAGCGCAGC
AGCCGCAACAGTTTCTGACGATGAACGCGAAGCTCTACTCTCTGGAGAGGTTCCGAGCAG
ATTTTGTTGATGTCTCGGTAAAGGAGGTAGATCTGCTCAACGAGTTGGAGGTATCCAAAG
TATATCACTGCGACGGGTTGGTGTTATGCGTGGCTAAGGACAAGAAGGAGGAACCGAAGC
TGGTGTTGTGGAACCCTTATCTGTGTCAAACAAGGTGGATCGAACCGAGAGAGACTTTCA
ACAAAAATAACAGGTTCGCGATCGGATATGACGACGGCTCAGGCTCAGGCTCAGACTCGC
AGCGCAACCACAAAATCCTGAGGTTAGCGGATGCTTACACCTTTGGACCAGAACGCAAAC
ACGAGTTTGTGTGCGAAATCTATGAAATTAGGTCTAATTCATGGAGGGTTCTCGATGTGG
TGAAGGATAATCCCAAGTGGTCGATAGATATGGATCAGCGAGGCGTGTCTGTCAAGGGAA
ACACCTACTTTTTTGCTCATCATCTTGCAGAAAGAGTTTTTAGAGGACTCGTCCTTAAAC
AGGAGGAAATTTTCTTAATCTGTTTTGATTCTGCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL7702Contig1 1231 2 2 U
GGAAAATTCCAAGCCATGAATCGCGGCTCTTCTTCTTCTTCTTACGGATCCGGCGGGGGA
GCTAGTGATTCGTTTCGGAGAAGATCCGATGCAGCACGCAAGCGAAACAATAAAGGTGGA
GAAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGAAGTTTCATTCATTGTCGGAACTTGCTCTTCTATG
TGTCCTGAACGGGAAAGAGTGACAAGAGAACGCTTGCGTGATCTCTCAGTGTTTGAGAGG
CTTTATGAAAACCCCACTAAATCATCCACTCATCTTGCTGTCAAAAAGTTTTGCAGAACC
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CTGAGTTACCTTCTAAGTTTGCTGGACTCAAGGGAGCACCCCTTTGAAGTTGTTCATGAT
TTTATTTTCATATCTGGCCAGAGGCTTCAGGGTTGTAGTGGTGCAAATATTAGCTCAATG
CATCACCTGAACATGGAGCAGCTAGCAAAAACTCTCACCACTTTGTATAATATCTATGAT
GTAAATAGGAAACCAGATTACATCTACGAAAAAGAAGCGGAGTTCCGTTCACTCTATGTG
CTGCTTCATCTCAATACCAGTAGTGGAGTGATGAGGGAACCACTGTCTTTGTGGTTTCGC
AAGTTGACTTCTAATTTGATAAAGTCCAAGGAAATGCGTTTTGTACGGAACCTGTTAAGA
TCATATCGGAATGGTAATTACCAGAGTTTTTTAAGAACAACGGCTTCTGAAGCGACATAC
TTGCAGTATTGCATAAGTGAACCCCATATCAGAGAGATGAGATCGTTCGTTCTGGAATGC
ATAAATAATGTTTGCTACAAGCTTCAACCTTATCCACTCTTGCGGATATTTCAGCAGCTG
ATGATGAAGGAGTTGGATGTTGAGTCTTTATGCCATGAGTGTGGTCTTGAGATGCGTACT
GATTCCGATGGGTGCATTGTGTTGCCAACGAAGCAGACAAACTTCCATAGTCCAAAGGAA
GGTTTTAAAAACTATGATCTGACTGGAATCGAAATTGAGAGGTGGTTGTGAAAACACATA
AAACATAACAATGTGAGTTGTATCATTCACTTGTGCCCTAATCCTAAAGCCTGTAATCAA
TCTTTTGGATCTTTTATAACCCAAAAAAATGTATACATTCATGCCCTATTCGTTGTCTCA
TGATTGAACAATCAGCAGAGACATGCTGAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E634TF U 1
AF RR4E634JQ C 606
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BS 681 1231 RR4E634JQ

RD RR4E634TF 680 0 0
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GCTAGTGATTCGTTTCGGAGAAGATCCGATGCAGCACGCAAGCGAAACAATAAAGGTGGA
GAAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGAAGTTTCATTCATTGTCGGAACTTGCTCTTCTATG
TGTCCTGAACGGGAAAGAGTGACAAGAGAACGCTTGCGTGATCTCTCAGTGTTTGAGAGG
CTTTATGAAAACCCCACTAAATCATCCACTCATCTTGCTGTCAAAAAGTTTTGCAGAACC
CTTTCAGCAGCTGATGTTCAGGCATCGGATGTAAGACCCCTCCCGGTCTTAGAAGAAACC
CTGAGTTACCTTCTAAGTTTGCTGGACTCAAGGGAGCACCCCTTTGAAGTTGTTCATGAT
TTTATTTTCATATCTGGCCAGAGGCTTCAGGGTTGTAGTGGTGCAAATATTAGCTCAATG
CATCACCTGAACATGGAGCAGCTAGCAAAAACTCTCACCACTTTGTATAATATCTATGAT
GTAAATAGGAAACCAGATTACATCTACGAAAAAGAAGCGGAGTTCCGTTCACTCTATGTG
CTGCTTCATCTCAATACCAGTAGTGGAGTGATGAGGGAACCACTGTCTTTGTGGTTTCGC
AAGTTGACTTCTAATTTGAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4E634JQ 626 0 0
TCATCTCAATACCAGTAGTGGAGTGATGAGGGAACCACTGTCTTTGTGGTTTCGCAAGTT
GACTTCTAATTTGATAAAGTCCAAGGAAATGCGTTTTGTACGGAACCTGTTAAGATCATA
TCGGAATGGTAATTACCAGAGTTTTTTAAGAACAACGGCTTCTGAAGCGACATACTTGCA
GTATTGCATAAGTGAACCCCATATCAGAGAGATGAGATCGTTCGTTCTGGAATGCATAAA
TAATGTTTGCTACAAGCTTCAACCTTATCCACTCTTGCGGATATTTCAGCAGCTGATGAT
GAAGGAGTTGGATGTTGAGTCTTTATGCCATGAGTGTGGTCTTGAGATGCGTACTGATTC
CGATGGGTGCATTGTGTTGCCAACGAAGCAGACAAACTTCCATAGTCCAAAGGAAGGTTT
TAAAAACTATGATCTGACTGGAATCGAAATTGAGAGGTGGTTGTGAAAACACATAAAACA
TAACAATGTGAGTTGTATCATTCACTTGTGCCCTAATCCTAAAGCCTGTAATCAATCTTT
TGGATCTTTTATAACCCAAAAAAATGTATACATTCATGCCCTATTCGTTGTCTCATGATT
GAACAATCAGCAGAGACATGCTGAGC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7703Contig1 912 2 2 U
GGGCGATAGATGTACTGGTCACAGCATATTCATATTCGGTTAAAGCTGGTATATACAAGG
AACTAAAGAACGAAAAGACTACTCCAACTGATGGAGCATCTCCTGATAACAAAAGACGTA
GAGCATCTGGAAGCAGTATTGATGAAGAAGAAGAAGTTGAAATAAATGTACCATCTGGTC
CTGCTGATGAGCAGCAGGAATCTCAACTCTCGTCACCAGCCGTTTCACCTGATGAGCTCT
ACAAGTTTGTGTTTGCTTCTGCGGAGGAAACGATGGTTGAGGAATCTGACTACCTAGTTG
CTATCATAACTGAGTTCCTTCGCAGTATAAGCGCAGAGAAACTCAAAGTGGATCTCAACA
TTTATGTGATGACCATCAGACTTTTAGCACACAGTAAACGATTTGCAGAACTGTCACTAT
TCATCACAAACAAGATAATCGAACCATCAAAGGAAGTCGCGCTCCAGCTTCTCGAGAGTG
GTCGTCAAAACCTGCGGGTAAGGAAACTTGGGCTTGATATGCTGAGACAGCTCTCGTTGC
ACCATGAGTATATCTCTTCCCTTGTGCAAGATGGATACTATCTTGAAGCTCTGCGTTATG
CTCAGAAGCGTAAGGTGACGAGTGTGCGATCGTCACTGTTTCTGGAAGCAGCATTCGCGT
CGAATGATATGCAACATTTGGCTGCAATACTAAGGGTCTTGTCGGAATTGATTCCTGGAT
TCAAAGAAACTTCAGAGTATTACACGTTCCATGGTCTTCTTAATGAGACCAGTTCCTCAG
TTGCTGTCTGAGAGAGAACTTCTTACCATGTTTTATGTTCTCAATAAACCTAAAATAATA
CTTGGTTGTTGTTTGGATCTTTATAAGGAAACGATTTTCTGGTTCATTAAAAATAAAATA
ACGATTAGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI40TF U 1
AF RR4FI40JQ C 233
BS 1 688 RR4FI40TF
BS 689 912 RR4FI40JQ

RD RR4FI40TF 688 0 0
GGGCGATAGATGTACTGGTCACAGCATATTCATATTCGGTTAAAGCTGGTATATACAAGG
AACTAAAGAACGAAAAGACTACTCCAACTGATGGAGCATCTCCTGATAACAAAAGACGTA
GAGCATCTGGAAGCAGTATTGATGAAGAAGAAGAAGTTGAAATAAATGTACCATCTGGTC
CTGCTGATGAGCAGCAGGAATCTCAACTCTCGTCACCAGCCGTTTCACCTGATGAGCTCT
ACAAGTTTGTGTTTGCTTCTGCGGAGGAAACGATGGTTGAGGAATCTGACTACCTAGTTG
CTATCATAACTGAGTTCCTTCGCAGTATAAGCGCAGAGAAACTCAAAGTGGATCTCAACA
TTTATGTGATGACCATCAGACTTTTAGCACACAGTAAACGATTTGCAGAACTGTCACTAT
TCATCACAAACAAGATAATCGAACCATCAAAGGAAGTCGCGCTCCAGCTTCTCGAGAGTG
GTCGTCAAAACCTGCGGGTAAGGAAACTTGGGCTTGATATGCTGAGACAGCTCTCGTTGC
ACCATGAGTATATCTCTTCCCTTGTGCAAGATGGATACTATCTTGAAGCTCTGCGTTATG
CTCAGAAGCGTAAGGTGACGAGTGTGCGATCGTCACTGTTTCTGGAAGCAGCATTCGCGT
CGAATGATATGCAACATTTGGCTGCAAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FI40JQ 680 0 0
TGAGCTCTACAAGTTTGTGTTTGCTTCTGCGGAGGAAACGATGGTTGAGGAATCTGACTA
CCTAGTTGCTATCATAACTGAGTTCCTTCGCAGTATAAGCGCAGAGAAACTCAAAGTGGA
TCTCAACATTTATGTGATGACCATCAGACTTTTAGCACACAGTAAACGATTTGCAGAACT
GTCACTATTCATCACAAACAAGATAATCGAACCATCAAAGGAAGTCGCGCTCCAGCTTCT
CGAGAGTGGTCGTCAAAACCTGCGGGTAAGGAAACTTGGGCTTGATATGCTGAGACAGCT
CTCGTTGCACCATGAGTATATCTCTTCCCTTGTGCAAGATGGATACTATCTTGAAGCTCT
GCGTTATGCTCAGAAGCGTAAGGTGACGAGTGTGCGATCGTCACTGTTTCTGGAAGCAGC
ATTCGCGTCGAATGATATGCAACATTTGGCTGCAATACTAAGGGTCTTGTCGGAATTGAT
TCCTGGATTCAAAGAAACTTCAGAGTATTACACGTTCCATGGTCTTCTTAATGAGACCAG
TTCCTCAGTTGCTGTCTGAGAGAGAACTTCTTACCATGTTTTATGTTCTCAATAAACCTA
AAATAATACTTGGTTGTTGTTTGGATCTTTATAAGGAAACGATTTTCTGGTTCATTAAAA
ATAAAATAACGATTAGTTGT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL7704Contig1 780 2 2 U
GGACCAGCGCTCCTCTCTCTCTAATCGAATTGAAGTCGTTTTGCGGAAGGAAGAAAATGG
TTAATGGATTAATCAACGAGAACCCGATCGTGTACGAGGTAAAACATCGTCGTGATGTTC
GAGCCGATTCCAGCAGCAATACCAATGAGCTCTCGGTAGATGCAATCGGTCATCTCGAAG
TTTTCGATCATATAAGAGATATAAAAGATCCAGAGCATCCTTACTCTCTGGAACAACTCA
AAGTCCTTACAGAAGATTCTGTTGAAGTTGATGATTCCAAGAGTCATGTTAGGGTTACGT
TCACTCCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAACTATTATTGGTCTCTGTGTCCGCGTGA
AGCTTATGCGAAGCCTTCCTCGTCGTTACAAGATTGATATAAGGGTAGCCCCCGGTACTC
ATGCAACTGAGGCTGCAGTCAATAAACAACTAAACGACAAAGAGCGTGTGGCGGCTGCAC
TAGAGAATCCAAACCTTGTGGAGATGGTCGATGAATGTCTTTCTTCATCATTTGAATGAT
GCCCTTGATGCTCTCAAGATACACTTTCATATATGTATATGTCTGCTTTTGTCTGCAAAT
ATTTTGATCAGTTACTATACGTTTAGTTTCATGTTTAGTGGAAGACTGGGAATATATCCA
CAGAACCATCTCAGAAAGGATTATTTCAGATACTCTACAACAGAACTTGTTGCACGTTTG
TTCTTTCACACATTTGTACCATTTGTTGCCATCTTGTTGTGGGTATAACTCGAGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H544TF U 1
AF RR4H544JQB C 36
BS 1 674 RR4H544TF
BS 675 780 RR4H544JQB

RD RR4H544TF 674 0 0
GGACCAGCGCTCCTCTCTCTCTAATCGAATTGAAGTCGTTTTGCGGAAGGAAGAAAATGG
TTAATGGATTAATCAACGAGAACCCGATCGTGTACGAGGTAAAACATCGTCGTGATGTTC
GAGCCGATTCCAGCAGCAATACCAATGAGCTCTCGGTAGATGCAATCGGTCATCTCGAAG
TTTTCGATCATATAAGAGATATAAAAGATCCAGAGCATCCTTACTCTCTGGAACAACTCA
AAGTCCTTACAGAAGATTCTGTTGAAGTTGATGATTCCAAGAGTCATGTTAGGGTTACGT
TCACTCCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAACTATTATTGGTCTCTGTGTCCGCGTGA
AGCTTATGCGAAGCCTTCCTCGTCGTTACAAGATTGATATAAGGGTAGCCCCCGGTACTC
ATGCAACTGAGGCTGCAGTCAATAAACAACTAAACGACAAAGAGCGTGTGGCGGCTGCAC
TAGAGAATCCAAACCTTGTGGAGATGGTCGATGAATGTCTTTCTTCATCATTTGAATGAT
GCCCTTGATGCTCTCAAGATACACTTTCATATATGTATATGTCTGCTTTTGTCTGCAAAT
ATTTTGATCAGTTACTATACGTTTAGTTTCATGTTTAGTGGAAGACTGGGAATATATCCA
CAGAACCATCTCAG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4H544JQB 745 0 0
GTCG
TTTGCGGAAGGAAGAAAATGGTTAATGGATTAATCAACGAGAACCCGATCGTGTACGAGG
TAAAACATCGTCGTGATGTTCGAGCCGATTCCAGCAGCAATACCAATGAGCTCTCGGTAG
ATGCAATCGGTCATCTCGAAGTTTTCGATCATATAAGAGATATAAAAGATCCAGAGCATC
CTTACTCTCTGGAACAACTCAAAGTCCTTACAGAAGATTCTGTTGAAGTTGATGATTCCA
AGAGTCATGTTAGGGTTACGTTCACTCCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAACTATTA
TTGGTCTCTGTGTCCGCGTGAAGCTTATGCGAAGCCTTCCTCGTCGTTACAAGATTGATA
TAAGGGTAGCCCCCGGTACTCATGCAACTGAGGCTGCAGTCAATAAACAACTAAACGACA
AAGAGCGTGTGGCGGCTGCACTAGAGAATCCAAACCTTGTGGAGATGGTCGATGAATGTC
TTTCTTCATCATTTGAATGATGCCCTTGATGCTCTCAAGATACACTTTCATATATGTATA
TGTCTGCTTTTGTCTGCAAATATTTTGATCAGTTACTATACGTTTAGTTTCATGTTTAGT
GGAAGACTGGGAATATATCCACAGAACCATCTCAGAAAGGATTATTTCAGATACTCTACA
ACAGAACTTGTTGCACGTTTGTTCTTTCACACATTTGTACCATTTGTTGCCATCTTGTTG
TGGGTATAACTCGAGTTTGCC

QA 5 745 5 745
DS 



AS 1 2

CO CL7705Contig1 892 2 2 U
GGAAGCTGAAATCGTGGCCAAGCTCGACGTGGAATCACCAGAGAAGGAGAACCATGTGTC
CGCTGCTGAAAAATCAAAGGAAGAGGTGGCTGAAACCAAGAAGATAGCGGTTATGATTGA
TGAATCAAACCTTGCAGACTATGTTGGCAAACCTGTTTTCCATGCGGAAAAGATCTACGA
GCCCACACCGGTAGGAGTTGTGATGGGTCTAGCTTGGACATCCATGGGTGGTTCAACGTT
ATACATAGAGACGACTGTTGTGGAGGAAGGGGAAGGTAAAGGTGGACTGAATATAACGGG
TCAGCTCGGTGATGTGATGAAAGAAAGCACACAAATTGCTCACACTGTCGCCAGAAAGAT
CTTGCTAGAGAAAGAGCCAGAGAATCTCTTCTTTGCAAACTCCAAGCTCCATCTCCATGT
TCCTGCAGGAGCCACACCCAAAGACGGTCCGAGTGCAGGCTGCACCATGATTACATCATT
GCTATCACTTGCCATGAATAAACCTGTTAGAGAAGACCTTGCGATGACCGGAGAAGTCAC
TTTAACCGGTAGAATCCTTCCTATTGGCGGGGTGAAGGAGAAAACCATAGCGGCGAGGCG
AAGCCAGGTGAAGACTATCATATTCCCGGAGGCAAACAGGAGAGACTTTGAAGAGCTGGC
GGAGAATGTGAAAGAAGGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATGGAAAGATTTTCGA
GCTTGCCTTTGGCTATGACAAACAACAAGACTGATATAACTCAAGCAGTCACGTTGAACT
CGGAACTCACGTTAACATTTTATTTGCATATTTCATTCCATCTTAAGAAAGATTTATCCA
TGCAGACAAATACAGAACTAATGAAAAAGAATGCTCCAGAGGCTTCTTCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FC81TF U 1
AF RR4FC81JQ C 199
BS 1 625 RR4FC81TF
BS 626 892 RR4FC81JQ

RD RR4FC81TF 625 0 0
GGAAGCTGAAATCGTGGCCAAGCTCGACGTGGAATCACCAGAGAAGGAGAACCATGTGTC
CGCTGCTGAAAAATCAAAGGAAGAGGTGGCTGAAACCAAGAAGATAGCGGTTATGATTGA
TGAATCAAACCTTGCAGACTATGTTGGCAAACCTGTTTTCCATGCGGAAAAGATCTACGA
GCCCACACCGGTAGGAGTTGTGATGGGTCTAGCTTGGACATCCATGGGTGGTTCAACGTT
ATACATAGAGACGACTGTTGTGGAGGAAGGGGAAGGTAAAGGTGGACTGAATATAACGGG
TCAGCTCGGTGATGTGATGAAAGAAAGCACACAAATTGCTCACACTGTCGCCAGAAAGAT
CTTGCTAGAGAAAGAGCCAGAGAATCTCTTCTTTGCAAACTCCAAGCTCCATCTCCATGT
TCCTGCAGGAGCCACACCCAAAGACGGTCCGAGTGCAGGCTGCACCATGATTACATCATT
GCTATCACTTGCCATGAATAAACCTGTTAGAGAAGACCTTGCGATGACCGGAGAAGTCAC
TTTAACCGGTAGAATCCTTCCTATTGGCGGGGTGAAGGAGAAAACCATAGCGGCGAGGCG
AAGCCAGGTGAAGACTATCATATTC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4FC81JQ 694 0 0
TGTGATGGGTCTAGCTTGGACATCCATGGGTGGTTCAACGTTATACATAGAGACGACTGT
TGTGGAGGAAGGGGAAGGTAAAGGTGGACTGAATATAACGGGTCAGCTCGGTGATGTGAT
GAAAGAAAGCACACAAATTGCTCACACTGTCGCCAGAAAGATCTTGCTAGAGAAAGAGCC
AGAGAATCTCTTCTTTGCAAACTCCAAGCTCCATCTCCATGTTCCTGCAGGAGCCACACC
CAAAGACGGTCCGAGTGCAGGCTGCACCATGATTACATCATTGCTATCACTTGCCATGAA
TAAACCTGTTAGAGAAGACCTTGCGATGACCGGAGAAGTCACTTTAACCGGTAGAATCCT
TCCTATTGGCGGGGTGAAGGAGAAAACCATAGCGGCGAGGCGAAGCCAGGTGAAGACTAT
CATATTCCCGGAGGCAAACAGGAGAGACTTTGAAGAGCTGGCGGAGAATGTGAAAGAAGG
GCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATGGAAAGATTTTCGAGCTTGCCTTTGGCTATGA
CAAACAACAAGACTGATATAACTCAAGCAGTCACGTTGAACTCGGAACTCACGTTAACAT
TTTATTTGCATATTTCATTCCATCTTAAGAAAGATTTATCCATGCAGACAAATACAGAAC
TAATGAAAAAGAATGCTCCAGAGGCTTCTTCTAG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7706Contig1 722 2 2 U
GGACAAATATATGTATTATACATATATATTAGATCCTTCTATAGTGAAGTCTGCAAAATG
GTCTTCTTCTACTTTTAGAAAGAATCACGAGAATGTTGTTCTTGTTTTGTGTTCATATTG
CTTCGCTGAAAGGAAACAAGAAAAATATCTCATCCGTACATGCCTATATATATAACGTCA
TTAACCGCACGTATTCATCAAACAAGAAGAGGTCAAAAGATTCCAAGAAAGTTCTAACAA
ATTGAACCACATTTTACAATCACTGTCTTCGAATTAACTTTAGTTAATGATGGTTTCCAT
GGAGGCTCTAGCGATGGCAGAAGCGGATTATCAAGAATGGGGACTTAGTATTGAGGAATG
GGAGTTTCAAGAATCAGTAGTTCCGTCCCATTTGCTTGCAGACGATGTTGAAAAGGATGA
AGAAGAAGATCATCAAAATGATGATGATAGGCTTTTCGATGGCGTAGAGGTTAAACAATC
TCTTACTTGTGACACTCGAGATTCGGTTGGGAAACTGAATGAACAATCTATCTTACATAT
CATTGTTCACCTCGAGCTGCTTAAGTTCTTGAGATATCTTCTTGTGAACTTTTTGTTTAG
CCATGTTCTTGATTTTATTTTGTACTAGCTCTTTTTGTGTTTAATAAAGAATGAATGATT
GTAATCTAAGTATTTATATTCAATTTTTTTAAACTGAATAATTTTAAAAAACCTTAAAGC
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4FJ05TF U 1
AF RR4FJ05JQ C 88
BS 1 706 RR4FJ05TF
BS 707 722 RR4FJ05JQ

RD RR4FJ05TF 706 0 0
GGACAAATATATGTATTATACATATATATTAGATCCTTCTATAGTGAAGTCTGCAAAATG
GTCTTCTTCTACTTTTAGAAAGAATCACGAGAATGTTGTTCTTGTTTTGTGTTCATATTG
CTTCGCTGAAAGGAAACAAGAAAAATATCTCATCCGTACATGCCTATATATATAACGTCA
TTAACCGCACGTATTCATCAAACAAGAAGAGGTCAAAAGATTCCAAGAAAGTTCTAACAA
ATTGAACCACATTTTACAATCACTGTCTTCGAATTAACTTTAGTTAATGATGGTTTCCAT
GGAGGCTCTAGCGATGGCAGAAGCGGATTATCAAGAATGGGGACTTAGTATTGAGGAATG
GGAGTTTCAAGAATCAGTAGTTCCGTCCCATTTGCTTGCAGACGATGTTGAAAAGGATGA
AGAAGAAGATCATCAAAATGATGATGATAGGCTTTTCGATGGCGTAGAGGTTAAACAATC
TCTTACTTGTGACACTCGAGATTCGGTTGGGAAACTGAATGAACAATCTATCTTACATAT
CATTGTTCACCTCGAGCTGCTTAAGTTCTTGAGATATCTTCTTGTGAACTTTTTGTTTAG
CCATGTTCTTGATTTTATTTTGTACTAGCTCTTTTTGTGTTTAATAAAGAATGAATGATT
GTAATCTAAGTATTTATATTCAATTTTTTTAAACTGAATAATTTTA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4FJ05JQ 635 0 0
CGAGAATGTTGTTCTTGTTTTGTGTTCATATTGCTTCGCTGAAAGGAAACAAGAAAAATA
TCTCATCCGTACATGCCTATATATATAACGTCATTAACCGCACGTATTCATCAAACAAGA
AGAGGTCAAAAGATTCCAAGAAAGTTCTAACAAATTGAACCACATTTTACAATCACTGTC
TTCGAATTAACTTTAGTTAATGATGGTTTCCATGGAGGCTCTAGCGATGGCAGAAGCGGA
TTATCAAGAATGGGGACTTAGTATTGAGGAATGGGAGTTTCAAGAATCAGTAGTTCCGTC
CCATTTGCTTGCAGACGATGTTGAAAAGGATGAAGAAGAAGATCATCAAAATGATGATGA
TAGGCTTTTCGATGGCGTAGAGGTTAAACAATCTCTTACTTGTGACACTCGAGATTCGGT
TGGGAAACTGAATGAACAATCTATCTTACATATCATTGTTCACCTCGAGCTGCTTAAGTT
CTTGAGATATCTTCTTGTGAACTTTTTGTTTAGCCATGTTCTTGATTTTATTTTGTACTA
GCTCTTTTTGTGTTTAATAAAGAATGAATGATTGTAATCTAAGTATTTATATTCAATTTT
TTTAAACTGAATAATTTTAAAAAACCTTAAAGCTT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL7707Contig1 1183 2 4 U
GCCTCACATTCTTTCAACAACTGCCAAAGTCTCAAGACCCTCAAACTCTCATGCATATTA
GCCTCCGATGTTGGGGTTTTTAACATTGTCTTAGCATCTTTCCCTTCCCTGGAGGTGCTT
GTACTAGACATTTCTTGCTTCAAAGAAAGTGGTCCTCTCAAGATTGACAACAACAGGTTG
AAGCTCTTGCAAGTGTTTGAAACCAAAAAGATTGATGGCATTCAAGTGTCATCAACTCGT
CTGGATTCTCTCGCCATCGGGAGACTCTCCTGTGGGAGAGATGATTTTGTTCTCAGGTGC
CCTAGACTCCGTTTTCATAGGAACTTTTGGCTTGCTGGGTTATGCTATCCTCACACGAGC
TACAACATATCACAGGAGGAAAAAAACAGTGGGCATGAAGAATTTGTGGTCACCACATCT
GACTTGGTTAGATACTTCTTTACTGCATCCTTGTCGGTGAGTCTAGATCTAATGAATCCA
AGACAAGTAGAGAGGTTAAGACAAGTGTTAAATCTATGGAGGATTACAATGATAGAGCTG
GAGATCTTGTTTAAGAATAACAATTCTCCTAGGGAAGAAGAAGGTGAGTCTTCACGTAAC
AAGTTGTGGGAGGAGAATAACAAAGACCATCCGTTCCCCAATGCTAAGTTCCGAGTGGAC
ACAGTGTGGATGCATAACTTCAGCGGTTCAGAGGAAGAGTTTGCATTGGCGTCGTGTTTG
ATTAGGCAAGGGACAGTGATAAAAAGGATGATGATCAAGTCCACGTCCTTTCCAGCAAGG
AAGAAGTTAGAGATAGAAACAGCAGTAGCCAAGCTACAAGCACTTATTCGGAAGAAAGAT
CAATGGCAGCTTGCCATCAAATGTTTCTAATGGACTTTGGTTTCTTTTCTTTTGGTAAAG
TTACACCCACTACCGAGAATCTCCCTTGGCCATTTATGTTCGGGAAGGGGTTTTTACTGG
CTGGCAGTGTTAGTTAACTGAGACCCGAGATGTCTAGTAACGCTATTGTCTAGAAAGCAA
ACGTTAACTAAAGATGATAATTGAAATTATCATGTTGGTGCCAGACGTTGGTATCTTATC
TATGGCAACTGATAGCTAAGCCATTTGTCTTTCGCTTTTTGCTCTTTCCATCTGTATATG
ACCATATTGTTTAAAGTTACTTAATAAATTTGAAATTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CH24TF U 1
AF RR4CH24JQ C 481
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RD RR4CH24TF 611 0 0
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AAGCTCTTGCAAGTGTTTGAAACCAAAAAGATTGATGGCATTCAAGTGTCATCAACTCGT
CTGGATTCTCTCGCCATCGGGAGACTCTCCTGTGGGAGAGATGATTTTGTTCTCAGGTGC
CCTAGACTCCGTTTTCATAGGAACTTTTGGCTTGCTGGGTTATGCTATCCTCACACGAGC
TACAACATATCACAGGAGGAAAAAAACAGTGGGCATGAAGAATTTGTGGTCACCACATCT
GACTTGGTTAGATACTTCTTTACTGCATCCTTGTCGGTGAGTCTAGATCTAATGAATCCA
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AAGTTGTGGGA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4CH24JQ 703 0 0
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GAGATCTTGTTTAAGAATAACAATTCTCCTAGGGAAGAAGAAGGTGAGTCTTCACGTAAC
AAGTTGTGGGAGGAGAATAACAAAGACCATCCGTTCCCCAATGCTAAGTTCCGAGTGGAC
ACAGTGTGGATGCATAACTTCAGCGGTTCAGAGGAAGAGTTTGCATTGGCGTCGTGTTTG
ATTAGGCAAGGGACAGTGATAAAAAGGATGATGATCAAGTCCACGTCCTTTCCAGCAAGG
AAGAAGTTAGAGATAGAAACAGCAGTAGCCAAGCTACAAGCACTTATTCGGAAGAAAGAT
CAATGGCAGCTTGCCATCAAATGTTTCTAATGGACTTTGGTTTCTTTTCTTTTGGTAAAG
TTACACCCACTACCGAGAATCTCCCTTGGCCATTTATGTTCGGGAAGGGGTTTTTACTGG
CTGGCAGTGTTAGTTAACTGAGACCCGAGATGTCTAGTAACGCTATTGTCTAGAAAGCAA
ACGTTAACTAAAGATGATAATTGAAATTATCATGTTGGTGCCAGACGTTGGTATCTTATC
TATGGCAACTGATAGCTAAGCCATTTGTCTTTCGCTTTTTGCTCTTTCCATCTGTATATG
ACCATATTGTTTAAAGTTACTTAATAAATTTGAAATTTCATCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

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ATATGCTTTTTGTACTCTCCAAACTATTGAAACAGCGTTTTTAAATTTTCATCATTTATC
TTATGTAGACATGTTGAGTTCTGCAACTATAATGAGGACTTGTTTACTCAA


BQ
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AF RR4BI19JQ C 1
AF RR4BI19TF U 1
BS 1 651 RR4BI19TF

RD RR4BI19JQ 651 0 0
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GTCGTGAGTCTTCTCTGCAAAATTGAAATAAACTGTCTACTTTGTTTATGATCTAGAAAA
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AAGAGCGCTCATAACTACACCGAGGCAACCATGGACGAGATCAAAATTTTGAAACTTCGC
GGAAGGTGACGCTCTTGATCATTTAAAGCACGCTGGTCCTAACGGGCTACATGTCTGTGT
GGTCTTTGAGTATTTGGGAGATAACCTCTTGTCTGTTATCAAGTACAGCGACTACCCCAG
TGTTCCTCTCAACATGGTTAAAGAGCTTTGTTTCCATATCTTAGTTGGTTTGGATTATCT
TCACCGCCAGCTTTCGATTATTCATGCCGATATCAAGCTGGAGAACATTCTGCTCTGTTC
GACCATCAACCCTGAGGCCCTGGAGGTGTTCTGTTTGATCCTCACAGCAGTGAAAACATA
ATATGCTTTTTGTACTCTCCAAACTATTGAAACAGCGTTTTTAAATTTTCATCATTTATC
TTATGTAGACATGTTGAGTTCTGCAACTATAATGAGGACTTGTTTACTCAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4BI19TF 651 0 0
GGACAGAAAGGATTGAGATTGATTGTAACAGAGAGAACAGAACCTCTCGACATCTCTTCT
GTCGTGAGTCTTCTCTGCAAAATTGAAATAAACTGTCTACTTTGTTTATGATCTAGAAAA
GATCTCTCCACTCTTCTTTGGTATGGACAACACTGGCGTTATGTAGCTTTGAAAATCTAG
AAGAGCGCTCATAACTACACCGAGGCAACCATGGACGAGATCAAAATTTTGAAACTTCGC
GGAAGGTGACGCTCTTGATCATTTAAAGCACGCTGGTCCTAACGGGCTACATGTCTGTGT
GGTCTTTGAGTATTTGGGAGATAACCTCTTGTCTGTTATCAAGTACAGCGACTACCCCAG
TGTTCCTCTCAACATGGTTAAAGAGCTTTGTTTCCATATCTTAGTTGGTTTGGATTATCT
TCACCGCCAGCTTTCGATTATTCATGCCGATATCAAGCTGGAGAACATTCTGCTCTGTTC
GACCATCAACCCTGAGGCCCTGGAGGTGTTCTGTTTGATCCTCACAGCAGTGAAAACATA
ATATGCTTTTTGTACTCTCCAAACTATTGAAACAGCGTTTTTAAATTTTCATCATTTATC
TTATGTAGACATGTTGAGTTCTGCAACTATAATGAGGACTTGTTTACTCAA

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL7709Contig1 841 2 2 U
GGACTATATAAAGTGCCCTTTCCCCCTCTCCCACCTTCTCAGCGGTTCTTAGATCTCTCT
GCAGTTACGATCGTTTCTCCTCTCGAACCGTCTTCTTCAACGCGTTTGACTCTTCCTTTC
TGCTAGCAATGAAGTCAGGAGGAGGATCAGGATTGAATCCTAACGCAGCAGCGTACGTAC
CACTCTCTAAAAGAGAAGGTGATTCTGCAAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCACAC
ATCACGTGCACCACCAACCCTATGGTTATGGAGTCCAAGGGAAGGGAGGCGCTCACATGA
GGGATGATGATCCGGAGATGGAGATGGATTTTCTTTTGACTAGTTTCTCTGGTTTGTCAG
ATGAGTCTATTCGTGATGTTTACTTGGCCAACAATGGTGATCTTGATGCAACTATCGAAA
TGCTCACTCAACTCGAGATTTTCAGTAATGAAGCTGAAGAGTACCTCCCACTCCCAGACA
CACTGGACATTGCCGATGTACCTGATGAAACCATAGTGCCTTCAACTTCCTCAGCTCCTC
AAAAACAAAAGAGTGCCAGTAATGAAGCAAGTGGATCATCATCATCATCAACATCCTCGG
GTACCCCAAACAACGCTCCTGTTTCATCCTCCTCCTGATCGGATGAGCCCCTCAAATGCG
AAGTTTTAATGTTTCTTGGTATGGTTTTCTTAGGAGAGGTCTCTTTTCTATATTGTCCAC
AGTGCTTTGTTTCTCTGTGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTACATTTGTATAGATTTG
GGTTTTGAGGATTGGGATTGTTGTTATGGTTGGACCAAAAGCTATGAATCATTTTACCCT
G


BQ
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10 

AF RR4BB53TF U 1
AF RR4BB53JQ C 39
BS 1 689 RR4BB53TF
BS 690 841 RR4BB53JQ

RD RR4BB53TF 689 0 0
GGACTATATAAAGTGCCCTTTCCCCCTCTCCCACCTTCTCAGCGGTTCTTAGATCTCTCT
GCAGTTACGATCGTTTCTCCTCTCGAACCGTCTTCTTCAACGCGTTTGACTCTTCCTTTC
TGCTAGCAATGAAGTCAGGAGGAGGATCAGGATTGAATCCTAACGCAGCAGCGTACGTAC
CACTCTCTAAAAGAGAAGGTGATTCTGCAAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCACAC
ATCACGTGCACCACCAACCCTATGGTTATGGAGTCCAAGGGAAGGGAGGCGCTCACATGA
GGGATGATGATCCGGAGATGGAGATGGATTTTCTTTTGACTAGTTTCTCTGGTTTGTCAG
ATGAGTCTATTCGTGATGTTTACTTGGCCAACAATGGTGATCTTGATGCAACTATCGAAA
TGCTCACTCAACTCGAGATTTTCAGTAATGAAGCTGAAGAGTACCTCCCACTCCCAGACA
CACTGGACATTGCCGATGTACCTGATGAAACCATAGTGCCTTCAACTTCCTCAGCTCCTC
AAAAACAAAAGAGTGCCAGTAATGAAGCAAGTGGATCATCATCATCATCAACATCCTCGG
GTACCCCAAACAACGCTCCTGTTTCATCCTCCTCCTGATCGGATGAGCCCCTCAAATGCG
AAGTTTTAATGTTTCTTGGTATGGTTTTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4BB53JQ 803 0 0
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AACGCGTTTGACTCTTCCTTTCTGCTAGCAATGAAGTCAGGAGGAGGATCAGGATTGAAT
CCTAACGCAGCAGCGTACGTACCACTCTCTAAAAGAGAAGGTGATTCTGCAAAGCCTGCT
GCTGCTGCTGCTGCTGCCACACATCACGTGCACCACCAACCCTATGGTTATGGAGTCCAA
GGGAAGGGAGGCGCTCACATGAGGGATGATGATCCGGAGATGGAGATGGATTTTCTTTTG
ACTAGTTTCTCTGGTTTGTCAGATGAGTCTATTCGTGATGTTTACTTGGCCAACAATGGT
GATCTTGATGCAACTATCGAAATGCTCACTCAACTCGAGATTTTCAGTAATGAAGCTGAA
GAGTACCTCCCACTCCCAGACACACTGGACATTGCCGATGTACCTGATGAAACCATAGTG
CCTTCAACTTCCTCAGCTCCTCAAAAACAAAAGAGTGCCAGTAATGAAGCAAGTGGATCA
TCATCATCATCAACATCCTCGGGTACCCCAAACAACGCTCCTGTTTCATCCTCCTCCTGA
TCGGATGAGCCCCTCAAATGCGAAGTTTTAATGTTTCTTGGTATGGTTTTCTTAGGAGAG
GTCTCTTTTCTATATTGTCCACAGTGCTTTGTTTCTCTGTGGAAAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGTACATTTGTATAGATTTGGGTTTTGAGGATTGGGATTGTTGTTATGGTTGGACCAA
AAGCTATGAATCATTTTACCCTG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL7710Contig1 646 2 2 U
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GACCAAAAACAAAGATAATTGGTCTAAAGTATCAAATCGATTGCGTCACTACAATCAATC
ACAACGAAAAAGGGGTAGTAACCATTCTTTTTAGTTAAAAAGAAGAGACCGAAACATAAA
TTTTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATCCCCGAGCCTTTCGACAACCAAATTGCATTG
ACCACCAGTCATAGGCTCCTCGTAAATACCAATGACCAAGGCTTGATTCGTCTTCTTGAT
AGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATGACAGCTCCTGGTTCACCTTGAATAAC
CATGTATTTCGCTCCACCGAGAAATAAACCGGTCGGGGCAAGAAACCCGGGCTCCTCGAA
ATCCTTGTTGATCCCATTGACTTCTTCAGTTTTCAACTGAGGGAAAGCGGCGCTCTGAGC
CCAGACACTGCCGTCATGACCGAGGATGGCGGCGGCTGTGAGTTGGCTGCCTTCGACATC
GCACATAAGGTGGTCGTCAACGTACGATTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTC
ACGACTTGGTGAAAGACTTCTCTGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H374TF C 1
AF RR4H374JQ U 8
BS 1 7 RR4H374TF
BS 8 646 RR4H374JQ

RD RR4H374TF 646 0 0
TTTTCTTAATATCATCAAATGCCATTACAAGACACACAAACCCAAACCCGGGTACAAGAA
GACCAAAAACAAAGATAATTGGTCTAAAGTATCAAATCGATTGCGTCACTACAATCAATC
ACAACGAAAAAGGGGTAGTAACCATTCTTTTTAGTTAAAAAGAAGAGACCGAAACATAAA
TTTTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATCCCCGAGCCTTTCGACAACCAAATTGCATTG
ACCACCAGTCATAGGCTCCTCGTAGATACCAATGACCAAGGCTTGATTCGTCTTCTTGAT
AGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATGACAGCTCCTGGTTCACCTTGAATAAC
CATGTATTTCGCTCCACCGAGAAATAAACCGGTCGGGGCAAGAAACCCGGGCTCCTCGAA
ATCCTTGTTGATCCCATTGACTTCTTCAGTTTTCAACTGAGGGAAAGCGGCGCTCTGAGC
CCAGACACTGCCGTCATGACCGAGGATGGCGGCGGCTGTGAGTTGGCTGCCTTCGACATC
GCACATAAGGTGGTCGTCAACGTACGATTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTC
ACGACTTGGTGAAAGACTTCTCTGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4H374JQ 639 0 0
AATATCATCAAATGCCATTACAAGACACACAAACCCAAACCCGGGTACAAGAAGACCAAA
AACAAAGATAATTGGTCTAAAGTATCAAATCGATTGCGTCACTACAATCAATCACAACGA
AAAAGGGGTAGTAACCATTCTTTTTAGTTAAAAAGAAGAGACCGAAACATAAATTTTTAG
AGATCAGACTCGATGAGGTAATCCCCGAGCCTTTCGACAACCAAATTGCATTGACCACCA
GTCATAGGCTCCTCGTAAATACCAATGACCAAGGCTTGATTCGTCTTCTTGATAGTAACT
CCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATGACAGCTCCTGGTTCACCTTGAATAACCATGTAT
TTCGCTCCACCGAGAAATAAACCGGTCGGGGCAAGAAACCCGGGCTCCTCGAAATCCTTG
TTGATCCCATTGACTTCTTCAGTTTTCAACTGAGGGAAAGCGGCGCTCTGAGCCCAGACA
CTGCCGTCATGACCGAGGATGGCGGCGGCTGTGAGTTGGCTGCCTTCGACATCGCACATA
AGGTGGTCGTCAACGTACGATTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCACGACTT
GGTGAAAGACTTCTCTGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL7711Contig1 800 2 30 U
GTCTGTATCAATGGACAGACATGACAAAGAGAAGGAGATGGCTTCAGTGTTACTTTCCTC
TTTGTATACTGATGTCATCAACCCGAACCATATAAGAGACGGATTTGTCCTGCTCCTGGA
GTCAGCTGATGACTTTGTGGTGGATATACCTGATGCTGTCAATGTTCTTGCCTTATTCCT
CGCACGTGCTGTTGTTGATGACATACTTCCTCCAGTTTTTCTCCCTAGAGTAAGCAAGGC
ACTTCCAGTATCTTCCAAAGGATACCAGGTAGTACAAACTGCAGAGAAGAGCTATCTATC
AGCTGCACACCACGCCGAGCTAGTTGAAAGAAGATGGGGTGGGATGACTCGAACCTCTGT
TGAGGAAGTGAAGAAGAAGATTGCTGACATTTTGAAGGAATACATGGAGACCGGAGACGC
TTATGAGGCGTGTCGCTGCATCAGGGAGCCGGGCGTGTCTTTCTTTCATCACGAGGTTGT
GAAGAGGGCTTTAATCACTGGCATGGAGAGTGACACAGCAGAGCCACTCGTGTTGAATCT
GCTGAAGGAAGCAGCTTCGAAGAACCTGATAAGCTCTAGTCAAATGGTGAAGGGGTTCTC
AAGGTTAAGGGAAAGCCTCGATGATCTTGCTCTTGACATTCCTTCAGCTAAAACCAAATT
TGATTCGATTGTGCCAAAGCTGTCTCTGCCGGTTGGCTTGATGCTTCGTTTAGTGATCCC
TCTGGTGAAAGTGGACGACAGGAGATGGAGGATGAGAAACTCAAGCGGTCAAGGAGAGTT
GTGACATCATTCATGAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4HA10TF U 1
AF RR4GW28TF U 26
BS 1 45 RR4HA10TF
BS 46 46 RR4GW28TF
BS 47 114 RR4HA10TF
BS 115 115 RR4GW28TF
BS 116 180 RR4HA10TF
BS 181 181 RR4GW28TF
BS 182 222 RR4HA10TF
BS 223 223 RR4GW28TF
BS 224 224 RR4HA10TF
BS 225 225 RR4GW28TF
BS 226 273 RR4HA10TF
BS 274 274 RR4GW28TF
BS 275 411 RR4HA10TF
BS 412 412 RR4GW28TF
BS 413 492 RR4HA10TF
BS 493 493 RR4GW28TF
BS 494 528 RR4HA10TF
BS 529 529 RR4GW28TF
BS 530 543 RR4HA10TF
BS 544 544 RR4GW28TF
BS 545 559 RR4HA10TF
BS 560 560 RR4GW28TF
BS 561 600 RR4HA10TF
BS 601 601 RR4GW28TF
BS 602 688 RR4HA10TF
BS 689 689 RR4GW28TF
BS 690 729 RR4HA10TF
BS 730 730 RR4GW28TF
BS 731 769 RR4HA10TF
BS 770 800 RR4GW28TF

RD RR4HA10TF 769 0 0
GTCTGTATCAATGGACAGACATGACAAAGAGAAGGAGATGGCTTCGGTGTTACTTTCCTC
TTTGTATACTGATGTCATCAACCCGAACCATATAAGAGACGGATTTGTCCTGCTGCTGGA
GTCAGCTGATGACTTTGTGGTGGATATACCTGATGCTGTCAATGTTCTTGCCTTATTCCT
TGCACGTGCTGTTGTTGATGACATACTTCCTCCAGTTTTTCTTC*TAGAGTAAGCAAGGC
ACTTCCAGTATCTTCCAAAGGATACCAGGTAGTTCAAACTGCAGAGAAGAGCTATCTATC
AGCTGCACACCACGCCGAGCTAGTTGAAAGAAGATGGGGTGGGATGACTCGAACCTCTGT
TGAGGAAGTGAAGAAGAAGATTGCTGACATTTTGAAGGAATACATGGAGACTGGAGACGC
TTATGAGGCGTGTCGCTGCATCAGGGAGCCGGGCGTGTCTTTCTTTCATCACGAGGTTGT
GAAGAGGGCTTTGATCACTGGCATGGAGAGTGACACAGCAGAGCCACTTGTGTTGAATCT
GCTTAAGGAAGCAGCTTCGGAGAACCTGATAAGCTCTAGTCAAATGGTGAAGGGGTTCTC
CAGGTTAAGGGAAAGCCTCGATGATCTTGCTCTTGACATTCCTTCAGCTAAAACCAAATT
TGATTCGATTGTGCCAAAGCTGTCTCTGGCGGTTGGCTTGATGCTTCGTTTAGTGATCCC
TCTGGTGAA*GTGGACGACAGGAGATGGAGGATGAGAAACTCAAGCGGT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR4GW28TF 775 0 0
GGG
GAGAAGGAGATGGCTTCAGTGTTGCTTTCCTCTTTGTATACTGATGTCATCAACCCGAAC
CATATAAGAGACGGATTTGTCCTGCTCCTGGAGTCAGCTGATGACTTTGTGGTGGATATA
CCTGATGCTGTCAATGTTCTTGCCTTGTTCCTCGCACGTGCTGTTGTTGATGACATACTT
CCTCCAGTTTTTCTCCCTAGAGTAAGCAAGGCGCTTCCAGTATCTTCCAAAGGATACCAG
GTAGTACAAACTGCAGAGAAGAGCTATCTATCAGCTGCACACCACGCCGAGCTAGTTGAG
AGAAGATGGGGTGGGATGACTCGGACCTCTGTTGAGGAAGTGAAGAAGAAGATTGCTGAC
ATTTTGAAGGAATACATGGAGACCGGAGACGCTTATGAGGCGTGTCGCTGCATCAGGGAG
CTGGGCGTGTCTTTCTTTCATCACGAGGTTGTGAAGAGGGCTTTAATCACTGGCATGGAG
AGTGACACAGCGGCGCCGCTCGTGTTGAATCTGCTGAAGGAAGCAGCTTCGAAGAACCTG
GTAAGCTCTAGTCAAATGGTGAAGGGGTTCTCAAGGTTAAGGGAAAGCCTCGATGATCTT
GCTCTTGACATTCCTTCAGCTAAAACCAAATTTGATTCGATTGTGCCAAAGCTGTCTCTG
CTGGTTGGCTTGATGCTTCGTTTAGTGATCCCTCTGGTGAAAGTGGACGACAGGAGATGG
AG*ATGAGAAACTCAAGCGGTCAAGGAGAGTTGTGACATCATTCATGAGTAT

QA 4 775 4 775
DS 



AS 1 2

CO CL7712Contig1 846 2 2 U
GGAGACAAACTCTCTTCATTGTTTGTGTCTTTCATAATGGCTATTGCGTCTAACTTGGTA
CTATCCCTGAGCTCTGACTCACTGAGTCATCATGATAATCAGCCTAGAATCCCTCTCATT
CTTTCCTCAAGATCTCATTCTGTTACTCTCCTACACAACAAGCGACCAAGTTCCCTTGCG
CTTCGTTGTTCAAACAATAGCGATAATGTCTCATCCGAGAAAGATACCCCCATCGAACTC
AAGTTTTCAGCATTTCCAACGGTTATGGACATTAACAAGATCAAAGAGATATTGCCTCAC
AGGTTTCCGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTGATAGAGTACACGCCTGGTGTTTCAGCTGTA
GCTATTAAGAATGTCACAATCAATGACAGTTTCTTCCCTGGTCATCTCCCTGATCGACCC
ACCATGCCTGGTGTTCTCATGATTGAGGCAATGGCCCAAGTGGGAGGCATAGTATTGCTA
CCGGAAGTAGGAGGATCTAAAGATCACTTCTTCGTTGGTGGTATTGATAAAGTGAAATTC
CGCAAACCAGTCATTGCAGGAGACACACTGGTCATGAGGATGACTATTCTCAACTTCCAG
AAACGCTTCGGGCTTGGTAAGATGGAAGGAAAAGCTTATGCGGGTGGCTCGCTGGTCTGC
GAAGGCGAGTTCACGATAGTTTCTTCTGAAAGTTCGCCATGATCTCACACACCCATTCCC
CATTACTGGTCTCACTCAGACACAGCTATATGCGTTTTCTTCTTATGCTTCTGATGTGAT
TCTCTTGGAGTTCTGTGTTCTGTATTGATGTCTCTGAGTGATAAATAAAAATAGAGAAAG
TTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD04TF U 1
AF RR4GD04JQ C 12
BS 1 775 RR4GD04TF
BS 776 846 RR4GD04JQ

RD RR4GD04TF 775 0 0
GGAGACAAACTCTCTTCATTGTTTGTGTCTTTCATAATGGCTATTGCGTCTAACTTGGTA
CTATCCCTGAGCTCTGACTCACTGAGTCATCATGATAATCAGCCTAGAATCCCTCTCATT
CTTTCCTCAAGATCTCATTCTGTTACTCTCCTACACAACAAGCGACCAAGTTCCCTTGCG
CTTCGTTGTTCAAACAATAGCGATAATGTCTCATCCGAGAAAGATACCCCCATCGAACTC
AAGTTTTCAGCATTTCCAACGGTTATGGACATTAACAAGATCAAAGAGATATTGCCTCAC
AGGTTTCCGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTGATAGAGTACACGCCTGGTGTTTCAGCTGTA
GCTATTAAGAATGTCACAATCAATGACAGTTTCTTCCCTGGTCATCTCCCTGATCGACCC
ACCATGCCTGGTGTTCTCATGATTGAGGCAATGGCCCAAGTGGGAGGCATAGTATTGCTA
CCGGAAGTAGGAGGATCTAAAGATCACTTCTTCGTTGGTGGTATTGATAAAGTGAAATTC
CGCAAACCAGTCATTGCAGGAGACACACTGGTCATGAGGATGACTATTCTCAACTTCCAG
AAACGCTTCGGGCTTGGTAAGATGGAAGGAAAAGCTTATGCGGGTGGCTCGCTGGTCTGC
GAAGGCGAGTTCACGATAGTTTCTTCTGAAAGTTCGCCATGATCTCACACACCCATTCCC
CATTACTGGTCTCACTCAGACACAGCTATATGCGTTTTCTTCTTATGCTTCTGAT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4GD04JQ 835 0 0
CTCTTCATTGTTT*TGTCTTTCATAATGGCTATTGCGTCTAACTTGGTACTATCC*TGAG
CTCTGACTCACTGAGTCATCATGATAATCAGCCTAGAATCCCTCTCATTCTTTCCTCAAG
ATCTCATTCTGTTACTCTCCTACACAACAAGCGACCAAGTTCCCTTGCGCTTCGTTGTTC
AAACAATAGCGATAATGTCTCATCCGAGAAAGATACCCCCATCGAACTCAAGTTTTCAGC
ATTTCCAACGGTTATGGACATTAACAAGATCAAAGAGATATTGCCTCACAGGTTTCCGTT
TCTGCTGGTGGATAGAGTGATAGAGTACACGCCTGGTGTTTCAGCTGTAGCTATTAAGAA
TGTCACAATCAATGACAGTTTCTTCCCTGGTCATCTCCCTGATCGACCCACCATGCCTGG
TGTTCTCATGATTGAGGCAATGGCCCAAGTGGGAGGCATAGTATTGCTACCGGAAGTAGG
AGGATCTAAAGATCACTTCTTCGTTGGTGGTATTGATAAAGTGAAATTCCGCAAACCAGT
CATTGCAGGAGACACACTGGTCATGAGGATGACTATTCTCAACTTCCAGAAACGCTTCGG
GCTTGGTAAGATGGAAGGAAAAGCTTATGCGGGTGGCTCGCTGGTCTGCGAAGGCGAGTT
CACGATAGTTTCTTCTGAAAGTTCGCCATGATCTCACACACCCATTCCCCATTACTGGTC
TCACTCAGACACAGCTATATGCGTTTTCTTCTTATGCTTCTGATGTGATTCTCTTGGAGT
TCTGTGTTCTGTATTGATGTCTCTGAGTGATAAATAAAAATAGAGAAAGTTTGAT

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL7713Contig1 1319 2 4 U
ACGATTCACGAAAACCCTAGACAGAGCTAGAGTTTGTTAATTGGGATCATCGACGACGAT
GCAACTAACTCTTGAATTCGGGGGTGGTTTAGAGCTGCTCTGTGATTCTGAGAAGATCCA
TAAAGTAAACGTCGATTTGCCCCATGGAGAAGAAGAGTTAACAATGAAGCATTTGCTTTC
GTGGGTTCGCACAAATGTGATCAAAGAGAGGCCTGAGATGTTCATCAAGGGAGATACTGT
GAGACCTGGTGTTCTTGTGCTTGTGAATGACTGTGATTGGGAGCTTAGCGGACAGCTCGA
GACCACAATTGAAGACAAAGATGTTATCGTTTTCATCTCCACATTGCACGGTGGATAAAT
GAAAATCATAGCTGTGGGGATCATCATCACACAAGAACCTTTTTTAACTATCTATGTTCT
TCACTTCTGTTATGTAATCTCCGCAACTAATGTGTTTGCTTACTTGGAGAAAGAAACTGA
TAAATGTGATCTCACATAAATCTAAATACAGTATTTGGTGGCAAGCAGACCCAAGATGTT
GATATGAGGAAAACATTCTGCGAGACCAATTCGTTGTAGTGTTTGAGGAAAACAATACAT
AATCACATGGTTTACACATTGCTACATTTAATTAGAACATGATAATATCTACTTCCCTGG
TCAGTCTTTGCCCCTCTCTGCTCAAATGGTAGCCAATGAGTATAATGGGCCATAACTAAT
ATATTTCAGTCCAGAAGGAGATTCTGGTGGCGTCTAGGTCGGTTTCTGGTTAAAGTGTAG
TGTTGTTTACTTGTTTATAAAGGCCTTGGTTGTTTGCTCAATTTAGAGTTTACACCTTTC
AAAAGGCATTTTATCGGCTGATTCTGCTTTCTCTGAAATTGTTTGGAGTAGGATCACTAG
AAGCTGACGAGGATGGTTTTTCAGAACGATATTGATTTGCTGAACCCACCAGCTGAGCTT
GAGAAGAGGAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCCTTTTTCATGGAT
GTCAAGTGCCAAGGCTGCTTTAACATTACGACAGTTTTCAGCCACTCGCAGACGGTTGTG
GTGTGTGGAAACTGCCAGACTGTGTTGTGCCAACCCCCCGGAGGAAAGGCATGGCTCACT
GAAGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTTATGAAGATGACTCGGCCACATTTTTTCCTTTTAG
CTTCTTCTTCCTTATAGTTTCTTTTATGAATTCTGAAGGCTTTTTGAGCTAGTAAAATCT
ATGACTTGTGAGTTTGAAGCGTGGATCTTTAGAGTTGAGTAAAAGTTTGCTCATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CC94TF U 1
AF RR4CC94JQ C 560
BS 1 685 RR4CC94TF
BS 686 686 RR4CC94JQ
BS 687 727 RR4CC94TF
BS 728 1319 RR4CC94JQ

RD RR4CC94TF 727 0 0
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GCAACTAACTCTTGAATTCGGGGGTGGTTTAGAGCTGCTCTGTGATTCTGAGAAGATCCA
TAAAGTAAACGTCGATTTGCCCCATGGAGAAGAAGAGTTAACAATGAAGCATTTGCTTTC
GTGGGTTCGCACAAATGTGATCAAAGAGAGGCCTGAGATGTTCATCAAGGGAGATACTGT
GAGACCTGGTGTTCTTGTGCTTGTGAATGACTGTGATTGGGAGCTTAGCGGACAGCTCGA
GACCACAATTGAAGACAAAGATGTTATCGTTTTCATCTCCACATTGCACGGTGGATAAAT
GAAAATCATAGCTGTGGGGATCATCATCACACAAGAACCTTTTTTAACTATCTATGTTCT
TCACTTCTGTTATGTAATCTCCGCAACTAATGTGTTTGCTTACTTGGAGAAAGAAACTGA
TAAATGTGATCTCACATAAATCTAAATACAGTATTTGGTGGCAAGCAGACCCAAGATGTT
GATATGAGGAAAACATTCTGCGAGACCAATTCGTTGTAGTGTTTGAGGAAAACAATACAT
AATCACATGGTTTACACATTGCTACATTTAATTAGAACATGATAATATCTACTTCCCTGG
TCAGTCTTTGCCCCTCTCTGCTCAA*TGGTAGCCAATGAGTATAATGGGCCATAACTAAT
ATATTTC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4CC94JQ 760 0 0
GCGAGACCAATTCGTTGTAGTGTTTGAGGAAAACAATACATAATCACATGGTTTACACAT
TGCTACATTTAATTAGAACATGATAATATCTACTTCCCTGGTCAGTCTTTGCCCCTCTCT
GCTCAAATGGTAGCCAATGAGTATAATGGGCCATAACTAATATATTTCAGTCCAGAAGGA
GATTCTGGTGGCGTCTAGGTCGGTTTCTGGTTAAAGTGTAGTGTTGTTTACTTGTTTATA
AAGGCCTTGGTTGTTTGCTCAATTTAGAGTTTACACCTTTCAAAAGGCATTTTATCGGCT
GATTCTGCTTTCTCTGAAATTGTTTGGAGTAGGATCACTAGAAGCTGACGAGGATGGTTT
TTCAGAACGATATTGATTTGCTGAACCCACCAGCTGAGCTTGAGAAGAGGAAGCACAAGC
TCAAGCGTCTTGTTCAATCTCCCAACTCCTTTTTCATGGATGTCAAGTGCCAAGGCTGCT
TTAACATTACGACAGTTTTCAGCCACTCGCAGACGGTTGTGGTGTGTGGAAACTGCCAGA
CTGTGTTGTGCCAACCCCCCGGAGGAAAGGCATGGCTCACTGAAGGTTGCTCTTTCAGGA
AAAAGTTATGAAGATGACTCGGCCACATTTTTTCCTTTTAGCTTCTTCTTCCTTATAGTT
TCTTTTATGAATTCTGAAGGCTTTTTGAGCTAGTAAAATCTATGACTTGTGAGTTTGAAG
CGTGGATCTTTAGAGTTGAGTAAAAGTTTGCTCATTTATC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7714Contig1 1315 2 4 U
GGACAGAAACTCAACAATGTCTTCCACAAAACCCATCTCGCTCCTTGTCTCCATCACTTT
CTTCTTCTCCCTCCTCCTCAGCTCATCCTCCGCTCAGTCCGTCGTCAAAGCTTCCTACTG
GTTCCCGGGAAGTGAGTTCCCCGTCACCGACATTGACTCGTCTCTCTTCACTCACCTCTT
CTGCGCCTTCGCTGACCTCAACTCTCAAACCAACCAAGTCACCATCGCCTCCGCGAACCA
ACAGAAGTTCTCCACCTTCACTCAAACCGTACAACGGCGAAACCCTTCGGTCAAAACCCT
TTTGTCCATCGGCGGTGGAGCCGCTGATAAAACAGCGTTTGCGTCCATGGCAAGTAACCC
CACTTCTCGAAAATCTTTCATTGATTCTTCGATAAGACTTGCGAGGTCGAATGGTTTCCA
CGGTCTTGACCTAGACTGGGAGTATCCGAGCAGTGCCGCGGAGATGAGCAACTTCGGGAC
GCTGCTTCGAGAATGGCGATCAGCGGTTGTAGCAGAAGCTAGTAGCAGTGGTAGACAGCG
TTTGCTTTTGGCGGCTGCGGTTTTCTACTCAAACAACTACTATTCGGTTCTGTATCCGAT
TCAAGCCGTTGCCGACAGTCTGGATTGGGTTAATCTTATGGCCTATGATTTTTATGGACC
GGGTTGGTCTAGAGTAACCGGTCCACCTGCCGCTTTGTATGACCCTTCAAACGCAGGTCC
AAGAGGAGACGCTGGAGTGAGATCATGGACACAAGCTGGACTTCCAGCGAAGAAAGCAGT
CTTGGGATTTCCATACTACGGCTACGCATGGACTCTCTCAAACCCAAACAGTCACAGCTA
CTACGCGCCTACAACCGGAGCGGCTATATCACCGGACGGTTCTATCGGATACGGTCAGAT
AAGGAAGTTTATAGTGGACAACAGAGCGACAACGGTTTATAACGCCTCGGTGGTCGGAGA
TTACTGTTACGCAGGGACGACTTGGATTGGATACGATGATAATCAGAGTATCGTGACCAA
AGTGAGATACGCTAAGCAGAAAGGTTTGCTTGGTTACTTCTCGTGGCATGTCGGAGCTGA
CGATAATTCTGGTCTATCTCGTGCAGCGACACGTGCATGGGATGCTGTGGCAACCACCAG
AACTATACAGAAGTTTTAAGGTTCTCCACAGTACGGGACTATGGCAAGTGGAATAGTTTT
CTCAGTCACTATACAAAGAAATAAGCGTTACTATTTGCGTATATGTTGTCAAAGGAAAAG
GGAACAATAAGACATTAAGATAATAAAAGCAAGAAGTACAAGTTATTAATGCTTC


BQ
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AF RR4ER41TF U 1
AF RR4ER41JQ C 552
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BS 653 653 RR4ER41JQ
BS 654 676 RR4ER41TF
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CTTCTTCTCCCTCCTCCTCAGCTCATCCTCCGCTCAGTCCGTCGTCAAAGCTTCCTACTG
GTTCCCGGGAAGTGAGTTCCCCGTCACCGACATTGACTCGTCTCTCTTCACTCACCTCTT
CTGCGCCTTCGCTGACCTCAACTCTCAAACCAACCAAGTCACCATCGCCTCCGCGAACCA
ACAGAAGTTCTCCACCTTCACTCAAACCGTACAACGGCGAAACCCTTCGGTCAAAACCCT
TTTGTCCATCGGCGGTGGAGCCGCTGATAAAACAGCGTTTGCGTCCATGGCAAGTAACCC
CACTTCTCGAAAATCTTTCATTGATTCTTCGATAAGACTTGCGAGGTCGAATGGTTTCCA
CGGTCTTGACCTAGACTGGGAGTATCCGAGCAGTGCCGCGGAGATGAGCAACTTCGGGAC
GCTGCTTCGAGAATGGCGATCAGCGGTTGTAGCAGAAGCTAGTAGCAGTGGTAGACAGCG
TTTGCTTTTGGCGGCTGCGGTTTTCTACTCAAACAACTACTATTCGGTTCTGTATCCGAT
TCAAGCCGTTGCCGACAGTCTGGATTGGGTTAATCTTATGGCCTATGATTTT*ATGGACC
GGGTTGGTCTAGAGTA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4ER41JQ 764 0 0
CGGCTGCGGTTTTCTACTCAAACAACTACTATTCGGTTCTGTATCCGATTCAAGCCGTTG
CCGACAGTCTGGATTGGGTTAATCTTATGGCCTATGATTTTTATGGACCGGGTTGGTCTA
GAGTAACCGGTCCACCTGCCGCTTTGTATGACCCTTCAAACGCAGGTCCAAGAGGAGACG
CTGGAGTGAGATCATGGACACAAGCTGGACTTCCAGCGAAGAAAGCAGTCTTGGGATTTC
CATACTACGGCTACGCATGGACTCTCTCAAACCCAAACAGTCACAGCTACTACGCGCCTA
CAACCGGAGCGGCTATATCACCGGACGGTTCTATCGGATACGGTCAGATAAGGAAGTTTA
TAGTGGACAACAGAGCGACAACGGTTTATAACGCCTCGGTGGTCGGAGATTACTGTTACG
CAGGGACGACTTGGATTGGATACGATGATAATCAGAGTATCGTGACCAAAGTGAGATACG
CTAAGCAGAAAGGTTTGCTTGGTTACTTCTCGTGGCATGTCGGAGCTGACGATAATTCTG
GTCTATCTCGTGCAGCGACACGTGCATGGGATGCTGTGGCAACCACCAGAACTATACAGA
AGTTTTAAGGTTCTCCACAGTACGGGACTATGGCAAGTGGAATAGTTTTCTCAGTCACTA
TACAAAGAAATAAGCGTTACTATTTGCGTATATGTTGTCAAAGGAAAAGGGAACAATAAG
ACATTAAGATAATAAAAGCAAGAAGTACAAGTTATTAATGCTTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7715Contig1 647 2 3 U
GGAACCCTCTCTTCTCTTCCTTGTCTTAACAAAAAAAAACCCTAATTAGTTTTTTCTTTT
TCCATTATTTCTCAGCTATGGAGGTTCCAATGATTAATAGAATTAGAGATTTCGAAGTGG
GCATAAACTCAATAAACGATCCTTCCTTTCTCTCTCGCTCCGTTGCTGTCTCCGGCATCG
GAAAGCTACACCAAGCTTACGGTTTCTGGAAATGGGGAGCTTTGATCATTGCATTTTTAG
CTTATTTCACGAATTTCATTACAAGACTCAATAGTTTAGTCGTTAGGTTAAGAGGATCTG
CTCAGGGGCAAAACGGTAATTTCGGATGTTTCAAAGGTAGCTTCGGAGGTTTCTCGGGAA
TGTGATCGGAGTAGACGTCGGCGGCGTGGAGAAGATATACGTTAGGGATGATGTCAGCGG
GAAGATCGCCGTGGGAGATCTGAGGAGGTTTAACGGTGCGTTGACGGACTTGACGGATGC
GGACGGTGATACTTGGTGGGACGCTGACGTCGTTATCGGGGGGGGATTGCGATTTGAGAA
GATGCGTTAATGATTAGTGATTTGATTTGTGACGGACGGTTGCGTCTATAAATGATTCAA
AACGCGAAAATGAATAAAAAAACGAGAACGACGAACGTTTTGTAAAT


BQ
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AF RR4A612TF U 1
AF RR4A612JQ C 18
BS 1 523 RR4A612TF
BS 524 524 RR4A612JQ
BS 525 647 RR4A612TF

RD RR4A612TF 647 0 0
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TCCATTATTTCTCAGCTATGGAGGTTCCAATGATTAATAGAATTAGAGATTTCGAAGTGG
GCATAAACTCAATAAACGATCCTTCCTTTCTCTCTCGCTCCGTTGCTGTCTCCGGCATCG
GAAAGCTACACCAAGCTTACGGTTTCTGGAAATGGGGAGCTTTGATCATTGCATTTTTAG
CTTATTTCACGAATTTCATTACAAGACTCAATAGTTTAGTCGTTAGGTTAAGAGGATCTG
CTCAGGGGCAAAACGGTAATTTCGGATGTTTCAAAGGTAGCTTCGGAGGTTTCTCGGGAA
TGTGATCGGAGTAGACGTCGGCGGCGTGGAGAAGATATACGTTAGGGATGATGTCAGCGG
GAAGATCGCCGTGGGAGATCTGAGGAGGTTTAACGGTGCGTTGACGGACTTGACGGATGC
GGACGGTGATACTTGGTGGGACGCTGACGTCGTTATCGGGGGGTGATTGCGATTTGAGAA
GATGCGTTAATGATTAGTGATTTGATTTGTGACGGACGGTTGCGTCTATAAATGATTCAA
AACGCGAAAATGAATAAAAAAACGAGAACGACGAACGTTTTGTAAAT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4A612JQ 630 0 0
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ATGGAGGTTCCAATGATTAATAGAATTAGAGATTTCGAAGTGGGCATAAACTCAATAAAC
GATCCTTCCTTTCTCTCTCGCTCCGTTGCTGTCTCCGGCATCGGAAAGCTACACCAAGCT
TACGGTTTCTGGAAATGGGGAGCTTTGATCATTGCATTTTTAGCTTATTTCACGAATTTC
ATTACAAGACTCAATAGTTTAGTCGTTAGGTTAAGAGGATCTGCTCAGGGGCAAAACGGT
AATTTCGGATGTTTCAAAGGTAGCTTCGGAGGTTTCTCGGGAATGTGATCGGAGTAGACG
TCGGCGGCGTGGAGAAGATATACGTTAGGGATGATGTCAGCGGGAAGATCGCCGTGGGAG
ATCTGAGGAGGTTTAACGGTGCGTTGACGGACTTGACGGATGCGGACGGTGATACTTGGT
GGGACGCTGACGTCGTTATCGGGGGGGGATTGCGATTTGAGAAGATGCGTTAATGATTAG
TGATTTGATTTGTGACGGACGGTTGCGTCTATAAATGATTCAAAACGCGAAAATGAATAA
AAAAACGAGAACGACGAACGTTTTGTAAAT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL7716Contig1 937 2 8 U
GGACAACCATCCAATCAGAAACACATGAAGGAAGAAGAACATCAAAACGAATTAGTTCAG
ACTCCCAAACAGAGAGCGGAAAATTGCTTCCGTTGCAATGTGTTCGCGTTTCTCATCCCA
CTCTTGGAGGTTATCAAGGTGGTTGCTGCTCCCGTTGCCTCCGTGATCTTTATAGGCATC
GCCGGGATAATACTCGCCGGTTCAGCCGTGGCATTAGCTGTATCCATGCCGCTTTTCATC
ATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCTGCCACTATAGCCACTACTCTCGCATTCACTGGGATC
GGCGCAATTATCGCATTCAAAGTGACTGCCGTGGGTCTCATCATATGGCTCATCAAGCAT
AGGATGGGAGTAAAGCCAGAGCATAATCCACCTCCACGAGGAGCTCCGCCAACCGGAAGT
GCACCTAGTGGTGGAATCTCACCAATTAGTGGAGGTTCACCAAGCGTTGGAATTTCATCT
AATAGTGGAAATTCATCTACCGGTGTAAGTTCATCTAAAACTAGAAAAACCCAAAGGTAA
AAACACAATTTTGGATAAAGTTAAATCCAAGATAAAAAATAAATTAAAAGGTAAGAGTGG
CTCATCTAGTGGTGGAAGTACACCTAGTGGTGGAATCTCACCAATTAGTGGGGGTTTACC
AAGCGGTGGAAATTCACCTAATAGTGAAAATTCATCTAGCGGTGTAGGTTCATCTAAGGC
TGGAAGTAAACACAAAGGTAAAAGAACAATTTTGGATAAAATTAAATCCAAGATTAAAAG
CAAATTGAAAGATAAGAATGGCTCTTCTAGTGGTGGAAGCTCATCAATAAGTGGAGGTTC
ACCAAGCGGTGGAAGTTCACCTAGTAGTGGAAATTCATCAAGCGGTGTAAGTTCACCTAA
GACTGAAAGTAAACACAAGAGCAAAAACACAATTTTA


BQ
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AF RR4D370TF U 1
AF RR4D370JQ C 399
BS 1 689 RR4D370TF
BS 690 690 RR4D370JQ
BS 691 707 RR4D370TF
BS 708 708 RR4D370JQ
BS 709 718 RR4D370TF
BS 719 719 RR4D370JQ
BS 720 729 RR4D370TF
BS 730 937 RR4D370JQ

RD RR4D370TF 732 0 0
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CTCTTGGAGGTTATCAAGGTGGTTGCTGCTCCCGTTGCCTCCGTGATCTTTATAGGCATC
GCCGGGATAATACTCGCCGGTTCAGCCGTGGCATTAGCTGTATCCATGCCGCTTTTCATC
ATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCTGCCACTATAGCCACTACTCTCGCATTCACTGGGATC
GGCGCAATTATCGCATTCAAAGTGACTGCCGTGGGTCTCATCATATGGCTCATCAAGCAT
AGGATGGGAGTAAAGCCAGAGCATAATCCACCTCCACGAGGAGCTCCGCCAACCGGAAGT
GCACCTAGTGGTGGAATCTCACCAATTAGTGGAGGTTCACCAAGCGTTGGAATTTCATCT
AATAGTGGAAATTCATCTACCGGTGTAAGTTCATCTAAAACTAGAAAAACCCAAAGGTAA
AAACACAATTTTGGATAAAGTTAAATCCAAGATAAAAAATAAATTAAAAGGTAAGAGTGG
CTCATCTAGTGGTGGAAGTACACCTAGTGGTGGAATCTCACCAATTAGTGGGGGTTTACC
AAGCGGTGGAAATTCACCTAATAGTGAAA*TTCATCTAGCGGTGTAG*TTCATCTAAG*C
TGGAAGTAA
CAC

QA 1 729 1 729
DS 

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ACCAAGCGTTGGAATTTCATCTAATAGTGGAAATTCATCTACCGGTGTAAGTTCATCTAA
AACTAGAAAAACCCAAAGGTAAAAACACAATTTTGGATAAAGTTAAATCCAAGATAAAAA
ATAAATTAAAAGGTAAGAGTGGCTCATCTAGTGGTGGAAGTACACCTAGTGGTGGAATCT
CACCAATTAGTGGGGGTTTACCAAGCGGTGGAAATTCACCTAATAGTGAAAATTCATCTA
GCGGTGTAGGTTCATCTAAGGCTGGAAGTAAACACAAAGGTAAAAGAACAATTTTGGATA
AAATTAAATCCAAGATTAAAAGCAAATTGAAAGATAAGAATGGCTCTTCTAGTGGTGGAA
GCTCATCAATAAGTGGAGGTTCACCAAGCGGTGGAAGTTCACCTAGTAGTGGAAATTCAT
CAAGCGGTGTAAGTTCACCTAAGACTGAAAGTAAACACAAGAGCAAAAACACAATTTTA

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL7717Contig1 1030 2 4 U
GAGTGTCTTTTCGGTGTTTGGGTCCCTCTGTCTATACCCGTGCTCAAGTTCGGTGGCGAT
GGTGGTGGGAGAGCAGCGCAAGAAGATTATCATCGATACTGATCCTGGAATCGATGATGC
AATGGCGATATTCGTGGCTCTAAAGTCACCAGAACTTGATGTCATTGGTCTCACTACTAT
CTATGGCAACGTCTACACCACTCTCGCCACTCGTAACGCCTTGCATTTGTTGGAGGTTGC
GGGTAGGACAGACATTCCTGTTGTTGCTTTGGGACCTTTGACAAATATAGCACTGGCTGT
TCAGCTTGATCCTGAGTTTTCCAAAAACGTTGGACAAATTGTACTTCTTGGTGGAGCATT
CGCAGTAAATGGAAATGTAAATCCAGCATCAGAAGCTAATATTTTTGGTGATCCAGAAGC
TGCAGATATTGTGTTCACATGTGGCGCCGATGTGATTGCTGTGGGAATCAACTGACTCAT
CAAGTTATCATGACAGCTGATGACAGAGACAAATTGGCATCATCGAACGGGAAATTAGCT
AAATACCTATGTAAAATCCTTGGTGTGTACTATTCTTATCATCTTGATGCTTATGAGATT
GAAGGTGTTTATCTTCATGATCCTACAACAATACTTGCGGCTTTCCTTCCTTCTCTATTC
ACTTATACAGAAAGAGTTGTTAGAGTACAAACAAACGGTATCACTAGAGGACTCACTTTA
CTCTACAACAATCGAAAGAGGTTTGAGGAAGTGAACGAGTGGTCAGACAAACCATCGGTG
AAAGTGGCAGTGACAGTTGATGCTCCTGCGGTTTTGAAGCTCATAATGGATAGGCTTATG
GAGTCTTGATCATTTGGGTTATTTACATCTCTATTTGATGTTTGCTCTTCTTGTGAGCCA
TTTTCTCTTTTGGTTTTAACACAATCCATATTGAAATAAGGCTCTTGTTGTTGCATTTTT
TTTCTGAACAACTCTCTTATTGTTGCATTTTAAACTCAAAAAATCATTCTTATTTTTGTA
TCTTACCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO34TF U 1
AF RR4AO34JQ C 216
BS 1 740 RR4AO34TF
BS 741 741 RR4AO34JQ
BS 742 829 RR4AO34TF
BS 830 1030 RR4AO34JQ

RD RR4AO34TF 829 0 0
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GGGTAGGACAGACATTCCTGTTGTTGCTTTGGGACCTTTGACAAATATAGCACTGGCTGT
TCAGCTTGATCCTGAGTTTTCCAAAAACGTTGGACAAATTGTACTTCTTGGTGGAGCATT
CGCAGTAAATGGAAATGTAAATCCAGCATCAGAAGCTAATATTTTTGGTGATCCAGAAGC
TGCAGATATTGTGTTCACATGTGGCGCCGATGTGATTGCTGTGGGAATCAACTGACTCAT
CAAGTTATCATGACAGCTGATGACAGAGACAAATTGGCATCATCGAACGGGAAATTAGCT
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GAAGGTGTTTATCTTCATGATCCTACAACAATACTTGCGGCTTTCCTTCCTTCTCTATTC
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CTCTACAACAATCGAAAGAG*TTTGAGGAAGTGAACGAGTGGTCAGACAAACCATCGGTG
AAAGTGGCAGTGACAGTTGATGCTCCTGCGGTTTTGAAGCTCATAATGG

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR4AO34JQ 815 0 0
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CTTTGACAAATATAGCACTGGCTGTTCAGCTTGATCCTGAGTTTTCCAAAAACGTTGGAC
AAATTGTACTTCTTGGTGGAGCATTCGCAGTAAATGGAAATGTAAATCCAGCATCAGAAG
CTAATATTTTTGGTGATCCAGAAGCTGCAGATATTGTGTTCACATGTGGCGCCGATGTGA
TTGCTGTGGGAATCAACTGACTCATCAAGTTATCATGACAGCTGATGACAGAGACAAATT
GGCATCATCGAACGGGAAATTAGCTAAATACCTATGTAAAATCCTTGGTGTGTACTATTC
TTATCATCTTGATGCTTATGAGATTGAAGGTGTTTATCTTCATGATCCTACAACAATACT
TGCGGCTTTCCTTCCTTCTCTATTCACTTATACAGAAGGAGTTGTTAGAGTACAAACAAA
CGGTATCACTAGAGGACTCACTTTACTCTACAACAATCGAAAGAGGTTTGAGGAAGTGAA
CGAGTGGTCAGACAAACCATCGGTGAAAGTGGCAGTGACAGTTGATGCTCCTGCGGTTTT
GAAGCTCATAATGGATAGGCTTATGGAGTCTTGATCATTTGGGTTATTTACATCTCTATT
TGATGTTTGCTCTTCTTGTGAGCCATTTTCTCTTTTGGTTTTAACACAATCCATATTGAA
ATAAGGCTCTTGTTGTTGCATTTTTTTTCTGAACAACTCTCTTATTGTTGCATTTTAAAC
TCAAAAAATCATTCTTATTTTTGTATCTTACCATC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL7718Contig1 825 2 12 U
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AACGCCGTTTGTTTCTCTCTTCACGCGCTCGATTACTTCCTCACAGCAGGATACTTCGCC
ATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGGCACTGGAAGATACTCCGTGGGGATAAT
GTAATGATAATCCGTGGGAAAGATAAAGGTGAGACTGGAACCATTAAGCGTGTCATCAGA
TCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGAAGCATATAAAGGGAGGC
CCTGATCATGAAGGTGGGATATTCACGGTGGAGGCTCCCCTTCACGCCTCTAATGTCCAA
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ATTCTGAAGATAAGGACTACACCAAGACCCACTACCGCTGGGCCTAAGGACACGCCGATG
GAGTTTGTTTGGGAGCAGACGTATGATGCTAAAACAGGAAAAGGCATGCCTGATCTTTGA
GTAAAACCTTCTTTGCTGCTCCCATCCATTACAGTTTGTTGAAGAAGCCTTTGATCCTGA
CGAAATGAAGTTTTATTCTTGTTTCTTTACTCTTATGAACTTTTCAATGTGCCAAATAAA
GCATTGGGAGGGAGATTCACCAGTATACAAACTTCAGCATTGTCTTATTAGGTCTGTGGT
TTTTAAACGAATGCTGAACCAAGATTTGTGGTTCATATTCCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FM42TF U 1
AF RR4FM42JQ C 44
BS 1 736 RR4FM42TF
BS 737 737 RR4FM42JQ
BS 738 771 RR4FM42TF
BS 772 772 RR4FM42JQ
BS 773 783 RR4FM42TF
BS 784 785 RR4FM42JQ
BS 786 790 RR4FM42TF
BS 791 791 RR4FM42JQ
BS 792 799 RR4FM42TF
BS 800 800 RR4FM42JQ
BS 801 824 RR4FM42TF
BS 825 825 RR4FM42JQ

RD RR4FM42TF 824 0 0
GGAATACTCCCCGACCATTTCAGCACCGTCGCTAACGCCGTCGTCTTCACATAAAGGTTC
AACGCCGTTTGTTTCTCTCTTCACGCGCTCGATTACTTCCTCACAGCAGGATACTTCGCC
ATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGGCACTGGAAGATACTCCGTGGGGATAAT
GTAATGATAATCCGTGGGAAAGATAAAGGTGAGACTGGAACCATTAAGCGTGTCATCAGA
TCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGAAGCATATAAAGGGAGGC
CCTGATCATGAAGGTGGGATATTCACGGTGGAGGCTCCCCTTCACGCCTCTAATGTCCAA
GTTGTTGATCCTGTCACTGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTAAAGTATCTCGAGGATGGA
ACAAAAGTAAGAGTTGCCAGAGGCACAGGCACATCTGGTTCCATAATTCCTCGTCCAGAG
ATTCTGAAGATAAGGACTACACCAAGACCCACTACCGCTGGGCCTAAGGACACGCCGATG
GAGTTTGTTTGGGAGCAGACGTATGATGCTAAAACAGGAAAAGGCATGCCTGATCTTTGA
GTAAAACCTTCTTTGCTGCTCCCATCCATTACAGTTTGTTGAAGAAGCCTTTGATCCTGA
CGAAATGAAGTTTTATTCTTGTTTCTTTACTCTTATGAACTTTTCAATGTGCCAAATAAA
GCATTGGGAGGGAGAT*CACCAGTATACAAACTTCAGCATTGTCTTATTAG*TCTGTGGT
TTT**AACGA*TGCTGAAC*AAGATTTGTGGTTCATATTCCGGT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4FM42JQ 782 0 0
TCTTCACATAAAGGTTCAACGCCGTTTGTTTCTCTCTTCACGCGCTCGATTACTTCCTCA
CAGCAGGATACTTCGCCATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGGCACTGGAAGA
TACTCCGTGGGGATAATGTAATGATAATCCGTGGGAAAGATAAAGGTGAGACTGGAACCA
TTAAGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGA
AGCATATAAAGGGAGGCCCTGATCATGAAGGTGGGATATTCACGGTGGAGGCTCCCCTTC
ACGCCTCTAATGTCCAAGTTGTTGATCCTGTCACTGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTAA
AGTATCTCGAGGATGGAACAAAAGTAAGAGTTGCCAGAGGCACAGGCACATCTGGTTCCA
TAATTCCTCGTCCAGAGATTCTGAAGATAAGGACTACACCAAGACCCACTACCGCTGGGC
CTAAGGACACGCCGATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACGTATGATGCTAAAACAGGAAAAG
GCATGCCTGATCTTTGAGTAAAACCTTCTTTGCTGCTCCCATCCATTACAGTTTGTTGAA
GAAGCCTTTGATCCTGACGAAATGAAGTTTTATTCTTGTTTCTTTACTCTTATGAACTTT
TCAATGTGCCAAATAAAGCATTGGGAGGGAGATTCACCAGTATACAAACTTCAGCATTGT
CTTATTAGGTCTGTGGTTTTTAAACGAATGCTGAACCAAGATTTGTGGTTCATATTCCGG
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL7719Contig1 1106 2 2 U
CTGTCGCCGGCGAGCAAAATCTCAGACCTGAACAGAAGAAGACAACTAAATCGAGCATGG
CTATGCAAACCGGTATAGGGTTATCAAGGCTTCTGATTCTAGCTGGAGCAGGTTATACAG
GAACGATCCTGGTGAAGAATGGGGAGATGTCAGATCTTTTGGGTGAGCTTCAGGCTTTGG
TGAAGAGATTTGAGAGATCAGGAGATCATTCAGATGACGATTCTGATCCCATGTCTACTG
AGATGCAACGGTTAGCTATGGAGATCAGGCAAATGTCCTCGTCTCGTCAGATAACTGTTG
TCAATGGAGGAGCTCAAGGAGCTGACTTCACCCCGCTTATAGTTCCCGCTGCGACTTTAG
GAGCTATAGGCTATGGCTACATGTGGTACAAGGGTATTTCATTCTCTGACATCATGTGCG
TTACAAAGAAGAACATGGAAGATGCTGTCTCCAACTTGACAAAGCATTTGAGCACCGTCT
CAGAAGCTATTTCTAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGAGAGGCTTAAGAAGACGGACGATA
AGCTGGAATCGCAGAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCAGGACGATGTGGGTTTGACTCTAG
AGGATATGGCTAAGATTGGAGATGATTTTTGTGCAATGCATAACATGTTTGGTGGTATGG
GTGGAACATTAGATAGTATTGAGTACAAGCAGAATATTGCGAATATGGGTTTAATGCATC
TGTGCGACTCTATGGGAGGAGAAAATCACAAGATGCCTGATATTATGATGCAGGAGAAGC
TTCGACTTTCTGGGAAGTCAAACACATGTCTAATACTTACAGACGAAGAAACTTCAAGCT
CAGAGGGTTTGAGAGAAAGTGATAAGATAGAGCTTATTGAAGGCTGATCTAGATGGTACA
CCATATGTCATCAAGGTTTGATGATATGGTAATGATGTGTAGTATAGGATACTGAGATAT
AGAATGTATTTTGGTGGTTTAAATTAATGGCCTTTGAGGGCAAATAAACGAAAAGAATGA
AGCCTAATCATTTACATGTACTGCTGCATTTATGCACAATTTGTTACAAAACACCATTCA
CAACAAAGAATAGACATTTTTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EP01TF U 1
AF RR4EP01JQ C 314
BS 1 598 RR4EP01TF
BS 599 1106 RR4EP01JQ

RD RR4EP01TF 598 0 0
CTGTCGCCGGCGAGCAAAATCTCAGACCTGAACAGAAGAAGACAACTAAATCGAGCATGG
CTATGCAAACCGGTATAGGGTTATCAAGGCTTCTGATTCTAGCTGGAGCAGGTTATACAG
GAACGATCCTGGTGAAGAATGGGGAGATGTCAGATCTTTTGGGTGAGCTTCAGGCTTTGG
TGAAGAGATTTGAGAGATCAGGAGATCATTCAGATGACGATTCTGATCCCATGTCTACTG
AGATGCAACGGTTAGCTATGGAGATCAGGCAAATGTCCTCGTCTCGTCAGATAACTGTTG
TCAATGGAGGAGCTCAAGGAGCTGACTTCACCCCGCTTATAGTTCCCGCTGCGACTTTAG
GAGCTATAGGCTATGGCTACATGTGGTACAAGGGTATTTCATTCTCTGACATCATGTGCG
TTACAAAGAAGAACATGGAAGATGCTGTCTCCAACTTGACAAAGCATTTGAGCACCGTCT
CAGAAGCTATTTCTAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGAGAGGCTTAAGAAGACGGACGATA
AGCTGGAATCGCAGAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCAGGACGATGTGGGTTTGACTCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4EP01JQ 793 0 0
TCAAGGAGCTGACTTCACCCCGCTTATAGTTCCCGCTGCGACTTTAGGAGCTATAGGCTA
TGGCTACATGTGGTACAAGGGTATTTCATTCTCTGACATCATGTGCGTTACAAAGAAGAA
CATGGAAGATGCTGTCTCCAACTTGACAAAGCATTTGAGCACCGTCTCAGAAGCTATTTC
TAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGAGAGGCTTAAGAAGACGGACGATAAGCTGGAATCGCA
GAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCAGGACGATGTGGGTTTGACTCTAGAGGATATGGCTAA
GATTGGAGATGATTTTTGTGCAATGCATAACATGTTTGGTGGTATGGGTGGAACATTAGA
TAGTATTGAGTACAAGCAGAATATTGCGAATATGGGTTTAATGCATCTGTGCGACTCTAT
GGGAGGAGAAAATCACAAGATGCCTGATATTATGATGCAGGAGAAGCTTCGACTTTCTGG
GAAGTCAAACACATGTCTAATACTTACAGACGAAGAAACTTCAAGCTCAGAGGGTTTGAG
AGAAAGTGATAAGATAGAGCTTATTGAAGGCTGATCTAGATGGTACACCATATGTCATCA
AGGTTTGATGATATGGTAATGATGTGTAGTATAGGATACTGAGATATAGAATGTATTTTG
GTGGTTTAAATTAATGGCCTTTGAGGGCAAATAAACGAAAAGAATGAAGCCTAATCATTT
ACATGTACTGCTGCATTTATGCACAATTTGTTACAAAACACCATTCACAACAAAGAATAG
ACATTTTTGTACC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL7720Contig1 828 2 10 U
GAGCCAATGGTGTCTCCATTAAGATTACAGCTGAAGTTCCCAAATATGTATGTAGAGGTG
GGCTGAAGCTGGAAGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTGATGTTTCTGAGAAAGTAGTTC
TTGATTCTGGACTTTCTACTGGAGGCTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCAGCTC
ATGTCTATGGTGTTGATGTTGGTTATGGTCAGGTAGCTGATAAGATTCGTAATGATAAGC
ATGTGACTGTTATAGAAAGGACAAATCTGAGATACCTCCCAGGACTCCCCCAAAAAGTCG
ATGTAGTTACACTCGATCTCTCTTTCATTTCCATTCTCAAGGTGATGCCAGCGGTTATGA
ATGTGATGAATGAAGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCTCAATTTGAAGCTCGGC
GATCACAGGTTGGGAGGGGTGGTATAGTGAGAGATCCTGAAGTACATCAGGAGATATGTT
TGTATTTCTCTGTAGCAATAAAGCCTACGTGGTAGTTACTGTGTTTTTTTATGTATGAGT
GAAGGTTCTTGAGAAGATAATAAATGGTATTGAGCGCTATGGATTCACCAACAAAGGGTT
TATAGAATCTCCCATCAAGGGCGCCGATGGAAACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCG
AGGGACTGTGAAATCCCAAGAAGAAGAATACTAAGACATTATTGTTTCTTTCTTCTTTCA
CCCCATTTCCTTGATTTAACGTTTTATGCACTTTACTACTGTTCTTTTCTTTTGTTAATG
TCTTGAATCTTGAAAGATACTTACCAAACCAATCCAAGACTTAAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GT85TF U 1
AF RR4GT85JQ C 45
BS 1 684 RR4GT85TF
BS 685 687 RR4GT85JQ
BS 688 723 RR4GT85TF
BS 724 724 RR4GT85JQ
BS 725 772 RR4GT85TF
BS 773 773 RR4GT85JQ
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BS 778 778 RR4GT85JQ
BS 779 821 RR4GT85TF
BS 822 828 RR4GT85JQ

RD RR4GT85TF 821 0 0
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TTGATTCTGGACTTTCTACTGGAGGCTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCAGCTC
ATGTCTATGGTGTTGATGTTGGTTATGGTCAGGTAGCTGATAAGATTCGTAATGATAAGC
ATGTGACTGTTATAGAAAGGACAAATCTGAGATACCTCCCAGGACTCCCCCAAAAAGTCG
ATGTAGTTACACTCGATCTCTCTTTCATTTCCATTCTCAAGGTGATGCCAGCGGTTATGA
ATGTGATGAATGAAGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCTCAATTTGAAGCTCGGC
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TGTATTTCTCTGTAGCAATAAAGCCTACGTGGTAGTTACTGTGTTTTTTTATGTATGAGT
GAAGGTTCTTGAGAAGATAATAAATGGTATTGAGCGCTATGGATTCACCAACAAAGGGTT
TATAGAATCTCCCATCAAGGGCGCCGATGGAAACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCG
AGGGACTGTGAAATCCCAAGAAGAG**ATACTAAGACATTATTGTTTCTTTCTTCTTTCA
CCC*ATTTCCTTGATTTAACGTTTTATGCACTTTACTACTGTTCTTTTCTTT*GTTA*TG
TCTTGAATCTTGAAAGATACTTACCAAACCAATCCAAGACT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4GT85JQ 784 0 0
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TCTGAGAAAGTAGTTCTTGATTCTGGACTTTCTACTGGAGGCTTTACAGATTGTTTGCTT
CGTTATGGTGCAGCTCATGTCTATGGTGTTGATGTTGGTTATGGTCAGGTAGCTGATAAG
ATTCGTAATGATAAGCATGTGACTGTTATAGAAAGGACAAATCTGAGATACCTCCCAGGA
CTCCCCCAAAAAGTCGATGTAGTTACACTCGATCTCTCTTTCATTTCCATTCTCAAGGTG
ATGCCAGCGGTTATGAATGTGATGAATGAAGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCT
CAATTTGAAGCTCGGCGATCACAGGTTGGGAGGGGTGGTATAGTGAGAGATCCTGAAGTA
CATCAGGAGATATGTTTGTATTTCTCTGTAGCAATAAAGCCTACGTGGTAGTTACTGTGT
TTTTTTATGTATGAGTGAAGGTTCTTGAGAAGATAATAAATGGTATTGAGCGCTATGGAT
TCACCAACAAAGGGTTTATAGAATCTCCCATCAAGGGCGCCGATGGAAACATAGAGTTCT
TGGTTCGCTTCGACCGAGGGACTGTGAAATCCCAAGAAGAAGAATACTAAGACATTATTG
TTTCTTTCTTCTTTCACCCCATTTCCTTGATTTAACGTTTTATGCACTTTACTACTGTTC
TTTTCTTTTGTTAATGTCTTGAATCTTGAAAGATACTTACCAAACCAATCCAAGACTTAA
ATCG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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GGTTTTATAGTATTATTGGATACAGGAATATCTCTGGAACTGTCATTCCTTTTTTTGTTA
TTTGATGAAATGGAAAAAGACCTTTGAAGTGTATTTTGCGCAAATTTTAATGTTTCTTTC
TCATGTAAAGAACACACATCTTGATAGCTCTGGGAACATGCTCCTTATTGGTTTTGGTAA
TGGTTGATGTGTTGGTGGTGATGGTGAGCGCTCTGGTGGTTCATCTGATGATCATGTAGT
TGATGAAAAACGCCTTGATGGTGGTGATCGTTATAGTGTTGATAGTCAACTTCGTTCTTT
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GTTATTTCCAGCAACGAGTTCCTCACATGTTCAGCTGGCACCATCTCGCTATCGTTTTTC
TCGACTTTGAAAACATTGGAGACGAGACTGAGGAAACGAGTCGTGTTTGCGTTTGTGACC
TCAAGTCCCAGAGAATCAAGTGCCTCCATCAGCCTTGTGAAGCCTCCTGGTTTGTATTCA
CAAATCACCTTTACGAAAAACTCTCTTCCATCTAGCTGAGCCACGTCCACTTGCGGCTCC
ATTTCTTGTCTTATAATTGCAGTTCTCGAGATCAACATCTTGTTTCATGTCGGGAAGATT
CGAGTTACACGAAAGCCCCTGGTGAAACCCAGTGAGCACTGTCCCGTTCAGACTCATCCC
TCCTTGCTGCCTATTAGATCCATCCTCAGTCTCTGAATTCTCTTCAAGCTCGTCTTGAAG
CTCCTTTGCCTCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY87JQ U 1
AF RR4BI74TF C 57
BS 1 499 RR4CY87JQ
BS 500 857 RR4BI74TF

RD RR4CY87JQ 499 0 0
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TCATGTAAAGAACACACATCTTGATAGCTCTGGGAACATGCTCCTTATTGGTTTTGGTAA
TGGTTGATGTGTTGGTGGTGATGGTGAGCGCTCTGGTGGTTCATCTGATGATCATGTAGT
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TCGACTTTGAAAACATTGG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR4BI74TF 801 0 0
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TGTAAAGAACACACATCTTGATAGCTCTGGGAACATGCTCCTTATTGGTTTTGGTAATGG
TTGATGTGTTGGTGGTGATGGTGAGCGCTCTGGTGGTTCATCTGATGATCATGTAGTTGA
TGAAGAACGCCTTGATGGTGGTGATCGTTATAGTGTTGATAGTCAACTTCGTTCTTTTCG
TTTTGCATGGAACCAGTTGCCATCTGATCATCATGCCATCCTCTAGATGTGTTCCTGGTT
ATTTCCAGCAACGAGTTCCTCACATGTTCAGCTGGCACCATCTCGCTATCGTTTTTCTCG
ACTTTGAAGACATTGGAGACGAGACTGAGGAAACGAGTCGTGTTTGCGTTTGTGACCTCA
AGTCCCAGAGAATCAAGTGCCTCCATCAGCCTTGTGAAGCCTCCTGGTTTGTATTCACAA
ATCACCTTTACGAAAAACTCTCTTCCATCTAGCTGAGCCACGTCCACTTGCGGCTCCATT
TCTTGTCTTATAATTGCAGTTCTCGAGATCAACATCTTGTTTCATGTCGGGAAGATTCGA
GTTACACGAAAGCCCCTGGTGAAACCCAGTGAGCACTGTCCCGTTCAGACTCATCCCTCC
TTGCTGCCTATTAGATCCATCCTCAGTCTCTGAATTCTCTTCAAGCTCGTCTTGAAGCTC
CTTTGCCTCATTCC

QA 8 801 8 801
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGCATCGGGTGGTCATTAGTGAAGGACAAGGAGGTGGCAAAGAAGATGGTTGAGTACATA
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ATGAAGAACCGTTGGGAAAAGCTTCGTGGAGTGGTGAAGGAAAGCAATGTCTTCTGTCTT
CCTAAATACCCTGAAGCTTATTGCAACTTTTTTGGCAAAACACTCGGATCTTATCCTGCG
TTTGCGTGGCTGGGGACGAAAGAAGAGACGGATCTGGTTAACGAATTGAGGAGACATAAG
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CTTAGTCGTGAAGATGTTTTCAATGTGTTTCTCGAGAGGCTTGCCGACATGAAGCTCATT
AAAAGTATTGACCTATAAAAAAGCTTTCATTTCATATGTATAGTTAATGGTTATGAAAAA
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CCAATTTATAATTTTATACCATAAATCACTTATCTAATTCAAATAGTAAACAAAGCTTCT
ATTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR04TF U 64
AF RR4CR04JQ C 1
BS 1 63 RR4CR04JQ
BS 64 499 RR4CR04TF
BS 500 500 RR4CR04JQ
BS 501 533 RR4CR04TF
BS 534 534 RR4CR04JQ
BS 535 559 RR4CR04TF
BS 560 728 RR4CR04JQ

RD RR4CR04TF 496 0 0
ATCGGGTGGTCATTAGTGAAGGACAAGGAGGTGGCAAAGAAGATGGTTGAGTACATAATT
GTGAACTCCATTGGTGTGTCTAAGGAGTCACAGATTCGAACCGCTAAGATTCTCAACGTT
CTTAAGGAGACATGTAAGAGCGAAACCGAGAACTTCTTCAAGTATGGTCACGAGATGATG
AAGAACCGTTGGGAAAAGCTTCGTGGAGTGGTGAAGGAAAGCAATGTCTTCTGTCTTCCT
AAATACCCTGAAGCTTATTGCAACTTTTTTGGCAAAACACTCGGATCTTATCCTGCGTTT
GCGTGGCTGGGGACGAAAGAAGAGACGGATCTGGTTAACGAATTGAGGAGACATAAGGTT
ATGAGCATAGCAGGAGAGCGTTGTGGTTCTGACAAGAAGCGTGTTAGAGTCAGTATGCTT
AGTCGTGAAGATGTTT*CAATGTGTTTCTCGAGAGGCTTGCCGACATGAA*CTCATTAAA
AGTATTGACCTATAAA

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR4CR04JQ 728 0 0
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CGCATCGGGTGGTCATTAGTGAAGGACAAGGAGGTGGCAAAGAAGATGGTTGAGTACATA
ATTGTGAACTCCATTGGTGTGTCTAAGGAGTCACAGATTCGAACCGCTAAGATTCTCAAC
GTTCTTAAGGAGACATGTAAGAGCGAAACCGAGAACTTCTTCAAGTATGGTCACGAGATG
ATGAAGAACCGTTGGGAAAAGCTTCGTGGAGTGGTGAAGGAAAGCAATGTCTTCTGTCTT
CCTAAATACCCTGAAGCTTATTGCAACTTTTTTGGCAAAACACTCGGATCTTATCCTGCG
TTTGCGTGGCTGGGGACGAAAGAAGAGACGGATCTGGTTAACGAATTGAGGAGACATAAG
GTTATGAGCATAGCAGGAGAGCGTTGTGGTTCTGACAAGAAGCGTGTTAGAGTCAGTATG
CTTAGTCGTGAAGATGTTTTCAATGTGTTTCTCGAGAGGCTTGCCGACATGAAGCTCATT
AAAAGTATTGACCTATAAAAAAGCTTTCATTTCATATGTATAGTTAATGGTTATGAAAAA
GCCATATAACTAAGGGCTTTTTACTAGTAGTTTTTAGCTTATCCTGCATGAATTGTCAAA
CCAATTTATAATTTTATACCATAAATCACTTATCTAATTCAAATAGTAAACAAAGCTTCT
ATTTAGTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7724Contig1 878 2 4 U
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ATCTCAGTCCCGCTAGTTTTCGTCGGTAGCTACCTGGGATACAAGAAGCCAGGGATCGAA
GACCCGGTCAAAACAAACAAGATCCCAAGGCAAGTACCAGAGCAACCATGGTACATGAAA
CCTGTGTTCTCCATACTAATCGGAGGCATCCTACCGTTTGGAGCAGTCTTCATCGAGCTC
TTCTTCATCCTGACATCAATATGGCTGAACCAGTTCTACTACATCTTCGGTTTCCTCTTC
ATAGTGTTCTTGATCTTGATCGTCACCTGCGCGGAGATCACGGTGGTGCTCTGTTATTTC
CAGCTTTGCAGCGAGGATTACAACTGGTGGTGGAGAGCTTACTTAACAGCAGGCTCATCT
GCTTTCTACCTCTTCCTCTACTCGATCTTTTACTTCTTCACAAAGCTGGAGATAACAAAG
CTAGTCTCGGGGATGCTCTACTTCGGGTACATGATCATCATCTCTTACCCCTTCTTTGTC
CTAACTGGCACAATTGGTTTCTACGCTTGCTTCTGGTTCGTGAGGAAGATCTACTCTTCG
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AAAGAGTTTTTTTTTTTGAGGTTATTGTATGTTTGGGTGATTGTAGTAGCTGTGACAAAG
TAAACTTCGAATCAAATCAACTTTTAAATTTATTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GQ81TF U 1
AF RR4GQ81JQ C 134
BS 1 648 RR4GQ81TF
BS 649 649 RR4GQ81JQ
BS 650 742 RR4GQ81TF
BS 743 878 RR4GQ81JQ

RD RR4GQ81TF 742 0 0
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ATGTTTCCTGGTATCCTCTTTGTGATCTTCTTCGTTCTGAATGGCCTCATCTGGGGTGAG
CAGTCGTCTGGAGCTATACCTTTCGGTACAATGTTTGCTCTCTTCTGCCTCTGGTTCGGC
ATCTCAGTCCCGCTAGTTTTCGTCGGTAGCTACCTGGGATACAAGAAGCCAGGGATCGAA
GACCCGGTCAAAACAAACAAGATCCCAAGGCAAGTACCAGAGCAACCATGGTACATGAAA
CCTGTGTTCTCCATACTAATCGGAGGCATCCTACCGTTTGGAGCAGTCTTCATCGAGCTC
TTCTTCATCCTGACATCAATATGGCTGAACCAGTTCTACTACATCTTCGGTTTCCTCTTC
ATAGTGTTCTTGATCTTGATCGTCACCTGCGCGGAGATCACGGTGGTGCTCTGTTATTTC
CAGCTTTGCAGCGAGGATTACAACTGGTGGTGGAGAGCTTACTTAACAGCAGGCTCATCT
GCTTTCTACCTCTTCCTCTACTCGATCTTTTACTTCTTCACAAAGCTGGAGATAACAAAG
CTAGTCTCGGGGATGCTCTACTTCGGGTACATGATCATCATCTCTTACGCCTTCTTTGTC
CTAACTGGCACAATTGGTTTCTACGCTTGCTTCTGGTTCGTGAGGAAGATCTACTCTTCG
GTAAAGATTGACTAGAACACAA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4GQ81JQ 745 0 0
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TAGTTTTCGTCGGTAGCTACCTGGGATACAAGAAGCCAGGGATCGAAGACCCGGTCAAAA
CAAACAAGATCCCAAGGCAAGTACCAGAGCAACCATGGTACATGAAACCTGTGTTCTCCA
TACTAATCGGAGGCATCCTACCGTTTGGAGCAGTCTTCATCGAGCTCTTCTTCATCCTGA
CATCAATATGGCTGAACCAGTTCTACTACATCTTCGGTTTCCTCTTCATAGTGTTCTTGA
TCTTGATCGTCACCTGCGCGGAGATCACGGTGGTGCTCTGTTATTTCCAGCTTTGCAGCG
AGGATTACAACTGGTGGTGGAGAGCTTACTTAACAGCAGGCTCATCTGCTTTCTACCTCT
TCCTCTACTCGATCTTTTACTTCTTCACAAAGCTGGAGATAACAAAGCTAGTCTCGGGGA
TGCTCTACTTCGGGTACATGATCATCATCTCTTACCCCTTCTTTGTCCTAACTGGCACAA
TTGGTTTCTACGCTTGCTTCTGGTTCGTGAGGAAGATCTACTCTTCGGTAAAGATTGACT
AGAACACAAGACAGAAGAAACCAACTCTGATAAGTCTGCAGAAAAGAAAAGAGTTTTTTT
TTTTGAGGTTATTGTATGTTTGGGTGATTGTAGTAGCTGTGACAAAGTAAACTTCGAATC
AAATCAACTTTTAAATTTATTTTGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL7725Contig1 754 2 2 U
TTTTTTTTTGAGATAGAGACATGGACCAAAAAGATCGAAGCAGTTAATAACCCTAATCAA
AACCCAAACCCCAAATTGATACTCAGAAAACCATAAAACACCAGGATCCTCAGTAAATCT
GAAAACTTTGTGAATCAATCAGCGAGAAATTACCGGAAAGATCTCGCGATGAACAGTTTA
ATCGAAATCTAAATCAGAAGAGGCAGTGTCTTGATGAGTTTTCTTGCGGGAGAGAGAGAG
ATGTGGAGATTGTTTAACGCTAACTTTTTTCGATCTTGTTCTTTTTGCTTTTATCGATGA
TTTAAGAAGAGAGACTCCGTATCAGAGCGAGAAAGTGAATTTATAGAAGAAACCAAAAAG
GTTACTAGCCGTTAAGAGCCGTTGTAGAATATTTTAAATACGGCCTAACAAGACATGGTC
CAGGCCCATCAACATAAAGCCCATTAGTTACCCGAAGTAATGAATCCACGTCACCATTCT
AAAAATTTTATGAGAAAACAGAAGTAAAAAGAAAGTAAACCGGGCCGGGAACTTTACCGG
TGACGGAATGTTACTCGGCACTTCCAATCACAGCCCTACACGTCGACTCCCCGTATCGTC
TCAGGTCCATCCACGTGTCCCCTAACTCACCGACGCCGTCTCCTTCCCGTTACCCCCGCG
AACAGAGATATTAACCCAAACCCTAACCTTATCTCTTCCCCCACCACATTCTGACTCAGA
TCCGGCGATATCTCTCAACATCATCCATCCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BS76TF C 1
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BS 1 13 RR4BS76TF
BS 14 754 RR4BS76JQ

RD RR4BS76TF 676 0 0
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ATGTGGAGATTGTTTAACGCTAACTTTTTTCGATCTTGTTCTTTTTGCTTTTATCGATGA
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AAAAATTTTATGAGAAAACAGAAGTAAAAAGAAAGTAAACCGGGCCGGGAACTTTACCGG
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TCAGGTCCATCCACGTGTCCCCTAACTCACCGACGCCGTCTCCTTCCCGTTACCCCCGCG
AACAGAGATATTAACC

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DS 

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GAGAT
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ACTCCGTATCAGAGCGAGAAAGTGAATTTATAGAAGAAACCAAAAAGGTTACTAGCCGTT
AAGAGCCGTTGTAGAATATTTTAAATACGGCCTAACAAGACATGGTCCAGGCCCATCAAC
ATAAAGCCCATTAGTTACCCGAAGTAATGAATCCACGTCACCATTCTAAAAATTTTATGA
GAAAACAGAAGTAAAAAGAAAGTAAACCGGGCCGGGAACTTTACCGGTGACGGAATGTTA
CTCGGCACTTCCAATCACAGCCCTACACGTCGACTCCCCGTATCGTCTCAGGTCCATCCA
CGTGTCCCCTAACTCACCGACGCCGTCTCCTTCCCGTTACCCCCGCGAACAGAGATATTA
ACCCAAACCCTAACCTTATCTCTTCCCCCACCACATTCTGACTCAGATCCGGCGATATCT
CTCAACATCATCCATCCATGC

QA 6 746 6 746
DS 



AS 1 2

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GTCCGGAAAGCGCGGAGACGCCTGAGATTCACGGCAATGGCGTCATATCACAATACTCTA
ACCTACTGGCTCGTCAACCATCCCAACATCGCCCATTTCACTTGGACTGAAGGTGAAACC
CTCGGCTCCACCGTCTTCTTCGTCTCCGTCGTAGTCTCAGTTTACCTTACCGCCACATTA
CTTCTCAGATCCGCCATCGATTCGCTCCCTTCGCTAGGTCCTCGAATTCTCAAACCAATC
ACAGCCGTCCACAGCCTTATCCTCCGCCTCCTCTCCTTAATCATGGCTGTCGGCTGCACT
CTCTCTATAACCTCAGACCCGACCACGGCAAGTTTCTTCAAAGCGATTTGTTTTCCCGTA
GATGTGAAGCCCAACGGGCCTCTCTTTTTCTGGGCTCAAGTCTTCTACCTCTCGAAGATC
CTCGAGTTCGGAGACACGATCCTCATCGTACTAGGCAAGTCAATCCAACGGCTGTCTTTT
CTGCACGTGTACCACCACGCGACGGTTGTTGTTATGTGTTACCTCTGGCTTCGAACCCGC
CAGTCTATGTTTCCGGTTGCTCTGGTGACGAATTCCACGGTCCATGTCATTATGTACGGT
TATTACTTCCTTTGTGCCGTTGGATCGAGGCCCAAATGGAAGAGATTGGTGACGGACTGT
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CTTTTGGCTCTATTTTTCAACTTCCATTCCAAGAACTATGCCAAAAACACAAGAGAGGAG
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TGTTACAAATAGTTTGAAATTGTTTACTACAAATAAGACGGAAAAACGATAATAAATCTT
GAAATGGCTTTTTATTTATCG


BQ
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AF RR4E623TF U 1
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BS 660 775 RR4E623TF
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CTGCACGTGTACCACCACGCGACGGTTGTTGTTATGTGTTACCTCTGGCTTCGAACCCGC
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QA 1 775 1 775
DS 

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CTCAAGTCTTCTACCTCTCGAAGATCCTCGAGTTCGGAGACACGATCCTCATCGTACTAG
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TGTGTTACCTCTGGCTTCGAACCCGCCAGTCTATGTTTCCGGTTGCTCTGGTGACGAATT
CCACGGTCCATGTCATTATGTACGGTTATTACTTCCTTTGTGCCGTTGGATCGAGGCCCA
AATGGAAGAGATTGGTGACGGACTGTCAGATTGTGCAGTTTGTTTTCAGCTTTGGGTTAT
CTGGTTGGATGCTCCAAGAGCATTTATTCGGGTCTGGTTGCTCCGGGATTTGGGCGTGGT
GCTTCAACGCTGCGTTTAATGCTTCTCTTTTGGCTCTATTTTTCAACTTCCATTCCAAGA
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TTGTTGAATGTTCTTGGAGTTGTATTTGTTACAAATAGTTTGAAATTGTTTACTACAAAT
AAGACGGAAAAACGATAATAAATCTTGAAATGGCTTTTTATTTATCG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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ATCTATTTCTGTCTCTTAGCAACCTTTCTACATCCCACAACCTCTCTGTTCCGTGTCGGT
CTGAAGAAAAGACGGCTCGAGCTCGATGATATTAGAACCGGCAGAGTGATCAGAAAGCTG
AAACATTCACAAGGAGAACTCACTTATTACCCTTCTTTTGCTACTCTTGGAAGTGATCCT
AGTCAAGAAAATCAGGTTATTCTTAAGAACTACTTAGACGCTCAATACTATGGAGTGATT
GGAATCGGAACACCTTCACAAGAATTCGAAGTTATATTCGACACCGGAAGTTCCAATCTC
TGGGTTCCATCTATACATTGCAAACTCTTTGACCTGGCTTGCTGGGTCCATCACCAGTAC
AAGTCTAGCCAATCCAACACATACACAAAGAACGGAAAGCCGTGTACTATAACATATGGT
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GGAGATATCTTTGTCGGAAATAACTCAACTGGCTTCTGTGAGCAAGGATGTGATGCAATC
ATGGACTCAGGAACTTCGCTACTTGCTGGACCAACTACGGTAATCGCGCAAATCAACCAT
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GCAGAGAGTCAATCATCGACTGCATACATCCAAACATGCCAATGTTACATTCA


BQ
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AF RR4EW94TF U 1
AF RR4DW93TF U 584
BS 1 690 RR4EW94TF
BS 691 691 RR4DW93TF
BS 692 732 RR4EW94TF
BS 733 1373 RR4DW93TF

RD RR4EW94TF 732 0 0
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AGTTTAACAGTCACTAATCAAGCAAGTGGCTCTAAGGACATGATGCTTATCCGTCAAGCC
ATCTATTTCTGTCTCTTAGCAACCTTTCTACATCCCACAACCTCTCTGTTCCGTGTCGGT
CTGAAGAAAAGACGGCTCGAGCTCGATGATATTAGAACCGGCAGAGTGATCAGAAAGCTG
AAACATTCACAAGGAGAACTCACTTATTACCCTTCTTTTGCTACTCTTGGAAGTGATCCT
AGTCAAGAAAATCAGGTTATTCTTAAGAACTACTTAGACGCTCAATACTATGGAGTGATT
GGAATCGGAACACCTTCACAAGAATTCGAAGTTATATTCGACACCGGAAGTTCCAATCTC
TGGGTTCCATCTATACATTGCAAACTCTTTGACCTGGCTTGCTGGGTCCATCACCAGTAC
AAGTCTAGCCAATCCAACACATACACAAAGAACGGAAAGCCGTGTACTATAACATATGGT
TCGGGATCCATCTCTGGATTCTTTAGTGAGGACAATGTGAAAGTTGGTGGTCTTGTAGTC
AAAGATCAGGAGTTTATCGAAGCTACACATGAAGGGAGTCTCTCTTTTCTCCTAGCAAAG
TTCGATGGACTACTGGGGTTAGGGTTTCAG*AGATTTCAGTGGGAAATGCTGTGCCAGTT
TGGTACAACATG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4DW93TF 790 0 0
G
TGGTGGTCTTGTAGTCAAAGATCAGGAGTTTATCGAAGCTACACATGAAGGGAGTCTCTC
TTTTCTCCTAGCAAAGTTCGATGGACTACTGGGGTTAGGGTTTCAGGAGATTTCAGTGGG
AAATGCTGTGCCAGTTTGGTACAACATGGTGGATCAAGAACTAGTGAAGGAGAAAGTATT
CTCATTCTGGCTAAACCGTGATGCGGGTACTGAAATAGGAGGTGAGATTGTGTTTGGTGG
TGTTGATCCTGCGCACTTTAAAGGCAACCACACTTATGTACCTGTCACTAAAAAAGGCTA
TTGGCAGTTTAACATGGGAGATATCTTTGTCGGAAATAACTCAACTGGCTTCTGTGAGCA
AGGATGTGATGCAATCATGGACTCAGGAACTTCGCTACTTGCTGGACCAACTACGGTAAT
CGCGCAAATCAACCATGGTATTGGCGCTACGGGAGTTGTTAGTGCGGAGTGCAAAATAGT
TGTTTCTCAATACGGAGAGATGATATGGGATCTGTTAGTCTCAAGGTGCTGCCTAATCTT
GTGTGTAAACAGATCGGTCTCTGTGTTTTTGGAAAAGAGACGGGAGTCATATCAGTGGTC
GAGCAAGAGGAATCATCAGTTTTATGTAAGGTCTGTGAGATGGCTGTTGTCTGGGTTGAA
ACACGACTGAAACAGAAAGAAACCAAAGAGAAAGTGTTTGAGACCTGAACAGATTTGTGA
GAGCTTTCCTAGTCCCGCAGAGAGTCAATCATCGACTGCATACATCCAAACATGCCAATG
TTACATTCA

QA 2 790 2 790
DS 



AS 1 2

CO CL7728Contig1 788 2 2 U
GGATACAAAATTGGGCTGATGATATGGTAAGCCCTCAAGCGATAGATTACCCCCTCCTCC
CCTCTCCATATTTATTCTTAGCCACTGAAACAAAAGAGGGTACCATTTTCGCTGCGCTGT
TCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTCGAAGAAGAAGATGCCAGGCCCCGTCGTCGACGAAGT
GAAGGTTGAGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGC
CGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTTACAATC
AAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAAC
TCGGACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAA
GCTCAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGAT
GCCTCTGAAGCAGCCACGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACT
GGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAA
GCCACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACC
ACCTAGGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATGGTTCTCGTTTCTCAATTCACTTCTCGTCTC
TCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGGCTATTTTTCTTTATAATATGAGGCA
TTCATGTC


BQ
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AF RR4CX91TF U 1
AF RR4CX91JQ C 55
BS 1 605 RR4CX91TF
BS 606 788 RR4CX91JQ

RD RR4CX91TF 605 0 0
GGATACAAAATTGGGCTGATGATATGGTAAGCCCTCAAGCGATAGATTACCCCCTCCTCC
CCTCTCCATATTTATTCTTAGCCACTGAAACAAAAGAGGGTACCATTTTCGCTGCGCTGT
TCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTCGAAGAAGAAGATGCCAGGCCCCGTCGTCGACGAAGT
GAAGGTTGAGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGC
CGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTTACAATC
AAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAAC
TCGGACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAA
GCTCAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGAT
GCCTCTGAAGCAGCCACGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACT
GGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAA
GCCAC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4CX91JQ 734 0 0
CCCC
CCCCTCTCCATATTTATTCTTAGCCACTGAAACAAAAGAGGGTACCATTTTCGCTGCGCT
GTTCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTCGAAGAAGAAGATGCCAGGCCCCGTCGTCGACGAA
GTGAAGGTTGAGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAA
GCCGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTTACAA
TCAAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAA
ACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGACGATATGAGCTTTCAGCTAC
AAGCTCAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTG
ATGCCTTTGAAGCAGCCACGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGA
CTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCA
AAGCCACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCA
CCACCTAGGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATGGTTCTCGTTTCTCAATTCACTTCTCGTC
TCTCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGGCTATTTTTCTTTATAATATGAGG
CATTCATGTC

QA 5 734 5 734
DS 



AS 1 2

CO CL7729Contig1 950 2 4 U
CTCCCCGATTCGCTCTTCAGACACAAAAAGGGGTTTCTAATTCGGATCTGTACTTTCGCC
ATGGATACTCGTAAGAGAGGACGGCCTGAAGCTGCTGGTTCGTTCAACTCCAATGGCGGC
GGCGGAGGATTCAAGAAGTCTAAGCAAGAGATGGAATCATATTCAACTGGTTTAGGAAGC
AAATCCAAGCCTTGCACTAAATTTTTCAGCACTTCTGGCCGTCCTTTTGGAGATAACTGC
CACTTTTTGCATTATGTTCCCGGAGGATACAATGCTGTAGCACAGCTGACGAACATGGCG
CCCATGCCTCAAGCTTCCAGAAACATGCAAGGATCTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGAGA
TTCTCAGGGAGAGGAGGAGGAGAGTCTGGTCCTGGACACGTGTCTAGCTTTGGTGCATCA
GCCACTGCGAAGATCAGCGTGGATGCTTCGCTGGCCGGCGCCATCATTGGTAAAGGAGGA
GTCAGTTCGAAACAGATATGTCGTCAGACAGGGGCGAAGCTGTCGATTCAAGACCACGAG
AGAGACCCTAACCTTAAGAACATTGAGCTCGAAGGGACGTTCGAGCAGATAAACGAAGCT
AGCGCGATGGTTAGGGAGCTGATCGGGAGGCTTAACTCTGCTGCTGGTAGGAGACCACCT
GGTGCTGGTGGTGGACTTGGAGGTGGGTGGGGGTTGGTTCAGAAAGGGAAACCGCATCCA
GGAAGCAACTTCAAGACGAAGATGTGTGAGAGATTCGCGAAAGGGAACTGTACGTTTGGT
GATAGATGTCACTTTGCACACGGGGAAGCAGAGCTGCGCAGGTCAGGAATTGCCTAAGAC
AAGTCGTTTTCTTTTGTGAACTCTAATATCAATCTTCATCTACTTTTATTTTATGTTTGT
TTTAAAAAATACAATGTTAGTTTCATTGTCATTGTAAGTTTTCTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT25TF U 1
AF RR4AT25JQ C 207
BS 1 764 RR4AT25TF
BS 765 765 RR4AT25JQ
BS 766 816 RR4AT25TF
BS 817 950 RR4AT25JQ

RD RR4AT25TF 816 0 0
CTCCCCGATTCGCTCTTCAGACACAAAAAGGGGTTTCTAATTCGGATCTGTACTTTCGCC
ATGGATACTCGTAAGAGAGGACGGCCTGAAGCTGCTGGTTCGTTCAACTCCAATGGCGGC
GGCGGAGGATTCAAGAAGTCTAAGCAAGAGATGGAATCATATTCAACTGGTTTAGGAAGC
AAATCCAAGCCTTGCACTAAATTTTTCAGCACTTCTGGCCGTCCTTTTGGAGATAACTGC
CACTTTTTGCATTATGTTCCCGGAGGATACAATGCTGTAGCACAGCTGACGAACATGGCG
CCCATGCCTCAAGCTTCCAGAAACATGCAAGGATCTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGAGA
TTCTCAGGGAGAGGAGGAGGAGAGTCTGGTCCTGGACACGTGTCTAGCTTTGGTGCATCA
GCCACTGCGAAGATCAGCGTGGATGCTTCGCTGGCCGGCGCCATCATTGGTAAAGGAGGA
GTCAGTTCGAAACAGATATGTCGTCAGACAGGGGCGAAGCTGTCGATTCAAGACCACGAG
AGAGACCCTAACCTTAAGAACATTGAGCTCGAAGGGACGTTCGAGCAGATAAACGAAGCT
AGCGCGATGGTTAGGGAGCTGATCGGGAGGCTTAACTCTGCTGCTGGTAGGAGACCACCT
GGTGCTGGTGGTGGACTTGGAGGTGGGTGGGGGTTGGTTCAGAAAGGGAAACCGCATCCA
GGAAGCAACTTCAAGACGAAGATGTGTGAGAGATTCGCGAAAGG*AACTGTACGTTTGGT
GATAGATGTCACTTTGCACACGGGGAAGCAGAGCTG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AT25JQ 744 0 0
CAGCACTTCTGGCCGTCCTTTTGGAGATAACTGCCACTTTTTGCATTATGTTCCCGGAGG
ATACAATGCTGTAGCACAGCTGACGAACATGGCGCCCATGCCTCAAGCTTCCAGAAACAT
GCAAGGATCTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGAGATTCTCAGGGAGAGGAGGAGGAGAGTC
TGGTCCTGGACACGTGTCTAGCTTTGGTGCATCAGCCACTGCGAAGATCAGCGTGGATGC
TTCGCTGGCCGGCGCCATCATTGGTAAAGGAGGAGTCAGTTCGAAACAGATATGTCGTCA
GACAGGGGCGAAGCTGTCGATTCAAGACCACGAGAGAGACCCTAACCTTAAGAACATTGA
GCTCGAAGGGACGTTCGAGCAGATAAACGAAGCTAGCGCGATGGTTAGGGAGCTGATCGG
GAGGCTTAACTCTGCTGCTGGTAGGAGACCACCTGGTGCTGGTGGTGGACTTGGAGGTGG
T**GGGGTTGGTTCAGAA*GGGAAACCGCATCCAGGAAGCAACTTCAAGACGAAGATGTG
TGAGAGATTCGCGAAAGGGAACTGTACGTTTGGTGATAGATGTCACTTTGCACACGGGGA
AGCAGAGCTGCGCAGGTCAGGAATTGCCTAAGACAAGTCGTTTTCTTTTGTGAACTCTAA
TATCAATCTTCATCTACTTTTATTTTATGTTTGTTTTAAAAAATACAATGTTAGTTTCAT
TGTCATTGTAAGTTTTCTTTCTCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7730Contig1 1010 2 2 U
GGAACCGAATTTTAAAGGGAACAGTGGTTCTACTATTCCAACCAGCAGAAGAGGCTGGAA
ACGGTGCCAAGAAGATGATTGAAGACGGAGCCTTGGATGACGTGGAGGCTATCTTTGCAG
TCCATGTGTCCCACGAGCATCCAACGGGTGTCATTGGATCTAGGAGCGGTCCTCTGCTCG
CTGGATGTGGATTTTTCCGGGCAATCATTACTTCGGAAGAGACCGGCAGCTCTGCTGATC
TTATTATCGCAGCTTCTTCCGCCGTCATAAGCCTTCAAGGCATTGTATCACGTGAAGCTA
GTCCTCTTGATGCTCAGGTTGTGTCGGTGACTTCGTTTGATGGCGGTCACAGTCTCGATG
CGGTGCCGGATATGGTGGTTCTTGGGGGCACTTTCAGAGCCTTTTCCAACTCAAGCTTCT
ACTACCTTATGAAGCGTATTCGAGAGGTACTAGTGGAACAGGTCGGGGTTTTCGGTTGCA
CAGCGACTCTGAATTTCTTTGAGGAGCAGAACGCAATATACCCGCCAACCACAAACGAAG
ACGGAATGTACACACACTTGAAAAAAGTCACCGTTGATTTGTTGGGAGACAACCACTTCG
CGGTGACTCCACAAGTTATGGGAGCTGAAGATTTTGCATTCTACTCAGAGGTCATCCCGG
CCGCATTTTACTTCATTGGCATAAGAAATGAGGAACTTGGATCAGTCCATATTGGTCATT
CACCGCATTTTATGATCGATGAAGATAGTTTACCGGTTGGAGCCGCTGTTCACGCCGCCG
TGGCTGAGAGATACTTAAATGATAAATGTTCGTAAGAATAAAGACAATCTTCCCGACTTT
TTGGATGATTTTGTTTTAGGTTTTGCATAAAATTATTATTTAATCATTGCATCGCTAGTA
TTTGTCAACCTTTTTTCCTTTTTCGTTTAAACTTGTAGACCGCATATATTGCATAAGAAT
ACTGGTACAAAATGTAGCGAATTTTATATTTATTCCTTATATACTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H660TF U 1
AF RR4H660JQB C 344
BS 1 616 RR4H660TF
BS 617 1010 RR4H660JQB

RD RR4H660TF 616 0 0
GGAACCGAATTTTAAAGGGAACAGTGGTTCTACTATTCCAACCAGCAGAAGAGGCTGGAA
ACGGTGCCAAGAAGATGATTGAAGACGGAGCCTTGGATGACGTGGAGGCTATCTTTGCAG
TCCATGTGTCCCACGAGCATCCAACGGGTGTCATTGGATCTAGGAGCGGTCCTCTGCTCG
CTGGATGTGGATTTTTCCGGGCAATCATTACTTCGGAAGAGACCGGCAGCTCTGCTGATC
TTATTATCGCAGCTTCTTCCGCCGTCATAAGCCTTCAAGGCATTGTATCACGTGAAGCTA
GTCCTCTTGATGCTCAGGTTGTGTCGGTGACTTCGTTTGATGGCGGTCACAGTCTCGATG
CGGTGCCGGATATGGTGGTTCTTGGGGGCACTTTCAGAGCCTTTTCCAACTCAAGCTTCT
ACTACCTTATGAAGCGTATTCGAGAGGTACTAGTGGAACAGGTCGGGGTTTTCGGTTGCA
CAGCGACTCTGAATTTCTTTGAGGAGCAGAACGCAATATACCCGCCAACCACAAACGAAG
ACGGAATGTACACACACTTGAAAAAAGTCACCGTTGATTTGTTGGGAGACAACCACTTCG
CGGTGACTCCACAAGT

QA 1 616 1 616
DS 

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CGGTCACAGTCTCGATGCGGTGCCGGATATGGTGGTTCTTGGGGGCACTTTCAGAGCCTT
TTCCAACTCAAGCTTCTACTACCTTATGAAGCGTATTCGAGAGGTACTAGTGGAACAGGT
CGGGGTTTTCGGTTGCACAGCGACTCTGAATTTCTTTGAGGAGCAGAACGCAATATACCC
GCCAACCACAAACGAAGACGGAATGTACACACACTTGAAAAAAGTCACCGTTGATTTGTT
GGGAGACAACCACTTCGCGGTGACTCCACAAGTTATGGGAGCTGAAGATTTTGCATTCTA
CTCAGAGGTCATCCCGGCCGCATTTTACTTCATTGGCATAAGAAATGAGGAACTTGGATC
AGTCCATATTGGTCATTCACCGCATTTTATGATCGATGAAGATAGTTTACCGGTTGGAGC
CGCTGTTCACGCCGCCGTGGCTGAGAGATACTTAAATGATAAATGTTCGTAAGAATAAAG
ACAATCTTCCCGACTTTTTGGATGATTTTGTTTTAGGTTTTGCATAAAATTATTATTTAA
TCATTGCATCGCTAGTATTTGTCAACCTTTTTTCCTTTTTCGTTTAAACTTGTAGACCGC
ATATATTGCATAAGAATACTGGTACAAAATGTAGCGAATTTTATATTTATTCCTTATATA
CTATTTG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7733Contig1 852 2 4 U
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TGGCATAAGTGACAAGCCTTGCAAGGAACAGACGTTTGAATACAGGCCAAGGAACGCACC
CAAGAATGAAAATGGAGAGTGTGAAACTGTTGAAATAACGGTGTATGACTACTTCCTGAG
AGAAAGGAACATGGAGTTGCAGTACTCTGCGGATTTGCCGTGCGTCAATGTTGGGAGGCC
AAAGCGACCCACCTATATTCCCCTTGAGCACTGCACCTTGATTCCTCTTCAGAGGTACAC
AAAGGCGCTGAACACCTTCCAAAGATCTGCCCTCGTTGAGAAATCTAGACAGAAGCCCCA
AGAGAGGATGAATGTTCTGTCAAAGGCTCTGAAAGTGAGCAACTATGACAGTGAACCTCT
CCTGCGCTCCTGTGGCATTTCTATCAGCTCCAACTTTACTCAGGTTGAGGGTCGTGTGCT
GCAAGCTCCTAAGCTGAAAATGGGACGTGGAGATGAACTGTTCCCGCGCAATGGTCGCTG
GAACTTCAACAACAAGCAATTTGTTGAGCCAACCAAGATTGACAAATGGGCCGTTGCAAA
TTTCTCTGCTCGCTGTAATGTGCGTCAACTGGTTGATGATCTGATCCGAATTGGAGGATC
CAAAGGAATTGAAATTGCTGCTCCCTTTGATGTGTTTGAGGAGGGTCATCAGTTTCGCCG
TGCTCCTCCTCTTATTCGAGTTGAGAAGATGTTTAAAGAGATCCAGTCTAAACTCCCTGG
TGCTCCACAGTTCCTTCTGTGTCTGCTCCCCGAAAGGAGACTGCGACATTTATGGGCCAT
GGAGAGAGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM84TF U 1
AF RR4CT49TF U 144
BS 1 554 RR4AM84TF
BS 555 555 RR4CT49TF
BS 556 812 RR4AM84TF
BS 813 852 RR4CT49TF

RD RR4AM84TF 812 0 0
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AGAAAGGAACATGGAGTTGCAGTACTCTGCGGATTTGCCGTGCGTCAATGTTGGGAGGCC
AAAGCGACCCACCTATATTCCCCTTGAGCACTGCACCTTGATTCCTCTTCAGAGGTACAC
AAAGGCGCTGAACACCTTCCAAAGATCTGCCCTCGTTGAGAAATCTAGACAGAAGCCCCA
AGAGAGGATGAATGTTCTGTCAAAGGCTCTGAAAGTGAGCAACTATGACAGTGAACCTCT
CCTGCGCTCCTGTGGCATTTCTATCAGCTCCAACTTTACTCAGGTTGAGGGTCGTGTGCT
GCAAGCTCCTAAGCTGAAAATGGGACGTGGAGATGAACTGTTCCCGCGCAATGGTCGCTG
GAACTTCAACAACA*GCAATTTGTTGAGCCAACCAAGATTGACAAATGGGCCGTTGCAAA
TTTCTCTGCTCGCTGTAATGTGCGTCAACTGGTTGATGATCTGATCCGAATTGGAGGATC
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TGCTCCACAGTTCCTTCTGTGTCTGCTCCCCG

QA 1 812 1 812
DS 

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TTGAGCACTGCACCTTGATTCCTCTTCAGAGGTACACAAAGGCGCTGAACACCTTCCAAA
GATCTGCCCTCGTTGAGAAATCTAGACAGAAGCCCCAAGAGAGGATGAATGTTCTGTCAA
AGGCTCTGAAAGTGAGCAACTATGACAGTGAACCTCTCCTGCGCTCCTGTGGCATTTCTA
TCAGCTCCAACTTTACTCAGGTTGAGGGTCGTGTGCTGCAAGCTCCTAAGCTGAAAATGG
GACGTGGAGATGAACTGTTCCCGTGCAATGGTCGCTGGAACTTCAACAACAAGCAATTTG
TTGAGCCAACCAAGATTGACAAATGGGCCGTTGCAAATTTCTCTGCTCGCTGTAATGTGC
GTCAACTGGTTGATGATCTGATCCGAATTGGAGGATCCAAAGGAATTGAAATTGCTGCTC
CCTTTGATGTGTTTGAGGAGGGTCATCAGTTTCGCCGTGCTCCTCCTCTTATTCGAGTTG
AGA*GATGTTTGAAGAGATCCAGTCTAAACTCCCTGGTGCTC*ACAGTTCCTTCTGTGTC
TGCTCCCCGAAAGGAGACTGCGACATTTATGGGCCATGGAGAGAGAGAC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL7734Contig1 862 2 4 U
GGATAACATTCGCAGCAATCAATCTCTATTAGAGCCAGAGAGAGAGAGACCACATCCTCC
CTCCATTACCTCACTCCCAATGGCATCAAACACCCCGACAACTCCTCCTCTCAGGCGCCT
CGCCAAAGACCCCGCCAAAGAAACGGACCTCCTCCTCCTCGCCGCCACGGAAGAAACCCG
CCGCCTCGTTATCACCAGACGACGGCCACGGCCACTGCTCAGGCTCCTCAGGAGAAGAAG
AAACCCGTCTTCGTCAAGGTCGATCATCTCAAACCAGGCACGAGCGGACACACCCTGACC
GTCAAAGTCGTCGATCAAACCTCCGTCCCTCAGAAACCGAACGCCGCCGCCGCCGCCTCT
TCCCACCTCCGTCCTAATCGGATCTCCGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACGCTTCCATCC
TCTTCACCGCTCGCAACGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCGGGAGCTACTGTGAATCTCC
GGAATGCGAAGATAGATATGTTCAAGGGGTCAACGAGGCTTGCGGTTGACAAATGGGGTC
GTATTGAGGTCACTGAGCCTGTTGAGATGACTGTTAGAGAGGATAACAATCTTTCTCTTG
TGGAGTATGAGCTCGTCAATGTTGAGGAATGATCGATCAAGCGCCACAATGGGGTTTTGT
TTTGTGGTAATGTAACAGGCGAATGGGAAAATTATATGTTTTTATCTTATGACAGTTGCA
AGTTTGGTACATTATGTTGATCTTGGGTTTTTGGTGCACACAATATATCATCATCATGGG
TATGTACTCTTTCAGTTGTGGCCTCTACTCTGTTTTTTGTATGGTTATTGAACAGAGAGG
TTAATGCAAAAAAAACTTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG44TF U 1
AF RR4DG44JQ C 125
BS 1 644 RR4DG44TF
BS 645 645 RR4DG44JQ
BS 646 675 RR4DG44TF
BS 676 862 RR4DG44JQ

RD RR4DG44TF 675 0 0
GGATAACATTCGCAGCAATCAATCTCTATTAGAGCCAGAGAGAGAGAGACCACATCCTCC
CTCCATTACCTCACTCCCAATGGCATCAAACACCCCGACAACTCCTCCTCTCAGGCGCCT
CGCCAAAGACCCCGCCAAAGAAACGGACCTCCTCCTCCTCGCCGCCACGGAAGAAACCCG
CCGCCTCGTTATCACCAGACGACGGCCACGGCCACTGCTCAGGCTCCTCAGGAGAAGAAG
AAACCCGTCTTCGTCAAGGTCGATCATCTCAAACCAGGCACGAGCGGACACACCCTGACC
GTCAAAGTCGTCGATCAAACCTCCGTCCCTCAGAAACCGAACGCCGCCGCCGCCGCCTCT
TCCCACCTCCGTCCTAATCGGATCTCCGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACGCTTCCATCC
TCTTCACCGCTCGCAACGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCGGGAGCTACTGTGAATCTCC
GGAATGCGAAGATAGATATGTTCAAGGGGTCAACGAGGCTTGCGGTTGACAAATGGGGTC
GTATTGAGGTCACTGAGCCTGTTGAGATGACTGTTAGAGAGGATAACAATCTTTCTCTTG
TGGAGTATGAGCTCGTCAATGTTGAGGAATGATCGATCAAGCGC*ACAATGGGGTTTTGT
TTTGTGGTAATGTAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4DG44JQ 738 0 0
AAAGACCCCGCCAAAGAAACGGACCTCCTCCTCCTCGCCGCCACGGAAGAAACCCGCCGC
CTCGTTATCACCAGACGACGGCCACGGCCACTGCTCAGGCTCCTCAGGAGAAGAAGAAAC
CCGTCTTCGTCAAGGTCGATCATCTCAAACCAGGCACGAGCGGACACACCCTGACCGTCA
AAGTCGTCGATCAAACCTCCGTCCCTCAGAAACCGAACGCCGCCGCCGCCGCCTCTTCCC
ACCTCCGTCCTAATCGGATCTCCGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACGCTTCCATCCTCTT
CACCGCTCGCAACGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCGGGAGCTACTGTGAATTTCCGGAA
TGCGAAGATAGATATGTTCAAGGGGTCAACGAGGCTTGCGGTTGACAAATGGGGTCGTAT
TGAGGTCACTGAGCCTGTTGAGATGACTGTTAGAGAGGATAACAATCTTTCTCTTGTGGA
GTATGAGCTCGTCAATGTTGAGGAATGATCGATCAAGCGCCACAATGGGGTTTTGTTTTG
TGGTAATGTAACAGGCGAATGGGAAAATTATATGTTTTTATCTTATGACAGTTGCAAGTT
TGGTACATTATGTTGATCTTGGGTTTTTGGTGCACACAATATATCATCATCATGGGTATG
TACTCTTTCAGTTGTGGCCTCTACTCTGTTTTTTGTATGGTTATTGAACAGAGAGGTTAA
TGCAAAAAAAACTTGGTG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7736Contig1 721 2 2 U
GTGCCTATGTGGCCCATGATGCTCTTCCGTATGCTGATGCCAGTGGAGCTGGAAAAGATG
TCTATGAATTCGTAAAGAAAGTCGGGAGGTTCAAGGAGACTAAGAGAACTGAAGGGATAT
CTACTTCGGATATCATAATGAGGATAGTGAAAGATTATAACCAGTATGTCATGCGTAACC
TTGACAGGGGATACTCAAGGGAGGATCTTGGAGTTAGCTTTGTCAAAGAAAAGAGACTTC
GAGTTAATATGAGGCTGAAGAAACTTCAGGAGAAGGTCAAAGAACAACAAGAAAAAGTTG
GGGAAAAGATGCAAACTGTGAAAATGGTACGTAATGAGTGGGTGGAGAATGCAGATCGTT
GGGTAGCTGGATTCCTTGAAATGTTTGAAGAAGGCTGCCATAAGATGGGAACTGCCATCA
GAGACCGAATCCAAGAGAAGTTAATGCGACAAGAGTCCAAAGAATTGCTCGAGAAGGATC
AAATCGGTCAGCATAAAGACACAGAGGAACAGTTCTATGAAGAATATTTCGAGCATGACA
TTGTTGACAGCTGTGAAGACGATGAAGAAGAGTACCATGATGAGATTCAAGAGCAATGTA
GTGCCTCAAAAGCCATAAAAAGTAACTAGAGGAACACAAATTTATGTTGTTTTAGTGCCT
ATTTCAATACTTTTGCAGTAAAATGCTTATCAAATGACTTACTTGTTAGCTATAAAGTTT
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RR4E095TF U 1
AF RR4E572TF U 18
BS 1 621 RR4E095TF
BS 622 721 RR4E572TF

RD RR4E095TF 621 0 0
GTGCCTATGTGGCCCATGATGCTCTTCCGTATGCTGATGCCAGTGGAGCTGGAAAAGATG
TCTATGAATTCGTAAAGAAAGTCGGGAGGTTCAAGGAGACTAAGAGAACTGAAGGGATAT
CTACTTCGGATATCATAATGAGGATAGTGAAAGATTATAACCAGTATGTCATGCGTAACC
TTGACAGGGGATACTCAAGGGAGGATCTTGGAGTTAGCTTTGTCAAAGAAAAGAGACTTC
GAGTTAATATGAGGCTGAAGAAACTTCAGGAGAAGGTCAAAGAACAACAAGAAAAAGTTG
GGGAAAAGATGCAAACTGTGAAAATGGTACGTAATGAGTGGGTGGAGAATGCAGATCGTT
GGGTAGCTGGATTCCTTGAAATGTTTGAAGAAGGCTGCCATAAGATGGGAACTGCCATCA
GAGACCGAATCCAAGAGAAGTTAATGCGACAAGAGTCCAAAGAATTGCTCGAGAAGGATC
AAATCGGTCAGCATAAAGACACAGAGGAACAGTTCTATGAAGAATATTTCGAGCATGACA
TTGTTGACAGCTGTGAAGACGATGAAGAAGAGTACCATGATGAGATTCAAGAGCAATGTA
GTGCCTCAAAAGCCATAAAAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4E572TF 704 0 0
GATGCTCTTCCGTATGCTGATGCCAGTGGAGCTGGAAAAGATGTCTATGAATTCGTAAAG
AAAGTCGGGAGGTTCAAGGAGACTAAGAGAACTGAAGGGATATCTACTTCGGATATCATA
ATGAGGATAGTGAAAGATTATAACCAGTATGTCATGCGTAACCTTGACAGGGGATACTCA
AGGGAGGATCTTGGAGTTAGCTTTGTCAAAGAAAAGAGACTTCGAGTTAATATGAGGCTG
AAGAAACTTCAGGAGAAGGTCAAAGAACAACAAGAAAAAGTTGGGGAAAAGATGCAAACT
GTGAAAATGGTACGTAATGAGTGGGTGGAGAATGCAGATCGTTGGGTAGCTGGATTCCTT
GAAATGTTTGAAGAAGGCTGCCATAAGATGGGAACTGCCATCAGAGACCGAATCCAAGAG
AAGTTAATGCGACAAGAGTCCAAAGAATTGCTCGAGAAGGATCAAATCGGTCAGCATAAA
GACACAGAGGAACAGTTCTATGAAGAATATTTCGAGCATGACATTGTTGACAGCTGTGAA
GACGATGAAGAAGAGTACCATGATGAGATTCAAGAGCAATGTAGTGCCTCAAAAGCCATA
AAAAGTAACTAGAGGAACACAAATTTATGTTGTTTTAGTGCCTATTTCAATACTTTTGCA
GTAAAATGCTTATCAAATGACTTACTTGTTAGCTATAAAGTTTA

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL7737Contig1 1385 2 6 U
GGATATATAAGACTAGAGAAACAGAACAGTGTGCAAGAGAGAGAGATTTGAAAAATGTCG
AAGGTAACCTTAGGGAACGAATCGCTTGTTGGGTCATTGACTCCATCGAACAAGAAGTCG
TCAAAGTGACCAATAGGATTCAAGAAGGGAAGAAGCCTCTGTACGCTGTTGTCTTCAACT
TCCTTGATTCTCGTTTCTTCAGTGTCTTCGTCACCGCTGGTGGAAATAAGATTACGCTGT
ACAACTGTCTTGAAGATGGTGCCATATCTGCATTGCAATCCTATGCTGATGAAGACAAGG
AGGAGTCGTTTTACACTGTTAGCTGGGCTTGCGGCTTTTTGGGGAACCCATTTGTTGCGG
CTGGTGGAGTGAAAGGCATAGTCCGAGTCATTGACGTCAACAATGAAAAGATTCACAAGA
GCCTTTTGGGCCATGGGGATTCAGTGAACAAAATCAGGACACAACCTCTGAAACCTCAGC
TTGTGATTACTGCAAGCAAGGATGAATCTGTTAGGTTGTGGAACGTTGAAACTGGGATAT
GTATTCTGATATTTGCTGGAGCTGGAGGTCACCGATACGAAGTTCTAAGTGTGGACTTTC
ATCCCACTGAGATTTTCCGTTTTGCTAGCTGTGGTATGGACACCACTATTAAGATATGGT
CAATGAAAGAGTTTTGGACTTATGTTGAGAAGTCATACACATGGACTGATGATCCAACAA
AGTTCCCAACAAAGTATGTGCAATTCCCTGTATTTACTGCTTCAGTTCATACAAACTATG
TAGATTGTAACCGTTGGGTTGGTGATTTTATCCTTTCAAAGAGTGTGGACAACGAGATCT
TATTGTGGGAACCACAACTGAAAGAGAACTCTCCTGGAGAGGGTACTTCAGATGTTCTAC
AAAGATACCCGGTTCCAATGTCTGATATCTGGTTTATCAAGTTTTCTTGCGACTTCCAAT
TCAGTTCTCTTGCAATAGGGAATCAGGAAGGAAAGATTTATGTCTGGGATTTGAAAAGTT
GCCCTCCTGTTTTGATTACAAAGTTGTCACACAACCAGTCGAAATGTGTGATCAGGCAAA
CCGCTATGTCCGTTGATGGAAACACAATTCTTGCTGCCTGCGAGGACGGGACCATATGGC
GTTGGGATGTGATCACCAAGTAGCAAACTGAGTCTTTTAAGAACTGATGGATTAGGACCT
GGAGGAAGAAGATATATAGTGTTTTGTTGTAACTTATATATTTATCACATTACAATTTGG
GAAAGTTATATTACTATCCCCTGAAACTTTACGATGCTATTTATAGCCTCAATAACTTCA
CTTTGGTTTAAAAACTTTATAGTCTTCTGATCAATACACAATGCTGTATCCAGGAGCTTT
GTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4B254TF U 1
AF RR4B254JQ C 551
BS 1 774 RR4B254TF
BS 775 775 RR4B254JQ
BS 776 831 RR4B254TF
BS 832 832 RR4B254JQ
BS 833 850 RR4B254TF
BS 851 1385 RR4B254JQ

RD RR4B254TF 863 0 0
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TCAAAGTGACCAATAGGATTCAAGAAGGGAAGAAGCCTCTGTACGCTGTTGTCTTCAACT
TCCTTGATTCTCGTTTCTTCAGTGTCTTCGTCACCGCTGGTGGAAATAAGATTACGCTGT
ACAACTGTCTTGAAGATGGTGCCATATCTGCATTGCAATCCTATGCTGATGAAGACAAGG
AGGAGTCGTTTTACACTGTTAGCTGGGCTTGCGGCTTTTTGGGGAACCCATTTGTTGCGG
CTGGTGGAGTGAAAGGCATAGTCCGAGTCATTGACGTCAACAATGAAAAGATTCACAAGA
GCCTTTTGGGCCATGGGGATTCAGTGAACAAAATCAGGACACAACCTCTGAAACCTCAGC
TTGTGATTACTGCAAGCAAGGATGAATCTGTTAGGTTGTGGAACGTTGAAACTGGGATAT
GTATTCTGATATTTGCTGGAGCTGGAGGTCACCGATACGAAGTTCTAAGTGTGGACTTTC
ATCCCACTGAGATTTTCCGTTTTGCTAGCTGTGGTATGGACACCACTATTAAGATATGGT
CAATGAAAGAGTTTTGGACTTATGTTGAGAAGTCATACACATGGACTGATGATCCAACAA
AGTTCCCAACAAAGTATGTGCAATTCCCTGTATTTACTGCTTCAGTTCATACAA*CTATG
TAGATTGTAACCGTTGGGTTGGTGATTTTATCCTTTCAAAGAGTGTGGACA*CGAGATCT
TATTGTGGGA
CCACACTGAAGAG

QA 1 850 1 850
DS 

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GTTTTGGACTTATGTTGAGAAGTCATACACATGGACTGATGATCCAACAAAGTTCCCAAC
AAAGTATGTGCAATTCCCTGTATTTACTGCTTCAGTTCATACAAACTATGTAGATTGTAA
CCGTTGGGTTGGTGATTTTATCCTTTCAAAGAGTGTGGACAACGAGATCTTATTGTGGGA
ACCACAACTGAAAGAGAACTCTCCTGGAGAGGGTACTTCAGATGTTCTACAAAGATACCC
GGTTCCAATGTCTGATATCTGGTTTATCAAGTTTTCTTGCGACTTCCAATTCAGTTCTCT
TGCAATAGGGAATCAGGAAGGAAAGATTTATGTCTGGGATTTGAAAAGTTGCCCTCCTGT
TTTGATTACAAAGTTGTCACACAACCAGTCGAAATGTGTGATCAGGCAAACCGCTATGTC
CGTTGATGGAAACACAATTCTTGCTGCCTGCGAGGACGGGACCATATGGCGTTGGGATGT
GATCACCAAGTAGCAAACTGAGTCTTTTAAGAACTGATGGATTAGGACCTGGAGGAAGAA
GATATATAGTGTTTTGTTGTAACTTATATATTTATCACATTACAATTTGGGAAAGTTATA
TTACTATCCCCTGAAACTTTACGATGCTATTTATAGCCTCAATAACTTCACTTTGGTTTA
AAAACTTTATAGTCTTCTGATCAATACACAATGCTGTATCCAGGAGCTTTGTTAC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL7738Contig1 746 2 4 U
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TGCGAATGCTTTCTTGGTTGGAGGAGCTGGAGATTTCCTTGTTATAGAACTTACTGATCA
GCTGCAAAAACTGAAAGTAGAACCAGTGCTGCTACACTATCTTTCTCAGATGAAGATTCT
TCAAGGTATGGAACTGAGAATGACAACCAGCACGAGGTTAAAGGCGTGTTTGTACAGTTT
TACCTCTCCCGGACGTCCAATGTACCCGACAAGAGCTGTCCGTCATGCAGCCTGGGATGC
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AGCAGTACTTTATTCCATCGTGAGGCTCATCTTTTCACGGCGAGAGAAGCCGAGGCAAAG
CTAAATAGCGCTTTTACTCATTTGATGAAGCCTGCAGCACGAATCCAATCCCTTAGTTGT
ATATAAATGTGGTTTTTGGCCACAAGAGGCAAACCAGAGAACTTTACCCCTTCACCTGTA
TTGCGTTCTATGGAGAACATAAAATCCGTTTCGAGGAAGATCCCCATGGAATGGCTCTTG
ACGTGTGTTTTGTTGTCATTGTTAAGTTGTTATTTTACTGCTATAGAGGATCATGTATTT
TCTGACCAGGAACCCTTTTCTACGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BF41JQ C 1
AF RR4BF41TF U 120
BS 1 119 RR4BF41JQ
BS 120 640 RR4BF41TF
BS 641 641 RR4BF41JQ
BS 642 746 RR4BF41TF

RD RR4BF41JQ 746 0 0
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TGCGAATGCTTTCTTGGTTGGAGGAGCTGGAGATTTCCTTGTTATAGAACTTACTGATCA
GCTGCAAAAACTGAAAGTAGAACCAGTGCTGCTACACTATCTTTCTCAGATGAAGATTCT
TCAAGGTATGGAACTGAGAATGACAACCAGCACGAGGTTAAAGGCGTGTTTGTACAGTTT
TACCTCTCCCGGACGTCCAATGTACCCGACAAGAGCTGTCCGTCATGCAGCCTGGGATGC
TTTAGGTTCCCTCTTTCCTGTTGGGCGTTACCCTAGGCATCTCATCAGCCTATTTTTCAG
GCTGCTGTATCCGTGGTACTGGCCATCCTCGTGCTGGAACTTTGTGGTTTCTTGCATTAA
AGCAGTACTTTATTCCATCGTGAGGCTCATCTTTTCACGGCGAGAGAAGCCGAGGCAAAG
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ATATAAATGTGGTTTT*GGCCACAAGAGGCAAACCAGAGAACTTTACCC*TTCACCTGTA
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ACGTGTGTTTTGTTGTCATTGTTAAGTTGTTATTTTACTGCTATAGAGGATCATGTATTT
TCTGACCAGGAACCCTTTTCTACGGG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4BF41TF 627 0 0
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TTCAAGGTATGGAACTGAGAATGACAACCAGCACGAGGTTAAAGGCGTGTTTGTACAGTT
TTACCTCTCCCGGACGTCCAATGTACCCGACAAGAGCTGTCCGTCATGCAGCCTGGGATG
CTTTAGGTTCCCTCTTTCCTGTTGGGCGTTACCCTAGGCATCTCATCAGCCTATTTTTCA
GGCTGCTGTATCCGTGGTACTGGCCATCCTCGTGCTGGAACTTTGTGGTTTCTTGCATTA
AAGCAGTACTTTATTCCATCGTGAGGCTCATCTTTTCACGGCGAGAGAAGCCGAGGCAAA
GCTAAATAGCGCTTTTACTCATTTGATGAAGCCTGCAGCACGAATCCAATCCCTTAGTTG
TATATAAATGTGGTTTTTGGCCACAAGAGGCAAACCAGAGAACTTTACCCCTTCACCTGT
ATTGCGTTCTATGGAGAACATAAAATCCGTTTCGAGGAAGA*CCCCATGGAATGGCTCTT
GACGTGTGTTTTGTTGTCATTGTTAAGTTGTTATTTTACTGCTATAGAGGATCATGTATT
TTCTGACCAGGAACCCTTTTCTACGGG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7739Contig1 737 2 2 U
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TGGATGAGTGGTCGGAAGGTGACGTGGCGGCTGAGATGCCGTGCAAGCACAAGTTTCACT
CGAAGTGTGTAGAGGAGTGGTTGGGGAGACACGCCACGTGTCCGTTGTGTAGGTACGAGA
TGCCTGTTGAGGAAGTTGAAGAGGAGAAGAAAGTCGGCGTTTGGATTGGACTCTCTGTTA
GCACCGGTGTGGGAAGAAACGAAGAAATCGGTGGTGATTCGAACCCTCGAGATGAAACAG
AGGCTTAGGATCTAGGCTTGTGTTTTTGTATATATTATTATTCCTTTTTCCAAAATTTCA
ATTAAGAATTGATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F576TF U 1
AF RR4F576JQ C 51
BS 1 658 RR4F576TF
BS 659 737 RR4F576JQ

RD RR4F576TF 658 0 0
CCAGTTTCCTTCTCCTCCTTTGTTTACTCCGAGAAAAGTTAGCTCCTTTTTTCTTCTTCT
CTCTCGAAAAGATCTCTCCTTTCAATCTTAATTGTTTGCGTGTGATGTCTTCGGAGACGC
TCTTTTTAGCGTTAGCGGTTGCGTTCCGTAGGAGGATCGAAGAAGGTGGACTCCTACCGC
TGAATTTTGCTTCATCCGGAGAAGCCGACGAGGGCGAAGAATCCACCGATCGTCGTGGTT
CGGTGTTCGAGAGAGTGGTGGTGATCAGATCGCCTGTTGGACTCGAGGATTTCTTGAACG
GCTCTGAGAAACAGGGGAGATCCCCGGCGTCGAAATCAGCCGTGAAGAGTCTGCCACGTG
TCGTGATCGGAGGAGATAAGGAGGCAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGTGTCCGATTTGTC
TGGATGAGTGGTCGGAAGGTGACGTGGCGGCTGAGATGCCGTGCAAGCACAAGTTTCACT
CGAAGTGTGTAGAGGAGTGGTTGGGGAGACACGCCACGTGTCCGTTGTGTAGGTACGAGA
TGCCTGTTGAGGAAGTTGAAGAGGAGAAGAAAGTCGGCGTTTGGATTGGACTCTCTGTTA
GCACCGGTGTGGGAAGAAACGAAGAAATCGGTGGTGATTCGAACCCTCGAGATGAAAC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4F576JQ 687 0 0
TTCTTCTTCTCTCTCGAAAAGATCTCTCCTTTCAATCTTAATTGTTTGCGTGTGATGTCT
TCGGAGACGCTCTTTTTAGCGTTAGCGGTTGCGTTCCGTAGGAGGATCGAAGAAGGTGGA
CTCCTACCGCTGAATTTTGCTTCATCCGGAGAAGCCGACGAGGGCGAAGAATCCACCGAT
CGTCGTGGTTCGGTGTTCGAGAGAGTGGTGGTGATCAGATCGCCTGTTGGACTCGAGGAT
TTCTTGAACGGCTCTGAGAAACAGGGGAGATCCCCGGCGTCGAAATCAGCCGTGAAGAGT
CTGCCACGTGTCGTGATCGGAGGAGATAAGGAGGCAGGAGGAGGTGGAGGAGGAGGGTGT
CCGATTTGTCTGGATGAGTGGTCGGAAGGTGACGTGGCGGCTGAGATGCCGTGCAAGCAC
AAGTTTCACTCGAAGTGTGTAGAGGAGTGGTTGGGGAGACACGCCACGTGTCCGTTGTGT
AGGTACGAGATGCCTGTTGAGGAAGTTGAAGAGGAGAAGAAAGTCGGCGTTTGGATTGGA
CTCTCTGTTAGCACCGGTGTGGGAAGAAACGAAGAAATCGGTGGTGATTCGAACCCTCGA
GATGAAACAGAGGCTTAGGATCTAGGCTTGTGTTTTTGTATATATTATTATTCCTTTTTC
CAAAATTTCAATTAAGAATTGATTTGC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7740Contig1 760 2 3 U
TTTTTCACTGGTCGAACATATTTATAAGTAATTAAACATAACAAGATTACACCGAGAAAA
AGTAGAAGAAAAAAAATCAAAATGTTTCTTCAAAGGGCATAAAAAAAGCAAAAAAGATGT
AAACTAAGATAAAAAATCATAAATGAAAAACACCCAGAGTAAAAGAAAAAGCGAAAGTAA
AAGAAAAAGCAGAAAGAAAATAAATGATACACAGGAATAACAACGATGTGGAAGTGAAAT
CAGATGTTGATGGTCGCATCCCAAAGCCGGAGAACTCCATTCCGGCCACCGCTACATATC
CGTTTCCTCTCCAGATCAGACGCAACACATCTCACCACAGCGGCTGTTTTTTGGGGTACT
CTGTACAGTTGCCAGCCTGAGACTTTGGTTCCAGCGTTAGAAGGACGATGGAAAAGAGAC
ATCGAGTTATCCGCTGCTCCGATGCCTAACCAATGCTCACCAGCGTTGATTGATAGTATA
GACGAATTATGGAGCGTTATGTTCTTCACGCATTTAATGCCATCATCATCATTTTCCCAA
AAACGGAGCAATCCATCAGCGGAACCTGTGATTATTCCTTTGTCGAGTGTGGAGTATTCA
ACAGATTGTACTGGCCCAGCATGGCATGCTAAAACAGCGTCGCATGATCCTCTGGAGATA
GACCACACTCTTGCTGTCCGGTCATCGCTCCCTGTTATCAAGGTATCTTCCACCATTCGA
AGTGACCGTATCCATTTTGTATGCCCTTTCAGTTTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4GV60TF C 1
AF RR4GV60JQ U 6
BS 1 5 RR4GV60TF
BS 6 759 RR4GV60JQ
BS 760 760 RR4GV60TF

RD RR4GV60TF 760 0 0
TTTTTCACTGGTCGAACATATTTATAAGTAATTAAACATAACAAGATTACACCGAGAAAA
AGTAGAAGAAAAAAAATCAAAATGTTTCTTCAAAGGGCATAAAAAAAGCAAAAAAGATGT
AAACTAAGATAAAAAATCATAAATGAAAAACACCCAGAGTAAAAGAAAAAGCGAAAGTAA
AAGAAAAAGCAGAAAGAAAATAAATGATACACAGGAATAACAACGATGTGGAAGTGAAAT
CAGATGTTGATGGTCGCATCCCAAAGCCGGAGAACTCCATTCCGGCCACCGCTACATATC
CGTTTCCTCTCCAGATCAGACGCAACACATCTCACCACAGCGGCTGTTTTTTGGGGTACT
CTGTACAGTTGCCAGCCTGAGACTTTGGTTCCAGCGTTAGAAGGACGATGGAAAAGAGAC
ATCGAGTTATCCGCTGCTCCGATGCCTAACCAATGCTCACCAGCGTTGATTGATAGTATA
GACGAATTATGGAGCGTTATGTTCTTCACGCATTTAATGCCATCATCATCATTTTCCCAA
AAACGGAGCAATCCATCAGCGGAACCTGTGATTATTCCTTTGTCGAGTGTGGAGTATTCA
ACAGATTGTACTGGCCCAGCATGGCATGCTAAAACAGCGTCGCATGATCCTCTGGAGATA
GACCACACTCTTGCTGTCCGGTCATCGCTCCCTGTTATCAAGGTATCTTCCACCATTCGA
AGTGACCGTATCCATTTTGTATGCCCTTTCAGTTTATGCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GV60JQ 754 0 0
CACTGGTCGAACATATTTATAAGTAATTAAACATAACAAGATTACACCGAGAAAAAGTAG
AAGAAAAAAAATCAAAATGTTTCTTCAAAGGGCATAAAAAAAGCAAAAAAGATGTAAACT
AAGATAAAAAATCATAAATGAAAAACACCCAGAGTAAAAGAAAAAGCGAAAGTAAAAGAA
AAAGCAGAAAGAAAATAAATGATACACAGGAATAACAACGATGTGGAAGTGAAATCAGAT
GTTGATGGTCGCATCCCAAAGCCGGAGAACTCCATTCCGGCCACCGCTACATATCCGTTT
CCTCTCCAGATCAGACGCAACACATCTCACCACAGCGGCTGTTTTTTGGGGTACTCTGTA
CAGTTGCCAGCCTGAGACTTTGGTTCCAGCGTTAGAAGGACGATGGAAAAGAGACATCGA
GTTATCCGCTGCTCCGATGCCTAACCAATGCTCACCAGCGTTGATTGATAGTATAGACGA
ATTATGGAGCGTTATGTTCTTCACGCATTTAATGCCATCATCATCATTTTCCCAAAAACG
GAGCAATCCATCAGCGGAACCTGTGATTATTCCTTTGTCGAGTGTGGAGTATTCAACAGA
TTGTACTGGCCCAGCATGGCATGCTAAAACAGCGTCGCATGATCCTCTGGAGATAGACCA
CACTCTTGCTGTCCGGTCATCGCTCCCTGTTATCAAGGTATCTTCCACCATTCGAAGTGA
CCGTATCCATTTTGTATGCCCTTTCAGTTTATGC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL7741Contig1 257 2 2 U
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TGGTAAGCAGAAGATGCAGCGCCGAAGATGAAGTCTTTTTCGAAACTGCCACTGTTGAAT
TTATCAGTATGACCACATTCTGACACACTCTCTTCGCAAGTAGGTTCTTCATCAGCTTTG
CAAGTCGCCACAGCTAGTAAAAAAACTAATATGAACCCAATGTGCTTCATGATTAATTTG
TAGATGTATGTGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F987TF C 1
AF RR4F987JQ U 96
BS 1 95 RR4F987TF
BS 96 257 RR4F987JQ

RD RR4F987TF 257 0 0
GGGTATCGGTGAGTGAAGCTATCCCAAATGTTAAGTCCACGACCTACGCTACCTTCAATC
TGGTAAGCAGAAGATGCAGCGCCGAAGATGAAGTCTTTTTCGAAACTGCCACTGTTGAAT
TTATCAGTATGACCACATTCTGACACACTCTCTTCGCAAGTAGGTTCTTCATCAGCTTTG
CAAGTCGCCACAGCTAGTAGAAAAACTAATATGAGCCCAATGTGCTTCATGATTAATTTG
TAGATGTATGTGTTATC

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR4F987JQ 162 0 0
TTTTTCGAAACTGCCACTGTTGAATTTATCAGTATGACCACATTCTGACACACTCTCTTC
GCAAGTAGGTTCTTCATCAGCTTTGCAAGTCGCCACAGCTAGTAAAAAAACTAATATGAA
CCCAATGTGCTTCATGATTAATTTGTAGATGTATGTGTTATC

QA 1 162 1 162
DS 



AS 1 2

CO CL7742Contig1 1037 2 10 U
TTTTTTTTTCAATGGAAGGTCATGGACACTCGCGGAGGAGAAGGGGAGATGGTTGCATAG
TCGTCCAGTGTTACACGCCTAGGAGGGTCGTGTCTCGGTTGCTTTCTGGCCTCAGAAGTT
CCAAGGGGAAGAGAGAGGCAGGGGAGGTACAAGATGAAGCAGATAAGGGAGGGAACCATT
TGGCACGGTGTTCAACGAAACGCATCAACGATAGTGGGCTGTTGGATAGAAAGCCAGAAA
CCAATAGATTTGAACCACAAAGCAGAGAAGCACCTTTGGAAATGGGGATAGGCTCATTCT
TGCTGCATCTTGCCGTTGCAAGTAAAACTGAGCTAGACAAAATGGCAAACCTGAGAATGC
AAATGGAGATGCTCCTTCTAAGCGCAAAAGAAGAGTTGCAGAAGAATGATGCATATGCAA
AAGAGGCAGCAAGGGGTGGTAACCAGTTCTCTCCTCAAGTCATTTCGAATTTGGCATCAT
CTATTTTCGAAGGGTCATCGACAAGTGTTCTTCAAGAGGAGAACTCTGAATGCGAGGTCT
CAAAACCAGAGGATAGACATACAAAGCATCAGATTCAAAGGCAACACAAACTTAAAGACA
AGGAGAATCATGTACCAGAGGTGGTGACAGATGAAAGATATGGAGTATGTCCTTACGAAC
TTGAGAAGAAGCTGCATGAAATACTAGAGACAAGGCAGCAAGAAGAGTTACTGAAGCTTG
AAAATGCTCTGAGTCGCGTTGAGCGCAGACTAGAGGAGAAAGAAACCGAGGTTTCATGGT
GGAAAGACGCAGCCCGCCTGCTTGCTCAGCGTGTTCCTGAATCTTCTCGAGCTGGACTAG
AATGGTGCAACAACCCGGAATCTGCTTCCGTAACATGTTCGGAAGACTTCGGTCCAGTTT
CACCTAGATGATCTTGTATAAGAGAAAGTGTCTATAGCTATGCTGTTACAAGAGCTTGTA
TGATGAGTTCTTTAGTGTTTGTGTGAAGTTTGCTTTTGAGTTACACTAGCTGTCCTTGTC
TCGTACATGGCGTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D393TF U 1
AF RR4D393JQ C 206
BS 1 694 RR4D393TF
BS 695 695 RR4D393JQ
BS 696 723 RR4D393TF
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BS 725 773 RR4D393TF
BS 774 774 RR4D393JQ
BS 775 820 RR4D393TF
BS 821 821 RR4D393JQ
BS 822 836 RR4D393TF
BS 837 1037 RR4D393JQ

RD RR4D393TF 836 0 0
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CCAAGGGGAAGAGAGAGGCAGGGGAGGTACAAGATGAAGCAGATAAGGGAGGGAACCATT
TGGCACGGTGTTCAACGAAACGCATCAACGATAGTGGGCTGTTGGATAGAAAGCCAGAAA
CCAATAGATTTGAACCACAAAGCAGAGAAGCACCTTTGGAAATGGGGATAGGCTCATTCT
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AAATGGAGATGCTCCTTCTAAGCGCAAAAGAAGAGTTGCAGAAGAATGATGCATATGCAA
AAGAGGCAGCAAGGGGTGGTAACCAGTTCTCTCCTCAAGTCATTTCGAATTTGGCATCAT
CTATTTTCGAAGGGTCATCGACAAGTGTTCTTCAAGAGGAGAACTCTGAATGCGAGGTCT
CAAAACCAGAGGATAGACATACAAAGCATCAGATTCAAAGGCAACACAAACTTAAAGACA
AGGAGAATCATGTACCAGAGGTGGTGACAGATGAAAGATATGGAGTATGTCCTTACGAAC
TTGAGAAGAAGCTGCATGAAATACTAGAGACAAG*CAGCAAGAAGAGTTACTGAAGCTTG
AAA*TGCTCTGAGTCGCGTTGAGCGCAGACTAGAGGAGAAAGAAACCGAGGTT*CATGGT
GGAAAGACGCAGCCCGCCTGCTTGCTCAGCGTGTTCCTGA*TCTTCTCGAGCTGGA

QA 1 836 1 836
DS 

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AGAAGCAC*TTTGGAAATGGGGATAGGCTCATTCTTGCTGCATCTTGCCGTTGCAAGTAA
AACTGAGCTAGACAAAATGGCAAACCTGAGAATGCAAATGGAGATGCTCCTTCTAAGCGC
AAAAGAAGAGTTGCAGAAGAATGATGCATATGCAAAAGAGGCAGCAAGGGGTGGTAACCA
GTTCTCTCCTCAAGTCATTTCGAATTTGGCATCATCTATTTTCGAAGGGTCATCGACAAG
TGTTCTTCAAGAGGAGAACTCTGAATGCGAGGTCTCAAAACCAGAGGATAGACATACAAA
GCATCAGATTCAAAGGCAACACAAACTTAAAGACAAGGAGAATCATGTACCAGAGGTGGT
GACAGATGAAAGATATGGAGTATGTCCTTACGAACTTGAGAAGAAGCTGCATGAAATACT
AGAGACAAGGCAGCAAGAAGAGTTACTGAAGCTTGAAAATGCTCTGAGTCGCGTTGAGCG
CAGACTAGAGGAGAAAGAAACCGAGGTTTCATGGTGGAAAGACGCAGCCCGCCTGCTTGC
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AAGTGTCTATAGCTATGCTGTTACAAGAGCTTGTATGATGAGTTCTTTAGTGTTTGTGTG
AAGTTTGCTTTTGAGTTACACTAGCTGTCCTTGTCTCGTACATGGCGTAGAT

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DU62JQ C 1
AF RR4DU62TF U 1
BS 1 646 RR4DU62TF

RD RR4DU62JQ 646 0 0
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TGGGGCTTTGTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCGAAAGCCTCCTGAGATGATCTCCGGA
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QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DU62TF 646 0 0
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AACATGACCTCAGCCATGTGCATTTACTCTGCATTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTC
CAACCACGCAACTATTTACTACTTGCCTGCCATGCTTCCAACGAGACTGTTCAGCTCTAT
CAGCTCTCCCGCTGGGCTAGAGCTCAGGGGTATCTATCCTCGACGAAACAAGAGGAGAAA
CCGGCTCAGTAAACTGTCACAAGGAAAGGTTTCTTCAACGCCTCTGCTTGCTTCGGGTGA
TCAACGAAACGGATCATCTGCATATCTCTTCTGGGGAATTAATAAATTCTGAAACCATCT
GTTTGCTTTTACTTTGAAACATATTTGTGTTGTGTCCCACCCAAGCTATGATTTACTTGT
TGGATCCTTCATTAACATCTCTCCTTTTTAATAAAATTGGGGATCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7744Contig1 1375 2 2 U
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AAAGCAAACAGATATTTACCACTGTTTTTTCCCGATCGATCTTTTCAAACTATTTCTTTT
TAATCGGAAAAAAGGATTCAGTGAGATTTTATTTTCTTGGTAAGCTGCCTTGACCTGTTA
CATTGTTGCTTATCCTCTGTCACTTGATTGATTTGATTTTTGACAGAATCGATTCGTCAC
TCGTCTCTCTTATTTTTTCTTTGGGGGAATAAAATCGCATAATAAATGTCCAAAAGATTT
CTCTAGTGTCCCATTTCTAAGCATTCAAACAGATTTTTCTTAAATCTTTCCAGGAAAATT
TTAACGCTTCTTCTTCATTTCAAAAGCTTCCTTGTATTTATTGTTTCCTAACTTTTTTAC
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TCATCATCATCAATTGGTTTTGTCCTTTTATTCACATTTATTACGGTTGCTAATGTTGTG
CAGCCATTGATGGTCTATATGTAGGCTTAGACACAGAACAAACCCCACTCGTGCCTGGCT
ATCAATATAGACTGAACCTTAAAGAGGAAATAAAAGCAGCAGCGCTCTCTTATCAAACAC
GCAGATATCGAAACAAAAGGTGAGTAAATCTCTTACTAAACCCCCCGTTCAAATCAAAAT
TCAATGTCTATAATAATGGCTTTTTAGTTATTGTTGCCTTTGCTATTCATAATAAAGAAA
AAAATCATTCTTCGTAATTCGTGATCGTTGCATTATTTTGTTTTTGTATTCTGAATAGTA
CATATTCATATCTGTAGCTTTCATCTCTCGACACGCTTTAGATTGGTCCATCATCACACA
CAACCCTAAAATAGAAACCAAACTCTTTTTCTTTATACAAACACGTGACTGTCAAGATTC
CATTCTATTGTTTAATACATTCAATATATTTCCTTTTCCAGTTATTCTATTAATGTTCGT
ATTTTTTGGTCTTGAATGGTGTTTTACACACGGAGGAATCTGAACATATTATTTGACTCT
TTGTTAATTTAGTTGTTTTGTTTTTATCTTTAATGTCAGGACTTTCGGCTACTGC


BQ
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AF RR4A804TF U 1
AF RR4A804JQ C 676
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BS 757 1375 RR4A804JQ

RD RR4A804TF 756 0 0
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TGTGAAGATTTGTATATTGAGAATCTGATTCTGTTTCGCTACGAAGCAGACATTTCAGGT
CATTACGAGTCGTTTTGAGAAATCCTGTTTTGTTTTTTTTTCTTTTGTCCCGGGAAAAGA
GAAACAGAGAGATTCTTTGCTTGTTTCTTTTGTACTTTCGCTTCTGTAGAAACGATTGAG
AAAGCAAACAGATATTTACCACTGTTTTTTCCCGATCGATCTTTTCAAACTATTTCTTTT
TAATCGGAAAAAAGGATTCAGTGAGATTTTATTTTCTTGGTAAGCTGCCTTGACCTGTTA
CATTGTTGCTTATCCTCTGTCACTTGATTGATTTGATTTTTGACAGAATCGATTCGTCAC
TCGTCTCTCTTATTTTTTCTTTGGGGGAATAAAATCGCATAATAAATGTCCAAAAGATTT
CTCTAGTGTCCCATTTCTAAGCATTCAAACAGATTTTTCTTAAATCTTTCCAGGAAAATT
TTAACGCTTCTTCTTCATTTCAAAAGCTTCCTTGTATTTATTGTTTCCTAACTTTTTTAC
TTTAAAGAAAGTAAGAAGATGAATACGCAGAGTTTTACCCTTCACATTGAAAAGCTAAAT
TCATCATCATCAATTGGTTTTGTCCTTTTATTCACA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4A804JQ 700 0 0
AG
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TTTTGTCCTTTTATTCACATTTATTACGGTTGCTAATGTTGTGCAGCCATTGATGGTCTA
TATGTAGGCTTAGACACAGAACAAACCCCACTCGTGCCTGGCTATCAATATAGACTGAAC
CTTAAAGAGGAAATAAAAGCAGCAGCGCTCTCTTATCAAACACGCAGATATCGAAACAAA
AGGTGAGTAAATCTCTTACTAAACCCCCCGTTCAAATCAAAATTCAATGTCTATAATAAT
GGCTTTTTAGTTATTGTTGCCTTTGCTATTCATAATAAAGAAAAAAATCATTCTTCGTAA
TTCGTGATCGTTGCATTATTTTGTTTTTGTATTCTGAATAGTACATATTCATATCTGTAG
CTTTCATCTCTCGACACGCTTTAGATTGGTCCATCATCACACACAACCCTAAAATAGAAA
CCAAACTCTTTTTCTTTATACAAACACGTGACTGTCAAGATTCCATTCTATTGTTTAATA
CATTCAATATATTTCCTTTTCCAGTTATTCTATTAATGTTCGTATTTTTTGGTCTTGAAT
GGTGTTTTACACACGGAGGAATCTGAACATATTATTTGACTCTTTGTTAATTTAGTTGTT
TTGTTTTTATCTTTAATGTCAGGACTTTCGGCTACTGC

QA 3 700 3 700
DS 



AS 1 2

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CGAGACTCTTCTGCTCCTGTTTTCGATAAGCCAGCTCCCAGTAGCAAATCACCTGAGCAA
GCTGTCTTCACCAAACCAGTCTATGACCACCAACAAACGGATCAGTTGCTGCCTCGTGCT
CCCCCACCAATGTCTGTTAGAACCAACCAGAGGCAACAGCATAGTAATGTTCCTCAACGA
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CTGAATCCAACCTCCTCAGCTGCTACACCACCACCGAAGAAAGATGACAAACCAGAGGAT
ATCCTTTTCAAGGACTTGGTTGACTTTGCAAGAACCAGGAAGTCGTCGTCCTCTTCCTCC
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AATAACTAACTACTCATACAATTTTTTCTTAATTTGTGTCCTTGTTTTCTTTTATTGAAC
ATGGATGATTAAAAGCTTGAATATATAGAGATCT


BQ
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AF RR4FG71TF U 1
AF RR4FG71JQ C 83
BS 1 694 RR4FG71TF

RD RR4FG71TF 694 0 0
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CTTCCTCAGTGGGATGTCTACACACCTCAAGGAACCTCAAGTACTTCCCATTCATCAGAT
CGAGACTCTTCTGCTCCTGTTTTCGATAAGCCAGCTCCCAGTAGCAAATCACCTGAGCAA
GCTGTCTTCACCAAACCAGTCTATGACCACCAACAAACGGATCAGTTGCTGCCTCGTGCT
CCCCCACCAATGTCTGTTAGAACCAACCAGAGGCAACAGCATAGTAATGTTCCTCAACGA
TCAAGCAGTGGCTCTGAGTCCTCTTACGATGATCTCTTGGGACAATCAAGGAATCTTTCT
CTGAATCCAACCTCCTCAGCTGCTACACCACCACCGAAGAAAGATGACAAACCAGAGGAT
ATCCTTTTCAAGGACTTGGTTGACTTTGCAAGAACCAGGAAGTCGTCGTCCTCTTCCTCC
AAACCCAACAATTAGAACAACACACCCTTTTGAGACAGAGCTGCTGGTTGTTGCTTTAGT
AATAACTAACTACTCATACAATTTTTTCTTAATTTGTGTCCTTGTTTTCTTTTATTGAAC
ATGGATGATTAAAAGCTTGAATATATAGAGATCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4FG71JQ 612 0 0
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TCGATAAGCCAGCTCCCAGTAGCAAATCACCTGAGCAAGCTGTCTTCACCAAACCAGTCT
ATGACCACCAACAAACGGATCAGTTGCTGCCTCGTGCTCCCCCACCAATGTCTGTTAGAA
CCAACCAGAGGCAACAGCATAGTAATGTTCCTCAACGATCAAGCAGTGGCTTTGAGTCCT
CTTACGATGATCTCTTGGGACAATCAAGGAATCTTTCTTTGAATCCAACCTCCTCAGCTG
CTACACCACCACCGAAGAAAGATGACAAACCAGAGGATATCCTTTTCAAGGACTTGGTTG
ACTTTGCAAGAACCAGGAAGTCGTCGTCCTCTTCCTCCAAACCCAACAATTAGAACAACA
CACCCTTTTGAGACAGAGCTGCTGGTTGTTGCTTTAGTAATAACTAACTACTCATACAAT
TTTTTCTTAATTTGTGTCCTTGTTTTCTTTTATTGAACATGGATGATTAAAAGCTTGAAT
ATATAGAGATCT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL7746Contig1 942 2 4 U
GGACGCATAATATTAACACACTAATCTCTCCGGCGAGATCTCGAGACGTATCACAGATCC
GTCAGGCTAGTTTGATCTCTCGAGGAAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACTGGCCAAGTA
TAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGTTGGGAAGACGAGTATCATCACTCGATTCAT
GTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTTTGTCAAAGAC
AATGTACCTCGAAGATCGAACTGTTAGACTGCAGTTGTGGGATACGGCAGGGCAAGAGAG
ATTCAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATTAGGGATTCTTCTGTCGCTGTTATTGTCTATGA
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GCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTTGTGGGAAATAAAACCGACCTTGTCGACAAAAG
GCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTTATCGA
AACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATAAAGGCGCTTTTCCGCAAGATCGCAGCAGCTTT
GCCCGGAATGGAAACACTGTTTTCGACAAAGCAAGAGGATATGGTTGATGTTAATCTTAA
GTCTTCCAACGCCAATGCATCTTTGGCTCAGCAGCAATCAGGAGGATGTTCTTGTTAAAA
TTTGCAACAACCACAGCAAATTGATAGAGACGATAAGAAAAAACACAGATATAAAGTCCT
CGAGCCTTTTTTTCCATCAGATTGTTTTAGTTTATGGTCTTTGGATTTTCAAATGCTCTC
TGCTTCAGTACTTTTTGTTAGTTTTTAACAACTTTTCCCAAAACTGTGATTTGTCGATTT
TATAACTGTAATCTTTATAAACTAGACAGACGCTTCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ46TF U 1
AF RR4CZ46JQ C 233
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BS 412 412 RR4CZ46JQ
BS 413 424 RR4CZ46TF
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RD RR4CZ46TF 424 0 0
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GTCAGGCTAGTTTGATCTCTCGAGGAAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACTGGCCAAGTA
TAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGTTGGGAAGACGAGTATCATCACTCGATTCAT
GTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTTTGTCAAAGAC
AATGTACCTCGAAGATCGAACTGTTAGACTGCAGTTGTGGGATACGGCAGGGCAAGAGAG
ATTCAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATTAGGGATTCTTCTGTCGCTGTTATTGTCTATGA
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GCGT

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR4CZ46JQ 710 0 0
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CAAGAGAGATTCAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATTAGGGATTCTTCTGTCGCTGTTATT
GTCTATGATGTTGCTAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTT
AGGACAGAGCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTTGTGGGAAATAAAACCGACCTTGTC
GACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATG
TTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATAAAGGCGCTTTTCCGCAAGATCGCA
GCAGCTTTGCCCGGAATGGAAACACTGTTTTCGACAAAGCAAGAGGATATGGTTGATGTT
AATCTTAAGTCTTCCAACGCCAATGCATCTTTGGCTCAGCAGCAATCAGGAGGATGTTCT
TGTTAAAATTTGCAACAACCACAGCAAATTGATAGAGACGATAAGAAAAAACACAGATAT
AAAGTCCTCGAGCCTTTTTTTCCATCAGATTGTTTTAGTTTATGGTCTTTGGATTTTCAA
ATGCTCTCTGCTTCAGTACTTTTTGTTAGTTTTTAACAACTTTTCCCAAAACTGTGATTT
GTCGATTTTATAACTGTAATCTTTATAAACTAGACAGACGCTTCTTGTTT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL7747Contig1 672 2 2 U
TTTCTTTTAAAACAGAAAGATACATCACATAAAGTTGAAAATAACATGTTTTGTCTGATT
TTACAACAGCATGGTGGGTTCAGATCTTATTGATTGTTGTTACAGAAAGACTTGATGCGA
AACTATAAGTGGACCTTTTTATAACTCATCTCGTGAACCACTCTTGCTTTCATATGATGC
ATAAGCTTTGATAATTGAAACATACACGTCAATCCCCTTCAAATACTCAGCTCTACCCAA
ATACTTATTGTGGTCATGAAGCAAACTAGGGGTGTTTGAAATGGGAGAGAAGCCAAACGC
GGGAACGCCAGCCATCCGGAAGTAGCGAGCATCTGTTGATGCAGGGAAAATCTCAGGCTT
ACTAGTTTTACCTCCAGCTTCCTTGACAGCATTTTCCAAGAGCCTCCACCAAGGATTTGA
ATCATCTGCTGCTGTAAGTAGCGGTTCCCCCGAATGCTTCTGCTTGAACTCAAAGGACAT
GTTGCGTGCGGCGGGAGCCCATTCCTCCACCAAACGTCTTTCAAGTGATTCAGAATCAAA
GGTGGGAGGGATACGAATGTCGAAACCAGCTTCAGCCTCAGAAGGTTGCAGATTCATCAC
GAAACCAGTTGGGGAGGGTGTGCCAGCCTTGAGGAAGGCCATGTTGACGGAGACGACATC
GCCTTCAGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CV55TF C 1
AF RR4CV55JQ U 23
BS 1 22 RR4CV55TF
BS 23 672 RR4CV55JQ

RD RR4CV55TF 672 0 0
TTTCTTTTAAAACAGAAAGATACATCACATAAAGTTGAAAATAACATGTTTTGTCTGATT
TTACAACAGCATGGTGGGTTCAGATCTTATTGATTGTTGTTACAGAAAGACTTGATGCGA
AACTATAAGTGGACCTTTTTATAACTCATCTCGTGAACCACTCTTGCTTTCATATGATGC
ATAAGCTTTGATAATTGAAACATACACGTCAATCCCCTTCAGATACTCAGCTCTACCCAA
ATACTTATTGTGGTCATGAAGCAAACTAGGGGTGTTTGAAATGGGAGAGAAGCCAAACGC
GGGAACGCCAGCCATCCGGAAGTAGCGAGCATCTGTTGATGCAGGGAAAATCTCAGGCTT
ACTAGTTTTACCTCCAGCTTCCTTGACAGCATTTTCCAAGAGCCTCCACCAAGGATTTGA
ATCATCTGCTGCTGTAAGTAGCGGTTCCCCCGAATGCTTCTGCTTGAACTCAAAGGACAT
GTTGCGTGCGGCGGGAGCCCATTCCTCCACCAAACGTCTTTCAAGTGATTCAGAATCAAA
GGTGGGAGGGATACGAATGTCGAAACCAGCTTCAGCCTCAGAAGGTTGCAGATTCATCAC
GAAACCAGTTGGGGAGGGTGTGCCAGCCTTGAGGAAGGCCATGTTGACGGAGACGACATC
GCCTTCAGCAGC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4CV55JQ 650 0 0
CATCACATAAAGTTGAAAATAACATGTTTTGTCTGATTTTACAACAGCATGGTGGGTTCA
GATCTTATTGATTGTTGTTACAGAAAGACTTGATGCGAAACTATAAGTGGACCTTTTTAT
AACTCATCTCGTGAACCACTCTTGCTTTCATATGATGCATAAGCTTTGATAATTGAAACA
TACACGTCAATCCCCTTCAAATACTCAGCTCTACCCAAATACTTATTGTGGTCATGAAGC
AAACTAGGGGTGTTTGAAATGGGAGAGAAGCCAAACGCGGGAACGCCAGCCATCCGGAAG
TAGCGAGCATCTGTTGATGCAGGGAAAATCTCAGGCTTACTAGTTTTACCTCCAGCTTCC
TTGACAGCATTTTCCAAGAGCCTCCACCAAGGATTTGAATCATCTGCTGCTGTAAGTAGC
GGTTCCCCCGAATGCTTCTGCTTGAACTCAAAGGACATGTTGCGTGCGGCGGGAGCCCAT
TCCTCCACCAAACGTCTTTCAAGTGATTCAGAATCAAAGGTGGGAGGGATACGAATGTCG
AAACCAGCTTCAGCCTCAGAAGGTTGCAGATTCATCACGAAACCAGTTGGGGAGGGTGTG
CCAGCCTTGAGGAAGGCCATGTTGACGGAGACGACATCGCCTTCAGCAGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7748Contig1 940 2 6 U
GGGTGCCTCTATTCACCTTTGAATATATATATAAATATAACCGAAGATCTCTCTTCACAC
ACATATACACATTCCATGGAAACTCTTTTTCTTGTAGCTAGTCTCCTAATTCTGGCTCTC
TCCTCTTCCTCTTTCACACGAGGGCAAAGAATCGTACAGATTCCACCACCGCGTCCATTA
TGCGCCTCTCAATACGCGCTGGCTAACTACGCCTGCTCTCGTCTCCCTATGAACACCGTC
CCACCTCCTTCCCCCATTGCCCCACCTCCTCCTCCCATCTTTCCTCCTCCTCCTGACCAT
GACCATGACCATGATGATGACCACGCGATGATGATGATGATGATGATGACCACGACGATG
ATGATGACCACCATGATCACGACCATGACCACCATGATCACGACCATGACAATGATCACC
ATGACCATGACGACAATGACCACGACCATGATCACGATGACCATGACCATCATCGCAACC
GCGACCATGACCATGATCATGATCATAACCGCGACCACGACCATGATCACAACAACCATG
GTCATGATCACAACAACCATGATCATGATCACGATGACGATGACCATGAACACCACAACA
ATAACGACAACAGCCACAGACGCCACCATCGGCGCCGACACCACCACCATCATCATCACA
GACACAGAGAGGAGACGTATGCAGAGCAAGAGTGCTGCAAGTGGTTGAAGCAAATGGACA
ACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTAGGCTGCCGCCATTGCTAGCGAAACCTGCTCATA
ACTATACAGTCTTTGTGGATGAGTCCTGCATTGTCACTTTCACCTGTGGAGGCAGACTCA
TTCACTGATCATACACTTTCACTCTCATTGTTTTTTTTTTCTTCAAATATCCTTTTGTTT
ACGTCTTTTCTTTAGCTGTAATACAAACAAAAATTCCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B923TF U 1
AF RR4B923JQ C 252
BS 1 811 RR4B923TF
BS 812 812 RR4B923JQ
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BS 825 868 RR4B923TF
BS 869 940 RR4B923JQ

RD RR4B923TF 870 0 0
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ACATATACACATTCCATGGAAACTCTTTTTCTTGTAGCTAGTCTCCTAATTCTGGCTCTC
TCCTCTTCCTCTTTCACACGAGGGCAAAGAATCGTACAGATTCCACCACCGCGTCCATTA
TGCGCCTCTCAATACGCGCTGGCTAACTACGCCTGCTCTCGTCTCCCTATGAACACCGTC
CCACCTCCTTCCCCCATTGCCCCACCTCCTCCTCCCATCTTTCCTCCTCCTCCTGACCAT
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ATGATGACCACCATGATCACGACCATGACCACCATGATCACGACCATGACAATGATCACC
ATGACCATGACGACAATGACCACGACCATGATCACGATGACCATGACCATCATCGCAACC
GCGACCATGACCATGATCATGATCATAACCGCGACCACGACCATGATCACAACAACCATG
GTCATGATCACAACAACCATGATCATGATCACGATGACGATGACCATGAACACCACAACA
ATAACGACAACAGCCACAGACGCCACCATCGGCGCCGACACCACCACCATCATCATCACA
GACACAGAGAGGAGACGTATGCAGAGCAAGAGTGCTGCAAGTGGTTGAAGCAAATGGACA
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GT

QA 1 868 1 868
DS 

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CATGATCACGACCATGACCACCATGATCACGACCATGACAATGATCACCATGACCATGAC
GACAATGACCACGACCATGATCACGATGACCATGACCATCATCGCAACCGCGACCATGAC
CATGATCATGATCATAACCGCGACCACGACCATGATCACAACAACCATGGTCATGATCAC
AACAACCATGATCATGATCACGATGACGATGACCATGAACACCACAACAATAACGACAAC
AGCCACAGACGCCACCATTGGCGCCGACACCACCACCATCATCATCACAGACACAGAGAG
GAGACGTATGCAGAGCAAGAGTGCTGCAAGTGGTTGAAGCAAATGGACAACGAGTGCGTG
TGCGACCTTCTGGTTAGGCTGCCGCCATTGCTAGCGAAACCTGCTCATAACTATACAGTC
TTTGTGGATGAGTCCTGCATTGTCACTTTCACCTGTGGAGGCAGACTCATTCACTGATCA
TACACTTTCACTCTCATTGTTTTTTTTTTCTTCAAATATCCTTTTGTTTACGTCTTTTCT
TTAGCTGTAATACAAACAAAAATTCCTTG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL7749Contig1 609 2 1 U
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TGATGATATAACCTCAGCGTTTCTTCAAACAATCGAAACGTTATTGCCAGTGCAACCACT
AGACTCGCTTCTTCGGACTCACACCTTAACCGGGTTTCACAATACAGGCGGAGCGACTCA
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TGATGACTTTACTTTGCTCGGAGAAGTATGCCTATGAATAAATGCACGACCATAATGCCT
GATGAGTGTTGTCTTAACTTCTGAATATTATTTCTCAAAAAAAACTTTTAATATTACAAA
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CATATCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F184JQ C 1
AF RR4F184TF U 1
BS 1 609 RR4F184TF

RD RR4F184JQ 609 0 0
GGAGAGCCAAGACTCACCTTCCTCGTCTCATCTCCACGGCAAAAATATGCACAAAAATCC
AGAGCTTCATGAGGCTAATGAACTCCAGGAGATCCAACTCCTTCTCGACCTTGACGACTT
TGATGATATAACCTCAGCGTTTCTTCAAACAATCGAAACGTTATTGCCAGTGCAACCACT
AGACTCGCTTCTTCGGACTCACACCTTAACCGGGTTTCACAATACAGGCGGAGCGACTCA
AGAGGCAACCGAACTGCAACCATTTGATCATTCTCAACCGGAAATTCCTTGCGGATTTGA
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TGATGACTTTACTTTGCTCGGAGAAGTATGCCTATGAATAAATGCACGACCATAATGCCT
GATGAGTGTTGTCTTAACTTCTGAATATTATTTCTCAAAAAAAACTTTTAATATTACAAA
TATCACCTGTATTTATAAACCTTTTTTTTT*GAGAAAAGAATATATAAACCTATATGCAT
CATATCTTC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR4F184TF 609 0 0
GGAGAGCCAAGACTCACCTTCCTCGTCTCATCTCCACGGCAAAAATATGCACAAAAATCC
AGAGCTTCATGAGGCTAATGAACTCCAGGAGATCCAACTCCTTCTCGACCTTGACGACTT
TGATGATATAACCTCAGCGTTTCTTCAAACAATCGAAACGTTATTGCCAGTGCAACCACT
AGACTCGCTTCTTCGGACTCACACCTTAACCGGGTTTCACAATACAGGCGGAGCGACTCA
AGAGGCAACCGAACTGCAACCATTTGATCATTCTCAACCGGAAATTCCTTGCGGATTTGA
AGAAACAAACGGAGAATTTGATTTGTTGTCGCAGCTGGTTGAATCAAACTCGCCTACGCC
TAGTCCTACTAGTGAGGAGTTCAACGAGTGGCTCAGCTTTATGGACAACCAAACTTACTT
TGATGACTTTACTTTGCTCGGAGAAGTATGCCTATGAATAAATGCACGACCATAATGCCT
GATGAGTGTTGTCTTAACTTCTGAATATTATTTCTCAAAAAAAACTTTTAATATTACAAA
TATCACCTGTATTTATAAACCTTTTTTTTTTGAGAAAAGAATATATAAACCTATATGCAT
CATATCTTC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL7750Contig1 741 2 2 U
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GCAAAGTCCATAAGTCGAACTCCAAAGTTAATAGAAAGGAAAAAGTAGAGTTGATTAGTT
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TATTTTGCTTATCTGTGATCACATGCATGTTCGCTTCTCTACCCCCACTTTCTTTCTATT
TCTCTTCTCACTCCTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTCAACTGTTACTGATATATATT
GGCAAATAATAGCGCTATAGCCTTTAGCATTATTAGCCATCAGACAAATCATTGGTTGAT
GAATTTGAATTTAACTAAAACAGATTTTGCGTAGCTGTACTCAGTTGGTACATGCAATCA
ATGAGAAGACATTTGCAACGAAGCGTATCCATTTTTATGGAGTAAGTGAATCATCTGTTT
AGCTGTACTCAGTTGGGTACGTACATGCGAGATTAGAAGACAAAAAAAAAAGGATTTTGC
AACAAAACGGATCCGTTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR24TF U 1
AF RR4DR24JQ C 83
BS 1 694 RR4DR24TF
BS 695 741 RR4DR24JQ

RD RR4DR24TF 694 0 0
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GCCCGACCATATAAAATTTACTTCCGACCGTTGGAGAAAGAAAGAAAGGGAAAGATTTGT
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TATTTTGCTTATCTGTGATCACATGCATGTTCGCTTCTCTACCCCCACTTTCTTTCTATT
TCTCTTCTCACTCCTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTCAACTGTTACTGATATATATT
GGCAAATAATAGCGCTATAGCCTTTAGCATTATTAGCCATCAGACAAATCATTGGTTGAT
GAATTTGAATTTAACTAAAACAGATTTTGCGTAGCTGTACTCAGTTGGTACATGCAATCA
ATGAGAAGACATTTGCAACGAAGCGTATCCATTTTTATGGAGTAAGTGAATCATCTGTTT
AGCTGTACTCAGTTGGGTACGTACATGCGAGATT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4DR24JQ 659 0 0
TCCGACCGTTGGAGAAAGAAAGAAAGGGAAAGATTTGTGTGGAAGGAAGGTGACTGCTTT
ATGAAAAAAGGCACAGTCGTATGGACCATTGTGTCAGGCCTCGACTATGTATTTATTATC
TGTACTAACGACAAAATAAATATCATTTGTTCTTTTATGCAAAGTCCATAAGTCGAACTC
CAAAGTTAATAGAAAGGAAAAAGTAGAGTTGATTAGTTCCCTATTTACGGCGGTAGACAT
ATGGAAGTAGTATGTAAAGATTGAACAGTTCAGAAATGTATTTTGCTTATCTGTGATCAC
ATGCATGTTCGCTTCTCTACCCCCACTTTCTTTCTATTTCTCTTCTCACTCCTTTTCTGT
TTTGTTTGTTTGTTTGTCAACTGTTACTGATATATATTGGCAAATAATAGCGCTATAGCC
TTTAGCATTATTAGCCATCAGACAAATCATTGGTTGATGAATTTGAATTTAACTAAAACA
GATTTTGGGTAGCTGTACTCAGTTGGTACATGCAATCAATGAGAAGACATTTGCAACGAA
GCGTATCCATTTTTATGGAGTAAGTGAATCATCTGTTTAGCTGTACTCAGTTGGGTACGT
ACATGCGAGATTAGAAGACAAAAAAAAAAGGATTTTGCAACAAAACGGATCCGTTAGTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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AACTCTACAGTCTCGTGCTTAAAGTGGACCTACTCTTCCGGATTAGTGTCTGATGTATTA
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CACATATAGCTTGTGTTCTCTATATTGTATTAATTTACCTGAATGTGGATCTAAATCTTG
AATCACAAGAAACTTGTAGATTATATTTGATTTTGTCACCTTAATGTCTGAACTCGTCTA
GCTGGAACCATAGTTTACTGTTCAGAACAGCATTTAGATTATTATTTCTTTGTTCATATT
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CACACGAACAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FL63JQ C 1
AF RR4FL63TF U 1
BS 1 645 RR4FL63TF

RD RR4FL63JQ 645 0 0
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CACATATAGCTTGTGTTCTCTATATTGTATTAATTTACCTGAATGTGGATCTAAATCTTG
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GCTGGAACCATAGTTTACTGTTCAGAACAGCATTTAGATTATTATTTCTTTGTTCATATT
TGTCGTAGACAGCTGAATCTTGTGTTGTTGTCCTTTCTCTTCTCTCATGTGTTATCTTTA
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QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4FL63TF 645 0 0
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CACATATAGCTTGTGTTCTCTATATTGTATTAATTTACCTGAATGTGGATCTAAATCTTG
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GCTGGAACCATAGTTTACTGTTCAGAACAGCATTTAGATTATTATTTCTTTGTTCATATT
TGTCGTAGACAGCTGAATCTTGTGTTGTTGTCCTTTCTCTTCTCTCATGTGTTATCTTTA
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QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7752Contig1 613 2 2 U
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TCAAAAGACTGTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EP94TF U 1
AF RR4EV05TF U 1
BS 1 606 RR4EP94TF
BS 607 613 RR4EV05TF

RD RR4EP94TF 607 0 0
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TCAAAA
A

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4EV05TF 613 0 0
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CGACCAAATCTGAAGAAAGGATCTTTTAGTCCTGAGGAAGAGAAGATGATCATCGAGCTT
CATGCTAGGTTGGGAAACAAATGGGCTCGCATGGCTTCTCAGTTGCCTGGACGAACAGAC
AACGAGATCAAAAACTATTGGAACACAAGGATGAAGAGAAGACAACGAGATGGTTTGCCT
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ACTAATTCTTCTAATACTCCATCATCCTCGTCCTCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCAACCT
TCAAAAGACTGTG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7754Contig1 1011 2 2 U
GCTTGAGATTCGATTCGGTGGACTCCGACTCTTGAGCAATTGTCAAAAGCTTTTCCCCTT
CCTTCCTTCAACTTTTCCAACGATCCCAAAGTCGAAATCGAAAGAAAGAGACAGAGAGAG
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TAATGTTTCTCTCTCCTTGTCGAAGCAACAACCTCTGATTCTACTTTTTGATTGGAACTG
TTTCAGATCTGAAGACAGTTGTGTTGAAGTCTGTTTTTTTTTGTTTGGAGAATCGGGATT
TGGGTTAACGGAGGTCGTCTGAGAGAAGTTCAACGGAGATGCCGGAGGAGGAGTCGATAG
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CTACTGTTGATTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTGATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTG
TTCCGAAGGGGATAAACGAAGTAAAGCTGGTCAGTCCGGGTAAGATCTTGGATAACAACA
AGACTGTTAGCCAGTGTAAGACTCCATTTGGAGAGACTGCAGGGGGTGGAGTTACTGTGA
TGCATGTTGTTGTACAGCCTTCTCCAGCTAAAACCAAATCAGAGAAGAAGGTCGATAAAG
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GGTATACTTCATTCGCGTTCATTGCTTTTACTGTAATAAACGGAATTTGTATAGGTTATT
AGCTCTGAATGATTGATTACGTGTGATGAAGATAATTTAATATGTATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EB06TF U 1
AF RR4EB06JQ C 456
BS 1 641 RR4EB06TF
BS 642 1011 RR4EB06JQ

RD RR4EB06TF 641 0 0
GCTTGAGATTCGATTCGGTGGACTCCGACTCTTGAGCAATTGTCAAAAGCTTTTCCCCTT
CCTTCCTTCAACTTTTCCAACGATCCCAAAGTCGAAATCGAAAGAAAGAGACAGAGAGAG
AGCTAATGTTCTGTATTTTGATTCCCTCCCCTTCCCCTCTCCCCTTGATTGTCTTTTAAT
TAATGTTTCTCTCTCCTTGTCGAAGCAACAACCTCTGATTCTACTTTTTGATTGGAACTG
TTTCAGATCTGAAGACAGTTGTGTTGAAGTCTGTTTTTTTTTGTTTGGAGAATCGGGATT
TGGGTTAACGGAGGTCGTCTGAGAGAAGTTCAACGGAGATGCCGGAGGAGGAGTCGATAG
ATATCAAATTCAGGCTCTACGATGGCTCCGACATCGGACCCTTTCGTTATTCAGTTGCCT
CTACTGTTGATTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTGATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTG
TTCCGAAGGGGATAAACGAAGTAAAGCTGGTCAGTCCGGGTAAGATCTTGGATAACAACA
AGACTGTTAGCCAGTGTAAGACTCCATTTGGAGAGACTGCAGGGGGTGGAGTTACTGTGA
TGCATGTTGTTGTACAGCCTTCTCCAGCTAAAACCAAATCA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4EB06JQ 556 0 0
GATTGGCCCAAAGGCAAAACAGTTGTTCCGAAGGGGATAAACGAAGTAAAGCTGGTCAGT
CCGGGTAAGATCTTGGATAACAACAAGACTGTTAGCCAGTGTAAGACTCCATTTGGAGAG
ACTGCAGGTGGTGGAGTTACTGTGATGCATGTTGTTGTACAGCCTTCTCCAGCTAAAACC
AAATCAGAGAAGAAGGTCGATAAAGCACCAAAGTCAGTTATATGCACATGCACCATTTTG
TAAAGGGAGCAAGACATGTATCATACAGACCATCCTCAACTCTTCAAGGACAGAAGAAAA
CAACAACAACCAAAAAAAAAGAAAAGTAAAGCTTCCCTTTAAGCTGTGGAGTATCATAAC
CTGGAAATGCAAGCTCTGAATGTGTAGAAAATGATTAGATTCTTTTGAATCTGTTGTCCC
TTATTTGTTTTTGTTCATACAATCTGGTATACTTCATTCGCGTTCATTGCTTTTACTGTA
ATAAACGGAATTTGTATAGGTTATTAGCTCTGAATGATTGATTACGTGTGATGAAGATAA
TTTAATATGTATCTAC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL7755Contig1 844 2 2 U
GAAGGAGCTGGTCGTGGAAATTGGGGAACACCAGGAGAAGAAGTTCTTGTTGTAGAGACT
GAAGAAGTTGCTGGTGCTGAGACTGAGAAGTCTGCTGGTGATGAGGTTGCTGCTGATGCT
AAGAAGGAGAACACTGCTGAAGTGGAGGAGCAGAAAGAGCCTGAGGATAAGGAAATGACT
TTGGATGAGTATGAGAAAATACTCGAGGAAAAGAGAAAGGCCCTTCAATCTCAGACCACA
TCTGAGAGGAAAGTTGATACTAAAGTGTTTGAATCAATGCAACAACTCTCAAACAAGAAG
AAGTCTAACGATGAAATCTTCATCAAGTTGGGTTCAGATAAGGACAAACGTAAAGATGAC
AAGGAAGAGAAGGCTAAGAAGGCTGTGAGCATTAATGAGTTTCTGAAACCAGCTGAGGGT
GAGAACTACTACCGAGGAGGAGGTCGTGGTGGTCGTGGAAGGGGACGTGGTGGTCGTGAC
CGTGGAGGTGCTTCTGGTGGTGGATTTGATGGTTACCGTATTGAAGCTGCGCCTTCCATT
GGAGATACTGCTCAGTTCCCATCTCTTGGGGGCAAGTAAGAACCATCCATGGAAACTCGT
GCTGTTTTCTTCAAGACTGAAGTATTCCACGCGAAAGGGTTTGGTGTTGTCAGGTGTAAA
TTGTTAGTTGTTGTCAGTTTTTACTTTTTAGAGTTTCTGCAAACTTATGCCTGACCTGTC
TTTTTTTTTTCTAAACGTTTGACATAATACCCCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTGGTTTACC
ACTTAAGTCTTTATAGTTGTTTGTTGTTTACTTATTTATGAGAAGACAGACAAGTTCTAA
TATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RR4DS39TF U 1
AF RR4DS39JQ C 39
BS 1 649 RR4DS39TF
BS 650 844 RR4DS39JQ

RD RR4DS39TF 649 0 0
GAAGGAGCTGGTCGTGGAAATTGGGGAACACCAGGAGAAGAAGTTCTTGTTGTAGAGACT
GAAGAAGTTGCTGGTGCTGAGACTGAGAAGTCTGCTGGTGATGAGGTTGCTGCTGATGCT
AAGAAGGAGAACACTGCTGAAGTGGAGGAGCAGAAAGAGCCTGAGGATAAGGAAATGACT
TTGGATGAGTATGAGAAAATACTCGAGGAAAAGAGAAAGGCCCTTCAATCTCAGACCACA
TCTGAGAGGAAAGTTGATACTAAAGTGTTTGAATCAATGCAACAACTCTCAAACAAGAAG
AAGTCTAACGATGAAATCTTCATCAAGTTGGGTTCAGATAAGGACAAACGTAAAGATGAC
AAGGAAGAGAAGGCTAAGAAGGCTGTGAGCATTAATGAGTTTCTGAAACCAGCTGAGGGT
GAGAACTACTACCGAGGAGGAGGTCGTGGTGGTCGTGGAAGGGGACGTGGTGGTCGTGAC
CGTGGAGGTGCTTCTGGTGGTGGATTTGATGGTTACCGTATTGAAGCTGCGCCTTCCATT
GGAGATACTGCTCAGTTCCCATCTCTTGGGGGCAAGTAAGAACCATCCATGGAAACTCGT
GCTGTTTTCTTCAAGACTGAAGTATTCCACGCGAAAGGGTTTGGTGTTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4DS39JQ 806 0 0
AGAAGTTCTTGTTGTAGAGACTGAAGAAGTTGCTGGTGCTGAGACTGAGAAGTCTGCTGG
TGATGAGGTTGCTGCTGATGCTAAGAAGGAGAACACTGCTGAAGTGGAGGAGCAGAAAGA
GCCTGAGGATAAGGAAATGACTTTGGATGAGTATGAGAAAATACTCGAGGAAAAGAGAAA
GGCCCTTCAATCTCAGACCACATCTGAGAGGAAAGTTGATACTAAAGTGTTTGAATCAAT
GCAACAACTCTCAAACAAGAAGAAGTCTAACGATGAAATCTTCATCAAGTTGGGTTCAGA
TAAGGACAAACGTAAAGATGACAAGGAAGAGAAGGCTAAGAAGGCTGTGAGCATTAATGA
GTTTCTGAAACCAGCTGAGGGTGAGAACTACTACCGAGGAGGAGGTCGTGGTGGTCGTGG
AAGGGGACGTGGTGGTCGTGACCGTGGAGGTGCTTCTGGTGGTGGATTTGATGGTTACCG
TATTGAAGCTGCGCCTTCCATTGGAGATACTGCTCAGTTCCCATCTCTTGGGGGCAAGTA
AGAACCATCCATGGAAACTCGTGCTGTTTTCTTCAAGACTGAAGTATTCCACGCGAA*GG
GTTTGGTGTTGTCAGGTGTAAATTGTTAGTTGTTGTCAGTTTTTACTTTTTAGAGTTTCT
GCAAACTTATGCCTGACCTGTCTTTTTTTTTTCTAAACGTTTGACATAATACCCCTTTTC
TTTTCTTTTTTTTTGGTTTACCACTTAAGTCTTTATAGTTGTTTGTTGTTTACTTATTTA
TGAGAAGACAGACAAGTTCTAATATC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL7756Contig1 974 2 4 U
ACATAACCGGTGAATCCTACGCCGGACATTACATTCCGGCATTGGCTTCAAGAGTTCACC
GTGGAAACAAGAACAAGGAAGGAACTCACATCAACCTTAAGGGATTTGCGATTGGTAACG
GTTTGACCAACCCGGAGATCCAATATGCTGCATACGCGGATTACGCGCTCGACATGAAGT
TGATCTCACAATCTGATCACGATAACCTCAACCGTGATTACGAATCTTGTCAACAATCCA
TCAAAGAATGCAGCGCTGATGGAAGTGATGAAGCTTGTGCGTCTTCTTACATTGTATGCA
ACAACATATTCCAAAAGATCATGAATATCGCTGGAAACGTAAACTACTACGACGTGAGGA
AACAATGCAAAGGAAGCTTGTGCTATGATTTCTCGAACATGGAGAAGTTCTTGAACCAGA
GATCCGTCCGCACGGCATTAGGTGTGGGAGATATCAAGTTTGTGTCATGCAGTACCGCCT
TCTATGATGCAATGCAGCTGGATTGGATGAAGAATCTTGAGGTCGGGATTCCCGCTCTGC
TCGAAGATGGAATCAAGATGCTTATCTATGCTGGAGAATACGATCTCATCTGCAATTGGC
TCGGAAACTCGAAATGGGTTCACGAGATGGAATGGTCAGGCCGGAAAGAGTTTGTAGCAG
CTGCAACGGTTCCATTCCATGTAGATAGTAAAGAAGCCGGTTTAATGAAGAACCACGGTT
CACTCACTTTCCTCAAGGTCCACGATGCTGGACACATGGTTCCAATGGATCAGCCAAAAG
CAGCATTGCAAAGCTCAGGGATTGGATGCAAGGAAAGCTCGGTACACCCACCGGTCGGAC
CGCTCGCCAGTGACTTCGTTTCTTCTCAACATCAGTGATTCTAAACACCAAGCCGATTGT
ACTGTTGTTATGTATCTTAGATCATCATTTTTAACTTATATAAGTAAACTAAATAATATA
TACACTTGTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A729TF U 1
AF RR4A729JQ C 235
BS 1 737 RR4A729TF
BS 738 738 RR4A729JQ
BS 739 796 RR4A729TF
BS 797 974 RR4A729JQ

RD RR4A729TF 796 0 0
ACATAACCGGTGAATCCTACGCCGGACATTACATTCCGGCATTGGCTTCAAGAGTTCACC
GTGGAAACAAGAACAAGGAAGGAACTCACATCAACCTTAAGGGATTTGCGATTGGTAACG
GTTTGACCAACCCGGAGATCCAATATGCTGCATACGCGGATTACGCGCTCGACATGAAGT
TGATCTCACAATCTGATCACGATAACCTCAACCGTGATTACGAATCTTGTCAACAATCCA
TCAAAGAATGCAGCGCTGATGGAAGTGATGAAGCTTGTGCGTCTTCTTACATTGTATGCA
ACAACATATTCCAAAAGATCATGAATATCGCTGGAAACGTAAACTACTACGACGTGAGGA
AACAATGCAAAGGAAGCTTGTGCTATGATTTCTCGAACATGGAGAAGTTCTTGAACCAGA
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TCTATGATGCAATGCAGCTGGATTGGATGAAGAATCTTGAGGTCGGGATTCCCGCTCTGC
TCGAAGATGGAATCAAGATGCTTATCTATGCTGGAGAATACGATCTCATCTGCAATTGGC
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CTGCAACGGTTCCATTCCATGTAGATAGTAAAGAAGCCGGTTTAATGAAGAACCACGGTT
CACTCACTTTCCTCAAG*TCCACGATGCTGGACACATGGTTCCAATGGATCAGCCAAAAG
CAGCATTGCAAAGCTC

QA 1 796 1 796
DS 

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TATGCAACAACATATTCCAAAAGATCATGAATATCGCTGGAAACGTAAACTACTACGACG
TGAGGAAACAATGCAAAGGAAGCTTGTGCTATGATTTCTCGAACATGGAGAAGTTCTTGA
ACCAGAGATCCGTCCGCACGGCATTAGGTGTGGGAGATATCAAGTTTGTGTCATGCAGTA
CCGCCTTCTATGATGCAATGCAGCTGGATTGGATGAAGAATCTTGAGGTCGGGATTCCCG
CTCTGCTCGAAGATGGAATCAAGATGCTTATCTATGCTGGAGAATACGATCTCATCTGCA
ATTGGCTCGGAAACTCGAAATGGGTTCACGAGATGGAATGGTCAGGCCGGAAAGAGTTTG
TAGCAGCTGCAACGGTTCCATTCCATGTAGATAGTAAAGAAGCCGGTTTAATGAAGAACC
ACGGTTCACTCACTTTCCTCAAGGTCCACGATGCTGGACACATGGTTCCAATGGATCAGC
CAAAAGCAGCATTGCAAAGCTCAGGGATTGGATGCAAGGAAAGCTCGGTACACCCACCGG
TCGGACCGCTCGCCAGTGACTTCGTTTCTTCTCAACATCAGTGATTCTAAACACCAAGCC
GATTGTACTGTTGTTATGTATCTTAGATCATCATTTTTAACTTATATAAGTAAACTAAAT
AATATATACACTTGTGAATC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7757Contig1 762 2 3 U
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ATGCTAAAACATATTGGTCGAAGTAAACCAATTCTTTATTTTTCAAATAAGCACACTCTA
AACCCTTATTATGTTTCAAACAGCGACGGTGAGTAACTGACCATTTCCAAGCGCTATTTA
ACAAACCAAATCACTGTCTGTTCATATCTCCCAAGCATATGTATTTGATCTCATGGTATT
CGTCCATACCGTACTTGGATCCTTCCCTTCCAAGACCAGACTGCTTCACTCCCCCGAATG
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CTGAAACACGCCACGATCGTTGCACACTGTTTGTGAATATATAAGCAGCAAGTCCTGCAA
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BQ
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AF RR4BK14JQ U 10
AF RR4BK14TF C 1
BS 1 9 RR4BK14TF
BS 10 581 RR4BK14JQ
BS 582 762 RR4BK14TF

RD RR4BK14JQ 572 0 0
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TATTACACACAAAAAAACAACTTAAGAAGCTCAAAATATTATTCAAGAACCATGCTAAAA
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TATGTTTCAAACAGCGACGGTGAGTAACTGACCATTTCCAAGCGCTATTTAACAAACCAA
ATCACTGTCTGTTCATATCTCCCAAGCATATGTATTTGATCTCATGGTATTCGTCCATAC
CGTACTTGGATCCTTCCCTTCCAAGACCAGACTGCTTCACTCCCCCGAATGGAGCCACCT
CAGTTGATATGATTCCTTCGTTCACCCCTACAAGTCCGTATTCAAGTGCTTCTGAAACAC
GCCACGATCGTTGCACACTGTTTGTGAATATATAAGCAGCAAGTCCTGCAATAGTGTCAT
TAGCGATTCTGATAGCGTCCTCCTCAGTTTTGAATCGAATAAGGGGAGCTACTCGGAAAC
GCTTCGTGCATCCATACTCATCTGGCGAGACT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4BK14TF 762 0 0
TTTTTTTTTCCAAGAACAAGACCGCTCTCTTTTTAGTATATACTACATACGAACCAAAAA
TTGTCAGAATAT*ACACACAAAAAAACAACTTAAGAAGCTCAGAATATTATTCAAGAACC
ATGCTAAAACATATTGGTCGAAGTAGACCAATTCTTTATTTT*CAAATAAGCACACTCTA
AACCCTTATTATGTTTCAAACAGCGACGGTGAGTAACTGACCATTTCCAAGCGCTATTTA
ACAAACCAAATCACTGTCTGTTCATATCTCCCAAGCATATGTATTTGATCTCATGGTATT
CGTCCATACCGTACTTGGATCCTTCCCTTCCAAGACCAGACTGCTTCACTCCCCCGAATG
GAGCCACCTCAGTTGATATGATTCCTTCGTTCACCCCTACAAGTCCGTATTCAAGTGCTT
CTGAGACACGCCACGATCGTTGCACACTGTTTGTGAATATATAAGCAGCAAGTCCTGCAA
TAGTGTCATTAGCGATTCTGATAGCGTCCTCCTCAGTTTTGAATCGAATAAGGGGAGCTA
CTCGGAAACGCTTCGTGCATCCATACTCATCTGGCGAGACTGAGAAGAGACGAGGATGGG
AGCATGTGATGAGGAGACGAGGATCCCTCGGCAACCGACGATGGCTACACGCGCTGCAGC
TCCGACTACCATTGATTTTCAATCGAACAGAGAAGACGACGACGAGGAAGAGACTAGCGA
GAAGAGATATCAAATTGTAAGCGATGATGAAAACGAGTGTCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7758Contig1 884 2 4 U
GGCCGCAACCAAACACACAAAAAAAAATCGATTCCGGTAATAAACTCCCCTCTCCCCCAA
CAGAACCTTGCTGATCTCCGCCGGGAAGATTCAGTGAAACATAACCCACCGTCTTTTGAG
ATGGTGTCGCCCGAAAACGCAAATTGGATATCGGAATTGATCGATGCAGAAGAGTATGGG
AGTTTCACAATCCAAGGTCCTGGCTTCTCCTGGCCTCTTCCCCAACCTATTCCCGCCGTT
TCCAGCCTTGGAGTTGATGGCTCAGCTGGTAATTCAGAAGCCACCAAAGAACCTGGCTCT
AAAAAGAGGACGAGATGTGAATCGTCCTCTGCCACTAGCTCCAAAGCCTGTAGAGAGAAG
CTGCGACGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTTGGAGCCTGGG
AATCCTCCCAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTTGGTTACACAA
CTTCGTGGCGAGGCACAGAAGTTGAAGGACTCTAATTCAAGTCTTCAAGACAAAATCAAG
GAGTTGAAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAAGACAGAGAAA
GAGAAGCTGGAGCAACAACTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTCTTCCCAGCC
CCACCTATGATGCCAACTGCTTTTGCTTCTGCGCAAGGCCAAGCTCCCGGAAACAAGATG
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ACCCTCAAGAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCTCGCTTCCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED69TF U 1
AF RR4ED69JQ C 125
BS 1 697 RR4ED69TF
BS 698 698 RR4ED69JQ
BS 699 735 RR4ED69TF
BS 736 884 RR4ED69JQ

RD RR4ED69TF 735 0 0
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CAGAACCTTGCTGATCTCCGCCGGGAAGATTCAGTGAAACATAACCCACCGTCTTTTGAG
ATGGTGTCGCCCGAAAACGCAAATTGGATATCGGAATTGATCGATGCAGAAGAGTATGGG
AGTTTCACAATCCAAGGTCCTGGCTTCTCCTGGCCTCTTCCCCAACCTATTCCCGCCGTT
TCCAGCCTTGGAGTTGATGGCTCAGCTGGTAATTCAGAAGCCACCAAAGAACCTGGCTCT
AAAAAGAGGACGAGATGTGAATCGTCCTCTGCCACTAGCTCCAAAGCCTGTAGAGAGAAG
CTGCGACGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTTGGAGCCTGGG
AATCCTCCCAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTTGGTTACACAA
CTTCGTGGCGAGGCACAGAAGTTGAAGGACTCTAATTCAAGTCTTCAAGACAAAATCAAG
GAGTTGAAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAAGACAGAGAAA
GAGAAGCTGGAGCAACAACTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTCTTCCCAGCC
CCACCTATGATGCCAACTGCTTTTGCTTCTGCGCAAG*CCAAGCTCCCGGAAACAAGATG
GTGCCAGTCATCAGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4ED69JQ 760 0 0
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TCACAATCCAAGGTCCTGGCTTCTCCTGGCCTCTTCCCCAACCTATTCCCGCCGTTTCCA
GCCTTGGAGTTGATGGCTCAGCTGGTAATTCAGAAGCCACCAAAGAACCTGGCTCTAAAA
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GACGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTTGGAGCCTGGGAATC
CTCCCAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTTGGTTACACAACTTC
GTGGCGAGGCACAGAAGTTGAAGGACTCTAATTCAAGTCTTCAAGACAAAATCAAGGAGT
TGAAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAAGACAGAGAAAGAGA
AGCTGGAGCAACAACTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTCTTCCCAGCCCCAC
CTATGATGCCAACTGCTTTTGCTTCTGCGCAAGGCCAAGCTCCCGGAAACAAGATGGTGC
CAGTCATCAGTTACCCAGGAGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCTCCTGCTTCAGTCGATA
CTTCTCAGGATCACGTCCTTCGTCCACCAGTTGCTTAACTGGGAGTAACAAAGAAAACCC
TCAAGAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCTCGCTTCCTCCG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7759Contig1 801 2 4 U
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TCAGGGCTGTCACTGAAAATCATTATCTGCCTCTCTTCAAACCCTTTATATTTTTAAAAA
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GTCGAGAAGGAGAATCGAGTCTTATGACTCCAAAAAACGCATCGGAGTTGTTCGTTGTTG
TTCCTCAGGCGACATTCAGCAGCAGAGAGGGAGATTATTGAGAGAAAGTGCGATTTCATT
AGCTTTATCGTTGGGTTTGATAGCTGGAGGAGTAGTCCCTTCCATTGCTTCCCCTCCCTA
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GATTCCAGAGGTGTCGGTGTTGATATCAGGACCTCCCATCAAAGACCCAGGAGCCTTGTT
AAGATATGCATTGCCTATCGACAACAAAGCCATCAGAGAAGTTCAGAAGCCTCTCGAGGA
TATCACTGACAGCCTCAAGATTTCTGGCCTCAAGGCCCTCGATTCTGTTGAACGTAATGT
GAGGCAAGCAAATAGATCACTTCAGCAAGGGAAAAGCATGATTGTGTCTGGTTTTGCTGA
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GCTTCAGATTGTGGAAGATCGGAAGAGAGATGCGGTTTCTCCTAAACAGAAAGAGATTCT
CCAATTTGTTGGCGGAATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F266TF U 1
AF RR4BA67TF U 19
BS 1 506 RR4F266TF
BS 507 507 RR4BA67TF
BS 508 670 RR4F266TF
BS 671 801 RR4BA67TF

RD RR4F266TF 671 0 0
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ATAAAATCTGGAAATGGCGGCATCGTTAGCCTCACTGCCTACGTTTAGTTTGGTGAATGC
GTCGAGAAGGAGAATCGAGTCTTATGACTCCAAAAAACGCATCGGAGTTGTTCGTTGTTG
TTCCTCAGGCGACATTCAGCAGCAGAGAGGGAGATTATTGAGAGAAAGTGCGATTTCATT
AGCTTTATCGTTGGGTTTGATAGCTGGAGGAGTAGTCCCTTCCATTGCTTCCCCTCCCTA
TGCCAATGCCAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTACGCCGTAGCAAACCCAGC
GATTCCAGAGGTGTCGGTGTTGATATCAGGACCTCCCATCAAAGACCCAGGAGCCTTGTT
AAGATATGCATTGCCTATCGACAACAGAGCCATCAGAGAAGTTCAGAAGCCTCTCGAGGA
TATCACTGACAGCCTCAAGATTTCTGGCCTCAAGGCCCTCGATTCTGTTGAACGTAATGT
GAGGCAAGCAAATAGATCACTTCAGCAAGGGAAAAGCATGATTGTGTCTGGTTTTGCTGA
CTCCAAGAAG
A

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR4BA67TF 783 0 0
GGA
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ATTATCTGCCTCTCTTCAAACCCTTTATATTTTTAAAAAATAAAATCTGGAAATGGCGGC
ATCGTTAGCCTCACTGCCTACGTTTAGTTTGGTGAATGCGTCGAGAAGGAGAATCGAGTC
TTATGACTCCAAAAAACGCATCGGAGTTGTTCGTTGTTGTTCCTCAGGCGACATTCAGCA
GCAGAGAGGGAGATTATTGAGAGAAAGTGCGATTTCATTAGCTTTATCGTTGGGTTTGAT
AGCTGGAGGAGTAGTCCCTTCCATTGCTTCCCCTCCCTATGCCAATGCCAATGCTGCTGC
TGCTGCTGCTGCTGCTGCTTACGCCGTAGCAAACCCAGCGATTCCAGAGGTGTCGGTGTT
GATATCAGGACCTCCCATCAAAGACCCAGGAGCCTTGTTAAGATATGCATTGCCTATCGA
CAACAAAGCCATCAGAGAAGTTCAGAAGCCTCTCGAGGATATCACTGACAGCCTCAAGAT
TTCTGGCCTCAAGGCCCTCGATTCTGTTGAACGTAATGTGAGGCAAGCAAATAGATCACT
TCAGCAAGGGAAAAGCATGATTGTGTCTGGTTTTGCTGACTCCAAGAAGGATCACGGTAA
CCAACTGATTCAACAGTTGGAAGCTGGTATGCAAGACATGCTTCAGATTGTGGAAGATCG
GAAGAGAGATGCGGTTTCTCCTAAACAGAAAGAGATTCTCCAATTTGTTGGCGGAATTGA

QA 4 783 4 783
DS 



AS 1 2

CO CL7760Contig1 395 2 5 U
CTTCTCCGGCGTAATTCCTCCGGCCAGTTCCCATTCAAATCCGTGCACAAGCGTCCCCGT
CAGTAACTGAATCGTCCGTAACCCTAAACTCAGCCCGGCGCAAATTCCCCTCCCTGCTCC
GAACGGTATGAGCTCGTAATCGTTTCCTTTCACATCGACGCCGGCTTTTTCACCACCGGG
TAAAAATCTCTCGGGTCGAAACGATAACGGGTCGGTCCATTGGTCAGGGTCACGAGCTAT
GGCCCATATGTTTGTCAAAAGGGTTGATCCTTTGGGGATATGATAGCCGTTGATCTCACA
GCTCTCTGATGCGATGTGTGGTAACGAGAGTGGTGTTGGTGGATGGAGTCTGAAATTCTC
TTTGATAACCGCCTGAAGGTAATGAAGCTGAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG27JQ U 7
AF RR4BG27TF C 1
BS 1 6 RR4BG27TF
BS 7 174 RR4BG27JQ
BS 175 175 RR4BG27TF
BS 176 277 RR4BG27JQ
BS 278 395 RR4BG27TF

RD RR4BG27JQ 271 0 0
CGGCGTAATTCCTCCGGCCAGTTCCCATTCAAATCCGTGCACAAGCGTCCCCGTCAGTAA
CTGAATCGTCCGTAACCCTAAACTCAGCCCGGCGCAAATTCCCCTCCCTGCTCCGAACGG
TATGAGCTCGTAATCGTTTCCTTTCACATCGACGCCGGCTTTTTCACCCCCGGGTAAAAA
TCTCTCGGGTCGAAACGATAACGGGTCGGTCCATTGGTCAGGGTCACGAGCTATGGCCCA
TATGTTTGTCAAAAGGGTTGATCCTTTGGGG

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR4BG27TF 395 0 0
CTTCTCCGGCGTAATTCCTCCGGCCAGTTCCCATTCAAATCCGTGCACAAGCGTCGCCGT
CAGTAACTGAATCGTCCGTAACCCTAAACTCAGCCCGGCGCAGATTCTCCTCCCTGCTCC
GAACGGTATGAGCTCGTAGTCGTTTCCTTTCACATCGACGCCGGCTTTTTCACCACCGGG
TAAGAATCTCTCGGGTCGAAACGATAACGGGTCGGTCCATTGGTCAGGGTCACGAGCTAT
GGCCCATATGTTTGTCAAAAGGGTTGATCCTTTGGGGATATGATAGCCGTTGATCTCACA
GCTCTCTGATGCGATGTGTGGTAACGAGAGTGGTGTTGGTGGATGGAGTCTGAAATTCTC
TTTGATAACCGCCTGAAGGTAATGAAGCTGAGAGA

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL7761Contig1 606 2 1 U
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TTTATTTATTTTGACTAAAGGTTTCTCTCTCGTTAGAGTTTGTTATCATGGAAGACACCA
AGAAGAAGACGCCATGCAGCAAGAAGCTTGGAGGATATTTGAGAGAGCAAAAGGGACGCC
TGTACATCATCAGAAGATGTGCGGTCATGCTCATTTGTTGGCGTGACTAAACATTTGCGG
CTCCTCTACCTCTACATATACACATCAGTACTAGACAGCATATTGTGCACACAATATCTA
TTTGTATTGTACTACTGATATATGATTGAAGAGAGGTGTTGGATCTTTGTGGCTATAAAC
GATGTGAGATGAGTCCACGAGCTGGAGTTCAAGCATTCGTGAATGACATATATCCTGTTA
TCTCCGAGGTGTTAAGAGATATAAGTTTAGATAATAGTTTTTTTTCTTGAATTTTTTTTT
TCTTGAATTAGCTAGCATGGAAATGAATAATTAATTAGATACATCTTTTTATATTAGTGT
ACGATATAAAGTAAAGAGAGAAAATATGAGCACAGTTTGTCAATGCGTATAGGATACTTT
CTAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4AR06JQ C 1
AF RR4AR06TF U 1
BS 1 606 RR4AR06TF

RD RR4AR06JQ 606 0 0
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TCTCCGAGGTGTTAAGAGATATAAGTTTAGATAATAGTTTTTTTTCTTGAATTTTTTTTT
TCTTGAATTAGCTAGCATGGAAATGAATAATTAATTAGATACATCTTTTTATATTAGTGT
ACGATATAAAGTAAAGAGAGAAAATATGAGCACAGTTTGTCAATGCGTATAGGATACTTT
CTAGGG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4AR06TF 606 0 0
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TTTATTTATTTTGACTAAAGGTTTCTCTCTCGTTAGAGTTTGTTATCATGGAAGACACCA
AGAAGAAGACGCCATGCAGCAAGAAGCTTGGAGGATATTTGAGAGAGCAAAAGGGACGCC
TGTACATCATCAGAAGATGTGCGGTCATGCTCATTTGTTGGCGTGACTAAACATTTGCGG
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TTTGTATTGTACTACTGATATATGATTGAAGAGAGGTGTTGGATCTTTGTGGCTATAAAC
GATGTGAGATGAGTCCACGAGCTGGAGTTCAAGCATTCGTGAATGACATATATCCTGTTA
TCTCCGAGGTGTTAAGAGATATAAGTTTAGATAATAGTTTTTTTTCTTGAATTTTTTTTT
TCTTGAATTAGCTAGCATGGAAATGAATAATTAATTAGATACATCTTTTTATATTAGTGT
ACGATATAAAGTAAAGAGAGAAAATATGAGCACAGTTTGTCAATGCGTATAGGATACTTT
CTAGGG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7762Contig1 607 2 2 U
GCTCGCGACGTAAGGTTGCAATGGCCATGGCTGCCAAGGCAAAGCTTCTTCTTCGGGAGC
TGAAGATGGTTAAGTCTGATCTTGCCTTTGCAAAGCAGCGGTGCGCTCAGCTTGAAGAGG
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TGCAGGATGTTGTCTACTTTGATGAGAAGACTGAAGAAGTAACCGAGGTGTATCCTATTA
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TGGAGTTCAAGTGAGACACAACAACAACACTCGGTTCATTCTCTTCTTGTAGTGAATCAG
ACAACAAGACAAGACAGACGTTGTCTGTAAATCACTCTGTATCTGTAGAAAATATATGTA
TACTCTGTATTCTCTTCTCTTTTGAGATGGGTTACCTATGAATGCTATTTATAGCCCTTA
AGTTACT


BQ
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20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4EV24JQ C 1
AF RR4EV24TF U 1
BS 1 606 RR4EV24TF
BS 607 607 RR4EV24JQ

RD RR4EV24JQ 607 0 0
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TGAAGATGGTTAAGTCTGATCTTGCCTTTGCAAAGCAGCGGTGCGCTCAGCTTGAAGAGG
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TGCAGGATGTTGTCTACTTTGATGAGAAGACTGAAGAAGTAACCGAGGTGTATCCTATTA
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TGGAGTTCAAGTGAGACACAACAACAACACTCGGTTCATTCTCTTCTTGTAGTGAATCAG
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TACTCTGTATTCTCTTCTCTTTTGAGATGGGTTACCTATGAATGCTATTTATAGCCCTTA
AGTTACT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4EV24TF 606 0 0
GCTCGCGACGTAAGGTTGCAATGGCCATGGCTGCCAAGGCAAAGCTTCTTCTTCGGGAGC
TGAAGATGGTTAAGTCTGATCTTGCCTTTGCAAAGCAGCGGTGCGCTCAGCTTGAAGAGG
AGAACAAGGTTCTGAGGGAGGATCATAGCGGCGAAAACAGCCAAACTGATAACGATGATC
TTGTGCGACTTCAACTTGAGACTTTATTGGCTGAGAAGGCTCGGTTAGCTCATGAGAACT
CGATATACACACGCGAAAACCTCTATCTGAGAGGAGTGGTCGAATACCACCAGCTTACGA
TGCAGGATGTTGTCTACTTTGATGAGAAGACTGAAGAAGTAACCGAGGTGTATCCTATTA
ACGTCACTTCAGTGTCTTCTCCATCAGATATGTCTCACGCTCATCCAAACCCACAAGTGC
TGGAGTTCAAGTGAGACACAACAACAACACTCGGTTCATTCTCTTCTTGTAGTGAATCAG
ACAACAAGACAAGACAGACGTTGTCTGTAAATCACTCTGTATCTGTAGAAAATATATGTA
TACTCTGTATTCTCTTCTCTTTTGAGATGGGTTACCTATGAATGCTATTTATAGCCCTTA
AGTTAC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7763Contig1 698 2 2 U
GGAAGCGGAATCTAATCCCAGGTCTCATTCTTATCAAAATCTCTCTGAAAGGGATCCGAA
ACTGTGAGCTCTGAATCCGTTACCTAGAGCGTAATCGATTTCGAAAGCTCTTTTAAGTAT
GGGAAGCAGAGCTAATCGTGTGGGAGAAAGATGGAATCAGATGGGCTATGAAGAAAAATC
GAGAGTCATTCAGGAAGAGATTAAAAGGGTTAGTAAATTTCCTTCAAACAGTGTTTATGC
AGTTCATCGTCTCAAGGTTCTTAACAAAATCAACGACCTTTTATCTGTCCAAAGAACCTT
GTCGCAAGAGGAGGAGTTAGAGCTACTCTTCACACAGCTCTCTCTGTAGGAAAAAAAAAA
GAAAGCCAGAGTTTTGGTCTGTATAACGGTGAAAATTGCCATTTGTAAGATTGAATCATA
AGTCTATTTACTGATGTAATTGAAACTCAATATTGTAGGTTGATCAATGGCGTTTTACGA
ATGCCAATCTAAGCAACAAGCTAGTTCCTCTATATAACTTGGTGTTTATGGTTTTTTACT
TGTATGCATTTAGTTTTACTTAAGACATGTGTATGTCTGTGGCACCTAGTGGTGTCTTTG
TCTTTGACCATTAAGACCAGTTTCAGATAAAGACGATTTGGTTAACCTTTGCAGTCCATT
GTTTTTGTTCTTGCTTAGAATATTTGATTTTGATTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY63TF U 1
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QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

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TC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4FV30JQ U 1
AF RR4GV71JQ U 1
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BS 758 782 RR4GV71JQ

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TAG

QA 1 757 1 757
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TC

QA 1 782 1 782
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AS 0 0

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TTTATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BJ43JQ C 1
AF RR4BJ43TF U 1
BS 1 607 RR4BJ43TF

RD RR4BJ43JQ 607 0 0
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TTTATTG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4BJ43TF 607 0 0
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AAGCTAGTGAAGCCAAATGTTGCACTTATCAAGAGCAGTATCGATTACTTAGGGGTCGAG
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TTCAATAATCCTTTGTCCTCCAGACAAAAAGAACTGTATCCATGAAATGAAATTATCATA
TTTATTG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL7767Contig1 619 2 1 U
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CGCCGATCAGGCGATACGTGTGGAAGAAGGAGGACGTGGTTCAGATGATGAACGAGAAGA
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AGAATGCTCGCGGCGGAGGCTACGAGTGACGAAACAGGTTTTTTTCTCCTGTAATCTGCT
TTGGTGGGAGACAGACTGCGTGTGATATTAATCTCACTACCGAGAAGAATTCTCACTAGT
TTTCCATTATTATCCAATAATAAGGTTTGTAGAGGCTTTACAAAACACTTTATGAGTTTG
TTCCTCCACAAGAACTTGGATTGTTGTTCAGTTGTATTCCCTTTGTTTTACAGACATGAC
AATTATATGTTTTTGTTTCCTATGGTGAGTGAACTCATCAAAATATTATTTCAAGGCTAA
TGTAACAACACAGAGAAAC


BQ
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QA 1 619 1 619
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AS 0 0

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CC


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AF RR4EZ62JQ C 1
AF RR4EZ62TF U 1
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RD RR4EZ62JQ 574 0 0
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AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGATGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGCATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCAAGAAACATAAACCCAAAGGAGATTGTGCTCT
TGGGAAAACCAAGGCTTTCAATCTTGATTGACATCTTGCTCTGTGTATCTTTAATAAAAT
GATGAAAACACTAATAAGAGAGTGGTCATCTTAT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4EZ62TF 574 0 0
GGAAGAAGAAGCGATGGGTGGTCTCGTCCTACTTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCT
CGTCCTCGTCTCTCGGCTTCACCAGTTCTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGCAATTTCGCT
CAATCGTCAAATTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCT
TCCTCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGTGGGGT
GTTTGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCG
AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGATGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGCATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCAAGAAACATAAACCCAAAGGAGATTGTGCTCT
TGGGAAAACCAAGGCTTTCAATCTTGATTGACATCTTGCTCTGTGTATCTTTAATAAAAT
GATGAAAACACTAATAAGAGAGTGGTCATCTTAT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7772Contig1 645 2 1 U
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ATACAAACACAGATTCAAACACCTGGTTTGCTGGCTCTTACGGCTACATTGCTCCAGAGT
ATGCTTACTCATTGAAGGCGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTATGGGGATAGTGTTGA
TGGAGATTGTGTCCGGGAAAATGCCAACTGAGTCAGTGTTTGGTGCAGAGATGAATATGA
TGAGATGGGTTGAAACACAGCTTGAGATAGTTGGTTCTGCAAGAGAAAAGCTCATAGATC
CAAAGCTAAAGCCGCTGATGCCATTTGAAGAAGAAGCAGCTTATAAGGTGCTTGAGATTG
CACTTCAGTGCACAAAAACTTCTCCACAAGAGAGACCATCTTCTAGACAAGCATGTGATA
GCCTTCTCCATGTCTTCAACAATAGAACTGCTGGTTATAAGAAGCTGTAAAGTGATGCCT
GCTAATGATTTTGAAGACATGAAACTGCAAAATTGATTTTTTTTTTTCTTTCTGAAATTA
TGTATTTATAATATCTGCATTCGTATAGAGTGGCAGCTCCACAAATATTTCTTGTTTTTG
CTTGAACAAATGCATATCGTCTACTAGCAAGTCATTGCTATCCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EK19JQ C 1
AF RR4EK19TF U 1
BS 1 645 RR4EK19TF

RD RR4EK19JQ 645 0 0
GCAACATGGAAGCACATTTGGGAGACTTTGGTCTGGCCAAGGTCCTAACTGAGAACTATG
ATACAAACACAGATTCAAACACCTGGTTTGCTGGCTCTTACGGCTACATTGCTCCAGAGT
ATGCTTACTCATTGAAGGCGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTATGGGGATAGTGTTGA
TGGAGATTGTGTCCGGGAAAATGCCAACTGAGTCAGTGTTTGGTGCAGAGATGAATATGA
TGAGATGGGTTGAAACACAGCTTGAGATAGTTGGTTCTGCAAGAGAAAAGCTCATAGATC
CAAAGCTAAAGCCGCTGATGCCATTTGAAGAAGAAGCAGCTTATAAGGTGCTTGAGATTG
CACTTCAGTGCACAAAAACTTCTCCACAAGAGAGACCATCTTCTAGACAAGCATGTGATA
GCCTTCTCCATGTCTTCAACAATAGAACTGCTGGTTATAAGAAGCTGTAAAGTGATGCCT
GCTAATGATTTTGAAGACATGAAACTGCAAAATTGATTTTTTTTTTTCTTTCTGAAATTA
TGTATTTATAATATCTGCATTCGTATAGAGTGGCAGCTCCACAAATATTTCTTGTTTTTG
CTTGAACAAATGCATATCGTCTACTAGCAAGTCATTGCTATCCTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4EK19TF 645 0 0
GCAACATGGAAGCACATTTGGGAGACTTTGGTCTGGCCAAGGTCCTAACTGAGAACTATG
ATACAAACACAGATTCAAACACCTGGTTTGCTGGCTCTTACGGCTACATTGCTCCAGAGT
ATGCTTACTCATTGAAGGCGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTATGGGGATAGTGTTGA
TGGAGATTGTGTCCGGGAAAATGCCAACTGAGTCAGTGTTTGGTGCAGAGATGAATATGA
TGAGATGGGTTGAAACACAGCTTGAGATAGTTGGTTCTGCAAGAGAAAAGCTCATAGATC
CAAAGCTAAAGCCGCTGATGCCATTTGAAGAAGAAGCAGCTTATAAGGTGCTTGAGATTG
CACTTCAGTGCACAAAAACTTCTCCACAAGAGAGACCATCTTCTAGACAAGCATGTGATA
GCCTTCTCCATGTCTTCAACAATAGAACTGCTGGTTATAAGAAGCTGTAAAGTGATGCCT
GCTAATGATTTTGAAGACATGAAACTGCAAAATTGATTTTTTTTTTTCTTTCTGAAATTA
TGTATTTATAATATCTGCATTCGTATAGAGTGGCAGCTCCACAAATATTTCTTGTTTTTG
CTTGAACAAATGCATATCGTCTACTAGCAAGTCATTGCTATCCTT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7773Contig1 880 2 2 U
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CTTTTGAGTCTTTAATTAAGTCATGCAGTTCAAATCATCATCATCATGTTCATCTTCAAC
TTCATCACCTTCCATGAAACTCAAAACCATAATCCAAAATCTCCTCGCACATCCTCTCTA
CCGTTTCCTTAGAGCTGTTTCGAGAGCCAAATCAATCTTTCTAGAGATCTCTAAACATAA
CAACAAGAAATGAAAGCTCACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCGAAGAATCAACGCAA
GATCTTTTTTGGATCGTTCAGGTTGCATTACAACTGGTGTTCATCTGATGTTGTTCCTGT
CCCTCAGCCTTTCCCTTTTTCTGTCTCTGACATCAGTGGCGCAGAAGATGATGAGTCTCA
GCTCTCTGGCTACCTCGAGTGGCTGGAGCACAAGAAGGTGGATGATTTGGAAGAGAACAG
AGATGTTGGAGAAGCGGATGATGATAATGATATCGATCATTTGGCAGATATGTTCATCGC
TAATTGTCATGAGAAGTTTTTACTCGAGAAAGTGGAATCTTATAGGAGATCTCAAGAAAT
GTTAGAAAGTAGTTTGTGAATTATCAGATGTGAAACGTAGATTTGAACTTTTGAATCATT
AGTTAATAATCATTCTGTGAAATTTTAGCTACTTTGATTTGATTATATTGCCAAAAGGTG
GTGCAAGTCTTGAAAGTTTTGGGGGGTAATGTGTGACAAGTGAAACTTTTGGGGTTGTCA
GTGAAACATGATACTGTAATAAGACAAATAACTATTGATGTCCATCTAATTGGGCACATT
TAGTTAAGTTGCGAGTTATAATTAGTGTTTGGTGTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F095TF U 1
AF RR4F095JQ C 433
BS 1 649 RR4F095TF
BS 650 880 RR4F095JQ

RD RR4F095TF 649 0 0
GGAAATGCATTGAGAAAGAAAAAACACAAAATAAGTGTGAGAAAGATAGAAAGAGTCTCT
CTTTTGAGTCTTTAATTAAGTCATGCAGTTCAAATCATCATCATCATGTTCATCTTCAAC
TTCATCACCTTCCATGAAACTCAAAACCATAATCCAAAATCTCCTCGCACATCCTCTCTA
CCGTTTCCTTAGAGCTGTTTCGAGAGCCAAATCAATCTTTCTAGAGATCTCTAAACATAA
CAACAAGAAATGAAAGCTCACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCGAAGAATCAACGCAA
GATCTTTTTTGGATCGTTCAGGTTGCATTACAACTGGTGTTCATCTGATGTTGTTCCTGT
CCCTCAGCCTTTCCCTTTTTCTGTCTCTGACATCAGTGGCGCAGAAGATGATGAGTCTCA
GCTCTCTGGCTACCTCGAGTGGCTGGAGCACAAGAAGGTGGATGATTTGGAAGAGAACAG
AGATGTTGGAGAAGCGGATGATGATAATGATATCGATCATTTGGCAGATATGTTCATCGC
TAATTGTCATGAGAAGTTTTTACTCGAGAAAGTGGAATCTTATAGGAGATCTCAAGAAAT
GTTAGAAAGTAGTTTGTGAATTATCAGATGTGAAACGTAGATTTGAACT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4F095JQ 448 0 0
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AGCGGATGATGATAATGATATCGATCATTTGGCAGATATGTTCATCGCTAATTGTCATGA
GAAGTTTTTACTCGAGAAAGTGGAATTTTATAGGAGATCTCAAGAAATGTTAGAAAGTAG
TTTGTGAATTATCAGATGTGAAACGTAGATTTGAACTTTTGAATCATTAGTTAATAATCA
TTCTGTGAAATTTTAGCTACTTTGATTTGATTATATTGCCAAAAGGTGGTGCAAGTCTTG
AAAGTTTTGGGGGGTAATGTGTGACAAGTGAAACTTTTGGGGTTGTCAGTGAAACATGAT
ACTGTAATAAGACAAATAACTATTGATGTCCATCTAATTGGGCACATTTAGTTAAGTTGC
GAGTTATAATTAGTGTTTGGTGTGTTAC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL7774Contig1 869 2 4 U
GGTAGTACTGAGGCTGTAACCAGTGATCCTGATGCTATCAACAATCCGCATGTGACATTT
GCCCCAGCAGCATATCACAACTCGAAGGGACTACCTGTAAGGCCGGGTGAAGTAGACTGC
CCGTTCTATCTCAAGACGGGAAGCTGCGAGTATGGCGCCACCTGTCGTTACAATCACCCT
GAGAGGACTGCATTCACTCCCCAAGCTACTGGGATAAACTATCCTCTAGTGTCCCCAACC
GCTGCGAGTGTAAACCTTGGGTTGATTAACTCAGCTGCCTCCCTATATCAGACCCTTGCT
CAACCCACGCTAGGAGCGCTTACAGCAACTTATCCCCAAAGGCCTGGACAACCAGAATGT
GACTACTACATGAAGACAGGGGAGTGCAAGTTTGGAGAGAGGTGCAGGTTCCATCACCCA
GCAGATAGGTTAAATGCAACAAGCAAACAAGCTCCTCAACAGCCGAATGTAAAGCTGAGT
CTTGCAGGGTATCCTAGAAGAGAGGGTGCGCAAAACTGCCCGTACTACATGAAGACAGGG
ACTTGCAAGTATGGGGCAACGTGTAAGTTTGACCATCCTCCTCCAGGTGAAGTTATGGCT
AAAACCGCTTCAGAAGCTGATGCTGCTCCTCCTGGTGAAGGAACTGACACGACGACTCAG
TGAGTAGGCAGCTATGTGTAAGATAAGATGATAAGCATGTTGTAATCTTGTTTTACTTGC
TATGTTCTCTGCATCTGTTTCTCCTTTCTCAAATCCCTTTTTATCATATCCTAAAACCAA
AAGAAGAGATTGATTGAGTCTACTTTACTTGGTATCTTCTCTACAATTGGTCAAGCAGTA
GAGCTTTCTATGTTTATAAAGGCAACTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GH31TF U 1
AF RR4GH31JQ C 109
BS 1 666 RR4GH31TF
BS 667 667 RR4GH31JQ
BS 668 757 RR4GH31TF
BS 758 869 RR4GH31JQ

RD RR4GH31TF 757 0 0
GGTAGTACTGAGGCTGTAACCAGTGATCCTGATGCTATCAACAATCCGCATGTGACATTT
GCCCCAGCAGCATATCACAACTCGAAGGGACTACCTGTAAGGCCGGGTGAAGTAGACTGC
CCGTTCTATCTCAAGACGGGAAGCTGCGAGTATGGCGCCACCTGTCGTTACAATCACCCT
GAGAGGACTGCATTCACTCCCCAAGCTACTGGGATAAACTATCCTCTAGTGTCCCCAACC
GCTGCGAGTGTAAACCTTGGGTTGATTAACTCAGCTGCCTCCCTATATCAGACCCTTGCT
CAACCCACGCTAGGAGCGCTTACAGCAACTTATCCCCAAAGGCCTGGACAACCAGAATGT
GACTACTACATGAAGACAGGGGAGTGCAAGTTTGGAGAGAGGTGCAGGTTCCATCACCCA
GCAGATAGGTTAAATGCAACAAGCAAACAAGCTCCTCAACAGCCGAATGTAAAGCTGAGT
CTTGCAGGGTATCCTAGAAGAGAGGGTGCGCAAAACTGCCCGTACTACATGAAGACAGGG
ACTTGCAAGTATGGGGCAACGTGTAAGTTTGACCATCCTCCTCCAGGTGAAGTTATGGCT
AAAACCGCTTCAGAAGCTGATGCTGCTCCTCCTGGTGAAGGAACTGACACGACGACTCAG
TGAGTATGCAGCTATGTGTAAGATAAGATGATAAGCATGTTGTAATCTTGTTTTACTTGC
TATGTTCTCTGCATCTGTTTCTCCTTTCTCAAATCCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GH31JQ 761 0 0
GAAGTAGACTGCCCGTTCTATCTCAAGACGGGAAGCTGCGAGTATGGCGCCACCTGTCGT
TACAATCACCCTGAGAGGACTGCATTCACTCCCCAAGCTACTGGGATAAACTATCCTCTA
GTGTCCCCAACCGCTGCGAGTGTAAACCTTGGGTTGATTAACTCAGCTGCCTCCCTATAT
CAGACCCTTGCTCAACCCACGCTAGGAGCGCTTACAGCAACTTATCCCCAAAGGCCTGGA
CAACCAGAATGTGACTACTACATGAAGACAGGGGAGTGCAAGTTTGGAGAGAGGTGCAGG
TTCCATCACCCAGCAGATAGGTTAAATGCAACAAGCAAACAAGCTCCTCAACAGCCGAAT
GTAAAGCTGAGTCTTGCAGGGTATCCTAGAAGAGAGGGTGCGCAAAACTGCCCGTACTAC
ATGAAGACAGGGACTTGCAAGTATGGGGCAACGTGTAAGTTTGACCATCCTCCTCCAGGT
GAAGTTATGGCTAAAACCGCTTCAGAAGCTGATGCTGCTCCTCCTGGTGAAGGAACTGAC
ACGACGACTCAGTGAGTAGGCAGCTATGTGTAAGATAAGATGATAAGCATGTTGTAATCT
TGTTTTACTTGCTATGTTCTCTGCATCTGTTTCTCCTTTCTCAAATCCCTTTTTATCATA
TCCTAAAACCAAAAGAAGAGATTGATTGAGTCTACTTTACTTGGTATCTTCTCTACAATT
GGTCAAGCAGTAGAGCTTTCTATGTTTATAAAGGCAACTAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7775Contig1 958 2 4 U
TAAGAACAGGGGGCTTGTTGTTCTGCTACATGGTCTGAACGAACACAGTGGCAGGTATAG
TGATTTTGCAAAGCAGCTAAATGTTAATGGATTCAAGGTCTATGGAATAGACTGGATCGG
TCATGGTGGAAGCGATGGACTTCATGCTTATGTTCCTTCTCTTGATTATGCTGTCACTGA
TTTGAACTCGTTTCTTGAAAAGGTAATCTCAGAAAACCCGGGACTGCCCTGTTTCTGCGT
TGGCCACTCAACAGGAGGCGCCATCATCTTGAAGGCTATGCTAGATCCAAAGATCGAAGC
TCAAGTTTCAGGGATTGTGTTAACTTCACCCGCAGTTGGAGTCCAACCATCTCACCCCGT
CTTTTGGGTAATTGCACCATTCCTCGCGTTCCTCATCCCAAGGTACCAGTTGAGCGCTGC
TAAAAAGAAAATAATGCCTGTTTCTCGCGACCCGGAAGCTCTCCTGGCTAAATACTCTGA
CCCGTTGGTCTACACAGGGTTTATCAGAGCCAGAACCGGGTTACGAGATCCTCAGACTTG
GCTCTCATCTGCTGGGGAACCTGAACAGAATCAAGGTCCCTTTTCTTGTGCTCCACGGGA
CGGCTGATACGGTTACTGATCCTAAAGCTACTCAGAGACTCTACGATGAAGCTTCCTCGT
CCGACAAGTCGATCAAGCTGTTCGACGGGTTGTTGCATGATCTGCTCTTTGAACCGGAAC
GAGGAATTATCGCTGGAGTCATATTGGATTGGCTAAACCGGCGGGTTTAAATTTATCAAA
CCAAATGTAGTTGTTGTATTAATTATGTGTTTATATACGATTTGTCAACCCTAGCCCCTA
GGCATTGCCTTTCTCTCTTGCGCCGCTGTGATTGTTGGTTTGAGTTATCTTTTAGTTTTT
GTTCTCTGTGTGATTTGGCTGATTGTCGATGGTTTCCGAAATAAAGGCAGATGTTGAG


BQ
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AF RR4BD43TF U 1
AF RR4BD43JQ C 16
BS 1 575 RR4BD43TF
BS 576 576 RR4BD43JQ
BS 577 598 RR4BD43TF
BS 599 958 RR4BD43JQ

RD RR4BD43TF 598 0 0
TAAGAACAGGGGGCTTGTTGTTCTGCTACATGGTCTGAACGAACACAGTGGCAGGTATAG
TGATTTTGCAAAGCAGCTAAATGTTAATGGATTCAAGGTCTATGGAATAGACTGGATCGG
TCATGGTGGAAGCGATGGACTTCATGCTTATGTTCCTTCTCTTGATTATGCTGTCACTGA
TTTGAACTCGTTTCTTGAAAAGGTAATCTCAGAAAACCCGGGACTGCCCTGTTTCTGCGT
TGGCCACTCAACAGGAGGCGCCATCATCTTGAAGGCTATGCTAGATCCAAAGATCGAAGC
TCAAGTTTCAGGGATTGTGTTAACTTCACCCGCAGTTGGAGTCCAACCATCTCACCCCGT
CTTTTGGGTAATTGCACCATTCCTCGCGTTCCTCATCCCAAGGTACCAGTTGAGCGCTGC
TAAAAAGAAAATAATGCCTGTTTCTCGCGACCCGGAAGCTCTCCTGGCTAAATACTCTGA
CCCGTTGGTCTACACAGGGTTTATCAGAGCCAGAACCGGGTTACGAGATCCTCAGACTTG
GCTCTCATCTGCTGGGGAACCTGAACAGAATCAAG*TCCCTTTTCTTGTGCTCCACGG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BD43JQ 943 0 0
TGTTGTTCTGCTACATGGTCTGAACGA*CACAGTGGCAGGTATAGTGATTT*GCAAAGCA
GCTAAATGTTAATGGATTCAAGGTCTATGGAATAGACTGGATCGGTCATGGTGGAAGCGA
TGGACTTCATGCTTATGTTCCTTCTCTTGATTATGCTGTCACTGATTTGAACTCGTTTCT
TGAAAAGGTAATCTCAGAAAACCCGGGACTGCCCTGTTTCTGCGTTGGCCACTCAACAGG
AGGCGCCATCATCTTGAAGGCTATGCTAGATCCAAAGATCGAAGCTCAAGTTTCAGGGAT
TGTGTTAACTTCACCCGCAGTTGGAGTCCAACCATCTCACCCCGTCTTTTGGGTAATTGC
ACCATTCCTCGCGTTCCTCATCCCAAGGTACCAGTTGAGCGCTGCTAAAAAGAAAATAAT
GCCTGTTTCTCGCGACCCGGAAGCTCTCCTGGCTAAATACTCTGACCCGTTGGTCTACAC
AGGGTTTATCAGAGCCAGAACCGG*TTACGAGATCCTCAGACTTGGCTCTCATCTGCTGG
GGAACCTGAACAGAATCAAGGTCCCTTTTCTTGTGCTCCACGGGACGGCTGATACGGTTA
CTGATCCTAAAGCTACTCAGAGACTCTACGATGAAGCTTCCTCGTCCGACAAGTCGATCA
AGCTGTTCGACGGGTTGTTGCATGATCTGCTCTTTGAACCGGAACGAGGAATTATCGCTG
GAGTCATATTGGATTGGCTAAACCGGCGGGTTTAAATTTATCAAACCAAATGTAGTTGTT
GTATTAATTATGTGTTTATATACGATTTGTCAACCCTAGCCCCTAGGCATTGCCTTTCTC
TCTTGCGCCGCTGTGATTGTTGGTTTGAGTTATCTTTTAGTTTTTGTTCTCTGTGTGATT
TGGCTGATTGTCGATGGTTTCCGAAATAAAGGCAGATGTTGAG

QA 1 943 1 943
DS 



AS 1 2

CO CL7776Contig1 787 2 2 U
GGGACAACTTTGGAAACGAAAAAAGAAAAACACAATACACTCTCTCTTTCTCGTTCTCTC
TTCCATGGAGATCTTCTCACTACCTTCTCTGTTCCTTCTCTCCACACTCTTCGTCTTCTA
CATCATCAAGTTTCTCAACAAAAGAAACCGAAGAAACTGTTACATGCTTCACTACGAGTG
CTTCAAGGGCAAAGACGAGAGAAAACTCGACACCGAGACATGTGCCAAAGTCGTTGAACG
AAACAAGCACTTAGGTCTCGAAGAGTACGGGTTTCTTCTACGTACGATGGCTAGTTCAGG
CATCGGAGAAGAAACTTACGGCCCAATAAACGTCCTCCAAGGCAGAGAGGCCTCTCCTAC
TCTCCTCGACGCTTACTCCGAGATGGACGAGATCATGTTCGACACCCTAGACAAGCTTTT
CCACAAGACAAAGGGCTTTGTCTCTCCTTCGGATATAGACATTCTCGTTGTCAACGTCTC
TCTCTTCGCTCCGTCTCCTTCTCTAACCTCACGTGTCATCAACAGATACAAGATGAGAGA
AGACGTCAAGTCCTTCAACCTCTCGGGCCTCGGGTGTAGCGCGAGCGTTATATCAATAGA
TATAGTGCAACGCATATTCGAAACGCGGGAAAACGCGTTTGCGCTCGTGGTTAGCACCGA
GACGATGGGTCCTCACTGGTATTGCGGTAAAGATAGGTCGATGATGTTGTCAAACTGTTT
ATTCCGAGCTGGAGGAGCTCTGTGCTGTTACCACGCGGCTAGTTCAGACAGGCTTGATGA
GCTAGTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ93TF U 1
AF RR4E332TF U 1
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DS 

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TTCCATGGAGATCTTCTCACTACCTTCTCTGTTCCTTCTCTCCACACTCTTCGTCTTCTA
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CTTCAAGGGCAAAGACGAGAGAAAACTCGACACCGAGACATGTGCCAAAGTCGTTGAACG
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CCACAAGACAAAGGGCTTTGTCTCTCCTTCGGATATAGACATTCTCGTTGTCAACGTCTC
TCTCTTCGCTCCGTCTCCTTCTCTAACCTCACGTGTCATCAACAGATACAAGATGAGAGA
AGACGTCAAGTCCTTCAACCTCTCGGGCCTCGGGTGTAGCGCGAGCGTTATATCAATAGA
TATAGTGCAACGCATATTCGAAACGCGGGAAAACGCGTTTGCGCTCGTGGTTAGCACCGA
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ATTCCGAGCTGGAGGAGCTCTGTGCTGTTACCACGCGGCTAGTTCAGACAGGCTTGATGA
GCTAGTG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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GTGCGTGTTAGGAATGTCAATGAGCAGAGGGTGGCTATGGTGTTGGTTATGGTTGTGTCG
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GGGTTACTATAGGTTTTATATTTACTGTCACTAGTAATTCCGGTTAGTTAATCC


BQ
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AF RR4CO77TF U 1
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TCGGTTGGGCTCTTGTACACTGGGGTTGGGTTGCTCTTGGCGTATGTCACTGACGCGCTT
GTGCGTGTTAGGAATGTCAATGAGCAGAGGGTGGCTATGGTGTTGGTTATGGTTGTGTCG
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GGGTTACTATAGGTTTTATATTTACTGTCACTAGTAATTCCGGTTAGTTAATCC

QA 1 354 1 354
DS 

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GGGGTTGGGTTGCTCTTGGCGTATGTCACTGACGCGCTTGTGCGTGTTAGGAATGTCAAT
GAGCAGAGGGTGGCTATGGTGTTGGTTATGGTTGTGTCGTTGTTGGCTGCGAAGAGGGTT
GTTTACTTGAATAATTGGAAGACTGGGTATCAGATTCAAATGTATTGGCCATCTAGTTGG
CAGTGATGATGGAACCTTTTACCTTGAGGTAACTCTTTTGGGTTACTATAGGTTTTATAT
TTACTGTCACTAGTAATTCCGGTTAGTTAATCC

QA 9 341 9 341
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GI94TF U 1
AF RR4CJ20TF U 45
BS 1 56 RR4GI94TF
BS 57 57 RR4CJ20TF
BS 58 541 RR4GI94TF
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RD RR4GI94TF 667 0 0
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ATGTGAGCTCTCTTCAAGTTTGTCGAAAAGGTAACAACTTTACAGTCTCTTACCTGGTTG
ATTCATTCGGTTTCACAACCAAACTCGCTGAATCAATCTGGAGGAAAGTCAGCTCTGAGG
CCAAGGCCAATCCAGATTCTGTTCTGAATCTTCTCAGGAGTCATGGCTTCACAGATTCTC
AAATCTCCACCGTCATTACGAACTACCCAAAACTGCTCACATTAGATGCTGAGAAAACCC
TTGCTCCCAATCTCAAGTTCCTGCAGTCCAGAGAAGGAGCTTCAACCTCTGAGCTCGCTG
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ATTACGATTTCGTCAAAGACATCATCGAAGCAGACAAGTGCTCCAATTACGAAATGTCTT
TCCCACATGGTACCTGCCAGGAGAACATCATCAGAA*CGTGTTGGCTCTGAGACGATTGG
GCGTGCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4CJ20TF 664 0 0
G
GAAAGTCTCTCGAGTTTCAGAAATGGCGTCTCTTGAGATCTGTAGTGAACCTTCTTCAAA
TTGAGTCTGCTTTTCCCCCAATTATATTTTCTTCTCCTTCCCACTCCTTCTCCTCTGCTA
GTGCCGCTGCTTCTGATGTGAGCTCTCTTCAAGTTTGTCGAAAAGGTAACAACTTTACAG
TCTCTTACCTGGTTGATTCATTCGGTTTCACAACCAAACTCGCTGAATCAATCTGGAGGA
AAGTCAGCTCTGAGGCCAAGGCCAATCCAGATTCTGTTCTGAATCTTCTCAGGAGTCATG
GCTTCACAGATTCTCAAATCTCCACCGTCATTACGAACTACCCAAAACTGCTCACATTAG
ATGCTGAGAAAACCCTTGCTCCCAATCTCAAGTTCCTGCAGTCCAGAGAAGGAGCTTCAA
CCTCTGAGCTCGCTGAGATAGTTTCCAATGTACCGAGAATCTTGGGAATGAGATGGCACA
AAGCAGTCGGCAGGTACTACGATTTCGTCAAAGACATCATCGAAGCAGACAAGTGCTCCA
ATTACGAAATGTCTTTCCCACATGGTACCTGCCAGGAGAACATCATCAGAAACGTGTTGG
CTCTGAGACGATTGGGCGTGCCTCAAAGTTCTTGTTCTCCTGCTCACTCCACTTCCATGT
CGT

QA 2 664 2 664
DS 



AS 1 2

CO CL7779Contig1 721 2 4 U
GGACACACAAGACAACCAAAACACGAGAAGATTTTATTCGATTTTATCTGTCATTTGCGT
CAACTGTTACTATCGCGACCAATCTCGGTGTTCGTAGCCATGAGTCTTCTTACAGATCTC
ATTAACCTTAACCTCTCGGAGACCACTGACAAAATCATTGCGGAATACATATGGGTTGGA
GGTTCTGGAATGGATATGAGAAGCAAAGCCAGGACTCTTCCTGAACCAGTGAGTGACCCT
TCGGAGCTACCAAAGTGGAACTATGATGGTTCAAGCACAGGCCAAGCTCCTGGTGAAGAT
AGTGAAGTCATCTTATACCCACAAGCGATATTCAAAGATCCTTTCCGTAGAGGCAATAAC
ATTCTTGTCATGTGCGACGCTTACACTCCAGCGGGTGAACCAATCCCAACAAACAAAAGA
CACGCTGCGGCTAAGGTCTTTAGCCAGCCTGATGTGGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGT
ATTGAGCAAGAGTATACTTTACTTCAGAAAGATGTGAAGTGGCCTGTTGGTTGGCCTATT
GGCGGCTTCCCCGGTCCTCAGGGACCATACTATTGTGGTGTTGGAGCAGATAAATCTTTT
GGCAGAGACGTTGTTGATGCTCACTACAAGCCTGCTTATACGCTGGTATCAACATTAGTG
GCATCAATGGAGAAGTCATGCCCGGTCAGTGGGAGTTCCAGTTGGTCCAGCTGTTGGTAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4EY44TF U 1
AF RR4FR77TF U 7
BS 1 223 RR4EY44TF
BS 224 224 RR4FR77TF
BS 225 621 RR4EY44TF
BS 622 721 RR4FR77TF

RD RR4EY44TF 621 0 0
GGACACACAAGACAACCAAAACACGAGAAGATTTTATTCGATTTTATCTGTCATTTGCGT
CAACTGTTACTATCGCGACCAATCTCGGTGTTCGTAGCCATGAGTCTTCTTACAGATCTC
ATTAACCTTAACCTCTCGGAGACCACTGACAAAATCATTGCGGAATACATATGGGTTGGA
GGTTCTGGAATGGATATGAGAAGCAAAGCCAGGACTCTTCCTGGACCAGTGAGTGACCCT
TCGGAGCTACCAAAGTGGAACTATGATGGTTCAAGCACAGGCCAAGCTCCTGGTGAAGAT
AGTGAAGTCATCTTATACCCACAAGCGATATTCAAAGATCCTTTCCGTAGAGGCAATAAC
ATTCTTGTCATGTGCGACGCTTACACTCCAGCGGGTGAACCAATCCCAACAAACAAAAGA
CACGCTGCGGCTAAGGTCTTTAGCCAGCCTGATGTGGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGT
ATTGAGCAAGAGTATACTTTACTTCAGAAAGATGTGAAGTGGCCTGTTGGTTGGCCTATT
GGCGGCTTCCCCGGTCCTCAGGGACCATACTATTGTGGTGTTGGAGCAGATAAATCTTTT
GGCAGAGACGTTGTTGATGCT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4FR77TF 715 0 0
GG
AAGACAACCAAAACACGAGAAGATTTTATTCGATTTTATCTGTCATTTGCGTCAACTGTT
ACTATCGCGACCAATCTCGGTGTTCGTAGCCATGAGTCTTCTTACAGATCTCATTAACCT
TAACCTCTCGGAGACCACTGACAAAATCATTGCGGAATACATATGGGTTGGAGGTTCTGG
AATGGATATGAGAAGCAAAGCCAGGACTCTTCCTGAACCAGTGAGTGACCCTTCGGAGCT
ACCAAAGTGGAACTATGATGGTTCAAGCACAGGCCAAGCTCCTGGTGAAGATAGTGAAGT
CATCTTATACCCACAAGCGATATTCAAAGATCCTTTCCGTAGAGGCAATAACATTCTTGT
CATGTGCGACGCTTACACTCCAGCGGGTGAACCAATCCCAACAAACAAAAGGCACGCTGC
GGCTAAGGTCTTTAGCCAGCCTGATGTGGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGTATTGAGCA
AGAGTATACTTTACTTCAGAAAGATGTGAAGTGGCCTGTTGGTTGGCCTATTGGCGGCTT
CCCCGGTCCTCAGGGACCATACTATTGTGGTGTTGGAGCAGATAAATCTTTTGGCAGAGA
CGTTGTTGATGCTCACTACAAGCCTGCTTATACGCTGGTATCAACATTAGTGGCATCAAT
GGAGAAGTCATGCCCGGTCAGTGGGAGTTCCAGTTGGTCCAGCTGTTGGTATT

QA 3 715 3 715
DS 



AS 1 2

CO CL7780Contig1 426 2 2 U
GGTAGCCAATAGATAAAAAGGCAGAGAAATCATCATCCAAAAGTTATTCAAGTAAGTTTA
TATGCCCATGAGATCCAATTTATCATCAAACCCCAGCACACTCTTATATGGTTTACACAA
TTGCATTTGCCGCCTCTTTCAAGTAAAAAAAAACTGCTAAACAACTATACCACAAAGACT
CAAGCAGCATTAAGAGCTTCGAGCTGTTTCTTCAGTTCTTCAAGGTCGTCCTCCTCCTCT
GCCTCTCCAAAATCTCCTCATCATTCTTGATCACTACTTCATCATTCTTCTTAGTCTCCT
CGACGACACCACCACGGTTAACATCTTTCCTTCCCAGCTTCACCACTCGATCCTCCTCCC
CACCAGAAACAATCTTTCCAGCTTTCTTGTCATCAACATGTGAATGCTTGAGTTGATAAA
GTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4CE63TF C 1
AF RR4CE63JQ U 29
BS 1 28 RR4CE63TF
BS 29 426 RR4CE63JQ

RD RR4CE63TF 426 0 0
GGTAGCCAATAGATAAAAAGGCAGAGAAATCATCATCCAAAAGTTATTCAAGTAAGTTTA
TATGCCCATGAGATCCAATTTATCATCAAACCCCAGCACACTCTTATATGGTTTACACAA
TTGCATTTGCCGCCTCTTTCAAGTAAAAAAAAACTGCTAAACAACTATACCACAAAGACT
CAAGCAGCATTAAGAGCTTCGAGCTGTTTCTTCAGTTCTTCAAGGTCGTCCTCCTCCTCT
GCCTCTCCAAAATCTCCTCATCATTCTTGATCACTACTTCATCATTCTTCTTAGTCTCCT
CGACGACACCACCACGGTTAACATCTTTCCTTCCCAGCTTCACCACTCGATCCTCCTCCC
CACCAGAAACAATCTTTCCAGCTTTCTTGTCATCAACATGTGAATGCTTGAGTTGATAAA
GTAGCC

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR4CE63JQ 398 0 0
ATCATCATCCAAAAGTTATTCAAGTAAGTTTATATGCCCATGAGATCCAATTTATCATCA
AACCCCAGCACACTCTTATATGGTTTACACAATTGCATTTGCCGCCTCTTTCAAGTAAAA
AAAAACTGCTAAACAACTATACCACAAAGACTCAAGCAGCATTAAGAGCTTCGAGCTGTT
TCTTCAGTTCTTCAAGGTCGTCCTCCTCCTCTGCCTCTCCAAAATCTCCTCATCATTCTT
GATCACTACTTCATCATTCTTCTTAGTCTCCTCGACGACACCACCACGGTTAACATCTTT
CCTTCCCAGCTTCACCACTCGATCCTCCTCCCCACCAGAAACAATCTTTCCAGCTTTCTT
GTCATCAACATGTGAATGCTTGAGTTGATAAAGTAGCC

QA 1 398 1 398
DS 



AS 1 2

CO CL7781Contig1 782 2 3 U
GGAAGAACAGAGCCTGAAAAAAAAAAAAAATTTAGAAACATTGACAAAAAATGGCCGAAT
CATTGGTGGAAACTCGAATCCCACACCAAAAACTCTACGAATCAAAACCTTTCCCTGCGG
TGATCACTCAGTCACCGTCCCTCCCACTCCCTGCTCCGTCTCTCCCACTCTTCACACAAA
CAATCACCACCCACAAACCCTATCTCTACTCCCTCCTCCACCGATCCGGAGCCATCCTCT
TCCGAGGCTTCCCCGTCTCTTCCGCCTCCGACTTCAACGACGTCGTCAAGGCTTTCGGCT
ACGACGAGCTTCCCTACGTGGGAGGCGCCGCGCCACGCACTAGCGTCGTCGGCCGTGTCT
TCACCGCCAACGAGTCTCCTCCTGATCAAAAGATCCCCTTTCACCACGAGATGGCTCAGG
TTCCTGAGTTTCCATCAAAGTTGTTCTTTTACTGTGAGGTAGAGCCTAAGTGTGGAGGAG
AGACACCGATCGTGTTGAGTCATGTCGTGTACGAGAGGATGAAAGAGAAGCATCCAGAGT
TTGTTCAGAGGTTGGAGGAACACGGTTTGGTCTACGTTAGGGTTTTAGGGGAAGATGACG
ATCCTTCTTCACCCATTGGCCGTGGCTGGAAATCAACTTTCTTGACACACGACAAGAACG
TTGCTGAGGAAAGGGCCACTAAACTGGGAATGGAGCTGGAATGGACCGAGGAAGGAGCCA
AGACAATAATGGGTCCAATCCCGGCTATCAAGTACGACAGTCGAGGAACCGTAAAGTGTG
GT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4A184TFB U 1
AF RR4A184TF U 1
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BS 726 726 RR4A184TFB
BS 727 782 RR4A184TF

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CATTGGTGGAAACTCGAATCCCACACCAAAAACTCTACGAATCAAAACCTTTCCCTGCGG
TGATCACTCAGTCACCGTCCCTCCCACTCCCTGCTCCGTCTCTCCCACTCTTCACACAAA
CAATCACCACCCACAAACCCTATCTCTACTCCCTCCTCCACCGATCCGGAGCCATCCTCT
TCCGAGGCTTCCCCGTCTCTTCCGCCTCCGACTTCAACGACGTCGTCAAGGCTTTCGGCT
ACGACGAGCTTCCCTACGTGGGAGGCGCCGCGCCACGCACTAGCGTCGTCGGCCGTGTCT
TCACCGCCAACGAGTCTCCTCCTGATCAAAAGATCCCCTTTCACCACGAGATGGCTCAGG
TTCCTGAGTTTCCATCAAAGTTGTTCTTTTACTGTGAGGTAGAGCCTAAGTGTGGAGGAG
AGACACCGATCGTGTTGAGTCATGTCGTGTACGAGAGGATGAAAGAGAAGCATCCAGAGT
TTGTTCAGAGGTTGGAGGAACACGGTTTGGTCTACGTTAGGGTTTTAGGGGAAGATGACG
ATCCTTCTTCACCCATTGGCCGTGGCTGGAAATCAACTTTCTTGACACACGACAAGAACG
TTGCTGAGGAAAGGGCCACTAAACTGGGAATGGAGCTGGAATGGACCGAGGAAGGAGCCA
AGACAATAATGGGTCCAATCCCGGCTATCAAGTACGACA
AGTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4A184TF 782 0 0
GGAAGAACAGAGCCTGAAAAAAAAAAAAAATTTAGAAACATTGACAAAAAATGGCCGAAT
CATTGGTGGAAACTCGAATCCCACACCAAAAACTCTACGAATCAAAACCTTTCCCTGCGG
TGATCACTCAGTCACCGTCCCTCCCACTCCCTGCTCCGTCTCTCCCACTCTTCACACAAA
CAATCACCACCCACAAACCCTATCTCTACTCCCTCCTCCACCGATCCGGAGCCATCCTCT
TCCGAGGCTTCCCCGTCTCTTCCGCCTCCGACTTCAACGACGTCGTCAAGGCTTTCGGCT
ACGACGAGCTTCCCTACGTGGGAGGCGCCGCGCCACGCACTAGCGTCGTCGGCCGTGTCT
TCACCGCCAACGAGTCTCCTCCTGATCAAAAGATCCCCTTTCACCACGAGATGGCTCAGG
TTCCTGAGTTTCCATCAAAGTTGTTCTTTTACTGTGAGGTAGAGCCTAAGTGTGGAGGAG
AGACACCGATCGTGTTGAGTCATGTCGTGTACGAGAGGATGAAAGAGAAGCATCCAGAGT
TTGTTCAGAGGTTGGAGGAACACGGTTTGGTCTACGTTAGGGTTTTAGGGGAAGATGACG
ATCCTTCTTCACCCATTGGCCGTGGCTGGAAATCAACTTTCTTGACACACGACAAGAACG
TTGCTGAGGAAAGGGCCACTAAACTGGGAATGGAGCTGGAATGGACCGAGGAAGGAGCCA
AGACA*TAATGGGTCCAATCCCGGCTATCAAGTACGACAGTCGAGGAACCGTAAAGTGTG
GT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL7782Contig1 866 2 2 U
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TCAACGATCTATCGATTCACCCTCCCGGGAAGCTCGCTCTGGCTGTGTACCGCGACGAGT
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GGCGAGTCTTGTCAAGTTTGATCCGAGTGGGGAGAGGTTTTTCATGGTGGTTAATGATAA
AATCGGAGTTCATCAGTCTGAGGATGCTAAGCTTCTTCTCGAGCTTGATAATGGTAGCCG
CAAGCGTATACTCTGTGCTTCTCCTGGAGATAGTGGGACTCTGTTTACAGCTGGTGAGGA
TCGGGCAATAACAGCGTGGGACACAAATAGCGATAAGCTTGCTTATTCCATACAAGATGC
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TACGTGTCTTGCAGGGTCAGCTCTTAAATCTATGAGACGGCCACAGATTGGAAATCAAAA
ACCCCAGAAGCTAAAAGAAGGGCCGAACTCAGCATAAGAGCTGACATTTTTCTTGATACA
AGTTTTGTTAGAATTTTTTTTTTTAAATATGATTTCACGTGTGTTCTTGTCGAATTACAA
TTAAACAAATTTGTTAAACCCTCTATTTGTGAAAGAAGACTGTTCTTACTACATGAGTTC
TTTATTGTATGAATCTTTGAAATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD10TF U 1
AF RR4FD10JQ C 316
BS 1 643 RR4FD10TF
BS 644 866 RR4FD10JQ

RD RR4FD10TF 643 0 0
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TCAACGATCTATCGATTCACCCTCCCGGGAAGCTCGCTCTGGCTGTGTACCGCGACGAGT
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GGCGAGTCTTGTCAAGTTTGATCCGAGTGGGGAGAGGTTTTTCATGGTGGTTAATGATAA
AATCGGAGTTCATCAGTCTGAGGATGCTAAGCTTCTTCTCGAGCTTGATAATGGTAGCCG
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TCGGGCAATAACAGCGTGGGACACAAATAGCGATAAGCTTGCTTATTCCATACAAGATGC
TCACCCAGCTCGTATCAAAGGTGTGGTCTCGCTTACCAGGAACGAGAGTGACGGTGCATC
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GCGGATGGCGGCTAAAGAGAATGCGAAACCATTAGCCGAGACAAATACTAAATCGAGGCT
TACGTGTCTTGCAGGGTCAGCTCTTAAATCTATGAGACGGCCA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4FD10JQ 551 0 0
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GTGGGACACAAATAGCGATAAGCTTGCTTATTCCATACAAGATGCTCACCCAGCTCGTAT
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GGTTGCGTTTGCATCTTTTGATGGGATCATACGTGTGTGGGACATGCGGATGGCGGCTAA
AGAGAATGCGAAACCATTAGCCGAGACAAATACTAAATCGAGGCTTACGTGTCTTGCAGG
GTCAGCTTTTAAATTTATGAGACGGCCACAGATTGGAAATCAAAAACCCCAGAAGCTAAA
AGAAGGGCCGAACTCAGCATAAGAGCTGACATTTTTCTTGATACAAGTTTTGTTAGAATT
TTTTTTTTTAAATATGATTTCACGTGTGTTCTTGTCGAATTACAATTAAACAAATTTGTT
AAACCCTCTATTTGTGAAAGAAGACTGTTCTTACTACATGAGTTCTTTATTGTATGAATC
TTTGAAATCCT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL7783Contig1 645 2 1 U
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TGTGTGTATGAAATACAAGCATTTCTACATATAGTTTGGATTGTAATTTTGTAAAATTTG
AAAACATTTGTTATTACTATTTAATGGTAGCTTTTCTTTTGCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C919JQ C 1
AF RR4C919TF U 1
BS 1 645 RR4C919TF

RD RR4C919JQ 645 0 0
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TCTTGGTCGGTGTGGGTGAAGCGTTTGCTTACGTTGGACAGCTTGAGTTCTTTATAAGAG
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GATTCTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTTTCTCTTGTTGATAAGGTTACGGACAAGAGCTGGC
TTAGAAGCAACCTTAACAAAGCGAGATTGAACTACTTCTACTGGTTGCTTGTTGTCTTGG
GAGCTTTTAACTTCTTGGTTTTTATAGTGTTTGCGATGAGGCATCAGTATAAAGCTGATA
TGATTAGTGTTGGGGTTGATGATTCACAGGAGAAGGAGAAGGATAACGAGAAAGACAAAT
CTGAGCTTGAGCTTAAAGACATTCCATAAAACCAGAGATTTGTCTTGGATCTTTCTTCCC
ACTTGCTTGTTGTTGCTTTGAAGATTTTCATTTTTTTTTTTTGTATTTTTAAAACTATAA
TGTGTGTATGAAATACAAGCATTTCTACATATAGTTTGGATTGTAATTTTGTAAAATTTG
AAAACATTTGTTATTACTATTTAATGGTAGCTTTTCTTTTGCATC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR4C919TF 645 0 0
GCGAGGCAGAAGTTACCAACGGTTATAAGATAAGCGCGTTCTGGTTGACCCCACAGTATT
TCTTGGTCGGTGTGGGTGAAGCGTTTGCTTACGTTGGACAGCTTGAGTTCTTTATAAGAG
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GATTCTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTTTCTCTTGTTGATAAGGTTACGGACAAGAGCTGGC
TTAGAAGCAACCTTAACAAAGCGAGATTGAACTACTTCTACTGGTTGCTTGTTGTCTTGG
GAGCTTTTAACTTCTTGGTTTTTATAGTGTTTGCGATGAGGCATCAGTATAAAGCTGATA
TGATTAGTGTTGGGGTTGATGATTCACAGGAGAAGGAGAAGGATAACGAGAAAGACAAAT
CTGAGCTTGAGCTTAAAGACATTCCATAAAACCAGAGATTTGTCTTGGATCTTTCTTCCC
ACTTGCTTGTTGTTGCTTTGAAGATTTTCATTTTTTTTTTTTGTATTTTTAAAACTATAA
TGTGTGTATGAAATACAAGCATTTCTACATATAGTTTGGATTGTAATTTTGTAAAATTTG
AAAACATTTGTTATTACTATTTAATGGTAGCTTTTCTTTTGCATC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7784Contig1 764 2 4 U
GGAACTTGAAACGAACAAATATGGCTCTTAAAGCGATTCTCTTTCTTGGTTTGCTTCTCG
CCGTGATATCTTCTCCGACCACCGTCGATGGTGGATCAGTTTGTCCGAAGGCTTCCACTT
TTGGTAGAGGAAGCTTTCCCGATGGTTTCTTGTTCGGTGCCACAACTTCTGCTTTCCAGC
ATGAAGGTGCACCAGAGGAAGGAGGCAGAGGTTTGAGCATTTGGGACTCATTCACTCATA
AACATTCAGAGAAAAACAATAACCTTCTGGGAGTTGATTTCTATCACCATTACAAGGAAG
ATGTTCAACTATTGAAAAATTTGAACATGGATGCCTTTAGGTTCTCCATCTCTTGGTCAA
GAATCTTTCCTCATGGGAAAAAGGACAAGGGAGTGAGTGAAACCGGAGTTAAATTCTACA
ATGATCTCATCAACGAGCTCATTGCAAATGGTGTAACGCCTGTGGTTACATTATTCCAAT
GGGATGTACCTCAAGCCCTAGAAGATGAGTATGGCGGTTTCTTGAGTGACCGTATCTTGG
AGGACTTCCGAGAGTTTGCAAAATTTGCTTTCAACGAATATGGTGATAGAGTGAAGCATT
GGGTTACCATAAACGAGCCTCATGAGTTTAGCCTTGGTGGATACGGCACTGGAGAGAAAG
CACCAGGAAGGTGTTCTAAATGCGTTGCTGGAGATTCTGGACGTGAAGTCTACACCGTGA
GTCATAACTTGCTGTTGGCTCATGCTGAAGCTGTGGAAGAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY78TF U 1
AF RR4BC13TF U 49
BS 1 645 RR4FY78TF
BS 646 646 RR4BC13TF
BS 647 663 RR4FY78TF
BS 664 764 RR4BC13TF

RD RR4FY78TF 663 0 0
GGAACTTGAAACGAACAAATATGGCTCTTAAAGCGATTCTCTTTCTTGGTTTGCTTCTCG
CCGTGATATCTTCTCCGACCACCGTCGATGGTGGATCAGTTTGTCCGAAGGCTTCCACTT
TTGGTAGAGGAAGCTTTCCCGATGGTTTCTTGTTCGGTGCCACAACTTCTGCTTTCCAGC
ATGAAGGTGCACCAGAGGAAGGAGGCAGAGGTTTGAGCATTTGGGACTCATTCACTCATA
AACATTCAGAGAAAAACAATAACCTTCTGGGAGTTGATTTCTATCACCATTACAAGGAAG
ATGTTCAACTATTGAAAAATTTGAACATGGATGCCTTTAGGTTCTCCATCTCTTGGTCAA
GAATCTTTCCTCATGGGAAAAAGGACAAGGGAGTGAGTGAAACCGGAGTTAAATTCTACA
ATGATCTCATCAACGAGCTCATTGCAAATGGTGTAACGCCTGTGGTTACATTATTCCAAT
GGGATGTACCTCAAGCCCTAGAAGATGAGTATGGCGGTTTCTTGAGTGACCGTATCTTGG
AGGACTTCCGAGAGTTTGCAAAATTTGCTTTCAACGAATATGGTGATAGAGTGAAGCATT
GGGTTACCATAAACGAGCCTCATGAGTTTAGCCTTGGTGGATACG*CACTGGAGAGAAAG
CAC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4BC13TF 716 0 0
GTTTGCTTCTCGCCGTGATATCTTCTCCGACCACCGTCGATGGTGGATCAGTTTGTCCGA
AGGCTTCCACTTTTGGTAGATGAAGCTTTCCCGATGGTTTCTTGTTCGGTGCCACAACTT
CTGCTTTCCAGCATGAAGGTGCACCAGAGGAAGGAGGCAGAGGTTTGAGCATTTGGGACT
CATTCACTCATAAACATTCAGAGAAAAACAATAACCTTCTGGGAGTTGATTTCTATCACC
ATTACAAGGAAGATGTTCAACTATTGAAAAATTTGAACATGGATGCCTTTAGGTTCTCCA
TCTCTTGGTCAAGAATCTTTCCTCATGGGAAAAAGGACAAGGGAGTGAGTGAAACCGGAG
TTAAATTCTACAATGATCTCATCAACGAGCTCATTGCAAATGGTGTAACGCCTGTGGTTA
CATTATTCCAATGGGATGTACCTCAAGCCCTAGAAGATGAGTATGGCGGTTTCTTGAGTG
ACCGTATCTTGGAGGACTTCCGAGAGTTTGCAAAATTTGCTTTCAACGAATATGGTGATA
GAGTGAAGCATTGGGTTACCATAAACGAGCCTCATGAGTTTAGCCTTGGTGGATACGGCA
CTGGAGAGAAAGCACCAGGAAGGTGTTCTAAATGCGTTGCTGGAGATTCTGGACGTGAAG
TCTACACCGTGAGTCATAACTTGCTGTTGGCTCATGCTGAAGCTGTGGAAGAGTTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7785Contig1 421 2 1 U
GGGAGATTGGATCTGCCGAGTACGGTGGTGCAATGTCTAGCTACCAGTCTCCTTCCTTTG
ACGACGGCGGGGAGGTTAATCCTTTTGCGAATCCTCCAACTGTTCCTGCTGTGTATGAGC
ACACCACTGATATTCCTCTATACTCTCGGAAGGATCTGAAAGCCTGGAGTCACTCGTGAG
CATCTGGGTTATTCAGCAAGTATACATGTACTTCAGAGGGAGCGGTAAAGCAGCAGAGAT
GAAGCAGGAGGCAACAAGACGAGCAATGATGGCAGCTCTCTGACCACACACCCTTGAGTC
TTAACCATGAAGATACCATACAGACAGATCCTCTCCTTTTCACTCTTCTTTTGCTTCATT
TAACTAAATGTAACCAAAACTTCTTGATTTCTTTTTAACCATCATCTTTGAAAGGAGCCC
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RR4AI93JQ C 1
AF RR4AI93TF U 1
BS 1 421 RR4AI93TF

RD RR4AI93JQ 421 0 0
GGGAGATTGGATCTGCCGAGTACGGTGGTGCAATGTCTAGCTACCAGTCTCCTTCCTTTG
ACGACGGCGGGGAGGTTAATCCTTTTGCGAATCCTCCAACTGTTCCTGCTGTGTATGAGC
ACACCACTGATATTCCTCTATACTCTCGGAAGGATCTGAAAGCCTGGAGTCACTCGTGAG
CATCTGGGTTATTCAGCAAGTATACATGTACTTCAGAGGGAGCGGTAAAGCAGCAGAGAT
GAAGCAGGAGGCAACAAGACGAGCAATGATGGCAGCTCTCTGACCACACACCCTTGAGTC
TTAACCATGAAGATACCATACAGACAGATCCTCTCCTTTTCACTCTTCTTTTGCTTCATT
TAACTAAATGTAACCAAAACTTCTTGATTTCTTTTTAACCATCATCTTTGAAAGGAGCCC
C

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR4AI93TF 421 0 0
GGGAGATTGGATCTGCCGAGTACGGTGGTGCAATGTCTAGCTACCAGTCTCCTTCCTTTG
ACGACGGCGGGGAGGTTAATCCTTTTGCGAATCCTCCAACTGTTCCTGCTGTGTATGAGC
ACACCACTGATATTCCTCTATACTCTCGGAAGGATCTGAAAGCCTGGAGTCACTCGTGAG
CATCTGGGTTATTCAGCAAGTATACATGTACTTCAGAGGGAGCGGTAAAGCAGCAGAGAT
GAAGCAGGAGGCAACAAGACGAGCAATGATGGCAGCTCTCTGACCACACACCCTTGAGTC
TTAACCATGAAGATACCATACAGACAGATCCTCTCCTTTTCACTCTTCTTTTGCTTCATT
TAACTAAATGTAACCAAAACTTCTTGATTTCTTTTTAACCATCATCTTTGAAAGGAGCCC
C

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

CO CL7786Contig1 879 2 4 U
GTAAGATGCTTCTATCTGCCATCGACGAGCATTGTAAAGGAACATATGATTTCCTTTATT
TGCCAATTGACTTCAAGAACAAATGCAATGTGGGATATGCTTTCATCAACCTTGTCGAAC
CTGAAAAGATTGTACCATTTTATAAGGCGTTTAATGGAAAAAAGTGGGAAAAGTTTAACA
GCGAGAAGGTGGCAACTCTTACATATGCTAGAATCTAAGGGAAAGTAGCTCTTATTGCCC
ATTTCCAGAACTCAAGCTTAATGAACGAGGACAAACGTTGCCGGCCTATTCTTTTCCACA
CTGATGGTCCAAATGCTGGTGATCAGGAACCATTTCCAATGGGTACCAACATACGATCAA
GACCAGGAAAGCCACGAAGCAGTAGCATTGATAACCACAGCAGCTTTAGCATCCCTTCCG
TTTCAGAAAACCTAGAAGAACCTCCTAGTGGAACCGATCCTTTCTTGAAGGAGAACTAAC
CAACCAAGCAGAGGTAAATAAAGTTGAGGAAAAATGAAGATCTAAAGATAAGAATTTTTT
TATATTATAATCATATCATCAACACACCCTAGAGTTCTGTAAATCGGGGGGGGGGTGGGT
GTTAAATTTACCCTGACCAAACTCTTTTTGCAGTGAAGATTTTTTTTTGGAGAGAAACCT
TCACAGGTTACTTCACCAGTTTTGTTGTATTATCAAAATCCCCAGAGAAATCTTCCAAGA
GTTTCTCATTACCTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTCTCGTCTTGTTTGGGGTTATATTC
AAGGATTTTTGTCTTCTTGCTATCAATGTAGTATGTAACAAGCCTTGGATTACATTCAAC
GTCTTTGCTGACTATTTGTGGCCATTTATTTTTAATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FX28TF U 1
AF RR4FX28JQ C 132
BS 1 579 RR4FX28TF
BS 580 580 RR4FX28JQ
BS 581 594 RR4FX28TF
BS 595 879 RR4FX28JQ

RD RR4FX28TF 594 0 0
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TGCCAATTGACTTCAAGAACAAATGCAATGTGGGATATGCTTTCATCAACCTTGTCGAAC
CTGAAAAGATTGTACCATTTTATAAGGCGTTTAATGGAAAAAAGTGGGAAAAGTTTAACA
GCGAGAAGGTGGCAACTCTTACATATGCTAGAATCTAAGGGAAAGTAGCTCTTATTGCCC
ATTTCCAGAACTCAAGCTTAATGAACGAGGACAAACGTTGCCGGCCTATTCTTTTCCACA
CTGATGGTCCAAATGCTGGTGATCAGGAACCATTTCCAATGGGTACCAACATACGATCAA
GACCAGGAAAGCCACGAAGCAGTAGCATTGATAACCACAGCAGCTTTAGCATCCCTTCCG
TTTCAGAAAACCTAGAAGAACCTCCTAGTGGAACCGATCCTTTCTTGAAGGAGAACTAAC
CAACCAAGCAGAGGTAAATAAAGTTGAGGAAAAATGAAGATCTAAAGATAAGAATTTTTT
TATATTATAATCATATCATCAACACACCCTAGAGTTCTG*AAATCGGGGGGGGG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR4FX28JQ 748 0 0
GTACCATTTTATAAGGCGTTTAATGGAAAAAAGTGGGAAAAGTTTAACAGCGAGAAGGTG
GCAACTCTTACATATGCTAGAATCTAAGGGAAAGTAGCTCTTATTGCCCATTTCCAGAAC
TCAAGCTTAATGAACGAGGACAAACGTTGCCGGCCTATTCTTTTCCACACTGATGGTCCA
AATGCTGGTGATCAGGAACCATTTCCAATGGGTACCAACATACGATCAAGACCAGGAAAG
CCACGAAGCAGTAGCATTGATAACCACAGCAGCTTTAGCATCCCTTCCGTTTCAGAAAAC
CTAGAAGAACCTCCTAGTGGAACCGATCCTTTCTTGAAGGAGAACTAACCAACCAAGCAG
AGGTAAATAAAGTTGAGGAAAAATGAAGATCTAAAGATAAGAATTTTTTTATATTATAAT
CATATCATCAACACACCCTAGAGTTCTGTAAATCGGGGTGGGGGTGGGTGTTAAATTTAC
CCTGACCAAACTCTTTTTGCAGTGAAGATTTTTTTTTGGAGAGAAACCTTCACAGGTTAC
TTCACCAGTTTTGTTGTATTATCAAAATCCCCAGAGAAATCTTCCAAGAGTTTCTCATTA
CCTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTCTCGTCTTGTTTGGGGTTATATTCAAGGATTTTTG
TCTTCTTGCTATCAATGTAGTATGTAACAAGCCTTGGATTACATTCAACGTCTTTGCTGA
CTATTTGTGGCCATTTATTTTTAATGAA

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7787Contig1 1035 2 8 U
GTACCTCCTTATACATCAGTGGAATATCTCTAAACTCCAATCAAGTTTTCGCCATTACCA
CCACTCTTATCGTTCTTCCCACTGTTTGGCTTAGAGACCTTAGCTTATTGTCCTATATCT
CAGCCGGAGGGGTCTTCTCTTCAATCTTGCTTGCGCTCTGCCTCTTTTGGGTCGGATCCG
TAGGCGGAGTTGGATTTCAAATTCAAGGACAAATTCTTGATTTAACTAACCTACCTGTCG
CCATAGGAATATATGGGTTTGGTTTTGGTGGTCACTCTGTTTTACCCAACATTTACTCTT
CCATGAAAGAGCCTTCCAAGTTTCCAGTTGTGCTTCTTACAAGTTTTGGCCTTTGCACGC
TATTTTACATCGCTATATCGGTTTGTGGATACACTATGTTTGGCGAGGCGATACAATCCC
AGTTCACACTTAACATGCCTCAACATTTCACCTCATCTAAAATCGCGGTTTGGACAGCGG
TTATTACGCCAATGACAAAATACCCTTTAACGCTCACTCCCGTCTTGCTAAGCCTAGAAG
AACTCTTACCTTCTTCGTCAAGAAAGATGAGATCCAAAGGTGTTTCTATGCTTATCAGAA
CCATCTTAGTTCTCTCTACTTTGGTCGTCGCACTCACAGTCCCCTTCTTCGCTACTGTCG
CGGCTCTGATCGGATCTTTCGCCGCAATGCTTATCGCGGTAATATTCCCGTGTCTCTGTT
ATCTAAAGATTATGAAGGGTAGATTAACCAACTTTCAGATGGCGATTTGTATATTCATCA
TTATCGTCGGCGTTGTGAGCGGTTGCTGCGGAACTTACTCTGCTATTGTCAGATTAATCG
GCGAAATGACTTGACTCGTTTTGCGGAATAATAAGGAGCATATTCTTTCTTGAGAAAACT
TCACCCAAGTTTTTTAAAAAAATATATATATTTACTACTAGCAAGTTTTATTTCACCCAA
CTTCACCCAAGTTTTATTTTACAATGTTGCGGCTTAAGTTATCTATGGATTATATACTAT
ATTACGTCTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG90TF U 1
AF RR4AG90JQ C 236
BS 1 789 RR4AG90TF
BS 790 790 RR4AG90JQ
BS 791 812 RR4AG90TF
BS 813 813 RR4AG90JQ
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BS 828 855 RR4AG90TF
BS 856 1035 RR4AG90JQ

RD RR4AG90TF 855 0 0
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CCACTCTTATCGTTCTTCCCACTGTTTGGCTTAGAGACCTTAGCTTATTGTCCTATATCT
CAGCCGGAGGGGTCTTCTCTTCAATCTTGCTTGCGCTCTGCCTCTTTTGGGTCGGATCCG
TAGGCGGAGTTGGATTTCAAATTCAAGGACAAATTCTTGATTTAACTAACCTACCTGTCG
CCATAGGAATATATGGGTTTGGTTTTGGTGGTCACTCTGTTTTACCCAACATTTACTCTT
CCATGAAAGAGCCTTCCAAGTTTCCAGTTGTGCTTCTTACAAGTTTTGGCCTTTGCACGC
TATTTTACATCGCTATATCGGTTTGTGGATACACTATGTTTGGCGAGGCGATACAATCCC
AGTTCACACTTAACATGCCTCAACATTTCACCTCATCTAAAATCGCGGTTTGGACAGCGG
TTATTACGCCAATGACAAAATACCCTTTAACGCTCACTCCCGTCTTGCTAAGCCTAGAAG
AACTCTTACCTTCTTCGTCAAGAAAGATGAGATCCAAAGGTGTTTCTATGCTTATCAGAA
CCATCTTAGTTCTCTCTACTTTGGTCGTCGCACTCACAGTCCCCTTCTTCGCTACTGTCG
CGGCTCTGATCGGATCTTTCGCCGCAATGCTTATCGCGGTAATATTCCCGTGTCTCTGTT
ATCTAAAGATTATGAAGGGTAGATTAACCAACTTTCAGATGGCGATTTGTATATTCATCA
TTATCGTCG*CGTTGTGAGCGGTTGCTGCGGA*CTTACTCTGCTAT*GTCAGATTAATCG
GCGAAATGACTTGAC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4AG90JQ 800 0 0
TGTCGCCATAGGAATATATGGGTTTGGTTTTGGTGGTCACTCTGTTTTACCCAACATTTA
CTCTTCCATGAAAGAGCCTTCCAAGTTTCCAGTTGTGCTTCTTACAAGTTTTGGCCTTTG
CACGCTATTTTACATCGCTATATCGGTTTGTGGATACACTATGTTTGGCGAGGCGATACA
ATCCCAGTTCACACTTAACATGCCTCAACATTTCACCTCATCTAAAATCGCGGTTTGGAC
AGCGGTTATTACGCCAATGACAAAATACCCTTTAACGCTCACTCCCGTCTTGCTAAGCCT
AGAAGAACTCTTACCTTCTTCGTCAAGAAAGATGAGATCCAAAGGTGTTTCTATGCTTAT
CAGAACCATCTTAGTTCTCTCTACTTTGGTCGTCGCACTCACAGTCCCCTTCTTCGCTAC
TGTCGCGGCTCTGATCGGATCTTTCGCCGCAATGCTTATCGCGGTAATATTCCCGTGTCT
CTGTTATCTAAAGATTATGAAGGGTAGATTAACCAACTTTCAGATGGCGATTTGTATATT
CATCATTATCGTCGGCGTTGTGAGCGGTTGCTGCGGAACTTACTCTGCTATTGTCAGATT
AATCGGCGAAATGACTTGACTCGTTTTGCGGAATAATAAGGAGCATATTCTTTCTTGAGA
AAACTTCACCCAAGTTTTTTAAAAAAATATATATATTTACTACTAGCAAGTTTTATTTCA
CCCAACTTCACCCAAGTTTTATTTTACAATGTTGCGGCTTAAGTTATCTATGGATTATAT
ACTATATTACGTCTTTGATT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7788Contig1 727 2 4 U
GGAGTCACTTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCA
GGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACTT
CAAGAACACGAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATCGAACAAGGCCAAGAG
GTACTTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCCTTCACACGTTTCTGTCGTGG
TGTTGGTCGTACCGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTAGATGGCCTGC
TAAATCTGCTCAATTCGTTCTCGATCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCGAAG
GTTTGGATGTGGATGCACTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCTGCTAAACAGA
GGCGGAGGACATACCGTGCTCATGGAGGAATCAATCCGTACATGTCAAACCCATGCCACA
TTGAGTTGATATCGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGG
CTTCTAAGTCGAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGATTATATAGACAAGTAGCTTTTCGTGA
TCATCTCTGTTATAAGAACGTATGATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCTGTAAGACA
AGGAGCCAACATTTTCAAAGACATTATAATTATGTTGATTTGTTTTTGGAATACCAGAGC
TTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D468TF U 1
AF RR4D468JQ C 71
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BS 679 679 RR4D468JQ
BS 680 720 RR4D468TF
BS 721 727 RR4D468JQ

RD RR4D468TF 720 0 0
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CAAGAACACGAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATCGAACAAGGCCAAGAG
GTACTTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCCTTCACACGTTTCTGTCGTGG
TGTTGGTCGTACCGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTAGATGGCCTGC
TAAATCTGCTCAATTCGTTCTCGATCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCGAAG
GTTTGGATGTGGATGCACTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCTGCTAAACAGA
GGCGGAGGACATACCGTGCTCATGGAGGAATCAATCCGTACATGTCAAACCCATGCCACA
TTGAGTTGATATCGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGG
CTTCTAAGTCGAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGATTATATAGACAAGTAGCTTTTCGTGA
TCATCTCTGTTATAAGAACGTATGATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCTGTAAGACA
AGGAGCCAACATTTTCAA*GACATTATAATTATGTTGATTTGTTTTTGGAATACCAGAGC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4D468JQ 657 0 0
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AGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATCGAACAAGGCCAAGAGGTACTTGGAA
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ACCGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTAGATGGCCTGCTAAATCTGCT
CAATTCGTTCTCGATCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCGAAGGTTTGGATGT
GGATGCACTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCTGCTAAACAGAGGCGGAGGAC
ATACCGTGCTCATGGAGGAATCAATCCGTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGAT
ATCGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGGCTTCTAAGTC
GAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGATTATATAGACAAGTAGCTTTTCGTGATCATCTCTGT
TATAAGAACGTATGATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCTGTAAGACAAGGAGCCAAC
ATTTTCAAAGACATTATAATTATGTTGATTTGTTTTTGGAATACCAGAGCTTTGTTC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7789Contig1 660 2 3 U
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ATGCCACTATCTTCACCCGACTCACATTCTCTTGACGGTCGTCATTCTTGAACATCGCGT
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TCGACACCTTGGTCTTCACTTGGCCCTCAAGAGCTTCAGTCATGGACTTGTCAAACTGAA
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TCGATCTCCGGAGACAGCGAGGAGATAGATTGAACGGTGAATGCAGGAGCTACTACCGTT
TGGTCGATTGCGAAGGAGTTTTGTCTCTTTGAGTGGAGAAATGATTTGGGGCTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D449TF C 1
AF RR4D449JQ U 10
BS 1 9 RR4D449TF
BS 10 615 RR4D449JQ
BS 616 660 RR4D449TF

RD RR4D449TF 660 0 0
TTTTTTTTTCGAATAAACGAAATCTCAAGATCTTAAGAACTGTCTCATAGCAACATTGTC
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ATGCCACTATCTTCACCCGACTCACATTCTCTTGACGGTCGTCATTCTTGAACATCGCGT
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TCGACACCTTGGTCTTCACTTGGCCCTCAAGAGCTTCAGTCATGGACTTGTCAAACTGAA
CAAGGACTTGGATAGCAAGCTCAGGGCTTAGCGTACCGCTCTGAACCATCTCGTCCAAAG
TCTCCGTCAAACACATCCCGATCGTCGATCTCCTGTACAGCTCAAACGTCGCCATAACGA
TCGATCTCCGGAGACAGCGAGGAGATAGATTGAACGGTGAATGCAGGAGCTACTACCGTT
TGGTCGATTGCGAAGGAGTTTTGTCTCTTTGAGTGGAGAAATGATTTGGGGCTTTTATCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4D449JQ 606 0 0
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TCTTCACCCGACTCACATTCTCTTGACGGTCGTCATTCTTGAACATCGCGTCCTGTAATA
TGAAGGTCCAGACGTTGTCACAGAACCTGTAAGTGTGCAGGTGCCCCTTAATCGACACCT
TGGTCTTCACTTGGCCCTCAAGAGCTTCAGTCATGGACTTGTCAAACTGAACAAGGACTT
GGATAGCAAGCTCAGGGCTTAGCGTACCGCTCTGAACCATCTCGTCCAAAGTCTCCGTCA
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GGAGACAGCGAGGAGATAGATTGAACGGTGAATGCAGGAGCTACTACCGTTTGGTCGATT
GCGAAG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7790Contig1 651 2 1 U
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AAATAAGTACCTACCTATATAAAAGTGAACGGATCGTTGAGTTAAGTTTGGTTATGTTTC
ATTTTTCAGTCGACAGACAGTTATGTTCAGCAGTTTCGTAAGATGTTTATTTAAGTTTGT
GTTGTATTGTCTTGGTAAAATATTAAGTTTCAGATTCTACTCTCTGTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A828JQ C 1
AF RR4A828TF U 1
BS 1 651 RR4A828TF

RD RR4A828JQ 651 0 0
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AGAGAGAAATTGAACCAGTGAAATACTCAACCCGTCGTGTAATAACCTATATAGCTAATT
AAATAAGTACCTACCTATATAAAAGTGAACGGATCGTTGAGTTAAGTTTGGTTATGTTTC
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GTTGTATTGTCTTGGTAAAATATTAAGTTTCAGATTTTACTCTCTGTTTTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4A828TF 651 0 0
GCAAACTGTGGCAAGCTCTCTGTACTTCCAGAGGCTATAGGTAACTTGAGTAATCTTGAA
GTGTTGAGGTTGTGTTCTTGTATCAATCTCCATGAGCTGCCGGAATCAACTGAGAGGCTC
GGCAATTTACGGTTTCTGGATATTTCTGATTGTTTAGCACTGAAGAAGTTGCCTTTAGAG
ATTGGGAAGTTGCAGAAGCTGAAAAAAATATCGATGAGGATGTGTTTGGGATGCGAAGAA
TTACCGGATTCTGTGAAGAATTTAGGGAGATTGAAGGTAGATTGTGATGAAGATACTCGA
CTGTTGTGGGAAAGGTTGAAGCCAGAAATGGGGTTTTTCAAAATCCTGATGGGAATATAG
CAGAGCGTAACCTGAAAATAAATGCTAGTTTGTCCAAAGACTAAGGAAAGGAGAAGAAAG
AGAGAGAAATTGAACCAGTGAAATACTCAACCCGTCGTGTAATAACCTATATAGCTAATT
AAATAAGTACCTACCTATATAAAAGTGAACGGATCGTTGAGTTAAGTTTGGTTATGTTTC
ATTTTTCAGTCGACAGACAGTTATGTTCAGCAGTTTCGTAAGATGTTTATTTAAGTTTGT
GTTGTATTGTCTTGGTAAAATATTAAGTTTCAGATTCTACTCTCTGTTTTT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL7791Contig1 640 2 1 U
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BQ
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QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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TCTTCTTCCCCGAGAAATCGAACAGTCCACGATCTGTGACCTCTGTGGCCGCTGCTGATG
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GGAAAAGTTTTGTTTGCTCTGCTGATGAGAATACGAAACGATCAATGTATACTTGAGATT
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BQ
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QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

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GATACCATCGTTGGGACGAATTCATCTATCTTTCTGTTCC


BQ
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AF RR4EW47JQ C 1
AF RR4EW47TF U 1
BS 1 640 RR4EW47TF

RD RR4EW47JQ 640 0 0
GGAGAGGCGTTGGAGAGAGAGAAGTTGAGGATGAAGGATAAGGGGTTTACTGATGAAGAG
ATAGAGTTTGTGAATTTGAAGGTGCCCTTGGAGCCAAAAATTTATGAAGAGTTGGTGGCA
AAACATAAAAAGGAGGGAGAGTTGAGGAGGAGTCGCATCAATGCAGGAGTTGAGATCAGG
GACCAGGAGGCTGCTACTGGGGGAATCGTGGTTAGTGAGGGGAATGTTGAAGAGCTGCCG
GTGGAGCAGAAGGGGAAGAAGCGAAAGGGGAAGGAGAAAGTTGTGGATGAGGAGGATGAC
AAAGAGTTTGCCGAGCGGTCGGCCAAGATTGGGCGCGAGAAGATTAAAAAGATACAGGGA
CCAGGAGGCAGCGATATCTAGGTGGTTCCTGTTCCTTTTGTGTCGGGTTTAAGCATTTGC
CTGAGCCGATGAAACTTCTTTATTTTCCTACGTTTGACCAGGAGGCAGCGATATCTAGGT
GGTTCCTGTTCCTTTTGTGTCGGGTTTAAGCATTGGCCTGAGCCGATGAAACTTCTTTAT
TTTCCTACGTTTGCTTGACACAGTTCAATGATATTGTAAATGTGCCCTCTCTTTTTGTTG
GATACCATCGTTGGGACGAATTCATCTATCTTTCTGTTCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4EW47TF 640 0 0
GGAGAGGCGTTGGAGAGAGAGAAGTTGAGGATGAAGGATAAGGGGTTTACTGATGAAGAG
ATAGAGTTTGTGAATTTGAAGGTGCCCTTGGAGCCAAAAATTTATGAAGAGTTGGTGGCA
AAACATAAAAAGGAGGGAGAGTTGAGGAGGAGTCGCATCAATGCAGGAGTTGAGATCAGG
GACCAGGAGGCTGCTACTGGGGGAATCGTGGTTAGTGAGGGGAATGTTGAAGAGCTGCCG
GTGGAGCAGAAGGGGAAGAAGCGAAAGGGGAAGGAGAAAGTTGTGGATGAGGAGGATGAC
AAAGAGTTTGCCGAGCGGTCGGCCAAGATTGGGCGCGAGAAGATTAAAAAGATACAGGGA
CCAGGAGGCAGCGATATCTAGGTGGTTCCTGTTCCTTTTGTGTCGGGTTTAAGCATTTGC
CTGAGCCGATGAAACTTCTTTATTTTCCTACGTTTGACCAGGAGGCAGCGATATCTAGGT
GGTTCCTGTTCCTTTTGTGTCGGGTTTAAGCATTGGCCTGAGCCGATGAAACTTCTTTAT
TTTCCTACGTTTGCTTGACACAGTTCAATGATATTGTAAATGTGCCCTCTCTTTTTGTTG
GATACCATCGTTGGGACGAATTCATCTATCTTTCTGTTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7794Contig1 827 2 2 U
TCATTAGCCGCTCATGGCCGTCTGCGATATCCCACGCCGTCTATCTCCCGTAGTAATCTC
TTCTCCACATCGGCTAGAAAGAAAGCTTCTTCAACCGATCTGCCTCTCCGAGTGATCGAA
ACCGAGATCGGATTCGCCGAGCAAGCCGATGATTACGATCGAGTCGAAGAAACTCCAAGT
GGTTTCCCTTTTAAGATGGAAGACAAACCAGGATCCAAGGTCGTGACATTGACTAGAGAT
TACCAAGGAGAGAGTGTTGTAGTTGAAGTACACATGACTAATCTTGTGACAGGTGATAAA
GGAGACGACGAAGAGAGTGAGGAAGAGAGTGAAGAAGAAGATGAAGAAGAGCATGAGGAT
AAGCCGGAGAAGCCTAAGCAATCAAATGTGCCTCTTTTGGTAACGCTTTCCAAGAAGACA
GGACCGAGTTTGGAGTTTAGGTGTACTGCTTTTCCTGACAAGATTGTGATCAAGGACATG
TGGGTTACGTTTCCCGATGGTCCTTCCAGGGATGAACTTGCCTATGAAGGCCCTTCCTTC
CGGGTTTTGGATGAAAAGTTAAGGAAGGCTTTTCATAGGTACATCGAGATTAGGGGGATA
ACGCCTGGCATGATCAACTTCTTGCACGAGTATATGATCAACAAGGATAGTAAAGAGCAC
CTACTTTGGTTGAAAACGCTCAAGAACTTTGTCAAGTCTTGAGGGGAGGGGGAAATAACA
CTTTTTTTTAAGTTGTTAGATGCTCTGTCTTTCAAAACTTGTAGTTGAAACACTATTCTG
TTTTGTTTGGATCTATTTATATGATTAAAAAAGAGCATTGTGAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU36TF U 1
AF RR4CU36JQ C 43
BS 1 110 RR4CU36TF
BS 111 827 RR4CU36JQ

RD RR4CU36TF 110 0 0
TCATTAGCCGCTCATGGCCGTCTGCGATATCCCACGCCGTCTATCTCCCGTAGTAATCTC
TTCTCCACATCGGCTAGAAAGAAAGCTTCTTCAACCGATCTGCCTCTCCG

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR4CU36JQ 785 0 0
TATCT
CCGTAGTAATCTCTTCTCCACATCGGCTAGAAAGAAAGCTTCTTCAACCGATCTGCCTCT
CCGAGTGATCGAAACCGAGATCGGATTCGCCGAGCAAGCCGATGATTACGATCGAGTCGA
AGAAACTCCAAGTGGTTTCCCTTTTAAGATGGAAGACAAACCAGGATCCAAGGTCGTGAC
ATTGACTAGAGATTACCAAGGAGAGAGTGTTGTAGTTGAAGTACACATGACTAATCTTGT
GACAGGTGATAAAGGAGACGACGAAGAGAGTGAGGAAGAGAGTGAAGAAGAAGATGAAGA
AGAGCATGAGGATAAGCCGGAGAAGCCTAAGCAATCAAATGTGCCTCTTTTGGTAACGCT
TTCCAAGAAGACAGGACCGAGTTTGGAGTTTAGGTGTACTGCTTTTCCTGACAAGATTGT
GATCAAGGACATGTGGGTTACGTTTCCCGATGGTCCTTCCAGGGATGAACTTGCCTATGA
AGGCCCTTCCTTCCGGGTTTTGGATGAAAAGTTAAGGAAGGCTTTTCATAGGTACATCGA
GATTAGGGGGATAACGCCTGGCATGATCAACTTCTTGCACGAGTATATGATCAACAAGGA
TAGTAAAGAGCACCTACTTTGGTTGAAAACGCTCAAGAACTTTGTCAAGTCTTGAGGGGA
GGGGGAAATAACACTTTTTTTTAAGTTGTTAGATGCTCTGTCTTTCAAAACTTGTAGTTG
AAACACTATTCTGTTTTGTTTGGATCTATTTATATGATTAAAAAAGAGCATTGTGAAGTC

QA 6 785 6 785
DS 



AS 1 2

CO CL7795Contig1 773 2 1 U
GGAATCTTTCGAATCTCCTCCGACCAATGGCTCTCCAAGCCACCACTACTACGTTCTCCT
TCTCCGCTCCTACTTTCCGATCAACTCCTCCTCCTCACGCATTCACTTCGAAGCGTCGTC
TCTCCATCAAATCTTCTTCTTCGGGACTCTCTTCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTCTTT
CACGATCTAATCTCAAAGGAAGAGCCTTTTCAAGTGATGGCTCATCAACGCAAGAGTCTC
CCTCAGTGGTCTGTTTCGGAGAAATGCTGATCGACTTCGTACCAACCACTAGTGGGCTTT
CATTGGCCCAAACACCAGCTTTCAAAAAGGCTCCAGGTGGTGCCCCTGCCAATGTCGCCG
TTGGTATCGCTCGTCTCGGTGGCTCTTCAGCTTTCATTGGCAAGGTTGGTGAAGATGAGT
TTGGTTATATGCTTGCGTTTGTTGCCGGAATACTATCTCAACTAGCATGTGATCTCTCTT
TGCTTCAGGACGAAGAAAGACTGAGAGAGGCTCTAATGTTTGCGAATGCGTGTGGTGCCT
TGACCGTAAAGGAGAGAGGTGCAATACCTGCACTTCCTACAAAACAAGCTGTACTCGACG
CCCTACTCAAAGCCGTCGTCTAAAATTCAAATCTGTATTTGTTTTTTGTTGTAACATAAC
TGTATGTTATTAGTTATTTGTCACATTGTTATTATGCTAGCAGCTAACTAATAAACTAGC
CTGCTTTGTCAAGTCAAGAGGTATATTTAAAAATAAAAAAACTATTTCTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AN79TF U 1
AF RR4AN79JQ C 134
BS 1 773 RR4AN79TF

RD RR4AN79TF 773 0 0
GGAATCTTTCGAATCTCCTCCGACCAATGGCTCTCCAAGCCACCACTACTACGTTCTCCT
TCTCCGCTCCTACTTTCCGATCAACTCCTCCTCCTCACGCATTCACTTCGAAGCGTCGTC
TCTCCATCAAATCTTCTTCTTCGGGACTCTCTTCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTCTTT
CACGATCTAATCTCAAAGGAAGAGCCTTTTCAAGTGATGGCTCATCAACGCAAGAGTCTC
CCTCAGTGGTCTGTTTCGGAGAAATGCTGATCGACTTCGTACCAACCACTAGTGGGCTTT
CATTGGCCCAAACACCAGCTTTCAAAAAGGCTCCAGGTGGTGCCCCTGCCAATGTCGCCG
TTGGTATCGCTCGTCTCGGTGGCTCTTCAGCTTTCATTGGCAAGGTTGGTGAAGATGAGT
TTGGTTATATGCTTGCGTTTGTTGCCGGAATACTATCTCAACTAGCATGTGATCTCTCTT
TGCTTCAGGACGAAGAAAGACTGAGAGAGGCTCTAATGTTTGCGAATGCGTGTGGTGCCT
TGACCGTAAAGGAGAGAGGTGCAATACCTGCACTTCCTACAAAACAAGCTGTACTCGACG
CCCTACTCAAAGCCGTCGTCTAAAATTCAAATCTGTATTTGTTTTTTGTTGTAACATAAC
TGTATGTTATTAGTTATTTGTCACATTGTTATTATGCTAGCAGCTAACTAATAAACTAGC
CTGCTTTGTCAAGTCAAGAGGTATATTTAAAAATAAAAAAACTATTTCTTTGG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4AN79JQ 640 0 0
TTCTTCTTCGGGACTCTCTTCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTCTTTCACGATCTAATCT
CAAAGGAAGAGCCTTTTCAAGTGATGGCTCATCAACGCAAGAGTCTCCCTCAGTGGTCTG
TTTCGGAGAAATGCTGATCGACTTCGTACCAACCACTAGTGGGCTTTCATTGGCCCAAAC
ACCAGCTTTCAAAAAGGCTCCAGGTGGTGCCCCTGCCAATGTCGCCGTTGGTATCGCTCG
TCTCGGTGGCTCTTCAGCTTTCATTGGCAAGGTTGGTGAAGATGAGTTTGGTTATATGCT
TGCGTTTGTTGCCGGAATACTATCTCAACTAGCATGTGATCTCTCTTTGCTTCAGGACGA
AGAAAGACTGAGAGAGGCTCTAATGTTTGCGAATGCGTGTGGTGCCTTGACCGTAAAGGA
GAGAGGTGCAATACCTGCACTTCCTACAAAACAAGCTGTACTCGACGCCCTACTCAAAGC
CGTCGTCTAAAATTCAAATCTGTATTTGTTTTTTGTTGTAACATAACTGTATGTTATTAG
TTATTTGTCACATTGTTATTATGCTAGCAGCTAACTAATAAACTAGCCTGCTTTGTCAAG
TCAAGAGGTATATTTAAAAATAAAAAAACTATTTCTTTGG

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7796Contig1 968 2 6 U
GAGTCAAGACTTAGTCAAGAGTTTGAAGAATGGGGTAGTAACGAGGTTGCAAATGGTGAA
TCCGTTTCTCAGCTTGACACTGGTTCAAATGCTGAGTTACCTACTGCTGCTATAGCTTCC
AGGCATCATCAGACCATCGGTTCGTTCCTGGATTCACGAGGGGCATCTGAACTGGATGCT
ACAGTGGACTCTCCTGCTTTCTGGAACTTGTCTTCCCTTAACCAACCAGAGAATAATGAG
ACAAGTCAGATGAGGAAGAAATGGGGAGCTGCTCAGAAACGCCTTGGTGCTGGTAATAAT
CAATCTCAGAGCCAGTGCCAGCAGGATGTGACTAAAGGGTTGAAAAGGCTGTTGAATTTT
GGAAGGAAGAACCGTGCGGCTGAGAATTTGGCTGACTGGATATCTGCTACAACCTCTTAA
GGGGATGATGATACTGAAGACGGACGAGATCTTGCAAATCGATCATCAGAAGACTTGAGG
AAGTCGAGAATGGGATTTTTGCAGACACAGGCCTCTGATGATAGCTTCAACGAGTGTGAG
CTATACAATGAACAAGCCCAAAACACAAGTGCACCTTTAAGCTTTAAACTGAAGGAGGAT
CAGGTGTCCGGAGCTTCTGTAAAAGCACCAAGGTCATTCTTTTCACTCTCCAATTTTCGT
AGCAAAGGAAAATGATTCTAAACCCAAAGATTCATAGGATCTAAGCGAATGAAAGATAAA
AAGAAAAAAAGATTCACATCACAGGCAGTGGCCACACGAGTGAAATGATCTTTGAGATAT
TACGTGCTGTGAATGTATCATTGAGAATAGTTCCTCTTGTATTCATAATCATCCCCTGTT
TACATTTGTAAATTCGTATCAAACCGGAAACATATGTCCTTATCGGTTTGGAATCCATGT
GATTTTGGTAGTACAAAACAAAAGGATGGCAATGTTTATTTAACAAGTTTATATATTGTT
GAAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B351TF U 1
AF RR4B351JQ C 198
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AAGAAAAAA*GATTCACATCACAGGCAGTGGCCACACGAGTGAAATGATCTTTGAGATAT
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TACATT

QA 1 846 1 846
DS 

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GGCTGAGAATTTGGCTGACTGGATATCTGCTACAACCTCTTAAGGGGATGATGATACTGA
AGACGGACGAGATCTTGCAAATCGATCATCAGAAGACTTGAGGAAGTCGAGAATGGGATT
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CCAAAACACAAGTGCACCTTTAAGCTTTAAACTGAAGGAGGATCAGGTGTCCGGAGCTTC
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CTAAACCCAAAGATTCATAGGATCTAAGCGAATGAAAGATAAAAAGAAAAAAAGATTCAC
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TCATTGAGAATAGTTCCTCTTGTATTCATAATCATCCCCTGTTTACATTTGTAAATTCGT
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QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA23TF U 1
AF RR4GK65TF U 8
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TCTGAGTTTGGTTTTTTTACCTAAGAAATATTCAATCTTTAGATTTAATTGATAAAAAAT
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ACACTTCACTCTCAACCGCCATTGTTGAACCAGCTCGAGTTTGGATCGGCCGTGGTGACT
GTCCGGAGTCTTAGAGTGAAGCTCGAGCAATAATCACTCTGTGTTGCCGTGATCTCAGAC
CTTCTCCCTGATCTCTGGTGAACCGTAAATCAATGGCGGCATTTCTCGGAGCTCGAGATC
ACCATTGACGAACCTTGACTTCAAGTTTGTGAATTTTCACCTCCACCACAATTTGCTTGA
TTAAAGATAGCTCGGCTGGTAGGCCTAGCTCGGTTTGTAGGGTCGGATTTACACTCCCCC
TGTTGCGGCTCACCAGATACAGTCTTGCTTGGGAGACTCCTAACTTCTCTAGCCACTGTG
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QA 1 672 1 672
DS 

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GGGAA
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CAACACTTCGCTTTAAAAGATAGATTGTTTCCTCTCACCCTCTTCTGATCTGAGTTTGGT
TTTTTTACCTAAGAAATATTCAATCTTTAGATTTAATTGATAAAAAATCAGTTTCAAGTT
TCATCCTCCTCTGTTCAAGTTCAAGTCCAAACAATGGCGATCTCATCTACACTTCACTCT
CAACCGCCATTGTTGAACCAGCTCGAGTTTGGATCGGCCGTGGTGACTGTCCGGAGTCTT
AGAGTGAAGCTCGAGCAATAATCACTCTGTGTTGCCGTGATCTCAGACCTTCTCCCTGAT
CTCTGGTGAACCGTAAATCAATGGCGGCATTTCTCGGAGCTCGAGATCACCATTGACGAA
CCTTGACTTCAGGTTTGTGAATTTTCACCTCCACCACAATTTGCTTGATTAAAGATAGCT
CGGCTGGTAGGCCTAGCTCGGTTTGTAGGGTCGGATTTACACTCTCCCTGTTGCGGCTCA
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CTGCGGTGAAACTTTAAATGGATGGCTTCCGCGAAAGTTGATTCTTTTAAGAAGATTGAG
AAGAACGAATGTGTTGTCACACATTAATGTCCATGTCACATCTCTAGTGTCACATTTCTA
TCAT

QA 6 729 6 729
DS 



AS 1 2

CO CL7798Contig1 640 2 1 U
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TATATGCTACTTGGTTTGTCTTCCAATTAATAAAAGTGAACCAACTTTTAGGAGAGTTTA
TTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATACAG


BQ
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AF RR4B803TF U 1
AF RR4BE55TF U 1
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CATTGGAGAACATATCAGTTACAGCTATGTGCAGGAATTAAAAAAAACAATATTTTGTTT
TGGCTTTTCCATTAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATGATGGTG
GGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGTGGATGATGCAGCAACAGC
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TTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATACAG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GL57TF U 1
AF RR4GL57JQ C 72
BS 1 692 RR4GL57TF
BS 693 693 RR4GL57JQ
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CGAAGATGAGGAGGAGGAGGAAGACATCAACAACGACGGCGACACGGCGGCGGCTGGAGG
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GGACGCAGGGATCGGTGGAACGGCAAAGGGAAGAGATCTAAAGATATTGAGGAACGTGAT
TTGGGGAGAAGATCGGACTTCTGGATTAGTGATAATTAGTATATCAATTAATTATAAACT
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QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4GL57JQ 782 0 0
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TTAACCGGAAAGCGCCAAAGACCGGTTCGCTTCCGGTTAACATACCCGACTGGTCGAAGA
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TCGGTGGAACGGCAAAGGGAAGAGATCTAAAGATATTGAGGAACGTGATTTGGG*AGAAG
ATCGGACTTCTGGATTAGTGATAATTAGTATATCAATTAATTATAAACTCCAATAGGTTA
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TTTTGTGGAGTTTTGATCATCCAATCCTTTTCATTTTGGATAATGATAAATGAAAATTTT
AT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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ATATATTAAGATGTGATAAAGTTGTAATGTTTTTCAAAAGCCAAAGTAAATACAATGTTC
AACTCTCTTTTCTTTTTCTTCTCCATTTCCATTAATGAAAAA


BQ
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AF RR4FN66TF U 1
AF RR4FN66JQ C 324
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ATACTTGTGGAACTACTATCAAAGCACACTGGGAATTCTGTGGAGACTGTGGCTAACGTG
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GCTAAAGATTT

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TGAACGAGTTTAGTTTTAAGTCCTCTGGCCTCAAATCTCCGTTTTAATGGAGAACAATGA
ACAGAATTACAGACTTATCAAACTCCTTTAGCTGTGAGCCTGTGACTGCCTTATTTCGAA
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CATTTCCATTAATGAAAAA

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DN90JQ C 1
AF RR4DN90TF U 1
BS 1 655 RR4DN90TF

RD RR4DN90JQ 655 0 0
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TTTGGGACTGACTTTGTGTGACCAAATCTTACTTATATGCCAATTGTTATCTAAAGATTA
AACGGACCTATTATTAATTAAATTAATTATACTACTAATATGTTCTTGTAACATT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4DN90TF 655 0 0
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GGAACACCTTTAATCCTTTTTACAAAAAGAAAAATGGCACGTCAATTTGTAGTATTTGGT
CTATTGGCTTTGGTGGTGGCCACCGTATTCGCTGCTGAGGCACCCTCAGCTGCTCCCACC
GCCTCCCCTACCAAGGCACCCGCCACCAAGGCTCCGGCTGCTGCACCCAAATCCTCCACC
TCAGCATCCGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTGGCAGAAGAACCAACAGCCGAAGACGAT
TACACAGGAAACAGCCCCACTGAATCTGTCGAGGGACCCACCGTCTCCTCCCCACCAGCT
CCTACCCCTGAGGCTTCGGCTGATGGACCATCATCCGATGCACCCACCCCTGGCCCCGAG
GTACTTGATGGCAGCGCCACTAACGTGAAGCTCTCCATCGCCGGCACTGTCGCCGCCCTC
GGATTCTTCTTCTTCTCTCTCTAAGAAGTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAACGACAACCTTG
TTTGGGACTGACTTTGTGTGACCAAATCTTACTTATATGCCAATTGTTATCTAAAGATTA
AACGGACCTATTATTAATTAAATTAATTATACTACTAATATGTTCTTGTAACATT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL7804Contig1 721 2 5 U
AAGATCAAGAATCATCAAGATGCTATTATTTATCTTCTCTTTGGAACTTTTATTCCAAAA
CAAACAGAGTCTACAAATTATTTAAGAACCGAGATATTCTTCTATGGTTTTGTAGATCAT
AAAAATAAAACTTAAAAAATCAACTTGTAATCACTCACTCCTCCCTTTCAAAAGTTCTTC
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TTTGGGTTCTCGCTTATCATGACCCGCATAGGAGAGAGGTCGAAGTGAAACTTTGCAACA
GGGTAATAGTAACCATGAGCCACACTGCTATGAGCTGTATATTCATATTCCTCAATCACC
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TCGATAGTAACATTAGCAGCAAACTTTCCTTCATTAACGAACCATTTTCCATTAAGCCTG
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ATCATCCTACCAAACGATAGATGGCTTACAAAATGTGTCATGTTCATTCGAGAAGCATCG
AATGAATGAACTCCCGAAACAGCTGAGATAACGAGTTCACCAGGAACCTTCTTGGCACGC
C


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10 

AF RR4EI44JQ U 17
AF RR4G240TF C 1
BS 1 16 RR4G240TF
BS 17 624 RR4EI44JQ
BS 625 625 RR4G240TF
BS 626 669 RR4EI44JQ
BS 670 721 RR4G240TF

RD RR4EI44JQ 664 0 0
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AAATCAACTTGTAATCACTCACTCCTCCCTTTCAAAAGTTCTTCCCTAGTTCGACCTTTT
TCATTATTCCGTAAGTGCTTTGAAATATCGAATCTAGTATCCCGGCAACCGTGAAAACAC
CACCTATTATGGCGCAAACATTTGTAACGAAGTGTGAGAATGACTTTGGGTTCTCGCTTA
TCATGACCCGCATAGGAGAGAGGTCGAAGTGAAACTTTGCAACAGGGTAATAGTAACCAT
GAGCCACACTGCTATGAGCTGTATATTCATATTCCTCAATCACCGAGTGTTCTTGACCGA
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CAGCAAACTTTCCTTCATTAACGAACCATTTTCCATTAAGCCTGTCATGGCTTAGACCAA
GATAAGGCAGTAACCGTTTCATATCAGTCAACAACCTAGCTGAAATCATCCTACCAAACG
ATAGATGGTTTACAAAATGTGTCATGTTCATTCGAGAAGCATCGAATGAATGA
GCCCCTGAAAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4G240TF 721 0 0
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CAAACAGAGTCTACAAATTATTTAAGAACCGAGATATTCTTCTATGGTTTTGTAGATCAT
AAAAATAAAACTTAAAAAATCAACTTGTAATCACTCACTCCTCCCTTTCAAAAGTTCTTC
CCTAGTTCGACCTTTTTCATTATTCCGTAAGTGCTTTGAAATATCGAATCTAGTATCCCG
GCAACCGTGAAAACACCACCTATTATGGCGCAAACATTTGTAACGAAGTGTGAGAATGAC
TTTGGGTTCTCGCTTATCATGACCTGCATAGGAGAGAGGTCGAAGTGAAACTTTGCAACA
GGGTAATAGTAACCATGAGCCACACTGCTATGAGCTGTATATTCATATTCCTCAATCACC
GAGTGTTCTTGACCGAACCTTCTTGAAACGACTTCTGTTTTGACTACTTGAAGATAATGT
TCGATAGTAACATTAGCAGCAAACTTTCCTTCATTAACGAACCATTTTCCATTAAGCCTG
TCATGGCTTAGACCAAGATAAGGCAGTAACCGTTTCATATCAGTCAACAACCTAGCTGAA
ATCATCCTACCAAACGATAGATGGCTTACAAAATGTGTCATGTTCATTCGAGAAGCATCG
AATGAATGAACTCCCGAAACAGCTGAGATAACGAGTTCACCAGGAACCTTCTTGGCACGC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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TTATGAGCTCGAAGGAGAAACCCACTCTCGGAGGTACGCGGATTAAGACCCGCAAGCGGA
ATATTGCTGCTCCTCTGGACCCTGCAGCTTTTTCTGATGCAGTAGTCCAGATTTACCTTG
ATAATGCTGGTGATTTGGAACTTGTTGCCAAAAGTATTGAGTCAACAGATCTTAATTTCT
CAAGATACGGTGACATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGACGACGTACACAACCTGGAA
CAGTGAAGCCTGATGAGGGTGAACGTCATCCTTACTCTGTAATCGACTGCGAGCCCACGC
GTGAAGCCATTTTGCCATCTGTTGTCTATATACAGAAGATTCTGCGGAGGAGGCCGTCGC
TCATAAAGAACCTCGAAAATGTTACAAGGAGATTCCTGCAGTCTCTGGAGCTTTTTGAGG
AAAATGAAAGGAAGAAGCTTGCCATCTTCACAGCACTTGCCTTTTCCCAGAAGCTCTCTG
GATTACCTCCGGAGACTGTCTTCCAGCCTTTGCTCAAGGATAATCTTGTTGCCAAAGGGA
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TACATTCAAGAAATGTTTGAGTGAACTGAGAATCAAACCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4BX12TF U 1
AF RR4CG38TF U 6
BS 1 199 RR4BX12TF
BS 200 200 RR4CG38TF
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RD RR4BX12TF 675 0 0
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ATAATGCTGGTGATTTGGAGCTTGTTGCCAAAAGTATTGAGTCAACAGATCTTAATTTCT
CAAGATACGGTGACATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGACGACGTACACAACCTGGAA
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ACTTGATTTCTATTC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4CG38TF 818 0 0
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TCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGACGACGTACACAACCTGGAACAGTGAAGCCTGATG
AGGGTGAACGTCATCCTTACTCTGTAATCGACTGCGAGCCCACGCGTGAAGCCATTTTGC
CATCTGTTGTCTATATACAGAAGATTTTGCGGAGGAGGCCGTCGCTCATAAAGAACCTCG
AAAATGTTACAAGGAGATTCCTGCAGTCTCTGGAGCTTTTTGAGGAAAATGAAAGGAAGA
AGCTTGCCATCTTCACAGCACTTGCCTTTTCCCAGAAGCTCTCTGGATTACCTCCGGAGA
CTGTCTTCCAGCCTTTGCTCAAGGATAATCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTTTG
TAACAGACTTCTTCAAGGAGTATTTGGTTGAGAACAGTCTTGAAGACTTGATTTCTATTC
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TTTGAGTGAACTGAGAATCAAACCGTTC

QA 11 818 11 818
DS 



AS 1 2

CO CL7806Contig1 703 2 1 U
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AGAATCGTGGTGAAAACTAAACTGTTGAACCATCCTTTGTTCAAGAACTTGTTAGAAGAT
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TTCTTCTTCAAGGTTTTGGCTGAAATAAAGTCCGATGTTCACGGTGATGATGATGAAGAT
GATGATGGTTTGATTAGTTCTCCGATTTGCGGGTTGGGTAGTCCCTGTGGTGGTCTCGAT
TCCATTGGCATGAGAAGAAACGGTTCTTACAAGCTTCTTCGATCTCCATCTTTGTTCAAG
TTGAATGATTTTGAATTTCTTTTTCTTTTCCATAATATTATATACTTGTTATTGTTCACA
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AACCCTCACGTTTCCGAATGCAATTTGCATAAACAACTTCCCATAGTATTTTCTTGTGAT
TCTGATGTCGATTTATATCAGATGTGTCAAAATGTTTATAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FH40TF U 1
AF RR4FH40JQ C 64
BS 1 703 RR4FH40TF

RD RR4FH40TF 703 0 0
GGAATGAAGACATGGAGAAAAGTAAAGACTTTTGGCAAAACGAGCTCTTCAACCACGGCC
TCTCTCACAAGTAGCAAGACTTGGAATGGCTCTGCTTATCTCGAGGATGCTAAGAACAGG
GAATCCATAGGAAAGATCAAGAAAAAGTGTTTCACTGTTTACGTGGGTCCCATGAAACAG
AGAATCGTGGTGAAAACTAAACTGTTGAACCATCCTTTGTTCAAGAACTTGTTAGAAGAT
GCAGAGAATGAATATGGATATGGACGTGATGGGCCCATTGTTCTTCCTTGCGAGGTTGAC
TTCTTCTTCAAGGTTTTGGCTGAAATAAAGTCCGATGTTCACGGTGATGATGATGAAGAT
GATGATGGTTTGATTAGTTCTCCGATTTGCGGGTTGGGTAGTCCCTGTGGTGGTCTCGAT
TCCATTGGCATGAGAAGAAACGGTTCTTACAAGCTTCTTCGATCTCCATCTTTGTTCAAG
TTGAATGATTTTGAATTTCTTTTTCTTTTCCATAATATTATATACTTGTTATTGTTCACA
ACCTTACTATATGTATTTACGTCTCAAGCTTGAGTAGAGAAAAAATGTGAGGCAAAAAAG
AACCCTCACGTTTCCGAATGCAATTTGCATAAACAACTTCCCATAGTATTTTCTTGTGAT
TCTGATGTCGATTTATATCAGATGTGTCAAAATGTTTATAACT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4FH40JQ 640 0 0
CTCACAAGTAGCAAGACTTGGAATGGCTCTGCTTATCTCGAGGATGCTAAGAACAGGGAA
TCCATAGGAAAGATCAAGAAAAAGTGTTTCACTGTTTACGTGGGTCCCATGAAACAGAGA
ATCGTGGTGAAAACTAAACTGTTGAACCATCCTTTGTTCAAGAACTTGTTAGAAGATGCA
GAGAATGAATATGGATATGGACGTGATGGGCCCATTGTTCTTCCTTGCGAGGTTGACTTC
TTCTTCAAGGTTTTGGCTGAAATAAAGTCCGATGTTCACGGTGATGATGATGAAGATGAT
GATGGTTTGATTAGTTCTCCGATTTGCGGGTTGGGTAGTCCCTGTGGTGGTCTCGATTCC
ATTGGCATGAGAAGAAACGGTTCTTACAAGCTTCTTCGATCTCCATCTTTGTTCAAGTTG
AATGATTTTGAATTTCTTTTTCTTTTCCATAATATTATATACTTGTTATTGTTCACAACC
TTACTATATGTATTTACGTCTCAAGCTTGAGTAGAGAAAAAATGTGAGGCAAAAAAGAAC
CCTCACGTTTCCGAATGCAATTTGCATAAACAACTTCCCATAGTATTTTCTTGTGATTCT
GATGTCGATTTATATCAGATGTGTCAAAATGTTTATAACT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7807Contig1 643 2 1 U
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TCATTTTCACCCTGCAGAGCTCGCGATCTTATTTGAACTCCTCGGATATTAAGAGAGAGA
GAGAGATGGCGTCGAGAAACTCCGTAGCCGGATTCGCGTTATTCACATTTGTATTCGCCG
TCATCTCGTCTCTCGCCGGTGCTCAAACCCTAGCTCCCGCTCCAGCTCCCACCAGTGACG
GTAACTATCTCCCTCCTCTCCTCGCATTTCCCTTCCGGATCTGAATCCCGTGAAATCTGG
AATAACCGAGATCTAATTGGTGTGTGTGGTTTAATTGACGTTTTGGTTTAATTTGGTTAA
TGATGATGAACAGCAGGGACATCGATAGACCAAGGGATTGCGTATTTGCTAATGGTGGTG
GCGCTTGTCCTCACTTACCTTATCCATCCTCTCGATGCTTCTTCTTCCCTCTCCTTCTTC
TGATTTTTCTTTTTATCCTTCTAGTAGTTTGTGGATAACATTCTCTTTAAAGAGTGAGTC
TCTCAAGGCTATTTAATTTGCTCATGATTTGTGCTTCTGTCATGATTCCTGGAGATTGAA
TCTTTCTCTATTGTTTTCCATCAATCATATTGTTTGTTCGTTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FQ62TF U 1
AF RR4FQ62JQ C 4
BS 1 643 RR4FQ62TF

RD RR4FQ62TF 643 0 0
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TCATTTTCACCCTGCAGAGCTCGCGATCTTATTTGAACTCCTCGGATATTAAGAGAGAGA
GAGAGATGGCGTCGAGAAACTCCGTAGCCGGATTCGCGTTATTCACATTTGTATTCGCCG
TCATCTCGTCTCTCGCCGGTGCTCAAACCCTAGCTCCCGCTCCAGCTCCCACCAGTGACG
GTAACTATCTCCCTCCTCTCCTCGCATTTCCCTTCCGGATCTGAATCCCGTGAAATCTGG
AATAACCGAGATCTAATTGGTGTGTGTGGTTTAATTGACGTTTTGGTTTAATTTGGTTAA
TGATGATGAACAGCAGGGACATCGATAGACCAAGGGATTGCGTATTTGCTAATGGTGGTG
GCGCTTGTCCTCACTTACCTTATCCATCCTCTCGATGCTTCTTCTTCCCTCTCCTTCTTC
TGATTTTTCTTTTTATCCTTCTAGTAGTTTGTGGATAACATTCTCTTTAAAGAGTGAGTC
TCTCAAGGCTATTTAATTTGCTCATGATTTGTGCTTCTGTCATGATTCCTGGAGATTGAA
TCTTTCTCTATTGTTTTCCATCAATCATATTGTTTGTTCGTTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4FQ62JQ 640 0 0
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TTTTCACCCTGCAGAGCTCGCGATCTTATTTGAACTCCTCGGATATTAAGAGAGAGAGAG
AGATGGCGTCGAGAAACTCCGTAGCCGGATTCGCGTTATTCACATTTGTATTCGCCGTCA
TCTCGTCTCTCGCCGGTGCTCAAACCCTAGCTCCCGCTCCAGCTCCCACCAGTGACGGTA
ACTATCTCCCTCCTCTCCTCGCATTTCCCTTCCGGATCTGAATCCCGTGAAATCTGGAAT
AACCGAGATCTAATTGGTGTGTGTGGTTTAATTGACGTTTTGGTTTAATTTGGTTAATGA
TGATGAACAGCAGGGACATCGATAGACCAAGGGATTGCGTATTTGCTAATGGTGGTGGCG
CTTGTCCTCACTTACCTTATCCATCCTCTCGATGCTTCTTCTTCCCTCTCCTTCTTCTGA
TTTTTCTTTTTATCCTTCTAGTAGTTTGTGGATAACATTCTCTTTAAAGAGTGAGTCTCT
CAAGGCTATTTAATTTGCTCATGATTTGTGCTTCTGTCATGATTCCTGGAGATTGAATCT
TTCTCTATTGTTTTCCATCAATCATATTGTTTGTTCGTTC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7808Contig1 751 2 5 U
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CTTATCAAGATAGAGTACTTATATTGTTTTACATCCAAACAACCATTGGTCCATTACAGA
ACCTAATCAAAAGGACAACCGCTGTACGGATACGACGGATCGGTAGGACCCTTATAATAT
TTTTTTGGTAATAACTATTTTCTTTTTATTTTTTTCCACCAAGAGAGAAAGAGGGAAAAA
ATTAAAATCAGTCACATGGAGAAGAAACGAAAATACGGATATGATCCAAGAAGCTAAGAT
GCTGCGGTCTATCGTTCCGCTTCACGTACCCACGCGCTTCCTTCTCCGTGTACGCGCCGA
AAGATCTCCTCCTATTCCTCTCCCACAGCTCCTCCTCGTAGCTCTTGTGCGCGTAGTACG
CCTCCACCACGCACGACGAGGCATGCTCTGTTTCAAGATCATCTCCTCCTCCTTCCTCCT
TCAGGAGGAAAGGGACGCGGTAGGGCCCGCAGACGAGGGGGTACTTGTCTAAGGTTTGGT
AGACTCCTTTGAAAGACGCGTCGCCGGATCGGATCAGATCTTGCATCAGGACGTGGTTCG
AGAATCCTCTCTTCAGAGTTCCGTACGAGAACACCAGCGTCGTCGTCTTCGTGGCGGTGA
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GTATTAACAGAGAGAGAGAAGTTATTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX43JQ U 30
AF RR4FX43TF C 1
BS 1 43 RR4FX43TF
BS 44 100 RR4FX43JQ
BS 101 101 RR4FX43TF
BS 102 697 RR4FX43JQ
BS 698 751 RR4FX43TF

RD RR4FX43JQ 668 0 0
CGTTTATAAAGTTA
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CATTGGTCCATTACAGAACCTAATCAAAAGGACAACCGCTGTACGGATACGACGGATCGG
TAGGACCCTTATAATATTTTTTTGGTAATAACTATTTTCTTTTTATTTTTTTCCACCAAG
AGAGAAAGAGGGAAAAAATTAAAATCAGTCACATGGAGAAGAAACGAAAATACGGATATG
ATCCAAGAAGCTAAGATGCTGCGGTCTATCGTTCCGCTTCACGTACCCACGCGCTTCCTT
CTCCGTGTACGCGCCGAAAGATCTCCTCCTATTCCTCTCCCACAGCTCCTCCTCGTAGCT
CTTGTGCGCGTAGTACGCCTCCACCACGCACGACGAGGCATGCTCTGTTTCAAGATCATC
TCCTCCTCCTTCCTCCTTCAGGAGGAAAGGGACGCGGTAGGGCCCGCAGACGAGGGGGTA
CTTGTCTAAGGTTTGGTAGACTCCTTTGAAAGACGCGTCGCCGGATCGGATCAGATCTTG
CATCAGGACGTGGTTCGAGAATCCTCTCTTCAGAGTTCCGTACGAGAACACCAGCGTCGT
CGTCTTCGTGGCGGTGATTGTGGTCTCCGTCGCGTTTGATTCGTGGCCCATGGT

QA 15 668 15 668
DS 

RD RR4FX43TF 751 0 0
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CTTATCAAGATAGAGTACTTATATTGTTT*ACATCCAAACAACCATTGGTCCATTACAGA
ACCTAATCAAAAGGACAACCGCTGTACGGATACGACGGATCGGTAGGACCCTTATAATAT
TTTTTTGGTAATAACTATTTTCTTTTTATTTTTTTCCACCAAGAGAGAAAGAGGGAAAAA
ATTAAAATCAGTCACATGGAGAAGAAACGAAAATACGGATATGATCCAAGAAGCTAAGAT
GCTGCGGTCTATCGTTCCGCTTCACGTACCCACGCGCTTCCTTCTCCGTGTACGCGCCGA
AAGATCTCCTCCTATTCCTCTCCCACAGCTCCTCCTCGTAGCTCTTGTGCGCGTAGTACG
CCTCCACCACGCACGACGAGGCATGCTCTGTTTCAAGATCATCTCCTCCTCCTTCCTCCT
TCAGGAGGAAAGGGACGCGGTAGGGCCCGCAGACGAGGGGGTACTTGTCTAAGGTTTGGT
AGACTCCTTTGAAAGACGCGTCGCCGGATCGGATCAGATCTTGCATCAGGACGTGGTTCG
AGAATCCTCTCTTCAGAGTTCCGTACGAGAACACCAGCGTCGTCGTCTTCGTGGCGGTGA
TTGTGGTCTCCGTCGCGTTTGATTCGTGGCCCATGGTTGAGAGAAATAGAATCAAGAATC
GTATTAACAGAGAGAGAGAAGTTATTGGACC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7809Contig1 677 2 3 U
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TTCGTTTTTTTTTTTTGATAAAAACAAATAGCCTTGTCCAAATAAATAATAGTTATTGTT
CAGGAAGAAAAAAAGCTTCAAACTTCGGAAGGAGTCTTTGTTGTCATTTGATCAACGGCA
TGAACAACGTTCTGAAGCTCCTCCCAAATGGCTTTGTAGACCATCCTTTGTCTGTTCACT
GCAGATTGTCCTTCAAAAGCCGATGATACCACATTTATGCAAACATGGCGTACATCACCA
GACATATCCTTGACAGAAACAGACTCTGCATTCAACTGTTCTTTGATCTTTAGCTCCATG
GATTGCATAAGGGTTTGATCAACAGACCCAGTATCGTTGACCTGAGAGGATCTAGCGCTG
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GACGGCGGCGGAGCAGGAGTCTCTCCGCGAGACGAAACGGCGCTTAAACATATGGAACTG
GAGCTTCTCGCGGCGGCGGGAGATGAGAGGGTTGATAGAGACGAAGCGAAGGGTCTCTTT
GGAGACCGGAAAAGGAGATGAAGGCTCGCTCTTGTGGAGGAGAGGAGGACGTATGGACGA
GTAGTCGCTGCCATTCC


BQ
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AF RR4DH83JQ U 126
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AA
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TAAGGGTTTGATCAACAGACCCAGTATCGTTGACCTGAGAGGATCTAGCGCTGAACCCAC
GGCTGCGAATGTCCACGGCACCAAACCC

QA 3 330 3 330
DS 

RD RR4DH83TF 677 0 0
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GCAGATTGTCCTTCAAAAGCCGATGATACCACATTTATGCAAACATGGCGTACATCACCA
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GTAGTCGCTGCCATTCC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATATAATTTCGA


BQ
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AF RR4EF10TF U 1
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BS 624 672 RR4EF10JQ

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GGGGTTTTTTTGTTATTTTTGTT

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DS 

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AGTCTAAATTGTCTATCATGTCAAGCTCTTTCACGTACGGATTCCAACAAGCAGTTTGAT
CTCTCTGGTCCCGGACCACCACCGGTTGAAAGTAACCATGTCTTAGGTAAAACATATGGT
GCTGATCAGGTTGGTGGGAGAAATTGGTCAGGTAATTTGAATGCTAGAATCTCTGAGAAA
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ATTAGGCTAAGTGGTCCGGTTGGTTCAAGCTCTGGCAATGGACTGCTTCGAACCGAACAA
CCAAAGCTTGTGAGAAGTAGTGGAATGAGAAGGAATTGGAGTTTTGAGAATTTGAGAGAT
CAAGGGTTGATAGAAGAGAAGAGCAAGGTTAACATATGATCATCAATGATTTATTATGAT
TCTGAGATTTTATGGAGGACAAATGAAACTGGTTACATATAGTTTCAATCCATATTCATG
ATTGTATAAGTCATGATAGAATATATGAGATGTAAAATAGTATGTTTTGATGAAACTTAT
GGGGTTTTTTTGTTATTTTTGTTCACTTTCAATATTATATTATGCTGTTGTAAACTTGTG
ATATAATTTCGA

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7812Contig1 968 2 2 U
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TCATCCCATGTTCGGTGGAGTTGAGAGGACTCAGTCTGAGATGAAACTAGATGGCAAGTA
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CTTCCCCAAGAGTCTTGTCGTTGTTGCTGGTTTAGATCTTGTTCAGGACTGGCAGTTGGC
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CACCATTGGGTTTTACTTCTTGCCTAACAATGATCACTTTCATTGTCTTATGGACGAGTT
AAAGAAGTTTGTGCACTCGATAGAGGAGTGTAGCCGAAGCACGTCAAGTCCTACTCTTCT
GAGTCTATAGCAGCATGGAGGTCTACTCATGTTGCTGCAATATATGATGGTATTTTTTTT
TTGTACAGTTTTCCACAAGTATTGTGGAGTGCCAAGTCACGTTTTTATGTGTTCGTTAGT
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TGGTAGTAGTACTAGGAGGTAGTCTTTAATTTGGCTCTAAAGTACAGAGGGTAAATTTAC
TAGACAACTAACTTGTCTTCAATATGTTGTGAAAATTAAAAAAAAACTTATCCTGGTACG
GATTTGTATGTTTATATTTATTTATATTTAACCATGCTTTTAATAGAAAAGAACATGTAT
TTGTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM14TF U 1
AF RR4CM14JQ C 102
BS 1 708 RR4CM14TF
BS 709 968 RR4CM14JQ

RD RR4CM14TF 708 0 0
GGGTAAAGACTCAAATGTTTATGTTTACTTGGCTGGTGATAGCTCTGGTGGCAACATTGC
TCATCATGTTGCTGTGAGAGCTACCAACGAAGGAGTTAAAGTTCTTGGGAACATTCTTCT
TCATCCCATGTTCGGTGGAGTTGAGAGGACTCAGTCTGAGATGAAACTAGATGGCAAGTA
CTTTGTGACTATTCAAGATCGAGATTGGTATTGGAGGGCTTATCTACCTGAAGGTGAAGA
TAGAGATCACCCAGCTTGTAATCCCTTTGGCCCTCGTGGTCAAACCCTTGAAGGTGTCAA
CTTCCCCAAGAGTCTTGTCGTTGTTGCTGGTTTAGATCTTGTTCAGGACTGGCAGTTGGC
TTATGTCGATGGTCTCAAGAAGACTGGTCACCATGTTAACCTTTTGTATCTGAAGCAGGC
CACCATTGGGTTTTACTTCTTGCCTAACAATGATCACTTTCATTGTCTTATGGACGAGTT
AAAGAAGTTTGTGCACTCGATAGAGGAGTGTAGCCGAAGCACGTCAAGTCCTACTCTTCT
GAGTCTATAGCAGCATGGAGGTCTACTCATGTTGCTGCAATATATGATGGTATTTTTTTT
TTGTACAGTTTTCCACAAGTATTGTGGAGTGCCAAGTCACGTTTTTATGTGTTCGTTAGT
CTCCTGAAGCTTCATAAGTCTGGCTTATTGTGAGATGTTGTTGGTTGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4CM14JQ 867 0 0
AAGTCTGGGAACA
TCTTCTTCATCCCATGTTCGG*GGAGT*GAGAGGACTCAGTCTGAGATGAAACTAGATGG
CAAGTACTTTGTGACTAT*CAAGATCGAGATTGGTATTGGAGGGCTTATCTACCTGAAGG
TGAAGATAGAGATCACCCAGCTTGTAATCCCTTTGGCCCTCGTGGTCAAACCCTTGAAGG
TGTCAACTTCCCCAAGAGTCTTGTCGTTGTTGCTGGTTTAGATCTTGTTCAGGACTGGCA
GTTGGCTTATGTCGATGGTCTCAAGAAGACTGGTCACCATGTTAACCTTTTGTATCTGAA
GCAGGCCACCATTGGGTTTTACTTCTTGCCTAACAATGATCACTTTCATTGTCTTATGGA
CGAGTTAAAGAAGTTTGTGCACTCGATAGAGGAGTGTAGCCGAAGCACGTCAAGTCCTAC
TCTTCTGAGTCTATAGCAGCATGGAGGTCTACTCATGTTGCTGCAATATATGATGGTATT
TTTTTTTTGTACAGTTTTCCACAAGTATTGTGGAGTGCCAAGTCACGTTTTTATGTGTTC
GTTAGTCTCCTGAAGCTTCATAAGTCTGGCTTATTGTGAGATGTTGTTGGTTGAGCCGGA
AGCAAAAACCAATTCGGTTGTCGGCATCTATCGGTTCAGGGCTAAACCGGGAGATTGTAC
TTTGCTTGGTAGTAGTACTAGGAGGTAGTCTTTAATTTGGCTCTAAAGTACAGAGGGTAA
ATTTACTAGACAACTAACTTGTCTTCAATATGTTGTGAAAATTAAAAAAAAACTTATCCT
GGTACGGATTTGTATGTTTATATTTATTTATATTTAACCATGCTTTTAATAGAAAAGAAC
ATGTATTTGTGGTT

QA 14 867 14 867
DS 



AS 1 2

CO CL7813Contig1 808 2 6 U
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TCTCATGTTGCCAGCGATAGCCTACAGTAGGAAACCGGAGAAGAAGGTAACGGTTTCGTC
GGGAAGGAAAGAGGAAGACCTTGTGACTAGTTTGCCCGGTCAACCACCGGTTAACTTCAG
ACATTACGCCGGTTACGTGGATCTAGGGCCTCGACAGAAGCAAAAGGCACTTTTCTATTG
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ACCGGGTTGCTCATCGGTAGCCTATGGAGCTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTGTTCG
CACCAACGGTGGCAACCTTACCTTCAATGACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTT
GTTCTTGGAAGCACCGGTAGGGGTTGGATTCTCGTATACTAATAACTCGGTGGATCTCGG
AAAGCTTGGGGATCAAGTTACTTCAGAGGACTCTCTTACTTTCTTGATCAACTGGTTCAT
GAAATTCCCTGAGTTTCGGTCCAACGAGTTCTACCTCACTGGAGAGAGTTACGCCGGTCA
CTATGTTCCTCAGCTTGCGGAGGTCATTTATGACAGGAACAAGAAGGTACCAAGAGACTC
TCGCATCAATCTCAAGGGTTTCATGATTGGGAATGCGGCTATAAACGAGGAAACAGACAT
GACAGGACTAGTGGACTACGCATGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF21TF U 1
AF RR4EB10TF U 60
BS 1 696 RR4GF21TF
BS 697 697 RR4EB10TF
BS 698 706 RR4GF21TF
BS 707 707 RR4EB10TF
BS 708 732 RR4GF21TF
BS 733 808 RR4EB10TF

RD RR4GF21TF 732 0 0
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TCATTTCGAGGAGAAAGAAGTTTTGGCGATGAAGAAGAACGCACTATGGCTACTGCTCGT
TCTCATGTTGCCAGCGATAGCCTACAGTAGGAAACCGGAGAAGAAGGTAACGGTTTCGTC
GGGAAGGAAAGAGGAAGACCTTGTGACTAGTTTGCCCGGTCAACCACCGGTTAACTTCAG
ACATTACGCCGGTTACGTGGATCTAGGGCCTCGACAGAAGCAAAAGGCACTTTTCTATTG
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ACCGGGTTGCTCATCGGTAGCCTATGGAGCTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTGTTCG
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GTTCTTGGAAGCACCGGTAGGGGTTGGATTCTCGTATACTAATAACTCGGTGGATCTCGG
AAAGCTTGGGGATCAAGTTACTTCAGAGGACTCTCTTACTTTCTTGATCAACTGGTTCAT
GAAATTCCCTGAGTTTCGGTCCAACGAGTTCTACCTCACTGGAGAGAGTTACGCCGGTCA
CTATGTTCCTCAGCTTGCGGAGGTCATTTATGACAG*AACAAGAAG*TACCAAGAGACTC
TCGCATCAATCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4EB10TF 749 0 0
GGAT
TTTCGAGGAGAAAGAAGTTTTGGCGATGAAGAAGAACGCACTATGGCTACTGCTCGTTCT
CATGTTGCCGGCGATAGCCTACAGTAGGAAACCGGAGAAGAAGGTAACGGTTTCGTCGGG
AAGGAAAGAGGAAGACCTTGTGACTAGTTTGCCCGGTCAACCACCGGTTAACTTCAGACA
TTACGCCGGTTACGTGGATCTAGGGCCTCGACAGAAGCAAAAGGCACTTTTCTATTG*TT
CTTCGAAGCCCAACACAACTCTTCTGGTCGTCCTCTCGTCCTTTGGCTCAACGGAGGACC
GGGTTGCTCATCGGTAGCCTATGGAGCTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTGTTCGCAC
CAACGGTGGCAACCTTACCTTCAATGACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTTGTT
CTTGGAAGCACCGGTAGGGGTTGGATTCTCGTATACTAATAACTCGGTGGATCTTGGAAA
GCTTGGGGATCAAGTTACTTCAGAGGACTCTCTTACTTTCTTGATCAACTGGTTCATGAA
ATTCCCTGAGTTTCGGTCCAACGAGTTCTACCTCACTGGAGAGAGTTACGCCGGTCACTA
TGTTCCTCAGCTTGCGGAGGTCATTTATGACAGGAACAAGAAGGTACCAAGAGACTCTCG
CATCAATCTCAAGGGTTTCATGATTGGGAATGCGGCTATAAACGAGGAAACAGACATGAC
AGGACTAGTGGACTACGCATGGAGC

QA 5 749 5 749
DS 



AS 1 2

CO CL7814Contig1 945 2 2 U
GGAGATTTTCTCAAAGATCCAAAGCACTTCTTCTCAAAACATGGACCGATCCATCTTTCT
TTCTCTAGCACTAGCCTCACTCTTAATCGGAGTCGTCTCTGCTCGTGACTGGAACATCTT
GAACCATCTCAAATCACTCGGCTCGTCTTCACCAAGCCAAAAAGCCATCGTTTCATCAGG
ACTGTCAACCAACCTGAAACGTTACTGCGAAAGCTGGAGGTTCAACGTGGAAGTACACAA
CATCAGAAACTTCGATGTAGTGCCTCAGGAGTGCGTGTCTCACGTCCAGAACTACATGAC
GTCATCGCAGTACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAGGTCATCCTGCATTTTGG
GAGCATGTGTTGTGGCAAGAGTAAGTGTGATGGCATGGACGCTTGGATCTTTGATATTGA
TGACACGCTTCTCTCTACCATTCCTTACCACAAGAGCAATGGCTTCTTCGGAGGAGAGAA
ATTGAACTCTACTAAATTCGAGGACTGGATAAAGAAGAGAAAAGCACCATCAGTGCCACA
CATGGTGAAGTTGTACCACGAGATCAGAGAAAGAGGCATCAAGATTTTCTTGATCTCTTC
CAGGAAGGAGTATCTCAGATCTGCCACCGTTGACAACCTCATCCAAGCCGGTTATTATGG
CTGGTCCAACCTCATCCTCAGGGGGCTAGAAGATGAACAAAAAGAAGTCAAACAGTACAA
GTCAGAGAAGAGGACATGGCTAACGAGTCTTGGTTACAGAGTTTGGGGAGTGATGGCAGA
CCAATGGAGCAGCTTCGCAGGCTGTCCTCTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCCAACTC
CATTTACTATGTCGCCTGATCAAAACACAATAAAAACGTTGGTTTTAGCTTTCATTGTAC
AAGAAGTATAATCCATAAATAAGAGAGAACAGTTTTGGTTAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AG26TF U 1
AF RR4AG26JQ C 274
BS 1 782 RR4AG26TF
BS 783 945 RR4AG26JQ

RD RR4AG26TF 782 0 0
GGAGATTTTCTCAAAGATCCAAAGCACTTCTTCTCAAAACATGGACCGATCCATCTTTCT
TTCTCTAGCACTAGCCTCACTCTTAATCGGAGTCGTCTCTGCTCGTGACTGGAACATCTT
GAACCATCTCAAATCACTCGGCTCGTCTTCACCAAGCCAAAAAGCCATCGTTTCATCAGG
ACTGTCAACCAACCTGAAACGTTACTGCGAAAGCTGGAGGTTCAACGTGGAAGTACACAA
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TGACACGCTTCTCTCTACCATTCCTTACCACAAGAGCAATGGCTTCTTCGGAGGAGAGAA
ATTGAACTCTACTAAATTCGAGGACTGGATAAAGAAGAGAAAAGCACCATCAGTGCCACA
CATGGTGAAGTTGTACCACGAGATCAGAGAAAGAGGCATCAAGATTTTCTTGATCTCTTC
CAGGAAGGAGTATCTCAGATCTGCCACCGTTGACAACCTCATCCAAGCCGGTTATTATGG
CTGGTCCAACCTCATCCTCAGGGGGCTAGAAGATGAACAAAAAGAAGTCAAACAGTACAA
GTCAGAGAAGAGGACATGGCTAACGAGTCTTGGTTACAGAGTTTGGGGAGTGATGGCAGA
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4AG26JQ 672 0 0
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CGTTGATGAGGTCATCCTGCATTTTGGGAGCATGTGTTGTGGCAAGAGTAAGTGTGATGG
CATGGACGCTTGGATCTTTGATATTGATGACACGCTTCTCTTTACCATTCCTTACCACAA
GAGCAATGGCTTCTTCGGAGGAGAGAAATTGAACTTTACTAAATTCGAGGACTGGATAAA
GAAGAGAAAAGCACCATCAGTGCCACACATGGTGAAGTTGTACCACGAGATCAGAGAAAG
AGGCATCAAGATTTTCTTGATTTTTTCCAGGAAGGAGTATTTCAGATCTGCCACCGTTGA
CAACCTCATCCAAGCCGGTTATTATGGCTGGTCCAACCTCATCCTCAGGGGGCTAGAAGA
TGAACAAAAAGAAGTCAAACAGTACAAGTCAGAGAAGAGGACATGGCTAACGAGTCTTGG
TTACAGAGTTTGGGGAGTGATGGCAGACCAATGGAGCAGCTTCGCAGGCTGTCCTCTTCC
CAAGAGAACCTTCAAGCTCCCCAACTCCATTTACTATGTCGCCTGATCAAAACACAATAA
AAACGTTGGTTTTAGCTTTCATTGTACAAGAAGTATAATCCATAAATAAGAGAGAACAGT
TTTGGTTAAAAG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7815Contig1 878 2 2 U
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TCAAGAGCGAGGCTCTCCAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCATG
AAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACAGTCCACAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGA
AGGTACCAGTTGATGAAGGGCACTTTTTATGGATGCTTATAAAAATGATGAATGCCAAAG
ATACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTATTCGTTGCTCACGACTGCCCTCGCATTGC
CTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGATAAAGAAGCTTACGAGTTGGATCTAG
AGTTCATCAAGAATGCAGGTGTTGATCACAAAATAAATTTCATCCAATCCGATGGTCTTC
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ATGCTGATAAGACACACTATGCCAATGCTTACGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTTG
GTGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTATGTGGCTGAGGAAGAGGAGG
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TCTCTTGTCTTGTGTTCTTTCTCATTGTGTGTCTTTCCCGTGCGAGACGAGTTCCGGTTT
GTGTGTTCGATTATGCTTGAAGATTTTTTTATTTTTAT


BQ
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AF RR4GC89TF U 1
AF RR4GC89JQ C 77
BS 1 727 RR4GC89TF
BS 728 878 RR4GC89JQ

RD RR4GC89TF 727 0 0
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CTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGATAAAGAAGCTTACGAGTTGGATCTAG
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AGGCCTTAGACAAGATGTTGAACAAGAATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCATTTGTTG
ATGCTGATAAGACACACTATGCCAATGCTTACGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTTG
GTGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTATGTGGCTGAGGAAGAGGAGG
ATGTTCCACAGCACTTGAGGGTGTGCAGAAAAGCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCG
CTTCTGATCCTCACATAGAGATCTCTCAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCA
GACGCCT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4GC89JQ 802 0 0
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AGGGCACTTTTTATGGATGCTTATAAAAATGATGAATGCCAAAGATACGCTAGAACTCGG
TGTTTTCACGGGCTATTCGTTGCTCACGACTGCCCTCGCATTGCCTGAAGATGGCCGTAT
TACTGCAATAGACATTGATAAAGAAGCTTACGAGTTGGATCTAGAGTTCATCAAGAATGC
AGGTGTTGATCACAAAATAAATTTCATCCAATCCGATGGTTTTCAGGCCTTAGACAAGAT
GTTGAACAAGAATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCATTTGTTGATGCTGATAAGACACA
CTATGCCAATGCTTACGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTTGGTGGAATAATAGCTTT
TGATAACACATTGTGGTTTGGGTATGTGGCTGAGGAAGAGGAGGATGTTCCACAGCACTT
GAGGGTGTGCAGAAAAGCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCACAT
AGAGATCTCTCAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATT
AAAGAGACCCATCAAAGTACAAAAGTTGTAATAATATTCAATGCTCTCTTGTCTTGTGTT
CTTTCTCATTGTGTGTCTTTCCCGTGCGAGACGAGTTCCGGTTTGTGTGTTCGATTATGC
TTGAAGATTTTTTTATTTTTAT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7816Contig1 752 2 1 U
GGGATTTCCACCGCACTGCCTCCCTCCATCGAGACGAAAATGGGTGCCTTCAGGTTTCAC
CAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAACCCAAGATTTAC
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AGGAAGCTCAAGAAGGTCAAGAAGAGTAACGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTT
GAGAAGAACCCGACAACGATCAAGAACTTTGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACT
GGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACCACCTTGAACGGTGCCGTTGAGCAG
ATGTACACCGAGATGGCGTCCAGGCACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATTCAGATCATCAAG
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AAGATCAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCTACCAGGAAGCTCAAGACC
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CTGCTGCTTTCGCTCTTCTCGGATATTTTTGTTTTTTTTAGGCATTTCCATGGAACTAAA
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GTTTCTTAATTTATATGTTATCTTTTTTTATT


BQ
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AF RR4BI28JQ C 1
AF RR4BI28TF U 1
BS 1 752 RR4BI28TF

RD RR4BI28JQ 752 0 0
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QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4BI28TF 752 0 0
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AAGATCAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCTACCAGGAAGCTCAAGACC
ACTTACAAGGCCTCTAAGCCCAACTTGTTTATGTAATTTGGGTGAAGTTTATTCTATCTG
CTGCTGCTTTCGCTCTTCTCGGATATTTTTGTTTTTTTTAGGCATTTCCATGGAACTAAA
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GTTTCTTAATTTATATGTTATCTTTTTTTATT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CK64JQ C 1
AF RR4CK64TF U 1
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DS 

RD RR4CK64TF 325 0 0
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AATTCAAATGTTTTATTTCAGTTTATAATTGGTTATGGGAATGTACGATTGGGACTCGAA
TGCTATATGTAATGTTGGGGTCCAACATGGTTTTCTGTTTGGGCCCATTGGGCTTTGTTA
TTATAATTCAGTTATGTTTTGTTCC

QA 1 325 1 325
DS 



AS 1 2

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TGACATTCTGGTTCTGTTTGTGAATTTTAGATTTCTTCTTATAATATTTCTCTTTAAACA
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BQ
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AF RR4BS11JQ C 1
AF RR4BS11TF U 1
BS 1 466 RR4BS11TF

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TGACATTCTGGTTCTGTTTGTGAATTTTAGATTTCTTCTTATAATATTTCTCTTTAAACA
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QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4BS11TF 466 0 0
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TGACATTCTGGTTCTGTTTGTGAATTTTAGATTTCTTCTTATAATATTTCTCTTTAAACA
ATTTATGGTCTTATTTTTGTATTATTAACAATATTCAAGAGGTTAT

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

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TATACTTTTATTTAGCAAAATATCATATGTTAAAATTT


BQ
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AF RR4FI53JQ C 1
AF RR4FI53TF U 1
BS 1 458 RR4FI53TF

RD RR4FI53JQ 458 0 0
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TCGTTGTGACTGTGAAAACATTAAAATTGTACTTCAAGACGGCTATGGTTGCACTTGTTT
TACTAAACTTCCGTGCGGCTAGTAATATATCAAAGCATATACTAATGAATAAGATAAAAG
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TATACTTTTATTTAGCAAAATATCATATGTTAAAATTT

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR4FI53TF 458 0 0
TTTTTAAGCAAAAAAAAAACTTAAGCAATTTCTTCATATTTCTGGAATTATGAGGTTGGC
TATTTTATTAATAATTTTTGGTATTTTCATGTTCCTCGTTCTGAACCATGTTAAAGAAGT
GGATGCACAGTATAATCCGCCGTGCAGATTTTTTAAGGGAAAACCTGGAACATGTGGTCC
TAATGGAAGCAAGAAGTGTGAAAATGAAATGAAGTCACCACAAACCAGCCAAAGTTTTGT
TCGTTGTGACTGTGAAAACATTAAAATTGTACTTCAAGACGGCTATGGTTGCACTTGTTT
TACTAAACTTCCGTGCGGCTAGTAATATATCAAAGCATATACTAATGAATAAGATAAAAG
AACATATTTGTTCTTTGCTTATTATATGACTGACTTTTTGTATATGTCAGTCTTTTGTTT
TATACTTTTATTTAGCAAAATATCATATGTTAAAATTT

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL7820Contig1 1045 2 6 U
GAATCGTGTAATCCATTCTCCTTTTGAACAAATATATATTCACTTAACAAGATGATGATG
AAGATGAGCTAAATCGGATGAATTGACAAGATTAAGTGGATGTGTATACGAGAAAAGAGG
TTGTTAGTCGGTTGAAAGGCGAAGAAGCAAACCAGAAGTGGTTTGGAAAGTTTTGAGGTG
ACGAGAGCCAATGAGATCTCGAATGTGAAATCTCATATCAAGAGGAGAGTAGCGGAGTCG
TTTCTTTTCAAGCTGGGCCAAGAACATCTCTTTGTGACGCTTGCGCTTTAGCAACGAGAG
TAACTCCTTCCTTCCCTGATCATCAAGAGTTAGAGAAAAGGTTTGATCGAATAAAAGTTA
TAGCTAGGAAGTTACCTGCCGCAGAGCCTTCAACAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAAA
CCAGTACATGTCTGGATCGATAAGTTGGCGTGTCTGAGAGACAAAAATGGTATCAAGTGT
TACAGAGAGAGAGAGAGAGTGGATGAAGGAGTGGTATAATTGTTTACATACGAGAAGGCC
AGCGTTGATTAAGAGAGTGATGTGCGCATCTTTCACCTTTCCTCCCAATGACAAGAGCGT
ACACTGCATTTGAATTTTAGTTGAAAACTTTCATGTACAAGTAGAGCGAGGACAAAAGAC
AGATTCGTATAGAGAGAGAGAGGACTCTCACAAGCTCATGATGTGAAATATTGGGCTCAA
TTTTAGAATCAAGGACATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGAT
TCTTATCTTCCATCCTCTTTGCTATTCGATCAACCTTAAAACATATTGGATGGATTATGT
AGAATAGGCGACAAGGAAGGAAGGGAAGGGAAGGAAAGCACAGGCAACCTGGTTAAGATA
GTCATCCAGAAAGATGATTGCATGATCATCTTGTCCAGTGTTGAGTTTGAAAACACGAAC
AACTTTATCCCTTCGTAGAAGCTGCAACAATTTGAAATTGATCATTACAGAAAAGAACTA
TTATAGATGATAAAAGTTGACAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BD25TF U 1
AF RR4BD25JQ C 195
BS 1 812 RR4BD25TF
BS 813 813 RR4BD25JQ
BS 814 820 RR4BD25TF
BS 821 821 RR4BD25JQ
BS 822 843 RR4BD25TF
BS 844 1045 RR4BD25JQ

RD RR4BD25TF 843 0 0
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AAGATGAGCTAAATCGGATGAATTGACAAGATTAAGTGGATGTGTATACGAGAAAAGAGG
TTGTTAGTCGGTTGAAAGGCGAAGAAGCAAACCAGAAGTGGTTTGGAAAGTTTTGAGGTG
ACGAGAGCCAATGAGATCTCGAATGTGAAATCTCATATCAAGAGGAGAGTAGCGGAGTCG
TTTCTTTTCAAGCTGGGCCAAGAACATCTCTTTGTGACGCTTGCGCTTTAGCAACGAGAG
TAACTCCTTCCTTCCCTGATCATCAAGAGTTAGAGAAAAGGTTTGATCGAATAAAAGTTA
TAGCTAGGAAGTTACCTGCCGCAGAGCCTTCAACAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAAA
CCAGTACATGTCTGGATCGATAAGTTGGCGTGTCTGAGAGACAAAAATGGTATCAAGTGT
TACAGAGAGAGAGAGAGAGTGGATGAAGGAGTGGTATAATTGTTTACATACGAGAAGGCC
AGCGTTGATTAAGAGAGTGATGTGCGCATCTTTCACCTTTCCTCCCAATGACAAGAGCGT
ACACTGCATTTGAATTTTAGTTGAAAACTTTCATGTACAAGTAGAGCGAGGACAAAAGAC
AGATTCGTATAGAGAGAGAGAGGACTCTCACAAGCTCATGATGTGAAATATTGGGCTCAA
TTTTAGAATCAAGGACATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGAT
TCTTATCTTCCATCCTCTTTGCTATTCGATCA*CCTTAAA*CATATTGGATGGATTATGT
AGA

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR4BD25JQ 851 0 0
GATCTCGAATGTGAAATCTCATATCAAGAGGAGAGTAGCGGAGTCGTTTCTTTTCAAGCT
GGGCCAAGAACATCTCTTTGTGACGCTTGCGCTTTAGCAACGAGAGTAACTCCTTCCTTC
CCTGATCATCAAGAGTTAGAGAAAAGGTTTGATCGAATAAAAGTTATAGCTAGGAAGTTA
CCTGCCGCAGAGCCTTCAACAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAAACCAGTACATGTCTG
GATCGATAAGTTGGCGTGTCTGAGAGACAAAAATGGTATCAAGTGTTACAGAGAGAGAGA
GAGAGTGGATGAAGGAGTGGTATAATTGTTTACATACGAGAAGGCCAGCGTTGATTAAGA
GAGTGATGTGCGCATCTTTCACCTTTCCTCCCAATGACAAGAGCGTACACTGCATTTGAA
TTTTAGTTGAAAACTTTCATGTACAAGTAGAGCGAGGACAAAAGACAGATTCGTATAGAG
AGAGAGAGGACTCTCACAAGCTCATGATGTGAAATATTGGGCTCAATTTTAGAATCAAGG
ACATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGATTCTTATCTTCCATC
CTCTTTGCTATTCGATCAACCTTAAAACATATTGGATGGATTATGTAGAATAGGCGACAA
GGAAGGAAGGGAAGGGAAGGAAAGCACAGGCAACCTGGTTAAGATAGTCATCCAGAAAGA
TGATTGCATGATCATCTTGTCCAGTGTTGAGTTTGAAAACACGAACAACTTTATCCCTTC
GTAGAAGCTGCAACAATTTGAAATTGATCATTACAGAAAAGAACTATTATAGATGATAAA
AGTTGACAACC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL7821Contig1 661 2 4 U
TTTTTTTTTGTGAAGCTAACATAAACTGAGGAAAAGGAATAGAGTTTTAACAAATCACAT
TCAGGATTTGTACTACCACAAGATTCAATTTTTAAAAACAAAAAAAAAACGGAAACCACA
AACTCTTCTTCACGAGATGCTCTTATGTTTAGTAACCGCCTCCATCACCACCTCCTCCAT
AGCCACCACCACCTCCACCGTAGCCACCACCTCCTCCATAGCCACCGCCACCACCATAAG
CCCGTGGAGCACTTGGTCTATCGTTGGCAACATTCACTCGGATGTTGCGTCAATTCAGTT
CCTTTCCGTCCATCTCGGAAATGGCAGCATTAGCAGCACTCTCATCAGAAAAATTGACAA
ATCCAAAACCCCTCCACCTTCCAGTTTCTCTATCAACGATGACCTTAGAGTCAATCACTT
CACCAAAGTTGGAAAAAGCCTCCCTCAATGACTGGTCGTCAGTACCCCATGAGAGACCAC
CGACAAAAAGCTTGGTAGACATGTAGCGGAGAGAACCGAGCATGGACTGAACGGGAACAT
TACCGGTCTGAGAAACCGAACCTTGCCTCAATAGACCAACGAGACTTTTGCAAAAAGCCA
TTTCTGGGAAGTAAAGCTTGGAAACTAGGGTTTTGGTAAACTGGGAGAGAGAGGCAGATC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR4CZ47TF C 1
AF RR4CZ47JQ U 10
BS 1 9 RR4CZ47TF
BS 10 373 RR4CZ47JQ
BS 374 375 RR4CZ47TF
BS 376 661 RR4CZ47JQ

RD RR4CZ47TF 661 0 0
TTTTTTTTTGTGAAGCTAACATAAACTGAGGAAAAGGAATAGAGTTTTAACAAATCACAT
TCAGGATTTGTACTACCACAAGATTCAATTTTTAAAAACAAAAAAAAAACGGAAACCACA
AACTCTTCTTCACGAGATGCTCTTATGTTTAGTAACCGCCTCCATCACCACCTCCTCCAT
AGCCACCACCACCTCCACCGTAGCCACCACCTCCTCCATAGCCACCGCCACCACCATAAG
CCCGTGGAGCACTTGGTCTATCGTTGGCAACATTCACTCGGATGTTGCGTCAATTCAGTT
CCTTTCCGTCCATCTCGGAAATGGCAGCATTAGCAGCACTCTCATCAGAGAAATTGACAA
ATCCAAAACCCCTCCACCTTCCAGTTTCTCTATCAACGATGACCTTAGAGTCAATCACTT
CACCAAAGTTGGAAAAAGCCTCCCTCAATGACTGGTCGTCAGTACCCCATGAGAGACCAC
CGACAAAAAGCTTGGTAGACATGTAGCGGAGAGAACCGAGCATGGACTGAACGGGAACAT
TACCGGTCTGAGAAACCGAACCTTGCCTCAATAGACCAACGAGACTTTTGCAAAAAGCCA
TTTCTGGGAAGTAAAGCTTGGAAACTAGGGTTTTGGTAAACTGGGAGAGAGAGGCAGATC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4CZ47JQ 652 0 0
GTGAAGCTAACATAAACTGAGGAAAAGGAATAGAGTTTTAACAAATCACATTCAGGATTT
GTACTACCACAAGATTCAATTTTTAAAAACAAAAAAAAAACGGAAACCACAAACTCTTCT
TCACGAGATGCTCTTATGTTTAGTAACCGCCTCCATCACCACCTCCTCCATAGCCACCAC
CACCTCCACCGTAGCCACCACCTCCTCCATAGCCACCGCCACCACCATAAGCCCGTGGAG
CACTTGGTCTATCGTTGGCAACATTCACTCGGATGTTGCGTCAATTCAGTTCCTTTCCGT
CCATCTCGGAAATGGCAGCATTAGCAGCACTCTCATCAGAAAAATTGACAAATCCAAAAC
CCCTTGACCTTCCAGTTTCTCTATCAACGATGACCTTAGAGTCAATCACTTCACCAAAGT
TGGAAAAAGCCTCCCTCAATGACTGGTCGTCAGTACCCCATGAGAGACCACCGACAAAAA
GCTTGGTAGACATGTAGCGGAGAGAACCGAGCATGGACTGAACGGGAACATTACCGGTCT
GAGAAACCGAACCTTGCCTCAATAGACCAACGAGACTTTTGCAAAAAGCCATTTCTGGGA
AGTAAAGCTTGGAAACTAGGGTTTTGGTAAACTGGGAGAGAGAGGCAGATCC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL7822Contig1 647 2 1 U
GGAAGGAGAAACCAAACGAGAAGAAGCATCATCTCTCTCTCTCTACTGACTGTTACGCCG
TGAAATGACGAGATCACCCCTCTTCGTCTCCGTCCTCCTCCTCCTCGTCTCCGCCGCAAC
TTTCATCACTCGCGCATCGGCGGAGATAAAGTCTCTCACGATCTCCGACGACGACAGACC
GATGATCCTCTTCGAGAAGTTCGGATTCACACGATCTGGCCACGTCAGCGTCTCCGTCTC
CTCCGTATCGGCGTATAAGTATCTGTGGGTGAGCAATGCGGCTGAGGAGATTGCGAGTCT
GGCGTTTTACATGGTGATGTTCTATATGTTTAGGCCGGTTGAGAAGAATGAGTATTTTGT
TTTGGATGAGGAAGATGAAGAAGCAGCGGAGCTGGCATTGAAGGAAGATGATTTTGAACT
CTGAAGAATCAGATCAAGAACTTTCATTGACTATACAAAGCCGTGACTGTGTGAGGAGGT
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AAAGGGGAATAACCTTGTATGTAGTAGTACTCTCTTACATTGTAAAAGCTTGTTTGTCCC
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BQ
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DS 

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TGAAATGACGAGATCACCCCTCTTCGTCTCCGTCCTCCTCCTCCTCGTCTCCGCCGCAAC
TTTCATCACTCGCGCATCGGCGGAGATAAAGTCTCTCACGATCTCCGACGACGACAGACC
GATGATCCTCTTCGAGAAGTTCGGATTCACACGATCTGGCCACGTCAGCGTCTCCGTCTC
CTCCGTATCGGCGTATAAGTATCTGTGGGTGAGCAATGCGGCTGAGGAGATTGCGAGTCT
GGCGTTTTACATGGTGATGTTCTATATGTTTAGGCCGGTTGAGAAGAATGAGTATTTTGT
TTTGGATGAGGAAGATGAAGAAGCAGCGGAGCTGGCATTGAAGGAAGATGATTTTGAACT
CTGAAGAATCAGATCAAGAACTTTCATTGACTATACAAAGCCGTGACTGTGTGAGGAGGT
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AAAGGGGAATAACCTTGTATGTAGTAGTACTCTCTTACATTGTAAAAGCTTGTTTGTCCC
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QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7823Contig1 1455 2 2 U
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ATCATCTTCATGGACGAGCCTACTTCAGGGTTGGATGCTAGCGCAGCTGCCATCGTGATG
AGGGCTGTGAGGAACACGGTGGACACAGGGAGAACTGTGGTCTGCACCATCCACCAACCT
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CCCGGAGTGCCAAAGATTCCTGAAAAGTACAATCCAGCCACTTGGATGCTTGAAGCCAGC
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TTATGCCAGCGAAACAAGCAGCTAGTACAAGAACTGAGCGTGCCTCCACAAGGAGCATCT
GATCTCTACTTTGCCACACAGTTTTCACAGGACACATGGGGACAATACAAATCATGTCTA
TGGAAGCAGCGGTGGACTTACTGGAGATCACCTGACTACAACGTTGTCCGGTTCATCTTC
ACCTTAGCAACAGCTCTTATGATCGGTTCCATCTTTTGGCAAATCGGAGGCAAGAGATCA
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GTAAACAACTGCTCACGGTGCAACCGATGGTGGCGGTAGAACGTTCGGTGTTCTACAGAG
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TCGAGTGGAAAGCTTCCAAGTTCTTCTGGTTCCTCTTCATCAACTACACTTCTTTCCTCT
ACTGGACTTACTACGGCATGATGACTGTCTCCCTCACGCCTAACCACCAAGTTGCTTCCA
TCTTTGCATCAGCGTTTTATGGTATCTTTAACCTCTTCTCCGGCTTCTTTATCCCAAGAC
CTAAAATCCCCAAGTGGTGGATATGGTATTACTGGATCTGCCCTGTCGCTTGGACCATAT
ACGGTTTGATCACCTCTCAGTACGGTGACGTTGATACTCCCATTGCTTTCCCTGGCGGTC
CTTCTAACCTCACTGTGAAACAGTACCTTAAAGACCAGTATGGTTTTGAGGAGAGCTTCA
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AAGTAATTACCACAT


BQ
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AGGGCTGTGAGGAACACGGTGGACACAGGGAGAACTGTGGTCTGCACCATCCACCAACCT
AGCATTGATATCTTCGAGGCGTTTGATGAGTTGCTACTAATGAAGAGAGGAGGACAAGTG
ATCTACTCTGGTCCTTTGGGCAAAGACTCTCACAAGATTGTTGAGTACTTTGAAGCCATC
CCCGGAGTGCCAAAGATTCCTGAAAAGTACAATCCAGCCACTTGGATGCTTGAAGCCAGC
TCCCTTGCCGCCGAGTTGAAGCTTGGTGTTGACTTTGCTGAGCTATACAAGTCTTCTTCC
TTATGCCAGCGAAACAAGCAGCTAGTACAAGAACTGAGCGTGCCTCCACAAGGAGCATCT
GATCTCTACTTTGCCACACAGTTTTCACAGGACACATGGGGACAATACAAATCATGTCTA
TGGAAGCAGCGGTGGACTTACTGGAGATCACCTGACTACAACGTTGTCCGGTTCATCTTC
ACCTTAGCAACAGCTCTTATGATCGGTTCCATCTTTTGGCAAATCGGAGGCAAGAGATCA
AACGTCCAAGACCTGACGATGGTGTTAGGAGCAATCTACTCAGCAGTCATATTCGTTGGT
GTAAACAACTGCTCACGGTGCAACCGATGGTGGCGGTAGAACGTTCGGTGTTCTACAGAG
AGAAAGCAGCTGGAATGTACTCAGCTATACCTTATGCCATCTCCCAAGTTACCTGCGAGC
TACCTTACGTCTTCATC

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR4AD82JQ 779 0 0
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GGTGCAACCGATGGTGGCGGTAGAACGTTCGGTGTTCTACAGAGAGAAAGCAGCTGGAAT
GTACTCAGCTATACCTTATGCCATCTCCCAAGTTACCTGCGAGCTACCTTACGTCTTCAT
CCAGACCACGTACTACTCACTTATCGTCTACGCGATGATTGGATTCGAGTGGAAAGCTTC
CAAGTTCTTCTGGTTCCTCTTCATCAACTACACTTCTTTCCTCTACTGGACTTACTACGG
CATGATGACTGTCTCCCTCACGCCTAACCACCAAGTTGCTTCCATCTTTGCATCAGCGTT
TTATGGTATCTTTAACCTCTTCTCCGGCTTCTTTATCCCAAGACCTAAAATCCCCAAGTG
GTGGATATGGTATTACTGGATCTGCCCTGTCGCTTGGACCATATACGGTTTGATCACCTC
TCAGTACGGTGACGTTGATACTCCCATTGCTTTCCCTGGCGGTCCTTCTAACCTCACTGT
GAAACAGTACCTTAAAGACCAGTATGGTTTTGAGGAGAGCTTCATGGGACCTGTTGCAGC
TGTCCTTGTTATTTTCTCTGTCTTCTTTGCCTTTGTCTTCGCCTTCTGCATTAAGACTCT
CAACTTCCAGACTAGATAAACCCCTACTCTCTGTCTTTTTTGTTGTTGTAATAAAACTCT
TTCTTCTTTTATTATTTGTGATATATTGAAATTTGTGATAATAAAAGTAATTACCACAT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL7824Contig1 734 2 1 U
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ATTTCCTCTTCAACCGTAAAATACATAGATATTGATTCATAATCATAAACCTATTTCAAA
AGTAAAACAAAGAAACAAAAACTAGCAATGGATATGATAACAGAGATGGTTCTGGAGAGA
CCAGTGGTGATATACAGCAAAAGCTTATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACATTGCTC
TGCGATTTCGGAGCAAATCCAGCCGTTTACGCGCTAGATGAGGTATCAAGAGGGAGGGAG
ATTGAGCAGGCCTTGTTGCGGCTTGGATGTAGCCCAGCGGTTCCAGCGGTTTTTATCGGA
GGAGAGTTCGTTGGTGGAGCCAACGAGGTCATGAGTCTTCATCTTAACGGCTCATTGATC
CCTATGCTTAAGAGGGCTGGTGCATTGTGGGTTTGACTTAATATATTTATCTATAGTTAT
TTGACACTAAGTACTAGCTACTTAACATTAAAGTACGCAGAATAATGTTTTTTTTTTAAA
TTCACACACATCTATGATCTTTGGCATGGTGATCATATGAGTCCATGTAAGATCACTAAT
CAAGGTGTTGTCTTTTTATTGTTTTTGAGCTAAACTCAATTAAAAATGTTTGAGTTTATT
GAACTTGTAAGAAGAATATATTGACCTGAAAGGATGCACTATAATAATTAAGAAAGAAAA
AATTACAATGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AI26TF U 1
AF RR4AI26JQ C 70
BS 1 734 RR4AI26TF

RD RR4AI26TF 734 0 0
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ATTTCCTCTTCAACCGTAAAATACATAGATATTGATTCATAATCATAAACCTATTTCAAA
AGTAAAACAAAGAAACAAAAACTAGCAATGGATATGATAACAGAGATGGTTCTGGAGAGA
CCAGTGGTGATATACAGCAAAAGCTTATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACATTGCTC
TGCGATTTCGGAGCAAATCCAGCCGTTTACGCGCTAGATGAGGTATCAAGAGGGAGGGAG
ATTGAGCAGGCCTTGTTGCGGCTTGGATGTAGCCCAGCGGTTCCAGCGGTTTTTATCGGA
GGAGAGTTCGTTGGTGGAGCCAACGAGGTCATGAGTCTTCATCTTAACGGCTCATTGATC
CCTATGCTTAAGAGGGCTGGTGCATTGTGGGTTTGACTTAATATATTTATCTATAGTTAT
TTGACACTAAGTACTAGCTACTTAACATTAAAGTACGCAGAATAATGTTTTTTTTTTAAA
TTCACACACATCTATGATCTTTGGCATGGTGATCATATGAGTCCATGTAAGATCACTAAT
CAAGGTGTTGTCTTTTTATTGTTTTTGAGCTAAACTCAATTAAAAATGTTTGAGTTTATT
GAACTTGTAAGAAGAATATATTGACCTGAAAGGATGCACTATAATAATTAAGAAAGAAAA
AATTACAATGTTGC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4AI26JQ 665 0 0
TCAACCGTAAAATACATAGATATTGATTCATAATCATAAACCTATTTCAAAAGTAAAACA
AAGAAACAAAAACTAGCAATGGATATGATAACAGAGATGGTTCTGGAGAGACCAGTGGTG
ATATACAGCAAAAGCTTATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACATTGTTTTGCGATTTC
GGAGCAAATCCAGCCGTTTACGCGCTAGATGAGGTATCAAGAGGGAGGGAGATTGAGCAG
GCCTTGTTGCGGCTTGGATGTAGCCCAGCGGTTCCAGCGGTTTTTATCGGAGGAGAGTTC
GTTGGTGGAGCCAACGAGGTCATGAGTTTTCATTTTAACGGCTCATTGATCCCTATGCTT
AAGAGGGCTGGTGCATTGTGGGTTTGACTTAATATATTTATCTATAGTTATTTGACACTA
AGTACTAGCTACTTAACATTAAAGTACGCAGAATAATGTTTTTTTTTTAAATTCACACAC
ATCTATGATTTTTGGCATGGTGATCATATGAGTCCATGTAAGATCACTAATCAAGGTGTT
GTCTTTTTATTGTTTTTGAGCTAAACTCAATTAAAAATGTTTGAGTTTATTGAACTTGTA
AGAAGAATATATTGACCTGAA*GGATGCACTATAATAATTAAGAAAGAAAAAATTACAAT
GTTGC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7825Contig1 727 2 4 U
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AACATGAACAAGAATATGAAGAAGACAGATGAGAAGACTTGGAAGGAGGAGAAGAAGAGT
ATGTCGTCAATGGTGTTCTTATTATACTCGATGATTGTGGTTACATTCGGAGGATTATTT
CTATCATATTGGGTTTACAAATACCATCCCACAAATTCTAATCTTTGGATGGTTCCTGTG
GGACTCATCTTCCTCATCACTCCTGCGTTCCTCTCTATCTCCGTTTTGGTCTCCGATCTA
TGCGACGATGACGGCGTGAATCATCATGACCTAAATCAAATCACGAGCGTGACATAAAAC
TAAAACGTTTGACTTTTTCTTTAAACTGTTGTTAATAATTTGGAATTAAATTATATATTA
TCAATTAATCTCCTTGTAGGAGGGAGAATGTTTCTTTATGTTTTTTAAGGTTTAAGAGGA
TAAATTAGCATCTTTTTTCCGACAAACCAGTTCATACTTGTGCCGTTGGACGATAAGTTG
TTGTATGAAAAATATAAAATAAAAATTAAGGACCTAGCTGGGTCAGTGGGTGATGGGCCT
TATAATATTGTAGTAGAGGTTGAATCTCAAGGCCCAGAATGAACTAAAGACTAAACCTTT
AGTACGGCTTAGAGGGTTTCATTAATCTGTTCGTTACTAAAAGGAAAGTGGAGACATTTT
TGGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H652TF U 1
AF RR4H652JQB C 23
BS 1 631 RR4H652TF
BS 632 632 RR4H652JQB
BS 633 666 RR4H652TF
BS 667 727 RR4H652JQB

RD RR4H652TF 669 0 0
GGATCGTCACCCCACCACCTCTTTTCTTTCACTTCACCAAGCAAAATGAAACACAAAAGC
AACATGAACAAGAATATGAAGAAGACAGATGAGAAGACTTGGAAGGAGGAGAAGAAGAGT
ATGTCGTCAATGGTGTTCTTATTATACTCGATGATTGTGGTTACATTCGGAGGATTATTT
CTATCATATTGGGTTTACAAATACCATCCCACAAATTCTAATCTTTGGATGGTTCCTGTG
GGACTCATCTTCCTCATCACTCCTGCGTTCCTCTCTATCTCCGTTTTGGTCTCCGATCTA
TGCGACGATGACGGCGTGAATCATCATGACCTAAATCAAATCACGAGCGTGACATAAAAC
TAAAACGTTTGACTTTTTCTTTAAACTGTTGTTAATAATTTGGAATTAAATTATATATTA
TCAATTAATCTCCTTGTAGGAGGGAGAATGTTTCTTTATGTTTTTTAAGGTTTAAGAGGA
TAAATTAGCATCTTTTTTCCGACAAACCAGTTCATACTTGTGCCGTTGGACGATAAGTTG
TTGTATGAAAAATATAAAATAAAAATTAAGGACCTAGCTGGGTCAGTGGGTGATGGGCCT
TATAATATTGTAGTAGAGGTTGAATCTCAAG*CCCAGAATGAACTAAAGACTAAACCTTT
AGTACG
CTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4H652JQB 705 0 0
TTTCTTTCACTTCACCAAGCAAAATGAAACACAAAAGCAACATGAACAAGAATATGAAGA
AGACAGATGAGAAGACTTGGAAGGAGGAGAAGAAGAGTATGTCGTCAATGGTGTTCTTAT
TATACTCGATGATTGTGGTTACATTCGGAGGATTATTTCTATCATATTGGGTTTACAAAT
ACCATCCCACAAATTCTAATCTTTGGATGGTTCCTGTGGGACTCATCTTCCTCATCACTC
CTGCGTTCCTCTCTATCTCCGTTTTGGTCTCCGATCTATGCGACGATGACGGCGTGAATC
ATCATGACCTAAATCAAATCACGAGCGTGACATAAAACTAAAACGTTTGACTTTTTCTTT
AAACTGTTGTTAATAATTTGGAATTAAATTATATATTATCAATTAATCTCCTTGTAGGAG
GGAGAATGTTTCTTTATGTTTTTTAAGGTTTAAGAGGATAAATTAGCATCTTTTTTCCGA
CAAACCAGTTCATACTTGTGCCGTTGGACGATAAGTTGTTGTATGAAAAATATAAAATAA
AAATTAAGGACCTAGCTGGGTCAGTGGGTGATGGGCCTTATAATATTGTAGTAGAGGTTG
AATCTCAAGGCCCAGAATGAACTAAAGACTAAACCTTTAGTACGGCTTAGAGGGTTTCAT
TAATCTGTTCGTTACTAAAAGGAAAGTGGAGACATTTTTGGTGTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7826Contig1 817 2 2 U
GGACTTTGATAATAATAACGATGGCTACTGCATCCAACTCGGTACTCTTCTCGAGCTCCG
ACTCACTGAGTCATCACCATCACAACCCGCCCAGAACCCATCTCCATCTTTCCTCCTTCG
GATCCCATTCCGTTTCCCTCATACCCACCAAGCAATCCACCTCCCTCGCGATCCGTTGCT
CCAACAATGGCGATAACAACGCCTCATCCCAAAAAGACACCCCGATCGAACTCAAGTTCC
CAGCATTTCCAACTGTCATGGACATTAACCAGATCAGAGAGATATTGCCTCACAGGTTCC
CGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTGATTGAGTATACACCTGGTGTTTCAGCTGTAGCTATTA
AGAACGTCACTATCAATGACAACTTCTTCCCTGGTCATTTCCCTGACCTACCCATCATGC
CTGGTGTTCTCATGGTTGAGGCGATGGCGCAAGTGGGAGGAATAGTAATGCTGCAGCCGG
AAGTAGGAGGATCTCAGGATAACTTCTTCTTTGCGGGTATTGATAAAGTGAGATTCCGCA
AACCCGTGATTGCAGGAGACACACTGGTGATGAGGATGACTCTCCTCAAGTTCCAGAAAC
GCTTCGGTCTTGCTAAGATGGAAGGTAAAGCTTACGTGGGTGGGTCTTTGGTCTGCGAGG
GAGAGTACATGATGGTTTCTGCTGGCAGTTCTTGATCTTCTCAGCTATTGTTTCCCCCGT
TATATGTTATGTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTATGCTTCTTCTGTGATTCGGATAACTAG
ACAAGACCAAAGTTTAAAACAAAGCGACACTTATACG


BQ
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AF RR4ER88TF U 1
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CCAAAGTTTAAAACAAAGCGACACTTATACG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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AF RR4G494JQ C 1
AF RR4G494TF U 1
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QA 1 647 1 647
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AS 1 2

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AF RR4AL62JQ C 1
AF RR4AL62TF U 1
BS 1 640 RR4AL62TF

RD RR4AL62JQ 640 0 0
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TGCTTAACGGGTGTTGAAGAGCTTGCCGATGCTGTTAGGGTCACTATGCGTCCCAAGGGA
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GTTGCTAAAAGCATTGAGTTCAAGGATAAAGTCAAGAACGTTGGTGCCCACTCTTGTCAA
GCAAGTTACTAATGCTACTAATGACAGTTGCTGGTTATGGGGTACCACTTGTGCTACTGT
ACTCACCAGGGCGATATTCACCCAAGGTTGCAAATCAGTTGCCGCAGGGATGAACGCCAT
GGACCTAAGGCGAGGTATTTCCATGGCGGTTGACAAAACCTTAAAAGCAGGGCTAGGATG
ATCAGCACATCTGAAGAGATTGCTCAGGTTGGGACCATTTCTGCAAACGGAGAGAGGGAG
ATTGGTGAACTGATCGCTAAGGCTATGGAGAGGGTTGGCAAAGAAGGTGTAATCACAATC
CAAGACGGAAAGACATTGATTAACGAGTTGGAAGTTGTAGAAGGGATGAAGCTGGACAGA
GGTTATACATCCCCTTATTTTATCGCCAATCAGAAAACCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4AL62TF 640 0 0
GGAAGTGCAGGAACTATGCAGCGAAAGAGATCAAGTTTGGTGTTGAAGCTCGTGCTTTGA
TGCTTAACGGGTGTTGAAGAGCTTGCCGATGCTGTTAGGGTCACTATGCGTCCCAAGGGA
CGTAATGTTGTGATTGAGCAAAGTTGGGGAGCTCCTAAAGTGACTAAAGATGGTGTCACC
GTTGCTAAAAGCATTGAGTTCAAGGATAAAGTCAAGAACGTTGGTGCCCACTCTTGTCAA
GCAAGTTACTAATGCTACTAATGACAGTTGCTGGTTATGGGGTACCACTTGTGCTACTGT
ACTCACCAGGGCGATATTCACCCAAGGTTGCAAATCAGTTGCCGCAGGGATGAACGCCAT
GGACCTAAGGCGAGGTATTTCCATGGCGGTTGACAAAACCTTAAAAGCAGGGCTAGGATG
ATCAGCACATCTGAAGAGATTGCTCAGGTTGGGACCATTTCTGCAAACGGAGAGAGGGAG
ATTGGTGAACTGATCGCTAAGGCTATGGAGAGGGTTGGCAAAGAAGGTGTAATCACAATC
CAAGACGGAAAGACATTGATTAACGAGTTGGAAGTTGTAGAAGGGATGAAGCTGGACAGA
GGTTATACATCCCCTTATTTTATCGCCAATCAGAAAACCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7829Contig1 968 2 2 U
GATTGATGACTCGGTGATTACTAAAGTGACTGATGAGCATATCTATCTGGTGGTGAATGC
TGGCTGTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTGAGGAGCATATGAAGGCTTTTAAATCCAA
AGGTGGTGATGTCTCTTGGCATATCCATGATGAGAGATCTCTTCTCGCCCTTCAGGGTCC
TTTGGCTGCTCCGGTGCTTCAACACCTGACTAAAGAAGACTTGAGCAAGCTTTACTTTGG
TCAGTTCCAGATCCTGGACATTAATGGTTCCACCTGCTTCCTTACCAGGACCGGGTATAC
TGGGGAAGATGGGTTTGAGATCTCTGTTCCATCAGAGCATGCAGTTGATTTAGCCAAAGC
AATCTTGGAGAAGTCCGAGGGGAAGGTAAGGCTTACTGGTCTAGGAGCAAGAGACAGTCT
CAGGCTAGAAGCAGGGCTTTGTCTATACGGAAACGACATGGAGCAGCACATCACTCCTGT
CGAAGCTGGACTCGCACGGGCCATAGGGAAACGCAGAAGAGCTGAAGGAGGGTTTCTTGG
CGCTGATGTGATCCTCAAACAGCTTCAAGATGGACCTACTATCAGGAGGGTAGGATTCTT
CTCCTCTGGACCGCCGGCGAGGTCGCATAGCGAGGTGCACGATGAGAACGGTGACAAGAT
TGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGCCCCAACTTGAAGAAGAACGTAGCCATGGGGTA
CGTGAAGTCAGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTGAAGATCTTGGTCCGTGGGAAACC
TTATGAAGGCAACATCACCAAGATGCCGTTTGTGGCCACTAAATACTAAAGCCATCATAA
TATGTGTGTCTTCTTCTTCTTCTTTGACCTGTTTCTCTCTTTCCTTTCTTAAATGACTTC
TGTTCTGATTTGGTCTGAAAGAGTACGTTCTTTTGCCAAGAGGGCATATGCTTATTCCAC
TGTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H408TF U 1
AF RR4H408JQB C 286
BS 1 581 RR4H408TF
BS 582 968 RR4H408JQB

RD RR4H408TF 581 0 0
GATTGATGACTCGGTGATTACTAAAGTGACTGATGAGCATATCTATCTGGTGGTGAATGC
TGGCTGTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTGAGGAGCATATGAAGGCTTTTAAATCCAA
AGGTGGTGATGTCTCTTGGCATATCCATGATGAGAGATCTCTTCTCGCCCTTCAGGGTCC
TTTGGCTGCTCCGGTGCTTCAACACCTGACTAAAGAAGACTTGAGCAAGCTTTACTTTGG
TCAGTTCCAGATCCTGGACATTAATGGTTCCACCTGCTTCCTTACCAGGACCGGGTATAC
TGGGGAAGATGGGTTTGAGATCTCTGTTCCATCAGAGCATGCAGTTGATTTAGCCAAAGC
AATCTTGGAGAAGTCCGAGGGGAAGGTAAGGCTTACTGGTCTAGGAGCAAGAGACAGTCT
CAGGCTAGAAGCAGGGCTTTGTCTATACGGAAACGACATGGAGCAGCACATCACTCCTGT
CGAAGCTGGACTCGCACGGGCCATAGGGAAACGCAGAAGAGCTGAAGGAGGGTTTCTTGG
CGCTGATGTGATCCTCAAACAGCTTCAAGATGGACCTACTA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4H408JQB 683 0 0
CAGGACCGGGTATACTGGGGAAGATGGGTTTGAGATCTCTGTTCCATCAGAGCATGCAGT
TGATTTAGCCAAAGCAATCTTGGAGAAGTCCGAGGGGAAGGTAAGGCTTACTGGTCTAGG
AGCAAGAGACAGTCTCAGGCTAGAAGCAGGGCTTTGTCTATACGGAAACGACATGGAGCA
GCACATCACTCCTGTCGAAGCTGGACTCGCACGGGCCATAGGGAAACGCAGAAGAGCTGA
AGGAGGGTTTCTTGGCGCTGATGTGATCCTCAAACAGCTTCAAGATGGACCTACTATCAG
GAGGGTAGGATTCTTCTCCTCTGGACCGCCGGCGAGGTCGCATAGCGAGGTGCACGATGA
GAACGGTGACAAGATTGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGCCCCAACTTGAAGAAGAA
CGTAGCCATGGGGTACGTGAAGTCAGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTGAAGATCTT
GGTCCGTGGGAAACCTTATGAAGGCAACATCACCAAGATGCCGTTTGTGGCCACTAAATA
CTAAAGCCATCATAATATGTGTGTCTTCTTCTTCTTCTTTGACCTGTTTCTCTCTTTCCT
TTCTTAAATGACTTCTGTTCTGATTTGGTCTGAAAGAGTACGTTCTTTTGCCAAGAGGGC
ATATGCTTATTCCACTGTTATTG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL7830Contig1 791 2 2 U
GGATCGCACACACACAAGTAGCACAACCAAGACAAATGGCAAAAACCTCACTTTCTACGT
TCATCTTCTCCATCCTTTTCCTCATCTCCACAGCAAAGGCTGCCCGATTTGATATCCTGA
ACCAATGTGGTTACACTGTATGGGGTCGGACAAACTGTAATTTTGATTCTTCAGGCCGTG
GGCGATGCCAAACTGGTGATTGTTCTGGTGGACTTCAATGCACGGGTTGGGGCCAGCCAC
CGAACACGTTGGCTGAGTATGCCTTGAACCAATACAACAACTTAGACTTCTATGACATCT
CACTTGTCGATGGATTTAACATCCCTATGGAATTTAGCTCGAATTGCAAGCGGATACTAT
GCAACGCGGACATAAACGGTCAGTGTCCGAACCAGTTGAGAGCGCCAGGAGGTTGCAACA
ACCCGTGCACGGTGTTCAAGACAAACGAGTACTGCTGTACAAACGGGCAGGGATCCTGTG
GCGCCACTGGGTTCTCAAGGTTCTTCAAGCAGAGATGTCCGGACGCCTACAGCTATCCAC
AAGACGACCCAACCAGCACTTTCACTTGCAGTAACACTAATTACAGAGTCGTGTTTTGTC
CTAGGTGATAGACTCTCTCAACACCTGTTTGTACGTTGGTACACGCGTACGTGTTTCTAT
AAAATAAATAAGAGATGGGATCTGTATTGTGGGTTTGATCCGTGAGTATACGTTTGATAC
GCGACTATCAACGCTCAATGGATAATAATGTGGAAAATGTAATAATAATGACGTATTTGG
ACTTGTTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED57TF U 1
AF RR4ED57JQ C 138
BS 1 740 RR4ED57TF
BS 741 791 RR4ED57JQ

RD RR4ED57TF 740 0 0
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TCATCTTCTCCATCCTTTTCCTCATCTCCACAGCAAAGGCTGCCCGATTTGATATCCTGA
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GGCGATGCCAAACTGGTGATTGTTCTGGTGGACTTCAATGCACGGGTTGGGGCCAGCCAC
CGAACACGTTGGCTGAGTATGCCTTGAACCAATACAACAACTTAGACTTCTATGACATCT
CACTTGTCGATGGATTTAACATCCCTATGGAATTTAGCTCGAATTGCAAGCGGATACTAT
GCAACGCGGACATAAACGGTCAGTGTCCGAACCAGTTGAGAGCGCCAGGAGGTTGCAACA
ACCCGTGCACGGTGTTCAAGACAAACGAGTACTGCTGTACAAACGGGCAGGGATCCTGTG
GCGCCACTGGGTTCTCAAGGTTCTTCAAGCAGAGATGTCCGGACGCCTACAGCTATCCAC
AAGACGACCCAACCAGCACTTTCACTTGCAGTAACACTAATTACAGAGTCGTGTTTTGTC
CTAGGTGATAGACTCTCTCAACACCTGTTTGTACGTTGGTACACGCGTACGTGTTTCTAT
AAAATAAATAAGAGATGGGATCTGTATTGTGGGTTTGATCCGTGAGTATACGTTTGATAC
GCGACTATCAACGCTCAATG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4ED57JQ 654 0 0
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GATTGTTCTGGTGGACTTCAATGCACGGGTTGGGGCCAGCCACCGAACACGTTGGCTGAG
TATGCCTTGAACCAATACAACAACTTAGACTTCTATGACATCTCACTTGTCGATGGATTT
AACATCCCTATGGAATTTAGCTCGAATTGCAAGCGGATACTATGCAACGCGGACATAAAC
GGTCAGTGTCCGAACCAGTTGAGAGCGCCAGGAGGTTGCAACAACCCGTGCACGGTGTTC
AAGACAAACGAGTACTGCTGTACAAACGGGCAGGGATCCTGTGGCGCCACTGGGTTCTCA
AGGTTCTTCAAGCAGAGATGTCCGGACGCCTACAGCTATCCACAAGACGACCCAACCAGC
ACTTTCACTTGCAGTAACACTAATTACAGAGTCGTGTTTTGTCCTAGGTGATAGACTCTC
TCAACACCTGTTTGTACGTTGGTACACGCGTACGTGTTTCTATAAAATAAATAAGAGATG
GGATCTGTATTGTGGGTTTGATCCGTGAGTATACGTTTGATACGCGACTATCAACGCTCA
ATGGATAATAATGTGGAAAATGTAATAATAATGACGTATTTGGACTTGTTTCTC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

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GTACACCCCGGTGGGACGAGGATAAAGATGCTGACAAAAGGTTGCGTTAGCTACAGAAAT
GTTAGGTGTGCGACAAACGCAGAGGCGTTCTCGCTGAGTGTAGCAGATCTTGAAGATGTA
ACGAGCTTGTTCTCAAGAGTCCTAAGGAGCAATCGAGTGCAAGGAGCCATAAGGTATGAG
TCTCCTTATTGGAGGCTAAGAGCAGCTAGGCAGATTCAAGTGGCTTGGAGATATCGTAGG
AGACGGCTTCAGAGATTGTACACTGATCAGTCCAGTTACAGTCTTTAGATTGTAATCTTC
ATGCTAGATGATGGTGGTTATCATATAGGTGGTGTTATGTATTACATGATATGATGATAT
AAGCTTTACTTAAATTCATCTTTTCACTATAAAAATATGACATCAATGCATTTGCTTTAA
TCG


BQ
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20 20 20 

AF RR4FB69JQ C 1
AF RR4FB69TF U 1
BS 1 603 RR4FB69TF

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TCG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR4FB69TF 603 0 0
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TTGTCAGAAGGAGACGTTTGTGGTGAAGAACTTCTCACTTGGTGCCTCGAACGCTCTTCT
GTACACCCCGGTGGGACGAGGATAAAGATGCTGACAAAAGGTTGCGTTAGCTACAGAAAT
GTTAGGTGTGCGACAAACGCAGAGGCGTTCTCGCTGAGTGTAGCAGATCTTGAAGATGTA
ACGAGCTTGTTCTCAAGAGTCCTAAGGAGCAATCGAGTGCAAGGAGCCATAAGGTATGAG
TCTCCTTATTGGAGGCTAAGAGCAGCTAGGCAGATTCAAGTGGCTTGGAGATATCGTAGG
AGACGGCTTCAGAGATTGTACACTGATCAGTCCAGTTACAGTCTTTAGATTGTAATCTTC
ATGCTAGATGATGGTGGTTATCATATAGGTGGTGTTATGTATTACATGATATGATGATAT
AAGCTTTACTTAAATTCATCTTTTCACTATAAAAATATGACATCAATGCATTTGCTTTAA
TCG

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL7832Contig1 383 2 2 U
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AAACAACACCTCGATTGGATATCACCTCCGATCTTCTTCCCAGCTCTTGGCTGAGAATGA
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CAAAAAGGATTTGGTGTTAAAAT


BQ
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AF RR4BE29JQ C 1
AF RR4BE29TF U 207
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BS 207 383 RR4BE29TF

RD RR4BE29JQ 383 0 0
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AAACAACACCTCGATTGGATATCACCTCCGATCTTCTTCCCAGCTCTTGGCTGAGAATGA
TGCTTTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGCCAGTTGAAAAGGGTCGGAGA
TGTTCTCACTCTTGTCGTTCTTGCTGGATGCTGCTATGAGATCTATGCCAGAGCAACACT
GCAAAAGGAAGATTAAGCTGCTGCAGGAGTTAAGCTCATGAGTTTGATCATCCTTCTCCC
TTTTTTTTAGTAAATCTCACAAGTTCATGTTGGCTTTTGCTCTGAATTAAGTGAATAAAC
CAAAAAGGATTTGGTGTTAAAAT

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR4BE29TF 177 0 0
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ATGTTGGCTTTTGCTCTGAATTAAGTGAATAAACCAAAAAGGATTTGGTGTTAAAAT

QA 1 177 1 177
DS 



AS 1 2

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AGAAGATTGAAACAAATAAGAACAGATAACACCCTACATGGATATTTTTTTGGAACAAGT
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ACAAAATCAAGATGTTTTGTTCTTCTTTCCGATCAGCGAGAACCAGATTGAGATCCAGAG
GATGAAGAAGAAGAAGAGAACAATCCACTAAACGGCCACGAAAACGAAAACCTTCTTCCA
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GCTTCTTCCTCCACTCCTCCTCCCCCAAACTCATCCAAACAAACCGAACACTGCAGCGAC
GGTTCCGTTATCTTAACCGTCGGCAAAGCATCTACCACTTCTTTACGAGCAGGCGGAGTC
CCTTGCCTGTTAGGATCGTTCTCAGCCAAATGCTGAAGCAAAAGATCCAAACCAGGTCCG
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CCTTGAACGACGAGGGACTGGTTCAACGGATTGATCATTATAACTCTGTTGTTGCTCTCT
CGTTGATCATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GO47JQ U 36
AF RR4B652JQ U 1
BS 1 57 RR4B652JQ
BS 58 58 RR4GO47JQ
BS 59 209 RR4B652JQ
BS 210 210 RR4GO47JQ
BS 211 278 RR4B652JQ
BS 279 279 RR4GO47JQ
BS 280 393 RR4B652JQ
BS 394 394 RR4GO47JQ
BS 395 507 RR4B652JQ
BS 508 508 RR4GO47JQ
BS 509 562 RR4B652JQ
BS 563 563 RR4GO47JQ
BS 564 566 RR4B652JQ
BS 567 567 RR4GO47JQ
BS 568 851 RR4B652JQ

RD RR4GO47JQ 711 0 0
G
TCTCTGTACAACAACAATTTAATAAGAAGATTGAAACAAATAAGAACAGATAACACCCTA
CATGGATATTTTTTTGGAACAAGTGAAAGAACATCATTTGTATGTACATAAAAGCAGAGG
AGAACAAGAACAAGAACAAGAACAACAAGTTCAAGATGTTTTGTTCTTCTTTCCGATCAG
CGAGAACCAGATTGAGATCCAGAGGATGAAGAAGAAGAAGAGAACAATCCACTAAACGGC
CACGAAAACGAGAACCTTCTTCCATTACCACTCCTCGCATCATCCTCCCTTCCTCTTCTT
TCCTCATTCCCCACATTCTCAACAACGTTTCCGTTACTACTCTCCGGAAGAGTCCTACT*
**TCTTGTCCTCGCCGATTCAACCTTACTCTCATCACCATTCGCAGAAGGAAGCTCGAAC
CGACACACGGGGCAAGAGCTATGAAGCTCAAGCCACGGAACAATACACTTAACATGAAAC
TTATGCTTACACGGCATCTCTTTAGCTTCTTCCTCCACTCCTCCTCCCCCAAACTCATCC
AAACAAACCGAACACTGCAGCGACGGTTCCGTTATCTTAACCGTCGGCAAAGCATCTACC
ACTTCTTTACGAGCAGGCGGAGTCCCTTGCCTGTTAGGATCGTTCTCAGCCAAATGCTGA
AGCAAAAGATCCAAACCAGGTCCGATGAAGTAATCTCCAAGCGAAGTCAA

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR4B652JQ 851 0 0
GATCAAAACAAACACACTCAAAGTAAAACTTGATCATCTCTGTACAACAACAATTTA*TA
AGAAGATTGAAACAAATAAGAACAGATAACACCCTACATGGATATTTTTTTGGAACAAGT
GAAAGAACATCATTTGTATGTACATAAAAGCAGAGGAGAACAAGAACAAGAACAAGAACA
ACAAAATCAAGATGTTTTGTTCTTCTTTC*GATCAGCGAGAACCAGATTGAGATCCAGAG
GATGAAGAAGAAGAAGAGAACAATCCACTAAACGGCCAGGAAAACGAAAACCTTCTTCCA
TTACCACTCCTCGCATCATCCTCCCTTCCTCTTCTTTCCTCATTCCCCACATTCTCAACA
ACGTTTCCGTTACTACTCTCCGGAAGAGTCCTAGTAGTTCTTGTCCTCGCCGATTCAACC
TTACTCTCATCACCATTCGCAGAAGGAAGCTCGAACCGACACACGGGACAAGAGCTATGA
AGCTCAAGCCACGGAACAATACACTTAGCATGAAACTTATGCTTACACGGCATCTCTTTA
GCTTCTTCCTCCACTCCTCCTCTCCCGAACTCATCCAAACAAACCGAACACTGCAGCGAC
GGTTCCGTTATCTTAACCGTCGGCAAAGCATCTACCACTTCTTTACGAGCAGGCGGAGTC
CCTTGCCTGTTAGGATCGTTCTCAGCCAAATGCTGAAGCAAAAGATCCAAACCAGGTCCG
ATGAAGTAATCTCCAAGCGAAGTCAATGCAGGATGATGATGATGGCTACTCTGAGCTTGT
CCTTGAACGACGAGGGACTGGTTCAACGGATTGATCATTATAACTCTGTTGTTGCTCTCT
CGTTGATCATC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL7834Contig1 484 2 1 U
GGGGTGAAGTTTGGATCTTTGATAGAGAGAAAGGAAGGAGAAGATGTCTTTGGTGTGGCT
AGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTCTGCATTATGGGAAACTCTCA
GTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATGGGA
TGTTGCGATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGCCACATCTCCTTCCTCGTG
ATGATCAGGGGCGTAAGGTGGTCCACAAATAAAAGGATACTCCAGAAGATAAGAATTGAA
GAAGAAGAAGCCGGAGAATCTAATTCTGTTGTTTCAAAATTGACAACCTTAATGACATTT
GGTCGATAACTCTCGACTCTTTTTTTTTTCTTTGTTTCTTGTTAAGTTGCATGATATTTG
GTTTACAACTACACTTCTTGCTGTGTGAATGTATTATGAATATCTCGAAAAATTGGCTCT
CACC


BQ
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20 20 20 20 

AF RR4FW14JQ C 1
AF RR4FW14TF U 1
BS 1 484 RR4FW14TF

RD RR4FW14JQ 484 0 0
GGGGTGAAGTTTGGATCTTTGATAGAGAGAAAGGAAGGAGAAGATGTCTTTGGTGTGGCT
AGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTCTGCATTATGGGAAACTCTCA
GTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATGGGA
TGTTGCGATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGCCACATCTCCTTCCTCGTG
ATGATCAGGGGCGTAAGGTGGTCCACAAATAAAAGGATACTCCAGAAGATAAGAATTGAA
GAAGAAGAAGCCGGAGAATCTAATTCTGTTGTTTCAAAATTGACAACCTTAATGACATTT
GGTCGATAACTCTCGACTCTTTTTTTTTTCTTTGTTTCTTGTTAAGTTGCATGATATTTG
GTTTACAACTACACTTCTTGCTGTGTGAATGTATTATGAATATCTCGAAAAATTGGCTCT
CACC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR4FW14TF 484 0 0
GGGGTGAAGTTTGGATCTTTGATAGAGAGAAAGGAAGGAGAAGATGTCTTTGGTGTGGCT
AGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTCTGCATTATGGGAAACTCTCA
GTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATGGGA
TGTTGCGATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGCCACATCTCCTTCCTCGTG
ATGATCAGGGGCGTAAGGTGGTCCACAAATAAAAGGATACTCCAGAAGATAAGAATTGAA
GAAGAAGAAGCCGGAGAATCTAATTCTGTTGTTTCAAAATTGACAACCTTAATGACATTT
GGTCGATAACTCTCGACTCTTTTTTTTTTCTTTGTTTCTTGTTAAGTTGCATGATATTTG
GTTTACAACTACACTTCTTGCTGTGTGAATGTATTATGAATATCTCGAAAAATTGGCTCT
CACC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL7835Contig1 1244 2 2 U
GGGAGAGAGTAGAGATGACGCGAAAATATTTTCAGAGAGAGGTGTTGCCGGTGACGGCGC
TGGTAATAATGGAATGTGCCAACGTGGGCTTAAACACTCTGTTCAAGGCAGCGACTTTAC
AAGGCATGAGTTTCCACGTCTTCATCGTTTACTCTTACGGTCTTGCTGCTCTTCTTCTAC
TTCCTTCTCTTTTCTTCTCCTACAGATCAAGAACGCTTCCACCGATGAATTTCTCAATTC
TCTACAAAGTCGTGCTTCTTGGGTTAATTGGATGCTGCTCAAACATAATGGGATACACGG
GAATTAACTATAGCTCTCCAACACTTGCTTCTGCAATCAGCAACCTCACTCCTGCGTTTA
CCTTCTTGCTGGCCATCCTTTTCAGGATGGAGAGTGTATCATTCAAGAGAACAAGTAGTG
TGGCTAAAATGTTAGGAACCGTAGTTTCCATTGGAGGAGCATTTATTGTGACTCTTTACA
ATGGTCCTGTGGTGATCGCTATGTCACCACCATCCATTTCTCTACGGTCAGAGTCGCCTA
ACCATGATTGGATCATTGGTGCGGCTTTCCTTGCCGTTGAGTACTTCATGGTTCCGTTGT
GGTACATTGTACAGACTCAAATCATGAGAGAGTATCCATCCGAGTTCACCATTGTTTGCT
ATTATAGCTTTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCACGTTGTTCACTGAAGGGAGTG
ACTTGAGTACATGGAAGATAAAACCAAATATAGCTTTAGTATCAATCGTTTGCTCGGGAT
TGTTTGGATCTTGCATAAACAATACAATCCACACGTGGGCGTTGCGGATCAAGGGGCCTT
TATTCGTTGCAATGTTCAAGCCTCTGTCCATTGCCATTGCCGTTGCAATGGGCGTGATCT
TCCTCCGGGATTCTCTTTACATCGGCAGCTTGATAGGGGCAACGGTAATAACCATGGGGT
TTTACACGGTGATGTGGGGCAAAGCCAAGGAAGTGGCCTTAGTCGAAGATGACAACAAGG
CTAATAACGAGGATGCTAACGAAGCTGACCTTGATTCTCCACCAGGTTCACAGAAGGCTC
CGCTCTTGGAAAGTTACAAGAACGATGAGCATGTATAAGTATCATCAACCAGTCAATACA
TCTCTCTATATTTGTGTATGAAAATTTGATATGTAAAAGTCTTTTAATTTATTTGACGAT
ACAAATGTGATCTTTAATTTTAGGAATCAAGTTTCTTCTAATCG


BQ
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AF RR4DN65TF U 1
AF RR4DN65JQ C 641
BS 1 703 RR4DN65TF
BS 704 1244 RR4DN65JQ

RD RR4DN65TF 703 0 0
GGGAGAGAGTAGAGATGACGCGAAAATATTTTCAGAGAGAGGTGTTGCCGGTGACGGCGC
TGGTAATAATGGAATGTGCCAACGTGGGCTTAAACACTCTGTTCAAGGCAGCGACTTTAC
AAGGCATGAGTTTCCACGTCTTCATCGTTTACTCTTACGGTCTTGCTGCTCTTCTTCTAC
TTCCTTCTCTTTTCTTCTCCTACAGATCAAGAACGCTTCCACCGATGAATTTCTCAATTC
TCTACAAAGTCGTGCTTCTTGGGTTAATTGGATGCTGCTCAAACATAATGGGATACACGG
GAATTAACTATAGCTCTCCAACACTTGCTTCTGCAATCAGCAACCTCACTCCTGCGTTTA
CCTTCTTGCTGGCCATCCTTTTCAGGATGGAGAGTGTATCATTCAAGAGAACAAGTAGTG
TGGCTAAAATGTTAGGAACCGTAGTTTCCATTGGAGGAGCATTTATTGTGACTCTTTACA
ATGGTCCTGTGGTGATCGCTATGTCACCACCATCCATTTCTCTACGGTCAGAGTCGCCTA
ACCATGATTGGATCATTGGTGCGGCTTTCCTTGCCGTTGAGTACTTCATGGTTCCGTTGT
GGTACATTGTACAGACTCAAATCATGAGAGAGTATCCATCCGAGTTCACCATTGTTTGCT
ATTATAGCTTTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCACGTT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4DN65JQ 604 0 0
CGAGTTCACCATTGTTTGCTATTATAGCTTTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCAC
GTTGTTCACTGAAGGGAGTGACTTGAGTACATGGAAGATAAAACCAAATATAGCTTTAGT
ATCAATCGTTTGCTCGGGATTGTTTGGATCTTGCATAAACAATACAATCCACACGTGGGC
GTTGCGGATCAAGGGGCCTTTATTCGTTGCAATGTTCAAGCCTCTGTCCATTGCCATTGC
CGTTGCAATGGGCGTGATCTTCCTCCGGGATTCTCTTTACATCGGCAGCTTGATAGGGGC
AACGGTAATAACCATGGGGTTTTACACGGTGATGTGGGGCAAAGCCAAGGAAGTGGCCTT
AGTCGAAGATGACAACAAGGCTAATAACGAGGATGCTAACGAAGCTGACCTTGATTCTCC
ACCAGGTTCACAGAAGGCTCCGCTCTTGGAAAGTTACAAGAACGATGAGCATGTATAAGT
ATCATCAACCAGTCAATACATCTCTCTATATTTGTGTATGAAAATTTGATATGTAAAAGT
CTTTTAATTTATTTGACGATACAAATGTGATCTTTAATTTTAGGAATCAAGTTTCTTCTA
ATCG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL7836Contig1 907 2 2 U
GGACGATTGAGACGGAGAAAGGAAGAAGAAAAGAGAAAGAGATCGGAGAAAATGACGACG
TCGATGATACAGAGGCTGTTCACGCAAGGCACCAGGATCGTCTGCGTAGGCCGTAACTAC
GCCGCTCACGCCAAAGAACTAGGCAACGCCGTCCCCAAGGAACCAGTTATATTCTTAAAG
CCGACCTCATCATACTTAGAGAACGGAGGAACGATTGAGATTCCACATCCTCTAGAATCA
CTTCATCATGAGGTGGAGCTCGCTGTGGTGATGGGAGAGAAGGCTAGAGATGTACCTGAG
TCAACCGCCATGGATTACATTGGAGGATATGCGGTTGCTCTTGATATGACTGCTAGGGAA
CTCCAGGCTTCTGCCAAGGCATCTGGTCTTCCCTGGACACTTGCTAAAGGACAGGATACT
TTCACTCCAATAAGCTCTGTTCTGCCAAAGGCGATGGTTCACGATCCCGATAATCTAGAA
CTTTGGCTGAAGGTTGATGGTGAAACAAGACAGAAGGGTTTGACCAAAGATATGATCTTC
AAGGTCCCGTATCTCATCAGCTACATAAGCTCTATCATTACGCTCTACGAAGGAGATGTC
ATCTTGACTGGAACACCTTCTGGTGTTGGACCTGTAAAGATAGGACAGAAGATAACCGCA
GGGATCACTGGTCTATCTGAAGTTCAGTTCGATGTTGAAAGGCGTGTAAAGCCTTTGATT
TAAGTGTTTTGTTTGTGTTTATTATAATAACTAATAAAAATGTTAAATCTTTTGATTTAA
GTAATAAACCATGTGTAATTTTCTTCAGTTATTGTACTGTATTTCCTTGCAGTTGAGAAA
GGAGAATAGAAACTAGAACTATCAATAGTGCAAAGTCAACTAATATGTTTACGATATTTT
ACGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC84TF U 1
AF RR4AC84JQ C 157
BS 1 803 RR4AC84TF
BS 804 907 RR4AC84JQ

RD RR4AC84TF 803 0 0
GGACGATTGAGACGGAGAAAGGAAGAAGAAAAGAGAAAGAGATCGGAGAAAATGACGACG
TCGATGATACAGAGGCTGTTCACGCAAGGCACCAGGATCGTCTGCGTAGGCCGTAACTAC
GCCGCTCACGCCAAAGAACTAGGCAACGCCGTCCCCAAGGAACCAGTTATATTCTTAAAG
CCGACCTCATCATACTTAGAGAACGGAGGAACGATTGAGATTCCACATCCTCTAGAATCA
CTTCATCATGAGGTGGAGCTCGCTGTGGTGATGGGAGAGAAGGCTAGAGATGTACCTGAG
TCAACCGCCATGGATTACATTGGAGGATATGCGGTTGCTCTTGATATGACTGCTAGGGAA
CTCCAGGCTTCTGCCAAGGCATCTGGTCTTCCCTGGACACTTGCTAAAGGACAGGATACT
TTCACTCCAATAAGCTCTGTTCTGCCAAAGGCGATGGTTCACGATCCCGATAATCTAGAA
CTTTGGCTGAAGGTTGATGGTGAAACAAGACAGAAGGGTTTGACCAAAGATATGATCTTC
AAGGTCCCGTATCTCATCAGCTACATAAGCTCTATCATTACGCTCTACGAAGGAGATGTC
ATCTTGACTGGAACACCTTCTGGTGTTGGACCTGTAAAGATAGGACAGAAGATAACCGCA
GGGATCACTGGTCTATCTGAAGTTCAGTTCGATGTTGAAAGGCGTGTAAAGCCTTTGATT
TAAGTGTTTTGTTTGTGTTTATTATAATAACTAATAAAAATGTTAAATCTTTTGATTTAA
GTAATAAACCATGTGTAATTTTC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR4AC84JQ 751 0 0
AAGGAACCAGTTATATTCTTAAAGCCGACCTCATCATACTTAGAGAACGGAGGAACGATT
GAGATTCCACATCCTCTAGAATCACTTCATCATGAGGTGGAGCTCGCTGTGGTGATGGGA
GAGAAGGCTAGAGATGTACCTGAGTCAACCGCCATGGATTACATTGGAGGATATGCGGTT
GCTCTTGATATGACTGCTAGGGAACTCCAGGCTTCTGCCAAGGCATCTGGTCTTCCCTGG
ACACTTGCTAAAGGACAGGATACTTTCACTCCAATAAGCTCTGTTCTGCCAAAGGCGATG
GTTCACGATCCCGATAATCTAGAACTTTGGCTGAAGGTTGATGGTGAAACAAGACAGAAG
GGTTTGACCAAAGATATGATCTTCAAGGTCCCGTATCTCATCAGCTACATAAGCTCTATC
ATTACGCTCTACGAAGGAGATGTCATCTTGACTGGAACACCTTCTGGTGTTGGACCTGTA
AAGATAGGACAGAAGATAACCGCAGGGATCACTGGTCTATCTGAAGTTCAGTTCGATGTT
GAAAGGCGTGTAAAGCCTTTGATTTAAGTGTTTTGTTTGTGTTTATTATAATAACTAATA
AAAATGTTAAATCTTTTGATTTAAGTAATAAACCATGTGTAATTTTCTTCAGTTATTGTA
CTGTATTTCCTTGCAGTTGAGAAAGGAGAATAGAAACTAGAACTATCAATAGTGCAAAGT
CAACTAATATGTTTACGATATTTTACGTAAC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7837Contig1 1356 2 6 U
GGGAACATGTTATCAAAGAAGAGAAACAGCTAGAGAAGGGGCCCTTGATTAAGTAATTAA
CAAATAGTTACTTAACTAACTAATCATGGGTTATATCGATGGAAAATGGGCACCGCTGAT
CGTGATGACTGTGATTCACATGATTAATGGGATGGTTAACGCTTTGATTAAGAAAGTTCT
TGATGGAGGCATTAATCATATGGTCATTGCTACCTATCGTTTGGGTATCTCCACCATATT
TCTTCTTCCGGTCGCTTATTTTTGGGAACGGAAAACAAGGCCGAAGCTTACCATAAGCAT
TTCGTGCCAGCTTTTCATCAGTGCTCTTTTTGGGGCGAGCTTGGTACTGTATTTCTACTT
ACTCGGACTCACCTATACTTCTGCTACGTTAGGATCTGCTTTCTCGGCGATAATGCCTGC
CCTTACTTTCATTATGGCTTTAATATTTAGGTTCGAGAAGCTAAATATGAAAACAAAAGT
GGGATACGGCATCGTTCTTGGAACTATGATAAGCTTAGGAGGAGCTTTAGTTCTTACGAT
GTACCAAGGCATCCCGTTAACGAACTCTCAAGAACAAGCCTCTACTTTAAAACATCTCAC
AAAACATGCGCATTGGACCAAAGGTTGTATATTTTTATTCATATCAGTTATGTTTTTCAG
TTCTTGGATGCTTATACAAGCCAAAGTCAACGTGAATTACCCTTGTCCATACTCGAGCAC
CGTTATTTTATCTGCTTTCGGTACGCTTCAGTGCGCCCTTCTTAGCTTGATCAAGACTAG
AAATGCAAAAGAATGGATCCTCAAAGACAGACTCCCCATCATCACCATCATTATAGCGGG
TGTGGTTGCACAAGGAATGTGTACGGTGGGAATATCATGGTGTATCAAACAGCGAGGACC
TGTCTTTACCTCAGCATTTACTCCTGTCATGCTTATGTCTGCAACCTTGTTTGATTTCTT
GATATTTAATCGTATGATTTATTTGGGAAGCGTAATCGGATCTGTGGTGGTGGTGATTGG
CTTATACGTATTTTTATGGAGTAAGAGCAAACAAATAAATGACTGTGAGATCAGTAAGTT
ACCTACAAACGCCGTGGAAGAAGAAAAGGAAGATGAAGACCATAAAAATGTTGACAAATT
AGGCAATCTTTTGGTTATCCCCATGGCTCCTTGATCCACTTCCCTAGCTAAACCCTATAT
ACCTTCAACTAGAAGGGACCGATATGCCATCTTGACATTTCATCAAATATGAACAAGATT
AGAAATTCTCCTTTGAATGTTGATCGGAGAATATCATCATTTTTATTTGGATAGTGTAAT
ATATTTATATAAATAAACAGTATGGAATATGACTTC


BQ
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AF RR4G744TF U 1
AF RR4G744JQ C 653
BS 1 728 RR4G744TF
BS 729 729 RR4G744JQ
BS 730 740 RR4G744TF
BS 741 741 RR4G744JQ
BS 742 773 RR4G744TF
BS 774 1356 RR4G744JQ

RD RR4G744TF 773 0 0
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CAAATAGTTACTTAACTAACTAATCATGGGTTATATCGATGGAAAATGGGCACCGCTGAT
CGTGATGACTGTGATTCACATGATTAATGGGATGGTTAACGCTTTGATTAAGAAAGTTCT
TGATGGAGGCATTAATCATATGGTCATTGCTACCTATCGTTTGGGTATCTCCACCATATT
TCTTCTTCCGGTCGCTTATTTTTGGGAACGGAAAACAAGGCCGAAGCTTACCATAAGCAT
TTCGTGCCAGCTTTTCATCAGTGCTCTTTTTGGGGCGAGCTTGGTACTGTATTTCTACTT
ACTCGGACTCACCTATACTTCTGCTACGTTAGGATCTGCTTTCTCGGCGATAATGCCTGC
CCTTACTTTCATTATGGCTTTAATATTTAGGTTCGAGAAGCTAAATATGAAAACAAAAGT
GGGATACGGCATCGTTCTTGGAACTATGATAAGCTTAGGAGGAGCTTTAGTTCTTACGAT
GTACCAAGGCATCCCGTTAACGAACTCTCAAGAACAAGCCTCTACTTTAAAACATCTCAC
AAAACATGCGCATTGGACCAAAGGTTGTATATTTTTATTCATATCAGTTATGTTTTTCAG
TTCTTGGATGCTTATACAAGCCAAAGTCAACGTGAATTACCCTTGTCCATACTCGAGCAC
CGTTATTT*ATCTGCTTTCG*TACGCTTCAGTGCGCCCTTCTTAGCTTGATCA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4G744JQ 704 0 0
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TCGAGCACCGTTATTTTATCTGCTTTCGGTACGCTTCAGTGCGCCCTTCTTAGCTTGATC
AAGACTAGAAATGCAAAAGAATGGATCCTCAAAGACAGACTCCCCATCATCACCATCATT
ATAGCGGGTGTGGTTGCACAAGGAATGTGTACGGTGGGAATATCATGGTGTATCAAACAG
CGAGGACCTGTCTTTACCTCAGCATTTACTCCTGTCATGCTTATGTCTGCAACCTTGTTT
GATTTCTTGATATTTAATCGTATGATTTATTTGGGAAGCGTAATCGGATCTGTGGTGGTG
GTGATTGGCTTATACGTATTTTTATGGAGTAAGAGCAAACAAATAAATGACTGTGAGATC
AGTAAGTTACCTACAAACGCCGTGGAAGAAGAAAAGGAAGATGAAGACCATAAAAATGTT
GACAAATTAGGCAATCTTTTGGTTATCCCCATGGCTCCTTGATCCACTTCCCTAGCTAAA
CCCTATATACCTTCAACTAGAAGGGACCGATATGCCATCTTGACATTTCATCAAATATGA
ACAAGATTAGAAATTCTCCTTTGAATGTTGATCGGAGAATATCATCATTTTTATTTGGAT
AGTGTAATATATTTATATAAATAAACAGTATGGAATATGACTTC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL7838Contig1 793 2 2 U
GGGTAAAATAACTTAATAGGACAGCCTGTCATTGAGGAGTTCATTATTAATCCCAACTCT
GCTTATTTTCTACTCTTAGCTTCTTAGACATTAAAGTGCAGTCTTTTTAAGGAGTTTGCC
TTCTTTCTTAATGTATACTATATATATATAGATTTTTCCCCGTATGCTTATGCAAGTTAA
AGTGTGAATTCTATATGTAGTTTATACATTCTGATCTGGATATGTTTATATTTGGCATTG
GTTCTGCCTCTATTGTTTTATTTTGTTTTGTTGATCTACCTAGACATGAATAGTTTTACA
TGGAATGGTGGTTTTTGTAGGAAAAAAACCATATCTTCACTGCTTTCCTCTACTAAAGTT
TTGACCTTTGATCTAAGATGATGTTTCAGACGGCTAAACAGTATTCGTTATATTTTATTT
GGGGAAAGAGCAAAGAGTAAAATTCTTACGATACGTTTTGGGGGCCAATCGCTATTCTTT
CGGTGAAGATCTTGGCAGACGAGCTCAAATGATGACTAAGGGACATCAAGGAGAAGTTAC
CTATGTGGCGCTGGAAGTTGAGACAGCGAAATCAAGCTTTACAATCGAGAAGACTAATGA
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TCAGCCATTGTTTGTCGGGATAGAAGCACAGGGTTTATATTGTGATCTAGACCGTCGTTG
CTAATTTATATATTTACATAAATTGACATAACTCCTAACGTTTAGTTCAGAGATACCTAG
TGAAGTCATGGGA


BQ
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AF RR4EF12TF U 1
AF RR4EZ38TF U 6
BS 1 612 RR4EF12TF
BS 613 793 RR4EZ38TF

RD RR4EF12TF 612 0 0
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GCTTATTTTCTACTCTTAGCTTCTTAGACATTAAAGTGCAGTCTTTTTAAGGAGTTTGCC
TTCTTTCTTAATGTATACTATATATATATAGATTTTTCCCCGTATGCTTATGCAAGTTAA
AGTGTGAATTCTATATGTAGTTTATACATTCTGATCTGGATATGTTTATATTTGGCATTG
GTTCTGCCTCTATTGTTTTATTTTGTTTTGTTGATCTACCTAGACATGAATAGTTTTACA
TGGAATGGTGGTTTTTGTAGGAAAAAAACCATATCTTCACTGCTTTCCTCTACTAAAGTT
TTGACCTTTGATCTAAGATGATGTTTCAGACGGCTAAACAGTATTCGTTATATTTTATTT
GGGGAAAGAGCAAAGAGTAAAATTCTTACGATACGTTTTGGGGGCCAATCGCTATTCTTT
CGGTGAAGATCTTGGCAGACGAGCTCAAATGATGACTAAGGGACATCAAGGAGAAGTTAC
CTATGTGGCGCTGGAAGTTGAGACAGCGAAATCAAGCTTTACAATCGAGAAGACTAATGA
GCTCCCTGATGG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4EZ38TF 788 0 0
AAATAACTTAATAGGACAGCCTGTCATTGAGGAGTTCATTATTAATCCCAACTTTGCTTA
TTTTCTACTCTTAGCTTCTTAGACATTAAAGTGCAGTCTTTTTAAGGAGTTTGCCTTCTT
TCTTAATGTATACTATATATATATAGATTTTTCCCCGTATGCTTATGCAAGTTAAAGTGT
GAATTCTATATGTAGTTTATACATTCTGATCTGGATATGTTTATATTTGGCATTGGTTCT
GCCTCTATTGTTTTATTTTGTTTTGTTGATCTACCTAGACATGAATAGTTTTACATGGAA
TGGTGGTTTTTGTAGGAAAAAAACCATATCTTCACTGCTTTCCTCTACTAAAGTTTTGAC
CTTTGATCTAAGATGATGTTTCAGACGGCTAAACAGTATTCGTTATATTTTATTTGGGGA
AAGAGCAAAGAGTAAAATTCTTACGATACGTTTTGGGGGCCAATCGCTATTCTTTCGGTG
AAGATCTTGGCAGACGAGCTCAAATGATGACTAAGGGACATCAAGGAGAAGTTACCTATG
TGGCGCTGGAAGTTGAGACAGCGAAATCAAGCTTTACAATCGAGAAGACTAATGAGCTCC
CTGATGGTCAGGTGATCCCGATTGGTGCAGAAAGGTTCTGCTCGGAAGTCCTCTTTCAGC
CATTGTTTGTCGGGATAGAAGCACAGGGTTTATATTGTGATCTAGACCGTCGTTGCTAAT
TTATATATTTACATAAATTGACATAACTCCTAACGTTTAGTTCAGAGATACCTAGTGAAG
TCATGGGA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL7839Contig1 993 2 16 U
GGATCTGTAAGTTCTTTTCTTCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCAA
AGAATCGAAATGTTGGCTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGCCCCGAAGCACTGCAG
AGTCCTCACTCTGGATCATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAA
TTCGTCTCCAAAAACTCAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCGTCGGGAGTGCTCGCT
TACTCTCTTGATAACACCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATC
TTCTGCGTCTTCAGAGGACACATTGAGAACCTTCCGTTTCTGAGGCAGCAGTATGGGCTG
AGCAAAGTCACAAACGAGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGT
GGCCCTTACCCCGTCGACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTTGCCTTCATCCTC
TTCGATGGCACCAACGAAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGTACTGTGCCTTTC
TTCTGGGGTACTGATGCTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAG
AAAGGTTGCTCCAAATCTTACAGTCCTTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACATCGTCGGGA
GGATTGAGGAGCTACGAGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGAGGGTGGATAGC
TCAGGAGAGGTGTGTGGTGCCACCTTTCAGGTTGATGCCGAGGCTAAGAGAGAGGGTACC
ACCGGCATGCCTAGAGTCGAGAGCTCCCAAAACTGGGCCGGTCATATCTAAACCGGAAAT
GTTTACCGAAATTTCAAAGCTCAAGCAGAGACGAGACTTTGTTTCGTTTGATATATCTCT
GAGACTTTACTTTACCAATGTTGTTTCTCTGTTTCCGTTTGCGTTTCTCGGATTCAAATA
AAAAAAATAAGATTTTTTTTCATCATTTGTTCC


BQ
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CC

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10 10 10 10 

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GTAAACGAGGCATTAGCGCTGAATCTGGAAACTCCAGAAACAAGAGGCCAATTGACAGAA
CCAGGCTTTGGAACTCTGGCAGAAATAGATGGACGTTTGGTTGCTGTGGGTGCACTTGAA
TGGGTTTCCAATCGTTTCCACAAAAAGAACGACTCCTCGGACGTAGTTAAGCTGGAAAGC
TATTTGGATCATAAACTATCCAGCTCATCATTGACGTCCAGGTATTCAAAGACCGTTGTC
TACGTTGGACGCGAAGGAGAAGGGATTATTGGTGCTATTGCAATGTCTGATTGCTTGCGC
AAAGATGCTGAGTTTACTGTAGCCAGGCTTCAGGAGAGAGGCATCAAAACAGTCCTCTTA
TCAGGGGATAGGGAAGGGGCAGTGGCAACAGTGGCAAAGAATGTGGGGATTGAGAGTGAA
TCAACCAACTATTCTCTGTCTCCGGATAAGAAGTTTGAGTTTATATCTAATCTTCAATCC
TCTGGACATCGTGTCGCTATGGTGGGTGATGGCATAAACGATGCCCCTTCGTTGGCTCAA
GCTGATGTCGGAATAGCTCTGAAGATCGAGGCACAAGAAAACGCTGCATCGAATGCAGCA
TCAGTCATACTTGTCCGCAACAAACTCTCACATGTTGTGGATGCACTGAGTCTTGCACAA
GCGACAATGTCGAAAGTTTATCAGAATCTGGCATGGGCAATTGCATATAATGTCATCTCG
ATCCCTATAGCTGCAG*TGTCTTGCTTC*TCAGTATGGTTTCGCCATGACACCTTCCTT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR4AG19JQ 864 0 0
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GGTATTCAAAGACCGTTGTCTACGTTGGACGCGAAGGAGAAGGGATTATTGGTGCTATTG
CAATGTCTGATTGCTTGCGCAAAGATGCTGAGTTTACTGTAGCCAGGCTTCAGGAGAGAG
GCATCAAAACAGTCCTCTTATCAGGGGATAGGGAAGGGGCAGTGGCAACAGTGGCAAAGA
ATGTGGGGATTGAGAGTGAATCAACCAACTATTCTCTGTCTCCGGATAAGAAGTTTGAGT
TTATATCTAATCTTCAATCCTCTGGACATCGTGTCGCTATGGTGGGTGATGGCATAAACG
ATGCCCCTTCGTTGGCTCAAGCTGATGTCGGAATAGCTCTGAAGATCGAGGCACAAGAAA
ACGCTGCATCGAATGCAGCATCAGTCATACTTGTCCGCAACAAACTCTCACATGTTGTGG
ATGCACTGAGTCTTGCACAAGCGACAATGTCGAAAGTTTATCAGAATCTGGCATGGGCAA
TTGCATATAATGTCATCTCGATCCCTATAGCTGCAGGTGTCTTGCTTCCTCAGTATGGTT
TCGCCATGACACCTTCCTTATCCGGTGGACTAATGGCACTGAGCTCGATATTTGTCGTCT
CAAATTCATTACTTCTCCAGCTCCATAAATTTGAAACAAGTGGAAACAGCTAGAAAGCTG
GTTCCATCTGTTTTGGAGGCCAAGAAGAAACAATGAATGGTTTTGTATGATAGAGAGTAC
GAATCTTGTAATTATTTATGATCACATATATACATAGAATCTTGATGTTAATATTTGATA
AGATTTTACGAAGGGTTTGACTTG

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL7841Contig1 604 2 1 U
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AGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAA
AGGGTATCGATTCAAGGGTTAGGAGAAAGTTCAAGGGTGTGACGTTGATGCCCAATGTGG
GTTACGGATCAGACAAGAAGACACGTCACTACCTCCCGAACGGGTTCAAGAAGTTTGTTG
TGCACAACACGAGTGACCTCGAGCTGCTGATGATGCACAAAAGGACGTACTGCGCGGAGA
TTGCACACAACGTTTCGACAAAGAAGAGGAAGGCAATTGTGGAGAGAGCTTCGCAGTTGG
ATATTGTTGTGACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGTAACT
AAACTAGCAAAGGCATTTGAAATATTGAAGTTTGTTTCTGGTTTGTTTGCATTTATTTCC
GTTTTTGTAAGACAGATTTTGTTTAACTGTTTGTGTTTTGCAATCTACAAACATGAGTTT
TGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RR4BQ40JQ C 1
AF RR4BQ40TF U 1
BS 1 604 RR4BQ40TF

RD RR4BQ40JQ 604 0 0
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AGGGTATCGATTCAAGGGTTAGGAGAAAGTTCAAGGGTGTGACGTTGATGCCCAATGTGG
GTTACGGATCAGACAAGAAGACACGTCACTACCTCCCGAACGGGTTCAAGAAGTTTGTTG
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ATATTGTTGTGACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGTAACT
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GTTTTTGTAAGACAGATTTTGTTTAACTGTTTGTGTTTTGCAATCTACAAACATGAGTTT
TGGT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4BQ40TF 604 0 0
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AAGCAACAGAAATGGCGGTACCGTTGCTAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCA
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AGGGTATCGATTCAAGGGTTAGGAGAAAGTTCAAGGGTGTGACGTTGATGCCCAATGTGG
GTTACGGATCAGACAAGAAGACACGTCACTACCTCCCGAACGGGTTCAAGAAGTTTGTTG
TGCACAACACGAGTGACCTCGAGCTGCTGATGATGCACAAAAGGACGTACTGCGCGGAGA
TTGCACACAACGTTTCGACAAAGAAGAGGAAGGCAATTGTGGAGAGAGCTTCGCAGTTGG
ATATTGTTGTGACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGTAACT
AAACTAGCAAAGGCATTTGAAATATTGAAGTTTGTTTCTGGTTTGTTTGCATTTATTTCC
GTTTTTGTAAGACAGATTTTGTTTAACTGTTTGTGTTTTGCAATCTACAAACATGAGTTT
TGGT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL7842Contig1 628 2 1 U
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GCCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACCCCCTCGCCCTAAAGCCGAACCTGTCGATCG
CGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATACTAA
GGAAGATTATGCTGTGAGAGGCAAAGAGCCAAAGGATGAAGTTCAGATTTACACTTGGAA
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AAGAGATGCTAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTATTGT
CAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAGCAACCAGACGACAGTAAAAC
ACTCGCGGACCTTCATTTTGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGGAGGA
GGAGGTTTCTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAGGAAAAGAACAC
ATTCGTAGTCGTTCCCATTCCCTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTCCCATTTCAAATCTT
CGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DF79TF U 1
AF RR4DF79JQ C 21
BS 1 628 RR4DF79TF

RD RR4DF79TF 628 0 0
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GCCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACCCCCTCGCCCTAAAGCCGAACCTGTCGATCG
CGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATACTAA
GGAAGATTATGCTGTGAGAGGCAAAGAGCCAAAGGATGAAGTTCAGATTTACACTTGGAA
AGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACGGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGGCAGCTAGGAG
AAGAGATGCTAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTATTGT
CAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAGCAACCAGACGACAGTAAAAC
ACTCGCGGACCTTCATTTTGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGGAGGA
GGAGGTTTCTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAGGAAAAGAACAC
ATTCGTAGTCGTTCCCATTCCCTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTCCCATTTCAAATCTT
CGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4DF79JQ 608 0 0
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TTAATCAACCCCCTCGCCCTAAAGCCGAACCTGTCGATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGC
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GCAAAGAGCCAAAGGATGAAGTTCAGATTTACACTTGGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGC
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TTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTATTGTCAGACAGGTTGGTCAGACGA
TGTTTTATCCAAACAGAAAGCAACCAGACGACAGTAAAACACTCGCGGACCTTCATTTTG
AGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGGAGGAGGAGGTTTCTGTTTTTTCCT
CGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAGGAAAAGAACACATTCGTAGTCGTTCCCATTC
CCTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTCCCATTTCAAATCTTCGTTTAGACACATATTATGT
ATCCTTGG

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL7843Contig1 751 2 14 U
GTGAAATATCTTTTTTTTATTTGCAATTTTTAGACAAGTAGGGAAAAATAATCCTGTAAC
TTACAAATAATTGATATTACAACTATTTTTAAAAGCAAGAATGAGTCTGTCCAGACAGAG
GGTTACTCTGTCAACGCATTGAATGAGTATGGATAAAAAACCTCCTTGTAAACAAAGACA
TGAATCCCATTTTCTATTAACAGGAGCAGAAACTATTGAGATTTGAGAAGAGTCAAGTTT
CAGATACTTCTTAAACGCCTTGAGCTTTTCGATCCTAAAGGTGAGCACATTGTACCATGT
CCTCTGTTTCACTCGCAAAAGTCTAATTACATTTTCATATATAGGAGGAATAGGTGAACC
GTACTCCGAGAACAGCTTCATGAGCATATTCAGTAACAGAAAGATCTCTACTGAAAAGTT
CTTCCGAGTACAACTCCACTAAATATAATAGCTCCAAACCACTTGTTCGACACAAACTTT
TTACTGCAGTCAGTGCGAGATGACAAGTCAGCTGTTCCTATCTGCCATCCTAATTGTCCT
GATGCAGCCACCAGTGATGCGAAGTATTGCCACCCGAGATCTGCACTCAGTCCAGAAAGT
GCAAGCAACCCCATGGATGCTGTTCCAAATCCAGTTAGCCAAAGCTTTGTATTATCACCA
AATCGAAGAGCTGTTGACTTCACACCAACCTTCACATCATCTTCTTTGCCCTAATGTGCA
TAGATAGTATCATACACAAGGGTCCAGCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FN48JQ U 1
AF RR4AA39JQ U 23
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BS 710 726 RR4FN48JQ
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RD RR4FN48JQ 726 0 0
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TGAATCCCATTTTCTATTAACAGGAGCAGAAACTATTGAGATTTGAGAAGAGTCAAGTTT
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CCTCTGTTTCACTCGCAAAAGTCTACTTACATTTTCATATATAGGAGGAATAGGTGGCCC
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CTTCCGAGTACAACTCCACTAAATATAATAGCTCCAAACCACTTGTTCGACACAAACTTT
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AATCGAAGTGCTGTTGACTTCACACCAACCTTCACATCATCTTCTTTGTCCTAATGTGCA
TAGATA

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DS 

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CTAATTACATTTTCATATATAGGAGGAATAGGTGAACCGTACTCCGAGAACAGCTTCATG
AGCATATTCAGTAACAGAGAGATCTCTACTGAAAAGTTCTTCCGAGTACAACTCCACTAA
A*ATAATAGCTCCAAACCACTTGTTCGACACAAACTTTTTACTGCAGTCAGTGCGAGATG
ACAAGTCAGCTGTTCCTATCTGCCATCCTAATTGTCCTGATGCAGCCACCAGTGATGCGT
AGTATTGCCACCCGAGATCTGCACTCAGTCCAGAAAGTGCAAGCAACCCCATGGATGCTG
TTCCAAATCCAGTTAGCCAAAGCTTTGTATTATCACCGAATCTAAGAGCTGTTGACTTCG
CACCAACCTTCACATCATCTTCTTTGCCCTGATGTGCATAGATAGTATCATACACAAGGG
TCCAGCAGA

QA 1 729 1 729
DS 



AS 0 0

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BQ
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AF RR4ER83JQ C 1
AF RR4ER83TF U 1
BS 1 508 RR4ER83TF

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GAGCGATTTAGGCACTACCTCGGCCCTTTCGATCAAGCTCAACCACTGTTAGGATAATCA
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TAAAAAGACCCAAATATACTTTTCGTAT

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DS 

RD RR4ER83TF 508 0 0
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TTACGTCGTGTTGACAAAGTCTTATTGATCAGACGAGCTCGGTGATTTTCCAGGTATTGG
GAGCGATTTAGGCACTACCTCGGCCCTTTCGATCAAGCTCAACCACTGTTAGGATAATCA
CCTACCCCGAAAGTCGTGTTGACAGAGTCGTATTGACGAAAACCGATCAAGAAGAATTAC
AGCTAAGAGTTGGATCGCATCTTGTGTATGGAAGATAGGAATCAGAGCTTATCAAAAATG
AGATAAGGTCTGGAAAACTAGAGAACTTTAGAGAGACATTAGAGAGAGAAACTTAGAGAG
AGGTTTTTATGAAATTATTTGATGATATTTCACAAGAAGTCTATTAAATTTTGTAAATAT
TAAAAAGACCCAAATATACTTTTCGTAT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL7846Contig1 1030 2 10 U
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GCAGGTGCCAGATTTTTCATCAGAGAGCTTGACAGTGAAGAAATTCGTCTTGGTGCACGG
TGAAGGCTTTGGGGCGTGGTGTTGGTACAAAATCGTTGCTTCACTGTAAGAGTCAGGACT
GTCTCCTATTACAGTGGACCTCACTGGATCTGGTTTTAATATGACTGACACAAACACTGT
CTCTACCTTGGAGGAATACTCAAAACCATTGATTGAGTACCTTGGAAATCTCCCTGAGGA
AGAGAAGGTTATTCTGGTTGGTCATAGTACTGGAGGTGCGTCCATTTCATACGCTTTAGA
GAGGTTTCCAGAGAAAATCTCCAAAGCTATACTTGTATGTGCAACCATGGTTTCTGATGG
CCAAAGACCCTTTGATGTTTTCTCTGAAGAGCTTGGTTCCGCAGAGAGGTTCATGAAAGA
GTCGCAGTTCTTGATCTATGGAAATGGAAAAGATGAGCCTCCTACAGGGTTCATGTTCGA
GAAACAACACATGAAAGGCTTGTATTTCAATCAATCTCCCAACAAGGATATAGCTTTGGC
GATGATGTCAATGCGGCCTGTACCGCTTGGACCAATGATGGAGAAGGTAACACTGACCAC
AGAAAGATATGGTAAAGGGAGAAGATTCTATATTCAGACACTAGACGACCTTGCACTCTC
ACCAGACGTTCAAGAGAAGCTAGTGAGAGAGAACAGCCCTGAAGGAGTCTACAAGATCAA
AGGAAGTGATCATTCTCCTTTCTTCTCAAAGCCTCAGTCTCTCCACAAGATCCTTCTCGA
GATTGCACAGATTCCTTAAAGATCATCTGAGACCAACTTCTTTGGAGAGGAGGATATTGA
ACATATACTGAATTGAGAATGAATTTTTCTTTGGGATCATTTATGTTTTACATACCCTTT
TGTATACATTTTTAGAATCGATCCATAGATCATATTTATAACATTTGAAGATAAAAAGTG
GTTGAACAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH15TF U 1
AF RR4EH15JQ C 318
BS 1 646 RR4EH15TF
BS 647 647 RR4EH15JQ
BS 648 752 RR4EH15TF
BS 753 753 RR4EH15JQ
BS 754 764 RR4EH15TF
BS 765 765 RR4EH15JQ
BS 766 773 RR4EH15TF
BS 774 774 RR4EH15JQ
BS 775 784 RR4EH15TF
BS 785 1030 RR4EH15JQ

RD RR4EH15TF 790 0 0
GGAATGACCGATTGCTTCCTTCACCTACTCTCTCTCTGACCCTTTTTCTAATGGCGCCAA
GCAGGTGCCAGATTTTTCATCAGAGAGCTTGACAGTGAAGAAATTCGTCTTGGTGCACGG
TGAAGGCTTTGGGGCGTGGTGTTGGTACAAAATCGTTGCTTCACTGTAAGAGTCAGGACT
GTCTCCTATTACAGTGGACCTCACTGGATCTGGTTTTAATATGACTGACACAAACACTGT
CTCTACCTTGGAGGAATACTCAAAACCATTGATTGAGTACCTTGGAAATCTCCCTGAGGA
AGAGAAGGTTATTCTGGTTGGTCATAGTACTGGAGGTGCGTCCATTTCATACGCTTTAGA
GAGGTTTCCAGAGAAAATCTCCAAAGCTATACTTGTATGTGCAACCATGGTTTCTGATGG
CCAAAGACCCTTTGATGTTTTCTCTGAAGAGCTTGGTTCCGCAGAGAGGTTCATGAAAGA
GTCGCAGTTCTTGATCTATGGAAATGGAAAAGATGAGCCTCCTACAGGGTTCATGTTCGA
GAAACAACACATGAAAGGCTTGTATTTCAATCAATCTCCCAACAAGGATATAGCTTTGGC
GATGATGTCAATGCGGCCTGTACCGCTTGGACCAATGATGGAGAAG*TAACACTGACCAC
AGAAAGATATGGTAAAGGGAGAAGATTCTATATTCAGACACTAGACGACCTTGCACTCTC
ACCAGACGTTCAAGAGAAGCTAGTGAGAGAGA*CAGCCCTGAAG*AGTCTACA*GATCAA
AGGA
GTGATC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4EH15JQ 713 0 0
TTGGTCATAGTACTGGAGGTGCGTCCATTTCATACGCTTTAGAGAGGTTTCCAGAGAAAA
TCTCCAAAGCTATACTTGTATGTGCAACCATGGTTTCTGATGGCCAAAGACCCTTTGATG
TTTTCTCTGAAGAGCTTGGTTCCGCAGAGAGGTTCATGAAAGAGTCGCAGTTCTTGATCT
ATGGAAATGGAAAAGATGAGCCTCCTACAGGGTTCATGTTCGAGAAACAACACATGAAAG
GCTTGTATTTCAATCAATCTCCCAACAAGGATATAGCTTTGGCGATGATGTCAATGCGGC
CTGTACCGCTTGGACCAATGATGGAGAAGGTAACACTGACCACAGAAAGATATGGTAAAG
GGAGAAGATTCTATATTCAGACACTAGACGACCTTGCACTCTCACCAGACGTTCAAGAGA
AGCTAGTGAGAGAGAACAGCCCTGAAGGAGTCTACAAGATCAAAGGAAGTGATCATTCTC
CTTTCTTCTCAAAGCCTCAGTCTCTCCACAAGATCCTTCTCGAGATTGCACAGATTCCTT
AAAGATCATCTGAGACCAACTTCTTTGGAGAGGAGGATATTGAACATATACTGAATTGAG
AATGAATTTTTCTTTGGGATCATTTATGTTTTACATACCCTTTTGTATACATTTTTAGAA
TCGATCCATAGATCATATTTATAACATTTGAAGATAAAAAGTGGTTGAACAGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7847Contig1 1030 2 4 U
GGGAAGAGACAGAACACAAACTCATAAATCTTCTTTTGGTTTTCGACAAAAGAAGGATAC
CTCTGATTCAGATCTGAACTAAAGGTGTAAACGAGTTAATGGATCGTTATTCGAGGAGGA
ACGCTGAGGATCTAGTTGTGCCTAACTATCATGAGACATCGGATTCATACCCATCTTCTG
ATATGTGGGGTGGATGGAGTATGAACTCCCAGAAAGCTGCTGAGAAATGCTTTGACTTCG
ATGTGATTAACAATGGATTCAGCGGAGGGTTATACAGTCAGATGGATATGGAGATAGGGA
CGAGTGGCGAAGAAGTAAAACAAGATGAAGAGGAATCAAAGAGGTTAAAGGCTCTTGGTT
GTTTCTATAACTCTCCTTCGTCGCTTCATGATTTCGATGGAATCCAGCAGATGGATGACG
TATTCTTAAGTTCCATTTTGGAGGATGTTCCAGGGAATGGCAATCTTCATTGTTTCAAAG
AGTCGGATAACAACAGCCCCGGCTCTTCCTCTGTTGCGTATCTTGACACTCTCGACGGCA
GGGAAGTACCCATGTATCAATACAACTGGGAAGCTTGTAATGACATGCCTCTTATGGAGG
GGGAAGAAGCAATGAAGATCTCGGATCTGTGTGAGGAGAACATGGAAGAGCCATCTACAG
AAGAAGTTGTGTTGCAGGATCTACAGAGGGCTAGTGAAAAGTTGAATGATGTTACCCGGA
AATGCTTCCGCGATACTTTCTACCGGCTTGCAAAGAACTCACAACTGAAGTGTGAATCAG
ACAACATTAACTCAGAGGCATTCCTTGAGGATAGAACCTTCAGTGGGAACATAAACCAGA
AGACTGAATTTGAAACGAACTCAATCGACAGAGCAGTCGCGAACCTCACGTTCAACAATA
TGGAGTCCAACATGAGGAATCTGCCTCCACCAAAGAGAGTTTCTTGTAATAAAGGGTAAG
AGAAAGCTTCAGAACAAGAAACAAAGATGTGTTTGTATATATATAAATATAAAAATATAT
ATTGTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D516TF U 1
AF RR4D516JQ C 441
BS 1 635 RR4D516TF
BS 636 636 RR4D516JQ
BS 637 672 RR4D516TF
BS 673 1030 RR4D516JQ

RD RR4D516TF 672 0 0
GGGAAGAGACAGAACACAAACTCATAAATCTTCTTTTGGTTTTCGACAAAAGAAGGATAC
CTCTGATTCAGATCTGAACTAAAGGTGTAAACGAGTTAATGGATCGTTATTCGAGGAGGA
ACGCTGAGGATCTAGTTGTGCCTAACTATCATGAGACATCGGATTCATACCCATCTTCTG
ATATGTGGGGTGGATGGAGTATGAACTCCCAGAAAGCTGCTGAGAAATGCTTTGACTTCG
ATGTGATTAACAATGGATTCAGCGGAGGGTTATACAGTCAGATGGATATGGAGATAGGGA
CGAGTGGCGAAGAAGTAAAACAAGATGAAGAGGAATCAAAGAGGTTAAAGGCTCTTGGTT
GTTTCTATAACTCTCCTTCGTCGCTTCATGATTTCGATGGAATCCAGCAGATGGATGACG
TATTCTTAAGTTCCATTTTGGAGGATGTTCCAGGGAATGGCAATCTTCATTGTTTCAAAG
AGTCGGATAACAACAGCCCCGGCTCTTCCTCTGTTGCGTATCTTGACACTCTCGACGGCA
GGGAAGTACCCATGTATCAATACAACTGGGAAGCTTGTAATGACATGCCTCTTATGGAGG
GGGAAGAAGCAATGAAGATCTCGGATCTGTGTGAG*AGAACATGGAAGAGCCATCTACAG
AAGAAGTTGTGT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR4D516JQ 590 0 0
GAGGATGTTCCAGGGAATGGCAATCTTCATTGTTTCAAAGAGTCGGATAACAACAGCCCC
GGCTCTTCCTCTGTTGCGTATCTTGACACTCTCGACGGCAGGGAAGTACCCATGTATCAA
TACAACTGGGAAGCTTGTAATGACATGCCTCTTATGGAGGGGGAAGAAGCAATGAAGATC
TCGGATCTGTGTGAGGAGAACATGGAAGAGCCATCTACAGAAGAAGTTGTGTTGCAGGAT
CTACAGAGGGCTAGTGAAAAGTTGAATGATGTTACCCGGAAATGCTTCCGCGATACTTTC
TACCGGCTTGCAAAGAACTCACAACTGAAGTGTGAATCAGACAACATTAACTCAGAGGCA
TTCCTTGAGGATAGAACCTTCAGTGGGAACATAAACCAGAAGACTGAATTTGAAACGAAC
TCAATCGACAGAGCAGTCGCGAACCTCACGTTCAACAATATGGAGTCCAACATGAGGAAT
CTGCCTCCACCAAAGAGAGTTTCTTGTAATAAAGGGTAAGAGAAAGCTTCAGAACAAGAA
ACAAAGATGTGTTTGTATATATATAAATATAAAAATATATATTGTGTGTT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL7848Contig1 976 2 6 U
GGGATCCTGATGGTGGAATATCTGCTGCACAAGTAACCAACAAGCTTAAACAGCTAGGTC
TAGAAACAAGGAAAAGACTTCGGCGTGGTGCTAACTCCCTGGAAGCAAGCAAATGCAGTA
ATGGAAATGATGATCAAGATCACGTAGAGGCAGCATCAGATCAGCAACCTTCAAACACCA
GAAAAAGAGTGAGTTCCTTTAGCAAAGAACAAGAAACACTTATTAAGGAACTATACGAGA
AATTTAAGGACGAGAGGCGCTGCTGTTACTTAATTGCCAATGAATTGGGTTCCGAGAATA
CATATACCACTGCCCAAGTTTCACGTAAATTAAAGCAACTTGGTCTGCGTCTCCCTCGTG
GTAAGAAGTCAGAAGCTGGCATGAAGCTGCTAGATGACCATGACGATTCTTCAGCAGATG
AATCCGATAACGAAACCTTACTAGCATTCAAGAAAAGGAAGAGCGCGGCGAGACGAAAAC
TTGAGAAGCACACAAGACCAAGCAATGAGATTTCTCCAGAAGGTTCTGAAGACAAAACAG
AGAGGAATGAAACAAGTCCAGATGTGCTTGCCACTAGCAAAGACGAGAACAATGATCAAG
AAGACTACATCACCGGGCAAAGTAGAGAATCAGATACAGATGTTCACATCAGGGAGAATG
ATCCATCTGCTTCATCTCCAGAAGATCAAAATCTTGTATCAGATCATGAACTGGAGGATG
ATGATGAGTTAGCAGATTCCGGTGATGACTCTGAAGCTGGTGGTGCCTCACTCACTCAAA
GTCCGCTTAGCAGAGGAAAATTGAAGATGGTACTTGATGTGGACGACGAGGATGATTGAA
GATACCTAGGCTCATCCATATCCTTGTTATTTTGATCGACTTCATCTCGAAAATACTAGA
GTGGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGGACACAATCTCCATTTTGTTAACAAAATATTTCAA
ATTTATATGTGTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AG70TF U 1
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BQ
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AF RR4AT32JQ C 1
AF RR4AT32TF U 1
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GAACAAATTCATGACTTTGCATTGATTGGTGCAAGTGTCCTCCAAGTCTATCTCCTGCGT
CGCTTGTTTGAACGCAAACTCGGCATGTCTCGTGTCTAAAAGCTTTTGTCTTTAGCTCTT
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GTTTTTCTTTTCTTTATTAACATAAAAAGCTGTTTCTGACG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G541TF U 1
AF RR4G541JQ C 76
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BS 649 649 RR4G541JQ
BS 650 680 RR4G541TF
BS 681 847 RR4G541JQ

RD RR4G541TF 680 0 0
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ATTTCCAAACGGTGTTTTTGTTCTACACAGTTTTCTCGTCGTTGCTTTTACCCAATAATG
CCAATATTTATATCCATGATTCTTATCACTGGCTTTAATTGGGAGAAGATAGTAAAGAGA
CGTGATGGTGTGTTTGAAGTTCATTATTTCTTCCTATGGAGGAGTTTCTTCCCGGTGAAT
GGACAACATTTTTTGAAGTCTACTTTTACCGACGTTTGTTCGTGTAGTACATTGCACGAT
GATTTCCCCTCTACCGACATCTTCGTTCGAGGGCTTCAATGTTTATGGAAGAGACGACCA
CCACGAAAGCCGCCTTGGCATGTTTCTCTGAAGAGAGGGAATCAATCTGAAAGTCAGTAT
AAGCCATCATATAGATGGGACTTACAGAAGATCAAATGGTTAACACATCAGAAGTACAAG
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CTAGAGCATGTTCTGGATGCAATGGGTTTTTTCTATACGATTTGGACAAAAAATAAAATG
CCAAAATGGCATACCTATCGTATTAGAGTGAGACGAATTTTCAAGAAG*AAAATAACAGA
TCTAATGTTCTGTTAGCGTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4G541JQ 772 0 0
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ATGATTCTTATCACTGGCTTTAATTGGGAGAAGATAGTAAAGAGACGTGATGGTGTGTTT
GAAGTTCATTATTTCTTCCTATGGAGGAGTTTCTTCCCGGTGAATGGACAACATTTTTTG
AAGTCTACTTTTACCGACGTTTGTTCGTGTAGTACATTGCACGATGATTTCCCCTCTACC
GACATCTTCGTTCGAGGGCTTCAATGTTTATGGAAGAGACGACCACCACGAAAGCCGCCT
TGGCATGTTTCTCTGAAGAGAGGGAATCAATCTGAAAGTCAGTATAAGCCATCATATAGA
TGGGACTTACAGAAGATCAAATGGTTAACACATCAGAAGTACAAGGAAGGTATAGAATCT
ACTTTCATCACAAGAACACAGATATGGATTATCCGTGTCAATTTTCTAGAGCATGTTCTG
GATGCAATGGGTTTTTTCTATACGATTTGGACAAAAAATAAAATGCCAAAATGGCATACC
TATCGTATTAGAGTGAGACGAATTTTCAAGAAGGAAAATAACAGATCTAATGTTCTGTTA
GCGTGTAAGGCTTACTGCAAAAGAAAGCAACGTCAATCTTCACTTCTACAAATGATTTGT
CTTCAGCATATGTCGCATATTTCTGCTTATGTAATAATTTGTATTCCAATGCTTTGTAAA
CGATTATATAATCTTTTTGTATTTTGATATATCAATAAGATCAGATTAGACG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7851Contig1 647 2 1 U
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CTCATATCAACAACCAGGAGTTAAACGGCAGTGAGAATGATAAATCTATCAACAGAAAGA
TCTCTGCAGGTGAAAAATCTGCGAGATTCTAAGAATCTGATTTTTATGTTTTTGTTAATA
CGTTCATAATTATTGTCTCTCTGTTTAATGTTTGTTTGTTAGAGCTTGGAAGGAGAAGAA
TGTTTATGTATGTATACAAATGTTTAAATACTGTTTAATATGGGTAGGTATTGCCAAATT
TTTAAGACCATTCTCGTGGGGAGACCAATTACTGTATCAACTGATCCTGGTTTGAGTTAT
ATTGTTTTTCAACAAGAGGGTCGGTGTTTCTAGAGTTGATATCCCAACCCTTTATCAGTA
TCTTAAAAGCATTGGCTAGCATAGTCTCAAGAATATCCTCTTCTCAAGTAGAGTTTAATG
CAAATAAGATACTACAACTTTGGCCAAATCATGAATCAGTAGAACTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4AJ05TF U 1
AF RR4AJ16TF U 1
BS 1 647 RR4AJ05TF

RD RR4AJ05TF 647 0 0
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CTCATATCAACAACCAGGAGTTAAACGGCAGTGAGAATGATAAATCTATCAACAGAAAGA
TCTCTGCAGGTGAAAAATCTGCGAGATTCTAAGAATCTGATTTTTATGTTTTTGTTAATA
CGTTCATAATTATTGTCTCTCTGTTTAATGTTTGTTTGTTAGAGCTTGGAAGGAGAAGAA
TGTTTATGTATGTATACAAATGTTTAAATACTGTTTAATATGGGTAGGTATTGCCAAATT
TTTAAGACCATTCTCGTGGGGAGACCAATTACTGTATCAACTGATCCTGGTTTGAGTTAT
ATTGTTTTTCAACAAGAGGGTCGGTGTTTCTAGAGTTGATATCCCAACCCTTTATCAGTA
TCTTAAAAGCATTGGCTAGCATAGTCTCAAGAATATCCTCTTCTCAAGTAGAGTTTAATG
CAAATAAGATACTACAACTTTGGCCAAATCATGAATCAGTAGAACTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR4AJ16TF 647 0 0
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ACTCTAAATAGTATGTTCCTCTTAATTAGTAGGTTACCCAGACCACCTCAAGTTTGAGTA
ATACAATAGCCTTTTGAACTCATGCTCATGGTCTTGGAATTTGGTAACAGATCACATGCG
CTCATATCAACAACCAGGAGTTAAACGGCAGTGAGAATGATAAATCTATCAACAGAAAGA
TCTCTGCAGGTGAAAAATCTGCGAGATTCTAAGAATCTGATTTTTATGTTTTTGTTAATA
CGTTCATAATTATTGTCTCTCTGTTTAATGTTTGTTTGTTAGAGCTTGGAAGGAGAAGAA
TGTTTATGTATGTATACAAATGTTTAAATACTGTTTAATATGGGTAGGTATTGCCAAATT
TTTAAGACCATTCTCGTGGGGAGACCAATTACTGTATCAACTGATCCTGGTTTGAGTTAT
ATTGTTTTTCAACAAGAGGGTCGGTGTTTCTAGAGTTGATATCCCAACCCTTTATCAGTA
TCTTAAAAGCATTGGCTAGCATAGTCTCAAGAATATCCTCTTCTCAAGTAGAGTTTAATG
CAAATAAGATACTACAACTTTGGCCAAATCATGAATCAGTAGAACTC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7852Contig1 631 2 2 U
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GGTTTGAAGAAGGAGAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCACGCTGGTCTCGGAAG
CAATGAACAGCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTGGAGTATCGTTTGTGGTTCTGGGGC
TGAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCT
CAAAGTCTAACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACAACAGCTCTTTGCTG
AAGCCACCTCTGCTGGTGTTTCCGCGGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATG
GAGAACTCACCACCCAATCTGGTGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCA
GGATCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTGATTTGCATTTGTAAACATCAAACTGTCT
GTTGTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTT
CATTATTGGACCCATTGGTTGAAAGTGGGACCTGCATGCAGAATTAATGACTGATAAGGT
ATATGAAATCAGGAATAAGTGTTGTTTCCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E308JQ C 1
AF RR4E308TF U 1
BS 1 609 RR4E308TF
BS 610 631 RR4E308JQ

RD RR4E308JQ 631 0 0
GGATCGTGAATTAGGAGTGTTGACATTTGCAGATAATCGTGAGTTGTGATCTCTACTTAA
GGTTTGAAGAAGGAGAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCACGCTGGTCTCGGAAG
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TGAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCT
CAAAGTCTAACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACAACAGCTCTTTGCTG
AAGCCACCTCTGCTGGTGTTTCCGCGGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATG
GAGAACTCACCACCCAATCTGGTGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCA
GGATCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTGATTTGCATTTGTAAACATCAAACTGTCT
GTTGTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTT
CATTATTGGACCCATTGGTTGAAAGTGGGACCTGCATGCAGAATTAATGACTGATAAGGT
ATATGAAATCAGGAATAAGTGTTGTTTCCAT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4E308TF 609 0 0
GGATCGTGAATTAGGAGTGTTGACATTTGCAGATAATCGTGAGTTGTGATCTCTACTTAA
GGTTTGAAGAAGGAGAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCACGCTGGTCTCGGAAG
CAATGAACAGCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTGGAGTATCGTTTGTGGTTCTGGGGC
TGAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCT
CAAAGTCTAACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGAGTGGAAACAACAGCTCTTTGCTG
AAGCCACCTCTGCTGGTGTTTCCGCGGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATG
GAGAACTCACCACCCAATCTGGTGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCA
GGATCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTGATTTGCATTTGTAAACATCAAACTGTCT
GTTGTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTT
CATTATTGGACCCATTGGTTGAAAGTGGGACCTGCATGCAGAATTAATGACTGATAAGGT
ATATGAAAT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL7853Contig1 989 2 8 U
CATCCTATTCCTATGCAGCGAATCTATCCTTGTCGGAAGACCCAATTTCACAACGCCTTT
TACTCGCATTACCATTCACAGCTGCAAAGCCCGGTGTTTGCTCTACCTTTCATAACACGA
CAGATCCAAGGTATAATCGACTTAACTCTGGCTCCATCAAAGTTCTTTGGCTCCGATACG
GTAATATTGGTGTCCCGAGTTTCTCTTTGGCCATTGGTTCTGCGGTTCTTTCAAATCAGG
TCAAGCTCCTATGTTGTTACGCCGGTGTAGAGGTGGTTCAGTCTTCACCTCCAGATTCAT
CATTCTCACGCTCTCCACCTTCAAGCTTTGAGCCAGACACCATGCCTGATAGCTCTACTT
CAGATGTCACAAGTGAACACCTTACGAAGCCTCCACAAGATAAGGGAAGCATCTCCTTCA
ATAGTTCTTGGCATGGTCTTACAACTTTCATATGTCTAAAGCCAGCTATTTCAACCGGGA
GACAATGCACAGTATCATCTCCAAATCTGAGACTCCCAAAACTCCAACTAATCAGCCTTT
TAAATTTATCTTTTTGGATAAGTTTATTCGAACTTCCTCTCGACAGGGCTGAGAGAGATC
ATCATCCACCTCCTCCTTTCAGGAGAGAATTTTTTCACCACGGTCCCTCTTTGTAAGAAG
AAATTCTCATTTGGTATTCAAATTGTGGATCATCAATGATGCAGGGACATCCCCATCTCA
CTCAACGACAGCTCTTTTTGTAGCGTCGCCCCTAATTGCAGAAACTTTGGCAATGCAAAA
CGCCATGATCTCTGCTCACATTTGTGGGTTAAACTCTCTCAGCTTAGAAGCCCTTGTTAA
GAAGCTTCCGGTTTTTGTCTATGATTCAAACCGTTTAACCTATCTCTTTAATGCTTTAGT
TTTCGTTAATGTAACAAGTGAGTTTCACTCTATGGCACTGAACTTTCTATTTGTAATCTT
CATTTAAGGCTAATATAATCCTTGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B050TF U 1
AF RR4B050JQ C 218
BS 1 834 RR4B050TF
BS 835 835 RR4B050JQ
BS 836 837 RR4B050TF
BS 838 839 RR4B050JQ
BS 840 850 RR4B050TF
BS 851 852 RR4B050JQ
BS 853 887 RR4B050TF
BS 888 989 RR4B050JQ

RD RR4B050TF 887 0 0
CATCCTATTCCTATGCAGCGAATCTATCCTTGTCGGAAGACCCAATTTCACAACGCCTTT
TACTCGCATTACCATTCACAGCTGCAAAGCCCGGTGTTTGCTCTACCTTTCATAACACGA
CAGATCCAAGGTATAATCGACTTAACTCTGGCTCCATCAAAGTTCTTTGGCTCCGATACG
GTAATATTGGTGTCCCGAGTTTCTCTTTGGCCATTGGTTCTGCGGTTCTTTCAAATCAGG
TCAAGCTCCTATGTTGTTACGCCGGTGTAGAGGTGGTTCAGTCTTCACCTCCAGATTCAT
CATTCTCACGCTCTCCACCTTCAAGCTTTGAGCCAGACACCATGCCTGATAGCTCTACTT
CAGATGTCACAAGTGAACACCTTACGAAGCCTCCACAAGATAAGGGAAGCATCTCCTTCA
ATAGTTCTTGGCATGGTCTTACAACTTTCATATGTCTAAAGCCAGCTATTTCAACCGGGA
GACAATGCACAGTATCATCTCCAAATCTGAGACTCCCAAAACTCCAACTAATCAGCCTTT
TAAATTTATCTTTTTGGATAAGTTTATTCGAACTTCCTCTCGACAGGGCTGAGAGAGATC
ATCATCCACCTCCTCCTTTCAGGAGAGAATTTTTTCACCACGGTCCCTCTTTGTAAGAAG
AAATTCTCATTTGGTATTCAAATTGTGGATCATCAATGATGCAGGGACATCCCCATCTCA
CTCAACGACAGCTCTTTTTGTAGCGTCGCCCCTAATTGCAGAAACTTTGGCAATGCAAAA
CGCCATGATCTCTGCTCACATTTGTGGGTTAAACTCTCTCAGCTTAGAAGCCCT*GT**A
GAAGCTTCCG**TTTTGTCTATGATTCAAACCGTTTAACCTATCTCT

QA 1 887 1 887
DS 

RD RR4B050JQ 772 0 0
TTCTGCGGTTCTTTCAAATCAGGTCAAGCTCCTATGTTGTTACGCCGGTGTAGAGGTGGT
TCAGTCTTCACCTCCAGATTCATCATTCTCACGCTCTCCACCTTCAAGCTTTGAGCCAGA
CACCATGCCTGATAGCTCTACTTCAGATGTCACAAGTGAACACCTTACGAAGCCTCCACA
AGATAAGGGAAGCATCTCCTTCAATAGTTCTTGGCATGGTCTTACAACTTTCATATGTCT
AAAGCCAGCTATTTCAACCGGGAGACAATGCACAGTATCATCTCCAAATCTGAGACTCCC
AAAACTCCAACTAATCAGCCTTTTAAATTTATCTTTTTGGATAAGTTTATTCGAACTTCC
TCTCGACAGGGCTGAGAGAGATCATCATCCACCTCCTCCTTTCAGGAGAGAATTTTTTCA
CCACGGTCCCTCTTTGTAAGAAGAAATTCTCATTTGGTATTCAAATTGTGGATCATCAAT
GATGCAGGGACATCCCCATCTCACTCAACGACAGCTCTTTTTGTAGCGTCGCCCCTAATT
GCAGAAACTTTGGCAATGCAAAACGCCATGATCTCTGCTCACATTTGTGGGTTAAACTCT
CTCAGCTTAGAAGCCCTTGTTAAGAAGCTTCCGGTTTTTGTCTATGATTCAAACCGTTTA
ACCTATCTCTTTAATGCTTTAGTTTTCGTTAATGTAACAAGTGAGTTTCACTCTATGGCA
CTGAACTTTCTATTTGTAATCTTCATTTAAGGCTAATATAATCCTTGGTTTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7854Contig1 629 2 17 U
GGGCTAGTCATTTTCTTCCGCAAAGCCAAAACTGAAGAACCCTTGGCGGTCTTGTCTTCG
TCGACGTAGATCCGTCTCTTAGTCTGGGTTGAAATATGGCCAAGTCTTGCAAGGGTCTTG
CTGAAGAGCTTGTCAAGTGTCTCAGTGAATCGATGTGTGTTAAGGAGGAGAAACGGTCAA
TTAGGGACTGCGCGGGTGAGAAAAGCCCCTGTATACCGAGTGAATGTGTTGGCCTACGCG
AAACCTACTTCAATTGTAAAAGAGGACAAGTAGACATGAGAGCCAGGATTCGAGGAAACA
AGGGTTACTAACAGAAGACATGTACTGAGCACCTGCTTGCTTGTTCAATACCACCGCATT
TTTCACCTTTTTAAATTTGTGTTCTTTCTGGTTTCTACACGATGCTAAAGGGTGGGAATG
CAGGGACTCACAATACTTTGCCATGTCAATATCAAGTTAAGCTTTGTCCCCAAATACTCA
ACTTGATTTCTTTTCCTTTTCATAAAAGCTGGTATTTTCATTTTCATCGGACCGGATGCA
CTTGAATGTCTTCATGTAGCTTAAAGAAAGAGAAACAATGTAAACGAACGATGCTTTCTT
CCAATTTCTCAATGCACACATCTCAAACT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CK77TF U 2
AF RR4BQ01TF U 1
BS 1 377 RR4BQ01TF
BS 378 378 RR4CK77TF
BS 379 411 RR4BQ01TF
BS 412 412 RR4CK77TF
BS 413 438 RR4BQ01TF
BS 439 439 RR4CK77TF
BS 440 464 RR4BQ01TF
BS 465 465 RR4CK77TF
BS 466 470 RR4BQ01TF
BS 471 471 RR4CK77TF
BS 472 499 RR4BQ01TF
BS 500 500 RR4CK77TF
BS 501 517 RR4BQ01TF
BS 518 518 RR4CK77TF
BS 519 523 RR4BQ01TF
BS 524 524 RR4CK77TF
BS 525 629 RR4BQ01TF

RD RR4CK77TF 594 0 0
GGG
TAGTCATTTTCTTCCGCAAAGCCAAAACTGAAGAACCCTTGGCGGTCTTGTCTTCGTCGA
CGTAGATCCGTCTCTTAGTCTGGGTTGAAATATGGCCAAGTCTTGCAAGGGTCTTGCTGA
AGAGCTTGTCAAGTGTCTCAGTGAATCGATGTGTGTTAAGGAGGAGAAACGGTCAATTAG
GGACTGCGCGGGTGAGAAAAGCCCCTGTATACCGAGTGAATGTGTTGGCCTACGCGAAAC
CTACTTCAATTGTAAAAGAGGACAAGTAGACATGAGAGCCAGGATTCGAGGAAACAAGGG
TTACTAACAGAAGACATGTACTGAGCACCTGCTTGCTTGTTCAATACCACCGCATTTTTC
ACCTTTTTAAATTTGTGTTCTTTCTGGTTTCTACACGATGCTAAAGGGTGGGAATGCAGG
GACTCACAATACTTTGCCATGTCAATATCAAGTTAAGCTTTGTCCCCAAATACTCAACTT
GATTTCTTTTCCTTTTCATAAAAGCTGGTATTTTCATTTTCATCGGACCGGATGCACTTG
AATGTCTTCATGTAGCTTAAAGAAAGAGAAACAATGTAAACGAACGATGCT

QA 4 594 4 594
DS 

RD RR4BQ01TF 629 0 0
GGGCTAGTCATTTTCTTCCGCAAAGCCAAAACTGAAGAACCCTTGGCGGTCTTGTCTTCG
TCGACGTAGATCCGTCTCTTAGTCTGGGTTGAAATATGGCCAAGTCTTGCAAGGGTCTTG
CTGAAGAGCTTGTCAAGTGTCTCAGTGAATCGATGTGTGTTAAGGAGGAGAAACGGTCAA
TTAGGGACTGCGCGGGTGAGAAAAGCCCCTGTATACCGAGTGAATGTGTTGGCCTACGCG
AAACCTACTTCAATTGTAAAAGAGGACAAGTAGACATGAGAGCCAGGATTCGAGGAAACA
AGGGTTACTAACAGAAGACATGTACTGAGCACCTGCTTGCTTGTTCAATACCACCGCATT
TTTCACCTTTTTAAATT*GTGTTCTTTCTGGTTTCTACACGATGCTAAAGG*TGGGAATG
CAGGGACTCACAATACTT*GCCATGTCAATATCAAGTTAAGCTT*GTCCC*AAATACTCA
ACTTGATTTCTTTTCCTTT*CATAAAAGCTGGTATTT*CATTT*CATCGGACCGGATGCA
CTTGAATGTCTTCATGTAGCTTAAAGAAAGAGAAACAATGTAAACGAACGATGCTTTCTT
CCAATTTCTCAATGCACACATCTCAAACT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL7855Contig1 646 2 2 U
TTTTTACTCCAGAAAACCAACAACATATTTAAACTTTTTTATTTTCTTTGACAAAGAAAT
GATAATATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTTGTGTAGATAAAAAAATCAGCGAGCGC
ACAGATAATGACATACACATCGCTTTTTTTTGTATTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTACC
CCTTCTTTATGCCTTTTGGCACATTCGGCTTGACACACCTGGTAGGGACATGTTCCACTT
TTATTTCGTAATACCCTATTACATTGCTTGCCACCTTTTACTTTCGGAGCAATCGCCGTT
TCACCTATTATTATAACAATAAAAACATAATCTTAGTTTTTATATTTAAAACAGAAAATC
ATTGTTTTGTAAAATATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAGAAAAACTGAAAGT
CTAAAACATCTTAAAAAATCATTAAACTCGATATTACAGAAATAGACATACAATTTATAT
AGGTGTATAATTAAACCACATCAATAAAATTTATATTAGAAGGATTATATTATATATTAA
TAAAGTTGTAAATCAAAATACAAACCGAACAGAAAAATTGTGAGCATAAAAAAACCAATA
AGCTAAAGTTTGAAAGCAACTTTCATCTTCGATTGTGAAATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DG76TF C 1
AF RR4DG76JQ U 6
BS 1 5 RR4DG76TF
BS 6 646 RR4DG76JQ

RD RR4DG76TF 646 0 0
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GATAATATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTTGTGTAGATAAAAAAATCAGCGAGCGC
ACAGATAATGACATACACATCGCTTTTTTTTGTATTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTACC
CCTTCTTTATGCCTTTTGGCACATTCGGCTTGACACACCTGGTAGGGACATGTTCCACTT
TTATTTCGTAATACCCTATTACATTGCTTGCCACCTTTTACTTTCGGAGCAATCGCCGTT
TCACCTATTATTATAACAATAAAAACATAATCTTAGTTTTTATATTTAAAACAGAAAATC
ATTGTTTTGTAAAATATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAGAAAAACTGAAAGT
CTAAAACATCTTAAAAAATCATTAAACTCGATATTACAGAAATAGACATACAATTTATAT
AGGTGTATAATTAAACCACATCAATAAAATTTATATTAGAAGGATTATATTATATATTAA
TAAAGTTGTAAATCAAAATACAAACCGAACAGAAAAATTGTGAGCATAAAAAAACCAATA
AGCTAAAGTTTGAAAGCAACTTTCATCTTCGATTGTGAAATAATCC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4DG76JQ 641 0 0
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TATTATAACCCAATATTATTTGAGTGCTTGTGTAGATAAAAAAATCAGCGAGCGCACAGA
TAATGACATACACATCGCTTTTTTTTGTATTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTACCCCTTC
TTTATGCCTTTTGGCACATTCGGCTTGACACACCTGGTAGGGACATGTTCCACTTTTATT
TCGTAATACCCTATTACATTGCTTGCCACCTTTTACTTTCGGAGCAATCGCCGTTTCACC
TATTATTATAACAATAAAAACATAATCTTAGTTTTTATATTTAAAACAGAAAATCATTGT
TTTGTAAAATATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAGAAAAACTGAAAGTCTAAA
ACATCTTAAAAAATCATTAAACTCGATATTACAGAAATAGACATACAATTTATATAGGTG
TATAATTAAACCACATCAATAAAATTTATATTAGAAGGATTATATTATATATTAATAAAG
TTGTAAATCAAAATACAAACCGAACAGAAAAATTGTGAGCATAAAAAAACCAATAAGCTA
AAGTTTGAAAGCAACTTTCATCTTCGATTGTGAAATAATCC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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GGGTTCAACCTCTTGGAGCAATCAAAGGGATACTCAAGATGATCGGATGATTGCTCTTAT
GTTATCTGAAGAGTACACTAACCTAGATGGTGCTGTTGCCAGACGCCTCTCCAATCTTGC
TCCCGTTCCCCATGTTCCGCGAATAAATTCTTATATCCCCAACTTAAATGATGCCACCTT
GGATCACCAACGCCTTCTTCAAAGGCTAAATGTTTATGGTTTGTGTGAGTTGAAGGTCTC
TGGTGATGGAAACTGCCAGTTCCGAGCTCTTTCCGACCAGTTGTACCGATCTTCAGAGTA
CCACAAGCAAGTTAGGGGAGAAGTTGTTAAACAGCTCAAGGACAATCGCACTATGTACGA
AAGTTATGTTCCTATGAAATACAAACGGTATTACAAGAAGATGGCAAAACTTGGAGAATG
GGGAGACCATATTACCCTACAATCTGCGGCAGATAGGTTTGCAGCAAAGATATGCCTGCT
GACATCCTTCAGAGACACTTGTTTCATTGAAATCATGCCTCGAGACCAAGCACCTAAGCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H165TF U 1
AF RR4H165JQ C 94
BS 1 661 RR4H165TF
BS 662 891 RR4H165JQ

RD RR4H165TF 661 0 0
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GGACCGGAAGGACTAGAAAGAGTTTCACCTACAAGAAAACATGATGGGAGACTCTTCTTC
GGGTTCAACCTCTTGGAGCAATCAAAGGGATACTCAAGATGATCGGATGATTGCTCTTAT
GTTATCTGAAGAGTACACTAACCTAGATGGTGCTGTTGCCAGACGCCTCTCCAATCTTGC
TCCCGTTCCCCATGTTCCGCGAATAAATTCTTATATCCCCAACTTAAATGATGCCACCTT
GGATCACCAACGCCTTCTTCAAAGGCTAAATGTTTATGGTTTGTGTGAGTTGAAGGTCTC
TGGTGATGGAAACTGCCAGTTCCGAGCTCTTTCCGACCAGTTGTACCGATCTTCAGAGTA
CCACAAGCAAGTTAGGGGAGAAGTTGTTAAACAGCTCAAGGACAATCGCACTATGTACGA
AAGTTATGTTCCTATGAAATACAAACGGTATTACAAGAAGATGGCAAAACTTGGAGAATG
GGGAGACCATATTACCCTACAATCTGCGGCAGATAGGTTTGCAGCAAAGATATGCCTGCT
GACATCCTTCAGAGACACTTGTTTCATTGAAATCATGCCTCGAGACCAAGCACCTAAGCG
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4H165JQ 798 0 0
AAG
AAACATGATGG*AGACTCTTCTTCGGGTTCAACCTCTTGGAGCAATCAAAGGGATACTCA
AGATGATCGGATGATTGCTCTTATGTTATCTGAAGAGTACACTAACCTAGATGGTGCTGT
TGCCAGACGCCTCTCCAATCTTGCTCCCGTTCCCCATGTTCCGCGAATAAATTCTTATAT
CCCCAACTTAAATGATGCCACCTTGGATCACCAACGCCTTCTTCAAAGGCTAAATGTTTA
TGGTTTGTGTGAGTTGAAGGTCTCTGGTGATGGAAACTGCCAGTTCCGAGCTCTTTCCGA
CCAGTTGTACCGATCTTCAGAGTACCACAAGCAAGTTAGGGGAGAAGTTGTTAAACAGCT
CAAGGACAATCGCACTATGTACGAAAGTTATGTTCCTATGAAATACAAACGGTATTACAA
GAAGATGGCAAAACTTGGAGAATGGGGAGACCATATTACCCTACAATTTGCGGCAGATAG
GTTTGCAGCAAAGATATGCCTGCTGACATCCTTCAGAGACACTTGTTTCATTGAAATCAT
GCCTCGAGACCAAGCACCTAAGCGTGAGTTATGGTTAAGTTTCTGGTCGGAGGTGCATTA
TAACTCTTTATACGACAATCGAGCGGTTCCAGTTCAGCAGAAGCCAAAGAGAAAACATTG
GTTGTTCTAGAAAGCAAGTGTCAGGACAACATCTTCATATTATTATTTTGTATCAGTATT
GTGCATAAGTCAAACATTTTCAGACGCCGCAACTCTTCCTTTGTACTTGTGTATACACTT
GAACTAGCTTGAGCG

QA 4 798 4 798
DS 



AS 1 2

CO CL7857Contig1 1106 2 2 U
TTTTTTCCTCTTTCCTGTTCTCTCTATATATCTTCCTCCGCCTGTTGTTAAAAAAAAAAA
AATATCTTCCTCCGCCGCCGAAAGAGAATCGTCTATCGGAAAAACTCTCAAGATGTCGAC
TGGATTAGATATGTCTCTCGACGACATGATCGCTAAAAACCGCAAGTCCCGCGGATCCGG
TCCCCCCGTGGATCTGGATCCGGATCCGGTCCAATCCGCCGCAACAACCCTAATCGGAAA
TCAAACCGATCTGCTCCATACCAATCGGCCGCCAAGGCGCCGGAGTCCACCTGGGAACAC
GACATGTACTCCTCCGAAGGCTTCCCTTCCCGATCTACCCGTTCTTCCGCCGGAATCGAA
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GAACTGTTTGCTGAAGTAGGGGAGCTTAAACGTTACACTGTTCACTTTGACAGGAGTGGA
AGATCAAAGGGAACTGCTGAAGTTGTATACTCTCGGCGTGGTGATGCAATCGCTGCTGTG
AAGAAGTACAACGACGTTCAGCTCGACGGAAAGCCCATGAAGATTGAGATTGTGGGCAAC
AATCTTCAAGCCGCTTCTGCTCCTTCTGGTAGACACGGCGGGAATGCAAACTTCGGTGGC
GCTTCTTCAAGGCGTGGAGGACAAGGGAGAGGTGGTCAACAACGTCGTGGTGGTGGTGGT
GGTCAAGGAGGCCGTGGTGGTGGTCGTGGCAGACGCTCTGGCAAGGGCCCGGCAGAGAAG
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AACTGAGGAACGTGGCTCGTATCTTCTCGAAACCACCGCAAGTGTGTGAGCGAAGAAGAG
GAGAAGCTAGAAAACTTTGTCCAGAGGCTTTGCTATATATCCTCTTCTTGGCCGTATGTT
GTTTGATTTGTTTCATTAGAATGACCCTTATGAGATTGTTGTTTAATCTTAATGCCCTCG
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AGGTTATGACAATGATGATTTAGCTG


BQ
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AF RR4FC68TF U 1
AF RR4FC68JQ C 405
BS 1 711 RR4FC68TF
BS 712 1106 RR4FC68JQ

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TTTTTTCCTCTTTCCTGTTCTCTCTATATATCTTCCTCCGCCTGTTGTTAAAAAAAAAAA
AATATCTTCCTCCGCCGCCGAAAGAGAATCGTCTATCGGAAAAACTCTCAAGATGTCGAC
TGGATTAGATATGTCTCTCGACGACATGATCGCTAAAAACCGCAAGTCCCGCGGATCCGG
TCCCCCCGTGGATCTGGATCCGGATCCGGTCCAATCCGCCGCAACAACCCTAATCGGAAA
TCAAACCGATCTGCTCCATACCAATCGGCCGCCAAGGCGCCGGAGTCCACCTGGGAACAC
GACATGTACTCCTCCGAAGGCTTCCCTTCCCGATCTACCCGTTCTTCCGCCGGAATCGAA
ACCGGAACGAAGCTCTACATATCCAATTTGGACTACGGTGTCATGAACGACGACATCAAG
GAACTGTTTGCTGAAGTAGGGGAGCTTAAACGTTACACTGTTCACTTTGACAGGAGTGGA
AGATCAAAGGGAACTGCTGAAGTTGTATACTCTCGGCGTGGTGATGCAATCGCTGCTGTG
AAGAAGTACAACGACGTTCAGCTCGACGGAAAGCCCATGAAGATTGAGATTGTGGGCAAC
AATCTTCAAGCCGCTTCTGCTCCTTCTGGTAGACACGGCGGGAATGCAAACTTCGGTGGC
GCTTCTTCAAGGCGTGGAGGACAAGGGAGAGGTGGTCAACAACGTCGTGGT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4FC68JQ 702 0 0
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CTTTGACAGGAGTGGAAGATCAAAGGGAACTGCTGAAGTTGTATACTCTCGGCGTGGTGA
TGCAATCGCTGCTGTGAAGAAGTACAACGACGTTCAGCTCGACGGAAAGCCCATGAAGAT
TGAGATTGTGGGCAACAATCTTCAAGCCGCTTCTGCTCCTTCTGGTAGACACGGCGGGAA
TGCAAACTTCGGTGGCGCTTCTTCAAGGCGTGGAGGACAAGGGAGAGGTGGTCAACAACG
TCGTGGTGGTGGTGGTGGTCAAGGAGGCCGTGGTGGTGGTCGTGGCAGACGCTCTGGCAA
GGGCCCGGCAGAGAAGGTATCTGCTGAAGATCTTGATGCGGATCTTGATAAGTACCACGC
AGGAGATATGGAGACAAACTGAGGAACGTGGCTCGTATCTTCTCGAAACCACCGCAAGTG
TGTGAGCGAAGAAGAGGAGAAGCTAGAAAACTTTGTCCAGAGGCTTTGCTATATATCCTC
TTCTTGGCCGTATGTTGTTTGATTTGTTTCATTAGAATGACCCTTATGAGATTGTTGTTT
AATCTTAATGCCCTCGAGTACAAGGCAGAGGAACGAAAACGAGTTTTATATGCACACAGA
AGTGCTTTCACAAGCTAGGTTATGACAATGATGATTTAGCTG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7858Contig1 671 2 1 U
GCTCAACGAACCTGCGACGGCTGTTATCGGAGGGAACATCGTTGTTTTGATTGAAGAGAC
AGTGAAGAGCTGTGTCTCTCCTCTGATCAAGGAGATGATGAACGGGACGACGAGTATGAT
GATGGCTGCAATGGGAGGAGGAGGTGGTGTTGGTGGTGGTCATGGTCATGGTTTTGGCTC
GTTAAGCCCAGTGTTTACACGGCCGTTAGGTTATGGTGTGGAAGGAGGGTGGGAACAAGG
CGGTGAATGATGAGCGGTGGAGGAAGCAACAGATACTGGAGCTGGAAGTGTATTCGAGGA
GATTAGAGCTGGTTCAAGAGCAGATTAGAGCTACATTGCATGAGTTAAAGACGATGCCGA
GTGGTGTATGATGATGATGATGAAACAAGAAGAAGAGGAATAAGACAATAACCAGTTAGG
TTGATATTTGATTATGAGTTTAACCTTCTGGAATGTGTGTGGTGAGTATTAGTAGTATGA
GAGATTTGAATATTTTTCCAGTTATAAATTTGCTTAAGGTATTATTGTGATATTATTCTA
GGTTTTTATTTTTGTTTTTCTCTTCTTTAAATTATTTGTCAATAGGGATGAATCATCATA
GTTGGGGGTTTGTGTATAACCTTTGTATTAGATTTTTATAGTTTTCTCGTATAACCTTTG
TTTCATGATGC


BQ
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AF RR4G086TF U 1
AF RR4G086JQ C 84
BS 1 671 RR4G086TF

RD RR4G086TF 671 0 0
GCTCAACGAACCTGCGACGGCTGTTATCGGAGGGAACATCGTTGTTTTGATTGAAGAGAC
AGTGAAGAGCTGTGTCTCTCCTCTGATCAAGGAGATGATGAACGGGACGACGAGTATGAT
GATGGCTGCAATGGGAGGAGGAGGTGGTGTTGGTGGTGGTCATGGTCATGGTTTTGGCTC
GTTAAGCCCAGTGTTTACACGGCCGTTAGGTTATGGTGTGGAAGGAGGGTGGGAACAAGG
CGGTGAATGATGAGCGGTGGAGGAAGCAACAGATACTGGAGCTGGAAGTGTATTCGAGGA
GATTAGAGCTGGTTCAAGAGCAGATTAGAGCTACATTGCATGAGTTAAAGACGATGCCGA
GTGGTGTATGATGATGATGATGAAACAAGAAGAAGAGGAATAAGACAATAACCAGTTAGG
TTGATATTTGATTATGAGTTTAACCTTCTGGAATGTGTGTGGTGAGTATTAGTAGTATGA
GAGATTTGAATATTTTTCCAGTTATAAATTTGCTTAAGGTATTATTGTGATATTATTCTA
GGTTTTTATTTTTGTTTTTCTCTTCTTTAAATTATTTGTCAATAGGGATGAATCATCATA
GTTGGGGGTTTGTGTATAACCTTTGTATTAGATTTTTATAGTTTTCTCGTATAACCTTTG
TTTCATGATGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4G086JQ 588 0 0
TGATCAAGGAGATGATGAACGGGACGACGAGTATGATGATGGCTGCAATGGGAGGAGGAG
GTGGTGTTGGTGGTGGTCATGGTCATGGTTTTGGCTCGTTAAGCCCAGTGTTTACACGGC
CGTTAGGTTATGGTGTGGAAGGAGGGTGGGAACAAGGCGGTGAATGATGAGCGGTGGAGG
AAGCAACAGATACTGGAGCTGGAAGTGTATTCGAGGAGATTAGAGCTGGTTCAAGAGCAG
ATTAGAGCTACATTGCATGAGTTAAAGACGATGCCGAGTGGTGTATGATGATGATGATGA
AACAAGAAGAAGAGGAATAAGACAATAACCAGTTAGGTTGATATTTGATTATGAGTTTAA
CCTTCTGGAATGTGTGTGGTGAGTATTAGTAGTATGAGAGATTTGAATATTTTTCCAGTT
ATAAATTTGCTTAAGGTATTATTGTGATATTATTCTAGGTTTTTATTTTTGTTTTTCTCT
TCTTTAAATTATTTGTCAATAGGGATGAATCATCATAGTTGGGGGTTTGTGTATAACCTT
TGTATTAGATTTTTATAGTTTTCTCGTATAACCTTTGTTTCATGATGC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL7859Contig1 880 2 2 U
GAACTTTTAAATGAATGGATCTAAATATAAAAAATGATACAGATCCCAAAACCAAATGTA
CACAAGACGACGTTTATACACAACTCTTCTCTGAAAACCCCCAGAAAAGAAAAAGATGGA
AAAGAAAGAATCAAAGCCTCTTCTCTCAATTCCACAGTGGAATTAAATGTTACATACACA
AACCCTTCTACCCTCTACCCCCCAAACTCTAATGTACCTACGTACATAGATACACACATA
TGTGCATGAGAATGCATTGTACTATCTTCATATGATATAGGAAAAAGGAAAAAAAAGTCT
TCATATGATATTGTTGCCTCGGTGCAAATCAAACTTGATCTGAAGAGATGCATATTCTTC
TCCGGTCAGTGCTTGGCTTAGGTCGTTGGGATGGTGACGGGCTTGGAATAGCCTCGAGAG
TGGATCGAGGGGACAGACGGGGCACTGTCCCTGTTAGATCAGGAGACCGGTACTGTTGCT
GCTGCCAACTTTCACTCTCTGAGGATGTCACGTTTCTAGCGCGTGGAATTTGATCTAGTT
TGAAATTTGGTTTCTCCCTCCTAGTGTTTTGTTCCTTTATGTTCATCCCGTTAAGTAAAT
GAGAGCAATTTGAGACGTCGCTGTTACGTGGTGAGGTTGATTGCACAGAGTTCTTTAGGA
ACCGGTGTTCTAGCAACATAGATGCAGTTGGTCGCTCTGCGGGGTTTCTCTGGAAACATA
ATCTGAGAAATTCTTTGCCCTCCGGTGACATTGATTCAGTACCGGTGGGCTATCTCTCAT
GACCTTGAACATAGCTGCAGCCCCTTCAAACTCACTCCATGGAGGCTTTCCAGTGAACAT
CTCGATGATTGTACATCCTAAACTCATATATCACAGCAAT


BQ
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AF RR4CL43JQ U 1
AF RR4CL79JQ U 1
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BS 756 880 RR4CL79JQ

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DS 



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BQ
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AF RR4C890JQ C 1
AF RR4C890TF U 1
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AS 1 2

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TTT


BQ
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10 10 10 

AF RR4EJ14TF U 1
AF RR4EJ14JQ C 56
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BS 626 626 RR4EJ14JQ
BS 627 644 RR4EJ14TF
BS 645 783 RR4EJ14JQ

RD RR4EJ14TF 644 0 0
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CAAGAGTTCCGAAGCATCCTCAATCTATTCCCCGTCGTACGCTCTCGCGACCACCGTTCT
GAATTAGATTCTTCAAGTCCAGCGCAATCAACTTCACAGTCAATTGTTGAGCGAGAGTGT
GATGGAACTTGGAATCACTCAAAGCAGCTAAGTGTTGATGAGCCGAAAGACTTTAAAGAT
CTGAAGACTGATCAAGATACGTTTACATTCTGGGATAAACTCAGAACGGCTGCTGCGAAT
AAGGTTGGTGAGGTTGAAGCAGAGAGGTTTTGCAAGGCTTTCGAGAAACTCCACAAGAAA
CTTGTTTATGAAGAGTTGGATACTGAAACTGCAAAGCGATACTTATTAAACTCTTAAAAC
AACTTCATGTCTTCATTACAATATGCCACCAAAGGTTTGAGATTATGTGGAGATGTTTCG
ACTCTCTTTTTGCTTTTTGGATTATCGTAATTATGTATGAGTGGTCAACAATACATTCTC
TTCCCGTGTTCATCTAATGATGATTCTCATCTTAAATGGTAGAAAAAGTTATGCTTGGGA
CATGATTAATCAG*ATCTTTTATTA*TTTAGTATATCTTTTTGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4EJ14JQ 728 0 0
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GTTCTGAATTAGATTCTTCAAGTCCAGCGCAATCAACTTCACAGTCAATTGTTGAGCGAG
AGTGTGATGGAACTTGGAATCACTCAAAGCAGCTAAGTGTTGATGAGCCGAAAGACTTTA
AAGATCTGAAGACTGATCAAGATACGTTTACATTCTGGGATAAACTCAGAACGGCTGCTG
CGAATAAGGTTGGTGAGGTTGAAGCAGAGAGGTTTTGCAAGGCTTTCGAGAAACTCCACA
AGAAACTTGTTTATGAAGAGTTGGATACTGAAACTGCAAAGCGATACTTATTAAACTCTT
AAAACAACTTCATGTCTTCATTACAATATGCCACCAAAGGTTTGAGATTATGTGGAGATG
TTTCGACTCTCTTTTTGCTTTTTGGATTATCGTAATTATGTATGAGTGGTCAACAATACA
TTCTCTTCCCGTGTTCATCTAATGATGATTCTCATCTTAAATGGTAGAAAAAGTTATGCT
TGGGACATGATTAATCAGGATCTTTTATTAATTTAGTATATCTTTTTGAACATCCTTATT
TTTCTATATCTATGATTATTAGTTTTTCTCGTTTTTGATTTCTGATTATGGCTATGGGAA
AATCTATTTCGTGTCCCTACTTCACATCTCGAATTTTCAATGAAAATGTAATCAGATTTT
TTTTCTTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7862Contig1 1124 2 2 U
GGCTCTCTATTCTCTTTCTCTCCTCTGAAACTGGGACCCTTTAACATATCAAATCCACTT
CCTCGAAAGAAAAATCATGGAACCTGCTTACAGCTTAGTCGACGACGCTGAGTTCTGGCT
TCCGCCGGAGCTTCTCACGGACGATGATTTCATCGTGGAGAAGGAGAACAAAGAGTCTAT
GTTCCCGTACGAGACTCCGAGTCATGGCTTCGCGTTGGACTCGAGTTACGGTGACGACGA
AGAGAGTTTCTTAGCCGGATTGAGCCGGAAAATGGCTCAGTCAACTCTTCAAGATGATTT
CTCCGCCAAGGCGTGGGGTATGACTCGTCCGACTCAGTCGACTCGTTGTGGTGGCGGTTA
CGGTTGTCAGACGCGAGTTTCTTCTCAATCGGCTGCGGCGTCATGGGATATGTACTGTGC
CGCTGCCGAAGAGCTGGCGATGATGAGTCTGAACGGTTACAATAACCGTCACAGTGGCGG
AGGACTTGTTGATCATCCCAGAAAACAACACTCCCTCGCGGCAGCTAAAAGCTCTAACGA
CGGCTCCGGCTTCTACAGCCGCCAATCTCTTCAATATCAGAAGCTTCAAGCTATTCAACA
GCTAAAGCAGCTACAGTTGATGAAAGAACACCGTCGCTATTTGGCGCATCAGAGTGTTAA
TAGTCGCACTAAAAGTACTACTCCCGGTCATGTTGATTTGTCGCCATCTGCTGCATGGCC
ACAGAGGCGTGGTGTTTCTGGCATGCGTGCTGTTTCCCTCGGTGGTGACCGTACCGGAAC
CGGCGTGTTCTTGCCTCGAAGCGTTGACCGAACTTCCCCTGTAACCGCCCAGACTCGCAA
GAAGCCCAGTCCTGGTACGGTTTTGGTTCCGGCTAGAGTGGCGCATGTACTTAACCGAAA
CGAATCTGTGGTCCACCAGACGCCAGTCCGATCTTCAGCTAGTTTCAACGATGGGTCGTG
GAGACAGAGGAGTAACAATGGTGGGTACTCGAGCCAGATGATGATAGAGCAGACAGTTAA
CGAGCCTCGGTTACCTTCGGATTGGGCTTACTGACCACTTGTGGGTGTTTTTAGGTAAAG
GTTTGAAGAAAAGTGAAGGAGGAATAAAGATAAGATTTTGAAGA


BQ
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AF RR4CD14TF U 1
AF RR4CD14JQ C 334
BS 1 722 RR4CD14TF
BS 723 1124 RR4CD14JQ

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CCTCGAAAGAAAAATCATGGAACCTGCTTACAGCTTAGTCGACGACGCTGAGTTCTGGCT
TCCGCCGGAGCTTCTCACGGACGATGATTTCATCGTGGAGAAGGAGAACAAAGAGTCTAT
GTTCCCGTACGAGACTCCGAGTCATGGCTTCGCGTTGGACTCGAGTTACGGTGACGACGA
AGAGAGTTTCTTAGCCGGATTGAGCCGGAAAATGGCTCAGTCAACTCTTCAAGATGATTT
CTCCGCCAAGGCGTGGGGTATGACTCGTCCGACTCAGTCGACTCGTTGTGGTGGCGGTTA
CGGTTGTCAGACGCGAGTTTCTTCTCAATCGGCTGCGGCGTCATGGGATATGTACTGTGC
CGCTGCCGAAGAGCTGGCGATGATGAGTCTGAACGGTTACAATAACCGTCACAGTGGCGG
AGGACTTGTTGATCATCCCAGAAAACAACACTCCCTCGCGGCAGCTAAAAGCTCTAACGA
CGGCTCCGGCTTCTACAGCCGCCAATCTCTTCAATATCAGAAGCTTCAAGCTATTCAACA
GCTAAAGCAGCTACAGTTGATGAAAGAACACCGTCGCTATTTGGCGCATCAGAGTGTTAA
TAGTCGCACTAAAAGTACTACTCCCGGTCATGTTGATTTGTCGCCATCTGCTGCATGGCC
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4CD14JQ 791 0 0
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TGCGGCGTCATGGGATATGTACTGTGCCGCTGCCGAAGAGCTGGCGATGATGAGTCTGAA
CGGTTACAATAACCGTCACAGTGGCGGAGGACTTGTTGATCATCCCAGAAAACAACACTC
CCTCGCGGCAGCTAAAAGCTCTAACGACGGCTCCGGCTTCTACAGCCGCCAATCTCTTCA
ATATCAGAAGCTTCAAGCTATTCAACAGCTAAAGCAGCTACAGTTGATGAAAGAACACCG
TCGCTATTTGGCGCATCAGAGTGTTAATAGTCGCACTAAAAGTACTACTCCCGGTCATGT
TGATTTGTCGCCATCTGCTGCATGGCCACAGAGGCGTGGTGTTTCTGGCATGCGTGCTGT
TTCCCTCGGTGGTGACCGTACCGGAACCGGCGTGTTCTTGCCTCGAAGCGTTGACCGAAC
TTCCCCTGTAACCGCCCAGACTCGCAAGAAGCCCAGTCCTGGTACGGTTTTGGTTCCGGC
TAGAGTGGCGCATGTACTTAACCGAAACGAATCTGTGGTCCACCAGACGCCAGTCCGATC
TTCAGCTAGTTTCAACGATGGGTCGTGGAGACAGAGGAGTAACAATGGTGGGTACTCGAG
CCAGATGATGATAGAGCAGACAGTTAACGAGCCTCGGTTACCTTCGGATTGGGCTTACTG
ACCACTTGTGGGTGTTTTTAGGTAAAGGTTTGAAGAAAAGTGAAGGAGGAATAAAGATAA
GATTTTGAAGA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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GCAGGAGGAGATGGTATCAAAGCTCTGTTTTGGCGTGTGCGGTTGGTTCGTTGGTGGCCG
TGACAGGCAGTCGTCTATGGCTCCTAGATGGTTATTAGTGGCTCCGCTTCTCTTCTGATC
TCTCCCCCTCTCGGCATTCTGTCGGGCTCTCCGTGTCGGAAGTGGCCACTCTCTTACCGG
AGCAGCCTTTTGCGTTTCAATGTCCAACAGCTTCATTGACTCTGAAGTCTGTGTTTCTCT
ATCAAGTAAACGGTCTTACGGTTCTCGATAGTCGGATTTGTTGAGACGATTCTCGGGAGT
CATTGATTGTCTCGGGTCATCGAATTGTTTTAGCTCACATCCGAGTGTCGTTATGGTTCG
TTTGTTCTTTGCGGCAGTGGGCTTGACTTTACTTGCAGGTGAAAGAGGCTTTCTGACAGT
GTGTGGCGATGACATCAATCCGATTTCTTGCTTGGTTCTTGGCGGCAGTGGAGGTGGTCG
TCTCTTGGTAAGAGTTTTTCATCTCTATGCTCGTCTAGCACTTCATCGACAGTGACGGTT
ACAAGTTAGAGGAGTTCATCGGGAGCCAGCTACTCCGGAGACGACACGGGAGTTCCCGGC
ATCCAAGGCGACGAGGAGAACCTCACGGTCCTGTGGTCATCGTCGATGGTTGAGAACGGC
AATCGATTCCTGAGGATTTTAAAAATGACCTAGCGGAATGTGCCGGGTCTAGTGGGTGGG
CGAAGCTACGTTGTAATACATTGACTTAGGAGCTTTTGTTCGAATCGATCTTGTAACCGG
TTCTGAATTTCCCGTCTAACGGGTTGAATAAAATCTTAACTC


BQ
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AF RR4AH11TF U 1
AF RR4AH11JQ C 99
BS 1 745 RR4AH11TF
BS 746 822 RR4AH11JQ

RD RR4AH11TF 745 0 0
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TGACAGGCAGTCGTCTATGGCTCCTAGATGGTTATTAGTGGCTCCGCTTCTCTTCTGATC
TCTCCCCCTCTCGGCATTCTGTCGGGCTCTCCGTGTCGGAAGTGGCCACTCTCTTACCGG
AGCAGCCTTTTGCGTTTCAATGTCCAACAGCTTCATTGACTCTGAAGTCTGTGTTTCTCT
ATCAAGTAAACGGTCTTACGGTTCTCGATAGTCGGATTTGTTGAGACGATTCTCGGGAGT
CATTGATTGTCTCGGGTCATCGAATTGTTTTAGCTCACATCCGAGTGTCGTTATGGTTCG
TTTGTTCTTTGCGGCAGTGGGCTTGACTTTACTTGCAGGTGAAAGAGGCTTTCTGACAGT
GTGTGGCGATGACATCAATCCGATTTCTTGCTTGGTTCTTGGCGGCAGTGGAGGTGGTCG
TCTCTTGGTAAGAGTTTTTCATCTCTATGCTCGTCTAGCACTTCATCGACAGTGACGGTT
ACAAGTTAGAGGAGTTCATCGGGAGCCAGCTACTCCGGAGACGACACGGGAGTTCCCGGC
ATCCAAGGCGACGAGGAGAACCTCACGGTCCTGTGGTCATCGTCGATGGTTGAGAACGGC
AATCGATTCCTGAGGATTTTAAAAATGACCTAGCGGAATGTGCCGGGTCTAGTGGGTGGG
CGAAGCTACGTTGTAATACATTGAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4AH11JQ 724 0 0
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GAAGTGGCCACTCTCTTACCGGAGCAGCCTTTTGCGTTTCAATGTCCAACAGCTTCATTG
ACTCTGAAGTCTGTGTTTCTCTATCAAGTAAACGGTCTTACGGTTCTCGATAGTCGGATT
TGTTGAGACGATTCTCGGGAGTCATTGATTGTCTCGGGTCATCGAATTGTTTTAGCTCAC
ATCCGAGTGTCGTTATGGTTCGTTTGTTCTTTGCGGCAGTGGGCTTGACTTTACTTGCAG
GTGAAAGAGGCTTTCTGACAGTGTGTGGCGATGACATCAATCCGATTTCTTGCTTGGTTC
TTGGCGGCAGTGGAGGTGGTCGTCTCTTGGTAAGAGTTTTTCATCTCTATGCTCGTCTAG
CACTTCATCGACAGTGACGGTTACAAGTTAGAGGAGTTCATCGGGAGCCAGCTACTCCGG
AGACGACACGGGAGTTCCCGGCATCCAAGGCGACGAGGAGAACCTCACGGTCCTGTGGTC
ATCGTCGATGGTTGAGAACGGCAATCGATTCCTGAGGATTTTAAAAATGACCTAGCGGAA
TGTGCCGGGTCTAGTGGGTGGGCGAAGCTACGTTGTAATACATTGACTTAGGAGCTTTTG
TTCGAATCGATCTTGTAACCGGTTCTGAATTTCCCGTCTAACGGGTTGAATAAAATCTTA
ACTC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7864Contig1 734 2 2 U
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TTCAGAATCCAAGACTCTAGCGTTTGCTGCTCCATTGGTTTCTATCTCGCATACCAAAAG
ACAGATTGTGCTGGGACGGCGCGATTCCGTCAAAGTTTCTGCAGCAAAATCCGGAAATTT
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ATGTTTTGAATGCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGTGGGAAGGGAGGTTT
GACGCCAGAACAGAGAGGGGAAAGATAGAAGAACTATACTACTTGTTTTTAATAAACATG
ATTCCGAGAATTTTTCATCCACGCAACCTACCGAGCTATCCACAACAACGTAACATGAGT
TCATGTTAGCCATTATCTTGAAGATATAAATGTATGGTGTGTTGCCTTTGGACTTCGGCG
TAGTGTGCCATTAGAAGGTTGGGCCTAGCAAGTGACAGCATAATGGTACAGAAAACTGAT
TGAGATAGAAAAATAATTGAGGGGACATACAAAATATCCAGTTAAAAAAAAATTATATTC
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TTGTTGGATTGTAG


BQ
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AF RR4BL84TF U 1
AF RR4BL84JQ C 12
BS 1 652 RR4BL84TF
BS 653 734 RR4BL84JQ

RD RR4BL84TF 652 0 0
TATCTTCTTCTTACAGCTTACAAAAATGTTGACATTCCCACTTTGTGGTTGCGAGTTATC
TTCAGAATCCAAGACTCTAGCGTTTGCTGCTCCATTGGTTTCTATCTCGCATACCAAAAG
ACAGATTGTGCTGGGACGGCGCGATTCCGTCAAAGTTTCTGCAGCAAAATCCGGAAATTT
CTCGCTTGGTTCGATATTCAAAAGCTGTGACACTTGTGGAGCCAAAGGAGCAATTGAATG
CCCCGGTTGCAAGGGAACAGGTAGAAATAAGAAGAATGGAAATATTTTCGAGAGGTGGAA
ATGTTTTGAATGCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGTGGGAAGGGAGGTTT
GACGCCAGAACAGAGAGGGGAAAGATAGAAGAACTATACTACTTGTTTTTAATAAACATG
ATTCCGAGAATTTTTCATCCACGCAACCTACCGAGCTATCCACAACAACGTAACATGAGT
TCATGTTAGCCATTATCTTGAAGATATAAATGTATGGTGTGTTGCCTTTGGACTTCGGCG
TAGTGTGCCATTAGAAGGTTGGGCCTAGCAAGTGACAGCATAATGGTACAGAAAACTGAT
TGAGATAGAAAAATAATTGAGGGGACATACAAAATATCCAGTTAAAAAAAAA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4BL84JQ 723 0 0
TACAGCTTACAAAAATGTTGACATTCCCACTTTGTGGTTGCGAGTTATCTTCAGAATCCA
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TGGGACGGCGCGATTCCGTCAAAGTTTCTGCAGCAAAATCCGGAAATTTCTCGCTTGGTT
CGATATTCAAAAGCTGTGACACTTGTGGAGCCAAAGGAGCAATTGAATGCCCCGGTTGCA
AGGGAACAGGTAGAAATAAGAAGAATGGAAATATTTTCGAGAGGTGGAAATGTTTTGAAT
GCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGTGGGAAGGGAGGTTTGACGCCAGAAC
AGAGAGGGGAAAGATAGAAGAACTATACTACTTGTTTTTAATAAACATGATTCCGAGAAT
TTTTCATCCACGCAACCTACCGAGCTATCCACAACAACGTAACATGAGTTCATGTTAGCC
ATTATCTTGAAGATATAAATGTATGGTGTGTTGCCTTTGGACTTCGGCGTAGTGTGCCAT
TAGAAGGTTGGGCCTAGCAAGTGACAGCATAATGGTACAGAAAACTGATTGAGATAGAAA
AATAATTGAGGGGACATACAAAATATCCAGTTAAAAAAAAATTATATTCATAGCTAATGG
CCCCCATGCAAAATTGAATAATGGACGTCAAAATGTTTATATTGAACAGTTGTTGGATTG
TAG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7865Contig1 779 2 2 U
GGAGTATCATCTGAAACGTAAGGGCAAGGCCTTCAACACTAGGAAGACTGACAATGGAAG
ACCCATTTCTTATAAGAGATGAACAGTTAGTTCCTAGTACAACGACATGGCACAGAGGTC
AGCTCACCGTGGAGCTGAAGAAAGTATGCCGCTTGGCAGCTCCTATGGCCACCGTGACCA
GTGCTCAATACCTTTTACCTGTCATCTCAGTCATGGTCGCCGGCCACAACGGCGAGCTTC
AGCTCTCCGGCGTCGCTCTTGCCACCTCGTTCACAAATGTCTCCGGTTTCAGCATTATGT
ATGGATTAGCGGGTGCTTTAGAAACTCTTTGTGGCCAAGCTTATGGAGCTAAACAATACG
AGAAACTCGGAACCTACGCATACTCTGCAATCGCCTCCAACATCCCAATCTGTTTCCTCA
TATCAACTCTCTGGATATTCATCGACAAGCTCTTGATCTCTCTTGGACAAGACCCTGACA
TCTCCAGAGTCGCTGGTTCCTACGCCTTTCGCCTTATACCGGCTTTGTTCGGACAAGCTA
TTGTCATACCGCTGACTCGGTTTCTTCTGACGCAAGGGTTGGTTCTTCCTCTTCTCTGCT
GTGCCGTAACCACCCTTTTGTTCCACATCTCCGTTTGCTGGATTTTGGTTTTCAAATTTG
GTCTGGGAAGCAATGGAGCTGCTTTGTCTATTAGTGTGTCTTTCTGGTTCTATGCTTTGA
TTCTCGCATGCTATGTGAGATTCTCCACCTCTTGTGAGAGGACACGCAGCTTTGTATCC


BQ
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AF RR4A696TF U 1
AF RR4AL15TF U 1
BS 1 755 RR4A696TF
BS 756 779 RR4AL15TF

RD RR4A696TF 755 0 0
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ACCCATTTCTTATAAGAGATGAACAGTTAGTTCCTAGTACAACGACATGGCACAGAGGTC
AGCTCACCGTGGAGCTGAAGAAAGTATGCCGCTTGGCAGCTCCTATGGCCACCGTGACCA
GTGCTCAATACCTTTTACCTGTCATCTCAGTCATGGTCGCCGGCCACAACGGCGAGCTTC
AGCTCTCCGGCGTCGCTCTTGCCACCTCGTTCACAAATGTCTCCGGTTTCAGCATTATGT
ATGGATTAGCGGGTGCTTTAGAAACTCTTTGTGGCCAAGCTTATGGAGCTAAACAATACG
AGAAACTCGGAACCTACGCATACTCTGCAATCGCCTCCAACATCCCAATCTGTTTCCTCA
TATCAACTCTCTGGATATTCATCGACAAGCTCTTGATCTCTCTTGGACAAGACCCTGACA
TCTCCAGAGTCGCTGGTTCCTACGCCTTTCGCCTTATACCGGCTTTGTTCGGACAAGCTA
TTGTCATACCGCTGACTCGGTTTCTTCTGACGCAAGGGTTGGTTCTTCCTCTTCTCTGCT
GTGCCGTAACCACCCTTTTGTTCCACATCTCCGTTTGCTGGATTTTGGTTTTCAAATTTG
GTCTGGGAAGCAATGGAGCTGCTTTGTCTATTAGTGTGTCTTTCTGGTTCTATGCTTTGA
TTCTCGCATGCTATGTGAGATTCTCCACCTCTTGT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4AL15TF 779 0 0
GGAGTATCATCTGAAACGTAAGGGCAAGGCCTTCAACACTAGGAAGACTGACAATGGAAG
ACCCATTTCTTATAAGAGATGAACAGTTAGTTCCTAGTACAACGACATGGCACAGAGGTC
AGCTCACCGTGGAGCTGAAGAAAGTATGCCGCTTGGCAGCTCCTATGGCCACCGTGACCA
GTGCTCAATACCTTTTACCTGTCATCTCAGTCATGGTCGCCGGCCACAACGGCGAGCTTC
AGCTCTCCGGCGTCGCTCTTGCCACCTCGTTCACAAATGTCTCCGGTTTCAGCATTATGT
ATGGATTAGCGGGTGCTTTAGAAACTCTTTGTGGCCAAGCTTATGGAGCTAAACAATACG
AGAAACTCGGAACCTACGCATACTCTGCAATCGCCTCCAACATCCCAATCTGTTTCCTCA
TATCAACTCTCTGGATATTCATCGACAAGCTCTTGATCTCTCTTGGACAAGACCCTGACA
TCTCCAGAGTCGCTGGTTCCTACGCCTTTCGCCTTATACCGGCTTTGTTCGGACAAGCTA
TTGTCATACCGCTGACTCGGTTTCTTCTGACGCAAGGGTTGGTTCTTCCTCTTCTCTGCT
GTGCCGTAACCACCCTTTTGTTCCACATCTCCGTTTGCTGGATTTTGGTTTTCAAATTTG
GTCTGGGAAGCAATGGAGCTGCTTTGTCTATTAGTGTGTCTTTCTGGTTCTATGCTTTGA
TTCTCGCATGCTATGTGAGATTCTCCACCTCTTGTGAGAGGACACGCAGCTTTGTATCC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL7866Contig1 1089 2 2 U
TTTTTCTTTTCTAACTATCCCAATTAGCTTTGGGTGAGAAAGTGTTCTAGGGTATTTTTT
TGTCCGAATCTCAAACAGAAGGTGTTCTAGAGTAGTTGACCAAAAAAAAAAGGTGTTCTA
GAGTTTTGTCCGAATATCATGGTTCTCAAACCTTGCTCAGAGACAGATAGAGATTCGAGC
AACTTTAAGGAAGCATCTTCAGTGGTTCTCAAACACTGCGCAGCCTTGACGATGAGGGAA
GGGTGTTCAACGGAGTTGAGGAGGGAGGCGACAGATCCCATGGAGGTTTCTTCAGTCGTT
GACGATTCGCTCCTGAGAAAACGTAAGGCCGAGCTCGATCCAGAGGAAGAGGATGAGAGT
GAAGAAGGCAGTGATGAAAGAGGCGGGATTGAGGAGCGCGAGGATGATAAGAAAGATCTC
TTAGAGGTACCAGAGTGGGATGTGGACAGCTTCGATGGTGTAGTGTATACTTCCTCTTCG
GACCCTGACCTTCCCCAACATTACCAGCCTTATGAAGACATGGAGAATGCTAGAGAACAC
TATCGCATCTATAAACAGCAGCTCATCACCAGCAAGGGATTCATGGTGGATCCATCGCTT
AGGCCAAGTGATAGGTACAAAGGAATCAAGCCGGTGAGTTTTGACGATGGAGGGGCTAAC
CCCAAAACCTTCCGCGATTACTGTGAGGAGATGGCCATCATATGTCTCCAAAGACACAAC
CAAGACAAGGATTCCAACGTGGAGTTTGTTGAAGTGGTAAGAGGTAACTATCGAGGAGGC
CCGAGACCCAAGTCATACATTACATTCATGGCCAGGGAGATACCCGATGGACCTCTTGTT
GAGTATCAAGCCAAGGCTATGGCTACTCTTGACAGAAAGTTTCATCCCATACTCTGTAGA
CCGGCTCCTACTAACTAAGGATTTTTTTTTAGCCAGTTTTAGATTCAAACGTATTTAGAT
GTTGATGTCATAGATGCTTTTTTGGCTTCGAAGATGTGTGCATATGCATGATATGGTGTC
TTATACAATAAACACACACACATGTATAAACATATATAATATTACCATATGAACTAATTT
GCTCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CY46TF U 1
AF RR4CY46JQ C 492
BS 1 599 RR4CY46TF
BS 600 1089 RR4CY46JQ

RD RR4CY46TF 599 0 0
TTTTTCTTTTCTAACTATCCCAATTAGCTTTGGGTGAGAAAGTGTTCTAGGGTATTTTTT
TGTCCGAATCTCAAACAGAAGGTGTTCTAGAGTAGTTGACCAAAAAAAAAAGGTGTTCTA
GAGTTTTGTCCGAATATCATGGTTCTCAAACCTTGCTCAGAGACAGATAGAGATTCGAGC
AACTTTAAGGAAGCATCTTCAGTGGTTCTCAAACACTGCGCAGCCTTGACGATGAGGGAA
GGGTGTTCAACGGAGTTGAGGAGGGAGGCGACAGATCCCATGGAGGTTTCTTCAGTCGTT
GACGATTCGCTCCTGAGAAAACGTAAGGCCGAGCTCGATCCAGAGGAAGAGGATGAGAGT
GAAGAAGGCAGTGATGAAAGAGGCGGGATTGAGGAGCGCGAGGATGATAAGAAAGATCTC
TTAGAGGTACCAGAGTGGGATGTGGACAGCTTCGATGGTGTAGTGTATACTTCCTCTTCG
GACCCTGACCTTCCCCAACATTACCAGCCTTATGAAGACATGGAGAATGCTAGAGAACAC
TATCGCATCTATAAACAGCAGCTCATCACCAGCAAGGGATTCATGGTGGATCCATCGCT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4CY46JQ 598 0 0
TCCCCAACATTACCAGCCTTATGAAGACATGGAGAATGCTAGAGAACACTATCGCATCTA
TAAACAGCAGCTCATCACCAGCAAGGGATTCATGGTGGATCCATCGCTTAGGCCAAGTGA
TAGGTACAAAGGAATCAAGCCGGTGAGTTTTGACGATGGAGGGGCTAACCCCAAAACCTT
CCGCGATTACTGTGAGGAGATGGCCATCATATGTCTCCAAAGACACAACCAAGACAAGGA
TTCCAACGTGGAGTTTGTTGAAGTGGTAAGAGGTAACTATCGAGGAGGCCCGAGACCCAA
GTCATACATTACATTCATGGCCAGGGAGATACCCGATGGACCTCTTGTTGAGTATCAAGC
CAAGGCTATGGCTACTCTTGACAGAAAGTTTCATCCCATACTCTGTAGACCGGCTCCTAC
TAACTAAGGATTTTTTTTTAGCCAGTTTTAGATTCAAACGTATTTAGATGTTGATGTCAT
AGATGCTTTTTTGGCTTCGAAGATGTGTGCATATGCATGATATGGTGTCTTATACAATAA
ACACACACACATGTATAAACATATATAATATTACCATATGAACTAATTTGCTCATCCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL7867Contig1 1018 2 2 U
GGGAGCTAGTGAAGCAGATGAGATATACAAAATCTGCAGTGTGATAGGCAGCCCAACTGA
ACAGACATGGTTGGAGGGTCTTAATCTTGCTAGCGTAATCAATTACCAATTCCCTCGGCT
TTCCGGTGTACCCCTCTCAAGCTTGATGCCGTATGCTAGTGCAGAAGCGGTTAACCTTGT
TGAGCGCCTCTGCTCGTGGGATCCCAGCAATAGGCCGACGGCTGCAGAGGCTTTGCAGCA
TCCCTTCTTCCAGAGTTGCTACTATGTTCCACCATCTCTCCGTGCCAAACAGTCTGCTGG
ACAGAGAGGGACTCTAGAGCATCAGCAGCAATACGTCAAGAGGTTGCCAGCGGCTTTGAC
CAATACTGCTAATAATAATAAGCCATATAACAGTTATGCTGCTGCAAAGGCGAATGCTCC
TTCGTTTGGCGCTTGTCAGACCCAGCGGAAGCTGGAGATGATGCCTAATAAGATTAACCA
GGACACAAGATGGAACAACAAAGCTGTCGGAGGTTATCATGTTAGAGATGCAAGGTATAT
ACCACCGCCTGGAAGGAAGAGTCCTTCATCGATGAAGAATTGGGTCTTTCCTCGTGGGCC
ATCAGAGAGTGCAAGTAAACAGGCAAATGGAGCGGTGGGGGGAAGGAAGATGGAGTCAAA
GTCAAAGTCAAAGGCCTGCAATGAAGGCAGGGTGGTTGGGAGAAAGTGGTGAAATGTTCC
TCAGACCTATACAGCCTCCAAATCCCTACTCTAGGAGAATCGCTGGTTAAAACCCAAAGG
ATGACTCGCTCTATAAGTTAATCTTCTGAGTCATCGTTTTAATAAACAATTAAAACCTCT
CTTGCTTGTCCATGGTCCATGGAGCTGATTTCGTCTGTACTGCCTTTAATGTTTCGGTCA
CGGCTCGAACATTATGTATGAAGTACTCTTTTTTTTTTTCATTTCGTAATAACGCTCTCG
ACTTTGTACCAATTTTCCTCAGTTTATCTTCATGATGTTTATATCAGTTTCATTAACT


BQ
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AF RR4AA62TF U 1
AF RR4AA62JQ C 120
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RD RR4AA62TF 750 0 0
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TTCCGGTGTACCCCTCTCAAGCTTGATGCCGTATGCTAGTGCAGAAGCGGTTAACCTTGT
TGAGCGCCTCTGCTCGTGGGATCCCAGCAATAGGCCGACGGCTGCAGAGGCTTTGCAGCA
TCCCTTCTTCCAGAGTTGCTACTATGTTCCACCATCTCTCCGTGCCAAACAGTCTGCTGG
ACAGAGAGGGACTCTAGAGCATCAGCAGCAATACGTCAAGAGGTTGCCAGCGGCTTTGAC
CAATACTGCTAATAATAATAAGCCATATAACAGTTATGCTGCTGCAAAGGCGAATGCTCC
TTCGTTTGGCGCTTGTCAGACCCAGCGGAAGCTGGAGATGATGCCTAATAAGATTAACCA
GGACACAAGATGGAACAACAAAGCTGTCGGAGGTTATCATGTTAGAGATGCAAGGTATAT
ACCACCGCCTGGAAGGAAGAGTCCTTCATCGATGAAGAATTGGGTCTTTCCTCGTGGGCC
ATCAGAGAGTGCAAGTAAACAGGCAAATGGAGCGGTGGGGGGAAGGAAGATGGAGTCAAA
GTCAAAGTCAAAGGCCTGCAATGAAGGCAGGGTGGTTGGGAGAAAGTGGTGAAATGTTCC
TCAGACCTATACAGCCTCCAAATCCCTACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AA62JQ 899 0 0
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TTGAGCGCCTCTGCTCGTGGGATCCCAGCAATAGGCCGACGGCTGCAGAGGCTTTGCAGC
ATCCCTTCTTCCAGAGTTGCTACTATGTTCCACCATCTCTCCGTGCCAAACAGTCTGCTG
GACAGAGAGGGACTCTAGAGCATCAGCAGCAATACGTCAAGAGGTTGCCAGCGGCTTTGA
CCAATACTGCTAATAATAATAAGCCATATAACAGTTATGCTGCTGCAAAGGCGAATGCTC
CTTCGTTTGGCGCTTGTCAGACCCAGCGGAAGCTGGAGATGATGCCTAATAAGATTAACC
AGGACACAAGATGGAACAACAAAGCTGTCGGAGGTTATCATGTTAGAGATGCAAGGTATA
TACCACCGCCTGGAAGGAAGAGTCCTTCATCGATGAAGAATTGGGTCTTTCCTCGTGGGC
CATCAGAGAGTGCAAGTAAACAGGCAAATGGAGCGGTGGGGG*AAGGAAGATGGAGTCAA
AGTCAAAGTCAAAGGCCTGCAATGAAGGCAGGGTGGTTGGGAGAAAGTGGTGAAATGTTC
CTCAGACCTATACAGCCTCCAAATCCCTACTCTAGGAGAATCGCTGGTTAAAACCCAAAG
GATGACTCGCTCTATAAGTTAATCTTCTGAGTCATCGTTTTAATAAACAATTAAAACCTC
TCTTGCTTGTCCATGGTCCATGGAGCTGATTTCGTCTGTACTGCCTTTAATGTTTCGGTC
ACGGCTCGAACATTATGTATGAAGTACTCTTTTTTTTTTTCATTTCGTAATAACGCTCTC
GACTTTGTACCAATTTTCCTCAGTTTATCTTCATGATGTTTATATCAGTTTCATTAACT

QA 1 899 1 899
DS 



AS 1 2

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AAATAACAATAGAGAAAAGCTAAAAAGTTGACCAAATAGACAAGTCGAAAATAGGGAGAG
GAGGGATCACAAAGTGTTGTATTGAATCTGGTATCTCCCAAGCCACTCTTCACCTTTCTC
GTAGTAATCTTTCTTGGTAAATGCATTCCTCAAGAAGCTCAACTCAGCAGCAAACGCAGA
CGCTCCACGCCATGCGTCCAGCACTGGATCCTCAGCTTGAACCACGTTTATGGTCGACCC
ACACGGTCTTATCATCCTAAACCCACATTCCAACCGCTCTTTCATCCCCTGTACAAGGCT
GCACCCACCGGTCATCAGTATCGAGCTCGTTAGCCTCTCCTCTAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CQ76TF C 1
AF RR4CQ76JQ U 2
BS 1 4 RR4CQ76TF
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BS 40 77 RR4CQ76JQ
BS 78 78 RR4CQ76TF
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RD RR4CQ76TF 323 0 0
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AAATAACAATAGAGAAAAGCTAAAAAGTTGACCAAATAGACAAGTCGAAAATAGGGAGAG
GAGGGATCACAAAGTGTTGTATTGAATCTGGTATCTCCCAAGCCACTCTTCACCTTTCTC
GTAGTAATCTTTCTTGGTAAATGCATTCCTCAAGAAGCTCAACTCAGCAGCAAACGCAGA
CGCTCCACGCCATGCGTCCAGCACTGGATCCTCAGCTTGAACCACGTTTATGGTCGACCC
ACACGGTCTTATCATCCTAAACC

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR4CQ76JQ 404 0 0
GGT
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AACAATAGAGAAA*GCTAAAAAGTTGACCAAATAGACAAGTCGAAAATAGGGAGAGGAGG
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TAATCTTTCTTGGTAAATGCATTCCTCAAGAAGCTCAACTCAGCAGCAAACGCAGACGCT
CCACGCCATGCGTCCAGCACTGGATCCTCAGCTTGAACCACGTTTATGGTCGACCCACAC
GGTCTTATCATCCTAAACCCACATTCCAACCGCTCTTTCATCCCCTGTACAAGGCTGCAC
CCACCGGTCATCAGTATCGAGCTCGTTAGCCTCTCCTCTAC

QA 4 404 4 404
DS 



AS 1 2

CO CL7869Contig1 863 2 4 U
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AAGCGTAATTCTCGTGCTGAGAGGTTAGATTAGGGTTACGAAAAGCGGTGGTGGCGCAGT
CGTACGCGAGGATCTTTTTCAGGATCTCGGTGGCAACAAGGGAGATTTATCCACGTGATG
TGACGACGGCGGAGTTAAGGGAAGCCGAAAGTGTTTTGATTAATCATATGACTGGGAAGG
AGTATAGGCTTAAGGCGATTGGTGATGCCGGGCCTGTGATTGATGCTGGTGGTATCATTG
CGTATGCGAGGAAAGCTGGGATGATTCTTTCTGCAGCTGCTTGATTGATTTCTCCCTGCC
AGTGAAAACTGGTGTAGGAGAGATGAGCTTGAGTAGATTGATGCACGTGAAGTCTTGTTT
TGACTCCTTCCTTTTCAGGAATGTGAAGACCGTTTAATATCTTTGTTAATCGGGTTCTAC
CTGTTCTTCACAAAAGGCATGTAAGAGGGAGTGAAGTGGTTGTGGGTTTGTGGTGAGGAA
GGAGAGAGATGAAGATATTGCGCTCGTTGTGCCTCCTGTTTTCAGCTTCTGTACAAAGGT
ACTCGATGCAAAAGAGCAGATAGAAGCAAGGGACATGTACTGGGAAGCTGTGAGTGTTGT
TTCTGTTTCAAGTTCTTATGCTTGTTCTCTATCTGTTTCATACTTCATGTGCGTGTGCTT
TGTTGTTCTGTTTTATGTTTCATGTTTCAAGTTGTACTGCTTGTTATGTACTTCAAATGA
TTTTTACTAAGAGACGACATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D862TF U 1
AF RR4D862JQ C 127
BS 1 757 RR4D862TF
BS 758 758 RR4D862JQ
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AGTGAAAACTGGTGTAGGAGAGATGAGCTTGAGTAGATTGATGCACGTGAAGTCTTGTTT
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CTGTTCTTCACAAAAGGCATGTAAGAGGGAGTGAAGTGGTTGTGGGTTTGTGGTGAGGAA
GGAGAGAGATGAAGATATTGCGCTCGTTGTGCCTCCTGTTTTCAGCTTCTGTACAAAGGT
ACTCGATGCAAAAGAGCAGATAGAAGCAAGGGACATGTACTGGGAAGCTGTGAGTGTTGT
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TGT
GTTCTGTT

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GGCTTAAGGCGATTGGTGATGCCGGGCCTGTGATTGATGCTGGTGGTATCATTGCGTATG
CGAGGAAAGCTGGGATGATTCTTTCTGCAGCTGCTTGATTGATTTCTCCCTGCCAGTGAA
AACTGGTGTAGGAGAGATGAGCTTGAGTAGATTGATGCACGTGAAGTCTTGTTTTGACTC
CTTCCTTTTCAGGAATGTGAAGACCGTTTAATATCTTTGTTAATCGGGTTCTACCTGTTC
TTCACAAAAGGCATGTAAGAGGGAGTGAAGTGGTTGTGGGTTTGTGGTGAGGAAGGAGAG
AGATGAAGATATTGCGCTCGTTGTGCCTCCTGTTTTCAGCTTCTGTACAAAGGTACTCGA
TGCAAAAGAGCAGATAGAAGCAAGGGACATGTACTGGGAAGCTGTGAGTGTTGTTTCTGT
TTCAAGTTCTTATGCTTGTTCTCTATCTGTTTCATACTTCATGTGCGTGTGCTTTGTTGT
TCTGTTTTATGTTTCATGTTTCAAGTTGTACTGCTTGTTATGTACTTCAAATGATTTTTA
CTAAGAGACGACATAAA

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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TTCGTTTTCATCCAAATCGGATATTTGAATCTAAACTCAGTGCTTTTTGCCTCTCAACCT
ATTGAAAACCTAGAAGTTGATTTTCTGTTTCAATCTCAACTTATCCATGGACAAAAAGAG
GAACATGCACCAGCAATCCCATGTTGAAACAACCTCGAGGATAGGGTTATGTGATTCAGA
GATCATAGGAACTCCCAAAAACCAGCAAAAGGACAAGAAGCAGTGGAAGAATGTTGATCA
AGATGCCTTATTGAAGCCTATGAAGCTGCAGAAACACAAGTTGCTAAAAAGAAGGTTGTG
ACAACCCCGGAAATAGTGGTGGATGATTTGGAGATATTAGAAACGACCAAAAACTAGCAA
AAGGGCAAGAAGCGGGGGAAAAAGCAAAGGAAGGTTGAGATAACCAACGAGCCTCCTTTG
GAAGTAGAATCCAACAAGAACCTAAAGAAGATAATAGATGGATTAAGTGATCGTCTGAAC
GAGATGACTGAAATTGTCCAAAAATTGAAGAAGACTTCTGATCTACTAGACAAGGAGAAA
GAAACTCCAGAGGAAAAGGTGTTCGAGTGTCTTTACGAATCTATAGAAGCGTTTATCGAA
CACAAGAGAAGCATTTTCGTTAGGGGATTTGATTGTTCCTTCCCTAGGGATGAGATCAGG
AGCACATTAATAAAACACTTCAGTTCTTGCGGAGAGGTCTGCGAGGTTGCTATCCCCTTT
CATTGTAAAACCGGTTCTCCCATGGGATTTGCTTTTATTAATATGGTAAAGGATGAAGAG
AAGGCCTTAACACTTGATGGAAGTTACTTGGGAGGGATGAGGCTTGAGGTTACAATGGCT
ATAAATAGAAGCGAATACCATGGCTACACTGGCCGCCTTGGTTGTAACCGGTGTCGTCGT
GTTTTGTTGAAGCGCCGTATGGAAGACTTCTATAGTTTTCCGACAATACTAATCCCCTCA
CCAGAGATCAATAGAAGCAGCGGCTAGTCAGAGTCTCCCTACCAAGATCAAGAAGTGTTG
CCAACCAACTACATCATGCTTGCATAAATTTCTGTGTTCCAACATAACTTGTTTTATGGG
AATCG


BQ
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10 10 10 10 10 

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BS 716 1145 RR4AB79JQ

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AAGGGCAAGAAGCGGGGGAAAAAGCAAAGGAAGGTTGAGATAACCAACGAGCCTCCTTTG
GAAGTAGAATCCAACAAGAACCTAAAGAAGATAATAGATGGATTAAGTGATCGTCTGAAC
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GAAACTCCAGAGGAAAAGGTGTTCGAGTGTCTTTACGAATCTATAGAAGCGTTTATCGAA
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DS 

RD RR4AB79JQ 775 0 0
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CCAACAAGAACCTAAAGAAGATAATAGATGGATTAAGTGATCGTCTGAACGAGATGACTG
AAATTGTCCAAAAATTGAAGAAGACTTCTGATCTACTAGACAAGGAGAAAGAAACTCCAG
AGGAAAAGGTGTTCGAGTGTCTTTACGAATCTATAGAAGCGTTTATCGAACACAAGAGAA
GCATTTTCGTTAGGGGATTTGATTGTTCCTTCCCTAGGGATGAGATCAGGAGCACATTAA
TAAAACACTTCAGTTCTTGCGGAGAGGTCTGCGAGGTTGCTATCCCCTTTCATTGTAAAA
CCGGTTCTCCCATGGGATTTGCTTTTATTAATATGGTAAAGGATGAAGAGAAGGCCTTAA
CACTTGATGGAAGTTACTTGGGAGGGATGAGGCTTGAGGTTACAATGGCTATAAATAGAA
GCGAATACCATGGCTACACTGGCCGCCTTGGTTGTAACCGGTGTCGTCGTGTTTTGTTGA
AGCGCCGTATGGAAGACTTCTATAGTTTTCCGACAATACTAATCCCCTCACCAGAGATCA
ATAGAAGCAGCGGCTAGTCAGAGTCTCCCTACCAAGATCAAGAAGTGTTGCCAACCAACT
ACATCATGCTTGCATAAATTTCTGTGTTCCAACATAACTTGTTTTATGGGAATCG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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AAAAAGGAAATTATCAACGCGGATTGAAACGGAGGTGGAGAACGCGTCTGAAGTCGGATT
GGGACGGGGTTTGCGGCGCTGGATTCGTCTCGTCGAGAGCTTCAATTTGATATATGGAAC
GTCGGCTAACTCCGTATGGTTTGAGAGATACGTCGATTTGAAGTTGCGTCCGAATTAGGG
TTTTGAATCAAGTTGACGGCGCTTCTTGTAATAGCTCGTGAGAACGCGTCCGGTATCGGA
TTGCGATGAAGTCGACGGCGTTGGATTCATCTCGTCGAGATCTTGAATTGGATAGGTGGC
TCGTCGTCTGGACCCGTCGGGTTGAGGAGATACGGTGTTTTGAATTTTCGTCTGATTTCT
AGGGTTTATGGTGGTTGATGGGAAAAAGAGTTTCAAAATTCACTCAGGGTTTTCTCAGAG
CGCTCGTGCTGATAACATGTTGTAAAACTTGTATTTCTTTTTATTATTGATGTGCCAATA
GGCATCTATATATACATGTTAAAAGGAAGAGATAAATGGAAAGATTCTATTTCCAATAGG
AAATAGGAAATACATGGAAATAGTAATATCCTAATACAAATATGTTAATACATAAATATG
GTAAAGTCTAAATCTTCATTTCTTCCTTATGCGTCTGGTCCGGTTCACTATTGTCTGTCC
GTACGTCCGCCCGTACTGTCAGTACGGTTCGGTATGTCCGTCCATCCATGGTTATAACAT
AAATTATGTTTGGACATTAATCCATATATCATACATAACTTGTCGTCAAAGC


BQ
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AF RR4BM48TF U 1
AF RR4CT38TF U 74
BS 1 698 RR4BM48TF
BS 699 832 RR4CT38TF

RD RR4BM48TF 698 0 0
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AAAAAGGAAATTATCAACGCGGATTGAAACGGAGGTGGAGAACGCGTCTGAAGTCGGATT
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GTCGGCTAACTCCGTATGGTTTGAGAGATACGTCGATTTGAAGTTGCGTCCGAATTAGGG
TTTTGAATCAAGTTGACGGCGCTTCTTGTAATAGCTCGTGAGAACGCGTCCGGTATCGGA
TTGCGATGAAGTCGACGGCGTTGGATTCATCTCGTCGAGATCTTGAATTGGATAGGTGGC
TCGTCGTCTGGACCCGTCGGGTTGAGGAGATACGGTGTTTTGAATTTTCGTCTGATTTCT
AGGGTTTATGGTGGTTGATGGGAAAAAGAGTTTCAAAATTCACTCAGGGTTTTCTCAGAG
CGCTCGTGCTGATAACATGTTGTAAAACTTGTATTTCTTTTTATTATTGATGTGCCAATA
GGCATCTATATATACATGTTAAAAGGAAGAGATAAATGGAAAGATTCTATTTCCAATAGG
AAATAGGAAATACATGGAAATAGTAATATCCTAATACAAATATGTTAATACATAAATATG
GTAAAGTCTAAATCTTCATTTCTTCCTTATGCGTCTGG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4CT38TF 759 0 0
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CGGCGCTGGATTCGTCTCGTCGAGAGCTTCAATTTGATATATGGAACGTCGGCTAACTCC
GTATGGTTTGAGAGATACGTCGATTTGAAGTTGCGTCCGAATTAGGGTTTTGAATCAAGT
TGACGGCGCTTCTTGTAATAGCTCGTGAGAACGCGTCCGGTATCGGATTGCGATGAAGTC
GACGGCGTTGGATTCATCTCGTCGAGATCTTGAATTGGATAGGTGGCTCGTCGTCTGGAC
CCGTCGGGTTGAGGAGATACGGTGTTTTGAATTTTCGTCTGATTTCTAGGGTTTATGGTG
GTTGATGGGAAAAAGAGTTTCAAAATTCACTCAGGGTTTTCTCAGAGCGCTCGTGCTGAT
AACATGTTGTAAAACTTGTATTTCTTTTTATTATTGATGTGCCAATAGGCATCTATATAT
ACATGTTAAAAGGAAGAGATAAATGGAAAGATTCTATTTCCAATAGGAAATAGGAAATAC
ATGGAAATAGTAATATCCTAATACAAATATGTTAATACATAAATATGGTAAAGTCTAAAT
CTTCATTTCTTCCTTATGCGTCTGGTCCGGTTCACTATTGTCTGTCCGTACGTCCGCCCG
TACTGTCAGTACGGTTCGGTATGTCCGTCCATCCATGGTTATAACATAAATTATGTTTGG
ACATTAATCCATATATCATACATAACTTGTCGTCAAAGC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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TTCGAATCAGAGCAGAAGCAAGGTCGTCATTTTCCGGTGCGTGGTTTCTCTCTCTGGATC
TCATTCCAGAAGGGGTGGGGGTATATTCTTTATGCTCGTCGTGGTTATAGGGGTAAACGG
TTTGGTGTTTGGTTATAAAATTGAAAGATTTGGGGGTTTGTAGTTAAAAAGAAGAGAGTG
AAGGTTGTTGTAGAAAAAAAAAGGAATAAAAATGCCTTTGAATTTCGGCAACGATGTGGA
TGGATCGTCCCGGATTCTTTTGAATGAGCCTCGCGGATCTACTGCTCTGGTGCTTCTGTT
TGGAGGACAGGTCATCTCTTGGAAAAATGAAAGGAGGGAAGAACTTCTTTTTATGAGCAC
TAAGGCTCAGTATATGCCTCCCAAGATCATCAGAGGAGGAATACCTGTTTGCTTTCCTCA
GTTTGGAAACTTTGGTGGATTTGAGCGACATGGGTTTGCCCGCAACAGATTTTGGTCTCT
TGATGACGATCCTTCCCCGCTGCCTCCTGCCAACAAACAATCATCTGTTGATCTGATTCT
CAAGTCCACCGAAGATGACCTCAAGATCTGGCCTCACAGCTTTGAACTCCGTGTACGAAT
CTCTATCAGCTTTGGGAAACTTACTTTGATCCCTCGTGTGAGGAACATTGACTCAAAGCC
ATTCTCTTTCATGTTTGCTCTTCGAAACTACTTACACGTATCGGACATAAGTGAAGTACG
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CGAGCAAGCAGACGCAATTACCTTTGACGGTGAGATTGATAGGGTGTACTTGAACACACC
AACGAAGATTGCGGTCATAGACCATGAGCGGAAGAGAACCATCGAACTGCGAAAGGAAGG
CATGCCCAATGCAGTAGTGTGGAACCCTTGGGACAAAAAGGCAAAGAGCATAGCTGATAT
GGGGGATGAAGATTACATGACGATGCTGTGTGTAGATTCTGGAGCTATCGAACCTCAGGT
TTTGTTGAAGCCTGGTGAAGAGTGGAAAGGCAGACAAGAACTCTCTATCGTCTCGTCAAG
CTACTGCAGCGGACAGCTTGATCCACGCAAGGTTCTTTACGGAGATAGCTGATCCCCTTT
CTTTTTTTTTGATTAAGAAACAATAATAAGCACACCTTCTCATTGTCAGCTTCTTCTCAA
GTGTCAAAAGGTATTTTTGAATTTGTTAAGAAGAAAGAGAGGTCACGGTAATATTTTTTG
TAGCGTTGACACTGTGTTTGACCGTCCGTCAAAAGACTTTCTTT


BQ
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AF RR4H568TF U 1
AF RR4H568JQB C 624
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BS 704 767 RR4H568TF
BS 768 1364 RR4H568JQB

RD RR4H568TF 767 0 0
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TTCGAATCAGAGCAGAAGCAAGGTCGTCATTTTCCGGTGCGTGGTTTCTCTCTCTGGATC
TCATTCCAGAAGGGGTGGGGGTATATTCTTTATGCTCGTCGTGGTTATAGGGGTAAACGG
TTTGGTGTTTGGTTATAAAATTGAAAGATTTGGGGGTTTGTAGTTAAAAAGAAGAGAGTG
AAGGTTGTTGTAGAAAAAAAAAGGAATAAAAATGCCTTTGAATTTCGGCAACGATGTGGA
TGGATCGTCCCGGATTCTTTTGAATGAGCCTCGCGGATCTACTGCTCTGGTGCTTCTGTT
TGGAGGACAGGTCATCTCTTGGAAAAATGAAAGGAGGGAAGAACTTCTTTTTATGAGCAC
TAAGGCTCAGTATATGCCTCCCAAGATCATCAGAGGAGGAATACCTGTTTGCTTTCCTCA
GTTTGGAAACTTTGGTGGATTTGAGCGACATGGGTTTGCCCGCAACAGATTTTGGTCTCT
TGATGACGATCCTTCCCCGCTGCCTCCTGCCAACAAACAATCATCTGTTGATCTGATTCT
CAAGTCCACCGAAGATGACCTCAAGATCTGGCCTCACAGCTTTGAACTCCGTGTACGAAT
CTCTATCAGCTTTGGGAAACTTACTTTGATCCCTCGTGTGAG*AACATTGACTCAAAGCC
ATTCTCTTTCATGTTTGCTCTTCGAAACTACTTACACGTATCGGACA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4H568JQB 741 0 0
AGATCTGGCCTCACAGCTTTGAACTCCGTGTACGAATCTCTATCAGCTTTGGGAAACTTA
CTTTGATCCCTCGTGTGAGGAACATTGACTCAAAGCCATTCTCTTTCATGTTTGCTCTTC
GAAACTACTTACACGTATCGGACATAAGTGAAGTACGGGTTGAGGGTCTGGAGACACTTG
ATTATCTAGACAACTTGAAGGGTAAAGAAAGATTCACCGAGCAAGCAGACGCAATTACCT
TTGACGGTGAGATTGATAGGGTGTACTTGAACACACCAACGAAGATTGCGGTCATAGACC
ATGAGCGGAAGAGAACCATCGAACTGCGAAAGGAAGGCATGCCCAATGCAGTAGTGTGGA
ACCCTTGGGACAAAAAGGCAAAGAGCATAGCTGATATGGGGGATGAAGATTACATGACGA
TGCTGTGTGTAGATTCTGGAGCTATCGAACCTCAGGTTTTGTTGAAGCCTGGTGAAGAGT
GGAAAGGCAGACAAGAACTCTCTATCGTCTCGTCAAGCTACTGCAGCGGACAGCTTGATC
CACGCAAGGTTCTTTACGGAGATAGCTGATCCCCTTTCTTTTTTTTTGATTAAGAAACAA
TAATAAGCACACCTTCTCATTGTCAGCTTCTTCTCAAGTGTCAAAAGGTATTTTTGAATT
TGTTAAGAAGAAAGAGAGGTCACGGTAATATTTTTTGTAGCGTTGACACTGTGTTTGACC
GTCCGTCAAAAGACTTTCTTT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7874Contig1 521 2 1 U
GGAAGATCAAGTGGTAATGGAGAAAGATCAGAAGAAAGAGAGCGATATGTACGAGCAAAA
TCAGCATCAGCCACCATATGTGTCGCAGATGCAGCCGGTGACACACGAAGCTTACGGAGG
CGGACTTTACGGTATGGACGATGAGAAAGAAAAAGATTCCAAAACTATAAAGAGAGATGC
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TGATCGAGACATTGATATTACTGGCCAGTCATATATTCAATAATGACTAATGAATCATGA
AAAGAAGTTTTATTTAGTTCACTTTTGTGTGTGTTTGTATTGGCTCTTTGTAGTTTCTTT
ATTTCATGGTCTTTTATTGTGTGAGCAAGTTAGATCAAGTAGTTATGTTGTGTGTCGACG
TTACTCTAAAATACTGCAAATATAATAATTATCATTCACAC


BQ
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AF RR4EX16JQ C 1
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QA 1 521 1 521
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BQ
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AF RR4BW72JQ C 1
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QA 1 486 1 486
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BQ
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AF RR4AJ05JQ U 1
AF RR4AJ16JQ U 1
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QA 1 788 1 788
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GCACGGCTCTGTTAGTAATCAAACTAGAAGTTGGTTTCTTGTGTGGAAAGGAACCGTTTG
TGGAAACCTGACTTTTATTGAGAAGAGTCTCCTAAGCGTTTTTAATCCAAGAGAGACTTT
GTTTCTGAGTAACTTAACCTATTCTGTAGTTCAAATCTCCAAGCTAGATAACTGGCGTGA
GAGAAGAACATGGCTGATCAGCTTCTTTGTGAAACATCTGATCAATTGATACAAACATAT
TAGCTATATATGAAGCATATTAGCTATATATGCTAAAGCACTATGTATGGGACCAGGGGC
GAAGCCACGTTCATCAATAAGGGTGCATGTGCACCCAGTGTTTTCTTAATATTTAAAATT
TTACTCAAGAAAACTAAGACATAAGTGGTTTATTTGGTTATGTTGCACCCATAATTTTCT
AAGAAC

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

CO CL7877Contig1 733 2 3 U
GCTTGGTGTCAAGAGGATGAGCATTGTTGGAATCAGCTACGGTGGATTTGTAGGGTACAG
TTTAGCGGCGCAGTTTCCGGAGAAGGTGGAGAAGATTGTGCTGTGCTGCGCAGGGGTTTG
CCTTGAGGAGAAAGATATGGAGGATGGGTTGTTTAAGGTTCCGAATCTTGAAGAAGCCAC
TGGGATTTTGATTCCTCAGACGCCGGAGTAGCTTAAGGAGCTTATTAGATTCTCTTTCGT
TAAGCCTATCAAAGGTGTTCCATCGTTTTTTCTTTGGGACTTTATAGATGTAATGTGTAT
GGAGTTTGTAGAGGAGAAGAGAGATTTGATCAAATCAATACTTAAAGATCGGAGACTTTC
AGATCTTCCTAGGATCAAACAGAAATCTTTGATCATATGGGGAGAAGAAGATCAAATATT
TCCACTTGAGCTTGGTTACAGATTAAAAAGACATATAGGAGACAATGCAGAGATAATGGT
GATCAAGAAGGCAGGACATGCTGTGAATTTGGAGAAGTCTAAAGAGTTCCTCAAGCACTT
GAAATCCTTTCTCATTGACTCTTTGTGAACTACTGTTTTGTTTATCTATTTTTATAGATT
GATAACCAATAGTTCCTCGAACACTTTGAAATCTTCTAATCTCTCATTGACTCTTTATGA
ACTACTGTATTTTTTTTTTAAATTAGTGAACTACTGTTTTTAAAATTCTTTTGATAAATT
GATAACCTATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4A163TFB U 1
AF RR4A163TF U 580
BS 1 626 RR4A163TFB
BS 627 627 RR4A163TF
BS 628 733 RR4A163TFB

RD RR4A163TFB 733 0 0
GCTTGGTGTCAAGAGGATGAGCATTGTTGGAATCAGCTACGGTGGATTTGTAGGGTACAG
TTTAGCGGCGCAGTTTCCGGAGAAGGTGGAGAAGATTGTGCTGTGCTGCGCAGGGGTTTG
CCTTGAGGAGAAAGATATGGAGGATGGGTTGTTTAAGGTTCCGAATCTTGAAGAAGCCAC
TGGGATTTTGATTCCTCAGACGCCGGAGTAGCTTAAGGAGCTTATTAGATTCTCTTTCGT
TAAGCCTATCAAAGGTGTTCCATCGTTTTTTCTTTGGGACTTTATAGATGTAATGTGTAT
GGAGTTTGTAGAGGAGAAGAGAGATTTGATCAAATCAATACTTAAAGATCGGAGACTTTC
AGATCTTCCTAGGATCAAACAGAAATCTTTGATCATATGGGGAGAAGAAGATCAAATATT
TCCACTTGAGCTTGGTTACAGATTAAAAAGACATATAGGAGACAATGCAGAGATAATGGT
GATCAAGAAGGCAGGACATGCTGTGAATTTGGAGAAGTCTAAAGAGTTCCTCAAGCACTT
GAAATCCTTTCTCATTGACTCTTTGTGAACTACTGTTTTGTTTATCTATTTTTATAGATT
GATAACCAATAGTTCCTCGAACACTT*GAAATCTTCTAATCTCTCATTGACTCTTTATGA
ACTACTGTATTTTTTTTTTAAATTAGTGAACTACTGTTTTTAAAATTCTTTTGATAAATT
GATAACCTATTAC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4A163TF 153 0 0
GTTTATCTATTTTTATAGATTGATAACCAATAGTTCCTCGAACACTTTGAAATCTTCTAA
TCTCTCATTGACTCTTTATGAACTACTGTATTTTTTTTT*AAATTAGTGAACTACTGTTT
TTAAA*TTCTTTTGATAAATTGATAACCTATTA

QA 1 153 1 153
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7879Contig1 807 2 2 U
GCCTCTTACTTCCACACTGGAACATTATGACAAATTGGTTTTGGATCCTCGACGTATCCG
CCATGAATCCACTGTTGGTGCTGGGCTTCCTGTCATTGCATCCATGAACCGTATAATTTC
ATCCGGAGATCCTGTTCATAGCATTGTCGGTAGTTTGAGCGGTACCTTGGGATATGTAAT
GAGTGAGCTTGAAGATGGAAGGCCTCTAAGTCTAGTTGTTCGAGCTGCTAAAACACTGGG
GTATACTGAACCAGATCCACGTGATGACCTTAGTGGCATGGATGTTGCTAGAAAGAGTTT
GATTCTTGCTCGACTTCTTGGGAAGAGGATAACTATGGATAGCATTAAGATAGAGAGCTT
GTACCCTGAAGAGATGAGACCTGGAGTGATGACTGTGGATGGTTTCCTCGAGAATGGAAT
AGCAAAACTTGATCAGAGCATTGAGAGAGAGTTAAAAGAGCTTCATCAAACGGGTGTGTG
CTTCGTTATGTTTGTGTGATTGAGGGCTCAAGCGTTCAAGTTGGCATTCGAGAAGTTCCA
AAAGATTCCCCATTAGGACGACTAAGAGGCAGTGACAATATAGTAGAGATACGTAGCCGT
TGCTACAAGGAGCAGCCTTTGGTGATTCAAGGTGCCGGAGCCGGGAACGACACAACTGCA
GCCGGTGTTCTTGCAGACATCATCGACATGCAGGATCTTTTTCCTTGAGAGAGAGCATGT
GATCTGGTCATCATATCACAGTAATAATAAACCTAATTTTCAAAGGATTGTTTCCTATTC
ATCATAAAAGATAGTCTTTTGCCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DG37TF U 1
AF RR4DG37JQ C 55
BS 1 689 RR4DG37TF
BS 690 807 RR4DG37JQ

RD RR4DG37TF 689 0 0
GCCTCTTACTTCCACACTGGAACATTATGACAAATTGGTTTTGGATCCTCGACGTATCCG
CCATGAATCCACTGTTGGTGCTGGGCTTCCTGTCATTGCATCCATGAACCGTATAATTTC
ATCCGGAGATCCTGTTCATAGCATTGTCGGTAGTTTGAGCGGTACCTTGGGATATGTAAT
GAGTGAGCTTGAAGATGGAAGGCCTCTAAGTCTAGTTGTTCGAGCTGCTAAAACACTGGG
GTATACTGAACCAGATCCACGTGATGACCTTAGTGGCATGGATGTTGCTAGAAAGAGTTT
GATTCTTGCTCGACTTCTTGGGAAGAGGATAACTATGGATAGCATTAAGATAGAGAGCTT
GTACCCTGAAGAGATGAGACCTGGAGTGATGACTGTGGATGGTTTCCTCGAGAATGGAAT
AGCAAAACTTGATCAGAGCATTGAGAGAGAGTTAAAAGAGCTTCATCAAACGGGTGTGTG
CTTCGTTATGTTTGTGTGATTGAGGGCTCAAGCGTTCAAGTTGGCATTCGAGAAGTTCCA
AAAGATTCCCCATTAGGACGACTAAGAGGCAGTGACAATATAGTAGAGATACGTAGCCGT
TGCTACAAGGAGCAGCCTTTGGTGATTCAAGGTGCCGGAGCCGGGAACGACACAACTGCA
GCCGGTGTTCTTGCAGACATCATCGACAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DG37JQ 753 0 0
TATCCGCCATGAATCCACTGTTGGTGCTGGGCTTCCTGTCATTGCATCCATGAACCGTAT
AATTTCATCCGGAGATCCTGTTCATAGCATTGTCGGTAGTTTGAGCGGTACCTTGGGATA
TGTAATGAGTGAGCTTGAAGATGGAAGGCCTCTAAGTCTAGTTGTTCGAGCTGCTAAAAC
ACTGGGGTATACTGAACCAGATCCACGTGATGACCTTAGTGGCATGGATGTTGCTAGAAA
GAGTTTGATTCTTGCTCGACTTCTTGGGAAGAGGATAACTATGGATAGCATTAAGATAGA
GAGCTTGTACCCTGAAGAGATGAGACCTGGAGTGATGACTGTGGATGGTTTCCTCGAGAA
TGGAATAGCAAAACTTGATCAGAGCATTGAGAGAGAGTTAAAAGAGCTTCATCAAACGGG
TGTGTGCTTCGTTATGTTTGTGTGATTGAGGGCTCAAGCGTTCAAGTTGGCATTCGAGAA
GTTCCAAAAGATTCCCCATTAGGACGACTAAGAGGCAGTGACAATATAGTAGAGATACGT
AGCCGTTGCTACAAGGAGCAGCCTTTGGTGATTCAAGGTGCCGGAGCCGGGAACGACACA
ACTGCAGCCGGTGTTCTTGCAGACATCATCGACATGCAGGATCTTTTTCCTTGAGAGAGA
GCATGTGATCTGGTCATCATATCACAGTAATAATAAACCTAATTTTCAAAGGATTGTTTC
CTATTCATCATAAAAGATAGTCTTTTGCCAACG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7880Contig1 811 2 4 U
GGAAAATATATGGGAGATAACATTTGTTTCAAACGACAAAATGTTTGTTTCTAGAAAAGA
AAAAGACACACACATATATATAAATTAAATAGTGTAGAAAATAAATAAAAAATCCGAAAG
GTTTCCTCCTTGAGCAACTTTGTTTTATTTAAAACCGAACAAAAGCAAAACCAAAAGCCA
CAAGAAACCCCAAACCTAATAAAGAAAAAAAACACGGATCTCCGTAAGAAAAAGAGAGAG
AAGAAATGGTTCGTTTCTCAACTGCAACGATGATCTTTGCGGCGGCCATGACGGCGATGG
TTTTGGTTTCATTGCCGGAGGTGGAAGCGCAAACGGCTACTACTTGCGTGAACAAGCTAG
TCCCCTGCTTCAGTGCTCTGACGACGGCGACGAGGCCACCAAAGGAATGCTGTGACTCGA
TCAAGGAAGCGGTGAAAAATGAGCTTCAATGTCTCTGCACCGTCTACAACACTCCTGGTT
TGCTCTCTGGGTTCAACGTCTCTACTGAACAAGCTCTCAATCTCAGCCGTCGATGTGACG
TCACCACCGATCTCTCCGCTTGTTCCGGTACTGGAGCTTCATCGCCAAAGGCCTCTTTAC
TTCCTCCAGGAAACAAAGGAAAAGACACCGCAGCTGGGAACAAGCTCGCTGGTTATGGAG
TCACCACCGTGATCTTCTCTTTGTTTTTCACCAATTTCTTTTGAGAAAAAACCTGGAATT
ACCTGGTTTTCCGATTGTTAACCGGATTTATTATTAGCTCATATTTGACCTTATATTAAG
GGTAAAATAAAGTTTTCTTTTGTTCACGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GW30TF U 1
AF RR4GW30JQ C 26
BS 1 639 RR4GW30TF
BS 640 640 RR4GW30JQ
BS 641 687 RR4GW30TF
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RD RR4GW30TF 689 0 0
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CA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4GW30JQ 786 0 0
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AGCGCAAACGGCTACTACTTGCGTGAACAAGCTAGTCCCCTGCTTCAGTGCTCTGACGAC
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TCAATGTCTCTGCACCGTCTACAACACTCCTGGTTTGCTCTCTGGGTTCAACGTCTCTAC
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CGGTACTGGAGCTTCATCGCCAAAGGCCTCTTTACTTCCTCCAGGAAACAAAGGAAAAGA
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ACGTGC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GZ76TF U 1
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GAGATCATCGTGAGAGATAGAA

QA 1 682 1 682
DS 

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GCTGTTTGGAGTTCTGTCCTCCACGCATCTAGAATGTACAAGAACCTTGAACTTGGCGTG
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AAGGAGATCTCGAGGAGGCTGAGACTTGCTGGGTATAAAGCAGACACGAGCCCGGTTATG
TTTGACATAGACGAAGAAGAGAAAGAGGATGCTTTGTGTCTGCATAGCGAAAAGGCAGCG
ATTGCGTTTGGTATAATGAGTTTGAAAGAAGATGTCCCTATTAGGATCGTGAAGAACCTT
CGAGTTTGTGGCGATTGTCATCAGGTTTCTATGATGATCTCCAAGATTTTTGACAGAGAG
ATCATCGTGAGAGATAGAAATAGGTTCCACCATTTCAAAGACGGTCACTGTTCTTGCAAT
GGCTTTTGGTGAATCTTGTTTTGATATTCTTATGTTTAATTCATTGGAATGTTTTATACT
TTCGATAACTGGAACTTGATAAATTTAATTGAG

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DS 



AS 1 2

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TCTTTTTTTTTTTTTTCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE52TF U 1
AF RR4FB09TF U 1
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TCTTTTTTTTTTTTTTCT

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DS 

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TCTTCACTCTTGCTCCTCCGATGGTACCATCAGATCTTGGGACACCCGTTCTTTCCAGCA
GGTAGCGTTTATTGATGCTGCTGATAATGGTCAAGAGGTCTTTAGCTTCTCCTTTGGAGG
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CTTCAACACTGAAAGTGATATCAACGACGATGACCATCTCGATTCTGTATGTTTCTTTTT
T
TCTTT

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DH09JQ C 1
AF RR4DH09TF U 1
BS 1 626 RR4DH09TF

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TAATGTAATTAATATTGTTAGATGAA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4DH09TF 626 0 0
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CGATGAAGGACTTCAAAAAGACTTGCAAGCCGAGGCCATGATGGAGGAAGACTTGAAGGC
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GACGCTGAAACAACTTGGAAATGATTACAAAAAGGATACGGATGAAGCGCCTTACGGAAA
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AATCTGCATCCGTAATCCAAAAGATCTTAAAGGATCTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGAAT
GACAAAAGATAACCCTTAGGGTTTGATTACTATTCAAAGAAGGTTTGAACTTGTTCATTG
AGTTTAGCTTTACAAGTGAGAGGAGAAAATAATTTCCCCCATAGTATACTAGTTGCATTA
TAATGTAATTAATATTGTTAGATGAA

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7884Contig1 698 2 2 U
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TGTCTGGTGAGACACCATGGCAAATGCAGAGAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DS72TF U 1
AF RR4E750TF U 115
BS 1 581 RR4DS72TF
BS 582 698 RR4E750TF

RD RR4DS72TF 581 0 0
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TCTCTGCTCATCAAAGAGTTGATCTTGCCAACGTTGTAAGACGAAGAGGATATAAGTTCA
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AAGACGAGGAGGTCAACGATGTGGAAGAGGATTCCTCTCTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4E750TF 584 0 0
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CTTGTTCCATCAAACAAACCAGAGTTCGTAAGAGAGTGAAGAGCAACGAGGAGCTACGTA
ATGAGATTCTAGAGTTCGTTGCTTTGGCTGGCCTTCCTCCAGGTCACGTCCCCTCCATGA
AGGAACTCTCTGCTCATCAAAGAGTTGATCTTGCCAACGTTGTAAGACGAAGAGGATATA
AGTTCATCAGGGAGCTTCTTGCAAACTCTGAAGACTGTACTGAGCTTACAAGTGCAAGTG
GCGTCTGTTTTGAAGACTCGTTAACAGAAGGTCAGGACGAAGAAGCACTTGACGGAAGCT
TGTCTACTGAAAAACGACCTTCAAGCTCTCCGGAGAGAGAAGCTGACAATGTTCTGGTGG
CAGAGGAAGACGAGGAGGTCAACGATGTGGAAGAGGATTCCTCTCTTCTTAGCGATAATC
ATTACACCAGTCAAGATCTCAGTCACAACACCAAAAACGTTGTTGAAAGTGTTGCTACTG
AATCCTTGTCTGGTGAGACACCATGGCAAATGCAGAGAATTTTC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL7885Contig1 825 2 1 U
GGGATCTCACCGTCTCTCACAGCAAGGAGCTATCACAAAGAGGATGACAGCTATTGAAGA
GATGGCTGGGATGGATGTTTTGTGCAGTGACAAGACTGGAACTCTTACACTCAACAAGCT
TACCGTTGACAAGAGCATGGTTGAGGTTTTTGTTAAAGACTTGGACAAAGAGCAGCTTAT
GGTGAATGCAGCAAGAGCCTCTAGAGTAGAGAACCAGGATGCTATAGATGCTTGCATAGT
AGGAATGCTTGGAGATCCCAGTGAAGCAAGACAAGGCATCACTGAAGTCCATTTTTTCCC
TTTTAACCCTGTGGACAAGCGTACTGCTATCACTTACATTGATTCTAGCGGAAACTGGCA
CCGTGTCAGCAAAGGCGCCCCTGAGCAAATCATTGAGCTATGTAACCTTAGAGAGGATAC
AAAGAAGAGAGCTCATGACATCATTGACAAGTTTGCTGACAGAGGACTTCGTTCTTTGCT
GTTGGCAGACAGACCGTCTCTGAGAAAGACAAGAACAGCCCTGGAGAGCCATGGGAGTTT
CCTGGTCTCTTACCTCTCTTTGATCCTCCAAGACATGACAGTGCAGAGACAATCAGGCGA
GCCCTTGACCTCGGTGTCAATGTCAAGATGATCACTGGTGACCAGCTCGCCATTGGTAAG
GAAACAGGTCGTAGCTGGGTATGGGCACCAACATGTATCCTTCTTCTGCTCTACTTGGAC
AGGACAAGGATGAATCTATATCTAGTATTCCTGTTGATGAACTCATCGAGATGGCTGATG
GATTTGCCCGGTGTCTTCCCTGAACACAAGTATGAGATTGTGAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A678TF U 1
AF RR4AG94TF U 1
BS 1 825 RR4A678TF

RD RR4A678TF 825 0 0
GGGATCTCACCGTCTCTCACAGCAAGGAGCTATCACAAAGAGGATGACAGCTATTGAAGA
GATGGCTGGGATGGATGTTTTGTGCAGTGACAAGACTGGAACTCTTACACTCAACAAGCT
TACCGTTGACAAGAGCATGGTTGAGGTTTTTGTTAAAGACTTGGACAAAGAGCAGCTTAT
GGTGAATGCAGCAAGAGCCTCTAGAGTAGAGAACCAGGATGCTATAGATGCTTGCATAGT
AGGAATGCTTGGAGATCCCAGTGAAGCAAGACAAGGCATCACTGAAGTCCATTTTTTCCC
TTTTAACCCTGTGGACAAGCGTACTGCTATCACTTACATTGATTCTAGCGGAAACTGGCA
CCGTGTCAGCAAAGGCGCCCCTGAGCAAATCATTGAGCTATGTAACCTTAGAGAGGATAC
AAAGAAGAGAGCTCATGACATCATTGACAAGTTTGCTGACAGAGGACTTCGTTCTTTGCT
GTTGGCAGACAGACCGTCTCTGAGAAAGACAAGAACAGCCCTGGAGAGCCATGGGAGTTT
CCTGGTCTCTTACCTCTCTTTGATCCTCCAAGACATGACAGTGCAGAGACAATCAGGCGA
GCCCTTGACCTCGGTGTCAATGTCAAGATGATCACTGGTGACCAGCTCGCCATTGGTAAG
GAAACAGGTCGTAGCTGGGTATGGGCACCAACATGTATCCTTCTTCTGCTCTACTTGGAC
AGGACAAGGATGAATCTATATCTAGTATTCCTGTTGATGAACTCATCGAGATGGCTGATG
GATTTGCCCGGTGTCTTCCCTGAACACAAGTATGAGATTGTGAAG

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR4AG94TF 792 0 0
GGGATCTCACCGTCTCTCACAGCAAGGAGCTATCACAAAGAGGATGACAGCTATTGAAGA
GATGGCTGGGATGGATGTTTTGTGCAGTGACAAGACTGGAACTCTTACACTCAACAAGCT
TACCGTTGACAAGAGCATGGTTGAGGTTTTTGTTAAAGACTTGGACAAAGAGCAGCTTAT
GGTGAATGCAGCAAGAGCCTCTAGAGTAGAGAACCAGGATGCTATAGATGCTTGCATAGT
AGGAATGCTTGGAGATCCCAGTGAAGCAAGACAAGGCATCACTGAAGTCCATTTTTTCCC
TTTTAACCCTGTGGACAAGCGTACTGCTATCACTTACATTGATTCTAGCGGAAACTGGCA
CCGTGTCAGCAAAGGCGCCCCTGAGCAAATCATTGAGCTATGTAACCTTAGAGAGGATAC
AAAGAAGAGAGCTCATGACATCATTGACAAGTTTGCTGACAGAGGACTTCGTTCTTTGCT
GTTGGCAGACAGACCGTCTCTGAGAAAGACAAGAACAGCCCTGGAGAGCCATGGGAGTTT
CCTGGTCTCTTACCTCTCTTTGATCCTCCAAGACATGACAGTGCAGAGACAATCAGGCGA
GCCCTTGACCTCGGTGTCAATGTCAAGATGATCACTGGTGACCAGCTCGCCATTGGTAAG
GAAACAGGTCGTAGCTGGGTATGGGCACCAACATGTATCCTTCTTCTGCTCTACTTGGAC
AGGACAAGGATGAATCTATATCTAGTATTCCTGTTGATGAACTCATCGAGATGGCTGATG
GATTTGCC
GTGT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL7886Contig1 802 2 4 U
GAGTTACACGGGTCATTGATATTTAACACAAGAACAATATTCGTTACACATAAGAGTAGC
AACAAAAACAAAAAACAGCAGAGAGAGTGATGGAAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGT
ACCACATAACAAAAGATTTAAACCTAAGAGTTTTAAATCCTAGAATCTACCAGTTCCTCT
CCTTCACGACCTTTAGCACTGTGTCTATGGGCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTCA
GTACTGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAACACCCACTCCGTCCCCAAATGCGCAGTTAA
CGCCAATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAACCGGACCTCCAGAGTTACCCTCATTCAAAG
CACAATCAGTTTGGAAATAGAATTTGCAATTGCCTTCTATGCCAATTTACTTGTTTGTGC
GTTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGCTTGCAAACTCAAGAGGATTGCCGA
TGGACAGCACCATATCCCCAACAGAAACATCCTTGGAGATTCCAAACTTTGCAGGAGAGA
ATGAAGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGACTAGTGCGAGATCATAATCTGCATCATAAT
CAGCAACAACTCCTCGAAACGTTTGACCACAGTTCAATATCTTTACCTCCATTCGCTTCG
AACGATAGACAGGACTCGTTCTAAACTTGTGGGGGTTGAGGACGAAATGACCACAAGTTA
TTATTTTGCCTTCTCCCCCAAACAAAATCCCAGAGCCATAACCGTCGTTAGGTCCATCAA
TATTGACAACAGAAGAGCGATG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT96JQ U 1
AF RR4BP68JQ U 4
BS 1 455 RR4AT96JQ
BS 456 456 RR4BP68JQ
BS 457 766 RR4AT96JQ
BS 767 802 RR4BP68JQ

RD RR4AT96JQ 766 0 0
GAGTTACACGGGTCATTGATATTTAACACAAGAACAATATTCGTTACACATAAGAGTAGC
AACAAAAACAAAAAACAGCAGAGAGAGTGATGGAAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGT
ACCACATAACAAAAGATTTAAACCTAAGAGTTTTAAATCCTAGAATCTACCAGTTCCTCT
CCTTCACGACCTTTAGCACTGTGTCTATGGGCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTCA
GTACTGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAACACCCACTCCGTCCCCAAATGCGCAGTTAA
CGCCAATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAACCGGACCTCCAGAGTTACCCTCATTCAAAG
CACAATCAGTTTGGAAATAGAATTTGCAATTGCCTTCTATGCCAATTTACTTGTTTGTGC
GTTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGTTTGCAAACTCAAGAGGATTGCCGA
TGGACAGCACCATATCCCCAACAGAAACATCCTTGGAGATTCCAAACTTTGCAGGAGAGA
ATGAAGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGACTAGTGCGAGATCATAATCTGCATCATAAT
CAGCAACAACTCCTCGAAACGTTTGACCACAGTTCAATATCTTTACCTCCATTCGCTTCG
AACGATAGACAGGACTCGTTCTAAACTTGTGGGGGTTGAGGACGAAATGACCACAAGTTA
TTATTTTGCCTTCTCCCCCAAACAAAATCCCAGAGCCATAACCGTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4BP68JQ 799 0 0
C
TACACGGGTCATTGATATTTAACACAAGAACAATATTCGTTACACATAAGAGTAGCAACA
AAAACAAAAAACAGCAGAGAGAGTGATGGAAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGTACCA
CATAACAAAAGATTTAAACCTAAGAGTTTTAAATCCTAGAATCTACCAGTTCCTCTCCTT
CACGACCTTTAGCACTGTGTCTATGGGCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTCAGTAC
TGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAACACCCACTCCGTCCCCAAATGCGCAGTTAACGCC
AATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAACCGGACCTCCAGAGTTACCCTCATTCAAAGCACA
ATCAGTTTGGAAATAGAATTTGCAATTGCCTTCTATGCCAATTTCCTTGTTTGTGCGTTT
AACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGCTTGCAAACTCAAGAGGATTGCCGATGGA
CAGCACCATATCCCCAACAGAAACATCCTTGGAGATTCCAAACTTTGCAGGAGAGAATGA
AGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGACTAGTGCGAGATCATAATCTGCATCATAATCAGC
AACAACTCCTCGAAACGTTTGACCACAGTTCAATATCTTTACCTCCATTCGCTTCGAACG
ATAGACAGGACTCGTTCTAAACTTGTGGGGGTTGAGGACGAAATGACCACAAGTTATTAT
TTTGCCTTCTCCCC*AAACAAAATCCCAGAGCCATAACCGTCGTTAGGTCCATCAATATT
GACAACAGAAGAGCGATG

QA 2 799 2 799
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7888Contig1 717 2 3 U
TTCCGAAACTGTAACTTAACAATTGTGTTATTGTTTGTTATATAAAAATCATCTGGTTTC
AAGACAACTTTCAAAATGAGAATGGGAGTTTCTGTATTAAGAGAGGTTTGAACAAAATAC
GTCTAGACAGGAACAAGAAAAAAATTCTGAATCAAGCGAGGAAGCCAAGCCTCTCTCCAT
TCTTCTTAGCAAGCCTAATCAATCCTTGTCTCTGTTTCGCATCAGCTCCTATCGATTTAC
AGAACTCTGTAATCACCTAAAAGAAAAAAAAACAAAACACAAAACTTATTGATTCTGCTT
TCTTTTGCACTACACTTTCCAAAGGTCTAATGGAAGGATGATGACAAACCTGAAAGTGTA
AAGCAATGGCTTTGCCTCTAAGCTGATTAAACCTCTTCTTGCCTACTATGTTCCTAGTGA
CAACGACAAGTGGTGCGAATAAGCCTTTGCCTCGTTGACATTCTTCATCATCGGTTGTAC
TCTGATGGGTTTTCGTGAAACTCTAGCTTGTTTAGGTGGCGCAGTTGTTTTGATCTGGTA
ATCATCGCCTGAAATTGAGTTTCCCCAACCACCATAAAAGGATGTTCCAAGTAAACCTTG
ATTCGCAGAAAGTGAAGCAGTAGCAGCCATAGGAATCGGGTCGGGATTCTCCCTCTGATG
GATGCCAATGGTTGGAGAGAAATCGAGTGTTTGTGGTTTGATTTTGGAGCTGAATCC


BQ
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AF RR4H989JQB U 3
AF RR4H989TF C 1
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TGATGGGTTTTCGTGAAACTCTAGCTTGTTTAGGTGGCGCAGTTGTTTTGATCTGGTAAT
CATCGCCTGAAATTGAGTTTCCCCAACCACCATAAAAGGATGTTCCAAGTAAACCTTGAT
T

QA 1 601 1 601
DS 

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GTCTAGACAGGAACAAGAAGAAGATTCTGAATCAAGCGAGGAAGCCAAGCCTCTCTCCAT
TCTTCTTAGCAAGCCTAATCAATCCTTGTCTCTGTTTCGCATCAGCTCCTATCGATTTAC
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TCTTTTGCACTACACTTTCCAAAGGTCTAATGGAAGGATGATGACAAACCTGAGAGTGTA
AAGCAATGGCTTTGCCTCTAAGCTGATTAAACCTCTTCTTGCCTACTATGTTCCTAGTGA
CAACGACAAGTGGTGCGAATAAGCCTTTGCCTCGTTGACATTCTTCATCATCGGTTGTAC
TCTGATGGGTTTTCGTGAGACTCTAGCTTGTTTAGGTGGCGCAGTTGTTTTGATCTGGTA
ATCATCGCCTGAGATTGAGTTTCCCCAACCACCATAGAAGGATGTTCCAAGTAAACCTTG
ATTCGCAGAAAGTGAAGCAGTAGCAGCCATAGGAATCGGGTCGGGATTCTCCCTCTGATG
GATGCCAATGGTTGGAGAGAAATCGAGTGTTTGTGGTTTGATTTTGGAGCTGAATCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

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GCTGTTGCTTGGCGGTGGAGGAACTAAGCCTACCTTGTTTCGGATGACGAGGTCTTCTTC
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TATATGGAGCCGTTTGGTAGCCTCCTGTGTACATACCCTGGGATGAGAGAGAGGGGAAGG
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C


BQ
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20 

AF RR4CK05TF C 1
AF RR4CK05JQ U 4
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BS 4 661 RR4CK05JQ

RD RR4CK05TF 661 0 0
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GGTTACTTCTTAAGTTTTCATGATTCTGCTGATACTGTTGTTTGTTTTGATGAAAAGAGT
GCTGTTGCTTGGCGGTGGAGGAACTAAGCCTACCTTGTTTCGGATGACGAGGTCTTCTTC
TGGACTGATAACATTTGGGGATGAACACACCAGTCCCTTTGCTCAGTTCCAGATGGTACA
TATATGGAGCCGTTTGGTAGCCTCCTGTGTACATACCCTGGGATGAGAGAGAGGGGAAGG
AGGAGGAGAGATTAACAGGTTTTAACTGTTCATCTTCATCCATGATGGGAAGAGAGATCT
C

QA 1 661 1 661
DS 

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AAGAAAGAGTTACATTAGATCAAGAACTAAACGTGGAACAAATCTCCAAGACCTTCCTTG
TAAAGAATCCATACTATCTGCTGATTTACAAACAAATAAATCTTATTGCATCTATAAAAT
TTTATATATAGATATATGAATCAATCACACATAAACCATGAATCAAGTGTAGATAGATGT
GAAAAATCAATCAAGTGTAGATAGATGCTGCATCTCTGTAGGTTCTTCTTGGGATAGAAG
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TACTTCTTAAGTTTTCATGATTCTGCTGATACTGTTGTTTGTTTTGATGAAAAGAGTGCT
GTTGCTTGGCGGTGGAGGAACTAAGCCTACCTTGTTTCGGATGACGAGGTCTTCTTCTGG
ACTGATAACATTTGGGGATGAACACACCAGTCCCTTTGCTCAGTTCCAGATGGTACATAT
ATGGAGCCGTTTGGTAGCCTCCTGTGTACATACCCTGGGATGAGAGAGAGGGGAAGGAGG
AGGAGAGATTAACAGGTTTTAACTGTTCATCTTCATCCATGATGGGAAGAGAGATCTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL7890Contig1 874 2 10 U
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AGGCATGAGTGTTACGCAACAACATGTTGCTTTCTTCGACCAAAACGGCGACGGAATCGT
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ACAACATACACAAAGCTAAGCATGGGAGTGATTCAAGCACCTATGATACCGAAGGAAGGT
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TGTACTAATGTATGTGTAGCCTACTACAATTATGCCCTCGATCTTGGTTAGGAAAAAAAA
ACAAATAAACAAAAGTGTAAGTGGGAGAAAACTTTGTGTTCTTTACTATATTGTTGTGTA
AAATTTGTTGAACAAATAAAATGAGACTTTCATC


BQ
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AF RR4CL24TF U 1
AF RR4CL24JQ C 2
BS 1 680 RR4CL24TF
BS 681 681 RR4CL24JQ
BS 682 697 RR4CL24TF
BS 698 698 RR4CL24JQ
BS 699 706 RR4CL24TF
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BS 708 748 RR4CL24TF
BS 749 749 RR4CL24JQ
BS 750 776 RR4CL24TF
BS 777 874 RR4CL24JQ

RD RR4CL24TF 776 0 0
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GAAGAGAGAGAGAGTATGGGAGAAGAGTCAGAGGCTTTTGCCACGACGGCGCCTTTAGCT
CTGGTGACCGGTCAGCGAATAGTACGGAACGATTTGGAGGACACATTACCTAAACCATAT
TTGGCTAGAGCATTAGCAGCTCCAGATACAGAGCATCCGAATGGAAGGTCATGACAGCAA
AGGCATGAGTGTTACGCAACAACATGTTGCTTTCTTCGACCAAAACGGCGACGGAATCGT
CTATCCTTGGGAGACTTATGCAGAGTTGGTTGCCATCACCACTGTTACCTGTTTATATCG
ACAACATACACAAAGCTAAGCATGGGAGTGATTCAAGCACCTATGATACCGAAGGAAGGT
TTGTACCGGCTAATCTCGAGAACATATTTAGCAAATACGCTTTAGCAGTTTCGGATAAGT
TATCATTTAAAGAGCTTTGGAACTTAACCGAGGGAAACCGAATGGCAATCGATCCTTTTG
GGTGGGTTTCGAACAAAGTTGAATGGCTACTACTTTATCTTCTTGCAAAAGATGATGAAG
GGTTCGTGTCTAAAGAAGCTGTGAGAGGTTGCTTTGATGGAAGTTTATTTGAATATTGTG
CTAAACAGAATAAAGCGAAG*CCAATTCTCGCAAGCA*GACTAAAA*CGTGTTTACCTTT
TGTACTAATGTATGTGTAGCCTACTACA*TTATGCCCTCGATCTTGGTTAGGAAAA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4CL24JQ 873 0 0
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AAGAGAGAGAGAGTATGGGAGAAGAGTCAGAGGCTTTTGCCACGACGGCGCCTTTAGCTC
TGGTGACCGGTCAGCGAATAGTACGGAACGATTTGGAGGACACATTACCTAAACCATATT
TGGCTAGAGCATTAGCAGCTCCAGATACAGAGCATCCGAATGGAAGGTCATGACAGCAAA
GGCATGAGTGTTACGCAACAACATGTTGCTTTCTTCGACCAAAACGGCGACGGAATCGTC
TATCCTTGGGAGACTTATGCAGAGTTGGTTGCCATCACCACTGTTACCTGTTTATATCGA
CAACATACACAAAGCTAAGCATGGGAGTGATTCAAGCACCTATGATACCGAAGGAAGGTT
TGTACCGGCTAATCTCGAGAACATATTTAGCAAATACGCTTTAGCAGTTTCGGATAAGTT
ATCATTTAAAGAGCTTTGGAACTTAACCGAGGGAAACCGAATGGCAATCGATCCTTTTGG
GTGGGTTTCGAACAAAGTTGAATGGCTACTACTTTATCTTCTTGCAAAAGATGATGAAGG
GTTCGTGTCTAAAGAAGCTGTGAGAGGTTGCTTTGATGGAAGTTTATTTGAATATTGTGC
TAAACAGAATAAAGCGAAGGCCAATTCTCGCAAGCAAGACTAAAAACGTGTTTACCTTTT
GTACTAATGTATGTGTAGCCTACTACAATTATGCCCTCGATCTTGGTTAGGAAAAAAAAA
CAAATAAACAAAAGTGTAAGTGGGAGAAAACTTTGTGTTCTTTACTATATTGTTGTGTAA
AATTTGTTGAACAAATAAAATGAGACTTTCATC

QA 1 873 1 873
DS 



AS 1 2

CO CL7891Contig1 909 2 2 U
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TATCAGTCGCACAATCCGAGACGATGGACCGTCACATTGGAAGCTTTGAGATCCCACCAG
CTTCAATGGCCGTCTTCTATGTCGGTGGCCTCCTCTTAACCACCGCGATTTACGACCGTG
TCGCCATTCCCCTATGCAAAAAGCTATTCAACTACCCCCATGGTCTAAGACCACTTCAAC
GCATTGGTTTGGGTCTCATATTCGCAGCCGTGGGTATGGCTGCAGCTGCTTTGGTAGAGA
TCAAACGTCTTAGAACCGCACATTCGCATGGTCCAACTCAAAACGCCTCCTCTAGGGTTT
TATCTACTCATACAGGCCAACTAGATTTCTTCTTAAGAGAGTGCCCTAAAGGTATGAAAA
CAATGAGCACAGGTCTATTGTTGAGCACATTGGCGTTAGGGTTCTTTTTCAGCTCAGTTC
TCGTCACTATCGTGGAGAAATTCACCGATAAAGCTCGTCCGTGGATTGCTAATGATCTCA
ACAAGGGTCGTTTATACAATTTCTATTGGCTTGTGGCCGTAGTTGTTTTCTTGAACTTCC
TTATTTTCCTTGTTTTCTCCAAGTGGTACGTTTACAAGGACAAGATACTAGCTGACCTCG
GAATTGAGTTGGAAGATGAGCCGGACACTCCCATGGGTCATGCATGATCAGGATCCGATA
GTGATGAATATTGTGTCCATGTTGATATATATGCATTTTATTTTTATTTTTGAAATTTGT
GTTATATTTTATAATGATTTTCTCAGTTACCTCTTGTTTCGGAGTCAACAAATAATGGAC
CGACGGATAAGGGATAAAGGTTAAAGTTTCCCATTTGGATCGTTGTAAAACTTTTAAGGT
TTAACGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AP29TF U 1
AF RR4AP29JQ C 138
BS 1 762 RR4AP29TF
BS 763 909 RR4AP29JQ

RD RR4AP29TF 762 0 0
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TATCAGTCGCACAATCCGAGACGATGGACCGTCACATTGGAAGCTTTGAGATCCCACCAG
CTTCAATGGCCGTCTTCTATGTCGGTGGCCTCCTCTTAACCACCGCGATTTACGACCGTG
TCGCCATTCCCCTATGCAAAAAGCTATTCAACTACCCCCATGGTCTAAGACCACTTCAAC
GCATTGGTTTGGGTCTCATATTCGCAGCCGTGGGTATGGCTGCAGCTGCTTTGGTAGAGA
TCAAACGTCTTAGAACCGCACATTCGCATGGTCCAACTCAAAACGCCTCCTCTAGGGTTT
TATCTACTCATACAGGCCAACTAGATTTCTTCTTAAGAGAGTGCCCTAAAGGTATGAAAA
CAATGAGCACAGGTCTATTGTTGAGCACATTGGCGTTAGGGTTCTTTTTCAGCTCAGTTC
TCGTCACTATCGTGGAGAAATTCACCGATAAAGCTCGTCCGTGGATTGCTAATGATCTCA
ACAAGGGTCGTTTATACAATTTCTATTGGCTTGTGGCCGTAGTTGTTTTCTTGAACTTCC
TTATTTTCCTTGTTTTCTCCAAGTGGTACGTTTACAAGGACAAGATACTAGCTGACCTCG
GAATTGAGTTGGAAGATGAGCCGGACACTCCCATGGGTCATGCATGATCAGGATCCGATA
GTGATGAATATTGTGTCCATGTTGATATATATGCATTTTATT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4AP29JQ 772 0 0
TATGTCGGTGGCCTCCTCTTAACCACCGCGATTTACGACCGTGTCGCCATTCCCCTATGC
AAAAAGCTATTCAACTACCCCCATGGTCTAAGACCACTTCAACGCATTGGTTTGGGTCTC
ATATTCGCAGCCGTGGGTATGGCTGCAGCTGCTTTGGTAGAGATCAAACGTCTTAGAACC
GCACATTCGCATGGTCCAACTCAAAACGCCTCCTCTAGGGTTTTATCTACTCATACAGGC
CAACTAGATTTCTTCTTAAGAGAGTGCCCTAAAGGTATGAAAACAATGAGCACAGGTCTA
TTGTTGAGCACATTGGCGTTAGGGTTCTTTTTCAGCTCAGTTCTCGTCACTATCGTGGAG
AAATTCACCGATAAAGCTCGTCCGTGGATTGCTAATGATCTCAACAAGGGTCGTTTATAC
AATTTCTATTGGCTTGTGGCCGTAGTTGTTTTCTTGAACTTCCTTATTTTCCTTGTTTTC
TCCAAGTGGTACGTTTACAAGGACAAGATACTAGCTGACCTCGGAATTGAGTTGGAAGAT
GAGCCGGACACTCCCATGGGTCATGCATGATCAGGATCCGATAGTGATGAATATTGTGTC
CATGTTGATATATATGCATTTTATTTTTATTTTTGAAATTTGTGTTATATTTTATAATGA
TTTTCTCAGTTACCTCTTGTTTCGGAGTCAACAAATAATGGACCGACGGATAAGGGATAA
AGGTTAAAGTTTCCCATTTGGATCGTTGTAAAACTTTTAAGGTTTAACGCAG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7892Contig1 815 2 6 U
GGGGTTGCAAATCGAAATCGGATTTGGACAAACCCTAGAAACCGGCGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGGTGGAATCATTCTGGGGTCGAGAGGATGAAGAGCGATTGGTTTAACTTG
CATCAGGTCTCCTTCTCTCTTTCCAGTTTTCTTATTTCGATCTTTGACATCTTATGCCCC
CACAAACTTTGCAGATAGCGAGAAACTCATTCATAGCAACATCAACCGTGTACGCTTCCA
CCGAATTCAACTTCTCAAACACTGATCGAAGAAGCTTCTGCTTTTACGCACGAGACAGAT
CTGGCTTTGTCGTGTTGAAATCGGAGAAGGAGTTTAACAATGCACTGAGCAAAGCTCGAG
ATGGATCTTTGCCGTCGGTTTTCTACTTCACTGCTGCGTGGTGTGGACCTTGCGGGCTTA
TCGCTCCTGTTATCTTGTAGCTCAGTAATAAATATCCTCATGTTACTACATACAAGGTCG
ACATTGATGAGGGCGGTCTTTCAAATGCTCTTGGGAAGTTAAACGTCTCTGCTGTGCCAA
CAATGCAATTCTTCAAGGGGGCGTGAAGAAAGCAGAGCTTGTAGGTGCAGATGTCATTAA
GCTGAGGAGTATCATGGAACATCTCTACAAGTGAGAGACACTCCGTCACATTTTTATTTT
TTTGTTTTCTTGCGCTGCATCCAAGTAATGCACCAAGTGATTACGAACAAGGAAAAAAAA
AAAACTTTGCTACGATCGTTATGGAGACTCACTGTCTCAAGCATTTATTTATCAATGTAC
ATAATTTATGTGATTTTTTTCAAACAAGTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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ACATTGATGAGGGCGGTCTTTCAAATGCTCTTGGGAAGTTAAACGTCTCTGCTGTGCCAA
CAATGCAATTCTTCAAGGGGGCGTGAAGAAAGCAGAGCTTGTAGGTGCAGATGTCATTAA
GCTGAGGAGTATCATGGAACATCTCTACAAGTGAGAGACACTCCGTCACATTTTTATTTT
TTTGTTTTCTTGCGCTGCATCCAAGTAATGCACCAAGTGAT*ACGAACAAG***AAAAAA
AAAACTTTGCTACGATCGTTATGGAGACTCACTGTCTCA
GCA

QA 1 759 1 759
DS 

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GGACCTTGCGGGCTTATCGCTCCTGTTATCTTGTAGCTCAGTAATAAATATCCTCATGTT
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GTTTTTGCTGTGCCAACAATGCAATTCTTCAAGGGGGCGTGAAGAAAGCAGAGCTTGTAG
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TTATTTATCAATGTACATAATTTATGTGATTTTTTTCAAACAAGTTTCATC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GB85TF U 1
AF RR4D616TF U 386
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DS 

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GGGTGGT
GGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTAGCTATGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAA
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AAACTCTC

QA 8 195 8 195
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EV74TF U 1
AF RR4EV74JQ C 43
BS 1 621 RR4EV74TF
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RD RR4EV74TF 680 0 0
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CATTGGCACATCATGGGCTTGGCCATAAGGCCTTGCGAGTGCTTGATGACATGATCAAAC
TCACAGTTGTCCCAAACCGGACGACTCTGGTTGTGATTCTGAGTGCCTGCAGTCACTCAG
GTCTGGTGGAGGAAGGAGTCAGGTGGTTTGATTCAATGACTGCTGATTACGGGATCGTTC
CCGACCAAGAACATTACGCATGTCTGATAGATCTCCTAGGTCGTGCCGGTTGCTTTAAAG
AGTTGATGAGTAGGATCGAGAAAATGCCTTTTAGACCAGACGAGCATATTTGGAATGTAA
TCCTAGGAGTATCTGAGAATTGGGAATCAGTAGAAGAGCTGAGAGGGATTATGAAGAAGA
GAAAGGTGAATAAAGAGAAAGCTCTTAGCTGGATTGAAATAGAGCAGAAAGTTGAAACTT
TCACAGTTCAGACGGTCGGCATCATCGTCGCAAAGAAGAAATCTACTCCGTTCTGCATAA
TCTGGCTGTACTTATGGAAAA*GAAGAAGTTTCAAGAACATGATCCTCGAACAACAAGAA
GATGCAATTCCTGTAA
TTCA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4EV74JQ 795 0 0
GCTTAGAAGCCAGCGAGCGGGTTTT*GATCTTTGCGGTGACAAGCAAGACTGTGTTGTGT
GGAACACGATGATTTCTGCATTGGCACATCATGGGCTTGGCCATAAGGCCTTGCGAGTGC
TTGATGACATGATCAAACTCACAGTTGTCCCAAACCGGACGACTCTGGTTGTGATTCTGA
GTGCCTGCAGTCACTCAGGTCTGGTGGAGGAAGGAGTCAGGTGGTTTGATTCAATGACTG
CTGATTACGGGATCGTTCCCGACCAAGAACATTACGCATGTCTGATAGATCTCCTAGGTC
GTGCCGGTTGCTTTAAAGAGTTGATGAGTAGGATCGAGAAAATGCCTTTTAGACCAGACG
AGCATATTTGGAATGTAATCCTAGGAGTATCTGAGAATTGGGAATCAGTAGAAGAGCTGA
GAGGGATTATGAAGAAGAGAAAGGTGAATAAAGAGAAAGCTCTTAGCTGGATTGAAATAG
AGCAGAAAGTTGAAACTTTCACAGTTCAGACGGTCGGCATCATCGTCGCAAAGAAGAAAT
CTACTCCGTTCTGCATAATCTGGCTGTACTTATGGAAAAAGAAGAAGTTTCAAGAACATG
ATCCTCGAACAACAAGAAGATGCAATTCCTGTAAATTCATGAGGATTGTGCACTACTGTT
AAAAGCCTGCAGAAGAAGAGGGAGTTATACGTGTTGTGGTGACTGGTGATACTTGTTTTT
AGCTTCAAAAGTTTTATAAGTCTAGCAGAGCTAACTAACTACACTGTTCGAATTCTTTCT
TATTTTCCTTCCTGG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL7895Contig1 804 2 4 U
GGATTTGCTTTGTTTTATCTTATCTTTCTCTTCTCTGTCGTCTTGCTTGGAGCTGTGGGA
TGAGCTTCTGATCGTCTGCGGTAGATGGCTTCGATCTGGAGTTTCAGTGAGGTGGGTGGG
CTGTGAATGAACGGAGTCGGCATTTAGGGTTTGGAGGCGGCGATTAGATGTGATTTTCAG
CTTTCTCGATCTAGTCCTCCCTGTCTACGGTGAGAGCGTGTGAACGTGGTTAAAAGGTTA
CTCCTTTCAGATCTGGTGAGCTTGCTGGTCTTCTCTGGGTTTGGAGTGAAGTGGTCCGGT
GTCGTCTGAGTTCTGTCATTGCTCTGTGTGGCGACACCTCCCTCTTCTTCCGCCAAGTAG
TACTTCAGAGCTCATTATGGAGACACGCCTGTGGTGGTCCAGTTATTATGTGGTTGCCAT
CCCATGACAGTGTCATGTTTGGTCGTCGGTTTGTTTCTCGAATGGGCCATCTATAACCTG
TGTTTAGAACTCTCCGTTCACCGTTGCTACTTTGTCTCCTCGTTTCACTCCTCTCTTGTG
CTGTTATATCGTGTCTGATCAATGTGGTTGGCGTTACCAAGGTCTCATCCATTGTAATCT
CTTCTACAAGGCTTTGTAGAGCTCCCATTGGTTCTCGGTGTGAACGCGAGTTAAGGTATA
AGACACATGAATTGTTACCCATTTAGGTTTCTGATCACACATATAATCTTACTTCTAGTT
TATTTCCTCTCTTTTTCACTTTACTCAGTTTATTTCTCCCAAAATTTGTTGGGTATCATT
TTATTTTTTTCAGTGGAAGATTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B717TF U 1
AF RR4BJ26TF U 1
BS 1 685 RR4B717TF
BS 686 686 RR4BJ26TF
BS 687 793 RR4B717TF
BS 794 804 RR4BJ26TF

RD RR4B717TF 793 0 0
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TGAGCTTCTGATCGTCTGCGGTAGATGGCTTCGATCTGGAGTTTCAGTGAGGTGGGTGGG
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CTTCTACAAGGCTTTGTAGAGCTCCCATTGGTTCTCGGTGTGAACGCGAGTTAAGGTATA
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TATTTCCTCTCTTTTTCACTTTACTCAGTTTATTTCTCCCAAAATTTGTTGGGTATCATT
TTATTTTTTTCAG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4BJ26TF 804 0 0
GGATTTGCTTTGTTTTATCTTATCTTTCTCTTCTCTGTCGTCTTGCTTGGAGCTGTGGGA
TGAGCTTCTGATCGTCTGCGGTAGATGGCTTCGATCTGGAGTTTCAGTGAGGTGGGTGGG
CTGTGAATGAACGGAGTCGGCATTTAGGGTTTGGAGGCGGCGATTAGATGTGATTTTCAG
CTTTCTCGATCTAGTCCTCCCTGTCTACGGTGAGAGCGTGTGAACGTGGTTAAAAGGTTA
CTCCTTTCAGATCTGGTGAGCTTGCTGGTCTTCTCTGGGTTTGGAGTGAAGTGGTCCGGT
GTCGTCTGAGTTCTGTCATTGCTCTGTGTGGCGACACCTCCCTCTTCTTCCGCCAAGTAG
TACTTCAGAGCTCATTATGGAGACACGCCTGTGGTGGTCCAGTTATTATGTGGTTGCCAT
CCCATGACAGTGTCATGTTTGGTCGTCGGTTTGTTTCTCGAATGGGCCATCTATAACCTG
TGTTTAGAACTCTCCGTTCACCGTTGCTACTTTGTCTCCTCGTTTCACTCCTCTCTTGTG
CTGTTATATCGTGTCTGATCAATGTGGTTGGCGTTACCAAGGTCTCATCCATTGTAATCT
CTTCTACAAGGCTTTGTAGAGCTCCCATTGGTTCTCGGTGTGAACGCGAGTTAAGGTATA
AGACACATGAATTGTTACCCATTTAGGTTTCTGATCACACATATAATCTTACTTCTAGTT
TATTTCCTCTCTTTTTCACTTTACTCAGTTTATTTCTCCCAAAATTTGTTGGGTATCATT
TTATTTTTTTCAGTGGAAGATTTC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7897Contig1 688 2 4 U
GGGTGCTCTCTCCTCCCTTCTTCACTCTATATTTACCTCTCTTGCCCTAGTGTTTAGGCT
TCTTCTCGATCCGCTTCACATCATGCATCCTTACGATTCACAGTTTTTCCTGACGGTTTC
CCGTTGATTACTTCAGTGGGATCTCGTGAAAGAGGAGTCGCCATTTTTTTTCTTGAAAAG
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GTAGTTTCAACGGATCTGTCTCCTTTTCTGTGTGCTACATTATAGATTTGGGATGCTGGG
TGACTAAACTGAAGACGGGCAGGTTCGCTTGAGTTGTCTAGATGTGCGAGGTGACTCCCA
TGGAGGTAAAGAGATATGGTGACTTTGCGAAGCATTCAGGTTGAGTACACCACGCAATTA
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AAGAAGTGCAAGAGCTAAAGAGGTCAGAAGTGTTTTATCGATGAAAGAGCAAGAGAAAAC
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CGCACCAGTACTTGGTTGATTCTAACTACAAATGAAAGATATGTATATATACTTAGCCAA
TGCTTCATATAATAGAACTACTTCTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF48JQ C 1
AF RR4CF48TF U 1
BS 1 575 RR4CF48TF
BS 576 576 RR4CF48JQ
BS 577 662 RR4CF48TF
BS 663 688 RR4CF48JQ

RD RR4CF48JQ 688 0 0
GGGTGCTCTCTCCTCCCTTCTTCACTCTATATTTACCTCTCTTGCCCTAGTGTTTAGGCT
TCTTCTCGATCCGCTTCACATCATGCATCCTTACGATTCACAGTTTTTCCTGACGGTTTC
CCGTTGATTACTTCAGTGGGATCTCGTGAAAGAGGAGTCGCCATTTTTTTTCTTGAAAAG
TTGTTGAATCAGACGAGTCACTTCCTAAGCTTCGATTACTTGATTGATGCTCATGGGAGA
GTAGTTTCAACGGATCTGTCTCCTTTTCTGTGTGCTACATTATAGATTTGGGATGCTGGG
TGACTAAACTGAAGACGGGCAGGTTCGCTTGAGTTGTCTAGATGTGCGAGGTGACTCCCA
TGGAGGTAAAGAGATATGGTGACTTTGCGAAGCATTCAGGTTGAGTACACCACGCAATTA
TCCAAACTAAACGTAAGCGATGGATACGTAAGCATGTTGCGAGGTCCTTTGCGAAAACTG
AAGAAGTGCAAGAGCTAAAGAGGTCAGAAGTGTTTTATCGATGAAAGAGCAAGAGAAAAC
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CGCACCAGTACTTGGTTGATTCTAACTACAAATGAAAGATATGTATATATACTTAGCCAA
TGCTTCATATAATAGAACTACTTCTTGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4CF48TF 662 0 0
GGGTGCTCTCTCCTCCCTTCTTCACTCTATATTTACCTCTCTTGCCCTAGTGTTTAGGCT
TCTTCTCGATCCGCTTCACATCATGCATCCTTACGATTCACAGTTTTTCCTGACGGTTTC
CCGTTGATTACTTCAGTGGGATCTCGTGAAAGAGGAGTCGCCATTTTTTTTCTTGAAAAG
TTGTTGAATCAGACGAGTCACTTCCTAAGCTTCGATTACTTGATTGATGCTCATGGGAGA
GTAGTTTCAACGGATCTGTCTCCTTTTCTGTGTGCTACATTATAGATTTGGGATGCTGGG
TGACTAAACTGAAGACGGGCAGGTTCGCTTGAGTTGTCTAGATGTGCGAGGTGACTCCCA
TGGAGGTAAAGAGATATGGTGACTTTGCGAAGCATTCAGGTTGAGTACACCACGCAATTA
TCCAAACTAAACGTAAGCGATGGATACGTAAGCATGTTGCGAGGTCCTTTGCGAAAACTG
AAGAAGTGCAAGAGCTAAAGAGGTCAGAAGTGTTTTATCGATGAAAGAGCAAGAGAAAAC
ACCAAAGAGGTGGTGTGTTTACCTGACGTAACGCCCAGCATTAAGAATATTTTGATTGTA
CGCACCAGTACTTGGTTGATTCTAACTACAAATGAAAGATATGTATATATACTTAGCCAA
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL7898Contig1 251 2 1 U
GATTGCTTGGGTTAGAGTTCTTCTCATGAAGTCACAGGATCAATCTTGGCCAGATGTTTC
TTGGGGAATCTTGAACTTGGGTCTTGTGCGCTAAAAAAAACCTATTGCTTATATACCACA
ATAAAAGGTAATCGATGCATGTAGATCATCATCAAAGTCTTGTTGGCTTTATGATAAATG
TAATTCAGAATTGCAACGCCCAAACATATAATTGGTCATTGTACCATAAGAATAATATGA
CAGTTATTTGG


BQ
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AF RR4GN78JQ C 1
AF RR4GN78TF U 1
BS 1 251 RR4GN78TF

RD RR4GN78JQ 251 0 0
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CAGTTATTTGG

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR4GN78TF 251 0 0
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TTGGGGAATCTTGAACTTGGGTCTTGTGCGCTAAAAAAAACCTATTGCTTATATACCACA
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TAATTCAGAATTGCAACGCCCAAACATATAATTGGTCATTGTACCATAAGAATAATATGA
CAGTTATTTGG

QA 1 251 1 251
DS 



AS 1 2

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TTTTCTTCG


BQ
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AF RR4BR46JQ C 1
AF RR4BR46TF U 1
BS 1 489 RR4BR46TF

RD RR4BR46JQ 489 0 0
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TATGTGTACAATTGATACCGATATCAAAATCACAAATTGTTGCAGTGAAAAGAAGACCAG
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TTTTCTTCG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR4BR46TF 489 0 0
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TATGTGTACAATTGATACCGATATCAAAATCACAAATTGTTGCAGTGAAAAGAAGACCAG
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TTTTCTTCG

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 2

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ACGGTGACAGAGGTTGGAATGGAGGAGGTGGCAGTGGTATGACTTCTCGGAGACTAAGCT
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GAATTAGTACGCACGTTGTGTTAACTTTTTGTTAG


BQ
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AF RR4CU13TF U 1
AF RR4CU13JQ C 129
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BS 623 935 RR4CU13JQ

RD RR4CU13TF 622 0 0
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AAAGTTCAATATCTGCAAAAAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4CU13JQ 807 0 0
TTGGAA
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ATAGCTTTACAGCTTCTTTTGAGGCTCAAGAGATACTTAAAAGTCACGTACAGCTTAAAC
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AAACAGAACGTTGCATTTGACCTCAGCGAAACTCGCACCGACTTACCTTCAACATATCAA
GACTTGGTTTTGAGATATCAGGAGTTCAAGAACGCGATGAGAGAAGATACACTTGACTAC
ACCATTTATTCATCAAACGTCAAGAGAAAACGGCCAACGCCAAGAAAAAGTTCAATATTT
GCAAAAAAAGCAGTGGCCTACAGTGAGGACGATGATGATGACGACGACGGTGACAGAGGT
TGGAATGGAGGAGGTGGCAGTGGTATGACTTCTCGGAGACTAAGCTACAGCACCAGAAAT
AGCAACAGAAGGTAATGTCAGACGGCACTTGCTCCTGTTATAAATTACTACTGTATATAC
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TGACAGTGTACAGTATGATTTCTTGCAAAACTTGGAAGACACGAACGAATTAGTACGCAC
GTTGTGTTAACTTTTTGTTAG

QA 7 807 7 807
DS 



AS 1 2

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TGAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGGAGTTTTGTAAAAATATTGTTTTTTCCTT
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BQ
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AF RR4C511TF U 1
AF RR4C511JQ C 363
BS 1 370 RR4C511TF
BS 371 371 RR4C511JQ
BS 372 375 RR4C511TF
BS 376 376 RR4C511JQ
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RD RR4C511TF 478 0 0
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AAGGATCCGAAAAATACTCCGTCGATGAAAGTTGTTCCGAAGGGGCATTTGGTGGTTCAC
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TGAACTAAAAGAAAAGAAAAAAAAAATAGAGGAGTTTTGTAAATATATTGTTTTTTCCTT
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ATT

QA 1 475 1 475
DS 

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AAA
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ATAAACCCGGTATGCCAATTCATAATTGAAAAGAATTATGTTTTAACACTTTT

QA 4 116 4 116
DS 



AS 1 2

CO CL7902Contig1 820 2 2 U
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CGTGTAGTGACCAAATCATACCTTAGTGGTTTAGGAATTAACTGGGCATCTGTTAGAAAT
GTCATGGACATGAAAGCCGTTTATGGAGGATTTGCAGCGGCTCTAAGGGACATGAAAGTG
TGGGTGATGAATGTGGTTCCAATAGACTCACCAGACACTAGCAATAATCTATGAACGAGG
ACTCTTCGGTATCTACCACGACTGGTGTGAATCTTTCAGCACTTATCCGAGATCATACGA
TCTTGTTCACGCCGACCATCTTTTCTCCAAACTCAAACAAAGGTGCAATCTAACGGCTGT
TGTTGCGGAAGTGGATCGGGTTCTGAGACCAGAAGGGAAAATGATAGTCCGGGACGATGC
GAAAACCATACAAGAAGTGGAAGCGATGGTGAAAGCAATGAAATGGGAAGTTCATATGAC
TTACTCTAAAGGAAAAGAAGGTTTGCTTACTGTTCAAAAGTCAATTTGGCGACCTGAAGA
TGTACAAACTCTCGCTTATGCTATCGCCGCTTGAGAACAAACATTGTTCGAGTCCCCCCA
TTCTATTTGTACGTAAACACACATACACACACACACTTATTAACTCGTTATATCATCTTC
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TTGAGTTGAGTCGTTTGTTTGTATGTACTACTCGCACCTGTTTCTCGTCTTGAAGATGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CY05TF U 1
AF RR4CY05JQ C 12
BS 1 668 RR4CY05TF
BS 669 820 RR4CY05JQ

RD RR4CY05TF 675 0 0
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TTCTATTTGTACGTAAACACACATACACACACACACTTATTAACTCGTTATATCATCTTC
CTCCTTTT
GTCGTCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4CY05JQ 809 0 0
AT
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TGGTTCCAATAGACTCACCAGACACTAGCAATAATCTATGAACGAGGACTCTTCGGTATC
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GACCATCTTTTCTCCAAACTCAAACAAAGGTGCAATCTAACGGCTGTTGTTGCGGAAGTG
GATCGGGTTCTGAGACCAGAAGGGAAAATGATAGTCCGGGACGATGCGAAAACCATACAA
GAAGTGGAAGCGATGGTGAAAGCAATGAAATGGGAAGTTCATATGACTTACTCTAAAGGA
AAAGAAGGTTTGCTTACTGTTCAAAAGTCAATTTGGCGACCTGAAGATGTACAAACTCTC
GCTTATGCTATCGCCGCTTGAGAACAAACATTGTTCGAGTCCCCCCATTCTATTTGTACG
TAAACACACATACACACACACACTTATTAACTCGTTATATCATCTTCCTCCTTTTTGTCG
TCTTTTAGGGTTATTCTTCCCATTTTTAGCGTTTTAAGTTTTAACTCTTGAGTTGAGTCG
TTTGTTTGTATGTACTACTCGCACCTGTTTCTCGTCTTGAAGATGCAGAACTTTCTTGTT
TTGTAAATGTTAGATGATTACAGAGCC

QA 3 809 3 809
DS 



AS 1 2

CO CL7903Contig1 658 2 1 U
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ATATTCCTGTTTTAATCTCATCAAAAACCTATAAAATGGCACGTCAATTTGTCATATTGG
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AAAAATCTCCATCACCAACCACTGCCCCAACCAAGGCTCCCGCCGCCCCAACCAAAGCTC
TGGCCGCTGCACCTAAGTCAACCTCAGCCTCTTCTCCTAAAGCATCTTCCCCTGCTGCGG
AAGGACCTGCTGCTGAAGGACCTGCTGCCGAAGATGACTACTCCGCGGCTGGCCCCAGTG
ATGCTAGTGAGGCGCCTGACGTCTCCTCTCCACCTGCTCCTACACCCGATAGCACATCAG
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TATACGTTTATAAATCGAGGTTACCTGGAGTTAATATAAACTCAAGTATCAATAATGA


BQ
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AF RR4A517JQ C 1
AF RR4A517TF U 1
BS 1 658 RR4A517TF

RD RR4A517JQ 658 0 0
TGCAGTAAAAAAATAAAGCAAGATAAAATTAAATAAAAATACTGCTCTAGCTTTTGGAAT
ATATTCCTGTTTTAATCTCATCAAAAACCTATAAAATGGCACGTCAATTTGTCATATTGG
CCCTATTGGCTTTGACTGTGGCCACCGTTTTCGCTGCAGACGCTCCCTCAGCCTCTCCCA
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ATGCTAGTGAGGCGCCTGACGTCTCCTCTCCACCTGCTCCTACACCCGATAGCACATCAG
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CTGTTGCCGGCACTATCATCACCGCCGTCAGCTTCCTCTTATTTTCTCTCTAAGTTTAAA
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QA 1 658 1 658
DS 

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ATATTCCTGTTTTAATCTCATCAAAAACCTATAAAATGGCACGTCAATTTGTCATATTGG
CCCTATTGGCTTTGACTGTGGCCACCGTTTTCGCTGCAGACGCTCCCTCAGCCTCTCCCA
AAAAATCTCCATCACCAACCACTGCCCCAACCAAGGCTCCCGCCGCCCCAACCAAAGCTC
TGGCCGCTGCACCTAAGTCAACCTCAGCCTCTTCTCCTAAAGCATCTTCCCCTGCTGCGG
AAGGACCTGCTGCTGAAGGACCTGCTGCCGAAGATGACTACTCCGCGGCTGGCCCCAGTG
ATGCTAGTGAGGCGCCTGACGTCTCCTCTCCACCTGCTCCTACACCCGATAGCACATCAG
CAGATGGACCAAGTGAGGCAGAGGCACCAAGTAGCAGCGCCGTGGCCACCGTCAGGCTCT
CTGTTGCCGGCACTATCATCACCGCCGTCAGCTTCCTCTTATTTTCTCTCTAAGTTTAAA
GCAGTCCACATTTTGCCAGACAATTATTTTTTGAGATGAGGTCGTAAATGTATCTTATAA
TATACGTTTATAAATCGAGGTTACCTGGAGTTAATATAAACTCAAGTATCAATAATGA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BI96JQ C 1
AF RR4BI96TF U 1
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QA 1 500 1 500
DS 

RD RR4BI96TF 500 0 0
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ACTCAAGGGACATGTTGAATCAGTCGTGAAGCTAAAGGGTTTGGACATTGAAACTCCCGG
ACACTACACTGTCTAAGTCGCAAGCAAAGAAAAAGAAATACCAAACATGTGATTTGATCC
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TTGCATAGGGAGAGAGGGATCTTTGTTTATTTCCATAACTCTTCCCCCATTCCTATTGTT
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QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL7905Contig1 626 2 1 U
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CTTCGGATCCACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCCGTCTCCTGGATCCA
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GAAATAAAAATGTGCGTTTGGGATCT


BQ
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AF RR4AV77JQ C 1
AF RR4AV77TF U 1
BS 1 626 RR4AV77TF

RD RR4AV77JQ 626 0 0
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CTTCGGATCCACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCCGTCTCCTGGATCCA
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ATAACTAAATAAAGACTGCTTACGTGTCGGTGTCTGGTTGGTTTGTCGTTGAGGATTTTG
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GAAATAAAAATGTGCGTTTGGGATCT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4AV77TF 626 0 0
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CTTCGGATCCACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCCGTCTCCTGGATCCA
CGCCTGGACCGTGTCGCATGGGATAATCGTTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCT
CACCGTCACCCGGATCGGTGGCGTCGTCCCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCA
CTGCCCCTCCGTGTGGGAAAGCAAATTCTCGGGTCGGGCGGGAAAATCCGTACCGGGTCT
GGTTCTGGCGATTTGAGGATTTGGTCAGTATTTTCGGTAAGGAAATAGCCACGTGGACTA
ATAACTAAATAAAGACTGCTTACGTGTCGGTGTCTGGTTGGTTTGTCGTTGAGGATTTTG
TGCGGTTGAAGACGCGGTGTGGGCTGCGTTTTGGCTGTCGCTAGTTCTTCATTTGTTTTT
TTTCTTTTCTTATTTGCTTTATAATCGTGCTTTTGTATTTTAGTGGCTACAGCAAACATG
GGGATACCCAAATTGGCTTGTGCCGTTGTGTCTGATGTAACGTTTGGTTATGTTATAATT
GAAATAAAAATGTGCGTTTGGGATCT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7906Contig1 836 2 4 U
GGGTGAATCTTCTTCTCCATCGTTCGAATCGCCCACCTCCTCGCCTCCGATCCGCTCTGC
CGGAGTTCTACAAAAGACCAGACACGTTCAGCCTCTCCTTTGTTTGATGCTGAGAAGGGT
TTCTCTTCATCCTCATCGTTAGACCCAAACGATTCATCGTGAGAAGGGTTTCTTGTGGTC
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CACAGGCTTCTAGCCTTGAAGAAAATCAATATCTTCGAAAGGGAGAAAAGGCAACAACTG
CTTACAGAGATAAGGACGTTGTGTGAAGCTCCTTGTCATGAAGGACTTGTGGATTTCCAC
GGAGTGTTTTATAGTCCTGACTCGGGACAGATCAGCATAGCTCTTGAATATATGGATGGA
GGATCTCTTGCAGATATCTTGAAAGTAACTAAGAAGATACATGAGCCTGTTTTTTCGTCA
ATGTTCCACAAACTCTTGCAAGATGAGAAGAAGCTAAGAGAGGCGCTTCTATTCGCAAAT
GCTTGTGGAGCTATTACTGTAACAGAGAGAGGAGCTATTCCAGCTATATATGCCCACCAT
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CAGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACA
ATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGAAATGTTTGTGTCTGAGTTTCCTATGTTT
TCTACTCTTATGCAATACATTTTTTTATATCTCAAATATAAGAAACACCATTGCAC


BQ
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AF RR4A594TF U 1
AF RR4A594JQ C 29
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BS 655 655 RR4A594JQ
BS 656 659 RR4A594TF
BS 660 836 RR4A594JQ

RD RR4A594TF 659 0 0
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CGGAGTTCTACAAAAGACCAGACACGTTCAGCCTCTCCTTTGTTTGATGCTGAGAAGGGT
TTCTCTTCATCCTCATCGTTAGACCCAAACGATTCATCGTGAGAAGGGTTTCTTGTGGTC
TTTGGAGCTATAGGAAGCGGAGCTAGCAGCGTTGTTCAACTCGCTATTCATATCCCGAAA
CACAGGCTTCTAGCCTTGAAGAAAATCAATATCTTCGAAAGGGAGAAAAGGCAACAACTG
CTTACAGAGATAAGGACGTTGTGTGAAGCTCCTTGTCATGAAGGACTTGTGGATTTCCAC
GGAGTGTTTTATAGTCCTGACTCGGGACAGATCAGCATAGCTCTTGAATATATGGATGGA
GGATCTCTTGCAGATATCTTGAAAGTAACTAAGAAGATACATGAGCCTGTTTTTTCGTCA
ATGTTCCACAAACTCTTGCAAGATGAGAAGAAGCTAAGAGAGGCGCTTCTATTCGCAAAT
GCTTGTGGAGCTATTACTGTAACAGAGAGAGGAGCTATTCCAGCTATATATGCCCACCAT
GAATGCTGTTCAAGACCTTCTCTCTTGTTGGGGAGTAGTGTTGCAAACTGCAGACAATT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4A594JQ 808 0 0
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CAGCCTCTCCTTTGTTTGATGCTGAGAAGGGTTTCTCTTCATCCTCATCGTTAGACCCAA
ACGATTCATCGTGAGAAGGGTTTCTTGTGGTCTTTGGAGCTATAGGAAGCGGAGCTAGCA
GCGTTGTTCAACTCGCTATTCATATCCCGAAACACAGGCTTCTAGCCTTGAAGAAAATCA
ATATCTTCGAAAGGGAGAAAAGGCAACAACTGCTTACAGAGATAAGGACGTTGTGTGAAG
CTCCTTGTCATGAAGGACTTGTGGATTTCCACGGAGTGTTTTATAGTCCTGACTCGGGAC
AGATCAGCATAGCTCTTGAATATATGGATGGAGGATCTCTTGCAGATATCTTGAAAGTAA
CTAAGAAGATACATGAGCCTGTTTTTTCGTCAATGTTCCACAAACTCTTGCAAGATGAGA
AGAAGCTAAGAGAGGCGCTTCTATTCGCAAATGCTTGTGGAGCTATTACTGTAACAGAGA
GAGGAGCTATTCCAGCTATATATGCCCACCATGAATGCTGTTCAAGACCTTCTCTCTTGT
TGGGGAGTAGTGTTGCAAACTGCAGAAAATTGCAGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAA
TTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTTTT
GGGAAATGTTTGTGTCTGAGTTTCCTATGTTTTCTACTCTTATGCAATACATTTTTTTAT
ATCTCAAATATAAGAAACACCATTGCAC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7908Contig1 1313 2 4 U
GGTTGGTCTCAAGAGGAAACAGATGGTTTAAAAGATGCATTAAGCAAGGAGATACTGAAG
CTTAAGGATCAACCTGGTTCAAGACAGAAGTCTATTGCTTTCTTTGAGCATGACAAATCA
AGCGACGAGCTGATACCTGCCTGCATTGAAATCCCCACGGACGGAACTGACGAGTGGGAT
ATTGACCTGAAACAGCTCAAAATAGAAAAGAAAGTGGCATCTGGTTCATATGGGGATCTG
CATAAAGGCACTTATTGCAGTCAGGAAGTTGCTAACAAATTTCTTAGGCCTGAGCGTGTA
AACACAGAGATGCGTAGAGAATTTTCTCAAGAAGTTTATATCATGAGGAAAGTCCGACAT
AAAAACGTTGTTCAGTTTTTGGGTGCATGCACACGATCTCCGACCCTCTGTATTGTGACT
GAGTTTATGTCTCGGGGGAGCATTTATGATTTTCTGCACAAACAGAAATGCGCTTTCAAA
CTTCAGACTTTGCTTAAAGTTGCACTTGATGTTGCAAAAGGGATGTGCTATCTGCATCAG
AACAATATTATTCACAGGGACCTTAAGACTGCAAATCTTCTTATGGATGAACATGGACTT
GTCAAGGTTGCTGATTTTGGAGTTGCCAGAGTACAGATCGAATCACGGGTCATGACAGCT
GAAACAGGGACGTATCGATGGATGGCTCCAGAGGTCATTGAACACAAACCTTACAGTCAC
AAAGCTGATGTGTTCAGTTATGCGATAGTGCTATGGGAACTTTTGACTGGTGATATCCCA
TATGCTTACTTGACTCCACTACAAGCGGCTGTTGGTGTTGTTCATAAGGGGCTTAGACCG
AAGATTCCAAGAAGACGCACCCAAAAGTGAAGGGACTCCTAGAGAGATGCTGGCACCCCG
ACCCAAAAGAAAGACCAGGCTTTGAGGAAATCATAGAAATGCTTCAACAGATAATGATTG
AGGTAAACGTCGCACCGTGATGATGATCCGAGTAAAAAAAAAAAGAACAAAAACCCTTTT
AAGAGGCGAGATTCATCAGAGCAGGATGTGGTGGTGGCGAAAAACAAGCAGTGTTTTAGA
TTCATACAAGCCCTCAAAAAAGCCCCGTTACTAGTTCTGATCAGTTTCGAGGATTAACTC
CCACTCTCTTACATTTTGACTTGTACAGTTTTTCTCTTCTTTTAGTTGTTCTTTGATGAT
TCCTTTCTACCTTAGAAAACACTTTTTTTTTTCTTTTGTTAAAAAAAGGAAGCTTACGTA
TTCATTTGACTACTTTCCATGTCTAAATGTTGGATTGTTACATACTTTCCCCG


BQ
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AF RR4GZ04TF U 1
AF RR4GZ04JQ C 566
BS 1 693 RR4GZ04TF
BS 694 694 RR4GZ04JQ
BS 695 796 RR4GZ04TF
BS 797 1313 RR4GZ04JQ

RD RR4GZ04TF 803 0 0
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CTTAAGGATCAACCTGGTTCAAGACAGAAGTCTATTGCTTTCTTTGAGCATGACAAATCA
AGCGACGAGCTGATACCTGCCTGCATTGAAATCCCCACGGACGGAACTGACGAGTGGGAT
ATTGACCTGAAACAGCTCAAAATAGAAAAGAAAGTGGCATCTGGTTCATATGGGGATCTG
CATAAAGGCACTTATTGCAGTCAGGAAGTTGCTAACAAATTTCTTAGGCCTGAGCGTGTA
AACACAGAGATGCGTAGAGAATTTTCTCAAGAAGTTTATATCATGAGGAAAGTCCGACAT
AAAAACGTTGTTCAGTTTTTGGGTGCATGCACACGATCTCCGACCCTCTGTATTGTGACT
GAGTTTATGTCTCGGGGGAGCATTTATGATTTTCTGCACAAACAGAAATGCGCTTTCAAA
CTTCAGACTTTGCTTAAAGTTGCACTTGATGTTGCAAAAGGGATGTGCTATCTGCATCAG
AACAATATTATTCACAGGGACCTTAAGACTGCAAATCTTCTTATGGATGAACATGGACTT
GTCAAGGTTGCTGATTTTGGAGTTGCCAGAGTACAGATCGAATCACGGGTCATGACAGCT
GAAACAGGGACGTATCGATGGATGGCTCCAGAG*TCATTGAACACAAACCTTACAGTCAC
AAAGCTGATGTGTTCAGTTATGCGATAGTGCTATGGGAACTTTTGACTGGTGATATCCCA
TATGCTTACTTGACTC
ACTACAA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4GZ04JQ 748 0 0
AGACTGCAAATCTTCTTATGGATGAACATGGACTTGTCAAGGTTGCTGATTTTGGAGTTG
CCAGAGTACAGATCGAATCAGGGGTCATGACAGCTGAAACAGGGACGTATCGATGGATGG
CTCCAGAGGTCATTGAACACAAACCTTACAGTCACAAAGCTGATGTGTTCAGTTATGCGA
TAGTGCTATGGGAACTTTTGACTGGTGATATCCCATATGCTTACTTGACTCCACTACAAG
CGGCTGTTGGTGTTGTTCATAAGGGGCTTAGACCGAAGATTCCAAGAAGACGCACCCAAA
AGTGAAGGGACTCCTAGAGAGATGCTGGCACCCCGACCCAAAAGAAAGACCAGGCTTTGA
GGAAATCATAGAAATGCTTCAACAGATAATGATTGAGGTAAACGTCGCACCGTGATGATG
ATCCGAGTAAAAAAAAAAAGAACAAAAACCCTTTTAAGAGGCGAGATTCATCAGAGCAGG
ATGTGGTGGTGGCGAAAAACAAGCAGTGTTTTAGATTCATACAAGCCCTCAAAAAAGCCC
CGTTACTAGTTCTGATCAGTTTCGAGGATTAACTCCCACTCTCTTACATTTTGACTTGTA
CAGTTTTTCTCTTCTTTTAGTTGTTCTTTGATGATTCCTTTCTACCTTAGAAAACACTTT
TTTTTTTCTTTTGTTAAAAAAAGGAAGCTTACGTATTCATTTGACTACTTTCCATGTCTA
AATGTTGGATTGTTACATACTTTCCCCG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7909Contig1 656 2 1 U
GGACGACCGGCTAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTGCTAAAACATGGTGCTCGATGC
TTATGCTTCGTCGAACCCTAATCAGGTTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGATGC
TTGCTACAAGGCAAGAGATGCTTTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACC
AACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCTTTCCAGAACAGA
GTTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAA
CAAGAGAGTCCAGAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTCCC
TCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCCCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGG
AAGATGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATT
ATCTTTGCCGACTTTTTTTCTTATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGT
AAGCTTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTGGTTCTTTTGCTTA
TTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATTAATATAAAATGATTACTTTGTTAG


BQ
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AF RR4CZ87JQ C 1
AF RR4CZ87TF U 1
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RD RR4CZ87JQ 656 0 0
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QA 1 656 1 656
DS 

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QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A467TF U 1
AF RR4A467JQ C 32
BS 1 687 RR4A467TF
BS 688 828 RR4A467JQ

RD RR4A467TF 687 0 0
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AAACCAGGGATGCGTGTTCTTGATGTCGGCTCTGGAACCGGATACTTAACAGCTTGCTTT
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AAGGACTCTGATGGTTCGGTTAGCATC

QA 1 687 1 687
DS 

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AAGGATGGGCTGAGTTTGCACCTTATGATGCTATTCATGTGGGAGCAGCGGCACCGGAGA
TCCCAGAGGCATTGATTGATCAATTGAAACCTGGTGGGAGACTGGTGATCCCGGTTGGCA
ACTTATTCCAAGATCTGCAAGTGGTGGATAAGGACTCTGATGGTTCGGTTAGCATCAGGA
GCGAAACATCAGTTCGTTATGTTCCTTTAACTAGCCGTGAAGCCCAATTGAGAGGGGAGT
GATATGATGATGCTTCTTATACAGAACAATGGATCATGTATGCTTCACTTGGTTTTATAA
ATCAACCTTGTTACTCG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL7911Contig1 627 2 1 U
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TCATAATGGCTCTCTCAAAGTCTCTAGGGTTCCTTCTTCTCGCCGCTTTCTTCGTGTCCT
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AAACCGCACCGACTCCAGATTCCTCCGCCTCGCCTCCATCGCCGCCTGCAGCACACTCTC
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BQ
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AF RR4AK94JQ C 1
AF RR4AK94TF U 1
BS 1 627 RR4AK94TF

RD RR4AK94JQ 627 0 0
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CTACATATTAATATATGAGTTTATCGG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4AK94TF 627 0 0
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TCATAATGGCTCTCTCAAAGTCTCTAGGGTTCCTTCTTCTCGCCGCTTTCTTCGTGTCCT
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AAACCGCACCGACTCCAGATTCCTCCGCCTCGCCTCCATCGCCGCCTGCAGCACACTCTC
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TAACCGCTGCCGTTTTGGCTATGTAGGTTTCTTCTTGGCATGGGTTTTTAGAATAAATTA
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TTTTATTACATCGGATATTCGGATTACTATTTGTTTTTCGTTTTTGTTGATTATGAGTCT
CTACATATTAATATATGAGTTTATCGG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7912Contig1 816 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BJ96TF U 1
AF RR4GD19TF U 89
BS 1 748 RR4BJ96TF
BS 749 816 RR4GD19TF

RD RR4BJ96TF 748 0 0
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TCCGAGAATCAGTCTATCGGTCTCGCTCGTGCTCTCGGCTTGGCCGAAAACCACCTACTC
TACCGAGTTACAAGACCTAAAGGAGGGATACATGAGTGGCTACACTGGCTCCCTGTTGGT
TTTCACAAGAAGCTGGAGTTTATCCTAAGGCATCTTTACCTCTACTCCAGATTGATGCTT
AGGCCCAAACAATGTAAATACATCGCGTCAGAGAATGGTGGCAGCATCAATGTAGGCTTG
TCTTCTGTTCTCGAGGCTGACGTGAAGGAGATTGTCACCATGGCTCGTGAGACCTATGAA
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QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4GD19TF 728 0 0
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TTGTCGTTCCGATACAACATCCTAGATCACACCTGAATAGGTTTGACATGGTGATAACCC
CTCGTCACGACTATTATCCTCTAACCCCCGAAGCGCAAGAGCAAGTTCCTAGATTTTTGC
GTAGTGGATAACTCCTAGTGAACCACCTCAGATCATGTAGTCTTGACTACTGGAGCTCTA
CACAGATC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4H278JQ C 1
AF RR4H278TF U 1
BS 1 708 RR4H278TF

RD RR4H278JQ 708 0 0
GGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACGAAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGTT
GTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCTA
TGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAG
AAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCCA
ACAACCATCAAGAACTTTGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAAC
ATGTACAAGGAGTACCGCGACACAACCTTGAACGGAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGC
ACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTTCCCATTGGTTTTCCGCAAGGTCAGACCA
CCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAA
CAGTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGTTTGGGTTTTAGA
GAATCTTGATGATGGAAGTTTTCTGCTGTTTTGTTTCTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTT
ATCAGCAACATTTTAGTATTATTCATGGAACTGAACTCGACTTTGTCTTGATTTTGTGGT
TCTTGTTTCTTCTTTATTTAGACAAAGTCCCTTTCTTTCTTGATTCCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4H278TF 708 0 0
GGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACGAAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGTT
GTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCTA
TGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAG
AAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCCA
ACAACCATCAAGAACTTTGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAAC
ATGTACAAGGAGTACCGCGACACAACCTTGAACGGAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGC
ACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTTCCCATTGGTTTTCCGCAAGGTCAGACCA
CCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAA
CAGTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGTTTGGGTTTTAGA
GAATCTTGATGATGGAAGTTTTCTGCTGTTTTGTTTCTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTT
ATCAGCAACATTTTAGTATTATTCATGGAACTGAACTCGACTTTGTCTTGATTTTGTGGT
TCTTGTTTCTTCTTTATTTAGACAAAGTCCCTTTCTTTCTTGATTCCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7915Contig1 928 2 8 U
GGGCGAGCGAGCGAGCGAACTTCATCATCTCCCTCGATGCTTTCTCTGCTTCGATGGTAA
CGGTGTCGTTTCCATCTGCCTCGCTCTCTTTCGTAGAGAGCGGGACGACGTGTAAATCGC
CTCAAGTATCTCGGGTTCTGTTCTCTGGTCCTGATGATGAGCTTCACGGAGAGTCGTCTC
AACCCAAGAAGATACTCAGAGATGTTCATATATCAGAGAGGTTGATGGAGGATTTCACTG
AGCTTGCGAGAGAGAACACTGAGAAAGACCTCGAGACTTGTGGAACTCTCGCTGCCTTCC
CCGTAACATTACGTCTTAGTGACTCTCAATCTAAAGTTCCAAGTGATGATATTTTTTTAA
TAAAGTTCATGATTAATGGTTTAGGAAAGCGGAGTTTTTTATGTGACCACTCTGATAATA
CCTAAGCAAGAATCAACTGCTAACTCTGTGAGTGTATCTTAGATTAGAGACTTTCTTGAT
CATTTTTTGTGGTGGCTTAAGTACTAATAAATAATGGGGAGGGGGCAGTGTCAAGCAATG
AATGAAGTGGATGTGTTTTCCATACAAAACGAAAGAGAGCTTTATCCCGTTGGATGGATT
CATACTCATCCTTCTCAGGGTTGTTTCATGTCGTCAGTAGATCTGCATACCCATTACTCG
TATCAGGTAATGGTGCCAGAGGCTTTTGCAATCGTCGTGGCTCCAACCGATAGCTCCAGG
AGTCACGGGATATTTAAGCTAACGGACCCGGGAGGAATGGAGATACTCAGAGGCTGCTCG
GAGACAGGATTCCACCCACACAAAGAACCAGAAGATGGAAACCCGGTTTATGAGCATTGC
TCAAACGTCTACAAGAACTCCAACCTTAGGTTCGAGATTTTCGATCTGCGCTGAGGTAAA
ACAACCCCTTCAGTGGCCTTGTCAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DM57TF U 1
AF RR4DM57JQ C 155
BS 1 619 RR4DM57TF
BS 620 620 RR4DM57JQ
BS 621 666 RR4DM57TF
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BS 668 756 RR4DM57TF
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BS 758 768 RR4DM57TF
BS 769 928 RR4DM57JQ

RD RR4DM57TF 768 0 0
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CGGTGTCGTTTCCATCTGCCTCGCTCTCTTTCGTAGAGAGCGGGACGACGTGTAAATCGC
CTCAAGTATCTCGGGTTCTGTTCTCTGGTCCTGATGATGAGCTTCACGGAGAGTCGTCTC
AACCCAAGAAGATACTCAGAGATGTTCATATATCAGAGAGGTTGATGGAGGATTTCACTG
AGCTTGCGAGAGAGAACACTGAGAAAGACCTCGAGACTTGTGGAACTCTCGCTGCCTTCC
CCGTAACATTACGTCTTAGTGACTCTCAATCTAAAGTTCCAAGTGATGATATTTTTTTAA
TAAAGTTCATGATTAATGGTTTAGGAAAGCGGAGTTTTTTATGTGACCACTCTGATAATA
CCTAAGCAAGAATCAACTGCTAACTCTGTGAGTGTATCTTAGATTAGAGACTTTCTTGAT
CATTTTTTGTGGTGGCTTAAGTACTAATAAATAATGGGGAGGGGGCAGTGTCAAGCAATG
AATGAAGTGGATGTGTTTTCCATACAAAACGAAAGAGAGCTTTATCCCGTTGGATGGATT
CATACTCATCCTTCTCAGG*TTGTTTCATGTCGTCAGTAGATCTGCATACCCATTACTCG
TATCAG*TAATGGTGCCAGAGGCTTTTGCAATCGTCGTGGCTCCAACCGATAGCTCCAGG
AGTCACGGGATATTTAAGCTAACGGACCCGGGAGGA*TGGAGATACTC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4DM57JQ 774 0 0
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AGAGAGGTTGATGGAGGATTTCACTGAGCTTGCGAGAGAGAACACTGAGAAAGACCTCGA
GACTTGTGGAACTCTCGCTGCCTTCCCCGTAACATTACGTCTTAGTGACTCTCAATCTAA
AGTTCCAAGTGATGATATTTTTTTAATAAAGTTCATGATTAATGGTTTAGGAAAGCGGAG
TTTTTTATGTGACCACTCTGATAATACCTAAGCAAGAATCAACTGCTAACTCTGTGAGTG
TATCTTAGATTAGAGACTTTCTTGATCATTTTTTGTGGTGGCTTAAGTACTAATAAATAA
TGGGGAGGGGGCAGTGTCAAGCAATGAATGAAGTGGATGTGTTTTCCATACAAAACGAAA
GAGAGCTTTATCCCGTTGGATGGATTCATACTCATCCTTCTCAGGGTTGTTTCATGTCGT
CAGTAGATCTGCATACCCATTACTCGTATCAGGTAATGGTGCCAGAGGCTTTTGCAATCG
TCGTGGCTCCAACCGATAGCTCCAGGAGTCACGGGATATTTAAGCTAACGGACCCGGGAG
GAATGGAGATACTCAGAGGCTGCTCGGAGACAGGATTCCACCCACACAAAGAACCAGAAG
ATGGAAACCCGGTTTATGAGCATTGCTCAAACGTCTACAAGAACTCCAACCTTAGGTTCG
AGATTTTCGATCTGCGCTGAGGTAAAACAACCCCTTCAGTGGCCTTGTCAGTCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7916Contig1 989 2 2 U
GATATGCCACATGGCACACTTAGAGACCATCTCTACAAGAGAAACAAGGCTTTTGATCCT
CCGTTATCGTGGACACGGAGGTTAGAGATATGCATCGGAGCGGCTCGTGGAATACAGTAT
CTTCATACAGGCGCGAAGCACATGATCATACATAGAGACATCAAAACGACAAACATACTT
GATGAGAACTACATAGCTAAAGTCTCCGACTTTGGGTTATCAAAAGTGGGGCCTACTAGT
GCCTCTCAAACGCACGTCTCGACCGTAGTTAAAGGTTCGTTTGGTTACTTGGACCCTGAG
TACTACCGCCGTCAAGTTTTGACGGAAAAATCTGACGTGTACTCCTTTGGAGTTGTTCTG
TTCGAAGTTCTATGTTGTAGACCGGTGAAACTCGAAAATGTCCCACGAGAAGAAGCAGAT
TTGGTCCGATGGGTGAAGTCAAATTACAAAAACGGGACCGTTGATCAGATCGTTGACGCA
ATCTGACGGCTGATATTACTCATGTGTCATTGGAGAAGTTCTGTGAGATTGCCGTGAGAT
GTGTTCAGGATCGTGGTATCGAACGGCCACCGATGAACGACGTCGTCTGGGCGCTTGAGT
TTGCGCTTCAGCTTCACGAAACTGCTACGGCTAAGAATGGCGTGGACTCTCTGGATCTGC
CGACACGTGGCGAGGTAGGTACGATGACTGAAGGAGAAGATGACTTCTTTAGTAGGATTA
CAGGACACGCGTCGGAATCTACCACTACCGACCATGAGAAGAGCGGATCGAGTTGGGGAG
TATTTTCGGAGATCAAAGAACCTAAAGCACGGTAGACTGTTAAATATGTATCATGTACGT
AATTGTTTAACCAAAACAGTATAATTTAAGTTTTTCTCGTAACTATATTTATGTTTAGTT
AAAAAACAACTATATTTATGTTTTCTTATCAATTATTCACGTACTGGTATTATGGCCCAT
AATGCTTTTGCAAGGCCAGAATCATTGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU84TF U 1
AF RR4DU84JQ C 555
BS 1 625 RR4DU84TF
BS 626 989 RR4DU84JQ

RD RR4DU84TF 625 0 0
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CTTCATACAGGCGCGAAGCACATGATCATACATAGAGACATCAAAACGACAAACATACTT
GATGAGAACTACATAGCTAAAGTCTCCGACTTTGGGTTATCAAAAGTGGGGCCTACTAGT
GCCTCTCAAACGCACGTCTCGACCGTAGTTAAAGGTTCGTTTGGTTACTTGGACCCTGAG
TACTACCGCCGTCAAGTTTTGACGGAAAAATCTGACGTGTACTCCTTTGGAGTTGTTCTG
TTCGAAGTTCTATGTTGTAGACCGGTGAAACTCGAAAATGTCCCACGAGAAGAAGCAGAT
TTGGTCCGATGGGTGAAGTCAAATTACAAAAACGGGACCGTTGATCAGATCGTTGACGCA
ATCTGACGGCTGATATTACTCATGTGTCATTGGAGAAGTTCTGTGAGATTGCCGTGAGAT
GTGTTCAGGATCGTGGTATCGAACGGCCACCGATGAACGACGTCGTCTGGGCGCTTGAGT
TTGCGCTTCAGCTTCACGAAACTGC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4DU84JQ 435 0 0
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GAATCTACCACTACCGACCATGAGAAGAGCGGATCGAGTTGGGGAGTATTTTCGGAGATC
AAAGAACCTAAAGCACGGTAGACTGTTAAATATGTATCATGTACGTAATTGTTTAACCAA
AACAGTATAATTTAAGTTTTTCTCGTAACTATATTTATGTTTAGTTAAAAAACAACTATA
TTTATGTTTTCTTATCAATTATTCACGTACTGGTATTATGGCCCATAATGCTTTTGCAAG
GCCAGAATCATTGTT

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL7917Contig1 758 2 8 U
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ACTTGTTGTTCTGTGATGTTCTGGTCATTTCTGAAACTCGATCACGATGGATGGAGTCGA
TTAGGGCTTTTTATAGAGGGATGGTGAGACCAAAGGCGACTTGGTGGAGGCGAGAGTCGA
CGTTTAGGGTTCATCTTTGCCAGATCCAATTTCCCCCTTTTGAGATCCCCGACTAAAGCT
TCTTGACGACGGCGCGTGACTAGACGTGACAGCTCCTTCGCCTAGGATCCACATGTCCTT
AGCGGCGGTGTGTCTGTAGGAGGAGGTATTAGACTGGCGCTGAAAAGAGGATCGGTCTTC
GATTCTCGAGATCGAAGCACGGCACTGACAACAGACTTACCCTCCGAAGAAAAGGTCCCT
GCCGGATTTTACGTGGTGGAGAAGTACTTACCGGTGCTGGATTGAGCATGAGGTTGATCT
TATATTTCTATCTCCGCACTTTTTCAAACTACAATTTGGAGTCCTAGTTTCTTTGGCCGA
TGTCAAGGCCCAACTTTTATTCCAGAAAGTCTTGTTTGGCTCATGGCTATGTGCCTTAGG
CGAGGTCATATTAGTCCACAAGCTAAAGGCACACTTTGTGGAAACTAATAGTGTTGAAGT
AACTTTAGAAATGACTGAGTCTTCGCTGTTAACAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C625TF U 1
AF RR4C625JQ C 80
BS 1 659 RR4C625TF
BS 660 660 RR4C625JQ
BS 661 688 RR4C625TF
BS 689 689 RR4C625JQ
BS 690 703 RR4C625TF
BS 704 704 RR4C625JQ
BS 705 748 RR4C625TF
BS 749 758 RR4C625JQ

RD RR4C625TF 748 0 0
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CTTTCCTTCCTTCCTCGTTTTTATCTGCTCTCGTCCTCCCTGTCTTTCCTTGGTTAATAT
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TTAGGGCTTTTTATAGAGGGATGGTGAGACCAAAGGCGACTTGGTGGAGGCGAGAGTCGA
CGTTTAGGGTTCATCTTTGCCAGATCCAATTTCCCCCTTTTGAGATCCCCGACTAAAGCT
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AGCGGCGGTGTGTCTGTAGGAGGAGGTATTAGACTGGCGCTGAAAAGAGGATCGGTCTTC
GATTCTCGAGATCGAAGCACGGCACTGACAACAGACTTACCCTCCGAAGAAAAGGTCCCT
GCCGGATTTTACGTGGTGGAGAAGTACTTACCGGTGCTGGATTGAGCATGAGGTTGATCT
TATATTTCTATCTCCGCACTTTTTCAAACTACAATTTGGAGTCCTAGTTTCTTTGGCCGA
TGTCAAGGCCCAACTTTTATTCCAGAAAGTCTTGTTTGGCTCATGGCTATGTGCCTTAG*
CGAGGTCATATTAGTCCACAAGCTAAAG*CACACTTTGTGGAA*CTAATAGTGTTGAAGT
AACTTTAGAAATGACTGAGTCTTCGCTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4C625JQ 679 0 0
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CTAGACGTGACAGCTCCTTCGCCTAGGATCCACATGTCCTTAGCGGCGGTGTGTCTGTAG
GAGGAGGTATTAGACTGGCGCTGAAAAGAGGATCGGTCTTCGATTCTCGAGATCGAAGCA
CGGCACTGACAACAGACTTACCCTCCGAAGAAAAGGTCCCTGCCGGATTTTACGTGGTGG
AGAAGTACTTACCGGTGCTGGATTGAGCATGAGGTTGATCTTATATTTCTATCTCCGCAC
TTTTTCAAACTACAATTTGGAGTCCTAGTTTCTTTGGCCGATGTCAAGGCCCAACTTTTA
TTCCAGAAAGTCTTGTTTGGCTCATGGCTATGTGCCTTAGGCGAGGTCATATTAGTCCAC
AAGCTAAAGGCACACTTTGTGGAAACTAATAGTGTTGAAGTAACTTTAGAAATGACTGAG
TCTTCGCTGTTAACAGTCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL7918Contig1 628 2 1 U
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GCGAACAGGCTCTCTTCCTCATCCACCACCGTCCTTGCTTCCGGTAAGGATGGTGACAAG
GCAATGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAAT
TGATGAAGACAGATTTAAGATTTTTTATTATCTTTGCCATATATAGATTGGTTCGGATAG
GTTGTATCTATGTCGGTGAAATCGAAAGCCTAAGAACCTTAAATAGACGCTATGAGTCTT
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TAGAGATGAATATAGAGGTTTATGTTCATGTTACTGGAAATGACAGAAGCTTTAAGCTCG
GTAATCACATAATCTATTAATGTTTGGG


BQ
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AF RR4C840JQ C 1
AF RR4C840TF U 1
BS 1 628 RR4C840TF

RD RR4C840JQ 628 0 0
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AACTACACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAACAATGTGAGATCCGCTACTCAG
GCGAACAGGCTCTCTTCCTCATCCACCACCGTCCTTGCTTCCGGTAAGGATGGTGACAAG
GCAATGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAAT
TGATGAAGACAGATTTAAGATTTTTTATTATCTTTGCCATATATAGATTGGTTCGGATAG
GTTGTATCTATGTCGGTGAAATCGAAAGCCTAAGAACCTTAAATAGACGCTATGAGTCTT
GGGGTTTTGATGGATTGTTTTGGGGATGCAATTAATGACGGACTCGAATTGTACAGAATG
TAGAGATGAATATAGAGGTTTATGTTCATGTTACTGGAAATGACAGAAGCTTTAAGCTCG
GTAATCACATAATCTATTAATGTTTGGG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4C840TF 628 0 0
GGATCGACAACTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTACAAACAAAACACAAAGCTAAGAGTT
TCTGCAATTAAGCAAAAAAAAACAGAGAAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAAATCGTGGTTA
GTGGCAGCAACCATTGGAGCTGTAGAGGCCTCCAAAGACCAATTAGGTCTATGCAGGTGG
AACTACACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAACAATGTGAGATCCGCTACTCAG
GCGAACAGGCTCTCTTCCTCATCCACCACCGTCCTTGCTTCCGGTAAGGATGGTGACAAG
GCAATGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAAT
TGATGAAGACAGATTTAAGATTTTTTATTATCTTTGCCATATATAGATTGGTTCGGATAG
GTTGTATCTATGTCGGTGAAATCGAAAGCCTAAGAACCTTAAATAGACGCTATGAGTCTT
GGGGTTTTGATGGATTGTTTTGGGGATGCAATTAATGACGGACTCGAATTGTACAGAATG
TAGAGATGAATATAGAGGTTTATGTTCATGTTACTGGAAATGACAGAAGCTTTAAGCTCG
GTAATCACATAATCTATTAATGTTTGGG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL7919Contig1 765 2 2 U
GGTTGTGAAGAGAGGTGTTTTAACATAAAGAAAGAGAGAGAGAAACAAGAAAAAAGAAGA
AAATGGAGAAGAGTGGAGGAAGAAAAGTGATGGATGAGATAAGAAGCTTTGAGAAGGCAA
GCTTGTTCGATCTTGGCCATCCTCTTCTCAACCGCATCGCCGACTCCTTCGTCAAAGCCG
CCGGTGTCGGAGCTTTGCAAGCTGTGTCGAGGGAAGCTTACTTTACAGTGGTCGATGGGA
CAGGTTTTGACTCGAGCAGCATGGGTCCACCGTCTGAGGACACCGGCAGCAAGAAACATA
GGTTCCCTAATCTCAGAGGTGAAAACAACAGCAAATCTCTGGAGGCATTGGTGAAGAATA
CAGGAAAAGAATCTCTCCAATGGGGGCTAGCAGCTGGATTATACTCTGGTATCACTTATG
GTATGAAGGAGGCTCGTGGAGGAGCTCATGATTGGAGAAACAGTGCAGTGGCTGGAGCAT
TGACAGGAGCGGCAATGGCTATGACAACCTCGGAGAGGACAAGCCATGAGCAAGTGGTTC
AGTCTGCTCTTACTGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCTAATCTCCTTTCCAGCGTTTTCT
AGATGATTTTCATTATAAGGTTGTTATTTGTGTTAGTTTTACATAAATATGTCTCCATCT
CCTTTTAAATTTCTCTACGTGCCAGTGAAGACTACGTTTTGTCTGAAACTCAAAACTCAT
GAAGCCACACATCACATATCACATTTTCCTCTGTTTGAATTGTCC


BQ
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AF RR4GU95TF U 1
AF RR4GU95JQ C 131
BS 1 466 RR4GU95TF
BS 467 765 RR4GU95JQ

RD RR4GU95TF 466 0 0
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GCTTGTTCGATCTTGGCCATCCTCTTCTCAACCGCATCGCCGACTCCTTCGTCAAAGCCG
CCGGTGTCGGAGCTTTGCAAGCTGTGTCGAGGGAAGCTTACTTTACAGTGGTCGATGGGA
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CAGGAAAAGAATCTCTCCAATGGGGGCTAGCAGCTGGATTATACTCTGGTATCACTTATG
GTATGAAGGAGGCTCGTGGAGGAGCTCATGATTGGAGAAACAGTGC

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4GU95JQ 635 0 0
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GGCAATGGCTATGACAACCTCGGAGAGGACAAGCCATGAGCAAGTGGTTCAGTCTGCTCT
TACTGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCTAATCTCCTTTCCAGCGTTTTCTAGATGATTTT
CATTATAAGGTTGTTATTTGTGTTAGTTTTACATAAATATGTCTCCATCTCCTTTTAAAT
TTCTCTACGTGCCAGTGAAGACTACGTTTTGTCTGAAACTCAAAACTCATGAAGCCACAC
ATCACATATCACATTTTCCTCTGTTTGAATTGTCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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CATCACTCCTCATAAGTACCCTAACCACACTCTTGATGCTTCCTTGCATTCTTGTTTCCA
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CACTGTCGCTGTTAACGCTGGTGATAGGAAGCTTGGTGAAGCTTGGAGGCACAACAAACG
CATTGATATCGACCGCTAGCATCATGGTGTACCTTAGCTGTTTCGTGATGGGTTTTGGAG
CCATCCCAAACATCCTCTGTTCAGAGATTTTCCCTACCTCTGTGCGTGGCCTCTGCATCA
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TGCTCAAGTCTCTAGGCCTTGCGGGAGTCTTTGGAATTTACGCATGTGTTTGCACCGTAG
CTTGTGTTTTCGTGTACCTCAAGGTACCGGAGACAAAGGGAATGCCCCTTGAAGTTATCT
CTGAGTTCTTCTCTGTTGGTGCAAAACACCAAGATGCTGCTAGCTTCGTTTCTCTTTGAT
GGTCCTTTCCAACTTTCTTGATGTATGTTGAACATTAATAATAATAAACCCTACGGCTAG
CTTGTGCTCCAATAATGCAGGCTACATAGAGGCTTTCTTGGATTGTTGATCTGTAGCTGA
AAATGGGGAGATGTTCTCTTTAATAACAACCATGGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EO64TF U 1
AF RR4EO64JQ C 107
BS 1 655 RR4EO64TF
BS 656 656 RR4EO64JQ
BS 657 680 RR4EO64TF
BS 681 681 RR4EO64JQ
BS 682 722 RR4EO64TF
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BS 724 742 RR4EO64TF
BS 743 760 RR4EO64JQ

RD RR4EO64TF 757 0 0
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CATCACTCCTCATAAGTACCCTAACCACACTCTTGATGCTTCCTTGCATTCTTGTTTCCA
TGAGGTTAATGGATGTATCTGGAAGAAGGTCTCTGTTGCTTTCAACAATCCCCGTTCTAA
CACTGTCGCTGTTAACGCTGGTGATAGGAAGCTTGGTGAAGCTTGGAGGCACAACAAACG
CATTGATATCGACCGCTAGCATCATGGTGTACCTTAGCTGTTTCGTGATGGGTTTTGGAG
CCATCCCAAACATCCTCTGTTCAGAGATTTTCCCTACCTCTGTGCGTGGCCTCTGCATCA
CAATATGTGCGCTCACTTTCTGGATCTGCAACATCATCGTAACTTACACTCTCCCTGTCA
TGCTCAAGTCTCTAGGCCTTGCGGGAGTCTTTGGAATTTACGCATGTGTTTGCACCGTAG
CTTGTGTTTTCGTGTACCTCAAGGTACCGGAGACAAAGGGAATGCCCCTTGAAGTTATCT
CTGAGTTCTTCTCTGTTGGTGCAAAACACCAAGATGCTGCTAGCTTCGTTTCTCTTTGAT
GGTCCTTTCCAACTTTCTTGATGTATGTTGAACATTAATAATAATAAACCCTACG*CTAG
CTTGTGCTCCAATAATGCAG*CTACATAGAGGCTTTCTTGGATTGTTGATCTGTAGCTGA
AA*TGGGGAGATGTTCTCTTTA
TACACCATGGATGAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4EO64JQ 654 0 0
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AGGCACAACAAACGCATTGATATCGACCGCTAGCATCATGGTGTACCTTAGCTGTTTCGT
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TGGCCTCTGCATCACAATATGTGCGCTCACTTTCTGGATCTGCAACATCATCGTAACTTA
CACTCTCCCTGTCATGCTCAAGTCTCTAGGCCTTGCGGGAGTCTTTGGAATTTACGCATG
TGTTTGCACCGTAGCTTGTGTTTTCGTGTACCTCAAGGTACCGGAGACAAAGGGAATGCC
CCTTGAAGTTATCTCTGAGTTCTTCTCTGTTGGTGCAAAACACCAAGATGCTGCTAGCTT
CGTTTCTCTTTGATGGTCCTTTCCAACTTTCTTGATGTATGTTGAACATTAATAATAATA
AACCCTACGGCTAGCTTGTGCTCCAATAATGCAGGCTACATAGAGGCTTTCTTGGATTGT
TGATCTGTAGCTGAAAATGGGGAGATGTTCTCTTTAATAACAACCATGGATGAC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL7921Contig1 964 2 6 U
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AACCGGTCGTCAGCTGGGAGCTAGAATAACGTTTGCAGGGCAAGTAGCTAATCACGTGAA
CACAGTGTCACAAGTGGTGAACATACTCGGAGACGAGAATGAAGCTGCTAATTACCTAAG
TAAATGCATCTACTCTATAGGGTTAGGCAGTAACGACTATCTCAATAACTACTTTATGCC
TCTCTATTACTCCACTGGAAACCAGTACTCCCCAGACTCCTTTGCCAACGACCTCATCAA
ACGATACACCGAACAACTCAGGATATTGTATAACAACGGAGCGAGGAAGTTTGTGCTAAT
TGGTATCGGTGCAATAGGATGTAGCCCTAACGAGCTGGCGCAGAACAGCAGAGACGGGAG
GACATGTGACGAAAGGATCAATTCAGCAAACAGGATCTTTAACAGCAAGCTCGTGTCTCT
GGTCGACTATTTCAACCAAAACACACCGGATGCTAAGTTCACTTACATCAATGCTTATGG
TATCTTCCAGGACATGGTAGCTAATCCTTCTCGCTATGGGTTTAGGGTGACAAACGCGGG
GTGTTGTGGAGTTGGGAGGAACAATGGACAGATAACTTGTCTTCCAGGTCAAGCTCCTTG
TCTGAACAGAGATGAGTTTGTGTTCTGGGATGCGTTTCATCCAGGGGAAGCAGCTAATAT
CGTGATCGGTAGTCGATCTTTAGGAGAGAATCTCCATCTGATGCTCACCCTTATGATATC
CAGCAGCTTGCTTTGCTCTAGCTCATGAAAGTTCTTCCACACAGACAAAGAGAGAAAGAG
AGAGAGAGATTTAATCTTTTGCTTTGTTTGATACTTGTTTTTTTTTTGGTTGCAGAAACT
GTTTCTGGTGTGGTCCGTTGAGCTGATGTATTATGGTTCTATATAATGACATGAATTTGC
TGTC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4H369TF U 1
AF RR4H369JQ C 182
BS 1 647 RR4H369TF
BS 648 648 RR4H369JQ
BS 649 665 RR4H369TF
BS 666 666 RR4H369JQ
BS 667 724 RR4H369TF
BS 725 964 RR4H369JQ

RD RR4H369TF 724 0 0
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AACCGGTCGTCAGCTGGGAGCTAGAATAACGTTTGCAGGGCAAGTAGCTAATCACGTGAA
CACAGTGTCACAAGTGGTGAACATACTCGGAGACGAGAATGAAGCTGCTAATTACCTAAG
TAAATGCATCTACTCTATAGGGTTAGGCAGTAACGACTATCTCAATAACTACTTTATGCC
TCTCTATTACTCCACTGGAAACCAGTACTCCCCAGACTCCTTTGCCAACGACCTCATCAA
ACGATACACCGAACAACTCAGGATATTGTATAACAACGGAGCGAGGAAGTTTGTGCTAAT
TGGTATCGGTGCAATAGGATGTAGCCCTAACGAGCTGGCGCAGAACAGCAGAGACGGGAG
GACATGTGACGAAAGGATCAATTCAGCAAACAGGATCTTTAACAGCAAGCTCGTGTCTCT
GGTCGACTATTTCAACCAAAACACACCGGATGCTAAGTTCACTTACATCAATGCTTATGG
TATCTTCCAGGACATGGTAGCTAATCCTTCTCGCTATGGGTTTAGGGTGACAAACGCGGG
GTGTTGTGGAGTTGGGAGGAACAATGGACAGATAACTTGTCTTCCAG*TCAAGCTCCTTG
TCTGA*CAGAGATGAGTTTGTGTTCTGGGATGCGTTTCATCCAGGGGAAGCAGCTAATAT
CGTG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4H369JQ 783 0 0
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CTCTATTACTCCACTGGAAACCAGTACTCCCCAGACTCCTTTGCCAACGACCTCATCAAA
CGATACACCGAACAACTCAGGATATTGTATAACAACGGAGCGAGGAAGTTTGTGCTAATT
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ACATGTGACGAAAGGATCAATTCAGCAAACAGGATCTTTAACAGCAAGCTCGTGTCTCTG
GTCGACTATTTCAACCAAAACACACCGGATGCTAAGTTCACTTACATCAATGCTTATGGT
ATCTTCCAGGACATGGTAGCTAATCCTTCTCGCTATGGGTTTAGGGTGACAAACGCGGGG
TGTTGTGGAGTTGGGAGGAACAATGGACAGATAACTTGTCTTCCAGGTCAAGCTCCTTGT
CTGAACAGAGATGAGTTTGTGTTCTGGGATGCGTTTCATCCAGGGGAAGCAGCTAATATC
GTGATCGGTAGTCGATCTTTAGGAGAGAATCTCCATCTGATGCTCACCCTTATGATATCC
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GAGAGAGATTTAATCTTTTGCTTTGTTTGATACTTGTTTTTTTTTTGGTTGCAGAAACTG
TTTCTGGTGTGGTCCGTTGAGCTGATGTATTATGGTTCTATATAATGACATGAATTTGCT
GTC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL7922Contig1 799 2 4 U
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GTGAACTATAATACGCTTGAGTTCATAACAGCGTTGTTGCTTCGTGTGAGCCATAAAGCA
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CGAGAGGAGAAGAGACCCGAGTCTTATAGGGAATATTGGAGACGGCCAAGGAGGAGTCCT
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TTTCTCAGTTTCTGGACCAATGATTTTGATCTGGATAATGATTTAACTTATGGTTCCAGT
AAATAAGCTTCGTTTCATATGGTTCTTGTGTAACATTGTTGAAATTTCAGAAGCTGTTCA
AAAATAAGTTCATTTTTAT


BQ
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AF RR4FC34TF U 1
AF RR4FC34JQ C 124
BS 1 618 RR4FC34TF
BS 619 619 RR4FC34JQ
BS 620 752 RR4FC34TF
BS 753 799 RR4FC34JQ

RD RR4FC34TF 758 0 0
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AAGAAAAGCATTGATTTTGAAACTGCTTCTCCATGGGGCTTGCTCTCAGATGAAGGAGAA
GGTGTGGATGCATCTTCATCGATCTCTCTTGATGATATTGTTCAAGTTGATTTTGGTGCG
GTAGACGTTGTGCAGTGCCTGATTAACATCACAATGCGATTTTCACTGATGCAGGGGAGA
CTGTTGGAGGTGAAAAAA*CAACAGTTTTAACTAATCTTTTCTCTGATGATTTTGTGAGA
TTTCTCAGTTTCTGGACCAATGATTTTGATCTGGATAATGATTTAACTTATGGTTCCAGT
AAATAAGCTTCGTTTCATATGGTTCTTGTGTA
CATTGT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4FC34JQ 676 0 0
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AACTATAATACGCTTGAGTTCATAACAGCGTTGTTGCTTCGTGTGAGCCATAAAGCACAA
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GAGGAGAAGAGACCCGAGTCTTATAGGGAATATTGGAGACGGCCAAGGAGGAGTCCTAAG
AAAAGCATTGATTTTGAAACTGCTTCTCCATGGGGCTTGCTCTCAGATGAAGGAGAAGGT
GTGGATGCATCTTCATCGATCTCTCTTGATGATATTGTTCAAGTTGATTTTGGTGCGGTA
GACGTTGTGCAGTGCCTGATTAACATCACAATGCGATTTTCACTGATGCAGGGGAGACTG
TTGGAGGTGAAAAAAACAACAGTTTTAACTAATCTTTTCTCTGATGATTTTGTGAGATTT
CTCAGTTTCTGGACCAATGATTTTGATCTGGATAATGATTTAACTTATGGTTCCAGTAAA
TAAGCTTCGTTTCATATGGTTCTTGTGTAACATTGTTGAAATTTCAGAAGCTGTTCAAAA
ATAAGTTCATTTTTAT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL7923Contig1 632 2 3 U
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AAGCGTAGGGGCATCCATGGAGGAAGATCCAGCTCTGGAATATGAGCTTGCGGCTTTAAG
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GACTTATATGGTCTAAGTGTTTTGATACTTTGTGATCATCTCTCCATGCGTTGGGCTTTG
TTTCTTGCGATCCACTTTTGTGTGTTGTCGTTACCGCGAGGAAGATTTCCTAAGATTCAT
GTTTGTAATAGTTAATCAGAGGAGATGAATATCATCTCCTTACAGGTAAACATAATTTAA
AGTAGATAATTATATACTTCTGTGTATTTGTCAAAAACAAATTTCCAATTACAAAGTGGA
TCATACTTATACGTTGTAAGTTGTAACTGTATTTTTGTTAAATGTTGCATACTTCATCAC
TATAAATTTATAAAATTGAGAGCATTACACAT


BQ
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AF RR4EB90JQ C 1
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DS 

RD RR4EB90TF 632 0 0
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AAGCGTAGGGGCATCCATGGAGGAAGATCCAGCTCTGGAATATGAGCTTGCGGCTTTAAG
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GACTTATATGGTCTAAGTGTTTTGATACTTTGTGATCATCTCTCCATGCGTTGGGCTTTG
TTTCTTGCGATCCACTTTTGTGTGTTGTCGTTACCGCGAGGAAGATTTCCTAAGATTCAT
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TATAAATTTATAAAATTGAGAGCATTACACAT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AB09JQ C 1
AF RR4AB09TF U 1
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QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4AB09TF 631 0 0
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TTTTGTCCTGATATTATCTTTCTCGAGTTCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL7925Contig1 957 2 4 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E411TF U 1
AF RR4E411JQ C 111
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QA 1 775 1 775
DS 

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TCATTCTTTCACTTTTTAGTCTATTTAACGTTTTACGTTGTTACACTGAATTTAAATAAG
AATATGCGTGTGTTTGTCAATATTTTACAATCAAAATTATGAGAGTTTTTAATTACAATA
TAAAAGCAATCACAATAATAGAAATTTATCTTTAATTGATTGAACATAGTCAAAATGTGG
TAAATTTGTTGGTTAGCTAGATTATAGGAAGTAGTAGTTTTAATTTTAATTAAATAAGTA
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TATTGTACAAGTTTAAGGGTTATCTTAATTTGTCTCTATTAATAGATTAGATTCCTCTCG
TGTGTCCATTGATTTTTTGATTTTAGATTAAAGTGTGCACGTTACTCTTTATAATTTATT
AGTATAATATTCTATTATAATATGTAGAGAGTTTAACTCATTATAATTTATTATTCCGTA
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AAAAGTATATGAGTGTGATTGATAAAAGTTAGTGTAACCAGGGGTAAATAAATGGATAAA
CTGAGAC

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 2

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GCTGATTCAGTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FT59TF U 1
AF RR4FT59JQ C 49
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GCTGATTCAGTTCA

QA 1 674 1 674
DS 

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QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B341JQ C 1
AF RR4B341TF U 1
BS 1 642 RR4B341TF

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QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4B341TF 642 0 0
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CACAGCAAGTTCAGGTGGGGATGGAGAATATGCTCAAGCTGGTCAATGAGATCGATGGGA
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ACTTTTCTCAGGTAGGTTTGATGGCAATGACATACCAGGCTACATATTATACAAGGAGCC
AATGAGATCTCAAAGAGCGTTAAAGCAAAGAAGAATGCATGCTCAGATATATCTTGTTTC
TTTCTGGGAAACTGAAGCAATCAATCTAAATGACTTTTTTTTTTTTTTAATATAAATGAC
TTTCAAAGCGTCTCTGTAAACTTCTCCATTTTTTGTCGAAGTTGTGTGTTTTTTCATTCG
TTAATGATATGCTGTAATGGCAGAGAGAGTTATCATCAAAAG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7928Contig1 699 2 2 U
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CTTACATTAATTATATGTTCAACTCAAGTTTTGAGGATC


BQ
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QA 1 626 1 626
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AF RR4GH91JQ C 1
AF RR4GH91TF U 1
BS 1 660 RR4GH91TF

RD RR4GH91JQ 660 0 0
GGGGTTTCGATTTGGTTAGGTTCGGGTCTGGCAGTGTTTAGCCTTTAGGGTTTCTAACGT
TGGAGCTCGTAACTCTACCGAACCTCAAAGTCTCTCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAAGAGTTTAGAAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTG
GAGCGGAGATCATGGTCGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGC
TTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGCGTTCAATCGGCTATGGCTT
CGATTGGTGCTTCTAGGGAGGCTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGG
CTTCTGTTAAAATCAATGCCGCTGATGTTGAGCTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGA
AGAATGTGGTGGAAAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGG
AGCTGCTTTCACGATATCCTCTATGATCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTTT
GAGAGTTTTGAGACACGTGAGATTGTGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTT
CATTTTTGAATCACTCTCTTCCCTTAGTATATAAATCCCTCAATAAAATGTTCGCTCTGG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4GH91TF 660 0 0
GGGGTTTCGATTTGGTTAGGTTCGGGTCTGGCAGTGTTTAGCCTTTAGGGTTTCTAACGT
TGGAGCTCGTAACTCTACCGAACCTCAAAGTCTCTCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAAGAGTTTAGAAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTG
GAGCGGAGATCATGGTCGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGC
TTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGCGTTCAATCGGCTATGGCTT
CGATTGGTGCTTCTAGGGAGGCTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGG
CTTCTGTTAAAATCAATGCCGCTGATGTTGAGCTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGA
AGAATGTGGTGGAAAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGG
AGCTGCTTTCACGATATCCTCTATGATCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTTT
GAGAGTTTTGAGACACGTGAGATTGTGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTT
CATTTCTGAATCACTCTCTTCCCTTAGTATATAAATCCCTCAATAAAATGTTCGCTCTGG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7931Contig1 658 2 2 U
GGAACAACACCCAAAACACAACAAAAAGTTTACACTTCTGAGCCCTAACTCTTTAGTTCA
GCACAAGGAACACAAAACCCATTGATAAAAAATGGCTGATACCCAAAATACCGTTCCGTC
TTCCGACCAGACCATCAGAATCTGGCACCTCAACCTCTGACTCCATTCTCTGCCGTGACC
CCTCACCGTGCTACAGCCCCACGAGCACGCCGCCACATCTCTACCACAACCCTCGAAATG
ATTCTTGAGGAAGATACCGCACCGGAAGAAGATCGTCCTAGCACCGTCGCTGAGATGGAT
ACTCTTGCGGTATTTCCAGCGACCTCTTGTTTCTTGATGGCTAATAAACAAGTCTCTTTC
ATGTTATACGGAAGCTGCAAGTGCCCTTGATAATTTCACTAGAAAGCGACTTAAAAATGG
TGTTTTTATTTTCTTGTACTAGTCAACTTAGTAATATCTGATGTCAGTTTATGGGTCGAT
GCATTGTTTTTACAGAAGTTTCTTTTCTGTTATACTGAAACTGCAAGTCCCCTTGATGTT
TCTTTCACCACAAAGCGATTATGGTGTTTTTTTGGTTTTCTTGTAATAATCAAGTTAGTG
ATGTCTGATGTCCGATAATGGTTGGTCTTTGTTTTAATAGAAGTTGATATATTCCATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AT81TF U 1
AF RR4AY92TF U 1
BS 1 657 RR4AT81TF
BS 658 658 RR4AY92TF

RD RR4AT81TF 657 0 0
GGAACAACACCCAAAACACAACAAAAAGTTTACACTTCTGAGCCCTAACTCTTTAGTTCA
GCACAAGGAACACAAAACCCATTGATAAAAAATGGCTGATACCCAAAATACCGTTCCGTC
TTCCGACCAGACCATCAGAATCTGGCACCTCAACCTCTGACTCCATTCTCTGCCGTGACC
CCTCACCGTGCTACAGCCCCACGAGCACGCCGCCACATCTCTACCACAACCCTCGAAATG
ATTCTTGAGGAAGATACCGCACCGGAAGAAGATCGTCCTAGCACCGTCGCTGAGATGGAT
ACTCTTGCGGTATTTCCAGCGACCTCTTGTTTCTTGATGGCTAATAAACAAGTCTCTTTC
ATGTTATACGGAAGCTGCAAGTGCCCTTGATAATTTCACTAGAAAGCGACTTAAAAATGG
TGTTTTTATTTTCTTGTACTAGTCAACTTAGTAATATCTGATGTCAGTTTATGGGTCGAT
GCATTGTTTTTACAGAAGTTTCTTTTCTGTTATACTGAAACTGCAAGTCCCCTTGATGTT
TCTTTCACCACAAAGCGATTATGGTGTTTTTTTGGTTTTCTTGTAATAATCAAGTTAGTG
ATGTCTGATGTCCGATAATGGTTGGTCTTTGTTTTAATAGAAGTTGATATATTCCAT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4AY92TF 658 0 0
GGAACAACACCCAAAACACAACAAAAAGTTTACACTTCTGAGCCCTAACTCTTTAGTTCA
GCACAAGGAACACAAAACCCATTGATAAAAAATGGCTGATACCCAAAATACCGTTCCGTC
TTCCGACCAGACCATCAGAATCTGGCACCTCAACCTCTGACTCCATTCTCTGCCGTGACC
CCTCACCGTGCTACAGCCCCACGAGCACGCCGCCACATCTCTACCACAACCCTCGAAATG
ATTCTTGAGGAAGATACCGCACCGGAAGAAGATCGTCCTAGCACCGTCGCTGAGATGGAT
ACTCTTGCGGTATTTCCAGCGACCTCTTGTTTCTTGATGGCTAATAAACAAGTCTCTTTC
ATGTTATACGGAAGCTGCAAGTGCCCTTGATAATTTCACTAGAAAGCGACTTAAAAATGG
TGTTTTTATTTTCTTGTACTAGTCAACTTAGTAATATCTGATGTCAGTTTATGGGTCGAT
GCATTGTTTTTACAGAAGTTTCTTTTCTGTTATACTGAAACTGCAAGTCCCCTTGATGTT
TCTTTCACCACAAAGCGATTATGGTGTTTTTTTGGTTTTCTTGTAATAATCAAGTTAGTG
ATGTCTGATGTCCGATAATGGTTGGTCTTTGTTTTAATAGAAGTTGATATATTCCATT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL7932Contig1 656 2 1 U
GGCCTTAGCCAAACGGGAAGCTTACAGATATTCCGAGCTCTGTTCGCCGCCTTAGAGTCA
ATCCTCCGTCACCGGAATTTACACCCCTGTTTCTTCCAGATTCGTGGTTACAAAGGGGGG
AGATACATAAAAGGATGAGTGGGTTCAGAGCATTCAAAGCACAGGTGCCCATTAAGTGGA
GCGAGAGCTTGTACATAACCTTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGC
GTACACTCGAGGCTATGGGATTCCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTT
CTTCCATTAGAGGAATGATTCAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGA
TGTTCAAAGCTCGCAAAGAAGCTGAAGCTAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTG
TCAGCCATTCAAGCCCTGCAACGGGCTCATCCAACATGTCTTAGAGGATTTCAGAAGATG
GTAGAGCTCTTCAACCGTTTGTTTAATTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAG
TGACGCGATAAGAAATTTCGTTATCAGTGAATTTGGTGCCTCATTGTGTACACTAGGCTG
GGTACTTGTGTATGTTTACTCTCATTTTGTCAAATCTCGAATCCACCAGTTTGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H182JQ C 1
AF RR4H182TF U 1
BS 1 656 RR4H182TF

RD RR4H182JQ 656 0 0
GGCCTTAGCCAAACGGGAAGCTTACAGATATTCCGAGCTCTGTTCGCCGCCTTAGAGTCA
ATCCTCCGTCACCGGAATTTACACCCCTGTTTCTTCCAGATTCGTGGTTACAAAGGGGGG
AGATACATAAAAGGATGAGTGGGTTCAGAGCATTCAAAGCACAGGTGCCCATTAAGTGGA
GCGAGAGCTTGTACATAACCTTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGC
GTACACTCGAGGCTATGGGATTCCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTT
CTTCCATTAGAGGAATGATTCAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGA
TGTTCAAAGCTCGCAAAGAAGCTGAAGCTAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTG
TCAGCCATTCAAGCCCTGCAACGGGCTCATCCAACATGTCTTAGAGGATTTCAGAAGATG
GTAGAGCTCTTCAACCGTTTGTTTAATTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAG
TGACGCGATAAGAAATTTCGTTATCAGTGAATTTGGTGCCTCATTGTGTACACTAGGCTG
GGTACTTGTGTATGTTTACTCTCATTTTGTCAAATCTCGAATCCACCAGTTTGGTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4H182TF 656 0 0
GGCCTTAGCCAAACGGGAAGCTTACAGATATTCCGAGCTCTGTTCGCCGCCTTAGAGTCA
ATCCTCCGTCACCGGAATTTACACCCCTGTTTCTTCCAGATTCGTGGTTACAAAGGGGGG
AGATACATAAAAGGATGAGTGGGTTCAGAGCATTCAAAGCACAGGTGCCCATTAAGTGGA
GCGAGAGCTTGTACATAACCTTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGC
GTACACTCGAGGCTATGGGATTCCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTT
CTTCCATTAGAGGAATGATTCAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGA
TGTTCAAAGCTCGCAAAGAAGCTGAAGCTAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTG
TCAGCCATTCAAGCCCTGCAACGGGCTCATCCAACATGTCTTAGAGGATTTCAGAAGATG
GTAGAGCTCTTCAACCGTTTGTTTAATTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAG
TGACGCGATAAGAAATTTCGTTATCAGTGAATTTGGTGCCTCATTGTGTACACTAGGCTG
GGTACTTGTGTATGTTTACTCTCATTTTGTCAAATCTCGAATCCACCAGTTTGGTT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL7933Contig1 900 2 4 U
GGTAAACTCTGTGTTCGACAATCAATTCCCAGCTGCAATTAAAAGACTGCAGTTCGACAA
GCATCTCTCCATGGACAATGTGCGTAAACTGATCACTGAAACAGACGGATATCAACCGCA
TCTCATAGCTCCTGAACAAGGTTACCGCCGTCTCATAGAATCATGCTTAGTCTCCATTAG
AGGCCCAGCTGAAGCAGCTGTTGACGCGGTTCATTCCATTCTCAAGGATCTTATCCACAA
ATCCATCAGCGAAACATCTGAGCTGAAGCAATACCCAACACTGAGAGTTGAAGTATCAGG
CGCGGCGGTGGATTCACTGGATCGAATGAGAGACGAGAGCAGGAAAGCAACTCTGTTGCT
AGTGGACATGGAGTCTGGCTACTTAACAGTCGAATTCTTCAGGAAGCTCCCACAAGATTC
TGAGAAAGGAGGGAATCCGACACATTCGATATTCGACAGGTACAACGACGCTTACCTCAG
AAGAATCGGTTCCAATGTTCTGTCTTACGTGAACATGGTCTGCGCTGGATTGAGAAACTC
CATCCCGAAATCCATCGTTTACTGTCAAGTCCGTGAAGCGAAACGAAGCCTTCTTGATAT
CTTCTTCACTGAGCTTGGCCAGAAAGAGATGAGTAAGCTGTCGAAGCTGTTGGATGAGGA
TCCTGCGGTTCAGCAGAGAAGGACTTCGATTGCAAAGAGGCTGGAACTGTATCGAAGTGC
TCAAACAGATATTGAAGCAGTTGCTTGGTCCAAGTAGAGAGAGTGTTTCTTTATGACACG
TTCTTTTTTTCCATTCTTTTTTCAAACATTATTACACGTTCTTTTATCTCTATTGTAACT
GTTTTATTTTATTCGTTGTTCGAGTTAACATTGTTTCAGAATAATGAGTTTTGTCAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DT17TF U 1
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4G221JQ C 1
AF RR4G221TF U 1
BS 1 656 RR4G221TF

RD RR4G221JQ 656 0 0
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DS 

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GGTGGAACTCCAGTAGTTAGAAAACTCTACCCGAGATCTGTTACTCCTGATTCCGCAAAG
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QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4H113TF U 1
AF RR4H113JQ C 270
BS 1 335 RR4H113TF
BS 336 1020 RR4H113JQ

RD RR4H113TF 335 0 0
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GGCGAAAAGTTTATATGTGAGATATCAGATTCTCCACTCAAAAAAAGAAAAGATTCAACC
TTTTGGGGAAGAAGGTAGAAGGAAGCACATCTCAAGAAGACGCGGCAGTGTAGTGTAGCT
TATCTCTCTTTCCCCCCTTTGGTAATCGTTTAAACTTGAACTCGTTCTTGCAGCAATTAG
TGTTTCAGACATGGGCTACTATAACAATGTTTTTGATGGATGCAATGACCAAACTGATAT
CGGTGCTGTTATGCGCGATGGAAGGGAAGTCATTC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR4H113JQ 751 0 0
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TCCTGGATTTAACTATAAATAATGTTCCACC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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GTGTGTCTCTGTAATACTGAATTATCAAAGACTTGGTATGGGATGTGGGACAAGTTATCT
AATTTCACCTTTTTATTATTGT


BQ
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AF RR4EG82JQ C 1
AF RR4EG82TF U 1
BS 1 622 RR4EG82TF

RD RR4EG82JQ 622 0 0
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TTGTGACTAAGCGCGGCTCGAAAGTTGTTGGATACGCCTATAAAGGGGCGTTTTGTGGTA
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GTGTGTCTCTGTAATACTGAATTATCAAAGACTTGGTATGGGATGTGGGACAAGTTATCT
AATTTCACCTTTTTATTATTGT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4EG82TF 622 0 0
GGACAGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAGGTTCCTGGGAAGCACGTTGGCTAAGTCTTGT
GGCAAGGGGAGGCTGCAGTGTCGTGATTTTTCATCCGTCGATGAGAAAGGTATCTCATTT
ATTTGCACAGCAATATCTATCACCGTCAATCAATTATGTATTATCTGACTTGTATTTTTT
TTTGAACACATCTGACTTGTATTTAAAATTGGTATTTTGCAATCAAATTTTGTGTGTTAG
TTGTGACTAAGCGCGGCTCGAAAGTTGTTGGATACGCCTATAAAGGGGCGTTTTGTGGTA
TTGGATACGTGATTGGTATGATGTTGATTTGTTAGCATTTTGTTTGTTGATAATCTTGTT
CCTTTTTTAACATGTTCGTCTGGTTTGTTTAAGGTGGCTTAACGACAAACTCTGTCTCGG
CGCAAGTTCAGGGAGTTGAGGAGAGACTGCTGGAAGTATCGAAAAGCTGTGATGAAACCG
AAGCAGCGTTGGAGGCACGAATGAAGAACTGGAAGACGAAGAATATCTAATTTTACTTTT
GTGTGTCTCTGTAATACTGAATTATCAAAGACTTGGTATGGGATGTGGGACAAGTTATCT
AATTTCACCTTTTTATTATTGT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL7937Contig1 943 2 4 U
GAGGTGGAGGAGACCACGACGACGATGATGCTCCGCACGCCAAGAGTACCGAACTCAAAT
CAAAATCCTTAATCACTGTCAAAATAGCGTGTCTTGTCATCATCTTTGTGCTCACGTTCA
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AGACGTTTCGGGATTTGCTGACCAAGGAAGGAGAGTCGGAGCCGTCTCCGGCTTACCCAT
TCGCGTTCATGTTGGCCTGTGCTGGTTATATGCTGACCATGCTCGCTGATTCCGTCATCG
CTCATGTCTACTCCAAGACCCCATCCAAAGACGTCGAGGAGCTTCAAGGAGAAGAGAAAC
CGAACCAGGGTTCAGGTATAGGAGATAGCATTCTACTGATCGTAGCTCTGTGTTTCCACT
CTGTATTCGAAGGGATAGCCATAGGGATCTCAGAGAGTAAAGCAGATGCGTGGAGAGCTC
TATGGACAATAACACTCCACAAGATATTCCAGCGATAGCAATGGGGATAGCTCTTCTCCG
TATGATCCCTGACCGTCCTCTCTTCTCCACCATCATCTATTCTTTCGCATTCGCCATCTC
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GGATTGGATATTCGCAGTGTCTATGAGCTTGGCGTGCGGGGTGTTCGTTTACGTGTCAGT
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CTTTAAGTTTTTGGCTGTTTTGTCTGGAGTTGTTGTCATCGCCATTGTTATGATTTGGGA
CACTTGAATTGTCTACTCAAAAACTACTACAGATTTTAGAATC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BC63TF U 1
AF RR4BC63JQ C 71
BS 1 671 RR4BC63TF
BS 672 672 RR4BC63JQ
BS 673 706 RR4BC63TF
BS 707 943 RR4BC63JQ

RD RR4BC63TF 706 0 0
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CAAAATCCTTAATCACTGTCAAAATAGCGTGTCTTGTCATCATCTTTGTGCTCACGTTCA
TCAGCGGCGTATCTCCTTATTTCCTGAAATGGAGCCAAGGGTTTCTGGTCCTTGGAACAC
AGTTCGCAGGAGGAGTGTTTCTCGCGACGGCCCTGATGCATTTCTTGCCAGATGCCGACG
AGACGTTTCGGGATTTGCTGACCAAGGAAGGAGAGTCGGAGCCGTCTCCGGCTTACCCAT
TCGCGTTCATGTTGGCCTGTGCTGGTTATATGCTGACCATGCTCGCTGATTCCGTCATCG
CTCATGTCTACTCCAAGACCCCATCCAAAGACGTCGAGGAGCTTCAAGGAGAAGAGAAAC
CGAACCAGGGTTCAGGTATAGGAGATAGCATTCTACTGATCGTAGCTCTGTGTTTCCACT
CTGTATTCGAAGGGATAGCCATAGGGATCTCAGAGAGTAAAGCAGATGCGTGGAGAGCTC
TATGGACAATAACACTCCACAAGATATTCCAGCGATAGCAATGGGGATAGCTCTTCTCCG
TATGATCCCTGACCGTCCTCTCTTCTCCACCATCATCTATTCTTTCGCATTCGCCATCTC
CAGCCCAATAG*TGTTGGGATCGGAATAGTGATAGACGCGACGACG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4BC63JQ 873 0 0
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ATCTCCTTATTTCTTGAAATGGAGCCAAGGGTTTCTGGTCCTTGGAACACAGTTCGCAGG
AGGAGTGTTTCTCGCGACGGCCCTGATGCATTTCTTGCCAGATGCCGACGAGACGTTTCG
GGATTTGCTGACCAAGGAAGGAGAGTCGGAGCCGTCTCCGGCTTACCCATTCGCGTTCAT
GTTGGCCTGTGCTGGTTATATGCTGACCATGCTCGCTGATTCCGTCATCGCTCATGTCTA
CTCCAAGACCCCATCCAAAGACGTCGAGGAGCTTCAAGGAGAAGAGAAACCGAACCAGGG
TTCAGGTATAGGAGATAGCATTCTACTGATCGTAGCTCTGTGTTTCCACTCTGTATTCGA
AGGGATAGCCATAGGGATCTCAGAGAGTAAAGCAGATGCGTGGAGAGCTCTATGGACAAT
AACACTCCACAAGATATTCCAGCGATAGCAATGGGGATAGCTCTTCTCCGTATGATCCCT
GACCGTCCTCTCTTCTCCACCATCATCTATTCTTTCGCATTCGCCATCTCCAGCCCAATA
GGTGTTGGGATCGGAATAGTGATAGACGCGACGACGCAAGGGACGGTGGCGGATTGGATA
TTCGCAGTGTCTATGAGCTTGGCGTGCGGGGTGTTCGTTTACGTGTCAGTGAATCATTTG
TTGGCCAAAGGGTATATTCCGAACAAAAAGGTTAATGTGGATCAGCCTAGCTTTAAGTTT
TTGGCTGTTTTGTCTGGAGTTGTTGTCATCGCCATTGTTATGATTTGGGACACTTGAATT
GTCTACTCAAAAACTACTACAGATTTTAGAATC

QA 1 873 1 873
DS 



AS 1 2

CO CL7938Contig1 627 2 1 U
GGAGACTTGCGGCGGCGGGGAAGATGCAGATATTCGTGAAAACGCTAACGGGCAAGACCA
TCACCCTCGAGGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAATGTCAAGGCTAAGATCCATGACA
AAGAAGGAATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATATTCGCCGGAAAACAGCTTGAAGATG
GTCGTACCTTGGCTGACTATAACATCCAGAAAGAGTCGACTCTGCATCTTGTTCTGAGGC
TAAGGGGAGGTATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCCCGTAAGTATAATCAAGACA
AGATGATCTGTCGCAAGTGTTACGCTCGTCTACACCCGAGGGCTGTGAACTGCAGGAAGA
AGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCGAAGAAGAAGATCAAGTGATCTGTTTTAT
CACCAGAAGCTCATTTATCTATGTTATATTTTTGTGTGTTTCCTCAATCTTGTTTTGATA
CGAACTCGTTTCAGTGGATTTTAGTCCTAAAAGATTATTAGTAATTCTGATTGTTTTTTT
TTGCGGTTTTAATAATTCGAAAATGTGACACAAACTAGTTTCGGTGGATTGCCGCGCATT
ATATTTTCCTTATAGGTTGATTGAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AN10JQ C 1
AF RR4AN10TF U 1
BS 1 627 RR4AN10TF

RD RR4AN10JQ 627 0 0
GGAGACTTGCGGCGGCGGGGAAGATGCAGATATTCGTGAAAACGCTAACGGGCAAGACCA
TCACCCTCGAGGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAATGTCAAGGCTAAGATCCATGACA
AAGAAGGAATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATATTCGCCGGAAAACAGCTTGAAGATG
GTCGTACCTTGGCTGACTATAACATCCAGAAAGAGTCGACTCTGCATCTTGTTCTGAGGC
TAAGGGGAGGTATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCCCGTAAGTATAATCAAGACA
AGATGATCTGTCGCAAGTGTTACGCTCGTCTACACCCGAGGGCTGTGAACTGCAGGAAGA
AGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCGAAGAAGAAGATCAAGTGATCTGTTTTAT
CACCAGAAGCTCATTTATCTATGTTATATTTTTGTGTGTTTCCTCAATCTTGTTTTGATA
CGAACTCGTTTCAGTGGATTTTAGTCCTAAAAGATTATTAGTAATTCTGATTGTTTTTTT
TTGCGGTTTTAATAATTCGAAAATGTGACACAAACTAGTTTCGGTGGATTGCCGCGCATT
ATATTTTCCTTATAGGTTGATTGAAAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR4AN10TF 627 0 0
GGAGACTTGCGGCGGCGGGGAAGATGCAGATATTCGTGAAAACGCTAACGGGCAAGACCA
TCACCCTCGAGGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAATGTCAAGGCTAAGATCCATGACA
AAGAAGGAATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATATTCGCCGGAAAACAGCTTGAAGATG
GTCGTACCTTGGCTGACTATAACATCCAGAAAGAGTCGACTCTGCATCTTGTTCTGAGGC
TAAGGGGAGGTATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCCCGTAAGTATAATCAAGACA
AGATGATCTGTCGCAAGTGTTACGCTCGTCTACACCCGAGGGCTGTGAACTGCAGGAAGA
AGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCGAAGAAGAAGATCAAGTGATCTGTTTTAT
CACCAGAAGCTCATTTATCTATGTTATATTTTTGTGTGTTTCCTCAATCTTGTTTTGATA
CGAACTCGTTTCAGTGGATTTTAGTCCTAAAAGATTATTAGTAATTCTGATTGTTTTTTT
TTGCGGTTTTAATAATTCGAAAATGTGACACAAACTAGTTTCGGTGGATTGCCGCGCATT
ATATTTTCCTTATAGGTTGATTGAAAT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7939Contig1 672 2 2 U
GGGGTTACTCTCGACCTTCTTCTTCTTCAGAAACAAACAAGATGATGAACACTCCAAACA
TTTCAGACAACTCTAACACCAAACTTTCATGTTCTGTTCAATCCCCCAAGACATTTCATT
TCTCGAACCCAATTCCTCTGTCTCTCGAAATCCAGAGATGGAAACTCTGACTCAGAGTCT
GATCCGGATCCTCCGAAACCAGAAGGAGATACACAGAGACAAGAGCTCTTAGCCAGGATC
GCCATGCTTCAGACATCCAAGGTCCGTTTAACTGATTTCTTGGACGAACGATCAGATTAT
CTCACCAAGTTTGCTGAAGAAGCCAACGCTGAGTTTGACAAAGTTGGAGAAGACGCCATG
AAAGACCTCGACGAAGCAAGCTCAAGGATACTATAGAACATCGAGAGCAAGATGCAAGCT
TTTGAGTAATCTGTGGGATTAAACAGATTGGAGATAGAGGAGAACGATAACAAGTTGGCC
GAGTTTGAAGAGAAGATTGTGGAAGAGAGGAACGAAGGATTGTTCTTCAAGAGCTTACGT
GATAAGAAGCCTGTGGATGTAGAGAAAGCTAAAGAGGAGACTGAGAGAATACAAGAGGTC
ACCAAAGAAAGTGCAGGATCAGAGTCAAGAAGGAACATTTACCTCGGTTTAATTGGGGAT
CGTGGGCTCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GP67TF U 1
AF RR4GP67JQ C 218
BS 1 631 RR4GP67TF
BS 632 672 RR4GP67JQ

RD RR4GP67TF 631 0 0
GGGGTTACTCTCGACCTTCTTCTTCTTCAGAAACAAACAAGATGATGAACACTCCAAACA
TTTCAGACAACTCTAACACCAAACTTTCATGTTCTGTTCAATCCCCCAAGACATTTCATT
TCTCGAACCCAATTCCTCTGTCTCTCGAAATCCAGAGATGGAAACTCTGACTCAGAGTCT
GATCCGGATCCTCCGAAACCAGAAGGAGATACACAGAGACAAGAGCTCTTAGCCAGGATC
GCCATGCTTCAGACATCCAAGGTCCGTTTAACTGATTTCTTGGACGAACGATCAGATTAT
CTCACCAAGTTTGCTGAAGAAGCCAACGCTGAGTTTGACAAAGTTGGAGAAGACGCCATG
AAAGACCTCGACGAAGCAAGCTCAAGGATACTATAGAACATCGAGAGCAAGATGCAAGCT
TTTGAGTAATCTGTGGGATTAAACAGATTGGAGATAGAGGAGAACGATAACAAGTTGGCC
GAGTTTGAAGAGAAGATTGTGGAAGAGAGGAACGAAGGATTGTTCTTCAAGAGCTTACGT
GATAAGAAGCCTGTGGATGTAGAGAAAGCTAAAGAGGAGACTGAGAGAATACAAGAGGTC
ACCAAAGAAAGTGCAGGATCAGAGTCAAGAA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4GP67JQ 455 0 0
GAGACAGAGCTC
TAGCCAGGATCGCCATGCTTCAGACATCCAAGGTC*GTTTAACTGATTTCTTGGACGAAC
GATCAGATTATCTCACCAAGTTTGCTGAAGAAGCCAACGCTGAGTTTGACAAAGTTGGAG
AAGACGCCATGAAAGACCTCGACGAAGCAAGCTCAAGGATACTATAGAACATCGAGAGCA
AGATGCAAGCTTTTGAGTAATCTGTGGGATTAAACAGATTGGAGATAGAGGAGAACGATA
ACAAGTTGGCCGAGTTTGAAGAGAAGATTGTGGAAGAGAGGAACGAAGGATTGTTCTTCA
AGAGCTTACGTGATAAGAAGCCTGTGGATGTAGAGAAAGCTAAAGAGGAGACTGAGAGAA
TACAAGAGGTCACCAAAGAAAGTGCAGGATCAGAGTCAAGAAGGAACATTTACCTCGGTT
TAATTGGGGATCGTGGGCTCTAG

QA 13 455 13 455
DS 



AS 1 2

CO CL7940Contig1 822 2 4 U
GGGAGAATAACGTTGATGATGAGGATAAGATTGGGAGAGTGGTTCCGGATGTGGAAGTCT
CCAACTCGCATGATTTGGTACTCTATTGTGATGATCAAATGCAAAGACAGACCGAAGCTT
CTCTTTGATACTGTTTTTACTTTGACGGATATGAAGTACGTGGTCTCGCATGCCAGCATT
GATGCTGAAGGCCCTGAAGCTTATCAGGAGTACTACATAAGACATACGGATGGATCTCCT
GTGAAGTCTGAGGCAGAGAGACAGAGAGTCATCAAGTGTCTTAAAGCAGCTATTCAGAGA
AGAGTCTTTGAGGGTTTGATGCTTGAGCTTTGTACTTCAGATAGGGTTGGATTACTATCA
GACGTGACTCGGATATTCCGTGAGAACAGTCTAACGGTAACAAGAGCTGAAGTGAAAACA
AAAGGAGGCAAAGCGCTCAACACGTTCTACGTGAGGGATGCGTCTGGTTATGAAGTTGAT
GCTAAGACCATAGATTCAATCAGACAAGTGATTGGTCAGAAGATTCTTCAGGTGAAAGGG
GGAAACACAGAGGTTAAACCGAGTTCTCAAGAATCTCAAACGGGGTTTCTCTTTGGGGTT
TTCAAGTCTAGATCTTTCGTCAATTTCGGGTTGATCAGATCTTAAACATATAGTATTACT
CTTTAATCTGTAAATGACAGAAGTAAAGTAGTACATTGTGTGAATGTGTAGAAGAAGGAG
AAGCTTTTAGAAATGAAAGTTTAGATTCTTACAGGGGGGCTTTTTAAGTAATATTTTGTG
TACTTTTACATTGGTGGATGTATATATATATAATTGGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GI61TF U 1
AF RR4GI61JQ C 52
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BS 602 602 RR4GI61JQ
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RD RR4GI61TF 712 0 0
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CTCTTTGATACTGTTTTTACTTTGACGGATATGAAGTACGTGGTCTCGCATGCCAGCATT
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GTGAAGTCTGAGGCAGAGAGACAGAGAGTCATCAAGTGTCTTAAAGCAGCTATTCAGAGA
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GGAAACACAGAGGTTAAACCGAGTTCTCAAGAATCTCAAACGGGGTTTCTCTTTGGGGTT
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QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4GI61JQ 771 0 0
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TTACTATCAGACGTGACTCGGATATTCCGTGAGAACAGTCTAACGGTAACAAGAGCTGAA
GTGAAAACAAAAGGAGGCAAAGCGCTCAACACGTTCTACGTGAGGGATGCGTCTGGTTAT
GAAGTTGATGCTAAGACCATAGATTCAATCAGACAAGTGATTGGTCAGAAGATTCTTCAG
GTGAAAGGGGGAAACACAGAGGTTAAACCGAGTTCTCAAGAATCTCAAACGGGGTTTCTC
TTTGGGGTTTTCAAGTCTAGATCTTTCGTCAATTTCGGGTTGATCAGATCTTAAACATAT
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AAGAAGGAGAAGCTTTTAGAAATGAAAGTTTAGATTCTTACAGGGGGGCTTTTTAAGTAA
TATTTTGTGTACTTTTACATTGGTGGATGTATATATATATAATTGGATTAC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

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CATCATCATCCCAACAATTTGGTTCTCCGCCACGTAGAGCATCCGTCAGGTTACCCTTAA
CATCTACGCCGAAGTTTCGGCTACTTAAACTCCGAAAGTTCCAATCTTTATCGTCGACCC
ATGAAGGAGAAGAAGACTCCGAGTCAGTCGTACAAACCCTCAAGATTCCAGACGAGTGGT
TGCTCCCTTCCAAGGCCATCGAGGAATCTGAATGGTTGAGAGTAACTCTACACAAGTGGT
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BQ
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AF RR4F085JQ C 1
AF RR4F085TF U 1
BS 1 566 RR4F085TF
BS 567 567 RR4F085JQ
BS 568 631 RR4F085TF

RD RR4F085JQ 631 0 0
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CATGGGTTTGCTCTTACGTGACTCGAAACCTGGTAACCGCCGATCATCCACATCCTTTCT
CATCATCATCCCAACAATTTGGTTCTCCGCCACGTAGAGCATCCGTCAGGTTACCCTTAA
CATCTACGCCGAAGTTTCGGCTACTTAAACTCCGAAAGTTCCAATCTTTATCGTCGACCC
ATGAAGGAGAAGAAGACTCCGAGTCAGTCGTACAAACCCTCAAGATTCCAGACGAGTGGT
TGCTCCCTTCCAAGGCCATCGAGGAATCTGAATGGTTGAGAGTAACTCTACACAAGTGGT
TGGACGATGAGTATTGCCCTGAGCCAACCAATGTGGAGATCAGCAATGTAGCTGCAAAGT
CTCTCCACACTTCACTGTTGGAGAAAGAAACTGACATGGGAGTGATTTTGCTCAAGATGG
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ACGCAGCTATAAATTTGATTGTAGAAAGAGTAGAAACTGGCATAGCTTAATCTCAAGAAC
AGTGTCTTTCTTGTTTGTATAAGAGTTATGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4F085TF 631 0 0
GGGGAGAAAATCAGCAAAGTGAGGCAATATAGAGCACGAGAAGGAAGGAAAGAATGAGCT
CATGGGTTTGCTCTTACGTGACTCGAAACCTGGTAACCGCCGATCATCCACATCCTTTCT
CATCATCATCCCAACAATTTGGTTCTCCGCCACGTAGAGCATCCGTCAGGTTACCCTTAA
CATCTACGCCGAAGTTTCGGCTACTTAAACTCCGAAAGTTCCAATCTTTATCGTCGACCC
ATGAAGGAGAAGAAGACTCCGAGTCAGTCGTACAAACCCTCAAGATTCCAGACGAGTGGT
TGCTCCCTTCCAAGGCCATCGAGGAATCTGAATGGTTGAGAGTAACTCTACACAAGTGGT
TGGACGATGAGTATTGCCCTGAGCCAACCAATGTGGAGATCAGCAATGTAGCTGCAAAGT
CTCTCCACACTTCACTGTTGGAGAAAGAAACTGACATGGGAGTGATTTTGCTCAAGATGG
CTCAAGACTTAACCTCAATTTCATATCAAGAAAGCTTCCACGGAGCTTTCACATCCGCAA
ACGCAGCTATAAATTTGATTGTAGAA*GAGTAGAAACTGGCATAGCTTAATCTCAAGAAC
AGTGTCTTTCTTGTTTGTATAAGAGTTATGA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL7942Contig1 662 2 2 U
CTTTACTTTCTTAATGATTGATCCCTTCTATTGTAAAACCACGCTTAAGTTTGTGTTTAT
ATATACTCACAAGGCAAATATAAGGGAGACGTGTTCCATTGTTTTAGCATCAGAACTCAC
AAGCCCCATAGAAAAGAAGCCGGACTAGTATGATTACAATTGGGTAATTTGGTTTTCTCT
ACAGCAAAAATACAAGAGATTGGCCAAGCCAAGCAGTGCCAAGATGATAATGATAAAAAC
ATATAAAGTACAATGGGAACAAGATTTCTTTTGGTTCACTCGGAATGCTGCGCGTGGTTT
TGGATTGTCAGCTTCTGCCATAGCATGGTGGATTTGATGATGAAGTTTATCACGTCTAGT
CGCATTCCCCTGCACTGATGCCGGAAACAAAACACAGTAGCAAACAAGATGAAAAAAGAT
AACAGAAAAAATGCAAATCTATGTTTAACTACACAGAACAAGCAACACAACATACCGGGA
ACACTTGAGAAGATGCGTCATCCTCCTGTTCCTCTTGATCTTGGTCTCTTCTGTCGTTTG
ACAATGTATCAGAGCTGATGATATCTACGGAGGATCTGTTATTTTCTCCATTCAGACATG
CTGCCTCTTCAAGTGAATCAGCGGTTATTTGTGGCAACACAAGCCGTTGAAAGTCGGACA
AC


BQ
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20 20 

AF RR4AZ05TF C 1
AF RR4AZ05JQ U 36
BS 1 35 RR4AZ05TF
BS 36 662 RR4AZ05JQ

RD RR4AZ05TF 662 0 0
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ATATACTCACAAGGCAAATATAAGGGAGACGTGTTCCATTGTTTTAGCATCAGAACTCAC
AAGCCCCATAGAAAAGAAGCCGGACTAGTATGATTACAATTGGGTAATTTGGTTTTCTCT
ACAGCAAAAATACAAGAGATTGGCCAAGCCAAGCAGTGCCAAGATGATAATGATAAAAAC
ATATAAAGTACAATGGGAACAAGATTTCTTTTGGTTCACTCGGAATGCTGCGCGTGGTTT
TGGATTGTCAGCTTCTGCCATAGCATGGTGGATTTGATGATGAAGTTTATCACGTCTAGT
CGCATTCCCCTGCACTGATGCCGGAAACAAAACACAGTAGCAAACAAGATGAAAAAAGAT
AACAGAAAAAATGCAAATCTATGTTTAACTACACAGAACAAGCAACACAACATACCGGGA
ACACTTGAGAAGATGCGTCATCCTCCTGTTCCTCTTGATCTTGGTCTCTTCTGTCGTTTG
ACAATGTATCAGAGCTGATGATATCTACGGAGGATCTGTTATTTTCTCCATTCAGACATG
CTGCCTCTTCAAGTGAATCAGCGGTTATTTGTGGCAACACAAGCCGTTGAAAGTCGGACA
AC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4AZ05JQ 627 0 0
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CCATTGTTTTAGCATCAGAACTCACAAGCCCCATAGAAAAGAAGCCGGACTAGTATGATT
ACAATTGGGTAATTTGGTTTTCTCTACAGCAAAAATACAAGAGATTGGCCAAGCCAAGCA
GTGCCAAGATGATAATGATAAAAACATATAAAGTACAATGGGAACAAGATTTCTTTTGGT
TCACTCGGAATGCTGCGCGTGGTTTTGGATTGTCAGCTTCTGCCATAGCATGGTGGATTT
GATGATGAAGTTTATCACGTCTAGTCGCATTCCCCTGCACTGATGCCGGAAACAAAACAC
AGTAGCAAACAAGATGAAAAAAGATAACAGAAAAAATGCAAATCTATGTTTAACTACACA
GAACAAGCAACACAACATACCGGGAACACTTGAGAAGATGCGTCATCCTCCTGTTCCTCT
TGATCTTGGTCTCTTCTGTCGTTTGACAATGTATCAGAGCTGATGATATCTACGGAGGAT
CTGTTATTTTCTCCATTCAGACATGCTGCCTCTTCAAGTGAATCAGCGGTTATTTGTGGC
AACACAAGCCGTTGAAAGTCGGACAAC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7943Contig1 1300 2 2 U
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ATGTTAGTACAGAGACTCTCAGGACCAGGGATATTAAATGCTAATGTAAAAATCTTTACT
GAAGAAGGCATGAAGACATCAACCGATGGTTATGACAAGAGCAGAATCCTAGGCCAGGGA
GGACAAGGAACCGTCTACAAAGGGATATTACCAGACAACTCCATAGTCGCAATAAAGAAA
GCTCGGCTTGGAGACAACAGCCAAGTTGAGCAGTTCATCAACGAAGTGCTAGTTCTTTCA
CAGATCAACCATAGGAACGTGGTCAAGCTCTTGGGCTGCTGTCTAGAGACTGAAGTTCCC
TTGCTTGTCTATGAGTTCATTAACAGCGGCACTCTTTTCGATCACTTGCACGGTTCTTTG
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CTTGCTTATCTTCACTCCTCTGCTTCTATTCCAATCATCCACCGAGACGTCAAGACGGCT
AACATTCTCTTGGATGAAAACTTAACTGCAAAGGTAGCTGACTTTGGTGCTTCAAGGCTG
ATTCCGATGGATAAAGAGCAGCTCACAACAATGGTGCAAGGAACTCTAGGCTACTTGGAC
CCGGAATACTACAACACTGGTCTGCTGAACGAAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTA
GTTCTCATGGAACTGCCCTCAAGCCAAAAGGCATTGTGCTTCGAAAGGCCACTGCAGTCA
AAACATCTGGTGCATTACATTGCTTCTGCCATGAAGGAGAACAGGTTGCACGAGGTTATT
GATGAGAAAGTAATCAAGGAGAATAACTGGAAGGAGATCTAGGAAGCTGTGAGAGTTGCT
ATGGAGTGTACAAGAGTGACAGGAGAGGAAAGGCCACTGATGACAGAAGTAGCTGCAAAG
CTTGAGGGCTTGAGAGTCACAAAAACCAAACATCAGTGGTCAGATGATCAGTATCCTGGC
GAGGAGACTGGGAACCTGGTCGGTTCTTGGAATCCTATCAGAGCAAGGCGATACAAGTAG
CACTGGCTATGACAGCATCAAGAATGTAGCAAGCATGCACATGGAAGCTGGTCGCTAATA
CTTATTAGTCAAGGCTCTGTCAAAATCACGTTCAAATCTTGTTTATGAAAAAATAATATC
ATGTCTGTATTTCATCTCACCTCTTTTGTCTACCTATGAAGAACATCTAGGCATTGAAAT
GAAGAACATTTATGCATTGATAATGTTCTTATAGACCATC


BQ
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AF RR4C995TF U 1
AF RR4C995JQ C 455
BS 1 675 RR4C995TF
BS 676 1300 RR4C995JQ

RD RR4C995TF 675 0 0
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ATGTTAGTACAGAGACTCTCAGGACCAGGGATATTAAATGCTAATGTAAAAATCTTTACT
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GGACAAGGAACCGTCTACAAAGGGATATTACCAGACAACTCCATAGTCGCAATAAAGAAA
GCTCGGCTTGGAGACAACAGCCAAGTTGAGCAGTTCATCAACGAAGTGCTAGTTCTTTCA
CAGATCAACCATAGGAACGTGGTCAAGCTCTTGGGCTGCTGTCTAGAGACTGAAGTTCCC
TTGCTTGTCTATGAGTTCATTAACAGCGGCACTCTTTTCGATCACTTGCACGGTTCTTTG
TTTGGTCCTTCACTTACATGGGAACAACGCCTGAGGATAGCCGTGGAGATAGCTGGAACT
CTTGCTTATCTTCACTCCTCTGCTTCTATTCCAATCATCCACCGAGACGTCAAGACGGCT
AACATTCTCTTGGATGAAAACTTAACTGCAAAGGTAGCTGACTTTGGTGCTTCAAGGCTG
ATTCCGATGGATAAAGAGCAGCTCACAACAATGGTGCAAGGAACTCTAGGCTACTTGGAC
CCGGAATACTACAAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4C995JQ 846 0 0
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TCATCCACCGAGACGTCAAGACGGCTAACATTCTCTTGGATGAAAACTTAACTGCAAAGG
TAGCTGACTTTGGTGCTTCAAGGCTGATTCCGATGGATAAAGAGCAGCTCACAACAATGG
TGCAAGGAACTCTAGGCTACTTGGACCCGGAATACTACAACACTGGTCTGCTGAACGAAA
AGAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTAGTTCTCATGGAACTGCCCTCAAGCCAAAAGGCAT
TGTGCTTCGAAAGGCCACTGCAGTCAAAACATCTGGTGCATTACATTGCTTCTGCCATGA
AGGAGAACAGGTTGCACGAGGTTATTGATGAGAAAGTAATCAAGGAGAATAACTGGAAGG
AGATCTAGGAAGCTGTGAGAGTTGCTATGGAGTGTACAAGAGTGACAGGAGAGGAAAGGC
CACTGATGACAGAAGTAGCTGCAAAGCTTGAGGGCTTGAGAGTCACAAAAACCAAACATC
AGTGGTCAGATGATCAGTATCCTGGCGAGGAGACTGGGAACCTGGTCGGTTCTTGGAATC
CTATCAGAGCAAGGCGATACAAGTAGCACTGGCTATGACAGCATCAAGAATGTAGCAAGC
ATGCACATGGAAGCTGGTCGCTAATACTTATTAGTCAAGGCTCTGTCAAAATCACGTTCA
AATCTTGTTTATGAAAAAATAATATCATGTCTGTATTTCATCTCACCTCTTTTGTCTACC
TATGAAGAACATCTAGGCATTGAAATGAAGAACATTTATGCATTGATAATGTTCTTATAG
ACCATC

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

CO CL7944Contig1 1003 2 6 U
GGATCATCAGTTGATTAATAAACAAACCTCTACATATCAATAGAAATGGACGCTGGAGAA
GAGAATAAGGGCAGTATAAGTATGGTTGAGGCTAAGCTGCCTCGTGGGTTTAGATTCCAC
CCGAGAGACGACGAGCTCGTCTGCGACTACTTAATGAGAAGAAACGGTCGCAGCCTCTAT
CAGCCAGTTGTGCTGATCGAAGTCGATCTCAACCAGTGCGAACCTTGGGACATTCCCCAA
ACGGCGAGGGTTGGAGGTAAAGAATGGTATTTTTATAGCCAAAAAGATCGAAAATACGCA
ACAGGACAAAGAACAAACCGGGCTACGGCCACCGGTTATTGGAAAGCAACTGGTAAAGAT
AGAGCAATCCAAAGAAATGGTAGTCTTGTGGGCATGAGAAAGACACTTGTGTTTTACAGA
GGTCGAGCCCCTAAAGGTCATAAAACTGATTGGGTCATGCACGAGTTTCGTCTACAAGGG
ACTTCTATCCACCACTCTCCCAAGGAAGAATGGGTATTGTGTAGAGTTTTCAACAAGAAA
AACAACGAAGTCGACAAGGACAACAACATGAGAAGTTGCTCTGATGAACCAGCTTCCGCA
GCAATGGACTCGTACATCAACTTCGATCATCATCCTCACACCATCAACCAGCAAGTGCCC
TGCTTCTCCAATTTGTCACAGAACCAAATCGGTTTGGTCTACAAGAACCCCTACCCGTTG
TCTATTAGTCCTTCCACTGATCATATGATTCTCAAAACTTTACTAAGTCAGCTTACCAAG
AATACCAAAGAATCACAGATTTATGGAGAAGGAAGCTCAGAGAGCCAGTTGACCGACGTT
GGCATACCAAGCCACCATACTTGGAAATATTGATCACTATATCAGAAATCTCTATTATCA
TTGTGTATGAACCATACGTATTATTTCACCAATGCAAACATTATTCACCCATCCCGTGTA
AACATTGTTATACCATTATGGATTAGATACTCACATCAAACTT


BQ
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AF RR4F894TF U 1
AF RR4F894JQ C 325
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AACAACGAAGTCGACAAGGACAACAACATGAGAAGTTGCTCTGATGAACCAGCTTCCGCA
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CTTTAC

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DS 

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AACATGAGAAGTTGCTTTGATGAACCAGCTTCCGCAGCAATGGACTCGTACATCAACTTC
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AGATACTCACATCAAACTT

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4E970JQ C 1
AF RR4E970TF U 1
BS 1 623 RR4E970TF

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DS 

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CAAGCTGAAGCTGACAAAACCAACTGAGAAAACTAAAAGACAGGAAGGAGTTTCAAGTTT
GTAATGTTGCCATGTTGGTGTGGATTTGTTGTTGTCTTTCTACTTTGTGCAGTAATAATC
ATCTCCCTCTCTGTTTCTTCTCCCTCTTGTGGGGAGAAAAAAAAGATTCAGACTTTCAAT
TCCAAATCTCTTTATTATCACTC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AB48TF U 1
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DS 

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DS 



AS 1 2

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AAA


BQ
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10 10 10 

AF RR4AV05TF U 1
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DS 

RD RR4AV05JQ 663 0 0
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TCAGGGATCGGTTTACTGGGACACATGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATT
CCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGCTAGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCGTTGCGTT
GACAAAAGAAGCGGTGACAGACAAAACAGTGCTTGCAGTGACGTCAGCCAAGATGCCTAC
TTACGTAACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCAAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACA
CGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACGCCGTCAGCTGAATGTCCCGCCGCT
TTTAAGGAGCTCGGAATCGTTCCTGACGTCACCTTCTAAATATGATTACGACTTCTATCT
CAGAGATCGTTATTTTACTGCATCATCAATTGTTTGTTTTCTTATATGTAAAAGTGTAAT
ATGATAAAATACAAAAATGGGTAATTAAAATAATTAATTATAACTTTCCGAGCAAATAGA
AAA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4F964TF U 1
AF RR4F964JQ C 97
BS 1 654 RR4F964TF
BS 655 655 RR4F964JQ
BS 656 699 RR4F964TF
BS 700 700 RR4F964JQ
BS 701 708 RR4F964TF
BS 709 710 RR4F964JQ
BS 711 728 RR4F964TF
BS 729 729 RR4F964JQ
BS 730 737 RR4F964TF
BS 738 738 RR4F964JQ
BS 739 758 RR4F964TF
BS 759 871 RR4F964JQ

RD RR4F964TF 763 0 0
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TTCCCTCCTCCCTCACTAGAAGCTGATGCCGCCTTTCAAATCTCCAATACCCCTCAAACC
ACCACCTAAAACACATAAGCGGTTTCAAAAACGAGGCCATACTGAGTTGAGACTGATTTT
CCTGAAATCTTCCATCTCTTCTCTCCTTATACATCTCCATCAACGGCTTTGACTATATCC
TTTCTCCACTGATGGCCCTTCGTATAGGCTGCGTTTCATGGAAGGAAACGGACGCTCTGG
TTCTACCAGTCTCTGGCTCTGAATTTCTCTTGGCACCTTCTCAGTGGAGCCGTAATGTCA
TTGGGCGGACACTGATCGTCTTATAGAGATAATAAATTCAAGGGCTATTGATCTACCTTA
TGTCGCGAGAGAAGAGATAATGGAGATCCCTACGAGAGAGAGCCAAGAAAAGTGTGAGTT
TTCTTGATCAGAAAAAATTACCCGTTCGTGGCAAGGATGCTGGTAATGATCATTGGGCTA
CACCAACCCCACTTGCCAAGTCAGTAGGTCAAAACAGTGTTCCAACAATGGATTCAATAC
AATAGAGCATATTGGTAGACTTCTACTGTTCAGTGATCTCTTGAGTTTTCAGGG*TTCAA
AGAGTTCTCTGCTTCAAACACTATCTCAACTGAAGATGA*TCTTACAA**GTCTTAGTAA
TCTGGTAA*GTGCTTCA*TGTCTCTGATAATGTCGTTT
TATTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4F964JQ 775 0 0
CAAATCTCCAATACCCCTCAAACCACCAC*TAAAACACATAAGCGGTT*CAAAAACGAGG
CCATACTGAGTTGAGACTGATTTTCCTGAAATCTTCCATCTCTTCTCTCCTTATACATCT
CCATCAACGGCTTTGACTATATCCTTTCTCCACTGATGGCCCTTCGTATAGGCTGCGTTT
CATGGAAGGAAACGGACGCTCTGGTTCTACCAGTCTCTGGCTCTGAATTTCTCTTGGCAC
CTTCTCAGTGGAGCCGTAATGTCATTGGGCGGACACTGATCGTCTTATAGAGATAATAAA
TTCAAGGGCTATTGATCTACCTTATGTCGCGAGAGAAGAGATAATGGAGATCCCTACGAG
AGAGAGCCAAGAAAAGTGTGAGTTTTCTTGATCAGAAAAAATTACCCGTTCGTGGCAAGG
ATGCTGGTAATGATCATTGGGCTACACCAACCCCACTTGCCAAGTCAGTAGGTCAAAACA
GTGTTCCAACAATGGATTCAATACAATAGAGCATATTGGTAGACTTCTACTGTTCAGTGA
TCTCTTGAGTTTTCAGGGGTTCAAAGAGTTTTCTGCTTCAAACACTATCTCAACTGAAGA
TGAATCTTACAAAGGTCTTAGTAATCTGGTAAAGTGCTTCAATGTCTCTGATAATGTCGT
TTATATTTTTATTTCTTCCTCCTAACTTCCATTGATCTTACCGTGTAATGAATGCATGAC
AATGCATGAGTGTTTCAGTGACTTATGACCTACACGCAAATGACAATTTTCTTGA

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL7949Contig1 883 2 2 U
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CGTAAGAAGTGTTTGAGCTTTCTCGGAGCTTTGATCTTCCATATTAAAAACATGGATTTC
CTGCTACTACGCGCCAAGGCCAATGGAGTGAGTTCAGATGTGCTAGTTGCATTCTCGTGG
ATTACTTGGTATATCTGGAAAGTGCGTTACGAAATTTTTTTTAAAGATAAGGATATTTCG
CCGATGGATACACTTCAACTCGCAGTCAAGGAAGCCGAAAGCTGGATGCTAGCACTGAGA
ATAGAAGTAGAACCGGACAGAGATGTAGACGAGCATCAAGGCATGGAGATCAAAGGCTTG
CAGGAGCCACACTCATGTCGCTGGAGATGTCAAACAGACGCGTCTTGTATCAATGCGAAC
GATAAAACCGGACTAGGTTTTGTAATGCCCAACAGTGGAACCCCGGTCTTGTTTGGAGCG
CAAGGAATAAGATATGCCGCATCCTCTCTCCATGCTGAAGCGAAAGGCCTGCTGTGGGCT
ATGCAGGAGATTTTGAAGCTCGGGAATAGAGAGATCCGGTTCGAGACTGACTGCGAACAA
CTGGTTAAGCTAGTGAAAGATGATGAAAACTAGCCAGCAATGGTGCCTGGAGTAGATGGG
ATTAAAACACTCTCTACTGATTTTATCAACTTCTCTATAGCTCACATTCCAAAATCGATG
AATGTTTGTGCTGACTTCCTTGCTAAAGAAGGAAGATCACGAGTATTTGGGTTTTCTTTT
GTCAATGGCTTTGCACTAAATTGGCTAGCTCCTTATACTGATTAAGAGGATGCAAACTAG
TTTATTAAAGTTTTTTTGATATAAAAAAAAGAGTGACCATATT


BQ
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AF RR4A568TF U 1
AF RR4A568JQ C 126
BS 1 748 RR4A568TF
BS 749 883 RR4A568JQ

RD RR4A568TF 748 0 0
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CGTAAGAAGTGTTTGAGCTTTCTCGGAGCTTTGATCTTCCATATTAAAAACATGGATTTC
CTGCTACTACGCGCCAAGGCCAATGGAGTGAGTTCAGATGTGCTAGTTGCATTCTCGTGG
ATTACTTGGTATATCTGGAAAGTGCGTTACGAAATTTTTTTTAAAGATAAGGATATTTCG
CCGATGGATACACTTCAACTCGCAGTCAAGGAAGCCGAAAGCTGGATGCTAGCACTGAGA
ATAGAAGTAGAACCGGACAGAGATGTAGACGAGCATCAAGGCATGGAGATCAAAGGCTTG
CAGGAGCCACACTCATGTCGCTGGAGATGTCAAACAGACGCGTCTTGTATCAATGCGAAC
GATAAAACCGGACTAGGTTTTGTAATGCCCAACAGTGGAACCCCGGTCTTGTTTGGAGCG
CAAGGAATAAGATATGCCGCATCCTCTCTCCATGCTGAAGCGAAAGGCCTGCTGTGGGCT
ATGCAGGAGATTTTGAAGCTCGGGAATAGAGAGATCCGGTTCGAGACTGACTGCGAACAA
CTGGTTAAGCTAGTGAAAGATGATGAAAACTAGCCAGCAATGGTGCCTGGAGTAGATGGG
ATTAAAACACTCTCTACTGATTTTATCAACTTCTCTATAGCTCACATTCCAAAATCGATG
AATGTTTGTGCTGACTTCCTTGCTAAAG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4A568JQ 758 0 0
ACTACGCGCCAAGGCCAATGGAGTGAGTTCAGATGTGCTAGTTGCATTCTCGTGGATTAC
TTGGTATATCTGGAAAGTGCGTTACGAAATTTTTTTTAAAGATAAGGATATTTCGCCGAT
GGATACACTTCAACTCGCAGTCAAGGAAGCCGAAAGCTGGATGCTAGCACTGAGAATAGA
AGTAGAACCGGACAGAGATGTAGACGAGCATCAAGGCATGGAGATCAAAGGCTTGCAGGA
GCCACACTCATGTCGCTGGAGATGTCAAACAGACGCGTCTTGTATCAATGCGAACGATAA
AACCGGACTAGGTTTTGTAATGCCCAACAGTGGAACCCCGGTCTTGTTTGGAGCGCAAGG
AATAAGATATGCCGCATCCTCTCTCCATGCTGAAGCGAAAGGCCTGCTGTGGGCTATGCA
GGAGATTTTGAAGCTCGGGAATAGAGAGATCCGGTTCGAGACTGACTGCGAACAACTGGT
TAAGCTAGTGAAAGATGATGAAAACTAGCCAGCAATGGTGCCTGGAGTAGATGGGATTAA
AACACTCTCTACTGATTTTATCAACTTCTCTATAGCTCACATTCCAAAATCGATGAATGT
TTGTGCTGACTTCCTTGCTAAAGAAGGAAGATCACGAGTATTTGGGTTTTCTTTTGTCAA
TGGCTTTGCACTAAATTGGCTAGCTCCTTATACTGATTAAGAGGATGCAAACTAGTTTAT
TAAAGTTTTTTTGATATAAAAAAAAGAGTGACCATATT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7950Contig1 870 2 6 U
GGACTGGAGAAAAAGGCGTTGTTGGAGGCTATTGAGCTAGCTCAAGACTTGATTGAGAAA
AACAAGGATTTACACTTCCATCTTCTTTGCCTTCATTTTCTTGACCTTAGATGTGCTGCC
AAGTGCCCTGAAGCTCTTGAATCTGCTCAGACAAGGTTGGTGGCTCTTTTTGGGGATGTC
CCAAAATATGTCGAAAAGCTTCAAGTTAAAGTCTCTGAATCTTTGATGAATTGGCGCAGA
TTATGTTTTCTCTTCTCCAAATGATGGAAGCTGTTAGTTGAAAAGTTGAAACCAGTTTGT
TTCCCTCTGTGTGTGGCAGGCCACAATAGAGTTGCTGACTTGTGATTTTGAAGACCCTGA
GCTATCCTCAGATTCACATCTTTCCAGCTTTGAATACAGCCAACAGGTTGCCGATAAACT
GAACCGCGCCATTCTTGAACATGCAAAAGATACACACCAATGGAAAGGCTCTTACAACAG
GTGACAGTTGCGAGACAGTACTTGACCCAGGAGTATGGCAAGGTAGTCTTAACATCTCTG
TGCTTACTCAGATTTTATCTTTTTTCACTTTAGAAAAACCCTGTGGAATATAGTTAGTGC
CTGTGTTAAAATAAAACGCTATTTCATGATAGGACGCGTTTCCTCCATTCTCCTTGGAAG
ATTCTCTCAAAGGCTTAAGATCGCAGCAGGACGACTCTGAAGTTTGCCAAGAGAAGGATA
TGCTTAACATTGGCATTTAAATACAGAAAAACGCTTTTTGCTTCTCAATGTCTATCTCCA
TTGGTTTAAAATCCGTCTTCTAACTCATTTCTCTTTGTAATGAACTAATGATCGTTTATG
TAACACATAACTTCAAGATAGATACTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FH62TF U 1
AF RR4FH62JQ C 97
BS 1 689 RR4FH62TF
BS 690 690 RR4FH62JQ
BS 691 716 RR4FH62TF
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BS 718 737 RR4FH62TF
BS 738 870 RR4FH62JQ

RD RR4FH62TF 737 0 0
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AACAAGGATTTACACTTCCATCTTCTTTGCCTTCATTTTCTTGACCTTAGATGTGCTGCC
AAGTGCCCTGAAGCTCTTGAATCTGCTCAGACAAGGTTGGTGGCTCTTTTTGGGGATGTC
CCAAAATATGTCGAAAAGCTTCAAGTTAAAGTCTCTGAATCTTTGATGAATTGGCGCAGA
TTATGTTTTCTCTTCTCCAAATGATGGAAGCTGTTAGTTGAAAAGTTGAAACCAGTTTGT
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TGCTTACTCAGATTTTATCTTTTTTCACTTTAGAAAAACCCTGTGGAATATAGTTAGTGC
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TGCTTAACATTGGCATT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FH62JQ 774 0 0
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CTTTTTGGGGATGTCCCAAAATATGTCGAAAAGCTTCAAGTTAAAGTCTCTGAATCTTTG
ATGAATTGGCGCAGATTATGTTTTCTCTTCTCCAAATGATGGAAGCTGTTAGTTGAAAAG
TTGAAACCAGTTTGTTTCCCTCTGTGTGTGGCAGGCCACAATAGAGTTGCTGACTTGTGA
TTTTGAAGACCCTGAGCTATCCTCAGATTCACATCTTTCCAGCTTTGAATACAGCCAACA
GGTTGCCGATAAACTGAACCGCGCCATTCTTGAACATGCAAAAGATACACACCAATGGAA
AGGCTCTTACAACAGGTGACAGTTGCGAGACAGTACTTGACCCAGGAGTATGGCAAGGTA
GTCTTAACATCTCTGTGCTTACTCAGATTTTATCTTTTTTCACTTTAGAAAAACCCTGTG
GAATATAGTTAGTGCCTGTGTTAAAATAAAACGCTATTTCATGATAGGACGCGTTTCCTC
CATTCTCCTTGGAAGATTCTCTCAAAGGCTTAAGATCGCAGCAGGACGACTCTGAAGTTT
GCCAAGAGAAGGATATGCTTAACATTGGCATTTAAATACAGAAAAACGCTTTTTGCTTCT
CAATGTCTATCTCCATTGGTTTAAAATCCGTCTTCTAACTCATTTCTCTTTGTAATGAAC
TAATGATCGTTTATGTAACACATAACTTCAAGATAGATACTTTGC

QA 10 774 10 774
DS 



AS 1 2

CO CL7951Contig1 698 2 1 U
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BQ
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AF RR4EL15TF U 1
AF RR4EO76TF U 1
BS 1 698 RR4EL15TF

RD RR4EL15TF 698 0 0
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TTGGTTTTAAAGATCATACATATATTCAGAGGCGGCTAGATCTTTGCATTTGTTTTAGGA
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TCATAAACATTTTACAAAATCTGTATAAAAGTTCTCTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4EO76TF 664 0 0
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AGGTTGCAGAAGGTGTAGCAACGGCTGGGGCAGTGATAGCATTAGCACAGAAATACAACG
TGAAGCTCCCTGTTTTGACAGCCGTAGCTAAGATAATCGATAACGAACTGACACCAACTA
AAGCTGTTCTTGAACTCATGAGCCTTCCTCAGGTTGAGGAAGTATGAGAGATAAAACAAA
TTGGTTTTAAAGATCATACATATATTCAGAGGCGGCTAGATCTTTGCATTTGTTTTAGGA
GATAGCTCATTACAGAGATGATTTGGAAGTGAGTTTTGTA*TCTCATTAATGTGAATTGT
TCAT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL7952Contig1 871 2 2 U
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AACTGGATAACGTGAGGAATCAGCTGATCCAGTTCGAGTTGTTTCTGACGACAGCAACAC
TTGTGGTAGCCATATTTGGGGTGGTGGCAGGGATATTTGGAATGAACTTTGAGATAGACT
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TATGTTGCTTTACATGATAGACTAATGATTTGTTTCCTTTGCACACACAATTAAACATTA
CCAAATGCAAATGTGATAAAATCTTTTTGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DS94TF U 1
AF RR4DS94JQ C 273
BS 1 702 RR4DS94TF
BS 703 871 RR4DS94JQ

RD RR4DS94TF 702 0 0
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GCAGACTCGTAGCACTCACAAGGAGAGTCCAGAAGGTTAGGGATGAGATAGAGCAGCTGA
TGGATGATGATGGAGATATGGCGGAAATGTATCTCACGGAGAAGAAGAAGAGGATGGAAG
GATCTTTGTACGGTGGTGACCACCAGTCCTTACTGGGATACAGATCGAACGATGGTTTAT
CTTTTTCTGCGCCGGTCTCTCCTGTGTCTTCTCCGCCTGATTCACGTGGAAGACTCGATA
GAAGCGTGAGTATTGCTAGGAGCAGACATTACAGTGCGAGGAGTTCGGAAGGTGTGACAG
AGAACATAGAAGAGCTGGAGATGTTGCTGGAAGCTTACTTTGTCGTCATTGATAGTACTC
TAAACAAACTGACATCCTTGAAGGAGTACATTGATGATACTGAAGATTTCATTAACATTC
AACTGGATAACGTGAGGAATCAGCTGATCCAGTTCGAGTTGTTTCTGACGACAGCAACAC
TTGTGGTAGCCATATTTGGGGTGGTGGCAGGGATATTTGGAATGAACTTTGAGATAGACT
TTTTCACTCAGCCAGGGGCATTCAGATGGGTACTTATCATTACAGGAATCTGTGGCTTTG
TCATATTTTCCGCGTTTGTCTGGTTCTTCAAGTGTAGAAGAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4DS94JQ 599 0 0
CCGCCTGATTCACGTGGAAGACTCGATAGAAGCGTGAGTATTGCTAGGAGCAGACATTAC
AGTGCGAGGAGTTCGGAAGGTGTGACAGAGAACATAGAAGAGCTGGAGATGTTGCTGGAA
GCTTACTTTGTCGTCATTGATAGTACTCTAAACAAACTGACATCCTTGAAGGAGTACATT
GATGATACTGAAGATTTCATTAACATTCAACTGGATAACGTGAGGAATCAGCTGATCCAG
TTCGAGTTGTTTCTGACGACAGCAACACTTGTGGTAGCCATATTTGGGGTGGTGGCAGGG
ATATTTGGAATGAACTTTGAGATAGACTTTTTCACTCAGCCAGGGGCATTCAGATGGGTA
CTTATCATTACAGGAATCTGTGGCTTTGTCATATTTTCCGCGTTTGTCTGGTTCTTCAAG
TGTAGAAGACTCATGCCTCTATGAGAGACAGAGAGAGAGAGGAGATGATGAATGTAGACA
GACCACCAGCTCTTTTCATTATTATTATTATGTTGCTTTACATGATAGACTAATGATTTG
TTTCCTTTGCACACACAATTAAACATTACCAAATGCAAATGTGATAAAATCTTTTTGTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL7953Contig1 851 2 4 U
GATGCAGAAGATATCAGAAATGAAAAGGTAAAGGTTCTACGTTCAATGAGGCCAATACAA
CTTGAAGATGTGGTGATAGGACAGTACAAGAGCACCACTAAAGGAGGAGTCACTTATCCA
GGCTATACCGATGATAAAACTGTCCCAAAAGGTAGCCTGACACCCACATTTGCAGCTGCT
GCACTCTTCATCGACAATGCAAGATGGGACGGTGTACCTTTTCTAATGAAAGCTGGGAAA
GCATTACACACCCGGAGTGCGGAGATAAGAGTGCAGTTCAGGCATGTGCCTGGGAATTTA
TATAACAGGAACTCTGGTACTAATCTTGACCGGACCACAAATGAGCTTGTCATCCGTGTC
CAACCAGATGAAGGCATCTATTTGAAAATCAACAACAAGGTCCCTGGTTTAGGAATGAGA
TTAGATCAGAGTAACTTGAACCTTCTCTATTCAGCAAGGTATTCAAAGGAGATCCCAGAT
GCATATGAGAGGCTGTTGCTGGATGCAATAGAAGGGGAACGAAGGTTGTTCATCAGAAGT
AATGAACTGGACGCTGCTTGGGCGCTTTTCACTCCATTGCTCAAAGAGATAGAAGAAAAG
AAGACAATCCCAGAGTTCTATCCTTATGGCAGTCGTGGTCCAGTTGGTGCTCATTATCTA
GCTGCAAAACACAATGTCCAATGGGGAGACCTTAGTCTCGACCAGTGAAACTGTGGACCT
TTTCTTTGTTCCATTGATCCACGTCTTAAGAATTCTCATTGATTTGTTGATGATAATTTT
CTTGAATTAATAAGGGTTCTGTATCTTGAATAAGAAGTAAGGGTTGCTTTTTCGACCCTT
TTATTTGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DI90TF U 1
AF RR4DI90JQ C 28
BS 1 751 RR4DI90TF
BS 752 753 RR4DI90JQ
BS 754 784 RR4DI90TF
BS 785 851 RR4DI90JQ

RD RR4DI90TF 784 0 0
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CTTGAAGATGTGGTGATAGGACAGTACAAGAGCACCACTAAAGGAGGAGTCACTTATCCA
GGCTATACCGATGATAAAACTGTCCCAAAAGGTAGCCTGACACCCACATTTGCAGCTGCT
GCACTCTTCATCGACAATGCAAGATGGGACGGTGTACCTTTTCTAATGAAAGCTGGGAAA
GCATTACACACCCGGAGTGCGGAGATAAGAGTGCAGTTCAGGCATGTGCCTGGGAATTTA
TATAACAGGAACTCTGGTACTAATCTTGACCGGACCACAAATGAGCTTGTCATCCGTGTC
CAACCAGATGAAGGCATCTATTTGAAAATCAACAACAAGGTCCCTGGTTTAGGAATGAGA
TTAGATCAGAGTAACTTGAACCTTCTCTATTCAGCAAGGTATTCAAAGGAGATCCCAGAT
GCATATGAGAGGCTGTTGCTGGATGCAATAGAAGGGGAACGAAGGTTGTTCATCAGAAGT
AATGAACTGGACGCTGCTTGGGCGCTTTTCACTCCATTGCTCAAAGAGATAGAAGAAAAG
AAGACAATCCCAGAGTTCTATCCTTATGGCAGTCGTGGTCCAGTTGGTGCTCATTATCTA
GCTGCAAAACACAATGTCCAATGGGGAGACCTTAGTCTCGACCAGTGAAACTGTGGACCT
TTTCTTTGTTCCATTGATCCACGTCTTAAGA**TCTCATTGATTTGTTGATGATAATTTT
CTTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4DI90JQ 824 0 0
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AAGAGCACCACTAAAGGAGGAGTCACTTATCCAGGCTATACCGATGATAAAACTGTCCCA
AAAGGTAGCCTGACACCCACATTTGCAGCTGCTGCACTCTTCATCGACAATGCAAGATGG
GACGGTGTACCTTTTCTAATGAAAGCTGGGAAAGCATTACACACCCGGAGTGCGGAGATA
AGAGTGCAGTTCAGGCATGTGCCTGGGAATTTATATAACAGGAACTCTGGTACTAATCTT
GACCGGACCACAAATGAGCTTGTCATCCGTGTCCAACCAGATGAAGGCATCTATTTGAAA
ATCAACAACAAGGTCCCTGGTTTAGGAATGAGATTAGATCAGAGTAACTTGAACCTTCTC
TATTCAGCAAGGTATTCAAAGGAGATCCCAGATGCATATGAGAGGCTGTTGCTGGATGCA
ATAGAAGGGGAACGAAGGTTGTTCATCAGAAGTAATGAACTGGACGCTGCTTGGGCGCTT
TTCACTCCATTGCTCAAAGAGATAGAAGAAAAGAAGACAATCCCAGAGTTCTATCCTTAT
GGCAGTCGTGGTCCAGTTGGTGCTCATTATCTAGCTGCAAAACACAATGTCCAATGGGGA
GACCTTAGTCTCGACCAGTGAAACTGTGGACCTTTTCTTTGTTCCATTGATCCACGTCTT
AAGGATTCTCATTGATTTGTTGATGATAATTTTCTTGAATTAATAAGGGTTCTGTATCTT
GAATAAGAAGTAAGGGTTGCTTTTTCGACCCTTTTATTTGCACC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL7954Contig1 1005 2 2 U
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGG
CAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTA
ACCGCTGCAGCAATCGTTGGCCATGACGGTAGCGTTTGGACTCAGAGCGCCAACTTCCCT
CAGGTATATACAGATTTTAATAATGCCATTGCGTATGGAAATTCCCTTTTTATGTTATAT
CATACATAGATCCATAGTCTTGTTACATTCGAATTCGATTGATCTCTATCTTGTTCTTGT
GTGTATAAGCGCATACACTTCTTGTGTATTATTTAAGATAATGCCATACATCTTCTTGGC
CCGATTGAAATATTTCTTACTATCTTTATGATACTGCATGTTGATGATAGTTCAAGGCAC
AAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCGCCCACAGGGT
TATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTTATCCGTG
GAAAGAAGGTAATGTAGACTCATCGATTAACTTCAAGATCTTACATGTTATCCATATTTA
TATGTGTGTGTGTATGCAAGATCAAAGAACACTATATTTTATGGTTGGTTTGATTCAATA
GGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGA
AGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCT
CGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCACCTGCTTCC
ACATTATTTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGA
AGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTTCTTCATTTCCATACGTTT
CATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B086TF U 1
AF RR4B086JQ C 232
BS 1 860 RR4B086TF
BS 861 1005 RR4B086JQ

RD RR4B086TF 868 0 0
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGG
CAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTA
ACCGCTGCAGCAATCGTTGGCCATGACGGTAGCGTTTGGACTCAGAGCGCCAACTTCCCT
CAGGTATATACAGATTTTAATAATGCCATTGCGTATGGAAATTCCCTTTTTATGTTATAT
CATACATAGATCCATAGTCTTGTTACATTCGAATTCGATTGATCTCTATCTTGTTCTTGT
GTGTATAAGCGCATACACTTCTTGTGTATTATTTAAGATAATGCCATACATCTTCTTGGC
CCGATTGAAATATTTCTTACTATCTTTATGATACTGCATGTTGATGATAGTTCAAGGCAC
AAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCGCCCACAGGGT
TATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTTATCCGTG
GAAAGAAGGTAATGTAGACTCATCGATTAACTTCAAGATCTTACATGTTATCCATATTTA
TATGTGTGTGTGTATGCAAGATCAAAGAACACTATATTTTATGGTTGGTTTGATTCAATA
GGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGA
AGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCT
CGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCACCTGCTTCC
ACATTATTTTTCTTATACAA
CTATATAT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR4B086JQ 774 0 0
ATGTTATATCATACATAGATCCATAGTCTTGTTACATTCGAATTCGATTGATCTCTATCT
TGTTCTTGTGTGTATAAGCGCATACACTTCTTGTGTATTATTTAAGATAATGCCATACAT
CTTCTTGGCCCGATTGAAATATTTCTTACTATCTTTATGATACTGCATGTTGATGATAGT
TCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCGC
CCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTG
TTATCCGTGGAAAGAAGGTAATGTAGACTCATCGATTAACTTCAAGATCTTACATGTTAT
CCATATTTATATGTGTGTGTGTATGCAAGATCAAAGAACACTATATTTTATGGTTGGTTT
GATTCAATAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTATTTGG
GATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGA
TTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCA
CCTGCTTCCACATTATTTT*CTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTTTCTGGATTC
TCTCTAAGAAGCTGAATCCTGGTTGAGAGTCTGATTCTTTAAATTGGTTTTCTTCATTTC
CATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATGTTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7955Contig1 859 2 2 U
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TGCTAGGGAATCAAAGCTTCTTCATTACCAGACCAAAGCATCATCCCATCATGGATTCAC
TCGTAAGACATGGACAACAAAAACAAACCAAGGCAATGCAGATCAACAACAACAACTTGA
ATCTCCGACATCAACAGTTTCATTCTCGGACATGAAGGAACAATCGACCGCGAAGATGGA
GTTCACTGGATCATCATCCACGGGTCTAGCTCTGGTCAAAGAACCAGAAAATGACTGGAT
CAGTACAACGATTTTCGAAGCTGCGCAGATGGCGGAAGGAGTCGAAGAAGGCTTCACGGG
TCTGTTGCTAGGAGACGATACACTAGGACGGAGTTTCTCCGCCGATAAAAACGAGAGGGA
TCACATAGAGAATAGTGGTGGTGAGTGCAACAACTACTTCGAGGATAACAAGAACTATTT
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AGTCAAAGGTTGATATTTCTCCGGGAATGTTTTTGACTCTTTTAGTTACTTAGTAGTTGT
ATGAACCAATCATATGATCGATCTTTCATATGAGAACTTTCAGAAGAAAGAATACAGTTC
ATAATATCCGTTTCATCTTCTTAACATGTCCAACCGCATACTGGTGAATGCTAGCACTTT
AGACAATATGTCAATATCCCTAGACAAACACCACTAAACTAGAAACTATAGTAGACCAGT
AGTGATAGTGTGGCTGTGGTGAAAACAGCACGTTGACATGTCGACTATACTATAATAAAT
GTTGGTGGTTTCATGTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AH72TF U 1
AF RR4AH72JQ C 127
BS 1 789 RR4AH72TF
BS 790 859 RR4AH72JQ

RD RR4AH72TF 789 0 0
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ATCTCCGACATCAACAGTTTCATTCTCGGACATGAAGGAACAATCGACCGCGAAGATGGA
GTTCACTGGATCATCATCCACGGGTCTAGCTCTGGTCAAAGAACCAGAAAATGACTGGAT
CAGTACAACGATTTTCGAAGCTGCGCAGATGGCGGAAGGAGTCGAAGAAGGCTTCACGGG
TCTGTTGCTAGGAGACGATACACTAGGACGGAGTTTCTCCGCCGATAAAAACGAGAGGGA
TCACATAGAGAATAGTGGTGGTGAGTGCAACAACTACTTCGAGGATAACAAGAACTATTT
GGACAGCATTTTCAACTTTGTTGATCCTCCACCTTCGTCCGATTCTCAGCCCATATTCTA
AGTCAAAGGTTGATATTTCTCCGGGAATGTTTTTGACTCTTTTAGTTACTTAGTAGTTGT
ATGAACCAATCATATGATCGATCTTTCATATGAGAACTTTCAGAAGAAAGAATACAGTTC
ATAATATCCGTTTCATCTTCTTAACATGTCCAACCGCATACTGGTGAATGCTAGCACTTT
AGACAATATGTCAATATCCCTAGACAAACACCACTAAACTAGAAACTATAGTAGACCAGT
AGTGATAGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4AH72JQ 733 0 0
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GACATCAACAGTTTCATTCTCGGACATGAAGGAACAATCGACCGCGAAGATGGAGTTCAC
TGGATCATCATCCACGGGTCTAGCTCTGGTCAAAGAACCAGAAAATGACTGGATCAGTAC
AACGATTTTCGAAGCTGCGCAGATGGCGGAAGGAGTCGAAGAAGGCTTCACGGGTCTGTT
GCTAGGAGACGATACACTAGGACGGAGTTTCTCCGCCGATAAAAACGAGAGGGATCACAT
AGAGAATAGTGGTGGTGAGTGCAACAACTACTTCGAGGATAACAAGAACTATTTGGACAG
CATTTTCAACTTTGTTGATCCTCCACCTTCGTCCGATTCTCAGCCCATATTTTAAGTCAA
AGGTTGATATTTCTCCGGGAATGTTTTTGACTCTTTTAGTTACTTAGTAGTTGTATGAAC
CAATCATATGATCGATCTTTCATATGAGAACTTTCAGAAGAAAGAATACAGTTCATAATA
TCCGTTTCATCTTCTTAACATGTCCAACCGCATACTGGTGAATGCTAGCACTTTAGACAA
TATGTCAATATCCCTAGACAAACACCACTAAACTAGAAACTATAGTAGACCAGTAGTGAT
AGTGTGGCTGTGGTGAAAACAGCACGTTGACATGTCGACTATACTATAATAAATGTTGGT
GGTTTCATGTCCG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL7956Contig1 733 2 2 U
GGACAAAGGGAACACATTCACGGTTCCTTCTAATGCATTCGCCGAGTTCAATATGTTTCT
TGATCCTTTAGCAGCAAAGACTGTTCTCGAATCCGGTCTAAACATCACACTCATCCCTCT
AGCCACCCAACGCAACTTGACTTCTTTCCAGATGCTCAACAGTCTCAACTCTACGGTTCA
AACACCTGAATCTCAGTTTGTGCACCGGTTGCTCGCTAGACTACACGCCCTTCATCAGGA
TCACAGGAGCTACAAGCATGTGGGAATGTTCTTAGGAGAGGTTCTTGGAGCATTGTTCTT
GGGAGGAGACCATGCTGCGTTGAAGCCAAAACTACGAGATGAGCAAGTCAAAGTGATCGC
CCAAGGTTATGAATCAAGAGACGGTCAAATAGTGATTGATAAACTGCATGGAAGACGAGT
ACAGATACTTGAAAGCATCGATTCAAGAGGCTGCTATGAGAGTTTCGCTTCAAAGCTCAA
TGACAAGAGACAATCTGCTGTCATAGGAAGCTTTGAAGAACAAATGAACAAATGGATCAC
ACCACCTAACGGAACGCTCAGAAGGAAGAAATGGATCACACCACCAAGCAGAACGCTCAG
AAGGAAGAAATGGATCACACAACCTGTAAAAGATATGACCAATGCTCTGAATAGATATAC
GTAGAGATTTTTGTTACTGATGCCGTGCACTTTCTTGCGTTACTATTCAATATATAAGTC
TATATATGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EF03TF U 1
AF RR4EF03JQ C 174
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BS 535 733 RR4EF03JQ

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TGATCCTTTAGCAGCAAAGACTGTTCTCGAATCCGGTCTAAACATCACACTCATCCCTCT
AGCCACCCAACGCAACTTGACTTCTTTCCAGATGCTCAACAGTCTCAACTCTACGGTTCA
AACACCTGAATCTCAGTTTGTGCACCGGTTGCTCGCTAGACTACACGCCCTTCATCAGGA
TCACAGGAGCTACAAGCATGTGGGAATGTTCTTAGGAGAGGTTCTTGGAGCATTGTTCTT
GGGAGGAGACCATGCTGCGTTGAAGCCAAAACTACGAGATGAGCAAGTCAAAGTGATCGC
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ACAGATACTTGAAAGCATCGATTCAAGAGGCTGCTATGAGAGTTTCGCTTCAAAGCTCAA
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QA 1 534 1 534
DS 

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TGTTCTTGGGAGGAGACCATGCTGCGTTGAAGCCAAAACTACGAGATGAGCAAGTCAAAG
TGATCGCCCAAGGTTATGAATCAAGAGACGGTCAAATAGTGATTGATAAACTGCATGGAA
GACGAGTACAGATACTTGAAAGCATCGATTCAAGAGGCTGCTATGAGAGTTTCGCTTCAA
AGCTCAATGACAAGAGACAATCTGCTGTCATAGGAAGCTTTGAAGAACAAATGAACAAAT
GGATCACACCACCTAACGGAACGCTCAGAAGGAAGAAATGGATCACACCACCAAGCAGAA
CGCTCAGAAGGAAGAAATGGATCACACAACCTGTAAAAGATATGACCAATGCTCTGAATA
GATATACGTAGAGATTTTTGTTACTGATGCCGTGCACTTTCTTGCGTTACTATTCAATAT
ATAAGTCTATATATGTGTTT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

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AAAACCACAACCAAAAACATACTGAGCACTCGTAGAAGAACCAACGTTACCAAAGATCTA
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CATAGCCTTTAAGGCCAACGTAGTGAGCTGGATTATTCGTCATCACCTTCATCGTTCTAA
CTCCTAGATCCCTCAGTATCTGTGCTCCGATGCCGTATTCTCTTGAAGCAACGGGGAATG
AAACACCCTCGGCTTGATCTGAAGTGTTGTTGTTGTCGTACGTACGAGGCTTGTGGGTTA
GGTCAATGCCTTTAGCTTCAGAACCACGCAAGTACACAAACACACCTCTCCCAGTTTCTT
CAATCTGTCTCATAGCGATTGCTAATTGCTTTCCACCAGAGCCATTCCCAAATATATCAT
CTGTGATGCATTCAGCATGTACTCTCACCAGAACATCCTTCCCATCTCCGACTTCACCTT
TGACCATTGCAATGTGCTCAACTCCATCAAGCAATGACTTGAAGCAATATGCTTTAAATG
GTCCCCACATTGTCGGTATAGGCGCCACCGCAGTAAACTCCACCAGTCTCTCTCTTTTCC
TTCGGTATCTGATTAGAT


BQ
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AF RR4A037JQD U 1
AF RR4A037JQ U 1
BS 1 858 RR4A037JQ

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DS 

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CATAGCCTTTAAGGCCAACGTAGTGAGCTGGATTATTCGTCATCACCTTCATCGTTCTAA
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CAATCTGTCTCATAGCGATTGCTAATTGCTTTCCACCAGAGCCATTCCCAAATATATCAT
CTGTGATGCATTCAGCATGTACTCTCACCAGAACATCCTTCCCATCTCCGACTTCACCTT
TGACCATTGCAATGTGCTCAACTCCATCAAGCAATGACTTGAAGCAATATGCTTTAAATG
GTCCCCACATTGTCGGTATAGGCGCCACCGCAGTAAACTCCACCAGTCTCTCTCTTTTCC
TTCGGTATCTGATTAGAT

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 2

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TTAAGCCTAAAGATGTGGGCTATTATCACCTTGTGGTTTATCTTGGCTCCTATTGCCCAT
CGTTGGGAACTCGGCCCTATTTTTTTACTAGCGACTGGCTTCTCAATCATCTTGCTCAAC
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GAGCTTCCGGGTACATATAATGCAGAGCGTATAGACCGGGACATACGAGCAGGCCATATA
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TTATATATTTTTTAAAAATATGTATGATATCACACTTTTTGTC


BQ
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AF RR4CY80TF U 1
AF RR4CY80JQ C 113
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BS 671 671 RR4CY80JQ
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BS 737 756 RR4CY80TF
BS 757 943 RR4CY80JQ

RD RR4CY80TF 773 0 0
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GGAAGAAATGAGCAGCGACGATGGCACTGTGGAGATCACCCACAAAACCATCGGCCCATC
TCGACCGTCTCGAATTCGAGTGGCGTCTCGTATCAAAGTTGGTGATTTGAGGAATGCGAT
TGCCGAAAAGGGTCGGTTCCAGTCGCGAATTTGAGGATGATTCTCCGTGGAAAGGCATTG
CAAGACGAGGAAGATGGAGATGATGTATACGTCACCCTCAAGGACCAAGATTCCTTGACC
GTTGCTGTCATACCAAAGAGACCAGTTGGAATTGAGACATACGATGATGATGATGATGAT
GATGACGAGGAATTGAAGTTTCAGCTCCCAGCATCAGCAAGCAGGTGGAAGAGGAAGTTT
TACTACTTTCTTCGTAACAAGTTGAAGCTTCCCGATATCATCCTGATGGGACTTTTCTCT
TTAAGCCTAAAGATGTGGGCTATTATCACCTTGTGGTTTATCTTGGCTCCTATTGCCCAT
CGTTGGGAACTCGGCCCTATTTTTTTACTAGCGACTGGCTTCTCAATCATCTTGCTCAAC
CTTGGTAAACGACAACCTGGTGATGTCAGTGCATATTCCATATTCAACGAGGACTTTAGA
GAGCTTCCGG*TACATATAATGCAGAGCGTATAGACCGGGACATACGAGCAG*CCATATA
TA*TATGATGCAAA**TTGCATCAAAGATTTCTTTA
GATCACATCAGCGTCGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4CY80JQ 831 0 0
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AGGCATTGCAAGACGAGGAAGATGGAGATGATGTATACGTCACCCTCAAGGACCAAGATT
CCTTGACCGTTGCTGTCATACCAAAGAGACCAGTTGGAATTGAGACATACGATGATGATG
ATGATGATGATGACGAGGAATTGAAGTTTCAGCTCCCAGCATCAGCAAGCAGGTGGAAGA
GGAAGTTTTACTACTTTCTTCGTAACAAGTTGAAGCTTCCCGATATCATCCTGATGGGAC
TTTTCTCTTTAAGCCTAAAGATGTGGGCTATTATCACCTTGTGGTTTATCTTGGCTCCTA
TTGCCCATCGTTGGGAACTCGGCCCTATTTTTTTACTAGCGACTGGCTTCTCAATCATCT
TGCTCAACCTTGGTAAACGACAACCTGGTGATGTCAGTGCATATTCCATATTCAACGAGG
ACTTTAGAGAGCTTCCGGGTACATATAATGCAGAGCGTATAGACCGGGACATACGAGCAG
GCCATATATAATATGATGCAAAATTTGCATCAAAGATTTCTTTAAGATCAACATCAGCGG
TCGAACAGAACATATACAAATCTGCAACCAGAAGGAAAATATTAGATGTTTTGTGTACCA
TCAGATTGAGAGAACACAAAGCATGACAGTAACTTGTACATGAGAGATCTAATTTTGATA
TTTCAACCTTATATATTTTTTAAAAATATGTATGATATCACACTTTTTGTC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL7959Contig1 1043 2 2 U
GGACTCTGAGAACAGAGGAACTCGAGTCTTTACTCCGCAAGCAAGCAACAATGGTGAAGG
CAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTATGCCAGCTCATCGACGAGT
TCACACAGATCTTAGTCGTCGCCGCGGACAACGTGGGATCGACTCAGCTACAGAACATCA
GGAAGGGACTTCGCGGAGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACCATGATGAAACGTT
CGGTTAAGATCCACGCCGAGATTACGGGGAACACTGGGATCCTCAACCTCATGCCCCTCC
TTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAG
TTGCCAAGTACAAGGTCGGTGCTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTAGCCCCAATTGATGTGG
TTGTCCAGCCTGGTAACACCGGTCTCGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTA
ACATTCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCAGGCCGTTCTCATACGGTC
TTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGATCTCA
CGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTGCATGGTCACTTCCTTGGCTC
TAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCCCCGCATATGTTCATCAATGCATACAAGA
ATGCCTTGGCTATCTCTGTTGCCACTGAGTACACTTTCCCTCAAGCAGAGAAGGTTAAAG
AGTTCTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGTAGCGGCTGTGTCTGCTGATGCGG
GTGGTGGTGCTTCAGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTTGAGGAAT
CAGATGAAGAAGACTATGGTGGTTTTGACATGTTCGGTGATGAGTAGATTAATATATGAT
TTTTTTACACAAAGACACATTATGACTTCTCTATTACATCAAGAGACGTATTGCATTGAG
ACACTTTTTAGCGTTGATTTGTC


BQ
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AF RR4AW73TF U 1
AF RR4AW73JQ C 151
BS 1 773 RR4AW73TF
BS 774 1043 RR4AW73JQ

RD RR4AW73TF 776 0 0
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TCACACAGATCTTAGTCGTCGCCGCGGACAACGTGGGATCGACTCAGCTACAGAACATCA
GGAAGGGACTTCGCGGAGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACCATGATGAAACGTT
CGGTTAAGATCCACGCCGAGATTACGGGGAACACTGGGATCCTCAACCTCATGCCCCTCC
TTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAG
TTGCCAAGTACAAGGTCGGTGCTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTAGCCCCAATTGATGTGG
TTGTCCAGCCTGGTAACACCGGTCTCGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTA
ACATTCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCAGGCCGTTCTCATACGGTC
TTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGATCTCA
CGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTGCATGGTCACTTCCTTGGCTC
TAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCCCCGCATATGTTCATCAATGCATACAAGA
ATGCCTTGGCTATCTCTGTTGCCACTGAGTACACTTTCCCTCAAGCAGAGAAG
TTA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4AW73JQ 893 0 0
ACGTGGGATCGACTCAGCTACAGAACATCAGGAAGGGACTTCGCGGAGACTCAGTGGTGC
TCATGGGGAAGAACACCATGATGAAACGTTCGGTTAAGATCCACGCCGAGATTACGGGGA
ACACTGGGATCCTCAACCTCATGCCCCTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCA
AGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAAGTACAAGGTCGGTGCTCCTGCTC
GTGTGGGTTTGGTAGCCCCAATTGATGTGGTTGTCCAGCCTGGTAACACCGGTCTCGATC
CATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATTCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAG
TCGAAATCATCAGGCCGTTCTCATACGGTCTTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCT
CAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGATCTCACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCG
CTGGTATCTGCATGGTCACTTCCTTGGCTCTAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTG
CCCCGCATATGTTCATCAATGCATACAAGAATGCCTTGGCTATCTCTGTTGCCACTGAGT
ACACTTTCCCTCAAGCAGAGAAGGTTAAAGAGTTCTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTG
TTGCTGTAGCGGCTGTGTCTGCTGATGCGGGTGGTGGTGCTTCAGCTGGAGCTGCCAAGG
TAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTTGAGGAATCAGATGAAGAAGACTATGGTGGTTTTGACA
TGTTCGGTGATGAGTAGATTAATATATGATTTTTTTACACAAAGACACATTATGACTTCT
CTATTACATCAAGAGACGTATTGCATTGAGACACTTTTTAGCGTTGATTTGTC

QA 1 893 1 893
DS 



AS 1 2

CO CL7960Contig1 623 2 1 U
GAACGACGGGAACATATATTGAGTGACCAATTATCTTCATACGAAACATCAGCTATGCAA
CACCAAAACATGGGTGGACCTTTTGTTAATGACGTCGCTGGAGGCTGGCTGGCTGAAAAT
GGGCCTATTCAAACCCAATTATTCGACGCATCGACCAATTCAGCTATTTATGAAACGTTG
TTGCAAGGAAGTAGCTCAAGCTCGAACCAAAACAACAACATGAGTGAATGTAACGTGACA
AATCATAATGGTGACATGTTCCAAGAATGGGCCCAAGCTTATACTTCTACTACGGGTCTC
AATCCGTCGGCCTTGTTTCCCCCCATGCAGCATCAGCATGGAGTGGTGGATCCTAATATA
AAGGAAAGTGAAATGCCGGTTATAACGAGGGAGGCACAAGCAGACCACGAAGTCTCCGAC
TATGATATCAGAATGCCGCAGCTCAGTAGCCAATAATCTCCAAGAGATTTCAACTTACCA
ATATATTATTTACATTTTTATACGTTTTTATTATTATATAATAAGATTATACTTTGCTTT
GCCCAGGAGGCCAGGACTGAAAATTCGTTCTCTCTCATTTGTATATATAACTATTTCATG
AAATAACAGTTTAATCATTTATT


BQ
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AF RR4GP75JQ C 1
AF RR4GP75TF U 1
BS 1 623 RR4GP75TF

RD RR4GP75JQ 623 0 0
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CACCAAAACATGGGTGGACCTTTTGTTAATGACGTCGCTGGAGGCTGGCTGGCTGAAAAT
GGGCCTATTCAAACCCAATTATTCGACGCATCGACCAATTCAGCTATTTATGAAACGTTG
TTGCAAGGAAGTAGCTCAAGCTCGAACCAAAACAACAACATGAGTGAATGTAACGTGACA
AATCATAATGGTGACATGTTCCAAGAATGGGCCCAAGCTTATACTTCTACTACGGGTCTC
AATCCGTCGGCCTTGTTTCCCCCCATGCAGCATCAGCATGGAGTGGTGGATCCTAATATA
AAGGAAAGTGAAATGCCGGTTATAACGAGGGAGGCACAAGCAGACCACGAAGTCTCCGAC
TATGATATCAGAATGCCGCAGCTCAGTAGCCAATAATCTCCAAGAGATTTCAACTTACCA
ATATATTATTTACATTTTTATACGTTTTTATTATTATATAATAAGATTATACTTTGCTTT
GCCCAGGAGGCCAGGACTGAAAATTCGTTCTCTCTCATTTGTATATATAACTATTTCATG
AAATAACAGTTTAATCATTTATT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR4GP75TF 623 0 0
GAACGACGGGAACATATATTGAGTGACCAATTATCTTCATACGAAACATCAGCTATGCAA
CACCAAAACATGGGTGGACCTTTTGTTAATGACGTCGCTGGAGGCTGGCTGGCTGAAAAT
GGGCCTATTCAAACCCAATTATTCGACGCATCGACCAATTCAGCTATTTATGAAACGTTG
TTGCAAGGAAGTAGCTCAAGCTCGAACCAAAACAACAACATGAGTGAATGTAACGTGACA
AATCATAATGGTGACATGTTCCAAGAATGGGCCCAAGCTTATACTTCTACTACGGGTCTC
AATCCGTCGGCCTTGTTTCCCCCCATGCAGCATCAGCATGGAGTGGTGGATCCTAATATA
AAGGAAAGTGAAATGCCGGTTATAACGAGGGAGGCACAAGCAGACCACGAAGTCTCCGAC
TATGATATCAGAATGCCGCAGCTCAGTAGCCAATAATCTCCAAGAGATTTCAACTTACCA
ATATATTATTTACATTTTTATACGTTTTTATTATTATATAATAAGATTATACTTTGCTTT
GCCCAGGAGGCCAGGACTGAAAATTCGTTCTCTCTCATTTGTATATATAACTATTTCATG
AAATAACAGTTTAATCATTTATT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7961Contig1 642 2 2 U
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TCACCCTTTCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACGCATTCTACA
TCGAAACTGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGTTAAAATCTCGG
ACAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTTAATGGGAC
CAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAAGCGCAGTGTC
TTCCGAGCCCAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGTTTACCCGGCCT
GGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATCTTAAGAGTGAACATCAAT
ACTTCAATGTGGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGC
GGAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCT
CCTACGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGTTGCAATGC
CGATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCGTCTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CF01TF U 1
AF RR4CF01JQ C 258
BS 1 605 RR4CF01TF
BS 606 642 RR4CF01JQ

RD RR4CF01TF 605 0 0
GGACATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCTCCTCGTCA
TCACCCTTTCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACGCATTCTACA
TCGAAACTGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGTTAAAATCTCGG
ACAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTTAATGGGAC
CAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAAGCGCAGTGTC
TTCCGAGCCCAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGTTTACCCGGCCT
GGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATCTTAAGAGTGAACATCAAT
ACTTCAATGTGGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGC
GGAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCT
CCTACGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGTTGCAATGC
CGATA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR4CF01JQ 385 0 0
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TGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGCGGAACAACTGCCAGGTT
TTTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCTCCTAGGATCGTGTTGTA
AATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGTTGCAATGCCGATAATGTAAACGATC
CGATCGAATAAAAGTGTCGTCTCTG

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 2

CO CL7962Contig1 650 2 2 U
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TTTTCAAAACATGGCTTCAAAGAACATCACCATAGCTCTCTTCCTCACCATCAACCTCGT
CTTCTTCGGCTTTACCATGGCCCAAGCTCCTGGACCTCAAGCTCCGATATGTCCCAGAAG
CTCCACCCAGGTCCAAGCTTGTGTCAACAGGCTTACCTCTATCGTGGGCCTCAACGTTCT
ACCGCTGACGCAATGCTGTTCTCTAGTTGCTGGGCTTGCCCCCTCTGTGGCCTCTGTCTG
CATCTGCAATGCCTTAAAACTGTCAGTTCTCAATATATTGGAGATCAGTGTAAGACTTGG
TGAGGTTCTTAGGCCCTGCGGTGTTTCTCCCCCAGCTGATTTCGTATGCGCCTAATTCTC
TCTTATAAGACACCAGTTCCCTATTATCGGATAATAATGGTGCAAATATGCTTCTCTAAT
AATTATATGCGTGTTAGCAATATCTATATGTGGTTGAAAATAAAGCGAAACATTTGTACT
ATTTTTCCATGTTTCGTTGTTAACTATGTTCTTCAATTTAGATTTTCCGGTCGTAGGTTG
TATCTCTTGGTTCTGATTAAAAAAAAAAGTAATATACATATACTTTATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DS80JQ C 1
AF RR4DS80TF U 1
BS 1 623 RR4DS80TF
BS 624 650 RR4DS80JQ

RD RR4DS80JQ 650 0 0
GGACTCAACCCTCATCTCCAATAACATACAAAAAGTAAAGAAAGAGAAGCTTAATTAGAA
TTTTCAAAACATGGCTTCAAAGAACATCACCATAGCTCTCTTCCTCACCATCAACCTCGT
CTTCTTCGGCTTTACCATGGCCCAAGCTCCTGGACCTCAAGCTCCGATATGTCCCAGAAG
CTCCACCCAGGTCCAAGCTTGTGTCAACAGGCTTACCTCTATCGTGGGCCTCAACGTTCT
ACCGCTGACGCAATGCTGTTCTCTAGTTGCTGGGCTTGCCCCCTCTGTGGCCTCTGTCTG
CATCTGCAATGCCTTAAAACTGTCAGTTCTCAATATATTGGAGATCAGTGTAAGACTTGG
TGAGGTTCTTAGGCCCTGCGGTGTTTCTCCCCCAGCTGATTTCGTATGCGCCTAATTCTC
TCTTATAAGACACCAGTTCCCTATTATCGGATAATAATGGTGCAAATATGCTTCTCTAAT
AATTATATGCGTGTTAGCAATATCTATATGTGGTTGAAAATAAAGCGAAACATTTGTACT
ATTTTTCCATGTTTCGTTGTTAACTATGTTCTTCAATTTAGATTTTCCGGTCGTAGGTTG
TATCTCTTGGTTCTGATTAAAAAAAAAAGTAATATACATATACTTTATCG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4DS80TF 623 0 0
GGACTCAACCCTCATCTCCAATAACATACAAAAAGTAAAGAAAGAGAAGCTTAATTAGAA
TTTTCAAAACATGGCTTCAAAGAACATCACCATAGCTCTCTTCCTCACCATCAACCTCGT
CTTCTTCGGCTTTACCATGGCCCAAGCTCCTGGACCTCAAGCTCCGATATGTCCCAGAAG
CTCCACCCAGGTCCAAGCTTGTGTCAACAGGCTTACCTCTATCGTGGGCCTCAACGTTCT
ACCGCTGACGCAATGCTGTTCTCTAGTTGCTGGGCTTGCCCCCTCTGTGGCCTCTGTCTG
CATCTGCAATGCCTTAAAACTGTCAGTTCTCAATATATTGGAGATCAGTGTAAGACTTGG
TGAGGTTCTTAGGCCCTGCGGTGTTTCTCCCCCAGCTGATTTCGTATGCGCCTAATTCTC
TCTTATAAGACACCAGTTCCCTATTATCGGATAATAATGGTGCAAATATGCTTCTCTAAT
AATTATATGCGTGTTAGCAATATCTATATGTGGTTGAAAATAAAGCGAAACATTTGTACT
ATTTTTCCATGTTTCGTTGTTAACTATGTTCTTCAATTTAGATTTTCCGGTCGTAGGTTG
TATCTCTTGGTTCTGATTAAAAA

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7963Contig1 853 2 2 U
GGTCTCCACTGCGTTCGTCGTCGACTGTCCGTCTTACATGTGTCGATCCCTACCTAGCAT
GAAGCAAGAACGAGGCTGCGCCGCCGCGGGGATCGTGGACGGGAAGTTGTATGTGATGGG
AGGGTGTGACCCTCTGTCTTCGAACTGGGTGGAGGCTTTTGATCTAAAGACTCAGACTTG
GGAGACTGTGACGAGGGGTCTTTATAACAACGTGGAGGAGGTGTATGAGAAAACGATCAG
GAGTTTCGCGATGGATGATAAGATCTGCATAATGGATCGAAACAGTAGCTTTGTTTACGA
TCCTAAAGAAGGAAGCTTGGAGAGTGACTTGTTGTTGAACACGCGGTGGAGGGTGGGTTC
TTGCGTCATTGATGACAAGATGTACAGTTTTGATCTGGAGAATAAGTTATGGGAGTTTGA
TCCTGTCTCCAGGGTTTGGAGCCAAGTGAAGGGTCTTGAAGATTTTTCCGTTGAGCGTTG
TGATGTTTCTAAGATGGCGAGTTATGGTGGCAAAATTGCGATTTTGTGTAACCTTGATAG
GCGTTCTACGGAGATTTGGTACACGGAGATCGGGTTGGAAAGGAGGGAAGGAGGAGAGGT
TTGGGGGACCATCTTGTGTTCTAGTCTTGTGCTTGCTTCCGATGGTTTTTCTACCATTGT
ACGATCTCTCTCTGTGTCATTCTGATGAGTGATGATGACACTACTCCATTGAGCTTACAG
GTTTAAGTTTGAAAATGTATTTGAGCAGCTTGGTTTGATCGAGATGAAGATCTAAGGCGA
TAAACTATTGGATGTTGAATTTTCTTGCCCTTTGTTTCTTTCTTTTGCAAATCTATGGAT
GTGGTTTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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AF RR4CW63TF U 1
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QA 1 716 1 716
DS 

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TTGGGAGACTGTGACGAGGGGTCTTTATAACAACGTGGAGGAGGTGTATGAGAAAACGAT
CAGGAGTTTCGCGATGGATGATAAGATCTGCATAATGGATCGAAACAGTAGCTTTGTTTA
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TGATCCTGTCTCCAGGGTTTGGAGCCAAGTGAAGGGTCTTGAAGATTTTTCCGTTGAGCG
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TAGGCGTTCTACGGAGATTTGGTACACGGAGATCGGGTTGGAAAGGAGGGAAGGAGGAGA
GGTTTGGGGGACCATCTTGTGTTCTAGTCTTGTGCTTGCTTCCGATGGTTTTTCTACCAT
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GATGTGGTTTTATTTT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

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GTGTTTAAAGAACTGTTATTTAGTATCATACTTTGTAAATGAGTATAGAACTGAACCTGA
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BQ
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AF RR4AY45JQ C 1
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TTCTTCTGTCAAATAAAATAACATTTATTTCGAA

QA 1 574 1 574
DS 

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CTTCTGTCAAATAAAATAACATTTATTTCG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL7965Contig1 730 2 6 U
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TTTTAACTTA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP79TF U 1
AF RR4BP79JQ C 48
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RD RR4BP79TF 684 0 0
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GATGTTACCAGCGGATGTTCGTGTTGCTAGAGATGCACAAGATCTTCTCATCGAGTGTTG
TGTAGAGTTTATAAATCTGATATCGTCAGAGTCTAATGAAGTGTGTAACAAAGAGGATAA
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CGTTGAAGAAGTCTACGCTGCTTATGAGCAACATAAATACGAAACCATGCAAGATTCACA
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AGATCAAGAGCAACAAGTAGATGATAATACCCAACAGTCGAATCTACAAAGCTAATCAAG
AAGTAAGGGAGAATCCTTTTGTTTT*AACATTATCCTTTTGACTTTATTTTTCTAGCGTT
*CTTTGTAAAGTGCCCAAAAAAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4BP79JQ 683 0 0
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TCATCGAGTGTTGTGTAGAGTTTATAAATCTGATATCGTCAGAGTCTAATGAAGTGTGTA
ACAAAGAGGATAAACGAACAATCGCGCCTGAACATGTGCTCAAAGCGCTTCAGGTTCTTG
GCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTCTACGCTGCTTATGAGCAACATAAATACGAAACCA
TGCAAGATTCACAGAGGAGTGTGAAGATGAACAGCGGAGCAGAGATGACGGAGGAGGAAG
CAGCGGCGGAACAACAGAGGATGTTTGCTGAAGCTCGAGCTAGAATGAATGGTGGTGTTT
CTGTTCCTCAACCAGATCAAGAGCAACAAGTAGATGATAATACCCAACAGTCGAATCTAC
AAAGCTAATCAAGAAGTAAGGGAGAATCCTTTTGTTTTTAACATTATCCTTTTGACTTTA
TTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAGTGCCCAAAAAAAAAACATGGTCAGTCTTGGTGTTGA
TATGCTTTCCACATTTTAACTTA

QA 1 683 1 683
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTTAATCAATTTTTAATTATTAAAATTTACTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G570JQ C 1
AF RR4G570TF U 1
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BS 676 676 RR4G570JQ
BS 677 692 RR4G570TF

RD RR4G570JQ 692 0 0
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GCGACTTTGGTTGGTTTCCAGAGCATGCCAGGTCTTGTCATCCTTTACGCTTCCATCGTC
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ACTATTAGGAAGTTTGGGAACGGTACGACGGAGAAAGAAGCGACGATGCCGTATTTTCCG
ATGGCGACTTTGGTTTATTTTCAGTTTACTTTTGCGGCGATAACGACGATACTTGTGGCA
GGGTCGGTGTTGGGG*AGGATGAATATCAAAGCGTGGATGGCTTTTGTGCCATTGTGGTT
GATATTTAGCTACACTGTCGGAGCTTAGAGCATGTGCATTGCAAACAACCTTATTTGTTG
CTTAATCAATTTTTAATTATTAAAATTTACTG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4G570TF 692 0 0
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GGATCATTGACTCCTAGAAAGAGATAGAGATAGAGTGACATGGCCGGCGCTTACGATGCG
AGCTTACCGGGGGTTCCTGATTGGCTCAACAAAGGAGACAGCGCGTGGCAGCTCACGTCG
GCGACTCTGGTTGGTCTCCAGAGCATGCCAGGTCTTGTCATCCTCTACGCTTCCATCGTC
AAGAAGAAATGGGCCGTGAACTCCGCTTTTATGGCCCTTTACGCATTTGCCGCCGTTCTC
CTCTGCTGGGTCCTCCTCTGTTACAAAATGGCTTTCGGAGATGAGCTTGTGCCTTTCTGG
GGTAGAGGTGGTCCCGCCTTCGACCAAGGATACCTCAAAGGACAAGCCAAGATTCCAGAA
ACTATTAGGAAGTTTGGGAACGGTACGACGGAGAAAGAAGCGACGATGCCGTATTTTCCG
ATGGCGACTTTGGTTTATTTTCAGTTTACTTTTGCGGCGATAACGACGATACTTGTGGCA
GGGTCGGTGTTGGGGGAGGATGAATATCAAAGCGTGGATGGCTTTTGTGCCATTGTGGTT
GATATTTAGCTACACTGTCGGAGCTTAGAGCATGTGCATTGCAAACAACCTTATTTGTTG
CTTAATCAATTTTTA*TTATTAAAATTTACTG

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL7968Contig1 633 2 1 U
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TTCAGTGAAAAAGGTCGTCTGCAATGCAGAAATCTCGAGAAAGCGGTTTCTTGTTCTGCA
ATATGTGCTCAACGATGCTGGTTTTGAAATCAAGCAAGTATGCGGAATGTCCACTTTGCA
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GGATATCAGAAGAGAACTTTGAATATCTCTCTTTGGTGAAAAAACGCAGGAAGATACTGA
GCTGCCAAAGATCAAAAAGGCCTGCGAGAAATGCCAGCACCCTGAGCTTGTTTACACGAC
CAGACAGACAAGATCAGCAGACGAAGGACAAACAACATATTATACTTGCCCCAATTGTGG
ATATAGATTCACAGAAGGTTGAGATTATTACTACGTTCTCCAGCCAGTTTTGTGGTTGTT
ACATTTATATGTTGCGAACTCAATGTTCTACGACATGATCAAAACCTTTTATGTATTATT
GATTCTTCCATTTATGTTACGAGTTAATTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F064TF U 1
AF RR4F064JQ C 120
BS 1 633 RR4F064TF

RD RR4F064TF 633 0 0
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TTCAGTGAAAAAGGTCGTCTGCAATGCAGAAATCTCGAGAAAGCGGTTTCTTGTTCTGCA
ATATGTGCTCAACGATGCTGGTTTTGAAATCAAGCAAGTATGCGGAATGTCCACTTTGCA
AAACAACCCGAAATGCTAAGATATCATTGGCAAGGATATAGCTTACGTAGTTTCTGATGA
GGATATCAGAAGAGAACTTTGAATATCTCTCTTTGGTGAAAAAACGCAGGAAGATACTGA
GCTGCCAAAGATCAAAAAGGCCTGCGAGAAATGCCAGCACCCTGAGCTTGTTTACACGAC
CAGACAGACAAGATCAGCAGACGAAGGACAAACAACATATTATACTTGCCCCAATTGTGG
ATATAGATTCACAGAAGGTTGAGATTATTACTACGTTCTCCAGCCAGTTTTGTGGTTGTT
ACATTTATATGTTGCGAACTCAATGTTCTACGACATGATCAAAACCTTTTATGTATTATT
GATTCTTCCATTTATGTTACGAGTTAATTAGCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4F064JQ 514 0 0
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AATATGTGCTCAACGATGCTGGTTTTGAAATCAAGCAAGTATGCGGAATGTCCACTTTGC
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AGGATATCAGAAGAGAACTTTGAATATCTCTCTTTGGTGAAAAAACGCAGGAAGATACTG
AGCTGCCAAAGATCAAAAAGGCCTGCGAGAAATGCCAGCACCCTGAGCTTGTTTACACGA
CCAGACAGACAAGATCAGCAGACGAAGGACAAACAACATATTATACTTGCCCCAATTGTG
GATATAGATTCACAGAAGGTTGAGATTATTACTACGTTCTCCAGCCAGTTTTGTGGTTGT
TACATTTATATGTTGCGAACTCAATGTTTTACGACATGATCAAAACCTTTTATGTATTAT
TGATTCTTCCATTTATGTTACGAGTTAATTAGCC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL7969Contig1 622 2 1 U
GGGAGCAATGCATCACGACTGTCCCATTTGTTTCGAGTACCTCTTTGAATCACGGAACGA
TGTAACTGTACTGCCCTGTGGACACACCATCCATCAGAAGTGCCTGGAGGAAATGAGAGA
ACATTACCAATACGCGTGCCCGCTATGCTCAAAATCTGTATGCGACATGTCAAAGGTGCG
GGAGAAATTTGACGTGGAGATTGCTGCTACACCAATGCCAGAACCATACCAGAACAGAAT
GGTTCAGATCCTCTGCAACGACTGTGGGAAAAAATCGGAGGTGCAGTACCATGTGGTGGC
TCAGAAATGTCCGGACTGCAAATCATACAACACTCGCCAAACCCGAGGCTGAACTGAAGC
AGGCTTTTTTGTGAAAACATGGCGTTTTCAAGTTGGTATTTGCTATGAGATGCATTTACA
GAGCAAATTCACTTGAGCCAATCCTGTCATTTGGCTCCTTCACTTGAGGGAGAGTCATCT
CTTTACTCTCTGTTTCAGTATTATCTGGTTGGTCTTTTGTTAGCTGGTGTTCTGTAATAA
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TTGAATAGTTTCATTCAATCTC


BQ
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AF RR4F648JQ C 1
AF RR4F648TF U 1
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DS 

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GGGAGCAATGCATCACGACTGTCCCATTTGTTTCGAGTACCTCTTTGAATCACGGAACGA
TGTAACTGTACTGCCCTGTGGACACACCATCCATCAGAAGTGCCTGGAGGAAATGAGAGA
ACATTACCAATACGCGTGCCCGCTATGCTCAAAATCTGTATGCGACATGTCAAAGGTGCG
GGAGAAATTTGACGTGGAGATTGCTGCTACACCAATGCCAGAACCATACCAGAACAGAAT
GGTTCAGATCCTCTGCAACGACTGTGGGAAAAAATCGGAGGTGCAGTACCATGTGGTGGC
TCAGAAATGTCCGGACTGCAAATCATACAACACTCGCCAAACCCGAGGCTGAACTGAAGC
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CTTTACTCTCTGTTTCAGTATTATCTGGTTGGTCTTTTGTTAGCTGGTGTTCTGTAATAA
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TTGAATAGTTTCATTCAATCTC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

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GTGTATATTTGGTTTTATATATATATATATTACTTCGGACGGCAAAAAAAAAGAATCTTC
TTAATTTTCTATTTGATGTCCGTAGATTTTTACAGTCACGGTATCGATCAGACTTTAACT
TTTATTATCTATCTATTTTTTTGATGTGTATAGTGGTTGGTTGGTTTTAGCATCTCATTT
CTATGGTATTCATCCAATTTGCCTCTTAGAAGTGGTGACTTACTCAACATCAGTTTTGCC
GGCTTTTATTTTCGGGAGGCGGTGGTTTCTTCGACACCGTCATCGCCTATTTTTTCTAGG
TTTTTATTCCATTTTTTCTATCTATGAATATGAGACTTATCCGTTATTCTGCCTCTCGAT
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AF RR4AR04JQ C 1
AF RR4AR04TF U 1
BS 1 622 RR4AR04TF
BS 623 636 RR4AR04JQ

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GTGTATATTTGGTTTTATATATATATATATTACTTCGGACGGCAAAAAAAAAGAATCTTC
TTAATTTTCTATTTGATGTCCGTAGATTTTTACAGTCACGGTATCGATCAGACTTTAACT
TTTATTATCTATCTATTTTTTTGATGTGTATAGTGGTTGGTTGGTTTTAGCATCTCATTT
CTATGGTATTCATCCAATTTGCCTCTTAGAAGTGGTGACTTACTCAACATCAGTTTTGCC
GGCTTTTATTTTCGGGAGGCGGTGGTTTCTTCGACACCGTCATCGCCTATTTTTTCTAGG
TTTTTATTCCATTTTTTCTATCTATGAATATGAGACTTATCCGTTATTCTGCCTCTCGAT
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TCTTTTGATGCTTTCATAGTTCCACCATGTTCCAGATCTGACTCCGCCGTCGACGGGGTG
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QA 1 636 1 636
DS 

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GTGTATATTTGGTTTTATATATATATATATTACTTCGGACGGCAAAAAAAAAGAATCTTC
TTAATTTTCTATTTGATGTCCGTAGATTTTTACAGTCACGGTATCGATCAGACTTTAACT
TTTATTATCTATCTATTTTTTTGATGTGTATAGTGGTTGGTTGGTTTTAGCATCTCATTT
CTATGGTATTCATCCAATTTGCCTCTTAGAAGTGGTGACTTACTCAACATCAGTTTTGCC
GGCTTTTATTTTCGGGAGGCGGTGGTTTCTTCGACACCGTCATCGCCTATTTTTTCTAGG
TTTTTATTCCATTTTTTCTATCTATGAATATGAGACTTATCCGTTATTCTGCCTCTCGAT
TTTTGTCTATTGACGCATGCATGTATGATAAAAATGGAGGATCAATTGTAGGCATTTTAA
TCTTTTGATGCTTTCATAGTTCCACCATGTTCCAGATCTGACTCCGCCGTCGACGGGGTG
TCGGGATGAGTCTGTTATGTGGGCTTTTGTAGTATTGTATTTCGGACTTTGTTCCAGTTT
GGACTTCGACTCGTTAGTTAAT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL7971Contig1 1065 2 2 U
GGACAACACCCTTTGATCTTCTTCTCCTTCTTCTTATTAGGGTTTTCTTGTAATGTGTCT
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CTTGGAGGAACCGACTCTCCCTCTTTTCATGGTAATAACAATGGTGGATCCATCGGATCA
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CACACTCTCAGTCTTGAGGTTAAATGGAGCCTGCATGTTTCTTTC


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AF RR4EL21TF U 1
AF RR4EL21JQ C 369
BS 1 631 RR4EL21TF
BS 632 1065 RR4EL21JQ

RD RR4EL21TF 631 0 0
GGACAACACCCTTTGATCTTCTTCTCCTTCTTCTTATTAGGGTTTTCTTGTAATGTGTCT
GTAAGAAGAAAAAACAACATGATAGGAATCTCCGAGTCAATTTCAGACGGGGTCGAGACA
GAACCTGTGTCTGGATCTCCTTCTGATCTCAATCAGGCGGCGGATGTCGTCGTCCTGAGT
AACGAGTTTCGGAATGTGGTTCTTGATGAAGTTTCCAAGGATGGGAAGAAGATGATGAGT
GTCTCTGAGGGTGATGGGAAAGCCCTAGAGGAAGAGGTGGAAGAAGAAGATTGTGTGAGC
GAGGAGGAGGATGAGGGTCAAGTGTTGTTGTATCCGGTGAGGCCAGGAGCAGAGGATTGC
GCCTTTTACATGAAAACAGGGAGCTGCAAGTTCGGATCCACTTGCAAATTCAACCATCCT
CTTCCAAATCCCAGCAAAATCCAAATTGCTAAGGAGACTAAAGTAACAGAAAAGGAAGAG
GATGCTGATAAAATGAGACTCATGGATTGCAAGTATTACTTCAGGACAGGAGGTTGCAAA
TATGGATTAACTTGTAGATTCAACCACACTAAACCAAACTCTGATCTTCCCTCACCACCT
GAGCTTAACTTCCTCGGCCTTCCCATCAGAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4EL21JQ 697 0 0
CATGAAAACAGGGAGCTGCAAGTTCGGATCCACTTGCAAATTCAACCATCCTCTTCCAAA
TCCCAGCAAAATCCAAATTGCTAAGGAGACTAAAGTAACAGAAAAGGAAGAGGATGCTGA
TAAAATGAGACTCATGGATTGCAAGTATTACTTCAGGACAGGAGGTTGCAAATATGGATT
AACTTGTAGATTCAACCACACTAAACCAAACTCTGATCTTCCCTCACCACCTGAGCTTAA
CTTCCTCGGCCTTCCCATCAGACCAGGAGAAATTGAATGTCTTTTCTACATGCGCAATGG
CTCATGTAAGTTCGGAGCTGACTGCAAATTCAATCATCCTGATCCTACAACTCTTGGAGG
AACCGACTCTCCCTCTTTTCATGGTAATAACAATGGTGGATCCATCGGATCATTTTCCCC
CAGGTCGGTGCTAATGGGAATGAAAGTGACGGTTGGAATTGACACCAAAGCTTCATGAGC
TTGCATAACTGATACGTTTTGTCTTTTATCGTGGGTTTTCTTTTTTTTCAATTTTCGTCA
CAAAACGTTTTAGGTCAATTACACATTCTGAACAATGTCTATGTGGCAAGCCCTATCCTC
AGTGCTTTTGACAGATTTTCACCAAAGAACTTTTGTAATCTACCTTACCCACCACACTCT
CAGTCTTGAGGTTAAATGGAGCCTGCATGTTTCTTTC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL7972Contig1 901 2 4 U
GGGTGGGAAACAGACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATAATGGCGCGAGTTCTGCCTCT
GCATCATCCGTACAGAGCGACGACTGTACGAGCATCTTCGTCAAACGAAACCAAATACGA
CGGAGGCGTTCCGGAGGTCAAGCTCGCGGATCCTACCCGAAACTATCGGGTCTTGGTGCT
GGGTGGGACGGGTCGGGTCGGCGGGTCAACTTCTGTTGCTCTCTCTAAGCTCTGTCCCAA
GCTTAAGATCGTCGTCGCTGGACGTAACAGAGAGAAAGGTGAAGCAATGGTGGCTAAACT
GGGAGAGAACTCTGAGTTTTGTCAAGTGGATGTCAATGACAGTAACATGCTTCAGACAAG
TCTCAGAGACGTTGATCTTGTAGTACATGCTGCTGGACCTTTCCAGCAAGCTCCTAAGTG
CACTGTTCTTGAAGCTGCCATAAAGACCAAGGTGAGGATAAGGTAAAAAAAAAAGGAACA
TTTTCACTGAATCTTACCTTGTCTGTATGAATGAAGGAGTCCGAATCTTAGGAGATTAAA
CTTACATTTTTTTTTTTGGCTCATGTCTGCAACAGACTGCTTATATAGATGTTTGTGATG
ACACAAGCTACGCTTTCCGCGCTAAATCTCTTCAGGCAGAGGCCGTTTCTGCCAATGTCC
CGGCGATTACAACAGCTGGAATATATCCAGGAGTTAGCAACGGTGTTAAATCTTATCACA
AGCCTCCTCTTTCTTTTATGTTTTAGTTATAGTTCCCATTGATGCAAGTATTCAAAAGCT
TGTTTTGAATTTTCTCACTAGTGATGGCGGCAGAAATGGTCGCTGCAGCAAGAACTGAAG
ACAAAGGGAAGCCAGAGAAACTGAGGTAACACCAGGAACTTTCTCGGATGTTTATTATTG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4GD51TF U 1
AF RR4GD51JQ C 249
BS 1 635 RR4GD51TF
BS 636 636 RR4GD51JQ
BS 637 671 RR4GD51TF
BS 672 901 RR4GD51JQ

RD RR4GD51TF 674 0 0
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GCATCATCCGTACAGAGCGACGACTGTACGAGCATCTTCGTCAAACGAAACCAAATACGA
CGGAGGCGTTCCGGAGGTCAAGCTCGCGGATCCTACCCGAAACTATCGGGTCTTGGTGCT
GGGTGGGACGGGTCGGGTCGGCGGGTCAACTTCTGTTGCTCTCTCTAAGCTCTGTCCCAA
GCTTAAGATCGTCGTCGCTGGACGTAACAGAGAGAAAGGTGAAGCAATGGTGGCTAAACT
GGGAGAGAACTCTGAGTTTTGTCAAGTGGATGTCAATGACAGTAACATGCTTCAGACAAG
TCTCAGAGACGTTGATCTTGTAGTACATGCTGCTGGACCTTTCCAGCAAGCTCCTAAGTG
CACTGTTCTTGAAGCTGCCATAAAGACCAAGGTGAGGATAAGGTAAAAAAAAAAGGAACA
TTTTCACTGAATCTTACCTTGTCTGTATGAATGAAGGAGTCCGAATCTTAGGAGATTAAA
CTTACATTTTTTTTTTTGGCTCATGTCTGCAACAGACTGCTTATATAGATGTTTGTGATG
ACACAAGCTACGCTTTCCGCGCTAAATCTCTTCAG*CAGAGGCCGTTTCTGCCAATGTCC
CGGCGATTACA
CAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4GD51JQ 653 0 0
TCGTCGTCGCTGGACGTAACAGAGAGAAAGGTGAAGCAATGGTGGCTAAACTGGGAGAGA
ACTCTGAGTTTTGTCAAGTGGATGTCAATGACAGTAACATGCTTCAGACAAGTTTCAGAG
ACGTTGATCTTGTAGTACATGCTGCTGGACCTTTCCAGCAAGCTCCTAAGTGCACTGTTC
TTGAAGCTGCCATAAAGACCAAGGTGAGGATAAGGTAAAAAAAAAAGGAACATTTTCACT
GAATCTTACCTTGTCTGTATGAATGAAGGAGTCCGAATCTTAGGAGATTAAACTTACATT
TTTTTTTTTGGCTCATGTCTGCAACAGACTGCTTATATAGATGTTTGTGATGACACAAGC
TACGCTTTCCGCGCTAAATCTCTTCAGGCAGAGGCCGTTTCTGCCAATGTCCCGGCGATT
ACAACAGCTGGAATATATCCAGGAGTTAGCAACGGTGTTAAATCTTATCACAAGCCTCCT
CTTTCTTTTATGTTTTAGTTATAGTTCCCATTGATGCAAGTATTCAAAAGCTTGTTTTGA
ATTTTCTCACTAGTGATGGCGGCAGAAATGGTCGCTGCAGCAAGAACTGAAGACAAAGGG
AAGCCAGAGAAACTGAGGTAACACCAGGAACTTTCTCGGATGTTTATTATTGC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7973Contig1 1067 2 4 U
GGATACACATCAAATCAGGCACAATCTGTCGAGAGCTTACAAGGTCCAACTGTTGATGAT
CGGTGTCGGAAGGGATTTGAGAAGAGAGTTAGCTTGCAGGCCGGGCAAGATTTGCCTCTT
TATGCCACAAGTACCAGGAAGAGTAGTAAGACAAACCCATTGGTGTTTCCTAATGCTGCT
CCTATCCAAAAGATCGGGCTTGAGGATGACCACAGAAAAGTTGCGGCTAAAGTGGAAACA
TCAAACAGGACGGAAAGTTCATGTGTTAGCTCTGTAGTTGATGACATTTCACTGGAGGCA
ACAAGTTTTCGCCAGCTTCAACAAGTTATAGAACAGTTGGATGTTAGGACGAAGCTTAAC
ATAAGGGACAGCTTATACCGATTGGCAAAAAGCGCCGAGCAGAGACATCATTGTATGGAT
GCAAATGGTGGAAACAGACAGGTGAAAGGTGCTGGCTCGCATCTCGAGACTGGTGAAACA
GACAAGTACGTGGGATTCTTGGATATAGAAACTGATACAAACCCGATAGAGATCCATAGC
TCATTTGCTGTTTCATAGACCCTCAGACTCATCTCTTTCATCAGATCAGGATGTTCTCTC
TTATAAATCCCATCCAATGATTCCTCAGCCCAACAGTAGTCCGAGCCTGAGGATAGAGAA
CCAAGAGGAAACCCAAGAACTTAGAACCGAAGCTGTAGCAAGTGACAACAAGTAGTGATG
TCAACTGGAAACCGGCTCTTTCAGTGCTGAACCAAACCGAGACATGGTTGTGCCAGTTAG
TTACAAAACTCCTGAATGGGTCTTTCATTAGAATCATGGATTTTGTAACGCGGTCGGGAA
TGATTGTCTGGTTTGGATTCCATTTCGAATTTGATTCTACATTGTACACTTGGTTGCTCG
GGTCTTTGAGACGTGTTTATTGCCCTTGTCGTATGTTCAAGTTGTTAAGTAGAGAGGCAC
ATAGCAATTCTGTAGATAAAGATGTTAGTATCTCTTTTTCTTTTCTGTTGCAATGCTATA
ATCACTCTGCTGCTGTGTATATCTCTCAACATCAATTACTTAAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BD26TF U 1
AF RR4BD26JQ C 169
BS 1 787 RR4BD26TF
BS 788 788 RR4BD26JQ
BS 789 832 RR4BD26TF
BS 833 1067 RR4BD26JQ

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GCAAATGGTGGAAACAGACAGGTGAAAGGTGCTGGCTCGCATCTCGAGACTGGTGAAACA
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TCAACTGGAAACCGGCTCTTTCAGTGCTGAACCAAACCGAGACATGGTTGTGCCAGTTAG
TTACAAA*CTCCTGAATGGGTCTTTCATTAGAATCATGGATTTTGTAACGCG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4BD26JQ 899 0 0
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ACGAAGCTTAACATAAGGGACAGCTTATACCGATTGGCAAAAAGCGCCGAGCAGAGACAT
CATTGTATGGATGCAAATGGTGGAAACAGACAGGTGAAAGGTGCTGGCTCGCATCTCGAG
ACTGGTGAAACAGACAAGTACGTGGGATTCTTGGATATAGAAACTGATACAAACCCGATA
GAGATCCATAGCTCATTTGCTGTTTCATAGACCCTCAGACTCATCTCTTTCATCAGATCA
GGATGTTCTCTCTTATAAATCCCATCCAATGATTCCTCAGCCCAACAGTAGTCCGAGCCT
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CAAGTAGTGATGTCAACTGGAAACCGGCTCTTTCAGTGCTGAACCAAACCGAGACATGGT
TGTGCCAGTTAGTTACAAAACTCCTGAATGGGTCTTTCATTAGAATCATGGATTTTGTAA
CGCGGTCGGGAATGATTGTCTGGTTTGGATTCCATTTCGAATTTGATTCTACATTGTACA
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GTAGAGAGGCACATAGCAATTCTGTAGATAAAGATGTTAGTATCTCTTTTTCTTTTCTGT
TGCAATGCTATAATCACTCTGCTGCTGTGTATATCTCTCAACATCAATTACTTAAGAAC

QA 1 899 1 899
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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10 

AF RR4F478JQ U 9
AF RR4F478TF C 1
BS 1 17 RR4F478TF
BS 18 636 RR4F478JQ
BS 637 661 RR4F478TF

RD RR4F478JQ 628 0 0
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TCTTCTACTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTGTTCACCTTCTTCATTTCCGCCTTCACTC
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TGGAAAACAGATGATATGT

QA 10 628 10 628
DS 

RD RR4F478TF 661 0 0
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TTCCTTGACACATGACACACTTAAGACAAAGAGCTGGAGAAGTTCACAAGTTTTAAAGAT
TGTCACAAGACTCACAATACTAAAAAATGAAAACACACAAATTTTAAAGATTTTACAACA
CTTATCATCAATCATCAATTCATCATGTTGCATTTCTTCTCTTTGTCACCACCTTCTTCT
TCTTTCCACCACCACCTTCTTCTACTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTGTTCACCTTCTT
CATTTCCGCCTTCACTCACTCTTCTTTCGCTTCATGTTCATCTTCAGAATCACCTCTCCC
AGTATATCATCACATGTGACACCTGGCCAAGAACAGCAGTCCACGCTCTTGTTCCATGAA
AGTGTTGTTACACGTTCGTCATCCTTGATATGGTCCGGGAACTCCTTTTTTAACTCCAAA
AGAGCATCTCTTTGGTCGGGGCGGCACAAGGATTGTGCAAATATGTTTGGTAGGGGGTGG
AGGAAAAAGAAGAAAAACATGGTAACTATACCACGAGAACAATAAAATTTGCTTGGAATC
ATCGGCTCTCTACAATTTGGAAAACAGATGATATGTTTAGACTTGAATGGTATGTGATCC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL7975Contig1 1002 2 2 U
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CTTCTAGCTGTTTCATGGGATTTGCCATCACCGTGGTATTACCTAGCTGTGGAATTAAGT
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GTCGTTTCCTTCGTCCTACACGGCCTTTGTTGGGCAGACATCAAAGGAGAATGTCATGGA
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GACTTGCCCTTGGACTTTTCCTAGACTCATTCAAGTTTTAGCTCAAGACCTTGAAAGCGA
GAAAACACAACCGAAACCTGGCTCAAGAATGGACAGTGACCAGCAAAATTTGACAAGTTG
TGTATCCTTTTATGCCATGAAAGTTGTGAAGACTTAAAGTCAGGTCACTGCAAGACATGG
AAAGATCAAACCCTCCGATCTACACAAAGCAAGTCACCAGCAAACAGTGCTAGAGAGTCT
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GATTCCCTGAGTTATTTTCTCCCACTTCTCTTTTTTATCAAAGATGTCACAAGCTCACAA
AACATCTTATGGATTTACATAGCTATGCAAGCATTTGAGAGC


BQ
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AF RR4FW09TF U 1
AF RR4FW09JQ C 296
BS 1 374 RR4FW09TF
BS 375 1002 RR4FW09JQ

RD RR4FW09TF 374 0 0
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CTTCTAGCTGTTTCATGGGATTTGCCATCACCGTGGTATTACCTAGCTGTGGAATTAAGT
TCTTGCCAAGGAGGAGTTTTGGAGACAAGGGTGCTTTCTATCTTGCCGCTTGTTCTGTTT
GTCGTTTCCTTCGTCCTACACGGCCTTTGTTGGGCAGACATCAAAGGAGAATGTCATGGA
CAACAATCAGGAGCTCGGTTGGTGGGAGCCGAACAGATCCACCATCCGGTTCTTCAAGTA
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TGGTGAAAATTCAG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR4FW09JQ 707 0 0
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GGTGGGATTCTACTCTGCAACTGCTTTCTCTACGTTTATAGGACAAACAGGAGACTGGGA
TGTTTTATCCGCAGCATTGGCTGTAATCGTAGTCGAATGCATCGGAGCTTTAATGTACAG
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GACCGGACTTGCCCTTGGACTTTTCCTAGACTCATTCAAGTTTTAGCTCAAGACCTTGAA
AGCGAGAAAACACAACCGAAACCTGGCTCAAGAATGGACAGTGACCAGCAAAATTTGACA
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CATGGAAAGATCAAACCCTCCGATCTACACAAAGCAAGTCACCAGCAAACAGTGCTAGAG
AGTCTGTATAGCCTTATATGTATTTGGTTGCATCGTTGCAGATGGATACGTTTAATATAA
GCATTGATTCCCTGAGTTATTTTCTCCCACTTCTCTTTTTTATCAAAGATGTCACAAGCT
CACAAAACATCTTATGGATTTACATAGCTATGCAAGCATTTGAGAGC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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GGTTCCAACATCAAGTACGGATGTGAACGAAACGTAACGCAAGAAGATATAGTATGGGCT
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GTTGATGATGATTTACTCAGTGGAGGGCAGAAACAGCGGATTGCCATTGCTCGTGCCATC
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GACAGTGGACGAGTCGTTGAGATGGGCAATCACGAAGAGCTTATGAGCAAAGATGGGTTA
TACGCGAGATTGACTAAGAGACAAGCCGATGCTGTTGTATGATTGATCCTCTAAGCTTTT
ACACATGCAAATACAGTTCGTGATTAGTGTCATGATTATGTTTTTGATGGTCATGACAAA
ATGTAATGATAGAAATTTGTGTAAAAAGATGCAAACAACCATAGTTCATTCTTTACTTC


BQ
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AF RR4E660JQ C 1
AF RR4E660TF U 1
BS 1 659 RR4E660TF

RD RR4E660JQ 659 0 0
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GGTTCCAACATCAAGTACGGATGTGAACGAAACGTAACGCAAGAAGATATAGTATGGGCT
GCAAAGCAAGCCTATGCACATGACTTCATCACAGCGCTTCCCAATGGTTACAACACAATT
GTTGATGATGATTTACTCAGTGGAGGGCAGAAACAGCGGATTGCCATTGCTCGTGCCATC
CTTAGAGATCCTAAAATACTCATCCTAGATGAAGCCACAAGTGCACTTGATGCAGAGAGC
GAGCACAACGTTAAGGGAGTACTTCGTTCGATCGGAAGCGACCCAGCAACGAAGAGAAGC
GTCATAGTGATAGCACACAGGCTTTCCACTATTAAGGCTGCGGATAGAATAGTGGCTATG
GACAGTGGACGAGTCGTTGAGATGGGCAATCACGAAGAGCTTATGAGCAAAGATGGGTTA
TACGCGAGATTGACTAAGAGACAAGCCGATGCTGTTGTATGATTGATCCTCTAAGCTTTT
ACACATGCAAATACAGTTCGTGATTAGTGTCATGATTATGTTTTTGATGGTCATGACAAA
ATGTAATGATAGAAATTTGTGTAAAAAGATGCAAACAACCATAGTTCATTCTTTACTTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4E660TF 659 0 0
GGGCTAAGGCAAAGAATCGGATACGTGGGGCAGGAACCAAAACTCTTCCGCACAGACATC
GGTTCCAACATCAAGTACGGATGTGAACGAAACGTAACGCAAGAAGATATAGTATGGGCT
GCAAAGCAAGCCTATGCACATGACTTCATCACAGCGCTTCCCAATGGTTACAACACAATT
GTTGATGATGATTTACTCAGTGGAGGGCAGAAACAGCGGATTGCCATTGCTCGTGCCATC
CTTAGAGATCCTAAAATACTCATCCTAGATGAAGCCACAAGTGCACTTGATGCAGAGAGC
GAGCACAACGTTAAGGGAGTACTTCGTTCGATCGGAAGCGACCCAGCAACGAAGAGAAGC
GTCATAGTGATAGCACACAGGCTTTCCACTATTAAGGCTGCGGATAGAATAGTGGCTATG
GACAGTGGACGAGTCGTTGAGATGGGCAATCACGAAGAGCTTATGAGCAAAGATGGGTTA
TACGCGAGATTGACTAAGAGACAAGCCGATGCTGTTGTATGATTGATCCTCTAAGCTTTT
ACACATGCAAATACAGTTCGTGATTAGTGTCATGATTATGTTTTTGATGGTCATGACAAA
ATGTAATGATAGAAATTTGTGTAAAAAGATGCAAACAACCATAGTTCATTCTTTACTTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7978Contig1 1378 2 4 U
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AACAGTGCAAACCCAAGTGGTAGCAGAGTTAACTTCTCCCCTCCTAGTGCAATGTCAAGA
GCCGCGATGAGTCGTGTAACCAGTGTTGCTTCAGGATCTTTAGTGGTTGGCTCAGGGTTG
TCTGTACGTAGACCACCAGGCGGTGGTGTGCCAGCACATGTAAGAGGCGAATTAAACACA
GCAATTATCGGTTTAGGTGATGATGGTGGCTATGGTGGAGGATGGGTTCCTCTTGTGGCT
CTTAAAAAAGTTTTGCGTGGTATCCTTAAATATCTTGGAGTACTGTGGCTGTTTGCTCAG
CTACCAGATCTCTTGAGAGAAATCTTAGGTTCAATCTTGAAGGAGAACGAAGGCGCTCTC
TTGAATCTATACCAAGAACAACCAGCGTTACGCTTCTTTGTCGGTGGCTATGTATTTGCG
GTGAGTGTCCATAGAGTTCAGCTTCTTCTTCAAGTCCTTAGCGTGAGGAGATTCCATCAC
GGGCAGCCACAGCAGCAAAACGGTTCATCAGCTCAAGAGGAATTAACCCAAACTGAAATT
GGAGAAATCTGTGACTATTTCAGCAGACGCGTTGCGTCAGAGCCTTACGATGCTTCAAGA
GTTGCCTCGTTCATAACACTCCTCACAGTACCCATTCATGTGCTAAGAGAGTTTCTAAAA
CTGATAGCTTGGAAGAAGGGCTTATCGCAATCACAGCAAGCTGGAGAAGTTACTCCTGCG
CAGAGACCTAGAATCGAGCTATGTCTAGAGAACCATTCCGGTGCAACAGATGTAGAAAAC
AGCTGTGCGGCTAAAAGCAATATCCATTTCGACCGGCCTCAGAACACGGTTGACTTTGCT
TTGACCGTGGTTCTTGATCCTGCGCACATACCTCACATAAACGCAGCTGGAGGAGCGGCG
TGGTTGCCTTACTGTGTATCGGTTAGGTTAAGGTACACCTTTGGGGAAAACCCTAGCGTG
ACGTTTCTTGGGATGGAAGGAAGCCATGGAGGTCGGGCTTGTTGGCAGCGTGTTGATGAT
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TGTCTTCAAGGTCTCAGAGAAGGCAGTAGTAATAACACTCTTCAAAAGGAGTTTACCATA
TAGGGGAGATGAACTTTTGTCAGTTTGTTGGTTTAATGTGTACATACAATCCTTTTGGTT
GTGAAATTTTGGTTGAATTTAGACAATACCATAATCAAAAATTTGCTTCAGAAAGACC


BQ
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AF RR4BC41TF U 1
AF RR4BC41JQ C 510
BS 1 855 RR4BC41TF
BS 856 856 RR4BC41JQ
BS 857 870 RR4BC41TF
BS 871 1378 RR4BC41JQ

RD RR4BC41TF 870 0 0
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TCTGTACGTAGACCACCAGGCGGTGGTGTGCCAGCACATGTAAGAGGCGAATTAAACACA
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CTACCAGATCTCTTGAGAGAAATCTTAGGTTCAATCTTGAAGGAGAACGAAGGCGCTCTC
TTGAATCTATACCAAGAACAACCAGCGTTACGCTTCTTTGTCGGTGGCTATGTATTTGCG
GTGAGTGTCCATAGAGTTCAGCTTCTTCTTCAAGTCCTTAGCGTGAGGAGATTCCATCAC
GGGCAGCCACAGCAGCAAAACGGTTCATCAGCTCAAGAGGAATTAACCCAAACTGAAATT
GGAGAAATCTGTGACTATTTCAGCAGACGCGTTGCGTCAGAGCCTTACGATGCTTCAAGA
GTTGCCTCGTTCATAACACTCCTCACAGTACCCATTCATGTGCTAAGAGAGTTTCTAAAA
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AGCTGTGCGGCTAAA*GCAATATCCATTTC

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR4BC41JQ 869 0 0
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CGTTGCGTCAGAGCCTTACGATGCTTCAAGAGTTGCCTCGTTCATAACACTCCTCACAGT
ACCCATTCATGTGCTAAGAGAGTTTCTAAAACTGATAGCTTGGAAGAAGGGCTTATCGCA
ATCACAGCAAGCTGGAGAAGTTACTCCTGCGCAGAGACCTAGAATCGAGCTATGTCTAGA
GAACCATTCCGGTGCAACAGATGTAGAAAACAGCTGTGCGGCTAAAAGCAATATCCATTT
CGACCGGCCTCAGAACACGGTTGACTTTGCTTTGACCGTGGTTCTTGATCCTGCGCACAT
ACCTCACATAAACGCAGCTGGAGGAGCGGCGTGGTTGCCTTACTGTGTATCGGTTAGGTT
AAGGTACACCTTTGGGGAAAACCCTAGCGTGACGTTTCTTGGGATGGAAGGAAGCCATGG
AGGTCGGGCTTGTTGGCAGCGTGTTGATGATTGGGAGAAGTGTAAACAGAGAGTGAGCCG
TACGGTTGAAGTCAATGGTTCTGCTGCAGGAGATGTGACTCAAGGGAAGCTCAAGTTGGT
TGCTGATAGTGTCCAGAGAACATTGCATCTGTGTCTTCAAGGTCTCAGAGAAGGCAGTAG
TAATAACACTCTTCAAAAGGAGTTTACCATATAGGGGAGATGAACTTTTGTCAGTTTGTT
GGTTTAATGTGTACATACAATCCTTTTGGTTGTGAAATTTTGGTTGAATTTAGACAATAC
CATAATCAAAAATTTGCTTCAGAAAGACC

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL7979Contig1 1124 2 2 U
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GAATGTTAAACGCGTCAGTGAGTTAATGGGTGCCGACATGCTCCTCCTGGTCGCCAAGGA
GCAGTTTTAACTTCAAGCTGTCAGACTCTCCTGTCTCAATCCGGTTTCAAAGACTTATCC
GACCAAGTTTCACCAATTCCTGAGTTCCTCGATCACGATGAGTTGCTTGATCTAACAAAC
ACAAACACCCATCTTACAGATATCATAGGTGAGCCTACTGCTATAAAGAGCATTTTAAGT
GGCCCTCTAGAAGACAAAAGCCGTGTCATGGCGATCATCATACTTGACAGTGGTGTGTCT
GTCACTGTGAGTGCGTTCGACACTCAGGCTGTATCGTTTGACAAACAAATTGAAGGCTAC
AAGGTCGATCCACAGTGGTTGTTGCAACATGCATTAATCTGAAGCTTATAGGAGGTATTT
TGTTCATGAATGTGCATCTGAACTGATTTCTATTACTGATGCTGTCGATTGCTACAAGTT
GGTCACAAATGGCATTGGGAATACATCAGAAGCTTCATTGTTGAGAGGCTATGACAAGGT
TGAGCCAAAGACAATAGCTGAGCTTAACAAATTTATCATCACAGCCGAACCTCAGAAAAT
AGAATTTATCTACACTGGAAATGTCACCTACATCAAGACAGAAAATAGATGGTGCTACAT
CCAAGTGCTTGGACACTTCAGAGGAGTGCCTCATCGTTTGCATGCATGTTCTGCAATCAG
ACAAATGCCGTTGGTGGTTTCAGGTAAAAAGGACATTTTAGTTGTTCCTTTTTATAAAGA
TATAGACGTAAATTAGGTGGTCTATACTTGAATTCAACCTGGTCAAGGAGCAAGACTACA
GAAGGGACATGATTCTCATCGTGCCCTCACCGATAACGTACTGGACAGATGTTATGATTG
TTTCCACTACAAACAGATGGAAAAATTCATTCGTTTCGTTATTTGACACCACAGCCATTC
ACAACCCACCATATTCAGACTGTAATTATCTTCTTCTTCATGACACTGTGATTTACTCAC
CTTACTGTTAAGTTTTTCTGTTAATATAATAACTTCCTTCTAGT


BQ
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AF RR4D288TF U 1
AF RR4D288JQ C 401
BS 1 771 RR4D288TF
BS 772 1124 RR4D288JQ

RD RR4D288TF 771 0 0
GAAGGCTGGCCGCTGCACCTCCACCGTCAACCTCTGTTTACTTAGGTTCTGGGGAGCAAG
GAATGTTAAACGCGTCAGTGAGTTAATGGGTGCCGACATGCTCCTCCTGGTCGCCAAGGA
GCAGTTTTAACTTCAAGCTGTCAGACTCTCCTGTCTCAATCCGGTTTCAAAGACTTATCC
GACCAAGTTTCACCAATTCCTGAGTTCCTCGATCACGATGAGTTGCTTGATCTAACAAAC
ACAAACACCCATCTTACAGATATCATAGGTGAGCCTACTGCTATAAAGAGCATTTTAAGT
GGCCCTCTAGAAGACAAAAGCCGTGTCATGGCGATCATCATACTTGACAGTGGTGTGTCT
GTCACTGTGAGTGCGTTCGACACTCAGGCTGTATCGTTTGACAAACAAATTGAAGGCTAC
AAGGTCGATCCACAGTGGTTGTTGCAACATGCATTAATCTGAAGCTTATAGGAGGTATTT
TGTTCATGAATGTGCATCTGAACTGATTTCTATTACTGATGCTGTCGATTGCTACAAGTT
GGTCACAAATGGCATTGGGAATACATCAGAAGCTTCATTGTTGAGAGGCTATGACAAGGT
TGAGCCAAAGACAATAGCTGAGCTTAACAAATTTATCATCACAGCCGAACCTCAGAAAAT
AGAATTTATCTACACTGGAAATGTCACCTACATCAAGACAGAAAATAGATGGTGCTACAT
CCAAGTGCTTGGACACTTCAGAGGAGTGCCTCATCGTTTGCATGCATGTTC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4D288JQ 724 0 0
ACAAACAAATTGAAGGCTACAAGGTCGATCCACAGTGGTTGTTGCAACATGCATTAATCT
GAAGCTTATAGGAGGTATTTTGTTCATGAATGTGCATCTGAACTGATTTCTATTACTGAT
GCTGTCGATTGCTACAAGTTGGTCACAAATGGCATTGGGAATACATCAGAAGCTTCATTG
TTGAGAGGCTATGACAAGGTTGAGCCAAAGACAATAGCTGAGCTTAACAAATTTATCATC
ACAGCCGAACCTCAGAAAATAGAATTTATCTACACTGGAAATGTCACCTACATCAAGACA
GAAAATAGATGGTGCTACATCCAAGTGCTTGGACACTTCAGAGGAGTGCCTCATCGTTTG
CATGCATGTTCTGCAATCAGACAAATGCCGTTGGTGGTTTCAGGTAAAAAGGACATTTTA
GTTGTTCCTTTTTATAAAGATATAGACGTAAATTAGGTGGTCTATACTTGAATTCAACCT
GGTCAAGGAGCAAGACTACAGAAGGGACATGATTCTCATCGTGCCCTCACCGATAACGTA
CTGGACAGATGTTATGATTGTTTCCACTACAAACAGATGGAAAAATTCATTCGTTTCGTT
ATTTGACACCACAGCCATTCACAACCCACCATATTCAGACTGTAATTATCTTCTTCTTCA
TGACACTGTGATTTACTCACCTTACTGTTAAGTTTTTCTGTTAATATAATAACTTCCTTC
TAGT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7980Contig1 773 2 5 U
GGAGAGTCACTAAGAAGTAACTACGTCCGAATGAACAACAAAAACATAACGATGGGTCAA
CGCTTAGAAGTTGAAGGAATCACTCCTGCTCAGGCCGATGTGGAAGTGACATTCAACGTG
GGACAATGTCTAGAGAAAGCTGAGGCATTCGACCCGAGCTTCACATTCAAACCGTTTGAT
TTGTGTAAAATAAAAGGCTCGAATGTGACAGGTGGTGTTGGACCTTTTGGTCTGATCACA
TTGGCCACTCCTGATTTGGAAGAGTACACTCCTGTCTTCTTTAGAGTCTTCAAAGACACC
TCTACATATAAGCCTAAGGTTCTCATGTGCTCCGATGCTAGACCTTCATCGTTGAAGCAA
GACAGGGGTCCACTCAAACAAGATAGGATGTACAAACCATCATTTGCTGGTTTTGTGGAT
GTTGATCTATCTAATGGAAGGATCTCTTTAAGGAGTTTGATTGATCACTCGGTAGTAGAG
AGCTTCGGAGCATTGGGGAAGACAGTCATAACGTCAAGAGTGTATCCAGTGAAAGCAGTG
AAAGAGAATGCGCATTTGTATGTGTTTAACAATGGAACACAAACTGTGAACGTAGAGAGT
CTCGATGCATGGAGCATGGAGAGGCCACTGAAGATGAATAATGGAGCTCTTTAATTAACT
CTCATTTATCCTTTCTTATAATGTTGGTTAGTAACTACGAGATGATTTGATGACATAGAA
AGAAAACTTTGTGATTTTCTGTGTGTTTATCAATATGATTAGTGCATGTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB19TF U 80
AF RR4DJ55TF U 1
BS 1 161 RR4DJ55TF
BS 162 162 RR4DB19TF
BS 163 561 RR4DJ55TF
BS 562 562 RR4DB19TF
BS 563 773 RR4DJ55TF

RD RR4DB19TF 645 0 0
G
CACTCCTGCTCATGCCGATGTGGAAGTGACATTCAACGTGGGACAATGTCTAGAGAAAGC
TGAGGCATTCGACCCGAGCTTCACATTCAAACCGTTTGATTTGTGTAAAATAAAAGGCTC
GAATGTGACAGGTGGTGTTGGACCTTTTGGTCTGATCACATTGGCCACTCCTGATTTGGA
AGAGTACACTCCTGTCTTCTTTAGAGTCTTCAAAGACACCTCTACATATAAGCCTAAGGT
TCTCATGTGCTCCGATGCTAGACCTTCATCGTTGAAGCAAGACAGGGGTCCACTCAAACA
AGATAGGATGTACAAACCATCATTTGCTGGTTTTGTGGATGTTGATCTATCTAATGGAAG
GATCTCTTTAAGGAGTTTGATTGATCACTCGGTAGTAGAGAGCTTCGGAGCATTGGGGAA
GACAGTCATAACGTCAAGAGTGTATCCAGTGAAAGCAGTGAAAGAGAATGCGCATTTGTA
TGTGTTTAACAATGGAACACAAACTGTGAACGTAGAGAGTCTCGATGCATGGAGCATGGA
GAGGCCTCTGAAGATGAATAATGGAGCTCTTTAATTAACTCTCATTTATCCTTTCTTATA
ATGTTGGTTAGTAACTACGAGATGATTTGATGACAT
TAGAAAGA

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR4DJ55TF 773 0 0
GGAGAGTCACTAAGAAGTAACTACGTCCGAATGAACAACAAAAACATAACGATGGGTCAA
CGCTTAGAAGTTGAAGGAATCACTCCTGCTCAGGCCGATGTGGAAGTGACATTCAACGTG
GGACAATGTCTAGAGAAAGCTGAGGCATTCGACCCGAGCTT*ACATTCAAACCGTTTGAT
TTGTGTAAAATAAAAGGCTCGAATGTGACAGGTGGTGTTGGACCTTTTGGTCTGATCACA
TTGGCCACTCCTGATTTGGAAGAGTACACTCCTGTCTTCTTTAGAGTCTTCAAAGACACC
TCTACATATAAGCCTAAGGTTCTCATGTGCTCCGATGCTAGACCTTCATCGTTGAAGCAA
GACAGGGGTCCACTCAAACAAGATAGGATGTACAAACCATCATTTGCTGGTTTTGTGGAT
GTTGATCTATCTAATGGAAGGATCTCTTTAAGGAGTTTGATTGATCACTCGGTAGTAGAG
AGCTTCGGAGCATTGGGGAAGACAGTCATAACGTCAAGAGTGTATCCAGTGAAAGCAGTG
AAAGAGAATGCGCATTTGTATTTGTTTAACAATGGAACACAAACTGTGAACGTAGAGAGT
CTCGATGCATGGAGCATGGAGAGGCCACTGAAGATGAATAATGGAGCTCTTTAATTAACT
CTCATTTATCCTTTCTTATAATGTTGGTTAGTAACTACGAGATGATTTGATGACATAGAA
AGAAAACTTTGTGATTTTCTGTGTGTTTATCAATATGATTAGTGCATGTCCGC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL7981Contig1 661 2 2 U
GGGATGGTGCAGCGAGAGAGAGGAGATCCAATAACTTTGGGAGACAAAGAAGACAACCAA
TTCATCTCACCTTTGTCAGTCTCAATTGGGTTTCTTGACTCTGCTTCAAAAATGTTCTTT
AACCCATTCAGTGGAAACATCTCATTGACACCAGAGTATTGTTCACCTCGAATTCCAGGT
GGTATCCTTGCTGATGAGATGGGATTGGGGAAAACAGTTGAACTACTTGCTTGCATCTTT
TCTCATCGAAAACCAGACGAGGAGGAAGAAACATCTGTGTCTAATGGGTCACCTGTACCT
GATGATTTAAAAACTGGCTTGAAGAGGTGGATGGAAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTT
TGGTCGGAACAGAGTGTGTCCACCAGAATAGTGTACAGAGGAAACTCTGTGGCTTCCACA
TTGTCGCCAGGGAAACTCTTTACTTTTGACAAAGATTTGAGATGCATTCGGACAGAGAAC
TTATAGAAAGTAAGATACGAGATCTGTTTTTGTCATCATAATGTTTTGTTCATCTAAGAG
AGAGAGAGGAAAAAGCATTGTTTTGTCCATCGTTCAACGAGCTATGTACAAGTGTAACGT
AACCCACATGTGTCCACACAAACAAGTTTACAGTGAAGTAATGTATCTTGTTATCTATTC
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 

AF RR4F034TF U 1
AF RR4F034JQ C 1
BS 1 659 RR4F034TF
BS 660 661 RR4F034JQ

RD RR4F034TF 659 0 0
GGGATGGTGCAGCGAGAGAGAGGAGATCCAATAACTTTGGGAGACAAAGAAGACAACCAA
TTCATCTCACCTTTGTCAGTCTCAATTGGGTTTCTTGACTCTGCTTCAAAAATGTTCTTT
AACCCATTCAGTGGAAACATCTCATTGACACCAGAGTATTGTTCACCTCGAATTCCAGGT
GGTATCCTTGCTGATGAGATGGGATTGGGGAAAACAGTTGAACTACTTGCTTGCATCTTT
TCTCATCGAAAACCAGACGAGGAGGAAGAAACATCTGTGTCTAATGGGTCACCTGTACCT
GATGATTTAAAAACTGGCTTGAAGAGGTGGATGGAAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTT
TGGTCGGAACAGAGTGTGTCCACCAGAATAGTGTACAGAGGAAACTCTGTGGCTTCCACA
TTGTCGCCAGGGAAACTCTTTACTTTTGACAAAGATTTGAGATGCATTCGGACAGAGAAC
TTATAGAAAGTAAGATACGAGATCTGTTTTTGTCATCATAATGTTTTGTTCATCTAAGAG
AGAGAGAGGAAAAAGCATTGTTTTGTCCATCGTTCAACGAGCTATGTACAAGTGTAACGT
AACCCACATGTGTCCACACAAACAAGTTTACAGTGAAGTAATGTATCTTGTTATCTATT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4F034JQ 661 0 0
GGGATGGTGCAGCGAGAGAGAGGAGATCCAATAACTTTGGGAGACAAAGAAGACAACCAA
TTCATCTCACCTTTGTCAGTCTCAATTGGGTTTCTTGACTCTGCTTCAAAAATGTTCTTT
AACCCATTCAGTGGAAACATCTCATTGACACCAGAGTATTGTTCACCTCGAATTCCAGGT
GGTATCCTTGCTGATGAGATGGGATTGGGGAAAACAGTTGAACTACTTGCTTGCATCTTT
TCTCATCGAAAACCAGACGAGGAGGAAGAAACATCTGTGTCTAATGGGTCACCTGTACCT
GATGATTTAAAAACTGGCTTGAAGAGGTGGATGGAAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTT
TGGTCGGAACAGAGTGTGTCCACCAGAATAGTGTACAGAGGAAACTCTGTGGCTTCCACA
TTGTCGCCAGGGAAACTCTTTACTTTTGACAAAGATTTGAGATGCATTCGGACAGAGAAC
TTATAGAAAGTAAGATACGAGATCTGTTTTTGTCATCATAATGTTTTGTTCATCTAAGAG
AGAGAGAGGAAAAAGCATTGTTTTGTCCATCGTTCAACGAGCTATGTACAAGTGTAACGT
AACCCACATGTGTCCACACAAACAAGTTTACAGTGAAGTAATGTATCTTGTTATCTATTC
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL7982Contig1 593 2 1 U
GGATCATTATCTGATTCGGTTCCTCCGTCGTAATATCTCAGCTTCCGGTTATCTTAGGTG
GCGGTGATGGCGGCAGCTCATGGACTGGTGGTCCAGAAAACAGAGGAGGAGTGGCGTGCG
ATCCTTTCTCCTGAGCAGTTTAGGATTCTTCGACAAAAAGGCACTGAAATAGCAGGAACT
GGAGAATATGACAAGTTCTTCGAGGATGGAATTTTCAGCTGTGTCGGATGCAAAACTCCT
CTCTATAAATCTACCACCAAGTTCGACTCCGGATGTGGGTGGCCAGCTTTCTTTGAAGGA
TTCCCTGGTGCCATTAACCGAGCGCCTGATCCAGATGGGAGAAGAACAGAGATAACTTGT
GCAGTATGCGACGGGCATTTAGGCCATGTTATTAAAGGAGAAGGTTATGGTACTCCTACC
GATGAACGCCACTGCGTTAACAGCGTTTCGATCATCTTCAACCCGCAAAAACCACCTGAG
GAGGCTGAGGATTGATCATAAAATATAATCAATCAGATATTTACTGTGTTCTTTAGTTCT
CCGGTTTGCTCATGTGAAATAATTCAGAATAATAATGTTGGATCATCTTTGCC


BQ
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AF RR4B192JQ C 1
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QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DK45JQ C 1
AF RR4DK45TF U 1
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AAAATAGTTGATACTTCGCCTTTAGATACTATCTGTTTGGTTCACAAATAATATTGCTTT
CAATTGCTACCATATCTCATCTCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FD07TF U 1
AF RR4FD07JQ C 119
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RD RR4FD07TF 747 0 0
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AAGAGCTCATCCTCAGCCGCGTCTCCCACAAAGAATCTCAGATCGATTCCGTTCGACGAG
AGATTACTCGGCTCTACATCTTCTTCTTCCTCTTCCACTCCATTTCCCTCCTCCTCCTCT
TCCACGCCGCTTCCTCTTCTTCTACTTCTTCATCATCAGCCTGTAAGAGATCATGGATCC
CTTCTCTCTGCTCCCTCGTGTCTTCGCTCGGGATCATATGGGCCGTGAGGTACAAGTCTG
AAGTCGAGTCGCATGCCGAGAAGTTGTTGGAGAGGGAGAGAGAAGACGAAGCTGCTGCGG
AAGTGCGTTGAGGAGTTGAAGAAGAAAGGGGTTGAGTTTGATTTGCTTAAGGAAGTGGAC
GCTCTTCGTAGGGCGAAGAGCTTGAGGGTTGAGTCGAAGTTGGTGGCTGCTGCTGTGAGG
AAATGGTCTGCGAGGGATTTCGTGACGCTCTTCTTCTTCTCTGTTTCGTGTTTGGTTCTT
GCGATGGTTAGGCTCATTCTCTGCGATTAGATTCTTCTCTTGCTTTTTTTCTCTCTCTCT
TTTGT*ATACTCTGCAGTACTATTTAG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4FD07JQ 710 0 0
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AGAAGAGCTCATCCTCAGCCGCGTCTCCCACAAAGAATCTCAGATCGATTCCGTTCGACG
AGAGATTACTCGGCTCTACATCTTCTTCTTCCTCTTCCACTCCATTTCCCTCCTCCTCCT
CTTCCACGCCGCTTCCTCTTCTTCTACTTCTTCATCATCAGCCTGTAAGAGATCATGGAT
CCCTTCTCTCTGCTCCCTCGTGTCTTCGCTCGGGATCATATGGGCCGTGAGGTACAAGTC
TGAAGTCGAGTCGCATGCCGAGAAGTTGTTGGAGAGGGAGAGAGAAGACGAAGCTGCTGC
GGAAGTGCGTTGAGGAGTTGAAGAAGAAAGGGGTTGAGTTTGATTTGCTTAAGGAAGTGG
ACGCTCTTCGTAGGGCGAAGAGCTTGAGGGTTGAGTCGAAGTTGGTGGCTGCTGCTGTGA
GGAAATGGTCTGCGAGGGATTTCGTGACGCTCTTCTTCTTCTCTGTTTCGTGTTTGGTTC
TTGCGATGGTTAGGCTCATTCTCTGCGATTAGATTCTTCTCTTGCTTTTTTTCTCTCTCT
CTTTTGTTATACTCTGCAGTACTATTTAGCAGAAAGTTTCTTGTTTCTGCAAGTTGTAAT
GTTTTTTTTGGAGATAATAAAGAGAATAAAAACATGTTTGATTCTCTTTC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL7985Contig1 846 2 2 U
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TGATCATCCTGATCTTAGAATGGGTAACTCAATCGGTTCCCGGAAGCTGGAAACGGCTGC
GATGGCTGGCGGAAAAGTTGTATTATCCGACGGAAGAGTACAAAACTTAGAGGAAGAGAC
GACGGTAGCTGAGATCATGCTGGAGAATCCTCAACACGTCGTTGTCGAGTTCGATCCTTC
ATCGATAACATTCAACAAGGATGGAAAGACGGTGAAGAAGAAGCTGACTCCTTTACCGGC
GGACAACACACTCGAGCCGGGAAAAATCTATCTGGTCCTCCCCGCCAAAAGAAGCGGTGG
TAGCGGCGGCGGAGCCAAATCATCATCATCATCCTCGGCGGTGATGACGTCAGAGGAGAT
ACGTAAAATGCTGTTTAGCGCCACGGCGATGGTAAGGTCATCGTTTAGCTACTATGAAGG
GATTCTTCCTTGGTTTACTGCTAGAAGTTATAATAATAGTAATAGTCCGGCGGTCGATGC
GGTGGTTGCTGCTACGTCGGTTGGAAAGTTGGAGGCGGAGGAGGAAGGCAGGTCGGAGTT
TTTGAGCAGGCAACTGTCGGGAAGAGGGTGGAAACCAAGCTTGGATCCTATCAAGGAGAA
GAAAGCAAAGAAGAAAATCCATCAACTGTTGTCGTTTTAGTTACGGCGTCGTTTCACTGT
GTATCCCTTTTCTTTGTGTTTTGTTTCTGCATGTGCTCTAGTCGTAAATTATTTCGTTAC
GTGCGTGTGTGTATGTACGCCGGTCACGAGAAACTCACGTGAACCCTAAAACTATTTTAT
GCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4CN84TF U 1
AF RR4CN84JQ C 73
BS 1 606 RR4CN84TF
BS 607 846 RR4CN84JQ

RD RR4CN84TF 606 0 0
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TGATCATCCTGATCTTAGAATGGGTAACTCAATCGGTTCCCGGAAGCTGGAAACGGCTGC
GATGGCTGGCGGAAAAGTTGTATTATCCGACGGAAGAGTACAAAACTTAGAGGAAGAGAC
GACGGTAGCTGAGATCATGCTGGAGAATCCTCAACACGTCGTTGTCGAGTTCGATCCTTC
ATCGATAACATTCAACAAGGATGGAAAGACGGTGAAGAAGAAGCTGACTCCTTTACCGGC
GGACAACACACTCGAGCCGGGAAAAATCTATCTGGTCCTCCCCGCCAAAAGAAGCGGTGG
TAGCGGCGGCGGAGCCAAATCATCATCATCATCCTCGGCGGTGATGACGTCAGAGGAGAT
ACGTAAAATGCTGTTTAGCGCCACGGCGATGGTAAGGTCATCGTTTAGCTACTATGAAGG
GATTCTTCCTTGGTTTACTGCTAGAAGTTATAATAATAGTAATAGTCCGGCGGTCGATGC
GGTGGTTGCTGCTACGTCGGTTGGAAAGTTGGAGGCGGAGGAGGAAGGCAGGTCGGAGTT
TTTGAG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4CN84JQ 774 0 0
TCTTAGAATGGGTAACTCAATCGGTTCCCGGAAGCTGGAAACGGCTGCGATGGCTGGCGG
AAAAGTTGTATTATCCGACGGAAGAGTACAAAACTTAGAGGAAGAGACGACGGTAGCTGA
GATCATGCTGGAGAATCCTCAACACGTCGTTGTCGAGTTCGATCCTTCATCGATAACATT
CAACAAGGATGGAAAGACGGTGAAGAAGAAGCTGACTCCTTTACCGGCGGACAACACACT
CGAGCCGGGAAAAATCTATCTGGTCCTCCCCGCCAAAAGAAGCGGTGGTAGCGGCGGCGG
AGCCAAATCATCATCATCATCCTCGGCGGTGATGACGTCAGAGGAGATACGTAAAATGCT
GTTTAGCGCCACGGCGATGGTAAGGTCATCGTTTAGCTACTATGAAGGGATTCTTCCTTG
GTTTACTGCTAGAAGTTATAATAATAGTAATAGTCCGGCGGTCGATGCGGTGGTTGCTGC
TACGTCGGTTGGAAAGTTGGAGGCGGAGGAGGAAGGCAGGTCGGAGTTTTTGAGCAGGCA
ACTGTCGGGAAGAGGGTGGAAACCAAGCTTGGATCCTATCAAGGAGAAGAAAGCAAAGAA
GAAAATCCATCAACTGTTGTCGTTTTAGTTACGGCGTCGTTTCACTGTGTATCCCTTTTC
TTTGTGTTTTGTTTCTGCATGTGCTCTAGTCGTAAATTATTTCGTTACGTGCGTGTGTGT
ATGTACGCCGGTCACGAGAAACTCACGTGAACCCTAAAACTATTTTATGCAGTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7986Contig1 774 2 2 U
GGAACCGAAAGAAGCGAAGCCATGGCTACAGAACCGATCATCCAAGGAGCAATCTTGCTC
CTAACCTTCGTTATGTTCTGGGCGCTCAAGTACCTCTCTCAACAAGGCCTAACCAAGTTC
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CTCGCTCGAGCCCGAGCCACCCCTAAGAAATCTCAATCACAGTTCCTCGCCAAGACCGCG
CTCACCGAAGCCGACGACGTGATCGCGATCTCTCCGGACGACGCCGCCGGTCACATAGTC
CGTGCCTTATCTCTGGATCTGCTCGGCCACCACACCGCCGCTCTCAGATCGTTCGACACG
GCACCGACTTATCCGAGGCTGAAGTCGCTTTCCGTGGGGGAGCGAGTGACGCGCTCGTGA
AGAGAGCTGAGATGAAGGTCGCTGTGAATCGTAGACGGAGGAATGATTCGGCGATCGAAG
ATCTGGAGGAGGCGACGCGGCTCGCCGCCGGGACGGATACGGCGAGGATATTCCGTCTTT
TGGGGGAGTGTTATGAGTTCAAAGGCTTGAAAGAGAAGGCCCAGTGGGCTTTTAACGAAG
CACTGAAAGCTCAATAGAGTTCTGTTAACGGTTCGTGATGGATGAGAAGGACCGAGAGTA
GTAGTTCGTAGCTATCTCCCTTGTAACTTCTTATTTCACTTTGGACCCCGTTTTTTTTGG
TATTCTTTTAGTTGGGTGACTGTTGATTACTTAAGGAAAAAAACTTCAAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BN48TF U 1
AF RR4BN48JQ C 71
BS 1 708 RR4BN48TF
BS 709 774 RR4BN48JQ

RD RR4BN48TF 708 0 0
GGAACCGAAAGAAGCGAAGCCATGGCTACAGAACCGATCATCCAAGGAGCAATCTTGCTC
CTAACCTTCGTTATGTTCTGGGCGCTCAAGTACCTCTCTCAACAAGGCCTAACCAAGTTC
CGAACCAAACACCGAGCCGCACTCCAAACCCAGCGTCAGCTAATCCAAGCCTCTCGCCTC
CTCGCTCGAGCCCGAGCCACCCCTAAGAAATCTCAATCACAGTTCCTCGCCAAGACCGCG
CTCACCGAAGCCGACGACGTGATCGCGATCTCTCCGGACGACGCCGCCGGTCACATAGTC
CGTGCCTTATCTCTGGATCTGCTCGGCCACCACACCGCCGCTCTCAGATCGTTCGACACG
GCACCGACTTATCCGAGGCTGAAGTCGCTTTCCGTGGGGGAGCGAGTGACGCGCTCGTGA
AGAGAGCTGAGATGAAGGTCGCTGTGAATCGTAGACGGAGGAATGATTCGGCGATCGAAG
ATCTGGAGGAGGCGACGCGGCTCGCCGCCGGGACGGATACGGCGAGGATATTCCGTCTTT
TGGGGGAGTGTTATGAGTTCAAAGGCTTGAAAGAGAAGGCCCAGTGGGCTTTTAACGAAG
CACTGAAAGCTCAATAGAGTTCTGTTAACGGTTCGTGATGGATGAGAAGGACCGAGAGTA
GTAGTTCGTAGCTATCTCCCTTGTAACTTCTTATTTCACTTTGGACCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4BN48JQ 704 0 0
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ACCGAGCCGCACTCCAAACCCAGCGTCAGCTAATCCAAGCCTCTCGCCTCCTCGCTCGAG
CCCGAGCCACCCCTAAGAAATCTCAATCACAGTTCCTCGCCAAGACCGCGCTCACCGAAG
CCGACGACGTGATCGCGATCTCTCCGGACGACGCCGCCGGTCACATAGTCCGTGCCTTAT
CTCTGGATCTGCTCGGCCACCACACCGCCGCTCTCAGATCGTTCGACACGGCACCGACTT
ATCCGAGGCTGAAGTCGCTTTCCGTGGGGGAGCGAGTGACGCGCTCGTGAAGAGAGCTGA
GATGAAGGTCGCTGTGAATCGTAGACGGAGGAATGATTCGGCGATCGAAGATCTGGAGGA
GGCGACGCGGCTCGCCGCCGGGACGGATACGGCGAGGATATTCCGTCTTTTGGGGGAGTG
TTATGAGTTCAAAGGCTTGAAAGAGAAGGCCCAGTGGGCTTTTAACGAAGCACTGAAAGC
TCAATAGAGTTCTGTTAACGGTTCGTGATGGATGAGAAGGACCGAGAGTAGTAGTTCGTA
GCTATCTCCCTTGTAACTTCTTATTTCACTTTGGACCCCGTTTTTTTTGGTATTCTTTTA
GTTGGGTGACTGTTGATTACTTAAGGAAAAAAACTTCAAATGCT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL7987Contig1 826 2 4 U
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GTTTATAAAAAAAAAAAACTCTCTGTGTAGCTGCAAGCCTGCAACCATGGGTGGTTGTCT
CTCTGCCTCAGCGTCCTGTGATAAAGTTGTGGATAATATTTCTCAATGGTTATGTGTGAA
AGCGAGCTATATTCACAACCTTGAGAAAAATCTCAGAGATTTGGAGACAGCCATGGAAGA
GTTGAAGGCAAGGCGAGATGATTTGTCAGCAAGGGTGGACAATGAGGAGATGAAAGGTCT
ACGAAAGCTTTCTGAAGTCCAGGTATGGCTTACTAAAGTAGTAAACCTCGAAAATGAAGT
CAATGGTCTGGTCAATGTTAGAGAAACTGAGCTCGAAAGGCTATGTCTTTGTGGGGTTTG
CTCCAAAAGTTTAAAACTGAGTTATAGTTATGGGAAACGGGTGTTCTTAAAGTTGGGCGA
GGTTGAGAAACACAAATCTGAAGGGTTTTTTGGAGTTGTAGCTGGGAAAGCTCCAGCGTC
TGAGGTGATAGAGAGGCCTATTCAACCTACAACCGTCTGTCAAGAAGAGATTCTTGAAAA
AGCATGGAACCGTCTCATGAGTGATGATGGTGTTGGTATTATGGGGTTGCACGGTATGGG
GGGGAGTTGGAAAAACTACACTCCTCACTCAGATCAACAATAAATTTACCGAGAAGAATA
ATACTTTTGATGTGATTTGGGTTGAGGTGTCTAAAGAGCTAAAGATCCAAAAGATTCAAA
ACCAGGTTGCAAAGAAACTAGGCTTGGATGGAGATGACTGGAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK69TF U 1
AF RR4GK69JQ C 103
BS 1 720 RR4GK69TF
BS 721 721 RR4GK69JQ
BS 722 773 RR4GK69TF
BS 774 826 RR4GK69JQ

RD RR4GK69TF 773 0 0
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GTTTATAAAAAAAAAAAACTCTCTGTGTAGCTGCAAGCCTGCAACCATGGGTGGTTGTCT
CTCTGCCTCAGCGTCCTGTGATAAAGTTGTGGATAATATTTCTCAATGGTTATGTGTGAA
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GTTGAAGGCAAGGCGAGATGATTTGTCAGCAAGGGTGGACAATGAGGAGATGAAAGGTCT
ACGAAAGCTTTCTGAAGTCCAGGTATGGCTTACTAAAGTAGTAAACCTCGAAAATGAAGT
CAATGGTCTGGTCAATGTTAGAGAAACTGAGCTCGAAAGGCTATGTCTTTGTGGGGTTTG
CTCCAAAAGTTTAAAACTGAGTTATAGTTATGGGAAACGGGTGTTCTTAAAGTTGGGCGA
GGTTGAGAAACACAAATCTGAAGGGTTTTTTGGAGTTGTAGCTGGGAAAGCTCCAGCGTC
TGAGGTGATAGAGAGGCCTATTCAACCTACAACCGTCTGTCAAGAAGAGATTCTTGAAAA
AGCATGGAACCGTCTCATGAGTGATGATGGTGTTGGTATTATGGGGTTGCACGGTATGGG
GGGGAGTTGGAAAAACTACACTCCTCACTCAGATCAACAATAAATTTACCGAGAAGAATA
*TACTTTTGATGTGATTTGGGTTGAGGTGTCTAAAGAGCTAAAGATCCAAAAG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4GK69JQ 724 0 0
AACCATGGGTGGTTGTCTCTCTGCCTCAGCGTCCTGTGATAAAGTTGTGGATAATATTTC
TCAATGGTTATGTGTGAAAGCGAGCTATATTCACAACCTTGAGAAAAATCTCAGAGATTT
GGAGACAGCCATGGAAGAGTTGAAGGCAAGGCGAGATGATTTGTCAGCAAGGGTGGACAA
TGAGGAGATGAAAGGTCTACGAAAGCTTTCTGAAGTCCAGGTATGGCTTACTAAAGTAGT
AAACCTCGAAAATGAAGTCAATGGTCTGGTCAATGTTAGAGAAACTGAGCTCGAAAGGCT
ATGTCTTTGTGGGGTTTGCTCCAAAAGTTTAAAACTGAGTTATAGTTATGGGAAACGGGT
GTTCTTAAAGTTGGGCGAGGTTGAGAAACACAAATTTGAAGGGTTTTTTGGAGTTGTAGC
TGGGAAAGCTCCAGCGTCTGAGGTGATAGAGAGGCCTATTCAACCTACAACCGTCTGTCA
AGAAGAGATTCTTGAAAAAGCATGGAACCGTCTCATGAGTGATGATGGTGTTGGTATTAT
GGGGTTGCACGGTATGGGGGG*AGTTGGAAAAACTACACTCCTCACTCAGATCAACAATA
AATTTACCGAGAAGAATAATACTTTTGATGTGATTTGGGTTGAGGTGTCTAAAGAGCTAA
AGATCCAAAAGATTCAAAACCAGGTTGCAAAGAAACTAGGCTTGGATGGAGATGACTGGA
ACCG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7988Contig1 665 2 2 U
TTTTATCATCACAAGCATCCTTAAAGAGAAAATAAGAAACAAAGATAAAAATAAAGTACA
TAGAAAGACTTGAGAAACATCCAAAAGGTTCTAAAGAGACCAAAAAAAAAACAACCACAA
TAACAACATATAGTTTCAGTCCCATCTCAACAAGGGGAGATCGTACCAAACTCATACCAC
CACGAACGAGAGAAGAAACACCTTAGAAGCATTTCCTGTGGACGATGGATGGACCGGACT
CATCGTACTCTCCCTTCGAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAG
ATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCAGGCGGTGCAACCACCTTGATCTTCATGC
TGCTTGGTGCCAGCGCGGTGATCTCCTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGG
TCGAACCACCACTGAGCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCGCACT
TCATGATGGAGTTGTATGTCGTCTCATGGATTCCAGGGGCTTCCATCCCGACAAGCGACG
GCTGGAAGAGTACTTCAGGGCAACGGAATCCTTCAGCTCCAATGGTGATGACTTGTCCAT
CAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACCGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCCAGCTCTTGCT
CGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR4CN96TF C 1
AF RR4CN96JQ U 8
BS 1 7 RR4CN96TF
BS 8 665 RR4CN96JQ

RD RR4CN96TF 665 0 0
TTTTATCATCACAAGCATCCTTAAAGAGAAAATAAGAAACAAAGATAAAAATAAAGTACA
TAGAAAGACTTGAGAAACATCCAAAAGGTTCTAAAGAGACCAAAAAAAAAACAACCACAA
TAACAACATATAGTTTCAGTCCCATCTCAACAAGGGGAGATCGTACCAAACTCATACCAC
CACGAACGAGAGAAGAAACACCTTAGAAGCATTTCCTGTGGACGATGGATGGACCGGACT
CATCGTACTCTCCCTTCGAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAG
ATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCAGGCGGTGCAACCACCTTGATCTTCATGC
TGCTTGGTGCCAGCGCGGTGATCTCCTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGG
TCGAACCACCACTGAGCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCGCACT
TCATGATGGAGTTGTATGTCGTCTCATGGATTCCAGGGGCTTCCATCCCGACAAGCGACG
GCTGGAAGAGTACTTCAGGGCAACGGAATCCTTCAGCTCCAATGGTGATGACTTGTCCAT
CAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACCGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCCAGCTCTTGCT
CGTAC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR4CN96JQ 658 0 0
ATCACAAGCATCCTTAAAGAGAAAATAAGAAACAAAGATAAAAATAAAGTACATAGAAAG
ACTTGAGAAACATCCAAAAGGTTCTAAAGAGACCAAAAAAAAAACAACCACAATAACAAC
ATATAGTTTCAGTCCCATCTCAACAAGGGGAGATCGTACCAAACTCATACCACCACGAAC
GAGAGAAGAAACACCTTAGAAGCATTTCCTGTGGACGATGGATGGACCGGACTCATCGTA
CTCTCCCTTCGAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCC
AATCCAGACACTGTATTTCCTCTCAGGCGGTGCAACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGG
TGCCAGCGCGGTGATCTCCTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTCGAACC
ACCACTGAGCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCGCACTTCATGAT
GGAGTTGTATGTCGTCTCATGGATTCCAGGGGCTTCCATCCCGACAAGCGACGGCTGGAA
GAGTACTTCAGGGCAACGGAATCCTTCAGCTCCAATGGTGATGACTTGTCCATCAGGTAG
CTCGTAGTTCTTCTCCACCGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCCAGCTCTTGCTCGTAC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL7989Contig1 1000 2 4 U
GGGTTAACATGAGAAAGGAAAAGTTCCTGCTTGCATTCCAGGCTGTCAAGCAATTGCTTA
AATTGGACGCGGAGAACCCTGATTCACATCGTTCACTGGTTAAATTCTTTCTCAGGACAG
GATCGACAAGTGCTCCAACGACTAAAGCTGAGAAACTTCGTTGGAGTGTCCTAGAGGCTG
AGCGCCCATCAATCAGTCAACTGCAGAATAAATCATTATTGGAGGCAAACAAAGAGTTTC
TTGGTCGACACGAAGATTCTTTGGTGCACAGAGCGGCATACGCAGAAACGCTGTACCTTT
TAGATCAAAGCAAGAAAACTGAGGCTATCAAAGTAATTGAAGATTCAACCAACAAAGTGG
TTCAACAAACAAATGGAGCTCTCGGACAAGCAAGAGAGTGGAAACTCAAAGAATGTATGG
CAGTTCATAAGCTCCTAGAGACAGTTTTCCTCGACTCAGAAGCTGCCTCCAGATGGAAAT
CACGCTGTGCCGAGTATTTTCCCTGGTCGACTCACTTTGAAGGCAAGCGTAGCTCTGTGA
TGCCTGATTCAGTGTACAACTCTTGTCGCAAGAGTAATGAGAGTGGCGACACACCAAACC
ATCCAATGGGTAACGATGGACAGCTCGAAGCATTCAAGAGCCTTGCCGTCTCTACGTGAA
GCTCTTTTTTCGTATTAATAAGAGAGGCACAAAGACAGAGGATCCGTTGTTGCAGACCTT
CGATCATACTTGATGAATCTTTTTGCAGAGGGGTGGAACAAAGATGTTTGGAGTTGTAAC
AGCGCCAAATGTGTAATAACTGTTTTATCTCTATATAAGGAGGCTGCGTTTCTCAAGTCT
GATGAACACAATGGCACAGAGAAAGAAATGATCTTTTTGTCTCTCTTTTCGTTTTGTTTT
CTCCCTTTCGGCACTTCACGAGGATTTTTCGAGCTTTCTTTTGTTGTTGTACCCTTGTTA
CTCCTTGACATCATCTCTTTGCTTAAACTTTTTAACCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DW45TF U 1
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DS 

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AAGTCTGATGAACACAATGGCACAGAGAAAGAAATGATCTTTTTGTCTCTCTTTTCGTTT
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TTGTTACTCCTTGACATCATCTCTTTGCTTAAACTTTTTAACCTTT

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 777 1 777
DS 

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GAGATAAGCAAAGTCATTGAGCCAACTAACACGTTGATGAATAAATTTTACGGATGTGAC
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GAATACAGACCTTTAGATATTTTTACTCTTGTCGCCAGTGAGCATTTATAACACCATGA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL7991Contig1 775 2 5 U
TTTTGGGATCCAAATAGTTGGCAATTCATAAAGATCATACGAAATGGTAATGAGACAATT
GTACTTGGGACCAAAAAAACATGCATCTATCTACCCTTTCTCTTTCGGTTCACTAGTCGC
TTGACAACAATCTCTTTCTTGACCTTGTTATTAACATGGGTCCCTTTGCCAGTTGCCTGA
ATCATTCATGAGAAGAAACCCAAAAATGAAACGAAACGAGTATTGATGTAAACAATATAC
TTTCTTCTTGCATCCAAGTTCACCCTCTGATGTAGTTTAATAGTCTAATAAGGTAATACA
TGACCAAAAACAGGAGCACAAAATACGCAATGAGTTTGCAATTTTTTCGATTCGACTTCT
TCTTAAAGACCAACTTGAAACGGTTGATTGTTCCTGACATTATTCCCCTGGCCGAGTCCA
TTTTGTTACCCACTTTGTCAAGCATGCGGTTATGACTCTCAACTTCCTCATGTATGTCTC
CAGTCACTCTCTTTAAAAATGAAACTCTGTCCTGAAAACTTTCGAGGGCTTCATCATTGT
CGCGTTCGGTGGTATCATGAGAGTAGGAAGAGGAAGCTCTCAAGCGACCTTCCTCAAGTC
CATCAAGCCCGTCGAAGAGAGATGTCCTCGACGCACGATTCTCCCTTCGAAAGTTCATGT
CACGCACAATCACTTGTTTCGTTTTCGCTTTTACAGTGTCCTGTTGAGGACTCTCACCAT
CACAGAGAGAGATCAGAGCAGTGCGAACGGATCCGAGGAACGTAGGATTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B936JQ U 5
AF RR4B936TF C 1
BS 1 4 RR4B936TF
BS 5 98 RR4B936JQ
BS 99 99 RR4B936TF
BS 100 616 RR4B936JQ
BS 617 775 RR4B936TF

RD RR4B936JQ 612 0 0
GGGATCCAAATAGTTGGCAATTCATAAAGATCATACGAAATGGTAATGAGACAATTGTAC
TTGGGACCAAAAAAACATGCATCTATCTACCCTT*CTCTTTCGGTTCACTAGTCGCTTGA
CAACAATCTCTTTCTTGACCTTGTTATTAACATGGGTCCCTTTGCCAGTTGCCTGAATCA
TTCATGAGAAGAAACCCAAAAATGAAACGAAACGAGTATTGATGTAAACAATATACTTTC
TTCTTGCATCCAAGTTCACCCTCTGATGTAGTTTAATAGTCTAATAAGGTAATACATGAC
CAAAAACAGGAGCACAAAATACGCAATGAGTTTGCAATTTTTTCGATTCGACTTCTTCTT
AAAGACCAACTTGAAACGGTTGATTGTTCCTGACATTATTCCCCTGGCCGAGTCCATTTT
GTTACCCACTTTGTCAAGCATGCGGTTATGACTCTCAACTTCCTCATGTATGTCTCCAGT
CACTCTCTTTAAAAATGAAACTCTGTCCTGAAAACTTTCGAGGGCTTCATCATTGTCGCG
TTCGGTGGTATCATGAGAGTAGGAAGAGGAAGCTCTCAAGCGACCTTCCTCAAGTCCATC
AAGCCCGTCGAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4B936TF 775 0 0
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GTACTTGGGACCAAAAAAACATGCATCTATCTACCCTTTCTCTTTCGGTTCACTAGTCGC
TTGACAACAATCTCTTTCTTGACCTTGTTATTAACATGGGTCCCTTTGCCAGTTGCCTGA
ATCATTCATGAGAAGAAACCCAAAAATGAAACGAAACGAGTATTGATGTAAACAATATAC
TTTCTTCTTGCATCCAAGTTCACCCTCTGATGTAGTTTAATAGTCTAATAAGGTAATACA
TGACCAAGAACAGGAGCACAAAATACGCAATGAGTTTGCAATTTTTTCGATTCGACTTCT
TCTTAAAGACCAACTTGAAACGGTTGATTGTTCCTGACATTATTCCCCTGGCCGAGTCCA
TTTTGTTACCCACTTTGTCAAGCATGCGGTTATGACTCTCAACTTCCTCATGTATGTCTC
CAGTCACTCTCTTTAGAAATGAAACTCTGTCCTGAAGACTTTCGAGGGCTTCATCATTGT
CGCGTTCGGTGGTATCATGAGAGTAGGAAGAGGAAGCTCTCAAGCGACCTTCCTCAAGTC
CATCAAGCCCGTCGAAGAGAGATGTCCTCGACGCACGATTCTCCCTTCGAAAGTTCATGT
CACGCACAATCACTTGTTTCGTTTTCGCTTTTACAGTGTCCTGTTGAGGACTCTCACCAT
CACAGAGAGAGATCAGAGCAGTGCGAACGGATCCGAGGAACGTAGGATTTCGTCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL7992Contig1 625 2 1 U
GGAGAAATCACACGGTTGGATTGAAATCCTAATCATAGTTGGTTCGCTGCTTCGTCGTCT
TCACTCCTCTTCGATCGGCAACAGACGATCCACATTCCGTACGTCATGGCGGTGCTCATC
AGTTGTGGAGGCCAGATTGCTTCGTTTCTGTGACACTAGGAACAGTTAATAATTCCGAAT
TAAAGTCAAAATTTTCCTACAACCTTCGTGAAACCGAGCATGGCGTCTTCTTAAAGCGGC
AAGAAGGCTTTGTGGTGCTAGGTGACAAACTCTTCATCGTCATTGAGAAGGAATGTGACC
CAGGAGAGAGATGAAAAGGCCAGTGATTGCTTCTCTGGTGTTCAGATGCGCTTGGATCAC
TCCCGAATCTGATAATAGTCCTCTTTCAATTGTCCTTATAATAGCAGTTGAAGTTCATGC
TTGGCTTTACTGGTTAAGCAACTGAAGAGTCATTGTTTTCCTTATGATTCTGAGCTTGAG
TAGTTTAAAAGATTTGGTATGAAGTTTGGAAGTTAGTGTTTGAATTGAATGTAGAGCAAA
AATCTTGAGTATTGCTATGTGATCATGTGATCTCTATTGTACAATGACCACATAAACATG
ATTAGTTTATTCATCATTTCTTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BD27JQ C 1
AF RR4BD27TF U 1
BS 1 625 RR4BD27TF

RD RR4BD27JQ 625 0 0
GGAGAAATCACACGGTTGGATTGAAATCCTAATCATAGTTGGTTCGCTGCTTCGTCGTCT
TCACTCCTCTTCGATCGGCAACAGACGATCCACATTCCGTACGTCATGGCGGTGCTCATC
AGTTGTGGAGGCCAGATTGCTTCGTTTCTGTGACACTAGGAACAGTTAATAATTCCGAAT
TAAAGTCAAAATTTTCCTACAACCTTCGTGAAACCGAGCATGGCGTCTTCTTAAAGCGGC
AAGAAGGCTTTGTGGTGCTAGGTGACAAACTCTTCATCGTCATTGAGAAGGAATGTGACC
CAGGAGAGAGATGAAAAGGCCAGTGATTGCTTCTCTGGTGTTCAGATGCGCTTGGATCAC
TCCCGAATCTGATAATAGTCCTCTTTCAATTGTCCTTATAATAGCAGTTGAAGTTCATGC
TTGGCTTTACTGGTTAAGCAACTGAAGAGTCATTGTTTTCCTTATGATTCTGAGCTTGAG
TAGTTTAAAAGATTTGGTATGAAGTTTGGAAGTTAGTGTTTGAATTGAATGTAGAGCAAA
AATCTTGAGTATTGCTATGTGATCATGTGATCTCTATTGTACAATGACCACATAAACATG
ATTAGTTTATTCATCATTTCTTTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4BD27TF 625 0 0
GGAGAAATCACACGGTTGGATTGAAATCCTAATCATAGTTGGTTCGCTGCTTCGTCGTCT
TCACTCCTCTTCGATCGGCAACAGACGATCCACATTCCGTACGTCATGGCGGTGCTCATC
AGTTGTGGAGGCCAGATTGCTTCGTTTCTGTGACACTAGGAACAGTTAATAATTCCGAAT
TAAAGTCAAAATTTTCCTACAACCTTCGTGAAACCGAGCATGGCGTCTTCTTAAAGCGGC
AAGAAGGCTTTGTGGTGCTAGGTGACAAACTCTTCATCGTCATTGAGAAGGAATGTGACC
CAGGAGAGAGATGAAAAGGCCAGTGATTGCTTCTCTGGTGTTCAGATGCGCTTGGATCAC
TCCCGAATCTGATAATAGTCCTCTTTCAATTGTCCTTATAATAGCAGTTGAAGTTCATGC
TTGGCTTTACTGGTTAAGCAACTGAAGAGTCATTGTTTTCCTTATGATTCTGAGCTTGAG
TAGTTTAAAAGATTTGGTATGAAGTTTGGAAGTTAGTGTTTGAATTGAATGTAGAGCAAA
AATCTTGAGTATTGCTATGTGATCATGTGATCTCTATTGTACAATGACCACATAAACATG
ATTAGTTTATTCATCATTTCTTTAC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL7993Contig1 464 2 4 U
GAAATAAGAAAATTACGATTGATTCATTATCATATAAGTAATTTTACAAAAAGACAAAAT
CTGATTATTAAGCAAGATTAAAAAGAAGAAGGACAAAAGACTTATGCAACGATAAAAAGG
CTTAAACAATAATAAGACGCAAATGAAAATACGAAATCAACTAGAAGAGGCATTACCTTC
CTTGCTAGCATTGTCATCATTATTACGACGGTTTGTCGGAGGAGCAGCTGGAGACGGCGG
AGGAATCTGATGGCGTGGCGGCTGAAAAGGGATGGATGATGGAGGATTAGCTGTGAGAGA
TATATCGGAGAGATCCTCGAGGGAGATGGGCAAAACGCTCTGAGAAAGTCTTCTCTGGTG
ACGATTTGGTCTCTCCGACATTGTTAGTACCAGATTCAGACAAGAAGGATTAGAAGCAGA
GTAATATGTAGAGAGAGAGAGAGAGAAGATAGTTTGTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CM68TF C 1
AF RR4CM68JQ U 2
BS 1 9 RR4CM68TF
BS 10 51 RR4CM68JQ
BS 52 52 RR4CM68TF
BS 53 464 RR4CM68JQ

RD RR4CM68TF 454 0 0
GAAATAAGAAAATTACGATTGATTCATTATCATATAAGTAATTTTACAAAAAGACAAAAT
CTGATTATTAAGCAAGATTAAAAAGAAGAAGGACAAAAGACTTATGCAACGATAAAAAGG
CTTAAACAATAATAAGACGCAAATGAAAATACGAAATCAACTAGAAGAGGCATTACCTTC
CTTGCTAGCATTGTCATCATTATTACGACGGTTTGTCGGAGGAGCAGCTGGAGACGGCGG
AGGAATCTGATGGCGTGGCGGCTGAGAAGGGATGGATGATGGAGGATTAGCTGTGAGAGA
TATATCGGAGAGATCCTCGAGGGAGATGGGCAAAACGCTCTGAGAAAGTCTTCTCTGGTG
ACGATTTGGTCTCTCCGACATTGTTAGTACCAGATTCAGACAAGAAGGATTAGAAGCAGA
GTAATATGTAGAGAGAGAGAGAGAGAAGATAGTT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR4CM68JQ 463 0 0
GAAATAAG
AAATTACGATTGATTCATTATCATATAAGTAATTTTACAAAA*GACAAAATCTGATTATT
AAGCAAGATTAAAAAGAAGAAGGACAAAAGACTTATGCAACGATAAAAAGGCTTAAACAA
TAATAAGACGCAAATGAAAATACGAAATCAACTAGAAGAGGCATTACCTTCCTTGCTAGC
ATTGTCATCATTATTACGACGGTTTGTCGGAGGAGCAGCTGGAGACGGCGGAGGAATCTG
ATGGCGTGGCGGCTGAAAAGGGATGGATGATGGAGGATTAGCTGTGAGAGATATATCGGA
GAGATCCTCGAGGGAGATGGGCAAAACGCTCTGAGAAAGTCTTCTCTGGTGACGATTTGG
TCTCTCCGACATTGTTAGTACCAGATTCAGACAAGAAGGATTAGAAGCAGAGTAATATGT
AGAGAGAGAGAGAGAGAAGATAGTTTGTTTCTTCC

QA 9 463 9 463
DS 



AS 1 2

CO CL7994Contig1 718 2 1 U
GGAGAATCGTTTCGTCACTGAGATCACTACGCAACTTTTTTTTTTTCCTCTTCCCCCGAA
TCTTCTCCTCTCATTTCGTTCCCCGGAGACCTAATCGGAAACTTCACCGGAAAATCTAAT
GCCGGAAGACTCTTCATCGATTGACTACGTCATGGAGAAGGCATCGGGGCCACACTTCTC
CGGTCTTCGCCTCGACGGTGTCCTTCTCTCTTCCCCGTCCAAATCCGCCAACTCTTCCCC
TTCTCCCTTCCGGTCAGGCGTTCCATCTTTCTCCCCGATTTCCGATCCCGCGGCGCCTAA
TCAGCCTTTCGTCATCGGAGTTACTGGTGGTACAGCTTCTGGTAAGACCACGGTATGTGA
CATGATCATCCAGCAACTTCATGATCATCGCATTGTTCTTGTTAACCAGGATTCCTTTTA
CCGTGGTCTCACATCTGAAGAACTGGCGCGTTTCCAAGAATACAATTTCGATCATCCTGA
TGCATTTGACACTGAGCAGCTTTTGCATTGCATTGATACACTCAAGAGTGGGCAACCCTA
TCAAATTCCAATTTACGACTTCAAGACCCATCAACGTAAATCTGATGCTTTTCGCCAGGT
CAATGCTTGCGATGTCATAATTTTGGAAGGATTCTAGTTTTTCATGACTCACGAGTTCGG
ATCTGATGAATATGAAGATCTTCGTTGACACAGATGCTGATGTGAGCTTGCTCGCAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA70TF U 1
AF RR4D965TF U 1
BS 1 718 RR4D965TF

RD RR4DA70TF 625 0 0
GGAGAATCGTTTCGTCACTGAGATCACTACGCAACTTTTTTTTTTTCCTCTTCCCCCGAA
TCTTCTCCTCTCATTTCGTTCCCCGGAGACCTAATCGGAAACTTCACCGGAAAATCTAAT
GCCGGAAGACTCTTCATCGATTGACTACGTCATGGAGAAGGCATCGGGGCCACACTTCTC
CGGTCTTCGCCTCGACGGTGTCCTTCTCTCTTCCCCGTCCAAATCCGCCAACTCTTCCCC
TTCTCCCTTCCGGTCAGGCGTTCCATCTTTCTCCCCGATTTCCGATCCCGCGGCGCCTAA
TCAGCCTTTCGTCATCGGAGTTACTGGTGGTACAGCTTCTGGTAAGACCACGGTATGTGA
CATGATCATCCAGCAACTTCATGATCATCGCATTGTTCTTGTTAACCAGGATTCCTTTTA
CCGTGGTCTCACATCTGAAGAACTGGCGCGTTTCCAAGAATACAATTTCGATCATCCTGA
TGCATTTGACACTGAGCAGCTTTTGCATTGCATTGATACACTCAAGAGTGGGCAACCCTA
TCAAATTCCAATTTACGACTTCAAGACCCATCAACGTAAATCTGATGCTTTTCGCCAGGT
CAATGCTTGCGATGTCATAATTTTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4D965TF 718 0 0
GGAGAATCGTTTCGTCACTGAGATCACTACGCAACTTTTTTTTTTTCCTCTTCCCCCGAA
TCTTCTCCTCTCATTTCGTTCCCCGGAGACCTAATCGGAAACTTCACCGGAAAATCTAAT
GCCGGAAGACTCTTCATCGATTGACTACGTCATGGAGAAGGCATCGGGGCCACACTTCTC
CGGTCTTCGCCTCGACGGTGTCCTTCTCTCTTCCCCGTCCAAATCCGCCAACTCTTCCCC
TTCTCCCTTCCGGTCAGGCGTTCCATCTTTCTCCCCGATTTCCGATCCCGCGGCGCCTAA
TCAGCCTTTCGTCATCGGAGTTACTGGTGGTACAGCTTCTGGTAAGACCACGGTATGTGA
CATGATCATCCAGCAACTTCATGATCATCGCATTGTTCTTGTTAACCAGGATTCCTTTTA
CCGTGGTCTCACATCTGAAGAACTGGCGCGTTTCCAAGAATACAATTTCGATCATCCTGA
TGCATTTGACACTGAGCAGCTTTTGCATTGCATTGATACACTCAAGAGTGGGCAACCCTA
TCAAATTCCAATTTACGACTTCAAGACCCATCAACGTAAATCTGATGCTTTTCGCCAGGT
CAATGCTTGCGATGTCATAATTTTGGAAGGATTCTAGTTTTTCATGACTCACGAGTTCGG
ATCTGATGAATATGAAGATCTTCGTTGACACAGATGCTGATGTGAGCTTGCTCGCAGA

QA 1 718 1 718
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7996Contig1 786 2 2 U
GGGACTTCATAAAGAAAGAAAAAAATATCAGACCAAAAAATGTCAGAAGAAAAAGTGGTC
GTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAAA
GAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCTC
CAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATGC
GAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATGACGACAAGACTCTTCGT
CTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGAT
AAAAAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGCAAAACGAGAGT
TTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTACTTCGGAGGAA
ACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCCTTGGTTCCACACTT
GGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATACTCCCAAGCTAATGGATTGGGTCC
GTAGATGTTTAGCCCGACCAGTTATCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCTTAAGATCCTTG
GTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTATTGATATATCAATA
TTTCTAGCTTTTAAATAAAATAATGATGTGAATCATAACGAGTGAGTGTAATGGACCGAT
TTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU37TF U 1
AF RR4BU37JQ C 110
BS 1 734 RR4BU37TF
BS 735 786 RR4BU37JQ

RD RR4BU37TF 734 0 0
GGGACTTCATAAAGAAAGAAAAAAATATCAGACCAAAAAATGTCAGAAGAAAAAGTGGTC
GTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAAA
GAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCTC
CAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATGC
GAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATGACGACAAGACTCTTCGT
CTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGAT
AAAAAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGCAAAACGAGAGT
TTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTACTTCGGAGGAA
ACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCCTTGGTTCCACACTT
GGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATACTCCCAAGCTAATGGATTGGGTCC
GTAGATGTTTAGCCCGACCAGTTATCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCTTAAGATCCTTG
GTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTATTGATATATCAATA
TTTCTAGCTTTTAA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4BU37JQ 677 0 0
TAGAGGAAAAAGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCG
ATTTATTGCTCCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTA
AACCGGTATGCGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATGACGACA
AGACTCTTCGTCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTG
ATTTAATTGATAAAAAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGC
AAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTA
CTTCGGAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCCTTG
GTTCCACACTTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATACTCCCAAGCTAAT
GGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGTTATCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCT
TAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTATTG
ATATATCAATATTTCTAGCTTTTAAATAAAATAATGATGTGAATCATAACGAGTGAGTGT
AATGGACCGATTTTCAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL7997Contig1 794 2 2 U
GGACTGAATGTAAAACCATTCTCTCTTCTCGCTCTCTCTTAAGGTTGAAGATGATGACAA
CAGTAGGATCTGCTCAATCGAATCCCTTTCTTGTTTCCTTCAAAATTGAATCCATCGAAA
AGACTAAAGCTTTGCGAGCAAAATGGGTCACTTGTTCTTCTTCTTTTTCTCATACTCCAT
TATCGTCCTCTTCCAATGAGGCATTTCATCGAACAGAATATGGACAAGCTATTGGTAAGG
ATGTTGAGAGTGAAGGGAGCAGGAAGAAAAAGAGAAGGGTCTTCTTCTTAGACGTTAGTC
CACTCTGCTACGAAGGAAACAAGCCAAGTTCAAAAGCTTTTGGTCACTGGCTTTCACTCT
TCTTCTCTCAAGTCAGCCTCACCGATCCTGTCATAGCTGTTCTTGATGGAGAAGAAGGTA
ACAAGCGACGCCGAGAGTTACTGCCTTCTTATAAAGCGCATAGGAAATCACCAAATCCTG
GAAAATACTCCAAAAGGTCACACCAATTCGTCGAAGATGTTCTCACGAAATGCAATGTGC
CAGTTGTTAGACTACAAGGGCATGAAGCAGACGACGTGGTGGCTACCTTGATGGGACAAG
CCGTTCAAAGAGGGTACCGCGCGGTTATTGCATCGCCTGACAAAGACTTCAAGCAGTTGA
TCTCAGAAAATGTTCAGATTGTCATTCCTTTGTCTGATCTCAGAAGATGGTCTTTCTACA
CACTGAAACACTACCATGCTCAGTATAACTGTGATCCACAGTCTGATTTGAGCTTTCGAT
GTATAATGGGTGAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR4B860TF U 1
AF RR4B969TF U 1
BS 1 789 RR4B860TF
BS 790 794 RR4B969TF

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CACTGAAACACTACCATGCTCAGTATAACTGTGATCCACAGTCTGATTTGAGCTTTCGAT
GTATAATGG
TGA

QA 1 789 1 789
DS 

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GGACTGAATGTAAAACCATTCTCTCTTCTCGCTCTCTCTTAAGGTTGAAGATGATGACAA
CAGTAGGATCTGCTCAATCGAATCCCTTTCTTGTTTCCTTCAAAATTGAATCCATCGAAA
AGACTAAAGCTTTGCGAGCAAAATGGGTCACTTGTTCTTCTTCTTTTTCTCATACTCCAT
TATCGTCCTCTTCCAATGAGGCATTTCATCGAACAGAATATGGACAAGCTATTGGTAAGG
ATGTTGAGAGTGAAGGGAGCAGGAAGAAAAAGAGAAGGGTCTTCTTCTTAGACGTTAGTC
CACTCTGCTACGAAGGAAACAAGCCAAGTTCAAAAGCTTTTGGTCACTGGCTTTCACTCT
TCTTCTCTCAAGTCAGCCTCACCGATCCTGTCATAGCTGTTCTTGATGGAGAAGAAGGTA
ACAAGCGACGCCGAGAGTTACTGCCTTCTTATAAAGCGCATAGGAAATCACCAAATCCTG
GAAAATACTCCAAAAGGTCACACCAATTCGTCGAAGATGTTCTCACGAAATGCAATGTGC
CAGTTGTTAGACTACAAGGGCATGAAGCAGACGACGTGGTGGCTACCTTGATGGGACAAG
CCGTTCAAAGAGGGTACCGCGCGGTTATTGCATCGCCTGACAAAGACTTCAAGCAGTTGA
TCTCAGAAAATGTTCAGATTGTCATTCCTTTGTCTGATCTCAGAAGATGGTCTTTCTACA
CACTGAAACACTACCATGCTCAGTATAACTGTGATCCACAGTCTGATTTGAGCTTTCGAT
GTATAATGGGTGAT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7998Contig1 670 2 2 U
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AAACGACTACTATGGAGGAGAATCAAGCTCTCTTAACCTCACTCAGCTATGGAAGCGTTT
CAGGGGAAGTGACACTCCTCAAGAAAATCTTGGAGCTATCAGAGAATACAATGTCGATAT
GATCCCAAAGTTCATAATGGCTAATGGAACCCTTGTTCAAACCCTTATTCACACCGATGT
CACCAAGTACCTTAACTTCAAAGCCGTTGATGGTAGCTTCGTCTACAAGAAGGGCAAGAT
CTATAAAGTCCCAGCCACTGATGTGGAAGCCCTAAAGTCGCCATTGATGGGTCTGTTCGA
GAAACGACGTGCGAGAAAGTTCTTTATCTATGTGCAAGACTACGATGAGAAGGATCCCAA
GTCTCACGAAGGACTTGACCTCAGCAAAGTCACTGCCAGAGAGATAATCTCGAAGTATGG
ATTAGAAGATGATACCATTGACTTCATAGGCCATGCCTTAGCACTTCACAATGATGATGA
CTACTTGGATCAACCCGCCATTGATTTTGTTATGAGAATCAAGCTCTACGCGGAATCTTT
GGCACGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR4BI53TF U 1
AF RR4CH96TF U 6
BS 1 668 RR4BI53TF
BS 669 670 RR4CH96TF

RD RR4BI53TF 668 0 0
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GGAGTGTATCCTTAGTGGTCTCCTTTCTGTCGATGGCCTCAAGGTACTGCACATGGATAG
AAACGACTACTATGGAGGAGAATCAAGCTCTCTTAACCTCACTCAGCTATGGAAGCGTTT
CAGGGGAAGTGACACTCCTCAAGAAAATCTTGGAGCTATCAGAGAATACAATGTCGATAT
GATCCCAAAGTTCATAATGGCTAATGGAACCCTTGTTCAAACCCTTATTCACACCGATGT
CACCAAGTACCTTAACTTCAAAGCCGTTGATGGTAGCTTCGTCTACAAGAAGGGCAAGAT
CTATAAAGTCCCAGCCACTGATGTGGAAGCCCTAAAGTCGCCATTGATGGGTCTGTTCGA
GAAACGACGTGCGAGAAAGTTCTTTATCTATGTGCAAGACTACGATGAGAAGGATCCCAA
GTCTCACGAAGGACTTGACCTCAGCAAAGTCACTGCCAGAGAGATAATCTCGAAGTATGG
ATTAGAAGATGATACCATTGACTTCATAGGCCATGCCTTAGCACTTCACAATGATGATGA
CTACTTGGATCAACCCGCCATTGATTTTGTTATGAGAATCAAGCTCTACGCGGAATCTTT
GGCACGGT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4CH96TF 665 0 0
G
GATAACAACAATGGATGAAGAATATGATGTGATTGTTCTTGGGACTGGTCTCAAGTAGTG
TATCCTTAGTGGTCTCCTTTCTGTCGATGGCCTCAAGGTACTGCACATGGATAGAAACGA
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AAGTGACACTCCTCAAGAAAATCTTGGAGCTATCAGAGAATACAATGTCGATATGATCCC
AAAGTTCATAATGGCTAATGGAACCCTTGTTCAAACCCTTATTCACACCGATGTCACCAA
GTACCTTAACTTCAAAGCCGTTGATGGTAGCTTCGTCTACAAGAAGGGCAAGATCTATAA
AGTCCCAGCCACTGATGTGGAAGCCCTAAAGTCGCCATTGATGGGTCTGTTCGAGAAACG
ACGTGCGAGAAAGTTCTTTATCTATGTGCAAGACTACGATGAGAAGGATCCCAAGTCTCA
CGAAGGACTTGACCTCAGCAAAGTCACTGCCAGAGAGATAATCTCGAAGTATGGATTAGA
AGATGATACCATTGACTTCATAG*CCATGCCTTAGCACTTCACAATGATGATGACTACTT
GGATCAACCCGCCATTGATTTTGTTATGAGAATCAAGCTCTACGCGGAATCTTTGGCACG
GTTC

QA 2 665 2 665
DS 



AS 1 2

CO CL7999Contig1 850 2 2 U
GGGTTTGCTGAGAAGGACGGAAGGTAAAGTCAAACAAACAGAAGAGGGGCGAGCGATCAT
CAGAAGGAGGAGGATCTTCCTTGTGCGATCTCTGAGATTCCGCGAACCAAATCTCATATA
TTAATCGGGGAAAGTTCGAAATGGTACTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTCCATGTACCCC
ATAGAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAGTCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAAC
ACATCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATAT
GCCCTGATTTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGACCA
AAACCTTGACTATCGGCCAGTTCAAGCTTGGTCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCAT
GGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAA
CAGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGTAGGAGTCGTGATTAACCCTG
GCTCTGCTACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTA
TGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTATGAGCTCATCGACGGAGAGGTTA
AAGTCGACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTCTGCTCCTTAGCGTATTA
TAAAGATGAACCCTGTTTTCTTTTATGTTTTCGTTTGGAATCACTCGTGAAGTTTGCAAC
TTTCTTTAGCTTGCCTGTGAAAATAATTTTTAAAGATTTGGAAATTGGACCACTGATAAC
AATGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX32TF U 1
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BS 741 850 RR4EX32JQ

RD RR4EX32TF 740 0 0
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CAGAAGGAGGAGGATCTTCCTTGTGCGATCTCTGAGATTCCGCGAACCAAATCTCATATA
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ACATCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATAT
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AAACCTTGACTATCGGCCAGTTCAAGCTTGGTCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCAT
GGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAA
CAGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGTAGGAGTCGTGATTAACCCTG
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TAAAGATGAACCCTGTTTTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4EX32JQ 657 0 0
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TGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATATGCCCTGATTTGCA
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CGGCCAGTTCAAGCTTGGTTTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATCTAGA
ATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAACAGGCCACACCCA
CCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGTAGGAGTCGTGATTAACCCTGGCTCTGCTACTGG
AGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGG
TCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTATGAGCTCATCGACGGAGAGGTTAAAGTCGACAAGAT
CGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTCTGCTCCTTAGCGTATTATAAAGATGAACCC
TGTTTTCTTTTATGTTTTCGTTTGGAATCACTCGTGAAGTTTGCAACTTTCTTTAGCTTG
CCTGTGAAAATAATTTTTAAAGATTTGGAAATTGGACCACTGATAACAATGTTTTAC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

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CGATCAAATCCGAATTACTGAAACTGTTTCCT


BQ
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AF RR4DL83TF U 1
AF RR4DL83JQ C 57
BS 1 714 RR4DL83TF
BS 715 812 RR4DL83JQ

RD RR4DL83TF 714 0 0
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TCCGTCTCTTCAAAACGACGAGCCGGTACGATTCGATTTCTCGGGTCCGGATCAACAACG
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CAGCGGAACTACGTTGGAGAAGGATAGTCGGACAGACAATGATTGGGTACTCAATTTGGA
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TCCTGACTTGGCCGAGTCGACTCGACGGTGGAGCTTTGAGTTGTTAGGGGCTCAGGCTGA
GGTGTGTTTGTGTTGTCGGATAGGGTCTCGCAACCAGTCGTGTCGGAACTGTCGTACTTC
CGATGTTTTAACTACTTGGGAATCGAAAATTATTTAGGATTTTATTTATTTACAAGTTTG
ATTTGTGTTTTTTGTTCCTATAATACTTCTTGTAATGAATGCATCAGGTAACAA

QA 1 714 1 714
DS 

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AACGGCCGGTTAAACCGGAACCGATGGTACTAGACCGAGAAGAGGCTAATAATAACTGCA
CTAGCAGCGGAACTACGTTGGAGAAGGATAGTCGGACAGACAATGATTGGGTACTCAATT
TGGAACTCTCCGTTGGTCCAGCGACGACCAAGAGTTATCGGTACCAGTTGACTCGCAAGG
CGAATCCTGACTTGGCCGAGTCGACTCGACGGTGGAGCTTTGAGTTGTTAGGGGCTCAGG
CTGAGGTGTGTTTGTGTTGTCGGATAGGGTCTCGCAACCAGTCGTGTCGGAACTGTCGTA
CTTCCGATGTTTTAACTACTTGGGAATCGAAAATTATTTAGGATTTTATTTATTTACAAG
TTTGATTTGTGTTTTTTGTTCCTATAATACTTCTTGTAATGAATGCATCAGGTAACAACT
AGGTTTAATTACCAGATGGGACAGGGTTATTAGTGCTAATCTAGTAGTATCAGTATTTGT
TATCCGATCAAATCCGAATTACTGAAACTGTTTCCT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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CTCGTCCTCCGTCTTCTATTCCTCCTTCTCCTCAATTGTTTCCTCCTACACCTGTTATTC
CCTCCTACATCCCCTATTTGAAACCCATCACCGTCGAAATCAAAATCACCATTGAATTTC
TTAGGCGGCGACGGAGGGGAATCCCCTCGAATCCCATCTTCGTTGTCTCCTTCTTCGGTG
GGTTATCAACAAGTTGGGAGTGGTCAGAGATAAAGAGAGTTTCTTGCAGAGGCTGGTGAT
TTTGGTTACGCCCACGCTGTACAAGATTGATATGATTGTGTTTTGAGCTTCTAAGTGATG
CCGAAGATAGCGTCAGATTTTCTGTAGCTCATGGCGTAAGTGTTTTTTTTATTGATGAAA
TAATGTTTGGAAAAATTGTTTTAAGCTGAATTATCTGAATGGTGAGGTCAGTGTGTCTGG
CAAAGTGTTGATAGCATCCAAGGAAGATAAGAACATAATAGAGTGTACTGATCTTGTGTT
TCTGACCCAAGAACATGAAGATTTCCCCTTTGTGACAATTAAGATTGATAAAGATTTGAT
TTTGTGTTATAAGTTATTTTGTTTTGGTAGTATGATACTGCCCTCTTTGTATTTGTATAT
ATTTGGAAGATTCTTCAGCGCAAAATTGCAGGCTTTTATGTAAAGTTTTTTAAAAAGGTC
AGTTATGTTTACATGCTTGAAGGTCTGATGCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DD95TF U 1
AF RR4DD95JQ C 120
BS 1 712 RR4DD95TF
BS 713 754 RR4DD95JQ

RD RR4DD95TF 712 0 0
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CTCGTCCTCCGTCTTCTATTCCTCCTTCTCCTCAATTGTTTCCTCCTACACCTGTTATTC
CCTCCTACATCCCCTATTTGAAACCCATCACCGTCGAAATCAAAATCACCATTGAATTTC
TTAGGCGGCGACGGAGGGGAATCCCCTCGAATCCCATCTTCGTTGTCTCCTTCTTCGGTG
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TTTGGTTACGCCCACGCTGTACAAGATTGATATGATTGTGTTTTGAGCTTCTAAGTGATG
CCGAAGATAGCGTCAGATTTTCTGTAGCTCATGGCGTAAGTGTTTTTTTTATTGATGAAA
TAATGTTTGGAAAAATTGTTTTAAGCTGAATTATCTGAATGGTGAGGTCAGTGTGTCTGG
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TCTGACCCAAGAACATGAAGATTTCCCCTTTGTGACAATTAAGATTGATAAAGATTTGAT
TTTGTGTTATAAGTTATTTTGTTTTGGTAGTATGATACTGCCCTCTTTGTATTTGTATAT
ATTTGGAAGATTCTTCAGCGCAAAATTGCAGGCTTTTATGTAAAGTTTTTTA

QA 1 712 1 712
DS 

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GGGTTATCAACAAGTTGGGAGTGGTCAGAGATAAAGAGAGTTTCTTGCAGAGGCTGGTGA
TTTTGGTTACGCCCACGCTGTACAAGATTGATATGATTGTGTTTTGAGCTTCTAAGTGAT
GCCGAAGATAGCGTCAGATTTTCTGTAGCTCATGGCGTAAGTGTTTTTTTTATTGATGAA
ATAATGTTTGGAAAAATTGTTTTAAGCTGAATTATCTGAATGGTGAGGTCAGTGTGTCTG
GCAAAGTGTTGATAGCATCCAAGGAAGATAAGAACATAATAGAGTGTACTGATCTTGTGT
TTCTGACCCAAGAACATGAAGATTTCCCCTTTGTGACAATTAAGATTGATAAAGATTTGA
TTTTGTGTTATAAGTTATTTTGTTTTGGTAGTATGATACTGCCCTCTTTGTATTTGTATA
TATTTGGAAGATTCTTCAGCGCAAAATTGCAGGCTTTTATGTAAAGTTTTTTAAAAAGGT
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QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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CATTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTCTTGTGTTGGGACGGCAGTTCTTG
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AGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGG
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TTGCTTTCATGTTATTTGGAGTTTCTTAGTTGACACTTGGAATCAGACTTACACTTTTGA
GATAATTTTATACTGTATTTGTCAAAAGAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACAC
TGTTTCGTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FB24JQ C 1
AF RR4FB24TF U 1
BS 1 610 RR4FB24TF

RD RR4FB24JQ 610 0 0
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TGTTTCGTGC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4FB24TF 610 0 0
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TCCGTTCTCTTCACTCCGCTTACTCCGCTACTCCCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGT
ATGTTGTTTTCGCTGTCTTCACTGCTCTGATTCAGTTGGCTTATATGGCATTGGTTGGAT
CATTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTCTTGTGTTGGGACGGCAGTTCTTG
CTGGTGTAATTTTTAGCATTTTGGGCAACATGTACCTTTGGAATTTATGGAACTAACTAT
CTTTCTTTCTTTGTTTTGTGTTTATAGTTTGCCTCCGGATTCAAGTTAACAAAGAAAACA
AGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGG
TCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTCTCCTCTCCTATCATACAGAGG
TTGCTTTCATGTTATTTGGAGTTTCTTAGTTGACACTTGGAATCAGACTTACACTTTTGA
GATAATTTTATACTGTATTTGTCAAAAGAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACAC
TGTTTCGTGC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL8003Contig1 628 2 1 U
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GCTAATATATTAGATGTTTTGTTTGGATAATCTAATATTTGTAATGGTTTCAGTTGTATA
TTGTAAATAATGTTTGTAGTATTCTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EL76JQ C 1
AF RR4EL76TF U 1
BS 1 628 RR4EL76TF

RD RR4EL76JQ 628 0 0
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TTGTAAATAATGTTTGTAGTATTCTGTT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4EL76TF 628 0 0
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TGACGACGTGGTGGAAGAGAAGCTGCTCGGAGAAACAAGTAACGTGTCGTCATCAACCTC
TTCTTCCACGTGTGGAGGAAGAGAGATTAAGATAAAGATGACGAGGAAAGAATTTGAAGA
TCTCATGAGAAACATTAGTTTGGAGGGTTTGACGGCGGAAGAGGTTTTTTCTAATTTTCT
TTCCGACGGTGGAGATCAAATCGGAACCGCCGCTGATGTATCTAATGATCACCAACGGCC
GTGGAGACCAGCGTTACAGAGCATCCCTGAGATTGATTAATGTACTTTTGGTGAATTGAT
TGGAAAAGGACTGAGTTTAATCGCTTAATCAGTGATTTTAGCTAATCCAAAGTTGTGTAC
ATGTTTGTTTTTGTTATCTTTTCCTTTTCAGCAAAATACATTTGGATGAAACATCCGAGT
GCTAATATATTAGATGTTTTGTTTGGATAATCTAATATTTGTAATGGTTTCAGTTGTATA
TTGTAAATAATGTTTGTAGTATTCTGTT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL8004Contig1 940 2 3 U
GATTCAGTTTCCAGAATCATATTTTCATGGAAGAAAATATAGAGGAGAAGCTGAAGAGTC
AGCTTCATCAGCTTGAACTTGAGCAAGCGGTCTTCGAGAGAATGGTTTACAAGAATAAGA
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GGAACTAAACAGAAACTTCATGTTCTGGAGAGCCTGAATATCTTGGACCGACTTCGTGGA
GCGATTTATCTACTCTCACAGATGACTGAACCCATCTTGAAGGCAGCTAGTGGGATATCC
ATTCTACTAGCTTTGTTCATTTTTTCATAGGATCCTCTGTGACATTTCTTGGCGCTGCTT
TGCACGTCTCCGAGTATTGATTCAACAAATATTACTTGATGCTGTTTCAGTTTTCAGTTT
GGTAACCTCTACATCCTTAGAGAAACAGTCTGCACATGATGGGGTTGATGAGGTGTTCCG
TGAGTTTTATCCAAAGGATGAAGAGTGCATCACCTTATTGGGATTGTGTATGGAAGACCG
ATAAATATGTCTTACTCGAGACATTTCAGAACCGTGAGAGTAGTAAACCTATAGATGACA
GAGTTTCAGAAAATGCTACTACTACTAGGGATTCTTTGGGTACAGTATTATCAAACAGAT
GTTTCTCCTCTCGGCGAGAGTTCAACTCCCCTCGCTGAGGCAGGTTCCTCCAAGACTAAT
AATGGATCCCAAACAGAAGATTCAGAAAAACCAGATGATGAATCTACAAATCTCGTGAGC
TCGGCAAGAATCATCACAGACACAACTCTCAAAAGAGCAACCAAGGTGGATTTCCTACCT
GTGAAAAGACCTTACTCTGCAGTAACACCAAACACCACAG


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AB74TF U 140
AF RR4AB74JQ C 1
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AGATGACTGAACCCATCTTGAAGGCAGCTAGTGGGATATCCATTCTACTAGCTTTGTTCA
TTTTTTCATAGGATCCTCTGTGACATTTCTTGGCGCTGCTTTGCACGTCTCCGAGTATTG
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GAGAAACAGTCTGCACATGATGGGGTTGATGAGGTGTTCCGTGAGTTTTATCCAAAGGAT
GAAGAGTGCATCACCTTATTGGGATTGTGTATGGAAGACCGATAAATATGTCTTACTCGA
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TACTACTAGGGATTCTTTGGGTACAGTATTATCAAACAGATGTTTCTCCTCTCGGCGAGA
GTTCAACTCCCCTCGCTG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4AB74JQ 940 0 0
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TTGCGAACAGCAAACATGGGGGAGATTCTGAGACCATGCTTTCATGTTATTTCTGGGACA
GGAACTAAACAGAAACTTCATGTTCTGGAGAGCCTGAATATCTTGGACCGACTTCGTGGA
GCGATTTATCTACTCTCACAGATGACTGAACCCATCTTGAAGGCAGCTAGTGGGATATCC
ATTCTACTAGCTT*GTTCATTTTT*CATAGGATCCTCTGTGACATT*CTTGGCGCTGCTT
*GCACGTCTCCGAGTATTGATTCAACAAATATTACTTGATGCTGTTTCAGTTTTCAGTTT
GGTAACCTCTACATCCTTAGAGAAACAGTCTGCACATGATGGGGTTGATGAGGTGTTCCG
TGAGTTTTATCCAAAGGATGAAGAGTGCATCACCTTATTGG*ATTGTGTATGGAAGACCG
ATAAATATGTCTTACTCGAGACATTTCAGAACCGTGAGAGTAGTAAACCTATAGATGACA
GAGTTTCAGAAAATGCTACTACTACTAGGGATTCTTTGG*TACAGTATTATCAAACAGAT
GTTTCTCCTCTCGGCGAGAGTTCAACTCCCCTCGCTGAGGCAGGTTCCTCCAAGACTAAT
AATGGATCCCAAACAGAAGATTCAGAAAAACCAGATGATGAATCTACAAATCTCGTGAGC
TCGGCAAGAATCATCACAGACACAACTCTCAAAAGAGCAACCAAGGTGGATTTCCTACCT
GTGAAAAGACCTTACTCTGCAGTAACACCAAACACCACAG

QA 1 940 1 940
DS 



AS 1 2

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ACCATCAATGGATGGATCAGAATCAGTTCCAGAAGCAAAGTCAGTCGCTATGTCTGATTC
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AF RR4EM87JQ C 1
AF RR4EM87TF U 1
BS 1 624 RR4EM87TF

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GCCGTAGAGGAAACAACAGAGAATGGTGGTGTTAGGGATACAGTCTCTTCACTGGTACGT
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ACCATCAATGGATGGATCAGAATCAGTTCCAGAAGCAAAGTCAGTCGCTATGTCTGATTC
TGAGCTTATCCAGTTTCCACTTTCGTCTTTTCCTGAAAACACTTCTAAATAGTAAACCCC
ACAGAGTGTTTTTTTAATATGCTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4EM87TF 624 0 0
GGAATTTTGCCAACAACGATGTCCACACACACACAGACACTAAACATTTATCATCACAGA
GCCGTAGAGGAAACAACAGAGAATGGTGGTGTTAGGGATACAGTCTCTTCACTGGTACGT
ACATGGAGGATTCATGGAGAAGAAGAATAAAAAATATCTGATGAGTATTGTAAAAGCCAC
TGAAAGCGACGACTCTTCTTCTTCTTCTGCACAGAGATTCGAAGTCGATAGAGATAAAGC
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AACCTTCGTCAAGACGTCATCGGAGGTTGTCAGAACAAGTAGCGGAGGAGGTTCGTCATC
AATGGATCCATTCATGTTTGAAGAACCACCTGAGATGTCCGGATCGTTCCTCACAACTAC
AGCTTTTCTTCTCTTAGCTTTTACACTGTTCTATAATATTTTTTTCTTTACAGTGATAAA
ACCATCAATGGATGGATCAGAATCAGTTCCAGAAGCAAAGTCAGTCGCTATGTCTGATTC
TGAGCTTATCCAGTTTCCACTTTCGTCTTTTCCTGAAAACACTTCTAAATAGTAAACCCC
ACAGAGTGTTTTTTTAATATGCTC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL8006Contig1 1298 2 2 U
GGTCGGCGATTAGTCTCAAAGCTGCTCACTTTCCCCTATAAAGAAGCAAAGCTCCCACCT
TTTGCCATGGCTTCTTCTTGTTTCCTCCGTCAGATTCTCTTCTCTCCAGTACCCACCAAC
CTTCAACCTCCTTCAAATCCTCTTTCACTTTCCTTCCCAAAGAATCTAACTTGTTCGATC
AGAAGTAAATCAATCAAGAGATTAGCTTTTAGTCGGAGAAAGGCATCGGGGACGAGAAGC
ATGTCTACGACGGCCGCGACGGAAAAAGGCAAAGAAGAGAATAAAAAAGTAGAGATCTTT
GACACGGAGGAGAACTTAGCTGCTGAGTTAGCCAAGTACACATCCCATCTCTCCGACAAG
TACTGCAAAGAGAGGGGAGCTTTCACCGTCGTCATCTCCGGTGGCTCCTTAATCAAATCT
CTCCGGAAGCTAGTAGAGGTTGATTCGATAGATTGGTCAAAACGGCATTTCTTCTGGGTG
GACGAGAGAGTTGTCCCCAAGCACCATGAAGACAGCAACTACAAACTTGCTTACGATGCC
TTCCTCTCCAAGGTTCCCATCCCTCCTGGAAACGTATACGCGATCAATGATTCACTTACC
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GCAGTGGAGGCGGCTCTGAAGAAGACTGGGGATGATGATGTGCCTGCGGGTTGTGTTTCT
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GTGTTGTGGTGCTTCCAGTTTTTGGAACTTGGCAGTGTGAGTGGACTAGTCCGGTTTGCT
TTTTGTCTTGTTGGGTCTGGTTCTCTCCGTTTGGGCTCTGGGAGAGAGGTTGTGTTGTAA
TAAAAGCAGAGAATAAGAGAGGGTTGAATTCAACCTAGTCAATGGTTTCTTTGCATTTGT
TTGGTTGAATGCAATAAAACAAAAGATATTTTTCTAAATTTAAACAATGTATCATCAGTA
TTTAACTATAAGTTTGGTACCGAAAAGAATAGTTGTAG


BQ
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AF RR4AC73TF U 1
AF RR4AC73JQ C 472
BS 1 778 RR4AC73TF
BS 779 1298 RR4AC73JQ

RD RR4AC73TF 778 0 0
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CTTCAACCTCCTTCAAATCCTCTTTCACTTTCCTTCCCAAAGAATCTAACTTGTTCGATC
AGAAGTAAATCAATCAAGAGATTAGCTTTTAGTCGGAGAAAGGCATCGGGGACGAGAAGC
ATGTCTACGACGGCCGCGACGGAAAAAGGCAAAGAAGAGAATAAAAAAGTAGAGATCTTT
GACACGGAGGAGAACTTAGCTGCTGAGTTAGCCAAGTACACATCCCATCTCTCCGACAAG
TACTGCAAAGAGAGGGGAGCTTTCACCGTCGTCATCTCCGGTGGCTCCTTAATCAAATCT
CTCCGGAAGCTAGTAGAGGTTGATTCGATAGATTGGTCAAAACGGCATTTCTTCTGGGTG
GACGAGAGAGTTGTCCCCAAGCACCATGAAGACAGCAACTACAAACTTGCTTACGATGCC
TTCCTCTCCAAGGTTCCCATCCCTCCTGGAAACGTATACGCGATCAATGATTCACTTACC
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CTCCGCGTGTCTGAATCAACCGGGTTTCCGAAGTTTGATCTCGTGCTTCTTGGTATGGGA
CCTGATGGCCACGTGGCGTCTCTGTTTCCAGGGCATGGTCTTTGTGATGAGAAGAAGA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4AC73JQ 827 0 0
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TACGATGCCTTCCTCTCCAAGGTTCCCATCCCTCCTGGAAACGTATACGCGATCAATGAT
TCACTTACCGCTGCGGCTGCAGCGGAAGATTACGAGACGTGTCTGAAGCATCTGGTCAAG
ACCGGTGTCCTCCGCGTGTCTGAATCAACCGGGTTTCCGAAGTTTGATCTCGTGCTTCTT
GGTATGGGACCTGATGGCCACGTGGCGTCTCTGTTTCCAGGGCATGGTCTTTGTGATGAG
AAGAAGAGATGGGTGGCTTCTATCACTGACTCTCCGAAGCCTCCTTCTGAGAGGATCACG
TTCACGTTTCCGGTTATTAACTCCTCTGCGCATGTAGCTTTAGTTGTTTGCGGTTCTGGG
AAGGCAGAGGCAGTGGAGGCGGCTCTGAAGAAGACTGGGGATGATGATGTGCCTGCGGGT
TGTGTTTCTGCTGAAGAAGAGCTGGTTTGGTTTCTTGATAAACCAGCTTGTTCCAAGCTC
TAATAACCGGTGTTGTGGTGCTTCCAGTTTTTGGAACTTGGCAGTGTGAGTGGACTAGTC
CGGTTTGCTTTTTGTCTTGTTGGGTCTGGTTCTCTCCGTTTGGGCTCTGGGAGAGAGGTT
GTGTTGTAATAAAAGCAGAGAATAAGAGAGGGTTGAATTCAACCTAGTCAATGGTTTCTT
TGCATTTGTTTGGTTGAATGCAATAAAACAAAAGATATTTTTCTAAATTTAAACAATGTA
TCATCAGTATTTAACTATAAGTTTGGTACCGAAAAGAATAGTTGTAG

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

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CAAATGCAAACGGTGCCCTCCCAACGGTTAACGGTATCAACGGTGTACCTCTCGGGACAG
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CTGATGGTCTGAGTCTTGGGTTTGGTACCATAACAGTCATCGATGACATACTCACATCTG
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GAGATGGAAGCACACAGATGATGGCCTTCACAGCTATGCTTGAAGGTGGAGAGTACAATG
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CTGGAGGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DN74TF U 1
AF RR4DN51TF U 1
BS 1 668 RR4DN51TF

RD RR4DN74TF 624 0 0
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GAGATGGAAGCACACAGATGATGGCCTTCACAGCTATGCTTGAAGGTGGAGAGTACAATG
ACAACCTAAACTTCTATGGGATTT

QA 1 624 1 624
DS 

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TTAAGCAATCACCATTCTTGCTTTTAACAGCAATCTTCTTGTTCACAGTTTCTGTTCTCG
CAGCAGCACTTGATCCTGCACCTGAAGACCCAATTTTCGAACTCTACATGCACGACATAC
TTGGAGGAGGCAGCCCCACGGCGAGGCCCATCACAGGTTTGCTCGGGAACATATACAACG
GTCAAGTTCCTTTCGCCAAGCAAATTGGTTTCACTCCTCCTGAGAACGGTATAGCCATAC
CAAATGCAAACGGTGCCCTCCCAACGGTTAACGGTATCAACGGTGTACCTCTCGGGACAG
GCTTGTCCGGTACAGCTTACTCTGGTCAGAATCTGAACGGGATCCAGACTCAGCTGGGTC
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GTCCTGGCTTGGGTTCCCAGCCACTTGGTAAGGCTCAAGGAGTTTACGTTGCAAGTTCCG
GAGATGGAAGCACACAGATGATGGCCTTCACAGCTATGCTTGAAGGTGGAGAGTACAATG
ACAACCTAAACTTCTATGGGATTTACAGGATAGGAAGCGCCATGTCTCATCTGTCAGTGA
CTGGAGGA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL8008Contig1 671 2 2 U
TTCTTACAACAGATCCAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACGTCGGGTAACAAGTT
CAGGATGTCGCTGGGTCTTCCCGTGGCGGCGACGGTGAACTGTGCTGACAACACAGGTGC
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CTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATCGTGAACCCCAAGGGAGAAATGAAAGG
ATCTGCAATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCAAGGATTGCTAG
TGCTGCCAATGCCATTGTCTGATAAAGATCAATCATAGCTAGTCGGTCTTTGTTGCCGTG
CGTTTGATTGTTTTTCTGAATCTTGTTCGAGTTCGAAATATATCACAAACAAATTTGAGG
ATTTTGGTAGATGGTATTTTGATTTTCTGACAATCTGAACGACGTTCAAATAATTTGGTT
ATTTAGACAAATCCTTAGTCATCCTCTCATGTTTTGATTCACAAAACCACAATGAAAATT
AACTGTTTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO90JQ C 1
AF RR4A070TFB U 133
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ATTTTGGTAGATGGTATTTTGATTTT

QA 1 566 1 566
DS 

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TGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGA
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TCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCAAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCAT
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QA 4 539 4 539
DS 



AS 1 2

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TAGGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

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AF RR4DU01JQ C 1
BS 1 636 RR4DU01TF
BS 637 666 RR4DU01JQ

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CCGTTCCAGTACATCCTCATCTGGTGTCTTGGTTATGTTTTCATGATGCTTGTCGAGTCA
AAGGAGGATCCAAGTGCTCGTGCCAAATCCGTCTCCTGATGTTCTTGGCATAAACCATTA
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QA 1 636 1 636
DS 

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TATTACGGTGTTCGGTTCGGGAAGAGTATACCTTGGGTTACAGAGTTTCCATTTGGGGTC
ATCAGAGATCCACAGTATGTTGGGAGCATCATGTCTTTGTTGGCTTGTCTCTCTTGGGTT
CCGTTCCAGTACATCCTCATCTGGTGTCTTGGTTATGTTTTCATGATGCTTGTCGAGTCA
AAGGAGGATCCAAGTGCTCGTGCCAAATCCGTCTCCTGATGTTCTTGGCATAAACCATTA
GTTAATAGATAGCTTCACTCCCATCTTTGTTGTTTTGACTGTTTCTGTTTTCAGCTTTGT
ACCCAAACTGGTTTTACAGTTTCGTGGAGACTTTATACATTTTTTGTTAAATCAAAACTT
TAGGAC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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AGATGCAAACAGATTCCATCATTTCAAGAACGGAGTGTGTTCTTGTAAAGATTATTGGTG
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TTTCTACT


BQ
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AF RR4EM32TF U 1
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GCACAGTGAGAGACTCGCGGTGGCTTATGGACTCTTAAAGCTACCAGAAAGAGTTCCCAT
TCGAGTCATCAAAAACCTAAGAGTCTGTGGAGATTGCCACGCGGTCATCAAACTGATTTC
GAAAGTGACAGAGCGAGAGATCATTCTTAGAGATGCAAACAGATTCCATCATTTCAAGAA
CGGAGTGTGTTCTTGTAAAGATTATTGGTGAGACTCTGATCATCCGTACCCGGTTAGCTC
ATACTCAAAACCGAAAAGGTTTCAATTTGGTTTGGTTCACGTTCTATTGGTTTAGTCGAG
TCTAGAATGTTGCAGGCAACTGTCCACGCATAACAATGCAATGTACAGGCATTCACCACT
TGAACCACTCAGTTATCATATAATAATATGTTTCTACT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

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TTTTCAATTTGTGGACAAATAAATTTATAACTTTTGATTCGGAGAAATTTAGCACTAGAT
TATAGTTTGGACTAAATTATAGTTTGGTGGAGATATAGTATGATAGTGGTGAGGGGAAAT
AGGTCGTTGTCCCCTATGAAAATTTTCCAGCGGTGGACAAACCATCCATCAATCTATTAT
ACGTAAAGATATCAGGCAACATATCTTTATCCAACATCTCGTTCACCAAAACCTCTCCTT
CCTTCCTTCTCCCCTCTTTTGAGAACCCCGAAACCAAAACACGGTACGTCGTCTCATCGG
CCTCAAACCCTTTACTCGTCGCCAACACTCTCAACCTGTTTGCATCCATCGAACGACCAG
AATCACATAGATCCCGAATAACCAAGTTAAACGTCACGCTATCAGGAACCACGCCTACAT
TCACCATCATCATCTTCTCCACAAACTCCGCCGCTTTCTCCGCTCTCCCTGATCTCCTCA
ACCCTTCCACGAGCGTAGTACAAGCAATCAAACACGGAGTCG


BQ
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BS 1 14 RR4E381TF
BS 15 642 RR4E381JQ

RD RR4E381TF 642 0 0
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ACCATGGTTTATGGGTAATTAGATGTCAAACTATAGATTCATGGATAAATAAGTTTACAA
TTTTCAATTTGTGGACAAATAAATTTATAACTTTTGATTCGGAGAAATTTAGCACTAGAT
TATAGTTTGGACTAGATTATAGTTTGGTGGAGATATAGTATGATAGTGGTGAGGGGAAAT
AGGTCGTTGTCCCCTATGAAAATTTTCCAGCGGTGGACAAACCATCCATCAATCTATTAT
ACGTAAAGATATCAGGCAACATATCTTTATCCAACATCTCGTTCACCAAAACCTCTCCTT
CCTTCCTTCTCCCCTCTTTTGAGAACCCCGAAACCAAAACACGGTACGTCGTCTCATCGG
CCTCAAACCCTTTACTCGTCGCCAACACTCTCAACCTGTTTGCATCCATCGAACGACCAG
AATCACATAGATCCCGAATAACCAAGTTAAACGTCACGCTATCAGGAACCACGCCTACAT
TCACCATCATCATCTTCTCCACAAACTCCGCCGCTTTCTCCGCTCTCCCTGATCTCCTCA
ACCCTTCCACGAGCGTAGTACAAGCAATCAAACACGGAGTCG

QA 1 642 1 642
DS 

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AGTTTAACTGGTTAAAAATTATTTGGTTAGTAATAAACCAACTAAAACCATGGTTTATGG
GTAATTAGATGTCAAACTATAGATTCATGGATAAATAAGTTTACAATTTTCAATTTGTGG
ACAAATAAATTTATAACTTTTGATTCGGAGAAATTTAGCACTAGATTATAGTTTGGACTA
AATTATAGTTTGGTGGAGATATAGTATGATAGTGGTGAGGGGAAATAGGTCGTTGTCCCC
TATGAAAATTTTCCAGCGGTGGACAAACCATCCATCAATCTATTATACGTAAAGATATCA
GGCAACATATCTTTATCCAACATCTCGTTCACCAAAACCTCTCCTTCCTTCCTTCTCCCC
TCTTTTGAGAACCCCGAAACCAAAACACGGTACGTCGTCTCATCGGCCTCAAACCCTTTA
CTCGTCGCCAACACTCTCAACCTGTTTGCATCCATCGAACGACCAGAATCACATAGATCC
CGAATAACCAAGTTAAACGTCACGCTATCAGGAACCACGCCTACATTCACCATCATCATC
TTCTCCACAAACTCCGCCGCTTTCTCCGCTCTCCCTGATCTCCTCAACCCTTCCACGAGC
GTAGTACAAGCAATCAAACACGGAGTCG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGACCCCACCCTCTGACAAACAAGTTGATATATCTCCATCCGATCCTCCATCTCTGACCA
CACCATCACTCACCTTCAACGTGGCAACACCGGCCCATGACCACGAAGGAACCTTTTTCC
ACACCGGAATACCTATCAAACAAGATCCAGCTGCTCATTATTGGTCTAACGTTTTTGGAT
TCCCGCCAAACTTGAAAACCGAGACCCGACAAATAGCAACCTTTGGGTCGGATCTTCACA
ACACCTCTCCGGGGTTTGCTATCATGCAAGATGGAGGAAACAACTTTGGTGGTGGGTTTG
TTGAGTCCGAAGGGTATAACAATCATTCAGCTGCATCAAGTCCTGTCTCGGCAATTCCTC
TACCCTCAACGGTAGATAACGGCAACGAAGGATATGGTGGAAACGTAAACTGGATAAGTA
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TTTTTGGATTGGAATGAGCTCTCGAACTCATCTTAGTGAGTACCAAAGAAAAGATTGTAG
GATAAAAAAGAACGGCGTTGTTTGAAATGGAATATTCTCTTGTTAGATTATTTAAATAGT
TTTCTTAAAGATATTTTCTTCACT


BQ
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AF RR4BS22JQ C 1
AF RR4BS22TF U 1
BS 1 624 RR4BS22TF

RD RR4BS22JQ 624 0 0
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QA 1 624 1 624
DS 

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TCCCGCCAAACTTGAAAACCGAGACCCGACAAATAGCAACCTTTGGGTCGGATCTTCACA
ACACCTCTCCGGGGTTTGCTATCATGCAAGATGGAGGAAACAACTTTGGTGGTGGGTTTG
TTGAGTCCGAAGGGTATAACAATCATTCAGCTGCATCAAGTCCTGTCTCGGCAATTCCTC
TACCCTCAACGGTAGATAACGGCAACGAAGGATATGGTGGAAACGTAAACTGGATAAGTA
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TTTTTGGATTGGAATGAGCTCTCGAACTCATCTTAGTGAGTACCAAAGAAAAGATTGTAG
GATAAAAAAGAACGGCGTTGTTTGAAATGGAATATTCTCTTGTTAGATTATTTAAATAGT
TTTCTTAAAGATATTTTCTTCACT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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TTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATCG


BQ
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AF RR4G226JQ C 1
AF RR4G226TF U 1
BS 1 408 RR4G226TF

RD RR4G226JQ 408 0 0
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QA 1 408 1 408
DS 

RD RR4G226TF 408 0 0
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CGACCGTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGAGACGGAAAAATATCTGCCTCCGAGCT
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CGAGATTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAAG
TGCCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATGATCAAATTT
TATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTATG
TTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATCG

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 2

CO CL8015Contig1 987 2 6 U
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GCAACAAGATTATTATTGTAAGAGAGATAATGCATTACACAGTATCTGTTCAGGATAGCC
ATTGATTATAAATTACAGAGTTTTACT


BQ
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AF RR4AX38TF U 1
AF RR4AX38JQ C 208
BS 1 766 RR4AX38TF
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BS 786 878 RR4AX38TF
BS 879 987 RR4AX38JQ

RD RR4AX38TF 878 0 0
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CAAA*TTCAGAACATATTGGAGACCAACTTCGACCTCAACCCATAGTTTTTTTTTCCCGG
TCTCCAAGTTCCTCATCTTATAGTCTCAGTGAACCTAC

QA 1 878 1 878
DS 

RD RR4AX38JQ 780 0 0
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CTATGTGGCTTTCTTGATTCCAAGAAGATAAAGTTGGTTTTCAGATTCTTCTCTCTCTCT
CTACAGCTTGTGTTGTTTAGCCTTGCTCATCAATAATGTTAAGAAGAGTTGAGCAACTTT
TTGTTTCATTTTTTGTAGGAGGGGGCTAATCACACGCAATGTTAAGAAGGCAATCGACAT
ATTCCACCAACGTTTTGAGGTTATCTTTTCACCGGCGCTAGGCAGAGAGTTTCGTCCATA
TAAACCAAACCCAGACCCGCTTCTGCATATATGTTCTGCATGGGACATCCAACCTAATGA
AGTCATGATGGTTGGTGATAGCTTAAAAGATGATATAGCTTGTGGGAAAGGAGCTGGAGC
TTTCACATGCTTGCTTGATGAAACCGGAAGGTATGGACCAGATGACTTTTCTGTCTCTGG
ACTGCTTCCTGATTTTAAGGTTGATTCTCTGTCCAAAATTCAGAACATATTGGAGACCAA
CTTCGACCTCAACCCATAGTTTTTTTTTCCCGGTCTCCAAGTTCCTCATCTTATAGTCTC
AGTGAACCTACTCAATACAAAAGGCTGTAGTTTGCAACAAGATTATTATTGTAAGAGAGA
TAATGCATTACACAGTATCTGTTCAGGATAGCCATTGATTATAAATTACAGAGTTTTACT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL8016Contig1 838 2 5 U
GCGATAGAAAAGCGTTTTCCTGGGAAAAACTTCACGAATCAATCGGGAAACTCACCAAGA
GCTCGAGAAAACCATGAGCAACGAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTCTGTTGATCGGTGA
CTCATCTGTTGGGAAATCATGCCTGCTTCTTCGATTCGCTGATGATGCGTACATTGACAG
TTACATAAGCACCATTGGTGTTGACTTCAAAATTAGGACGATTGAGCAGTATGGGAAGAC
GATTAAGCTCCAAATCTGGGATACTGCTGGGCAGGAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAG
CTACTACAGAGGAGCTCATGGAATCATCATTGTGTATGACTGTACTGAGATGGAAAGCTT
CAATAACGTGAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGACAGATATGCTAATGACAGTGTATGCAA
GCTTCTTATTGGTAACAAGAATGATATGGTTGACAGTAAAGTTGTTTCCACCGAAACTGG
AAAGGCCTTAGCAGACGAGCTCGGAATACCCTTTCTGGAGACCGGTGCTAAGGATTCTAT
CAACGTCGAACAGGCATTCTTAACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAGAAAATGGGAAGCCA
GACGAATGCAAACAAGACATCTGGAAGTGGAACTGTCCAAATGAAAGGTCAGCCAATCCA
ACAAAACAATGGGTGGCGGTTGCTGCGGTCAGTAGTTAAGCAAACTGTTACCAAAACTAC
CTGTTCTTCTCTTACTATGTGTGTTGTGAAAACTAATGGCTGTCTAAAACAATAACACTG
GAAACTTTAGTATTTCATGTCACTCTGTGTTACAAATGATCTATGGTGTGTTAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AH40TF U 1
AF RR4AH40JQ C 35
BS 1 768 RR4AH40TF
BS 769 769 RR4AH40JQ
BS 770 815 RR4AH40TF
BS 816 816 RR4AH40JQ
BS 817 838 RR4AH40TF

RD RR4AH40TF 838 0 0
GCGATAGAAAAGCGTTTTCCTGGGAAAAACTTCACGAATCAATCGGGAAACTCACCAAGA
GCTCGAGAAAACCATGAGCAACGAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTCTGTTGATCGGTGA
CTCATCTGTTGGGAAATCATGCCTGCTTCTTCGATTCGCTGATGATGCGTACATTGACAG
TTACATAAGCACCATTGGTGTTGACTTCAAAATTAGGACGATTGAGCAGTATGGGAAGAC
GATTAAGCTCCAAATCTGGGATACTGCTGGGCAGGAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAG
CTACTACAGAGGAGCTCATGGAATCATCATTGTGTATGACTGTACTGAGATGGAAAGCTT
CAATAACGTGAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGACAGATATGCTAATGACAGTGTATGCAA
GCTTCTTATTGGTAACAAGAATGATATGGTTGACAGTAAAGTTGTTTCCACCGAAACTGG
AAAGGCCTTAGCAGACGAGCTCGGAATACCCTTTCTGGAGACCGGTGCTAAGGATTCTAT
CAACGTCGAACAGGCATTCTTAACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAGAAAATGGGAAGCCA
GACGAATGCAAACAAGACATCTGGAAGTGGAACTGTCCAAATGAAAGGTCAGCCAATCCA
ACAAAACAATGGGTGGCGGTTGCTGCGGTCAGTAGTTAAGCAAACTGTTACCAAAACTAC
CTGTTCTTCTCTTACTATGTGTGTTGTGAAAACTAATGGCTGTCTAAA*CAATAACACTG
GAAACTTTAGTATTTCATGTCACTCTGTGTTACAA*TGATCTATGGTGTGTTAGTTGC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4AH40JQ 804 0 0
CGAATCAATCGGGAAACTCACCAAGAGCTCGAGAAAACCATGAGCAACGAGTACGATTAT
CTGTTCAAGCTTCTGTTGATCGGTGACTCATCTGTTGGGAAATCATGCCTGCTTCTTCGA
TTCGCTGATGATGCGTACATTGACAGTTACATAAGCACCATTGGTGTTGACTTCAAAATT
AGGACGATTGAGCAGTATGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATCTGGGATACTGCTGGGCAG
GAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGAATCATCATTGTG
TATGACTGTACTGAGATGGAAAGCTTCAATAACGTGAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGAC
AGATATGCTAATGACAGTGTATGCAAGCTTCTTATTGGTAACAAGAATGATATGGTTGAC
AGTAAAGTTGTTTCCACCGAAACTGGAAAGGCCTTAGCAGACGAGCTCGGAATACCCTTT
CTGGAGACCGGTGCTAAGGATTCTATCAACGTCGAACAGGCATTCTTAACTATTGCTGGC
GAGATCAAGAAGAAAATGGGAAGCCAGACGAATGCAAACAAGACATCTGGAAGTGGAACT
GTCCAAATGAAAGGTCAGCCAATCCAACAAAACAATGG*TGGCGGTTGCTGCGGTCAGTA
GTTAAGCAAACTGTTACCAAAACTACCTGTTCTTCTCTTACTATGTGTGTTGTGAAAACT
AATGGCTGTCTAAAACAATAACACTGGAAACTTTAGTATTTCATGTCACTCTGTGTTACA
AATGATCTATGGTGTGTTAGTTGC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL8017Contig1 898 2 4 U
GTTTCGTGAATCTGTTTCTCCTTAGATCCAAACCATTTCAATCTCATAAAAATATCGATT
TCGCGTTTCTGGTCTGTCACAATCAGAAGCCAGAAAAAAGGGGATGGCGGCGGTGAATGG
GTACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACCGGATCGAAGCAACCTGC
TCCTCCGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTTGCAATCTGAACTAAT
GGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATATT
CTGCTGGAAAGGAACTATCACAGGGAGCAAAGAGACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAG
ACTCTCACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTTGAGAC
TTGCTGCTTCCATCCCTAATGTCGATCTCTATGGCAATATTTGCTTGGATATTCTTCAGG
ATAAATGGTCATCCGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTTG
GAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCAAGCAGCTTAGCTTTGGAGCAACCAAG
AAGAGTATAGGAAGATGGTGGAGAAGCTCTACAAACCTCTAAACGCATGATTCTGAAAAG
CCTCTTGTAACTTGGATGCAAGAGTGTCACTGCATTCAAAAGATCATGCTACTTTTTTTT
ATTAAACTTTGTAATCTCAATTACAAACCTCTAAACGCATGATTCTGAAAAGCCTCTTGT
AACTTGGATGCAAGAGTGTCACTGCATTCAAAAGATCATGCTACTTTTTTTTATTAAACT
TTGTAATCTCAATTCGTGCCAGTCTTAGCAATCAAAACCAGTAATATCTTCCGTGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF29TF U 1
AF RR4BF29JQ C 106
BS 1 812 RR4BF29TF
BS 813 813 RR4BF29JQ
BS 814 848 RR4BF29TF
BS 849 898 RR4BF29JQ

RD RR4BF29TF 848 0 0
GTTTCGTGAATCTGTTTCTCCTTAGATCCAAACCATTTCAATCTCATAAAAATATCGATT
TCGCGTTTCTGGTCTGTCACAATCAGAAGCCAGAAAAAAGGGGATGGCGGCGGTGAATGG
GTACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACCGGATCGAAGCAACCTGC
TCCTCCGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTTGCAATCTGAACTAAT
GGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATATT
CTGCTGGAAAGGAACTATCACAGGGAGCAAAGAGACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAG
ACTCTCACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTTGAGAC
TTGCTGCTTCCATCCCTAATGTCGATCTCTATGGCAATATTTGCTTGGATATTCTTCAGG
ATAAATGGTCATCCGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTTG
GAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCAAGCAGCTTAGCTTTGGAGCAACCAAG
AAGAGTATAGGAAGATGGTGGAGAAGCTCTACAAACCTCTAAACGCATGATTCTGAAAAG
CCTCTTGTAACTTGGATGCAAGAGTGTCACTGCATTCAAAAGATCATGCTACTTTTTTTT
ATTAAACTTTGTAATCTCAATTACAAACCTCTAAACGCATGATTCTGAAAAGCCTCTTGT
AACTTGGATGCAAGAGTGTCACTGCATTCAAA*GATCATGCTACTTTTTTTTATTAAACT
TTGTAATC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR4BF29JQ 793 0 0
GGCGGCGGTGAATGGGTACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACCGG
ATCGAAGCAACCTGCTCCTCCGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTT
GCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCCAGA
GGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACTATCACAGGGAGCAAAGAGACTGTGTTTGA
AGGAACTGAGTACAGACTCTCACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAA
GATCAAGTTTGAGACTTGCTGCTTCCATCC*TAATGTCGATCTCTATGGCAATATTTGCT
TGGATATTCTTCAGGATAAATGGTCATCCGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTCGA
TTCAAAGCCTTCTTGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCAAGCAGCTTAGC
TTTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTGGAGAAGCTCTACAAACCTCTAAACG
CATGATTCTGAAAAGCCTCTTGTAACTTGGATGCAAGAGTGTCACTGCATTCAAAAGATC
ATGCTACTTTTTTTTATTAAACTTTGTAATCTCAATTACAAACCTCTAAACGCATGATTC
TGAAAAGCCTCTTGTAACTTGGATGCAAGAGTGTCACTGCATTCAAAAGATCATGCTACT
TTTTTTTATTAAACTTTGTAATCTCAATTCGTGCCAGTCTTAGCAATCAAAACCAGTAAT
ATCTTCCGTGCAG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL8018Contig1 662 2 1 U
GGGACACCAAGCAAATTTTATTATACTACTCGATCTCTAGAAAACTCAGAAAAGAGAGAA
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AAGGTGCTGAAGCAGGTTCACCCGGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATG
AACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCGGCGAGTCTTCAAAGCTCGCGAGG
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CCTGGAGAGTTGGCGAAGCACGCCGTCTCGGAGGGTACCAAGGCGGTTACCAAGTTCACG
AGCTCCTGAACTTTGATTTAGTTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAATCTGGATTGTCTGGATT
AGGGTTTGTAGAATTTAATTTCTTGTGATTGTAATCTCTATCTTTTTTTTGTAAGTACGT
TTGAAATCTACGTTGAATCATTGTGTCCTAATCACTCTTAATGAAGTTTTTATCTGCCAG
CC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4DM75JQ C 1
AF RR4DM75TF U 1
BS 1 662 RR4DM75TF

RD RR4DM75JQ 662 0 0
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CCGGCGGAGAAGAAGCCAAAAGCCGGGAAGAAGCTCCCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCC
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AGGGTTTGTAGAATTTAATTTCTTGTGATTGTAATCTCTATCTTTTTTTTGTAAGTACGT
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CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4DM75TF 662 0 0
GGGACACCAAGCAAATTTTATTATACTACTCGATCTCTAGAAAACTCAGAAAAGAGAGAA
TCCATGGCTCCCAAAGCAGCAGAGAAGAAGCCCGCTGAGAAGAAGCCAGCCGAGAAAGCT
CCGGCGGAGAAGAAGCCAAAAGCCGGGAAGAAGCTCCCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCC
GGAGACAAGAAGAAGAAGCGGTCGAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTC
AAGGTGCTGAAGCAGGTTCACCCGGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATG
AACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCGGCGAGTCTTCAAAGCTCGCGAGG
TACAACAAGAAGCCTACCATCACTTCCAGGGAGATCCAGACGGCTGTTAGACTCGTCTTG
CCTGGAGAGTTGGCGAAGCACGCCGTCTCGGAGGGTACCAAGGCGGTTACCAAGTTCACG
AGCTCCTGAACTTTGATTTAGTTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAATCTGGATTGTCTGGATT
AGGGTTTGTAGAATTTAATTTCTTGTGATTGTAATCTCTATCTTTTTTTTGTAAGTACGT
TTGAAATCTACGTTGAATCATTGTGTCCTAATCACTCTTAATGAAGTTTTTATCTGCCAG
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL8019Contig1 771 2 8 U
GGAAAACAAAAAAAAAGACAAAAAAAGATCTTCTTCTTCTTCCTCGTTCTCTTCTGTTCT
GTTCTGTTTCTAGGGTTTCTTGGATTCCATATCTCCAAGATTTGCTCTGATATGAAAGGG
AATGCTATTAGACGAGAGACGGAAGGGGAGTTTAGGTTACTTGGAAGAAGAGGAGGGAGG
CTTATGGGTGTTGAAGATGAACAGCCGAGCAGAGGGACAAGGGTCTCGTTTAACGTGGAC
CGTGTCAGTCATAGTCTGGACCAAGGTGAAGCTTTGTATAACGAAGAAAGTGGTGATGAT
GGTGAGAATCAGAACGAGGATGATTGGGAGAGAAGGGAGCCTGAGATTGTTTGCAGCCAT
ATCGATCATGTGAATATGTTAGGTCTTAGTAAAACCACGACTAGGCTGAGGTTTCTGATA
AACTGGCTTGTGATCTCTTTGCTGCAGCTCAAGGTGCCTGAAACAGGGAGTCTTGTGCAG
ATATATGGGCCGAAGATAAAGTACGAGAGAGTCAGAGACGTGATGGGGAAAAAGCCTAAA
ACTTTTTGAATATGACTCGGAGAAGAGGCTGCGTCATAGAGCATGCTTATGGAAATGGAA
GTGAGAGATGTGAGGTTGAGATTTGCTGCTGCTATATATTGTTTTTCTTTTTTGGGTTGC
GTTTTGATGTGTTTATTATTAGTTGTGAGATAGGGAGGGAACAATTCTTGTAATCTGGAA
AGGGAGAAACAGTGTTTGGTCCAAAGATTTTTCACGTTTAGATTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BS47TF U 1
AF RR4BS47JQ C 2
BS 1 723 RR4BS47TF
BS 724 724 RR4BS47JQ
BS 725 744 RR4BS47TF
BS 745 745 RR4BS47JQ
BS 746 751 RR4BS47TF
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BS 753 763 RR4BS47TF
BS 764 771 RR4BS47JQ

RD RR4BS47TF 763 0 0
GGAAAACAAAAAAAAAGACAAAAAAAGATCTTCTTCTTCTTCCTCGTTCTCTTCTGTTCT
GTTCTGTTTCTAGGGTTTCTTGGATTCCATATCTCCAAGATTTGCTCTGATATGAAAGGG
AATGCTATTAGACGAGAGACGGAAGGGGAGTTTAGGTTACTTGGAAGAAGAGGAGGGAGG
CTTATGGGTGTTGAAGATGAACAGCCGAGCAGAGGGACAAGGGTCTCGTTTAACGTGGAC
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GGTGAGAATCAGAACGAGGATGATTGGGAGAGAAGGGAGCCTGAGATTGTTTGCAGCCAT
ATCGATCATGTGAATATGTTAGGTCTTAGTAAAACCACGACTAGGCTGAGGTTTCTGATA
AACTGGCTTGTGATCTCTTTGCTGCAGCTCAAGGTGCCTGAAACAGGGAGTCTTGTGCAG
ATATATGGGCCGAAGATAAAGTACGAGAGAGTCAGAGACGTGATGGGGAAAAAGCCTAAA
ACTTTTTGAATATGACTCGGAGAAGAGGCTGCGTCATAGAGCATGCTTATGGAAATGGAA
GTGAGAGATGTGAGGTTGAGATTTGCTGCTGCTATATATTGTTTTTCTTTTTTGGGTTGC
GTTTTGATGTGTTTATTATTAGTTGTGAGATAGGGAGGGAACAATTCTTGTAATCTGGAA
AGG*AGAAACAGTGTTTGGTCCAA*GATTTT*CACGTTTAGAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4BS47JQ 770 0 0
GGAAAAC
AAAAAAAAGACAAAAAAAGATCTTCTTCTTCTTCCTCGTTCTCTTCTGTTCTGTTCTGTT
TCTAGGGTTTCTTGGATTCCATATCTCCAAGATTTGCTCTGATATGAAAGGGAATGCTAT
TAGACGAGAGACGGAAGGGGAGTTTAGGTTACTTGGAAGAAGAGGAGGGAGGCTTATGGG
TGTTGAAGATGAACAGCCGAGCAGAGGGACAAGGGTCTCGTTTAACGTGGACCGTGTCAG
TCATAGTCTGGACCAAGGTGAAGCTTTGTATAACGAAGAAAGTGGTGATGATGGTGAGAA
TCAGAACGAGGATGATTGGGAGAGAAGGGAGCCTGAGATTGTTTGCAGCCATATCGATCA
TGTGAATATGTTAGGTCTTAGTAAAACCACGACTAGGCTGAGGTTTCTGATAAACTGGCT
TGTGATCTCTTTGCTGCAGCTCAAGGTGCCTGAAACAGGGAGTCTTGTGCAGATATATGG
GCCGAAGATAAAGTACGAGAGAGTCAGAGACGTGATGGGGAAAAAGCCTAAAACTTTTTG
AATATGACTCGGAGAAGAGGCTGCGTCATAGAGCATGCTTATGGAAATGGAAGTGAGAGA
TGTGAGGTTGAGATTTGCTGCTGCTATATATTGTTTTTCTTTTTTGGGTTGCGTTTTGAT
GTGTTTATTATTAGTTGTGAGATAGGGAGGGAACAATTCTTGTAATCTGGAAAGGGAGAA
ACAGTGTTTGGTCCAAAGATTTTTCACGTTTAGATTAAAAAAA

QA 8 770 8 770
DS 



AS 1 2

CO CL8020Contig1 640 2 2 U
GAAGAGATTTTAAGGACTAACTCCTTAAGCTTTCACCTACTCAACTCACCCCCACGATGA
TCATCATCTCCAACCTCCATCGCCAATTTATCTCCATGAGCTGTCTCGTTGCTCTCTCTG
CCATCATCACAGTTTGAGTGGGCTTGGCAGCATCCGAGAGAAGCTGCCGCTGCTTTCAAA
TCCTTCTCTGGACTTGCTAGCAATGTCAAGCTTGATTTCATCTTGCTCTCTCTTCCTGCT
TGGAATAGACTTGGAAGCTGAGAAGACAAGAAAGAAGACGGAACTGGAACTTTCCTCCGA
TGGAGAAAAGAGTCGGAATAAAACAAAGGTTGATCTTAATCAATCTGCTGCTGCTGCTGC
CGCTGCTGCTGCTATAACTGATGTTGATGAGAGTTACGAGTTGCGTGGAAATTTTCAGCT
TGAAGTTGTGGCTACTGAATCTTCACCACGAGATGATACTCTTCCGGAAACAGCCAGAAA
AGGTATCCTCTGTCTGTCTATAAAAGATTGGAGCATAGTTATCTGTTGTTTAATTGAATC
TAGTTATGCTCTCATAATGTAATTGTGATTCTCGTGTAGAAACTGAGATGGGTAATTCTT
TTTATTCCTAAAGATTCAAATATAAAAAACACCATTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D136TF U 1
AF RR4CR62JQ C 25
BS 1 616 RR4D136TF
BS 617 640 RR4CR62JQ

RD RR4D136TF 616 0 0
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TCATCATCTCCAACCTCCATCGCCAATTTATCTCCATGAGCTGTCTCGTTGCTCTCTCTG
CCATCATCACAGTTTGAGTGGGCTTGGCAGCATCCGAGAGAAGCTGCCGCTGCTTTCAAA
TCCTTCTCTGGACTTGCTAGCAATGTCAAGCTTGATTTCATCTTGCTCTCTCTTCCTGCT
TGGAATAGACTTGGAAGCTGAGAAGACAAGAAAGAAGACGGAACTGGAACTTTCCTCCGA
TGGAGAAAAGAGTCGGAATAAAACAAAGGTTGATCTTAATCAATCTGCTGCTGCTGCTGC
CGCTGCTGCTGCTATAACTGATGTTGATGAGAGTTACGAGTTGCGTGGAAATTTTCAGCT
TGAAGTTGTGGCTACTGAATCTTCACCACGAGATGATACTCTTCCGGAAACAGCCAGAAA
AGGTATCCTCTGTCTGTCTATAAAAGATTGGAGCATAGTTATCTGTTGTTTAATTGAATC
TAGTTATGCTCTCATAATGTAATTGTGATTCTCGTGTAGAAACTGAGATGGGTAATTCTT
TTTATTCCTAAAGATT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4CR62JQ 616 0 0
GG
AAGCTTTCACCTACTCAACTCACCCCTACGATGATCATCATCTCCAACCTCCATCGCCAA
TTTATCTCCATGAGCTGTCTCGTTGCTCTCTCTGCCATCATCACAGTTTGAGTGGGCTTG
GCAGCATCCGAGAGAAGCTGCCGCTGCTTTCAAATCCTTCTCTGGACTTGCTAGCAATGT
CAAGCTTGATTTCATCTTGCTCTCTCTTCCTGCTTGGAATAGACTTGGAAGCTGAGAAGA
CAAGAAAGAAGACGGAACTGGAACTTTCCTCCGATGGAGAAAAGAGTCGGAATAAAACAA
AGGTTGATCTTAATCAATCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTATAACTGATGTTG
ATGAGAGTTACGAGTTGCGTGGAAATTTTCAGCTTGAAGTTGTGGCTACTGAATCTTCAC
CACGAGATGATACTCTTCCGGAAACAGCCAGAAAAGGTATCCTCTGTCTGTCTATAAAAG
ATTGGAGCATAGTTATCTGTTGTTTAATTGAATCTAGTTATGCTCTCATAATGTAATTGT
GATTCTTGTGTAGAAACTGAGATGGGTAATTCTTTTTATTCCTAAAGATTCAAATATAAA
AAACACCATTGGAC

QA 3 616 3 616
DS 



AS 1 2

CO CL8021Contig1 853 2 2 U
GTGGCGTTGAACCGTCTTGGAACTCCTGTGGAGATATTAGATTACGCATGGATGGTCTTT
TCGAACTGAAGGAACATGCGGTTCAGTTAACGAAAGAGTTTACTGCTTTATATACAAACG
GACCAGCTGGTGGTGGTGGAATTAGTACCGGACACAAGATGGAGATTGTTCTTGAAAAAC
GTTTGGTAAGCCGTGAATCTGTGATGTGGAAAACTGGGATTGAGCACACAAAAACGTCAG
AGTCAGAGACCCCTGAACATCCTTTTCCAGTTGCTCGAGAGAAAATTGGAAAGACCTCTA
CCGAAAATCAAAATATATTGGTAGTGAGAGGGGAACAATGGACGGATTCATCTGGAACGA
ATCGCTCTCCTGCTCCATCTGGCCAAAAGATCCCACTCTACTCTGTTGCTCATAGCAGGG
CAGGTGATAAAGGAAACGACATAAACTTCTCACTAATCCCTCATTATCCACCAGATATAG
AGCGTCTGAAACTCATCATTACTCATCAATGGGTTAAAAAAGTGATGTCGGTACTGTTAT
CAACCTCTTCGTTTATGGAGATGGATGCAAAACCAGTCTATGAAAATGTGTCAGTAGAGA
TATATGATGTGAAAGGCATTCACGCTTTGAATGTTGTTGTACGGAACGTGTTAGATGGGG
GGAGTCAACTGTTCCAGGAGAATTGATAGACATGGAAAGACAATCTCAGATCTTATCTTG
TGTCAACAAGTTGTGTTATGACACTACTTTTTTTTTACTTTATTCAAATTAATAATTGTG
TGGTAATCATGATTGTGCAAATGAGACTTGTACTACACTGTTTTTATATCCAAGAAATCG
ACTTTAGTGGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A742TF U 1
AF RR4A742JQ C 31
BS 1 822 RR4A742TF
BS 823 853 RR4A742JQ

RD RR4A742TF 822 0 0
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TCGAACTGAAGGAACATGCGGTTCAGTTAACGAAAGAGTTTACTGCTTTATATACAAACG
GACCAGCTGGTGGTGGTGGAATTAGTACCGGACACAAGATGGAGATTGTTCTTGAAAAAC
GTTTGGTAAGCCGTGAATCTGTGATGTGGAAAACTGGGATTGAGCACACAAAAACGTCAG
AGTCAGAGACCCCTGAACATCCTTTTCCAGTTGCTCGAGAGAAAATTGGAAAGACCTCTA
CCGAAAATCAAAATATATTGGTAGTGAGAGGGGAACAATGGACGGATTCATCTGGAACGA
ATCGCTCTCCTGCTCCATCTGGCCAAAAGATCCCACTCTACTCTGTTGCTCATAGCAGGG
CAGGTGATAAAGGAAACGACATAAACTTCTCACTAATCCCTCATTATCCACCAGATATAG
AGCGTCTGAAACTCATCATTACTCATCAATGGGTTAAAAAAGTGATGTCGGTACTGTTAT
CAACCTCTTCGTTTATGGAGATGGATGCAAAACCAGTCTATGAAAATGTGTCAGTAGAGA
TATATGATGTGAAAGGCATTCACGCTTTGAATGTTGTTGTACGGAACGTGTTAGATGGGG
GGAGTCAACTGTTCCAGGAGAATTGATAGACATGGAAAGACAATCTCAGATCTTATCTTG
TGTCAACAAGTTGTGTTATGACACTACTTTTTTTTTACTTTATTCAAATTAATAATTGTG
TGGTAATCATGATTGTGCAAATGAGACTTGTACTACACTGTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR4A742JQ 823 0 0
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CGAAAGAGTTTACTGCTTTATATACAAACGGACCAGCTGGTGGTGGTGGAATTAGTACCG
GACACAAGATGGAGATTGTTCTTGAAAAACGTTTGGTAAGCCGTGAATCTGTGATGTGGA
AAACTGGGATTGAGCACACAAAAACGTCAGAGTCAGAGACCCCTGAACATCCTTTTCCAG
TTGCTCGAGAGAAAATTGGAAAGACCTCTACCGAAAATCAAAATATATTGGTAGTGAGAG
GGGAACAATGGACGGATTCATCTGGAACGAATCGCTCTCCTGCTCCATCTGGCCAAAAGA
TCCCACTCTACTCTGTTGCTCATAGCAGGGCAGGTGATAAAGGAAACGACATAAACTTCT
CACTAATCCCTCATTATCCACCAGATATAGAGCGTCTGAAACTCATCATTACTCATCAAT
GGGTTAAAAAAGTGATGTCGGTACTGTTATCAACCTCTTCGTTTATGGAGATGGATGCAA
AACCAGTCTATGAAAATGTGTCAGTAGAGATATATGATGTGAAAGGCATTCACGCTTTGA
ATGTTGTTGTACGGAACGTGTTAGATGGGGG*AGTCAACTGTTCCAGGAGAATTGATAGA
CATGGAAAGACAATCTCAGATCTTATCTTGTGTCAACAAGTTGTGTTATGACACTACTTT
TTTTTTACTTTATTCAAATTAATAATTGTGTGGTAATCATGATTGTGCAAATGAGACTTG
TACTACACTGTTTTTATATCCAAGAAATCGACTTTAGTGGTGT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL8022Contig1 1325 2 4 U
GGGACCTCTTCGAACTTATGCTCAATCAATAATCTCAAACAGAAACTTGCAGAAATTTTG
AAGTGATGAAGACTCGTAGGCGAACATACACGGCCGAAACTCCAGCATTGTTGTTCTCCG
AAGCCCTCACAGTGAAACTCAATTTTAAAGCGCTTCCAGTACCAAACAGTATAAATCATG
TATCAAAAAAGAAGTGTATTAAAGGATTGTGGAATATAAATATTCCTTCAGATCTACTGC
AAGAGATACTATCCCGCCTCAGTTTAAAAGGCAACATACGAGCTGCTGCTGTCTGCAAGA
CATGGTGTGAAGCAGCTGTTTCTGTCAGAAAGTTACAGCCTCGCCCTTGGCTTTTTTATC
CACTAAGAGGACTAGAAGAGGGAAACTACATCCTTTTAGACCCATCACGGCCTCAAGCAT
ATAAGTTTAGTTTCCCAGTGTTAAAGGGATGTGTATTATCTTATTCTAGGGATGGTTGGT
TGCTTGTGAAAAAAACACATGCCCTCTCGTATTTGGTATTCTTATTCAATCCATTTACCG
GGAACCGTATCTTCTTACCCAAGGTGTCACTTACATCAGGCTATTGTTTAGCTATCTCCG
CCGCCCCTACATCAAGTAGTTGTATGGTGATTTCTTGCAACTATACTAGTATCCCCTCAT
ATATTGTCATCAATACTTGGCGGCCTGGTCAAACCGTATGGACCACCCATCAATTTAAGA
ACCAGTTACCCGGTGGTGGATTGAACAATTGTGTCATCTCGAATGGTATGTTCTATTGTC
TTAGTACCTGCGGCTACCTCGGGGTTTTCGACCCGCCTAGAGCAACATGGAATATTCTAC
CATTGAGACCATGTCTCGCTTTTCGTCAGGTAGATATCACTAGGAGAATGCTGATGACGG
AGCATGAAGGGGACATCTTTGTTATGTTTACAAGTGGCAATAAGAGTCCATCGGTGTTTA
AACTAAACCTTAAACGCATGGCGTGGGAAAAGAAGAGAGAGCTTGGTGGCTTAACAGTAT
TTGCAAGTCAGCCTTCCTCTCTTATTAGAGCTAGTTTCTCGGTGAAGGAGAGGAATAGAT
TATACCCATCACGTAATGCTCACCTTGGGGTATACTTCTCCCTTGGTGATGATGAGAAAA
TTAGCTCTTGTCCCTCTTCCAGTAACTATTTCTCTAACCGCATTGCTTGGGTGTTTCCTC
CTCAAGACAACGTTAGTTTCTGACTTCACCCTTTATGTTTTGTTTTACAAAGGACTTTAT
TTATGATTTTTAAGCGTTCGATCAAATTGAAAAATAGGTGTTTTATATAATTAGTTGCAA
GTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4B114TF U 1
AF RR4B114JQ C 555
BS 1 830 RR4B114TF
BS 831 831 RR4B114JQ
BS 832 865 RR4B114TF
BS 866 1325 RR4B114JQ

RD RR4B114TF 865 0 0
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AAGTGATGAAGACTCGTAGGCGAACATACACGGCCGAAACTCCAGCATTGTTGTTCTCCG
AAGCCCTCACAGTGAAACTCAATTTTAAAGCGCTTCCAGTACCAAACAGTATAAATCATG
TATCAAAAAAGAAGTGTATTAAAGGATTGTGGAATATAAATATTCCTTCAGATCTACTGC
AAGAGATACTATCCCGCCTCAGTTTAAAAGGCAACATACGAGCTGCTGCTGTCTGCAAGA
CATGGTGTGAAGCAGCTGTTTCTGTCAGAAAGTTACAGCCTCGCCCTTGGCTTTTTTATC
CACTAAGAGGACTAGAAGAGGGAAACTACATCCTTTTAGACCCATCACGGCCTCAAGCAT
ATAAGTTTAGTTTCCCAGTGTTAAAGGGATGTGTATTATCTTATTCTAGGGATGGTTGGT
TGCTTGTGAAAAAAACACATGCCCTCTCGTATTTGGTATTCTTATTCAATCCATTTACCG
GGAACCGTATCTTCTTACCCAAGGTGTCACTTACATCAGGCTATTGTTTAGCTATCTCCG
CCGCCCCTACATCAAGTAGTTGTATGGTGATTTCTTGCAACTATACTAGTATCCCCTCAT
ATATTGTCATCAATACTTGGCGGCCTGGTCAAACCGTATGGACCACCCATCAATTTAAGA
ACCAGTTACCCGGTGGTGGATTGAACAATTGTGTCATCTCGAATGGTATGTTCTATTGTC
TTAGTACCTGCGGCTACCTCGGGGTTTTCGACCCGCCTAGAGCAACATGGGATATTCTAC
CATTGAGACCATGTCTCGCTTTTCG

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR4B114JQ 771 0 0
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AGTAGTTGTATGGTGATTTCTTGCAACTATACTAGTATCCCCTCATATATTGTCATCAAT
ACTTGGCGGCCTGGTCAAACCGTATGGACCACCCATCAATTTAAGAACCAGTTACCCGGT
GGTGGATTGAACAATTGTGTCATCTCGAATGGTATGTTCTATTGTCTTAGTACCTGCGGC
TACCTCGGGGTTTTCGACCCGCCTAGAGCAACATGGAATATTCTACCATTGAGACCATGT
CTCGCTTTTCGTCAGGTAGATATCACTAGGAGAATGCTGATGACGGAGCATGAAGGGGAC
ATCTTTGTTATGTTTACAAGTGGCAATAAGAGTCCATCGGTGTTTAAACTAAACCTTAAA
CGCATGGCGTGGGAAAAGAAGAGAGAGCTTGGTGGCTTAACAGTATTTGCAAGTCAGCCT
TCCTCTCTTATTAGAGCTAGTTTCTCGGTGAAGGAGAGGAATAGATTATACCCATCACGT
AATGCTCACCTTGGGGTATACTTCTCCCTTGGTGATGATGAGAAAATTAGCTCTTGTCCC
TCTTCCAGTAACTATTTCTCTAACCGCATTGCTTGGGTGTTTCCTCCTCAAGACAACGTT
AGTTTCTGACTTCACCCTTTATGTTTTGTTTTACAAAGGACTTTATTTATGATTTTTAAG
CGTTCGATCAAATTGAAAAATAGGTGTTTTATATAATTAGTTGCAAGTCTT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8024Contig1 807 2 2 U
ATATGATTCTTATTACACATTTATACAAAAAAGAGAGGCTTTGAGCTTCAGAATTTCTAC
TGTTACACACTTCTATCCACACTTTTTCATATAATAAATAAGATTACATCAAGTTTGGGC
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GCTCCTGCGAGCGGAAATACATGAAAGGTGTGTAGTTGAGGAAGTTGGAGACTCTTGATG
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CACGTGAAAGGAAGCCCCACCTTTTATTGAAGAGCTCGCCGTCTGATTCAAGCATTAAAC
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GCAGAACAAGCCGAAGCTGGTTAAAGAGATCCCCAACAACCTCTTTTTGATTTATAAGCT
CTATTAGCTCTTCTCTGTGACCACGACTACCAATTAGAGCCATATACTCTTCTTCCAGTT
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AGATGTGGTCACCAACATACAAAATCTCATCTCCATGAACGTTGAGTGAGCTCTCTACCA
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AACCCTCTCCAGTCACAACCTCGTACC


BQ
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AF RR4B470JQ U 1
AF RR4AY18TF C 4
BS 1 659 RR4B470JQ
BS 660 807 RR4AY18TF

RD RR4B470JQ 659 0 0
ATATGATTCTTATTACACATTTATACAAAAAAGAGAGGCTTTGAGCTTCAGAATTTCTAC
TGTTACACACTTCTATCCACACTTTTTCATATAATAAATAAGATTACATCAAGTTTGGGC
ACAAGACCCGCTAGTTTTCCATAGCCGCATCAGGAAGCGGAAAATCATGAGCCAATGACT
GCTCCTGCGAGCGGAAATACATGAAAGGTGTGTAGTTGAGGAAGTTGGAGACTCTTGATG
TGTATATATCAGCATACTTTTCGATTTGCCTCATCAAGTGGCTTTTGTCCCACAACCCCG
CACGTGAAAGGAAGCCCCACCTTTTATTGAAGAGCTCGCCGTCTGATTCAAGCATTAAAC
CAATCTTGTCATCTAGTCTTTGCATTACAATGAGAAGCTTCTGCATGGTCTCTGTAAGTT
CTTGATCAGCCAAGTTGGTAGCAGCTAGGGTCTGAACAGGACGGCCTTTGCTTCTTCTTT
GCAGAACAAGCCGAAGCTGGTTAAAGAGATCCCCAACAACCTCTTTTTGATTTATAAGCT
CTATTAGCTCTTCTCTGTGACCACGACTACCAATTAGAGCCATATACTCTTCTTCCAGTT
CACGGCAAATGAGTGCAGTTCGCCACCTGAGATGGACTTTGGAGACGCTGACATCAGTG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4AY18TF 804 0 0
ATGA
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CACTTCTATCCACACTTTTTCATATAATAAATAAGATTACATCAAGTTTGGGCACAAGAC
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CGAGCGGAAATACATGAAAGGTGTGTAGTTGAGGAAGTTGGAGACTCTTGATGTGTATAT
ATCAGCATACTTTTCGATTTGTCTCATCAAGTGGCTTTTGTCCCACAACCCCGCACGTGA
AAGGAAGCCCCACCTTTTATTGAAGAGCTCGCCGTCTGATTCAAGCATTAGACCAATCTT
GTCATCTAGTCTTTGCATTACAATGAGAAGCTTCTGCATGGTCTCTGTAAGTTCTTGATC
AGCCAAGTTGGTAGCAGCTAGGGTCTGAGCAGGACGGCCTTTGCTTCTTCTTTGCAGAGC
AAGCCGAAGCTGGTTAAAGAGATCCCCAACAACCTCTTTTTGATTTATAAGCTCTATTAG
CTCTTCTCTGTGACCACGACTACCAATTAGAGCCATATACTCTTCTTCCAGTTCACGGCA
AATGAGTGCAGTTCGCCACCTGAGATGGACTTTGGAGACGCTGACATCAGTGTAGATGTG
GTCACCAACATACAAAATCTCATCTCCATGAACGTTGAGTGAGCTCTCTACCATCTGAGC
ACTTCCTCCTGAGTATAAACCTCCTGTTTCAGCCTTGAAGCATGGACGCATTAAACCCTC
TCCAGTCACAACCTCGTACC

QA 5 804 5 804
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8026Contig1 821 2 8 U
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CCTCTTCAAATGGACGTCTCTCTTGATCCCTCTGACCACGCTGTTCATCATCAACGTGAT
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ATTTATTGGGGAGAAGAAGAAAATAGTAGATTGGAGAAGAAAATTGATTTAGATATGTAA
TGCTTTTTTTTCTTCTGAAAGGTGTTGTATTGTAGATACAAAGATGTTCTTTCTATTTGT
TCTTGTTATATATATGTTTTTTTTGTGGTGAAAGTGATTCAGAGAGAGAGATGTTATGTT
ATGAGTTATTTCATTGAATGTTCTATGAAATCTTTATGCCC


BQ
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AF RR4GY92TF U 1
AF RR4GY92JQ C 105
BS 1 670 RR4GY92TF
BS 671 671 RR4GY92JQ
BS 672 681 RR4GY92TF
BS 682 682 RR4GY92JQ
BS 683 743 RR4GY92TF
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BS 745 770 RR4GY92TF
BS 771 821 RR4GY92JQ

RD RR4GY92TF 774 0 0
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CCTCTTCAAATGGACGTCTCTCTTGATCCCTCTGACCACGCTGTTCATCATCAACGTGAT
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ATTTATTGGGGAGAAGAAGAAAATAGTAGATTGGAGAAGAAAATTGATTTAGATATGTAA
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TCTTGTTATATATATGTTTTTTT*GTGGTGAAAGTGATTCAGAGAGAGAG
TGTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4GY92JQ 717 0 0
AGGTTTTAGCCGGAGTCGACACGAACTTCACCGTCACGTCAAAGGCGGCGGATGACGGGG
AGTTCTCGGAGCTCTACCTCTTCAAATGGACGTCTCTCTTGATCCCTCTGACCACGCTGT
TCATCATCAACGTGATCGGAGTCGTTGTGGGAATCTCTGACGCGATCAGCAACGGGTATG
ACTCGTGGGGACCGTTGTTTGGGAGACTGTTCTTTGCTCTTTGGGTGATTCTGCATCTTT
ATCCTTTCTTGAAAGGGTTGCTTGGGAAGCAAGGCAGGATGCCTACCATTATTCTTGTCT
GGTCGATTCTTCTGTCCTCTATCTTGACGCTTCTTTGGGTCAGAGTCAATCCGTTTGTGG
CTAAAGGTGGTCCGGTGCTAGAGATATGCGGTTTGGACTGTCTTTGATTAATTACATTTA
AAAAAAACGTTTTAAATTTCCACAGCGGTTTAAGTAGAGAGGAGAGTCTCGCAGATTTGT
GTTAATGTGTTGTATTATTTATTGGGGAGAAGAAGAAAATAGTAGATTGGAGAAGAAAAT
TGATTTAGATATGTAATGCTTTTTTTTCTTCTGAAAGGTGTTGTATTGTAGATACAAAGA
TGTTCTTTCTATTTGTTCTTGTTATATATATGTTTTTTTTGTGGTGAAAGTGATTCAGAG
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QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL8027Contig1 793 2 12 U
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TCTCCGATCTCAAAATCCGCACCCACTTAAAAAGACTCAACAAGCCAGCTCTCAAATCCA
TAAAGAGCCCAGATGGAGATGTAATAGATTGTGTCCCAATCACCGACCAACCAGCTTTAG
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TCTTTAAAGAGAGTAAAGTTTCATCAAACACCAAGAATCAGCAGCATAGTAGTGCTATAT
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TGGTGATAGTCGC


BQ
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AF RR4A531TF U 1
AF RR4GU70TF U 59
BS 1 224 RR4A531TF
BS 225 225 RR4GU70TF
BS 226 301 RR4A531TF
BS 302 302 RR4GU70TF
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BS 403 403 RR4GU70TF
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BS 540 760 RR4A531TF
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GAAAAGCTTAAACCTTTTCTGTGTGTTCTTCGACCATGACAAGGGTTAGCTTCTTGCTTG
CTCTGGTAATGACGGTGGTGGTGATTCTCACTCCTTCAGTCGTCTCCGGCGAAAATGGTT
TCTCCGATCTCAAAATCCGCACCCACTTAAAAAGACTCAACAAGTCAGCTCTCAAATCCA
TAAAGAGCCCAGATGGAGATGTAATAGATTGTGTCCCAATCACCGACCAACCAGCTTTAG
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TCTTTAAAGAGAGTAAAGTTTCATCAAACACCAAGAATCAGCGGTATAGTAGTGCTATAT
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GTATCCTTAAGCGTAAATCTTATGAGCCAGCTAGTGTCCTTACACAAAATGGCCATCAGC
ATGCGATAATGTATGTCGAAGATGGAGTTTTCTACGGGGCGAAAGCGAAGATCAATGTAT
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GAAACTTCAATTCTGATCTTAATAGTATTGAAGCTGGCTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4GU70TF 735 0 0
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TGCTCTGGTAATGACGGTGGTGGTGATTCTCACTCCTTCAGTCGTCTCCGGCGAAAATGG
TTTCTCCGATCTCAAAATCCGCACCCACTTAAAAAGACTCAACAAGCCAGCTCTCAAATC
CATAAAGAGCCCAGATGGAGATGTAATAGATTGTGTCCCAATCACCGACCAACCAGCTTT
AGCACATCCTCTGCTCATTAACCACACTGTCCAGATGATTCCAAGTGTCAACCCGGAGAG
TGTCTTTAGCGAGAGTAAAGTTTCATCAAACACCAAGAATCAGCAGCCTAGT***GCTAT
ATCTCAGCTTTGGCATGTGAATGGGAAATGCCCAGAGAACACAGTTCCAATCAGAAGAAC
GACAAAGCAAGATCTTTTCAGAGCGAGTTCCGTTGAGAAGTTCGGTATGAAGAGTCAGAA
AAGTATCCTTAAGCGTAAATCTTATGAGCCAGCTAGTGTCCTTACACAAAATGGTCATCA
GCATGCGATAATGTATGTGGAAGATGGAGTTTTCTACGGGGCGAAAGCGAAGATCAATGT
ATGGAAACCGAACGTGGAGATGCCTAATGAGTTTAGCTTGGCTCAGATTTGGGTTTTGGG
TGGAAACTTCAATTCTGATCTTA*TAGTATTGAAGCTGGCTGGCAGTAAGTCCACAGTTG
TATGGTGATAGTCGC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL8028Contig1 653 2 1 U
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AGATCGTTCCGGCTAGGTTGATCCGGAGGAATCATGGCTCCGGTCTCGGCGCTCGCAAAA
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ATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACGATTGGTATTGATTTTCTATCAAAG
ACAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCTGCAGCTATGGGATACAGCTGGGCAAGAG
AGGTTCAGGAGTCTTATTCCCAGTTACATTAGGGACTCTTCTATTGCTGTTATTGTCTAT
GATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACC
GAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTGCTTGTGGGAAATAAAACCGACCTTGTTAGAACA
ACAACAAACACACACACAAAAAAAACTCCTCGAGCCTTAGCATGATCCCAAACACTATCA
TCGTCCGTCTCTGTAAAATTTTTGCCTGCTTTATAATCAGATTTTATTTTAGAGTGACTT
TGTCTTTGGAGTTTCAAATACTCTGCTTCAGCACTGTGATTTGTATGTCTATG


BQ
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BQ
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QA 1 759 1 759
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BQ
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AF RR4AL90JQ C 1
AF RR4AL90TF U 1
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QA 1 522 1 522
DS 

RD RR4AL90TF 522 0 0
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GGACGCTATTGATTCCGCCATCGATCCACTCAGAGATTTCGCTAAAAGCAGCATCCGTCT
CGTCCAGCGCTGTCACAAACCCGATCGCAAGGAATTCACGAAGGTGGCTGTGCGTACGGC
GATAGGATTTGTGGTGATGGGATTCGTAGGGTTCTTCGTGAAGCTCGTTTTCATCCCAAT
CAACAACATCATCGTTGGATCTTCTTAGCCTAAATATTTTTACGAGGCTATGCGCCAAGG
AGTAGGAAGGAAAGAGACTCCAAAACCTATTGTGAAGCCTCTCTGTATTCTCTGTTTTTC
TAGGTTACATCTCTTGAAACTTGAAAGTCTAATTTTCCTTTATTTGGATTTTGGTCGTTT
CTTTTACTCGTTATAGCCTAAAAGACCTAAGATTTTATTTCTTTTTGTATAAAACAAAAA
GTATTGTCCTCGAGAAACTACGCTTTAAACACGAAACTCTAC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL8031Contig1 653 2 1 U
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AAGGCAGAGGAACAGACGAAGAGACGCATTTCAATGTGAAGATTGTCTCGAAAGGATTCG
AAGGGATGAATCTGGTGAAGAGGCACAGGCTCGTTTACGATCTGCTCAGGGAGGAGCTTG
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TTTTTTTCTTATATCATTGATGCTTAGTTTGTTGTCAAAAAGCAATCTATTATCGGATTC
AACAGACTTGAGTTTTTCACCATCAAAGAAAGGGCTCTCTGCTTTTGGTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CB13JQ C 1
AF RR4CB13TF U 1
BS 1 653 RR4CB13TF

RD RR4CB13JQ 653 0 0
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QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4CB13TF 653 0 0
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AAGGCAGAGGAACAGACGAAGAGACGCATTTCAATGTGAAGATTGTCTCGAAAGGATTCG
AAGGGATGAATCTGGTGAAGAGGCACAGGCTCGTTTACGATCTGCTCAGGGAGGAGCTTG
ATAGCGGATTGCACGCGCTTTCCATCGTCTCCAAGACTCCCTCCGAGTCCACTCGCTAGC
CAAAAAAAAATTTACTCTGTTTTTATGTTTCTTTCTCTTATGAGAGTTTGTGTTACACTC
TTTTTTTCTTATATCATTGATGCTTAGTTTGTTGTCAAAAAGCAATCTATTATCGGATTC
AACAGACTTGAGTTTTTCACCATCAAAGAAAGGGCTCTCTGCTTTTGGTTTCG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8033Contig1 674 2 1 U
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TCCTCCTGTGGTTTCGTTTCTAAAAGAGTACAGAAGCAATGGCGAGCGGCTTGAGAGAAC
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TCTATTCCAACATTACCGATCTCGAGATACAAGTCAGCGAACACTCTCTCGTCATCAACG
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AGAGAACCGTCAGAGAGGTGCTCCCAGCTGTCCAGCGCAACAAGGAAGGGCTCGAGGAGG
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CCAAGTATCAGATCAGGCTAAGGAAGCAGGACGATTCCAAGGAAGAAGGTAATAACAAAA
AGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTCGGCGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCCACTT
CCAGCCAGTAAAACTTTCTTCCTTCTTTTTATGTGTCTACTTTAATGGTGTTTTGCTAAG
TTTATCTGGAATGTTTTGCATGTTACAAAACTTAGTAGACTGGAGACTCACCAATTTATA
GATCAGTTTTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G606TF U 1
AF RR4G606JQ C 39
BS 1 674 RR4G606TF

RD RR4G606TF 674 0 0
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TCCTCCTGTGGTTTCGTTTCTAAAAGAGTACAGAAGCAATGGCGAGCGGCTTGAGAGAAC
CACCGAACGAGCAAGCCGTTCTGAACATGTACGAGTCCATGAGATCAGAGCTGAGCCAGA
TCTATTCCAACATTACCGATCTCGAGATACAAGTCAGCGAACACTCTCTCGTCATCAACG
CCATCCAGCCTCTGGACCAGTCTAGGAAATGCTTCCGCATGATAGGAGGCGTTCTTGTGG
AGAGAACCGTCAGAGAGGTGCTCCCAGCTGTCCAGCGCAACAAGGAAGGGCTCGAGGAGG
TTGTGAGGAAGCTTTACGAGACGTTGGAGAAGAAGAAGAAAGATATGAGTGAGTTTGAAG
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AGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTCGGCGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCCACTT
CCAGCCAGTAAAACTTTCTTCCTTCTTTTTATGTGTCTACTTTAATGGTGTTTTGCTAAG
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GATCAGTTTTGTGT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4G606JQ 636 0 0
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ATGAGATCAGAGCTGAGCCAGATCTATTCCAACATTACCGATCTCGAGATACAAGTCAGC
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ATGATAGGAGGCGTTCTTGTGGAGAGAACCGTCAGAGAGGTGCTCCCAGCTGTCCAGCGC
AACAAGGAAGGGCTCGAGGAGGTTGTGAGGAAGCTTTACGAGACGTTGGAGAAGAAGAAG
AAAGATATGAGTGAGTTTGAAGCCAAGTATCAGATCAGGCTAAGGAAGCAGGACGATTCC
AAGGAAGAAGGTAATAACAAAAAGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTCGGCGCTGCT
GCTGCTGCTGCCGCTGCCACTTCCAGCCAGTAAAACTTTCTTCCTTCTTTTTATGTGTCT
ACTTTAATGGTGTTTTGCTAAGTTTATCTGGAATGTTTTGCATGTTACAAAACTTAGTAG
ACTGGAGACTCACCAATTTATAGATCAGTTTTGTGT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTCAAATCAGGTTGGGATTAAGATTTAAAAGTGTTCTCTTGATTTTTAATTTGGTTTCC
TTAAGATGGTCTTGTTGTGTTAGAAAATAAGAAGTTTTATTTTTTGGTCAACTAGGAGCC
TTTATGTCTCTCTGTTTTTGTATTTATTCCTCTGTTTCCTAAAGTAGTAGACAAATCTAC
AGATCTCTCAATCTATTTTTACTTTAGATTCTGTTGCGGGTGTGTGATGTCGTTTTAACT
AGCTGTAACTGATCTTTTCCTTACATCCTCTGCTTTTGATGTGATCTGTTTCACAGTGTT
GAGGAAGTTGATGGCTTCCTTTGTGATTCAGATGTTATCAAAGAACCTGGCTCAAAGAAA
AGGTCTTTAATTGATTTTTAACTTATACTTGTCTTTCAATTATATAAGATTGATTTTGAA
ACCTGTGGAGTTATTTTCTTTGTTTTACTTTTTATGTTTTCGTTGCTTCAGAATCAAACC
GGAATCTTGCGCTGGTTCTAGCTCGAAAGCCTGTAGGGAGAAACAAAGACGTGATAGGCT
AAATGACAAGTATTATTATTTTGCTTTCTCTTCCTTTCTCTCTTCATCTTTAAAAGTTTC
TTAATATATGTGCATTAACTATATATAGGTTTACGGACTTGAGTTCCGTATTGGAACCTG
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AAGCAAGAGACGAAGCACGGAGATTGAAAGACTTGAACTCATGCCTCCAGGAGAAAATCA
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GTTGTAATTTTTTTTAATATGTAGGATGAGAAGAACGAGCTGCGTGATGAGAAACAGAAG
CTGAAGATTGAGAAAGAGAGTATCGAGCAGCAACTCAAAGCAGCCATTAACACGTCACAG
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GATACCTCACAGGACCATGTCCTTCGTCCTCCGGTTGCTTAGAAAAGCTGCCCTCTTTGT
TCACTTTTTTTTCTTCTGATATAATGGTTCTCCCATTCTGGAGACAATCCTATGCAAACT
TGTATTGTGATTTATGATCATCATGCGATTAATTTGCATGTAAAATGGAAATAAGCATAT
GCACTAACTGTGCAAAATGTTGTAAACATTGAAAATTATGGTTCTACTGATTGTGAATTT
TATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GV84TF U 1
AF RR4GV84JQ C 678
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TTTCAAATCAGGTTGGGATTAAGATTTAAAAGTGTTCTCTTGATTTTTAATTTGGTTTCC
TTAAGATGGTCTTGTTGTGTTAGAAAATAAGAAGTTTTATTTTTTGGTCAACTAGGAGCC
TTTATGTCTCTCTGTTTTTGTATTTATTCCTCTGTTTCCTAAAGTAGTAGACAAATCTAC
AGATCTCTCAATCTATTTTTACTTTAGATTCTGTTGCGGGTGTGTGATGTCGTTTTAACT
AGCTGTAACTGATCTTTTCCTTACATCCTCTGCTTTTGATGTGATCTGTTTCACAGTGTT
GAGGAAGTTGATGGCTTCCTTTGTGATTCAGATGTTATCAAAGAACCTGGCTCAAAGAAA
AGGTCTTTAATTGATTTTTAACTTATACTTGTCTTTCAATTATATAAGATTGATTTTGAA
ACCTGTGGAGTTATTTTCTTTGTTTTACTTTTTATGTTTTCGTTGCTTCAGAATCAAACC
GGAATCTTGCGCTGGTTCTAGCTCGAAAGCCTGTAGGGAGAAACAAAGACGTGATAGGCT
AAATGACAAGTATTATTATTTTGCTTTCTCTTCCTTTCTCTCTTCATCTTTAAAAGTTTC
TTAATATATGTGCATTAACTATATATAGGTTTACGGACTTGAGTTCCGTATTGGAACCTG
GGAGAGCTCCAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GV84JQ 710 0 0
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GACAAGGTTGCTATCATCAGTGACGCCATTCGCATGGTGAATCAAGCAAGAGACGAAGCA
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TATGTAGGATGAGAAGAACGAGCTGCGTGATGAGAAACAGAAGCTGAAGATTGAGAAAGA
GAGTATCGAGCAGCAACTCAAAGCAGCCATTAACACGTCACAGCCTTGTTTCTTACCAAA
CCCGCCAACACTCTCTCAAGCTCAAACTCCTGGAAGCAAGCTTGTGCCTTACACAACTTA
CCCCGGCTTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCTCCTGCTGCTGTTGATACCTCACAGGACCA
TGTCCTTCGTCCTCCGGTTGCTTAGAAAAGCTGCCCTCTTTGTTCACTTTTTTTTCTTCT
GATATAATGGTTCTCCCATTCTGGAGACAATCCTATGCAAACTTGTATTGTGATTTATGA
TCATCATGCGATTAATTTGCATGTAAAATGGAAATAAGCATATGCACTAACTGTGCAAAA
TGTTGTAAACATTGAAAATTATGGTTCTACTGATTGTGAATTTTATGATC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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ATATCGTCTAATACAGTATATTATCTTTTGTTATGCATAAACTTATTTATACAAAAGTTT
TGGTTTAGTAGATAATTAGTACGTTGGCTTGAGCTTCATCAAAGATATACAAAGAAACTA
AAGAAACTGGTTCTTGAAACATCTTGTGAGTTCTGTCCATTAGCATCGTTTTCCTGGCTT
CTTGGACCCTCGTTTTTAACTGTAGGGTAACTTTGGTTGGTGGTGGATCGAGGGTATACG
TCTTGACCACCGTAGTAAAGAGAAGAGCTTAGATTGCATGGCTCAACTCTATCTTGTACA
TTTGAAGATTCTCTACGTTGAGCTTGTGAGCCATGTTTGGAGCTTTGACCATCTCTTGTA
ACGCCCTTGGAGGGATGAGGGAAAATGGAGGAGAAGATTCCAGAGGAAGAAGATGGCGGC
GACGGATCTCTGGAGCCGAAGAGTTCGGTGGTTAAAGAAGAAGAAGTTGATGATGCAATT
CGTCCTCTACCTTCCATTAATAATTGTCAAAGCTTACACTCTACTCACTTTGAAACAGAT
TTTCTTTCTGATTCTTGCTATGCAAGAGAACTAGAATGAATAAGACAGTTGTGTGTCC


BQ
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AF RR4CE19TF C 1
AF RR4CE19JQ U 6
BS 1 5 RR4CE19TF
BS 6 658 RR4CE19JQ

RD RR4CE19TF 658 0 0
TTTTTAAATACTAATACAGTTCATTATCAACACACTTTTACTAGGAGATCCCTTTCAATA
ATATCGTCTAATACAGTATATTATCTTTTGTTATGCATAAACTTATTTATACAAAAGTTT
TGGTTTAGTAGATAATTAGTACGTTGGCTTGAGCTTCATCAAAGATATACAAAGAAACTA
AAGAAACTGGTTCTTGAAACATCTTGTGAGTTCTGTCCATTAGCATCGTTTTCCTGGCTT
CTTGGACCCTCGTTTTTAACTGTAGGGTAACTTTGGTTGGTGGTGGATCGAGGGTATACG
TCTTGACCACCGTAGTAAAGAGAAGAGCTTAGATTGCATGGCTCAACTCTATCTTGTACA
TTTGAAGATTCTCTACGTTGAGCTTGTGAGCCATGTTTGGAGCTTTGACCATCTCTTGTA
ACGCCCTTGGAGGGATGAGGGAAAATGGAGGAGAAGATTCCAGAGGAAGAAGATGGCGGC
GACGGATCTCTGGAGCCGAAGAGTTCGGTGGTTAAAGAAGAAGAAGTTGATGATGCAATT
CGTCCTCTACCTTCCATTAATAATTGTCAAAGCTTACACTCTACTCACTTTGAAACAGAT
TTTCTTTCTGATTCTTGCTATGCAAGAGAACTAGAATGAATAAGACAGTTGTGTGTCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4CE19JQ 653 0 0
AAATACTAATACAGTTCATTATCAACACACTTTTACTAGGAGATCCCTTTCAATAATATC
GTCTAATACAGTATATTATCTTTTGTTATGCATAAACTTATTTATACAAAAGTTTTGGTT
TAGTAGATAATTAGTACGTTGGCTTGAGCTTCATCAAAGATATACAAAGAAACTAAAGAA
ACTGGTTCTTGAAACATCTTGTGAGTTCTGTCCATTAGCATCGTTTTCCTGGCTTCTTGG
ACCCTCGTTTTTAACTGTAGGGTAACTTTGGTTGGTGGTGGATCGAGGGTATACGTCTTG
ACCACCGTAGTAAAGAGAAGAGCTTAGATTGCATGGCTCAACTCTATCTTGTACATTTGA
AGATTCTCTACGTTGAGCTTGTGAGCCATGTTTGGAGCTTTGACCATCTCTTGTAACGCC
CTTGGAGGGATGAGGGAAAATGGAGGAGAAGATTCCAGAGGAAGAAGATGGCGGCGACGG
ATCTCTGGAGCCGAAGAGTTCGGTGGTTAAAGAAGAAGAAGTTGATGATGCAATTCGTCC
TCTACCTTCCATTAATAATTGTCAAAGCTTACACTCTACTCACTTTGAAACAGATTTTCT
TTCTGATTCTTGCTATGCAAGAGAACTAGAATGAATAAGACAGTTGTGTGTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL8037Contig1 764 2 4 U
GAACACAACTCCTTATAAAAATATACCTCATCAACCTTTAGATCTCACTCACAAAAACTT
TATCTCCAAACAAAGAAGAAATGAGTAGGTCTAGTGAACAAGATCTACTCTCTACCGAGA
TTGTTAACCGTGGGATCGAACCTTCTGGTCCGAACGCCGGTTCACCAACGTTCTCGGTCA
GAGTTCGGAGACGTTTACCGGATTTTCTTCAATCCGTAAACTTGAAGTACGTGAAACTTG
GTTATCACTACCTCATAAACCATGCGGTTTACTTGGCGACCATACCGGTTCTCGTGCTTG
TGTTTAGTGCCGAAGTTGGGAGTTTAAGCAGAGAAGAGATTTGGAAGAAGCTTTGGGATT
ATGATCTCGCAACCGTCATCGGATTCTTCGGTGTCTTTGTCTTAACCGTTTGTGTCTACT
TCATGTCTCGTCCTCGATCTGTTTATCTCATTGATTTCGCTTGTTTCGAGCCTTCCGATG
AGCTTAAGGTACGTCTCTGCACATCAAACCTTGTCTTGAAGGAACTAGTCAAACTAAGTT
TGCTTTGATATTATGGTAACAGGTTTGACTTTTGTAACCAGTAACAGGTTTGACTTATAA
CTAGTTTCAGAAAAAAAAAGGTTTTGACTTATAATTTATTTTGAAACATACAAATTTATT
TACAACCATATAATCGATGAGTTCAATAGGAACCGGACAGGTAATATAGTGAATTTGAAC
CAAACTAATTATCAGTTCAAGTTATAACCGGTTTAGTGAGGGGG


BQ
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AF RR4FP69TF U 1
AF RR4FP69JQ C 84
BS 1 562 RR4FP69TF
BS 563 563 RR4FP69JQ
BS 564 583 RR4FP69TF
BS 584 764 RR4FP69JQ

RD RR4FP69TF 583 0 0
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TATCTCCAAACAAAGAAGAAATGAGTAGGTCTAGTGAACAAGATCTACTCTCTACCGAGA
TTGTTAACCGTGGGATCGAACCTTCTGGTCCGAACGCCGGTTCACCAACGTTCTCGGTCA
GAGTTCGGAGACGTTTACCGGATTTTCTTCAATCCGTAAACTTGAAGTACGTGAAACTTG
GTTATCACTACCTCATAAACCATGCGGTTTACTTGGCGACCATACCGGTTCTCGTGCTTG
TGTTTAGTGCCGAAGTTGGGAGTTTAAGCAGAGAAGAGATTTGGAAGAAGCTTTGGGATT
ATGATCTCGCAACCGTCATCGGATTCTTCGGTGTCTTTGTCTTAACCGTTTGTGTCTACT
TCATGTCTCGTCCTCGATCTGTTTATCTCATTGATTTCGCTTGTTTCGAGCCTTCCGATG
AGCTTAAGGTACGTCTCTGCACATCAAACCTTGTCTTGAAGGAACTAGTCAAACTAAGTT
TGCTTTGATATTATGGTAACAG*TTTGACTTTTGTAACCAGTA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4FP69JQ 681 0 0
AGTAGGTCTAGTGAACAAGATCTACTCTCTACCGAGATTGTTAACCGTGGGATCGAACCT
TCTGGTCCGAACGCCGGTTCACCAACGTTCTCGGTCAGAGTTCGGAGACGTTTACCGGAT
TTTCTTCAATCCGTAAACTTGAAGTACGTGAAACTTGGTTATCACTACCTCATAAACCAT
GCGGTTTACTTGGCGACCATACCGGTTCTCGTGCTTGTGTTTAGTGCCGAAGTTGGGAGT
TTAAGCAGAGAAGAGATTTGGAAGAAGCTTTGGGATTATGATCTCGCAACCGTCATCGGA
TTTTTCGGTGTCTTTGTCTTAACCGTTTGTGTCTACTTCATGTCTCGTCCTCGATCTGTT
TATCTCATTGATTTCGCTTGTTTCGAGCCTTCCGATGAGCTTAAGGTACGTCTCTGCACA
TCAAACCTTGTCTTGAAGGAACTAGTCAAACTAAGTTTGCTTTGATATTATGGTAACAGG
TTTGACTTTTGTAACCAGTAACAGGTTTGACTTATAACTAGTTTCAGAAAAAAAAAGGTT
TTGACTTATAATTTATTTTGAAACATACAAATTTATTTACAACCATATAATCGATGAGTT
CAATAGGAACCGGACAGGTAATATAGTGAATTTGAACCAAACTAATTATCAGTTCAAGTT
ATAACCGGTTTAGTGAGGGGG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL8038Contig1 848 2 1 U
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AGTTGATTTTGGAGAAGAGCATAGTGAAGCTTGTGGACATTCTAGGTTTGGTAGAGACTA
CGGAGAAGGGCAATACCCTGAATGGGATGAAGATCATCCTATTCATTTTGTGGGGCATTC
AGCTGGAGCTCAAGTTGTGCGTGTATTGCAGCAAATGCTTGCAGATAAGGCATTTGAAGG
GTTTGAAGAAACGAATGAGAATTGGGTTCTTAGTGTGACATCGTTGTCTGGAGCATTCAA
TGGTACTACCAGGACTTACTTAGATGGCATGAGGACAGAAGATGGAATAAGCATGAAACC
AATATCTCTGTTGCAGCTATGTCGTATAGGCGTGATAATGTACGATTGGTTGGACATCTC
ATGGCTAAAGACTTACTACAGTTTCGGGTTCGATCACTTCAACATGTCATGGAAGAAAAC
CGGCTTGAGAGGTCTAGTTGATTGCCTTGTCGGAAACACAGGTCCTTTTGCTACTGGTGA
TTGGATCTTACCTGATCTGACGATACAAGGCTCCACAAGTCTCAACTCCAATCTACAGAC
GTTCTCAAACACTTACTACTTCAGCTACCTACTAAACGCACACGCAGAATCATGGGCATG
ACTATCCCTTCAGGAGTTCTCGGCATCCACCCTATGCTCTTCCTCCGTGTCTTTCAGATG
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AGCATCCT


BQ
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AF RR4B003TF U 1
AF RR4AW31TF U 1
BS 1 848 RR4AW31TF

RD RR4B003TF 759 0 0
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AATATCTCTGTTGCAGCTATGTCGTATAGGCGTGATAATGTACGATTGGTTGGACATCTC
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CGGCTTGAGAGGTCTAGTTGATTGCCTTGTCGGAAACACAGGTCCTTTTGCTACTGGTGA
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AGCCAATGGAGATTCCCACAAGATGTTTCTCCTCCTTAT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4AW31TF 848 0 0
GTCCTTAACAAGCATCTATGATAGGGCAAGGGAGTTATTCTATTACCTAAAAGGAGGAAG
AGTTGATTTTGGAGAAGAGCATAGTGAAGCTTGTGGACATTCTAGGTTTGGTAGAGACTA
CGGAGAAGGGCAATACCCTGAATGGGATGAAGATCATCCTATTCATTTTGTGGGGCATTC
AGCTGGAGCTCAAGTTGTGCGTGTATTGCAGCAAATGCTTGCAGATAAGGCATTTGAAGG
GTTTGAAGAAACGAATGAGAATTGGGTTCTTAGTGTGACATCGTTGTCTGGAGCATTCAA
TGGTACTACCAGGACTTACTTAGATGGCATGAGGACAGAAGATGGAATAAGCATGAAACC
AATATCTCTGTTGCAGCTATGTCGTATAGGCGTGATAATGTACGATTGGTTGGACATCTC
ATGGCTAAAGACTTACTACAGTTTCGGGTTCGATCACTTCAACATGTCATGGAAGAAAAC
CGGCTTGAGAGGTCTAGTTGATTGCCTTGTCGGAAACACAGGTCCTTTTGCTACTGGTGA
TTGGATCTTACCTGATCTGACGATACAAGGCTCCACAAGTCTCAACTCCAATCTACAGAC
GTTCTCAAACACTTACTACTTCAGCTACCTACTAAACGCACACGCAGAATCATGGGCATG
ACTATCCCTTCAGGAGTTCTCGGCATCCACCCTATGCTCTTCCTCCGTGTCTTTCAGATG
AGCCAATGGAGATTCCCACAAGATGTTTCTCCTCCTTATAAAGGCTACAGGGATGAGGAG
TGGCAAGAGAACGATGGGGCAATGAACACATATCAATGACACATCCGAGGCTACCCGTGG
AGCATCCT

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

CO CL8039Contig1 537 2 1 U
GACCCAAATGCTTAACTGAGTCAACTCGACCGCCTCATATCCCAAACTGATTTCGATATC
GTTTTAAGTTTATTTCAAAAAAGGCCAAAGACGCTAGTTTTGCCAATGGCACCATCACGT
AACATGATTGTAGCTACGGGTCTGGTTGTTTTCGCATCTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTT
TACATGGCATCGTCAAAGAAACCGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCTCAAGCA
GCTTTTAGAGGACCTTACATTAACACCGGTTCTCGCGATGTTGGGCCTGACCATCGAACT
TACCCTAAGAAATAATATCCCCATCGAATCAAAACCCACACAAACTGTAAACATGAGCTG
TCCCGTTGTTATATCTCTTTAGTAGTAGTTTGTGATCCAATCCATTTAAAGCCATTATGT
TACATGTAACGCTATGATGAACACAACCTGTCCAATCTATCCATTAAAATGGTTATGATT
AATAGCTTGCGAATTTGGTTTTTATATTGTTATAATGTCATAAGAATGCAATAACAA


BQ
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AF RR4BJ12JQ C 1
AF RR4BJ12TF U 1
BS 1 537 RR4BJ12TF

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QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4BJ12TF 537 0 0
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GTTTTAAGTTTATTTCAAAAAAGGCCAAAGACGCTAGTTTTGCCAATGGCACCATCACGT
AACATGATTGTAGCTACGGGTCTGGTTGTTTTCGCATCTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTT
TACATGGCATCGTCAAAGAAACCGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCTCAAGCA
GCTTTTAGAGGACCTTACATTAACACCGGTTCTCGCGATGTTGGGCCTGACCATCGAACT
TACCCTAAGAAATAATATCCCCATCGAATCAAAACCCACACAAACTGTAAACATGAGCTG
TCCCGTTGTTATATCTCTTTAGTAGTAGTTTGTGATCCAATCCATTTAAAGCCATTATGT
TACATGTAACGCTATGATGAACACAACCTGTCCAATCTATCCATTAAAATGGTTATGATT
AATAGCTTGCGAATTTGGTTTTTATATTGTTATAATGTCATAAGAATGCAATAACAA

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DC92TF U 1
AF RR4DC92JQ C 375
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CCTGACAATTGCACCTTACCAAAGGACGTTGTGCTGTGTAAGATATACAGAAAAGCCACA
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GAG

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TCTTCCGAGACCGTTTCTTACGCTGGAAAAGAAGAAGACTTGATGATGACTTCGTTCCCT
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GGACAAGACCAGCTCTTGAGTATAAGCCCATGGCTCCAGAATCTTACACCAATAATTAAT
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QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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TACCTCTGCACCATATTTGGGTGTTTTATCC


BQ
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QA 1 631 1 631
DS 



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BQ
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AF RR4C636JQ U 1
AF RR4BW42JQ U 1
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BQ
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AF RR4AI53TF U 1
AF RR4AI53JQ C 118
BS 1 791 RR4AI53TF
BS 792 792 RR4AI53JQ
BS 793 821 RR4AI53TF
BS 822 822 RR4AI53JQ
BS 823 858 RR4AI53TF
BS 859 859 RR4AI53JQ
BS 860 866 RR4AI53TF
BS 867 867 RR4AI53JQ
BS 868 885 RR4AI53TF
BS 886 990 RR4AI53JQ

RD RR4AI53TF 885 0 0
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ATCATAATCTTCTATTCATTTCTCCGATGTACCCTAATGTCTATACTTCATCAATACCAC
AACAAGCAGGAGAATACAAACCAGCGCGGCCGAGGAGGAGGAGGAAGAGCAAGAGTGTTG
CGGTGGTAGGTGGAGAAGGGAGCAATGGGTGGTTTAGGAAGAGGAAATTGAGTGATGAGC
AAGTAAGAATGCTGGAGATGAGTTTTGGAGATGAACATAAGCTTGAGTCAGAGAGGAAAG
ATCGTCTTGCTAAGGAGTTAGGGCTTGATCCCCGCCAAGTCGCCGTCTGGTTCCAGAACC
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ACGAAAACGTCGCCGTTGAGAAGCGTCGTCTTGATTCTGAGGTTCTTCACCTAAAGGAGC
AGCTTCATGACGCTGAAAGAGAGATCCAACGGCTGGCACAAAGAGTTGAAGGAGCCATAA
GTAACAGTCCGATCTCATCTGTCTCTGTCGTAGCCAATCAGACTACGCCGTTTTTCGGAG
ACTATGAAGTCGAAGTCGAAGTCGGAGACGACGGTGACGGTTACCAGAACTTGTTCTACT
CGCCGGAATACATTAATGGATTTGAATGGATTAGCCCATTCATGTGAAAACAACTAGCCT
AAATATTAATTTTATTAGTATAGAGATAACTAGGTTATTTATATGATTGGTCGATATCTA
TAATGAAGCAG*TTGTGGATTAAAGCTATAGATCTAATTCG*TTGTCTAATATTGTGGAT
ATCTTTATCTAAGCATCA*TTGCTTA*CTAGATAGCTAAGTCGAA

QA 1 885 1 885
DS 

RD RR4AI53JQ 873 0 0
CACAACAAGCAGGAGAATACAAACCAGCGCGGCCGAGGAGGAGGAGGAAGAGCAAGAGTG
TTGCGGTGGTAGGTGGAGAAGGGAGCAATGGGTGGTTTAGGAAGAGGAAATTGAGTGATG
AGCAAGTAAGAATGCTGGAGATGAGTTTTGGAGATGAACATAAGCTTGAGTCAGAGAGGA
AAGATCGTCTTGCTAAGGAGTTAGGGCTTGATCCCCGCCAAGTCGCCGTCTGGTTCCAGA
ACCGCCGTGCACGGTGGAAGAACAAGAGGCTTGAAGATGAATACACTAGACTCAAGAACG
CACACGAAAACGTCGCCGTTGAGAAGCGTCGTCTTGATTCTGAGGTTCTTCACCTAAAGG
AGCAGCTTCATGACGCTGAAAGAGAGATCCAACGGCTGGCACAAAGAGTTGAAGGAGCCA
TAAGTAACAGTCCGATCTCATCTGTCTCTGTCGTAGCCAATCAGACTACGCCGTTTTTCG
GAGACTATGAAGTCGAAGTCGAAGTCGGAGACGACGGTGACGGTTACCAGAACTTGTTCT
ACTCGCCGGAATACATTAATGGATTTGAATGGATTAGCCCATTCATGTGAAAACAACTAG
CCTAAATATTAATTTTATTAGTATAGAGATAACTAGGTTATTTATATGATTGGTCGATAT
CTATAATGAAGCAGGTTGTGGATTAAAGCTATAGATCTAATTCGGTTGTCTAATATTGTG
GATATCTTTATCTAAGCATCAATTGCTTAACTAGATAGCTAAGTCGAAAGCGGCTTTAAT
TTGTTTGACTTGAATGTCAAGTTTGTACAAAACAATGTATTTATTTGTCAATTATAAGTA
AATATATGTGATATGATATGAAATCATGTTAAC

QA 1 873 1 873
DS 



AS 1 2

CO CL8044Contig1 838 2 10 U
GATAGTCGGGCAGTTACCAAAGAAAACTCCTTAAACAAACCATCCAGTGAAGCTGTTGAG
GATATGTCTCAGAACTTATCGATGATCTATCTGAAAGAGCCCCCAGCTGTCTTGAGGCCA
GCCGAAACCCACTCCGAACAGCAAGCAGTCGAGATTCAGATAACAAAGCTGTTGCTTAAA
TCATACTATGACATTGTGAGGAAGAACATTGAGGATTCAGTACCAAAAGCAATCATGCAT
TTCCTGGTTAACCACACGAAACGTGAGCTGCACAATGTGTTCATCAAGAAGCTTTACAGG
GAGAACTTGTTTGAGGAAATGCTCCAAGAGACAGATGAGATAGCAGTTAAGAGGAAACGC
ACTCAAGAGACTCTCCACGTTCTTCAGCAAGCTTACAGGACACTAGACGAGTTACCTGGA
AGCAGAATCAGTATGCAATCGTGGTACCGAGACAACAGGTGTGTCGAAACATCTGGATTT
ACCGACCTCTTCTTCCAAGTATACCACGAGCAATTCCTACACTGCATCTCCGGGTACAGG
AAGAAGATCTAGAAGAGCTGGTGATCAACACCAAAACGGATATGGATTCTGACATGATCC
CAAATCAATATATCTGACTTTTGATAGACACATTTCATTCATTTAATGGCTCTTTAAGGT
TTTGGAATTATTAAATTGTGTTGGCAAAATGAATAATTTTTGATAGAAAATTGGTATACA
CTGGTTTTGGAGTCTGCATCTGTGTTTTGACAAAGGGTTGATACAGTTTGTATTTGTTTT
AGACTGTAAAAATCCTATACGTTGGGGTACTAGCTAACAACCAATTGGCGTTTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CR31TF U 1
AF RR4CR31JQ C 56
BS 1 658 RR4CR31TF
BS 659 659 RR4CR31JQ
BS 660 688 RR4CR31TF
BS 689 689 RR4CR31JQ
BS 690 700 RR4CR31TF
BS 701 701 RR4CR31JQ
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BS 710 710 RR4CR31JQ
BS 711 728 RR4CR31TF
BS 729 838 RR4CR31JQ

RD RR4CR31TF 728 0 0
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TCATACTATGACATTGTGAGGAAGAACATTGAGGATTCAGTACCAAAAGCAATCATGCAT
TTCCTGGTTAACCACACGAAACGTGAGCTGCACAATGTGTTCATCAAGAAGCTTTACAGG
GAGAACTTGTTTGAGGAAATGCTCCAAGAGACAGATGAGATAGCAGTTAAGAGGAAACGC
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AAGAAGATCTAGAAGAGCTGGTGATCAACACCAAAACGGATATGGATTCTGACATGATCC
CAAATCAATATATCTGACTTTTGATAGACACATTTCATTCATTTAATGGCTCTTTAAG*T
TTTGGAATTATTAAATTGTGTTGGCAAA*TGAATAATTTT*GATAGAAA*TTGGTATACA
CTGGTTTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4CR31JQ 783 0 0
G
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GCCAGCCGAAACCCACTCCGAACAGCAAGCAGTCGAGATTCAGATAACAAAGCTGTTGCT
TAAATCATACTATGACATTGTGAGGAAGAACATTGAGGATTCAGTACCAAAAGCAATCAT
GCATTTCCTGGTTAACCACACGAAACGTGAGCTGCACAATGTGTTCATCAAGAAGCTTTA
CAGGGAGAACTTGTTTGAGGAAATGCTCCAAGAGACAGATGAGATAGCAGTTAAGAGGAA
ACGCACTCAAGAGACTCTCCACGTTCTTCAGCAAGCTTACAGGACACTAGACGAGTTACC
TGGAAGCAGAATCAGTATGCAATCGTGGTACCGAGACAACAGGTGTGTCGAAACATCTGG
ATTTACCGACCTCTTCTTCCAAGTATACCACGAGCAATTCCTACACTGCATCTCCGGGTA
CAGGAAGAAGATCTAGAAGAGCTGGTGATCAACACCAAAACGGATATGGATTCTGACATG
ATCCCAAATCAATATATCTGACTTTTGATAGACACATTTCATTCATTTAATGGCTCTTTA
AGGTTTTGGAATTATTAAATTGTGTTGGCAAAATGAATAATTTTTGATAGAAAATTGGTA
TACACTGGTTTTGGAGTCTGCATCTGTGTTTTGACAAAGGGTTGATACAGTTTGTATTTG
TTTTAGACTGTAAAAATCCTATACGTTGGGGTACTAGCTAACAACCAATTGGCGTTTTGC
TT

QA 2 783 2 783
DS 



AS 1 2

CO CL8045Contig1 926 2 12 U
GGAAATCGTCTCGCCCACCAAAATCTCGAAAACCCTAAATAGTAGTATCTCCGATTCGCC
AAAAGGAACTTCGGGGCTCTTCTGGTTTCTCCGTAATGAGCGCCATCAACATCACCAACG
TCACCGCCTTGGATAATCCAGCGCCTTTTGTTAGCCCTTTTCAGTTCGAGATCTCCTACG
AGTGCCTTACATCTCTCAAAGACGATTTGGAGTGGAAGCTTATCTGCGTCGGTTCAGCAG
AAGATGAGACTTATGATCAAACTCTAGGGAGTGTGCTTGTTGGACCTGTTAACGTTGGCA
ACTACCGGTTTGTACTGCAGGCTGATCCTCCGGATCCATCAAAGATCCGTGAGGAAGACA
TCATAGGTGTGACGGTTCTGTTGTTGACGTGTTCTTACATGGGTCAGGAGTTCTTGAGGG
TTGGATATTACGTGAACAATGACTATGAAGATGAGCAACTCAGGGAAGAGCCTCCAACTA
AGGTTTTGATTGATAAAGTCCAGAGGAACATTCTCTCCGACAAGCCTAGAGTTACTAAGT
TCCCTATAAATTTTCATCCAGAAGACGAGCAAATTGCTACCGCCCCTCCTCCTCCTGAAC
CATCTGACGAACAACAACCTGATGTCAATGACGCATCTCAAGTTTCACCTGACCAGCACC
AAAACCACAGGAGTCTCCCCAGGAATCATGATTCTTTCTTGAGTCAAATCGTCGAAAATT
GGATGAAAGAAAGATTGTGTCCTTGTCCCCCAAGATCTTGGGTTTTGCTTCTCTATCTCC
AAACATTATTTGCAATTTTGCTGTACTTGTTTGTAAGAGGCTTTAGGGAAGTGGTTCTTG
ACATGTTTGAATGTTTTTGTTATTGGGGCAAAGATTTAGTTGAAGCAAAGCCCACATTTC
GAAAACAAGATAATGTTTCTAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F593TF U 1
AF RR4F593JQ C 199
BS 1 707 RR4F593TF
BS 708 708 RR4F593JQ
BS 709 717 RR4F593TF
BS 718 718 RR4F593JQ
BS 719 727 RR4F593TF
BS 728 730 RR4F593JQ
BS 731 735 RR4F593TF
BS 736 736 RR4F593JQ
BS 737 750 RR4F593TF
BS 751 751 RR4F593JQ
BS 752 765 RR4F593TF
BS 766 926 RR4F593JQ

RD RR4F593TF 776 0 0
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AAAAGGAACTTCGGGGCTCTTCTGGTTTCTCCGTAATGAGCGCCATCAACATCACCAACG
TCACCGCCTTGGATAATCCAGCGCCTTTTGTTAGCCCTTTTCAGTTCGAGATCTCCTACG
AGTGCCTTACATCTCTCAAAGACGATTTGGAGTGGAAGCTTATCTGCGTCGGTTCAGCAG
AAGATGAGACTTATGATCAAACTCTAGGGAGTGTGCTTGTTGGACCTGTTAACGTTGGCA
ACTACCGGTTTGTACTGCAGGCTGATCCTCCGGATCCATCAAAGATCCGTGAGGAAGACA
TCATAGGTGTGACGGTTCTGTTGTTGACGTGTTCTTACATGGGTCAGGAGTTCTTGAGGG
TTGGATATTACGTGAACAATGACTATGAAGATGAGCAACTCAGGGAAGAGCCTCCAACTA
AGGTTTTGATTGATAAAGTCCAGAGGAACATTCTCTCCGACAAGCCTAGAGTTACTAAGT
TCCCTATAAATTTTCATCCAGAAGACGAGCAAATTGCTACCGCCCCTCCTCCTCCTGAAC
CATCTGACGAACAACAACCTGATGTCAATGACGCATCTCAAGTTTCACCTGACCAGCACC
AAAACCACAGGAGTCTCCCCAGGAATCATGATTCTTTCTTGAGTCAA*TCGTCGAAA*TT
GGATGAA**GAAGAT*GTGTCCTTGTCCCC*AAGATCTTGGGTTT
GCTCTCTATCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4F593JQ 728 0 0
AAGACGATTTGGAGTGGAAGCTTATCTGCGTCGGTTCAGCAGAAGATGAGACTTATGATC
AAACTCTAGGGAGTGTGCTTGTTGGACCTGTTAACGTTGGCAACTACCGGTTTGTACTGC
AGGCTGATCCTCCGGATCCATCAAAGATCCGTGAGGAAGACATCATAGGTGTGACGGTTC
TGTTGTTGACGTGTTCTTACATGGGTCAGGAGTTCTTGAGGGTTGGATATTACGTGAACA
ATGACTATGAAGATGAGCAACTCAGGGAAGAGCCTCCAACTAAGGTTTTGATTGATAAAG
TCCAGAGGAACATTCTCTCCGACAAGCCTAGAGTTACTAAGTTCCCTATAAATTTTCATC
CAGAAGACGAGCAAATTGCTACCGCCCCTCCTCCTCCTGAACCATCTGACGAACAACAAC
CTGATGTCAATGACGCATCTCAAGTTTCACCTGACCAGCACCAAAACCACAGGAGTCTCC
CCAGGAATCATGATTCTTTCTTGAGTCAAATCGTCGAAAATTGGATGAAAGAAAGATTGT
GTCCTTGTCCCCCAAGATCTTGGGTTTTGCTTCTCTATCTCCAAACATTATTTGCAATTT
TGCTGTACTTGTTTGTAAGAGGCTTTAGGGAAGTGGTTCTTGACATGTTTGAATGTTTTT
GTTATTGGGGCAAAGATTTAGTTGAAGCAAAGCCCACATTTCGAAAACAAGATAATGTTT
CTAGTTTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL8046Contig1 1110 2 2 U
GTATGCACGTAAGCTGATCGCTGGAAACCCATTGTTCGCTGATCGGATCACAGTCATCAA
GGGAAAAGTCGAGGATATCGAGTTGCCTGAGAAAGCGGATGTTTTGATCTCTGAACCGAT
GGGCACCCTATTGGTCAACGAGAGAATGTTGGAGTCGTATGTAATTGCTAGGGATCGTTT
CATGTCTCCGCATGGCAAAATGTTTCCCACTGTTGGAAGGATTCACATGGCACCTTTCTC
GGATGAATTTTTATTTATAGAAATGGCAAATAAGGCTTTGTTTTGGCAACAACAGAACTA
TTACGGTGTTGATTTGACACCTCTGTTTGGGTCAGCGCACCAAGGCTATTTTTCTCAGCC
TGTGGTTGATGCATTTGATCCGAGGTTATTGGTAGCTCCCCCTATGTTTCATACGATTAA
TTTCACTCAGATGAAGGAAGAAGACTTTTATGAGATCGATGTCCCATTGAAGTTTACTGC
TTCCATGTGCACCCGAGTGCATGGACTTGCCTGCTGGTTCGACGTTCTCTTTGATGGGAG
CACGGTACGAAGATGGCTAACAACTGCTCCTGGTGCACCTACGACGCACTGGTACCAAAT
CAGATGCGTTCTCGCGCAACCCATTTATGTGATGGCAGGTCAAGAGATCACTGGTAGACT
TCATTTGATAGCCCACAGTGCTCAGAGTTATACAATTGATTTAACTCTATCAGCGAAAAT
GTGGGGTCCGGGAGCAAGTCAAGGTGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCT
GAAAGAACCTTATTATAGAATGTCTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACC
ATTACCACCACAACCGCAGCTAAACACTCAGGACATACAGATACAGAACGATGACTTCGA
AGAAGAGTTATTACAAGAACCGCCACAGAACTCGAGTACCCAGCTCTAAAGCTTAGATCA
TTGAATTTCAGCCATCTTTGGTTCCTTGCGAGTTTGGTCTGGTTCTATTTTAAAATGGTA
GCACGACAGAATTTTATCATTCCCAATCCTTCCATGTAACAGTGTCTTTACCTTTGTGTT
TTGTTTCCACATGAACCAAGTTGTCTATCC


BQ
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AF RR4AD44TF U 1
AF RR4AD44JQ C 369
BS 1 814 RR4AD44TF
BS 815 1110 RR4AD44JQ

RD RR4AD44TF 814 0 0
GTATGCACGTAAGCTGATCGCTGGAAACCCATTGTTCGCTGATCGGATCACAGTCATCAA
GGGAAAAGTCGAGGATATCGAGTTGCCTGAGAAAGCGGATGTTTTGATCTCTGAACCGAT
GGGCACCCTATTGGTCAACGAGAGAATGTTGGAGTCGTATGTAATTGCTAGGGATCGTTT
CATGTCTCCGCATGGCAAAATGTTTCCCACTGTTGGAAGGATTCACATGGCACCTTTCTC
GGATGAATTTTTATTTATAGAAATGGCAAATAAGGCTTTGTTTTGGCAACAACAGAACTA
TTACGGTGTTGATTTGACACCTCTGTTTGGGTCAGCGCACCAAGGCTATTTTTCTCAGCC
TGTGGTTGATGCATTTGATCCGAGGTTATTGGTAGCTCCCCCTATGTTTCATACGATTAA
TTTCACTCAGATGAAGGAAGAAGACTTTTATGAGATCGATGTCCCATTGAAGTTTACTGC
TTCCATGTGCACCCGAGTGCATGGACTTGCCTGCTGGTTCGACGTTCTCTTTGATGGGAG
CACGGTACGAAGATGGCTAACAACTGCTCCTGGTGCACCTACGACGCACTGGTACCAAAT
CAGATGCGTTCTCGCGCAACCCATTTATGTGATGGCAGGTCAAGAGATCACTGGTAGACT
TCATTTGATAGCCCACAGTGCTCAGAGTTATACAATTGATTTAACTCTATCAGCGAAAAT
GTGGGGTCCGGGAGCAAGTCAAGGTGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCT
GAAAGAACCTTATTATAGAATGTCTCAGCCACAA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4AD44JQ 742 0 0
ATGCATTTGATCCGAGGTTATTGGTAGCTCCCCCTATGTTTCATACGATTAATTTCACTC
AGATGAAGGAAGAAGACTTTTATGAGATCGATGTCCCATTGAAGTTTACTGCTTCCATGT
GCACCCGAGTGCATGGACTTGCCTGCTGGTTCGACGTTCTCTTTGATGGGAGCACGGTAC
GAAGATGGCTAACAACTGCTCCTGGTGCACCTACGACGCACTGGTACCAAATCAGATGCG
TTCTCGCGCAACCCATTTATGTGATGGCAGGTCAAGAGATCACTGGTAGACTTCATTTGA
TAGCCCACAGTGCTCAGAGTTATACAATTGATTTAACTCTATCAGCGAAAATGTGGGGTC
CGGGAGCAAGTCAAGGTGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGAAC
CTTATTATAGAATGTTTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCATTACCAC
CACAACCGCAGCTAAACACTCAGGACATACAGATACAGAACGATGACTTCGAAGAAGAGT
TATTACAAGAACCGCCACAGAACTCGAGTACCCAGCTCTAAAGCTTAGATCATTGAATTT
CAGCCATCTTTGGTTCCTTGCGAGTTTGGTCTGGTTCTATTTTAAAATGGTAGCACGACA
GAATTTTATCATTCCCAATCCTTCCATGTAACAGTGTCTTTACCTTTGTGTTTTGTTTCC
ACATGAACCAAGTTGTCTATCC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL8047Contig1 644 2 2 U
GATAGTTACGGAGTAGTGTTACTAGAGGCTTTAACCGGGAAGCATCCTTTAGACCCGGAT
CTACCAGGAGGTGCACATTTGGTTAAGTGGGTGAGAGATCATTTAGCTGAGAAGAAAGAT
CCGAGCAAGCTTCTTGACCCGAGACTTGATGGACGAACCGACTCGATTATGCATGAGATG
CTTCAAACACTTGCGGTCGCGTTCCTTTGTGTGAGTAACAAGGCAAGTGAAAGGCCTATG
ATGAAAGACGTTGTCGCCATGCTCACCGAGATAAGGGATATTGATGTTGGACGTTCGGAG
ATCGATAAGATAAAAGATGGTGGTAGTTGCGGAAGCAAAGAGCCGCAGGTGATAACGCAT
GAGAAAATCATCATCTCTCACGGTTCATCTAATTGTTCATTTGCCTTCTCGGATGACTCT
GTTTGAAACATACTAACGGTGAAAAGTGTGAATTGTGTGTGTATTTACAAAGTTGTGTGA
ATAAATTTTGTTGGAATTTTAAGCATTTTGAAAAGTTTTTGTGTAAGGGTCACAACAGAA
AGTCTTATAATTGCAATAGATTTATTTCTGTAAATCTTAATTATCAAGTAATGTAATCAA
GCATAAATTAAGCTAACAGGGTGAAAATACATCATAAAAAAAAA


BQ
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AF RR4CC46JQ C 1
AF RR4CC46TF U 1
BS 1 635 RR4CC46TF
BS 636 644 RR4CC46JQ

RD RR4CC46JQ 644 0 0
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GAGAAAATCATCATCTCTCACGGTTCATCTAATTGTTCATTTGCCTTCTCGGATGACTCT
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GCATAAATTAAGGTAACAGGGTGAAAATACATCATAAAAAAAAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4CC46TF 635 0 0
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CTACCAGGAGGTGCACATTTGGTTAAGTGGGTGAGAGATCATTTAGCTGAGAAGAAAGAT
CCGAGCAAGCTTCTTGACCCGAGACTTGATGGACGAACCGACTCGATTATGCATGAGATG
CTTCAAACACTTGCGGTCGCGTTCCTTTGTGTGAGTAACAAGGCAAGTGAAAGGCCTATG
ATGAAAGACGTTGTCGCCATGCTCACCGAGATAAGGGATATTGATGTTGGACGTTCGGAG
ATCGATAAGATAAAAGATGGTGGTAGTTGCGGAAGCAAAGAGCCGCAGGTGATAACGCAT
GAGAAAATCATCATCTCTCACGGTTCATCTAATTGTTCATTTGCCTTCTCGGATGACTCT
GTTTGAAACATACTAACGGTGAAAAGTGTGAATTGTGTGTGTATTTACAAAGTTGTGTGA
ATAAATTTTGTTGGAATTTTAAGCATTTTGAAAAGTTTTTGTGTAAGGGTCACAACAGAA
AGTCTTATAATTGCAATAGATTTATTTCTGTAAATCTTAATTATCAAGTAATGTAATCAA
GCATAAATTAAGCTAACAGGGTGAAAATACATCAT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8048Contig1 759 2 1 U
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TCGGGACCGTTGGATTTAAAACATCGAATGCCAGAGAAAACGACATTTACAGCTAACCGG
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AGAAGCCCTGTTGTGTCGGGACAGTTAGATGGAAACTTGAACGAACGGCTCAAATTATCA
GGGCCGTTGAATGCAAGACCACCGAGCCCAAGTGTGTATGTGGAGTACAGTAAAAGAGAC
GATGACACACGATGGGCTGCTCTGTTTCACAACTTGAAGCCAACATAGATCTCGAGTTTA
AGTGGTTTTTGTTTAGTGTTGAGAAAACGGTATGTAGCCAGGGGTACTCAATTTTCGGGT
ATCCGTTGTGCTGACTGCTGAGTATACAAACTATTTTCTTATGCTCTTACTTATGGGGAT
ATCTTTTTATCATTCAATTCAAGTATTGCTCGCTCTGAG


BQ
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AF RR4A932JQ C 1
AF RR4A932TF U 1
BS 1 759 RR4A932TF

RD RR4A932JQ 759 0 0
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GGGCCGTTGAATGCAAGACCACCGAGCCCAAGTGTGTATGTGGAGTACAGTAAAAGAGAC
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QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4A932TF 759 0 0
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CCCAATCACGACTTTTTGCGACAGGATTTTCTATATAGTGGAAATAATAAAGCTAACGAC
GAAAAAGCTGAGCTCCCAGTGGAGAGATTACCTGTGATAAGGAAAAAGAGGATCGCCAAA
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AGCATGAACCTATCTGGACCGTTGGATCAAAGTGTCCAAGAAAGACTGGTATTAGCGTAC
AGAAGCCCTGTTGTGTCGGGACAGTTAGATGGAAACTTGAACGAACGGCTCAAATTATCA
GGGCCGTTGAATGCAAGACCACCGAGCCCAAGTGTGTATGTGGAGTACAGTAAAAGAGAC
GATGACACACGATGGGCTGCTCTGTTTCACAACTTGAAGCCAACATAGATCTCGAGTTTA
AGTGGTTTTTGTTTAGTGTTGAGAAAACGGTATGTAGCCAGGGGTACTCAATTTTCGGGT
ATCCGTTGTGCTGACTGCTGAGTATACAAACTATTTTCTTATGCTCTTACTTATGGGGAT
ATCTTTTTATCATTCAATTCAAGTATTGCTCGCTCTGAG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL8049Contig1 1067 2 2 U
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CATACGATTGTTAAGGTTATCCAATGGTGTCGATATCTATACACCAGTATCCAGAGATAT
GTCTTATTCCGGCTCACTGCGAGTGTTTCAGCCGTGGTTATATGTGTGGTCGGGGTTGTA
TTTTATGATGCATTTCCACTTAATGCCGTGCCGCTTCTGTTGCTTAATCTTATTGTCGAC
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GTGATTTACATAGTGCTGTTGCTAGCCCTCGTACATTCTGATAGTATACTGACGCTAGAT
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AAAGACAACATGTTTGTCTTTATAATAACCGCAACTATCATAGTTCAGATAATCTTGGTA
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ATCGCTGTAGGATTACTCAGCCAGGTTGCCACTCGCTTCCCTTTGGAAGTCTATCAATAC
TACCACAACTGATGGACGGCTCACAAGCTGTTTTCTGTGTGAATAACTGCGTGGCATTTG
TTATGTCATTCTTTGATTTGTTATGTCATCATCCTTTGATCTTGTTCTGTTGTTTATATA
TAGCATGTATGCAAGTAATCCATGTATGGTACAATTATTTCAGCGCT


BQ
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BS 700 1067 RR4FX19JQ

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GAGGACAGTCTTCTGTTTGTTAAAGCACTGAAGAGAAAAGGGTATGTAGTTGCAGCCACT
GGGATGGGAATACATGATACAATGACACTACGCGCAGCGGATGTTAGCCTTGCAATGGGA
ATTGGAGGGACAGCAGTAGCTAAAGAGAATTCCGATATTATTATATTGGATGACAATTTT
CATACGATTGTTAAGGTTATCCAATGGTGTCGATATCTATACACCAGTATCCAGAGATAT
GTCTTATTCCGGCTCACTGCGAGTGTTTCAGCCGTGGTTATATGTGTGGTCGGGGTTGTA
TTTTATGATGCATTTCCACTTAATGCCGTGCCGCTTCTGTTGCTTAATCTTATTGTCGAC
ATTTTTGGAGCTCTAGCGTTGGCTTGCAAACCAATAGCTCGCAACATAATGGAAAAACCA
CCAGTTGGTAGAAGAGACCCTCTTATAACCAAGACGATGTGGTTCAAGATGGTGACTCAG
GTGATTTACATAGTGCTGTTGCTAGCCCTCGTACATTCTGATAGTATACTGACGCTAGAT
CATCTTCATGCCGGTGATGCTGAAAAAGTGAAGAACACATTTATTTTCAATTCTTTGGTC
TTCTGCCTGGTATTCAATGAGTTTGAAATCAGAGGAGAA

QA 1 699 1 699
DS 

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ATCCAGAGATATGTCTTATTCCGGCTCACTGCGAGTGTTTCAGCCGTGGTTATATGTGTG
GTCGGGGTTGTATTTTATGATGCATTTCCACTTAATGCCGTGCCGCTTCTGTTGCTTAAT
CTTATTGTCGACATTTTTGGAGCTCTAGCGTTGGCTTGCAAACCAATAGCTCGCAACATA
ATGGAAAAACCACCAGTTGGTAGAAGAGACCCTCTTATAACCAAGACGATGTGGTTCAAG
ATGGTGACTCAGGTGATTTACATAGTGCTGTTGCTAGCCCTCGTACATTCTGATAGTATA
CTGACGCTAGATCATCTTCATGCCGGTGATGCTGAAAAAGTGAAGAACACATTTATTTTC
AATTCTTTGGTCTTCTGCCTGGTATTCAATGAGTTTGAAATCAGAGGAGAAAAAACCTTG
ATAGAAGTTTTTAAAGACAACATGTTTGTCTTTATAATAACCGCAACTATCATAGTTCAG
ATAATCTTGGTAGAGTTCCTTGGAATTTTCAACTCTGCTGTTAGGCTTGACTTGATAAAA
TGGCTCATCTCCATCGCTGTAGGATTACTCAGCCAGGTTGCCACTCGCTTCCCTTTGGAA
GTCTATCAATACTACCACAACTGATGGACGGCTCACAAGCTGTTTTCTGTGTGAATAACT
GCGTGGCATTTGTTATGTCATTCTTTGATTTGTTATGTCATCATCCTTTGATCTTGTTCT
GTTGTTTATATATAGCATGTATGCAAGTAATCCATGTATGGTACAATTATTTCAGCGCT

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

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GGGGGAAAGGAAGCGTGGGGACGTCTTATAAGGCGGTGTTGGAGGAAGGCACCACGGTGG
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TTGTCGGCAGAGTTAAACACCCGAATGTTGTTCCGTTGAGAGCTTATTATTACTCTAAAT
ATGAGAAGCTTCTTGTCTTTGATTTCATGCCCAACGGAAGCCTCTCTGCTCTCCTTCGCG
GGAGCCGTGGATCGGGACGAACTCCGTTAGACTGGGATAACCGTATGAGAATAGCAATAA
CTGCAGCGAGAGGTTTGGCCCATCTTCATGTTTCAGCCAAATTGGTACATGGAAACATCA
AAGCCTCAAACATACTCCTACAACCAAACCAAGACACTTGCGTCTCTGACTATGGACTTA
ATCAACTGTTCAGTAACTCGAGTCCACCAAACCGTTTGGCGGGTTATCATCTCCTGAAGT
TCTCGAGACACGGAAAGTAACTTTCAAATCGGATGTGTACAGTTTCGGGGTGTTGCTGCT
TGAACTGTTGACTGGCAAATCACCAAACCAGGCATCACTTGGCGAAGAAAGCATTGATCT
GCCTCGGTGGGTGCTGTCTGTGGTTAGAGAAGAATGGACCGCTGAAGTGTTCGATGTCGA
GCTGATGCGGTACCACAACATAGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGC
TTGTGTCGCTACGGTTCCTGATCAACGACCGGTGATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTGA
GGATGTGAACAGAAGTGAAACAACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTTTGATGACCCGTC
CAAAGGTTCAGAGGGTCAGACTCCTCCAGGGGAATCAAGGACGCCACCACGTTCGGTCAC
GCCTTAGTAGTAACTCAAAGCAGCTTTAGTTTGTGTGTGTTCACTTTCTCCTCAAAAGGA
GATAAAAAGAAAAGTGTGTTAGGTCTTTGTTGGGTTACGTTAAAGCAAAAAAAGGCTGGA
CCAGACCAGTGTGGCATTTGAACCAAGTTCTTAAAAGATGGCATCTCCCATCTATTTTTT
TCTTGATTTTTTTTATAAATACATTTCGAGATATTTTAGTAGTTACTTTTTCTCTTTTTT
TTTTTTAATTTGAATATTGTTTTCACAGGTTTCAATCAAAATTCAATCTTAACG


BQ
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AF RR4GW38JQ C 481
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BS 644 1194 RR4GW38JQ

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GGGGGAAAGGAAGCGTGGGGACGTCTTATAAGGCGGTGTTGGAGGAAGGCACCACGGTGG
TCGTGAAGCGTTTGAAGGACGTGGCGGCGACCAAGAAAGAGTTCGAGTCGCAGATGGAGA
TTGTCGGCAGAGTTAAACACCCGAATGTTGTTCCGTTGAGAGCTTATTATTACTCTAAAT
ATGAGAAGCTTCTTGTCTTTGATTTCATGCCCAACGGAAGCCTCTCTGCTCTCCTTCGCG
GGAGCCGTGGATCGGGACGAACTCCGTTAGACTGGGATAACCGTATGAGAATAGCAATAA
CTGCAGCGAGAGGTTTGGCCCATCTTCATGTTTCAGCCAAATTGGTACATGGAAACATCA
AAGCCTCAAACATACTCCTACAACCAAACCAAGACACTTGCGTCTCTGACTATGGACTTA
ATCAACTGTTCAGTAACTCGAGTCCACCAAACCGTTTGGCGGGTTATCATCTCCTGAAGT
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TGAACTGTTGACTGGCAAATCACCAAACCAGGCATCACTTGGCGAAGAAAGCATTGATCT
GCCTCGGTGGGTGCTGTCTGTGGTTAGAGAAGAATGGACCGCT

QA 1 643 1 643
DS 

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TGAACTGTTGACTGGCAAATCACCAAACCAGGCATCACTTGGCGAAGAAGGCATTGATCT
GCCTCGGTGGGTGCTGTCTGTGGTTAGAGAAGAATGGACCGCTGAAGTGTTCGATGTCGA
GCTGATGCGGTACCACAACATAGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGC
TTGTGTCGCTACGGTTCCTGATCAACGACCGGTGATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTGA
GGATGTGAACAGAAGTGAAACAACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTTTGATGACCCGTC
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GCCTTAGTAGTAACTCAAAGCAGCTTTAGTTTGTGTGTGTTCACTTTCTCCTCAAAAGGA
GATAAAAAGAAAAGTGTGTTAGGTCTTTGTTGGGTTACGTTAAAGCAAAAAAAGGCTGGA
CCAGACCAGTGTGGCATTTGAACCAAGTTCTTAAAAGATGGCATCTCCCATCTATTTTTT
TCTTGATTTTTTTTATAAATACATTTCGAGATATTTTAGTAGTTACTTTTTCTCTTTTTT
TTTTTTAATTTGAATATTGTTTTCACAGGTTTCAATCAAAATTCAATCTTAACG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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GGAAACACTCACTTTCAAAAAAACCTCTCGCATCTCTCTAAACCAGACAACGACGGAATC
CTAGCTCCGGCCCGGTTAATCCGGTGCCGGAGGCATCTCTTCTTCTTCTTTTCTCTTTTT
TTCTTTGCTTTCTCTCCTCTTGCTTGATCTCGGCCGATATGCGCGTGTGCTCTGGGTCGG
AAATCCTCTCAAAGTTTCTGATTGAAACTGACGGTGGTAAGCTCCAGCGTGCCTGGAGTC
GCGGCGAGGTCAATGAGATGGCGGGAGGAAGAAAGTCGGCTTTTAGGGTTATTGGAGGAA
ACAGATCTGGTTTTTCCCCTTTTTCAGATCTCGTTGATTCCATTCCGGTGACGGCGCGTG
GTTTCGGGAGACGCTCTCTACTCCTTGATTCTACGTCTCCAGAAGACGGTGAGGCGAGCG
GAGGAAGTTTCGACGGTGGATGGACAGGGTATCGTTCTCCGGTTTTGGGGAACACACGAA
CAATGACTCCCGCCGATAAAAATGGTCAAGAAGAAGATATTATAGTGGTGGTTCGTGGTG
GTGACTATTATCCTAGTGCTGAAAGTCTTATTTTTTGGTGTGAGTCTCACTTCTCTGAAA
GTCCGATGAGCTAAATCGACCCGCGTTTTACGGAGCCGAAACCCGACTTTCATTCGGATC
TTGTGTCCGTTTTAGGCTGAGGGTCACAACGTTCGAAAACCAGGAGGATGAGGAGTTCCC
GATTATGCACCTTGGTGAAGAGGCTATTGGGTCATGAGCTTTAATGTCGATCATTAGGAT
CCTTAGCTAGTTCTAATTTTGTTTCGGTGAAGTCTGTAATTTTGTTGTGTTAGTAGACGT
TTGCTGTACCATGAAGTCAATTTAGGTGTGGTAGAAGAGATGAATCAGTCTGAGTCGTGG
ATTGATTTCATTCTCATGGTGGTCCAATATGCATTGAGTTAAGGTTAGGTAATGTTAGTT
CCAATCAAGTGAGCTAGGGTGATACTAGACCAACTCAATGCATTTGTGGTGAAAGTCTAT
TGTGGACAAGTATGTTCTTGTATCATGATTTGGTTAATGAAAGTAGTTGTTGAGCT


BQ
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AF RR4B813TF U 1
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GAGGAAGTTTCGACGGTGGATGGACAGGGTATCGTTCTCCGGTTTTGGGGAACACACGAA
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GAGCT

QA 1 725 1 725
DS 



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AF RR4H314JQ C 1
AF RR4H314TF U 1
BS 1 653 RR4H314TF

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QA 1 653 1 653
DS 

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GACAGTATTCTCGACCTCAAGATTGACGGTTCAAAATGCTCTCAACAACTCATCTGGGAT
TTCTTTAAAGAAGATGGTGAAGATGAAGAAGAAAAAAGATTTAGTACTGATCAAGAAGGC
TCAAGTTCTGGGGTTTGGGATAATATGTCAGCGGATTATGAAGACAAAGAGTTGGGTCTG
AAGCTGAGCTTAAACCATCAAGAAGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGCCAGCAACCT
CTGTGGACGGATAACGCAAACTTAATGGCTCCGACCAGTGCCGTTTATAGTGGAGAAGTG
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QA 1 653 1 653
DS 



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BQ
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AF RR4HB45JQB C 1
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CAGGGGTTTGGAGAGTTGCAAATGGTGAAGTAGTCCTGGGCGGAGTTGAGGGAAGGGAAG
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TCTATCCAGACGTTTATGAAACGAGTATCAGTTCATCTAACAGTGCAAATGGTAAAGATA
GGTTGATGGCGAATTCTGGAGAGTTGGAGGTTCTTTTCTTCCAGCATTATCCTCCTGAAT
ATAATTATTATTAAGTCGCATGTTTCGTTTTTACCCGGGCTTTATTATTATGTAATCTGT
TTTCATTTCAAAATTAAATAAAACTTGACGT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

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AACATCATATTAGCAATACACACAAAATGGTTTTTTTAAATATCATTATATATAATTAAC
ATTTTGCAAATTTTATACTATTTTCAGACTTATCAAATACATAATTTATATATACCTATA
CTGGTGCAATTTATAAGAATAATTAATTAAAAAAACCAAATTATATATGCGAGAACATTT
TAAAAATAAGTGTTTGTGAAATATACTGAATGTAGGTATAAGGTTTGCTTATAATCAAAT
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GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RR4GU48TF U 1
AF RR4GU48JQ C 226
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BS 727 963 RR4GU48JQ

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ATTTTGCAAATTTTATACTATTTTCAGACTTATCAAATACATAATTTATATATACCTATA
CTGGTGCAATTTATAAGAATAATTAATTAAAAAAACCAAATTATATATGCGAGAACATTT
TAAAAATAAGTGTTTGTGAAATATACTGAATGTAGGTATAAGGTTTGCTTATAATCAAAT
ACGAGAGTGTTTATTTATTCTTCCTCAGAGTTTGAGAACCCATTTGATATTTAAAAATAT
GTTTCTCATCTTAACCAACGTCATAATATAATTTAGCTATATGTTGCACAGGAAGTCGTG
AAGAAAGGAAAGGCGAGGGAACGTGGTACGGCAGTTCGCCGAGAGGAGACGATGGGGTTG
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GGTTTTGTTATTGATCAGGAAGATGGAAGCTCGATATCGGGCTTCTTTGGGAGAAACCAA
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GAAGAA

QA 1 726 1 726
DS 

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GAGACGATGGGGTTGCATAGACCGAGATGTCAAGTGGATGCATCTTGGGCAACCAACCAG
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TTTGGGAGAAACCAAGTCCACTCTCCCTTCCATGCAGAGTTCCATTCTCTACTATGGACA
ATGGGTAAGTCTCTCCAGATGGGGCATCAATCTATGCATTTCGAATCGGATAGCCTGCAA
ATGGTTAAACTGATCGAAGAAGAAGAGTTTTGGCCATCTTTGGCTTCAGAATTGGATGAT
TTTTATCATCTGCGTTCTTTGTTTACTTTGTTTTCTCTATCTTTTATTCATCGTGAGTTA
AACTCTCGTGCTGATTTACTTGCTAAAGGAGCTCGACTGAGAATCTCTGAATTATCCCAT
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ATTATGGAGTTCGCCGCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATATCGCGTTAGAGTTGCCTCCTGTGATGATACGGTGGGTTCAGGCTTCGGAAGGAGGAA
GGAGAGAAACTCTGACGGTGGTGGTAGTACTAGTAGTCGCCGGAGGAGGGAATGCTACGC
GGCGGAGCTGAGCACCATAGAAGAGTGAAGGGTATCTGGAATTTGTTGATAGTTGTAATT
ATGCTGGGGTAGTTTAGTCATTTAAAAAAACAATATGCAAATTTAGCAATTTATGAAAGT
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GTCGAATTTAGTGTTTTTCCTACACTTTTCCTTTTTCTCAAGAAGACTAAATTCTCCATG
GTGAACATTTAGATTAGCATAATTACATTAATCATTCATAGTATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AG34TF U 1
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BS 1 725 RR4AG34TF
BS 726 827 RR4AG34JQ

RD RR4AG34TF 725 0 0
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ATGCACTTCGACTGAGTCGACTCAAGTGGCCACGACGAAACTGATCTTGCTAGACGGGAG
GATGATGGAGTTCACGAAACCCGTGAAGGTCGGATACGTTCTGCAGAAGAACCCCATGTG
TTTTATCTGTAACTCGGACGACATGGAGTTCGACGAGGCTCTTTCCGCCATTAGCGCCGA
CGAAGAGCTTCAGCTAGGTCAGATATACTTCGCTCTTCCTCTTCGTTATCTTCGTCAGCC
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GGCGGAGCTGAGCACCATAGAAGAGTGAAGGGTATCTGGAATTTGTTGATAGTTGTAATT
ATGCTGGGGTAGTTTAGTCATTTAAAAAAACAATATGCAAATTTAGCAATTTATGAAAGT
TCTCTTATGGGATTTTAGTAGTTAGTGCTTAGTAGCATCTCTCGTTGATTTGTGACATTT
GTCGA

QA 1 725 1 725
DS 

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GAACCCCATGTGTTTTATCTGTAACTCGGACGACATGGAGTTCGACGAGGCTCTTTCCGC
CATTAGCGCCGACGAAGAGCTTCAGCTAGGTCAGATATACTTCGCTCTTCCTCTTCGTTA
TCTTCGTCAGCCACTTCAAGCGGAGGAGATGGCGGCATTGGCCGCCAAAGCTAACTCTGC
GCTCATGCGAGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGCTGTCGCCGGAGACGTGTAGATCCTATTGT
CCCTGGTGATAAATATCGCGTTAGAGTTGCCTCCTGTGATGATACGGTGGGTTCAGGCTT
CGGAAGGAGGAAGGAGAGAAACTCTGACGGTGGTGGTAGTACTAGTAGTCGCCGGAGGAG
GGAATGCTACGCGGCGGAGCTGAGCACCATAGAAGAGTGAAGGGTATCTGGAATTTGTTG
ATAGTTGTAATTATGCTGGGGTAGTTTAGTCATTTAAAAAAACAATATGCAAATTTAGCA
ATTTATGAAAGTTCTCTTATGGGATTTTAGTAGTTAGTGCTTAGTAGCATCTCTCGTTGA
TTTGTGACATTTGTCGAATTTAGTGTTTTTCCTACACTTTTCCTTTTTCTCAAGAAGACT
AAATTCTCCATGGTGAACATTTAGATTAGCATAATTACATTAATCATTCATAGTATTAG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL8057Contig1 1372 2 2 U
CTTCGTTATTAGATTTCTTGGAGAAACAGTTTGATGTTATTTTGTCCCATTGATAAAGTG
ATTCTGAATCCTTTGATTTTTTGTTGTTGTTTTTCAGAGTTGGCAAGGCATCGTTGATGA
ATCACAGAATTCTTAGGATGATTGAAGCAACGCTTATCTCGGTAAATCAACGATTAGTTT
CCAGATTCTTAAAAAAAACAAACAAACATCAATTCTTTGAACGATTGGCTGCATCTCCTC
CTTTGTGAGTGGCTTCAGGTCTCTTCTTATGCCCCATTGTCATATGCGACTCCTCTGTTG
TAGATCGTCCGTACCAGATATCATCAGGTTTTGGAGAAGCTTGATGCGGTGCTTGATGTT
GGTGGTGTGTATGATCCTGAGAGAAAACGTTAGGACCATCACCAGTAAGGCTTCACCCAA
GTGTTTGCACATGGGTTTAATACTAAACTCAGTAGTGATGGGATTATCTATCAGCGATAT
GGCTTGGAGATAATTGCTAAGGAGCTTCGACTTGCTTTGGAGAGGTTGGCTACATTCTTT
GGTGTGTATTGAGTAAACTTAGACAGAGTTGAGTGTGCTCTGAAAGAGTTGAGAATACTC
TGAAAGATATGGCTATCTTGATGAAGCAGCAAGATCAGGCAGAAGAAGCTATCGAAGCTA
TTAAGTCTCTTATAGTCAGAGATGTGGGAGAAAAGATGACCATATTTCACTGTTGAAACA
CAAACTCTTCTTGATACATAAATGACTCGCCTTTGACGGCAAACGAACCAAAACCGCTGG
ATCTCAGGGGAAGAACTTTCAAGTCTCTGTTGAGCAAGAAGCGACTCGGCTACTGGGGAA
CTTAGGATGGGTTTTGATTGAAAGAGACAACTTCTTGGAAGCGTAAGAAGCATACATGAA
AGCTTTATCTATCGCACTTGACAGCAACAAGATGTGTAACCTCGGAATCTGTCTTTAAGC
AGGGCAGGATCGATGAAGCCAAAGAGGCAAAGAGACGTTACGGCGTGTGAGGCCAGGGAC
GGTCATAGAGGATTGGATCCGCATTTAAAAGCTTACGAGAGAGCGCAGCAGATGTTTATA
ACGATCTTGGATCCGAGATAATGAGAAGAGGAGCGCAGCGAATGTAGTAGTAAACTGCCT
TTTACTCTTCATCTCAGATTCAAAGGCAAACTTAAGATCCAGGTTCCTCCTTGGCTTCTT
TTTTCCATCACCTCCGTCTCTACTATATACATATAAATCTTGCTGTGCACTTTCATTCTT
TGTGTTCCGATGTTTGTAACTCAACGTTTCAAAATACTCGAACTCTATAATTTGTTCTTG
AAAATAGACCTTTACCAAGGTTTACGCTCAATGATGGTTCTAATGTTCCACC


BQ
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AF RR4B380TF U 1
AF RR4B380JQ C 579
BS 1 770 RR4B380TF
BS 771 1372 RR4B380JQ

RD RR4B380TF 770 0 0
CTTCGTTATTAGATTTCTTGGAGAAACAGTTTGATGTTATTTTGTCCCATTGATAAAGTG
ATTCTGAATCCTTTGATTTTTTGTTGTTGTTTTTCAGAGTTGGCAAGGCATCGTTGATGA
ATCACAGAATTCTTAGGATGATTGAAGCAACGCTTATCTCGGTAAATCAACGATTAGTTT
CCAGATTCTTAAAAAAAACAAACAAACATCAATTCTTTGAACGATTGGCTGCATCTCCTC
CTTTGTGAGTGGCTTCAGGTCTCTTCTTATGCCCCATTGTCATATGCGACTCCTCTGTTG
TAGATCGTCCGTACCAGATATCATCAGGTTTTGGAGAAGCTTGATGCGGTGCTTGATGTT
GGTGGTGTGTATGATCCTGAGAGAAAACGTTAGGACCATCACCAGTAAGGCTTCACCCAA
GTGTTTGCACATGGGTTTAATACTAAACTCAGTAGTGATGGGATTATCTATCAGCGATAT
GGCTTGGAGATAATTGCTAAGGAGCTTCGACTTGCTTTGGAGAGGTTGGCTACATTCTTT
GGTGTGTATTGAGTAAACTTAGACAGAGTTGAGTGTGCTCTGAAAGAGTTGAGAATACTC
TGAAAGATATGGCTATCTTGATGAAGCAGCAAGATCAGGCAGAAGAAGCTATCGAAGCTA
TTAAGTCTCTTATAGTCAGAGATGTGGGAGAAAAGATGACCATATTTCACTGTTGAAACA
CAAACTCTTCTTGATACATAAATGACTCGCCTTTGACGGCAAACGAACCA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4B380JQ 794 0 0
TCTGAAAGAGTTGAGAATACTCTGAAAGATATGGCTATCTTGATGAAGCAGCAAGATCAG
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ACCATATTTCACTGTTGAAACACAAACTCTTCTTGATACATAAATGACTCGCCTTTGACG
GCAAACGAACCAAAACCGCTGGATCTCAGGGGAAGAACTTTCAAGTCTCTGTTGAGCAAG
AAGCGACTCGGCTACTGGGGAACTTAGGATGGGTTTTGATTGAAAGAGACAACTTCTTGG
AAGCGTAAGAAGCATACATGAAAGCTTTATCTATCGCACTTGACAGCAACAAGATGTGTA
ACCTCGGAATCTGTCTTTAAGCAGGGCAGGATCGATGAAGCCAAAGAGGCAAAGAGACGT
TACGGCGTGTGAGGCCAGGGACGGTCATAGAGGATTGGATCCGCATTTAAAAGCTTACGA
GAGAGCGCAGCAGATGTTTATAACGATCTTGGATCCGAGATAATGAGAAGAGGAGCGCAG
CGAATGTAGTAGTAAACTGCCTTTTACTCTTCATCTCAGATTCAAAGGCAAACTTAAGAT
CCAGGTTCCTCCTTGGCTTCTTTTTTCCATCACCTCCGTCTCTACTATATACATATAAAT
CTTGCTGTGCACTTTCATTCTTTGTGTTCCGATGTTTGTAACTCAACGTTTCAAAATACT
CGAACTCTATAATTTGTTCTTGAAAATAGACCTTTACCAAGGTTTACGCTCAATGATGGT
TCTAATGTTCCACC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL8058Contig1 658 2 1 U
GCACATCTTCTTTTCCTCCATTGTGTGAATCCAGAGCTATAAATATATCCGCTGTTGAAG
TGCGTCTTTTGAGTTTTTGGGAAAACAGCGTTAAGATGATAAAGGCAATGGTGATGATGA
ACAGACAAGCCACATCATAAGCTAGAGAAGCAACGATAGCTCATAATCAACGTGTTGTCA
TGTATGATTTTTTAAAGGAAGCATGGATAGAATGATGAAGGCATCAACAGTCGAGTCAGT
TGAATTTCTTTTCCCTGCTTTAGAAATATGGTACCGTTACGAATCATTGTCATCAACCTT
CTAATTGAATCCATCTTTCCACTCATTCCACGATATAAATATGTAATTAATCTGACGGAA
GTGAAACCCCGTGAATTTGTACAGTATGGTTTAGTGTGTTTGGAGACGTTTGCAGCAGAA
TGAAATGACTGTGCAAGAGAAGAAGATAATGATGCAGATCATGGTGAGTAATATATCCTT
TGGCAATGGGAATTGGATTTATCAAGTTTGTGGCAAGAAAGATGCTGATAGGTGGCAGGT
GGTGATGGTACCTGTGATTGTATTCTTGATTGTCTTGATGAGAAACCCAATATTGTTCTG
TAATCTTTAGAGATTATTCAATCAAAATTATAATAACAATAAATGGGAATTATAGTGG


BQ
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QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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20 

AF RR4A542TF C 1
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C

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CACCACGCAAATCCGCAGTTCTAGAAGGTTTATTTCCGCCAAGAAACACTGAGACCTC

QA 1 658 1 658
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AS 1 2

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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FE03JQ U 147
AF RR4A854TF C 1
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BS 630 675 RR4FE03JQ
BS 676 878 RR4A854TF

RD RR4FE03JQ 529 0 0
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TTCTGGTAAATCCCCATTCCCACATCGTCACTGGAGCTGGCAATTCCCTCCTCTGTGAAT
CATAGGTCGCCAATAGTTCTTCAACACTCCCGAGCGGAACTAACGACTGTCGAGCTTCAA
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ATGGCTTCCTCCGTGTATGGTTTCAGCCATTCC

QA 17 529 17 529
DS 

RD RR4A854TF 878 0 0
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GACTCTTGGATAGCTTTATGTAGACAAGAAGATTATCTGTTCTTTATTAAGAGGAAGGCA
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GCACTGCCAACATGGCCGCTCTTCCGTTCCATGTTTCTACACTTCTGGTAAATCCCCATT
CCCACATCGTCACTGGAGCTGGCAATTCCCTCCTCTGTGAATCATAGGTCGCCAATAGTT
CTTCAACACTCCCGAGCGGAACTAACGACTGTCGAGCTTCAAGGTTTGAGACTGCCATGG
CTCCAACATATGGAAGGCTTTCCACAACAGCATCTGCCAAGTCAGATATAAACAAAGGCT
CTGTTCCTAGCGCAGGCACTCGGCCCCAATTCTTGATACCAGAACTCAAAGCCAACTCTT
TATACTCAACATCTATCTCTTCCAGAGTTTCAATGTGCTCGCTCACAAAACTTATGGGTA
CAGCCAGAAGATTTTCAACACCTTTTTTTACCAAGTTCAGTAATGGCTTCCTCCGTGTAT
GGTTTCAGCCATTCCACAGGTCCAACTCTGCTCTGATAAGCGAGCGTGTAAGCGTTGGTT
ATATTTCTCTTGTCTAATTCTTCCATTATCAGATCGACGCATTCTTCCATCTCTGCCTTG
TACGGATCACCAGCTTCTTCAGCATATGCAAGTGGCACGCCATGTGCACTGAAAAATATT
ACAACCTGACTAGGGGAATCAAATTTTCCCAACTCGCC

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 2

CO CL8061Contig1 730 2 2 U
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AGATATGTCTGCACGTCGAAAGAAAAACAGAAACTATTTAATTAGTAAAAAGAGTTCAAA
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AAAGTGTATTCAGATACCTCGCCGATGACGTCTTCTTTACGCGAATTGAATCTGGTTCCC
TTGTAGATATAGTTTCCGCATCTATTGCATTGGACACTCATGGGAAGCATCATACGAACG
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AGCCTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD91TF U 1
AF RR4GD91JQ C 119
BS 1 602 RR4GD91TF
BS 603 730 RR4GD91JQ

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CC

QA 1 602 1 602
DS 

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TAAAAAGAAAAGAGAGAGAAGACAATTCTTGTTCTTTTTGTGACAGATAAATGACCTTAA
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ATGGAAAGAATTTAGGAAAAAAGGATATTATGCATTCTTAACAAAGGAAAAGGGAAAACA
ACAGCCTTTTGC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL8062Contig1 641 2 1 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AI13JQ C 1
AF RR4AI13TF U 1
BS 1 641 RR4AI13TF

RD RR4AI13JQ 641 0 0
GGGGACGAAACAGAGGAAGACAACTAGAACAGAGGAAGTGACGAGAACCGAGGAGGTTGT
GGTCTTCAAGAGGAGTAGTAGCGGCTGCGTTGAGATCAACAAGACGAAGCATCATAGATT
CTCGAGACTCGGGAGGTTCTTCAGGAAGATTAATCCGACGATTCTAACGTTTTGGATTAT
AAGAAACATAGTGCTTGGAGACCGAGATCACTTTGTAGCTTCCGAGGAGGAAACATGTAC
TTTATTGGGTCGGAAGAGGACGTGTTGTCTTACTCCGGCGTGAGGAGCTCCTTTTCCGCC
GCGAGAAGCTCGAGCGTCAATGGCGTTTTCGATGCAACGATAACAGAGCATCGAAAGAGT
AATTTTGAAGGGAGGAAAAGCAACTTCGAAAGGAAGAAGAGTAATTTCAGCGAAACAATG
GAGCACCGGAGAAGTAATTTCAGTAAACTGTCACGGAGGAGCTGTAAAGAGGCGAAGAAG
CTTTAGAAAGGATGTGGACATTGCTGGAATATTTAAAAAGTGAACAGTGCACATCCGAAG
ACCTAAATAATCTTTGTTCTTTGTATATCAAGTGCAATTACTCTAAATTAAAAGCTCCCA
CCAATACATTTTCTTCTATTCACCAAAACAATAATACAAAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4AI13TF 641 0 0
GGGGACGAAACAGAGGAAGACAACTAGAACAGAGGAAGTGACGAGAACCGAGGAGGTTGT
GGTCTTCAAGAGGAGTAGTAGCGGCTGCGTTGAGATCAACAAGACGAAGCATCATAGATT
CTCGAGACTCGGGAGGTTCTTCAGGAAGATTAATCCGACGATTCTAACGTTTTGGATTAT
AAGAAACATAGTGCTTGGAGACCGAGATCACTTTGTAGCTTCCGAGGAGGAAACATGTAC
TTTATTGGGTCGGAAGAGGACGTGTTGTCTTACTCCGGCGTGAGGAGCTCCTTCTCCGCC
GCGAGAAGCTCGAGCGTCAATGGCGTTTTCGATGCAACGATAACAGAGCATCGAAAGAGT
AATTTTGAAGGGAGGAAAAGCAACTTCGAAAGGAAGAAGAGTAATTTCAGCGAAACAATG
GAGCACCGGAGAAGTAATTTCAGTAAACTGTCACGGAGGAGCTGTAAAGAGGCGAAGAAG
CTTTAGAAAGGATGTGGACATTGCTGGAATATTTAAAAAGTGAACAGTGCACATCCGAAG
ACCTAAATAATCTTTGTTCTTTGTATATCAAGTGCAATTACTCTAAATTAAAAGCTCCCA
CCAATACATTCTCTTCTATTCACCAAAACAATAATACAAAC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL8063Contig1 902 2 2 U
GCTTCTCCATATATGCATATGGATTCTTTCCTTATACTAACTCCAAGGAAGATGAAATAG
CAACTCAGAGAACTACAGATTTCTTCTCTGGCTGGATGTTGAAGCCATTGGTGTTTGGGG
ACTATCCGGATGTGATGAAGAGAGTGGTGGGATCTAGGTTACCTGTTTTCTCTGAGGAAG
AGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCATCCGATTTTTTAGGCATTATCCATTACACGACAATGT
ATGTCACAAAGAGTACACCCACCACATCTTCTATCCTTCCTAGAAACCACGAGTTCTTCA
CAGACATGGGGGCAGAGACTATCCCCATTGGGAATCAATCTATTCCATGGGGGTTTGAAG
GTGTTTTGGATTATTTGAAACAGAGCTATAACAATCCTCCTATCTACATTCTTGAAAATG
GTTTAGCTACGAATCACAGTTCCACGCTACAAGACACAGAAAGAGTTGAATACATTCAAT
CTAGTATTGGTGCCATGTTAAACGCCATCAGGAATGGATCGGACACGAGAGGTTACTTTT
TATGGTCGATGATTGACTTGTACGAGCTAGTTGCTGGCTACAAGCTCAGCTTTGGATTGT
ACTACGTGAATTTCAGTGATCCTGGTCTCGAGAGGTCACCAAAGCTCTCTGCTTCTTGGT
ACTCTGGTTTTCTCAATGGTTCAGTTGTTGTTGCTCCTCAGGATATTACTCACCCGCAGA
GCCACTTCTCTGGCTCCTCATCTATGTGATGTAGTTATACATATATATAAGTAGTAACTA
GAACACAGCCACGTAAGCTTCCAGAAGTATTATTTAAGTAAAATAATGTTTGCATATCGT
TCCAATATATGCAAAAGCACATCTGTGTAGCGGTTTCACAGTACCCCTTCACGGTACTGA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BP85TF U 1
AF RR4BP85JQ C 209
BS 1 650 RR4BP85TF
BS 651 902 RR4BP85JQ

RD RR4BP85TF 650 0 0
GCTTCTCCATATATGCATATGGATTCTTTCCTTATACTAACTCCAAGGAAGATGAAATAG
CAACTCAGAGAACTACAGATTTCTTCTCTGGCTGGATGTTGAAGCCATTGGTGTTTGGGG
ACTATCCGGATGTGATGAAGAGAGTGGTGGGATCTAGGTTACCTGTTTTCTCTGAGGAAG
AGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCATCCGATTTTTTAGGCATTATCCATTACACGACAATGT
ATGTCACAAAGAGTACACCCACCACATCTTCTATCCTTCCTAGAAACCACGAGTTCTTCA
CAGACATGGGGGCAGAGACTATCCCCATTGGGAATCAATCTATTCCATGGGGGTTTGAAG
GTGTTTTGGATTATTTGAAACAGAGCTATAACAATCCTCCTATCTACATTCTTGAAAATG
GTTTAGCTACGAATCACAGTTCCACGCTACAAGACACAGAAAGAGTTGAATACATTCAAT
CTAGTATTGGTGCCATGTTAAACGCCATCAGGAATGGATCGGACACGAGAGGTTACTTTT
TATGGTCGATGATTGACTTGTACGAGCTAGTTGCTGGCTACAAGCTCAGCTTTGGATTGT
ACTACGTGAATTTCAGTGATCCTGGTCTCGAGAGGTCACCAAAGCTCTCT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4BP85JQ 694 0 0
TTTTTTAGGCATTATCCATTACACGACAATGTATGTCACAAAGAGTACACCCACCACATC
TTCTATCCTTCCTAGAAACCACGAGTTCTTCACAGACATGGGGGCAGAGACTATCCCCAT
TGGGAATCAATCTATTCCATGGGGGTTTGAAGGTGTTTTGGATTATTTGAAACAGAGCTA
TAACAATCCTCCTATCTACATTCTTGAAAATGGTTTAGCTACGAATCACAGTTCCACGCT
ACAAGACACAGAAAGAGTTGAATACATTCAATCTAGTATTGGTGCCATGTTAAACGCCAT
CAGGAATGGATCGGACACGAGAGGTTACTTTTTATGGTCGATGATTGACTTGTACGAGCT
AGTTGCTGGCTACAAGCTCAGCTTTGGATTGTACTACGTGAATTTCAGTGATCCTGGTCT
CGAGAGGTCACCAAAGCTCTCTGCTTCTTGGTACTCTGGTTTTCTCAATGGTTCAGTTGT
TGTTGCTCCTCAGGATATTACTCACCCGCAGAGCCACTTCTCTGGCTCCTCATCTATGTG
ATGTAGTTATACATATATATAAGTAGTAACTAGAACACAGCCACGTAAGCTTCCAGAAGT
ATTATTTAAGTAAAATAATGTTTGCATATCGTTCCAATATATGCAAAAGCACATCTGTGT
AGCGGTTTCACAGTACCCCTTCACGGTACTGACC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL8064Contig1 645 2 6 U
GAGTCCGATGAATAGTCCTCGTCTGAGGAACAACCCGTGCTTTGGTCTTGAGAGCATTCC
GGAGAGTGATGTGAGCGTGAAGGAGCAGAAGGAGGATGAGAAGAGTCTTGAGAGCATTCC
GGAGAGCGATGAGAGCAGCACGAGAGAGGGTATGAAGATGATGAATCAGCAAGAGTACTT
TGTTCCGTGGCATTCGCCTTACCACCGTGCTGAAGTCAGTGGGGCGTCTGCTTCTGCACT
TGCGAGTGGGCTTGCGAAGAAAGACGATAGGAAAGGAGCTGTTGTGTACAAGAGATACTA
CCACGTCTTCAGTGAAGGCGAACTTGAAAGGTTGGCATCTGGAGTAGGGAATGCAATGAT
AGTTGATAGATTTTACGACAAGTCCAATTGGTGTATCGTTCTTCAGAAAGAAGGTTTAAA
TAAAGATCACTGAAACCAGGCTCTTTGGCTTCAAAATCAGTTTTACCTTTTTCCCATCTT
TCTGAAACTGGAACACTCCATTGCAGTCACCACTGGAGGTTTTACCATATGTAATCCAAG
TTTTTTTTTTTCTTCTTATGGTTGTAGTTGAGATTCTGTGGCAGCTCATTTGTTGTGCAA
TTTCGTTCATTTGTATAACAAAAGAAAAGTGCATTTTTGCTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB79TF U 1
AF RR4CB79JQ C 108
BS 1 222 RR4CB79TF
BS 223 223 RR4CB79JQ
BS 224 455 RR4CB79TF
BS 456 456 RR4CB79JQ
BS 457 633 RR4CB79TF
BS 634 645 RR4CB79JQ

RD RR4CB79TF 633 0 0
GAGTCCGATGAATAGTCCTCGTCTGAGGAACAACCCGTGCTTTGGTCTTGAGAGCATTCC
GGAGAGTGATGTGAGCGTGAAGGAGCAGAAGGAGGATGAGAAGAGTCTTGAGAGCATTCC
GGAGAGCGATGAGAGCAGCACGAGAGAGGGTATGAAGATGATGAATCAGCAAGAGTACTT
TGTTCCGTGGCATTCGCCTTACCACCGTGCTGAAGTCAGTGGTGCGTCTGCTTCTGCACT
TGCGAGTGGGCTTGCGAAGAAAGACGATAGGAAAGGAGCTGTTGTGTACAAGAGATACTA
CCACGTCTTCAGTGAAGGCGAACTTGAAAGGTTGGCATCTGGAGTAGGGAATGCAATGAT
AGTTGATAGATTTTACGACAAGTCCAATTGGTGTATCGTTCTTCAGAAAGAAGGTTTAAA
TAAAGATCACTGAAACCAGGCTCTTTGGCTTCAAACTCAGTTTTACCTTTTTCCCATCTT
TCTGAAACTGGAACACTCCATTGCAGTCACCACTGGAGGTTTTACCATATGTAATCCAAG
TTTTTTTTTTTCTTCTTATGGTTGTAGTTGAGATTCTGTGGCAGCTCATTTGTTGTGCAA
TTTCGTTCATTTGTATAACAAAAGAAAAGTGCA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4CB79JQ 538 0 0
TTGAGAGCATTCCGGAGAGCGATGAGAGCAGCACGAGAGAGGGTATGAAGATGATGAATC
AGCAAGAGTACTTTGTTCCGTGGCATTCGCCTTACCCCCGTGCTGAAGTCAGTGGGGGGT
TTGCTTTTGCACTTGGGAGTGGGCTTGGGAAGAAAGACGATAGGAAAGGAGCTGTTGTGT
ACAAGAGATACTACCACGTTTTCAGTGAAGGCGAACTTGAAAGGTTGGCATTTGGAGTAG
GGAATGCAATGATAGTTGATAGATTTTACGACAAGTCCAATTGGTGTATCGTTTTTCAGA
AAGAAGGTTTAAATAAAGATCACTGAAACCAGGCTTTTTGGCTTCAAAATCAGTTTTACC
TTTTTCCCATTTTTTTGAAACTGGAACACTCCATTGCAGTCACCACTGGAGGTTTTACCA
TATGTAATCCAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTATGGTTGTAGTTGAGATTTTGTGGCAGCTC
ATTTGTTGTGCAATTTCGTTCATTTGTATAACAAAAGAAAAGTGCATTTTTGCTTCCT

QA 1 538 1 538
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8066Contig1 625 2 1 U
CAATTTCAATGGCGATTTCTCTCCCCACCTCCTATGTCTCTCCCCCTGAGTCGTGTTTCT
CCTTTTCATCCTCGTCGAAGCTATTTTCTCATTCATCCCTGCGCTTATCGTCTCAGATTC
GCCGCTTCGGTATCCGTCACGACAGAGTGAACTCGCCGTCGTCGTCTCGCTGCGCCCCAC
TCACTGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCTCAACTCTG
ACAAACCTTTACTTGTAGACTTTTATGCCACATGGTGTGGTCCATGCCAGCTTATGGTAC
CTATTCTCAATGATGTGAGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATA
CTGAAAAGTATCCAAAGGTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGGCTTTACCTACATTCATCT
TATTCAAAGACGGGAAACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTTGCCAGCGAACCAACTTG
TGGAACGGATCGAGACTTCATTGCAAGTGAAGCAATAGATATGATAAACTAAGAAAACTT
GTCATTCATGAACAAACAATCCGTTGTAACAAAACGTTCATTGTTGATTGCTACCTATTC
AATATATGGCATTAGCCATTTGAGG


BQ
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AF RR4B984JQ C 1
AF RR4B984TF U 1
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RD RR4B984JQ 625 0 0
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DS 

RD RR4B984TF 625 0 0
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TCACTGTTAGAGCAAAGAAGCAAACCTTCAACTCTTTTGATGATTTATTGCTCAACTCTG
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CTATTCTCAATGATGTGAGTGAAACTCTGAAAGATAAGATTACAGTTGTGAAAATCGATA
CTGAAAAGTATCCAAAGGTTGCCAACAAATACCAGGTTGAGGCTTTACCTACATTCATCT
TATTCAAAGACGGGAAACTCTGGGACCGTTTTGAGGGTGCCTTGCCAGCGAACCAACTTG
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AATATATGGCATTAGCCATTTGAGG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4E809TF U 1
AF RR4E809JQ C 79
BS 1 734 RR4E809TF
BS 735 753 RR4E809JQ

RD RR4E809TF 734 0 0
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TCTCTGTGGATTCGCCGAAGAGAGACGACATAGATCCGGTATGGCGAGTGATAACACGGG
CAGCGCGAAATCGAGCTCATCCTCTGCGGATTCATACGTGGGGAGCTTGATTAGTTTGAC
TTCCAAGAGTGAGATCAGATACGAAGGCATCCTTTACAACATCAACACCGATGAATCCAG
TATCGGTCTTCAAAACGTCCGATCATTTGGAACTGAAGGAAGGAAAAAAGACGGTCCTCA
AGTTCCTCCTAGTGACAAAGTTTATGAGTACATATTGTTCCGTGGTACTGATATCAAGGA
TTTGCAAGTCAAAGCTTCTCCTCCAGCTCAGCCTCCAGCTCCACCTACTCTTAACAATGA
CCCTGCTATCATTCAGTCTCACTACCCTAAAAGTTGTGCTAAGAGGATTTCTAAAAGACT
CTGGAATCCGATGGAGCTCATCATACTTTGAGTGCTTTTGGTATGTTGCAATAAAACAAA
ACACTTGAAGAGTCTTATGTAATGCATTTTGTTGTTAGAGAAACCCCACCTGTGTGGTTT
TCGAGTGTATCAATTTGATTTGCGATCTTTTGTTATAAAGACTTGGTACGACCGTCTTTC
AGTATTCAGTGACA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4E809JQ 675 0 0
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ATACGAAGGCATCCTTTACAACATCAACACCGATGAATCCAGTATCGGTCTTCAAAACGT
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AGTTTATGAGTACATATTGTTCCGTGGTACTGATATCAAGGATTTGCAAGTCAAAGCTTC
TCCTCCAGCTCAGCCTCCAGCTCCACCTACTCTTAACAATGACCCTGCTATCATTCAGTC
TCACTACCCTAAAAGTTGTGCTAAGAGGATTTCTAAAAGACTCTGGAATCCGATGGAGCT
CATCATACTTTGAGTGCTTTTGGTATGTTGCAATAAAACAAAACACTTGAAGAGTCTTAT
GTAATGCATTTTGTTGTTAGAGAAACCCCCCCTGTGTGGTTTTCGAGTGTATCAATTTGA
TTTGCGATCTTTTGTTATAAAGACTTGGTACGACCGTCTTTCAGTATTCAGTGACATTTC
CTTTTGTTTCTTTGT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL8068Contig1 1222 2 2 U
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TAGCGTCTCTACCGTATATTAAAAAGCTTGCTTCGGAACATGACATTCCCATTGTATCCT
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CTCGTTTGCCTACCAAATGGGGTCTTTTCCAAGCTTATTGCTATCGCTCAAAACTTGATG
GAGCCGAAAATATTGCCCTTGTTAAGGGAAACATTGGAAACGGTCAGGACATTCTGGTAA
GAGTGCATTCAGAGTGCTTAACCGGAGATATTTTCGGTTCAGCAAGGTGTGACTGTGGAA
ACCAGTTGGAGTTAGCCATGCAGCTAATCGAGAAAGAGGGAAGAGGTGTGGTTGTGTATC
TTAGGGGACACGAAGGAAGAGGCATTGGTCTTGGTCACAAGCTTAGAGCTTATAACTTGC
AAGACGAAGGACATGATACTGTACAGGCTAATCTTGAACTTGGTCTAGCCATTGATGCTC
GTGAATACGGTATTGGTGCTCAGATGCTTCGGGACATAGGAGTGAGAACAATGAGGCTGA
TGACGAATAATCCGGCGAAGTTCACAGGACTGAAAGGGTACGGACTGGCCGTAGTTGGGC
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ATTTTGATATTTATTTATGTTAATCGATTTAATTACATTGGCGGTACGCCTGTTTTATAT
CTATCTATCTATCTATATATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C396TF U 1
AF RR4C396JQ C 495
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BS 639 1222 RR4C396JQ

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TGGCTGGTTTACGTCCAGTCTCTGTTCTTTCAGCCATTCTTGATCAAGAAGATGGGTCAA
TAGCGTCTCTACCGTATATTAAAAAGCTTGCTTCGGAACATGACATTCCCATTGTATCCT
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CTCGTTTGCCTACCAAATGGGGTCTTTTCCAAGCTTATTGCTATCGCTCAAAACTTGATG
GAGCCGAAAATATTGCCCTTGTTAAGGGAAACATTGGA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4C396JQ 728 0 0
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GCCATGCAGCTAATCGAGAAAGAGGGAAGAGGTGTGGTTGTGTATCTTAGGGGACACGAA
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GATACTGTACAGGCTAATCTTGAACTTGGTCTAGCCATTGATGCTCGTGAATACGGTATT
GGTGCTCAGATGCTTCGGGACATAGGAGTGAGAACAATGAGGCTGATGACGAATAATCCG
GCGAAGTTCACAGGACTGAAAGGGTACGGACTGGCCGTAGTTGGGCGTGTGCCGGTGGTG
ACACCAATCACCAATGAGAACAGAAGATACATGGAGACCAAACGCAAGAAGATGGGTCAC
ATTTACATCTCTGATGATACTAATCAGCCTTTGGTTTGACCATAAGATTTTGATATTTAT
TTATGTTAATCGATTTAATTACATTGGCGGTACGCCTGTTTTATATCTATCTATCTATCT
ATATATAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TATGAAAGCACTATGTTGAGTTTTTCTCTGGTGATGGTTTGAGCTTATTTATGGGGTTTT
CCCATACATACAAACATTATTAACCAACAAAAAAAAAACACTATTACAAGTGTTTAACTA
GTGTTGATTTTTTTTTTAACTGGAACCGCATGTAACGGGTTTGCCTTGTGCAAACTAATA
CCAAAGGTTTCATCCATGTCCACGGTGATAGGAAGCTCCCAGTCAAAGGAGTAAAGAAGA
GAAACAAGCATAAGAGATACCGTCTTCACAGCCAAAGGCAATCCTGGACAAATTCTTCTT
CCTGCCCCAAACGGTATTAACTCATAATCTTTACCTTTCACATCAGTTTCTTTCCCCAAA
AACCTCTCAGGCTCGAACCGGGTCGGGTTCTCCCACACTTTCGGGTCTCGTCCTATGGCC
CATGCATTCACCAAAACTTGAGAATCTTTAGGCACAATGTATCCAAAAATCTCTACATCT
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TCTGCCATTGCCCATTCAAGGGTACTAGAGCTTGTGTCCGTGCCTGCTACAAACATATCC
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AAATCGCTGTTGGAAGCATCTTTTGGATTTTTCAGCAATGATTTTTCCGCTGTTTTAGTA
TCTATGAACCCTCGGAAAACCTTAAACAACCTCTCTGTAAA


BQ
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AF RR4CZ54JQ U 1
AF RR4B142JQ U 55
BS 1 157 RR4CZ54JQ
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RD RR4CZ54JQ 737 0 0
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TATGAAAGCACTATGTTGAGTTTTTCTCTGGTGATGGTTTGAGCTTATTTATGGGGTTTT
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GAAACAAGCATAAGAGATACCGTCTTCACAGCCAAAGGCAATCCTGGACAAATTCTTCTT
CCTGCCCCAAACGGTATTAACTCATAATCTTTACCTTTCACATCAGTTTCTTTCCCCAAA
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GCTTCGGCTTTCCGCGGAAGAAGAAGAGGAACAGCTGGGTGCAAACGGAGAGTTTCTTTC
AGAACCGCTTGTATATATGGAAAGTCTGACATATCAGGCTCTTGAACCAACCCGTCTTGG
TCTAGCATACGTTCGATCTCAGCCTGAGCTTTCACCATCGTTTTAGGGTTAGCAAGTAAC
TCTGCCATTGCCCATTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4B142JQ 887 0 0
AG
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AAGAGAAACAAGCATAAGAGATACCGTCTTCACAGCCAAAGGCAATCCTGGACAAATTCT
TCTTCCTGCCCCAAACGGTATTAACTCATAATCTTTACCTTTCACATCAGTTTCTTTCCC
CAAAAACCTCTCAGGCTCGAACCGGGTCGGGTTCTCCCACACTTTCGGGTCTCGTCCTAT
GGCCCATGCATTCACCAAAACTTGAGAATCTTTAGGCACAATGTATCCAAAAATCTCTAC
ATCTGCTTCGGCTTTCCGAGGAAGAAGAAGAGGAACAGCTGGGCGCAAACGGAGAGTTTC
TTTCAGAACCGCTTGTATATATGGAAAGTCTGACATATCAGGCTCTTGAACCAACCCGTC
TTGGTCTAGCATACGTTCGATCTCAGCCTGAGCTTTCACCATCGTTTTAGGGTTAGCAAG
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CAAAAAATCGCTGTTGGAAGCATCTTTTGGATTTTTCAGCAATGATTTTTCCGCTGTTTT
AGTATCTATGAACCCTCGGAAAACCTTAAACAACCTCTCTGTAAA

QA 3 887 3 887
DS 



AS 1 2

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GAAAAAATATTCACAAATAAGTAAAACATGATTTACATACAGAGACAAGAACTTCAAGGT
TAAAAAAAAACACAAATGTCCACAAAAAGTAAAGTAACCTAACTAAGCTCAGCGATGATG
AACGAGTACTGAACCACCCTCTAACCCGATTGTGAAGTAGATTTTCCTAGCGAGACCGAT
GCAAGTGCGTTCTTTGCACTCTCTTGGAAGTTCCTTGTTTTGGTGAGTCTCAGTTTAATC
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ATGATGGGGAAGATCAAAATCGCCAGTTTTAGAGACAGAAACATCAGTGCAAGTACCAAA
TATGGATCTCTTTCAGCTATTTCCCAGATAGATGACCCGTTGTGTAGCCATGTGATCAGG
TTACCATCGTTGTCCAGGCTTGTTGTTGGTTCACCTTCATCCACATAGTGGACAGGTTTA
AGACCTGTTGTACGTTGGTAAAACTGAATAAGGGAAGCAAGATCCTTCTTTTGACCATGG
TAACGCATCCTGAATGTTTGATTCGCCATGAGGATTGAAGGCAAGCTGTGGATACCATAC
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BQ
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BR20TF C 1
AF RR4BR20JQ U 7
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BS 7 460 RR4BR20JQ

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GAATTCATCTTGTGCCCACTGTTTCGAGCATCTGATCGATGATATTCAGTGAGACGGAGT
AGGCTGATTTTGTTTGTGGTGAGATGATTTGGAAGGAGCCAAAGCTTTGCTGTAGATCTG
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GCCGGTCGTACCCAAAGGCTTCGCCATTTTAATCCCCCCT

QA 1 460 1 460
DS 

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ATCTTGTGCCCACTGTTTCGAGCATCTGATCGATGATATTCAGTGAGACGGAGTAGGCTG
ATTTTGTTTGTGGTGAGATGATTTGGAAGGAGCCAAAGCTTTGCTGTAAATCTGCTCACC
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TTGGTAAGAAAGCATCGGATGCTTCCTCCATTCATCTCTTCGCCGGAAAAACTCGCCGGT
CGTACCCAAAGGCTTCGCCATTTTAATCCCCCCT

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H717TF U 1
AF RR4GX93TF U 1
BS 1 706 RR4GX93TF

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DS 

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QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL8075Contig1 739 2 2 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4FK03JQ C 1
AF RR4FK03TF U 1
BS 1 737 RR4FK03TF
BS 738 739 RR4FK03JQ

RD RR4FK03JQ 739 0 0
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TTGTTTCTTTAAGTAATGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4FK03TF 737 0 0
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TGTGTTCAAGTCCGGTATGGCCAAGTCCATTCACCACGCCCGTGTCCTTATCCGACAAAG
ACACATCAGAGTTGGGAGGCAACTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAAAGTAGACTC
GCAGAAACACATTGACTTTTCTCTGACTAGTCCATTTGGTGGTGGTCGACCTGGAAGAGT
GAAGAGAAGGAACGAGAGAGCTGGAGCCAAGAAAGCCGGTGGTGGTGGTGATGGAGACGA
GGATGATGAAGAGTGAAAGTACCAAACCTTTTAAAACCCTCCATTGTTAGATAAATAATG
TATTTGGAGTTGTTTTCTTGAACTAGATGAAGTCAAGTGTGTTGGTTTGTAATGGATTTA
GCCTTTTATGTGGTGTGTGTTTTGCAATAATGTGGTAGTGGACCTCTATGTTCTTGCTTG
AACAATGATGCCACTTTCAGATCTTGCTCCTCTACTCTGGTTTTACTTTTGTATTTGCTC
TTGTTTCTTTAAGTAAT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL8076Contig1 726 2 2 U
ATTTATTATTCTCATGAATCCACAAATATTAAACCAACCTGACTACTAATAAAAATTCGA
AATTTATGATATGTTTCTCTGTAAATCATATGTACATATAACTCTCAATGCCCATATGGA
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CTTTCATTCTGGCATAATCAATGTTACCAGCATAATCTGCTTCAGTGTTCGAGTGACTTC
CACCTTCTCTTGAACTTGGGTCAATCCAACGATTTATGTAAGACTTCTTCCACATATTCT
TTAGTCTTCCCTCTTTCTCATTGCTCATAACTATTCTCCCACTTTTTCCGTTATTTCTCC
ATCACTTGTACCACTCATTTTGTCTTTTAGCGATTGATATTCCTGTCGTAGTCGTGCCAA
CTCCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 10 

AF RR4FY79JQ U 1
AF RR4G819JQ U 1
BS 1 725 RR4FY79JQ
BS 726 726 RR4G819JQ

RD RR4FY79JQ 725 0 0
ATTTATTATTCTCATGAATCCACAAATATTAAACCAACCTGACTACTAATAAAAATTCGA
AATTTATGATATGTTTCTCTGTAAATCATATGTACATATAACTCTCAATGCCCATATGGA
ACTAAAGAATTGAGTTTCAGTTGTGTTGCACTTTCATTATCTCGGCTGCTAGAATAACAA
GCTCCACCATTTCAAATCCTGCAGCAGAAACAGAATCCGTCTTATCACAGCTTGATTCAC
CATCAGTAACTGATTCACTGACTGATTCAGCCGACCAGCTAATTGGTATGGAGATGCCAA
GAGCAGTCTTTAAATGGGTTGCCTCCACAAGGATGTTGGAAATCGCTACTTCGCAACTTC
TCGCAGATGTTTCAGTATCATTCATCTCCTTTACCTTCAAGAGCGCTAGACGAAGCCTGC
GGATTGAAGTAGTCAAGTGCCCCATGCTTTCAAGGCTCTCTTTTAAAGCTGCGTATTCTA
CTTTCATTCTGGCATAATCAATGTTACCAGCATAATCTGCTTCAGTGTTCGAGTGACTTC
CACCTTCTCTTGAACTTGGGTCAATCCAACGATTTATGTAAGACTTCTTCCACATATTCT
TTAGTCTTCCCTCTTTCTCATTGCTCATAACTATTCTCCCACTTTTTCCGTTATTTCTCC
ATCACTTGTACCACTCATTTTGTCTTTTAGCGATTGATATTCCTGTCGTAGTCGTGCCAA
CTCCA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4G819JQ 726 0 0
ATTTATTATTCTCATGAATCCACAAATATTAAACCAACCTGACTACTAATAAAAATTCGA
AATTTATGATATGTTTCTCTGTAAATCATATGTACATATAACTCTCAATGCCCATATGGA
ACTAAAGAATTGAGTTTCAGTTGTGTTGCACTTTCATTATCTCGGCTGCTAGAATAACAA
GCTCCACCATTTCAAATCCTGCAGCAGAAACAGAATCCGTCTTATCACAGCTTGATTCAC
CATCAGTAACTGATTCACTGACTGATTCAGCCGACCAGCTAATTGGTATGGAGATGCCAA
GAGCAGTCTTTAAATGGGTTGCCTCCACAAGGATGTTGGAAATCGCTACTTCGCAACTTC
TCGCAGATGTTTCAGTATCATTCATCTCCTTTACCTTCAAGAGCGCTAGACGAAGCCTGC
GGATTGAAGTAGTCAAGTGCCCCATGCTTTCAAGGCTCTCTTTTAAAGCTGCGTATTCTA
CTTTCATTCTGGCATAATCAATGTTACCAGCATAATCTGCTTCAGTGTTCGAGTGACTTC
CACCTTCTCTTGAACTTGGGTCAATCCAACGATTTATGTAAGACTTCTTCCACATATTCT
TTAGTCTTCCCTCTTTCTCATTGCTCATAACTATTCTCCCACTTTTTCCGTTATTTCTCC
ATCACTTGTACCACTCATTTTGTCTTTTAGCGATTGATATTCCTGTCGTAGTCGTGCCAA
CTCCAT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL8077Contig1 831 2 1 U
GGCACTTAAAAAAATATTCATTAGACGTCTATTAGGCTATTAGCTAACATAATAAACTTA
CAACAGTAGTACCACTCAATGAGTTGAGTTGTAGCATTAGACTTGGTAACATATACCAAA
TTCATCAATGACACAAGGGTGGATTTTACTTCTACACCCAAGACATGGGCAAAAAGAAAG
CTTCATAGAGGGTTCTACAGTTTAGTTTCTCAGTGTTAAAAGAGTTAAACTAAAGCTAAA
ACCAAAACCTAACACTAAACTAAATTTCACTTTGGAGACTTGCTGCTAACGTTACAGGTT
TTACCACTTCAATCGCTTCTGCATCCTTGAAGAAGATATGAGGCTTTGGTACGAACCTTT
GATGCAAAAGGCCGAAGATCGGTGCTATTGATCTGACTAAAACAGTTTCTGAGAAACACA
GCCCACATGTCTCTCAACACTGGCTTCTCCTCAGCCAATTTACTGGACAAGAGCCAGTTC
TCTGCCAAAACCAACAGCATGTAAGTTCTGAAAAGGTTGCAACTCTTCTCCTTCAGATTG
ATAGACATCAGCGAGCTCATCAACTTCTCGTCGCTCTCCTTATGATCAAGTAAAACAACA
AGCATTTGATTAGCGATGGTGCTTCTCAAATGCTTGCTTCGAGCATCAACACCTGATACA
GATTCCACTATCCTCAAACAGTTCATGTCTTGAGCTACTCTGGAAGCAAGAGAGTTTGCT
ATGTTCTTGCAGTTTGAAACCCATTCTCCCTCTTTGAGGATTCAGTAACAGATATCAAGC
ATTCTTGTAGAGAAGCGAAAGACTTGAAGACCGCGATCTAAGAGCAGCAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G231JQ U 1
AF RR4FS17JQ U 1
BS 1 831 RR4FS17JQ

RD RR4G231JQ 741 0 0
GGCACTTAAAAAAATATTCATTAGACGTCTATTAGGCTATTAGCTAACATAATAAACTTA
CAACAGTAGTACCACTCAATGAGTTGAGTTGTAGCATTAGACTTGGTAACATATACCAAA
TTCATCAATGACACAAGGGTGGATTTTACTTCTACACCCAAGACATGGGCAAAAAGAAAG
CTTCATAGAGGGTTCTACAGTTTAGTTTCTCAGTGTTAAAAGAGTTAAACTAAAGCTAAA
ACCAAAACCTAACACTAAACTAAATTTCACTTTGGAGACTTGCTGCTAACGTTACAGGTT
TTACCACTTCAATCGCTTCTGCATCCTTGAAGAAGATATGAGGCTTTGGTACGAACCTTT
GATGCAAAAGGCCGAAGATCGGTGCTATTGATCTGACTAAAACAGTTTCTGAGAAACACA
GCCCACATGTCTCTCAACACTGGCTTCTCCTCAGCCAATTTACTGGACAAGAGCCAGTTC
TCTGCCAAAACCAACAGCATGTAAGTTCTGAAAAGGTTGCAACTCTTCTCCTTCAGATTG
ATAGACATCAGCGAGCTCATCAACTTCTCGTCGCTCTCCTTATGATCAAGTAAAACAACA
AGCATTTGATTAGCGATGGTGCTTCTCAAATGCTTGCTTCGAGCATCAACACCTGATACA
GATTCCACTATCCTCAAACAGTTCATGTCTTGAGCTACTCTGGAAGCAAGAGAGTTTGCT
ATGTTCTTGCAGTTTGAAACC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4FS17JQ 831 0 0
GGCACTTAAAAAAATATTCATTAGACGTCTATTAGGCTATTAGCTAACATAATAAACTTA
CAACAGTAGTACCACTCAATGAGTTGAGTTGTAGCATTAGACTTGGTAACATATACCAAA
TTCATCAATGACACAAGGGTGGATTTTACTTCTACACCCAAGACATGGGCAAAAAGAAAG
CTTCATAGAGGGTTCTACAGTTTAGTTTCTCAGTGTTAAAAGAGTTAAACTAAAGCTAAA
ACCAAAACCTAACACTAAACTAAATTTCACTTTGGAGACTTGCTGCTAACGTTACAGGTT
TTACCACTTCAATCGCTTCTGCATCCTTGAAGAAGATATGAGGCTTTGGTACGAACCTTT
GATGCAAAAGGCCGAAGATCGGTGCTATTGATCTGACTAAAACAGTTTCTGAGAAACACA
GCCCACATGTCTCTCAACACTGGCTTCTCCTCAGCCAATTTACTGGACAAGAGCCAGTTC
TCTGCCAAAACCAACAGCATGTAAGTTCTGAAAAGGTTGCAACTCTTCTCCTTCAGATTG
ATAGACATCAGCGAGCTCATCAACTTCTCGTCGCTCTCCTTATGATCAAGTAAAACAACA
AGCATTTGATTAGCGATGGTGCTTCTCAAATGCTTGCTTCGAGCATCAACACCTGATACA
GATTCCACTATCCTCAAACAGTTCATGTCTTGAGCTACTCTGGAAGCAAGAGAGTTTGCT
ATGTTCTTGCAGTTTGAAACCCATTCTCCCTCTTTGAGGATTCAGTAACAGATATCAAGC
ATTCTTGTAGAGAAGCGAAAGACTTGAAGACCGCGATCTAAGAGCAGCAAC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL8078Contig1 638 2 1 U
GAACTCTGGGAGGCATACTGAGGCAGCAGAAGCTCTGTTTAACGCTGAAAAGATTTGCTA
CGTGCTTTACCCCGGAGACGACTCAAATGAAGGAAAGGCTCTTCGTCTGAAGCAGCAGTA
CACTCTGTGCTCAGCGTCGCTTCAAGATATCGTAGCACGCTTTGAGACAAGGTCTGGAGG
AAGCATCAACTGGGAAGAGTTTCCAAACAAGGTTGCAGTGCAGATGAATGACACTCACCC
TACCTTATGCATTCCTGAGCTGATGAGGATTCTAATGGATTTGAAAGGACTAAGCTGGGA
GGACGCTTGGAAAATCACACAGAGGACTGTGGCGTACACAAACCACACAGTCTTGCCTGA
GGCACTGGAGAAGTGGAGTTTAGACCTTATGGGGAAATTGCTACCTCGTCATGTGGAGAT
TATTGAAATGATTGATGAGGAGCTAGTCAGCACAATTGTTTCTGAGTATGGCACCGAGGA
TCCTGACTTGCTCGAGGAGAAACTGAAGGCGATGAGGATCTTAGAAAACGTCGAGTTGCC
TTCTGCTTTTGCAGATGTGATTGTGAAGCCAAAGAACAAACCAGTTGCTGCAAAAAAACA
CAAAAGATTCTAAAGAAGAAGATGCTCAAACTGTGGTG


BQ
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AF RR4FH14TF U 1
AF RR4FH14JQ C 111
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DS 

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CAAAAAAACACAAAAGATTCTAAAGAAGAAGATGCTCAAACTGTGGTG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A385TFB U 1
AF RR4A385TF U 1
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QA 1 652 1 652
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QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4E921TF U 1
AF RR4E921JQ C 353
BS 1 659 RR4E921TF

RD RR4E921TF 659 0 0
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TTACTACCCATCAAAGTTTGACCCCGTCCGCTGCGCAGAGAAGGTTCCTATCCCTAACAA
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CATCTAGAGTTTGCTTGTCTTTGGGAAAGGTACAAATCATGATCGATCCTTCATCACTCT
AAAAAAAATCCCTCAAAAGATATTTAATCCCATGTGTTGTTGTTTATATGTTTGTATAAT
AATAATGATGCTTTGTAATCCTTTTAAACCAATGTTTCCTTGGTATTTTTACTTGTCAAC
ATTGTAATCATGTCTTCATAATAAAAATCAATGAAAATAACGCAATACTACTTATTTCC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4E921JQ 307 0 0
TCTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCACTGGGACAGAAACTTGCAAGCCGTCTGAACGTG
AGGCCAAGCATCTAGAGTTTGCTTGTCTTTGGGAAAGGTACAAATCATGATCGATCCTTC
ATCACTCTAAAAAAAATCCCTCAAAAGATATTTAATCCCATGTGTTGTTGTTTATATGTT
TGTATAATAATAATGATGCTTTGTAATCCTTTTAAACCAATGTTTCCTTGGTATTTTTAC
TTGTCAACATTGTAATCATGTCTTCATAATAAAAATCAATGAAAATAACGCAATACTACT
TATTTCC

QA 1 307 1 307
DS 



AS 1 2

CO CL8081Contig1 1030 2 2 U
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CTTATGGGGTGGAGCTTGGTTGTATTACGCTACTGGAAATGTAACTTACCTTGATCATGT
TACAAGTCACGATATGGCTCGGAAAGCTGGTGCTTTCTCGAGTAGCCCTGACTATAGAGT
ACCTAGCTGGGACAACAAGCTTCCCGGAGCTCAGTTGTTGTTGACACGTTTGAGACTGTT
TCTGAGCCCTGGATATCCATATGAAGACATTTTGAACACCTTTCATAATCAAACCGGCGT
AGTTATGTGCTCTTACTTACCCTATTTCACAAGATTCAAAAGAACCAAGGGAGGTTTAAT
CATGTTGAACCATGGAGAACCACAGCCGCTTCAATATGCTGCTAACGCTGCTTTCTTGGC
CGCGCTATACAGTGATTATCTAGATGCTGCTGATGCTCCTGGATGGTACTGTGGTCCTAA
CTTCTACTCTACTCATGTCCTGCGTGATTTTGCTAGATCTCAGATTGATTACATACTTGG
TAAGAACCCTCAGCAGATGAGTTACGTTGTGGATTTTGGACAGAATTACCCTAAGCATGT
ACATCACAGAGGAGCTTCGATACCGAAAAGCGTAAAGAAAGAAAGCTGCAAAGGAGGCTG
GAGGTGGAGAGACACCAAAAGAGATGATCCAAACATCATTGTAGGAGCAATGGTTGTTGG
ACCTGACAAGCATGATGGGTTCCACGACCTTCGCTCAAACTACAACTACACTGAGCCTAC
TCTAGCGGGTAATGCCGGTCTGGTCGCAGCTCTGGTGGCTTTATCAGGAGGAGAAGAGAC
GTCTGCAGCTATTGACAAAAACACTATGTTTTCTGCCGTACCTCCTTTAACACCAGCCAC
ACCACCTCCTCCGGCACCTTGGACACCTTAGAGATAGAGAGAAAAAAACACTTAAGAAAA
AACTGAAAACTATTGAATGTAATAAGTCATATATTGTTGTTGCCTAAGTGAATAAATTAG
TTTCAAGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF51TF U 1
AF RR4DF51JQ C 290
BS 1 524 RR4DF51TF
BS 525 1030 RR4DF51JQ

RD RR4DF51TF 524 0 0
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CTTATGGGGTGGAGCTTGGTTGTATTACGCTACTGGAAATGTAACTTACCTTGATCATGT
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TCTGAGCCCTGGATATCCATATGAAGACATTTTGAACACCTTTCATAATCAAACCGGCGT
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CGCGCTATACAGTGATTATCTAGATGCTGCTGATGCTCCTGGATGGTACTGTGGTCCTAA
CTTCTACTCTACTCATGTCCTGCGTGATTTTGCTAGATCTCAGA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR4DF51JQ 741 0 0
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GCTTTCTTGGCCGCGCTATACAGTGATTATCTAGATGCTGCTGATGCTCCTGGATGGTAC
TGTGGTCCTAACTTCTACTCTACTCATGTCCTGCGTGATTTTGCTAGATCTCAGATTGAT
TACATACTTGGTAAGAACCCTCAGCAGATGAGTTACGTTGTGGATTTTGGACAGAATTAC
CCTAAGCATGTACATCACAGAGGAGCTTCGATACCGAAAAGCGTAAAGAAAGAAAGCTGC
AAAGGAGGCTGGAGGTGGAGAGACACCAAAAGAGATGATCCAAACATCATTGTAGGAGCA
ATGGTTGTTGGACCTGACAAGCATGATGGGTTCCACGACCTTCGCTCAAACTACAACTAC
ACTGAGCCTACTCTAGCGGGTAATGCCGGTCTGGTCGCAGCTCTGGTGGCTTTATCAGGA
GGAGAAGAGACGTCTGCAGCTATTGACAAAAACACTATGTTTTCTGCCGTACCTCCTTTA
ACACCAGCCACACCACCTCCTCCGGCACCTTGGACACCTTAGAGATAGAGAGAAAAAAAC
ACTTAAGAAAAAACTGAAAACTATTGAATGTAATAAGTCATATATTGTTGTTGCCTAAGT
GAATAAATTAGTTTCAAGCCT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL8082Contig1 707 2 2 U
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CTTGAAGTGGACAGCATCTAACAAGCGGAAAAGAACTGTCAGTTCCATGGGAGATTCTCT
GTTTAGCTCCTCGGCTGTTGGCCCAAGGAAGCGCAACCGTATAGTCAGTTGCCCCCCGCA
TGATCCTAGCTTGACTGATGGTTTCTCATGCGAAAAGTCATTGAGCTGTGAGAAGGGCGG
CAAGTTCATGGGAGATTCTGTATTTGGCTCGTCGGTTGGACAGCATTTGGCTGGCCTGTT
GATGTCAAGATGATGATTGGGGATTGGAGTGTGTCTCGTCTTGTGAGGTACATATTACCT
AATGTGCATCTGCTCAATGCGATTTTGGGTTTTTAGATCAGTGTGACTCGGGATTATAGG
GGTTTAGATCGCCATGGCATCCAGATTCGTTTTGTGTACGTATGTGTAACAGTAGACATA
GAGCGCTTCAATACAGGCAGCAAGTTTTGGATGCAGTAGAGAGTAGGTGATATTAGCATT
TTACCTTGCTAGGTTTTTTAGACACTAAACAGTGTGTTTTTAGAATTTTGATCATCTTCT
TCGTTTCTTCTTTAGCATAGAGATAAGATTTGTTTTCTTTCTTGGTGTGGGATCTTTCTT
TTTATGTAATATATGTATCATCAAATAAAACATCTCTCTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4D610TF U 1
AF RR4D610JQ C 75
BS 1 706 RR4D610TF
BS 707 707 RR4D610JQ

RD RR4D610TF 706 0 0
GAAGCCGTCTACTACTAAGCTACCAGTTCCAGATCTTCTAAAACACGTCTTAGTTTCTAA
CTTGAAGTGGACAGCATCTAACAAGCGGAAAAGAACTGTCAGTTCCATGGGAGATTCTCT
GTTTAGCTCCTCGGCTGTTGGCCCAAGGAAGCGCAACCGTATAGTCAGTTGCCCCCCGCA
TGATCCTAGCTTGACTGATGGTTTCTCATGCGAAAAGTCATTGAGCTGTGAGAAGGGCGG
CAAGTTCATGGGAGATTCTGTATTTGGCTCGTCGGTTGGACAGCATTTGGCTGGCCTGTT
GATGTCAAGATGATGATTGGGGATTGGAGTGTGTCTCGTCTTGTGAGGTACATATTACCT
AATGTGCATCTGCTCAATGCGATTTTGGGTTTTTAGATCAGTGTGACTCGGGATTATAGG
GGTTTAGATCGCCATGGCATCCAGATTCGTTTTGTGTACGTATGTGTAACAGTAGACATA
GAGCGCTTCAATACAGGCAGCAAGTTTTGGATGCAGTAGAGAGTAGGTGATATTAGCATT
TTACCTTGCTAGGTTTTTTAGACACTAAACAGTGTGTTTTTAGAATTTTGATCATCTTCT
TCGTTTCTTCTTTAGCATAGAGATAAGATTTGTTTTCTTTCTTGGTGTGGGATCTTTCTT
TTTATGTAATATATGTATCATCAAATAAAACATCTCTCTTTTTTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4D610JQ 633 0 0
CATCTAACAAGCGGAAAAGAACTGTCAGTTCCATGGGAGATTCTCTGTTTAGCTCCTCGG
CTGTTGGCCCAAGGAAGCGCAACCGTATAGTCAGTTGCCCCCCGCATGATCCTAGCTTGA
CTGATGGTTTCTCATGCGAAAAGTCATTGAGCTGTGAGAAGGGCGGCAAGTTCATGGGAG
ATTCTGTATTTGGCTCGTCGGTTGGACAGCATTTGGCTGGCCTGTTGATGTCAAGATGAT
GATTGGGGATTGGAGTGTGTCTCGTCTTGTGAGGTACATATTACCTAATGTGCATCTGCT
CAATGCGATTTTGGGTTTTTAGATCAGTGTGACTCGGGATTATAGGGGTTTAGATCGCCA
TGGCATCCAGATTCGTTTTGTGTACGTATGTGTAACAGTAGACATAGAGCGCTTCAATAC
AGGCAGCAAGTTTTGGATGCAGTAGAGAGTAGGTGATATTAGCATTTTACCTTGCTAGGT
TTTTTAGACACTAAACAGTGTGTTTTTAGAATTTTGATCATCTTCTTCGTTTCTTCTTTA
GCATAGAGATAAGATTTGTTTTCTTTCTTGGTGTGGGATCTTTCTTTTTATGTAATATAT
GTATCATCAAATAAAACATCTCTCTTTTTTTTT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL8083Contig1 621 2 1 U
GGAGCTTTCGAAAAGATCTAGATCGATTTCACCATTTTGCAGAAAGAAAAAAAAAACCTA
GAGAGGTGGTCGATCATGAAGTGTGGTCAAATTCGATCTGTGTTTTAAAAAACAAGTGAA
TTAGCAATGTCCAAGCCCATCATGCTCGTCTGTCTACTAGTTATACTTATAGTCACCTCT
CAGTTTGAATGGAGACAACCACTCGTTGACCTTGATTCACCCACCACCATTTCTCAGAAA
CAGCAGCAATTTTCAGACAAGGAAGAAGCTGTCAAAGAGAAGATCATCATATCGCAAGAG
AGACATATCCAGAAGCTAAATGAGCTTGTCAGGAGTCTTCAGTTGCAGTTGCTGCAATGC
AAGGGAGATAATGGGACCCAAAATGCCATCAAAAGCTTTCATTCAGATAAACAATTCATT
GAGGTCGAGAGGAAACAAATCTTTCAAGGCTAATCTCCCCTGCAAAAAATGAAATGATAC
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TCATATTGAGAAGGCTTTCCTGATACATTATAACGAGGCTGAAAAAAATTTAATATAAAA
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI47TF U 1
AF RR4AI47JQ C 192
BS 1 482 RR4AI47TF
BS 483 483 RR4AI47JQ
BS 484 827 RR4AI47TF
BS 828 928 RR4AI47JQ

RD RR4AI47TF 829 0 0
GTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG
TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCTGAATAG
GTTAACCTTTTGAACAATCTGCTTGGGATCTCTATCTGTATTGCCTTCGTCAGTCATGTT
CGTCTTCCTAATATCAAAACGTGTGCTATGCTCCTCGTGTGTCTCTTTGTGTATGACATC
TTCTGGGTTTTCTTCTCTGAGAGGTTCTTTGGTGCTAACGTTATGGTCTCCGTGGCTACT
CAAAAAGCGTCTAACCCGGTTCATACGGTAGCCAACAGTTTGAATCTTCCTGGACTGCAA
CTGATCACAAAGAAACTGGAGCTGCCGGTTAAAATAGTGTTTCCGAGGAACTTATTGGGC
GGTGTGGTGCCTGGTGTGAGTGCCTCGGAGTTCATGATGCTTGGTCTTGGTGACATGGCT
ATTCCTGCGATGCTTTTGGCTTTGGTTCTCTGCTTTGACTATCGGAAAAGTAGAGATGTG
GTGAATCTTTTTGATCTAAAATCTTCAAAGGGACACAAATACATATGGTATGCTCTTCCT
GGGTACGCCATTGGCTTGGTCTCGGCTCTAGCTGCAGGTGTCCTGACCCACTCACCTCAG
CCGGCTCTACTTTATCTGGTACCATCTACATTAGGACCGGTGATCTTCATGTCATGGCGT
AGAAAGGATCTTGCGGAGCTGTGGGATGGTCCAGCATTATCCAATCCCACTGAGAAATCT
CATGAAGTAGAGATCTGAGTTTATATAAATCAAAACATTGCTCAGCA
CA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR4AI47JQ 737 0 0
TATCAAAACGTGTGCTATGCTCCTCGTGTGTCTCTTTGTGTATGACATCTTCTGGGTTTT
CTTCTCTGAGAGGTTCTTTGGTGCTAACGTTATGGTCTCCGTGGCTACTCAAAAAGCGTC
TAACCCGGTTCATACGGTAGCCAACAGTTTGAATCTTCCTGGACTGCAACTGATCACAAA
GAAACTGGAGCTGCCGGTTAAAATAGTGTTTCCGAGGAACTTATTGGGCGGTGTGGTGCC
TGGTGTGAGTGCCTCGGAGTTCATGATGCTTGGTCTTGGTGACATGGCTATCCCTGCGAT
GCTTTTGGCTTTGGTTCTCTGCTTTGACTATCGGAAAAGTAGAGATGTGGTGAATCTTTT
TGATCTAAAATCTTCAAAGGGACACAAATACATATGGTATGCTCTTCCTGGGTACGCCAT
TGGCTTGGTCTCGGCTCTAGCTGCAGGTGTCCTGACCCACTCACCTCAGCCGGCTCTACT
TTATCTGGTACCATCTACATTAGGACCGGTGATCTTCATGTCATGGCGTAGAAAGGATCT
TGCGGAGCTGTGGGATGGTCCAGCATTATCCAATCCCACTGAGAAATCTCATGAAGTAGA
GATCTGAGTTTATATAAATCAAAACATTGCTCAGCAACAATTAAAAAGAAACACAGAGAC
GTTAGTAGAACGATAACAGATCAGGTGTTCTTGTATTCTCATGTAAAAAGAAAAAAATAA
CACAAGTATTATATCAC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL8087Contig1 804 2 2 U
GGATCTCTCTCGATCTCAAACCCAACCTAGCTCTCTCTCTCGAACCCAGTTCTCTCTCGA
TCTCTCGATCTCTTGAAACTCATCTCATCTCACTCTCTCGTAAGTTCTTTCCTTTTCTGG
GTTTTGTTTGCTTACTACTGTTTAGAATGCTAAGTGTTGTTTCTTGTCTATTGGATATCG
TTTTGTCTGAGAACCAAAGTGTTCTTGTCTTGATAAACAAGACTTCTTTGGGTCTCACGT
TAAGACCGTTTTATTTTTTCTTCTAGTGATCAGGAAGATGGACTTCTTAGGTTTCGTGGC
AATTACTAAACAAAATTATTTTAACAAAGTTCCAAATACATTATGTCCTGCATATTAATA
CAAATTAATTGCAACAACTATTATACATATGATAATCGTCTTTACTTATTAATCAATTTG
TTATATGTTTCCTCGTCTGACTATGAGTTTAAATGGTAGGTATAGCTTTTTTGTAGGTTG
ATAAAGTAATTTCCGCTGAAAACATAAAACGACAAAATAAAAATTAACAAGCAAAATTTT
AATCCATCTTCCATGTTTTAAATTTATAACTGGTTAGAAAACATGATTGACCTAATAAAT
ATTGGATTTTCCTGGTATGTTATCTATGTAACAGAGTAGTGGGATAACTGATTAGTGAAA
TAGCAAAATTAATTTGATTTTCCTGATATGTTATCTATGTAACAGAGTAGTGAGATAACT
GATTAGTGAAATAGCAAAATTAATTGGATTTCTTGTTTAAGAATAAGCATTGAGGAGCAG
CAACATTGATACAACATTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY84TF U 1
AF RR4GY84JQ C 31
BS 1 662 RR4GY84TF
BS 663 804 RR4GY84JQ

RD RR4GY84TF 662 0 0
GGATCTCTCTCGATCTCAAACCCAACCTAGCTCTCTCTCTCGAACCCAGTTCTCTCTCGA
TCTCTCGATCTCTTGAAACTCATCTCATCTCACTCTCTCGTAAGTTCTTTCCTTTTCTGG
GTTTTGTTTGCTTACTACTGTTTAGAATGCTAAGTGTTGTTTCTTGTCTATTGGATATCG
TTTTGTCTGAGAACCAAAGTGTTCTTGTCTTGATAAACAAGACTTCTTTGGGTCTCACGT
TAAGACCGTTTTATTTTTTCTTCTAGTGATCAGGAAGATGGACTTCTTAGGTTTCGTGGC
AATTACTAAACAAAATTATTTTAACAAAGTTCCAAATACATTATGTCCTGCATATTAATA
CAAATTAATTGCAACAACTATTATACATATGATAATCGTCTTTACTTATTAATCAATTTG
TTATATGTTTCCTCGTCTGACTATGAGTTTAAATGGTAGGTATAGCTTTTTTGTAGGTTG
ATAAAGTAATTTCCGCTGAAAACATAAAACGACAAAATAAAAATTAACAAGCAAAATTTT
AATCCATCTTCCATGTTTTAAATTTATAACTGGTTAGAAAACATGATTGACCTAATAAAT
ATTGGATTTTCCTGGTATGTTATCTATGTAACAGAGTAGTGGGATAACTGATTAGTGAAA
TA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4GY84JQ 774 0 0
CTCTCTCTCTCGAACCCAGTTCTCTCTCGATCTCTCGATCTCTTGAAACTCATCTCATCT
CACTCTCTCGTAAGTTCTTTCCTTTTCTGGGTTTTGTTTGCTTACTACTGTTTAGAATGC
TAAGTGTTGTTTCTTGTCTATTGGATATCGTTTTGTCTGAGAACCAAAGTGTTCTTGTCT
TGATAAACAAGACTTCTTTGGGTCTCACGTTAAGACCGTTTTATTTTTTCTTCTAGTGAT
CAGGAAGATGGACTTCTTAGGTTTCGTGGCAATTACTAAACAAAATTATTTTAACAAAGT
TCCAAATACATTATGTCCTGCATATTAATACAAATTAATTGCAACAACTATTATACATAT
GATAATCGTCTTTACTTATTAATCAATTTGTTATATGTTTCCTCGTCTGACTATGAGTTT
AAATGGTAGGTATAGCTTTTTTGTAGGTTGATAAAGTAATTTCCGCTGAAAACATAAAAC
GACAAAATAAAAATTAACAAGCAAAATTTTAATCCATCTTCCATGTTTTAAATTTATAAC
TGGTTAGAAAACATGATTGACCTAATAAATATTGGATTTTCCTGGTATGTTATCTATGTA
ACAGAGTAGTGGGATAACTGATTAGTGAAATAGCAAAATTAATTTGATTTTCCTGATATG
TTATCTATGTAACAGAGTAGTGAGATAACTGATTAGTGAAATAGCAAAATTAATTGGATT
TCTTGTTTAAGAATAAGCATTGAGGAGCAGCAACATTGATACAACATTTTCTCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL8088Contig1 782 2 2 U
GGCCTCTCAGTATGCTGATCCAAGATCGGACCCGGACTTCTGGAACAACTGGCACGAGTT
TGAGGTGTTGCATGGGAATGAAGACACGTATAGAGAGATGCTTAGGATCAAGAGAAGTGT
CTCCGCTAGTTACAGTCAGACTCATTTCATTCTGCCAGAGAACATGATGCTAAAGGACAA
GATAGATGTGGAGGAGGCGAAAGACGAGCTGAAGAAAGCGGGTTTTGATGAAATGGCGGC
TCTGGAGAGGCAGCTGATGGCTCCGATGTCTACCACGGTTACATCAAAAGATGGTGGAAG
GAGAGTTGGGTTTGTGAGCGCAGGAGTCATCGCACAGTCGGGTGAGAATGCAGGGAAACC
TGTGACAGGGAATGGGGAAGATATCGAGCTTCCAGATGAGAGTGATGAAGAGGAGTCTGA
TGGAGAAGACAATGTAGAGATTGCTCAGAAAGAAGTCCCTGCTGCTGTGTTTGGAGGACT
TGCCAGAAAGAGAGAGGAAGACGGCAAAGAAGCTGAGGAAGACGGTGCCGGCAAGGCTCT
GGGTGCGCTAGATAGGATAAAGAGACAGAAGCTAGCTCAGTGAATAAAAATCCTGTAAGA
CAAATATGACTCTTGTGCTACAGATTTGGAATTGTAATATCCAGAACAGGATCTTGGGAG
TGTCATGAGAATTTTTTGTACTTTTGCTTGTCTCAGTTCCACCATGTTTTTAGTTTACGG
CAGAGCTCTCTGTACTCTTTTTTTTTTTAATTTCCTTGGTCTTAATCAGAGTAACATTTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4EJ71TF U 1
AF RR4EJ71JQ C 8
BS 1 639 RR4EJ71TF
BS 640 782 RR4EJ71JQ

RD RR4EJ71TF 639 0 0
GGCCTCTCAGTATGCTGATCCAAGATCGGACCCGGACTTCTGGAACAACTGGCACGAGTT
TGAGGTGTTGCATGGGAATGAAGACACGTATAGAGAGATGCTTAGGATCAAGAGAAGTGT
CTCCGCTAGTTACAGTCAGACTCATTTCATTCTGCCAGAGAACATGATGCTAAAGGACAA
GATAGATGTGGAGGAGGCGAAAGACGAGCTGAAGAAAGCGGGTTTTGATGAAATGGCGGC
TCTGGAGAGGCAGCTGATGGCTCCGATGTCTACCACGGTTACATCAAAAGATGGTGGAAG
GAGAGTTGGGTTTGTGAGCGCAGGAGTCATCGCACAGTCGGGTGAGAATGCAGGGAAACC
TGTGACAGGGAATGGGGAAGATATCGAGCTTCCAGATGAGAGTGATGAAGAGGAGTCTGA
TGGAGAAGACAATGTAGAGATTGCTCAGAAAGAAGTCCCTGCTGCTGTGTTTGGAGGACT
TGCCAGAAAGAGAGAGGAAGACGGCAAAGAAGCTGAGGAAGACGGTGCCGGCAAGGCTCT
GGGTGCGCTAGATAGGATAAAGAGACAGAAGCTAGCTCAGTGAATAAAAATCCTGTAAGA
CAAATATGACTCTTGTGCTACAGATTTGGAATTGTAATA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4EJ71JQ 775 0 0
CAGTATGCTGATCCAAGATCGGACCCGGACTTCTGGAACAACTGGCACGAGTTTGAGGTG
TTGCATGGGAATGAAGACACGTATAGAGAGATGCTTAGGATCAAGAGAAGTGTCTCCGCT
AGTTACAGTCAGACTCATTTCATTCTGCCAGAGAACATGATGCTAAAGGACAAGATAGAT
GTGGAGGAGGCGAAAGACGAGCTGAAGAAAGCGGGTTTTGATGAAATGGCGGCTCTGGAG
AGGCAGCTGATGGCTCCGATGTCTACCACGGTTACATCAAAAGATGGTGGAAGGAGAGTT
GGGTTTGTGAGCGCAGGAGTCATCGCACAGTCGGGTGAGAATGCAGGGAAACCTGTGACA
GGGAATGGGGAAGATATCGAGCTTCCAGATGAGAGTGATGAAGAGGAGTCTGATGGAGAA
GACAATGTAGAGATTGCTCAGAAAGAAGTCCCTGCTGCTGTGTTTGGAGGACTTGCCAGA
AAGAGAGAGGAAGACGGCAAAGAAGCTGAGGAAGACGGTGCCGGCAAGGCTCTGGGTGCG
CTAGATAGGATAAAGAGACAGAAGCTAGCTCAGTGAATAAAAATCCTGTAAGACAAATAT
GACTCTTGTGCTACAGATTTGGAATTGTAATATCCAGAACAGGATCTTGGGAGTGTCATG
AGAATTTTTTGTACTTTTGCTTGTCTCAGTTCCACCATGTTTTTAGTTTACGGCAGAGCT
CTCTGTACTCTTTTTTTTTTTAATTTCCTTGGTCTTAATCAGAGTAACATTTTCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL8089Contig1 632 2 1 U
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CACCAAGCACGTTTGAGAACCTTCACAACTACTTGCAGAATCAAGCCTCAAGTCCCAGGA
ACGGGAGAATTAGGTTCCATTTGGTACCCGGATGATGATGTTGATCCCTGTTACAAAGTT
GATTTGCCTAATTGGCTACAAGATGATGTACTTACAGGAGAGGATAAGCTTCGATTTTAT
GAGGTGAAAGATTGGGAGCTGAAAGACAACCAGTGGCTTTATCTATACGCTGAGTTTGCA
TTGTTCTCCTATTTCGAGGATGACCTGAGCGATTATATGCCATTTGAGATGAGGAAAGTA
GTGGTGCAAACCAAGGAAGATATGAAGCTCAAGTCGGGCAATGCAATCCTCTTCCTGAGT
TTCAAGACCCGTGCTGGTCAGGAGTGCAGAGGTATCGTAAGGAGAACTACCGATGGAAAA
CCTGGGCACATGTGCCTTGAAGCTAGGTGTTGGATCGACAAGTAGAGTTGCTGGTTCTCT
CTTTCATTAGCTAATCTCTACTCTATGAGTCGATCAATACTTTTTATTTCCTTGTTATCT
ACTACTCTACTTATAAGTTATGCCTTTTGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AJ38JQ C 1
AF RR4AJ38TF U 1
BS 1 632 RR4AJ38TF

RD RR4AJ38JQ 632 0 0
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GAGGTGAAAGATTGGGAGCTGAAAGACAACCAGTGGCTTTATCTATACGCTGAGTTTGCA
TTGTTCTCCTATTTCGAGGATGACCTGAGCGATTATATGCCATTTGAGATGAGGAAAGTA
GTGGTGCAAACCAAGGAAGATATGAAGCTCAAGTCGGGCAATGCAATCCTCTTCCTGAGT
TTCAAGACCCGTGCTGGTCAGGAGTGCAGAGGTATCGTAAGGAGAACTACCGATGGAAAA
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CTTTCATTAGCTAATCTCTACTCTATGAGTCGATCAATACTTTTTATTTCCTTGTTATCT
ACTACTCTACTTATAAGTTATGCCTTTTGACT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4AJ38TF 632 0 0
CCTGCCCACGACGACTCACCTGTTACTTTCCAGACCTGTGTCACCGATACTGTGCTCATG
CACCAAGCACGTTTGAGAACCTTCACAACTACTTGCAGAATCAAGCCTCAAGTCCCAGGA
ACGGGAGAATTAGGTTCCATTTGGTACCCGGATGATGATGTTGATCCCTGTTACAAAGTT
GATTTGCCTAATTGGCTACAAGATGATGTACTTACAGGAGAGGATAAGCTTCGATTTTAT
GAGGTGAAAGATTGGGAGCTGAAAGACAACCAGTGGCTTTATCTATACGCTGAGTTTGCA
TTGTTCTCCTATTTCGAGGATGACCTGAGCGATTATATGCCATTTGAGATGAGGAAAGTA
GTGGTGCAAACCAAGGAAGATATGAAGCTCAAGTCGGGCAATGCAATCCTCTTCCTGAGT
TTCAAGACCCGTGCTGGTCAGGAGTGCAGAGGTATCGTAAGGAGAACTACCGATGGAAAA
CCTGGGCACATGTGCCTTGAAGCTAGGTGTTGGATCGACAAGTAGAGTTGCTGGTTCTCT
CTTTCATTAGCTAATCTCTACTCTATGAGTCGATCAATACTTTTTATTTCCTTGTTATCT
ACTACTCTACTTATAAGTTATGCCTTTTGACT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL8090Contig1 775 2 3 U
TTTTTAAAGCTCGATATTATTTTTCTCATTTGTCTGAATTTCACAAGCACAATTACACAT
GAAACATAATAACTCTCTTTAATTTTCAACACATTATTTTCCCTGAACAAAGCCAAAATG
CTAACCAGAAAAAATGATAAGTCAGACTCTAAAAAAAACCCTAAAACCTAAGATTGCCGG
GCTGAGTCACCCTGACATGACTCAAAGCTCTGAATCCCCCTGCCGTAACGATAGCTGTCA
TCTTCCTACGTTATAACTAAACGCGCAATTGTGAACCAGGAGGTGAGTTTTGTGAAGAAG
AAGGAAAAAAAGAGAGTTGCAACTTCTCTCATGATGGGGTTTCTTTACATAGAAAGTGGA
AGAAGCATCCTTCGCTTCTTCTTCCAGGCAGATCTCACCTGCTTAGTGACCTTCATGCAA
ACAAGAAGTAGCAAAGTGACGCAAACCAAGATGAAGGCGAGCTGCAATCGTTTGAAGTAC
AAGGAAACGGCAGAGAAGACTAAGAAGGCTAAGATGATTAGCTCCCAGATGACAAACACT
ACAACATCCACCCTAGACGAAGAAAAGCTCGAGGTTGACGAGAAGAAGGAGACGGACGCC
CAATCGTGCTTAGATCGAATCTGGTATTCCCTCAGCTGCTCCGCCAGATTCGATCTTGTT
ATCATCGCTTCGCTTACAATCCTCTTCTCTTCTCTCACTCGATTGATACTCGAGATGGAA
GATCGAATTCGAAATTGATGAATCCAACAAACCAACTCTCTGTGGATTCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB14JQ U 5
AF RR4FB14TF C 1
BS 1 10 RR4FB14TF
BS 11 672 RR4FB14JQ
BS 673 775 RR4FB14TF

RD RR4FB14JQ 668 0 0
AAAGCT
TCGATATTATTTTTCTCATTTGTCTGAATTTCACAAGCACAATTACACATGAAACATAAT
AACTCTCTTTAATTTTCAACACATTATTTTCCCTGAACAAAGCCAAAATGCTAACCAGAA
AAAATGATAAGTCAGACTCTAAAAAAAACCCTAAAACCTAAGATTGCCGGGCTGAGTCAC
CCTGACATGACTCAAAGCTCTGAATCCCCCTGCCGTAACGATAGCTGTCATCTTCCTACG
TTATAACTAAACGCGCAATTGTGAACCAGGAGGTGAGTTTTGTGAAGAAGAAGGAAAAAA
AGAGAGTTGCAACTTCTCTCATGATGGGGTTTCTTTACATAGAAAGTGGAAGAAGCATCC
TTCGCTTCTTCTTCCAGGCAGATCTCACCTGCTTAGTGACCTTCATGCAAACAAGAAGTA
GCAAAGTGACGCAAACCAAGATGAAGGCGAGCTGCAATCGTTTGAAGTACAAGGAAACGG
CAGAGAAGACTAAGAAGGCTAAGATGATTAGCTCCCAGATGACAAACACTACAACATCCA
CCCTAGACGAAGAAAAGCTCGAGGTTGACGAGAAGAAGGAGACGGACGCCCAATCGTGCT
TAGATCGAATCTGGTATTCCCTCAGCTGCTCCGCCAGATTCGATCTTGTTATCATCGCTT
CG

QA 7 668 7 668
DS 

RD RR4FB14TF 775 0 0
TTTTTAAAGCTCGATATTATTTT*CTCATTTGTCTGA*TTTCACAAGCACAATTACACAT
GAAACATAATA*CTCTCTTTAATTT*CAACACAT*ATTTTCC*TGAACAAAGCCAAAATG
CTAACCAGAAAAAATGATAAGTCAGACTCTAAAAAAA*CCCTAAAACCTAAGATTGCCGG
GCTGAGTCACCCTGACATGACTCAAAGCTCTGAATCCCCCTGCCGTAACGATAGCTGTCA
TCTTCCTACGTTATAACTAAACGCGCAATTGTGAACCAGGAGGTGAGTTTTGTGAAGAAG
AAGGAAAAAAAGAGAGTTGCAACTTCTCTCATGATGGGGTTTCTTTACATAGAAAGTGGA
AGAAGCATCCTTCGCTTCTTCTTCCAGGCAGATCTCACCTGCTTAGTGACCTTCATGCAA
ACAAGAAGTAGCAAAGTGACGCAAACCAAGATGAAGGCGAGCTGCAATCGTTTGAAGTAC
AAGGAAACGGCAGAGAAGACTAAGAAGGCTAAGATGATTAGCTCCCAGATGACAAACACT
ACAACATCCACCCTAGACGAAGAAAAGCTCGAGGTTGACGAGAAGAAGGAGACGGACGCC
CAATCGTGCTTAGATCGAATCTGGTATTCCCTCAGCTGCTCCGCCAGATTCGATCTTGTT
ATCATCGCTTCGCTTACAATCCTCTTCTCTTCTCTCACTCGATTGATACTCGAGATGGAA
GATCGAATTCGAAATTGATGAATCCAACAAACCAACTCTCTGTGGATTCAAAAAA

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL8091Contig1 1094 2 6 U
GGAGCTTTACAGTAAAAAAAACAAAAAAAAAACCCTAAGTCTCTCTCTCCGGTCTGGATC
GCAACCTGAGAGTAGTAGTCTACTCGTTTCTTTCGCAATGGCAGAGTCTCCTCTAAAAGA
AAGAGATTCTCGATCTCCTTCACCACGAAAACAACGGTCCCTTTCTAGGTCCAGATCCAG
ATCCATGCCGAGGTCCAGGTCCAGGTCCAGATCCAGATCTTTGCCAAGGGCTAGGTCTAA
GTCTAGATCTTTGCCAAGGGCTAGGTCTAGGTCTAGGTCAAGATCTTTGCCAAGGCATAT
ATCTCCATCAAGAACCCGTGGAAGGTCTGAAGTTGAAAACCCTGGTACCACTCTCTATGT
GACTGGCCTATCCACAAGAGTCACTGACAAGGATCTTGAATCACATTTCTCCAAGGAAGG
CAAGGTATCTTCTTGCTTTCTAGTAATAGAGCCGCGCACCCGCGAGTCTCGTGGTTTTGC
CTTTGCTACAATGGATACCCTTAAAGACGCTGACCGTTGCATCAAGTATCTCAACCAATC
TGTACTTGAAGGCCGTTACATCACTGTCGAAAGGTCTCGAAAAGCGTCCCAGAACTCCCA
CCCCAGGCCACTATCTTGGCTTGAAAAGCTCCAGAGACAATGACCGAGATGGCCGTAGCA
GTCGAGGGAGACATTATGATCGTGATGATTATGGACACCGTAGGTCACCAAGACGTGACT
ATTCACCTCGTGGTGGTGGTGGAAGGAGGTCACCAAGACGTGAGTATTCACCTCGTGGTG
GTGGTGGAAGAAGTTTTAGAAGAGATCGATCTTACTCTCCTTATGGAAGAAGAAGCCCAG
AGAGAAGGTTTGAGAGAAGGTATTAACCCTGTCTGTGGTGGCTCGAGATGACCTGTTTTA
GCTCTGTTGACAAAAAAAACTTCATTGTTGATTTTAGGTTGTGTGATTGATCTTCTTTAA
AGTATTACAGAGATTTTGTTTGATGACAAACTATGATTCTATGTGTCTTTTTATCTTATG
TATGCCGCGGAACGAAGTGAAACTTGCAATGTATGCTACTTTTGTTATTTGAGTGAATCA
GAATCTCCTATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DQ76TF U 1
AF RR4DQ76JQ C 331
BS 1 703 RR4DQ76TF
BS 704 704 RR4DQ76JQ
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BS 712 728 RR4DQ76TF
BS 729 1094 RR4DQ76JQ

RD RR4DQ76TF 728 0 0
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AAGAGATTCTCGATCTCCTTCACCACGAAAACAACGGTCCCTTTCTAGGTCCAGATCCAG
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GTCTAGATCTTTGCCAAGGGCTAGGTCTAGGTCTAGGTCAAGATCTTTGCCAAGGCATAT
ATCTCCATCAAGAACCCGTGGAAGGTCTGAAGTTGAAAACCCTGGTACCACTCTCTATGT
GACTGGCCTATCCACAAGAGTCACTGACAAGGATCTTGAATCACATTTCTCCAAGGAAGG
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CTTTGCTACAATGGATACCCTTAAAGACGCTGACCGTTGCATCAAGTATCTCAACCAATC
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GTCGAGGGAGACATTATGATCGTGATGATTATGGACACCGTAG*TCACCA*GACGTGACT
ATTCACCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4DQ76JQ 764 0 0
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AAGGTCTCGAAAAGCGTCCCAGAACTCCCACCCCAGGCCACTATCTTGGCTTGAAAAGCT
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ATGGACACCGTAGGTCACCAAGACGTGACTATTCACCTCGTGGTGGTGGTGGAAGGAGGT
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CTTACTCTCCTTATGGAAGAAGAAGCCCAGAGAGAAGGTTTGAGAGAAGGTATTAACCCT
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CTATGATTCTATGTGTCTTTTTATCTTATGTATGCCGCGGAACGAAGTGAAACTTGCAAT
GTATGCTACTTTTGTTATTTGAGTGAATCAGAATCTCCTATGCG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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ATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGAAAGATGC


BQ
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AF RR4FI08JQ C 1
AF RR4FI08TF U 1
BS 1 632 RR4FI08TF

RD RR4FI08JQ 632 0 0
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TTTGTTAACCGTGTGAAGCAATTGATATACACATTTCCTGAAGATGCTGCGGCAAGTACC
GGATCTCCATTCTGGTCTGCTCCAAAAAGATTCCCACGTCCGCTCCAGTACTCCTCTTCC
GACCCAAGCCTCCTTAACTTCATCACGGCTACTGCTATTTTAAGAGCAGAGACATTTGGG
ATCCCTGTGCCTGAGTGGACCAAAAACCCAAAGGAAGCAGCTGAAGCTATCGACAGAGTG
ATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGAAAGATGC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4FI08TF 632 0 0
GGGACTCTTGGTGCAAAGTGCAACACACAGATGGTTATCCCACATCTAACTGAAAATTAC
GGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAGCAAGCTCCCATGTGTACAGTGCACTCGTTTCCG
CATAACATTGATCACCGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAGGGTCTGCTTGAGAAG
ACTCCCGCTGAAGTGAATGCATATCTTTCTAGCCCGGTTGAGTACACTAACTCAATGATG
AGTGCAGGCGATGCTCAGGCAAGGGACACATTGGAGAGGATCGTTGAGTGCCTTGAAAAG
GAGAAGTGTGAGGACTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCCCGACTCAGGTTTGAGGATTAC
TTTGTTAACCGTGTGAAGCAATTGATATACACATTTCCTGAAGATGCTGCGGCAAGTACC
GGATCTCCATTCTGGTCTGCTCCAAAAAGATTCCCACGTCCGCTCCAGTACTCCTCTTCC
GACCCAAGCCTCCTTAACTTCATCACGGCTACTGCTATTTTAAGAGCAGAGACATTTGGG
ATCCCTGTGCCTGAGTGGACCAAAAACCCAAAGGAAGCAGCTGAAGCTATCGACAGAGTG
ATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGAAAGATGC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL8093Contig1 714 2 3 U
TTTTTTTTTGTATTGATAAGTTCCTTACATTAACTTAGTGTTGAGAACAGATATCACAGA
GAAATTATGTTTCACTTAAAACTCTCAAAGTCTATTTGCATAGAATTCAACTCATATGAA
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TAATGGGACACAACCTGATAGAGAATGTGTATGGTTCTGGTGGAATCAGATACTTATCAT
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CCTCAATGCTTTGTCCTTTGATAAGATCCTCTTCATGCGTTGCACGATCAAGCTCATCGG
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TTCCCACACCCTCTTTGTTTGTGAATGTCACCCACCTAACATCTGTTCTACCCCCACATT
CTCCTGGAACAATATAAGGTACATGCATGTCCGCAACGTTGTGTTCATATATCCCCACAT
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GGTCCAGTGTATTCTCAAGGTGAAACTCTACACCAACCCGTGGTAGCGGTGGAAGATCAG
AGTTTGGGACTACATACCAATTGGTGATGATATCTCCGGAACCATAGATCATCC


BQ
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AF RR4G419TF C 1
AF RR4G419JQ U 10
BS 1 9 RR4G419TF
BS 10 661 RR4G419JQ
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TAATGGGACACAACCTGATAGAGAATGTGTATGGTTCTGGTGGAATCAGATACTTATCAT
GAACACAAGGGGTCCAGCTATCATCTCCTCCAATACCCATATGTTTATGGTCCAGATGCA
CCTCAATGCTTTGTCCTTTGATAAGATCCTCTTCATGCGTTGCACGATCAAGCTCATCGG
TTGTGTAATAGCTAGCATTCATCTGCATTGGAGAAGAGCTACCATATGTTGAAGCATATA
TTCCCACACCCTCTTTGTTTGTGAATGTCACCCACCTAACATCTGTTCTACCCCCACATT
CTCCTGGAACAATATAAGGTACATGCATGTCCGCAACGTTGTGTTCATATATCCCCACAT
GGGCTGCTGATTTTCGGTCTGGGTAACACTCAAATGGACCTCTTCCATACCATTCCACAC
GGTCCAGTGTATTCTCAAGGTGAAACTCTACACCAACCCGTGGTAGCGGTGGAAGATCAG
AGTTTGGGACTACATACCAATTGGTGATGATATCTCCGGAACCATAGATCATCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4G419JQ 652 0 0
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TTTCACTTAAAACTCTCAAAGTCTATTTGCATAGAATTCAACTCATATGAAAGAAGAGAT
TCTAGCAGGGAAGCTGATCCTTGTACATGTCCAAGACCGAACTCGCTGCGGTAATGGGAC
ACAACCTGATAGAGAATGTGTATGGTTCTGGTGGAATCAGATACTTATCATGAACACAAG
GGGTCCAGCTATCATCTCCTCCAATACCCATATGTTTATGGTCCAGATGCACCTCAATGC
TTTGTCCTTTGATAAGATCCTCTTCATGCGTTGCACGATCAAGCTCATCGGTTGTGTAAT
AGCTAGCATTCATCTGCATTGGAGAAGAGCTACCATATGTTGAAGCATATATTCCCACAC
CCTCTTTGTTTGTGAATGTCACCCACCTAACATCTGTTCTACCCCCACATTCTCCTGGAA
CAATATAAGGTACATGCATGTCCGCAACGTTGTGTTCATATATCCCCACATGGGCTGCTG
ATTTTCGGTCTGGGTAACACTCAAATGGACCTCTTCCATACCATTCCACACGGTCCAGTG
TATTCTCAAGGTGAAACTCTACACCAACCCGTGGTAGCGGTGGAAGATCAGA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

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AGAGAGACAACAACAGCCCTTAAAGCAGTTGAAACGAGGAAGACGAGTAAAAACAGAACA
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AAAAAAAAAAAAAAGAATGTCGTTCCGTAGCATAGTACGCGATGTGATCAAAAGGCTGGA
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GCTCATGGAGAGATATGTGCAAAGAGATTGTTCAGAGGCCCGAGCTTTCAGGAAAAATCA
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AAAGAGATAAGTCTAATCTGACTTACCATCTATACCTTTGTCTCAGTCCTGCTTTGTTGG
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ACGTCATCTCTATGCATGCAGACACCATTTCAAGAACTTTCAGCTTATTGCAGCAAACCA
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GTTGCAGTTTGGGAAAGTGGGGAAAGACATGTTCACGATGGACTTCAGGTATCCGCTGTC
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ATAGAAGAAGAAGTCAGCTTTGTATGTAATATATATATATCACATGTGGTTTGTATGATT
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AAAAGATAGTTCCTCC


BQ
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AF RR4FE74TF U 1
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BS 1 609 RR4FE74TF
BS 610 976 RR4FE74JQ

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AAAAAAAAAAAAAAGAATGTCGTTCCGTAGCATAGTACGCGATGTGATCAAAAGGCTGGA
AGAGAGCGAAAGCGTGTGGCCTGCAAGGAAACATGTGGTTGCTTGTGCTTCTGTTTGCGG
GCTCATGGAGAGATATGTGCAAAGAGATTGTTCAGAGGCCCGAGCTTTCAGGAAAAATCA
CATTTCCTGTTTCGCTTAAACAGCCTGGACCAAGAGATGCAACAATGCAATGCTTTATCA
AAAGAGATAAGTCTAATCTGACTTACCATCTATACCTTTGTCTCAGTCCTGCTTTGTTGG
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ACGTCATCTCTATGCATGCAGACACCATTTCAAGAACTTTCAGCTTATTGCAGCAAACCA
ATCACAGGT

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DS 

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TCTTTCGGCGAAACGCATAAGAAGAACCACTTACACAGAGTACGTCATCTCTATGCATGC
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GCTCAGGGGTCTGGCCAGGCTGATGGTCCGGACAAGATCTTGTTGCAGTTTGGGAAAGTG
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ATATGTTTGAGCAGTTTCGATACCAAACTCGCATGCGAATGATAGAAGAAGAAGTCAGCT
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GTCATTTATTACGTTCTGCTTATGTTGTTTATTAATGCATCAAAAGATAGTTCCTCC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

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ACAATGTTACCTCCCACGTCCGGGAACGCCTCACTCCCAGGTAATGGTCGGACTTTGCCT
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GCTGCAAACTGTTCCCAGTTCCTCTCCCCCATTGTTCTCACTTTCCTTACACATTCTATA
CTCTCTGGTTGCGTGAAGCAGTCATCTAACGTTGCCATATGCTCTGCCCACAGCGACATT
CTGTATCCATATATCTGACCCCTTGGACCAGATTGTTTCCTTGCCCATGTATGCTGTGGC
TGATATGCTCCCATTGCAATCTCTGTATCTCTTGTGCCTTCCATTGATCGTTGGTTTATA
TTTGCCGATCCAATTACTACGTATTCATCATCTACGACCATCCCTTTCGAGTGAACATAG
ATCATAAATCTTCTGCTTTTCCGACTCAATGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E896JQ U 1
AF RR4DP42JQ U 1
BS 1 693 RR4DP42JQ

RD RR4E896JQ 652 0 0
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ACAATGTTACCTCCCACGTCCGGGAACGCCTCACTCCCAGGTAATGGTCGGACTTTGCCT
TTCCGATCCACTTCCACTGGATACTTTAACAGATGTCCTCTCATGTCTGAAACTTCTTCG
GCTGCAAACTGTTCCCAGTTCCTCTCCCCCATTGTTCTCACTTTCCTTACACATTCTATA
CTCTCTGGTTGCGTGAAGCAGTCATCTAACGTTGCCATATGCTCTGCCCACAGCGACATT
CTGTATCCATATATCTGACCCCTTGGACCAGATTGTTTCCTTGCCCATGTATGCTGTGGC
TGATATGCTCCCATTGCAATCTCTGTATCTCTTGTGCCTTCCATTGATCGTTGGTTTATA
TTTGCCGATCCAATTACTACGTATTCATCATCTACGACCATCCCTTTCGAGT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4DP42JQ 693 0 0
GGTATAGGTGTGTCCTTTATTGATGAAACTCGAAACTTGGTGGAAGAAACTTCAAATACA
TTAACCAGTTCGTACACCACAAATATGAATTATTTTTATACTTTATATACCCCCAACCAA
TGTGTAAAAGTTAAATCATCAACCAATTTTCAACTCTCAATAAATAAAATATCCACAACC
ACTGGTTCAGTATTTGTATGTCAAATGGTTAGATTCTCCTGGATGGCTATGAACGATCCG
ACAATGTTACCTCCCACGTCCGGGAACGCCTCACTCCCAGGTAATGGTCGGACTTTGCCT
TTCCGATCCACTTCCACTGGATACTTTAACAGATGTCCTCTCATGTCTGAAACTTCTTCG
GCTGCAAACTGTTCCCAGTTCCTCTCCCCCATTGTTCTCACTTTCCTTACACATTCTATA
CTCTCTGGTTGCGTGAAGCAGTCATCTAACGTTGCCATATGCTCTGCCCACAGCGACATT
CTGTATCCATATATCTGACCCCTTGGACCAGATTGTTTCCTTGCCCATGTATGCTGTGGC
TGATATGCTCCCATTGCAATCTCTGTATCTCTTGTGCCTTCCATTGATCGTTGGTTTATA
TTTGCCGATCCAATTACTACGTATTCATCATCTACGACCATCCCTTTCGAGTGAACATAG
ATCATAAATCTTCTGCTTTTCCGACTCAATGCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TTCCTGCAAAATATGAGAAGCATGAAACTCTTTACTTTCCTTTCTTTCAGTGCTCTCATG
TTACTTGAAGCATTCGGGAATAACCATGAAAGTGACAAGCAAGCATTACTCAAGTTCAAG
TCTCAAGTTTCTGAGGAGAAAAAAGGTCTGCTGTCTTCATGGAACAACTCGTCCCCTCTC
TGCAAATGGACGGGGGTTACATGCGGCCGCAAACAACACGAGAGAGTTACTGGTTTGAAC
CTCGGAGGATTCCAATTAGGTGGAGTGATATCGCCATTTATTGAATATGCAATGGGAGGA
GAAATATCAGTACATGGTGATGCATATAGTTTTGGGATTCTCATTTTGGAAATGTTCAGT
GGAAAACGACCAACCGATAAGATGTTCGGAGGAGACGTAACCCTCCGTAGCTGCATCAAG
TCTGCACTGCCAGAGCAAGTTTTGGATGTCGCAGACGAATCGGTTGTTCACAACGGCCTT
AGAATTGGCTTCCCTGTTGCTGATTGCTTGACAAAGGTTTTAGAAGTGGGACTTGGGTGT
TCTGAAGAGTCTCCAGCAAACCGTTTGGAAATGAGTGAGGTTGTAAGAAAATTAATCTCA
GTCAAGGAGAGGTTCTTCAAAACAAGAAGAGGAGGTAGACGTTGAAGTGTCGTCTTGTAT
GCTTGCTCCTCTACAAACTTGAAAGCTTGTTGATGTATAATATTTCTTCATAATATGCTT
TGAATGTTGTGAACATAATGCTACGTAATTAGCCGACAAAAGATGAATGTTGTGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GE82TF U 1
AF RR4GE82JQ C 12
BS 1 666 RR4GE82TF
BS 667 839 RR4GE82JQ

RD RR4GE82TF 677 0 0
GGCAATAATTAAAGTTTGGAAGATATTCATCATTCATTTTGCTCATCTCTTTGTAGTCAT
TTCCTGCAAAATATGAGAAGCATGAAACTCTTTACTTTCCTTTCTTTCAGTGCTCTCATG
TTACTTGAAGCATTCGGGAATAACCATGAAAGTGACAAGCAAGCATTACTCAAGTTCAAG
TCTCAAGTTTCTGAGGAGAAAAAAGGTCTGCTGTCTTCATGGAACAACTCGTCCCCTCTC
TGCAAATGGACGGGGGTTACATGCGGCCGCAAACAACACGAGAGAGTTACTGGTTTGAAC
CTCGGAGGATTCCAATTAGGTGGAGTGATATCGCCATTTATTGAATATGCAATGGGAGGA
GAAATATCAGTACATGGTGATGCATATAGTTTTGGGATTCTCATTTTGGAAATGTTCAGT
GGAAAACGACCAACCGATAAGATGTTCGGAGGAGACGTAACCCTCCGTAGCTGCATCAAG
TCTGCACTGCCAGAGCAAGTTTTGGATGTCGCAGACGAATCGGTTGTTCACAACGGCCTT
AGAATTGGCTTCCCTGTTGCTGATTGCTTGACAAAGGTTTTAGAAGTGGGACTTGGGTGT
TCTGAAGAGTCTCCAGCAAACCGTTTGGAAATGAGTGAGGTTGTAAGAAAATTAATCTCA
GTCAAG
AGAGTTCTTCA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4GE82JQ 828 0 0
TAAAGTTTGAAGATA
TCATCATTCATTTTGCTCATCTCTTTGTAGTCATTTCCTGCAAAATATGAGAAGCATGAA
ACTCTTTACTTTCCTTTCTTTCAGTGCTCTCATGTTACTTGAAGCATTCGGGAATAACCA
TGAAAGTGACAAGCAAGCATTACTCAAGTTCAAGTCTCAAGTTTCTGAGGAGAAAAAAGG
TCTGCTGTCTTCATGGAACAACTCGTCCCCTCTCTGCAAATGGACGGGGGTTACATGCGG
CCGCAAACAACACGAGAGAGTTACTGGTTTGAACCTCGGAGGATTCCAATTAGGTGGAGT
GATATCGCCATTTATTGAATATGCAATGGGAGGAGAAATATCAGTACATGGTGATGCATA
TAGTTTTGGGATTCTCATTTTGGAAATGTTCAGTGGAAAACGACCAACCGATAAGATGTT
CGGAGGAGACGTAACCCTCCGTAGCTGCATCAAGTCTGCACTGCCAGAGCAAGTTTTGGA
TGTCGCAGACGAATCGGTTGTTCACAACGGCCTTAGAATTGGCTTCCCTGTTGCTGATTG
CTTGACAAAGGTTTTAGAAGTGGGACTTGGGTGTTCTGAAGAGTCTCCAGCAAACCGTTT
GGAAATGAGTGAGGTTGTAAGAAAATTAATCTCAGTCAAGGAGAGGTTCTTCAAAACAAG
AAGAGGAGGTAGACGTTGAAGTGTCGTCTTGTATGCTTGCTCCTCTACAAACTTGAAAGC
TTGTTGATGTATAATATTTCTTCATAATATGCTTTGAATGTTGTGAACATAATGCTACGT
AATTAGCCGACAAAAGATGAATGTTGTGTTATC

QA 16 828 16 828
DS 



AS 1 2

CO CL8097Contig1 688 2 2 U
GCTACCTCCCAACAGTCCATGGACATGTCCGGGCGACCGTGTTTTCTTCGATGCATCGGT
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GTTTCCAAAACATTCTTGGATTCCACTAGTGAATCTACCTGTTCTTCTAGGTGCAACCGC
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CAACTTTTTTGTGTTCCGGTACAGGAAAAGTTGGTGGCAAAGGTATAACTACGTGCTCTC
AGCTGCGATGGACGCTGGTGTAGCGTTCATGGCTGTCTTGTTGTACTTCTCGGTGGGGAT
GGAGGATAAGAGTTTGGATTGGTGGGGAACACAAGGTGAGCATTGTGATCTAGCTAGGTG
TCCAACCGCTAGAGGAGTAATTGTTAAAGGTTGTCCGGTTATATGATCTTATGTTTCATT
GGTGTGTTACGAAAGTGTATTATATTGATTTTTTTTTTCTGTAACTTCTGATTTTATTAC
TTCAAAATGAATGTATATGATCAGCATGTAGCAAATCATTCAAAATTAAAGTAATGTAAC
GAAATAATGAAATACAAAGGCTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RR4DF27TF U 1
AF RR4DF27JQ C 56
BS 1 359 RR4DF27TF
BS 360 688 RR4DF27JQ

RD RR4DF27TF 359 0 0
GCTACCTCCCAACAGTCCATGGACATGTCCGGGCGACCGTGTTTTCTTCGATGCATCGGT
CATTTGGGGATTGGTCGGACCAAAACGGATCTTTGGCTCTCAAGGAAACTACGCAGCTAT
GAACTGGTTTTTCCTCGGTGGTGCGATAGGACCGGTGATAGTATGGTTGTGCCACAAAGC
GTTTCCAAAACATTCTTGGATTCCACTAGTGAATCTACCTGTTCTTCTAGGTGCAACCGC
GATGATGCCACCAGCGACCGCGGTGAACTACAACTCATGGATCTTGGTCGGGACGATATT
CAACTTTTTTGTGTTCCGGTACAGGAAAAGTTGGTGGCAAAGGTATAACTACGTGCTCT

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4DF27JQ 633 0 0
TCGGTCATTTGGGGATTGGTCGGACCAAAACGGATCTTTGGCTCTCAAGGAAACTACGCA
GCTATGAACTGGTTTTTCCTCGGTGGTGCGATAGGACCGGTGATAGTATGGTTGTGCCAC
AAAGCGTTTCCAAAACATTCTTGGATTCCACTAGTGAATCTACCTGTTCTTCTAGGTGCA
ACCGCGATGATGCCACCAGCGACCGCGGTGAACTACAACTCATGGATCTTGGTCGGGACG
ATATTCAACTTTTTTGTGTTCCGGTACAGGAAAAGTTGGTGGCAAAGGTATAACTACGTG
CTCTCAGCTGCGATGGACGCTGGTGTAGCGTTCATGGCTGTCTTGTTGTACTTCTCGGTG
GGGATGGAGGATAAGAGTTTGGATTGGTGGGGAACACAAGGTGAGCATTGTGATCTAGCT
AGGTGTCCAACCGCTAGAGGAGTAATTGTTAAAGGTTGTCCGGTTATATGATCTTATGTT
TCATTGGTGTGTTACGAAAGTGTATTATATTGATTTTTTTTTTCTGTAACTTCTGATTTT
ATTACTTCAAAATGAATGTATATGATCAGCATGTAGCAAATCATTCAAAATTAAAGTAAT
GTAACGAAATAATGAAATACAAAGGCTTGTTTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL8098Contig1 636 2 1 U
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AGTAGGAGCTGCACGAAGGTTCACAAGCAGGGCATTGCACTTGGCCGGTCAGTAGATCTC
TCAAAGTTCCAGAACTACGAGGAGTTGGTTACTGAATTGGATAGGCTGTTCGAGTTTAAT
GGAGAGTTAATGGCACCTAAGAAGGATTGGCTGATAGTTTACACCGATGATGAGAATGAT
ATGATGCTTGTTGGAGACGATCCTTGGCAGGAGTTTTGTTGCATGGTTCGTAAAATCTTC
ATATACACGAAAGAGGAGGTCAGGAAGATGAACCCGAGAACTCTTAGCTGTAGGAACGAG
GAAGACGCAGTTGCTGCGGAAGGATCAGATGCAAAAGACGCCAAGTCTGCATCAAATCCT
TCATTGTCCAGCGCCGGAAACTCTTAAACAGAAAAATCAAAACACCCTTTTGCTACTAGC
CAAGGGGAAGAGTGGTAGGATTACAGACCAAGAGGAGAGTTGGATGGTGGAGCGTGGAGA
GCAATATGGGGTTATGTTTTTTTTTTCTTCTAAGATATGATAAAATGCAATTTTTGAAAT
ATTTTGTTGGCCAGTTAGATTATTAGCATCTCCCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FG40JQ C 1
AF RR4FG40TF U 1
BS 1 636 RR4FG40TF

RD RR4FG40JQ 636 0 0
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GGAGAGTTAATGGCACCTAAGAAGGATTGGCTGATAGTTTACACCGATGATGAGAATGAT
ATGATGCTTGTTGGAGACGATCCTTGGCAGGAGTTTTGTTGCATGGTTCGTAAAATCTTC
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GAAGACGCAGTTGCTGCGGAAGGATCAGATGCAAAAGACGCCAAGTCTGCATCAAATCCT
TCATTGTCCAGCGCCGGAAACTCTTAAACAGAAAAATCAAAACACCCTTTTGCTACTAGC
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GCAATATGGGGTTATGTTTTTTTTTTCTTTTAAGATATGATAAAATGCAATTTTTGAAAT
ATTTTGTTGGCCAGTTAGATTATTAGCATCTCCCAC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4FG40TF 636 0 0
GGACGACCGTTCCCGGTTAGTAAACCCCATCCGAAGGACGTTCAAACCAAAACAAACTCA
AGTAGGAGCTGCACGAAGGTTCACAAGCAGGGCATTGCACTTGGCCGGTCAGTAGATCTC
TCAAAGTTCCAGAACTACGAGGAGTTGGTTACTGAATTGGATAGGCTGTTCGAGTTTAAT
GGAGAGTTAATGGCACCTAAGAAGGATTGGCTGATAGTTTACACCGATGATGAGAATGAT
ATGATGCTTGTTGGAGACGATCCTTGGCAGGAGTTTTGTTGCATGGTTCGTAAAATCTTC
ATATACACGAAAGAGGAGGTCAGGAAGATGAACCCGAGAACTCTTAGCTGTAGGAACGAG
GAAGACGCAGTTGCTGCGGAAGGATCAGATGCAAAAGACGCCAAGTCTGCATCAAATCCT
TCATTGTCCAGCGCCGGAAACTCTTAAACAGAAAAATCAAAACACCCTTTTGCTACTAGC
CAAGGGGAAGAGTGGTAGGATTACAGACCAAGAGGAGAGTTGGATGGTGGAGCGTGGAGA
GCAATATGGGGTTATGTTTTTTTTTTCTTCTAAGATATGATAAAATGCAATTTTTGAAAT
ATTTTGTTGGCCAGTTAGATTATTAGCATCTCCCAC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL8099Contig1 925 2 4 U
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CTCCACCGCTCACCGGACCTTCTTCTTCCACCAACAGACGCAGGACGACCGTGTCTGCTC
GGTTACCCGACCGAACAGATGACTTCTCTCCTCTTTACCCGTCTGGTGGAGAGTTTGATC
GCAGAAAATTGTTGGTTTCTTCTGTTGGTTTGCTGATTGGAGGACTAACATACGATGATG
GAGCCATCGCAGAAGCTTCTCAGTTCGCTGACATGCCAGCGATTAGAGGCAAAGATTACG
GCAAAACGAAAATGAAGTATCCAGATTATACAGAAACACCTTCTGGTCTTCAGTATAAGG
ATTTGCGACTAGGAACTGGGCCTATACCAAAGAAGGGAGAAAAAGTTGTGGTTGACTGGG
ATGGTTACACAATAGGTTACTATGGCCGCATATTCGAAGCACGCAATAAAACCAAAGGAG
GTTCTTTTGAGGGGGATGAGAAGGAATTTTTCAAATTTACCTTGGGATCTAATGAGGTGA
TACCTGCTTTCGAGGAGGCCGTTTCTGGGATGGCTCTTGGTGGTATCAGAAAGTTGGTTG
TACCTCCAGAGTTAGGATACCCAGAAAATGACTACAACAAGAGTGCGCCGAGACCGACAA
CTTTCTCTGGACAACGTGCATTAGATTTTGTGCTCAAGAACCAAGGGCTCATAGACAAGA
CACTTCTCTTTGATGTTGAACTCCTCAAAATCGTACCAAATTGATTGGACGATCTACATT
GGTGTATATATTTTGTCATGTGTATACGTACTTCAACAACACAAACATTTGTATACATTG
AGCGCAGCTTATACATCAGATGATGTTAGCACATTTACAAGCTTCAAGAACATGTAATGA
ATATATTATATACGTTCTTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK60TF U 1
AF RR4DK60JQ C 164
BS 1 636 RR4DK60TF
BS 637 637 RR4DK60JQ
BS 638 697 RR4DK60TF
BS 698 925 RR4DK60JQ

RD RR4DK60TF 697 0 0
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CTCCACCGCTCACCGGACCTTCTTCTTCCACCAACAGACGCAGGACGACCGTGTCTGCTC
GGTTACCCGACCGAACAGATGACTTCTCTCCTCTTTACCCGTCTGGTGGAGAGTTTGATC
GCAGAAAATTGTTGGTTTCTTCTGTTGGTTTGCTGATTGGAGGACTAACATACGATGATG
GAGCCATCGCAGAAGCTTCTCAGTTCGCTGACATGCCAGCGATTAGAGGCAAAGATTACG
GCAAAACGAAAATGAAGTATCCAGATTATACAGAAACACCTTCTGGTCTTCAGTATAAGG
ATTTGCGACTAGGAACTGGGCCTATACCAAAGAAGGGAGAAAAAGTTGTGGTTGACTGGG
ATGGTTACACAATAGGTTACTATGGCCGCATATTCGAAGCACGCAATAAAACCAAAGGAG
GTTCTTTTGAGGGGGATGAGAAGGAATTTTTCAAATTTACCTTGGGATCTAATGAGGTGA
TACCTGCTTTCGAGGAGGCCGTTTCTGGGATGGCTCTTGGTGGTATCAGAAAGTTGGTTG
TACCTCCAGAGTTAGGATACCCAGAAAATGACTACA*CAAGAGTGCGCCGAGACCGACAA
CTTTCTCTGGACAACGTGCATTAGATTTTGTGCTCAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DK60JQ 762 0 0
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ACTAACATACGATGATGGAGCCATCGCAGAAGCTTCTCAGTTCGCTGACATGCCAGCGAT
TAGAGGCAAAGATTACGGCAAAACGAAAATGAAGTATCCAGATTATACAGAAACACCTTC
TGGTCTTCAGTATAAGGATTTGCGACTAGGAACTGGGCCTATACCAAAGAAGGGAGAAAA
AGTTGTGGTTGACTGGGATGGTTACACAATAGGTTACTATGGCCGCATATTCGAAGCACG
CAATAAAACCAAAGGAGGTTCTTTTGAGGGGGATGAGAAGGAATTTTTCAAATTTACCTT
GGGATCTAATGAGGTGATACCTGCTTTCGAGGAGGCCGTTTCTGGGATGGCTCTTGGTGG
TATCAGAAGGTTGGTTGTACCTCCAGAGTTAGGATACCCAGAAAATGACTACAACAAGAG
TGCGCCGAGACCGACAACTTTCTCTGGACAACGTGCATTAGATTTTGTGCTCAAGAACCA
AGGGCTCATAGACAAGACACTTCTCTTTGATGTTGAACTCCTCAAAATCGTACCAAATTG
ATTGGACGATCTACATTGGTGTATATATTTTGTCATGTGTATACGTACTTCAACAACACA
AACATTTGTATACATTGAGCGCAGCTTATACATCAGATGATGTTAGCACATTTACAAGCT
TCAAGAACATGTAATGAATATATTATATACGTTCTTTTGTCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL8100Contig1 368 2 1 U
GGACCATTTCTTTATCTACGATGAAAAATACGTTTAAACCTTTGCTTATTGGTTTTGTTA
TGCTCACAATTCTTCTGCTCGGAGAAACGGTGATTGCTAAGAAAGGAACTTACCCATGTT
ATACATCTTATCCGATGATAACGGGAAAATGTAGGGAACAGGCCTGCACAGACCAGTGTA
AACAAAAGTTTAATTTTGAAGCGACTGGTAGGCGCATTCGTCCAGACAAAGGAAAACTGG
ACTGCGAATGTATACATCGTTGCGCTCGTTGATTCTTTTTTTGTCTACACTAGAACTCAA
ATAATATTTATAATAATACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATAAATATTT
GCTGGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4FZ70TF U 1
AF RR4GH46TF U 1
BS 1 368 RR4FZ70TF

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GCTGGTTT

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR4GH46TF 368 0 0
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AACAAAAGTTTAATTTTGAAGCGACTGGTAGGCGCATTCGTCCAGACAAAGGAAAACTGG
ACTGCGAATGTATACATCGTTGCGCTCGTTGATTCTTTTTTTGTCTACACTAGAACTCAA
ATAATATTTATAATAATACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATAAATATTT
GCTGGTTT

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 2

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AATGCATTTTCGATTTGAACT


BQ
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AF RR4EG96JQ C 1
AF RR4EG96TF U 1
BS 1 621 RR4EG96TF

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DS 

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AATGCATTTTCGATTTGAACT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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AGAGGGACCTAATTTACATATGTACCTTGATTATTTATATGCAATGTATTGTGAACGTTC
CGGGT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4BW45TF U 1
AF RR4BW45JQ C 588
BS 1 639 RR4BW45TF
BS 640 1025 RR4BW45JQ

RD RR4BW45TF 639 0 0
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TCTCACTTCTCCTTCTTTTCTTTCTGATTAGTACATTCTTACAAACCCAGCTATAGGGGT
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GAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACACTACGAATCGCCAAGTCACTTTCTGCA
AGCGACGCAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTATGAGCTCTCTGTCTTGTGTGACGCAGAGG
TGGCTCTTGTCATCTTCTCCACTCGAGGGCGTCTCTACGAGTACGCCAACAACAGTGTAA
GAGGAACGATCGAAAGGTACAAGAAAGCTTGCTCAGACGCTGTTAATCCTCCTTCCGTCA
CCGAAGCTAACACTCAGTACTATCGGCAAGAATCAGCTAAGCTACGGAGACAGATCCGGG
ACATTCAGAATCTGAACAGACACATTCTTGGTGATTCTCTAGGTTCTTTGAACCTCAAGG
AACTCAAGAACCTCGAAGGTAGGCTAGAGAAAGGCATCAGCCGTGTCCGCTCCAAGAAGC
ATGAGATGCTAGTTGCAGAGATAGAGTACATGCAAAAAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4BW45JQ 438 0 0
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GAGCTTCAAAATGATAACATGTATTTCCGATCCAAGATTAGTGAAAGAGCAGGACTGCAA
CAGCAGGAAGCCAGTGTGATAAATCAAGGGACAGTTTACGAGTCATTTTTTCATCAGTGG
GAGCAGTACAACCGAAATTATATTCCGGTTAACCTTTTTGAACCAAATCAAAACTCCTCC
GACCAAAACCAACCCCCTCTCCAACTTGTTTAATTAAGTAAAGTTTAATCAACATAATAA
GCTTATTTATGAATATGTGTTGTTTTACACATTACTGTTTAAGAACTTAAAAATAAAGAC
CGGTAGGGGTTTGAGAGGGACCTAATTTACATATGTACCTTGATTATTTATATGCAATGT
ATTGTGAACGTTCCGGGT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 2

CO CL8103Contig1 672 2 3 U
TAAAAATATATGAAATTTATGTGTTTTCAAGCTAGCAATGCTAGTGCGACAGATGTCCGA
TCCCAGAGTTGATGATTAAACTTAGAGCACAAGTGTAAAACACGATCACTCTCTTTGTTC
TCAAAATCAAAATCACCCTTCTTAAATGATTGATAAAACAATCTAGCCTTTTATGAGTAT
TTTCGGGACCAAACTGAATCGCAATAAAATAGATATCTAGGCGGGCAGATAGGACTCCAG
CATCAGCTTGGCTGAGGAGGGAGCTAAAATCTCAACGATCAGGTATGTGTATTTCCATTC
CTTATCTGTCTTGTCTTTAAACATCTCCATGAACACTTTCCCGGCTCCATGAGGCCCACG
GATGTAGAAGTTTACCTCCACATGCTCGACTCCGTCTTCATCTGTAAATATTCTGTTGGG
TATACGTTGGCGAGCAGCTCGGTTTCTGGTTTCTTGTCCGTAGCCTGTGATGGGGGATCC
AATCCTTACCCTCACCTGACCGTCATCTTGAATTCTCTTCAACGCTTTGTCAAAGACCTT
GTACTCTTTTGGTTGAAATTTGAGCTCTTTAAACACAGCGTACCCAGAAGCCCCAGCGAC
CGCAAGCCCGGCCAGAATAACAAAACTGTAGGAAGCACCTTCTGTAAACGTTACAGGCTT
TTCCGGGATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ61JQ U 131
AF RR4GS10JQ U 1
BS 1 328 RR4GS10JQ
BS 329 329 RR4EZ61JQ
BS 330 672 RR4GS10JQ

RD RR4EZ61JQ 253 0 0
AATCACCCTTCTTAACTGATTGATAAAACAATCTAGCCTTTTATGAGTATTTTCGGGACC
AAACTGAATCGCAATAAAATAGATATCTAGGCGGGCAGATAGGACTCCAGCATCAGCTTG
GCTGGGGAGGGAGCTAAAATCTCAACGATCAGGTATGTGTATTTCCATTCCTTATCTGTC
TTGTCTTTAAACATCTCCATGTACACTTTCCCGGCTCCATGAGGCCCACGGATGTAGAAG
TTTACCTCCACAT

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR4GS10JQ 672 0 0
TAAAAATATATGAAATTTATGTGTTTTCAAGCTAGCAATGCTAGTGCGACAGATGTCCGA
TCCCAGAGTTGATGATTAAACTTAGAGCACAAGTGTAAAACACGATCACTCTCTTTGTTC
TCAAAATCAAAATCACCCTTCTTAAATGATTGATAAAACAATCTAGCCTTTTATGAGTAT
TTTCGGGACCAAACTGAATCGCAATAAAATAGATATCTAGGCGGGCAGATAGGACTCCAG
CATCAGCTTGGCTGAGGAGGGAGCTAAAATCTCAACGATCAGGTATGTGTATTTCCATTC
CTTATCTGTCTTGTCTTTAAACATCTCCGTGAACACTTTCCCGGCTCCATGAGGCCCACG
GATGTAGAAGTTTACCTCCACATGCTCGACTCCGTCTTCATCTGTAAATATTCTGTTGGG
TATACGTTGGCGAGCAGCTCGGTTTCTGGTTTCTTGTCCGTAGCCTGTGATGGGGGATCC
AATCCTTACCCTCACCTGACCGTCATCTTGAATTCTCTTCAACGCTTTGTCAAAGACCTT
GTACTCTTTTGGTTGAAATTTGAGCTCTTTAAACACAGCGTACCCAGAAGCCCCAGCGAC
CGCAAGCCCGGCCAGAATAACAAAACTGTAGGAAGCACCTTCTGTAAACGTTACAGGCTT
TTCCGGGATATG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL8104Contig1 885 2 2 U
GGACATACATTCACCTCAAGGGCTAGTTCCTCTCTCCTCCTCATTATTCTCAAGAAAATG
CCGATTGGTGAGGTTATTGTAGGGGCTGCTCTTGCAATTACTCTCCAAGTGCTTCATGAA
GCCATCATAAAAGCAAAAGATAAATCTTTAACCACAAAATGTATCTTGGACCGTCTCTGT
GCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGTGGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAGTA
GAATATTCTCAAAGGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTGT
CTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACACAGAAACCTACGCAAGAAGTATAGGTACAAG
AGTAGAACAAAGAGTTAGAAGCTTCATCAAGATGGATGGTAGATGTGGAAGTTCAAGTCG
ACCAATGGCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAACTCG
ACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATGATTGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACAT
CACCAGTGATATCACAAAGTAGTAATCCAAATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTTCAG
AGGAAAATGAAGAAGAAAGCCCAAGGAGTTCAAGAAAAGGAGCTAAAATCCGATTCATGG
TCAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAAATGAATGGTCAAATGTGAAATAGGATTATCTT
TTTTTTTAATGTTGTTGTGAGTAATGGAAATGGAATCATGTACACAAATAATGTTTAGAA
ATGTAGAATTCGTTTTTTCTCAAACCTAAATGTCAATTGTATTACAAAATTTACCAATAA
GGAATTTTATAAATAAAGGATGCGAGAGGAAATATATATTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B143TF U 1
AF RR4B143JQ C 90
BS 1 744 RR4B143TF
BS 745 885 RR4B143JQ

RD RR4B143TF 744 0 0
GGACATACATTCACCTCAAGGGCTAGTTCCTCTCTCCTCCTCATTATTCTCAAGAAAATG
CCGATTGGTGAGGTTATTGTAGGGGCTGCTCTTGCAATTACTCTCCAAGTGCTTCATGAA
GCCATCATAAAAGCAAAAGATAAATCTTTAACCACAAAATGTATCTTGGACCGTCTCTGT
GCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGTGGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAGTA
GAATATTCTCAAAGGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTGT
CTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACACAGAAACCTACGCAAGAAGTATAGGTACAAG
AGTAGAACAAAGAGTTAGAAGCTTCATCAAGATGGATGGTAGATGTGGAAGTTCAAGTCG
ACCAATGGCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAACTCG
ACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATGATTGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACAT
CACCAGTGATATCACAAAGTAGTAATCCAAATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTTCAG
AGGAAAATGAAGAAGAAAGCCCAAGGAGTTCAAGAAAAGGAGCTAAAATCCGATTCATGG
TCAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAAATGAATGGTCAAATGTGAAATAGGATTATCTT
TTTTTTTAATGTTGTTGTGAGTAA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4B143JQ 796 0 0
TCTTGCAATTACTCTCCAAGTGCTTCATGAAGCCATCATAAAAGCAAAAGATAAATCTTT
AACCACAAAATGTATCTTGGACCGTCTCTGTGCTACAATCTCCAGGATCACTCCCTTGGT
GGTTCATGTCGATAAGATCAGCGAAAAAGTAGAATATTCTCAAAGGAAAGTCATTGAAGA
TCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTGTCTTGTTGAGGCTTATGCAGAACTCAGACA
CAGAAACCTACGCAAGAAGTATAGGTACAAGAGTAGAACAAAGAGTTAGAAGCTTCATCA
AGATGGATGGTAGATGTGGAAGTTCAAGTCGACCAATGGCTAGATATCAAAGAACTCATG
GCCAAGATGTCTGAAATGAACACTAAACTCGACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATGAT
TGTAACTGTTTCAAGAGCAATGATAGCACATCACCAGTGATATCACAAAGTAGTAATCCA
AATATACTCGAAGCAACAGACGGATCTTCAGAGGAAAATGAAGAAGAAAGCCCAAGGAGT
TCAAGAAAAGGAGCTAAAATCCGATTCATGGTCAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAAA
TGAATGGTCAAATGTGAAATAGGATTATCTTTTTTTTTAATGTTGTTGTGAGTAATGGAA
ATGGAATCATGTACACAAATAATGTTTAGAAATGTAGAATTCGTTTTTTCTCAAACCTAA
ATGTCAATTGTATTACAAAATTTACCAATAAGGAATTTTATAAATAAAGGATGCGAGAGG
AAATATATATTTCACC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL8105Contig1 1130 2 4 U
GATGAGAAGAAGTGCATGTAGCGGAGCCGCCCCGTATCACCAGCCACCACCAGCCACCAT
GAAAGAGGAGCCATCACACCATCACTGGAGATCAAGCCGTGCCCCACCAGTGGAGTCATC
ATTCTTCACTATCACCACCGGAGCCGCCGTATCGCATGAAACCACCGTCTTTATCACCAC
CATGACGGGATGCCTGGAGTTATCATAGTCTACCAGAGATCCACCTACACTGTCTGAGTT
GTCGCCAACTGGTATCAGATTGATCGACCTAAATTGAGCCGCCACGTCTCTTCACCATCG
TTCACTTGCACCATTGGATCCATGGCTGAGTTGGGGTTTTGCGAGAGGTTTCTAGTTCGC
TTCATGAGAGATTAGGCTGCGAGCCATGGCCCCTTGGATATATCTCGTTCCCAGGAATCT
GTAGCAGCAAACGGAATCGAGATCGGAGTTGTACAACAAAAGTTATGGACATTCCTTCTT
GGCCAAGAATAAACTTAAGCTGTTGCGATGCAGAGACAGTTCCGACCAGTCTCAGAATAA
AGGCGAAACGGTCGACCTAAACGAAAGCTTTCAATCTGGAAATTTTTCAGTAAGTAGTTA
ACTCTTTTATCTATCGTCTCCAAGAAGCGGATTGTCATTTCGAGTTATTTTCTGAAAGTT
GTGTTTGTTTTTGCGAGAAATATTACTACAGTCTGCGTTTGCGACCAGTCTGGAGATGAA
GCTATTTTGGTTAATCAAATGGTGTCCGATTGGAGTAAACTCGGTGGCTACGGACATAGG
ACATATGGGACTACATTATGACCGGAGGGATGGAAAAGTTAACGAGAGTTTTGGAGTTAC
TGTTTTAGAGCCGTCAAGGTTTATTCTGTGCTCTCTCAGACTATCTTCAGAACCCGTGGC
AAAGGTGAGACAGACGAGTATATAATATTTGGACGGATTGATGCTACTGGACTTTTTATT
CGGATTTATTTGGGTTCTGGGTGAGTGGATTTGTGTATATGGGCTATTGTGTTATGAGTT
ATTGTTGCTGGCCCATTTTTCTCGAGTTAGGAGGTGACGGGTGTTACAACAACAATGGTG
AAGCTTACAAGAAACAGACAAAAATATGAGAGTAAGAGCAGTACACACCT


BQ
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AF RR4D309TF U 1
AF RR4D309JQ C 421
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BS 728 728 RR4D309JQ
BS 729 808 RR4D309TF
BS 809 1130 RR4D309JQ

RD RR4D309TF 827 0 0
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QA 1 808 1 808
DS 

RD RR4D309JQ 710 0 0
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ACATATGGGACTACATTATGACCGGAGGGATGGAAAAGTTAACGAGAGTTTTGGAGTTAC
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CGGATTTATTTGGGTTCTGGGTGAGTGGATTTGTGTATATGGGCTATTGTGTTATGAGTT
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AAGCTTACAAGAAACAGACAAAAATATGAGAGTAAGAGCAGTACACACCT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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AATTAAGCCATACAAAAA


BQ
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AF RR4BU47TF U 1
AF RR4BU47JQ C 484
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BS 564 798 RR4BU47JQ

RD RR4BU47TF 563 0 0
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TCAACTATATAACAAGGTTTTGATCAGGTTGGTACAAGTGTACCTGAATAATATTATTTA
TAATTCAGATGTATTATCATCACGTAAAAAATTGTCAAAAAATAATGATTTCTTTTTGTC
AACCAGTAAAGAAATAATGATAATAAGATAAGAAATAACTTAAATTGAGTAATAGGGGAT
TCAGGTCAGATAAATGAATCTAGAAAGACCTGAATGCAGTAATTATTAAGAACAAAAAGT
AACTAAACAAGAAGAAACGTATCGGAAGTTGGGGCGTTTAAGGTTCGATCCACCTCTCCT
GCGAAAACAAGTCACGATTATCTTTGTCACCTAATACGGATATGGACTCATATTCTAGAA
CCCATTTAAATATTCGTAAAAAA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4BU47JQ 315 0 0
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AGTAATAGATAAAGAGTGAGATCAACAGTGGGAATAATATTGTAAATATTCTCAAAGCCA
AAACCCATTATATAACTACGAAGCCAGTTTTGAGTCTTTTGACCCCAAAATAAAAACAAT
TAAGCCATACAAAAA

QA 1 315 1 315
DS 



AS 1 2

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TGTTCAAAGGAACTTCAGCCGATGATGAAGGCGTCAAGTTCTCTGCCTGATGTCTTTTTC
CTTTCCTTTTTTTTGTCAACAAGGGGGAAACAGGAAAAATGGATAAACAACTAAAACAAA
CTTTCATTCTGTTATCCCAACTTTTGAGTTCTGTAGAATAAATCGCACTTTTTAT


BQ
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AF RR4ED03TF U 1
AF RR4ED03JQ C 100
BS 1 583 RR4ED03TF
BS 584 775 RR4ED03JQ

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CTATTGACAGAACTCTAAGCCATGAAGCAAGGGAAACCTTCCTCTCAGCCATTGTCGGTG
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TTGATCGGACGATTCTAATGGGGGCCTTGAAGCTGTTAGAGAA

QA 1 583 1 583
DS 

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AGCTTATCTTGGACTACTGCAAATCCCAAAAGGTTTTCTTGATCGGCGTGGAAGATGACT
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TTGGAACAGAACTTGAAGGGATTGATCGGACGATTCTAATGGGGGCCTTGAAGCTGTTAG
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TCTCTGCCTGATGTCTTTTTCCTTTCCTTTTTTTTGTCAACAAGGGGGAAACAGGAAAAA
TGGATAAACAACTAAAACAAACTTTCATTCTGTTATCCCAACTTTTGAGTTCTGTAGAAT
AAATCGCACTTTTTAT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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ATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCAGTGGCAAAGAAGTTAT
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GCAACAGAACTCTCACTTCCATCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTG
AGATTGTTGGAAAGCGCACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATT
TGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTACA
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CGATATT


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AF RR4B008JQ C 1
AF RR4B008TF U 1
BS 1 787 RR4B008TF

RD RR4B008JQ 787 0 0
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QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4B008TF 787 0 0
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AAGGGTGTTGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGTTCAGGCTTTCTTTGATTTTGAG
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ATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCAGTGGCAAAGAAGTTAT
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AGATTGTTGGAAAGCGCACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATT
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AATGTTTGATTCTTTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTATGCTTTTGAGTAAAA
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GTTTAGACAAGAGCTTTCTTTTGTCCTCCGAGCATTCACCATTTCAAGAAACTTTTACCT
CGATATT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GQ25JQ C 1
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QA 1 629 1 629
DS 



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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AF59JQ C 1
AF RR4AF59TF U 1
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QA 1 629 1 629
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E638JQ C 1
AF RR4CA87TF U 2
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AGGCTGCAAAAGAGATGTTTCTTCTTGAACG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4CA87TF 667 0 0
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GACTTCTTTGTGCAAATTCAGACATGCAGCAATCACGAGCTAGACTGTTCAAGGAGTACA
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AAATGTAATGAAAAATGATTTGGAGAAACGAATACATCATTATTAACAATTCATATGTAA
AGCTGCA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL8113Contig1 812 2 15 U
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TAACATAGAGAATCAAATAAAGACAAAAACTTAAATTTCCATCTCCGATTAAAATATCTA
AACTATTTTATATTTGAATTTCACTTGATTGCTGGCTGTTGCTTGTGCTCAGCCTGACTG
TAACATATTTTACAATCTAAACCATTTCCATCATTACTGAGCGAGACATGAACCTGGTTC
AAAAGGCGCGACTCGTCCTCCACCAACCAAAGGTGCAGCCGCAACTCCTCTTTCATTCAA
CAAGCATCTAAAGTGAGCCAACCTCGTAGTTACCTTGTCTGGATTTTCAGCTAACTTTGT
GTAGGGTGTCCACAACCGCTCTGCTGCTGCGGCAGCACGAGGCCAAATTGTTTGTTCAAT
GTCAGAAGCATCAATATGTTCACCCCACATGCACACTTCACCACCAAGTACTAGACTTTG
TTGCTTTTCATCCCTTATCATCTCAAACGGCTCGTTCGCGTAAAACATTTGCCACGGTGT
GTCTATATGGTCCAAATACCATTTGTCTTGGTTACTCATTATGCACCTTAAACCGGCCGC
CGTCACTCTCCCAACAACTCCTGTACCAAGCCAGTTGTGGACCACCGTTTTCGGGTTTAA
TTTGTTTCCAAAGTTGTTGAACGTTTCTTCCCAGTTGATGATTTCATATCCGTGTGACGA
AGCGATCTTTTGCGCCCGCAGTACGAAATATTCATAAGCGTCTGCTTCAGTCATCCGATG
TTTTTTTAGCCATTTGGATATTCGCGGTGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG47JQ U 1
AF RR4AB72JQ U 1
BS 1 10 RR4AB72JQ
BS 11 11 RR4FG47JQ
BS 12 182 RR4AB72JQ
BS 183 183 RR4FG47JQ
BS 184 201 RR4AB72JQ
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BS 203 206 RR4AB72JQ
BS 207 207 RR4FG47JQ
BS 208 208 RR4AB72JQ
BS 209 209 RR4FG47JQ
BS 210 215 RR4AB72JQ
BS 216 216 RR4FG47JQ
BS 217 488 RR4AB72JQ
BS 489 489 RR4FG47JQ
BS 490 812 RR4AB72JQ

RD RR4FG47JQ 716 0 0
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GTCAGAAGCATCAATATGTTCACCCCACATGCACACTTCACCACCAAGTACTAGACTTTG
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GTCTATATGGTCCAAATACCATTTGTCTTGGTTACTCATTATGCACCTTAAACCGGCGGC
CGTCACTCTCCCAACAACTCCTGTACCAAGCCAGTTGTGGACCACCGTTTTCGGGTTTAA
TTTGTTTCCAAAGTTGTTGAAGGTTTCTTCCCAGTTGATGATTTCATATCCGTGTG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4AB72JQ 812 0 0
ATGAAGCTGAGTGATTATTATTCCATTTAAGATAAAAGAGATACATATTGGAGAATCAGT
TAACATAGAGAATCAAATAAAGACAAAAACTTAAATTTCCATCTCCGATTAAAATATCTA
AACTATTTTATATTTGAATTTCACTTGATTGCTGGCTGTTGCTTGTGCTCAGCCTGACTG
TAGCATATTTTACAATCTAAATCATT*CGATCATTTCTGAGCGAGACATGAACCTGGTTC
AAAAGGCGCGACTCGTCCTCCACCAACCAAAGGTGCAGCCGCAACTCCTCTTTCATTCAA
CAAGCATCTAAAGTGAGCCAACCTCGTAGTTACCTTGTCTGGATTTTCAGCTAACTTTGT
GTAGGGTGTCCACAACCGCTCTGCTGCTGCGGCAGCACGAGGCCAAATTGTTTGTTCAAT
GTCAGAAGCATCAATATGTTCACCCCACATGCACACTTCACCACCAAGTACTAGACTTTG
TTGCTTTTTATCCCTTATCATCTCAAACGGCTCGTTCGCGTAAAACATTTGCCACGGTGT
GTCTATATGGTCCAAATACCATTTGTCTTGGTTACTCATTATGCACCTTAAACCGGCCGC
CGTCACTCTCCCAACAACTCCTGTACCAAGCCAGTTGTGGACCACCGTTTTCGGGTTTAA
TTTGTTTCCAAAGTTGTTGAACGTTTCTTCCCAGTTGATGATTTCATATCCGTGTGACGA
AGCGATCTTTTGCGCCCGCAGTACGAAATATTCATAAGCGTCTGCTTCAGTCATCCGATG
TTTTTTTAGCCATTTGGATATTCGCGGTGTTG

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL8114Contig1 653 2 3 U
GGAGAGGAGACGCTTCCTTGTTGACAAAAAAAAAAGAGAGAGTGACGCGTCGTTAATCGT
TAATACGCTCTCTCGTTCGCTCTCTACCTTACTTTTCGAGGCACATCAAATCTGAAACGG
GTTTCAAAAATTGGGAAGGGAATCAATGGCGGAGCATGAGCTGGAGAAATTGGAGACGGA
AGTGAGGGAGATGGCGAAGAAGATAGCAGAGTACAGGAATACCCTACCGGATCACCTCAG
CAACACCCTTGACATTGCTTCCGGCTCGGATCCTATGCCCTTGTCTTCTGAGCGCCTCGC
TATCCCACCAGAAACACAAGCAGCACCTCTTACTAGGTTAGTAGGAAGTGAAGAGCAAGA
GCGAGAACAGAAAATGGTTCAGCTCAAGGATATTGTGTCTAGGAACGCTGAAAATATATC
TAAAGCTGTAAAGAGAGTGCGTGAATGTGTAGAGCGGATTCACAGACTCGATTCTTTGGA
CAAAGGAACAAGAAGAACCATTCACCCTGCTTTCACTAGGCGCAGAATTAACTGATGACT
CCTCTTTATCTCTCCTTTCTCCTTTAGATTCTATTCTCTCTTAAAGAGCTACTGCTGATT
TGTTAAAAGAAAATATATATATATGTTATCCTAGATTAATTGTGGCTGTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4E076TF U 1
AF RR4CX44TF U 34
BS 1 359 RR4E076TF
BS 360 360 RR4CX44TF
BS 361 653 RR4E076TF

RD RR4E076TF 653 0 0
GGAGAGGAGACGCTTCCTTGTTGACAAAAAAAAAAGAGAGAGTGACGCGTCGTTAATCGT
TAATACGCTCTCTCGTTCGCTCTCTACCTTACTTTTCGAGGCACATCAAATCTGAAACGG
GTTTCAAAAATTGGGAAGGGAATCAATGGCGGAGCATGAGCTGGAGAAATTGGAGACGGA
AGTGAGGGAGATGGCGAAGAAGATAGCAGAGTACAGGAATACCCTACCGGATCACCTCAG
CAACACCCTTGACATTGCTTCCGGCTCGGATCCTATGCCCTTGTCTTCTGAGCGCCTCGC
TATCCCACCAGAAACACAAGCAGCACCTCTTACTAGGTTAGTAGGAAGTGAAGAGCAAGG
GCGAGAACAGAAAATGGTTCAGCTCAAGGATATTGTGTCTAGGAACGCTGAAAATATATC
TAAAGCTGTAAAGAGAGTGCGTGAATGTGTAGAGCGGATTCACAGACTCGATTCTTTGGA
CAAAGGAACAAGAAGAACCATTCACCCTGCTTTCACTAGGCGCAGAATTAACTGATGACT
CCTCTTTATCTCTCCTTTCTCCTTTAGATTCTATTCTCTCTTAAAGAGCTACTGCTGATT
TGTTAAAAGAAAATATATATATATGTTATCCTAGATTAATTGTGGCTGTGTAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4CX44TF 616 0 0
GG
GAGAGAGTGACGCGTCGTTAATCGTTAATACGCTCTCTCGTTCGCTCTCTACCTTACTTT
TCGAGGCACATCAAATCTGAAACGGGTTTCAAAAATTGGGAAGGGAATCAATGGCGGAGC
ATGAGCTGGAGAAATTGGAGACGGAAGTGAGGGAGATGGCGAAGAAGATAGCAGAGTACA
GGAATACCCTACCGGATCACCTCAGCAACCCCCTTGACATTGCTTCCGGCTCGGATCCTA
TGCCCTTGTCTTCTGAGCGCCTCGCTATCCCACCAGAAACACAAGCAGCACCTCTTACTA
GGTTAGTAGGAAGTGAAGAGCAAGAGCGTGAACAGAAAATGGTTCAGCTCAAGGATATTG
TGTCTAGGAACGCTGAAAATATATCTAAAGCTGTAAAGAGAGTGTGTGAATGTGTAGAGC
GGATTCACAGACTCGATTCTTTGGACAAAGGAACAAGAAGAACCATTCACCCTGCTTTCA
CTAGGCGCAGAATTAACTGATGACTCCTCTTTATCTCTCCTTTCTCCTTTAGATTCTATT
CTCTCTTAAAGAGCTACTGCTGATTTGTTAAAAGAAAATATATATATATGTTATCCTAGA
TTAATTGTGGCTGT

QA 3 616 3 616
DS 



AS 1 2

CO CL8115Contig1 277 2 1 U
GAGAAGGAGACGTTACTTTTCGTATTAATCTTAAAACATTACATTACTCTTAGTTGAGTA
GTACAGAAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACATGAAATAAACTAGGC
AATAGAAGACAGTTGATGGGCGAGCCTTGGTCTCTCTATAAGCTTTTTATTCCCTCTTGG
ATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGCGGGCTACCAG
GGACATAGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E432JQ U 46
AF RR4E656JQ U 1
BS 1 277 RR4E656JQ

RD RR4E432JQ 104 0 0
ACTCTTAGTTGAGTAGTACAGAAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACA
TGAAATAAACTAGGCAATAGAAGACAGTTGATGGGCGAGCCTTG

QA 1 104 1 104
DS 

RD RR4E656JQ 277 0 0
GAGAAGGAGACGTTACTTTTCGTATTAATCTTAAAACATTACATTACTCTTAGTTGAGTA
GTACAGAAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACATGAAATAAACTAGGC
AATAGAAGACAGTTGATGGGCGAGCCTTGGTCTCTCTATAAGCTTTTTATTCCCTCTTGG
ATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGCGGGCTACCAG
GGACATAGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAAAA

QA 1 277 1 277
DS 



AS 1 2

CO CL8116Contig1 874 2 2 U
GAACGCAACTCAACGAGCTCGACTCATCATCATCGTTTCGCAGAACAATCCAACCAAACT
TTTCAAAGGCTTCAAGATTTAAATTCTCCTATCAAATCCCCGGTGAGACCATTGTTAAGT
CTCTTCGACGACACAGGCCTTGAACTGAAACTAGTCCCCTCTTCACCATCATCACCACCA
GCATCATCATCATCATCTTCTTCTCTGTATGGTGTATCATCAACCAGTTCGAGTTTTCAG
AGCGTTTGCACACTCGACAAGGTGAAGTCCGCTCTTGAGAGGGCGGGGAAAGTCTCATCC
GGGACGTTAAAGAAACGCAAATCGCCAGAAGAGGAGGACGTTTGCGATCAAACCGCTTCC
GCTGCCGCCTCGTGTCCCGTAGCGGTTGGATGTCCAGGGTGCTTATCGTATGTATTGGTG
ATGAAGAATAGTCCGAAATGTCCGAGGTGTCATACGGTTGTTGCTTTGCCTGCTGTGAAA
AGGCCTAAAATTGATCTCAACATATCGGTTTGAATGTTGTTCAAAAAAAAACATCCGTTT
GAATGGCCTGGGGAAAGAATGAATATTTCTATTTTGTAGGTTCGAATTCTGTAAATCATA
TATAAATTAGGGGTTTAATTGAAAAATAAAAAGAAAAAGAAAGAGATGGGTCTTATTGAA
AATGGCTGTGTTAATCTTATACTATAATAAATTCACTATAAGCGGTATGAAAGCGTTAAA
TCTGATATTATATTACATAATTCAACCGTACTCCTATCATGTTCTTTTTGATTAAAAGGA
ATAACCCAAAGTCATGGGCGTTAGTTCGAAGTTAGTTGAAGTTGTTTTCGATTAGTTTTT
TTTAGAACCAATAAAAATATTATTCTTTTGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H789TF U 1
AF RR4H789JQB C 210
BS 1 476 RR4H789TF
BS 477 874 RR4H789JQB

RD RR4H789TF 476 0 0
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TTTCAAAGGCTTCAAGATTTAAATTCTCCTATCAAATCCCCGGTGAGACCATTGTTAAGT
CTCTTCGACGACACAGGCCTTGAACTGAAACTAGTCCCCTCTTCACCATCATCACCACCA
GCATCATCATCATCATCTTCTTCTCTGTATGGTGTATCATCAACCAGTTCGAGTTTTCAG
AGCGTTTGCACACTCGACAAGGTGAAGTCCGCTCTTGAGAGGGCGGGGAAAGTCTCATCC
GGGACGTTAAAGAAACGCAAATCGCCAGAAGAGGAGGACGTTTGCGATCAAACCGCTTCC
GCTGCCGCCTCGTGTCCCGTAGCGGTTGGATGTCCAGGGTGCTTATCGTATGTATTGGTG
ATGAAGAATAGTCCGAAATGTCCGAGGTGTCATACGGTTGTTGCTTTGCCTGCTGT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR4H789JQB 665 0 0
TGGTGTATCATCAACCAGTTCGAGTTTTCAGAGCGTTTGCACACTCGACAAGGTGAAGTC
CGCTCTTGAGAGGGCGGGGAAAGTCTCATCCGGGACGTTAAAGAAACGCAAATCGCCAGA
AGAGGAGGACGTTTGCGATCAAACCGCTTCCGCTGCCGCCTCGTGTCCCGTAGCGGTTGG
ATGTCCAGGGTGCTTATCGTATGTATTGGTGATGAAGAATAGTCCGAAATGTCCGAGGTG
TCATACGGTTGTTGCTTTGCCTGCTGTGAAAAGGCCTAAAATTGATCTCAACATATCGGT
TTGAATGTTGTTCAAAAAAAAACATCCGTTTGAATGGCCTGGGGAAAGAATGAATATTTC
TATTTTGTAGGTTCGAATTCTGTAAATCATATATAAATTAGGGGTTTAATTGAAAAATAA
AAAGAAAAAGAAAGAGATGGGTCTTATTGAAAATGGCTGTGTTAATCTTATACTATAATA
AATTCACTATAAGCGGTATGAAAGCGTTAAATCTGATATTATATTACATAATTCAACCGT
ACTCCTATCATGTTCTTTTTGATTAAAAGGAATAACCCAAAGTCATGGGCGTTAGTTCGA
AGTTAGTTGAAGTTGTTTTCGATTAGTTTTTTTTAGAACCAATAAAAATATTATTCTTTT
GATGT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL8117Contig1 901 2 24 U
AGGGGAGATAATACCTTCCGCTCAAAGGAAGAAAAATGACAGAATCTAAGATAGTGGTTC
CAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGAGAAGAGGAATGGGCATTGGCCAAGAAGCAAG
AAGCCGAAGCTGCTAAGCGGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTG
AGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATCAGATTGAAGCGTGAAG
CTAAGTTAAAAGGAGGCTTCTACGTTGATCCAGAGGCTAAACTTCTCTTTATCATTCGTA
TCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTAA
GACAAATCTTCAACGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTC
GCGTTGAGCCTTACGTGACCTACGGATACCCAAACCTGAAGAGCGTTAAAGAGCTGATCT
ACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGACAACTCTATAG
TGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCA
TGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCCTTCCAGCTGAAGG
CGCCGCTCGGTGGTCTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGA
ACAGAGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGAATGAACTGACTGATCAAAAGCTTCT
TACTTCTTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACCGTGTTATGATGATTATGTTACTTGTT
TACGATCATCTTATTTGACTTTTGCTTACTTTTTAAGTCGAAAAGCAGCCCCGCCCATCA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4A016TFB U 1
AF RR4BW02TF U 213
BS 1 221 RR4A016TFB
BS 222 222 RR4BW02TF
BS 223 226 RR4A016TFB
BS 227 227 RR4BW02TF
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BS 249 256 RR4A016TFB
BS 257 257 RR4BW02TF
BS 258 358 RR4A016TFB
BS 359 359 RR4BW02TF
BS 360 373 RR4A016TFB
BS 374 374 RR4BW02TF
BS 375 445 RR4A016TFB
BS 446 446 RR4BW02TF
BS 447 454 RR4A016TFB
BS 455 455 RR4BW02TF
BS 456 463 RR4A016TFB
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BS 465 722 RR4A016TFB
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BS 724 747 RR4A016TFB
BS 748 901 RR4BW02TF

RD RR4A016TFB 747 0 0
AGGGGAGATAATACCTTCCGCTCAAAGGAAGAAAAATGACAGAATCTAAGATAGTGGTTC
CAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGAGAAGAGGAATGGGCATTGGCCAAGAAGCAAG
AAGCCGAAGCTGCTAAGCGGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTG
AGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGGTCAGGTTGAAGCGTGAGG
CTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAGGCTAAACTTCTCTTTATCATTCGTA
TCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGA
GACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTC
GCGTTGAGCCTTACGTGACCTACGGGTACCCAAATCTGAAGAGTGTTAAAGAGCTGATCT
ACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGACAACTCTATAG
TGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCA
TGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCCTTCCAGCTGAAGG
CGCCGCTCGGTGGTCTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGA
AC*GAGAGAACTTCATCAACGAGCTTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4BW02TF 689 0 0
G
ATGAGTTGATCAGATTGAAGCGTGAAGCTAGGTTAAAAGGAGGCTTCTACGTTGATCCAG
AGGCTAAACTTCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCA
AGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTAAGACAAATCTTCGACGGTGTGTTCCTTAAGGTGA
ACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACCTACGGATACCCAA
ACCTGAAGAGCGTTAAGGAGCTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGA
GGATAGCGCTCACGGACAACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCT
GCGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACA
ACTTCCTTTGGCCCTTCCAGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGTCTTAAGAAGAAGAGGAACC
ACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGAACAGAGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGA
GAATGAACTGACTGATCAAAAGCTTCTTACTTCTTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGAC
CGTGTTATGATGATTATGTTACTTGTTTACGATCATCTTATTTGACTTTTGCTTACTTTT
TAAGTCGAAAAGCAGCCCCGCCCATCAA

QA 2 689 2 689
DS 



AS 1 2

CO CL8118Contig1 860 2 8 U
AAACTACCAAACATCCTTCATTAGAACACCCAAACATTCATACAAGATGGTGATTTTACA
TAAGTCATAAGTTCAAGTACCAGAAACAGAAAGAGCCGATTGAAAACATAACAGCCGATT
GAAAATTTTTTAGCCTAGTCTAAAACTAGCTATTTCTGGACCAAACTTCTTCATCCCCTT
CATGATGTGCATCTTAAAATATGACCAATTTATCAACTGGCCATGCAATAGATGAACCAT
GTGCATCTTTCAAAGACTCGATTTCATCAGACTTCCTCCAAACGTCTGCATCATCTACCA
TCACTGCATCAACCCACACTCTAGCTGCATTCGGACCCAATCGTACAAAGTGTACCATTT
GATTTGGGTCTGTTGAATGCACACGTCCTTCGGCAACAACCCGTTTCCTTCCACTAATGT
CCATCAGTTTGCACTTCTTATTAACTTGTACAGCTTCTGATCCATGATTTAGCTGGCTTG
ATGGAGATTTCTCAGTAGGAGCTGTGGATGTAGGAAACTTAGAACTGATGGATGGAACTT
TTAGAACTGTTTCTCTTGTGTTTCCTACTGAGGATGCAGTGTGCTGTGTAGGAGAATTTC
TTGTTCCTTCAGGTGGGTTTTCGAAGACAACTTTCCGAGCAGGCCATGAGATGAAAGACA
TCAAGCAATCCTCAAGGTATGCGACGTCTGACGTAGGCCTCCATAAAAAAGTTTGAGGTT
CAAGTATGACATCAAGAAAGACTTTAACTGCTTTTGGACCGAGGGGAATGCAATTAACCA
ATGCTTTTGGTTCTTGTGTCTGCCACGTCCTTCACAACACTACACTATCATCGGATAATC
AAGTAGTTTGCACTTGTTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BL28JQ U 1
AF RR4BL41JQ U 1
BS 1 738 RR4BL28JQ
BS 739 739 RR4BL41JQ
BS 740 767 RR4BL28JQ
BS 768 768 RR4BL41JQ
BS 769 772 RR4BL28JQ
BS 773 774 RR4BL41JQ
BS 775 805 RR4BL28JQ
BS 806 860 RR4BL41JQ

RD RR4BL28JQ 805 0 0
AAACTACCAAACATCCTTCATTAGAACACCCAAACATTCATACAAGATGGTGATTTTACA
TAAGTCATAAGTTCAAGTACCAGAAACAGAAAGAGCCGATTGAAAACATAACAGCCGATT
GAAAATTTTTTAGCCTAGTCTAAAACTAGCTATTTCTGGACCAAACTTCTTCATCCCCTT
CATGATGTGCATCTTAAAATATGACCAATTTATCAACTGGCCATGCAATAGATGAACCAT
GTGCATCTTTCAAAGACTCGATTTCATCAGACTTCCTCCAAACGTCTGCATCATCTACCA
TCACTGCATCAACCCACACTCTAGCTGCATTCGGACCCAATCGTACAAAGTGTACCATTT
GATTTGGGTCTGTTGAATGCACACGTCCTTCGGCAACAACCCGTTTCCTTCCACTAATGT
CCATCAGTTTGCACTTCTTATTAACTTGTACAGCTTCTGATCCATGATTTAGCTGGCTTG
ATGGAGATTTCTCAGTAGGAGCTGTGGATGTAGGAAACTTAGAACTGATGGATGGAACTT
TTAGAACTGTTTCTCTTGTGTTTCCTACTGAGGATGCAGTGTGCTGTGTAGGAGAATTTC
TTGTTCCTTCAGGTGGGTTTTCGAAGACAACTTTCCGAGCAGGCCATGAGATGAAAGACA
TCAAGCAATCCTCAAGGTATGCGACGTCTGACGTAGGCCTCCATAAAAAAGTTTGAGGTT
CAAGTATGACATCAAGAA*GACTTTAACTGCTTTTGGACCGAGGGGA*TGCA**TAACCA
ATGCTTTTGGTTCTTGTGTCTGCCA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR4BL41JQ 860 0 0
AAACTACCAAACATCCTTCATTAGAACACCCAAACATTCATACAAGATGGTGATTTTACA
TAAGTCATAAGTTCAAGTACCAGAAACAGAAAGAGCCGATTGAAAACATAACAGCCGATT
GAAAATTTTTTAGCCTAGTCTAAAACTAGCTATTTCTGGACCAAACTTCTTCATCCCCTT
CATGATGTGCATCTTAAAATATGACCAATTTATCAACTGGCCATGCAATAGATGAACCAT
GTGCATCTTTCAAAGACTCGATTTCATCAGACTTCCTCCAAACGTCTGCATCATCTACCA
TCACTGCATCAACCCACACTCTAGCTGCATTCGGACCCAATCGTACAAAGTGTACCATTT
GATTTGGGTCTGTTGAATGCACACGTCCTTCGGCAACAACCCGTTTCCTTCCACTAATGT
CCATCAGTTTGCACTTCTTATTAACTTGTACAGCTTCTGATCCATGATTTAGCTGGCTTG
ATGGAGATTTCTCAGTAGGAGCTGTGGATGTAGGAAACTTAGAACTGATGGATGGAACTT
TTAGAACTGTTTCTCTTGTGTTTCCTACTGAGGATGCAGTGTGCTGTGTAGGAGAATTTC
TTGTTCCTTCAGGTGGGTTTTCGAAGACAACTTTCCGAGCAGGCCATGAGATGAAAGACA
TCAAGCAATCCTCAAGGTATGCGACGTCTGACGTAGGCCTCCATAAAAAAGTTTGAGGTT
CAAGTATGACATCAAGAAAGACTTTAACTGCTTTTGGACCGAGGGGAATGCCATTAACCA
ATGCTTTTGGTTCTTGTGTCTGCCACGTCCTTCACAACACTACACTATCATCGGATAATC
AAGTAGTTTGCACTTGTTGA

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL8119Contig1 841 2 4 U
GGTCTAATATCAACCTTAACGGTTCGATTTACTTTGGTTGTCTGAGTGTGCCTGGAATAC
TCTTAGCTCATGATTTCTATTCCGATTCCGATCAATTCCGGGTTGTTCAATTACCGGACT
ATCCGGATCACAACAAGGACTACAAACGGACCTTGACTACATCAGGAGGCTTTGTCATGT
ACGTCAGGACATTAGCAAAAAAGGAAGAAACTGTTTTGAAGATTTGGAGGCTGAACAATG
ATGACGACACTTGGCATCTTTTGTGGGAAGTAGGCTTCCCGATTACCGGTAACTATGCAC
CCATGGCAATGCATCCATTTGATGTCGGTACTGTCTATCTGTGGAGTCAACGGGATCATC
ATTTGGTATCATGTAACTTGCGGGAAGGAGACCACACAGTCAACGGGGATGCAGCTAATG
ATGGTCATCAATATTGTTTCATTGACCATTCTGTTTGTAAGGAGAGTGTGGATGAGCTAT
GGTGATCATCAGAAGATTTAGAGGAAGAAGGCTTGAACTTTAGAGTTTGTATCCGGTTGT
TCCAATTCGTGATCCCACGGTGGATGGAATCCGTGCCTCGTCCTCCCCAAGCTGAGGTGA
TAGATACGACATCACTGCTTTCTTACGCTGCCGCAACACATGAGAGAATGATGGAGGGTA
TAAGATATGAAGAGAACTTTTGGATGGAGATGGAGTGATGTCAGTATGTTTTTTTTTTTT
AATGTGATGTCTTTTGGATTTAATATTGCTTTATAAACGGTCTGAACTATAATTTTTTTC
TTTTCAGAATTCTGTATTAACACTTTCAATTAATCTTAATCCTACAAACTAGTTTTGGAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4GB06TF U 1
AF RR4GB06JQ C 119
BS 1 719 RR4GB06TF
BS 720 721 RR4GB06JQ
BS 722 755 RR4GB06TF
BS 756 841 RR4GB06JQ

RD RR4GB06TF 755 0 0
GGTCTAATATCAACCTTAACGGTTCGATTTACTTTGGTTGTCTGAGTGTGCCTGGAATAC
TCTTAGCTCATGATTTCTATTCCGATTCCGATCAATTCCGGGTTGTTCAATTACCGGACT
ATCCGGATCACAACAAGGACTACAAACGGACCTTGACTACATCAGGAGGCTTTGTCATGT
ACGTCAGGACATTAGCAAAAAAGGAAGAAACTGTTTTGAAGATTTGGAGGCTGAACAATG
ATGACGACACTTGGCATCTTTTGTGGGAAGTAGGCTTCCCGATTACCGGTAACTATGCAC
CCATGGCAATGCATCCATTTGATGTCGGTACTGTCTATCTGTGGAGTCAACGGGATCATC
ATTTGGTATCATGTAACTTGCGGGAAGGAGACCACACAGTCAACGGGGATGCAGCTAATG
ATGGTCATCAATATTGTTTCATTGACCATTCTGTTTGTAAGGAGAGTGTGGATGAGCTAT
GGTGATCATCAGAAGATTTAGAGGAAGAAGGCTTGAACTTTAGAGTTTGTATCCGGTTGT
TCCAATTCGTGATCCCACGGTGGATGGAATCCGTGCCTCGTCCTCCCCAAGCTGAGGTGA
TAGATACGACATCACTGCTTTCTTACGCTGCCGCAACACATGAGAGAATGATGGAGGGTA
TAAGATATGAAGAGAACTTTTGGATGGAGATGGAGTGATGTCAGTATGTTTTTTTTTTT*
*ATGTGATGTCTTTTGGATTTAATATTGCTTTATA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4GB06JQ 723 0 0
CTATCCGGATCACAACAAGGACTACAAACGGACCTTGACTACATCAGGAGGCTTTGTCAT
GTACGTCAGGACATTAGCAAAAAAGGAAGAAACTGTTTTGAAGATTTGGAGGCTGAACAA
TGATGACGACACTTGGCATCTTTTGTGGGAAGTAGGCTTCCCGATTACCGGTAACTATGC
ACCCATGGCAATGCATCCATTTGATGTCGGTACTGTCTATCTGTGGAGTCAACGGGATCA
TCATTTGGTATCATGTAACTTGCGGGAAGGAGACCACACAGTCAACGGGGATGCAGCTAA
TGATGGTCATCAATATTGTTTCATTGACCATTCTGTTTGTAAGGAGAGTGTGGATGAGCT
ATGGTGATCATCAGAAGATTTAGAGGAAGAAGGCTTGAACTTTAGAGTTTGTATCCGGTT
GTTCCAATTCGTGATCCCACGGTGGATGGAATCCGTGCCTCGTCCTCCCCAAGCTGAGGT
GATAGATACGACATCACTGCTTTCTTACGCTGCCGCAACACATGAGAGAATGATGGAGGG
TATAAGATATGAAGAGAACTTTTGGATGGAGATGGAGTGATGTCAGTATGTTTTTTTTTT
TTAATGTGATGTCTTTTGGATTTAATATTGCTTTATAAACGGTCTGAACTATAATTTTTT
TCTTTTCAGAATTCTGTATTAACACTTTCAATTAATCTTAATCCTACAAACTAGTTTTGG
ACC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL8120Contig1 628 2 1 U
GGAGGTATAGATTCGATTCCCGTTCTTGAGAGCGCCTTAGCTGATTTGTGTTGTTGTTTT
GTTTCGATTGGGTTTATACTCGATCGAGTAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTG
TGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACCGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTGATGTGA
GTATGAATACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTGAAGGGGAAGAACCCAGTGACGA
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ACCTGGAGACTTTGCTCGTGGAAGACACTCCTCGAATTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTG
GGAAACCTGTTGGACGAGGGCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGGCTGGTCGTG
GCAGAGGTCGTTAAGTTGCAGCAAGTGCACTTGAAAGAGTTGAAGGCGAGTGAGTTGAAT
TTCTTGAGGAAGTGGTGGATCCCTTTTGGTGTCTAGGAGAATGTACTGAACTATGTATTT
AGGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATGTTGGCATGATTTGTGCTCGTAAGCAAGTTACTGT
GTAATGCGACTCTTCATCATGGATAAGA


BQ
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AF RR4FG04JQ C 1
AF RR4FG04TF U 1
BS 1 628 RR4FG04TF

RD RR4FG04JQ 628 0 0
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GTTTCGATTGGGTTTATACTCGATCGAGTAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTG
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GGAAACCTGTTGGACGAGGGCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGGCTGGTCGTG
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GTAATGCGACTCTTCATCATGGATAAGA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4FG04TF 628 0 0
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GTTTCGATTGGGTTTATACTCGATCGAGTAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTG
TGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACCGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTGATGTGA
GTATGAATACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTGAAGGGGAAGAACCCAGTGACGA
TGGACCATCTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTCCCTGATAGCTTGA
ACCTGGAGACTTTGCTCGTGGAAGACACTCCTCGAATTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTG
GGAAACCTGTTGGACGAGGGCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGGCTGGTCGTG
GCAGAGGTCGTTAAGTTGCAGCAAGTGCACTTGAAAGAGTTGAAGGCGAGTGAGTTGAAT
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AGGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATGTTGGCATGATTTGTGCTCGTAAGCAAGTTACTGT
GTAATGCGACTCTTCATCATGGATAAGA

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL8121Contig1 820 2 2 U
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GCAAGGCGGTTGCTTTCTCATGAAGTGGGATCAATAACAAATGTCGTGTTTATGGGAATG
GGTGAGCCATTTCACAATATTGAGAATGTCATCAAAGCTGCAAATATAATGGTAGATGAG
AATGGACTTCACTTTAGTCCACGCAAGGTCACAGTCTCTACCAGTGGCCTTGTTCCTCAG
CTAAAGCGGTTTCTCCGTGAATGTAACTGCGCTTTGGCAGTCAGTCTTAATGCAACAACC
GATGAGGTTAGAAACTGGATCATGCCCATCAACAGGAAATACAAGTTATCTTTGCTCCTT
GAGACGCTCAGAGAAGAACTCAGTTCAATGCACAAGTACAAAGTGTTGTTCGAGTACGTG
ATGCTCGCAGGAGTGAATGACAGCATGGAAGATGCGAGGAGGCTAGTGGAGCTTGTGCAG
GGAATCCCATGCAAGATCAACCTTATCAGTTCAACCCACACAGTGGTTCTCAGTTTATAC
AGACCGATGAAGACAAGATGATCAAGCGTAATGTTCTGGCTGAAGGAGGCTGCACTGTTT
TAATGCGGTTTAGCCGAGGCAATGATCAAATGGCTGCATGTGGGCAGCTTGGCATGCTTG
GTGCTACTCAAGCACCAGTGATGAGGGTGCCTGAGCAGTTCCGCACCGCTCTAAAAGCAT
CTATTTGATCTTTTAGATTTCTAAGATTAGGACAAAAGATGTACTAAATCTCCATGTTGT
GAAATTACATTGATTATATTTAAATTTTAAGGTTTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FW59TF U 1
AF RR4FW59JQ C 81
BS 1 682 RR4FW59TF
BS 683 820 RR4FW59JQ

RD RR4FW59TF 682 0 0
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GATGAGGTTAGAAACTGGATCATGCCCATCAACAGGAAATACAAGTTATCTTTGCTCCTT
GAGACGCTCAGAGAAGAACTCAGTTCAATGCACAAGTACAAAGTGTTGTTCGAGTACGTG
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TAATGCGGTTTAGCCGAGGCAATGATCAAATGGCTGCATGTGGGCAGCTTGGCATGCTTG
GTGCTACTCAAGCACCAGTGAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4FW59JQ 740 0 0
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ACGCAAGGTCACAGTCTCTACCAGTGGCCTTGTTCCTCAGCTAAAGCGGTTTCTCCGTGA
ATGTAACTGCGCTTTGGCAGTCAGTCTTAATGCAACAACCGATGAGGTTAGAAACTGGAT
CATGCCCATCAACAGGAAATACAAGTTATCTTTGCTCCTTGAGACGCTCAGAGAAGAACT
CAGTTCAATGCACAAGTACAAAGTGTTGTTCGAGTACGTGATGCTCGCAGGAGTGAATGA
CAGCATGGAAGATGCGAGGAGGCTAGTGGAGCTTGTGCAGGGAATCCCATGCAAGATCAA
CCTTATCAGTTCAACCCACACAGTGGTTCTCAGTTTATACAGACCGATGAAGACAAGATG
ATCAAGCGTAATGTTCTGGCTGAAGGAGGCTGCACTGTTTTAATGCGGTTTAGCCGAGGC
AATGATCAAATGGCTGCATGTGGGCAGCTTGGCATGCTTGGTGCTACTCAAGCACCAGTG
ATGAGGGTGCCTGAGCAGTTCCGCACCGCTCTAAAAGCATCTATTTGATCTTTTAGATTT
CTAAGATTAGGACAAAAGATGTACTAAATCTCCATGTTGTGAAATTACATTGATTATATT
TAAATTTTAAGGTTTTTTCG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL8122Contig1 805 2 1 U
GGGGAAGGAAAAGAACTAAAAAAAAAAACAAAAAATGGAATCGAAAGCTATTTGCTTAGG
GTTTCTTCCGCCAAGACTTCAACTTTCATCTCGACTCTCACTCTCCCGTCTTCACGGTTC
TTCCACATCTCCAAAGCCTCTTGTCAGACAAACCTTAGTCTGGAATAAACCACAAGGTGG
CCGTGTCCTATGTTCTTCTCAACCTGATAGTTATGCTCCTCGATCTGAGCTGTTCCGTGG
AAAGTCTGGTTCTGTTTCTTTCAACGGCCTGACCCACCAGCTGGTTGAAGAAAGTAAACT
TGTCTCGGCTCCGTTTCAGGAAGAAGACAAAGGTTCCTTCTTGTGGGTCTTGGCTCCTGC
CGTCTTGATATCCTCATTGATTCTTCCTCAGTTCTTTCTCAGTGGTGCCATTGAATCTAC
CTTTAAAAACGAGACCGTTGCAGAGATTGTTACTTCTTTCTGCTTTGAGACGGCGTTTTA
TACTGGTTTAGCGATATTCCTTTCTGTGACGGACAGAGTGTAGAGGCCGTACTTAGACTT
CAGCACCAAGAGATGGGGTCTAATCACTGGACTTAGAGGATACCTCATGTCAACATTTCT
GATGATGGGTTTGAAAGTTGTAGTCCCTGTGTTTGCTGTGTACATGACTTGGCCAGCTCT
TGGAATGGATGCGTTGATTGCTGTCCTTCCTTTCTTGGTTGGATGTGCGGTTCAGCGAGG
TTTCGAGGCTCAGCTTGAACGACGTGGCTCGTCCTGTTGGCCCATTGTTCCAATAGTCTT
TGAGTGTATAGGCTGTATCACGTGA


BQ
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AF RR4AB68TF U 1
AF RR4AF49TF U 1
BS 1 805 RR4AB68TF

RD RR4AB68TF 805 0 0
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AAAGTCTGGTTCTGTTTCTTTCAACGGCCTGACCCACCAGCTGGTTGAAGAAAGTAAACT
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TGAGTGTATAGGCTGTATCACGTGA

QA 1 805 1 805
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CCGTGTCCTATGTTCTTCTCAACCTGATAGTTATGCTCCTCGATCTGAGCTGTTCCGTGG
AAAGTCTGGTTCTGTTTCTTTCAACGGCCTGACCCACCAGCTGGTTGAAGAAAGTAAACT
TGTCTCGGCTCCGTTTCAGGAAGAAGACAAAGGTTCCTTCTTGTGGGTCTTGGCTCCTGC
CGTCTTGATATCCTCATTGATTCTTCCTCAGTTCTTTCTCAGTGGTGCCATTGAATCTAC
CTTTAAAAACGAGACCGTTGCAGAGATTGTTACTTCTTTCTGCTTTGAGACGGCGTTTTA
TACTGGTTTAGCGATATTCCTTTCTGTGACGGACAGAGTGTAGAGGCCGTACTTAGACTT
CAGCACCAAGAGATGGGGTCTAATCACTGGACTTAGAGGATACCTCATGTCAACATTTCT
GATGATGGGTTTGAAAGTTGTAGTCCCTGTGTTTGCTGTGTACATGACTTGGCCAGCTCT
TGGAATGGATGCGTTGATTGCTGTCCTTCCTTTCTTGGTTGGATGTGCGGTTCAGCGAGG
TTTCGAGGCTCAGCTTGAACGACGTGGCTCGTCCTGTTGGCCCATTGTTCCAATAGTCTT
TGAGTGT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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TTCTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ34JQ U 4
AF RR4AZ34TF C 1
BS 1 3 RR4AZ34TF
BS 4 631 RR4AZ34JQ
BS 632 727 RR4AZ34TF

RD RR4AZ34JQ 628 0 0
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AACTATCACCAGCCATGAGAGTCCGTAAACTATGATGCTCTGCTGTTTTCCGAGTCTGCT
CTCTTTGGTTAAGTTCAAATGGTAGACA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4AZ34TF 727 0 0
CGAGGAAAAAAGTAGTAACAGATTTAAGAGGAAGAAGCAATAGAGTTATAAAAGAAAATC
AGAGAATAGTTTTTAAAGAAGAGAACAAGTAGAGGTGAAGTAATCTCACTTCTGTTTTTT
ACCACCAGCAAGGATACGTTGAATCTGAAGGCCACGGCTAAATGCTTGGTTGAAAAGAAG
CCTAGTCTGAAACTCGGAGACGAAGGGGAACCAGGCGAGAATGGTGACTGGCATGAAGAT
GACAACCCCCATTATGTACTCATACCCTCGAGCCAATGCCTTAACCGAGCCCCACATTCC
TACGGCCTTCATCAGTGTTCTTCCCACCTGCGAGATCTGAAGCAGAGCCCATCCGGTTGG
TAGAAACGCTAAGAAACTCTGCAGTATATCTCCCACTGTAAGTTTCAGGAAGTGAAATAG
CATTCCAACTATCACCACTGATCCTATGAAGAGAAACAGCTTGAGCAATCTGAACATCAG
CTGGAAATCCGCGCTAAACTTCTTTCTCCCCATCGACACTATCTTCAGTACGATCATCAC
TGCAACTATCACCAGCCATGAGAGTCCGTAAACTATGATGCTCTGCTGTTTTCCGAGTCT
GCTCTCTTTGGTTAAGTTCAAATGGTAGACAATTCCATATTGGTAGATGAAGTAGCGGAG
AGGGAGGAAGATCTTCCAGAACTTTCCGAAAAAGCCAGAGTGAAGCAAATGCTCTTGTTC
TTCTTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL8124Contig1 1167 2 2 U
GGAGGTGGGTGGGCTGTTCAAACCTTTTACTTCTCTCTTCCGCTAAATAATATTCTCTCC
CCTCTCAGACTTCCTTCCTTCCGCCGCCGACAATGCAGCACCAGACGAGGAGTGTTAAAG
TGGAGAATGTGTCAGATCTGGCAACGGAGAGAGAGATTCACGAGTTTTTCTCCTTCTCCG
GCGACATAGACCACATCCACATCCTCAAAGATGCTTCCGAGCAATCAAGAGTCGCTTTTG
TTACCTTTACTGAACCTAAAGCCCTTGAAATCGCTCTCTTGTTATCGGGTGCCACAATTG
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AAGTGGTAGAGAACACGATACCACCAACACCAACACGCCAGAACACGGATGGCAATGGTG
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CTCTTGGACAAGATGCTGTCAACAAAGCCAAGGCTTTTGATGAGTTGCACCAGCTAAGAG
CCAATGCTTCCGCCAAAGTTTCTTCTTTTGACAAGAGAGTCAGGCTTAGCGAGAAGTTCA
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CAGATAAAACCATGGCCGCTATATTTGCAGCTGAGAAGAAGTTAAACGACACTGGTTCAG
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TCTCCAATATAGCTTCCAAGGATACACCGATTGCTGTATAATAAGAAGTCGGAAGGGGAG
TAAAAGCGTTGAAGTGAGGATCAATGAGTAGCTCCTAAAAGAGCTATTATATGATGGCCT
TGTGTGAACAAATTTTGTGTGATAAATAGCATATTCCTATTCTTTTTAGTATTCATTATA
TACTGCATTGTTCCCTTAATTCACTTCATGTTTTTGCATCAGTGTAAGTGTTTTCGAATT
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GTGAACGACTTGACGTTCATCTAAATC


BQ
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AF RR4D389TF U 1
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GCGACATAGACCACATCCACATCCTCAAAGATGCTTCCGAGCAATCAAGAGTCGCTTTTG
TTACCTTTACTGAACCTAAAGCCCTTGAAATCGCTCTCTTGTTATCGGGTGCCACAATTG
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DS 

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TGACGTTCATCTAAATC

QA 1 617 1 617
DS 



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BQ
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AF RR4EM77JQ C 1
AF RR4EM77TF U 1
BS 1 628 RR4EM77TF

RD RR4EM77JQ 628 0 0
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CCCCTGCTCCTTCCGCTCTGCATGTCTATGATCTCTGATCGCTGCTCCAATTGAGGCTGA
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TCATGCTTTCAATAGAATATAATTTAGC

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DS 

RD RR4EM77TF 628 0 0
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ATCACCTCTGATCCCTCTCTCGTTCCGCCTACTCAATGGACAGATGTTCTCACTGCGCTG
CACTCGCCCTCACTCACTGGAACATGGCGCCTACTAACACTTCTTGCTTGGCAATCTACT
ATCTACTTCTGTTGGTCTGAGCGCAATACCCGTATCCACCGCTCATCGTACCGCCACCAG
GATTTGATCAGAAAAGAAATAGACAAGGTGATCAAGGTCAAGATCGCGTCTATCAGACTC
TCAAACCCGTCGCTTGCATCGTCTCTGTTCCAAGCCTGGACTCGGTGAGATTCGTTCTCT
CCCCTGCTCCTTCCGCTCTGCATGTCTATGATCTCTGATCGCTGCTCCAATTGAGGCTGA
AAATTTGTTTGGGCTTGGGCAAGCCTACAGATTTCTTTCTCTCGTTTATTTTGGTTCTGG
TTCTATTCCTAAATGTATGGCCCTTGGCCCATTAAGCCCAGCTTTGTAAACTTTATGGTC
TCATGCTTTCAATAGAATATAATTTAGC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

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AACAACATTTCTCTTTACCAACATTGTTGATCAAAAATCATTTGAAATTTTCCCG


BQ
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AF RR4FG80JQ C 1
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DS 

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GTCCAGTGGCAGTTGGAGATTTCTTGGTAGCACACTCGCAAGTTCTACCTGGTTATACTC
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GCATCAAATTCTCATTCATGATTGGATTGGGATCATCATCGGTGGCCGACATGTAGAGCT
ATTTTGCTCGCTGGGATATACCCATGCGATCACTCCATTTGCTTTGTATAAAAAAAGAAA
AACAACATTTCTCTTTACCAACATTGTTGATCAAAAATCATTTGAAATTTTCCCG

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D681TF U 1
AF RR4D681JQ C 245
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BS 800 812 RR4D681TF
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AGTAGTTTGTCGTCTTTGCATGTTTTGAGCCAACCTATAATACTTTTTTCACTTTCACTT
AG*TGTTGTATCGGATTT*GTCCTAATGTTT*CTTTCTCGACA*TTTATT*ATATCCCAT
GTCTT*CTACTCTCTTTT*AACTTTTATCAGA
TTTGTTTCATTAAA

QA 1 812 1 812
DS 

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TTACGAGCGTAAGAAACAGCTTAACAAACTTAGAGCCAAGGCTGAGAAGGTGGCTGAGGA
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QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AE43JQ C 1
AF RR4AE43TF U 1
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RD RR4AE43JQ 655 0 0
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GACCATATAAATACTCTTGTAATCCCAAAATTTGGGAATTAACTATTTTTCTCTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4AE43TF 655 0 0
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TGACCCGGAGCGGGGTTGTGACCCGGGTACGGAGACCCCGCTGCGTGTTATCTCTTGGTC
GTTTTTATGACTTTTAAGGGGTTTTTTAGACTTTTCTATTGGTACCATTAGGTTTCTAAA
GACCATATAAATACTCTTGTAATCCCAAAATTTGGGAATTAACTATTTTTCTCTC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL8129Contig1 670 2 5 U
ACTAGACGGTACCAAATAAATATAATTGAAGTATATGGTTGATCTTACATAGTTATTATA
TGTATACACTGATAAAGAAGAATCATAAGCTTAAGACTTAACTAAGCAGAAACAAGACCA
GTTCCACGAGCCACTCCTTTTGATCTCATCACTCAGCCAAAATCTACAGAAGAATTTGTT
AGAGAGCTGTGACGTGACGCCTTGGTGGTTCTTGATTTTGCAGCCAAATCAAGAACTGTA
ACAAATCACCTACAAAATCTGAAAACTTCAACCAAAGCCCACTCAGTATTTCGTCTAAAG
AATCTTCTGGTCACACGACCCTTTCTGACATTAAACCGGAGAGATCAGGAGGTTAGCAAT
AATCCATACCATCACCAAAAGTGAGCCTGAGTTCGCCCCTATAAACCCCTTTAATTCCAT
CTAGCTGGTGCCCTTGCGGATTTTTTACTCTTGTCCTTCTTTAAGAGCGTCGACATGTGG
TTAAGATCATTCAAACTCGACTTGGACTCGCCTTGTAACCACAACAAAGCCTCACGAGCT
GCATCCTTCTCTGCGCTTTTCTTCGTACCACATGGTTGCCCCATGAAATCCAACCCATTG
AAAGTGACCATTGCCCGAAACTGGTTGTTCTTCAGCTGTCTCGTCTTGTACACTGGTGTT
CCGTGTCCTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG19JQ U 4
AF RR4DE71JQ U 1
BS 1 199 RR4DE71JQ
BS 200 200 RR4EG19JQ
BS 201 396 RR4DE71JQ
BS 397 397 RR4EG19JQ
BS 398 670 RR4DE71JQ

RD RR4EG19JQ 640 0 0
AGACGGTACCAAATAAATATAATTGAAGTATATGGTTGATCTTACATAGTTATTATATGT
ATACACTGATAAAGAAGAATCATAAGCTTAAGACTTAACTAAGCAGAAACAAGACCAGTT
CCACGAGCCACTCCTTTTGATCTCATCACTCAGCCAAAATCTACAGAAGAATTTGTTAGA
GAGCTGTGACGTGACGCCTTGGTGGTTCTTGATTTTGCAGCCAAATCAAGAACTGTAACA
AATCACCTACAAAATCTGAAAACTTCAACCAAAGCCCACTCAGTATTTCGTCTAAAGAAT
CTTCTGGTCACACGACCCTTTCTGACATTAAACCGGAGAGATCAGGAGGTTAGCAATAAT
CCATACCATCACCAAAAGTGAGCCTGAGTTCGCCCCTATAAACCCCTTTAATTCCATCTA
GCTGGTGCCCTTGCGGATTTTTTACTCTTGTCCTTCTTTAAGAGCGTCGACATGTGGTTA
AGATCATTCAAACTCGACTTGGACTCGCCTTGTAACCACAGCAAAGCCTCACGAGCTGCA
TCCTTCTCTGCGCTTTTCTTCGTACCACATGGTTGCCCCATGAAATCCAACCCATTGAAA
GTGACCATTGCCCGAAACTGGTTGTTCTTCAGCTGTCTCG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4DE71JQ 670 0 0
ACTAGACGGTACCAAATAAATATAATTGAAGTATATGGTTGATCTTACATAGTTATTATA
TGTATACACTGATAAAGAAGAATCATAAGCTTAAGACTTAACTAAGCAGAAACAAGACCA
GTTCCACGAGCCACTCCTTTTGATCTCATCACTCAGCCAAAATCTACAGAAGAATTTGTT
AGAGAGCTGTGACGTGACGTCTTGGTGGTTCTTGATTTTGCAGCCAAATCAAGAACTGTA
ACAAATCACCTACAAAATCTGAAAACTTCAACCAAAGCCCACTCAGTATTTCGTCTAAAG
AATCTTCTGGTCACACGACCCTTTCTGACATTAAACCGGAGAGATCAGGAGGTTAGCAAT
AATCCATACCATCACCAAAAGTGAGCCTGAGTTCGCTCCTATAAACCCCTTTAATTCCAT
CTAGCTGGTGCCCTTGCGGATTTTTTACTCTTGTCCTTCTTTAAGAGCGTCGACATGTGG
TTAAGATCATTCAAACTCGACTTGGACTCGCCTTGTAACCACAACAAAGCCTCACGAGCT
GCATCCTTCTCTGCGCTTTTCTTCGTACCACATGGTTGCCCCATGAAATCCAACCCATTG
AAAGTGACCATTGCCCGAAACTGGTTGTTCTTCAGCTGTCTCGTCTTGTACACTGGTGTT
CCGTGTCCTC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL8130Contig1 1049 2 2 U
AACCAACACAAAATGGGTAGCTATCTGATCTCTTTCTCCCAGTTGTCCACATGTTGGTGT
TATTAGGATCCTCAGTAGATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTACTGGCCAAGCTCCA
AGGTTGGACCCGTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAGGAATCTTTGGGGTCCTCAGCATCAGA
GAATGGACCAAAATGCTCTTAACCTCTGGCTTGATAGAGCCTCAGGAAGTGGATTCAAGT
CAGTGAAGCCATTCAGATCAGGTTTTGGGGCATCCATTAAACTCCAACCTGGCTACACTG
CTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACATCCAGGCTTCCATGATG
AAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACAACATTTGGAAAACCATACACACTTCAGACAAATG
TGTACATTAGTGGAAGTGGTGATGGCAAAATTATTGGTCGTGAAATGAAGTATCGCTTGT
GGTTTGATCCCACTTCAGGTTTTCACCATTATGCTATTCTTTGGAACCCTAAAGAAATCA
TATTTTTGGTAGATGATATTCCAATAAGTAGATACCCAAAGAAGAGTGCGGCCACATTTC
CTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGTTCCATATGGGACGCTTCTTCTTGGGCAACGGAAGA
TGTATGGTGCCATCCCGTGTCGGCTTCACCATACCGTTCTGGTGGGTTAACACGAAAGCA
ATACCAAGCTATGAGATGGGTTCAAACACATAGCATGGTATACGACTATTGCAAAGATTA
TAAGCGAGACCATTCTCTAACGCCGGAATGTTGGCGTTAGGAAAAAATCCAGGGCAGTTT
CGAAGTTCCAGAATTTTAATTAAATCAAAGGAAGTACAACAAAAGCTTGGTAATTTTTTG
GGACTTCTTCTGCTACTATATTATTGTGGTTTTTGTTTCACAAAATAAAAGTTCTTTTTT
TTGCTTATAATCGTTGTGTAATGTGTAAATGTTTCAAATACAATGTTGTTGATCAACTTT
GAATCATAAAAAAAATTGTTTGAAAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG53TF U 1
AF RR4EG53JQ C 386
BS 1 565 RR4EG53TF
BS 566 1049 RR4EG53JQ

RD RR4EG53TF 565 0 0
AACCAACACAAAATGGGTAGCTATCTGATCTCTTTCTCCCAGTTGTCCACATGTTGGTGT
TATTAGGATCCTCAGTAGATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTACTGGCCAAGCTCCA
AGGTTGGACCCGTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAGGAATCTTTGGGGTCCTCAGCATCAGA
GAATGGACCAAAATGCTCTTAACCTCTGGCTTGATAGAGCCTCAGGAAGTGGATTCAAGT
CAGTGAAGCCATTCAGATCAGGTTTTGGGGCATCCATTAAACTCCAACCTGGCTACACTG
CTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACATCCAGGCTTCCATGATG
AAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACAACATTTGGAAAACCATACACACTTCAGACAAATG
TGTACATTAGTGGAAGTGGTGATGGCAAAATTATTGGTCGTGAAATGAAGTATCGCTTGT
GGTTTGATCCCACTTCAGGTTTTCACCATTATGCTATTCTTTGGAACCCTAAAGAAATCA
TATTTTTGGTAGATGATATTCCAAT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR4EG53JQ 664 0 0
AACATTTGGAAAACCATACACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGTGGAAGTGGTGATGG
CAAAATTATTGGTCGTGAAATGAAGTATCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCAGGTTTTCA
CCATTATGCTATTCTTTGGAACCCTAAAGAAATCATATTTTTGGTAGATGATATTCCAAT
AAGTAGATACCCAAAGAAGAGTGCGGCCACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGT
TCCATATGGGACGCTTCTTCTTGGGCAACGGAAGATGTATGGTGCCATCCCGTGTCGGCT
TCACCATACCGTTCTGGTGGGTTAACACGAAAGCAATACCAAGCTATGAGATGGGTTCAA
ACACATAGCATGGTATACGACTATTGCAAAGATTATAAGCGAGACCATTCTCTAACGCCG
GAATGTTGGCGTTAGGAAAAAATCCAGGGCAGTTTCGAAGTTCCAGAATTTTAATTAAAT
CAAAGGAAGTACAACAAAAGCTTGGTAATTTTTTGGGACTTCTTCTGCTACTATATTATT
GTGGTTTTTGTTTCACAAAATAAAAGTTCTTTTTTTTGCTTATAATCGTTGTGTAATGTG
TAAATGTTTCAAATACAATGTTGTTGATCAACTTTGAATCATAAAAAAAATTGTTTGAAA
GGCT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL8131Contig1 604 2 1 U
TTTTTGCCGCCGCCTTCAGGTAAAGTCAAACAGGTAAACTAAACTTAAAAGATGGGGCGT
GTCCGAACCAAGACCGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGC
ATGACGCTCGACTTCCACACGAACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTCGCCATCATCCCTTCC
AAGCGTCTCCGCAACAAGATTGCTGGATTCTCCACTCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAG
GGACCGGTACGTGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGAC
TTTGTGCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGGGATCAAGGTCGACAAGGAGACTCTT
GAGATGCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCTG
GCTGTGGCTCCTGCTTTTGGTGGCAGGCCACAAAGAAGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCA
CTATTATGAGTCAATCAAAGAGAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGA
TTCGAGACTTTTATGTCCCAAGCTGAAAGTGAGACTACTTTTCTACTATATGAGTTTTTG
AGTT


BQ
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AF RR4G332JQ C 1
AF RR4G332TF U 1
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QA 1 604 1 604
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GGACCGGTACGTGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGAC
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GAGATGCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCTG
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QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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TTGATTGAAGGT


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AF RR4HB35TF U 1
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BS 1 740 RR4HB35TF
BS 741 972 RR4HB35JQB

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ACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCTCTTGTCACACTCTTATTCATCATAGCAATCAAC
TTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCGCACATTGGAGGCTTCTTAACA
GGGTTGTGCCTCAGGTTTGTCCTCCTTGTCCGACCACAGTACGGTTGGGAAGCTTCTCGC
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TGGTGTCA

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DS 

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TGGACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCTCTTGTCACACTCTTATTCATCATAGCAATC
AACTTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCGCACATTGGAGGCTTCTTA
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TGTTTGATTGAAGGT

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GC27TF U 1
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DS 

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AGCATAAAGACGAGGTTGTCGTAAGGCAGTTCAATGTGGAGCAGATTAAGAAGAGGTTGG
AGGAAGAGGAAGAGGCTTACCAGAGACAAAGCCAACAAGTTAGAGAGAAGTCGATTGCTA
GCCTTAGAACTCGTCTTCCTGAGCTTTTTCAGGCAATGTCTGAGGTTGCGTATTCGTGTT
CGGATATGTATAGAGCGGTTGCGTATTATGTGACTCAGCGGCAAAGCCAAAGCGAACGGC
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TAAGAAAAGAGTGATGTCTTTCTTTTTTTCTTTGGTCTGAATTGTTCAGCACACACAAAT
ACAGCTTATAGCATATAGTTATCTTTGCTTTCTTATATTATGTTTTTGGGGTTTTATAAG
GTTTGTTACGTCTGTGTTATATATAGACTTGATTTCT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4E691TF U 1
AF RR4DW73TF U 1
BS 1 688 RR4DW73TF

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AACGGCGATGTGGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAG
AATCTGAACACAGATGCCTTCAGAATGTCCATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGG
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TTAGAGGACGAATATGGTGGCTTTTTAAGCGAAAGAATTGTGAAAGACTTCCGAGAATAT
GCAGATTTTGTTTTCCAAGAATATGGTGGAAAAGTGAAACATTGGATCACTTTCAACGAA
CCAGGGTTTTCTCCCACGCTGGTTATGA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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GTACCTCTTTAAAGAACTCACTCACTCTCTCTTTCTCTCTGTTACCAAAAATCCCTAAAC
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ATTCTATTTTCAATAGAATCCTTAACTATTCC


BQ
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AF RR4GF66TF U 1
AF RR4GF66JQ C 301
BS 1 695 RR4GF66TF
BS 696 1052 RR4GF66JQ

RD RR4GF66TF 695 0 0
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GTCCTCTCTCCGAGATCACAAGATCCTGCATCCTCCAACACCATTGTGTTTCGTTTCGTT
CCTCGTCCTTTTAGCCTTCGGCCTCATCGCTGACTTCCTCTGGGCTATTGCTTTTGTCTT
GTACCTCTTTAAAGAACTCACTCACTCTCTCTTTCTCTCTGTTACCAAAAATCCCTAAAC
CAAAGATTTCCAATTGGTTCTCGTGTAGTTGGAGCTTTCATTATCCCGTGTGGAACCTGT
TCTTATTGTGCTAAGGGCCACGATGATCTATGTTCTTTGCTTTACAATAGAGCCGTCCTG
GGGATTCTATTGCTGTGATTGGAATTGGTGGTGTTGACTCTAGGTTGACGTGGACAATTG
CAACACACATAAGCATTGAAGATGATGGACCTTGAGAACGAAGATGAGGATCGTGTAGTG
TCAAGTGACTTCATGGGCAGAGGAGAGAGCGAAGAGAGAGCCATTGGTAAAGCGTGAGAT
CGTTTAGAAAGGATGAAGACCCTTCGTTGGTGGAACTTTTGTTCCAATATGGTCGGTGCC
TTCTTATATCTTCTTCAAGACCTGGAACTCAGGTTGCTAACTTGCAGAGGATATGGAACA
GAGACGTTCAGCCGCCATGGGATGGTGCTCTTCAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GF66JQ 752 0 0
TCTTATTGTGCTAAGGGCCACGATGATCTATGTTCTTTGCTTTACAATAGAGCCGTCCTG
GGGATTCTATTGCTGTGATTGGAATTGGTGGTGTTGACTCTAGGTTGACGTGGACAATTG
CAACACACATAAGCATTGAAGATGATGGACCTTGAGAACGAAGATGAGGATCGTGTAGTG
TCAAGTGACTTCATGGGCAGAGGAGAGAGCGAAGAGAGAGCCATTGGTAAAGCGTGAGAT
CGTTTAGAAAGGATGAAGACCCTTCGTTGGTGGAACTTTTGTTCCAATATGGTCGGTGCC
TTCTTATATCTTCTTCAAGACCTGGAACTCAGGTTGCTAACTTGCAGAGGATATGGAACA
GAGACGTTCAGCCGCCATGGGATGGTGCTCTTCACCTGAACATTAATCTCCAGATGAACT
ATTGGCATTCTCTTCCTGCTAATATAAGGGAATGCCAAGAACCGTTGTTTGATTATATGT
CTGCTTTAGCTATCAATGGCCGCAAGACATCACAAGTAAGTTTCTATCCTTTTTGTATTG
ATGGTTACATTGTTGACATCAATGTGTGAAGTTTAATCGAAGATGAACAAGATATCAGAT
TCTTTTTGTGAAACTGTGTTGTTCTTGCAAACAAAAGTGTCACAGAACATAAACACATTT
GATCATATTGCTAATTTTTTTTTATTCCTAAGGATTCAAAATTAGAAAACACCATTGGAC
ATTCTATTTTCAATAGAATCCTTAACTATTCC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL8136Contig1 1207 2 2 U
ATTACTTAGTCGGCTTCAGCATCAGAATATAGTGAGATATCGTGGCACAGCCAAGGATGG
GTCGAATTTGTACATCTTTCTTGAGCTTGTATCCCAAGGTTCACTTCTAAAAACTTACCA
GAGATACCAGCTTCCGGACTCTGTAGTGTCCACCTACACCAGGCAGATCCTTGACGGCTT
GAAATATCTCCACGGAGAAGGTTTCATCCACCGGGACATCAAATGTGCAAATATATTGGT
GGACACAAGCGGAGCTGTTAAGCTTGCAGACTTTGGATTGGCAAAGGTTTCAAAATTAAA
CGACATTAAGTCCAGCAAGGGGACTCCATTCTGGATGGCTCCAGAGGTTATTAACCCGAA
GCGTACTGACGGGTATGGAAGTTCAGCTGATATATGGAGCCTTGGGTGTACAGTGCTGGA
ACTGCTGACTCAGAAGATCCCCTACTGCGATCTAGAAAACCCATATCAAGCCCTGTATAG
GATCGGAAAGGGTGAGCTTCCGGACATACCTGATACATTATCTCTGGACGCTAGAGATCT
CATTATTAGATGTCTCAGAGTGAACCCTGATGAGCGGCCAACTGCAGCTGAGCTACTGAA
CCATCCATTTGTGAAACGGCCCTTAGCGTCCTCAGGCTCGGGAATCAAGATCTTCGCTTC
TCCATAGACGATGCTAGCTTAGTAGAATGTCTACATTGGCGTAAGTAGAAGATTTGTGAG
AGGTGGATAAGACCCCAAAGAAACTAAAAACAATTGGGAAAACTTGGAGTATGATTCTTC
AACACAAGTCTCTGGTTCGGTTTGGCAGCAAGAGCTAAACTGCTTGGAGACATATCCTTT
AGGTTGTTTCTGGCTGATTCATTGGTTGTTTGTTGTTTAAGTTGTGTTAGGCTTTGATTC
TAAAACTGAACAGCCAATATTCTTCTAGGAAAAGGATAAATTAGAGAGTGACTTTGGGGT
TTTGAGTGTATATGTTTTGTTAAGTTATAGTGTATGCATCCCATATGTAATGTGATGTAA
TGTATGTATAATTGGGGTTTGGTAGTTCTTTTGTGTTTGTATCTCTGCACATTTCTTGTA
CCGTTGGGTTCTTTGCTCTAACTATCGTGTGAGACCCCTTCACGTATGGTCTTTTTTCTT
GTAGATTTTTGGTCAAAGCCACATTTATTGAAGTCTATGATTCAACTTGAATCGTACATT
TTTGCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CS52TF U 1
AF RR4CS52JQ C 363
BS 1 633 RR4CS52TF
BS 634 1207 RR4CS52JQ

RD RR4CS52TF 633 0 0
ATTACTTAGTCGGCTTCAGCATCAGAATATAGTGAGATATCGTGGCACAGCCAAGGATGG
GTCGAATTTGTACATCTTTCTTGAGCTTGTATCCCAAGGTTCACTTCTAAAAACTTACCA
GAGATACCAGCTTCCGGACTCTGTAGTGTCCACCTACACCAGGCAGATCCTTGACGGCTT
GAAATATCTCCACGGAGAAGGTTTCATCCACCGGGACATCAAATGTGCAAATATATTGGT
GGACACAAGCGGAGCTGTTAAGCTTGCAGACTTTGGATTGGCAAAGGTTTCAAAATTAAA
CGACATTAAGTCCAGCAAGGGGACTCCATTCTGGATGGCTCCAGAGGTTATTAACCCGAA
GCGTACTGACGGGTATGGAAGTTCAGCTGATATATGGAGCCTTGGGTGTACAGTGCTGGA
ACTGCTGACTCAGAAGATCCCCTACTGCGATCTAGAAAACCCATATCAAGCCCTGTATAG
GATCGGAAAGGGTGAGCTTCCGGACATACCTGATACATTATCTCTGGACGCTAGAGATCT
CATTATTAGATGTCTCAGAGTGAACCCTGATGAGCGGCCAACTGCAGCTGAGCTACTGAA
CCATCCATTTGTGAAACGGCCCTTAGCGTCCTC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4CS52JQ 845 0 0
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TGCTGACTCAGAAGATCCC*TACTGCGATCTAGAAAACCCATATCAAGCCCTGTATAGGA
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TTATTAGATGTCTCAGAGTGAACCCTGATGAGCGGCCAACTGCAGCTGAGCTACTGAACC
ATCCATTTGTGAAACGGCCCTTAGCGTCCTCAGGCTCGGGAATCAAGATCTTCGCTTCTC
CATAGACGATGCTAGCTTAGTAGAATGTCTACATTGGCGTAAGTAGAAGATTTGTGAGAG
GTGGATAAGACCCCAAAGAAACTAAAAACAATTGGGAAAACTTGGAGTATGATTCTTCAA
CACAAGTCTCTGGTTCGGTTTGGCAGCAAGAGCTAAACTGCTTGGAGACATATCCTTTAG
GTTGTTTCTGGCTGATTCATTGGTTGTTTGTTGTTTAAGTTGTGTTAGGCTTTGATTCTA
AAACTGAACAGCCAATATTCTTCTAGGAAAAGGATAAATTAGAGAGTGACTTTGGGGTTT
TGAGTGTATATGTTTTGTTAAGTTATAGTGTATGCATCCCATATGTAATGTGATGTAATG
TATGTATAATTGGGGTTTGGTAGTTCTTTTGTGTTTGTATCTCTGCACATTTCTTGTACC
GTTGGGTTCTTTGCTCTAACTATCGTGTGAGACCCCTTCACGTATGGTCTTTTTTCTTGT
AGATTTTTGGTCAAAGCCACATTTATTGAAGTCTATGATTCAACTTGAATCGTACATTTT
TGCCT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL8137Contig1 677 2 1 U
GGAAGATATTAAACATATTTTCGTTATAAAAGTTAATATCTTCCTCTCTATCAGTCCCTC
TCTTTCGTGATGGAAGCTCAGCACCTTCATGGCAAGCCTCAAGCTGAAGGAGAATGGTCC
ACAGGCTTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCGGAAACTGTTGTATCACATTCTGGTGTCCA
TGTATTACATTTGGCCAAGTGGCGGAGATTGTAGATCAAGGATCAACCACGTGTGGTACG
GCTGGAGCACTATATACGTTAATAAGTGCAGTAACGGGTTGCGGATGTCTCTACTCGTGT
TTCTATCGTGGAAAGATGAGGGCTCAGTACAATATTGGAGGCAATGATTGTGGAGATTGC
CTTAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCCCCTCACTCAACAATACCGTGAACTCAAGAA
CCGTGGCTACAATATGAAACTTGGATGGGCCGGGAACGCACAGATACAACAGAACCAAGG
CGTGGCGATGGGTGCTCCAGTCTTCCAAGGCGGCATGACCCGCTAAGATTCGTTCCTTTA
TATGTAATTTATTTATTTATATAATAAAGTGAGGTTTAATCCCTCTGTGTGGGATTTGTG
TAATATGCTTGTTATGATTTATGAAAGTGAATGTATATATTTGTATAATACCCGGTCAAG
GATATGACAATTTGACT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AS21JQ C 1
AF RR4AS21TF U 1
BS 1 677 RR4AS21TF

RD RR4AS21JQ 677 0 0
GGAAGATATTAAACATATTTTCGTTATAAAAGTTAATATCTTCCTCTCTATCAGTCCCTC
TCTTTCGTGATGGAAGCTCAGCACCTTCATGGCAAGCCTCAAGCTGAAGGAGAATGGTCC
ACAGGCTTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCGGAAACTGTTGTATCACATTCTGGTGTCCA
TGTATTACATTTGGCCAAGTGGCGGAGATTGTAGATCAAGGATCAACCACGTGTGGTACG
GCTGGAGCACTATATACGTTAATAAGTGCAGTAACGGGTTGCGGATGTCTCTACTCGTGT
TTCTATCGTGGAAAGATGAGGGCTCAGTACAATATTGGAGGCAATGATTGTGGAGATTGC
CTTAAACATTTTTTTTGCGAGCTCTGTGCCC*TCACTCAACAATACCGTGAACTCAAGAA
CCGTGGCTACAATATGAAACTTGGATGGGCCGGGAACGCACAGATACAACAGAACCAAGG
CGTGGCGATGGGTGCTCCAGTCTTCCAAGGCGGCATGACCCGCTAAGATTCGTTCCTTTA
TATGTAATTTATTTATTTATATAATAAAGTGAGGTTTAATCC*TCTGTGTGG*ATTTGTG
TAATATGCTTGTTATGATTTATGAAAGTGAATGTATATATTTGTATAATACCCGGTCAAG
GATATGACAATTTGACT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4AS21TF 677 0 0
GGAAGATATTAAACATATTTTCGTTATAAAAGTTAATATCTTCCTCTCTATCAGTCCCTC
TCTTTCGTGATGGAAGCTCAGCACCTTCATGGCAAGCCTCAAGCTGAAGGAGAATGGTCC
ACAGGCTTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCGGAAACTGTTGTATCACATTCTGGTGTCCA
TGTATTACATTTGGCCAAGTGGCGGAGATTGTAGATCAAGGATCAACCACGTGTGGTACG
GCTGGAGCACTATATACGTTAATAAGTGCAGTAACGGGTTGCGGATGTCTCTACTCGTGT
TTCTATCGTGGAAAGATGAGGGCTCAGTACAATATTGGAGGCAATGATTGTGGAGATTGC
CTTAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCCCCTCACTCAACAATACCGTGAACTCAAGAA
CCGTGGCTACAATATGAAACTTGGATGGGCCGGGAACGCACAGATACAACAGAACCAAGG
CGTGGCGATGGGTGCTCCAGTCTTCCAAGGCGGCATGACCCGCTAAGATTCGTTCCTTTA
TATGTAATTTATTTATTTATATAATAAAGTGAGGTTTAATCCCTCTGTGTGGGATTTGTG
TAATATGCTTGTTATGATTTATGAAAGTGAATGTATATATTTGTATAATACCCGGTCAAG
GATATGACAATTTGACT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL8138Contig1 869 2 6 U
GGCGTTGATATTGTTCAGGGCTATGGCTTGACATAGAGTACTGGCCCAGCTGCGGCGACG
TTTGGACCTGAAGAGACGGTTAGATATGGGTCAGTTGGTCGTATCTCTGAGAATATAGAG
GCGAAAATCGTTGATCCATCCACCGGAGAAGCTTTACCACCGGGGAAGAACGGTGACTTT
GGCTACGAGGACCAATCATCATGAAAGGTTATGTGGAGAATGAGAAAGCAACTGCTGAAA
CATTAGATCAAGAAGGGTGGTTAAAGACTGGTGATCTTTGTTACATTGATTCTGAAGGGT
TTTTATATATTGTTGATAGGCTAAAAGAACTTATCAAATACAAAGCTTATCAGGTCCCAC
CGGTAGAACTGGAGCAGATTCTTCATTCGAATCCGGACGTGGTTGATGCTGCAGTTGTTC
CGTTTCTGGACGAGGATGCAGGAGAGATTCCAATGGCTTTCATAGTGAGAAAACCAGGAA
GCAATCTCAACGAAGCACAAGTCATTGACTTTGTAGCTAAACAAGTTGCTCCGTATAAGA
AAGTAAGAAGAGTTGCTTTCATAAACGCAATTCCCAAAAACCCTGCTGGCAAGATTCTGC
GTCAGGAGCTAACCAAAATCGCCGTGAGTGGCAACGCCTCTAAACTTTGAGATAACCGGC
CGGTGTGGATATGATTCTATCGCTTCTCGGTGAATATGGAACCCGGTTTACTTGTTTAAA
TTATCCATCGTTCTCTTTTACCGCTTCAATTTCATTCCGTGCAAATCTGTAATTTCTTGC
GTTTTATTGGTCTGTTGAAATAAGCAAGTACAGTGAGCGGTTTGTATTTTCGTTAAATAT
GATTTAAGTTAAATACAGACCGTTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H663TF U 1
AF RR4H663JQB C 26
BS 1 591 RR4H663TF
BS 592 592 RR4H663JQB
BS 593 605 RR4H663TF
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BS 607 684 RR4H663TF
BS 685 869 RR4H663JQB

RD RR4H663TF 684 0 0
GGCGTTGATATTGTTCAGGGCTATGGCTTGACATAGAGTACTGGCCCAGCTGCGGCGACG
TTTGGACCTGAAGAGACGGTTAGATATGGGTCAGTTGGTCGTATCTCTGAGAATATAGAG
GCGAAAATCGTTGATCCATCCACCGGAGAAGCTTTACCACCGGGGAAGAACGGTGACTTT
GGCTACGAGGACCAATCATCATGAAAGGTTATGTGGAGAATGAGAAAGCAACTGCTGAAA
CATTAGATCAAGAAGGGTGGTTAAAGACTGGTGATCTTTGTTACATTGATTCTGAAGGGT
TTTTATATATTGTTGATAGGCTAAAAGAACTTATCAAATACAAAGCTTATCAGGTCCCAC
CGGTAGAACTGGAGCAGATTCTTCATTCGAATCCGGACGTGGTTGATGCTGCAGTTGTTC
CGTTTCTGGACGAGGATGCAGGAGAGATTCCAATGGCTTTCATAGTGAGAAAACCAGGAA
GCAATCTCAACGAAGCACAAGTCATTGACTTTGTAGCTAAACAAGTTGCTCCGTATAAGA
AAGTAAGAAGAGTTGCTTTCATAAACGCAATTCCCAAAAACCCTGCTGGCA*GATTCTGC
GTCAG*AGCTAACCAAAATCGCCGTGAGTGGCAACGCCTCTAAACTTTGAGATAACCGGC
CGGTGTGGATATGATTCTATCGCT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4H663JQB 844 0 0
GGC
TGACATAGAGTACTGGCCCAGCTGCGGCGACGTTTGGAC*TGAAGAGACGGTTAGATATG
GGTCAGTTGGTCGTATCTCTGAGAATATAGAGGCGAAAATCGTTGATCCATCCACCGGAG
AAGCTTTACCACCGGGGAAGAACGGTGACTTTGGCTACGAGGACCAATCATCATGAAAGG
TTATGTGGAGAATGAGAAAGCAACTGCTGAAACATTAGATCAAGAAGGGTGGTTAAAGAC
TGGTGATCTTTGTTACATTGATTCTGAAGGGTTTTTATATATTGTTGATAGGCTAAAAGA
ACTTATCAAATACAAAGCTTATCAGGTCCCACCGGTAGAACTGGAGCAGATTCTTCATTC
GAATCCGGACGTGGTTGATGCTGCAGTTGTTCCGTTTCTGGACGAGGATGCAGGAGAGAT
TCCAATGGCTTTCATAGTGAGAAAACCAGGAAGCAATTTCAACGAAGCACAAGTCATTGA
CTTTGTAGCTAAACAAGTTGCTCCGTATAAGAAAGTAAGAAGAGTTGCTTTCATAAACGC
AATTCCCAAAAACCCTGCTGGCAAGATTTTGCGTCAGGAGCTAACCAAAATCGCCGTGAG
TGGCAACGCCTCTAAACTTTGAGATAACCGGCCGGTTTGGATATGATTCTATCGCTTCTC
GGTGAATATGGAACCCGGTTTACTTGTTTAAATTATCCATCGTTCTCTTTTACCGCTTCA
ATTTCATTCCGTGCAAATCTGTAATTTCTTGCGTTTTATTGGTCTGTTGAAATAAGCAAG
TACAGTGAGCGGTTTGTATTTTCGTTAAATATGATTTAAGTTAAATACAGACCGTTCGAC
C

QA 4 844 4 844
DS 



AS 1 2

CO CL8139Contig1 1294 2 2 U
GGGTCGTTGTCTCTCTCTAGCTTCTCCAAAGTTCCTCCGTTGGACGATCTTTCATCTTCA
TCATCCGGGACGAGGCAGTAACCGATTCCCCCTCATTAAGCCCTCCTTAATCAATCACAC
ATGATCTCCATTCAATGCGACCCTGGAGAGTGCAAGACGGTGGAGGCTCTACTATAAAAA
GAACCAGCCACTCCTCCTTCACCGTTGAAGTCCACTTGCTCCGCTTTACGTCCGCCGAGG
TAGAGAACAAGTCGGGCGTTTTTCTAACAAATTGGAGGTCCATCTGCACCGATTCTGGGA
ACCCAGAAAGGAAGAGAGCTTATGGGCCCGACATGCTCTTCCTTAACGAGAAGGTAAAGC
CTGTATAAATTTGTATCCGTCGTTCTATTATTTAGTTTTTCTTTTGTTATGTCTGTGAAA
TAATCATATAATTGCTGTTCAGCCACGGTTTACGCCCACTCACAGTTCTGTTAACTCCCA
CCGTCTGAAGAAGTACAAACACCTGGTCAGTGAAGGTTACTTTGTTCGATGTAGACATGG
CCCTTTAGTTATACATTCTCTTTCTTGGTTGCAAGTAGTGAGCTTTGTTTTATTGAGTTT
TTATCTTATGTGTGAATTTGGCTTATGGAGTATCGTGCTAAGTTGGATGAGAAGCTCAAG
TTGACCGAATCCATTATCCCAAGCAAATTATTGCTCGGTGAATTCTTCCTTGCTTGATTA
TGTTACACCTTATATTTTTTTATACTAAAATAACACAAAACAACCCTGTTGCTGTCTTCC
TGATATTCTTATATTCTGTTCTAGAATTTATATGTGCCCTTTGATTAAAATGTAGCTAAT
ACTCTACATGATATGCAGATATGGAAGGCGGATGAGAGAGAGAGGCTGAAGAGAATATGT
AGGAACATATAGAGAGAGATAACTTTGCGGGTAGAGAAGAGAAGATCCAGAAAACGTGCG
GATCAGAAACAGAGACAGAGAGACACCATTTGTTGGCCGAGTTATCTTGAGAAGAAAAAA
GAGAGGCTCAAAAGATACCAATGAATTATCAACAAAATCCTAAGGATGATAGATAGATAG
GTACTGCAAATGAGAGATTATTTTACTTATTGCAGGGAGAATGGTAAGGTAATAGAGTGA
GATTTGATTGTGTTCTTAGTTTTGGTTTACTGATTTCAGAAACTTATGATCTTGATTCTA
TGTATTGATTCTTCCTGCAATACATTTCTTTTGGGTATGATACACAAATGTAAAAACAGA
TTATTCCTGCAATTACGTATTGATTATTCCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C601TF U 1
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BS 1 737 RR4C601TF
BS 738 1294 RR4C601JQ

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TCATCCGGGACGAGGCAGTAACCGATTCCCCCTCATTAAGCCCTCCTTAATCAATCACAC
ATGATCTCCATTCAATGCGACCCTGGAGAGTGCAAGACGGTGGAGGCTCTACTATAAAAA
GAACCAGCCACTCCTCCTTCACCGTTGAAGTCCACTTGCTCCGCTTTACGTCCGCCGAGG
TAGAGAACAAGTCGGGCGTTTTTCTAACAAATTGGAGGTCCATCTGCACCGATTCTGGGA
ACCCAGAAAGGAAGAGAGCTTATGGGCCCGACATGCTCTTCCTTAACGAGAAGGTAAAGC
CTGTATAAATTTGTATCCGTCGTTCTATTATTTAGTTTTTCTTTTGTTATGTCTGTGAAA
TAATCATATAATTGCTGTTCAGCCACGGTTTACGCCCACTCACAGTTCTGTTAACTCCCA
CCGTCTGAAGAAGTACAAACACCTGGTCAGTGAAGGTTACTTTGTTCGATGTAGACATGG
CCCTTTAGTTATACATTCTCTTTCTTGGTTGCAAGTAGTGAGCTTTGTTTTATTGAGTTT
TTATCTTATGTGTGAATTTGGCTTATGGAGTATCGTGCTAAGTTGGATGAGAAGCTCAAG
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TGTTACACCTTATATTT

QA 1 737 1 737
DS 

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TGTTACTCCCA
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TATCTTATGTGTGAATTTGGCTTATGGAGTATCGTGCTAAGTTGGATGAGAAGCTCAAGT
TGACCGAATCCATTATCCCAAGCAAATTATTGCTCGGTGAATTCTTCCTTGCTTGATTAT
GTTACACCTTATATTTTTTTATACTAAAATAACACAAAACAACCCTGTTGCTGTCTTCCT
GATATTCTTATATTCTGTTCTAGAATTTATATGTGCCCTTTGATTAAAATGTAGCTAATA
CTCTACATGATATGCAGATATGGAAGGCGGATGAGAGAGAGAGGCTGAAGAGAATATGTA
GGAACATATAGAGAGAGATAACTTTGCGGGTAGAGAAGAGAAGATCCAGAAAACGTGCGG
ATCAGAAACAGAGACAGAGAGACACCATTTGTTGGCCGAGTTATCTTGAGAAGAAAAAAG
AGAGGCTCAAAAGATACCAATGAATTATCAACAAAATCCTAAGGATGATAGATAGATAGG
TACTGCAAATGAGAGATTATTTTACTTATTGCAGGGAGAATGGTAAGGTAATAGAGTGAG
ATTTGATTGTGTTCTTAGTTTTGGTTTACTGATTTCAGAAACTTATGATCTTGATTCTAT
GTATTGATTCTTCCTGCAATACATTTCTTTTGGGTATGATACACAAATGTAAAAACAGAT
TATTCCTGCAATTACGTATTGATTATTCCTGCC

QA 12 824 12 824
DS 



AS 1 2

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TTCTTCCTCCCGTCGGAGTTTGTCTCAGGCATGGCTGTTGCACTGTTGAGTTCTTCATTT
GTTTGGTTCTCACTTGTTTGGGATACCTCCCGGGAATAATCTACGCGATCTACGCCATCT
TGTTCTTGAACCGCGATGACTACTTTGATGAATGCAGACGCCCGATCTACTACGTTGCTT
GACCATTGTTCTTGAATGGAAACATATAATATATTCTGGTTCGATGTGATCACTGTTTCT
TATAAACATTGGTGGCTATATGTTATGTTTTTATAAATATACATTGAAG


BQ
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AF RR4A212TF U 1
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GTTTGGTTCTCACTTGTTTGGGATACCTCCCGGGAATAATCTACGCGATCTACGCCATCT
TGTTCTTGAACCGCGATGACTACTTTGATGAATGCAGACGCCCGATCTACTACGTTGCTT
GACCATTGTTCTTGAATGGAAACATATAATATATTCTGGTTCGATGTGATCACTGTTTCT
TATAAACATTGGTGGCTATATGTTATGTTTTTATAAATATACATTGAAG

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DS 

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GGAAGAAAAAATTAATGGTGAGTAGTTGCGAGCTTTGCTGCGAGATCTTGATCGCAATCC
TTCTTCCTCCCGTCGGAGTTTGTCTCAGGCATGGCTGTTGCACTGTTGAGTTCTTCATTT
GTTTGGTTCTCACTTGTTTGGGATACCTCCCGGGAATAATCTACGCGATCTACGCCATCT
TGTTCTTGAACCGCGATGACTACTTTGATGAATGCAGACGCCCGATCTACTACGTTGCTT
GACCATTGTTCTTGAATGGAAACATATAATATATTCTGGTTCGATGTGATCACTGTTTCT
TATAAACATTGGTGGCTATATGTTATGTTTTTATAAATATACATTGAAG

QA 1 349 1 349
DS 



AS 1 2

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TTTTGTAAATGCAAATATATACATATTTGTAAATTAAACTGGTTTACAATTAGATTGTTT
TACAATTAAAATCAGTTTACAGATTTAAAACAAATTAATAAAAAAAATTAAACCTTAATT
ACAACAAAAACTAATTAAAAAAACTAATCAATCCTAAACGTAATTAACCTACGTCCTCGT
TGTCTTCCACCTACTCAAGCTATCGCCTTGACCACCAATATTCTCCGCCGCACCACCACC
TAAAAATCTAAACCTAAAAAGCTTAACCGAAAAACAAAATTAACCATACAGCTAAACTCT
TTGCCGTCAACTTCAACTCCATCGATTTCTTCTTCTTCTACTTCATCGTCTTTGAACAGC
CACCAGTAAACCTTAACATTGCCTCTGAACTATATCCATCAAGCTCTTCTCTAGTGCTTC
TCATCTATTTCTCCTCCCTCGTATCTGAACAAACTCCAGCTCCTCTCTTCTCTCTCGCTA
GACTCCAACTCCAGCTAATGTATCTTCAGCTAACGACCCACCGCTTCTGCTACCCTCCTA
CTCCATCAAGCTCTTCTTCCTTGTCCAGGAAAAAGTGCCTATTTCAACATGAAGAAGGTG
AAGGAGACCTAAACGACGATGATGAAGAAGAAGAACGGTGTCTCCATTTCTGCTTAGAAT
TCCCTGTCCCCATCGAACTCAAAAAAAAAAAACTAAACCCTTTCGCTTCAAAACTAAACC
CCCTCCCCTCCTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F746JQ U 5
AF RR4F746TF C 1
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BS 672 736 RR4F746TF

RD RR4F746JQ 667 0 0
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CAAAAACTAATTAAAAAAACTAATCAATCCTAAACGTAATTAACCTACGTCCTCGTTGTC
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AATCTAAACCTAAAAAGCTTAACCGAAAAACAAAATTAACCATACAGCTAAACTCTTTGC
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CTATTTCTCCTCCCTCGTATCTGAACAAACTCCAGCTCCTCTCTTCTCTCTCGCTAGACT
CCAACTCCAGCTAATGTATCTTCAGCTAACGACCCACCGCTTCTGCTACCCTCCTACTCC
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AGACCTAAACGACGATGATGAAGAAGAAGAACGGTGTCTCCATTTCTGCTTAGAATTCCC
TGTCCCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4F746TF 736 0 0
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TACAATTAAAATCAGTTTACAGATTTAAAACAAATTAATAAAAAAAATTAAACCTTAATT
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CACCAGTAAACCTTAACATTGCCTCTGAACTATATCCATCAAGCTCTTCTCTAGTGCTTC
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GACTCCAACTCCAGCTAATGTATCTTCAGCTAACGACCCACCGCTTCTGCTACCCTCCTA
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AAGGAGACCTAAACGACGATGATGAAGAAGAAGAACGGTGTCTCCATTTCTGCTTAGAAT
TCCCTGTCCCCATCGAACTCAAAAAAAAAAAACTAAACCCTTTCGCTTCAAAACTAAACC
CCCTCCCCTCCTCTCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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CACCTTTTTATAGGTGAGAATGGCCGCTTGGATGAATGATAAGAATCAGTTAATGCAAGA
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F173JQ U 4
AF RR4F173TF C 1
BS 1 5 RR4F173TF
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BS 636 681 RR4F173TF

RD RR4F173JQ 632 0 0
AC
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QA 3 632 3 632
DS 

RD RR4F173TF 681 0 0
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CACCTTTTTATAGGTGAGAATGGCCGCTTGGATGAATGATAAGAATCAGTTAATGCAAGA
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TAACAGTTGGTAGGTGAAAAA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FJ12TF U 1
AF RR4FJ12JQ C 1
BS 1 630 RR4FJ12TF
BS 631 697 RR4FJ12JQ

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CAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTAAG
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QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4FJ12JQ 697 0 0
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CTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGATAGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCT
CAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTAAG
CCTTTTTAATAACACCATTGTGACAAGCGTCTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTGAGACTT
CAATTCGAACTTGTAATCTCTTTCTTATGTCACCAACTAGAAACAACTATTTGTTTATTT
GAAGAACCCACATGACACAAATAGTTTGGTGAGTTGC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL8144Contig1 855 2 2 U
GGGCACAGGAAAAATACATTAGCTTATCAGCTTCAACTCTATCTCCAGATTAGTCTCCCA
GAAAGAGCCTGTATACCTTTGATGGCAAGTCTCAACATCGAAACTACTGACGTGGTTTCC
TCTCTCTATCGTCTCTCATCGGATTGGTGCCTCTGTTTCTCTGAAAATCCCTTGTCGATG
GCTCCATTCTGGTTCTAAGCGCTACTTCTCTCACCACCGTAGATCGATCTATCGATGAAC
TTTGCTTCTGGTCGGATACCCACTTTATCGAGCCTTGGTTCTTGCATCGGACTGAAATTT
CAGGTGGGCTGAATCTTAACGACTTGGGAGTTTAGGATCTCGCGCATAACAACATTATGA
CTGAAACAACAACAAAATGCAGAATATGTGAAAGCGTCTAAGTGTTGGTAACGTGTCACC
TCAGGGATCCATATTATCTTGCCTCTCATTTTTCTTTAAAATAAGTTTTGAAATTTCGAG
TTTCTGATTTGTAAGTTGGATAAATTCTTTATTTCAAAAGATACGATATTTGTAAAAGTT
TTAAAGTTGGTATGCTATCCATGCTACGATGCATACAGTGTGGAGATAACACAATGGTAG
AAGACACGGGGGAACAACCGAAAGATATCAACTGTTTGGTCAGATTTGTGGATAGGATAA
TAAGACTCAAGTTGCTTTCTGTGAAAGGGAGGGAGGGGCCAGCAGTACCTTGAGGAAGTG
TTAATCACTTGGTTTGGGGTACAAGAAAACGGAAGAGCTGAAAGTGCAGGATAATTCTTT
TATTGAGAACAGATTTTTGATGCTGTAAATAAATAGAAGCACAGTTCAACCTGATGTAAA
AAAAGTTTTTACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GD62TF U 1
AF RR4GD62JQ C 81
BS 1 710 RR4GD62TF
BS 711 855 RR4GD62JQ

RD RR4GD62TF 710 0 0
GGGCACAGGAAAAATACATTAGCTTATCAGCTTCAACTCTATCTCCAGATTAGTCTCCCA
GAAAGAGCCTGTATACCTTTGATGGCAAGTCTCAACATCGAAACTACTGACGTGGTTTCC
TCTCTCTATCGTCTCTCATCGGATTGGTGCCTCTGTTTCTCTGAAAATCCCTTGTCGATG
GCTCCATTCTGGTTCTAAGCGCTACTTCTCTCACCACCGTAGATCGATCTATCGATGAAC
TTTGCTTCTGGTCGGATACCCACTTTATCGAGCCTTGGTTCTTGCATCGGACTGAAATTT
CAGGTGGGCTGAATCTTAACGACTTGGGAGTTTAGGATCTCGCGCATAACAACATTATGA
CTGAAACAACAACAAAATGCAGAATATGTGAAAGCGTCTAAGTGTTGGTAACGTGTCACC
TCAGGGATCCATATTATCTTGCCTCTCATTTTTCTTTAAAATAAGTTTTGAAATTTCGAG
TTTCTGATTTGTAAGTTGGATAAATTCTTTATTTCAAAAGATACGATATTTGTAAAAGTT
TTAAAGTTGGTATGCTATCCATGCTACGATGCATACAGTGTGGAGATAACACAATGGTAG
AAGACACGGGGGAACAACCGAAAGATATCAACTGTTTGGTCAGATTTGTGGATAGGATAA
TAAGACTCAAGTTGCTTTCTGTGAAAGGGAGGGAGGGGCCAGCAGTACCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4GD62JQ 775 0 0
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GGATTGGTGCCTCTGTTTCTCTGAAAATCCCTTGTCGATGGCTCCATTCTGGTTCTAAGC
GCTACTTCTCTCACCACCGTAGATCGATCTATCGATGAACTTTGCTTCTGGTCGGATACC
CACTTTATCGAGCCTTGGTTCTTGCATCGGACTGAAATTTCAGGTGGGCTGAATCTTAAC
GACTTGGGAGTTTAGGATCTCGCGCATAACAACATTATGACTGAAACAACAACAAAATGC
AGAATATGTGAAAGCGTCTAAGTGTTGGTAACGTGTCACCTCAGGGATCCATATTATCTT
GCCTCTCATTTTTCTTTAAAATAAGTTTTGAAATTTCGAGTTTCTGATTTGTAAGTTGGA
TAAATTCTTTATTTCAAAAGATACGATATTTGTAAAAGTTTTAAAGTTGGTATGCTATCC
ATGCTACGATGCATACAGTGTGGAGATAACACAATGGTAGAAGACACGGGGGAACAACCG
AAAGATATCAACTGTTTGGTCAGATTTGTGGATAGGATAATAAGACTCAAGTTGCTTTCT
GTGAAAGGGAGGGAGGGGCCAGCAGTACCTTGAGGAAGTGTTAATCACTTGGTTTGGGGT
ACAAGAAAACGGAAGAGCTGAAAGTGCAGGATAATTCTTTTATTGAGAACAGATTTTTGA
TGCTGTAAATAAATAGAAGCACAGTTCAACCTGATGTAAAAAAAGTTTTTACTTG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL8145Contig1 772 2 1 U
AGGGGATCCCTCTTTCACACTACCCATCTTTTCTTTATAAGGTCCAAGACCGACGTCGAA
ACTACAGTAACCAAACCCCAAAAAATGCAGGAGGATCTGACGTCAGCAGCGGCGTATTAC
CACCAATCGTTGATCATGGCAACGGCTAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACCGGGT
TTACCGGAGCAAGAGCAGCTAAACTGCCCTCGCTGTGACTCACCCAACACCAAGTTCTGT
TACTACAACAACTACAACCTGTTACAGCCACTTCACTTTTGCAAAAGCTGCCGTCGTTAC
TGGACCAAAGGCGGTTCCCTCCGTAACATCCCCGTCGGCGGCGGTTCTCGCAAGAACAGC
AGTAAACAATCCTCTGTCGGATCGTCCTCTTCTTCTTCTTCGGCTCCGTCGAGCAGCAGT
CCCAAGAGTAAAACCGTCTCTGTTTCCGACCAAGAGAGGAGTGTCATGGGGAGTTCGGAA
ATGGATCCGACCCGGATGTTATACGGGTTGCCCGTTGGAGATCCGACTGGTGGGAGTTTC
AGCTCGCTGCTGGCTTCGAATATGCAGCAGATTAGAGGGGTTAACTACCAAACCGGGTCG
GGCTGGTATCCGGGTATGGAGTTGGGGTTTGGGTTTTCGGATAAGTGATGATGATACAGT
GGAGAAGAACTGAAGAATATGAAGGGTAGTTTGGTAAATTTCTCATAGATGTATAGGATT
TTTAGTCTTGGCGTAGTCATATAACGACAAATGATGTCGGTCCATTTAAGTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT60TF U 1
AF RR4GE63TF U 1
BS 1 772 RR4GE63TF

RD RR4GT60TF 634 0 0
AGGGGATCCCTCTTTCACACTACCCATCTTTTCTTTATAAGGTCCAAGACCGACGTCGAA
ACTACAGTAACCAAACCCCAAAAAATGCAGGAGGATCTGACGTCAGCAGCGGCGTATTAC
CACCAATCGTTGATCATGGCAACGGCTAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACCGGGT
TTACCGGAGCAAGAGCAGCTAAACTGCCCTCGCTGTGACTCACCCAACACCAAGTTCTGT
TACTACAACAACTACAACCTGTTACAGCCACTTCACTTTTGCAAAAGCTGCCGTCGTTAC
TGGACCAAAGGCGGTTCCCTCCGTAACATCCCCGTCGGCGGCGGTTCTCGCAAGAACAGC
AGTAAACAATCCTCTGTCGGATCGTCCTCTTCTTCTTCTTCGGCTCCGTCGAGCAGCAGT
CCCAAGAGTAAAACCGTCTCTGTTTCCGACCAAGAGAGGAGTGTCATGGGGAGTTCGGAA
ATGGATCCGACCCGGATGTTATACGGGTTGCCCGTTGGAGATCCGACTGGTGGGAGTTTC
AGCTCGCTGCTGGCTTCGAATATGCAGCAGATTAGAGGGGTTAACTACCAAACCGGGTCG
GGCTGGTATCCGGGTATGGAGTTGGG
TTTGGGTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4GE63TF 772 0 0
AGGGGATCCCTCTTTCACACTACCCATCTTTTCTTTATAAGGTCCAAGACCGACGTCGAA
ACTACAGTAACCAAACCCCAAAAAATGCAGGAGGATCTGACGTCAGCAGCGGCGTATTAC
CACCAATCGTTGATCATGGCAACGGCTAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACCGGGT
TTACCGGAGCAAGAGCAGCTAAACTGCCCTCGCTGTGACTCACCCAACACCAAGTTCTGT
TACTACAACAACTACAACCTGTTACAGCCACTTCACTTTTGCAAAAGCTGCCGTCGTTAC
TGGACCAAAGGCGGTTCCCTCCGTAACATCCCCGTCGGCGGCGGTTCTCGCAAGAACAGC
AGTAAACAATCCTCTGTCGGATCGTCCTCTTCTTCTTCTTCGGCTCCGTCGAGCAGCAGT
CCCAAGAGTAAAACCGTCTCTGTTTCCGACCAAGAGAGGAGTGTCATGGGGAGTTCGGAA
ATGGATCCGACCCGGATGTTATACGGGTTGCCCGTTGGAGATCCGACTGGTGGGAGTTTC
AGCTCGCTGCTGGCTTCGAATATGCAGCAGATTAGAGGGGTTAACTACCAAACCGGGTCG
GGCTGGTATCCGGGTATGGAGTTGGGGTTTGGGTTTTCGGATAAGTGATGATGATACAGT
GGAGAAGAACTGAAGAATATGAAGGGTAGTTTGGTAAATTTCTCATAGATGTATAGGATT
TTTAGTCTTGGCGTAGTCATATAACGACAAATGATGTCGGTCCATTTAAGTA

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL8146Contig1 843 2 4 U
GCGTTTAGTCTTATATAGTGTATAGACGATTATTGTTCACCAAACCATTGTTTGAAAGAC
TAAAACCACTTGTAGGAGACTTGGACCAACTTTTACCGATGGTGGCTATAGGTACAGTGG
GTAAGAAAATTGCAAAAAGTGGTGAAGAAAAAGAAATATCCGAGGAGTGTACTGTATTTC
TCTACCTTTTACAACCTTGCTTGAACACAAGTCATTCTCTAACTTTTATTTATTTATATA
TTTCTTTTTGTAAATTGATTCTCTAACTTTATTCGGTGACGAATTTTGGTGGATGTGGAA
TAAATCGCATCAGTAAATGAAGTTTCCATACATCAAAGTTGTTTGTCGATAAGAAAAAAA
CAAACAATATTTTAAACACTGGTTTACGGATCGTTCAGAAAAAACATTGGTTTACGGCTA
ATTAAACAAGGATAAAATAAAAATTATAAACATAGATATTAACTGCTCCAATATTATGTA
AAATCCCAATACGGCGTATCCAGGTTCAAATCCTACCGGCCACACGGATATGAGTTATTG
CCTTCGATTCATTTGAATGTCCAGAAGAGGGTTTATCCGTGTGATGTACTTCTACCTGGA
GGTTAGGTCTGTGTCTTTAATAAATTTGGGTTTAATCCTTTTTTTATCAAAAAAAATATT
ATGTAAAACCTACATTGATTAAATGCTAGTTTTGATATTTTCCTATCACCTAACGTATTT
GTACTATTTCAATTATTTTTCTATTTAAAATGATTTTTAGAATTTTCTTTCTTTTTTTCC
ATTTTCTATTATTTTGAAGGGCTGGCATTTATGATGTTTAATTCATCTGGCAGGTTGTTG
TTC


BQ
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10 10 10 

AF RR4GG74TF U 1
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TTTATATATTTCTTTTTGTAAATTGATTCTCTAACTTTATTCGGTGACGAATTTTGGTGG
ATGTGGAATAAATCGCATCAGTAAATGAAGTTTCCATACATCAAAGTTGTTTGTCGATAA
GAAAAAAACAAACAATATTTTAAACACTGGTTTACGGATCGTTCAGAAAAAACATTGGTT
TACGGCTAATTAAACAAGGATAAAATAAAAATTATAAACATAGATATTAACTGCTCCAAT
ATTATGTAAAATCCCAATACGGCGTATCCAGGTTCAAATCCTACCGGCCACACGGATATG
AGTTATTGCCTTCGATTCATTTGAATGTCCAGAAGAGGGTTTATCCGTGTGATGTACTTC
TACCTGGAGGTTAGGTCTGTGTCTTTAATAAATTTGGGTTTAATCCTTTTTTTATCAAAA
AAAATATTATGTAAAACCTACATTGATTAAATGCTAGTTTTGATATTTTCCTATCACCTA
ACGTATTTGTACTATTTCAATTATTTTTCTATTTAAAATGATTTTTAGAATTTTCTTTCT
TTTTTTCCATTTTCTATTATTTTGAAGGGCTGGCATTTATGATGTTTAATTCATCTGGCA
GGTTGTTGTTC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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ACCGTCCCTACTTTCGTCTTCTCCGACGGGTACTTTCCTTCCTTCTGTTCCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGGGAAACTAAAAAAACCTTCTCTTTCATTT
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GAGTTCGAGAATGC


BQ
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AF RR4F779JQ U 5
AF RR4F779TF C 1
BS 1 4 RR4F779TF
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BS 406 674 RR4F779TF

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AGAAGATGGAAAGGATCAAACTTTCTTTCCCAGCGGACGCTCCACCGCTTTCAGTCATCG
CTGCTCTTCATATCTCATCCTCTCCGGTGACCATTGACTCCTCCTCCGCCGCAACCACCG
TCCCTACTTTCGTCTTCTCCGACGGGTACTTTCCTTCCTTCTGTTCCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGGGAAACTAAAAAAA

QA 1 401 1 401
DS 

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TTTTGGGGTAAATAATGTAAAGATTAATACTTTATGGACAATAATGTAAAACATTCACAA
CTCGAGCCTCCCCCCAGTAAAAAAAAGATACCTTCCTAGTCTGAAAAAACCTAACCTTGA
AGAACAAAACATCGCCGCCCACTCCTTCTCTGCTCTCACTCTCTACACATTGCCCAAAGG
AAGAAGAAGATGGAAAGGATCAAACTTTCTTTCCCAGCGGACGCTCCACCGCTTTCAGTC
ATCGCTGCTCTTCATATCTCATCCTCTCCGGTGACCATTGACTCCTCCTCCGCCGCAACC
ACCGTCCCTACTTTCGTCTTCTCCGACGGGTACTTTCCTTCCTTCTGTTCCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGGGAAACTAAAAAAACCTTCTCTTTCATTT
CATTTCAGGAGAAAACTGAGTGGGACTCCCGTTCTTCTACGCTACGTTGCTCGATCAGCT
CCCTCGCTTCCTGACTTCTACGGCCGCGATGCCTTTGAATCTTCTCAGGTAAAGTCTCAA
CCTTTTTCTTACACCACGAATTTTCTATCATGTATAAAGTCTTTGCCTTTTTTTATGTTA
TGGATTCGTTATCAGGTTGATGAGTGGATAGATTACGCTTATGTCTTCTCCTCTGGCTCA
GAGTTCGAGAATGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

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GCTCACTACACTCATAAGCAAATACCAAACCATAACCCTACTCGCTGTTAACAACAGCGC
CATCGGTTCTATCACTAACAAATCCGCCATGGAGCTCAAGAACATCCTCATGACTCATGT
CATTCTTGACTACTACGACGAGCTCAAGCTCAAGGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCT
CACTACCTTGTACCAAACAACCGGTTTGGGTGAAGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTAC
CAAATCTAAAGGAAGAGTCTACTTTGGATCCGGAGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGA
GTATGTTACCGCGTTGTATCACAACCCTTTTAACCTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCC
CATTGTGGCTCCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTCCCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTT
GGCTCCAGCTCCAGCTCCGTCTCCGGCTCCATCTCCTATGCATGCTGCAATGGCTCCAGG
TCCATCTCCCATCAGTGGTGCAACCCCTTCAGCTCCAGCTCCTGGACCAGGGGATGAAGA
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GACACCTGAAGTTGATTCTCCTGCACCTACTCCAAGCGCTGACAATGAGAAGATTGAAGC
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TCTGATGACAATAATGGTAGATGAGATTCAAAA


BQ
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AF RR4BA22TF U 1
AF RR4BA22JQ C 154
BS 1 786 RR4BA22TF
BS 787 933 RR4BA22JQ

RD RR4BA22TF 786 0 0
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GCTCACTACACTCATAAGCAAATACCAAACCATAACCCTACTCGCTGTTAACAACAGCGC
CATCGGTTCTATCACTAACAAATCCGCCATGGAGCTCAAGAACATCCTCATGACTCATGT
CATTCTTGACTACTACGACGAGCTCAAGCTCAAGGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCT
CACTACCTTGTACCAAACAACCGGTTTGGGTGAAGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTAC
CAAATCTAAAGGAAGAGTCTACTTTGGATCCGGAGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGA
GTATGTTACCGCGTTGTATCACAACCCTTTTAACCTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCC
CATTGTGGCTCCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTCCCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTT
GGCTCCAGCTCCAGCTCCGTCTCCGGCTCCATCTCCTATGCATGCTGCAATGGCTCCAGG
TCCATCTCCCATCAGTGGTGCAACCCCTTCAGCTCCAGCTCCTGGACCAGGGGATGAAGA
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TGCTGA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4BA22JQ 780 0 0
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GGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCTCACTACCTTGTACCAAACAACCGGTTTGGGTGA
AGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTACCAAATCTAAAGGAAGAGTCTACTTTGGATCCGG
AGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACCGCGTTGTATCACAACCCTTTTAA
CCTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCT
CCCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTTGGCTCCAGCTCCAGCTCCGTCTCCGGCTCCATC
TCCTATGCATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCATCTCCCATCAGTGGTGCAACCCCTTCAGC
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ACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGTTGATTCTCCTGCACCTACTCC
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QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL8149Contig1 657 2 1 U
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CTTTATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACTCAGATAATATTATTATTTTAACCT
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GTTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGGAGCGTCGTGTTCCTCGCTAGTC
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TATTCAATTGGGGTCTGTGATTTGATTTGATTTTCGTTATTAATTTTGGGGATAAAATTC
TAATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGTCTTTCCATGGTCAAATATC
TTTCCTATTTTTGTAACTTTTTCTTCATTTTCTTGGGTTTTATTTACCTGTAAATAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4B736TF U 1
AF RR4BJ66TF U 1
BS 1 657 RR4B736TF

RD RR4B736TF 657 0 0
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CTTTATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACTCAGATAATATTATTATTTTAACCT
CCGATCGAGATCCATTCCTCGTCGGAGAATTCAGATCAAGAAACTAAACCCTTATGGAGA
GTTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGGAGCGTCGTGTTCCTCGCTAGTC
AATTCCACAAGCGTCTCCTCTCCGATTACATGGACAAGTTCGAATTCGAAATCCGATCGA
GAGAGAATGTGGTGATGAAGAAGAAGGTGAGATTTGCGGCGGATGTGGTGGAGCCGTCGG
GGAATAACAAAGAGTATCGCCGGAGACACTCTTCCAAGGCTAAATTTGATAAGGAATCCA
AGATGGCGGCAATTGTTTGAAGGTTTTTTTTTTTGGTTTTTGAAGGAGTGGTTGTGTAAT
TATTCAATTGGGGTCTGTGATTTGATTTGATTTTCGTTATTAATTTTGGGGATAAAATTC
TAATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGTCTTTCCATGGTCAAATATC
TTTCCTATTTTTGTAACTTTTTCTTCATTTTCTTGGGTTTTATTTACCTGTAAATAT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4BJ66TF 654 0 0
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CTTTATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACTCAGATAATATTATTATTTTAACCT
CCGATCGAGATCCATTCCTCGTCGGAGAATTCAGATCAAGAAACTAAACCCTTATGGAGA
GTTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGGAGCGTCGTGTTCCTCGCTAGTC
AATTCCACAAGCGTCTCCTCTCCGATTACATGGACAAGTTCGAATTCGAAATCCGATCGA
GAGAGAATGTGGTGATGAAGAAGAAGGTGAGATTTGCGGCGGATGTGGTGGAGCCGTCGG
GGAATAACAAAGAGTATCGCCGGAGACACTCTTCCAAGGCTAAATTTGATAAGGAATCCA
AGATGGCGGCAATTGTTTGAAGGTTTTTTTTTTTGGTTTTTGAAGGAGTGGTTGTGTAAT
TATTCAATTGGGGTCTGTGATTTGATTTGATTTTCGTTATTAATTTTGGGGATAAAATTC
TAATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGTCTTTCCATGGTCAAATATC
TTTCCTATTTTTGTAACTTTTTCTTCATTTTCTTGGGTTTTATTTACCTGTAAA

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL8150Contig1 602 2 1 U
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TATATATGCGAATAATTGGACGTGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTCTCGT
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CG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4BW95JQ C 1
AF RR4BW95TF U 1
BS 1 602 RR4BW95TF

RD RR4BW95JQ 602 0 0
GGCCAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAA
CAGCTTTCGTTTCCAAAGTAAACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTCCCAT
CAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACA
TCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGA
AGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTTTGCTGCAACG
GGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGA
AGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCC
ACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATA
TATATATGCGAATAATTGGACGTGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTCTCGT
TTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTT
CG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4BW95TF 602 0 0
GGCCAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAA
CAGCTTTCGTTTCCAAAGTAAACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTCCCAT
CAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACA
TCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGA
AGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACG
GGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGA
AGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCC
ACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATA
TATATATGCGAATAATTGGACGTGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTCTCGT
TTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTT
CG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL8151Contig1 730 2 3 U
GGAAGGAAGAAAAAAAAAACATTCTAACTCTCTTCTCCGATCTAAATCCCGAGGAATCCG
ATGATGAGAGACCGGCAACTATTCTCCGGCCTTCTACTTATCTTAGCTCTCTTCTCGCTT
CAGAACCTTTGCTTCTGCGACGATGATGCGGTGTTGTATGAGTCGTTCGATGAGCCGTTT
GATGGTCGCTGGATCGTTTCGAAGAATGGTGATTACGAAGGTGTGTGGAAGCATGCCAAG
AGTGAGGGACATGATGACTATGGACTTCTCGCGAGCGAGAAGGCACGCAAGTACGGTATA
GTGAAAGAGCTCGAGGAGCCTCTAAACCTCAAGGAAGGAACGATTGTTCTTCAGTACGAG
GTTCGTTTCCAGGAAGGGCTCGAGTGTGGCGGTGCGTACTTGAAGTACCTCCGTCCTCAG
GAAGCTGGGTGGACGCCTGAAGGGTTCGACAGCGAGTCCCCTTACTCTATCATGTTTGGG
CCTGACAAGTGTGGAGCCACGAACAAAGTGCATTTCATCTTGAAGCACAAGAATCCCAAG
AGTGGAGAGTACGTTGAGCACCACCTCAAGTTCCCTCCCTCTGTTCCTCACGACAAGCTT
TCTCATGTCTACACCGCGGTCTTGAAGCCCGACAACGAGGTTAGGATTCTGGTTGATGGA
GAGGAGAAGAAGAAGGCTAATTTACTCTCTGGGGAGGACTTTGAGCCTGCGTTGATCCCT
GCCAAGACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL46TF U 19
AF RR4BE12TF U 1
BS 1 375 RR4BE12TF
BS 376 376 RR4EL46TF
BS 377 730 RR4BE12TF

RD RR4EL46TF 653 0 0
GG
ATTCTAACTCTCTTCTTCGATCTAAATCCCGAGGAATCCGATGATGAGAGACCGGCAACT
ATTCTCCGGCCTTCTACTTATCTTAGCTCTCTTCTCGCTTCAGAACCTTTGCTTCTGCGA
CGATGATGCGGTGTTGTATGAGTCGTTCGATGAGCCGTTTGATGGTCGCTGGATCGTTTC
GAAGAATGGTGATTACGAAGGTGTGTGGAAGCATGCCAAGAGTGAGGGTCATGATGACTA
TGGACTTCTCGTGAGCGAGAAGGCACGCAAGTACGGTATAGTGAAAGAGCTCGAGGAGCC
TCTAAACCTCAAGGAAGGAACGATTGTTCTTCAGTACGAGGTTCGTTTCCAGGAAGGGCT
CGAGTGTGGCGGTGCGTACTTGAAGTACCTCCGTCCTCAGGAAGCTGGGTGGACGCCTGA
AGGGTTCGACAGCGAGTCCCCTTACTCTATCATGTTTGGGCCTGACAAGTGTGGAGCCAC
GAACAAAGTGCATTTCATCTTGAAGCACAAGAATCCCAAGAGTGGAGAGTACGTTGAGCA
CCACCTCAAGTTCCCTCCCTCTGTTCCTCACGACAAGCTTTCTCATGTCTACACCGCGGT
CTTGAGGCCCGACAACGAGGTTAGGATTCTGGTTGATGGAGAGGAGAAGAA

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR4BE12TF 730 0 0
GGAAGGAAGAAAAAAAAAACATTCTAACTCTCTTCTCCGATCTAAATCCCGAGGAATCCG
ATGATGAGAGACCGGCAACTATTCTCCGGCCTTCTACTTATCTTAGCTCTCTTCTCGCTT
CAGAACCTTTGCTTCTGCGACGATGATGCGGTGTTGTATGAGTCGTTCGATGAGCCGTTT
GATGGTCGCTGGATCGTTTCGAAGAATGGTGATTACGAAGGTGTGTGGAAGCATGCCAAG
AGTGAGGGACATGATGACTATGGACTTCTCGCGAGCGAGAAGGCACGCAAGTACGGTATA
GTGAAAGAGCTCGAGGAGCCTCTAAACCTCAAGGAAGGAACGATTGTTCTTCAGTACGAG
GTTCGTTTCCAGGAATGGCTCGAGTGTGGCGGTGCGTACTTGAAGTACCTCCGTCCTCAG
GAAGCTGGGTGGACGCCTGAAGGGTTCGACAGCGAGTCCCCTTACTCTATCATGTTTGGG
CCTGACAAGTGTGGAGCCACGAACAAAGTGCATTTCATCTTGAAGCACAAGAATCCCAAG
AGTGGAGAGTACGTTGAGCACCACCTCAAGTTCCCTCCCTCTGTTCCTCACGACAAGCTT
TCTCATGTCTACACCGCGGTCTTGAAGCCCGACAACGAGGTTAGGATTCTGGTTGATGGA
GAGGAGAAGAAGAAGGCTAATTTACTCTCTGGGGAGGACTTTGAGCCTGCGTTGATCCCT
GCCAAGACCA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL8152Contig1 901 2 2 U
GGTCTAGAAGGAGATCACCTATAAACAGCAGATTCAGAACATCACAAGCGCAACCTAGAT
ATGATCATCATTCTCCAAGACCTGCAGAACCATTACCATCTGTCACATCATCAAGGGCTG
CAACACCTGAAACAGCTTCTGTATCTGACGGATGTCCAGAACCTAATCCAAGTCTTCCCA
AGACAAATGGACGCAAGCGTAAAAGCAGATGGGACCAGCCATGTCAACAAACAGATGCAA
CCCTACACGACCTTCCGCCACCAGGGTTTTCATCACCTTGCACGGTTGCGTCTGATAATA
CAATCACCGCACAGCCGCAAGAGAAGTTTCTTTCTCGGTTAACAGTCTCGTATGGGATCC
CTCTTAGCATCGTTCATCAACTTGGTTCACCCAGCAAAGATGACCCGACAGGCTGGTCCG
TTGCTCCTGGGATACCGTTTTCCGTACCCACCTCTGCCTCCGGTTTCTCATGGTGAGTTT
TTGGCTAAGATGAATGGGATCTTACCGGATACAAACATCTCAGGTGTTACCGGGACTGTC
TCAACCGCTCCAAACAGGAAGAGGGAGTTTTCATCTGATATAGGAACAAGTTACTTTCGG
CAACAGAAACAGAACATTCCTCCGTGGATTCGGAACAGCAAACAGCCTTGGAAACCTAAC
CTTAGAGAAGAAGATCAACAGTTAAGAAACTTTTAGCTTTAGAGAAGTACACAGTCCTTG
AGAGTTAAAATGGAGAGACGATGCAGCTCTTGAGGAGAATTACAGTGATTGATTGGTTAG
TTTTGCTCATAGTAAAGTCCCCTTTAAGGGAATCATGTGCTTTTCTTCCCTTTTTAGTAT
ATTTTAAATTCTTTTTGTTTATGACTTTTTAATATTAAAAGTCACATGAAATAGCAATCA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR4DS43TF U 1
AF RR4DS43JQ C 288
BS 1 628 RR4DS43TF
BS 629 901 RR4DS43JQ

RD RR4DS43TF 628 0 0
GGTCTAGAAGGAGATCACCTATAAACAGCAGATTCAGAACATCACAAGCGCAACCTAGAT
ATGATCATCATTCTCCAAGACCTGCAGAACCATTACCATCTGTCACATCATCAAGGGCTG
CAACACCTGAAACAGCTTCTGTATCTGACGGATGTCCAGAACCTAATCCAAGTCTTCCCA
AGACAAATGGACGCAAGCGTAAAAGCAGATGGGACCAGCCATGTCAACAAACAGATGCAA
CCCTACACGACCTTCCGCCACCAGGGTTTTCATCACCTTGCACGGTTGCGTCTGATAATA
CAATCACCGCACAGCCGCAAGAGAAGTTTCTTTCTCGGTTAACAGTCTCGTATGGGATCC
CTCTTAGCATCGTTCATCAACTTGGTTCACCCAGCAAAGATGACCCGACAGGCTGGTCCG
TTGCTCCTGGGATACCGTTTTCCGTACCCACCTCTGCCTCCGGTTTCTCATGGTGAGTTT
TTGGCTAAGATGAATGGGATCTTACCGGATACAAACATCTCAGGTGTTACCGGGACTGTC
TCAACCGCTCCAAACAGGAAGAGGGAGTTTTCATCTGATATAGGAACAAGTTACTTTCGG
CAACAGAAACAGAACATTCCTCCGTGGA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4DS43JQ 614 0 0
GCGTCTGATAATACAATCACCGCACAGCCGCAAGAGAAGTTTCTTTCTCGGTTAACAGTC
TCGTATGGGATCCCTCTTAGCATCGTTCATCAACTTGGTTCACCCAGCAAAGATGACCCG
ACAGGCTGGTCCGTTGCTCCTGGGATACCGTTTTCCGTACCCACCTCTGCCTCCGGTTTC
TCATGGTGAGTTTTTGGTTAAGATGAATGGGATCTTACCGGATACAAACATCTCAGGTGT
TACCGGGACTGTTTCAACCGCTCCAAACAGGAAGAGGGAGTTTTCATTTGATATAGGAAC
AAGTTACTTTCGGCAACAGAAACAGAACATTCCTCCGTGGATTCGGAACAGCAAACAGCC
TTGGAAACCTAACCTTAGAGAAGAAGATCAACAGTTAAGAAACTTTTAGCTTTAGAGAAG
TACACAGTCCTTGAGAGTTAAAATGGAGAGACGATGCAGCTCTTGAGGAGAATTACAGTG
ATTGATTGGTTAGTTTTGCTCATAGTAAAGTCCCCTTTAAGGGAATCATGTGCTTTTCTT
CCCTTTTTAGTATATTTTAAATTCTTTTTGTTTATGACTTTTTAATATTAAAAGTCACAT
GAAATAGCAATCAC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL8153Contig1 654 2 1 U
AGGGGCGGAAAAAAGCTTAGAAAGGAAAAAAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGATGACCA
GATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCAC
CACGAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAACCCAACCGAAGCTGAGCT
CCAAGACATGATCAACGAGGTCGACGCAGACGGGAACGGGACCATCGATTTCCCCGAGTA
CCTTAACCTGATGGCTAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGC
CTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCGGAGCTTCGACACGT
GATGACGAACCTCGGGGAGAAACTCACCGACGAGGAGGTTGATGAGATGATCAGAGAGGC
TGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAA
GTGATGGAGAGAGAGAGAGTGAATCTTTCTTTCTCGTTATGACTTGTTCCAGTTTGCTGT
CATGTAGAACATGTTTTCTTCCCCTTTGATTTGTTTTTGCTTTGGTGATTTTTATGTGAA
GTATGAACTCATGTCTTGCTCATCTTTTGACAATTGATATTCTCTCCTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F460JQ C 1
AF RR4F460TF U 1
BS 1 654 RR4F460TF

RD RR4F460JQ 654 0 0
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QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4F460TF 654 0 0
AGGGGCGGAAAAAAGCTTAGAAAGGAAAAAAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGATGACCA
GATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCAC
CACGAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAACCCAACCGAAGCTGAGCT
CCAAGACATGATCAACGAGGTCGACGCAGACGGGAACGGGACCATCGATTTCCCCGAGTA
CCTTAACCTGATGGCTAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGC
CTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCGGAGCTTCGACACGT
GATGACGAACCTCGGGGAGAAACTCACCGACGAGGAGGTTGATGAGATGATCAGAGAGGC
TGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAA
GTGATGGAGAGAGAGAGAGTGAATCTTTCTTTCTCGTTATGACTTGTTCCAGTTTGCTGT
CATGTAGAACATGTTTTCTTCCCCTTTGATTTGTTTTTGCTTTGGTGATTTTTATGTGAA
GTATGAACTCATGTCTTGCTCATCTTTTGACAATTGATATTCTCTCCTTTTTCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL8154Contig1 830 2 8 U
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CAAAATATCTTGGTGTATCAGTTATTCAAGATATGTGCCAGCACCGACAAACTCTCCTTC
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AGAACATAAAGCCAACAATAAGAACAACAAAGGGAAATGGGTCCACAGCAACAGAATCGG
AAGCAGCATTGGTTGCTAAAAGACCTGACTCTGGTGGTTAACAAGGCCCTGTTATACATC
TTCTCGCCAACCATTTTTTGCCAAGTTTGATCCTTCACTGAAGATATAACATTACAACGT
TGAGATCTCTCCAAACCAGATCTCTCCAAACCCTTCAAAGGAAATTGCTCGGATGATCAA
ACAAAAACTCGTGGAGACTATGCAGGGTAGCTTCTCTGGTGCTGTCCCTTTTTTTAATGG
TAGGAAAACATTTACATCCCTGTGGAGTTTCAAGAAGATAGGCTTCAGTTCTTTGCTAAC
CTCCCTATCCCATCCTGCAATACTTTGATCAAGTGTGGTGACTAGCATGAGAAGCTACCG
CAGAAGAAGATTGTTAAATGTTTAGGGTTAACATGAAGCTTACATTGAACATTGCATTGA
AAGCTTTATTTAAGAAAACCACTTTCTATGAACTAAGACATTTTCCTTAAAACCATGTCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DG88TF U 1
AF RR4DG88JQ C 126
BS 1 711 RR4DG88TF
BS 712 712 RR4DG88JQ
BS 713 727 RR4DG88TF
BS 728 728 RR4DG88JQ
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BS 774 802 RR4DG88TF
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RD RR4DG88TF 802 0 0
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CAAAATATCTTGGTGTATCAGTTATTCAAGATATGTGCCAGCACCGACAAACTCTCCTTC
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AGAACATAAAGCCAACAATAAGAACAACAAAGGGAAATGGGTCCACAGCAACAGAATCGG
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TTCTCGCCAACCATTTTTTGCCAAGTTTGATCCTTCACTGAAGATATAACATTACAACGT
TGAGATCTCTCCAAACCAGATCTCTCCAAACCCTTCAAAGGAAATTGCTCGGATGATCAA
ACAAAAACTCGTGGAGACTATGCAGGGTAGCTTCTCTGGTGCTGTCCCTTTTTTTAATGG
TAGGAAAACATTTACATCCCTGTGGAGTTTCAAGAAGATAGGCTTCAGTTCTTTGCTAAC
CTCCCTATCCCATCCTGCAATACTTTGATCAAGTGTGGTGACTAGCATGAGAAGCTACCG
CAGAAGAAGATTGTTAAATGTTTAGGGTTAACATGAAGCTTACATTGAACATTGCATTGA
AAGCTTTATTTAAGAAAACCACTTTCTATGAACTAAGACATTTTCCTTAAA*CCATGTCA
CTGTTTT*ATAAGTTAATTTTGTCCAGCTACTCTATTACTGCTCGGTTATCA*TGTCAAG
AAATATTTTTATTATAATGAAT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR4DG88JQ 705 0 0
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ATAAAGCCAACAATAAGAACAACAAAGGGAAATGGGTCCACAGCAACAGAATCGGAAGCA
GCATTGGTTGCTAAAAGACCTGATTCTGGTGGTTAACAAGGCCCTGTTATACATCTTCTC
GCCAACCATTTTTTGCCAAGTTTGATCCTTCACTGAAGATATAACATTACAACGTTGAGA
TCTTTCCAAACCAGATCTTTCCAAACCCTTCAAAGGAAATTGTTCGGATGATCAAACAAA
AACTCGTGGAGACTATGCAGGGTAGCTTTTCTGGTGCTGTCCCTTTTTTTAATGGTAGGA
AAACATTTACATCCCTGTGGAGTTTCAAGAAGATAGGCTTCAGTTCTTTGCTAACCTCCC
TATCCCATCCTGCAATACTTTGATCAAGTGTGGTGACTAGCATGAGAAGCTACCGCAGAA
GAAGATTGTTAAATGTTTAGGGTTAACATGAAGCTTACATTGAACATTGCATTGAAGGCT
TTATTTAAGAAAACCACTTTTTATGAATTAAGACATTTTCCTTAAAACCATGTCACTGTT
TTTATAAGTTAATTTTGTCCAGCTACTCTATTACTGCTCGGTTATCAATGTCAAGAAATA
TTTTTATTATAATGAATCGGCTACATCATATAAATCAACAGTTCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL8155Contig1 1203 2 2 U
GGATCACTAAAAACCAAACACAAAGAAAAAGATTTTAAAATTAAAAAAAAAAGATATGTC
TCTTCGTAACCCCCATCTCATCCTCTACCTGCTTTTCTTGACGGTGGTCACCGGAGAAAT
TCTCCGACCAAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATAGTAAGAAGAGA
AATGAAGAAAGCCATGTTCAGAGAAGCAAGAAGCGTCGCGTCCGTTATGCGTCTCCAGTT
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GCTTGGTGAGAAACTATCACTTTCCAACATCAATTCACTGAGATCTTTCGAAGTTGTGGA
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AAGAGCAAACGCAACGTTCTTGATTGATCTCTTCAAAAGATTCGATCTTTCCGTCAAAGA
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TAGGCTTTATAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCAGTTCTCGAACCGGTTTACAA
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CGCAACACCACATGTTTTTGATAACCAGTACTTCAAAGACTTGGTCTCAGGGAGAGGGTT
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TAGTGAGGATCAAGGGGAGTTCTTCAGGACTTTTGCAGAAGGGATGGTGAAACTGGGTGA
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CTTAAAGTGCTCTTTATTTAACCTGCAGTTGTAACTTTGGATCAGTAAAACTTAAGATGA
AAC


BQ
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10 10 10 

AF RR4AX30TF U 1
AF RR4AX30JQ C 366
BS 1 826 RR4AX30TF
BS 827 1203 RR4AX30JQ

RD RR4AX30TF 826 0 0
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TCTCCGACCAAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATAGTAAGAAGAGA
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CGCAACACCACATGTTTTTGATAACCAGTACTTCAAAGACTTGGTC

QA 1 826 1 826
DS 

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TTGCTTTATCTGGGTCACACTCGATTGGTCAAGGTCGGTGTTTTTCTATCATGTTTAGGC
TTTATAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCAGTTCTCGAACCGGTTTACAAGAAGA
AGCTTAACAAGCTTTGTCCTTTGGGTGGAGACGAGAACGTGACCGGAGATCTAGACGCAA
CACCACATGTTTTTGATAACCAGTACTTCAAAGACTTGGTCTCAGGGAGAGGGTTCCTTA
ATTCTGATCAGACTCTGTACACGAGTAGAGAGACAAGAGAGTATGTGAAAAGGTTTAGTG
AGGATCAAGGGGAGTTCTTCAGGACTTTTGCAGAAGGGATGGTGAAACTGGGTGATTTGC
AATCTGGTAGACCTGGTGAGGTTAGGTTTAATTGTAGAGTTGTTAATAGAATCCATAATG
ATGTATTGCTTGTCTCTTGAAATTACCAGAGAGACAGAAAGAGAGAGCTATTACTTTCTA
AATAGATACAAGACTTAAGACTTTTAAATACTTACATGCCATGATTGTTTGGTCCCTTAA
AGTGCTCTTTATTTAACCTGCAGTTGTAACTTTGGATCAGTAAAACTTAAGATGAAAC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C275TF U 1
AF RR4FF11TF U 1
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QA 1 651 1 651
DS 

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GTGAAGAATAAGTATTGTTCTACAGATGTCAAGGAGAGATTTGTTTACAACAATAACATC
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QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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GCTTGCAGTTACTTGCCTTTTGATGATTCTAATCTAATGAATCTTTATAAGAAAATTTCA
TCTGGTGAATTCGACTGTCCTCC


BQ
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AF RR4DX53TF U 1
AF RR4DU64TF U 1
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QA 1 743 1 743
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BQ
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AF RR4C333TF U 1
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AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU45TF U 1
AF RR4DU45JQ C 153
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BS 661 661 RR4DU45JQ
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RD RR4DU45TF 788 0 0
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TATAGGAAATCAGTTTTTGCATCAACTCTCCTCTGACCTCGTCTTATCCAATTGTTGTGT
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TCCTTCATTTGCTGTCCAATACCGCCGTCATTCTTGAAAAGTTGCAGACAGAGCTGAGAC
AGACAGAGAATTGAATCGACCAAGCTATTTGTCGCTTTCGTTCGCTTTGCTCTTCACGGA
TCAAAACCATTAACGGAAGCAAAGCATCAACACCTGTTTTTGATTCCATGGCTTACTTTG
GGCCTAAAGATTGGAGTAGTTCTAGTGTCTCCGACCACTAGATGTAATCCTTCCTGCAAT
TTCTTGCAGTCGGAAAAGTGGCTTCGCCGTTCCGACAAAGTTATAGAACATTCGGAAAAA
TGTAACGAGATCTAGAGAGATTGGGAATTCAAGTCGTGTTCAGCTTTCCCTCCAGCGTTG
CTAACCAGAAACGGTCGAGCCGAGAAGCAGAAACAGCTGAAGCAAGACCTGCTTGAAGCA
ATTGAGCCCCTAGAACGTGACACCACAGATTCTCCTGATGAGCAGCTTCGTATTGATCAG
*TTCCTTTCTCTTTCTTGTTGCAGATAGTTGGAGCCTTTAAGAATGTAGAATGAGCCATT
TAGATCTCAA*TAGACAAGTTTGTTTGTGAAA*CTTTCATGTATATCATCGTCCACAACA
TCAGTTGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4DU45JQ 713 0 0
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CGCTTTCGTTCGCTTTGCTCTTCACGGATCAAAACCATTAACGGAAGCAAAGCATCAACA
CCTGTTTTTGATTCCATGGCTTACTTTGGGCCTAAAGATTGGAGTAGTTCTAGTGTCTCC
GACCACTAGATGTAATCCTTCCTGCAATTTCTTGCAGTCGGAAAAGTGGCTTCGCCGTTC
CGACAAAGTTATAGAACATTCGGAAAAATGTAACGAGATCTAGAGAGATTGGGAATTCAA
GTCGTGTTCAGCTTTCCCTCCAGCGTTGCTAACCAGAAACGGTCGAGCCGAGAAGCAGAA
ACAGCTGAAGCAAGACCTGCTTGAAGCAATTGAGCCCCTAGAACGTGACACCACAGATTC
TCCTGATGAGCAGCTTCGTATTGATCAGGTTCCTTTCTCTTTCTTGTTGCAGATAGTTGG
AGCCTTTAAGAATGTAGAATGAGCCATTTAGATCTCAAATAGACAAGTTTGTTTGTGAAA
ACTTTCATGTATATCATCGTCCACAACATCAGTTGACAGATGGATGAGATTTGGTGTTCC
CCTATTTTTGAGTTTTCATGTACAGCATCAGTTGTCCACAACATCATTTGTTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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GAATGGAGTACGTAAACCCTGAAGGTCTTCGGTTAGATGGTCGCCGATTCAATGAGATGA
GGCAAATCGTAGCTGAAGTTGGAGTGGTTTCCAAGGCTGATGGCTCTGCTGTTTTCGAGA
TGGGTAACACAAAAGTAATAGCAGCTGTTTATGGCCCAAGAGAGATTCAAAACAAGAGCC
AACAAAAGAATGGTCATGCATTGGTGCTCTGTGAGTATAGTATGGCTCATTCTAGTACTG
GTGATCGTAGAAGACAGAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTC
AGACAATGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTATTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCC
TTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCCGCGACGCTAG
CTCTTGCTGACGCTGGAATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTTTCCTGCAGTGCTGGATACT
TGAACAGTACTCCACTTCTTGATCTGAACTACGTCGAAGATAGCGCTGGAGGAGCTGATG
TAACTGTCGGCATTCTACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTCAGATGGATGCAAAGT
TACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCTGAAGGCTGCAAGGCGATTG
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TTGTTAAATGTTTCTTCTAACTTTCCCAAACTCAAAAGTTAGTAATGCAAAAGACATACT
GTGTTTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C407TF U 1
AF RR4C407JQ C 88
BS 1 705 RR4C407TF
BS 706 910 RR4C407JQ

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AGACAATGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTATTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCC
TTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCCGCGACGCTAG
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TGAACAGTACTCCACTTCTTGATCTGAACTACGTCGAAGATAGCGCTGGAGGAGCTGATG
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TACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCTGAAG
CT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4C407JQ 823 0 0
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TCTGTGAGTATAGTATGGCTCATTCTAGTACTGGTGATCGTAGAAGACAGAAAAACGACA
GGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTCAGACAATGGAAGCTTGCATATTAACCG
AACTATTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGAA
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GTGATCTCGCTGTTTCCTGCAGTGCTGGATACTTGAACAGTACTCCACTTCTTGATCTGA
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ACAAAGTGACACTCCTTCAGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGT
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AAACTCAAAAGTTAGTAATGCAAAAGACATACTGTGTTTGGCG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

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TGAACAGCGTTGTCTTGGTATGATCCTCATCCCTGCCTCTTGCAGGACCTCTTGCCATGT
TGATTGCTCCATCGAGGAACAGCTTTCATTGATTCAGCTCAATGAGTAGAAGAGCCGCCT
CTTTTAATAGACTTGATGATTGTTGGTCAAAATTGATTCCGTGTTATTGTATTGTATGAT
TAATGAGTCACATGACTTTATGGAGATTAATGTATGCATGCAATTGCATTTGGAGTTTTG
TATTTACATCTAAAGAGAAGATGTTTTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DK09TF U 1
AF RR4DK09JQ C 5
BS 1 633 RR4DK09TF

RD RR4DK09TF 633 0 0
GGGTCTTCTCCGACAATTGTCTCCAGTTGCGTTTCCGACTCGGAGCCGTAGATTAATCGT
CCTAGGGTTCCACGAACCATCGTCTTACTACCAACCATATATACAAGAACAAGAGCCTGT
TGTCGGAATGGAACAAGAAGATGCAGAGAGAAACACCACCGTTGCTGTTGCGTCGACGAC
GACCTCGGATTTAGATCCGATAGCACGAGTGAGGAAGCTCTTGTTCCGCCAGATGCTCGT
TGGTATCAAAGACGGGAGATTCTTCCTTGGCAGTTTCCACTGCATTGACAAACAAGGAAA
CATCATTCTCCAAGACACCGTTGAGTATCGCAGCGTCAGAAGATCCTCTCCTTCTCCTAC
TGAACAGCGTTGTCTTGGTATGATCCTCATCCCTGCCTCTTGCAGGACCTCTTGCCATGT
TGATTGCTCCATCGAGGAACAGCTTTCATTGATTCAGCTCAATGAGTAGAAGAGCCGCCT
CTTTTAATAGACTTGATGATTGTTGGTCAAAATTGATTCCGTGTTATTGTATTGTATGAT
TAATGAGTCACATGACTTTATGGAGATTAATGTATGCATGCAATTGCATTTGGAGTTTTG
TATTTACATCTAAAGAGAAGATGTTTTGTTTAC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4DK09JQ 629 0 0
CTTCTCCGACAATTGTCTCCAGTTGCGTTTCCGACTCGGAGCCGTAGATTAATCGTCCTA
GGGTTCCACGAACCATCGTCTTACTACCAACCATATATACAAGAACAAGAGCCTGTTGTC
GGAATGGAACAAGAAGATGCAGAGAGAAACACCACCGTTGCTGTTGCGTCGACGACGACC
TCGGATTTAGATCCGATAGCACGAGTGAGGAAGCTCTTGTTCCGCCAGATGCTCGTTGGT
ATCAAAGACGGGAGATTCTTCCTTGGCAGTTTCCACTGCATTGACAAACAAGGAAACATC
ATTCTCCAAGACACCGTTGAGTATCGCAGCGTCAGAAGATCCTCTCCTTCTCCTACTGAA
CAGCGTTGTCTTGGTATGATCCTCATCCCTGCCTCTTGCAGGACCTCTTGCCATGTTGAT
TGCTCCATCGAGGAACAGCTTTCATTGATTCAGCTCAATGAGTAGAAGAGCCGCCTCTTT
TAATAGACTTGATGATTGTTGGTCAAAATTGATTCCGTGTTATTGTATTGTATGATTAAT
GAGTCACATGACTTTATGGAGATTAATGTATGCATGCAATTGCATTTGGAGTTTTGTATT
TACATCTAAAGAGAAGATGTTTTGTTTAC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL8163Contig1 993 2 4 U
GTCTGTGTACTTTATTTTATATATATACGTTACAGAAATGCCATATTATGATGATCATGA
AGTTTGTGATCGTTAGAGGAAATGAATGAACCTCCTTTTTTCCAATTATTAATTTAGTTT
CCATATTTGTTTTCATTTACTTTTGTTGATTTTTTTTAACTCTTGTTATATAGCCACCAG
ATAAAATAATGAAAAAGTTTGCATAAGATTTATCATTGGTGATGTCAAAAAAAAAAGATT
TATCATCTGTGAAACAATCATGTTATATACAAAAGTCTGCCCCCTTATGGTATGAATATT
TATTTATGTAGCAGCAACATTTTGGGATAAATATCATCTCTGTGAAGTTAAAAAAAAATA
TCATCTCTTTGTTCTTATAGATTGCTCAATAAGCCGGTTTGAAATCAATTTGGCATATAT
TGCGGATGTGGCACACCATACATGATACATATATGATAAATGATGTGGTAAAGAACTATA
CCACTCTGTTTAAAATTTGGTATCTCTCCAATCGCGTTATTTCTTAGAGAATTTACATGA
CCTGCTATTTGCTTGATATATTCTTATTCTTGAAAATACATATGCTATACTAACATGCAT
ATAGCACATTGGAATTTTCTCAAAAAGTTATTGTTGTCATTGTCAAGACATGCCACTTGA
AACCGTCTAGCTGGTTTGGAAGTGCTTTTTGGTAGTTGAGATGAATGGAATGGGATGGTA
TGGTAGGTGAGCTGGGAGCATGTAGTTGAAGATATAATAGCACGTGATGTGAGTTACATT
GATACGTGCGAACTTAAGTTGGTGGAGGATCCAGTTGGTGGAGGATCCACTTTCCAACGA
TAAACAACATGATGTTCTCTTCCTCTTTCAACTAGTACTTTTTTCTTTTCTTGTTGTGTG
TTTCTCTCCACCTCATAAATTAGTCTTGATGTTACTACAAAAAAATATTAAAAGTACTAG
AAAACTATTAAACGAAAATAAATTGTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B053TF U 1
AF RR4B053JQ C 187
BS 1 283 RR4B053TF
BS 284 284 RR4B053JQ
BS 285 722 RR4B053TF
BS 723 993 RR4B053JQ

RD RR4B053TF 722 0 0
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AGTTTGTGATCGTTAGAGGAAATGAATGAACCTCCTTTTTTCCAATTATTAATTTAGTTT
CCATATTTGTTTTCATTTACTTTTGTTGATTTTTTTTAACTCTTGTTATATAGCCACCAG
ATAAAATAATGAAAAAGTTTGCATAAGATTTATCATTGGTGATGTCAAAAAAAAAAGATT
TATCATCTGTGAAACAATCATGTTATATACAAAAGTCTGCCCC*TTATGGTATGAATATT
TATTTATGTAGCAGCAACATTTTGGGATAAATATCATCTCTGTGAAGTTAAAAAAAAATA
TCATCTCTTTGTTCTTATAGATTGCTCAATAAGCCGGTTTGAAATCAATTTGGCATATAT
TGCGGATGTGGCACACCATACATGATACATATATGATAAATGATGTGGTAAAGAACTATA
CCACTCTGTTTAAAATTTGGTATCTCTCCAATCGCGTTATTTCTTAGAGAATTTACATGA
CCTGCTATTTGCTTGATATATTCTTATTCTTGAAAATACATATGCTATACTAACATGCAT
ATAGCACATTGGAATTTTCTCAAAAAGTTATTGTTGTCATTGTCAAGACATGCCACTTGA
AACCGTCTAGCTGGTTTGGAAGTGCTTTTTGGTAGTTGAGATGAATGGAATGGGATGGTA
TG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4B053JQ 807 0 0
TAATGAAAAAGTTTGCATAAGATTTATCATTGGTGATGTCAAAAAAAAAAGATTTATCAT
CTGTGAAACAATCATGTTATATACAAAAGTCTGCCCCCTTATGGTATGAATATTTATTTA
TGTAGCAGCAACATTTTGGGATAAATATCATCTCTGTGAAGTTAAAAAAAAATATCATCT
CTTTGTTCTTATAGATTGCTCAATAAGCCGGTTTGAAATCAATTTGGCATATATTGCGGA
TGTGGCACACCATACATGATACATATATGATAAATGATGTGGTAAAGAACTATACCACTC
TGTTTAAAATTTGGTATCTCTCCAATCGCGTTATTTCTTAGAGAATTTACATGACCTGCT
ATTTGCTTGATATATTCTTATTCTTGAAAATACATATGCTATACTAACATGCATATAGCA
CATTGGAATTTTCTCAAAAAGTTATTGTTGTCATTGTCAAGACATGCCACTTGAAACCGT
CTAGCTGGTTTGGAAGTGCTTTTTGGTAGTTGAGATGAATGGAATGGGATGGTATGGTAG
GTGAGCTGGGAGCATGTAGTTGAAGATATAATAGCACGTGATGTGAGTTACATTGATACG
TGCGAACTTAAGTTGGTGGAGGATCCAGTTGGTGGAGGATCCACTTTCCAACGATAAACA
ACATGATGTTCTCTTCCTCTTTCAACTAGTACTTTTTTCTTTTCTTGTTGTGTGTTTCTC
TCCACCTCATAAATTAGTCTTGATGTTACTACAAAAAAATATTAAAAGTACTAGAAAACT
ATTAAACGAAAATAAATTGTTTGTTTC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL8164Contig1 716 2 5 U
GGGTTCATCGATCATTCTTCGTTTTATCTTATCTCCGGCGATAATGGAATCTCACGGAAA
CGCAAGCGACAAGCAATCTCAATCTCTTTACCCTACTGTCGACATGTCGAATCCCGAAGC
TCCTCTTAACCCTACCTCCTCCTCCTCCTCTTCTACTACTGCTACTAACCTCTATCCTTC
CCTCGACATGAACGATCTCGCTCGTGATCTCTTCCCCGAACAACCGGAGACGACGACTTC
CACCGTCCCCGTCTCAGCTCCTCCCGCCGCGACGGAGGAGGAGATTCTGAAAATCTCCGG
CGCGATACTCCACCTCATCGACAAATCATACAGCGTCGAGCTCGCTTGCGGCGACCTCAC
GATCATCCGTATCGTTCAGGACGGAAACGTCGTCACCGTTCTCGCTCGCGTCGCCGACGA
GATTCAGTGGCCGTTGACCAAGGACGAGAACTCCGTCAAGGTCGATGAGTCTCACTACTT
CTTCACCCTCCGTCCAGCTAAAGATTTCGGAGGACATGACTACTCGAGCGACGAAGACGA
AGGAGTGAAGAAGCAGCGAGAAGAGAACGAAATGTTGAACTACGGACTCACGATTGCTTC
CAAGGGTCAAGAGCATTTGCTGGAGGAGCTCGAGAAGATCTTGGAGGATTACAGCTGTTT
CACGGTGCAGCAAGTGTCGGAAGAGCGAAGAACAGGGGAAAGGGGTGTGGGATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BT38TF U 1
AF RR4GZ69TF U 210
BS 1 281 RR4BT38TF
BS 282 282 RR4GZ69TF
BS 283 646 RR4BT38TF
BS 647 647 RR4GZ69TF
BS 648 716 RR4BT38TF

RD RR4BT38TF 716 0 0
GGGTTCATCGATCATTCTTCGTTTTATCTTATCTCCGGCGATAATGGAATCTCACGGAAA
CGCAAGCGACAAGCAATCTCAATCTCTTTACCCTACTGTCGACATGTCGAATCCCGAAGC
TCCTCTTAACCCTACCTCCTCCTCCTCCTCTTCTACTACTGCTACTAACCTCTATCCTTC
CCTCGACATGAACGATCTCGCTCGTGATCTCTTCCCCGAACAACCGGAGACGACGACTTC
CACCGTCCCCGTCTCAGCTCCTCCCGCCGCGACGGAGGAGGTGATTCTGAAAATCTCCGG
CGCGATACTCCACCTCATCGACAAATCATACAGCGTCGAGCTCGCTTGCGGCGACCTCAC
GATCATCCGTATCGTTCAGGACGGAAACGTCGTCACCGTTCTCGCTCGCGTCGCCGACGA
GATTCAGTGGCCGTTGACCAAGGACGAGAACTCCGTCAAGGTCGATGAGTCTCACTACTT
CTTCACCCTCCGTCCAGCTAAAGATTTCGGAGGACATGACTACTCGAGCGACGAAGACGA
AGGAGTGAAGAAGCAGCGAGAAGAGAACGAAATGTTGAACTACGGACTCACGATTGCTTC
CAAGGGTCAAGAGCATTTGCTGGAGGAGCTCGAGAAGATCTTGGAG*ATTACAGCTGTTT
CACGGTGCAGCAAGTGTCGGAAGAGCGAAGAACAGGGGAAAGGGGTGTGGGATGTG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4GZ69TF 479 0 0
G
CTTCCCCGAACAACCGGAGACGACGACTTCCACCGTCCCCGTCTCAGCTCCTCCCGCCGC
GACGGAGGAGGAGATTCTGAAAATCTCCGGCGCGATACTCCACCTCATCGACAAATCATA
CAGCGTCGAGCTCGCTTGCGGCGACCTCACGATCATCCGTATCGTTCAGGACGGAAACGT
CGTCACCGTTCTCGCTCGCGTCGCCGACGAGATTCAGTGGCCGTTGACCAAGGACGAGAA
CTCCGTCAAGGTCGATGAGTCTCACTACTTCTTCACCCTCCGTCCAGCTAAAGATTTCGG
AGGACATGACTACTCGAGCGACGAAGACGAAGGAGTGAAGAAGCAGCGAGAAGAGAACGA
AATGTTGAACTACGGACTCACGATTGCTTCCAAGGGTCAAGAGCATTTGCTGGAGGAGCT
CGAGAAGATCTTGGAGGATTACAGCTGTTTCACGGTGCAGCAAGTGTCGGAAGAG
GCG

QA 2 476 2 476
DS 



AS 1 2

CO CL8165Contig1 1195 2 2 U
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TGCACACACCGACATGGTCACCGCAATCGCCACCCCATCGACAACTCAGACCCATCGTCT
CGGCTTCCCGCGACAAATCCATCATCGTCTGGAAACTCACCAAGGACGACAAGTCCTACG
GCGTAGCTCAGAGGCGTCTCACCGGCCACTCTCACTTCGTCGAGGACGTCGTCCTCTCCT
CCGACGGCCAATTCGCCCTCTCCGGAAGCTGGGACGGCGAGCTCCGCCTCTGGGATCTCG
CCGCCGGCGTGTCCACTCGCAGATTCGTTGGACACACCAAGGACGTTCTCTCCGTCGCGT
TCCCGCTCGACAACCGTCAGATCGTGTCGGCGTCTCGCGACCGTACGATCAAGCTCTGGA
ACACTCTGGGCGAGTGTAAGTACACTATCGCCGAGGGAGGTGAGGGACACAATGAGTGGG
TTAGCTGCGTCAGGTTCATTCCCAACACGCTCCAGCCGACGATTGTGTCGGCTTCTTGGG
ACAAGACCGCGAAAGTGTGGAACTTGTCGAACTGCAAGCTCAGGTCGACTCTTGCTGGCC
ACACTGGGAACGTCAACACTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAG
GCAAAGACGGTGTCGTTTTGCTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTG
AAGCTAACTCTGAGATCCACGCGCTTTGCTTTAGCCCTAACAGGTACTGGCTGTGTGCTG
CGACTCAGCAGGGTATTAAGATTTGGGATCTTGAGAGCAAGAGCGTTGTTGAGGACTTGA
AGGTTGATCTCAAGGCCGAGGCTGAGAAGTCTGACGGAAGTGCTACTGCTGCCAACAAAA
GGAAGGTTATTTACTGCACCAGCCTGAACTGGAGTGCTGATGGAAGCACTTTGTTCAGTG
GTTACACGGATGGAGTTATCAGAGTTTGGGGTATTGGCCGTTACTAGTTATCCCGTCTCT
TCTATGTCTTTCTCCTTTGTTGTTGGTTTTATCTATCACTCTTTTGTTTTGTGAGCAAAC
TCATACACGGTGCATCATAAAGTACTCTGAAGGATATTTTGTTTTATGTCAACTTTTAGG
TTCGGATCTTTACTTATTTGTGAGAACTTGCCTTTCTAAGTTACTTCTGTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CF68TF U 1
AF RR4CF68JQ C 561
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BS 666 1195 RR4CF68JQ

RD RR4CF68TF 665 0 0
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TGCACACACCGACATGGTCACCGCAATCGCCACCCCATCGACAACTCAGACCCATCGTCT
CGGCTTCCCGCGACAAATCCATCATCGTCTGGAAACTCACCAAGGACGACAAGTCCTACG
GCGTAGCTCAGAGGCGTCTCACCGGCCACTCTCACTTCGTCGAGGACGTCGTCCTCTCCT
CCGACGGCCAATTCGCCCTCTCCGGAAGCTGGGACGGCGAGCTCCGCCTCTGGGATCTCG
CCGCCGGCGTGTCCACTCGCAGATTCGTTGGACACACCAAGGACGTTCTCTCCGTCGCGT
TCCCGCTCGACAACCGTCAGATCGTGTCGGCGTCTCGCGACCGTACGATCAAGCTCTGGA
ACACTCTGGGCGAGTGTAAGTACACTATCGCCGAGGGAGGTGAGGGACACAATGAGTGGG
TTAGCTGCGTCAGGTTCATTCCCAACACGCTCCAGCCGACGATTGTGTCGGCTTCTTGGG
ACAAGACCGCGAAAGTGTGGAACTTGTCGAACTGCAAGCTCAGGTCGACTCTTGCTGGCC
ACACTGGGAACGTCAACACTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAG
GCAAA

QA 1 665 1 665
DS 

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GTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAGGCAAAGACGGTGTCGTTTTG
CTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAAGCTAACTCTGAGATCCAC
GCGCTTTGCTTTAGCCCTAACAGGTACTGGCTGTGTGCTGCGACTCAGCAGGGTATTAAG
ATTTGGGATCTTGAGAGCAAGAGCGTTGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTCAAGGCCGAG
GCTGAGAAGTCTGACGGAAGTGCTACTGCTGCCAACAAAAGGAAGGTTATTTACTGCACC
AGCCTGAACTGGAGTGCTGATGGAAGCACTTTGTTCAGTGGTTACACGGATGGAGTTATC
AGAGTTTGGGGTATTGGCCGTTACTAGTTATCCCGTCTCTTCTATGTCTTTCTCCTTTGT
TGTTGGTTTTATCTATCACTCTTTTGTTTTGTGAGCAAACTCATACACGGTGCATCATAA
AGTACTCTGAAGGATATTTTGTTTTATGTCAACTTTTAGGTTCGGATCTTTACTTATTTG
TGAGAACTTGCCTTTCTAAGTTACTTCTGTTTTGT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8166Contig1 778 2 2 U
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AAACTCTCATCGCCTTGTGTAGTACGGTACCTGGTTACCGGTTCACAGTTGCGTTTATAG
ATGTCATTGGAAGGTTTGCGATTCAGATGATGGGATTCTTCTTCATGACGGTGTTCATGT
TTGCTTTGGCTATTCCATACAACCACTGGACTCACAAGGAGAACAGAATTGGATTCGTTA
TCATGTACTCTTTAACGTTCTTTTTTGCCAACTTTGGGCCTAATGCTACAACCTTCGTTG
TACCCGCGGAGATCTTCCCAGCCAGGTTCAGATCCACCTGCCATGGTATCTCGGCAGCAT
CGGGTAAACTAGGTGCGATGGTTGGTGCGTTTGGATTCTTGTATTTGGCCCAGAGTCCAG
ATAAAAACAAGACAGACGCAGGATACCCTCCAGGTATTGGAGTCAGGAACTCGCTTCTCG
TGCTAGGTGTGGTTAACTTCTTGGGTATTCTCTTCACTTTCTTGGTACCTGAATCTAAAG
GGAAGTCGCTTGAGGAAATGTCCGGTGAAAATGAAGACGATGAGAACACAACAACAAGTG
ATAGTAGAACGGTCCCAGTTGTGTAGTTTGATATAATAAGATTTTTGTTTTAATTTTTCT
TTGGTCCTTTTGTTTCCAGCAGTTTAAGTTGTTTCTGGTGTGATATCTTTGTTGTACTAA
TGCTATAAAAATCAAAATGCTCATGTACCGATTTTAATTAAAGGAAATGTTCTTCTTC


BQ
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AF RR4EN71TF U 1
AF RR4EN71JQ C 78
BS 1 731 RR4EN71TF
BS 732 778 RR4EN71JQ

RD RR4EN71TF 731 0 0
GGATTCCTCCGGCTCAAACCATGAATGCGATTCAAGAAGTTTTCAAGATTGCGCGTGCTC
AAACTCTCATCGCCTTGTGTAGTACGGTACCTGGTTACCGGTTCACAGTTGCGTTTATAG
ATGTCATTGGAAGGTTTGCGATTCAGATGATGGGATTCTTCTTCATGACGGTGTTCATGT
TTGCTTTGGCTATTCCATACAACCACTGGACTCACAAGGAGAACAGAATTGGATTCGTTA
TCATGTACTCTTTAACGTTCTTTTTTGCCAACTTTGGGCCTAATGCTACAACCTTCGTTG
TACCCGCGGAGATCTTCCCAGCCAGGTTCAGATCCACCTGCCATGGTATCTCGGCAGCAT
CGGGTAAACTAGGTGCGATGGTTGGTGCGTTTGGATTCTTGTATTTGGCCCAGAGTCCAG
ATAAAAACAAGACAGACGCAGGATACCCTCCAGGTATTGGAGTCAGGAACTCGCTTCTCG
TGCTAGGTGTGGTTAACTTCTTGGGTATTCTCTTCACTTTCTTGGTACCTGAATCTAAAG
GGAAGTCGCTTGAGGAAATGTCCGGTGAAAATGAAGACGATGAGAACACAACAACAAGTG
ATAGTAGAACGGTCCCAGTTGTGTAGTTTGATATAATAAGATTTTTGTTTTAATTTTTCT
TTGGTCCTTTTGTTTCCAGCAGTTTAAGTTGTTTCTGGTGTGATATCTTTGTTGTACTAA
TGCTATAAAAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4EN71JQ 701 0 0
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GCGATTCAGATGATGGGATTCTTCTTCATGACGGTGTTCATGTTTGCTTTGGCTATTCCA
TACAACCACTGGACTCACAAGGAGAACAGAATTGGATTCGTTATCATGTACTCTTTAACG
TTCTTTTTTGCCAACTTTGGGCCTAATGCTACAACCTTCGTTGTACCCGCGGAGATCTTC
CCAGCCAGGTTCAGATCCACCTGCCATGGTATCTCGGCAGCATCGGGTAAACTAGGTGCG
ATGGTTGGTGCGTTTGGATTCTTGTATTTGGCCCAGAGTCCAGATAAAAACAAGACAGAC
GCAGGATACCCTCCAGGTATTGGAGTCAGGAACTCGCTTCTCGTGCTAGGTGTGGTTAAC
TTCTTGGGTATTCTCTTCACTTTCTTGGTACCTGAATCTAAAGGGAAGTCGCTTGAGGAA
ATGTCCGGTGAAAATGAAGACGATGAGAACACAACAACAAGTGATAGTAGAACGGTCCCA
GTTGTGTAGTTTGATATAATAAGATTTTTGTTTTAATTTTTCTTTGGTCCTTTTGTTTCC
AGCAGTTTAAGTTGTTTCTGGTGTGATATCTTTGTTGTACTAATGCTATAAAAATCAAAA
TGCTCATGTACCGATTTTAATTAAAGGAAATGTTCTTCTTC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

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TCAACAATGTGAATGAGGTGAATGCGAAGGTGTGCATAAAATCACAAGACTTCGAACAGA
ACTGTGGCTGGGATGGAAACAAGACTTGCATAAGAGGATTTAATAAAATTAATAAGTTCC
CTATTTCTTGCGAGTGTACCCATAAAAACCCTACCGTGAGCAGCAAACGTACCTGCAAAT
GTAAATTTCCAAAGTCTCCCTGCTAAGATTTCATGTAGTTTTATATAAACCAGTATCTCT
TTGTTACTATACGTACAAGAATTGAATACACGTATAAGTCGTTGTATTAACATGGCAGAT
AAAGTTAGCAGGGCTCTCGTTTAATAATGTATTTTTAAATGTCTTTTGTTACTTTTATCT
CCTTGTAAAATCAGTAGAGTTATAATCTAAAAGCATGTTTATTGGGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4G063TF U 1
AF RR4GA34TF U 1
BS 1 525 RR4G063TF
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GTAAATTTCCAAAGTCTCCCTGCTAAGATTTCATGTAGTTTTATATAAACCAGTATCTCT
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QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4GA34TF 528 0 0
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ACTGTGGCTGGGATGGAAACAAGACTTGCATAAGAGGATTTAATAAAATTAATAAGTTCC
CTATTTCTTGCGAGTGTACCCATAAAAACCCTACCGTGAGCAGCAAACGTACCTGCAAAT
GTAAATTTCCAAAGTCTCCCTGCTAAGATTTCATGTAGTTTTATATAAACCAGTATCTCT
TTGTTACTATACGTACAAGAATTGAATACACGTATAAGTCGTTGTATTAACATGGCAGAT
AAAGTTAGCAGGGCTCTCGTTTAATAATGTATTTTTAAATGTCTTTTGTTACTTTTATCT
CCTTGTAAAATCAGTAGAGTTATAATCTAAAAGCATGTTTATTGGGTC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL8168Contig1 711 2 1 U
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CCTATGTGCACAACCGTGCTCGTGCCGCTGTTGGTGTGGCTCCGATAAGATGGCATGCGG
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ACTCAGGCGGGCGTTACGGCGAAAACTTGGCAGGAAGCAGTCGTGATCTGTCTGGAGCTG
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AAAACATGTCCATAGAGGACGTACGTGTGTGTGTTGTTTTTATCTTTCAAATAATGATTA
TCATCTACCACTACTAGGATATGGTGATTCGATAACGTTCGTGTGTATGGTTGCATAATA
TTTTGTGATGGGATAATACATTGATAAATAGTTGTTTGTACGTACAATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GK45TF U 1
AF RR4GK45JQ C 92
BS 1 711 RR4GK45TF

RD RR4GK45TF 711 0 0
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GATGTGCCAAAGTCAGGTGTAATAGTGGTGGAACTTTCATCGTTTGCAGCTATGATCCTC
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AAAACATGTCCATAGAGGACGTACGTGTGTGTGTTGTTTTTATCTTTCAAATAATGATTA
TCATCTACCACTACTAGGATATGGTGATTCGATAACGTTCGTGTGTATGGTTGCATAATA
TTTTGTGATGGGATAATACATTGATAAATAGTTGTTTGTACGTACAATTAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4GK45JQ 620 0 0
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TGGTGTGGCTCCGATAAGATGGCATGCGGATGTGGCGGAATACGCCCGACGACATGCTCT
GCAAAGGCGAGGGGACTGTCGTCTAACTCACTCAGGCGGGCGTTACGGCGAAAACTTGGC
AGGAAGCAGTCGTGATCTGTCTGGAGCTGACGCAGTGAGGTTGTGGGTCAACGAGAAGAA
CGACTACTTTTACAATTCGAACACTTGTCGTTCCGGAAAAGCATGTGGTCACTATACTCA
AGTTGTGTGGAGAAGCTCGGTGTGGGTTGGATGTGCCAAAGTCAGGTGTAATAGTGGTGG
AACTTTCATCGTTTGCAGCTATGATCCTCCTGGTAATATTAGGGGCCGTAGGCCTTACTA
AGAATATATATATATGTACGCAAATAAATAAAACATGTCCATAGAGGACGTACGTGTGTG
TGTTGTTTTTATCTTTCAAATAATGATTATCATCTACCACTACTAGGATATGGTGATTCG
ATAACGTTCGTGTGTATGGTTGCATAATATTTTGTGATGGGATAATACATTGATAAATAG
TTGTTTGTACGTACAATTAC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL8169Contig1 907 2 18 U
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CACTAGGACTGCTCCAGGTGACTGTTATTCGAGGAAAGAAACTGGCTATCAGAGACTTCA
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TCAACAATTGCCTGAATCCTGTGTGGGATGAGGAACTGAGCTTTACACTCAAAGACCCTG
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GCCTTTGTTTCACAACATGTAATGCCAATTAATGTCTTCTAACTCAACACAACTCTCTTA
ACTTCAACTTGTTGACGTGTTTCTGTAGTAGAACGCAAAGCGTGTGTATATTTGTTCAAG
TTTGTGTGTCGTCATGAGACCCCTTGACTTTGTATTTGAGAGATGCAATGGAAGTTTGTT
AGAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN26TF U 1
AF RR4FN26JQ C 197
BS 1 761 RR4FN26TF
BS 762 762 RR4FN26JQ
BS 763 766 RR4FN26TF
BS 767 767 RR4FN26JQ
BS 768 771 RR4FN26TF
BS 772 772 RR4FN26JQ
BS 773 780 RR4FN26TF
BS 781 781 RR4FN26JQ
BS 782 786 RR4FN26TF
BS 787 787 RR4FN26JQ
BS 788 812 RR4FN26TF
BS 813 813 RR4FN26JQ
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BS 839 839 RR4FN26JQ
BS 840 862 RR4FN26TF
BS 863 907 RR4FN26JQ

RD RR4FN26TF 864 0 0
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GTTCTTCTGTGTTTCTTAAGCTCAAGCTCTGATTGCCTTTGAGGTCTGAGATGGGCGAGC
CACTAGGACTGCTCCAGGTGACTGTTATTCGAGGAAAGAAACTGGCTATCAGAGACTTCA
AGTCAAGTGATCCTTACGTGATTGTCAAATTGGGGAATGAGTCATCCAAGACCAAAGTGA
TCAACAATTGCCTGAATCCTGTGTGGGATGAGGAACTGAGCTTTACACTCAAAGACCCTG
CAGCAGCTCTCGCATTGGAAGTGTTTGATAAAGATAGGTTCAAGGCAGATGACAAGATGG
GTCATGCCACTCTCAGCCTTCAGCCGCTCATCTCAGTAGCCAGACTAAGGCATATAGTGC
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TATCTCGGGAGAGCACGATCAGTTGCATAAACGGAGAGGTGGTGCAGAGCGTGTGGCTAA
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CAACATGTAATGGTCGTCTCTGTGTTTCCAAATGAGTGTGAAACGGCTTTAAACCTTTTT
GCCTTTGTTTCACAACATGTAATGCCAATTAATGTCTTCTA*CTCA*CACA*CTCTCTTA
*CTTCA*CTTGTTGACGTGTTTCTGTAGTAGA*CGCAA*GCGTGTGTATATTTGTTCA*G
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TT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4FN26JQ 711 0 0
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GGAAGTGTTTGATAAAGATAGGTTCAAGGCAGATGACAAGATGGGTCATGCCACTCTCAG
CCTTCAGCCGCTCATCTCAGTAGCCAGACTAAGGCATATAGTGCATGTCTCCTCTGATGG
TGAGACAACGCTTAGGAAAGTGTTACCTGATTCTGACAACTGTGTATCTCGGGAGAGCAC
GATCAGTTGCATAAACGGAGAGGTGGTGCAGAGCGTGTGGCTAAAGCTGTGCGCTGTTGA
ATCGGGTGAGATTGAGTTAAAGATCAAGTTGATTGATCATCCTGGAACAAAGTAGAATGC
ACACATGCGCCGGGGGGAGCAACCCGATTGTCTAGTGATAACTGCAACATGTAATGGTCG
TCTCTGTGTTTCCAAATGAGTGTGAAACGGCTTTAAACCTTTTTGCCTTTGTTTCACAAC
ATGTAATGCCAATTAATGTCTTCTAACTCAACACAACTCTCTTAACTTCAACTTGTTGAC
GTGTTTCTGTAGTAGAACGCAAAGCGTGTGTATATTTGTTCAAGTTTGTGTGTCGTCATG
AGACCCCTTGACTTTGTATTTGAGAGATGCAATGGAAGTTTGTTAGAAATC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACTCAGCTTCTCACCGGCGGTTTTGACGAACCGAACCGGAATTGGATCGGTGGTTCTTC
TTCTGATTGTTTTAACCCGGTTCAGCTCTTACCCAGCCCATCCTCCTCCTCCTCTCTACA
TCATCATTACAACAACAACAGTACTAATCATCGTCAAGAGACGTCGTTGAACCATCATCA
TCAGAATCATTTCTCGTTTGTACCGGATTACAACTTTGGAATCTCCTCTTCTGATTCTCC
CGGAGCAGCCGGAGGCTGCTACACTAGTAGGGGGACCCTTCAGTCCAATTCACACTCTCT
CTTTCTCAACAACAACAACAACGTTAATCAAAGACCGATATCTTTCATGGCTACACCTCC
TCCTCTTGACCACCATAACCACCAGCTTCCAGCAGCTTTTGACGGCCGGTTATATCTCTA
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AAGCTTCATTAATTCCATCTTGCGGAAGGAATTGACGAAAGACGATGTATGTGCAGCCGG
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AATATCTCAAATATATGCATCTTTCTGTGTTTTCATCTTTTTGTCATGTAATTTGCCTAA
AACTGGGACCAAGGTCCAAGGTTTGTCTAGTC


BQ
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AF RR4F792TF U 1
AF RR4F792JQ C 415
BS 1 542 RR4F792TF
BS 543 812 RR4F792JQ

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CACTCAGCTTCTCACCGGCGGTTTTGACGAACCGAACCGGAATTGGATCGGTGGTTCTTC
TTCTGATTGTTTTAACCCGGTTCAGCTCTTACCCAGCCCATCCTCCTCCTCCTCTCTACA
TCATCATTACAACAACAACAGTACTAATCATCGTCAAGAGACGTCGTTGAACCATCATCA
TCAGAATCATTTCTCGTTTGTACCGGATTACAACTTTGGAATCTCCTCTTCTGATTCTCC
CGGAGCAGCCGGAGGCTGCTACACTAGTAGGGGGACCCTTCAGTCCAATTCACACTCTCT
CTTTCTCAACAACAACAACAACGTTAATCAAAGACCGATATCTTTCATGGCTACACCTCC
TCCTCTTGACCACCATAACCACCAGCTTCCAGCAGCTTTTGACGGCCGGTTATATCTCTA
TTACGGTGAAGGAAACCGGAGCTCCGACGATAAAGGAAAGGATGGGAGATAGTACAGAAA
AA

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4F792JQ 398 0 0
ACCTCTTCT
TCTTGACCACCATAACCACCAGCTTCCAGCAGCTTTTGACGGCCGGTTATATCTCTATTA
CGGTGAAGGAAACCGGAGTTCCGACGATAAAGGAAAGGATGGGAGATAGTACAGAAAAAG
CTTCATTAATTCCATCTTGCGGAAGGAATTGACGAAAGACGATGTATGTGCAGCCGGAAA
CTTGTCTTTTGAACTTCCATCGCAATAATAAGCCTAATGGATGTAGGCTGCGAGGAATTT
GTTGTTGTTTGATGAGAAAATGTGATAATGTAACGAAAATGTTTGTTTGTTTTTTTTAAT
ATCTCAAATATATGCATCTTTCTGTGTTTTCATCTTTTTGTCATGTAATTTGCCTAAAAC
TGGGACCAAGGTCCAAGGTTTGTCTAGTC

QA 10 398 10 398
DS 



AS 1 2

CO CL8172Contig1 714 2 3 U
GGAGTTCACCAATAAGATATTTTATTCAACCTCCATCCACCGTCCGGAGCAGAACAAAGA
GAAGAGGATCAAATGACGCCGACTATCTTTACTCCGACGACTCTTCCTCCCTCGACTATT
ACATGGCCATGTACCACCACACCTCAGAAGCTCACTACCATTAGAACACCTTTCAAGCTC
AAGTGTAGAGCTACTTCATCATCTTCCATCACAGACTTTGATCTTTACGACCTCTTAGGT
ATCGACCGGGGATCCGACAAGTCTCAGATCAAAGCAGCTTATCGTAACTTGCAAAAACGT
TGTCATCCAGATATCGCAGGAGTTCCAGGCCACGACATGGCCATCATACTTAACGAGGCT
TACAAGCTTCTGTCTGATCCTATCTCACGCCAAGCCTATGATAAGGAGCAAGCGAAACTG
GAAGAGCTTAGAGGCTACACAGGGAAACCAATCTACTCGGTTTGGTGTGGACCAGAGACA
GAGCAACGAGCTGTGTTTGTAGATGAGGTCAAGTGCGTTGGTTGCTTGAAGTGTGCTTTG
TGTGCAGAGAGAACGTTTGCTATCGAAACAGCTCACGGGAGAGCTAGGGTTGTCGCTCAG
TGGGCTGACCCTGAGTCTAAAATCAAAGAAGCTATCGAAGCTTGCCCCATAGACTGCATC
TCATGGTGGAGAGATCTGATCTAGCGCCATTGGAGTTTCTTATGTCAAGCAGCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH34TF U 2
AF RR4BW29TF U 1
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RD RR4EH34TF 640 0 0
GG
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GACCGGGGATCCGACAAGTCTCAGATCAAAGCAGCTTATCGTAACTTGCAAAAACGTTGT
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DS 

RD RR4BW29TF 714 0 0
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ACATGGCCATGTACCACCACACCTCAGAAGCTCACTACCATTAGAACACCTTTCAAGCTC
AAGTGTAGAGCTACTTCATCATCTTCCATCACAGACTTTGATCTTTACGACCTCTTAGGT
ATCGACCGGGGATCCGACAAGTCTCAGATCAAAGCAGCTTATCGTAACTTGCAAAAACGT
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TACAAGCTTCTGTCTGATCCTATCTCACGCCAAGCCTATGATAAGGAGCAAGCGAAACTG
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GAGCAACGAGCTGTGTTTGTAGATGAGGTCAAGTGCGTTGGTTGCTTGAAGTGTGCTTTG
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TGGGCTGACCCTGAGTCTAAAATCAAAGAAGCTATCGAAGCTTGCCCCATAGACTGCATC
TCATGGTGGAGAGATCTGATCTAGCGCCATTGGAGTTTCTTATGTCAAGCAGCT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL8173Contig1 828 2 2 U
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AGGACATGGTATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCTAAGATTTTTCGGTTCTGTAGGTCTAA
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AAACAGACCTGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAA
GATTGATAAGATCAGAATTTCAAGAGAAGCTGATCACATCAATAAGAGGTTGAAGCCAAA
CAAACAGAAGATATTCAAGAGTGCAGTCCAGGAGATAGATCAGCACATTAGTTTGATCAT
AGCACCAGGTTCTCACCAACAAGATTCAGAGAAGATGAAAGTTTCGGTCTCCACAAACAA
GTCTGTTCAGAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGAAACTCTTCAAAAAATATCAC
TTCAGTCTGATGCTTATGTCGTCGCCCTTTCAGTAAAAAAGAAGAGTTTTTGATTGTTTT
CATTTGCAATACAATGTATTGTTTATTACCTGGAACGTCATTTTCATTTATTCCGATTTT
GTGCTTTGTTTTTGTTTCTTGATCTTTTTGTTTGTTGGCAAGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F378TF U 1
AF RR4F378JQ C 219
BS 1 648 RR4F378TF
BS 649 828 RR4F378JQ

RD RR4F378TF 648 0 0
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4F378JQ 610 0 0
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GAAACTCTTCAAAAAATATCACTTCAGTCTGATGCTTATGTCGTCGCCCTTTCAGTAAAA
AAGAAGAGTTTTTGATTGTTTTCATTTGCAATACAATGTATTGTTTATTACCTGGAACGT
CATTTTCATTTATTCCGATTTTGTGCTTTGTTTTTGTTTCTTGATCTTTTTGTTTGTTGG
CAAGAAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL8174Contig1 658 2 1 U
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CTGTCATAGTGGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGGTTTCAGTTTTGTGGTGA
TTAATGTCTCTGTATCCCTCATCTTCTTTTTGTTGACAACTGCACTTGAATGTGTGTAAA
CTTATACAAATCTTCTCGCCCTTTTTCAAATTATGAATTTGGAGATTTACACCACAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A813JQ C 1
AF RR4A813TF U 1
BS 1 658 RR4A813TF

RD RR4A813JQ 658 0 0
GGAGTGAATCGAAGCAACCACGGTGTTGAGTGAGAACTAGAAATCTCAAACGGCGAAGAT
GAGTTCATCTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTCGAGTCCAAGGCCAATGATCT
CGCCAAAATCCAGAAAGATATCGCCAAGGATCACCAGCTGAGGAAGAAGTATACGATCCA
ACTTGGTGAGAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGT
CTACAAGTTGATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATCTAGCAGAAGCTAATGCGAATGT
TCGCAAACGTATTGAGTACATTTCTGCTGAGTTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAGA
TAATGAAGGACAACAGAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTACA
ATCTATCCAGGCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATTGTCCAAGTCCTTCACTCGTGCACGCCC
CTGTCATAGTGGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGGTTTCAGTTTTGTGGTGA
TTAATGTCTCTGTATCCCTCATCTTCTTTTTGTTGACAACTGCACTTGAATGTGTGTAAA
CTTATACAAATCTTCTCGCCCTTTTTCAAATTATGAATTTGGAGATTTACACCACAGT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4A813TF 658 0 0
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CGCCAAAATCCAGAAAGATATCGCCAAGGATCACCAGCTGAGGAAGAAGTATACGATCCA
ACTTGGTGAGAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGT
CTACAAGTTGATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATCTAGCAGAAGCTAATGCGAATGT
TCGCAAACGTATTGAGTACATCTCTGCTGAGTTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAGA
TAATGAAGGACAACAGAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTACA
ATCTATCCAGGCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATTGTCCAAGTCCTTCACTCGTGCACGCCC
CTGTCATAGTGGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGGTTTCAGTTTTGTGGTGA
TTAATGTCTCTGTATCCCTCATCTTCTTTTTGTTGACAACTGCACTTGAATGTGTGTAAA
CTTATACAAATCTTCTCGCCCTTTTTCAAATTATGAATTTGGAGATTTACACCACAGT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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TGCTGCTAATGCTGCCATTTCTGAGATGGACGGAAAGGAACTGAATGGACGCAACATCCG
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CGGTGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGATGGTGG
TGGTTACTAAACAGAGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGATCTCTCTGTTTGTTTTGG
ACTTCCGTTTGTTGTTTTAAAAATTAAATCGAGTCTGGTGTTTGTACCAAAACCTAATTA
GGATTTGTTTAAACTCTTAGTCACTACTCTTATCTAAGAGACGCCTTTTCACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BF27JQ C 1
AF RR4BF27TF U 1
BS 1 654 RR4BF27TF

RD RR4BF27JQ 654 0 0
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QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4BF27TF 654 0 0
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TGCTGCTAATGCTGCCATTTCTGAGATGGACGGAAAGGAACTGAATGGACGCAACATCCG
AGTGAATGTTGCCAACGATAGAACAAGTGCTCCAAGGGCTTATGGAGGTGGTGGTGGCTA
CGGTGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGATGGTGG
TGGTTACTAAACAGAGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGATCTCTCTGTTTGTTTTGG
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GGATTTGTTTAAACTCTTAGTCACTACTCTTATCTAAGAGACGCCTTTTCACTC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL8176Contig1 722 2 1 U
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GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4C389TF U 1
AF RR4C389JQ C 32
BS 1 722 RR4C389TF

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AACTTCAGCAGTCACTATTGGTGCGACCGAAGCTAGAGCAAGGATTTTCGGACACATGCT
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TAAGGTTGCTGACCGGTATCCTTACAACATCAAGAATGCAGATCCCAATGTCTTATTGGG
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GACCACCGAAAAAGGGTCATGGAAGACGTGCTGCAAAGCGTAACAAGTAGAGAATGTCCT
AGTCGTACTTCCAACAAAAGAGCTCTGCACTCTCATAATCAGATTCTTCTTCTTGTTAAT
GTCAGATACAACTTACTAGTTAGATTCTTTTTTATTTTGTGTTTTAATCTACTTCTTTAT
AGCCTTTCTCTCTAGTATGCAACAACCTGATATACTTGTGTTGTGTGTAATAATCATGGA
TTCAAATCCAAAACTATGCGTATTGAGATTTGATCATAATCTTCTGAGAGACATCCAGTT
GC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4C389JQ 691 0 0
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GCTAGAGCAAGGATTTTCGGACACATGCTTAACCCAACGACGGGACAGAGATCTCCTCAT
AAGATCTTAAGGAAGAAGCTTTTCGGTGATAAGGTTGCTGACCGGTATCCTTACAACATC
AAGAATGCAGATCCCAATGTCTTATTGGGAGTTTGTGTGTTACTGTAGGCGCTTATCGAA
GCTTGAGATGTTGAAGCGTCGTGACAAAGGACCACCGAAAAAGGGTCATGGAAGACGTGC
TGCAAAGCGTAACAAGTAGAGAATGTCCTAGTCGTACTTCCAACAAAAGAGCTCTGCACT
CTCATAATCAGATTCTTCTTCTTGTTAATGTCAGATACAACTTACTAGTTAGATTCTTTT
TTATTTTGTGTTTTAATCTACTTCTTTATAGCCTTTCTCTCTAGTATGCAACAACCTGAT
ATACTTGTGTTGTGTGTAATAATCATGGATTCAAATCCAAAACTATGCGTATTGAGATTT
GATCATAATCTTCTGAGAGACATCCAGTTGC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8177Contig1 551 2 1 U
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CGGAAGAGAGCGATGGAGATCTTGGATTCGGCTTGTTCGATTAGTTTGGTCTCCCTGTTA
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CATTAATACAGTTTGGTCCGTTTTGTTATATCACGTTACTGCCTCGTATCGAATCTACAA
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BQ
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AF RR4BU26JQ C 1
AF RR4BU26TF U 1
BS 1 551 RR4BU26TF

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ACTGATTTGGT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR4BU26TF 551 0 0
GGATCGCAAAACCCTAATCTGTGTTTCAAGCGGCGCCACTTCTCATCGCAGTCTTAGAGA
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AGTCATATTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATGGCTGAGAAGCGTAACGTCACTGACCTCA
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CTGCTGCTGGAGGAGCCGCAGCTGCTGCCCCTGCAAAGGAGGAGAAGAAGGATGAACCAG
CGGAAGAGAGCGATGGAGATCTTGGATTCGGCTTGTTCGATTAGTTTGGTCTCCCTGTTA
TACACTTGCTATGTTCTATTGCTCTAGTTTATTTGAGATTTTCAGTTTTGCCATTTTCGA
CATTAATACAGTTTGGTCCGTTTTGTTATATCACGTTACTGCCTCGTATCGAATCTACAA
ACTGATTTGGT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL8178Contig1 1028 2 2 U
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TCTCCGAGTGGGCGACACGGTGCGTTCAAGAAAGCCTGCCAATTCTTTTAAGCATGAGAA
CATGGATGTGCCAGAAGGAATAGTGGTTGGTTTAGAACGTGACACCGACCCAGATGAGTT
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TTGCCTCGAGGTGGAGTTCCCTGGAGTGTTACCTTTTGGGGAGGAGCATGGAAGCTGTCT
TGCGGATCCAGCTGAAGTAGAGATTGTGAACTTCAACACGTGTGATGGAGTTGTGAAAAA
ATATCAGCATCTGGAGGATTTTCACTGGGCTGTGAGGCCCTTGCTGATTGCCATGGGTCT
ATTGACAGCGATGAAGTTAGGGTTATTCGTTGGGAAGAAAGCAGGAAGATCAAAGGATGG
GAAACAGCGTGATGGCTCTGGTGGACAAGGTGGTGATTGTCAGATTGTGGATGGTCAGGA
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CTCTGATATAATCTATGTTCTAGTAGTAATGGGTACATGTACATAATAACATTGTTTTAC
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TTCGTCTT


BQ
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AF RR4AP56TF U 1
AF RR4AP56JQ C 197
BS 1 747 RR4AP56TF
BS 748 1028 RR4AP56JQ

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GATGCGTAAAGGGAGAGGGATTTGGGCAACGGGCAGGATCTCTAAGGTTTTACCAAACGG
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TGCGGATCCAGCTGAAGTAGAGATTGTGAACTTCAACACGTGTGATGGAGTTGTGAAAAA
ATATCAGCATCTGGAGGATTTTCACTGGGCTGTGAGGCCCTTGCTGATTGCCATGGGTCT
ATTGACAGCGATGAAGTTAGGGTTATT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4AP56JQ 832 0 0
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GATTTTCACTGGGCTGTGAGGCCCTTGCTGATTGCCATGGGTCTATTGACAGCGATGAAG
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GTTCTAGTAGTAATGGGTACATGTACATAATAACATTGTTTTACTTTCGTATGATGTTTG
ATGATATCAAGCATATAAACATCATCTTTATTAAAAACCAAAGATTCGTCTT

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

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TTCAAGAAGGAAGAAGACGAAGATTACGAGGACGACGAAGAAGAAGAAGAAGATGAACAA
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ACGACGGCGAAGACGGTTGCACCGCTGTCATATAGACGGTCCAGGAGGAAGAACACACCG
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BQ
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AF RR4CK19JQ C 1
AF RR4CK19TF U 1
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DS 

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CAGACGACGACAAGGAGACGAAGAGGAAGGCCGAGGAAGAATCTTGAGAATCCAGAAGAT
TTCAAGAAGGAAGAAGACGAAGATTACGAGGACGACGAAGAAGAAGAAGAAGATGAACAA
GTTGAGATTATTAACAGAGAGAAACTGAAGAAGAAGATTAGAAGTAGCACTAGCGTCGAA
GAAGGGCAGAAGTGGAAACGTGGAGAACTAGCTGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAACCGGAT
ACGACGGCGAAGACGGTTGCACCGCTGTCATATAGACGGTCCAGGAGGAAGAACACACCG
GTGAAGAGCTGGTAAACTTTAATTACCAAACCATTTGGAGCTTTGATATTATGTTGTGTG
TTCATGGATTAACTATCGTTGAGTTATAAATTAATCAAAACCCCTCATGGGAAGACAAGA
ACCTTTGATTTATAAATTTCTTAGATTG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

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TGTTATTTATGTGTTTTTAAACTTTGTAATAGACAAAATTCGC


BQ
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AF RR4BW32JQ C 1
AF RR4BW32TF U 1
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DS 

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TCGTATATCTTCCTCCATAGTTGAACTTTGTGGCTTGGTCACAGCAACGACAAAGATGAA
AACGACAACGATGACAACGACTACGAAGAAAGTAGCAGCGAGGGAAGCGGCAGCAACGAG
GGAAACGGCAACGAGGGAAACAAAAACGAGGGAAGTGGCAATAATAGGAAGCTATAAACG
ATTCTTACTTATGTGTTATGGAACTTGTTTTTGTGTATGGAACTTATTATGTGTTAGGGA
TGTTATTTATGTGTTTTTAAACTTTGTAATAGACAAAATTCGC

QA 1 403 1 403
DS 



AS 1 2

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ATGGTGGTGTGTGGAATCTTCCTAAAACTTGTAACTTTACACTGGGTGTTCCAATCGGAC
CCATGCTTGCAAAACCAACAAAAGGTGTAGGTGAGATACTGAATAAATTCCAGGACACCG
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TGTTATATCTAAATGGCCAGCAACTTATCCAGGAGAATCTTAATATTCGCCGAGAGAAAC
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CGATATTGATGAAATACAAAAGTTTCTAGATGCGTCCGTTGATATTGGATGTG


BQ
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AF RR4DL77TF U 1
AF RR4G569TF U 532
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RD RR4DL77TF 742 0 0
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CTGTTTACCTCGCGGCGAACGAGATTGCTCCTGCGCACGAAGGGGTTGAGCTGGGGATTG
GTGAAGGCTCTATTATTAAGGCCATCTCTGAAGCTTTTGGTAGAACGGAGGCTCAGGTTA
AGAAGCAAAACACGGAGCTTGGAGACTTGGGGCTTGTAGCAAAAGGAAGCCGTTCGTCTC
AAACTATGATGTTCAAGCCAGAGGCATTGACTGTTGTCAAGGTTTTCAACACATTTAGAC
AAATCGCGAAGGAAAGTGGAAAAGATAGTACAGAAAAGAAGAAGGATCGAATGAAGGCAC
TCCTTGTGGCAGCAACAGACTGTGAACCTCTCTACTTAACTCGTTTACTTCAGGCAAAAT
TGAGGTTAGGGTTTTCAAATCAGACTGTCTTAGCTGCTTTAGGGCAGGCAGCTGTTTATA
ATGAAGAGCACTCAAAGCCACCCCCTAATACCAAGTCTCCTTTAGAAGAG*CTGCGAAGA
TTGTTAAACAAGTATTCACTGTACTTCCTGTATATGACATTATTGTTCCTGCTCTTT*AA
ATGGTGGTGTGTGGAATCTTCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4G569TF 782 0 0
G
GGCAAAATTGAGGTTAGGGTTTTCAAATCAGACTGTCTTAGCTGCTTTAGGGCAGGCAGC
TGTTTATAATGAAGAGCACTCAAAGCCACCCCCTAATACCAAGTCTCCTTTAGAAGAGGC
TGCGAAGATTGTTAAACAAGTATTCACTGTACTTCCTGTATATGACATTATTGTTCCTGC
TCTTTTAAATGGTGGTGTGTGGAATCTTCCTAAAACTTGTAACTTTACACTGGGTGTTCC
AATCGGACCCATGCTTGCAAAACCAACAAAAGGTGTAGGTGAGATACTGAATAAATTCCA
GGACACCGTTTTCACATGCGAATACAAATACGATGGAGAACGTGCACAGGTACATTGTAT
GGAGGATGGTACATTCGAGATATATAGTCGAAATGCTGAAAGAAACACTGGGAAGTACCC
TGATGTTGCTGTTGCTTTGTCAAGATTAAAGAAGCCTTCTGTGAAATCTTTTATTCTGGA
TTGTGAGGTTGTTGCTTTCGACAGGGAGAAAAAGAAGATTCTACCATTTCAGATTTTGAG
CACTCGAGCCCGTAAAAATGTGAATGTCAATGATATCAAAGTTGGCGTATGTATCTTTGC
TTTTGATATGTTATATCTAAATGGCCAGCAACTTATCCAGGAGAATCTTAATATTCGCCG
AGAGAAACTATACGAGTCATTTGAGGAGATCCTGGATATTTCCAGTTTGCAACAACTCTA
ACATCCAGCGATATTGATGAAATACAAAAGTTTCTAGATGCGTCCGTTGATATTGGATGT
G

QA 2 782 2 782
DS 



AS 1 2

CO CL8182Contig1 928 2 4 U
GAGTTGAGCTGGAGAGGAGGATTGAATCAATGAGGGAAGAATCAGAGTCTCTAGCGGAGG
AGTTGGAAGCGGTGAAGCGCATCAAGGATGAAAAAGAAGCAGCGATTACACAGTTACAGA
CAGAGTTAGAAACCGTAAGAGCCGAGTGCGATGACCTGAAGCATTCTTTATCAGAGAACG
ATTCGGAGATGGAGAAACACAAGAAGCAAGTAACACAAGTGAAAGGTGAGGTGAAGAAGA
AAGAAGAAGCAATAGCTAACCTTGAGAAGAAGCTCAAGGAAAGCAGAATCGCGTTTAACA
ACTTGACGAAAACCTCACAAAGAAACAACAACAACAAAGGAAGTACAACAGGAGCTAAAG
AAGTTGCTGTTATGAAAGATAAAATAAAACTTCTCGAGGGGCAAATCAAACTGAAGGAGA
CAGCTCTGGAAGCTTCCTCAAACATGTTCATAGAAAAGGAGAAGAATCTGAAGAACAGAA
TCGAGGAGCTGGAAACTAGTCTCGACCAACTCGATCAGATCAGTGACAACGAGGCTCTGA
ATGTTGAAGAAAAGGAACAAGTCCGAGTTCTCGAAGCGGAGATGGCGTCGTTGAGAGAAT
GTAACGAGACGATGGAGATGGAGCTGAAGGAGATGCAAGGGAGATACTCTGAGTTAAGCT
TGAGATTTGCAGAAGTGGAAAGTGAGAGACAACAGCTTGTTATGACGGTACGTAATCTCA
AAAACGCCAAGAGGAGCTAAACCGGTATATAATCACAAGCCGGTTTATTCAGATTGAAAA
AAAAAATGGATATCTTTGTATTCGTGTTAATGTAATTACTTTGTGTTCTTGTTATGAAAC
TTTCAATGTTGTTGTAACGATACAAACGTTGTATACCAACGTCCAATCCAATTATGGATC
TGGTCCGGTTTAGTTGAATCGTACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW65TF U 1
AF RR4GW65JQ C 168
BS 1 723 RR4GW65TF
BS 724 724 RR4GW65JQ
BS 725 735 RR4GW65TF
BS 736 928 RR4GW65JQ

RD RR4GW65TF 735 0 0
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AGTTGGAAGCGGTGAAGCGCATCAAGGATGAAAAAGAAGCAGCGATTACACAGTTACAGA
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ATTCGGAGATGGAGAAACACAAGAAGCAAGTAACACAAGTGAAAGGTGAGGTGAAGAAGA
AAGAAGAAGCAATAGCTAACCTTGAGAAGAAGCTCAAGGAAAGCAGAATCGCGTTTAACA
ACTTGACGAAAACCTCACAAAGAAACAACAACAACAAAGGAAGTACAACAGGAGCTAAAG
AAGTTGCTGTTATGAAAGATAAAATAAAACTTCTCGAGGGGCAAATCAAACTGAAGGAGA
CAGCTCTGGAAGCTTCCTCAAACATGTTCATAGAAAAGGAGAAGAATCTGAAGAACAGAA
TCGAGGAGCTGGAAACTAGTCTCGACCAACTCGATCAGATCAGTGACAACGAGGCTCTGA
ATGTTGAAGAAAAGGAACAAGTCCGAGTTCTCGAAGCGGAGATGGCGTCGTTGAGAGAAT
GTAACGAGACGATGGAGATGGAGCTGAAGGAGATGCAAGGGAGATACTCTGAGTTAAGCT
TGAGATTTGCAGAAGTGGAAAGTGAGAGACAACAGCTTGTTATGACGGTACGTAATCTCA
AAA*CGCCAAGAGGA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GW65JQ 761 0 0
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GAGGTGAAGAAGAAAGAAGAAGCAATAGCTAACCTTGAGAAGAAGCTCAAGGAAAGCAGA
ATCGCGTTTAACAACTTGACGAAAACCTCACAAAGAAACAACAACAACAAAGGAAGTACA
ACAGGAGCTAAAGAAGTTGCTGTTATGAAAGATAAAATAAAACTTCTCGAGGGGCAAATC
AAACTGAAGGAGACAGCTCTGGAAGCTTCCTCAAACATGTTCATAGAAAAGGAGAAGAAT
TTGAAGAACAGAATCGAGGAGCTGGAAACTAGTCTCGACCAACTCGATCAGATCAGTGAC
AACGAGGCTTTGAATGTTGAAGAAAAGGAACAAGTCCGAGTTCTCGAAGCGGAGATGGCG
TCGTTGAGAGAATGTAACGAGACGATGGAGATGGAGCTGAAGGAGATGCAAGGGAGATAC
TCTGAGTTAAGCTTGAGATTTGCAGAAGTGGAAGGTGAGAGACAACAGCTTGTTATGACG
GTACGTAATCTCAAAAACGCCAAGAGGAGCTAAACCGGTATATAATCACAAGCCGGTTTA
TTCAGATTGAAAAAAAAAATGGATATCTTTGTATTCGTGTTAATGTAATTACTTTGTGTT
CTTGTTATGAAACTTTCAATGTTGTTGTAACGATACAAACGTTGTATACCAACGTCCAAT
CCAATTATGGATCTGGTCCGGTTTAGTTGAATCGTACAATC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL8183Contig1 816 2 2 U
GGATTTCTTCTCTGTATTAATCTTCTTTCCTACTTGGAGATTCACGAGTCTGTCTGTCGA
TTCATTATATTCGGATCCATGACTAGCCGAAAAAACACACATTGGTGTAGTACTTGCAGA
CGAGGAATCCGTCTTCTCCTTGAAGGCTCAAGAGGAGGGGTTTGCATTTACTGTGGTAAC
ACTTTTCTTGAACGTCTCTATGAGAATGTTGAACTTAGCCCTTTTGATTTTTTCGGAGTA
TCCAATGAACAATCTCGTAACCATCCTAGCAACAACAGAAGATTGATTCTTGAAAACCAA
TCAAGTTTTCAAGAATTGTTTAACCGTTTCTCATCACAAAATCGCCGTGGTCCACCTCCA
GCTTCACTAACCGTGATTAACTCAATGCCAAAGATCAAGATTAGTAAGAAGCATCTTGGT
TTCGATCCGTGTTGTCCGGTTTGCCAAGACCGGTTTGAAGTCGGATCGGTTGCAAGAAAG
TTGCCGTGTAAACATATCTACCATTCGGAATGCATAGTTCCCTGGCTAGTACAGCGTAAT
ACTTGTCCAGTGTGTCGCAAAGAGCTGCCACAAGACCGGAATAATGGCGGGAAGAATCCT
TTGTTTTATCTATGGCCGTTTAGCTCCTCTGGTTCGGCCTCAAACACCAGCGGATCACCT
TTTCATTAAGACGCTTGTATATCAGTCCATAAGGCTCCAATCCATGAAATATGTAACTTT
TTCTGATAAATTGTTGGTTTTTTCAAAAAAATATATGTTGATGTACAAAAGGGTTTTGGA
TGTTAGTACGATTTGTGTTTATATCGAACGTATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FO48TF U 1
AF RR4FO48JQ C 134
BS 1 684 RR4FO48TF
BS 685 816 RR4FO48JQ

RD RR4FO48TF 684 0 0
GGATTTCTTCTCTGTATTAATCTTCTTTCCTACTTGGAGATTCACGAGTCTGTCTGTCGA
TTCATTATATTCGGATCCATGACTAGCCGAAAAAACACACATTGGTGTAGTACTTGCAGA
CGAGGAATCCGTCTTCTCCTTGAAGGCTCAAGAGGAGGGGTTTGCATTTACTGTGGTAAC
ACTTTTCTTGAACGTCTCTATGAGAATGTTGAACTTAGCCCTTTTGATTTTTTCGGAGTA
TCCAATGAACAATCTCGTAACCATCCTAGCAACAACAGAAGATTGATTCTTGAAAACCAA
TCAAGTTTTCAAGAATTGTTTAACCGTTTCTCATCACAAAATCGCCGTGGTCCACCTCCA
GCTTCACTAACCGTGATTAACTCAATGCCAAAGATCAAGATTAGTAAGAAGCATCTTGGT
TTCGATCCGTGTTGTCCGGTTTGCCAAGACCGGTTTGAAGTCGGATCGGTTGCAAGAAAG
TTGCCGTGTAAACATATCTACCATTCGGAATGCATAGTTCCCTGGCTAGTACAGCGTAAT
ACTTGTCCAGTGTGTCGCAAAGAGCTGCCACAAGACCGGAATAATGGCGGGAAGAATCCT
TTGTTTTATCTATGGCCGTTTAGCTCCTCTGGTTCGGCCTCAAACACCAGCGGATCACCT
TTTCATTAAGACGCTTGTATATCA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4FO48JQ 683 0 0
TTCTCCTTGAAGGCTCAAGAGGAGGGGTTTGCATTTACTGTGGTAACACTTTTCTTGAAC
GTCTCTATGAGAATGTTGAACTTAGCCCTTTTGATTTTTTCGGAGTATCCAATGAACAAT
CTCGTAACCATCCTAGCAACAACAGAAGATTGATTCTTGAAAACCAATCAAGTTTTCAAG
AATTGTTTAACCGTTTCTCATCACAAAATCGCCGTGGTCCACCTCCAGCTTCACTAACCG
TGATTAACTCAATGCCAAAGATCAAGATTAGTAAGAAGCATCTTGGTTTCGATCCGTGTT
GTCCGGTTTGCCAAGACCGGTTTGAAGTCGGATCGGTTGCAAGAAAGTTGCCGTGTAAAC
ATATCTACCATTCGGAATGCATAGTTCCCTGGCTAGTACAGCGTAATACTTGTCCAGTGT
GTCGCAAAGAGCTGCCACAAGACCGGAATAATGGCGGGAAGAATCCTTTGTTTTATCTAT
GGCCGTTTAGCTCCTCTGGTTCGGCCTCAAACACCAGCGGATCACCTTTTCATTAAGACG
CTTGTATATCAGTCCATAAGGCTCCAATCCATGAAATATGTAACTTTTTCTGATAAATTG
TTGGTTTTTTCAAAAAAATATATGTTGATGTACAAAAGGGTTTTGGATGTTAGTACGATT
TGTGTTTATATCGAACGTATAAT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL8184Contig1 927 2 12 U
GGGAATCGGTCGGAGAGAGAAAAAAGAGAGATGGGAGGGAAAGGTAAGAAGAGGAGAGAG
AAAAACTATTTGGCAGCTCACGGCGGACCGGCGAGACTCCCGCCGCCGCCTGATCGTTCC
AAGCAAGATGCACTTCCTTCCAAGCTCCGTGTTCTCATGAACTACACCTCTCCGCCTCCT
CCTCAAGATTCTACTAAACAACAAGTTGTTGTAGAGAGGAAAGAAAAAAATTCTAAAGCT
GGAGTAGTAGTTGGTGCTGCCAAGAATGTCAAGTCTGGGAGTGAAGCAAAGTCGGAAGCA
AAGGCGGTTGGAGAAGGAAAATCTGAGGGATACACAACCTCTTCTGATCATGAGAATGAT
GGAGACGATATAAAGTTGAACAACAAGGGGGGAGATGAAAAGAAGAAGAAAAAGAGAAAG
AGGAGTGAGATCAAGGACCTTCGTTTCGAACAGGAACTTGCAGAGTTGGATGGTCGGTCC
AAAAGGAAAGAACGCAAGAAGAAGTATTGGGAGGCAAAGAAGCAAAAGAAGAATAAAGGA
AAAACAGAAGATACACTCCGAGAAAACTTCCCCAAGCATGAGCAGATCAGATTTGGTGAT
GTGGTTCAAGCTCCACCGAAGCTGGCCGTTGTTCCAAAGGCACGAAAGACTCCTATGAGT
GCTTCCAAGGAGAGACTGCGGTTAGAGGCCATTGAAGCTTACAGATCTCGCAATGGATGG
ACCTCAAGACCAGGCGTTCAGATTCCTACCGTCACCATGCAATGAGATTTTGGTTGGGTC
ATATGAACTCAGTTTTGTGTTACTAGCTAGCTGGCTGTTAAACTAGTTTGGATTCTAACG
TTGTGATAGTTTGAATTACCCAAACATCTCTTCCAATATGTAAAAGTGGATTATTTAAAT
TTCAGTACCAAGGAAATCTTTTTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP67TF U 1
AF RR4BP67JQ C 141
BS 1 639 RR4BP67TF
BS 640 640 RR4BP67JQ
BS 641 667 RR4BP67TF
BS 668 669 RR4BP67JQ
BS 670 680 RR4BP67TF
BS 681 681 RR4BP67JQ
BS 682 689 RR4BP67TF
BS 690 690 RR4BP67JQ
BS 691 695 RR4BP67TF
BS 696 696 RR4BP67JQ
BS 697 711 RR4BP67TF
BS 712 927 RR4BP67JQ

RD RR4BP67TF 711 0 0
GGGAATCGGTCGGAGAGAGAAAAAAGAGAGATGGGAGGGAAAGGTAAGAAGAGGAGAGAG
AAAAACTATTTGGCAGCTCACGGCGGACCGGCGAGACTCCCGCCGCCGCCTGATCGTTCC
AAGCAAGATGCACTTCCTTCCAAGCTCCGTGTTCTCATGAACTACACCTCTCCGCCTCCT
CCTCAAGATTCTACTAAACAACAAGTTGTTGTAGAGAGGAAAGAAAAAAATTCTAAAGCT
GGAGTAGTAGTTGGTGCTGCCAAGAATGTCAAGTCTGGGAGTGAAGCAAAGTCGGAAGCA
AAGGCGGTTGGAGAAGGAAAATCTGAGGGATACACAACCTCTTCTGATCATGAGAATGAT
GGAGACGATATAAAGTTGAACAACAAGGGGGGAGATGAAAAGAAGAAGAAAAAGAGAAAG
AGGAGTGAGATCAAGGACCTTCGTTTCGAACAGGAACTTGCAGAGTTGGATGGTCGGTCC
AAAAGGAAAGAACGCAAGAAGAAGTATTGGGAGGCAAAGAAGCAAAAGAAGAATAAAGGA
AAAACAGAAGATACACTCCGAGAAAACTTCCCCAAGCATGAGCAGATCAGATTTGGTGAT
GTGGTTCAAGCTCCACCGAAGCTGGCCGTTGTTCCAAAG*CACGAAAGACTCCTATGAGT
GCTTCCA**GAGAGACTGCG*TTAGAGGC*ATTGA*GCTTACAGATCTCGC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4BP67JQ 787 0 0
CAAGCTCCGTGT*CTCATGAACTACACCTCTCCGCCTCCTCCTCAAGATTCTACTAAACA
ACAAGTTGTTGTAGAGAGGAAAGAAAAAAATTCTAAAGCTGGAGTAGTAGTTGGTGCTGC
CAAGAATGTCAAGTCTGGGAGTGAAGCAAAGTCGGAAGCAAAGGCGGTTGGAGAAGGAAA
ATCTGAGGGATACACAACCTCTTCTGATCATGAGAATGATGGAGACGATATAAAGTTGAA
CAACAAGGGGGGAGATGAAAAGAAGAAGAAAAAGAGAAAGAGGAGTGAGATCAAGGACCT
TCGTTTCGAACAGGAACTTGCAGAGTTGGATGGTCGGTCCAAAAGGAAAGAACGCAAGAA
GAAGTATTGGGAGGCAAAGAAGCAAAAGAAGAATAAAGGAAAAACAGAAGATACACTCCG
AGAAAACTTCCCCAAGCATGAGCAGATCAGATTTGGTGATGTGGTTCAAGCTCCACCGAA
GCTGGCCGTTGTTCCAAAGGCACGAAAGACTCCTATGAGTGCTTCCAAGGAGAGACTGCG
GTTAGAGGCCATTGAAGCTTACAGATCTCGCAATGGATGGACCTCAAGACCAGGCGTTCA
GATTCCTACCGTCACCATGCAATGAGATTTTGGTTGGGTCATATGAACTCAGTTTTGTGT
TACTAGCTAGCTGGCTGTTAAACTAGTTTGGATTCTAACGTTGTGATAGTTTGAATTACC
CAAACATCTCTTCCAATATGTAAAAGTGGATTATTTAAATTTCAGTACCAAGGAAATCTT
TTTGGTG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL8185Contig1 994 2 6 U
TCCTCATTTGCTTCCCCACTCTAAAGGTGCAAGCAATTTGATTTCGCTTCGCTTCGCTTC
TAAAGTTCGAACCTTTCCATGTTCGAGTCATCAATACTAACATGGCTATGGTGCGTGAGT
TGTTTGGGCTTCTAGGTTCTTCGACTGCAATCCAACACCGCACCAAGTTGATCCCACTCT
TAATCCGAAGATTCTCGCTCCCTTCAACGAGGAAAGACCCCGACCTCGAATCCGCTCTCT
CCCGCAACAAGAGGTGGATAGGCAACAGCCGCCTCAAAAACATCATCCTAACAGGTGGCA
CCCGTTAAGTTTCTACAGGAGAAGTTCAAGAGAAGGCCCTGAACTGGCTTAAGAAGTACC
CTTGTTGTCTCGATGTCTATCTTGACGAAGATGAGTATTACTGTCGTTTGACGAAGCCCA
TGATGGCCCTCGTGGAAGAAGAGGAGCTTGTTAAAGAAGCCCAAGAGCCTGTGTTGGCGG
ATAGGCTTGCGAAGCTGCTTATGATGAGCGTTGGCCAGCGTCTTAACGTGGTGATGCTTA
ATGAGTTGAAAAGGAGTTTTGGGTTTGGGGATGATTATGTTGTCAGGATTGTGGCCAAGT
ATGGGGATGTGTTTCGGTTGGTGAATTATAGCTGTAGGAAGAGTTCTATGGAGATTGAGC
TTTTGTCTTGGAAGCCTGAGCTGGCTGTTTCTGCTGTTGAAGCAGCAGCAGCGGGGAAAA
GAAAACAAATGTAAATTATTGGCATAAAGGCAACTTTCTGTGAAACTGCAGTCACAGAAT
GGATGAATCCCCACCTTTGCTTCCTTTTGTTACTTCGTTTATCACGAACACCATTTTCTT
AAAAAAAAATATCTATGCTCTAACGATAAGCATCGGATCAACATTTGACCTGAACCTGGC
AAATTAACAATGTTTCTCTAAACTAATCTTTATATTTAAGTTATTTAAAATTGTATACTC
GTATTTGAGGAATTTTGCTACTTGAACATCTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC62TF U 1
AF RR4AC62JQ C 229
BS 1 728 RR4AC62TF
BS 729 729 RR4AC62JQ
BS 730 747 RR4AC62TF
BS 748 749 RR4AC62JQ
BS 750 786 RR4AC62TF
BS 787 994 RR4AC62JQ

RD RR4AC62TF 788 0 0
TCCTCATTTGCTTCCCCACTCTAAAGGTGCAAGCAATTTGATTTCGCTTCGCTTCGCTTC
TAAAGTTCGAACCTTTCCATGTTCGAGTCATCAATACTAACATGGCTATGGTGCGTGAGT
TGTTTGGGCTTCTAGGTTCTTCGACTGCAATCCAACACCGCACCAAGTTGATCCCACTCT
TAATCCGAAGATTCTCGCTCCCTTCAACGAGGAAAGACCCCGACCTCGAATCCGCTCTCT
CCCGCAACAAGAGGTGGATAGGCAACAGCCGCCTCAAAAACATCATCCTAACAGGTGGCA
CCCGTTAAGTTTCTACAGGAGAAGTTCAAGAGAAGGCCCTGAACTGGCTTAAGAAGTACC
CTTGTTGTCTCGATGTCTATCTTGACGAAGATGAGTATTACTGTCGTTTGACGAAGCCCA
TGATGGCCCTCGTGGAAGAAGAGGAGCTTGTTAAAGAAGCCCAAGAGCCTGTGTTGGCGG
ATAGGCTTGCGAAGCTGCTTATGATGAGCGTTGGCCAGCGTCTTAACGTGGTGATGCTTA
ATGAGTTGAAAAGGAGTTTTGGGTTTGGGGATGATTATGTTGTCAGGATTGTGGCCAAGT
ATGGGGATGTGTTTCGGTTGGTGAATTATAGCTGTAGGAAGAGTTCTATGGAGATTGAGC
TTTTGTCTTGGAAGCCTGAGCTGGCTGTTTCTGCTGTTGAAGCAGCAGCAGCGGGGAAAA
GAAAACAA*TGTAAATTATTGGCATAA**GCAACTTTCTGTGAAACTGCAGTCACAGAAT
GGATGA
TC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4AC62JQ 766 0 0
AATCCGCTCTCTCCCGCAACAAGAGGTGGATAGGCAACAGCCGCCTCAAAAACATCATCC
TAACAGGTGGCACCCGTTAAGTTTCTACAGGAGAAGTTCAAGAGAAGGCCCTGAACTGGC
TTAAGAAGTACCCTTGTTGTCTCGATGTCTATCTTGACGAAGATGAGTATTACTGTCGTT
TGACGAAGCCCATGATGGCCCTCGTGGAAGAAGAGGAGCTTGTTAAAGAAGCCCAAGAGC
CTGTGTTGGCGGATAGGCTTGCGAAGCTGCTTATGATGAGCGTTGGCCAGCGTCTTAACG
TGGTGATGCTTAATGAGTTGAAAAGGAGTTTTGGGTTTGGGGATGATTATGTTGTCAGGA
TTGTGGCCAAGTATGGGGATGTGTTTCGGTTGGTGAATTATAGCTGTAGGAAGAGTTCTA
TGGAGATTGAGCTTTTGTCTTGGAAGCCTGAGCTGGCTGTTTCTGCTGTTGAAGCAGCAG
CAGCGGGGAAAAGAAAACAAATGTAAATTATTGGCATAAAGGCAACTTTCTGTGAAACTG
CAGTCACAGAATGGATGAATCCCCACCTTTGCTTCCTTTTGTTACTTCGTTTATCACGAA
CACCATTTTCTTAAAAAAAAATATCTATGCTCTAACGATAAGCATCGGATCAACATTTGA
CCTGAACCTGGCAAATTAACAATGTTTCTCTAAACTAATCTTTATATTTAAGTTATTTAA
AATTGTATACTCGTATTTGAGGAATTTTGCTACTTGAACATCTCCA

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL8186Contig1 931 2 2 U
GGAAAGGTATCCTCTCTCTGGACTAGCTTCTCTCATGGCAGAGCGTTCGAATGTTCCAAA
GTTTGGGAACTGGGAAGGAGAGGAGAATGTTCCTTACACGGCTTACTTTGAGAAAGCGCG
TAAAGGACGCGCCGCCCCAGGGAGTAGAGTAACGAATCCGAACGACCCGGAGTATAACTC
GACCAAACCTGAGGAAGTTGTTGACCACCCGGTTAGAAAGTCGCGTGAAGGGACGAGAAG
CCGAGAAGAGAGCGAGTTGAAGCAGTTTGGTGGTGGTGGTGATGGTAGTGGGAGTTCATC
AAACGAGAAAAGACAAGGAAAGTCTTCTCAGAACAATAGCTACGATAATAAGTCCCCATT
GCATAAGAACTCATATGATGCCGGCGCTGCAAGATCAAAGCCCAAACCAAACCTTAGACA
TGACGAAAGCCCTGAAAAAGTGACGGTGGTGCCGAAATTCGGTGATTGGGATGAGAATAA
TCCGGCGTCAGCTGATGGATATACACACATTTTCAACAAAGTCCGTGAAGAGAGGAGCAC
TGGAGCTAATAATGTGAGTGGATCTTCCAGAACGCCGACTCACGCCAGCTCCCGTAATAG
CCCTTCTAGCAGTTCCAAATGTTGCTGCTTTGGCTTTGGAGGAAAATGAATGGGAAAAGG
TTTGTTTCGGGAACAATTGTGTGTATAGTTATCGAGAAATATGTGTGTGTTGTAATCTTA
ATGATCAGACGGTCGAGTAACTTTAGATGGGAATAAGGCATATCAGTCATAAAACTTATA
TACTCTAGCTTTTGTATGTATGTTTAGTGATTTTTCATTTTACTTTTGGTGTTTTCGTTC
TGCGCATTCCAGTTTTGGACCTGCTTGCAGATTCATTATATCTTGGTACAATGGTACGGG
TTCACCAATTTGGTTAAGAAAAAAAGCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN53TF U 1
AF RR4FN53JQ C 199
BS 1 750 RR4FN53TF
BS 751 931 RR4FN53JQ

RD RR4FN53TF 750 0 0
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GTTTGGGAACTGGGAAGGAGAGGAGAATGTTCCTTACACGGCTTACTTTGAGAAAGCGCG
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TGGAGCTAATAATGTGAGTGGATCTTCCAGAACGCCGACTCACGCCAGCTCCCGTAATAG
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ATGATCAGACGGTCGAGTAACTTTAGATGG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4FN53JQ 733 0 0
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GAAGCAGTTTGGTGGTGGTGGTGATGGTAGTGGGAGTTCATCAAACGAGAAAAGACAAGG
AAAGTCTTCTCAGAACAATAGCTACGATAATAAGTCCCCATTGCATAAGAACTCATATGA
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AGTGACGGTGGTGCCGAAATTCGGTGATTGGGATGAGAATAATCCGGCGTCAGCTGATGG
ATATACACACATTTTCAACAAAGTCCGTGAAGAGAGGAGCACTGGAGCTAATAATGTGAG
TGGATCTTCCAGAACGCCGACTCACGCCAGCTCCCGTAATAGCCCTTCTAGCAGTTCCAA
ATGTTGCTGCTTTGGCTTTGGAGGAAAATGAATGGGAAAAGGTTTGTTTCGGGAACAATT
GTGTGTATAGTTATCGAGAAATATGTGTGTGTTGTAATCTTAATGATCAGACGGTCGAGT
AACTTTAGATGGGAATAAGGCATATCAGTCATAAAACTTATATACTCTAGCTTTTGTATG
TATGTTTAGTGATTTTTCATTTTACTTTTGGTGTTTTCGTTCTGCGCATTCCAGTTTTGG
ACCTGCTTGCAGATTCATTATATCTTGGTACAATGGTACGGGTTCACCAATTTGGTTAAG
AAAAAAAGCATTT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL8187Contig1 734 2 2 U
GACCAGAATCCCTGATGATCATCTTCCTTCTTCTCTCTTTGCTTCCCGTCGACCCCGCGA
TTTCATCAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTT
CGATGAAGAGGAAGACGAGCGTGATGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAGAAGCTT
GGATCTTTTACTTAGGTTCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAA
AGCCGTCCGATCAATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAA
TGGCGTACTTATACTTGCTCTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCAC
ACTTGGGACTATTGTATTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGACTTTGGGCTGGTGTAGC
ATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACCGGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTG
GAACGGGGTGCAACCAGCGTCACGATTAAAAATGTTTCAGAGAATCTCAAGTTCCTGACT
TTCGAGAGAGCCAAAACCGGTTTAGGTGGTTCTCCCCCAAGGCAATAAAACGACAGCTGA
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TAATTAGAAAAGAACACAAAATTGTAATACTTGTAGCATTTTACAAAGTCACCTATGGAA
GCTTGGCATGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ68TF U 1
AF RR4DZ68JQ C 22
BS 1 576 RR4DZ68TF
BS 577 734 RR4DZ68JQ

RD RR4DZ68TF 576 0 0
GACCAGAATCCCTGATGATCATCTTCCTTCTTCTCTCTTTGCTTCCCGTCGACCCCGCGA
TTTCATCAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTT
CGATGAAGAGGAAGACGAGCGTGATGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAGAAGCTT
GGATCTTTTACTTAGGTTCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAA
AGCCGTCCGATCAATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAA
TGGCGTACTTATACTTGCTCTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCAC
ACTTGGGACTATTGTATTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGACTTTGGGCTGGTGTAGC
ATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACCGGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTG
GAACGGGGTGCAACCAGCGTCACGATTAAAAATGTTTCAGAGAATCTCAAGTTCCTGACT
TTCGAGAGAGCCAAAACCGGTTTAGGTGGTTCTCCC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR4DZ68JQ 713 0 0
TCTTCCTTCTTCTCTCTTTGCTTCCCGTCGACCCCGCGATTTCATCAACGGGAGGGATGA
CTTGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTTCGATGAAGAGGAAGACGAGCG
TGATGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAGAAGCTTGGATCTTTTACTTAGGTTCGT
CGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCAATCTTGCC
TGTTTCCATCTCCACCAGGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACTTGCTCT
TTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTATTTAC
GAGCATTCTACTTATACGGGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAAGCCGCAA
CAACCGGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTGGAACGGGGTGCAACCAGCGTC
ACGATTAAAAATGTTTCAGAGAATCTCAAGTTCCTGACTTTCGAGAGAGCCAAAACCGGT
TTAGGTGGTTCTCCCCCAAGGCAATAAAACGACAGCTGAGTTCTGAATCACAAAGCAGTT
ACAGTGGATGATGTTCTTTCGCTATGTGTGTTGATTTAGTAATTAGAAAAGAACACAAAA
TTGTAATACTTGTAGCATTTTACAAAGTCACCTATGGAAGCTTGGCATGTAGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL8188Contig1 724 2 1 U
GGGAACGATGTCTGCGACAACAACTCCATATCTCTCTCTTCCGAGTTTCAGACCAAGATT
CCAAAATCCAGCTAAAACCCACCAATTATCTCCACTCTCTTGCTCTGTTTCAAGGAGAAA
GATCTTGTCTTCCGACAGACAACAAGCTCCTTCTGCTCTTCTTCTGCTTCACCAGGAAAA
AAAAACAATCATGGAGACTGTCTGCAACTCCAGAGGAGATATCCCAGGAGATATTTTCTT
CTGATACTTCTTCTACAGAAGCTATTGTCTCTGGTGGTGGTAGTCAAGATGGTGTTGCTT
TGATTATACAAGTGCTTCTCATTGTCGCTTTTCTTGCTCTCAGTGTTCTCACAATTGGTG
TTGTTTACATAGGAGTGACCGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGAGAGAAGTTTGAGAAAG
AAGAGGCAGCAAAGAAGTCCAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAACGAGGGCCAAAGCTG
GACCAAGGGGGTTCGGTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACATTGATCTTGAATGAT
TCTTTTTTGTTCAATTGCGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCTCTGTTGGTAAGGTTCT
GCGATTTTCATATCTATCATACTTTTCTTACTTGACAAGCAATATAAACAGGAAAAACTG
CTAAAGAGTGCCTGTGTAAACAAAGTGTGTGGTTTTTTTGTTTTATTAAATCTTTTAAAG
AAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RR4B913TF U 1
AF RR4B913JQ C 256
BS 1 724 RR4B913TF

RD RR4B913TF 724 0 0
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CCAAAATCCAGCTAAAACCCACCAATTATCTCCACTCTCTTGCTCTGTTTCAAGGAGAAA
GATCTTGTCTTCCGACAGACAACAAGCTCCTTCTGCTCTTCTTCTGCTTCACCAGGAAAA
AAAAACAATCATGGAGACTGTCTGCAACTCCAGAGGAGATATCCCAGGAGATATTTTCTT
CTGATACTTCTTCTACAGAAGCTATTGTCTCTGGTGGTGGTAGTCAAGATGGTGTTGCTT
TGATTATACAAGTGCTTCTCATTGTCGCTTTTCTTGCTCTCAGTGTTCTCACAATTGGTG
TTGTTTACATAGGAGTGACCGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGAGAGAAGTTTGAGAAAG
AAGAGGCAGCAAAGAAGTCCAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAACGAGGGCCAAAGCTG
GACCAAGGGGGTTCGGTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACATTGATCTTGAATGAT
TCTTTTTTGTTCAATTGCGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCTCTGTTGGTAAGGTTCT
GCGATTTTCATATCTATCATACTTTTCTTACTTGACAAGCAATATAAACAGGAAAAACTG
CTAAAGAGTGCCTGTGTAAACAAAGTGTGTGGTTTTTTTGTTTTATTAAATCTTTTAAAG
AAGT

QA 1 724 1 724
DS 

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TTCTCATTGTCGCTTTTCTTGCTCTCAGTGTTCTCACAATTGGTGTTGTTTACATAGGAG
TGACCGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGAGAGAAGTTTGAGAAAGAAGAGGCAGCAAAGA
AGTCCAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAACGAGGGCCAAAGCTGGACCAAGGGGGTTCG
GTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACATTGATCTTGAATGATTCTTTTTTGTTCAAT
TGCGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCTCTGTTGGTAAGGTTTTGCGATTTTCATATCT
ATCATACTTTTCTTACTTGACAAGCAATATAAACAGGAAAAACTGCTAAAGAGTGCCTGT
GTAAACAAAGTGTGTGGTTTTTTTGTTTTATTAAATCTTTTAAAGAAGT

QA 1 469 1 469
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8190Contig1 724 2 2 U
GGAGTTCTGGAAAATAGGGAAAGCCATGCGCATAGAGATTGATCGAAGTGGAATGATTCC
AAGATTGAGGTTCCACGATCGTGAATCCTATGCGAGAAACAAAACCAAGGAGTATGATGA
TATGGCCATTAAATTCTTATCCTATGTGCTTCTCCTCCTTGTTTCGGGATTCGCTATATA
TTCACTCGCCTATGAACGACACAAGAGCTGGTACTCATGGATACTATCTTCACTAACGAG
CTGCGTCTACATGTTTGGTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCAACTATAAGCT
AAAGTCAGTAGCGCATCTACCATGGAGGCAAATGACTTATAAGTTCCTCAACACCATCAT
CGACGATCTCTTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAATGCTGCACCGTCTTTCTGTCTTCCG
AGATGATGTGATATTCTTGATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTGTGGACAAAAC
ACGTGTCAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTTGATCCGAAGAAGATCAC
TGACCAAGAAGATGACAAGAAAACAAACTAAAATAAGCTTTTTTTTTTAATTTTCCAAAT
CAATTTTAATTTCTTTGTTCTACTTTAGAAGTGTTGTTTTAAGCTTATACGATATAGTTA
AGATATAAAAGTTTTATAAAGTAACCATAATACATTATTGTTTTCACACTTTGGTTGTTG
TGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RR4F114TF U 1
AF RR4F114JQ C 138
BS 1 688 RR4F114TF
BS 689 724 RR4F114JQ

RD RR4F114TF 688 0 0
GGAGTTCTGGAAAATAGGGAAAGCCATGCGCATAGAGATTGATCGAAGTGGAATGATTCC
AAGATTGAGGTTCCACGATCGTGAATCCTATGCGAGAAACAAAACCAAGGAGTATGATGA
TATGGCCATTAAATTCTTATCCTATGTGCTTCTCCTCCTTGTTTCGGGATTCGCTATATA
TTCACTCGCCTATGAACGACACAAGAGCTGGTACTCATGGATACTATCTTCACTAACGAG
CTGCGTCTACATGTTTGGTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCAACTATAAGCT
AAAGTCAGTAGCGCATCTACCATGGAGGCAAATGACTTATAAGTTCCTCAACACCATCAT
CGACGATCTCTTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAATGCTGCACCGTCTTTCTGTCTTCCG
AGATGATGTGATATTCTTGATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTGTGGACAAAAC
ACGTGTCAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTTGATCCGAAGAAGATCAC
TGACCAAGAAGATGACAAGAAAACAAACTAAAATAAGCTTTTTTTTTTAATTTTCCAAAT
CAATTTTAATTTCTTTGTTCTACTTTAGAAGTGTTGTTTTAAGCTTATACGATATAGTTA
AGATATAAAAGTTTTATAAAGTAACCAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4F114JQ 587 0 0
TATCCTATGTGCTTCTCCTCCTTGTTTCGGGATTCGCTATATATTCACTCGCCTATGAAC
GACACAAGAGCTGGTACTCATGGATACTATCTTCACTAACGAGCTGCGTCTACATGTTTG
GTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCAACTATAAGCTAAAGTCAGTAGCGCATC
TACCATGGAGGCAAATGACTTATAAGTTCCTCAACACCATCATCGACGATCTCTTTGCTT
TTGTCATCAAAATGCCAATGCTGCACCGTCTTTCTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCT
TGATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTGTGGACAAAACACGTGTCAACGAGTTTG
GTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTTGATCCGAAGAAGATCACTGACCAAGAAGATGACA
AGAAAACAAACTAAAATAAGCTTTTTTTTTTAATTTTCCAAATCAATTTTAATTTCTTTG
TTCTACTTTAGAAGTGTTGTTTTAAGCTTATACGATATAGTTAAGATATAAAAGTTTTAT
AAAGTAACCATAATACATTATTGTTTTCACACTTTGGTTGTTGTGGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL8191Contig1 657 2 2 U
GGATAGACATTTTGCATTAGGGTTTTCTCTCTTGGCTGCTGCAGGTGAAGCACCGAATCT
TTCAACCCCAACCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAA
GAAGACGGCCGTCGCCGCCACCCACTGCAAACGCGGATGCGGCCTGATCAAGCTCAACGG
CTCCCCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCTGTCTT
TCTCCTCGGGAAGCACCGTTTCGCAGGTGTCGACATGAGGATCAGTGTCAACGGTGGTGG
TCACACTTCTCAGGTGTACGCGATTCGTCAGAGCATCGCTAAGGCGCTTGTGGCGTTCTA
CCAGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTGAAGGACATTCTGATTCGTTACGA
TAGGACTTTGCTCGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGTCGTGG
CGCTCGTTCACGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAGCGAATCTGGTTTGTGTTTACTTATA
ACCGTTTTGAGAAATGAGTTGTTGAAGTATCGTCTTTTGAGTTTTGTTTTTATGGTTATT
GGGATAATGTTTTGACAATGCCTTGATCGTTTATTTTGAAGAACTTCTCAAGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BO16TF U 1
AF RR4BO16JQ C 81
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RD RR4BO16TF 655 0 0
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GAAGACGGCCGTCGCCGCCACCCACTGCAAACGCGGATGCGGCCTGATCAAGCTCAACGG
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TCTCCTCGGGAAGCACCGTTTCGCAGGTGTCGACATGAGGATCAGTGTCAACGGTGGTGG
TCACACTTCTCAGGTGTACGCGATTCGTCAGAGCATCGCTAAGGCGCTTGTGGCGTTCTA
CCAGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTGAAGGACATTCTGATTCGTTACGA
TAGGACTTTGCTCGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGTCGTGG
CGCTCGTTCACGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAGCGAATCTGGTTTGTGTTTACTTATA
ACCGTTTTGAGAAATGAGTTGTTGAAGTATCGTCTTTTGAGTTTTGTTTTTATGGTTATT
GGGATAATGTTTTGACAATGCCTTGATCGTTTATTTTGAAGAACTTCTCAAGTTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4BO16JQ 577 0 0
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CCCACTGCAAACGCGGATGCGGCCTGATCAAGCTCAACGGCTCCCCGATCGAGCTATTCA
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TCGCAGGTGTCGACATGAGGATCAGTGTCAACGGTGGTGGTCACACTTTTCAGGTGTACG
CGATTCGTCAGAGCATCGCTAAGGCGCTTGTGGCGTTTTACCAGAAGTATGTTGATGAGC
AGTCGAAGAAGGAGGTGAAGGACATTTTGATTCGTTACGATAGGACTTTGCTCGTGGCGG
ATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGTCGTGGCGCTCGTTCACGTTTCCAGA
AGAGTTACCGTTAAGCGAATTTGGTTTGTGTTTACTTATAACCGTTTTGAGAAATGAGTT
GTTGAAGTATCGTCTTTTGAGTTTTGTTTTTATGGTTATTGGGATAATGTTTTGACAATG
CCTTGATCGTTTATTTTGAAGAACTTCTCAAGTTTCG

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL8192Contig1 736 2 4 U
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ATGGAGATGTGAAGCCCGAAAACTTTTTACTCGGCCAACCTGGCACAGCAGATGAGAAAA
AACTCTACCTTGTCGATCTTGGTCTAGCATCAAAATGGAAAGATTCACACTCCGGTCATC
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TAATTTTTCTCCTGAAGGGAAGATTGCCATGGCAAGGTTACCAGGGTGATAACAAGAGCT
TTCTTGTCTCCAAGAAAAAGATGTCAACTTCTCCTGAAATGATGTGCCGTTTTTGTCCAC
CACCGTTTAAGCTATTCCTCGAGGCAGTTACTAATATGAAGTTTGACGAGGAGCCTAACT
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TTAGAATTGATGGGGCTCTTAAGGTTGGGCAAAAACGAGGAAGATTACTTCTTAATTTGG
AAGAGGATGAACAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D159TF U 1
AF RR4D159JQ C 75
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BS 684 684 RR4D159JQ
BS 685 694 RR4D159TF
BS 695 736 RR4D159JQ

RD RR4D159TF 694 0 0
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GCCCCAGCCTCTGGGATGTTTGGAACTCTTCGGGGCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAG
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ATGGAGATGTGAAGCCCGAAAACTTTTTACTCGGCCAACCTGGCACAGCAGATGAGAAAA
AACTCTACCTTGTCGATCTTGGTCTAGCATCAAAATGGAAAGATTCACACTCCGGTCATC
ATGTTGAATATGATCAAAAACCTGATGTGTTCAGGGGAACAATAAGGTATGCAAGTGTTA
ATGCACATCTTGGTCGTACTGGAAGTCGGAGAGATGATCTAGAGTCATTGGCTTATACTT
TAATTTTTCTCCTGAAGGGAAGATTGCCATGGCAAGGTTACCAGGGTGATAACAAGAGCT
TTCTTGTCTCCAAGAAAAAGATGTCAACTTCTCCTGAAATGATGTGCCGTTTTTGTCCAC
CACCGTTTAAGCTATTCCTCGAGGCAGTTACTAATATGAAGTTTGACGAGGAGCCTAACT
ATGCCAAGCTTATTTCGATTTTGGATACTCTAATTGAGCCATCTGCTTTATCCAGACCTA
TTAGAATTGATGGGGCTCTTAAG*TTGGGCAAAA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4D159JQ 662 0 0
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GAGTCCGTATCTATTCTTGAGAAATTTCATATGAAAGGGTTTGTCCATGGAGATGTGAAG
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CAAAAACCTGATGTGTTCAGGGGAACAATAAGGTATGCAAGTGTTAATGCACATCTTGGT
CGTACTGGAAGTCGGAGAGATGATCTAGAGTCATTGGCTTATACTTTAATTTTTCTCCTG
AAGGGAAGATTGCCATGGCAAGGTTACCAGGGTGATAACAAGAGCTTTCTTGTCTCCAAG
AAAAAGATGTCAACTTCTCCTGAAATGATGTGCCGTTTTTGTCCACCACCGTTTAAGCTA
TTCCTCGAGGCAGTTACTAATATGAAGTTTGACGAGGAGCCTAACTATGCCAAGCTTATT
TCGATTTTGGATACTCTAATTGAGCCATCTGCTTTATCCAGACCTATTAGAATTGATGGG
GCTCTTAAGGTTGGGCAAAAACGAGGAAGATTACTTCTTAATTTGGAAGAGGATGAACAG
CT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL8193Contig1 709 2 6 U
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TCTGTTCCAAACGTGGATGATGGGCAAGTCATTGAGATCACAGTGCAGTCATTATCAGAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F339TF U 1
AF RR4F339JQ C 145
BS 1 622 RR4F339TF
BS 623 623 RR4F339JQ
BS 624 674 RR4F339TF
BS 675 675 RR4F339JQ
BS 676 703 RR4F339TF
BS 704 709 RR4F339JQ

RD RR4F339TF 708 0 0
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ATGCATGGGATGATGCAACCACCACCTATGCATGGGATGCCGCCTCCTCCACCACATGAG
GAGGCACCACCGCCTCTTCCTGAGGAGCCAGAGCCTAAGAGACAAAAATTCGACGAGTCA
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TCTGTTCCAAACGTGGATGATGGGCAAGTCATTGAGATCACAGTGCAGTCATTATCAGAA
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AAGTTGAGTGGAAAAGCTGGCTTCTTAAAGGACAACACGTCACTGGCACATTACAATGTC
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GTCAGCTGGTGGATGCAGAGAAATGCATTTGATTTCTTCTTTAGATGTTTTCAAAACTTG
GTGGCCAAAACTATTTGTACTGCTATCTTTTTTACTCTTGGCCCATCGCATCTAGTATCT
ATTGAAGTTTAGATTGAAAAAA*GAATATCACTGAGTTAAGTTCGTGTCGGATCTGCAAT
CAACGTTTTGGAAA*CTCATCTTTACTATATGATACTTTGTTT
GCCTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4F339JQ 565 0 0
GAGCCAGAGCCTAAGAGACAAAAATTCGACGAGTCAGCTCTCTTTCCAGAAGAACAGTTC
CTTGCTCAGCATCCGGGTGCTGCTACAATCAGGGTCTCTGTTCCAAACGTGGATGATGGG
CAAGTCATTGAGATCACAGTGCAGTCATTATCAGAAAACGTGGGAAGTTTGAAAGAGAAG
ATAGCCGGTGAGACACAAATCCCAGCAAACAGACAGAAGTTGAGTGGAAAAGCTGGCTTC
TTAAAGGACAACACGTCACTGGCACATTACAATGTCGGAGCAGGTGAAATCTTAACACTG
TCTTTGAGAGAGCGTGGTGGGAGAAAGAGATAGAGAGTCAGCTGGTGGATGCAGAGAAAT
GCATTTGATTTCTTCTTTAGATGTTTTCAAAACTTGGTGGCCAAAACTATTTGTACTGCT
ATCTTTTTTACTCTTGGCCCATCGCATCTAGTATCTATTGAAGTTTAGATTGAAAAAAAG
AATATCACTGAGTTAAGTTCGTGTCGGATCTGCAATCAACGTTTTGGAAAACTCATCTTT
ACTATATGATACTTTGTTTTGCCTC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL8194Contig1 1033 2 2 U
GTAACCTCGTTAGGCTTCGAGGTTTCTGTTCGGAGAATCTCCACAGGCTTCTCGTCTATG
ACTACATGCCGAACGGATCGCTGAGCTCCTACTTGTCGAGGACAAGTCCTGAGTTGCTAA
GCTGGGAAACGCGTTTCAGGACCGCCTTAGGGACTGCGAAAGGGATCGCGTATCTGCACG
AAGGGTGTAGGGACTGTATTATCCACTGTGATATCAAACCGGAGAATATTCTGTTGGACA
GTGTTTACAACGCCAAAGTATCTGACTTCGGATTGGCTAAGCTTGTTGGCCGTGACTTCA
GCAGGGTTCTCGCCACTATGAGAGGTACATGGGGATACGTTGCTCCTGAGTGGATATCGG
GTTTACCCATCACGACTAAAGCTGATGTGTATAGCTTCGGAATGACACTTCTTGAGCTCA
TCGGTGGTCGAAGAAACGTCGTTAGCGATACACCAGGAGGAGAGAAAGATGAGAAAGAAC
CCGAGAAATGGTTCTTTCCTCCATGGGCAGCACGTGAAATCATACAAGGAAACGTGGACT
TGGTTGTGGACTCTAGACTCAGCGGAGAATACAACAATGAAGAGGCGACGAGGATGGCCA
CAGTGGCGGTATGGTGCATCCAAGACAATGAAGAGATAAGGCCGGCAATGGGAACGGTGG
TGAAGATGCTTGAAGGAGTTGTGGAGGTGACGGTTCCTCCACCGCCTAAGTTGATACAAG
CTCTTGTCTCTGGCGACTCGTATATTGGAGTGGGCAACGGTTTGAGCGGCACAAGCTGTA
GTGAAGGCAGGGGTTGTTCGGATCTCATGACTGGATTGTCTAGCCCCACCGGCTCACGGT
CGTCTTTTGGTGGTAAACTTCCTCCTTCTCCCTGATCAGTTTGTAGATGGTTTTGTTAGA
AAACGGTCTTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTGCTCTCTGAGAGGGT
TTAATTAGTAGTACTAATCTCTAGTTGTTGGTTGTATGACAATGAAGCTTTAATTTGTCA
TTTCCTGTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C923TF U 1
AF RR4C923JQ C 350
BS 1 638 RR4C923TF
BS 639 1033 RR4C923JQ

RD RR4C923TF 638 0 0
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GCTGGGAAACGCGTTTCAGGACCGCCTTAGGGACTGCGAAAGGGATCGCGTATCTGCACG
AAGGGTGTAGGGACTGTATTATCCACTGTGATATCAAACCGGAGAATATTCTGTTGGACA
GTGTTTACAACGCCAAAGTATCTGACTTCGGATTGGCTAAGCTTGTTGGCCGTGACTTCA
GCAGGGTTCTCGCCACTATGAGAGGTACATGGGGATACGTTGCTCCTGAGTGGATATCGG
GTTTACCCATCACGACTAAAGCTGATGTGTATAGCTTCGGAATGACACTTCTTGAGCTCA
TCGGTGGTCGAAGAAACGTCGTTAGCGATACACCAGGAGGAGAGAAAGATGAGAAAGAAC
CCGAGAAATGGTTCTTTCCTCCATGGGCAGCACGTGAAATCATACAAGGAAACGTGGACT
TGGTTGTGGACTCTAGACTCAGCGGAGAATACAACAATGAAGAGGCGACGAGGATGGCCA
CAGTGGCGGTATGGTGCATCCAAGACAATGAAGAGATA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4C923JQ 684 0 0
GTGGATATCGGGTTTACCCATCACGACTAAAGCTGATGTGTATAGCTTCGGAATGACACT
TCTTGAGCTCATCGGTGGTCGAAGAAACGTCGTTAGCGATACACCAGGAGGAGAGAAAGA
TGAGAAAGAACCCGAGAAATGGTTCTTTCCTCCATGGGCAGCACGTGAAATCATACAAGG
AAACGTGGACTTGGTTGTGGACTCTAGACTCAGCGGAGAATACAACAATGAAGAGGCGAC
GAGGATGGCCACAGTGGCGGTATGGTGCATCCAAGACAATGAAGAGATAAGGCCGGCAAT
GGGAACGGTGGTGAAGATGCTTGAAGGAGTTGTGGAGGTGACGGTTCCTCCACCGCCTAA
GTTGATACAAGCTCTTGTCTCTGGCGACTCGTATATTGGAGTGGGCAACGGTTTGAGCGG
CACAAGCTGTAGTGAAGGCAGGGGTTGTTCGGATCTCATGACTGGATTGTCTAGCCCCAC
CGGCTCACGGTCGTCTTTTGGTGGTAAACTTCCTCCTTCTCCCTGATCAGTTTGTAGATG
GTTTTGTTAGAAAACGGTCTTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTGCTC
TCTGAGAGGGTTTAATTAGTAGTACTAATCTCTAGTTGTTGGTTGTATGACAATGAAGCT
TTAATTTGTCATTTCCTGTTAATC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL8195Contig1 1446 2 2 U
GGATCTCGGAGAAGAAGACGAGGATAGTGACATTAGAGACGGCTGCGACGAAGGCCAAAA
GGAGCATCGCTTCGTCGAACCTGTTAGAGAATGCATTATCATCGACGGCCGAGATTTGGT
CGGTTCCTAGCTTGAGAAGCTGGTCGGATGATCTCTGCGGTTCTTAGCTTTAATCTTGTC
GGATCTTAGCTCGAATCTGGTCGGATCTTAGCTCGAATCTGGTCGGATCTTAGCTCGAAT
CTGATCGGATCTTAGCTTGAATCTGGTCGGATCTTAGCTTGAAGCTTGTCGGATCTTAGC
TTGAAGCTTGTCGGATCTTAGCTCGAAGCCGGTCGGATCTGTGCGGTTCTAGCATGAGCG
ATACTGTGATGAATCTTGAAGAAGCTGGTGGAGAGACATGGAGCAATATGGTTCTGAAAA
AGCTTCTTCGACCAGCAAGGTACTTCGACCCACCCGATGAACCTGGTTTAACGACTGATT
CTTCTTCTTGCGAGGAGCAAGAAGAAGACACGAAGCCTCCTAGGAAGCGTTGCTTTATAT
GCGCTAGTTTCGAGCACGTCGGGGAACAGTGTTCAATGGGACACGACTCTTGTCCTAACG
ACGGGTCCGTTTGCTTAAGATGTGGAGACATGGGGCATGATATGTCTTTGTGCAAGTACG
AATACTCTGTGGATGATCTGAAGATGTACGGTGTTATGTCTGTAATGGCTTTGGCCACAT
GTGCTGTGGGGAGGCGGCGCTCTCGTCGTCATCGTCGTGGGCTGTCTCTTGTTACAAGTG
TGGTAAAGCGTGTCATGTTGGACTGGGGTGTGGTAGACACTACGAGGAACCCGCCACGTG
TTGGGGGAAAAGGCATTGCTCGAGTAGATTAGCTGAGAAGAAAAGGAAACGTCTTGCCAA
GGCTCTTGCTACTTCTGCAGCCATTCGGGAGAGGCTTGAGAAGAAGAAGCATATGATACT
GGAAGAACAAGAGCACCATTTTACTGTTCATGAATCCAACGGGAAGAGTGATGGAAACTT
TGAAGAGGGTTCTAGTTCCCACGAACCTAACTGGAAGAAGAATGATGGAAACTCGGAACA
GCAACATTGTACTCCTGATGGGAAGACGATGAAGGATAATGTTGAGTTGGAGCAGGAAGA
TGAATCAAATGATAGAAGCGTTTGGACAACAGAGGGTTCGATTTTTGGAAAGCATCAGGA
GGCTGAGTTATCCCATTACACCATCAGGTGATGACCATAGATCACCGACAGTCAGTTATG
GTAAGCATTCGAGTGTAATGGGCATCTGTCGGGTTTTCGAACTTCAAGGTGCATATATGG
TCATGTTTTTTCAAGGTATGGTCAGTCCAGTCCACCACTATGGCGAGTTTTAAGGAAACT
ATGAACGGTTGTAGTATCATTTGATATTGGTAAAAGGTCAAGATAGTGTTGTTTTGTTTC
TTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4AV42TF U 1
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GGATCTTAGCTCGAATCTGGTCGGATCTTAGCTCGAATCTGGTCGGATCTTAGCTCGAAT
CTGATCGGATCTTAGCTTGAATCTGGTCGGATCTTAGCTTGAAGCTTGTCGGATCTTAGC
TTGAAGCTTGTCGGATCTTAGCTCGAAGCCGGTCGGATCTGTGCGGTTCTAGCATGAGCG
ATACTGTGATGAATCTTGAAGAAGCTGGTGGAGAGACATGGAGCAATATGGTTCTGAAAA
AGCTTCTTCGACCAGCAAGGTACTTCGACCCACCCGATGAACCTGGTTTAACGACTGATT
CTTCTTCTTGCGAGGAGCAAGAAGAAGACACGAAGCCTCCTAGGAAGCGTTGCTTTATAT
GCGCTAGTTTCGAGCACGTCGGGGAACAGTGTTCAATGGGACACGACTCTTGTCCTAACG
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AATACTCTGTGGATGATCTGAAGATGTACGGTGTTATGTCTGTAATGGCTTTGGCCACAT
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TTGGGGGAAAAG
C

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ACGGGAAGAGTGATGGAAACTTTGAAGAGGGTTCTAGTTCCCACGAACCTAACTGGAAGA
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ATGTTGAGTTGGAGCAGGAAGATGAATCAAATGATAGAAGCGTTTGGACAACAGAGGGTT
CGATTTTTGGAAAGCATCAGGAGGCTGAGTTATCCCATTACACCATCAGGTGATGACCAT
AGATCACCGACAGTCAGTTATGGTAAGCATTCGAGTGTAATGGGCATCTGTCGGGTTTTC
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TATGGCGAGTTTTAAGGAAACTATGAACGGTTGTAGTATCATTTGATATTGGTAAAAGGT
CAAGATAGTGTTGTTTTGTTTCTTTTTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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CATCAAATTGGACTAAAACAGAGGGGTGGGTACTGGCATCATAGTCAGTTTCTCGTACCA
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TCCCTCTACTTGTCATGAAACTTTGTGATCGTTCTTCTTCGTTCATTTTGTTTTCTTGGT
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TTTGTGCTCT


BQ
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AF RR4GH57TF U 1
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CCTTACTGGAATCAAATATTTTCCTGCTGCTCCAAAGAAGCAAGAAGAAGAGAAAGATAC
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TCCCTCTACTTGTCATGAAACTTTGTGATCGTTCTTCTTCGTTCATTTTGTTTTCTTGGT
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TTTGTGCTCT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4GH57TF 550 0 0
GCAGAAGATGGGGTTTGAGGTCCTTGGAGACAATGATTCCCCAGTTATGCCCATAATGCT
TTACAATCCTGCGAAAATCCCAGCCTTCTCAAGGGAATGCCTGCGAGAAAACGTGGCAGT
TGTGGTTGTTGGTTTCCCAGCTACACCTCTATTGCTAGCCAGGGCTCGTATTTGTATATC
CGCATCTCACTCAAGAGAAGATCTTCTTAAAGCTCCACAGGTTATAAGCAAAGCAGGTGA
CCTTACTGGAATCAAATATTTTCCTGCTGCTCCAAAGAAGCAAGAAGAAGAGAAAGATAC
CATCAAATTGGACTAAAACAGAGGGGTGGGTACTGGCATCATAGTCAGTTTCTCGTACCA
AAAGAGGTTTAATTAGTACTAACTTGCATTAGTTTACTAGTTTCCCTTGCGGTTCGATGT
TCCCTCTACTTGTCATGAAACTTTGTGATCGTTCTTCTTCGTTCATTTTGTTTTCTTGGT
TGTCAGAGTTAAAATTGTATAGTTTCCCTCTTTGAGTAACAGATATGCTATCGATGACAT
TTTGTGCTCT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8198Contig1 837 2 2 U
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CGTCGATTGGCTGTGATCTCCCCGAAGAAAAGGGCCTTCAGCAGTAAAATTTCCGAAGAA
ATCGATCTCCGAGTATTGAATGAGCTGAATCAGGAAATGCAATCAATCTTTGGAGCTGAA
CCTCCTGCCACAATGGACTACCCTGAGTTGAACTCCAGTATTGGATCTACAAAACCGGAA
AGTTCTATGCAATATGAACAACCTGCAAAACGTCTTACCGAAGATATCTCTAAGCTGACA
CATGTTGGTGTCTCCGGGGAAGCTCAGATGGTGGATGTTTCTTGCAAGGACAATACTAAG
AGAACCGCATTGGCTTGCTGCAAAGTGATTCTAGGGAAAAGAGTTTTCGAATTGGTCTTA
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GCGAAACAAACCAGCAGTTTAATCCCATTGTGTCATAACATTGCTCTTACGCATGTTCGT
GTTGACTTGAGATTAAACCCCGAGGATTTCAGTGTTGACATCGAAGGAGAAGCTTCTTGC
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GTTTACGACATGTGCAAAGCTGCTTCCAAAGATATCAGTGTTACGGATGTTAGGCTTGAA
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TAGCTATGGAGTCACAGATTACGCGTAGACAAAGCCATAGCTAGCCTTGCCTGGACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B047TF U 1
AF RR4B047JQ C 292
BS 1 796 RR4B047TF
BS 797 837 RR4B047JQ

RD RR4B047TF 796 0 0
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CGTCGATTGGCTGTGATCTCCCCGAAGAAAAGGGCCTTCAGCAGTAAAATTTCCGAAGAA
ATCGATCTCCGAGTATTGAATGAGCTGAATCAGGAAATGCAATCAATCTTTGGAGCTGAA
CCTCCTGCCACAATGGACTACCCTGAGTTGAACTCCAGTATTGGATCTACAAAACCGGAA
AGTTCTATGCAATATGAACAACCTGCAAAACGTCTTACCGAAGATATCTCTAAGCTGACA
CATGTTGGTGTCTCCGGGGAAGCTCAGATGGTGGATGTTTCTTGCAAGGACAATACTAAG
AGAACCGCATTGGCTTGCTGCAAAGTGATTCTAGGGAAAAGAGTTTTCGAATTGGTCTTA
GCCAATCAAATGGGGAAAGGAGATGTTCTCGGAGTGGCCAAAATCGCTGGCATCAACGGA
GCGAAACAAACCAGCAGTTTAATCCCATTGTGTCATAACATTGCTCTTACGCATGTTCGT
GTTGACTTGAGATTAAACCCCGAGGATTTCAGTGTTGACATCGAAGGAGAAGCTTCTTGC
ACTGGAAAAACAGGAGTTGAGATGGAAGCTTTGACTGCTGTGTCAGTTGCTGGTTTAACT
GTTTACGACATGTGCAAAGCTGCTTCCAAAGATATCAGTGTTACGGATGTTAGGCTTGAA
CGTAAAACTGGTGGAAAGAGTGGCTATTGGTCTAGAGGCGAGTGAAAACACTTGTCTCCG
TAGCTATGGAGTCACA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR4B047JQ 546 0 0
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AATACTAAGAGAACCGCATTGGCTTGCTGCAAAGTGATTCTAGGGAAAAGAGTTTTCGAA
TTGGTCTTAGCCAATCAAATGGGGAAAGGAGATGTTCTCGGAGTGGCCAAAATCGCTGGC
ATCAACGGAGCGAAACAAACCAGCAGTTTAATCCCATTGTGTCATAACATTGCTCTTACG
CATGTTCGTGTTGACTTGAGATTAAACCCCGAGGATTTCAGTGTTGACATCGAAGGAGAA
GCTTCTTGCACTGGAAAAACAGGAGTTGAGATGGAAGCTTTGACTGCTGTGTCAGTTGCT
GGTTTAACTGTTTACGACATGTGCAAGGCTGCTTCCAAAGATATCAGTGTTACGGATGTT
AGGCTTGAACGTAAAACTGGTGGAAAGAGTGGCTATTGGTCTAGAGGCGAGTGAAAACAC
TTGTCTCCGTAGCTATGGAGTCACAGATTACGCGTAGACAAAGCCATAGCTAGCCTTGCC
TGGACC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL8199Contig1 704 2 9 U
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TCCATCGATCGTTGATTGCAGCTAAAGAGCATCTGAATCCTACCCAGGGTTTGTTGGTAA
TCTTCTCCACAATGACGACTTCTGTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTCGTCCCGACGACG
CCTCTGCTCGAAAACAAGGCGAAACTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAAGCCGATG
CCTCTGCTCGAAAACAAGCCGACACGACAGCCTCTACTTGCCCTTTCTCCAAACCTGATG
ATGCCTCGGCTCGTAAAGCATGTCCTGAAAACGAAGGAAGAGTGAACAAAGAGGAATCTG
CTGATTCCGCAACGGTGCCTGCCAAGTGCCCGTTTGGTTATGATTCCCAGACGTTCAAGC
CTGGGCCTTTTAGTTGTATGCTATGTCAGGCACTTCTGTATGATAGCAGTAGATGTGTTC
CTTGCACACATGTGTTCTGCAAGGTGTGCGTATCACGGTTTAAGGACTGCCCCTTATGTG
GCGCTGACGTGGAGAGTATTGAAGCTGATGAAAGCCTTCAGAAGATGGTTGATCAGTTTA
TTGAAAGTCATGCTAGGATCAAGAGGTCTGTTGTTAACAGCACTGATAAAGAAGAGGTCG
AAAATGATAACAAGAAGTGATTTACGCTGATGTTTCCATGGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4HA23TF U 72
AF RR4E659TF U 1
BS 1 388 RR4E659TF
BS 389 389 RR4HA23TF
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BS 551 551 RR4HA23TF
BS 552 605 RR4E659TF
BS 606 606 RR4HA23TF
BS 607 704 RR4E659TF

RD RR4HA23TF 559 0 0
GG
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GACGACTTCTGTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTCGTCCCGACGACGCCTCTGCTCGAAA
ACAAGGCGAAACTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAAGCCGATGCCTCTGCTCGAAA
ACAAGCCGACACGACAGCCTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAACCTGATGATGCCTCGGCTCG
TAAAGCATGTCCTGAAAACGAAGGAAGAGTGAACAAAGAGGAATCTGCTGATTCCGCAAC
GGTGCCTGCCAAGTGCCCGTTTGGTTATGATTCCCAGACGTTCAAGCTTGGGCCTTTTAG
TTGTATGCTATGTCAGGCACTTCTGTATGATAGCAGTAGATGTGTTCCTTGCACACATGT
GTTCTGCAAGGTGTGCGTATCACGGTTTAAGGACTGCCCCTTATGTGGCGCTGACGTGGA
GAGTATTGAAGCTGATGAAAGCCTTCAGAAGATGGTTGATCAGTTTATTGAAAGTCATGC
TAGGATCAAGAGGTCTG

QA 3 559 3 559
DS 

RD RR4E659TF 704 0 0
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TCTTCTCCACAATGACGACTTCTGTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTCGTCCCGACGACG
CCTCTGCTCGAAAACAAGGCGAAACTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAAGCCGATG
CCTCTGCTCGAAAACAAGCCGACACGACAGCCTCTACTTGCCCTTTCTCCAAACCTGATG
ATGCCTCGGCTCGTAAAGCATGTCCTGAAAACGAAGGAAGAGTGAACAAAGAGGAATCTG
CTGATTCCGCAACGGTGCCTGCCAAGTGTCCGTTTGGTTATGATTCCCAGACGTTCAAGC
CTGGGCCTTT*AGTTGTATGCTATGTCAGGCACTTCTGTATGATAGCAGTAGATGTGTTC
CTTGCACACATGTGTTCTGCAAGGTGTGCGTATCACGGTTTAAGGACTGCCCCTTATGTG
GCGCTGACGTTGAGAGTATTGAAGCTGATGAAAGCCTTCAGAAGATGGTTGATCAGTTTA
TTGAAGGTCATGCTAGGATCAAGAGGTCTGTTGTTAACAGCACTGATAAAGAAGAGGTCG
AAAATGATAACAAGAAGTGATTTACGCTGATGTTTCCATGGAGA

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL8200Contig1 901 2 2 U
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AAGGCCGTCGCTAAGATCATCGGCAAACCTGAATCCGTATTTAAAAGCTCTAAAACCCTC
TGTTTCCGACAATTATAACTTCGATGTCTCGTGTGTCTGTGTTTGTCTCTTTCCAGGGTT
TTGATTATATAAAAACATATCATAGCGATAATCACTAGCTGGTCGTGTAAGCAGTATATG
CACGCCAACTGTTTGATGAAATTCCTGTGTGAATCTGGTCTTAACTTGCGAGCTACGTTT
CGTTACAACAATGACTGCTCTTTTTCTTTTTCTTGGTTGGTTGGTTTTGCAGTATGTGAT
GATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCTGGTACCGAGGAACCTGCTGCTTA
TGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGGCGTGAATGGGAAGCTTAGCGAGAC
TATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCTCCCGCTTTTACATCAAGTT
CTACGATTCCCCAGTAAGCTGATGAAATGAAATCACAACTGTTCAAAAGATATCTTATTT
AACTTGAATTTATAATATGCTTGGGGATCTTTGTTATTTTTCTTGTTCCAGCGACCCTTC
TTTGGATTCAACGGATCAACTTTCTGAACACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCG
GAGAATTCAACTTCCTAATGAAATTATTGTTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGAT
TCTTGAGCTTGGTTTATAATATGGTACTTCCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTT
CATATTGTTTTCTGTGACTAGTTACTATTTCTGATGTGATCTTATTACTAGCAAATTTTA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4DX17TF U 1
AF RR4DX17JQ C 150
BS 1 684 RR4DX17TF
BS 685 901 RR4DX17JQ

RD RR4DX17TF 684 0 0
GGATTCACGAACATACCAGTCGACGCTGTCACATGCTCCGACATCCTCAAGGACGCTACT
AAGGCCGTCGCTAAGATCATCGGCAAACCTGAATCCGTATTTAAAAGCTCTAAAACCCTC
TGTTTCCGACAATTATAACTTCGATGTCTCGTGTGTCTGTGTTTGTCTCTTTCCAGGGTT
TTGATTATATAAAAACATATCATAGCGATAATCACTAGCTGGTCGTGTAAGCAGTATATG
CACGCCAACTGTTTGATGAAATTCCTGTGTGAATCTGGTCTTAACTTGCGAGCTACGTTT
CGTTACAACAATGACTGCTCTTTTTCTTTTTCTTGGTTGGTTGGTTTTGCAGTATGTGAT
GATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCTGGTACCGAGGAACCTGCTGCTTA
TGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAGGTGCGGGCGTGAATGGGAAGCTTAGCGAGAC
TATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCTCCCGCTTTTACATCAAGTT
CTACGATTCCCCAGTAAGCTGATGAAATGAAATCACAACTGTTCAAAAGATATCTTATTT
AACTTGAATTTATAATATGCTTGGGGATCTTTGTTATTTTTCTTGTTCCAGCGACCCTTC
TTTGGATTCAACGGATCAACTTTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4DX17JQ 752 0 0
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AATCACTAGCTGGTCGTGTAAGCAGTATATGCACGCCAACTGTTTGATGAAATTCCTGTG
TGAATCTGGTCTTAACTTGCGAGCTACGTTTCGTTACAACAATGACTGCTCTTTTTCTTT
TTCTTGGTTGGTTGGTTTTGCAGTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCATTG
CATTTGCTGGTACCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAATTGATATCTATTGGAGGATTAG
GTGCGGGCGTGAATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGCTCT
CTATTGATAGCTCCCGCTTTTACATCAAGTTCTACGATTCCCCAGTAAGCTGATGAAATG
AAATCACAACTGTTCAAAAGATATCTTATTTAACTTGAATTTATAATATGCTTGGGGATC
TTTGTTATTTTTCTTGTTCCAGCGACCCTTCTTTGGATTCAACGGATCAACTTTCTGAAC
ACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGAGAATTCAACTTCCTAATGAAATTATTG
TTTGCCTCTTTTGAGTTCAGAAGCTATAGATTCTTGAGCTTGGTTTATAATATGGTACTT
CCCTTAAAAGCTAATCTAATCTCTTCATGTTCATATTGTTTTCTGTGACTAGTTACTATT
TCTGATGTGATCTTATTACTAGCAAATTTTAG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL8201Contig1 987 2 10 U
AATTTACTTGTTAAAATTCGATACCAGTGAATGGGCTCATCTTCGTCGCTTAATAAGTCT
CCGTTTGGAACAGAACGCATGGTAACACCAGAGTCTCCCACGAAAGATATTGATTCATCT
CCGATGACTGTTAAAAACGACGGCGTTACGATCATTTCTAATTCCTTGTACTCGTCGTCT
CCTTCTGCCACGAAAATCTTCGAATCGCCGAGAAAGAGTACAACACCGGTTCGTGTGGCG
TCTCCGGCTGTCAAATCTCGGTGGTCGTTTTCCTCTTCAAAGAAAAGCTTCGGAAGTAAA
GATGAAACCTTTTTCGATACGCAGCAATGGCTACAATCTGACTCGGACGATGATTTCCAC
AGCGTAAATGGCGATTTCACTCCATCGCGTGGAAACACTCCCAAGAGCAGCTTCTCGGAT
AGACTTCCTCGTATCAACAACTTTATATTCCACGAGAAGAAGCCTTCTCGAGGCTCTTCT
CCAGCGCCAAAACCGAGGAGGAAGAAGCTTGGTGATCTTTTCATAGAAAGCATAAGAGAA
GAACGAGAGGAAAGCTCTGGAGGGTCGTCATCTCTAAGCTCTCCCTATCTCTCTGGTGAA
AACTCGCGCGAATCCAACAAGGTCGCCATTGAAGAAGACGCTAGTGTGAAAGGAAGAGAA
GAAGAAGTCTAACTGGCAGCATCATCGTTGTCTTCCTGGTTTCTCTGCATGGGGGTGGAA
GTTTCATGGAGAGGAGGAAGAAGATGAGCTCTGAAACTGGGGTTGTTGCTGTGAAATGAG
ATGCAGAGAGAATAATATTAATGTGTATATGATAAAATTGAGAAAGAGATCTCTCAGAGT
AAAAGCTCTTGTGAATTTTTGCAAGTACCACTACTTCACTTGCTGTGATGAGAAGAAAAT
GAATCCAGATAGTTGAAGAGATTATGTGAAAAAAAAAGTAAGAGATGTTCTGGTGTGTTA
ATGAAATGATGACTATTGGATCTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI15TF U 1
AF RR4AI15JQ C 274
BS 1 621 RR4AI15TF
BS 622 622 RR4AI15JQ
BS 623 791 RR4AI15TF
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BS 845 854 RR4AI15TF
BS 855 987 RR4AI15JQ

RD RR4AI15TF 860 0 0
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CCTTCTGCCACGAAAATCTTCGAATCGCCGAGAAAGAGTACAACACCGGTTCGTGTGGCG
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GATGAAACCTTTTTCGATACGCAGCAATGGCTACAATCTGACTCGGACGATGATTTCCAC
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CCAGCGCCAAAACCGAGGAGGAAGAAGCTTGGTGATCTTTTCATAGAAAGCATAAGAGAA
GAACGAGAGGAAAGCTCTGGAGGGTCGTCATCTCTAAGCTCTCCCTATCTCTCTGGTGAA
AACTCGCGCGAATCCAACAAG*TCGCCATTGAAGAAGACGCTAGTGTGAAAGGAAGAGAA
GAAGAAGTCTAACTGGCAGCATCATCGTTGTCTTCCTGGTTTCTCTGCATGGGGGTGGAA
GTTTCATGGAGAGGAGGAAGAAGATGAGCTCTGAAACTGGGGTTGTTGCTGTGAAATGAG
ATGCAGAGAGA*TAATATTAATGTGTATATGATAAAAT*GAGAAAGAGATCTCTCAGAGT
AAA*GCTCTTGTGA
TTTTGC

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR4AI15JQ 714 0 0
TCTTCAAAGAAAAGCTTCGGAAGTAAAGATGAAACCTTTTTCGATACGCAGCAATGGCTA
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GAGAAGAAGCCTTCTCGAGGCTCTTCTCCAGCGCCAAAACCGAGGAGGAAGAAGCTTGGT
GATCTTTTCATAGAAAGCATAAGAGAAGAACGAGAGGAAAGCTCTGGAGGGTCGTCATCT
CTAAGCTCTCCCTATCTCTCTGGTGAAAACTCGCGCGAATCCAACAAGGTCGCCATTGAA
GAAGACGCTAGTGTGAA*GGAAGAGAAGAAGAAGTCTAACTGGCAGCATCATCGTTGTCT
TCCTGGTTTCTCTGCATGTGG*TGGAAGTTTCATGGAGAGGAGGAAGAAGATGAGCTCTG
AAACTGGGGTTGTTGCTGTGAAATGAGATGCAGAGAGAATAATATTAATGTGTATATGAT
AAAATTGAGAAAGAGATCTCTCAGAGTAAAAGCTCTTGTGAATTTTTGCAAGTACCACTA
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AAAAGTAAGAGATGTTCTGGTGTGTTAATGAAATGATGACTATTGGATCTTTAG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL8202Contig1 1220 2 2 U
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TCCTTAAGGCAAAGGAGTATCTTCCTCTGCATCAGTTGAAGTTGCTACCATGTCTGCTAT
CGCTGCTGCTCATGGTCTTGAGATATCTCCGAGAGATGTTGCTTTGCTTTGCCAAAAGGT
GGAGAACTATGTTGTTGGAGCACCTTGTGGAGTGATGGATCAAATGGCTTCTGCTTGTGG
AGAAGCTAACAAGCTTCTTGCTATGATCTGTCAGCCTGCTGAGATACTAGGACTTGTTGA
AATACCTTCTCACATTCGCTTCTGGGGGATCGATTCTGGAATACGACACAGTGTTGGTGG
TTCAGACTATGGCTCTGTGAGGATAGGAGCTTTTATTGGCAAAACAATGATAAGATCTTG
TGCATCTTCTGAAACCAACTCAGGAGAGACTGATGAGGAGAGCTCGGAGTTGGTAGATTA
CGATGCTTCTTTGGATTACTTATGCAACCTTTCACCTCATAGATTTCAAGCTCTATACGC
AAGTAAGCTCCCACAGGTTATCACAGGAGAAGAATTCATCGAAAAGTATGGTGATCATGG
TGATTCTGTCACAACCATTGACAGGAAAGGTACTTACCATATAATGTCCCCGACTAAACA
TCCAATCTATGAGAACTTCCGTGTCCAGGCTTTCAAAGCATTGTTGACAGCAACTCCTTC
AGAAGAACAGGTCATTGGTCTAGGGGAGCTAATGTACCAGTGCCATGATAGCTACAGCGC
GTGTGGGCTTGGATCTGATGGTACAGACAGGTTAGTGAGACTAGTACAGAAAATGGAGAA
GTTGAAGCACTCTAAAACCGAGAACGGGACTCTATACGGGGCCAAGATCACAGGAGGTGG
TAGCGGCGGAACGGTGTGTGTTATTGGAAGAAGCAGTTTGAGAAGCAGTGAACAGATTCT
TGAGATACAGAGAAAGTACAAGGAAGCAACAGGGTTTATGCCGTATGTGTTTGAAGGATC
ATCTCCGGGAGCTGGCAAGTTTGGATATTTGAAGATACGCAAGAACTCTGCTCCTCCTTC
TTCCACTTAAAACATTTCTTCTTCTTCTTTATTTTCTGCTTAATAGTATAGCTTTTGTCA
TTGATAACTTAAATACAGTTCAAGAACTCTGTCTGGTCACTTTCGTGTCTTCATTAAAAT
TCATGCAGAAACGATTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BA26TF U 1
AF RR4BA26JQ C 314
BS 1 863 RR4BA26TF
BS 864 1220 RR4BA26JQ

RD RR4BA26TF 871 0 0
GGAGAGAGAGATGAACGTTCGTTTTGAAGATAGCATTAGCATACTGGTTTCTTCAACGGT
TCCTTAAGGCAAAGGAGTATCTTCCTCTGCATCAGTTGAAGTTGCTACCATGTCTGCTAT
CGCTGCTGCTCATGGTCTTGAGATATCTCCGAGAGATGTTGCTTTGCTTTGCCAAAAGGT
GGAGAACTATGTTGTTGGAGCACCTTGTGGAGTGATGGATCAAATGGCTTCTGCTTGTGG
AGAAGCTAACAAGCTTCTTGCTATGATCTGTCAGCCTGCTGAGATACTAGGACTTGTTGA
AATACCTTCTCACATTCGCTTCTGGGGGATCGATTCTGGAATACGACACAGTGTTGGTGG
TTCAGACTATGGCTCTGTGAGGATAGGAGCTTTTATTGGCAAAACAATGATAAGATCTTG
TGCATCTTCTGAAACCAACTCAGGAGAGACTGATGAGGAGAGCTCGGAGTTGGTAGATTA
CGATGCTTCTTTGGATTACTTATGCAACCTTTCACCTCATAGATTTCAAGCTCTATACGC
AAGTAAGCTCCCACAGGTTATCACAGGAGAAGAATTCATCGAAAAGTATGGTGATCATGG
TGATTCTGTCACAACCATTGACAGGAAAGGTACTTACCATATAATGTCCCCGACTAAACA
TCCAATCTATGAGAACTTCCGTGTCCAGGCTTTCAAAGCATTGTTGACAGCAACTCCTTC
AGAAGAACAGGTCATTGGTCTAGGGGAGCTAATGTACCAGTGCCATGATAGCTACAGCGC
GTGTGGGCTTGGATCTGATGGTACAGACAGGTTAGTGAGACTAGTACAGAAAATGGAGAA
GTTGAAGCACTCTAAAACCGAGA
CGGGACTC

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR4BA26JQ 907 0 0
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TCTGTGAGGATAGGAGCTTTTATTGGCAAAACAATGATAAGATCTTGTGCATCTTCTGAA
ACCAACTCAGGAGAGACTGATGAGGAGAGCTCGGAGTTGGTAGATTACGATGCTTCTTTG
GATTACTTATGCAACCTTTCACCTCATAGATTTCAAGCTCTATACGCAAGTAAGCTCCCA
CAGGTTATCACAGGAGAAGAATTCATCGAAAAGTATGGTGATCATGGTGATTCTGTCACA
ACCATTGACAGGAAAGGTACTTACCATATAATGTCCCCGACTAAACATCCAATCTATGAG
AACTTCCGTGTCCAGGCTTTCAAAGCATTGTTGACAGCAACTCCTTCAGAAGAACAGGTC
ATTGGTCTAGGGGAGCTAATGTACCAGTGCCATGATAGCTACAGCGCGTGTGGGCTTGGA
TCTGATGGTACAGACAGGTTAGTGAGACTAGTACAGAAAATGGAGAAGTTGAAGCACTCT
AAAACCGAGAACGGGACTCTATACGGGGCCAAGATCACAGGAGGTGGTAGCGGCGGAACG
GTGTGTGTTATTGGAAGAAGCAGTTTGAGAAGCAGTGAACAGATTCTTGAGATACAGAGA
AAGTACAAGGAAGCAACAGGGTTTATGCCGTATGTGTTTGAAGGATCATCTCCGGGAGCT
GGCAAGTTTGGATATTTGAAGATACGCAAGAACTCTGCTCCTCCTTCTTCCACTTAAAAC
ATTTCTTCTTCTTCTTTATTTTCTGCTTAATAGTATAGCTTTTGTCATTGATAACTTAAA
TACAGTTCAAGAACTCTGTCTGGTCACTTTCGTGTCTTCATTAAAATTCATGCAGAAACG
ATTAAAC

QA 1 907 1 907
DS 



AS 1 2

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AGAGACAGACATACATGTCAGAGGGAAGAAAGAAGCAGTAAAGATGATATCTGATGAAAC
ATTGTGAGGTAGACTCACCAATCTCTCAGCATTCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCTTTA
CTCCTCTCACAATCTTACCGAACCATACCAAGTTCATGATACCAAGCGCAGCTGGTACCC
CAAATACCAGAGCGTACCCGAAGATGTGCATCCTCATGACCTATATATACCCCGAAAACA
GAAGTAAATCCAATCACATAAACACACAAAACAAACTAGGATATTGGATAAATATTGTCA
TGCGTTGAATTCAATGGGGACGGCTTTGAGGCAGCATTCGACTCGTATATGAAGAGAGTA
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ATATGAAAAGAAGAATTCTAGCAACCTGACAAGAAAATGTTAAGAGTGATCGATCAGTAG
ACACCAAAAGGTTGTGCATCAAAATGAGTAGAATGTTTATGTACCAGCCAAGCCAAGAAG
ATGAAGACGCCATTGACAACATAAGCCATTGACTTCTTCATACCAGCTGTGTCCAGGTAC
CTTCATAAGAAAGATTACTAAGGTGAAAATCTTGTAAGGTAGATGG


BQ
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AF RR4CV67JQ C 1
AF RR4CV67TF U 1
BS 1 671 RR4CV67TF
BS 672 706 RR4CV67JQ

RD RR4CV67JQ 706 0 0
TTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTCTTCTCGTTTCTCCATCAGACAAAAACTACTTACACTAG
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ATTGTGAGGTAGACTCACCAATCTCTCAGCATTCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCTTTA
CTCCTCTCACAATCTTACCGAACCATACCAAGTTCATGATACCAAGCGCAGCTGGTACCC
CAAATACCAGAGCGTACCCGAAGATGTGCATCCTCATGACCTATATATACCCCGAAAACA
GAAGTAAATCCAATCACATAAACACACAAAACAAACTAGGATATTGGATAAATATTGTCA
TGCGTTGAATTCAATGGGGACGGCTTTGAGGCAGCATTCGACTCGTATATGAAGAGAGTA
CCGAGAAGGAGATTATGAGTTTTACCTGGTTGTAGTGCAGATAGACATGATAAAACATGT
ATATGAAAAGAAGAATTCTAGCAACCTGACAAGAAAATGTTAAGAGTGATCGATCAGTAG
ACACCAAAAGGTTGTGCATCAAAATGAGTAGAATGTTTATGTACCAGCCAAGCCAAGAAG
ATGAAGACGCCATTGACAACATAAGCCATTGACTTCTTCATACCAGCTGTGTCCAGGTAC
CTTCATAAGAAAGATTACTAAGGTGAAAATCTTGTAAGGTAGATGG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4CV67TF 675 0 0
TTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTCTTCTCGTTTCTCCATCAGACAAAAACTACTTACACTAG
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ATTGTGAGGTAGACTCACCAATCTCTCAGCATTCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCTTTA
CTCCTCTCACAATCTTACCGAACCATACCAAGTTCATGATACCAAGCGCAGCTGGTACCC
CAAATACCAGAGCGTACCCGAAGATGTGCATCCTCATGACCTATATATACCCCGAAAACA
GAAGTAAATCCAATCACATAAACACACAAAACAAACTAGGATATTGGATAAATATTGTCA
TGCGTTGAATTCAATGGGGACGGCTTTGAGGCAGCATTCGACTCGTATATGAAGAGAGTA
CCGAGAAGGAGATTATGAGTTTTACCTGGTTGTAGTGCAGATAGACATGATAAAACATGT
ATATGAAAAGAAGAATTCTAGCAACCTGACAAGAAAATGTTAAGAGTGATCGATCAGTAG
ACACCAAAAGGTTGTGCATCAAAATGAGTAGAATGTTTATGTACCAGCCAAGCCAAGAAG
ATGAAGACGCCATTGACAACATAAGCCATTGACTTCTTCATACCAGCTGTGTCCAGGTAC
CTTCATAAGAA
GATT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL8204Contig1 1315 2 6 U
TTTTTCCGCCCCACATTTTGTTTGTAGCCGTTGCGTTGTTCTTCCTTCCACAATATATGT
TTACACTAACTAAGCACATCACAAGAAAGAAACAAAAAAAAACGGCTTGACTTTTTCTTC
TGCCATGGAAACTAGACTAAGCAGCACGGTCCCAAAGCTTCCGTCTTTGAAGAGAAAGAG
ACCTCCCCAGATAGAAATCCCAAACATCCTCCAAGAAATCCAAACCGATGACCTCAGATT
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TGTCTCCAGAAAGGGGAAGAAGAAGTTCATGGAAGACAGTCACAGAGTTGCTGTCGGAAC
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TGTAGCTGAGAATCTGCACAAACATGTTCTTGAGATGGTGAAGGATTGTAAGGATAAAGG
AGAAGCCTTTAAAGCTGCTTATTTGAGGACTGATCGTGATTTCTTAGAAGAGGGTGTAGT
GAGTGGTGCCTGCTGTGTTACAGCTTTGATACAGAACCGGGAGATGATTGTCTCTAATTT
GGGAGATTGTAGAGCTGTTCTTTGCCGTGGTGGAGTAGCTGAGCTCTTACGACTGATCAC
AGAGCGGGAAGAGACGATGAGCGCGAAAGAATTGAGAATCAGGGTGGTTATGTTGAGTTT
CATCGTGGGGCGTGGCGAGTTCATGGAATACTTGCAATCTCCAGAAGCATTGGAGATGTA
CACTTGAAGAAATGGGTGGTTGCTGAACCGGAGACAAGAGTACTCGATTTGGAACATGAT
ATGGAGTTTCTTGTCTTAGCTTCTGATGGACTTTGGGATGTGGTTAGTAATCAAGAAGCA
GTTGACACTGTGTTGAGTGTTCAAGGTCAGAGAAAGACGCCTAGAGAAACTGAGGAGGAC
GAGAGTTTGTTCAAGGGGCTTGTCAATGTAAGTCCATCTTCAAAACTTCGGCGAGTTTCG
CTTGTCAAGCAACGTAAGGAGCTCTTGCCAGTTCAATCTCCCAGATGTGCAAAACCATAC
CACTCAGAGAATGAATCACCACCCTACCATGAAGTTGGGAGTCCACCTCCAAAGTCGAGG
AAGATCACCGCGTTGAAGCGGGTAAAGATGAAGAAGTCTGAGTCTTCTTGGGCCAAGGAA
GCTACCAAAGAGCTTGTGAACCTTGCCGTGAGTAGAGGTAGTATGGATGATATCACAGTG
GTCATTGTAGATCTCAACCGCTATAAATGCTGAAAAGCCTCATCACTCCCTTCAC


BQ
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AF RR4H375TF U 1
AF RR4H375JQ C 640
BS 1 690 RR4H375TF
BS 691 691 RR4H375JQ
BS 692 703 RR4H375TF
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BS 705 756 RR4H375TF
BS 757 1315 RR4H375JQ

RD RR4H375TF 756 0 0
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TTACACTAACTAAGCACATCACAAGAAAGAAACAAAAAAAAACGGCTTGACTTTTTCTTC
TGCCATGGAAACTAGACTAAGCAGCACGGTCCCAAAGCTTCCGTCTTTGAAGAGAAAGAG
ACCTCCCCAGATAGAAATCCCAAACATCCTCCAAGAAATCCAAACCGATGACCTCAGATT
CAGAGACTCATCTCACGGAAACGACGCCGTCGTGTGCCTCGGAGGAAACGGGTTCGGTGT
TGTCTCCAGAAAGGGGAAGAAGAAGTTCATGGAAGACAGTCACAGAGTTGCTGTCGGAAC
CTCAAACACGAGCTTCTTTGGAGTTTATGATGGCCATGGAGGAGGTAAAGCTGCAGACTT
TGTAGCTGAGAATCTGCACAAACATGTTCTTGAGATGGTGAAGGATTGTAAGGATAAAGG
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GAGTGGTGCCTGCTGTGTTACAGCTTTGATACAGAACCGGGAGATGATTGTCTCTAATTT
GGGAGATTGTAGAGCTGTTCTTTGCCGTGGTGGAGTAGCTGAGCTCTTACGACTGATCAC
AGAGCGGGAAGAGACGATGAGCGCGAAAGA*TTGAGAATCAGG*TGGTTATGTTGAGTTT
CATCGTGGGGCGTGGCGAGTTCATGGAATACTTGCA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4H375JQ 676 0 0
GAG
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GGTGGTTATGTTGAGTTTCATCGTGGGGCGTGGCGAGTTCATGGAATACTTGCAATCTCC
AGAAGCATTGGAGATGTACACTTGAAGAAATGGGTGGTTGCTGAACCGGAGACAAGAGTA
CTCGATTTGGAACATGATATGGAGTTTCTTGTCTTAGCTTCTGATGGACTTTGGGATGTG
GTTAGTAATCAAGAAGCAGTTGACACTGTGTTGAGTGTTCAAGGTCAGAGAAAGACGCCT
AGAGAAACTGAGGAGGACGAGAGTTTGTTCAAGGGGCTTGTCAATGTAAGTCCATCTTCA
AAACTTCGGCGAGTTTCGCTTGTCAAGCAACGTAAGGAGCTCTTGCCAGTTCAATCTCCC
AGATGTGCAAAACCATACCACTCAGAGAATGAATCACCACCCTACCATGAAGTTGGGAGT
CCACCTCCAAAGTCGAGGAAGATCACCGCGTTGAAGCGGGTAAAGATGAAGAAGTCTGAG
TCTTCTTGGGCCAAGGAAGCTACCAAAGAGCTTGTGAACCTTGCCGTGAGTAGAGGTAGT
ATGGATGATATCACAGTGGTCATTGTAGATCTCAACCGCTATAAATGCTGAAAAGCCTCA
TCACTCCCTTCAC

QA 4 676 4 676
DS 



AS 1 2

CO CL8205Contig1 1163 2 2 U
GATCATGGGGAAAGAGAGCAAAGCCTTGAGCTTGAAATCGGAGCAGAAGGCTCTCCTTCT
CCGTTCGATAGCTCAGTACTTGGACCGATGTGGGTTTTCTAAATGCTTCAAGAAACTCCT
CTCCGAAGCCGAAATCGAGAAGAAGGAATTGGATAGTGAGTTGCCGGATCTAGAGGAAGT
TTACCGCGTGTTTTTGAACAAGAGCAGTCTAGAAGCTGTGGAGGGGAAAGATGAATCAGG
GGATGAAGTGGAGAAGAATGCATCTGATGATCAAAAGAAAGAAGCTGCGGAGGAAGTAAA
GAAGGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGGTTAAAGAGACTGATGGTGAGATTGAAGATGGGAT
TAAAGAGAAGAAGAAGAACAAGAAGGAACCGAAAGTGGAGGTAGCTAAGGAGGAGAAGAC
TGATGGTGAGATCGAAGATGGAGTGAAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGACCAAGTCGAA
ATCTGCCGAGGCTGAGACTTTGGGTGATGAGGAGAGAGTTTCCAAGAAGAGAAAAAGGTC
AGAGCCTGAAGAAGAGACAAAAGAACAGACAGAGGATGATGATGATGATGAGGACTCTAA
ACGTAGGAAGAAGGCAGGAGAAGAAGAAGATATGGATGTTCAAGAAACCCCTGTTAAGCA
AACCGATGTCCAGGAGAACGGTAACGTTGAAACAAAATCAACTAATAAGAAGTCTGGAAA
GGGGCTTTCCGACTCAAAAGAGCCGAAGAAACCGTTTCAGAGAGTGAACGTTGAGGAAGT
TGTGTTCACTGACGATAGGCTTAAAGACAACTCTTATTGGGCGAAGGGTGGTGCTGATTC
GGGCTATGGTGCTAAAGCTCAAGAGGTTTTAGGGCAAGTCAGGAAGGGGTTTCCGACATG
AGAAGACGAAGAAGAAAAGAGGAAGCTACAGAGGAGGAGAGATCGATCTTCAATCACATT
CAGTTAAGTTTGAGTACTCAGACGATGAATGATGATCATTTTATGAACACTTACTTATTC
TCATTGTTTCCTTTGCTTCTCTTTTTTGATTTATCATCTTTCTCATTTTGTTTCGCTTAT
TTCAATATGTAAAACTATTCTTGTTTTGTCTGTGTTAATGGTCCCATCTGGAACTTGCGA
GAAGAAGATTCTGTTTCAGTTCG


BQ
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AF RR4BU65TF U 1
AF RR4BU65JQ C 383
BS 1 523 RR4BU65TF
BS 524 1163 RR4BU65JQ

RD RR4BU65TF 523 0 0
GATCATGGGGAAAGAGAGCAAAGCCTTGAGCTTGAAATCGGAGCAGAAGGCTCTCCTTCT
CCGTTCGATAGCTCAGTACTTGGACCGATGTGGGTTTTCTAAATGCTTCAAGAAACTCCT
CTCCGAAGCCGAAATCGAGAAGAAGGAATTGGATAGTGAGTTGCCGGATCTAGAGGAAGT
TTACCGCGTGTTTTTGAACAAGAGCAGTCTAGAAGCTGTGGAGGGGAAAGATGAATCAGG
GGATGAAGTGGAGAAGAATGCATCTGATGATCAAAAGAAAGAAGCTGCGGAGGAAGTAAA
GAAGGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGGTTAAAGAGACTGATGGTGAGATTGAAGATGGGAT
TAAAGAGAAGAAGAAGAACAAGAAGGAACCGAAAGTGGAGGTAGCTAAGGAGGAGAAGAC
TGATGGTGAGATCGAAGATGGAGTGAAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGACCAAGTCGAA
ATCTGCCGAGGCTGAGACTTTGGGTGATGAGGAGAGAGTTTCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR4BU65JQ 781 0 0
GAAGG
ACCGAAAGTGGAGGTAGCTAAGGAGGAGAAGACTGATGGTGAGATCGAAGATGGAGTGAA
AGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGACCAAGTCGAAATCTGCCGAGGCTGAGACTTTGGGTGA
TGAGGAGAGAGTTTCCAAGAAGAGAAAAAGGTCAGAGCCTGAAGAAGAGACAAAAGAACA
GACAGAGGATGATGATGATGATGAGGACTCTAAACGTAGGAAGAAGGCAGGAGAAGAAGA
AGATATGGATGTTCAAGAAACCCCTGTTAAGCAAACCGATGTCCAGGAGAACGGTAACGT
TGAAACAAAATCAACTAATAAGAAGTCTGGAAAGGGGCTTTCCGACTCAAAAGAGCCGAA
GAAACCGTTTCAGAGAGTGAACGTTGAGGAAGTTGTGTTCACTGACGATAGGCTTAAAGA
CAACTCTTATTGGGCGAAGGGTGGTGCTGATTCGGGCTATGGTGCTAAAGCTCAAGAGGT
TTTAGGGCAAGTCAGGAAGGGGTTTCCGACATGAGAAGACGAAGAAGAAAAGAGGAAGCT
ACAGAGGAGGAGAGATCGATCTTCAATCACATTCAGTTAAGTTTGAGTACTCAGACGATG
AATGATGATCATTTTATGAACACTTACTTATTCTCATTGTTTCCTTTGCTTCTCTTTTTT
GATTTATCATCTTTCTCATTTTGTTTCGCTTATTTCAATATGTAAAACTATTCTTGTTTT
GTCTGTGTTAATGGTCCCATCTGGAACTTGCGAGAAGAAGATTCTGTTTCAGTTCG

QA 6 781 6 781
DS 



AS 1 2

CO CL8206Contig1 600 2 2 U
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ATCGACTCAACATTCTCTTGATTTTCGCAAGTTTGATCTCTCGTTACTTTGACATCATTT
TAGGTTTCTGAACAGACGGTAGTCCATGGCAAAGCATCACCCTGATCTGATCATGTGCCG
GAAACAGCCAGGCATTGCTATCGGACGGCTGTGTGAGAAATGCGACGGGAAATGCGTGGT
TTGCGACTCTTACGTGCGTCCGTGCACTCTGTTGCGTATTTGTGACGAATGCAACTACGG
GTCGTTCCAAGGCCGGTGCACTATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTACTACTG
CAAAGAGTGTACGCAGCAGGAGAAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAACCTTGG
GAGTGCTAAGACGGATCTCTTCTATGAACGCAAGAAATATGGATTCAAAAAACGATGATC
AATGTATTGGGGTTTCCCGATTACTGGATTTCTTATGCTACTATGTCTGTTGCATAAAAC
TAATATGTATTCATACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTAGACTTGAGTTGTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G368JQ C 1
AF RR4G368TF U 51
BS 1 50 RR4G368JQ
BS 51 600 RR4G368TF

RD RR4G368JQ 600 0 0
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GAAACAGCCAGGCATTGCTATCGGACGGCTGTGTGAGAAATGCGACGGGAAATGCGTGGT
TTGCGACTCTTACGTGCGTCCGTGCACTCTGTTGCGTATTTGTGACGAATGCAACTACGG
GTCGTTCCAAGGCCGGTGCACTATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTACTACTG
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GAGTGCTAAGACGGATCTCTTCTATGAACGCAAGAAATATGGATTCAAAAAACGATGATC
AATGTATTGGGGTTTCCCGATTACTGGATTTCTTATGCTACTATGTCTGTTGCATAAAAC
TAATATGTATTCATACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTAGACTTGAGTTGTCTTT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4G368TF 550 0 0
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CTTACTACTGCAAAGAGTGTACGCAGCAGGAGAAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTG
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AACGATGATCAATGTATTGGGGTTTCCCGATTACTGGATTTCTTATGCTACTATGTCTGT
TGCATAAAACTAATATGTATTCATACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTAGACTTG
AGTTGTCTTT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL8207Contig1 707 2 2 U
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GAGTGAATGTGATACACACTTAAACTCAATCTCCATAACAGTGTGACTAAACCGGATGTA
TATAAGTTTACAAGGAAGAGAAAAGTTGTTACAATTAGGGTTTGACATTTCTCTTTGAAC
CATTGTCATCATCGTTATCAGAACTCCGGTCGTCACCATCATCATCATCGTCGTCAGAGG
GAGGAGAAGGATCGAGACGAGCAGCGTCTATAGCCCACTGTATCAGCTTCTCCACTTCAT
CATCTTCTCCTAATTCACCAGCCTCATCTCCGATTTCACTCGGACGAAGAACTGACGGCG
GAACAGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGGAAGAGTAGTCTTCAGAGAGGCGAATCTGA
GCATGAGATCGTCCGGCGTTTTCAACACCCTTCGATTTCCGCGGAAAAATCGGCCGCCGT
TTCTGATCCTTCGTCTCCTTCTTCTTCTGCTGCTGATGCAAAGGTTTAGATCTGAGGGCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BT66TF C 1
AF RR4BT66JQ U 13
BS 1 12 RR4BT66TF
BS 13 707 RR4BT66JQ

RD RR4BT66TF 707 0 0
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GAGTGAATGTGATACACACTTAAACTCAATCTCCATAACAGTGTGACTAAACCGGATGTA
TATAAGTTTACAAGGAAGAGAAAAGTTGTTACAATTAGGGTTTGACATTTCTCTTTGAAC
CATTGTCATCATCGTTATCAGAACTCCGGTCGTCACCATCATCATCATCGTCGTCAGAGG
GAGGAGAAGGATCGAGACGAGCAGCGTCTATAGCCCACTGTATCAGCTTCTCCACTTCAT
CATCTTCTCCTAATTCACCAGCCTCATCTCCGATTTCACTCGGACGAAGAACTGACGGCG
GAACAGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGGAAGAGTAGTCTTCAGAGAGGCGAATCTGA
GCATGAGATCGTCCGGCGTTTTCAACACCCTTCGATTTCCGCGGAGAAATCGGCCGCCGT
TTCTGATCCTTCGTCTCCTTCTTCTTCTGCTGCTGATGCAAAGGTTTAGATCTGAGGGCG
AGGAATCTAGAGTGAAGATCCGGATCGAGGTAATCAGGTTTGGAGCGAGAGGTATGAGAA
TTAACGGAGAGCTTGAGAATCATCTCGTCTTGAGCGGCTTGAAGCAACTGTTCGACTTCA
TCGTCTTCATCCTTGCCGCCTCTCCTCATCTTTCTTCTTCGATCCCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4BT66JQ 695 0 0
AACCAGATGAAAAAAATTGAATTAACTTGATTGCAAACCGAAGGATTAGAGTGAATGTGA
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AGGAAGAGAAAAGTTGTTACAATTAGGGTTTGACATTTCTCTTTGAACCATTGTCATCAT
CGTTATCAGAACTCCGGTCGTCACCATCATCATCATCGTCGTCAGAGGGAGGAGAAGGAT
CGAGACGAGCAGCGTCTATAGCCCACTGTATCAGCTTCTCCACTTCATCATCTTCTCCTA
ATTCACCAGCCTCATCTCCGATTTCACTCGGACGAAGAACTGACGGCGGAACAGAGGAGG
AAGACGAGGAGGAGGAGGGAAGAGTAGTCTTCAGAGAGGCGAATCTGAGCATGAGATCGT
CCGGCGTTTTCAACACCCTTCGATTTCCGCGGAAAAATCGGCCGCCGTTTCTGATCCTTC
GTCTCCTTCTTCTTCTGCTGCTGATGCAAAGGTTTAGATCTGAGGGCGAGGAATCTAGAG
TGAAGATCCGGATCGAGGTAATCAGGTTTGGAGCGAGAGGTATGAGAATTAACGGAGAGC
TTGAGAATCATCTCGTCTTGAGCGGCTTGAAGCAACTGTTCGACTTCATCGTCTTCATCC
TTGCCGCCTCTCCTCATCTTTCTTCTTCGATCCCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL8208Contig1 906 2 6 U
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TAAACCGGCCGTTCCGGTTAAGGAGAAGAAGAGCTCTGCTCCAGCTTCCAAGGCACAAGT
TGTGGGTTGGCCACCGATTAGATCATTCAGGAAGAACACAATGGCTTCTTCTCAGTCTCA
GAAACAAGATGGTTGTGATAATAATAACAACACAGAGACTGAAGGTTGTGAAACTAAGTC
TGGACCTGAGCCTTGCTTGTATGTTAAAGTGAGCATGGAAGGTGCTCCTTACTTGAGGAA
AATCGATCTCAAGACTTACAAGAGCTACGTTGAACTCTCTTCTGCTCTTGAGAAGATGTT
CAGCTGCTTCACTATTGGTCAGTTTGGGTCTCATGGAGGTTGTGGTCGAGATGGGTTAAA
CGAGAGTCGCTTAACTGATCTCTTGCGTGGTTCTGAGTATGTTGTTACCTATGAAGACAA
AGACAGTGACTGGATGCTGGTCGGTGATGTCCCTTGGGAAATGTTTATATGCTCCTGTAA
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ATGCAGAAGCCGGAACTAGTAAATGCCGCCCTTTTATGATACGTGATATGATAAAATGAT
TTGGAAGAATGTTATTAAGAAATGTAATAGCCCATTTTGTTTTTCTAAGTATTCTTGTGT
GTGTTGTGTGCTAAGAGTGATGTTTGATCCTTCTTAAAACAGCCTCTACTACTAATAAGG
CCCATTCTGTCTCTAATCCATCAAATGGGTGGTTTTGTGTATGTGTGTGTTTTTTTTTTG
CTAGGTAAGACTTTCATAACTCATATGTATAAAAAGTTTGTCAGTGTGTAAAAGCAGACC
CCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW13TF U 1
AF RR4BW13JQ C 91
BS 1 703 RR4BW13TF
BS 704 704 RR4BW13JQ
BS 705 782 RR4BW13TF
BS 783 783 RR4BW13JQ
BS 784 795 RR4BW13TF
BS 796 906 RR4BW13JQ

RD RR4BW13TF 797 0 0
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GAAACAAGATGGTTGTGATAATAATAACAACACAGAGACTGAAGGTTGTGAAACTAAGTC
TGGACCTGAGCCTTGCTTGTATGTTAAAGTGAGCATGGAAGGTGCTCCTTACTTGAGGAA
AATCGATCTCAAGACTTACAAGAGCTACGTTGAACTCTCTTCTGCTCTTGAGAAGATGTT
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CGAGAGTCGCTTAACTGATCTCTTGCGTGGTTCTGAGTATGTTGTTACCTATGAAGACAA
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TTGGAAGAATGTTATTAAGAAATGTAATAGCCCATTTTGTTTT*CTAAGTATTCTTGTGT
GTGTTGTGTGCTAAGAGTGATGTTTGATCCTTCTTAAAACAGCCTCTACTACTAATAAGG
CC*ATTCTGTCTCTA
TC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4BW13JQ 816 0 0
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GAAGAACACAATGGCTTCTTCTCAGTCTCAGAAACAAGATGGTTGTGATAATAATAACAA
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GAGCATGGAAGGTGCTCCTTACTTGAGGAAAATCGATCTCAAGACTTACAAGAGCTACGT
TGAACTCTCTTCTGCTCTTGAGAAGATGTTCAGCTGCTTCACTATTGGTCAGTTTGGGTC
TCATGGAGGTTGTGGTCGAGATGGGTTAAACGAGAGTCGCTTAACTGATCTCTTGCGTGG
TTCTGAGTATGTTGTTACCTATGAAGACAAAGACAGTGACTGGATGCTGGTCGGTGATGT
CCCTTGGGAAATGTTTATATGCTCCTGTAAGAAGCTGAGGATCATGAAGAGCTCTGAGGC
TATAGGCTTAGCTCCAAGGGTGATGGAGAAATGCAGAAGCCGGAACTAGTAAATGCCGCC
CTTTTATGATACGTGATATGATAAAATGATTTGGAAGAATGTTATTAAGAAATGTAATAG
CCCATTTTGTTTTTCTAAGTATTCTTGTGTGTGTTGTGTGCTAAGAGTGATGTTTGATCC
TTCTTAAAACAGCCTCTACTACTAATAAGGCCCATTCTGTCTCTAATCCATCAAATGGGT
GGTTTTGTGTATGTGTGTGTTTTTTTTTTGCTAGGTAAGACTTTCATAACTCATATGTAT
AAAAAGTTTGTCAGTGTGTAAAAGCAGACCCCTTTT

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL8209Contig1 864 2 13 U
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TTGATGGTGCATAGTAAGTACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FU42JQ U 76
AF RR4CX73JQ U 1
BS 1 132 RR4CX73JQ
BS 133 133 RR4FU42JQ
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RD RR4FU42JQ 605 0 0
G
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ATATCAAAAAAAATATTTAAA*TTTTATAAGTTGTCAACGCACCAAACGTTTACCGCGAG
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ATTCAGAGCCTCAAGCAATGAAGCATCATCAGTGAAAACGGAGCTAAGATGAGAAGAACT
TTTTTTT*AGAGACACTTGGCTTCAATCTCTTCAAGAGTGAGACCCTTCGTTTCAGGCAC
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TCCTGCTCCAAACAGCTCCTTTAAAGGTGAGAAAGCGAACGTCATAAGCGCGTTTGTGCC
GAAATTTACAAGTACTGCTATGCTGATTCCCCTACCTCTTAATTTTAAGGGGAATATCTC
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GAAC

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR4CX73JQ 864 0 0
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GACAAGAAAAAAAATACACAAAAGAATAATGCAATAGAACAAAAATAGATGGGTGGCTTT
TTGCATTATAGA*AACATAATTAGAAAAATATTTAAAATTTTATAAGTTGTCAACGCACC
AAACGTTTACCGCGAGCTGCACTCACCAATTCCGCGGTAAAAATGGCTACGCCCACTTGT
GGTTGCTGCGTTTGCCATTCAGAGCCTCAAGCAATGAAGCATCATCAGTGAAAACGGAGC
TAAGATGAGAAGAACTTTTTTTTTAGAGACACTTGGCTTCAATCTCTTCAAGAGTGAGAC
CCTTCGTTTCAGGCACAATGAAGTATATGAAGAAGAGAGACACTATACATATCACTCCAA
ATCCAAAGAACAGCACTCCTGCTCCAAACAGCTCCTTTAAAGGTGAGAAAGCGAACGTCA
CAAGCGCGTTTGTGCCGAAATTTACAAGTACTGCTATGCTGATTCCTCTACCTCTTAATT
TTAAGGGGAATATCTCTGAGATCATCAGCCAACCAATAGGGCCAAAGGATAACTGATAGC
AGCCCACATATAGTAGCAATGCAACCACAGCAACAGCCGGTACAGTGTTGTAAAAGATGT
AGTATGACCCCAGGAGGAACAAAGAGACCACCATGCCACTAACACCACCAAAAAGTAAAG
GCCTTCTTCCAAGTTTGTCAATCACTATAACAGCAACTCCAGTCATGACCAACTTCAATA
GACCGAGTAGATTGAGATCCGAGTTGCATCAGTTGCAGCCGAAAGCAGCAGTCTGTAGTA
TTGATGGTGCATAGTAAGTACACT

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

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AAATCAGAAAGTGGTCTCACATACAACTTTCACTCTACCAACGTTCTTCCACCGTCCACA
AAACGTCCGCGAGTATCTCAGCACCTTGACTCAGACGCTCAATACGCGTCTACGTTTAAA
CGGGGGTCCGGCGCGTTTGGTCCACCATCATCATTGATAAACGCTGAACTCATATCTCAT
ATCCAAAACCAACAACAGTTGGAGATTGATCAGTTCGTAGCTCAGCAAACAGAGAAGCTT
AGAATAGAGATTGAAGCTCGCCAGCGAAATCAAACGCGGATGCTAGCGTCTGCCGTTCAA
AACGCGATGGCCAAGAAGTTAAAAGAGAAAGACGACGAAATCATACGGATGAGGAACCTT
AACTTCGTTTTACAAGAGCGGGTCAAAAGTCTTTACGTTGAAAATCATATATGGCGAGAT
ATAGCTCAAACCAACGAAGCACAAGCTAACAATCTTCGAACAAACCTTGACCAAGTTCTT
GCTCAAATCAAAACGTTACCAACCGCTGTAGAAAACGACGTGGAGTCGAGCTACGGAAGT
TGCGCTGAAGGTGGTGAAGCTATTGCAGCGGTTAGCGGCGGTTGCAAGCGGTGCGGTGAG
AGAGAAGCGAGTGTGTTGGTATTACCTTGTCGTCATTTGTGTTTGTGTACGGTTTGTGGT
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AACATGTCTTTTTAACCTTTTTTTATTTTTGGTGCAATTAAATTTGTACTTTTTCTCTAG
AAACTTTATTTAATTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CX12TF U 1
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CTCTAGAAACTTTATTTAATTCTTTT

QA 1 686 1 686
DS 



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BQ
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GATTTTATCG

QA 1 550 1 550
DS 



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AAAAAAGGAA


BQ
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AF RR4FU39JQ C 1
AF RR4FU39TF U 1
BS 1 550 RR4FU39TF

RD RR4FU39JQ 550 0 0
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ATCTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTTTTTCTTATT
GTTTATAGATCTCAAATTTCTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGTTATAA
AAAAAAGGAA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4FU39TF 550 0 0
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CAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGTGTGATTACCAATCTCGCATC
CTCTTCCTCGTGAACGAACTCTCTCGCCTCTCTTCCTCCGATTTGGCCTCGCCCTAGATA
TATAGACACATACGTATGTATGGTATGTGTAAGGATAGATTCTTAGACTGATATGCATTT
ATCTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTTTTTCTTATT
GTTTATAGATCTCAAATTTCTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGTTATAA
AAAAAAGGAA

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

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ACACTTTTAAACCC


BQ
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AF RR4F970JQ C 1
AF RR4F970TF U 1
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ACACTTTTAAACCC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4F970TF 554 0 0
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TTCTGCCAAGAGAATCCTGAGACCGACGAGTGTCGAATCTACGAAGACCAATAAGCAATA
ATTAAGATGTTGCTCTAAAATAAAATAAAATAAAAAAGAAGATCTATGAAACAACAAAAA
TACTTGTCTAAGTTTCATTCAACCACAAGAATGTTACAAGATGAATTTGAAGCCTTGACC
ACACTTTTAAACCC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL8214Contig1 969 2 4 U
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TATGTTAACTCTTTCTTTTTTCTTTGTCAAAGAGAGTTGTTCAAACGGTTGCATAACTCA
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TTTTCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ41TF U 1
AF RR4AZ41JQ C 176
BS 1 805 RR4AZ41TF
BS 806 806 RR4AZ41JQ
BS 807 851 RR4AZ41TF
BS 852 969 RR4AZ41JQ

RD RR4AZ41TF 851 0 0
GGGTGCCATTGTGTTTTCTCTTTTGGATATCATCCAAGAACCCGTGAGGAAGCATCATCT
CAAACCCAGTCAAGAAAAAAGACAAAGGATAAAGATTATCTGAAAAACGTTTTTGAGAGA
GAAAGAGAGAAAGATTAAGAAGATGTTGGAAGGAAAAGCAATGGTGGAAGATTCAGACAT
GCCAGTAAAAATGCAGGTACAAGCCATGGCTTTGGCTTCTCAAGCTCTTGATCTCTTTGA
TGTCGTTTACTGTAAATCCATTGCTGGCCACATCAAGAAGGAGTTTGATGAGAGATATGG
GAGTGGATGGCAATGTGTGGTGGGATCAAATTTTGGATGTTTCTTCACACATTCTAAAGG
GACATTCATCTATTTTCAATTGGAGACACTTAAGTTCCTAGTCTTCAAAGGCTCTTGTAC
TCCTTAATAAAACAAACCCTAAGCCAATGTTAAATCAAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT
GGCTTACGGCCGGGGTTTGTTCAGAAGTCTCTTGAACGCAAAGAGGATTATTGGCCTTTC
TGTTGCGGCTACAAGCAGAAAGACAGTTTCAGCACCGAAGGGGTTTCTTGCGGTGTATGT
TGGTGAAGACCAGGTCCATAAGAAGAGATATCTGGTGCCAGTTTCATACTTAAACCAGCC
TTCTTTTCAAGCTCTTTTGAGTAAATCCGAGGAAGTGTTTGGGTATGATCATCCAATGGG
TGGATTAACGATCCCTTGTCCTGAAGATACCTTCATTAACGTAACTTCCAAGCTTCAGTG
CTGAGGTTCCATAAGAAAAGAAAAA*CTAAAATTAGTTAGAGATAGAATCAATCAATGTA
TATGTTAACTC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4AZ41JQ 794 0 0
GACATGCCAGTAAAAATGCAGGTACAAGCCATGGCTTTGGCTTCTCAAGCTCTTGATCTC
TTTGATGTCGTTTACTGTAAATCCATTGCTGGCCACATCAAGAAGGAGTTTGATGAGAGA
TATGGGAGTGGATGGCAATGTGTGGTGGGATCAAATTTTGGATGTTTCTTCACACATTCT
AAAGGGACATTCATCTATTTTCAATTGGAGACACTTAAGTTCCTAGTCTTCAAAGGCTCT
TGTACTCCTTAATAAAACAAACCCTAAGCCAATGTTAAATCAAAGCAGTGGTATCAACGC
AGAGTGGCTTACGGCCGGGGTTTGTTCAGAAGTCTCTTGAACGCAAAGAGGATTATTGGC
CTTTCTGTTGCGGCTACAAGCAGAAAGACAGTTTCAGCACCGAAGGGGTTTCTTGCGGTG
TATGTTGGTGAAGACCAGGTCCATAAGAAGAGATATCTGGTGCCAGTTTCATACTTAAAC
CAGCCTTCTTTTCAAGCTCTTTTGAGTAAATCCGAGGAAGTGTTTGGGTATGATCATCCA
ATGGGTGGATTAACGATCCCTTGTCCTGAAGATACCTTCATTAACGTAACTTCCAAGCTT
CAGTGCTGAGGTTCCATAAGAAAAGAAAAAACTAAAATTAGTTAGAGATAGAATCAATCA
ATGTATATGTTAACTCTTTCTTTTTTCTTTGTCAAAGAGAGTTGTTCAAACGGTTGCATA
ACTCAAATGTTTATGCCATATTTCTATTTAAGGACAATGGCTTCTATTATACAAATTGAA
GGAATTTTTCTGAG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL8215Contig1 685 2 11 U
GGAGACAAATTCAACTGTACAAACACAGAGAGAGCGAGATCTTCTATATCTCCTTCTCCT
TGAACAAGCCTCACTCACGAACCTCGTGATCACCGTGAACAAGCTGCCGCAGAAGCCATG
GTGTTTGATTCCGAGAAGCAATCGATCGTTTCTCTTGGACAGGTTGGTGATTCATCTTCA
GGTGGGATTAGCTCGGTCAAAGAACCTCTGATTAAGGAGAAACACCACAGCCCAGAAGAC
TACTCTGTTCTTGCAGCCATTCCCTCGTTCCTCTTTCCAGCTCTTGGAGCTTTGCTTTTT
GGTTACGAGATTGGAGCCACATCTTGTGCAATCATTTCTATTAAGTCTCCTACGCTAAGT
GGGATATCATGGTACAACTTGTCTCCAGTGGATGTCGGTATAATAACTAGTGGCTCCCTG
TACGGTGCCTTAATTGGATCCATTGTGGCATTTACTATTGCTGACACAATAGGAAGAAGA
AAGGAGCTGATCTTGGCTGCATTTTGTTATCTAGTTGGAGCCATTGTGAATTCACTAGCA
CCTGTCTTCTCCGTCCTGATAATTGGACGCCTTATGTATGGCATTGGGATTGGACTGACA
ATGCACGCAGCTCCAATGTACATTGCGGAGACTTCACCAAGTCAGATACGTGGAAGGATG
ATATCACTAAAAGAGTTCTCACCGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CX73TF U 16
AF RR4FU42TF U 1
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BS 271 314 RR4FU42TF
BS 315 315 RR4CX73TF
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BS 419 685 RR4FU42TF

RD RR4CX73TF 636 0 0
G
GTACAAACACAGAGGGAGCGAGATCTTCTATATCTCCTTCTCCTTGAACAAGCCTCACTC
ACGAACCTCGTGATCACCGTGAACAAGCTGTCGTAGCAGCCATGGTGTTTGATTCCGAGA
AGCAATCGATCGTTTCTCTTGGACAGGTTGGTGATTCATCTTCAGGTGGGATTAGCTCGG
TCAAAGAACCTCTGATTAAGGAGAAACACCACTGCCCAGAAGACTACTCTGTTCTTGCAG
CCATTCCCTCGTTCCTCTTTCCAGCTCTTGGAGCTTTGCTTTTTGGTTACGAGATTGGAG
CCACATCTTGTGCAATCATTTCTATTAAGTCTCCTACGTTAAGTGGGATATCATGGTACA
ACTTGTCTCCAGTGGATGTCGGTATCATTACTAGTGGCTCTCTGTACGGTGCCTTAATTG
GATCCATTGTGGCATTTACTATTGCTGACACAATAGGAAGAAGAAAGGAGCTGATCTTGG
CTGCATTTTGTTATCTAGTTGGAGCCATTGTGACTTCACTAGCACCTGTCTTTTCTGTCC
TGATAATTGGACGCCTTATGTATGGCATTGGGATTGGACTGACA*TGCACGCAGCTCCGA
TGTACATTGCG*AGACTTCACCA*GTCAGATACGT

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR4FU42TF 685 0 0
GGAGACAAATTCAACTGTACAAACACAGAGAGAGCGAGATCTTCTATATCTCCTTCTCCT
TGAACAAGCCTCACTCACGAACCTCGTGATCACCGTGAACAAGCTGCCGCAGAAGCCATG
GTGTTTGATTCCGAGAAGCAATCGATCGTTTCTCTTGGACAGGTTGGTGATTCATCTTCA
GGTGGGATTAGCTCGGTCAAAGAACCTCTGATTAAGGAGAAACACCACAGCCCAGAAGAC
TACTCTGTTCTTGCAGCCATTCCCTCGTTTCTCTTTCCAGCTCTTGGAGCTTTGCTTTTT
GGTTACGAGATTGGTGCTACTTCTTGTGCAATCATTTCTATTAAGTCTCCTACGCTAAGT
GGGATATCATGGTACAACTTGTCTCCAGTGGATGTCGGTATAATAACTAGTGGCTCCTTG
TACGGTGCCTTAATTGGATCCATTGTGGCATTTACTATTGCTGACACAATAGGAAGAAGA
AAGGAGCTGATCTTGGCTGCATTTTGTTATCTAGTTGGAGCCATTGTGAATTCACTAGCA
CCTGTCTTCTCCGTCCTGATAATTGGACGCCTTATGTATGGCATTGGGATTGGACTGACA
ATGCACGCAGCTCCAATGTACATTGCGGAGACTTCACCAAGTCAGATACGTGGAAGGATG
ATATCACTAAAAGAGTTCTCACCGT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL8216Contig1 562 2 2 U
GGGAGAGAGAGAGAGGCGGGATGCAGGATCTCCAATCTCCTAACATACGATCTTACAAAT
CGTATGAAGGAGATAGGAACCTCCAACTAGTTGATCCTGCCGATTTAAAACCGGTTAGAG
GAATCTATGTTGTTAGAGAATCAAAGAATAATCGATCTCCCATGACATCAGATCTATGGC
GTAAAATTTCATACGAAGACATGCCCGTTAAATCCAGAAGACCTCCTTCTCATTCAAAAT
CGTTAAAAGGATGGTGGAACGATCCTGAGATAAAGAGAAAGAGACGAGTGGCGAAATACA
AGCTTTATTCTACTGAGGGAAAGGTGAAGAAATCTTTGAAAAAGAGTTACAAATGGATTA
AGATCCAATGCGCTAAGATTATTCATGGAATATAGCTTTCTGATGTGTTTTATTGCTTAG
TAGTCTGTTTTTTTTAAACAATAAATATCGTGTTTGTTTAATTTATTTGATTTTTTTGTT
AGTTGTGGTGTATCTCTATGACGACATTATATTTGATATGACTTGCAAATCCAATACATA
AAATGAATATATTTTTAATTCG


BQ
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AF RR4CT61JQ C 1
AF RR4CT61TF U 32
BS 1 31 RR4CT61JQ
BS 32 562 RR4CT61TF

RD RR4CT61JQ 562 0 0
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CGTATGAAGGAGATAGGAACCTCCAACTAGTTGATCCTGCCGATTTAAAACCGGTTAGAG
GAATCTATGTTGTTAGAGAATCAAAGAATAATCGATCTCCCATGACATCAGATCTATGGC
GTAAAATTTCATACGAAGACATGCCCGTTAAATCCAGAAGACCTCCTTTTCATTCAAAAT
CGTTAAAAGGATGGTGGAACGATCCTGAGATAAAGAGAAAGAGACGAGTGGCGAAATACA
AGCTTTATTCTACTGAGGGAAAGGTGAAGAAATCTTTGAAAAAGAGTTACAAATGGATTA
AGATCCAATGCGCTAAGATTATTCATGGAATATAGCTTTTTGATGTGTTTTATTGCTTAG
TAGTCTGTTTTTTTTAAACAATAAATATCGTGTTTGTTTAATTTATTTGATTTTTTTGTT
AGTTGTGGTGTATCTCTATGACGACATTATATTTGATATGACTTGCAAATCCAATACATA
AAATGAATATATTTTTAATTCG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4CT61TF 531 0 0
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TGATCCTGCCGATTTAAAACCGGTTAGAGGAATCTATGTTGTTAGAGAATCAAAGAATAA
TCGATCTCCCATGACATCAGATCTATGGCGTAAAATTTCATACGAAGACATGCCCGTTAA
ATCCAGAAGACCTCCTTCTCATTCAAAATCGTTAAAAGGATGGTGGAACGATCCTGAGAT
AAAGAGAAAGAGACGAGTGGCGAAATACAAGCTTTATTCTACTGAGGGAAAGGTGAAGAA
ATCTTTGAAAAAGAGTTACAAATGGATTAAGATCCAATGCGCTAAGATTATTCATGGAAT
ATAGCTTTCTGATGTGTTTTATTGCTTAGTAGTCTGTTTTTTTTAAACAATAAATATCGT
GTTTGTTTAATTTATTTGATTTTTTTGTTAGTTGTGGTGTATCTCTATGACGACATTATA
TTTGATATGACTTGCAAATCCAATACATAAAATGAATATATTTTTAATTCG

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL8217Contig1 887 2 2 U
AGGGGATCACTGAAACGGTCCCTGTTATGGAATCTTCTGTTATATCCCTTATTAATTCAA
TCTACCACGCTGTCTTCAATGCGATATATTTTCTTTAGCGAGGCTGTGTACCTGCGATTA
TAAAAAGTCCGGTCGAGGATCTCCCACAATTGATTTTAGATTGCTGCAATTCTGGGAAGT
GCGTCCCTTGATATGCTTTTACTTGATTCAAAGGCGACTTTTATGCCAGCTATCTTAAGT
GCTAACCGGGTTCCAACCTTATCTTCAAGCGCCGGCGAGAAAGAAATAGAGTTCGAGTCG
GAAGATCATCAAACGAGGAGTTCCGACAAGGTTCAGCTGTCAGGGAGGAAGCGGCTGGTT
TTAGAGGTCGCAACCAACGTGAGTTCGAAGGAGCCAAGAAAATCTATAAACAAGGTGTAG
ATTTCAAAAGACTTTTCGTTGTGCTGCGGTAGATGGGGGTTGGTTCCTTACCAGGAAGGT
AATGATATTCCAATTGAAGATCTGATTTTCGTTTGATACTGATATCAACCAGATGGATTT
GGACGGTTGGTTGGAAAACTATGATTCTTCTGAGAGATGTTGAGTTGAGTCCACCAAAGT
CTACGATCAGCATGCCCAAGACTGAAGAACAATGAGATTACTTCAGATATGCATGTCCAG
TTCCATGATTTATGTTCTGATCGTTTCTCTGAAGATTGTTGGACGTCTCTTCCGTTTCTT
GGATATGAGCATTACTAACAAGGAAAGTGAATTCATATGAATTCTATTTCTTCTTGACGA
AAAATGTATAAGTTCGATAGCCTTTCACTATATCAAATACACGTCCTCATTTATGTTGTT
ATCATAAATTATTTTCGTTCATCAAACTATAGGTAAAGTAAAAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AS33TF U 1
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BS 1 849 RR4AS33TF
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QA 1 849 1 849
DS 

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ATCTATAAACAAGGTGTAGATTTCAAAAGACTTTTCGTTGTGCTGCGGTAGATGGGG*TT
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ATATCAACCAGATGGATTTGGACGGTTGGTTGGAAAACTATGATTTTTTTGAGAGATGTT
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CGTCCTCATTTATGTTGTTATCATAAATTATTTTCGTTCATCAAACTATAGGTAAAGTAA
AAGCTG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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CATTGTTTAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F015TF U 1
AF RR4F015JQ C 227
BS 1 638 RR4F015TF
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BS 653 672 RR4F015TF

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DS 

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TACTTGTTGTTGTCAAACAAAGTTACTTGGAACTTCTTTCAGACTTGTTTAAACATAAGA
AATGAATATTGAATCATTGTTTAGTG

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL8219Contig1 769 2 2 U
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TGATACACTGGCTTATGTTACTGCTTTCTATTCGGGTCCAGATATTGCTATCATCAATAA
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ACAGCAAAACCAAATACATAACACGAACGAACCATCCACACAGATCACA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DP48JQ U 1
AF RR4E422JQ U 1
BS 1 553 RR4DP48JQ
BS 554 769 RR4E422JQ

RD RR4DP48JQ 553 0 0
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TGGTGCCTTAAATCATTGAGAAAGGGACTTCTCTTGTAATCTTGCCTATCAAATGAATTC
AGAAGTCGCTTAGGCTTCTCCGCAAACTTTGCAACTGTACAGGAGCCTTTGATTTTTCCA
AAGAAGCTACGTGAATTAAGAAGATGAACTATGGTGGACTCGTTCACTTCTCCATCTGTC
ACATTCCCATGATCCTGCTGTAAATTTTCTCACATATAACAAAATAACCACAATAAGGGG
TAGGAACCTCTGA

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4E422JQ 769 0 0
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AATATGTTTTTTAAGTTCTCGGTCAAGAAATGGAAACAAATATAACTGTTGAAACTAATT
TATACCATTATCCTTGTAAGACCACCAGCAACATTCTTCAACTTGAAACTGCATATTCAG
ACGTCCTTTCAGATCCTATGGAGAGCGCATACGTAATTGGTTGATCTTCCAACACATAAG
CTCAGCAAACACTTATATGCAATGACCTTCACCTCTCTTGTTTTCAAAATCCTTCAACCT
TGGTGCCTTAAATCATTGAGAAAGGGACTTCTCTTGTAATCTTGCCTATCAAATGAATTC
AGAAGTCGCTTAGGCTTCTCCGCAAACTTTGCAACTGTACAGGAGCCTTTGATTTTTCCA
AAGAAGCTACGTGAATTAAGAAGATGAACTATGGTGGACTCGTTCACTTCTCCATCTGTC
ACATTCCCATGATCCTGCTGTAAATTTTCTCACATATAACAAAATAACCACAATAAGGGG
TAGGAACCTCTGAGTTCCTGGAGAAAGAGGGGATAAAGGAGAGACTGCAACTCAGTCATG
TGATACACTGGCTTATGTTACTGCTTTCTATTCGGGTCCAGATATTGCTATCATCAATAA
CAGAAGAGTGTAAGAACTTATCAATCATAACATTGCATTCTCATCTTCACCACCACTTGA
ACAGCAAAACCAAATACATAACACGAACGAACCATCCACACAGATCACA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL8220Contig1 936 2 2 U
GCAAAACTACTTGATCTTATCTGAGCTGAGAAAAAAGGATTTAGGGTTTCGATATGTTCC
GATCCTCACCGTGTGAGCAACCCTGTATACTTCCTTTTTGGAGTGTATGGCTGGCGGCTC
CGGTGACGGAAAAGATCTTGATGCGTTATCCTTAATTTTACCCTTTTTGTTTTCAGCGAT
GAAGACTGCTTGCTGCCTGAGCTTCGCGCTGTGATGGCTTTTGCGAGCTTTAACACTCCC
AAAATTATTTATGTTTTCGAAAACTTAGGTTTTGATTCTTTTTCTAGGTTTTTTGTTTTT
AGACTGAGATTGAAAAATGCTTTTTTTTTGTTTTCAAAAGTTTTGTTCTTTAACATTACG
CCTAATGCCTCTGTTTCTAGTTTGATTAAGTTCTGAAGAGAAACAAAGTATCTGAAGATT
CAGTCTTCTTGTTATAGGTAATAAACATAATGTTAACTTACGATAGATCTTTCTAAGATT
CATAGAAGAACCTAATAGAATTGGGTCATGTTGGATTCCATGGAGAAGATGAGAAGGTTA
TATTTTGAACAGAAGCTGAGCTTTTCACATTTCTTGCTTCTTCTCCTAATTTTGTTATTA
TTTTGTTGCAATTCCTACTAGTCGGCTCTGATTCCATAGCTGTGCAACTTTTTCGAGAGA
TCTTGGTGCCAGTTGCATCGTCTCAGGCACTGTCAACGGCTGCCCCAATGGTATTTGAGC
AAACATGGCAAGATGGGGTTTGAGCAGTTTGAGTCACTTCTGTCTAAACACTCAACTTGA
GGACACACCAGCCAGATAGGAGCTTCTTGCAAACCTCCGCATCTCTGTTGTGTCATTGAA
GCTGGTTCAAATCTCTGTTTTCCACATCTAGCAACATGTCTAGGTGGTTCATGATTGTAA
TCAAATCTTAATAAATAAATTAAATTGTTGAATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AQ44TF U 1
AF RR4AQ44JQ C 126
BS 1 682 RR4AQ44TF
BS 683 936 RR4AQ44JQ

RD RR4AQ44TF 682 0 0
GCAAAACTACTTGATCTTATCTGAGCTGAGAAAAAAGGATTTAGGGTTTCGATATGTTCC
GATCCTCACCGTGTGAGCAACCCTGTATACTTCCTTTTTGGAGTGTATGGCTGGCGGCTC
CGGTGACGGAAAAGATCTTGATGCGTTATCCTTAATTTTACCCTTTTTGTTTTCAGCGAT
GAAGACTGCTTGCTGCCTGAGCTTCGCGCTGTGATGGCTTTTGCGAGCTTTAACACTCCC
AAAATTATTTATGTTTTCGAAAACTTAGGTTTTGATTCTTTTTCTAGGTTTTTTGTTTTT
AGACTGAGATTGAAAAATGCTTTTTTTTTGTTTTCAAAAGTTTTGTTCTTTAACATTACG
CCTAATGCCTCTGTTTCTAGTTTGATTAAGTTCTGAAGAGAAACAAAGTATCTGAAGATT
CAGTCTTCTTGTTATAGGTAATAAACATAATGTTAACTTACGATAGATCTTTCTAAGATT
CATAGAAGAACCTAATAGAATTGGGTCATGTTGGATTCCATGGAGAAGATGAGAAGGTTA
TATTTTGAACAGAAGCTGAGCTTTTCACATTTCTTGCTTCTTCTCCTAATTTTGTTATTA
TTTTGTTGCAATTCCTACTAGTCGGCTCTGATTCCATAGCTGTGCAACTTTTTCGAGAGA
TCTTGGTGCCAGTTGCATCGTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4AQ44JQ 811 0 0
ACGGAAAAGATCTTGATGCGTTATCCTTAATTTTACCCTTTTTGTTTTCAGCGATGAAGA
CTGCTTGCTGCCTGAGCTTCGCGCTGTGATGGCTTTTGCGAGCTTTAACACTCCCAAAAT
TATTTATGTTTTCGAAAACTTAGGTTTTGATTCTTTTTCTAGGTTTTTTGTTTTTAGACT
GAGATTGAAAAATGCTTTTTTTTTGTTTTCAAAAGTTTTGTTCTTTAACATTACGCCTAA
TGCCTCTGTTTCTAGTTTGATTAAGTTCTGAAGAGAAACAAAGTATCTGAAGATTCAGTC
TTCTTGTTATAGGTAATAAACATAATGTTAACTTACGATAGATCTTTTTAAGATTCATAG
AAGAACCTAATAGAATTGGGTCATGTTGGATTCCATGGAGAAGATGAGAAGGTTATATTT
TGAACAGAAGCTGAGCTTTTCACATTTCTTGCTTCTTCTCCTAATTTTGTTATTATTTTG
TTGCAATTCCTACTAGTCGGCTCTGATTCCATAGCTGTGCAACTTTTTCGAGAGATCTTG
GTGCCAGTTGCATCGTCTCAGGCACTGTCAACGGCTGCCCCAATGGTATTTGAGCAAACA
TGGCAAGATGGGGTTTGAGCAGTTTGAGTCACTTCTGTCTAAACACTCAACTTGAGGACA
CACCAGCCAGATAGGAGCTTCTTGCAAACCTCCGCATCTCTGTTGTGTCATTGAAGCTGG
TTCAAATCTCTGTTTTCCACATCTAGCAACATGTCTAGGTGGTTCATGATTGTAATCAAA
TCTTAATAAATAAATTAAATTGTTGAATAAG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL8221Contig1 897 2 2 U
GGCTGTTCGAGATGGATCTACTGAACTACGAAACTGTTTCCGCCGCCGTCAACGGCTGCG
CCGGCGTTTTCCACCTCGCATCTCCCTGTATCGTCGACGAAGTCCAAGATCCTCAGAAGC
AACTACTTGATCCAGCGGTTAAGGGGACATTAAATGTACTGACGGCGGCGAAAGAAGCCG
GCGTGAAGAGGGTTGTGGTGACGTCTTCCATATCGGCGATAACTCCGAGCCCCAACTGGC
CTGCTGATAAGATCAAGAACGAGGAGTGTTGGGCTGATCAAGACTTCTGCAAGCAAAATG
GATTGAGGTATCCACTTTCCAAGACGCTTGCTGAGAAGGCAGCTTGGGAGTTTGCAGAGG
AGAAGGGATTGGATGTGGTTGTGGTGAATCCAGGAACCGTCATGGGTCCCGTCATCCCTC
CATCGATCAACGCTAGCATGCTCATGCTTCTACGCCTCCTTCAGGGGTGTACAGAGACGT
ACGAGAACTTCTTCATGGGCTCGGTGCATTTCAAGGATGTGGCATTAGCTCATATTCTTG
TTTACGAGAACCCATCTGCAAAAGGAAGACACTTGTGCGTTGAGGCTATCTCTCACTACG
GTGATTTTGTTGCCAAAGTAGCTGAACTCTATCCTAATTACAATGTCCCCAAGTTGCCGA
GAGAGACACAACCGGGTTTACTCCGAGCTAAGAACGCAGCGAAGAAGCTGATGGAATTGG
GGTTAGAGTTCAGTTCCATGGAGGATATCATCAAGGACGGTGTGGAGAGTCTTAAAAGCA
AAGGATTTGTCTCTTAAAACTCATTTGCGTTATTTAGCAGTGAGCTAATTATGGTGGCAG
CAGAATCATGTCATTGTTATATGATACTTCGCAATTTGAATAAATAAGCTACCCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AN01TF U 1
AF RR4AN01JQ C 225
BS 1 750 RR4AN01TF
BS 751 897 RR4AN01JQ

RD RR4AN01TF 750 0 0
GGCTGTTCGAGATGGATCTACTGAACTACGAAACTGTTTCCGCCGCCGTCAACGGCTGCG
CCGGCGTTTTCCACCTCGCATCTCCCTGTATCGTCGACGAAGTCCAAGATCCTCAGAAGC
AACTACTTGATCCAGCGGTTAAGGGGACATTAAATGTACTGACGGCGGCGAAAGAAGCCG
GCGTGAAGAGGGTTGTGGTGACGTCTTCCATATCGGCGATAACTCCGAGCCCCAACTGGC
CTGCTGATAAGATCAAGAACGAGGAGTGTTGGGCTGATCAAGACTTCTGCAAGCAAAATG
GATTGAGGTATCCACTTTCCAAGACGCTTGCTGAGAAGGCAGCTTGGGAGTTTGCAGAGG
AGAAGGGATTGGATGTGGTTGTGGTGAATCCAGGAACCGTCATGGGTCCCGTCATCCCTC
CATCGATCAACGCTAGCATGCTCATGCTTCTACGCCTCCTTCAGGGGTGTACAGAGACGT
ACGAGAACTTCTTCATGGGCTCGGTGCATTTCAAGGATGTGGCATTAGCTCATATTCTTG
TTTACGAGAACCCATCTGCAAAAGGAAGACACTTGTGCGTTGAGGCTATCTCTCACTACG
GTGATTTTGTTGCCAAAGTAGCTGAACTCTATCCTAATTACAATGTCCCCAAGTTGCCGA
GAGAGACACAACCGGGTTTACTCCGAGCTAAGAACGCAGCGAAGAAGCTGATGGAATTGG
GGTTAGAGTTCAGTTCCATGGAGGATATCA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4AN01JQ 673 0 0
CCGAGCCCCAACTGGCCTGCTGATAAGATCAAGAACGAGGAGTGTTGGGCTGATCAAGAC
TTCTGCAAGCAAAATGGATTGAGGTATCCACTTTCCAAGACGCTTGCTGAGAAGGCAGCT
TGGGAGTTTGCAGAGGAGAAGGGATTGGATGTGGTTGTGGTGAATCCAGGAACCGTCATG
GGTCCCGTCATCCCTCCATCGATCAACGCTAGCATGCTCATGCTTCTACGCCTCCTTCAG
GGGTGTACAGAGACGTACGAGAACTTCTTCATGGGCTCGGTGCATTTCAAGGATGTGGCA
TTAGCTCATATTCTTGTTTACGAGAACCCATCTGCAAAAGGAAGACACTTGTGCGTTGAG
GCTATCTCTCACTACGGTGATTTTGTTGCCAAAGTAGCTGAACTCTATCCTAATTACAAT
GTCCCCAAGTTGCCGAGAGAGACACAACCGGGTTTACTCCGAGCTAAGAACGCAGCGAAG
AAGCTGATGGAATTGGGGTTAGAGTTCAGTTCCATGGAGGATATCATCAAGGACGGTGTG
GAGAGTCTTAAAAGCAAAGGATTTGTCTCTTAAAACTCATTTGCGTTATTTAGCAGTGAG
CTAATTATGGTGGCAGCAGAATCATGTCATTGTTATATGATACTTCGCAATTTGAATAAA
TAAGCTACCCCTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL8222Contig1 796 2 2 U
GGCTATCGGCTAGGCTTGACGAGTTCTTGCAAAGGTTGGTCGATGAGAAACGGGAAGCTA
AAGAGAAGGGCAACACGATGGTCGATCACTTGCTTTCTCTGCAAGAAACGCAGCCTGGTT
ACTTCACTGATCGCATCATCAAAGGAAACATGCTTTCCTTGATACTAGCGGGGACTGATA
CATCAGCGGTGACACTAGAATGGGCATTGTCGAACTTGTTAAACCATCCGGAGGTATTGA
AAAAGGCAAGAGATGAGATCGATAGAAAAGTCGGTTTAGACAGGCTTATAGACGAATCAG
ACATCTCGAATCTGCCTTATCTCCAAAACATTGTCTCTGAAACGTTACGCATGTACCCTG
CCGTCCCCATGCTGCTTCCTCACGTGGCCTCGGAAGATTGTAAGGTAGGTGGATACGATA
TGCCTAGTGGGACGATACTGTTGACCAACGCGTGGGCTATACACAGAGATCCTCAGCTAT
GGGAAGATCCCACGAGTTTCAAGCCAGAGAGGTTCGAGAAAGAAGGAGAATCTCAGAAGA
TAATGGCGTTTGGGTTGGGAAGACGGGCGTGTCCTGGTTCCGGACTGGCTCGTCGGCTAG
TAAACCTGACTCTTGGGTCATTGATTCAGTGTTTGGAATGGGAGAGGCTTGGAGAAGAGA
AAGTGGATATGAGTGAAAGGAAAGGAGGAACTATGCCTAAAGCCAAGCCTCTTGAAGCCA
TGTGCAGAGCACGTGCCTCTGTTGGTAACATCTTCCACGAGGGAGCTTGATTTTAGGACT
TTCTGCAAGGATTCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY27TF U 1
AF RR4FY27JQ C 4
BS 1 677 RR4FY27TF
BS 678 796 RR4FY27JQ

RD RR4FY27TF 677 0 0
GGCTATCGGCTAGGCTTGACGAGTTCTTGCAAAGGTTGGTCGATGAGAAACGGGAAGCTA
AAGAGAAGGGCAACACGATGGTCGATCACTTGCTTTCTCTGCAAGAAACGCAGCCTGGTT
ACTTCACTGATCGCATCATCAAAGGAAACATGCTTTCCTTGATACTAGCGGGGACTGATA
CATCAGCGGTGACACTAGAATGGGCATTGTCGAACTTGTTAAACCATCCGGAGGTATTGA
AAAAGGCAAGAGATGAGATCGATAGAAAAGTCGGTTTAGACAGGCTTATAGACGAATCAG
ACATCTCGAATCTGCCTTATCTCCAAAACATTGTCTCTGAAACGTTACGCATGTACCCTG
CCGTCCCCATGCTGCTTCCTCACGTGGCCTCGGAAGATTGTAAGGTAGGTGGATACGATA
TGCCTAGTGGGACGATACTGTTGACCAACGCGTGGGCTATACACAGAGATCCTCAGCTAT
GGGAAGATCCCACGAGTTTCAAGCCAGAGAGGTTCGAGAAAGAAGGAGAATCTCAGAAGA
TAATGGCGTTTGGGTTGGGAAGACGGGCGTGTCCTGGTTCCGGACTGGCTCGTCGGCTAG
TAAACCTGACTCTTGGGTCATTGATTCAGTGTTTGGAATGGGAGAGGCTTGGAGAAGAGA
AAGTGGATATGAGTGAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4FY27JQ 793 0 0
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AGAAGGGCAACACGATGGTCGATCACTTGCTTTCTCTGCAAGAAACGCAGCCTGGTTACT
TCACTGATCGCATCATCAAAGGAAACATGCTTTCCTTGATACTAGCGGGGACTGATACAT
CAGCGGTGACACTAGAATGGGCATTGTCGAACTTGTTAAACCATCCGGAGGTATTGAAAA
AGGCAAGAGATGAGATCGATAGAAAAGTCGGTTTAGACAGGCTTATAGACGAATCAGACA
TCTCGAATCTGCCTTATCTCCAAAACATTGTTTCTGAAACGTTACGCATGTACCCTGCCG
TCCCCATGCTGCTTCCTCACGTGGCCTCGGAAGATTGTAAGGTAGGTGGATACGATATGC
CTAGTGGGACGATACTGTTGACCAACGCGTGGGCTATACACAGAGATCCTCAGCTATGGG
AAGATCCCACGAGTTTCAAGCCAGAGAGGTTCGAGAAAGAAGGAGAATCTCAGAAGATAA
TGGCGTTTGGGTTGGGAAGACGGGCGTGTCCTGGTTCCGGACTGGCTCGTCGGCTAGTAA
ACCTGACTCTTGGGTCATTGATTCAGTGTTTGGAATGGGAGAGGCTTGGAGAAGAGAAAG
TGGATATGAGTGAAAGGAAAGGAGGAACTATGCCTAAAGCCAAGCCTCTTGAAGCCATGT
GCAGAGCACGTGCCTCTGTTGGTAACATCTTCCACGAGGGAGCTTGATTTTAGGACTTTC
TGCAAGGATTCCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL8223Contig1 1137 2 2 U
GAAATGCACTTCCTCTATCCTCTCGAGCTCTCTCTCACTCTCCTCCATGGCGACCACCGC
ATCCACCTCTCTCCCACGTAACTACTCCATTCCTCCTCCTCCTCCCTCTTTCACCCGCGC
CACGTCATTTCCCAAATCGTTCCCGCTCTATACCCGCCCCAACCGCCGGTTCGCTCTCAC
TTACCGTTTAAACCAAAACTCTAAACAGAGAACCGGAGGGATCGGGATGCGAGGCGACGG
AGGTCTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCGTCCGTTGCTTCCCCGGGAAGAA
ACTGGGTGCCAGTGGTGCCGTTATCCGCGCTTCCGAAAGGTGAACGGAGAGTGATTATCC
AAGACGACGAGGCGATATTGCTGCTTTGGTATAAGAACGATGTCTTCGCGATTGAGAACC
GTTCTCCCGCCGAAGGAGCCTACAGCGAGGGACTTCTCAACGCTAAGCTCACTCAGGATG
GTTGCATTGTGTGCCCGGCAACGGATAGTACATTTGATCTCAGAACCGGAGAGATTAAGG
AATGGTACCCAAAGAACCCGGTTCTCAGAGTCTTGACACCTGCACTGAGAAAGCTGTTTG
TGTACCCTGTCAAATTTGATGAAGAAAACATCTACATCAGCATTAGAGGCAACGGGAAGA
ACGAGGCTGCTGCTGAAATCGTCTTCAGTGGAAAAGCTCAGCCTGGGCTCACAGCAACGA
ATGTCAATGTAGACGAGGTGAGGATGGTGGTGGACGAGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCT
CGAGGAAGAACGAAGTGATAAATGGCAAAGCAGCAGTGATAGGATTCTTACTGCTGTTAG
ATTTTGAGCTATTGACAGGTAAAGGTCTATTGAAGGGGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTT
ACTCTTCTTCTGATGCTTTCAAGTAGAGATCAATATATATCTCTTTGGTCTGGTTTTTGC
TTTACCTCCCTTGTGCAATTTGTGGAAGCATTATTCAGTAAATGGAGAAACAAACAACAT
ACTGTTAAGTAACAAAATTCACACCATGTCTTAGTATATGAATCACATTTTATAGAGATG
TCTTGCCTTTGCTTTGTTTGTGTGTTTACCTCTTAATATAAGATATTCTTTGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CC36TF U 1
AF RR4CC36JQ C 445
BS 1 537 RR4CC36TF
BS 538 1137 RR4CC36JQ

RD RR4CC36TF 537 0 0
GAAATGCACTTCCTCTATCCTCTCGAGCTCTCTCTCACTCTCCTCCATGGCGACCACCGC
ATCCACCTCTCTCCCACGTAACTACTCCATTCCTCCTCCTCCTCCCTCTTTCACCCGCGC
CACGTCATTTCCCAAATCGTTCCCGCTCTATACCCGCCCCAACCGCCGGTTCGCTCTCAC
TTACCGTTTAAACCAAAACTCTAAACAGAGAACCGGAGGGATCGGGATGCGAGGCGACGG
AGGTCTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCGTCCGTTGCTTCCCCGGGAAGAA
ACTGGGTGCCAGTGGTGCCGTTATCCGCGCTTCCGAAAGGTGAACGGAGAGTGATTATCC
AAGACGACGAGGCGATATTGCTGCTTTGGTATAAGAACGATGTCTTCGCGATTGAGAACC
GTTCTCCCGCCGAAGGAGCCTACAGCGAGGGACTTCTCAACGCTAAGCTCACTCAGGATG
GTTGCATTGTGTGCCCGGCAACGGATAGTACATTTGATCTCAGAACCGGAGAGATTA

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR4CC36JQ 693 0 0
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TCAGAGTCTTGACACCTGCACTGAGAAAGCTGTTTGTGTACCCTGTCAAATTTGATGAAG
AAAACATCTACATCAGCATTAGAGGCAACGGGAAGAACGAGGCTGCTGCTGAAATCGTCT
TCAGTGGAAAAGCTCAGCCTGGGCTCACAGCAACGAATGTCAATGTAGACGAGGTGAGGA
TGGTGGTGGACGAGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCTCGAGGAAGAACGAAGTGATAAATG
GCAAAGCAGCAGTGATAGGATTCTTACTGCTGTTAGATTTTGAGCTATTGACAGGTAAAG
GTCTATTGAAGGGGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTTACTCTTCTTCTGATGCTTTCAAGT
AGAGATCAATATATATCTCTTTGGTCTGGTTTTTGCTTTACCTCCCTTGTGCAATTTGTG
GAAGCATTATTCAGTAAATGGAGAAACAAACAACATACTGTTAAGTAACAAAATTCACAC
CATGTCTTAGTATATGAATCACATTTTATAGAGATGTCTTGCCTTTGCTTTGTTTGTGTG
TTTACCTCTTAATATAAGATATTCTTTGTTCTT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TAGAGCCTTGCCCTGAATCCGACTGCTCGCCTCTCCCAGTGTCTGCGAAGGTTCAAGGAG
CTTCTGAAAAATCACAGCGAAGCGAGGTAGCAACAATGTCAACTGGTTCGAGAAGCGGAA
TGGGAGCTGGTGGTGTGGTCGGGATCATCTTTGGACTTGCGTTTCCCATGGTGATGTGAA
CCATTCTAGTTCCATCCAACCTATTGTTTGAGCTGATATAATGATAGATTATATATCTAG
ACTTTGAGTTTAAATGTGTGTTTTTTTTTTCTTCACTTGTTCTTAAAGCTTGTATTTAGA
TTTCCATACGCTGTGGTTAATAGCAGAACGTATTGGATTGTTTGGCTACGGATCTCAGTT
ATATTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G011TF U 1
AF RR4G011JQ C 58
BS 1 610 RR4G011TF

RD RR4G011TF 610 0 0
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CTTCTGAAAAATCACAGCGAAGCGAGGTAGCAACAATGTCAACTGGTTCGAGAAGCGGAA
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ATATTTGATT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4G011JQ 553 0 0
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GAACCATTCTAGTTCCATCCAACCTATTGTTTGAGCTGATATAATGATAGATTATATATC
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GTTATATTTGATT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL8225Contig1 674 2 1 U
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ACGCCAACGGGTTTCTCATTTCAACAACAGCTTCGAGCGGCTTACTCAGAATCTTGGTTT
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TATATCTGCGGAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4E685JQ U 1
AF RR4EA33JQ U 1
BS 1 674 RR4E685JQ

RD RR4E685JQ 674 0 0
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TACTACTCCCGGTCTTAAGCGACAAGCCTCCAAATTTCATCATCTTCCCCTCTCCTGCAT
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CCTTGTCTGAACCGTGCTCCACGGATTTAGCATCTGTTCTAACCTCAGGCGTTGTGAAAG
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TCCCGTCAAACCTCGTGATCAGATATGAGTTATGTGCGTCGACATCTGGATACCCGGGAA
TATATCTGCGGAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4EA33JQ 670 0 0
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CCAAGAAAATTAGACTTCAGCTCTATATTCTCCTTCCATCTTCCTCTTCATCAACTGGAG
TATACCACTCTGGTCTTCTCTCGGAGTTACTCAGACTGTAATTCAGCATCAATTCTTCAT
TGCACAACGCTCTTGTAGCCACCAGAACAACCGTCTTCAGTACAGGAGCATCCAAACTGC
TACTACTCCCGGTCTTAAGCGACAAGCCTCCAAATTTCATCATCTTCCCCTCTCCTGCAT
TTCCGTAAGCTACATTTGGAATGTAAGCTCGCATCCCATTCTCTGACAAAGGGAAGTCAT
ACGGACAAACCATGACGTTAGGATCCATATCTTTGCCCGGGTGATTCAAGAAATGACCAA
ACGCCAACGGGTTTCTCATTTCAACAACAGCTTCGAGCGGCTTACTCAGAATCTTGGTTT
CCTTGTCTGAACCGTGCTCCACGGATTTAGCATCTGTTCTAACCTCAGGCGTTGTGAAAG
AGCCGTTCCATACTTGCCGTGATTCTCCTCCACGACCCCAAGGCTGAGCATTTATTACCA
TCCCGTCAAACCTCGTGATCAGATATGAGTTATGTGCGTCGACATCTGGATACCCGGGAA
TATATCTGCG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL8226Contig1 970 2 2 U
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ATCCAGGCTGCTGCGAGACGTTCTTTGCTTAAAGGAACCAACTTTAACTCCATTATCTCC
ATGCTTAAAGAGGTTATACCGCAGTTATCTTGTCCTATTGCATTGTTTACGTATTACAAC
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GGATGGTGCTACCATTGATTCTCAATAATATAACAATCATCTCCGAATAAAAATCAAGAG
TTTTACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BY23TF U 1
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QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FS89TF C 1
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BS 42 595 RR4FS89JQ

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TCCTTAATCTCCCC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C206JQ C 1
AF RR4C206TF U 1
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ATTTTTAATAGGAG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4C206TF 554 0 0
GGAAGAAAAAAGAATAGAGAGAAAAAAATGGACTTTCAGAGGATTCAAATGACACCATGG
GAGTATCTTCTATCTTCTCGAGCTCTTAATGGCTACCAAGTAACTCAAGAGAATCATATT
CGTTGGTCTCAGACTCCAGATTCTCACATTTTCTCTGTTGATCTTCCTGGTTTGAGGAAA
GAAGAAATAAAAGTGGAAATCGAAGATTCCATCTACTTAATCATACGCACGGAGACTACG
GAAAGATCCCCGGAACCACCGGTCAGGAGTTTCAAAAGGAAATTCCGGTTACCGGAATCG
ATAGATATAACCGGGATATCAGCTGGTTATGAAGACGGTGTGTTGACTGTGACTGTACCA
AAGGTGGTTTTGAGAAGGAGGAGTTTCTTTATTGATCCTTCTGATGTTCCTGAAAGTCTT
CAAGTTCTTGCAAGAGCTGCTTAAACAAAGCTACTCTTGTTTCTTTATTGATCCTTCTGA
TGTTACTGAAAGTCTTCCTTCTTGCAAGAGCTGCTTAATAAGTAGCTTTTGTTTCTTCCT
ATTTTTAATAGGAG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL8229Contig1 1408 2 2 U
ACAACACCAACAACAAGCCTTGTTGTTAAGCACGACAAGTTCTATGGTGAATCTCCTCGC
TGGTCTTGCTCAGTATGCTTTGGTGCTGTCCCAAGCTTTGAAGATTTCACCACCCATCTC
AAGTCTGTAGAACATGAATTTCGTGAGTGGGACAGGCATGCTAGAAAATACGACCTGGAT
CGTACTAACCGTAATAACTTGCCGTTTGGTCGATCACAGGAGTTGGACTTGCTGCTTACT
CAAGAGATGCTTAGATGTCAAGAGATGCTTAGTGAGTGCCGGCTCGGTGGCTTTAAGCCT
AAAGACAGACCTGTAACCTTAGAAAGAGTCGATCCAAGGGGAATGAACAAAACCGAGAAC
ATGACGACGCAGCAGCATGAGGAGAAAGAGGTGGAGAAAGCTTTTGTGCTATGGGACATG
GGCTACTGTCCAATTCCAGATGGTCACGATCCTCTTATGGTGGTTAGGAAAATACAAATG
GCGGTGGAAAAGTCAGGCCACGTCCGCCGCAATGGTGAGATCTCCATCACTGCCATCGGC
AGCAAACTAACAGAGATCCCTGGTGAAGACGTCATGAGGACACTCTCTTCGTTTGAAATC
TCTCTTAAACTTTCCCACCTCTATACACATGATTTGGACGAGTGGACCGATGCGAATCCT
CCTCCGAGCACTATGATGATCATAGATGATCATGAGCGAATCGGATGGATGGCTTCTCAA
CTTTCCGATCTTGAAGATGCTGGATACAGAATTCTTCTTGCATATCCTCCTCAGCGTGAC
CTAGCAGCCACCACACCCTTTCCACGTTCCTTTTCTAAACAGTGGGATTGGGATGCCTTA
GTCTTTGATGATGGACAGGAGACAACAACAACAACAACGAGCCTTGTTTTTAGTCAGGGC
AAGTACAATGATGAATATCCCTTTGCTTGCGAAGTATGCTTTGTTGCTGTCAAAAGCTTT
GAAGATTTCACCGCCCATCTCAATAGTGTAGAACATGAGTATGGTGAGTGGGACAGGTAT
GCTAGTAAAAACGGTGTGGATCGTACTATCCGTGAAAACTTGCCCTTGGGTCGATCAAGG
GAGATGGACGTGCTGCTTATCCAAGACATGGAATGGCGTCTTATGAAAAGGAAGGAGCAT
AGCCACGGCTTACGTAGTCCTCAAACCAGACTTGACCTCTTTTGAGTCCCAACTAATTTA
CTTAGCTATGAGTTTTGGTTTTACCTTGACTTGGGTTTTATTCTAAAGTATTGAAAGGAA
CATTTGAAGAAGGATAAGCTGGGAGATCAAGCGAGAAAAGGGTGTTTCGATTGTAAAATA
AATAAAACTACTTGGTACTGTGTTATCTCTTGTTTATCCTGATTGTTTTGTTTAAACATC
GCACTTCAGTCTTAAGTTTTTTATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C780TF U 1
AF RR4C780JQ C 621
BS 1 699 RR4C780TF
BS 700 1408 RR4C780JQ

RD RR4C780TF 699 0 0
ACAACACCAACAACAAGCCTTGTTGTTAAGCACGACAAGTTCTATGGTGAATCTCCTCGC
TGGTCTTGCTCAGTATGCTTTGGTGCTGTCCCAAGCTTTGAAGATTTCACCACCCATCTC
AAGTCTGTAGAACATGAATTTCGTGAGTGGGACAGGCATGCTAGAAAATACGACCTGGAT
CGTACTAACCGTAATAACTTGCCGTTTGGTCGATCACAGGAGTTGGACTTGCTGCTTACT
CAAGAGATGCTTAGATGTCAAGAGATGCTTAGTGAGTGCCGGCTCGGTGGCTTTAAGCCT
AAAGACAGACCTGTAACCTTAGAAAGAGTCGATCCAAGGGGAATGAACAAAACCGAGAAC
ATGACGACGCAGCAGCATGAGGAGAAAGAGGTGGAGAAAGCTTTTGTGCTATGGGACATG
GGCTACTGTCCAATTCCAGATGGTCACGATCCTCTTATGGTGGTTAGGAAAATACAAATG
GCGGTGGAAAAGTCAGGCCACGTCCGCCGCAATGGTGAGATCTCCATCACTGCCATCGGC
AGCAAACTAACAGAGATCCCTGGTGAAGACGTCATGAGGACACTCTCTTCGTTTGAAATC
TCTCTTAAACTTTCCCACCTCTATACACATGATTTGGACGAGTGGACCGATGCGAATCCT
CCTCCGAGCACTATGATGATCATAGATGATCATGAGCGA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4C780JQ 788 0 0
CTATACACATGATTTGGACGAGTGGACCGATGCGAATCCTCCTCCGAGCACTATGATGAT
CATAGATGATCATGAGCGAATCGGATGGATGGCTTCTCAACTTTCCGATCTTGAAGATGC
TGGATACAGAATTCTTCTTGCATATCCTCCTCAGCGTGACCTAGCAGCCACCACACCCTT
TCCACGTTCCTTTTCTAAACAGTGGGATTGGGATGCCTTAGTCTTTGATGATGGACAGGA
GACAACAACAACAACAACGAGCCTTGTTTTTAGTCAGGGCAAGTACAATGATGAATATCC
CTTTGCTTGCGAAGTATGCTTTGTTGCTGTCAAAAGCTTTGAAGATTTCACCGCCCATCT
CAATAGTGTAGAACATGAGTATGGTGAGTGGGACAGGTATGCTAGTAAAAACGGTGTGGA
TCGTACTATCCGTGAAAACTTGCCCTTGGGTCGATCAAGGGAGATGGACGTGCTGCTTAT
CCAAGACATGGAATGGCGTCTTATGAAAAGGAAGGAGCATAGCCACGGCTTACGTAGTCC
TCAAACCAGACTTGACCTCTTTTGAGTCCCAACTAATTTACTTAGCTATGAGTTTTGGTT
TTACCTTGACTTGGGTTTTATTCTAAAGTATTGAAAGGAACATTTGAAGAAGGATAAGCT
GGGAGATCAAGCGAGAAAAGGGTGTTTCGATTGTAAAATAAATAAAACTACTTGGTACTG
TGTTATCTCTTGTTTATCCTGATTGTTTTGTTTAAACATCGCACTTCAGTCTTAAGTTTT
TTATTTGC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL8230Contig1 834 2 6 U
GAAGAATGCGCTTCTTGAACGCTTAGATCAGGACAATGAGGCAAGTCTTCCAGGAAGGCA
AAAGGGTAGTGATGCATGGGAAATGCATAGTTTTTATCAACATTACAACGAGACATATAT
TCAGCCTTTGCTAGACGGTGCTGACAAAGCTGACCGTGCTCAACTTAAAAAGGCATATCA
AACGTATGCTGTTCTCTTTGAAGTTTTAAAGGCTGCTGATGTAGAAATGGATGATGAGGC
GAATCTGATGATTTTGGAAGCCCACACAAAGGTCAAAGAAAGAATTCAGATTCTATGTGC
CTTGGATGACGATGCCGACATTATTCAGGGATACCCATCTCAACAACCAAATGGAGTTAA
AGAATCCAAATTAAAAAGAGAAAGTGTTGATCAAACATCTATTCTTATCAACACTATAAG
AGAAGGAAATAAACAACTTCTAGAGCAACTGAAGAAGACACACGAACAAGGACAACAGTT
TCTGGATATTCAAAGTAAGACCTACGCACTCAAAGAAATTGGAGAAGAAAACAAAATATT
ATTGCTGGACTTGAGTTCTATACAAAATCCGCATATTCGTTCATTTATGGACGGTGAACA
ATCAAGGATTTTGCAAAAGCGTAATCCGTACGATTTTTTTTTTTTTTCTTGAGAACAATG
ATCAGTACCGATGTTAAGAATCTATCATTCGCTATATTTCGGTTTTGGCAATACTTTAAT
GATCTTGGTGCATCTAAAAATGATTTACCAGATGATTAATTTAATAGTCTTTGTTGTATT
TATCTTTAATTTTGCTACTCTATGTATTCTAAAATTTAAAGTTACTTGCGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BW54TF U 1
AF RR4BW54JQ C 107
BS 1 355 RR4BW54TF
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BS 364 364 RR4BW54JQ
BS 365 377 RR4BW54TF
BS 378 834 RR4BW54JQ

RD RR4BW54TF 377 0 0
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AAAGGGTAGTGATGCATGGGAAATGCATAGTTTTTATCAACATTACAACGAGACATATAT
TCAGCCTTTGCTAGACGGTGCTGACAAAGCTGACCGTGCTCAACTTAAAAAGGCATATCA
AACGTATGCTGTTCTCTTTGAAGTTTTAAAGGCTGCTGATGTAGAAATGGATGATGAGGC
GAATCTGATGATTTTGGAAGCCCACACAAAGGTCAAAGAAAGAATTCAGATTCTATGTGC
CTTGGATGACGATGCCGACATTATTCAGGGATACCCATCTCAACAACCAAATGGA*TTAA
AGA*TCCAAATTAAAAA

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR4BW54JQ 728 0 0
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AAAAAGGCATATCAAACGTATGCTGTTCTCTTTGAAGTTTTAAAGGCTGCTGATGTAGAA
ATGGATGATGAGGCGAATCTGATGATTTTGGAAGCCCACACAAAGGTCAAAGAAAGAATT
CAGATTCTATGTGCCTTGGATGACGATGCCGACATTATTCAGGGATACCCATCTCAACAA
CCAAATGGAGTTAAAGAATCCAAATTAAAAAGAGAAAGTGTTGATCAAACATCTATTCTT
ATCAACACTATAAGAGAAGGAAATAAACAACTTCTAGAGCAACTGAAGAAGACACACGAA
CAAGGACAACAGTTTCTGGATATTCAAAGTAAGACCTACGCACTCAAAGAAATTGGAGAA
GAAAACAAAATATTATTGCTGGACTTGAGTTCTATACAAAATCCGCATATTCGTTCATTT
ATGGACGGTGAACAATCAAGGATTTTGCAAAAGCGTAATCCGTACGATTTTTTTTTTTTT
TCTTGAGAACAATGATCAGTACCGATGTTAAGAATCTATCATTCGCTATATTTCGGTTTT
GGCAATACTTTAATGATCTTGGTGCATCTAAAAATGATTTACCAGATGATTAATTTAATA
GTCTTTGTTGTATTTATCTTTAATTTTGCTACTCTATGTATTCTAAAATTTAAAGTTACT
TGCGATTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8232Contig1 655 2 2 U
GTGAAGCAAAGAAATAACACAAGACTTACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTA
TGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTC
TCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGT
TCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACAGCTCCATATATGTATCATAAAGAACCAA
GCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATC
CGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCAACGCCAAGCAACATAACCCTCTTCATCAAAACA
GACAACAGTATCAAGACAACTCAAGGTGTACCCTCACAACTCACAGCAACAACAAGAGCA
GCATGATCACTAATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAGCAT
CTATCTACACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGTATTATTCATGGTTTTTGTGTGAT
TGATTCATATAATATATATAGATGCATAAGATTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATA
AGGATTCTTTCATAAGGAAGGTTTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G490TF U 1
AF RR4G490JQ C 482
BS 1 613 RR4G490TF
BS 614 655 RR4G490JQ

RD RR4G490TF 613 0 0
GTGAAGCAAAGAAATAACACAAGACTTACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTA
TGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTC
TCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGT
TCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACAGCTCCATATATGTATCATAAAGAACCAA
GCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATC
CGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCAACGCCAAGCAACATAACCCTCTTCATCAAAACA
GACAACAGTATCAAGACAACTCAAGGTGTACCCTCACAACTCACAGCAACAACAAGAGCA
GCATGATCACTAATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAGCAT
CTATCTACACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGTATTATTCATGGTTTTTGTGTGAT
TGATTCATATAATATATATAGATGCATAAGATTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATA
AGGATTCTTTCAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR4G490JQ 174 0 0
TTTT
TACACTTGATTAATTTTTAACAAATATTTTGTATTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATT
CATATAATATATATAGATGCATAAGATTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGAT
TTTTTCATAAGGAAGGTTTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTTTTGTTTT

QA 5 174 5 174
DS 



AS 1 2

CO CL8233Contig1 800 2 4 U
TAGGCAGTGTTAGAATGATATATGAAACAGAGGAGGCAAGATGGGTAAAGTTCGCCATGA
TTCAGGATCAGGCGATGATTTTGCAATAGACAAAAACTTTCACAAAGGCCCTTGGACATC
GGCTGAAGACCAACTTCTGATAGCTTATGTTGACAAGCATGGTGATGGTAACTGGAACCT
GTTCAGAAACACTCTGGCCTTTCTCGCTGCGGCAAAAGCTGCCGCCTCCGCTGGGTGAAT
CACCTTAGGCCTGATTTAAAGAAAGGCTCTTTTACCGACAAGGAAGAGCAGCGTGTCATC
GAGCTTCATGCTTCCATGGGTAACAAATGGGCACGAATGGCTGCTGAACTACCTGGTCGC
ACGGATCCAGATTCCCCGCTGCTTCATCAGTCCTCTCTACTTGACCATATCGAGATAACA
CCAGCCACTGCAAACACAGCAGGACACAACTCCAATGCTGAAACCGATTTGGTTCATTTT
CCTCCAACTTCCTCAAATGAGAGACGCACATCCTTTGAGAGCGGTGATTGGATAAGACAA
CTTCTTGGTGAGGATAGGGACTACACCAAGTAGAAGAGGATTCTCTCGATGGCATTATGC
ATAAACAGCTCTCTCTCACTTCTGATCTCTGACTCACTCTGGAGTAGATTAGTCTGTCTT
TACATTTGTCCGTACTGTGGCTACAAAAATAACGACCTGTTAGTTTCTTAGTCGCTTTTA
TAAGCAAGCTTTATGGCTGCACGAGATTATGATAAGGATTTTAAAGATTTTTGATCACGG
CTTGATGATCATGTCAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E490TF U 1
AF RR4E490JQ C 86
BS 1 578 RR4E490TF
BS 579 579 RR4E490JQ
BS 580 643 RR4E490TF
BS 644 800 RR4E490JQ

RD RR4E490TF 643 0 0
TAGGCAGTGTTAGAATGATATATGAAACAGAGGAGGCAAGATGGGTAAAGTTCGCCATGA
TTCAGGATCAGGCGATGATTTTGCAATAGACAAAAACTTTCACAAAGGCCCTTGGACATC
GGCTGAAGACCAACTTCTGATAGCTTATGTTGACAAGCATGGTGATGGTAACTGGAACCT
GTTCAGAAACACTCTGGCCTTTCTCGCTGCGGCAAAAGCTGCCGCCTCCGCTGGGTGAAT
CACCTTAGGCCTGATTTAAAGAAAGGCTCTTTTACCGACAAGGAAGAGCAGCGTGTCATC
GAGCTTCATGCTTCCATGGGTAACAAATGGGCACGAATGGCTGCTGAACTACCTGGTCGC
ACGGATCCAGATTCCCCGCTGCTTCATCAGTCCTCTCTACTTGACCATATCGAGATAACA
CCAGCCACTGCAAACACAGCAGGACACAACTCCAATGCTGAAACCGATTTGGTTCATTTT
CCTCCAACTTCCTCAAATGAGAGACGCACATCCTTTGAGAGCGGTGATTGGATAAGACAA
CTTCTTGGTGAGGATAGGGACTACACCAAGTAGAAGAG*ATTCTCTCGATGGCATTATGC
ATAAACAGCTCTCTCTCACTTCTGATCTCTGACTCACTCTGGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4E490JQ 715 0 0
ATAGACAAAAACTTTCACAAAGGCCCTTGGACATCGGCTGAAGACCAACTTCTGATAGCT
TATGTTGACAAGCATGGTGATGGTAACTGGAACCTGTTCAGAAACACTCTGGCCTTTCTC
GCTGCGGCAAAAGCTGCCGCCTCCGCTGGGTGAATCACCTTAGGCCTGATTTAAAGAAAG
GCTCTTTTACCGACAAGGAAGAGCAGCGTGTCATCGAGCTTCATGCTTCCATGGGTAACA
AATGGGCACGAATGGCTGCTGAACTACCTGGTCGCACGGATCCAGATTCCCCGCTGCTTC
ATCAGTCCTCTCTACTTGACCATATCGAGATAACACCAGCCACTGCAAACACAGCAGGAC
ACAACTCCAATGCTGAAACCGATTTGGTTCATTTTCCTCCAACTTCCTCAAATGAGAGAC
GCACATCCTTTGAGAGCGGTGATTGGATAAGACAACTTCTTGGTGAGGATAGGGACTACA
CCAAGTAGAAGAGGATTCTCTCGATGGCATTATGCATAAACAGCTCTCTCTCACTTCTGA
TCTCTGACTCACTCTGGAGTAGATTAGTCTGTCTTTACATTTGTCCGTACTGTGGCTACA
AAAATAACGACCTGTTAGTTTCTTAGTCGCTTTTATAAGCAAGCTTTATGGCTGCACGAG
ATTATGATAAGGATTTTAAAGATTTTTGATCACGGCTTGATGATCATGTCAAGCT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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TCTAAGTTTTCAGGTGTTACTTCGATAGCAATGGATGACAAAACCGGAAAAATGACGGTG
GTGGGAGAAGTTGATGTACCGAAACTCGTAAAGAAGCTAAGGAAGATATGTACCGCAGAT
ATCGTTTCGGTGGAAGTTGTTAAACCACCTGAGAAAAAGGAAGAGAAAAAGGAGCCGGAG
AAACCGAAACAACCCGAGGTTATTGCTCACCCAGTTACCTATTGGAACAACCAGTACCAA
TACCATCCTGCTTCGTATGCAAGTTCTTACTATCCACCAAGTGGGTATTCTAGAGTTGTG
GTGGAGGAACCAAGGCCTTGTGTGATTATGTAATTTTTCCTAGAATTATTTCATTAGTGT
TAATTATGTTTGCACTTAATTTTGATGGAAGAGTGTATTTTTGGGTATTATAATCAACAT
TTCCCGTATGAGCGC


BQ
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AF RR4DL80JQ C 1
AF RR4DL80TF U 1
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QA 1 615 1 615
DS 

RD RR4DL80TF 615 0 0
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TAATTATGTTTGCACTTAATTTTGATGGAAGAGTGTATTTTTGGGTATTATAATCAACAT
TTCCCGTATGAGCGC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL8235Contig1 552 2 1 U
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TTTATCTTGGTT


BQ
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AF RR4G545JQ C 1
AF RR4G545TF U 1
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QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4G545TF 552 0 0
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TACGCTGCAGGTGCTTCGGCTGCTACCTTGGGAATAGGTCCTAAATGGCTTTTTATTTCA
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TTTATCTTGGTT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL8236Contig1 949 2 2 U
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ATTTGTAAGGAGATTTTATGTTAATATGGAAATGAAATTTTTAGACTAG


BQ
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AF RR4GO62TF U 1
AF RR4GO62JQ C 148
BS 1 616 RR4GO62TF
BS 617 949 RR4GO62JQ

RD RR4GO62TF 616 0 0
TTGTTAACACTGTATCTTCATCCTCTCCTACCATTCATTCTCAGATCCTCCCTTCACTCA
AGCTCTCGCCCAAAAAGATTTCTTTTCATATACATGGAAGGGTCAACTTGCCTGGGGAAT
TTGTTGCTAGAGGCTTGCCGGTTCTAAACAAAGCTTCCTTGAAGAAGATGCATGTAAAGG
GCTCTCCTTTCTTGCTGGGCCAAAGCTTGTTGCTCATCTCTGCTGCTAACCCACAGTTGG
CAGCAGCAGCAGCAGAAACTATTATTAAGCCAGAACCGGTTTACGAAGTTGGAGAGTTGT
TTGAATTAAGTATTCAGCTTTCTTACTTGTTGTTACTACTTGGTTTGCTCGGGGTTGGTA
CTTCTATGTGATTCGTCAAGTACTTGTCCGCAGAGAGCTTGACCTCTCCGCCAAAGAACT
ACAGGAACAAGTTAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTAGGTGCAGT
GATGCTGAGACGGAAGTTCTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAA
ATGGGACGGTGATGACCAGGATCTTGCTCAGGTCTATAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGT
TCGAGAGGAGAAACTA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4GO62JQ 802 0 0
AACAAAGC
TCCTTGAAGAAGATGCATGTAAAGGGCTCTCCTTTCTTGCTGGGCCAAAGCTTGTTGCTC
ATCTCTGCTGCTAACCCACAGTTGGCAGCAGCAGCAGCAGAAACTATTATTAAGCCAGAA
CCGGTTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAATTAAGTATTCAGCTTTCTTACTTGTTGTTA
CTACTTGGTTTGCTCGGGGTTGGTACTTCTATGTGATTCGTCAAGTACTTGTCCGCAGAG
AGCTTGACCTCTCCGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTTAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAA
CAGAGCTCTTTGAGCTAGGTGCAGTGATGCTGAGACGGAAGTTCTATCCTGCAGCCAACA
AGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGGACGGTGATGACCAGGATCTTGCTCAGGTCT
ATAACGCTCTTGGAGTGAGTTATGTTCGAGAGGAGAAACTAGAAAAAGGAATCGCTCAGT
TCGAAATGGCTGTGAAACTGCAACCTGGTTATGTAACGGCTTGGAACAACCTTGGAGATG
CTTATGAGCAGAAAAAGAGCTTCCTTTGGCGTTGAAAGCGTTTGAAGAGGTCTTGTTGTT
TGATCCTAACAATAAGGTGGCTCGGCCTAGACGGGATGCGTTGAAGGATCGTGTTAAGCT
CTATAAAGACGTTGTGGCTGTTAAGTCCAAAAAACGGTGACCAACAATCGTTCTTCTCTC
TCCTTTGTTTTGTGTTTCTTGTGTAATTTGTAAGGAGATTTTATGTTAATATGGAAATGA
AATTTTTAGACTAG

QA 9 802 9 802
DS 



AS 1 2

CO CL8237Contig1 806 2 2 U
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ATTCTTAACCAATGTTTCAGGCGTTTATGCTATCGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCT
GGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTGGCTTGTGTTGAGTTTATAGCAGGCAAACACGG
CCATGTGGATTACGACAAGGTCCCTGGTGTTGTCTACACATATCCCGAAGTTGCCTCTGT
GGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTACCGAGTTGGGAAGTTCCC
GTTCATGGCGAATAGCAGAGCAAAGGCTATAGATACAGCAGAGGGAATGGTCAAGATTTT
GGCTGATAAAGAGACAGACAAGATCTTGGGAGTTCACATTATGTCCCCAAACGCAGGAGA
GTTGATCCACGAGGCGGTTCTAGCGATCAACTATGATGCTTCTAGTGAAGACATTGCTCG
AGTGTGTCACGCTCATCCCACCATGAGTGAGGCTATCAAGGAAGCTGCAATGGCTACCTA
CGACAAGCCCATTCACATGTAAGAAGAAGCTCCACAGGTAAAATCACGGTTTAGTTTTGG
TCCTGTTTTGGCCAAATCGAGAAGTTAAACCGGAGTTGTTTTGGTTATATTTGGTTTGGT
TTTATATTTTCGGTTTAAACCTTGATTTTCTTTTTTACTTTCCCGTTGATGTGGGATGAG
CTCAAAGAATATAACTTTACCACTCCTTTGTAATAATTTGAAATGCTCAAGTAACCATTT
TTAATTGAATAAACCGAATTCAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FX47TF U 1
AF RR4FX47JQ C 144
BS 1 695 RR4FX47TF
BS 696 806 RR4FX47JQ

RD RR4FX47TF 698 0 0
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ATTCTTAACCAATGTTTCAGGCGTTTATGCTATCGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCT
GGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTGGCTTGTGTTGAGTTTATAGCAGGCAAACACGG
CCATGTGGATTACGACAAGGTCCCTGGTGTTGTCTACACATATCCCGAAGTTGCCTCTGT
GGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTACCGAGTTGGGAAGTTCCC
GTTCATGGCGAATAGCAGAGCAAAGGCTATAGATACAGCAGAGGGAATGGTCAAGATTTT
GGCTGATAAAGAGACAGACAAGATCTTGGGAGTTCACATTATGTCCCCAAACGCAGGAGA
GTTGATCCACGAGGCGGTTCTAGCGATCAACTATGATGCTTCTAGTGAAGACATTGCTCG
AGTGTGTCACGCTCATCCCACCATGAGTGAGGCTATCAAGGAAGCTGCAATGGCTACCTA
CGACAAGCCCATTCACATGTAAGAAGAAGCTCCACAGGTAAAATCACGGTTTAGTTTTGG
TCCTGTTTTGGCCAAATCGAGAAGTTAAACCGGAGTTGTTTTGGTTATATTTGGTTTGGT
TTTATATTTTCGGTTTAAACCTTGATTTTCTTTTT
ACT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4FX47JQ 663 0 0
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CTGGTGTTGTCTACACATATCCCGAAGTTGCCTCTGTGGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGA
AGAAAGACGGTGTGAGCTACCGAGTTGGGAAGTTCCCGTTCATGGCGAATAGCAGAGCAA
AGGCTATAGATACAGCAGAGGGAATGGTCAAGATTTTGGCTGATAAAGAGACAGACAAGA
TCTTGGGAGTTCACATTATGTCCCCAAACGCAGGAGAGTTGATCCACGAGGCGGTTCTAG
CGATCAACTATGATGCTTCTAGTGAAGACATTGCTCGAGTGTGTCACGCTCATCCCACCA
TGAGTGAGGCTATCAAGGAAGCTGCAATGGCTACCTACGACAAGCCCATTCACATGTAAG
AAGAAGCTCCACAGGTAAAATCACGGTTTAGTTTTGGTCCTGTTTTGGCCAAATCGAGAA
GTTAAACCGGAGTTGTTTTGGTTATATTTGGTTTGGTTTTATATTTTCGGTTTAAACCTT
GATTTTCTTTTTTACTTTCCCGTTGATGTGGGATGAGCTCAAAGAATATAACTTTACCAC
TCCTTTGTAATAATTTGAAATGCTCAAGTAACCATTTTTAATTGAATAAACCGAATTCAG
TGG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL8238Contig1 907 2 4 U
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ATTCATGGGGAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACTAATCGAGAACAAAAGTAGTAGACAAGT
AACTTTTTCTAAACGACGCACTGGTCTCATCGAGAAGGCACGACAGCTTTCAGTTCTCTG
TGAATCATCCGTCGCTGTGCTCGTTGTCTCCGCCTCTGGAAAACTCTACAACTCCTCTTC
CGGTGACAACATGACCAACATCATCGATCGTTATGAAATACAACATGCTGGTGAACTTAG
AAGCTTGGATCTTGCGGAAAAAACTCGGATTTATCTTCCACACAATGAGTTACTCGAATC
AGTCAAAAGCAATCAAGAATCAAATGTCGACAATGTAAGTGTAGATTCTCTAATTTCTCT
GGAGGACCAGCTCGAGACTGCTCTGTGTTCAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAAAGAT
GGAGTTTGTGAAGATGCTTCAAGAAAAGGAGGAGTTGCTGAGACAAGAGAATCTGGTTTT
GGCTAGCCAGATAGGGAAGACGAAGGGAGGGAGAGAGAACAATTCACCGGAAAATAGCTC
CGGCATCAATCCTCCGGAGACTCTCCCGTTGCTCAAGTAACCACCATGATCCAACGGCCG
AGTTAACTGAAAGCCTGATTTGAAGTTAAAAAGCAGATGTGTATATTATAAAAAGCTGCA
TAACCTCAAAACCCTTTTTTTATCTTGCTCTAATGCGGAAGTTTAGGTGAAAAAAACGGA
GCTATATTCCTCTTGCTAAAAAAGGAATTGTAAAATTAAGATAGTATGGAACTTTGTTGT
ACCTTCGTAGACAAGATCGGAGCTTGTGTACTTGTGTTCTTGTCTGAAAGTACAGGTTTT
GGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ER10TF U 1
AF RR4ER10JQ C 154
BS 1 691 RR4ER10TF
BS 692 692 RR4ER10JQ
BS 693 710 RR4ER10TF
BS 711 907 RR4ER10JQ

RD RR4ER10TF 710 0 0
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ATTCATGGGGAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACTAATCGAGAACAAAAGTAGTAGACAAGT
AACTTTTTCTAAACGACGCACTGGTCTCATCGAGAAGGCACGACAGCTTTCAGTTCTCTG
TGAATCATCCGTCGCTGTGCTCGTTGTCTCCGCCTCTGGAAAACTCTACAACTCCTCTTC
CGGTGACAACATGACCAACATCATCGATCGTTATGAAATACAACATGCTGGTGAACTTAG
AAGCTTGGATCTTGCGGAAAAAACTCGGATTTATCTTCCACACAATGAGTTACTCGAATC
AGTCAAAAGCAATCAAGAATCAAATGTCGACAATGTAAGTGTAGATTCTCTAATTTCTCT
GGAGGACCAGCTCGAGACTGCTCTGTGTTCAACTAGAGCTAGGAAGACAGAACTAAAGAT
GGAGTTTGTGAAGATGCTTCAAGAAAAGGAGGAGTTGCTGAGACAAGAGAATCTGGTTTT
GGCTAGCCAGATAGGGAAGACGAAGGGAGGGAGAGAGAACAATTCACCGGAAAATAGCTC
CGGCATCAATCCTCCGGAGACTCTCCCGTTGCTCAAGTAACCACCATGATCCAACGGCCG
AGTTAACTGAAAGCCTGATTTGAAGTTAAAA*GCAGATGTGTATATTATA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4ER10JQ 754 0 0
GAAGGCACGACAGCTTTCAGTTCTCTGTGAATCATCCGTCGCTGTGCTCGTTGTCTCCGC
CTCTGGAAAACTCTACAACTCCTCTTCCGGTGACAACATGACCAACATCATCGATCGTTA
TGAAATACAACATGCTGGTGAACTTAGAAGCTTGGATCTTGCGGAAAAAACTCGGATTTA
TCTTCCACACAATGAGTTACTCGAATCAGTCAAAAGCAATCAAGAATCAAATGTCGACAA
TGTAAGTGTAGATTCTCTAATTTCTCTGGAGGACCAGCTCGAGACTGCTCTGTGTTCAAC
TAGAGCTAGGAAGACAGAACTAAAGATGGAGTTTGTGAAGATGCTTCAAGAAAAGGAGGA
GTTGCTGAGACAAGAGAATCTGGTTTTGGCTAGCCAGATAGGGAAGACGAAGGGAGGGAG
AGAGAACAATTCACCGGAAAATAGCTCCGGCATCAATCCTCCGGAGACTCTCCCGTTGCT
CAAGTAACCACCATGATCCAACGGCCGAGTTAACTGAAAGCCTGATTTGAAGTTAAAAAG
CAGATGTGTATATTATAAAAAGCTGCATAACCTCAAAACCCTTTTTTTATCTTGCTCTAA
TGCGGAAGTTTAGGTGAAAAAAACGGAGCTATATTCCTCTTGCTAAAAAAGGAATTGTAA
AATTAAGATAGTATGGAACTTTGTTGTACCTTCGTAGACAAGATCGGAGCTTGTGTACTT
GTGTTCTTGTCTGAAAGTACAGGTTTTGGATTTC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL8239Contig1 823 2 2 U
GGATTCTCGAACTGTTTGGAGATCATCCAGGCGAATACATGACGCAAGAGCTCAAGAAGC
ATCACAAGAGTCTTGCGAAAGCCAAGTCTGAGCAGATGTGGTGTGGCTTGTGCAAGAAGT
ACGATCACAATCAAGAAGACTGTTACCGTAGCGACACGAGTGTACAGTGCCATGTGTGTG
GAGCGAGGAGAGGAGGGGAGTGTGCGAGAGGTTGTACAGCGAAGAAGAACGGGAAGCCTG
AGCATTTGATGGTGGCTGTGACTACGGGTGATTTCACATACGGTGAAGATATGTGGATGG
TGTACTCCACTGCTTTCGACCACATGACTCCGTATTTGAAGGTTTTCAGCACTTTGGACA
GAACGTACAAAGCTCGTGTTGGAATGGCTAATGGGAACGTTGTTATGGCGGAAGGGAAAG
GAGATGTGAAGATTACTATGAAGGGTGTGAGGAAGTTGATCAAGAACGTGCTTTTCGTTC
CGGGGATTGATAGAAACGTGCTGAGTATTAGTAAGCTGACATCAGGTGGCGGTTCGGTGG
TGATAGGTGGTGGGGAATGCACTGTTAGAGATGAGAATGGGAAAGTGTTTGCTAACACGA
GGTTGGAAGAGAGAGGCATTGCTCTACGTTTTAAGGTGATTAGGTAATGTGTGACCAGGT
GATAATTCTACTTGAATAAAATTGGTAGTAGTTTGGTTTCAGTTTGGATTTGTCCGGTGT
TATAACCTAGGCCGCTTTAGTTTTCAGAAACTCTATTGTAATTCACTATGCAATGCTTCT
TTTGAGTTTTCATTATAATGAAAAGGAGACGAAATTTAGTCCC


BQ
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AF RR4BO84TF U 1
AF RR4BO84JQ C 147
BS 1 698 RR4BO84TF
BS 699 823 RR4BO84JQ

RD RR4BO84TF 698 0 0
GGATTCTCGAACTGTTTGGAGATCATCCAGGCGAATACATGACGCAAGAGCTCAAGAAGC
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ACGATCACAATCAAGAAGACTGTTACCGTAGCGACACGAGTGTACAGTGCCATGTGTGTG
GAGCGAGGAGAGGAGGGGAGTGTGCGAGAGGTTGTACAGCGAAGAAGAACGGGAAGCCTG
AGCATTTGATGGTGGCTGTGACTACGGGTGATTTCACATACGGTGAAGATATGTGGATGG
TGTACTCCACTGCTTTCGACCACATGACTCCGTATTTGAAGGTTTTCAGCACTTTGGACA
GAACGTACAAAGCTCGTGTTGGAATGGCTAATGGGAACGTTGTTATGGCGGAAGGGAAAG
GAGATGTGAAGATTACTATGAAGGGTGTGAGGAAGTTGATCAAGAACGTGCTTTTCGTTC
CGGGGATTGATAGAAACGTGCTGAGTATTAGTAAGCTGACATCAGGTGGCGGTTCGGTGG
TGATAGGTGGTGGGGAATGCACTGTTAGAGATGAGAATGGGAAAGTGTTTGCTAACACGA
GGTTGGAAGAGAGAGGCATTGCTCTACGTTTTAAGGTGATTAGGTAATGTGTGACCAGGT
GATAATTCTACTTGAATAAAATTGGTAGTAGTTTGGTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4BO84JQ 677 0 0
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GGTGATTTCACATACGGTGAAGATATGTGGATGGTGTACTCCACTGCTTTCGACCACATG
ACTCCGTATTTGAAGGTTTTCAGCACTTTGGACAGAACGTACAAAGCTCGTGTTGGAATG
GCTAATGGGAACGTTGTTATGGCGGAAGGGAAAGGAGATGTGAAGATTACTATGAAGGGT
GTGAGGAAGTTGATCAAGAACGTGCTTTTCGTTCCGGGGATTGATAGAAACGTGCTGAGT
ATTAGTAAGCTGACATCAGGTGGCGGTTCGGTGGTGATAGGTGGTGGGGAATGCACTGTT
AGAGATGAGAATGGGAAAGTGTTTGCTAACACGAGGTTGGAAGAGAGAGGCATTGCTCTA
CGTTTTAAGGTGATTAGGTAATGTGTGACCAGGTGATAATTCTACTTGAATAAAATTGGT
AGTAGTTTGGTTTCAGTTTGGATTTGTCCGGTGTTATAACCTAGGCCGCTTTAGTTTTCA
GAAACTCTATTGTAATTCACTATGCAATGCTTCTTTTGAGTTTTCATTATAATGAAAAGG
AGACGAAATTTAGTCCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL8240Contig1 1020 2 2 U
GACTCCGTCTTCCTCCACACCAAACACCAAAACCATGGCGGCTTCTTCTCTGCAATCCCT
AAAACCTACATTACCCCAAACCCTATCTTCCCCCAACACCCCTCCTCCCTTCCGATCTCC
CTTCCTCAGATTCAACTCCCCTCTCACTCCCAAACCCCTCGTCTCCCGCTCCTCCTCCTT
CACCACCCGCTCCGCCGCCGAGCCGCAGGAGAGAAAAACCTTCCACGGCCTCTGCTACGT
CGTCGGCGACAACATCGACACGGACCAGATCATCCCCGCGGAGTACCTCACCCTCGTCCC
CTCCAACCCCGACGAGTACGAGAAGCTCGGCTCCTACGCCCTGATCGGCCTCCCCGCCTC
GTACTCGGACCGGTTCGTCCAGCCCGGGGAGACGAAGACGAAGTACTCCATCATCATCTG
CGGGGAGAACTTCGGGTGCGGGTCGTCTCGGGAGCACGCGCCGGTGTGTCTGGGGGCGGC
GGGGGCGAAGGCGGTGGTGGCGCAGTCGTACGCGAGGATCTTTTTCAGGAACTCGGTGGC
GACGGGGGAGGTTTATCCGCTTGATTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTGCAAGACGGG
TGACGTGGCGACGGTGGAGTTGAGGGAAGGGGATAGTGTTTTGATTAATCATACGACCGG
GAAGGAGTATAAGCTGAAGCCTATTGGTGACGCTGGGCCTGTGATTGATGCTGGTGGGAT
CTTTGCTTATGCTAGGAAAGCTGGCATGATTCCTTCTGCTGCTGCTGCTCCTTGATTTGG
TTTCTCCCCACTGGGGGTAAATGCATATGTCGATGAGAGTTGATGTTCAAGGGTAAAGTA
ATTTTCTGCTTCCATTTCCAATAAAAGAACAATAAGTACATGTATGTTTCAAGAATTTGT
GAACCTAAGTCTATATGCTTTTGTGGGATTTGTGTTATGTTTTTCGGTTTTTCGTCTTCT
TTTTCACTTCATATGTTTTCTACTTCCTTTGGATGTTAACTAAAAAAATAATGTTGACAC


BQ
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AF RR4AH83TF U 1
AF RR4AH83JQ C 365
BS 1 782 RR4AH83TF
BS 783 1020 RR4AH83JQ

RD RR4AH83TF 782 0 0
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AAAACCTACATTACCCCAAACCCTATCTTCCCCCAACACCCCTCCTCCCTTCCGATCTCC
CTTCCTCAGATTCAACTCCCCTCTCACTCCCAAACCCCTCGTCTCCCGCTCCTCCTCCTT
CACCACCCGCTCCGCCGCCGAGCCGCAGGAGAGAAAAACCTTCCACGGCCTCTGCTACGT
CGTCGGCGACAACATCGACACGGACCAGATCATCCCCGCGGAGTACCTCACCCTCGTCCC
CTCCAACCCCGACGAGTACGAGAAGCTCGGCTCCTACGCCCTGATCGGCCTCCCCGCCTC
GTACTCGGACCGGTTCGTCCAGCCCGGGGAGACGAAGACGAAGTACTCCATCATCATCTG
CGGGGAGAACTTCGGGTGCGGGTCGTCTCGGGAGCACGCGCCGGTGTGTCTGGGGGCGGC
GGGGGCGAAGGCGGTGGTGGCGCAGTCGTACGCGAGGATCTTTTTCAGGAACTCGGTGGC
GACGGGGGAGGTTTATCCGCTTGATTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTGCAAGACGGG
TGACGTGGCGACGGTGGAGTTGAGGGAAGGGGATAGTGTTTTGATTAATCATACGACCGG
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CTTTGCTTATGCTAGGAAAGCTGGCATGATTCCTTCTGCTGCTGCTGCTCCTTGATTTGG
TT

QA 1 782 1 782
DS 

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GAGAACTTCGGGTGCGGGTCGTCTCGGGAGCACGCGCCGGTGTGTCTGGGGGCGGCGGGG
GCGAAGGCGGTGGTGGCGCAGTCGTACGCGAGGATCTTTTTCAGGAACTCGGTGGCGACG
GGGGAGGTTTATCCGCTTGATTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTGCAAGACGGGTGAC
GTGGCGACGGTGGAGTTGAGGGAAGGGGATAGTGTTTTGATTAATCATACGACCGGGAAG
GAGTATAAGCTGAAGCCTATTGGTGACGCTGGGCCTGTGATTGATGCTGGTGGGATCTTT
GCTTATGCTAGGAAAGCTGGCATGATTCCTTCTGCTGCTGCTGCTCCTTGATTTGGTTTC
TCCCCACTGGGGGTAAATGCATATGTCGATGAGAGTTGATGTTCAAGGGTAAAGTAATTT
TCTGCTTCCATTTCCAATAAAAGAACAATAAGTACATGTATGTTTCAAGAATTTGTGAAC
CTAAGTCTATATGCTTTTGTGGGATTTGTGTTATGTTTTTCGGTTTTTCGTCTTCTTTTT
CACTTCATATGTTTTCTACTTCCTTTGGATGTTAACTAAAAAAATAATGTTGACAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAATAGCTATAGTATTAGATCTATTCAAGAAATCTCATAACAAACACACTTTCCACTCA
CAGTCGTCTCTGTCTTCTGCCGCCGCCGTATCTGCTTTCGCCACTGCTCCTTTCGCGTCT
AGGTTTCTCTTCGGTTCTTTTGAGCCTCGAGTTGCGTATTGTGATGCTGCGGCACCAGCT
GCGATAGATGATGATTACCTCGCCGCTATACGAAAGATGTCTGCGGATGCTTTGCAGTTT
GAATCGCCTGCATACGTTCCTAGTTCCAAGGTTTACAATATCCAACCAAAACCACTCTTC
TCGGCCTTCGAGTTCAGGGCACTTGCGATGACCACAGTTAGATCTCTCCTCATGTTTTAC
CTGCCTCTTCTGGAGCCTAAACCGGATGATGATTTCCTAAACAATGATGCGGAAGAAGAA
CGCCGGGCAGACCTGATTGTTCCTCTTAAAAAGTCAGTCAAGCAGATCGCCCGTGAGACC
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TGGCCTACACATTTATACATCTATAAAGTCAGCCAGACAACTCTAAGAGGACACTTCCTC
GGAATTGCAGCATCATGGACAGTTCAAGTAGGCATAGAAATCTACAGATGTGTGGTCCGG
AATGTAAAACCCAAACCCGAAGAAGAAGAGGAGGAACAGGTCGAGATAGCAGAGCAAGCC
AAGGATCTTGGAAACAAAGTTGTGGGTATCACAGTAAGATGTGGTGCTTCTTTAGTATTT
GCTGCCATTGGAGCTGGTATCTGTTCTTGCCTCATGCGTCCCTCCACCGGACAATGGATC
GGCTGCGCGCTGGGGGACTTGGCTGGTCCGATGGTTGTTTCGATTTGCCTGCAGAAGACT
CTTCAAGCTGATGGTTAACTTCTTATGTGGAGATTGAATTCTTCAACTTTGACGATATAA
AATGAAATCAAAAGGTTGCTTTTTTCTGATTTTTTTTTCTTATGGTTTTTACTGAAACCT
TGAAAACGTTTTGATCAATATACACTCCGAGTGATTCACAAATTGTACCTACTTTTGACA
ATATCTGAATAAGGCAGGTGTTTAT


BQ
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AF RR4F660TF U 1
AF RR4F660JQ C 516
BS 1 578 RR4F660TF
BS 579 1225 RR4F660JQ

RD RR4F660TF 578 0 0
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GGAATAGCTATAGTATTAGATCTATTCAAGAAATCTCATAACAAACACACTTTCCACTCA
CAGTCGTCTCTGTCTTCTGCCGCCGCCGTATCTGCTTTCGCCACTGCTCCTTTCGCGTCT
AGGTTTCTCTTCGGTTCTTTTGAGCCTCGAGTTGCGTATTGTGATGCTGCGGCACCAGCT
GCGATAGATGATGATTACCTCGCCGCTATACGAAAGATGTCTGCGGATGCTTTGCAGTTT
GAATCGCCTGCATACGTTCCTAGTTCCAAGGTTTACAATATCCAACCAAAACCACTCTTC
TCGGCCTTCGAGTTCAGGGCACTTGCGATGACCACAGTTAGATCTCTCCTCATGTTTTAC
CTGCCTCTTCTGGAGCCTAAACCGGATGATGATTTCCTAAACAATGATGCGGAAGAAGAA
CGCCGGGCAGACCTGATTGTTCCTCTTAAAAAGTCAGTCAAGCAGATCGCCCGTGAGACC
ACAGTTGTGACAACTAGGAGAGTCCTCGAAAGGCTGGC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4F660JQ 710 0 0
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GGCTATTAGTTATGTCTCACAGCGTATGGCATGGAAACTTCTAAAGGATGTGCCTCAGTC
TACTTTACGCAAGGCTGGGAGAGGGTGGCCTACACATTTATACATCTATAAAGTCAGCCA
GACAACTCTAAGAGGACACTTCCTCGGAATTGCAGCATCATGGACAGTTCAAGTAGGCAT
AGAAATCTACAGATGTGTGGTCCGGAATGTAAAACCCAAACCCGAAGAAGAAGAGGAGGA
ACAGGTCGAGATAGCAGAGCAAGCCAAGGATCTTGGAAACAAAGTTGTGGGTATCACAGT
AAGATGTGGTGCTTCTTTAGTATTTGCTGCCATTGGAGCTGGTATCTGTTCTTGCCTCAT
GCGTCCCTCCACCGGACAATGGATCGGCTGCGCGCTGGGGGACTTGGCTGGTCCGATGGT
TGTTTCGATTTGCCTGCAGAAGACTCTTCAAGCTGATGGTTAACTTCTTATGTGGAGATT
GAATTCTTCAACTTTGACGATATAAAATGAAATCAAAAGGTTGCTTTTTTCTGATTTTTT
TTTCTTATGGTTTTTACTGAAACCTTGAAAACGTTTTGATCAATATACACTCCGAGTGAT
TCACAAATTGTACCTACTTTTGACAATATCTGAATAAGGCAGGTGTTTAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8244Contig1 797 2 3 U
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TCAGAGACATAGAGTGAGAGAGGGTGAGACGAGAGACTGAGAGTGTAACATACACAGAAG
ATACGCATCTCAAGATTTCTTCAGAAAACATGCTCGGGTTCACAATGTTGTTCTCTACGA
TGTGAGACGAACCTAGAAGATCTCCGAGAGTAGTGTGATTATTATCAGAAACATATCTTG
TCTTCTCTCTTGCGGAAAAGGCTTTTAAGCTGGCTTGGAAACTCCGAGGACAGGAAGAGG
AACGGTCAGAAAGGGGAGAAGGTTGGTAATGGTAGCTGAAGACACGGGTGAGGTCAGATT
GGTCGGATTTGGGACAGAACTGATTGGAGACTAAGCTTGTTTCAGTGTGAGGAGAGTAAG
AAGAAGAAGTGACTTGTTGTTCATCAAAAGCTGTCCTGTAAAGAGAGAGAAGGTACTGTT
CCGTACGCAGAATCTCAAACTCAAGTGAAGCAATCTCCTTCCTCAAATCTTCTGAAGACT
TTTGCATTACGTTGCAATGAGAATCCTTATGAGTTAGTAATCTCTTCTCAATAGATACAA
ACTGCCATGAGAGGAAATGTACAGACAAATGTTACTTTTTGGAACCCATAAAGACAATCT
CCAAAAAGTTTTGCTTTCGCAAAGAGAGTGAAATCACCGGTTCACTGTAGCAAGAGAATC
TTGAAGGTGATGCAACAATCACACTCTGCTTCTCCGAGTTCCTTGGAGAAGATGAGGAGC
AATCAGGAGAAGAGCCC


BQ
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AF RR4EO42JQ U 89
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DS 



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BQ
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QA 1 556 1 556
DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGCTTTGGTGGCTCTTTGGGGATCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAAGCTTCCATT
GTTTCCAGGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGTTTACAAGAA
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CATATTAGGGAGCAACAGCTAAATCAAAGGAAGAAAAGTGAGAAACATTCATGAAGGAAA
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QA 1 707 1 707
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CCTCATCTCGGCAATCGACAAGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTTGAACTTGTAGGCAT
TGGTTACACTGGGTGGTTTGTTTACAAGAACATCATCTTCAAACCAGACAGAGAGGTGAT
GTTTCAGAAGGTCAAAGACACATACAGAAACATATTAGGGAGCAACAGCTAAATCAAAGG
AAGAAAAGTGAGAAACATTCATGAAGGAAAATCAAAAGAAGAATTTAAGACATGCCTATC
TCTCTCTCTCTTTGTGCTCCTTGTGGCTCAAAATATCATCCATTTTATGTCAAAGTGTCG
TAAATTCCTCAAGACTGCAATGATGAGATGTCTATTTCATCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BD13TF U 133
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QA 1 562 1 562
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QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

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TGATATTTTCCCGTTTGGGT


BQ
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AF RR4B705JQ C 1
AF RR4B705TF U 1
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RD RR4B705JQ 800 0 0
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CTCGGTCTTCTTCTTATTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACGACGACTTCATCC
CGGCGATCGAACCGGAGGAGATTCTTCTGGCGGATCAAATCTATTTCGTTCTCCCTATCT
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TCGCGATGGAGAAAGCTGCGAAGAATAAAAACCGCCGTCGTAAGAGCGGGAGGATCTCTC
CGGTGATGGGGATGAATCAGCCTAACGAACGGACCGTCGCCGTTAATAGAAGTTCGACGG
TGATGCAAGTTAAGGGAAACCTACCTAATAAAACGACGCAGTTTAAGAGTACTAATACAA
TCGGTTATTCCCGGTCCGGTTCGGTACGGCAATTGAAAAGATATGCGTCTGGGAGAGCTA
GGAAGCTTGCGGATCGATCTATTAAAAGAGTACTGTCAACAATCCACGAAGAAAACATAT
TTTAGATTTCTAAGAATACATTTTTTATTTTAATTTTTGTTGTTGTTACGGAAATTATTG
TTAATGTTTGAAATGGAAAAAACTCTCTGTAAATTACAGTGTTCATTTGTTTCTGTGATA
TGATATTTTCCCGTTTGGGT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR4B705TF 799 0 0
GGAGATTCGAAAGAAAAACTCAAATGGGTCTTTGCGTATCTGTTGGTCGTAGCGACTGCG
ATTCTTCTCCGGCGGCTAAAATCGTGACGGTTAACGGCGATCTCCGGGAATACAATGTCC
CCGTGTTAGCTTCACAGGTTCTTGAAGCGGAATCAATGGCTTCCTCGTCTTCCTCCTCCT
CTCGGTCTTCTTCTTATTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACGACGACTTCATCC
CGGCGATCGAACCGGAGGAGATTCTTCTGGCGGATCAAATCTATTTCGTTCTCCCTATCT
CTAAACGTCGGTACCGTCTCACGGCTTCGGACATGGCGGCTCTGGCGGTGAAAGCCAGCG
TCGCGATGGAGAAAGCTGCGAAGAATAAAAACCGCCGTCGTAAGAGCGGGAGGATCTCTC
CGGTGATGGGGATGAATCAGCCTAACGAACGGACCGTCGCCGTTAATAGAAGTTCGACGG
TGATGCAAGTTAAGGGAAACCTACCTAATAAAACGACGCAGTTTAAGAGTACTAATACAA
TCGGTTATTCCCGGTCCGGTTCGGTACGGCAATTGAAAAGATATGCGTCTGGGAGAGCTA
GGAAGCTTGCGGATCGATCTATTAAAAGAGTACTGTCAACAATCCACGAAGAAAACATAT
TTTAGATTTCTAAGAATACATTTTTTATTTTAATTTTTGTTGTTGTTACGGAAATTATTG
TTAATGTTTGAAATGGAAAAAACTCTCTGTAAATTACAGTGTTCATTTGTTTCTGTGATA
TGATATTTTCCCGTTTGG
T

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL8249Contig1 829 2 6 U
GGACACTATACGTATCAACCAATGGGTCGTGTTACTACTCCACAAAGGGAGAATCCAGAT
GACAGTTCACCAGTTCAGCAAACCGGTATACCGGTCCAACAAACCGGAGTTCCCATGAGC
CAGTTTGCACCGCCTAGTTATCATCAAGCTAATGTTAACATATCGGTTGGGACTCCATGG
AGAAGTGGTTTGTTTGATTGTCAAGAAGACCAAACCAATGCCGTGATGACAGCAATCTTA
CCATGTTTGACATTTGGACAAATAGCTGAGGTGTTGGATGAAGGCGAGATGACTTGTCCT
CTTGGAAGTTTCATATACTTGTTGATGGTGCCGGCTTTGTGCTCACAGTGGGTGATGGGA
TCAAAGTATAGGGAAAAAATGAGGAGAAGATTTAATCTTGTGGAAGCTCCATATTCAGAT
TGTGCCACTCATGTCTTATGCTCTTGTTGCTCTCTTTGTCAAGAATATAGAGAGCTCAAG
GCTAGGAATCTTGATCCTTCTTTGGGTTGGAATGGGATACTTGCTCAAAGGCAAGGACAA
CATGAGAGTGACGCACCAAGCTTTGCTCCACCAAAGCAATATATGTCTAAGTAAAGATTT
ATACCGTAGTTAACCTCCAAATTTTATATACATTATTTGCGACCATCATACAATGCCAGT
GTGGTATATGTATTATATAATGTAAAACAAAAGACATCCACATCTTCAAGTTTTTGGACT
TTGTTGTTTTCGTTTTTTCTTTACGTAACTAAATTGGTTTGATTTATTTTTCAGTTGTTG
GTTATTGTGAAAGTGTTATTTGTTGAAGTAACTAAATTGGTTTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G321TF U 1
AF RR4G321JQ C 194
BS 1 714 RR4G321TF
BS 715 715 RR4G321JQ
BS 716 737 RR4G321TF
BS 738 738 RR4G321JQ
BS 739 754 RR4G321TF
BS 755 829 RR4G321JQ

RD RR4G321TF 754 0 0
GGACACTATACGTATCAACCAATGGGTCGTGTTACTACTCCACAAAGGGAGAATCCAGAT
GACAGTTCACCAGTTCAGCAAACCGGTATACCGGTCCAACAAACCGGAGTTCCCATGAGC
CAGTTTGCACCGCCTAGTTATCATCAAGCTAATGTTAACATATCGGTTGGGACTCCATGG
AGAAGTGGTTTGTTTGATTGTCAAGAAGACCAAACCAATGCCGTGATGACAGCAATCTTA
CCATGTTTGACATTTGGACAAATAGCTGAGGTGTTGGATGAAGGCGAGATGACTTGTCCT
CTTGGAAGTTTCATATACTTGTTGATGGTGCCGGCTTTGTGCTCACAGTGGGTGATGGGA
TCAAAGTATAGGGAAAAAATGAGGAGAAGATTTAATCTTGTGGAAGCTCCATATTCAGAT
TGTGCCACTCATGTCTTATGCTCTTGTTGCTCTCTTTGTCAAGAATATAGAGAGCTCAAG
GCTAGGAATCTTGATCCTTCTTTGGGTTGGAATGGGATACTTGCTCAAAGGCAAGGACAA
CATGAGAGTGACGCACCAAGCTTTGCTCCACCAAAGCAATATATGTCTAAGTAAAGATTT
ATACCGTAGTTAACCTCCAAATTTTATATACATTATTTGCGACCATCATACAATGCCAGT
GTGGTATATGTATTATATAATGTAAAACAAAAGACATCCACATCTTCAAGTTTT*GGACT
TTGTTGTTTTCGTTTTT*CTTTACGTAACTAAAT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4G321JQ 636 0 0
TTGATTGTCAAGAAGACCAAACCAATGCCGTGATGACAGCAATCTTACCATGTTTGACAT
TTGGACAAATAGCTGAGGTGTTGGATGAAGGCGAGATGACTTGTCCTCTTGGAAGTTTCA
TATACTTGTTGATGGTGCCGGCTTTGTGCTCACAGTGGGTGATGGGATCAAAGTATAGGG
AAAAAATGAGGAGAAGATTTAATCTTGTGGAAGCTCCATATTCAGATTGTGCCACTCATG
TCTTATGCTCTTGTTGCTCTCTTTGTCAAGAATATAGAGAGCTCAAGGCTAGGAATCTTG
ATCCTTCTTTGGGTTGGAATGGGATACTTGCTCAAAGGCAAGGACAACATGAGAGTGACG
CACCAAGCTTTGCTCCACCAAAGCAATATATGTCTAAGTAAAGATTTATACCGTAGTTAA
CCTCCAAATTTTATATACATTATTTGCGACCATCATACAATGCCAGTGTGGTATATGTAT
TATATAATGTAAAACAAAAGACATCCACATCTTCAAGTTTTTGGACTTTGTTGTTTTCGT
TTTTTCTTTACGTAACTAAATTGGTTTGATTTATTTTTCAGTTGTTGGTTATTGTGAAAG
TGTTATTTGTTGAAGTAACTAAATTGGTTTTTGTTG

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL8250Contig1 739 2 2 U
AGAAACAATATTATTTGTAAGACTTTGAAGCTGTGAGCTTTGTTTGTTCATCGTTTCTCT
CAGGATATATATCAAAAGGACATCCTCATGTCAATAAACATATTAATATAAACTCTCAGT
GATGAACTCATTGATGATTAGGGGTTCCCAAGTTTTGTTCTAGTTTCCAAACCGCCACCA
CTTTCTCCTCCTCTGTAGCTCTGTTGCAGATGTATCTGAACACACACACACACACAAATT
ATCAAGAAGAATATCTCTCTCTTAGTGAATCAAGATGAATAAGCAAAAACAGTCTGTTCA
AAATGAGTTACGGTTGTTAGTACAATGTACCTCTGTTCAAGTAGATAGAGTTGTAATGAA
CCTCTGCCCAGAAGCTCAAGAAAATTACTACAGAACAACAAGCAAAATTAACATATCATC
ACTGTAAAACAAATATTTGAGATATGAAGAAGACAAGCAGAAAGTATAGAGTGGACTAAA
AAACTATTTACCTCCTTTAGATTCTTGAGAGGTAGGAAGAATTTCAATATAACATGTATC
CTTGAACGATGTTAGCACTACTATTTTCAACCGATACTGCAAAGATTCAAAAGTTTTCAC
CAAAACTGTTTAAGTTACGGATTAATGATAAGATAAGTAAAGTTTTGAGTGACAATATAT
ATACCGCATCAGCAGCTGCCTGTAATGTAACGTGATCACCCCACTCTCCGCTCCTGTGTT
CAAAGTTGAATACTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C749TF C 1
AF RR4C749JQ U 9
BS 1 8 RR4C749TF
BS 9 739 RR4C749JQ

RD RR4C749TF 687 0 0
AGAAACAATATTATTTGTAAGACTT*GAAGCTGTGAGCTTTGTT*GTTCATCGTTTCTCT
CAGGATATATATCAAAAGGACATCCTCATGTCAATAAACATATTAATATAAACTCTCAGT
GATGAACTCATTGATGATTAGGGGTTCCCAAGTTTTGTTCTAGTTTCCAAACCGCCACCA
CTTTCTCCTCCTCTGTAGCTCTGTTGCAGATGTATCTGAACACACACACACACACAAATT
ATCAAGAAGAATATCTCTCTCTTAGTGAATCAAGATGAATAAGCAAAAACAGTCTGTTCA
AAATGAGTTACGGTTGTTAGTACAATGTACCTCTGTTCAAGTAGATAGAGTTGTAATGAA
CCTCTGCCCAGAAGCTCAAGAAAATTACTACAGAACAACAAGCAAAATTAACATATCATC
ACTGTAAAACAAATATTTGAGATATGAAGAAGACAAGCAGAAAGTATAGAGTGGACTAAA
AAACTATTTACCTCCTTTAGATTCTTGAGAGGTAGGAAGAATTTCAATATAACATGTATC
CTTGAACGATGTTAGCACTACTATTTTCAACCGATACTGCAAAGATTCAAAAGTTTTCAC
CAAAACTGTTTAAGTTACGGATTAATGATAAGATAAGTAAAGTTTTGAGTGACAATATAT
ATACCGCATCAGCAGCTGCCTGTAATG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4C749JQ 731 0 0
TATTATTTGTAAGACTTTGAAGCTGTGAGCTTTGTTTGTTCATCGTTTCTCTCAGGATAT
ATATCAAAAGGACATCCTCATGTCAATAAACATATTAATATAAACTCTCAGTGATGAACT
CATTGATGATTAGGGGTTCCCAAGTTTTGTTCTAGTTTCCAAACCGCCACCACTTTCTCC
TCCTCTGTAGCTCTGTTGCAGATGTATCTGAACACACACACACACACAAATTATCAAGAA
GAATATCTCTCTCTTAGTGAATCAAGATGAATAAGCAAAAACAGTCTGTTCAAAATGAGT
TACGGTTGTTAGTACAATGTACCTCTGTTCAAGTAGATAGAGTTGTAATGAACCTCTGCC
CAGAAGCTCAAGAAAATTACTACAGAACAACAAGCAAAATTAACATATCATCACTGTAAA
ACAAATATTTGAGATATGAAGAAGACAAGCAGAAAGTATAGAGTGGACTAAAAAACTATT
TACCTCCTTTAGATTCTTGAGAGGTAGGAAGAATTTCAATATAACATGTATCCTTGAACG
ATGTTAGCACTACTATTTTCAACCGATACTGCAAAGATTCAAAAGTTTTCACCAAAACTG
TTTAAGTTACGGATTAATGATAAGATAAGTAAAGTTTTGAGTGACAATATATATACCGCA
TCAGCAGCTGCCTGTAATGTAACGTGATCACCCCACTCTCCGCTCCTGTGTTCAAAGTTG
AATACTTGAGC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL8251Contig1 714 2 7 U
GCCATAAAGTGCAACGTGAATATATTATATAATCTGATGAATATGTTTCTAAGGAACATT
CTCTTACTCTGCTAAAAGGTTTATCTTCCATGAAATAACAATATTATAGTACACAGTTTT
GCTTAATTGCTAATGACCAAAGGACATACATAAATCTAAAACTCCAGTCTTGCTTGCTGG
CTTCTGACTGCTTCACCGGAACATTTATTACTTCATACAGAATCACAGCCCGGTGAGAGA
TCAGATTCTGTCTCCTAGATCTTCTGCTTAAGGACATGCTTCAACTGAACTTTTTGGCTT
TCAATTCTTGCTTCAATGAGTTTTGCCTTCAAACTATGCTTCTGTGCACCTCTAGGCCAT
TCTATGCAACCTTTCATCCCTCCACGGTTCACATGAGGATGGCTTGCAGATTCAGGTGAA
GAGCTCCATTGTCCAACCAGATCCATCATTGGGCTGAACCCTCCTTTGCTTGAGCCTCTC
TCTGGTGATGAAACCATTCCCACGCTTGATTTCCTCCCATTTGAAACCCTTCCTCCGTTC
ATACCTTCCATTGATATCACCTTGAAGCTGTTACTGTCTCTATCTCCATTGTTACTTGCA
CCTGATGATCTCCACAGTTTTGCTATTGATGAAACCTTTTTGGTTGACCGTCTTGGAACA
GAACACACTTCGCTTATCTCTGTTGTCGGAGTCATCATCGTCTCTTCCCACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EZ09JQ U 9
AF RR4C045TF C 1
BS 1 8 RR4C045TF
BS 9 139 RR4EZ09JQ
BS 140 140 RR4C045TF
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BS 204 236 RR4EZ09JQ
BS 237 714 RR4C045TF

RD RR4EZ09JQ 228 0 0
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CTGCTAAAAGGTTTATCTTCCATGAAATAACAATATTATAGTACACAGTTTTGCTTAATT
GCTAATGACCAGAGGACATACATAAATCTAAAACTCCAGTCTTGCTTGCTGGCTTCTGAC
TGCTTCACCGGAAC*TTTATTACTTCATACAGAATCACAGCCCGGTGA

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR4C045TF 714 0 0
GCCATAAAGTGCAACGTGAATATATTATATAATCTGATGAATATGTTTCTAAGGAACATT
CTCTTACTCTGCTAAAAGGTTTATCTTCCATGAGATAACAATATTATAGTACACAGTTT*
GCTTAATTGCTAATGACCAAAGGACATACATAAATCTAAAACTCCGGTCTTGCTTGCTGG
CTTCTGACTGCTTCACCGGAACATTTATTACTTCATACAGAATCACAGCCCGGTGAGAGA
TCAGATTCTGTCTCCTAGATCTTCTGCTTAAGGACATGCTTCAACTGAACTTTTTGGCTT
TCAATTCTTGCTTCAATGAGTTTTGCCTTCAAACTATGCTTCTGTGCACCTCTAGGCCAT
TCTATGCAACCTTTCATCCCTCCACGGTTCACATGAGGATGGCTTGCAGATTCAGGTGAA
GAGCTCCATTGTCCAACCAGATCCATCATTGGGCTGAACCCTCCTTTGCTTGAGCCTCTC
TCTGGTGATGAAACCATTCCCACGCTTGATTTCCTCCCATTTGAAACCCTTCCTCCGTTC
ATACCTTCCATTGATATCACCTTGAAGCTGTTACTGTCTCTATCTCCATTGTTACTTGCA
CCTGATGATCTCCACAGTTTTGCTATTGATGAAACCTTTTTGGTTGACCGTCTTGGAACA
GAACACACTTCGCTTATCTCTGTTGTCGGAGTCATCATCGTCTCTTCCCACCCT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL8252Contig1 930 2 4 U
GGTTTGCTCAAGGGATGGGTTTCCTCAATTGCAGAAGCTAGTAATTAATGGATTAAATGA
GTGGGAAGAGTGGATAGTAGAAGAAGGCTCCATGCCCCTTCTCCATGCTCTCGATATTCA
CTATTGTCCAGAGTTAAAGGAGCTTCCTGATGGGCTGCGATTCATCACTAACTTGGAAAA
TCTGAGTGTTGATAATATGGGAGACGAATTCAGCTTGAGATTGTTGGAAGGATACTTTCC
TTCTCACCTTACAACCATAGATCTAGGTGAGTGTCATCTGAAAGAGGATCCAATGCCGAT
TCTAGAGAAGTTGCTTCACTTGAAAGACATTAGTTTAGGATATGGATCTTTCAGCGGGAG
GAGAATGGTTTGCTCGAGGGATGGATTTCCTCAATTGCAGAAGCTAAGATTTGACGGATT
AGAGGAGTGGAAAGAGTGGATAGTAGAAGAAGGCTCTATGCCCCTTCTCCATACTCTCGA
GATTTGGGATTGTCCAAAGTTAAAGGAACTTCCTGATGGGCTGCGATTCATCACTTCTTT
GAAGAGTCTGATCTCTTGTGATATGGGAATTGGATGGGAGAAGAAACTGTCAGAAGGAGG
AGAAGATTACTACAAAGTCCAACACATCCCTTCTGTTACAATTCGATGACTGATCTCGGA
AATAGTGAGTTATGAGTGGCAAACAGAGAATTTACAAGCGAAACATACTGGCAACTGACG
CGGTGAAGCTGTTCGATGGAAGTGTCTATTTGAGACACTTGATCTCCTGCAATGATTTAA
GTTTGCCTATTATTAGTATTCTCTTTACACTTTCTTGTATACCGATTTTTTTTTTGAGAT
TTTTCATTTTGTTTCTGTAACTCAAAAATTTACATGCCTTTGTACAAAAATTTATGGATT
GATTTCCACAGAACAGTTGATATTATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BO08TF U 1
AF RR4BO08JQ C 102
BS 1 596 RR4BO08TF
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BS 598 676 RR4BO08TF
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RD RR4BO08TF 676 0 0
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GTGGGAAGAGTGGATAGTAGAAGAAGGCTCCATGCCCCTTCTCCATGCTCTCGATATTCA
CTATTGTCCAGAGTTAAAGGAGCTTCCTGATGGGCTGCGATTCATCACTAACTTGGAAAA
TCTGAGTGTTGATAATATGGGAGACGAATTCAGCTTGAGATTGTTGGAAGGATACTTTCC
TTCTCACCTTACAACCATAGATCTAGGTGAGTGTCATCTGAAAGAGGATCCAATGCCGAT
TCTAGAGAAGTTGCTTCACTTGAAAGACATTAGTTTAGGATATGGATCTTTCAGCGGGAG
GAGAATGGTTTGCTCGAGGGATGGATTTCCTCAATTGCAGAAGCTAAGATTTGACGGATT
AGAGGAGTGGAAAGAGTGGATAGTAGAAGAAGGCTCTATGCCCCTTCTCCATACTCTCGA
GATTTGGGATTGTCCAAAGTTAAAGGAACTTCCTGATGGGCTGCGATTCATCACTTCTTT
GAAGAGTCTGATCTCTTGTGATATGGGAATTGGATGGGAGAAGAAACTGTCAGAAG*AGG
AGAAGATTACTACAAAGTCCAACACATCCCTTCTGTTACAATTCGATGACTGATCTCGGA
AATAGTGAGTTATGAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4BO08JQ 829 0 0
TCCATGCTCTCGATAT*CACTAT*GTCCAGAGT*AAAGGAGCTTC*TGATGGGCTGCGAT
TCATCACTAACTTGGAAAATCTGAGTGTTGATAATATGGGAGACGAATTCAGCTTGAGAT
TGTTGGAAGGATACTTTCCTTCTCACCTTACAACCATAGATCTAGGTGAGTGTCATCTGA
AAGAGGATCCAATGCCGATTCTAGAGAAGTTGCTTCACTTGAAAGACATTAGTTTAGGAT
ATGGATCTTTCAGCGGGAGGAGAATGGTTTGCTCGAGGGATGGATTTCCTCAATTGCAGA
AGCTAAGATTTGACGGATTAGAGGAGTGGAAAGAGTGGATAGTAGAAGAAGGCTCTATGC
CCCTTCTCCATACTCTCGAGATTTGGGATTGTCCAAAGTTAAAGGAACTTCCTGATGGGC
TGCGATTCATCACTTCTTTGAAGAGTCTGATCTCTTGTGATATGGGAATTGGATGGGAGA
AGAAACTGTCAGAAGGAGGAGAAGATTACTACAAAGTCCAACACATCCCTTCTGTTACAA
TTCGATGACTGATCTCGGAAATAGTGAGTTATGAGTGGCAAACAGAGAATTTACAAGCGA
AACATACTGGCAACTGACGCGGTGAAGCTGTTCGATGGAAGTGTCTATTTGAGACACTTG
ATCTCCTGCAATGATTTAAGTTTGCCTATTATTAGTATTCTCTTTACACTTTCTTGTATA
CCGATTTTTTTTTTGAGATTTTTCATTTTGTTTCTGTAACTCAAAAATTTACATGCCTTT
GTACAAAAATTTATGGATTGATTTCCACAGAACAGTTGATATTATTTGG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL8255Contig1 550 2 2 U
GTATGTACATTTGTTGATTTTATTTCATGTATTCAGCCACACTGCGAAATATCATCAATG
AAAGCCACAAAACCCATGGCACTAGCAAAACCGCTACCATACACGTCTTGTTCTTCTATA
AGATAGTTTTCAAAGGCCGTAACATCGTCTTGTCCTCCTCGGATAAACATCAGTTTCGGT
GTGATGCTCCTTCCTTGCTTCAACCTCATTAATGCTCTTCCTCAATAAACAGTCTTGTGG
TGGAGGGAAAGGGAGTGAGGGTCAGCTGTTGATGAGTAGAAGACTATCAAAGTGGTGTAC
GCATCAGTGAATGGCGCGGATACGCCTTAGATTGGAGAGTTTGTGATGTTCAGGTTGATC
GAAGAGCTCCCGTCGGAGAACTTGTGATGACTAGCCTCTGTGTCCATCATCTCTGCTCGG
AATCAACGTTTGCAAGCAAATTGAGAAGAATCAAACAGAAATTGGTCAGTAATACCGTGA
AGACCTCTATCGCAAATAAAGACTAAGCTAGTTCCATGGACTTTGCAAATTTCATTCCTT
TTGATTGCCC


BQ
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AF RR4FM84TF C 1
AF RR4FM84JQ U 4
BS 1 3 RR4FM84TF
BS 4 550 RR4FM84JQ

RD RR4FM84TF 550 0 0
GTATGTACATTTGTTGATTTTATTTCATGTATTCAGCCACACTGCGAAATATCATCAATG
AAAGCCACAAAACCCATGGCACTAGCAAAACCGCTACCATACACGTCTTGTTCTTCTATA
AGATAGTTTTCAAAGGCCGTAACATCGTCTTGTCCTCCTCGGATAAACATCAGTTTCGGT
GTGATGCTCCTTCCTTGCTTCAACCTCATTAATGCTCTTCCTCAATAAACAGTCTTGTGG
TGGAGGGAAAGGGAGTGAGGGTCAGCTGTTGATGAGTAGAAGACTATCAAAGTGGTGTAC
GCATCAGTGAATGGCGCGGATACGCCTTAGATTGGAGAGTTTGTGATGTTCAGGTTGATC
GAAGAGCTCCCGTCGGAGAACTTGTGATGACTAGCCTCTGTGTCCATCATCTCTGCTCGG
AATCAACGTTTGCAAGCAAATTGAGAAGAATCAAACAGAAATTGGTCAGTAATACCGTGA
AGACCTCTATCGCAAATAAAGACTAAGCTAGTTCCATGGACTTTGCAAATTTCATTCCTT
TTGATTGCCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR4FM84JQ 547 0 0
TGTACATTTGTTGATTTTATTTCATGTATTCAGCCACACTGCGAAATATCATCAATGAAA
GCCACAAAACCCATGGCACTAGCAAAACCGCTACCATACACGTCTTGTTCTTCTATAAGA
TAGTTTTCAAAGGCCGTAACATCGTCTTGTCCTCCTCGGATAAACATCAGTTTCGGTGTG
ATGCTCCTTCCTTGCTTCAACCTCATTAATGCTCTTCCTCAATAAACAGTCTTGTGGTGG
AGGGAAAGGGAGTGAGGGTCAGCTGTTGATGAGTAGAAGACTATCAAAGTGGTGTACGCA
TCAGTGAATGGCGCGGATACGCCTTAGATTGGAGAGTTTGTGATGTTCAGGTTGATCGAA
GAGCTCCCGTCGGAGAACTTGTGATGACTAGCCTCTGTGTCCATCATCTCTGCTCGGAAT
CAACGTTTGCAAGCAAATTGAGAAGAATCAAACAGAAATTGGTCAGTAATACCGTGAAGA
CCTCTATCGCAAATAAAGACTAAGCTAGTTCCATGGACTTTGCAAATTTCATTCCTTTTG
ATTGCCC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL8256Contig1 1012 2 2 U
GGATATGCGCAGGCAGGGGCCTTGCAGTAATCGATATGTTTCAGTAGCGTTTTGGCAGTG
AAACAATACTTGCTTTCACATCTATCTTCAGCTGCGTTGCATTTGCGAACATGCAGCAGG
AACAAAAGCCACCTCCTCTGGTTTACATAACTTGAATCACTATCTCCATTCACCTGTTTA
CTCAAGGTGCTGCTTCCTTCTGGAAGATGTGGAGCTGGAGCCTCCAAGGTGCTTCTAGGA
GCAACAGTTTGACAGTAAGCAGCATTAGTGGTTTCAAGCTTAATAGGTAAAATTTGACTT
GAGTTCACCCCGGACTGCTCTCTCTCCCCATTAAAATCTTTTGATGCTTGTGTCAAGTTC
TGAGAAGGTGAATGCCACTGTCCCAGACTTGATACTGTCGGAACTCCACCGGAGAGGTTA
TTCACATCTTTCCATTGAGGTATCTGCTGCGTCTGATGAGTCTGCGCTGGGAAAGATTGA
GAAATATTTAGCTGGCTACTACTCTGAGTACCAACATAGTCGTCTTTGACAGCGTTCTGT
TTGTACTGGTTTTGAGGCTTGGATGGTTCTACTTGGTTTATAGCCTGCTGTTGAAAAGCT
TCATTATAGTATTCCGCGCGAGGCTCATGCTTGACTTGACTAACAATGTTTGAAGCTCGC
TGAGGCTGACGATAAGCATCGTTGTTCACTAAGTGTTCTTGTTGCTGGTACTGACCATGA
TGAGATGGCTGGTTGAACTGGTGTTCTAATGGCTGATGACTCATCTGAGCCACATTTTCT
TTGGAACTAGAAGAGGACTGGAAGTTCCCATTCTCGAACTGTTGATGCTTTATCAATGGA
GTCTTGTCCACTGCTTGCAGGCTTGACTGATTACTACCAAAGGAAACATCAACTCTCCTC
ATAGGGTTTTGACTCATTGAATTCATATCCACAGAAGCTTCCACTGAGCCAGATGATCCA
CAGAGATTCCCGGACCCAAAAGCACCAGAGTTGCTCATTGAGTATCCTTCAC


BQ
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AF RR4EO06TF U 1
AF RR4EO06JQ C 295
BS 1 488 RR4EO06TF
BS 489 1012 RR4EO06JQ

RD RR4EO06TF 488 0 0
GGATATGCGCAGGCAGGGGCCTTGCAGTAATCGATATGTTTCAGTAGCGTTTTGGCAGTG
AAACAATACTTGCTTTCACATCTATCTTCAGCTGCGTTGCATTTGCGAACATGCAGCAGG
AACAAAAGCCACCTCCTCTGGTTTACATAACTTGAATCACTATCTCCATTCACCTGTTTA
CTCAAGGTGCTGCTTCCTTCTGGAAGATGTGGAGCTGGAGCCTCCAAGGTGCTTCTAGGA
GCAACAGTTTGACAGTAAGCAGCATTAGTGGTTTCAAGCTTAATAGGTAAAATTTGACTT
GAGTTCACCCCGGACTGCTCTCTCTCCCCATTAAAATCTTTTGATGCTTGTGTCAAGTTC
TGAGAAGGTGAATGCCACTGTCCCAGACTTGATACTGTCGGAACTCCACCGGAGAGGTTA
TTCACATCTTTCCATTGAGGTATCTGCTGCGTCTGATGAGTCTGCGCTGGGAAAGATTGA
GAAATATT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR4EO06JQ 718 0 0
TGACTTGAGTTCACCCCGGACTGCTCTCTCTCCCCATTAAAATCTTTTGATGCTTGTGTC
AAGTTCTGAGAAGGTGAATGCCACTGTCCCAGACTTGATACTGTCGGAACTCCACCGGAG
AGGTTATTCACATCTTTCCATTGAGGTATCTGCTGCGTCTGATGAGTCTGCGCTGGGAAA
GATTGAGAAATATTTAGCTGGCTACTACTCTGAGTACCAACATAGTCGTCTTTGACAGCG
TTCTGTTTGTACTGGTTTTGAGGCTTGGATGGTTCTACTTGGTTTATAGCCTGCTGTTGA
AAAGCTTCATTATAGTATTCCGCGCGAGGCTCATGCTTGACTTGACTAACAATGTTTGAA
GCTCGCTGAGGCTGACGATAAGCATCGTTGTTCACTAAGTGTTCTTGTTGCTGGTACTGA
CCATGATGAGATGGCTGGTTGAACTGGTGTTCTAATGGCTGATGACTCATCTGAGCCACA
TTTTCTTTGGAACTAGAAGAGGACTGGAAGTTCCCATTCTCGAACTGTTGATGCTTTATC
AATGGAGTCTTGTCCACTGCTTGCAGGCTTGACTGATTACTACCAAAGGAAACATCAACT
CTCCTCATAGGGTTTTGACTCATTGAATTCATATCCACAGAAGCTTCCACTGAGCCAGAT
GATCCACAGAGATTCCCGGACCCAAAAGCACCAGAGTTGCTCATTGAGTATCCTTCAC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL8257Contig1 546 2 1 U
CCCGGCAGTTTCTTCGAATAACCAAACCACCATCACGCACAAACTCGAATACCCGTACAA
CCATTTCAACCGTTCCCACGAAGGCGAGAGCTTCCAAGCCGTCGTTACGGTGCGGGGCTC
GGAGAAGGGTGAGAGACGACGGAGAAGATGAAGACGAATCTTACGGCTACAACGAGGAGA
TAGCGATGCTGGAGGCTTATAGCCAGTTGTGTAGAGAAGAAGCGCTCATTGTGACTGCCA
TTGTTGACGATGAAGAGGTCGAAGTTCTCATCTTTAAAGGATTTTCTTCGTGCCTGAGCG
GAGAGACGGCGGTGGATCCGGCGAGGAGTGTCTTACCGGAGAGAGCAGTGATTACAAAGA
TAGATAGAGTGAGAGGTCCTTTTGATCCTTCAGAGATTCATTACATTCAGAAAGGACTCT
CTTTTGAAGTCTTTAAGGAGACCATGATCACGTTCAAGTAATATTCTATCGATATACACT
ATTTATTGAGAGTGTTATGGTTAATGAATGTTGTGTTTGGATTAATAAAGAATGCTAATT
TAAGTC


BQ
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AF RR4H873JQB C 1
AF RR4H873TF U 1
BS 1 546 RR4H873TF

RD RR4H873JQB 546 0 0
CCCGGCAGTTTCTTCGAATAACCAAACCACCATCACGCACAAACTCGAATACCCGTACAA
CCATTTCAACCGTTCCCACGAAGGCGAGAGCTTCCAAGCCGTCGTTACGGTGCGGGGCTC
GGAGAAGGGTGAGAGACGACGGAGAAGATGAAGACGAATCTTACGGCTACAACGAGGAGA
TAGCGATGCTGGAGGCTTATAGCCAGTTGTGTAGAGAAGAAGCGCTCATTGTGACTGCCA
TTGTTGACGATGAAGAGGTCGAAGTTCTCATCTTTAAAGGATTTTCTTCGTGCCTGAGCG
GAGAGACGGCGGTGGATCCGGCGAGGAGTGTCTTACCGGAGAGAGCAGTGATTACAAAGA
TAGATAGAGTGAGAGGTCCTTTTGATCCTTCAGAGATTCATTACATTCAGAAAGGACTCT
CTTTTGAAGTCTTTAAGGAGACCATGATCACGTTCAAGTAATATTCTATCGATATACACT
ATTTATTGAGAGTGTTATGGTTAATGAATGTTGTGTTTGGATTAATAAAGAATGCTAATT
TAAGTC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR4H873TF 546 0 0
CCCGGCAGTTTCTTCGAATAACCAAACCACCATCACGCACAAACTCGAATACCCGTACAA
CCATTTCAACCGTTCCCACGAAGGCGAGAGCTTCCAAGCCGTCGTTACGGTGCGGGGCTC
GGAGAAGGGTGAGAGACGACGGAGAAGATGAAGACGAATCTTACGGCTACAACGAGGAGA
TAGCGATGCTGGAGGCTTATAGCCAGTTGTGTAGAGAAGAAGCGCTCATTGTGACTGCCA
TTGTTGACGATGAAGAGGTCGAAGTTCTCATCTTTAAAGGATTTTCTTCGTGCCTGAGCG
GAGAGACGGCGGTGGATCCGGCGAGGAGTGTCTTACCGGAGAGAGCAGTGATTACAAAGA
TAGATAGAGTGAGAGGTCCTTTTGATCCTTCAGAGATTCATTACATTCAGAAAGGACTCT
CTTTTGAAGTCTTTAAGGAGACCATGATCACGTTCAAGTAATATTCTATCGATATACACT
ATTTATTGAGAGTGTTATGGTTAATGAATGTTGTGTTTGGATTAATAAAGAATGCTAATT
TAAGTC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL8258Contig1 692 2 1 U
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GTTGGTCTCAGAAACGATGAACAAGAATGCTGTAATAAACACATGTCTTGGAGTGTCGTT
TGTTGTTTTGGGGTTTAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTACGGGATCA
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GCAACTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGGTGATTCTGCGATTGTTCCTCTGTCCACTCT
TAAAGCCATCTATGGCGAAGTCACCACAAACACTCAATCTGGTGAAACAGTCGAGAAAGA
GTCTAAAATGTCTACCTCCAGGATCATGGTTTGAGAGGTTCTCAAGTAAAGATTATCATT
TTGGTCTCTATTTTTAAAACTTGGTTAGCATCAAACTGTACAACCTTAAAAGATTTGGCT
TTCAAATTATGGACCCATCGGTCTAAGATTAGGTCTTTTCTTTTTGAGTTAAAGATTTGC
TCTTGTTTTTATATTCTGTCATGTAAGTTTGCGTGTGCAAACAAGAAAATTTGTAAGTCC
AAGATTAGGTCTTGTTTAAAAGAAAATTCTGGTGCCAGATATCATATTGTAAATTGTGAC
TAAAGGAGTAATGAACTTTGGGATAAACAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AT03JQ C 1
AF RR4AT03TF U 1
BS 1 692 RR4AT03TF

RD RR4AT03JQ 692 0 0
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GTTGGTCTCAGAAACGATGAACAAGAATGCTGTAATAAACACATGTCTTGGAGTGTCGTT
TGTTGTTTTGGGGTTTAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTACGGGATCA
AAAGGATTCACTCTTCAAGTCTAACAAAGAAATGAAAGTCAATATGTGGCAGTGGAAACA
GCAACTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGGTGATTCTGCGATTGTTCCTCTGTCCACTCT
TAAAGCCATCTATGGCGAAGTCACCACAAACACTCAATCTGGTGAAACAGTCGAGAAAGA
GTCTAAAATGTCTACCTCCAGGATCATGGTTTGAGAGGTTCTCAAGTAAAGATTATCATT
TTGGTCTCTATTTTTAAAACTTGGTTAGCATCAAACTGTACAACCTTAAAAGATTTGGCT
TTCAAATTATGGACCCATCGGTCTAAGATTAGGTCTTTTCTTTTTGAGTTAAAGATTTGC
TCTTGTTTTTATATTCTGTCATGTAAGTTTGCGTGTGCAAACAAGAAAATTTGTAAGTCC
AAGATTAGGTCTTGTTTAAAAGAAAATTCTGGTGCCAGATATCATATTGTAAATTGTGAC
TAAAGGAGTAATGAACTTTGGGATAAACAGAC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4AT03TF 692 0 0
GGGTCGCTGTCGGCTCCGTCGTCGAACCCTCATTTCAGGAATGGCAAACAAGATTGGGAT
GTTGGTCTCAGAAACGATGAACAAGAATGCTGTAATAAACACATGTCTTGGAGTGTCGTT
TGTTGTTTTGGGGTTTAGATCTGATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCCTTACGGGATCA
AAAGGATTCACTCTTCAAGTCTAACAAAGAAATGAAAGTCAATATGTGGCAGTGGAAACA
GCAACTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGGTGATTCTGCGATTGTTCCTCTGTCCACTCT
TAAAGCCATCTATGGCGAAGTCACCACAAACACTCAATCTGGTGAAACAGTCGAGAAAGA
GTCTAAAATGTCTACCTCCAGGATCATGGTTTGAGAGGTTCTCAAGTAAAGATTATCATT
TTGGTCTCTATTTTTAAAACTTGGTTAGCATCAAACTGTACAACCTTAAAAGATTTGGCT
TTCAAATTATGGACCCATCGGTCTAAGATTAGGTCTTTTCTTTTTGAGTTAAAGATTTGC
TCTTGTTTTTATATTCTGTCATGTAAGTTTGCGTGTGCAAACAAGAAAATTTGTAAGTCC
AAGATTAGGTCTTGTTTAAAAGAAAATTCTGGTGCCAGATATCATATTGTAAATTGTGAC
TAAAGGAGTAATGAACTTTGGGATAAACAGAC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL8259Contig1 457 2 1 U
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GCGAGAAGGTTCATTTCTCCCTCTCCAAATGGGCTGGCGGAAAGCCTGAGAAACCAATTC
TGCGTTCTGACACACCTGGAGTTTGAGATTTTTTTAGCGTTTCGATATCAAGTTTGAGGT
TAATAATGGTGAGGAATGCAAGATATTATGTACTCTGCAACATTTTCCTTCTTTTAACTT
TAAGATTGTTAACAATGGAGTTCGAGTGAGAGAGAGTGACCTCATTCCTATCTTGAAACT
TTTTTTTTTTTTGAAAATGGCTTTCAAATTAAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EQ35TF U 1
AF RR4EQ35JQ C 9
BS 1 457 RR4EQ35TF

RD RR4EQ35TF 457 0 0
GGAACCAGTCTCTCTACCAAAGAGAAAAGAGAAAAGAGAAAAGAAGATCGGAGACGGCAT
CGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCTGGGATGACTTACATCACCTACTCAAACA
TTTGTGCGAATCTCGTGAGAGACTGTCTCAAAGAGCCTTTCAAAGCTGAAGCCCTTAATC
GCGAGAAGGTTCATTTCTCCCTCTCCAAATGGGCTGGCGGAAAGCCTGAGAAACCAATTC
TGCGTTCTGACACACCTGGAGTTTGAGATTTTTTTAGCGTTTCGATATCAAGTTTGAGGT
TAATAATGGTGAGGAATGCAAGATATTATGTACTCTGCAACATTTTCCTTCTTTTAACTT
TAAGATTGTTAACAATGGAGTTCGAGTGAGAGAGAGTGACCTCATTCCTATCTTGAAACT
TTTTTTTTTTTTGAAAATGGCTTTCAAATTAAAGAGC

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR4EQ35JQ 449 0 0
TTTTTT
TACCAAAGAGAAAAGAGAAAAGAGAAAAGAAGATCGGAGACGGCATCGACGGCGGCGGTT
CCGTTTTGGAGAGCGGCTGGGATGACTTACATCACCTACTCAAACATTTGTGGGAATTTC
GTGAGAGACTGTTTCAAAGAGCCTTTCAAAGCTGAAGCCCTTAATCGCGAGAAGGTTCAT
TTTTCCCTTTCCAAATGGGCTGGCGGAAAGCCTGAGAAACCAATTTTGCGTTTTGACACA
CCTGGAGTTTGAGATTTTTTTAGCGTTTCGATATCAAGTTTGAGGTTAATAATGGTGAGG
AATGCAAGATATTATGTACTTTGCAACATTTTCCTTTTTTTAACTTTAAGATTGTTAACA
ATGGAGTTCGAGTGAGAGAGAGTGACCTCATTCCTATCTTGAAACTTTTTTTTTTTTTGA
AAATGGCTTTCAAATTAAAGAGC

QA 7 449 7 449
DS 



AS 1 2

CO CL8260Contig1 1206 2 2 U
GGGGTGTACAGATAGATCTTTCTCCCACAGTCCCACGGCCCCCTCTTCTCTAGATTTGCT
CTGCTCGAGAACTTCTCTAAACACTCTGTTGACATTTCGTTTCGAGATCACATATTCATC
CCTCTCAAAATCACAACTCATCTGCTGGATCGATCTCCCCGAAACCAAGTTTGATTTCCA
TTTTCTCCGCCTTCTCACGAGATTCGATCTCGCTGCTAAGTAGATGACTGGTTTAATTGA
AATCTGAGATTCGACGGACTATTATCGCAGCTGGATCGAGATGGAAGAAGAAAGTGCTGT
TGAGATTCTGCAGAGGTATCGCCGCGACAGGCGTAAACTCTTGGATTTCATGTTGGCTGG
TAGCTTAATCAAGAAAGTCATTATGCCTCCTGGAGCCGTTACTCTTGATGATGTGGATTT
AGATCAAGTTAGTGTTGATTATGTCATTAACTGTGCTAAGAAAGGTGGAATGCTCGAGCT
TTCTGAAGCGATTCGGGACTTTCATGATCACAGTGGATTGCCTTATATGAATAGCGTGGG
TACTGCTGATGATTTCTTTTTGGCTACAAACCCTGAATCTTCTGGCTCACCTCCCAAAAG
GGCGCCGCCGCCTATTCCTTTGTTGACTTCCTCATCCTCATCCATCCCCACGAATCCCGA
GTGGTGTGAGTCACCGTCTGCGCCACCGTTGATGCGATCGGAATCTATCGATTCATCACA
CGCTCAAGAGCAGGAGCTGACTGTTGATGACATTGAAGACTTTGAGGATGACGATGACAA
TGAGGGAGTTGGTAATTTCAGGATCTCGAGGCGGACTGCTGGTGATGCAGCTGATCTTGT
GCCTAAACTCCCATCGTTTGCCACTGGTATTACAGATGATGATCTCCGTGAAACTGCATT
TGAAATCTTGTTGGCTTGCGCTGGAGCCTCAGGGGGCCTCATAGTACCATCAAAAGAGAA
AAAGAATGAGAAACGAAGATCTAGGCTCATTAAAAAGCTCGGTCGCAAAAGTGAGAGTGT
TTCTCAGTCTCAAAGTTCATCAGGATTGGTTACTCTTTTGGAAATGATGCGAGGCCAAAT
GGAGGTAACTCTTTCTAACTGTTTCTTTCTAAAACATGTATTGTTTGTTTGAGCATTGAC
TTTACATAGTCATTTCTCTTTACTTTCCCAAACAATTGTTTAGATGCCAGTATCATGCAT
GATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ20TF U 1
AF RR4AJ20JQ C 360
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BS 764 1206 RR4AJ20JQ

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QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4AJ20JQ 847 0 0
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GTACTGCTGATGATTTCTTTTTGGCTACAAACCCTGAATCTTCTGGCTCACCTCCCAAAA
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TGCCTAAACTCCCATCGTTTGCCACTGGTATTACAGATGATGATCTCCGTGAAACTGCAT
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AAAAGAATGAGAAACGAAGATCTAGGCTCATTAAAAAGCTCGGTCGCAAAAGTGAGAGTG
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CTTTACATAGTCATTTCTCTTTACTTTCCCAAACAATTGTTTAGATGCCAGTATCATGCA
TGATGTC

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CS27JQ U 1
AF RR4CI18JQ U 154
BS 1 568 RR4CS27JQ

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DS 

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QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BI40JQ C 1
AF RR4BI40TF U 1
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GGTAAATTGTTTC

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR4BI40TF 433 0 0
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GCGGCTTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGACAACAGTTCGAGTTTACTAACATCTCCTCAT
CATGCTAGTTGTCTGTCTCTCTCTCATGGCCGTTTGCACCTCCAACGAACGCCGTACTGC
CGTTCGTGTTGTCCGGTGCCGTTGACCAACCTTGATCAACAAGTATACCATCTATATATC
AGATCACAATTACTCCACAAAAAGATTTCTCCCTTTTATACATGTATGTTTGGTTCTTGA
TTAGTGATCACTAATGAATAAGGTGTTCTAGTTTTGCTTTCTTGAATAGTAATGAGTTAA
GGTAAATTGTTTC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 2

CO CL8263Contig1 789 2 8 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGACAGTCATCTGTACCTCTT
TGAAGACACTCTTATCTCTTTATCCACGAAACCAAAGAACAGAGACAGACAAAATGAGAT
AAGCGCTCGAAGCCTCTCACCTCTTTCCTCGCTTCTCTTTAGGCTTATTTGTCAGAGCAA
AGACGAACTTACAAGTAGGTGATGGCTACGGCTAGTCCTTCTTCTATCATCAGCAAAGCC
TGGCTCATTCCCGGAGCTGCTTTCACTGTGAAAAAGAATGATTGCTTCTCGCCTAAAGCT
GGACAAAAGCAGACACCATCATCAACTCAAAGGCTCTTCTTACCTCTTTCGACTTCGCTT
AAGTTGTTTCCTACTCAGTTTGTGTTGCATCCTCGTCGTAGTAGAGCAGCCACAGGGACT
GATGTTGTGGCAACAGTAGAGGAACAAGACTCTCCTCCTCCTATTGCGGATGATGCAGCT
CCTACTACTACTACTACTACTACTACAACATCTCAGCCAAGGGGAAGGAAGAGTGAAATG
CCTGCAGTTAAGAACGAGGAGCTTGTTGCTGGTGCTACCTTCACTGGTAAAGTAAGAGCC
ATCCAGCCCTTTGGTGCTTTCGTCGATTTTGGTGCCTTCACTGATGGACTAGTCCATGTC
TCTCAATTGAGTGACACCTTTGTCAAAGATGTTGCTAGTGTTGTGACCATTGGACAAGAG
GTGAAAGTGAGCTTGTGGAAGCTGACATTGAGTCCAAACGCATTCTCTTACTATGCGTGA
GATGACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EL26TF U 1
AF RR4C328TF U 377
BS 1 412 RR4EL26TF
BS 413 413 RR4C328TF
BS 414 686 RR4EL26TF
BS 687 687 RR4C328TF
BS 688 707 RR4EL26TF
BS 708 708 RR4C328TF
BS 709 720 RR4EL26TF
BS 721 789 RR4C328TF

RD RR4EL26TF 726 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGACAGTCATCTGTACCTCTT
TGAAGACACTCTTATCTCTTTATCCACGAAACCAAAGAACAGAGACAGACAAAATGAGAT
AAGCGCTCGAAGCCTCTCACCTCTTTCCTCGCTTCTCTTTAGGCTTATTTGTCAGAGCAA
AGACGAACTTACAAGTAGGTGATGGCTACGGCTAGTCCTTCTTCTATCATCAGCAAAGCC
TGGCTCATTCCCGGAGCTGCTTTCACTGTGAAAAAGAATGATTGCTTCTCGCCTAAAGCT
GGACAAAAGCAGACACCATCATCAACTCAAAGGCTCTTCTTACCTCTTTCGACTTCGCTT
AAGTTGTTTCCTACTCAGTTTGTGTTGCATCCTCGTCGTAGTAGAGCAGCCATAGGGACT
GATGTTGTGGCAACAGTAGAGGAACAAGACTCTCCTCCTCCTATTGCGGATGATGCAGCT
CCTACTACTACTACTACTACTACTACAACATCTCAGCCAAGGGGAAGGAAGAGTGAAATG
CCTGCAGTTAAGAACGAGGAGCTTGTTGCTGGTGCTACCTTCACTGGTAAAGTAAGAGCC
ATCCAGCCCTTTGGTGCTTTCGTCGATTTTGGTGCCTTCACTGATGGACTAGTCCATGTC
TCTCAATTGAGTGACACCTTTGTCAA*GATGTTGCTAGTGTTGTGAC*ATTGGACAAGAG
TGAAAG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4C328TF 413 0 0
AGTTTGTGTTGCATCCTCGTCGTAGTAGAGCAGCCACAGGGACTGATGTTGTGGCAACAG
TAGAGGAACAAGACTCTCCTCCTCCTATTGCGGATGATGCAGCTCCTACTACTACTACTA
CTACTACTACAACATCTCAGCCAAGGGGAAGGAAGAGTGAAATGCCTGCAGTTAAGAACG
AGGAGCTTGTTGCTGGTGCTACCTTCACTGGTAAAGTAAGAGCCATCCAGCCCTTTGGTG
CTTTCGTCGATTTTGGTGCCTTCACTGATGGACTAGTCCATGTCTCTCAATTGAGTGACA
CCTTTGTCAAAGATGTTGCTAGTGTTGTGACCATTGGACAAGAGGTGAAAGTGAGCTTGT
GGAAGCTGACATTGAGTCCAAACGCATTCTCTTACTATGCGTGAGATGACGAT

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 2

CO CL8264Contig1 917 2 2 U
GGAAGGAAACACCAGAGCAGGAAAAATCAGACAGCAGTTTGATCTTCGAACTTCAGGCTC
TTGCGTGATTGAGAATGAGTTTATCATCGCCAACCAGTGCCTGCAGCTCGTCAAGATGTT
ACTCCTCGGGCTTATCGTTACCAATAGGGTTTCGATCAAGTCCCATCAATGTGGGATTAG
TTTCATACCCAAGAAGACACACTAACGCTCCTCGCAAGCTCGTCATAGCTTCCTCCTCCT
CCTCCTCCTCTTCATCCTCAGATCCACTATTGGTCAAAGCTGCTAAAGGGCAAGCAGTGT
CCCGCCCACCAGCTTGGATGATGCGTCAAGCGGGAAGGTACATGTCCGTCTACAAAAAGC
TCGCCCAAAAGCACCCTTCCTTCAGAGAGAGATCAGAGAACACTGACCTCATCGTTGAGA
TCTCTCTGCAGCCTTGGCAAGCATTCAAACCAGATGGCGTCATCATCTTCTCCGACATCC
TCACTCCGCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGGTGAAGAGTGCTGGACCAA
AAGGGCATATACTCAACTTAGGACATGGTGTCTTGGTAGGGACGCCAGAGGAAGCCGTGG
CTCATTTCTTTGAAACCGCAAGGAGCTTGGATTACAAAACGTTTTTCCAAAACCATGTTC
CTGCAGAATTTGAATTGGTTGCCTGAGGGGAGAGTACTGTTGAATAGACAGGAATCAGAG
AAAATTTTCTGTTTTTGACTCGTAATCTTATCCTAGAGTGAGTGACTTGCTTTGAGAACA
TTCGACACTGTCCTAGTTTTAACTCTTTAACAGTGTCTTGAGTTGCTCAATTGAAAATTT
TCCCTGTTTGTTTTCTCGATCTTTATTTGTTGTATTTTCTTTGTGAAACCAAGTAGCTTG
TTTTGTATCATGAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW56TF U 1
AF RR4CW56JQ C 68
BS 1 557 RR4CW56TF
BS 558 917 RR4CW56JQ

RD RR4CW56TF 557 0 0
GGAAGGAAACACCAGAGCAGGAAAAATCAGACAGCAGTTTGATCTTCGAACTTCAGGCTC
TTGCGTGATTGAGAATGAGTTTATCATCGCCAACCAGTGCCTGCAGCTCGTCAAGATGTT
ACTCCTCGGGCTTATCGTTACCAATAGGGTTTCGATCAAGTCCCATCAATGTGGGATTAG
TTTCATACCCAAGAAGACACACTAACGCTCCTCGCAAGCTCGTCATAGCTTCCTCCTCCT
CCTCCTCCTCTTCATCCTCAGATCCACTATTGGTCAAAGCTGCTAAAGGGCAAGCAGTGT
CCCGCCCACCAGCTTGGATGATGCGTCAAGCGGGAAGGTACATGTCCGTCTACAAAAAGC
TCGCCCAAAAGCACCCTTCCTTCAGAGAGAGATCAGAGAACACTGACCTCATCGTTGAGA
TCTCTCTGCAGCCTTGGCAAGCATTCAAACCAGATGGCGTCATCATCTTCTCCGACATCC
TCACTCCGCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGGTGAAGAGTGCTGGACCAA
AAGGGCATATACTCAAC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR4CW56JQ 850 0 0
TGATGAG
ATGAGTTTATCATCGCCAACCAGTGC*TGCAGCTCGTCAAGATGTTACTCCTCGGGCTTA
TCGTTACCAATAGGGTTTCGATCAAGTCCCATCAATGTGGGATTAGTTTCATACCCAAGA
AGACACACTAACGCTCCTCGCAAGCTCGTCATAGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCA
TCCTCAGATCCACTATTGGTCAAAGCTGCTAAAGGGCAAGCAGTGTCCCGCCCACCAGCT
TGGATGATGCGTCAAGCGGGAAGGTACATGTCCGTCTACAAAAAGCTCGCCCAAAAGCAC
CCTTCCTTCAGAGAGAGATCAGAGAACACTGACCTCATCGTTGAGATCTCTTTGCAGCCT
TGGCAAGCATTCAAACCAGATGGGGTCATCATTTTTTCCGACATCCTCACTCCGCTTCCT
GCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGGTGAAGAGTGCTGGACCAAAAGGGCATATACTC
AACTTAGGACATGGTGTCTTGGTAGGGACGCCAGAGGAAGCCGTGGCTCATTTCTTTGAA
ACCGCAAGGAGCTTGGATTACAAAACGTTTTTCCAAAACCATGTTCCTGCAGAATTTGAA
TTGGTTGCCTGAGGGGAGAGTACTGTTGAATAGACAGGAATCAGAGAAAATTTTCTGTTT
TTGACTCGTAATCTTATCCTAGAGTGAGTGACTTGCTTTGAGAACATTCGACACTGTCCT
AGTTTTAACTCTTTAACAGTGTCTTGAGTTGCTCAATTGAAAATTTTCCCTGTTTGTTTT
CTCGATCTTTATTTGTTGTATTTTCTTTGTGAAACCAAGTAGCTTGTTTTGTATCATGAA
CTG

QA 8 850 8 850
DS 



AS 1 2

CO CL8265Contig1 552 2 1 U
GGAATCTCATTTTGCAATCCTCTCCGTCGCATATTATTTCTAAAGGTATCGAAGCTTTGT
GAAGAGATGTCAGGAAGAGGAAAGGGAGGAAAGGGATTGGGAAAGGGAGGAGCCAAGAGG
CACAGGAAGGTGCTGAGAGACAACATCCAAGGTATCACCAAGCCTGCCATCCGTCGTCTT
GCTCGCCGAGGTGGAGTCAAGCGTATAAGCGGTCTCATCTACGAAGAGACCAGAGGAGTC
CTCAAGATCTTCCTCGAGAATGTCATCCGCGATGCCGTCACCTACACCGAGCACGCCAGG
AGGAAGACCGTCACCGCCATGGATGTCGTCTATGCTTTGAAGAGGCAGGGACGCACTCTC
TACGGTTTCGGCGGTTAAATCAAATCGACGGAGTTGGGAATTAGGGTTTCGAAAGTTTGG
TTAATTTCGCTGGCGTTGTGAACTTGATTAGTAAAAGTAAATCTAGGAGTTTGTTTTTGT
TGTTGTTCTGTCTCTCGTCCTTAAATCAATGTGGTCTTATTGTAGCTGAGAAAAATCTTA
AATGGAAGTTGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BB23JQ C 1
AF RR4BB23TF U 1
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AATGGAAGTTGG

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DS 

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GGAATCTCATTTTGCAATCCTCTCCGTCGCATATTATTTCTAAAGGTATCGAAGCTTTGT
GAAGAGATGTCAGGAAGAGGAAAGGGAGGAAAGGGATTGGGAAAGGGAGGAGCCAAGAGG
CACAGGAAGGTGCTGAGAGACAACATCCAAGGTATCACCAAGCCTGCCATCCGTCGTCTT
GCTCGCCGAGGTGGAGTCAAGCGTATAAGCGGTCTCATCTACGAAGAGACCAGAGGAGTC
CTCAAGATCTTCCTCGAGAATGTCATCCGCGATGCCGTCACCTACACCGAGCACGCCAGG
AGGAAGACCGTCACCGCCATGGATGTCGTCTATGCTTTGAAGAGGCAGGGACGCACTCTC
TACGGTTTCGGCGGTTAAATCAAATCGACGGAGTTGGGAATTAGGGTTTCGAAAGTTTGG
TTAATTTCGCTGGCGTTGTGAACTTGATTAGTAAAAGTAAATCTAGGAGTTTGTTTTTGT
TGTTGTTCTGTCTCTCGTCCTTAAATCAATGTGGTCTTATTGTAGCTGAGAAAAATCTTA
AATGGAAGTTGG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

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TACGATTTGTCCGTACTCTCCTAGTTGTGCATGATGATCATGTCCAGAATTACGTTGTTA
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CAGCCCGGTCTATGT


BQ
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AF RR4BH15TF U 1
AF RR4BI63TF U 1
BS 1 802 RR4BH15TF
BS 803 855 RR4BI63TF

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QA 1 802 1 802
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CTGCTGCTGCGGTTGATCTGAGAAGAAGAGTTGACGACCGTGCATTGGATAAAGAGGAGG
AAGATTATTTCAATGAAGAGAGCGATGAAGAAGATTCCGCATCTGCTTCTAATACACAAA
AGGAAAAACCTGCTTCTAACGCAAAGAAAGAGCAACCGAAGCCTCCTCACATATCAAATG
GAGTTGCTGCAAGCCCAGCTTCTTCGAGCCCGAGGTCTGGAGGCTTGGTTGACTATGAGG
ACGATGAAGATGATGAAGACTATAAACCTCCTCCCAGGAAACAGCCCGAAGTCTTGAGGA
GGAAGAAGGCGAGCTCCTTGGGCTGAAACGCAAATCCCCTTTCCCAGAAAGAGAACAAGA
GCCTTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAA*CCCGAAA*GAGAAAACGTGTTTGCTGT
GCTGTGTTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTCGCAAAGAAAGTCAGGCAGCACTGGATCTG
CAGCCCGGTCTATGT

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4D209TF U 1
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GTGCGGGAGCAATACTCCAAGCAAGGGTCAACACTCTCGTGTGGGGTGCTCCCAATAAAC
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GAGGAGTTCTGGAATCAGAATGTGCTCAGACAATGCAGCAGTTTTTCCAGCTGAGGAGAA
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ATCATCATCCCTCGAAGCTCCTCAACAAGATGCATCAAATCTTACCCTTCTTCTGTCTAT
AGAAGCTTTGCCTCCAAATCCTCCAGTGTTCATGCATCTTTGACGCAGCCAAACCACGGT
ACAACTTTTGCATCTGATCTGTTCAGAATTTGTATATTTATGTTTC
ACTGTC

QA 1 706 1 706
DS 

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TCTCGGAGCAGATGGCAGCTGGATCAGGCTGTTTCCTGGAGGTGAAGGAAATGGATCAGA
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AGGAGTTCTGGAATCAGAATGTGCTCAGACAATGCAGCAGTTTTTCCAGCTGAGGAGAAA
GAAGAAAGACAAGGACTCAGATCCACCCGCTCCTACCGATCATCACCATCATCATCATCA
TCATCATCCCTCGAAGCTCCTCAACAAGATGCATCAAATCTTACCCTTCTTCTGTCTATA
GAAGCTTTGCCTCCAAATCCTCCAGTGTTCATGCATCTTTGACGCAGCCAAACCACGGTA
CAACTTTTGCATCTGATCTGTTCAGAATTTGTATATTTATGTTTCCACTGTCTTTTGTTA
AAGTCTGAAGACCAGGTTGGTTCATTGTAATGCCAGTGATTGTAATGTTAATGCGGCATT
TTCTATTGGAAACGCATGTTTTAGTTTTGGTGTATATATTCATTTGGG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

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GTGGAAAGGGAGCCCGGTTCATCTCGTGGTCGGTATGGGTGGTCACGATTGGCAATCGAA
TTGGGCGGTTAGACCGAACCATCCGGATCTTCCTATATTCCCTCAGCCTGAAGAATCAAT
GTACCGGACGGGTGAGTTTGGGTACACTCGCCTGGTTGCAAACGAAGACAAGCTCACCGT
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TGAAGTAATCAGTGGGAGCAGAGACGATTTTAAAAGCTCAGATGCTGCGACCGCTCCTGC
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TCCTTCATCTGCAACATTTGTGGAAAAATCTGAAGCTAGTGATGGCTCGTGGTCTGTCAA
AGGAGCAGGGTTGGTGGTTATGGGTGTGGTATTAGGGTTCATTGCTGGGTATTTTACGGG
GGTGAAGAAAGGATCTTCAGCTCGTAACCGTTGGATCCCAGTCAAGAGCGAGGAGATTTA
ATATTAAACAAGTGAATCTATTTAGGCGCACGTTTTGTGTATAGTATCTTCTTCCCCACG
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TATTTCATTTTGGATGTAGAACAAAAAAAACACATTCTTATACC


BQ
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AF RR4F440TF U 1
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GAGA
TCCCTC

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DS 

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TTTTACGGGGGTGAAGAAAGGATCTTCAGCTCGTAACCGTTGGATCCCAGTCAAGAGCGA
GGAGATTTAATATTAAACAAGTGAATCTATTTAGGCGCACGTTTTGTGTATAGTATCTTC
TTCCCCACGGTAAGGGAGCACAAGTTTTAGTGATACATTATAATAATACTGATTCTTGTA
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CATCCTTTTTATTTCATTTTGGATGTAGAACAAAAAAAACACATTCTTATACC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

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TTCTGAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GI95JQ C 1
AF RR4GI95TF U 1
BS 1 547 RR4GI95TF

RD RR4GI95JQ 547 0 0
TTTTTTTTCTCTCGATGGATTCTCCCATGGCAATCACTCCGGCCACCACCGCTTCCCTCT
CTTTTCCAGTTCCCACTCTTTCGTCTTCTCTACCACAGATTCCAAAATCCGAGTTTCTCT
ACAGTGAGCGCGGCGGCCAATCTGACGGCAGGAGCGATCACGAAGATGCTGAGCGGAGAA
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CAAGCGCGGGGGAACCAGAAGCAGAGCGTTGAGAGGTACAAGGTCGCCGTATCAGACGGG
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ATTAAAAATCAGATCGATCCTTAGACTCACTCGATTCAACTGCAGCCCGAATCGAAGGTA
ATGATTCTGATGATAAGTTGTGTAGATGATTGATTGTAGAACGAATCAATGTAAATGTTA
AACTCTGATTGATTATTACTTCTGTTACTCTATGAAATGCATTTAGCTTCTATGAGATTT
TTCTGAC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR4GI95TF 547 0 0
TTTTTTTTCTCTCGATGGATTCTCCCATGGCAATCACTCCGGCCACCACCGCTTCCCTCT
CTTTTCCAGTTCCCACTCTTTCGTCTTCTCTACCACAGATTCCAAAATCCGAGTTTCTCT
ACAGTGAGCGCGGCGGCCAATCTGACGGCAGGAGCGATCACGAAGATGCTGAGCGGAGAA
GTAAAGGGGGAGGAGGGGATGACGCCCATCCTGCAAGTCATAGAGATTAAGATGATTCAG
CAAGCGCGGGGGAACCAGAAGCAGAGCGTTGAGAGGTACAAGGTCGCCGTATCAGACGGG
ATCCAGTCTCAAGAAGATATGCTGAGCACCGCTTCCAACGTCCTCGTCAAACAAGGGAGT
ATTAAAAATCAGATCGATCCTTAGACTCACTCGATTCAACTGCAGCCCGAATCGAAGGTA
ATGATTCTGATGATAAGTTGTGTAGATGATTGATTGTAGAACGAATCAATGTAAATGTTA
AACTCTGATTGATTATTACTTCTGTTACTCTATGAAATGCATTTAGCTTCTATGAGATTT
TTCTGAC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL8270Contig1 579 2 3 U
GATCAAAACATTAAACGTTTATGTAAGTAAAAAAGAATAGTTACAACAACTAATGGTTGG
CAACAGAGAAGACACTAAACGCTATGAAAATGGTAAAAGATTACAATTTTCTTGAAAATA
ACTTAACTGTATGATCCTTTTATTTCTTTGAATGTACATAAAACGAAAACCTTAAGAAAG
CATGTGCATTTTGCTTTGTTGAAAACCTAAGCCTTTTGTTTTGTTCTTCCTTTCATTTGT
ACATGAACTACAAGAGGAGAATCCAGCACAGCAAAAACCTCCCATCTTAACTCTATATTC
AGACCAGACCAGACAAACAAAACAACACAACTTTAATCCCCAAAACCACCACCGACGATC
GAAGACCTGATCCTTTAAACATTTTCCACACTCCCAAAAGTCAAGAATCCATTGGATTCC
CAAGTAGAGTATGAACCAAGTTAGTAGCATTCCTCCTGATTTTCTCACTCTCATTATCCT
CCAAACCAAAGCATATCTCAACCACACCTTCTCTCTTAACCTCATCAACGATCTCTCTGC
TACAACAACACAAGCAGTTGAGGATAAACAGAGAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EA24TF C 1
AF RR4EA24JQ U 19
BS 1 18 RR4EA24TF
BS 19 569 RR4EA24JQ
BS 570 579 RR4EA24TF

RD RR4EA24TF 579 0 0
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CAACAGAGAAGACACTAAACGCTATGAAAATGGTAAAAGATTACAATTTTCTTGAAAATA
ACTTAACTGTATGATCCTTTTATTTCTTTGAATGTACATAAAACGAAAACCTTAAGAAAG
CATGTGCATTTTGCTTTGTTGAAAACCTAAGCCTTTTGTTTTGTTCTTCCTTTCATTTGT
ACATGAACTACAAGAGGAGAATCCAGCACAGCAAAAACCTCCCATCTTAACTCTATATTC
AGACCAGACCAGACAAACAAAACAACACAACTTTAATCCCCAAAACCACCACCGACGATC
GAAGACCTGATCCTTTAAACATTTTCCACACTCCCAAAAGTCAAGAATCCATTGGATTCC
CAAGTAGAGTATGAACCAAGTTAGTAGCATTCCTCCTGATTTTCTCACTCTCATTATCCT
CCAAACCAAAGCATATCTCAACCACACCTTCTCTCTTAACCTCATCAACGATCTCTCTGC
TACAACAACACAAGCAGTTGAGGATAAACAGAGAATACC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4EA24JQ 551 0 0
TTATGTAAGTAAAAAAGAATAGTTACAACAACTAATGGTTGGCAACAGAGAAGACACTAA
ACGCTATGAAAATGGTAAAAGATTACAATTTTCTTGAAAATAACTTAACTGTATGATCCT
TTTATTTCTTTGAATGTACATAAAACGAAAACCTTAAGAAAGCATGTGCATTTTGCTTTG
TTGAAAACCTAAGCCTTTTGTTTTGTTCTTCCTTTCATTTGTACATGAACTACAAGAGGA
GAATCCAGCACAGCAAAAACCTCCCATCTTAACTCTATATTCAGACCAGACCAGACAAAC
AAAACAACACAACTTTAATCCCCAAAACCACCACCGACGATCGAAGACCTGATCCTTTAA
ACATTTTCCACACTCCCAAAAGTCAAGAATCCATTGGATTCCCAAGTAGAGTATGAACCA
AGTTAGTAGCATTCCTCCTGATTTTCTCACTCTCATTATCCTCCAAACCAAAGCATATCT
CAACCACACCTTCTCTCTTAACCTCATCAACGATCTCTCTGCTACAACAACACAAGCAGT
TGAGGATAAAC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL8271Contig1 369 2 1 U
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AAGAAGGAAGGAAGGAAGGATGAAGAAGATATCGGTGGTTCTCATGGGCTGTGGAGGCGT
TGGCCGACAACTTCTGCAACACATTGTCTCTTTCCGATCCCTACACGCCAAAATGGGAGT
TCATATACGTGTGATTGGAGTCAGTGACAGTAAATCCTTACTTGTTCCAGTGGATGTGGT
CAAAGAGGAACTTGATGATGATCTCTTGTCAGTTGTTTGCCGTCTCAAATCTGCTGGTTC
TCCGTTATCCACGCTTGGTGCTTTAGGTAAAGGTGAATATCGTGTGTTCAGTGGTTCTGA
GTCAAGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AC80JQ C 1
AF RR4AC80TF U 1
BS 1 369 RR4AC80TF

RD RR4AC80JQ 369 0 0
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AAGAAGGAAGGAAGGAAGGATGAAGAAGATATCGGTGGTTTTCATGGGCTGTGGAGGCGT
TGGCCGACAACTTTTGCAACACATTGTCTCTTTCCGATCCCTACACGCCAAAATGGGAGT
TCATATACGTGTGATTGGAGTCAGTGACAGTAAATCCTTACTTGTTCCAGTGGATGTGGT
CAAAGAGGAACTTGATGATGATCTCTTGTCAGTTGTTTGCCGTCTCAAATTTGCTGGTTT
TCCGTTATCCACGCTTGGTGCTTTAGGTAAAGGTGAATATCGTGTGTTCAGTGGTTTTGA
GTCAAGAAG

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR4AC80TF 369 0 0
GGACCCATATGAGCCATAGTTAGCCATAGTCAATACTAGCGAAGCTGAGGAAATCTGAGA
AAGAAGGAAGGAAGGAAGGATGAAGAAGATATCGGTGGTTCTCATGGGCTGTGGAGGCGT
TGGCCGACAACTTCTGCAACACATTGTCTCTTTCCGATCCCTACACGCCAAAATGGGAGT
TCATATACGTGTGATTGGAGTCAGTGACAGTAAATCCTTACTTGTTCCAGTGGATGTGGT
CAAAGAGGAACTTGATGATGATCTCTTGTCAGTTGTTTGCCGTCTCAAATCTGCTGGTTC
TCCGTTATCCACGCTTGGTGCTTTAGGTAAAGGTGAATATCGTGTGTTCAGTGGTTCTGA
GTCAAGAAG

QA 1 369 1 369
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8273Contig1 880 2 4 U
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CGCTATTACAGCCGATGCGGAGGAGTTGCTAGCAGAAGCTGAAGAGATGGCCCAAACAGG
AATTCTCGTGTCTATAGACAATGAGTTAACTGGAGTTCTAGCTGTTTCGGATCCTGTAAA
ACCGAGTGCTCGAGAAGCCATCTCAATTCTAAAATCCATGAATATCAAAAGTATCATGGT
AACAGGTGACAACTGGGGAACTGCAAACTCCATTGCTAGAGAAGTCGGCATCGACTCTGT
CATCGCAGAGGCTAAACCCGAGCAGAAAGCAGAGAAAGTCAAGGAACTACAGGCTGCGGG
TCATGTTGTGGCAATGGTTGGAGATGGAGTCAATGACTCACCTGCTCTCGTGGCAGCGGA
TGTAGGAATGGCCATTGGTGCAGGAACCGACATTGCCATAGAAGCAGCTGATATTGTCCT
GATGAAAAGCAACTTGGAAGATGTGATCACAGCCATTGATCTTTCGAGGAAAACGTTCTC
AAGGATCCGTCTCAACTACGTATGGGCTCTCGGGTATAACCTCATGGGCATACCGATCGC
TGCGGGGGTGCTTTTCCCGTCTACTCGGTTCAGGTTGCCTCCGTGGATTGCAGGTGCTGC
AATGGCTGCTTCTTCTGTGAGTGTTGTGTGTTGCTCTCTCTTGTTGAAGAACTACAAACG
TCCTAAGAGGCTTGATAGTCTGGCGATCCGTGAGGTTCAAGTGGAGCGGGTTTAGAAAAC
CAAACTAAACCGATCCACAAACAGATTACTTGGTTGTGTGATTTGATGAACTATATGATT
TGTTACGTTAGCATAATAAGAAATTTCACATGATTGGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H350TF U 1
AF RR4H350JQ C 300
BS 1 653 RR4H350TF
BS 654 654 RR4H350JQ
BS 655 705 RR4H350TF
BS 706 880 RR4H350JQ

RD RR4H350TF 705 0 0
GACCGTTAAAGGAAGAGAGATTATGGTGGGAAACAAGAACCTCACGTCTGGTTACAAAGT
CGCTATTACAGCCGATGCGGAGGAGTTGCTAGCAGAAGCTGAAGAGATGGCCCAAACAGG
AATTCTCGTGTCTATAGACAATGAGTTAACTGGAGTTCTAGCTGTTTCGGATCCTGTAAA
ACCGAGTGCTCGAGAAGCCATCTCAATTCTAAAATCCATGAATATCAAAAGTATCATGGT
AACAGGTGACAACTGGGGAACTGCAAACTCCATTGCTAGAGAAGTCGGCATCGACTCTGT
CATCGCAGAGGCTAAACCCGAGCAGAAAGCAGAGAAAGTCAAGGAACTACAGGCTGCGGG
TCATGTTGTGGCAATGGTTGGAGATGGAGTCAATGACTCACCTGCTCTCGTGGCAGCGGA
TGTAGGAATGGCCATTGGTGCAGGAACCGACATTGCCATAGAAGCAGCTGATATTGTCCT
GATGAAAAGCAACTTGGAAGATGTGATCACAGCCATTGATCTTTCGAGGAAAACGTTCTC
AAGGATCCGTCTCAACTACGTATGGGCTCTCGGGTATAACCTCATGGGCATACCGATCGC
TGCGGGGGTGCTTTTCCCGTCTACTCGGTTCAGGTTGCCTCCGTGGATTGCAG*TGCTGC
AATGGCTGCTTCTTCTGTGAGTGTTGTGTGTTGCTCTCTCTTGTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4H350JQ 581 0 0
TCATCGCAGAGGCTAAACCCGAGCAGAAAGCAGAGAAAGTCAAGGAACTACAGGCTGCGG
GTCATGTTGTGGCAATGGTTGGAGATGGAGTCAATGACTCACCTGCTCTCGTGGCAGCGG
ATGTAGGAATGGCCATTGGTGCAGGAACCGACATTGCCATAGAAGCAGCTGATATTGTCC
TGATGAAAAGCAACTTGGAAGATGTGATCACAGCCATTGATCTTTCGAGGAAAACGTTCT
CAAGGATCCGTCTCAACTACGTATGGGCTCTCGGGTATAACCTCATGGGCATACCGATCG
CTGCGGGGGTGCTTTTCCCGTCTACTCGGTTCAGGTTGCCTCCGTGGATTGCAGGTGCTG
CAATGGCTGCTTCTTCTGTGAGTGTTGTGTGTTGCTCTCTCTTGTTGAAGAACTACAAAC
GTCCTAAGAGGCTTGATAGTCTGGCGATCCGTGAGGTTCAAGTGGAGCGGGTTTAGAAAA
CCAAACTAAACCGATCCACAAACAGATTACTTGGTTGTGTGATTTGATGAACTATATGAT
TTGTTACGTTAGCATAATAAGAAATTTCACATGATTGGTCG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8274Contig1 915 2 2 U
GGAGCCAAAGAAATCAAATCAGACCAGAGGGTCTCCCTGGAGGGCTACTAGGCCTTCCAG
AAGGTGGTAACTTACTTGCAGTTGGGGATCATGCAAACCGACAAAAATACATGTCTTTTC
CAGGACCTCATAATCAGGAGCCTGAAGTAGCTTTCAACATCTCTGACAAGCTAGCTACTT
TAAACTCCGGACCAATAATGGGAGGTCCAGATGGTACTTTTCTTCACCATCATCCTCAAC
AATATGCGACCAACCCTTCTCCTCACTTGAATGGTTCAGGCCCTGGTTTCCATCATTTGG
ATACTCGACATGCACCTCAGCTGGATTTCATGGGCCAAGGAAATATCCAGGATCCTCCAC
TAAATCACCTGTTTCCACCAGACATGATTCATCGTCCACCTTTCCTTCCAGAGTTTGATC
GTCTTCCTCCACATGTGCAGCAGAAGATGCATATGCAAGACAACCTGCAACGCCATCATC
TTATGCAAGGATTCCCCGGTGGTGGTCCACCACACCATCACTCTCCTAATCTAAACAACC
AAATGCAGGGTCTCCCCTTCGCCCATCACCAGCCCAACTACGGTTCTCAAGGCAACAGAG
TTGAACATCCAGCTTCACTGCAGACACTCTTAGGGATTCATCAGAGGATGGACCCATCCA
AGCAGCCTCCAGCAATGGGTCAAGCCGGTGGTCCCAATCGTCAGGGCTCTATGGGTCAGG
AACTCGACCTTGGCTTGGGCTACAGGTGATTTTACTCTGCTCACAATCCCTTTACGGTTT
ACACTAAGTTACTTTGTGATGTGCAAAGTAGTCAAAATTATCATTTAAAGAAGAAAAAAA
ATCAGTGAACTGTCTTTTCTATTTGTGCTTGTGATATCTGGATGCTTTTAATTAACAGTG
GTAGATTTTGATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D847TF U 1
AF RR4D847JQ C 425
BS 1 673 RR4D847TF
BS 674 915 RR4D847JQ

RD RR4D847TF 673 0 0
GGAGCCAAAGAAATCAAATCAGACCAGAGGGTCTCCCTGGAGGGCTACTAGGCCTTCCAG
AAGGTGGTAACTTACTTGCAGTTGGGGATCATGCAAACCGACAAAAATACATGTCTTTTC
CAGGACCTCATAATCAGGAGCCTGAAGTAGCTTTCAACATCTCTGACAAGCTAGCTACTT
TAAACTCCGGACCAATAATGGGAGGTCCAGATGGTACTTTTCTTCACCATCATCCTCAAC
AATATGCGACCAACCCTTCTCCTCACTTGAATGGTTCAGGCCCTGGTTTCCATCATTTGG
ATACTCGACATGCACCTCAGCTGGATTTCATGGGCCAAGGAAATATCCAGGATCCTCCAC
TAAATCACCTGTTTCCACCAGACATGATTCATCGTCCACCTTTCCTTCCAGAGTTTGATC
GTCTTCCTCCACATGTGCAGCAGAAGATGCATATGCAAGACAACCTGCAACGCCATCATC
TTATGCAAGGATTCCCCGGTGGTGGTCCACCACACCATCACTCTCCTAATCTAAACAACC
AAATGCAGGGTCTCCCCTTCGCCCATCACCAGCCCAACTACGGTTCTCAAGGCAACAGAG
TTGAACATCCAGCTTCACTGCAGACACTCTTAGGGATTCATCAGAGGATGGACCCATCCA
AGCAGCCTCCAGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4D847JQ 491 0 0
TCCTCCACATGTGCAGCAGAAGATGCATATGCAAGACAACCTGCAACGCCATCATTTTAT
GCAAGGATTCCCCGGTGGTGGTCCACCACACCATCACTTTCCTAATTTAAACAACCAAAT
GCAGGGTTTCCCCTTCGCCCATCACCAGCCCAATTACGGTTCTCAAGGCAACAGAGTTGA
ACATCCAGCTTCACTGCAGACACTTTTAGGGATTCATCAGAGGATGGACCCATCCAAGCA
GCCTCCAGCAATGGGTCAAGCCGGTGGTCCCAATCGTCAGGGCTCTATGGGTCAGGAACT
CGACCTTGGCTTGGGCTACAGGTGATTTTACTCTGCTCACAATCCCTTTACGGTTTACAC
TAAGTTACTTTGTGATGTGCAAAGTAGTCAAAATTATCATTTAAAGAAGAAAAAAAATCA
GTGAACTGTCTTTTCTATTTGTGCTTGTGATATCTGGATGCTTTTAATTAACAGTGGTAG
ATTTTGATGCT

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL8275Contig1 1142 2 6 U
GGATACCAAGAGCCCTACAAAGCTTTGAGTGGCGATCCGATTCTCACTCTCTCCCTTTCT
CTCTCATCTCAATATTTTTTTTTTTCTCAAAGAAAATCCAACGAAGGAAAAAAAGAGGGG
GGTTCATCATCATCAAATCATCAATCAATCAAATTCAATATCTTCATCAGCACGAGATCC
ATCTCTTTCCTTTCCACTCACTCCTCACTAATCAATGCCTTGATTTTCCCGAGATCAAAA
AAATGGAGAAGAAGAAGTATCCGATAGGGCCAGAGCACTACACCATCTACGAGGTCATCG
GTCAAGGCTGCAGCGCTTTAGTGCATCGCGCCTTGTGCATCCCTTTCGATGAAGTCGTTG
CTATTAAGATTCTCGATTTCGAACGAGACAACTGCGACCTGAACAATATATCACGTGAAG
CGCAGACGATGATGCTAGTAGATCATCCCAATGTGTTGAAATCGCATTGCTCTTTCGTGA
GTGACCACAACCTGTGGGTTGTCATGCCTTACATGTCTGGTGGTTCTTGTCTTCACATTC
TCAAAGCGGCTTATCCTGATGGCTTTGAGGAAGTTATTATTGCCACTATGCTCCGTGAGG
CCTTGAAGGGCTTAGACTATCTCCATCAGCACGGCCACATTCATCGTGATGTCAAAGCGG
GGAACATTTTGCTCGGTGCTCGTGGTGCAATCAAATTGGGAGACTTTGGTGTATCTGCCT
GTCTCTTTGATTCTGGTGATAGGCAACGGACGAGGAACACATTTGTTGGAACGCCTTGTT
GGATGGCACCTGAAGTCATGGAGCAGCTACATGGTTATGACTTCAAGGCTGATATTTGGT
CGTTTGGTATAACTGGGCTAGAGCTTGCACATGGACACGCTCCTTTCTCTAAATATCCAC
CTATGAAGGTTCTGCTTATGACGTTACAAAATGCACCACCAGGGCTGGATTACGAAAGAG
ATAGGAAGTTTTCAAGGTCTTTCAAGCAGATGATTGCTAGTTGTCTAGTCAAAGACCCTT
CCAAACGCCCATTTGCTAAGAAGTTGTTAAAGCATTCCTTTCAAGCAAGCAAGGTCAAGC
GACTACATTGCTCGGAAACTTCTGGATGGATTACCAGATCTTGTTAACCGTGTTCAGGCC
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4H352TF U 1
AF RR4H352JQ C 307
BS 1 689 RR4H352TF
BS 690 690 RR4H352JQ
BS 691 718 RR4H352TF
BS 719 719 RR4H352JQ
BS 720 730 RR4H352TF
BS 731 1142 RR4H352JQ

RD RR4H352TF 730 0 0
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CTCTCATCTCAATATTTTTTTTTTTCTCAAAGAAAATCCAACGAAGGAAAAAAAGAGGGG
GGTTCATCATCATCAAATCATCAATCAATCAAATTCAATATCTTCATCAGCACGAGATCC
ATCTCTTTCCTTTCCACTCACTCCTCACTAATCAATGCCTTGATTTTCCCGAGATCAAAA
AAATGGAGAAGAAGAAGTATCCGATAGGGCCAGAGCACTACACCATCTACGAGGTCATCG
GTCAAGGCTGCAGCGCTTTAGTGCATCGCGCCTTGTGCATCCCTTTCGATGAAGTCGTTG
CTATTAAGATTCTCGATTTCGAACGAGACAACTGCGACCTGAACAATATATCACGTGAAG
CGCAGACGATGATGCTAGTAGATCATCCCAATGTGTTGAAATCGCATTGCTCTTTCGTGA
GTGACCACAACCTGTGGGTTGTCATGCCTTACATGTCTGGTGGTTCTTGTCTTCACATTC
TCAAAGCGGCTTATCCTGATGGCTTTGAGGAAGTTATTATTGCCACTATGCTCCGTGAGG
CCTTGAAGGGCTTAGACTATCTCCATCAGCACGGCCACATTCATCGTGATGTCAAAGCGG
GGAACATTTTGCTCGGTGCTCGTGGTGCA*TCAAATTGGGAGACTTTGGTGTATCTGC*T
GTCTCTTTGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4H352JQ 836 0 0
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AGAT*CTCGATT*CGAACGAGACAACTGCGACCTGAACAATATATCACGTGAAGCGCAGA
CGATGATGCTAGTAGATCATCCCAATGTGTTGAAATCGCATTGCTCTTTCGTGAGTGACC
ACAACCTGTGGGTTGTCATGCCTTACATGTCTGGTGGTTCTTGTCTTCACATTCTCAAAG
CGGCTTATCCTGATGGCTTTGAGGAAGTTATTATTGCCACTATGCTCCGTGAGGCCTTGA
AGGGCTTAGACTATCTCCATCAGCACGGCCACATTCATCGTGATGTCAAAGCGGGGAACA
TTTTGCTCGGTGCTCGTGGTGCAATCAAATTGGGAGACTTTGGTGTATCTGCCTGTCTCT
TTGATTCTGGTGATAGGCAACGGACGAGGAACACATTTGTTGGAACGCCTTGTTGGATGG
CACCTGAAGTCATGGAGCAGCTACATGGTTATGACTTCAAGGCTGATATTTGGTCGTTTG
GTATAACTGGGCTAGAGCTTGCACATGGACACGCTCCTTTCTCTAAATATCCACCTATGA
AGGTTCTGCTTATGACGTTACAAAATGCACCACCAGGGCTGGATTACGAAAGAGATAGGA
AGTTTTCAAGGTCTTTCAAGCAGATGATTGCTAGTTGTCTAGTCAAAGACCCTTCCAAAC
GCCCATTTGCTAAGAAGTTGTTAAAGCATTCCTTTCAAGCAAGCAAGGTCAAGCGACTAC
ATTGCTCGGAAACTTCTGGATGGATTACCAGATCTTGTTAACCGTGTTCAGGCCAT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL8276Contig1 1141 2 6 U
GAAGGTTCTATCGCCGCCGATGGAGGCTAAGCTACTCAACCCCACTTTTTACAACTCGCC
AAGACTCTGTCTCGCTCCCCATTCTTCTACACCTGTCTCGTATCTACCCGGTAAATTAAG
ATTTGGAACGCCTCGCTCTCTTTCACTCCGTCTCTCCACGGCAACACCGATCCGTGGTTG
CAGACATGATCCTGACCTGAGCTGTACGGTAAAACAATGTTGTGTACTTATGCTCGAGGA
GGGGGCTAAGGGTGGATGAGAGTGAGAGCCTGACACTTGACAGCATAAGTCACTCTTTGA
TCCGTCAAGAGGACAGCATTATATTCCACCTTCTTGAGCGAGCTCAGTATTGTTACAATG
CTGATACTTATGACGAGGATGCTTTTACTATGGAAGGGTTTCAAGGATCTTTGGTCGAGT
TTATTGTCAGAGAAACCGAACAGCTTCAGGCTAAGGTGGACAAGTATAAAAGTCCAGATG
AACATCCCTTCTTCCCACAGTGCTTGCCTGAGGCTGAGTCAATCCCTCCCCCTATTCAAT
ACCCACAGGTTCTACATCAAAGTGCCCACTCGATAAGCATCAACAAGAAGGTGTGGAACA
TGTATTTCAAACACATTCTTCCCAGACTGGTCAAGCCAGGGGACGATGGTAATAGTGGTT
CATCTGCTCTATGTGACACCATGTGTTTACAGATACTTTCAAAGAGAATTCACTATGGTA
AATTTGTTGCTGAGGCCAAGTTTCGTGAAGATCCAGCTACATATGAAACAGCCATCCGTG
AACAAGACCGGACACAACTGTTGATACTTCTGACGTATGAAACAGATGAAGAAGTAATCA
AGAAACGAGTTGAGAGCAAAGCTAGAATTTTCGGTCAATACATAACGATCAACGATCAAG
ACACTGGAGCTGCTGATCCTTCATACAAAATCAATCCTAGCTTAGTTTCAAAACTCTATG
GAGAAAGGATCATGCCACTCACAAAGGAAGTCCAAGTTGAGTACTTGCTTAGGAGGCTGG
ATTGGTGTTGTTTATCAAGAAGAAAGAAACCATAACATTTGTATTTGATACTCACTCTGT
TTCATTTTAATTGTCATTCTAGACTTATGCACACATATTAATAAAACATGTAATTTTATA
T


BQ
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10 

AF RR4FV13TF U 1
AF RR4FV13JQ C 337
BS 1 702 RR4FV13TF
BS 703 703 RR4FV13JQ
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BS 736 746 RR4FV13TF
BS 747 1141 RR4FV13JQ

RD RR4FV13TF 746 0 0
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AAGACTCTGTCTCGCTCCCCATTCTTCTACACCTGTCTCGTATCTACCCGGTAAATTAAG
ATTTGGAACGCCTCGCTCTCTTTCACTCCGTCTCTCCACGGCAACACCGATCCGTGGTTG
CAGACATGATCCTGACCTGAGCTGTACGGTAAAACAATGTTGTGTACTTATGCTCGAGGA
GGGGGCTAAGGGTGGATGAGAGTGAGAGCCTGACACTTGACAGCATAAGTCACTCTTTGA
TCCGTCAAGAGGACAGCATTATATTCCACCTTCTTGAGCGAGCTCAGTATTGTTACAATG
CTGATACTTATGACGAGGATGCTTTTACTATGGAAGGGTTTCAAGGATCTTTGGTCGAGT
TTATTGTCAGAGAAACCGAACAGCTTCAGGCTAAGGTGGACAAGTATAAAAGTCCAGATG
AACATCCCTTCTTCCCACAGTGCTTGCCTGAGGCTGAGTCAATCCCTCCCCCTATTCAAT
ACCCACAGGTTCTACATCAAAGTGCCCACTCGATAAGCATCAACAAGAAGGTGTGGAACA
TGTATTTCAAACACATTCTTCCCAGACTGGTCAAGCCAGGGGACGATGGTAATAGTGGTT
CATCTGCTCTATGTGACACCATGTGTTTACAGATACTTTCAA*GAGAATTCACTATGGTA
AATTTGTTGCTGAG*CCAAGTTTCGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4FV13JQ 805 0 0
AGCGAGCTCAGTATTGTTACAATGCTGATACTTATGACGAGGATGCTTTTACTATGGAAG
GGTTTCAAGGATCTTTGGTCGAGTTTATTGTCAGAGAAACCGAACAGCTTCAGGCTAAGG
TGGACAAGTATAAAAGTCCAGATGAACATCCCTTCTTCCCACAGTGCTTGCCTGAGGCTG
AGTCAATCCCTCCCCCTATTCAATACCCACAGGTTCTACATCAAAGTGCCCACTCGATAA
GCATCAACAAGAAGGTGTGGAACATGTATTTCAAACACATTCTTCCCAGACTGGTCAAGC
CAGGGGACGATGGTAATAGTGGTTCATCTGCTCTATGTGACACCATGTGTTTACAGATAC
TTTCAAAGAGAATTCACTATGGTAAATTTGTTGCTGAGGCCAAGTTTCGTGAAGATCCAG
CTACATATGAAACAGCCATCCGTGAACAAGACCGGACACAACTGTTGATACTTCTGACGT
ATGAAACAGATGAAGAAGTAATCAAGAAACGAGTTGAGAGCAAAGCTAGAATTTTCGGTC
AATACATAACGATCAACGATCAAGACACTGGAGCTGCTGATCCTTCATACAAAATCAATC
CTAGCTTAGTTTCAAAACTCTATGGAGAAAGGATCATGCCACTCACAAAGGAAGTCCAAG
TTGAGTACTTGCTTAGGAGGCTGGATTGGTGTTGTTTATCAAGAAGAAAGAAACCATAAC
ATTTGTATTTGATACTCACTCTGTTTCATTTTAATTGTCATTCTAGACTTATGCACACAT
ATTAATAAAACATGTAATTTTATAT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8278Contig1 566 2 11 U
AATCTCGATTCTCTAAAAATAAAAAAATCTCTGATCACGGAAGAAGAGAAATGAGCTACG
AGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCCTCCAGGATACCAATCTCATTATCCGCCTCCTG
GTTATCCATCGGCGCCTCCGCCGCCGGGATATCCTCCGCCGCATCAGGAAGGTTATCCAC
CACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTACCCACCGCCGCGTCCATACGAAGGCGGTTATC
AAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCAGCAGTGCAACCACT
ACCAGCACGATCACCACCATTACCAGGATTCGAACTCCGATGGCTCCTCTTTCCTCCGTG
GCTGTCTTGCTGCTCTGTGCTGTTGCTGTTTGCTGGAGGAATGCTTCTGAAAATGCCCCT
TCCTTCTCCCCCGGATCATCTCTTGTTACTATCGTCATTTACAGTTACATTATATGTTAA
AATCAAATCCCAGACATGCCATAACTTCTCTGTCTTTATATACTGTGAAATGTTTCATTG
TCTGTTAATGCTGTACCTCTTTGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FI82TF U 13
AF RR4GX47TF U 1
BS 1 105 RR4GX47TF
BS 106 106 RR4FI82TF
BS 107 211 RR4GX47TF
BS 212 212 RR4FI82TF
BS 213 221 RR4GX47TF
BS 222 222 RR4FI82TF
BS 223 223 RR4GX47TF
BS 224 224 RR4FI82TF
BS 225 410 RR4GX47TF
BS 411 411 RR4FI82TF
BS 412 566 RR4GX47TF

RD RR4FI82TF 446 0 0
GGAAAATA
AAAAAAATCTCTGATCACGGAAGAAGAGAAATGAGCTCCGAGAGAGTTCCACCGGAATCG
TATCCTCCTCCAGGGTACCAATCTCATTATCCGCCTCCTGGTTATCCATCGGCGCCTCCG
CCGCCGGGATATCCTCCGCCGCATCAGGAAGGTTATCCACCACCTCAGCCTCACGGATAT
CCACCGTACCCACCGCCGCGTCCATACGAAGGCGGTTATCAAGGCTACTTCGCCGGTAAC
TATCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAGTGCAATCACTACCAGCACGATCACCACCAT
TACCAGGATTCGAACTCTGATGGCTCCTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTTGCTGCTCTGTGC
TGTTGCTGTTTGTTGGAGGAATGCTTCTGAAAATGCCC*TTCCTTCTCCCC*GGATCATC
TCTTGTTACTATCGTCAT

QA 9 446 9 446
DS 

RD RR4GX47TF 566 0 0
AATCTCGATTCTCTAAAAATAAAAAAATCTCTGATCACGGAAGAAGAGAAATGAGCTACG
AGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCCTCCAGGATACCAATCTC*TTATCCGCCTCCTG
GTTATCCATCGGCGCCTCCGCCGCCGGGATATCCTCCGCCGCATCAGGAAGGTTATCCAC
CACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTACCCGCCGCCGCGTTCTTACGAAGGCGGTTATC
AAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCAGCAGTGCAACCACT
ACCAGCACGATCACCACCATTACCAGGATTCGAACTCCGATGGCTCCTCTTTCCTCCGTG
GCTGTCTTGCTGCTCTGTGCTGTTGCTGTTTGCTGGAGGAATGCTTCTGAGAATGCCCCT
TCCTTCTCCCCCGGATCATCTCTTGTTACTATCGTCATTTACAGTTACATTATATGTTAA
AATCAAATCCCAGACATGCCATAACTTCTCTGTCTTTATATACTGTGAAATGTTTCATTG
TCTGTTAATGCTGTACCTCTTTGTTT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL8279Contig1 987 2 8 U
AGGGAAGCTAGCAAAAGTACCAGATGTAAGCATATTCTCAAAGCTTTTGGTGTTTGATGT
ATCGTTCAACGAAATCACTTCGTTGGAAGGATTATCGAAGGCCTCTAGCACATTGAAGGA
ACTCTATGTCTCTAAGAATGAGGTTAACAAGATTATGGAGATTGAACATTTGCATGACTT
GCAGATTCTTGAGCTAGGGTCCAATAGATTGCGGGTAATGGAGAATATGGAGAACTTGGC
AAAGTTAGAAGAACTGTGGCTTGGAAGGAACCGTATCAAAGTTGTGAACTTGTGTGGGCT
CAATTGTATTAGAAAGATTAGCTTGCAGAGCAATCGTTTGACCTCTATGAAAGGATTTGA
GGACTGTGTTGCTCTTGAAGAATTATATTTGAGCCATAATGGTATCTCAAAAATGGAAGG
TTTGAGTGCATTGGTTAACCTGCGGGTATTGGACGTGTCGAACAACAAGCTCACATCAGT
TGATGACATTCAGAGCCTCACAAAGCTGGAAGATTTATGGCTTAATGACAACCAGATAGA
ACACTTGAAGCAATCACAGAAGCTGTTGCAGGCTCTAAAGATAAGCTTACCACTATCTAC
CTCGAAAATAACCCTTGTGCCAAGTCTTCTGATTACGTTGCTGTGCTCAGACAAATCTTC
CCAAACGTGGAGCAAATAGACTCTAACTTATTTGCTTAAGAAGTTGGATATTCCTCGTTT
GCTCGTTTTTAGAGAGCCTGCTTCCTCATGGTTTAGACTTCAGAGAACATACATGTCTCT
GCTGCTGATCATAAAGAAGTGAAAACAAACAAATGAAACCGTTCAGTTGAGCAATATTTT
ATCAAAACGGTTATAGTGTTCGCTTGCAAGCAAAATCAATACTTGTGTTTTGGTCTGTAA
GCAGTAGTATCTAGACCTTGTCTGTAAAAGGGAACCCCGGTTGTCTTTGTTTCGACCAAC
AGTAACTTGAATACCTTGACTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FK41TF U 1
AF RR4FK41JQ C 373
BS 1 729 RR4FK41TF
BS 730 730 RR4FK41JQ
BS 731 737 RR4FK41TF
BS 738 738 RR4FK41JQ
BS 739 766 RR4FK41TF
BS 767 767 RR4FK41JQ
BS 768 795 RR4FK41TF
BS 796 987 RR4FK41JQ

RD RR4FK41TF 797 0 0
AGGGAAGCTAGCAAAAGTACCAGATGTAAGCATATTCTCAAAGCTTTTGGTGTTTGATGT
ATCGTTCAACGAAATCACTTCGTTGGAAGGATTATCGAAGGCCTCTAGCACATTGAAGGA
ACTCTATGTCTCTAAGAATGAGGTTAACAAGATTATGGAGATTGAACATTTGCATGACTT
GCAGATTCTTGAGCTAGGGTCCAATAGATTGCGGGTAATGGAGAATATGGAGAACTTGGC
AAAGTTAGAAGAACTGTGGCTTGGAAGGAACCGTATCAAAGTTGTGAACTTGTGTGGGCT
CAATTGTATTAGAAAGATTAGCTTGCAGAGCAATCGTTTGACCTCTATGAAAGGATTTGA
GGACTGTGTTGCTCTTGAAGAATTATATTTGAGCCATAATGGTATCTCAAAAATGGAAGG
TTTGAGTGCATTGGTTAACCTGCGGGTATTGGACGTGTCGAACAACAAGCTCACATCAGT
TGATGACATTCAGAGCCTCACAAAGCTGGAAGATTTATGGCTTAATGACAACCAGATAGA
ACACTTGAAGCAATCACAGAAGCTGTTGCAGGCTCTAAAGATAAGCTTACCACTATCTAC
CTCGAAAATAACCCTTGTGCCAAGTCTTCTGATTACGTTGCTGTGCTCAGACAAATCTTC
CCAAACGTGGAGCAAATAGACTCTAACTTATTTGCTTAAGAAGTTGGATATTCCTCGTTT
GCTCGTTTT*AGAGAGC*TGCTTCCTCATGGTTTAGACTTCAGAGA*CATACATGTCTCT
GCTGCTGATCATAAA
AA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR4FK41JQ 615 0 0
TCTTGAAGAATTATATTTGAGCCATAATGGTATCTCAAAAATGGAAGGTTTGAGTGCATT
GGTTAACCTGCGGGTATTGGACGTGTCGAACAACAAGCTCACATCAGTTGATGACATTCA
GAGCCTCACAAAGCTGGAAGATTTATGGCTTAATGACAACCAGATAGAACACTTGAAGCA
ATCACAGAAGCTGTTGCAGGCTCTAAAGATAAGCTTACCACTATCTACCTCGAAAATAAC
CCTTGTGCCAAGTCTTCTGATTACGTTGCTGTGTTCAGACAAATCTTCCCAAACGTGGAG
CAAATAGACTCTAACTTATTTGCTTAAGAAGTTGGATATTCCTCGTTTGCTCGTTTTTAG
AGAGCCTGCTTCCTCATGGTTTAGACTTCAGAGAACATACATGTTTCTGCTGCTGATCAT
AAAGAAGTGAAAACAAACAAATGAAACCGTTCAGTTGAGCAATATTTTATCAAAACGGTT
ATAGTGTTCGCTTGCAAGCAAAATCAATACTTGTGTTTTGGTCTGTAAGCAGTAGTATCT
AGACCTTGTCTGTAAAAGGGAACCCCGGTTGTCTTTGTTTCGACCAACAGTAACTTGAAT
ACCTTGACTTTTTCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL8280Contig1 947 2 6 U
TGACGGTGGAGTACCAGAGCAGATCCACCGGTTCATAGCATCTGCACAGCCACCTCCTCC
GCTTCATCCGCATCAACCGGCGGCAGAAAGATCACTGCCTTTTCCTGTCCCATTCGCTTC
TTTTAGCACTGATCATCAAGCCAATATTTTGAACCTTGATGGCCCTAAGATCATTCACCA
TCACCATCATCATCATCACCATGGCATCAAAGATAGTGGTGCTACATCTGAGTGGATGGG
TCATACAGATCATGATGGCGATAATCATCGTCACCATCACCATCATCCATGGTGTAGTGA
TGAAGTCCTTGCCCTTCTTAGGTTCAGATCTACGGTGGACAATTGGTTCCCTGAATTCAC
ATGGGAGCACACCTCAAGGAAGTTGGCAGAAGTTGGGTTTAAGAGGAGTCCACAAGAATG
CAAAGAGAAGTTCGAAGAAGAAGAGAGAAGATATTTCAATAGTAACAACAACACTAATGC
TCATCATATGAGCAATTACAATAAGGGAAATTATAGGCTCTTCAGTGAGGTCGATGAGTT
TTATCATCATGGTCATGCTGATGAGGAGCATGTCGTCTCATCAGAAGTTGGGGATAACCA
AAACAAGAGGAACAGTTCGTTAGAGGGAAAAGGAAACGTTGAGGAAACGGGACAAGACTT
GTTGGAGGACAAAATAGATCATCAGGATCAGTGTCAAGTAGATGAATCATCAATGGGGAA
TAAAATAAACTCCATTGAAAATGTTGTAAAAGTAGGAAATGTGGGAAGATGATGCGAAGT
CATCATCATCAGCAAGCTTGATGATGATCATGAGGGACAATAAGAAGAGGAAGGGGAAGA
AAAAGAAGGAGAAGTTTGGTGTGTTGAAAGGGTTTTGTGAAGGTCTTGTGAGGAACGTGA
TAGCCCAACAAGAGGAGATGCATAAGAATCTTCTTGAGGATATGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AZ90TF U 1
AF RR4AZ90JQ C 75
BS 1 685 RR4AZ90TF
BS 686 686 RR4AZ90JQ
BS 687 755 RR4AZ90TF
BS 756 756 RR4AZ90JQ
BS 757 780 RR4AZ90TF
BS 781 947 RR4AZ90JQ

RD RR4AZ90TF 780 0 0
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GCTTCATCCGCATCAACCGGCGGCAGAAAGATCACTGCCTTTTCCTGTCCCATTCGCTTC
TTTTAGCACTGATCATCAAGCCAATATTTTGAACCTTGATGGCCCTAAGATCATTCACCA
TCACCATCATCATCATCACCATGGCATCAAAGATAGTGGTGCTACATCTGAGTGGATGGG
TCATACAGATCATGATGGCGATAATCATCGTCACCATCACCATCATCCATGGTGTAGTGA
TGAAGTCCTTGCCCTTCTTAGGTTCAGATCTACGGTGGACAATTGGTTCCCTGAATTCAC
ATGGGAGCACACCTCAAGGAAGTTGGCAGAAGTTGGGTTTAAGAGGAGTCCACAAGAATG
CAAAGAGAAGTTCGAAGAAGAAGAGAGAAGATATTTCAATAGTAACAACAACACTAATGC
TCATCATATGAGCAATTACAATAAGGGAAATTATAGGCTCTTCAGTGAGGTCGATGAGTT
TTATCATCATGGTCATGCTGATGAGGAGCATGTCGTCTCATCAGAAGTTGGGGATAACCA
AAACAAGAGGAACAGTTCGTTAGAGGGAAAAGGAAACGTTGAGGAAACGGGACAAGACTT
GTTGGAGGACAAAATAGATCATCAG*ATCAGTGTCAAGTAGATGAATCATCAATGGGGAA
TAAAATAAACTCCATTGAAAATGTTGTAAAAGTAG*AAATGTGGGAAGATGATGCGAAGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4AZ90JQ 873 0 0
AACCGGCGGCAGAAAGATCACTGCCTTTTCCTGTCCCATTCGCTTCTTTTAGCACTGATC
ATCAAGCCAATATTTTGAACCTTGATGGCCCTAAGATCATTCACCATCACCATCATCATC
ATCACCATGGCATCAAAGATAGTGGTGCTACATCTGAGTGGATGGGTCATACAGATCATG
ATGGCGATAATCATCGTCACCATCACCATCATCCATGGTGTAGTGATGAAGTCCTTGCCC
TTCTTAGGTTCAGATCTACGGTGGACAATTGGTTCCCTGAATTCACATGGGAGCACACCT
CAAGGAAGTTGGCAGAAGTTGGGTTTAAGAGGAGTCCACAAGAATGCAAAGAGAAGTTCG
AAGAAGAAGAGAGAAGATATTTCAATAGTAACAACAACACTAATGCTCATCATATGAGCA
ATTACAATAAGGGAAATTATAGGCTCTTCAGTGAGGTCGATGAGTTTTATCATCATGGTC
ATGCTGATGAGGAGCATGTCGTCTCATCAGAAGTTGGGGATAACCAAAACAAGAGGAACA
GTTCGTTAGAGGGAAAAGGAAACGTTGAGGAAACGGGACAAGACTTGTTGGAGGACAAAA
TAGATCATCAGGATCAGTGTCAAGTAGATGAATCATCAATGGGGAATAAAATAAACTCCA
TTGAAAATGTTGTAAAAGTAGGAAATGTGG*AAGATGATGCGAAGTCATCATCATCAGCA
AGCTTGATGATGATCATGAGGGACAATAAGAAGAGGAAGGGGAAGAAAAAGAAGGAGAAG
TTTGGTGTGTTGAAAGGGTTTTGTGAAGGTCTTGTGAGGAACGTGATAGCCCAACAAGAG
GAGATGCATAAGAATCTTCTTGAGGATATGATG

QA 1 873 1 873
DS 



AS 1 2

CO CL8281Contig1 910 2 14 U
GTGAGACAAAAAGGCAAAACACTTTGAGAATGGATTCTTCTCAGAGAACTTCAGCTTGTG
CAGGACAACAGAGGATCGAGATTCAGAACAGCCACAAGGAGAAACTGGTGGGCCTGCTTC
ACGAAACTGGTTCAAGAGAAGTTGTGGTCTTATGCCATGGATTTCGATCAAACAAGAATG
ACACAATCATGAAGAGTGTGTCTGCTGCTATAGAGAAAGAAGGGATCAGCGTTTTCCGTT
TTGATTTCTCTGGAAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTTTCTATTTTGGTAACTACAACCATG
AGGCTGATGATCTACATTCTGTCATCCAACACTTCTCTAACATGAACCGTGTGGTTCCTG
TTATCCTCGGACACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTCCTCTATGCCTCCAAGTATCATG
ATATCAGTAATGTGATCAATCTCTCGGGACGTTATGATCTCAAAAAAGGGATAGGAGAAC
GTATTGGTGAAGACTTTTTGGAAAAGTTTAAGGAACAAGGATTCATCCATATTAAAGATG
GAAGATCCGTGTACCGTGTTACTGAGGAGAGCATAATGGAGAGGCTGAACACTGATATGC
ATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAAGATTGCAGAGTCTTGACGGTTCATGGATCAGAGG
ATGAGATTATACCTGTGGATGATGCCAGGGAGTTCGCTAAGATCATAACCAACCACAAGC
TGGAGATTGTGGAAGGAGCTGATCATGGTTATACAAAACATCAAAGTCAGTTGGTTTCAA
CAGTTGTGGAGTTCATAAAGACGGTCACTGTGAAGAACAACTAATTCACTGACATGACCC
TGGATGCGCTGAATTGTTGAGCCTTCCAAAGAGGGTCAAGGTTCTTGAGGGACTATATGA
ATCTCATCTA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP53TF U 1
AF RR4CP53JQ C 367
BS 1 713 RR4CP53TF
BS 714 714 RR4CP53JQ
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BS 781 792 RR4CP53TF
BS 793 910 RR4CP53JQ

RD RR4CP53TF 798 0 0
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CAGGACAACAGAGGATCGAGATTCAGAACAGCCACAAGGAGAAACTGGTGGGCCTGCTTC
ACGAAACTGGTTCAAGAGAAGTTGTGGTCTTATGCCATGGATTTCGATCAAACAAGAATG
ACACAATCATGAAGAGTGTGTCTGCTGCTATAGAGAAAGAAGGGATCAGCGTTTTCCGTT
TTGATTTCTCTGGAAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTTTCTATTTTGGTAACTACAACCATG
AGGCTGATGATCTACATTCTGTCATCCAACACTTCTCTAACATGAACCGTGTGGTTCCTG
TTATCCTCGGACACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTCCTCTATGCCTCCAAGTATCATG
ATATCAGTAATGTGATCAATCTCTCGGGACGTTATGATCTCAAAAAAGGGATAGGAGAAC
GTATTGGTGAAGACTTTTTGGAAAAGTTTAAGGAACAAGGATTCATCCATATTAAAGATG
GAAGATCCGTGTACCGTGTTACTGAGGAGAGCATAATGGAGAGGCTGAACACTGATATGC
ATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAAGATTGCAGAGTCTTGACGGTTCATGGATCAGAGG
ATGAGATTATACCTGTGGATGATGCCAGGGAGTTCGCTAAGATCATAACCAAC*ACAAGC
TGGAGATTGTGGAAG*AGCTGATCATGGT*ATACAAA*CATCAAAGTCAGT*GGTTTCAC
CAGTTGTGGAGT
CATAAA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4CP53JQ 544 0 0
TCGGACACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTCCTCCTCTATGCCTCCAAGTATCATGATATCA
GTAATGTGATCAATCTCTCGGGACGTTATGATCTCAAAAAAGGGATAGGAGAACGTATTG
GTGAAGACTTTTTGGAAAAGTTTAAGGAACAAGGATTCATCCATATTAAAGATGGAAGAT
CCGTGTACCGTGTTACTGAGGAGAGCATAATGGAGAGGCTGAACACTGATATGCATGAAG
CTTGCCTCAAGATTGACAAAGATTGCAGAGTCTTGACGGTTCATGGATCAGAGGATGAGA
TTATACCTGTGGATGATGCCAGGGAGTTCGCTAAGATCATAACCAACCACAAGCTGGAGA
TTGTGGAAGGAGCTGATCATGGTTATACAAAACATCAAAGTCAGTTGGTTTCAACAGTTG
TGGAGTTCATAAAGACGGTCACTGTGAAGAACAACTAATTCACTGACATGACCCTGGATG
CGCTGAATTGTTGAGCCTTCCAAAGAGGGTCAAGGTTCTTGAGGGACTATATGAATCTCA
TCTA

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL8282Contig1 960 2 8 U
GGATCCCTAATCTGCAGAATCCATCGCTCGAGAGAGAAAGAGAGAGAGTATGAAGAGAAA
AGTATCGCCGGAGAGCGAAATCCACGAAAACCAGGCCAAGAAGACTACCTTCTCCAAGTC
TCTTTCTCCAGGACAAAACTGGAAGTCTAAATCAATGAGGATTATTCCTCAAGAGATTGC
GAGAAGCAACAACGCGGCTTTTGAGCACAGAGTGGTGTTCACTGTCCCATGGAAGAACTC
CTGGCAGCTCTGGCTCCAGCGAGACAAGAATTGTCTGTTCATGATAAAAGAAGATTGGGA
TGAGTTCGTCGACGACAACCTTTTGGGTTCGGATGATACTTTGGTCTTCACGCATCAAGG
AACTATGTATTTCCAAGTGCGTATCTTTAGGAAAGATGGGAAAGAGGTCGTCTCCGCTTC
CTCTTAAAGTTACTGAACCGGAAACTGAACCGGTTATTCTTCATCCTAAGCCCGAGAGTT
CTCACCAGGAGATGACAACGCCTGCCTCTGCAAGTGGAGGGAGGGAGAGTTTTGCTGAGC
GATGCCTCTTAAATCCCAACATCCCTTACTTTGAGAAGACGCTGAGTAAAACTAATAAAA
TTCTGTATGTGAGTCCTTTGGTGATTAAGAAGTATGACTTGGAGTTTGGTCCCCATAATT
CCTCCATGGACTTCCTTCTCCCCGATGGAGACAAACTCGAGGGCTTCACTAAGAGTTACA
GCGGTTTGTATGCTTTCTCTGGCTGGGAAGATGTCTGTCAAAAGTACAACCTCAAACAAG
GAGACACTGTGGTTTGTGAATTTGAACTCTCTGGACGTGTGGTTACTGCTGTTAGAGTGC
ATTTGGTGAGTGAGTGAATGAGTCATTGTTTCTGAACATAGTCTTTACCAACCTATTATT
TTAATGCTAGATGTGACCTCTATGTTGATTTAACAAATTTGTAGCAAAAAAGGTGAGTTT


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AV20TF U 1
AF RR4AV20JQ C 416
BS 1 775 RR4AV20TF
BS 776 776 RR4AV20JQ
BS 777 780 RR4AV20TF
BS 781 781 RR4AV20JQ
BS 782 805 RR4AV20TF
BS 806 806 RR4AV20JQ
BS 807 832 RR4AV20TF
BS 833 960 RR4AV20JQ

RD RR4AV20TF 838 0 0
GGATCCCTAATCTGCAGAATCCATCGCTCGAGAGAGAAAGAGAGAGAGTATGAAGAGAAA
AGTATCGCCGGAGAGCGAAATCCACGAAAACCAGGCCAAGAAGACTACCTTCTCCAAGTC
TCTTTCTCCAGGACAAAACTGGAAGTCTAAATCAATGAGGATTATTCCTCAAGAGATTGC
GAGAAGCAACAACGCGGCTTTTGAGCACAGAGTGGTGTTCACTGTCCCATGGAAGAACTC
CTGGCAGCTCTGGCTCCAGCGAGACAAGAATTGTCTGTTCATGATAAAAGAAGATTGGGA
TGAGTTCGTCGACGACAACCTTTTGGGTTCGGATGATACTTTGGTCTTCACGCATCAAGG
AACTATGTATTTCCAAGTGCGTATCTTTAGGAAAGATGGGAAAGAGGTCGTCTCCGCTTC
CTCTTAAAGTTACTGAACCGGAAACTGAACCGGTTATTCTTCATCCTAAGCCCGAGAGTT
CTCACCAGGAGATGACAACGCCTGCCTCTGCAAGTGGAGGGAGGGAGAGTTTTGCTGAGC
GATGCCTCTTAAATCCCAACATCCCTTACTTTGAGAAGACGCTGAGTAAAACTAATAAAA
TTCTGTATGTGAGTCCTTTGGTGATTAAGAAGTATGACTTGGAGTTTGGTCCCCATAATT
CCTCCATGGACTTCCTTCTCCCCGATGGAGACAAACTCGAGGGCTTCACTAAGAGTTACA
GCGGTTTGTATGCTTTCTCTGGCTGGGAAGATGTCTGTCAAAAGTACAACCTCAA*CAAG
*AGACACTGTGGTTTGTGAATTTGA*CTCTCTGGACGTGTGGTTACTGCTGT
AGAGTG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR4AV20JQ 545 0 0
CGC
TCCTCTTAAAGTTACTGAACCGGAAACTGAACCGGTTATTCTTCATCCTAAGCCCGAGAG
TTCTCACCAGGAGATGACAACGCCTGCCTCTGCAAGTGGAGGGAGGGAGAGTTTTGCTGA
GCGATGCCTCTTAAATCCCAACATCCCTTACTTTGAGAAGACGCTGAGTAAAACTAATAA
AATTCTGTATGTGAGTCCTTTGGTGATTAAGAAGTATGACTTGGAGTTTGGTCCCCATAA
TTCCTCCATGGACTTCCTTCTCCCCGATGGAGACAAACTCGAGGGCTTCACTAAGAGTTA
CAGCGGTTTGTATGCTTTCTCTGGCTGGGAAGATGTCTGTCAAAAGTACAACCTCAAACA
AGGAGACACTGTGGTTTGTGAATTTGAACTCTCTGGACGTGTGGTTACTGCTGTTAGAGT
GCATTTGGTGAGTGAGTGAATGAGTCATTGTTTCTGAACATAGTCTTTACCAACCTATTA
TTTTAATGCTAGATGTGACCTCTATGTTGATTTAACAAATTTGTAGCAAAAAAGGTGAGT
TT

QA 4 545 4 545
DS 



AS 1 2

CO CL8283Contig1 1002 2 2 U
GTCTATTAAGTTTGTTATCTTCTTCTTTACCCCATAAAGAGATTGAATAGAAGGAGCGAC
TTTTTTTTCCACTATAATTTATAAAATAAGTGTTTAAATGTCCTTCAAAAGTAAGTAAAT
AAATCCGAAACATATAAAATGCGGTTAATCCCGCTGTTGAACAAGCTATTATTGCAAAAA
TTGGCGAAAATAACAAACTATCATTAAGAATTTCATCTTTAGACCAAAAACAAGCAAGGG
GGGGAATACCACAAAGTGAGAGTGTTCCTACTAAAAAGGCAGTTTTTGTAATCGGCACGT
GTTTTGTTAAACCACCCATAAGAATCATATTCTGACTTTTATCAGGAGAATATCCAACTA
TAGCTTCCATTGAATGAATAATGGATCCAGATCCTAAAAACAACAAAGCTTTCGAATAAG
CATGAGTAATCAAATGAAATAAAGCGGATCTATAAGACCCCATACCTAGAGCTAACATCA
TATAACCCAGTTGAGACATTGTAGAATAGGCTAAACCTCTCTTAATATCTTTTTGAGCAA
GAGCTAAAGTGGCTCCTAAGAGTACTGTTATTATACCTATCAAAGATATTATATACATTA
TAGAAGGGATAACTATAAAAAGAGGAAGAAGACGAGCTACAAGAAAAATTCCCGCCGCTA
CCATAGTAGCAGCATGTATAAGAGCCGAAATAGGAGTAGGGCCCTCCATGGCATCCGGCA
ACCATACATGAAGAGGAAATTGTGCAGATTTAGCAATAGGACCCACAAATAATAGAAATT
CACACAAAGTAAGGAATAAGAGATTTATTCTATTATTTAAAATTAAATTATTGAATATTT
CGAACAAATCTTGAAATTCGGAACTGCCAGTTATCCAATAAAGACCTAAAATTCCTAATA
ATAAACCAAAATCCCCTACACGATTGGTTACAAAAGCTTTTTGACAGGCATTCGCTGCAA
TAGGTCGTGTGAACCAAAAACCTATTAATAAATACGAACACA


BQ
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AF RR4AU62TF U 1
AF RR4AU62JQ C 287
BS 1 689 RR4AU62TF
BS 690 1002 RR4AU62JQ

RD RR4AU62TF 689 0 0
GTCTATTAAGTTTGTTATCTTCTTCTTTACCCCATAAAGAGATTGAATAGAAGGAGCGAC
TTTTTTTTCCACTATAATTTATAAAATAAGTGTTTAAATGTCCTTCAAAAGTAAGTAAAT
AAATCCGAAACATATAAAATGCGGTTAATCCCGCTGTTGAACAAGCTATTATTGCAAAAA
TTGGCGAAAATAACAAACTATCATTAAGAATTTCATCTTTAGACCAAAAACAAGCAAGGG
GGGGAATACCACAAAGTGAGAGTGTTCCTACTAAAAAGGCAGTTTTTGTAATCGGCACGT
GTTTTGTTAAACCACCCATAAGAATCATATTCTGACTTTTATCAGGAGAATATCCAACTA
TAGCTTCCATTGAATGAATAATGGATCCAGATCCTAAAAACAACAAAGCTTTCGAATAAG
CATGAGTAATCAAATGAAATAAAGCGGATCTATAAGACCCCATACCTAGAGCTAACATCA
TATAACCCAGTTGAGACATTGTAGAATAGGCTAAACCTCTCTTAATATCTTTTTGAGCAA
GAGCTAAAGTGGCTCCTAAGAGTACTGTTATTATACCTATCAAAGATATTATATACATTA
TAGAAGGGATAACTATAAAAAGAGGAAGAAGACGAGCTACAAGAAAAATTCCCGCCGCTA
CCATAGTAGCAGCATGTATAAGAGCCGAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4AU62JQ 716 0 0
TGTAATCGGCACGTGTTTTGTTAAACCACCCATAAGAATCATATTCTGACTTTTATCAGG
AGAATATCCAACTATAGCTTCCATTGAATGAATAATGGATCCAGATCCTAAAAACAACAA
AGCTTTCGAATAAGCATGAGTAATCAAATGAAATAAAGCGGATCTATAAGACCCCATACC
TAGAGCTAACATCATATAACCCAGTTGAGACATTGTAGAATAGGCTAAACCTCTCTTAAT
ATCTTTTTGAGCAAGAGCTAAAGTGGCTCCTAAGAGTACTGTTATTATACCTATCAAAGA
TATTATATACATTATAGAAGGGATAACTATAAAAAGAGGAAGAAGACGAGCTACAAGAAA
AATTCCCGCCGCTACCATAGTAGCAGCATGTATAAGAGCCGAAATAGGAGTAGGGCCCTC
CATGGCATCCGGCAACCATACATGAAGAGGAAATTGTGCAGATTTAGCAATAGGACCCAC
AAATAATAGAAATTCACACAAAGTAAGGAATAAGAGATTTATTCTATTATTTAAAATTAA
ATTATTGAATATTTCGAACAAATCTTGAAATTCGGAACTGCCAGTTATCCAATAAAGACC
TAAAATTCCTAATAATAAACCAAAATCCCCTACACGATTGGTTACAAAAGCTTTTTGACA
GGCATTCGCTGCAATAGGTCGTGTGAACCAAAAACCTATTAATAAATACGAACACA

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL8284Contig1 802 2 2 U
GGGAAACTCTTTGGCATAAACCTTCTTGAAACAACCTCGGATCCAGATCAATCGCCCGAA
CCAAGATCCGGACCTGAGCCCGAATCACGGAAGTACGAGTGTCAATACTGTTGCAGGGAG
TTTGCAAATTCTCAAGCTTTTGGTGGTCACCAAAACGCTCACAAGAAAGAGCGTCAGCTT
CTTAAACGTGCACAGATGCTAGCCTCTCGTGGTATGCCACGTCATGCCAACTATCACCCT
CACATGAATCCGCTTCTCTCTGCCTTCGCGCCGCCGCATATGATGCTCTCTCCTTCCTCG
ACTTCTAAGTGGCTCTACGGTGAGCACGTGTCGTCACAAAAAGCCGTTGGCCCCATGTAT
TTTTACGGTGGATCCGAAAGAAGGGGGTTTTACGGCGGTGGGATGGAGACTATGGCCGGC
GAAGTTAGGGCTCACGGTGGATCTTTGCCGGAGATGAGGAGGTTTGCCGGAGAGAACTAT
CGTATTAGCGAAGTCAAGTTAGATAATGGTATCGGCCTTAATCTCCATTTAAGTCTTGGG
CCATGATTGATTTTTAAGTTGGCCCAATTAAAATCTGTGATATACTACTCGGATTTGAAT
TTTATAGAGTAAATTTTCTGTGGTGAATTTTTTTTCCTGGACTTTACCAACTCGCGTGTT
CTATGTATGCGTTTGCTTTCACTTTTTTATTCATCTTGTAAAAATGCTATGTGAATTTCT
TATAATTCTGCCAATTTTAGTTCAATTCTTAGTCCTCCGTATATATATATAGGAATATAT
TGTCACCAAGTCGATTTCGAAT


BQ
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AF RR4EG35TF U 1
AF RR4EG35JQ C 277
BS 1 679 RR4EG35TF
BS 680 802 RR4EG35JQ

RD RR4EG35TF 679 0 0
GGGAAACTCTTTGGCATAAACCTTCTTGAAACAACCTCGGATCCAGATCAATCGCCCGAA
CCAAGATCCGGACCTGAGCCCGAATCACGGAAGTACGAGTGTCAATACTGTTGCAGGGAG
TTTGCAAATTCTCAAGCTTTTGGTGGTCACCAAAACGCTCACAAGAAAGAGCGTCAGCTT
CTTAAACGTGCACAGATGCTAGCCTCTCGTGGTATGCCACGTCATGCCAACTATCACCCT
CACATGAATCCGCTTCTCTCTGCCTTCGCGCCGCCGCATATGATGCTCTCTCCTTCCTCG
ACTTCTAAGTGGCTCTACGGTGAGCACGTGTCGTCACAAAAAGCCGTTGGCCCCATGTAT
TTTTACGGTGGATCCGAAAGAAGGGGGTTTTACGGCGGTGGGATGGAGACTATGGCCGGC
GAAGTTAGGGCTCACGGTGGATCTTTGCCGGAGATGAGGAGGTTTGCCGGAGAGAACTAT
CGTATTAGCGAAGTCAAGTTAGATAATGGTATCGGCCTTAATCTCCATTTAAGTCTTGGG
CCATGATTGATTTTTAAGTTGGCCCAATTAAAATCTGTGATATACTACTCGGATTTGAAT
TTTATAGAGTAAATTTTCTGTGGTGAATTTTTTTTCCTGGACTTTACCAACTCGCGTGTT
CTATGTATGCGTTTGCTTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4EG35JQ 526 0 0
CATATGATGCTCTCTCCTTCCTCGACTTCTAAGTGGCTCTACGGTGAGCACGTGTCGTCA
CAAAAAGCCGTTGGCCCCATGTATTTTTACGGTGGATCCGAAAGAAGGGGGTTTTACGGC
GGTGGGATGGAGACTATGGCCGGCGAAGTTAGGGCTCACGGTGGATCTTTGCCGGAGATG
AGGAGGTTTGCCGGAGAGAACTATCGTATTAGCGAAGTCAAGTTAGATAATGGTATCGGC
CTTAATCTCCATTTAAGTCTTGGGCCATGATTGATTTTTAAGTTGGCCCAATTAAAATCT
GTGATATACTACTCGGATTTGAATTTTATAGAGTAAATTTTCTGTGGTGAATTTTTTTTC
CTGGACTTTACCAACTCGCGTGTTCTATGTATGCGTTTGCTTTCACTTTTTTATTCATCT
TGTAAAAATGCTATGTGAATTTCTTATAATTCTGCCAATTTTAGTTCAATTCTTAGTCCT
CCGTATATATATATAGGAATATATTGTCACCAAGTCGATTTCGAAT

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL8285Contig1 976 2 6 U
GGAGAAACACAAAATCTAGCGCCGCTCTCTCTCTCTTGAACAGGCGATTTCCGGCTGTCT
TCATGAAGACCCTACCGAGTCTCTTCGTTCTTCTCCCACTTGTCGTCCTCTCCCATCCGT
CAGCCATCTCCATGCTGTCTCCGTGTCCACCTCGTCACCACCGTTCTTCTCCACCTTGTC
ACCACTGTTCCTCTCCTCGTCGTCACCACTGTTCCTCTCCTCGTCGTCACCACCGTTCCT
CTCCTCCTCGTCACCACCGTTCCTCTTCTGTTTAAGAAGAATATCCAAGGCGCTACTTCA
TCCCGGACTACTTCCTCTGCTTCTCGACACCACTTCCTAGCTTCGCGGCAGTGATGAGTG
CACCAAAGAGACGTGAAAGGCCCCCACAAAGGCTTAATGGAGATATGAGGCAGCGAACAA
ACGGTGCATACTGTCCATCTCTCTTTTTCCGGTTGCCCTCAAGGCGAAGGTGAAATAGTC
CTTGACTTCTTTTGTTTTGATAACCTAACTGGTAGACTTATCTCTATGTGCGTATATATT
CTCTTGGCCAAAACATTACTGATATAACTCTTTGTATATTCATTCATGAAATTTTTGGAT
GTGTTAACAGGGATGTGTTTCATTCTTTTGAACCCAAGCACATGCGTGCTTCATTCTTCA
AAAGCTGCTAAAAGATAAAAGAGGCTCTGGAGACTCGGTGATGATAGAAGGCAGTTCCTT
CTTGATGCCCTAGAAACATGTTGCCTCACTCGCTATGAGTTTTGCGTAGTAGGGATGGGA
AGACTCGCCATCTACATTATAATCTGTGGTTCTTGTCTAATGATACACAAAATTTCTGCA
AGTAGTTTTTGTTTGTTTGTAGTATTGTTGCATGTATTTACTTCTGAGTTTCAGTTTACC
ATACTTGTTGTAACAAACATATGTAATTTGCTTGCATCAAGCTTCGTTATAAGTCCAAGA
CATCATGTTTTGCTGC


BQ
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AF RR4DJ66TF U 1
AF RR4DJ66JQ C 297
BS 1 683 RR4DJ66TF
BS 684 684 RR4DJ66JQ
BS 685 697 RR4DJ66TF
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BS 699 708 RR4DJ66TF
BS 709 976 RR4DJ66JQ

RD RR4DJ66TF 708 0 0
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TCATGAAGACCCTACCGAGTCTCTTCGTTCTTCTCCCACTTGTCGTCCTCTCCCATCCGT
CAGCCATCTCCATGCTGTCTCCGTGTCCACCTCGTCACCACCGTTCTTCTCCACCTTGTC
ACCACTGTTCCTCTCCTCGTCGTCACCACTGTTCCTCTCCTCGTCGTCACCACCGTTCCT
CTCCTCCTCGTCACCACCGTTCCTCTTCTGTTTAAGAAGAATATCCAAGGCGCTACTTCA
TCCCGGACTACTTCCTCTGCTTCTCGACACCACTTCCTAGCTTCGCGGCAGTGATGAGTG
CACCAAAGAGACGTGAAAGGCCCCCACAAAGGCTTAATGGAGATATGAGGCAGCGAACAA
ACGGTGCATACTGTCCATCTCTCTTTTTCCGGTTGCCCTCAAGGCGAAGGTGAAATAGTC
CTTGACTTCTTTTGTTTTGATAACCTAACTGGTAGACTTATCTCTATGTGCGTATATATT
CTCTTGGCCAAAACATTACTGATATAACTCTTTGTATATTCATTCATGAAATTTTTGGAT
GTGTTAACAGGGATGTGTTTCATTCTTTTGAACCCAAGCACATGCGTGCTTCATTCTTCA
AAAGCTGCTAAAAGATAAAAGAG*CTCTGGAGACTCG*TGATGATAGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4DJ66JQ 680 0 0
TTCATCCCGGACTACTTCCTCTGCTTCTCGACACCACTTCCTAGCTTCGCGGCAGTGATG
AGTGCACCAAAGAGACGTGAAAGGCCCCCACAAAGGCTTAATGGAGATATGAGGCAGCGA
ACAAACGGTGCATACTGTCCATCTCTCTTTTTCCGGTTGCCCTCAAGGCGAAGGTGAAAT
AGTCCTTGACTTCTTTTGTTTTGATAACCTAACTGGTAGACTTATCTCTATGTGCGTATA
TATTCTCTTGGCCAAAACATTACTGATATAACTCTTTGTATATTCATTCATGAAATTTTT
GGATGTGTTAACAGGGATGTGTTTCATTCTTTTGAACCCAAGCACATGCGTGCTTCATTC
TTCAAAAGCTGCTAAAAGATAAAAGAGGCTCTGGAGACTCGGTGATGATAGAAGGCAGTT
CCTTCTTGATGCCCTAGAAACATGTTGCCTCACTCGCTATGAGTTTTGCGTAGTAGGGAT
GGGAAGACTCGCCATCTACATTATAATCTGTGGTTCTTGTCTAATGATACACAAAATTTC
TGCAAGTAGTTTTTGTTTGTTTGTAGTATTGTTGCATGTATTTACTTCTGAGTTTCAGTT
TACCATACTTGTTGTAACAAACATATGTAATTTGCTTGCATCAAGCTTCGTTATAAGTCC
AAGACATCATGTTTTGCTGC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL8286Contig1 403 2 1 U
GGGTAAGACGGCGACCGGATAGTTTGGGCGAGCGGCGGCGATTTGGTTTCGATCTGAAAG
GATGTTTCGGAGGAACAGGTTTTTGTCTCTTCCGATGGTGGTTGGAGCTGTTGTAATTGG
TGTTGTTTCGGGTAAAGCCATATTCGGGCCTCCACTTGATCAGTACTGGAAGGAGAAGCT
CGAAGGAGAAGCTGCTGCTAAGGAAGCCACTGAAAAGAGCTCAGATTAATTAAAAGTCTT
TAAAGGAGCAGAGTGTTTTGTAAATCACACCATAAACTAAAGAGCTTTTCTATAAGGAAG
CATTGTTTCATTGTATGATGCGATATAAAAGCCAGAAAGTGTAATAATGATGTAAGTGCC
TGCGTATTACGTTTTGCTGTTTGAAGGAGAATGATAAAACCCT


BQ
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AF RR4C484JQ C 1
AF RR4C484TF U 1
BS 1 403 RR4C484TF

RD RR4C484JQ 403 0 0
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GATGTTTCGGAGGAACAGGTTTTTGTCTCTTCCGATGGTGGTTGGAGCTGTTGTAATTGG
TGTTGTTTCGGGTAAAGCCATATTCGGGCCTCCACTTGATCAGTACTGGAAGGAGAAGCT
CGAAGGAGAAGCTGCTGCTAAGGAAGCCACTGAAAAGAGCTCAGATTAATTAAAAGTCTT
TAAAGGAGCAGAGTGTTTTGTAAATCACACCATAAACTAAAGAGCTTTTCTATAAGGAAG
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TGCGTATTACGTTTTGCTGTTTGAAGGAGAATGATAAAACCCT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR4C484TF 403 0 0
GGGTAAGACGGCGACCGGATAGTTTGGGCGAGCGGCGGCGATTTGGTTTCGATCTGAAAG
GATGTTTCGGAGGAACAGGTTTTTGTCTCTTCCGATGGTGGTTGGAGCTGTTGTAATTGG
TGTTGTTTCGGGTAAAGCCATATTCGGGCCTCCACTTGATCAGTACTGGAAGGAGAAGCT
CGAAGGAGAAGCTGCTGCTAAGGAAGCCACTGAAAAGAGCTCAGATTAATTAAAAGTCTT
TAAAGGAGCAGAGTGTTTTGTAAATCACACCATAAACTAAAGAGCTTTTCTATAAGGAAG
CATTGTTTCATTGTATGATGCGATATAAAAGCCAGAAAGTGTAATAATGATGTAAGTGCC
TGCGTATTACGTTTTGCTGTTTGAAGGAGAATGATAAAACCCT

QA 1 403 1 403
DS 



AS 1 2

CO CL8287Contig1 402 2 1 U
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TTACTTTTGATATCGAGAAAGAAAAACAAACAACAAATAAAATGAGAATGAAATCAAAAT
AATACGCCAAGTGGTGTAACAGCCATATCCAAGCCCTGCACATGTGAACAGATTAGGGTT
CGTAATCTCAGCCAACAGCAAAGTCTTAATCTCAGGAGCGTTCGAAGCTGCAAAAGGAAA
GAAGAGAAGATACTTTAAAAATCTAACAATCTGTTAATCAATCTATCAATCTGTTAATCT
GTTAATCAAAGCGAGAAAGCTGTTTCAGTTTTCGAATTTGAT


BQ
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AF RR4D883JQ C 1
AF RR4D883TF U 1
BS 1 402 RR4D883TF

RD RR4D883JQ 402 0 0
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TTACTTTTGATATCGAGAAAGAAAAACAAACAACAAATAAAATGAGAATGAAATCAAAAT
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QA 1 402 1 402
DS 

RD RR4D883TF 402 0 0
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CGATATTCATAGAGTTGAATGAGTTCTGTTGAAAAGAAAAAAAAGAGCAAATACAAATTT
TTACTTTTGATATCGAGAAAGAAAAACAAACAACAAATAAAATGAGAATGAAATCAAAAT
AATACGCCAAGTGGTGTAACAGCCATATCCAAGCCCTGCACATGTGAACAGATTAGGGTT
CGTAATCTCAGCCAACAGCAAAGTCTTAATCTCAGGAGCGTTCGAAGCTGCAAAAGGAAA
GAAGAGAAGATACTTTAAAAATCTAACAATCTGTTAATCAATCTATCAATCTGTTAATCT
GTTAATCAAAGCGAGAAAGCTGTTTCAGTTTTCGAATTTGAT

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 2

CO CL8288Contig1 716 2 6 U
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TCTCCTACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGAACGACCTAAGACGCGTGAAAGG
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CTTCAGACAAGACTGATGAATCACCGAAACGGATGAAGCTGATGATGAGTTTCCGCTCTC
TGCTCGTATCCTCCATGCTCCTCCGCGTGTTCTTGATCGTCTACGGAGAGTGGCAAGACG
CTCACATGGAGGTCCGCTACACAGACGTCGACTACATCGTCTTCTCCGACGCTGCCTCCC
TTATGGCCTCTGGTCAATCTCCTTACAAGAGAACCACTTACCGTTACTCACCTCTCCTCG
CGCTTCTCCTCGTCCCCCAACTCAAGCTTCCATCGCTCTTGGGGAAAGTTCCTCTTCTCT
GCTTCTGATTTGCTGGTGGGTTTGTTTATTCGTAAGATTTTGAAACAACGCAAAGTGTCT
GAGAAGGTGTGTACAGCTTCTGTAATGGTATGGCTTCTCAATCCGTTTACGTTCACAATT
GGAACCAGAGGGAACTGTGAACCCATCGTTTGTGCTATGATTCTGTGGATCATCATCTCC
CTTATGAAAGGTAATTTGTCGCAAGCTGCGTTTTGGTACGGCCTTGTTGTTCATTT


BQ
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AF RR4GX33TF U 1
AF RR4B471TF U 279
BS 1 437 RR4GX33TF
BS 438 438 RR4B471TF
BS 439 670 RR4GX33TF
BS 671 671 RR4B471TF
BS 672 700 RR4GX33TF
BS 701 716 RR4B471TF

RD RR4GX33TF 705 0 0
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TCTCCTACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGAACGACCTAAGACGCGTGAAAGG
AGAACGCTTCCTTGTTTCTAAAAGTCTGAAGATTTGAGAAAACAACTGACATGTCCCGTG
CTTCAGACAAGACTGATGAATCACCGAAACGGATGAAGCTGATGATGAGTTTCCGCTCTC
TGCTCGTATCCTCCATGCTCCTCCGCGTGTTCTTGATCGTCTACGGAGAGTGGCAAGACG
CTCACATGGAGGTCCGCTACACAGACGTCGACTACATCGTCTTCTCCGACGCTGCCTCCC
TTATGGCCTCTGGTCAATCTCCTTACAAGAGAACCACTTACCGTTACTCACCTCTCCTCG
CGCTTCTCCTCGTCCCC*AACTCAAGCTTCCATCGCTCTTGGGGAAAGTTCCTCTTCTCT
GCTTCTGATTTGCTGGTGGGTTTGTTTATTCGTAAGATTTTGAAACAACGCAAAGTGTCT
GAGAAGGTGTGTACAGCTTCTGTAATGGTATGGCTTCTCAATCCGTTTACGTTCACAATT
GGAACCAGAGGGAACTGTGAACCCATCGTTTGTGCTATGATTCTGTGGATCATCATCTCC
CTTATGAAAG*TAATTTGTCGCAAGCTGCGTTTTGGTACG
CCTTG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4B471TF 438 0 0
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GTCTTCTCCGACGCTGCCTCTCTTATGGCCTCTGGTCAATCTCCTTACAAGAGAACCACT
TACCGTTACTCACCTCTCCTCGCGCTTCTCCTCGTCCCCCAACTCAAGCTTCCGTCGCTC
TTGGGGAAAGTTCCTCTTCTCTGCTTCTGATTTGCTGGTGGGTTTGTTTATTCGTAAGAT
TT*GAAACAACGCAAAGTGTCTGAGAAGGTGTGTACAGCTTCTGTAATGGTATGGCTTCT
CAATCCGTTTACGTTCACAATTGGAACCAGAGGGAACTGTGAACCCATCGTTTGTGCTAT
GATTCTGTGGATCATCATCTCCCTTATGAAAGGTAATTTGTCGCAAGCTGCGTTTTGGTA
CGGCCTTGTTGTTCATTT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 2

CO CL8289Contig1 690 2 2 U
GGGATGTCAACTCTCCAGATCGAACAAAGTTTTTTAAAACAATCCAACTTGTAGTTTCAT
GAATAAGAATCGCAGACTTATATGAGAACAAAAAAAATAAAACCGTAAACACCAGTGTAG
AGGTTTATCTAACTCAGATTCACAGTCCAGTTCATGTTGTCCTCGTTCAGACCCATCTGT
AGGCTTGTCAGAACGGTGTAAAGTTTCTCCGAAACAGGTCCAAAGCTACCTTCTCCATAA
GATACTCTTTTGCCCTTGTGTGTAATGCTTCCAACTGGAGAGACAACCACGGCGGTTCCT
GTGCAGAAAACTTCATCTGCTTCTAGTAACTCGTCCACTGTCACATCCCGTTCCTCCACC
TTAAACCCTTGGGTACGAGCCACATCGATTATGCTTTTCCGCGTAATCCCAGGTAAAATG
GTTCCTTTTATTTCAGGAGTAGATATCACATTGTCCTTAACAATGAAGATATTGCAAGAG
GAGACCTCTTCAAGATATCTTTTGTAAACGCAATCAAGGTACAAAACATCAGAATATCCT
TTAGATTTCGCAATCGACTGTGCTTTTAGTACTGCAGCGTAATTGCCAATGGTCTTAACA
CCTCCAGTACCACCAGGTGTTGCACGGTGAAATTCACTTTCCACAATCAAATTGATTGGT
GCCACACCTTCCTTGAAGTAGTTTCCAACA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CR27JQ U 1
AF RR4DK25JQ U 6
BS 1 424 RR4CR27JQ
BS 425 690 RR4DK25JQ

RD RR4CR27JQ 424 0 0
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AGGTTTATCTAACTCAGATTCACAGTCCAGTTCATGTTGTCCTCGTTCAGACCCATCTGT
AGGCTTGTCAGAACGGTGTAAAGTTTCTCCGAAACAGGTCCAAAGCTACCTTCTCCATAA
GATACTCTTTTGCCCTTGTGTGTAATGCTTCCAACTGGAGAGACAACCACGGCGGTTCCT
GTGCAGAAAACTTCATCTGCTTCTAGTAACTCGTCCACTGTCACATCCCGTTCCTCCACC
TTAAACCCTTGGGTACGAGCCACATCGATTATGCTTTTCCGCGTAATCCCAGGTAAAATG
GTTC

QA 1 424 1 424
DS 

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TATCTAACTCAGATTCACAGTCCAGTTCATGTTGTCCTCGTTCAGACCCATCTGTAGGCT
TGTCAGAACGGTGTAGAGTTTCTCCGAGACAGGTCCAAAGCTACCTTCTCCATAAGATAC
TCTTTTGCCTTTGTGTGTAATGCTTCCAACTGGAGAGACAACCACGGCGGTTCCTGTGCA
GAAAACTTCATCTGCTTCTAGTAACTCGTCCACTGTCACATCCCGTTCCTCCACCTTAAA
CCCTTGGGTACGAGCCACATCGATTATGCTTTTCCGCGTAATCCCAGGTAAAATGGTTCC
TTTTATTTCAGGAGTAGATATCACATTGTCCTTAACAATGAAGATATTGCAAGAGGAGAC
CTCTTCAAGATATCTTTTGTAAACGCAATCAAGGTACAAAACATCAGAATATCCTTTAGA
TTTCGCAATCGACTGTGCTTTTAGTACTGCAGCGTAATTGCCAATGGTCTTAACACCTCC
AGTACCACCAGGTGTTGCACGGTGAAATTCACTTTCCACAATCAAATTGATTGGTGCCAC
ACCTTCCTTGAAGTAGTTTCCAACA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

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TTTTTTGGAGAAAGACAATGAAATGTTATGTTGATCATATTTCGTATG


BQ
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AF RR4B672JQ C 1
AF RR4B672TF U 1
BS 1 708 RR4B672TF

RD RR4B672JQ 708 0 0
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TGGAAATAGCAACTCCGATTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATAT
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AGCTTTCTGCACTTGGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATTTCAGAAATATTGAAGA
ACAATGGGCTTGCAACAGAGAAGAAAGTTCTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGG
TCAAAGGGAAAATAGTTCAGAAGACAAAGATAGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAAT
TTGATTCTCTGATGACTCCAGCGTCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAAC
CAGTAGAAGCTGAAGCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGA
TTAGTATCATTTTCTTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAA
AGAATGCTCTATTATTAACTCAAAAGTGATATTTTATGGAAATACAATGAAATGTTTCTT
TTTTTTGGAGAAGGACAATGAAATGTTATGTTGATCATATTTCGTATG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4B672TF 708 0 0
GGGAAAAAAGTTTAGTTAAACTCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGA
TGGAAATAGCAACTCCGATTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATAT
CAGCAACAACGGCCGCAGAAACTCAGAAGAAAAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGA
AACCCTTGTTCTTCTACGTTAATCTCGCCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTG
AGCTTTCTGCACTTGGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATCTCAGAAATATTGAAGA
ACAATGGGCTTGCAACAGAGAAGAAAGTTCTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGG
TCAAAGGGAAAATAGTTCAGAAGACAAAGATAGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAAT
TTGATTCTCTGATGACTCCAGCGTCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAAC
CAGTAGAAGCTGAAGCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGA
TTAGTATCATTTTCTTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAA
AGAATGCTCTATTATTAACTCAAAAGTGATATTTTATGGAAATACAATGAAATGTTTCTT
TTTTTTGGAGAAAGACAATGAAATGTTATGTTGATCATATTTCGTATG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL8291Contig1 828 2 2 U
TTTTTAATAAAAGAAACCTCTTCATCGGACCGGCGAGAATCGTTAGCCATGTCAATAGAA
ACAATGCCGGAGAACACGGAGGAGAGAGATCCGCAACAAGAGATCGAAGAGACTACACCG
CTGCTCGACGAGGAATCGAATTCAAGGACCGCGACGACGAAGGTTCCGGAGGTGGAAATC
CATCTATACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGACGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGTTGG
GAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCCATCCTTGAGAAATATGGATTGAAATCTATCTTC
GCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGTGCCGCCCCAATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGCTGG
TCTGTGTTGCCTTACAGAGATGGTGCCGTGGTTTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCT
CTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGGAGTCGCGATTGTAATGCTGCTAATAACG
TTTCTGTTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAAGAACAACATCTCCATGGGGAACTTTCCT
CCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGTAATAGTTGTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACGAGAGAC
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TCTGTTGAATATAGTTTTGTGCATTTTCATGTGTATGCGAGTGGAAATAGATAATTTAAT
CTTCTGGAAACCCAAAAGTTTTGTAAAAGTAACAAGACTGTTTATGTC


BQ
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AF RR4D443TF U 1
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BS 1 656 RR4D443TF
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CATCTATACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGACGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGTTGG
GAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCCATCCTTGAGAAATATGGATTGAAATCTATCTTC
GCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGTGCCGCCCCAATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGCTGG
TCTGTGTTGCCTTACAGAGATGGTGCCGTGGTTTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCT
CTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGGAGTCGCGATTGTAATGCTGCTAATAACG
TTTCTGTTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAAGAACAACATCTCCATGGGGAACTTTCCT
CCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGTAATAGTTGTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACGAGAGAC
TTCTTCAAGAAGTGTGGCTGGTGATGTCACAGACCCTAACACTTGTCGCCTTTGTC

QA 1 656 1 656
DS 

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AATCTATCTTCGCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGTGCCGCCCCAATCCGGTGTCACCCTA
GGAATGGCTGGTCTGTGTTGCCTTACAGAGATGGTGCCGTGGTTTACATCGACGGTGAAC
CTCAGGATTCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGGAGTCGCGATTGTAATGC
TGCTAATAACGTTTCTGTTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAAGAACAACATCTCCATGG
GGAACTTTCCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGTAATAGTTGTCACCCGAGCGAGGAAGA
GAACGAGAGACTTCTTCAAGAAGTGTGGCTGGTGATGTCACAGACCCTAACACTTGTCGC
CTTTGTCAGGCCTTGTGGTGCCAGGTTGTTTGCTTTCGGAAGCAAGAAGGCAATCATTCT
CTCCATTTGCATCTGTTGAATATAGTTTTGTGCATTTTCATGTGTATGCGAGTGGAAATA
GATAATTTAATCTTCTGGAAACCCAAAAGTTTTGTAAAAGTAACAAGACTGTTTATGTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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TGGTCGCGCTTTCCAGCTCTATTCTTCGGGTGTATTTGATGGAATATGTGGAACAGAGCT
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GAGAAACTCATGGGGAGGAAGCTGGGGAGAGAGCGGATACATAAAGATGGCACGTAACAT
TGCGGATGCAACAGGAAAGTGTGGAATCGCTATGGAGGCTTCATACCCTATCAAGAAAGG
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TGACAATTACTACTCTTGCCCCGAGAGTAACACTTGTTGCTGTCTCTTCCAGTACGGCAA
GTACTGCTTCGGTTGGGGATGTTGCCCTCTCGAAGCTGCTACTTGCTGCGATGACAACAC
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TTCCTAAGTTTCATTCAGTTTCATCATTGATCCTAAACATTGGTATTTTACCGGTTATTT
ATGGATAAATTTATCTTTTCAC


BQ
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AF RR4EK93TF U 1
AF RR4EK93JQ C 141
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BS 690 862 RR4EK93JQ

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QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4EK93JQ 722 0 0
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ACCCGGTTTGCAATGGCGATACCTGTTTGATGAGTAAGAACAGTCCATTCAGTGTTAAGG
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AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL8293Contig1 792 2 2 U
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ATCGAGATGGGCGTGATGGGCATGTCGCATAAAGAAGGCGTATCAAGGTACTACGGATCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN74TF U 1
AF RR4EN74JQ C 207
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RD RR4EN74TF 663 0 0
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ATCGAGATGGGCGTGATGGGCATGTCGCATAAAGAAGGCGTATCAAGGTACTACGGATCA
GGTTCCCAATCCTAGAAGAGCACAACAATTGGAGTCGATCAATAAAGCTAGTTAATCAAA
ACTTACATAAGAACACAACATTTCTATTAGAAAAAAAAACTACAGAAAGAACGATTGCTT
ACTCAGAATCTGTTTCTTCGTCTAACATTTGAAATAAGTTACCTTCAATCTGCTCATCAA
TGACAGATACCTAAAAACAAGAATTATAAATTCGAGGGTGCGATAAATTTCAAGACAAGA
GGATTCTGGAAAGAAAAATCAGGATCAAAGCATGATGTTTACCGGGTCTTTCTCAATCAA
ATGCCGAAGAGTTGATACAGAGAGACGCCTAATTATTGGCTGTTTTACAAAAGATATAAA
CTACTTTTAATCATGAACCCCTTGAAGACTTGCCTAAGAAAAGAAGAGATAGCGAAGAAA
AAAACCTGTCTTGATGTCAGTGTCAGTAACAGATTCTTCACGTGTGAATGCACTGAAACG
GCTTGTGGAGCAAAAAGAATAAGCTGCTGGGTAAAACGGACGCTCCTGAAAATATTTACA
TGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4EN74JQ 586 0 0
TTAGAAAAAAAAACTACAGAAAGAACGATTGCTTACTCAGAATCTGTTTCTTCGTCTAAC
ATTTGAAATAAGTTACCTTCAATCTGCTCATCAATGACAGATACCTAAAAACAAGAATTA
TAAATTCGAGGGTGCGATAAATTTCAAGACAAGAGGATTCTGGAAAGAAAAATCAGGATC
AAAGCATGATGTTTACCGGGTCTTTCTCAATCAAATGCCGAAGAGTTGATACAGAGAGAC
GCCTAATTATTGGCTGTTTTACAAAAGATATAAACTACTTTTAATCATGAACCCCTTGAA
GACTTGCCTAAGAAAAGAAGAGATAGCGAAGAAAAAAACCTGTCTTGATGTCAGTGTCAG
TAACAGATTCTTCACGTGTGAATGCACTGAAACGGCTTGTGGAGCAAAAAGAATAAGCTG
CTGGGTAAAACGGACGCTCCTGAAAATATTTACATGTACAAAAAATTAGGCTTCGATAAG
ACGGTGGTAACAGTGGATTAAAATGATTGTGAGAGGAGAAGCATTCACATACTCAAGCAG
TGTCGGAATTTCTTGCCAGGAACTAATCTCTGCAATAACAGACTGC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL8294Contig1 898 2 4 U
GGGATTTTCTCCAGATCCGTTTCGACGAGTAATCACCAGTAACATCTCTAATCAAATCCT
TGCCAAACTCATTCAATGGATTCCTTTCAATTTCTTCTCTGTTTTTTTCTATTTATAGGC
CTCTTTTCATTTCTTATTTCTCCACCGAAATTGCTAAGCTACTCTTTGACACTCATCCTG
ATAGATCCCACCAGAAACTCTTCACTCTCCAGCGTCCGCAAGAACGGCAATAAGACCGTC
GTCTCCTCTGCAAATCCGAAACCAAACTGGAAGTCTATTGTTTCCTCCGCCGCTGTAGAG
AAACCTAAGGAGAAGACTGCTTTGTTGTCCACCAATTCGATGAAACCAAACGCCGCTACC
GCTCTCTCCTCCGCGCATGGTGAACAGGTTATGTTCTTCTGGGATGTTTCACACGAAGCC
GTGATGAGGCTTATAAAGAAGACTTTGGTGATGCATCAGAGCTTGCACCAATTTTAGGAT
ATCTTCAACGCATGAGTTCCACTCATCCCAGACGATGACGGATTGATGTCCCAAGCGATC
CAGCCGTCGATCAAGATGGAGTGACAACTAAAGCATCAGAGAGAGGTGAGTTTGTGGCAT
TGTAACTGTGATGGAGGTAGGAATCAAGTTTTGGAAGGTCCAAGAAAGTCTGGAACTTAC
CGTCTGTGTAGAGCAAGTTTGTGAAATAAGAGAGACAAGCCATGGCTGATGAGTTCTGGT
CTGGTGTTTGATAAGACGCTTGACGAGTACTTCGTTTATAAGGACTGTAAGAGTGGCTGA
TTAGTTCTGGTCTCGTGTTTGATCTGGATGCCCTCCAGATCTACTTATCTATGTATAAAC
AAACATGCTTCTTCCTTGCATGTGGCTCTGTTTTAACCGAGGGTCTAGCCATTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GO51TF U 1
AF RR4GO51JQ C 124
BS 1 637 RR4GO51TF
BS 638 638 RR4GO51JQ
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RD RR4GO51TF 681 0 0
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GTCTCCTCTGCAAATCCGAAACCAAACTGGAAGTCTATTGTTTCCTCCGCCGCTGTAGAG
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TGTAACTGTGATGGAGGTAGGAATCAAGTTTTGGAAG*TCCAAGAAAGTCTGGAACTTAC
CGTCTGTGTAGAGCAAGTTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4GO51JQ 775 0 0
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CCTAAGGAGAAGACTGCTTTGTTGTCCACCAATTCGATGAAACCAAACGCCGCTACCGCT
CTCTCCTCCGCGCATGGTGAACAGGTTATGTTCTTCTGGGATGTTTCACACGAAGCCGTG
ATGAGGCTTATAAAGAAGACTTTGGTGATGCATCAGAGCTTGCACCAATTTTAGGATATC
TTCAACGCATGAGTTCCACTCATCCCAGACGATGACGGATTGATGTCCCAAGCGATCCAG
CCGTCGATCAAGATGGAGTGACAACTAAAGCATCAGAGAGAGGTGAGTTTGTGGCATTGT
AACTGTGATGGAGGTAGGAATCAAGTTTTGGAAGGTCCAAGAAAGTCTGGAACTTACCGT
CTGTGTAGAGCAAGTTTGTGAAATAAGAGAGACAAGCCATGGCTGATGAGTTCTGGTCTG
GTGTTTGATAAGACGCTTGACGAGTACTTCGTTTATAAGGACTGTAAGAGTGGCTGATTA
GTTCTGGTCTCGTGTTTGATCTGGATGCCCTCCAGATCTACTTATCTATGTATAAACAAA
CATGCTTCTTCCTTGCATGTGGCTCTGTTTTAACCGAGGGTCTAGCCATTTATTC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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TGGATTGGGTAAGAGCAATGAGGCAAGAAGATAAGAAGTCCAAGGAAGAGAATGGGCTTG
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ACGATAAGTTCCAGTACTCGTAGTGTTTTCGATCATTAATGGTGTACGTGAAAAGTGTAT
ATGTTCTTTGATATGATTTGGAAACATCGTCACCAAGGACATGTGTGATTAGTTTTGTAA
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AATTGGCCGTCTCTGGCAATCG


BQ
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AF RR4FF23TF U 1
AF RR4FF23JQ C 108
BS 1 652 RR4FF23TF
BS 653 742 RR4FF23JQ

RD RR4FF23TF 652 0 0
GAGCACTATATTACATTCACCAATCATCTGCAAAATTCCACGGAAACCTCAAGTCCACAA
ACATCCTCCTAGGTCACGACTTCGAAGCTTGTCTCACGGATTACTGCCTAAGTGTCTTAA
TAGACTCATCTGTCCCACCTAGTGATCCTGACATCGCTTCCTACACAGCACCAGAGATCA
GGAAATCAACAAACAGTCCTACGTCCAAATGTGATGTCTACTCGTTCGGAGTCTTCCTCT
TGGAGCTGTTGACGGGTAAACCGGCTTCAAGGCAACCGTTTATGGCGGAGAATGATATGT
TGGATTGGGTAAGAGCAATGAGGCAAGAAGATAAGAAGTCCAAGGAAGAGAATGGGCTTG
AGATGATGACTCAAACAGCTTGTCTTTGCCGTGTGACGTCGCCTGATAAAAGGCCGACGA
TGAGAGAAGTGATAAAGATGATTCAAGATATAAAGGAGAGCGTTGTGATGACTGAAGAGA
ACGATAAGTTCCAGTACTCGTAGTGTTTTCGATCATTAATGGTGTACGTGAAAAGTGTAT
ATGTTCTTTGATATGATTTGGAAACATCGTCACCAAGGACATGTGTGATTAGTTTTGTAA
GAAGAATATTCGCCGCTGTAGTGGAAGATGGAACTTTATTTTTATTCGGCGC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR4FF23JQ 635 0 0
CTAAGTGTCTTAATAGACTCATCTGTCCCACCTAGTGATCCTGACATCGCTTCCTACACA
GCACCAGAGATCAGGAAATCAACAAACAGTCCTACGTCCAAATGTGATGTCTACTCGTTC
GGAGTCTTCCTCTTGGAGCTGTTGACGGGTAAACCGGCTTCAAGGCAACCGTTTATGGCG
GAGAATGATATGTTGGATTGGGTAAGAGCAATGAGGCAAGAAGATAAGAAGTCCAAGGAA
GAGAATGGGCTTGAGATGATGACTCAAACAGCTTGTCTTTGCCGTGTGACGTCGCCTGAT
AAAAGGCCGACGATGAGAGAAGTGATAAAGATGATTCAAGATATAAAGGAGAGCGTTGTG
ATGACTGAAGAGAACGATAAGTTCCAGTACTCGTAGTGTTTTCGATCATTAATGGTGTAC
GTGAAAAGTGTATATGTTCTTTGATATGATTTGGAAACATCGTCACCAAGGACATGTGTG
ATTAGTTTTGTAAGAAGAATATTCGCCGCTGTAGTGGAAGATGGAACTTTATTTTTATTC
GGCGCCAAAACAAATGACTTGTACAGGTGGTTTGATTTTTATGTGCGTACAAAATTTGTT
GTTGTAAAAAGAAAATTGGCCGTCTCTGGCAATCG

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8296Contig1 919 2 10 U
GCAAGTTAGTAGCTTTTGACGATAAACTGCAAAAATTTGAGCAGACAAATGATGTGAATC
CTCATCTGGCTTTTCATACCGGACGGGGTTACAACACAAGAGGTCGTGGCAACTACAATT
ACAGAGGAGGATACAGAGGTCGTGGTAATGGTTCTTACTCAACCAGAGGTCGTGGTTTCC
AGCAACAGTCCTCTGGAGGGTCAGGTTCCAACTCCAACACGCGACCTACTTGCCAAATAT
GTGGTCGGTTTGGGCATTCTGCTGCAAAGTGTTTCAATAGGTTTGATCAAGACTTTCAGA
CTCCTGAGAATATTCACACTGCTTTGGCAACAATGAAGGTCTCAGATCATCACGGTGGTC
AAGAATGGTATCCAGACTCGGCAGCAACAGCTCACATTACCAGCAACCACAGTCAGCCTC
AGTCTTCAGAACCATATTTGGGACAAGATCAGGTCATAGTGGGTAATGGTGACTTCTTAC
CCATCACACATGTGGGTTCTGTCTCGCTTCAAACCCCTCAAGGACAAGGCAACAAAGAGG
GTGATAACTCAAGGAAGAAGACTTAAAGATATGTATGTACTGAAGGACATGCGGTTCCAA
GCTTTCTATTCAACTCGTCAACAGGCTGCTACTGATGGTGTTTGGCATAGAAGATTAGGT
CACGCCAATATGGATGTTCTTCAGCACCTCTCAAGAAACCTATCTATCGTAATGAATAAG
TCAGGATCACGTTTGTGTTGTGATGCCTGTTCTCTAGGAAAGAGTTCAAAGCTTCCCTTT
GTTGACTCAGAGTCTGTTTCTAGTCGTCCTTTAGAGAGAATTCACTGTGATTTGTGGGGG
CCTAGTCCTGTTGTTTCATCTCAGGGGTTCAGATACTATGTGATTTTCATTGATAATTAT
TCAAGATACACTTGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL12TF U 1
AF RR4CL12JQ C 82
BS 1 657 RR4CL12TF
BS 658 658 RR4CL12JQ
BS 659 693 RR4CL12TF
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BS 791 919 RR4CL12JQ

RD RR4CL12TF 790 0 0
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AGCAACAGTCCTCTGGAGGGTCAGGTTCCAACTCCAACACGCGACCTACTTGCCAAATAT
GTGGTCGGTTTGGGCATTCTGCTGCAAAGTGTTTCAATAGGTTTGATCAAGACTTTCAGA
CTCCTGAGAATATTCACACTGCTTTGGCAACAATGAAGGTCTCAGATCATCACGGTGGTC
AAGAATGGTATCCAGACTCGGCAGCAACAGCTCACATTACCAGCAACCACAGTCAGCCTC
AGTCTTCAGAACCATATTTGGGACAAGATCAGGTCATAGTGGGTAATGGTGACTTCTTAC
CCATCACACATGTGGGTTCTGTCTCGCTTCAAACCCCTCAAGGACAAGGCAACAAAGAGG
GTGATAACTCAAGGAAGAAGACTTAAAGATATGTATGTACTGAAGGACATGCGGTTCCAA
GCTTTCTATTCAACTCGTCAACAGGCTGCTACTGATGGTGTTTGGCATAGAAGATTATGT
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GTTGACTCAG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR4CL12JQ 838 0 0
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CAGGTTCCAACTCCAACACGCGACCTACTTGCCAAATATGTGGTCGGTTTGGGCATTCTG
CTGCAAAGTGTTTCAATAGGTTTGATCAAGACTTTCAGACTCCTGAGAATATTCACACTG
CTTTGGCAACAATGAAGGTCTCAGATCATCACGGTGGTCAAGAATGGTATCCAGACTCGG
CAGCAACAGCTCACATTACCAGCAACCACAGTCAGCCTCAGTCTTCAGAACCATATTTGG
GACAAGATCAGGTCATAGTGGGTAATGGTGACTTCTTACCCATCACACATGTGGGTTCTG
TCTCGCTTCAAACCCCTCAAGGACAAGGCAACAAAGAGGGTGATAACTCAAGGAAGAAGA
CTTAAAGATATGTATGTACTGAAGGACATGCGGTTCCAAGCTTTCTATTCAACTCGTCAA
CAGGCTGCTACTGATGGTGTTTGGCATAGAAGATTAGGTCACGCCAATATGGATGTTCTT
CAGCACCTCTCAAGAAACCTATCTATCGTAATGAATAAGTCAGGATCACGTTTGTGTTGT
GATGCCTGTTCTCTAGGAAAGAGTTCAAAGCTTCCCTTTGTTGACTCAGAGTCTGTTTCT
AGTCGTCCTTTAGAGAGAATTCACTGTGATTTGTGGGGGCCTAGTCCTGTTGTTTCATCT
CAGGGGTTCAGATACTATGTGATTTTCATTGATAATTATTCAAGATACACTTGGTTTC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL8297Contig1 808 2 6 U
GGAAAGAAGGAAGATACTCTAATTCATGGCTATTCTCTTCACACCTCCACAGTGCAGAGC
CTTCTCTCCTCCCGTATTCAACAACCACGCTACCGGAGAAACCACTCCCTCTCCTAACTC
CGTAAAGCTAAAAACCTCTCGGTTTATCTCTATCCGGCGGCGTTGGAGTTGCAGAAGCGG
CGAAAGTGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTCCCAAAAGAGTTCACTTCTGTCATAGATG
TTGCTGGTTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAGAGGATTGCTGAAGAAATCGATGATATTG
AGAAAGATACAGGGTTTAAGTTGAGAGTCTTGGCTCAAAACTATCCTGTTACACCTGGAC
TAGCTGTCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGATAACACTATTGTGTTTGTCGCTGATCCCA
CTTTTGGGAACATATTGAACTTCAATGTTGGGGCTACTGTTGATTTGGACATACCTCGTA
GTTTCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAACATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTG
AAGATGCATCCATCGAAGCTGCAGTGATGGCTATATCAAGTTGCTTAAGGGAACCCGTTG
GTGCAAATAACTGTGCAGAGATTTACTGAAGTATTATGACCCGATAAAATGTCTGTTATA
AGAGTACTGTATAAACATCCATGCCACATGTGATAGTAAGAGTATAGATGTTGAATCTGA
CATCAACCCTATATAGTTTTTGTACTTGTGTTATCGTACTGTATTGGTACGTTTGTCGAG
ATCGTTCAAAGAAACAACTTTAGGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF56TF U 1
AF RR4DF56JQ C 184
BS 1 698 RR4DF56TF
BS 699 699 RR4DF56JQ
BS 700 740 RR4DF56TF
BS 741 741 RR4DF56JQ
BS 742 783 RR4DF56TF
BS 784 808 RR4DF56JQ

RD RR4DF56TF 783 0 0
GGAAAGAAGGAAGATACTCTAATTCATGGCTATTCTCTTCACACCTCCACAGTGCAGAGC
CTTCTCTCCTCCCGTATTCAACAACCACGCTACCGGAGAAACCACTCCCTCTCCTAACTC
CGTAAAGCTAAAAACCTCTCGGTTTATCTCTATCCGGCGGCGTTGGAGTTGCAGAAGCGG
CGAAAGTGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTCCCAAAAGAGTTCACTTCTGTCATAGATG
TTGCTGGTTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAGAGGATTGCTGAAGAAATCGATGATATTG
AGAAAGATACAGGGTTTAAGTTGAGAGTCTTGGCTCAAAACTATCCTGTTACACCTGGAC
TAGCTGTCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGATAACACTATTGTGTTTGTCGCTGATCCCA
CTTTTGGGAACATATTGAACTTCAATGTTGGGGCTACTGTTGATTTGGACATACCTCGTA
GTTTCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAACATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTG
AAGATGCATCCATCGAAGCTGCAGTGATGGCTATATCAAGTTGCTTAAGGGAACCCGTTG
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AGAGTACTGTATAAACATCCATGCCACATGTGATAGTA*GAGTATAGATGTTGAATCTGA
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ATC

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DS 

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TCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAACATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTGAAG
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CAACCCTATATAGTTTTTGTACTTGTGTTATCGTACTGTATTGGTACGTTTGTCGAGATC
GTTCAAAGAAACAACTTTAGGGATC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

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CATAGAGGTTTTGAGAATTCGTTCTTGAGATCGAGGTACTTTTCATTATCTGTTCCCATG
TATTTTTTTATAACATGGAGAACCAGAAGAATTTATATGTCTAAGATTTATATCCACATT
TTATATTTATGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B849JQ C 1
AF RR4B849TF U 1
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TTATATTTATGTT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR4B849TF 553 0 0
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GATCTCATCGCTTCTCGGTATCAATAAGAGAAGTTTGTATCATTTTAGTAGAATTGTAAT
CATAGAGGTTTTGAGAATTCGTTCTTGAGATCGAGGTACTTTTCATTATCTGTTCCCATG
TATTTTTTTATAACATGGAGAACCAGAAGAATTTATATGTCTAAGATTTATATCCACATT
TTATATTTATGTT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL8299Contig1 549 2 1 U
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CATACTCTTCGGTTGCAAAGATCATTAGGAACTATGACTGAAGAAGCCACCATAGTCTCT
CTTTTTTGAGTTTAATGTTTATGTTTATGCTAATAAAAATCTTTATTAAGATCAATTTGG
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GAATTGACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4F991JQ C 1
AF RR4F991TF U 1
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DS 

RD RR4F991TF 549 0 0
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CACAGATTATTCTGAGTTGGATAATAGTGGCGATTGGTTTGGTAAGTGGGACCTTGGGGG
CATACTCTTCGGTTGCAAAGATCATTAGGAACTATGACTGAAGAAGCCACCATAGTCTCT
CTTTTTTGAGTTTAATGTTTATGTTTATGCTAATAAAAATCTTTATTAAGATCAATTTGG
ACTTTAAAGTAGTAATAAGATTAGTGAGAGGTTTTGCTTTCTCAAAAGTTGTCATGTTTG
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GAATTGACC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

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CACGGGGGATGTCATTTTAGCGGAACATTTATCGCACCGGTTCGGTAAGATTGGTCTCGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV20TF U 1
AF RR4FV20JQ C 21
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BS 735 735 RR4FV20JQ
BS 736 756 RR4FV20TF
BS 757 806 RR4FV20JQ

RD RR4FV20TF 756 0 0
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GGAAGCATTCGAGCAAGTATCAATTGTAGCCAAGTTTCCCTGTTTGATCCACGTCACCGA
TCGTTACATAATCTCATCAACCCATGTTCAAGGTCCTAGCATGCTTCCGACGCTTAACCT
CACGGGGGATGTCATTTTAGCGGAACATTTATCGCACCGGTTCGGTAAGATTGGTCTCGG
TGACATTGTGTTGGTTCGATCTCCGACTGACCCGACTAGGATGGTGACGAAGAGGATCTT
GGGTTTAGAAGGGCATAGACTCTCTTTCTCTGCTGACCCTTTGGTTGGTGATAGCTCCGT
CAGCGTTGTGGTTCCAAAAGGCCATGTTTGGATTCAGGGAGATAACTTGTATGCTTCAAC
TGATTCGCGTAATTTCGGACCTGTACCTTACAATCTCATCGAAGGAAAAGCTCTTCTTCG
TGTCTGGCCACCACGGTTCTTTGGGTCATTGAGGTGACGATCACAATCCGGGTTGTTTCC
CTTTCAGTTGTTTTTGCAGTAGGATGTGTGTAACTCCAGCGGTTTTATTGCAATGTTGAT
CATACTCATTAGAGTAATGTTATGTATCAATCGGATTTAGATAAAGCCACAGAAGTGGGA
TAAATATTAGAGGA*GCCATGGACCTGCCTTTGTTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4FV20JQ 786 0 0
A
CCCTCTCCCGATCCAGTTTCAGAATCCGGACCTGGTTCGGTGCCTTTGTCGAGACATGAG
ATGGCTGAGATATCTAAACCAATGGCGTGGAACCGCGAAGGAAGCATTCGAGCAAGTATC
AATTGTAGCCAAGTTTCCCTGTTTGATCCACGTCACCGATCGTTACATAATCTCATCAAC
CCATGTTCAAGGTCCTAGCATGCTTCCGACGCTTAACCTCACGGGGGATGTCATTTTAGC
GGAACATTTATCGCACCGGTTCGGTAAGATTGGTCTCGGTGACATTGTGTTGGTTCGATC
TCCGACTGACCCGACTAGGATGGTGACGAAGAGGATCTTGGGTTTAGAAGGGCATAGACT
CTCTTTTTCTGCTGACCCTTTGGTTGGTGATAGCTCCGTCAGCGTTGTGGTTCCAAAAGG
CCATGTTTGGATTCAGGGAGATAACTTGTATGCTTCAACTGATTCGCGTAATTTCGGACC
TGTACCTTACAATCTCATCGAAGGAAAAGCTCTTCTTCGTGTCTGGCCACCACGGTTCTT
TGGGTCATTGAGGTGACGATCACAATCCGGGTTGTTTCCCTTTCAGTTGTTTTTGCAGTA
GGATGTGTGTAACTCCAGCGGTTTTATTGCAATGTTGATCATACTCATTAGAGTAATGTT
ATGTATCAATCGGATTTAGATAAAGCCACAGAAGTGGGATAAATATTAGAGGAAGCCATG
GACCTGCCTTTGTTTTATACCTGAAGCTACGTTAAGATTCATTTTGTAAGATCTAAAAAG
TTGGT

QA 2 786 2 786
DS 



AS 1 2

CO CL8301Contig1 680 2 2 U
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CGATAAGGAGCTTCAGGGAGCGCTCTCTTCGTATAATCAGAGCTTCAGCATGAGAACTGT
TCATCTCCTCATGTATCTCTTCACCAACAGCAACGTCAGAAAGATCGGACCGAAAGAGTT
TACTTCACTTTTCTACAGTCTTCAGAGTTGGAGGACAATATTCGAGAGGTTTGATAAGGA
CAGAAGTGGGAGAATCGATACAAACGAGCTAAGAGATGCACTCTTGAGCCTCGGGTTTTC
AGTGTCTCCTGTGGTTTTGGATCTGCTCGTTTCTAAGTTTGATAAAAGTGGAGGCAGGAA
CAGGGCTATTGAATATGACAACTTCATCGAGTGTTGTTTGACTGTAAAGGGGCTGACTGA
GAAGTTCAAGGAGAAGAATACGGCGTTATCAGGATCAGCTACTTTCAACTACGAGGCCTT
CATGCTCACTGTTCTACCGTTCCTAGTCGCTTAAGTTCGTTGCCCTTATGGAGCCTTTGG
AATAATTTGTTTGTAGTTGAATTATGGAGTTTGCTCTTTTACCTTTTCTTATCGTCTTTG
CTTTTGTAAGATTTGGAAGTGGCTCTCTCTGTATGAGCATTTAAACAAGTGTTGTGGGAT
AAATTTGACTCTTAAAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG54TF U 1
AF RR4EG54JQ C 85
BS 1 633 RR4EG54TF
BS 634 680 RR4EG54JQ

RD RR4EG54TF 633 0 0
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TCATCTCCTCATGTATCTCTTCACCAACAGCAACGTCAGAAAGATCGGACCGAAAGAGTT
TACTTCACTTTTCTACAGTCTTCAGAGTTGGAGGACAATATTCGAGAGGTTTGATAAGGA
CAGAAGTGGGAGAATCGATACAAACGAGCTAAGAGATGCACTCTTGAGCCTCGGGTTTTC
AGTGTCTCCTGTGGTTTTGGATCTGCTCGTTTCTAAGTTTGATAAAAGTGGAGGCAGGAA
CAGGGCTATTGAATATGACAACTTCATCGAGTGTTGTTTGACTGTAAAGGGGCTGACTGA
GAAGTTCAAGGAGAAGAATACGGCGTTATCAGGATCAGCTACTTTCAACTACGAGGCCTT
CATGCTCACTGTTCTACCGTTCCTAGTCGCTTAAGTTCGTTGCCCTTATGGAGCCTTTGG
AATAATTTGTTTGTAGTTGAATTATGGAGTTTGCTCTTTTACCTTTTCTTATCGTCTTTG
CTTTTGTAAGATTTGGAAGTGGCTCTCTCTGTA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4EG54JQ 596 0 0
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CGAGCTAAGAGATGCACTCTTGAGCCTCGGGTTTTCAGTGTCTCCTGTGGTTTTGGATCT
GCTCGTTTCTAAGTTTGATAAAAGTGGAGGCAGGAACAGGGCTATTGAATATGACAACTT
CATCGAGTGTTGTTTGACTGTAAAGGGGCTGACTGAGAAGTTCAAGGAGAAGAATACGGC
GTTATCAGGATCAGCTACTTTCAACTACGAGGCCTTCATGCTCACTGTTCTACCGTTCCT
AGTCGCTTAAGTTCGTTGCCCTTATGGAGCCTTTGGAATAATTTGTTTGTAGTTGAATTA
TGGAGTTTGCTCTTTTACCTTTTCTTATCGTCTTTGCTTTTGTAAGATTTGGAAGTGGCT
CTCTCTGTATGAGCATTTAAACAAGTGTTGTGGGATAAATTTGACTCTTAAAAATG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL8302Contig1 907 2 4 U
AGGGGACCGAAGAATCAAGTTATGGCGGCGGGCATGGTTACGTCGGCAGGATCGCGACGG
TGGAAATGGTTAATTGAAGCTCTGCTACTAGTGGTATCACTATCATTCCCGCATCTCTCC
AGCGCTTACCGACCAGGAGACATCGTGGCGATGAGCAAGATGGGACAGTACCATTCCTCG
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CAGTTCTGGGACCCTCAACACTGGCCAAAACATGTTCTTGTTAGATACACATGGAAGGAA
CAGTCAGAGATTGATGTTTCCTCAGGATTTTATGTCCTCTTTGGTTCAGCTCTCACATTC
TCTTTCGTACTCTCCATTTACGTCTTACAATCTTCAAGAGAGAAGCTGGCGAGGTTTGTA
AGAGAGACGGTTGTGGAAAGCAGCTCGAATGTTGGAGAGTTTGGCAAGGTTGAGTGAGAG
TGTCATATAGTCGAGAGCGTTTGTATGTTGCTGCTGCCATAGATGCTTGGACTTGGTTGG
TTAAGAAAAAAAACAATTCCAGAAAAGGAATGAGATTTGATCGTGTTTGAATTAGTCGAA
AGCAAAACTCTGTTATTGTCATATACGGTGTTCCAAACCAAATCAATCAACACAAGTAAC
TTGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CF16TF U 1
AF RR4CF16JQ C 146
BS 1 669 RR4CF16TF
BS 670 670 RR4CF16JQ
BS 671 704 RR4CF16TF
BS 705 907 RR4CF16JQ

RD RR4CF16TF 704 0 0
AGGGGACCGAAGAATCAAGTTATGGCGGCGGGCATGGTTACGTCGGCAGGATCGCGACGG
TGGAAATGGTTAATTGAAGCTCTGCTACTAGTGGTATCACTATCATTCCCGCATCTCTCC
AGCGCTTACCGACCAGGAGACATCGTGGCGATGAGCAAGATGGGACAGTACCATTCCTCG
AGAACGACTTGGCATGATGTGATCGGAAAGCATTGCCCGATCTTCGCCGTTAATCGCGAG
GTGCTGATCCCCATAGCGAAACCAGTTGGCTACACTGGCACTGATCCTTATAAGATAAAA
TTCCAAGTTGGAAGTGAGAAATTTCTAATACACTGGCTTTTGGTGATAAACCGGAAGAGT
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ACAGCTCAAGTTGTCGATATGCCTCTTAGCTATTTGAATACACACCCGGAGATCCGCAAG
CAGTTCTGGGACCCTCAACACTGGCCAAAACATGTTCTTGTTAGATACACATGGAAGGAA
CAGTCAGAGATTGATGTTTCCTCAGGATTTTATGTCCTCTTTGGTTCAGCTCTCACATTC
TCTTTCGTACTCTCCATTTACGTCTTACAATCTTCAAGAGAGAAGCTGGCGAGGTTTGTA
AGAGAGACG*TTGTGGAAAGCAGCTCGAATGTTGGAGAGTTTGG

QA 1 704 1 704
DS 

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GAAAGCATTGCCCGATCTTCGCCGTTAATCGCGAGGTGCTGATCCCCATAGCGAAACCAG
TTGGCTACACTGGCACTGATCCTTATAAGATAAAATTCCAAGTTGGAAGTGAGAAATTTC
TAATACACTGGCTTTTGGTGATAAACCGGAAGAGTTCAGAAGTTCCAATGATCGATGTCA
ATTTGAGATATTCTGGAGGAGATTTGCTTGGAGTTACAGCTCAAGTTGTCGATATGCCTC
TTAGCTATTTGAATACACACCCGGAGATCCGCAAGCAGTTCTGGGACCCTCAACACTGGC
CAAAACATGTTCTTGTTAGATACACATGGAAGGAACAGTCAGAGATTGATGTTTCCTCAG
GATTTTATGTCCTCTTTGGTTCAGCTCTCACATTTTCTTTCGTACTCTCCATTTACGTCT
TACAATCTTCAAGAGAGAAGCTGGCGAGGTTTGTAAGAGAGACGGTTGTGGAAAGCAGCT
CGAATGTTGGAGAGTTTGGCAAGGTTGAGTGAGAGTGTCATATAGTCGAGAGCGTTTGTA
TGTTGCTGCTGCCATAGATGCTTGGACTTGGTTGGTTAAGAAAAAAAACAATTCCAGAAA
AGGAATGAGATTTGATCGTGTTTGAATTAGTCGAAAGCAAAACTCTGTTATTGTCATATA
CGGTGTTCCAAACCAAATCAATCAACACAAGTAACTTGTAGT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL8303Contig1 1361 2 2 U
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CCTCAGATGATTAGTGCTGCTGTTAAGGGAGTAGCTCGTTTGACATATGAGTTCTCCGAC
TCATAGCTAGTGCTTACAATTTGCTCCCTTCAACATTTCTTCTCCTCCAGAGGAAAAATA
AGGAAATCACAAAAGCAAATTTAGGTTTGTTGAAGGTGTTGGTGGCTAAGTCACCCGTTG
AAGGACTACATGCAAACTTAAAGAGCATGGTTGAAGGTTTACTGAAATGGCCTGAAGGAA
CCAAAAACCTTTTCAAAGCAAAGGTGAGGCTTCTATTGGAGATGCTAATCAAGAAATGTG
GCACGGAGGCTGTTAAGTCTGTGATGCCTGAAGAACATATGAAACTCCTGACAAACATCC
GAAAGGTCAAGGAACGTAAAGAGAGAAAATATGCAGCTGCCTCTGAGATGAGTAGATCTC
AGCATTCAAAAGAAACTTCATCAAAGGCTGGCCGTTGGAATGATACCAAAATATTTTCTG
ATTTTGATGATGAAGACGAGGACAGCGATGGAGATTACATGGATGGGGAGACGCATGGCC
GTAGCAAGGCTTCCTCTCTGTTGAAATCTAAAGCAGCATCCGCTTTGAGATCAAAGAAAA
GTCAGAGGCAGTCTCATCTTGAAGTCAATGAGTCAGATGATGAGCCGCTTGACTTAATGG
ATCGATACAAAACAAGATCAGCTCTTCGATCAAGTGAGCTACGCAAACGGAAAGCTGACT
CGGATGAAGAAGCAGAGTTTGACGAGGAAGGACGGCTAATCATCCATGAAGGAGGGAGAG
GTAAAAGGAAGGAGATCTCTGATCCAGATTGTGATGCCAAGAGCAGCAAAGGTAGCCGTT
TCTCTGCAAATACATCTAAGAAGAACCAAAAGGGGATGAAGACATCAGAGTCAGGATACG
CTTACACTGGTAAAGAGTACGCAAGCAAAAAGGCAAGTGGGGATCTTAGGAGGAAAGATA
AGCTTGAACCGTATGCGTATTGGCCACTTGATCGCAAGATGATGAGCCGTAGACCAGATC
AGAGGGCTGTTGCGGTCAAAGGTATGTCTAGTGTGGTTAAGCTGACGAAGAGGTTGGAAG
GAAAGAGCACTGCGGAAGCACTTGCCGCCACTAAGTTCAAAAAGTTCAAGAGGAGTGGTC
AGAAGAAATCAGCTGGGAAGAAGAAAAGCAAGTGAGCAAAAGCGGCAGTAAGCTTCTCAC
TATGTTTAAGATGTATTAGAAGTGGGATTGTATTTTATTTCACAGTTTTGACTGCTGAAA
CTTTGCATGCCAATTTGTTCATTTACTAGTGTAACAGCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF13TF U 1
AF RR4BF13JQ C 624
BS 1 810 RR4BF13TF
BS 811 1361 RR4BF13JQ

RD RR4BF13TF 811 0 0
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CCTCAGATGATTAGTGCTGCTGTTAAGGGAGTAGCTCGTTTGACATATGAGTTCTCCGAC
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AGGAAATCACAAAAGCAAATTTAGGTTTGTTGAAGGTGTTGGTGGCTAAGTCACCCGTTG
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GCACGGAGGCTGTTAAGTCTGTGATGCCTGAAGAACATATGAAACTCCTGACAAACATCC
GAAAGGTCAAGGAACGTAAAGAGAGAAAATATGCAGCTGCCTCTGAGATGAGTAGATCTC
AGCATTCAAAAGAAACTTCATCAAAGGCTGGCCGTTGGAATGATACCAAAATATTTTCTG
ATTTTGATGATGAAGACGAGGACAGCGATGGAGATTACATGGATGGGGAGACGCATGGCC
GTAGCAAGGCTTCCTCTCTGTTGAAATCTAAAGCAGCATCCGCTTTGAGATCAAAGAAAA
GTCAGAGGCAGTCTCATCTTGAAGTCAATGAGTCAGATGATGAGCCGCTTGACTTAATGG
ATCGATACAAAACAAGATCAGCTCTTCGATCAAGTGAGCTACGCAAACGGAAAGCTGACT
CGGATGAAGAAGCAGAGTTTGACGAGGAAG
A

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4BF13JQ 738 0 0
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CTTCGATCAAGTGAGCTACGCAAACGGAAAGCTGACTCGGATGAAGAAGCAGAGTTTGAC
GAGGAAGGACGGCTAATCATCCATGAAGGAGGGAGAGGTAAAAGGAAGGAGATCTCTGAT
CCAGATTGTGATGCCAAGAGCAGCAAAGGTAGCCGTTTCTCTGCAAATACATCTAAGAAG
AACCAAAAGGGGATGAAGACATCAGAGTCAGGATACGCTTACACTGGTAAAGAGTACGCA
AGCAAAAAGGCAAGTGGGGATCTTAGGAGGAAAGATAAGCTTGAACCGTATGCGTATTGG
CCACTTGATCGCAAGATGATGAGCCGTAGACCAGATCAGAGGGCTGTTGCGGTCAAAGGT
ATGTCTAGTGTGGTTAAGCTGACGAAGAGGTTGGAAGGAAAGAGCACTGCGGAAGCACTT
GCCGCCACTAAGTTCAAAAAGTTCAAGAGGAGTGGTCAGAAGAAATCAGCTGGGAAGAAG
AAAAGCAAGTGAGCAAAAGCGGCAGTAAGCTTCTCACTATGTTTAAGATGTATTAGAAGT
GGGATTGTATTTTATTTCACAGTTTTGACTGCTGAAACTTTGCATGCCAATTTGTTCATT
TACTAGTGTAACAGCTCG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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GGAAAAGAAAAAGAAAATAAAAAACAACATGAAAACATTACAAAGGCATAGAAGAAGAGT
ACTACTACTACAAACGACGATCCTCCCGTTATTGTTAATTTTTGCACTATCCATGGCGAA
GGAGCGTCCTTCTTTCGAGCGCGCGAAAGACATCAATTGCCTCGACAAAATCGTCCTCCG
CGAGTCTCGCTGCCGCTCCGCTGAGGTATACTTGTATGGTGGTCATGTGACTTCCTGGAA
GAATGAGAACGGAGAAGAGTTACTTTTCCTCAGTAGCAAGTCTATATTCAAGCCTCCAAA
ACCCATCCGTGGAGGGATTCCACTGTGCTTCCCTCAATTCAGTAACTATGGTCCAGTAAA
ATCTCATGGATTCGCTAGAAACAGGATTTGGGAAGTCGATACTAGCCCACCTCCTCTGGC
CAATTCTTCTTCTAACGCTTTTGTTGACCTGATCCTAAGGCCAACTGAAGACGATCTCAA
GATGTGGCCTAACAATTTTGAGTTCCGGATGAGGGTAGCTTTGGGATGTGAAGGGGAATT
GACGCTGACATCTCGTA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EV93TF U 1
AF RR4DE95TF U 2
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GG
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ACTACTACAAACGACGATCCTCCCGTTATTGTTAATTTTTGCACTATCCATGGCGAAGGA
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GCTGACATCTCGTA

QA 3 556 3 556
DS 



AS 1 2

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AGAGAACAATGGTCAATGGAGGCATGAAACTACCAGTTGGATACAGATTTCACCCAACGG
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CCATCATCCCTGTCTTTGACGTTTTCGTCTCTCATCCTCTCACTTTTCCAGGGGATCAAG
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GAATCAAGACTTCATCTGGTGATGGTTATTGGAAAGCTATTAGGAAAGAAAGAGAAGTCA
TTGCTTGTGGTAGAACAGTTGGGATTAGAAGAACACGTGTTTTCTATGGAACAAACAACT
CTTCGGCTAACTGCAACAAAACCAGATGGTGCATGACAGAGTATTCCCTTGCCGGATTTG
CATCAACTAAGGTGTTTGGAGAATGGGCAGTGTACAAAGTGTATAAGAGGAAAGAATCAA
AAGGAAGAAGGCAGAGGAGATCAAAAGGGAGAGATCATGAAGAAGAAGATTTGAATTGCA
TCCAGTTTACTATTGGGACTGATCATGAAACCTGTCCTCCACCGCCCTCTCCTCCTACCT
CAGCTGATGAGTCAGGGAGCATTATTTAGAAGTTGTTCCTTAACTCTAACCTACTCTGCT
TACGTTTTTGTCACGTCTTGATTCATTTGTTAGAAACAAGTAAAAGGAGGCTAGAGGGGG
TCAAATTTTATCAGAAAGTGTTGTGTGAGTGGAGATTTGTTGAACAAACCACATATATGT
CAAACTTGTTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BC77TF U 1
AF RR4BC77JQ C 148
BS 1 796 RR4BC77TF
BS 797 797 RR4BC77JQ
BS 798 847 RR4BC77TF
BS 848 976 RR4BC77JQ

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TACGTTT
CTGT

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DS 

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TCCCAAAGGCCCTTGCTTCTCGTTTGCCTTCTTCCATCATCCCTGTCTTTGACGTTTTCG
TCTCTCATCCTCTCACTTTTCCAGGGGATCAAGAGGAGAGGCAGAGGTACTTCTTTTGCA
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AGTGGAGATTTGTTGAACAAACCACATATATGTCAAACTTGTTACTTTT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL8306Contig1 920 2 2 U
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AGAACTCGGAGCAAACTATGCAAAACCCATCGTAGATATCGACACAGCTCGTGAGCTTCT
TACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGATCATGATTGGAGCAGCACCTGATGA
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ATGTGCATGTGGTGTTTCAC


BQ
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BS 1 696 RR4AP69TF
BS 697 920 RR4AP69JQ

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TGGGAGCTTACCTGATGGCCACGAGCTTGATCGCTTGGACAATCCCGCGATACAAGGTGC
AAAGTACGATCCGGAAGGTGAGTACATAAGGCAATGGCTTCCCGAGCTGGCGAGAATGCC
AACGGAATGGATCCATCATCCATGGGACGCTCCTTCAACTGTACTCAAAGCTTCCGGAGT
AGAACTCGGAGCAAACTATGCAAAACCCATCGTAGATATCGACACAGCTCGTGAGCTTCT
TACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGATCATGATTGGAGCAGCACCTGATGA
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CCCGTCTTCGTCTTCTAATGACCAGAGAGTACCTTCGGATGTTCGTTACAATGGGTCAAA
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AGAAAGGGACTTGTTTTCATCCACTGCCGAGTCTTCTTCTGATGGTTAGAAGCGTGTTCT
TGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTATCAGAAGGGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4AP69JQ 774 0 0
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TAAGGCAATGGCTTCCCGAGCTGGCGAGAATGCCAACGGAATGGATCCATCATCCATGGG
ACGCTCCTTCAACTGTACTCAAAGCTTCCGGAGTAGAACTCGGAGCAAACTATGCAAAAC
CCATCGTAGATATCGACACAGCTCGTGAGCTTCTTACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTG
AGGCACAGATCATGATTGGAGCAGCACCTGATGAGGTTGTAGCTGATAGCTACGAGGTCT
TAGAGGGTAATACCGTGAAAGTACCAGGTGTTTGCCCGTCTTCGTCTTCTAATGACCAGA
GAGTACCTTCGGATGTTCGTTACAATGGGTCAAAGAGAGTGAAACCTGCGGGAGAAGAAG
ATGAAGAAGAGAGGGAGATGAAGAGATGTAGAGAAGAAAGGGACTTGTTTTCATCCACTG
CCGAGTCTTCTTCTGATGGTTAGAAGCGTGTTCTTGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTA
TCAGAAGGGTATAACTTGGAAGAAGGTATTCAAGATTCTTCTGATCAGATTACTACTAGA
AGCTCTGTAAAAAATGGTTAAAAGTTGTTATTACAAAACCTAACACGTTGTATATCTTTA
AGTGTGTATGTGTGTCTCTTGATTCGTTATTACATCGCTGACAACTACGGTCTGTCAACG
GATATGTAAGGATGAAGACATAAAAGGTTGTTTTATGTGCATGTGGTGTTTCAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL8307Contig1 1158 2 2 U
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ACAAAGGAGCAAATAAAGGTAACATATGTGCACACCTCAAGGATGATAAGAGCCACCGGA
GAGCGTCCCTTGGGTGATAGGAGATGGAGCCGTTTCAACGAAGGGTTCACTGTTCCACAG
AACTGTCTAGTGGATAAGATCCATGGGAGCTTCAAGAACAATGCCCTCACCATCACCATG
CCTAAGGAGACTATTACAAAAATGTCCAACCTTCCAGAAACTTCCAAATCTGTGGCTGAG
AAGGTGAAGCAGCTAGAAGAGAAGAGGCTGTTGGAGGAAGCTAGAAGGAAAGAAGAAGAG
GCTGAGAAGAAGAAGAAGCTTTTAGAAGAGAAAGAGGGGATACTTAGGAAGCTTCAAGAA
GAAGCTAAAGCAAAAGAGATGGCTGAAGCAAGAAAGCTTCAAGAAGAAGCTAGAGCAAGG
AAACTTCAAGAAGAAGCTAGGGCAAAAGAAGAAGCTAAAGCAAGGCAGCTTCAAGAAGAG
GCCAAAGCAAAAGAGATAGCTGAAGCAAGAAAAATTCAAGAAGAAGCTAGAGCAAGGAAA
CTTCAAGAAGAAGCTAGGGCAAAAGAAGAAGCTAGAGCAAGGCAGATTCAGGAAGAGGCC
AGAGCATATGAGAAACTTGAGGAGAGGAGGCGTGTGGAAGAAGCTGCACTAAAGAAGAAG
TATATGGATGAATCTGTAGGAAACAGGAAGATAATAAAGCCAGAAGATAGGTTGCTTCCA
GAAGTGGACTATACAAAATCCATCCCTAGTTCTTCGACCAAACCTGCGTTTGAAAGAACA
AGAGAGGTCGTGAAAGCAGCAGAAGAGAAACTAGGTTACTTGGTGGAGAAGGAAAAGAAA
ACAGAGAAAGGGATGATGGAGAAAATGAGAGGAAAAGAGATAACAAGGGAAGATAAGAAG
ATGATGTTGAATGCAGGAGTGGCTGCTCTAGTGATCTTTGCTCTCGGGGCTTACGTTTCT
TATACCTTTTGCTCATCATCTCCATCTCCTAATAGCAAACCAGAATGATGATGTTTATAG
GAAAAAATTGTGTGAAGACGTGCTTTTATAATTTGTAAACTGTAAAATATTCTGAAATAT
AATAAAGTTTGATGATGT


BQ
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GCTGAGAAGAAGAAGAAGCTTTTAGAAGAGAAAGAGGGGATACTTAGGAAGCTTCAAGAA
GAAGCTAAAGCAAAAGAGATGGCTGAAGCAAGAAAGCTTCAAGAAGAAGCTAGAGCAAGG
AAACTTCAAGAAGAAGCTAGGGCAAAAGAAGAAGCTAAAGCAAGGCAGCTTCAAGAAGAG
GCCAAAGCAAAAGAGATAGCTGAAGCAAGA

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DS 

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AAGCTAGAGCAAGGAAACTTCAAGAAGAAGCTAGGGCAAAAGAAGAAGCTAAAGCAAGGC
AGCTTCAAGAAGAGGCCAAAGCAAAAGAGATAGCTGAAGCAAGAAAAATTCAAGAAGAAG
CTAGAGCAAGGAAACTTCAAGAAGAAGCTAGGGCAAAAGAAGAAGCTAGAGCAAGGCAGA
TTCAGGAAGAGGCCAGAGCATATGAGAAACTTGAGGAGAGGAGGCGTGTGGAAGAAGCTG
CACTAAAGAAGAAGTATATGGATGAATCTGTAGGAAACAGGAAGATAATAAAGCCAGAAG
ATAGGTTGCTTCCAGAAGTGGACTATACAAAATCCATCCCTAGTTCTTCGACCAAACCTG
CGTTTGAAAGAACAAGAGAGGTCGTGAAAGCAGCAGAAGAGAAACTAGGTTACTTGGTGG
AGAAGGAAAAGAAAACAGAGAAAGGGATGATGGAGAAAATGAGAGGAAAAGAGATAACAA
GGGAAGATAAGAAGATGATGTTGAATGCAGGAGTGGCTGCTCTAGTGATCTTTGCTCTCG
GGGCTTACGTTTCTTATACCTTTTGCTCATCATCTCCATCTCCTAATAGCAAACCAGAAT
GATGATGTTTATAGGAAAAAATTGTGTGAAGACGTGCTTTTATAATTTGTAAACTGTAAA
ATATTCTGAAATATAATAAAGTTTGATGATGT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACGAAAGTAACAAAAAAAAAGGACGATTTGATAGCAA
TCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTTCAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCCG
GATACGCGGCTAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATCT
CCAGGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGACCTGCACTCAGCAAAGGAAAATGGCAAAGCT
GTGGTTGTTGGTGGTGGTTACATCGGTCTTGAACTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAAC
ATGGAAGTTCTATTCCTGAATATGATTATCTTCCATACTTCTACTCTAGAGCCTTTAATC
TCTCGTGGCAGTTCTACGGTGATAACGTTGGAGAGACCGTGTTGTTTGGTGACAATGACC
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ATTTATCTGATTGAGAAATAAATTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DA10TF U 1
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ATGGAAGTTCTATTCCTGAATATGATTATCTTCCATACTTCTACTCTAGAGCCTTTAATC
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TATG

QA 1 604 1 604
DS 

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AAGCTGTGGTTGTTGGTGGTGGTTACATCGGTCTTGAACTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTA
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TTGGGATTTATCTGATTGAGAAATAAATTTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATAAAATCAC


BQ
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ATAAAATCAC

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DS 

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ATAAAATCAC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

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TTGGAGAGTCCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D668JQ C 1
AF RR4D668TF U 1
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TTGGAGAGTCCT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4D668TF 552 0 0
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TGATTGATTGATAGCTCCACCTTGTTAGTTCACTAAAAGTGTGGAACTTTGTACTTAGGT
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TTGGAGAGTCCT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL8312Contig1 828 2 2 U
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BQ
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AF RR4FS50TF U 1
AF RR4FS50JQ C 65
BS 1 612 RR4FS50TF
BS 613 828 RR4FS50JQ

RD RR4FS50TF 612 0 0
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TCTTTCTGTAGGCATCGATGAGGTTTTTATTTCGGGTGTTGATGGGTGTATGGGTCTAAT
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TAGGAGCCTGAT

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DS 

RD RR4FS50JQ 764 0 0
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TCTATGGATTTTGGTTTTAATTTATGGTGAATCTAATATGTATTAGGTTTCATATGGTGG
TTGCTGGCCAATTCTCGGGATCTTGGATCATGGTTTTATACGGTTTCGATGTCAGTTCTT
TCTGTAGGCATCGATGAGGTTTTTATTTCGGGTGTTGATGGGTGTATGGGTCTAATGGGT
GATTTAGGACCAATCTTCTTCGATTCACCAGTCTGGTTTAATTTAGGACAAAACAGAGCT
CCAAGGATCTGCTATCTGACTGCTTATTGAAGGGAGTTTGTTGGAAAGAGAAGAGAACAT
GGATTTGAACTTCGAAGTGTTCTGAAGAGTATAGGTGGTTGGGAGCTGCAGTCTGTTTCA
AGAAGCGTGAATAAAGTTGCCTTTATGATTGCTAGGAGTGTGATGATGGAACAGAAAATG
CAGTAATACGTTTCTCAAGGTGAACCAGTTTGGCTAAGGAATGATGTAGCTGTGGATAGG
AGCCTGATCTAAGGATGGCATTATTTTGGATGTGGAGTGAAGAGGTTAAAGAAATTATAG
TGTTTGGGATCTTTCGACATGAATGAGCTTCAGGCTCTGTTTATGTCTTTATCTTTTATA
TTGTTTTTGTTGGTTTTGGTTTTGTACGATACTGTGATTCCTATTGCAATGCATTCTCAG
AGTTAAAAAAGAAAAATAAATAAAACTATTTGTATCTTTGTATC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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T


BQ
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10 

AF RR4E903TF U 1
AF RR4E903JQ C 106
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BS 688 688 RR4E903JQ
BS 689 722 RR4E903TF
BS 723 723 RR4E903JQ
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BS 733 754 RR4E903TF
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RD RR4E903TF 754 0 0
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TAAGACACTAGAGGCTCCGGCTGAGTTGCATGGCAAGAGGTCGTAATCCAACGGCGATGA
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ACGACGAATTAGAACTCGCCGAGGAAGACATCTGGTCACCGGCAGTCATTCACAACACTG
AGACCGAAGATTCATACGGCGGGTGGAACTTACATGCTAACTCGCTGAAAAGTGGGCGCG
TGGGAGGACTGTCACTGACTTTCAAGAGCTCTTCAAACGCGCCGTCGTCATCTCCGATGC
TCGTGCAGCAGATCCACGGCGGAGTAGGTGACGAAGGAGGAAAAATGATGCGGAGTCTGG
CGTCTTCAGCGCCGGTTAACGTGCCGGATTGGAGTAAGATATACCGAGTCAACTTGGTTG
AGTCAACACAGGAGCTGGAGGATGATGACGAGGAGGAGGAACCGGGGATGATGCCGCCGC
ACGAATACCTTGCTAAGAGTCAAGCACGGCGGAGCAGGAAAATGGGAGGCAGTGGGGCGT
CGTTGTTCGAGGGTGTTGGAAGGACTCTCAAAGGCAGGGAACTAAGGCGTGTTCGTGATG
CAATTTGGAGCCAAACAGGGTTCTACG*CTAAGAAATTTAATAAATATCAATATTCTAGA
TT*CAGTTGAA*TATTTGTTTTGGTAGTATACAA

QA 1 754 1 754
DS 

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AGGGAACCTCCCTCAACGACGAATTAGAACTCGCCGAGGAAGACATCTGGTCACCGGCAG
TCATTCACAACACTGAGACCGAAGATTCATACGGCGGGTGGAACTTACATGCTAACTCGC
TGAAAAGTGGGCGCGTGGGAGGACTGTCACTGACTTTCAAGAGCTCTTCAAACGCGCCGT
CGTCATTTCCGATGCTCGTGCAGCAGATCCACGGCGGAGTAGGTGACGAAGGAGGAAAAA
TGATGCGGAGTCTGGCGTTTTCAGCGCCGGTTAACGTGCCGGATTGGAGTAAGATATACC
GAGTCAACTTGGTTGAGTCAACACAGGAGCTGGAGGATGATGACGAGGAGGAGGAACCGG
GGATGATGCCGCCGCACGAATACCTTGCTAAGAGTCAAGCACGGCGGAGCAGGAAAATGG
GAGGCAGTGGGGCGTCGTTGTTCGAGGGTGTTGGAAGGACTCTCAAAGGCAGGGAACTAA
GGCGTGTTCGTGATGCAATTTGGAGCCAAACAGGGTTCTACGGCTAAGAAATTTAATAAA
TATCAATATTCTAGATTTCAGTTGAAATATTTGTTTTGGTAGTATACAAGTAATTTTGTA
ATTTTCGAAGTTTTTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL8314Contig1 953 2 2 U
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AGGGTATGAGGTGCTCAAGAAGGTTTTGAGACAAGGGCTTGATCCAGGACATGGTGTGTA
TACTAAACTGATATCTGGCTTCTGTAAGATTGGGAACTACGCTTGTATGTCGGAGATTCT
CCACACGATGATCGCCTGGAACCATCTCCCGAGCATTTACACCTACCAGGAGATCATCAA
AGGGCTGTGCAAGAACCAGAAGCAGCGGGAGGCGTTTTGTGTGTTTAATAGTCTCAAAGA
GAGAGGCTATGCGCCGGACAGGGTCGTGTACACCACGATGATCCACGGTTTATGCGAGAT
GGGGTGGTTCGGGAGCGCGAGGAAGCTGTGGTTTGAGATGATAGAGAAAGGGATGCGGCC
TAACGAGTTTACTTACAATGTGATGATACACGCGCACTTGAAAAGAGGGGAGGTTGTGCT
GGCGAGGGAGCTCTACGGGGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGGAGAGACGACGGTGAGCTG
TAATACGATGATCACGGGGTTCTGCTCTTACGGGAGAGCGGACCAGGCGTTGGAGGTTTT
CAAGAAAATGTCTGAGACATGGGTTAGACCGGATGCGATCACTTATAACGCTTTGGTTCA
AGGGTTTTGCAAGGAGAATAAGGTTGAGAAAGGGATTGGTCTGTTCAAGGAGCTCAAGGC
CTTGGGGATGAAGCCTTCTGATAGGACTTATGCTGCACTTCGAAAGATGAGAGATCTTAA
GATGTCTGACTCTGTTGCAGCTTCCTTAAATGAGATTCTAGAGGCTGTTTGAAAGTATGA
TGATCCACAAAACTGTAACAATAGGTTGATTCATCAACAAAAAGTCATTTCAT


BQ
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AF RR4DQ73TF U 1
AF RR4DQ73JQ C 150
BS 1 697 RR4DQ73TF
BS 698 953 RR4DQ73JQ

RD RR4DQ73TF 697 0 0
GGTTAGGAAACTAGATCTCTTCTGGGAGCTTCACAAGGAGATGAAAGAGTCGGAGGTTGT
TGATCTCGAGAGGAGTCAGTGTTTGATTCAAGCTTTGTGCGACGGTGGGGAGGTTTCAGA
AGGGTATGAGGTGCTCAAGAAGGTTTTGAGACAAGGGCTTGATCCAGGACATGGTGTGTA
TACTAAACTGATATCTGGCTTCTGTAAGATTGGGAACTACGCTTGTATGTCGGAGATTCT
CCACACGATGATCGCCTGGAACCATCTCCCGAGCATTTACACCTACCAGGAGATCATCAA
AGGGCTGTGCAAGAACCAGAAGCAGCGGGAGGCGTTTTGTGTGTTTAATAGTCTCAAAGA
GAGAGGCTATGCGCCGGACAGGGTCGTGTACACCACGATGATCCACGGTTTATGCGAGAT
GGGGTGGTTCGGGAGCGCGAGGAAGCTGTGGTTTGAGATGATAGAGAAAGGGATGCGGCC
TAACGAGTTTACTTACAATGTGATGATACACGCGCACTTGAAAAGAGGGGAGGTTGTGCT
GGCGAGGGAGCTCTACGGGGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGGAGAGACGACGGTGAGCTG
TAATACGATGATCACGGGGTTCTGCTCTTACGGGAGAGCGGACCAGGCGTTGGAGGTTTT
CAAGAAAATGTCTGAGACATGGGTTAGACCGGATGCG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DQ73JQ 804 0 0
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TTGGGAACTACGCTTGTATGTCGGAGATTCTCCACACGATGATCGCCTGGAACCATCTCC
CGAGCATTTACACCTACCAGGAGATCATCAAAGGGCTGTGCAAGAACCAGAAGCAGCGGG
AGGCGTTTTGTGTGTTTAATAGTCTCAAAGAGAGAGGCTATGCGCCGGACAGGGTCGTGT
ACACCACGATGATCCACGGTTTATGCGAGATGGGGTGGTTCGGGAGCGCGAGGAAGCTGT
GGTTTGAGATGATAGAGAAAGGGATGCGGCCTAACGAGTTTACTTACAATGTGATGATAC
ACGCGCACTTGAAAAGAGGGGAGGTTGTGCTGGCGAGGGAGCTCTACGGGGAGATGCTTA
GAGATGGGTTTGGAGAGACGACGGTGAGCTGTAATACGATGATCACGGGGTTCTGCTCTT
ACGGGAGAGCGGACCAGGCGTTGGAGGTTTTCAAGAAAATGTCTGAGACATGGGTTAGAC
CGGATGCGATCACTTATAACGCTTTGGTTCAAGGGTTTTGCAAGGAGAATAAGGTTGAGA
AAGGGATTGGTCTGTTCAAGGAGCTCAAGGCCTTGGGGATGAAGCCTTCTGATAGGACTT
ATGCTGCACTTCGAAAGATGAGAGATCTTAAGATGTCTGACTCTGTTGCAGCTTCCTTAA
ATGAGATTCTAGAGGCTGTTTGAAAGTATGATGATCCACAAAACTGTAACAATAGGTTGA
TTCATCAACAAAAAGTCATTTCAT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL8315Contig1 817 2 2 U
GGATAGTTTCCCGAGACAAAACAGAGAACCGCTTCTCTTGATGCCGGCGGTCTCCTTCTC
CCCGTCTCGTTTGTCGTCATGCTTTGGTCTCACCTGTTCGTCACTTTCCGCTACGAGTCA
CTTCTTCTCGCTGTCTCCTACGGCTCGCGTCCTATGTCTCCTCTCGAAGTTCTTCACGCC
AGATCTGTTCGCCTCCTTGTACAAGTAGAGTCAACGCTTGGGTTTCAGACAAATCCTCCT
CTGCTCACCGCCACCATCGTCCTTCCCTCTTCAATCCCTGGCGTCGCTCCTTCATGTGGA
AACACAACCACCGGATCTACTCATCCCGGGCTTGGGCTCGCCGGATCTGGAGGTTTGTGT
AGTTCTGAAGCGCTTTCATCATTCCTAGCCACCTTCACCTTCAACGAGACTCCACCATAC
TGCATTGAAACACTTTCTGTTTGGAGTCCAAATTCGGCCATTATCCCCATCGTCGACCGC
TGTCTCTCACCAACCGTTGTCTTGTGCCTTGTTTGTCTTGGTCCCGTCGTGTATACTGTC
TTTGTGACAGCACGAGCTCACCAAAACAGAGACAACCTTTCAAGAGAACACCTAGTGAAA
TCTCCGGCACAGCAAAGGCTCCACCCATCGCAACTCCTCCAACGCCCTTACCCAGAAGAT
TACAAGATCTATCTGTTTACCAGATTTACGAGCATCACCGGATGAAGAGAGGCTGAGCCG
TTTTCAGAGAACGGCGTCGCGAGTCTCTCAAATACAAAACCCTAATCTGCAAATTTTGGG
TAAGTTATGGGCTTGGCTGGTTACATTGTTGGGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DY83TF U 1
AF RR4D118TF U 22
BS 1 571 RR4DY83TF
BS 572 817 RR4D118TF

RD RR4DY83TF 571 0 0
GGATAGTTTCCCGAGACAAAACAGAGAACCGCTTCTCTTGATGCCGGCGGTCTCCTTCTC
CCCGTCTCGTTTGTCGTCATGCTTTGGTCTCACCTGTTCGTCACTTTCCGCTACGAGTCA
CTTCTTCTCGCTGTCTCCTACGGCTCGCGTCCTATGTCTCCTCTCGAAGTTCTTCACGCC
AGATCTGTTCGCCTCCTTGTACAAGTAGAGTCAACGCTTGGGTTTCAGACAAATCCTCCT
CTGCTCACCGCCACCATCGTCCTTCCCTCTTCAATCCCTGGCGTCGCTCCTTCATGTGGA
AACACAACCACCGGATCTACTCATCCCGGGCTTGGGCTCGCCGGATCTGGAGGTTTGTGT
AGTTCTGAAGCGCTTTCATCATTCCTAGCCACCTTCACCTTCAACGAGACTCCACCATAC
TGCATTGAAACACTTTCTGTTTGGAGTCCAAATTCGGCCATTATCCCCATCGTCGACCGC
TGTCTCTCACCAACCGTTGTCTTGTGCCTTGTTTGTCTTGGTCCCGTCGTGTATACTGTC
TTTGTGACAGCACGAGCTCACCAAAACAGAG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4D118TF 796 0 0
GG
GAGAACCGCTTCTCTTGATGCCGGCGGTCTCCTTCTCCCCGTCTCGTTTGTCGTCATGCT
TTGGTCTCACCTGTTCGTCACTTTCCGCTACGAGTCACTTCTTCTCGCTGTCTCCTACGG
CTCGCGTCCTATGTCTCCTCTCGAAGTTCTTCACGCCAGATCTGTTCGCCTCCTTGTACA
AGTAGAGTCAACGCTTGGGTTTCAGACAAATCCTCCTCTGCTCACCGCCACCATCGTCCT
TCCCTCTTCAATCCCTGGCGTCGCTCCTTCATGTGGAAACACAACCACCGGATCTACTCA
TCCCGGGCTTGGGCTCGCCGGATCTGGAGGTTTGTGTAGTTCTGAAGCGCTTTCATCATT
CCTAGCCACCTTCACCTTCAACGAGACTCCACCATACTGCATTGAAACACTTTCTGTTTG
GAGTCCAAATTCGGCCATTATCCCCATCGTCGACCGCTGTCTCTCACCAACCGTTGTCTT
GTGCCTTGTTTGTCTTGGTCCCGTCGTGTATACTGTCTTTGTGACAGCACGAGCTCACCA
AAACAGAGACAACCTTTCAAGAGAACACCTAGTGAAATCTCCGGCACAGCAAAGGCTCCA
CCCATCGCAACTCCTCCAACGCCCTTACCCAGAAGATTACAAGATCTATCTGTTTACCAG
ATTTACGAGCATCACCGGATGAAGAGAGGCTGAGCCGTTTTCAGAGAACGGCGTCGCGAG
TCTCTCAAATACAAAACCCTAATCTGCAAATTTTGGGTAAGTTATGGGCTTGGCTGGTTA
CATTGTTGGGCTAC

QA 3 796 3 796
DS 



AS 1 2

CO CL8316Contig1 604 2 8 U
GGGCTTCTTAACCAGTTAAACTAAAAAAAAAGGACAAATGGCGGTTTCTCTCCCGAACTC
ATTTCTCCAGATCAATCAATGTGCTCCTTCTCTCGTCATCAGAAAGCCGGTTAAGGTGGC
ATCGATTGGCGCGAACCGAGGAATTAAACCGGCGGGAAGCAACTCTTCGGTGGTTCGAGT
GACATGCAGGAAGAAGGATCTGCACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAA
CGGAGAGCTCGTGATGACGACCGGAGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTC
CGGTAACCATCCCTTTTACCTCGGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGT
TGAGAAGTTCCGGAAGAGGTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAA
AGGAGAGATCGTCTTGCCCACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATG
ATGAGAGAGAGACTTTGTAATGTTTGAAATTGGAGTTTTCTGGTAAAAGTTTTTAAGTTT
GTCTTTGCTTTGCTTGGGCTGTTTGAATAGTTATGCTATGTTTCTTCTTGAATGCAAGTG
TTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 10 10 

AF RR4A881TF U 1
AF RR4BQ08TF U 18
BS 1 258 RR4A881TF
BS 259 259 RR4BQ08TF
BS 260 286 RR4A881TF
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RD RR4A881TF 602 0 0
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GACATGCAGGAAGAAGGATCTGCACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAA
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CGGTAACCATCCCTTTTAT***GGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGT
TGAGAAGTTCCGGAAGAGGTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAA
AGGAGAGATCGTCTTGCCCACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATG
ATGAGAGAGAGACTTTGTAATGTTTGAAATTGGAGTTTTCTGGTAAAAGTTTTTAAGTTT
GTCTTTGCTTTGCTTGGGCTGTTTGAATAGTTATGCTATGTTTCTTCTTGAATGCAAGTG
TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR4BQ08TF 587 0 0
GGAAACT
AAAAAAAGGACAAATGGCGGTTTCTCTCCCGAACTCATTTCTCCAGATCAATCAATGTGC
TCCTTCTCTCGTCATCAGAAAGCCGGTTAAGGTGGCATCGATTGGCGCGAACCGAGGAAT
TAAACCGGCGGGAAGCAACTCTTCGGTGGTTCGAGTGACGTGCAGGAAGAAGGATCTGCA
CCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGATGACGACCGG
AGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCCTTTTACCTCGG
GAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAAGAGGTTCGC
GGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAAAGGAGAGATCGTCTTGCCCACGAA
GAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATGAGAGAGAGACTTTGTAATGTT
TGAAATTGGAGTTTTCTGGTAAAAGTTTTTAAGTTTGTCTTTGCTTTGCTTGGGCTGTTT
GAATAGTTATGTTATGTTTCTTCTTGAATGCAAGTGTTTA

QA 8 587 8 587
DS 



AS 1 2

CO CL8317Contig1 1074 2 4 U
GGGTTACCGATAAATATATTCCATTGATCTATACTTCAAAAAATTAATAGTTTTTGATTA
GAGAAGAAATCAGAATCAAAAAGAGAGAGAATATGGGAAGAGGGAGAGTGGAGATGAAGA
GGATAGAGAACAAAATCAATAGGCAAGTGACCTTCTCAAAAAGAAGAAATGGTTTGTTGA
AGAAAGCTTATGAGCTCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCTCTCATCGTCTTCTCTA
GCCGTGGCAAGCTCTACGAGTTCGGCAGTGTCGAGAGTTGGAAGAACAATTGAACGGTAT
CATCGTTGCTACAACTCTTCTCTGACCAATAATAGGCCTGAAGAGTCTACACAGAACTGG
TCTCAGGAGGTGACGAAGCTGAAAGCCAAATACGAATCGCTTGTTCGCACTAATAGGCAT
TTGCTTGGAGAAGATCTCCGAGATATGAGCGTGAAGGAACTGCAAGCGTTGGAGAGAAAG
CTGGAAACCGCTCTTACTGCGACTCGACAACGCAAGACACAAGTTATGATGGAAGAAATG
GAAGATCTTCGGAAAAAGGAGCGGCAACTCGGAGATATAAACAAACAACTCAAGATTAAG
TTTGAGACCGAAGGCCTTGCTTTCAAATCATTTCAAGACTTATGGCCAAACTCGGCAGCA
TCGGTGGCTGATGATCCTAACAATTCTGGATTTCCGGTTCAGCCTTCTCATCCTAGTTCA
TTGGATTGCAACACCGAACCCTTTTTACAAATAGGGTTCCAACAACATTACTACGTGCAA
GGTGAAGGGTCTTCGGTATCAAAGAGTAATGTGGCACGTGAGACTAATTTCGTCCAATGT
TGGGTTCTTTAGCATTTGTTGACTAGATCACGATGCCACTGTCCCTCCAATTTCAGCTCT
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TCTATCACTGGTGCGGTACTTAATTCGAGTTCCTACGAATGTATTCGCATGTATGGGTTC
CTTAAACATTTTCACACGCTGGTTTTTCTACAATGAGATCGAAAACATTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC89TF U 1
AF RR4BC89JQ C 224
BS 1 273 RR4BC89TF
BS 274 274 RR4BC89JQ
BS 275 776 RR4BC89TF
BS 777 1074 RR4BC89JQ

RD RR4BC89TF 776 0 0
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GAGAAGAAATCAGAATCAAAAAGAGAGAGAATATGGGAAGAGGGAGAGTGGAGATGAAGA
GGATAGAGAACAAAATCAATAGGCAAGTGACCTTCTCAAAAAGAAGAAATGGTTTGTTGA
AGAAAGCTTATGAGCTCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCTCTCATCGTCTTCTCTA
GCCGTGGCAAGCTCTACGAGTTCGGCAGTGTCG*GAGTTGGAAGAACAATTGAACGGTAT
CATCGTTGCTACAACTCTTCTCTGACCAATAATAGGCCTGAAGAGTCTACACAGAACTGG
TCTCAGGAGGTGACGAAGCTGAAAGCCAAATACGAATCGCTTGTTCGCACTAATAGGCAT
TTGCTTGGAGAAGATCTCCGAGATATGAGCGTGAAGGAACTGCAAGCGTTGGAGAGAAAG
CTGGAAACCGCTCTTACTGCGACTCGACAACGCAAGACACAAGTTATGATGGAAGAAATG
GAAGATCTTCGGAAAAAGGAGCGGCAACTCGGAGATATAAACAAACAACTCAAGATTAAG
TTTGAGACCGAAGGCCTTGCTTTCAAATCATTTCAAGACTTATGGCCAAACTCGGCAGCA
TCGGTGGCTGATGATCCTAACAATTCTGGATTTCCGGTTCAGCCTTCTCATCCTAGTTCA
TTGGATTGCAACACCGAACCCTTTTTACAAATAGGGTTCCAACAACATTACTACGT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4BC89JQ 851 0 0
TCTCATCGTCTTCTCTAGCCGTGGCAAGCTCTACGAGTTCGGCAGTGTCGAGAGTTGGAA
GAACAATTGAACGGTATCATCGTTGCTACAACTCTTCTCTGACCAATAATAGGCCTGAAG
AGTCTACACAGAACTGGTCTCAGGAGGTGACGAAGCTGAAAGCCAAATACGAATCGCTTG
TTCGCACTAATAGGCATTTGCTTGGAGAAGATCTCCGAGATATGAGCGTGAAGGAACTGC
AAGCGTTGGAGAGAAAGCTGGAAACCGCTCTTACTGCGACTCGACAACGCAAGACACAAG
TTATGATGGAAGAAATGGAAGATCTTCGGAAAAAGGAGCGGCAACTCGGAGATATAAACA
AACAACTCAAGATTAAGTTTGAGACCGAAGGCCTTGCTTTCAAATCATTTCAAGACTTAT
GGCCAAACTCGGCAGCATCGGTGGCTGATGATCCTAACAATTCTGGATTTCCGGTTCAGC
CTTCTCATCCTAGTTCATTGGATTGCAACACCGAACCCTTTTTACAAATAGGGTTCCAAC
AACATTACTACGTGCAAGGTGAAGGGTCTTCGGTATCAAAGAGTAATGTGGCACGTGAGA
CTAATTTCGTCCAATGTTGGGTTCTTTAGCATTTGTTGACTAGATCACGATGCCACTGTC
CCTCCAATTTCAGCTCTAAAGTTGGATTCTTCAGTTAGAATTATTTTTCTTTACAAGAAA
AACTTATGGTCTATAGTTCTATCACTGGTGCGGTACTTAATTCGAGTTCCTACGAATGTA
TTCGCATGTATGGGTTCCTTAAACATTTTCACACGCTGGTTTTTCTACAATGAGATCGAA
AACATTTTCAC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL8318Contig1 843 2 2 U
GGATCCGGTAACACTCAAATCTAACCAGCTACTACATAAACTCAAAAAGAATGAATCATA
TGTTTTATTTCCTTCTTGCCTTCACTGCTGTTTTGGCCGCGACAGCAAACGCCGGCGCAG
TAATTCGCGACGTTGAGGGTGTACCCGTATTGAACGGCAACAGCAGTTACTACCTTCGCC
CCCTCTTCCCATATGGCGGCCTGACTCTTTCCCCCCGTGGTGACAATCAATGTCCCCTCT
ATATCGGACTGGACCGTTACACCTTGGGCATTCCCGTCATAATCTCAGATCTTTCTACTT
CTGCTTACATTTACGAAACATATGACCTCAACATCAAAATGGATGTCAAAGCCACGACAT
GTGCTCAGCCAACCTATTGGAGTGTCTCTACGCCCGACACGGTCATTAAGCCGGCGTTCA
TATTGGCTGGTCCTAAACCGTCGACTGGTTCGTTCCAGATCAAGAAAACTGAAGATGGTA
TTGGCGGTTACAAGATCATGTTTTGTCCTAAAGGTAAAGTTTGCACCGACGATGTCGGTA
TATTTGTGGACCCTGCAGATGGCGTTCTTCGTTTGGCTTTAATTAGCTTTATCCCATACT
ATAGGCCATTCGAGTTTGTGTTCGTGAAAACTACTGAGGAAGAGGCTTCGTTCAAGACCA
TGTCTATTATCTAAGAGAATTTGAAGACTACAAAACTGAGAGGATAAGAGTTACAGCTTG
CGACTAATAATAAAACTCTATCTGTGTGTTTCTGTTTTTGATTGTTTGTTCATCAATTAT
CATATATGGAATGAAACATATTTCCTTTGTTACTTTTTTCATCATTTATGTACAAGCTTC
TAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

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BS 636 843 RR4F289JQ

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QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4G190JQ C 1
AF RR4G190TF U 1
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BS 667 667 RR4G190JQ
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BS 687 696 RR4G190TF
BS 697 707 RR4G190JQ

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GCGACAACACTTGGTAGATGTGACAGAGATATTCAATTTGCTTAACTGGGAAAAGAAGAA
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TTTTTT*CTTTTAGAAACATTTTTT*CAGACAAGAA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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CTTGTCTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BY57JQ C 1
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QA 1 548 1 548
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4H528TF U 1
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ84TF U 1
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QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4EZ84JQ 770 0 0
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AAGCTCGTGCTATAGTTCTAAATCTTTTTCAATCTTTAGCTTTTTATCTTCATTCGACTT
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CAATTGTAATTTTACTTTGAAGATAGAAAAAAAATGATGAATATGCACTGGGCTCTGAGT
TGTTGATTTGACAGTCAACTTCCTTTTGATGGATAACGCAGCCTAGAAAGCTTAATCTGA
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ATCTTTATTGTTTTCTTGTATACGTATTGGCATTATAATTTCCTCTAAATTATTTGGATA
TCGCCACACAGTTGAATTGTCAATTTACTCATTACGTAGGGTAAATTTTCAGTTCAGAAA
AGCCCATAACGAGTCCTTCTATGAAATTCGAAGATTCAAATAAATAGAAACTGCGAATGT
TAGTTTTGTGTTACAAAAAAAATGTTAGTTTTGTGATAAAAAAAAATAAGTGTTAGTTAT
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TTTGGACATAAACATTGTTATTCTATGTATAAAGTTGTACTTTTTTCATC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL8323Contig1 762 2 4 U
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TGTTAGTTTTCGTAGAAAGTGTTTATATGAACATTGTAGTAGTTTACCTCATGCTGTTTA
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AATTATCCATAGGTGCTGCTTGCAGACTCAAATGGCCATCGGATCGACTAATCGTTCAAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H168TF U 1
AF RR4H168JQ C 20
BS 1 663 RR4H168TF
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BS 665 707 RR4H168TF
BS 708 762 RR4H168JQ

RD RR4H168TF 722 0 0
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TGTTAGTTTTCGTAGAAAGTGTTTATATGAACATTGTAGTAGTTTACCTCATGCTGTTTA
AACGCAAACCTGAGAAGATCTACAAATGGGAGGCAATGCAAGAGGACCTCGAGCAAGGAG
GTCAAAACTTTCCCATGGTTCTTGTGCAAATCCCAATGTACAATGAAAGAGAGGTTTTTC
AATTATCCATAGGTGCTGCTTGCAGACTCAAATGGCCATCGGATCGACTAATCGTTCAAG
TTTTAGATGATTCCACTGATCCCACCATCATGGTACATACTAATTGATTGTGTTCACATT
AAAATATAAGCAAACATTTGTCTTTTAATATTATTAATTTAACCATAAAGACACAACAAA
AAG*TTCTCTTCCCTTCTGTTTAGCTTTTGTCTTCACTGGCTTTCAA
TACATTTCTTAAAAG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4H168JQ 743 0 0
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TACTGAGAAGAAAATTTTATTTTGTATTTCATTTTGCGCTAAGTTTCATGGAAGGGGAGT
AATTATGAAGATGCAGCTACAACTTTCGAAACGCTTGAAGCATATGATTGTGTGAAGAGT
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AATCTTCAAATGTTTGGTGGCTATATGTTTGGTCATCTCCTTGTTAGTTTTCGTAGAAAG
TGTTTATATGAACATTGTAGTAGTTTACCTCATGCTGTTTAAACGCAAACCTGAGAAGAT
CTACAAATGGGAGGCAATGCAAGAGGACCTCGAGCAAGGAGGTCAAAACTTTCCCATGGT
TCTTGTGCAAATCCCAATGTACAATGAAAGAGAGGTTTTTCAATTATCCATAGGTGCTGC
TTGCAGACTCAAATGGCCATCGGATCGACTAATCGTTCAAGTTTTAGATGATTCCACTGA
TCCCACCATCATGGTACATACTAATTGATTGTGTTCACATTAAAATATAAGCAAACATTT
GTCTTTTAATATTATTAATTTAACCATAAAGACACAACAAAAAGGTTCTCTTCCCTTCTG
TTTAGCTTTTGTCTTCACTGGCTTTCAAATAACATTTCTTAAAAGACTTAATGTTAGTAT
GTTTATCTCATAAACACAATGAT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL8324Contig1 800 2 2 U
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TGTCCAGGTATGGTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU79TF U 1
AF RR4DU79JQ C 238
BS 1 675 RR4DU79TF
BS 676 800 RR4DU79JQ

RD RR4DU79TF 675 0 0
GAGCACTTAGAAAAAAACAAATCAAAAATAAACATGAAATTCGCCAAAATCCAAAATAGG
ATGATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTTTTGGTTACATCATCTTCAGAGACTGCTCCACA
AACTCAATTGGCCGCACCATTGGAACCAACAGGAGACGTCACCAATTCACCAACAAAGCC
ACAAGGTTTTCCAGCTGAGAACCAGAACCAACCAATTCTTGGTCAACCTTCTTCTGCTTC
TTCTGTAAACCAGCCTTTAACCGGGTTAAATCAACCATTAACCGGATTTAATCAGCCATC
CTCATCAACTGGACTCAACCAACCGATTCTTGGTCAACCATCTTCTCCTGTAAACCAACC
TTTAACCGGGTTTAATCAACCATCATCAACTGGATTCAACCAACCAATTTCTTCTTCATC
CTCTAATTCTGCTCTCAACCAGCCATTTGGGAATCGAATCAACCAAAACAGTCTCACGGG
AAGCAACGTTCCATTTCTGAATGGAAACTCGAAGCTAGAAGTCTCCATTACAAAGATTGT
CTTCATCTGCATTGCTCTTCTCCTTGCTTTGCACGGTACAGACAGGAACTGAACCAAACT
TATACATCATGTGTCACTTCTGTATAATTTGGTTTTCATCATATTTGTTCTATAACTTGT
CCTTTTTGCTCATTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4DU79JQ 563 0 0
TTCTTCTGTAAACCAGCCTTTAACCGGGTTAAATCAACCATTAACCGGATTTAATCAGCC
ATCCTCATCAACTGGACTCAACCAACCGATTTTTGGTCAACCATTTTTTCCTGTAAACCA
ACCTTTAACCGGGTTTAATCAACCATCATCAACTGGATTCAACCAACCAATTTTTTTTTC
ATCCTCTAATTTTGCTCTCAACCAGCCATTTGGGAATCGAATCAACCAAAACAGTCTCAC
GGGAAGCAACGTTCCATTTTTGAATGGAAACTCGAAGCTAGAAGTCTCCATTACAAAGAT
TGTCTTCATTTGCATTGCTTTTCTCCTTGCTTTGCACGGTACAGACAGGAACTGAACCAA
ACTTATACATCATGTGTCACTTCTGTATAATTTGGTTTTCATCATATTTGTTCTATAACT
TGTCCTTTTTGCTCATTTCGGATTTTACTGAAATGTTTGTTCTATAAGAGTGTGTAGTGT
GTTATGTGTATATTACTACTGAATGTCTTTACTTTTTGGTTATTTGACCAGTGTTCGGTT
TCATGTCCAGGTATGGTTCAATT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL8325Contig1 602 2 3 U
GGAAAACATGAAGATTATTTTATTCTATAAATGGGCATTCCAGTTGAACTTGCACGATAT
AAGACTAAAAACAGCTGATTCAGTTGAAACAAGTTCTTACAGGTTGCTGAAGAGGTAGCT
TGCTAAATTGGCTAGTTGACTGAGAGGCTTTTCCCATTCGTCAATCATAGCCGTTTCCTC
CATCGGTGGATGTTTCATGGCAGAAAACGCAGCGGTTAAGTTTTCGCGATTGATGCTACC
TGGTTTAACTCTATAGAAGATTGGAATCAGCACACTGATGTCTTCCTTTCGCTTGACCGC
TGCCACCTCCATTATAGCCCGGAGCTCCTCCAAGCACCAGTACGAATTATCATACTTTTC
TGAGATTACAACTATGAAGAACCTGGAAGTATTGATGGCTTTGATGAGTTCGTCTGGAAT
TGAGTCTCCCTTCTCCATCTCCTCATCGTCTTTATAAGTATATAAACCCTTTCTACAAAG
TGCCGCGTATAAATGGCTGACAATATTTTTGCGGGTGTCTTGTCCTCGAAAGCTTAAGAA
CACATCAAACTTGGGTGCCGGAGTTGCAGACGATGACGAAGACGACGCCATTTTGTGAGC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4BT34JQ U 25
AF RR4BT34TF C 1
BS 1 24 RR4BT34TF
BS 25 576 RR4BT34JQ
BS 577 602 RR4BT34TF

RD RR4BT34JQ 552 0 0
CTATAAATGGGCATTCCAGTTGAACTTGCACGATATAAGACTAAAAACAGCTGATTCAGT
TGAAACAAGTTCTTACAGGTTGCTGAAGAGGTAGCTTGCTAAATTGGCTAGTTGACTGAG
AGGCTTTTCCCATTCGTCAATCATAGCCGTTTCCTCCATCGGTGGATGTTTCATGGCAGA
AAACGCAGCGGTTAAGTTTTCGCGATTGATGCTACCTGGTTTAACTCTATAGAAGATTGG
AATCAGCACACTGATGTCTTCCTTTCGCTTGACCGCTGCCACCTCCATTATAGCCCGGAG
CTCCTCCAAGCACCAGTACGAATTATCATACTTTTCTGAGATTACAACTATGAAGAACCT
GGAAGTATTGATGGCTTTGATGAGTTCGTCTGGAATTGAGTCTCCCTTCTCCATCTCCTC
ATCGTCTTTATAAGTATATAAACCCTTTCTACAAAGTGCCGCGTATAAATGGCTGACAAT
ATTTTTGCGGGTGTCTTGTCCTCGAAAGCTTAAGAACACATCAAACTTGGGTGCCGGAGT
TGCAGACGATGA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4BT34TF 602 0 0
GGAAAACATGAAGATTATTTTATTCTATAAATGTGCATTCCAGTTGAACTTGCACGATAT
AAGACTAAAAACAGCTGATTCAGTTGAAACAAGTTCTTACAGGTTGCTGAAGAGGTAGCT
TGCTAAATTGGCTAGTTGACTGAGAGGCTTTTCCCATTCGTCAATCATAGCCGTTTCCTC
CATCGGTGGATGTTTCATGGCAGAAAACGCAGCGGTTAAGTTTTCGCGATTGATGCTACC
TGGTTTAACTCTATAGAAGATTGGAATCAGCACACTGATGTCTTCCTTTCGCTTGACCGC
TGCCACCTCCATTATAGCCCGGAGCTCCTCCAAGCACCAGTACGAATTATCATACTTTTC
TGAGATTACAACTATGAAGAACCTGGAAGTATTGATGGCTTTGATGAGTTCGTCTGGAAT
TGAGTCTCCCTTCTCCATCTCCTCATCGTCTTTATAAGTATATAAACCCTTTCTACAAAG
TGCCGCGTATAAATGGCTGACAATATTTTTGCGGGTGTCTTGTCCTCGAAAGCTTAAGAA
CACATCAAACTTGGGTGCCGGAGTTGCAGACGATGACGAAGACGACGCCATTTTGTGAGC
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL8326Contig1 835 2 8 U
GGGATGTGTTATCCTGCTTCCAATGGCCATCACTTTCTATGTGACGTGGTGGTTCATTCA
TTTCGTTGATGGTTTCTTCTCCCCTATCTGTGCTCAACTCGGCATCGACATCTTTGGACT
TGGGTTTATCACCTCTATTACGTTCATCTTCTTGGTCGGAGTGTTCATGTCGTCGTGGCT
GGGGACTTCCGTTCTCAACTTGGGAGAGTGGTTTATCAAGCGCATGCCCTTCGTTCGCCA
CATCTACAATGCCTCCAAGCAAATCAGTACTGCCATTTCACCAGATCAAAACACTCAGGC
TTTCAAAGAAGTCGCCATTATAAGGCATCCACGTATTGGTGAATACGCGATTGGGTTCAT
CACATCCACCCTTGTTCTCCAGACTTACACGGATGAAGAGGAGCTTTGCTGTGTGTATGT
GCCTACAAATCACCTTTACATCGGGGATGTGTTCCTTGTAAGTACAAAGGATGTAATCAG
ACCAAACCTCTCTGTAAGAGAAGGCATAGAGATCGTAGTGTCAGGAGGAATGTCAATGCC
GCAAGTTCTGTCAACACTTGATAGAATGGCTCCAGAAAGAAGTAGAAGTAGTAGAGTCGA
AAGAAGCTGAAGATTAGTCCTTTGCACAAAAAGAAAAAAACAAACAGATTCTCAAATCTT
TTCTCGTTCAATGTCTTTTTTCTTTTGGATTCAGTTAATTTCACATGTGATGTTCAAGCA
TTAGAAAAGCAATCGTGTTCTATAAGTGGTTTGTTCTCCAGACTAACTCCATCTGTGTCT
ATATACTAGCTTTTCCTACTCTCAAGTAATCTGTATGATATAATTCATTTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV22TF U 1
AF RR4EV22JQ C 248
BS 1 639 RR4EV22TF
BS 640 640 RR4EV22JQ
BS 641 758 RR4EV22TF
BS 759 759 RR4EV22JQ
BS 760 793 RR4EV22TF
BS 794 794 RR4EV22JQ
BS 795 804 RR4EV22TF
BS 805 835 RR4EV22JQ

RD RR4EV22TF 816 0 0
GGGATGTGTTATCCTGCTTCCAATGGCCATCACTTTCTATGTGACGTGGTGGTTCATTCA
TTTCGTTGATGGTTTCTTCTCCCCTATCTGTGCTCAACTCGGCATCGACATCTTTGGACT
TGGGTTTATCACCTCTATTACGTTCATCTTCTTGGTCGGAGTGTTCATGTCGTCGTGGCT
GGGGACTTCCGTTCTCAACTTGGGAGAGTGGTTTATCAAGCGCATGCCCTTCGTTCGCCA
CATCTACAATGCCTCCAAGCAAATCAGTACTGCCATTTCACCAGATCAAAACACTCAGGC
TTTCAAAGAAGTCGCCATTATAAGGCATCCACGTATTGGTGAATACGCGATTGGGTTCAT
CACATCCACCCTTGTTCTCCAGACTTACACGGATGAAGAGGAGCTTTGCTGTGTGTATGT
GCCTACAAATCACCTTTACATCGGGGATGTGTTCCTTGTAAGTACAAAGGATGTAATCAG
ACCAAACCTCTCTGTAAGAGAAGGCATAGAGATCGTAGTGTCAGGAGGAATGTCAATGCC
GCAAGTTCTGTCAACACTTGATAGAATGGCTCCAGAAAGAAGTAGAAGTAGTAGAGTCGA
AAGAAGCTGAAGATTAGTCCTTTGCACAAAAAGAAAAAA*CAAACAGATTCTCAAATCTT
TTCTCGTTCAATGTCTTTTTTCTTTTGGATTCAGTTAATTTCACATGTGATGTTCAAGCA
TTAGAAAAGCAATCGTGTTCTATAAGTGGTTTGTTCTC*AGACTAACTCCATCTGTGTCT
ATATACTAGCTTT*CCTACTCTCA
GTATCTGTATGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4EV22JQ 588 0 0
AATGCCTCCAAGCAAATCAGTACTGCCATTTCACCAGATCAAAACACTCAGGCTTTCAAA
GAAGTCGCCATTATAAGGCATCCACGTATTGGTGAATACGCGATTGGGTTCATCACATCC
ACCCTTGTTCTCCAGACTTACACGGATGAAGAGGAGCTTTGCTGTGTGTATGTGCCTACA
AATCACCTTTACATCGGGGATGTGTTCCTTGTAAGTACAAAGGATGTAATCAGACCAAAC
CTCTCTGTAAGAGAAGGCATAGAGATCGTAGTGTCAGGAGGAATGTCAATGCCGCAAGTT
CTGTCAACACTTGATAGAATGGCTCCAGAAAGAAGTAGAAGTAGTAGAGTCGAAAGAAGC
TGAAGATTAGTCCTTTGCACAAAAAGAAAAAAACAAACAGATTCTCAAATCTTTTCTCGT
TCAATGTCTTTTTTCTTTTGGATTCAGTTAATTTCACATGTGATGTTCAAGCATTAGAAA
AGCAATCGTGTTCTATAAGTGGTTTGTTCTCCAGACTAACTCCATCTGTGTCTATATACT
AGCTTTTCCTACTCTCAAGTAATCTGTATGATATAATTCATTTAGGAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL8327Contig1 552 2 1 U
GGACGTACGGTCGTCGGTCGCAGGAGATTCCAATCGAACACCGGAGAAAATGGCGAAGAC
TTTAGGTACTACCGGCGAGTTTTTCCGGCGAAGAGACGAATGGAGGAAGCATCCGATGCT
TTCGAATCAAATGAGGCACGCTCTTCCCGGGCTCGGCATCGGCGTCGCGGCCTTCTGCGT
GTACCTCGTGGGTGAGCAGATCTACAGCAAAGCCTTGGCTCCTTCCAAATCATCATCTCA
CCACAATCAGAAACAGACTGCTCCTTCTCATTGAATGGCTTTTGATCAGATGCTGGAAAC
TGTGGGCACAAGATGAACGCAAATGCTTCTTCTGGGCTTTTTATTAATAATATGTTGGTT
GTGTTGGACACAAGTTTTTCGATTTCTCTGTTGAATTTTAAAGCTTGTTGGGTTCAAAGT
TAACTCTTTGTCTCCCGTAAGTTATGTTTTTTTTCTTCTAAACGTTGAAGGTTGATTTGT
CTTGTTTGATTGTCTTTTGTAATCGTGACTTGTTGCTGAGTAGACACTCAGCTAAAACTG
CGTCGTTTTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CM76JQ C 1
AF RR4CM76TF U 1
BS 1 552 RR4CM76TF

RD RR4CM76JQ 552 0 0
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GTACCTCGTGGGTGAGCAGATCTACAGCAAAGCCTTGGCTCCTTCCAAATCATCATCTCA
CCACAATCAGAAACAGACTGCTCCTTCTCATTGAATGGCTTTTGATCAGATGCTGGAAAC
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CGTCGTTTTTTG

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR4CM76TF 552 0 0
GGACGTACGGTCGTCGGTCGCAGGAGATTCCAATCGAACACCGGAGAAAATGGCGAAGAC
TTTAGGTACTACCGGCGAGTTTTTCCGGCGAAGAGACGAATGGAGGAAGCATCCGATGCT
TTCGAATCAAATGAGGCACGCTCTTCCCGGGCTCGGCATCGGCGTCGCGGCCTTCTGCGT
GTACCTCGTGGGTGAGCAGATCTACAGCAAAGCCTTGGCTCCTTCCAAATCATCATCTCA
CCACAATCAGAAACAGACTGCTCCTTCTCATTGAATGGCTTTTGATCAGATGCTGGAAAC
TGTGGGCACAAGATGAACGCAAATGCTTCTTCTGGGCTTTTTATTAATAATATGTTGGTT
GTGTTGGACACAAGTTTTTCGATTTCTCTGTTGAATTTTAAAGCTTGTTGGGTTCAAAGT
TAACTCTTTGTCTCCCGTAAGTTATGTTTTTTTTCTTCTAAACGTTGAAGGTTGATTTGT
CTTGTTTGATTGTCTTTTGTAATCGTGACTTGTTGCTGAGTAGACACTCAGCTAAAACTG
CGTCGTTTTTTG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL8328Contig1 905 2 8 U
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ATGCGCAGCATGCAAATACCAACGCAGGAAATGCGCTCCCGATTGTCTTCTCGCCCCTTA
TTTCCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTCTTTGGTGTCAGCAA
CATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGAGAAAGACGCGGCTATGCATACAAT
CATGTTTCAGTCTGATGCTCGTGCCAATGATCCCATTGAAGGTTGCTATAGCATCATAAG
AAGGCTTCAGTACGAGATCGAATATAATAAGAATGAATTGGACATGGTTCTTCATCAATT
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AGAACCTGATGATCTCTCGAGTTCTCTTGATCTAAACGACAACAACTCGATTCCTTACAA
TTACCCGCCTCATCATGTACAAGAACCAAACCAACAACAACAATTTTGTTCTTCTGGAAA
CTTCAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAGATTCATCAACAACAGT
GAATATGAAGGGTGGCTTCATTGATGAATGTGGGGGCGTTAAGCCTGTAGAAGAGGCTTC
TAACGAGTTCGAGCATCATGATGGTTTCGTTGAAGACAGTAAACTCGACTTGCCTTCAAC
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TTAACAAATAATCCTCTCATAGATCGATCTCAATAGATTTTCTTTCACTTTACTTTCTTT
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TTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4GN50TF U 1
AF RR4GN50JQ C 174
BS 1 655 RR4GN50TF
BS 656 656 RR4GN50JQ
BS 657 693 RR4GN50TF
BS 694 694 RR4GN50JQ
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BS 720 735 RR4GN50TF
BS 736 905 RR4GN50JQ

RD RR4GN50TF 735 0 0
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CATGTTTCAGTCTGATGCTCGTGCCAATGATCCCATTGAAGGTTGCTATAGCATCATAAG
AAGGCTTCAGTACGAGATCGAATATAATAAGAATGAATTGGACATGGTTCTTCATCAATT
GGCTGTGTTTCGTGACCGTGCTCATAATCATTATCATCAAGAGCCGCATATGCAGATGCA
AGAACCTGATGATCTCTCGAGTTCTCTTGATCTAAACGACAACAACTCGATTCCTTACAA
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GAATATGAAGGGTGGCTTCATTGATGAATGTGGGGGCGTTAAGCCTGTAGAAGAG*CTTC
TAACGAGTTCGAGCATCATGATGGTTTCGTTGA*GACAGTAAACTCGACTTGCCTTCA*C
ACAATTCATTGTTTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GN50JQ 732 0 0
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ATCAATTGGCTGTGTTTCGTGACCGTGCTCATAATCATTATCATCAAGAGCCGCATATGC
AGATGCAAGAACCTGATGATCTCTCGAGTTCTCTTGATCTAAACGACAACAACTCGATTC
CTTACAATTACCCGCCTCATCATGTACAAGAACCAAACCAACAACAACAATTTTGTTCTT
CTGGAAACTTCAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAGATTCATCAA
CAACAGTGAATATGAAGGGTGGCTTCATTGATGAATGTGGGGGCGTTAAGCCTGTAGAAG
AGGCTTCTAACGAGTTCGAGCATCATGATGGTTTCGTTGAAGACAGTAAACTCGACTTGC
CTTCAACACAATTCATTGTTTCTTCTTAGCTTTTATTTTCTTGATTTAAGAATCATTTAT
ATAGGGCTTAACAAATAATCCTCTCATAGATCGATCTCAATAGATTTTCTTTCACTTTAC
TTTCTTTTTCTTTTGTATCTCATTTGGTTAAATTCGTTATAGGATTAGATGTGAAGGAGA
CATGGAATTTCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL8329Contig1 658 2 2 U
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ATGCCCTTCTTCGAAACCCTAGATTACTGGGGAATCCAACGCAAACGGACCAAGATCAAG
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TTGAGTTGGATTTGTGATTATATTGGTGCTGTTTGTGTTTGATGTGACTCACATGGTTGC
TTGATGGTTTGTTCATATTTATTTTTGAATCTTTTCTTCAATAATCATCAGTTCTTGTAA
CGGATGTCCTCTTGTAATAGGCAAAGTTTAAACTTTACATAGATATACACACACATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EZ73TF U 1
AF RR4EZ73JQ C 98
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CGGATGTCCTCTTGTAATAGGCAAAGTTTAAACTTTACATAGATATACACACACATG

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ACGATGGTCCTCCCCTCACCGGAGGTATAGGCCAGTACGGGTTCGGTCCGAGTCAGGTCG
TTCCTCGTGCTCCTCGTTATCGATTCAAAACCAGGACCCTTTTGATCTCGTCACAGACCA
CCTAATAAAACCTTTACGCGAACCAGAGGGTTTAAGCTTTAGATAGAGATATACACACAC
ATGTATGTAATTGAGTATGTTGCTTGAGTTGGATTTGTGATTATATTGGTGCTGTTTGTG
TTTGATGTGACTCACATGGTTGCTTGATGGTTTGTTCATATTTATTTTTGAATCTTTTCT
TCAATAATCATCAGTTCTTGTAACGGATGTCCTCTTGTAATAGGCAAAGTTTAAACTTTA
CATAGATATACACACACATGC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

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TACACCGACTGTGGGGGCTCCACAATGTTCTCATCCTCTTCAGAAAAGTACTGTGGCGCT
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GCTGAATTCAATGTAGCAATCCCTCCAACAGGAGGAATCGGCATACCAAGAGGTCTTCTT
CCAAACCATGACAGCAATTCATCACGGAAGAACATAGCCAGTTGATACCGAAGATGGTCG
TTTTGCTTGGAGGAGATAACTGCTTGAGCTGCTGAACACATGGATGACATGAGAAGACCT
TCGACTACAAACTGAGAGAAGAACGCTTGCATGTTCCTTGTGAGTCGGAAAGGCACCGGC
TCGTTAAACTCTATCATCCCATTGGCGTCATAAGCAGGGTGAAAATCTGTCTGGAACATT
TTCCCGGTGTTTTTCGCAAACAAGACCTTGTTCGGGGACCTCCCACCAATTTGTAGCATG
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TGGCTTCCGCTCATCAATGTTTTGTACATGTACTGAGAGAATATACTGTCATTTACCAAG
GTTTTTGTTATGTCACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EA32JQ U 1
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RD RR4EA32JQ 833 0 0
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DS 

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GT
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TACATAAGTTGCGAGGCGACAATGCCGCCTCCACCAACTCGTTCACTCCTCTTTGCACCG
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TGGAGGAGATAACTGCTTGAGCTGCTGAACACATGGATGACATGAGAAGACCTTCGACTA
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TTATGTCACT

QA 3 852 3 852
DS 



AS 1 2

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AGTGCTTACTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FK81TF U 1
AF RR4FK81JQ C 174
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CTGCAGGGTTCTTCTGTTCTTACTAGGCGGTCTACTAATCAAGAATCTCATCCTCACGCT
TTAATGAACTCTGATTCGACGTTTATGACATCCTCACAGGTTGAACCAACCTTGTTCTCG
AGTAGATACCATGGCCATCTTCGGCGCCCTTACCCCGATGATCTTACCGAGATGATGATG
CTCCGGAATGGTTTTGTAATGGGAAGGACAACAGATTCGCTTGATCACTTCCACAACTTG
AGGCTTGATGTTGATAATATGTCATACGAGCAACTACTAGAGCTTGGTGATAGAATTGGT
TATGTGAATACTGGACTAAAAGAGAGCGAGATACGTCGTTGTCTTCGGAAAATCAATCCA
TTCTTATCAAACACTCTTCTTGCTGATAGAAAATGCAGCATTTGTCAGGATGAGTATGAG
AGAGAGGGTCAGGTTGGGAAACTGGAATGTGGACACAGCTTCCATGTCCACTGCGTGAAG
CAGTGGCTATCGAGGAAGAATGCTTGTCCTGTCTGTAAGAAGACAGCATACGTCAAGGCT
TAAGATTGCTGTATAGAACCAACTCATCTGATTCTTTATTTCATGCGTGTTGTTCTGTGA
TTTAGCAGTCATGTGTGTGTTCTTGATCTTGTTTTCCTTTGT**GTTTTTTTTATATGAT
TGAAATACTATTTTGTA
GACACAGTTTGTGACC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4FK81JQ 619 0 0
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GATGATGCTCCGGAATGGTTTTGTAATGGGAAGGACAACAGATTCGCTTGATCACTTCCA
CAACTTGAGGCTTGATGTTGATAATATGTCATACGAGCAACTACTAGAGCTTGGTGATAG
AATTGGTTATGTGAATACTGGACTAAAAGAGAGCGAGATACGTCGTTGTCTTCGGAAAAT
CAATCCATTCTTATCAAACACTCTTCTTGCTGATAGAAAATGCAGCATTTGTCAGGATGA
GTATGAGAGAGAGGGTCAGGTTGGGAAACTGGAATGTGGACACAGCTTCCATGTCCACTG
CGTGAAGCAGTGGCTATCGAGGAAGAATGCTTGTCCTGTCTGTAAGAAGACAGCATACGT
CAAGGCTTAAGATTGCTGTATAGAACCAACTCATCTGATTCTTTATTTCATGCGTGTTGT
TCTGTGATTTAGCAGTCATGTGTGTGTTCTTGATCTTGTTTTCCTTTGTTGTTTTTTTTT
ATATGATTGAAATACTATTTTGTAAGAACAACAGTTTGTGACCTAAGGATTCTGCAGCTT
ATACTATAGTGCTTACTAC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL8332Contig1 759 2 5 U
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GACAAGAACAGAGTTCTCTTCAAACAATTAGACAAGAAACAAGAATGATAAAGCTTTGCT
TCATAACTTCTCATGGCTACTCAATCCCTGGCCTTGGTCTTCCTTATGAGCTCAGTAACG
CGGGGATCATCATCAAGAATAGCCAGTCTTATCTTGTGAAAAACGGAACCATCTCCATGA
GGAGTAAGAAAGCTAAAGAGAGAGACCTCTACAAAAGGAACCATCTCCATGCTTACGAGA
GCCTTTTGTCTTTATTAATGATAGGCAATGATCATCAAAACAAACAAACAACAATAGAGA
GATCAAGCAGAGAGATCTCGGAGATTCTTACTCAGTTTTCTATCACCGCTGCTGGAACTG
GAATCGCCATGCTATTCTCCGTGGCCTATAGTCTTGCCTCAAGGCGTGTACCCTTTTGTG
CAAAAAAGTTCGTAGACACTGGACTTGGTTTCAGTTTGGTATTACTGTCATGGGCTGTGA
ATAGACTCAGAGAGGTGATTAGGAAAGCAAACAAGCAATGCTCAAGTTTGAAGGGAGATG
AAATCGTAAAGAATGTGGAGACAAGCATCAATGAAGTTTACCACAGAGCTGCCATTGTAA
TCATAGTGTTTACACTTAGGTTTGCTTGTTGAGTAACTCACAAGTTTTGTAACAATCTAT
CTTTCATTGATCTTATGAAAACACAATATCATCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D175TF U 1
AF RR4D175JQ C 63
BS 1 679 RR4D175TF
BS 680 680 RR4D175JQ
BS 681 745 RR4D175TF
BS 746 746 RR4D175JQ
BS 747 759 RR4D175TF

RD RR4D175TF 759 0 0
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CGGGGATCATCATCAAGAATAGCCAGTCTTATCTTGTGAAAAACGGAACCATCTCCATGA
GGAGTAAGAAAGCTAAAGAGAGAGACCTCTACAAAAGGAACCATCTCCATGCTTACGAGA
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GAATCGCCATGCTATTCTCCGTGGCCTATAGTCTTGCCTCAAGGCGTGTACCCTTTTGTG
CAAAAAAGTTCGTAGACACTGGACTTGGTTTCAGTTTGGTATTACTGTCATGGGCTGTGA
ATAGACTCAGAGAGGTGATTAGGAAAGCAAACAAGCAATGCTCAAGTTTGAAGGGAGATG
AAATCGTAAAGAATGTGGAGACAAGCATCAATGAAGTTTACCACAGAGCTGCCATTGTAA
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CTTTCATTGATCTTATGAAAACACA*TATCATCTTTTCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4D175JQ 697 0 0
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CTTTTGTCTTTATTAATGATAGGCAATGATCATCAAAACAAACAAACAACAATAGAGAGA
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ATCGCCATGCTATTCTCCGTGGCCTATAGTCTTGCCTCAAGGCGTGTACCCTTTTGTGCA
AAAAAGTTCGTAGACACTGGACTTGGTTTCAGTTTGGTATTACTGTCATGGGCTGTGAAT
AGACTCAGAGAGGTGATTAGGAAAGCAAACAAGCAATGCTCAAGTTTGAAGGGAGATGAA
ATCGTAAAGAATGTGGAGACAAGCATCAATGAAGTTTACCACAGAGCTGCCATTGTAATC
ATAGTGTTTACACTTAGGTTTGCTTGTTGAGTAACTCACAAGTTTTGTAACAATCTATCT
TTCATTGATCTTATGAAAACACAATATCATCTTTTCT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL8333Contig1 894 2 6 U
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AAGAAAATTAGGAAGCCTAAACCGTGGAAGCATACTCAACCGATCACAAAAGCTGAGCTT
ATGAAACTGAGAGAAGAGTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGGTATA
GCTGAATACTTCTCTCTATAGTTTGCCTTTTTATATTGTGTTTTTGAGTGGTGTGGTTTC
ATTTTTATACAAAAGAAATGAAGGGTTTTGTAAAAAAGGGTTGGTAGTAGTAGTTATTAA
GAGGGAGATGTAGTAAAACAGAATTTTTAAAGGGCTCTACCGGATTCGAACCGGTGACCT
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AGTGACACATAAAGAAGATTGTGGCATAAGCATTGTGATCAATAGGTTTAGTTTCTGTGA
ATTAGTATTAGATTTGGGAAAGAGTGAAAAATAGATTTAAAAGGGTCCTACCGGATTCGA
ACCGGTGGCCTATTGATCTGCAGTCAATTGCTCTACCACTGAGCTAAGAACCCTTTTGTT
GATTAGTGATGAGTGACACATAAAGAAGATTTTGGCATATGCATTGTGATTGAAGGACTT
TGCTAAAAGGATGATCAATAGGTTTAGTTTCTGTGAATTGGTATTAGATTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G588TF U 1
AF RR4G588JQ C 190
BS 1 645 RR4G588TF
BS 646 646 RR4G588JQ
BS 647 690 RR4G588TF
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BS 757 894 RR4G588JQ

RD RR4G588TF 762 0 0
GGAACACCACCACCCAGATTCATCATCATCGTCACCTCCAACTCGGTCTTGATCTTAAAG
ATTCGGAAAATTTATCATTTTTAAAAGGAAAGTTTACGACTTTGATTGGCTTCGATGAAG
GGTTTTGTCTGAATCATCATTTGTGGTCTCTCTGTTTCCGTACTTGAACGATTGAAGGAA
GAAGGAAGAACAGAGATGGGTTGTGCTGGATCGACACAGTCTCAAGCAGAAGGGCCAGTG
AAGAAAATTAGGAAGCCTAAACCGTGGAAGCATACTCAACCGATCACAAAAGCTGAGCTT
ATGAAACTGAGAGAAGAGTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGGTATA
GCTGAATACTTCTCTCTATAGTTTGCCTTTTTATATTGTGTTTTTGAGTGGTGTGGTTTC
ATTTTTATACAAAAGAAATGAAGGGTTTTGTAAAAAAGGGTTGGTAGTAGTAGTTATTAA
GAGGGAGATGTAGTAAAACAGAATTTTTAAAGGGCTCTACCGGATTCGAACCGGTGACCT
ATTGATCTGCAGTCAATTGCTCTACCACTGAGCTAAGAACCCTTTTGTTGATTAGTGATG
AGTGACACATAAAGAAGATTGTGGCATAAGCATTGTGATCAATAG*TTTAGTTTCTGTGA
ATTAGTATTAGATTTGGGAAAGAGTGAAAA*TAGATTTAAAAGGGTCCTACCGGATTCGA
ACCGGTGGCCTATTGATCTGCAGTCAATTGCTCTAC
ACTGAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4G588JQ 705 0 0
ACAGAGATGGGTTGTGCTGGATCGACACAGTCTCAAGCAGAAGGGCCAGTGAAGAAAATT
AGGAAGCCTAAACCGTGGAAGCATACTCAACCGATCACAAAAGCTGAGCTTATGAAACTG
AGAGAAGAGTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGGTATAGCTGAATAC
TTCTCTCTATAGTTTGCCTTTTTATATTGTGTTTTTGAGTGGTGTGGTTTCATTTTTATA
CAAAAGAAATGAAGGGTTTTGTAAAAAAGGGTTGGTAGTAGTAGTTATTAAGAGGGAGAT
GTAGTAAAACAGAATTTTTAAAGGGCTCTACCGGATTCGAACCGGTGACCTATTGATCTG
CAGTCAATTGCTCTACCACTGAGCTAAGAACCCTTTTGTTGATTAGTGATGAGTGACACA
TAAAGAAGATTGTGGCATAAGCATTGTGATCAATAGGTTTAGTTTCTGTGAATTAGTATT
AGATTTGGGAAAGAGTGAAAAATAGATTTAAAAGGGTCCTACCGGATTCGAACCGGTGGC
CTATTGATCTGCAGTCAATTGCTCTACCACTGAGCTAAGAACCCTTTTGTTGATTAGTGA
TGAGTGACACATAAAGAAGATTTTGGCATATGCATTGTGATTGAAGGACTTTGCTAAAAG
GATGATCAATAGGTTTAGTTTCTGTGAATTGGTATTAGATTTGGG

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL8334Contig1 822 2 4 U
GGACTGGAGTTCACCATTGTGAGACCTTTTAACTGGATTGGACCTAGGATGGATTTCATC
CCCGGCATTGATGGTCCTAGCGAAGGTGTCCCTCGTGTTCTCGCCTGCTTTAGTAATAAT
CTTCTTCGCCGTGAGCCTCTGAAGCTTGTGGATGGTGGAGAATCGCAGAGAACTTTCATC
TACATCAAGGATGCTATCGAAGCTGTTCTTTTGATGATCGTGAGTGCTCTATTGTCTAAT
ACCATCCTTTGTGCTTTTCGTTTACAAACTGTTAACCTACAATGATATTGTGTGTTTGTG
GCTCAGGAAAACCCGGAGAGGGCCAATGGGCATATATTCAATGTAGGCAACCCGAACAAC
GAAGTCACAGTACGACAGCTTGCTGAAATGATGACCGAGGTTTACGCAAAAGTGAGTGGA
GAGGGAGCTATAGAGAGCCCGACGGTTGATGTAAGCTCAAAAGAGTTTTACGGGGAAGGT
TATGACGACAGTGACAAGAGAATCCCAGACATGACCATCATAAACCGCCAACTGGGATGG
AACCCGAAGACATCTCTGTGGGACTTGCTGGAATCGACCTTAACCTATCAGCACAGGACT
TACGCAGAAGCTGTGAAGAAGGCAACATCCAAACCAGTAGCTTCCTAAGATGTTCAAGTC
CAACAGTCATCAACACACTCATTAAAGACGCCCTGATTTTGGCATTTTTAAAAACTCTAT
TCGACTCTTTTCTATTCACATCCCATAGACTCTTTTTTTACCTTTCTTCTTAAGAAAACA
ACCTTGTTACGCTGGTCCGTTGTTCTCAAATATACCGTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FI69TF U 1
AF RR4DE63JQ C 470
BS 1 602 RR4FI69TF
BS 603 603 RR4DE63JQ
BS 604 619 RR4FI69TF
BS 620 822 RR4DE63JQ

RD RR4FI69TF 625 0 0
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CCCGGCATTGATGGTCCTAGCGAAGGTGTCCCTCGTGTTCTCGCCTGCTTTAGTAATAAT
CTTCTTCGCCGTGAGCCTCTGAAGCTTGTGGATGGTGGAGAATCGCAGAGAACTTTCATC
TACATCAAGGATGCTATCGAAGCTGTTCTTTTGATGATCGTGAGTGCTCTATTGTCTAAT
ACCATCCTTTGTGCTTTTCGTTTACAAACTGTTAACCTACAATGATATTGTGTGTTTGTG
GCTCAGGAAAACCCGGAGAGGGCCAATGGGCATATATTCAATGTAGGCAACCCGAACAAC
GAAGTCACAGTACGACAGCTTGCTGAAATGATGACCGAGGTTTACGCAAAAGTGAGTGGA
GAGGGAGCTATAGAGAGCCCGACGGTTGATGTAAGCTCAAAAGAGTTTTACGGGGAAGGT
TATGACGACAGTGACAAGAGAATCCCAGACATGACCATCATAAACCGCCAACTGGGATGG
AACCCGAAGACATCTCTGTGGGACTTGCTGGAATCGACCTTAACCTATCAGCACAGGACT
TA*GCAGAAGCTGTGAAGA
GGCAAC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4DE63JQ 353 0 0
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AACTGGGATGGAACCCGAAGACATCTCTGTGGGACTTGCTGGAATCGACCTTAACCTATC
AGCACAGGACTTACGCAGAAGCTGTGAAGAAGGCAACATCCAAACCAGTAGCTTCCTAAG
ATGTTCAAGTCCAACAGTCATCAACACACTCATTAAAGACGCCCTGATTTTGGCATTTTT
AAAAACTCTATTCGACTCTTTTCTATTCACATCCCATAGACTCTTTTTTTACCTTTCTTC
TTAAGAAAACAACCTTGTTACGCTGGTCCGTTGTTCTCAAATATACCGTCTAT

QA 1 353 1 353
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8336Contig1 689 2 4 U
GGAAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAG
ATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAG
CTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTG
TACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAAC
TACGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGC
CAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAAT
CTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAG
CTTGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTC
AATGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAGG
TTAGCTGATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTT
GACTTTGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCC
ATTTTTCAAATCGGGTATCATCAGGGGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FP36TF U 1
AF RR4GC37TF U 1
BS 1 538 RR4FP36TF
BS 539 539 RR4GC37TF
BS 540 564 RR4FP36TF
BS 565 689 RR4GC37TF

RD RR4FP36TF 564 0 0
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ATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAG
CTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTG
TACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAAC
TACGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGC
CAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAAT
CTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAG
CTTGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTC
AATGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCATG
TTAGCTGATGGGTATCAGATGCCA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR4GC37TF 689 0 0
GGAAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAG
ATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAG
CTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTG
TACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAAC
TACGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGC
CAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAAT
CTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAG
CTTGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTC
AATGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAGG
TTAGCTGATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTT
GACTTTGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCC
ATTTTTCAAATCGGGTATCATCAGGGGCA

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL8337Contig1 560 2 1 U
GGGCTTAGAAATCATCTTCTCTTTCTTCATCTTTCCCTCTCTGAAACAGAAGATTTTTTA
AAAAGAAAACGATGGCGTTTCATCACAATCATTTCAATCACTTCACCGACCAACAACACC
AGCCTCCTCTACCTCCGCCGCCACAGCAGCAGGAACAAGACACTACCTCGGTTCTCAAAG
CTTGGTGGCAGTCTCATTCAAAGTGGCCTTACCCTACTGAAGAAGATAAGGCGAGGTTGG
TGCAGGATACGGGTTTGCAGCTCAAACAGATAAACAATTGGTTCATCAATCAAAGAAAGA
GGAATTGGCATAGTAATCCATCTTCTTCCACCGCCTCAAAGAACAAACGCAAAAGCAATG
CAGGTGAAAATAGCGGAAGAGAGCGTTGAAGTCAGTTTGTAGCTGTGCATGAAAATATCA
AATAGCTTGATAGAAGGTTGGAGATACAAAGATGAAACTCCTATAGAAAACCAGCGTAGA
AAGTATTTTTGTGACTTCATATGTTGTATTAGAGAGCACAAAAAAAACCGAAAAGACCAA
GAAGCAGAAGCATGATTTGT


BQ
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DS 



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BQ
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TG

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BQ
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AF RR4DR17TF C 1
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TTCTTGTCACCCTAGACAAGAACAATCTAGAGCTATGTATTTTTTTGTCTGAAAAGTTAT
ATTTGAAGTTAAGATCTTCACAATTTTGGATGTGTCC

QA 1 697 1 697
DS 

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CAGCAACTCCAGCAATTAAAGCAAACATCACAAAGAATCCAGTGGCCGCATTGCCCATCG
GAAAATATATGGGCGAAAAATGAGCGGGAAGACTGAAATCCGCACCAATAGGGAAGCCAT
GGCTGATAGCTTTGTTCATGGACCATGCTCCAATTCCGAGAACAATGGCGTACATGCAGA
AATTCAGGAGTAGAAGCAAAGAGGCCACTGGTTTCATCTGCTGTTCCGCCATTTTTTCTT
GTCACCCTAGACAAGAACAATCTAGAGCTATGTATTTTTTTGTCTGAAAAGTTATATTTG
AAGTTAAGATCTTCACAATTTTGGATGTGTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL8340Contig1 988 2 2 U
TGATAAGGTTGCTGATGAAGTCGCTACCCTTGTTCAGATGAGCGAGCATAACATCACAGA
AAGGAGGAAGCTTGGATTTTTTCTCTTTGTGGAACCGGTAACCCAATCGATGACTGTTTG
GCGTTTGTGACCGTAACTGGCGTAACAACCGCAAACGCCTCGCTGACTGTGGGATCGGTT
TTTGGACGCAACGCAATTTGGTGGTCGCGATGGACGCTTCTACGTTGTCACTGACCCCAC
TGACGAAGACGTTATTAACCCCAAACCAGGAACTCTTCGCCATGCGGTCATCCAAGATGA
GCCGCTGTGGATTGTGTTCAAAAGAGATATGGTGATAGAGCTGAAACAAGAGCTGATTAT
GAACAGTTTCAAGACCATTGATGGTCGTGGTGCTAATGTCCATATAGCCAACGGTGCTTG
CATCACTATCCAGTTTATCACCAACGTCATCATTCATGGTCTCCATATTCATGATTGCAA
ACCTACTGGAAACGCCATGGTTAGAAGCTCCCCATCTCATTTTGGCTGGAGGACGATGGC
TGATGGTGATGCAGTCTCTATCTTTCAATCATCTCATATCTGGATTGATCATAACTCTCT
CTCACACTGTGCTGACGGCCTTGTGGACGCTGTCATGGGTTCCACTGCTATTACCGTTTC
CAATAACCACTTTACACACCACAATGAGGTCATGTTGCTAGGCCACAGTGATTCCTACAC
AAAAGATAAGCTGATGCAAGTGATCATTGCTTACAACCATTTTGGAGAAGGATTGGTTCA
AAGAATGCCAAGGTGTAGACATGGGTATTTCCATGTGGTTAACAACGACTATACACACTG
GGAGATGTACGCAATTGGTGGGAGTGCAGATCCAACCATCAACAGTCAAGGAAACAGATA
TGCTGCTCCCAAGGACCCTTTCGCCAAGGAGGTGACGAAAAGAGTACAGACAGCTGCAAG
TGAGTGGCAGAAGTGGAATTGGAGGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BC33TF U 1
AF RR4DT45TF U 354
BS 1 494 RR4BC33TF
BS 495 988 RR4DT45TF

RD RR4BC33TF 494 0 0
TGATAAGGTTGCTGATGAAGTCGCTACCCTTGTTCAGATGAGCGAGCATAACATCACAGA
AAGGAGGAAGCTTGGATTTTTTCTCTTTGTGGAACCGGTAACCCAATCGATGACTGTTTG
GCGTTTGTGACCGTAACTGGCGTAACAACCGCAAACGCCTCGCTGACTGTGGGATCGGTT
TTTGGACGCAACGCAATTTGGTGGTCGCGATGGACGCTTCTACGTTGTCACTGACCCCAC
TGACGAAGACGTTATTAACCCCAAACCAGGAACTCTTCGCCATGCGGTCATCCAAGATGA
GCCGCTGTGGATTGTGTTCAAAAGAGATATGGTGATAGAGCTGAAACAAGAGCTGATTAT
GAACAGTTTCAAGACCATTGATGGTCGTGGTGCTAATGTCCATATAGCCAACGGTGCTTG
CATCACTATCCAGTTTATCACCAACGTCATCATTCATGGTCTCCATATTCATGATTGCAA
ACCTACTGGAAACG

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR4DT45TF 635 0 0
G
GATTATGAACAGTTTCAAGACCATTGATGGTCGTGGTGCTAATGTCCATATAGCCAACGG
TGCTTGCATCACTATCCAGTTTATCACCAACGTCATCATTCATGGTCTCCATATTCATGA
TTGCAAACCTACTGGAAACGCCATGGTTAGAAGCTCCCCATCTCATTTTGGCTGGAGGAC
GATGGCTGATGGTGATGCAGTCTCTATCTTTCAATCATCTCATATCTGGATTGATCATAA
CTCTCTCTCACACTGTGCTGACGGCCTTGTGGACGCTGTCATGGGTTCCACTGCTATTAC
CGTTTCCAATAACCACTTTACACACCACAATGAGGTCATGTTGCTAGGCCACAGTGATTC
CTACACAAAAGATAAGCTGATGCAAGTGATCATTGCTTACAACCATTTTGGAGAAGGATT
GGTTCAAAGAATGCCAAGGTGTAGACATGGGTATTTCCATGTGGTTAACAACGACTATAC
ACACTGGGAGATGTACGCAATTGGTGGGAGTGCAGATCCAACCATCAACAGTCAAGGAAA
CAGATATGCTGCTCCCAAGGACCCTTTCGCCAAGGAGGTGACGAAAAGAGTACAGACAGC
TGCAAGTGAGTGGCAGAAGTGGAATTGGAGGTCA

QA 2 635 2 635
DS 



AS 1 2

CO CL8341Contig1 732 2 2 U
GGACATTCGTACTCTGTCCTAGTCCGTTTCGCTTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATACTTTCTTAGCACAAAGAGATATTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCGCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACATGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGACGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTTAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCATCTAAATGG
GCAAACCAGAGGGTTGCTGTTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGTACCTTTGT
AATTTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTATG
ATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAGTTGTAAG
CTTTGAATGAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP62TF U 1
AF RR4BP62JQ C 1
BS 1 692 RR4BP62TF
BS 693 732 RR4BP62JQ

RD RR4BP62TF 692 0 0
GGACATTCGTACTCTGTCCTAGTCCGTTTCGCTTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATACTTTCTTAGCACAAAGAGATATTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCGCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACATGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGACGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTTAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCATCTAAATGG
GCAAACCAGAGGGTTGCTGTTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGTACCTTTGT
AATTTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTATG
ATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4BP62JQ 732 0 0
GGACATTCGTACTCTGTCCTAGTCCGTTTCGCTTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATACTTTCTTAGCACAAAGAGATATTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCGCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACATGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGACGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATTTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTTAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCATCTAAATGG
GCAAACCAGAGGGTTGCTGTTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGTACCTTTGT
AATTTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTATG
ATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAGTTGTAAG
CTTTGAATGAGT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL8342Contig1 553 2 1 U
ATCGCTAAAACGCGCCGCCGTTGAGTCATGCCGCATATTCCAAACCCGAAGTTTGAGCCA
CGCCGCGTCAATGCCACCGCCTTTGAACAGCGCCGTCGATCTACCATTCGCTATTCCGCC
GCCGATCTCACCCGAGTTCGATCAGAATCAACCGGGTTCGATCGAGGATAAGAGATTCGG
TTTTGGGGTGCCTGATTTTGGATTGAGTGGATCCATGGAGCTAATGGCTGTTCCCAAGAA
GAAGGTTTCTAAACACAAGAGAGGGATACGAAATGGGCCCAAGGCTCTTAAGCCTGTTCC
TGTCATCATCCGTTGCAGGAGTTGCGGGAGAGTTAAGCTGCCACATTTCTTTTGTTGCAG
CGGTGAGCGAGGAAACCCTAGTGAGCAAGGCAATTAGATCAACTATTCCAAGATTTCCTT
TTATGATTTGTCACTTGTTGGATGTTTAGAGGAAAAATATATCTTGGCTTTCTTAGTCGA
GTGATACTATACACTTGGTTGACTCTGTTTTGTCGAACTATTTGGGCTTTTCTTGCAAAA
TCATGTTATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E433TF U 1
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TCATGTTATTCCC

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AGCGGTGAGCGAGGAAACCCTAGTGAGCAAGGCAATTAGATCAACTATTCCAAGATTTCC
TTTTATGATTTGTCACTTGTTGGATGTTTAGAGGAAAAATATATCTTGGCTTTTTTAGTC
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AATCATGTTATTCCC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

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CCGTTCCTCCT


BQ
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AF RR4D008JQ U 1
AF RR4F001JQ U 26
BS 1 397 RR4D008JQ
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CCGTTCCTCCT

QA 1 731 1 731
DS 

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TCTAATGCTTTGATCTTTATCATGAGCAGCCTTTCTCAAAGTTATCACCTCCTTTTGAAG
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QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

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AC


BQ
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20 20 

AF RR4AV94TF U 1
AF RR4AV94JQ C 35
BS 1 722 RR4AV94TF

RD RR4AV94TF 722 0 0
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AAGTCAGATGTGTACTCTTTTGGCGTTGTGTTGTTTGAAGCTGTTTGTGCTCGAGCTGTT
ATAAACCCGACTTTGCCTAAAGACCAGATCAACCTTGCGGAATGGGCTTTAAGCTGGCAG
AAACAGAGGTCTCTCGAGTCGATCATACCCGAATCTGAGAGGGAACCACAGTCCTGAGTC
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AGGATCAACTCTTCACAACATGGTGTAGAGGAAGGAACGGATTCGACTATCCTCAAAATT
ATTCTTTTGTTCTTTTGTTTCTATTGATTATGATCTATTCAGAAGCTCTTAGTAATAGAG
CTTGTAATGTGTTATGCTGCTACTTGCAAATATGATTTGCTTTTTAAGGTATTTGTCTCT
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4AV94JQ 688 0 0
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TTGAAGCTGTTTGTGCTCGAGCTGTTATAAACCCGACTTTGCCTAAAGACCAGATCAACC
TTGCGGAATGGGCTTTAAGCTGGCAGAAACAGAGGTCTCTCGAGTCGATCATACCCGAAT
CTGAGAGGGAACCACAGTCCTGAGTCGTTGGAGAAGTATGGTGAGATAGCTGAGAAGTGC
TTAGCGGATGAAGGGAAGAACAGGCCGATGATGGGAGAAGTTTTGTGGCATTTGGAGTAT
GTTTTGCAGCTTCATGAAGCTTGGCTTCGCAAACAGAACGGAGAGAACTCGTTTTCGAGC
AGCCAAGCGTTAGAAGAAGCGCCAGAGAGTTCTCTGCAAGCTTGTTGTTCCAATCAAGAT
TCCTCTGAAGCGGAGAAGAGTCAAACAGGATCAACTCTTCACAACATGGTGTAGAGGAAG
GAACGGATTCGACTATCCTCAAAATTATTCTTTTGTTCTTTTGTTTCTATTGATTATGAT
CTATTCAGAAGCTCTTAGTAATAGAGCTTGTAATGTGTTATGCTGCTACTTGCAAATATG
ATTTGCTTTTTAAGGTATTTGTCTCTAC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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CCTAAATTCAAACCC


BQ
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AF RR4ET48JQ C 1
AF RR4ET48TF U 1
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CCTAAATTCAAACCC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR4ET48TF 555 0 0
GGAGTCGAAAGAAAAAAAGGAGATTTGGGTTCGATCGATCAGTGAGAAGAATGGTGAAAT
CGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTC
CCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTTTGATTC
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TCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAGAAA
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TGGTCCTGCACTTGGTTATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTCCCGTCTCCTATCTTACAG
GTTGCTCTCATGTTATGGACATTTTAGTTGTGACTTGGAATCATAATTGTAGTATTGAGA
TATTTTATGTTTCTGTCAAAGAATCGAACTTTTTGTGCACTAATGGGGTTAATTGCTCGG
CCTAAATTCAAACCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL8346Contig1 833 2 4 U
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CCAGAATCAGAGAGAAGTACGGATTGAACAACGGCCAGAGCCAGAGTCCCTCAGTCTAAC
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TTGCTACCTTTGTAACTTTCAGAGTGTGCATAAGTATTACACAACTTTTTAGATTGGAAC
ATTGGTTTCTCTCTGGTGTGTTTGCACAAAAAGCGTAACGAGATTTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GE41TF U 1
AF RR4GE41JQ C 53
BS 1 605 RR4GE41TF
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RD RR4GE41TF 617 0 0
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ACTAATGTGGAAACGTATATTAGCAAGTTTAATTCCTTGATATGTCTGTCTGTCTGTCTT
AGTATTCAATCCTCAAAACTCTTGTCATCATACTTGAAGCAGCTCTCGTTGGATTCATTG
CCATTGACCGTCACTGGGAGAAGGATCTTCCTTATGATCCAACTGGAGAACTCACTAGCC
TTCGAGCTTTCATTGAAGCAAACATCGATATTTGCAAATGGGTTGGGGTTGGCGTGGTAG
CTATCCAGCTACTGTCTTTGCTACTGGCTATGGTTCTAAGAGCTATGGTTTCTCCTAGGC
AATCAGAGCTTGATGACGAAGATGATTATGAGAATCCGATTAACAGAGCGCGGGAGAATC
TTCTTGCTCCACAGACTAACCAGACATCTTCTGGATCAAGCAATATTGACAACTGGAGGT
CCAGA*TCAGAGAGAAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4GE41JQ 781 0 0
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GCAGCTGAAGCTATCAATGGCTGCTGCTTGTGTTTCGTATCCTTTTTTATTATATACTTC
TTTTATTCACTAATGTGGAAACGTATATTAGCAAGTTTAATTCCTTGATATGTCTGTCTG
TCTGTCTTAGTATTCAATCCTCAAAACTCTTGTCATCATACTTGAAGCAGCTCTCGTTGG
ATTCATTGCCATTGACCGTCACTGGGAGAAGGATCTTCCTTATGATCCAACTGGAGAACT
CACTAGCCTTCGAGCTTTCATTGAAGCAAACATCGATATTTGCAAATGGGTTGGGGTTGG
CGTGGTAGCTATCCAGCTACTGTCTTTGCTACTGGCTATGGTTCTAAGAGCTATGGTTTC
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GGAGAATCTTCTTGCTCCACAGACTAACCAGACATCTTCTGGATCAAGCAATATTGACAA
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AGTCTAACTCAAAAGATTTGAGTTCGTGTGTGTGTGTTTGGTATCACTACTTTCGTTTTG
TTCCTCTCTTGCTACCTTTGTAACTTTCAGAGTGTGCATAAGTATTACACAACTTTTTAG
ATTGGAACATTGGTTTCTCTCTGGTGTGTTTGCACAAAAAGCGTAACGAGATTTGTGTTT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL8347Contig1 799 2 4 U
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CTATGGAGGAAGAAGCAGTCCGATGTCATGAGGTTCGTGCAGAGGGTGAGGTGCTGGGAG
TACAGACAGCAACCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCTCGT
CGTTTGGGTTACAAGGCCAAACAGGGCTTTGTGGTGTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGT
GGACGCAAGAGGCCAGTGCCAAAGGGTATTGTCTACGGTAAGCCCACAAACCAGGGAGTA
ACCCAGCTCAAGTTCCAGAGGAGCAAGCGTTCTGTTGCCGAGGAGCGTGCTGGAAGGAAA
CTGGGAGGCCTCAGAGTCGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACCTACAAGTAC
TACGAGATCATCTTGGTTGACCCGGCGCACAACGCTGTGCGTAACGACCCGAGGATCAAC
TGGATCTGCAACCCGGTGCACAAACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACTTCCGAGGGAAAG
AAGAACAGAGGACTCCGCGGAAAGGGTCACAACAACCACAATAACCGTCCGTCTCGCAGA
GCTACATGGAAGAAGAACAATTCTCTCTCCCTTCGCCGTTACCGTTAATTGCTTTTTGCT
GTTTTCGTTACTACTGCTATCATCAACTTCTAGTTTCTCTGTTGTTGCTCTTTTATCTTT
CGCATGATGTTTTTGCAAAATTTGGGAGGCTATGCAATTGCGTTCGTTTATGGTTTTAAA
AAAGACATTTGCTTTAGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV27TF U 1
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TACGAGATCATCTTGGTTGACCCGGCGCACAACGCTGTGCGTAACGACCCGAGGATCAAC
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CGCATGATGTTTTT

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TGGGAGGCCTCAGAGTCGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACCTACAAGTACT
ACGAGATCATCTTGGTTGACCCGGCGCACAACGCTGTGCGTAACGACCCGAGGATCAACT
GGATCTGCAACCCGGTGCACAAACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACTTCCGAGGGAAAGA
AGAACAGAGGACTCCGCGGAAAGGGTCACAACAACCACAATAACCGTCCGTCTCGCAGAG
CTACATGGAAGAAGAACAATTCTCTCTCCCTTCGCCGTTACCGTTAATTGCTTTTTGCTG
TTTTCGTTACTACTGCTATCATCAACTTCTAGTTTCTCTGTTGTTGCTCTTTTATCTTTC
GCATGATGTTTTTGCAAAATTTGGGAGGCTATGCAATTGCGTTCGTTTATGGTTTTAAAA
AAGACATTTGCTTTAGTG

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DS 



AS 1 2

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AATGGCACCGGATAAAATTAGAGTTTTGCGTGTGTGCTCTAAGTCGTTGACTAGTCTTCA
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CACAGGGGTTTTCATCGATGCTCCTAAACTCGAGTTCTTGAAGTTCGAAGAAGATCTATC
TGATACTAAAATAATTACCAATACAGGGTCCTTAGCCAAGGTCAACATTGTTTTTCTTTT
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AAAAAGTTTCGGCGGAGACCCTGCTAGAATGAAAGTAGCAAGGTACTTTGTGGAGAACTC
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CATCACAGCACAGGGGTTTTCCATGTTTAGGGATCTCCTTGCGTTGCCCAGGCCATCTAG
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TTTTTTTTGGTCTTCTCTTAAGCCATCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AP85TF U 1
AF RR4AP85JQ C 416
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AAAA
GT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AP85JQ 757 0 0
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CATAACTTCTTTACTAGCATCTCACGTGTTACTGATATGAAGCTCTCTGCCCATATTGTG
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GAGAGCTGTCCGAATCTAAACTCACTCGTCTTGGCGCTGGATTTTCATCCGGATGATGAA
GCAGCGGAAATTAAATCATCATCGATACCTCGGTGTTTGCAATCATCACTAGAGTATGTA
GAGATAAAAAGTTTCGGCGGAGACCCTGCTAGAATGAAAGTAGCAAGGTACTTTGTGGAG
AACTCGCTGGTGCTTAAAAAGCTTGTTCTGGATATTAGATGCAAAACCATGGAGAACGGG
TTTTACATCACAGCACAGGGGTTTTCCATGTTTAGGGATCTCCTTGCGTTGCCCAGGCCA
TCTAGCGCGTGTCAGATCCTACTTAAATGATTAGACTCGAGAGTTAGCATTTTCTAACTG
GTTTTGTTAGACTGCATTTGGATGTTTTGGTTTTGTTTTTTTTGTTTTGTTGAGGTTTCT
ATTGAAGTCTTTGTGAGCTTTTCTGTCACTAGTTATGGATAATGTTTGAGAATTCTATAA
CTAAGTTTTTTTTGGTCTTCTCTTAAGCCATCTGTCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL8349Contig1 758 2 4 U
GGACTAGAAACTCTTTAACCGATCTTTGGCAATCGGTGGCCGGCGGCCTCCGTCGTCGAT
CACCACCAACTCTTTTGTTTTTTGGTGTAATATAACTTCCGGTAGCGGATATCACTTCGG
CTTATCCGATCTTTTCTTCCGTCGCGGATATTAGGTCAATAGTTTCGCTTTTCCTTTGAG
TTTTTAATTCCTTATTCTGTTCGATTTGAAAGGTTTTTTTCTGCAAGCAAGATATACTCA
GATTCATGAATCGGAGAGGAATCAATCTCTGTTTTATACCGACAGAGTATCTTCAGAAAT
CAAGTATCTGTGAGTTTGGTTTGTGCTTTGTTGAAGAAAAACAGAATCAGATAAGATGGA
GCTTTCTATGAAAGTGTTCCGACAAGGTTTTGTTTTCTCTTTAATTGAAGCTTTCCACCG
GTCTTCACATCAAGCAAGCGGATGAAGAACCTATTGAATCGACAGCGAAAGATAAAGGAA
AAGCCTACAAACAGTATTTCAAGCGAAACGGGATTGGAGAACGACGACGTCCGGCCGGCA
AAAGTCCGGTGAAACTCTCAATCTTCGTTTCACGAGGAGGAGAAGCCACGTAGCAACACG
TGGAGATCATGCAATCATCTTTATCTTATTTTACGGGATTTATTGGGCTGAATATAATTT
TGTAAGCTCTTGGGCTTTGAACTGTTTGTACTCTAAATTGGCTTTTAAAACTTAATACAA
AGTCGACAAAAAAAAAAAGACTATAATAGTCTTCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DX16TF U 1
AF RR4DX16JQ C 78
BS 1 705 RR4DX16TF
BS 706 707 RR4DX16JQ
BS 708 729 RR4DX16TF
BS 730 758 RR4DX16JQ

RD RR4DX16TF 729 0 0
GGACTAGAAACTCTTTAACCGATCTTTGGCAATCGGTGGCCGGCGGCCTCCGTCGTCGAT
CACCACCAACTCTTTTGTTTTTTGGTGTAATATAACTTCCGGTAGCGGATATCACTTCGG
CTTATCCGATCTTTTCTTCCGTCGCGGATATTAGGTCAATAGTTTCGCTTTTCCTTTGAG
TTTTTAATTCCTTATTCTGTTCGATTTGAAAGGTTTTTTTCTGCAAGCAAGATATACTCA
GATTCATGAATCGGAGAGGAATCAATCTCTGTTTTATACCGACAGAGTATCTTCAGAAAT
CAAGTATCTGTGAGTTTGGTTTGTGCTTTGTTGAAGAAAAACAGAATCAGATAAGATGGA
GCTTTCTATGAAAGTGTTCCGACAAGGTTTTGTTTTCTCTTTAATTGAAGCTTTCCACCG
GTCTTCACATCAAGCAAGCGGATGAAGAACCTATTGAATCGACAGCGAAAGATAAAGGAA
AAGCCTACAAACAGTATTTCAAGCGAAACGGGATTGGAGAACGACGACGTCCGGCCGGCA
AAAGTCCGGTGAAACTCTCAATCTTCGTTTCACGAGGAGGAGAAGCCACGTAGCAACACG
TGGAGATCATGCAATCATCTTTATCTTATTTTACGGGATTTATTGGGCTGAATATAATTT
TGTAAGCTCTTGGGCTTTGAACTGTTTGTACTCTAAATTGGCTTT**AAACTTAATACAA
AGTCGACAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4DX16JQ 681 0 0
TTTTTTGGTGTAATATAACTTCCGGTAGCGGATATCACTTCGGCTTATCCGATCTTTTCT
TCCGTCGCGGATATTAGGTCAATAGTTTCGCTTTTCCTTTGAGTTTTTAATTCCTTATTC
TGTTCGATTTGAAAGGTTTTTTTCTGCAAGCAAGATATACTCAGATTCATGAATCGGAGA
GGAATCAATCTCTGTTTTATACCGACAGAGTATCTTCAGAAATCAAGTATCTGTGAGTTT
GGTTTGTGCTTTGTTGAAGAAAAACAGAATCAGATAAGATGGAGCTTTCTATGAAAGTGT
TCCGACAAGGTTTTGTTTTCTCTTTAATTGAAGCTTTCCACCGGTCTTCACATCAAGCAA
GCGGATGAAGAACCTATTGAATCGACAGCGAAAGATAAAGGAAAAGCCTACAAACAGTAT
TTCAAGCGAAACGGGATTGGAGAACGACGACGTCCGGCCGGCAAAAGTCCGGTGAAACTC
TCAATCTTCGTTTCACGAGGAGGAGAAGCCACGTAGCAACACGTGGAGATCATGCAATCA
TCTTTATCTTATTTTACGGGATTTATTGGGCTGAATATAATTTTGTAAGCTCTTGGGCTT
TGAACTGTTTGTACTCTAAATTGGCTTTTAAACCTTAATACAAAGTCGACAAAAAAAAAA
AGACTATAATAGTCTTCTCGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL8350Contig1 214 2 1 U
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TCAGAATGTGGAGCAAGAGTTTCAGGAAACTGTGACTCTTCCGTGGTAATTATGATGATA
ATAAGCTAGACATATATATGAATGAATGTTTGTGTAATAACTCTTTTGACTACTTAATGT
TTGTGGAATCTTCTAAGGAAAGTCTTCTATGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G103JQ C 1
AF RR4G103TF U 1
BS 1 214 RR4G103TF

RD RR4G103JQ 214 0 0
GATGATGGACAAGGAGGTAGCTCGGAAGCAGACCCACGCAGCTGTTTTAGACCAAAAGGT
TCAGAATGTGGAGCAAGAGTTTCAGGAAACTGTGACTCTTCCGTGGTAATTATGATGATA
ATAAGCTAGACATATATATGAATGAATGTTTGTGTAATAACTCTTTTGACTACTTAATGT
TTGTGGAATCTTCTAAGGAAAGTCTTCTATGACC

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR4G103TF 214 0 0
GATGATGGACAAGGAGGTAGCTCGGAAGCAGACCCACGCAGCTGTTTTAGACCAAAAGGT
TCAGAATGTGGAGCAAGAGTTTCAGGAAACTGTGACTCTTCCGTGGTAATTATGATGATA
ATAAGCTAGACATATATATGAATGAATGTTTGTGTAATAACTCTTTTGACTACTTAATGT
TTGTGGAATCTTCTAAGGAAAGTCTTCTATGACC

QA 1 214 1 214
DS 



AS 1 2

CO CL8351Contig1 1078 2 6 U
GGGGAGAATCTTGAGGAGAATGGGATTAGGCTTCATTCGATGATTAGGTTGACGGATATG
GTTAGGGTTTTGAAGGAGAAGGGGAAGATCGAGGAGGGGGTTGAAGCTAACTTGCTCAAG
TTTCTTGCGGAGAACGGTAGGGTTGGTGTTCCTAGTGTGGAGAAAGTAAAGGTTAAGAGT
TTAGGGTTTAAGGAGAGGTCGGAGATGTGTAAGAATCAGATGGGGAAGAAGATGTTTGAG
GTTATGATGGAGAAGGAGACTAATCTTTGCTTAGCTGCTGATGTTGGAACTGCTGCTGAG
TTGCTAGACATTGCTGATAAGGTGGGGCCAGAGATTTGTCTTTTGAAGACTCATGTTGAT
ATTCTGCCTGACTTCACCTCTGACTTTGGCTCTAAACTCCGTGCGATCGCAGAGAAGCAC
AATTTTCTTATATTTGAGGATCGCAAGTTTGCAGACATTGGTAACACCGTCACTATGCAG
TATGAAGGAGGTGTCTTTAAGATATTAGAGTGGGCTGACATTATAAACGCCCACATAATA
TCAGGGCCAGGAATCGTTGATGGTTTGAAGTTGAAGGGTTTGCCACGTGGTAAGGGTCTG
CTTTTGCTAGCTGAGATGAGCTCTGCTGGTAACCTTGCTACAGGAGACTACACCGCAGCA
GCAGCCAAAATCGCAGAGGCTCATTCAGATTTCGTGATGGGATTCATCTCGGTTAACCCT
GCGTCTTGGAAATGCGGGAATGTGAATCCGTCTATGGTTCACGCGACGCCTGGTGTTCAG
ATGGTGAAAGGTGGTGACGCACTTGGTCAACAGTACAACACTCCACGCTCTGTGATTACT
GAGAGGGAAAGTGATATTATAATCGTGGGACGGGGAATCATAAAGGCGGAGAACCCTGCA
GTGACGGCTCATGAGTATAGACTTGAAGGTTGGAAAGCATACTTGGAGAAATGCTCTCAG
TAGTAGATTCTATCCTGAGAGATTGTGTTCTAATTCTATGAGTGTGTGTGTGGTTTTAAG
ACTCATGTCTTAGTTTGGTCTCAACTCTGAATAGTAATAATAAAGCATTTTGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GY90TF U 1
AF RR4GY90JQ C 258
BS 1 643 RR4GY90TF
BS 644 644 RR4GY90JQ
BS 645 678 RR4GY90TF
BS 679 679 RR4GY90JQ
BS 680 731 RR4GY90TF
BS 732 1078 RR4GY90JQ

RD RR4GY90TF 732 0 0
GGGGAGAATCTTGAGGAGAATGGGATTAGGCTTCATTCGATGATTAGGTTGACGGATATG
GTTAGGGTTTTGAAGGAGAAGGGGAAGATCGAGGAGGGGGTTGAAGCTAACTTGCTCAAG
TTTCTTGCGGAGAACGGTAGGGTTGGTGTTCCTAGTGTGGAGAAAGTAAAGGTTAAGAGT
TTAGGGTTTAAGGAGAGGTCGGAGATGTGTAAGAATCAGATGGGGAAGAAGATGTTTGAG
GTTATGATGGAGAAGGAGACTAATCTTTGCTTAGCTGCTGATGTTGGAACTGCTGCTGAG
TTGCTAGACATTGCTGATAAGGTGGGGCCAGAGATTTGTCTTTTGAAGACTCATGTTGAT
ATTCTGCCTGACTTCACCTCTGACTTTGGCTCTAAACTCCGTGCGATCGCAGAGAAGCAC
AATTTTCTTATATTTGAGGATCGCAAGTTTGCAGACATTGGTAACACCGTCACTATGCAG
TATGAAGGAGGTGTCTTTAAGATATTAGAGTGGGCTGACATTATAAACGCCCACATAATA
TCAGGGCCAGGAATCGTTGATGGTTTGAAGTTGAAGGGTTTGCCACGTGGTAAGGGTCTG
CTTTTGCTAGCTGAGATGAGCTCTGCTGGTAACCTTGCTACAG*AGACTACACCGCAGCA
GCAGCCAAAATCGCAGAG*CTCATTCAGATTTCGTGATGGGATTCATCTCGGTTAACCCT
GCGTCTTGGAA
T

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4GY90JQ 821 0 0
GAGACTATC
TTGCTTAGCTGCTGATGT*GGAACTGCTGCTGAGT*GCTAGACATTGCTGATAAGGTGGG
GCCAGAGATTTGTCTTT*GAAGACTCATGTTGATATTCTGCCTGACTTCACCTCTGACTT
TGGCTCTAAACTCCGTGCGATCGCAGAGAAGCACAATTTTCTTATATTTGAGGATCGCAA
GTTTGCAGACATTGGTAACACCGTCACTATGCAGTATGAAGGAGGTGTCTTTAAGATATT
AGAGTGGGCTGACATTATAAACGCCCACATAATATCAGGGCCAGGAATCGTTGATGGTTT
GAAGTTGAAGGGTTTGCCACGTGGTAAGGGTCTGCTTTTGCTAGCTGAGATGAGCTCTGC
TGGTAACCTTGCTACAGGAGACTACACCGCAGCAGCAGCCAAAATCGCAGAGGCTCATTC
AGATTTCGTGATGGGATTCATCTCGGTTAACCCTGCGTCTTGGAAATGCGGGAATGTGAA
TCCGTCTATGGTTCACGCGACGCCTGGTGTTCAGATGGTGAAAGGTGGTGACGCACTTGG
TCAACAGTACAACACTCCACGCTCTGTGATTACTGAGAGGGAAAGTGATATTATAATCGT
GGGACGGGGAATCATAAAGGCGGAGAACCCTGCAGTGACGGCTCATGAGTATAGACTTGA
AGGTTGGAAAGCATACTTGGAGAAATGCTCTCAGTAGTAGATTCTATCCTGAGAGATTGT
GTTCTAATTCTATGAGTGTGTGTGTGGTTTTAAGACTCATGTCTTAGTTTGGTCTCAACT
CTGAATAGTAATAATAAAGCATTTTGTCTTCC

QA 10 821 10 821
DS 



AS 1 2

CO CL8352Contig1 559 2 1 U
GGAGCAACCGTTTGTTTATAGTCTCATTTGCTTGCTTACTCATCGCGGAGATGGCGTTTT
TGCTTAAAAACAACTCGATTTCATCTCACCTCCGATCTTACCCCCAGGAGAAGGATGGTG
GAGCTCTAGGTCAATCCCGTCGGGGATTCCATGTGGAGCTAGGAGCTCGCGAGAAAGACC
TTTTGGCTGAGAACGATGCATTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGTCAAT
TGAAAAGAATTGGAGATGTCATCACTGCTGTCGTTGTTGCTGGGTGCTGCTATGAGATCT
ATACGAGAGCAACGGTTAAAAAGGAAGCTTAGGCTGCTGCTTGAGGAAGCTCATGTGTCC
TCTCCTTTCGCTTTTATCATCAATCTTCCCTTTTCTAGCATATGTCTCTGGGAATTCATG
TTGCCTAATTGTTGCTCAGCGGTCTCTGAATAAGTGAATAATCGAAAAGTATTTGGTTGT
TTTCGAGAAATGGAATAAACCAGAAAGACTCGTTTGTTGAGCTCGTAAACTTGAATGATT
CGTCAAATGTTATTTCTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CQ69JQ C 1
AF RR4CQ69TF U 1
BS 1 559 RR4CQ69TF

RD RR4CQ69JQ 559 0 0
GGAGCAACCGTTTGTTTATAGTCTCATTTGCTTGCTTACTCATCGCGGAGATGGCGTTTT
TGCTTAAAAACAACTCGATTTCATCTCACCTCCGATCTTACCCCCAGGAGAAGGATGGTG
GAGCTCTAGGTCAATCCCGTCGGGGATTCCATGTGGAGCTAGGAGCTCGCGAGAAAGACC
TTTTGGCTGAGAACGATGCATTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGTCAAT
TGAAAAGAATTGGAGATGTCATCACTGCTGTCGTTGTTGCTGGGTGCTGCTATGAGATCT
ATACGAGAGCAACGGTTAAAAAGGAAGCTTAGGCTGCTGCTTGAGGAAGCTCATGTGTCC
TCTCCTTTCGCTTTTATCATCAATCTTCCCTTTTCTAGCATATGTCTCTGGGAATTCATG
TTGCCTAATTGTTGCTCAGCGGTCTCTGAATAAGTGAATAATCGAAAAGTATTTGGTTGT
TTTCGAGAAATGGAATAAACCAGAAAGACTCGTTTGTTGAGCTCGTAAACTTGAATGATT
CGTCAAATGTTATTTCTAT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4CQ69TF 559 0 0
GGAGCAACCGTTTGTTTATAGTCTCATTTGCTTGCTTACTCATCGCGGAGATGGCGTTTT
TGCTTAAAAACAACTCGATTTCATCTCACCTCCGATCTTACCCCCAGGAGAAGGATGGTG
GAGCTCTAGGTCAATCCCGTCGGGGATTCCATGTGGAGCTAGGAGCTCGCGAGAAAGACC
TTTTGGCTGAGAACGATGCATTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGTCAAT
TGAAAAGAATTGGAGATGTCATCACTGCTGTCGTTGTTGCTGGGTGCTGCTATGAGATCT
ATACGAGAGCAACGGTTAAAAAGGAAGCTTAGGCTGCTGCTTGAGGAAGCTCATGTGTCC
TCTCCTTTCGCTTTTATCATCAATCTTCCCTTTTCTAGCATATGTCTCTGGGAATTCATG
TTGCCTAATTGTTGCTCAGCGGTCTCTGAATAAGTGAATAATCGAAAAGTATTTGGTTGT
TTTCGAGAAATGGAATAAACCAGAAAGACTCGTTTGTTGAGCTCGTAAACTTGAATGATT
CGTCAAATGTTATTTCTAT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL8353Contig1 890 2 2 U
GGAGTTTCTATAAGAAAATCAGATCTGATCTGAAAGCTACTGTTTAACCAACCATGGACA
AAGGCATAGGTCTTTACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCGCCTGGTGAGACATGCTC
AGGGGATTCATAATGTTGCTGGAGAAAAATACCATAGTGCTTACTCTTCCGAGGACTATT
TTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGAACCATGTTT
TAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGCTTAGAACTA
TACAAACTGCTGTCGGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAGTGGAGCAGATGCAACAC
CGCTAATGGTGGCCGACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCTTAAACAGCC
CACCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACCATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGC
GAAGAAGCGTTACAGAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAA
GCGACAAGGATTGTGTCGACGAGATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTG
AGCTTCGTTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAACCTGGGGACTAATTCTACAGAGACTA
CAAACTATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGCCTAACCGATGACGA
GTAAGAGATATAAATAAGAAGGGAACACCTGATGGCTCCATTGGAATATTATTTGGCATT
TTCAGCTTGTATTGTATTTTGATAAACATAATTTAAATTTCAGTACTTATGTCAGCTACT
AAATGAATTTACTGATTATGGTTTTTATTTGGGGAAAATGAATAAATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GO38TF U 1
AF RR4GO38JQ C 112
BS 1 673 RR4GO38TF
BS 674 890 RR4GO38JQ

RD RR4GO38TF 673 0 0
GGAGTTTCTATAAGAAAATCAGATCTGATCTGAAAGCTACTGTTTAACCAACCATGGACA
AAGGCATAGGTCTTTACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCGCCTGGTGAGACATGCTC
AGGGGATTCATAATGTTGCTGGAGAAAAATACCATAGTGCTTACTCTTCCGAGGACTATT
TTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGAACCATGTTT
TAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGCTTAGAACTA
TACAAACTGCTGTCGGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAGTGGAGCAGATGCAACAC
CGCTAATGGTGGCCGACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCTTAAACAGCC
CACCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACCATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGC
GAAGAAGCGTTACAGAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAA
GCGACAAGGATTGTGTCGACGAGATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTG
AGCTTCGTTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAACCTGGGGACTAATTCTACAGAGACTA
CAAACTATTCTGG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4GO38JQ 779 0 0
GACATGCTCAGGGGAT*CATAATGT*GCTGGAGAAAAATACCATAGTGCTTACTCTTCCG
AGGACTATTTTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGA
ACCATGTTTTAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGC
TTAGAACTATACAAACTGCTGTCGGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAGTGGAGCAG
ATGCAACACCGCTAATGGTGGCCGACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCT
TAAACAGCCCCCCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACCATGGGTGATCATCCCT
GTGACAGGCGAAGAAGCGTTACAGAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAA
TTATTGAAAGCGACAAGGATTGTGTCGACGAGATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCA
AAAACTGTGAGCTTCGTTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAACCTGGGGACTAATTCTA
CAGAGACTACAAACTATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGCCTAAC
CGATGACGAGTAAGAGATATAAATAAGAAGGGAACACCTGATGGCTCCATTGGAATATTA
TTTGGCATTTTCAGCTTGTATTGTATTTTGATAAACATAATTTAAATTTCAGTACTTATG
TCAGCTACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTTTTATTTGGGGAAAATGAATAAATTTC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL8354Contig1 720 2 3 U
CGAAAGGAATCGTCGAATTGAGATTAAAGACAAAAAGCTATATATCCTGAGGCTGAGCCG
TATCGGTTAAAATACATACAAAACAAAACAAAAAAGGGGAAAAAGCTGACCTGAGCCCTG
CCATTTGCACTTACTACCCTTCTTCATAACCCATTTGCCCTTCTTCATAACCCATTTGAA
GCCAACACACACTTACTTACATAGCCCGGATCTGTCCTCCATAGCCATAGTACTTGAGAA
GTCCCTCATCTTGTCTCCAATTTTCCTTCACTCTCACTTCCACCCCAAGGAAGACTTTTT
TCTGAAGGAAATCTTCAATGTCAAGTCGAGCGGCCGTTGCTAGCGTTTTCAAAGCCTTCC
CTTCTTTTCCAATAAGGATGATCTTCTGAGAATTTTTATCCACGACTACTTCTACTTGAA
TAAAATCTTTTGCAGCTGGTCTAGTTTTGTAGCTCAGCACGTTGACCTGACATGCATAAG
GAACTTCATTTCGGTACTGCATAAATATCTTCTCTCTAACGATCTCAGCAACAAAGAATC
TCTCTGGGTGCTCACTCACAATATCCTTGGGATAATAAGGTGGGCCAAAGGGAAGTTTGG
ATAAGATCCACTCTTTCACATCCTCCACTCCATGTCCATACTTTGCACTAACAGGTATAA
CTTCATCAACATCTGTAAATTTTTCATACCGCTCCAGTTTCTTGGCAATCTCACCAGGTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G510JQ U 6
AF RR4FV55JQ U 1
BS 1 323 RR4FV55JQ
BS 324 324 RR4G510JQ
BS 325 720 RR4FV55JQ

RD RR4G510JQ 575 0 0
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GTTAAAATACATACAAAACAAAACAAAAAAGGGGAAAAAGCTGACCTGAGCCGTGCCATT
TGCACTTACTACCCTTCTTCATAACCCATTTGCCCTTCTTCATAACCCATTTGAAGCCAA
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TCATCTTGTCTCCAATTTTCCTTCACTCTCACTTCCACCTCAAGGAAGACTTTTTTCTGG
AGGAAATCTTCAATGTCAAGTCGAGCGGCCGTTGCTAGCGTTTTCAAAGCCTTCCCTTCT
TTTCCAATAAGGATGATCTTCTGAGAATTTTTATCCACGACTACTTCTACTTGAATAAAA
TCTTTTGCAGCTGGTCTAGTTTTGTAGCTCAGCACGTTGACCTGACATGCATAAGGAACT
TCATTTCGGTACTGCATAAATATCTTCTCTCTAACGATCTCAGCAACAAAGAATCTCTCT
GGGTGCTCACTCACAATATCCTTGGGATAATAAGG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4FV55JQ 720 0 0
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TATCGGTTAAAATACATACAAAACAAAACAAAAAAGGGGAAAAAGCTGACCTGAGCCCTG
CCATTTGCACTTACTACCCTTCTTCATAACCCATTTGCCCTTCTTCATAACCCATTTGAA
GCCAACACACACTTACTTACATAGCCCGGATCTGTCCTCCATAGCCATAGTACTTGAGAA
GTCCCTCATCTTGTCTCCAATTTTCCTTCACTCTCACTTCCACCCCAAGGAAGACTTTTT
TCTGAAGGAAATCTTCAATGTCAGGTCGAGCGGCCGTTGCTAGCGTTTTCAAAGCCTTCC
CTTCTTTTCCAATAAGGATGATCTTCTGAGAATTTTTATCCACGACTACTTCTACTTGAA
TAAAATCTTTTGCAGCTGGTCTAGTTTTGTAGCTCAGCACGTTGACCTGACATGCATAAG
GAACTTCATTTCGGTACTGCATAAATATCTTCTCTCTAACGATCTCAGCAACAAAGAATC
TCTCTGGGTGCTCACTCACAATATCCTTGGGATAATAAGGTGGGCCAAAGGGAAGTTTGG
ATAAGATCCACTCTTTCACATCCTCCACTCCATGTCCATACTTTGCACTAACAGGTATAA
CTTCATCAACATCTGTAAATTTTTCATACCGCTCCAGTTTCTTGGCAATCTCACCAGGTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL8355Contig1 785 2 5 U
GGATTGTGTGTGTGGTACCTAGACCTTATCTTCTCCATAGCAACTGCATCACCTCTGTCT
TGTCGTTCTCACTTCTTTGCTTGGATCTCTTGTTTTTGTGCCAATTCCAGTTCTTCCACA
AATCCTAATAAAGAAGAAGTTCCGAGTTGGTGAAATTTATTGTGTCAAAATCAACGGTTT
CGAGCAACATATCAGAACAACGGTTTAGAGGTTATCTGATTAGAAGATGGAGAACGGAGG
GTCAAGGTTTCCACCTTTACAGAATTGATGCGTATCAATAGCGAACGGTATACGGTGTTG
TTCTTCCTGTTTTCCAGATTCAGCGCCAGCTATATTTGTCTCTGCTCTTCTGCTATGCAA
TCGCCATGAAGTTTCTTCCTCTGTGTTTGGATAAGTTAGTCAATGGATACACTTCTTTAA
TTGTCGACGTCCTGAACTTTGCATTGGTTTCTCAAGTGGTATGCTGCTGTTTTGGACTTT
ATCTGGGAACACGATTTAACTGGCTCATCCAAATCGTGATGACTATGTTCTACCCGATAG
CATATCCCATTGGAAAGATATTGGATCGGGTACTGGGATGCAGTAAAGTTTTTTATAGTC
GTGCTCAATTCAAAGCCCTTGTATCAATCCATAAACTTGAGGCCGGTAAAGGAGGTGAAC
TCACGAATGATGAGACACAAATCATTGGTGGAGCACTGGATTTAACGATGAAGACTGCAC
AAGAGCAATGATACCAATCGAATCAACCTTTGCTTTAGATATCGATCAAACATTGATGGC
GACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4FW13TF U 15
AF RR4DJ18TF U 1
BS 1 152 RR4DJ18TF
BS 153 153 RR4FW13TF
BS 154 286 RR4DJ18TF
BS 287 293 RR4FW13TF
BS 294 785 RR4DJ18TF

RD RR4FW13TF 541 0 0
GG
ACCTAGACCTTATCTTCTCCATAGCAACTGCATCACCTCTGTCTTGTCGTTCTCACTTCT
TTGCTTGGATCTCTTGTTTTTGTGCCAATTCCAGTTCTTCCACAAATCCTAATAAAGAAG
AAGTTCCGAGTTGGTGAAATTTATTGTGTCAAAATCAACGGTTTCGAGCAACATATCAGA
ACAACGGTTTAGAGGTTATCTGATTAGAAGATGGAGAACGGAGGGTCAAGGTTTCCACCT
TTACAGAATTGATGCGTATCAATAGCGAACGGTATACGGTGTTGTTCTTCCTGTTTTCCA
GATTCAGCGCCAGCTATATTTGTCTCTGCTCTTCTGCTATGCAATCGCCATGAAGTTTCT
TCCTCTGTTTTTGGATAAGTTAGTCAATGGATACACTTCTTTAATTGTCGACGTCCTGAA
CTTTGCATTGGTTTCTCAAGTGGTATGCTGCTGTTTTGGACTTTATCTGGGAACACGATT
TAACTGGCTCATCCAAATCGTGATGACTATGTTCTACCCGATAGCATATCCCATTGGAA

QA 3 541 3 541
DS 

RD RR4DJ18TF 785 0 0
GGATTGTGTGTGTGGTACCTAGACCTTATCTTCTCCATAGCAACTGCATCACCTCTGTCT
TGTCGTTCTCACTTCTTTGCTTGGATCTCTTGTTTTTGTGCCAATTCCAGTTCTTCCACA
AATCCTAATAAAGAAGAAGTTCCGAGTTGGTGGAATTTATTGTGTCAAAATCAACGGTTT
CGAGCAACATATCAGAACAACGGTTTAGAGGTTATCTGATTAGAAGATGGAGAACGGAGG
GTCAAGGTTTCCACCTTTACAGAATTGATGCGTATCAATAGCGAAC*******GGTGTTG
TTCTTCCTGTTTTCCAGATTCAGCGCCAGCTATATTTGTCTCTGCTCTTCTGCTATGCAA
TCGCCATGAAGTTTCTTCCTCTGTGTTTGGATAAGTTAGTCAATGGATACACTTCTTTAA
TTGTCGACGTCCTGAACTTTGCATTGGTTTCTCAAGTGGTATGCTGCTGTTTTGGACTTT
ATCTGGGAACACGATTTAACTGGCTCATCCAAATCGTGATGACTATGTTCTACCCGATAG
CATATCCCATTGGAAAGATATTGGATCGGGTACTGGGATGCAGTAAAGTTTTTTATAGTC
GTGCTCAATTCAAAGCCCTTGTATCAATCCATAAACTTGAGGCCGGTAAAGGAGGTGAAC
TCACGAATGATGAGACACAAATCATTGGTGGAGCACTGGATTTAACGATGAAGACTGCAC
AAGAGCAATGATACCAATCGAATCAACCTTTGCTTTAGATATCGATCAAACATTGATGGC
GACGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL8356Contig1 559 2 1 U
GGAGTCCTCATTGGTATTATCGAAAGGAAGCAGCTTTAATTGGCTTCAAGACCCTACAGA
GAAACCCCTTTCAAAATAAGGTTAAAAATGCAATCTTTGAACTTCGAAATCATCAAACAG
ATTCAGAAAAAAACTAAACCCAGTAAACGAAAAGCACGAGTTTTGTGATTTGCGTTTCAT
CCAGAGACACTAACGATCCTAATTTGGAGGAACCCATTTAACCAGAAAGCGAAAACTGAA
TCAAATAAAAATAAAAAAAGTGATATCGCAAGCCCACAAGGTGTTCGATGATATTACCAG
AGCCAGCGCTTCAGGGACCGAGCCGGGGAAGAGAAGGAGCAGAAGATATGGATTTAGTTA
GGAGACGATATAACTTGGTTTCATTTGGTTATTTATGTCGTTGTTATTTTGATTTGGTCT
TCCCGGTTTAATCAACTGTCTGTATATATACGGATGCGTTGACTTTGGTTTCAAGTGAAG
AAAAGAAAAAAAACAGAAAATCAATTTTCATATTCTTGATTGCATTTTCTATTATGGTAT
CAATGTTTTATTTCTGCCG


BQ
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AF RR4AC60JQ C 1
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DS 

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TCAAATAAAAATAAAAAAAGTGATATCGCAAGCCCACAAGGTGTTCGATGATATTACCAG
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CAATGTTTTATTTCTGCCG

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
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AF RR4GK19TF U 1
AF RR4GK19JQ C 83
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TCA
TAAAGAAA

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ATGTGCCAAGGCTTTGATGTCTTCGTTAAGATCATTTCTCAGCTTGAACAAGACTAAAGA
AGATGAATGCAATAAAAGCTTCTCTCTTATTATTAGCTAATGGTTCTATACACTTTGCTT
CCTAAGTTTCTATCTATTTGTACAATGTCAATGGTTGCTCAATAAAGAAAAGACAATTCA
CAAAATTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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TTGCAGCGAGTAAAAGGGCATTTTTTTACTTCATTTTCCCCCTTTGATTACTTTTTTTTT
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TCAATGTTATAACAGACGTGTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G601TF U 1
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G

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QA 1 643 1 643
DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F818TF U 1
AF RR4F818JQ C 1
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QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DU06TF C 1
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BS 8 699 RR4DU06JQ

RD RR4DU06TF 699 0 0
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ACATGTCCGGTCTGCTGCGTCTTGTGTAAGAGCTGTTCC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4DU06JQ 692 0 0
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AGCCGTGAATGCACTGCGTTTGCTTACAGAAGTAGCCGAGTATAGCTGAAGACTGTTCTC
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GTAGACTGGTCCAGACCGGCCTGAGTTGTCTAGGACGAGGTGGGATGAGTAGAACATGTC
CGGTCTGCTGCGTCTTGTGTAAGAGCTGTTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL8361Contig1 684 2 2 U
CGAGGAAAACTAATTCCATTTAATTTCTTGAGAAATTTTCTTAGTCTAACTTAACATGAC
GTTTAAAGAGAAAAAAACAAACAAAAAGCCGATAGTTAATTTAATGACCAAGAACATATG
GAACTTGAAAAGTTCATTTTACCCCGAATTTGTTTCTTAGAAGTTAAAGATTCCAGGTCT
CATGAGGGGAGGTTGGAAGCCATTAGTCTGCAGCCAATTTTGATGAGAAGTAGGAGTAGA
ATTAAAACTCTGATTGTGATTATGAGGAGAGAATCCTGATGATGCTGCAGCATTTGCCAA
CACTTGGTCTGCGGTGGTCTGACCATCAAACCGGTGGTTCTCAACCACAGGAAAGAGCGA
GAATCCTCCTCCGCCGCCCCCAATGTTACTGCTTCCAGGAAATTGGTGAACTGAATTGGG
GATATGGTTAACCATTCCGGTTTGACCTAGTCCGAGTATCTCATTAGAGTGGAAGGAATC
TTGTTGGTTCATCTTGAGCCGCATATCTTGACCCTTTTGCTTCAAATTGACCGAGTTTCC
CAAACTCAAATCGAGGTTATGATCTTGTTGAATTGGATTCCCCGATGACTCGGCATTCAG
TTCGTCCTCGTATATGCTTGAATCAAAGTTCGTCACAGCGTCTTTGCCATTACATTTGAT
TGCAGCTTTATCATAAGCTCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH48JQ U 1
AF RR4CR44JQ U 71
BS 1 630 RR4CH48JQ
BS 631 684 RR4CR44JQ

RD RR4CH48JQ 630 0 0
CGAGGAAAACTAATTCCATTTAATTTCTTGAGAAATTTTCTTAGTCTAACTTAACATGAC
GTTTAAAGAGAAAAAAACAAACAAAAAGCCGATAGTTAATTTAATGACCAAGAACATATG
GAACTTGAAAAGTTCATTTTACCCCGAATTTGTTTCTTAGAAGTTAAAGATTCCAGGTCT
CATGAGGGGAGGTTGGAAGCCATTAGTCTGCAGCCAATTTTGATGAGAAGTAGGAGTAGA
ATTAAAACTCTGATTGTGATTATGAGGAGAGAATCCTGATGATGCTGCAGCATTTGCCAA
CACTTGGTCTGCGGTGGTCTGACCATCAAACCGGTGGTTCTCAACCACAGGAAAGAGCGA
GAATCCTCCTCCGCCGCCCCCAATGTTACTGCTTCCAGGAAATTGGTGAACTGAATTGGG
GATATGGTTAACCATTCCGGTTTGACCTAGTCCGAGTATCTCATTAGAGTGGAAGGAATC
TTGTTGGTTCATCTTGAGCCGCATATCTTGACCCTTTTGCTTCAAATTGACCGAGTTTCC
CAAACTCAAATCGAGGTTATGATCTTGTTGAATTGGATTCCCCGATGACTCGGCATTCAG
TTCGTCCTCGTATATGCTTGAATCAAAGTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR4CR44JQ 614 0 0
AAAAAAACAAACAAAAAGCCGATAGTTAATTTAATGACCAAGAACATATGGAACTTGAAA
AGTTCATTTTACCCCGAATTTGTTTCTTAGAAGTTAAAGATTCCAGGTCTCATGAGGGGA
GGTTGGAAGCCATTAGTCTGCAGCCAATTTTGATGAGAAGTAGGAGTAGAATTAAAACTC
TGATTGTGATTATGAGGAGAGAATCCTGATGATGCTGCAGCATTTGCCAACACTTGGTCT
GCGGTGGTCTGACCATCAAACCGGTGGTTCTCAACCACAGGAAAGAGCGAGAATCCTCCT
CCGCCGCCCCCAATGTTACTGCTTCCAGGAAATTGGTGAACTGAATTGGGGATATGGTTA
ACCATTCCGGTTTGACCTAGTCCGAGTATCTCATTAGAGTGGAAGGAATCTTGTTGGTTC
ATCTTGAGCCGCATATCTTGACCCTTTTGCTTCAAATTGACCGAGTTTCCCAAACTCAAA
TCGAGGTTATGATCTTGTTGAATTGGATTCCCCGATGACTCGGCATTCAGTTCGTCCTCG
TATATGCTTGAATCAAAGTTCGTCACAGCGTCTTTGCCATTACATTTGATTGCAGCTTTA
TCATAAGCTCTAGC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL8362Contig1 925 2 2 U
GGTGCTCTAATTCAGAAGAACCCCTTGAAGATGCAAAAACTGTTAACGTTCATGAGAATG
ACTTACCTAAGAATGGCGTTTCAAAAGATGATTTGCTCTGTTCAGCATGTAGGGACCTGC
TCGTGCGACCTGTGGTTCTCAACTGCGGACATGTGTATTGTGAAGGTTGTGTGGTAGATA
TGATGGATCAAGAAAGCGAAAAGATCATATGTAAAGAGTGCCATGTTTGTGACCCAAGAA
GATATCCCAAAGTTTGTTTGGCTCTTGAGCAGCTTTTGGAGGAAAGCTTTCCTGAAGAAT
ACAGTTCAAGGAGAAGTTTGATTCAGAAAAAGCTTACCCACAATAGCAGGAAAGGGCGGC
ACATCCTCCTCATCAGAAGAAAACAGCAACAACAGTCTTCCAAACACTACCTGTAATGTT
CACATCGGAGTTGGTTGTGATTCATGCGGAGTTTATCCAATCATAGGCGAGCGATACAGA
TGCAAAGACTGCAAGGAGAAAATGGGGTATGACCTTTGCAAAGCCTGTTACGAGTCTCCT
TCTAAAGTTCCGGGGAGATTCAACCAGCAACACACTCCTGACCACAGGTTTAAGCGTGCA
TCGTTTCGTCAGCTTCCGCTCAATCTCAATTTTGTCGGTATCCTTCTGGCACCGATGGTC
CGTGAGTGTGTGAATGCACAAGGACGTGATGAAAGCCAGGAAGGGCCTCATGATTCTAAT
GAGTCATCATCACCAAGCACAGAATGAAATAGCAGTCTTGAGTGTGCTGGAAACTTGTAG
GGAGAGACATGGTGTGTGCTTGTTGAAAATGGTTTGCGTTAGTATATATTTTATGGAAAG
AAAAAAGTTGTGGTTTCTAAAACATTTTAAATCAATTGTTAAATTATGACCATAAAAATA
AAACTAATCAGAATATTAGGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FM04TF U 1
AF RR4FM04JQ C 123
BS 1 682 RR4FM04TF
BS 683 925 RR4FM04JQ

RD RR4FM04TF 686 0 0
GGTGCTCTAATTCAGAAGAACCCCTTGAAGATGCAAAAACTGTTAACGTTCATGAGAATG
ACTTACCTAAGAATGGCGTTTCAAAAGATGATTTGCTCTGTTCAGCATGTAGGGACCTGC
TCGTGCGACCTGTGGTTCTCAACTGCGGACATGTGTATTGTGAAGGTTGTGTGGTAGATA
TGATGGATCAAGAAAGCGAAAAGATCATATGTAAAGAGTGCCATGTTTGTGACCCAAGAA
GATATCCCAAAGTTTGTTTGGCTCTTGAGCAGCTTTTGGAGGAAAGCTTTCCTGAAGAAT
ACAGTTCAAGGAGAAGTTTGATTCAGAAAAAGCTTACCCACAATAGCAGGAAAGGGCGGC
ACATCCTCCTCATCAGAAGAAAACAGCAACAACAGTCTTCCAAACACTACCTGTAATGTT
CACATCGGAGTTGGTTGTGATTCATGCGGAGTTTATCCAATCATAGGCGAGCGATACAGA
TGCAAAGACTGCAAGGAGAAAATGGGGTATGACCTTTGCAAAGCCTGTTACGAGTCTCCT
TCTAAAGTTCCGGGGAGATTCAACCAGCAACACACTCCTGACCACAGGTTTAAGCGTGCA
TCGTTTCGTCAGCTTCCGCTCAATCTCAATTTTGTCGGTATCCTTCTGGCACCGATGGTC
CGTGAGTGTGTGAATGCACAAG
ACGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4FM04JQ 803 0 0
GTGCGACCTGTGGTTCTCAACTGCGGACATGTGTATTGTGAAGGTTGTGTGGTAGATATG
ATGGATCAAGAAAGCGAAAAGATCATATGTAAAGAGTGCCATGTTTGTGACCCAAGAAGA
TATCCCAAAGTTTGTTTGGCTCTTGAGCAGCTTTTGGAGGAAAGCTTTCCTGAAGAATAC
AGTTCAAGGAGAAGTTTGATTCAGAAAAAGCTTACCCACAATAGCAGGAAAGGGCGGCAC
ATCCTCCTCATCAGAAGAAAACAGCAACAACAGTCTTCCAAACACTACCTGTAATGTTCA
CATCGGAGTTGGTTGTGATTCATGCGGAGTTTATCCAATCATAGGCGAGCGATACAGATG
CAAAGACTGCAAGGAGAAAATGGGGTATGACCTTTGCAAAGCCTGTTACGAGTCTCCTTC
TAAAGTTCCGGGGAGATTCAACCAGCAACACACTCCTGACCACAGGTTTAAGCGTGCATC
GTTTCGTCAGCTTCCGCTCAATCTCAATTTTGTCGGTATCCTTCTGGCACCGATGGTCCG
TGAGTGTGTGAATGCACAAGGACGTGATGAAAGCCAGGAAGGGCCTCATGATTCTAATGA
GTCATCATCACCAAGCACAGAATGAAATAGCAGTCTTGAGTGTGCTGGAAACTTGTAGGG
AGAGACATGGTGTGTGCTTGTTGAAAATGGTTTGCGTTAGTATATATTTTATGGAAAGAA
AAAAGTTGTGGTTTCTAAAACATTTTAAATCAATTGTTAAATTATGACCATAAAAATAAA
ACTAATCAGAATATTAGGTTTAC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL8363Contig1 906 2 4 U
GGGTAGTCACCAACAAATTTACACAGCTCTGAAGGGTATGGTTTGTCTTGGAGTAAGTTC
AAGCCGGGTCATTTGCTCAGTGGATCTGATGACGCTCAGATCTGCTTGTGGGGTATTAAC
GCCACTCCTAAGAACAAGGTCATTGATGCTCAGCAGATCTTTAAGGCTCATGAAGGGGTG
GTGGAAGATGTTGCGTGGCATATGAGTCATGAATACTTGTTTGGATCCGTTGGTGATGAT
CAGTTCCTTCTTATATGGGATCTGCGTTCTCCATCTGCTAGTAAACCAATACAGTCTGTG
GTTGCTCACTCCATGGAGGTTAACTGCTTAGCCTTCAATCCAATCAATGAGTGGGTTGTG
GCAACAGGGCCAACTGATAAGACTGTTAAATTATTCGATCTGCGGAAGCTAACCAGCGCT
CTTCACACGTTTGATAGCCATAAAGAGGAGGTTTTCCAAGTTGGTTGGAACCCGAAGAAC
GAGACTATCTTAGCCTCATGTTGCCTTGGTAGAAGGCTTATGGTTTGGGACCTTAGCAGA
ATCGACGAGGAACAGACAGCAGAGGATGCAGAGGACGGTCCACCAGAGCTGCTGTTCATC
CATGGTGGTCACACCAGCAAAATATCAGATTTCTCGTGGAACCCCTGTGAAGATTGGGTT
ATTTCCAGTGTAGCTGAGGACAACATACTCCAAATATGGCAAATGGCTGAGAACATTTAT
CATGACGAAGATGATGCTCCAGGGGAAGAACCAATAAAAAGTTCTTAGCTTTATTGTTAG
GTTCCTTATCTTATGTGACATTAATTTTCTTTTTACGCATCCTGCCTTTGATCTGTGTTA
ATCTATTCCAAGTATTTAGTGTATGTTATGTAAAACGATACATGAAATGAGTTTTCTTTT
CAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4BE11TF U 1
AF RR4GG55TF U 350
BS 1 780 RR4BE11TF
BS 781 781 RR4GG55TF
BS 782 809 RR4BE11TF
BS 810 906 RR4GG55TF

RD RR4BE11TF 809 0 0
GGGTAGTCACCAACAAATTTACACAGCTCTGAAGGGTATGGTTTGTCTTGGAGTAAGTTC
AAGCCGGGTCATTTGCTCAGTGGATCTGATGACGCTCAGATCTGCTTGTGGGGTATTAAC
GCCACTCCTAAGAACAAGGTCATTGATGCTCAGCAGATCTTTAAGGCTCATGAAGGGGTG
GTGGAAGATGTTGCGTGGCATATGAGTCATGAATACTTGTTTGGATCCGTTGGTGATGAT
CAGTTCCTTCTTATATGGGATCTGCGTTCTCCATCTGCTAGTAAACCAATACAGTCTGTG
GTTGCTCACTCCATGGAGGTTAACTGCTTAGCCTTCAATCCAATCAATGAGTGGGTTGTG
GCAACAGGGCCAACTGATAAGACTGTTAAATTATTCGATCTGCGGAAGCTAACCAGCGCT
CTTCACACGTTTGATAGCCATAAAGAGGAGGTTTTCCAAGTTGGTTGGAACCCGAAGAAC
GAGACTATCTTAGCCTCATGTTGCCTTGGTAGAAGGCTTATGGTTTGGGACCTTAGCAGA
ATCGACGAGGAACAGACAGCAGAGGATGCAGAGGACGGTCCACCAGAGCTGCTGTTCATC
CATGGTGGTCACACCAGCAAAATATCAGATTTCTCGTGGAACCCCTGTGAAGATTGGGTT
ATTTCCAGTGTAGCTGAGGACAACATACTCCAAATATGGCAAATGGCTGAGAACATTTAT
CATGACGAAGATGATGCTCCAGGGGAAGAACCAATAAAAAGTTCTTAGCTTTATTGTTAG
*TTCCTTATCTTATGTGACATTAATTTTC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR4GG55TF 557 0 0
G
GTGGGTTGTGGCAACAGGGTCAACTGATAAGACTGTTAAATTATTCGATCTGCGTAAGCT
AACCAGCGCTCTTCACACGTTTGATAGCCATAAAGAGGAGGTTTTCCAAGTTGGTTGGAA
CCCGAAGAACGAGACTATCTTAGCCTCATGTTGCCTTGGTAGAAGGCTTATGGTTTGGGA
CCTTAGCAGAATCGACGAGGAACAGACAGCAGAGGATGCAGAGGACGGTCCACCAGAGCT
GCTGTTCATCCATGGTGGTCACACCAGCAAAATATCAGATTTCTCGTGGAACCCCTGTGA
AGATTGGGTTATTTCCAGTGTAGCTGAGGACAACATACTCCAAATATGGCAAATGGCTGA
GAACATTTATCATGACGAAGATGATGCTCCAGGGGAAGAACCAATAAAAGGTTCTTAGCT
TTATTGTTAGGTTCCTTATCTTATGTGACATTAATTTTCTTTTTACGCATCCTGCCTTTG
ATCTGTGTTAATCTATTCCAAGTATTTAGTGTATGTTATGTAAAACGATACATGAAATGA
GTTTTCTTTTCAATCC

QA 2 557 2 557
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8365Contig1 940 2 2 U
GATCTCAATTAATGTAACATTTTCATCTTTCTCAAGGGTATATTCTATGACAAAAAGAGT
TTTTTTTTCATATCTCTTCCTCATAAATATATAGTGTATCCTAACACTATAATCTCTTAT
CATTACGTAGTGAATTATTTATTTTTGATGGTCATCCACTCTAATTTCCCATGATCGTAT
GTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTGCTAAAAATCATCATATGTCTTTCGAGCGTCAAAAC
AATCCGATTAAAAAGGTCTTTTTATATGGCCGATGTACATGTGATGCTAGTACTAGAAGA
CAAATGTGGATACGTCTAATTACCACTGTGAGTCTGCAACTAAAGCTCGCCACTTGTAAT
GCTAATAGAGCTTCCAATGTGCGTGTGACGCCCATACGCCTCCAGAGACCTGAATGTTTT
CACTCTCTTTTTTCGTTTCCGACAAAATATTCGATTAACCGTATGAGAATAGAAAAATAA
ATAATTAAAAGATGATTCCGATTTTTAAATGCTATAATTACTTCTTTTAAAAATATTAAT
TTTTATATTCAACCCGAATGCTATAATAACTTCTATGAAATCGTATTTTTGTTTGTTTTA
TGTACAAAAAGATTGTTATTCAAGTTCCAAATACTCAAAAGCTACTTAAAGCTTTTCATG
TAACTATGGTAAATTTGTATGCACGGTACAAGACTTTTAAATGGTGTCGAGTGCTAAACT
GCTACTTGTGAAGTATATATCTTCTTCATGTCGAGTTAGAAACTCTTAAAAAGAGAGAGT
TAGATACTCTAGTTTAGGCAATACCGAATCCACAAATACTGAATCATTTACCAAATTTTC
AGTCAACTCATTTTGACTCAAATGGCTCGGAGTTGATTTTATTATACAGTCTTCTACACA
ATGCTGTAAAAACCTAACTGAACTAGTCTCCAGTTTGATC


BQ
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AF RR4H487TF U 1
AF RR4H487JQB C 205
BS 1 763 RR4H487TF
BS 764 940 RR4H487JQB

RD RR4H487TF 763 0 0
GATCTCAATTAATGTAACATTTTCATCTTTCTCAAGGGTATATTCTATGACAAAAAGAGT
TTTTTTTTCATATCTCTTCCTCATAAATATATAGTGTATCCTAACACTATAATCTCTTAT
CATTACGTAGTGAATTATTTATTTTTGATGGTCATCCACTCTAATTTCCCATGATCGTAT
GTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTGCTAAAAATCATCATATGTCTTTCGAGCGTCAAAAC
AATCCGATTAAAAAGGTCTTTTTATATGGCCGATGTACATGTGATGCTAGTACTAGAAGA
CAAATGTGGATACGTCTAATTACCACTGTGAGTCTGCAACTAAAGCTCGCCACTTGTAAT
GCTAATAGAGCTTCCAATGTGCGTGTGACGCCCATACGCCTCCAGAGACCTGAATGTTTT
CACTCTCTTTTTTCGTTTCCGACAAAATATTCGATTAACCGTATGAGAATAGAAAAATAA
ATAATTAAAAGATGATTCCGATTTTTAAATGCTATAATTACTTCTTTTAAAAATATTAAT
TTTTATATTCAACCCGAATGCTATAATAACTTCTATGAAATCGTATTTTTGTTTGTTTTA
TGTACAAAAAGATTGTTATTCAAGTTCCAAATACTCAAAAGCTACTTAAAGCTTTTCATG
TAACTATGGTAAATTTGTATGCACGGTACAAGACTTTTAAATGGTGTCGAGTGCTAAACT
GCTACTTGTGAAGTATATATCTTCTTCATGTCGAGTTAGAAAC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4H487JQB 736 0 0
GCTAAAAATCATCATATGTCTTTCGAGCGTCAAAACAATCCGATTAAAAAGGTCTTTTTA
TATGGCCGATGTACATGTGATGCTAGTACTAGAAGACAAATGTGGATACGTCTAATTACC
ACTGTGAGTCTGCAACTAAAGCTCGCCACTTGTAATGCTAATAGAGCTTCCAATGTGCGT
GTGACGCCCATACGCCTCCAGAGACCTGAATGTTTTCACTCTCTTTTTTCGTTTCCGACA
AAATATTCGATTAACCGTATGAGAATAGAAAAATAAATAATTAAAAGATGATTCCGATTT
TTAAATGCTATAATTACTTCTTTTAAAAATATTAATTTTTATATTCAACCCGAATGCTAT
AATAACTTCTATGAAATCGTATTTTTGTTTGTTTTATGTACAAAAAGATTGTTATTCAAG
TTCCAAATACTCAAAAGCTACTTAAAGCTTTTCATGTAACTATGGTAAATTTGTATGCAC
GGTACAAGACTTTTAAATGGTGTCGAGTGCTAAACTGCTACTTGTGAAGTATATATCTTC
TTCATGTCGAGTTAGAAACTCTTAAAAAGAGAGAGTTAGATACTCTAGTTTAGGCAATAC
CGAATCCACAAATACTGAATCATTTACCAAATTTTCAGTCAACTCATTTTGACTCAAATG
GCTCGGAGTTGATTTTATTATACAGTCTTCTACACAATGCTGTAAAAACCTAACTGAACT
AGTCTCCAGTTTGATC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL8366Contig1 737 2 3 U
GGAAACATTCGGCTGAAGCAATGTCGTCTTTTGCGCTAACGTTACACATTCCTTCGGTGG
TGTCGGTGTGGAACACTAAACTACTGGGGCGGAGTGTCAGCGACTCCTGCCGGAATTGGT
CGGGACTTCCTAAATCGAGGAGCAGACGAGGGTGTGGTTTATGTTGTAAGGCGGAGCTGT
CGGCGCTAGCTCCTGCCGTCTCTGCTGGTTATGGTGTTCTTCTTCTAGGAGGCGGTCTCT
TCGCCTATAGCAAATCTGGAAGCAAGGGTTCTCTCTTTGGGGGTTTGACTGGCTCTGTCC
TTATGGCTTCTGCCTACTTCCTTACCAAGTCTCCTGAGACAAGAGTCCTCGGCGATACCA
TAGGACTTGGCTCTGCCTTCCTCTTCTCTTCTGTCTTTGGGTTTCGTTTGGCGTCCTCCC
GGAAACCGGTCCCATCAGGCCCGCTACTACTTCTCTCTATCGCCATGTTGTCCTTCTTTG
TAATGGCGTATATGCACGACAGTTTACCTGTGGCTGTACCAGTACCAGTACCAGATGCGT
TACCTCTACCTTAGCCTTGATGAGAGAGCATGGGCTTTTAACCAAGTAGGAAAGTTCTCA
AATGTTTGAATTCAAAGAACTGTTTTGCTTTTGCCCACACACCCAATAAGTAGCGCAAAA
GCTTTGTGAGAATGGATAATGTTTGTAGCTTTTTGAACTTGAATGATCTATGCTGCTGAA
TAAGAGAATGTTGAATT


BQ
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AF RR4BL42JQ C 1
AF RR4BL42TF U 168
BS 1 167 RR4BL42JQ
BS 168 730 RR4BL42TF
BS 731 737 RR4BL42JQ

RD RR4BL42JQ 737 0 0
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TAAGAGAATGTTGAATT

QA 1 737 1 737
DS 

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TTGGCGTCCTCCCGGAAACCGGTCCCATCAGGCCCGCTACTACTTCTCTCTATCGCCATG
TTGTCCTTCTTTGTAATGGCGTATATGCACGACAGTTTACCTGTGGCTGTACCAGTACCA
GTACCAGATGCGTTACCTCTACCTTAGCCTTGATGAGAGAGCATGGGCTTTTAACCAAGT
AGGAAAGTTCTCAAATGTTTGAATTCAAAGAACTGTTTTGCTTTTGCCCACACACCCAAT
AAGTAGCGCAAAAGCTTTGTGAGAATGGATAATGTTTGTAGCTTTTTGAACTTGAATGAT
CTATGCTGCTGAATAAGAGAATG

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

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AGTTGTTGATGCCAAATTTATCGTGGACCGTGAAACTGGTAGATCGAGGGGTTTTGCTTT
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TCATGGTCGAAGAATTAGGGTGAACTACGCTACTGAAAGAGGAAGTGGGTTTGGAGGAAG
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TCTGAGATTTGAGGCTCATAAATTAAGAGTTGTAATAAACTTAATAACAGACTACTCCTA
TTCTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO78TF U 1
AF RR4EO78JQ C 274
BS 1 623 RR4EO78TF
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RD RR4EO78TF 782 0 0
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AGTTGTTGATGCCAAATTTATCGTGGACCGTGAAACTGGTAGATCGAGGGGTTTTGCTTT
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TCATGGTCGAAGAATTAGGGTGAACTACGCTACTGAAAGAGGAAGTGGGTTTGGAGGAAG
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TG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR4EO78JQ 754 0 0
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AATAAACTTAATAACAGACTACTCCTATTCTATT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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TCCAAATGCATTTTCTATTTGATCC


BQ
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AF RR4D647TF U 1
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QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BP12TF U 1
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AAAAAA

QA 1 726 1 726
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RD RR4BP12JQ 616 0 0
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QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DL35TF U 1
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BS 768 822 RR4DL35JQ

RD RR4DL35TF 767 0 0
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TGAAGATAACTACAGAGGCTCGCGAACTAGCTGACAACATGGGAATCAAGATCTTCTGCG
CTGATATAATCTATCATCTGTTCGATCAGTTTAAAGGTTATGTCAAGGATGTCAGAGATG
AAGAAAGGAAAGAAACAGCATCTGAAGTAGTGTTTCCATGTGTACTTAAGATTTTGCCAG
ACCATGTCTTCAAAAGAGGAGACCCAATCATCCTTGGAGTCGAAGTCATCGATGGTATAC
TCAAGGTTGGAACTCCCATGTGCTTTCTAAAGGAGATTGAGAAGGCGAGAGTGTTTGTTG
ATCTTGGTCGCGTTGCATCTATTCATAAAGACAAGAAGCCACTTGACGACGCCAAGAAAG
GCCAGCAGGTTGCTATCAAGATCATTGCCTCTAACCCTGGAGAAGAGAAAACGTTTGGAG
AGGACTTTGGTATAGAAGACGAGCTTGTCAGTCATATTTCTAGGCGATCCATCGACATAC
TCAAAACACTCTACAGGAATGAGTTGAAGGACGAGTTTAAGCTTGTTAAGAAACTTAAAA
CGCTGTTCAAGATACAATAGGTTCTTCTTGCCCTCTGATCCATTTTGATGCTAAGCATAG
AGGTTACAGTGAAGATTTGTGGGAGATTTGAGAGGGACATGTTCG*TTTCCTTTGTTTTG
AACTCTTGTTTCTTTTCTGTTTTGATAT*ATAGACCTTTTTTTTCTA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4DL35JQ 755 0 0
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AATCTATCATCTGTTCGATCAGTTTAAAGGTTATGTCAAGGATGTCAGAGATGAAGAAAG
GAAAGAAACAGCATCTGAAGTAGTGTTTCCATGTGTACTTAAGATTTTGCCAGACCATGT
CTTCAAAAGAGGAGACCCAATCATCCTTGGAGTCGAAGTCATCGATGGTATACTCAAGGT
TGGAACTCCCATGTGCTTTTTAAAGGAGATTGAGAAGGCGAGAGTGTTTGTTGATCTTGG
TCGCGTTGCATCTATTCATAAAGACAAGAAGCCACTTGACGACGCCAAGAAAGGCCAGCA
GGTTGCTATCAAGATCATTGCCTCTAACCCTGGAGAAGAGAAAACGTTTGGAGAGGACTT
TGGTATAGAAGACGAGCTTGTCAGTCATATTTCTAGGCGATCCATCGACATACTCAAAAC
ACTCTACAGGAATGAGTTGAAGGACGAGTTTAAGCTTGTTAAGAAACTTAAAACGCTGTT
CAAGATACAATAGGTTCTTCTTGCCCTCTGATCCATTTTGATGCTAAGCATAGAGGTTAC
AGTGAAGATTTGTGGGAGATTTGAGAGGGACATGTTCGGTTTCCTTTGTTTTGAACTCTT
GTTTCTTTTCTGTTTTGATATTATAGACCTTTTTTTTCTAAATGTCCCTAGACATTCTAT
GCAATCAAATAACTATAATTGTGTTTTATGCAGTT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL8371Contig1 827 2 4 U
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CGCCGTGACTTTCATCTCAGTCATCTCCATCGTCCGATCATGCTCGCCTGCCGATCAGAC
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GTCCGAAAACACAGACTGTTTCAAAGGATGGTACGGCATTAGCTGCGATCCGGACACGGG
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TTCCGGTTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCGAAATGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGT
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TGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTTAATAAACAATCGATTA
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GTCCAATTTGTTTCCTGGTGTATGGAATATGGTAGCACATGTTATAG


BQ
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AF RR4F161TF U 1
AF RR4F161JQ C 165
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GTCCGAAAACACAGACTGTTTCAAAGGATGGTACGGCATTAGCTGCGATCCGGACACGGG
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TTCCGGTTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCGAAATGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGT
TTTCGGATCCGCGACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAATAATCTGGCGGGTCG
GATCCCTGACTCGCTATCTTCAGCTAAGTTCGTGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAA
GCTTTGTGGGCCTATTCCAACCGGTTCTCCTTTTGATCACCTTGAAGCGTCGTCGTTTAG
TGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTTAATAAACAATCGATTA
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GGTTTAACTGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4F161JQ 663 0 0
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GCGATCCGGACACGGGTCGGGTCACTGATATTTCTCTCCGTGGCGAATCAGAAGACGCTA
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GCTTAACCTCGCTCAATTCCGGTTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCGAAATGCGTTGGAAG
GAACCATACCCGACGTTTTCGGATCCGCGACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACA
ATAATCTGGCGGGTCGGATCCCTGACTCGCTATCTTCAGCTAAGTTCGTGGGCCATCTCG
ATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCCTATTCCAACCGGTTCTCCTTTTGATCACCTTG
AAGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTT
AATAAACAATCGATTATGGTTCCGGTTCTGCTGAACCGGGGGTTTATCAAGTTCCTTGTT
GCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTGTTTATTTATTTACCTTTTCAAATTATAAGTGCCT
GCCAATTGCTACAATGGTCCAATTTGTTTCCTGGTGTATGGAATATGGTAGCACATGTTA
TAG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTGATTCTGACTTGGTTGCTAAATCATTACAAGTCAGTCCTTACATGGATATGCTTGGGA
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GGGTTTCTGATCCCGCGGTCTTCTTCTGGTTGATGCCTCATAAGGTCGCGATATGGATCT
ATCGGCATGCACTTAAACTCTGGTGGAAGAATGTACCTTTCATTCCGACACCACGTGGGA
TTTACACATGGAAGGCGTCGACTCTGGTTCTAAATTCAACGTCTCCACCTTCCTCTCGCG
CCCGAAGCACAATGCCACGTTGAGTTTCATTCGTTTAGAATCAGACGGAAACGTTAGAGT
TTGGAGTTATAGTTGCGTGGCGAGATGCTAATTGGCCTTGGTCATGATCATTACACACAC
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GGATTGGTGGACTTGTTTAGGCTTTGGCTTAGTAACAAAAATGAAAGGTATTTGATGATA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG07TF U 1
AF RR4FG18TF U 1
BS 1 687 RR4FG07TF
BS 688 713 RR4FG18TF

RD RR4FG07TF 687 0 0
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CTGATTCTGACTTGGTTGCTAAATCATTACAAGTCAGTCCTTACATGGATATGCTTGGGA
ATTGGAAGATCAGAGCAAATGAACCTGGAGATGAGTTATCTGTCTCCATTGAATCACAGC
ATCCTCATCATGGTAACTACTTCTCTGCGACACTGAAGGCGAAAAGAATAGACCAAACAC
GGGTTTCTGATCCCGCGGTCTTCTTCTGGTTGATGCCTCATAAGGTCGCGATATGGATCT
ATCGGCATGCACTTAAACTCTGGTGGAAGAATGTACCTTTCATTCCGACACCACGTGGGA
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CCCGAAGCACAATGCCACGTTGAGTTTCATTCGTTTAGAATCAGACGGAAACGTTAGAGT
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GGATTGGTGGACTTGTTTAGGCTTTGGCTTAGTAACAAAAATGAAAGGTATTTGATGATA
AGCCTACGATGTAGCTCGACTTATTGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4FG18TF 713 0 0
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CTGATTCTGACTTGGTTGCTAAATCATTACAAGTCAGTCCTTACATGGATATGCTTGGGA
ATTGGAAGATCAGAGCAAATGAACCTGGAGATGAGTTATCTGTCTCCATTGAATCACAGC
ATCCTCATCATGGTAACTACTTCTCTGCGACACTGAAGGCGAAAAGAATAGACCAAACAC
GGGTTTCTGATCCCGCGGTCTTCTTCTGGTTGATGCCTCATAAGGTCGCGATATGGATCT
ATCGGCATGCACTTAAACTCTGGTGGAAGAATGTACCTTTCATTCCGACACCACGTGGGA
TTTACACATGGAAGGCGTCGACTCTGGTTCTAAATTCAACGTCTCCACCTTCCTCTCGCG
CCCGAAGCACAATGCCACGTTGAGTTTCATTCGTTTAGAATCAGACGGAAACGTTAGAGT
TTGGAGTTATAGTTGCGTGGCGAGATGCTAATTGGCCTTGGTCATGATCATTACACACAC
ACTTGGGATTATCAGGTTGTCAGAGTTTGGACTTTACAATCATTCATTCTTCGGATGGTA
GGATTGGTGGACTTGTTTAGGCTTTGGCTTAGTAACAAAAATGAAAGGTATTTGATGATA
AGCCTACGATGTAGCTCGACTTATTGCAAGTTTAGAGAACAAACCTGAATTTT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL8374Contig1 738 2 1 U
GGGACCCGGAGATTGCTTTGGATTCTCTCGCTATATGCATGTCAATTTCTGCAGTCTCGT
TCATGGTTTCCGTTGGATTCAACGCAGCTGCAAGTGTGAGAGTAAGCAATGAATTAGGAG
CTGGAAACCCAAGGGCTGCTGCCTTCTCCACAGTAGTGACAACAAGTGTATCATTCTTAC
TAGCGGTTTTCGAAGCCATCGTGGTCATGTCTTGGCGTAATGTCCTCGGCTACATGTTTA
CTGATAGTCCTATCGTAGCCGAGGCCGTTGCGGATTTATCCCCCTTTTTAGCCATCACTA
TTGTCCTCAATGGAATCCAGCCTGTTTTGTCAGGTGTGGCTGCTGGATGTGGCTGGCAGG
CATTTGTGGCGTACGTTAACATTGGATGTTACTACGTGGTGGGGATTCCGATCGGTTTCG
TACTTGGTTTCACCTATGATATGGGAGCAAAGGGTATATGGACGGGGATGATTGGTGGAA
CATTAGTGCAAACCATAATCTTAGTGGTTGTTACCTTGAGAACTGATTGGGATAAAGAGG
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TCACTAATTTTTCAATCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AA44JQ C 1
AF RR4AA44TF U 1
BS 1 738 RR4AA44TF

RD RR4AA44JQ 738 0 0
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TAGCGGTTTTCGAAGCCATCGTGGTCATGTCTTGGCGTAATGTCCTCGGCTACATGTTTA
CTGATAGTCCTATCGTAGCCGAGGCCGTTGCGGATTTATCCCCCTTTTTAGCCATCACTA
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TACTTGGTTTCACCTATGATATGGGAGCAAAGGGTATATGGACGGGGATGATTGGTGGAA
CATTAGTGCAAACCATAATCTTAGTGGTTGTTACCTTGAGAACTGATTGGGATAAAGAGG
TGGAGAAAGCTTCGAGCCGATTGGACCAGTGGGAAGAGAGCCGTGAACGGCTTTTGAAGC
AATAGAAAGAAGCAACAAGAATTTTCGTGTAAAAGGTTTTGGGAATTTGAGGTCAAGCTG
AAATCAATTTTTTTT*GTTTCCCAAAATCTGTGACCGAGTATCACATTCCAATTGATAAA
TCACTAATTTTTCAATCG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4AA44TF 738 0 0
GGGACCCGGAGATTGCTTTGGATTCTCTCGCTATATGCATGTCAATTTCTGCAGTCTCGT
TCATGGTTTCCGTTGGATTCAACGCAGCTGCAAGTGTGAGAGTAAGCAATGAATTAGGAG
CTGGAAACCCAAGGGCTGCTGCCTTCTCCACAGTAGTGACAACAAGTGTATCATTCTTAC
TAGCGGTTTTCGAAGCCATCGTGGTCATGTCTTGGCGTAATGTCCTCGGCTACATGTTTA
CTGATAGTCCTATCGTAGCCGAGGCCGTTGCGGATTTATCCCCCTTTTTAGCCATCACTA
TTGTCCTCAATGGAATCCAGCCTGTTTTGTCAGGTGTGGCTGCTGGATGTGGCTGGCAGG
CATTTGTGGCGTACGTTAACATTGGATGTTACTACGTGGTGGGGATTCCGATCGGTTTCG
TACTTGGTTTCACCTATGATATGGGAGCAAAGGGTATATGGACGGGGATGATTGGTGGAA
CATTAGTGCAAACCATAATCTTAGTGGTTGTTACCTTGAGAACTGATTGGGATAAAGAGG
TGGAGAAAGCTTCGAGCCGATTGGACCAGTGGGAAGAGAGCCGTGAACGGCTTCTGAAGC
AATAGAAAGAAGCAACAAGAATTTTCGTGTAAAAGGTTTTGGGAATTTGAGGTCAAGCTG
AAATCAATTTTTTTTTGTTTCCCAAAATCTGTGACCGAGTATCACATTCCAATTGATAAA
TCACTAATTTTTCAATCG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL8375Contig1 342 2 2 U
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AGAATGGCTGATGACAAATGGACCGATGAAGAAGTTAGGCATTTCTTTGCTCTGTATGCT
GATGAGAAAAAGAAAGGGAACAGACCAAGGAGTGGCATAAATCTAGCTGGAAGAGAGTTC
ATCGTAAATAAGTTTGAAGAGAAATTTGGTAAGAGATGGATATGGGACAGGTTTAAGAAC
AAGGTTGATATTAGTAGAAAAGCATATGTCAAGTTCAAGAAGCTTACCCACAACAGAACC
GACTTGTATATGATTAATCTTAAAACATTTGACTTTTGTTAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H520JQB C 1
AF RR4H520TF U 1
BS 1 4 RR4H520JQB
BS 5 342 RR4H520TF

RD RR4H520JQB 342 0 0
GCTTTCTGATTTTGATTCGGGCACAGGTTTCAACATAAATCACAACTATACAAGGCAAGA
AGAATGGCTGATGACAAATGGACCGATGAAGAAGTTAGGCATTTCTTTGCTCTGTATGCT
GATGAGAAAAAGAAAGGGAACAGACCAAGGAGTGGCATAAATCTAGCTGGAAGAGAGTTC
ATCGTAAATAAGTTTGAAGAGAAATTTGGTAAGAGATGGATATGGGACAGGTTTAAGAAC
AAGGTTGATATTAGTAGAAAAGCATATGTCAAGTTCAAGAAGCTTACCCACAACAGAACC
GACTTGTATATGATTAATCTTAAAACATTTGACTTTTGTTAC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR4H520TF 342 0 0
GCTC
TCTGATTCTGATTCGGGCACAGGTTTCAACATAAATCACAACTATACAAGGCAAGAAGAA
TGGCTGATGACAAATGGACCGATGAAGAAGTTAGGCATTTCTTTGCTCTGTATGCTGATG
AGAAAAAGAAAGGGAACAGACCAAGGAGTGGCATAAATCTAGCTGGAAGAGAGTTCATCG
TAAATAAGTTTGAAGAGAAATTTGGTAAGAGATGGATATGGGACAGGTTTAAGAACAAGG
TTGATATTAGTAGAAAAGCATATGTCAAGTTCAAGAAGCTTACCCACAACAGAACCGACT
TGTATATGATTAATCTTAAAACATTTGACTTTTGTTAC

QA 5 342 5 342
DS 



AS 1 2

CO CL8376Contig1 566 2 1 U
TTTTTTTTGCTTTTGTCACAGTGTCGCCAATTTTACGCGAAGAAAAAGAGCAGAGCCAAT
TGACGCGACATTGCACGAATCAACATAACTTTCATCGATTCAAGGGGAAAGAAAGGGATT
TATCAGAGTGAGAGAGATGAGTGATGAATCGGGGAAGGTGAGTAAAGAAGAGGAAGAAGA
ATATGTTCTGATGGATCTTGACGATGTTTCGAGGCACATTGACATCCCTTCAGACGCTCC
TTTTACTCTCTCAGGTTTGGATACTTTAAATCCCATATTGACCATTGATGGGAAAATCAA
ACTGGTTGGAGAATACTTGGAGACATTTGGTACATGTCTTGCTTTCTCTGATAAGGAAGT
TCCGGCAGCTGAAAACCAGACACCACACAAGACCGTTGAACCTGTTGCCAAGCTCCACAA
GATTCTTAAGTTTAGGCTTGCATTAGATACTGAGGATGGAGAAACAAGAGCAACCACCTT
GTAAAAATAACAACATCTTTCTAGTTTATATAACTTTATGCTAAGTGAAACAAGGCCACG
GGGAAAAGAGTATCTCTGAGTTTTCT


BQ
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AF RR4DP66JQ C 1
AF RR4DP66TF U 1
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QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4DP66TF 566 0 0
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TGACGCGACATTGCACGAATCAACATAACTTTCATCGATTCAAGGGGAAAGAAAGGGATT
TATCAGAGTGAGAGAGATGAGTGATGAATCGGGGAAGGTGAGTAAAGAAGAGGAAGAAGA
ATATGTTCTGATGGATCTTGACGATGTTTCGAGGCACATTGACATCCCTTCAGACGCTCC
TTTTACTCTCTCAGGTTTGGATACTTTAAATCCCATATTGACCATTGATGGGAAAATCAA
ACTGGTTGGAGAATACTTGGAGACATTTGGTACATGTCTTGCTTTCTCTGATAAGGAAGT
TCCGGCAGCTGAAAACCAGACACCACACAAGACCGTTGAACCTGTTGCCAAGCTCCACAA
GATTCTTAAGTTTAGGCTTGCATTAGATACTGAGGATGGAGAAACAAGAGCAACCACCTT
GTAAAAATAACAACATCTTTCTAGTTTATATAACTTTATGCTAAGTGAAACAAGGCCACG
GGGAAAAGAGTATCTCTGAGTTTTCT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL8377Contig1 923 2 2 U
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ATAAGGTCTGTGACGCTGTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTGATGTCAACCTCGTCCACCG
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GGCTAGACGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCCTGGGCTGCTTTCAAAATCAGAAAGG
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TGGTGCGTTTGGATTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGAATCCTGTGATGTAAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GI62TF U 1
AF RR4GI62JQ C 91
BS 1 657 RR4GI62TF
BS 658 923 RR4GI62JQ

RD RR4GI62TF 657 0 0
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QA 1 657 1 657
DS 

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TTTCTCTGACTGAGAATCCTGTGATGTAATGAATATGCGATGTATTTGCAAGC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL8378Contig1 638 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DH02TF U 1
AF RR4DH02JQ C 42
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GTGAGCTTATCCGAAGGGGTTTTGTTCCAAGTGTGTTAGCATTCACTGATGTGATTGGTG
GGTTTTCCAAGAAGGGGGATTTTCAGGAAGCGTTTCTTCTGTGGCATTACATGGCTGATC
TTAGAGTGCAACCTGACGTTGTGACGTGCAGTGCGTTGCTACATGGGTATTGCAGAGCGC
AGAGGATGGGTGATGCTATGGTTTTGTTTAATAAGTTGCTTGATGCTGGGCTAAAGCCTG
ATGTGGTTTTGTATAATACTCTTATACATGGATATTGCAGTGTAGGAGATGTTGAGAAAG
CATGCGAGTTGATTGGTGTGATGGTTCAAAGGGGAATGGTTCCAAATGAGAGTACCTTCG
TAGCACTTGTTGTGGGGCTCGAGGGAAAGACTGATGTGGAGGACTCAGAAAAGCATGCAT
CCATGTTGCTTGAAGAAATTTTTGTAGCCAATAGTGACATGTAACACTGTTTTTTTTTTT
GGTGACTAAAGCTATTTTC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4DH02JQ 597 0 0
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GAAGCAAATGGTATTGTCAGTGAGCTTATCCGAAGGGGTTTTGTTCCAAGTGTGTTAGCA
TTCACTGATGTGATTGGTGGGTTTTCCAAGAAGGGGGATTTTCAGGAAGCGTTTTTTTTG
TGGCATTACATGGCTGATTTTAGAGTGCAACCTGACGTTGTGACGTGCAGTGCGTTGCTA
CATGGGTATTGCAGAGCGCAGAGGATGGGTGATGCTATGGTTTTGTTTAATAAGTTGCTT
GATGCTGGGCTAAAGCCTGATGTGGTTTTGTATAATACTTTTATACATGGATATTGCAGT
GTAGGAGATGTTGAGAAAGCATGCGAGTTGATTGGTGTGATGGTTCAAAGGGGAATGGTT
CCAAATGAGAGTACCTTCGTAGCACTTGTTGTGGGGCTCGAGGGAAAGACTGATGTGGAG
GACTCAGAAAAGCATGCATCCATGTTGCTTGAAGAAATTTTTGTAGCCAATAGTGACATG
TAACACTGTTTTTTTTTTTGGTGACTAAAGCTATTTTCAGCGATAATTGAAACTACT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL8379Contig1 778 2 3 U
GGAATTCAATCAATTCATCAGTAGTTGAGGAGAAGCGCCGGAGAAGATGAAGCTGAAGCA
ATTAGAAGGCTTGTTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAACCCTAAAGTAGACTTGGAGCA
GTACCCAACAGGTCCTCACATTGCTTCTCGCATGCTCTTCACTGCAGAGAATTCATATGG
AGACATAACTGACAAAGTCGTTGCTGATTTTGGTTGTGGCTGCGGTACTCTAAGCGCTGC
TGCTGCTCTTCTAGATGCAGCTTGTGTGATTGGATTCGATATCGACCCACAATCTCTTGA
AACAGCAACACTTAATGCAGAGGAGCTTGAGGTGGAGATAGATTTGTTCAGTGTGACATT
ACAAAGCTAGAGTTAAAAGGCCGGGTTGTAGATACTGTTGTGATGAATCCTCCCTTTGGT
ACGCGGAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTTCTTTCTGCGGCTATGAAGGTCGCCTCTCGA
GCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACTAGAGAACACATTAAAAGGGCTGCGTTGTGT
GATTTTAATGCGAAAACTGCTGAAGTTATATGTGAGCTCCGGTATGACTTGCCGAAACTG
TACAAGTTCCATAAGCGAAAAGAAGTTGATATTGCTGTTGATCTCTGGCGCTTTGAGCCT
AAACAGAAGTAGACCGCCATGATTATGTAATGTTTCAGCTTTAAGTTAAAAAAAAAAAAC
TGATTGTATGTTGAAGGATTTTATGATATGAACTCACAACTAAGAGAACTTAAAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV39TF U 21
AF RR4DV39JQ C 1
BS 1 20 RR4DV39JQ
BS 21 707 RR4DV39TF
BS 708 778 RR4DV39JQ

RD RR4DV39TF 687 0 0
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ATCTTCAACAGTTCTCTAACCCTAAAGTAGACTTGGAGCAGTACCCAACAGGTCCTCACA
TTGCTTCTCGCATGCTCTTCACTGCAGAGAATTCATATGGAGACATAACTGACAAAGTCG
TTGCTGATTTTGGTTGTGGCTGCGGTACTCTAAGCGCTGCTGCTGCTCTTCTAGATGCAG
CTTGTGTGATTGGATTCGATATCGACCCACAATCTCTTGAAACAGCAACACTTAATGCAG
AGGAGCTTGAGGTGGAGATAGATTTGTTCAGTGTGACATTACAAAGCTAGAGTTAAAAGG
CCGGGTTGTAGATACTGTTGTGATGAATCCTCCCTTTGGTACGCGGAAGAAAGGAGCTGA
CATGGAGTTTCTTTCTGCGGCTATGAAGGTCGCCTCTCGAGCTGTTTACTCCTTGCATAA
GACATCTACTAGAGAACACATTAAAAGGGCTGCGTTGTGTGATTTTAATGCGAAAACTGC
TGAAGTTATATGTGAGCTCCGGTATGACTTGCCGAAACTGTACAAGTTCCATAAGCGAAA
AGAAGTTGATATTGCTGTTGATCTCTGGCGCTTTGAGCCTAAACAGAAGTAGACCGCCAT
GATTATGTAATGTTTCAGCTTTAAGTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4DV39JQ 778 0 0
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ATTAGAAGGCTTGTTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAACCCTAAAGTAGACTTGGAGCA
GTACCCAACAGGTCCTCACATTGCTTCTCGCATGCTCTTCACTGCAGAGAATTCATATGG
AGACATAACTGACAAAGTCGTTGCTGATTTTGGTTGTGGCTGCGGTACTCTAAGCGCTGC
TGCTGCTCTTCTAGATGCAGCTTGTGTGATTGGATTCGATATCGACCCACAATCTCTTGA
AACAGCAACACTTAATGCAGAGGAGCTTGAGGTGGAGATAGATTTGTTCAGTGTGACATT
ACAAAGCTAGAGTTAAAAGGCCGGGTTGTAGATACTGTTGTGATGAATCCTCCCTTTGGT
ACGCGGAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTTCTTTCTGCGGCTATGAAGGTCGCCTCTCGA
GCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACTAGAGAACACATTAAAAGGGCTGCGTTGTGT
GATTTTAATGCGAAAACTGCTGAAGTTATATGTGAGCTCCGGTATGACTTGCCGAAACTG
TACAAGTTCCATAAGCGAAAAGAAGTTGATATTGCTGTTGATCTCTGGCGCTTTGAGCCT
AAACAGAAGTAGACCGCCATGATTATGTAATGTTTCAGCTTTAAGTTAAAAAAAAAAAAC
TGATTGTATGTTGAAGGATTTTATGATATGAACTCACAACTAAGAGAACTTAAAGGCT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL8380Contig1 642 2 3 U
GGGGGAGAGTCAAACAAGTTGAAAAGTTTCCATCAAGGGTCCCCGTCGTCGATCGGAGAT
CTCTTCCTAAGGAAGAACTCAGCAGCGCCGTGAAATCTCCGTCCACCGCCGCCGTTAGCG
ATGTTTCTGATGAAGCTAGAGGAAGCAGTGGTGATACTGTTTTAGAAGAAAGAGACCCGC
AATACGATACAATGTTGAACCAAATGGTTGGGAGGATAAAAGCTAAACCCGGTGGCAAAG
CTGAGATGGGAGAGGCATCGGTAGTGGAAACCTCGAAAAGGCCACTCCCAAAGCTCCGGA
ACACAACCCCTGAATCAACAAGGTACGAGGAAAAACCGGTGCCGCAAGGGACACTGAACG
TGGCTCAAGTGAGACACATCATGCTTCTCTATCAGGGCAAGGCTCAGGATCACAACGGTC
CAATGAGTGTGAACGAGATTGCCAAAAACTACAGGATTGACGTCTCCCAGGTCCAGAAAA
TCACTCAGTTCCTATCTTTGCCACCAGAGGCTACTGACAAGCAGAAGAAACGATACGAAT
AAAAAGTAAAAGACTATGTTTGTTCATCTAGATTCAATATTTTTTTCTCTAGCAATAATG
TAAGAAGGATACAAAGCTTTACACACGTGTGACAACAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FU51TF U 1
AF RR4FU51JQ C 71
BS 1 607 RR4FU51TF
BS 608 608 RR4FU51JQ
BS 609 642 RR4FU51TF

RD RR4FU51TF 642 0 0
GGGGGAGAGTCAAACAAGTTGAAAAGTTTCCATCAAGGGTCCCCGTCGTCGATCGGAGAT
CTCTTCCTAAGGAAGAACTCAGCAGCGCCGTGAAATCTCCGTCCACCGCCGCCGTTAGCG
ATGTTTCTGATGAAGCTAGAGGAAGCAGTGGTGATACTGTTTTAGAAGAAAGAGACCCGC
AATACGATACAATGTTGAACCAAATGGTTGGGAGGATAAAAGCTAAACCCGGTGGCAAAG
CTGAGATGGGAGAGGCATCGGTAGTGGAAACCTCGAAAAGGCCACTCCCAAAGCTCCGGA
ACACAACCCCTGAATCAACAAGGTACGAGGAAAAACCGGTGCCGCAAGGGACACTGAACG
TGGCTCAAGTGAGACACATCATGCTTCTCTATCAGGGCAAGGCTCAGGATCACAACGGTC
CAATGAGTGTGAACGAGATTGCCAAAAACTACAGGATTGACGTCTCCCAGGTCCAGAAAA
TCACTCAGTTCCTATCTTTGCCACCAGAGGCTACTGACAAGCAGAAGAAACGATACGAAT
AAAAAGTAAAAGACTATGTTTGTTCATCTAGATTCAATATTTTTTTCTCTAGCAATAATG
TAAGAAG*ATACAAAGCTTTACACACGTGTGACAACAATACC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR4FU51JQ 572 0 0
GGAAGAACTCAGCAGCGCCGTGAAATCTCCGTCCACCGCCGCCGTTAGCGATGTTTCTGA
TGAAGCTAGAGGAAGCAGTGGTGATACTGTTTTAGAAGAAAGAGACCCGCAATACGATAC
AATGTTGAACCAAATGGTTGGGAGGATAAAAGCTAAACCCGGTGGCAAAGCTGAGATGGG
AGAGGCATCGGTAGTGGAAACCTCGAAAAGGCCACTCCCAAAGTTCCGGAACACAACCCC
TGAATCAACAAGGTACGAGGAAAAACCGGTGCCGCAAGGGACACTGAACGTGGCTCAAGT
GAGACACATCATGCTTCTCTATCAGGGCAAGGCTCAGGATCACAACGGTCCAATGAGTGT
GAACGAGATTGCCAAAAACTACAGGATTGACGTCTCCCAGGTCCAGAAAATCACTCAGTT
CCTATCTTTGCCACCAGAGGCTACTGACAAGCAGAAGAAACGATACGAATAAAAAGTAAA
AGACTATGTTTGTTCATCTAGATTCAATATTTTTTTCTCTAGCAATAATGTAAGAAGGAT
ACAAAGCTTTACACACGTGTGACAACAATACC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL8381Contig1 868 2 2 U
GGAGATTTGATCTACGCAGCAGCTGATTCAATCTTCTCCACAACTTCTAGTCGCGTTTTC
CTCTTCCAGCTTTTCATGGTGGCTACTAAATTCACCAGTCCAATGACCTGTGCTTTCGTA
TATTCCTGTATGTTGTTTACACATTTTCATCACATGTCTTTTTATCCCAGCGATTTAATT
TACGCAAAACATCATAAAGATTGAGAAGATTTGTTGGTTTACCGGATGAGCCCTTGCCCA
GTGGACATATTCCGTCTCTGGCAGATAGTATGCCTGCAAAAAATGAGTGATGATTCCAGT
TTTTAGTGTGTATCAATCATCAGCACATTTGATATGTGTTTCTGGTTTGCTTACCTTGAT
AAATGTTTCGACTATCTGTAACTTTGGCTTCACCTTTGTTGGCACAAAGTGCTGTAGCCC
GTTTATTAGGACCTACAAGAAAAGATAGATAACGTCCGCCAGACCAGAATCATTCCCATG
CATATTAACTATACCGCAGAGGCATGTTCAAACGACGCATCTGACTCAATATATCAATTT
CTTATTCACACTGTCGTATCAATACAGAGTACAAGAAGAGAACAGAGGGGAGAGGTACCT
GAATATCTAATGACATGAGAGCACGTCCTTCATCAGTACATCTTTTTATTCGAGAGAACC
CTTCGACCAGCATCTCCGCAAATATTTCAACTCCATATTGCAGTAGGAGATTCTGGACCT
ATTTATGAGAAAAAATAGTTCAAGATGAATACAGCTTTCCCAATAATTTGAGAAGAAATA
TACTCATTAATCTGATATATTAATCAAACTGAGTTCGTGCTGTCTGTTGATAATTTATGA
AGCAGAATGTGTTAGGGTTTGAGTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TACGCAAAACATCATAAAGATTGAGAAGATTTGTTGGTTTACCGGATGAGCCCTTGCCCA
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TTTTAGTGTGTATCAATCATCAGCACATTTGATATGTGTTTCTGGTTTGCTTACCTTGAT
AAATGTTTCGACTATCTGTAACTTTGGCTTCACCTTTGTTGGCACAAAGTGCTGTAGCCC
GTTTATTAGGACCTACAAGAAAAGATAGATAACGTCCGCCAGACCAGAATCATTCCCATG
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CTTATTCACACTGTCGTATCAATACAGAGTACAAGAAGAGAACAGAGGGGAGAGGTACCT
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ATTTATGAGA

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DS 



AS 0 0

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BQ
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AF RR4A632JQ C 1
AF RR4A632TF U 1
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TTGACCGTTTCCAGATTCAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTA
CCCGTCTCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACAA
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AAGTAACCGGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGACA
GTGGTTGCAGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTAA
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QA 1 675 1 675
DS 



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TATGCTTTTCCATGTGACACTATCTAAGACAGCTCCAATGAATTGGCAGTTGTTTACTAT
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GTTTACGCTTACTTTAATGAATGATCCACCACTACACTTTTGTCTTTTTGTTTTGTTTGT
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BQ
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AF RR4A602TF U 1
AF RR4A602JQ C 270
BS 1 832 RR4A602TF
BS 833 1132 RR4A602JQ

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TTTCATCCTCTTCTCTGCTCCTATCTTCCTCTCCGTCGCAGACGCCGTCCTCCCCTCTAT
CATCCTCTCTTCCTTCTCATCTCTCCTTCGTCTTTCTCCGGCGACTGTTTCTTCTCATAT
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TCTGACAATAACTACGATCTGCTCGATTTTGTCATTGTTCTACGTGTCTTTTAAGGCAGC
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DS 

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TGTCATTGTTCTACGTGTCTTTTAAGGCAGCTGTTGTGTTTGCCGAGCCAGTGATCAGAG
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ACACAGAAAGAGAATCATTGTAGGAGGTCTTGTTTACGCTTACTTTAATGAATGATCCAC
CACTACACTTTTGTCTTTTTGTTTTGTTTGTAATAAACCATATTTTCATCAATGAAATAA
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BY85TF U 1
AF RR4CM40TF U 1
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AACACCGGCGCCAAGAACCTCTACATCATTTCGGTGAAGGGGATCAAGGTTCGTCTCAAC
AGGTTGCCTTCCGCCGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTGAAGAAGGGGAAGCCTG
ATCTGAGGAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAA
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AAATGAAAGGTTCTGCGATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAATGCGCTGATTTTTGGCCTA
GGATTGCAAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTGAGTGTGCGTTTGATTATCTTTCAAACAAA
TTTGAGAATTTTGATTTTCTGACAATATGTGTACGACATTCGAGTGTTTTGGTTATTTAG
ACATCATCAATCAATGTTTTTTT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL8386Contig1 821 2 1 U
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TATACCGTTTAAGGGTGCTGGTAGGACATCTGGGAAATCAAATCTACTAAATTCTCCAGG
TTTACTTGGCATGGCGATATCATGGAGTGTTCCTTCCACTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C391JQ U 1
AF RR4C101JQ U 1
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TATACCGTT

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GCACCTTCCATGGAAGCTAAGTACTTCTGTTTAGTGTAATCCCCAGCTAAGTAGAATCCT
TTAATAGGAGATCTTTGTAGTGGACGACATGGTTCACAGTCTGGGATGGTCTTGTACACT
GACCTTGGAGTTTTGACGACATGGTACTTGAGAATTTTAGCTTTGCTTTGGTCAGCTGAG
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DS 



AS 0 0

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AB80JQ C 1
AF RR4AB80TF U 44
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BS 44 492 RR4AB80TF

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TTTTTTTAAAAG

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QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AI77TF U 1
AF RR4AI77JQ C 79
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BS 797 797 RR4AI77JQ
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RD RR4AI77TF 888 0 0
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TCGAGCATCGTGTTTTTGCCACAAGAAGACTATAGATATGGGGTACGTATGTTCAGTGTG
TCTGTCGATTTTCTGTGAGCATCACAAGAAATGTTCAACGTGCGGGTCTGTTTTTGGTCA
GTCTAAACTTGATGGTGCTAATGCTTCATCATCTGTCAATGATAGGAAGAGAAAAGCTCC
TGATTCCTAAATTCATCTTTTATGCTGCAAACTTTGCTAAATATTCATGCATTGTCTTTC
TTTGCGTTGATTTACA*GAAGTTATGAAGTAATACCAAATTGAAACA*CTAAAATACAAT
TTTGATCGA*CGCTTATTTGCCAAGTTATTCGAGCAGTCCTTTGTAAC

QA 1 888 1 888
DS 

RD RR4AI77JQ 810 0 0
AGCAAATCGGATCTTGTCTCCGGCGTGAAGTTTTCTCGTGACTTGCATTCTGTTGGAAGC
TATGGCGTCCGTTGCTTCAAAGCTGTATTCAGATGATGTAAGTCTCCTAGTGTTGCTGCT
CGATACGAATCCCTTCTTCTGGGACACCACATCGACTACCTTCTCTCAGTTCCCCTCTCA
TGTGCTTGCTTTTCTGAACGCGGTTTTGGGGTTGAATCAGCTGAACCAAGTTGTAGTGAT
GAACTCTATTTTCTCTGCTCAACGCCTAATGGTTCCCATTGATTCCTGTTACATAGGTAC
ACAGAACTCAGCATTTTTGCAGCAGGCATCTTACATAACCGGCGGAGTACATCATGCACC
TAAACAATTGGATGGGCTGTTTCAGTTTCTAACGACGATCTTTGCAACTGATTTGCACAC
CCGCCGTTTTGTACAACTTCCTAAACCTGTAGGCGTTGATTTTCGAGCATCGTGTTTTTG
CCACAAGAAGACTATAGATATGGGGTACGTATGTTCAGTGTGTCTGTCGATTTTCTGTGA
GCATCACAAGAAATGTTCAACGTGCGGGTCTGTTTTTGGTCAGTCTAAACTTGATGGTGC
TAATGCTTCATCATCTGTCAATGATAGGAAGAGAAAAGCTCCTGATTCCTAAATTCATCT
TTTATGCTGCAAACTTTGCTAAATATTCATGCATTGTCTTTCTTTGCGTTGATTTACAAG
AAGTTATGAAGTAATACCAAATTGAAACAACTAAAATACAATTTTGATCGAACGCTTATT
TGCCAAGTTATTCGAGCAGTCCTTTGTAAC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL8390Contig1 736 2 5 U
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AAAAATGATAATAACTCTCTCAAAGTAACAACGATATCAATAAAACGGAATATTATAGTT
CCCATCAATTGCTTTTCTTTGGATTCAATAACTCTTTGAACCACTTAGCCGATTTCTTGG
GGTATCTCTTGCATCCATCTTTGAAGTCCACATAAACCAACCCGAACCGGACGGTGTATC
CCATTGCCCATTCAAAGTTGTCCAACAACGACCATGCAAAAAATCCCTTAACATTGGCTC
CAACCGAGATTGCGTCTTGAACCATCTCAAGATGTCGAGCGTAGTAATCGATTCTATCAC
CGTCTTTGAGGAATATTTTGTCCGTGCTAAATTCATCTCTCCCGTTTTCGGTTATGTACA
TGACCGGGTCTTTGAACTTGTACTTTGCATAGAGGACAAGATCACGAATACCCTTTGGAT
ATATCAAAAGCCAATCTGATGCAGCCTTTGGACCAATGGGAACGCCTTCTCTTTCACCTG
TGACACTGGCACAAGGATCAGAGAACATTGTAACTTGTTCAGTGGAGCAGGGAACATCCT
TTGCGTAAGTGGAAGAGTAGTAACTGATGCCAATGAAATCATATGAGCCCTTAAGCATCT
TAGATTGTTGTGCAGTGAAGGTAGGCAACCGACCGCCTTTTACGTTGTTGACCATGTCGA
TAGGGCATTTACCGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK95JQ U 1
AF RR4A529JQ U 1
BS 1 64 RR4A529JQ
BS 65 65 RR4GK95JQ
BS 66 346 RR4A529JQ
BS 347 347 RR4GK95JQ
BS 348 736 RR4A529JQ

RD RR4GK95JQ 708 0 0
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AAAAATGATAATAACTCTCTCAAAGTAACAACGATATCAATAAAACGGAATATTATAGTT
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CCATTGCCCATTCAAAGTTGTCCAACAACGACCATGCAAAAAATCCCTTAACATTGGCTC
CAACCGAGATTGCGTCTTGAACCATCTCAAGATGTCGAGCGTAGTAATCGATTCTATCAC
CGTCTTTGAGGAATATTTTGTCCGTGCTAAATTCATCTCTCCCGTTTTCGGTTATGTACA
TGACCGGGTCTTTGAACTTGTATTTTGCATAGAGGACAAGATCACGAATACCCTTTGGAT
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TAGATTGTTGTGCAGTGAAGGTAGGCAACCGACCGCCTTTTACGTTGT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4A529JQ 736 0 0
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GGTATCTCTTGCATCCATCTTTGAAGTCCACATAAACCAACCCGAACCGGACGGTGTATC
CCATTGCCCATTCAAAGTTGTCCAACAACGACCATGCAAAAAATCCCTTAACATTGGCTC
CAACCGAGATTGCGTCTTGAACCATCTCAAGATGTCGAGCGTAGTATTCGATTCTATCAC
CGTCTTTGAGGAATATTTTGTCCGTGCTAAATTCATCTCTCCCGTTTTCGGTTATGTACA
TGACCGGGTCTTTGAACTTGTACTTTGCATAGAGGACAAGATCACGAATACCCTTTGGAT
ATATCAAAAGCCAATCTGATGCAGCCTTTGGACCAATGGGAACGCCTTCTCTTTCACCTG
TGACACTGGCACAAGGATCAGAGAACATTGTAACTTGTTCAGTGGAGCAGGGAACATCCT
TTGCGTAAGTGGAAGAGTAGTAACTGATGCCAATGAAATCATATGAGCCCTTAAGCATCT
TAGATTGTTGTGCAGTGAAGGTAGGCAACCGACCGCCTTTTACGTTGTTGACCATGTCGA
TAGGGCATTTACCGGT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL8391Contig1 778 2 4 U
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GGCCAAAGTGACCAAGTACGGTGATAGGTTGTTGGAAACAATAGAGGCAACGGTCAACGA
CTACCATGGAATTAGTAAGAAAGAAGAGTCCATGATTAGTCCGGATTCAGGGAAGAGGAG
AAGAGACGAGAACATTAGTCCGAATGTAGCCGAGGAGGATGATGATTTCGCAGAGAGCTC
TAGCCAGTCTTGCAAAAAAACGGCGAGAAGCAAAAGCAATGAGGTTCTTCATGGGGAATC
TGTTGATGGAGACGGAGTAGGTATGGTCATAGAGAAGCTAGATTTTGATTTTGAAGACGA
AGATGTGTCGGAGATACGACCAGAGGGAGGAAGAGTATTACCCTGGTGAAGTAGTAAGCA
ACCAGTGTGAATTCTTATATATTCAAAAAGAAATAATCACTTATTTTATGCGTTATATTT
TATTTTGGACCATATCTTAAAAAAATCATCACTTTTAGTTATTTTCTTTTCGCGAGGAAG
TTTCATGTGAGCACTCTCGAGCCTCTCATGAAGATTGCTTCATATTTGTATGGAATATAA
AAATACTAATCATGTGTATATTATAAAACTACTAATCATGTGTATATTACATTGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4BZ24TF U 1
AF RR4BZ24JQ C 84
BS 1 722 RR4BZ24TF
BS 723 723 RR4BZ24JQ
BS 724 776 RR4BZ24TF
BS 777 778 RR4BZ24JQ

RD RR4BZ24TF 776 0 0
GGATGTGAATCTCTCCGCTATCATGTACACAGCCTTGAGGAAGCTTCGTGCACTTCTTGT
CAAAGAAGCCCCTGACGGTGTCATGGCATATCATATATTTGGCAATGCAACGCTTCAGCA
GATAAGCAAGAAGATTCCGAGAACCAAAGAGGAACTCCTAGAGATAAATGGCCTTGGAAA
GGCCAAAGTGACCAAGTACGGTGATAGGTTGTTGGAAACAATAGAGGCAACGGTCAACGA
CTACCATGGAATTAGTAAGAAAGAAGAGTCCATGATTAGTCCGGATTCAGGGAAGAGGAG
AAGAGACGAGAACATTAGTCCGAATGTAGCCGAGGAGGATGATGATTTCGCAGAGAGCTC
TAGCCAGTCTTGCAAAAAAACGGCGAGAAGCAAAAGCAATGAGGTTCTTCATGGGGAATC
TGTTGATGGAGACGGAGTAGGTATGGTCATAGAGAAGCTAGATTTTGATTTTGAAGACGA
AGATGTGTCGGAGATACGACCAGAGGGAGGAAGAGTATTACCCTGGTGAAGTAGTAAGCA
ACCAGTGTGAATTCTTATATATTCAAAAAGAAATAATCACTTATTTTATGCGTTATATTT
TATTTTGGACCATATCTTAAAAAAATCATCACTTTTAGTTATTTTCTTTTCGCGAGGAAG
TTTCATGTGAGCACTCTCGAGCCTCTCATGAAGATTGCTTCATATTTGTATGGAATATAA
AA*TACTAATCATGTGTATATTATAAAACTACTAATCATGTGTATATTACATTGTA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR4BZ24JQ 695 0 0
TGGCATATCATATATTTGGCAATGCAACGCTTCAGCAGATAAGCAAGAAGATTCCGAGAA
CCAAAGAGGAACTCCTAGAGATAAATGGCCTTGGAAAGGCCAAAGTGACCAAGTACGGTG
ATAGGTTGTTGGAAACAATAGAGGCAACGGTCAACGACTACCATGGAATTAGTAAGAAAG
AAGAGTCCATGATTAGTCCGGATTCAGGGAAGAGGAGAAGAGACGAGAACATTAGTCCGA
ATGTAGCCGAGGAGGATGATGATTTCGCAGAGAGCTCTAGCCAGTCTTGCAAAAAAACGG
CGAGAAGCAAAAGCAATGAGGTTCTTCATGGGGAATCTGTTGATGGAGACGGAGTAGGTA
TGGTCATAGAGAAGCTAGATTTTGATTTTGAAGACGAAGATGTGTCGGAGATACGACCAG
AGGGAGGAAGAGTATTACCCTGGTGAAGTAGTAAGCAACCAGTGTGAATTCTTATATATT
CAAAAAGAAATAATCACTTATTTTATGCGTTATATTTTATTTTGGACCATATCTTAAAAA
AATCATCACTTTTAGTTATTTTCTTTTCGCGAGGAAGTTTCATGTGAGCACTCTCGAGCC
TCTCATGAAGATTGCTTCATATTTGTATGGAATATAAAAATACTAATCATGTGTATATTA
TAAAACTACTAATCATGTGTATATTACATTGTACT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL8392Contig1 870 2 2 U
GGAAAACGGTTTGGTTCATACCGTACCGTCATCTTCATCTTCCTCATGCCTCCGGTTCCC
TTCAACCGGTTTCAACGGCCGTCCTTGGCGGCGGAAGCTCCTCCTCCCTCACGGCGCTTT
GAAGATAAAAGCAGTGCTGTACTCTGCAATGATGGAACAGTTCGGTCTCAAGGACTCTTA
ATGCTTATGAGAAGAAGAGGTGTCCATTCTGGTTTGGTGGTTAAGGGAGAAGAAGGGGCA
CTCTCAATGACAACAAGGGTGCGAGCAGCAACTGCATCGAAAGGGTTTCCAGTTAACTAC
TGTTCTGGTTTCCGTTCTTCCAGTTCAGACACTGCTCTTGAAGCTGACGGGGTGTCACGC
CAGAGTTTCAACCTTGAGGTGGATGCAAGAAACTATGGGTTTGAGCCAACAGAGACTCCA
AGAACTGATCGTTCGGTTTCGAAGAACATAGAGCTTGGTTTGGCAGCGCTGCGTGGTGAG
AAAGGCGCTGCTTATGATAGAATCGTCCTAAACGCTGGGATTGTGGATCATTTGTTGGGA
TCCGAAGGTGCAGAGGATGTGGCTGTGGCTATGGAGAGAGCAAAGGAGGCTATTGACAGT
GGGAAGGCTCTGAAGAAGCTTTTTAATTACATTGAGATCTCACGCAAGATGAAATAATCT
GGAGTCTTTGACAAATCATCACACACGGAATAGAGAAATGCATACATCTTTCCTTTAATC
TTCTCTTTTTTTTTGTGTGGACAAAACTCTATTGTTGTTGTTGTTGCAAAACTAAGTGTT
GTTTTTTACAGAGTGGACACACAACATAAATGTTTGTGGGGCTTTCTGTGGATGCTATGT
ACAGAATCTGGAGAGAAATGTTTATTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AP75TF U 1
AF RR4AP75JQ C 93
BS 1 653 RR4AP75TF
BS 654 870 RR4AP75JQ

RD RR4AP75TF 653 0 0
GGAAAACGGTTTGGTTCATACCGTACCGTCATCTTCATCTTCCTCATGCCTCCGGTTCCC
TTCAACCGGTTTCAACGGCCGTCCTTGGCGGCGGAAGCTCCTCCTCCCTCACGGCGCTTT
GAAGATAAAAGCAGTGCTGTACTCTGCAATGATGGAACAGTTCGGTCTCAAGGACTCTTA
ATGCTTATGAGAAGAAGAGGTGTCCATTCTGGTTTGGTGGTTAAGGGAGAAGAAGGGGCA
CTCTCAATGACAACAAGGGTGCGAGCAGCAACTGCATCGAAAGGGTTTCCAGTTAACTAC
TGTTCTGGTTTCCGTTCTTCCAGTTCAGACACTGCTCTTGAAGCTGACGGGGTGTCACGC
CAGAGTTTCAACCTTGAGGTGGATGCAAGAAACTATGGGTTTGAGCCAACAGAGACTCCA
AGAACTGATCGTTCGGTTTCGAAGAACATAGAGCTTGGTTTGGCAGCGCTGCGTGGTGAG
AAAGGCGCTGCTTATGATAGAATCGTCCTAAACGCTGGGATTGTGGATCATTTGTTGGGA
TCCGAAGGTGCAGAGGATGTGGCTGTGGCTATGGAGAGAGCAAAGGAGGCTATTGACAGT
GGGAAGGCTCTGAAGAAGCTTTTTAATTACATTGAGATCTCACGCAAGATGAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4AP75JQ 778 0 0
GGAAGCTCCTCCTCCCTCACGGCGCTTTGAAGATAAAAGCAGTGCTGTACTCTGCAATGA
TGGAACAGTTCGGTCTCAAGGACTCTTAATGCTTATGAGAAGAAGAGGTGTCCATTCTGG
TTTGGTGGTTAAGGGAGAAGAAGGGGCACTCTCAATGACAACAAGGGTGCGAGCAGCAAC
TGCATCGAAAGGGTTTCCAGTTAACTACTGTTCTGGTTTCCGTTCTTCCAGTTCAGACAC
TGCTCTTGAAGCTGACGGGGTGTCACGCCAGAGTTTCAACCTTGAGGTGGATGCAAGAAA
CTATGGGTTTGAGCCAACAGAGACTCCAAGAACTGATCGTTCGGTTTCGAAGAACATAGA
GCTTGGTTTGGCAGCGCTGCGTGGTGAGAAAGGCGCTGCTTATGATAGAATCGTCCTAAA
CGCTGGGATTGTGGATCATTTGTTGGGATCCGAAGGTGCAGAGGATGTGGCTGTGGCTAT
GGAGAGAGCAAAGGAGGCTATTGACAGTGGGAAGGCTCTGAAGAAGCTTTTTAATTACAT
TGAGATCTCACGCAAGATGAAATAATCTGGAGTCTTTGACAAATCATCACACACGGAATA
GAGAAATGCATACATCTTTCCTTTAATCTTCTCTTTTTTTTTGTGTGGACAAAACTCTAT
TGTTGTTGTTGTTGCAAAACTAAGTGTTGTTTTTTACAGAGTGGACACACAACATAAATG
TTTGTGGGGCTTTCTGTGGATGCTATGTACAGAATCTGGAGAGAAATGTTTATTTCCG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL8393Contig1 791 2 12 U
ATCAAAATAAATATCATTCATTGATGTGATCATATAGATTTCAGTATACACATGTGACAA
TATTCTTTATAGAAATTATCTTCTCTTCACACCATAGAAACAAACAATAAACCACTCGTG
CAATCCGAAACCAAAATACTTAAGAATGTGTATATATAATATATGCTTTATACAGTTGAT
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CCACCATAATAGAAGTGACTTCCCCAAGAACCTCCACTGCCACTCTTGACATTGTAACAG
TTCTCTTGATCAGTGAACACTTGAAGATTATCAGGGCTTCTCAGCTCATTTGATCCATCA
ACTATTTGAATGTTCTTGAAGTAACTAGCTTTGCCCCAACCTTACTCTGCGAACCTACCA
CTTCCCATCTGAGTTGTAGTGTGTTGTCCTTCCTCAGACTGCGAGTTAACCACTTCACCA
CCCCATTCGATCATTGATGCACCTTCTGATAAGTAAGAAAAGAGTGAAGCTGGCCAGTAT
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AACTGTGGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4A531JQ U 1
AF RR4GU70JQ U 59
BS 1 129 RR4A531JQ
BS 130 130 RR4GU70JQ
BS 131 233 RR4A531JQ
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BS 657 787 RR4A531JQ
BS 788 791 RR4GU70JQ

RD RR4A531JQ 787 0 0
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TATTCTTTATAGAAATTATCTTCTCTTCACACCATAGAAACAAACAATAAACCACTCGTG
CAATCCGAAGCCAAAATACTTAAGAATGTGTATATATAATATATGCTTTATACAGTTGAT
GATTAATTTGGAATGATCTAGGTACACGGATCTTAGGGGCAACTAGGGTTTCTGCCCGGA
CCACCATAATAGAAGTGACTTCCCCAAGAACCTCCACTGCCACTCTTGACATTGTAACAG
TTCTCTTGATCAGTGAACACTTGAAGATTATCAGGGCTTCTCAGCTCATTTGATCCATCA
ACTATTTGAATGTTCTTGAAGTAACTAGCTTTGCCCCAACCTTACTCTGCGAACCTACCA
CTTCCCATCTGAGTTGTAGTGTGTTGTCCTTCCTCAGACTGCGAGTTAACCACTTCACCA
CCCCATTCGATCATTGATGCACTTTCTGATAAGTAAGAGAAGAGTGAAGCTGGCCAGTAT
CCTATTATGTACTTCTCTCCAAATTGTAACCACCAGTGTCCTTCTTTTGGATCCTTCCAG
ATAAGTATGGTAATGTCATACTGAGAGTCTCCAAAGCTTGACAGAGGTGAGATT**TCCA
CCCATTGCAATCTCCCTGTTGATTTGAACGAATCCTGAGCACAGAAGATTGTAGCAGCCT
GTTCCTTGGTATGCATCACTAGTCCAATAAGTGAAGAGCCTGGTGCGACTATCACCATAC
AACTGTG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR4GU70JQ 733 0 0
AATG
TTCTTTATAGAAATTATCTTCTCTTCACACCATAGAAACAAACAATAAACCACTCTTGCA
ATCCGAAACCAATATACTTAAGAATGTGTATATATAATATATGCTTTATACAGTTGATGA
TTAATTTGGAATGATCTAGGTACACGGATCTTAGGGGCAACTAGGGTTTCTACCCGGACC
ACCATAATAGAAGTGACTTCCCCAAGAACCTCCACTGCCACTCTTGACATTGTAACAGTT
CTCTTGATCAGTGAACACTTGAAGATTATCAGGGCTTCTCAGCTCATTTGATCCATCAAC
TATTTGAATGTTCTTGAAGTAACTAGCTTTGCCCCAACCTTCCTCTGCGAACCTACCACT
TCCCATCTGAGTTGTAGTGTGTTGTCCTTCCTCAGACTGCGAGTTAACCACTTCACCACC
CCATTCGATCATTGATGCACCTTCTGATAAGTAAGAAAAGAGTGAAGCTGGCCAGTATCC
TATTATGTACTTCTCTCCAAATTGTAACCACCAGTGTCCTTCTTTTGGATCCTTCCAGAT
AAGTATGGTAATGTCATACTGAGAGTCTCCAAAGCTTGACAGAGGTGAGATTGATCCACC
CATTGCAATCTCCCTGTTGATTTGAACGAATCCTGAGCACAGAAGATTGTAGCAGCCTGT
TCCTTGGTATGCATCACTAGTCCAATAAGTGAAGAGCCTGGTGCGACTATCACCATACAA
CTGTGGACT

QA 5 733 5 733
DS 



AS 1 2

CO CL8394Contig1 561 2 1 U
CTGTGCAATTGTTTCCCACCCTGCTGATAACCTAGTTTCGTTCCTCAACAATGCTAAGGG
AGCAACCGTTGGAGATGCGGTGAAGAAGATAGGACTGTTGGGACTCTTCACAAGAGGACT
TCCTCTAAGGATTGTGATGATAGGGACATTGACCGGAGCACAATGGGGTTTATATGATGC
CTTCAAAGTGTTTGTTGGCCTTCCCACCACCGGGGGTGTTGCTCCAGCGCCTGCCATCGT
TGCTGCTGAAGCCAAAGCCCAAAACTAAATGATGATGAAAAGGGTTTGGGATTTTTGTTT
GACAAAAAATAAGAGAAACGTATTGCAGAGAGAGGAAGAGTGAGCTCATCCTCCGATTCC
AACTTTATTTTTCCTTTTTCTTTTGTGTTCCTGAATTCAGGATAGTGCTCTCTTTCCCTA
TTATTGTTTCTTTCTTGTTTGTGGGATTGTAATCGTAAAAAGATGAGAGGGACACACTGC
ACAATAGAGAGAGCGGGCACACACCCACTTACTACTTTTGGTTATATTTCTTTTGAAAAT
CTTCTTTTCTCCTGTTTCATT


BQ
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AF RR4CW18JQ C 1
AF RR4CW18TF U 1
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DS 

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QA 1 561 1 561
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8397Contig1 917 2 2 U
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BQ
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AF RR4A535TF U 1
AF RR4A535JQ C 112
BS 1 799 RR4A535TF
BS 800 917 RR4A535JQ

RD RR4A535TF 799 0 0
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AAATGCTATTAATTAGAATAGTAATTCATTATTCTTAACAATAGGTCCTGGAGATTTCTT
GGTTCATCATGCTATTGCTTTAGGTTTACATACAACTACATTGATCTTAGTAAAAGGTGC
TTTAGATGCACGTGGTTCCAAGTTAATGCCAGATAAAAAGGATTTCGGGTATAGTTTTCC
TTGCGATGGTCCGGGACGAGGTGGTACTTGTGATATTTCGGCTTGGGACGCATTTTATTT
GGCAGTTTTTTGGATGTTAAATACTATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGCATTGGAAACA
CATCACATCATGGCAAGGTAACGTTTCACAGTTTAATGAATCTTCCACTTATTTGATGGG
ATGGTTAAGAGATTATCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATATAACCCTTT
TGGTATGAATAGTTTATCAGTCTGGGCATGGATGTTCTTATTTGGGCATCTTGTTTGGGC
TACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGTTATTGGCAGGAATTGATTGAAACTTT
AACATGGGCTCATGAACGTACACCTTTGGCAAATTTGATTCGATGGAAAGATAAACCAGT
AGCTCTTTCAATTGTGCAAGCAAGATTGGTTGGATTAGCCCACTTTTCTGTAGGTTATAT
ATTCACTTATGCGGCTTTCTTGATTGCCTCCACGTCGGGCAAGTTCGGTTAATTATTTAT
GTATTCTATCCGCAATAAT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4A535JQ 806 0 0
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AAAAGGTGCTTTAGATGCACGTGGTTCCAAGTTAATGCCAGATAAAAAGGATTTCGGGTA
TAGTTTTCCTTGCGATGGTCCGGGACGAGGTGGTACTTGTGATATTTCGGCTTGGGACGC
ATTTTATTTGGCAGTTTTTTGGATGTTAAATACTATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGCA
TTGGAAACACATCACATCATGGCAAGGTAACGTTTCACAGTTTAATGAATCTTCCACTTA
TTTGATGGGATGGTTAAGAGATTATCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATA
TAACCCTTTTGGTATGAATAGTTTATCAGTCTGGGCATGGATGTTCTTATTTGGGCATCT
TGTTTGGGCTACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGTTATTGGCAGGAATTGAT
TGAAACTTTAACATGGGCTCATGAACGTACACCTTTGGCAAATTTGATTCGATGGAAAGA
TAAACCAGTAGCTCTTTCAATTGTGCAAGCAAGATTGGTTGGATTAGCCCACTTTTCTGT
AGGTTATATATTCACTTATGCGGCTTTCTTGATTGCCTCCACGTCGGGCAAGTTCGGTTA
ATTATTTATGTATTCTATCCGCAATAATAAAAATATAGGTATGCACTCTTATATTTATTT
CTACATCTAGGATCCGATTTGTATCATTATCATTGATAATAAGAGGAACTTAAGCATTAT
GGCAAAGAAAAGTTTGATTTATAGGG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL8398Contig1 1143 2 2 U
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GTCCCCAAGTTTCTGCACCTCCAGGGTTTTCTGCTCCCAGCAGGTTGCCTCCTCCTGGCT
TCTCTTCACATGAAAGACTGGGGCTATCTTCAGATACTGCAACAGGAACTCGTTTTCTTG
ACACTGCCTCCTTTATGAGGAATGCATATCAATCACTGCCTCCAGTTGGTAATCAAAGTG
GTGCAAGTGATATTGAGTTTGCCGATCCTGCCATCCTAGCTGTTGGAAGAGGGATGATTA
ACACAGACTTAGGTATGAGATCAGGTTTCTCATCACAAATGAATTCCTTTGGGAACGAAA
CAGCACTCCAGATGTTGAGACAGCAATCTCTGTCTGCCGCACAGCAGCAAGAAGTAAATG
GGTTTCATCATGATCTCAGAAACTTGTCTCCGCCACCTACCGATCCTTATGGATTTAGTT
CAAGGCTAATGGAAGGAAGTAGCTTATCTCATTTCTCACAGCTCGCCAGACAACAACCAT
CTGCAAATCCAGGCTTGTCTAATAGTAATGGTCACTGGGATAAGTGGAATGAAGGCCAGA
GTTTGAACTCTATAGGTATGGCCGAGCTTCTTAGGAATGAACGGCTGGGATTCAATGGGA
GCCTATACAACAACGGGTATGAAGAACCCAGATTCCGGATTCCGAGTCCTGGAGATGCGT
ATAATAATAGAACATATGGGATGTAATTCTGGTGGCATGAAGAGAGGTTTTCTGCTTTGT
TGGATTTGCTCTGGCTGATCCCAAAAAGGCTATAGAAGAAATTATTCTCAAAAACTGCTT
CCTTCACTGCGCATATCGAAGATGCATGGCCCCAACAAAGATTCACCAAGAGCGTTTTTG
AACTTTGAAGGAGCCGAAGAAACGTTATGTTCGGGTGGGTGCTTTGGATAGATTTGAGTT
CTGCAGATTGGTTTGAGAATAGTGGCAAAAAGTGGATGTATGTCTTGCGAAATTGATTTG
CAATTTCTTATTCATTATTGTAAATCAATTCAGTTCTGAAACAGTAAACTTTGTTTTTTG
TAATAAACGTTTTATACAACAAATTGTCATAGCTGTTAGAAAACGAAATACATTTGTTGT
ACC


BQ
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10 10 10 

AF RR4DC52TF U 1
AF RR4DC52JQ C 499
BS 1 588 RR4DC52TF
BS 589 1143 RR4DC52JQ

RD RR4DC52TF 588 0 0
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TCTCTTCACATGAAAGACTGGGGCTATCTTCAGATACTGCAACAGGAACTCGTTTTCTTG
ACACTGCCTCCTTTATGAGGAATGCATATCAATCACTGCCTCCAGTTGGTAATCAAAGTG
GTGCAAGTGATATTGAGTTTGCCGATCCTGCCATCCTAGCTGTTGGAAGAGGGATGATTA
ACACAGACTTAGGTATGAGATCAGGTTTCTCATCACAAATGAATTCCTTTGGGAACGAAA
CAGCACTCCAGATGTTGAGACAGCAATCTCTGTCTGCCGCACAGCAGCAAGAAGTAAATG
GGTTTCATCATGATCTCAGAAACTTGTCTCCGCCACCTACCGATCCTTATGGATTTAGTT
CAAGGCTAATGGAAGGAAGTAGCTTATCTCATTTCTCACAGCTCGCCAGACAACAACCAT
CTGCAAATCCAGGCTTGTCTAATAGTAATGGTCACTGGGATAAGTGGA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4DC52JQ 645 0 0
GTAGCTTATCTCATTTCTCACAGCTCGCCAGACAACAACCATCTGCAAATCCAGGCTTGT
CTAATAGTAATGGTCACTGGGATAAGTGGAATGAAGGCCAGAGTTTGAACTCTATAGGTA
TGGCCGAGCTTCTTAGGAATGAACGGCTGGGATTCAATGGGAGCCTATACAACAACGGGT
ATGAAGAACCCAGATTCCGGATTCCGAGTCCTGGAGATGCGTATAATAATAGAACATATG
GGATGTAATTCTGGTGGCATGAAGAGAGGTTTTCTGCTTTGTTGGATTTGCTCTGGCTGA
TCCCAAAAAGGCTATAGAAGAAATTATTCTCAAAAACTGCTTCCTTCACTGCGCATATCG
AAGATGCATGGCCCCAACAAAGATTCACCAAGAGCGTTTTTGAACTTTGAAGGAGCCGAA
GAAACGTTATGTTCGGGTGGGTGCTTTGGATAGATTTGAGTTCTGCAGATTGGTTTGAGA
ATAGTGGCAAAAAGTGGATGTATGTCTTGCGAAATTGATTTGCAATTTCTTATTCATTAT
TGTAAATCAATTCAGTTCTGAAACAGTAAACTTTGTTTTTTGTAATAAACGTTTTATACA
ACAAATTGTCATAGCTGTTAGAAAACGAAATACATTTGTTGTACC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL8399Contig1 866 2 15 U
GCTTTTGAATAGTGAAGGACTCTAATCTTAATTTTGTGTCCAATGGTGTTCTTTATTTTG
GAGTCCTTAACAATAAAAAATATTAAATTTATAAGCAAGCACAGCCCATAAGCAAGCATA
CGAATAGCTGCCGTACACTTTTGTAGTGCAGTTAGACCTAACCTTCCGACTGCATCTCTT
CTTTGTTGAAAAGAATGGGAATGTTTTGTGAGAGGCGATCGACAAATACTTAAGAATAGT
GGCTTGTTCATGCGGAAAACGGCGTCTGAATAAATGAGACTCAAAATATTGGATGTTCAC
TGAAGTAGTCATTCCATAGACGGTCGTGGCCTGCTTCGCGGTTTCGTTCGATATATGCAC
GTCTCCTTTGTGTATTTGTTTGATTCTCGACGATGCTGTTGTAAGTATCTTCAAAACATG
ATTCTAAAGCGTCATCGATAGCCGCATCCAATCTTTGATCGACTCCATCTGCCATATTTG
CCTATGAAATATATAGTAATCATCTTTATCATATAGGATAGATAGTCATCATCTTTATCA
TATAGAATAGATAGTTATCATCTTTGTCTTTGTCATAATTTGTAAAATTTGTATCATATA
GAATAGATACTAAAATTTTATACAAGTCAATGGTTTTTTTTCTCTTAAAAATGAAGAATA
TAGAAAGAGTGTTAACTATTTTTGTCTTAAAACAGAGCAATTAATTGGAACCATACTTCT
TGTATAAAAAGATTTAATTACAAGTTCTGAATAAATACAAAATGAAGAACCTGTTTGCAG
AGATAGAGCTTGTACAAGTAGAGGTTGTAGAATAAGAGTTAATTAATAAAACAGAGGGAG
AGATTGTTCTGAATACAAGAGAGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AK31JQ U 7
AF RR4AK31TF C 1
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QA 1 770 1 770
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QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

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BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AI55JQ C 1
AF RR4AI55TF U 1
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CTATTGCAATGTGATGACAAACTAAAACGATTTGAAATGAATAAAACTGTTGGCAGG

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4CE23TF U 1
AF RR4CK95TF U 1
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TATACAGATATATGTTGTGAGGTGATTGTAGCTAGAGAGATTCTTTTTTATTTTTGTTGT
TGTTGAGTAA*TACATACATTACGTCT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4CK95TF 567 0 0
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AGTTGACACTTGACAGCCTATACGAGGATGCAATCAGAGTGAATCAACAGCAAAACAGAA
GCCACAATCCATGGGAGCAACAGCATCCAGTCCATAACGGTCCCATGATGCACCAGCCTT
TCTTTGTGTCTAATGGAGTCTCAGCTCCTCCTCCTTTTCAAATGGCAAATCAATATCATC
AGCCGTATGGTGGGTTTCAGCATCAGAACTCAGGGATGATGATGGGACCTGTGCAGCCTT
ATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACAACAACAGAACATGAATCCCTTCGGAA
ACCCGTTTGTCGCGAATGGTAATCCACACCAACCGTATGGCTCGGTTCAAGGAGGTTACA
ATCCATATTCTAGCCTTATGTGAGATTTGATACTAATGTATGTTTGTGTATAATCTTATA
TATACAGATATATGTTGTGAGGTGATTGTAGCTAGAGAGATTCTTTTTTATTTTTGTTGT
TGTTGAGTAAATACATACATTACGTCT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8403Contig1 563 2 2 U
GGATGAGACTTGCAGCTTCGCCGACACCATTGTACGTTGCAACTTGCAGTCGTTGGCTAA
ACTCGCCGAGAACCCGCCTAGAATCTCGTAATTACATTTTCGTTTGAAAACTTTTTAATT
TTATATTTATCTTCTAATATATTCTCTATTTCAAAGATTTTATCCGTTTTTAGGCTCTAG
ATTATTTAATAATCGTCGGGGATTTTTCGAAACTACAAAAAATGAATGGTTTTGGTTTTT
CGGAGTTAGGGTTTTAGGGTTTGTTAAGTGTTCGTTTCAACGATACTTTAGTTTACCCTT
AAGATCGGTTACTTCTTGAACTTATGTGTAAATACAATCTCGTAGCTTTTAAATAAACAA
GACATTGTTTGCATAGGTTTTTATCTCCCTAGTGCTCTTGTTTCCAGTTACTTTAAATAT
GTATGATCTTTGTTTAATCATGTAACAATATAATGTTCAGTTACTGACTATTGTTTTTAT
GTTTTCGGGATTATGATCTCTAGTTTGAATCTGATAATTTTTAAGGTACGGCAATTATAT
GATTAAGATAGTAATATTGGCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4DW12JQ C 1
AF RR4DW12TF U 1
BS 1 561 RR4DW12TF
BS 562 563 RR4DW12JQ

RD RR4DW12JQ 563 0 0
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TTATATTTATCTTCTAATATATTCTCTATTTCAAAGATTTTATCCGTTTTTAGGCTCTAG
ATTATTTAATAATCGTCGGGGATTTTTCGAAACTACAAAAAATGAATGGTTTTGGTTTTT
CGGAGTTAGGGTTTTAGGGTTTGTTAAGTGTTCGTTTCAACGATACTTTAGTTTACCCTT
AAGATCGGTTACTTCTTGAACTTATGTGTAAATACAATCTCGTAGCTTTTAAATAAACAA
GACATTGTTTGCATAGGTTTTTATCTCCCTAGTGCTCTTGTTTCCAGTTACTTTAAATAT
GTATGATCTTTGTTTAATCATGTAACAATATAATGTTCAGTTACTGACTATTGTTTTTAT
GTTTTCGGGATTATGATCTCTAGTTTGAATCTGATAATTTTTAAGGTACGGCAATTATAT
GATTAAGATAGTAATATTGGCTT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR4DW12TF 561 0 0
GGATGAGACTTGCAGCTTCGCCGACACCATTGTACGTTGCAACTTGCAGTCGTTGGCTAA
ACTCGCCGAGAACCCGCCTAGAATCTCGTAATTACATTTTCGTTTGAAAACTTTTTAATT
TTATATTTATCTTCTAATATATTCTCTATTTCAAAGATTTTATCCGTTTTTAGGCTCTAG
ATTATTTAATAATCGTCGGGGATTTTTCGAAACTACAAAAAATGAATGGTTTTGGTTTTT
CGGAGTTAGGGTTTTAGGGTTTGTTAAGTGTTCGTTTCAACGATACTTTAGTTTACCCTT
AAGATCGGTTACTTCTTGAACTTATGTGTAAATACAATCTCGTAGCTTTTAAATAAACAA
GACATTGTTTGCATAGGTTTTTATCTCCCTAGTGCTCTTGTTTCCAGTTACTTTAAATAT
GTATGATCTTTGTTTAATCATGTAACAATATAATGTTCAGTTACTGACTATTGTTTTTAT
GTTTTCGGGATTATGATCTCTAGTTTGAATCTGATAATTTTTAAGGTACGGCAATTATAT
GATTAAGATAGTAATATTGGC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL8404Contig1 787 2 2 U
GGCTTCTGACCAGAAACCAGAGAGAGAGTTTCATTACCAAAGAGAGAGAGATAGAAAGGA
GAGAGAGAAGGTAGAGAGAGAGTTTGCGGAGGAGCTTCTTCGTAGGGTTCATCGTTATTA
ACGTTTAATCTCTATCCCCCCTACGTCAGCTGAAGAAAACAATATGGGTGCAGGTGGAAG
AATGCAGGTATCTCCTTCTCCCAAGAAGTCAGAAACCGAAACCCTCAAACGCGTACCCTG
CGAGACTCCTCCCTTCACTGTAGGACAGCTCAAGAAAGCGATCCCACCGCACTGTTTCAA
ACGCTCCATCCCTCGCTCATTCTCCTACCTCATCTGGGACATCATCATAGCCTCCTGCTT
CTACTACGGAATCTTGAACAAGGTGTTCCACAATATCACGGACACGCACGTGGCGCATCA
CCTGTTCTTCACGATACCGCATTACCACGCGATGGAAGCTACCAGGGCGATAAAGCCGAT
ACTGGGAGATTATTACCAGTTCGATGGGACGCCAGTGTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGC
GAAGGAGTGTATCTATGTAGAGCCTGACAGGCAAAGTGAGAAGAAAGGTGTGTTTTGGTA
CAACAATAAGTTATGAGGAAGATGATACATGGTGGAAGAACAAAAGAAGATATTTTCCAT
TGATCTTTCTATTGTTGTCTCTGGTCGTCTTTGTTTTTAAGAAGCTATGTTTTTTCGTTT
CAATAATCTAAATTATCCATTTTGACATTTTGGCTAAAATTATTGTGATATGGGACGTTA
GTAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BO57TF U 1
AF RR4BO57JQ C 181
BS 1 582 RR4BO57TF
BS 583 787 RR4BO57JQ

RD RR4BO57TF 582 0 0
GGCTTCTGACCAGAAACCAGAGAGAGAGTTTCATTACCAAAGAGAGAGAGATAGAAAGGA
GAGAGAGAAGGTAGAGAGAGAGTTTGCGGAGGAGCTTCTTCGTAGGGTTCATCGTTATTA
ACGTTTAATCTCTATCCCCCCTACGTCAGCTGAAGAAAACAATATGGGTGCAGGTGGAAG
AATGCAGGTATCTCCTTCTCCCAAGAAGTCAGAAACCGAAACCCTCAAACGCGTACCCTG
CGAGACTCCTCCCTTCACTGTAGGACAGCTCAAGAAAGCGATCCCACCGCACTGTTTCAA
ACGCTCCATCCCTCGCTCATTCTCCTACCTCATCTGGGACATCATCATAGCCTCCTGCTT
CTACTACGGAATCTTGAACAAGGTGTTCCACAATATCACGGACACGCACGTGGCGCATCA
CCTGTTCTTCACGATACCGCATTACCACGCGATGGAAGCTACCAGGGCGATAAAGCCGAT
ACTGGGAGATTATTACCAGTTCGATGGGACGCCAGTGTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGC
GAAGGAGTGTATCTATGTAGAGCCTGACAGGCAAAGTGAGAA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4BO57JQ 607 0 0
AATGCAGGTATCTCCTTCTCCCAAGAAGTCAGAAACCGAAACCCTCAAACGCGTACCCTG
CGAGACTCCTCCCTTCACTGTAGGACAGCTCAAGAAAGCGATCCCACCGCACTGTTTCAA
ACGCTCCATCCCTCGCTCATTTTCCTACCTCATTTGGGACATCATCATAGCCTCCTGCTT
TTACTACGGAATCTTGAACAAGGTGTTCCACAATATCACGGACACGCACGTGGCGCATCA
CCTGTTTTTCACGATACCGCATTACCACGCGATGGAAGCTACCAGGGCGATAAAGCCGAT
ACTGGGAGATTATTACCAGTTCGATGGGACGCCAGTGTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGC
GAAGGAGTGTATTTATGTAGAGCCTGACAGGCAAGGTGAGAAGAAAGGTGTGTTTTGGTA
CAACAATAAGTTATGAGGAAGATGATACATGGTGGAAGAACAAAAGAAGATATTTTCCAT
TGATCTTTCTATTGTTGTCTCTGGTCGTCTTTGTTTTTAAGAAGCTATGTTTTTTCGTTT
CAATAATCTAAATTATCCATTTTGACATTTTGGCTAAAATTATTGTGATATGGGACGTTA
GTAGTCT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL8405Contig1 852 2 4 U
GGGAACCACATCTGTTACCTTCAAAAAAATCCCCAACCCCTTCCTTCACTCATCTCCCCT
CTCTCCTTGTCCACTCTCATCTGCAATCCACACAGATGGCAGCTTCATCTACCTGTCTTG
TCGGAAACGGATTGTCACTACACACGACCAAACATAAGCTAATCAAAGACTTCCCACGCA
GACAGGTTGGTCTTTCCTCTTCAGTCACCAGAACATCCAAGGCTAATGTCGTGAAGGCTT
CTCTGGATGTGAAGAAACACGAAGGAAGAAGAAGAGACTTTCTCAAAGTCTTGTTAGGAA
ACGCCGGAATCGGTTTGCTCGGAAGCGGCAAAGCGAACGCCGCAGATGAACAACAAGAGG
AATGGGCGGTCCTGGTGGTCCTGGTGGCCCGCTTCAGTTTGGTCAGTCCAAAGCTAAGTT
CCAGATGGAGCCGAACACTGGTGTGACGTTCGATGATGTTGCTGGAGTCGATGAAGCGAA
GCAGGACTTCATGGAGGTTGTGGAGTTTCTGAAGAAACTGTCAGACAGTGCATACGAGAT
AGCTCTAAGCCACATAAGGAACAACCGTGAGGCCATGGATAAGATAGTTGAAGTGCTTCT
AGAGAAAGAAACTATCGGAGGCGACGAGTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGTTCACTGAGAT
CCCGCCGGAAAACCGAGTTCCTGCCTCAATCCCAACATCTACACCAACGCCAGCTTCTGT
CTAGGTAATGAATCTGTATACTTCCGATTTTTCTGTACATTTGTACTGTCAAAACTTGAG
CTCTAGAAATATGTGGTGATGTCCCAATACTGTGTAACACAAGTAAATGTTATAAGTGGA
ATTGGTATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA61TF U 1
AF RR4FA61JQ C 243
BS 1 773 RR4FA61TF
BS 774 774 RR4FA61JQ
BS 775 812 RR4FA61TF
BS 813 852 RR4FA61JQ

RD RR4FA61TF 812 0 0
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AGCTCTAAGCCACATAAGGAACAACCGTGAGGCCATGGATAAGATAGTTGAAGTGCTTCT
AGAGAAAGAAACTATCGGAGGCGACGAGTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGTTCACTGAGAT
CCCGCCGGAAAACCGAGTTCCTGCCTCAATCCCAACATCTACACCAACGCCAGCTTCTGT
CTAGGTAATGAATCTGTATACTTCCGATTTTTCTGTACATTTGTACTGTCAAA*CTTGAG
CTCTAGAAATATGTGGTGATGTCCCAATACTG

QA 1 812 1 812
DS 

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AGATGGAGCCGAACACTGGTGTGACGTTCGATGATGTTGCTGGAGTCGATGAAGCGAAGC
AGGACTTCATGGAGGTTGTGGAGTTTCTGAAGAAACTGTCAGACAGTGCATACGAGATAG
CTTTAAGCCACATAAGGAACAACCGTGAGGCCATGGATAAGATAGTTGAAGTGCTTCTAG
AGAAAGAAACTATCGGAGGCGACGAGTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGTTCACTGAGATCC
CGCCGGAAAACCGAGTTCCTGCCTCAATCCCAACATCTACACCAACGCCAGCTTCTGTCT
AGGTAATGAATCTGTATACTTCCGATTTTTCTGTACATTTGTACTGTCAAAACTTGAGCT
CTAGAAATATGTGGTGATGTCCCAATACTGTGTAACACAAGTAAATGTTATAAGTGGAAT
TGGTATATCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL8406Contig1 1310 2 4 U
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ACAATGGATGATCTTATGTTTGTGAAGGATCCAAGAAGTCTTTCGGGGAAGAAGAATAAG
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ACGTTTCCTGGTGAGAAGAAGAAACATCGCAAAGAGTACATTGCTTTGAAGCGTCGTGAG
AGGATGCTGCAGCGTGGTGTTGATCTTGCTGATATAAACATCCAGTTAGAGCGTTTTGTT
CTGGACAAAGTGGACATGCACTGTTTCCAGCGAATGCATAACCGAGATTGCTCTCAGGTG
AGACGATTAGCAGATGTGTACCGCTTATCTAGTAGCTGCACTGGCTCTGGAAAGAAAAGC
TTTGTGACGGTGACTCGAACGTATCAGACGTGTATGCCATCTGCTAGCGATAAGGTTCGC
ATTGAGAAGCTTATAGGAGCAGGTTAGAGAGGAAGAGAGTAAAAGACTCAGCCAAAAAGC
GACCTACTAGAGAAGAACGGGAGAGAAACAAAAGCAGCGGGAAGAAGAGTTCATATGCTG
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GAGCAGATATTGGAGCATTCGAGGTGCACACCAGAGGCTTTGGATCTAAAATGATGGCAA
AAATGGGATTCATAGAAGGAGGCGGTCTAGGAAAGGAGGGTAAGGGGATAGCACAGCCAA
TAGAAGCTATTCAACGTCCGAAATCACTTGGTTTAGGCCTGGATTTCTCCATTGATACCG
ACGAGGCTAGTACATCAAGCAATAACGCTAAAAGGAACAGATCTTCTTCCTCTGGGAAAC
GCGTCTCCCATGACAGTGGTGGCTCTGGCTCAGGAAGAATTAGAGACAAAAGATTGGGAG
CCATTGAGCAGCACACAACAGGTTTCGGTTCGAGGATGATGGCGAGAATGGGTTTTGTGG
ATGGCTCTGGTTTGGGAAGAGAGTCACAAGGCATAGTCAATCCGTTGGTCGCTGTGAGAC
GTCCTAGAGCACGTGGACTAGGCGCTGAAGGCTAAAGATCGAGTGTTTTTAAGTTTGAAC
AAGACAGTATTGCTTTTAAAAGTTTATGTCCATCTTTGTTCTTTCAGTATGACTACTACT
TTGATGGCTTTAATAAACAAATCTTTTTTCTTAAGACAAGGCTGCTCGTG


BQ
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AF RR4AX31TF U 1
AF RR4AX31JQ C 393
BS 1 743 RR4AX31TF
BS 744 744 RR4AX31JQ
BS 745 777 RR4AX31TF
BS 778 1310 RR4AX31JQ

RD RR4AX31TF 777 0 0
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ACAATGGATGATCTTATGTTTGTGAAGGATCCAAGAAGTCTTTCGGGGAAGAAGAATAAG
AAGACTAAGTTTCTTCCACAGTCTTGGCCTTCAGGGGCACAAAAGAGCAAGCATTCTCGT
ACGTTTCCTGGTGAGAAGAAGAAACATCGCAAAGAGTACATTGCTTTGAAGCGTCGTGAG
AGGATGCTGCAGCGTGGTGTTGATCTTGCTGATATAAACATCCAGTTAGAGCGTTTTGTT
CTGGACAAAGTGGACATGCACTGTTTCCAGCGAATGCATAACCGAGATTGCTCTCAGGTG
AGACGATTAGCAGATGTGTACCGCTTATCTAGTAGCTGCACTGGCTCTGGAAAGAAAAGC
TTTGTGACGGTGACTCGAACGTATCAGACGTGTATGCCATCTGCTAGCGATAAGGTTCGC
ATTGAGAAGCTTATAGGAGCAGGTTAGAGAGGAAGAGAGTAAAAGACTCAGCCAAAAAGC
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AGCAGCCTGTTTCGTTTGTGTCATGTGGTGTTATTGATTCGGAGATCGCTGTGGCAAAGA
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GAGCAGATATTGGAGCATTCGAG*TGCACACCAGAGGCTTTGGATCTAAAATGATGG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR4AX31JQ 918 0 0
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AAGAGAGTAAAAGACTCAGCCAAAAAGCGACCTACTAGAGAAGAACGGGAGAGAAACAAA
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ATTGATTCGGAGATCGCTGTGGCAAAGACCTCTTTTGATGTCAACGATGCAAAACAAGTG
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AGAGGCTTTGGATCTAAAATGATGGCAAAAATGGGATTCATAGAAGGAGGCGGTCTAGGA
AAGGAGGGTAAGGGGATAGCACAGCCAATAGAAGCTATTCAACGTCCGAAATCACTTGGT
TTAGGCCTGGATTTCTCCATTGATACCGACGAGGCTAGTACATCAAGCAATAACGCTAAA
AGGAACAGATCTTCTTCCTCTGGGAAACGCGTCTCCCATGACAGTGGTGGCTCTGGCTCA
GGAAGAATTAGAGACAAAAGATTGGGAGCCATTGAGCAGCACACAACAGGTTTCGGTTCG
AGGATGATGGCGAGAATGGGTTTTGTGGATGGCTCTGGTTTGGGAAGAGAGTCACAAGGC
ATAGTCAATCCGTTGGTCGCTGTGAGACGTCCTAGAGCACGTGGACTAGGCGCTGAAGGC
TAAAGATCGAGTGTTTTTAAGTTTGAACAAGACAGTATTGCTTTTAAAAGTTTATGTCCA
TCTTTGTTCTTTCAGTATGACTACTACTTTGATGGCTTTAATAAACAAATCTTTTTTCTT
AAGACAAGGCTGCTCGTG

QA 1 918 1 918
DS 



AS 1 2

CO CL8407Contig1 311 2 1 U
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CTCATCCCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATG
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TTGAGTTGTCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DZ66JQ C 1
AF RR4DZ66TF U 1
BS 1 311 RR4DZ66TF

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TGTTTTCTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACAT
TTGAGTTGTCG

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR4DZ66TF 311 0 0
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CTCATCCCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATG
GGCTAATCAGGAAGTATGGTCTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGG
AAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTTATGCAGTTGCAGTCATTT
TGTTTTCTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACAT
TTGAGTTGTCG

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 2

CO CL8408Contig1 1049 2 8 U
GGGGAGAGGGTGTTTGCTTTGATTGGGAAGAGGTTTCTTCCCAGGTGGATCAAAGCCGCT
AACTTGCACAATCTCGTCTTCCCTTATGATGATATCGATAAGTTGCTTAGGAAAGATCGT
GAGCCACCCGTTAAATCTGTGTTCTGGGCTTTGTTTGGTGCTATCTATCTGTGCTACGGG
ATGCCGGAAGTCTACCGTGTACTTTTCGAGGTGTTTGGGATGGATCCAGATGCAGATGAT
TGCCAGCCTCGAGCTAGGAGACAGCTTGAGGATGTAGATTATGTCTCTGTTGAATTCGAA
GGCAAGGAGCTTGGCTGGCAAGACATTGCTACTTACAAGCCTCCTGAAGATGCTTTATTC
GCACACCCGAGGCTGTTCAGAGCTTGTGTTCCACCTGGAATGCACCGTTTCAGAGGGAAC
ATTTGGGATTTCGACAGCAAACCTAAAGTCATGCAGGCTTTAGGCTACCCTTTACCGATG
AACGATAGAATCCAAGAGATAACAGAAGCGAGAAACATCGAGCTTGGACTCGGTTTACAG
CTCTGCCTCTTGCATCCTTCAAAGCACAAGTTCGAACACCCTCGGTTCTGTTTCGAGCGG
TTAGAATACGTAGGCCAAAAGATACAGGACATAGCAATGGCGGAGCGTTTGTTGATGAAG
CACCTTGACGCACCAGGCAAATGGCTGCAAGAGAAACATAGGCGTCTGTTGATGAACAAG
TTCTGCGGTAGGTATCTGAGGGAGAAACGTCTTCACAACTTTATAATCTACTCGGAGGAG
GTTCATGATCGGTATGAACACAACAGGAGACTTAGGAATCCCGCGACGACAGCTGTTCAA
CAAGCTATTCACGGACTAGCGTACACCATCTATGGAAAGCCTGATGTTAGGAGGCTCATG
TTTGAGGTTTTCGACTTCGAGCAGATCCAACCTAAAGCAATCGTCTGAAAAAGCCTTTCT
CACTGTGTTGTCTTTTACTGTGTTTTTGTATTCATTATTGTTAGTTTGCTTCTGGATTTG
ATTTCTTTTAGTTTAATTCTTCAAACGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GH28TF U 1
AF RR4GH28JQ C 311
BS 1 676 RR4GH28TF
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RD RR4GH28TF 721 0 0
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AACTTGCACAATCTCGTCTTCCCTTATGATGATATCGATAAGTTGCTTAGGAAAGATCGT
GAGCCACCCGTTAAATCTGTGTTCTGGGCTTTGTTTGGTGCTATCTATCTGTGCTACGGG
ATGCCGGAAGTCTACCGTGTACTTTTCGAGGTGTTTGGGATGGATCCAGATGCAGATGAT
TGCCAGCCTCGAGCTAGGAGACAGCTTGAGGATGTAGATTATGTCTCTGTTGAATTCGAA
GGCAAGGAGCTTGGCTGGCAAGACATTGCTACTTACAAGCCTCCTGAAGATGCTTTATTC
GCACACCCGAGGCTGTTCAGAGCTTGTGTTCCACCTGGAATGCACCGTTTCAGAGGGAAC
ATTTGGGATTTCGACAGCAAACCTAAAGTCATGCAGGCTTTAGGCTACCCTTTACCGATG
AACGATAGAATCCAAGAGATAACAGAAGCGAGAAACATCGAGCTTGGACTCGGTTTACAG
CTCTGCCTCTTGCATCCTTCAAAGCACAAGTTCGAACACCCTCGGTTCTGTTTCGAGCGG
TTAGAATACGTAGGCCAAAAGATACAGGACATAGCAATGGCGGAGCGTTTGTTGATGAAG
CACCTTGACGCACCAG*CAAATGGCTGCA*GAGAAACATAG*CGTCTGTTGATGA
CAGTTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4GH28JQ 739 0 0
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GGCTGTTCAGAGCTTGTGTTCCACCTGGAATGCACCGTTTCAGAGGGAACATTTGGGATT
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TCCAAGAGATAACAGAAGCGAGAAACATCGAGCTTGGACTCGGTTTACAGCTCTGCCTCT
TGCATCCTTCAAAGCACAAGTTCGAACACCCTCGGTTCTGTTTCGAGCGGTTAGAATACG
TAGGCCAAAAGATACAGGACATAGCAATGGCGGAGCGTTTGTTGATGAAGCACCTTGACG
CACCAGGCAAATGGCTGCAAGAGAAACATAGGCGTCTGTTGATGAACAAGTTCTGCGGTA
GGTATCTGAGGGAGAAACGTCTTCACAACTTTATAATCTACTCGGAGGAGGTTCATGATC
GGTATGAACACAACAGGAGACTTAGGAATCCCGCGACGACAGCTGTTCAACAAGCTATTC
ACGGACTAGCGTACACCATCTATGGAAAGCCTGATGTTAGGAGGCTCATGTTTGAGGTTT
TCGACTTCGAGCAGATCCAACCTAAAGCAATCGTCTGAAAAAGCCTTTCTCACTGTGTTG
TCTTTTACTGTGTTTTTGTATTCATTATTGTTAGTTTGCTTCTGGATTTGATTTCTTTTA
GTTTAATTCTTCAAACGTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL8409Contig1 1064 2 2 U
GGAATCACCGTCGGGTAGTAAAACATGCTCCGTCGTCTGATTCTCCGGCAAGTTTCCGGC
GCCGCCGCGGAATCGAAGTTAGGTCGTCGTACTCACGGATTCGATCAACGAAGAGGAATA
CACAGCAGGAACAAGAAGGCGATGGAGCACGTAGCGAAAGGATGGAGCGCGATTAAGGAA
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GGAGCTAAAGAGAACTTTGAGCTTGCTCTTGAGGCTGATAATCTCAACACTCATGCTAGG
TTTTGGCTTTCTAAGCTGCATTTGAAGTATCATGTTCCTGGTGCTTGTAAAGCTATTGGA
GCTGCTTTTCTTGTCGAGGCAGCTGACATGGGTAATGCAGATGCTCAGTATGAGCTTGGT
TGTCGTTTAAGAGTTGAGAATGATCATGTCCAGTCAGACCAGCAAGCGTTTCATTATATA
GAGAATGCTGTTGATCAGCTGCATCCAGGTGCCCTTTACCTTTTAGGGATAGTGTATCTG
ACAGGAGACTGTGTGAAGCAAGATATGGATTCCGCTGTATGGTGTTTCCACAGGGCTTCA
GAGAAGGGACATGCCGGTGCTGCTATAGCGTATGGATCTCTTTTACTTAGAGGTGTGCAA
GTCCCGGAATCTCTAACAAGAATGAACACGGTTGGAGTTCCGCCGTCCAAGAGATCCAGA
GAAAACATGGATATGAACCCGTTAGAGTTGGCCAAAGAGCAGTTCCAAGTCGCTGCAAGA
GCAGGATGTGATCTCGGGCTGAAATGGCTGCAAAGGTTGGAGCAGGAAGAGGAGCTTCTT
TTGAACCAAGAAGATAACGAATGTGCACCTGCATAAGTTCACACTTATATCGCTCCTGTC
CTGTGGAGAGTGAAATCATTAAACATCTTATTGTGCTATTTCTGCTAGAAAGATATCTGT
TTATAGAAATGTGCTAAAATTGAGATCCTAGAGATAAAAGAACCAAACAGAGAACCATGA
AGTCATTGAATCTCTCCATGAAAGTCAGTAATCATCTTGAGAGT


BQ
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GAGCCGGCCC


BQ
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GAGGTCATTAAGTGGAATCATCAGCGTGAGAGTTTTCCTTTTTTACCCTCGGCTGTATCC
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GAGCCGGCCC

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AATCTCCCGACAGGAACCGGAGAAGTGTTCCCGAGGTTGTAAACACGTAGCTGAGCCGGC
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

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GCACTAATGGAGTCCACCGTTGCACTGGCTATGTTGCTGCAGAAATTCGACGTGGAGCTG
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CCTATTACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A575JQ C 1
AF RR4A575TF U 1
BS 1 669 RR4A575TF

RD RR4A575JQ 669 0 0
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CTCATCGTTGTTGAATCCCTTCGTCTATATCCTCAGCCGCCTCTGCTCATCAGACGCACT
CTTAAACCAGAAACCTTGCCTGGAGGATACAAAGGTGAAAAGGAAGGTCATAAAGTTCCA
AAAGGGACTGATATCTTCATTTCCGTGTACAATCTCCATAGATCTCCATACTTTTGGGAT
AACCCACAAGAGTTTGAGCCTGAGAGGTTCTTAAGAACAAAGGAGAGCAATGGTATTGAA
GGCTGGGCTGGCTTTGATCCATCTCGAAGCCCTGGTGCACTCTACCCCAACGAGATCATA
GCAGACTTTGCATTCTTACCATTTGGTGGAGGGCCGAGGAAATGCATTGGAGACCAGTTT
GCACTAATGGAGTCCACCGTTGCACTGGCTATGTTGCTGCAGAAATTCGACGTGGAGCTG
CGTGGAACGCCGGAATCTGTTGAGCTCGTGAGCGGCGCTACGATCCATGCCAAAAATGGG
ATGTGGTGTAAACTTAAGAGAAGATCAAAATGAAATGAGAGAAGCAAGAAAACACCATTG
TGTTTTGTCTTGGTGAAATAGTGAAACTTGGAACTTCAGGATGCATTATTTTGATACAAT
CCTATTACC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4A575TF 669 0 0
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CTCATCGTTGTTGAATCCCTTCGTCTATATCCTCAGCCGCCTCTGCTCATCAGACGCACT
CTTAAACCAGAAACCTTGCCTGGAGGATACAAAGGTGAAAAGGAAGGTCATAAAGTTCCA
AAAGGGACTGATATCTTCATTTCCGTGTACAATCTCCATAGATCTCCATACTTTTGGGAT
AACCCACAAGAGTTTGAGCCTGAGAGGTTCTTAAGAACAAAGGAGAGCAATGGTATTGAA
GGCTGGGCTGGCTTTGATCCATCTCGAAGCCCTGGTGCACTCTACCCCAACGAGATCATA
GCAGACTTTGCATTCTTACCATTTGGTGGAGGGCCGAGGAAATGCATTGGAGACCAGTTT
GCACTAATGGAGTCCACCGTTGCACTGGCTATGTTGCTGCAGAAATTCGACGTGGAGCTG
CGTGGAACGCCGGAATCTGTTGAGCTCGTGAGCGGCGCTACGATCCATGCCAAAAATGGG
ATGTGGTGTAAACTTAAGAGAAGATCAAAATGAAATGAGAGAAGCAAGAAAACACCATTG
TGTTTTGTCTTGGTGAAATAGTGAAACTTGGAACTTCAGGATGCATTATTTTGATACAAT
CCTATTACC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL8412Contig1 569 2 5 U
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ATTAGATTTGTCCGTGGATATCTCGAGAAAATCAAGGAGAAAACCGGCGGTCCAGTTGGC
GGAGGTTTAGGCTGCGGCGCTGGACTCGGTATTGGTCTAACCGGTGGGCTCGGGTTAGAC
GCTTCAGAAGGCTTGAACCATAGTAATGTGGTGTTTGGAATCGGAATGGGTTGTGGTATT
GGGTTGGGGTTCGGGTACGGATTTGGAGTTGGCGGCGGAATCAATTTCGACGACATTGGA
GATTATTTGACCTACGAGAAAAGCTCCGGGTCAAAGTCCAGGTCTGGTAAAGGATTTTTT
TTCAATTGATTATCAAGAAATCGTTGTCAATTGTGTCCCTTTTTTCAGTCAAAGTACTCG
TCCTTTTAAGTCTTCTTTATTTTGGTTTAACCATGTCTTTCGGTTTATTGTATCTCAGTC
TCAGTTCCGGTTAAAAAAAAAAGTCTCAGTTCCGGTTTAAGTTTGTGTATGTAATCTTAT
TAATGGAATCAGTGAGCCTTGTCTTCTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CY71JQ C 1
AF RR4CY71TF U 1
BS 1 501 RR4CY71TF
BS 502 502 RR4CY71JQ
BS 503 520 RR4CY71TF
BS 521 521 RR4CY71JQ
BS 522 569 RR4CY71TF

RD RR4CY71JQ 569 0 0
GGAGATAAGCTCTGGAGTCGATCACCAGTCGTCAAAACCGGGAAATCCGAGTTTCCGGTT
ATTAGATTTGTCCGTGGATATCTCGAGAAAATCAAGGAGAAAACCGGCGGTCCAGTTGGC
GGAGGTTTAGGCTGCGGCGCTGGACTCGGTATTGGTCTAACCGGTGGGCTCGGGTTAGAC
GCTTCAGAAGGCTTGAACCATAGTAATGTGGTGTTTGGAATCGGAATGGGTTGTGGTATT
GGGTTGGGGTTCGGGTACGGATTTGGAGTTGGCGGCGGAATCAATTTTGACGACATTGGA
GATTATTTGACCTACGAGAAAAGCTCCGGGTCAAAGTCCAGGTCTGGTAAAGGATTTTTT
TTCAATTGATTATCAAGAAATCGTTGTCAATTGTGTCCCTTTTTTCAGTCAAAGTACTCG
TCCTTTTAAGTCTTCTTTATTTTGGTTTAACCATGTCTTTCGGTTTATTGTATCTCAGTC
TCAGTTCCGGTTAAAAAAAAAAGTCTCAGTTCCGGTTTAAGTTTGTGTATGTAATCTTAT
TAATGGAATCAGTGAGCCTTGTCTTCTGG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4CY71TF 569 0 0
GGAGATAAGCTCTGGAGTCGATCACCAGTCGTCAAAACCGGGAAATCCGAGTTTCCGGTT
ATTAGATTTGTCCGTGGATATCTCGAGAAAATCAAGGAGAAAACCGGCGGTCCAGTTGGC
GGAGGTTTAGGCTGCGGCGCTGGACTCGGTATTGGTCTAACCGGTGGGCTCGGGTTAGAC
GCTTCAGAAGGCTTGAACCATAGTAATGTGGTGTTTGGAATCGGAATGGGTTGTGGTATT
GGGTTGGGGTTCGGGTACGGATTTGGAGTTGGCGGCGGAATCAATTTCGACGACATTGGA
GATTATTTGACCTACGAGAAAAGCTCCGGGTCAAAGTCCAGGTCTGGTAAAGGATTTTTT
TTCAATTGATTATCAAGAAATCGTTGTCAATTGTGTCCCTTTTTTCAGTCAAAGTACTCG
TCCTTTTAAGTCTTCTTTATTTTGGTTTAACCATGTCTTTCGGTTTATTGTATCTCAGTC
TCAGTTCCGGTTAAAAAAAAA*GTCTCAGTTCCGGTTTAA*TTTGTGTATGTAATCTTAT
TAATGGAATCAGTGAGCCTTGTCTTCTGG

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL8413Contig1 910 2 8 U
GCTCTACCCTGATCTTGAATGGGACTTTAGGCTTCCATGGGTGAAGAGTATCAACGTCAG
TGGTCATAAGTATGGACTTGTCTATGCAGTAGTTGGTTGGATTGTCTGGAGAACCAAAGA
TGATTTGCCTGAGGACCTTGTCTTTCACATCAACTACTTAGGAGCTGATCAACCCACTTT
CACTCTTAATTTCTCTAAAGGGTCGAGCCAAATCATTGGTCAGTACTATCAGTTTATCCG
CCTAGGATTTGAGGGATATAAGAACATAATGGAAAACTGCATGGACAATGCAAGGAGGCT
AAGAGAAGGAATAGAGATGACAGGGAAGTTCAACATTGTGTCTAAGGATATTGGTGTGCC
ACTAGTTGCATTCTCTCTCAAGGACAGTAGCAAACACACAGTGTTTGAGATTGCAGAGTC
TCTGAGGAAGTTTGGGTGGATCATACCAGCGTATACTATGCCTGCTGATGCACAACACAT
TGCTGTGCTTAGAGTTGTTATCAGGGAAGACTTTAGCCGAGGCCTTGCAGACAGACTCAT
CACACACATCTTACAGGTACTGAAAGAGATTGAAGGGCTTCCTAGTCGGATTGCACATAT
AGCAGCAGCTGCAAAGGTTAGTGGTGGTGAAGAGAAGACTGCTAAGATGTCGTTGGAGGA
TATCGCTAAGTATTGGAAACGCCTCGTGGAGAACAAAAGAAATATTGTCTGTTAGGGCCT
AAGGCTAAGTCAGTGAGCCATGCTTCTTTTTTGGACCAGTCATGGTAATAAGGTTTTTAA
TTTAGACCATTGAACTTAAGTTTTTGTTTTTATTTCATGGCATTATAAACCATAAGAGTG
ATTTCTCAAGAGTCTGTTTGAGTCTTGATCAATAGTACTTGTGAGGTAAAAAAAAATAGT
ACTTGGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB18TF U 1
AF RR4FB18JQ C 44
BS 1 692 RR4FB18TF
BS 693 695 RR4FB18JQ
BS 696 718 RR4FB18TF
BS 719 719 RR4FB18JQ
BS 720 723 RR4FB18TF
BS 724 724 RR4FB18JQ
BS 725 743 RR4FB18TF
BS 744 910 RR4FB18JQ

RD RR4FB18TF 743 0 0
GCTCTACCCTGATCTTGAATGGGACTTTAGGCTTCCATGGGTGAAGAGTATCAACGTCAG
TGGTCATAAGTATGGACTTGTCTATGCAGTAGTTGGTTGGATTGTCTGGAGAACCAAAGA
TGATTTGCCTGAGGACCTTGTCTTTCACATCAACTACTTAGGAGCTGATCAACCCACTTT
CACTCTTAATTTCTCTAAAGGGTCGAGCCAAATCATTGGTCAGTACTATCAGTTTATCCG
CCTAGGATTTGAGGGATATAAGAACATAATGGAAAACTGCATGGACAATGCAAGGAGGCT
AAGAGAAGGAATAGAGATGACAGGGAAGTTCAACATTGTGTCTAAGGATATTGGTGTGCC
ACTAGTTGCATTCTCTCTCAAGGACAGTAGCAAACACACAGTGTTTGAGATTGCAGAGTC
TCTGAGGAAGTTTGGGTGGATCATACCAGCGTATACTATGCCTGCTGATGCACAACACAT
TGCTGTGCTTAGAGTTGTTATCAGGGAAGACTTTAGCCGAGGCCTTGCAGACAGACTCAT
CACACACATCTTACAGGTACTGAAAGAGATTGAAGGGCTTCCTAGTCGGATTGCACATAT
AGCAGCAGCTGCAAAGGTTAGTGGTGGTGAAGAGAAGACTGCTAAGATGTCGTTGGAGGA
TATCGCTAAGTATTGGAAACGCCTCGTGGAGAC**AAAGAAATATTGTCTGTTAGGGC*T
AAG*CTAAGTCAGTGAGCCATGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4FB18JQ 867 0 0
AAGAGTATCAACGTCAGTGGTCATAAGTATGGACTTGTCTATGCAGTAGTTGGTTGGATT
GTCTGGAGAACCAAAGATGATTTGC*TGAGGAC*TTGTCTTTCACATCAACTACTTAGGA
GCTGATCAACCCACTTTCACTCTTAATTTCTCTAAAGGGTCGAGCCAAATCATTGGTCAG
TACTATCAGTTTATCCGCCTAGGATTTGAGGGATATAAGAACATAATGGAAAACTGCATG
GACAATGCAAGGAGGCTAAGAGAAGGAATAGAGATGACAGGGAAGTTCAACATTGTGTCT
AAGGATATTGGTGTGCCACTAGTTGCATTCTCTCTCAAGGACAGTAGCAAACACACAGTG
TTTGAGATTGCAGAGTTTCTGAGGAAGTTTGGGTGGATCATACCAGCGTATACTATGCCT
GCTGATGCACAACACATTGCTGTGCTTAGAGTTGTTATCAGGGAAGACTTTAGCCGAGGC
CTTGCAGACAGACTCATCACACACATCTTACAGGTACTGAAAGAGATTGAAGGGCTTCCT
AGTCGGATTGCACATATAGCAGCAGCTGCAAAGGTTAGTGGTGGTGAAGAGAAGACTGCT
AAGATGTCGTTGGAGGATATCGCTAAGTATTGGAAACGCCTCGTGGAGAACAAAAGAAAT
ATTGTCTGTTAGGGCCTAAGGCTAAGTCAGTGAGCCATGCTTCTTTTTTGGACCAGTCAT
GGTAATAAGGTTTTTAATTTAGACCATTGAACTTAAGTTTTTGTTTTTATTTCATGGCAT
TATAAACCATAAGAGTGATTTCTCAAGAGTCTGTTTGAGTCTTGATCAATAGTACTTGTG
AGGTAAAAAAAAATAGTACTTGGGAGC

QA 1 867 1 867
DS 



AS 1 2

CO CL8414Contig1 700 2 2 U
TTCCTCGGCTCATCTCTCGTCTCTCTCTCTCCGCGATCAGATCGCAAAACCAAAATCGTA
TCGAATCCACGACTTTGATCAAATATGACCCTTGGCTCCGGAGGGACGAGTGTCGTTGTC
CCAAGGAATTTCCGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGGAGATGGA
ACTGTTAGCTATGGAATGGATGATGGTGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACT
ATCATTGGTCCTCACAACACCGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGT
GACAAAGATTACCCTGAGAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGACT
TGTGTCAACCATGAAACAGGAGTTGTGGATCCTAAGAAGTTCGGTCTTCTTGCCAACTGG
CAAAGGGAGTACACAATGGAAGATATACTGGTACAGCTGAAGAAAGAAATGACTGCCTCG
CATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGAAATCT
TCTTCTGCTTTGCTTAAAAAAATATTTGCCCCCTTCTAACACTAAAGTATGTATCTGGGG
GTAATCCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTATGAATTATAAAATGGTCTCTGGATGGTGGTT
ATGTTGTTCGATTGATCATCTGAAGTTTCACTGTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RR4F501TF U 1
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ATCATTGGTCCTCACAACACCGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGT
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TCTTCTGCTTTGCTTAAAAAAATATTTGCCCCCTTCTAACACTAAAGTATGTATCTGGGG
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DS 

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TATCATTGGTCCTCACAACACCGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTG
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TTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTTGTGGATCCTAAGAAGTTCGGTCTTCTTGCCAACTG
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TATGTTGTTCGATTGATCATCTGAAGTTTCACTGTTTAATC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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GATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTACAAAACCA
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BQ
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AF RR4BC03JQ C 1
AF RR4BC03TF U 100
BS 1 99 RR4BC03JQ
BS 100 659 RR4BC03TF

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GATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTACAAAACCA
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TGCAAACTCGGAAGCCGCTCGGATGTACAGCGAAAACAAGCGTGAGTACAACAGAAAAGT
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TGAATTATTCACTTTTTTAC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL8416Contig1 966 2 8 U
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ATCTAGCAGACCGAGTCATTGTCTATGAAGGACAACCATCCATTGATTGTATTGCAAATT
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GACGGGATCCCACCAATTTCAGACCAAGAATCAACAAATTAGAGTCGACTAAAGACAGGG
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TAGAGCATGATCTGGATAAAACATTGTCTGAATTCAACGAAGGTCTTTCGCTCTGAGGAA
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CTTCCAACCTTTTTCTGAATACTTCGCAAGGTTTTCTATTAACTGAACAGTAAAACTCTT
TGAATCGTTTTTAACCTTTTTTGGCATTTGTACTTCTTTACTGTAATGTTATTATATGGA
TTTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4H665TF U 1
AF RR4H665JQB C 134
BS 1 640 RR4H665TF
BS 641 641 RR4H665JQB
BS 642 645 RR4H665TF
BS 646 646 RR4H665JQB
BS 647 702 RR4H665TF
BS 703 703 RR4H665JQB
BS 704 713 RR4H665TF
BS 714 966 RR4H665JQB

RD RR4H665TF 713 0 0
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TTAATGTTTCGTACAAGCCACAAAAGATCAGCCCGAGGTTTCAAAATTCTGTTAGGCATT
TGCTACATCAAAAGATTCGGGATTCTTACATGCATCCTCAGTTTGTGTCGGACGTGATGA
AACCGCTTCAGATCGAGCAGTTGATGGATCAGGAAGTTGTCAATCTCTCAGGAGGAGAGC
TGCAGAGGGTTGCACTAGCTCTGTGCCTCGGAAAACCTGCAGATATATACCTGATTGATG
AGCCAAGTGCATACCTCGATTCAGAGCAACGTATTGTGGCTTCTAAAGTGATTAAGCGAT
TCATTCTCCATGCAAAGAAAACTGCATTTATAGTGGAGCATGACTTTATAATGGCTACCT
ATCTAGCAGACCGAGTCATTGTCTATGAAGGACAACCATCCATTGATTGTATTGCAAATT
GTCCTCAATCACTACTCAGTGGAATGAATCTCTTCCTCTCTCATCTGAACATCACCTTCA
GACGGGATCCCACCAATTTCAGACCAAGAATCAACAAATTAGAGTCGACTAAAGACAGGG
AGCAAAAGTCTGCTGGCTCATACTACTACTTGGACGATTA*GACA*CTACCATGAGAACA
TAGAGCATGATCTGGATAAAACATTGTCTGAATTCAACGAAG*TCTTTCGCTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4H665JQB 833 0 0
AAGATCGGGA
TCTTACATGCATCCTCAGTT*GTGTCGGACGTGATGAAACCGCTTCAGATCGAGCAGTTG
ATGGATCAGGAAGTTGTCAATCTCTCAGGAGGAGAGCTGCAGAGGGTTGCACTAGCTCTG
TGCCTCGGAAAACCTGCAGATATATACCTGATTGATGAGCCAAGTGCATACCTCGATTCA
GAGCAACGTATTGTGGCTTCTAAAGTGATTAAGCGATTCATTCTCCATGCAAAGAAAACT
GCATTTATAGTGGAGCATGACTTTATAATGGCTACCTATCTAGCAGACCGAGTCATTGTC
TATGAAGGACAACCATCCATTGATTGTATTGCAAATTGTCCTCAATCACTACTCAGTGGA
ATGAATCTCTTCCTCTCTCATCTGAACATCACCTTCAGACGGGATCCCACCAATTTCAGA
CCAAGAATCAACAAATTAGAGTCGACTAAAGACAGGGAGCAAAAGTCTGCTGGCTCATAC
TACTACTTGGACGATTAAGACAACTACCATGAGAACATAGAGCATGATCTGGATAAAACA
TTGTCTGAATTCAACGAAGGTCTTTCGCTCTGAGGAAGTTGATCTGTGAGCTTGCAACCA
TCTTTTCCTGAGGTCCTAAGGAGATGTTTCTCTTCTCAAGCTTTTGATTGTTTGTTCTAT
CAGTTTTGCTTCTCACATTTTCCATTGCCGTCTTCCTCTTCCAACCTTTTTCTGAATACT
TCGCAAGGTTTTCTATTAACTGAACAGTAAAACTCTTTGAATCGTTTTTAACCTTTTTTG
GCATTTGTACTTCTTTACTGTAATGTTATTATATGGATTTTAC

QA 11 833 11 833
DS 



AS 1 2

CO CL8417Contig1 746 2 2 U
TTGAGTATCTCTGACCCTCAACAATCTTGCATACCTCCATTGGTAGATAATTTGGCCTGT
TAGAATTCCCAACTTGCAAGCACGGAAGCTGTGTGTGCTGAATACGAAAACCGTATGTTT
CGTAAAAGTATTCAACAACAGATTTCTGGGTGTTTCTTTCATCCACAGGAAACGTCAGTT
CTCGAGTGGCCACAGCAGTCAGGCCAGAAATGCGGTACTTTCGGCGCATATTTCCTCGAT
GGGTCACTTCAACCTTGACACCTCTAAGAGCCTTTTTTATCTTCACACGATCAGCATCAG
ATAAAGGCCGGGATCTAATATCCCTATTCAGCAACTGGCAAACAAATTCAGTCACAGGAA
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GACGAATGCTTTGGTAGAATCCACGCCAGCTCTCCAAGCCATCCCCCAATGATTGCTTTC
TTCCAATATCAGGAGAATAAAATGACCGGGCCACAGGAGTATACTTGGAAGTTGGAAGCT
CACGAAGAACAATATCAAGAACCTGCAGAGCCTCCTGCGGGGCATCAGCTTGTTTCCCTT
GTAGAAACATCCCTAGGTGATGCAGATCAGCACGTGCAGCTAGCTTGATCACAACTTTGA
ACTCCCTTTCTCGTCTTTGTCCCCCAGCACCTTCTTCCTCGTCATGGAGCAAGATTCTGA
ATTCCTTAGAAACAAATGGAAGCGGC


BQ
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AF RR4FM44TF C 1
AF RR4FM44JQ U 3
BS 1 2 RR4FM44TF
BS 3 746 RR4FM44JQ

RD RR4FM44TF 746 0 0
TTGAGTATCTCTGACCCTCAACAATCT*GCATAC*TCCATTGGTAGATAATTTGGCGTGT
TAGAATTCCCAACTTGCAAGCACGGAAGCTGTGTGTGCTGAATACGAAAACCGTATGTTT
CGTAGAAGTATTCAACAACAGATTTCTGGGTGTTTCTTTCATCCACAGGAAACGTCAGTT
CTCGAGTGGCCACAGCAGTCAGGCCAGAAATGCGGTACTTTCGGCGCATATTTCCTCGAT
GGGTCACTTCAACCTTGACACCTCTAAGAGCCTTTTTTATCTTCACACGATCAGCATCAG
ATAAAGGCCGGGATCTAATATCCCTATTCAGCAACTGGCAAACAAATTCAGTCACAGGAA
GTGCCTCAATGAATGCTGTCGATGACATATCAATGTTGAGTGATAAACCCATCTGTGTAG
GACGAATGCTTTGGTAGAATCCACGCCAGCTCTCCAAGCCATCCCCCAATGATTGCTTTC
TTCCAATATCAGGAGAATAAAATGACCGGGCCACAGGAGTATACTTGGAAGTTGGAAGCT
CACGAAGAACAATATCAAGAACCTGCAGAGCCTCCTGCGGGGCATCAGCTTGTTTCCCTT
GTAGAAACATCCCTAGGTGATGCAGATCAGCACGTGCAGCTAGCTTGATCACAACTTTGA
ACTCCCTTTCTCGTCTTTGTCCCCCAGCACCTTCTTCCTCGTCATGGAGCAAGATTCTGA
ATTCCTTAGAAACAAATGGAAGCGGC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4FM44JQ 744 0 0
GAGTATCTCTGACCCTCAACAATCTTGCATACCTCCATTGGTAGATAATTTGGCCTGTTA
GAATTCCCAACTTGCAAGCACGGAAGCTGTGTGTGCTGAATACGAAAACCGTATGTTTCG
TAAAAGTATTCAACAACAGATTTCTGGGTGTTTCTTTCATCCACAGGAAACGTCAGTTCT
CGAGTGGCCACAGCAGTCAGGCCAGAAATGCGGTACTTTCGGCGCATATTTCCTCGATGG
GTCACTTCAACCTTGACACCTCTAAGAGCCTTTTTTATCTTCACACGATCAGCATCAGAT
AAAGGCCGGGATCTAATATCCCTATTCAGCAACTGGCAAACAAATTCAGTCACAGGAAGT
GCCTCAATGAATGCTGTCGATGACATATCAATGTTGAGTGATAAACCCATCTGTGTAGGA
CGAATGCTTTGGTAGAATCCACGCCAGCTCTCCAAGCCATCCCCCAATGATTGCTTTCTT
CCAATATCAGGAGAATAAAATGACCGGGCCACAGGAGTATACTTGGAAGTTGGAAGCTCA
CGAAGAACAATATCAAGAACCTGCAGAGCCTCCTGCGGGGCATCAGCTTGTTTCCCTTGT
AGAAACATCCCTAGGTGATGCAGATCAGCACGTGCAGCTAGCTTGATCACAACTTTGAAC
TCCCTTTCTCGTCTTTGTCCCCCAGCACCTTCTTCCTCGTCATGGAGCAAGATTCTGAAT
TCCTTAGAAACAAATGGAAGCGGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL8418Contig1 663 2 1 U
GGACTTTTCAATCGGAAATCAAATCGTCCTCTCTCTTAGCTCGTCGATGTTGCCTCTGAT
GAGGGAAGGAGGAAGGATGACAGGAGGATCCGAGAGGAAGACGATACTGGTGGGTCTGAT
TCTAGCCCTCGTTCTCGGCGTCGCTGTTTACTTAAGGCTGTGGACAATCGATTACACTCT
ATCGTCTGACGACACAGAACGCTTAAGGAGACAGTTTGATTTGGCTAATAGGGAAGCAAT
GGATGAATCCGCAGAATGGCGGAGAATGTTTGACAGTGAAGCTGAGAAAGCTTCTAAGTG
TAACACAGAGCTGGCACTGATTAAGGAGTCATCTGGGAATGGAAACGCATTTACTCTCAA
TCAAAAGTTAGAGTCGTTGCACAAGGAAAATACGGCGTTGCTCAATGAGATAGAGACATT
AAAACAAGAGCTGGAAGCTTCAAGGTTAAAGTGCCGTTCGAGAGAAGCACCCCGTTAGAT
TGAATTTTCCTAGTAGTAGTAGACATCCAGCGTTTGATATTGCTCTCGCTCATTCAGCTG
CTGTGCCTTTGCTGGTAAGAAAATCTTAAATATTTTCATTCTCATGTATAACACTTGTTG
TAGTAGACTATTCGTAGCCTTTTTCTTGGAACAATCAATCACTAGCAATACATGTATTAA
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 

AF RR4FE81TF U 1
AF RR4FE81JQ C 185
BS 1 663 RR4FE81TF

RD RR4FE81TF 663 0 0
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GAGGGAAGGAGGAAGGATGACAGGAGGATCCGAGAGGAAGACGATACTGGTGGGTCTGAT
TCTAGCCCTCGTTCTCGGCGTCGCTGTTTACTTAAGGCTGTGGACAATCGATTACACTCT
ATCGTCTGACGACACAGAACGCTTAAGGAGACAGTTTGATTTGGCTAATAGGGAAGCAAT
GGATGAATCCGCAGAATGGCGGAGAATGTTTGACAGTGAAGCTGAGAAAGCTTCTAAGTG
TAACACAGAGCTGGCACTGATTAAGGAGTCATCTGGGAATGGAAACGCATTTACTCTCAA
TCAAAAGTTAGAGTCGTTGCACAAGGAAAATACGGCGTTGCTCAATGAGATAGAGACATT
AAAACAAGAGCTGGAAGCTTCAAGGTTAAAGTGCCGTTCGAGAGAAGCACCCCGTTAGAT
TGAATTTTCCTAGTAGTAGTAGACATCCAGCGTTTGATATTGCTCTCGCTCATTCAGCTG
CTGTGCCTTTGCTGGTAAGAAAATCTTAAATATTTTCATTCTCATGTATAACACTTGTTG
TAGTAGACTATTCGTAGCCTTTTTCTTGGAACAATCAATCACTAGCAATACATGTATTAA
GAT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FE81JQ 479 0 0
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ACAGAGCTGGCACTGATTAAGGAGTCATCTGGGAATGGAAACGCATTTACTCTCAATCAA
AAGTTAGAGTCGTTGCACAAGGAAAATACGGCGTTGCTCAATGAGATAGAGACATTAAAA
CAAGAGCTGGAAGCTTCAAGGTTAAAGTGCCGTTCGAGAGAAGCACCCCGTTAGATTGAA
TTTTCCTAGTAGTAGTAGACATCCAGCGTTTGATATTGCTCTCGCTCATTCAGCTGCTGT
GCCTTTGCTGGTAAGAAAATCTTAAATATTTTCATTCTCATGTATAACACTTGTTGTAGT
AGACTATTCGTAGCCTTTTTCTTGGAACAATCAATCACTAGCAATACATGTATTAAGAT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL8419Contig1 733 2 2 U
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GTCTGCTGCTTCCCGCTCCAGGAGCTGGGTCGATTAGTTCTATGGCTTTTAACTTTTCTT
TCTCTTCCTCCTCCAGGTTTTCTATTTCCCGAAGCTGACGAAGAGGTCGATCGTGATCGC
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TGTTTCTTGGGTCCCAAGAAAAAGCTTGTTTATACTACTTTGCAAGTGTGAATTCAGTTC
TACTTCTTCAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO96TF U 1
AF RR4AO96JQ C 1
BS 1 556 RR4AO96TF
BS 557 733 RR4AO96JQ

RD RR4AO96TF 556 0 0
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QA 1 556 1 556
DS 

RD RR4AO96JQ 733 0 0
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CAGAGACTACGGCGGATCCCACCGTCCGAACGCATTGGCAGCAGCGAGATGCTTAGCCTC
GTCTGCTGCTTCCCGCTCCAGGAGCTGGGTCGATTAGTTCTATGGCTTTTAACTTTTCTT
TCTCTTCCTCCTCCAGGTTTTCTATTTCCCGAAGCTGACGAAGAGGTCGATCGTGATCGC
GGTTTTGTTTATGGCTCATATTCAACCGCCATCGCTTCATATTAGTATCACTTTCATTTG
CATTTTGAGTGTTCAAATATCAAACCCAGCTCATATTGGTGTCTCTACACTTTGGTTAAG
TAGTCTTCTTTGTGTTAATATTGGGTTTTTTAAAAAGGTTGATGAACAGTATTAGTTAGA
TCTTCATTTTCTTTTGTTCTCAAGTCTCAGTCTTTCTTGTTCTGTGAGATTGGCTTTGTT
TGTTTCTTGGGTCCCAAGAAAAAGCTTGTTTATACTACTTTGCAAGTGTGAATTCAGTTC
TACTTCTTCAACC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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TTGTTTACTGCCAAGTTAGAGAAGCTAAGAGATCGCTCCTCAACTTCTTCTACGCTCAAG
TCGGCAGGAAAGAGAAGGAGAAGCTGGGTGGGATGTTGGACGAAGACCCACAACTAATGG
AACGAAGAGGAACCTTAGCCAAACGGCTCGAGCTCTACAAACAAGCTAGAGATGACATCG
ATGCTGTGGCTTGGAAGTAAGGTGTGATCAAAGGGAATATTCTTTATATCTTTAATTCCT
TTTGCTCGTGTGAGCACTACTGTATTATTACTAGATATGTTGGAAGTTCTAACCTTCAAT
CCATTGCTGCACGTGCACACACGTTAACTCATATTGTATTCGGTCGCTGATGTCTATCTC
CTACTTTTTGGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4H604TF U 1
AF RR4H604JQB C 34
BS 1 582 RR4H604TF
BS 583 583 RR4H604JQB
BS 584 614 RR4H604TF
BS 615 615 RR4H604JQB

RD RR4H604TF 614 0 0
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ATGCCCCACCACAAAACGCAGACATCCACTCCGATAATCACTTCAGGAAGATCGGATCCA
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TTGTTTACTGCCAAGTTAGAGAAGCTAAGAGATCGCTCCTCAACTTCTTCTACGCTCAAG
TCGGCAGGAAAGAGAAGGAGAAGCTGGGTGGGATGTTGGACGAAGACCCACAACTAATGG
AACGAAGAGGAACCTTAGCCAAACGGCTCGAGCTCTACAAACAAGCTAGAGATGACATCG
ATGCTGTGGCTTGGAAGTAAGGTGTGATCAAAGGGAATATTCTTTATATCTTTAATTCCT
TTTGCTCGTGTGAGCACTACTGTATTATTACTAGATATGTTGGAAGTTCTAACCTTCAAT
CCATTGCTGCACGTGCACACACGTTAACTCATATTGTATTCG*TCGCTGATGTCTATCTC
CTACTTTTTGGTGT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4H604JQB 582 0 0
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ATAATCACTTCAGGAAGATCGGATCCAACGTGAGTGCGTACATAAACATGGTGTGTGATA
CATTGAGAATCTCTCTTCCCAAAGCTGTTGTTTACTGCCAAGTTAGAGAAGCTAAGAGAT
CGCTCCTCAACTTTTTTTACGCTCAAGTCGGCAGGAAAGAGAAGGAGAAGCTGGGTGGGA
TGTTGGACGAAGACCCACAACTAATGGAACGAAGAGGAACCTTAGCCAAACGGCTCGAGC
TTTACAAACAAGCTAGAGATGACATCGATGCTGTGGCTTGGAAGTAAGGTGTGATCAAAG
GGAATATTCTTTATATCTTTAATTCCTTTTGCTCGTGTGAGCACTACTGTATTATTACTA
GATATGTTGGAAGTTTTAACCTTCAATCCATTGCTGCACGTGCACACACGTTAACTCATA
TTGTATTCGGTCGCTGATGTCTATTTCCTACTTTTTGGTGTG

QA 1 582 1 582
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8422Contig1 994 2 2 U
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AGGATGGTGGTGGAGAAACGCGGACCGAGGAACTGGTCGGCGATCAGCAAATCGATCCCA
GGTCGATCCGGCAAATCGTGCCGGTTACGGTGGTGCAACCAGCTGTCTCCGGAGGTCGAG
CACCGTCCGTTCTCGTCGGAGGAAGACGAGACGATCCTCTCCGCCCGCGCGAAGTTCGGC
AACAAGTGGGCCACCATCGCCCGTCTTCTCAACGGACGCACGGACAACGCCGTGAAGAAC
CACTGGAACTCGACGCTCAAGCGAAAGTTCGTAGCCGGAGGAGGAGGAGACTGTGATGTC
GTCGTCGCGAAGAGGAGATCGGTGAGCTCTGAGTCTTCTCCTCCGGTGGACACTGGGTTG
TACATGATCAGCCCTGAGAGTCCCACCAGCACGATTCCATCTCCGCCGTCTCCGATGCCG
GTTTCCGGTGGATTCACGGTGGTGTCGTCGGAGGAGGAGGATCCGGCAACGTCGTTGAGC
CTGTCGCTGTCACTTCCCGGAGTTGTTGTCAGCCAGGGGTCGAGGAACACGGGTTCGAGC
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GAGGCGGCGCGGAGAGATGAGTTTATGAGGGTGGTGCAGGAGATGATTAAGGCGGAAGTG
AGGAGTTATATGTCGAAGATTCAGAAAGATAGTGGTGGATTCGCTGTCGGAGGAGGTGGA
GGTTTATACGGAACTGGTAACTGCGGTTTCAGGGATAGTGGATTATTACCAAAGGTCGAG
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TCAGTTTCGGGTTGTGGTCAAATATTAAAAAAAAAATGTAGAGTGGAATTAAATTTGGAT
GATATAAAGTTTATGGAAATAATCTTTATTCAAT


BQ
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AF RR4BI82TF U 1
AF RR4BI82JQ C 190
BS 1 699 RR4BI82TF
BS 700 994 RR4BI82JQ

RD RR4BI82TF 704 0 0
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AGGATGGTGGTGGAGAAACGCGGACCGAGGAACTGGTCGGCGATCAGCAAATCGATCCCA
GGTCGATCCGGCAAATCGTGCCGGTTACGGTGGTGCAACCAGCTGTCTCCGGAGGTCGAG
CACCGTCCGTTCTCGTCGGAGGAAGACGAGACGATCCTCTCCGCCCGCGCGAAGTTCGGC
AACAAGTGGGCCACCATCGCCCGTCTTCTCAACGGACGCACGGACAACGCCGTGAAGAAC
CACTGGAACTCGACGCTCAAGCGAAAGTTCGTAGCCGGAGGAGGAGGAGACTGTGATGTC
GTCGTCGCGAAGAGGAGATCGGTGAGCTCTGAGTCTTCTCCTCCGGTGGACACTGGGTTG
TACATGATCAGCCCTGAGAGTCCCACCAGCACGATTCCATCTCCGCCGTCTCCGATGCCG
GTTTCCGGTGGATTCACGGTGGTGTCGTCGGAGGAGGAGGATCCGGCAACGTCGTTGAGC
CTGTCGCTGTCACTTCCCGGAGTTGTTGTCAGCCAGGGGTCGAGGAACACGGGTTCGAGC
AGCAGCAACAACGCGTTGCTGTTTCAGCGGTTTGAGAGTCAGATGAGGATTGATAGTGGA
GAGGCGGCGCGGAGAGATGAGTTTATGAGGGTGGTGCAG
AGATG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4BI82JQ 805 0 0
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GCCACCATCGCCCGTCTTCTCAACGGACGCACGGACAACGCCGTGAAGAACCACTGGAAC
TCGACGCTCAAGCGAAAGTTCGTAGCCGGAGGAGGAGGAGACTGTGATGTCGTCGTCGCG
AAGAGGAGATCGGTGAGCTCTGAGTCTTCTCCTCCGGTGGACACTGGGTTGTACATGATC
AGCCCTGAGAGTCCCACCAGCACGATTCCATCTCCGCCGTCTCCGATGCCGGTTTCCGGT
GGATTCACGGTGGTGTCGTCGGAGGAGGAGGATCCGGCAACGTCGTTGAGCCTGTCGCTG
TCACTTCCCGGAGTTGTTGTCAGCCAGGGGTCGAGGAACACGGGTTCGAGCAGCAGCAAC
AACGCGTTGCTGTTTCAGCGGTTTGAGAGTCAGATGAGGATTGATAGTGGAGAGGCGGCG
CGGAGAGATGAGTTTATGAGGGTGGTGCAGGAGATGATTAAGGCGGAAGTGAGGAGTTAT
ATGTCGAAGATTCAGAAAGATAGTGGTGGATTCGCTGTCGGAGGAGGTGGAGGTTTATAC
GGAACTGGTAACTGCGGTTTCAGGGATAGTGGATTATTACCAAAGGTCGAGTAGTTTTTG
GCATGTGAGAGAGAGTTAATTAGTCATCGATTTGGAGATTTGAAGAGCAATTCAGTTTCG
GGTTGTGGTCAAATATTAAAAAAAAAATGTAGAGTGGAATTAAATTTGGATGATATAAAG
TTTATGGAAATAATCTTTATTCAAT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL8423Contig1 707 2 4 U
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CGTTGAGAAAATCAGCTTTAGCGGCTCTTGCCAAGACATTAACTGTACCGCAGCTAGCTT
ATCTGAGGGAGCAGTTTACATCGTTGGAGCCAAGCAAGGATGGATATTTATCCATGCAGA
ATTTCAAAACAGCAATTCTTAAGAGCTCAACAGATGCTATGAAGGATTCAAGAGTCTTAG
ATTATGTTCACATGATAAGTTGTCTTCAATACAAGAAACTAGACTTTGAAGAGTTCTGTG
CTTCAGCATTAAGTGTTTATCAGATGGAAGCAATGGAAACATGGGAGCAACATGCACGCC
GTGCTTATGAGTTGTTTGAGAAAGATGGGAATAGATCCATCATTATTGAGGAACTTGCAT
CAGAACTCAGACTCGGGCCATCATCAGTCCCTATGCATGATGCACGTCAGGATTGGATAA
GACAATCAGATGGAAAGCTTAGTTTCTTGGGTTTTGTCAGACTACTACTACACGGTGGGT
CTTCTCAGACATAACAGAAAGCTTAGGAGGAGTAAGGAGATTGTTTTAGATGTGAAAAGA
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BQ
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AF RR4CV91JQ C 1
AF RR4CV91TF U 39
BS 1 38 RR4CV91JQ
BS 39 643 RR4CV91TF
BS 644 644 RR4CV91JQ
BS 645 707 RR4CV91TF

RD RR4CV91JQ 707 0 0
GGAAGATACCGTGTGATATGATCATATACAAGCTTGTGAGAGTGTACATAATGTCAACTT
CGTTGAGAAAATCAGCTTTAGCGGCTCTTGCCAAGACATTAACTGTACCGCAGCTAGCTT
ATCTGAGGGAGCAGTTTACATCGTTGGAGCCAAGCAAGGATGGATATTTATCCATGCAGA
ATTTCAAAACAGCAATTCTTAAGAGCTCAACAGATGCTATGAAGGATTCAAGAGTCTTAG
ATTATGTTCACATGATAAGTTGTCTTCAATACAAGAAACTAGACTTTGAAGAGTTCTGTG
CTTCAGCATTAAGTGTTTATCAGATGGAAGCAATGGAAACATGGGAGCAACATGCACGCC
GTGCTTATGAGTTGTTTGAGAAAGATGGGAATAGATCCATCATTATTGAGGAACTTGCAT
CAGAACTCAGACTCGGGCCATCATCAGTCCCTATGCATGATGCACGTCAGGATTGGATAA
GACAATCAGATGGAAAGCTTAGTTTCTTGGGTTTTGTCAGACTACTACTACACGGTGGGT
CTTCTCAGACATAACAGAAAGCTTAGGAGGAGTAAGGAGATTGTTTTAGATGTGAAAAGA
TGCAACTAAGTGTTCATGTATAAGGTTTTAAGTCAAAGATTCAATAACTATGTCAGTGTC
TGTGTGTGTGGTGTGTATGAGACTTATTCAATATCTCTTTAACCACG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4CV91TF 669 0 0
AGAGTGTACATAATGTCAACTTCGTTGAGAAAATCAGCTTTAGCGGCTCTTGCCAAGACA
TTAACTGTACCGCAGCTAGCTTATCTGAGGGAGCAGTTTACATCGTTGGAGCCAAGCAAG
GATGGATATTTATCCATGCAGAATTTCAAAACAGCAATTCTTAAGAGCTCAACAGATGCT
ATGAAGGATTCAAGAGTCTTAGATTATGTTCACATGATAAGTTGTCTTCAATACAAGAAA
CTAGACTTTGAAGAGTTCTGTGCTTCAGCATTAAGTGTTTATCAGATGGAAGCAATGGAA
ACATGGGAGCAACATGCACGCCGTGCTTATGAGTTGTTTGAGAAAGATGGGAATAGATCC
ATCATTATTGAGGAACTTGCATCAGAACTCAGACTCGGGCCATCATCAGTCCCTATGCAT
GATGCACGTCAGGATTGGATAAGACAATCAGATGGAAAGCTTAGTTTCTTGGGTTTTGTC
AGACTACTACTACACGGTGGGTCTTCTCAGACATAACAGAAAGCTTAGGAGGAGTAAGGA
GATTGTTTTAGATGTGAAAAGATGCAACTAAGTGTTCATGTATAAGGTTTTAAGTCAAAG
ATTCA*TAACTATGTCAGTGTCTGTGTGTGTGGTGTGTATGAGACTTATTCAATATCTCT
TTAACCACG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL8424Contig1 756 2 7 U
GGGAGCTTTCGTTGATCTTGTTTCTCTTTTCAGGCAAGCATGGAGGAAACTGGGTGCTAT
GCCCCCTGAGGAAGCGATGGAGAAGTATATTGAGATCGTCACTCAGCTTTATCCAACTTG
GTTAGACGGTGGCGTGAAAGCTGGAAGTCGAAATGATGCAGTCTCAAGCTCAGGAGGAAC
CATGGGGCCAGTTTTCAGCTCTTTGGTTTATGAAGAGGAATCTCAAAATGAGTTGAAGAT
TGATGCCATCCATGCGTTTGCTAGAGAAGGAGAAGTCGAGAATCTGATTAAAAGCATTAA
AAGCGGCATTCCAGTAAATGCAAGGGGTTAGTCCTCTCCTTCTGTACGTACATTGTCGTG
ATGTTTGGATACTTTGCTTTCCAATTTCCCTGTAAACTGCAGACAGTGAAGGTCGCACAC
CACTGCACTGGGGCATAGACCGTGGCCACCTCGACACTGCTAAACTTCTGGTCGATAAGA
ACGCCGATGTGAATGCTAAGGACAAAGAAGGGAAAACCCCGTTGCATTACGCTGTTGTGT
GCGACAGAGAAGCCATCTCCGAGTTTCTGGTGAAGCAGAAAGCTGATGATACAGCTTCTA
AAGATGATGAAAGAAACTCCCCGCTCGATCTCTGCGAATCAAACTGGCCCTGGTTTCGAG
ATTCTGCAAAGCAGACAGACTGAAAACAAATACTAACTGCAGAGATGACCACACAAATGT
ATATGATGAAGTGACTTAGTAGACTCTCTTTTTTCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FU04TF U 1
AF RR4G315TF U 1
BS 1 685 RR4FU04TF
BS 686 686 RR4G315TF
BS 687 716 RR4FU04TF
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QA 1 756 1 756
DS 

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TGATGCCATCCATGCGTTTGCTAGAGAAGGAGAAGTCGAGAATCTGATTAAAAGCATTAA
AAGCGGCATTCCAGTAAATGCAAGGGGTTAGTCCTCTCCTTCTGTACGTACATTGTCGTG
ATGTTTGGATACTTTGCTTTCCAATTTCCCTGTAAACTGCAGACAGTGAAGGTCGCACAC
CACTGCACTGGGGCATAGACCGTGGCCACCTCGACACTGCTAAACTTCTGGTCGATAAGA
ACGCCGATGTGAATGCTAAGGACAAAGAAGGGAAAACCCCGTTGCATTACGCTGTTGTGT
GCGACAGAGAAGCCATCTCCGAGTTTCTGGTGAAGCAGAAAGCTGATGATACAGCTTCTA
AAGATGATGAAGGAAACTCCCCGCTCGATCTCTGCGAATCAAACTGGCCCTGGTTTCGAG
ATTCTGCAAAGCAGACAGACTGAAAACAAATACTAACTGCAGAGATGACCACACAAATGT
ATATGATGAAGTGACTTAGTA
AGACTCTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GA74TF C 1
AF RR4GA74JQ U 5
BS 1 4 RR4GA74TF
BS 5 677 RR4GA74JQ

RD RR4GA74TF 677 0 0
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CTAGGGCCTCAAGCCTCTCGATCTCCGGCATTTCCTTGAATATCTCCGCCGTCACTAGCC
TCACCGCCTCCGTAGCGAACCCTTTTCCCCAATACTTTCTCGCTAGCACATAACCGATCT
CTTTCCTAATGTTATCGACCGGCATGATCAAGATGTAGCCGATGGGACGGTCGTCCTCTA
AACAGATGGCTCGGAGCCATGGGTGTGTCAAGACCGAATCCGTTATGTATTTTATGGCTT
CTTCTCGGCTCGTGCAAGGCTCCCATGAGCAAAAGCGAGCGACTTCAGCGTCCGTGGCCC
AAACCATGTAGTCGTCAACGTCGGAAAGAGTCATTGGCCGGAGTGATATTCTCCCCGGCG
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ATTGTTTGAGATATCCC

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DS 

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TCTAGTAAACCCAACTTTTTCAAGAACCCTTTGAGATCCCACATTGTCCACGTCAACTAG
GGCCTCAAGCCTCTCGATCTCCGGCATTTCCTTGAATATCTCCGCCGTCACTAGCCTCAC
CGCCTCCGTAGCGAACCCTTTTCCCCAATACTTTCTCGCTAGCACATAACCGATCTCTTT
CCTAATGTTATCGACCGGCATGATCAAAATGTAGCCGATGGGACGGTCGTCCTCTAAACA
GATGGCTCGGAGCCATGGGTGTGTCAAGACCGAATCCGTTATGTATTTTATGGCTTCTTC
TCGGCTCGTGCAAGGCTCCCATGAGCAAAAGCGAGCGACTTCAGCGTCCGTGGCCCAAAC
CATGTAGTCGTCAACGTCGGAAAGAGTCATTGGCCGGAGTGATATTCTCCCCGGCGCCGA
TGAAACAACCAACGTTGGGTGAGTTTCGTTTGAGTCCATCTCCATTTAGGATAATGATTG
TTTGAGATATCCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL8426Contig1 605 2 2 U
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CGATCGACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCCAAGGCAGTGATGTCAGTGTTCATCTTCTTC
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CTCCC


BQ
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AF RR4E585TF C 1
AF RR4E585JQ U 50
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BS 50 605 RR4E585JQ

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TCAACATCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACATTATCCTCAAAAAGAGTTCATTTTC
GAATTGGAACCCAGAGATCCAGCAATAGACTCTCATTTGGAGAACCCATCGCGCTTCTGG
TAACTAGCAACCTCGCCTTCGTTAGGGAAGAAACCCATGAGCCTCCCCGCCGAGTTCTGG
TACGCATACATGAACCCACCCATGAGTCCAATCAGTCCTCCCGTCACCATTGACGGTCCT
TTGATCCCAGGCTTAATCCCTGATAGGTAGCCGACGGTGACGGAAACGCCGGTGATGGTG
GAGAAACGGAGGTAATCGAGTACGCTGAAGTTTCCGACGACTTTTGTGAATGGTGGATTC
CGATCGACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCCAAGGCAGTGATGTCAGTGTTCATCTTCTTC
GATCAATCTACGATTCTCTGGTCTGAATCGAATCTATCTATCTTCTTCTGCTTCCTCTCT
CTCCC

QA 1 605 1 605
DS 

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AATCTTTACTGGTGTCAGCATCATAAGTCATAACAAACAATTTTTGAGCAAGCTCAAATA
TTTATTGATCATCAACATCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACATTATCCTCAAAAAG
AGTTCATTTTCGAATTGGAACCCAGAGATCCAGCAATAGACTCTCATTTGGAGAACCCAT
CGCGCTTCTGGTAACTAGCAACCTCGCCTTCGTTAGGGAAGAAACCCATGAGCCTCCCCG
CCGAGTTCTGGTACGCATACATGAACCCACCCATGAGTCCAATCAGTCCTCCCGTCACCA
TTGACGGTCCTTTGATCCCAGGCTTAATCCCTGATAGGTAGCCGACGGTGACGGAAACGC
CGGTGATGGTGGAGAAACGGAGGTAATCGAGTACGCTGAAGTTTCCGACGACTTTTGTGA
ATGGTGGATTCCGATCGACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCCAAGGCAGTGATGTCAGTGT
TCATCTTCTTCGATCAATCTACGATTCTCTGGTCTGAATCGAATCTATCTATCTTCTTCT
GCTTCCTCTCTCTCCC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL8427Contig1 1299 2 2 U
GCAGCAATGGGTCTGATTAACAGGATCCAAGTCAACGACGAAGAAGGCCGATCTCGCCAG
CGTGTTCTTGCTTTTGCTGCCCGCAAGTATGCGAGTGCGATTGAGAGAAATCCAGATGAT
CATGATGCTTTATACAACTGGGCACTTATTCTCCAGGAAAGTGCTGATAATGTCAGCCCA
GATTCTGTTTCACCATCTAAGGATGATTTGCTCGAGGAAGCTTGTAAGAAGTATGATGAG
GCTACCCGTCTCTGCCCTACCCTCTATGATGCTTACTACAACTGGGCTATCGCAATCTCT
GATAGAGCAAAGATGCGTGGTCGCACCAAGGAAGCTGAAGAATTATGGCAACAGGCGACC
AATAACTATGAAAAGGCTGTCCAGCTCAACTGGAACAGTTCCCAGGCTTTAAACAACTGG
GGACTGGCGTTGCAGGAACTCAGCCAAATTGTTCCTGCAAGAGAGAAGGAAAAAGTGGTC
AGAACTGCAATTAGCAAGTTTAGGGCGGCAATCAGGCTGCAATTTGATTTCCATCGAGCC
ATATACAACCTTGGAACCGTTCTGTATGGGTTAGCAGAAGACACACTTAGAACGGGGGGT
TCAGGAAATGGCAAAGACATTCCTCCGGGTGAGTTATATAGCCAATCTGCCATCTACATC
GCTGCAGCTCATTCGTTGAAGCCAAGTTATTCGATTTACAGCAGCGCTTTGAGGCTCGTT
CGTTCCATGCTACCTCTACCGCATCTTAAGGTTGGATATCTGACGGCACCACCCGTGGGA
AACTCACTCGCTCCTCACAGTGATTGGAAACGCACGGAGTTTGAACTCAATCACGAGAGG
CTACTTCAGGTACTGAAACCTGAAGCAAGGGAAATGGGGAGAAACCTGTCTGGAAAAGCA
AGACAATGAGCACAAACGTGGAGAAGGACGGTAAAAGTGAACATAACAGAGATAGTGTCA
GTGACGACATGTGCTGATCTGACTCTGCCTCCTGGTGCTGGTCTCTGCATTGATACTGTT
CATGGCCCAGTTTACTTGGTAGCAGATTCATGGGAGGCGCTGGATGGATGGCTGGATGCG
ATACGTTTGGTGTATACAATTTATGCGAGAGGGAAGAGTGATGTTTTAGCCGGTATTATT
GCCGCTTAATCACACACACTTTCTTTCTTTTTCATACTTGGACTCTCTCCTTTTTTAAAA
ATCATATATAGTTTCTATCTTTGTATTGACACCCCCATAGCCAGCCAGATGTTTTGATTT
TGTTTTTGCATGAATTCTCGATTTAAAACATTTTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A675TF U 1
AF RR4A675JQ C 554
BS 1 746 RR4A675TF
BS 747 1299 RR4A675JQ

RD RR4A675TF 746 0 0
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CGTGTTCTTGCTTTTGCTGCCCGCAAGTATGCGAGTGCGATTGAGAGAAATCCAGATGAT
CATGATGCTTTATACAACTGGGCACTTATTCTCCAGGAAAGTGCTGATAATGTCAGCCCA
GATTCTGTTTCACCATCTAAGGATGATTTGCTCGAGGAAGCTTGTAAGAAGTATGATGAG
GCTACCCGTCTCTGCCCTACCCTCTATGATGCTTACTACAACTGGGCTATCGCAATCTCT
GATAGAGCAAAGATGCGTGGTCGCACCAAGGAAGCTGAAGAATTATGGCAACAGGCGACC
AATAACTATGAAAAGGCTGTCCAGCTCAACTGGAACAGTTCCCAGGCTTTAAACAACTGG
GGACTGGCGTTGCAGGAACTCAGCCAAATTGTTCCTGCAAGAGAGAAGGAAAAAGTGGTC
AGAACTGCAATTAGCAAGTTTAGGGCGGCAATCAGGCTGCAATTTGATTTCCATCGAGCC
ATATACAACCTTGGAACCGTTCTGTATGGGTTAGCAGAAGACACACTTAGAACGGGGGGT
TCAGGAAATGGCAAAGACATTCCTCCGGGTGAGTTATATAGCCAATCTGCCATCTACATC
GCTGCAGCTCATTCGTTGAAGCCAAGTTATTCGATTTACAGCAGCGCTTTGAGGCTCGTT
CGTTCCATGCTACCTCTACCGCATCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4A675JQ 746 0 0
GAACCGTTCTGTATGGGTTAGCAGAAGACACACTTAGAACGGGGGGTTCAGGAAATGGCA
AAGACATTCCTCCGGGTGAGTTATATAGCCAATCTGCCATCTACATCGCTGCAGCTCATT
CGTTGAAGCCAAGTTATTCGATTTACAGCAGCGCTTTGAGGCTCGTTCGTTCCATGCTAC
CTCTACCGCATCTTAAGGTTGGATATCTGACGGCACCACCCGTGGGAAACTCACTCGCTC
CTCACAGTGATTGGAAACGCACGGAGTTTGAACTCAATCACGAGAGGCTACTTCAGGTAC
TGAAACCTGAAGCAAGGGAAATGGGGAGAAACCTGTCTGGAAAAGCAAGACAATGAGCAC
AAACGTGGAGAAGGACGGTAAAAGTGAACATAACAGAGATAGTGTCAGTGACGACATGTG
CTGATCTGACTCTGCCTCCTGGTGCTGGTCTCTGCATTGATACTGTTCATGGCCCAGTTT
ACTTGGTAGCAGATTCATGGGAGGCGCTGGATGGATGGCTGGATGCGATACGTTTGGTGT
ATACAATTTATGCGAGAGGGAAGAGTGATGTTTTAGCCGGTATTATTGCCGCTTAATCAC
ACACACTTTCTTTCTTTTTCATACTTGGACTCTCTCCTTTTTTAAAAATCATATATAGTT
TCTATCTTTGTATTGACACCCCCATAGCCAGCCAGATGTTTTGATTTTGTTTTTGCATGA
ATTCTCGATTTAAAACATTTTTTCCG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8429Contig1 884 2 2 U
ATGGTGAAGCGAGAATGGCTAAAGCCAAAATGAAACTGACTCAGGTTGGGAATTCCTGAC
GCTCTTTACACATAGTGACACAAGTTTTGAAGTGGAAGTGTAATGTACTTGTTATGTAAC
AATGAATGAAATGAAACAAAGACTGATTCTTCACATAAAGTCAGATTCTTAGCACATGGA
AGAGTAAAATCTTGGCTGTTTATGTGAAGCAAAAGGGTCTGTCTGCAGTGGGGTTGTGAG
CTCCAGGAAGAAGTCTTTTTGCAAGGATCTGTTACCAGAAAGCCAAGGTAATGATCAAGG
TGACGATGATGAAGTTACTAACTCAAAGTGTGGAACTAAGTCTAAGGGACCAAGAACAGC
GCTTGGAGTGGAAAAAACTCAGGGTAAGGCAAGGTAGATTGATGAGAGTTTCACACAAAG
GAGAAGCTACTTGGAAAGACTAGTGGCGGGTCTTTTGAGTTGAGTAATGTGTGTTGAGGC
GGGAGCTCTAAGGGACAGCAAAAGAGAATTCTTAAATAAATGAATGGAAACTGATTTGTA
TTGGAAGATTCTTGCAACAGGAAGCCAGTTACATTCCATCCCTTGTTAGTTGTTACTGGT
CACAGATTTACTTGCGGAACAGAACAAAAGCTACACTTGAGAACTTTTAAGTGGCATTCC
TTCCACACAAGTTGAAAGAAAAACGTTCTCATTTATTTAGAGCATCATCTCCAACCCCCA
TTTATTTTTTTATTTTTTAAATAGTTTTGCATTCCAACAGTTTTTATTTTATTTCCTTTT
TTAAAATGAGTATATAGTACATTTTCAAATATCGCTATTGAGACTTTTTAAACATTTTTC
AATTTAAGGGGATGTATTCAATTTAGCATTTGATGTGATTTGAT


BQ
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AF RR4A842TF U 1
AF RR4A842JQ C 271
BS 1 713 RR4A842TF
BS 714 884 RR4A842JQ

RD RR4A842TF 732 0 0
ATGGTGAAGCGAGAATGGCTAAAGCCAAAATGAAACTGACTCAGGTTGGGAATTCCTGAC
GCTCTTTACACATAGTGACACAAGTTTTGAAGTGGAAGTGTAATGTACTTGTTATGTAAC
AATGAATGAAATGAAACAAAGACTGATTCTTCACATAAAGTCAGATTCTTAGCACATGGA
AGAGTAAAATCTTGGCTGTTTATGTGAAGCAAAAGGGTCTGTCTGCAGTGGGGTTGTGAG
CTCCAGGAAGAAGTCTTTTTGCAAGGATCTGTTACCAGAAAGCCAAGGTAATGATCAAGG
TGACGATGATGAAGTTACTAACTCAAAGTGTGGAACTAAGTCTAAGGGACCAAGAACAGC
GCTTGGAGTGGAAAAAACTCAGGGTAAGGCAAGGTAGATTGATGAGAGTTTCACACAAAG
GAGAAGCTACTTGGAAAGACTAGTGGCGGGTCTTTTGAGTTGAGTAATGTGTGTTGAGGC
GGGAGCTCTAAGGGACAGCAAAAGAGAATTCTTAAATAAATGAATGGAAACTGATTTGTA
TTGGAAGATTCTTGCAACAGGAAGCCAGTTACATTCCATCCCTTGTTAGTTGTTACTGGT
CACAGATTTACTTGCGGAACAGAACAAAAGCTACACTTGAGAACTTTTAAGTGGCATTCC
TTCCACACAAGTTGAAAGAAAAACGTTCTCATTTATTTAGAGCATCATCTCCA
CACCCATTTATCTCTTTAT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4A842JQ 614 0 0
GTTACCAGAAAGCCAAGGTAATGATCAAGGTGACGATGATGAAGTTACTAACTCAAAGTG
TGGAACTAAGTTTAAGGGACCAAGAACAGCGCTTGGAGTGGAAAAAACTCAGGGTAAGGC
AAGGTAGATTGATGAGAGTTTCACACAAAGGGGAAGCTACTTGGAAAGACTAGTGGCGGG
TTTTTTGAGTTGAGTAATGTGTGTTGAGGCGGGAGCTTTAAGGGACAGCAAAAGAGAATT
TTTAAATAAATGAATGGAAACTGATTTGTATTGGAAGATTTTTGCAACAGGAAGCCAGTT
ACATTCCATCCCTTGTTAGTTGTTACTGGTCACAGATTTACTTGGGGAACAGAACAAAAG
CTACACTTGAGAACTTTTAAGTGGCATTCCTTCCCCACAAGTTGAAAGAAAAACGTTTTC
ATTTATTTAGAGCATCATTTCCAACCCCCATTTATTTTTTTATTTTTTAAATAGTTTTGC
ATTCCAACAGTTTTTATTTTATTTCCTTTTTTAAAATGAGTATATAGTACATTTTCAAAT
ATCGCTATTGAGACTTTTTAAACATTTTTCAATTTAAGGGGATGTATTCAATTTAGCATT
TGATGTGATTTGAT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

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GGGAAAAAGACAAACTATACCGTCGACAAAAATTAAATAGCGAGCGATAACTCGTCCCGA
GTCCTCTCGCTCCGACGGCGAATCCGTCTTCTCCCGCCGATGTCAGCATACAATAACAGA
GCAAATCCGTGATTCTGTAGATTCTCCAAATCCAGGAGGCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GGAAGATGAGTTTCGTATTCAGAGGAAGTAGAGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGAT
TCATCCCCGAGAGACGAGCTATGCGTGTTCATGGAGCTCGACCTGTGAACTCTAATTCCC
TCGCTTTTCTTGTCACTGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAACTCGCATCAGATGCCTC
CTAATTTCCTGCTCTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGACTTAGATTATGAAACTCT
AAGAGCACTTGATTCTGATAATGTCCCCACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAGATAAATGC
ACTTCCAGTACACAAGTACAAAGTGTTGGATCCTGAAAATGGTTCCTCTTTGACAAAGCA
GGCATCAACAACATCCTCAGCGGAGAAGAAGCAGGATTCTGTCGGTGCGAGTAAAAAAGG
AACGGAAGATGAGCTCACTTGTAGTGTTTGCCTCGAACAAGTTACCGTTGGGGAGGTTGT
TCGCACCCTACCTTGCCTGCATCAGTTTCATGCAGTCTGTATCGATCCATGGCTTATACA
GCAAGGAACATGTCCTGTCTGTAAATTCAAGGCGCACTCAGGATGGCAAGAACAAGACGA
CGGGACAGATGATGATGATGATGATGATGAAGCTTCCGTCATGGTTTGAGAGTTCGGTTT
TTGGACACTTGTTATGTTATTAATGTGTGTATTGAAAAATGGAGACCCCAAAACAAATCA
TGTAATGGTTGATGAGTTTTTAACTGTTTGATTAGATCC


BQ
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AF RR4EV92TF U 1
AF RR4EV92JQ C 177
BS 1 536 RR4EV92TF
BS 537 939 RR4EV92JQ

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GGGAAAAAGACAAACTATACCGTCGACAAAAATTAAATAGCGAGCGATAACTCGTCCCGA
GTCCTCTCGCTCCGACGGCGAATCCGTCTTCTCCCGCCGATGTCAGCATACAATAACAGA
GCAAATCCGTGATTCTGTAGATTCTCCAAATCCAGGAGGCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GGAAGATGAGTTTCGTATTCAGAGGAAGTAGAGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGAT
TCATCCCCGAGAGACGAGCTATGCGTGTTCATGGAGCTCGACCTGTGAACTCTAATTCCC
TCGCTTTTCTTGTCACTGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAACTCGCATCAGATGCCTC
CTAATTTCCTGCTCTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGACTTAGATTATGAAACTCT
AAGAGCACTTGATTCTGATAATGTCCCCACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAGATAAATGC
ACTTCCAGTACACAAGTACAAAGTGTTGGATCCTGAAAATGGTTCCTCTTTGACAA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4EV92JQ 763 0 0
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GGATTCATCCCCGAGAGACGAGCTATGCGTGTTCATGGAGCTCGACCTGTGAACTCTAAT
TCCCTCGCTTTTCTTGTCACTGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAACTCGCATCAGATG
CCTCCTAATTTCCTGCTCTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGACTTAGATTATGAAA
CTCTAAGAGCACTTGATTCTGATAATGTCCCCACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAGATAA
ATGCACTTCCAGTACACAAGTACAAAGTGTTGGATCCTGAAAATGGTTCCTCTTTGACAA
AGCAGGCATCAACAACATCCTCAGCGGAGAAGAAGCAGGATTCTGTCGGTGCGAGTAAAA
AAGGAACGGAAGATGAGCTCACTTGTAGTGTTTGCCTCGAACAAGTTACCGTTGGGGAGG
TTGTTCGCACCCTACCTTGCCTGCATCAGTTTCATGCAGTCTGTATCGATCCATGGCTTA
TACAGCAAGGAACATGTCCTGTCTGTAAATTCAAGGCGCACTCAGGATGGCAAGAACAAG
ACGACGGGACAGATGATGATGATGATGATGATGAAGCTTCCGTCATGGTTTGAGAGTTCG
GTTTTTGGACACTTGTTATGTTATTAATGTGTGTATTGAAAAATGGAGACCCCAAAACAA
ATCATGTAATGGTTGATGAGTTTTTAACTGTTTGATTAGATCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL8431Contig1 748 2 15 U
CGAAAACTCGTTGTTTGAGGGGGAAGCTACAAAAGTGCAACTCTTTGTTCTTAAGTGTCC
CAAAAGACACACCCTAGAGAACGAAAAGAGTTAAACCGTAAAATGCAAGAAACTTAAAAC
AGAAATGGGTATTCCCCTGCTGCTACACTTTTCCCTCGATAGATTTTGAGAATATTATTC
AAACAGATCTTATACTTGCAGAATAATGGATCCCAAGTCCTCAGTTGAGCAAAGCTTCAT
TCTTGTTTAACTCATCCAGATCCACACTCACTCTTAAACCCGACTTCGCCAAAGCATTCA
CCATTCCAGGGATCTCCGATCTCAATGAAGCTGCTACAGCCTTCTTATATTCTTCCTTTT
GGTGCTTGACAACATCCACAGACCACTCGTTTACCAGCTTCTTGAATTCAGCTTCAAGTG
CTGACTTCTTCTCATCAGGATATGCCTGGCAAATAATTTGGATGACAGCAGCAGCTTCTT
CAGGTTTATGTTCTAGCAAAAAACCCTTTGCACATGAAAAGGCTGCGGAAAAAGTGTGTT
GGGTGTAAGTCTCAAATCTCAGCTTATCAACCTTCCATAACGCCTCTGTGTCTCCTCTTT
TAGCAGCAAATTCCATCCATACATCAAATGTGGTCTTCCTTAACTTGACTCCAGCTTTGC
AGAATTTCTTAGAGTACTTAGCTAATAGATCCCAGCTATCTGTCTCATGGCAGATCCTGA
AAACTAAATCCGCTGTACCGGGTTGTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV69JQ U 85
AF RR4CB88JQ U 1
BS 1 127 RR4CB88JQ
BS 128 128 RR4GV69JQ
BS 129 231 RR4CB88JQ
BS 232 232 RR4GV69JQ
BS 233 348 RR4CB88JQ
BS 349 349 RR4GV69JQ
BS 350 451 RR4CB88JQ
BS 452 452 RR4GV69JQ
BS 453 531 RR4CB88JQ
BS 532 532 RR4GV69JQ
BS 533 554 RR4CB88JQ
BS 555 555 RR4GV69JQ
BS 556 560 RR4CB88JQ
BS 561 561 RR4GV69JQ
BS 562 748 RR4CB88JQ

RD RR4GV69JQ 586 0 0
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ACACTTTTCCCTCGATAGATTTTGAGAATATTATTCAAACAGATCTTATACTTGCAGAAT
AATGGATCCCAAGTCCTCAGTTGAGCAAAGCTTCATTCTTGTTTAACTCGTCCAGATCCA
CACTCACTCTTAAACCCGACTTCGCCAAAGCATTCACCATTCCAGGGATCTCCGATCTCA
ATGAAGCTGCTACAGCCTTCTTATATTCTTCCTTTTGGTGCTTGACAACATCCACAGACC
ACTCGTTTACCAGCTTCTTGAATTCAGCTTCAAGTGCTGACTTCTTCTCATCAGGATATG
CCTGGCAAATAATTTGGATGACAGCAGCAGCTTCTTCAGGTTTATGTTCTAGCAAAAAAC
CCTTTGCACATGAAAAGGCTGCGGAAAAAGTGTGTTGGGTGTAAGTCTCAAATCTCAGCT
TATCAACCTTCCATAACGCCTCTGTGTCTCCTCTTTTAGCAGCAAATTCCATCCATACAT
CAAATGTGGTCTTCCTTAACTTGACTCCAGCTTTGCAGAATTTCTT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4CB88JQ 748 0 0
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AGAAATGTGTATTCCCCTGCTGCTACACTTTTCCCTCGATAGATTTTGAGAATATTATTC
AAACAGATCTTATACTTGCAGAATAATGGATCCCAAGTCCTCAGTTGAGCAGAGCTTCAT
TCTTGTTTAACTCATCCAGATCCACACTCACTCTTAAACCCGACTTCGCCAAAGCATTCA
CCATTCCAGGGATCTCCGATCTCAATGAAGCTGCTACAGCCTTCTTATCTTCTTCCTTTT
GGTGCTTGACAACATCCACAGACCACTCGTTTACCAGCTTCTTGAATTCAGCTTCAAGTG
CTGACTTCTTCTCATCAGGATATGCCTGGCAGATAATTTGGATGACAGCAGCAGCTTCTT
CAGGTTTATGTTCTAGCAAAAAACCCTTTGCACATGAAAAGGCTGCGGAAAGAGTGTGTT
GGGTGTAAGTCTCAGATCTCGGCTTATCAACCTTCCATAACGCCTCTGTGTCTCCTCTTT
TAGCAGCAAATTCCATCCATACATCAAATGTGGTCTTCCTTAACTTGACTCCAGCTTTGC
AGAATTTCTTAGAGTACTTAGCTAATAGATCCCAGCTATCTGTCTCATGGCAGATCCTGA
AAACTAAATCCGCTGTACCGGGTTGTAG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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TCGAATCGTAGTGACATCAAGTTTGGTAAATGGAGTCTACTTATTGCAACAGGATAAGCA
AAAGAAATTGAACTCAATACCCTACATCTGGTGGGAATCCTTCGGTTTCTCTTTAGCTAA
ACTCTTGATCAACGAAGATGATACCTCCATCTACGGCGCTGTTTTTGAGTATAACAACTA
CCAGAATAAACCTCATTTTGGAATTCCTCCGCGTTACGTGGTTGCCTTTCGCGGCACACA
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CCTTCATAAAGGCAGTAGGTTTCAACAAGCCATACAAGCAATCGAAACTATACTGGAAAA
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GCTGATGGTCGGGAAGACCATGACGAAACGTGGATTCCCCCTCAAGACCTATGCATTCAA
CCCGCCTACCTTGTCTACTCCTCTAGAGATGCTACCTGATATTGATGTGGTTAAAGGCAT
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AGAAACGATCCA


BQ
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AF RR4EQ02TF U 1
AF RR4FT89TF U 2
BS 1 573 RR4EQ02TF
BS 574 732 RR4FT89TF

RD RR4EQ02TF 573 0 0
TTTTTTTCTGATCTACCTCGAGAGAAAAAGGAAGAAGAAAAAAATGGGAGGAGGAGCGGA
AGATTCAAAGAACTCTGATCCCAAGCATCTTCCATCCATTGATTGGTTAGATTCCTACCA
TCGAATCGTAGTGACATCAAGTTTGGTAAATGGAGTCTACTTATTGCAACAGGATAAGCA
AAAGAAATTGAACTCAATACCCTACATCTGGTGGGAATCCTTCGGTTTCTCTTTAGCTAA
ACTCTTGATCAACGAAGATGATACCTCCATCTACGGCGCTGTTTTTGAGTATAACAACTA
CCAGAATAAACCTCATTTTGGAATTCCTCCGCGTTACGTGGTTGCCTTTCGCGGCACACA
ACTTAAATCAAAAACTTGGCTTTCTGATCTGAAAGAAGACATGCGATGCTGGTTCAACAA
CCTTCATAAAGGCAGTAGGTTTCAACAAGCCATACAAGCAATCGAAACTATACTGGAAAA
ACACACTACCGAGACAACATCTGTCTGGCTAGCTGGACACTCTCTGGGAGCAGGTGTAGC
GCTGATGGTCGGGAAGACCATGACGAAACGTGG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4FT89TF 731 0 0
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**AATCGTAGTGACATCAAGTTTGGTAAATGGAGTCTACTTATTGCAACAGGATAAGCAA
AAGAAATTGAACTCAATACCCTACATCTGGTGGGAATCCTTCGGTTTCTCTTTAGCTAAA
CTCTTGATCAACGAAGATGATACCTCCATCTACGGCGCTGTTTTTGAGTATAACAACTAC
CAGAATAAACCTCATTTTGGAATTCCTCCGCGTTACGTGGTTGCCTTTCGCGGCACACAA
CTTAAATCAAAAACTTGGCTTTCTGATCTGAAAGAAGACATGCGATGCTGGTTCAACAAC
CTTCATAAAGGCAGTAGGTTTCAACAAGCCATACAAGCAATCGAAACTATACTGGAAAAA
CACACTACCGAGACAACATCTGTCTGGCTAGCTGGACACTCTCTGGGAGCAGGTGTAGCG
CTGATGGTCGGGAAGACCATGACGAAACGTGGATTCCCCCTCAAGACCTATGCATTCAAC
CCGCCTACCTTGTCTACTCCTCTAGAGATGCTACCTGATATTGATGTGGTTAAAGGCATG
TTTCGATTCGCTGAGAGTCTCTTCAAAGGACCGTAGCCGCGGTCGCTCATCTAAGACCGA
GAAACGATCCA

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL8433Contig1 853 2 2 U
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AGATGAAACGGTGTCGACATGAGGACAGGATCAGTGAGCTTCCGGACGCTCTGCTTGTGC
AGATATTGTCTTCGATTCCGACAAAAGATGCTTTCGCCACTAGTGTTTTGTCCAAACGGT
GGCGGTCTCTTTGTAAGATGATGCCGAATCTCGAGTTTTGCTACCGTGGCAGTGGTGTCG
AGAGGTTTTCAGACAATGTCTGCAGGTGTTTGTTCTCGCATCAGGCTCCTGTTCTTCAGA
GTTTGCATCTCGAAATGAATTTTGAAAAGGATTCAACTATGGATATGGGAGTGATGATTG
GGGTTGCGTTTGGACTCCGTGTGCGTGAGTTGAAACTCGAAGTTTACGATGGTCATGAGC
AGTATACGTTTCCCACAAGCTTGTACAACTGTGGGACACTTGAGACCTTGAAACTCTACT
GTGATGTCCTTGTCGACGTCCCGTTTCCGGTTTGCCTCAAGTCCCTTAGAACTCTATTCC
TTTACGAAGTGAGATTCCAAGACGATGAATCTGTTGTTAACCTTTTATCTGGCTGCTCTA
GTCTTGAAAATCTGGAGGTTCGGGGGGCATTCATTCTCTGATTTGAAGTCTTTCACTGTT
GATGTGCCTTCTTTGCAGAGGTTAACACTTACTTCTGAAAATGAAAGTGAGAATTGTTTT
ACGGAATATGTGATAAATGCTCCTTCTTTGAAACACCTGGAGATTAATGGAGTAATGGAG
GATGACTCTGCTTGTCTGATTGAGATATGCCTGAGCTTGTGGAGGCACATATTAATGTGT
GTGGTGTAATCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC69TF U 1
AF RR4AC70TF U 48
BS 1 717 RR4AC69TF
BS 718 853 RR4AC70TF

RD RR4AC69TF 717 0 0
GGGCCTTTGAAGCCCTAATGTCAGCCGTATAACACTGATCTCTTTTTCTCTCCCAATCGG
AGATGAAACGGTGTCGACATGAGGACAGGATCAGTGAGCTTCCGGACGCTCTGCTTGTGC
AGATATTGTCTTCGATTCCGACAAAAGATGCTTTCGCCACTAGTGTTTTGTCCAAACGGT
GGCGGTCTCTTTGTAAGATGATGCCGAATCTCGAGTTTTGCTACCGTGGCAGTGGTGTCG
AGAGGTTTTCAGACAATGTCTGCAGGTGTTTGTTCTCGCATCAGGCTCCTGTTCTTCAGA
GTTTGCATCTCGAAATGAATTTTGAAAAGGATTCAACTATGGATATGGGAGTGATGATTG
GGGTTGCGTTTGGACTCCGTGTGCGTGAGTTGAAACTCGAAGTTTACGATGGTCATGAGC
AGTATACGTTTCCCACAAGCTTGTACAACTGTGGGACACTTGAGACCTTGAAACTCTACT
GTGATGTCCTTGTCGACGTCCCGTTTCCGGTTTGCCTCAAGTCCCTTAGAACTCTATTCC
TTTACGAAGTGAGATTCCAAGACGATGAATCTGTTGTTAACCTTTTATCTGGCTGCTCTA
GTCTTGAAAATCTGGAGGTTCGGGGGGCATTCATTCTCTGATTTGAAGTCTTTCACTGTT
GATGTGCCTTCTTTGCAGAGGTTAACACTTACTTCTGAAAATGAAAGTGAGAATTGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR4AC70TF 806 0 0
CTCTCCCAATCGGAGATGAAACGGTGTCGACATGAGGACAGGATCAGTGAGCTTCCGGAC
GCTCTGCTTGTGCAGATATTGTCTTCGATTCCGACAAAAGATGCTTTCGCCACTAGTGTT
TTGTCCAAACGGTGGCGGTCTCTTTGTAAGATGATGCCGAATCTCGAGTTTTGCTACCGT
GGCAGTGGTGTCGAGAGGTTTTCAGACAATGTCTGCAGGTGTTTGTTCTCGCATCAGGCT
CCTGTTCTTCAGAGTTTGCATCTCGAAATGAATTTTGAAAAGGATTCAACTATGGATATG
GGAGTGATGATTGGGGTTGCGTTTGGACTCCGTGTGCGTGAGTTGAAACTCGAAGTTTAC
GATGGTCATGAGCAGTATACGTTTCCCACAAGCTTGTACAACTGTGGGACACTTGAGACC
TTGAAACTCTACTGTGATGTCCTTGTCGACGTCCCGTTTCCGGTTTGCCTCAAGTCCCTT
AGAACTCTATTCCTTTACGAAGTGAGATTCCAAGACGATGAATCTGTTGTTAACCTTTTA
TCTGGCTGCTCTAGTCTTGAAAATCTGGAGGTTCGGGGG*CATTCATTCTCTGATTTGAA
GTCTTTCACTGTTGATGTGCCTTCTTTGCAGAGGTTAACACTTACTTCTGAAAATGAAAG
TGAGAATTGTTTTACGGAATATGTGATAAATGCTCCTTCTTTGAAACACCTGGAGATTAA
TGGAGTAATGGAGGATGACTCTGCTTGTCTGATTGAGATATGCCTGAGCTTGTGGAGGCA
CATATTAATGTGTGTGGTGTAATCTA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL8434Contig1 877 2 8 U
GGGCTGCGCTGTTCCAAGGGTTTCGTTGGTTACGAAGGAAGAGAAGAGAAGATAAGAAAG
AGGGTGAAGAAGATGCCAGGCCCAGTCGTTGAAGAAGTTAACACTGAGAAGCAGTTGATG
GATGCCATCAAAGAGCAAATGAAGCTCCAGAAGGAAAATGATGTTGTCGTTGAGGATGTG
AAAGACGGAGATGAAGAAGACGATGATGAGGACGACGACGATGACAAGATCGATGGAGCT
GGTGAGAATGAGAGCTCCAAGCAGAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTG
AAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAAT
GTTCTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTTAAGAGTCCAAACTCTGACACCTATGTC
ATATTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCTCAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAG
AGGTTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCA
GCCACTGTTGCACAAGGGGAGGAAGATGCTGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAA
GCTAAGGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAGGCCAAAGCCGTTAAG
GCTCTCAAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGTC
GAGTTGCAGAGGCTTCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAACCGTTT
TCATTTGTGTTTCCCCACTTCTAAGGCTTATTTTTCCCTTCTATGAGCCCATAAACATAT
TTGCTTCAAAGTCTATAATATGAGACATGTTATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GA77TF U 1
AF RR4GA77JQ C 129
BS 1 606 RR4GA77TF
BS 607 607 RR4GA77JQ
BS 608 645 RR4GA77TF
BS 646 646 RR4GA77JQ
BS 647 660 RR4GA77TF
BS 661 661 RR4GA77JQ
BS 662 695 RR4GA77TF
BS 696 877 RR4GA77JQ

RD RR4GA77TF 711 0 0
GGGCTGCGCTGTTCCAAGGGTTTCGTTGGTTACGAAGGAAGAGAAGAGAAGATAAGAAAG
AGGGTGAAGAAGATGCCAGGCCCAGTCGTTGAAGAAGTTAACACTGAGAAGCAGTTGATG
GATGCCATCAAAGAGCAAATGAAGCTCCAGAAGGAAAATGATGTTGTCGTTGAGGATGTG
AAAGACGGAGATGAAGAAGACGATGATGAGGACGACGACGATGACAAGATCGATGGAGCT
GGTGAGAATGAGAGCTCCAAGCAGAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTG
AAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAAT
GTTCTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTTAAGAGTCCAAACTCTGACACCTATGTC
ATATTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCTCAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAG
AGGTTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCA
GCCACTGTTGCACAAGGGGAGGAAGATGCTGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAA
GCTAAG*ACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAG*CCAAAGCCGTTAAG
*CTCTCAAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGC
ATTATGGACTCACTAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GA77JQ 749 0 0
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AGATGAAGAAGACGATGATGAGGACGACGACGATGACAAGATCGATGGAGCTGGTGAGAA
TGAGAGCTCCAAGCAGAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTGAAACTTGG
AATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGTTCTGTT
TGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTTAAGAGTCCAAATTCTGACACCTATGTCATATTCGG
CGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTTTCAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAGAGGTTCAA
GATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCCACTGT
TGCACAAGGGGAGGAAGATGCTGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCTAAGGA
CATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAGGCCAAAGCCGTTAAGGCTCTCAA
GACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGTCGAGTTGCA
GAGGCTTCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAACCGTTTTCATTTGT
GTTTCCCCACTTCTAAGGCTTATTTTTCCCTTCTATGAGCCCATAAACATATTTGCTTCA
AAGTCTATAATATGAGACATGTTATGCCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL8435Contig1 804 2 2 U
GGGCCCGGATCAAAACAAGTAAACACAAATCTAATCTTCGCGTCACCGTTTGAGTTCTTT
CTCTCTTATCTAGGGTTCTTCTTCTTCTTACAAGCTTCGTCCATTAAACATGAGTCGTCA
TCCTGAAGTGAAGTGGGCCGAGACCACTGACAAGATTTTCCTCACCGTAGTGTTGGCTGA
CTCCAAGGAGACTAAAGTTAATCTTCTCCCTGAAGTTGTCTTTGATTTCTCGGCAAAAGT
TGGTCCTGAAAACCACGTTTATGAACTCAAACTCCAACTTCACGACAAAGTCAACGTTGA
TGAGAGCAAAATCAACATCGGAGTGAGAAGCATTTTCTGCATAATAGAGAAAGCAGAGCC
GGAAAGGTGGAACAAGCTAATCCGCGGTGGGAAAGCGCCACACCATGTCAAGATTGATTG
GGACAAGTGGGTAGATGAGGACGATGAAGGCACCGCTGGTGCTGGAGATATGGATATGGG
AGGAATGGGCGGTATGGGTGGAATGCCCGGACTTGAAGACAGTGATGATGAGGAAGAAAC
TGCAAAATCAGGAGACAAAAAAGATGAAGCCGCCGTTAAGGAGGAAACGAAGCCACTAGA
TGTGAAGTGAAGAAGACACTCTTCCTTCCAGAAATTATTGTTTTCAAGTTTGTTAGCTAA
GGGTTTACTATTAGATTCTTAAGTTTATGATCAAACCCTCTGATTTTACTTCTTTTAAAA
ATTATGTTACTCTTGTTTTGCTTTTATGGATTTGGTTCAATTTTTAAGTATCTCTGCATT
TTTGGCACTGCCAAATGCATTGAC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DM06TF U 1
AF RR4DM06JQ C 4
BS 1 562 RR4DM06TF
BS 563 804 RR4DM06JQ

RD RR4DM06TF 562 0 0
GGGCCCGGATCAAAACAAGTAAACACAAATCTAATCTTCGCGTCACCGTTTGAGTTCTTT
CTCTCTTATCTAGGGTTCTTCTTCTTCTTACAAGCTTCGTCCATTAAACATGAGTCGTCA
TCCTGAAGTGAAGTGGGCCGAGACCACTGACAAGATTTTCCTCACCGTAGTGTTGGCTGA
CTCCAAGGAGACTAAAGTTAATCTTCTCCCTGAAGTTGTCTTTGATTTCTCGGCAAAAGT
TGGTCCTGAAAACCACGTTTATGAACTCAAACTCCAACTTCACGACAAAGTCAACGTTGA
TGAGAGCAAAATCAACATCGGAGTGAGAAGCATTTTCTGCATAATAGAGAAAGCAGAGCC
GGAAAGGTGGAACAAGCTAATCCGCGGTGGGAAAGCGCCACACCATGTCAAGATTGATTG
GGACAAGTGGGTAGATGAGGACGATGAAGGCACCGCTGGTGCTGGAGATATGGATATGGG
AGGAATGGGCGGTATGGGTGGAATGCCCGGACTTGAAGACAGTGATGATGAGGAAGAAAC
TGCAAAATCAGGAGACAAAAAA

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4DM06JQ 801 0 0
CCCGGATCAAAACAAGTAAACACAA*TCTAATCTTCGCGTCACCGTTTGAGTTCTTTCTC
TCTTATCTAGGGTTCTTCTTCTTCTTACAAGCTTCGTCCATTAAACATGAGTCGTCATCC
TGAAGTGAAGTGGGCCGAGACCACTGACAAGATTTTCCTCACCGTAGTGTTGGCTGACTC
CAAGGAGACTAAAGTTAATCTTCTCCCTGAAGTTGTCTTTGATTTCTCGGCAAAAGTTGG
TCCTGAAAACCACGTTTATGAACTCAAACTCCAACTTCACGACAAAGTCAACGTTGATGA
GAGCAAAATCAACATCGGAGTGAGAAGCATTTTCTGCATAATAGAGAAAGCAGAGCCGGA
AAGGTGGAACAAGCTAATCCGCGGTGGGAAAGCGCCACACCATGTCAAGATTGATTGGGA
CAAGTGGGTAGATGAGGACGATGAAGGCACCGCTGGTGCTGGAGATATGGATATGGGAGG
AATGGGCGGTATGGGTGGAATGCCCGGACTTGAAGACAGTGATGATGAGGAAGAAACTGC
AAAATCAGGAGACAAAAAAGATGAAGCCGCCGTTAAGGAGGAAACGAAGCCACTAGATGT
GAAGTGAAGAAGACACTCTTCCTTCCAGAAATTATTGTTTTCAAGTTTGTTAGCTAAGGG
TTTACTATTAGATTCTTAAGTTTATGATCAAACCCTCTGATTTTACTTCTTTTAAAAATT
ATGTTACTCTTGTTTTGCTTTTATGGATTTGGTTCAATTTTTAAGTATCTCTGCATTTTT
GGCACTGCCAAATGCATTGAC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL8436Contig1 913 2 2 U
GGATAGGAAGATAACTATCTCACTGCTTTTCCTGTCTCATTTTGGTATCAGAGCACTTCG
ATTCTACGGATCTAACGATGGTTGAGACACGGCTTCAAGAAAAATCGATGCTTGAACTGA
TCGAGGAGATCCGACTTGGCCAAGAGCGTCAGTCAAACGAGCTCCGTCAACGTTCTGATG
CTCTCGACGAGCGTTACAACAAGCTAGAAAGACTGGTCTTTGACCATATTTCTGTGCTTC
AAGCGCAGGGGAAGCAAGCTGTTCCAGATGGTGGCAGTTTTCAGATGGTGGACCCAACCT
CCGCGGAATCGACCCGACCCCCAGATCCACCGGACTTTCATGGAGTCCAACAAAGCCCCA
ACAGAGCTTCTCCTCACCACAACCCTAACGGCCTCGCCGGTCGCCTGACAAAAGTGGGGT
TTCCTACCTTTGATGGAACAGACCTCCGCGAATGGATCTGTCAGTGTGAACAGTTCTTCG
ATCTTGACAGCACCTCCCCGGAGCTGAAGGTTCGGTTAGCCGCGATGCACCTCCGCGGAA
GAGCTCTCCAGTGGCACCGCAACTTTATGACAGAGCGTTTCGGCAACAGAAAAGACCAAT
CCCCGCCGATGCCCAGATCAACCGACGCCAGAGATAGCCACATCTAACGCCATCATAGAC
CACAAAATGAAAACCCACGACCCTAAAACCGAGGCACCCCCTACTCCATCATCGAGGGTA
GAGAAGCCAAGGCAGCTGCAGTTTAATATGCAAGTATGAGGATAAAATTCTTAAAATTCC
CAACGATGTAGAAAAAGACCAAAGATAAATAATGCAAAACAGTTTCAAAACTATAATAAG
CTCTTTGACCAAGTTGATGTATGCTTCAATTTCTTATTATGGACGATGATAAGTATAGGT
TATGTCGATAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AZ36TF U 1
AF RR4AZ36JQ C 28
BS 1 728 RR4AZ36TF
BS 729 913 RR4AZ36JQ

RD RR4AZ36TF 728 0 0
GGATAGGAAGATAACTATCTCACTGCTTTTCCTGTCTCATTTTGGTATCAGAGCACTTCG
ATTCTACGGATCTAACGATGGTTGAGACACGGCTTCAAGAAAAATCGATGCTTGAACTGA
TCGAGGAGATCCGACTTGGCCAAGAGCGTCAGTCAAACGAGCTCCGTCAACGTTCTGATG
CTCTCGACGAGCGTTACAACAAGCTAGAAAGACTGGTCTTTGACCATATTTCTGTGCTTC
AAGCGCAGGGGAAGCAAGCTGTTCCAGATGGTGGCAGTTTTCAGATGGTGGACCCAACCT
CCGCGGAATCGACCCGACCCCCAGATCCACCGGACTTTCATGGAGTCCAACAAAGCCCCA
ACAGAGCTTCTCCTCACCACAACCCTAACGGCCTCGCCGGTCGCCTGACAAAAGTGGGGT
TTCCTACCTTTGATGGAACAGACCTCCGCGAATGGATCTGTCAGTGTGAACAGTTCTTCG
ATCTTGACAGCACCTCCCCGGAGCTGAAGGTTCGGTTAGCCGCGATGCACCTCCGCGGAA
GAGCTCTCCAGTGGCACCGCAACTTTATGACAGAGCGTTTCGGCAACAGAAAAGACCAAT
CCCCGCCGATGCCCAGATCAACCGACGCCAGAGATAGCCACATCTAACGCCATCATAGAC
CACAAAATGAAAACCCACGACCCTAAAACCGAGGCACCCCCTACTCCATCATCGAGGGTA
GAGAAGCC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4AZ36JQ 886 0 0
TTTCCTGTCTCATTTTGGTATCAGAGCACTTCGATTCTACGGATCTAACGATGGTTGAGA
CACGGCTTCAAGAAAAATCGATGCTTGAACTGATCGAGGAGATCCGACTTGGCCAAGAGC
GTCAGTCAAACGAGCTCCGTCAACGTTCTGATGCTCTCGACGAGCGTTACAACAAGCTAG
AAAGACTGGTCTTTGACCATATTTCTGTGCTTCAAGCGCAGGGGAAGCAAGCTGTTCCAG
ATGGTGGCAGTTTTCAGATGGTGGACCCAACCTCCGCGGAATCGACCCGACCCCCAGATC
CACCGGACTTTCATGGAGTCCAACAAAGCCCCAACAGAGCTTCTCCTCACCACAACCCTA
ACGGCCTCGCCGGTCGCCTGACAAAAGTGGGGTTTCCTACCTTTGATGGAACAGACCTCC
GCGAATGGATCTGTCAGTGTGAACAGTTCTTCGATCTTGACAGCACCTCCCCGGAGCTGA
AGGTTCGGTTAGCCGCGATGCACCTCCGCGGAAGAGCTCTCCAGTGGCACCGCAACTTTA
TGACAGAGCGTTTCGGCAACAGAAAAGACCAATCCCCGCCGATGCCCAGATCAACCGACG
CCAGAGATAGCCACATCTAACGCCATCATAGACCACAAAATGAAAACCCACGACCCTAAA
ACCGAGGCACCCCCTACTCCATCATCGAGGGTAGAGAAGCCAAGGCAGCTGCAGTTTAAT
ATGCAAGTATGAGGATAAAATTCTTAAAATTCCCAACGATGTAGAAAAAGACCAAAGATA
AATAATGCAAAACAGTTTCAAAACTATAATAAGCTCTTTGACCAAGTTGATGTATGCTTC
AATTTCTTATTATGGACGATGATAAGTATAGGTTATGTCGATAAAG

QA 1 886 1 886
DS 



AS 1 2

CO CL8437Contig1 1018 2 6 U
GGTGGCAAATCGCCGATCGATAAAAGCACAAAAGAACCATTTTCACACAATGAAGGCGGA
GCTAAACTTACCGGAGGGATTCCGATTTCACCCGACGGACGAAGAGCTCGTGAAGTTCTA
TCTTTGCCGGAGATGCGCATCGGAGCCGATCAGCGCTCCGGTTATCGCCGAGATTGATCT
GTACAAGTTCAATCCATGGGAGCTTCCAGAGATGGCTCTGTACGGAGAGAAAGAATGGTA
CCTCTTCTCGCACCGAGACCGGAAATACCCAAACGGTTCGCGACCGAACCGGTCAGCTGG
AACCGGTTATTGGAAAGCGACGGGAGCTGATAAACCGATCGGTAAACCGAAGACGTTAGG
GATTAAGAAAGCACTCGTCTTCTACGCCGGGAAGGCTCCGAGAGGGGTGAAGACGAATTG
GATCATGCACGAGTATCGTCTCGCTAATGTTGATCGATCTGCCTCTTCTTCGAACAAGAA
GAACAGCTTGAGGCTTGATGATTGGGTTTTATGTCGGATTTATAACAAGAAAGGAACATT
GGAGAAGTGTTATCCGGTGGATGAGGTGACTACGACGAGTACGTCGGAGTCTAAATGCTC
AAGTCACGTGGTTTCGCCGGGCGTCACGTGTTCGGACAACGTCGAGTCGAAATGGGTTGA
TGATCTCGAGGACGCGTTCGTGTTTGGTTCCATCGAGTCGTTGCGAAATGACACTTTTGT
CCCTCGGTTTCCGTATCAGTACGATGATTTCGCCGCATCGTTCGAAGACCCGCCGGAGCA
GAAGCCGTTCCCGGATTGGAGTTTTGCTACTCAGGGGTGAAGTTGCCAAAGAGCATAAAG
ATTGAAGCTTTCTCAGAGTATCTAGCCACCACACACACCAGCTCGGTGTTCGGATTTTGA
CCCGGAAACCAAGCTGGGTCATACAGTTAGAGAGTTGGTACTGGTTGATCCGACTCATCA
GCTAGATTCGATTTTTGTTTTGTTATAAATGTCTAAAGAAATCTAAGGCAGATTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FR15TF U 1
AF RR4FR15JQ C 174
BS 1 707 RR4FR15TF
BS 708 708 RR4FR15JQ
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BS 754 754 RR4FR15JQ
BS 755 765 RR4FR15TF
BS 766 1018 RR4FR15JQ

RD RR4FR15TF 766 0 0
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GCTAAACTTACCGGAGGGATTCCGATTTCACCCGACGGACGAAGAGCTCGTGAAGTTCTA
TCTTTGCCGGAGATGCGCATCGGAGCCGATCAGCGCTCCGGTTATCGCCGAGATTGATCT
GTACAAGTTCAATCCATGGGAGCTTCCAGAGATGGCTCTGTACGGAGAGAAAGAATGGTA
CCTCTTCTCGCACCGAGACCGGAAATACCCAAACGGTTCGCGACCGAACCGGTCAGCTGG
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GGAGAAGTGTTATCCGGTGGATGAGGTGACTACGACGAGTACGTCGGAGTCTAAATGCTC
AAGTCACGTGGTTTCGCCGGGCGTCACGTGTTCGGACAACGTCGAGTCGAAATGGGTTGA
TGATCTCGAGGACGCGTTCGTGTTTGGTTCCATCGAGTCGTTGCGAA*TGACACTTTTGT
CCCTCGGTTTCCGTATCAGTACGATGATTTCGC*GCATCGTTCGA
G

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4FR15JQ 845 0 0
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CACTCGTCTTCTACGCCGGGAAGGCTCCGAGAGGGGTGAAGACGAATTGGATCATGCACG
AGTATCGTCTCGCTAATGTTGATCGATCTGCCTCTTCTTCGAACAAGAAGAACAGCTTGA
GGCTTGATGATTGGGTTTTATGTCGGATTTATAACAAGAAAGGAACATTGGAGAAGTGTT
ATCCGGTGGATGAGGTGACTACGACGAGTACGTCGGAGTCTAAATGCTCAAGTCACGTGG
TTTCGCCGGGCGTCACGTGTTCGGACAACGTCGAGTCGAAATGGGTTGATGATCTCGAGG
ACGCGTTCGTGTTTGGTTCCATCGAGTCGTTGCGAAATGACACTTTTGTCCCTCGGTTTC
CGTATCAGTACGATGATTTCGCCGCATCGTTCGAAGACCCGCCGGAGCAGAAGCCGTTCC
CGGATTGGAGTTTTGCTACTCAGGGGTGAAGTTGCCAAAGAGCATAAAGATTGAAGCTTT
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AGCTGGGTCATACAGTTAGAGAGTTGGTACTGGTTGATCCGACTCATCAGCTAGATTCGA
TTTTTGTTTTGTTATAAATGTCTAAAGAAATCTAAGGCAGATTGATG

QA 19 845 19 845
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL8440Contig1 876 2 2 U
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CGATCTTGGCGACATCGGAAGCATCGCTTCTTTTCCCGAAGTCGAAGCAGGAAAGTTGAA
TCACCCCTTGACCCGTAACCTTCGTGCACAGTTGCTTGAAAACGCTAACAAAAGCAAATC
AATGTAGCCAAGAAACCAGAAGCCGTTCAAAAGAAAGCAAGAGCTGTTGTCGGGGTTCCT
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TATTGAAGAGCTAACAGTGAAAGAGTTTGTGTTTCAGATCCGTGTTACACCTTTCAACTT
CACACCCAACCACCGTACCTTCACCGTCTCTACAATCACTGAAGATAACACCTTAGAGAA
CCATGGGGAGGTTGTATAACTTAACTTGTCAATATGTTAACTGTTTGCACATTTTCTTTA
AACAACACGTTCATGTATCTCAGGAACACGGTGAGAACATTCTCCCAAGCGGTGATGCAG
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TGGGGAATGTGCTGCAGCAGATCCTCCGAAAATTTCAGACGCTCAGAGCGCAAGCGCCCC
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TCAACTTTGGAATTTTTTCCTCTATCGTCTTTTTTCTGCTCAGATACTTCCTCTGTTTTG
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BQ
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AF RR4AN38TF U 1
AF RR4AN38JQ C 157
BS 1 834 RR4AN38TF
BS 835 876 RR4AN38JQ

RD RR4AN38TF 834 0 0
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CGATCTTGGCGACATCGGAAGCATCGCTTCTTTTCCCGAAGTCGAAGCAGGAAAGTTGAA
TCACCCCTTGACCCGTAACCTTCGTGCACAGTTGCTTGAAAACGCTAACAAAAGCAAATC
AATGTAGCCAAGAAACCAGAAGCCGTTCAAAAGAAAGCAAGAGCTGTTGTCGGGGTTCCT
TGTCGAGCTTGCTGTTGATGATGGAAAAAATAGCGCCACATTTGTTGTCTTCGATAAGGA
CATGACAAAACTTGCACTGGAGGAGGGCTCAAACGGTGGAGAGGAGGATCTCCCAAGTTG
TATTGAAGAGCTAACAGTGAAAGAGTTTGTGTTTCAGATCCGTGTTACACCTTTCAACTT
CACACCCAACCACCGTACCTTCACCGTCTCTACAATCACTGAAGATAACACCTTAGAGAA
CCATGGGGAGGTTGTATAACTTAACTTGTCAATATGTTAACTGTTTGCACATTTTCTTTA
AACAACACGTTCATGTATCTCAGGAACACGGTGAGAACATTCTCCCAAGCGGTGATGCAG
ACGTAGGATTGGGAGCATCGTCTTCGGGCCCGTCTGTTTTGTGAGACAAGACCGGTGAGG
TGGGGAATGTGCTGCAGCAGATCCTCCGAAAATTTCAGACGCTCAGAGCGCAAGCGCCCC
GTGAATCAACTGTCTTAGTTATGTTTTTAAAAAAACTGCTACTAGCTTTGTTTCCCATTA
TCAACTTTGGAATTTTTTCCTCTATCGTCTTTTTTCTGCTCAGATACTTCCTCT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4AN38JQ 720 0 0
TGAAAACGCTAACAAAAGCAAATCAATGTAGCCAAGAAACCAGAAGCCGTTCAAAAGAAA
GCAAGAGCTGTTGTCGGGGTTCCTTGTCGAGCTTGCTGTTGATGATGGAAAAAATAGCGC
CACATTTGTTGTCTTCGATAAGGACATGACAAAACTTGCACTGGAGGAGGGCTCAAACGG
TGGAGAGGAGGATCTCCCAAGTTGTATTGAAGAGCTAACAGTGAAAGAGTTTGTGTTTCA
GATCCGTGTTACACCTTTCAACTTCACACCCAACCACCGTACCTTCACCGTCTTTACAAT
CACTGAAGATAACACCTTAGAGAACCATGGGGAGGTTGTATAACTTAACTTGTCAATATG
TTAACTGTTTGCACATTTTCTTTAAACAACACGTTCATGTATTTCAGGAACACGGTGAGA
ACATTCTCCCAAGCGGTGATGCAGACGTAGGATTGGGAGCATCGTCTTCGGGCCCGTCTG
TTTTGTGAGACAAGACCGGTGAGGTGGGGAATGTGCTGCAGCAGATCCTCCGAAAATTTC
AGACGCTCAGAGCGCAAGCGCCCCGTGAATCAACTGTCTTAGTTATGTTTTTAAAAAAAC
TGCTACTAGCTTTGTTTCCCATTATCAACTTTGGAATTTTTTCCTCTATCGTCTTTTTTC
TGCTCAGATACTTCCTCTGTTTTGGAATATTAATTAATCTATGACGGGTTTTACTTGATT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL8441Contig1 555 2 1 U
GGATACCTCTCAAATCTCATCTTCTCTCTGGCCACCATGAAAGGAGCTTGAAGCTCTCAC
CTCACCGTCGCTCTCTCGCCATCTCTCTCGTCGTCTCTCTCGCCATCTCTCTCGTCATCT
CTCTGCCATCTCTCTCTCTCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCATCTCTCTCTCGC
CGTCATCTCTCTCACCGGTTTGATCTTCTGTGGGAAGCTATTGTTCTTCAAGAGTATTCT
AACGCAAAGCTTGAGAAGGTTTTGATTGGATCATCTCTTGGAATTGGATGAGGAATGACG
TGAACATTTTGCTCTCATTTTTTTTATCAAACTCAAGCTTGTTATTTTTAAAACCTTGTT
ACCATTATTGTTGTTGCTTTTGAAACTTTATATCACATTATGTTATGTGGGTTTTCATTT
TCTAGATTTAAATATCTTGAATCTTTATATCACATTATGTCAATATGTAGATTCTCATCT
TCTAGATTTAAATATTTTGAAACTTTATTACATTCTATAATGTTGGTTCTCATTTATAAA
ACTTATAAATTTATG


BQ
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AF RR4FO67JQ C 1
AF RR4FO67TF U 1
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QA 1 555 1 555
DS 

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CTCACCGTCGCTCTCTCGCCATCTCTCTCGTCGTCTCTCTCGCCATCTCTCTCGTCATCT
CTCTGCCATCTCTCTCTCTCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCATCTCTCTCTCGC
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AACGCAAAGCTTGAGAAGGTTTTGATTGGATCATCTCTTGGAATTGGATGAGGAATGACG
TGAACATTTTGCTCTCATTTTTTTTATCAAACTCAAGCTTGTTATTTTTAAAACCTTGTT
ACCATTATTGTTGTTGCTTTTGAAACTTTATATCACATTATGTTATGTGGGTTTTCATTT
TCTAGATTTAAATATCTTGAATCTTTATATCACATTATGTCAATATGTAGATTCTCATCT
TCTAGATTTAAATATTTTGAAACTTTATTACATTCTATAATGTTGGTTCTCATTTATAAA
ACTTATAAATTTATG

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

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CTCGCCTCTTATTAAGCACAAGTTCAAAGTAAACTCGCCTAAATCGTCACCGGCATGAAT
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CTCTCTACGAACTTGGGGGGACTTACTGTTGGGGGTGGATTTACATCTTCCCTCAAGGCC
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AAGGAGCTTCCTTTTTCTTAGAAGGGAACTCTTCCACATTTTTAGATCTAGAACACTTCT
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TCTTTGAGTAATAAAATCTCTAGATGTTCTTTTCTC


BQ
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AF RR4DM74TF U 1
AF RR4DM74JQ C 301
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CTC

QA 1 723 1 723
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CATTAGACAATGAGTTAGGCCCACTTGACTAGGAAACCCTAGGCTTCACTTTCTATAAAC
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TCTTTGAGTAATAAAATCTCTAGATGTTCTTTTCTC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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AGCCATCTATCTTAGAATTAGAATTGTTGTTTGTTGAATGCTTATGGTTTTTCAGTTTGT
TTCCCATGTGTGGGATTAGCTTCCGGGGACATTCATGTCGTCCGCCGGCCCTAGTAGATC
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TTCGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4GS13TF U 1
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BS 660 966 RR4GS13JQ

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TCCCCTGTGGAAGTGATTAACAGATTCGTCAATCTGTAGCGTTGTAGAGGTTTTGTACCT
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AGCCTAATATTGTCTACGGCTGCTCTGGATAAGCGGATTTTGTTGTACCGGAGGGAACT

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DS 

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CAATAAAAGGTTCTTCTCGGTTCTTCTCAAGCAGATCTCCAACCAGTTATCTTTGATCTG
TTGTAACCGGTTCGGGTTTGGAGTTTGCGGTGATTGATTGTGGATTTGTATCCATTGAAG
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TTCCCATGTGTGGGATTAGCTTCCGGGGACATTCATGTCGTCCGCCGGCCCTAGTAGATC
GGGATTGTGTGATCCTTCGATTGTGTAAACCGGTTTGTGTTTGTGTTTTAATGAAATCTG
TTCGAG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

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ACAGCTCCACCTTCGAACGTAACCGGGGATAGTATGGTCACTATCACCCTTCTGTTCCCG
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ACATTCAAGAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F944TF U 1
AF RR4F944JQ C 481
BS 1 724 RR4F944TF
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BS 793 806 RR4F944TF
BS 807 1272 RR4F944JQ

RD RR4F944TF 806 0 0
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QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4F944JQ 792 0 0
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GATCCGATGGTCCAATCCGAGCCAGGGCTTTCAGCATTTGAGATATTGTCTGGACTCTTT
TGTGTCTGTGTGAGTCGAGCCAAAGGGAAGAGGAACGAGCTCACGGACATGTCCTTGTGC
CTAGACGTTAGGAAGCTATTGCGTTTAGACCAAAGTTACTTTGGTAATTGCATGGTCTAT
CACAAGGTTCACTATTCCAAACCAGTTAACACCAAAGATAGGTTATTATTATTATTATCT
TACGTTGTTAAAGAGATGCATAACGTGACCAAGGGACTAGGCTACGACACGGTCATGGAC
TTGGTCGAGTGGCTCAGTAGCAACAATAACAATCCGATATCCAACGGTTCGGATCTCGTG
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CTTCCTTCACCGCCCAGCGAGGGACCAATGAGCCGAGTGGTTATGGTTACTCTTCCTCAA
AGAGAAATGGTTAAGGTTTTAGAGGATGATCTTCTTCAAAGATTTTCTCCTGTTTTACTT
ATGGAATATACAAAACTGCTAAATCAATAAAGGTTCAAATATACAGATTTATAAATCAAT
AAAGTTACACATGCAATGTTTTTGAATGTTCCACATGTATGAAACTCAATTAAAACAGAG
ACATTCAAGAGT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL8445Contig1 864 2 2 U
GCCGAGGGAAGATGCAAAGATAGTGACAGATGAGAAGGCTACAACTCTGTCTACAGCTTC
AGTCGATGATGCAGCAGTAATCGATGAACTAATTGCAAAACTAGAGCGGTGCAGGCTGAG
CTTGCAGCCGGAGTTCAGGATGAAGCCAATTCAGTTTGAAAAGGATGACGATACCAACTA
CCACATGGATATGATCGCTGGGCTAGCCAACATGAGAGCAAGGAACTACAGCGTTCCGGA
GGTGGACAAGCTTAAAGCCAAGTTCATCGCCGGAAGAATCATACCTGCCATCGCAACATC
AACGGCTATGGCAACGGGTTTTGTTTGCCTCGAGCTGTACAAGGTCTTAGACGGCGCACA
CAAAGTGGAAGACTACAGAAACACATTCGCTAACTTAGCGCTTCCACTCTTCTCCATAGC
TGAGCCGGTTCCACCCAAAGTAGTGAAGCACCAAGACCAAAGCTGGACGGTTTGGGACCG
ATGGGTCATCAAAGGAAACCCAACCCTAAAAGAGTTGCTGAAATGGGTAAAAGAGAAAGG
ACTAAACGCGTACAGCATATCTGTCGGAAGCTCTTTACTGTACAACAGTATGTTCCCAAG
GCATAAAGAGAGGATGGACAGGAGAGTGGTGGATATTGCAAGAGAAGTAGCTAAAGTTGA
GTTGCCTGCTTACAGACGTCACTTAGATGTTGTGGTGGCTTGTGAGGATGACGACGACAA
TGACGTTGATATCCCTCTCGTATCAGTCTACTACGCCTGATCAGAATTTTAACATCTCCC
AAAAGTCTTTGTACTACTACAGAACAGAGTTTTAGTATGTGTCTTGTTTTAATATGCGAA
CAATATAGCATGAAGTCAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BS74TF U 1
AF RR4BS74JQ C 41
BS 1 595 RR4BS74TF
BS 596 864 RR4BS74JQ

RD RR4BS74TF 595 0 0
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CTTGCAGCCGGAGTTCAGGATGAAGCCAATTCAGTTTGAAAAGGATGACGATACCAACTA
CCACATGGATATGATCGCTGGGCTAGCCAACATGAGAGCAAGGAACTACAGCGTTCCGGA
GGTGGACAAGCTTAAAGCCAAGTTCATCGCCGGAAGAATCATACCTGCCATCGCAACATC
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CAAAGTGGAAGACTACAGAAACACATTCGCTAACTTAGCGCTTCCACTCTTCTCCATAGC
TGAGCCGGTTCCACCCAAAGTAGTGAAGCACCAAGACCAAAGCTGGACGGTTTGGGACCG
ATGGGTCATCAAAGGAAACCCAACCCTAAAAGAGTTGCTGAAATGGGTAAAAGAGAAAGG
ACTAAACGCGTACAGCATATCTGTCGGAAGCTCTTTACTGTACAACAGTATGTTC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4BS74JQ 824 0 0
ACAACTCTGTCTACAGCTTCAGTCGATGATGCAGCAGTAATCGATGAACTAATTGCAAAA
CTAGAGCGGTGCAGGCTGAGCTTGCAGCCGGAGTTCAGGATGAAGCCAATTCAGTTTGAA
AAGGATGACGATACCAACTACCACATGGATATGATCGCTGGGCTAGCCAACATGAGAGCA
AGGAACTACAGCGTTCCGGAGGTGGACAAGCTTAAAGCCAAGTTCATCGCCGGAAGAATC
ATACCTGCCATCGCAACATCAACGGCTATGGCAACGGGTTTTGTTTGCCTCGAGCTGTAC
AAGGTCTTAGACGGCGCACACAAAGTGGAAGACTACAGAAACACATTCGCTAACTTAGCG
CTTCCACTCTTCTCCATAGCTGAGCCGGTTCCACCCAAAGTAGTGAAGCACCAAGACCAA
AGCTGGACGGTTTGGGACCGATGGGTCATCAAAGGAAACCCAACCCTAAAAGAGTTGCTG
AAATGGGTAAAAGAGAAAGGACTAAACGCGTACAGCATATCTGTCGGAAGCTCTTTACTG
TACAACAGTATGTTCCCAAGGCATAAAGAGAGGATGGACAGGAGAGTGGTGGATATTGCA
AGAGAAGTAGCTAAAGTTGAGTTGCCTGCTTACAGACGTCACTTAGATGTTGTGGTGGCT
TGTGAGGATGACGACGACAATGACGTTGATATCCCTCTCGTATCAGTCTACTACGCCTGA
TCAGAATTTTAACATCTCCCAAAAGTCTTTGTACTACTACAGAACAGAGTTTTAGTATGT
GTCTTGTTTTAATATGCGAACAATATAGCATGAAGTCAGTTTGC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL8446Contig1 474 2 1 U
ATCTGATCCCCATGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCTATTCTCTTCATGTTCGATTTGACTA
GTCGTTGCACACTTAACAAGTATAATTACTGTTTAGTGTGATCAGCTGGTATCAAGAAGC
TAGAAAGTCTAATCGGACTGCGATCCCAGTTATGGTAGGAACCAAGTTTGATGAGTTTAT
CCAGCTTCCTATTGATCTTCAATGGACTATTGCTAGCCAGGCGAGAACCTACGCGAAGGT
GCTAAACGCGACGCTCTTCTTCTCGAGTGCTTCATACAACATAAACGTAAATAAGATCTT
TAAGTTTGTCACGGCGAAGCTCTTTGACTTACCATGGACAGTGGAGCGGAATCTCACCAT
CGGAGAACCACTCATCGACTTCTAGCATCTTCCACGACGTATATCCCCTTCTTATTATTT
GAGGAGCACTATTAGTAATGAACCTTGGTTTGATGTATGATTAACAAAAATGCC


BQ
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AF RR4GU88JQ C 1
AF RR4GU88TF U 1
BS 1 474 RR4GU88TF

RD RR4GU88JQ 474 0 0
ATCTGATCCCCATGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCTATTCTCTTCATGTTCGATTTGACTA
GTCGTTGCACACTTAACAAGTATAATTACTGTTTAGTGTGATCAGCTGGTATCAAGAAGC
TAGAAAGTCTAATCGGACTGCGATCCCAGTTATGGTAGGAACCAAGTTTGATGAGTTTAT
CCAGCTTCCTATTGATCTTCAATGGACTATTGCTAGCCAGGCGAGAACCTACGCGAAGGT
GCTAAACGCGACGCTCTTCTTCTCGAGTGCTTCATACAACATAAACGTAAATAAGATCTT
TAAGTTTGTCACGGCGAAGCTCTTTGACTTACCATGGACAGTGGAGCGGAATCTCACCAT
CGGAGAACCACTCATCGACTTCTAGCATCTTCCACGACGTATATCCCCTTCTTATTATTT
GAGGAGCACTATTAGTAATGAACCTTGGTTTGATGTATGATTAACAAAAATGCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR4GU88TF 474 0 0
ATCTGATCCCCATGGCTTGCAAGGACTCTGTAGCTATTCTCTTCATGTTCGATTTGACTA
GTCGTTGCACACTTAACAAGTATAATTACTGTTTAGTGTGATCAGCTGGTATCAAGAAGC
TAGAAAGTCTAATCGGACTGCGATCCCAGTTATGGTAGGAACCAAGTTTGATGAGTTTAT
CCAGCTTCCTATTGATCTTCAATGGACTATTGCTAGCCAGGCGAGAACCTACGCGAAGGT
GCTAAACGCGACGCTCTTCTTCTCGAGTGCTTCATACAACATAAACGTAAATAAGATCTT
TAAGTTTGTCACGGCGAAGCTCTTTGACTTACCATGGACAGTGGAGCGGAATCTCACCAT
CGGAGAACCACTCATCGACTTCTAGCATCTTCCACGACGTATATCCCCTTCTTATTATTT
GAGGAGCACTATTAGTAATGAACCTTGGTTTGATGTATGATTAACAAAAATGCC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL8447Contig1 741 2 2 U
GGCATGATGTGGGGGGTGTAAAAGGAAAAACAAAGTTCTTAGCTTAGCAAAGCTGAGAAA
CCTCTCTTATGTTTGACGGCCTCTTGCAATATTGACCATGCGTGATCTGAATGTGTTGTC
TCTTACTGCTTTTATCAAGTTGTATATAGGTTTGTTCTAATTGTAACATTTATAAGAGGG
TACGATGGTTTACAAACTCTTATAAGTGTAGAACTAGATTTTGACCCGCGCTTTTTAAAG
CGTGGAATAAGTTTTTTTTTGACAAATTTATCAACTTATTAGTTTTTTTCACTAATATAT
TTAGGTTTGCGTGCGGTTTCAAATTGTTGTTTTTTTGGTTTTCGGTTCGATTATGTTTTG
GGTATCTGTTTATTTTTGGTTCATGAGATATATAAAATGTTCGGTTATTTATGAATTGAA
TTTGATTTTGGATTGATTATTTTAGTCCGGTTTGGTTCGGGTAATAATGATAATAATCCG
ATAAAATTTCAAGTTCAGTTATTTTCTGGTTTGGTTTTCGTTTTTCGATAATCTCAAATA
CAAAATCATACTTTATATAAAATATTGTATAGCTCAAATAAATTTTATCATATGAAAAAA
AAATTCTCGTGTTTCAGTTCTTCAGAAAATTAGGATAAATTTATATATTTCGGGTAAAAG
TAATATGATAATCTTTTTGGATACTTTGGTCTATAATTAGGATTTTAAAAATATTTGATA
AATTTAAAACTAAAATACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GZ83TF U 1
AF RR4GZ83JQ C 38
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BS 596 741 RR4GZ83JQ

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TCTTACTGCTTTTATCAAGTTGTATATAGGTTTGTTCTAATTGTAACATTTATAAGAGGG
TACGATGGTTTACAAACTCTTATAAGTGTAGAACTAGATTTTGACCCGCGCTTTTTAAAG
CGTGGAATAAGTTTTTTTTTGACAAATTTATCAACTTATTAGTTTTTTTCACTAATATAT
TTAGGTTTGCGTGCGGTTTCAAATTGTTGTTTTTTTGGTTTTCGGTTCGATTATGTTTTG
GGTATCTGTTTATTTTTGGTTCATGAGATATATAAAATGTTCGGTTATTTATGAATTGAA
TTTGATTTTGGATTGATTATTTTAGTCCGGTTTGGTTCGGGTAATAATGATAATAATCCG
ATAAAATTTCAAGTTCAGTTATTTTCTGGTTTGGTTTTCGTTTTTCGATAATCTCAAATA
CAAAATCATACTTTATATAAAATATTGTATAGCTCAAATAAATTTTATCATATGA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4GZ83JQ 704 0 0
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ATGCGTGATCTGAATGTGTTGTCTCTTACTGCTTTTATCAAGTTGTATATAGGTTTGTTC
TAATTGTAACATTTATAAGAGGGTACGATGGTTTACAAACTCTTATAAGTGTAGAACTAG
ATTTTGACCCGCGCTTTTTAAAGCGTGGAATAAGTTTTTTTTTGACAAATTTATCAACTT
ATTAGTTTTTTTCACTAATATATTTAGGTTTGCGTGCGGTTTCAAATTGTTGTTTTTTTG
GTTTTCGGTTCGATTATGTTTTGGGTATCTGTTTATTTTTGGTTCATGAGATATATAAAA
TGTTCGGTTATTTATGAATTGAATTTGATTTTGGATTGATTATTTTAGTCCGGTTTGGTT
CGGGTAATAATGATAATAATCCGATAAAATTTCAAGTTCAGTTATTTTCTGGTTTGGTTT
TCGTTTTTCGATAATCTCAAATACAAAATCATACTTTATATAAAATATTGTATAGCTCAA
ATAAATTTTATCATATGAAAAAAAAATTCTCGTGTTTCAGTTCTTCAGAAAATTAGGATA
AATTTATATATTTCGGGTAAAAGTAATATGATAATCTTTTTGGATACTTTGGTCTATAAT
TAGGATTTTAAAAATATTTGATAAATTTAAAACTAAAATACAAT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGTAGGAATAAAATTTGAAATTCAAACGCTCCTTTTCTCTCAAACCTACTCTCTCTCTC
TTCCACGATAAACCCTAAAAATTCAAATTTGTGTTCTTCACGATGACTCTTGTACCATCT
ATAGGTCGCGAGCTCTCGAATCCACCGTCCGATGGGATTTCGAATCTCCGGTTCTCCGAT
AGCAGCGATCATCTACTTGTCTCTTCATTGGATCTTTTGCTTCAGCATTTGGCTGAGAAC
GATCCTAACAGGCAAGGGACTCCGCCTGCTCGTAAAGAAGTGGTAGATGCTTTGCCGACG
GTTAAGATAACGGAACCGTCGCTGCAGTGTTCGGTTTGTTTGGATGAGTTTGGGGGAGGA
GGAGTGGAGGAGGAAGCTAAAGAGATGCCGTGTAAGCATAAGTTTCATGTTAAGTTGTAT
TGTTCCGTGGCTCGAGCTTCATAGCTCTTGCCCCGTGTGTCGGTTCGAGCTTCCTTCTGC
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GTGTTTGTTTTGATTTTCTTGTTTCTACACTTGCTTTATGATATGAGTTATATATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BS16TF U 1
AF RR4BS16JQ C 150
BS 1 712 RR4BS16TF
BS 713 958 RR4BS16JQ

RD RR4BS16TF 713 0 0
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TGCGAGGAGTGGTAATGGAAGAAGGTTCTCGTTTTCGTGGCCGTTTAGTGGATTGTTCTC
TTCTTCTTCTTCATCCTCTGGATCTCAATCTGGTTCTCGCTGATCGGAAAGA
G

QA 1 712 1 712
DS 

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GCCCCGTGTGTCGGTTCGAGCTTCCTTCTGCGAATGGTGATGAGAGTATGGTTGAATCGG
CGAGGACAAGAAGTAGGACTCTTCCGGAGAGTAGTAACGGAAACGTTGTTGAGAATGTGG
GGAATGAGGAAAGAAGAGGAAGGGAGGATGATGCGAGGAGTGGTAATGGAAGAAGGTTCT
CGTTTTCGTGGCCGTTTAGTGGATTGTTCTCTTCTTCTTCTTCATCCTCTGGATCTCAAT
CTGGTTCTCGCTGATCGGAAAGAAGAACAAAACATCTTGAACTTGTTGTTCTTGTTCTTG
TTCTTGTTCTCCTCTGCTTTTATGTACATACAAATGATGTTCTTTCACTTGTTCCAAAAA
AATATCCATGTAGGGTGTTATCTGTTCTTATTTGTTTCAATCTTCTTATTAAATTGTTGT
TGTACAGAGATGATCAAGTTTTACTTTGTGTGTGTTTGTTTTGATTTTCTTGTTTCTACA
CTTGCTTTATGATATGAGTTATATATGTC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

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AGTCTGACCTAGAGATGTTTAAACGGGTTCAAAACCCGCGGATTCCAACGGGCTTAGTAT
AAACGGACTGACCCGTGGCCCGTTTATTATCATGCAAAAATAAATAGGTTTATACGGGTC
AGCCCGTTTCAGTTCTTTTCGTTAGCAGGCATACCCGTTAAACAAATGGGTACCTGTTTA
GACCCGTTTATGATTTTTTTTATTTTTATTTAAAACGAATTTAAAGACATTTAAAAAAAC
TCATAAACTTTTTATAATTTGTGTATTTTAAAACAGAATAATTGTATTATATTTAGTTTG
TGTTTCCTTTTTTTTAAAGTATGTATAGTTATGTTTAAAACCTATTAGAATTTGTTGATA
TTTTCTGATATTAATATTTAACAAAACTTCTGCCCAAAAAAAGTTATTTAACAAAAAATT
TCTTTAGTCTCCATTTCTATTTTTATAAAGTTTTGAAATCAAATAAAAAGCTATTAGAAC
TATATTAAAATATGACAAAAGGTTATTGACAAAATACTAAAATTCTC


BQ
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AF RR4ET65TF U 1
AF RR4ET65JQ C 123
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BS 681 827 RR4ET65JQ

RD RR4ET65TF 680 0 0
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AGTCTGACCTAGAGATGTTTAAACGGGTTCAAAACCCGCGGATTCCAACGGGCTTAGTAT
AAACGGACTGACCCGTGGCCCGTTTATTATCATGCAAAAATAAATAGGTTTATACGGGTC
AGCCCGTTTCAGTTCTTTTCGTTAGCAGGCATACCCGTTAAACAAATGGGTACCTGTTTA
GACCCGTTTATGATTTTTTTTATTTTTATTTAAAACGAATTTAAAGACATTTAAAAAAAC
TCATAAACTTTTTATAATTTGTGTATTTTAAAACAGAATAATTGTATTATATTTAGTTTG
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TTTTCTGATATTAATATTTA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4ET65JQ 705 0 0
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TCTGACCTAGAGATGTTTAAACGGGTTCAAAACCCGCGGATTCCAACGGGCTTAGTATAA
ACGGACTGACCCGTGGCCCGTTTATTATCATGCAAAAATAAATAGGTTTATACGGGTCAG
CCCGTTTCAGTTCTTTTCGTTAGCAGGCATACCCGTTAAACAAATGGGTACCTGTTTAGA
CCCGTTTATGATTTTTTTTATTTTTATTTAAAACGAATTTAAAGACATTTAAAAAAACTC
ATAAACTTTTTATAATTTGTGTATTTTAAAACAGAATAATTGTATTATATTTAGTTTGTG
TTTCCTTTTTTTTAAAGTATGTATAGTTATGTTTAAAACCTATTAGAATTTGTTGATATT
TTCTGATATTAATATTTAACAAAACTTCTGCCCAAAAAAAGTTATTTAACAAAAAATTTC
TTTAGTCTCCATTTCTATTTTTATAAAGTTTTGAAATCAAATAAAAAGCTATTAGAACTA
TATTAAAATATGACAAAAGGTTATTGACAAAATACTAAAATTCTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C978JQ C 1
AF RR4C978TF U 1
BS 1 696 RR4C978TF

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DS 

RD RR4C978TF 696 0 0
GACTGGCGCCATCTTTGAAGAGCAGCCGATGCTGTGAGACTTCTTCTTCTATAAACTGAT
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GAGATCACTGCTCTCTCTGCGATATTTCAAGAGGACTGCAAAGTTATCTCTTCTTCTACT
AGTTCAAGTTCGCCTCCTCAGATAGTTATTAAACTCAGGCCTTACTCGAAAGATATGGGG
TATGAGGACACTGACATCTCCGCCACGCTTTAGTTAGATGCTTGCCGGGGTATCCTTACA
AGTCCCCCAAGCTGCAGATTACTCCAGAACAAGGGATGACAACAGCTGATGCGGAGAAGC
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TCAACTTGGTGGAAGCTGCTCAAGAGTTTCTATCCG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FB57TF U 1
AF RR4FB57JQ C 222
BS 1 566 RR4FB57TF
BS 567 898 RR4FB57JQ

RD RR4FB57TF 566 0 0
GGGAGCTTTGTTGTTGTATGTGACCGAGTCATCGTCGTCGTGCTCGCCCATCTCTCTTCT
TGTTCAAGAGCCTAAAGAAGAAATAAAACTTCTTGAAAAAATTCGGATCTCTCTTATTAA
TCACTCTCGTTATTCTCCTTTCATCTGAGAGCAACGTGAACATGGCGTCTGTTTCTGCTT
TGGCAAAGTTTAAGTTGGTCTTCTTAGGAGATCAATCTGTGGGCAAAACAAGCATCATCA
CCCGTTTCATGTATGATAAATTCGACACCTCTTACCAGCCTACCATTGGGATCGATTTTC
TGTCCAAAACAATGTACCTCGAAGATCGAACTGTTCGTTTGCAGCTTTGGGATACGGCTG
GACAAGAAAGATTCAGGAGTCTGATCCCAAGTTACATCAGAGACTCTTCTGTTGCAATCG
TTGTCTATGGTGTAGCCAATAGGCAAACGTTTCTGAATATTCCGAAATGGATCGATGATG
TACACAGAGAAAGAGGTGGTTCAGGCGACGTTATTATTGTCCTTGTTGGTAACAAAACCG
ATCTTGTTGATAAAAGACAAGTATCG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4FB57JQ 677 0 0
GGCAAAACAAGCATCATCACCCGTTTCATGTATGATAAATTCGACACCTCTTACCAGCCT
ACCATTGGGATCGATTTTCTGTCCAAAACAATGTACCTCGAAGATCGAACTGTTCGTTTG
CAGCTTTGGGATACGGCTGGACAAGAAAGATTCAGGAGTCTGATCCCAAGTTACATCAGA
GACTCTTCTGTTGCAATCGTTGTCTATGGTGTAGCCAATAGGCAAACGTTTCTGAATATT
CCGAAATGGATCGATGATGTACACAGAGAAAGAGGTGGTTCAGGCGACGTTATTATTGTC
CTTGTTGGTAACAAAACCGATCTTGTTGATAAAAGACAAGTATCGATCAGTGAAGGGGAA
GAAAAGGGTAAAGAGCATGGCGTGATGTTCATTGAGACCAGCGCCAAAGAAAATTTCAAC
ATTAAGGCTTTGTTCAGGAAGATAGCTGCAGCATTGCCTGGGATGGATTCATATTCGTCG
GCGACAAAATCAGATGATATGGTTGATGTGAACCTAAAGAACACTTCAAGTTCATCACAA
GGTGAGCAACAAGGAGGAGGTGGTGGAGGCGGCTGTTCTTGTTGATTCAATAAATTTATT
TATAAAACATATTCCGTTTAAGACACTTGTGAAGCCAAGAAAACAAAAAAAAAGGACCAA
GAAAGTTTTCTTTTGAG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8454Contig1 570 2 2 U
GTTCCGGAGTTTGGTGGAGAAGCTACCGGGAAAGAAATTTCGGGACGAGAATCTGGATCG
GGACCGGTCAGGACCAGACACAAATAACGGTCGGAGGAGAGGGTCAAACGAAGCGAGTGA
GGACTCTGGCTGAGAAGAGACCAAGCAGATAAAGAGGTACCCAGTTTTTTACACTTTTTA
CCATTATTGTTTAGAGGGTGGTAAATAAAGGTTGGTTGCGTGATGGGGATTGTTTGGTAG
TTTTTTTGTGAATAAAAAACGTTTTGAGGAACAGAGTCTCAGCACAGCAGAGAGGAAGAA
AGCTTACTTGGGTGAACTGGAAAACAGAGTGAAAGACTTGGAGAACAGAAACTCTGAACT
TGAAGGGAGACTTTCTACTTTGCAGAACTAGAACCTGATGCTTAAACAAGTACGCTTTTT
ATCTATCCCGTTAGACTTCAAACATATCACATTGCTGGAATTAACCATCAATTTTCAAGC
CGTAGGGACCCATTCATCGAATTAAATACTAAGTAGCCTAAGATAAGCTTGAGATTAGTT
CACAAATATTTTTAGATTTCCAATGGTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DP48TF U 1
AF RR4E422TF U 1
BS 1 558 RR4DP48TF
BS 559 570 RR4E422TF

RD RR4DP48TF 558 0 0
GTTCCGGAGTTTGGTGGAGAAGCTACCGGGAAAGAAATTTCGGGACGAGAATCTGGATCG
GGACCGGTCAGGACCAGACACAAATAACGGTCGGAGGAGAGGGTCAAACGAAGCGAGTGA
GGACTCTGGCTGAGAAGAGACCAAGCAGATAAAGAGGTACCCAGTTTTTTACACTTTTTA
CCATTATTGTTTAGAGGGTGGTAAATAAAGGTTGGTTGCGTGATGGGGATTGTTTGGTAG
TTTTTTTGTGAATAAAAAACGTTTTGAGGAACAGAGTCTCAGCACAGCAGAGAGGAAGAA
AGCTTACTTGGGTGAACTGGAAAACAGAGTGAAAGACTTGGAGAACAGAAACTCTGAACT
TGAAGGGAGACTTTCTACTTTGCAGAACTAGAACCTGATGCTTAAACAAGTACGCTTTTT
ATCTATCCCGTTAGACTTCAAACATATCACATTGCTGGAATTAACCATCAATTTTCAAGC
CGTAGGGACCCATTCATCGAATTAAATACTAAGTAGCCTAAGATAAGCTTGAGATTAGTT
CACAAATATTTTTAGATT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4E422TF 570 0 0
GTTCCGGAGTTTGGTGGAGAAGCTACCGGGAAAGAAATTTCGGGACGAGAATCTGGATCG
GGACCGGTCAGGACCAGACACAAATAACGGTCGGAGGAGAGGGTCAAACGAAGCGAGTGA
GGACTCTGGCTGAGAAGAGACCAAGCAGATAAAGAGGTACCCAGTTTTTTACACTTTTTA
CCATTATTGTTTAGAGGGTGGTAAATAAAGGTTGGTTGCGTGATGGGGATTGTTTGGTAG
TTTTTTTGTGAATAAAAAACGTTTTGAGGAACAGAGTCTCAGCACAGCAGAGAGGAAGAA
AGCTTACTTGGGTGAACTGGAAAACAGAGTGAAAGACTTGGAGAACAGAAACTCTGAACT
TGAAGGGAGACTTTCTACTTTGCAGAACTAGAACCTGATGCTTAAACAAGTACGCTTTTT
ATCTATCCCGTTAGACTTCAAACATATCACATTGCTGGAATTAACCATCAATTTTCAAGC
CGTAGGGACCCATTCATCGAATTAAATACTAAGTAGCCTAAGATAAGCTTGAGATTAGTT
CACAAATATTTTTAGATTTCCAATGGTTCT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL8455Contig1 754 2 2 U
GGGAGTGAAAAAACAGAGCAAATGGCAATATCTCATCTTCTTTCTCCTTTACCATCTCTA
ACCGGAAACCTAACCCTAACCGGTCGTTCTTCTTCATCTCTCCCTCTAAACCCTAATCCC
CACTTCCCAAAACCAATACTTTCAAGGGAAAGAGCCGCCACACTCGTCCTCCGATCAAAA
GGAGACGACTCCGTCGACGCATCCGATCGTCTCATCTCAGCCGTCTGTTACTTCTACCCG
TTCTTCGACGGCATTCAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAGTACCAACCTTTCCAGATT
CTCATCCAACCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAACGGCTTC
CTCATCTTCATCACTCTCTACTTCGTCGTCGTCAGGAACCAGAACTTCAGCAGGTACGTT
AGGTGCAACACGATGCAGGCCATCGTCCTCGACGTGCTGTTGATCTTCCCGGATTTGCTC
GAGAGGAGCTTCAACCCCAGAGATGGGTTTGGTCTGGATGTGGTGATGAGTCTGGACAGC
ACTGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTCTTTGATCTATGGTTTTTCTGCTTGCTTGTTTGGT
CTGATTCCGAGGTTGCCCATTGTCGCTGATGCTGCTGATAGGCAAGTCCTTTGAACAAAC
AACATATATGTATATGTGGTTGAACCTCTCTATGTTGAATCTGTTTCTGATAATGTAACT
TTTTGATCAATGAAAGGTTTCTCTGTCGCTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EH30TF U 1
AF RR4EH30JQ C 80
BS 1 747 RR4EH30TF
BS 748 754 RR4EH30JQ

RD RR4EH30TF 747 0 0
GGGAGTGAAAAAACAGAGCAAATGGCAATATCTCATCTTCTTTCTCCTTTACCATCTCTA
ACCGGAAACCTAACCCTAACCGGTCGTTCTTCTTCATCTCTCCCTCTAAACCCTAATCCC
CACTTCCCAAAACCAATACTTTCAAGGGAAAGAGCCGCCACACTCGTCCTCCGATCAAAA
GGAGACGACTCCGTCGACGCATCCGATCGTCTCATCTCAGCCGTCTGTTACTTCTACCCG
TTCTTCGACGGCATTCAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAGTACCAACCTTTCCAGATT
CTCATCCAACCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAACGGCTTC
CTCATCTTCATCACTCTCTACTTCGTCGTCGTCAGGAACCAGAACTTCAGCAGGTACGTT
AGGTGCAACACGATGCAGGCCATCGTCCTCGACGTGCTGTTGATCTTCCCGGATTTGCTC
GAGAGGAGCTTCAACCCCAGAGATGGGTTTGGTCTGGATGTGGTGATGAGTCTGGACAGC
ACTGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTCTTTGATCTATGGTTTTTCTGCTTGCTTGTTTGGT
CTGATTCCGAGGTTGCCCATTGTCGCTGATGCTGCTGATAGGCAAGTCCTTTGAACAAAC
AACATATATGTATATGTGGTTGAACCTCTCTATGTTGAATCTGTTTCTGATAATGTAACT
TTTTGATCAATGAAAGGTTTCTCTGTC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4EH30JQ 675 0 0
CCGGTCGTTCTTCTTCATCTCTCCCTCTAAACCCTAATCCCCACTTCCCAAAACCAATAC
TTTCAAGGGAAAGAGCCGCCACACTCGTCCTCCGATCAAAAGGAGACGACTCCGTCGACG
CATCCGATCGTCTCATCTCAGCCGTCTGTTACTTCTACCCGTTCTTCGACGGCATTCAGT
ACGGTAAATTCATCATCACGCAGTACCAACCTTTCCAGATTCTCATCCAACCTCTGTTTC
CCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAACGGCTTCCTCATCTTCATCACTCTCT
ACTTCGTCGTCGTCAGGAACCAGAACTTCAGCAGGTACGTTAGGTGCAACACGATGCAGG
CCATCGTCCTCGACGTGCTGTTGATCTTCCCGGATTTGCTCGAGAGGAGCTTCAACCCCA
GAGATGGGTTTGGTCTGGATGTGGTGATGAGTCTGGACAGCACTGTGTTCCTCTTCTTGC
TTGTCTCTTTGATCTATGGTTTTTCTGCTTGCTTGTTTGGTCTGATTCCGAGGTTGCCCA
TTGTCGCTGATGCTGCTGATAGGCAAGTCCTTTGAACAAACAACATATATGTATATGTGG
TTGAACCTCTCTATGTTGAATCTGTTTCTGATAATGTAACTTTTTGATCAATGAAAGGTT
TCTCTGTCGCTTCCG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL8456Contig1 558 2 1 U
GGATTCACAAATCCACAGAAGCATTCCATCGTCAATCTATCCTCGAGATTAAAGAATCAT
ATATTCAAAAGCAGTTAAACATTTTATCGTTCTTTTCTCTTTTGAAATATAAGTTATATA
GCAGTTTTGGAGCCAAAGATTGGTCAATAATGGAGATCAAATCGGTGGCGTGCGAGTGTT
GCGGTTTAACGGAAGATTGTACACAAAACTACATTAGTAAGGTCAATGCTAACTTCGGTG
GAAAATGGCTTTGTGGGCTTTGCTCTGAGGCGGTGAGTGATGAATTCAGCCGCGACAGGA
AGATGACGACGGTGGAGGAAGCAGTTAACGCCCATGTGACATTTTGTAGTAAGTTTAGAG
CCAACCCGGCTGAACTCGTCGCCGACGGCATGAGACAGATGCTACGTCGGAGGTCCGGTG
AGTTGTTGCCGGCGAAGTCCAAGAAGTTTGGAAGATCTAACACCACGTAGTTGTGTGTAT
ACACATCTTTTTCTCTCATCACTTTCTTCGCTTTTATAGTGTTGGCTAATGTACGATATA
ATATAAAATCATCACCCT


BQ
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AS 1 2

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CC

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QA 1 669 1 669
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AF RR4AR27JQ C 1
AF RR4AR27TF U 1
BS 1 608 RR4AR27TF

RD RR4AR27JQ 608 0 0
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AGGCGGAGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGCCGGTGGACTTGGTGGCGG
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AAAATTTC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4AR27TF 608 0 0
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GAGAGCAACTTTCACTAACTTGCTTGGGCTTCTCTTCATTGCACTTGTTTGCGTAAATGT
CGGTGCTAGGAAACTTATTTCCGGAGATTCCCAATTCAAAGATGAAAAATTCCTTGGCGG
CGGTGGAGCCGGTGGTGGCCTTGGTGGGCTAGGGATTGGAGCTAATATCAATGTTGGAGC
TGGGTTAGGGCTAGGTGGTGGACTTGGCGGTGGTGGTGGACTCCTAGGCGGAGGTGGTTT
AGGCGGAGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGCCGGTGGACTTGGTGGCGG
TGGTGGCTTTCCTTGAACGTATAGTCAAGTGTTTGTGTGTGTGTCTGAGCTCATTCACAG
CTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCTCATAATAAATTTAGAGTGGTTTAATCACATTCAC
GTCTTTTATTTCGACATCAATGTTTTAATCGAGAAAGGCCTTAGCTAATAGCTACTACTT
CTAGCGGTTATGGTCGGACTCGTAGTATGTGTAACGTCAAATATTATTATTAATTAGTGA
AAAATTTC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL8459Contig1 654 2 1 U
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TCTTCCCGTCAACAGAGATCGCTTCATCAGCAAGATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCAT
TATCGTCCTTAGGAATCCCAAGTAAGAGACATTACAAGAGATGTATCTGCTCCTAGTTGT
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ACTTTTTCACTTGTCTTCTGTCTTATCTCGTATGACTAAGAAGTAGCGCTAAGTAGTTTG
TAATAGCCAAAGACAGTTTTTTTTTTTGAGGGTTAAAACGATAGACAAAGTTGC


BQ
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AF RR4GG18TF U 1
AF RR4GG18JQ C 96
BS 1 654 RR4GG18TF

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TATCGTCCTTAGGAATCCCAAGTAAGAGACATTACAAGAGATGTATCTGCTCCTAGTTGT
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DS 

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TCTTGAAAATCTAGCGTTGCCTTGTACTTTTTCACTTGTCTTCTGTCTTATCTCGTATGA
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AAACGATAGACAAAGTTGC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL8460Contig1 1208 2 6 U
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TATCGCCGTCGTTGCCCACTCCACTTTCAACTCTCTTCGCCTTGGAAGAACTGCTCAGTA
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CCTGAGCAAAGAGTGGAATCCACAGAACACGAGAGGAAAAAAAAAACATATTACAATTCT
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ACAATTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D725TF U 1
AF RR4D725JQ C 610
BS 1 682 RR4D725TF
BS 683 683 RR4D725JQ
BS 684 710 RR4D725TF
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BS 712 720 RR4D725TF
BS 721 1208 RR4D725JQ

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GACGACTTCATTCTTGTAACTCCATCTCTTCGACTGCCGACTAAACCAAAAAAACGATTT
GTCTTCGTATAAAGCCTTTTTCAGGCTCCTTCATAGAGAGGGCGACGAAGGTGAGCTTTC
ATTACCTCATAATTTTCCTCCTACACTTTTTTCTACGTTTTCCACTGTAACTCCCGTTCC
TATCGCCGTCGTTGCCCACTCCACTTTCAACTCTCTTCGCCTTGGAAGAACTGCTCAGTA
CGTAGTTGGTCCCTTTGCAATCGGTTTGATGTTTTTTTCTGTGGTTATCCTCTAATGAAT
TAATTGGACTTATTAACAAAAGTCACTTTTTAGATGCTTCAAAATAGGCTCCCGTTGTTA
CTCCTCTTACGGAATTCATACATCAAAAACGTGCTACTGTGATTGGATCCCAGGGTTTAT
TAGATGGTCGAAGAGGAGGCAGAAGAGCCAGAGCAGTCTCTGCAAACAAGCCAAGTTCGA
GACCTTCGAAACAAAACTCTGAGAAGAAAAGGTGTCTCTGACTTTGTATTTGTAGTGAAC
AGTCATTGTAGTCTACCATTTCACTCATATGTGTTGCCTTCTTGTGGTGAACAAACATTT
ATGTCCATTTTTTAGTTTTTTT*GAACTTTTCTTAATAGTATGTGGAAAA*GACAATTCA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4D725JQ 599 0 0
AGTCTACCATTTCACTCATATGTGTTGCCTTCTTGTGGTGAACAAACATTTATGTCCATT
TTTTAGTTTTTTTTGAACTTTTCTTAATAGTATGTGGAAAAAGACAATTCAAAAGGTGTA
CCCCGTACGGCTTCATCAGACGTCGGCAGCTCCAAGCACGATTACAATCAGGCAAATTCA
AGTGGAAATGACTTACCAGCAACTGAAACTGCCTCTGTCATGGATACCTCTCTCCCAGGG
ATTGCATTGACTATGGATTCTGGGAAGAAAAAGATCTTGCTCCTGAAAAAAGACCGCGAC
AACCCTGTTGACTCTCCATTACAAGCGGAACAGCAGCAGATCGAAGCTAATCTTTTTGGA
AGCTCCTAAACTTCAAGACAGAATCAGAAGACAGATGTTTGTGGGAGGTTGATCAAGGGA
ATACTTCGGAGAAATGAGCCGCAGTCTAGCCAGGCTGCATCTTTGGTCCAACCTGAGCAA
AGAGTGGAATCCACAGAACACGAGAGGAAAAAAAAAACATATTACAATTCTGTCTTTTTA
AAAAAACAATTGGTAAAAATAAGAGAATGTCCTAAATCTTCTTAAAAATATACAATTCT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL8461Contig1 958 2 2 U
GATATTCTCTTCACATTAGACAAACTTATCTACAAGCTCATCAAGCATATCCAAGTAGTA
GCAGCTGATGAGATGGACAACAAACTACAACAGTTGTATTCATATGAGAAATCAAGAAAG
CCTGAAAAGTATATGGATGAGGTTTATTATGAAAACGCTCGTGTTCTTCTTCCTGATGAA
GATGTATACCGCATTAAATGTAAACTTTCAGCACCAACAAAATTATCTATTCAGCTTCTG
GACTATGGACATGATAAGCCTGATGTGCATCCATTTCCACGGACCCAAATTTTGCAGCTT
ACCTCCAAAACAAGTTCCTTTCCTGCCACGCTTATGTGAAAGAGAAGCCTCTAATCTATC
TAAAACGGAATAAGCGTAAAAATGGTGATGACGATGAACTATGCACCACGGATCGAGTTA
AGATCAATAATGGTTTGGAGTGTAAGATAACATGCAGTTCTTCAAAGGTTTCATATGTAT
TTGACACAGAGGATGTATTGCATCGTGTTAAGAGGAGGAAGGTATTGAACCAAAGCAGTG
GTTCTTTAATTAGGGAAAAGAGGATACAAAGATACCAAAGACTTCTCACCAGCCAATGAC
ATTTTCTCGCTTGCACTCTCAGGCAAAAAGCTCGTGAACAGAGCAACTTGGTACGCTTTT
AAAGACGCAAGGATGCCATTCTTTTTGCTTGTTGTACATCAACATTGAGATTTTGTCTGA
CGAGAAGAGAAAATTAAAGATGGCACTCTCTCACTTCTGCTGCTGTTGCCTCTGCTCCTT
GTTGACAAAAAAAAAGGGAGGGAGGGATGAAATGAATACTGAAAAGGGATGAAGCGTTCC
ACAATTGGTGTATATAAAGCTTTTGTATGTTGTAACATTAACATAAAGTTCCTCTTTTGT
TTGTTGGTACCTATTCTTTTCAACATTAGTCTCTCATGAATGCAAAAATTTGTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BE07TF U 1
AF RR4BE07JQ C 406
BS 1 786 RR4BE07TF
BS 787 958 RR4BE07JQ

RD RR4BE07TF 786 0 0
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CCTGAAAAGTATATGGATGAGGTTTATTATGAAAACGCTCGTGTTCTTCTTCCTGATGAA
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GACTATGGACATGATAAGCCTGATGTGCATCCATTTCCACGGACCCAAATTTTGCAGCTT
ACCTCCAAAACAAGTTCCTTTCCTGCCACGCTTATGTGAAAGAGAAGCCTCTAATCTATC
TAAAACGGAATAAGCGTAAAAATGGTGATGACGATGAACTATGCACCACGGATCGAGTTA
AGATCAATAATGGTTTGGAGTGTAAGATAACATGCAGTTCTTCAAAGGTTTCATATGTAT
TTGACACAGAGGATGTATTGCATCGTGTTAAGAGGAGGAAGGTATTGAACCAAAGCAGTG
GTTCTTTAATTAGGGAAAAGAGGATACAAAGATACCAAAGACTTCTCACCAGCCAATGAC
ATTTTCTCGCTTGCACTCTCAGGCAAAAAGCTCGTGAACAGAGCAACTTGGTACGCTTTT
AAAGACGCAAGGATGCCATTCTTTTTGCTTGTTGTACATCAACATTGAGATTTTGTCTGA
CGAGAAGAGAAAATTAAAGATGGCACTCTCTCACTTCTGCTGCTGTTGCCTCTGCTCCTT
GTTGAC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4BE07JQ 553 0 0
CCACGGATCGAGTTAAGATCAATAATGGTTTGGAGTGTAAGATAACATGCAGTTCTTCAA
AGGTTTCATATGTATTTGACACAGAGGATGTATTGCATCGTGTTAAGAGGAGGAAGGTAT
TGAACCAAAGCAGTGGTTCTTTAATTAGGGAAAAGAGGATACAAAGATACCAAAGACTTC
TCACCAGCCAATGACATTTTCTCGCTTGCACTCTCAGGCAAAAAGCTGGTGAACAGAGCA
ACTTGGTACGCTTTTAAAGACGCAAGGATGCCATTCTTTTTGCTTGTTGTACATCAACAT
TGAGATTTTGTCTGACGAGAAGAGAAAATTAAAGATGGCACTCTCTCACTTCTGCTGCTG
TTGCCTCTGCTCCTTGTTGACAAAAAAAAAGGGAGGGAGGGATGAAATGAATACTGAAAA
GGGATGAAGCGTTCCACAATTGGTGTATATAAAGCTTTTGTATGTTGTAACATTAACATA
AAGTTCCTCTTTTGTTTGTTGGTACCTATTCTTTTCAACATTAGTCTCTCATGAATGCAA
AAATTTGTTATGT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL8462Contig1 734 2 4 U
GTATCTGAGATTCTTCGGAATTTGGGAGAGGGTTAGTAGATTAATTAGATCATGTATGTG
GGAAGAGGGACGGTTGGACCGAAAGCCGAACGGGAAGAGATTAGCGAAGCTTACGATGTT
AATCGGTCCGAGGGCAAAGAAACGGGCGGATCGAACTCCGTGTTGCATGATTCTCGTTCT
TCTACCCTCTCCCGGACTCACATTTCCCAAGCTGTAGATTCATCAGAAGACTCAGAGGTC
AAGGGTTCCGACGAAGAAGACTTGGCATGGACTACCTGGTTCTGTAAACTACCTGGCAAC
GAATTCTTGTGCGAAGTCGATGATTATTACATCCTAGACAATTTCAACTTGTGTGGACTC
AGACATCAAGTTCCTTACTACGACCACGCTCTCGATTTGATTCTCGATGATGATTCTTCT
TCTCATGGTCAGAAGATCACAGATGAAAAGAACGAACTGATTGAGTCAGCAGCCGAGATG
TTATACGGATTGATTCATGCTCGTTACATATTGACAGACAAAGGATTCCATTCTATGTTA
AACAAATACAATAGGTCTGAGTTTGGAAGATGCCCCAGAGTTTCTTGTAGTGGCCAATCT
TGTTTGCCTATTGGTCTATCCGATGTCCCTGGAGCAACTACCGTCAAGATGTATTGTCCC
AAATGTGAGACGTTTATCACCCGCCATCAAAATTCCAAGGAGTAGTATCCTTTTGTTGTT
TCGCATTCGATTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DZ05TF U 1
AF RR4GG11TF U 5
BS 1 529 RR4DZ05TF
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BS 531 686 RR4DZ05TF
BS 687 734 RR4GG11TF

RD RR4DZ05TF 686 0 0
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TCTACCCTCTCCCGGACTCACATTTCCCAAGCTGTAGATTCATCAGAAGACTCAGAGGTC
AAGGGTTCCGACGAAGAAGACTTGGCATGGACTACCTGGTTCTGTAAACTACCTGGCAAC
GAATTCTTGTGCGAAGTCGATGATTATTACATCCTAGACAATTTCAACTTGTGTGGACTC
AGACATCAAGTTCCTTACTACGACCACGCTCTCGATTTGATTCTCGATGATGATTCTTCT
TCTCATGGTCAGAAGATCACAGATGAAAAGAACGAACTGATTGAGTCAGCAGCCGAGATG
TTATACGGATTGATTCATGCTCGTTACATATTGACAGACAAAGGATTCCTTTCTATGTTA
AACAAATACAATAGGTCTGAGTTTGGAAGATGCCCCAGAGTTTCTTGTAGTGGCCAATCT
TGTTTGCCTATTGGTCTATCCGATGTCCCTGGAGCAACTACCGTCAAGATGTATTGTCCC
AAATGTGAGACGTTTATCACCCGCCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4GG11TF 730 0 0
GG
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GGGACGGTTGGACCGAAAGCCGAACGGGAAGAGATTAGCGAAGCTTACGATGTTAATCGG
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CTCTCCCGGACTCACATTTTCCAAGCTGTAGATTCATCAGAAGACTCAGAGGTCAAGGGT
TCCGACGAAGAAGACTTGGCATGGACTACCTGGTTCTGTAAACTACCTGGCAACGAATTC
TTGTGCGAAGTCGATGATTATTACATCCTAGACAATTTCAACTTGTGTGGACTCAGACAT
CAAGTTCCTTACTACGACCACGCTCTCGATTTGATTCTCGATGATGATTCTTCTTCTCTT
GGTCAGAAGATCACAGATGAAAAGAACGAACTGATTGAGTCAGCAGCCGAGATGTTATAC
GGATTGATTCATGCTCGTTACATATTGACAGACAAAGGATTCCATTCTATGTTAAACAAA
TACAATAGGTCTGAGTTTGGAAGATGCCCCAGAGTTTCTTGTAGTGGCCAATCTTGTTTG
CCTATTGGTCTATCCGATGTCCCTGGAGCAACTACCGTCAAGATGTATTGTCCCAAATGT
GAGACGTTTATCACCCGCCATCAAAATTCCAAGGAGTAGTATCCTTTTGTTGTTTCGCAT
TCGATTTT

QA 3 730 3 730
DS 



AS 1 2

CO CL8463Contig1 908 2 6 U
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GGGTCACATCAGGCACAGGAATCTTCTCCCCTTGTTAGCACACGTTCCGAGACCCGAGTG
TCACTATCTAGTCTACGAGTACATGAAGAACGGGAGTTTGCAAGATATACTGACCGACGT
TACAGCTGGAAACAGAGATTTAATGTGGCCAGCAAGGCACAAGATTGCTGTAGGTATAGC
TGCAGGGCTTGAGTACCTTCACACGGATCATAAACCAGCAATCATTCACAGAGACTTGAA
GCCAGCAAATATTCTTCTAGATGATGACATGGAGGCTAGGATTTCGGATTTCGGGCTGGC
GAAGGTGATGCCTGATGCAGTCACTCACATTACAGCCTCGAAACTTGCAGGCACCGTGGG
GTACATAGCATCAGAGTATCATCAGACTCTCAAGTTCACGGATAAATGTGATATCTATAG
TTTTGGAGTGATTCTTGGGGTTCTTGTGATTGGGAAGCTTCCTTCAGATGAGTTTTTCCA
GACTACTGAAGAGATGAGTCTGATAAAGTGGATGAGGAACAAGGTAACATCGGAGAATCC
AAGCCTTGCTATTGATCCGAAGCTGATGGAGCAAGGATTCGATGAGCAGATGCTTTTGGT
TCTGAAAATCGCTTGTTACTGCACTTTGGATGATCCGAAACAGAGGCCGAACAGCAAAGA
TGTCAGGACTATGTTGTCCCAGATCAAGAGCCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATGATGT
ATTGTTTGCTTCTAAATGTGTATTCTATATTCCCTGTTTGAGAAATAACTAGGAACACAA
TAGTGTTTACTTGGCAGAAGCTTGTGATCAAGATGTATGATTTAAATGGTTTTAATTATG
TTTTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E436TF U 1
AF RR4E436JQ C 233
BS 1 705 RR4E436TF
BS 706 706 RR4E436JQ
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BS 727 727 RR4E436JQ
BS 728 799 RR4E436TF
BS 800 908 RR4E436JQ

RD RR4E436TF 799 0 0
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GACTACTGAAGAGATGAGTCTGATAAAGTGGATGAGGAACAAGGTAACATCGGAGAATCC
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TCTGAAAATCGCTTGTTACTGCACTTTGGATGATCCGAAACAGAG*CCGAACAGCAAAGA
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ATTGTTTGCTTCTAAATGT

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DS 

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ATCTATAGTTTTGGAGTGATTCTTGGGGTTCTTGTGATTGGGAAGCTTCCTTCAGATGAG
TTTTTCCAGACTACTGAAGAGATGAGTCTGATAAAGTGGATGAGGAACAAGGTAACATCG
GAGAATCCAAGCCTTGCTATTGATCCGAAGCTGATGGAGCAAGGATTCGATGAGCAGATG
CTTTTGGTTCTGAAAATCGCTTGTTACTGCACTTTGGATGATCCGAAACAGAGGCCGAAC
AGCAAAGATGTCAGGACTATGTTGTCCCAGATCAAGAGCCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TATGATGTATTGTTTGCTTCTAAATGTGTATTCTATATTCCCTGTTTGAGAAATAACTAG
GAACACAATAGTGTTTACTTGGCAGAAGCTTGTGATCAAGATGTATGATTTAAATGGTTT
TAATTATGTTTTCTTA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL8464Contig1 779 2 2 U
GGAAGTCTCTCTTGTGTAACAGAACACCAAAGCTCCTTTCTCTTGAGTCTCCGTTCTTAA
ACGTCAAGAGGTATGGTGAGAGTCTTTCTTCTCTACAATCTCTTAAACTCATTTCTTCTC
TGTTTGGTTCCCAAGAAGCTTAGAGTTCTCTTCCCTCCTTCTTGGTACACCGACGACAAG
ATCCCACCACCGTCTGAATCGGAATGTTCTTTGAGAACAGACCCGGTGGATCTTAAACGA
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TCTTTAGAGAATCTTGGTATCTTCATGCCAGACAAAGATCTGATCCAGATGATCCAGAAG
ATGGATGCAAATGGAGATGGCTGTGTAGACATCAACGAGTTTGAGTCTCTTTACGGTTCG
ATTGTCGAAGAGAAAGAGGAAGAGGATATGAGAGATGCGTTCAACGTGTTTGATCAAGAC
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CAAGGTAAAACTCTAAAGTGTTGTAAAGATATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGAT
GGTAGAGTCAATTACAATGAGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTCAGCAATAGA
TCATCATCAAATTAAGCTGATTTGATCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTTCTTTTTTACG
CTTTGTATTAATCTTGAACTAAATTGTTAAAACATTAAACAATCTTTGTTTTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTGATGGGTTTATTAGCGTTGAGGAGTTAAAGTCTGTGATGGCTTCCTTGGGACTCAAGC
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GTAGAGTCAATTACAATGAGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTCAGCAATAGAT
CATCATCAAATTAAGCTGATTTGATCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTTCTTTTTTACGC
TTTGTATTAATCTTGAACTAAATTGTTAAAACATTAAACAATCTTTGTTTTTTTTTTC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

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ATTGTACAATGGCACTGATGAAACGTTACCTATACTCTTAGGGATTCTTGGATCTGTATA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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DS 

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QA 1 808 1 808
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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TTTAACAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F421TF U 1
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CGGCATAAGAAAGAAAGAAAATGGGATCTCATGCCGTTTCTCCCGCCCGGAAACAACACG
TAGTTTGTGTGCCTTACCCAGCTCAAGGCCATATCAATCCGATGATGAAAGTGGCTAAAC
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TCCTCCGGTCCCGTGGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTCCTTCCTTCCAGTTCGAGTCCA
TCCCTGACGGTCTACCGGAGACTGACGTGGACGTCACACAGGATATCCCTTCCCTTTGCG
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AAGATGAAGTCCCTCCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACGGTTGTATGAGCTTTACTCTGG
ATGCTGCGGAGGAGCTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTCTGGACCACAAGTGCTTGTGGCT
TCTTGGCTTATTTACACTACCATCGCTTCGTCGAGAAAGGTTTATTGTAGAATAAGATAT
CAAACTGACTTGTTTATTAAGCTATGCAAGCTATCGTATATATACAACGTTATATG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4F421JQ 569 0 0
CTCCCGCCCGGAAACAACACGTAGTTTGTGTGCCTTACCCAGCTCAAGGCCATATCAATC
CGATGATGAAAGTGGCTAAACTCCTCCACGCCAAAGGCTTCTATGTTACCTTTGTCAACA
CCATCTACAATCACAACCGTCTCCTCCGGTCCCGTGGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTC
CTTCCTTCCAGTTCGAGTCCATCCCTGACGGTCTACCGGAGACTGACGTGGACGTCACAC
AGGATATCCCTTCCCTTTGCGAGTCCACTCCGAAGAATAGTCTCGCACCGTTCAAGGAGC
TTCTTCGACGGATCAACGCCCAAGATGAAGTCCCTCCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACG
GTTGTATGAGCTTTACTCTGGATGCTGCGGAGGAGCTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTCT
GGACCACAAGTGCTTGTGGCTTCTTGGCTTATTTACACTACCATCGCTTCGTCGAGAAAG
GTTTATTGTAGAATAAGATATCAAACTGACTTGTTTATTAAGCTATGCAAGCTATCGTAT
ATATACAACGTTATATGACGGTTTAACAT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL8469Contig1 802 2 4 U
GGAAACCCAATTGTGAAGCCAGCCAGAGAGATACTAACAAAAGAGAGGAGAACGAGACGA
CGATCTAACAAAGATGAGGATCACTGTGATGACCGCCGGCGAACAGATCATCACCCTTGA
CGTCGATTCACACGAAACCGTTGAGAATGTTAAAGCCTTGCTCGAAGTTGAGGCGAGTGT
TCCGATTCAACAGCAGCAGCTGTTGTACAATGGAAACGAGATGAGGAACTCAGATAAATT
GAGTGCCTTGGGTGTAAAGGATGATGATTTATTGATGATGATGGTGGCCAACGCCTCATC
TGGTAGTGCGGCGGGGAATGATTTGGGTATGAATCCTGATGGGTCAGCTTCCAACCCTGC
AGCTTTTCAGCAACACATTCGGGGTGATGCTAATATTATGGGACAGTTATTCCAGACGGA
TCCTGAGCTTGCACAAGTTATCTCTGGAAGTGATTTAAACAAGTTACAGGATGTTTTGCG
TTCACGGCATCAACAGAGATCTGTAGCGCAGCGTCAGAAGGAGGAGGAACTCGCCCTTCT
GTATGCAGATCCTTTCGATGTTGAAGCACAGAAGAAAATCGAAGCTGCAATTCGTCAGAA
AGGAATTGATGAGAACTGGGAAGCTGCCCTTGAACATAATCCCGAAGTTTTGCTCGGGTG
ATAATGCTGTATGTGGATATGGAGGTCAATGGTATACCTCTAAAGCTTTTGTTGATAGTG
GTGCTCAATCTACAATCATATCCAAGAGTGTGCTGAGAGATGCGGATTGCTGAGACTCAT
GGATCACGGTATAAAGTATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CA72TF U 1
AF RR4C974TF U 19
BS 1 47 RR4CA72TF
BS 48 48 RR4C974TF
BS 49 702 RR4CA72TF
BS 703 802 RR4C974TF

RD RR4CA72TF 702 0 0
GGAAACCCAATTGTGAAGCCAGCCAGAGAGATACTAACAAAAGAGAG*AGAACGAGACGA
CGATCTAACAAAGATGAGGATCACTGTGATGACCGCCGGCGAACAGATCATCACCCTTGA
CGTCGATTCACACGAAACCGTTGAGAATGTTAAAGCCTTGCTCGAAGTTGAGGCGAGTGT
TCCGATTCAACAGCAGCAGCTGTTGTACAATGGAAACGAGATGAGGAACTCAGATAAATT
GAGTGCCTTGGGTGTAAAGGATGATGATTTATTGATGATGATGGTGGCCAACGCCTCATC
TGGTAGTGCGGCGGGGAATGATTTGGGTATGAATCCTGATGGGTCAGCTTCCAACCCTGC
AGCTTTTCAGCAACACATTCGGGGTGATGCTAATATTATGGGACAGTTATTCCAGACGGA
TCCTGAGCTTGCACAAGTTATCTCTGGAAGTGATTTAAACAAGTTACAGGATGTTTTGCG
TTCACGGCATCAACAGAGATCTGTAGCGCAGCGTCAGAAGGAGGAGGAACTCGCCCTTCT
GTATGCAGATCCTTTCGATGTTGAAGCACAGAAGAAAATCGAAGCTGCAATTCGTCAGAA
AGGAATTGATGAGAACTGGGAAGCTGCCCTTGAACATAATCCCGAAGTTTTGCTCGGGTG
ATAATGCTGTATGTGGATATGGAGGTCAATGGTATACCTCTA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4C974TF 784 0 0
GG
AGCCAGAGAGATACTAACAAAAGAGAGGAGAACGAGACGACGATCTAACAAAGATGAGGA
TCACTGTGATGACCGCCGGTGAACAGATCATCACCCTTGACGTCGATTCACACGAAACCG
TTGAGAATGTTAAAGCCTTGCTCGAAGTTGAGGCGAGTGTTCCGATTCAGCAGCAGCAGC
TGTTGTACAATGGAAACGAGATGAGGAACTCAGATAAATTGAGTGCCTTGGGTGTAAAGG
ATGATGATTTATTGATGATGATGGTGGCCAACGCCTCATCTGGTAGTGCGGCGGGGAATG
ATTTGGGTATGAATCCTGATGGGTCAGCTTCCAACCCTGCAGCTTTTCAGCAACACATTC
GGGGTGATGCTAATATTATGGGACAGTTATTCCAGACGGATCCTGAGCTTGCACAAGTTA
TCTCTGGAAGTGATTTAAACAAGTTACAGGATGTTTTGCGTTCACGGCATCAACAGAGAT
CTGTAGCGCAGCGTCAGAAGGAGGAGGAACTCGCCCTTCTGTATGCAGATCCTTTCGATG
TTGAAGCACAGAAGAAAATCGAAGCTGCAATTCGTCAGAAAGGAATTGATGAGAACTGGG
AAGCTGCCCTTGAACATAATCCCGAAGTTTTGCTCGGGTGATAATGCTGTATGTGGATAT
GGAGGTCAATGGTATACCTCTAAAGCTTTTGTTGATAGTGGTGCTCAATCTACAATCATA
TCCAAGAGTGTGCTGAGAGATGCGGATTGCTGAGACTCATGGATCACGGTATAAAGTATT
GC

QA 3 784 3 784
DS 



AS 1 2

CO CL8470Contig1 1111 2 2 U
GCTCCAATCATCGTTTGAAAAGCTGCTTATCCCGGATATCACAAGAGTGTGAGCAATGGA
TAAGCCCTCAGTTTTCATCATCACCATCTTCTTCACTTTCCTTCCCCAACACAGTACATA
GTCTTGCGGACGTGACTCCCGCGAGTCCCATAAAAACATCTGTATCAGGCACATCTTTTA
GTCTCAAGGAAAGATGTGCTGCAGTGGACACTGTTTCTCTTGTGGCTCGTATACTGCATA
AATCAAAAGCTCATCTCCAGTCTATGCTTATGTCACGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACT
TCTTTGGTCAACTGGTTGGTTCCGTACCTGAACTGACAGAGCACTTGCATAGGACAACTG
CAAGGATACTGCTGCATGTTAATGGATATGTTGACCGGATTGCTAATTCTAAATGGGAAG
TCAAGGAGCTTGGAGTGGAGCATAATGGGTATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTCAAAC
ACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGGAGGAATCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGC
AATATGGAGTTGAAATATTTGCGGAGATGCTGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGAT
GTACTGATGAAGGACGGGCTCTCATGTCATTAGATATTCACGTCCTAATAAACGGGCTAC
AGCACTTTGTGCCAACAAAGGTGAAGCCAAAGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGG
CATACTATCTGCCAGAGACGGAATATGTCCACTGGGCAAGGGCCCATCCGGAATATACGA
AAGCACAGGTCATCGGACTGGTGAATTTAGTAGCCACCATGAAAAGCTGGAAGAGGAAAA
CGCGACTAGAAGTTGTGGAGAAGATTGAATCAGCTGCTGCATAGATCAAATCTAAAAGCA
ACAACAAAGTAATGTCTACTTCTTTTCTCTGGCCTTGTTTTGTCTTTTGCTTTTGGCTCT
TTCTTTTGCATTTAGAATCGAGTGGTGTAAATTTGAGGATAAGCCCTTCTTAGTTGCTGT
CCTGCTTAATGGGTTTGTGTAAAAGATTCTCCTCAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGATTGT
AACACACATTTTCCTACATTTAAATACTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AL70TF U 1
AF RR4AL70JQ C 334
BS 1 767 RR4AL70TF
BS 768 1111 RR4AL70JQ

RD RR4AL70TF 767 0 0
GCTCCAATCATCGTTTGAAAAGCTGCTTATCCCGGATATCACAAGAGTGTGAGCAATGGA
TAAGCCCTCAGTTTTCATCATCACCATCTTCTTCACTTTCCTTCCCCAACACAGTACATA
GTCTTGCGGACGTGACTCCCGCGAGTCCCATAAAAACATCTGTATCAGGCACATCTTTTA
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AATCAAAAGCTCATCTCCAGTCTATGCTTATGTCACGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACT
TCTTTGGTCAACTGGTTGGTTCCGTACCTGAACTGACAGAGCACTTGCATAGGACAACTG
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TCAAGGAGCTTGGAGTGGAGCATAATGGGTATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTCAAAC
ACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGGAGGAATCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGC
AATATGGAGTTGAAATATTTGCGGAGATGCTGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGAT
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TTGATTTGATGCTGGGGGAATTCAAACACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGGAGGAATCC
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TCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGGGCTCTCATGTCATTAG
ATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTTGTGCCAACAAAGGTGAAGCCAAAGT
TACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCATACTATCTGCCAGAGACGGAATATGTCCACT
GGGCAAGGGCCCATCCGGAATATACGAAAGCACAGGTCATCGGACTGGTGAATTTAGTAG
CCACCATGAAAAGCTGGAAGAGGAAAACGCGACTAGAAGTTGTGGAGAAGATTGAATCAG
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CTTGTTTTGTCTTTTGCTTTTGGCTCTTTCTTTTGCATTTAGAATCGAGTGGTGTAAATT
TGAGGATAAGCCCTTCTTAGTTGCTGTCCTGCTTAATGGGTTTGTGTAAAAGATTCTCCT
CAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGATTGTAACACACATTTTCCTACATTTAAATACTTCG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TATTAAACAAAGGTCCGTTCATCGATTTCTTCCGATCTCACCTTAACACCACCACCGCAA
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CATGGGCTTCCTTCTTCATTCTTCAGGCATCAACTTTGAAGAAATACGCAGCCCATCTCT
CATTATCAACCATGGTGTGTTTCATGGGAACTTTACAATCCTTGGCCCTGACCTTCGTAA
TGGAACAAAACGCTTCTGCTTTGAACATCGGTTTTGACATGAACCTTCTCGCTTCTGCAT
ACGCGGGAATAATGTCGTCGAGCATAGCTTACTACGTTCAAGGACTTATGATGCAGCGAA
AGGGGCCTGTCTTCGTTACTGCATTTAACCCTTTTGTCGTTATCATTGTTTCTATAATCA
GCTTCTTTGTTCTAGGCCAAGGAATCTACCTTGGAGGGGTTATTGGACTGGTTGTTTTAA
CATTGGGAGTCTATGCCGTGTTGTGGGGCAAGCACGTAGATGACAATGGCGATGAAATAC
CCTGTGAAAATAACGTTTTAGAAGCTGTTAAGTGTTGTAGTGGTAATAATGGTCTCTCGA
TCATGCCAACAATCGACGAAACTGACGAAGATGTTGAAACTGGGAACGTTCAGACGGTTG
AGAAAGAAAGATCACTGGTCGTTGTGGTTTTTTGTCGTGAAAGTGTGGATAATGTTTCAC
GATGCTAATTAGATGGTTTTTGTTTTTGTTTGAAGCAAAACTGGGAAGAAGAGTAACTTA
TTTTTGGTACTTGTAAGTTTGAATTCCTTCCCTTGTTTCAAACGTGTTTGATTTATAGTT
TTTGACTATTTAGAGTAACTATGGTTTCTATGTAACATCCATTTTGATAACTAGCTATAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RR4AO91TF U 1
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QA 1 749 1 749
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RD RR4AO91JQ 828 0 0
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AGCTTCTTTGTTCTAGGCCAAGGAATCTACCTTGGAGGGGTTATTGGACTGGTTGTTTTA
ACATTGGGAGTCTATGCCGTGTTGTGGGGCAAGCACGTAGATGACAATGGCGATGAAATA
CCCTGTGAAAATAACGTTTTAGAAGCTGTTAAGTGTTGTAGTGGTAATAATGGTCTCTCG
ATCATGCCAACAATCGACGAAACTGACGAAGATGTTGAAACTGGGAACGTTCAGACGGTT
GAGAAGGAAGGATCACTGGTCGTTGTGGTTTTTTGTCGTGAAAGTGTGGATAATGTTTCA
CGATGCTAATTAGATGGTTTTTGTTTTTGTTTGAAGCAAAACTGGGAAGAAGAGTAACTT
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QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

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GAGTGAAAGATGAAGAACACAAACAGGGAAGCTAACCCATAGAGTATGAGGGCGTAGGCA
AGTTAATGACAGTGGTCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACCTTGTG
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CAAAGTTGATCTGAACCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTTATTGA
TGTCTTTAGTGAATACACATCCCTGAAGGCCAAAGTTACTAGCATTGCAATGATTAATGC
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TTTTATACTCTTGACAGAACGTTGCTCCCTTCTCCTTAGCATCCATCACCAATCCTTCAA
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TTCCTCCAAGTTCCATCTGGAGAGGGATCATTCCAGCTTTCTTGGAGATTGAGATCCCGG
TATCACCGCCAGTGAAACTAATGCAGTTAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RR4ES25TF C 1
AF RR4BI92JQ U 56
BS 1 55 RR4ES25TF
BS 56 149 RR4BI92JQ
BS 150 150 RR4ES25TF
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BS 443 443 RR4ES25TF
BS 444 932 RR4BI92JQ

RD RR4ES25TF 619 0 0
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ATCACTCCATTTTATTCATAGTTTTTGATTCAATCCGATACAAACGAGGTAGTAAGGAGC
GAGTGAAAGATGAAGAACACAAACAGGGAAGCTAACCCATAGAGTATGAGGGCGTAGGCA
AGTTAATGACAGTGGTCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACCTTGTG
ATCCTATTCCACTGTCCTTTAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTGGTCCACGAGCTGGCG
CAGAGTTGATCTGAACCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTTATTGA
TGTCTTTAGTGAATACACATCCCTGAAGGCCAAAGTTACTAGCATTGCAATGATTAATGC
CTTCCTCAACCGAACTGATCCTAAAGACAGGCAAGACAGGACCGAAAGGTTCCTCCCAAG
CAATCCTCATGTCCGGTCTGACATTGTCCAAAAGCAACGGCCAAATCAAGTTACCTTCTC
TTTTATACTCTTGACAGAACGTTGCTCCTTTCTCCTTAGCATCCATCACCAATCCTTCAA
TGAAATTAGCTGAGGATTC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4BI92JQ 877 0 0
CGCTAATCACTCCATTTTATTCATAGTTTTTGATTCAATCCGATACAAACGAGATAGTAA
GGAGCGAGTGAAAGATGAAGAACACAAACAGGGAGGCTAACCCATAGAGTATGAGGGCGT
AGGCAAGTTAATGACAGTGGTCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACC
TTGTGATCCTATTCCACTGTCCTTTAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTGGTCCACGAGC
TGGCGCAAAGTTGATCTGAACCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTT
ATTGATGTCTTTAGTGAATACACATCCCTGAAGGCCAAAGTTACTAGCATTGCAATGATT
AATGCCTTCCTCAACCGAACTGATCCTCAAGACAGGCAAGACAGGACCAAAAGGTTCCTC
CCAAGCAATCCTCATGTCCGGTCTGACATTGTCCAAAAGCAACGGCCAAATCAAGTTACC
TTCTCTTTTATACTCTTGACAGAACGTTGCTCCCTTCTCCTTAGCATCCATCACCAATCC
TTCAATGAAATTAGCTGAGGATTCCGACACCACGGCTGTAATATCACAGTTCTCTTCCGG
CGGTCCCACCGTGAGTTTAGCCACTTTAGCTTTCACTTTCTCAACAAGCTCATCCGCCAC
TGATTCCATCACTAGGACTACCTTAACCGCAGTGCATCTCTGCCCACTGTAGGAGAATCC
TCCTTTGATGATATTGGAAGCCACTAAATCAAGATCAGCATCTTCCAGGACAATGCATGC
ATCTTTTCCTCCAAGTTCCATCTGGAGAGGGATCATTCCAGCTTTCTTGGAGATTGAGAT
CCCGGTATCACCGCCAGTGAAACTAATGCAGTTAACA

QA 1 877 1 877
DS 



AS 1 2

CO CL8474Contig1 1356 2 4 U
GGCCTGGGTCGTCTAATAACTGGAGTTGGAAACTTTCATGCTCTTAATTTCATTCTGAAT
ATCCTAATCGAAAACGGGCAGCTCGATCTCTTGCTACAAAAATTTTCTAGTGCTGCTGAT
GCAAACACTGGCACTGCCCAGGCTGTCAGAAGTTTCAGGATGGCTGTTCTGACTTCGTTG
AATCTCTTCAACCCGAATGACCATGATGCATTCGCAATGGTATATAAACACTTTGACATG
AAGCATGAAACGGCTGCTTTGCTAGAATCACGTGCAGATCAGGCTGCACAGCAGTGGTTT
AGACGGTATGACAAGGATGAAAATGAAGGTCTCCTCGATGCTATGCGCTATTACATTGAA
GCAGCTGAAGTTCACACTTCTATTGATGCTGGAAACAAAGCTCGAAAGGCTTGTGGTCAG
GCTTCCCTTGTCTCGCTTCAAATAAGGATGCCAGATTCCAAGTGGCTCTGTTTATCCGAA
ACAAACGCTAGAAGAGCATCTGTTGATCAGTCTCGTTTCCAGGAGGCTCTCTCGTTTCCA
GAAGCGTATAGTCTTAACCAGCCAAGCGAATGGGCGCTTGTGCTTTGGAGTCTGATGCTC
AAACCCGAACTAGCGGAAGAGTTTGTGGCTGAGTCTGTGGCGGTGCTTCCCCTGCAGGCG
TCAATGCTACTGGAACTGGCTAGATTTTACAGGGCCGAAATGGCAGCTCGAGGTGACCAG
TCTCAGTTCTCAGTCTGGCTGACAGGAGGAGGTTTGCCAGCTGAGTGGGCCAAATACATG
TGGAGATCATTCAGGTGTTTGCTGAAGAGAACACGGGACTTGAGGTTACGGTTACGGCTG
GCTACAACAGCGACTGGATTCTCTGACATGGTTGATGGGTGTATGAACGCGTTGGATAAG
GTCCCGGAAAATGCAGGACCACTTGTACTGAAGAAAGGACATGGAGGAGGATACTTACCA
CTCATGTAAGTGAGTGAGTGAACTAAGAGATCATCATCCCTAAAGGATGCAATGTTGAGT
ATCTCGCTCTGCTACATCGTTGTGAAAGCTCGATGGAGCTGTAAATTAACCGGAGAAATT
GAAAAAGAGTTCGATGTTTTGGAAGAGAAAACTGAAGTTTTTTAAAAAATATATATATAT
AGGTTTCTCAGTGTTTTGGTGTGTGTTTGTTGATGATTGGTTCCACAATTCTTTCCATTT
TGTTTGTTCGTTCTTATACCTTGCGGTAATTAAATGGCAGTGTGGAGAGAGATATAGAGG
TTTGTAACAGTGTAATAACTGTCTGTTATAAGTTGTTGGAAAGATCACATTGTTGTAATA
AGTTCGAATCTTATATTTATTTGCCTGGGAACGAGT


BQ
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AF RR4H537TF U 1
AF RR4H537JQB C 596
BS 1 657 RR4H537TF
BS 658 658 RR4H537JQB
BS 659 708 RR4H537TF
BS 709 1356 RR4H537JQB

RD RR4H537TF 708 0 0
GGCCTGGGTCGTCTAATAACTGGAGTTGGAAACTTTCATGCTCTTAATTTCATTCTGAAT
ATCCTAATCGAAAACGGGCAGCTCGATCTCTTGCTACAAAAATTTTCTAGTGCTGCTGAT
GCAAACACTGGCACTGCCCAGGCTGTCAGAAGTTTCAGGATGGCTGTTCTGACTTCGTTG
AATCTCTTCAACCCGAATGACCATGATGCATTCGCAATGGTATATAAACACTTTGACATG
AAGCATGAAACGGCTGCTTTGCTAGAATCACGTGCAGATCAGGCTGCACAGCAGTGGTTT
AGACGGTATGACAAGGATGAAAATGAAGGTCTCCTCGATGCTATGCGCTATTACATTGAA
GCAGCTGAAGTTCACACTTCTATTGATGCTGGAAACAAAGCTCGAAAGGCTTGTGGTCAG
GCTTCCCTTGTCTCGCTTCAAATAAGGATGCCAGATTCCAAGTGGCTCTGTTTATCCGAA
ACAAACGCTAGAAGAGCATCTGTTGATCAGTCTCGTTTCCAGGAGGCTCTCTCGTTTCCA
GAAGCGTATAGTCTTAACCAGCCAAGCGAATGGGCGCTTGTGCTTTGGAGTCTGATGCTC
AAACCCGAACTAGCGGAAGAGTTTGTGGCTGAGTCTGTGGCGGTGCTTCCCCTGCAG*CG
TCAATGCTACTGGAACTGGCTAGATTTTACAGGGCCGAAATGGCAGCT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4H537JQB 761 0 0
TGCTCAAACCCGAACTAGCGGAAGAGTTTGTGGCTGAGTCTGTGGCGGTGCTTCCCCTGC
AGGCGTCAATGCTACTGGAACTGGCTAGATTTTACAGGGCCGAAATGGCAGCTCGAGGTG
ACCAGTCTCAGTTCTCAGTCTGGCTGACAGGAGGAGGTTTGCCAGCTGAGTGGGCCAAAT
ACATGTGGAGATCATTCAGGTGTTTGCTGAAGAGAACACGGGACTTGAGGTTACGGTTAC
GGCTGGCTACAACAGCGACTGGATTCTCTGACATGGTTGATGGGTGTATGAACGCGTTGG
ATAAGGTCCCGGAAAATGCAGGACCACTTGTACTGAAGAAAGGACATGGAGGAGGATACT
TACCACTCATGTAAGTGAGTGAGTGAACTAAGAGATCATCATCCCTAAAGGATGCAATGT
TGAGTATCTCGCTCTGCTACATCGTTGTGAAAGCTCGATGGAGCTGTAAATTAACCGGAG
AAATTGAAAAAGAGTTCGATGTTTTGGAAGAGAAAACTGAAGTTTTTTAAAAAATATATA
TATATAGGTTTCTCAGTGTTTTGGTGTGTGTTTGTTGATGATTGGTTCCACAATTCTTTC
CATTTTGTTTGTTCGTTCTTATACCTTGCGGTAATTAAATGGCAGTGTGGAGAGAGATAT
AGAGGTTTGTAACAGTGTAATAACTGTCTGTTATAAGTTGTTGGAAAGATCACATTGTTG
TAATAAGTTCGAATCTTATATTTATTTGCCTGGGAACGAGT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL8475Contig1 602 2 2 U
GAACACGAGGACGAGGTTAAGCAAACGCTTGTAACGGTCTGTAACGCTGCGGTCGAAGCG
TTTGTAAGAGCGTCGAGAAGACGAGCGACGGAACCGGGATCGGACCGGTCGTTATCTAAA
ACGCTGACCGTTGGATCTAAACCGGCACCTACGTGGATCGATCGGGTTTCGTATTCGCTG
TCTGTACCGAGTAACCGGAAATACGTGGTGGATTTAACCGGGAGGGTGACGTTTGAGACG
GTTAGATCGTTGTTAGAAGTGTTGGTGGAGAGAGCGAATGGTAAAGTGGAGAGTTACGTG
GAGAGAGTTAGAGAGAGGGAACGAGACGAGGAGATTCGTGAGAGTTAAATCATCGCTTCT
GCATAGTTTATGTTTGTCTATGTGTTTACAGATTGTTGAGGCTCCTTGGATACTGACTCC
AAGAGACTGATCAGGCTTAAAGACAAGACCCCGTTTTTTTTCTTGTTCTGTAATTCTTGG
ATTCGATCAAATTCGATGTAAAATTGCTTCTTTTTTTCTTTTGATTGGTAGAAGAAATGA
TTGTTTGTTTTATTCTGGATTTGGATATTTGGATAATGATAGGCTTGGGACATTGTTTGT
TC


BQ
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10 10 

AF RR4E160TF U 1
AF RR4E160JQ C 1
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BS 278 602 RR4E160JQ

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TTTGTAAGAGCGTCGAGAAGACGAGCGACGGAACCGGGATCGGACCGGTCGTTATCTAAA
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QA 1 277 1 277
DS 

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TTTGTAAGAGCGTCGAGAAGACGAGCGACGGAACCGGGATCGGACCGGTCGTTATCTAAA
ACGCTGACCGTTGGATCTAAACCGGCACCTACGTGGATCGATCGGGTTTCGTATTCGCTG
TCTGTACCGAGTAACCGGAAATACGTGGTGGATTTAACCGGGAGGGTGACGTTTGAGACG
GTTAGATCGTTGTTAGAAGTGTTGGTGGAGAGAGCGAATGGTAAAGTGGAGAGTTACGTG
GAGAGAGTTAGAGAGAGGGAACGAGACGAGGAGATTCGTGAGAGTTAAATCATCGCTTCT
GCATAGTTTATGTTTGTCTATGTGTTTACAGATTGTTGAGGCTCCTTGGATACTGACTCC
AAGAGACTGATCAGGCTTAAAGACAAGACCCCGTTTTTTTTCTTGTTCTGTAATTCTTGG
ATTCGATCAAATTCGATGTAAAATTGCTTCTTTTTTTCTTTTGATTGGTAGAAGAAATGA
TTGTTTGTTTTATTCTGGATTTGGATATTTGGATAATGATAGGCTTGGGACATTGTTTGT
TC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL8476Contig1 744 2 4 U
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CTTTCGTCTCCCTAATCCAAACCCCTTGATTCCGCCCTCACATCTGCTCACTTCCCCAAT
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GAACCCAAGAGGTGTCAATGTTGATAACCGCAACAAATTTGTTTTGGTTTTCATTTTCTT
TTCTTTCTGATATTATTTCATCAC


BQ
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AF RR4G473TF U 1
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BS 601 738 RR4G473TF
BS 739 744 RR4G473JQ

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GAAGGTAGCGTATCCAAGGATGATCTTAAGTTTATGAATGGTACTGGGAAACATGTAGGA
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ACAGGATAGAAGTAATCAGTTAATTGTCCAAGCTTATATCAAAGGTCCAGAAAACGTCGT
GCTTGAGGTATCATCATGTCCACTTTGTCTCAAGTTTGATCAAGCACTAAGTTCTATGAA
GAACCCAAGAGGTGTCAATGTTGATAACCGCAACAAATTTGTTTTGGTTTTCATTTTCTT
TTCTTTCTGATATTATTT

QA 1 738 1 738
DS 

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GATATTATTTCATCAC

QA 1 256 1 256
DS 



AS 1 2

CO CL8477Contig1 748 2 8 U
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TGTGGTTTCTAGTCATTATCGACTTCGTTAAACTCGTTTTTGGTTTTGGTTTATAAATTT
TGTTGGGCCTCTTTTGTGGGCTTTGTCT


BQ
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CTTTATCCTTTGCTTTCATGTTTTTTTTTGCTTCCATTGAAGCCGATCTCAATATGAGAT
AGTTCTTTCCTCCACTCTTTGAAGGTCTCAACATCTTCCATCTTTATATTTAAAGATGTT
CTAGGTTTCACTTAAGTAAAATTGATTGTTGGGTTGCGGTTATTTTCAATTGAAGTTGTT
TGAAGCAAAGAAACTTTAACTTTGGTTCTCGCTCGCTTGGTGGCTTTCATCCAAGTTTGA
TCGGTGAAGTGTTTTAACCGAAGTTGTAGATAGCCGCGCTTTCATTTTCTGATGTCTTCG
ACGGTGAGATGCTTTGGTCGGACCTTTTCCGATTTGATCTTCGCCAGAGATGTCCTTGTC
GACGAAGTGCGGTGGTGGTTCGTATGGTGGGCACGTCCTTATCTCGTTAAAAATGGAACA
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TGTTGGGCCT

QA 1 730 1 730
DS 

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TTTCCACTATTGGCTCCGGTTGTATCATCGTCTTTTCGGCGATAAACCGGCTCTTGGTTC
CGGTGACGGTCGCTTTATCCTTTGCTTTCATGTTTTTTTTTGCTTCCATTGAAGCCGATC
TCAATATGAGATAGTTCTTTCCTCCACTCTTTGAAGGTCTCAACATCTTCCATCTTTATA
TTTAAAGATGTTCTAGGTTTCACTTAAGTAAAATTGATTGTTGGGTTGCGGTTATTTTCA
ATTGAAGTTGTTTGAAGCAAAGAAACTTTAACTTTGGTTCTCGCTCGCTTGGTGGCTTTC
ATCCAAGTTTGATCGGTGAAGTGTTTTAACCGAAGTTGTAGATAGCCGCGCTTTCATTTT
CTGATGTCTTCGACGGTGAGATGCTTTGGTCGGACCTTTTCCGATTTGATCTTCGCCAGA
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AAAAATGGAACATGTGGTTTCTAGTCATTATCGACTTCGTTAAACTCGTTTTTGGTTTTG
GTTTATAAATTTTGTTGGGCCTCTTTTGTGGGCTTTGTCT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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AAAGACTGCAGGAACTAGAAGGATGATGTACTTCCATGGTTTTACTTCTTCTGGGTGATT
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TTTGAGATTGGAACACAATGAACAATGGAAGAAATGTCACAGTATCTGTGAAGGCTCTCA
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TTTACACGAGTCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AB04JQ C 1
AF RR4AB04TF U 236
BS 1 235 RR4AB04JQ
BS 236 613 RR4AB04TF

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TTTGAGATTGGAACACAATGAACAATGGAAGAAATGTCACAGTATCTGTGAAGGCTCTCA
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DS 

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GTTGTTTTACACGAGTCT

QA 1 378 1 378
DS 



AS 1 2

CO CL8479Contig1 989 2 2 U
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AGTTGTTCTTGCCACTCTTTTACAACGATCCGAGGTCCTTTATGATATATTCCGGTCTGA
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BQ
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AF RR4B735TF U 1
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RD RR4B735TF 716 0 0
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AAGAGCTCGTCGTTCAAGGAGCAAAGTCCTCACGTTGCTTCTGTCAAGAGCATACTAGAG
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AACCGGTTAGATGCAGAGTTTTTATTGGCTCAGATGTGTTCGGTCAAGTTCAAAGAAGAT
AGTTGTTCTTGCCACTCTTTTACAACGATCCGAGGTCCTTTATGATATATTCCGGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4B735JQ 831 0 0
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TCTTGCTGGAGAGCTGGTGAGGTTCTTGCTGAGATCTGGAAGAGAAATTGAGCAAGCACC
AACAGAATCAGATACAGTATCATCGCCTAAGCTTCTCGGGTTTCGAATTTTCGGTTCCAG
CCACAAGAAGTCATCACTGGATAAGAGCTCGTCGTTCAAGGAGCAAAGTCCTCACGTTGC
TTCTGTCAAGAGCATACTAGAGAGTCACGCCAGTTACTTGATGTCGGGTAAAGAACTTTC
AAAGCTTGTCGCCTTCGTGAAAGGCACCCAGTTTGATATTGTGGATTTTCTTCAAAGAGA
AAGATATGGCTGTGCTCAGCTGGAGAATTTCGCAGCAGGACTTGAACTCATTGGGCAAAA
GCTGCAAATGAATGAGCTACAGAACCGGTTAGATGCAGAGTTTTTATTGGCTCAGATGTG
TTCGGTCAAGTTCAAAGAAGATAGTTGTTCTTGCCACTCTTTTACAACGATCCGAGGTCC
TTTATGATATATTCCGGTCTGATCTACGGTTGTGGAAAGCATATAGCATGGCATTACAGT
CACACTTGGGTTTCGCACAGTACCATGACTTACTCCAGGTCTTAGAGGAGAAACTCTCAG
CCGCTGCAGGAGAAGGAAGCAGTAGAGGTTCCATCTCTTGATACAATAGTCTTTTCTTTT
TTTTGGGAGCTTTTGTCACTATTAAACACTTTCTGCTTCTTTACAATTTTTCACGTTCGT
GTAGATATATATAAACATGATTCAAATTAAATAAGAAATACATCTCCCTCG

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL8480Contig1 790 2 4 U
GAAAGCAAGCATCAGTGAGAAGAGACCCAGCTCTACGCCACCACAACCATCTTCTAGTGA
TGACGATGACTCAGAGATCCAACTTCGTTCAGGAAGAAGAGAAACAAAACCTCAAACCTC
ATATCGTCATTCTCGTTTCAGCCATGATGACTCAGAGGAAGAAGGTCCACCTCGAGCTTT
TGCCAGAAGTCAAGAGAAGACTCATAAGCCAACAACGGGAGTGAGAGATCAAAATAGATC
AAACTTCAAGATCCCAGCTTCAATCTCGTATGAAGATGATGAAGAAGAAGTCGAAAGAGT
CAGTGCCAAGCCATTTAAAACAACCGGGATCTCTCTAAGGACTAAGGCTCATGAGAAGCG
TTCATTTCCAGTTACACCAACGAGAACCAACCAAGAGCCTCGTGACCATCCATCTCCAAA
ATCAACTTCAGGGCAAAAGACAGTCCCTGTTCCACAAACTGTAAAATCACCAGATCCAGA
GACTCCTCCAAGGGCTAGTCATGTTCATCCCAACCTCCCAGATTGTGATGATATCTTTGC
AAGGCTTGGAGCTCTTCGTACTCCTAATCGCCGCTGAATCTGCTCATCCTCCGTCTGTTG
ATACATTTACTCTTTGTCACAAAGATCACTCCAAACTCATTCTTTACTCTTGACTGAATT
TGATATTCATACACATTATACATATTGAAGCAGTGGTGTGATAATACTTGTTCTTTTCTT
CTTTTGGTGTTTACTCTGACTGAAGTTGATATTCGTACACATTATACAGATTGAAGCATT
TGGTGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR4E939TF U 1
AF RR4E939JQ C 160
BS 1 716 RR4E939TF
BS 717 717 RR4E939JQ
BS 718 788 RR4E939TF
BS 789 790 RR4E939JQ

RD RR4E939TF 788 0 0
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TGACGATGACTCAGAGATCCAACTTCGTTCAGGAAGAAGAGAAACAAAACCTCAAACCTC
ATATCGTCATTCTCGTTTCAGCCATGATGACTCAGAGGAAGAAGGTCCACCTCGAGCTTT
TGCCAGAAGTCAAGAGAAGACTCATAAGCCAACAACGGGAGTGAGAGATCAAAATAGATC
AAACTTCAAGATCCCAGCTTCAATCTCGTATGAAGATGATGAAGAAGAAGTCGAAAGAGT
CAGTGCCAAGCCATTTAAAACAACCGGGATCTCTCTAAGGACTAAGGCTCATGAGAAGCG
TTCATTTCCAGTTACACCAACGAGAACCAACCAAGAGCCTCGTGACCATCCATCTCCAAA
ATCAACTTCAGGGCAAAAGACAGTCCCTGTTCCACAAACTGTAAAATCACCAGATCCAGA
GACTCCTCCAAGGGCTAGTCATGTTCATCCCAACCTCCCAGATTGTGATGATATCTTTGC
AAGGCTTGGAGCTCTTCGTACTCCTAATCGCCGCTGAATCTGCTCATCCTCCGTCTGTTG
ATACATTTACTCTTTGTCACAAAGATCACTCCAAACTCATTCTTTACTCTTGACTGAATT
TGATATTCATACACATTATACATATTGAAGCAGTGGTGTGATAATACTTGTTCTTT*CTT
CTTTTGGTGTTTACTCTGACTGAAGTTGATATTCGTACACATTATACAGATTGAAGCATT
TGGTGTTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4E939JQ 631 0 0
AGAAGGTCCACCTCGAGCTTTTGCCAGAAGTCAAGAGAAGACTCATAAGCCAACAACGGG
AGTGAGAGATCAAAATAGATCAAACTTCAAGATCCCAGCTTCAATCTCGTATGAAGATGA
TGAAGAAGAAGTCGAAAGAGTCAGTGCCAAGCCATTTAAAACAACCGGGATCTCTCTAAG
GACTAAGGCTCATGAGAAGCGTTCATTTCCAGTTACACCAACGAGAACCAACCAAGAGCC
TCGTGACCATCCATCTCCAAAATCAACTTCAGGGCAAAAGACAGTCCCTGTTCCACAAAC
TGTAAAATCACCAGATCCAGAGACTCCTCCAAGGGCTAGTCATGTTCATCCCAACCTCCC
AGATTGTGATGATATCTTTGCAAGGCTTGGAGCTCTTCGTACTCCTAATCGCCGCTGAAT
CTGCTCATCCTCCGTCTGTTGATACATTTACTCTTTGTCACAAAGATCACTCCAAACTCA
TTCTTTACTCTTGACTGAATTTGATATTCATACACATTATACATATTGAAGCAGTGGTGT
GATAATACTTGTTCTTTTCTTCTTTTGGTGTTTACTCTGACTGAAGTTGATATTCGTACA
CATTATACAGATTGAAGCATTTGGTGTTGCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL8481Contig1 753 2 2 U
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AAAGATGACAATCTCTGAAGAAGAAATCCAGAGAGGGAGATCGCAAGAAGAAGGCCCTTC
ATCCGCCTCCTCCGGAGATCACCGCTTCCATAAGCTTCGCGGCGTCCGATGGCGAAGCAA
CCTCGGAATCTTGCCTTCTTCTCCTTCCTCCCCCATCGATGACCTTCGCAGAGTCACCGC
CGATTCCAGAAGAAGATATGCTGCTTTGAGAAGGAGACTATTGATTGATCCACATTTGCC
TAAGAAAGGAATCAATTCTCCAGATCTACCATTGATAACCCTTTATCACAGAATCCTGAT
AGTACTTGGGGAAGGTTCTTCCGTAACGCAGAGCTTGAGAAAACACTTGATCAAGATCTC
TCACGCTTGTATCCTGAACATGGGAGTTACTTTCAATCCTCTGGATGTCAAGGGATGCTT
AGACGGATACTTCTCCTTTGGTGTTTAAAGCATCCAGAGATTGGTTATAGACAAGGGATG
CATGAACTGTTGGCTCCTTTGCTATATGTTCTTCAAGTGGATGTGCAATATCTCACCGAA
GTTAGATCAAACTACGAAGACCAGTTTACCGATTTGTTTGATGAGCTAGCCTTTCAAGAA
CGCGATTCTGCAGCTTACGATTTCGATATAAAGAAAGTTTTAGATGATTCCATGGAAGAA
GAAGAGGAAGGAGAAGAAAATGGTCATGCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F546TF U 1
AF RR4F546JQ C 56
BS 1 723 RR4F546TF
BS 724 753 RR4F546JQ

RD RR4F546TF 723 0 0
GGGTTTTGTCAGTTTGCACGGAAATCGAAGATTGGATGAAGCAAAAAAGAGTGTTATCCA
AAAGATGACAATCTCTGAAGAAGAAATCCAGAGAGGGAGATCGCAAGAAGAAGGCCCTTC
ATCCGCCTCCTCCGGAGATCACCGCTTCCATAAGCTTCGCGGCGTCCGATGGCGAAGCAA
CCTCGGAATCTTGCCTTCTTCTCCTTCCTCCCCCATCGATGACCTTCGCAGAGTCACCGC
CGATTCCAGAAGAAGATATGCTGCTTTGAGAAGGAGACTATTGATTGATCCACATTTGCC
TAAGAAAGGAATCAATTCTCCAGATCTACCATTGATAACCCTTTATCACAGAATCCTGAT
AGTACTTGGGGAAGGTTCTTCCGTAACGCAGAGCTTGAGAAAACACTTGATCAAGATCTC
TCACGCTTGTATCCTGAACATGGGAGTTACTTTCAATCCTCTGGATGTCAAGGGATGCTT
AGACGGATACTTCTCCTTTGGTGTTTAAAGCATCCAGAGATTGGTTATAGACAAGGGATG
CATGAACTGTTGGCTCCTTTGCTATATGTTCTTCAAGTGGATGTGCAATATCTCACCGAA
GTTAGATCAAACTACGAAGACCAGTTTACCGATTTGTTTGATGAGCTAGCCTTTCAAGAA
CGCGATTCTGCAGCTTACGATTTCGATATAAAGAAAGTTTTAGATGATTCCATGGAAGAA
GAA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4F546JQ 698 0 0
ATCCAAAAGATGACAATCTCTGAAGAAGAAATCCAGAGAGGGAGATCGCAAGAAGAAGGC
CCTTCATCCGCCTCCTCCGGAGATCACCGCTTCCATAAGCTTCGCGGCGTCCGATGGCGA
AGCAACCTCGGAATCTTGCCTTCTTCTCCTTCCTCCCCCATCGATGACCTTCGCAGAGTC
ACCGCCGATTCCAGAAGAAGATATGCTGCTTTGAGAAGGAGACTATTGATTGATCCACAT
TTGCCTAAGAAAGGAATCAATTCTCCAGATCTACCATTGATAACCCTTTATCACAGAATC
CTGATAGTACTTGGGGAAGGTTCTTCCGTAACGCAGAGCTTGAGAAAACACTTGATCAAG
ATCTCTCACGCTTGTATCCTGAACATGGGAGTTACTTTCAATCCTCTGGATGTCAAGGGA
TGCTTAGACGGATACTTCTCCTTTGGTGTTTAAAGCATCCAGAGATTGGTTATAGACAAG
GGATGCATGAACTGTTGGCTCCTTTGCTATATGTTCTTCAAGTGGATGTGCAATATCTCA
CCGAAGTTAGATCAAACTACGAAGACCAGTTTACCGATTTGTTTGATGAGCTAGCCTTTC
AAGAACGCGATTCTGCAGCTTACGATTTCGATATAAAGAAAGTTTTAGATGATTCCATGG
AAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGAAAATGGTCATGCCACC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL8482Contig1 614 2 1 U
GGGGATTTCTTATTTTGTGTGTTAGTGCTTGGAGAGAGAGATAGAAACAGAAAGAAATCG
TCATGGCTCATGGGAGATATGATAATAATTATAAGAAGAAGAGCGGACAGATTCCAAGGT
TTGGAGACTGGGAGGACGCAAATGAGATGCCAATAACACAATACTTCGAGAACGCAAGAC
GGGCTGAAGCCCTCAAGCTTGCTTCTCAACATCCCCGTCCACGTCACCTCCATCCTTCGA
GACAGACGGCGGGGACGAAGGAAAAGAGGGGACCACAAAGGCGCGTGCGTGACGTCAGTT
CACAGACAGACAAGTATTATGTAGACGTCACCGGAGTGAAACACGACGTGGCTCCGGCTT
CGAGGCCACCTAAGCCCGTTGATGAGGATCTCTACAAGATTCCTCCTGAGCTTATCTATT
CTTCAAGAAGGAAGAGAAGGTCTGGCTTTTTAGCATGTTTGGTTCCATGCGCATCTTGAA
CTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAATGAAGAAAAGGAGAAGTAAAAGTAGGATCATTAATAA
TGTAATTTGCATTTCGTTATTTAATTTCATTTAATATACATATATGATGATATGTTATAT
ATATGTGGCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4F275JQ C 1
AF RR4F275TF U 1
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QA 1 534 1 534
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4D281TF U 1
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DS 

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CCCCCAAAGCACCTCTTCTTTCTGAAAACACTAAGAATTTGCAGATGAGTGGCACTGTCC
AGAAGTTCAATGCCTGGAGCACTAATTTAAAGACTTCCCTCATAAATGAATATATTCACT
TCTTGAATACAGCCAACAGAGAAGAGCTAATGGAGTTAAAGGGAATCGGAGAGAAGATGG
CTGAGTACGTTATCGAACTCAGAGAAACAAGCCCTGTAAAATCGCTTGCTGACTTAGAGA
AGATCGGCTTCACCTCAAGACAGGTACATAACTTATTCAAAAGAGCTACTGAAGTAATTC
TTGCTGCTTCCACAACAACACCTTAGTTTTGTTGTCTTTATCAAAACAAAACACTTTGGT
TTCTTCAAGAAAAGTGTGTACTGTGTGTGTCCGGAATAGTTTCATTATGCTTGTTCTTGT
CTACCTAAACCTTATAATCAGGGAGACATTGCTTTGATTGAGTAAGAAAGAAGCAAACTC
TTAAATTTCTGATTGAAACTTCACTCAAAAGACTT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8485Contig1 909 2 2 U
GGCTCTCAACAAATTCAATGGGGGAGTTAATTACACTTTTCACCAAAATCTGAGTAATTA
ACTCTCCTACAAAAAAAATATTATACGCTCTTTTGTTTCTTTTTTATAGAGAAAAATGGA
GCTTTGTAGACGGGAATTACGAGCTCCGTTTCCCATATTAGTCGCCGTTACGTTGTTCCT
CCTTCAGCTCTGTGCCGCGACGTCCCAAATTAATCACAGCGAGTCGTCTACACAAACATC
CGTTAACTCTCCATCAGCGCCAAACACTCGATTTCTGTCGTCATCAGCACTGTCGTTAAC
CGGAAAACATTCCTCCTTCAGGTGGGGGAGAAGACGACATCGTTACAAAATAAGCAGAGC
GAGCATTGAGTTCCTATTCGCACATAACCTCGTTGGGGACTGCAGGCTTGTTCACTCCAA
TGGTCCGTTCGGAGAAAACATATTTTGGGCCGGGCAGAATAACTGGACGCCCATGGATGT
TGTCAAAGTGTGGGCCGATGAGAATAAGTTCTACGACGTTAGGGGTAACACGTGTGAGTC
GGGGCAAATGTGTGGACACTATACGCAGATCGTGTGGAGAGATAGCACGAAGGTTGGGTG
CGCACGTGTGGATTGTTCAAACGGCGGCCTTTATGCGATTTGTGTTTATAACCCACCGGG
AAATTTTGAAGGTGAAAACCCTTTTGTAAGTTATCACGACCAGGTTGGTCTTCTCCGAGA
AGAGCCCCCAGCGGTTGTCGTTAATCCATTTTAACTTTAAATGGCTCGAAAGCTGAGCCT
GAGGACACGATGGATGGTTGTGCATTTTTAGTTTGTTAATTTTGTCTTTTTATTCAAATT
ATTATTATTAATCTTTCGAAAAAACTTATCTTCGGTTTATTCAGAGGTATTATCATCTGA
TACCTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AE95TF U 1
AF RR4AE95JQ C 187
BS 1 727 RR4AE95TF
BS 728 909 RR4AE95JQ

RD RR4AE95TF 727 0 0
GGCTCTCAACAAATTCAATGGGGGAGTTAATTACACTTTTCACCAAAATCTGAGTAATTA
ACTCTCCTACAAAAAAAATATTATACGCTCTTTTGTTTCTTTTTTATAGAGAAAAATGGA
GCTTTGTAGACGGGAATTACGAGCTCCGTTTCCCATATTAGTCGCCGTTACGTTGTTCCT
CCTTCAGCTCTGTGCCGCGACGTCCCAAATTAATCACAGCGAGTCGTCTACACAAACATC
CGTTAACTCTCCATCAGCGCCAAACACTCGATTTCTGTCGTCATCAGCACTGTCGTTAAC
CGGAAAACATTCCTCCTTCAGGTGGGGGAGAAGACGACATCGTTACAAAATAAGCAGAGC
GAGCATTGAGTTCCTATTCGCACATAACCTCGTTGGGGACTGCAGGCTTGTTCACTCCAA
TGGTCCGTTCGGAGAAAACATATTTTGGGCCGGGCAGAATAACTGGACGCCCATGGATGT
TGTCAAAGTGTGGGCCGATGAGAATAAGTTCTACGACGTTAGGGGTAACACGTGTGAGTC
GGGGCAAATGTGTGGACACTATACGCAGATCGTGTGGAGAGATAGCACGAAGGTTGGGTG
CGCACGTGTGGATTGTTCAAACGGCGGCCTTTATGCGATTTGTGTTTATAACCCACCGGG
AAATTTTGAAGGTGAAAACCCTTTTGTAAGTTATCACGACCAGGTTGGTCTTCTCCGAGA
AGAGCCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4AE95JQ 723 0 0
GCTCTGTGCCGCGACGTCCCAAATTAATCACAGCGAGTCGTCTACACAAACATCCGTTAA
CTCTCCATCAGCGCCAAACACTCGATTTCTGTCGTCATCAGCACTGTCGTTAACCGGAAA
ACATTCCTCCTTCAGGTGGGGGAGAAGACGACATCGTTACAAAATAAGCAGAGCGAGCAT
TGAGTTCCTATTCGCACATAACCTCGTTGGGGACTGCAGGCTTGTTCACTCCAATGGTCC
GTTCGGAGAAAACATATTTTGGGCCGGGCAGAATAACTGGACGCCCATGGATGTTGTCAA
AGTGTGGGCCGATGAGAATAAGTTTTACGACGTTAGGGGTAACACGTGTGAGTCGGGGCA
AATGTGTGGACACTATACGCAGATCGTGTGGAGAGATAGCACGAAGGTTGGGTGCGCACG
TGTGGATTGTTCAAACGGCGGCCTTTATGCGATTTGTGTTTATAACCCCCCGGGAAATTT
TGAAGGTGAAAACCCTTTTGTAAGTTATCACGACCAGGTTGGTCTTCTCCGAGAAGAGCC
CCCAGCGGTTGTCGTTAATCCATTTTAACTTTAAATGGCTCGAAAGCTGAGCCTGAGGAC
ACGATGGATGGTTGTGCATTTTTAGTTTGTTAATTTTGTCTTTTTATTCAAATTATTATT
ATTAATCTTTCGAAAAAACTTATCTTCGGTTTATTCAGAGGTATTATCATCTGATACCTG
ATT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL8486Contig1 741 2 8 U
GGTATTTATTAGGGCCAGCTTTATTGATTGTTTTGGTTTGTTGATAAAATCAACATTTCA
CGGAAATGATTTTGTGGATCAAATGTGATTCGCCCTGTATCCAACCTTTGAAGTTTTGAT
TGGTCACGGTATTGAAAATGACAGACATCTCATTCACGATCTTTTTTTCTCTGTATCTTC
AATGTTTATGTGGTGTGGCAGTAGATGATAACATCATGATAAATATAGGTATAATATATT
TGATTAAATGTTTTTATGGCAGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGATTTCTATGGGATA
CTGAAGAAGAAGGAGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGGAAGTAAATATGAGAATGGTTTCT
CTACCTATAATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGCTGATCTTAAACC
GGTGTAATTTAATAACAATTTCAAGTCCGGTTTAGTCATAAAATATCTTTTGCATATTGA
GGTAGATTGATGCTTATGTGTTGGAAGAGACGAACCTAGTATCAAAACTCCAAAGATGCA
TTATTGTGATATCCCAAAGAAGATAAAAAGGTGTGAATTGGGATTGGTCCATGGGCTCTG
GATAGAATCAATTATTGGTTGTCAAAAAATAAAAATCAATTATTGATCAATGGTGGCCAG
AGACGTCATGCTCAACGCTTGTTTTTTTTTGTGTCAATGCATACATGAAATAAAACTAAA
ACTTTGTTAGTTCCAATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4H150TF U 1
AF RR4H150JQ C 188
BS 1 628 RR4H150TF
BS 629 629 RR4H150JQ
BS 630 689 RR4H150TF
BS 690 690 RR4H150JQ
BS 691 696 RR4H150TF
BS 697 697 RR4H150JQ
BS 698 738 RR4H150TF
BS 739 741 RR4H150JQ

RD RR4H150TF 738 0 0
GGTATTTATTAGGGCCAGCTTTATTGATTGTTTTGGTTTGTTGATAAAATCAACATTTCA
CGGAAATGATTTTGTGGATCAAATGTGATTCGCCCTGTATCCAACCTTTGAAGTTTTGAT
TGGTCACGGTATTGAAAATGACAGACATCTCATTCACGATCTTTTTTTCTCTGTATCTTC
AATGTTTATGTGGTGTGGCAGTAGATGATAACATCATGATAAATATAGGTATAATATATT
TGATTAAATGTTTTTATGGCAGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGATTTCTATGGGATA
CTGAAGAAGAAGGAGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGGAAGTAAATATGAGAATGGTTTCT
CTACCTATAATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGCTGATCTTAAACC
GGTGTAATTTAATAACAATTTCAAGTCCGGTTTAGTCATAAAATATCTTTTGCATATTGA
GGTAGATTGATGCTTATGTGTTGGAAGAGACGAACCTAGTATCAAAACTCCAAAGATGCA
TTATTGTGATATCCCAAAGAAGATAAAAAGGTGTGAATTGGGATTGGTCCATGGGCTCTG
GATAGAATCAATTATTGGTTGTCAAAAA*TAAAAATCAATTATTGATCAATGGTGGCCAG
AGACGTCATGCTCAACGCTTGTTTTTTTT*GTGTCA*TGCATACATGAAATAAAACTAAA
ACTTTGTTAGTTCCAATT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4H150JQ 554 0 0
ATGTGGTGTGGCAGTAGATGATAACATCATGATAAATATAGGTATAATATATTTGATTAA
ATGTTTTTATGGCAGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGATTTTTATGGGATACTGAAGA
AGAAGGAGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGGAAGTAAATATGAGAATGGTTTCTCTACCTA
TAATAACTCATCTGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGCTGATCTTAAACCGGTGTAA
TTTAATAACAATTTCAAGTCCGGTTTAGTCATAAAATATCTTTTGCATATTGAGGTAGAT
TGATGCTTATGTGTTGGAAGAGACGAACCTAGTATCAAAACTCCAAAGATGCATTATTGT
GATATCCCAAAGAAGATAAAAAGGTGTGAATTGGGATTGGTCCATGGGCTCTGGATAGAA
TCAATTATTGGTTGTCAAAAAATAAAAATCAATTATTGATCAATGGTGGCCAGAGACGTC
ATGCTCAACGCTTGTTTTTTTTTGTGTCAATGCATACATGAAATAAAACTAAAACTTTGT
TAGTTCCAATTTGC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL8487Contig1 612 2 1 U
GGAGGCCAAATAGGTGCCGGAGCCAAGGTTGGAGGCAAAGGCAAAGGCAAAGGCAAAGGC
AAAGGTAAAGGCAAGGTCTGAGCTCAAGGCGAAGTTAAAATCGGAGGTAATGTCGGATTT
GAATTAGGAGCTAAAGCCGGAGCCAAGGTTGGAGTGAAGCCAAAGCCGGGTGTGGATCTA
AGGCCGGAGCCAAGGTCGGAGCTCAAACCGAAGTTAACGTCAGAGGTAATGCCGGAGTTA
ACGCCGGAGGATTCACCATTGGCTCCGGTCGTAGGTCCACATTAGGATCCAGAATCACCA
TCGGGGACCCCATTCGAGGAAGATTTGATGATGTGTACGATTTCGCGGGTAAGATACCTG
TGGGCGGAGGACGCACGCTCAGGCCAATGAGCCACACTAGCAGCAAACACTTGGACTGAG
TGAGACGCAAGCTAACAACAAACAACAGATGAAAGGAGGGAGCCATGAGTTCATCTCAAA
ATAATATTGGTTTTATTTAAATAAAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGCGATATTTATCT
CTATTTGTAACCCATTAACAAAATATCGATCTCTGTTACTATTCAATTAATACAATATCG
CATGTTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EQ66TF U 1
AF RR4EQ66JQ C 76
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TGAGACGCAAGCTAACAACAAACAACAGATGAAAGGAGGGAGCCATGAGTTCATCTCAAA
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CTATTTGTAACCCATTAACAAAATATCGATCTCTGTTACTATTCAATTAATACAATATCG
CATGTTTTCTTT

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DS 

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TTTAAATAAAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGCGATATTTATCTCTATTTGTAACCCAT
TAACAAAATATCGATTTCTGTTACTATTCAATTAATACAATATCGCATGTTTTCTTT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4B871JQ C 1
AF RR4B871TF U 1
BS 1 700 RR4B871TF

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TTGGGAAATTCATTCCGGTGTCGAAAACTCCTCTCAGCAACAAACTAAAATGCTGGGGCA
AGAAAAAATCTTCTGGAGAAGGTTCACTCTGATTTGATGGGTACCGGTTTTATGTCAAGA
CGCTCCGCGAGTTTTAAGTACTACTTCTAGGACTAACAAGAACAAAAAAACATATCGTTT
GGTGTTAACTATGGGGTTTATAATTGATATTGGGAAACCCCAAAAGTACAGTTTTTCGGG
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QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4B871TF 700 0 0
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TTGGGAAATTCATTCCGGTGTCGAAAACTCCTCTCAGCAACAAACTAAAATGCTGGGGCA
AGAAAAAATCTTCTGGAGAAGGTTCACTCTGATTTGATGGGTACCGGTTTTATGTCAAGA
CGCTCCGCGAGTTTTAAGTACTACTTCTAGGACTAACAAGAACAAAAAAACATATCGTTT
GGTGTTAACTATGGGGTTTATAATTGATATTGGGAAACCCCAAAAGTACAGTTTTTCGGG
GTTTGTCTATGCGGTCAAGTTTGGATTCATGTTTTTTTCGGTTATTGATAATACGATTGC
TTGACTTTGGAATCTTTACTAGTGAAATCTTATTATAACC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL8490Contig1 770 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX61TF U 1
AF RR4EX61JQ C 135
BS 1 671 RR4EX61TF
BS 672 770 RR4EX61JQ

RD RR4EX61TF 671 0 0
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CACGGTCTTGGAAATGGCGACAGTACCGGGACAATTGGTATGGGAGATCGTTAAGAGAAA
CAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGTAAAGA
GAAGAACAATCTCTGCAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCGAACAAGAAGAC
AGTGACCATCCAGCCAGCTGACAGGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAA
GAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAG
GATGTCTAATGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAA
ATTCGCTCTTGCTAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAATCCGGTGC
CAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTATTCAAGATATGTGTTTGAAGTAAAACAG
ATTTTGCTAAAGAGGGTTTATGAAATTGTTTTTGTTGAAATTGAATCACAACACTATGGT
TTTTTTTATTATTTTAAAATGTGTTTTCTTATGCTTATGTTTCTTGTGGCTTGTGATATG
AACTTTTGATT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR4EX61JQ 636 0 0
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GCAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCGAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGC
CAGCTGACAGGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGC
CTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCTAATGCTG
TTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCTA
GACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAATCCGGTGCCAAGCAAAGAAACC
GTCAAGCTTAAGCTTTTATTCAAGATATGTGTTTGAAGTAAAACAGATTTTGCTAAAGAG
GGTTTATGAAATTGTTTTTGTTGAAATTGAATCACAACACTATGGTTTTTTTTATTATTT
TAAAATGTGTTTTTTTATGCTTATGTTTCTTGTGGCTTGTGATATGAACTTTTGATTAAA
CCTCAAAGTTTCTTGTCTTAACGAATTAGGCAAACAAAAATCGTTCTTATATACTGATGA
TGTAATAAACATGTGAACTGAGTCGGTTCAAAATTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL8491Contig1 709 2 2 U
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ATTCAATCTGTTCGTCTTTATCAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACCTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTGCTGACAA
GAGTCGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAAAAGGCTGGTCTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTGCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTTTGTCCGTCGCCACGAACCCCGAAACGCCTGGAACGCTGTTCACCCTGA
GCATCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCAGCTCGTCGTGGCTCTCGTCTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTT
TTGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAAAAATCTGATTGACCCCGGTTATTTCGAT
TTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGGATTCGCTCGTGTATTTGAATCTAAATT
GCTTTAAGCTCATTTCAATGTTTATGTAAATGTTTATGAGGCCCATTAATAATTAAGCCT
GTTCCTAGGCCCATAAACTCTTTCGCCTAAGCCAAACCGGTAATTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F901TF U 1
AF RR4F901JQ C 120
BS 1 664 RR4F901TF
BS 665 709 RR4F901JQ

RD RR4F901TF 664 0 0
GGGAAGAAAACAAAACACAGAGAGCTAGAGAGAGAGAGAGAATTAGAACAATGGCGGCTA
ATTCAATCTGTTCGTCTTTATCAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACCTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTGCTGACAA
GAGTCGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAAAAGGCTGGTCTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTGCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTTTGTCCGTCGCCACGAACCCCGAAACGCCTGGAACGCTGTTCACCCTGA
GCATCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCAGCTCGTCGTGGCTCTCGTCTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTT
TTGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAAAAATCTGATTGACCCCGGTTATTTCGAT
TTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGGATTCGCTCGTGTATTTGAATCTAAATT
GCTTTAAGCTCATTTCAATGTTTATGTAAATGTTTATGAGGCCCATTAATAATTAAGCCT
GTTC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4F901JQ 590 0 0
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AGAGTCGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAAAAGGCTGGTCTTTTATCCTTAGCC
GAGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTGCTCACCAAAGCCGAG
GAGTTCGGCGTTTTGTCCGTCGCCACGAACCCCGAAACGCCTGGAACGCTGTTCACCCTG
AGCATCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTTTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCT
TGGCAAGTGGTGGTTCAGCTCGTCGTGGCTCTCGTCTCTGTCCTCGGTGGCTTTGCTGCT
TTTGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAAAAATTTGATTGACCCCGGTTATTTCGA
TTTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGGATTCGCTCGTGTATTTGAATCTAAAT
TGCTTTAAGCTCATTTCAATGTTTATGTAAATGTTTATGAGGCCCATTAATAATTAAGCC
TGTTCCTAGGCCCATAAACTCTTTCGCCTAAGCCAAACCGGTAATTGTTT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL8492Contig1 759 2 2 U
GGAATACAAAGGGTTAGCTGACCTTCTCTTCTCTTCTTCCTCCTACGACTTGTCTGTCAT
CCGTCGAAAAGCTTTTGTGAGTCTGTACCATCCTTCTCCAATGTCCGTAAACGTCAAGGA
AGAGCCAGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCGTCGAGAACACAGAGCTTGAAGTTGTCAA
TGGAGATGAGGGAAGTAAGCTTGAGGATTATGGGACTTGCGTAGATGTTATAACCGACAG
AGTCAATCAGCTTGAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTGAACAGTTTTACTCTACCAAAGACGG
AGCAGGTCAAACAAACACTTCCAAGAGTAACTCCGGTGGGAAAAAAGTTGCTATCTCTCA
ACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGGAATAACAAGAGGGAAACATGTTTCTAGCCC
TGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTCAGATTGCTCAACAAAAATGGGCGTG
GCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTGGACTCGATGATTATCACAAGGTTAT
AGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATCAGAACTAAAATGGAGGCTTCGGAGTACAGCAA
TGTCCGGGAGATATATGCTGATGCTAGGCTAGTTTTCAAGAACGCTATGAGATATAACGA
AGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCCGAATCTCTTTTGGAGAAGTTTGAGGAGAAATG
GCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DG20TF U 1
AF RR4CT73TF U 37
BS 1 747 RR4DG20TF
BS 748 759 RR4CT73TF

RD RR4DG20TF 747 0 0
GGAATACAAAGGGTTAGCTGACCTTCTCTTCTCTTCTTCCTCCTACGACTTGTCTGTCAT
CCGTCGAAAAGCTTTTGTGAGTCTGTACCATCCTTCTCCAATGTCCGTAAACGTCAAGGA
AGAGCCAGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCGTCGAGAACACAGAGCTTGAAGTTGTCAA
TGGAGATGAGGGAAGTAAGCTTGAGGATTATGGGACTTGCGTAGATGTTATAACCGACAG
AGTCAATCAGCTTGAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTGAACAGTTTTACTCTACCAAAGACGG
AGCAGGTCAAACAAACACTTCCAAGAGTAACTCCGGTGGGAAAAAAGTTGCTATCTCTCA
ACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGGAATAACAAGAGGGAAACATGTTTCTAGCCC
TGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTCAGATTGCTCAACAAAAATGGGCGTG
GCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTGGACTCGATGATTATCACAAGGTTAT
AGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATCAGAACTAAAATGGAGGCTTCGGAGTACAGCAA
TGTCCGGGAGATATATGCTGATGCTAGGCTAGTTTTCAAGAACGCTATGAGATATAACGA
AGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCCGAATCTCTTTTGGAGAAGTTTGAGGAGAAATG
GCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4CT73TF 723 0 0
GGA
CTCCTACGACTTGTCTGTCATCCGTCGAAAAGCTTTTGTGAGTCTGTACCATCCTTCTCC
AATGTCCGTAAACGTCAAGGAAGAGCCAGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCGTCGAGAA
CACAGAGCTTGAAGTTGTCAATGGAGATGAGGGAAGTAAGCTTGAGGATTATGGGACTTG
CGTAGATGTTATAACCGACAGAGTCAATCAGCTTGAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTGAACA
GTTTTACTCTACCAAAGACGGAGCAGGTCAAACAAACACTTCCAAGATTA*CTCCGGTGG
GAAAAAAGTTGCTATCTCTCAACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGGAATAACAAG
AGGGAAACATGTTTCTAGCCCTGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTCAGAT
TGCTCAACAAAAATGGGCGTGGCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTGGACT
CGATGATTATCACAAGGTTATAGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATCAGAACTAAAAT
GGAGGCTTCGGAGTACAGCAATGTCCGGGAGATATATGCTGATGTTAGGCTAGTTTTCAA
GAACGCTATGAGATATAACGAAGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCCGAATCTCTTTT
GGAGAAGTTTGAGGAGAAATGGCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGGAAAAAAA

QA 4 723 4 723
DS 



AS 1 2

CO CL8493Contig1 520 2 1 U
TTTTTTTGAAAACGTTTTTTGGGGACTATTAACTAACATAATGGTGCGCCTTCACGTAGC
TCTCCTTCTTCTCTTCATCGCCGTTTTCACCGTCATCGTATCAGCTACTGATAAACCGTC
GGTGACCACCTCTGGACCTCCAACCGCAACAGCTCCGACTCCCGGAGATGATGATGTGGC
AGTCGCCGGACCTATCGGAAGCGAAACTTCTTACGCAAACTATCCGCCGCCTCAGCAAAC
TTCAGGAAGTGGCCTCACCGCTATGATTGGAACTGTTTCTATTGCTGCTACGATGGTTGG
ATCGCTATTATTTTTCTGAGGCGTGATTGGTATATGTAATCTAAGAAATTAATATGTTTT
TAATGAATATTTTGTAATATTTTTCTTGTGTAGAATTATCATGTATAAGCATTTTGCTTG
TCCCTTCATGTATAACATTGGGACGGTACAGATCATTACAACATAAAAACTTTGTGTATG
TGATTCATATATATGGTTTATAATACCTTGTGATATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G089TF U 1
AF RR4G089JQ C 75
BS 1 520 RR4G089TF

RD RR4G089TF 520 0 0
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TCTCCTTCTTCTCTTCATCGCCGTTTTCACCGTCATCGTATCAGCTACTGATAAACCGTC
GGTGACCACCTCTGGACCTCCAACCGCAACAGCTCCGACTCCCGGAGATGATGATGTGGC
AGTCGCCGGACCTATCGGAAGCGAAACTTCTTACGCAAACTATCCGCCGCCTCAGCAAAC
TTCAGGAAGTGGCCTCACCGCTATGATTGGAACTGTTTCTATTGCTGCTACGATGGTTGG
ATCGCTATTATTTTTCTGAGGCGTGATTGGTATATGTAATCTAAGAAATTAATATGTTTT
TAATGAATATTTTGTAATATTTTTCTTGTGTAGAATTATCATGTATAAGCATTTTGCTTG
TCCCTTCATGTATAACATTGGGACGGTACAGATCATTACAACATAAAAACTTTGTGTATG
TGATTCATATATATGGTTTATAATACCTTGTGATATTCAT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR4G089JQ 446 0 0
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GACCTCCAACCGCAACAGCTCCGACTCCCGGAGATGATGATGTGGCAGTCGCCGGACCTA
TCGGAAGCGAAACTTCTTACGCAAACTATCCGCCGCCTCAGCAAACTTCAGGAAGTGGCC
TCACCGCTATGATTGGAACTGTTTCTATTGCTGCTACGATGGTTGGATCGCTATTATTTT
TCTGAGGCGTGATTGGTATATGTAATCTAAGAAATTAATATGTTTTTAATGAATATTTTG
TAATATTTTTCTTGTGTAGAATTATCATGTATAAGCATTTTGCTTGTCCCTTCATGTATA
ACATTGGGACGGTACAGATCATTACAACATAAAAACTTTGTGTATGTGATTCATATATAT
GGTTTATAATACCTTGTGATATTCAT

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL8494Contig1 1412 2 2 U
GCACTTTAGAACATATTCATTACGAAGATGAGAACACAAGGTACATCTGCATAGGACCCG
TGAATAAGGTATTAAATATGCTTTGTTGTTGGGTAGAGGACCCAAACTCAGAGGCTTTTA
AGTTGCACCTACCAAGAATCCATGACTATCTTTGGTTAGCTGAAGATGGAATGAAGATGC
AGGGTTATAACGGAAGCCAGCTATGGGATACGAGTTTTGCTGTTCAAGCTGTTCTGGCAA
CTAACTTTGTCGAAGAATATGGGCCCGTTTTGAAAAAAGCACATTCATATGTCAAGAATT
CTCAGGTGACGGAGGACTGCCCTGGAGATCTGAGTTACTGGTATCGACACATTTCTAAAG
GGGCTTGGCCTTTCTCAACTGCAGATCATGGTTGGCCAATCTCCGATTGCACTGCAGAGG
GACTTAAAGCTGCTCTTTTACTATCCAAAGTTCCTAAGGAGATTGTTGGTGAACCAGTAG
ATACAAAACGGTTATATGATGCTGTTAATGTTATCATTTCGTTACAGAATGCAGATGGAG
GTTTGGCAACGTATGAGCTCACAAGGTCATACCCTTGGTTGGAGCTAATCAATCCAGCAG
AAACCTTTGGCGATATTGTTATTGACTACCCTTACGTGGAGTGTACGTCAGCTGCTATCC
AAGCGTTGGTAGCTTTCCGAAAGCTTTATCCTGGTCATCGGAAGAAGGATGTAGATGAGT
GCATCGAGAAGGCGGTTAAGTTCATTGAATCTATTCAAGCATCAGATGGCCCATGGTATG
GATCATGGGCTGTTTGCTTCACGTATGGTACATGGTTTGGAGTGAAAGGGCTTGAAGCTG
CTGGAAAGACATTGAAAAACTCTCCAACTGTTGCGAAAGCTTGTGAATTTCTCTTGTCGA
AACAACTTCCTTCGGGCGGATGGGGAGAAAGCTATCTTTCATGTCAAGACAAAGTATATT
CAAACCTTGAAGGCAACCGGTCTCATGTTGTGAATACAGCATGGGCTTTGCTATCACTCA
TTGGTGCTGGGCAAGCGGAGGTAGATCAGAAACCCCTACATCGGGCTGCTAGATACTTGA
TTAATGCTCAAATGGAGAGTGGTGATTTCCCACAACAGGAAATAGTGGGAGTCTTCAACA
GGAACTGCATGATAACTTACGCTGCATACCGAAACATTTTCCCAATATGGGCATTGGGAG
AGTACCGCAGTAAGGTATTATTGCAACAAGGAGAATGAGTAGTAAGTAGTTCATGTTCTC
TTGGGGGACGATCTGTATTAGCTTCAATGCTTATTTTTTTTTCCAAAGCTGTGTGTTTCC
GTATATCTTATGGTTCAGCTGTCCAATCTTTGTTTACTTCACTCAAATCTTGGTTTCAGT
TTTTTTTTTTTGTGGGTTCTCTGAAATTCTGG


BQ
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AF RR4D648TF U 1
AF RR4D648JQ C 641
BS 1 702 RR4D648TF
BS 703 1412 RR4D648JQ

RD RR4D648TF 702 0 0
GCACTTTAGAACATATTCATTACGAAGATGAGAACACAAGGTACATCTGCATAGGACCCG
TGAATAAGGTATTAAATATGCTTTGTTGTTGGGTAGAGGACCCAAACTCAGAGGCTTTTA
AGTTGCACCTACCAAGAATCCATGACTATCTTTGGTTAGCTGAAGATGGAATGAAGATGC
AGGGTTATAACGGAAGCCAGCTATGGGATACGAGTTTTGCTGTTCAAGCTGTTCTGGCAA
CTAACTTTGTCGAAGAATATGGGCCCGTTTTGAAAAAAGCACATTCATATGTCAAGAATT
CTCAGGTGACGGAGGACTGCCCTGGAGATCTGAGTTACTGGTATCGACACATTTCTAAAG
GGGCTTGGCCTTTCTCAACTGCAGATCATGGTTGGCCAATCTCCGATTGCACTGCAGAGG
GACTTAAAGCTGCTCTTTTACTATCCAAAGTTCCTAAGGAGATTGTTGGTGAACCAGTAG
ATACAAAACGGTTATATGATGCTGTTAATGTTATCATTTCGTTACAGAATGCAGATGGAG
GTTTGGCAACGTATGAGCTCACAAGGTCATACCCTTGGTTGGAGCTAATCAATCCAGCAG
AAACCTTTGGCGATATTGTTATTGACTACCCTTACGTGGAGTGTACGTCAGCTGCTATCC
AAGCGTTGGTAGCTTTCCGAAAGCTTTATCCTGGTCATCGGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4D648JQ 772 0 0
GTGTACGTCAGCTGCTATCCAAGCGTTGGTAGCTTTCCGAAAGCTTTATCCTGGTCATCG
GAAGAAGGATGTAGATGAGTGCATCGAGAAGGCGGTTAAGTTCATTGAATCTATTCAAGC
ATCAGATGGCCCATGGTATGGATCATGGGCTGTTTGCTTCACGTATGGTACATGGTTTGG
AGTGAAAGGGCTTGAAGCTGCTGGAAAGACATTGAAAAACTCTCCAACTGTTGCGAAAGC
TTGTGAATTTCTCTTGTCGAAACAACTTCCTTCGGGCGGATGGGGAGAAAGCTATCTTTC
ATGTCAAGACAAAGTATATTCAAACCTTGAAGGCAACCGGTCTCATGTTGTGAATACAGC
ATGGGCTTTGCTATCACTCATTGGTGCTGGGCAAGCGGAGGTAGATCAGAAACCCCTACA
TCGGGCTGCTAGATACTTGATTAATGCTCAAATGGAGAGTGGTGATTTCCCACAACAGGA
AATAGTGGGAGTCTTCAACAGGAACTGCATGATAACTTACGCTGCATACCGAAACATTTT
CCCAATATGGGCATTGGGAGAGTACCGCAGTAAGGTATTATTGCAACAAGGAGAATGAGT
AGTAAGTAGTTCATGTTCTCTTGGGGGACGATCTGTATTAGCTTCAATGCTTATTTTTTT
TTCCAAAGCTGTGTGTTTCCGTATATCTTATGGTTCAGCTGTCCAATCTTTGTTTACTTC
ACTCAAATCTTGGTTTCAGTTTTTTTTTTTTGTGGGTTCTCTGAAATTCTGG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL8495Contig1 804 2 2 U
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GGATCTCAGGAATAACGATCGTGTTAGTGGCCTTAACCGCAGTGCTAGCTTCTTCAGTAC
GTAGCCAGCAACCGCCGCTTAGCCAATGTACTCCGTCTATGATGACCACCGTAGGTCCTT
GTATGAGCATTTTAACCAACAGCAGTAGCAACGGAACTTCACCTTCCACTGATTGTTGTA
ACTCATTAAAGTCTTTGACTACCAGAGGAATGGGATGTCTCTGTCTTATTGTCACCGGAA
GCGTTCCTTTTAATATCCCGATTAACCGTACAACCGCCGTCTCTCTTCCACGCGCTTGCA
ACATGCCTAGAGTCCCTCTTCAATGCAAAGCCAATATTGCTCCATCTGCTGCTCCTGGAC
CTGCTGGTACATTTGGACCGGCGATGTCTCCAGGTCCATCAACAACTCCCATAGTTCCAG
AGCCAACTCCAGCATCTCAGACGCCACAGTCCGATGCAACTAGACCTTTTACACCAACCG
TGGACGGAGCTGCTCCTACGTCTGACGACGGAGGAAGCACCAGTCAACCTTCTCTCACTC
CTTCATCCGCCTATGCTCTCTCACCATCTCTTCTCTTCTTCGGAGTCAGCCTCCTAGCTC
TCAAATTCTACTGATTCCACTTGCTTCCCTTTGTATTCCACATGTGATTTCATTTATGCT
TTGTGTATATTTGTTTTGAAACATTGTTTTGGGTGAGATTTTACTTCGTACTGTCTGTAG
AAATATATCATTTGCTTGATGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GL78TF U 1
AF RR4GL78JQ C 16
BS 1 739 RR4GL78TF
BS 740 804 RR4GL78JQ

RD RR4GL78TF 739 0 0
GGACAACACTCCTTCAAACGCAAGAACAACAAACAAGCTTTAATTGATCTACAATGTCCA
GGATCTCAGGAATAACGATCGTGTTAGTGGCCTTAACCGCAGTGCTAGCTTCTTCAGTAC
GTAGCCAGCAACCGCCGCTTAGCCAATGTACTCCGTCTATGATGACCACCGTAGGTCCTT
GTATGAGCATTTTAACCAACAGCAGTAGCAACGGAACTTCACCTTCCACTGATTGTTGTA
ACTCATTAAAGTCTTTGACTACCAGAGGAATGGGATGTCTCTGTCTTATTGTCACCGGAA
GCGTTCCTTTTAATATCCCGATTAACCGTACAACCGCCGTCTCTCTTCCACGCGCTTGCA
ACATGCCTAGAGTCCCTCTTCAATGCAAAGCCAATATTGCTCCATCTGCTGCTCCTGGAC
CTGCTGGTACATTTGGACCGGCGATGTCTCCAGGTCCATCAACAACTCCCATAGTTCCAG
AGCCAACTCCAGCATCTCAGACGCCACAGTCCGATGCAACTAGACCTTTTACACCAACCG
TGGACGGAGCTGCTCCTACGTCTGACGACGGAGGAAGCACCAGTCAACCTTCTCTCACTC
CTTCATCCGCCTATGCTCTCTCACCATCTCTTCTCTTCTTCGGAGTCAGCCTCCTAGCTC
TCAAATTCTACTGATTCCACTTGCTTCCCTTTGTATTCCACATGTGATTTCATTTATGCT
TTGTGTATATTTGTTTTGA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4GL78JQ 789 0 0
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CGATCGTGTTAGTGGCCTTAACCGCAGTGCTAGCTTCTTCAGTACGTAGCCAGCAACCGC
CGCTTAGCCAATGTACTCCGTCTATGATGACCACCGTAGGTCCTTGTATGAGCATTTTAA
CCAACAGCAGTAGCAACGGAACTTCACCTTCCACTGATTGTTGTAACTCATTAAAGTCTT
TGACTACCAGAGGAATGGGATGTCTCTGTCTTATTGTCACCGGAAGCGTTCCTTTTAATA
TCCCGATTAACCGTACAACCGCCGTCTCTCTTCCACGCGCTTGCAACATGCCTAGAGTCC
CTCTTCAATGCAAAGCCAATATTGCTCCATCTGCTGCTCCTGGACCTGCTGGTACATTTG
GACCGGCGATGTCTCCAGGTCCATCAACAACTCCCATAGTTCCAGAGCCAACTCCAGCAT
CTCAGACGCCACAGTCCGATGCAACTAGACCTTTTACACCAACCGTGGACGGAGCTGCTC
CTACGTCTGACGACGGAGGAAGCACCAGTCAACCTTCTCTCACTCCTTCATCCGCCTATG
CTCTCTCACCATCTCTTCTCTTCTTCGGAGTCAGCCTCCTAGCTCTCAAATTCTACTGAT
TCCACTTGCTTCCCTTTGTATTCCACATGTGATTTCATTTATGCTTTGTGTATATTTGTT
TTGAAACATTGTTTTGGGTGAGATTTTACTTCGTACTGTCTGTAGAAATATATCATTTGC
TTGATGCTC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL8496Contig1 545 2 1 U
GGAACATGATTGTGTTCGTGACCATGGGAGTCGCTCAGCTATTGCTATGGGCAAGATGGG
CAGCTGTCTCGAGACATCCTTCTAGTTGGAAACTATGGGTGGTTGTGATTGCTGGAGGGT
TGGCTATGCTTTTGGGGTTATATGATTTTCCTCCCTTTGAAGGCTACTTCGATTCTCACT
CCATCTGGCACGCCATCACAGTTCCTCTTACTGTTCTCTGGTGGAGCTTTATTAGAGACG
ATGCTGAGTTCAGAACTTCTAGTCTTGTCAAGAAATCTAAGACAAAGGCCAAGTAAGTCT
CACAGGGATATTTTTCTATCGATCATAAAATCAAAAGCACTGGGGAAAAAAGACAGAGGG
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GTGATTTTGATTTACTGTTACTGACAGTTGCAGAGGTTTCTTGTTTTTTTTTCCAATGGT
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CATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RR4A665JQ C 1
AF RR4A665TF U 1
BS 1 545 RR4A665TF

RD RR4A665JQ 545 0 0
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CAGCTGTCTCGAGACATCCTTCTAGTTGGAAACTATGGGTGGTTGTGATTGCTGGAGGGT
TGGCTATGCTTTTGGGGTTATATGATTTTCCTCCCTTTGAAGGCTACTTCGATTCTCACT
CCATCTGGCACGCCATCACAGTTCCTCTTACTGTTTTCTGGTGGAGCTTTATTAGAGACG
ATGCTGAGTTCAGAACTTCTAGTCTTGTCAAGAAATTTAAGACAAAGGCCAAGTAAGTCT
CACAGGGATATTTTTCTATCGATCATAAAATCAAAAGCACTGGGGAAAAAAGACAGAGGG
AATATGGATTCAAACATCAAGGAGAAAGCAGTTTCGTTTTTGTTTTAAAATAGGTGGTCT
GTGATTTTGATTTACTGTTACTGACAGTTGCAGAGGTTTCTTGTTTTTTTTTCCAATGGT
TTAATTCAAGCATTTGTCATGGTCTTACTTTGATCAATTGGGATTTTGCTAGCAGTTTAT
CATCC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR4A665TF 545 0 0
GGAACATGATTGTGTTCGTGACCATGGGAGTCGCTCAGCTATTGCTATGGGCAAGATGGG
CAGCTGTCTCGAGACATCCTTCTAGTTGGAAACTATGGGTGGTTGTGATTGCTGGAGGGT
TGGCTATGCTTTTGGGGTTATATGATTTTCCTCCCTTTGAAGGCTACTTCGATTCTCACT
CCATCTGGCACGCCATCACAGTTCCTCTTACTGTTCTCTGGTGGAGCTTTATTAGAGACG
ATGCTGAGTTCAGAACTTCTAGTCTTGTCAAGAAATCTAAGACAAAGGCCAAGTAAGTCT
CACAGGGATATTTTTCTATCGATCATAAAATCAAAAGCACTGGGGAAAAAAGACAGAGGG
AATATGGATTCAAACATCAAGGAGAAAGCAGTTTCGTTTTTGTTTTAAAATAGGTGGTCT
GTGATTTTGATTTACTGTTACTGACAGTTGCAGAGGTTTCTTGTTTTTTTTTCCAATGGT
TTAATTCAAGCATTTGTCATGGTCTTACTTTGATCAATTGGGATTTTGCTAGCAGTTTAT
CATCC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL8497Contig1 819 2 2 U
GGGACCAAACCATACTGTCCGTTCTACGGTGTCACTGCTCTTGCCAGGTTCTCAACAAAG
AGTTCGCATTACCCGGCATCCATCTCTCCATCGTTAAAACAAGTTTGTCTCATTGTAATG
CAGAAAGCTACAATATGATCTTATGGATCTGTTTTCACTTTGTAGGAGGAGATCTTCAGG
TTGATGTTCGAGATGAGAATGTTGTGGAGGCAGTCTGTGAACAACATCCTTTGTGTTTCT
TCAGTGAGTTTCTCGACTATAGGGATAGAGCTGGTGGCTCGGTGGATCTTTGATTGCATT
AACCTGAGACCGGTCGTACCTCGGACTAATATTCGTTTCAGGATGTTGATCTCATTTTTG
GGCTTGTGTTATGTTTTTCGACATGGATTTCTGGTTACTGTTGTCTAAAAAATCATTCTC
TGTTGATTTCAGTCATCCTCCTAAAGCGGGGTCTCATGAGCTTCTTCGTGAGGGGGTAAT
TAGAGAATCGATGTACACCAGCTAGTTAGCTGAGATTTGGAGATGGGAGTTCCATCCGCG
TCAAATTGCTGTCCTACGGCATGCGGGGAACACATGAGTTTTGTTACTCCTAATAATCAG
ATGTGTTTGTTCCAGTCACTTGATGTGTGTTTCACGTCGGATCGGCAGAGGATTTTTGTG
TTAATTTCTCCTCTTCTTCTTTCTAGCATCAAATAATACACTACAGATCCGCTCATAAAT
TATGACTATGCTTTAATCTAACACGTTGTACAAGTAATGAACTAAAATGACAATTTGTAT
GAAATTTGAAGGTGGAATTTTTTTTTTTTTTTGATACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FX84TF U 1
AF RR4FX84JQ C 201
BS 1 733 RR4FX84TF
BS 734 819 RR4FX84JQ

RD RR4FX84TF 733 0 0
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AGTTCGCATTACCCGGCATCCATCTCTCCATCGTTAAAACAAGTTTGTCTCATTGTAATG
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TTGATGTTCGAGATGAGAATGTTGTGGAGGCAGTCTGTGAACAACATCCTTTGTGTTTCT
TCAGTGAGTTTCTCGACTATAGGGATAGAGCTGGTGGCTCGGTGGATCTTTGATTGCATT
AACCTGAGACCGGTCGTACCTCGGACTAATATTCGTTTCAGGATGTTGATCTCATTTTTG
GGCTTGTGTTATGTTTTTCGACATGGATTTCTGGTTACTGTTGTCTAAAAAATCATTCTC
TGTTGATTTCAGTCATCCTCCTAAAGCGGGGTCTCATGAGCTTCTTCGTGAGGGGGTAAT
TAGAGAATCGATGTACACCAGCTAGTTAGCTGAGATTTGGAGATGGGAGTTCCATCCGCG
TCAAATTGCTGTCCTACGGCATGCGGGGAACACATGAGTTTTGTTACTCCTAATAATCAG
ATGTGTTTGTTCCAGTCACTTGATGTGTGTTTCACGTCGGATCGGCAGAGGATTTTTGTG
TTAATTTCTCCTCTTCTTCTTTCTAGCATCAAATAATACACTACAGATCCGCTCATAAAT
TATGACTATGCTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4FX84JQ 619 0 0
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AGGGATAGAGCTGGTGGCTCGGTGGATCTTTGATTGCATTAACCTGAGACCGGTCGTACC
TCGGACTAATATTCGTTTCAGGATGTTGATCTCATTTTTGGGCTTGTGTTATGTTTTTCG
ACATGGATTTCTGGTTACTGTTGTCTAAAAAATCATTCTCTGTTGATTTCAGTCATCCTC
CTAAAGCGGGGTCTCATGAGCTTCTTCGTGAGGGGGTAATTAGAGAATCGATGTACACCA
GCTAGTTAGCTGAGATTTGGAGATGGGAGTTCCATCCGCGTCAAATTGCTGTCCTACGGC
ATGCGGGGAACACATGAGTTTTGTTACTCCTAATAATCAGATGTGTTTGTTCCAGTCACT
TGATGTGTGTTTCACGTCGGATCGGCAGAGGATTTTTGTGTTAATTTCTCCTCTTCTTCT
TTCTAGCATCAAATAATACACTACAGATCCGCTCATAAATTATGACTATGCTTTAATCTA
ACACGTTGTACAAGTAATGAACTAAAATGACAATTTGTATGAAATTTGAAGGTGGAATTT
TTTTTTTTTTTTGATACTC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL8498Contig1 1084 2 2 U
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GTCCTTCCTCTGCTCCCGCTCGAGCTCAATATCGAAGTTGGAGTTCAATCTTGCCTTTCA
ATCGGAGGAGATTCAACTCCCCTAAAACTAAAACTATGACTATGGCCGATTTAGTCAAAA
CCCACGCTTGGAGAGACGGCGACGGGGAAGAACGGTTTCAGGCGTTGGAGCAAGAGGCTT
TTATGAATAATCCCTCCAACGATTTGGTCTCAGGGATCAACGCCGTCGCTAATCGTCTGA
GTAAATGGGTTGTCGCTGCTCTGTTTGGATCGGTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAG
CCTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAATTCCGCACTCTCCGTAGCTCTCAAGCGCA
TCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAGCACTTCGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTC
ATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTTACCCTCTTCTCTCCCATTGAGTGGCTTG
GAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCACCCTCATCCTCGCTTTGGCTTCTTACTTCG
TAAGTTTTCATATCTAGCATTAACCATATAAACGAAAAATCATTCCCTTACATAATAACT
GGTCATGATTTTTTATTTTATTTTTATGCAGACATGGTTAAGGGTTTCCCAGAAGCTTCA
CACGCCCAGTCAAGTGGTGGTAGGTGCAATCGTGGGCTCTCTTTACTCCACCTTGTGGTA
CATTACCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTTTGCCTCATCATTCTCCGTACAAATAGC
TGTCTTTACAGCTGCTGCTGCATCTGCTCTAGGTTTTGCAGTTTATGTGCTACTTAACTG
GTTCAAAGATGACAGATAGACAAAGAAAATATAGTTAGAGGGTTGGGTTGTAAAACTATT
CCTTTTGTTTCCCATTTCACTCGATACTGTTTGAACTGTATAGCAATCAATATTACCACA
CTTGTGTTCTGTTTCTTGACACAAAACAGTAACTTTTTAAGTATAGTATACAGTGTTTAA
GATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4B586TF U 1
AF RR4B586JQ C 288
BS 1 820 RR4B586TF
BS 821 1084 RR4B586JQ

RD RR4B586TF 820 0 0
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CCCACGCTTGGAGAGACGGCGACGGGGAAGAACGGTTTCAGGCGTTGGAGCAAGAGGCTT
TTATGAATAATCCCTCCAACGATTTGGTCTCAGGGATCAACGCCGTCGCTAATCGTCTGA
GTAAATGGGTTGTCGCTGCTCTGTTTGGATCGGTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAG
CCTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAATTCCGCACTCTCCGTAGCTCTCAAGCGCA
TCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAGCACTTCGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTC
ATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTTACCCTCTTCTCTCCCATTGAGTGGCTTG
GAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCACCCTCATCCTCGCTTTGGCTTCTTACTTCG
TAAGTTTTCATATCTAGCATTAACCATATAAACGAAAAATCATTCCCTTACATAATAACT
GGTCATGATTTTTTATTTTATTTTTATGCAGACATGGTTAAGGGTTTCCCAGAAGCTTCA
CACGCCCAGTCAAGTGGTGGTAGGTGCAATCGTGGGCTCTCTTTACTCCACCTTGTGGTA
CATTACCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTTTGCCTCA

QA 1 820 1 820
DS 

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GCTCTCAAGCGCATCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAGCACTTCGTTCTGACCCTGGC
ATGCCTTCTTCTCATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTTACCCTCTTCTCTCCC
ATTGAGTGGCTTGGAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCACCCTCATCCTCGCTTTG
GCTTCTTACTTCGTAAGTTTTCATATCTAGCATTAACCATATAAACGAAAAATCATTCCC
TTACATAATAACTGGTCATGATTTTTTATTTTATTTTTATGCAGACATGGTTAAGGGTTT
CCCAGAAGCTTCACACGCCCAGTCAAGTGGTGGTAGGTGCAATCGTGGGCTCTCTTTACT
CCACCTTGTGGTACATTACCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTTTGCCTCATCATTCT
CCGTACAAATAGCTGTCTTTACAGCTGCTGCTGCATCTGCTCTAGGTTTTGCAGTTTATG
TGCTACTTAACTGGTTCAAAGATGACAGATAGACAAAGAAAATATAGTTAGAGGGTTGGG
TTGTAAAACTATTCCTTTTGTTTCCCATTTCACTCGATACTGTTTGAACTGTATAGCAAT
CAATATTACCACACTTGTGTTCTGTTTCTTGACACAAAACAGTAACTTTTTAAGTATAGT
ATACAGTGTTTAAGATC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL8499Contig1 542 2 3 U
GGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGA
GCCTGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACGGTGGAGAACTTTCTTGAACGTCGTC
TTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCA
TCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAAGTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGA
GACATGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTC
CAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACG
CTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCCCCTGCTTTTAGCTATGAAGC
ACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCAGACCATTGTTGTCTG
TTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RR4AL46TF U 1
AF RR4AL46JQ C 6
BS 1 399 RR4AL46TF
BS 400 400 RR4AL46JQ
BS 401 542 RR4AL46TF

RD RR4AL46TF 542 0 0
GGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGA
GCCTGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACGGTGGAGAACTTTCTTGAACGTCGTC
TTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCA
TCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAAGTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGA
GACATGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTC
CAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACG
CTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGC
ACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCAGACCATTGTTGTCTG
TTATCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTT
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4AL46JQ 537 0 0
TTCGAAGGCGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCTG
AACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACGGTGGAGAACTTTCTTGAACGTCGTCTTCAG
ACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGG
CAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAAGTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACAT
GACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGA
AGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGAC
GGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCCCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCT
GCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCCTTCTTTTCAGACCATTGTTGTCTGTTATC
GATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTTCC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL8500Contig1 1330 2 2 U
GGAAGGTGGAAGCAGATCATTTGAGCTAGACACAAACACTGACTCTAAGAGAAAAGGAGG
AGAAGTGAGTTCAAAGAGTGAGTCCAAACCTGAATCATCTGCTCCTGAAAACAAGAATGA
GTTAGAAAAATCACTTCCTTCAAACAAGAATGATAATCCATCACCTCCAAAAGCGCCTGA
GGTTGTTCCTGACAATGAGTTCGAGAAGCGTATAAGACCGGAGGTTATACCAGCAAACGA
GATCGGTGTGACATTTGCAGATATTGGTTCTTTAGACGAAACAAAAGATTCACTTCAAGA
GCTTGTAATGCTTCCACTTAGAAGACCTGATCTCTTCAAAGGCGGTCTTCTCAAGCCATG
TAGAGGGATCCTTCTGTTCGGACCTCCTGGTACTGGCAAAACAATGCTTGCTAAAGCCAT
TGCAAATTAAGCTGGAGCTAGTTTCATCAATGTCTCAATGTCTACAATCACTTCTAAATG
GTTTGGGGAAGATGAGAAGAACGTGAGGGCTCTGTTTACTTTGGCAGCTAAAGTATCTCC
AACGATCATATTTGTGGATGAAGTGGATAGTATGTTGGGGCAAAGGACAAGAGTTGGAGA
GCATGAAGCTATGAGGAAGATCAAGAATGAGTTTATGACTCATTGGGGATGGGCTTATGA
CAAAACCTGGTGAAAGGATTTTGGTTCTTGCAGCCACAAACAGACCCTTTGATCTTGATG
AAGCTATCATTAGGAGGTTTGAGAGGAGAATAATGGTGGGACTTCCTTCAATTGAGAGCA
GAGAGAAGATCTTGAGAACTTTGTTGTCAAAAGAGAAGACAGATGATCTTGATTTTCATG
AGCTTGGACAGATGACAGAAGGCTACAGTGGAAGTGATCTCAAGAACTTATGCATAACAG
CTGCTTACAGACCTGTTAGAGAGCTAATTCAACAGGAGAGATTGAAAGATCAGGAGAGGA
AGAAGAGAGAAGAAGCAGGAAAAGGCACAGAAGAAACAAAAGATGAAGAAGAAGGTGTAG
AAGAGAGGGAGATTATATTGAGACCTTTGAACATGGAAGACATGAGAAAAGCTAAAAACC
AGGTGGGGGCAATTTTTGCATCAGAAGGATCTGGAATGAATGAGCTTAAACAGTGGAATG
ATTTGTACGGAGAAGGAGGCTCGAGGAAAAAGGAACAGCTCACTTACTTCCTCTGAAAAT
TGCAAAACCCCTATAAAGTTGTGAATGTATGTTTCTTGTTGCACAAGTTATCAAACTGAT
CGGTTTGGTGTTTGGCAAATCAAAAACAGAGAATCTTCTTTTACTTGTTAGGCTATTCCA
TTTTCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F248TF U 1
AF RR4F248JQ C 525
BS 1 678 RR4F248TF
BS 679 1330 RR4F248JQ

RD RR4F248TF 678 0 0
GGAAGGTGGAAGCAGATCATTTGAGCTAGACACAAACACTGACTCTAAGAGAAAAGGAGG
AGAAGTGAGTTCAAAGAGTGAGTCCAAACCTGAATCATCTGCTCCTGAAAACAAGAATGA
GTTAGAAAAATCACTTCCTTCAAACAAGAATGATAATCCATCACCTCCAAAAGCGCCTGA
GGTTGTTCCTGACAATGAGTTCGAGAAGCGTATAAGACCGGAGGTTATACCAGCAAACGA
GATCGGTGTGACATTTGCAGATATTGGTTCTTTAGACGAAACAAAAGATTCACTTCAAGA
GCTTGTAATGCTTCCACTTAGAAGACCTGATCTCTTCAAAGGCGGTCTTCTCAAGCCATG
TAGAGGGATCCTTCTGTTCGGACCTCCTGGTACTGGCAAAACAATGCTTGCTAAAGCCAT
TGCAAATTAAGCTGGAGCTAGTTTCATCAATGTCTCAATGTCTACAATCACTTCTAAATG
GTTTGGGGAAGATGAGAAGAACGTGAGGGCTCTGTTTACTTTGGCAGCTAAAGTATCTCC
AACGATCATATTTGTGGATGAAGTGGATAGTATGTTGGGGCAAAGGACAAGAGTTGGAGA
GCATGAAGCTATGAGGAAGATCAAGAATGAGTTTATGACTCATTGGGGATGGGCTTATGA
CAAAACCTGGTGAAAGGA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4F248JQ 806 0 0
CAGCTAAAGTATCTCCAACGATCATATTTGTGGATGAAGTGGATAGTATGTTGGGGCAAA
GGACAAGAGTTGGAGAGCATGAAGCTATGAGGAAGATCAAGAATGAGTTTATGACTCATT
GGG*ATGGGCTTATGACAAAACCTGGTGAAAGGATTTTGGTTCTTGCAGCCACAAACAGA
CCCTTTGATCTTGATGAAGCTATCATTAGGAGGTTTGAGAGGAGAATAATGGTGGGACTT
CCTTCAATTGAGAGCAGAGAGAAGATCTTGAGAACTTTGTTGTCAAAAGAGAAGACAGAT
GATCTTGATTTTCATGAGCTTGGACAGATGACAGAAGGCTACAGTGGAAGTGATCTCAAG
AACTTATGCATAACAGCTGCTTACAGACCTGTTAGAGAGCTAATTCAACAGGAGAGATTG
AAAGATCAGGAGAGGAAGAAGAGAGAAGAAGCAGGAAAAGGCACAGAAGAAACAAAAGAT
GAAGAAGAAGGTGTAGAAGAGAGGGAGATTATATTGAGACCTTTGAACATGGAAGACATG
AGAAAAGCTAAAAACCAGGTGGGGGCAATTTTTGCATCAGAAGGATCTGGAATGAATGAG
CTTAAACAGTGGAATGATTTGTACGGAGAAGGAGGCTCGAGGAAAAAGGAACAGCTCACT
TACTTCCTCTGAAAATTGCAAAACCCCTATAAAGTTGTGAATGTATGTTTCTTGTTGCAC
AAGTTATCAAACTGATCGGTTTGGTGTTTGGCAAATCAAAAACAGAGAATCTTCTTTTAC
TTGTTAGGCTATTCCATTTTCAGACC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL8501Contig1 807 2 3 U
GAGAACTAAGCAGAAAAGAAGGTTGGAGGTCGGCTTCTAGAAGGTGGACATCCGGAGATA
GCTCAACGGCCTTCGCCGACGACACAAGCGGTGGTGCTGGAGGTTACTCTTCAATGGAGG
GTCTATATGGGGTTTACTCCGGTGAAGATCCGGCGGCAAGAAGGAAAAGAGTGATGGTTG
TGGTGGATGAGACTTCGAGGTCTAAACATGCTATGATGTGGGCTTTTGACGCACTTTGAC
TAACAAAGGAGACTTTGATGACTCTTCTTCATGTTTGTGTCTCCCTCATGATGAAGCTTC
GCCCTTCTTTGGTTCAGTCACTTTGGCTCTCTTTGCAAAGCTTTGTAAACCCCGAGGTGG
ATGTGGAGGCGTTGGTGATTCAAGGACCAAAGTTAGCAACAGTACTCAGCCAAGTGAAGA
AACTTGAAGTCACTGTTCTTGTTTTGGGGTCAGAAGAAATCTGCACCATTCATCTCCTGC
TTATGTGGACCCAGTAGATCAGAGGAACTCGTGAATCGATGTATCAACGGTGCAGATTGT
TTGACGATTGGTGTGAGGAAACAGAGCAACGGTGTTAGTGGTTACTTGATTAACACACGA
TGGCAGAAGAACTTCTGGCTTTTGGCTTAATCGCAACTTCTAATATTAGCAGCCGTAGAC
CGGTTCCATAAGTTGGTGGTTAATTTGTAGTCTAATAAACTTTGCATCTCTCTCTCTCGT
CCCATGTTTAACATAACTTTGTCTTATGTCTTGTAAGGAATTAAAGTTAAATATTTGTAT
CTCAGTTCCCACATGAATGATTCCACC


BQ
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AF RR4B452TF U 145
AF RR4B452JQ C 1
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QA 1 578 1 578
DS 

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TTATGTGGACCCAGTAGATCAGAGGAACTCGTGAATCGATGTATCAACGGTGCAGATTGT
TTGACGATTGGTGTGAGGAAACAGAGCAACGGTGTTAGTGGTTACTTGATTAACACACGA
TGGCAGAAGAACTTCTGGCTTTTGGCTTAATCGCAACTTCTAATATTAGCAGCCGTAGAC
CGGTTCCATAAGTTGGTGGTTAATTTGTAGTCTAATAAACTTTGCATCTCTCTCTCTCGT
CCCATGTTTAACATAACTTTGTCTTATGTCTTGTAAGGAATTAAAGTTAAATATTTGTAT
CTCAGTTCCCACATGAATGATTCCACC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

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TCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTT
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TGATGTTGTGAACTCTAGGAATTGACAACACTATTGTTCACATTCGTCTTTTTAGTTTGT
AATTAAAGAGAATACAAATATCCTTGTTATTTTAATATTACTAAAATTGTGTC


BQ
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AF RR4G181JQ C 1
AF RR4G181TF U 1
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TCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTT
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QA 1 533 1 533
DS 

RD RR4G181TF 533 0 0
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CTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
AAGGAGCTTAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATATCATTATTTCATCC
TCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTT
TAATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATATTTTCATATTTCATAGACAGAGAT
TGATGTTGTGAACTCTAGGAATTGACAACACTATTGTTCACATTCGTCTTTTTAGTTTGT
AATTAAAGAGAATACAAATATCCTTGTTATTTTAATATTACTAAAATTGTGTC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL8503Contig1 707 2 2 U
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GGGGCTTATATGAATGGTCGTGCTATGGAGTTGACGAGTATTCTCGGGCCTTTCTTCCAC
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AACTTTATGAACATTTTGTACAGTGGGCTGCATGATGTACTGATGATTTTACTTAAAAGT
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AGTGCGGTCATGCTCCGGCTCTGTGAACCTTTTTTGGACCCGCATTT


BQ
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AF RR4EN24TF U 1
AF RR4EN24JQ C 13
BS 1 706 RR4EN24TF
BS 707 707 RR4EN24JQ

RD RR4EN24TF 706 0 0
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GACTCGGATTTTGATAACTTGGACGTGATTCTCAAGGAGTTGTACGAGGACTTGAGGTCT
ACGGTTATTAACGTCTCTGTGCTTGGTGACTTCCAGCCGCCGTTGAGGGCGCTTAAGTAT
CTCGTTAGCTTACCTGTGGGAGCTAAGTCTCTCGTTAGTCATGAGTGGTGGGTTCCACGT
GGGGCTTATATGAATGGTCGTGCTATGGAGTTGACGAGTATTCTCGGGCCTTTCTTCCAC
ATCGGCGCACTGCCGGATAACACTCTCTTCAAGAGTCAGCCTGATGTTGGGCAGCAGTGT
TTCTCTCAAGCATCGGAACGTCGTCCTGCAGATTTATTATCTTCCTTCTCTACAATCAAA
AACTTTATGAACATTTTGTACAGTGGGCTGCATGATGTACTGATGATTTTACTTAAAAGT
ACCGATACACGTGAGTGTGTTCTGCAGTTTCTTGCTGAGGTGATCAATGCAAATGCGTCG
AGAGGTCATATGCAGGTTGATCCCGTCTCTTGTGCTAGCTCAGGCATGTTTTGTAATCTC
AGTGCGGTCATGCTCCGGCTCTGTGAACCTTTTTTGGACCCGCATT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4EN24JQ 695 0 0
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GATAACTTGGACGTGATTCTCAAGGAGTTGTACGAGGACTTGAGGTCTACGGTTATTAAC
GTCTCTGTGCTTGGTGACTTCCAGCCGCCGTTGAGGGCGCTTAAGTATCTCGTTAGCTTA
CCTGTGGGAGCTAAGTCTCTCGTTAGTCATGAGTGGTGGGTTCCACGTGGGGCTTATATG
AATGGTCGTGCTATGGAGTTGACGAGTATTCTCGGGCCTTTCTTCCACATCGGCGCACTG
CCGGATAACACTCTCTTCAAGAGTCAGCCTGATGTTGGGCAGCAGTGTTTCTCTCAAGCA
TCGGAACGTCGTCCTGCAGATTTATTATCTTCCTTCTCTACAATCAAAAACTTTATGAAC
ATTTTGTACAGTGGGCTGCATGATGTACTGATGATTTTACTTAAAAGTACCGATACACGT
GAGTGTGTTCTGCAGTTTCTTGCTGAGGTGATCAATGCAAATGCGTCGAGAGGTCATATG
CAGGTTGATCCCGTCTCTTGTGCTAGCTCAGGCATGTTTTGTAATCTCAGTGCGGTCATG
CTCCGGCTCTGTGAACCTTTTTTGGACCCGCATTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8505Contig1 980 2 8 U
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TAACAAACGCTATAAGAGCTTTCTCTGGGTGAAGGAGAGAGAGATAGATCTCTTTTAACA
CCCTTCCCGCGTCTCGATTAAACGTGTCTAAAAGGCTCACACTTTAAGAGTTTTTGAGAA
AGATAGAAAAATGGCAGATGGGATATCGAGCTTCTGGGGTCCAGTGACTTCCAGCATGCT
CTACCATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCATTCTCCACAT
TTCCAACATGATCCTACATGTACATCCTTTACTCGCCGGACTGGCATTACAGAAGCACCA
TGCCCACTTTTCTCTTCCTCTACGGTGCTGCTTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCCTCAGGT
TTGGGACCGGTTTCAAGGTCCACTACGTGGTCCTCTGTCTTCTCTGCATCCCTCGGATGT
ACAAGTACTGCATTCACACGGCGGACACCGCGGCTAAAAGGATTGCCAAGTGGTATGTCG
CCACGATTCTTGTGGGGAGTGTTTGCTGGTTCTGCGACCGTGTTTTCTGCGAGAGGATAT
CTCAGTGGCCTGTGAACCCTCAGGGGCATGCTCTGTGGCATGTGTTCATGAGTTTCAACT
CCTACTGTGCAAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAGCGTGGATGGAATCCGA
AGGTTAAATACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTACGTCAAGATCGAGAAGCCAAAAGCAGAAT
GAGAAGCAGAATAGGGGAGAAAAAGAGCCCAGAAGATCATAAATATAGTTTTTTGTTCAT
TGTTTTGTCAGAAATTTCAATGTTGGTTTTTTTTTTGGAAGTGAAAGTACTCTCTAGATA
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AATTGATTTTTAACTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GZ29TF U 1
AF RR4GZ29JQ C 214
BS 1 625 RR4GZ29TF
BS 626 626 RR4GZ29JQ
BS 627 722 RR4GZ29TF
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BS 758 770 RR4GZ29TF
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RD RR4GZ29TF 770 0 0
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AGATAGAAAAATGGCAGATGGGATATCGAGCTTCTGGGGTCCAGTGACTTCCAGCATGCT
CTACCATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCATTCTCCACAT
TTCCAACATGATCCTACATGTACATCCTTTACTCGCCGGACTGGCATTACAGAAGCACCA
TGCCCACTTTTCTCTTCCTCTACGGTGCTGCTTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCCTCAGGT
TTGGGACCGGTTTCAAGGTCCACTACGTGGTCCTCTGTCTTCTCTGCATCCCTCGGATGT
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AG*TTAAATACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTACGTCA*GATCGAGAAGCCA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR4GZ29JQ 767 0 0
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TCTGTTTTTTCTGCATCCCTCGGATGTACAAGTACTGCATTCACACGGCGGACACCGCGG
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GCGACCGTGTTTTTTGCGAGAGGATATCTCAGTGGCCTGTGAACCCTCAGGGGCATGCTC
TGTGGCATGTGTTCATGAGTTTCAACTCCTACTGTGCAAACACGTTCTTGATGTTCTGTC
GAGCTCAGCAGCGTGGATGGAATCCGAAGGTTAAATACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTACG
TCAAGATCGAGAAGCCAAAAGCAGAATGAGAAGCAGAATAGGGGAGAAAAAGAGCCCAGA
AGATCATAAATATAGTTTTTTGTTCATTGTTTTGTCAGAAATTTCAATGTTGGTTTTTTT
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TTTCTTGGGGATGATGATCTTATGAAGAATTGATTTTTAACTTGCCG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL8506Contig1 795 2 2 U
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CTTTCGCCTTTCAAATCTCCGTCGTGTTTCTCCGCTGTCTCACTTCCGTCGTCTCCACTC
CTCTCTTCATGTTCCTTCTCGGAAACTCCATCGTCGTCGCTCTTCTCACCACCAAATCCG
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CGTTTATGCGGACCGGAGAAAACCACGTCATTTCTTCCGACGTTGGAGATCTAACGGAAG
ATGATCTGACGAACGAAGAGTTTCAGAAAACGATCGAAGCATTCATCGCTAAACAGTTGA
TATTCCGTCGCCGGGAATCACTCGCCGTCGTTATCCATAAGGACCATAACCAACAAACAA
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GGATTAAATACGTATAGTTATTATAAGAATGTGCGAATCAAAGATTTGTCGAAAGATTCG
GACGCATTTTGAACTCGATTTACATGAACAGTGTGTATGTTTTCTCGATATTATTTTGTC
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CTTGAAGTAGAAACT


BQ
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AF RR4DB13TF U 1
AF RR4DB13JQ C 103
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CTTTCGCCTTTCAAATCTCCGTCGTGTTTCTCCGCTGTCTCACTTCCGTCGTCTCCACTC
CTCTCTTCATGTTCCTTCTCGGAAACTCCATCGTCGTCGCTCTTCTCACCACCAAATCCG
CCGTCTTCTCCGCCGCCGCTAGTACCATCGACGGCGGAACAGAGACTGATATCTACGACG
CGTTTATGCGGACCGGAGAAAACCACGTCATTTCTTCCGACGTTGGAGATCTAACGGAAG
ATGATCTGACGAACGAAGAGTTTCAGAAAACGATCGAAGCATTCATCGCTAAACAGTTGA
TATTCCGTCGCCGGGAATCACTCGCCGTCGTTATCCATAAGGACCATAACCAACAAACAA
ACTTTTGTTAGGAAGAACACCAAAGAGATCGGTTCCATCTCGTGTGTTCCTTTCGTTGTT
GGATTAAATACGTATAGTTATTATAAGAATGTGCGAATCAAAGATTTGTCGAAAGATTCG
GACGCATTTTGAACTCGATTTACATGAACAGTGTGTATGTTTTCTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR4DB13JQ 693 0 0
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GGATATTCACTTCCCTTCCTTTCGCCTTTCAAATCTCCGTCGTGTTTCTCCGCTGTCTCA
CTTCCGTCGTCTCCACTCCTCTCTTCATGTTCCTTCTCGGAAACTCCATCGTCGTCGCTC
TTCTCACCACCAAATCCGCCGTCTTCTCCGCCGCCGCTAGTACCATCGACGGCGGAACAG
AGACTGATATTTACGACGCGTTTATGCGGACCGGAGAAAACCACGTCATTTCTTCCGACG
TTGGAGATCTAACGGAAGATGATCTGACGAACGAAGAGTTTCAGAAAACGATCGAAGCAT
TCATCGCTAAACAGTTGATATTCCGTCGCCGGGAATCACTCGCCGTCGTTATCCATAAGG
ACCATAACCAACAAACAAACTTTTGTTAGGAAGAACACCAAAGAGATCGGTTCCATCTCG
TGTGTTCCTTTCGTTGTTGGATTAAATACGTATAGTTATTATAAGAATGTGCGAATCAAA
GATTTGTCGAAAGATTCGGACGCATTTTGAACTCGATTTACATGAACAGTGTGTATGTTT
TCTCGATATTATTTTGTCCTTTCTTTTCTTCTGTTGGTTCAGCCAAGTGTCACTTCCCTG
AAGTGATAATAATACAAACTTGAAGTAGAAACT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8507Contig1 541 2 2 U
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ATAAATTAAGAGACTCGATCACACCCACACACAGACAAATAATGATAAAAAAGAAGTATA
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TCTTAAGCAGATTTGCTTAGTTGAGCAACTTGCTGCATTTATCTTTAACCCACTTGAAGC
TTTTTCTGAAAGAGCCTTTAAGCTTACCTTCAACTGTATAAGCTCTGTAACTCACAACTC
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TCTTCTGATTCGGGTTATCTTCGGGTATTCGGGTCGGGTGATCGGTGTAGGAAGTGCTGT
AAGACCTGAGATCTTGCATACCATTACCACCGAGTGAATCTGGACCGTCGTATCTCCGGT
CTGACGTTCTTCCGTCACCGTACGATCTGGATCTGAAGTCTTCCATATTGGTCGTATATC
C


BQ
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20 

AF RR4C909TF C 1
AF RR4C909JQ U 10
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TCTTCTGATTCGGGTTATCTTCGGGTATTCGGGTCGGGTGATCGGTGTAGGAAGTGCTGT
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CTGACGTTCTTCCGTCACCGTACGATCTGGATCTGAAGTCTTCCATATTGGTCGTATATC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4C909JQ 532 0 0
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GATTTGCTTAGTTGAGCAACTTGCTGCATTTATCTTTAACCCACTTGAAGCTTTTTCTGA
AAGAGCCTTTAAGCTTACCTTCAACTGTATAAGCTCTGTAACTCACAACTCTCTTCTTCC
TCTTTATATCTGGATCCACGAATCCCCATGAAGAAGATGAAGATTTTCCTTTCTTCTGAT
TCGGGTTATCTTCGGGTATTCGGGTCGGGTGATCGGTGTAGGAAGTGCTGTAAGACCTGA
GATCTTGCATACCATTACCACCGAGTGAATCTGGACCGTCGTATCTCCGGTCTGACGTTC
TTCCGTCACCGTACGATCTGGATCTGAAGTCTTCCATATTGGTCGTATATCC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGTTTTATATACTCATATGTATGATGATGTGAAAACACTTGACAATAAACG


BQ
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AF RR4F434JQ C 1
AF RR4F434TF U 1
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RD RR4F434JQ 531 0 0
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QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4F434TF 531 0 0
GGGCATTGTGTGCAAGCTTTCAGTTTTGTTTCTTCATCTCCCCAAACTCTTCTCAAAGTT
GTAAACCTTTATCGAAGCAGATTTAAGAAAAAAAAGAATCAACCTCGCTAAGAATGAAGA
TGAAGTTGGCTGTCATTCAATTCTTCATTATCTCTCTTCTCCTCTCATCTTCTTTGTTTA
TGCTTTCAGACGCAGATTCGTCACAATGCAATGGAAAATGCAATGCGAGATGCTCAAAGG
CCGGAAGACAAGATCGGTGTCTCGAGTATTGCAATATATGTTGCGAGAAGTGTGATGATC
ACTGTGTTCCCTCGGGCACTTATGGAAACAAAGATGAGTGTCCTTGTTACCGCGATATGA
GGAACTCCAAAGGCCAACCCAAATGTCCTTGAACATGTCTTGAAGATCATTCTCTCATAG
ACACCATATCTTTATATACCATATAAATATTTGCAATTGTTGTTAACACCTGAAATAATG
AGTTTTATATACTCATATGTATGATGATGTGAAAACACTTGACAATAAACG

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL8510Contig1 695 2 1 U
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TTTCGTATGGCTACGGTAGAAGAAATGAATTCAGTAGTGGCGGAAATGATGAGTATATAT
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TATGCAGGTTAAGGACTGTAGCAGAGAGACGCACATAATACAACTAAGCTGGAAACGGAC
TTCACAACTGTGGAAACTGATGGGTTTTCCATGACTTTTGATTTCCCAAGCTTTGTTACA
AGTTTTTTAATTTCAATAATTTATACCCGTTAGCACAAGTAGCCTGCTTTTTTGTGTGCA
CACAAGTACCCTGCTTAGCTTAGCTTTTAAAAGCTTAACATAGAAGTCTCATCAGATATA
CCTTATCTATTTTTATAACTACTAAAATGTAACAC


BQ
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AF RR4GX89JQ C 1
AF RR4GX89TF U 1
BS 1 695 RR4GX89TF

RD RR4GX89JQ 695 0 0
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CACTGCACAAGAAGCAGTCTTTCTCAAACAGTGTCAATGATTCTTATCAATAGTAGCAGC
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TTCACAACTGTGGAAACTGATGGGTTTTCCATGACTTTTGATTTCCCAAGCTTTGTTACA
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CCTTATCTATTTTTATAACTACTAAAATGTAACAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GX89TF 695 0 0
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TCCCTGGATAGAGAAATCTTTGTGTCGTTTCAACTCCGGTTTTTCTCCCCGGAACCGTTA
CGCGATGAATTGATTGTCTGTCATTAACGATCTTCTTAAATCCTTCAACGTACTGCAACC
ATATTTCACAGTCAGTGCATCTCCTCTCTCAAAGGCGATACTGGTGCATCGACATCTATA
AAAAGGTTCTATCAGGCTTACTTTTGAGTGAATTGTTTTCCTCTGAAGTATGGAACAAGT
TTTCGTATGGCTACGGTAGAAGAAATGAATTCAGTAGTGGCGGAAATGATGAGTATATAT
CACTGCACAAGAAGCAGTCTTTCTCAAACAGTGTCAATGATTCTTATCAATAGTAGCAGC
TATGCAGGTTAAGGACTGTAGCAGAGAGACGCACATAATACAACTAAGCTGGAAACGGAC
TTCACAACTGTGGAAACTGATGGGTTTTCCATGACTTTTGATTTCCCAAGCTTTGTTACA
AGTTTTTTAATTTCAATAATTTATACCCGTTAGCACAAGTAGCCTGCTTTTTTGTGTGCA
CACAAGTACCCTGCTTAGCTTAGCTTTTAAAAGCTTAACATAGAAGTCTCATCAGATATA
CCTTATCTATTTTTATAACTACTAAAATGTAACAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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ATTATTTATAAGTGTAGCTAGCTAGGGTTCTTATATCGGACCCTCTTCTGTTTTAACATG
CAACTTAAGCTATAATTATAATAAATTACATTTCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4E334TF U 1
AF RR4E628TF U 43
BS 1 49 RR4E334TF
BS 50 50 RR4E628TF
BS 51 578 RR4E334TF

RD RR4E334TF 578 0 0
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TATATATGCAAAAAAAAAAATATTAAGTTAAAAAACAAGTAAAATGTCGTCTAGCAGAAG
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CAACTTAAGCTATAATTATAATAAATTACATTTCAGCT

QA 1 578 1 578
DS 

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TTATATATCATTTTACAATCTCCTTGTGAGTTTGATCCATCAGGGTTTCTATTTTATTAT
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QA 1 535 1 535
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A724JQ C 1
AF RR4A724TF U 1
BS 1 695 RR4A724TF

RD RR4A724JQ 695 0 0
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CTTTCTTGGTGGCTTTACCTTTTTGCCTACATTATCTATCACCAACTCTATAGTTAATGT
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QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4A724TF 695 0 0
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CATGTATAAAGGTGATAGAGGGTTCTGTAGCGTGGAGTGTAGATCGAAGCAGATGGTCAT
GGACGAAGAAGAAAGCTTTAGGAGAGAGAACTGTTCGTTCATGGCTATTAAAGCAACGAA
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TGATCCGAGAAACTGAGCAGGCGGTTTCGTGAAAGCATTTGCAAACTGAAAAGTGTGATT
TGACTTTTCCACCCTTGGACTTTTTTGTCGTTTTGTTTTATGAGATGTAAACCAGAAGGG
TGTTTTCGGTATTTCTAGTTTTTGCATATCTATGGTAGCCCCTAGTTTTTATTTGCTTCT
CTTTCTTGGTGGCTTTACCTTTTTGCCTACATTATCTATCACCAACTCTATAGTTAATGT
TTGATGGAACTTACTTAGAGTAGAGAGAGTTTACC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL8515Contig1 956 2 4 U
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TTTCTTCACCGTACGATCGTTGTCTATCCAATGAGAGAAACATCAAAGCCAATGGCTACA
AGCTCTTCTTCCTCCTCCATCTCCTCAATTCCTCCTTCTTCCCCATCATCTTCTCCAGCC
ACCACGACCACGCCGCCACGTCAGAACAATCTCCTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGAAG
AAAAACAAATCAAACGTGTTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCTTC
ACAACATCATCCCTAGCATGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTTAGGTGTAGCAGAA
CCTCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGCACGTTGTTCGGATACCGTAAAGGCCGAGTAA
GTCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAATGTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGC
AAACCACAACGTTTCAAAAAGAACTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCG
AGAAACAACCTAACAATAATAACAAGACAGAAAAGAGCACAAATATCTTAGATGAACCGT
TGTGGACAATGTTTTGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAACG
ATGAAGACTTAAGCGTGATGGAACTGTTACGACCGGTGTCTATGGGCGCAGGAGTTTTGC
CTGGAAACTCGGAGTCGGAAGGACCAGACGGTGAAATGGCGTATATGAGAGCTTACTTTG
AGAGAGTTGTTGGGTCTAAAGATTCAGAGACTTTTTATATGTTGAGTCCAGAAGGTAATA
ATGGACCTGAGCTTAGTTTTTTCTTTGTAAGAGTTTGATTAATTTTGTTAATTTAACGTG
CATGTAAAGGCCGGAGACGGTGGTTGACGTTATATATATAGTATTATTTTAGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GX66TF U 1
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ATGAAGACTTAAGCGTGATGGA*CTGTTACGACCGGTGTCT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4GX66JQ 797 0 0
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TTAGAATCGCTCTCGAGACCGAGAAACAACCTAACAATAATAACAAGACAGAAAAGAGCA
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TGTTGAGTCCAGAAGGTAATAATGGACCTGAGCTTAGTTTTTTCTTTGTAAGAGTTTGAT
TAATTTTGTTAATTTAACGTGCATGTAAAGGCCGGAGACGGTGGTTGACGTTATATATAT
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QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

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GGTTGTAAGCCTCTCTCTAGACCTTACTTCATAAGTTATGCCAATTATGTTATTTTTTTC
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BQ
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AF RR4EB54JQ C 1
AF RR4EB54TF U 1
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GTACTGCATAGTCTGCAATCAGCTGCCTTTTGATTGCTTTTTGGAAGAAAATTTTTCAAC
TTTTGATTATGCAATCTTCTCTTCTTGAGACACCTTCTCCGCATGTGAGCTTCCTCTTCT
GTAGGATGTGTCTCGGTGAATAAGAGAAAAACAATAAGATCGGTAAGAAGCATGTTTCTC
GGTTGTAAGCCTCTCTCTAGACCTTACTTCATAAGTTATGCCAATTATGTTATTTTTTTC
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QA 1 359 1 359
DS 

RD RR4EB54TF 359 0 0
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GTACTGCATAGTCTGCAATCAGCTGCCTTTTGATTGCTTTTTGGAAGAAAATTTTTCAAC
TTTTGATTATGCAATCTTCTCTTCTTGAGACACCTTCTCCGCATGTGAGCTTCCTCTTCT
GTAGGATGTGTCTCGGTGAATAAGAGAAAAACAATAAGATCGGTAAGAAGCATGTTTCTC
GGTTGTAAGCCTCTCTCTAGACCTTACTTCATAAGTTATGCCAATTATGTTATTTTTTTC
TCTCTTCAGTAATATTGTGCTAATATGTTAAGAATTAAATCTACTAAGACAATGTTTCC

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL8517Contig1 849 2 2 U
GGGCCGAACATTGTTCGTTGGGCTCTAACTAAATTCAGTTAAATTTACAAACCAGATCCA
TTGTTTATTAGGGTTTCGTTCACTCACGCATACAGAGGTTTTGGGTCGAGTTCAAGCGAC
ATGCCTCTTTGGATCTCCAGTCCTCCTAGCAAAGCCTATGTAACGTCTTCCGTTCTCGGC
TATCATCTTTTAAATCCAAGCATCAAGGTCGTTCTCACCACTCCTCCTACTCTCTCGCAT
TTAAACGTCCTCATCATCCTTAAGATTACCGTTCGGAGCTCCGTTTATAAATTGATTCCT
TGCAAGCTATGAACATCCTCACTACTACGAAATCGAAAAAGTCAAACTCTGACAAGTATC
AACTCCTACCTTCCGAGGTTCTGAGAGGCAAAGAAAGTGAAAAAACACGTGGGCGTCGAC
ATGCTCTTCATGGATGAGAAGGTTAGTCAGGGAGGTAACAATGGTTCGGGTGGTGATACG
CCTGGAGAGAATCCAATAGCATCTAAGGTCTAACGCTGTTGTTGAGGCAGCAGGTGGTGT
GACAGCAGAACTTGGAGAAACTACAAATGTCAACAATCAACCATCATCGGCGACCGTCCA
GCATCAACCAAACCGATAATTGGCTCAAATGAGAATGGAAAGAAGTAGGCACGCATGGCA
TAGCTCGACATGGAAAACTCAAAGCCTTACTTACTTTTCTAATGTTTTTTTTTTCATCTG
GTTATCAAATAGTGCTTTAGCAACTCTATTATTTTTTGTTTATTTAAAGGAGTTAGTGGT
GGATGTTTTTTTTTTTTTTTGTAACTGAGTTAGTGGTGGATGTTTTAGTTATTAAAGTAA
GATTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG86TF U 1
AF RR4AG86JQ C 238
BS 1 798 RR4AG86TF
BS 799 849 RR4AG86JQ

RD RR4AG86TF 798 0 0
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TTGTTTATTAGGGTTTCGTTCACTCACGCATACAGAGGTTTTGGGTCGAGTTCAAGCGAC
ATGCCTCTTTGGATCTCCAGTCCTCCTAGCAAAGCCTATGTAACGTCTTCCGTTCTCGGC
TATCATCTTTTAAATCCAAGCATCAAGGTCGTTCTCACCACTCCTCCTACTCTCTCGCAT
TTAAACGTCCTCATCATCCTTAAGATTACCGTTCGGAGCTCCGTTTATAAATTGATTCCT
TGCAAGCTATGAACATCCTCACTACTACGAAATCGAAAAAGTCAAACTCTGACAAGTATC
AACTCCTACCTTCCGAGGTTCTGAGAGGCAAAGAAAGTGAAAAAACACGTGGGCGTCGAC
ATGCTCTTCATGGATGAGAAGGTTAGTCAGGGAGGTAACAATGGTTCGGGTGGTGATACG
CCTGGAGAGAATCCAATAGCATCTAAGGTCTAACGCTGTTGTTGAGGCAGCAGGTGGTGT
GACAGCAGAACTTGGAGAAACTACAAATGTCAACAATCAACCATCATCGGCGACCGTCCA
GCATCAACCAAACCGATAATTGGCTCAAATGAGAATGGAAAGAAGTAGGCACGCATGGCA
TAGCTCGACATGGAAAACTCAAAGCCTTACTTACTTTTCTAATGTTTTTTTTTTCATCTG
GTTATCAAATAGTGCTTTAGCAACTCTATTATTTTTTGTTTATTTAAAGGAGTTAGTGGT
GGATGTTTTTTTTTTTTT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4AG86JQ 612 0 0
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CCTTGCAAGCTATGAACATCCTCACTACTACGAAATCGAAAAAGTCAAACTTTGACAAGT
ATCAACTCCTACCTTCCGAGGTTTTGAGAGGCAAAGAAAGTGAAAAAACACGTGGGGGTC
GACATGCTTTTCATGGATGAGAAGGTTAGTCAGGGAGGTAACAATGGTTCGGGTGGTGAT
ACGCCTGGAGAGAATCCAATAGCATTTAAGGTCTAACGCTGTTGTTGAGGCAGCAGGTGG
TGTGACAGCAGAACTTGGAGAAACTACAAATGTCAACAATCAACCATCATCGGCGACCGT
CCAGCATCAACCAAACCGATAATTGGCTCAAATGAGAATGGAAAGAAGTAGGCACGCATG
GCATAGCTCGACATGGAAAACTCAAAGCCTTACTTACTTTTTTAATGTTTTTTTTTTCAT
CTGGTTATCAAATAGTGCTTTAGCAACTTTATTATTTTTTGTTTATTTAAAGGAGTTAGT
GGTGGATGTTTTTTTTTTTTTTTGTAACTGAGTTAGTGGTGGATGTTTTAGTTATTAAAG
TAAGATTTTACC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL8518Contig1 865 2 2 U
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AAAACACAGAGAATATTTCTTATAGGCAAAGCAACATGGCTTCAGGAGGATCAAAGTCGG
CAGCTTTCATGCTTCTGCTGCTGAATCTTGGTCTCTACTTTGTCGTCACCATCATCGCTG
CCTGGGCGGTTAATCACGGCATCGAGAGAGCTCGAGAGTCTGCGTCGGTGCTGTCTCTCC
CGGCGAAGATCTTCCCGATATACTTCCCGGTGGGGAACATGGCGACTGGCTTTTTCGTGA
TATTCACGTTGATCGCTGGAGTCGTGGGAATGGCGACGTCACTCACGGGAATCATGAACG
TTCTTCAGTGGGACTCTCCGAATCTACATTCCGCCGCAGCTTCCTCTCTCATCTCCTGGT
CTCTCACTCTCCTCGCCATGGGATTGGCTTGTAAAGAAATCAACATAGGCTGGACCGAAG
CTAATCTAAGAACTCTTGAAGTGCTGATGATAATAGTGAGTGGAACTCAGTTGTTGTGCA
CTGGAGCTATTCACGTCGGAGTTGGAGAAACAGTCGACGGAGCAAGACCTCATGTCGGAA
GAGCTTGAGTTTCTTTATGGTTTGAGAGACAATTTATATATTGGTTTGGTTTTCTTTTTC
TTCTTCTTAAAAACGGTTTACACACAAACCGAAAGTTTGAGATTGTGTAATTTGTGTGTT
GTGTGTGTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTGACGGCGTGTGTGTGTTGTTTATAATGTTTTCT
CGTCTATTTGTATTCATTTATTTTTGTTTTATACCATGATTGTTGTATACGGCACTATCT
GAAACTAATGTAAAGATGACTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EP05TF U 1
AF RR4EP05JQ C 137
BS 1 668 RR4EP05TF
BS 669 865 RR4EP05JQ

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AAAACACAGAGAATATTTCTTATAGGCAAAGCAACATGGCTTCAGGAGGATCAAAGTCGG
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CCTGGGCGGTTAATCACGGCATCGAGAGAGCTCGAGAGTCTGCGTCGGTGCTGTCTCTCC
CGGCGAAGATCTTCCCGATATACTTCCCGGTGGGGAACATGGCGACTGGCTTTTTCGTGA
TATTCACGTTGATCGCTGGAGTCGTGGGAATGGCGACGTCACTCACGGGAATCATGAACG
TTCTTCAGTGGGACTCTCCGAATCTACATTCCGCCGCAGCTTCCTCTCTCATCTCCTGGT
CTCTCACTCTCCTCGCCATGGGATTGGCTTGTAAAGAAATCAACATAGGCTGGACCGAAG
CTAATCTAAGAACTCTTGAAGTGCTGATGATAATAGTGAGTGGAACTCAGTTGTTGTGCA
CTGGAGCTATTCACGTCGGAGTTGGAGAAACAGTCGACGGAGCAAGACCTCATGTCGGAA
GAGCTTGAGTTTCTTTATGGTTTGAGAGACAATTTATATATTGGTTTGGTTTTCTTTTTC
TTCTTCTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR4EP05JQ 729 0 0
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CGGCATCGAGAGAGCTCGAGAGTCTGCGTCGGTGCTGTCTCTCCCGGCGAAGATCTTCCC
GATATACTTCCCGGTGGGGAACATGGCGACTGGCTTTTTCGTGATATTCACGTTGATCGC
TGGAGTCGTGGGAATGGCGACGTCACTCACGGGAATCATGAACGTTCTTCAGTGGGACTC
TCCGAATCTACATTCCGCCGCAGCTTCCTCTCTCATCTCCTGGTCTCTCACTCTCCTCGC
CATGGGATTGGCTTGTAAAGAAATCAACATAGGCTGGACCGAAGCTAATCTAAGAACTCT
TGAAGTGCTGATGATAATAGTGAGTGGAACTCAGTTGTTGTGCACTGGAGCTATTCACGT
CGGAGTTGGAGAAACAGTCGACGGAGCAAGACCTCATGTCGGAAGAGCTTGAGTTTCTTT
ATGGTTTGAGAGACAATTTATATATTGGTTTGGTTTTCTTTTTCTTCTTCTTAAAAACGG
TTTACACACAAACCGAAAGTTTGAGATTGTGTAATTTGTGTGTTGTGTGTGTGTTGTTTT
TTTTTTTTTTTGACGGCGTGTGTGTGTTGTTTATAATGTTTTCTCGTCTATTTGTATTCA
TTTATTTTTGTTTTATACCATGATTGTTGTATACGGCACTATCTGAAACTAATGTAAAGA
TGACTGGTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL8519Contig1 222 2 1 U
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CGCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGATTTATTGGTGTGTGTTCTTTGTTGGTA
TCTATCTCTCAAATACGCTTTTCAGCTCTCAAAAGTGTGATTTGTATTATGCAGTTTCGT
TGGTTTATTTGGTTATGGTGATATAATAACTATTATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AH84TF U 1
AF RR4AH84JQ C 12
BS 1 222 RR4AH84TF

RD RR4AH84TF 222 0 0
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CGCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGATTTATTGGTGTGTGTTCTTTGTTGGTA
TCTATCTCTCAAATACGCTTTTCAGCTCTCAAAAGTGTGATTTGTATTATGCAGTTTCGT
TGGTTTATTTGGTTATGGTGATATAATAACTATTATTTTATT

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR4AH84JQ 211 0 0
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AAAAAAAAAAAAAAAACTGAGATTTATTGGTGTGTGTTCTTTGTTGGTATCTATCTCTCA
AATACGCTTTTCAGCTCTCAAAAGTGTGATTTGTATTATGCAGTTTCGTTGGTTTATTTG
GTTATGGTGATATAATAACTATTATTTTATT

QA 1 211 1 211
DS 



AS 1 2

CO CL8520Contig1 998 2 4 U
GGGACGGCCCAAGAAGTTTATCCGGGATTTCCCGAAAAAGCTGAAAGATCTTCTCGATTC
TGGAATACTTGAGGGACTAACTGTGTACTATGTTCGAGGCGCAAAGATGAGAGAAGCAGG
GGCTAGGGGGCTTAAAGGAGTAATAACAGGATCTGGCATTATGTGCTTCTGTGGTGACTG
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GCGCCCACCAGAGTATATCTTACTGGAGTCTGGATGCACACTTCGTGACGTCATGAATGC
GTTCAAGGAAACTCCCTTTGAAGCTCTAGAAGAAAGACTTCGTGTGTTAGTTGGACCAGA
TTTCAAGAAATCTAGCTTGTGTTTTATCTGCCAAGGTCCAATGGTTGAGCCTTGTGAAAC
AGAGTCATTATTTTTGTGCAAATCGTGTTTGGAGAGAAAGGAGCCAGAACCCCATTCCAG
TCCGTCTAAAGAAAATGCTCTTAATGGATTTTCTAGCCCATGTGTGGTTAAGAAATCTAT
CCCCAGTAGGCCAATGTCTACTCCTCGCCAAAGTACCAGGCGTGAACAACCAACCAAAAA
GTCACCTGAGCTAGGTGTGGTTTCAGGAACTAAATCGAGTGAGTCAAAATCCAGCGCAAT
CAAAAGCAACAGCCATGGGAAAATAACCAGAAAGGATGTACGGCTGCATAAACTTGTTTT
TGAGGATGATATACTGCCAGATGGGACCGAAGTGGGATATTTTCTCGCTGGAAAGAAAAT
GCTTGTCGGCTATAAGAAGGGATTTGGGATACTCTGTTCTTGTTGTGACAAAGTGGTTAG
TCCTTCAACTTTTGAGGCGCATGCTGGCTGTGGAAGTCGTCGGAAACCGTTTCATCAAAT
TTATACAACCAATGGCGTATCTCTTCATGAGCTCTCAGTAGCACTAACAATGGACCAGAA
GTTTTCCGTACGTGAAAATGATGATCTTTGCAGTATCT


BQ
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AF RR4FY14TF U 1
AF RR4EN52TF U 431
BS 1 682 RR4FY14TF
BS 683 683 RR4EN52TF
BS 684 698 RR4FY14TF
BS 699 998 RR4EN52TF

RD RR4FY14TF 698 0 0
GGGACGGCCCAAGAAGTTTATCCGGGATTTCCCGAAAAAGCTGAAAGATCTTCTCGATTC
TGGAATACTTGAGGGACTAACTGTGTACTATGTTCGAGGCGCAAAGATGAGAGAAGCAGG
GGCTAGGGGGCTTAAAGGAGTAATAACAGGATCTGGCATTATGTGCTTCTGTGGTGACTG
CAAAGGAGTTCAGGTCGTAAGTGCCGCCGTGTTCGAGCAGCATGCTTCTAGCGCTAACAA
GCGCCCACCAGAGTATATCTTACTGGAGTCTGGATGCACACTTCGTGACGTCATGAATGC
GTTCAAGGAAACTCCCTTTGAAGCTCTAGAAGAAAGACTTCGTGTGTTAGTTGGACCAGA
TTTCAAGAAATCTAGCTTGTGTTTTATCTGCCAAGGTCCAATGGTTGAGCCTTGTGAAAC
AGAGTCATTATTTTTGTGCAAATCGTGTTTGGAGAGAAAGGAGCCAGAACCCCATTCCAG
TCCGTCTAAAGAAAATGCTCTTAATGGATTTTCTAGCCCATGTGTGGTTAAGAAATCTAT
CCCCAGTAGGCCAATGTCTACTCCTCGCCAAAGTACCAGGCGTGAACAACCAACCAAAAA
GTCACCTGAGCTAGGTGTGGTTTCAGGAACTAAATCGAGTGAGTCAAAATCCAGCGCAAT
CAAAAGCAACAGCCATGGGAAA*TAACCAGAAAGGATG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4EN52TF 568 0 0
TTTTTGTGCAAATCGTGTTTGGAGAGAAAGGAGCCAGAACCCCATTCCAGTCCGTCTAAA
GAAAATGCTCTTAATGGATTTTCTAGCCCATGTGTGGTTAAGAAATCTATCCCCAGTAGG
CCAATGTCTACTCCTCGCCAAAGTACCAGGCGTGAACAACCAACCAAAAAGTCACCTGAG
CTAGGTGTGGTTTCAGGAACTAAATCGAGTGAGTCAAAATCCAGCGCAATCAAAAGCAAC
AGCCATGGGAAAATAACCAGAAAGGATGTACGGCTGCATAAACTTGTTTTTGAGGATGAT
ATACTGCCAGATGGGACCGAAGTGGGATATTTTCTCGCTGGAAAGAAAATGCTTGTCGGC
TATAAGAAGGGATTTGGGATACTCTGTTCTTGTTGTGACAAAGTGGTTAGTCCTTCAACT
TTTGAGGCGCATGCTGGCTGTGGAAGTCGTCGGAAACCGTTTCATCAAATTTATACAACC
AATGGCGTATCTCTTCATGAGCTCTCAGTAGCACTAACAATGGACCAGAAGTTTTCCGTA
CGTGAAAATGATGATCTTTGCAGTATCT

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL8521Contig1 1027 2 2 U
GGGCTCCAATCTCAACCACGAGGTGTTTCCGGGGATTGAGACTGTTTCATCCGTCTCCCC
GAAAGCTCACCAGTCCTCCTCATCAGACTGCTCGAATCTAGCTCGAAGCTCTTCTCCTTC
GTTTCCTTACTACGGTGATTGGAAGTTCGGTGTTGATTCTAGCTTAAAGCCTAAGATATG
TATAACGACTAGCACATCAGCAGGATTGGATCAGATTTTGCCGTGGATGTTCTACCATAA
GGTTCTTGGCGTCTCTACTTTTTTCCTTTTCGTTGAAGGGAAAGCTGCTACGCCCGCCAT
CTCTAAAGTCCTCGAGTCTATTCCTGGGGTTAAGGTGATATACAGGACAAAAGATCTAGA
GGAGAAGCAGGCAAAGAGTCGGATTTGGAACGAGACGTGGCTATCTTCTTTCTTTTACAA
GCCATGCAATTACGAGTTATTTGTGAAGCAATCTCTCAACATGGAAATGGCTATTGTCAT
GGCAAGGGATGCGGGCATGGACTGGATACTTCATCTTGATACAGATGAGCTGATATACCC
AGCAGGTGCTCGTGAGTACTCGTTGAGACGGTTACTTCTTGATGTTCCTCCAAATGTGGA
TATGGTTATATTCCCAAATTATGAAAGCAGCGTAGAAAGAGATGATATCAAGGATCCTTT
TACAGAGGTGTCAATGTTTAAAAAGAACTATGACCATCTTCCAAAAGATACATATTTTGG
AATGTACAAGGAAGCAACCCGAAACAATCCTAACTACTTCTTGACTTATGGTAACGGCAA
ATCAGTTGCTAGGGTTCAAGATCACCTCCGACCAAATGGAGCACACAGATGGCATAATTA
CATGAAAACTCCCAATGAGATCAAATTGGAGGAGGCTGCTGTCTTACACTACACATATGC
CAAGTTCTCTGACTTAACATCCAGGCGTGACCGATGTGGCTGCAAGCCTACAAAAGAAGA
CGTGAAAAGATGCTTTATGTTGGGAAATTGAAGCATTTGGTATGAGTCACCTATTTGATT
TGTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF56TF U 1
AF RR4AF56JQ C 285
BS 1 816 RR4AF56TF
BS 817 1027 RR4AF56JQ

RD RR4AF56TF 816 0 0
GGGCTCCAATCTCAACCACGAGGTGTTTCCGGGGATTGAGACTGTTTCATCCGTCTCCCC
GAAAGCTCACCAGTCCTCCTCATCAGACTGCTCGAATCTAGCTCGAAGCTCTTCTCCTTC
GTTTCCTTACTACGGTGATTGGAAGTTCGGTGTTGATTCTAGCTTAAAGCCTAAGATATG
TATAACGACTAGCACATCAGCAGGATTGGATCAGATTTTGCCGTGGATGTTCTACCATAA
GGTTCTTGGCGTCTCTACTTTTTTCCTTTTCGTTGAAGGGAAAGCTGCTACGCCCGCCAT
CTCTAAAGTCCTCGAGTCTATTCCTGGGGTTAAGGTGATATACAGGACAAAAGATCTAGA
GGAGAAGCAGGCAAAGAGTCGGATTTGGAACGAGACGTGGCTATCTTCTTTCTTTTACAA
GCCATGCAATTACGAGTTATTTGTGAAGCAATCTCTCAACATGGAAATGGCTATTGTCAT
GGCAAGGGATGCGGGCATGGACTGGATACTTCATCTTGATACAGATGAGCTGATATACCC
AGCAGGTGCTCGTGAGTACTCGTTGAGACGGTTACTTCTTGATGTTCCTCCAAATGTGGA
TATGGTTATATTCCCAAATTATGAAAGCAGCGTAGAAAGAGATGATATCAAGGATCCTTT
TACAGAGGTGTCAATGTTTAAAAAGAACTATGACCATCTTCCAAAAGATACATATTTTGG
AATGTACAAGGAAGCAACCCGAAACAATCCTAACTACTTCTTGACTTATGGTAACGGCAA
ATCAGTTGCTAGGGTTCAAGATCACCTCCGACCAAA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AF56JQ 743 0 0
CTGCTACGCCCGCCATCTCTAAAGTCCTCGAGTCTATTCCTGGGGTTAAGGTGATATACA
GGACAAAAGATCTAGAGGAGAAGCAGGCAAAGAGTCGGATTTGGAACGAGACGTGGCTAT
CTTCTTTCTTTTACAAGCCATGCAATTACGAGTTATTTGTGAAGCAATCTCTCAACATGG
AAATGGCTATTGTCATGGCAAGGGATGCGGGCATGGACTGGATACTTCATCTTGATACAG
ATGAGCTGATATACCCAGCAGGTGCTCGTGAGTACTCGTTGAGACGGTTACTTCTTGATG
TTCCTCCAAATGTGGATATGGTTATATTCCCAAATTATGAAAGCAGCGTAGAAAGAGATG
ATATCAAGGATCCTTTTACAGAGGTGTCAATGTTTAAAAAGAACTATGACCATCTTCCAA
AAGATACATATTTTGGAATGTACAAGGAAGCAACCCGAAACAATCCTAACTACTTCTTGA
CTTATGGTAACGGCAAATCAGTTGCTAGGGTTCAAGATCACCTCCGACCAAATGGAGCAC
ACAGATGGCATAATTACATGAAAACTCCCAATGAGATCAAATTGGAGGAGGCTGCTGTCT
TACACTACACATATGCCAAGTTCTCTGACTTAACATCCAGGCGTGACCGATGTGGCTGCA
AGCCTACAAAAGAAGACGTGAAAAGATGCTTTATGTTGGGAAATTGAAGCATTTGGTATG
AGTCACCTATTTGATTTGTTGCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL8522Contig1 536 2 1 U
GGATAGATATAGTCAATATTAACAAAAAGAACCTTTTGATCTTAGAAATGGCAGCCAAAT
TCCACCTCTCGTCTTCCTTCAGCCAGAAGGCCAAAGATTCCACAACTTCATCATCTTCCT
CATATTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCTCTGTACACCGTCTTCATCAGGCTTTA
CGCAGTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGGAGATGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAA
AGAAGAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGAACAGTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAA
GAGAAGGGGAGAATCCGATGAAGACGCCTCTCCCTTACATAATCATTTTTGGTATGTCAA
CTCCATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAATGGCTGGATCAAAGTTCCTATTCGCT
GAGCACTTATTAAATTCTTCTTCCCTTGTTTAAGTTTCTAAACATGAAATGAATCATAGA
CATCTTCTTCGGCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAAAACAAAGTCTGCGTTTATATTGC


BQ
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AF RR4AR52JQ C 1
AF RR4AR52TF U 1
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TCCACCTCTCGTCTTCCTTCAGCCAGAAGGCCAAAGATTCCACAACTTCATCATCTTCCT
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TCCACCTCTCGTCTTCCTTCAGCCAGAAGGCCAAAGATTCCACAACTTCATCATCTTCCT
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QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

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TAGTTTTCCCCCC


BQ
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AF RR4ED90TF U 1
AF RR4ED90JQ C 123
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GTTT

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DS 



AS 1 2

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TCTTCTTCCGGAGCTTGGTCAAGAGAGAAGCTACATAAGTGAGACCCTCTTCACTACTGG
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BQ
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AF RR4H081TF U 1
AF RR4H081JQ C 400
BS 1 703 RR4H081TF
BS 704 1116 RR4H081JQ

RD RR4H081TF 703 0 0
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TCTTGTCTCAGCTTCGCCATCGCTCTCCGTAGATCTATCTCGTCTCAGCCTCTCCCTATC
GACGTTCCTCTCAAGTTCAGACCCCTCAGGCTCTCACTCTCTCGACGAAGCTCAGACCCT
CTCAAGCTCTCGACGACCATCTTACGCACTCTCTCAAGGTCATCACTCTCAAGATCATCA
CCTCTCTTTGAGCTTCGACCAAACCCATATCGAGCTTTCTCTTCTCCTCCACAGACGACG
CCTCTCGAGCTCCCTCGTCTCCTCCACAGACGACGCCGTACAGTACATTCATGGTTTAGC
TGCTAAAGGAGTACATTGTATTCATCGCCCTGCTCCTACTCTCCAGGATCTTGGCTTCTT
TCTTCTTCCGGAGCTTGGTCAAGAGAGAAGCTACATAAGTGAGACCCTCTTCACTACTGG
TTTTCTTTCTTTCTTCCTGGCTTCGTTTCACTTCTGCCATCATACTTAACAAAAGTATCG
AATCTAGAGAAAGTGACTGTTAAGGATATAGCCCCTCTTCTTCGTTGGGTCTCAAGCTCT
CCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGCTTC
TCTCACTCAAGCTCTCCTAAGCTCACTCTGTTTCTGTTCTTGT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4H081JQ 717 0 0
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TGAGACCCTCTTCACTACTGTTTTTCTTTCTTTCTTCCTGGCTTCGTTTCACTTCTGCCA
TCATACTTAACAAAAGTATCGAATCTAGAGAAAGTGACTGTTAAGGATATAGCCCCTCTT
TTTCGTTGGGTCTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTC
ACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCTAAGCTCACTCTGTTTCTGTTC
TTGTCAATGAAACTGGCTACTGTAAATCCAAGGATGGAGTTTAATGCTAATCCTGCTTTA
TCCACAGAGATGATTCAACCGGAGGAGTCATTATCGCAGTCTCTTTACGCAATGGCTTGC
TCAGAGCAAAGGCTTTTCAGACACATGCCTAGATACTCAGACACACAGTTTCCCTCGGGT
GATGGTTTGTTCAAGCCGAGGTAGTTGTTAGTAGTTAATGTCAACACTACAGATGAAGCT
TGAGCCATAAAAGCTAGGTGTTTGTTATTGTATCTCTCTGTACAGACAGAAACCAAGAAG
TGATGTGTACGGAGTGAAACATGTGGCAACTAACGTTTACTATCGTTTTTTCCTTTGTTT
GTGTCATCTGTTAATTTTTTATCAATCCCAAAAAGAAACCAAAAATATCTTCATACT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL8525Contig1 827 2 14 U
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TTCGAGACTCAACAAGGAGACTTGTGGAACAAGAGTGAGCTGCTGCTGAAATCAAACCCC
TGTTCACAAGAAAGTCCCTGTCCTTATCCACGGCGACAAACCCATCTCTGAATCTCTCAT
TCAAGTTCAGTACATCGATGAAACGTGGACTGATGCTGCTTCTTTCTTGCCCTCTGATCC
TCAAGCCAGAGCCACTGCAAGGTTCTGGGCTGATTTCGCCGAGAAAACGATATCGTTTGA
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GAGAAATAATTGGCTGTCTTTTTTTCTGGTGTATGATTCTTCTGTCT


BQ
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AF RR4CA50TF U 1
AF RR4CA50JQ C 50
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BS 761 771 RR4CA50TF
BS 772 827 RR4CA50JQ

RD RR4CA50TF 786 0 0
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TTCGAGACTCAACAAGGAGACTTGTGGAACAAGAGTGAGCTGCTGCTGAAATCAAACCC*
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TCAAGCCAGAGCCACTGCAAGGTTCTGGGCTGATTTCGCCGAGAAAACGATATCGTTTGA
AGGAGGAAGAAAGATTTGGGGAAACAACAAAGGAGAAGAACAAGAGAAAGGCAAGAAGGA
GTTTCTTGACAGCTTGAAGGTTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAGTCTTACTTTGGAGG
AGAGACATTTGGTTATGTTGACATAGCTCTTGTCCCATTCTACAGTTGGTCCTATGCCCT
CGAGAAATGTGGTGATTTTTCTGTGGAAGCTGAGTGTCCTAAGATCGTGGCTTGGGGGAA
GAGATGTGTTGAACGCGACAGTGTTGCTGCTTCGTTGCCTGAATCTGAGAAAGTT*ATCA
GCAAGTGCTTAAGCTTAGACAGATTTTTGGTGTTGAATAAATGCAAAA*CTGCATTTTGA
ACATCTTTGA*TCCTGTGTTTT*ATGTTTCCGTGTTGGA*GTGTTTACTGT
GTCTTTGAGAAAATG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4CA50JQ 778 0 0
GT
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GGAGTTGAGTTCGAGACTCAACAAGGAGACTTGTGGAACAAGAGTGAGCTGCTGCTGAAA
TCAAACCCCTGTTCACAAGAAAGTCCCTGTCCTTATCCACGGCGACAAACCCATCTCTGA
ATCTCTCATTCAAGTTCAGTACATCGATGAAACGTGGACTGATGCTGCTTCTTTCTTGCC
CTCTGATCCTCAAGCCAGAGCCACTGCAAGGTTCTGGGCTGATTTCGCCGAGAAAACGAT
ATCGTTTGAAGGAGGAAGAAAGATTTGGGGAAACAACAAAGGAGAAGAACAAGAGAAAGG
CAAGAAGGAGTTTCTTGACAGCTTGAAGGTTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAGTCTTA
CTTTGGAGGAGAGACATTTGGTTATGTTGACATAGCTCTTGTCCCATTCTACAGTTGGTC
CTATGCCCTCGAGAAATGTGGTGATTTTTCTGTGGAAGCTGAGTGTCCTAAGATCGTGGC
TTGGGGGAAGAGATGTGTTGAACGCGACAGTGTTGCTGCTTCGTTGCCTGAATCTGAGAA
AGTTTATCAGCAAGTGCTTAAGCTTAGACAGATTTTTGGTGTTGAATAAATGCAAAAACT
GCATTTTGAACATCTTTGAATCCTGTGTTTTTATGTTTCCGTGTTGGAAGTGTTTACTGT
TGTTCTTTTGAGAAATAATTGGCTGTCTTTTTTTCTGGTGTATGATTCTTCTGTCT

QA 3 778 3 778
DS 



AS 1 2

CO CL8526Contig1 629 2 1 U
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CTGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTAAACCTTATCATTTAGAGAAGGGAGAGAGTGTTGCC
CCTGGAACAGTGCTGGGAACCACACACACATACGTCATTAAAACTGGTACTCAGGACAAG
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TCGAAGAAAAGGAAGCGTGATAAGGAAGGAAAGAAGAAGAAAGATTTCAAATTTTGAGAA
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TTCTCCTGAGAATGTGTTTTTAGCTTTTACATAAGCTGAAGGAGGGGAAGGCAGATGCGT
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CCTGAAATAAATAAAAACACTTGTTTGCC


BQ
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AF RR4D345TF U 1
AF RR4D345JQ C 91
BS 1 629 RR4D345TF

RD RR4D345TF 629 0 0
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CTGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTAAACCTTATCATTTAGAGAAGGGAGAGAGTGTTGCC
CCTGGAACAGTGCTGGGAACCACACACACATACGTCATTAAAACTGGTACTCAGGACAAG
CCGGGAGCTAAAAGGGTTGATTTGCTTAAAGGACAAAAGACAGATCGTGTGGATGTCAGC
TTACAGCCAGAAGAGCTGGAAGCCTTGGAGAATGTTTTACCTGCCAAGTATGAGGAGGCG
AGAGAAGAGGAGAAACTTCGCAATAAGCCAGAGGACTTCAGTGACATGGTCGCAGAGAAT
TCGAAGAAAAGGAAGCGTGATAAGGAAGGAAAGAAGAAGAAAGATTTCAAATTTTGAGAA
AGCTTTTTCAATTCATGGAAGAACTCCGGAATCTGGACGTGTGTGTGAGAGAATGATTCA
TTCTCCTGAGAATGTGTTTTTAGCTTTTACATAAGCTGAAGGAGGGGAAGGCAGATGCGT
AGAAGATATCCTTGAGTTTATAAAAACCTATAAATGTTATGGATTCTAAATGCTGTGTTA
CCTGAAATAAATAAAAACACTTGTTTGCC

QA 1 629 1 629
DS 

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TATCATTTAGAGAAGGGAGAGAGTGTTGCCCCTGGAACAGTGCTGGGAACCACACACACA
TACGTCATTAAAACTGGTACTCAGGACAAGCCGGGAGCTAAAAGGGTTGATTTGCTTAAA
GGACAAAAGACAGATCGTGTGGATGTCAGCTTACAGCCAGAAGAGCTGGAAGCCTTGGAG
AATGTTTTACCTGCCAAGTATGAGGAGGCGAGAGAAGAGGAGAAACTTCGCAATAAGCCA
GAGGACTTCAGTGACATGGTCGCAGAGAATTCGAAGAAAAGGAAGCGTGATAAGGAAGGA
AAGAAGAAGAAAGATTTCAAATTTTGAGAAAGCTTTTTCAATTCATGGAAGAACTCCGGA
ATCTGGACGTGTGTGTGAGAGAATGATTCATTCTCCTGAGAATGTGTTTTTAGCTTTTAC
ATAAGCTGAAGGAGGGGAAGGCAGATGCGTAGAAGATATCCTTGAGTTTATAAAAACCTA
TAAATGTTATGGATTCTAAATGCTGTGTTCCCTGAAATAAATAAAAACACTTGTTTGCC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL8527Contig1 908 2 2 U
GGAACACAAGAGACGAGAATCATCTCTCATTCTCTTCTCTCCCATACACTCCTCTCTCTC
TCTCTACCCCTCATCGACACCACCAGTCACTCGCACAGAGAAGAAGTCGAAAGATAACAT
CAAAAAAGATTTTCAGTGTTAGTCAGAGCGATTCACAGAGAAGACGAGAGTGAGATTTCT
TCAACACAGCTTCAGTTTCCTCGAACGTCTGTGCTCATGAGCCGACGGCGACTTCTGTTA
TCGGCGACGCTGCTCTCGTATTTGCTTCACGGGATGGCTCTCGTCTCCGTCGTAGCCTCC
GGCGTGGAGGAGGTTAGTAGAGATAACGTGGATTTGACCAAAACGACGACGTTAACCACC
TCTCATACGCATCGGAAGATGCTCCATCTCTCTCATGAGACGAGAGCAGATCCGGATAGG
ATCGGAGAGAAGTGCAAGAAGTCAGACATAGTGGTGAACCAAGCAGCGACCGAACCTATG
CCCAACGGAATACCCGGTTACACTGTGGAGATCACGAACCAATGCATGTCTGGATGCAAC
ATCTCGAGGATCCACGTCAGCTGCGGTTGGTTCAGCTCCGTTAAGTTGGTTAACCCGAGA
GTTTTCAAGCGGATTCACTACGACGACTGTCTCGTCAACAACGGGAAGCCTTTGCCTTTT
GGCTCCACGCTCTCCTTCCACTACGCCAACACTTTCCCTTACCGTCTCGCTGTCTCGTTC
GTTACCTGCTCCTGAGTCCTCCTGAATCTTTTTCTTTCTCATATAGGATAAGATGATAGT
AAAGAAACATGGCGGGAAAAATTAAGATACAGGAAGTATGATTGATATTAATCACATTCA
TACCACACTCATCCTCTTCTCTTAGGATGTTAAATGTTTTTGAGCAACACTGATATATAT
AAAAGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV63TF U 1
AF RR4DV63JQ C 102
BS 1 639 RR4DV63TF
BS 640 908 RR4DV63JQ

RD RR4DV63TF 639 0 0
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TCTCTACCCCTCATCGACACCACCAGTCACTCGCACAGAGAAGAAGTCGAAAGATAACAT
CAAAAAAGATTTTCAGTGTTAGTCAGAGCGATTCACAGAGAAGACGAGAGTGAGATTTCT
TCAACACAGCTTCAGTTTCCTCGAACGTCTGTGCTCATGAGCCGACGGCGACTTCTGTTA
TCGGCGACGCTGCTCTCGTATTTGCTTCACGGGATGGCTCTCGTCTCCGTCGTAGCCTCC
GGCGTGGAGGAGGTTAGTAGAGATAACGTGGATTTGACCAAAACGACGACGTTAACCACC
TCTCATACGCATCGGAAGATGCTCCATCTCTCTCATGAGACGAGAGCAGATCCGGATAGG
ATCGGAGAGAAGTGCAAGAAGTCAGACATAGTGGTGAACCAAGCAGCGACCGAACCTATG
CCCAACGGAATACCCGGTTACACTGTGGAGATCACGAACCAATGCATGTCTGGATGCAAC
ATCTCGAGGATCCACGTCAGCTGCGGTTGGTTCAGCTCCGTTAAGTTGGTTAACCCGAGA
GTTTTCAAGCGGATTCACTACGACGACTGTCTCGTCAAC

QA 1 639 1 639
DS 

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GAG
AGTCGAAAGATAACATCAAAAAAGATTTTCAGTGTTAGTCAGAGCGATTCACAGAGAAGA
CGAGAGTGAGATTTCTTCAACACAGCTTCAGTTTCCTCGAACGTCTGTGCTCATGAGCCG
ACGGCGACTTCTGTTATCGGCGACGCTGCTCTCGTATTTGCTTCACGGGATGGCTCTCGT
CTCCGTCGTAGCCTCCGGCGTGGAGGAGGTTAGTAGAGATAACGTGGATTTGACCAAAAC
GACGACGTTAACCACCTCTCATACGCATCGGAAGATGCTCCATCTCTCTCATGAGACGAG
AGCAGATCCGGATAGGATCGGAGAGAAGTGCAAGAAGTCAGACATAGTGGTGAACCAAGC
AGCGACCGAACCTATGCCCAACGGAATACCCGGTTACACTGTGGAGATCACGAACCAATG
CATGTCTGGATGCAACATCTCGAGGATCCACGTCAGCTGCGGTTGGTTCAGCTCCGTTAA
GTTGGTTAACCCGAGAGTTTTCAAGCGGATTCACTACGACGACTGTCTCGTCAACAACGG
GAAGCCTTTGCCTTTTGGCTCCACGCTCTCCTTCCACTACGCCAACACTTTCCCTTACCG
TCTCGCTGTCTCGTTCGTTACCTGCTCCTGAGTCCTCCTGAATCTTTTTCTTTCTCATAT
AGGATAAGATGATAGTAAAGAAACATGGCGGGAAAAATTAAGATACAGGAAGTATGATTG
ATATTAATCACATTCATACCACACTCATCCTCTTCTCTTAGGATGTTAAATGTTTTTGAG
CAACACTGATATATATAAAAGAAT

QA 4 807 4 807
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8529Contig1 758 2 5 U
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AAGAACAGAGTAGCTCCCCAACACGCTTTCGTTTAGACACATCAGGTGGTCCTTCCTTGC
ATGCAGAGTTCGTGTTTCTTCCGTTTGTAGGCCTAAAGAGGTTCTCTTTTTGTGTGTTTG
TGCGTGTATGAGTTTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTC
CCTTTCTTTTTCTGTATGTCATCTCGCTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTT
GCTGGAGTGATAATAAAAATAAGTAGATGCTTAATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E655TF U 33
AF RR4E655JQ C 1
BS 1 32 RR4E655JQ
BS 33 569 RR4E655TF
BS 570 570 RR4E655JQ
BS 571 576 RR4E655TF
BS 577 758 RR4E655JQ

RD RR4E655TF 544 0 0
ATTTGATTCATGGGCTTACTAGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGAGTCCTCGGCC
AGATAACGGCCTTGGCAAGCTTCGGAGACACCATACCTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGG
CAATGATCAATCGGACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGTATCACCAGAGGAGGC
CGTGAAGGTAACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGATACCAAGGCGGTTCAGC
TCCGGTTTCACCGGCTGGTTCAACTCCACCGGTATCTCCTTTCTCTGAGCAAACGCAGGA
GGAAAGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGAAGGTCGACGTCGGTCGCGTTCGATAAGGAAGCA
GGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCCTGTGATCTCTAATCTCT
TAACTCAAATGAGAGAAAGAAGAAGGAAAAGAACAGAGTAGCTCCCCAACACGCTTTCGT
TTAGACACATCAGGTGGTCCTTCCTTGCATGCAGAGTTCGTGTTTCTTCCGTTTGTATGC
CTAA

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4E655JQ 758 0 0
CAATTTGCAGATCTTGAAAACTATTAGGGTTGATTTGATTCATGGGCTTACTAGATCATC
TCTGGGATGATACCGTCGCTG*GTCCTCGGCCAGATAACGGCCTTGGCAAGCTTCGGAGA
CACCATACCTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAATCGGACGGTGGAAGCGTG
AGATCGTACGGTGAAGTATCACCAGAGGAGGCCGTGAAGGTAACACGCAGCATCATGATA
ATAAAACCACCAGGATACCAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCACCGGCTGGTTCAACTCCA
CCGGTATCTCCTTTCTCTGAGCAAACGCAGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGAA
GGTCGACGTCGGTCGCGTTCGATAAGGAAGCAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTC
CTCCTACTTACGGCCTGTGATCTCTAATCTCTTAACTCAAATGAGAGAAAGAAGAAGGAA
AAGAACAGAGTAGCTCCCCAACACGCTTTCGTTTAGACACATCAGGTGGTCCTTCCTTGC
ATGCAGAGTTCGTGTTTCTTCCGTTTGTAGGCCTAAAGAGGTTCTCTTTTTGTGTGTTTG
TGCGTGTATGAGTTTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTC
CCTTTCTTTTTCTGTATGTCATCTCGCTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTT
GCTGGAGTGATAATAAAAATAAGTAGATGCTTAATGTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL8530Contig1 1133 2 8 U
GGACTTCTGATTTGATTTCTTCTCTTAACTGTTTGTCACGTCTTGCGCAGAAATTATGAT
TCCAAAGCATCAAGAAGATGTCAAGAGGCCACGAGACTGTGAACTGTGTCTGAACAAACA
CGCGGTTTGGTATTGTGCTTCCGACGATGCTTTCTTGTGCCATGTTTGTGACGAATCAGT
GCATCGTGCAAACCAAGTGACGACAAAACACGAGAGAGTTTGTCTCAAAACAAATGAGAT
ATCTAATGGCGTGCTTCAAGGAACAACACGAAAGCCGGTTTGGCACAGCTGGTTCAGAAG
AAAAGCAAGAACACCTAGAGTCCGTTGCGAGAAAAAGCTACAAGAGTAGGTGGATGATGA
GAAAAGAAGAGAAGACCCTCGCGTTCCCGAGATTGTAGGCGAAACCAATGAAGATGATGA
GGATCTAACTTCTCTCGTGTCAGAGTTTCAGGGATTCGTAGAGATGGAATTCTTCTTGAG
CAACCATGATGGTTCTGAAGAAACAATGAGACAATTCAACGTTGACCATGAAACTGATGC
AATGGAAGATCTATGTTACATTGAAGAAGAAGGTAAGACAAATGGAGATGAAGCATGTCA
TGAACAATCTTTGATGAGCTGCAAGAATGAGTACGACATTAATCCCGCCCTGGTTATAAC
AAAGACAGAAGAAAATGCAAAGCAGAGGAACATGTTACTCAGACTTAATTACGAAAATGT
TATAGCAGCATGGGATAAACAAGAATCTCCAAGAACAGCAACATGGAACCAAAATGAGTT
TAACAACACAAGTAACTTCCAGCTAGTTCCTCCAGGGATAGAGGAGAAGAAAGTAAGCAA
CAGAAGTGAGAGAGAAGCAAGAGTATGGAGGTACAGAGATAAACGCAAGAATCGTTTGTT
TGAGAAGAAGATAAGGTACGAAGTTAGAAAGGTTAACGCTGACAAAAGACCGAGGATGAA
AGGTCGATTTGTCCGGAGATCTTTTACCAACGACTCCTAGGAATGGATTGTCAGATTCAT
CTTTGTCCGAGTTCTTGTCACATAATATCAAACAAAGTAGAATAAACAATAATTCAGATG
CTAATATCTTCACGAATTGTTTGACAAGATTAATTAGCAAATTATTTGACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B303TF U 1
AF RR4B303JQ C 319
BS 1 827 RR4B303TF
BS 828 828 RR4B303JQ
BS 829 835 RR4B303TF
BS 836 836 RR4B303JQ
BS 837 844 RR4B303TF
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BS 846 855 RR4B303TF
BS 856 1133 RR4B303JQ

RD RR4B303TF 861 0 0
GGACTTCTGATTTGATTTCTTCTCTTAACTGTTTGTCACGTCTTGCGCAGAAATTATGAT
TCCAAAGCATCAAGAAGATGTCAAGAGGCCACGAGACTGTGAACTGTGTCTGAACAAACA
CGCGGTTTGGTATTGTGCTTCCGACGATGCTTTCTTGTGCCATGTTTGTGACGAATCAGT
GCATCGTGCAAACCAAGTGACGACAAAACACGAGAGAGTTTGTCTCAAAACAAATGAGAT
ATCTAATGGCGTGCTTCAAGGAACAACACGAAAGCCGGTTTGGCACAGCTGGTTCAGAAG
AAAAGCAAGAACACCTAGAGTCCGTTGCGAGAAAAAGCTACAAGAGTAGGTGGATGATGA
GAAAAGAAGAGAAGACCCTCGCGTTCCCGAGATTGTAGGCGAAACCAATGAAGATGATGA
GGATCTAACTTCTCTCGTGTCAGAGTTTCAGGGATTCGTAGAGATGGAATTCTTCTTGAG
CAACCATGATGGTTCTGAAGAAACAATGAGACAATTCAACGTTGACCATGAAACTGATGC
AATGGAAGATCTATGTTACATTGAAGAAGAAGGTAAGACAAATGGAGATGAAGCATGTCA
TGAACAATCTTTGATGAGCTGCAAGAATGAGTACGACATTAATCCCGCCCTGGTTATAAC
AAAGACAGAAGAAAATGCAAAGCAGAGGAACATGTTACTCAGACTTAATTACGAAAATGT
TATAGCAGCATGGGATAAACAAGAATCTCCAAGAACAGCAACATGGAACCAAAATGAGTT
TAACAACACAAGTAACTTCCAGCTAGTTCCTCCAGGGATAGAGGAGA*GAAAGTA*GCAA
CAGA*GTGAGAGAGA
GCAGAG

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR4B303JQ 815 0 0
AGTCCGTTGCGAGAAAAAGCTACAAGAGTAGGTGGATGATGAGAAAAGAAGAGAAGACCC
TCGCGTTCCCGAGATTGTAGGCGAAACCAATGAAGATGATGAGGATCTAACTTCTCTCGT
GTCAGAGTTTCAGGGATTCGTAGAGATGGAATTCTTCTTGAGCAACCATGATGGTTCTGA
AGAAACAATGAGACAATTCAACGTTGACCATGAAACTGATGCAATGGAAGATCTATGTTA
CATTGAAGAAGAAGGTAAGACAAATGGAGATGAAGCATGTCATGAACAATCTTTGATGAG
CTGCAAGAATGAGTACGACATTAATCCCGCCCTGGTTATAACAAAGACAGAAGAAAATGC
AAAGCAGAGGAACATGTTACTCAGACTTAATTACGAAAATGTTATAGCAGCATGGGATAA
ACAAGAATCTCCAAGAACAGCAACATGGAACCAAAATGAGTTTAACAACACAAGTAACTT
CCAGCTAGTTCCTCCAGGGATAGAGGAGAAGAAAGTAAGCAACAGAAGTGAGAGAGAAGC
AAGAGTATGGAGGTACAGAGATAAACGCAAGAATCGTTTGTTTGAGAAGAAGATAAGGTA
CGAAGTTAGAAAGGTTAACGCTGACAAAAGACCGAGGATGAAAGGTCGATTTGTCCGGAG
ATCTTTTACCAACGACTCCTAGGAATGGATTGTCAGATTCATCTTTGTCCGAGTTCTTGT
CACATAATATCAAACAAAGTAGAATAAACAATAATTCAGATGCTAATATCTTCACGAATT
GTTTGACAAGATTAATTAGCAAATTATTTGACAGT

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL8531Contig1 646 2 2 U
GGGCACAGAGTCTTGAATAGAGAGCATAGGAGGAGGTGATATCCAGCAAAGTCTTCGCCT
TTCAATCTCTGTGGTGGACTGTTGATTTCTTTGTTAGCCTTTTGGACAAGAGGGCGAGGT
GTGTGTGTGTATTGGTGTAGTAGAAGCTCTGCTTAGAAAAACTCTGAAGATACTAACAGC
AAATGGATCTCTAGTTCCCTCTTGTTAAAACCTCCCAAAAAACCGGCTTTAGCATCTACA
ACATTCTGAGAAATAAATAAAAAATGCATCTGTGGCCATCGTTGAAACTTCGAAACTCTT
TCAAGAGCACTAGCAAGAAGAGATATCAAAGAACTAACAGCAGCGGGCAAAACAGCCAAA
GCAATCAACAGAGACTCCTAGAATCTGGCCCTGAGATTCAATCTGGTAGCTGGTTTGGTG
TTGTCTGCGGAGATCTTGCCATGGTTCTCTCTTGCTGCTTCTGTTGTTTCTGCTGCGGAG
CTTGCATTGATGAGGAAGAGAATTGATGCTAAGTTGCGCCAGAGCTCCCACTGGAGGGAG
TAAGTGACCAGATAGTTATATCTCTCAGTATAAAGTACACAGTCTCTTCTCAAAATGTAA
CATTATCGTTTCCATTGACTTTCTGAATTCATATCTTTAGCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EX33JQ C 1
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AAATGGATCTCTAGTTCCCTCTTGTTAAAACCTCCCAAAAAACCGGCTTTAGCATTTACA
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TTGTTTGCGGAGATCTTGCCATGGTTCTCTCTTGCTGCTTCTGTTGTTTTTGCTGCGGAG
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DS 

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GAAAAACTCTGAAGATACTAACAGCAAATGGATCTCTAGTTCCCTCTTGTTAAAACCTCC
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CCATCGTTGAAACTTCGAAACTCTTTCAAGAGCACTAGCAAGAAGAGATATCAAAGAACT
AACAGCAGCGGGCAAAACAGCCAAAGCAATCAACAGAGACTCCTAGAATCTGGCCCTGAG
ATTCAATCTGGTAGCTGGTTTGGTGTTGTCTGCGGAGATCTTGCCATGGTTCTCTCTTGC
TGCTTCTGTTGTTTCTGCTGCGGAGCTTGCATTGATGAGGAAGAGAATTGATGCTAAGTT
GCGCCAGAGCTCCCACTGGAGGGAGTAAGTGACCAGATAGTTATATCTCTCAGTATAAAG
TACACAGTCTCTTCTCAAAATGTAACATTATCGTTTCCATTGACTTTCTGAATTCATATC
TTTAGCTTTTC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

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ATCATAATCTCCTACTCATTTCTCAGATGTACCCGAATGTCTATACTTCATTAGTACCAC
AACAAGTAGATTCAAAACCAGTGCGTCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGCAAGAATGTTGAGA
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AGCAAGTAAGAATGCTGGAGATGAGTTTCGGAGTTGAGTATAAGCTTGAGTCCGAGAGGA
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AACACGAAAACGCCGTCGTTCAGAAGTGTCGTCTTGATTCTGAGGTTCTTCACCTAAAGG
AACAGCTTTATGACGCTGAAAGAGAGATCCAACGGTTGGCACAAAGAGTCGAAAGAGCCG
CAAGCAACAGTCCAATCTCATCTTTTATCTCCGTTGAAGCTAATCAGGCTACGCCGTTTT
TTGGAGATTATCAAATCGGAGACGACTGTGACGGTTACGAGAACTTGTTCTACTCGCCGG
AATACATTGATGGATTAGAATGGATGAGCCAACTTATGTGAAAACAACTACCCAACTTAA
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GTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RR4F607TF U 1
AF RR4F607JQ C 142
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AACAAGTAGATTCAAAACCAGTGCGTCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGCAAGAATGTTGAGA
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T*GGAGATTATCAAATCGGAGACGACTGT

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AGAAGTGTCGTCTTGATTCTGAGGTTCTTCACCTAAAGGAACAGCTTTATGACGCTGAAA
GAGAGATCCAACGGTTGGCACAAAGAGTCGAAGGAGCCGCAAGCAACAGTCCAATCTCAT
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ACGACTGTGACGGTTACGAGAACTTGTTCTACTCGCCGGAATACATTGATGGATTAGAAT
GGATGAGCCAACTTATGTGAAAACAACTACCCAACTTAATTAATATAAAGTTCGTAAAAT
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QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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GCGAGTTTCTGGCACCGCCTCTTCTTTCTAGATAAAGGACCAGAAGCCTCTAGTCCATAC
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ATTTGGGTCTGTTTGTAATATGTGTCCATTGGACTATGGTTAATGAAACCAAAGC


BQ
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AF RR4F671JQ C 1
AF RR4F671TF U 1
BS 1 535 RR4F671TF

RD RR4F671JQ 535 0 0
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GCTTAGATTTTTGATTCGGAGGTGGTATTAATCTTCGCTTACAGTCTTGCGGAGTATCCA
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ATTGGAGCTGACATATAGTCAGTGTTCCAATAAGATTCTGTTCTTCGTTTCTTCTAAAGG
GTTCCCTAGTCTTATATTCTACCAATAGAGATTGAAGATTTTTCTTTAACCGAAGATTGA
AGGAGTAAAGAACATGCAAACAGGCTCAACTGATCGGAAACGGAGATGGATGGGTTACCG
GCGAGTTTCTGGCACCGCCTCTTCTTTCTAGATAAAGGACCAGAAGCCTCTAGTCCATAC
ACGTGTCTGTAAGAATGTAATCGATATCTATAGTGTTTGGGCTCTATTGGAAAGTTTAAA
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QA 1 535 1 535
DS 

RD RR4F671TF 535 0 0
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GCTTAGATTTTTGATTCGGAGGTGGTATTAATCTTCGCTTACAGTCTTGCGGAGTATCCA
CGAAGGTCAAGAACTGAGGTTTGGAACAAGCTTTGGAGATCCGGTCCAGAATTTTGATGA
ATTGGAGCTGACATATAGTCAGTGTTCCAATAAGATTCTGTTCTTCGTTTCTTCTAAAGG
GTTCCCTAGTCTTATATTCTACCAATAGAGATTGAAGATTTTTCTTTAACCGAAGATTGA
AGGAGTAAAGAACATGCAAACAGGCTCAACTGATCGGAAACGGAGATGGATGGGTTACCG
GCGAGTTTCTGGCACCGCCTCTTCTTTCTAGATAAAGGACCAGAAGCCTCTAGTCCATAC
ACGTGTCTGTAAGAATGTAATCGATATCTATAGTGTTTGGGCTCTATTGGAAAGTTTAAA
ATTTGGGTCTGTTTGTAATATGTGTCCATTGGACTATGGTTAATGAAACCAAAGC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

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TTGGTAGGAATCACTCAAAGGTTCGGTCTTTTTCTTCGTCTTTGGCTTCCTCCTCTTCTT
CTTCTTCTCTGACCAGAGAAAGTGGAACGAAACGGTCTGCTGATTCTTCTGCGGCTGCCT
CAAAAGGAAACGTTGCGGTAGGGTGGCCGCCTCTACGGACTTACAGGATCGACAGTTTGG
TCAACCAATCAAAGTCCTCGCCCGCTGAAGACGACATTCAAAAGGACACAACAAAAAACG
GCGTGAAGAACAATGACGCTTCCTTCATCAAGTCTCCAATGCTTGTGAAGGTTACAATGA
ACGGAGTTATAATAGGAAGGAAGATTGATCTGAATGCTATTGATTCTTATGAAGCCTTGG
CGAAGACTCTGGAACAAATGTTTTTCCACACACCTTCTTCTGTAACAACAAGATGCAAGG
AAACAAGACGTGGTTCAGAACTGCTGGATGGTTCATCAGAATATATCATAACGTATCAAG
ATAAAGACGGAGATTGGATGCTTGTAGGAGATGTTCCATGGCTGATGTTCCTTGGGTCTG
TTAAAAGACTGAGAATCATGAGAAGATCAGGTGAAACTGGAGTTGGCAAATAGGGATTCA
TCTTCTCTGAGAAACCACTCTCTGTTAATCAAGCTGAAGGGTGAAATCATCTTCTGTGTA
CGATGCAAATGATTGAACGTGGAGATAAAAAAGAGACAAGAAACACATATATATTGTTTT
ACTCGAGAACCAAAGTTTATGGTTAACCTGGTCTGTAAATTTGGTAAAATCTTGTTCAGA
TAATCACACATATATATAATACATGTATTTATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA45TF U 1
AF RR4AA45JQ C 152
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BS 688 936 RR4AA45JQ

RD RR4AA45TF 687 0 0
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CTTCTTCTCTGACCAGAGAAAGTGGAACGAAACGGTCTGCTGATTCTTCTGCGGCTGCCT
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QA 1 687 1 687
DS 

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AGAGACAAGAAACACATATATATTGTTTTACTCGAGAACCAAAGTTTATGGTTAACCTGG
TCTGTAAATTTGGTAAAATCTTGTTCAGATAATCACACATATATATAATACATGTATTTA
TTACG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL8535Contig1 929 2 4 U
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TCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCTACTATACCTATCATGTTATTGCAATTTCAACTCA
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TTTTACTACGTTAGAGAAAAATATTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GA45TF U 1
AF RR4GA45JQ C 171
BS 1 696 RR4GA45TF
BS 697 697 RR4GA45JQ
BS 698 714 RR4GA45TF
BS 715 929 RR4GA45JQ

RD RR4GA45TF 714 0 0
GGAGATCGCTCAAAGCCCTAACTAACTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAGTCTTTG
TAGGTCTCTAGGGCGATTGATTGATTCATATATCTATGGCGGACGTTGAGAATCAACAAG
ACTCTTCGTTTCCAGTGAAGAGGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGG
CGAACAAGGCTCACAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGAGTCCAAAGACGGACAAGTTA
ATGGAAGCGGCGTCGAGAATCTGAGTTCTTCAACTGATGAAAAACTAGTGACAGAGTCAT
CGCTTGAGAAGGCAGCTGAAGAAAATAAGCAAGAAGTGGAAGAGGAAGATGAAGAGGAAG
AGGAGGAGGAGGATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAG
AGGACAAAGGAAAAGGAAAACTGATCGAATTTGATGAAAGTGGCGATAGCGATGATGATG
ATGATGAAGACGACGAAGATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCTGACGATCCAT
TGGCGGAGGTGGATTTGGATAACATCATTCCCTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGC
CTGGAGTCTTCATCTCCAATGACCGTATCGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATGATA
GCAGTGACGATAGTGATGCTTAAACGTTTAGCTATA*CGAAAGTTAGTGCTAAG

QA 1 714 1 714
DS 

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ACAGAGTCATCGCTTGAGAAGGCAGCTGAAGAAAATAAGCAAGAAGTGGAAGAGGAAGAT
GAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGC
ATAGCGAGAGAGGACAAAGGAAAAGGAAAACTGATCGAATTTGATGAAAGTGGCGATAGC
GATGATGATGATGATGAAGACGACGAAGATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCT
GACGATCCATTGGCGGAGGTGGATTTGGATAACATCATTCCCTCGAGGACTAGGAGACGA
TCGATCCAGCCTGGAGTCTTCATCTCCAATGACCGTATCGGAAACCACGAGGATGATGAT
GATGATGATAGCAGTGACGATAGTGATGCTTAAACGTTTAGCTATAACGAAGGTTAGTGC
TAAGAAATCAAGATGTAGTTCCTTTGATTCTAAACTATGTTCAATGATTGTTGGTTATAA
TCTAAATGTTTCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCTACTATACCTATCATGTTATTGCAA
TTTCAACTCATTTTGCGTCTTGGTTGTGGTCTGTGTGAGCTTAAATTTCGTTTCTTTGTA
TGCTTGTGACTTTTACTACGTTAGAGAAAAATATTACCG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL8536Contig1 536 2 1 U
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AAGATTGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGCCCCAACTTGAAGAAGAACGTAGCCATG
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AGACCTTATGAAGGCAACATCACCAAGATGCCGTTTGTGGCCACTAAATACTACAAGCCA
TCATAATATGTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTTGACCTGTTTCTCTCTTTCTTTTCTTAAAT
GACTTCTGTTCTGATTTGGTCTGAAAGAGTACGTTCTTTTGCCAAGAGGGCATATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AY57JQ C 1
AF RR4AY57TF U 1
BS 1 536 RR4AY57TF

RD RR4AY57JQ 536 0 0
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AAGATTGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGCCCCAACTTGAAGAAGAACGTAGCCATG
GGGTACGTGAAGTCAGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTGAAGATCTTGGTCCGTGGG
AGACCTTATGAAGGCAACATCACCAAGATGCCGTTTGTGGCCACTAAATACTACAAGCCA
TCATAATATGTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTTGACCTGTTTCTCTCTTTCTTTTCTTAAAT
GACTTCTGTTCTGATTTGGTCTGAAAGAGTACGTTCTTTTGCCAAGAGGGCATATG

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4AY57TF 536 0 0
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ATCTCTCCAGAGGCAAACAACACAAAGTCTCAATCTTTGTTGAGGAGGAGGAGGAGAAGA
TGAGAGGTGGGAGTCTATGGCAGCTAGGCCAATCCATAACCCGTCGTCTAGCTCAATCCG
ACAAGAAAGCCGCCTCACGCCGCTGCTTCGCATAGCGAGGTGCACGATGAGAACGGTGAC
AAGATTGGAGAGATCACGAGCGGTGGGTTTAGCCCCAACTTGAAGAAGAACGTAGCCATG
GGGTACGTGAAGTCAGGTCAGCACAAGAACGGGACCAAAGTGAAGATCTTGGTCCGTGGG
AGACCTTATGAAGGCAACATCACCAAGATGCCGTTTGTGGCCACTAAATACTACAAGCCA
TCATAATATGTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTTGACCTGTTTCTCTCTTTCTTTTCTTAAAT
GACTTCTGTTCTGATTTGGTCTGAAAGAGTACGTTCTTTTGCCAAGAGGGCATATG

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL8537Contig1 864 2 8 U
GGGGAATCAGAGGAGAAATGGCTATGGCTACTTGTACTACTCAGCTATCTTCTTCTTCGT
CTCTGTTTCACTCTCAAATTACAAAAAGACCATCCCTTCTCCCGCTGGCGAAGATCGACC
GCCATGGGTTCTCACGGAGGCTAAAGTCTCTCTCTTTATCCCATCGTTCTTCAGTCTCGG
CTTCGGCTGCTTCCTCCGTCGTCCACGTCAATGAACCGGAGAAGAAATCAACGAGAACAC
TTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGATTAGAGCCAGGGTACCCTCTGA
TAATAGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATG
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AGATCTCCCCTGACTCTGATCCTAAATGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAG
AAGCCGTGAGACTCATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTGGACGCCACATTGA
TTCTACAGAGACCAAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGC
TTCTTGGTGCAGATCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAAACTCATGAGAAAGTTGATA
GTCTTGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAT
TCAGATGTATCAATCTCATTATAAAAAGATTTTGTTAAATGTAAAGTTACACTTGGTGTA
ATCACCCTTTACAGCCCTTATTAATCCCCTCTTAGAACCATGAAATCGATCATGTGATGA
TGATGATATATATAAATGGAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF93TF U 1
AF RR4CU11TF U 70
BS 1 277 RR4AF93TF
BS 278 278 RR4CU11TF
BS 279 426 RR4AF93TF
BS 427 427 RR4CU11TF
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BS 821 864 RR4CU11TF

RD RR4AF93TF 838 0 0
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CTCTGTTTCACTCTCAAATTACAAAAAGACCATCCCTTCTCCCGCTGGCGAAGATCGACC
GCCATGGGTTCTCACGGAGGCTAAAGTCTCTCTCTTTATCCCATCGTTCTTCAGTCTCGG
CTTCGGCTGCTTCCTCCGTCGTCCACGTCAATGAACCGGAGAAGAAATCAACGAGAACAC
TTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGTTAGAGCCAGGGTACCCTCTGA
TAATAGGAGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATG
TGTTGCTTCATTGTGTAGTGGATGCTATCTTGGGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATCGGTC
AGATCTTCCCTGACTCTGATCCTAAATGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAG
AAGCCGTGAGACTCATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTGGACGCCACATTGA
TTCTACAGAGACCAAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGC
TTCTTGGTGCAGATCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAAACTCATGAGAAAGTTGATA
GTCTTGGAGAAAACAGGAGCATTGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAT
TCAGATGTATCAATCTCATTATAAAAAGATTTTGTTAAATGTAAAGTTACACTTGGTGTA
ATCACCCTTTACAGCCCTTATTAATCCCCTCTTAGAACCA
ATGAAAATCGAATCATGT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR4CU11TF 795 0 0
G
CTCTCAAATTACAAAAAGACCATCCCTTCTCCCGCTGGCGAAGATCGACCGTCATGGGTT
CTCACGGAGGCTAAAGTCTCTCTCTTTATCCCATCGTTCTTCAGTCTCGGCTTCGGCTGC
TTCCTCCGTCGTCCACGTCAATGAACCGGAGAAGAAATCAACGAGAACACTTCCGTTTCG
AGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGATTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGAGG
GATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCA
TTGTGTAGTGGATGCTATCTTGGGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATCGGTCAGATCTCCCC
TGACTCTGATCCTAAATGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCCGTGAG
ACTCATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTGGACGCCACATTGATTCTACAGAG
ACCAAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGC
AGATCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAAACTCATGAGAAAGTTGATAGTCTTGGAGA
AAACAGAAGCATTGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGATTCAGATGTAT
CAATCTCATTATAAAAAGATTTTGTTAAATGTAAAGTTACACTTGGTGTAATCACC*TTT
ACAGCCCTTAT*AATCCC*TCTTAGAACCATGAAATCGATCATGTGATGATGATGATATA
TATAAATGGAAATT

QA 2 795 2 795
DS 



AS 1 2

CO CL8538Contig1 602 2 1 U
GGGATCTGTCACTTCCTCACCAAACGCTCTCGAGTTATCCACGAAATCCCGTTAAAAATC
TCACCTTTCGTCAAAATCTTGCCAAATCATCGAGCTTTCGGCTGTCTACGGTTGCTGTAA
AATCTCTGAGTCCAGTCGCGGTGGAGGGTTCGCCGGAGAAGAAAAAGATGGTGAAAGGTA
TCAGAGTTTACGAGCTCCGGATCCTGTTCCGTTATCCGATCTTGCCCCGAAGTCGCTCTT
CTTGACGAGACCTTCCATGATGCAATACAACGAGACTCGAGACGAGCTGTTGGAGTGTGC
GGGTGAGGTTTTCGCCAATGTTGCTTCGGGGGTTATAAAGGCTCGTTTGAACCACAAGTA
CCCGTTGGCTCGTGTGGCTGATGCTCACGCAGACCTTGAGAATAGGATAACATCTGGCTC
CGTTGTCCTCTTGCCGTGAAAACGTGTAATGTTGTTTCTTTTTTTAGTCTTCCAATAAGA
GCAATAAGATTCCTTTGTAGTGGAAAAATACCAAACCTGTGTACTACTTATCTTCCAGTA
AGAGCAGTACGGTTTTTATTATGTTTTCTTTGTACAATCTATTTACGATGTTTTCCTTTT
TC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

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TCACCTTTCGTCAAAATCTTGCCAAATCATCGAGCTTTCGGCTGTCTACGGTTGCTGTAA
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AGAGCAGTACGGTTTTTATTATGTTTTCTTTGTACAATCTATTTACGATGTTTTCCTTTT
TC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CH60JQ C 1
AF RR4CH60TF U 1
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DS 

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CCCTTTTATGTTTCAAGTTTAAATAATAATCCAAGTGCATTGTGAACCC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BJ14TF U 1
AF RR4BJ14JQ C 108
BS 1 791 RR4BJ14TF
BS 792 792 RR4BJ14JQ
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BS 803 943 RR4BJ14JQ

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AAGTTCTCTGGTTTCCTCTTGATAACAATCCTGCTATGTACAGGTTCAGCAACACAGTGA
TTGGGGTCTTAAACCTCCTCAGCTTACTAGCTTCGATACCAATCATAGGAACCGCTCTAT
GGAAGGCAAGAAGCAGCACAACTTGCGAGAACTTCCTCCAGACGCCGCTACTCGTTATAG
GATTCGTCATACTATTAGTATCCCTTGCTGGTTTCATAGGAGCCTGTTTCCACGTGGCAT
GGGCTCTTTGGGTGTACTTAGTTGTCATGATCTTCCTCATAGCGACTCTCATGGGGTTAA
CTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACCAGCCAAGGAGGCGGTGTGGAAGTACCAGGGAGGGTTT
ATAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGTTGAGAGAGAGAGTTAGAGATCAAG
AGTATTGGAACTCCATTAGAAGCTGTATCTTGACTTCAAAGACTTGTTCTAGGATTCAAT
CTTGGACTACACTTGATTATTTCCAAAGGGATATGACTTCTGTTCAGTCGGGATGTTGTA
AGCCACCGACGGCGTGCACGTACGAGACAGGAGTAATAGTAGGAGGAGAAAATCGCCACG
CAGCTCATCCTTATCATCCTTCTGATGATAACCGCATGACCAAAGTCCTTCCTCGTTGGG
ACTATTACTGGTGGAGATGGTGGCATGAAAAGAAAGAACAGCTTTACTGAGAGCCTCGTA
GTCTTTGTTTT*CTTCTTCTTT
CATCATA

QA 1 802 1 802
DS 

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GGAACCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACAACTTGCGAGAACTTCCTCCAGACGCCG
CTACTCGTTATAGGATTCGTCATACTATTAGTATCCCTTGCTGGTTTCATAGGAGCCTGT
TTCCACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTGTACTTAGTTGTCATGATCTTCCTCATAGCGACT
CTCATGGGGTTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACCAGCCAAGGAGGCGGTGTGGAAGTA
CCAGGGAGGGTTTATAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGTTGAGAGAGAGA
GTTAGAGATCAAGAGTATTGGAACTCCATTAGAAGCTGTATCTTGACTTCAAAGACTTGT
TCTAGGATTCAATCTTGGACTACACTTGATTATTTCCAAAGGGATATGACTTCTGTTCAG
TCGGGATGTTGTAAGCCACCGACGGCGTGCACGTACGAGACAGGAGTAATAGTAGGAGGA
GAAAATCGCCACGCAGCTCATCCTTATCATCCTTCTGATGATAACCGCATGACCAAAGTC
CTTCCTCGTTGGGACTATTACTGGTGGAGATGGTGGCATGAAAAGAAAGAACAGCTTTAC
TGAGAGCCTCGTAGTCTTTGTTTTTCTTCTTCTTTTCATCATATTTTTTCTATTTACCAA
CTTGAGATCAAGAAAACACAAAGATAAGAAATGTTGACACTATTGTTTTTTTGTTTGTTT
AAATCATCAAAGAAACATACATGGAAGATGAATATAGACTATGAAATATGCTTTCC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

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TGTCGTTTTTTTTTCTTCTTCTCCATTGGTTCGTTGATTTTCTCAAAAGGGTTGCTGCAA
GTTTTGATTACTTATTCATCATCGAAACTTGAGTTGGAGGAGGAGGATGGGTTGTTTCTC
GTGTTTTGATTCGAGTGACGATGAGACGCTGAATCCAGCTGAGGAATCCAAGGCTCAGAA
ACAATCACAGCCGACAGTTTCTAATAGCTTGTCTGGACTACCTTCAGGTGGGGAGAAGCT
TAGCTCAAAGAGCAATGGAGTCTCGAAAACGGAGCTACTTCTTCCAAGAGATGGGCTTGC
ACAAATCGCTGCTCACACATTTGCTTTCCGCGAGCTCGCTGCCGCTACTATGAACTTCCA
TCCCGACACTTTCTTAGGCGAAGGTGGTTTCGGACGTGTCTACAAAGGAAGGCTTGACAG
CACTGGTCAGGTTGTTGCTGTTAAACAATTGGACAGGAACGGTCTACAAGACATTAATAG
GGAGCGTGCGGTTGCGGAAGCTAAAATGTGGGGAGAGAGTTTGAGGGAGAAACGAAGACA
GAGTGAGCAAGGAACTTCAGAGAGTAACAGCACCGGTTAAAACCGGTTTGGGTTTTAAAC
CCCTTTTTTGTTCTTGTATCACAAATTCTCATTTGTTCTGAAACATAGAAAAAATTAAAG
AAAATAATTTAAAGAAAAAAACATTGGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D365TF U 1
AF RR4D365JQ C 74
BS 1 608 RR4D365TF
BS 609 750 RR4D365JQ

RD RR4D365TF 608 0 0
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TGTCGTTTTTTTTTCTTCTTCTCCATTGGTTCGTTGATTTTCTCAAAAGGGTTGCTGCAA
GTTTTGATTACTTATTCATCATCGAAACTTGAGTTGGAGGAGGAGGATGGGTTGTTTCTC
GTGTTTTGATTCGAGTGACGATGAGACGCTGAATCCAGCTGAGGAATCCAAGGCTCAGAA
ACAATCACAGCCGACAGTTTCTAATAGCTTGTCTGGACTACCTTCAGGTGGGGAGAAGCT
TAGCTCAAAGAGCAATGGAGTCTCGAAAACGGAGCTACTTCTTCCAAGAGATGGGCTTGC
ACAAATCGCTGCTCACACATTTGCTTTCCGCGAGCTCGCTGCCGCTACTATGAACTTCCA
TCCCGACACTTTCTTAGGCGAAGGTGGTTTCGGACGTGTCTACAAAGGAAGGCTTGACAG
CACTGGTCAGGTTGTTGCTGTTAAACAATTGGACAGGAACGGTCTACAAGACATTAATAG
GGAGCGTGCGGTTGCGGAAGCTAAAATGTGGGGAGAGAGTTTGAGGGAGAAACGAAGACA
GAGTGAGC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR4D365JQ 677 0 0
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AGTGACGATGAGACGCTGAATCCAGCTGAGGAATCCAAGGCTCAGAAACAATCACAGCCG
ACAGTTTCTAATAGCTTGTCTGGACTACCTTCAGGTGGGGAGAAGCTTAGCTCAAAGAGC
AATGGAGTCTCGAAAACGGAGCTACTTCTTCCAAGAGATGGGCTTGCACAAATCGCTGCT
CACACATTTGCTTTCCGCGAGCTCGCTGCCGCTACTATGAACTTCCATCCCGACACTTTC
TTAGGCGAAGGTGGTTTCGGACGTGTCTACAAAGGAAGGCTTGACAGCACTGGTCAGGTT
GTTGCTGTTAAACAATTGGACAGGAACGGTCTACAAGACATTAATAGGGAGCGTGCGGTT
GCGGAAGCTAAAATGTGGGGAGAGAGTTTGAGGGAGAAACGAAGACAGAGTGAGCAAGGA
ACTTCAGAGAGTAACAGCACCGGTTAAAACCGGTTTGGGTTTTAAACCCCTTTTTTGTTC
TTGTATCACAAATTCTCATTTGTTCTGAAACATAGAAAAAATTAAAGAAAATAATTTAAA
GAAAAAAACATTGGGGC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL8542Contig1 892 2 4 U
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TTTCATTGTTTTATTCTTCCTTATCAAACAACAAAACAACTGCCTTTTAACTTTTGTTGT
GTTTTCAGTACTGACTTCATATCAATGACACAAAAGTAGATACGTCATGAACACGTGGCC
ACATTTTAGTTGTACCTGAAAGTGAGATCAGATCCACCTAACTTGTCATCCACTAAGGCT
GACAATCTTTCGGCTTGTGGTGGTGATAGATAGTTAACCCAATCACTCACTTCTCCTTTC
CTAAACAAGTGCCTATTCTCAAAGTTCTTGATCGATTTGCTTGACTTGTTCACCTCCAAC
TTCTTTAGATTCTCGAAGCTGCACAGATCCGAGATTGCATGCACAACACCTTTTCGCTCC
TCTTCTTCCGTGAAAGGAACGCCTAAGAAACTTGCAAGCTTCTTCAAGTTGGACTCGATG
TCTTGTTTCAGATCTTCGCACCGTAAGAACAAGACTTTCTCTGGTGTCCTCAAGCTCTCT
CTCCAGTATCCCAACATGTGTTCCCAAAATGGTCCGAACCCGATCACTCCCCTGCAATAC
AGATCAAACCCTTCTTCCAACGAGACGGGACTCACTGCCTCCGACTTTATGTTGTTGATG
TAGTGCCACGAGGAGATGAATGTGTCGAACGGGTTTCGGCACAAGTAGACCACCTTCACG
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GGGCTGGCTAGACCGGAGAGATCAGGAACATCTCCGTTCGCGTAAAGCTTGTACTCGAAG
AAAGGTACGAGGTCATGAGGGTTTGATGTGAGGAGTGGGTGGTCGGTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C766JQ U 1
AF RR4BN91TF C 222
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BS 750 750 RR4BN91TF
BS 751 773 RR4C766JQ
BS 774 892 RR4BN91TF

RD RR4C766JQ 773 0 0
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TTTCATTGTTTTATTCTTCCTTATCAAACAACAAAACAACTGCCTTTTAACTTTTGTTGT
GTTTTCAGTACTGACTTCATATCAATGACACAAAAGTAGATACGTCATGAACACGTGGCC
ACATTTTAGTTGTACCTGAAAGTGAGATCAGATCCACCTAACTTGTCATCCACTAAGGCT
GACAATCTTTCGGCTTGTGGTGGTGATAGATAGTTAACCCAATCACTCACTTCTCCTTTC
CTAAACAAGTGCCTATTCTCAAAGTTCTTGATCGATTTGCTTGACTTGTTCACCTCCAAC
TTCTTTAGATTCTCGAAGCTGCACAGATCCGAGATTGCATGCACAACACCTTTTCGCTCC
TCTTCTTCCGTGAAAGGAACGCCTAAGAAACTTGCAAGCTTCTTCAAGTTGGACTCGATG
TCTTGTTTCAGATCTTCGCACCGTAAGAACAAGACTTTCTCTGGTGTCCTCAAGCTCTCT
CTCCAGTATCCCAACATGTGTTCCCAAAATGGTCCGAACCCGATCACTCCCCTGCAATAC
AGATCAAACCCTTCTTCCAACGAGACGGGACTCACTGCCTCCGACTTTATGTTGTTGATG
TAGTGCCACGAGGAGATGAATGTGTCGAACGGGTTTCGGCACAAGTAGACCACCTTCACG
CCTGGTTCCTCGATGGAAGCCTTGAGAGA*CCGAAAGGGACGTGGGTTGCGAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4BN91TF 671 0 0
CTTGTCATCCACTAAGGCTGACAATCTTTCGGCTTGTGGTGGTGATAGATAGTTAACCCA
ATCACTCACTTCTCCTTTCCTAAACAAGTGCCTATTCTCAAAGTTCTTGATCGATTTGCT
TGACTTGTTCACCTCCAACTTCTTTAGATTCTCGAAGCTGCACAGATCCGAGATTGCATG
CACAACACCTTTTCGTTCCTCTTCTTCCGTGAAAGGAACGCCTAAGAAACTTGCAAGCTT
CTTCAAGTTGGACTCGATGTCTTGTTTCAGATCTTCGTACCGTAAGAACAAGACTTTCTC
TGGTGTCCTCAAGCTCTCTCTCCAGTATCCCAACATGTGTTCCCAAAATGGTCCGAACCC
GATCATTCCCCTGCAATACAGATCAAACCCTTCTTCCAACGAGACGGGACTCACTGCCTC
CGACTTTATGTTGTTGATGTAGTGCCACGAGGAGATGAATGTGTCGAACGGGTTTCGGCA
CAAGTAGACCACCTTCACGCCTGGTTCCTCGATGGAAGCCTTGAGAGAACCGAAAGGGAC
GTGGGTTGCGAATGTTCTTGGGCTGGCTAGACCGGAGAGATCAGGAACATCTCCGTTCGC
GTAAAGCTTGTACTCGAAGAAAGGTACGAGGTCATGAGGGTTTGATGTGAGGAGTGGGTG
GTCGGTGGTTC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL8543Contig1 698 2 2 U
GGAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCTTGAAAACTCCTC
AGATCTCCTCCTCTGTGGGGACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACGCTACTCCTC
CTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTCATTCTCTCCTGCAAAGTTTGGAAT
CTCCAAGGATGTTTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCATCGGCAATCCTCTTGAGTTTGC
AAACAGTTTCTCAGCAGGGATAATCAGTTGTGTTAAACGCACAAACAAGGAAATTGGCAT
AGAAGGCAATTGCAAATTCTATTTCCAAACTGATTGTGCTTTGAATGAGGGTAACTCTGG
AGGTCCGGTTGTTAACCTAGACGGCGAGGTCATTGGCGTTAACTGCGCATTTGGGGACGG
AGTGGGTGTTGGGTTTGCAATACCCATAGACACAGTACTGAAGGTCATGAAGGAGAGAAA
CTGGTAGCCCATAGACACAGTGCTAAAGGTCGTGAAGGAGAGGAACTGGTAGATTCTAGG
ATTTAAAACTCTTAGGTTTAAATCTTTTGTTATGTGGTACTTTGAATGCTCTTAATGTTT
TGTTTCCATCACTCTCTCTGCTGTTTTTTGTTTTTGTTGCTACTCTTATGTGTAACGAAT
ATTGTTCTTGTGTTAAATATCAATGACCCGTGTAACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR4EE66JQ C 1
AF RR4EE66TF U 1
BS 1 694 RR4EE66TF
BS 695 698 RR4EE66JQ

RD RR4EE66JQ 698 0 0
GGAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCTTGAAAACTCCTC
AGATCTCCTCCTCTGTGGGGACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACGCTACTCCTC
CTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTCATTCTCTCCTGCAAAGTTTGGAAT
CTCCAAGGATGTTTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCATCGGCAATCCTCTTGAGTTTGC
AAACAGTTTCTCAGCAGGGATAATCAGTTGTGTTAAACGCACAAACAAGGAAATTGGCAT
AGAAGGCAATTGCAAATTCTATTTCCAAACTGATTGTGCTTTGAATGAGGGTAACTCTGG
AGGTCCGGTTGTTAACCTAGACGGCGAGGTCATTGGCGTTAACTGCGCATTTGGGGACGG
AGTGGGTGTTGGGTTTGCAATACCCATAGACACAGTACTGAAGGTCATGAAGGAGAGAAA
CTGGTAGCCCATAGACACAGTGCTAAAGGTCGTGAAGGAGAGGAACTGGTAGATTCTAGG
ATTTAAAACTCTTAGGTTTAAATCTTTTGTTATGTGGTACTTTGAATGCTCTTAATGTTT
TGTTTCCATCACTCTCTCTGCTGTTTTTTGTTTTTGTTGCTACTCTTATGTGTAACGAAT
ATTGTTCTTGTGTTAAATATCAATGACCCGTGTAACTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4EE66TF 694 0 0
GGAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCTTGAAAACTCCTC
AGATCTCCTCCTCTGTGGGGACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACGCTACTCCTC
CTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTCATTCTCTCCTGCAAAGTTTGGAAT
CTCCAAGGATGTTTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCATCGGCAATCCTCTTGAGTTTGC
AAACAGTTTCTCAGCAGGGATAATCAGTTGTGTTAAACGCACAAACAAGGAAATTGGCAT
AGAAGGCAATTGCAAATTCTATTTCCAAACTGATTGTGCTTTGAATGAGGGTAACTCTGG
AGGTCCGGTTGTTAACCTAGACGGCGAGGTCATTGGCGTTAACTGCGCATTTGGGGACGG
AGTGGGTGTTGGGTTTGCAATACCCATAGACACAGTACTGAAGGTCATGAAGGAGAGAAA
CTGGTAGCCCATAGACACAGTGCTAAAGGTCGTGAAGGAGAGGAACTGGTAGATTCTAGG
ATTTAAAACTCTTAGGTTTAAATCTTTTGTTATGTGGTACTTTGAATGCTCTTAATGTTT
TGTTTCCATCACTCTCTCTGCTGTTTTTTGTTTTTGTTGCTACTCTTATGTGTAACGAAT
ATTGTTCTTGTGTTAAATATCAATGACCCGTGTA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL8544Contig1 1086 2 2 U
GGCTGTGCAAGAACACCTCATAACAGCTGCTGCCACAACCGGGACTTTGGTCAGTAAAGG
TATCACTGAGACTAAAGAAAAGGTTTCCGTTGGAAAGATCAAAGTGGAAGAGGCGGCGAA
AAAGACTGCACAAAAGAGCAAGACCATTTTGACGGATATAGAAAGATGGCAGAAGGGAGT
TGCCAGCTCGGATGTGTTTGGTGTTGCCATTGAGGTCACTGTCCAGAGGCAAGAGTCGAC
CAGGCCTATTCCATTTATACTGATCAAATGCGCAGATCATCTCATTTTAACAGGACTCAA
CTCACCGAGCTTGTTCAAAGCCGAAGGAGACAGAAAGTTGATCCAGCAATTGGTTTCTGC
TTACAATCAAGATCCTAGCGCTTCAATACCTGAAGGAGTGAATCCAGTTGATGTCGCTGC
GCTCATGAAATACTATCTTGCGAGCCTTCCGACACCACTAACTACGTTTGAGCTTTACAA
CGAAATCAAAGATGCAAGATCGAGCGTGAACAGAATGAGAAAGTCACTCCAGAAGCTTTC
CAGTGTGAACTATAATACACTTGAGTTCGTAACAGCGTTATTGCTTCGTGTCAGCCAGAA
ATCACAGCTCAACAAGATGGATTCACACAGCCTAGCTATGGAGATGGCTCCAGTGATCAT
GTGGAGAGAAGACAAGAGGCCTGAATCTTATAGGGAGTATTGGAGACGCCCATCGAGGAG
TCCTAAGAAAAGCAACGACTTTGAAACTGCTTCTCCATGGGACTTGCTCTCAGATGAAGG
AGAAGGTGTAGATGCATCTTCATCAATCCCTCTGGATGATATCGTTCAAGTTGATTTTGG
TGCGGTGGAGGTTGTGCAGTGCCTGATTGAACATCATAACGCTATTTTCACCGATGCAGA
TGAGACTGTATGGAGGTGAAGAAAACAAACAGCTAAGCCAGAAGAACATATGCATGTTGA
TGATGATTAACCTTAACCAGTGTGGTTTAGTAAATACGCTTTGTTTCATATGGTTTTTGA
CTTTTTGTATAACATTGGTTTGAGAAGTAAGAATTCAATATTCGTATTAATTCCTTCTAG
ATATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR4AG31TF U 1
AF RR4AG31JQ C 252
BS 1 775 RR4AG31TF
BS 776 1086 RR4AG31JQ

RD RR4AG31TF 775 0 0
GGCTGTGCAAGAACACCTCATAACAGCTGCTGCCACAACCGGGACTTTGGTCAGTAAAGG
TATCACTGAGACTAAAGAAAAGGTTTCCGTTGGAAAGATCAAAGTGGAAGAGGCGGCGAA
AAAGACTGCACAAAAGAGCAAGACCATTTTGACGGATATAGAAAGATGGCAGAAGGGAGT
TGCCAGCTCGGATGTGTTTGGTGTTGCCATTGAGGTCACTGTCCAGAGGCAAGAGTCGAC
CAGGCCTATTCCATTTATACTGATCAAATGCGCAGATCATCTCATTTTAACAGGACTCAA
CTCACCGAGCTTGTTCAAAGCCGAAGGAGACAGAAAGTTGATCCAGCAATTGGTTTCTGC
TTACAATCAAGATCCTAGCGCTTCAATACCTGAAGGAGTGAATCCAGTTGATGTCGCTGC
GCTCATGAAATACTATCTTGCGAGCCTTCCGACACCACTAACTACGTTTGAGCTTTACAA
CGAAATCAAAGATGCAAGATCGAGCGTGAACAGAATGAGAAAGTCACTCCAGAAGCTTTC
CAGTGTGAACTATAATACACTTGAGTTCGTAACAGCGTTATTGCTTCGTGTCAGCCAGAA
ATCACAGCTCAACAAGATGGATTCACACAGCCTAGCTATGGAGATGGCTCCAGTGATCAT
GTGGAGAGAAGACAAGAGGCCTGAATCTTATAGGGAGTATTGGAGACGCCCATCGAGGAG
TCCTAAGAAAAGCAACGACTTTGAAACTGCTTCTCCATGGGACTTGCTCTCAGAT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4AG31JQ 835 0 0
CATTTATACTGATCAAATGCGCAGATCATCTCATTTTAACAGGACTCAACTCACCGAGCT
TGTTCAAAGCCGAAGGAGACAGAAAGTTGATCCAGCAATTGGTTTCTGCTTACAATCAAG
ATCCTAGCGCTTCAATACCTGAAGGAGTGAATCCAGTTGATGTCGCTGCGCTCATGAAAT
ACTATCTTGCGAGCCTTCCGACACCACTAACTACGTTTGAGCTTTACAACGAAATCAAAG
ATGCAAGATCGAGCGTGAACAGAATGAGAAAGTCACTCCAGAAGCTTTCCAGTGTGAACT
ATAATACACTTGAGTTCGTAACAGCGTTATTGCTTCGTGTCAGCCAGAAATCACAGCTCA
ACAAGATGGATTCACACAGCCTAGCTATGGAGATGGCTCCAGTGATCATGTGGAGAGAAG
ACAAGAGGCCTGAATCTTATAGGGAGTATTGGAGACGCCCATCGAGGAGTCCTAAGAAAA
GCAACGACTTTGAAACTGCTTCTCCATGGGACTTGCTCTCAGATGAAGGAGAAGGTGTAG
ATGCATCTTCATCAATCCCTCTGGATGATATCGTTCAAGTTGATTTTGGTGCGGTGGAGG
TTGTGCAGTGCCTGATTGAACATCATAACGCTATTTTCACCGATGCAGATGAGACTGTAT
GGAGGTGAAGAAAACAAACAGCTAAGCCAGAAGAACATATGCATGTTGATGATGATTAAC
CTTAACCAGTGTGGTTTAGTAAATACGCTTTGTTTCATATGGTTTTTGACTTTTTGTATA
ACATTGGTTTGAGAAGTAAGAATTCAATATTCGTATTAATTCCTTCTAGATATCG

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL8545Contig1 1154 2 2 U
GGAGACCGAACACGAAAACAAAACACGAGTTTAAAGAGATTCATTTGAGCTTTAAGGATT
CAAGAATTCGAAAGAGCTGTCTCTCCTTCGATTCCAGAATCATTTGTAGATCAATAAGGT
TGTATCACTGGTGGCTAAGTTAAAATTATGTCCGATCATCTGAGTTTATGTACGGATCGT
CTCATAACTGCTGAGAGCCTGAAGTCAGAAAAAAAATGCTGATTCTTCTGGAGAGACTTG
CGCGAACTTGGCTTCTTCTTCTTCATCTACGAATGAAGCTGAGGTAGTAGCGAGGCAGAA
CTATGCTGCCGTTGAGGAAGAGGAACCACTTCTCCAGTCTGTTGAGTGCCGTATTTGCCA
GGAGGAAGATACCACTAAGAACCTGGAGGCTCCTTGTATTTGTAATGGCAGTTTGAAGTA
TGCCCATCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACTTGCGAAAT
ATGCCACCAGGCTTATCAACCTGGATATACAGCACCTCTGCCTCCTGATGAAACAATAAT
TCACATTGGTGACAACTGGGAGAATGGAGTTCCCTTGGACTTGAGTGACCCACGCATCCT
GGCAATGGCTGCAGCAGAACGCCATTTCTTGGAAGCTGACTATGACGACTACTCTGAGTC
TAACTCTAGCGGAGCTGCCTTTTGCCGCTCTGCTGCTCTCATCCTAATGGCACTTTTACT
GCTACGTGATGCCCTAAACCTCACAGCTAACCCAGATCGAGGACGACCCAACAGCCTTCT
TCTCGCTTTTCCTTCTCCGTGCTGCCGGTTTTCTCCTGCCATGTTACATCATGGCATGGG
CCATCGGTATACTCCGACGCCGGAGGCAAAGACAGGAAGCAGCTGTAGCTGCGGCGGAAG
TTGCTTTCATGATACACGGTGGTGTGCCTTCCCAACGCAGGGGACTTCACTTTGCTGTAG
TACCACCAGAGCAGCCGCCCATACCCAACCAAACACCTGTCTGATCTTTGAAGTCAGTTT
GATTCTCCGGTAAGACTATTTATTACTAAAGAAAGGAACTGTGAAAAGAATGTCCCCCCT
ACTTATGTTTATCATCATCTTCCTTATATGTTTGTGTTCTCTGAATCTTGTTTAATGTCG
TTATTTCTCTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AL21TF U 1
AF RR4AL21JQ C 329
BS 1 862 RR4AL21TF
BS 863 1154 RR4AL21JQ

RD RR4AL21TF 864 0 0
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TGTATCACTGGTGGCTAAGTTAAAATTATGTCCGATCATCTGAGTTTATGTACGGATCGT
CTCATAACTGCTGAGAGCCTGAAGTCAGAAAAAAAATGCTGATTCTTCTGGAGAGACTTG
CGCGAACTTGGCTTCTTCTTCTTCATCTACGAATGAAGCTGAGGTAGTAGCGAGGCAGAA
CTATGCTGCCGTTGAGGAAGAGGAACCACTTCTCCAGTCTGTTGAGTGCCGTATTTGCCA
GGAGGAAGATACCACTAAGAACCTGGAGGCTCCTTGTATTTGTAATGGCAGTTTGAAGTA
TGCCCATCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACTTGCGAAAT
ATGCCACCAGGCTTATCAACCTGGATATACAGCACCTCTGCCTCCTGATGAAACAATAAT
TCACATTGGTGACAACTGGGAGAATGGAGTTCCCTTGGACTTGAGTGACCCACGCATCCT
GGCAATGGCTGCAGCAGAACGCCATTTCTTGGAAGCTGACTATGACGACTACTCTGAGTC
TAACTCTAGCGGAGCTGCCTTTTGCCGCTCTGCTGCTCTCATCCTAATGGCACTTTTACT
GCTACGTGATGCCCTAAACCTCACAGCTAACCCAGATCGAGGACGACCCAACAGCCTTCT
TCTCGCTTTTCCTTCTCCGTGCTGCCGGTTTTCTCCTGCCATGTTACATCATGGCATGGG
CCATCGGTATACTCCGACGCCG
AG

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR4AL21JQ 826 0 0
CTTCTCCAGTCTGTTGAGTGCCGTATTTGCCAGGAGGAAGATACCACTAAGAACCTGGAG
GCTCCTTGTATTTGTAATGGCAGTTTGAAGTATGCCCATCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGG
TGTAATGAGAAAGGCGACATAACTTGCGAAATATGCCACCAGGCTTATCAACCTGGATAT
ACAGCACCTCTGCCTCCTGATGAAACAATAATTCACATTGGTGACAACTGGGAGAATGGA
GTTCCCTTGGACTTGAGTGACCCACGCATCCTGGCAATGGCTGCAGCAGAACGCCATTTC
TTGGAAGCTGACTATGACGACTACTCTGAGTCTAACTCTAGCGGAGCTGCCTTTTGCCGC
TCTGCTGCTCTCATCCTAATGGCACTTTTACTGCTACGTGATGCCCTAAACCTCACAGCT
AACCCAGATCGAGGACGACCCAACAGCCTTCTTCTCGCTTTTCCTTCTCCGTGCTGCCGG
TTTTCTCCTGCCATGTTACATCATGGCATGGGCCATCGGTATACTCCGACGCCGGAGGCA
AAGACAGGAAGCAGCTGTAGCTGCGGCGGAAGTTGCTTTCATGATACACGGTGGTGTGCC
TTCCCAACGCAGGGGACTTCACTTTGCTGTAGTACCACCAGAGCAGCCGCCCATACCCAA
CCAAACACCTGTCTGATCTTTGAAGTCAGTTTGATTCTCCGGTAAGACTATTTATTACTA
AAGAAAGGAACTGTGAAAAGAATGTCCCCCCTACTTATGTTTATCATCATCTTCCTTATA
TGTTTGTGTTCTCTGAATCTTGTTTAATGTCGTTATTTCTCTACTC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL8546Contig1 558 2 2 U
GGACGCCCTCCTTGTCTGAAAGGATAATGGTGAGCTCCCGTGTGATATTCGTCCCAGTCA
CGATTCTCGTGTTGGTCGTGACCGCGACTGTGGAAGCCGGCGGCTACGAAGACACGTTGG
GATTCATGGTACGAACCGGACCGTCCTCTAACTGTAGAGGATCAATTGCAGATTGTATAT
CGGAAGAAGAAGAGTTCGAACTCGACTCTGAGATCAGCAGGCGCATTTTTGCCTCGAAGA
AGTATGTGAGCTACGGTGCGATGAGAAAGAACAATGTTCCTTGTTCTAGACGCGGCGCAT
CTTACTACAACTGCCAACGTGGCGCTCAGGCTAACCCTTACAGCCGCGGCTGCAGCACAA
TCACGAGGTGCAGACGTTGAAATTTGAATCTCCTGTTTTGCTATTTCGTTTTTTGTGTTG
TTTGTGTTTGTGTATGCGTCTTATATGAATATTTATACGTATTTCACCTACCGATACGTA
TGTGATGGTTTTGTTGTGAAACAAAACATCATACATGTGTTTACCTATGCTCTTCGTTAT
GTGAGTACATTTGATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BF08JQ C 1
AF RR4BF08TF U 17
BS 1 16 RR4BF08JQ
BS 17 558 RR4BF08TF

RD RR4BF08JQ 558 0 0
GGACGCCCTCCTTGTCTGAAAGGATAATGGTGAGCTCCCGTGTGATATTCGTCCCAGTCA
CGATTCTCGTGTTGGTCGTGACCGCGACTGTGGAAGCCGGCGGCTACGAAGACACGTTGG
GATTCATGGTACGAACCGGACCGTCCTCTAACTGTAGAGGATCAATTGCAGATTGTATAT
CGGAAGAAGAAGAGTTCGAACTCGACTTTGAGATCAGCAGGCGCATTTTTGCCTCGAAGA
AGTATGTGAGCTACGGTGCGATGAGAAAGAACAATGTTCCTTGTTCTAGACGCGGCGCAT
CTTACTACAACTGCCAACGTGGCGCTCAGGCTAACCCTTACAGCCGCGGCTGCAGCACAA
TCACGAGGTGCAGACGTTGAAATTTGAATCTCCTGTTTTGCTATTTCGTTTTTTGTGTTG
TTTGTGTTTGTGTATGCGTCTTATATGAATATTTATACGTATTTCACCTACCGATACGTA
TGTGATGGTTTTGTTGTGAAACAAAACATCATACATGTGTTTACCTATGCTTTTCGTTAT
GTGAGTACATTTGATTCG

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR4BF08TF 542 0 0
TGAAAGGATAATGGTGAGCTCCCGTGTGATATTCGTCCCAGTCACGATTCTCGTGTTGGT
CGTGACCGCGACTGTGGAAGCCGGCGGCTACGAAGACACGTTGGGATTCATGGTACGAAC
CGGACCGTCCTCTAACTGTAGAGGATCAATTGCAGATTGTATATCGGAAGAAGAAGAGTT
CGAACTCGACTCTGAGATCAGCAGGCGCATTTTTGCCTCGAAGAAGTATGTGAGCTACGG
TGCGATGAGAAAGAACAATGTTCCTTGTTCTAGACGCGGCGCATCTTACTACAACTGCCA
ACGTGGCGCTCAGGCTAACCCTTACAGCCGCGGCTGCAGCACAATCACGAGGTGCAGACG
TTGAAATTTGAATCTCCTGTTTTGCTATTTCGTTTTTTGTGTTGTTTGTGTTTGTGTATG
CGTCTTATATGAATATTTATACGTATTTCACCTACCGATACGTATGTGATGGTTTTGTTG
TGAAACAAAACATCATACATGTGTTTACCTATGCTCTTCGTTATGTGAGTACATTTGATT
CG

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL8547Contig1 678 2 2 U
GGACATTACCTAGCTACTAGAGATTCGCATCAAATCAAAACAGTTAGTTATAAAGATCCT
AACATCTTTCTCTATACCTGGATGTTGGATAGTTTACCTTTTGATCTCCTCTATGAGATT
CTCTCCAAGTTGGATCCCAAATCTCGGGTTGTAATGCAATCCGTAGATAAAACTATCAAC
ATGCTCATATCCCACGATCCGTATCTCAATTCCAGTATCAAGGGTTCGATTCCAAACCGG
TGCGATGGTAGTGGAGAGGACGACGGTTACGAGTTTACACAGCCTTCCTCCTCTGCGATG
GAAGTAGATGAGAAGGTTGGTCATGATGATAAGTGTATCTTCAATCTAAGCATGATCATG
AGTGCGATTGGTCAAATCTCACCATATGCTCAGAAGCTGGTGAATAAAACGGAAACCCTA
CTTGGTAAAAGATTGTTAATTGAAGATGAAACGAAACTGGAGATGGAGATGGATGTGTCT
TCTTCTTCGTCTGACAAGTTCATGAACGTGGAGAGAATAAACAAAAGAAGCAGATTCGCG
TAGACAAATACATATCGTGCGAGCGAGGAACATATGAGTATGTGGCTTATTTTGGTTAAA
TTGAATAGAAGTTTGATAGTTAAGTCTTTTAAGTTTTCTCTTTTTGGTTCATAATTTTAT
TGCGTTGAGCACCTCCTG


BQ
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AF RR4BC54JQ C 1
AF RR4BC54TF U 133
BS 1 135 RR4BC54JQ
BS 136 678 RR4BC54TF

RD RR4BC54JQ 678 0 0
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TGCGTTGAGCACCTCCTG

QA 1 678 1 678
DS 

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GAA
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ATCTCACCATATGCTCAGAAGCTGGTGAATAAAACGGAAACCCTACTTGGTAAAAGATTG
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AAGTTCATGAACGTGGAGAGAATAAACAAAAGAAGCAGATTCGCGTAGACAAATACATAT
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ATAGTTAAGTCTTTTAAGTTTTCTCTTTTTGGTTCATAATTTTATTGCGTTGAGCACCTC
CTG

QA 4 546 4 546
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CC77JQ C 1
AF RR4CC77TF U 1
BS 1 710 RR4CC77TF

RD RR4CC77JQ 710 0 0
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ACAAGGGTTCCATTCCATGTCCATACTGTCCTGCTCTCAACTTTTCAAACCGCACCTGCC
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GAACAAGTGAATGTCCGTTTGATAGATTGAGAAGGATGTTAGCTGGCTGGTTTTAGATAA
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TGCAAGTTGGTGTTTTTGATTAGCGCACACAAGATGTTTGATACAATGCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4CC77TF 710 0 0
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GTATCAGAGCTTCAGCCGATCTATGGGATTCATGGGTCTTATCATCTCACTAACATTGGT
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ACGGACAGTCATCTCTCTGTCTTTTATTACATCAAAGGAGTTCAAGGTTGAAGCTTTCAT
GGGTTTGATTTCACACGCTTAACCACTCAGGAGCTGGAAGAAGATGACAAACTCTGCAAG
TGGAGCCTGGTTCGTTCTTGCCGATTCATTAAGACCAGACTCAAGCCACTGTCAAGTACT
ACAAGGGTTCCATTCCATGTCCATACTGTCCTGCTCTCAACTTTTCAAACCGCACCTGCC
CTCAAGGAGCACGTCAAATCTGTTTATCTATGGTATGCATCTGTTCTTTTCTCTGCGACA
GAACAAGTGAATGTCCGTTTGATAGATTGAGAAGGATGTTAGCTGGCTGGTTTTAGATAA
GGAATCGTGAGGTTGATTGAATTAGTAGGTTGCGGTTAGTTTCAATGATGGGTTTGGGGC
TGCAAGTTGGTGTTTTTGATTAGCGCACACAAGATGTTTGATACAATGCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL8549Contig1 740 2 6 U
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CCCCAAATCTGCAGCAAACTCCGATCAACTAAACACCTCCGCAGAACTCCTTTCTCCTCT
AGAACTTCAGTAATTACACAAATTACGTATCCTCCTGGGAACGTTTCCGGCTACTCTTGC
GAGCTTCCTCCGTTCTCGTAAACCCTGTCTCCCTTCAGCTTCTCCAATACTCGTCTCCCT
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GAGCTGAAACCTCCGCCTCGCATCTTTTTCTCACAGCGTTGATAATGGAGTTACCTGGAG
CGACGTCCTTCTTAGTCGGAACCGCAGCGAACCTGAACCTCCTGCCCAGGCTTTTCGCTG
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TCCAAGATATTCGTAATTTAATTAAGCCTCATTACCATTTTGCTTTCAGCATGTTACAAG
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BQ
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AF RR4CO89JQ C 1
AF RR4CO89TF U 1
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RD RR4CO89JQ 740 0 0
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AGAACTTCAGTAATTACACAAATTACGTATCCTCCTGGGAACGTTTCCGGCTACTCTTGC
GAGCTTCCTCCGTTCTCGTAAACCCTGTCTCCCTTCAGCTTCTCCAATACTCGTCTCCCT
TCAGCTCTCCTCTGTGATTACTCTCCACCGTAGTAGCTGTTTAAGACGTTCTCTCCTGTT
CCTCATCCGTTGCTCCAGAGCCTTTGAGTGACTTTTCTTTTGTTTCAGCTGCTCCACCTT
GAGCTGAAACCTCCGCCTCGCATCTTTTTCTCACAGCGTTGATAATGGAGTTACCTGGAG
CGACGTCCTTCTTAGTCGGAACCGCAGCGAACCTGAACCTCCTGCCCAGGCTTTTCGCTG
GGCTGGGAATGGGCCTGAAGTATTAAAGTTTGGCCCACTTTACAGATGCTGCTATAATCC
TCCAAGATATTCGTAATTTAATTAAGCCTCATTACCATTTTGCTTTCAGCATGTTACAAG
ACTGTTTCTCACAGAAGTAG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4CO89TF 733 0 0
GGCCATCGACAGAGACCAAAAAAAAAAAATCTTCCCAACATCACGTACTCCGACGAATTC
TCGAGACGTTGCCGGTGACTGCTCCCGTCGTTGCTCTGACGAGTCCATGTAGCTCGTACG
CCGCTACAGCTTCACCATCCTCTCTCTCGTTTCTATTCCTTGTCGGTGAATCCATTTTTT
CCCCAAATCTGCAGCAAACTCCGATCAACTAAACACCTCCGCAGAACTCCTTTCTCCTCT
AGAACTTCAGTAATTACACAAATTACGTATCCTCCTGGGAACGTTTCCGGCTACTCTTGC
GAGCTTCCTCCGTTCTCGTAAACCCTGTCTCCCTTCAGCTTCTCCAATACTCGTCTCCCT
TCAGCTCTCCTCTGTGATTACTCTCCACCGTAGTAGCTGTTTAAGACGTTCTCTCCTGTT
CCTCATCCGTTGCTCCAGAGCCTTTGAGTGACTTTTCTTTTGTTTCAGCTGCTCCACCTT
GAGCTGAAACCTCCGCCTCGCATCTTTTTCTCACAGCGTTGATAATGGAGTTACCTGGAG
CGACGTCCTTCTTAGTCGGAACCGCAGCGAACCTGAACCTCCTGCCCAGGCTTTTCGCTG
GGCTGGGA*TGGGCCTGAAGTATTAAAGTTTGGCCCACTTTACAGATGCTGCTATAATCC
TCCAAGATATTCGTAATTTAATTAAGCCTCATTACCATTT*GCTTTCAGCATGTTACAAG
ACTGTTTCTCACA

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL8550Contig1 637 2 3 U
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AATTAAAAGAAAGACCAAACAACGTGAAAGCACATTAAGGAGTGTGCAAGCATCATGCAT
CCTATACAAAACCCGAATCCTCCATCTACTACCGAGGTGTTGGCGTCAAGACAGACTCAT
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TCGCGTCTTGTATATCCTTCTGCACCTCAAACATGGACGGTCTCATGTTCCCGTGTGGCT
TCACACACAGCAACGCCTTCTCCGCTATCTTCCACATCGACTGGAGACTGTAGTCGTCTT
CCGCTAGCGCTGGATCTATGATCCCTCTTATGTCCCCGTTGTCTATATGCATCTTGGCCC
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AAATAAGCTCAAGAAGAATGACTCCAAAGCTATATAC


BQ
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AF RR4CY34JQ U 10
AF RR4CY34TF C 1
BS 1 9 RR4CY34TF
BS 10 547 RR4CY34JQ
BS 548 637 RR4CY34TF

RD RR4CY34JQ 538 0 0
AATCACGCAGTTCTAAAAATTATATAAAAAATCCAGCTCGAAGCATTTCTTGTAAGCTCG
AGTCTCCAAAAACATAGTCTTACCCTCAAAAACTAAAAAAAAAAAACTAGAAATTAAAAG
AAAGACCAAACAACGTGAAAGCACATTAAGGAGTGTGCAAGCATCATGCATCCTATACAA
AACCCGAATCCTCCATCTACTACCGAGGTGTTGGCGTCAAGACAGACTCATCAATAGACA
CATAGTTCTCACGCATCCCCCCCATGTTGAACGACGACGAATGCGCCGAGCTCCTTGAAA
ACTCATCCGACACCCCTCCTCTTCCCACCAAAGCTTCCTTCTCCATCCTTATCGCGTCTT
GTATATCCTTCTGCACCTCAAACATGGACGGTCTCATGTTCCCGTGTGGCTTCACACACA
GCAACGCCTTCTCCGCTATCTTCCACATCGACTGGAGACTGTAGTCGTCTTCCGCTAGCG
CTGGATCTATGATCCCTCTTATGTCCCCGTTGTCTATATGCATCTTGGCCCATTGGAC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4CY34TF 637 0 0
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AATTAAAAGAAAGACCAAACAACGTGAAAGCACATTAAGGAGTGTGCAAGCATCATGCAT
CCTATACAAAACCCGAATCCTCCATCTACTACCGAGGTGTTGGCGTCAAGACAGACTCAT
CAATAGACACATAGTTCTCACGCATCCCCCCCATGTTGAACGACGACGAATGCGCCGAGC
TCCTTGAAAACTCATCCGACACCCCTCCTCTTCCCACCAAAGCTTCCTTCTCCATCCTTA
TCGCGTCTTGTATATCCTTCTGCACCTCAGACATGGACGGTCTCATGTTCCCGTGTGGCT
TCACACACAGCAACGCCTTCTCCGCTATCTTCCACATCGACTGGAGACTGTAGTCGTCTT
CCGCTAGCGCTGGATCTATGATCCCTCTTATGTCCCCGTTGTCTATATGCATCTTGGCCC
ATTGGACTATGTTTCTGCAGTTGACACCGAAGTTTTCATTAGATATGGCTTCTTGCCCTG
AAATAAGCTCAAGAAGAATGACTCCAAAGCTATATAC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL8551Contig1 1096 2 2 U
GCTGTGGAATCTGTCACTCTGATTTGCATATGATCAAGAATGATTGGGGAGTATCTACTT
ACCCTCTCGTCCCCGGGCATAAGATTGTTGGTGTGGTGACTGAAGTGGGAAGCAAAGTGA
CTAAATTCAAAACTGGAGACAAAGTGGGAGTCGGGTGCATGGTCGGCTCGTGCGGATCAC
GTGACAGCTGCACCGAAGGTCTCGAGAACTACTGTCCAAAAACGATCCAAACGTACGGTT
TTAAGTATTACGACGACACAATAACCTATGGTGGTTACTCAGACAACATGGTCTGCGACG
AATGTTTCATCATCCGTATTCCCGAAAATCTCCCACTGGACGCTGCTGCGCCGCTACTAT
GCGCGGGGATCACGGTCTACTCCCCGCTGAAATACCACGGGCTCGACAAGCCTGGTATGC
ACATTGGTGTGGTTGGACTAGGCGGTTTGGGCCATGTGGCGGTGAAATTTGCTAAGGCTA
TGGGTCTTAAGGTTACGGTTATTAGCACTTCGGATAGTAAGAGAGATGAAGCGATTAATA
GGCTTGGTGCAGACTCGTTCGTGGTGAGCCGTGACCAAAAGCAGATTAAGGATGCGATGA
GGACGTTGGATGGTATTATTAATACCGTATCTGCGACTCATTCGCTTCTCCCATTGCTCG
GTTCGTTAAAGCCTAAGGGAAAACTTGTTATGGTTGGTGTACCAGAAAAGCCACTCGAGC
TCCCGGTCATGCCTCTCATCTTCGAGAGGAAGATGGTAATGGGAAGTATGATAGGAGGGA
TAAAGGAGACGCAAGAGATGGTGGATATGGCCGGAAAACACAACATCACTGCGGATATTG
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TAAGAACTGAAGTTCCACAATGATATTGTTCTTGTTTGGTTTGTTTTAATAAGTTTTATG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DS46TF U 1
AF RR4DS46JQ C 327
BS 1 673 RR4DS46TF
BS 674 1096 RR4DS46JQ

RD RR4DS46TF 673 0 0
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ACCCTCTCGTCCCCGGGCATAAGATTGTTGGTGTGGTGACTGAAGTGGGAAGCAAAGTGA
CTAAATTCAAAACTGGAGACAAAGTGGGAGTCGGGTGCATGGTCGGCTCGTGCGGATCAC
GTGACAGCTGCACCGAAGGTCTCGAGAACTACTGTCCAAAAACGATCCAAACGTACGGTT
TTAAGTATTACGACGACACAATAACCTATGGTGGTTACTCAGACAACATGGTCTGCGACG
AATGTTTCATCATCCGTATTCCCGAAAATCTCCCACTGGACGCTGCTGCGCCGCTACTAT
GCGCGGGGATCACGGTCTACTCCCCGCTGAAATACCACGGGCTCGACAAGCCTGGTATGC
ACATTGGTGTGGTTGGACTAGGCGGTTTGGGCCATGTGGCGGTGAAATTTGCTAAGGCTA
TGGGTCTTAAGGTTACGGTTATTAGCACTTCGGATAGTAAGAGAGATGAAGCGATTAATA
GGCTTGGTGCAGACTCGTTCGTGGTGAGCCGTGACCAAAAGCAGATTAAGGATGCGATGA
GGACGTTGGATGGTATTATTAATACCGTATCTGCGACTCATTCGCTTCTCCCATTGCTCG
GTTCGTTAAAGCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR4DS46JQ 770 0 0
AATCTCCCACTGGACGCTGCTGCGCCGCTACTATGCGCGGGGATCACGGTCTACTCCCCG
CTGAAATACCACGGGCTCGACAAGCCTGGTATGCACATTGGTGTGGTTGGACTAGGCGGT
TTGGGCCATGTGGCGGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTCTTAAGGTTACGGTTATTAGC
ACTTCGGATAGTAAGAGAGATGAAGCGATTAATAGGCTTGGTGCAGACTCGTTCGTGGTG
AGCCGTGACCAAAAGCAGATTAAGGATGCGATGAGGACGTTGGATGGTATTATTAATACC
GTATCTGCGACTCATTCGCTTCTCCCATTGCTCGGTTCGTTAAAGCCTAAGGGAAAACTT
GTTATGGTTGGTGTACCAGAAAAGCCACTCGAGCTCCCGGTCATGCCTCTCATCTTCGAG
AGGAAGATGGTAATGGGAAGTATGATAGGAGGGATAAAGGAGACGCAAGAGATGGTGGAT
ATGGCCGGAAAACACAACATCACTGCGGATATTGAGCTTATCTCTGCGGATTATGTCAAC
ACTGCCATGGAACGGCTTGAGAAGGCCGACGTTAGATACCGTTTTGTGATTGATGTTGCC
AACACATTGAAGCCTGCTCCTTAATTATAAATCTTAAGAACTGAAGTTCCACAATGATAT
TGTTCTTGTTTGGTTTGTTTTAATAAGTTTTATGTTGTTTTGAGAACGTTGTGTTGCTAT
GCAGTATACCTTGATCAAATTAATAAACTTATACATCCTTATACCCTAGC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL8552Contig1 979 2 2 U
GGACGAAATCGATCGGAAACAATGGCGGACGAACACAAGCACGAAGAAACTCTCCCTAAT
TCGGATCCGGCGGTGGAAATCGTAGAGAGAGAATCGTTGATGGAGAAGATATCCGAGAAG
ATCCACCACAAAGGCGACTCGTCGTCATCGTCAGATGACGAGAGCGACAAGAAACCGTCG
TCTCTGAAATCGAAGGTTTACCGTTTGTTCGGCAGAGAGAGGCCCGTTCATAAGGTTCTC
GGTGGGGGAAAACCGGCTGATATATTTATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCAGGTGGTGTG
CTCGGTGGCGCCACAGTAGCTTGGGTGCTCTTTGAACTCATGGAGTATCATCTTCTCACT
CTGCTGTGTCACGTTATGATCGTCGCTCTCGCTGTGCTGTTTCTTTGGTCTAATGTCACC
ATGTCCATTCACAAGTCTACACCAAAGATTCCTGAAGTACATATCCCTGAGGAGCCTCTT
CTTCAGCTTGCATCTGGGCTCAGAATCGAAATCAACCGTGGGTTTTCTTCTCTTCACGAT
ATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAATTCCTCTCTGCTCTGCTCGGGCTGTGGATTCTA
TCAATCTTGGGTGGATGCTGTAGTTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTGGTTCTACTC
TTCACTGTTCCTCTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTAGACTCATATGGTGAGAAA
GCAATGGCTGAGTTGAAGAAGCATTATGCTGTGTTGGACGCAAAGGTATTGAGCAAAATC
CCAAAGGGTCCATTAAGGACAAGAAGAAAGATTAGGAGTCGTTTTCTTTTTCTACTTCTT
TTTTTTTTTTTGCATGCATGTGCACAGTGTTCTGGTTTTTGAAATGTGGGATTGTGTTGT
GAAATGGTAGTCTAAAATTTGTGTTAGCTCATCTTGTCGCTCTCGATTCTCGAATTTACT
TATAAACTCTGCTTCTGCC


BQ
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AF RR4BC85TF U 1
AF RR4BC85JQ C 169
BS 1 811 RR4BC85TF
BS 812 979 RR4BC85JQ

RD RR4BC85TF 811 0 0
GGACGAAATCGATCGGAAACAATGGCGGACGAACACAAGCACGAAGAAACTCTCCCTAAT
TCGGATCCGGCGGTGGAAATCGTAGAGAGAGAATCGTTGATGGAGAAGATATCCGAGAAG
ATCCACCACAAAGGCGACTCGTCGTCATCGTCAGATGACGAGAGCGACAAGAAACCGTCG
TCTCTGAAATCGAAGGTTTACCGTTTGTTCGGCAGAGAGAGGCCCGTTCATAAGGTTCTC
GGTGGGGGAAAACCGGCTGATATATTTATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCAGGTGGTGTG
CTCGGTGGCGCCACAGTAGCTTGGGTGCTCTTTGAACTCATGGAGTATCATCTTCTCACT
CTGCTGTGTCACGTTATGATCGTCGCTCTCGCTGTGCTGTTTCTTTGGTCTAATGTCACC
ATGTCCATTCACAAGTCTACACCAAAGATTCCTGAAGTACATATCCCTGAGGAGCCTCTT
CTTCAGCTTGCATCTGGGCTCAGAATCGAAATCAACCGTGGGTTTTCTTCTCTTCACGAT
ATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAATTCCTCTCTGCTCTGCTCGGGCTGTGGATTCTA
TCAATCTTGGGTGGATGCTGTAGTTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTGGTTCTACTC
TTCACTGTTCCTCTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTAGACTCATATGGTGAGAAA
GCAATGGCTGAGTTGAAGAAGCATTATGCTGTGTTGGACGCAAAGGTATTGAGCAAAATC
CCAAAGGGTCCATTAAGGACAAGAAGAAAGA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4BC85JQ 811 0 0
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CATAAGGTTCTCGGTGGGGGAAAACCGGCTGATATATTTATGTGGAAGAACAAGAAGATG
TCAGGTGGTGTGCTCGGTGGCGCCACAGTAGCTTGGGTGCTCTTTGAACTCATGGAGTAT
CATCTTCTCACTCTGCTGTGTCACGTTATGATCGTCGCTCTCGCTGTGCTGTTTCTTTGG
TCTAATGTCACCATGTCCATTCACAAGTCTACACCAAAGATTCCTGAAGTACATATCCCT
GAGGAGCCTCTTCTTCAGCTTGCATCTGGGCTCAGAATCGAAATCAACCGTGGGTTTTCT
TCTCTTCACGATATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAATTCCTCTCTGCTCTGCTCGGG
CTGTGGATTCTATCAATCTTGGGTGGATGCTGTAGTTTCTTGACATTGGCATACATAGCT
CTGGTTCTACTCTTCACTGTTCCTCTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTAGACTCA
TATGGTGAGAAAGCAATGGCTGAGTTGAAGAAGCATTATGCTGTGTTGGACGCAAAGGTA
TTGAGCAAAATCCCAAGGGGTCCATTAAGGACAAGAAGAAAGATTAGGAGTCGTTTTCTT
TTTCTACTTCTTTTTTTTTTTTTGCATGCATGTGCACAGTGTTCTGGTTTTTGAAATGTG
GGATTGTGTTGTGAAATGGTAGTCTAAAATTTGTGTTAGCTCATCTTGTCGCTCTCGATT
CTCGAATTTACTTATAAACTCTGCTTCTGCC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL8553Contig1 1039 2 8 U
GGACTCACTCTCTATCCAAACAATTAAAAAAAAAAGGTACATAAAGAAGAAAAAAAAGAC
AAGTTCCGGAAAACAACGCAGCATCGCCGTCGTCGTACCAAGAATCTTTAATATTTTTTT
GGTATCTCCCTTTGATTCTTTCGAATTGATTCGGTTTTGGAATCGAGAAAGAAATGGATT
CTGATTCATGGAGTGATCGTCTCGCATCGGCTTCACGAAGATACCAGCTCGATTTCTTGT
CTCGATCTGATAACTTCTTGGGGTTTGAGGAGGTAGAGGGAGAAGATGAGTTCAGGGAAG
AGTATGCTTGCCCCTTCTGCTCAGACTACTTTGATATCGTCTCTCTCTGCTGCCACATAG
ACGAAGATCATCCCACTGAAACAATCAATGGGGTATGTCCCGGTTGTGCGGTGAAAGTGA
GCTCTGATATGGTTGCTCATATAACTCTTCAACATGCAAATATGTTCAAGGTGACAACGA
AAAAAAGAAAATCAAGAAGAGGCGGGGTTCAATCCATGTTATCAATCTTGAAGAGAGAGT
TTCCTGATGGAAACTTCCAGAGCTTGTTTGAAGGATCTTCACGTGTTGTTGTACCTTCTT
CTTCCTCCAGTATTGCTGCTGACCCTTTGCTGTCTTCCTTTATTTCTCCAATGGCGGATG
GACTTTTCATTTCAGAGACGATTTCTGCCGAAAAGACATCAACCCAGAGTTTGCCTGAAC
GGAGTGTTGAGAAGAAGTCGCTTTCAGCAGAGGATCACAGAGAAAAGTTGAAACAGAGCG
AGTCCGTTCAAGGGGTTTTCTGCTCAATGATTCTTGATGACTTTTATAAAGGAAGAGATA
AAATAAATAACTTTGTCTACGAGTATTAGATCATTCAACTGTTGGAACAAATGTAATGGA
GTTGTTGTTTATTTTCAACAAGTGATATGGTGGGAGGATAACCAAGAATAATGTTAGAGA
AGCTTTGTATTGAAAGAGTCAAAAGAGATACATGAATAATGAGTATTATTTATCTTATTG
AACACATTTTTTCTTTGAC


BQ
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AF RR4BW05TF U 1
AF RR4BW05JQ C 318
BS 1 752 RR4BW05TF
BS 753 753 RR4BW05JQ
BS 754 765 RR4BW05TF
BS 766 766 RR4BW05JQ
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BS 769 771 RR4BW05JQ
BS 772 794 RR4BW05TF
BS 795 1039 RR4BW05JQ

RD RR4BW05TF 794 0 0
GGACTCACTCTCTATCCAAACAATTAAAAAAAAAAGGTACATAAAGAAGAAAAAAAAGAC
AAGTTCCGGAAAACAACGCAGCATCGCCGTCGTCGTACCAAGAATCTTTAATATTTTTTT
GGTATCTCCCTTTGATTCTTTCGAATTGATTCGGTTTTGGAATCGAGAAAGAAATGGATT
CTGATTCATGGAGTGATCGTCTCGCATCGGCTTCACGAAGATACCAGCTCGATTTCTTGT
CTCGATCTGATAACTTCTTGGGGTTTGAGGAGGTAGAGGGAGAAGATGAGTTCAGGGAAG
AGTATGCTTGCCCCTTCTGCTCAGACTACTTTGATATCGTCTCTCTCTGCTGCCACATAG
ACGAAGATCATCCCACTGAAACAATCAATGGGGTATGTCCCGGTTGTGCGGTGAAAGTGA
GCTCTGATATGGTTGCTCATATAACTCTTCAACATGCAAATATGTTCAAGGTGACAACGA
AAAAAAGAAAATCAAGAAGAGGCGGGGTTCAATCCATGTTATCAATCTTGAAGAGAGAGT
TTCCTGATGGAAACTTCCAGAGCTTGTTTGAAGGATCTTCACGTGTTGTTGTACCTTCTT
CTTCCTCCAGTATTGCTGCTGACCCTTTGCTGTCTTCCTTTATTTCTCCAATGGCGGATG
GACTTTTCATTTCAGAGACGATTTCTGCCGAAAAGACATCAACCCAGAGTTTGCCTGAAC
GGAGTGTTGAGAAGAAGTCGCTTTCAGCAGAG*ATCACAGAGAAA*GT**GAACAGAGCG
AGTCCGTTCAAGGG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR4BW05JQ 722 0 0
TGCTCAGACTACTTTGATATCGTCTCTCTCTGCTGCCACATAGACGAAGATCATCCCACT
GAAACAATCAATGGGGTATGTCCCGGTTGTGCGGTGAAAGTGAGCTCTGATATGGTTGCT
CATATAACTCTTCAACATGCAAATATGTTCAAGGTGACAACGAAAAAAAGAAAATCAAGA
AGAGGCGGGGTTCAATCCATGTTATCAATCTTGAAGAGAGAGTTTCCTGATGGAAACTTC
CAGAGCTTGTTTGAAGGATCTTCACGTGTTGTTGTACCTTCTTCTTCCTCCAGTATTGCT
GCTGACCCTTTGCTGTCTTCCTTTATTTCTCCAATGGCGGATGGACTTTTCATTTCAGAG
ACGATTTCTGCCGAAAAGACATCAACCCAGAGTTTGCCTGAACGGAGTGTTGAGAAGAAG
TCGCTTTCAGCAGAGGATCACAGAGAAAAGTTGAAACAGAGCGAGTCCGTTCAAGGGGTT
TTCTGCTCAATGATTCTTGATGACTTTTATAAAGGAAGAGATAAAATAAATAACTTTGTC
TACGAGTATTAGATCATTCAACTGTTGGAACAAATGTAATGGAGTTGTTGTTTATTTTCA
ACAAGTGATATGGTGGGAGGATAACCAAGAATAATGTTAGAGAAGCTTTGTATTGAAAGA
GTCAAAAGAGATACATGAATAATGAGTATTATTTATCTTATTGAACACATTTTTTCTTTG
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL8554Contig1 917 2 12 U
GGGCGCTGGCGAATCGTCCCAGACCTGGTGTTAGAGAATATGTCTGTGTGTCCGCGATCT
GAGCGTAGATCACGTCTGAGTATCTTCGTTCCAAGGAAGAGCTAGTTAATGGACAGTCCA
ATGAGATCTATCTTTAATAAAACACATAGCTTCCCACATTCAGAATGATATATCTAAAGC
GATTCAGAGAGACTACTACGTGTACTTTGTTCCTCGTATGTCTGTTGCGTGTGAGAAGCA
ACACTTATCCAATCAGCAGCTGCCACATCCTCGTCTAGTAACAACCTTGACCCGGTATGT
GGCACACCGAACCGTCTGAGTAGACCATCCTCTGTTTTACATTGAACCGGCTCTAATTCC
AGAGCTAACAGTTTAGATATCGGTCATCATCCTGAGCTTGATTTTGAACCGTTCAAGGCA
ACATTGGTTGCCCAAGATGTTGTGCCCTTTGCGGCAATGATCGCAGTGGAGTGTACCACG
GTTTGATCGTCCACACTGTTCAAAGCTGCGACCTTGAGAGGATTCAGTTTTTATGTCTTT
GTCTTCTACTCCTATGTTGTTGCTACACTCGTCCTATTTACACTTTCCATCATCTTTGGA
AGGAAGAGAAGATTACCTTCGCCCAAGTCTCCTCTCTTCTTCAAGATTTTCTTACTTACG
CTTCTTGGGCTCACCTCGCGTATAGCTGGTTGTAAAGGAATAGAATATAGTTCCCCAACT
CTTTCTTCTGCTATAAGCAACCTCACACCAGCTTTCACCTTCATGCTTGCCGTCTTCTTC
AGGTGTGTTTTTGCTTCATGGGATGCTCGTAAAAGGATGGAACAAATAATGTTAAGAAGC
TCTGCAACACAGGCTAAAATCATTGGCACAATAGTATCTATATCTGGTGCTCTTGTTATT
GTTCTTTATAAAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES32TF U 1
AF RR4ES32JQ C 246
BS 1 699 RR4ES32TF
BS 700 700 RR4ES32JQ
BS 701 770 RR4ES32TF
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BS 792 792 RR4ES32JQ
BS 793 810 RR4ES32TF
BS 811 917 RR4ES32JQ

RD RR4ES32TF 810 0 0
GGGCGCTGGCGAATCGTCCCAGACCTGGTGTTAGAGAATATGTCTGTGTGTCCGCGATCT
GAGCGTAGATCACGTCTGAGTATCTTCGTTCCAAGGAAGAGCTAGTTAATGGACAGTCCA
ATGAGATCTATCTTTAATAAAACACATAGCTTCCCACATTCAGAATGATATATCTAAAGC
GATTCAGAGAGACTACTACGTGTACTTTGTTCCTCGTATGTCTGTTGCGTGTGAGAAGCA
ACACTTATCCAATCAGCAGCTGCCACATCCTCGTCTAGTAACAACCTTGACCCGGTATGT
GGCACACCGAACCGTCTGAGTAGACCATCCTCTGTTTTACATTGAACCGGCTCTAATTCC
AGAGCTAACAGTTTAGATATCGGTCATCATCCTGAGCTTGATTTTGAACCGTTCAAGGCA
ACATTGGTTGCCCAAGATGTTGTGCCCTTTGCGGCAATGATCGCAGTGGAGTGTACCACG
GTTTGATCGTCCACACTGTTCAAAGCTGCGACCTTGAGAGGATTCAGTTTTTATGTCTTT
GTCTTCTACTCCTATGTTGTTGCTACACTCGTCCTATTTACACTTTCCATCATCTTTGGA
AGGAAGAGAAGATTACCTTCGCCCAAGTCTCCTCTCTTCTTCAAGATTTTCTTACTTACG
CTTCTTGGGCTCACCTCGCGTATAGCTGGTTGTAAAGGA*TAGAATATAGTTCCCCAACT
CTTTCTTCTGCTATAAGCAACCTCACACCAGCTTTCACCTTCATGCTTGC*GTCT*CTTC
AG*TGTGTTTT*GCTTCATGGGATGCTCGT

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR4ES32JQ 672 0 0
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ACCGAACCGTCTGAGTAGACCATCCTCTGTTTTACATTGAACCGGCTCTAATTCCAGAGC
TAACAGTTTAGATATCGGTCATCATCCTGAGCTTGATTTTGAACCGTTCAAGGCAACATT
GGTTGCCCAAGATGTTGTGCCCTTTGCGGCAATGATCGCAGTGGAGTGTACCACGGTTTG
ATCGTCCACACTGTTCAAAGCTGCGACCTTGAGAGGATTCAGTTTTTATGTCTTTGTCTT
CTACTCCTATGTTGTTGCTACACTCGTCCTATTTACACTTTCCATCATCTTTGGAAGGAA
GAGAAGATTACCTTCGCCCAAGTCTCCTTTTTTCTTCAAGATTTTCTTACTTACGCTTCT
TGGGCTCACCTCGCGTATAGCTGGTTGTAAAGGAATAGAATATAGTTCCCCAACTCTTTC
TTCTGCTATAAGCAACCTCACACCAGCTTTCACCTTCATGCTTGCCGTCTTCTTCAGGTG
TGTTTTTGCTTCATGGGATGCTCGTAAAAGGATGGAACAAATAATGTTAAGAAGCTCTGC
AACACAGGCTAAAATCATTGGCACAATAGTATCTATATCTGGTGCTCTTGTTATTGTTCT
TTATAAAGGCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL8555Contig1 1002 2 2 U
GTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTGGCGGTGGTCTCAGGCAT
GGCTGCTTTGGTTCTGCTGAGATTCATTGTCCACGATCACGACAATCTTTTCGTGGCCGC
CGAAGCTGTTCACTCCATCGGGATCTGTGTTCTCATCTACAAACTTATGAAAGAAAAGAC
CTGCGCCGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTTACGGCGATATTTCTAGCAGTTAGTCT
GTATTGCAGCTTTGTGATGGAGTATGATATACACACCATCCTGGATCTGGCTACTCTTGG
AACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGTTTTAAGTTAAGGCCTAGTTACATGCAGGA
CAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCCTGTGTTGTCTTAGCCGTGTTGAT
CCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCTTGGGCATTATGTGTGTACCT
CGAAGCTGTTTCAGTTCTGCCTCAGCTGCGCGTGATGCAGAACACCGAGATTGTTGAACC
GTTCACAGCGCATTATGTATTTGCACTAGGAGTAGCAAGGTTCCTTAGCTGTGCACACTG
GGTTTTACAGGTTGTGGACACGAGAGGAAGATTGCTGGTAGCATTGGGATATGGGATTGT
GGCCATCAATGGTTCTCATCTCAGAGATTGTTCAAACTTTCATTCTTGCTGATTTCTGTT
ACTACTACGTCAAAAGTGTATTCGGAGGGCAGCTTGTTCTCCGTCTTCCGTCTGGAGTAG
TTTAAAGTTACAAAGATAGAAAATACTCCAATGGTGTAGCTTGCCCAAGTCAGGATCAGG
AAAGGCAGGCAGCTTCTTTACCTCTTCCCTTATACAGTTTTATGTATCAGAAGGTGACTC
TTGTTACGAATTAATTTTACTGTGTTGTATATTTATGATTATTGAAGGTGGTTTTCACTT
CTTTGTGGCTGATTGAGAAAAAAAGAAGCAAATAGCGAACCT


BQ
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AF RR4A967TF U 1
AF RR4A967JQ C 195
BS 1 729 RR4A967TF
BS 730 1002 RR4A967JQ

RD RR4A967TF 729 0 0
GTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTGGCGGTGGTCTCAGGCAT
GGCTGCTTTGGTTCTGCTGAGATTCATTGTCCACGATCACGACAATCTTTTCGTGGCCGC
CGAAGCTGTTCACTCCATCGGGATCTGTGTTCTCATCTACAAACTTATGAAAGAAAAGAC
CTGCGCCGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTTACGGCGATATTTCTAGCAGTTAGTCT
GTATTGCAGCTTTGTGATGGAGTATGATATACACACCATCCTGGATCTGGCTACTCTTGG
AACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGTTTTAAGTTAAGGCCTAGTTACATGCAGGA
CAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCCTGTGTTGTCTTAGCCGTGTTGAT
CCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCTTGGGCATTATGTGTGTACCT
CGAAGCTGTTTCAGTTCTGCCTCAGCTGCGCGTGATGCAGAACACCGAGATTGTTGAACC
GTTCACAGCGCATTATGTATTTGCACTAGGAGTAGCAAGGTTCCTTAGCTGTGCACACTG
GGTTTTACAGGTTGTGGACACGAGAGGAAGATTGCTGGTAGCATTGGGATATGGGATTGT
GGCCATCAATGGTTCTCATCTCAGAGATTGTTCAAACTTTCATTCTTGCTGATTTCTGTT
ACTACTACG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4A967JQ 808 0 0
CACTGAAATCTCAGGAGCTTACGGCGATATTTCTAGCAGTTAGTCTGTATTGCAGCTTTG
TGATGGAGTATGATATACACACCATCCTGGATCTGGCTACTCTTGGAACAACTCTCTGGG
TTATATTTATGATCCGTTTTAAGTTAAGGCCTAGTTACATGCAGGACAAAGACAACTTTG
CTCTCTATTATGTGCTTGTGCCCTGTGTTGTCTTAGCCGTGTTGATCCATCCATCGACCT
CTCACAACATATTAAACAGGATTTCTTGGGCATTATGTGTGTACCTCGAAGCTGTTTCAG
TTCTGCCTCAGCTGCGCGTGATGCAGAACACCGAGATTGTTGAACCGTTCACAGCGCATT
ATGTATTTGCACTAGGAGTAGCAAGGTTCCTTAGCTGTGCACACTGGGTTTTACAGGTTG
TGGACACGAGAGGAAGATTGCTGGTAGCATTGGGATATGG*ATTGTGGCCATCAATGGTT
CTCATCTCAGAGATTGTTCAAACTTTCATTCTTGCTGATTTCTGTTACTACTACGTCAAA
AGTGTATTCGGAGGGCAGCTTGTTCTCCGTCTTCCGTCTGGAGTAGTTTAAAGTTACAAA
GATAGAAAATACTCCAATGGTGTAGCTTGCCCAAGTCAGGATCAGGAAAGGCAGGCAGCT
TCTTTACCTCTTCCCTTATACAGTTTTATGTATCAGAAGGTGACTCTTGTTACGAATTAA
TTTTACTGTGTTGTATATTTATGATTATTGAAGGTGGTTTTCACTTCTTTGTGGCTGATT
GAGAAAAAAAGAAGCAAATAGCGAACCT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL8556Contig1 1044 2 2 U
GGGCTGTTCTCTATTTCTTCTGAATCCGAGGAGCAGAGAGCGAGAAGCTGTAAAACCCTA
GAAGTAGAACAATGGTGAAGCTCACAGCTGATTTGATCTGGAACAGTCCTCACTTCTTCA
ATGCCATCAAGGAGCGAGAGTTGGAGCTAAGAGGCAACAAGATTCCTGTAATCGAGAACT
TGGGTGCTACCGAGGACCAGTTCGATACAATAGATCTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGC
TGGAAAACTTCCCACTTCTCAACCGGTTAGGGACTCTGATTGTAAATAACAATCGGATCA
CTCGGATAAACCCTAACATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTTTGGTTCTTACGA
ACAACAGGCTTGTGAATTTGGTTGAGATCGATCCCCTTGCCTCCATTCCGAAGCTTCAGT
ACCTTAGTTTATTGGATAATAATATCACCAAAAGGCCGAATTATCGCCTTTATGTGATTC
ACAAGCTTAAATCGCTTCGGGTACTGGATTTCATTAAAGTCAAAGACAAGGAGAGAGCTG
AAGCTGCGGCTTTGTTTTCATCTAAGGAAGCAGAAGAAGAGGTTAAGAAGGTATCTCAGC
AGGAGGTTCAAAAAGTGTCGGATACTACAGAAGATGCAGAGGCTCCTAAAGTTGTGGCCC
CAACACAGGAGCAAATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATCAATTCCCAGACGATAGAAG
AAATTGCCAGACTCGAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTCCTGCAGGCCTGATAGTTC
CTGATCCTGCATCTGGTGTTAATGACGGTTCTGGTCCTATGGAGGAATAGAAAGTGTAGC
TACTGCTCGAATGCTCAAATTATCGTCTGACAAGCTTCACGGTTCTGTAAGGTTTCTGTC
ACTTCCTTAGGAGAATTTGTAATGTACTTCTGCTCAAGAGCATCTGTCTTGAACCGTTGA
AAAGAATGACAAAAGAAGATTGTAATCTTTAACCTGCATTTGCAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGGCTGCACACAGATTTTACT


BQ
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AF RR4GY28TF U 1
AF RR4GY28JQ C 248
BS 1 598 RR4GY28TF
BS 599 1044 RR4GY28JQ

RD RR4GY28TF 598 0 0
GGGCTGTTCTCTATTTCTTCTGAATCCGAGGAGCAGAGAGCGAGAAGCTGTAAAACCCTA
GAAGTAGAACAATGGTGAAGCTCACAGCTGATTTGATCTGGAACAGTCCTCACTTCTTCA
ATGCCATCAAGGAGCGAGAGTTGGAGCTAAGAGGCAACAAGATTCCTGTAATCGAGAACT
TGGGTGCTACCGAGGACCAGTTCGATACAATAGATCTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGC
TGGAAAACTTCCCACTTCTCAACCGGTTAGGGACTCTGATTGTAAATAACAATCGGATCA
CTCGGATAAACCCTAACATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTTTGGTTCTTACGA
ACAACAGGCTTGTGAATTTGGTTGAGATCGATCCCCTTGCCTCCATTCCGAAGCTTCAGT
ACCTTAGTTTATTGGATAATAATATCACCAAAAGGCCGAATTATCGCCTTTATGTGATTC
ACAAGCTTAAATCGCTTCGGGTACTGGATTTCATTAAAGTCAAAGACAAGGAGAGAGCTG
AAGCTGCGGCTTTGTTTTCATCTAAGGAAGCAGAAGAAGAGGTTAAGAAGGTATCTCA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4GY28JQ 797 0 0
CTTCCCACTTCTCAACCGGT*AGGGACTCTGATTGTAAATAACAATCGGATCACTCGGAT
AAACCCTAACATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTTTGGTTCTTACGAACAACAG
GCTTGTGAATTTGGTTGAGATCGATCCCCTTGCCTCCATTCCGAAGCTTCAGTACCTTAG
TTTATTGGATAATAATATCACCAAAAGGCCGAATTATCGCCTTTATGTGATTCACAAGCT
TAAATCGCTTCGGGTACTGGATTTCATTAAAGTCAAAGACAAGGAGAGAGCTGAAGCTGC
GGCTTTGTTTTCATCTAAGGAAGCAGAAGAAGAGGTTAAGAAGGTATCTCAGCAGGAGGT
TCAAAAAGTGTCGGATACTACAGAAGATGCAGAGGCTCCTAAAGTTGTGGCCCCAACACA
GGAGCAAATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATCAATTCCCAGACGATAGAAGAAATTGC
CAGACTCGAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTCCTGCAGGCCTGATAGTTCCTGATCC
TGCATCTGGTGTTAATGACGGTTCTGGTCCTATGGAGGAATAGAAAGTGTAGCTACTGCT
CGAATGCTCAAATTATCGTCTGACAAGCTTCACGGTTCTGTAAGGTTTCTGTCACTTCCT
TAGGAGAATTTGTAATGTACTTCTGCTCAAGAGCATCTGTCTTGAACCGTTGAAAAGAAT
GACAAAAGAAGATTGTAATCTTTAACCTGCATTTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGC
TGCACACAGATTTTACT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL8557Contig1 758 2 1 U
GGATCAAACTTTGGTATATTTTCCTTCACTCACAGAAGCAAAAATGGTTCTATATCTAAT
TATATCTGTAATCACCATCATCATCACCACCAACATGCTTTATCAACGGTGGTGGGCATC
CAACATACCTCCAGGACCAAAGCCACGGTTTCTACTCGGAAACATTCATGAACTGAAACC
ACATTGGACTCATTCTTTTTCTGAATGGTCACAAACATATGGTCCCATCATATCGGTATG
GTTTGGAACAAACCTCTCTGTCGTTGTCTCTAACGCTGATTTAGCCAGACAAGTGTTGAA
AGACAACGACCATCAGTTGTGTAACCGAGAAAGGGTCGCAAAGATGACACAGTCAGGTAC
TGATCTCGTTTGGTCTGACTACAGTCCACATTACGTGAAGCTGAGGAAACTATGCACGCT
CGAGCTTTTCTCTTTGAAGAGCATTGAGAGTTTCAGATTGTTGAGAGAGATGGAGACAAG
GTCCATGGTCGAGTCGGTTTACAAGGACGTGATGATAGATTCAACAGATGGTCAGACTAG
AAAACCAGTGGTCGTGAGGAAGTATCTAGCTGCTGTTGTTTTGAACACAATCTCAAAGTT
AATGATCGGGAAACAGTTCAGCGCCGAGGAAGGTAAAGAGTTCAAAGAGATTGTCCACAA
AGAACATTTTCTTAGTGGCTCGGGGAGCTTGTTAGATGTCATATGGTGGCTCAATGGGTT
TCTAAGTGGCTCGTTACGACAAGGACTTCTTGGCGCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H004TF U 1
AF RR4FE69TF U 1
BS 1 758 RR4FE69TF

RD RR4H004TF 173 0 0
GGATCAAACTTTGGTATATTTTCCTTCACTCACAGAAGCAAAAATGGTTCTATATCTAAT
TATATCTGTAATCACCATCATCATCACCACCAACATGCTTTATCAACGGTGGTGGGCATC
CAACATACCTCCAGGACCAAAGCCACGGTTTCTACTCGGAAACATTCATGA
CT

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR4FE69TF 758 0 0
GGATCAAACTTTGGTATATTTTCCTTCACTCACAGAAGCAAAAATGGTTCTATATCTAAT
TATATCTGTAATCACCATCATCATCACCACCAACATGCTTTATCAACGGTGGTGGGCATC
CAACATACCTCCAGGACCAAAGCCACGGTTTCTACTCGGAAACATTCATGAACTGAAACC
ACATTGGACTCATTCTTTTTCTGAATGGTCACAAACATATGGTCCCATCATATCGGTATG
GTTTGGAACAAACCTCTCTGTCGTTGTCTCTAACGCTGATTTAGCCAGACAAGTGTTGAA
AGACAACGACCATCAGTTGTGTAACCGAGAAAGGGTCGCAAAGATGACACAGTCAGGTAC
TGATCTCGTTTGGTCTGACTACAGTCCACATTACGTGAAGCTGAGGAAACTATGCACGCT
CGAGCTTTTCTCTTTGAAGAGCATTGAGAGTTTCAGATTGTTGAGAGAGATGGAGACAAG
GTCCATGGTCGAGTCGGTTTACAAGGACGTGATGATAGATTCAACAGATGGTCAGACTAG
AAAACCAGTGGTCGTGAGGAAGTATCTAGCTGCTGTTGTTTTGAACACAATCTCAAAGTT
AATGATCGGGAAACAGTTCAGCGCCGAGGAAGGTAAAGAGTTCAAAGAGATTGTCCACAA
AGAACATTTTCTTAGTGGCTCGGGGAGCTTGTTAGATGTCATATGGTGGCTCAATGGGTT
TCTAAGTGGCTCGTTACGACAAGGACTTCTTGGCGCAT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL8558Contig1 933 2 8 U
GCTAGAGAAAGAGATACTTCTAGCCAAACTTCGGGATGATGAGGAGAAAGCCAATTGTGC
TGCGTCCGGTGAAGCTCCTGATCTGAATGATACCCAGTTTACTAAACTGGATGAGCCCTT
GACTCAGACCCAACTCTACTCTGAGTTTATTTTTGAGAAAATGGAGGATATCACAAAAGC
AAATCTCCTTTTTGCCTTTTTGTTGGTTAAAGAACATGATTTTTCTTAATTGAGTTAGTG
TGCTTTGGTAGAATGGGATAGAAGGTGAGACTCTAAAAGCCGAGCCTGAGAAGAAAGGAG
GTCGTGGACGCAAAAAAAGGATGCTACTCAGGCCGCCAATCTGAAGGTTAATAAAGCTGT
TGCTGCATGATTTCAAGAGCTAAAGGTCATATATCTGCCAACTCAGATCTGAGAGAGGAA
AAAAGGCATGAAAGAGCAGAGTGAATTCATGGGAATCTCTACTCCTCCTGATTGGAGATC
TCAACAACTTCCTCTCCAACTCTGACAAGCAGAAGCTTATTTTATTTGCAAGGTTCGGAT
TGCTCGGAAATTTTCAGCTATATAGAGGGCTTGGATGGTGAGCCAAAACTATATCTTGAG
ACAAAATGGTTTGTACTATGTCTCTTGCACTCTGCTGCAGCAAAAAAATTAGACAGATCT
CCCTCATCTCTCACTGCAACCAATGTGTCAATCACAATGTCACCATTGTTGTAAAGCCCA
TAGGTAAAGTTGATGTACTTCAAGAAGCTTTCATGGCTATCCTCAAACTCGAAAAGGAGG
TTTCTGCAATAATTTTAAGTTGCTCGATAAAAAGATCTATTACATTATATTTCATTTGAT
TCCTTTGTAAGAAACTATTTTCACACCTAATGCGTTCTTGCTTGCTTTCAAATAACCATG
TTTTCAGATGTATTAATCTTTTATTTAAATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB52TF U 1
AF RR4CB52JQ C 220
BS 1 647 RR4CB52TF
BS 648 648 RR4CB52JQ
BS 649 696 RR4CB52TF
BS 697 697 RR4CB52JQ
BS 698 723 RR4CB52TF
BS 724 724 RR4CB52JQ
BS 725 766 RR4CB52TF
BS 767 933 RR4CB52JQ

RD RR4CB52TF 770 0 0
GCTAGAGAAAGAGATACTTCTAGCCAAACTTCGGGATGATGAGGAGAAAGCCAATTGTGC
TGCGTCCGGTGAAGCTCCTGATCTGAATGATACCCAGTTTACTAAACTGGATGAGCCCTT
GACTCAGACCCAACTCTACTCTGAGTTTATTTTTGAGAAAATGGAGGATATCACAAAAGC
AAATCTCCTTTTTGCCTTTTTGTTGGTTAAAGAACATGATTTTTCTTAATTGAGTTAGTG
TGCTTTGGTAGAATGGGATAGAAGGTGAGACTCTAAAAGCCGAGCCTGAGAAGAAAGGAG
GTCGTGGACGCAAAAAAAGGATGCTACTCAGGCCGCCAATCTGAAGGTTAATAAAGCTGT
TGCTGCATGATTTCAAGAGCTAAAGGTCATATATCTGCCAACTCAGATCTGAGAGAGGAA
AAAAGGCATGAAAGAGCAGAGTGAATTCATGGGAATCTCTACTCCTCCTGATTGGAGATC
TCAACAACTTCCTCTCCAACTCTGACAAGCAGAAGCTTATTTTATTTGCAAGGTTCGGAT
TGCTCGGAAATTTTCAGCTATATAGAGGGCTTGGATGGTGAGCCAAAACTATATCTTGAG
ACAAAATGGTTTGTACTATGTCTCTTGCACTCTGCTGCAGCAAAAAA*TTAGACAGATCT
CCCTCATCTCTCACTGCAACCAATGTGTCAATCACA*TGTCACCATTGTTGTAAAGCCCA
TAG*TAAAGTTGATGTACTTCAAGAAGCTTTCATGGCTATCCTCAA
CTCG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR4CB52JQ 714 0 0
TTTTTCTTAATTGAGTTAGTGTGCTTTGGTAGAATGGGATAGAAGGTGAGACTCTAAAAG
CCGAGCCTGAGAAGAAAGGAGGTCGTGGACGCAAAAAAAGGATGCTACTCAGGCCGCCAA
TCTGAAGGTTAATAAAGCTGTTGCTGCATGATTTCAAGAGCTAAAGGTCATATATCTGCC
AACTCAGATCTGAGAGAGGAAAAAAGGCATGAAAGAGCAGAGTGAATTCATGGGAATCTC
TACTCCTCCTGATTGGAGATCTCAACAACTTCCTCTCCAACTCTGACAAGCAGAAGCTTA
TTTTATTTGCAAGGTTCGGATTGCTCGGAAATTTTCAGCTATATAGAGGGCTTGGATGGT
GAGCCAAAACTATATCTTGAGACAAAATGGTTTGTACTATGTCTCTTGCACTCTGCTGCA
GCAAAAAAATTAGACAGATCTCCCTCATCTCTCACTGCAACCAATGTGTCAATCACAATG
TCACCATTGTTGTAAAGCCCATAGGTAAAGTTGATGTACTTCAAGAAGCTTTCATGGCTA
TCCTCAAACTCGAAAAGGAGGTTTCTGCAATAATTTTAAGTTGCTCGATAAAAAGATCTA
TTACATTATATTTCATTTGATTCCTTTGTAAGAAACTATTTTCACACCTAATGCGTTCTT
GCTTGCTTTCAAATAACCATGTTTTCAGATGTATTAATCTTTTATTTAAATCAC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL8559Contig1 1029 2 4 U
GCCTTCCAAGGGGTTTATTTGTGATGCACAAGGCTACACAACTCATTTCTTCTGCGTAGC
TTCCTTCTTGTGGACAACCACTATTGCTTTCACTCTTCACCGCACTGTGGTTAAGCATAA
GACTGATGTTTAGGATTTGGAAGCCATGTTTCACTTGTATGTCTGGGGAACATCCTTGGT
TGTTACTGTTATACGTTCTTTTGGTAATAACCACTCGCATTTGGGGCCTTGGTGCTGGAC
TCAAACTGGTCTGAAAGGAAAAGCTGTTCATTTCTTAACTTTCTACGCTCCTCTTTGGGG
TGCCATTCTCTACAATGGGTTTACATACTTCCAAGTGATACGGATGCTTAGAAACGCTAG
ACGTATGGCAGTTGGAATGTCAGACCGAGTGGATCAGTTTGATAATAGAGCAGAGTTAAA
GGTGTTGAACCGTTGGGGATACTATCCACTCATTCTGATAGGATCATGGGCATTTGGTAC
CATCAACCGTATTCATGATTTCATCGAGCCAGGCCATAAGATCTTCTGGCTCTCGGCTCT
TGACGTGGGAACAGCTGCACTAATGGGCTTGTTCAGTTCAATAGCATATGGTTTCAACAG
CTCAGTGCGCAAAGCAATCCATGAAAGACTGGAACTGTTCTTGCCGGAGCGGATATATCG
ATGGCTTCCGAGCAATTTAAGACCAAAGAACCACCATCTGATTATGCACCAACAACAACA
ACGGCAGCGAAGTGAAATGGTCTCACTAAAGACGGAGGAGCAGCAATGATCACTAACTTT
TCAACATTGTGTTTCGTGGACCGATAACAAGAAGGCGGCGTATTATGATAATAGCAATTT
GGGTGGAGATTGGTAAGTTTTTGCCTTTAATGTCCTACGTTTATGAGTCCCAATGTGTTC
TTCTTTCTAGTATCTTTAGATATGGTGAGGGATGCACAACAGTGCGTTCATGTATATGAA
TCATTCTTTGGAGCACGAATTTGACAAACCATTATTTTTTTATTTATCATGCAAACATGT
CTCTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BG88TF U 1
AF RR4BG88JQ C 530
BS 1 757 RR4BG88TF
BS 758 758 RR4BG88JQ
BS 759 806 RR4BG88TF
BS 807 1029 RR4BG88JQ

RD RR4BG88TF 808 0 0
GCCTTCCAAGGGGTTTATTTGTGATGCACAAGGCTACACAACTCATTTCTTCTGCGTAGC
TTCCTTCTTGTGGACAACCACTATTGCTTTCACTCTTCACCGCACTGTGGTTAAGCATAA
GACTGATGTTTAGGATTTGGAAGCCATGTTTCACTTGTATGTCTGGGGAACATCCTTGGT
TGTTACTGTTATACGTTCTTTTGGTAATAACCACTCGCATTTGGGGCCTTGGTGCTGGAC
TCAAACTGGTCTGAAAGGAAAAGCTGTTCATTTCTTAACTTTCTACGCTCCTCTTTGGGG
TGCCATTCTCTACAATGGGTTTACATACTTCCAAGTGATACGGATGCTTAGAAACGCTAG
ACGTATGGCAGTTGGAATGTCAGACCGAGTGGATCAGTTTGATAATAGAGCAGAGTTAAA
GGTGTTGAACCGTTGGGGATACTATCCACTCATTCTGATAGGATCATGGGCATTTGGTAC
CATCAACCGTATTCATGATTTCATCGAGCCAGGCCATAAGATCTTCTGGCTCTCGGCTCT
TGACGTGGGAACAGCTGCACTAATGGGCTTGTTCAGTTCAATAGCATATGGTTTCAACAG
CTCAGTGCGCAAAGCAATCCATGAAAGACTGGAACTGTTCTTGCCGGAGCGGATATATCG
ATGGCTTCCGAGCAATTTAAGACCAAAGAACCACCATCTGATTATGCACCAACAACAACA
ACGGCAGCGAAGTGAAATGGTCTCACTAAAGACGGAG*AGCAGCAATGATCACTAACTTT
TCAACATTGTGTTTCGTGGACCGATA
CA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4BG88JQ 500 0 0
CTCTCGGCTCTTGACGTGGGAACAGGTGCACTAATGGGCTTGTTCAGTTCAATAGCATAT
GGTTTCAACAGCTCAGTGCGCAAAGCAATCCATGAAAGACTGGAACTGTTCTTGCCGGAG
CGGATATATCGATGGCTTCCGAGCAATTTAAGACCAAAGAACCACCATCTGATTATGCAC
CAACAACAACAACGGCAGGGAAGTGAAATGGTCTCACTAAAGACGGAGGAGCAGCAATGA
TCACTAACTTTTCAACATTGTGTTTCGTGGACCGATAACAAGAAGGCGGCGTATTATGAT
AATAGCAATTTGGGTGGAGATTGGTAAGTTTTTGCCTTTAATGTCCTACGTTTATGAGTC
CCAATGTGTTCTTCTTTCTAGTATCTTTAGATATGGTGAGGGATGCACAACAGTGCGTTC
ATGTATATGAATCATTCTTTGGAGCACGAATTTGACAAACCATTATTTTTTTATTTATCA
TGCAAACATGTCTCTTACAT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8561Contig1 909 2 4 U
GGTCTCCCACTTCGACAACGACGGTCTAACGCCGTTAATGCACGCCGCTAAAACCGGAAA
CTCCGAGATAATCTCCGCATTGCTCGAAGCGGGAGCTCCATGGAACGCATTATCCCCATC
AAACCTCTCAGCGGGAGACTTCGCCATGGAAGCAGGGCACCAGTAGCGTTCGATCTCCTC
CTCATAACCGGGATCCAATCCGAGCTGATCCTGGGAACCATCGCTCACAAAGAGACCAAG
AACGAGTACTCTAACAAAGAGCATCTCCAAGACCGAGTCACCTTCAGCGAGGACAAGATA
ATGGATAACGAGAGCAAAGGAGTCATGACGGCTTGGGAGAAGCCGTTGATGGAAGCTCAC
GCTAAAGCCATATGCACAAGCGGTGGATCGATTCTCAACGTCGGCTTCGGTATGGGACTG
GTGGATACAGCGATACAGCGGTATAATCCGACCAAACACACGATCGTCGAAGCTCATCCG
GATGTGTACAAGCGTATGATCGAGTCCGGTTGGGGTGAGAAGGAGAACGTGAGGATTGTG
TTCGGGAGGTGGCAAGATGTTGTCGATGAGCTTGATGAATGTGGCTACGATGGGGTCTTT
TTTGATACGTATGGAGAGTATTACGAAGATTTGTGGGAGTTTCATCAGAGACTTCCGAAG
CTTTTGAAGCCTGATGGGGTTTATTCGTATTTCAATGGGTTTTGCGGGAGCAATGCGTTT
TTTCATGTTGTGTATTGTAATCTGGTGACGTTGGAGATTGAGAGTTTGGGGTTTAGTACT
CAGTTGATTCCTTTGCCTGTTAAGGATTGTCTTGGTGATGAAGTTTGGGAAGGTGTCAAG
CAAAAATATTGGCAGCTTGATACTTATTATCTCCCTGTTTGTCAGTTTAGTGAGTGAGGT
TCTACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE33TF U 1
AF RR4EE33JQ C 212
BS 1 739 RR4EE33TF
BS 740 740 RR4EE33JQ
BS 741 750 RR4EE33TF
BS 751 909 RR4EE33JQ

RD RR4EE33TF 750 0 0
GGTCTCCCACTTCGACAACGACGGTCTAACGCCGTTAATGCACGCCGCTAAAACCGGAAA
CTCCGAGATAATCTCCGCATTGCTCGAAGCGGGAGCTCCATGGAACGCATTATCCCCATC
AAACCTCTCAGCGGGAGACTTCGCCATGGAAGCAGGGCACCAGTAGCGTTCGATCTCCTC
CTCATAACCGGGATCCAATCCGAGCTGATCCTGGGAACCATCGCTCACAAAGAGACCAAG
AACGAGTACTCTAACAAAGAGCATCTCCAAGACCGAGTCACCTTCAGCGAGGACAAGATA
ATGGATAACGAGAGCAAAGGAGTCATGACGGCTTGGGAGAAGCCGTTGATGGAAGCTCAC
GCTAAAGCCATATGCACAAGCGGTGGATCGATTCTCAACGTCGGCTTCGGTATGGGACTG
GTGGATACAGCGATACAGCGGTATAATCCGACCAAACACACGATCGTCGAAGCTCATCCG
GATGTGTACAAGCGTATGATCGAGTCCGGTTGGGGTGAGAAGGAGAACGTGAGGATTGTG
TTCGGGAGGTGGCAAGATGTTGTCGATGAGCTTGATGAATGTGGCTACGATGGGGTCTTT
TTTGATACGTATGGAGAGTATTACGAAGATTTGTGGGAGTTTCATCAGAGACTTCCGAAG
CTTTTGAAGCCTGATGGGGTTTATTCGTATTTCAATGGGTTTTGCGGGAGCAATGCGTTT
TTTCATGTTGTGTATTGTA*TCTGGTGACG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4EE33JQ 698 0 0
TGGGAACCATCGCTCACAAAGAGACCAAGAACGAGTACTCTAACAAAGAGCATCTCCAAG
ACCGAGTCACCTTCAGCGAGGACAAGATAATGGATAACGAGAGCAAAGGAGTCATGACGG
CTTGGGAGAAGCCGTTGATGGAAGCTCACGCTAAAGCCATATGCACAAGCGGTGGATCGA
TTCTCAACGTCGGCTTCGGTATGGGACTGGTGGATACAGCGATACAGCGGTATAATCCGA
CCAAACACACGATCGTCGAAGCTCATCCGGATGTGTACAAGCGTATGATCGAGTCCGGTT
GGGGTGAGAAGGAGAACGTGAGGATTGTGTTCGGGAGGTGGCAAGATGTTGTCGATGAGC
TTGATGAATGTGGCTACGATGGGGTCTTTTTTGATACGTATGGAGAGTATTACGAAGATT
TGTGGGAGTTTCATCAGAGACTTCCGAAGCTTTTGAAGCCTGATGGGGTTTATTCGTATT
TCAATGGGTTTTGCGGGAGCAATGCGTTTTTTCATGTTGTGTATTGTAATCTGGTGACGT
TGGAGATTGAGAGTTTGGGGTTTAGTACTCAGTTGATTCCTTTGCCTGTTAAGGATTGTC
TTGGTGATGAAGTTTGGGAAGGTGTCAAGCAAAAATATTGGCAGCTTGATACTTATTATC
TCCCTGTTTGTCAGTTTAGTGAGTGAGGTTCTACAGCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL8562Contig1 696 2 1 U
GGAAGTTCGTCATGGTGGGAAGATGTTCAACATCATCACAATGATCATGCAAGCTCCATT
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BQ
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QA 1 696 1 696
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BQ
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AF RR4H277TF C 1
AF RR4H277JQ U 7
BS 1 6 RR4H277TF
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QA 1 526 1 526
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BQ
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AF RR4GB80TF U 1
AF RR4GB80JQ C 269
BS 1 706 RR4GB80TF
BS 707 707 RR4GB80JQ
BS 708 737 RR4GB80TF
BS 738 994 RR4GB80JQ

RD RR4GB80TF 737 0 0
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GGTATCTACAAGAAGATCTCTTGATAGAGATATTCATCAGAGTTCCAATATCAGACTGGG
AACAAATCTCCTCCGTTAGAAAGCAGTGGGCTCATTTGTTCCGTGGAGAATGCTTATGGC
AGGCCGCTTTGAACCGAGCGTATCCTCTTGCTAGCAAAACTCAGAGATGGACTGGACCAA
TCAGTCAAGGGTCAAGCAAACGGTTTATATAATCTATATGCAAAAGAAGCCACCTGAAAC
GTTTTCATTCTTCCATATTATTCTTATTAGGTAGATTCAAAACTTAATAGAGTTTTTAGC
TTTTCAGGAGATTTATGGCTCTATACATCAGCAGAAACATATTAGGCGTGGATACAGAAG
ACATAGATGAAATGCTCGGACATATTTACTTATTCTTGGAAGATCAGCTTCAACTTTCAA
CTACGCCTGCTTCAGGCCTTCTGCACGGAACCATGATCGACCAATTGATTGTTTGTGGTA
AATCCAAAGAAGAAGCTGATGAGCTCGTTACAAAGATTTGGCTGGCTCTTCTCGACAACT
TAGAGGACACAAGACATACCTTTCTTGTTCTGAAGTCCATTGCACA*GAATATGATGGTT
TTCTTCCGTATCCATAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4GB80JQ 726 0 0
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ATAATCTATATGCAAAAGAAGCCACCTGAAACGTTTTCATTCTTCCATATTATTCTTATT
AGGTAGATTCAAAACTTAATAGAGTTTTTAGCTTTTCAGGAGATTTATGGCTCTATACAT
CAGCAGAAACATATTAGGCGTGGATACAGAAGACATAGATGAAATGCTCGGACATATTTA
CTTATTCTTGGAAGATCAGCTTCAACTTTCAACTACGCCTGCTTCAGGCCTTCTGCACGG
AACCATGATCGACCAATTGATTGTTTGTGGTAAATCCAAAGAAGAAGCTGATGAGCTCGT
TACAAAGATTTGGCTGGCTCTTCTCGACAACTTAGAGGACACAAGACATACCTTTCTTGT
TTTGAAGTCCATTGCACAAGAATATGATGGTTTTCTTCCGTATCCATATTCAAGACCGAT
CAAAGTGCAATGGAAAGTGTTTGAGAAACTGTTTGTGGACTTCCGGGACCTGTTGTTTGA
TCATTCGGAGTACTGCGACTTAATAGGAATCGCCAAGAAGAAGTTTCAGACAATACCACA
TCTTTGGTTAGGCTATTAACTTAAACCAAAGACATTCATTAAAGTCTCCATCGTCTGTAA
GAAAAACGTATAAAACACTGATTCTTTATGTGTCATGTAATATTCATGTTTGCTTTCTAA
AAGTAG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL8565Contig1 1256 2 2 U
AAAACGTGTCACAGAGTGGCGAATCACGCGACGAGCTTCGACCCCTTGCCTTGCCTCTTC
TTCTTCATAGCTTTGATTATTCTTCCGTCTTCTAAAGAAGAAGGATGAAGAACGAGGAAC
AGTCAAGATCTCTGTTTGGAATCTCTCTGTCTGATCGACCAACATGGCAACAGTTTCTCA
TCTGCACTTCTGGTTTCTTCTTTGGTTACCTCGTCAACGGAGTTTGCGAGGAATATGTTT
ATAATCGCCTGCAATTTAGCTTTGGTTGGTACTTCACGTTTATACAAGGATTTGTCTACT
TGTTCCTGATCTACCTTCAGGGGTTCACCACAAAGCATATTGTGAATCCTATGAGAACAT
ATGTCAAACTATCTGCTGTTCTCATGGGATCACATGGTTTAACCAAAGGCTCTTTGGCTT
ATCTCAATTATCCTGCTCAAATCATGTTCAAATCCACTAAGGTGTTGCCTGTGATGATAA
TGGGAGCGTTCATACCCGGTCTGAGGAGAAAATACCCGGTCCACGAATACATTTCAGCCT
TCTTGCTGGTTCTTGGTTTGATACTATTCACATTAGCAGACGCACAAATGTCTCCAAACT
TCATTATGATTGGGATTTTGATGATTACTGGTGCATTGATCATGGATGCTTTCTTGGGTA
ATCTTCAAGAAGCCATTTTCACAATGAACCCCGAGACAACTCAGATGGAGATGCTTTTCT
GCTCAACGGTTGTTGGACTACCGTTCTTGTTCGTTCCCATGGTCTTAACCGGAGAGCTTT
TCCGTGCTTGGACTGCGTGCTGGCAACATCCGTATGTGTACGGTGTGCTTGTATTCGAAG
CTATGGCCACATTTATCGGTCAAGTTTCGGTTCTATCTCTTATTGCCCTATTTGGAGCCG
CTACAACCGCCTTGATAACAACGGCTAGGAAAGGAGTCACGTTGTTGCTGTCGTATTTGA
TATTCACCAAGCCATTGACTGAGCAGCACGGGTCAGGATTGCTGTTGATAGCAATGGGAA
TAGTGTTGAAGATGGTTCCGATGGATAGTAAACCTCCTAGCAAGATTCCGGCGAGACAAG
CGGTTAGGAACGGTGGAGGTGAGGGTGATAGAGATGAGGATGAAGAGAGGAAGTCATTGG
TTTAATAAATGTTGCCATGTATCTATCTTCTATATATACATTTTATTTCAGAAGTTTTAA
AGGATTTATAGACAAAAGAAAGAAACACAAAAGATGGGGATGAAGGCAAATAGGAC


BQ
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AF RR4FV78TF U 1
AF RR4FV78JQ C 566
BS 1 708 RR4FV78TF
BS 709 1256 RR4FV78JQ

RD RR4FV78TF 708 0 0
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TTCTTCATAGCTTTGATTATTCTTCCGTCTTCTAAAGAAGAAGGATGAAGAACGAGGAAC
AGTCAAGATCTCTGTTTGGAATCTCTCTGTCTGATCGACCAACATGGCAACAGTTTCTCA
TCTGCACTTCTGGTTTCTTCTTTGGTTACCTCGTCAACGGAGTTTGCGAGGAATATGTTT
ATAATCGCCTGCAATTTAGCTTTGGTTGGTACTTCACGTTTATACAAGGATTTGTCTACT
TGTTCCTGATCTACCTTCAGGGGTTCACCACAAAGCATATTGTGAATCCTATGAGAACAT
ATGTCAAACTATCTGCTGTTCTCATGGGATCACATGGTTTAACCAAAGGCTCTTTGGCTT
ATCTCAATTATCCTGCTCAAATCATGTTCAAATCCACTAAGGTGTTGCCTGTGATGATAA
TGGGAGCGTTCATACCCGGTCTGAGGAGAAAATACCCGGTCCACGAATACATTTCAGCCT
TCTTGCTGGTTCTTGGTTTGATACTATTCACATTAGCAGACGCACAAATGTCTCCAAACT
TCATTATGATTGGGATTTTGATGATTACTGGTGCATTGATCATGGATGCTTTCTTGGGTA
ATCTTCAAGAAGCCATTTTCACAATGAACCCCGAGACAACTCAGATGG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4FV78JQ 691 0 0
ATTCACATTAGCAGACGCACAAATGTCTCCAAACTTCATTATGATTGGGATTTTGATGAT
TACTGGTGCATTGATCATGGATGCTTTCTTGGGTAATCTTCAAGAAGCCATTTTCACAAT
GAACCCCGAGACAACTCAGATGGAGATGCTTTTCTGCTCAACGGTTGTTGGACTACCGTT
CTTGTTCGTTCCCATGGTCTTAACCGGAGAGCTTTTCCGTGCTTGGACTGCGTGCTGGCA
ACATCCGTATGTGTACGGTGTGCTTGTATTCGAAGCTATGGCCACATTTATCGGTCAAGT
TTCGGTTCTATCTCTTATTGCCCTATTTGGAGCCGCTACAACCGCCTTGATAACAACGGC
TAGGAAAGGAGTCACGTTGTTGCTGTCGTATTTGATATTCACCAAGCCATTGACTGAGCA
GCACGGGTCAGGATTGCTGTTGATAGCAATGGGAATAGTGTTGAAGATGGTTCCGATGGA
TAGTAAACCTCCTAGCAAGATTCCGGCGAGACAAGCGGTTAGGAACGGTGGAGGTGAGGG
TGATAGAGATGAGGATGAAGAGAGGAAGTCATTGGTTTAATAAATGTTGCCATGTATCTA
TCTTCTATATATACATTTTATTTCAGAAGTTTTAAAGGATTTATAGACAAAAGAAAGAAA
CACAAAAGATGGGGATGAAGGCAAATAGGAC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8566Contig1 707 2 3 U
TTTTGCAAGAAAAGCTGTAAGATGGGAGTGTTGTGTTTTAACAAAGTTCTCGATGCTAAC
AGAAAATTGCTGATATCAAATGAAAAGAAACAATAACTATCGATCTTTGAGTTCCTGCTC
GAACTGAGCAAGTTTAAGGCGTATAGGCTCCAAGAACTGCTTCATATCCAACCGAACTTG
CTGCTTCAGTTGCTGGGAAAGCTCTTTGTCTTCACTGAGTTTCACATTCACCTCAAGATC
ATCAAGCTCGCCGAAAGAGAACTCAGGAATGTCGAGACTCCCCTTCACCTTTTTTGCGTC
CTCGTTAACAGACCACTCTCCTTGGACTTTGAGGGAAAGCTCGTAAGTATAGCCAACTCT
CTTCTTGTTCCGAACAGTGACCAAGAAAGCATCTCCAACACATCTGCTAACATCTATAAT
CTCAGCTTTTCCAGAAGAGAATTGAAGTGAACCCACTGACACCAGCAGCTCCTTTAATCG
ATCAGTGGCCCATTTAGTGAGATTTTTTTCCTCCCAAGTGCCAGCCTGATTCCAGAGGGA
GCCGAGGGCAGGAGGAGCATTGGAAGCGACGTCGTTGTTGTTGTTGGTGAGCTTTTGTGG
CTGAGGAGGAGGAGCTGCGTCCGCTGTGGCTTCTCTCACCCAGTACCTATACGATCCCTC
TTTCTTCTTCTCCTCCTCCATTATTTTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTC


BQ
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AF RR4F588JQ U 5
AF RR4F588TF C 1
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DS 

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CTTCTTGTTCCGAACAGTGACCAAGAAAGCATCTCCAACACATCTGCTAACATCTATAAT
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TTTCTTCTTCTCCTCCTCCATTATTTTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACAGTGCCAACGTACGGTCACCTGCTTAACCACATGTGCTTTGCGATACGAGAGGCTCAG
TCTCGCCTCGCCAGTGATGGGCACTACACAAACCCTGATGAGACCCCGGTGCCACTTCTA
ACATCATCTGAGGTATTCGACATATATGCTACAAAGTTTGTGCTCTGAAGGCTGTCTGTC
ACCTATTCTGCAAATAAGCTACTACACGCATACACATCTTCTTTATCTATATGTATAAAT
CATGTAATGATATCTCTGCAGCATACTTGCCAAAGCTGTAACAAGTATCTTTCTTTAAAT
AATTA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4E481TF U 1
AF RR4E481JQ C 547
BS 1 641 RR4E481TF
BS 642 1265 RR4E481JQ

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CGTTGTGGTAGATGGATGTGGGCTCAACCTGGGGTTAGTTCCATCCAATGCTCAACCTGC
CATTCTGTCACGCAGCTCTCCTCCCTCGTGGACATAGCGCGTGGTGCGAACCGCGTGCTT
CAAGGGCTTCAACAGCTGCGCAGACAACACAAACAACAGCAACCGCAGCATCAGCAACAA
ATATTGGCTCAACAGCCACCACCACCACCGAGGCTGCTCGAGCCTCTTCCTTCCCCGTTT
GGGAAGAAGAGAGCTGTTTTATGCGGTTTGGACTATAAGGGCAAAAGCTATAGCTTGAAA
GGTTGCATCAGTGATGCAAAGTCCATGAGATCTTTCTTGGTTCAGCAAATGGGCTTCCCT
ATTGACTCTATTCTCATGCTCACAGAAGATGAAGCCAGTCCGCAGAGAATACCAACGAAG
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GTGTTCCATTACTCTGGTCATGGATCTCAGCAGAAGGACTACAATGGAGACGAGGTCGAT
GGTCAAGACGAAGCTTTGTGCCCTTTAGACCATGAGACCGA

QA 1 641 1 641
DS 

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AACAAGATACTCGTGAGGCCGCTCGTCCATGGAGCTAAGCTTCACGCTGTCATCGACGCA
TGTAACAGCGGGACTGTCCTTGATTTACCCTCTGTTTGCAGGATGGAGAGGAATGGTTAT
TATGAGTGGGAACGTCAAACATCAGGGAGAACTTACAAAGGAACAAATGGCGGAACAGCT
ATTTGTTTCAGTGCGTGTGATGATCATGAAGCCAGTGGTTACACTCCTGTATTCACAGGG
AAGAACGCAGGAGCCATGACTTATAGCTTCATAAAGGCGGTGAAAACAGCTGGAACAGTG
CCAACGTACGGTCACCTGCTTAACCACATGTGCTTTGCGATACGAGAGGCTCAGTCTCGC
CTCGCCAGTGATGGGCACTACACAAACCCTGATGAGACCCCGGTGCCACTTCTAACATCA
TCTGAGGTATTCGACATATATGCTACAAAGTTTGTGCTCTGAAGGCTGTCTGTCACCTAT
TCTGCAAATAAGCTACTACACGCATACACATCTTCTTTATCTATATGTATAAATCATGTA
ATGATATCTCTGCAGCATACTTGCCAAAGCTGTAACAAGTATCTTTCTTTAAATAATTA

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL8569Contig1 788 2 2 U
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GAGATGAGAAACACCAAGTGATGCAAAGTTGTGTTTATACCTTCTTAATCCTGTGACCAA
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TAGTAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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AGTGCAACACGAAGAGTAGTTCGATTGCTGCTCCAACAATGCACCAAAGTGTGAACCGGC
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GACTGGAAATGAGAGCCGTTTCTTGACCAAACCCACCCGATCTCTCTCAGGAGTGGAAGG
TCGCTGCCTAGGCGCGCTCTGGGACCGAATCCTAGCCTTAACCGACTCTGTATTGGCCAT
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BQ
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AF RR4H694JQB U 1
AF RR4GF80TF C 4
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AGTGCAACACGAAGAGTAGTTCGATTGCTGCTCCAACAATGCACCAAAGTGTGAACCGGC
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GACTGGAAATGAGAGCCGTTTCTTGACCAAACCCACCCGGTCTCTCTCAGGAGTGGAAGG
TCGCTGCCTAGGCGCGCTCTGGGACCGAATCCTAGCCTTAACCGACTCTGTATTGGCCAT
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DS 

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TCAATATGAAAATCACTTTTATCCTTACTGCATAAAAATAAAATAAATAAAAAACGCTTT
TCCTGGAGGGATGACAACAGATTGTGACCACTGATTTGGCATCACCACCGACAGTCATCT
AAGCCAATTCCTATAGTCACTAGTAGAAGCTGGTGAGACCTCAACACCATTAGACTCAGT
GCAACACGAAGAGTAGTTCGATTGCTGCTCCAACAATGCACCAAAGTGTGAACCGGCCAC
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TGGAAATGAGAGCCGTTTCTTGACCAAACCCACCCGATCTCTCTCAGGAGTGGAAGGTCG
CTGCCTAGGCGCGCTCTGGGACCGAATCCTAGCCTTAGCCGACTCTGTATTGGCCATATA
ATTAGGCAACATTGATGCATTATTGACCATTGTGGTACTAATGCTACAACCACTTCTAGC
AGTGAAACTATAGTTAGATCTCAAGCTAGGTGTGTTTGATGTATAACTATAAGCTGCTCG
GTCATAGTCATCCCTAGGGTCTCTCTGGCACCGAGGACTAGCTGACCGGATATGC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL8571Contig1 746 2 2 U
GGAACCCAAACCTAAAAGAGGCTTCTACTTCTTTCATCCTCCTTACTGAGCCGCCATCTA
TCCTCCTCCGACCTCCGTCGTCTCTTTCGCTAAGCTTCTCCAAAGGGACAATGCCGAAGA
TTAAGACTAACAGAGTAAAGTACCCAGAAGGTTGGGAGTTGATTGAGCCTACTCTTCTTG
AGATAGAGGCCAAGATGAGAGAAGCTGAGATAGATACACATGATGGCAAGAGAAAGTGTG
AAGCCTTGTGGCCTATCTTCAAACTCTCTCATCAGAGGAGTCGCTATGTCTATGACCTCT
ATTACCGTAGGGAGGAGATCTCTAAAGACCTTTATGAGTTCTGCTTGGATCAGAACTATG
CTGATCGTAACCTCATTGCCAAGTGGAAAAAGTCAGGATATGAGCGTTTGTGCTGCTTGC
GCTGCATACAGCCAAGAGACCACAACTACGGAACAACATGCGTATGCCGTGTTCCCAAAC
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GCGATTAATCTCCGCCATTAGGTTTTTCTTTCACTATTCCTCACTGTTGCTGTATTCTAT
ATCTTGTCAAAATCTGAATCATGTACTCTAAAAGCACCCTGAAGAGACTACTTTTCAAAA
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ATGAACTGAGAGAATGATTTTCGGTT


BQ
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AF RR4AA60TF U 1
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ATGAACTGAGAGAATGATT

QA 1 739 1 739
DS 

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QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B085TF U 1
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DS 

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QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AS29JQ C 1
AF RR4AS29TF U 1
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BS 33 33 RR4AS29JQ
BS 34 697 RR4AS29TF
BS 698 698 RR4AS29JQ
BS 699 817 RR4AS29TF

RD RR4AS29JQ 817 0 0
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QA 1 817 1 817
DS 

RD RR4AS29TF 817 0 0
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CGCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGG
TGGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGGATCCGACCCGCAAGAAACGCTTATGGA
GGATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCA
TTTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAG
GAGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGA
AAGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGC
AACGCGACACGGCTAGCAAGCTTCCTTCTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTG
TTCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATA
ATTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTG
GTCTGTATTGGGAAATACTTAAAACTACAAGTAAAAGAAAATAAAAGAATTTATCATGTT
CACCAAAAAAAAGAAAATAAAAGAATACTAGAAAGAA*TAAGTAATAGATGGTTGATTGT
GGGCTTAAATAGTAAAGTTTATTTAATGTGTTTATTATTCATTTATGGAGCTTTGTTGAA
TCTATGCTTCTGAAATATAAAGATTCGCATTTATAGC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL8574Contig1 985 2 6 U
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GTGGTTCATTAGAGTTTGATCTTCTTCGATATTGAGATATTATGGTTTCAATCATTGAAT
TGTTTTATTGGAGTTTTATATTTAATTTCAGAACTAAGTAACATTGTTACTTGTTTATCT
CCGGTTTAATTTACACTTAACCAATTTGATCTCTTTTGAGATTTTCAGGTACTAACTGGC
TCAACAGAAGCTCAGTTAAAGAATTTAGATATGATACAAGGAGCTGAATACGTGAGGAAG
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CCCTTAGATTGCTTAAACCTTGAATAAGTTTCCACTGATACAGGAGACATCCGAGAAAAT
GCAAGTGGAAGCTCTAATATGGGCCAACAAGGATGATCCAGACATGTATGGAGAATGGAA
TTTCGAGGTTTGAAACCATATTAGGCATTATTAGCTCTCTCAAGTGCACAAGTTTCCAAT
AATCATTTAAAACTTATACTCTAGTGTTGCCAACAAGGATGATCACTTTTGTGACTTTTG
ATTTGGTTAGGAGTGGAAACGGCTTCACATGGATAAATTCATAGAGGCGTCAAAGAAATT
CATTTAATGGAAGAAGAATCCAGATGGTAAAACAAGGGAAGAGTTTGAGAAATTTGTACA
CGAGGATCGTCCTCCTGTGGTGTGAAGAATATGTCTGCCTTTTCTTGATATCTTAATCGT
TTACCACAAAATAGAAAGGTCTCTCATTTCAACTTCAAGTGCAATATAAGATTATAAGTT
CTAGTACATGATCATTGAGTTGTGGATCAGTTCGTAACACAAGGTAATCAATGTTGTCGT
ATCTACTTCATGAACATTGAGTTGCATTGCTTGTTATTGTTTTTATCGTTTCTAATCATT
ATGTCATCAATCGACCTGGTCTGGT


BQ
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AF RR4DK29TF U 1
AF RR4DK29JQ C 266
BS 1 551 RR4DK29TF
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BS 579 621 RR4DK29TF
BS 622 985 RR4DK29JQ

RD RR4DK29TF 621 0 0
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TGTTTTATTGGAGTTTTATATTTAATTTCAGAACTAAGTAACATTGTTACTTGTTTATCT
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TCAACAGAAGCTCAGTTAAAGAATTTAGATATGATACAAGGAGCTGAATACGTGAGGAAG
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QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4DK29JQ 720 0 0
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ATTGCTTGTTATTGTTTTTATCGTTTCTAATCATTATGTCATCAATCGACCTGGTCTGGT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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AACTCATGAAAATAGGAATAGACCCAACCAACCATCGTCTCTACCATCACGCAAACTATA
TTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATCGTTAGTGATC
AATCTTCTTCACTATCCAAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCAAGTACCGATT
GCTATGATGATAGTGCTACTAGTAGTGTCGGACATAGTCGTTTGCCTGACCTCAACATTA
GTCTCATCCCGGCTGAGACGGTGGTTTCTTGGTCAGGTTGTGGTCTTCAAGAATCTAGCA
GCAGTGGTTCGACCCGTCAAGAAACGCTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCGGATATTTTATT
GCTACATAAGAAATGAAAAATGGTGTATGTCATTCG


BQ
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AF RR4B017JQ C 1
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DS 



AS 1 2

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CAACAAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AX64TF U 1
AF RR4AX64JQ C 1
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QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DZ21TF U 1
AF RR4DZ21JQ C 606
BS 1 686 RR4DZ21TF
BS 687 1187 RR4DZ21JQ

RD RR4DZ21TF 686 0 0
GGACACCACCACCCTCTAGCTTGTCTCTAGATGGATACCATGAGAGATAAGCCAATAAAA
TTCTCATATTCTGTTTTCTGTTTGATCATTTTATTATCGGTCTATAACTCCACTGCGGAG
CTACGACGGTTGGTCCAACCACCAAAATCCGATGGTACACTCAGTTTTCTAGTTGTCGGC
GACTGGGGAAGAAGAGGTTCTTATAATCAGTCTCAAGTAGCTCTTCAGATGGGAAAAACA
GGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGATGGA
ATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACCAATATTTACACAGCACCT
AGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTACTAGGAAATCATGATTATAGAGGTAACGTCGCT
GCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTTGACTCTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTAC
TTGGTTAACGCCTATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTTGTAGACAAA
TATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTCCTACCAAGAAACAAG
TATCTTAACAATATCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAATGG
AAAATAGTGGTAGGTCACCACACAAT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DZ21JQ 582 0 0
TAACAATATCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAATGGAAAAT
AGTGGTAGGTCACCACACAATCAAAAGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAGCTTGA
GAAACAACTTTTACCTATCCTTGAGGCTAATAAAGTTGATCTCTACATAAACGGGCATGA
TCATTGCTTGGAGCACATAAGTAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGTGGCGG
TGGGTCCAAGGCGTGGAAAGGGGACGTGAATGAGTGGAATCCGCAAGAGATGAGGTTTTA
CTACGATGGACAAGGATTCATGTCGATTTATCTATCGGAAGCAGAACTGCGTGTAATTTT
TTACGATGGGTATGGTCGTGTTTTGCATCAATGGAACACTTACAAGGAGGGGATTTATAC
GGAAATCTAAACGATCTGATTACAAAGTTGAGAAACCAAATACTACTATTCATATTAGTA
GTTCACTGTTTTTATATTTGGTGGTGATTTTCATGTGACATAATTATTTTTAATGATGTT
ATTATCCAGCTAATAAAGTTTGAGAAAGCGAAATTTACACGT

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL8578Contig1 875 2 9 U
AACATGAAAAGAATAGTTTAATACAGGAAAAAAGGATTTGCGATGTGTAAAAGCTACAAT
GGAATATTCAAATGTCACATTAGAAACAAGAAAACGAAAGAAAGACACAAGAGGATAAAT
GAATCTCAAAGGATCCATGACAATGCACTATTATTAATAAACATAAGGAAGGATTCTATA
GGGGACCAGTCTAAGATACTCAGCCCAAATCTCCTTGTACTTCTCTGCACATCGTTCCTC
GTCTCTTCGCTCTCTCCATATCAACAGTATCAGGAGGTATATCGGGTAGAAATATGGAAC
CGGAGAACTTATTCCACACGGCAAACTGAAAGACAGAGCAAGCATCAAGTCACCAAGGTA
ATTACAGTGCCTTGCGATTCCCCAATAGCCTGAAGCAAGCAACTTTCCACCAACCACCAC
TGGAGGCTTACCCCATATAGGTGTTTTAGGGTTCTTCTTAAAGATATGTTTTTGTTTGTT
AGCCCCTCTAAAAACCATGTACCCTATCAAGAACACAAAGCAATTGGCTACAATAGCAGG
AGCTGTTAGTTCTACTTTGTTGTGCAAAAGCCACCAGCCCTGGATGCTAAAAGTGAAAGG
AATCCACAGGAGATCTCCAAACACCAGCATGAACCCCAACCTCTCTGCAATTATGTCCCA
CGTGGAGGTCATATATTCTTCATGAACGAAGTAGTCCAATATATATAACGCACAGAAAAT
CTGGTAAAGAATCATGGACTGACTCAAGGAACCGTCCTGAAAACTTTTTGCCAGAATAGA
GAGATTGATAAGCAGCCATCCCATCATCCCGGCTCTGACAAAGAAAAACTTGAGATCGAT
GCTCATAAACTGAGGATTCAGCTGTATTCCAAACC


BQ
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AF RR4C555JQ U 25
AF RR4AB16JQ U 1
BS 1 149 RR4AB16JQ
BS 150 150 RR4C555JQ
BS 151 318 RR4AB16JQ
BS 319 319 RR4C555JQ
BS 320 351 RR4AB16JQ
BS 352 352 RR4C555JQ
BS 353 386 RR4AB16JQ
BS 387 387 RR4C555JQ
BS 388 875 RR4AB16JQ

RD RR4C555JQ 571 0 0
GGA
AAAAAAGGATTTGCGATGTGTAAAAGTTACAATGGAATATTTAA*TGTCACATTAGAAAC
AAGAAAACGAAAGAAAGACACAAGAGGATAAATGAATCTCAAAGGATCCATGACAATGCA
CTATTATTAATAGACATACGGAAGGATTCTATAGGGGACCAGTCTAAGATACTCAGCCCA
AATCTCCTTGTACTTCTCTGCACATCGTTCCTCGTCTCTTCGCTCTCTCCATATCAACAG
TATCAGGAGGTATATCGGGTAGAAATATGGAACCGGAGAACTTATTCCACACGGCAAACT
GAAAGACAGAGCAAGCATCAAGTCACCAAGGTAATTACAGTGCCTTGCGATTCCCCAATA
GCCTGAAGCAAGCAACTTTCCACCAACCACCACTGGAGGCTTACCCCATATAGGTGTTTT
AGGGTTCTTCTTAAAGATATGTTTTTGTTTGTTAGCCCCTCTAAAAACCATGTACCCTAT
CAAGAACACAAAGCAGTTGGCTACAATAGCAGGAGCTGTTAGTTCTACTTTGTTGTGCAA
AAGCCACCAGCCCTGGATGCTAAAAGTG

QA 4 571 4 571
DS 

RD RR4AB16JQ 875 0 0
AACATGAAAAGAATAGTTTAATACAGGAAAAAAGGATTTGCGATGTGTAAAAGCTACAAT
GGAATATTCAAATGTCACATTAGAAACAAGAAAACGAAAGAAAGACACAAGAGGATAAAT
GAATCTCAAAGGATCCATGACAATGCACTGTTATTAATAAACATAAGGAAGGATTCTATA
GGGGACCAGTCTAAGATACTCAGCCCAAATCTCCTTGTACTTCTCTGCACATCGTTCCTC
GTCTCTTCGCTCTCTCCATATCAACAGTATCAGGAGGTATATCGGGTAGAAATATGGAAC
CGGAGAACTTATTCCACAGGGCAAACTGAAAGACAGAGCAAGCATCAAGTCGCCAAGGTA
ATTACAGTGCCTTGCGATTCCCCAATGGCCTGAAGCAAGCAACTTTCCACCAACCACCAC
TGGAGGCTTACCCCATATAGGTGTTTTAGGGTTCTTCTTAAAGATATGTTTTTGTTTGTT
AGCCCCTCTAAAAACCATGTACCCTATCAAGAACACAAAGCAATTGGCTACAATAGCAGG
AGCTGTTAGTTCTACTTTGTTGTGCAAAAGCCACCAGCCCTGGATGCTAAAAGTGAAAGG
AATCCACAGGAGATCTCCAAACACCAGCATGAACCCCAACCTCTCTGCAATTATGTCCCA
CGTGGAGGTCATATATTCTTCATGAACGAAGTAGTCCAATATATATAACGCACAGAAAAT
CTGGTAAAGAATCATGGACTGACTCAAGGAACCGTCCTGAAAACTTTTTGCCAGAATAGA
GAGATTGATAAGCAGCCATCCCATCATCCCGGCTCTGACAAAGAAAAACTTGAGATCGAT
GCTCATAAACTGAGGATTCAGCTGTATTCCAAACC

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL8579Contig1 767 2 3 U
TATCATCATTCATGTGTTTAGATCAGAGAGATCATATGCATGTACACACCAATTATGTGC
TTCAACAGGCAAATGTAAACCCTTACAAAAGAAGATAGAAACAAAAAAATTGCAAAAAAA
AGTGAAGTTGGGAAGTAGAGAAAACTATGGTTTTGCCCCCCTTTCCAAGAGTTATCACTA
GTCACTCACTACCATAAGCACACACTTCAAAGCCAAATCTTGCAACGTTTTGAATCAAAT
TCTCTGATCAAAAACCACACCCATCTCAAATCAAAGGGATCAAATCTTTGTAGACATCAT
GAATTTAGACTTCTTCTCCGCAGGCTTCAAAACCTGAAACGAACACAAGGTTCTCATCCA
CGCTCATCATCGCACCAGCATTATCAAACTCCCCACAGTAGTTAGGAGCTGAGAACACCG
TCACCAGCTGTCTATCCGCAAAGAACTCATAACCATCTTCCACAACCTGATGAGCACGGC
ATACAAGATCCAAATCATGTTTCTCTAGAAACTCAGAGACTTTGTCAGGACCAAACGTGT
ACGAAACGCCTCTATCATTCATCCCCCATCCTTTAACATCTTTCCCAGGATCAGACCAGA
GCAAATCACAGAGCAGACCAGTGTCCGGAATCATAGTCGGACGAGGCAAGCTTCTAATCT
CATCCAAATGGTTGAGCTCAGGAGAGAGTCCACCGTGCATACACAGTATCTTGTCATCTA
TAAGCGCCGCAACGGGAAGGCAATTGAAACAGTCTGTGAAAACCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 767 1 767
DS 



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BQ
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AF RR4BR28JQ C 1
AF RR4BR28TF U 1
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QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

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AF RR4ES84JQ U 186
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C

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DS 

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CTTTTCTTCGAACTCGTCTCTGTCTCCTCTTCATCAACCATCTTCCTCTTTCCCTTATTC
TTCTTCTTTCGAGAAGACTCTTTACTTTTCTTACCAGGAGTGTCTACCACTGGAGTATCA
TCCCCTCTTGGGAACGAGCCTTCTTCGAGTTGCCAATTGCAGAAAAGTCCACCATTGCTT
TTGCTGTTAGCTGACATTGGCAATGGCTCCCCAGCTCCGGGGAGCAAGCTGTTGAAAGTG
ACATCCCCGTTTTTACCACCTTTGCGCTCTAACAGAATCCTGTCTGGTCTGATTATCGTG
CCGAGAATGCTCCTGTTCGGTCCCAAGGCTAGAATAGCTTTCGTGTTTGTCAATGTAGAC
AAGGCCATTGAAAACGCTGATCGAATCTGAAAGTAGTTGAATGAGTTCTTGCCAATGTCA
TTCTCTGGTGTCTGTGGATCCTCGATAGAAATGAGCCCTGGCCGGGCTGTGTTGAGGAAA
CCTTTGTTGTATTTTGAAAAGAAAGAGCCACCCTTCTTGCAAGATACACCGACATCTGCG
GTGTTTAGTTTTCTCCCGTAGAAGTCAAAGAACTTAACCAACAGAACTCCCAGGTTATGC
TCTGGTGGGCTTCGACCATCTTTGAGGTACTTGAGAAATGCAATGAGCATTGCTAGAAGT
GCGTATGAACCAATCCCACCACTGTACACCTCATTGAGTTCTCTCTGCTGTAGAAATACT
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL8582Contig1 525 2 1 U
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GAAATAAACAATAATGGCAAGAGGAAGCTACCAGAAGAAGAAACTGAAAAGAAGGAAGCA
AACAAGCCTCCAGAAGCGTGGTTTGAGCTGAAAGTAAACCCACATATCTATGTCACTGGG
TTGCCCAAAGATGTCACGATCGAGGAAGTGGTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGGATTATT
AAGGAGGATGACAGTGGCAAGCCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAA
TTAAAAGGCGATGCCCTTATCACGTATCTGAAGGAACCCTCAGTGGATCTTGCAATCCAA
ATCTTAGACGGTGCTCCTTTACGTCCAGCTGACAAGCTCCTCATGTCAGTTTCTCGAGCT
AATTTCGAGCAGAAAGGGGAGAGATTTATAACAAAGCAAACCGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CI06JQ C 1
AF RR4CI06TF U 1
BS 1 525 RR4CI06TF

RD RR4CI06JQ 525 0 0
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GAAATAAACAATAATGGCAAGAGGAAGCTACCAGAAGAAGAAACTGAAAAGAAGGAAGCA
AACAAGCCTCCAGAAGCGTGGTTTGAGCTGAAAGTAAACCCACATATCTATGTCACTGGG
TTGCCCAAAGATGTCACGATCGAGGAAGTGGTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGGATTATT
AAGGAGGATGACAGTGGCAAGCCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAA
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AATTTCGAGCAGAAAGGGGAGAGATTTATAACAAAGCAAACCGAT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4CI06TF 525 0 0
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GAAATAAACAATAATGGCAAGAGGAAGCTACCAGAAGAAGAAACTGAAAAGAAGGAAGCA
AACAAGCCTCCAGAAGCGTGGTTTGAGCTGAAAGTAAACCCACATATCTATGTCACTGGG
TTGCCCAAAGATGTCACGATCGAGGAAGTGGTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGGATTATT
AAGGAGGATGACAGTGGCAAGCCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAA
TTAAAAGGCGATGCCCTTATCACGTATCTGAAGGAACCCTCAGTGGATCTTGCAATCCAA
ATCTTAGACGGTGCTCCTTTACGTCCAGCTGACAAGCTCCTCATGTCAGTTTCTCGAGCT
AATTTCGAGCAGAAAGGGGAGAGATTTATAACAAAGCAAACCGAT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL8583Contig1 908 2 2 U
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AGATTGTGATTATTTTTAGTAAATCATACAATCATGACTCAATCAATAATCATTTTTGAC
TCCTAAAACAAATTTATGCATTTATCAACATACGAAAAAATAAAATAAAAATTGCATTAA
GAACTATAGTATTTGACATATAAAAATTACAGTTTTGACACAACAAAATCGACATACAAA
GGGGATCGTCAAATAGGAGGAAGAAGACAACTATAGTATTTGCATTAAGAACTCGAATTT
AAAATATCAATCATTGCCATCAATCGATTTTGTTGTATAAATTGATATGTCATCTTTGTA
TGTATAAATTGAATGTTAAATGCACAGTTAAATATATAATGTACATGGGATTTGGCACTA
ATTGACCCCGAGATTGATTTTAAAAAGATCATAATCTCGGAAACTAACCGATTTATAACA
GAAGATCGAGAAATCAGAGGAACAATACCATTAATATATTCCATTAATTTTCTGAAACTT
AAATATCATTAATTGTCATTAATTCGGCCGTGGGGGCATCTAGGAAGATTAAGGTTTATA
ATTTTCTGTTTTTGAACAAATTATTATGTCAATTTAATTGTAAGTTAAAATATACCAATG
GCACAATATGTAATAACTCCAGTAGGTTAAGGGTTGTTTTAAAATAGGAGTGAGAGTGAT
TGTGAGGCTGCCATATAGGAAATTGCACTCATGTAAATCACACATCAAGTGAAGGTTATT
TATTTTGAGTGCTCCTAAAATAATATATAGGGGATAAGCTTCAAGATATCAAAAAAGTCC
TTGCCAACGTCAATGGTCCTATGTTATAACACATATAAATAACTTAATTAATATCCATAA
CTTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE59TF U 1
AF RR4CE59JQ C 156
BS 1 685 RR4CE59TF
BS 686 908 RR4CE59JQ

RD RR4CE59TF 685 0 0
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AGATTGTGATTATTTTTAGTAAATCATACAATCATGACTCAATCAATAATCATTTTTGAC
TCCTAAAACAAATTTATGCATTTATCAACATACGAAAAAATAAAATAAAAATTGCATTAA
GAACTATAGTATTTGACATATAAAAATTACAGTTTTGACACAACAAAATCGACATACAAA
GGGGATCGTCAAATAGGAGGAAGAAGACAACTATAGTATTTGCATTAAGAACTCGAATTT
AAAATATCAATCATTGCCATCAATCGATTTTGTTGTATAAATTGATATGTCATCTTTGTA
TGTATAAATTGAATGTTAAATGCACAGTTAAATATATAATGTACATGGGATTTGGCACTA
ATTGACCCCGAGATTGATTTTAAAAAGATCATAATCTCGGAAACTAACCGATTTATAACA
GAAGATCGAGAAATCAGAGGAACAATACCATTAATATATTCCATTAATTTTCTGAAACTT
AAATATCATTAATTGTCATTAATTCGGCCGTGGGGGCATCTAGGAAGATTAAGGTTTATA
ATTTTCTGTTTTTGAACAAATTATTATGTCAATTTAATTGTAAGTTAAAATATACCAATG
GCACAATATGTAATAACTCCAGTAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4CE59JQ 753 0 0
AAAAATAAAATAAAAATTGCATTAAGAACTATAGTATTTGACATATAAAAATTACAGTTT
TGACACAACAAAATCGACATACAAAGGGGATCGTCAAATAGGAGGAAGAAGACAACTATA
GTATTTGCATTAAGAACTCGAATTTAAAATATCAATCATTGCCATCAATCGATTTTGTTG
TATAAATTGATATGTCATCTTTGTATGTATAAATTGAATGTTAAATGCACAGTTAAATAT
ATAATGTACATGGGATTTGGCACTAATTGACCCCGAGATTGATTTTAAAAAGATCATAAT
TTCGGAAACTAACCGATTTATAACAGAAGATCGAGAAATCAGAGGAACAATACCATTAAT
ATATTCCATTAATTTTCTGAAACTTAAATATCATTAATTGTCATTAATTCGGCCGTGGGG
GCATCTAGGAAGATTAAGGTTTATAATTTTCTGTTTTTGAACAAATTATTATGTCAATTT
AATTGTAAGTTAAAATATACCAATGGCACAATATGTAATAACTCCAGTAGGTTAAGGGTT
GTTTTAAAATAGGAGTGAGAGTGATTGTGAGGCTGCCATATAGGAAATTGCACTCATGTA
AATCACACATCAAGTGAAGGTTATTTATTTTGAGTGCTCCTAAAATAATATATAGGGGAT
AAGCTTCAAGATATCAAAAAAGTCCTTGCCAACGTCAATGGTCCTATGTTATAACACATA
TAAATAACTTAATTAATATCCATAACTTGGTTC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL8584Contig1 1104 2 6 U
GACACAACTCTCTCTTAAAATCATCCAAAACATGGCTACTCGAAGAGTAATCCTCTTTCT
TTTCACCTTAACCATCATAACAAAAACCGTGTTTTCACAACACTGCAGTACAACCGGTTG
TGCGGGTAATCTATGCTGCAGTAGATATGGATACTGTGGCACCACACCCGCCTACTGCGG
CACCGGGTGTAGAAGTGGACCTTGCAGCTCCACACCTGTCTCACCAACTCCTGATGGTGG
CACAGGCGGTCTAAACGCTGACCCTCGTGATACAATTGCAAACGTTGTTACACAATCGTT
TTTCGATGGTATCATGAGCAAAGTGGGAAACGGCTGTCCAGCAAAAGGGTTCTACACCCG
ACAGGCTTTCATCGATGCAGCTCAATCTTTCCCAGCATATCAAGGAGCCGTCTCTAAGCG
TGAGATTGCCGCCATGTTGGCTCAGTTCTCACACGAATCTGGAAGTTTTTGTTACAAAGA
AGAAATAGCGAGAGGAAGGTACTGCCAAGCTAGCACAGTATATCCTTGTCAACCGGGAAA
GGACTACTACGGTCGCGGTCCGATCCAAATCACATGGAACTACAACTATGGTGCAGCCGG
AAATTCCCTTGGACTCCCTCTCTTGACTGATCCAGATATGGTGGCTCTTAGCCCTGAAGT
TGCCTTTAAGTGTGCCATGTGGTTCTGGAACCAAAATGTTCGTCCGGTCCTGGACCAAAG
CTTTGGAGCTACGACGAGGAAGATCAACGGTGGCGAATGTAACGGTCGACGTCCTGCAGC
GGTTCAAAGCAGAGTTGGCCACTACTTGGAGTTCTGTAGGACGTTTGGCATCTCTCCTGG
AACTAGTCTTAGTTGCTAAAGATGTTAAATGTGATTTAAAGGCCCGTTTCATGGTATGGT
GTTTGTCTTAATTACACTTATGAGCGAATAAAAAGGTGTTGAAATAAATGATTACTAGAT
TTTGATCCGCCCTTAAAAGGGCGGGTAAATGTTTTTATTTTACATTTTTTAGAAATTTAA
TTTTTATATTTGTGTTTTTAATTATATTTATGTTTTTATAATATTTTTATTAGATGATTG
ATAAGATATTTTAATAATTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AS80TF U 1
AF RR4AS80JQ C 311
BS 1 605 RR4AS80TF
BS 606 606 RR4AS80JQ
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BS 820 820 RR4AS80JQ
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A
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GGACTCCCTCTCTTGACTGATCCAGATATGGTGGCTCTTAGCCCTGAAGTTGCCTTTAAG
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TGTGTTTTTAATTATATTTATGTTTTTATAATATTTTTATTAGATGATTGATAAGATATT
TTAATAATTGGACC

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DS 



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BQ
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AF RR4CS94JQ U 1
AF RR4CB38JQ U 1
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GAATTTTTATGGGTTTTCTTTAATAAAGCTAAACGATCTATCAAAAGGAAAAGAAACAAC
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CAAGCTGGATGGATAGAGGTGAGGATCAATGAACCGGTAGATGATGGAGTGGAGTGAGAT
GGAAGGATCTGATGTAGAGGATGGCTTGAGTGATGGATCCGGTTATATTGAGACTCGCAA
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ATGGCAAATGGGATAGTTGTGGGTATGGATCTAAGTTGCTTGTTCGAATAAACAACTCAA
CAAAGACAAAGAGATGGTTTGATGTGGTGAGGTTTGATTGATTCACACAACCAAAGGATG
GATCGAAGTGTAACCACAAGTTCTATGATGAGGAACTTGATAAAACACGATTTTGCTCTC
AAGAATGCTTCTCACAAACTCTCAAAGGCTTAGTAGTTGCTAGGGCAACTGACTCATATA
TTTCATCAAGTTAAG

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

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AAAGAAGTCGATGAAGATGGGTTTTGAGGAAGTGAAGGCTTGTAGAGATCTCGGGTTCGT
TCTTGAAGTTCCGGGTCGGGTTTCAGTATCCGTCGGGTCAAACCGGGAGACTCAGACTAG
TAGTGGCAGCAACTCTCCGATTGCCAACTGGCGTATCTCAAGTCCTGGAGATGATCCCAA
GGAGGTTAAGGCGAGACTAAAGATGTGGGCACAAGCAGTTGCTTTGGCTTCTACGTCACG
TTAAGCTTCTCTATGTTAGGGTTTGTCTTTCGAATATTTAGGTCTTTTTTTTGTCCCATA
ATCTTACGAGCTGTTACCAGTTTTTTTCTCTTGAATCTGTAACTTTTCTATTGGTTTTGT
AAATATGAAAAGTATAATATATGTTG


BQ
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AF RR4B867TF U 1
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BS 778 986 RR4B867JQ

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TGCTACTACCCTTTAAATGGCTTCTGACGAAAGCATGTTGATCAATTCTTCTTCAGTTCT
AGACGAAGAGTACTCTGATACAGATGATGGGTTTCATTACCAGACAAGGCAAAGTAGTTT
GTCTAGGTTATCTATATGCACGAGCTCCTTCCACTACAACGACGATGAAGATAACTTCAC
AAGTGAACCTTCGGAACTGGGTAACTTCATGTCTGAGCTGTCTCTTGAGAGCTTCGACGA
CATGGGAGCCGAGGCTGATGGAGAGATCTCTGACGGTGAAGATTCAGATTCCGATAAGGA
ATCTGCTGGGTTTTACTCTCTCCCGACGATCATGTCTCGCCGGAGAATAAAAGTCAACGT
CTCCACCGGTTTATACAAAGATAACGAGGTGATGAGCGTCGATACGTTAGCTAAGCAGAG
ACGGTACGGTCACGGTTTCAACTTTAACGGCGAGGAGAGAGTCATGGACGGAGACGGAAA
CTGTTATGTAGGAGGAGGGGAAGGAGAGTCGTTGACGGTGTTAACGAAGGTGAAGGGAGG
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TCTTGAAGTTCCGGGTCGGGTTTCAGTATCCGTCGGGTCAAACCGGGAGACTCAGACTAG
TAGTGGCAGCAACTCTCCGATTGCCAACTGGCGTATCTCAAGTCCTGGAGATGATCC

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DS 

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ATACAAAGATAACGAGGTGATGAGCGTCGATACGTTAGCTAAGCAGAGACGGTACGGTCA
CGGTTTCAACTTTAACGGCGAGGAGAGAGTCATGGACGGAGACGGAAACTGTTATGTAGG
AGGAGGGGAAGGAGAGTCGTTGACGGTGTTAACGAAGGTGAAGGGAGGAAAGAAGTCGAT
GAAGATGGGTTTTGAGGAAGTGAAGGCTTGTAGAGATCTCGGGTTCGTTCTTGAAGTTCC
GGGTCGGGTTTCAGTATCCGTCGGGTCAAACCGGGAGACTCAGACTAGTAGTGGCAGCAA
CTCTCCGATTGCCAACTGGCGTATCTCAAGTCCTGGAGATGATCCCAAGGAGGTTAAGGC
GAGACTAAAGATGTGGGCACAAGCAGTTGCTTTGGCTTCTACGTCACGTTAAGCTTCTCT
ATGTTAGGGTTTGTCTTTCGAATATTTAGGTCTTTTTTTTGTCCCATAATCTTACGAGCT
GTTACCAGTTTTTTTCTCTTGAATCTGTAACTTTTCTATTGGTTTTGTAAATATGAAAAG
TATAATATATGTTG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGTGGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCA
AGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAGTTTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGA
GGCTTAATAAATCTCATATTATATTTGTTGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTAT
ATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTTCAAAATAAGTGTCGTTTTATGATTTCAATGCA
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BQ
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AF RR4BZ87JQ C 1
AF RR4BZ87TF U 1
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QA 1 525 1 525
DS 

RD RR4BZ87TF 525 0 0
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CCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGCCAAGGAGGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAAT
ACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCAGGGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGG
GTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACG
AAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGTGGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCA
AGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAGTTTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGA
GGCTTAATAAATCTCATATTATATTTGTTGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTAT
ATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTTCAAAATAAGTGTCGTTTTATGATTTCAATGCA
AAATTTATTGACTTTTTAATCTAATCTATTTTTCTATTTGTTGGC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL8589Contig1 756 2 3 U
GTCGGACATATGGCAATATCTTCATGATTCTATCAAACCAGAAGGAACAAAGATATAAGA
AGCTTGATTTGAAACCATTAATCAGTTTAGAATCACCAGGAAGTTGAATAAATCTCATAG
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GACATATGGCAATATCTTCATGATTCTTATCAACCCAGAAGGAACAAAGATGTAAGAAGC
TTGATTTTAAACCATTAATCAGTTTCGAATCACCAGAAAGTTGAATAAATCTCATAGGAG
TTTTGAGGAAAAAGCTATCTCACTTTCTATTAAGGGGATTCCACATTACCCTGTTCGGAC
GTATGGCAATATCTTCATGATTCTTATCAACCCAAAAGGAACAAAGATGTAAGAAGCTTG
ATTTGAAACCATTAATCAGTTTCGAATCACCAGAAAGTTGAATAAATCTCATAGGAGTTT
TGAGGAAGAAGCTATCCCACTTTTTATTCACGTGATTCCAGATTAGCATGTTTGGACATA
TGGCAATATCTTCATGATTCTTATCAAACCAGAAGGAACAAAAATGTAAGAAGCTTGATT
TTAAACCATTATTCAGTTTAGAATCACCAGGAATTTGAATAAATCACATAGGAGTTATGA
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CAATATCTTTATGATTCTTATCAAACCAGAAGGAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS45JQ U 269
AF RR4AS45TF C 1
BS 1 276 RR4AS45TF
BS 277 402 RR4AS45JQ
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RD RR4AS45JQ 134 0 0
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QA 9 134 9 134
DS 

RD RR4AS45TF 756 0 0
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AGCTTGATTTGAAACCATTAATCAGTTTAGAATCACCAGGAAGTTGAATAAATCTCATAG
GAGTTATGAGGAAGAAGCTATCCCACTTTCTATTCAGGTGATTCCAGATTAGCCTGTTCG
GACATATGGCAATATCTTCATGATTCTTATCAACCCAGAAGGAACAAAGATGTAAGAAGC
TTGATTTTAAACCATTAATCAGTTTCGAATCACCAGAAAGTTGAATAAATCTCATAGGAG
TTTTGAGGAAGAAGCTATCTCACTTTCTATTAAGGTGATTCCACATTAGCCTGTTCGGAC
GTATGGCAATATCTTCATGATTCTTATCAACCCAGAAGGAACAAAGATGTAAGAAGCTTG
ATTTGAAACCATTAATCAGTTTCGAATCACCAGAAAGTTGAATAAATCTCATAGGAGTTT
TGAGGAAGAAGCTATCCCACTTTTTATTCACGTGATTCCAGATTAGCATGTTTGGACATA
TGGCAATATCTTCATGATTCTTATCAAACCAGAAGGAACAAAAATGTAAGAAGCTTGATT
TTAAACCATTATTCAGTTTAGAATCACCAGGAATTTGAATAAATCACATAGGAGTTATGA
GGAAGAAGCTATCCCACTTTCTATTCAGGTGATTCCTGATTGGCATGTTCGCACATATGG
CAATATCTTTATGATTCTTATCAAACCAGAAGGAAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL8590Contig1 719 2 8 U
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GTATTCATAGGCGGAAAATACACATTTATAATTTCTCTCTCTCTCACAAAGATTAAAAAA
AAACTTGAACAGATAAAAAGGGAAATTAACGATAAAGTTTTGGCAACTATCCGGCGATTT
TGTAACTGGGGTTGACGAGATTGTCTAAACCGGAGACAACTTGAATGGACTCAATGACAT
CACCGACTTTAAGATCAGCCAGAAAATCTTCATTCTGAGTAACGTAACCGAAGACAGCGT
AACGACCGTCCAAGATGTTGGAATTGCTTGGGGTCAGCTCACTCTCTTTCAGCAGCCAAA
ACACTTGGCTCGATCCCGAGTCATTCTCAAACTCTTCTCTAGCCATAGCCATTGTTCCAA
ATGCGTTGAAAGGAAGCATAACCTGAGCCTTGTACAGACCCAATTCTTCAAGGGTAGAGC
CGTAAAAAGGAGTCTTCTTACCAGCCACCATAATCTCAAGAGGAACAGTCCTCACTTTCT
CAGTGCTTGGATCTATAAATCCTTCCGCAGGACCCTCTGGATCTCCCGTTTGTACCACAA
ACCCATCAGATCTCTGGATCTCCATGCCATCGTAGAAATGGCGCTCCACCAAGTCGACAA
AGTTCCCGGCAGTAACAGGGGCGTTGTAACCATCAAGTACAATACGGAAGACACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA67JQ U 1
AF RR4F266JQ U 46
BS 1 122 RR4BA67JQ
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BS 496 498 RR4F266JQ
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BS 501 607 RR4BA67JQ
BS 608 719 RR4F266JQ

RD RR4BA67JQ 607 0 0
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GTATTCATAGGCGGAAAATACACATTTATAATTTCTCTCTCTCTCACAAAGATTAAAAAA
AA*CTTGAACAGATAAAAAGGGAAATTAACGATAAAGTTTTGGCAACTATCCGGCGATTT
TGTAACTGGGGTTGACGAGATTGTCTAAACCGGAGACAACTTGAATGGACTCAATGACAT
CACCGACTTTAAGATCAGCCAGAAAATCTTCATTCTGAGTAACGTAACCGAAGACAGCGT
AACGACCGTCCAAGATGTTGGAATTGCTTGGGGTCAGCTCACTCTCTTTCAGCAGCCAAA
ACACTTGGCTCGATCCCGAGTCATTCTCAAACTCTTCTCTAGCCATAGCCATTGTTCCAA
ATGCGTTGAAAGGAAGCATAACCTGAGCCTTGTACAGACCCAATTCTTCAAGGGTAGAGC
CGTAAAAAGGAGTCT***TGCCAGCCACCATAATCTCAAGAGGAACAGTCCTCACTTTCT
CAGTGCTTGGATCTATAAATCCTTCCGCAGGACCCTCTGGATCTCCCGTTTGTACCACAA
ACCCATC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4F266JQ 674 0 0
G
GACAAGTTACAATAGTATTCATAGGCGGAAAATACACATTTATAATTTCTCTCTCTC**A
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CTATCCGGCGATTTTGTAACTGGGGTTGACGAGATTGTCTAAACCGGAGACAACTTGAAT
GGACTCAATGACATCACCGACTTTAAGATCAGCCAGAAAATCTTCATTCTGAGTAACGTA
ACCGAAGACAGCGTAACGACCGTCCAAGATGTTGGAATTGCTTGGGGTCAGCTCACTCTC
TTTCAGCAGCCAAAACACTTGGCTCGATCCCGAGTCATTCTCAAACTCTTCTCTAGCCAT
AGCCATTGTTCCAAATGCGTTGAGAGGAAGCATAACCTGAGCCTTGTACAGACCCAATTC
TTCAAGGGTAGAGCCGTAAAAAGGAGTCTTCTTACCAGCCACCATAATCTCAAGAGGAAC
AGTCCTCACTTTCTCAGTGCTTGGATCTATAAATCCTTCCGCAGGACCCTCTGGATCTCC
CGTTTGTACCACAAACCCATCAGATCTCTGGATCTCCATGCCATCGTAGAAATGGCGCTC
CACCAAGTCGACAAAGTTCCCGGCAGTAACAGGGGCGTTGTAACCATCAAGTACAATACG
GAAGACACAATCC

QA 2 674 2 674
DS 



AS 1 2

CO CL8591Contig1 562 2 1 U
GCTGGAGATCTCTGCTATATCGATGAAGATGGATTTATCTTTGTTGTTGATCGGTTAAAG
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TCCAACTCCAAACTTTGAGTCTTGTGTTGTGAGCCAATCTCCGAGTATTATTGTTACTTT
GTGTTGTAGTAACTCTTGTCAATTCTGTGAAATATATTACCCTGAAGATGATTTACACAT
AAGTAATGTGGACAACAATGTTGTTTATTTAATATAGAGCCTGCCTTCAAAACATGTTAT
CACCAAATATTAGCTCTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FK38TF U 1
AF RR4FK38JQ C 37
BS 1 562 RR4FK38TF

RD RR4FK38TF 562 0 0
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GAACTCATCAAGTACAAAGGCTACCAGGTCCCTCCAGCTGAGATAGAGGCGTTGTTGCTC
GCTCATCCTGAAATCGCTGATGCCGCAGTTATCCCGTTTCCGGACAAAGAAGTAGGGCAG
TTTCCGATGGCGTACGTTGTAAGGAAACCAGGAAGCTTGTTATCTGAGAAGTCAATGATG
GAGTTTGTAGCAAAACAAGTGGCACCGTACAAGAGGGTACGAAAGGTGGCTTTTGTATCC
TCCATACCAAAAAATCCTTCAGGAAAGATTCTGCGCAAGGATCTCATCAAGCTCGCAACG
TCCAACTCCAAACTTTGAGTCTTGTGTTGTGAGCCAATCTCCGAGTATTATTGTTACTTT
GTGTTGTAGTAACTCTTGTCAATTCTGTGAAATATATTACCCTGAAGATGATTTACACAT
AAGTAATGTGGACAACAATGTTGTTTATTTAATATAGAGCCTGCCTTCAAAACATGTTAT
CACCAAATATTAGCTCTGTGCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR4FK38JQ 526 0 0
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GCTGAGATAGAGGCGTTGTTGCTCGCTCATCCTGAAATCGCTGATGCCGCAGTTATCCCG
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GTACGAAAGGTGGCTTTTGTATCCTCCATACCAAAAAATCCTTCAGGAAAGATTCTGCGC
AAGGATCTCATCAAGCTCGCAACGTCCAACTCCAAACTTTGAGTCTTGTGTTGTGAGCCA
ATCTCCGAGTATTATTGTTACTTTGTGTTGTAGTAACTCTTGTCAATTCTGTGAAATATA
TTACCCTGAAGATGATTTACACATAAGTAATGTGGACAACAATGTTGTTTATTTAATATA
GAGCCTGCCTTCAAAACATGTTATCACCAAATATTAGCTCTGTGCC

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL8592Contig1 823 2 4 U
TTTTTGTCGGGCGTTGAACAGTACAGATGACCTTTCAGGCTGGCTGGATTCTGCTTATAG
TTATTTGGCAATGGTGGACTATCCGTATCCTGCTGACTTTATGATGCCTTTGCCTGGACA
TCCCATTAAAGAGGTCTGTAGAAAGATTGATGGGGCTAGTAGTGATGCTAGCATCCTAGA
ACGCATATATGCAGGAGTAAGTGTGTACTACAACTATACTGGGAAGGTTGGCTGCTTTGA
GTTGGATGATGACCCTCATGGTATGGATGGATGGAACTGGCAGGCGTACACGGAGATGGT
AATGCCCATGTCTAGTAGCCAAGAAAACAGCATGTTTACAGCTTATGATTTCAATTACTC
TTCATGCAAAGAGGATTGCTGGAATACATTCGGAGTCAATCCAAGGCCTAGGTGGGTTAC
AACAGAGCTCGGTGGACATAACATAGAGACCACATTGAAGTCGTTTGGAAGCAACGTCAT
TTTCTCGAATGGTCTGTTAGATCCTTGGAGTGGTGGCAGTGTTCTGAAGAACTTATCCAG
TACCATTGTTGCTCTTGTCACGGAAGAAGGTGGACATCATTTGGATCTACGACCTTCAAC
TCCAGAAGACCCAAAATGGCTAGTGGAACAGCGAGAAGCCGAAATACGGTTGATCCAAGA
GTGGATCAGAACATATCGACTAGAAAAAGAAGCTCAGTTTTCTTTGTTAAAAAGTTCATG
GTAAAAGAACATTGTAACACGTCTGGTAAGAGGATGTTGTCTGTTAAAACGTTCTTGGTA
AGATAACAGTGTAAAAGAATATTCTCAGTTCATGCATTCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GT20TF U 1
AF RR4GT20JQ C 58
BS 1 569 RR4GT20TF
BS 570 570 RR4GT20JQ
BS 571 588 RR4GT20TF
BS 589 823 RR4GT20JQ

RD RR4GT20TF 588 0 0
TTTTTGTCGGGCGTTGAACAGTACAGATGACCTTTCAGGCTGGCTGGATTCTGCTTATAG
TTATTTGGCAATGGTGGACTATCCGTATCCTGCTGACTTTATGATGCCTTTGCCTGGACA
TCCCATTAAAGAGGTCTGTAGAAAGATTGATGGGGCTAGTAGTGATGCTAGCATCCTAGA
ACGCATATATGCAGGAGTAAGTGTGTACTACAACTATACTGGGAAGGTTGGCTGCTTTGA
GTTGGATGATGACCCTCATGGTATGGATGGATGGAACTGGCAGGCGTACACGGAGATGGT
AATGCCCATGTCTAGTAGCCAAGAAAACAGCATGTTTACAGCTTATGATTTCAATTACTC
TTCATGCAAAGAGGATTGCTGGAATACATTCGGAGTCAATCCAAGGCCTAGGTGGGTTAC
AACAGAGCTCGGTGGACATAACATAGAGACCACATTGAAGTCGTTTGGAAGCAACGTCAT
TTTCTCGAATGGTCTGTTAGATCCTTGGAGTGGTGGCAGTGTTCTGAAGAACTTATCCAG
TACCATTGTTGCTCTTGTCACGGAAGAAG*TGGACATCATTTGGATCT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4GT20JQ 766 0 0
TAGTTATTTGGCAATGGTGGACTATCCGTATCCTGCTGACTTTATGATGCCTTTGCCTGG
ACATCCCATTAAAGAGGTCTGTAGAAAGATTGATGGGGCTAGTAGTGATGCTAGCATCCT
AGAACGCATATATGCAGGAGTAAGTGTGTACTACAACTATACTGGGAAGGTTGGCTGCTT
TGAGTTGGATGATGACCCTCATGGTATGGATGGATGGAACTGGCAGGCGTACACGGAGAT
GGTAATGCCCATGTCTAGTAGCCAAGAAAACAGCATGTTTACAGCTTATGATTTCAATTA
CTCTTCATGCAAAGAGGATTGCTGGAATACATTCGGAGTCAATCCAAGGCCTAGGTGGGT
TACAACAGAGCTCGGTGGACATAACATAGAGACCACATTGAAGTCGTTTGGAAGCAACGT
CATTTTCTCGAATGGTCTGTTAGATCCTTGGAGTGGTGGCAGTGTTCTGAAGAACTTATC
CAGTACCATTGTTGCTCTTGTCACGGAAGAAGGTGGACATCATTTGGATCTACGACCTTC
AACTCCAGAAGACCCAAAATGGCTAGTGGAACAGCGAGAAGCCGAAATACGGTTGATCCA
AGAGTGGATCAGAACATATCGACTAGAAAAAGAAGCTCAGTTTTCTTTGTTAAAAAGTTC
ATGGTAAAAGAACATTGTAACACGTCTGGTAAGAGGATGTTGTCTGTTAAAACGTTCTTG
GTAAGATAACAGTGTAAAAGAATATTCTCAGTTCATGCATTCCCAC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL8593Contig1 1001 2 2 U
GATGTCATCTTCCCTCAGTATAGAGAACCTGGTGTTCCACTATGGCGTGGCTTCACGCTT
CAAGAGTTTGCAAACCAGTGTTTTGGGAACAAATCTGATTATGGAAAAGGAAGACAGATG
CCTGTTCACTATGGCTCTAACAAGCTTAACTATTTCACCGTCTCAGCCACAATCGCTACG
CAGTTACCAAACGCCGTTGGTGCTGCTTATTCCTTAAAGATGGACGGGAAGGAAGCGTGT
GCGGTCACCTTCTTTGGCGATGGTGGCTCCAGTGAGGGGGACTTCCATGCTGCTTTGAAC
TTTGCAGCGGTTATGGAAGCACCTGTTTTGTTTATATGCAGGAACAATGGATGGGCGATC
AGTACTCCCACCTCAGATCAGTTCCGAAGTGATGGTGTAGTGGTGAAAGGCCGTGCTTAT
GGGATTAGGAGCATACGTGTGGATGGGAACGATGCGCTTGCTATGTACAGTGCGGTGCAT
GAAGGTCGCGAGATGGCGATTAGAGAACATAGGCCAATCTTGATCGAGGCCTTAACGTAT
CGTGTAGGACACCATTCAACGTCAGATGACTCCACTAGGTACCGCTCTGCAGATGAGATA
GAGTGGTGGAACAAAGCAAGAAACCCTCTGTCTAGGTTTAGGACTTGGGTTGAGAGTAAT
GGCTGGTGGAGTGATGAAGCTGAATCTGACCTGAGAAGCAGAATCAAGAAAGAGATGTTA
GAAGCTATCCGGGTTGCAGAGAAGACTGAGAAACCTAATCTGAATCACATGTTTTCAGAT
GTGTATGATGTTCCTCCTTTGAACCTCAGGGAGCAGGAACTTCTGGTGAGGAAGTGTGTC
AAAAGTCACCCACAAGATTACCCATCAGATGTACCTCTTTAGGCGGACACATATATGAAA
TACTCCCATGTAATAAAGTGTAAAAGATTATCTACACTGTGAATCATAATCTTTTCATTG
AAAACTGGATCATCATTAACTCAAATGCGTACAACTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D863TF U 1
AF RR4D863JQ C 327
BS 1 632 RR4D863TF
BS 633 1001 RR4D863JQ

RD RR4D863TF 632 0 0
GATGTCATCTTCCCTCAGTATAGAGAACCTGGTGTTCCACTATGGCGTGGCTTCACGCTT
CAAGAGTTTGCAAACCAGTGTTTTGGGAACAAATCTGATTATGGAAAAGGAAGACAGATG
CCTGTTCACTATGGCTCTAACAAGCTTAACTATTTCACCGTCTCAGCCACAATCGCTACG
CAGTTACCAAACGCCGTTGGTGCTGCTTATTCCTTAAAGATGGACGGGAAGGAAGCGTGT
GCGGTCACCTTCTTTGGCGATGGTGGCTCCAGTGAGGGGGACTTCCATGCTGCTTTGAAC
TTTGCAGCGGTTATGGAAGCACCTGTTTTGTTTATATGCAGGAACAATGGATGGGCGATC
AGTACTCCCACCTCAGATCAGTTCCGAAGTGATGGTGTAGTGGTGAAAGGCCGTGCTTAT
GGGATTAGGAGCATACGTGTGGATGGGAACGATGCGCTTGCTATGTACAGTGCGGTGCAT
GAAGGTCGCGAGATGGCGATTAGAGAACATAGGCCAATCTTGATCGAGGCCTTAACGTAT
CGTGTAGGACACCATTCAACGTCAGATGACTCCACTAGGTACCGCTCTGCAGATGAGATA
GAGTGGTGGAACAAAGCAAGAAACCCTCTGTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4D863JQ 675 0 0
TTTGTTTATATGCAGGAACAATGGATGGGCGATCAGTACTCCCACCTCAGATCAGTTCCG
AAGTGATGGTGTAGTGGTGAAAGGCCGTGCTTATGGGATTAGGAGCATACGTGTGGATGG
GAACGATGCGCTTGCTATGTACAGTGCGGTGCATGAAGGTCGCGAGATGGCGATTAGAGA
ACATAGGCCAATCTTGATCGAGGCCTTAACGTATCGTGTAGGACACCATTCAACGTCAGA
TGACTCCACTAGGTACCGCTCTGCAGATGAGATAGAGTGGTGGAACAAAGCAAGAAACCC
TCTGTCTAGGTTTAGGACTTGGGTTGAGAGTAATGGCTGGTGGAGTGATGAAGCTGAATC
TGACCTGAGAAGCAGAATCAAGAAAGAGATGTTAGAAGCTATCCGGGTTGCAGAGAAGAC
TGAGAAACCTAATCTGAATCACATGTTTTCAGATGTGTATGATGTTCCTCCTTTGAACCT
CAGGGAGCAGGAACTTCTGGTGAGGAAGTGTGTCAAAAGTCACCCACAAGATTACCCATC
AGATGTACCTCTTTAGGCGGACACATATATGAAATACTCCCATGTAATAAAGTGTAAAAG
ATTATCTACACTGTGAATCATAATCTTTTCATTGAAAACTGGATCATCATTAACTCAAAT
GCGTACAACTTGTTC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL8594Contig1 854 2 4 U
AGAGGTGGATCTTTAGCCGGAGTATCTCCCGTTGGAAATCGGTTTAGGAGATGGAGAGGA
GGGCAGAGGACGTTGAAGAAACAGCCGCCGAACCTTCTGGAGAAGCCATAAGATCTCGGC
TCAGTAACAGAGCAGACCCTTTCCTTGTCGTTTGCAGGTGCTTCAGCTTCGTTACGTCTC
TCGTCGCTGTTCTCTGCGTTGTTGTTAATGTTCTCGCTGCTATTCGTTCCTTCCGCGACA
GCCACGATATATTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGTTGATCGCTTGTTTTGTGG
TTCTCGCCGAGACGGAATGGGGATTTATCCTCAAGTTCTCCAAGGTTCTTGAGTACTGGG
CTGGCAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACTATA
TGACTCAAAAGAAGGATCTCTTGCTTCTACAGAACATCGCTAGCTACATGCTCCTCGCTT
GTGGTCTTGTCTATTTCATATCAGGGATTCTATGCATTGGTTTTCTGAAACGTGCTCGAC
AGAAGAAGGAGATCTCGAAAGAACAAGCTGTCAAAGATCTTGAGGAGATAGACCGACGCA
GGGAAGAGCTGGAACAGTTGCTCGTGGAGCATCGGAGTAGAGACGATGTGTAAATGTGAT
CACAAGTACAGTAGCTTCATTTTGAACAGACGAGATCAGTTTGTTTATGTATTAAAGGAT
TGTGTGAGCTCTCTGTTTTCATCCTTTCCACTTTGGATAGTAACAGCAGATTCTTTTTTT
CTTTCGTTCTTTCTTTGAATAATTAAACGCTAGGCTTGTAATAGTTGTCGTATAAGAGAC
GAGCACTATTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EW22TF U 1
AF RR4EW22JQ C 169
BS 1 685 RR4EW22TF
BS 686 686 RR4EW22JQ
BS 687 703 RR4EW22TF
BS 704 854 RR4EW22JQ

RD RR4EW22TF 703 0 0
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GGGCAGAGGACGTTGAAGAAACAGCCGCCGAACCTTCTGGAGAAGCCATAAGATCTCGGC
TCAGTAACAGAGCAGACCCTTTCCTTGTCGTTTGCAGGTGCTTCAGCTTCGTTACGTCTC
TCGTCGCTGTTCTCTGCGTTGTTGTTAATGTTCTCGCTGCTATTCGTTCCTTCCGCGACA
GCCACGATATATTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGTTGATCGCTTGTTTTGTGG
TTCTCGCCGAGACGGAATGGGGATTTATCCTCAAGTTCTCCAAGGTTCTTGAGTACTGGG
CTGGCAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACTATA
TGACTCAAAAGAAGGATCTCTTGCTTCTACAGAACATCGCTAGCTACATGCTCCTCGCTT
GTGGTCTTGTCTATTTCATATCAGGGATTCTATGCATTGGTTTTCTGAAACGTGCTCGAC
AGAAGAAGGAGATCTCGAAAGAACAAGCTGTCAAAGATCTTGAGGAGATAGACCGACGCA
GGGAAGAGCTGGAACAGTTGCTCGTGGAGCATCGGAGTAGAGACGATGTGTAAATGTGAT
CACAAGTACAGTAGCTTCATTTTGA*CAGACGAGATCAGTTTG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4EW22JQ 686 0 0
TCGTTACGTCTCTCGTCGCTGTTCTCTGCGTTGTTGTTAATGTTCTCGCTGCTATTCGTT
CCTTCCGCGACAGCCACGATATATTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGTTGATCG
CTTGTTTTGTGGTTCTCGCCGAGACGGAATGGGGATTTATCCTCAAGTTCTCCAAGGTTC
TTGAGTACTGGGCTGGCAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTT
TCCCTGACTATATGACTCAAAAGAAGGATCTCTTGCTTCTACAGAACATCGCTAGCTACA
TGCTCCTCGCTTGTGGTCTTGTCTATTTCATATCAGGGATTCTATGCATTGGTTTTTTGA
AACGTGCTCGACAGAAGAAGGAGATCTCGAAAGAACAAGCTGTCAAAGATCTTGAGGAGA
TAGACCGACGCAGGGAAGAGCTGGAACAGTTGCTCGTGGAGCATCGGAGTAGAGACGATG
TGTAAATGTGATCACAAGTACAGTAGCTTCATTTTGAACAGACGAGATCAGTTTGTTTAT
GTATTAAAGGATTGTGTGAGCTCTCTGTTTTCATCCTTTCCACTTTGGATAGTAACAGCA
GATTCTTTTTTTCTTTCGTTCTTTCTTTGAATAATTAAACGCTAGGCTTGTAATAGTTGT
CGTATAAGAGACGAGCACTATTGATG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL8595Contig1 789 2 4 U
GAACGTTCCAGAACTTCATATCAAAAACCGATCCCGACACGCTTGCTGCTCTGAGCGGAG
GAGGCAGAGCCGGAGGAGGAGATATGTCGCCAGACATGTTCAAAACCGCGTCCAGCATGA
TAGGCAAAATGTCACCCGAAGAGATTCAGAAAATGGTCCAAACAGCCTCATCTTTCAAAG
GAGACAACAACCCTGGAGAAAACGGGTTTGCACCAACACCAGACATGCTTAAACTCGCGT
CCGATATGATGAGTAAGATGTCACCAGAGGAGCGGGAGAGGATGTTTAACATGGCGTCGT
CTATGAAAGCAAACGCTCCACCAGTTTCGACATCATACAGCGATGCGCAAAGGTCTGAAC
CACCACGGGTTGTAGGCGAGTCTAGTTCCACCTTCGTGGCTCCAAGAAGCAGTATGCCTT
CTGCTCCTCCACCTGGTGACTTGCAGGAACAGATGAGAAACCAAATGAAAGATCCAGCGA
TGAGACAGATGTTCACGTCAATGATAAAGAACATGAATCCGGAGATGATGGCAAGCATGA
GTGAACAAATGGGAATGAAGCTTTCGCAAGAAGATGCTGCAAAAGCTCAGGAAGCCATGG
CTTCTCTTTCTCCTGAAGCTTTGGAGAAAATGATGAGATGGGCGGATAGGGCACAAACGG
GGATAGAGAAAGCGAAGAAAGCAAAGAAGTGGTTGCTAGGGAAAGAGGGTTGATCTTGCG
ATATGCATGCTCCTTTTAGCAATCATCCTTCATCGTCTGGGCTATATTGGAAGGTAAAAG
AGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EE04TF U 1
AF RR4EE04JQ C 198
BS 1 741 RR4EE04TF
BS 742 742 RR4EE04JQ
BS 743 767 RR4EE04TF
BS 768 789 RR4EE04JQ

RD RR4EE04TF 771 0 0
GAACGTTCCAGAACTTCATATCAAAAACCGATCCCGACACGCTTGCTGCTCTGAGCGGAG
GAGGCAGAGCCGGAGGAGGAGATATGTCGCCAGACATGTTCAAAACCGCGTCCAGCATGA
TAGGCAAAATGTCACCCGAAGAGATTCAGAAAATGGTCCAAACAGCCTCATCTTTCAAAG
GAGACAACAACCCTGGAGAAAACGGGTTTGCACCAACACCAGACATGCTTAAACTCGCGT
CCGATATGATGAGTAAGATGTCACCAGAGGAGCGGGAGAGGATGTTTAACATGGCGTCGT
CTATGAAAGCAAACGCTCCACCAGTTTCGACATCATACAGCGATGCGCAAAGGTCTGAAC
CACCACGGGTTGTAGGCGAGTCTAGTTCCACCTTCGTGGCTCCAAGAAGCAGTATGCCTT
CTGCTCCTCCACCTGGTGACTTGCAGGAACAGATGAGAAACCAAATGAAAGATCCAGCGA
TGAGACAGATGTTCACGTCAATGATAAAGAACATGAATCCGGAGATGATGGCAAGCATGA
GTGAACAAATGGGAATGAAGCTTTCGCAAGAAGATGCTGCAAAAGCTCAGGAAGCCATGG
CTTCTCTTTCTCCTGAAGCTTTGGAGAAAATGATGAGATGGGCGGATAGGGCACAAACGG
GGATAGAGAAAGCGAAGAAAGCAAAGAAGTGGTTGCTAGGGAAAGAGGGTTGATCTTGCG
ATATGCATGCTCCTTTTAGCA*TCATCCTTCATCGTCTGGGCTATAT
GGAG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4EE04JQ 592 0 0
GAAAACGGGTTTGCACCAACACCAGACATGCTTAAACTCGCGTCCGATATGATGAGTAAG
ATGTCACCAGAGGAGCGGGAGAGGATGTTTAACATGGCGTCGTCTATGAAAGCAAACGCT
CCACCAGTTTCGACATCATACAGCGATGCGCAAAGGTCTGAACCACCACGGGTTGTAGGC
GAGTCTAGTTCCACCTTCGTGGCTCCAAGAAGCAGTATGCCTTCTGCTCCTCCACCTGGT
GACTTGCAGGAACAGATGAGAAACCAAATGAAAGATCCAGCGATGAGACAGATGTTCACG
TCAATGATAAAGAACATGAATCCGGAGATGATGGCAAGCATGAGTGAACAAATGGGAATG
AAGCTTTCGCAAGAAGATGCTGCAAAAGCTCAGGAAGCCATGGCTTTTCTTTCTCCTGAA
GCTTTGGAGAAAATGATGAGATGGGCGGATAGGGCACAAACGGGGATAGAGAAAGCGAAG
AAAGCAAAGAAGTGGTTGCTAGGGAAAGAGGGTTGATCTTGCGATATGCATGCTCCTTTT
AGCAATCATCCTTCATCGTTTGGGCTATATTGGAAGGTAAAAGAGAAAAAAA

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL8596Contig1 987 2 2 U
TTGTCAACAGATACTAAGCCCAGACTCAAATGGACTTGTGAGCTTCATCACAGATTCATC
GAAGCCGTTAATCAACTCGGTGGACCTAACAAAGCAACACCTAAGGGTTTGATGAAGGCC
ATGGAGAACCCTGGACTTACCTTGTATCACCTCAAGAGCCATTTACAGAAATATCGGCTA
GGGAAGAGCCTAAAATTCGATGATAACAAGCTAGAAGTTTCCTCAGCTTCAGAAACCCAA
GAAGCTGAGAGTAAAAACGATTCTAGAGATTTTAGAGGCGATGCCAACGAAGAAAACAAC
GATTCAGCTAACGAAGGCTTGAAAATCACGGAGGCTCTACAACTGCAAATGGAAGTTCAG
AAGAAACTTCATGAACAAATCGAGGTTCAGAGGCATTTGCAAGTAAAGATTGAGGCACAA
GGAAAGTATTTACAGTCAGTTTTGATGAAAGCTCAACAAACTCTCGCTGGCTACACATCT
TCCACTCTTGGCATGGAATTTGCTAGAAGCGAGCTCTCTAGATTAGCTTCAATGGTGAAT
CCGAGTTCTTCCTTCTCAGAGCTAACGCAAATGGAAGATTACGAAGAAGAAAGATTCTTG
TGGTGCAAGAAACCAGAAAACAGAGGAGTTGGACAGCCAAGACGTTCAGTTGAGAGCTCG
TTGACATCTTCAGAGAGCTCAGAGACAAAACTGAATAATAATAACGACGAGAGGAAATCG
ATGGAGCTTCCATTGATGGAGATCAAACCAGAAGTGATGATGGAGAAGCAAAAGAAGAGA
AGCTTAAACGACGTCCTTTGTGTGGAACATCAGCCTCTTAAGAAAAGAGATTTTGGAGTT
GACGATGATGATGAGCAGCACTTGAGGTTGAGTTTGAATAGTTACAAGAAAAACATGGGG
ACATGTCCGAACATAGGACTATGGTTCGAGTGAGAAAAAAAATCAGTTTATTAAGATATA
TAAATATTTTAATAAAATCCAATATAC


BQ
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AF RR4A918TF U 1
AF RR4A918JQ C 219
BS 1 621 RR4A918TF
BS 622 987 RR4A918JQ

RD RR4A918TF 621 0 0
TTGTCAACAGATACTAAGCCCAGACTCAAATGGACTTGTGAGCTTCATCACAGATTCATC
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ATGGAGAACCCTGGACTTACCTTGTATCACCTCAAGAGCCATTTACAGAAATATCGGCTA
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GGAAAGTATTTACAGTCAGTTTTGATGAAAGCTCAACAAACTCTCGCTGGCTACACATCT
TCCACTCTTGGCATGGAATTTGCTAGAAGCGAGCTCTCTAGATTAGCTTCAATGGTGAAT
CCGAGTTCTTCCTTCTCAGAGCTAACGCAAATGGAAGATTACGAAGAAGAAAGATTCTTG
TGGTGCAAGAAACCAGAAAAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4A918JQ 769 0 0
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GCAAGTAAAGATTGAGGCACAAGGAAAGTATTTACAGTCAGTTTTGATGAAAGCTCAACA
AACTCTCGCTGGCTACACATCTTCCACTCTTGGCATGGAATTTGCTAGAAGCGAGCTCTC
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TTACGAAGAAGAAGGATTCTTGTGGTGCAAGAAACCAGAAAACAGAGGAGTTGGACAGCC
AAGACGTTCAGTTGAGAGCTCGTTGACATCTTCAGAGAGCTCAGAGACAAAACTGAATAA
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GATGGAGAAGCAAAAGAAGAGAAGCTTAAACGACGTCCTTTGTGTGGAACATCAGCCTCT
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AAAATCAGTTTATTAAGATATATAAATATTTTAATAAAATCCAATATAC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL8597Contig1 804 2 1 U
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GGACGCGGCTAAGTCGACAATGTATGTGAAAGAGAATGCACCTCCTCCTAGATATCCTCC
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ACCATATGTTAGTCACACTTGGCTTAAGCTGCCGATTGTTTGATTAGTTTCTTGTATTTA
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TGATAAAAAGATTTCCGAGTGTCG


BQ
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AF RR4B494JQ C 1
AF RR4B494TF U 1
BS 1 804 RR4B494TF

RD RR4B494JQ 804 0 0
GGCGAATCACTCTCTATCAATGTCAATGGATAAATCGTACAGCAGAAACGAGAGTTTCAA
GTCGTTTAAGGAAGAGAGGACTTCTCATGTCCCCCCAGTTCATGATTATCCAACTATGCA
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GCCAGTTACTAATCAAAGAAGAAGGGATAGACGAGCGTACAATAGAGCTGACACTATGGA
TAGTAGACATATGACGATACCAATCGACCCATCTTGGTATGATCCTAGTGATAGCAAGAT
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ACATGACAGACAGATCCAGGAATTTAATAGACAAACACAGAAGGCGCGAGAAGGCAAAAC
TGGCACATGATGTAAACGAATCATCAAACCAGACACTGGACTTTGTACTTGGAAGCTACA
GTTGAGTAAGGTTTAAGATCTGTCATTAGAATTTCTGTTGGTTCATATATTTGTGACTAT
ACCATATGTTAGTCACACTTGGCTTAAGCTGCCGATTGTTTGATTAGTTTCTTGTATTTA
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TGATAAAAAGATTTCCGAGTGTCG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR4B494TF 804 0 0
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GTCGTTTAAGGAAGAGAGGACTTCTCATGTCCCCCCAGTTCATGATTATCCAACTATGCA
AATTAGAAATAATCAACCTGGTGAGAGAGTTTCATACTCGGGTCCATTGATGAGCAACCG
GGACGCGGCTAAGTCGACAATGTATGTGAAAGAGAATGCACCTCCTCCTAGATATCCTCC
ATCTAGAGTAAACCCGAGGGTCTTGTCAGGCTCAGTCTCCTCCAAGGCGTTATTAGATCA
GCCAGTTACTAATCAAAGAAGAAGGGATAGACGAGCGTACAATAGAGCTGACACTATGGA
TAGTAGACATATGACGATACCAATCGACCCATCTTGGTATGATCCTAGTGATAGCAAGAT
TTACACGTCCGGAAGACCGTTGTTGGAACAGCCAAGCAGAGTGGATCAGATGCTTGAGGA
ACATGACAGACAGATCCAGGAATTTAATAGACAAACACAGAAGGCGCGAGAAGGCAAAAC
TGGCACATGATGTAAACGAATCATCAAACCAGACACTGGACTTTGTACTTGGAAGCTACA
GTTGAGTAAGGTTTAAGATCTGTCATTAGAATTTCTGTTGGTTCATATATTTGTGACTAT
ACCATATGTTAGTCACACTTGGCTTAAGCTGCCGATTGTTTGATTAGTTTCTTGTATTTA
AGATGTGTAATTATAGAGACTGATCTGTGTAAATTACATAGTGAGATTGTCCTTCACATA
TGATAAAAAGATTTCCGAGTGTCG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL8598Contig1 881 2 2 U
GGGACAAACCAGATTATTCATATCTGAGAAGACTTTTCAGAGACCTTTTCATTCGCGAAG
GTTACCAGCTGGACTACGTGTTTGATTGGACGACCTTGAAATATCCTCAGACTGGCTCTA
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TCTTTCGCTAGCCATCATCCTGGAAATCTATCATGAAGGTTTCCCTACTTAGTGATCCAA
ACACGAGTCTGATAGAAACCCTTCTTCATCCCGAAATGGAAGTACCTCAAAGAGAGGTGT
GATGTCAAGCAGCAGGCCTGCCTCCTCCGCTGAACCAAGCGAGAACCGCTCAAGCCGACT
ATTTTCAAGTGGATCACGGCTCGCCACAACTCAGCAGAACTATCAGTCTAAGGCATCTGT
AAAACCTGGGCCTGATGATGCCATTAGAAGCTTTGAGCTCCTTACCATCGGTTCTGCGAA
GAACAGGAAATGAAGATAGGGACGGAGAAGTTGATAAGAATGAAAAGACATATATGTACA
TTGTTTGTGTTGAAGAAATTGAAAGAGAGAATCTAATCTGCCTCTCCCAATCTCATTGTT
TGTGTTGAAGAAATATTATTCACATCCTTAAAGTGTAACTTGTGATGACTACAGTATTGT
AGAGATGAAAATATAAAACCTACCTTGTCGGAATTTGAACT


BQ
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TCTTTCGCTAGCCATCATCCTGGAAATCTATCATGAAGGTTTCCCTACTTAGTGATCCAA
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ATTTTCAAGTGGATCACGGCTCGCCACAACTCAGCAGAACTATCAGTCTAAGGCATCTGT
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DS 

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GATGTACCACCCTCTTCTTCCAGAGAAGTGGTTAGTTTTTGTTGCTCGTTCTTTCGCTAG
CCATCATCCTGGAAATCTATCATGAAGGTTTCCCTACTTAGTGATCCAAACACGAGTCTG
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GATCACGGCTCGCCACAACTCAGCAGAACTATCAGTTTAAGGCATCTGTAAAACCTGGGC
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GAAGATAGGGACGGAGAAGTTGATAAGAATGAAAAGACATATATGTACATTGTTTGTGTT
GAAGAAATTGAAAGAGAGAATCTAATCTGCCTCTCCCAATCTCATTGTTTGTGTTGAAGA
AATATTATTCACATCCTTAAAGTGTAACTTGTGATGACTACAGTATTGTAGAGATGAAAA
TATAAAACCTACCTTGTCGGAATTTGAACT

QA 9 758 9 758
DS 



AS 1 2

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ACCATCTTCTGCTGCTCCTACCTCTTCTTTGTTTGGAGCAGCAACTACTCCCTCGCAGAC
ACCACTCTTTGGTTCTTCACCAGCTTCTGCATTTGGTTCTGCTCCAGCTTCTGCATTTGG
CTCTGCTCCATCTTTGTTTGGCCAGCCAACTCCATCAATTGCTGCTACGCCTTCACAGTT
TGCAGGTATTACTCCGGGTTCAGGAGCCAGCTTCGGTTCTATGACTAAATCTTCAAGGCC
AAAATCTAGAACTTCACGCCGTTAAACCACTGGTTTCTTCTCTCAGCCTGTGGCCACGCA
TCATTACATCTCTTGAGAGTTCATCGCTTTTCACTCTGGTGATGTTTAGTTTGGTGAAAG
TCGGCTTATGGCACCAGTTTGTATCCTATGCCAGCCTGCCCGTTATTTATTGGATTGATC
ATTGAATGTTCCCAGAGGCAGTCACAGGGCACAAAAGTGTATCATCTGGACAATGTTTTT
GTTGTAGTAAAATCTTATTCATACAATCATACATCCCATGAAACATTTAGCCTATCATGG
TGGTGGAAACTTTAAATTTTTTTTTATTAATATATAATGACAATAATGATATCA


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AF RR4FB77TF U 1
AF RR4FB77JQ C 145
BS 1 678 RR4FB77TF
BS 679 714 RR4FB77JQ

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GGGGGCTTCAAATGCTCCACCAACATCCGCATCCTTTCCAACACCAAACCCTTCTTCAGG
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ACCATCTTCTGCTGCTCCTACCTCTTCTTTGTTTGGAGCAGCAACTACTCCCTCGCAGAC
ACCACTCTTTGGTTCTTCACCAGCTTCTGCATTTGGTTCTGCTCCAGCTTCTGCATTTGG
CTCTGCTCCATCTTTGTTTGGCCAGCCAACTCCATCAATTGCTGCTACGCCTTCACAGTT
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AAAATCTAGAACTTCACGCCGTTAAACCACTGGTTTCTTCTCTCAGCCTGTGGCCACGCA
TCATTACATCTCTTGAGAGTTCATCGCTTTTCACTCTGGTGATGTTTAGTTTGGTGAAAG
TCGGCTTATGGCACCAGTTTGTATCCTATGCCAGCCTGCCCGTTATTTATTGGATTGATC
ATTGAATGTTCCCAGAGGCAGTCACAGGGCACAAAAGTGTATCATCTGGACAATGTTTTT
GTTGTAGTAAAATCTTATTCATACAATCATACATCCCATGAAACATTTAGCCTATCATGG
TGGTGGAAACTTTAAATT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FB77JQ 570 0 0
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AACCACTGGTTTTTTCTCTCAGCCTGTGGCCACGCATCATTACATCTCTTGAGAGTTCAT
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CCTATGCCAGCCTGCCCGTTATTTATTGGATTGATCATTGAATGTTCCCAGAGGCAGTCA
CAGGGCACAAAAGTGTATCATCTGGACAATGTTTTTGTTGTAGTAAAATCTTATTCATAC
AATCATACATCCCATGAAACATTTAGCCTATCATGGTGGTGGAAACTTTAAATTTTTTTT
TATTAATATATAATGACAATAATGATATCA

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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TTCGCTGATTCAATACCAGAAGCCGAAGTCGTATCCGTCTGAGCAATGGCTTTGGTATTG
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TCCCTGATCGAATATGCACAAATTGAGCAATGGATCGATTTCTCCTCACTTGAGATTTTC
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GAGGAAGCTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGGGCACTTGATGCTCTGAACACCCATCTCACT
TCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTATCACCCTTGCCGATATCATCACTGTCTGCAAC
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BQ
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AF RR4G584TF U 1
AF RR4FM69TF U 1
BS 1 771 RR4FM69TF

RD RR4G584TF 544 0 0
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TCCA

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR4FM69TF 771 0 0
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TTCGCTGATTCAATACCAGAAGCCGAAGTCGTATCCGTCTGAGCAATGGCTTTGGTATTG
CACACATACAAGGGAAACAAAGGTGCTGAGAAGGCACTCATTGTCGCAGAGTACACTGGT
GTGCAGATCGATGTACCCGACTTTGAGATGGGTGTCTCTAACAAGACCCCTGAGTTCCTC
AAGATGAACCCTATTGGAAAGGTTCCGGTGCTTGAGACTCCCGAGGGTCCCATCTTTGAG
AGCAACGCCATTGCCCGTTATGTGAGCCGATTGAACGGTGAGAACTCTTTGAATGGATCT
TCCCTGATCGAATATGCACAAATTGAGCAATGGATCGATTTCTCCTCACTTGAGATTTTC
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GAGGAAGCTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGGGCACTTGATGCTCTGAACACCCATCTCACT
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GAGAGATACTTCTGGACCTCGATTAACCAGCCAAACTTCAAGAAGTGGTGGGTGATGTCA
AACAGACTGAAGCTGTCCCTCCCGTTACTTCCAGAAAGCTGCTGCCAGCTG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL8601Contig1 724 2 1 U
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CGCC


BQ
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AF RR4BP09JQ C 1
AF RR4BP09TF U 1
BS 1 724 RR4BP09TF

RD RR4BP09JQ 724 0 0
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TGGTTATGCTCAGACGGGTTCCATGCACCTAAGTAAGGACCCGAATTTTGATTCTCTCAC
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TGCAGTCGCTGGGGTAAATAAACTGTCATATATTTAAATATAACGATTACGTTTTTTGAG
TTTTTATAAACCTTATTTTTGAGCCAAAAGAGAAATGATAACATGAAACAAAAATAAGAC
TAGAGTTAACTAGAAATAAATATCATCTGGCAAAGTTTTGACATGTGTTATAATAGGGAT
GGGACAACTATCAAACATCTGGATTAGATATGAAATCCGCTCTAGATCCACTCTAAATAT
CCAGATATTTGTAAGATCGTATCTGTGTGATAGTACCTCGGATCAGTAGATCTTCAAAGT
TTGTAAATGTATTATAATATATGTTCTAAATAATTTACCAAAGATACATTAAATTTTATA
CGCC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4BP09TF 724 0 0
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CTCACTGAACATTACCAATGAGTATCTCAACCACAAATGCCTCCTTAATCAAGGGATATA
TAATGTTGGAGGTGAATACGAGAACAACCTCAACATTCTCTTTCGTAAAGTTCGTACTGA
TGGTTATGCTCAGACGGGTTCCATGCACCTAAGTAAGGACCCGAATTTTGATTCTCTCAC
CGTCATGTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGATCTAAATGTCGTACATGCGCTGACAC
TGCAGTCGCTGGGGTAAATAAACTGTCATATATTTAAATATAACGATTACGTTTTTTGAG
TTTTTATAAACCTTATTTTTGAGCCAAAAGAGAAATGATAACATGAAACAAAAATAAGAC
TAGAGTTAACTAGAAATAAATATCATCTGGCAAAGTTTTGACATGTGTTATAATAGGGAT
GGGACAACTATCAAACATCTGGATTAGATATGAAATCCGCTCTAGATCCACTCTAAATAT
CCAGATATTTGTAAGATCGTATCTGTGTGATAGTACCTCGGATCAGTAGATCTTCAAAGT
TTGTAAATGTATTATAATATATGTTCTAAATAATTTACCAAAGATACATTAAATTTTATA
CGCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL8602Contig1 866 2 2 U
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GATCACAAGATCCGTCACCGCTGCATCCTCCAACACCATTGTGTTTCGTTTCGACTGAAT
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TCTTCTCTGTTCTGCAAGTATATGTCTCCATATGGTTCATCTTCTTTTGTTCTGTTTTTG
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CTTATTAGGGTAACACTATTGCACAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G831TF U 1
AF RR4G831JQ C 120
BS 1 649 RR4G831TF
BS 650 866 RR4G831JQ

RD RR4G831TF 649 0 0
GGATCAACGTGGCGTCTAGCCATTGGCACTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCGCGCTCCGA
GATCACAAGATCCGTCACCGCTGCATCCTCCAACACCATTGTGTTTCGTTTCGACTGAAT
CCAAAGGTTTACCCTTTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCGGGGAGATGCCAATTTAGAG
AAAGACAGAGAGAGATATGGTGAAGCCAGCGGGAAAGCAGAGTTATGGGCGCCTTGTGTT
CGCTTCATTCCTCGCCCTTTTAGCCTTCGGCCTCATCGCCGACTTCCTCTGGGCTTCATC
TCATCGCTTCTCCTCCGCCATGCTCTCTCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTGGTCGTAAA
ACTCCCTCCAAGTTCCAATAAGAAACTAATGGCTGTAGATACAACACTCAGGAGTTGTAA
AGTTGGTGGAGTAAAAGTAAAAGCAGTGGATACAACCGGTGCAGGAGATGCATTTGTGAG
CGGTCTATTGAACAGCTTAGCTTCTGATCTCACTCTTCTCAATGATGAGAAGAAGCTAAG
AGAGGAGCTATTCCAGCTATGCCCACCATGAATGCTGTTCAAGACCTTCTCTCTTCTTGC
TCTCACTATCCGATTTGTTGGGGAGTGGTGTTACAAACTGCAGAAAATT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4G831JQ 747 0 0
TCCAAAGGTTTACCCTTTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCGGGGAGATGCCAATTTAGA
GAAAGACAGAGAGAGATATGGTGAAGCCAGCGGGAAAGCAGAGTTATGGGCGCCTTGTGT
TCGCTTCATTCCTCGCCCTTTTAGCCTTCGGCCTCATCGCCGACTTCCTCTGGGCTTCAT
CTCATCGCTTCTCCTCCGCCATGCTCTCTCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTGGTCGTAA
AACTCCCTCCAAGTTCCAATAAGAAACTAATGGCTGTAGATACAACACTCAGGAGTTGTA
AAGTTGGTGGAGTAAAAGTAAAAGCAGTGGATACAACCGGTGCAGGAGATGCATTTGTGA
GCGGTCTATTGAACAGCTTAGCTTCTGATCTCACTCTTCTCAATGATGAGAAGAAGCTAA
GAGAGGAGCTATTCCAGCTATGCCCACCATGAATGCTGTTCAAGACCTTCTCTCTTCTTG
CTCTCACTATCCGATTTGTTGGGGAGTGGTGTTACAAACTGCAGAAAATTGCAGGTTTTT
TTTTCATGTTTCTTTTGTGAAGTGTGTTGATGTTCATGTTGTGGTTGAGATATGTTTTAA
ATCTTCTCTGTTCTGCAAGTATATGTCTCCATATGGTTCATCTTCTTTTGTTCTGTTTTT
GATCTTGTTCAAAGAAAAGAAAAACAGAGAAATGTTTGTGTGTAACAAAAAAGCACAAAA
ACTTATTAGGGTAACACTATTGCACAC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL8603Contig1 705 2 5 U
GGGACAATGGCTTCAGCTTCAGCGACAGCTACTCTTCTCAAACCCAGTTCTGTTCCAACC
CAGCATAAACCGGTCACCACCGCCTCCGTATCTCCTCCTCTTCCTCCTCCACGTCGTCAC
AACCTCCTCCGCCGCGATGTACTCTCAATATCCGCCGCATCGACGCTTCTTCTAACGCAA
TCGCTCCCGTTTCTAGCTCCGTCGCCGGCTTCCGCCGCCGAAGACGAAGAGTACGTGAAA
GATACGTCGGCGGTGATCTCCAAAGTTCGGACGACGCTCTCGATGGAGAGGACGGATCCG
AATGTGGCGGACGCGGTGGCTGAGCTGGGAGAAGCGTCGAACTCGTGGGTTGCAAAGTAC
AGGAAGGAGAAAGCTCTTCTCGGGAAAGCGTCTTTCAGGGATATCTACTCGGCGTTGAAT
GCTGTGTCCGGACATTATGTGAGTTTTGGTCCGACGGCTCCGATCCCGGCGAGGAGGAAG
GCGAGGATTCTTGAAGAGATGGAGACTGCTGAGAAAGCTCTCTCGAGAGGAAGATAAATC
TATCAGTGAGCCCTAACAATTTCTTCTTCTTCTCCAGTTCCTTGTTGATGAAGTTTTCTT
TTACCTTCAAATGCATATTGGGATTATATGAGAAGAGAAACATGAATTTTCTCGTTTGTT
TTTGTAAAACACTTTCATGATAATTTACTTAATTATCATTTACAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BW78TF U 1
AF RR4BW78JQ C 2
BS 1 668 RR4BW78TF
BS 669 669 RR4BW78JQ
BS 670 682 RR4BW78TF
BS 683 683 RR4BW78JQ
BS 684 705 RR4BW78TF

RD RR4BW78TF 705 0 0
GGGACAATGGCTTCAGCTTCAGCGACAGCTACTCTTCTCAAACCCAGTTCTGTTCCAACC
CAGCATAAACCGGTCACCACCGCCTCCGTATCTCCTCCTCTTCCTCCTCCACGTCGTCAC
AACCTCCTCCGCCGCGATGTACTCTCAATATCCGCCGCATCGACGCTTCTTCTAACGCAA
TCGCTCCCGTTTCTAGCTCCGTCGCCGGCTTCCGCCGCCGAAGACGAAGAGTACGTGAAA
GATACGTCGGCGGTGATCTCCAAAGTTCGGACGACGCTCTCGATGGAGAGGACGGATCCG
AATGTGGCGGACGCGGTGGCTGAGCTGGGAGAAGCGTCGAACTCGTGGGTTGCAAAGTAC
AGGAAGGAGAAAGCTCTTCTCGGGAAAGCGTCTTTCAGGGATATCTACTCGGCGTTGAAT
GCTGTGTCCGGACATTATGTGAGTTTTGGTCCGACGGCTCCGATCCCGGCGAGGAGGAAG
GCGAGGATTCTTGAAGAGATGGAGACTGCTGAGAAAGCTCTCTCGAGAGGAAGATAAATC
TATCAGTGAGCCCTAACAATTTCTTCTTCTTCTCCAGTTCCTTGTTGATGAAGTTTTCTT
TTACCTTCAAATGCATATTGGGATTATATGAGAAGAGAAACATGAATTTTCTCGTTTGTT
TTTGTAAA*CACTTTCATGATA*TTTACTTAATTATCATTTACAG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4BW78JQ 704 0 0
GGACAATGGCTTCAGCTTCAGCGACAGCTACTCTTCTCAAACCCAGTTCTGTTCCAACCC
AGCATAAACCGGTCACCACCGCCTCCGTATCTCCTCCTCTTCCTCCTCCACGTCGTCACA
ACCTCCTCCGCCGCGATGTACTCTCAATATCCGCCGCATCGACGCTTCTTCTAACGCAAT
CGCTCCCGTTTCTAGCTCCGTCGCCGGCTTCCGCCGCCGAAGACGAAGAGTACGTGAAAG
ATACGTCGGCGGTGATCTCCAAAGTTCGGACGACGCTCTCGATGGAGAGGACGGATCCGA
ATGTGGCGGACGCGGTGGCTGAGCTGGGAGAAGCGTCGAACTCGTGGGTTGCAAAGTACA
GGAAGGAGAAAGCTCTTCTCGGGAAAGCGTCTTTCAGGGATATCTACTCGGCGTTGAATG
CTGTGTCCGGACATTATGTGAGTTTTGGTCCGACGGCTCCGATCCCGGCGAGGAGGAAGG
CGAGGATTCTTGAAGAGATGGAGACTGCTGAGAAAGCTCTCTCGAGAGGAAGATAAATCT
ATCAGTGAGCCCTAACAATTTCTTCTTCTTCTCCAGTTCCTTGTTGATGAAGTTTTCTTT
TACCTTCAAATGCATATTGGGATTATATGAGAAGAGAAACATGAATTTTCTCGTTTGTTT
TTGTAAAACACTTTCATGATAATTTACTTAATTATCATTTACAG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL8604Contig1 719 2 10 U
GTAATAAAAAGCTTTTCTCTGAGTAACATATCTTAGTTGACAGTTTTCAGCTAAAACCAA
AATGATAATCCGTTTCAATATTTCTTCCGGTAAATATATGAACAATTCACATCCAGACCC
GCAAAAAAAAAAAGGTTCATAATGGCTGAAAAATGCTTTCTGGGTCTGCAAAATCTTCAC
CATGTACGCTGCCAAAGTGAGCCATCTCCCAAGTTACTGTTTCAGGCAGTATCTTGATCT
CAGTTTCGCTATGAACTCTGCATATTCCATCGGAGTCGCTTTACTGCAGAAAACATCCTC
CCATATCTTCAAAAGCTCATTTTTCTCCGTGGAGGTAAGGCACATGACAATCATGTCGAA
TCTAGGAACCTTTGTAAGGTTCTCAATGTATTTAACAGCCAAATCCATATCTTCATTGAA
AAATGAGGCCACACATTTGATCATGTCAAACAAAACCGGAGAAGTCAAAGCGTTCTTGAA
AATATGAGGTAAAGAGCTCGGTGTCGTAACCTTTAACAACTGGGTTTGTAATGCACGGTC
GCCACAGAAACTCCGCCAAGAGTTCTCAAATTCATAAGCAGATTTTGGGGCTTGAATGTT
CTTTGAGACTTCAGTCATTGCTAGTGACGCTGCACGAACAGCAAGCTCTTGCACTGATGG
CTTTGGTTCCTTTTGATAGCTTTCGCTCTTAGGCGTCACTTTCTTGGAAACTTCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GB95JQ U 1
AF RR4BX72JQ U 2
BS 1 151 RR4GB95JQ
BS 152 152 RR4BX72JQ
BS 153 254 RR4GB95JQ
BS 255 255 RR4BX72JQ
BS 256 356 RR4GB95JQ
BS 357 357 RR4BX72JQ
BS 358 544 RR4GB95JQ
BS 545 545 RR4BX72JQ
BS 546 582 RR4GB95JQ
BS 583 719 RR4BX72JQ

RD RR4GB95JQ 582 0 0
GTAATAAAAAGCTTTTCTCTGAGTAACATATCTTAGTTGACAGTTTTCAGCTAAAACCAA
AATGATAATCCGTTTCAATATTTCTTCCGGTAAATATATGAACAATTCACATCCAGACCC
GCAAAAAAAAAAAGGTTCATAATGGCTGAAATATGCTTTCTGGGTCTGCAAAATCTTCAC
CATGTACGCTGCCAAAGTGAGCCATCTCCCAAGTTACTGTTTCAGGCAGTATCTTGATCT
CAGTTTCGCTATGACCTCTGCATATTCCATCGGAGTCGCTTTACTGCAGAAAACATCCTC
CCATATCTTCAAAAGCTCATTTTTCTCCGTGGAGGTAAGGCACATGACAATCATGTTGAA
TCTAGGAACCTTTGTAAGGTTCTCAATGTATTTAACAGCCAAATCCATATCTTCATTGAA
AAATGAGGCCACACATTTGATCATGTCAAACAAAACCGGAGAAGTCAAAGCGTTCTTGAA
AATATGAGGTAAAGAGCTCGGTGTCGTAACCTTTAACAACTGGGTTTGTAATGCACGGTC
GCCAGAGAAACTCCGCCAAGAGTTCTCAAATTCATAAGCAGA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4BX72JQ 718 0 0
GAATG
AAAAGCTTTTCTCTGAGTAACATATCTTAGTTGACAGTTTTCAGCTAAAACCAAAATGAT
AATCCGTTTTAATATT*CTTCCGGTAAATATATGAACAATTCACATCCAGACCCGCAAAA
AAAAA**GGTTCATAATGGCTGAAAAATGCTTTCTGGGTCTGCAAAATCTTCACCATGTA
CGCTGCCAAAGTGAGCCATCTCCCAAGTTACTGTTTCAGGCAGTATCTTGATCTCAGTTT
CGCTATGAACTCTGCATATTCCATCGGAGTCGCTTTACTGCAGAAAACATCCTCCTATAT
CTTCAAAAGCTCATTTTTCTCCGTTGAGGTAAGGCACATGACGATCATGTCGAATCTAGG
AACCTTTGTAAGGTTCTCAATGTATTTAACAGCCAAATCCATATCTTCATTGAAAAATGA
GGCCACACATTTGATCATGTCAAACAAAACCGGAGAAGTCAAAGCGTTCTTGAAAATATG
AGGTAAAGAGCTCGGTGTCGTAACCTTTAACAACTGGGTTTGTAATGCACGGTCGCCACA
GAAACTCCGCCAAGAGTTCTCAAATTCATAAGCAGATTTTGGGGCTTGAATGTTCTTTGA
GACTTCAGTCATTGCTAGTGACGCTGCACGAACAGCAAGCTCTTGCACTGATGGCTTTGG
TTCCTTTTGATAGCTTTCGCTCTTAGGCGTCACTTTCTTGGAAACTTCTTTCT

QA 6 718 6 718
DS 



AS 1 2

CO CL8605Contig1 662 2 1 U
CCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTGCGTTAACCAACAGAAACAACTCAGCTGCTGAC
CAGGTGAATCACACATCAAAGGGTAGTGGTCATGTGCCTTATATATGGATTATTGGTGGT
CTTACAATTGTGCTTGCGCTTCTCGTCATATGTATACTTGTATGCATCTGTTTGAGATCA
TCTAGTTGCAATTCTTCAAGTGATGAAGATAGTGGTGGACACAGCTTCCAAATCCTTAGG
AACTCCGGTTTCTTTTGCGGTTCTGGTCGGTATAACTGCTGCAGACAAACCAACTGTGAA
ACTCAGAGCAATCATCATCAAGTTGTTGCTTCCCAAAGCTCTTGGTGATGGAATGTTTGA
GATAGAGAAGCCTACTGTGTTCACTTATGAAGAGATCCGTGCTGCTACTGATGGGTTTGC
TGATTCTAATCTTCTTGGTCATGGAAACTATGGTTCAGTATACTTTGGTCTACTTAGAGA
ACAAGAAGTTGCTGTGAAAAGGATGACAGCTACAAAAACTAAAGAGTTTGCAGCAGAGAT
GAAAGTTCTATGCAGAGTTCATCATTCAAATCTGAGCTGATTGGTTATGCTGCAACCAGT
GATGAGCTTTTCGTAGTGTATGAATATGTGCAAAAGGAATGCTCAAAACCATTTGCATGA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR4CL21TF U 84
AF RR4C412TF U 1
BS 1 662 RR4C412TF

RD RR4CL21TF 309 0 0
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CGTCATATGTATACTTGTATGCATCTGTTTGAGATCATCTAGTTGCAATTCTTCAAGTGA
TGAAGATAGTGGTGGACACAGCTTCCAAATCCTTAGGAACTCCGGTTTCTTTTGCGGTTC
TGGTCGGTATAACTGCTGCAGACAAACCAACTGTGAAACTCAGAGCAATCATCATCAAGT
TGTTGCTTCCCAAAGCTCTTGGTGATGGAATGTTTGAGATAGAGAAGCCTACTGTGTTCA
CTTATGAAG

QA 1 309 1 309
DS 

RD RR4C412TF 662 0 0
CCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTGCGTTAACCAACAGAAACAACTCAGCTGCTGAC
CAGGTGAATCACACATCAAAGGGTAGTGGTCATGTGCCTTATATATGGATTATTGGTGGT
CTTACAATTGTGCTTGCGCTTCTCGTCATATGTATACTTGTATGCATCTGTTTGAGATCA
TCTAGTTGCAATTCTTCAAGTGATGAAGATAGTGGTGGACACAGCTTCCAAATCCTTAGG
AACTCCGGTTTCTTTTGCGGTTCTGGTCGGTATAACTGCTGCAGACAAACCAACTGTGAA
ACTCAGAGCAATCATCATCAAGTTGTTGCTTCCCAAAGCTCTTGGTGATGGAATGTTTGA
GATAGAGAAGCCTACTGTGTTCACTTATGAAGAGATCCGTGCTGCTACTGATGGGTTTGC
TGATTCTAATCTTCTTGGTCATGGAAACTATGGTTCAGTATACTTTGGTCTACTTAGAGA
ACAAGAAGTTGCTGTGAAAAGGATGACAGCTACAAAAACTAAAGAGTTTGCAGCAGAGAT
GAAAGTTCTATGCAGAGTTCATCATTCAAATCTGAGCTGATTGGTTATGCTGCAACCAGT
GATGAGCTTTTCGTAGTGTATGAATATGTGCAAAAGGAATGCTCAAAACCATTTGCATGA
TC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL8606Contig1 636 2 1 U
GATCAATTCAACCGACGTGGGCGGCTTGACAGCACTTCACCGAGCAATAATTGGTAAAAA
ACAGGCTATTACAAACTACCTGCTGAGGGAATCCGCAAACCCCTTTGTTCTTGATGATGA
AGGTGCGACCTTGATGCACTATGCTGTGCAGACAGCATCAGCTCCCACAATAAAACTTCT
CCTGCTGTATAACGCTGACATCAACGCGCAAGACAGGGACGGGTGGACCCCCCTGCACGT
TGCAGTACAGGCCAGAAGAAGCGACATGGTGAAACTTCTTTTGATAAAAGGGGCGGACAT
ACAAGTGAAGAACAAGGATGGGTTAACTCCGGTTGGCCTTTGCCTCTACCTAGGAAGAGA
GACAAGGACGTATGAAGTGTTGAAAATGTTGAAAGAGTTTCCCCGTAGTAGACTCAAGAG
ATTGGTAACGGATTAAGCTTTGGATTAACAGCAGAGCAGCTGCAGTCATATGTGTACTCG
CTGGACCACTTTACCACATTTGGTCGGTGTTTCGTTTGTTTTGCACACTGGTGATTAACA
TAGCCGAAATCATGTTACCCGAAAACAGTTACTACCTGTATACATGTAAAATTGTTTGAT
ACCCTCACTCACATTTATTCATGTATTATTACTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DG66TF U 1
AF RR4DG66JQ C 108
BS 1 636 RR4DG66TF

RD RR4DG66TF 636 0 0
GATCAATTCAACCGACGTGGGCGGCTTGACAGCACTTCACCGAGCAATAATTGGTAAAAA
ACAGGCTATTACAAACTACCTGCTGAGGGAATCCGCAAACCCCTTTGTTCTTGATGATGA
AGGTGCGACCTTGATGCACTATGCTGTGCAGACAGCATCAGCTCCCACAATAAAACTTCT
CCTGCTGTATAACGCTGACATCAACGCGCAAGACAGGGACGGGTGGACCCCCCTGCACGT
TGCAGTACAGGCCAGAAGAAGCGACATGGTGAAACTTCTTTTGATAAAAGGGGCGGACAT
ACAAGTGAAGAACAAGGATGGGTTAACTCCGGTTGGCCTTTGCCTCTACCTAGGAAGAGA
GACAAGGACGTATGAAGTGTTGAAAATGTTGAAAGAGTTTCCCCGTAGTAGACTCAAGAG
ATTGGTAACGGATTAAGCTTTGGATTAACAGCAGAGCAGCTGCAGTCATATGTGTACTCG
CTGGACCACTTTACCACATTTGGTCGGTGTTTCGTTTGTTTTGCACACTGGTGATTAACA
TAGCCGAAATCATGTTACCCGAAAACAGTTACTACCTGTATACATGTAAAATTGTTTGAT
ACCCTCACTCACATTTATTCATGTATTATTACTGTT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4DG66JQ 529 0 0
TTT
TTGATGATGAAGGTGCGACCTTGATGCACTATGCTGTGCAGACAGCATCAGCTCCCACAA
TAAAACTTTTCCTGCTGTATAACGCTGACATCAACGCGCAAGACAGGGACGGGTGGACCC
CCCTGCACGTTGCAGTACAGGCCAGAAGAAGCGACATGGTGAAACTTTTTTTGATAAAAG
GGGCGGACATACAAGTGAAGAACAAGGATGGGTTAACTCCGGTTGGCCTTTGCCTCTACC
TAGGAAGAGAGACAAGGACGTATGAAGTGTTGAAAATGTTGAAAGAGTTTCCCCGTAGTA
GACTCAAGAGATTGGTAACGGATTAAGCTTTGGATTAACAGCAGAGCAGCTGCAGTCATA
TGTGTACTCGCTGGACCACTTTACCACATTTGGTCGGTGTTTCGTTTGTTTTGCACACTG
GTGATTAACATAGCCGAAATCATGTTACCCGAAAACAGTTACTACCTGTATACATGTAAA
ATTGTTTGATACCCTCACTCACATTTATTCATGTATTATTACTGTT

QA 4 529 4 529
DS 



AS 1 2

CO CL8607Contig1 729 2 3 U
AATCTAACAAACTTAGTATAATCTTCTTGGTGTGTTATTAGTTTTGTCTACTCCGTTAAA
CATCAGAAACGTTGAAGAAGTTGATAATAAGACATTCTTAATAAAAGAAAGATAAAATTA
AGCGACTAATGGATAACCAAACCATTAATCAACCAATTAGAACAACGTTTTCTTGATGCT
GAGGATGTTGTCTCTGAGAAGCCTCCTCATGATTTTACCAGAGAGAGACTTGGGAATTGA
ATCCACAAAATATACGGCTCTGATCTTCTTGTAGTGAGCCACATTTGCCGCAACAAAGCT
AAGGATGTCTTCTTCTTTCTCTTTCGCTTTTGGATTCATCACAACACAAGCCACCGGAAT
CTCTCCCGCTTCCTCGTCCGGTAACGGCACGACGGCTACGTCTTCAACAGATGGATGAGT
GAGTAGAATAGCTTCAAGCTCCGCCGGAGCCACCTGAAAGCCCTTGTATTTGATAAGTTC
TTTGATGCGATCAACGATGAAGACATCTCCATCATCATCAATGTAACCTATATCTCCAGT
GTGAAGCCAACCTTCTTCATCGATAGTCTTCTCCGTCTCTTCCTTGTTCTCGAAGTAACC
TTGCATCACACATTGGCTCCTCACACAGAGCTCACCAGAAGTGTTCTTCGGAAGCGACCG
GCCAGTGTCAGGATCTACGAACTTCACCTCGAGATTCGGAAGTATAAAACCGACAGAGTT
TCGTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR4EC80JQ U 1
AF RR4H241JQ U 15
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AGCGACTAATGGATAACCAAACCATTAATCAACCAATTAGAACAACGTTTTCTTGATGCT
GAGGATGTTGTCTCTGAGAAGCCTCCTCATGATTTTACCAGAGAGAGACTTGGGAATTGA
ATCCACAAAATATACGGCTCTGATCTTCTTGTAGTGAGCCACATTTGCCGCAACGAAGCT
AAGGATGTCTTCTTCTTTCTCTTTCGCTTTTGGATTCATCACAACACAAGCCACCGGAAT
CTCTCCCGCTTCCTCGTCCGGTAACGGCACGACGGCTACGTCTTCAACAGATGGATGAGT
GAGTAGAATAGCTTCAAGCTCCGCCGGAGCCACCTGAAAGCCCTTGTATTTGATAAGTTC
TTTGATGCGATCAACGATGAAGACATCTCCATCATCATCAATGTAACCTATATCTCCAGT
GTGAAGCCAACCTTCTTCATCGATAGTCTTCTCCGTCTCTTCCTTGTTCTCGAAGTAACC
TTGCATCACACATTGGCTCCTCACACAGAGCTCACCAGAAGTGTTCTTCGGAAGCGACCG
GCCAGTGTCAGGATCTACGAACTTCACCTCGAGATTCGGAAGTATAAAACCGACAGAGTT
TCGTTTTGC

QA 1 729 1 729
DS 

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AAGAAGTTGATAATAAGACATTCTTAATAAAAGAAAGATAAAATTAAGCGACTAATGGAT
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TGAGAAGCCTCCTCATGATTTTACCAGAGAGAGACTTGGGAATTGAATCCACAAAATATA
CGGCTCTGATCTTCTTGTAGTGAGCCACATTTGCCGCAACAAAGCTAAGGATGTCTTCTT
CTTTCTCTTTCGCTTTTGGATTCATCACAACACAAGCCACCGGAATCTCTCCCGCTTCCT
CGTCCGGTAACGGCACGACGGCTACGTCTTCAACAGATGGATGAGTGAGTAGAATAGCTT
CAAGCTCCGCCGGAGCCACCTGAAAGCCCTTGTATTTGATAAGTTCTTTGATGCGATCAA
CGATGAAGATATCTCCATCATCATCAATGTAACCTATATCTCCAGTGTGAAGCCGACCTT
CTTCATCGATAGTCTTGTCCGTCTCTTCCTTGTTCTCGAAGTAACCTTGCATCACACATT
GGCTCCTCACACAGAGCTCACCAGAAGTGTTCTTCGGAAGCGACCGGCCAGTGTCAGGAT
CTATGAACTTCACCTCGAGATTCGGAAGTATAAAACCGACAGAGTTTCGTTTTGC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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CATGGTCGAATCTCATCAAGGATGTGTGGAAGAAGACGTTTATATAAGGAGAACAGGCGT
TACATGTTAGTGCTGCATTTAAGGTGTCCCGCTGTCGTCGAATTTAGGTTGCTCCTTTCT
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ATGTAAATGTAAGTTAATTTTTCCGATCTTGACAATTGTGTATTCAAATAAATGGTCGGT
TTGGGCAATCACAGGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCATTCAATACCTTATCCTCCATC
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GCAGTGGATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATGTACGTTCCTATTTGTTCGTTCCCACAAA
TCTACTTCTACTTTCTGTCTCGATATGTTTTTGTTGATCTTACGGATCCTTTGTTAAATT
ATGTCATAAGGGACTGATCTTTTCTTCTTATTGAAGACAGCACTAAGTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G695TF U 1
AF RR4G695JQ C 43
BS 1 592 RR4G695TF

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TACATGTTAGTGCTGCATTTAAGGTGTCCCGCTGTCGTCGAATTTAGGTTGCTCCTTTCT
CGGAGGCCAGAAATGTGAGGCGCTGTGGAGAGCTCATGTAGGTTGATCCTCTCATGGTGG
ATGTAAATGTAAGTTAATTTTTCCGATCTTGACAATTGTGTATTCAAATAAATGGTCGGT
TTGGGCAATCACAGGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCATTCAATACCTTATCCTCCATC
AATCATCAATCATCTTCGCACCGTTAGCTTTCAGAAGTATCTTCTGATTAGCCAATCATA
GCAGTGGATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATGTACGTTCCTATTTGTTCGTTCCCACAAA
TCTACTTCTACTTTCTGTCTCGATATGTTTTTGTTGATCTTACGGATCCTTTGTTAAATT
ATGTCATAAGGGACTGATCTTTTCTTCTTATTGAAGACAGCACTAAGTATAT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4G695JQ 550 0 0
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TTGATCCTCTCATGGTGGATGTAAATGTAAGTTAATTTTTCCGATCTTGACAATTGTGTA
TTCAAATAAATGGTCGGTTTGGGCAATCACAGGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCATTC
AATACCTTATCCTCCATCAATCATCAATCATTTTCGCACCGTTAGCTTTCAGAAGTATTT
TTTGATTAGCCAATCATAGCAGTGGATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATGTACGTTCCTA
TTTGTTCGTTCCCACAAATCTACTTTTACTTTCTGTCTCGATATGTTTTTGTTGATCTTA
CGGATCCTTTGTTAAATTATGTCATAAGGGACTGATCTTTTCTTTTTATTGAAGACAGCA
CTAAGTATAT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL8609Contig1 720 2 5 U
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CATGAATGAATGTATTTGTTTGGTTATGATGTGTACGTGTATGTCTTTGGGTTTTTTTTT
TTTGAACAACACGTGTATGTCTTTGGCTATTTATTGTTCCAAAATGCTTTTGATTTGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CB74JQ C 1
AF RR4CB74TF U 1
BS 1 662 RR4CB74TF
BS 663 663 RR4CB74JQ
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BS 704 704 RR4CB74JQ
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RD RR4CB74JQ 720 0 0
GGGAGGAAGATGATGTGAGATCAGGGTCATCGTCTCCAGATTCTACTGGATCAGTGGAAA
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TACCCGTTCTTTACGTTAACCAGTTTTAAATTTTTGTCGAAGCCGATGGTGAGTACTTAG
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CATGAATGAATGTATTTGTTTGGTTATGATGTGTACGTGTATGTCTTTGGGTTTTTTTTT
TTTGAACAACACGTGTATGTCTTTGGCTATTTATTGTTCCAAAATGCTTTTGATTTGTCG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR4CB74TF 720 0 0
GGGAGGAAGATGATGTGAGATCAGGGTCATCGTCTCCAGATTCTACTGGATCAGTGGAAA
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CCTCACAACCAACGGGAAAAACGGGTGGAAGCAAGTACCAGTCCACATACGAAGGCTATG
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AATCGTTTGAGAACCCAATGGCGGCAGGGTCTGGATCTCGAAGTTACGAATCAGATGATG
AAGAACCGAGGAAATCTACTGGTACAAGATTTGGAACAGCGCTCTATGACTTCACCGCAG
GAGGAGATGATGAGCTAAACTTGACGGCAGAAGAGGAACTGGAGATAGAATATGAAGTTG
ATGGCTGGTTTTACGTCAAGAAGAAGCGACCTGGCAGAGATGGGAAGATGGCTGGACTTG
TACCCGTTCTTTACGTTAACCAGTCTTAAATTTTTGTCGAAGCCGATGGTGAGTACTTAG
ATATATGCCCAGCAAGTTCTGATCCATAATTTCTTTGAAAGATAATGCTAAATCAGTGTA
CATGAATGAATGTATTTGTTTGGTTATGATGTGTACGTGTATGTCTTTGGGTTTTTTTTT
TT*GAACAACACGTGTATGTCTTTGGCTATTTATTGTTCCAAA*TGCTTTTGATTTGTCG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL8610Contig1 753 2 2 U
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TGTCGTTCGCTCTCCTCATCGCCTCCATGAATCCGTCGTCGTCGTGATCTGTCCTCGAGA
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TTTTTTTTAAGAATCACTAAACAAGATGCTTGC


BQ
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QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4E772JQ C 1
AF RR4E772TF U 1
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QA 1 531 1 531
DS 

RD RR4E772TF 531 0 0
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TGAGTTATGTTTAGTGAAGTAAATGTTAGTAATGGTTATGTAATATATATAGTTGTGCTT
ATTATGTAAAGAAGATTTTATGTTAAATAGTATATTGGTCAAATTTCATCG

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

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ACGGCCACGACCTCCACCGCGTCCTCTTACCATAGCACCTGCGGCAGCATCTCCTTGTGC
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AGTTGCAGCGTTTATAGCATTAATCTTCACAACTGCTGGTTCCCAGACGAAGTTAGCAAA
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CATGGCGTGTTTTTGTCTTAATTTATTCAGGACATCAGTTGCATCAAATCCAGCATTGTC
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TCCACCTCCAGGCACAACAGTCGAGTTCTTCACAGCTCTTCTCACGATCATAATAGCATC
ATGCAAACTCCGCTAAGCTTCTTCGATGAACTGATCAGCACCACCACGGAGGACAATAGT
TGCTGTACGTCCTGAAGGGCAACCACTGAATATGTTAAACCTCTCCCCACCAACTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EX86TF C 1
AF RR4BT67JQ U 14
BS 1 13 RR4EX86TF
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RD RR4EX86TF 589 0 0
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QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4BT67JQ 764 0 0
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CCTCCAGTGTTTATGTCCACTCCATAAGAAGCTCCTTCACCGCTTTGCATGGCGTGTTTT
TGTCTTAATTTATTCAGGACATCAGTTGCATCAAATCCAGCATTGTCACATAGCTGTCGT
GGAATAACCTCCAGGGCCTTTGCATACGAGTTGATGAAAAGCTGTGACTTCCCAGCAATT
GTTCGTGAATGCATCCTCAGGTACTTGCTTATCTCCATATCTATAGCTCCACCTCCAGGC
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QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GX25JQ C 1
AF RR4GX25TF U 1
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QA 1 526 1 526
DS 

RD RR4GX25TF 526 0 0
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ACAATGGAGAATCAGATAAGCTGCAGGAAAATGAGAGAGGTAACAATGGAGAATCAGAGA
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ACTACTAGGCACTAACTACGCTTTAAGAGAAAAAAACATTGGGGAC

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL8614Contig1 730 2 2 U
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TGGGATTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CF93TF C 1
AF RR4CF93JQ U 3
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GATACCGTTGGCGTCCACTTCAAACGTGACTTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGGGCCGG
TGGGATTCCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4CF93JQ 728 0 0
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TACACACTGCCTCTACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCTTTCTCTGAGTTTTGGT
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ATGTCTCCAGGCTGTTCCTAGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCTTCCTCTGCAA
ACTCCTCTGCCTCCTTAACCATCCCGTCAATCTCTTCCTGACTCAGACGTCCCTTCTCGT
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TACCGTTGGCGTCCACTTCAAACGTGACTTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGGGCCGGTG
GGATTCCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8616Contig1 679 2 4 U
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TCTCGTCCGACTCATCACTCTCTCGTCGCTCTCGTCTCACAACTCTCTGGGCTCTTCCCA
CTCTCTCGGCTCTCCCCACTCTCTCATCTCTCCTGACTCTCTCTTGTTCCCTCCGCATGT
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TGATTGTTTCATTTGCCATTTGTATATGTAACCGAACTTGTTTATATATTTGTATATGTA
ACCGAACTTGTTCATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CX01TF U 1
AF RR4CX01JQ C 83
BS 1 381 RR4CX01TF
BS 382 382 RR4CX01JQ
BS 383 632 RR4CX01TF
BS 633 679 RR4CX01JQ

RD RR4CX01TF 632 0 0
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CTTCTTTCCATCTTCTTCCTTCTTCTCTATTTTCCAAATTGATCGGTCACTGCAACCTCC
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GGCAGAATAACAAGGCCGAGGGCCCGAGATGATAGAGCTGGCTATCGATACTCTCCGATC
TCTCGTCCGACTCATCACTCTCTCGTCGCTCTCGTCTCACAACTCTCTGGGCTCTTCCCA
CTCTCTCGGCTCTCCCCACTCTCTCATCTCTCCTGACTCTCTCTTGTTCCCTCCGCATGT
GTATTTTGTTGATCTTTGTTGTGATTGCTTGATTCCGTGTGTAGATTATAGAAATTGAGA
ACTTGTAGTTTTCATTATTTAGAGTGGCGGATTGTTTATAGAAATTGATGAACTTGTATT
CGATTTATCTCCGCCGCATCTGATTCTTCAATATTTTCCTTGTTATCTTTGATGTGTTAT
CTCATTATTTGTTGTGATGAAATGATTACGGTTTACAGATGCGATGCTTGTTTCATTTGC
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QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4CX01JQ 597 0 0
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TCGTCGCTCTCGTCTCACAACTCTCTGGGCTCTTCCCACTCTCTCGGCTCTCCCCACTCT
TTCATCTTTCCTGACTCTCTCTTGTTCCCTCCGCATGTGTATTTTGTTGATCTTTGTTGG
GATTGCTTGATTCCGTGTGTAGATTATAGAAATTGAGAACTTGTAGTTTTCATTATTTAG
AGTGGCGGATTGTTTATAGAAATTGATGAACTTGTATTCGATTTATTTCCGCCGCATCTG
ATTCTTCAATATTTTCCTTGTTATCTTTGATGTGTTATCTCATTATTTGTTGTGATGAAA
TGATTACGGTTTACAGATGCGATGCTTGTTTCATTTGCTGATTGTTTCATTTGCCATTTG
TATATGTAACCGAACTTGTTTATATATTTGTATATGTAACCGAACTTGTTCATTTGT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL8617Contig1 958 2 12 U
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AGCAATCTCCTTGTGGGCAAACCACGAGGCGTTGAAAGGTTTCTCCATAACCATCATCAA
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CGCGGTGCGTGTCTTGCTCGAGACGAGCTTCTCTGTGGAGAGATTGCTCTACGACGGTGT
TCCTCATCGTCTCCGGAAGCCTGTGAACCACATTACCGTACGGTTCTATGGAAACAGAAG
CGATGTCTCGGTAACTTCTGACGCAAGTAATGGAGAGTATGTGATCGGTTTAAGCTCATA
TCTGACGGGAATAAGCGAGTTTCGTAACGGCGTGGAAGCAGCATTGCGACGATCTATGGT
TAGGATTTGGCAAGGGGGAGGGGCTTCGCCGGAGCTTGTGGCCGGGTTAGTGGAATACTT
ATTGGCCGTGGAGGGTGGAGAACGTCGTCGTTTTGATGAGTTAGATGTGTATCCAAAGGA
TAAGGAGTCTGCGTATGTGGTGGCTAGGTGGTTGGATTACTGTGAAAGACGTAACGAGGG
TTTCATCAGAAGGTTGAACCATGGGATGAGACTTGGGTGGGATGATCAGACGGTGGATCT
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AATGACAGTGGATTTGATCATTGAGACACGAACATGATTGGCTCCCGTGCTGTCTTATTG
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TGTGTGGAAAATGACTTGTTTTCTCGGATAAATAAAGGCTTTATAAGTTTGGTTTGTT


BQ
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AF RR4G442TF U 1
AF RR4G442JQ C 222
BS 1 490 RR4G442TF
BS 491 491 RR4G442JQ
BS 492 492 RR4G442TF
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BS 753 768 RR4G442TF
BS 769 958 RR4G442JQ

RD RR4G442TF 783 0 0
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AGCATTGGAGTCATCGGATTCAGGTATCTTTCTACGGATCTTCTCTGTTATCCTCGTCGG
AGCAATCTCCTTGTGGGCAAACCACGAGGCGTTGAAAGGTTTCTCCATAACCATCATCAA
CGAAGCTAAAGAAACTCCTTCCGGTGAAAGATTCTCCCTTTTCTTCGAGTCTGACGATAC
CGCGGTGCGTGTCTTGCTCGAGACGAGCTTCTCTGTGGAGAGATTGCTCTACGACGGTGT
TCCTCATCGTCTCCGGAAGCCTGTGAACCACATTACCGTACGGTTCTATGGAAACAGAAG
CGATGTCTCGGTAACTTCTGACGCAAGTAATGGAGAGTATGTGATCGGTTTAAGCTCATA
TCTGACGGGAATAAGCGAGTTTCGTAACGGCGTGGAAGCAGCATTGCGACGATCTATGGT
TAGGATTTGGTATGGGGGAGGGGCTTCGCCGGAGCTTGTGGCCGGGTTAGTGGAATACTT
ATTGGCCGTGGAGGGTGGAGAACGTCGTCGTTTTGATGAGTTAGATGTGTATCCAAAGGA
TAAGGAGTCTGCGTATGTGGTGGCTAGGTGGTTGGATTACTGTGAAAGACGTAACGAGGG
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TGTTTCGAATGGTGCGTGTGGCTCACGTAAG*ATGTGGTTGCGTGAGC
AAAGACGAAGATGAC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4G442JQ 737 0 0
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CATTGCGACGATCTATGGTTAGGATTTGGCTATGGGGAGGGGCTTCGCCGGAGCTTGTGG
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TAGATGTGTATCCAAAGGATAAGGAGTCTGCGTATGTGGTGGCTAGGTGGTTGGATTACT
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ATGATCAGACGGTGGATCTTGTTTCGAATGGTGCGTGTGGCTCACGTAAGGATGTGGTTG
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CTCCCGTGCTGTCTTATTGGAGAACACATGGCTCCACGTATGTAACTAAATTATTCAGTG
TATATAATTCAACCATTTTTGTGTGGAAAATGACTTGTTTTCTCGGATAAATAAAGGCTT
TATAAGTTTGGTTTGTT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL8618Contig1 871 2 2 U
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AAAGGTAACGGTCTCAACAACACACGCGGCTCCGGCTCCAAAGCGAAAAATAAGAAGAAG
ACGCCAAACAAGGCGGACCTAAAGGATTATGTTGCGAGGAAGGAGACGGAGGAGGAGGTT
CGTGACGAGATCTCAGAATCTTCTTCGAGCAGCGGAGAAGCGAGACGCGATGATGAGCGC
AAGGAAAGAAGCAACGGCGTCGTTTCGGAAGAGGCGAAGATGATTAGGTTCCCGATGACT
CGGATTCGGAGGATCATGAGGAGCGATAACTCTGCTCCTCAGATCATGCAGGACGCTGTG
TTTCTTGTCAATAAAGCCACGGAATTGTTCATTGAGAGGTTTTCAGAAGAAGCTTATGGA
AGTTCTGTCAAGGACAAGAAGAAGTTCATCCACTACAAACATCTCTCTTCTGTAGTGAGT
AACGAGGGGAGATATGAGTTCCTTACAGATTGTGTTCCTGAGAAACTAAAAGCAGAGGCG
GCGTTGGAGGAATGGGAAAGAAGCATGGCAGATGTAGGCTAGAGATAAAACCGTTTGGAG
CCGACCTGGACAATTTGGGAACTTGTGTCATGTCCTGGTGTACTGGTTTCATCTGCCCAA
TCTACACCTTCCTTTATAATCCCTAATGAGATTGCACATAATTCATTTCTAGAATGTACT
ACCTTTTCTTATTTTTGTTAATTTGAGTTTATAAGAGTTTCCGGAACTATAATGTTTTGC
TTTCTTAGGAATTATAAACGTTTTGTAGCCATACTGCGAAAGCATTATTCCTGCCTGGAC
AGTGATGTATACACATCATAAATTTTTCTTG


BQ
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AF RR4H383TF U 1
AF RR4H383JQ C 143
BS 1 656 RR4H383TF
BS 657 871 RR4H383JQ

RD RR4H383TF 656 0 0
GGAGTTGTGAAAACAATGGTGTCGTCGAAGAAGCCGAAGAGCGATGTCGTCGTCGTCGAT
AAAGGTAACGGTCTCAACAACACACGCGGCTCCGGCTCCAAAGCGAAAAATAAGAAGAAG
ACGCCAAACAAGGCGGACCTAAAGGATTATGTTGCGAGGAAGGAGACGGAGGAGGAGGTT
CGTGACGAGATCTCAGAATCTTCTTCGAGCAGCGGAGAAGCGAGACGCGATGATGAGCGC
AAGGAAAGAAGCAACGGCGTCGTTTCGGAAGAGGCGAAGATGATTAGGTTCCCGATGACT
CGGATTCGGAGGATCATGAGGAGCGATAACTCTGCTCCTCAGATCATGCAGGACGCTGTG
TTTCTTGTCAATAAAGCCACGGAATTGTTCATTGAGAGGTTTTCAGAAGAAGCTTATGGA
AGTTCTGTCAAGGACAAGAAGAAGTTCATCCACTACAAACATCTCTCTTCTGTAGTGAGT
AACGAGGGGAGATATGAGTTCCTTACAGATTGTGTTCCTGAGAAACTAAAAGCAGAGGCG
GCGTTGGAGGAATGGGAAAGAAGCATGGCAGATGTAGGCTAGAGATAAAACCGTTTGGAG
CCGACCTGGACAATTTGGGAACTTGTGTCATGTCCTGGTGTACTGGTTTCATCTGC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR4H383JQ 729 0 0
AGGATTATGTTGCGAGGAAGGAGACGGAGGAGGAGGTTCGTGACGAGATCTCAGAATCTT
CTTCGAGCAGCGGAGAAGCGAGACGCGATGATGAGCGCAAGGAAAGAAGCAACGGCGTCG
TTTCGGAAGAGGCGAAGATGATTAGGTTCCCGATGACTCGGATTCGGAGGATCATGAGGA
GCGATAACTCTGCTCCTCAGATCATGCAGGACGCTGTGTTTCTTGTCAATAAAGCCACGG
AATTGTTCATTGAGAGGTTTTCAGAAGAAGCTTATGGAAGTTCTGTCAAGGACAAGAAGA
AGTTCATCCACTACAAACATCTCTCTTCTGTAGTGAGTAACGAGGGGAGATATGAGTTCC
TTACAGATTGTGTTCCTGAGAAACTAAAAGCAGAGGCGGCGTTGGAGGAATGGGAAAGAA
GCATGGCAGATGTAGGCTAGAGATAAAACCGTTTGGAGCCGACCTGGACAATTTGGGAAC
TTGTGTCATGTCCTGGTGTACTGGTTTCATCTGCCCAATCTACACCTTCCTTTATAATCC
CTAATGAGATTGCACATAATTCATTTCTAGAATGTACTACCTTTTCTTATTTTTGTTAAT
TTGAGTTTATAAGAGTTTCCGGAACTATAATGTTTTGCTTTCTTAGGAATTATAAACGTT
TTGTAGCCATACTGCGAAAGCATTATTCCTGCCTGGACAGTGATGTATACACATCATAAA
TTTTTCTTG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL8619Contig1 872 2 2 U
GGGCCGATCAATCAGCTCACAGACACTTGAAAGAGGGTTTTACAGATCGAAGTCGCCGGA
GAAGAAGAAGATGTTTCTCACTAGGACTGAGTATGACAGAGGAGTCAACACTTTCTCTCC
TGAAGGCAGGCTTTTCCAAGTCGAGTACGCCATTGAAGCTATCAAGCTTGGTTCTACTGC
AATTGGAGTGAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTTGAGAAGCGTATCACCTCTCC
TTTGCTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGAGCCAATGACTGTAGA
GTCCACTACACAAGCCCTCTGTGATCTGGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATC
AATGTCTCGGCCTTTTGGAGTCTCTCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGGACCAAG
CTTGTACTACACGGACCCGTCTGGAACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCGATTGGTTC
AGGCTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAACAATTCAACAAAGATCTGTCACTTGA
AGAAGCTGAGACCATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCC
GAATAATGTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCGTACCATATCTACACTCCACAGGAAGT
TGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGAAGATACTCAAATGCGGTTGATGTATCTCTATC
CCCCTTTGTGTCTTCTTCGGATTTATAAACAAAGAGAATTTATTTTTCACCTGGTCTGCT
AGATTTGATGTTTCATTTGACGTTTTTAGTTGTGTTGTGTAAGAGAATCTTTTCTTTACC
ATGTCATTCAATAACCTATCGGATTTTCTGAC


BQ
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AF RR4G138TF U 1
AF RR4G138JQ C 180
BS 1 618 RR4G138TF
BS 619 872 RR4G138JQ

RD RR4G138TF 618 0 0
GGGCCGATCAATCAGCTCACAGACACTTGAAAGAGGGTTTTACAGATCGAAGTCGCCGGA
GAAGAAGAAGATGTTTCTCACTAGGACTGAGTATGACAGAGGAGTCAACACTTTCTCTCC
TGAAGGCAGGCTTTTCCAAGTCGAGTACGCCATTGAAGCTATCAAGCTTGGTTCTACTGC
AATTGGAGTGAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTTGAGAAGCGTATCACCTCTCC
TTTGCTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGAGCCAATGACTGTAGA
GTCCACTACACAAGCCCTCTGTGATCTGGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATC
AATGTCTCGGCCTTTTGGAGTCTCTCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGGACCAAG
CTTGTACTACACGGACCCGTCTGGAACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCGATTGGTTC
AGGCTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAACAATTCAACAAAGATCTGTCACTTGA
AGAAGCTGAGACCATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCC
GAATAATGTGGACATTGC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4G138JQ 693 0 0
CAATTGGAGTGAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTTGAGAAGCGTATCACCTCTC
CTTTGCTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGAGCCAATGACTGTAG
AGTCCACTACACAAGCCCTCTGTGATCTGGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAAT
CAATGTCTCGGCCTTTTGGAGTCTCTCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGGACCAA
GCTTGTACTACACGGACCCGTCTGGAACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCGATTGGTT
CAGGCTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAACAATTCAACAAAGATCTGTCACTTG
AAGAAGCTGAGACCATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTC
CGAATAATGTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCGTACCATATCTACACTCCACAGGAAG
TTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGAAGATACTCAAATGCGGTTGATGTATCTCTAT
CCCCCTTTGTGTCTTCTTCGGATTTATAAACAAAGAGAATTTATTTTTCACCTGGTCTGC
TAGATTTGATGTTTCATTTGACGTTTTTAGTTGTGTTGTGTAAGAGAATCTTTTCTTTAC
CATGTCATTCAATAACCTATCGGATTTTCTGAC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8620Contig1 705 2 2 U
ATTTTAAGCTTTGAACTCTATTTATTTTGGAAAACGAGATTTTGTCTTGTGACCAGTTCG
CAACAGAGGCAGCCATTACCATTCTGCGAATTGATGTCATATAATTATGGATATGAACAA
AAGAAACAAAAATATTTACCAATAAGCATAAGATCAAATCAGTAGAAACCTAGAAACATT
AAACAAGAGCCAGTTCAAAGGATGCCATCGCAGGAGGAGGAAGGAGATAAACGCACACCA
TAGACAAATTTATTGAGGAGGAACTCTGAAACTCTTGAATAAACTCCGGAACACATCTGA
CAAGTGCAGAGAACAAATAGAGAAATCCAAGAGGAAAAAGAGATTTGTCTTCATGGAAAA
AGTCTTTGCCACTGTCAACGGCGACGAACTCACCATCGAGGAGCGAAACCTTCTTTCCGT
CGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCACCGCGCCTCGTGGCGCATCATCTCCTCGTTGAG
CAGAAGGAGGAAAGCCGTGGCAACGACGACCACGTCAAGGCGATTCGAGACTACAGGTCG
AAGAACGAGACAGAGCTTCCGGGAATCTGCGACCGGATCCTTAAGCTTCTCGACGATAGG
CTCGTCTCCTCCGCTGCTTTCGGTGATTCAAAGGTGTTTTATTTGAAAATGAAAAGGGAG
TCTGGTTTTGGGATTCAAAGATTTTTGTTTTCTTTTGGGTGGCCC


BQ
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AF RR4H266TF C 1
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QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4H266JQ 701 0 0
A
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TTTTGGGATTCAAAGATTTTTGTTTTCTTTTGGGTGGCCC

QA 2 701 2 701
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4F784TF U 1
AF RR4F784JQ C 104
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BS 632 714 RR4F784JQ

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QA 1 631 1 631
DS 

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QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL8622Contig1 532 2 2 U
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BQ
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AF RR4EM96TF C 1
AF RR4EM96JQ U 5
BS 1 4 RR4EM96TF
BS 5 532 RR4EM96JQ

RD RR4EM96TF 532 0 0
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TGATGAAGCAAATGACTCATCATCGACGTCACCAGGTTGATACCAAGTTGTGCACCGGGA
CAAACCCGTCTTCCTGCTCCAAATGGAAGCAGCCTAAAATCATGACCTTTCATGTCAACG
TCTTCTTCCAAGAACCTCTCCGGTCTAAACTCCAATGGATTTTTCCATACGC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR4EM96JQ 528 0 0
ATGTATATTGGCTTTATGTTCGTTATTACAATGAGAAATAAGCATGTTTCTTTGCTTATC
CTTAAAAAGTTTAAAACAAGTGAAACCGCTAATCTCATCAAAAGTTTTCAATGATAAACC
ACAAAAGAGACATGCACACAACGAAAACAACAAGGCCATCAGCATCACTAGCAGCAGCAG
GATGTGGATCAGAGAAAGATGGTTACATATCGAAAGGCACGCGTTTATAAAGCTCAGAAG
GTAACCGAGGCGTTGCAACGGCTTGAGCAGGGACACGCATGTAAGTAACAAGTCCAGGGT
TTTCAGACATGTCAATCTCCTCTGGTTTAGTGCCTTGAGGCGGTGTCCAAACGAAATGAT
GAAGCAAATGACTCATCATCGACGTCACCAGGTTGATACCAAGTTGTGCACCGGGACAAA
CCCGTCTTCCTGCTCCAAATGGAAGCAGCCTAAAATCATGACCTTTCATGTCAACGTCTT
CTTCCAAGAACCTCTCCGGTCTAAACTCCAATGGATTTTTCCATACGC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL8623Contig1 874 2 2 U
GGAACGATCGTCGTTGCTCGATCTCCTTCAACGCCTTTCATTGTTTTCTTCTTCTCCTGT
ACAACACTATAGCGATGAAGCCAGGAGGATCAGCTTTAAATCCCCACGCAGCAGCTTACA
TACCACTCTCTAAAAGAGAAGCTGGTTCTTCTGCAAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTGATTCCACACATCACGTGCAGTACCAACCCTATGGAGCGTACGGTTATGATT
GCGTCCAAGGTTCTCAAATGTACATGCCAAAGACGACATACTCCTCCTCCGACAACAAGC
AGATGAGGGATGAGGATTTGGAGATGGACATGGAGATTGAGTACCTTTTAGCCACGTTCT
CTGCTTTGTCTCATGAGTCTATCAATGATGTCTACTTGGCCAACAGTGGTGATCTTGATG
CTACTATCGAAATGCTGAATCAGCTCGAGATTTACAGTACTGAAGCCCAAGAATACCTTC
CGGACACACTGGACATTGGCGATGTACCTGAGACCATCATGCCTTCAACTTCCTCAGCTC
CAGAACAAAAGAATGCGAGTAATGAAGCAAGTGCGTCATCGACATCCTCGGGTACCCTCA
AAGCTCATGTGTCTTCCTCCTGATTTGATGAGTCCTTAAATGGGAAGTATCATAAATTTC
TTGCAATTGATATGATATATGAAGCTTGATGGTTATAAATTAGGAGAGGGTCTCTTTCTA
TGTTTTCCTCATCCTCCCCTGCTTTGTTTCCTGGGGGAAAGAGAGTACATATGTATAGTT
TTTTTTCTTTTGAATATTTCATGTTGGGTGTTGAGAATGGGGTTGTTTCTATGGTGGATA
AAAGCTATGAATCAATGATATAGCCTTTCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GF26TF U 1
AF RR4GF26JQ C 168
BS 1 699 RR4GF26TF
BS 700 874 RR4GF26JQ

RD RR4GF26TF 699 0 0
GGAACGATCGTCGTTGCTCGATCTCCTTCAACGCCTTTCATTGTTTTCTTCTTCTCCTGT
ACAACACTATAGCGATGAAGCCAGGAGGATCAGCTTTAAATCCCCACGCAGCAGCTTACA
TACCACTCTCTAAAAGAGAAGCTGGTTCTTCTGCAAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTGATTCCACACATCACGTGCAGTACCAACCCTATGGAGCGTACGGTTATGATT
GCGTCCAAGGTTCTCAAATGTACATGCCAAAGACGACATACTCCTCCTCCGACAACAAGC
AGATGAGGGATGAGGATTTGGAGATGGACATGGAGATTGAGTACCTTTTAGCCACGTTCT
CTGCTTTGTCTCATGAGTCTATCAATGATGTCTACTTGGCCAACAGTGGTGATCTTGATG
CTACTATCGAAATGCTGAATCAGCTCGAGATTTACAGTACTGAAGCCCAAGAATACCTTC
CGGACACACTGGACATTGGCGATGTACCTGAGACCATCATGCCTTCAACTTCCTCAGCTC
CAGAACAAAAGAATGCGAGTAATGAAGCAAGTGCGTCATCGACATCCTCGGGTACCCTCA
AAGCTCATGTGTCTTCCTCCTGATTTGATGAGTCCTTAAATGGGAAGTATCATAAATTTC
TTGCAATTGATATGATATATGAAGCTTGATGGTTATAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4GF26JQ 707 0 0
GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATTCCACACATCACGTGCAGTACCAACCCTATGGAGCG
TACGGTTATGATTGCGTCCAAGGTTCTCAAATGTACATGCCAAAGACGACATACTCCTCC
TCCGACAACAAGCAGATGAGGGATGAGGATTTGGAGATGGACATGGAGATTGAGTACCTT
TTAGCCACGTTTTCTGCTTTGTCTCATGAGTCTATCAATGATGTCTACTTGGCCAACAGT
GGTGATCTTGATGCTACTATCGAAATGCTGAATCAGCTCGAGATTTACAGTACTGAAGCC
CAAGAATACCTTCCGGACACACTGGACATTGGCGATGTACCTGAGACCATCATGCCTTCA
ACTTCCTCAGCTCCAGAACAAAAGAATGCGAGTAATGAAGCAAGTGCGTCATCGACATCC
TCGGGTACCCTCAAAGCTCATGTGTCTTCCTCCTGATTTGATGAGTCCTTAAATGGGAAG
TATCATAAATTTCTTGCAATTGATATGATATATGAAGCTTGATGGTTATAAATTAGGAGA
GGGTCTCTTTCTATGTTTTCCTCATCCTCCCCTGCTTTGTTTCCTGGGGGAAAGAGAGTA
CATATGTATAGTTTTTTTTCTTTTGAATATTTCATGTTGGGTGTTGAGAATGGGGTTGTT
TCTATGGTGGATAAAAGCTATGAATCAATGATATAGCCTTTCTACCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8625Contig1 717 2 2 U
GGGGAGGAGAACGTCGTCTGCGAAGAAGACGGGAGAGAAAATTGCAAATCGAAATAGGAT
TTAGAGAAACCCTAAGAGAGGTGGAATCTTTGGGGTCGAGACGATCAAGAGTGACTTGAA
TTTTTCTTTTTCGAGCGAGGTTCCTGACGATACCATCGTTTCTCCCAAATCCGACACACC
TATTAAGCTTCTAGGTCGTGACGATGCTGGCGTTTGGTGACTTGAACCATTTGATATTTG
CTCCTCTCACCTCAAGAGGATCTCAGCAGTACCGTTCCCTCACTGTCCCCGAACTCACCC
AGCAAATGTAGGACTCCAAGAACATGATGTGTGCTGCTGACCCAAGGCACGGGCGTTATC
TCACAGCCTCTGCCATGTTTCGTGGTAAAATGAGCACAAAGGAAGTCGACGAGCAGATGC
TGAACGTGCAGAACAAGAACTCTTCCTACTTTGTTGACAGTCTGTGGCATCCCCTCCACC
GGTCTGAAGATGGCATCCACTTTCATTGGGAACTCAACATCGAGATGGAGTTCACAGAAG
CAGAGAGCAACATGAACGATCTTGTCTCAGAGTACCAGCAATAACAAGTGTGTGTATTGG
CAAGTGTGTGTGCAATAGTTAGGAATATATAAACATATCAAGAGTGAACTAATTAGCTTC
TTGTATCAAACACTTAAGAACTCCTAATTAAATAACACCATTGCACACACTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F405TF U 1
AF RR4F405JQ C 87
BS 1 618 RR4F405TF
BS 619 717 RR4F405JQ

RD RR4F405TF 618 0 0
GGGGAGGAGAACGTCGTCTGCGAAGAAGACGGGAGAGAAAATTGCAAATCGAAATAGGAT
TTAGAGAAACCCTAAGAGAGGTGGAATCTTTGGGGTCGAGACGATCAAGAGTGACTTGAA
TTTTTCTTTTTCGAGCGAGGTTCCTGACGATACCATCGTTTCTCCCAAATCCGACACACC
TATTAAGCTTCTAGGTCGTGACGATGCTGGCGTTTGGTGACTTGAACCATTTGATATTTG
CTCCTCTCACCTCAAGAGGATCTCAGCAGTACCGTTCCCTCACTGTCCCCGAACTCACCC
AGCAAATGTAGGACTCCAAGAACATGATGTGTGCTGCTGACCCAAGGCACGGGCGTTATC
TCACAGCCTCTGCCATGTTTCGTGGTAAAATGAGCACAAAGGAAGTCGACGAGCAGATGC
TGAACGTGCAGAACAAGAACTCTTCCTACTTTGTTGACAGTCTGTGGCATCCCCTCCACC
GGTCTGAAGATGGCATCCACTTTCATTGGGAACTCAACATCGAGATGGAGTTCACAGAAG
CAGAGAGCAACATGAACGATCTTGTCTCAGAGTACCAGCAATAACAAGTGTGTGTATTGG
CAAGTGTGTGTGCAATAG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4F405JQ 631 0 0
TCTTTGGGGTCGAGACGATCAAGAGTGACTTGAATTTTTCTTTTTCGAGCGAGGTTCCTG
ACGATACCATCGTTTCTCCCAAATCCGACACACCTATTAAGCTTCTAGGTCGTGACGATG
CTGGCGTTTGGTGACTTGAACCATTTGATATTTGCTCCTCTCACCTCAAGAGGATCTCAG
CAGTACCGTTCCCTCACTGTCCCCGAACTCACCCAGCAAATGTAGGACTCCAAGAACATG
ATGTGTGCTGCTGACCCAAGGCACGGGCGTTATCTCACAGCTTCTGCCATGTTTCGTGGT
AAAATGAGCACAAAGGAAGTCGACGAGCAGATGCTGAACGTGCAGAACAAGAACTCTTCC
TACTTTGTTGACAGTCTGTGGCATCCCCTCCACCGGTCTGAAGATGGCATCCACTTTCAT
TGGGAACTCAACATCGAGATGGAGTTCACAGAAGCAGAGAGCAACATGAACGATCTTGTC
TCAGAGTACCAGCAATAACAAGTGTGTGTATTGGCAAGTGTGTGTGCAATAGTTAGGAAT
ATATAAACATATCAAGAGTGAACTAATTAGCTTCTTGTATCAAACACTTAAGAACTCCTA
ATTAAATAACACCATTGCACACACTTTTGGC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL8626Contig1 951 2 2 U
GTTCCCGTCACGACTGGACCAAGCTCCTCATCTTCCAGTTCAGCTACCTCATCTTCCTCT
TCGCCTTCTCTCTCCTCTCAACCGCCGCCGTGGTCTTCACCGTCGCTTCCCTCTACACCG
GGAAGCCAGTCTCCTTCTCCTCCACCATCTCCACCATCCCCAAAGTCTTTAAACGACTCT
TGATCACTTTCCTCTGGGTTGCTCTCTTGATGTTCGCTTACAACGCTGTCTTCTTTGTCT
TCCTGGTGATCCTCTTCGTAGCTCTGGACATGAACAGCGTAGGCTTAGCGGTTATTGCCG
GACTGTTGATCGCTGTTCTGTACTTCGGTGTCCATGTCTATTTCACTGCGTTATGGCATC
TAGGTAGCGTGATCTCTGTTCTTGAGCCTGTTTATGGACTCGCTGCCATGAGAAAAGCTT
ATGAGCTTCTCAAAGGGAAGGTTAAGATGGCTATGGGGTTGGTCTTTGTTTACCTTTTGC
TCTGTGGGTTGATCGGAGTTACTTTTGGATCGACGGTGGTTCATGGTGGAGGGAAGTATG
AGACTTTGACTAGGACTCTTGTTGGTGGTTTGCTTGTTGGTTTTCTCGTGGCTGTGAATC
TTGTGGGTTTGCTGGTTCAGAGTGTGTTTTATTATGTTTGCAAGAGTTATCATCATCAGG
CGATTGATAAGACGGCTTTGTATGATCATCTTGGTGGCTATCTTGGTGATTATGTGCCTC
TTAAGAGCAACATTCAGTTGGAGAATTTAGACATTTGAAGCATAAGAGATTCTGGTACTG
TTTCTTCATATCTTTTCCGTCTCTTTTATAAGCTATGTAAGATTGGCGAGGAAGGATAAG
AAGTAGAAATGTCGAATCTGAATGAAGTATTAGTAATGAATGTAATGTTTATGTACAGAC
TCAGCACTCTTTGTTAGTGTTTTGATTTGGTTAATCCATGATTTTAAGGAT


BQ
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AF RR4CU19TF U 1
AF RR4CU19JQ C 158
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BS 658 951 RR4CU19JQ

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TGATCACTTTCCTCTGGGTTGCTCTCTTGATGTTCGCTTACAACGCTGTCTTCTTTGTCT
TCCTGGTGATCCTCTTCGTAGCTCTGGACATGAACAGCGTAGGCTTAGCGGTTATTGCCG
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ATGAGCTTCTCAAAGGGAAGGTTAAGATGGCTATGGGGTTGGTCTTTGTTTACCTTTTGC
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AGACTTTGACTAGGACTCTTGTTGGTGGTTTGCTTGTTGGTTTTCTCGTGGCTGTGAATC
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QA 1 657 1 657
DS 

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TGGTTTTCTCGTGGCTGTGAATCTTGTGGGTTTGCTGGTTCAGAGTGTGTTTTATTATGT
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CTATCTTGGTGATTATGTGCCTCTTAAGAGCAACATTCAGTTGGAGAATTTAGACATTTG
AAGCATAAGAGATTCTGGTACTGTTTCTTCATATCTTTTCCGTCTCTTTTATAAGCTATG
TAAGATTGGCGAGGAAGGATAAGAAGTAGAAATGTCGAATCTGAATGAAGTATTAGTAAT
GAATGTAATGTTTATGTACAGACTCAGCACTCTTTGTTAGTGTTTTGATTTGGTTAATCC
ATGATTTTAAGGAT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DK82JQ C 1
AF RR4DK82TF U 1
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QA 1 528 1 528
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RD RR4DK82TF 528 0 0
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AGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAACTCAATCTGAAAATGAAGTCTCTTCTTCAGATGGCAG
TGAAGGGAAGGCAATAGATGCTAATGAACAAAAGAAGAGGGAGATGGAGGTTAAAAAAGG
AAGCTTGATGTACACTCCTCCATTGCCACTAAAAATGGAACCTTGACCAAGTGGGTCATC
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CGGTTTCAGCATCCTTTAGAAACATGTGTGAGATTTTTTCTTGGTTTGATGATTCTGTTT
CTGTCTTTTTTTGTGTTCTTGAAATCTTTGAGTTGTGATGGTTTCCTTAGTTAACTGTGG
GAGTGTGTAATCTTGTTATTGGTTTTTGAAATTCAATAAGTTATATTT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL8628Contig1 846 2 2 U
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CAAGCTCTTCAAAGCTCGGAAACGATCAAATCAACAAAAGTGGTGATGAAGAGAAGCAAG
TTCAACCTAAGAGGGAAGGAATGTTTGTAAAGATCAACATGGATAGTGTTCTAATAGGTA
GAAAAGTCGATCTCAATGCTTACAGTAGCTACGAACGGCTATCTTTTGCCGTTGACAAAC
TCTTCAGAGGTCTACTCGCAGCTCAAAGAGATGCCTCTGGTGGTGAAGGAGAGGGGAAAC
CGATCATTGGTTTATTGGATGGTAAAGGAGAATTTACTTTAACATATGAAGACAATGAAG
GAGACAAGATGCTTGTTGGGGATGTTCCTTGGCAAATGTTTGTTTCAACTGTGAAGAGAC
TGCGCGTGATTAAAAGCTCTGAGATTTCATCTGCCTTGAGATTTGGATGCAGTAAGCAGG
ACAAGATGAAGAACTGAAGAGGCTTTCAGAAACTTATGTCTATCTCGAAAGGGTCTCACA
GTTTTTAATATGTACATTAGGATTTTGTTATAAAGAAATAATGATTGGCTTTGTCCAGAG
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ATTATG


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10 10 10 10 10 10 

AF RR4AH31TF U 1
AF RR4AH31JQ C 36
BS 1 736 RR4AH31TF
BS 737 846 RR4AH31JQ

RD RR4AH31TF 736 0 0
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CAGGAAACAACATCAAGAAGGGAGCAGAAGAGAAATCTATCTTCAATCTCAGTGGAAACC
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CAAGCTCTTCAAAGCTCGGAAACGATCAAATCAACAAAAGTGGTGATGAAGAGAAGCAAG
TTCAACCTAAGAGGGAAGGAATGTTTGTAAAGATCAACATGGATAGTGTTCTAATAGGTA
GAAAAGTCGATCTCAATGCTTACAGTAGCTACGAACGGCTATCTTTTGCCGTTGACAAAC
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CGATCATTGGTTTATTGGATGGTAAAGGAGAATTTACTTTAACATATGAAGACAATGAAG
GAGACAAGATGCTTGTTGGGGATGTTCCTTGGCAAATGTTTGTTTCAACTGTGAAGAGAC
TGCGCGTGATTAAAAGCTCTGAGATTTCATCTGCCTTGAGATTTGGATGCAGTAAGCAGG
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GTTTTTAATATGTACA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4AH31JQ 811 0 0
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TCTATCTTCAATCTCAGTGGAAACCATTTATCTTATTCCAATAAAACCACTTATGCTCCT
CCTCACATCTCTCATAAAAGAACTGCTCCTGGTCCAGTGGTGGGATGGCCTCCGGTTCGT
TCCTTCAGAAAGAATCTAGCGAGCTCAAGCTCTTCAAAGCTCGGAAACGATCAAATCAAC
AAAAGTGGTGATGAAGAGAAGCAAGTTCAACCTAAGAGGGAAGGAATGTTTGTAAAGATC
AACATGGATAGTGTTCTAATAGGTAGAAAAGTCGATCTCAATGCTTACAGTAGCTACGAA
CGGCTATCTTTTGCCGTTGACAAACTCTTCAGAGGTCTACTCGCAGCTCAAAGAGATGCC
TCTGGTGGTGAAGGAGAGGGGAAACCGATCATTGGTTTATTGGATGGTAAAGGAGAATTT
ACTTTAACATATGAAGACAATGAAGGAGACAAGATGCTTGTTGGGGATGTTCCTTGGCAA
ATGTTTGTTTCAACTGTGAAGAGACTGCGCGTGATTAAAAGCTCTGAGATTTCATCTGCC
TTGAGATTTGGATGCAGTAAGCAGGACAAGATGAAGAACTGAAGAGGCTTTCAGAAACTT
ATGTCTATCTCGAA*GGGTCTCACAGTTTTTAATATGTACATTAGGATTTTGTTATAAAG
AAATAATGATTGGCTTTGTCCAGAGAGACATTTGATCTGATCTTTGATATAATCTTCCCA
TGTTTTTAAGACACTCAACTATGAGATTATG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GQ29JQ U 1
AF RR4FB47JQ U 93
BS 1 788 RR4GQ29JQ
BS 789 789 RR4FB47JQ
BS 790 814 RR4GQ29JQ

RD RR4GQ29JQ 814 0 0
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CTTGGTTAAGATCAGTAGCTCTGATCCCCCAAGCCTTGCAAGTAAAAGCAATGTTGTGCG
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DS 

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G
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CCTTGCAAGTAAAAGCAATGTTGTGCGAGTCGTGAACTTTGCTGAGATGATA

QA 2 713 2 713
DS 



AS 1 2

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TAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGA
AGATGCAGAAGGCGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTCTTTGTA
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AAAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCA
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TT


BQ
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10 10 

AF RR4DU73TF U 1
AF RR4DU73JQ C 171
BS 1 697 RR4DU73TF
BS 698 842 RR4DU73JQ

RD RR4DU73TF 703 0 0
AGGGGACTCTCCTCTATCTGTGTCGAGCTCATTAATCCGAAATCGAATTGATCCGATTTG
ATTCTTTTTGTGAGTTTCGTCAAACGGAAGAGAAAGATGGTTGTGAGGCTACGATTATCG
AGACTAGGATGCAAGAACCGACCGTTTTTTAGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCG
AGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGTGATTTCATT
TAATTAAGAGAATGTTCTGATTTGCTCTTTTCGTTGGTTTTTTTTTACACCATTTCTGTC
TGTGTGTGCAGGGCAAGACGGTGGTAAGAGGATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTA
CTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGG
TTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGTGAAAGAGACACTCG
CCCTGTTGATCCTATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCGCTTATAGA
TAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAGACTTAAGGAAGAAGAAGA
AGATGCAGAAGGCGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTCTTTGTA
GCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCT
GGTTCT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DU73JQ 672 0 0
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TGATTTCATTTAATTAAGAGAATGTTCTGATTTGCTCTTTTCGTTGGTTTTTTTTTACAC
CATTTCTGTCTGTGTGTGCAGGGCAAGACGGTGGTAAGAGGATGGGTCTCAAGTTCGATC
GAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTT
TCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGTGAAA
GAGACACTCGCCCTGTTGATCCTATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCAC
CGCTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAGACTTAAGG
AAGAAGAAGAAGATGCAGAAGGCGAGAGAGTTCGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTT
TGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTTA
TTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTT
GAGGGACTCAGGTTATAAGTTTTGAGGTTTATGATGTGCTTATTACCACTACCTATATAA
GCTATTATTCTT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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CAAAGAAGGGCTTCTGTATCTGTACGAGAAGATGAAACTTTACAAGGAGGTTATTGCTTG
CTTGCAGAATCATGATCACGAGGGACTGATTGCTTGCTGCAAAAAGTTAGGTGATTCTGG
CAAGGGTGGGGATCCGTCTCTCTGGGCAGATCTTCTCAAATATTTTGGTGAAATCGGAGA
GGACTGTACTAAAGAGGTGAAGGAGGTTCTTCTTATATTGAACGAGATGATATTTTACCT
CCTATAATTGTTCTTCAGACCCTAGCGAAGAATCCATGCCTCACACTCTCTGTAATCAAA
GACTATATCGCACGGAAACTTGAACAAGAATCAAAGATAATTGAAGAGGATCGGCGAGCT
GTTGAGAAGTATCAGGAAACGACAAAAAGCATGAGAAAAGAGATTGAGGACCTTAGGACA
AATGCCAGAATATTTCAACTAAGCAAGTGCACTGCTTGCACTTTCACACTGGATATCCCT
GCAGTCCATTTCATGTGTATGCACTCATTCCATCAACGTTGCCTCGGTGACAACGAAACA
GAATGTCCCGAGTGTGCTCCCGAGTACAGATCCGTGGTGGAAATGAAGAGAAGTTTGGAG
CATAACTCGAAAGACCAAGCTCTGTTCTTCCAGCAGGTAAAGAGCTCGAAAGACGGGTTT
TCTGTAATTGCAGAGTATTTTGGGAAAGGAATCATCAGCAAAACTAGTGACTGAACAACT
CATTCTCTTCATCCCTGATGGGAGGGCGGGTCAAGATAGGCCGACATAAACCGTGTAGCA
TCTGTGTATTTCTTTTGTTTTGTTTGGACCTCTGTGTTCCTGTGATTGTGAGGTATCCGT
TGAAGCTCGAATCCTTCTACTTTAAGGCTAAAATATTAAGTATGCAGAGCTGGTGATGCC
GTATGACTGATCTTATTTTGCTTATCTGATTATCTGTTTAAGGGTGGGTTGCTTGGGATG
TATCAACAGGTGAAGAAGTTTTTGTATGTTTTGATTTTTATATTTGGAAGTCCAAACGTT
TTGTTTGCTTTGCATTCGATCCAATGGTTTAAGAGACTTGAGAGTC


BQ
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AF RR4AC21TF U 1
AF RR4AC21JQ C 406
BS 1 756 RR4AC21TF
BS 757 757 RR4AC21JQ
BS 758 801 RR4AC21TF
BS 802 1186 RR4AC21JQ

RD RR4AC21TF 801 0 0
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CCAAGAGCAACCACTCTATGATGTTGACCTTGCTATAATTCTTTGTGAGATGAATTCCTT
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CTTGCAGAATCATGATCACGAGGGACTGATTGCTTGCTGCAAAAAGTTAGGTGATTCTGG
CAAGGGTGGGGATCCGTCTCTCTGGGCAGATCTTCTCAAATATTTTGGTGAAATCGGAGA
GGACTGTACTAAAGAGGTGAAGGAGGTTCTTCTTATATTGAACGAGATGATATTTTACCT
CCTATAATTGTTCTTCAGACCCTAGCGAAGAATCCATGCCTCACACTCTCTGTAATCAAA
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GTTGAGAAGTATCAGGAAACGACAAAAAGCATGAGAAAAGAGATTGAGGACCTTAGGACA
AATGCCAGAATATTTCAACTAAGCAAGTGCACTGCTTGCACTTTCACACTGGATATCCCT
GCAGTCCATTTCATGTGTATGCACTCATTCCATCAACGTTGCCTCGGTGACAACGAAACA
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CATAACTCGAAAGACCAAGCTCTGTTCTTCCAGCAG*TAAAGAGCTCGAAAGACGGGTTT
TCTGTAATTGCAGAGTATTTT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4AC21JQ 781 0 0
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GAGGACCTTAGGACAAATGCCAGAATATTTCAACTAAGCAAGTGCACTGCTTGCACTTTC
ACACTGGATATCCCTGCAGTCCATTTCATGTGTATGCACTCATTCCATCAACGTTGCCTC
GGTGACAACGAAACAGAATGTCCCGAGTGTGCTCCCGAGTACAGATCCGTGGTGGAAATG
AAGAGAAGTTTGGAGCATAACTCGAAAGACCAAGCTCTGTTCTTCCAGCAGGTAAAGAGC
TCGAAAGACGGGTTTTCTGTAATTGCAGAGTATTTTGGGAAAGGAATCATCAGCAAAACT
AGTGACTGAACAACTCATTCTCTTCATCCCTGATGGGAGGGCGGGTCAAGATAGGCCGAC
ATAAACCGTGTAGCATCTGTGTATTTCTTTTGTTTTGTTTGGACCTCTGTGTTCCTGTGA
TTGTGAGGTATCCGTTGAAGCTCGAATCCTTCTACTTTAAGGCTAAAATATTAAGTATGC
AGAGCTGGTGATGCCGTATGACTGATCTTATTTTGCTTATCTGATTATCTGTTTAAGGGT
GGGTTGCTTGGGATGTATCAACAGGTGAAGAAGTTTTTGTATGTTTTGATTTTTATATTT
GGAAGTCCAAACGTTTTGTTTGCTTTGCATTCGATCCAATGGTTTAAGAGACTTGAGAGT
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

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GGACACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCTAATCATGGCATCTCTTGTAGAGAAACAACTCC
TCAAATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCGTTTCCGATACCGCTTTCTCGT
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TCCTCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGG
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AGAACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGA
CGGACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCA
CATTGAATGTAATGGGTGCGGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTG
GTGGGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTC
AAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAA
CTACATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTACTATTGAT
AAGTAAGCGGTTTTTGTTTTTGTTTTACAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTATATAATTC
ATGTTATCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4FB20TF U 1
AF RR4FB20JQ C 189
BS 1 680 RR4FB20TF
BS 681 681 RR4FB20JQ
BS 682 730 RR4FB20TF

RD RR4FB20TF 730 0 0
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TCAAATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCGTTTCCGATACCGCTTTCTCGT
CCCGAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACATTTCTCTTTCTACTTCCATGACA
TCCTCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGG
GATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACA
AGAACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGA
CGGACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCA
CATTGAATGTAATGGGTGCGGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTG
GTGGGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTC
AAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAA
CTACATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTACTATTGAT
AAGTAAGCGGTTTTTGTTTT*GTTTTACAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTATATAATTC
ATGTTATCCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4FB20JQ 542 0 0
GATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGATTAGGA
AACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAAGAACTAT
CTTTCAGAACCCGTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTTTATGACATGAAGACGGACTTC
AACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACATTGAAT
GTAATGGGTGCGGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTGGGACT
GGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAGGGGCT
AAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAACTACATGT
TTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTACTATTGATAAGTAAGC
GGTTTTTGTTTTTGTTTTACAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTATATAATTCATGTTATC
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL8633Contig1 1378 2 2 U
GAAGATGAAGAGGCAGAGTTCAAAGCTTACAAGGCTAAAGTCTACTCTCTGACCGTACCG
TTAAAACTCGCTGCCTTGCGTGGTTCAGTGCCACCTTCATGGATCAAGGAGTTCATGAGC
TCACAAGGGAAGAGAGTGAGGTTAAAGACGAGGTTCTTGGCAAATCTTGAAGATATTTTC
TTGAATCTATCAAATCCTACTAGTAAAGGGAAGAAAGAGTCTTCCGCTGATATGATCAGC
CTTGGTGATTCTTGGCTTAGTTTTGCAATTAAGGAGAAGCTTATTGAGCCAATGAAGGGT
GTAGAAGTTCAAGACTGGTATAAAGGCTTGAGTGATAAATGGAAGGTTTATCTCCGCAGG
AACTATGCTGGAGAACAAGCTCCTGACGGTGAAACGTGGGCTGTTCCATACCGATGGGGC
AGCATGGTAATAGCATACAAGAAGAGCAAGTTTCAGCAGTATAAACTGCCTCCAATACAG
GACTGGGAGGACCTGTGGCGACCCGAGCTTGCAGGGAGGATCTCAATGGTGAATTCTCCT
AGAGAGGTTGTTGGTGCTGTTCTCAAATCCATGGGAGCATCATACAACACCATCGACCTG
GATTCACAAGTTACTGGTGGAAAAAACGCTGTGGAGACAAATCTTGCATCGCTTATGAAA
CAGATTAGACTGTTTGACAGTACCAACTACTTAAAAGCTTTCAATGTGGGAGATGTCTGG
GTCACCGTTGGTTGGAGCAGTGATGTTATCCCTGTCGCCAAACGTATGTCTAATGTTACA
GTGATTGTTCCCAAGTCCGGTGCCGCCTTATGGGCTGATCTATGGGCAATCCCAGCTATA
TCTGACTCTGGAAAAGAAGCTGAAGCGCTAGGAGGACGAGTCCGAGGCCCATCTCCATTA
GTCCACCAGTGGATAGAGTTCTGCTTGCAACCAGCAAGATCATTGCCCTTCACAAGGGAA
GTGATCCCTGGTGCGTCTCCTTCAGCTATTGAGGGTTTCCTGGTTAGAGAACCCGAAGAA
ACAAAAAAGCAGAGCAAAACTGGACACGAACCTCGTCTCGGGTGTTCCTCCTCCAGAGAT
CTTGTTTAAGTGTGAGTTTTTGGAACCTTTACCAGAGGCTACGCTTTTGGAATACCAGCT
TCTGATCGATACTGTAAGGAAACAAAGAGAAGGACATGGCCTTAAGGAGAAACTTGAAGA
CATTTTTTCGAGTTTTAGGACAAAGTTTCACTTTCAGATGAAGAAAAACACTTAAAAACT
TGTCAACAAAAAGGTGGATACAGAATCATTTGTATGATTACATAGACCAACTTCATTTGG
AAAACGAGGTCCCATACCACGTAACTCGGTCAACGTCTTATTTCTTATAATTCATAAC


BQ
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AF RR4BF23TF U 1
AF RR4BF23JQ C 620
BS 1 786 RR4BF23TF
BS 787 1378 RR4BF23JQ

RD RR4BF23TF 786 0 0
GAAGATGAAGAGGCAGAGTTCAAAGCTTACAAGGCTAAAGTCTACTCTCTGACCGTACCG
TTAAAACTCGCTGCCTTGCGTGGTTCAGTGCCACCTTCATGGATCAAGGAGTTCATGAGC
TCACAAGGGAAGAGAGTGAGGTTAAAGACGAGGTTCTTGGCAAATCTTGAAGATATTTTC
TTGAATCTATCAAATCCTACTAGTAAAGGGAAGAAAGAGTCTTCCGCTGATATGATCAGC
CTTGGTGATTCTTGGCTTAGTTTTGCAATTAAGGAGAAGCTTATTGAGCCAATGAAGGGT
GTAGAAGTTCAAGACTGGTATAAAGGCTTGAGTGATAAATGGAAGGTTTATCTCCGCAGG
AACTATGCTGGAGAACAAGCTCCTGACGGTGAAACGTGGGCTGTTCCATACCGATGGGGC
AGCATGGTAATAGCATACAAGAAGAGCAAGTTTCAGCAGTATAAACTGCCTCCAATACAG
GACTGGGAGGACCTGTGGCGACCCGAGCTTGCAGGGAGGATCTCAATGGTGAATTCTCCT
AGAGAGGTTGTTGGTGCTGTTCTCAAATCCATGGGAGCATCATACAACACCATCGACCTG
GATTCACAAGTTACTGGTGGAAAAAACGCTGTGGAGACAAATCTTGCATCGCTTATGAAA
CAGATTAGACTGTTTGACAGTACCAACTACTTAAAAGCTTTCAATGTGGGAGATGTCTGG
GTCACCGTTGGTTGGAGCAGTGATGTTATCCCTGTCGCCAAACGTATGTCTAATGTTACA
GTGATT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR4BF23JQ 759 0 0
GAAAAAACGCTGTGGAGACAAATCTTGCATCGCTTATGAAACAGATTAGACTGTTTGACA
GTACCAACTACTTAAAAGCTTTCAATGTGGGAGATGTCTGGGTCACCGTTGGTTGGAGCA
GTGATGTTATCCCTGTCGCCAAACGTATGTCTAATGTTACAGTGATTGTTCCCAAGTCCG
GTGCCGCCTTATGGGCTGATCTATGGGCAATCCCAGCTATATCTGACTCTGGAAAAGAAG
CTGAAGCGCTAGGAGGACGAGTCCGAGGCCCATCTCCATTAGTCCACCAGTGGATAGAGT
TCTGCTTGCAACCAGCAAGATCATTGCCCTTCACAAGGGAAGTGATCCCTGGTGCGTCTC
CTTCAGCTATTGAGGGTTTCCTGGTTAGAGAACCCGAAGAAACAAAAAAGCAGAGCAAAA
CTGGACACGAACCTCGTCTCGGGTGTTCCTCCTCCAGAGATCTTGTTTAAGTGTGAGTTT
TTGGAACCTTTACCAGAGGCTACGCTTTTGGAATACCAGCTTCTGATCGATACTGTAAGG
AAACAAAGAGAAGGACATGGCCTTAAGGAGAAACTTGAAGACATTTTTTCGAGTTTTAGG
ACAAAGTTTCACTTTCAGATGAAGAAAAACACTTAAAAACTTGTCAACAAAAAGGTGGAT
ACAGAATCATTTGTATGATTACATAGACCAACTTCATTTGGAAAACGAGGTCCCATACCA
CGTAACTCGGTCAACGTCTTATTTCTTATAATTCATAAC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL8634Contig1 752 2 2 U
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ATTAAGCAAGAAGCACCACCGCCTCTTCCTCCAGGGATCTATGAGATACCGGGAGAGCCT
GCGGTTGTTATCACCGGTGTCCCTGATGAGCCTCAAACAGACTCCATGATTGCCAAGGAC
GAACCTGCAAAACCATCGAGTGCCGCCACTGTAGGATGCGGCGAATGGCTTGAAGGCAGA
GAAGTTCGCAGGTTTTTCTTGGGTCAGTACTATTCAGGTACGGTGACGAAGTTCGACAAA
GGTACTGGTTGGTACATGGTCGAGTATGAAGATGGGGATTCCGAATAGCTTGACTGGTCT
GAGCTAGAAGAAGTGCTTCTACCTATGGATGTTACTGTTCCACTGAGATCAATCTCCTTA
TGGGTCATCAAGAAACGTCAGACGCAGGCCCAAGCTTATGGAAGCATGGTGAAACACTAA
TGGGTCTTTTGCTTATTGTGCAGAGTGAATATGATGAAGCGCACGATGAGAAGAGGTTAC
AAACACTTTAACAGTCCTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAATATTTTTATGCCTTTTGT
AAACACTTTAACAATCTTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAATATTTTTATATTCAATCA
AACTGTGAATAATATTAGGCAATTAAAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H151TF U 1
AF RR4H151JQ C 38
BS 1 732 RR4H151TF
BS 733 752 RR4H151JQ

RD RR4H151TF 732 0 0
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GAATATCTCCTGCTGACACTTGAAAAAAACTGAAAAATGGACAACAACACTGTGAGTAGC
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GAACCTGCAAAACCATCGAGTGCCGCCACTGTAGGATGCGGCGAATGGCTTGAAGGCAGA
GAAGTTCGCAGGTTTTTCTTGGGTCAGTACTATTCAGGTACGGTGACGAAGTTCGACAAA
GGTACTGGTTGGTACATGGTCGAGTATGAAGATGGGGATTCCGAATAGCTTGACTGGTCT
GAGCTAGAAGAAGTGCTTCTACCTATGGATGTTACTGTTCCACTGAGATCAATCTCCTTA
TGGGTCATCAAGAAACGTCAGACGCAGGCCCAAGCTTATGGAAGCATGGTGAAACACTAA
TGGGTCTTTTGCTTATTGTGCAGAGTGAATATGATGAAGCGCACGATGAGAAGAGGTTAC
AAACACTTTAACAGTCCTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAATATTTTTATGCCTTTTGT
AAACACTTTAACAATCTTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAATATTTTTATATTCAATCA
AACTGTGAATAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4H151JQ 715 0 0
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TCTATGAGATACCGGGAGAGCCTGCGGTTGTTATCACCGGTGTCCCTGATGAGCCTCAAA
CAGACTCCATGATTGCCAAGGACGAACCTGCAAAACCATCGAGTGCCGCCACTGTAGGAT
GCGGCGAATGGCTTGAAGGCAGAGAAGTTCGCAGGTTTTTCTTGGGTCAGTACTATTCAG
GTACGGTGACGAAGTTCGACAAAGGTACTGGTTGGTACATGGTCGAGTATGAAGATGGGG
ATTCCGAATAGCTTGACTGGTCTGAGCTAGAAGAAGTGCTTCTACCTATGGATGTTACTG
TTCCACTGAGATCAATCTCCTTATGGGTCATCAAGAAACGTCAGACGCAGGCCCAAGCTT
ATGGAAGCATGGTGAAACACTAATGGGTCTTTTGCTTATTGTGCAGAGTGAATATGATGA
AGCGCACGATGAGAAGAGGTTACAAACACTTTAACAGTCCTTTGAACATTTCCTCATCAG
TTGAATATTTTTATGCCTTTTGTAAACACTTTAACAATCTTTTGAACATTTCCTCATCAG
TTGAATATTTTTATATTCAATCAAACTGTGAATAATATTAGGCAATTAAAGAATC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL8635Contig1 1125 2 2 U
GACTTCTCTACCTGTGACCTGGAGTGGAGGGATGATGATGCTCTCTTGATAGGGGTTCTG
TACATACAAACAACAAGTACTGTTACAATATTGGCTATCTATATATGGACGGGAGAAGGC
GCTGGTTGGACATAGAATTTATTGGTCTGTGCTGAAAGGATTCACTTATTAATGATTGCT
ATTTTCTAGACTTGTTTATCACTTAAGATGTCAGTATTGATCTCCCGCGACACATTTACT
GTACTATAGGGATCAAATGGAAAGAATCACTTTTATCTTTGTTACAAACCTGGCCCCTTG
TTCTGGAGTAAGACTCCATCTATGATGGCCTGAGAAGGAGAAATCGAATTCAAACTTGCC
ATTTTGTGAAAGGGTGGTTCTGGAAGTTACGTCAAAAATGGTTCTATCATTCCAAAAGGG
CCCGCCCCAAAACAGGTGATATATCAATTACAAAAATGCTTGATTTGTTTCCTTTGCACA
CACACATCTCTTGAGCATAGATGTATGTACGCATCCCCAGTTTACTAATCATGCATGTTA
TATAGTAGTGTGGTGCATAAAACTATTACCGCACACGCTTGCGTGTGTGTGTAATCATGC
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ATATCGCAGTGGTGGCCTAGTGGTCCCAGCAAATCTTCTCATACATGACTACTCGAGGTC
GCTAGTTCGATACTCGGGGACAGCAGGATGGTACTATGCCTCTCCAAATAAATCCTTCCT
CATACGAGTAGGGGCAAGCGGTGTATACCAACCGTAGGTCCAAGCCGGAGGGGTTTCCCC
ATACGAGTAGGGGCAAGCGGAATATACATTAATCCGTAGGTCCAAGCCGGAGGGGAAGGA
TTTCCTGGATTTGGGGCCGCGCAAGCGGTGGGGCTAGTCACTATAAAAAGTTAACCCTGA
ACAGTTAAACCGGGCTTCGTAGCCTGGTGGTAATGGAACCTCGGCTGAGGTGCCCGCCAC
CCAGCTTCGAAACCCGGCCACAGCGATTTAACATCCTTACTGCTGGGGCGCTGGACCCCT
TCGGGGGATATTTGGGAAAGTGGCTGCCCAGACACCAGAGATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DY95TF U 1
AF RR4DY95JQ C 542
BS 1 713 RR4DY95TF
BS 714 1125 RR4DY95JQ

RD RR4DY95TF 713 0 0
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TACATACAAACAACAAGTACTGTTACAATATTGGCTATCTATATATGGACGGGAGAAGGC
GCTGGTTGGACATAGAATTTATTGGTCTGTGCTGAAAGGATTCACTTATTAATGATTGCT
ATTTTCTAGACTTGTTTATCACTTAAGATGTCAGTATTGATCTCCCGCGACACATTTACT
GTACTATAGGGATCAAATGGAAAGAATCACTTTTATCTTTGTTACAAACCTGGCCCCTTG
TTCTGGAGTAAGACTCCATCTATGATGGCCTGAGAAGGAGAAATCGAATTCAAACTTGCC
ATTTTGTGAAAGGGTGGTTCTGGAAGTTACGTCAAAAATGGTTCTATCATTCCAAAAGGG
CCCGCCCCAAAACAGGTGATATATCAATTACAAAAATGCTTGATTTGTTTCCTTTGCACA
CACACATCTCTTGAGCATAGATGTATGTACGCATCCCCAGTTTACTAATCATGCATGTTA
TATAGTAGTGTGGTGCATAAAACTATTACCGCACACGCTTGCGTGTGTGTGTAATCATGC
ACTTATCGCACGACAAGTCTTCCTCCACAAATTGAATAACCTTTCTTCACATATAAGCTG
ATATCGCAGTGGTGGCCTAGTGGTCCCAGCAAATCTTCTCATACATGACTACT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4DY95JQ 584 0 0
ATAGTAGTGTGGTGCATAAAACTATTACCGCACACGCTTGCGTGTGTGTGTAATCATGCA
CTTATCGCACGACAAGTCTTCCTCCACAAATTGAATAACCTTTCTTCACATATAAGCTGA
TATCGCAGTGGTGGCCTAGTGGTCCCAGCAAATCTTTTCATACATGACTACTCGAGGTCG
CTAGTTCGATACTCGGGGACAGCAGGATGGTACTATGCCTCTCCAAATAAATCCTTCCTC
ATACGAGTAGGGGCAAGCGGTGTATACCAACCGTAGGTCCAAGCCGGAGGGGTTTCCCCA
TACGAGTAGGGGCAAGCGGAATATACATTAATCCGTAGGTCCAAGCCGGAGGGGAAGGAT
TTCCTGGATTTGGGGCCGCGCAAGCGGTGGGGCTAGTCACTATAAAAAGTTAACCCTGAA
CAGTTAAACCGGGCTTCGTAGCCTGGTGGTAATGGAACCTCGGCTGAGGTGCCCGCCACC
CAGCTTCGAAACCCGGCCACAGCGATTTAACATCCTTACTGCTGGGGCGCTGGACCCCTT
CGGGGGATATTTGGGAAAGTGGCTGCCCAGACACCAGAGATATC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8636Contig1 754 2 4 U
GAGTCAAAGATAGCACTAGCCGTTTTCTCGAAAAGGTATACGGAATCAAGATGGTGCTTA
GATGAGCTTGTGAAGATAAAAGAACGTGCAGATCTAGGCAAGCTCAAGGTGCTTCCCATC
TTCTACAATGTGACTACAGACAATGTGAAATATCTTACTGAAGAATTTGGCTCCAATCTT
GAGCGTCATCAGTCTCCGCATGAGCAAAACAAGATATGGAAAGAGGCGTTAGCATGTATC
TCTTGTAAGCTTGGGTGTCCGCTCATAGATAATAACGGTTTTAGCAGCAGCACAGAGAGG
GAGTTCATCGACAGTATCGTCAAGAACGTATTGGAAATGCTACAAGACATTTCCTCGGCG
CGAACACCAAATTCTTCTAGAAGCAAGCCTGTCGAAAGAGGAGAAGTTTCTTCAAAGACA
ACAAAGAGTTCTAAGAAAGCCTTGAAGGACGACTCAAAGGGAAACATAGTGATCAGTCCA
CCTAATGAGTACGTAGGCTTTAACGGTTTTCCAATTAGATATGGAAACCAGGAATCTGCG
AGAAGGGGGGGGAGATTCTACATCTCTGACTAAAAACTCTAAACCCCTCAAGCCTTCTAA
GAAAGACCTCTCTTGCTCGGGACTTCGACTTAGTCATGGCTCAGATTCCACCGAGACGAG
ACCGACATATAACGGCTTTCCGATTAGATATGGCAACCATGATCTGCTGGAAGGGAGATT
CTTCGTCTATGGTTATTTGCACATGTTTGAGATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY07TF U 1
AF RR4E715TF U 1
BS 1 551 RR4DY07TF
BS 552 552 RR4E715TF
BS 553 696 RR4DY07TF
BS 697 754 RR4E715TF

RD RR4DY07TF 713 0 0
GAGTCAAAGATAGCACTAGCCGTTTTCTCGAAAAGGTATACGGAATCAAGATGGTGCTTA
GATGAGCTTGTGAAGATAAAAGAACGTGCAGATCTAGGCAAGCTCAAGGTGCTTCCCATC
TTCTACAATGTGACTACAGACAATGTGAAATATCTTACTGAAGAATTTGGCTCCAATCTT
GAGCGTCATCAGTCTCCGCATGAGCAAAACAAGATATGGAAAGAGGCGTTAGCATGTATC
TCTTGTAAGCTTGGGTGTCCGCTCATAGATAATAACGGTTTTAGCAGCAGCACAGAGAGG
GAGTTCATCGACAGTATCGTCAAGAACGTATTGGAAATGCTACAAGACATTTCCTCGGCG
CGAACACCAAATTCTTCTAGAAGCAAGCCTGTCGAAAGAGGAGAAGTTTCTTCAAAGACA
ACAAAGAGTTCTAAGAAAGCCTTGAAGGACGACTCAAAGGGAAACATAGTGATCAGTCCA
CCTAATGAGTACGTAGGCTTTAACGGTTTTCCAATTAGATATGGAAACCAGGAATCTGCG
AGAAGGGGGGG*AGATTCTACATCTCTGACTAAAAACTCTAAACCCCTCAAGCCTTCTAA
GAAAGACCTCTCTTGCTCGGGACTTCGACTTAGTCATGGCTCAGATTCCACCGAGACGAG
ACCGACATATAACGGCTTTCCGATTAGATATGGCAA
ACCATGAATCTGCTGGA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4E715TF 754 0 0
GAGTCAAAGATAGCACTAGCCGTTTTCTCGAAAAGGTATACGGAATCAAGATGGTGCTTA
GATGAGCTTGTGAAGATAAAAGAACGTGCAGATCTAGGCAAGCTCAAGGTGCTTCCCATC
TTCTACAATGTGACTACAGACAATGTGAAATATCTTACTGAAGAATTTGGCTCCAATCTT
GAGCGTCATCAGTCTCCGCATGAGCAAAACAAGATATGGAAAGAGGCGTTAGCATGTATC
TCTTGTAAGCTTGGGTGTCCGCTCATAGATAATAACGGTTTTAGCAGCAGCACAGAGAGG
GAGTTCATCGACAGTATCGTCAAGAACGTATTGGAAATGCTACAAGACATTTCCTCGGCG
CGAACACCAAATTCTTCTAGAAGCAAGCCTGTCGAAAGAGGAGAAGTTTCTTCAAAGACA
ACAAAGAGTTCTAAGAAAGCCTTGAAGGACGACTCAAAGGGAAACATAGTGATCAGTCCA
CCTAATGAGTACGTAGGCTTTAACGGTTTTCCAATTAGATATGGAAACCAGGAATCTGCG
AGAAGGGGGGGGAGATTCTACATCTCTGACTAAAAACTCTAAACCCCTCAAGCCTTCTAA
GAAAGACCTCTCTTGCTCGGGACTTCGACTTAGTCATGGCTCAGATTCCACCGAGACGAG
AC*GACATATAACGGCTTTCCGATTAGATATGGCAACCATGATCTGCTGGAAGGGAGATT
CTTCGTCTATGGTTATTTGCACATGTTTGAGATT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL8637Contig1 1034 2 2 U
GGGTCCAAAGATCGAGAAAAAATCTTTAGGCGATCGATTACTGTCCGAAAGATTGAAACT
TTTGTTTGGTAAATCATCGATTTAGATTAGTGTTAGCCTGTTAGGTGTTTCAATCGCGGG
GGAGGGTCTGGTCTGGTTTGGAATGGCGCAACAAGGGGCAAGCATGGACCCTGCCGTTCT
AGACGACATCATCCGTCGTTTGTTGGATTACAAAAACCCTAACCCTGCAACCAAACAGGT
CATGTTAAACGAGTCCGAGATCCGACAGCTTTGCTTCATCTCCAGAAAGATTTTCCTCCA
ACAGCCGAACCTCCTCGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATACATGGACA
GTACTCAGATCTTTTGAGGCTCTTCGAGTACGGAGGCTACCCTCCCGCAGCTAACTATTT
ATTCTTAGGAGACTACGTTGACCGCGGGAAGCAGAGCCTTGAAACAATCTGTCTCCTCCT
CGCCTACAAAATCAAATACCCCGAGAATTTCTTCCTCCTAAGAGGAAACCACGAGTGCGC
TTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAGTGCAAACGGAGGTTCAGCGTGAGGCT
CTGGAAAGTCTTTACGGATTCGTTCAACTGCCTCCCCGTGGCTGCTGTGGTAGACGACAA
GATACTGTGCATGCACGGTGGTCTTTCTCTGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAGCA
TATGTGAAAGGCTGGGGGATGAACGACCGTGGAGTGTCGTACACGTTTGGACCTGATAAG
GTTGCTGAGTTTCTGATTAAGAATGATATGGATCTCATCTGTCGTGCTCACCAGGTAGTG
GAGGATGGTTATGAGTTCTTTGCGGATAGACAGCTAGTTACTATATTCTCAGCTCCAAAC
TACTGTGGTGAATTCGACAATGCGGGTGCATTGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGT
TCTTTCCAAATACTTAAGCCTGCGGATCGGAAGCCTGCGGATCGGAGGCCCCGGTTCTTA
TAATGATGTAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AC56TF U 1
AF RR4AC56JQ C 198
BS 1 726 RR4AC56TF
BS 727 1034 RR4AC56JQ

RD RR4AC56TF 726 0 0
GGGTCCAAAGATCGAGAAAAAATCTTTAGGCGATCGATTACTGTCCGAAAGATTGAAACT
TTTGTTTGGTAAATCATCGATTTAGATTAGTGTTAGCCTGTTAGGTGTTTCAATCGCGGG
GGAGGGTCTGGTCTGGTTTGGAATGGCGCAACAAGGGGCAAGCATGGACCCTGCCGTTCT
AGACGACATCATCCGTCGTTTGTTGGATTACAAAAACCCTAACCCTGCAACCAAACAGGT
CATGTTAAACGAGTCCGAGATCCGACAGCTTTGCTTCATCTCCAGAAAGATTTTCCTCCA
ACAGCCGAACCTCCTCGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATACATGGACA
GTACTCAGATCTTTTGAGGCTCTTCGAGTACGGAGGCTACCCTCCCGCAGCTAACTATTT
ATTCTTAGGAGACTACGTTGACCGCGGGAAGCAGAGCCTTGAAACAATCTGTCTCCTCCT
CGCCTACAAAATCAAATACCCCGAGAATTTCTTCCTCCTAAGAGGAAACCACGAGTGCGC
TTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAGTGCAAACGGAGGTTCAGCGTGAGGCT
CTGGAAAGTCTTTACGGATTCGTTCAACTGCCTCCCCGTGGCTGCTGTGGTAGACGACAA
GATACTGTGCATGCACGGTGGTCTTTCTCTGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAGCA
TATGTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR4AC56JQ 837 0 0
GTTTGTTGGATTACAAAAACCCTAACCCTGCAACCAAACAGGTCATGTTAAACGAGTCCG
AGATCCGACAGCTTTGCTTCATCTCCAGAAAGATTTTCCTCCAACAGCCGAACCTCCTCG
AGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATACATGGACAGTACTCAGATCTTTTGA
GGCTCTTCGAGTACGGAGGCTACCCTCCCGCAGCTAACTATTTATTCTTAGGAGACTACG
TTGACCGCGGGAAGCAGAGCCTTGAAACAATCTGTCTCCTCCTCGCCTACAAAATCAAAT
ACCCCGAGAATTTCTTCCTCCTAAGAGGAAACCACGAGTGCGCTTCCATCAACAGAATCT
ACGGATTCTACGACGAGTGCAAACGGAGGTTCAGCGTGAGGCTCTGGAAAGTCTTTACGG
ATTCGTTCAACTGCCTCCCCGTGGCTGCTGTGGTAGACGACAAGATACTGTGCATGCACG
GTGGTCTTTCTCTGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAGCATATGTGAAAGGCTGGGG
GATGAACGACCGTGGAGTGTCGTACACGTTTGGACCTGATAAGGTTGCTGAGTTTCTGAT
TAAGAATGATATGGATCTCATCTGTCGTGCTCACCAGGTAGTGGAGGATGGTTATGAGTT
CTTTGCGGATAGACAGCTAGTTACTATATTCTCAGCTCCAAACTACTGTGGTGAATTCGA
CAATGCGGGTGCATTGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGTTCTTTCCAAATACTTAA
GCCTGCGGATCGGAAGCCTGCGGATCGGAGGCCCCGGTTCTTATAATGATGTAAAAT

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL8638Contig1 528 2 1 U
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TCTATGTTAGTGGCAAATATATGCTTTAGTTTCTTAGTTGTCCAAGAGAATCTTATATGA
ATTTTGGAGAAAAAAATAAACATTTCTTTAGGTGGAAGCAATCAAGAAAATTTCAGAGTA
TGTAGCCCAACTACGAAGAGTTGGCAAAGGACACGGTAACATAACACAGATCATCTCTCC
CATTTTGTTTATATACATCACTTGTTCATCCTGCACTTTTTGCTTAGATTCGGTTCTAAA
GTATTTCTTTTGAATGTTGGTGGTGACCTTCAGGGACGTGGCATTTCAATCAGATGCTTT
TGGAACAGTAAAATCTACTTCGAGGGACTTATGGTCGTGTTTACTCTTGTGGTATTCAGT
CTATGAAGCTCACTAGCAATGTATCAACCAGTTTGTGTGTTAGTTCTGCAGCTTTTGTGA
TGTAGACTTTTTATTTTGTAAGAGCCGAAGAGAGATGTCTTTGAATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AG79JQ C 1
AF RR4AG79TF U 1
BS 1 528 RR4AG79TF

RD RR4AG79JQ 528 0 0
GCTTGGCAGATTTTATTGAGAGCGAGTTTCTGACCGAGCAGGTAAAATTACTTTGGTGTT
TCTATGTTAGTGGCAAATATATGCTTTAGTTTCTTAGTTGTCCAAGAGAATCTTATATGA
ATTTTGGAGAAAAAAATAAACATTTCTTTAGGTGGAAGCAATCAAGAAAATTTCAGAGTA
TGTAGCCCAACTACGAAGAGTTGGCAAAGGACACGGTAACATAACACAGATCATCTCTCC
CATTTTGTTTATATACATCACTTGTTCATCCTGCACTTTTTGCTTAGATTCGGTTCTAAA
GTATTTCTTTTGAATGTTGGTGGTGACCTTCAGGGACGTGGCATTTCAATCAGATGCTTT
TGGAACAGTAAAATCTACTTCGAGGGACTTATGGTCGTGTTTACTCTTGTGGTATTCAGT
CTATGAAGCTCACTAGCAATGTATCAACCAGTTTGTGTGTTAGTTCTGCAGCTTTTGTGA
TGTAGACTTTTTATTTTGTAAGAGCCGAAGAGAGATGTCTTTGAATTC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4AG79TF 528 0 0
GCTTGGCAGATTTTATTGAGAGCGAGTTTCTGACCGAGCAGGTAAAATTACTTTGGTGTT
TCTATGTTAGTGGCAAATATATGCTTTAGTTTCTTAGTTGTCCAAGAGAATCTTATATGA
ATTTTGGAGAAAAAAATAAACATTTCTTTAGGTGGAAGCAATCAAGAAAATTTCAGAGTA
TGTAGCCCAACTACGAAGAGTTGGCAAAGGACACGGTAACATAACACAGATCATCTCTCC
CATTTTGTTTATATACATCACTTGTTCATCCTGCACTTTTTGCTTAGATTCGGTTCTAAA
GTATTTCTTTTGAATGTTGGTGGTGACCTTCAGGGACGTGGCATTTCAATCAGATGCTTT
TGGAACAGTAAAATCTACTTCGAGGGACTTATGGTCGTGTTTACTCTTGTGGTATTCAGT
CTATGAAGCTCACTAGCAATGTATCAACCAGTTTGTGTGTTAGTTCTGCAGCTTTTGTGA
TGTAGACTTTTTATTTTGTAAGAGCCGAAGAGAGATGTCTTTGAATTC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL8639Contig1 799 2 10 U
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AGAGTGTTCGTTTCTCCAACAACTTTGGTCTATTGCTTGCTTAGAAGTAACGTTTTTGTA
TCATTCTTGAAATTTTCGGGAATTTAAGAACCAAAAGAATCATGTCTTGGATCAAGAACC
TCGTAAGGATCTCTCAGACAACTTCTTCTGTCGGAAACTTGTTCAGAAACCACGAATCCT
ACACTCTCTCGTCTCGTTTCTGCACGGCTCCGCAACATAAGCAGCAACAACAGAGCGAGA
TGGTTCAAGCAACGGAGGTCGTTAATGGGTTTGAGAAACAACAACAACAACATTGTTACG
AAGGTTTGGCTCCGACCAAAGAAGGAGAGAAGCCGAGACTGCTGGTTCTAGGGTCGGGTT
GGGCAGGTTGTCGTCTTATGAAAGGAATCGATACGAGCATTTACGACGTCGTTTGCGTCT
CTCCTAGGAACCACATGGTCTTCACTCCTCTCTTGGCTTCTACTTGCGTCGGTACGCTTG
AGTTTAGGTCCGTTGCAGAACCAATTTCTCGTATCCAACCGGCTATTTCACGTGAACCTG
GTTCTTATTACTTCCTCGCTAATTGCTCAAGACTTGATTCTCAAAACCATGAGGTGCATT
GTGAGACAGTAACTGATGCGTTAAGCACAGTGAAGCCGTGGAAGTTCAAGATCGCTTATG
ACAAACTTGTACTAGCTTGCGGTGCAGAGGCATCCACATTTGGGATTAACGGCGTCTTAG
AAAACGCCATCTTCCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G238TF U 1
AF RR4GA92TF U 113
BS 1 270 RR4G238TF
BS 271 271 RR4GA92TF
BS 272 629 RR4G238TF
BS 630 630 RR4GA92TF
BS 631 749 RR4G238TF
BS 750 750 RR4GA92TF
BS 751 766 RR4G238TF
BS 767 767 RR4GA92TF
BS 768 783 RR4G238TF
BS 784 799 RR4GA92TF

RD RR4G238TF 783 0 0
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AGAGTGTTCGTTTCTCCAACAACTTTGGTCTATTGCTTGCTTAGAAGTAACGTTTTTGTA
TCATTCTTGAAATTTTCGGGAATTTAAGAACCAAAAGAATCATGTCTTGGATCAAGAACC
TCGTAAGGATCTCTCAGACAACTTCTTCTGTCGGAAACTTGTTCAGAAACCACGAATCCT
ACACTCTCTCGTCTCGTTTCTGCACGGCTCTGCAACATAAGCAGCAACAACAGAGCGAGA
TGGTTCAAGCAACGGAGGTCGTTAATGGGTTTGAGAAACAACAACAACAACATTGTTACG
AAGGTTTGGCTCCGACCAAAGAAGGAGAGAAGCCGAGACTGCTGGTTCTAGGGTCGGGTT
GGGCAGGTTGTCGTCTTATGAAAGGAATCGATACGAGCATTTACGACGTCGTTTGCGTCT
CTCCTAGGAACCACATGGTCTTCACTCCTCTCTTGGCTTCTACTTGCGTCGGTACGCTTG
AGTTTAGGTCCGTTGCAGAACCAATTTCTCGTATCCAACCGGCTATTTCACGTGAACCTG
GTTCTTATTACTTCCTCGCTAATTGCTCAGGACTTGATTCTCAAAACCATGAGGTGCATT
GTGAGACAGTAACTGATGCGTTAAGCACAGTGAAGCCGTGGAAGTTCAAGATCGCTTATG
ACAAACTTGTACTAGCTTGCGGTGCAGAG*CATCCACATTTGGGAT*AACGGCGTCTTAG
AAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4GA92TF 687 0 0
TTTTTGTATCATTCTTGAAATTTTCGGGAATTTAAGAACCAAAAGAATCATGTCTTGGAT
CAAGAACCTCGTAAGGATCTCTCAGACAACTTCTTCTGTCGGAAACTTGTTCAGAAACGA
CGAATCCTACACTCTCTCGTCTCGTTTCTGCACGGCTCCGCAACATAAGCAGCAACAACA
GAGCGAGATGGTTCAAGCAACGGAGGTCGTTAATGGGTTTGAGAAACAACAACAACAACA
TTGTTACGAAGGTTTGGCTCCGACCAAAGAAGGAGAGAAGCCGAGACTGCTGGTTCTAGG
GTCGGGTTGGGCAGGTTGTCGTCTTATGAAAGGAATCGATACGAGCATTTACGACGTCGT
TTGCGTCTCTCCTAGGAACCACATGGTCTTCACTCCTCTCTTGGCTTCTACTTGCGTCGG
TACGCTTGAGTTTAGGTCCGTTGCAGAACCAATTTCTCGTATCCTACCGGCTATTTCACG
TGAACCTGGTTCTTATTACTTCCTCGCTAATTGCTCAAGACTTGATTCTCAAAACCATGA
GGTGCATTGTGAGACAGTAACTGATGCGTTAAGCACAGTGAAGCCGTGGAAGTTCAAGAT
CGCTTATGACAAACTTGTACTAGCTTGCGGTGCAGAGGCATCCACATTTGGGATTAACGG
CGTCTTAGAAAACGCCATCTTCCTCCG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL8640Contig1 1079 2 4 U
GCAAAGCCAAAGAGATACGAGACGAGAGGAGGATCCTGATGCTGCATTCTCTCAACTCCC
TCCGGTGGGAGTCGGTCATCCTCGAGCACCCTTCCACCTTCGAGACGATGGTCATGGAGG
ATCAGCTCAAGCGTGACGTCATAGACGATCTTGATAGGTTCATTAGGAGGAAAGAGTTTT
ACAAGAGGGTGGGGAAAGCTTGGAAGAGGGGTTACTTGCTGTACGGGCCACCGGGTACCG
GGAAGTCTAGTCTTGTCGCGGCCATGGCGTATTACCTCAAGTTTGATGTCTATGATCTTC
AGCTGGCCAGCGTGATGCGTGACTCTAACCATCGACGATGACAACATGGGCATGAGCAAC
GAGATCTACTCTTCTCTCCGGTCTCTGTTCCACCGCTCTTCCTCCACGACTCTCAGGGAC
CTTTGACGTTATCAGGGCTGCTGAATTTCATAGACGGGTTATGGTCAAGCTGTGGAGACG
AGCGGATTATAATATTCACCACGAACCATAAAGATAGGCTTGACCCAGCCTTACTACGTC
CTGGTCGTATGGATATGCACATCTACATGGGACATTGCACTTTCCAAGGATTCAAGACTC
TGGCCTCGAACTATTTGGGCTTGAACGACACAACCACAATGCCGCACCGTCTTTACCCGG
AGATAGAGCGACTGATGGATGGGGATGTAATCACGCCGGCACAAGTGGCAGAGGAGCTGA
TGAAAAGTGAGGATGCTGACATGGCGCTTGAGGGTTTGGTGAGTGTTTTAGAGAAGTTGA
GGTTTAAAGCTGATGATCAATCGAGTCAGGTGATGATGAAGAAGGAGGGTAGATTGGAGA
TGGATGAGATGAGCTTAAAGCGTGATACTGAGGGTTCTCCGAAGAAGAACAGCAAAAGGA
TTAAGAAACTTGTTCTGTTTTGGACCTAAGACAGTGTGTTAGAAACTTTCTATGATCCAG
TATTAGCTCAAATAAGAAAGACTATGAGGAAGTCATAAATAGGACCGAGGAGCCTTACTA
TTGTAAAAGTTAACCAGAAGTTTGGAAATCTCTGATGATATTAATTAAGTGTTTTTTTT


BQ
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AF RR4DN93TF U 1
AF RR4DN93JQ C 352
BS 1 713 RR4DN93TF
BS 714 714 RR4DN93JQ
BS 715 748 RR4DN93TF
BS 749 1079 RR4DN93JQ

RD RR4DN93TF 748 0 0
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TCCGGTGGGAGTCGGTCATCCTCGAGCACCCTTCCACCTTCGAGACGATGGTCATGGAGG
ATCAGCTCAAGCGTGACGTCATAGACGATCTTGATAGGTTCATTAGGAGGAAAGAGTTTT
ACAAGAGGGTGGGGAAAGCTTGGAAGAGGGGTTACTTGCTGTACGGGCCACCGGGTACCG
GGAAGTCTAGTCTTGTCGCGGCCATGGCGTATTACCTCAAGTTTGATGTCTATGATCTTC
AGCTGGCCAGCGTGATGCGTGACTCTAACCATCGACGATGACAACATGGGCATGAGCAAC
GAGATCTACTCTTCTCTCCGGTCTCTGTTCCACCGCTCTTCCTCCACGACTCTCAGGGAC
CTTTGACGTTATCAGGGCTGCTGAATTTCATAGACGGGTTATGGTCAAGCTGTGGAGACG
AGCGGATTATAATATTCACCACGAACCATAAAGATAGGCTTGACCCAGCCTTACTACGTC
CTGGTCGTATGGATATGCACATCTACATGGGACATTGCACTTTCCAAGGATTCAAGACTC
TGGCCTCGAACTATTTGGGCTTGAACGACACAACCACAATGCCGCACCGTCTTTACCCGG
AGATAGAGCGACTGATGGATGGGGATGTAATCACGCCGGCACAAGTGGCAGAG*AGCTGA
TGAAAAGTGAGGATGCTGACATGGCGCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4DN93JQ 728 0 0
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CTCAGGGACCTTTGACGTTATCAGGGCTGCTGAATTTCATAGACGGGTTATGGTCAAGCT
GTGGAGACGAGCGGATTATAATATTCACCACGAACCATAAAGATAGGCTTGACCCAGCCT
TACTACGTCCTGGTCGTATGGATATGCACATCTACATGGGACATTGCACTTTCCAAGGAT
TCAAGACTCTGGCCTCGAACTATTTGGGCTTGAACGACACAACCACAATGCCGCACCGTC
TTTACCCGGAGATAGAGCGACTGATGGATGGGGATGTAATCACGCCGGCACAAGTGGCAG
AGGAGCTGATGAAAAGTGAGGATGCTGACATGGCGCTTGAGGGTTTGGTGAGTGTTTTAG
AGAAGTTGAGGTTTAAAGCTGATGATCAATCGAGTCAGGTGATGATGAAGAAGGAGGGTA
GATTGGAGATGGATGAGATGAGCTTAAAGCGTGATACTGAGGGTTCTCCGAAGAAGAACA
GCAAAAGGATTAAGAAACTTGTTCTGTTTTGGACCTAAGACAGTGTGTTAGAAACTTTCT
ATGATCCAGTATTAGCTCAAATAAGAAAGACTATGAGGAAGTCATAAATAGGACCGAGGA
GCCTTACTATTGTAAAAGTTAACCAGAAGTTTGGAAATCTCTGATGATATTAATTAAGTG
TTTTTTTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL8641Contig1 1114 2 2 U
CAGGTCTGTTGTGTCAATAGGCGGTTGGTTGCAGGAGTATTGTTCTTCTCTGTTTTGATG
TTTTATTTTGTACTTTGTTTTCTCTCAGGGTTTTTGGCGTGGGAATGTGCCAGCTTTGCT
TATGGTCATGCCATATACTTCAATTCAGTTTACAGTTCTACATAAGTTGAAATCTTTTGC
ATCTGGCTCTACTAAAACAGAGGATCATATACATTTGAGTCCTTATCTATCCTTTATCAG
TGGAGCTTTAGCAGGATGTGCTGCTACACTAGGATCTTATCCTTTTGATCTTCTTAGGAC
AATACTAGCCTCACAAGGGGAGCCTAAGGTGTATCCAACAATGAGGTCTGCATTTGTCGA
TATTTTCCAATCTCGAGGTGTAAGAGGATTGTATAATGGACTAACACCAACACTTGTTGA
GATTGTGCCTTACGCTGGCCTGCAGTTTGGCACTTATGATATGTTTAAGCGTTGGATGAT
GGATTGGAACAGATGCATGTTATCCTCCAAAGAACCGATAAATGTGGACACAAACGTCTC
TAGCTTCCAGCTTTTTGTTTGTGGGCTTGGGGCAGGAACTAGCGCCAAACTCGTCTGCCA
TCCTCTTGATGTGGTTAAAAAGCGTTTTCAGATTGAAGGTTTACAGAGACATCCGAGATA
TGGTGCTCGGCTGGAGCAACGAGCTTACAGAAACATGTTAGACGGTCTTAAACAGATTCT
GATGTCAGAAGGGTGGCACGGTCTGTACAAAGGCATTGTGCCATCGACTGTGAAAGCTGC
TCCTGCTGGTGCCGTTACCTTTGTTGCATATGAGTTTACCTCCGACTGGTTGGAATCAAT
TTCTTGGTAGAGATTTTACACTCTTTTTCACATATTTTACATCTTTCTTTCTCTAGTGTT
TCCTATAGGCTTGGCCCCATTCACGGGTGTGTTAAACACATATCATATGATCATTGGTTA
TTGTGGGAATTATATGTCGGCAGTTTTGAAAGTTTCTAGGAAGCGTAGCCGATACGTAGA
GTGAGATTGTCTAACTGTGTAGCGAATCCTAGCTATCATATTCCAGAACATGTTTCTCAA
AATAAGGAAAAATACTATGGATCTTTTTCTGGGG


BQ
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AF RR4AZ62TF U 1
AF RR4AZ62JQ C 328
BS 1 749 RR4AZ62TF
BS 750 1114 RR4AZ62JQ

RD RR4AZ62TF 749 0 0
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TTTTATTTTGTACTTTGTTTTCTCTCAGGGTTTTTGGCGTGGGAATGTGCCAGCTTTGCT
TATGGTCATGCCATATACTTCAATTCAGTTTACAGTTCTACATAAGTTGAAATCTTTTGC
ATCTGGCTCTACTAAAACAGAGGATCATATACATTTGAGTCCTTATCTATCCTTTATCAG
TGGAGCTTTAGCAGGATGTGCTGCTACACTAGGATCTTATCCTTTTGATCTTCTTAGGAC
AATACTAGCCTCACAAGGGGAGCCTAAGGTGTATCCAACAATGAGGTCTGCATTTGTCGA
TATTTTCCAATCTCGAGGTGTAAGAGGATTGTATAATGGACTAACACCAACACTTGTTGA
GATTGTGCCTTACGCTGGCCTGCAGTTTGGCACTTATGATATGTTTAAGCGTTGGATGAT
GGATTGGAACAGATGCATGTTATCCTCCAAAGAACCGATAAATGTGGACACAAACGTCTC
TAGCTTCCAGCTTTTTGTTTGTGGGCTTGGGGCAGGAACTAGCGCCAAACTCGTCTGCCA
TCCTCTTGATGTGGTTAAAAAGCGTTTTCAGATTGAAGGTTTACAGAGACATCCGAGATA
TGGTGCTCGGCTGGAGCAACGAGCTTACAGAAACATGTTAGACGGTCTTAAACAGATTCT
GATGTCAGAAGGGTGGCACGGTCTGTACA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR4AZ62JQ 787 0 0
GGTGTATCCAACAATGAGGTCTGCATTTGTCGATATTTTCCAATCTCGAGGTGTAAGAGG
ATTGTATAATGGACTAACACCAACACTTGTTGAGATTGTGCCTTACGCTGGCCTGCAGTT
TGGCACTTATGATATGTTTAAGCGTTGGATGATGGATTGGAACAGATGCATGTTATCCTC
CAAAGAACCGATAAATGTGGACACAAACGTCTCTAGCTTCCAGCTTTTTGTTTGTGGGCT
TGGGGCAGGAACTAGCGCCAAACTCGTCTGCCATCCTCTTGATGTGGTTAAAAAGCGTTT
TCAGATTGAAGGTTTACAGAGACATCCGAGATATGGTGCTCGGCTGGAGCAACGAGCTTA
CAGAAACATGTTAGACGGTCTTAAACAGATTCTGATGTCAGAAGGGTGGCACGGTCTGTA
CAAAGGCATTGTGCCATCGACTGTGAAAGCTGCTCCTGCTGGTGCCGTTACCTTTGTTGC
ATATGAGTTTACCTCCGACTGGTTGGAATCAATTTCTTGGTAGAGATTTTACACTCTTTT
TCACATATTTTACATCTTTCTTTCTCTAGTGTTTCCTATAGGCTTGGCCCCATTCACGGG
TGTGTTAAACACATATCATATGATCATTGGTTATTGTGGGAATTATATGTCGGCAGTTTT
GAAAGTTTCTAGGAAGCGTAGCCGATACGTAGAGTGAGATTGTCTAACTGTGTAGCGAAT
CCTAGCTATCATATTCCAGAACATGTTTCTCAAAATAAGGAAAAATACTATGGATCTTTT
TCTGGGG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL8642Contig1 802 2 4 U
GCAACTCAAGCAAACGGTCAGCGACATAAAGCACGAGGTACAATCTCAGCTTCAGCAGTC
CAGGCAAACCGGTGTAAGAGTCCAGAAGATAGCAAAGAGACTCAAGAAGCTTCACATCAG
CGGTCTAAACAATGCTATAAACTCAGCAACCGTCGTGGCTGTGCTTATCGCCACGGTGGC
TTTCGCAGCCATTTTCACAATACCTGGACAATATGAAGAGGACCGGTCCAAAGGAGAGTT
GCTAGGACAGGCTCATATAGCAAACAGAGCACCGTTTCTGGTCTTCTTCATCTTTGACAG
CTTGGCACTGTTTATATCCTTAGCTGTTGTTGTTGTGCAGACTTCAGTTGTTGTGATTGA
GGAGAAGGCGAAGAAGAAGCTTGTCTTTGTGATCAACAAGCTCATGTGGTGCGCTTGCCT
GTTCATATCAATCGCCTTTGTTTCTCTCTCTTACATTGTTGTGGGCAAAGAGGAGATGTG
GTTGGCCGTGTGTGCAACTGTTATTGGCGGCACCATCATGTTGACAACGATCGGTGCCAT
GTGTTACTGTGTGGTCATGCATAGGATGGAGGAATCTAAGTTAAAAAGCATAAGGAAAGA
GAGAAGCAAGTCTCGGTCTTTCTCCATGTCTCGTATGCCTTCTGATTCAGAGATTCTAAA
TGGTGAATACAACAAGAGAATGTATGCACTATGAACAACCAATTTGGACAGCATGGTCTC
CTCATGTAAGAATAACCAGTATATACTTGTATTTTGTACCCTGTAACCCTTGCTATTCGA
TATTTTTCAGATTTTCTCGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F879TF U 1
AF RR4F879JQ C 304
BS 1 679 RR4F879TF
BS 680 680 RR4F879JQ
BS 681 728 RR4F879TF
BS 729 802 RR4F879JQ

RD RR4F879TF 742 0 0
GCAACTCAAGCAAACGGTCAGCGACATAAAGCACGAGGTACAATCTCAGCTTCAGCAGTC
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CGGTCTAAACAATGCTATAAACTCAGCAACCGTCGTGGCTGTGCTTATCGCCACGGTGGC
TTTCGCAGCCATTTTCACAATACCTGGACAATATGAAGAGGACCGGTCCAAAGGAGAGTT
GCTAGGACAGGCTCATATAGCAAACAGAGCACCGTTTCTGGTCTTCTTCATCTTTGACAG
CTTGGCACTGTTTATATCCTTAGCTGTTGTTGTTGTGCAGACTTCAGTTGTTGTGATTGA
GGAGAAGGCGAAGAAGAAGCTTGTCTTTGTGATCAACAAGCTCATGTGGTGCGCTTGCCT
GTTCATATCAATCGCCTTTGTTTCTCTCTCTTACATTGTTGTGGGCAAAGAGGAGATGTG
GTTGGCCGTGTGTGCAACTGTTATTGGCGGCACCATCATGTTGACAACGATCGGTGCCAT
GTGTTACTGTGTGGTCATGCATAGGATGGAGGAATCTAAGTTAAAAAGCATAAGGAAAGA
GAGAAGCAAGTCTCGGTCTTTCTCCATGTCTCGTATGCCTTCTGATTCAGAGATTCTAAA
TGGTGAATACAACAAGAGA*TGTATGCACTATGAACAACCAATTTGGACAGCATGGTCTC
CTCATGTA
GATACCAGTATATA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR4F879JQ 499 0 0
GGCACTGTTTATATCCTTAGCTGTTGTTGTTGTGCAGACTTCAGTTGTTGTGATTGAGGA
GAAGGCGAAGAAGAAGCTTGTTTTTGTGATCAACAAGCTCATGTGGTGCGCTTGCCTGTT
CATATCAATCGCCTTTGTTTTTCTTTTTTACATTGTTGTGGGCAAAGAGGAGATGTGGTT
GGCCGTGTGTGCAACTGTTATTGGCGGCACCATCATGTTGACAACGATCGGTGCCATGTG
TTACTGTGTGGTCATGCATAGGATGGAGGAATTTAAGTTAAAAAGCATAAGGAAAGAGAG
AAGCAAGTCTCGGTCTTTCTCCATGTTTCGTATGCCTTTTGATTCAGAGATTTTAAATGG
TGAATACAACAAGAGAATGTATGCACTATGAACAACCAATTTGGACAGCATGGTCTCCTC
ATGTAAGAATAACCAGTATATACTTGTATTTTGTACCCTGTAACCCTTGCTATTCGATAT
TTTTCAGATTTTCTCGAGT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL8643Contig1 1002 2 6 U
GGGTTGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCATCACCAAAGCCAAGTCTCC
TCCTCAAGATCTGATCGTACACGTTCGTTGACTTCGTCTTCTCTAGAGAAATGAGTCAGC
AGAAAGGTTTGATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTC
CTTACTCTGGAAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCAGAAGCTTCCCAATAACA
GCAGCAAGTATACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTCGTCGAAAACAACG
GTTTTGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCC
TTGAACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGAGC
CACACCCTCTTGCAGATGATGATGACGAGGATGATGATTTGTTTGGGAATCGGTTTAGCA
TCACTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTA
TGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTCGAAGTTGAAGGCTCAGATAAATGATGTCA
AGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAGGTTCTGGACAGGGGAGAGGAGATAGAACTTC
TGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCAGATAGCTTCCAGAGGCAAGGAAGGC
AACTTAGAAGGAAGATGTGGATACAGAGCCTGCAGATGAAGCTGATGGTGGGAGGTGCTG
TTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGGGTTGTTGCTTGTGGTGGTTTTAAATGCTCGTCAT
GATTCTCTGTATCTGTTTGATCGCCACCACCTTGTTTTACCACGTAAAACGCATGCTCAT
GTTTGTACATGTTATGATCAGTAACCATCATTCCCAGAAGTTTATTTATTATGCTTATAT
ATAGACAAATAAAAATCAAGTTTTGGTGTTTGCTTGTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H315TF U 1
AF RR4H315JQ C 292
BS 1 629 RR4H315TF
BS 630 630 RR4H315JQ
BS 631 671 RR4H315TF
BS 672 672 RR4H315JQ
BS 673 708 RR4H315TF
BS 709 1002 RR4H315JQ

RD RR4H315TF 708 0 0
GGGTTGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCATCACCAAAGCCAAGTCTCC
TCCTCAAGATCTGATCGTACACGTTCGTTGACTTCGTCTTCTCTAGAGAAATGAGTCAGC
AGAAAGGTTTGATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTC
CTTACTCTGGAAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCAGAAGCTTCCCAATAACA
GCAGCAAGTATACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTCGTCGAAAACAACG
GTTTTGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCC
TTGAACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGAGC
CACACCCTCTTGCAGATGATGATGACGAGGATGATGATTTGTTTGGGAATCGGTTTAGCA
TCACTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTA
TGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTCGAAGTTGAAGGCTCAGATAAATGATGTCA
AGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAG*TTCTGGACAGGGGAGAGGAGATAGAACTTC
TGGTTGACAAA*CGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCAGATAGCTTCCAGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR4H315JQ 711 0 0
AAAACAACGGTTTTGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTT
TCGTGTTCCTTGAACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGA
ACGATGAGCCACACCCTCTTGCAGATGATGATGACGAGGATGATGATTTGTTTGGGAATC
GGTTTAGCATCACTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGC
AGTATTGTATGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTCGAAGTTGAAGGCTCAGATAA
ATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAGGTTCTGGACAGGGGAGAGGAGA
TAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCAGATAGCTTCCAGAGGC
AAGGAAGGCAACTTAGAAGGAAGATGTGGATACAGAGCCTGCAGATGAAGCTGATGGTGG
GAGGTGCTGTTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGGGTTGTTGCTTGTGGTGGTTTTAAAT
GCTCGTCATGATTCTCTGTATCTGTTTGATCGCCACCACCTTGTTTTACCACGTAAAACG
CATGCTCATGTTTGTACATGTTATGATCAGTAACCATCATTCCCAGAAGTTTATTTATTA
TGCTTATATATAGACAAATAAAAATCAAGTTTTGGTGTTTGCTTGTTTTTT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL8644Contig1 640 2 3 U
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACGA
CGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTATGGATGAT
AGCCAATAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGAC
AAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGAT
GAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTA
CGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTT
CACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAAGGAAAGAATATGTTTATAATTTCGTG
AACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTCTCCCTTCTAAAGAAACAT
GATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTG
GTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGCTCGTCTTTATTGACCATCTTTGCCGT
ATCCGTTTTACGAAAAATTGTATCGAGTCAGTTCGATCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BY66JQ C 1
AF RR4BY66TF U 1
BS 1 616 RR4BY66TF
BS 617 617 RR4BY66JQ
BS 618 640 RR4BY66TF

RD RR4BY66JQ 640 0 0
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GAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTA
CGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTT
CACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAAGGAAAGAATATGTTTATAATTTCGTG
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GATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTG
GTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGCTCGTCTTTATTGACCATCTTTGCCGT
ATCCGTTTTACGAAAAATTGTATCGAGTCAGTTCGATCAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR4BY66TF 640 0 0
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACGA
CGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTATGGATGAT
AGCCAATAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGAC
AAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGAT
GAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGCTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTA
CGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTT
CACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAAGGAAAGAATATGTTTATAATTTCGTG
AACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTCTCCCTTCTAAAGAAACAT
GATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATGAAGAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTG
GTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGCTCGTCTTTATTGACCATCTTTGCCGT
ATCCGTTTTACGAAAA*TTGTATCGAGTCAGTTCGATCAT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL8645Contig1 1092 2 10 U
AAACTCAAAATGGGAAATGAATCCAAAAGCCAGCCTAGACAGATCCTAAATCTCGGCGAC
GGGAGCTGTCTGAAGAGATTCGAAAGCTAAAGTATCTACCTAGGTCCAAGATCGGAGCTT
CGGAAAATTCAGAATCGTCTCCAATTCTTATCAAACCTTTCACAGCTTCAGTTAATCTCC
CAATGGAACCTTCTCCACCATCACCCATCATATGGCCAAACGAAGGGACTCTCACCAACG
AGTGGGTCCACGGCCTCATGTCATCTTTCGAGTGGTCTTCATGGAACCTCCCTCCTTCTC
AGCTACCTTCGGTGCTGCCCGTCAGCGTCTTCGACTCACTCATCCTCACCGCTTCAAAAA
TCCTCCACAAAGAACGTAACATCGTCCACGTCGATGATCTCGACTCTGATTCCAAAGTTG
TTGTCGTTGGTGACGTTCACGGTCAGCTCCATGACCTTCTCTTCCTGTTGAAAGACGCTG
GCTTTCCGTCTCGAAACCAGTTCTACGTCTTCAACGGTGACTATGTTGATCGTGGTGCTT
GGGGTCTCGAGACTTTCCTCGTCCTCTTGTCCTGGAAGGTTCTAATGCCTGATAGAGTCT
TCCTTCTCCGCGGCAACCACGAATCCAAATACTGCACATCCATGTACGGTTTCGAGAAAG
AAGTGCTCACAAAATACGGAGACAAGGGAAAGCATGTGTACCGCAAATGCTTAGGCTGCT
TCGAAGCTCTTCCTCTGGCTTCCCTGATCTCAGGACGTGTTTACACAGCACACGGAGGGC
TTTTCCGCAGCCCGGTGTTGCCTAAGAGAACGAGGGGCAAAAAGAACCGCAGGGTGCGTC
TTCTTGAGCCTGAGACGAGCTCGTTGAAACTCGGTACTTTGGAAGATTTGATGCAAGCGA
GAAGATCGGTTCTTGATCCTCCTTGGGAGGGTTCTAACTTTATCCCCGGAGATGTTCTGT
GGTCTGATCCTTCCATGAGTCCTGGACTTGCGCCGAATGAACAAAGAGGCATTGGTCTTC
TTTGGGGTCCTGATTGTACAGAGGAGTTTTTGAAGAAGTATGAACTAAAGTTAATCATAA
GATCACATGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H481TF U 1
AF RR4GW03TF U 322
BS 1 551 RR4H481TF
BS 552 552 RR4GW03TF
BS 553 648 RR4H481TF
BS 649 649 RR4GW03TF
BS 650 673 RR4H481TF
BS 674 674 RR4GW03TF
BS 675 714 RR4H481TF
BS 715 715 RR4GW03TF
BS 716 743 RR4H481TF
BS 744 1092 RR4GW03TF

RD RR4H481TF 745 0 0
AAACTCAAAATGGGAAATGAATCCAAAAGCCAGCCTAGACAGATCCTAAATCTCGGCGAC
GGGAGCTGTCTGAAGAGATTCGAAAGCTAAAGTATCTACCTAGGTCCAAGATCGGAGCTT
CGGAAAATTCAGAATCGTCTCCAATTCTTATCAAACCTTTCACAGCTTCAGTTAATCTCC
CAATGGAACCTTCTCCACCATCACCCATCATATGGCCAAACGAAGGGACTCTCACCAACG
AGTGGGTCCACGGCCTCATGTCATCTTTCGAGTGGTCTTCATGGAACCTCCCTCCTTCTC
AGCTACCTTCGGTGCTGCCCGTCAGCGTCTTCGACTCACTCATCCTCACCGCTTCAAAAA
TCCTCCACAAAGAACGTAACATCGTCCACGTCGATGATCTCGACTCTGATTCCAAAGTTG
TTGTCGTTGGTGACGTTCACGGTCAGCTCCATGACCTTCTCTTCCTGTTGAAAGACGCTG
GCTTTCCGTCTCGAAACCAGTTCTACGTCTTCAACGGTGACTATGTTGATCGTGGTGCTT
GGGGTCTCGAGGCTTTCCTCGTCCTCTTGTCCTGGAAGGTTCTAATGCCTGATAGAGTCT
TCCTTCTCCGCGGCAACCACGAATCCAAATACTGCACATCCATGTACG*TTTCGAGAAAG
AAGTGCTCACAAA*TACGGAGACAAGGGAAAGCATGTGTACCGCAAATGCTTAG*CTGCT
TCGAAGCTCTTCCTCTGGCTTCC
TG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4GW03TF 771 0 0
G
CAGCGTCTTCGACTCACTCATCCTCACCGCTTCAAAAATCCTCCACAAAGAACGTAACAT
CGTCCACGTCGATGATCTCGACTCTGATTCCAAAGTTGTTGTCGTTGGTGACGTTCACGG
TCAGCTCCATGACCTTCTCTTCCTGTTGAAAGACGCTGGCTTTCCGTCTCGAAACCAGTT
CTACGTCTTCGACGGTGACTATGTTGATCGTGGTGCTTGGGGTCTCGAGACTTTCCTCGT
CCTCTTGTCCTGGAAGGTTCTGATGCCTGATAGAGTCTTCCTTCTCCGCGGCAACCACGA
ATCCAAATACTGCACATCCATGTACGGTTTCGAGAAAGAAGTGCTCACAAAATACGGAGA
CAAGGGAAAGCATGTGTACCGCAAATGCTTAGGCTGCTTCGAAGCTTTTCCTCTGGCTTC
CCTGATCTCAGGACGTGTTTACACAGCACACGGAGGGCTTTTCCGCAGCCCGGTGTTGCC
TAAGAGAACGAGGGGCAAAAAGAACCGCAGGGTGCGTCTTCTTGAGCCTGAGACGAGCTC
GTTGAAACTCGGTACTTTGGAAGATTTGATGCAAGCGAGAAGATCGGTTCTTGATCCTCC
TTGGGAGGGTTCTAACTTTATCCCCGGAGATGTTCTGTGGTCTGATCCTTCCATGAGTCC
TGGACTTGCGCCGAATGAACAAAGAGGCATTGGTCTTCTTTGGGGTCCTGATTGTACAGA
GGAGTTTTTGAAGAAGTATGAACTAAAGTTAATCATAAGATCACATGAAG

QA 2 771 2 771
DS 



AS 1 2

CO CL8646Contig1 1004 2 4 U
GGAGAGTCCTGCATTAGCATTTATTGACTGGAGCCAATTTAAAGCTTTTATATTTCTCGT
GAACTTGAGCGGAGTTAAAAGCTCCTTAAACGGTTACTTACTTCTCTGATTCTTTATTTT
TATTGGTGTCCGACTCAAGATGAGTCAACTCGGTGATTTGCTCAGAGAATCGGCGGACGA
AACGGAGAGTGGGAGGACGATGATGCTGAGTTTACTCGAGGAAGCTCGAACCGACGGTGA
AGATCGGCGACGAGCAAGTGGAGTACGCTGAAACAACGGCTGAGATTCGACTGGGTTGGC
TGTTGCGGTGGACCCACCTTGCTGCGTCTCAGAGGATCAGAAGCGCCAATCGCCGAGGAA
GACGAAGATGACGAGGAGGAGGAGGAGGAAAACTCGGGTCAAAACCGGGTCGTTGACTTG
TCGAATTCGGTTCCGGATCCGGGTTTAGTTGTGGAGACGGATTGTTTAACACGTGGCACA
AGGAATCTCGCGGAGGCTCTTGCAGAGGAGAGACTAGCGCGGGGCGAGCACGTGACGGAG
GCTTCGGTTGCTAAGGTACCGTTGATGAAACTGCTGGCGGAAACGGAAGGTTGCGATGTG
ACCACGTGGACAGGTGCTGATCCTTTGTGTTGCGTGTGTATGGGAAGGGAGAAAGACGCG
GCGTTTATCCCATGTGGGCATACGTATTGTAGAGTGTGTTCAAGAGAGATTTGGATGAAC
CGTGGATCGTGTCCTCTTTGTAACCGTTCCATCGTTGACGTTCTTGATCTTTACTGAAAA
TTTACATTCATGGATTTGTTATGTTCCGATCGACGGTAAAGTTCACGTTCTGTGTGCATA
TTTCGATTGTAGTTTCAAAAGAAGGATGATGTATTGGTGGGTCATAAACATTGTGGTAAG
AAAATAATTTGTTTAGACAAATGGAATATTTATGTTACGTTGTGAAGAATAATAGTTCAC
TTCACTCGAGTGTAAAGTAAATGATTATCGATCTTTTTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EQ45TF U 1
AF RR4EQ45JQ C 324
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BS 590 590 RR4EQ45JQ
BS 591 719 RR4EQ45TF
BS 720 1004 RR4EQ45JQ

RD RR4EQ45TF 719 0 0
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QA 1 719 1 719
DS 

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GATGAAACTGCTGGCGGAAACGGAAGGTTGCGATGTGACCACGTGGACAGGTGCTGATCC
TTTGTGTTGCGTGTGTATGGGAAGGGAGAAAGACGCGGCGTTTATCCCATGTGGGCATAC
GTATTGTAGAGTGTGTTCAAGAGAGATTTGGATGAACCGTGGATCGTGTCCTCTTTGTAA
CCGTTCCATCGTTGACGTTCTTGATCTTTACTGAAAATTTACATTCATGGATTTGTTATG
TTCCGATCGACGGTAAAGTTCACGTTCTGTGTGCATATTTCGATTGTAGTTTCAAAAGAA
GGATGATGTATTGGTGGGTCATAAACATTGTGGTAAGAAAATAATTTGTTTAGACAAATG
GAATATTTATGTTACGTTGTGAAGAATAATAGTTCACTTCACTCGAGTGTAAAGTAAATG
ATTATCGATCTTTTTTTTTAC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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TTCATCGTCCTCGTCATCTTCATCTTCATCATCATCATCTTCGTCATCCTCACCTGCCTT
TCCCTTCTCTATCTTCTCTTCCTCTTCACTAGCTTCATCTTCATCATTCACTTCAAATAA
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TTCGTATTCAGCTTTCCTCTTTGCAGCTTTCTCTTCATATGGAGCTTTTTCAGCCTGAGA
CATTGACTTCCATTTCTGTCCTCCTGCTTTCCCAACAGCAAAAACAGCCTTCACATCTGG
ATTCTCTTTCTTGAACGTTTGCCTAAAATCTTCTAAGAAGACAAAGAAAGCACTAGGAGC
TCTCTTGGGTTTGTTGGGGTCCTTCTTGGCTTTCTTCTCTCTACGAGTCTTCCTCTTGCT
AGGCTTCTCAGCCGGTGCCTTCCTCTTCCCCACCTTTCTGTCATCAACTGGCTTCAAGGC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CE18JQ U 19
AF RR4CE18TF C 1
BS 1 18 RR4CE18TF
BS 19 426 RR4CE18JQ
BS 427 687 RR4CE18TF

RD RR4CE18JQ 408 0 0
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TTCATCTTCATCATCATCATCTTCGTCATCCTCACCTGCCTTTCCCTTCTCTATCTTCTC
TTCCTCTTCACTAGCTTCATCTTCATCATTCACTTCAAATAAAGAATTTTCAGATTCATC
ACTCCCTTCCTCCATGCTTTTGTTGTATGCATCCATAAGCTTTTCGTATTCAGCTTTCCT
CTTTGCAGCTTTCTCTTCATATGGAGCTTTTTCAGCCTGAGACATTGACTTCCATTTCTG
TCCTCCTGCTTTCCCAACAGCAAAAACAGCCTTCACATCTGGATTCTCTTTCTTGAACGT
TTGCCTAAAATCTTCTAAGAAGACAAAGAAAGCACTAGGAGCTCTCTT

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR4CE18TF 687 0 0
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TTCATCGTCCTCGTCATCTTCATCTTCATCATCATCATCTTCGTCATCCTCACCTGCCTT
TCCCTTCTCTATCTTCTCTTCCTCTTCACTAGCTTCATCTTCATCATTCACTTCAGATAA
AGAATTTTCAGATTCATCACTCCCTTCCTCCATGCTTTTGTTGTATGCATCCATAAGCTT
TTCGTATTCAGCTTTCCTCTTTGCAGCTTTCTCTTCATATGGAGCTTTTTCAGCCTGAGA
CATTGACTTCCATTTCTGTCCTCCTGCTTTCCCAACAGCAGAGACAGCCTTCACATCTGG
ATTCTCTTTCTTGAACGTTTGCCTAAAATCTTCTAAGAAGACAAAGAAAGCACTAGGAGC
TCTCTTGGGTTTGTTGGGGTCCTTCTTGGCTTTCTTCTCTCTACGAGTCTTCCTCTTGCT
AGGCTTCTCAGCCGGTGCCTTCCTCTTCCCCACCTTTCTGTCATCAACTGGCTTCAAGGC
TTCCTTAGTGGTCTTAGCTTTACCTTTTCCCTTAGCTGTCTTCATCGCACAAGGTAACTT
TGAGACGAATGGAGGATCTGTTCGTTTGAGAGAAACCTAGCGGAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGGATCAGAAGGTAAAGACGCTCCCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL8648Contig1 938 2 2 U
TGGGGGTTTGATGGGTAGAGATGTGTCCGGTTTGGTTTTGAAAGGCTGTGTTGGTTTGGA
GATGTGGGAGTTGGTGGAGACTTTGGTTTCAAACTCCTTGGTTGATCATTCTTTGAACGG
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ACAAGCTTCGGATCTTGGAGCGAGCGAGCTGCTTTCAATCTTGAAGTATTTTCTCTGTTC
TTCTAAGGAAGCGGTTAGCACTATGGTTAAAGTGAGAGAAGAATGGGACAGTGAGGCTTT
GTCGGCTATTGAGAAACTTAGCAACAAAGAGGTGTCAAAGAAGTCTAGAGTTGTGGCTGA
AGAGGCTTCGGTCTTGCTGATGGTTGCACACGACGGGTTTTCACCTTCCGAGCTTTGCCT
TCACTACTTGTTAGCTTCGTCTGGTGTTGATGAAGTCATGTTTGCTTCTGCGGTCAGTAA
GCTGAACGGTAATGAGATGAGAAGCTTCATTCGGTACCTATCTAAGTGGATGAAGAAGTA
CGAGAGGTTTCCTCAAGCTGGTCCGTGTCCTAAAGCCGCCTCCATGCTCGGTTTGAAGCT
GTGCGATTGGGTTCCTAAGCTCGAGGACGTGACCAAGTGTTTGGGGCTTATCATCGATGA
GAACTTCTCTACTCTGGCTCTGCACTCGGATTTGCATGAAGAGCTGAAGGCTATTGAGAG
AGTAGCAGATGGTTTAGCTTCGTAATCAAAGCTTTGCGGTTTTGTGGCTAATGTTGCTGA
AAGATTGAAACTTGGAGCTGCTGATAACTAGATGTTTGCAGTTAAGATGTTGTTTGGTGC
AACCTTATTAAACTTCATTTTGAATGTTTTCTTGCAGTGTCTTTTGTATTTTCTAGTTTC
AGTTAAAACTATTTTTATAAAATATAATTTTGGTCGGC


BQ
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AF RR4EY35TF U 1
AF RR4EY35JQ C 166
BS 1 417 RR4EY35TF
BS 418 938 RR4EY35JQ

RD RR4EY35TF 417 0 0
TGGGGGTTTGATGGGTAGAGATGTGTCCGGTTTGGTTTTGAAAGGCTGTGTTGGTTTGGA
GATGTGGGAGTTGGTGGAGACTTTGGTTTCAAACTCCTTGGTTGATCATTCTTTGAACGG
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TTCTAAGGAAGCGGTTAGCACTATGGTTAAAGTGAGAGAAGAATGGGACAGTGAGGCTTT
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AGAGGCTTCGGTCTTGCTGATGGTTGCACACGACGGGTTTTCACCTTCCGAGCTTTG

QA 1 417 1 417
DS 

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GTATTTTCTCTGTTCTTCTAAGGAAGCGGTTAGCACTATGGTTAAAGTGAGAGAAGAATG
GGACAGTGAGGCTTTGTCGGCTATTGAGAAACTTAGCAACAAAGAGGTGTCAAAGAAGTC
TAGAGTTGTGGCTGAAGAGGCTTCGGTCTTGCTGATGGTTGCACACGACGGGTTTTCACC
TTCCGAGCTTTGCCTTCACTACTTGTTAGCTTCGTCTGGTGTTGATGAAGTCATGTTTGC
TTCTGCGGTCAGTAAGCTGAACGGTAATGAGATGAGAAGCTTCATTCGGTACCTATCTAA
GTGGATGAAGAAGTACGAGAGGTTTCCTCAAGCTGGTCCGTGTCCTAAAGCCGCCTCCAT
GCTCGGTTTGAAGCTGTGCGATTGGGTTCCTAAGCTCGAGGACGTGACCAAGTGTTTGGG
GCTTATCATCGATGAGAACTTCTCTACTCTGGCTCTGCACTCGGATTTGCATGAAGAGCT
GAAGGCTATTGAGAGAGTAGCAGATGGTTTAGCTTCGTAATCAAAGCTTTGCGGTTTTGT
GGCTAATGTTGCTGAAAGATTGAAACTTGGAGCTGCTGATAACTAGATGTTTGCAGTTAA
GATGTTGTTTGGTGCAACCTTATTAAACTTCATTTTGAATGTTTTCTTGCAGTGTCTTTT
GTATTTTCTAGTTTCAGTTAAAACTATTTTTATAAAATATAATTTTGGTCGGC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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GGGTAAGAAACGCAAACTGGAAACCAAAAGAGGCAGAGGCAGGCCTAAGAAAGTAAAACA
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CCGCTTATCAAGAAAGCCTGATGATGAACGGGTCAGTAAGTTCCAGAGAGATGGATGTTC
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GATGGACTCTGAAACCGGATCAACTTTCATCGCTTGCGAAATCTGTGAAAAGTGGTACCA
TGGAGATGCATGTGGGATTGACGAGAAGAACTCAAGTATGGTGATTGGATTCCGGTGCCA
TCTCTGTCGAGAAAAGCCTTCTCCCACCTGTCCACATATGAGATCTACTACATCCCCTGT
CCCATCCTAAGCTGTGAATATTGATCAAGTTAGAAAATCAGAGTAGAGAAGGAGGAAAGT
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TTTAACAGTAATTTCGATTTTTCAGCATGGAGGGGAGTTAGTAACATGTGACTGTATGTA
AAGAATATTGTTGAACCCATTTTCTACCAAAAACGATTGGTAGTGGTGTTTATTAGCTTT
ACCAAATGTAATATGTGCCCTTCTGTCTC


BQ
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AF RR4DR02TF U 1
AF RR4DR02JQ C 237
BS 1 632 RR4DR02TF
BS 633 809 RR4DR02JQ

RD RR4DR02TF 632 0 0
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GGGTAAGAAACGCAAACTGGAAACCAAAAGAGGCAGAGGCAGGCCTAAGAAAGTAAAACA
AGAGATTTCCGTAAGAAGTAAGAGAACAGAAAGGATCTTTAGCTATTGGTTGAATGGACT
CCGCTTATCAAGAAAGCCTGATGATGAACGGGTCAGTAAGTTCCAGAGAGATGGATGTTC
TAAACCCTTGGAGAACTCGGAATCTGATCAAGTTCAACGTCAGTGTCATTTATGCGGCTC
GATGGACTCTGAAACCGGATCAACTTTCATCGCTTGCGAAATCTGTGAAAAGTGGTACCA
TGGAGATGCATGTGGGATTGACGAGAAGAACTCAAGTATGGTGATTGGATTCCGGTGCCA
TCTCTGTCGAGAAAAGCCTTCTCCCACCTGTCCACATATGAGATCTACTACATCCCCTGT
CCCATCCTAAGCTGTGAATATTGATCAAGTTAGAAAATCAGAGTAGAGAAGGAGGAAAGT
GTTTGGTGGCAGTATGAAGTTATGTTTGGCTTGTTACTTGGACGAGTAGGTACTTGAGTG
AAGTGGTCGACTTAGAATTAGATTGAACAAAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4DR02JQ 573 0 0
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GCTCGATGGACTCTGAAACCGGATCAACTTTCATCGCTTGCGAAATCTGTGAAAAGTGGT
ACCATGGAGATGCATGTGGGATTGACGAGAAGAACTCAAGTATGGTGATTGGATTCCGGT
GCCATTTCTGTCGAGAAAAGCCTTCTCCCACCTGTCCACATATGAGATCTACTACATCCC
CTGTCCCATCCTAAGCTGTGAATATTGATCAAGTTAGAAAATCAGAGTAGAGAAGGAGGA
AAGTGTTTGGTGGCAGTATGAAGTTATGTTTGGCTTGTTACTTGGACGAGTAGGTACTTG
AGTGAAGTGGTCGACTTAGAATTAGATTGAACAAAAAAAAAGGGATTCAAGAACCAGAGT
TAATTTTAACAGTAATTTCGATTTTTCAGCATGGAGGGGAGTTAGTAACATGTGACTGTA
TGTAAAGAATATTGTTGAACCCATTTTCTACCAAAAACGATTGGTAGTGGTGTTTATTAG
CTTTACCAAATGTAATATGTGCCCTTCTGTCTC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL8650Contig1 507 2 2 U
GATCCTGGAGAATGTTCGATTAGTATATCTTTTGGAAAGAGATGAAAGTGGTTGGGATGC
TACAACCAACTGGGAGGACATATTATTTCTTGGAGAGCAACAGAGGCTTGGCATGGCACG
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GGAAACTGGGAGCTACGTTCTATCGAACAGACGACAGAGTAAAAACTCACCAAGACACTA
GTCTACTAATAATAGGAATCCCATTTAATTGCAAGGATTGCGTGTTCTTATAGGGATCAC
AATTCTCGATAAAAGTTGTGTTTGCTCATTAAGATGTTTTTTTTATAAAAGGTTGTATCT
CTTCCTTGATAAAAATTGTGTTTGTGC


BQ
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AF RR4BL59JQ C 1
AF RR4BL59TF U 111
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BS 111 507 RR4BL59TF

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TACAACCAACTGGGAGGACATATTATTTCTTGGAGAGCAACAGAGGCTTGGCATGGCACG
TTTATTCTTTCACAGACCGAAGTTTGGAATCCTAGATGAATGCACCAACGCGACGAGTGT
TGATGTTGAGTACAGCTCTACAGGGTTGCGAAAGACATGGGAGTTACTTTCATAACCTCA
TCACAGCGTCCGGCATTGATACCGTTCCACTCATTGGAGCTAAGGCTGATTGATGGAGAA
GGAAACTGGGAGCTACGTTCTATCGAACAGACGACAGAGTAAAAACTCACCAAGACACTA
GTCTACTAATAATAGGAATCCCATTTAATTGCAAGGATTGCGTGTTCTTATAGGGATCAC
AATTCTCGATAAAAGTTGTGTTTGCTCATTAAGATGTTTTTTTTATAAAAGGTTGTATTT
CTTCCTTGATAAAAATTGTGTTTGTGC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR4BL59TF 397 0 0
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CGACGAGTGTTGATGTTGAGTACAGCTCTACAGGGTTGCGAAAGACATGGGAGTTACTTT
CATAACCTCATCACAGCGTCCGGCATTGATACCGTTCCACTCATTGGAGCTAAGGCTGAT
TGATGGAGAAGGAAACTGGGAGCTACGTTCTATCGAACAGACGACAGAGTAAAAACTCAC
CAAGACACTAGTCTACTAATAATAGGAATCCCATTTAATTGCAAGGATTGCGTGTTCTTA
TAGGGATCACAATTCTCGATAAAAGTTGTGTTTGCTCATTAAGATGTTTTTTTTATAAAA
GGTTGTATCTCTTCCTTGATAAAAATTGTGTTTGTGC

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL8651Contig1 1088 2 2 U
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CTCACACGGGAGGTGCACCGACCATACTGAACATGATCATCAACGCTAGCGACTCCGAGA
AAAGGCCGCTTCCAGGGAAGGTGTCTTTTATAACCGGCGCTGCACCACCGCCTCCTCACG
TGATTTACAAGATGGAGGAGTTAGGGTTCTCTGTGTTTCACTCGTATGGGTTGACGGAGA
CTTACGGACCGGGAACGGTATGCGCGTGGAAGCCTGAGTGGGACTCTCTGCCTAGGGAAG
AGCAGGCGAAAATGAAGGCGAGGCAAGGAGTGAATCATGTAGGGATCGAGGAAGTCGCTG
TGAAAGATCCTGTGACCATGAGGACTCTCCCGGCTGATGGGGTGAGTATGGGTGAGGTTG
TCTTCAGGGGGAACACGGTGATGAACGGTTACTTAAAGAACCCTGAGGCGACCAAGGAGT
GTTTTAAAGGAGGTTGGTTTTGGAGTGGGGACTTGGGTGTGAAGCATCCCGATGGGTACG
TAGAGCTGAAAGATAGGTCCAAAGACATTATAATCTCGGGAGGAGAGAACATTAGCTCGA
TCGAAGTCGAGTCCGTTCTGTTTACTCATCCTTGCGTTCTCGAAGCGGCTGTGGTCGCGA
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AGGCCACGGCCGAGGAGATTATAAGCTACTGCAGGGGGAAGCTCCCGCATTACATGGCTC
CGAGGAGTATTGTGTTTGAGGATCTTCCTAAAACATCGACTGGGAAAGTTCAGAAGTTTG
TCCTGAGGAGTAAGGCTCAGGCTATGGGAAGCTTATCGAAGAAAGGAACAAGCAAGCTAT
GAACCGGTAAGTTTTTTTTTTTGTGTGTGTCGTGTTGGTTAAGGTAAACCGCAAACATTG
TACTACCACGGACAAGCCAAGTTGTGTCGTTATGAAATAAAGCATCATGTTGATTAAGCT
TAAACAGGAATGATTATTGTTTTAATATAAACCAAGTTGAAATAAATAAAAACAGGTATG
AGGGTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL48TF U 1
AF RR4DL48JQ C 321
BS 1 713 RR4DL48TF
BS 714 1088 RR4DL48JQ

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CTCACACGGGAGGTGCACCGACCATACTGAACATGATCATCAACGCTAGCGACTCCGAGA
AAAGGCCGCTTCCAGGGAAGGTGTCTTTTATAACCGGCGCTGCACCACCGCCTCCTCACG
TGATTTACAAGATGGAGGAGTTAGGGTTCTCTGTGTTTCACTCGTATGGGTTGACGGAGA
CTTACGGACCGGGAACGGTATGCGCGTGGAAGCCTGAGTGGGACTCTCTGCCTAGGGAAG
AGCAGGCGAAAATGAAGGCGAGGCAAGGAGTGAATCATGTAGGGATCGAGGAAGTCGCTG
TGAAAGATCCTGTGACCATGAGGACTCTCCCGGCTGATGGGGTGAGTATGGGTGAGGTTG
TCTTCAGGGGGAACACGGTGATGAACGGTTACTTAAAGAACCCTGAGGCGACCAAGGAGT
GTTTTAAAGGAGGTTGGTTTTGGAGTGGGGACTTGGGTGTGAAGCATCCCGATGGGTACG
TAGAGCTGAAAGATAGGTCCAAAGACATTATAATCTCGGGAGGAGAGAACATTAGCTCGA
TCGAAGTCGAGTCCGTTCTGTTTACTCATCCTTGCGTTCTCGAAGCGGCTGTGGTCGCGA
GGCCTGATGAGTATTGGGGTGAGACTGCCTGTGCGTTTGTGAAGCTTAAAGAC

QA 1 713 1 713
DS 

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AGGACTCTCCCGGCTGATGGGGTGAGTATGGGTGAGGTTGTCTTCAGGGGGAACACGGTG
ATGAACGGTTACTTAAAGAACCCTGAGGCGACCAAGGAGTGTTTTAAAGGAGGTTGGTTT
TGGAGTGGGGACTTGGGTGTGAAGCATCCCGATGGGTACGTAGAGCTGAAAGATAGGTCC
AAAGACATTATAATCTCGGGAGGAGAGAACATTAGCTCGATCGAAGTCGAGTCCGTTCTG
TTTACTCATCCTTGCGTTCTCGAAGCGGCTGTGGTCGCGAGGCCTGATGAGTATTGGGGT
GAGACTGCCTGTGCGTTTGTGAAGCTTAAAGACGGGTTTAAGGCCACGGCCGAGGAGATT
ATAAGCTACTGCAGGGGGAAGCTCCCGCATTACATGGCTCCGAGGAGTATTGTGTTTGAG
GATCTTCCTAAAACATCGACTGGGAAAGTTCAGAAGTTTGTCCTGAGGAGTAAGGCTCAG
GCTATGGGAAGCTTATCGAAGAAAGGAACAAGCAAGCTATGAACCGGTAAGTTTTTTTTT
TTGTGTGTGTCGTGTTGGTTAAGGTAAACCGCAAACATTGTACTACCACGGACAAGCCAA
GTTGTGTCGTTATGAAATAAAGCATCATGTTGATTAAGCTTAAACAGGAATGATTATTGT
TTTAATATAAACCAAGTTGAAATAAATAAAAACAGGTATGAGGGTTGT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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GACAAATGGGTTGGCAAGTTATTTGCTATGAAGGTCATACAGATGAACATACAAGAAGAA
ATCCGCAAGCAAATTGTCCAGGAGCTCAAAATAAACCAGGCATCGTCTCAGTGTCCACAT
GTTGTTGTCTGTTACCACTCTTTCTATCACAATGGAGCCTTTTCCCTTGTGCTCGAATAC
ATGGACCGTGGATCTCTTGTCGATGTGATTAGACAAGTGAAGACTATTCTCTAGCCTTAC
CTTGCTGTTGTCTGTAAACAGGTTTTGCAGGGCCTTGTGTACCTCCACAACGAAAGACAT
GTCATACACAGAGACATTAAACCATCAAACCTTCTTGTGAACCATAAAGGAGAAGTGAAA
ATCTCTGATTTTGGTGTCAGTGCAAGTCTTGCTAGCTCCATCGGACAGAGAGACACATTT
GTTGGAACCTACAACTATATGTCGCCTGAGAGGATCAGTGGAAGCACATACGACTACAGC
AGCGACATTTGGAGTTTGGGGATGTCAGTGTTAGAATGTGCAATCGGAAGATTCCCATAC
TTGGAATCTGAAGATCAGCAAAACCCGCCCAGCTTTTATGAGCTTTTGGCAGCAATCGTG
GAGAGTCCACCACCAACTGCTCCTTCTGATCAGTTCTCACCTGAATTCTGCTCCTTTGTA
TCAGCCTGCTTACAAAAGGATCCTCCAGCAAGAGCATCGTCATTGGACCTATTGAGTCAC
CCATTCATAAAAAAGTTTGAGGACATGGATATTGATCTTGGGATACTTGTTGGCACTATG
GAACCACCTGTTAACTGCCTTAGATAAGCAAGTCCTCTTTTCTTCTTCTGCATTTGGTGT
ATGATATGGTGTAAGATACATGATGTGTAATGTGTCTGAGTCTGCGAAAAGATTATTATT
ACTCAATGAACAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DA11TF U 1
AF RR4DA11JQ C 264
BS 1 607 RR4DA11TF
BS 608 916 RR4DA11JQ

RD RR4DA11TF 607 0 0
GACAAATGGGTTGGCAAGTTATTTGCTATGAAGGTCATACAGATGAACATACAAGAAGAA
ATCCGCAAGCAAATTGTCCAGGAGCTCAAAATAAACCAGGCATCGTCTCAGTGTCCACAT
GTTGTTGTCTGTTACCACTCTTTCTATCACAATGGAGCCTTTTCCCTTGTGCTCGAATAC
ATGGACCGTGGATCTCTTGTCGATGTGATTAGACAAGTGAAGACTATTCTCTAGCCTTAC
CTTGCTGTTGTCTGTAAACAGGTTTTGCAGGGCCTTGTGTACCTCCACAACGAAAGACAT
GTCATACACAGAGACATTAAACCATCAAACCTTCTTGTGAACCATAAAGGAGAAGTGAAA
ATCTCTGATTTTGGTGTCAGTGCAAGTCTTGCTAGCTCCATCGGACAGAGAGACACATTT
GTTGGAACCTACAACTATATGTCGCCTGAGAGGATCAGTGGAAGCACATACGACTACAGC
AGCGACATTTGGAGTTTGGGGATGTCAGTGTTAGAATGTGCAATCGGAAGATTCCCATAC
TTGGAATCTGAAGATCAGCAAAACCCGCCCAGCTTTTATGAGCTTTTGGCAGCAATCGTG
GAGAGTC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4DA11JQ 653 0 0
TTTGCAGGGCCTTGTGTACCTCCACAACGAAAGACATGTCATACACAGAGACATTAAACC
ATCAAACCTTCTTGTGAACCATAAAGGAGAAGTGAAAATCTCTGATTTTGGTGTCAGTGC
AAGTCTTGCTAGCTCCATCGGACAGAGAGACACATTTGTTGGAACCTACAACTATATGTC
GCCTGAGAGGATCAGTGGAAGCACATACGACTACAGCAGCGACATTTGGAGTTTGGGGAT
GTCAGTGTTAGAATGTGCAATCGGAAGATTCCCATACTTGGAATCTGAAGATCAGCAAAA
CCCGCCCAGCTTTTATGAGCTTTTGGCAGCAATCGTGGAGAGTCCACCACCAACTGCTCC
TTCTGATCAGTTCTCACCTGAATTCTGCTCCTTTGTATCAGCCTGCTTACAAAAGGATCC
TCCAGCAAGAGCATCGTCATTGGACCTATTGAGTCACCCATTCATAAAAAAGTTTGAGGA
CATGGATATTGATCTTGGGATACTTGTTGGCACTATGGAACCACCTGTTAACTGCCTTAG
ATAAGCAAGTCCTCTTTTCTTCTTCTGCATTTGGTGTATGATATGGTGTAAGATACATGA
TGTGTAATGTGTCTGAGTCTGCGAAAAGATTATTATTACTCAATGAACAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL8653Contig1 1050 2 6 U
GATTCAAATCATATTATTGGCACTGGATTGTGGGTGCATTAGTACTTGTGATTCATCTAG
CCACACTCTATGGAACTTACGTTCCTGACTGGGAGTTCGTTGTCTATGATAAACACAGCA
TCCTCCATGGGAAAATCCAGTCCGTATCATGTGGAGTGAGAGGGAAGCTAAACCCTCCTT
GCAATGCTGTTGGATATGTCGATAGACAAGTTCTAGGGATCAATCATATGCATCACCATC
CTGCCTGGAGACGATCCAAGGCTTGCACTGATTTTTCCCCTTACGAGGGATCTTTGTGTC
AAGATGCACCGTCATGGTGCCACGCTCCGTTTGAGCCTGAAGGAGTCTTGAGCTCTGTAT
CTGCTATTCTTTCTACAATCATCGGAGTCCATTTTGGTCATACTATCTTACACTTTAAGG
AGCATTCAGCTCGGTTGAAGCATTGGATCTCCACCGGTCTAGCTCTCCTAGCTCTCGGAC
TAACTCTACATTTCACTCACTTGATGCCTTTGAACAAACAACTCTACACTTTCAGCTACA
CATGCGTCACCTCCGGTGCAGCCGCGCTCGTATTCTCCCCCTTGTATTCTCTGGTGGATG
TAATGGAGTGGAAGCGCATGTTTCTACCTCTAGAATGGATAGGAATGAACGCGATGCTGG
TGTACGTGATGGGAGCTGAAGGCGTTTTAGCTGGGTTCTTCAACGGTTGGTACTATCGCC
ACCCGGACAAGACACTGATAAATTGGATTAAAGAGCATGTTTTGATCAGAGTTTGGCATT
CGAGAAGAGTTGGTGTTCTGATGTATGTTATTTTCGCGGAGATTCTCTTTTGGGGTCTGG
TTACTGGTGTTTGCCACAGGTTCAAGATCTATTGGAAACTATAAGCAGACCACCGTGAAA
AAAAAGAAACTTAACTCTATGCGAAGCTGTAATACTAATAGTTAGAAATATAAGTGAGAT
ACTTTGTGTATATATCCGAATGATGTGAACTTAACTCAAATTCGCAATAACTTTGTGTAT
AATATAATATCTTCTCAATAGTATTTTTGC


BQ
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AF RR4H292TF U 1
AF RR4H292JQ C 299
BS 1 578 RR4H292TF
BS 579 579 RR4H292JQ
BS 580 681 RR4H292TF
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BS 683 700 RR4H292TF
BS 701 1050 RR4H292JQ

RD RR4H292TF 700 0 0
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CCACACTCTATGGAACTTACGTTCCTGACTGGGAGTTCGTTGTCTATGATAAACACAGCA
TCCTCCATGGGAAAATCCAGTCCGTATCATGTGGAGTGAGAGGGAAGCTAAACCCTCCTT
GCAATGCTGTTGGATATGTCGATAGACAAGTTCTAGGGATCAATCATATGCATCACCATC
CTGCCTGGAGACGATCCAAGGCTTGCACTGATTTTTCCCCTTACGAGGGATCTTTGTGTC
AAGATGCACCGTCATGGTGCCACGCTCCGTTTGAGCCTGAAGGAGTCTTGAGCTCTGTAT
CTGCTATTCTTTCTACAATCATCGGAGTCCATTTTGGTCATACTATCTTACACTTTAAGG
AGCATTCAGCTCGGTTGAAGCATTGGATCTCCACCGGTCTAGCTCTCCTAGCTCTCGGAC
TAACTCTACATTTCACTCACTTGATGCCTTTGAACAAACAACTCTACACTTTCAGCTACA
CATGCGTCACCTCCGGTGCAGCCGCGCTCGTATTCTCCGCCTTGTATTCTCTGGTGGATG
TAATGGAGTGGAAGCGCATGTTTCTACCTCTAGAATGGATAGGAATGAACGCGATGCTGG
TGTACGTGATGGGAGCTGAAG*CGTTTTAGCTGGGTTCTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR4H292JQ 752 0 0
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ATCTGCTATTCTTTCTACAATCATCGGAGTCCATTTTGGTCATACTATCTTACACTTTAA
GGAGCATTCAGCTCGGTTGAAGCATTGGATCTCCACCGGTCTAGCTCTCCTAGCTCTCGG
ACTAACTCTACATTTCACTCACTTGATGCCTTTGAACAAACAACTCTACACTTTCAGCTA
CACATGCGTCACCTCCGGTGCAGCCGCGCTCGTATTCTCCCCCTTGTATTCTCTGGTGGA
TGTAATGGAGTGGAAGCGCATGTTTCTACCTCTAGAATGGATAGGAATGAACGCGATGCT
GGTGTACGTGATGGGAGCTGAAGGCGTTTTAGCTGGGTTCTTCAACGGTTGGTACTATCG
CCACCCGGACAAGACACTGATAAATTGGATTAAAGAGCATGTTTTGATCAGAGTTTGGCA
TTCGAGAAGAGTTGGTGTTCTGATGTATGTTATTTTCGCGGAGATTCTCTTTTGGGGTCT
GGTTACTGGTGTTTGCCACAGGTTCAAGATCTATTGGAAACTATAAGCAGACCACCGTGA
AAAAAAAGAAACTTAACTCTATGCGAAGCTGTAATACTAATAGTTAGAAATATAAGTGAG
ATACTTTGTGTATATATCCGAATGATGTGAACTTAACTCAAATTCGCAATAACTTTGTGT
ATAATATAATATCTTCTCAATAGTATTTTTGC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL8654Contig1 1012 2 2 U
GCAGCTTTCGCAGCAAATAAGAGAGAGTGTATATTGTCTCTTCCAACGTGTGCTTGCTCA
GAGGACTTCTCTTTTGTTTAATCGGCATATTGACCAGATCATTCTCTGTTGCTTTTACGG
AGTGGCCAAGATATCCCAAATGAGCCTGACGTTCAGGGAAATCATATACAACTATAGGAA
GCAACCACAGTGTAAACCACTAGTTTTCCGCAGCGTTTTTGTGGACTCATCACAGAGTCG
CCGTCAAGGGAGAGTAGGACCAGATCATGTTGACATCATCACATTCTACAACGATGTATT
TATCCCCGCCGTAAAGCCGTTGCTGGTGGAGATAGTTCCTGTGAAAAAGAACCAGGCTGT
GGAGGCCAATAACAATAATCCTGAAGGTCATTGTCCTGGATCGCCAAAGGTGTCGGTGTT
TCCAAGTGTTCCAGACATGTCCCCTAAGAAAGTATCTGCTGTGCATAATGTTTATGTTTC
TCCCCTAAGAGGATCAAAGATGGATGCTCTTATTTCACACAGCTCAAAGAGTTACTACGC
TTGTGTTGGAGAAAGCACACACGCTTACCAGAGCCCTTCAAAAGACTTATCTGCCATCAA
CAACCGCTTGAACAACAACAACAGCAGTAACCGCAAGAGGACGCTTAAGTTCGACGTAGA
AGCAGGACTGGTTAGCGATTCCATGGTAGGAAACAGTCTTTACCAAAACCAAAATGAGAC
CGATGCTTCAAACCAAAACCAAAATGGAAGCGATGCAGCGTCTTCAGGTGGTGCTCCCTT
TAAAACCGAGCCGCAAGATTGATAAAAGAGAGTATCAAACAAACGCCAGCTTCTCTTGAA
ACTATGTACATTATTTTTCATATAGAGTTTGTGTTTCTACGTTTAGTTTTCTAGTGATGA
TCACCTCAGGCTATGAGCGGATGGATCTTTTTTTTCTATTGTTTTTCTTCTCTTTCTCAT
TAATCAACTTAACTCTGTTTTAATAAGCGTTAATAAATATGTTATCAACAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AO82TF U 1
AF RR4AO82JQ C 263
BS 1 655 RR4AO82TF
BS 656 1012 RR4AO82JQ

RD RR4AO82TF 655 0 0
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GAGGACTTCTCTTTTGTTTAATCGGCATATTGACCAGATCATTCTCTGTTGCTTTTACGG
AGTGGCCAAGATATCCCAAATGAGCCTGACGTTCAGGGAAATCATATACAACTATAGGAA
GCAACCACAGTGTAAACCACTAGTTTTCCGCAGCGTTTTTGTGGACTCATCACAGAGTCG
CCGTCAAGGGAGAGTAGGACCAGATCATGTTGACATCATCACATTCTACAACGATGTATT
TATCCCCGCCGTAAAGCCGTTGCTGGTGGAGATAGTTCCTGTGAAAAAGAACCAGGCTGT
GGAGGCCAATAACAATAATCCTGAAGGTCATTGTCCTGGATCGCCAAAGGTGTCGGTGTT
TCCAAGTGTTCCAGACATGTCCCCTAAGAAAGTATCTGCTGTGCATAATGTTTATGTTTC
TCCCCTAAGAGGATCAAAGATGGATGCTCTTATTTCACACAGCTCAAAGAGTTACTACGC
TTGTGTTGGAGAAAGCACACACGCTTACCAGAGCCCTTCAAAAGACTTATCTGCCATCAA
CAACCGCTTGAACAACAACAACAGCAGTAACCGCAAGAGGACGCTTAAGTTCGAC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR4AO82JQ 750 0 0
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CTGGTGGAGATAGTTCCTGTGAAAAAGAACCAGGCTGTGGAGGCCAATAACAATAATCCT
GAAGGTCATTGTCCTGGATCGCCAAAGGTGTCGGTGTTTCCAAGTGTTCCAGACATGTCC
CCTAAGAAAGTATCTGCTGTGCATAATGTTTATGTTTCTCCCCTAAGAGGATCAAAGATG
GATGCTCTTATTTCACACAGCTCAAAGAGTTACTACGCTTGTGTTGGAGAAAGCACACAC
GCTTACCAGAGCCCTTCAAAAGACTTATCTGCCATCAACAACCGCTTGAACAACAACAAC
AGCAGTAACCGCAAGAGGACGCTTAAGTTCGACGTAGAAGCAGGACTGGTTAGCGATTCC
ATGGTAGGAAACAGTCTTTACCAAAACCAAAATGAGACCGATGCTTCAAACCAAAACCAA
AATGGAAGCGATGCAGCGTCTTCAGGTGGTGCTCCCTTTAAAACCGAGCCGCAAGATTGA
TAAAAGAGAGTATCAAACAAACGCCAGCTTCTCTTGAAACTATGTACATTATTTTTCATA
TAGAGTTTGTGTTTCTACGTTTAGTTTTCTAGTGATGATCACCTCAGGCTATGAGCGGAT
GGATCTTTTTTTTCTATTGTTTTTCTTCTCTTTCTCATTAATCAACTTAACTCTGTTTTA
ATAAGCGTTAATAAATATGTTATCAACAGT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL8655Contig1 735 2 8 U
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GTATATTATTATAAAGAAAAATGGGTATTTCCCGACAGAACCGGGTTGAAGTCAAGTCGA
TGCTAACCGCGATATCAAGCAAGCCATCTCGATCGGGTCAGGTACACACGTTTTCCGCTT
TAGACAACGCTGTGACTTCCCATACGGTCCATGTCATCTTCCACTATCCTCGTAGTCCAT
TCAAATCCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACC
CGCCCGTAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCAAGTGTAACG
ATGCCGGACTTCGAGTCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTGAGAT
CAGCTGATGGACATGAGGAATCTGATCTAACGGCTTGGGAAGACATGCCAGAAGATCCTA
GTACTTGGTCGCCGTTTCGCATGCAGATCAATGAATTCGAAGGAGGAGGTGTGGCTATAG
GTCTGAGCTGTCCACACATGCATGCAGACGCAACAACGTTAACAGTTCTCTTAAAGTCAT
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ACAACTTAACGGATACTGACGCCGTTACCTCCGACCGCGACTCCTTCTCCAAGCCCATCG
CTGGGCCCGTTTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DS95TF U 1
AF RR4DM84TF U 6
BS 1 137 RR4DS95TF
BS 138 138 RR4DM84TF
BS 139 556 RR4DS95TF
BS 557 559 RR4DM84TF
BS 560 724 RR4DS95TF
BS 725 725 RR4DM84TF
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BS 732 735 RR4DM84TF

RD RR4DS95TF 731 0 0
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GTATATTATTATAAAGAAAAATGGGTATTTCCCGACAGAACCGGGTTGAAGTCAAGTCGA
TGCTAACCGCGATATCAGGCAAGCCATCTCGATCGGGTCAGGTACACACGTTTTCCGCTT
TAGACAACGCTGTGACTTCCCATACGGTCCATGTCATCTTCCACTATCCTCGTAGTCCAT
TCAAATCCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACC
CGCCCGTAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCAAGTGTAACG
ATGCCGGACTTCGAGTCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTGAGAT
CAGCTGATGGACATGAGGAATCTGATCTAACGGCTTGGGAAGACATGCCAGAAGATCCTA
GTACTTGGTCGCCGTTTCGCATGCAGATCAATGAATTCGAAGGAGGAGGTGTGGCTATAG
GTCTGAGCTGTCCACAG**GCATGCAGACGCAACAACGTTAACAGTTCTCTTAAAGTCAT
GGACGGAAGCTCAACGCCGTCAGTGTATTACCCAACCTCCTTCCTTTTTCCCTATGCCCT
ACAACTTAACGGATACTGACGCCGTTACCTCCGACCGCGACTCCTTCTCCAAGCCCATCG
CTGGTCCCGTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4DM84TF 730 0 0
G
ATACCAATAAACAGTTTCTTTCTCTCGATCTTTATAGTAATTCTTCCCCAAAAAGTATAT
TATTATAAAGAAAAATGGGTATTTCCCGACAGAACCGGGTTGAAGTGAAGTCGATGCTAA
CCGCGATATCAAGCAAGCCATCTCGATCGGGTCAGGTACACACGTTTTCCGCTTTAGACA
ACGCTGTGACTTCCCATACGGTCCATGTCATCTTCTACTATCCTCGTAGTCCATTCAAAT
CCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACCCGCCCG
TAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCAAGTGTAACGATGCTG
GACTTCGAGTCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTGAGATCAGCTG
ATGGACATGAGGAATCTGATCTAACGGCTTGGGAAGACATGCCAGAAGATCCTAGTACTT
GGTCGCCGTTTCGCATGCAGATCAATGAATTCGAAGGAGGAGGTGTGGCTATAGGTCTGA
GCTGTCCACACATGCATGCAGACGCAACAACGTTAACAGTTCTCTTAAAGTCATGGACGG
AAGCTCAACGCCGTCAGTGTATTACCCAACCTCCTTCCTTTTTCCCTATGCCCTACAACT
TAACGGATACTGACGCCGTTACCTCCGACCGCGACTCCTTCTCCAAGCCCATCGCTGGGC
CCGTTTCAA

QA 2 730 2 730
DS 



AS 1 2

CO CL8656Contig1 788 2 2 U
GGTCTTCTTCTCCATTGATTCTTCCTCCCAATCCAAGCAAGGCCTTGTTCAATATCTCCT
CGTTGCTGCTGGAAGATTACATTTCTTAAGAATGGAGGCAGTAATAAGGAAATGGCAGCA
GAAGTTCAGAAAAGCGAAAGAGGAGATGAACAAGTGGGAGGCGCTTCAAGTTGGATGGTT
TTCCCGCTTCAGTAACGCTTCTTCTATCATCCAGAGATTAGAGGCAATTCAAAATCCTGG
GAGCTATGGAGCTTTGAGATGCGTTAAGGGGATTGAAGACGCTGTTCTGCAGAAACAGAT
GGATCAACTGGAGACTACTCTGCTTTCTATGAGAAACGATTTGGAGGAGTTCCGAGGATG
TGTTTTGACATTTGAGAAGCTTCATCGAGAAGGGTCGCAGCTACTGAAAATGGAACAGAG
CAAGAAGAGAATAGAGGAACGGATTGGAGTAAAACCTTGCATTGCTGATTGTTTGAAGGG
ACTTTCTCTTCTTTATGAGATGCATCAGTCTGAATACCATCTTAAATGTTCGATCCTTTC
GGCACCTTCATGTCTTGTACTGAAACCAAGTCCTGGCGACCTTGTAGCGCTGCAATACCT
CGTGGTTGATCAGCCAAATATCCTGAATAATGAAGTGCAACACATCTTCGATGTCATATT
TGCTGAAGATATCAAATGATGTCAAGAGGATATGTCTTTATTTTCTGTATTTTCTTAAAT
TGCAAAACGAAAATGTAGTTCTTAAGATAAGGTTATTCGGTGAATGAAAGACAGTGAGGA
GTGCAAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS41TF U 1
AF RR4FS41JQ C 322
BS 1 725 RR4FS41TF
BS 726 788 RR4FS41JQ

RD RR4FS41TF 725 0 0
GGTCTTCTTCTCCATTGATTCTTCCTCCCAATCCAAGCAAGGCCTTGTTCAATATCTCCT
CGTTGCTGCTGGAAGATTACATTTCTTAAGAATGGAGGCAGTAATAAGGAAATGGCAGCA
GAAGTTCAGAAAAGCGAAAGAGGAGATGAACAAGTGGGAGGCGCTTCAAGTTGGATGGTT
TTCCCGCTTCAGTAACGCTTCTTCTATCATCCAGAGATTAGAGGCAATTCAAAATCCTGG
GAGCTATGGAGCTTTGAGATGCGTTAAGGGGATTGAAGACGCTGTTCTGCAGAAACAGAT
GGATCAACTGGAGACTACTCTGCTTTCTATGAGAAACGATTTGGAGGAGTTCCGAGGATG
TGTTTTGACATTTGAGAAGCTTCATCGAGAAGGGTCGCAGCTACTGAAAATGGAACAGAG
CAAGAAGAGAATAGAGGAACGGATTGGAGTAAAACCTTGCATTGCTGATTGTTTGAAGGG
ACTTTCTCTTCTTTATGAGATGCATCAGTCTGAATACCATCTTAAATGTTCGATCCTTTC
GGCACCTTCATGTCTTGTACTGAAACCAAGTCCTGGCGACCTTGTAGCGCTGCAATACCT
CGTGGTTGATCAGCCAAATATCCTGAATAATGAAGTGCAACACATCTTCGATGTCATATT
TGCTGAAGATATCAAATGATGTCAAGAGGATATGTCTTTATTTTCTGTATTTTCTTAAAT
TGCAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FS41JQ 467 0 0
GCTTTCTATGAGAAACGATTTGGAGGAGTTCCGAGGATGTGTTTTGACATTTGAGAAGCT
TCATCGAGAAGGGTCGCAGCTACTGAAAATGGAACAGAGCAAGAAGAGAATAGAGGAACG
GATTGGAGTAAAACCTTGCATTGCTGATTGTTTGAAGGGACTTTTTTTTCTTTATGAGAT
GCATCAGTCTGAATACCATTTTAAATGTTCGATCCTTTCGGCACCTTCATGTCTTGTACT
GAAACCAAGTCCTGGCGACCTTGTAGCGCTGCAATACCTCGTGGTTGATCAGCCAAATAT
CCTGAATAATGAAGTGCAACACATCTTCGATGTCATATTTGCTGAAGATATCAAATGATG
TCAAGAGGATATGTCTTTATTTTCTGTATTTTCTTAAATTGCAAAACGAAAATGTAGTTC
TTAAGATAAGGTTATTCGGTGAATGAAAGACAGTGAGGAGTGCAAGG

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL8657Contig1 866 2 7 U
TTACCCGATATATCTCCCGAGTTCCAGATTCCTGGTCCCGAAGGCATTACGAAGATGAGA
GCTGCTTGCGAGCTCGCTGCTCGGGTTCTAACCTTTGCAGGAACTTTGGTTAAACCATCT
GTGACGACTAATGAGATAGACAAAGCGGTGCACGATATGATCATCGAAGCTGGTGCTTAT
CCTTCGCCTCTTGGGTATGGTGGATTTCCTAAAAGTGTGTGCACATCGGTTAACGAGTGT
ATGTGTCACGGGATACCGGATTCTCGTCAGCTACAGAATGGAGATATAATAAACATCGAT
GTCACGGTTTACTTGGATGGTTACCATGGAGATACATCAAAAACTTTCTTCTGTGGAGAA
GTAAATGAGGGTTTTAAACGACTTGTACAGATTACGGAGGAATGCTTAGAGAGAGGGATA
GCCGTTTGTAAAGATGGAGCAAGCTTCAAGAAAATCGGCAAGAGAATAAGTGAGCATGCC
GAGAAGTATGGCTACAACGTGGTGGAGCGCTTTGTTGGGCATGGTGTTGGACCAGTATTC
CACTCAGAACCCTTGATTTATCATTACCGAAATGACGAGCCTGGGCAAATGGTTGAGGGA
CAAACTTTCACAATCAAACCGATTCTAACGATTGGAACCACGGAATGTGTAACATGGCCA
GACAACTGGACCACTCTAACGGCTGATGGTGGGGTAGCCGCACAGTGTGAGCATACAATT
CTCATTACTAGAACTGGTTTTGAGATTCTTACCAAATGCTGAATCTATTCACTTTTGTCT
TTCTTTCCGTTTCCCTCTTTTGTCAAATGCTCTTATTTCTTCAGGCTGTTCATGGACCAT
GAAATCATATAGAATATACCTCCAAT


BQ
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AF RR4B438TF U 207
AF RR4B438JQ C 1
BS 1 206 RR4B438JQ
BS 207 342 RR4B438TF
BS 343 343 RR4B438JQ
BS 344 370 RR4B438TF
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BS 372 390 RR4B438TF
BS 391 866 RR4B438JQ

RD RR4B438TF 184 0 0
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TCAGCTACAGAATGGAGATATAATAAACATCGATGTCACGGTTTACTTGGATGGTTACCA
TGGAGATACATCAAAA*CTTTCTTCTGTGGAGAAGTAAATGAGG*TTTTAAACGACTTGT
ACAG

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR4B438JQ 866 0 0
TTACCCGATATATCTCCCGAGTTCCAGATTCCTGGTCCCGAAGGCATTACGAAGATGAGA
GCTGCTTGCGAGCTCGCTGCTCGGGTTCTAACCTTTGCAGGAACTTTGGTTAAACCATCT
GTGACGACTAATGAGATAGACAAAGCGGTGCACGATATGATCATCGAAGCTGGTGCTTAT
CCTTCGCCTCTTGGGTATGGTGGATTTCCTAAAAGTGTGTGCACATCGGTTAACGAGTGT
ATGTGTCACGGGATACCGGATTCTCGTCAGCTACAGAATGGAGATATAATAAACATCGAT
GTCACGGTTTACTTGGATGGTTACCATGGAGATACATCAAAAACTTTCTTCTGTGGAGAA
GTAAATGAGGGTTTTAAACGACTTGTACAGATTACGGAGGAATGCTTAGAGAGAGGGATA
GCCGTTTGTAAAGATGGAGCAAGCTTCAAGAAAATCGGCAAGAGAATAAGTGAGCATGCC
GAGAAGTATGGCTACAACGTGGTGGAGCGCTTTGTTGGGCATGGTGTTGGACCAGTATTC
CACTCAGAACCCTTGATTTATCATTACCGAAATGACGAGCCTGGGCAAATGGTTGAGGGA
CAAACTTTCACAATCAAACCGATTCTAACGATTGGAACCACGGAATGTGTAACATGGCCA
GACAACTGGACCACTCTAACGGCTGATGGTGGGGTAGCCGCACAGTGTGAGCATACAATT
CTCATTACTAGAACTGGTTTTGAGATTCTTACCAAATGCTGAATCTATTCACTTTTGTCT
TTCTTTCCGTTTCCCTCTTTTGTCAAATGCTCTTATTTCTTCAGGCTGTTCATGGACCAT
GAAATCATATAGAATATACCTCCAAT

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

CO CL8658Contig1 1146 2 6 U
GACGCGAGACAAACACTAGCCATTGCTTACGACACATTGCTAGCCCCAAACGTCAGAGCT
TGCATCGACGCGTCACCTTCTCCTGCAGAGAATGCACGTTTTGTGAAAACGAGAAAAAAC
GCTCGTGGAATAATGTCCGGTCTTGCAACATGGTCTAGTCAGCTATGCATCCTCCTCCAC
AGACTTATAAAAGAACGCCGCCACGAATCTTTTGATGCACTTCGTATTTTCCAAGTCCTC
GCCGCTTCACTGCTTTGTAGTCTCATGTGGTGGCACTCAGATTATCGAGACGTGCACGAC
CGACTAGGACTACTCTTCTTCGTATCTATTTTCTGGGGGGTACTTCCGTCATTTAACGCT
GTCTTCACGTTTCCGCAAGAACGAGCGATTTTCACTCGAGAGCGGGCGTCTGGTGTGTAC
ACACTCTCGTCTTACTTCATGGCTCACGTCATCGGATCGCTCACCATGGAACTCGTTCTC
CCGGCAGCGTTCTTGACGCTAACTTACTGGATGGTCGGTCTACGTCCAGGGCTAGTCCCT
TTCCTCCTCACCCTTTCCGTACTATTGCTATACGTCTTAGCCTCACAGGGACTCGGACTT
GCCTTAGGCGCAGCTATCATGGACGCTAAAAAAGCCTCCACGATCGTGACAGTGACAATG
CTAGCGTTTGTTTTAACCGGCGGTTACTATGTTAACAAAGTGCCATCAGGCATGGTGTGG
ATGAAATACGTTTCCACGACGTTTTATTGTTACCGTCTATTAATAGCGGTTCAGTACGGA
AATGGCGATGAGATATTGGCGATGGTTGGATGCAAGCCAAAGGGAACGCAAGGAGCGGCA
AAGACGGCTGGGTGTCGGTTTATGGAGGAGGAAGTGATTGGAGACATTGGATTGTGGACG
AGCGTTAGCGCTTTGTTCTTCATGTTTGTTGGTTATAGAGTATTGGCGTATTTGGCCTTG
AGGCGTATTAAACTATAAATGAGAGGTGAGAGGGAAAATTATTTGAATAAATAATGAGTG
GGTATAAATTAATTTCTAGGCTTTATAATTTCTAGTTAACTCAGTTTGTTCGATTTTTCT
TTTGAACATGTGAAAACAAAAATGACTAGTTCTTTTAGTTGATTTATAATAAATGTATAT
TTCACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN07TF U 1
AF RR4FN07JQ C 375
BS 1 725 RR4FN07TF
BS 726 726 RR4FN07JQ
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BS 762 775 RR4FN07TF
BS 776 1146 RR4FN07JQ

RD RR4FN07TF 775 0 0
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TGCATCGACGCGTCACCTTCTCCTGCAGAGAATGCACGTTTTGTGAAAACGAGAAAAAAC
GCTCGTGGAATAATGTCCGGTCTTGCAACATGGTCTAGTCAGCTATGCATCCTCCTCCAC
AGACTTATAAAAGAACGCCGCCACGAATCTTTTGATGCACTTCGTATTTTCCAAGTCCTC
GCCGCTTCACTGCTTTGTAGTCTCATGTGGTGGCACTCAGATTATCGAGACGTGCACGAC
CGACTAGGACTACTCTTCTTCGTATCTATTTTCTGGGGGGTACTTCCGTCATTTAACGCT
GTCTTCACGTTTCCGCAAGAACGAGCGATTTTCACTCGAGAGCGGGCGTCTGGTGTGTAC
ACACTCTCGTCTTACTTCATGGCTCACGTCATCGGATCGCTCACCATGGAACTCGTTCTC
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TTCCTCCTCACCCTTTCCGTACTATTGCTATACGTCTTAGCCTCACAGGGACTCGGACTT
GCCTTAGGCGCAGCTATCATGGACGCTAAAAAAGCCTCCACGATCGTGACAGTGACAATG
CTAGCGTTTGTTTTAACCGGCGGTTACTATGTTAACAAAGTGCCATCAGGCATGGTGTGG
ATGAA*TACGTTTCCACGACGTTTTATTGTTACCGTCTAT*AATAGCGGTTCAGT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4FN07JQ 772 0 0
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CTTCATGGCTCACGTCATCGGATCGCTCACCATGGAACTCGTTCTCCCGGCAGCGTTCTT
GACGCTAACTTACTGGATGGTCGGTCTACGTCCAGGGCTAGTCCCTTTCCTCCTCACCCT
TTCCGTACTATTGCTATACGTCTTAGCCTCACAGGGACTCGGACTTGCCTTAGGCGCAGC
TATCATGGACGCTAAAAAAGCCTCCACGATCGTGACAGTGACAATGCTAGCGTTTGTTTT
AACCGGCGGTTACTATGTTAACAAAGTGCCATCAGGCATGGTGTGGATGAAATACGTTTC
CACGACGTTTTATTGTTACCGTCTATTAATAGCGGTTCAGTACGGAAATGGCGATGAGAT
ATTGGCGATGGTTGGATGCAAGCCAAAGGGAACGCAAGGAGCGGCAAAGACGGCTGGGTG
TCGGTTTATGGAGGAGGAAGTGATTGGAGACATTGGATTGTGGACGAGCGTTAGCGCTTT
GTTCTTCATGTTTGTTGGTTATAGAGTATTGGCGTATTTGGCCTTGAGGCGTATTAAACT
ATAAATGAGAGGTGAGAGGGAAAATTATTTGAATAAATAATGAGTGGGTATAAATTAATT
TCTAGGCTTTATAATTTCTAGTTAACTCAGTTTGTTCGATTTTTCTTTTGAACATGTGAA
AACAAAAATGACTAGTTCTTTTAGTTGATTTATAATAAATGTATATTTCACC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL8659Contig1 662 2 2 U
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ATGATATCTGAATGTGAGACTAAACTCTGTTTTAAATTCGTTTTTTTTGGTGACAGATGC
AAAGGGATTGACTGATAGGAGATTTAGTGACACATCTGTCCAAAGCGACATGAAGCTATG
GCCTTTAAAGATCATACTTGGTCCTGCCTATAAACCCATGATCGTCGTCAACTACAAAGG
CGAAGAGAAACAGTCCGCCACCGAGGAGATCTCTTCCTTGGTTCTCACCAAGATACGTTA
GATGCTGAAGTTCAAAGCCGCATGGAAACCATAAAGCTTGATTATAGGGACAAACTTGTC
TGCCTCAGTATTCTTGATGGCCTTGATACCGACCTAGATACAAAACTACTAAGCTCTAGT
GTTGAACCCATGATGGTTGTCAACAAATACTAACCCGAAATTTGTTAGGAGGGAGGGAAT
GACAATCTTGGGGATGATATATGCCCGGTGCTGCAGCTATAAAGAAAACACCACTGCTTT
GAGCACTCTTCGCTTGAACACTAGAAGTACACAGCTAATGTGAATGTGATAGGTGGAAGA
TCTACGTAACTGAATACTACTTTTATATTAAGAATCTCAATGAACAATATAGCTTGTGTG
TG


BQ
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20 20 

AF RR4BC24JQ C 1
AF RR4BC24TF U 273
BS 1 272 RR4BC24JQ
BS 273 662 RR4BC24TF

RD RR4BC24JQ 662 0 0
AGGGCCAAAGAGATTGATTGTGATTTTCTTGGGTTTATAGTATGATCTAATTGAATGTGA
ATGATATCTGAATGTGAGACTAAACTCTGTTTTAAATTCGTTTTTTTTGGTGACAGATGC
AAAGGGATTGACTGATAGGAGATTTAGTGACACATCTGTCCAAAGCGACATGAAGCTATG
GCCTTTAAAGATCATACTTGGTCCTGCCTATAAACCCATGATCGTCGTCAACTACAAAGG
CGAAGAGAAACAGTCCGCCACCGAGGAGATCTCTTCCTTGGTTCTCACCAAGATACGTTA
GATGCTGAAGTTCAAAGCCGCATGGAAACCATAAAGCTTGATTATAGGGACAAACTTGTC
TGCCTCAGTATTCTTGATGGCCTTGATACCGACCTAGATACAAAACTACTAAGCTCTAGT
GTTGAACCCATGATGGTTGTCAACAAATACTAACCCGAAATTTGTTAGGAGGGAGGGAAT
GACAATCTTGGGGATGATATATGCCCGGTGCTGCAGCTATAAAGAAAACACCACTGCTTT
GAGCACTCTTCGCTTGAACACTAGAAGTACACAGCTAATGTGAATGTGATAGGTGGAAGA
TCTACGTAACTGAATACTACTTTTATATTAAGAATCTCAATGAACAATATAGCTTGTGTG
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4BC24TF 390 0 0
CTTCCTTGGTTCTCACCAAGATACGTTAGATGCTGAAGTTCAAAGCCGCATGGAAACCAT
AAAGCTTGATTATAGGGACAAACTTGTCTGCCTCAGTATTCTTGATGGCCTTGATACCGA
CCTAGATACAAAACTACTAAGCTCTAGTGTTGAACCCATGATGGTTGTCAACAAATACTA
ACCCGAAATTTGTTAGGAGGGAGGGAATGACAATCTTGGGGATGATATATGCCCGGTGCT
GCAGCTATAAAGAAAACACCACTGCTTTGAGCACTCTTCGCTTGAACACTAGAAGTACAC
AGCTAATGTGAATGTGATAGGTGGAAGATCTACGTAACTGAATACTACTTTTATATTAAG
AATCTCAATGAACAATATAGCTTGTGTGTG

QA 1 390 1 390
DS 



AS 1 2

CO CL8660Contig1 959 2 2 U
GGACGCTTTCTAACCGAAGTTCCCAAAGTCTTCGATCTTATAGAAAGTCCTTTAATTTGG
TCGATCCTGTAAAAGGGCAAACTCTTTTTTTTTCCGACAAGACACAAGCTTCTTCTGGTT
ATTCGCCGAATTATAGAAACGATGTTCAATTTCTGGGGATCAAAAGACCAACAAGGGCAA
TCACGTCCTCCTCCGGAAGTTTCTTCTTCTTCGCAGCAGCAGTAGCCATGGTACTCTCCT
TCTCTAGTCAGCTCGCCAAGCTCCTCATCTCGGCCTCAAACATCTGGTCAGATTCCAGCA
CATGTTTCACCTGGTGAAGCAGCTGGCATTATTACCTTCTTGAAAGACAAAAGTGTGGAC
GAGCTCAGGAAGCTTCTCTCTGACAAAGATGCGTATCAGCAGTTTCTGCTCTCTCTTGAC
CAGGTCAAGGTCCAGAGCAATATCAAAGATGAGCTCCGCAGAGAAACATTGCAGCTAGCT
AGAGAGAACTTAGAGAAGGAGCCACAGATAACGGAGCTCAGAAACCAATGCAGAATCATC
CGTACGACTGAGCTAGCAGCTGCGCAAGAAAAGCTTAATGAGCTGGAAAGACAAAGAGAA
GAGATCCTCAAGTTCTACTCCCCTGCTTCTCTTCTTAATAAACTTCAAGAGGCTATGAAT
CAGGTTGATGAAGAATCTGAAGCTCTGCAAGAGAAGTTCCTAGAAAAGGAGATTGATACA
GCAGCGTTTGTTCAGAAATACAAGAAGCTGCGCACTATCTATCATCGACGTGCATTGATT
CATCTTGCTGCTAAAACCTCAACCATCGGTTGAAACTATGATAACCAGTCCTTTTTTTTT
TGTCTTGTGACTTATGATGTTGTAAAAGAAATGATTTTGCTGTTTACGTTCATACTATAA
TGATTTGACATTGAAACCAGTCTTATGTTTTTTTCTGTAATAAGAAAAAATACTACACC


BQ
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AF RR4AM67TF U 1
AF RR4AM67JQ C 268
BS 1 659 RR4AM67TF
BS 660 959 RR4AM67JQ

RD RR4AM67TF 659 0 0
GGACGCTTTCTAACCGAAGTTCCCAAAGTCTTCGATCTTATAGAAAGTCCTTTAATTTGG
TCGATCCTGTAAAAGGGCAAACTCTTTTTTTTTCCGACAAGACACAAGCTTCTTCTGGTT
ATTCGCCGAATTATAGAAACGATGTTCAATTTCTGGGGATCAAAAGACCAACAAGGGCAA
TCACGTCCTCCTCCGGAAGTTTCTTCTTCTTCGCAGCAGCAGTAGCCATGGTACTCTCCT
TCTCTAGTCAGCTCGCCAAGCTCCTCATCTCGGCCTCAAACATCTGGTCAGATTCCAGCA
CATGTTTCACCTGGTGAAGCAGCTGGCATTATTACCTTCTTGAAAGACAAAAGTGTGGAC
GAGCTCAGGAAGCTTCTCTCTGACAAAGATGCGTATCAGCAGTTTCTGCTCTCTCTTGAC
CAGGTCAAGGTCCAGAGCAATATCAAAGATGAGCTCCGCAGAGAAACATTGCAGCTAGCT
AGAGAGAACTTAGAGAAGGAGCCACAGATAACGGAGCTCAGAAACCAATGCAGAATCATC
CGTACGACTGAGCTAGCAGCTGCGCAAGAAAAGCTTAATGAGCTGGAAAGACAAAGAGAA
GAGATCCTCAAGTTCTACTCCCCTGCTTCTCTTCTTAATAAACTTCAAGAGGCTATGAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR4AM67JQ 692 0 0
TT
TCGGCCTCAAACATCTGGTCAGATTCCAGCACATGTTTCACCTGGTGAAGCAGCTGGCAT
TATTACCTTCTTGAAAGACAAAAGTGTGGACGAGCTCAGGAAGCTTCTCTCTGACAAAGA
TGCGTATCAGCAGTTTCTGCTCTCTCTTGACCAGGTCAAGGTCCAGAGCAATATCAAAGA
TGAGCTCCGCAGAGAAACATTGCAGCTAGCTAGAGAGAACTTAGAGAAGGAGCCACAGAT
AACGGAGCTCAGAAACCAATGCAGAATCATCCGTACGACTGAGCTAGCAGCTGCGCAAGA
AAAGCTTAATGAGCTGGAAAGACAAAGAGAAGAGATCCTCAAGTTCTACTCCCCTGCTTC
TCTTCTTAATAAACTTCAAGAGGCTATGAATCAGGTTGATGAAGAATCTGAAGCTCTGCA
AGAGAAGTTCCTAGAAAAGGAGATTGATACAGCAGCGTTTGTTCAGAAATACAAGAAGCT
GCGCACTATCTATCATCGACGTGCATTGATTCATCTTGCTGCTAAAACCTCAACCATCGG
TTGAAACTATGATAACCAGTCCTTTTTTTTTTGTCTTGTGACTTATGATGTTGTAAAAGA
AATGATTTTGCTGTTTACGTTCATACTATAATGATTTGACATTGAAACCAGTCTTATGTT
TTTTTCTGTAATAAGAAAAAATACTACACC

QA 3 692 3 692
DS 



AS 1 2

CO CL8661Contig1 811 2 2 U
GGTCTGAGCTCTTTGGACCAAACAGCGTCGGGGTTAACCACAACATCCTCATCACAAACA
TACCGATAGGATCGTTGGTGTACGGTTTCTTAGCTGCTCTGGTCTATGAATCCCATAGCA
CGGCTGGGTCAAAGACCGGGTCGGTTATATGTATGGGGCGAGACTGTTATTTCCTAACGT
TTGTGTGGTGGGGATGCTTGTCGGTGATTGGGCTTGGTTCAAGTGTTGTCTTGTTTCTGA
GAACTAGAAGAGCTTATCAACGTTTTGAACAAGATCGGATAGCTTCAAGCATGCTCTATT
CTTGAAAATTTGAACTTCAATAGTGTTATATTGAAGGAAAAGCTGAAAATGACGACCAAA
ACTTGTGCAGAACTTTGTTAGTACACACATAAGTTTTGATATTTTTTTGCAGCAATAAAA
AAAGAAGGCTTTCGGTTTTGCATTTTGTGGCAGTGAATCGGTAAGTTGGAACGGGAAATT
GTAACTTTGAGGACATCGGAAGCGACCTGTAACACTTACTGAATTAACCTGAGGGGCCTA
AGTGGTTTATGTTTTGTTGTAGACTTGTTACATTTTGGACAAAAGTACATTGGTAATTTG
TGTTAACACATTCAAAATTGTGTTACTGTTTATGTCTGTACGGTTGTACGGTTGTTACTA
GTAAACAGAGTAGACTCTGCAGAGATACTTGGTTCAGAAAAAAACAAAAAGGATAGGTAA
TTTAACACTGCTTTGCAACATTAGCTTCGGACCATTGAATCAAATTGCGGCAGGTCTGGA
ACAAACCTTCTAGTTCTAGAACAAACTTCTC


BQ
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AF RR4EI36TF U 1
AF RR4EI36JQ C 177
BS 1 638 RR4EI36TF
BS 639 811 RR4EI36JQ

RD RR4EI36TF 638 0 0
GGTCTGAGCTCTTTGGACCAAACAGCGTCGGGGTTAACCACAACATCCTCATCACAAACA
TACCGATAGGATCGTTGGTGTACGGTTTCTTAGCTGCTCTGGTCTATGAATCCCATAGCA
CGGCTGGGTCAAAGACCGGGTCGGTTATATGTATGGGGCGAGACTGTTATTTCCTAACGT
TTGTGTGGTGGGGATGCTTGTCGGTGATTGGGCTTGGTTCAAGTGTTGTCTTGTTTCTGA
GAACTAGAAGAGCTTATCAACGTTTTGAACAAGATCGGATAGCTTCAAGCATGCTCTATT
CTTGAAAATTTGAACTTCAATAGTGTTATATTGAAGGAAAAGCTGAAAATGACGACCAAA
ACTTGTGCAGAACTTTGTTAGTACACACATAAGTTTTGATATTTTTTTGCAGCAATAAAA
AAAGAAGGCTTTCGGTTTTGCATTTTGTGGCAGTGAATCGGTAAGTTGGAACGGGAAATT
GTAACTTTGAGGACATCGGAAGCGACCTGTAACACTTACTGAATTAACCTGAGGGGCCTA
AGTGGTTTATGTTTTGTTGTAGACTTGTTACATTTTGGACAAAAGTACATTGGTAATTTG
TGTTAACACATTCAAAATTGTGTTACTGTTTATGTCTG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4EI36JQ 635 0 0
ACGTTTGTGTGGTGGGGATGCTTGTCGGTGATTGGGCTTGGTTCAAGTGTTGTCTTGTTT
CTGAGAACTAGAAGAGCTTATCAACGTTTTGAACAAGATCGGATAGCTTCAAGCATGCTC
TATTCTTGAAAATTTGAACTTCAATAGTGTTATATTGAAGGAAAAGCTGAAAATGACGAC
CAAAACTTGTGCAGAACTTTGTTAGTACACACATAAGTTTTGATATTTTTTTGCAGCAAT
AAAAAAAGAAGGCTTTCGGTTTTGCATTTTGTGGCAGTGAATCGGTAAGTTGGAACGGGA
AATTGTAACTTTGAGGACATCGGAAGCGACCTGTAACACTTACTGAATTAACCTGAGGGG
CCTAAGTGGTTTATGTTTTGTTGTAGACTTGTTACATTTTGGACAAAAGTACATTGGTAA
TTTGTGTTAACACATTCAAAATTGTGTTACTGTTTATGTCTGTACGGTTGTACGGTTGTT
ACTAGTAAACAGAGTAGACTCTGCAGAGATACTTGGTTCAGAAAAAAACAAAAAGGATAG
GTAATTTAACACTGCTTTGCAACATTAGCTTCGGACCATTGAATCAAATTGCGGCAGGTC
TGGAACAAACCTTCTAGTTCTAGAACAAACTTCTC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8662Contig1 915 2 4 U
GGATTACCCTAACTCTAGAAAACTTTTCCTGATATCTCTCTCCCTCTCTCCCAAGTGTGG
TTTTCAACCCATTCTTAAAGATCATGAACCTTGAAGAGAAACCAACCATGGCTTCAAGGG
CTTCACCTCAAGCCGAACATCTCTACTACGTCCGGTGCAGCATCTGCAACACCATCCTCG
CGGTTGGGATACCAATGAAGAGAATGCTTGACACTGTAACGGTGAAATGTGGCCATTGTG
GTAACCTCTCGTTTCTCACCACAAGCCCTCCTCTGCAAGGCCATGTCAGCCTCACCCTTC
AGATGCAGAGCTTTGGTGGGAATGAGTATAAGAAGGGAAGCTCTTCTTCCTCCTCGTCTT
CTACCTCCAGTGACCAGCCGCCGTCTCCTAGACCACCCTTTGTCGTTAAACCTCCTGAGA
AGAAGCAGAGACTTCCATCGGCTTACAACCGCTTCATGAGGGATGAGATACAACGCATCA
AGAGTGCGAATCCGGAAATACCACATCGTGAAGCTTTCAGCGCTGCTGCCAAAAATTGGG
CTAAGTACATACCCAATTCTCCTACTTCCATTACTTCCGGAGGCAGCAACATCCACGGTT
TCGGATTCGGTGAGAAGAAGTGAAGTCCCCAAGGAAATGCATGCCTAAAAATAATAATAA
ACGCACGTGTGCGTGATCAAACTTTTCAGCGAAGGGGTTTAGTTAACGGCGTCGTTTTCG
TCATTATGTGTTTTACATGTGTTTAAAGTTGGTGTGTTTTCCTTTGTATGTCTCAGCTGA
AGTGATGTTTGCCTCATAGTAGAATCTTTAGTTCTGTCTGTCTTAGATTTGAAAGCTACG
TTACGTTGATGTGTTCATCTGGACGTTCATGTCGGGACGTAATAAGTTTGTCTTAATCCT
ATAACATTTCTGCCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE83TF U 1
AF RR4DE83JQ C 290
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RD RR4DE83TF 687 0 0
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CTACCTCCAGTGACCAGCCGCCGTCTCCTAGACCACCCTTTGTCGTTAAACCTCCTGAGA
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CTTTTCA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4DE83JQ 626 0 0
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ACAACGCATCAAGAGTGCGAATCCGGAAATACCACATCGTGAAGCTTTCAGCGCTGCTGC
CAAAAATTGGGCTAAGTACATACCCAATTCTCCTACTTCCATTACTTCCGGAGGCAGCAA
CATCCACGGTTTCGGATTCGGTGAGAAGAAGTGAAGTCCCCAAGGAAATGCATGCCTAAA
AATAATAATAAACGCACGTGTGCGTGATCAAACTTTTCAGCGAAGGGGTTTAGTTAACGG
CGTCGTTTTCGTCATTATGTGTTTTACATGTGTTTAAAGTTGGTGTGTTTTCCTTTGTAT
GTCTCAGCTGAAGTGATGTTTGCCTCATAGTAGAATCTTTAGTTCTGTCTGTCTTAGATT
TGAAAGCTACGTTACGTTGATGTGTTCATCTGGACGTTCATGTCGGGACGTAATAAGTTT
GTCTTAATCCTATAACATTTCTGCCG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

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TTAGTAGCTATTCACTAACTACTACACATGCACTTTGACCACTACTACAACTTAGCCTTG
CTTCTCTTAACAACTCTAACAACTACACCTTAGGTAGACTTTAACGAACACAACACTCTT
TGTTGGTAGCTTTGTCTAAACACATGGTTAGTTGCATCTTGACTTTATTTGTTGTGACTA
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GCTTCAAGTATCTTCTTCTTCTTCTTCACACAAGTTTTTTCTTTCTTCTTTGTAGCTTCT
TCTCAGCTACTCTTCTTTCTTCCTTTTCTGTTGGAGATTCTAATCAAGGATCAATCTCTA
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TTCACTAAATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C236TF U 1
AF RR4C236JQ C 307
BS 1 633 RR4C236TF
BS 634 634 RR4C236JQ
BS 635 701 RR4C236TF
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RD RR4C236TF 701 0 0
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ATTAACGGATTTAAGTTAGTAAACTGTTGTGATTTTGCTCTTCTCTTTTGGCTTGGCCTC
TCCACTATCATTCCTCACGGCTAGCTCTCCATTCCTCTCTCTGTTTTACACTCACTCTCA
TGTTCTGTTTCTTACTTGTGTTTCATTGTACACAAGCATACACACTCTCTCTTTGCCCTT
TGTCTTTATTCATGTAGAGATAGAAGAGAGTTTATCTTTTGTATGTCTACATTGTTCTTT
CCCCAACTCTTTTCTTTATTAGAATTTGATTGCCTTTTACAATAACAACACATACATACT
TTAGTAGCTATTCACTAACTACTACACATGCACTTTGACCACTACTACAACTTAGCCTTG
CTTCTCTTAACAACTCTAACAACTACACCTTAG*TAGACTTTAACGAACACAACACTCTT
TGTTGGTAGCTTTGTCTAAACACATGGTTAGTTGCATCTTG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4C236JQ 727 0 0
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GCTATTCACTAACTACTACACATGCACTTTGACCACTACTACAACTTAGCCTTGCTTCTC
TTAACAACTCTAACAACTACACCTTAGGTAGACTTTAACGAACACAACACTCTTTGTTGG
TAGCTTTGTCTAAACACATGGTTAGTTGCATCTTGACTTTATTTGTTGTGACTAAGTCAC
AACTCAACTCCTCTTTGGCTTGTAACCAATGTCATGTGGCATTTTTTCCAACTTTGACTT
CATTCTTCTACGTGACTCTCCTTGATCACTTCTTCTTGTTCTTCTGTTTCTTGCGCTTCA
AGTATCTTCTTCTTCTTCTTCACACAAGTTTTTTCTTTCTTCTTTGTAGCTTCTTCTCAG
CTACTCTTCTTTCTTCCTTTTCTGTTGGAGATTCTAATCAAGGATCAATCTCTAACATAA
ACCCATTATTTTATTAGAAAATTAGTTGGGTTTAAAATTGAATGAATCTATAGTTTCACT
AAATTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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ATCCACCGTGCTGAGCCGCCGCCGCCGATTTGTATTTCAAATCGCGGAAGGGAGTAATTT
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TTCGATGAATCGTGCTCCTCCTCCTCCTCAATCATCCTCCTTACGTTCCAGCCGATCCAA
AGTATTGTATCAGTTTAAGCAGCAGAAACTACCAGCTTGTAAGCCAGTCTTAACTCCAAC
CTCGGTTATAACAGTGTTTATGTTGATGGGTTTTGTTTTCATTCCCATTGGCTTTGTTAC
TCTCCGTGCTTCTCGTGATGCTATTGAAATTGTTGACCGGTATGATGTTGAGTGTATTCC
TGAAGAATATAGAACCAACAAACTCTCTTACATTACAGACTCATCCATCTCTAAGAACTG
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CAGAAGAAGCTTATTCTCTCCACGTCAAGTTGGTTAGGAGGAAGAAATGATTTTCTCGGT
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CATTTAAAAAATCCGAGGCCTTATGGAGACAATTCTTGGAACAAGAAAAGCCTTTCGAGT
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TTTTTGGGTTCTAAAGATAAAGTGTTTGAGC


BQ
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AF RR4AZ40TF U 1
AF RR4AZ40JQ C 527
BS 1 818 RR4AZ40TF
BS 819 1411 RR4AZ40JQ

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TACTCGTTACTTAAAGGTACAAAAGCATATGAAAGCTCCCATTTTTATCTACTGCCAGCT
TGATAACTACTATCAGAACCACCGCCGGTATGTAAAGAGTAGAAGTGATCAACAACTGTT
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CCCCATTGTCCCCTGTGGGTTAATCGCTTGGAGTATGTTCAATGATACGTTTACCTTTGC
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GAGCACAAGTTTAGAAAGGATGTTTATCCTTTCAATTT

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DS 

RD RR4AZ40JQ 885 0 0
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ACGTTTACCTTTGCTCGCGAAAGCGCGAAGAAGCTAAGGTGAGCCGGAACAACATTGCCT
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TTATTGTGTGGATGCGAGCAGCTGCTCTACTAAGCTTCAGGAAACTATACGGAAGAATCG
AAGAGGACTTGGAACCAGGGAGCGTTGTTGTGGTGAATTTGTTCAACAACTACAATACTT
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TCTTCATGTTACTCCATTTAAAAAATCCGAGGCCTTATGGAGACAATTCTTGGAACAAGA
AAAGCCTTTCGAGTTGAGAAACTGTTACCATTCTTTCTCTAACATATTCCGATTCCAGGT
TCATATATACATTACTCAAGAGCCTGTATATGTGATTCATATAGATATAGTGAGTATAGA
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TATGACAATTCGGTTTTTTGGGTTCTAAAGATAAAGTGTTTGAGC

QA 1 885 1 885
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8666Contig1 1459 2 2 U
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TGTGTTTTCGATTCTGTTTCTCAGTTTGGTTTTAATTTTTATTCAGAAATCAGCAAAAAG
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TCAAAGTTGACTCTTCTGCTCAGACTTTAGACAACAACACTGCTTCTTCAGCAGCCGACA
CGAAGCCGCCGTCTTCATGTCCCGATGATGATGATCAGAGCCCTAAGTCTCTTAACTCAT
CGGATCCTCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGGACCAATGGGACTCCCCAAAAGGGTA
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CTAAGCAACCCGTTGGCTAAGGAGTTTGTTCCTCCTTCACTTGCTCGAACCCAATCTGGA
AATGGATTATTACGGTTTACTAACAACAATTTTGCAGCTCGGAGTGATCATCTTTCTACA
AGGATAAGGAGTTTTGGCTTTTGCCAAGGGAAGAGAAGAATGAACAAAAGAACCAGCTTG
GCTCAGAAGGATGACGTCATCAGGAGAACTGTATATGTCTCTGACATTGATCAACAGTTA
CCGAGGAGAACCTCGCAGTGTCTTTGTAAACTGTGGACAGGTTGTTGATTGTCGTGTATG
CGGTGATCCAAAGTCTGTCCTTCGTTTCGCATTCGTTGAATTCACCAATGAAGAGGGAGC
TAGGGCTGCTTTAAGCATGTCAGGAACAGTGCTTGGTTTTTACCCTCTTAAGGTGCTTCC
ATCCAAGACCGCTATCGCCCCTGTTAACCCAACTTTCCTTCCCCGGTCTGAGGATGAGCG
TGAGATGTGCGTGAGGACTGTTTACTGTACCAACATTGACAAGCGGGTTAGTCAAACTGA
CTTGAAAGGCTTCTTTGAAATGCTTTGCGGAGAGGTTCATCGTTTGAGGCTTGGAGACTA
TCACCACCAAACCCGCTTCGCGTTTGTTGAGTTTGCCACGGCGGAGAGTGCAATTGCTGC
TCTTAACTACAGTGGTATTGTATTGGGAGCACTCCCAATAAGGGTAAGCCCATCAAAGAC
ACCAGTAAGGCCGCACCTTCCCCGCCCTGAGTGCAAATGAAATGATGGCAAAGCTGTTGC
TGGAGATCCCATAAGAATATTTATAGAAAAAGAGAGAGAAAGCATGAAGAAGAAGGTACT
TGAGGCGTTTTATTTTAAGTTTGTTACACAGTCAGAGCCTGCCCGGTATCTTTGAACAAC
TTTGATCTTTAACTTTCTCCTCTTTTCTATAGAGTCTGCCAAAAACAAATACTGGTTTCC
TTTTTCTTTTGTTATTGTTATTGTCTAATTACCCTTTTAGATATTTTTAATGAGACATTT
GGAGCAGTTCATTGTTTAT


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AF RR4BW19TF U 1
AF RR4BW19JQ C 681
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BS 749 1459 RR4BW19JQ

RD RR4BW19TF 748 0 0
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TGTGTTTTCGATTCTGTTTCTCAGTTTGGTTTTAATTTTTATTCAGAAATCAGCAAAAAG
CTCCTAACTCTGTATTCTGATCCTTGCGGTCCGATCATATAATCATGGCCGTCGCTAGTG
TCAAAGTTGACTCTTCTGCTCAGACTTTAGACAACAACACTGCTTCTTCAGCAGCCGACA
CGAAGCCGCCGTCTTCATGTCCCGATGATGATGATCAGAGCCCTAAGTCTCTTAACTCAT
CGGATCCTCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGGACCAATGGGACTCCCCAAAAGGGTA
CCAAAACTCCAAGTGGAGGGAGTGTGAAGAGTGAGATCAGAGATTTGTCTGATGCGTTTT
CTAAGCAACCCGTTGGCTAAGGAGTTTGTTCCTCCTTCACTTGCTCGAACCCAATCTGGA
AATGGATTATTACGGTTTACTAACAACAATTTTGCAGCTCGGAGTGATCATCTTTCTACA
AGGATAAGGAGTTTTGGCTTTTGCCAAGGGAAGAGAAGAATGAACAAAAGAACCAGCTTG
GCTCAGAAGGATGACGTCATCAGGAGAACTGTATATGTCTCTGACATTGATCAACAGTTA
CCGAGGAGAACCTCGCAGTGTCTTTGTAAACTGTGGACAGGTTGTTGATTGTCGTGTATG
CGGTGATCCAAAGTCTGTCCTTCGTTTC

QA 1 748 1 748
DS 

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TTTACTGTACCAACATTGACAAGCGGGTTAGTCAAACTGACTTGAAAGGCTTCTTTGAAA
TGCTTTGCGGAGAGGTTCATCGTTTGAGGCTTGGAGACTATCACCACCAAACCCGCTTCG
CGTTTGTTGAGTTTGCCACGGCGGAGAGTGCAATTGCTGCTCTTAACTACAGTGGTATTG
TATTGGGAGCACTCCCAATAAGGGTAAGCCCATCAAAGACACCAGTAAGGCCGCACCTTC
CCCGCCCTGAGTGCAAATGAAATGATGGCAAAGCTGTTGCTGGAGATCCCATAAGAATAT
TTATAGAAAAAGAGAGAGAAAGCATGAAGAAGAAGGTACTTGAGGCGTTTTATTTTAAGT
TTGTTACACAGTCAGAGCCTGCCCGGTATCTTTGAACAACTTTGATCTTTAACTTTCTCC
TCTTTTCTATAGAGTCTGCCAAAAACAAATACTGGTTTCCTTTTTCTTTTGTTATTGTTA
TTGTCTAATTACCCTTTTAGATATTTTTAATGAGACATTTGGAGCAGTTCATTGTTTAT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAAACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTGGTTTTGGCCATCTCAGTAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCCGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGGGAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAGGATGGA
AAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATTCAATAGATGCAAAAGATGGAAAAGAT
GCAAAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGT


BQ
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AF RR4HB84JQB C 1
AF RR4HB84TF U 1
BS 1 389 RR4HB84TF

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GTTGTACTACTAGTGGTTTTGGCCATCTCAGTAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCCGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGGGAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAGGATGGA
AAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATTCAATAGATGCAAAAGATGGAAAAGAT
GCAAAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR4HB84TF 389 0 0
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GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAAACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTGGTTTTGGCCATCTCAGTAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCCGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGGGAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAGGATGGA
AAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATTCAATAGATGCAAAAGATGGAAAAGAT
GCAAAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGT

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 2

CO CL8668Contig1 1131 2 2 U
GAACCTGGAAATGTGCCACGTCAAGAACGAGAGGTTGCTGCAAGATGAGTTTAGCGGGAG
GAGTACGCCAGCAACATGGATCGAGAGAAGCTCGAGCGACACTCAAACTGCGCATGCCGC
TTCGCATGGTGGTGACAGTAACGAAATGTCATCACCGAATGAATCACTGTCCCGCCCCTC
TGATGTTTCTGCGTTTGAGCTTCAGACAAGTGGTAGCCCTTCTACAAGCCAGGAAAAAAC
AGAGGAGACTGCTGCTCAGAAAGACAAGCGAATCATTCATCGCTCCGTTAGTATATTTTT
TCTTCTGCTTATTTGCTCTTTCCTAACTTAAAAATAATCCACTTGAGTCGACATGTTAAC
AGATGGAGGAAATAGAACAGAAGTTCTTGGCGTTGAGTTCGACAAAGAGTTTCAAAGACG
CTGCATTGGACCCGATACAAGACTACTTAGACACGCCTTTGAATTGGCCGGAGGAGTTCA
AGAGGCTACAGCGGGAGATAATAGAGCTATGGCACACGTGTAACGTCTCCATGGCCCACA
GAAGCTACTTCTTCCTATTATTCAGAGGGGATCAGAAAGATTGCTTGTACTTGGAGGTCG
AACTCCGTAGACTCAAGTACATCGCCCATAATAGCAAAGCCAGCGACGATCTGAGCCTAG
TGTCCAGCACGAGGGCGTTGACTAGAGAGAGGTTTAAGCTGAGCAAGCTGGTGCAGAGGA
AACTATCCAAGGAAGAGAGAGAGAACCTGTTCTTGAGATGGGGCGTTGGGCTGAACACAA
GGCACAGGCGGGTCCAGCTGGCGCACAGACTCTGGTCTGATTATAAAGACATGGGGCATG
TCCGAGAGAGTGCTTCCCTCGTTGGTAAGCTCCATGGATTCGTCGACATGAACTTGACTT
CCTCTGACATGTTTGCCATCAACTTTGCTTTCAAACCACCTCGTCCCAAGAAATCTAGTC
TTTGGAAACGCAGCGTTTTGTCCCTCTCGTTTTTGTAACTTGTAGTTAGTAAGTAAAGCA
CACTATAAAGAAATGTTCGCAAATGAAATCACAATCTTCTTTTATATTTGATCCTGTTGT
CTCTCTCTCTTTAGTAAATTCGAAGGTAATGTCTATATCAATCTTCTAGCC


BQ
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AF RR4AJ07TF U 1
AF RR4AJ07JQ C 392
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BS 782 1131 RR4AJ07JQ

RD RR4AJ07TF 781 0 0
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GAGTACGCCAGCAACATGGATCGAGAGAAGCTCGAGCGACACTCAAACTGCGCATGCCGC
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TGATGTTTCTGCGTTTGAGCTTCAGACAAGTGGTAGCCCTTCTACAAGCCAGGAAAAAAC
AGAGGAGACTGCTGCTCAGAAAGACAAGCGAATCATTCATCGCTCCGTTAGTATATTTTT
TCTTCTGCTTATTTGCTCTTTCCTAACTTAAAAATAATCCACTTGAGTCGACATGTTAAC
AGATGGAGGAAATAGAACAGAAGTTCTTGGCGTTGAGTTCGACAAAGAGTTTCAAAGACG
CTGCATTGGACCCGATACAAGACTACTTAGACACGCCTTTGAATTGGCCGGAGGAGTTCA
AGAGGCTACAGCGGGAGATAATAGAGCTATGGCACACGTGTAACGTCTCCATGGCCCACA
GAAGCTACTTCTTCCTATTATTCAGAGGGGATCAGAAAGATTGCTTGTACTTGGAGGTCG
AACTCCGTAGACTCAAGTACATCGCCCATAATAGCAAAGCCAGCGACGATCTGAGCCTAG
TGTCCAGCACGAGGGCGTTGACTAGAGAGAGGTTTAAGCTGAGCAAGCTGGTGCAGAGGA
AACTATCCAAGGAAGAGAGAGAGAACCTGTTCTTGAGATGGGGCGTTGGGCTGAACACAA
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR4AJ07JQ 740 0 0
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GCACACGTGTAACGTCTCCATGGCCCACAGAAGCTACTTCTTCCTATTATTCAGAGGGGA
TCAGAAAGATTGCTTGTACTTGGAGGTCGAACTCCGTAGACTCAAGTACATCGCCCATAA
TAGCAAAGCCAGCGACGATCTGAGCCTAGTGTCCAGCACGAGGGCGTTGACTAGAGAGAG
GTTTAAGCTGAGCAAGCTGGTGCAGAGGAAACTATCCAAGGAAGAGAGAGAGAACCTGTT
CTTGAGATGGGGCGTTGGGCTGAACACAAGGCACAGGCGGGTCCAGCTGGCGCACAGACT
CTGGTCTGATTATAAAGACATGGGGCATGTCCGAGAGAGTGCTTCCCTCGTTGGTAAGCT
CCATGGATTCGTCGACATGAACTTGACTTCCTCTGACATGTTTGCCATCAACTTTGCTTT
CAAACCACCTCGTCCCAAGAAATCTAGTCTTTGGAAACGCAGCGTTTTGTCCCTCTCGTT
TTTGTAACTTGTAGTTAGTAAGTAAAGCACACTATAAAGAAATGTTCGCAAATGAAATCA
CAATCTTCTTTTATATTTGATCCTGTTGTCTCTCTCTCTTTAGTAAATTCGAAGGTAATG
TCTATATCAATCTTCTAGCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL8669Contig1 1120 2 6 U
GTGAAGCCCATAAATTCAAATCGAAACCAGATTTGGGTCCATCGGAGTGGCGAAAACAAA
CCTTGTTGGGCTTTTTTTTCCGAGTAATAGCATTATTGTAAATATCGACTTTTGTTCCGA
TTTGTTTCGGAAGAACCTCGAAAATGGATATGGGTCCTTCCTTGCCCAAAGGTGCACTCT
CTGCAGCTCAGGAAAGAGTTTTTTTTTTTGTCTTCAGTGGAACTTTACTTCTTTCTTTGT
ACTGCTGTGTTGCTTAGATAAAAAGAAGCAGAGGCAAAAGGTGTTGACAACTACGATAGG
GAATTGGAAGATGCGATAGACAGGCTTATCGTTTAGTGTGATAGGAAGATTGGTAGGGCT
CTTAAGCGTCTTCAGGAGAGGATGCCAAATCTGCGATTGCTATCTCAGTCACTATATCTA
TGCCACTAATCTGTGATTTGCATTAGCATTGTCAAAAATCTTTTGTACTGCCTTTAGTGA
TCGTCGGTTAGCTGATCATTTTGGAGGGAAGCTTCATTTGGGTTACATGCTGATCCGCGA
CAAATTAGCAGAGCTTCAGAACAAAGTTCACAAGGAACGGGTCGAAGAAAGGAGGTTCAG
TTTCCTAAAAACTTTGAGATGAATTCTTGATTTACTTCCTTAAATCCTCAACATTTTCGC
TGGAAAACTACTAACATCAGATCAAAGGAGAGGAGCAGAAAGCGAGAATCAAGTAAAGAC
AGAGACAGAGGAGATAGCCGTGACCGTGGAAGAGATCTTGACCGTAGGAGTAGAGACCGC
GACAGGCATCATGAACACCGTGACCATGACAGAAACCATAACTAGTCACGTGGCTATTAT
GACTCGAGAAGCAGGCGCAGTTCGCGTTCCAGGTCTAGGGAAAGACCAAGAGATTATGAT
CGCCGAAGACGCCATGACCGCTATTAAGACTGCTGGAGATAGTTGCAGCAAGTTTAAGAA
GTTTTTATAGATGCGTAGTTGCAAACACTTTTGTTTTTCTTATGTGTTTCTGAGATTGTA
AAAGTTGCTCAGTTTGCAAGAGGAGTCTCTTGTTCTAACCTTTCTTAGAAGATTGTGGTG
ATGGAATATAAACCTTCAGAATCTATTTAGCTTTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FI92TF U 1
AF RR4FI92JQ C 283
BS 1 610 RR4FI92TF
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RD RR4FI92TF 683 0 0
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TTTGTTTCGGAAGAACCTCGAAAATGGATATGGGTCCTTCCTTGCCCAAAGGTGCACTCT
CTGCAGCTCAGGAAAGAGTTTTTTTTTTTGTCTTCAGTGGAACTTTACTTCTTTCTTTGT
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GAATTGGAAGATGCGATAGACAGGCTTATCGTTTAGTGTGATAGGAAGATTGGTAGGGCT
CTTAAGCGTCTTCAGGAGAGGATGCCAAATCTGCGATTGCTATCTCAGTCACTATATCTA
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TCGTCGGTTAGCTGATCATTTTGGAGGGAAGCTTCATTTGGGTTACATGCTGATCCGCGA
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TGGAAA*CTACTAACATCAGATC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4FI92JQ 838 0 0
TG
TGACAACTACGATAGGGAATTGGAAGATGCGATAGACAGGCTTATCGTTTAGTGTGATAG
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TCAGTCACTATATCTATGCCACTAATCTGTGATTTGCATTAGCATTGTCAAAAATCTTTT
GTACTGCCTTTAGTGATCGTCGGTTAGCTGATCATTTTGGAGGGAAGCTTCATTTGGGTT
ACATGCTGATCCGCGACAAATTAGCAGAGCTTCAGAACAAAGTTCACAAGGAACGGGTCG
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TCCTCAACATTTTCGCTGGAAAACTACTAACATCAGATCAAAGGAGAGGAGCAGAAAGCG
AGAATCAAGTAAAGACAGAGACAGAGGAGATAGCCGTGACCGTGGAAGAGATCTTGACCG
TAGGAGTAGAGACCGCGACAGGCATCATGAACACCGTGACCATGACAGAAACCATAACTA
GTCACGTGGCTATTATGACTCGAGAAGCAGGCGCAGTTCGCGTTCCAGGTCTAGGGAAAG
ACCAAGAGATTATGATCGCCGAAGACGCCATGACCGCTATTAAGACTGCTGGAGATAGTT
GCAGCAAGTTTAAGAAGTTTTTATAGATGCGTAGTTGCAAACACTTTTGTTTTTCTTATG
TGTTTCTGAGATTGTAAAAGTTGCTCAGTTTGCAAGAGGAGTCTCTTGTTCTAACCTTTC
TTAGAAGATTGTGGTGATGGAATATAAACCTTCAGAATCTATTTAGCTTTTCATCC

QA 3 838 3 838
DS 



AS 1 2

CO CL8670Contig1 1098 2 2 U
GGCTCTTTCCTTTCTCTTGTTCCTCTTCATTTCTTTACATATTTAATTTATTTATTCAAT
CTTTTTTTGTTTCTTGTTTGGGTTGTATGATCAAAATCATCATCGGGAAACACCATATTA
TTTGCTGTTAAATTCTAATAACTATTCAAAACAAATGTCTCAAACGAGCTATTACCGATC
GCCGTTCGGAGACACGACTTACACCAAAGTCTTTGTTGGAGGATTAGCATGGGAGACTCC
CACCGAAGAGATGCGTCGTTACTTCGATCAGTTCGGAGAGATTCTTGAAGCCGTCATTAT
CACTGATAAAAACACAGGAAAATCTAAAGGCTATGGTTTCGTGACGTTTCGCGAGGCGGA
TTCTGCAACGAGAGCCGTGGCTGAGCCAAATCCGGTGATCGACGGAAGAAAAGCTAATTG
TAATATTGCTTCTTTTGGACGGCCTAGACCATCGCCACCTCGAGGTCGAGGACAAACAGG
AAGTCCAAGTCAGTACCAAAGTGGAGGACCATCAGCCTATACAGGGATGGCTGCACCGCT
GCCACCGGCTGCAGCTGCCCACCAGCTCATGTATCCATCCTATGGGTACACCTATAACCC
TGATCAGTTTGGATACCACCAAGCTTTGTACAACACACAGTTGCAACAAGCACAATACTA
TCAACAGCAGCAACAACTCTATGGAGGAGGAGCAACATCACCATCATCATCATCAGCAAC
CATCATGCCTTCTCCTTACTATTATGGCTATTCTCTTCAAGCTCCTAGAATGCCATACCA
ACATCATCATCTTCCTCAACCATATAACCCTCAACAACATCATCATCAACGGTTTACTTC
TCCTTTCTTCGTTTACCCATCCAATTCCTCTTTTGCACCTCCACTCCAAGGACCACACTC
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TGCACCTGAAATCACAACCAGCAACTACAAAGAACCAATATCTTCTTGATATCTTGCATT
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TGATATAAAAAAATAGAATAACTACAAAAA

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AF RR4DX42TF U 1
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A

QA 1 352 1 352
DS 

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AAAAAAAACACCAAAGTTCTAAATAGGCTTAAACCTTCAGAAACATCAATTAACACACCG
AAAAACACCAAATATATGTTTTTACTCGATAAAATTACTCAAATTGCAGACTAGAAATTA
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QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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CCCTTTCATGGGAACAGGTGAAGTTAAGTTCTTAGGAGGTGTTGCTTCTGTGAAAGGAGT
AAAAGAGTTTAATCCTGATGCAGCTAAAAAGCGCTTCTTTGAGATTTATCTCGATAAGTA
CGCGTAGCCAGAGTCTGGAATTGGATTTCCTGGAGCACTTGAGCTTGTTACTGAGTGTAA
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CACAAGCGAGTGTATTGTTATTGAGGATGCACTTGCTGGAGTCCAGGCTGCTCAAGCTGC
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BQ
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AF RR4FE56TF U 1
AF RR4FE56JQ C 367
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GAACAGAGGTCTCAAAGTCGCTGTTGCCTCTAGCGCCGACCGTGTCAAAGTTGATGCAAA
CCTTGCAGCCGCTGGTTTGTCTTTGTCCATGTTTGATGCAATTGTATCAGCAGACGCATT
TGAGAACTTGAAACCAGCTCCAGATATTTTCTTGGCTGCTTCCA*GATCTTGGGTGTGCC
CACAAGCGAGTGTATTGTTATTGAGGATGCACTTGCTG*AGTC*AGGCTGCTCA*GCTGC
AAACATGAGATGCATAGCT

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DS 

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DS 



AS 1 2

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AATGCATATAACATCATTGTCTCCTGGCTTGCCGAGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GV03JQ U 62
AF RR4EI32JQ U 1
BS 1 66 RR4EI32JQ
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BS 202 287 RR4EI32JQ
BS 288 288 RR4GV03JQ
BS 289 373 RR4EI32JQ
BS 374 374 RR4GV03JQ
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BS 376 376 RR4GV03JQ
BS 377 442 RR4EI32JQ
BS 443 443 RR4GV03JQ
BS 444 698 RR4EI32JQ

RD RR4GV03JQ 419 0 0
AAAAAAAAAAATGTATTCATCGTCATTCTTCTATTTACATTTTTTT*ACACTTTCCCTCG
GATATTCATTTCATCTTTGGTCTACTTTTAGTTTCTTCATAATACCGACAATCAACGCCC
TTCCTCTAAACTTACTACACGCGATAGGGATACCCTATCAATCTAAGCGCATCTTATATT
TCTCCTGAGTCCTCACCATACCCTTTTCATCACACCTGCATTCTCTCGACCCAAGCCTTT
ATCTACATCCATTTCCTCCTATTCTTTCTCTAGTCGTAGCTCTCAGGAGTTGCTACACCC
TCGTATACAACAAAACTCGAGTTCTGAAGCTTCTTCAATCTGTCTCTCCACATCGCTGCG
TCGGTGTACCTTTCCTCTTTAAACGCCAAATCCATATTCCTCAGTAGTTTAAGCTCCTC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR4EI32JQ 698 0 0
CTCTCTTAAAACATCTTATTTACCAATTCATTCAAAGTAGAAACTCACGTACACCAAAAA
GAAAAAGAAAAATGTATTCATCGTCATTCTTCTATTTACATTTTTTTTACACTTTCCCTC
GGATATTCATTTCATCTTTGGTCTACTTTTAGTTTCTTCATAATACCGACAATCAACGCC
CTTCCTCTAAACTTACTACATGCGATAGGGATACCCTATCAATCTAAGCGCATCTTATAT
TTCTCCTGAGTCCTCACCATACCCTTTTCATCACACCTGCATTCTCTTGACCCAAGCCTT
TATCTACATCCATTTCCTCCTATTCTTTCTCTAGTCGTAGCTCTCAGGAGTTGCTACACC
CTCGTATACAACAGAGCTCGAGTTCTGAAGCTTCTTCAATCTGTCTCTCCACATCGCTGC
GTCGGTGTACCTTTCCTCTTTAGACGCCAAATCCATATTCCTCAGTAGTTTAAGCTCCTC
CGATATGGGATCTGGTCCCTCTGGAGCGCTGTCAAGGATAACATTGAAAATGGGCTTTGT
GCTCTGCGGTCTGCCTCCATAACCAATCTTGATAGCATCTTCCAGGACTATTGATTTATT
CACATATATCGGAGCCTGGCATGCTCTTGCAACGTTGATAGCATCAGATGGCCGTGAGTC
AATGCATATAACATCATTGTCTCCTGGCTTGCCGAGAT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL8675Contig1 900 2 4 U
GGGAAGCAGAGATATCACTACAATGTTGGAGACTCGAGGCTGGACTCGCATATACAGAAG
GGTAATGAAGATAGCCTTTTGATTAGCTGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCCTC
ATTATGGATGCTGTAACTGGCTTCCCTTCTCAAGTCTATGAATTGTCAACCGTCTTCCTG
CACAAGGAGTGGATAATGGAACAGTGGGACAAGAACTACTATATAAGTTCTATAGCTGGT
TCGGATAACGGGAGCTCGTTAGTTGTTATGTCAAAAGGAACATGTTATACGCAGCAGTCA
TACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATACAAGTGGATAAATAAGAAATGGAAAGAAGATTTT
CATGTAACATCTATGACAACTGCTGGTAATCGTTGGGGTGTGATAATGTCAAAGAACTCT
GGCTTCTCTGATCAGGTGGTGGAGCTTGATTTTTTGTACCCAAGCGATGGAATACATAGG
AGGTGGGAGAGTGGGTATTGAATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGATCAAGCAGCTTTC
ATATTAAGCATACCAAAGCGTAAACTGAATGATGAAACTCAAGAGACTCTTCGTACTACT
GCCTTTCCAAGTACTCATGTCAAGGACAAGTGGGCGAAAAGTCTGTACATTGTATCAATA
TGCTATGGCAGAACAGTGTGCTGATACACACACACTCGGCATCATATGTTCTGTTAGAAA
GCCAAAGACAAATGGAGCTTCTTAAGAGTCGTAATACCAATCAAAATGTTAGAACCAGAC
GCAGCCTGTGATGAGAGATGGATGTGTCTTGGTAATGTATGTACACAAGTACAAAAAGAA
AGATAGAAACGAGAAAATGGAATTTAGTAATAGAAAGATTTGAGGGTTTTTTAAGCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FE43TF U 1
AF RR4FE43JQ C 273
BS 1 657 RR4FE43TF
BS 658 658 RR4FE43JQ
BS 659 667 RR4FE43TF
BS 668 900 RR4FE43JQ

RD RR4FE43TF 667 0 0
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GGTAATGAAGATAGCCTTTTGATTAGCTGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCCTC
ATTATGGATGCTGTAACTGGCTTCCCTTCTCAAGTCTATGAATTGTCAACCGTCTTCCTG
CACAAGGAGTGGATAATGGAACAGTGGGACAAGAACTACTATATAAGTTCTATAGCTGGT
TCGGATAACGGGAGCTCGTTAGTTGTTATGTCAAAAGGAACATGTTATACGCAGCAGTCA
TACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATACAAGTGGATAAATAAGAAATGGAAAGAAGATTTT
CATGTAACATCTATGACAACTGCTGGTAATCGTTGGGGTGTGATAATGTCAAAGAACTCT
GGCTTCTCTGATCAGGTGGTGGAGCTTGATTTTTTGTACCCAAGCGATGGAATACATAGG
AGGTGGGAGAGTGGGTATTGAATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGATCAAGCAGCTTTC
ATATTAAGCATACCAAAGCGTAAACTGAATGATGAAACTCAAGAGACTCTTCGTACTACT
GCCTTTCCAAGTACTCATGTCAAGGACAAGTGGGCGAAAAGTCTGTACATTGTATCA*TA
TGCTATG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR4FE43JQ 628 0 0
AAAAGGAACATGTTATACGCAGCAGTCATACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATACAAGTG
GATAAATAAGAAATGGAAAGAAGATTTTCATGTAACATCTATGACAACTGCTGGTAATCG
TTGGGGTGTGATAATGTCAAAGAACTCTGGCTTCTCTGATCAGGTGGTGGAGCTTGATTT
TTTGTACCCAAGCGATGGAATACATAGGAGGTGGGAGAGTGGGTATTGAATAACATCAAT
GGCAGCAACTGCAGATCAAGCAGCTTTCATATTAAGCATACCAAAGCGTAAACTGAATGA
TGAAACTCAAGAGACTCTTCGTACTACTGCCTTTCCAAGTACTCATGTCAAGGACAAGTG
GGCGAAAAGTCTGTACATTGTATCAATATGCTATGGCAGAACAGTGTGCTGATACACACA
CACTCGGCATCATATGTTCTGTTAGAAAGCCAAAGACAAATGGAGCTTCTTAAGAGTCGT
AATACCAATCAAAATGTTAGAACCAGACGCAGCCTGTGATGAGAGATGGATGTGTCTTGG
TAATGTATGTACACAAGTACAAAAAGAAAGATAGAAACGAGAAAATGGAATTTAGTAATA
GAAAGATTTGAGGGTTTTTTAAGCATTC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL8676Contig1 605 2 3 U
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GATAAAAACATTTTGCAAATAATCGAGGGGCTTTTTTACTTCTTCTTCTTGAATAGAACG
GCCTTCTCTTCCTCATCACCATCATCATCATCATCTTCTTCGTCAGTAGTATCGTCAAAC
TCTTCATCATCATCGTCCATATCAATATCATCAAACTCTTCCTCATCAAAATCTGTCTCC
TCCTCCTCCTCATCCGAGGAAGAGCTGCCCTCATTGTTCACCACTCGCTTTCCCTGACCC
GCTTCCATTTTCCCTCTTCTCACCACCGACACTGCCTCCTCATGAGTGAAGTAGGAACCG
AAACCGGGTTGCGTAACCGGAAATGGTTCAGCGAAAACCGGGGGTAGCCTCTGGTTTAGC
AGAAGCAGAGACCGAATGGCCGGTCCAGTGTTCTGCACCGTCTCCGTGAGATTGGCGGAG
GCACGTCCACGGAAGAGTAAACTCGCCACTGATTTTCCGTCGCGGATGAGTAATCTCGCC
GCTGATGATGAAGCTGAAGCCATGTTTGATCGTAGGTGGTTTTGTAGTACGTGTAACTGA
CTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RR4G409JQ U 34
AF RR4G409TF C 1
BS 1 33 RR4G409TF
BS 34 423 RR4G409JQ
BS 424 605 RR4G409TF

RD RR4G409JQ 390 0 0
CACATTAATCTCATAAAAAAAGAAACAGATAAAAACATTTTGCAAATAATCGAGGGGCTT
TTTTACTTCTTCTTCTTGAATAGAACGGCCTTCTCTTCCTCATCACCATCATCATCATCA
TCTTCTTCGTCAGTAGTATCGTCAAACTCTTCATCATCATCGTCCATATCAATATCATCA
AACTCTTCCTCATCAAAATCTGTCTCCTCCTCCTCCTCATCCGAGGAAGAGCTGCCCTCA
TTGTTCACCACTCGCTTTCCCTGACCCGCTTCCATTTTCCCTCTTCTCACCACCGACACT
GCCTCCTCATGAGTGAAGTAGGAACCGAAACCGGGTTGCGTAACCGGAAATGGTTCAGCG
AAAACCGGGGGTAGCCTCTGGTTTAGCAGA

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR4G409TF 605 0 0
CGTCAAAAACATATAATTATTTTGTAAGTCTAACACATTAATCTCATAAAAAAAGAAACA
GATAAAAACATTTTGCAAATAATCGAGGGGCTTTTTTACTTCTTCTTCTTGAATAGAACG
GCCTTCTCTTCCTCATCACCATCATCATCATCATCTTCTTCGTCAGTAGTATCGTCAAAC
TCTTCATCATCATCGTCCATATCAATATCATCAAACTCTTCCTCATCAAAATCTGTCTCC
TCCTCCTCCTCATCCGAGGAAGAGCTGCCCTCATTGTTCACCACTCGCTTTCCCTGACCC
GCTTCCATTTTCCCTCTTCTCACCACCGACACTGCCTCCTCATGAGTGAAGTAGGAACCG
AAACCGGGTTGCGTAACCGGAAATGGTTCAGCGAAAACCGGGGGTAGCCTCTGGTTTAGC
AGAAGCAGAGACCGAATGGCCGGTCCAGTGTTCTGCACCGTCTCCGTGAGATTGGCGGAG
GCACGTCCACGGAAGAGTAAACTCGCCACTGATTTTCCGTCGCGGATGAGTAATCTCGCC
GCTGATGATGAAGCTGAAGCCATGTTTGATCGTAGGTGGTTTTGTAGTACGTGTAACTGA
CTGCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL8677Contig1 777 2 2 U
GGGCCGCTTAACAGTCTTGAGTCGAAATCGGAATCGGAAATATCGCTTTCGTTCGAGGCG
TCACCTCTCTCCGTGATTTCTAGATTAGAGATTAGCGTTTGCAGAGGTTTTTGACCTATT
CGAGATGTATTCCGATCGTGTGGAGGCTGGGAATGTAAGTAAGAATACGGTTAAGAACCG
TCTCAATGGCGGCTCTGGAGACTTGTCTTCGCGCGGGAGACAAGTCACGAGGAAGAGAGG
AAGGCAGGATGATGATAAGTGGGAGCATGATCTTTTCGATGATGACAACAAGCCTCGACT
TTCAAAGAATCCACCACTAAGGAACAGTAACTTACAAAAGTCTACAAGGGAGGCTGCTAG
ATCACCAGCCGTAAAGAGTGGTTCAGGTGAAACCAAATCTGAGACCAGAGCAGCTTTGAA
CGGAGCTACTAAGAAGAAACCACAGCAGGCTGGTACCTCAGTTGATAGCTTCCTGGAATC
ATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACCTCATTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCT
GATGCATATGACAGACGATGACCTCAAAGCTATGCTCATACCAATGGGACCCAGGAAGAA
GATACTTCTTGCTTTGGGATCTAAACGTTGATAGATTTGCTTCTTGCTTCAAAGCTCTTA
GGTGAATGATTGTCAGAAAGACCCTCAACTTTTCTTTTTCAATGTCCCTTTTTGGTTTCT
CTTATGTATCTCAAGAGACGAAAGTAGGTCGCGTTTTGAGATTAAAACTGTTGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FT22TF U 1
AF RR4FT22JQ C 207
BS 1 596 RR4FT22TF
BS 597 777 RR4FT22JQ

RD RR4FT22TF 596 0 0
GGGCCGCTTAACAGTCTTGAGTCGAAATCGGAATCGGAAATATCGCTTTCGTTCGAGGCG
TCACCTCTCTCCGTGATTTCTAGATTAGAGATTAGCGTTTGCAGAGGTTTTTGACCTATT
CGAGATGTATTCCGATCGTGTGGAGGCTGGGAATGTAAGTAAGAATACGGTTAAGAACCG
TCTCAATGGCGGCTCTGGAGACTTGTCTTCGCGCGGGAGACAAGTCACGAGGAAGAGAGG
AAGGCAGGATGATGATAAGTGGGAGCATGATCTTTTCGATGATGACAACAAGCCTCGACT
TTCAAAGAATCCACCACTAAGGAACAGTAACTTACAAAAGTCTACAAGGGAGGCTGCTAG
ATCACCAGCCGTAAAGAGTGGTTCAGGTGAAACCAAATCTGAGACCAGAGCAGCTTTGAA
CGGAGCTACTAAGAAGAAACCACAGCAGGCTGGTACCTCAGTTGATAGCTTCCTGGAATC
ATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACCTCATTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCT
GATGCATATGACAGACGATGACCTCAAAGCTATGCTCATACCAATGGGACCCAGGA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4FT22JQ 571 0 0
CTTCGCGCGGGAGACAAGTCACGAGGAAGAGAGGAAGGCAGGATGATGATAAGTGGGAGC
ATGATCTTTTCGATGATGACAACAAGCCTCGACTTTCAAAGAATCCACCACTAAGGAACA
GTAACTTACAAAAGTCTACAAGGGAGGCTGCTAGATCACCAGCCGTAAAGAGTGGTTCAG
GTGAAACCAAATCTGAGACCAGAGCAGCTTTGAACGGAGCTACTAAGAAGAAACCACAGC
AGGCTGGTACCTCAGTTGATAGCTTCCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACCT
CATTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTGATGCATATGACAGACGATGACCTCA
AAGCTATGCTCATACCAATGGGACCCAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCTAAAC
GTTGATAGATTTGCTTCTTGCTTCAAAGCTCTTAGGTGAATGATTGTCAGAAAGACCCTC
AACTTTTCTTTTTCAATGTCCCTTTTTGGTTTCTCTTATGTATCTCAAGAGACGAAAGTA
GGTCGCGTTTTGAGATTAAAACTGTTGTAAC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL8678Contig1 863 2 2 U
GGAGAGGAGATTAAGAGATCGAGAAGTAGAGATGATGAGGTGAAGGGACGTCGCGAAAGA
GATTCATCCTAACCATTGCTGCATAAGCCTAGAAGAAGCCCCTGGATTTGAGTCTCGGAA
TGAAGAGAGTCTGTCCTTCACAGGGCGCTCCAATAAGCGTGATATTGCGACCGGTGATCG
GAATATTTTACGATGAAGACGGCCGTTCCTTTCTGTCCATGTCCAATAGATACAAGCCTG
CCAACAGAGACGGAGGAGGATACCAGTCGGAGATCATCTATCAGTTGATTGTAGATGTAC
CAATACTCGTTCCCATGTTCTCTCTGGTTGGATACCACAGCGCATTGCAGCTGATCGCCA
CAAGTCCCACGAGAATTGGCAATCGAAGAAGAGATGGTTTCGACTCTCCATCGCTTGGTT
ACAGAGCAGACAGTTTGGTGCAGTTTGAAGTCCCCAACCAAGTATCCTATCCCTTGTTGG
ACATCTGTTCAGTACAAAAAGCCAAGCTAAGAAGCTGTGTCTGGGAATCCCACCTTTATT
CCACACAGAATAGAACCAAAGCGGTAACCTCCATTGATTGTCTCGATAAAGTGATGCTAG
CGTTGCCTCAGAAGAGATCCCTATAGCTGAGTCACCAATGATGTTCATGTATGATCGCAG
TGAGCCATACTGTGTCCAATTGTCGCTCCAGAAACGAACCGAGTGGCCATTTTGAACGCG
CAGCTTGATCCATTCATAGATAGAGTGGCTCAGTTTTAGTAACTTGTTCACCTGCCATGA
GAAGCGTTTACTCGGTGCTGTTATCCAAAGGTTATCCAAAGATGGTATATTTGCATGATC
ATGAAATGAAAATTATTGAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CJ14TF U 1
AF RR4CJ14JQ C 120
BS 1 701 RR4CJ14TF
BS 702 863 RR4CJ14JQ

RD RR4CJ14TF 701 0 0
GGAGAGGAGATTAAGAGATCGAGAAGTAGAGATGATGAGGTGAAGGGACGTCGCGAAAGA
GATTCATCCTAACCATTGCTGCATAAGCCTAGAAGAAGCCCCTGGATTTGAGTCTCGGAA
TGAAGAGAGTCTGTCCTTCACAGGGCGCTCCAATAAGCGTGATATTGCGACCGGTGATCG
GAATATTTTACGATGAAGACGGCCGTTCCTTTCTGTCCATGTCCAATAGATACAAGCCTG
CCAACAGAGACGGAGGAGGATACCAGTCGGAGATCATCTATCAGTTGATTGTAGATGTAC
CAATACTCGTTCCCATGTTCTCTCTGGTTGGATACCACAGCGCATTGCAGCTGATCGCCA
CAAGTCCCACGAGAATTGGCAATCGAAGAAGAGATGGTTTCGACTCTCCATCGCTTGGTT
ACAGAGCAGACAGTTTGGTGCAGTTTGAAGTCCCCAACCAAGTATCCTATCCCTTGTTGG
ACATCTGTTCAGTACAAAAAGCCAAGCTAAGAAGCTGTGTCTGGGAATCCCACCTTTATT
CCACACAGAATAGAACCAAAGCGGTAACCTCCATTGATTGTCTCGATAAAGTGATGCTAG
CGTTGCCTCAGAAGAGATCCCTATAGCTGAGTCACCAATGATGTTCATGTATGATCGCAG
TGAGCCATACTGTGTCCAATTGTCGCTCCAGAAACGAACCG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4CJ14JQ 744 0 0
ATGAAGAGAGTCTGTCCTTCACAGGGCGCTCCAATAAGCGTGATATTGCGACCGGTGATC
GGAATATTTTACGATGAAGACGGCCGTTCCTTTCTGTCCATGTCCAATAGATACAAGCCT
GCCAACAGAGACGGAGGAGGATACCAGTCGGAGATCATCTATCAGTTGATTGTAGATGTA
CCAATACTCGTTCCCATGTTCTCTCTGGTTGGATACCACAGCGCATTGCAGCTGATCGCC
ACAAGTCCCACGAGAATTGGCAATCGAAGAAGAGATGGTTTCGACTCTCCATCGCTTGGT
TACAGAGCAGACAGTTTGGTGCAGTTTGAAGTCCCCAACCAAGTATCCTATCCCTTGTTG
GACATCTGTTCAGTACAAAAAGCCAAGCTAAGAAGCTGTGTCTGGGAATCCCACCTTTAT
TCCACACAGAATAGAACCAAGGCGGTAACCTCCATTGATTGTCTCGATAAAGTGATGCTA
GCGTTGCCTCAGAAGAGATCCCTATAGCTGAGTCACCAATGATGTTCATGTATGATCGCA
GTGAGCCATACTGTGTCCAATTGTCGCTCCAGAAACGAACCGAGTGGCCATTTTGAACGC
GCAGCTTGATCCATTCATAGATAGAGTGGCTCAGTTTTAGTAACTTGTTCACCTGCCATG
AGAAGCGTTTACTCGGTGCTGTTATCCAAAGGTTATCCAAAGATGGTATATTTGCATGAT
CATGAAATGAAAATTATTGAATTT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL8679Contig1 815 2 8 U
GGGAGACGGAGTGGTACGCAACCTTGTTCCTTCCTTGGAAAAGAGAAGATAAGAGCTTCT
TCTTCTTCTTCCTGGTCGTTTAAGAAAAAAAAAATCTCTCTCCTTCCCTTTTTTGATCTC
TGAAAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTTGGATCCTACTGGT
TAGGTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATCAATTCGATATCAA
CGAGCATCGAAGGCGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGAACAATGCAGAAGCC
GTTGCCTGAGCTGCTGAAAAAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTCCCACGGGATGCTAC
AAACTACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATCCCATCTGTCTGCGA
AGTTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACAACAACAGTAACGGGATATCTTGA
GAAAGGGAAGCTATGTGACGTGGAAGGGATGAAGACAAAAGTGATGATATGGGTCAAAGT
CACAAGCATCTCTGCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGGATGAAGAAGAGCAG
AAACCGAGATGCTTATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGATAAATTCTAACTCCT
TCTGCTGATGAGAGTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAATTAAATTATTAAGTT
TTAAGCTTTTTATGGGTTTGCATGATGGTGTTATGATCTGAAGAATTAACTTGTGCTGTA
TGGATTCGATTGATGAAGAGTATTCTTGGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DH39TF U 1
AF RR4DH39JQ C 74
BS 1 89 RR4DH39TF
BS 90 90 RR4DH39JQ
BS 91 93 RR4DH39TF
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BS 95 721 RR4DH39TF
BS 722 722 RR4DH39JQ
BS 723 778 RR4DH39TF
BS 779 815 RR4DH39JQ

RD RR4DH39TF 778 0 0
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TCTTCTTCTTCCTGGTCGTTTAAGAAAAAGAAA*TCTCTCTCCTTCCCTTTTTTGATCTC
TGAAAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTTGGATCCTACTGGT
TAGGTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATCAATTCGATATCAA
CGAGCATCGAAGGCGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGAACAATGCAGAAGCC
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AAACTACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATCCCATCTGTCTGCGA
AGTTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACAACAACAGTAACGGGATATCTTGA
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CACAAGCATCTCTGCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGGATGAAGAAGAGCAG
AAACCGAGATGCTTATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGATAAATTCTAACTCCT
TCTGCTGATGAGAGTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAATTAAATTATTAAGTT
T*AAGCTTTTTATGGGTTTGCATGATGGTGTTATGATCTGAAGAATTAACTTGTGCTG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4DH39JQ 742 0 0
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CGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGAACAATGCAGAAGCCGTTGCCTGAGCTG
CTGAAAAAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTCCCACGGGATGCTACAAACTACGAGTTC
GATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATCCCATCTGTCTGCGAAGTTGGCTACAAG
GACTCATCCGTCCTCAAATTCACAACAACAGTAACGGGATATCTTGAGAAAGGGAAGCTA
TGTGACGTGGAAGGGATGAAGACAAAAGTGATGATATGGGTCAAAGTCACAAGCATCTCT
GCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGGATGAAGAAGAGCAGAAACCGAGATGCT
TATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGATAAATTCTAACTCCTTCTGCTGATGAGA
GTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAATTAAATTATTAAGTTTTAAGCTTTTTAT
GGGTTTGCATGATGGTGTTATGATCTGAAGAATTAACTTGTGCTGTATGGATTCGATTGA
TGAAGAGTATTCTTGGTTTTAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL8680Contig1 605 2 1 U
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TCGGCCGGATTTAGCATTAGGAGTACCGGCGCACACCGATCTCAGTGGGATCACTCTGCT
TGTGCCTAACGAAGTTCCTGGACTTCAAGTCTTCAAAGACGATCACTGGTTCGACGCCGA
GTATATTCCTTCCGCCGTCATTGTTCACATCGGCGATCAGATTCTGAGGCTGAGTAATGG
GAGGTATAAGAACGTGTTGCATAGGACGACGGTGGATAAGGACAGGACAAGGATGTCGTG
GCCAGTTTTCTTGGAGCCTCACCGTGAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATCAG
CGATGGTAATCCTCCAAAGTACAAGCCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCT
CAATAAGCTTCCTCTGGATTAAGAAGGAAAAATAAAATCAAAAGTATGAAGAAAAGTGTT
GTTGAATTTAAATTAATTTATTTTAAAAACTGTTGTGTTTGAAATAAGGTGTGGTTGTTG
TTTTCCCGCGATAAGAAGTTTCGATGTATCTCTTCTTGTGTTCAGTTTTTATGATTAAAC
AAAGA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4GP22TF U 9
AF RR4GK62TF U 1
BS 1 605 RR4GK62TF

RD RR4GP22TF 429 0 0
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CTTCCGCCGTCATTGTTCACATCGGCGATCAGATTCTGAGGCTGA*TAATGGGTGGTATA
AGAACGTGTTGCATAGGACGACGGTGGATAAGGACAGGACAAGGATGTC*TGGCCAGTTT
TCTTGGAGCCTCACCGTGAAATG*TCGTCGGGCC*TTACCGGAGCTTATCAGCGATGG*A
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TTCCTCTGG

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR4GK62TF 605 0 0
GGGTCTCGGGGGAGATCTGGCGGAGTATATGATGAAGATTAACTACTATCCCCCGTGTCC
TCGGCCGGATTTAGCATTAGGAGTACCGGCGCACACCGATCTCAGTGGGATCACTCTGCT
TGTGCCTAACGAAGTTCCTGGACTTCAAGTCTTCAAAGACGATCACTGGTTCGACGCCGA
GTATATTCCTTCCGCCGTCATTGTTCACATCGGCGATCAGATTCTGAGGCTGAGTAATGG
GAGGTATAAGAACGTGTTGCATAGGACGACGGTGGATAAGGACAGGACAAGGATGTCGTG
GCCAGTTTTCTTGGAGCCTCACCGTGAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATCAG
CGATGGTAATCCTCCAAAGTACAAGCCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCT
CAATAAGCTTCCTCTGGATTAAGAAGGAAAAATAAAATCAAAAGTATGAAGAAAAGTGTT
GTTGAATTTAAATTAATTTATTTTAAAAACTGTTGTGTTTGAAATAAGGTGTGGTTGTTG
TTTTCCCGCGATAAGAAGTTTCGATGTATCTCTTCTTGTGTTCAGTTTTTATGATTAAAC
AAAGA

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL8681Contig1 909 2 4 U
GAACCGAAGAGTATTGTGGGGTTGGACTAACGAGTCATCATCGGTTGAGGATGATGTTGA
GAAAGGCTGGTCCGGTATTCAGACGATTCCAAGGAAAATTTGGCTTGACCGGTCCGGTAA
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ACGTAACAAAGTTTTAAATTCAAGATCTAGACTTGAAGTCTATGGTGTGACAGCTGCACA
GGCTGATGTGGAGGTTTTGTTCAAAGTGAGAAACTTGGAGAAAGCGGATGTGATAGAACC
AAATTGGACTGATCCACAGTTGATTTGTAGTAAGATGAATGTGTCGGTTAAGTCCGGTCT
AGGACCATTCGGTTTAATGGTTCTTGCATCTAAGAACTTGGAAGAGTACACATCCGTTTA
TCTTAGAATCTTCAAAGCCCATCAAAACAGCAATAAGTACGTTGTGGTCATGTGCAGTGA
CCAAAGCAGATCTTCATTGGAGGAAGATAATGACAAAACAACTTATGGAGCTTTTGTGGA
TATTGATCCTCGCCAACCACTCTCCCTCAGAGCCTTGATTGATCATTCAGTGGTGGAGAG
TTTCGGTGGAAGAGGAAGAGCATGCATTACCTCCAGAGTGTATCCAAAACTGGCAATAGG
AAAAAGTTCACATCTGTTTGCTTTTAATCATGGATCTCAAAGTGTTGATGTCTTAAGCTT
AAGCGCTTGGAGCATGAAGTCTGCCCAAATCAGTTGATCACGTATGGCAAAGATAGATAC
ATTTATTGAGCATTTATGATATGGTTCTGGAGATCTTAAATGGTCCAATTTGTTTGGTTG
CATGTGAAAAAGAGTCCAACTTGTATGTTGAAATGATTTCAAGTTTATATGACATTTTAT
TTGACTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EG80TF U 1
AF RR4EG80JQ C 145
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BS 518 518 RR4EG80JQ
BS 519 549 RR4EG80TF
BS 550 909 RR4EG80JQ

RD RR4EG80TF 549 0 0
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GGCTGATGTGGAGGTTTTGTTCAAAGTGAGAAACTTGGAGAAAGCGGATGTGATAGAACC
AAATTGGACTGATCCACAGTTGATTTGTAGTAAGATGAATGTGTCGGTTAAGTCCGGTCT
AGGACCATTCGGTTTAATGGTTCTTGCATCTAAGAACTTGGAAGAGTACACATCCGTTTA
TCTTAGAATCTTCAAAGCCCATCAAAACAGCAATAAGTACGTTGTGGTCATGTGCAGTGA
CCAAAGCAGATCTTCATTGGAGGAAGATAATGACAAA*CAACTTATGGAGCTTTTGTGGA
TATTGATCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4EG80JQ 765 0 0
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ATCTAGACTTGAAGTCTATGGTGTGACAGCTGCACAGGCTGATGTGGAGGTTTTGTTCAA
AGTGAGAAACTTGGAGAAAGCGGATGTGATAGAACCAAATTGGACTGATCCACAGTTGAT
TTGTAGTAAGATGAATGTGTCGGTTAAGTCCGGTCTAGGACCATTCGGTTTAATGGTTCT
TGCATCTAAGAACTTGGAAGAGTACACATCCGTTTATCTTAGAATCTTCAAAGCCCATCA
AAACAGCAATAAGTACGTTGTGGTCATGTGCAGTGACCAAAGCAGATCTTCATTGGAGGA
AGATAATGACAAAACAACTTATGGAGCTTTTGTGGATATTGATCCTCGCCAACCACTCTC
CCTCAGAGCCTTGATTGATCATTCAGTGGTGGAGAGTTTCGGTGGAAGAGGAAGAGCATG
CATTACCTCCAGAGTGTATCCAAAACTGGCAATAGGAAAAAGTTCACATCTGTTTGCTTT
TAATCATGGATCTCAAAGTGTTGATGTCTTAAGCTTAAGCGCTTGGAGCATGAAGTCTGC
CCAAATCAGTTGATCACGTATGGCAAAGATAGATACATTTATTGAGCATTTATGATATGG
TTCTGGAGATCTTAAATGGTCCAATTTGTTTGGTTGCATGTGAAAAAGAGTCCAACTTGT
ATGTTGAAATGATTTCAAGTTTATATGACATTTTATTTGACTTTT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL8682Contig1 1171 2 4 U
GGCAATAACCACTGTCCGGAGAGAAAACAGATCATATTCAAGAAAAATGGGGAAAGGCGG
ATCACTAAGCGAAGGCGTGATCAAGAACATCGTCCTCTCCTACACATACGTAGCGATATG
GATCTTCCTCAGCTTCACCGTCATCGTCTACAACAAATACATCCTCGACAAGAAGATGTA
CGACTGGCCATTCCCGGTCTCCCTCACCATGTTCCACATGTCCTTCTGCTCAACCCTAGC
GTTCCTCCTCATCAAGGTCTTCAACTTCGTCGAGCCTGTCTCCATGTCACGTGACACTTA
CCTCAGATCCGTGGTTCCCATCGGCGCGTTGTACTCACTCTCCCTCTGGCTCTCAAACTC
CGCTTACATTTATCTCTCCGTCTCCTTCATCCAAATGCTCAAAGCCCTCATGCCCGTTGC
GGTCTACTCCATCGGTGTCTTGTTCAAGAAGGAAGGTTTTAAGTCGGAGACTATGGTTAA
CATGTTATCTATCTCCTTTGGTGTCGCCATCGCTGCTTACGGAGAAGCTAGATTTGATGT
GTGGGGGTGTGGTTCTTCAGCTAGGTGCGGTTGCGTTTGAGGCGACAAGATTGGTAATGA
TTCAGATCTTGCTTACTTCTAAAGGCATCACGTTGAATCCCATCACTTCTCTAAATTACG
TTGCACCATGCTGCTTAGCTTTCTTGTTCATCCCTTGGATTGTTGTGGAGTTTCCTGTTC
TTAGAGAGACCTCTAGCTTTCATTTTGATTACGTTATTTTCGGGACGAACTCGTTCTGTG
CGTTTGCTTTGAATCTTGCCGTGTTTCTTTTGGTGGGGAAGACCTCTGCTTTGACCATGA
ATGTTGCTGGTGTGGTTAAGGACAGGTTGTTGATCGCATTCTCATGGTCGGTTATTAAGG
ACACTGTGACACCTATTAATCTTTTTGGTTATGGGATTGCGTTCTTGGGAGTTGCGTATT
ACAATCATGCTAAGTTACAAGCGCTGAAGGCTAAAGAGGCTCAGAAGAGTGCTCAGCAGA
TTGATGAAGAGAGTGGTCGCCTTTTGGAAGAGAAGGAAGGTGGGAGGAAGACTGAGCCAG
AGAATTTATTTTGTTTGGTGAAGTTTAAGATTTTATTTTATTTGCTTTAACATACATTTT
GTTTGAATAAGAGCTTGAAGGATTTATAAGC


BQ
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AF RR4DV77TF U 1
AF RR4DV77JQ C 332
BS 1 730 RR4DV77TF
BS 731 731 RR4DV77JQ
BS 732 758 RR4DV77TF
BS 759 1171 RR4DV77JQ

RD RR4DV77TF 758 0 0
GGCAATAACCACTGTCCGGAGAGAAAACAGATCATATTCAAGAAAAATGGGGAAAGGCGG
ATCACTAAGCGAAGGCGTGATCAAGAACATCGTCCTCTCCTACACATACGTAGCGATATG
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CGACTGGCCATTCCCGGTCTCCCTCACCATGTTCCACATGTCCTTCTGCTCAACCCTAGC
GTTCCTCCTCATCAAGGTCTTCAACTTCGTCGAGCCTGTCTCCATGTCACGTGACACTTA
CCTCAGATCCGTGGTTCCCATCGGCGCGTTGTACTCACTCTCCCTCTGGCTCTCAAACTC
CGCTTACATTTATCTCTCCGTCTCCTTCATCCAAATGCTCAAAGCCCTCATGCCCGTTGC
GGTCTACTCCATCGGTGTCTTGTTCAAGAAGGAAGGTTTTAAGTCGGAGACTATGGTTAA
CATGTTATCTATCTCCTTTGGTGTCGCCATCGCTGCTTACGGAGAAGCTAGATTTGATGT
GTGGGGGTGTGGTTCTTCAGCTAGGTGCGGTTGCGTTTGAGGCGACAAGATTGGTAATGA
TTCAGATCTTGCTTACTTCTAAAGGCATCACGTTGAATCCCATCACTTCTCTAAATTACG
TTGCACCATGCTGCTTAGCTTTCTTGTTCATCCCTTGGATTGTTGTGGAGTTTCCTGTTC
TTAGAGAGAC*TCTAGCTTTCATTTTGATTACGTTATT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4DV77JQ 840 0 0
TACTCACTCTCCCTCTG*CTCTCAAACTCCGCTTACATTT*TCTCTC*GTCTC*TTCATC
CAAATGCTCAAAGCCCTCATGCCCGTTGCGGTCTACTCCATCGGTGTCTTGTTCAAGAAG
GAAGGTTTTAAGTCGGAGACTATGGTTAACATGTTATCTATCTCCTTTGGTGTCGCCATC
GCTGCTTACGGAGAAGCTAGATTTGATGTGTGGGG*TGTGGTTCTTCAGCTAGGTGCGGT
TGCGTTTGAGGCGACAAGATTGGTAATGATTCAGATCTTGCTTACTTCTAAAGGCATCAC
GTTGAATCCCATCACTTCTCTAAATTACGTTGCACCATGCTGCTTAGCTTTCTTGTTCAT
CCCTTGGATTGTTGTGGAGTTTCCTGTTCTTAGAGAGACCTCTAGCTTTCATTTTGATTA
CGTTATTTTCGGGACGAACTCGTTCTGTGCGTTTGCTTTGAATCTTGCCGTGTTTCTTTT
GGTGGGGAAGACCTCTGCTTTGACCATGAATGTTGCTGGTGTGGTTAAGGACAGGTTGTT
GATCGCATTCTCATGGTCGGTTATTAAGGACACTGTGACACCTATTAATCTTTTTGGTTA
TGGGATTGCGTTCTTGGGAGTTGCGTATTACAATCATGCTAAGTTACAAGCGCTGAAGGC
TAAAGAGGCTCAGAAGAGTGCTCAGCAGATTGATGAAGAGAGTGGTCGCCTTTTGGAAGA
GAAGGAAGGTGGGAGGAAGACTGAGCCAGAGAATTTATTTTGTTTGGTGAAGTTTAAGAT
TTTATTTTATTTGCTTTAACATACATTTTGTTTGAATAAGAGCTTGAAGGATTTATAAGC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL8683Contig1 1260 2 8 U
GACAGTATGTCATTGCGTACTACTAGTCACCAAAGAGCAGTGCAAGGGGATGTACCAAGT
TCTGTATCTCCCGCGGAAGTTAATGCCGTAGCTGATGGACTTGCTCTTGTTAGTAGCAAC
CAAGGTGGCTTAAAACCTACTAGCTGTAAATCCAAAACCTCTGGAGGTTTGGCCATAGTG
GATGTGGTTGATGGGATAAGAAGTAACTCAGGTACACCGTCTTGTTCACAGAATAATAGT
CCGGATAGGATCATCCGCCAAAAGGGTCCACGTATAGCAAAAGTTGTGAGGAGGATCAAT
TGCAATGTAGAGCCTTTAAACTATGGATGTGTGCTTTCTGGAAAATCATGGTGCAACCGC
CAAGCGATTTTTCCTAAAGGATACCGTAGTCGGGTCAGGTACATAAATATTTTGGATCCA
ACAAGGATGAGCTTCTACATTTCAGAAATTCTTGATGCTGGACGCAATAATCCGTTGTTC
ATGGTTCACTTGGAGGGTAATCCCAGTGAGGTGTTTGCTCACTTGTCGCCTACAAGATGC
TGGGAGATGGTCAGAGATAGAGTAAACCAAGAGATAAGTAAGCAGCACAAAGCTGGTAAG
CTAGATCTTCCTCCTCTGCAGCCCTCTGGGAGTCCTGACGGTTTTGAAATGTTTGGATAT
ACTTCACTGCAATCCTACACGCTATTGAAGCGTTAGACGTGAATAGAGTTTGCACAGAGT
ATTGGGACTCCAGGCCTTACTCGCGGCCACAAGTGCAGTTCCTTGCAAATCCTCTTCTCA
GAGAAGCCAACAAGACAACAAGCATACAATCATCGGATGTGAGAAATCTCCAAAAAGCTC
CCGGACAACGTCGATTACCTGCTGGAACAAACTCCACTCTCAAAGTTCTGCTCAAGAAGG
CTAACATGGATGAACTGAGCTCACTTCAAGAGGTTTTAAGTGAGTCTAACATAGATTTGG
TTACCGAACTTGTGAAGGAAGAGATCCAGAAGTGGCGCTGATTTTATATGGAAGGAGATT
GGTTTTTTAGTGTGTACATACAGAGTTGATGAAGGCTGCATTGCTCATTCTTTTTGGTCA
CCTTTTACAGAGGAAGGATAGAAACATATAACTATGGGTTCTTGAAACCATTAGTTTTGG
TTACTAGTTAGACTCCACGGCTCTGTGTGGTTGGTTTTTAATTAACTTTACTAGTATTGA
CTCTCTTTTGAAAGTGCAAAGTACATTGAATTGAAAGAGATTATAAAAGAAATTCAGTTC


BQ
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AF RR4AK89TF U 1
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QA 1 823 1 823
DS 

RD RR4AK89JQ 845 0 0
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AGAGTATTGGGACTCCAGGCCTTACTCGCGGCCACAAGTGCAGTTCCTTGCAAATCCTCT
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ATTGACTCTCTTTTGAAAGTGCAAAGTACATTGAATTGAAAGAGATTATAAAAGAAATTC
AGTTC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

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TATGATTTGAAACAGTTACGTTTTGCTGGTGATCTTTTGATGGAGCTTGGTGCTGCTGTA
GAGTTAGCCACTTCTGCAGCTCCACACCTTTTCCTTCCTCTCGCTTGTGCTGCTAATGTT
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AF RR4CA23TF U 1
AF RR4CA23JQ C 385
BS 1 785 RR4CA23TF
BS 786 1155 RR4CA23JQ

RD RR4CA23TF 785 0 0
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TATGATTTGAAACAGTTACGTTTTGCTGGTGATCTTTTGATGGAGCTTGGTGCTGCTGTA
GAGTTAGCCACTTCTGCAGCTCCACACCTTTTCCTTCCTCTCGCTTGTGCTGCTAATGTT
GTAAAGCTGTAACATCAACGTCTACTCGCACCCCTATCTATAAAGCCTTTGCTAAAGGAG
AGAACATAGGAGATGTCACTGCTAAGGGAGAGTGTGTTGCTAACGTTGCAGATTTGATGG
GAACTGGATTTAGTATATTAATATCCAAAAGAAATCCTTCTTTGGTCACAACCTTTGGTC
TTTTATCATGTGGCTATCTCCTGAGCTCATACCAAGAGGTTAGATCTGTAGTATTGCATA
CACTAAACCGTGCAATATTTACAGTAGCAGTGGAGTCATTTTTCAAGACGGGGCGGGTTC
CCTCATTACAGGAAGGTAATATCCAAGAAAAGATATTTACTTTTCCATGGGTGGAGGATC
GACCAGTGATGCTTGGAGCCAGATTTAAGGATGCATTCCAAGACCCCAGCACATATCTGG
CAGTAAAGCCCTTTTTCTATAAAGAAAGATACATGGTGACTTACAGCCCTACCAATGGTA
AAGTCTGCGCACTCCTCAAGCATCAAGCTAACTCAGATGACATTCTCAAAGCGGCATTTC
ATGCACATGTGCTTCTTCATTTCATGAATCAATCGAAAGATGGCATCACAAAGTCAGTGG
AGCAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4CA23JQ 771 0 0
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TAGCAGTGGAGTCATTTTTCAAGACGGGGCGGGTTCCCTCATTACAGGAAGGTAATATCC
AAGAAAAGATATTTACTTTTCCATGGGTGGAGGATCGACCAGTGATGCTTGGAGCCAGAT
TTAAGGATGCATTCCAAGACCCCAGCACATATCTGGCAGTAAAGCCCTTTTTCTATAAAG
AAAGATACATGGTGACTTACAGCCCTACCAATGGTAAAGTTTGCGCACTCCTCAAGCATC
AAGCTAACTCAGATGACATTCTCAAAGCGGCATTTCATGCACATGTGCTTCTTCATTTCA
TGAATCAATCGAAAGATGGCATCACAAAGTCAGTGGAGCAACCAGATCCTTATGAGCTGG
ATTCTCGAGTAGCAGAGTCGTGTGAAATGGTTTTTACCTCGTACGGAATCTTCAAAACCA
GGGCTGCAGAACAGGGTTGGAGAATGTCAGAATTTTTGCTGAATCCTGGCCGGGCTAGGT
TATGTCAAATGAATGAGGAGAGGGAGTAAACCACACCTGAATCGGCTTCGATAATAGTTC
CACGGCACGCTATATTTTGTTGTCTAGGAAAACAAACAGATTTTGGTTGGTACACGTTTT
ATCAACTGCGCTGTAAAAAAACAGAATGATATGTAGATTGTGAGTAAAAAGACGAAGCTA
TAACGTGATTTTATGTTGCGGCCAACAAGAAACAAAGTAAAAAGTTCATGG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGAAACACGATCTGTTGTTCGTGTCGTCTGGATTTCTTCACGCTGGCAAAGTGAAACAC
GAACCGTTACAGATGCATTCAATTGAATCGTTATCATTAACAGCCATTTAACTCCTCCTC
TCCACTCCCATCACAATTGTTCATTCACTGCATCTGGCTTCTCTTCCAGCGGTGAATCTC
CATGTATAAAAAGGCCAAACAACACGAATGACTTTGGATTTACCTAGATGCCAAAAATGC
CAGTGAGGTCGAAGAGTTTCATCAAACCTTCAAGGAAAATTATTTCTCAGAAGAATGGCA
GTCTCATCTATCCTCTTCCATGATTTGAAGGCTGGACGTTGTTCTTCCACCGTCTAGGTC
CGACTTCAAAGATTCCGGGAAGCAATAACGCGATACGCGGCGGCGAGAGCATATGGGTTT
GGACATGATCCTCCTCGGCTCTAAGTGAAGTGGTTGAAAACTATAATAGTAGTGCACAAG
CTGCAGAGTTGCTTCTCAGAGAAAGATCATTCTGCAAGTCAAAAAGGGAGAAGAAAGATT
GTTTTCTTTAGGTTGAAACTTGGAATTTGACTCTAATCCAATTATTTTGGGTAACTGGTG
CTATGGCTCAAATTCTGCGCGGAAGATAGCGTCTCAAGAACCAAGTGTGAATAGTACAGC
AATAACAAAGATGAGGAAGTCACCATGGATAGGTTTCAAAATGAATTGGAGAAATCAAAG
TCACTGGGTTGAATATGATCAAAAGGCCAACATCGAAGTTGGTGAATCTGTGGCAGATGA
TGAAGCTAAATATGGTCGAGTGAAGGGGCCAAGTTACATTTTTCATAAAAAGTTTTAATA
CTTTTCCTATTGAGGAATGGTTGAGTGGGTGAATATTTGGGTTTAGTAAGCTACATATCC
GGGATTCAATTATTAGTTTGACCGAATTTAGTTTTCGAGGGATGTGGTTTACTGTTTTTT
TGAAGTATGGGGTTTTTATTGTTTTATATAACGTTTCACTTTAAACTGAAAACGTTTCAC
TTTAAATTGAATATCTTTTTTAAATTAAGAATTTGAGATG


BQ
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BS 1 728 RR4A548TF
BS 729 1120 RR4A548JQ

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GGGAAACACGATCTGTTGTTCGTGTCGTCTGGATTTCTTCACGCTGGCAAAGTGAAACAC
GAACCGTTACAGATGCATTCAATTGAATCGTTATCATTAACAGCCATTTAACTCCTCCTC
TCCACTCCCATCACAATTGTTCATTCACTGCATCTGGCTTCTCTTCCAGCGGTGAATCTC
CATGTATAAAAAGGCCAAACAACACGAATGACTTTGGATTTACCTAGATGCCAAAAATGC
CAGTGAGGTCGAAGAGTTTCATCAAACCTTCAAGGAAAATTATTTCTCAGAAGAATGGCA
GTCTCATCTATCCTCTTCCATGATTTGAAGGCTGGACGTTGTTCTTCCACCGTCTAGGTC
CGACTTCAAAGATTCCGGGAAGCAATAACGCGATACGCGGCGGCGAGAGCATATGGGTTT
GGACATGATCCTCCTCGGCTCTAAGTGAAGTGGTTGAAAACTATAATAGTAGTGCACAAG
CTGCAGAGTTGCTTCTCAGAGAAAGATCATTCTGCAAGTCAAAAAGGGAGAAGAAAGATT
GTTTTCTTTAGGTTGAAACTTGGAATTTGACTCTAATCCAATTATTTTGGGTAACTGGTG
CTATGGCTCAAATTCTGCGCGGAAGATAGCGTCTCAAGAACCAAGTGTGAATAGTACAGC
AATAACAA

QA 1 728 1 728
DS 

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CTGGACGTTGTTCTTCCACCGTCTAGGTCCGACTTCAAAGATTCCGGGAAGCAATAACGC
GATACGCGGCGGCGAGAGCATATGGGTTTGGACATGATCCTCCTCGGCTCTAAGTGAAGT
GGTTGAAAACTATAATAGTAGTGCACAAGCTGCAGAGTTGCTTCTCAGAGAAAGATCATT
CTGCAAGTCAAAAAGGGAGAAGAAAGATTGTTTTCTTTAGGTTGAAACTTGGAATTTGAC
TCTAATCCAATTATTTTGGGTAACTGGTGCTATGGCTCAAATTCTGCGCGGAAGATAGCG
TCTCAAGAACCAAGTGTGAATAGTACAGCAATAACAAAGATGAGGAAGTCACCATGGATA
GGTTTCAAAATGAATTGGAGAAATCAAAGTCACTGGGTTGAATATGATCAAAAGGCCAAC
ATCGAAGTTGGTGAATCTGTGGCAGATGATGAAGCTAAATATGGTCGAGTGAAGGGGCCA
AGTTACATTTTTCATAAAAAGTTTTAATACTTTTCCTATTGAGGAATGGTTGAGTGGGTG
AATATTTGGGTTTAGTAAGCTACATATCCGGGATTCAATTATTAGTTTGACCGAATTTAG
TTTTCGAGGGATGTGGTTTACTGTTTTTTTGAAGTATGGGGTTTTTATTGTTTTATATAA
CGTTTCACTTTAAACTGAAAACGTTTCACTTTAAATTGAATATCTTTTTTAAATTAAGAA
TTTGAGATG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

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GGAAAGTAGTTCGTCGCCGGTGATAACCTCTTTCGTTTCCTCTAACAGCTGCTCTCAGCG
AAGAAGAAGAAGAAGATCCACTAAACCTTAACAGTCTGCAGCTATGTCGAGGAGAAAGAC
AAGAGAACCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTAGGACCAGCTGTGCGTGATGGTGAGCAAGT
CTTTGGAGTTGTTCATATCTTTGCTTCCTTCAATGACACCTTCATCCATGTGACTGATCT
GTCTGGAAGGGAAACTCTCGTTCGTATCACTGGTGGAATGAAAGTGAAGGCTGATCGTGA
TGAGTCCCCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGTTCAAAGATGCAAGGA
GCTAGGCATCACAGCCATGCATGTGAAGCTCCGTGCTACTGGTGGGAACAAGACCAAGAC
TCCAGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCACTCCGAGCTCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGG
TCGCATTGAGGATGTGACTCCAATCCCAACCGATAGTACCCGTAGAAAGGGTGATAGAAG
AGGAAGACGTCTCTGATTTTGTCTTTCTCACAATGTCCCCCTGCTCTCATTGTGGTGCTA
CTTCTAAATTCCCCCATATAACTCTTTGCTATTGTTTTTATAAGACTTTTGCGTTTAC


BQ
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AF RR4GT11TF U 1
AF RR4GT11JQ C 63
BS 1 658 RR4GT11TF

RD RR4GT11TF 658 0 0
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AAGAAGAAGAAGAAGATCCACTAAACCTTAACAGTCTGCAGCTATGTCGAGGAGAAAGAC
AAGAGAACCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTAGGACCAGCTGTGCGTGATGGTGAGCAAGT
CTTTGGAGTTGTTCATATCTTTGCTTCCTTCAATGACACCTTCATCCATGTGACTGATCT
GTCTGGAAGGGAAACTCTCGTTCGTATCACTGGTGGAATGAAAGTGAAGGCTGATCGTGA
TGAGTCCCCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGTTCAAAGATGCAAGGA
GCTAGGCATCACAGCCATGCATGTGAAGCTCCGTGCTACTGGTGGGAACAAGACCAAGAC
TCCAGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCACTCCGAGCTCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGG
TCGCATTGAGGATGTGACTCCAATCCCAACCGATAGTACCCGTAGAAAGGGTGATAGAAG
AGGAAGACGTCTCTGATTTTGTCTTTCTCACAATGTCCCCCTGCTCTCATTGTGGTGCTA
CTTCTAAATTCCCCCATATAACTCTTTGCTATTGTTTTTATAAGACTTTTGCGTTTAC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR4GT11JQ 596 0 0
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GAGAACCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTAGGACCAGCTGTGCGTGATGGTGAGCAAGTCT
TTGGAGTTGTTCATATCTTTGCTTCCTTCAATGACACCTTCATCCATGTGACTGATCTGT
CTGGAAGGGAAACTCTCGTTCGTATCACTGGTGGAATGAAAGTGAAGGCTGATCGTGATG
AGTCCCCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGTTCAAAGATGCAAGGAGC
TAGGCATCACAGCCATGCATGTGAAGCTCCGTGCTACTGGTGGGAACAAGACCAAGACTC
CAGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCACTCCGAGCTCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTC
GCATTGAGGATGTGACTCCAATCCCAACCGATAGTACCCGTAGAAAGGGTGATAGAAGAG
GAAGACGTCTCTGATTTTGTCTTTCTCACAATGTCCCCCTGCTCTCATTGTGGTGCTACT
TCTAAATTCCCCCATATAACTCTTTGCTATTGTTTTTATAAGACTTTTGCGTTTAC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL8688Contig1 400 2 1 U
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CAAGTCGAAGAATCACACAGCGCACAACCAGTCTGCCAAGGCACACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCTAGGAGGCACCGTCACACTCACACCAGAGGAATGGACCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTTAAGAGCGGCGAGAATGCTAGCGCTGAAGAATA
AGCTTTTTTGATTTTGTATGAGAATACATTTTGATGTTTTTTTTTTTTAATTTTAATGAA
GTTGAGACTGTTTCAGTTCGTTTTGATTATGTTTTACGTACTCGTTTTATCCAGGCCTTG
ATTTATCATCGTATTCTCCTTAAAAAAATTGCATTTCTCG


BQ
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AF RR4FY80JQ C 1
AF RR4FY80TF U 1
BS 1 400 RR4FY80TF

RD RR4FY80JQ 400 0 0
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CAAGTCGAAGAATCACACAGCGCACAACCAGTCTGCCAAGGCACACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCTAGGAGGCACCGTCACACTCACACCAGAGGAATGGACCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTTAAGAGCGGCGAGAATGCTAGCGCTGAAGAATA
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GTTGAGACTGTTTCAGTTCGTTTTGATTATGTTTTACGTACTCGTTTTATCCAGGCCTTG
ATTTATCATCGTATTCTCCTTAAAAAAATTGCATTTCTCG

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR4FY80TF 400 0 0
GGATATTTGCATCGCCGTAAGCAACTCTATCCGAGCAGATCTATCCGACGCAGAGATGGC
CAAGTCGAAGAATCACACAGCGCACAACCAGTCTGCCAAGGCACACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCTAGGAGGCACCGTCACACTCACACCAGAGGAATGGACCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTTAAGAGCGGCGAGAATGCTAGCGCTGAAGAATA
AGCTTTTTTGATTTTGTATGAGAATACATTTTGATGTTTTTTTTTTTTAATTTTAATGAA
GTTGAGACTGTTTCAGTTCGTTTTGATTATGTTTTACGTACTCGTTTTATCCAGGCCTTG
ATTTATCATCGTATTCTCCTTAAAAAAATTGCATTTCTCG

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 2

CO CL8689Contig1 801 2 6 U
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GATCTTCTTCTGCGTTTCTGCTCGTGATTTTTGATCTTGCACTATGTTCTAATTCAGTTA
TTGTTTTGTCCGAATCGATTGCTTGAAAAATCATTGTTAGATTCGGAAATTAGATTTAGA
TATGCCTTTCTTCAGTTTGATTTACGAGCATCGCGACTGAACAAGTTGATTTCAAATTGG
ATTGAAACCATTTGTTATATTTTCAGATGCTTGTCTGTCTGTGTTAAGGAAACTTGAATC
TCGATTTTGATCTTCTCGTCTGTGTATTAACGGATAATGTCTTGAATTTAAGCAACTGAG
AACGATTGATCAGTGTGTGTTGCTGTTGCAGGGCTTGTCTAGATATAACGTTTGAGCTTT
GGTCTTAATCCTTGTTTTGTTGTCTTTATTGTATGACTGATTTCGATATCGTTTTAAGTT
TATTTTTAAAAAGCCCAAAGACGCTGGTTTTGCCAATGGCACCATCGCGTAACATGATTG
TAGCCACGGGTCTGGTTGTTTTCGCATCTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTTTACATGGCAT
CGTCAAAGAAACCGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCCCAAGCAACTTTTAGAG
GACCTTACATTAACACCGGTTCTCGCGATGTTGGACCTGACCATCGAACTTACCCTAAGA
AATAATATCCCCATCGAATTAAAACCCCCACAAACTGTAAACATGAGCTGTCCCATTGTT
ATATCTCTTTAGTAGTAGTTT


BQ
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20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CE47TF U 1
AF RR4CE47JQ C 321
BS 1 696 RR4CE47TF
BS 697 697 RR4CE47JQ
BS 698 721 RR4CE47TF
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BS 725 743 RR4CE47TF
BS 744 801 RR4CE47JQ

RD RR4CE47TF 746 0 0
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GATCTTCTTCTGCGTTTCTGCTCGTGATTTTTGATCTTGCACTATGTTCTAATTCAGTTA
TTGTTTTGTCCGAATCGATTGCTTGAAAAATCATTGTTAGATTCGGAAATTAGATTTAGA
TATGCCTTTCTTCAGTTTGATTTACGAGCATCGCGACTGAACAAGTTGATTTCAAATTGG
ATTGAAACCATTTGTTATATTTTCAGATGCTTGTCTGTCTGTGTTAAGGAAACTTGAATC
TCGATTTTGATCTTCTCGTCTGTGTATTAACGGATAATGTCTTGAATTTAAGCAACTGAG
AACGATTGATCAGTGTGTGTTGCTGTTGCAGGGCTTGTCTAGATATAACGTTTGAGCTTT
GGTCTTAATCCTTGTTTTGTTGTCTTTATTGTATGACTGATTTCGATATCGTTTTAAGTT
TATTTTTAAAAAGCCCAAAGACGCTGGTTTTGCCAATGGCACCATCGCGTAACATGATTG
TAGCCACGGGTCTGGTTGTTTTCGCATCTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTTTACATGGCAT
CGTCAAAGAAACCGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCCCAAGCAACTTTTAGAG
GACCTTACATTAACACCGGTTCTCGCGATGTTGGAC*TGACCATCGAACTTACCCTAAGA
A**TATATCCCCATCGAATTAAA
CCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR4CE47JQ 481 0 0
TGTGTATTAACGGATAATGTCTTGAATTTAAGCAACTGAGAACGATTGATCAGTGTGTGT
TGCTGTTGCAGGGCTTGTCTAGATATAACGTTTGAGCTTTGGTCTTAATCCTTGTTTTGT
TGTCTTTATTGTATGACTGATTTCGATATCGTTTTAAGTTTATTTTTAAAAAGCCCAAAG
ACGCTGGTTTTGCCAATGGCACCATCGCGTAACATGATTGTAGCCACGGGTTTGGTTGTT
TTCGCATTTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTTTACATGGCATCGTCAAAGAAACCGGTGATT
GATTCAACCAAACCGCTACCTCCCCAAGCAACTTTTAGAGGACCTTACATTAACACCGGT
TCTCGCGATGTTGGACCTGACCATCGAACTTACCCTAAGAAATAATATCCCCATCGAATT
AAAACCCCCACAAACTGTAAACATGAGCTGTCCCATTGTTATATCTCTTTAGTAGTAGTT
T

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 2

CO CL8690Contig1 401 2 1 U
GATGCAGGAAGTGATAGTTGCCATACAAGAAGCGGTAAGAATCGAGAGAGTAAACGAGAA
CGGGGGCAAGTCATCGGGTTCGAGCAGCTCAAAGGCGCAATCATCTCGTAAGACGTTGCT
CACCAGCTTCCTCGAGATAGAGAGTCCTGACATCTCAAGAAACAGCTTAGCTCCAGCTGC
TAGGTGATGAGTGTCCCTCCTCCTCTTGAAGGCTTTTAAACTCTCATCTTTTTGTACACT
TCACTCTTGTGGGAGTTACTATCTTCATATATATGAATGTGTGTGTGTATGTAATGTAAT
GTAGTGTGTATGTTTAATGTATCGACACACACTTTCTTGCATTTGCAACTCTGTAGTCTT
TTAGGGCCGAACATTTGGGTCGGACTTTTGGGTTTTCGATC


BQ
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AF RR4CR89JQ C 1
AF RR4CR89TF U 1
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QA 1 401 1 401
DS 



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AF RR4CN30TF U 48
AF RR4CN30JQ C 1
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BS 48 462 RR4CN30TF
BS 463 757 RR4CN30JQ

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TATAACCGATTTATCAAGAACTGAAGGAGTATTCTCTAATCGTAGTCGTATATAACATTG
ATTAATGTAATTCCGTTACCACGCCCTTCTTTTAGGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCT
GGTAATCCTGATATAAGCCACAGAGAAGCCTTTAGTGCTGCTGCCAAGAATTTGGGCCCA
CTTTCCCTCACATACACTTCGGACTGGCACCAGACAATCAACCCCGTGAAGAAAA
A

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR4CN30JQ 757 0 0
CGGGAAATCTAGAGAGAAAGAATCTATGTATTAGAAATTGGGCTTGTCTTTAGAAAATGA
TGAAGTGATGATGAGTTAGAGAGAGAAAAGCTTTTTGTGAGAGATAAAAAAAAAGACAAT
GAAAGAAGTTTTAATTAGTGTTTGTCTCTTTCTGTCTGAGTTTTTGTTTTTGCCGTTGTA
TTTTGCCATTGCCAGCTCCAGAGAAAAGACAGAGAGTCCCATCCGCATATAACCGATTTA
TCAAGAACTGAAGGAGTATTCTCTAATCGTAGTCGTATATAACATTGATTAATGTAATTC
CGTTACCACGCCCTTCTTTTAGGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCTGATA
TAAGCCACAGAGAAGCCTTTAGTGCTGCTGCCAAGAATT*GGGCCCACTT*CCCTCACAT
ACACTTCGGACTGGCACCAGACAATCAACCC*GTGAAGAAAACCAACATGCCCCAACAGG
AGGGGGAGGATAACGTGGGGATGAAAGAAGGGTTTTACGCTCCTGCGGCTAACATTGGTG
TGGCTCCTTACTAAAGACAAATATAATCGATAAGTATTCGAGAATTTGAATCCAATATCT
GTAAGATTTATGTTGTCCAAAAAGCTGGGTTTCTTTTATGTATTATGTATGCATGCGTCT
ACTTCTGTTGAGTGATCAAAATCTTTCTAATTAATGAGGTTTATTATGTTAGTTTTGATT
TGTAGTTGTGTAATCAAAATCTTTTTTGGCATAACCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL8693Contig1 487 2 1 U
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TGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATT
GAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGA
CAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGT
AGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCC
TGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCTTTGGTCTTGTTAGCTT
TGTGATACAATGCAATATTTCTTTTATCTTAATAGTAATCAACAGGCATGAGCTTTGTCT
ATGTAGCTTTGTTTTTCCTCACAAGTTTGTCAGGTTTAATCGAATTTATTCAAATAGCTT
CAGAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B739JQ C 1
AF RR4B739TF U 1
BS 1 487 RR4B739TF

RD RR4B739JQ 487 0 0
GGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGA
TGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATT
GAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGA
CAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGT
AGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCC
TGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCTTTGGTCTTGTTAGCTT
TGTGATACAATGCAATATTTCTTTTATCTTAATAGTAATCAACAGGCATGAGCTTTGTCT
ATGTAGCTTTGTTTTTCCTCACAAGTTTGTCAGGTTTAATCGAATTTATTCAAATAGCTT
CAGAATT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR4B739TF 487 0 0
GGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGA
TGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATT
GAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGA
CAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGT
AGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCC
TGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCTTTGGTCTTGTTAGCTT
TGTGATACAATGCAATATTTCTTTTATCTTAATAGTAATCAACAGGCATGAGCTTTGTCT
ATGTAGCTTTGTTTTTCCTCACAAGTTTGTCAGGTTTAATCGAATTTATTCAAATAGCTT
CAGAATT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL8694Contig1 835 2 6 U
CATACCAACCAAACATGGATATAGTCTCCAATGCTAGTTGTACCACCAATTGTCTTGCTC
CTCTTGCTAAGGTGGTGCATGAGGAATTTGGTATTCTTGAAGGCTTGATGACAACTTTCC
ACGCAACCACTGCTACTCAAAAAAACTGTTGATGGACCATCTATGAAGGACTGGAGAGGA
GGGCGAGGAGCTAGTCAAAACATCATTCCTAGCTCAACCGGTGCTGCCAAGGCTGTAGGT
AAAGTTCTGCCAGAACTGAACGGGAAACTTACGGGAATGGCATTCCGTGTACCAACACCA
AATGTTTCCGTTGTGGATTTAACCTGTAGGCTTGAGAAAGGTGCCTCTTACGAAGATGTT
AAAGCGGCCATTAAGTATGCCTCGGAAGGACCTTTAAAAGGCATTTTCGGGTACACAGAT
GAAGATGTCGTCTCCAATGACTTCGTGGGTGATTCAAGGTCAAGTATCTTTGACGCCAAT
GCTGGGATTGGATTGAGCAAGTCCTTTGTGAAACTTGTCTCTTGGTACGACAATGAATGG
GGTTACAGCAACCGAGTGCTTGACCTTATAGAGCACATGGCTTTGGTAGCAGCCAGCCGC
TAAGCATGCACGCACACACACACACCGGTTCTTGCAGAAGGACTTTTTACTTATTTTCTC
CCCTTCTACAAAGGCGGTTTGGTTTTGTTAGATGCTAGATCTTTTAATGTTTGGTTTGGT
TCGGTTCCTTCTTTTTGGTTCTGTTTCAGTATCTGCAACTACGAAAAAAAAACATAGAGA
TTTGGTGTAATAGACTACTGTCATTTATCAATAAGCATTAATTCTTTGCAAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CU68TF U 1
AF RR4CU68JQ C 53
BS 1 276 RR4CU68TF
BS 277 277 RR4CU68JQ
BS 278 288 RR4CU68TF
BS 289 289 RR4CU68JQ
BS 290 299 RR4CU68TF
BS 300 835 RR4CU68JQ

RD RR4CU68TF 299 0 0
CATACCAACCAAACATGGATATAGTCTCCAATGCTAGTTGTACCACCAATTGTCTTGCTC
CTCTTGCTAAGGTGGTGCATGAGGAATTTGGTATTCTTGAAGGCTTGATGACAACTTTCC
ACGCAACCACTGCTACTCAAAAAAACTGTTGATGGACCATCTATGAAGGACTGGAGAGGA
GGGCGAGGAGCTAGTCAAAACATCATTCCTAGCTCAACCGGTGCTGCCAAGGCTGTAGGT
AAAGTTCTGCCAGAACTGAACGGGAAACTTACGGGA*TGGCATTCCGT*TACCAACACC

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR4CU68JQ 783 0 0
TGTCTGCTCCTC
TGCTAAGGTGGTGCATGAGGAATTTGGTATTCTTGAAGGCTTGATGACAACTTTCCACGC
AACCACTGCTACTCAAAAAAACTGTTGATGGACCATCTATGAAGGACTGGAGAGGAGGGC
GAGGAGCTAGTCAAAACATCATTCCTAGCTCAACCGGTGCTGCCAAGGCTGTAGGTAAAG
TTCTGCCAGAACTGAACGGGAAACTTACGGGAATGGCATTCCGTGTACCAACACCAAATG
TTTCCGTTGTGGATTTAACCTGTAGGCTTGAGAAAGGTGCCTCTTACGAAGATGTTAAAG
CGGCCATTAAGTATGCCTCGGAAGGACCTTTAAAAGGCATTTTCGGGTACACAGATGAAG
ATGTCGTCTCCAATGACTTCGTGGGTGATTCAAGGTCAAGTATCTTTGACGCCAATGCTG
GGATTGGATTGAGCAAGTCCTTTGTGAAACTTGTCTCTTGGTACGACAATGAATGGGGTT
ACAGCAACCGAGTGCTTGACCTTATAGAGCACATGGCTTTGGTAGCAGCCAGCCGCTAAG
CATGCACGCACACACACACACCGGTTCTTGCAGAAGGACTTTTTACTTATTTTCTCCCCT
TCTACAAAGGCGGTTTGGTTTTGTTAGATGCTAGATCTTTTAATGTTTGGTTTGGTTCGG
TTCCTTCTTTTTGGTTCTGTTTCAGTATCTGCAACTACGAAAAAAAAACATAGAGATTTG
GTGTAATAGACTACTGTCATTTATCAATAAGCATTAATTCTTTGCAAACCT

QA 13 783 13 783
DS 



AS 1 2

CO CL8695Contig1 941 2 2 U
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGAGTGAGAGAGAGAGACAGAACTCTCTGGCT
GGTCTTTTTTTTTTTTTTCCCGATCAGATCGAAGAGTTCGAACTAAGAGATCCAAAGCTT
CACCACAATTGTCGTTGTTTCATATTATCCGCAAGGTACGCTTTTTTCCGCAAGATCTAT
CGAATCCTATCGTTTTGGTGATTTTCTTCGGTAAATCTCTTCGAACTGGAGAGTTATCTG
AATCCCAAAGCTCAATTTCACTTCCACAAGCATCAGAGAAGAGAAACATCTGTTGAATTC
TTCACTGAACTCGCAGATCTGAGTTGCTAGCTTCAGAATATTAGAGAATTCACGTCAATT
TTGCGAGTAAACGTCGACAATTCCCCGCGCAGAGAGTTGTTTTTTTTTGAAAAAGAGATT
TAAAGAACCATCGAAGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCATGCGGGCAACATCAGTATA
TCAAGTGTTTACTCGCAAGGATTGGTGAAAACACTAAGAGAAGCATTGGAGAACTCAGGA
GTGGACTTAACAAAAGCAAGCATCTCTGTCGAAATCGAACTTGCTAAACAATCCTCTTCC
TTCAAGGATCATGAACTCCGTGGACCGGTCTCTCGAACAGGAAACAATGACGACGCCAAG
CAAAGTCGGAAACCAAAACGGCTCAAGACGAACAACACAAGTTAAAAAAAAGCATCACAG
TCGGGTATAATAACCCCAAAGTTGAAACGTCCGTTTTCATTCTTCTTTATCTCAAAACAG
GGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATAGATATATTCAATCTTAAATTTTTCTTACTTTGTACA
TTGGAAACTATAATTTTTATAATGTTTTATCTCGTGGGGCCATAATCTTTTGAGGAGGCC
TAAGACTAGTGAGACCCGGTTATGCTAACCGCATTTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FF93TF U 1
AF RR4FF93JQ C 265
BS 1 664 RR4FF93TF
BS 665 941 RR4FF93JQ

RD RR4FF93TF 664 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGAGTGAGAGAGAGAGACAGAACTCTCTGGCT
GGTCTTTTTTTTTTTTTTCCCGATCAGATCGAAGAGTTCGAACTAAGAGATCCAAAGCTT
CACCACAATTGTCGTTGTTTCATATTATCCGCAAGGTACGCTTTTTTCCGCAAGATCTAT
CGAATCCTATCGTTTTGGTGATTTTCTTCGGTAAATCTCTTCGAACTGGAGAGTTATCTG
AATCCCAAAGCTCAATTTCACTTCCACAAGCATCAGAGAAGAGAAACATCTGTTGAATTC
TTCACTGAACTCGCAGATCTGAGTTGCTAGCTTCAGAATATTAGAGAATTCACGTCAATT
TTGCGAGTAAACGTCGACAATTCCCCGCGCAGAGAGTTGTTTTTTTTTGAAAAAGAGATT
TAAAGAACCATCGAAGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCATGCGGGCAACATCAGTATA
TCAAGTGTTTACTCGCAAGGATTGGTGAAAACACTAAGAGAAGCATTGGAGAACTCAGGA
GTGGACTTAACAAAAGCAAGCATCTCTGTCGAAATCGAACTTGCTAAACAATCCTCTTCC
TTCAAGGATCATGAACTCCGTGGACCGGTCTCTCGAACAGGAAACAATGACGACGCCAAG
CAAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4FF93JQ 677 0 0
CACAAGCATCAGAGAAGAGAAACATCTGTTGAATTCTTCACTGAACTCGCAGATCTGAGT
TGCTAGCTTCAGAATATTAGAGAATTCACGTCAATTTTGCGAGTAAACGTCGACAATTCC
CCGCGCAGAGAGTTGTTTTTTTTTGAAAAAGAGATTTAAAGAACCATCGAAGCTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTCATGCGGGCAACATCAGTATATCAAGTGTTTACTCGCAAGGATTG
GTGAAAACACTAAGAGAAGCATTGGAGAACTCAGGAGTGGACTTAACAAAAGCAAGCATC
TCTGTCGAAATCGAACTTGCTAAACAATCCTCTTCCTTCAAGGATCATGAACTCCGTGGA
CCGGTCTCTCGAACAGGAAACAATGACGACGCCAAGCAAAGTCGGAAACCAAAACGGCTC
AAGACGAACAACACAAGTTAAAAAAAAGCATCACAGTCGGGTATAATAACCCCAAAGTTG
AAACGTCCGTTTTCATTCTTCTTTATCTCAAAACAGGGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATA
GATATATTCAATCTTAAATTTTTCTTACTTTGTACATTGGAAACTATAATTTTTATAATG
TTTTATCTCGTGGGGCCATAATCTTTTGAGGAGGCCTAAGACTAGTGAGACCCGGTTATG
CTAACCGCATTTTTATG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL8696Contig1 1051 2 4 U
GAAAGGCTGCGGTGTACGACCTTTGTTCCCTGATTCTATTATTGACATAAACGCAGCCAC
TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGGGAACAAAGTTGAAAG
TGATCATTACGATAGTGACGAAGTTGAAAGTGATCATGATGAATCTATGCTCGTACCGGG
TGTAGAAGTGCCTGCACACTTCACTTACCGAGCTACTTCAGGTTTCCTAAAGATCAATCA
GACTCCAGGACCTCTTCCTCCATCCTTTAGATTCAAAGCTTGCATCTTGCTGTCAAGAGG
AACTATTAATCTCGTGGATGATGAAGACATTGTGTCTTGGCGCCTTAATTATTTATTTGA
TGACCGTGATGACCATGGAGAGGAGAAGAATTTATCGATGCGTGTGTCTTGTAGGTTTAG
GGGTAAACAAAATGGCCTCACTGTCCAATATGGATCAAACCAGCGTGACATGCCTTTTAT
AAGTGGATGGGAGGAACGTCTGTATACATTTGAAGATTCTTTCTGTCTAGACCAGGATTT
CCCTGAAGCCGAAGAAACCACTTTCAATGAGCTTGTGTTTCATTTCAAAGTCTTTTATAA
GAAATGGAAAGTGAAAGCTTGTGGTGTACAACTTCTGGAGGACAAAGAAGAAACTGGACG
TGAGAAGGAGGAAGATGATAAATCTGGTGATGGACCTGATGGTGATAATGATGGGGCTGA
GGAGGATATAAAGGATGATGTAGATAAAACTCAAGGAGTCAGATTTAGACGTGATGATGA
TGCAGAGAGAAGAAGCAAGAAACGAATGAGGTTCAGCCTTCCGTAGGTATATGAAATTGT
CATGTTAGTATATATTTTGTAATTCTGTGCAATTTAATTTTCTGTGCAATTTAATCTTCC
AAGAAGAGAAGCTCAATCTAAACACACTAGGGACACTGTTCTACACTTGAACAGCAATAG
CAAAGTTGCGTTTGTAAGAACATTTTCTGTCTCAAGTTATCTATCAAAAGACGCATGATT
GTAGGTTTGCTAAAGGAAAGATTTCTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EN07TF U 1
AF RR4EN07JQ C 350
BS 1 721 RR4EN07TF
BS 722 722 RR4EN07JQ
BS 723 754 RR4EN07TF
BS 755 1051 RR4EN07JQ

RD RR4EN07TF 754 0 0
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TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGGGAACAAAGTTGAAAG
TGATCATTACGATAGTGACGAAGTTGAAAGTGATCATGATGAATCTATGCTCGTACCGGG
TGTAGAAGTGCCTGCACACTTCACTTACCGAGCTACTTCAGGTTTCCTAAAGATCAATCA
GACTCCAGGACCTCTTCCTCCATCCTTTAGATTCAAAGCTTGCATCTTGCTGTCAAGAGG
AACTATTAATCTCGTGGATGATGAAGACATTGTGTCTTGGCGCCTTAATTATTTATTTGA
TGACCGTGATGACCATGGAGAGGAGAAGAATTTATCGATGCGTGTGTCTTGTAGGTTTAG
GGGTAAACAAAATGGCCTCACTGTCCAATATGGATCAAACCAGCGTGACATGCCTTTTAT
AAGTGGATGGGAGGAACGTCTGTATACATTTGAAGATTCTTTCTGTCTAGACCAGGATTT
CCCTGAAGCCGAAGAAACCACTTTCAATGAGCTTGTGTTTCATTTCAAAGTCTTTTATAA
GAAATGGAAAGTGAAAGCTTGTGGTGTACAACTTCTGGAGGACAAAGAAGAAACTGGACG
TGAGAAGGAGGAAGATGATAAATCTGGTGATGGACCTGATGGTGATAATGATGGGGCTGA
G*AGGATATAAAGGATGATGTAGATAAAACTCAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4EN07JQ 702 0 0
TATTTATTTGATGACCGTGATGACCATGGAGAGGAGAAGAATTTATCGATGCGTGTGTCT
TGTAGGTTTAGGGGTAAACAAAATGGCCTCACTGTCCAATATGGATCAAACCAGCGTGAC
ATGCCTTTTATAAGTGGATGGGAGGAACGTCTGTATACATTTGAAGATTCTTTCTGTCTA
GACCAGGATTTCCCTGAAGCCGAAGAAACCACTTTCAATGAGCTTGTGTTTCATTTCAAA
GTCTTTTATAAGAAATGGAAAGTGAAAGCTTGTGGTGTACAACTTCTGGAGGACAAAGAA
GAAACTGGACGTGAGAAGGAGGAAGATGATAAATCTGGTGATGGACCTGATGGTGATAAT
GATGGGGCTGAGGAGGATATAAAGGATGATGTAGATAAAACTCAAGGAGTCAGATTTAGA
CGTGATGATGATGCAGAGAGAAGAAGCAAGAAACGAATGAGGTTCAGCCTTCCGTAGGTA
TATGAAATTGTCATGTTAGTATATATTTTGTAATTCTGTGCAATTTAATTTTCTGTGCAA
TTTAATCTTCCAAGAAGAGAAGCTCAATCTAAACACACTAGGGACACTGTTCTACACTTG
AACAGCAATAGCAAAGTTGCGTTTGTAAGAACATTTTCTGTCTCAAGTTATCTATCAAAA
GACGCATGATTGTAGGTTTGCTAAAGGAAAGATTTCTGGATC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL8697Contig1 792 2 2 U
GGAATCATCCTCTTAGAAGAAAACTTGCAACAAACCAACAACCGCTAAATGGATCCTCCC
TTCGGCCACTCACACCACCACCACCACCACCATCACCACCACCAACGCGACGACGACAAC
GAAGACGATCGTCCATCCTTCGGCGCACCACCGCCGCCTAACTATTATCTGACGATCAGA
GACGGTCAGGTCATTCTCGCCCCAGCCGATCCTTCTGATGAAGCTCAGCACTGGTACAAA
GACGAGAAGTACAGTACTCGTGTGAAGGACGCAGAGGGTCATCCTTGTTTTGCTTTGGTT
AACAAGGCCACTGGTGAAGCCATGAAGCATTCTGTGGGAGCTACACAACCCGTTAATCTA
GTCAGATATGATCCTGATACGCTTGATGAGTCTGTGCTGTGGACTGAGAGCAAGGATATG
GGTGATGGTATCGAACAATAAGGATGGTAAACAATGTGGGGTTAAACGTTGATGCGTTTC
ACGGTGACAGCAAATCTGGTGGTGTTCGTGATGGCACAACTATTGTTCTCTGGGACTGGA
ACAAAGGAGACAACCAGCTTTGGAAGATCTTTCCTTTCTGAAAATTGGCGGGTGGGAGTG
GTAAAAAGTGGTTATGTGTTTAATGAATAATAAATAAACAAAACTGTTGTTGTGGCTGTA
AGACTTGAGTTTGTGACATTGTGATCTGTAATCTATTAAATCACATCTTAGAAGTATGCA
ATATTACATATGTGGTTTATGTATTTTACAATGTTTTTTTGAGTACTTCTATAAATATGC
TTTTATTATCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH55TF U 1
AF RR4FH55JQ C 143
BS 1 542 RR4FH55TF
BS 543 792 RR4FH55JQ

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TTCGGCCACTCACACCACCACCACCACCACCATCACCACCACCAACGCGACGACGACAAC
GAAGACGATCGTCCATCCTTCGGCGCACCACCGCCGCCTAACTATTATCTGACGATCAGA
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GACGAGAAGTACAGTACTCGTGTGAAGGACGCAGAGGGTCATCCTTGTTTTGCTTTGGTT
AACAAGGCCACTGGTGAAGCCATGAAGCATTCTGTGGGAGCTACACAACCCGTTAATCTA
GTCAGATATGATCCTGATACGCTTGATGAGTCTGTGCTGTGGACTGAGAGCAAGGATATG
GGTGATGGTATCGAACAATAAGGATGGTAAACAATGTGGGGTTAAACGTTGATGCGTTTC
ACGGTGACAGCAAATCTGGTGGTGTTCGTGATGGCACAACTATTGTTCTCTGGGACTGGA
AC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4FH55JQ 650 0 0
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CAGCCGATCCTTCTGATGAAGCTCAGCACTGGTACAAAGACGAGAAGTACAGTACTCGTG
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TGAAGCATTCTGTGGGAGCTACACAACCCGTTAATCTAGTCAGATATGATCCTGATACGC
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TGTTCGTGATGGCACAACTATTGTTCTCTGGGACTGGAACAAAGGAGACAACCAGCTTTG
GAAGATCTTTCCTTTCTGAAAATTGGCGGGTGGGAGTGGTAAAAAGTGGTTATGTGTTTA
ATGAATAATAAATAAACAAAACTGTTGTTGTGGCTGTAAGACTTGAGTTTGTGACATTGT
GATCTGTAATCTATTAAATCACATCTTAGAAGTATGCAATATTACATATGTGGTTTATGT
ATTTTACAATGTTTTTTTGAGTACTTCTATAAATATGCTTTTATTATCAT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL8698Contig1 1262 2 4 U
AGGGGAGATAAACATTGTCGGAAGCATAACCAAAATCAAAAGGTTGGGATCTTTTAGATG
AAAGTGATGGATATGGAAGAAGGGGTTAAAGATAATGCTGCTGCATCACCACCACCCCCT
AAATCAAGAATCACAAACCAATCCAGGGCTCTTGTGTCAATACGTCTGCTTCAGGTTTTG
TTGTTGTTTCTTGTTTTGACTCTTGGGATCTCAGTTGTTAGTATTCACATGATCAAGTTC
TTCAAGATTCAAGACCCTGTGGCTTCTTCAACCAATTTGGTCTCTATGTATGATCATAGG
GATGTTACTTTAGAGAGCTTTATTAGACCTCCTTTGAATGTTTGGCACACTATGAATGAC
GGTGAATTGCTTTGGCGCGCTTCCATGGAGCCAAAGAGACATGACTATCCGTTTAAAAGG
GTTCCTAAGTTGGCTTTCATGTTTCTCACCAAGGGGCCTTTACCATTTGCTCCCACTTTG
GGAGATGTTCTTTAAAGGACATGAGGGTCTTTACTCTATCTATGTTCATGCATTGCCTAA
TTACAGATCAGATTTTGAAAGGTCATCTGTGTTCTACAGAAGATACATCCCAAGTCAGGC
TGTGGCATGGGGAGAGATGAGTATGTGTGACGCTGAAAGGAGGCTTCTAGCTAATGCGTT
GCTTGATATATCTAATGAATGGTTTGTTCTGCTGTCTGAATCATGCATTCCGCTGCGCGG
TTTCGGCTCTATCTATGGTTATGTGTCTGGATCAAGATATAGTTTCATGGGTTGTGATGA
CGAGGAAGGACCTGATGGGAGAGGAAGATACAGAAACGGAATGGAGCCTGAGATCACGCT
TAGCCAGTGGAGAAAAGGGTCTCAGTGGTTTGAAGTTAACCGGAAACTCGCTCTTGAGAT
TGTTCAAGACACAACTTACTATCCCAAATTCAAAGAGTTTTGACATTGACGTGGACAGAT
TGGTCACGTGGTGGTGCTCATCCGGCTACTTTTAGTAAGGCTGATGTAACGGAAACTTTC
CTAAAGAATCTTCCAGGAGCTAAACCTTGCTTCTACAATGATCAGCGGTCTCCTGTTTGT
TATCTCTTTGCTAGAAAGTTTTCTCCGAGCGCATTGGAGCCTTTATTGGAACTTGCACCC
AAGATTCTTGGGTTCTAACAGATCTTACACTTGTTCAATCTTGTTTTCTTTTCTGAAAAG
TGCTTGAGTTTGGACTATAAAACACTATAGCTGATTTATTTAATAAGTCTCTTAATTCGG
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4A493TF U 1
AF RR4A493JQ C 414
BS 1 473 RR4A493TF
BS 474 474 RR4A493JQ
BS 475 785 RR4A493TF
BS 786 1262 RR4A493JQ

RD RR4A493TF 785 0 0
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AAATCAAGAATCACAAACCAATCCAGGGCTCTTGTGTCAATACGTCTGCTTCAGGTTTTG
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TTCAAGATTCAAGACCCTGTGGCTTCTTCAACCAATTTGGTCTCTATGTATGATCATAGG
GATGTTACTTTAGAGAGCTTTATTAGACCTCCTTTGAATGTTTGGCACACTATGAATGAC
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GGAGATGTTCTTTAAAGGACATGAGGGTCTTTACTCTATCTATGTTCATGCATTGCCTAA
TTACAGATCAGATTTTGAAAGGTCATCTGTGTTCTACAGAAGATACATCCCAAGTCAGGC
TGTGGCATGGGGAGAGATGAGTATGTGTGACGCTGAAAGGAGGCTTCTAGCTAATGCGTT
GCTTGATATATCTAATGAATGGTTTGTTCTGCTGTCTGAATCATGCATTCCGCTGCGCGG
TTTCGGCTCTATCTATGGTTATGTGTCTGGATCAAGATATAGTTTCATGGGTTGTGATGA
CGAGG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4A493JQ 849 0 0
TAAAAGGGTTC*TAAGTTGGCTTTCATGTTTCTCACCAAGGGGCCTTTACCATTTGCTCC
CACTTTGGGAGATGTTCTTTAAAGGACATGAGGGTCTTTACTCTATCTATGTTCATGCAT
TGCCTAATTACAGATCAGATTTTGAAAGGTCATCTGTGTTCTACAGAAGATACATCCCAA
GTCAGGCTGTGGCATGGGGAGAGATGAGTATGTGTGACGCTGAAAGGAGGCTTCTAGCTA
ATGCGTTGCTTGATATATCTAATGAATGGTTTGTTCTGCTGTCTGAATCATGCATTCCGC
TGCGCGGTTTCGGCTCTATCTATGGTTATGTGTCTGGATCAAGATATAGTTTCATGGGTT
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TTGAGATTGTTCAAGACACAACTTACTATCCCAAATTCAAAGAGTTTTGACATTGACGTG
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AACTTTCCTAAAGAATCTTCCAGGAGCTAAACCTTGCTTCTACAATGATCAGCGGTCTCC
TGTTTGTTATCTCTTTGCTAGAAAGTTTTCTCCGAGCGCATTGGAGCCTTTATTGGAACT
TGCACCCAAGATTCTTGGGTTCTAACAGATCTTACACTTGTTCAATCTTGTTTTCTTTTC
TGAAAAGTGCTTGAGTTTGGACTATAAAACACTATAGCTGATTTATTTAATAAGTCTCTT
AATTCGGCG

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

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CATTCCGATCCAGATTGGGAGGATACGGTTTGCGAGGAATGCAGCTCGGGGAAACAACCG
GCGAAGCTGCTTCTCTGCGACAAATGCGACAAAGGTTTCCATCTCTTCTGTCTCAGACCA
ATCCTCGTCTCTGTTCCCAAAGGCTCCTGGTTCTGCCCTTCCTGTTCTAAAACCCAGATC
CCCAAATCTTTCCCTCTTGTTCAGACCAAACTCATTGACTTCTTCCGGATTAAGCGGTCT
CCAGGCTCAACTTCTTCTCCAGAGAGCAGCAGCATTGGGAAGAAACGGAAAGGACGAGCT
TGGTTATGTCTAAGAAGAAGGGGAAGCTTCTTCCTTACATCCCCACCGTTGATCCTCAAC
GGAGGCTCGAGCAAATGGCGTCTCTGGCCACTGCGTTGAGAGCCTCCGACACTGAGTTCA
GGAACGAGCTCACTTATGTATCTGGCAAGGCTCCAAGATCTGCCAACAAGGCTGTCCTTG
AGAAAGGAGGCATGCAGGTTTTAAGTAAACAAGACGCAGAGACCTTAGCCTTGTGCAAGA
ACATGATGGACCGTGGTGAATGCCCGCCGCTTATGGTCGTCTTCGATCCTTATGAAAGGG
TTCACAGTGGAGGCGGACAGGTGTATAAAAGACTTGACCATAATCACAGAGTACGTTGGA
GATGTTGATTACCTGAGCAACAAAGAAGATGACTATGATGGAGACAGCATGATGACGCTA
CTCCATGCCTCTGATCCTTCCCAGTGTCTTGTTATTTGTCCTGACAGACGCAGTAACATT
GCTCGTTTCATCAGCGGCATCAACAATCACACCCCAGAAGGGAGGAAAAAGCAGAACCTG
AAATGTGTGAGGTTCAACGTCAACGGAGAAGCTAGAGTTCTTCTGGTAGCTAATAGAGAC
ATATCTAAAGGGGAGCGATTGTATTATGATTACAACGGATATGAACATTCATATCCTACT
GAACATTTTGTATAACCACTAGAAAGTGAATATATTTTTATAAGATTGTTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AO35TF U 1
AF RR4AO35JQ C 435
BS 1 797 RR4AO35TF
BS 798 1134 RR4AO35JQ

RD RR4AO35TF 797 0 0
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CATTCCGATCCAGATTGGGAGGATACGGTTTGCGAGGAATGCAGCTCGGGGAAACAACCG
GCGAAGCTGCTTCTCTGCGACAAATGCGACAAAGGTTTCCATCTCTTCTGTCTCAGACCA
ATCCTCGTCTCTGTTCCCAAAGGCTCCTGGTTCTGCCCTTCCTGTTCTAAAACCCAGATC
CCCAAATCTTTCCCTCTTGTTCAGACCAAACTCATTGACTTCTTCCGGATTAAGCGGTCT
CCAGGCTCAACTTCTTCTCCAGAGAGCAGCAGCATTGGGAAGAAACGGAAAGGACGAGCT
TGGTTATGTCTAAGAAGAAGGGGAAGCTTCTTCCTTACATCCCCACCGTTGATCCTCAAC
GGAGGCTCGAGCAAATGGCGTCTCTGGCCACTGCGTTGAGAGCCTCCGACACTGAGTTCA
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AGAAAGGAGGCATGCAGGTTTTAAGTAAACAAGACGCAGAGACCTTAGCCTTGTGCAAGA
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TTCACAGTGGAGGCGGACAGGTGTATAAAAGACTTGACCATAATCACAGAGTACGTTGGA
GATGTTGATTACCTGAG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR4AO35JQ 700 0 0
AAGAAGGGGAAGCTTCTTCCTTACATCCCCACCGTTGATCCTCAACGGAGGCTCGAGCAA
ATGGCGTCTCTGGCCACTGCGTTGAGAGCCTCCGACACTGAGTTCAGGAACGAGCTCACT
TATGTATCTGGCAAGGCTCCAAGATCTGCCAACAAGGCTGTCCTTGAGAAAGGAGGCATG
CAGGTTTTAAGTAAACAAGACGCAGAGACCTTAGCCTTGTGCAAGAACATGATGGACCGT
GGTGAATGCCCGCCGCTTATGGTCGTCTTCGATCCTTATGAA*GGGTTCACAGTGGAGGC
GGACAGGTGTATAAAAGACTTGACCATAATCACAGAGTACGTTGGAGATGTTGATTACCT
GAGCAACAAAGAAGATGACTATGATGGAGACAGCATGATGACGCTACTCCATGCCTCTGA
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CGGCATCAACAATCACACCCCAGAAGGGAGGAAAAAGCAGAACCTGAAATGTGTGAGGTT
CAACGTCAACGGAGAAGCTAGAGTTCTTCTGGTAGCTAATAGAGACATATCTAAAGGGGA
GCGATTGTATTATGATTACAACGGATATGAACATTCATATCCTACTGAACATTTTGTATA
ACCACTAGAAAGTGAATATATTTTTATAAGATTGTTCAAC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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TACGAGTCGTCTTCTTCAATCCGCTATATCCTATCCGACTAGGATGAACCAGACCTCATT
GTGTCTCGAGACGTTCCGCGGGATCTGGACCCTCTCCTCACCCTCGAAATCCACTTGCAC
CGACAGGTTCATCCCCTGCCGATCTTCCTCGAGGCTCCACGCTTCCGATCTGCAGGACAA
GGATCCGAAGACGCCGGCGGTGGAGGAGACGGATTGTTCCAATTCGAGTCCTTGTTCTCC
CTTCTCTCCTCGGCAACGACAATGGTCTCTCTAGTGACTCCTCTCCTCCTAAAACGCCTC
CTCGCAAGGTGTTTGCGGACTGGAGCTCACAGAATGTTCTTGCTGTGGGGCTTGGTACTT
GTGTCTATCTCTGGACTGCTTCTAATAGCAAAGTGACGAAGCTTTGTGACTTGGGTCCTA
ATGATAGCGTGTGCTCGCTTCAGCGGACACGGGAGGGAAGTTTGATTCTTGATTTTGAAG
TTATCTTTTATTGCCTTGTTTTATTCTAAGGATTCATGGTGATCGTTACAGGGCTCTGCT
GTGTCAGTCTCTATTCTATCTCACAACACCTTTCTTCCCCAGCTCTCCTGTGGGTTTCAA
AGATCACGCCAAGAGTTCAGTTCTCCTCTGGGTTTCAAAGGTCAAGCCAAGAGTTTCAGG
TAAGAAAGCTTGAAAAGAACATGGAAACTGACAAAAGAACCAGTAAGTGTGTTAGTTACT
GAGAACAATCCTCTCATAAGCATTATTTATATGCACTTATCATCATAATCAACAAGTTAA
AGTGTACATGTATTGTAAGTTATAATATAATGAATAGTTCTTACTCCGAAAAAAAA


BQ
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AF RR4GU35TF U 1
AF RR4GU35JQ C 200
BS 1 566 RR4GU35TF
BS 567 896 RR4GU35JQ

RD RR4GU35TF 566 0 0
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TACGAGTCGTCTTCTTCAATCCGCTATATCCTATCCGACTAGGATGAACCAGACCTCATT
GTGTCTCGAGACGTTCCGCGGGATCTGGACCCTCTCCTCACCCTCGAAATCCACTTGCAC
CGACAGGTTCATCCCCTGCCGATCTTCCTCGAGGCTCCACGCTTCCGATCTGCAGGACAA
GGATCCGAAGACGCCGGCGGTGGAGGAGACGGATTGTTCCAATTCGAGTCCTTGTTCTCC
CTTCTCTCCTCGGCAACGACAATGGTCTCTCTAGTGACTCCTCTCCTCCTAAAACGCCTC
CTCGCAAGGTGTTTGCGGACTGGAGCTCACAGAATGTTCTTGCTGTGGGGCTTGGTACTT
GTGTCTATCTCTGGACTGCTTCTAATAGCAAAGTGACGAAGCTTTGTGACTTGGGTCCTA
ATGATAGCGTGTGCTCGCTTCAGCGGACACGGGAGGGAAGTTTGATTCTTGATTTTGAAG
TTATCTTTTATTGCCTTGTTTTATTC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4GU35JQ 697 0 0
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GTGGAGGAGACGGATTGTTCCAATTCGAGTCCTTGTTCTCCCTTCTCTCCTCGGCAACGA
CAATGGTCTCTCTAGTGACTCCTCTCCTCCTAAAACGCCTCCTCGCAAGGTGTTTGCGGA
CTGGAGCTCACAGAATGTTCTTGCTGTGGGGCTTGGTACTTGTGTCTATCTCTGGACTGC
TTCTAATAGCAAAGTGACGAAGCTTTGTGACTTGGGTCCTAATGATAGCGTGTGCTCGCT
TCAGCGGACACGGGAGGGAAGTTTGATTCTTGATTTTGAAGTTATCTTTTATTGCCTTGT
TTTATTCTAAGGATTCATGGTGATCGTTACAGGGCTCTGCTGTGTCAGTCTCTATTCTAT
CTCACAACACCTTTCTTCCCCAGCTCTCCTGTGGGTTTCAAAGATCACGCCAAGAGTTCA
GTTCTCCTCTGGGTTTCAAAGGTCAAGCCAAGAGTTTCAGGTAAGAAAGCTTGAAAAGAA
CATGGAAACTGACAAAAGAACCAGTAAGTGTGTTAGTTACTGAGAACAATCCTCTCATAA
GCATTATTTATATGCACTTATCATCATAATCAACAAGTTAAAGTGTACATGTATTGTAAG
TTATAATATAATGAATAGTTCTTACTCCGAAAAAAAA

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL8701Contig1 1054 2 2 U
GTGATCTGGTTGTGGAGCCAATATCGACTTCATCTTCTTCGCAATATGCAAGACCAACTG
CAACTACCAATGCAAATGAACAAGCTCGTTCACGGAACTCTGGATCTGTTCCTCGAACAA
CTGGGCCATCTTCTACTGCTGGTGCAAACCCAAGTTCAGGGCGCTGGGATCAACAGACTA
TTCTGTTTTCTATCAATGCTTGGGTTTTCGTTATAGCGGTGCTGGCAGTGTTACCTCTAG
TGCCAAAGAACCTCTCTAATAGGGCTTATCGTCTATCTTTCATGGGAACTGCATGCTCAT
CTCTTTTTTCCTTGTACTCTCTTTACGGGAGGCCAAGTGCATGGAATATGCAAGGGCTGC
AATTTTATTTTCAATCAATTATGGGAGCAAAGGATTTCATCTATTTCATATACTGCCTTT
CACTTGTCACTTCACATCTCTGTGTCAAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCAC
TTGAACAATTAGCCAAGTTCTTGAGGCGTAACTTCACTCGTTCCACTATATACAGAAAGT
ACTTGGAAGATCCTTGCGTGTGGGGTGGAGTCAAACACAACTACTCTTAACATCCTCTCA
TCGCAGGCTGAGATAGCCATCGGCTTCCTTCTGATTATCTCTCTTCTCTCATGGCAACGC
AACATTATACAGACATTCATGTACTGGCAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACCAGTA
ACGGCAGGATACCACCAAAGCACGTGGAGCAGAATCGGGAGGACTGCGAATCCGATCATC
CAACGGTACGCTCCCTTCTTGAATACTCCGGTCACTGCCGTCCAGAGATGGTGGTTCAGG
TGAATAACCAACAGAAAATACAGAGGTGACTTTTGAAACCCCTTAAAGACAAAAGAAAAG
GTTTCAGCTTTATTTTTCATTTCAGCGTAAAGTAGGTTCTTCTCCTCTTACGTTTCTGGG
TTATGAAATATTATTGTTGCTAAAATTTTTTTTACTTTCTCTTCTAGTTGCTACTTTAGA
TATATGTGACTTAATTCCCCTTTGCATAGGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BX16TF U 1
AF RR4BX16JQ C 317
BS 1 716 RR4BX16TF
BS 717 1054 RR4BX16JQ

RD RR4BX16TF 716 0 0
GTGATCTGGTTGTGGAGCCAATATCGACTTCATCTTCTTCGCAATATGCAAGACCAACTG
CAACTACCAATGCAAATGAACAAGCTCGTTCACGGAACTCTGGATCTGTTCCTCGAACAA
CTGGGCCATCTTCTACTGCTGGTGCAAACCCAAGTTCAGGGCGCTGGGATCAACAGACTA
TTCTGTTTTCTATCAATGCTTGGGTTTTCGTTATAGCGGTGCTGGCAGTGTTACCTCTAG
TGCCAAAGAACCTCTCTAATAGGGCTTATCGTCTATCTTTCATGGGAACTGCATGCTCAT
CTCTTTTTTCCTTGTACTCTCTTTACGGGAGGCCAAGTGCATGGAATATGCAAGGGCTGC
AATTTTATTTTCAATCAATTATGGGAGCAAAGGATTTCATCTATTTCATATACTGCCTTT
CACTTGTCACTTCACATCTCTGTGTCAAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCAC
TTGAACAATTAGCCAAGTTCTTGAGGCGTAACTTCACTCGTTCCACTATATACAGAAAGT
ACTTGGAAGATCCTTGCGTGTGGGGTGGAGTCAAACACAACTACTCTTAACATCCTCTCA
TCGCAGGCTGAGATAGCCATCGGCTTCCTTCTGATTATCTCTCTTCTCTCATGGCAACGC
AACATTATACAGACATTCATGTACTGGCAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR4BX16JQ 738 0 0
CTCTCTTTACGGGAGGCCAAGTGCATGGAATATGCAAGGGCTGCAATTTTATTTTCAATC
AATTATGGGAGCAAAGGATTTCATCTATTTCATATACTGCCTTTCACTTGTCACTTCACA
TCTCTGTGTCAAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCACTTGAACAATTAGCCAA
GTTCTTGAGGCGTAACTTCACTCGTTCCACTATATACAGAAAGTACTTGGAAGATCCTTG
CGTGTGGG*TGGAGTCAAACACAACTACTCTTAACATCCTCTCATCGCAGGCTGAGATAG
CCATCGGCTTCCTTCTGATTATCTCTCTTCTCTCATGGCAACGCAACATTATACAGACAT
TCATGTACTGGCAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACCAGTAACGGCAGGATACCACC
AAAGCACGTGGAGCAGAATCGGGAGGACTGCGAATCCGATCATCCAACGGTACGCTCCCT
TCTTGAATACTCCGGTCACTGCCGTCCAGAGATGGTGGTTCAGGTGAATAACCAACAGAA
AATACAGAGGTGACTTTTGAAACCCCTTAAAGACAAAAGAAAAGGTTTCAGCTTTATTTT
TCATTTCAGCGTAAAGTAGGTTCTTCTCCTCTTACGTTTCTGGGTTATGAAATATTATTG
TTGCTAAAATTTTTTTTACTTTCTCTTCTAGTTGCTACTTTAGATATATGTGACTTAATT
CCCCTTTGCATAGGTGCT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL8702Contig1 935 2 8 U
TTTTTTTTTGGTAAAAGCAACATTTAGATTTTTGTTGATTTTTTTTAGTTCTTGCCATTT
CTTTCTCTCTCTCTATCGTAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAAACAAAGGATTGATTTGGTTG
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TGACGAATTTCTCGATGGTGGAAGACGGAATATACCGATCTGGGTTTCCTCAGCTCGAGA
ATTTCGGTTTTTTATCGACACTCAATCTTAAATCCATCATTTATCTGTGTCCTGAACCAT
ACCCTGAGGAGAATATAAAGCTTCTCCAATCCAACAACATCAAGCTTTTCCAGTTCGGTA
TCCAAGGCAAAACGGATCCTCCAACTCCTATGCCAAAGGATACGGTCTTGAGTGCTCTTA
GAGTACTTGTTGATGTTAGAAACCATCCAATTCTCATCCACTGTAAGCAAGGAAAGCATA
GGACAGGTTGTCTTGTGGGATGCTTGAGGAAGGTGCAGAACTGGTGCTTATCATCTGTTC
TTGAGGAATACCAGAAGTGTGCGGGTTTGAAATGGAGACAAAGAGACTTAAGGTTCATAG
AGGAGTTCGATGTGCAAAGTTTAAGGCAATGTCTGTACAGCATAATCTACCAGTACAATG
GTTATGGTCTCAAGAGGAGAAAGTTGCTGAATCAAGAAGAGTATGTTGTCCAAGAACAAC
AGCATAAACCTCAAGCCACCAAAGGGTGGTGAACAAACCAGAAGAGCTTGAAATCGGAGG
ATTATATCGTTTTTCTAGATCCTTTAGGTTCACAACAGATGATTTTTATTTGGTCTCTTT
TTCTTTTATTACAGCCTAGAAAAATTTTCAGATGGATTAAACTAACAACACATGTCTCGC
TTTTGTTTTGTTAATCATATGAGATTCATCAAGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E144TF U 1
AF RR4E144JQ C 300
BS 1 625 RR4E144TF
BS 626 626 RR4E144JQ
BS 627 690 RR4E144TF
BS 691 691 RR4E144JQ
BS 692 697 RR4E144TF
BS 698 698 RR4E144JQ
BS 699 712 RR4E144TF
BS 713 935 RR4E144JQ

RD RR4E144TF 720 0 0
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CTTTCTCTCTCTCTATCGTAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAAACAAAGGATTGATTTGGTTG
GATTGAGATTGATGGGTTTATTGATAGTGGACGATGAAGACGGCGAGGTTTTGATTCCGC
TGACGAATTTCTCGATGGTGGAAGACGGAATATACCGATCTGGGTTTCCTCAGCTCGAGA
ATTTCGGTTTTTTATCGACACTCAATCTTAAATCCATCATTTATCTGTGTCCTGAACCAT
ACCCTGAGGAGAATATAAAGCTTCTCCAATCCAACAACATCAAGCTTTTCCAGTTCGGTA
TCCAAGGCAAAACGGATCCTCCAACTCCTATGCCAAAGGATACGGTCTTGAGTGCTCTTA
GAGTACTTGTTGATGTTAGAAACCATCCAATTCTCATCCACTGTAAGCAAGGAAAGCATA
GGACAGGTTGTCTTGTGGGATGCTTGAGGAAGGTGCAGAACTGGTGCTTATCATCTGTTC
TTGAGGAATACCAGAAGTGTGCGGGTTTGAAATGGAGACAAAGAGACTTAAGGTTCATAG
AGGAGTTCGATGTGCAAAGTTTAAG*CAATGTCTGTACAGCATAATCTACCAGTACAATG
GTTATGGTCTCAAGAGGAGAAAGTTGCTGA*TCAAGA*GAGTATGTTGTCCA
GACACAGC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4E144JQ 636 0 0
TACCCTGAGGAGAATATAAAGCTTCTCCAATCCAACAACATCAAGCTTTTCCAGTTCGGT
ATCCAAGGCAAAACGGATCCTCCAACTCCTATGCCAAAGGATACGGTCTTGAGTGCTCTT
AGAGTACTTGTTGATGTTAGAAACCATCCAATTCTCATCCACTGTAAGCAAGGAAAGCAT
AGGACAGGTTGTCTTGTGGGATGCTTGAGGAAGGTGCAGAACTGGTGCTTATCATCTGTT
CTTGAGGAATACCAGAAGTGTGCGGGTTTGAAATGGAGACAAAGAGACTTAAGGTTCATA
GAGGAGTTCGATGTGCAAGGTTTAAGGCAATGTCTGTACAGCATAATCTACCAGTACAAT
GGTTATGGTCTCAAGAGGAGAAAGTTGCTGAATCAAGAAGAGTATGTTGTCCAAGAACAA
CAGCATAAACCTCAAGCCACCAAAGGGTGGTGAACAAACCAGAAGAGCTTGAAATCGGAG
GATTATATCGTTTTTCTAGATCCTTTAGGTTCACAACAGATGATTTTTATTTGGTCTCTT
TTTCTTTTATTACAGCCTAGAAAAATTTTCAGATGGATTAAACTAACAACACATGTCTCG
CTTTTGTTTTGTTAATCATATGAGATTCATCAAGTC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL8703Contig1 998 2 2 U
GGGTTTTCTTTCAACCGTTCCAGCACACCAAGGCCCTACTCCGTGGTTCAACCAGGTTTT
TCGACTGTGCCTCCATATTCTGGCAGTCAGGTACAACCAATGACCTCGATCTACAATGAG
GCCGTCGACCCTATCGACTTTCCAACCTGTCGCTAGCAGTGGGTTTAGACCAACGCTGTT
GCCAGACATAATCTCAAGCAACATGTCCCAATCAGTACGGCCTCTGGCTCCGGTAGCTCA
TCAGCTAGGTACTCAACAACCATCAGTTCCCTTTTCCCCGAGTATCAATCTGAAACATCT
AACAGAATATGCCTCTGGTGGTTCTCTGCGTCCCATGTCGGTGTCAGCACATATTGCTGG
CAGGCCTGCTGGTCCTCTTCCTACTTATCCATCCACGAATACAGCTCCAAGACTATTTCA
CGGGGATTTCGGTTTCCATCCACAAGCACATATATCTCCTAGACCCAACTCTCAAACAAT
TCATCTCCCTCCTCTGGTATTTCAAGCCCCATCCGTCAGTCCAGCCTCCCAACATTTTGG
GCAAAGCTTCACAAGATCACAGCACCTTGGGAGGCAGATGGATCAACCCCTGCGCCACCT
GCCTGGACCATCTCAGAGTAACGTGAGATCTTCCAGCTCGCAGACCTTTGGACCCCCGTT
TCTCAGGTGATGCCTAGGAACTTCCCTGAATCTCAGTTCCCGCAACGTTTTGCTCTTTTC
CCTCCAAGACCAGTGTTTCATAGTGATAACCTGAATCCAAATGGCCAACCACAGATTCGC
CACCGGTTTAACGCAGGTGTGCATCAAGTATATGATCCTTTCACCTAGTGACGCATGATG
ATGACCCATTAGTGTTTTTTTTTTTACATTACTGAGGAAAAAGAGATAATATTGGATATA
ATTTTCCTAACAGAGGTTTCAAAGCATTGGCTTTGTCTGTTTCCATGTATAAATGCTCGT
CTTTTTGTGATTTTAATGGTAAAATTGAAGATCGGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E367TF U 1
AF RR4E367JQ C 275
BS 1 666 RR4E367TF
BS 667 998 RR4E367JQ

RD RR4E367TF 672 0 0
GGGTTTTCTTTCAACCGTTCCAGCACACCAAGGCCCTACTCCGTGGTTCAACCAGGTTTT
TCGACTGTGCCTCCATATTCTGGCAGTCAGGTACAACCAATGACCTCGATCTACAATGAG
GCCGTCGACCCTATCGACTTTCCAACCTGTCGCTAGCAGTGGGTTTAGACCAACGCTGTT
GCCAGACATAATCTCAAGCAACATGTCCCAATCAGTACGGCCTCTGGCTCCGGTAGCTCA
TCAGCTAGGTACTCAACAACCATCAGTTCCCTTTTCCCCGAGTATCAATCTGAAACATCT
AACAGAATATGCCTCTGGTGGTTCTCTGCGTCCCATGTCGGTGTCAGCACATATTGCTGG
CAGGCCTGCTGGTCCTCTTCCTACTTATCCATCCACGAATACAGCTCCAAGACTATTTCA
CGGGGATTTCGGTTTCCATCCACAAGCACATATATCTCCTAGACCCAACTCTCAAACAAT
TCATCTCCCTCCTCTGGTATTTCAAGCCCCATCCGTCAGTCCAGCCTCCCAACATTTTGG
GCAAAGCTTCACAAGATCACAGCACCTTGGGAGGCAGATGGATCAACCCCTGCGCCACCT
GCCTGGACCATCTCAGAGTAACGTGAGATCTTCCAGCTCGCAGACCTTTGGACCCCCGTT
TCTCAG
TGATGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4E367JQ 724 0 0
TCCCCGAGTATCAATCTGAAACATCTAACAGAATATGCCTCTGGTGGTTCTCTGCGTCCC
ATGTCGGTGTCAGCACATATTGCTGGCAGGCCTGCTGGTCCTCTTCCTACTTATCCATCC
ACGAATACAGCTCCAAGACTATTTCACGGGGATTTCGGTTTCCATCCACAAGCACATATA
TCTCCTAGACCCAACTCTCAAACAATTCATCTCCCTCCTCTGGTATTTCAAGCCCCATCC
GTCAGTCCAGCCTCCCAACATTTTGGGCAAAGCTTCACAAGATCACAGCACCTTGGGAGG
CAGATGGATCAACCCCTGCGCCACCTGCCTGGACCATCTCAGAGTAACGTGAGATCTTCC
AGCTCGCAGACCTTTGGACCCCCGTTTCTCAGGTGATGCCTAGGAACTTCCCTGAATCTC
AGTTCCCGCAACGTTTTGCTCTTTTCCCTCCAAGACCAGTGTTTCATAGTGATAACCTGA
ATCCAAATGGCCAACCACAGATTCGCCACCGGTTTAACGCAGGTGTGCATCAAGTATATG
ATCCTTTCACCTAGTGACGCATGATGATGACCCATTAGTGTTTTTTTTTTTACATTACTG
AGGAAAAAGAGATAATATTGGATATAATTTTCCTAACAGAGGTTTCAAAGCATTGGCTTT
GTCTGTTTCCATGTATAAATGCTCGTCTTTTTGTGATTTTAATGGTAAAATTGAAGATCG
GCAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL8704Contig1 394 2 1 U
GGACTCTTCTTGAACTCAAAAACCTCCCCAAGCAATGCCTCTCTCTCTCCGTCTCGCACC
ATCTCCTACCGCTTTAGCTTCAACCAACGGTGGACTTGGTGGTCCCCTGAAGAAGAAGCA
GTGCCGCATCCCTTACTCCGGCGTCGCCACTAGTAAAGGAGCTAGGATTAAGAGTGGTTC
CAACTTTCAAAATCTTTAAGGATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTACCGGTGCCAAGTATG
ATAATCTGGTTGAAGCAATTGAAACGGCCAGGTCTGCTGCTGGTTCTTCAGGATGAACCA
AATCCTCATGTAAAGACTTTACCTTACTTGGGTTATAAAATGTAGTAAACTCTGCTGCTC
TTGTTTTATTGGAAATGAAAAGAGTTTTATGTAT


BQ
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AF RR4GC18JQ C 1
AF RR4GC18TF U 1
BS 1 394 RR4GC18TF

RD RR4GC18JQ 394 0 0
GGACTCTTCTTGAACTCAAAAACCTCCCCAAGCAATGCCTCTCTCTCTCCGTCTCGCACC
ATCTCCTACCGCTTTAGCTTCAACCAACGGTGGACTTGGTGGTCCCCTGAAGAAGAAGCA
GTGCCGCATCCCTTACTCCGGCGTCGCCACTAGTAAAGGAGCTAGGATTAAGAGTGGTTC
CAACTTTCAAAATCTTTAAGGATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTACCGGTGCCAAGTATG
ATAATCTGGTTGAAGCAATTGAAACGGCCAGGTCTGCTGCTGGTTCTTCAGGATGAACCA
AATCCTCATGTAAAGACTTTACCTTACTTGGGTTATAAAATGTAGTAAACTCTGCTGCTC
TTGTTTTATTGGAAATGAAAAGAGTTTTATGTAT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR4GC18TF 394 0 0
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ATCTCCTACCGCTTTAGCTTCAACCAACGGTGGACTTGGTGGTCCCCTGAAGAAGAAGCA
GTGCCGCATCCCTTACTCCGGCGTCGCCACTAGTAAAGGAGCTAGGATTAAGAGTGGTTC
CAACTTTCAAAATCTTTAAGGATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTACCGGTGCCAAGTATG
ATAATCTGGTTGAAGCAATTGAAACGGCCAGGTCTGCTGCTGGTTCTTCAGGATGAACCA
AATCCTCATGTAAAGACTTTACCTTACTTGGGTTATAAAATGTAGTAAACTCTGCTGCTC
TTGTTTTATTGGAAATGAAAAGAGTTTTATGTAT

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

CO CL8705Contig1 491 2 2 U
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AAAACTCACAACAACATATCATCATACCATCATCCCAAGTGGCATGATCTCTTTATTTTG
AAAGAAAATTTCAAAATTACATTTATAGTGAGGAATTATGAAAATATATTTTCATCCAAA
TATTGTGGGATCATGTGTTTTTGTTTCTTGAAAACCTTCAATGCCGTGGAGGGGGTGGAG
GTGAACGATATCGGGGTCTAATTTTTGGGTTAGGCTTACATATGAACGCTGGGCATTTAG
GGAAGCCTAAGAGAGAGCGCCTTCCAACCGTCGTCAGTTGATCGGGATGCTCCGTGCCTT
TAAGTCTTTTTTCACCGAGGGCTTTATCCATATGGGGAAACACAAGAACGACCAGGAGGA
GAAAGAGAAGCATGGAAGATACTTTAGAAGATGTCATCTTAGTATTCTCTTAATTTACTG
ATGAGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EQ59TF C 1
AF RR4GV50JQ U 81
BS 1 80 RR4EQ59TF
BS 81 491 RR4GV50JQ

RD RR4EQ59TF 491 0 0
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AAAACTCACAACAACATATCATCATACCATCATCCCAAGTGGCATGATCTCTTTATTTTG
AAAGAAAATTTCAGAATTACATTTGTAGTGAGGAATTATGAAAATATATTTTCATCCAAA
TATTGTGGGATCATGTGTTTTTGTTTCTTGAAAACCTTCAATGCCGTGGAGGGGGTGGAG
GTGAACGATATCGGGGTTTAATTTTTGGGTTAGGCTTACATATGAACGCTGGGCATTTAG
GGAAGCCTAAGAGAGAGCGCCTTCCAACCGTCGTCAGTTGATCGGGATGCTCTGTGCCTT
TAAGTCTTTTTTCACCGAGGGCTTTATCCATATGGGGAAACACAAGAACGACCAGGAGGA
GAAAGAGAAGCATGGAAGATACTTTAGAAGATGTCATCTTAGTATTCTCTTAATTTACTG
ATGAGTGATCC

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR4GV50JQ 411 0 0
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ATTTATAGTGAGGAATTATGAAAATATATTTTCATCCAAATATTGTGGGATCATGTGTTT
TTGTTTCTTGAAAACCTTCAATGCCGTGGAGGGGGTGGAGGTGAACGATATCGGGGTCTA
ATTTTTGGGTTAGGCTTACATATGAACGCTGGGCATTTAGGGAAGCCTAAGAGAGAGCGC
CTTCCAACCGTCGTCAGTTGATCGGGATGCTCCGTGCCTTTAAGTCTTTTTTCACCGAGG
GCTTTATCCATATGGGGAAACACAAGAACGACCAGGAGGAGAAAGAGAAGCATGGAAGAT
ACTTTAGAAGATGTCATCTTAGTATTCTCTTAATTTACTGATGAGTGATCC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

CO CL8706Contig1 1105 2 10 U
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GTGTGACGTTTTTTTTAAAGGCCAGATAATCCTCAAGACTACAAAGAAGTGATGGATGAG
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GTCTTTAATTCCAACTTAGAGATCCTTAGGTTTCTAATTTCATCACATGGTTTCAAGATC
TATCTAGAAACATCCTCAGAGGAATCTCCTTAGCTCTTGGGGGATCACCTTATGAATTTG
AGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTGGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAGGTGTAA
ACCAGGAAAATGTTATCGTATGGTAATACACTTCTCCCATTATTGTATAACTACGAAGAC
CTATCTTTTTGCCTCACTTAATTAGTAGCACGCCAAGAAAACTCTATCAGATGTAACTCG
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CTTCAACTCGAATCAAGAGGATCAATATTTTCATAATTTTTGTTTCAAGAGGGAGAAACA
CACAATACTTTTTAGTTTTTTTTTTGAACAACTTACACTTTTTAGTCAAAAACCGTAATT
TTGTAGGCTTGTTGTCGCTAATAAATCAAGATGATGATAAAACTGCTCTTCAGGTGAAGA
ACTTGGCCGGTGGTTGGATATCAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTTATTTGCAACATCG
GTGACATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGAATATGAATCCACAATTCATAGAGTGATCA
ATAACTCTCCTCGATACCGTGTATGCGTCGGATTCTTCTACGAGATCAACTTTGATGCGA
TGGCTGAACCATTGGATATCTTCAAAGGCCCGGGAAATAAAAGATCTCAAGTTTCCAAAA
GAGTTGTCTATGGAGAGCATCTGGTTAACAAACTCCAGGCTACCTTCGCAAATTCAATGG
AAAGCATTTAGTTTGATTGGTTGGGCTTTCAATTGCAATTTTTTTATCTGGATTTCTAGT
TCTAATAAAAAAACATTACTAAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED22TF U 1
AF RR4ED22JQ C 485
BS 1 624 RR4ED22TF
BS 625 625 RR4ED22JQ
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BS 714 1105 RR4ED22JQ

RD RR4ED22TF 716 0 0
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GTGTGACGTTTTTTTTAAAGGCCAGATAATCCTCAAGACTACAAAGAAGTGATGGATGAG
TATATTAAGCTATGCATAGGTGTGTATTAACATTTTTCAACCCTTTTCAGTTTCCTTTAT
GTCTTTAATTCCAACTTAGAGATCCTTAGGTTTCTAATTTCATCACATGGTTTCAAGATC
TATCTAGAAACATCCTCAGAGGAATCTCCTTAGCTCTTGGGGGATCACCTTATGAATTTG
AGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTGGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAGGTGTAA
ACCAGGAAAATGTTATCGTATGGTAATACACTTCTCCCATTATTGTATAACTACGAAGAC
CTATCTTTTTGCCTCACTTAATTAGTAGCACGCCAAGAAAACTCTATCAGATGTAACTCG
TCTCTTTTTTTTTGCTTAAAAAAATTTTCAGTGGAGCTCACACTGACTATGGTAAGTAAG
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CACAATACTTTTTAGTTTTTTTTT*GAACAACTTACACTTTTTAGTCAAAA*CCGTAATT
TTGTAG*CTTGTTGTCGCTAATAAATCAAGATGATGATAAA*CTGCTCTTCAG
TGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR4ED22JQ 621 0 0
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ATACTTTTTAGTTTTTTTTTTGAACAACTTACACTTTTTAGTCAAAAACCGTAATTTTGT
AGGCTTGTTGTCGCTAATAAATCAAGATGATGATAAAACTGCTCTTCAGGTGAAGAACTT
GGCCGGTGGTTGGATATCAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTTATTTGCAACATCGGTGA
CATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGAATATGAATCCACAATTCATAGAGTGATCAATAA
CTCTCCTCGATACCGTGTATGCGTCGGATTCTTCTACGAGATCAACTTTGATGCGATGGC
TGAACCATTGGATATCTTCAAAGGCCCGGGAAATAAAAGATCTCAAGTTTCCAAAAGAGT
TGTCTATGGAGAGCATCTGGTTAACAAACTCCAGGCTACCTTCGCAAATTCAATGGAAAG
CATTTAGTTTGATTGGTTGGGCTTTCAATTGCAATTTTTTTATCTGGATTTCTAGTTCTA
ATAAAAAAACATTACTAAACC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL8707Contig1 935 2 6 U
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AGATTAATTTCAATTTTAGGATAGCCATCCTGAACAAGGATTATCTAACATTCCTTACAC
GCTTTTGATTCTCTCCGAAAACAGACTTATGCAAGAAAACACACTCATTTTAGTTTTCTG
GAAACCCATCCTGAAAGTGCCAAAAGCTATATCCTATATAACATATGTGTTTTATAATGA
TACCACATTTAACACTTTCTTGATTTTTTTTCTTTTGAAGATTAATTTCAATTTTATTTT
AGGATAGCCATCCTGAATAAGGATTGTCTAACATTCCTTACACGCTTTTGATTCTCTTCG
AAAACAGACTTATGCAAGAAAACACACTCATTTTAGTTTTCTGGAAACCCATCCTGAAAG
TACCAAAAGCTATATCTTATATAACATATGTGTTTTATAATGATACCACATTTAACACTT
TCTCGATAGAATTATTGAAAATTCTTCAAACTATTCTATTTTAATGTTCTCTTTTTGATA
TGTGTTATCTATTTTGTAAACAATAAATTCTATATGGTGATTTCTATGTCCAATGAATTT
TGTTATAGATTTTGATTATGTTTTTTTTGTTTTGAAAAATTAAGTCCCAATTTAGGATAG
CCATCCTAAACAAGGATTGTTTAGCATTCCGATTTTGATTCTCTTCAAAAAAGACTTATG
CAAGAAAACACTTTCATTTTATTTTTCTGGAAACCCATCCTGAAAGTGCCAAAAGCCATC
CTATATAACATATGTGTTTTGTAATGATACCACATTTAGTACTTTCTTGATAAAATTATT
AAAAATGCTTCACATTAGGGGAAAAATCTTGAGTCCTAGTCTGTGGAGAGAATGGAGAGG
CAGGTGTCTCATTTGATAGCTCTGTCTCCTTCTGC


BQ
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AF RR4G705TF U 1
AF RR4G705JQ C 352
BS 1 711 RR4G705TF
BS 712 712 RR4G705JQ
BS 713 727 RR4G705TF
BS 728 728 RR4G705JQ
BS 729 755 RR4G705TF
BS 756 935 RR4G705JQ

RD RR4G705TF 759 0 0
GTATATAACATATGTGTTTTATAATGATACCACATTTAACACTTTCTTGATTTTTTTTGA
AGATTAATTTCAATTTTAGGATAGCCATCCTGAACAAGGATTATCTAACATTCCTTACAC
GCTTTTGATTCTCTCCGAAAACAGACTTATGCAAGAAAACACACTCATTTTAGTTTTCTG
GAAACCCATCCTGAAAGTGCCAAAAGCTATATCCTATATAACATATGTGTTTTATAATGA
TACCACATTTAACACTTTCTTGATTTTTTTTCTTTTGAAGATTAATTTCAATTTTATTTT
AGGATAGCCATCCTGAATAAGGATTGTCTAACATTCCTTACACGCTTTTGATTCTCTTCG
AAAACAGACTTATGCAAGAAAACACACTCATTTTAGTTTTCTGGAAACCCATCCTGAAAG
TACCAAAAGCTATATCTTATATAACATATGTGTTTTATAATGATACCACATTTAACACTT
TCTCGATAGAATTATTGAAAATTCTTCAAACTATTCTATTTTAATGTTCTCTTTTTGATA
TGTGTTATCTATTTTGTAAACAATAAATTCTATATGGTGATTTCTATGTCCAATGAATTT
TGTTATAGATTTTGATTATGTTTTTTTTGTTTTGAAAAATTAAGTCCCAATTTAGGATAG
CCATCCTAAACAAGGATTGTTTAGCATTCCGATTTTGATTCTCTTCAAAAA*GACTTATG
CAAGAAA*CACTTTCATTTTATTTTTCTGGAAACC
ATCC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4G705JQ 584 0 0
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TCCTGAAAGTACCAAAAGCTATATCTTATATAACATATGTGTTTTATAATGATACCACAT
TTAACACTTTCTCGATAGAATTATTGAAAATTCTTCAAACTATTCTATTTTAATGTTCTC
TTTTTGATATGTGTTATCTATTTTGTAAACAATAAATTCTATATGGTGATTTCTATGTCC
AATGAATTTTGTTATAGATTTTGATTATGTTTTTTTTGTTTTGAAAAATTAAGTCCCAAT
TTAGGATAGCCATCCTAAACAAGGATTGTTTAGCATTCCGATTTTGATTCTCTTCAAAAA
AGACTTATGCAAGAAAACACTTTCATTTTATTTTTCTGGAAACCCATCCTGAAAGTGCCA
AAAGCCATCCTATATAACATATGTGTTTTGTAATGATACCACATTTAGTACTTTCTTGAT
AAAATTATTAAAAATGCTTCACATTAGGGGAAAAATCTTGAGTCCTAGTCTGTGGAGAGA
ATGGAGAGGCAGGTGTCTCATTTGATAGCTCTGTCTCCTTCTGC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8709Contig1 396 2 1 U
GGATCACAAAGCTTGGCACTTTCTATATGGGGAAAGAGAGAAACAAAGGAACAGTCTTCC
TTGTTATGTTCTTAGCTCTAATGGTGGATGACATCTTTCACACGATTCACCCAAGTACAA
TATCATCAAGATCCCCTGAAGTATACCATGGAAAATCTTTGGAGGAATATCCAGAAGACT
CTCTGTTTCTCTCCAAAGGTTCGAGAAGACTACAGAAAACGAAGGCATGAGAGTATAAAT
TTCGCAACTTTTCCCGATCATCACCCTCCAAGCGTTTTGTGTAATAAATATACAAGAACT
GAAGAAAACATAAACAAGTTGCAACATCCAGAAACTTTTAGTATTATACTTATATATATT
TGTAATCTGCATCATTCAAAGTGACAAAAGACCATT


BQ
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AF RR4EH02JQ C 1
AF RR4EH02TF U 1
BS 1 396 RR4EH02TF

RD RR4EH02JQ 396 0 0
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TTGTTATGTTCTTAGCTCTAATGGTGGATGACATCTTTCACACGATTCACCCAAGTACAA
TATCATCAAGATCCCCTGAAGTATACCATGGAAAATCTTTGGAGGAATATCCAGAAGACT
CTCTGTTTCTCTCCAAAGGTTCGAGAAGACTACAGAAAACGAAGGCATGAGAGTATAAAT
TTCGCAACTTTTCCCGATCATCACCCTCCAAGCGTTTTGTGTAATAAATATACAAGAACT
GAAGAAAACATAAACAAGTTGCAACATCCAGAAACTTTTAGTATTATACTTATATATATT
TGTAATCTGCATCATTCAAAGTGACAAAAGACCATT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4EH02TF 396 0 0
GGATCACAAAGCTTGGCACTTTCTATATGGGGAAAGAGAGAAACAAAGGAACAGTCTTCC
TTGTTATGTTCTTAGCTCTAATGGTGGATGACATCTTTCACACGATTCACCCAAGTACAA
TATCATCAAGATCCCCTGAAGTATACCATGGAAAATCTTTGGAGGAATATCCAGAAGACT
CTCTGTTTCTCTCCAAAGGTTCGAGAAGACTACAGAAAACGAAGGCATGAGAGTATAAAT
TTCGCAACTTTTCCCGATCATCACCCTCCAAGCGTTTTGTGTAATAAATATACAAGAACT
GAAGAAAACATAAACAAGTTGCAACATCCAGAAACTTTTAGTATTATACTTATATATATT
TGTAATCTGCATCATTCAAAGTGACAAAAGACCATT

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 2

CO CL8710Contig1 1090 2 2 U
GGGGAGTTCCAATCAGCTTCAAGTGTTTTGTTCTGTCTTTGTGTGTGTGTGTTGTGTGTC
AGCAAACCAAACCAAACCCATCTCTCTCATCTTCTTACTACTTTTCTCCATTTATTATAA
ACCCCAAAAGCATTTGTAGTGAGTATTCTTCCATCACCTCATGGACGCCTCTAGGGACGA
GTCAAAGCCATCTGATTCCTCATGCATCGTTTCCACATCCAACACTCTTTCGTATCCAGA
TTCTCTTAACCTGAGCCTAGAGCATTACAACGTCGACGCAGAAGAGGGACAAGGAGAAGA
TGGCTGTGATCAAAAAGCAGGAAAGGAAGGTATAAGGCTCGATCTTACGCTAGCAGAATA
TGATTATAGTCAACCACAGCATAATCAAGAACTCAACCTCATCGACAACTTAGACGCGAG
TGAAGCCACTCCGAGTTATAAAGGGTCAACTTCCACTGCGCAGAAGCTCTTCTCATGCAA
CTACTGTCAAAGAACATTCTACAGCTCACAGGCCCTTGGTGGTCACCAAAACGCTCACAA
AAGAGAGAGGACTTTGGCTAAGCGAGGGAAACAGATGGAAGCTTTCGGCCATCCATATGG
TTTTGCTCATGTCCCGTTCCACGGCCAGTATAGCAACAGATCATTGGGTATTCACGCCCA
CTCAATGAGTCACAAGCTAAGTTCATACAACGCCTTTGGTGCTGGTGAGTATGGTCAGTT
CAACTGGTCAAGGATACCGTTAGCTCAGCAACCAGCCATAGGTAGACTATCTTCAACAGA
GAGTCGTCATCAGATGATGTTTCCACCACCGTTGACTTCAACAAGTGAAAACTTCGGTAG
GTTCGATGCAGGAACGATACCAGTAGATTCTGCAGAAGATCAGCAGAAGAACCTTGACTT
GTCCCTCAAACTCTGAGATTCTTGTCTCTTCAATTGTTTTTGTTTGTGCTGGTTTTTTGT
TGTCATTGATATGTTCACCAGTATTATCCAAGGGTGTTAGTAAGTATTCTTGTGAATAAT
ATTTTGTCTAGCATAGATTTATGTTGTACATGTTTCCATATTTTGTACAAATTTTCAGCT
AGACATCAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB83TF U 1
AF RR4DB83JQ C 406
BS 1 806 RR4DB83TF
BS 807 1090 RR4DB83JQ

RD RR4DB83TF 810 0 0
GGGGAGTTCCAATCAGCTTCAAGTGTTTTGTTCTGTCTTTGTGTGTGTGTGTTGTGTGTC
AGCAAACCAAACCAAACCCATCTCTCTCATCTTCTTACTACTTTTCTCCATTTATTATAA
ACCCCAAAAGCATTTGTAGTGAGTATTCTTCCATCACCTCATGGACGCCTCTAGGGACGA
GTCAAAGCCATCTGATTCCTCATGCATCGTTTCCACATCCAACACTCTTTCGTATCCAGA
TTCTCTTAACCTGAGCCTAGAGCATTACAACGTCGACGCAGAAGAGGGACAAGGAGAAGA
TGGCTGTGATCAAAAAGCAGGAAAGGAAGGTATAAGGCTCGATCTTACGCTAGCAGAATA
TGATTATAGTCAACCACAGCATAATCAAGAACTCAACCTCATCGACAACTTAGACGCGAG
TGAAGCCACTCCGAGTTATAAAGGGTCAACTTCCACTGCGCAGAAGCTCTTCTCATGCAA
CTACTGTCAAAGAACATTCTACAGCTCACAGGCCCTTGGTGGTCACCAAAACGCTCACAA
AAGAGAGAGGACTTTGGCTAAGCGAGGGAAACAGATGGAAGCTTTCGGCCATCCATATGG
TTTTGCTCATGTCCCGTTCCACGGCCAGTATAGCAACAGATCATTGGGTATTCACGCCCA
CTCAATGAGTCACAAGCTAAGTTCATACAACGCCTTTGGTGCTGGTGAGTATGGTCAGTT
CAACTGGTCAAGGATACCGTTAGCTCAGCAACCAGCCATAGGTAGACTATCTTCAACAGA
GAGTCGTCATCAGATGATGTTTCCAC
ACCG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR4DB83JQ 685 0 0
CAACTTAGACGCGAGTGAAGCCACTCCGAGTTATAAAGGGTCAACTTCCACTGCGCAGAA
GCTCTTCTCATGCAACTACTGTCAAAGAACATTCTACAGCTCACAGGCCCTTGGTGGTCA
CCAAAACGCTCACAAAAGAGAGAGGACTTTGGCTAAGCGAGGGAAACAGATGGAAGCTTT
CGGCCATCCATATGGTTTTGCTCATGTCCCGTTCCACGGCCAGTATAGCAACAGATCATT
GGGTATTCAGGCCCACTCAATGAGTCACAAGCTAAGTTCATACAACGCCTTTGGTGCTGG
TGAGTATGGTCAGTTCAACTGGTCAAGGATACCGTTAGCTCAGCAACCAGCCATAGGTAG
ACTATCTTCAACAGAGAGTCGTCATCAGATGATGTTTCCACCACCGTTGACTTCAACAAG
TGAAAACTTCGGTAGGTTCGATGCAGGAACGATACCAGTAGATTCTGCAGAAGATCAGCA
GAAGAACCTTGACTTGTCCCTCAAACTCTGAGATTCTTGTCTCTTCAATTGTTTTTGTTT
GTGCTGGTTTTTTGTTGTCATTGATATGTTCACCAGTATTATCCAAGGGTGTTAGTAAGT
ATTCTTGTGAATAATATTTTGTCTAGCATAGATTTATGTTGTACATGTTTCCATATTTTG
TACAAATTTTCAGCTAGACATCAAT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL8711Contig1 820 2 2 U
GGGAGATCGATCAAACAAAAGAAGAAATCGATCGGCGGGAGAAGCTAAGCTAAAAGCAAT
GTCGAGGCTATGGGCGAGAGTTGCCGGATTGTTCAGAAGCAAAAGTTTCATCGGAGCAGA
CAAGACTGGTAACAAGTACTTCTCCAGGATGGAGGAGATCGACGGTCTGGTGAAAGAGAA
GCGATGGGTTGTCTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCTGTTGAATGGATATG
TTGGCTGAATGGGCAGCGAAAAAGAGCTCCTACTCCAGAGGAAATGGCTGAACTTGAAGC
AAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCTCGTCTCAAGAAAGAAGAGGAGGAGAGGAA
AGCCAGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTTGAGGGTCCAGATTT
GACAAACTTTGTTCGCCATTTCCCACCGAATTCTAAATGTGATAAAACAAAGGAGGCTAG
TGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCCAGATAGTTACTGCAGAACC
ACCCGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTTAGGCCCGGGACCTG
GCAGCCACCATCCTAAACTCATCTCAATATCTCATGTTCACGCTCGCAGATAACAACCAA
CAAAGTTGTTTTGTCCAATCTTCTGTTTGTTGTAATCTATTGGTTTGAATCTTACATACT
ATTCAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCTAATATGTGCGGCCTTTCACACGTTGTTATTGAGG
ACTTAGAAGAGTCAAAAATGAAAAGCCATCTCACCTTATG


BQ
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AF RR4H296TF U 1
AF RR4H296JQ C 171
BS 1 566 RR4H296TF
BS 567 820 RR4H296JQ

RD RR4H296TF 566 0 0
GGGAGATCGATCAAACAAAAGAAGAAATCGATCGGCGGGAGAAGCTAAGCTAAAAGCAAT
GTCGAGGCTATGGGCGAGAGTTGCCGGATTGTTCAGAAGCAAAAGTTTCATCGGAGCAGA
CAAGACTGGTAACAAGTACTTCTCCAGGATGGAGGAGATCGACGGTCTGGTGAAAGAGAA
GCGATGGGTTGTCTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCTGTTGAATGGATATG
TTGGCTGAATGGGCAGCGAAAAAGAGCTCCTACTCCAGAGGAAATGGCTGAACTTGAAGC
AAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCTCGTCTCAAGAAAGAAGAGGAGGAGAGGAA
AGCCAGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTTGAGGGTCCAGATTT
GACAAACTTTGTTCGCCATTTCCCACCGAATTCTAAATGTGATAAAACAAAGGAGGCTAG
TGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCCAGATAGTTACTGCAGAACC
ACCCGAACCAAAGACAACAGAGCCAT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4H296JQ 650 0 0
TGAAAGAGAAGCGATGGGTTGTCTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCTGTTG
AATGGATATGTTGGCTGAATGGGCAGCGAAAAAGAGCTCCTACTCCAGAGGAAATGGCTG
AACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCTCGTCTCAAGAAAGAAGAGG
AGGAGAGGAAAGCCAGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTTGAGG
GTCCAGATTTGACAAACTTTGTTCGCCATTTCCCACCGAATTCTAAATGTGATAAAACAA
AGGAGGCTAGTGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCCAGATAGTTA
CTGCAGAACCACCCGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTTAGGC
CCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAACTCATCTCAATATCTCATGTTCACGCTCGCAGA
TAACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAATCTTCTGTTTGTTGTAATCTATTGGTTTGAAT
CTTACATACTATTCAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCTAATATGTGCGGCCTTTCACACGTT
GTTATTGAGGACTTAGAAGAGTCAAAAATGAAAAGCCATCTCACCTTATG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL8712Contig1 836 2 2 U
GAGCCTAATAACCTGGCTACTATATCAGACATGGACAAGCCTCTTATGAACGACATTGCT
TTGACTGTGGTGGAAGAATTGCTTAGGCTTTTTAACACAAACGAACCTCTCTGTACTAGA
GCTGATGGTGGCGGCGGCAGAGACGTACTCAGTTTGATGCTCAGGTTTATATTTTTGCAT
AGTTTGACTATGAAACCGGTGCTGGTCAATGCTTCCTCAGTAAGTGTATTTAGACAACAG
AGGGATGGGCGAAGTGTATTTAGATGATATGGGTGATATAGCAGACGACCAATCTCCTTT
ACTGATGTGTCAATGAGAATGGTAGTTCAAAGAGTAAGCAATATTGGTGGGGATATTTGT
CTTAAACACTCATCATGGGAGATGCTTAGATGCTTTGGGATGATGGTATACTTGAAGTTG
TCTTTAGACCAGAAGTGTTGAGTTTTGTTCATTGCTCAAAGGGAAGAGAGAACTACTTCG
GAAATGTTTTTGGAAGCTTGACTTGATTTGATTGCTTGAACAAATTAGAGATCAAGCAAC
CTTACACATAACGTCTGAAGGATCGCAAGTTCAATTATGGTGGGAAAGATCTATTCTCCT
AACTAAGTAGAGTTAATTTAACATGGTTTGTGCTTCGTTATAAGGAATGTACGGGGCTTC
GGCCTAGAATTTCCCATTCTTAAAAAGAAAGATACATATCGTCATGATGTTGTTGTTTTA
TGCTTCGGCTCTATTGATATATTGGTGTGAGCTTCACCATCTATTACGATCATGAAAAGC
AGCAAAATTGTGTCTTTAGATTCTCAATGGTGCATGTATAATAATAGTATTTAACC


BQ
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AF RR4DN12TF U 1
AF RR4DN12JQ C 172
BS 1 567 RR4DN12TF
BS 568 836 RR4DN12JQ

RD RR4DN12TF 567 0 0
GAGCCTAATAACCTGGCTACTATATCAGACATGGACAAGCCTCTTATGAACGACATTGCT
TTGACTGTGGTGGAAGAATTGCTTAGGCTTTTTAACACAAACGAACCTCTCTGTACTAGA
GCTGATGGTGGCGGCGGCAGAGACGTACTCAGTTTGATGCTCAGGTTTATATTTTTGCAT
AGTTTGACTATGAAACCGGTGCTGGTCAATGCTTCCTCAGTAAGTGTATTTAGACAACAG
AGGGATGGGCGAAGTGTATTTAGATGATATGGGTGATATAGCAGACGACCAATCTCCTTT
ACTGATGTGTCAATGAGAATGGTAGTTCAAAGAGTAAGCAATATTGGTGGGGATATTTGT
CTTAAACACTCATCATGGGAGATGCTTAGATGCTTTGGGATGATGGTATACTTGAAGTTG
TCTTTAGACCAGAAGTGTTGAGTTTTGTTCATTGCTCAAAGGGAAGAGAGAACTACTTCG
GAAATGTTTTTGGAAGCTTGACTTGATTTGATTGCTTGAACAAATTAGAGATCAAGCAAC
CTTACACATAACGTCTGAAGGATCGCA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4DN12JQ 665 0 0
TTTTTGCATAGTTTGACTATGAAACCGGTGCTGGTCAATGCTTCCTCAGTAAGTGTATTT
AGACAACAGAGGGATGGGCGAAGTGTATTTAGATGATATGGGTGATATAGCAGACGACCA
ATCTCCTTTACTGATGTGTCAATGAGAATGGTAGTTCAAAGAGTAAGCAATATTGGTGGG
GATATTTGTCTTAAACACTCATCATGGGAGATGCTTAGATGCTTTGGGATGATGGTATAC
TTGAAGTTGTCTTTAGACCAGAAGTGTTGAGTTTTGTTCATTGCTCAAAGGGAAGAGAGA
ACTACTTCGGAAATGTTTTTGGAAGCTTGACTTGATTTGATTGCTTGAACAAATTAGAGA
TCAAGCAACCTTACACATAACGTCTGAAGGATCGCAAGTTCAATTATGGTGGGAAAGATC
TATTCTCCTAACTAAGTAGAGTTAATTTAACATGGTTTGTGCTTCGTTATAAGGAATGTA
CGGGGCTTCGGCCTAGAATTTCCCATTCTTAAAAAGAAAGATACATATCGTCATGATGTT
GTTGTTTTATGCTTCGGCTCTATTGATATATTGGTGTGAGCTTCACCATCTATTACGATC
ATGAAAAGCAGCAAAATTGTGTCTTTAGATTCTCAATGGTGCATGTATAATAATAGTATT
TAACC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL8713Contig1 1076 2 4 U
GGGCCATGACAAGACGGTCCACCGAGAAGCTCTTCAAGATTCTTGACATCTATGAGACTC
TTAGAGACGGTTTCCCAGCTATTGAGGAGCTCTTCCCTGAGGAGCTCCGCGGCGAGCTGA
GAAGCGAGGTGACCACCGCTCGCTCCCGTTTAGGATAGAGTGCTATCAACATATTCTTTG
ATCTTGAGCACTCAATCAAATCAGATTCTAGCAAGACCCCTGTGCCGGGAGGCGCGGTGC
ATCCCCTGACTAGGTACACAATGAACTACCTCAAGTACTCGTGCGAGTACAAAGACACGT
TGGAGAAAGTGTTCAAGTCTCACTCGAAGATGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTCTAACACCG
AGAGAGCCTTCGCGAACCAGCTGATGAGGATCATGGACTCACTAGACGGGAACATGGAGG
CGAAGTCGAAGCTCTACAAAGACGTACCGCTGAGCTGTATCTTCATGATGAACAACGGGA
GATACATAGTGCAGAAGATCAAAGGATCTGCGGAGATACACGAGGTGATGGGAGACACGT
GGTGCAGGAAGAGGTCGTCGGAGCTGAGGACTTATCACAAGAACTACCAGAGAGAGACGT
GGGGGAAGCTGCTTGGGTTCTTAGGGCACGAGGGGCTCATGCATAACAACAAGATAGTGA
AGCCTAATCTCAAAGAGAGGTTCAAGAGCTTCAACGCGACGTTCGACGAGATACACAAGA
CGCAGACCACGTGGGTGGTTAATGATGAGCAGCTTCAGAGCGAGCTCAGAGTGTCTATAA
CCGCGGTGATGATACCTGCTTACAGAGCTTTCATGGCTAGGTCTGGACAGTACTTGGATC
CTGGTCGTCAGACAGAGAAGTATGTCAAGTACCAGCCTGAGGACATCGAGGATCTCATCG
ACCAGCTCTTTGAAGGCAACACTTCCTCCTCTTCAACAGCCACCGCCAAGCGAAGAACGT
AGCTACTTCTCTCTCTTTCTTTCTTGTTTTGCAAGCAACGCTTTCTTCTTATGAATAAAA
AAATCGATGTAATTCTTTTGTTGATAGCATGATGGTTAAGTTATTATGTGAACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FD89TF U 1
AF RR4FD89JQ C 386
BS 1 772 RR4FD89TF
BS 773 773 RR4FD89JQ
BS 774 780 RR4FD89TF
BS 781 1076 RR4FD89JQ

RD RR4FD89TF 780 0 0
GGGCCATGACAAGACGGTCCACCGAGAAGCTCTTCAAGATTCTTGACATCTATGAGACTC
TTAGAGACGGTTTCCCAGCTATTGAGGAGCTCTTCCCTGAGGAGCTCCGCGGCGAGCTGA
GAAGCGAGGTGACCACCGCTCGCTCCCGTTTAGGATAGAGTGCTATCAACATATTCTTTG
ATCTTGAGCACTCAATCAAATCAGATTCTAGCAAGACCCCTGTGCCGGGAGGCGCGGTGC
ATCCCCTGACTAGGTACACAATGAACTACCTCAAGTACTCGTGCGAGTACAAAGACACGT
TGGAGAAAGTGTTCAAGTCTCACTCGAAGATGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTCTAACACCG
AGAGAGCCTTCGCGAACCAGCTGATGAGGATCATGGACTCACTAGACGGGAACATGGAGG
CGAAGTCGAAGCTCTACAAAGACGTACCGCTGAGCTGTATCTTCATGATGAACAACGGGA
GATACATAGTGCAGAAGATCAAAGGATCTGCGGAGATACACGAGGTGATGGGAGACACGT
GGTGCAGGAAGAGGTCGTCGGAGCTGAGGACTTATCACAAGAACTACCAGAGAGAGACGT
GGGGGAAGCTGCTTGGGTTCTTAGGGCACGAGGGGCTCATGCATAACAACAAGATAGTGA
AGCCTAATCTCAAAGAGAGGTTCAAGAGCTTCAACGCGACGTTCGACGAGATACACAAGA
CGCAGACCACGTGGGTGGTTAATGATGAGCAGCTTCAGAGCGAGCTCAGAGTTTCTATAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4FD89JQ 691 0 0
GAGGATCATGGACTCACTAGACGGGAACATGGAGGCGAAGTCGAAGCTCTACAAAGACGT
ACCGCTGAGCTGTATCTTCATGATGAACAACGGGAGATACATAGTGCAGAAGATCAAAGG
ATCTGCGGAGATACACGAGGTGATGGGAGACACGTGGTGCAGGAAGAGGTCGTCGGAGCT
GAGGACTTATCACAAGAACTACCAGAGAGAGACGTGGGGGAAGCTGCTTGGGTTCTTAGG
GCACGAGGGGCTCATGCATAACAACAAGATAGTGAAGCCTAATCTCAAAGAGAGGTTCAA
GAGCTTCAACGCGACGTTCGACGAGATACACAAGACGCAGACCACGTGGGTGGTTAATGA
TGAGCAGCTTCAGAGCGAGCTCAGAGTGTCTATAACCGCGGTGATGATACCTGCTTACAG
AGCTTTCATGGCTAGGTCTGGACAGTACTTGGATCCTGGTCGTCAGACAGAGAAGTATGT
CAAGTACCAGCCTGAGGACATCGAGGATCTCATCGACCAGCTCTTTGAAGGCAACACTTC
CTCCTCTTCAACAGCCACCGCCAAGCGAAGAACGTAGCTACTTCTCTCTCTTTCTTTCTT
GTTTTGCAAGCAACGCTTTCTTCTTATGAATAAAAAAATCGATGTAATTCTTTTGTTGAT
AGCATGATGGTTAAGTTATTATGTGAACTCG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8714Contig1 857 2 2 U
GGATCTCTCTCTCTCTTTGAACATTCAAACAACAAATATAGAAAAGAAGTAAACCAGCAG
CAGGAAGACGAGAGGAACAAAACTGAAACGTGCCTCCATTTCCAAAACCCCAAATCCTTT
TAGTACAATGCCCTCTTAAATGCTAAAGGTTTGAAGTTATTAAGTAACAATAAGAGAACA
GTTATTTTTGTTCCTTGTTATGGTGGGGGCGATGGCAAACAATGGAAGAATCCGGTCAGC
TTTCCCGGTGCCAAATGGTTCAAAAGATCTGACATCGAACAGTGCTCCGGCAAGCACGGC
GGGATCTGAATATGGTCCGGTTGAGTTCAGTAGAGAAGACGTTGAAGCTCTTCTTAATGA
GAGAATCAAGTACAAAAGCAAGTTCAACTACAAGGAGAGATGTGAGAATATGATGGATTA
TATAAAAAGACACTAATGTTTGTGAACATTGCACCGGAATCTTCATCGACCGGTGAGTCT
CTCTGCTCGCTTAGATTTGCAGCGAGAGTAAATGCTTGTGAGATTGGAACTCCGCGAAGG
CAGACTAACATCAAACAGTTGGATCGTTTGAGCCTTGGATGAGAGACAAAGATGAAACTT
GAAGTTTGAAACCGAAGCTGAAGCATCATTTTCTAAGTTAATTATATGAGTGTTTGTACT
TAAAATATGGTCACAGTACTTGATGAATGATGGGATGAATTCTAACGGGAAACACACAAA
GACCTTTTTGTTATAATGTGTATAGATTGGTTTAGAATTTTACTATATCTGTTATCTGTT
GTATTGTAACTTTTCTTTATGCTTCTGGATCAATAGGATTTTACTTGTTTTTGGATTCGT
TCTAATTATTTTTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ26TF U 1
AF RR4AJ26JQ C 83
BS 1 812 RR4AJ26TF
BS 813 857 RR4AJ26JQ

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GAGAATCAAGTACAAAAGCAAGTTCAACTACAAGGAGAGATGTGAGAATATGATGGATTA
TATAAAAAGACACTAATGTTTGTGAACATTGCACCGGAATCTTCATCGACCGGTGAGTCT
CTCTGCTCGCTTAGATTTGCAGCGAGAGTAAATGCTTGTGAGATTGGAACTCCGCGAAGG
CAGACTAACATCAAACAGTTGGATCGTTTGAGCCTTGGATGAGAGACAAAGATGAAACTT
GAAGTTTGAAACCGAAGCTGAAGCATCATTTTCTAAGTTAATTATATGAGTGTTTGTACT
TAAAATATGGTCACAGTACTTGATGAATGATGGGATGAATTCTAACGGGAAACACACAAA
GACCTTTTTGTTATAATGTGTATAGATTGGTTTAGAATTTTACTATATCTGTTATCTGTT
GTATTGTAACTTTTCTTTATGCTTCTGGATCA

QA 1 812 1 812
DS 

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CGAGAGTAAATGCTTGTGAGATTGGAACTCCGCGAAGGCAGACTAACATCAAACAGTTGG
ATCGTTTGAGCCTTGGATGAGAGACAAAGATGAAACTTGAAGTTTGAAACCGAAGCTGAA
GCATCATTTTTTAAGTTAATTATATGAGTGTTTGTACTTAAAATATGGTCACAGTACTTG
ATGAATGATGGGATGAATTCTAACGGGAAACACACAAAGACCTTTTTGTTATAATGTGTA
TAGATTGGTTTAGAATTTTACTATATCTGTTATCTGTTGTATTGTAACTTTTCTTTATGC
TTCTGGATCAATAGGATTTTACTTGTTTTTGGATTCGTTCTAATTATTTTTTGGG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DJ10JQ C 1
AF RR4DJ10TF U 1
BS 1 396 RR4DJ10TF

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DS 

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CGGGGTCTGAAGACGGGACCATCAGGATCTGGCAGACGACACCAAACCATAGTGTGGATG
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TATGTTTCGTGTGTGTTTGTGTTTCCTGACTGAATATACAGAGAAAAAGAAAAACACAAG
GACCGGACCTTTCCTTATCTTTTAGTTTTTCTTAGATCTTTTCGTTATTATATAAAACCT
TTGGACCTGTTGTGCAATTTATGAAATAATTTGACC

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 2

CO CL8716Contig1 673 2 3 U
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GAGCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAAAGACTTTTCAGTGGGATCTAAGATGGTTG
ACAAGATTAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4CA06TF U 1
AF RR4CQ20TF U 60
BS 1 565 RR4CA06TF
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BS 567 673 RR4CA06TF

RD RR4CA06TF 673 0 0
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AAATGTCAAACATCACATCGTCCGACTTCTTCTTCGCCGGAATCTCAAGCCCCGCCGTCA
TAAACTCCACGATGGGCTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCA
ATACTCTCTCAGTTTCCCTAGCACGTATAGACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTC
ACACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGT
TTATCACGACGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTGTGT
TCCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGT
GTGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGG*AACGGTGTCTGTTGCGGCGACGCTTTTTGCGACG
GAGCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAAAGACTTTTCAGTGGGATCTAAGATGGTTG
ACAAGATTAAAGA

QA 1 673 1 673
DS 

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CTCTCTCAGTTTCCCTAGCACGTATAGACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCACA
CTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTTTA
TCATTACGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTGTGTTCC
CAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGTGTG
CGTTTAATAGTCAGTTACCGGGGAACGGTGTCTGTTGCGGCGACGCTTTTTGCGACGGAG
CCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAA*GACTTTTCAGTGGGATCTAAGATGGTTGACA
GATTAAAG

QA 5 604 5 604
DS 



AS 1 2

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AAGATCATGCCACTGATGTCCATCACCTTCTTCATACTCTTGTTATCATTTCTGGCTCCG
ATCAAAGCTCAAGGTATCGTTGGCTGCGACACTCAACTTGATAAATGCATAACCGCGATG
AATAAAAATGAATGGGGTCTCGTGCAAAAAGACTGTTGTCCCAGATTGAGGAAGACAGGC
CCTCAACCATGTATGTGTTTGATGTTTAAGTACCCTACGCTTAAAACCCCTGCTATGAGA
CTTATCAAATATTGTCAAGCTCCGACTCCCAAGTGCTAAAAGATTAATATACAATAAATT
AACAAGAATGTTTCGACCGAACTCGTGGACTAGCTGTCTTGTACTGGTGTCGTTTCCATG
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BQ
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CTTATCAAATATTGTCAAGCTCCGACTCCCAAGTGCTAAAAGATTAATATACAATAAATT
AACAAGAATGTTTCGACCGAACTCGTGGACTAGCTGTCTTGTACTGGTGTCGTTTCCATG
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QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

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TTCTTATGTGGTGCCTGTGTACATTGCTGAGATATCTCCAAAAAATCTACGAGGTGCACT
CACAACACTGAACCAACTCATGATTGTGATAGGCTCATCTGTTTCTTTCTTGATCGGATC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F526TF U 1
AF RR4F526JQ C 139
BS 1 628 RR4F526TF
BS 629 914 RR4F526JQ

RD RR4F526TF 628 0 0
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TAGGTATCTTGTTTTTCAGCTTGTAAGGGATTTGAAATGTTTGCAACAAGAACATACTGA
GGTGAAGTCTACTCCTGAGTAAAATTCGTTTAGTTGTGGGTATTAAAGGAGACAAGGCTT
TATAGGTGGATAGGAGATAAGAGGGGAATTGCTGAAGAGAAGCTTTTTAAGTGATTAGTA
GAAAGAGTTCTGATTGGAAAGGAAACTTAAGGAGGTGGAGACTCACGAAATGGTGCTCCT
CAAAGGGAGCTGCATATGGAAGATAAGGAAGCGACAACAACAACAGGAACAGGCTAGGCT
TCTAGAAGAAATACAGAAAAAAAAACACAAAGGTGGTGATATCGATGAAGACAGCATCAC
AAACTGGTGGACGTTGGAAGAAGAGACAGACAAGCTCTTTCAGTCTCTCCGGCACCTGAG
CAAAGCAGATAATTATCTCAGGGAAAGTGGAAATGCTGTAAGATTCATTAGTAGAGGCAG
TAACACATGAAGATATTTTAAGTTTGAAGCAGAGACTGAGTTCAAGGATTACACGTAGTG
GAAAGAGGTCAGTGAAATAAAAGAGCAT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR4F526JQ 776 0 0
GTAAAATTCGTTTAGTTGTGGGTATTAAAGGAGACAAGGCTTTATAGGTGGATAGGAGAT
AAGAGGGGAATTGCTGAAGAGAAGCTTTTTAAGTGATTAGTAGAAAGAGTTCTGATTGGA
AAGGAAACTTAAGGAGGTGGAGACTCACGAAATGGTGCTCCTCAAAGGGAGCTGCATATG
GAAGATAAGGAAGCGACAACAACAACAGGAACAGGCTAGGCTTCTAGAAGAAATACAGAA
AAAAAAACACAAAGGTGGTGATATCGATGAAGACAGCATCACAAACTGGTGGACGTTGGA
AGAAGAGACAGACAAGCTCTTTCAGTCTCTCCGGCACCTGAGCAAAGCAGATAATTATCT
CAGGGAAAGTGGAAATGCTGTAAGATTCATTAGTAGAGGCAGTAACACATGAAGATATTT
TAAGTTTGAAGCAGAGACTGAGTTCAAGGATTACACGTAGTGGAAAGAGGTCAGTGAAAT
AAAAGAGCATATTCAGTTAAAATAAAAAAGAAATAAAAGAGCATAGTGGTGAAGAGGATG
ATTGGAACTTTCACTCTTTCAGTATGATTAAAAAAAGCTTTGGGTCTTTTTCACAGCCTA
ATCATTTTCTCCCTCTCTTTTTCTGAAAGACAAAACTATCTCATAAGTAGAAGCTTCCTG
AGAAAAAAAACATCTTGTTATTTGTTGTTTATTTACTTTCTTTTCCAAGCAACTGAAACA
AAAGCAAGTGTAATCTTGGAAGCTAAGGGCTTTGTAGGAAATGCAATGTTTGATTC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL8720Contig1 816 2 10 U
TTTTTTTTTATAAAAGCTATCGTTCATCGGAAGAGACAAGGGCTCGCTCGCTCGCTCGCT
AGCCTTTTTACTATTCCGTAAAATCAAAATTCCGTTTTGCCATAGCGATTCTCTCTGGTC
ACTGTTTTAGGTTTTCAGAAAATCGATATTCTTCTTCTTCTGGCGTTTTCTTTTCAATCC
GGAGAAAGCGCCGGAGGTTTTGGGATAAACTTTTCCAAATGACACAACGGGTCTACCAAG
CCTGGAAAGGAAGCAATAAGTTCATCTTTGGTGGGAGATTGATATTTGGTCCAGATGCTA
GATCAGTGCCTCTTACCGTGCTACTTATCCTAGTTCCAGTTGTTTTATTCTGTGTATTTG
TAGCTAGGCATCTTCTCCATGAGTTCTCTCCCTACAATGCTGGATATGCTATCTTGGTCG
TCCCCATTCTCTTCACTATCTATGTATTGATCCTCCTATCTTTCACATCTGCAAGAGATC
CTGGTATTGTTCCAAGAAACTCGCATCCACCAGAGGAAGATCTACGCTACGAGACAACAG
TATCAGCAGATGGAAGACAAACACCTAGTGTTCAAATTCCCAGGACGAAAGAAGTCATGG
TTAATGGCATCACCGTCAGAGTGAAATACTGCGATACATGCATGCTTTACAGGCCTCCTC
GTTGCTCTCATTGTTCCATTTGCAACAACTGTATCGAGCGCTTTGATCATCATTGCCCCT
GGGTGGGCCAATGCATTGGACTGAGAAACTATAGTACTTCTTTATGTTTGTTTCTTCTGC
ACTCTTCTCTGCATCTATGTATCGCCATCTCGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EX94TF U 1
AF RR4EN40TF U 65
BS 1 147 RR4EX94TF
BS 148 148 RR4EN40TF
BS 149 538 RR4EX94TF
BS 539 539 RR4EN40TF
BS 540 574 RR4EX94TF
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BS 650 816 RR4EN40TF

RD RR4EX94TF 649 0 0
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AGCCTTTTTACTATTCCGTAAAATCAAAATTCCGTTTTGCCATAGCGATTCTCTCTGGTC
ACTGTTTTAGGTTTTCAGAAAATCGATTTTCTTCTTCTTCTGGCGTTTTCTTTTCAATCC
GGAGAAAGCGCCGGAGGTTTTGGGATAAACTTTTCCAAATGACACAACGGGTCTACCAAG
CCTGGAAAGGAAGCAATAAGTTCATCTTTGGTGGGAGATTGATATTTGGTCCAGATGCTA
GATCAGTGCCTCTTACCGTGCTACTTATCCTAGTTCCAGTTGTTTTATTCTGTGTATTTG
TAGCTAGGCATCTTCTCCATGAGTTCTCTCCCTACAATGCTGGATATGCTATCTTGGTCG
TCCCCATTCTCTTCACTATCTATGTATTGATCCTCCTATCTTTCACATCTGCAAGAGATC
CTGGTATTGTTCCAAGAAACTCGCATCCACCAGAGGAAGATCTACGCTACGAGACAACGG
TATCAGCAGATGGAAGACAAACACCTAGTGTTCAGATTCCCAGGACGAAAGAAGTCATGG
TTAATGGCATCACCGTTAGAGTGAAATACTGCGATACATGCATGCTTTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4EN40TF 752 0 0
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TTTTAGGTTTTCAGAAAATCGATATTCTTCTTCTTCTGGCGTTTTCTTTTCAATCCGGAG
AAAGCGCCGGAGGTTTTGGGCTAAACTTTTCCAAATGACACAACGGGTCTACCAAGCCTG
GAAAGGAAGCAATAAGTTCATCTTTGGTGGGAGGTTGATATTTGGTCCAGATGCTAGATC
AGTGCCTTTTACCGTGCTACTTATCCTAGTTCCAGTTGTTTTATTCTGTGTATTTGTAGC
TAGTCATCTTCTCCATGAGTTCTCTCCCTACAATGCTGGATATGCTATCTTGGTCGTGCC
CATTCTCTTCACTATCTATGTATTGATCCTCTTATCTTTCACATCTGCAAGAGATCCTGG
TATTGTTCCAAGAAACTCGCATCCACCAGAGGAAGATCTACGCTACGAGACAACAGTATC
AGCAGATGGAAGACAAACACCTAGTGTTCAAATTCCTAGGACGAAAGAAGTCATGGTTAA
TGGCATCACCGTCAGAGTGAAATACTGCGATACTTGCATGCTTTACAGGCCTCCTCGTTG
CTCTCATTGTTCCATTTGCAACAACTGTATCGAGCGCTTTGATCATCATTGCCCCTGGGT
GGGCCAATGCATTGGACTGAGAAACTATAGTACTTCTTTATGTTTGTTTCTTCTGCACTC
TTCTCTGCATCTATGTATCGCCATCTCGGCTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL8721Contig1 797 2 4 U
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CATATTATGATAGCTCAAGTCTTAACAACATGCAACAACAAGACTACTTCCACTTAAACC
ACTATTACAACAACCTAAACTCTCCAACCAATACCAATAATCTTATCCCATACCCTCAAA
TTCAAGAACTCAATCTACAATCTCCAGCAAGCAACAACTCTACCACGTCAGATGAAGCAA
CTGAAGACATATTCGTGATCAACGACAGAAAGCAAAGACGTATGGTATCTAACAGAGAAT
CAGCAAGAAGGTCAAGAATGAGAAAGCAAAGACACCTAGATGAGCTTCTCTCGCAGGTTG
CTTGGCTTCGAAGCGAGAACCAACAGCTTTTGGATAAGCTTAACCAAGCTTCGGATAGCA
ATAATCTTGTTATTCAAGAGAACTTGAGTCTTAAAGAGGAAAACTTGGAACTTCGTCAAG
TTATCACATCTATGAAGAAGCTTGGAGGAAGCACAAGCATCCATGGAAGATACTGCTCTT
CTTCAGTGGATCATGAGTTGGATCAGGACTTCTCTTGTATTACTGATGATCCAAGGACTT
ATCATCCATCTTGAGTTGTTCGTTCTGATCAACTCTAAGTTTCTACCTCTAATCTATCTT
ATTTTCTCTTTGTATCCACAAAACTCTGGCTCATATATATCTTTATGAGCCGAGAACAAA
GTGGATTTTTATGTAATTTTTTCTGTGGGCTAGACTTAGGTCTTGCACCGTTGAAACGTT
ACTTTTATAACGGTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F870TF U 1
AF RR4F870JQ C 203
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BS 677 677 RR4F870JQ
BS 678 734 RR4F870TF
BS 735 797 RR4F870JQ

RD RR4F870TF 734 0 0
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ACTATTACAACAACCTAAACTCTCCAACCAATACCAATAATCTTATCCCATACCCTCAAA
TTCAAGAACTCAATCTACAATCTCCAGCAAGCAACAACTCTACCACGTCAGATGAAGCAA
CTGAAGACATATTCGTGATCAACGACAGAAAGCAAAGACGTATGGTATCTAACAGAGAAT
CAGCAAGAAGGTCAAGAATGAGAAAGCAAAGACACCTAGATGAGCTTCTCTCGCAGGTTG
CTTGGCTTCGAAGCGAGAACCAACAGCTTTTGGATAAGCTTAACCAAGCTTCGGATAGCA
ATAATCTTGTTATTCAAGAGAACTTGAGTCTTAAAGAGGAAAACTTGGAACTTCGTCAAG
TTATCACATCTATGAAGAAGCTTGGAGGAAGCACAAGCATCCATGGAAGATACTGCTCTT
CTTCAGTGGATCATGAGTTGGATCAGGACTTCTCTTGTATTACTGATGATCCAAGGACTT
ATCATCCATCTTGAGTTGTTCGTTCTGATCAACTCTAAGTTTCTACCTCTAATCTATCTT
ATTTTCTCTTTGTATC*ACAAAACTCTGGCTCATATATATCTTTATGAGCCGAGAACAAA
GTGGATTTTTATGT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4F870JQ 595 0 0
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CGACAGAAAGCAAAGACGTATGGTATCTAACAGAGAATCAGCAAGAAGGTCAAGAATGAG
AAAGCAAAGACACCTAGATGAGCTTCTCTCGCAGGTTGCTTGGCTTCGAAGCGAGAACCA
ACAGCTTTTGGATAAGCTTAACCAAGCTTCGGATAGCAATAATCTTGTTATTCAAGAGAA
CTTGAGTCTTAAAGAGGAAAACTTGGAACTTCGTCAAGTTATCACATCTATGAAGAAGCT
TGGAGGAAGCACAAGCATCCATGGAAGATACTGCTCTTCTTCAGTGGATCATGAGTTGGA
TCAGGACTTCTCTTGTATTACTGATGATCCAAGGACTTATCATCCATCTTGAGTTGTTCG
TTCTGATCAACTCTAAGTTTCTACCTCTAATCTATCTTATTTTCTCTTTGTATCCACAAA
ACTCTGGCTCATATATATCTTTATGAGCCGAGAACAAAGTGGATTTTTATGTAATTTTTT
CTGTGGGCTAGACTTAGGTCTTGCACCGTTGAAACGTTACTTTTATAACGGTTTA

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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CTGGTGATGTGGTATAATCTTCAATATTATAACAATGGCTTTATCTTTTCTTTCTACTGC
TGTTGTTTCTAGCCTCTTTGGGTCTGTCTTGTGCTTTAAGCTTTGATAGTTCGACAATGG
CCTCATCTTGTCTTCCCTCCAACCTCTTTAGCTCACATTCCCATTCCTTTTGAGTTTTGT
CACGTAGAAAAGAGCCAAGTAATTTAAGGCCCAAAGGAAGACAGCCGGTTAGTTCGACTG
CAAGGACCGAGAGCTGCTCGAAATTTGCTGGAGGATACTGCTTCTGGAACGCGCATTCAC
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CACAATCTAAGAGCAAACTCTTGTCTTGTGTGGTTATTACTATAACTCTACTTCCTGGAC
CAAGGCATTTCGCATCTTTCATGATCTCTCCTAACTGTTCGATATTCTCAACGTTGTCGA
CTATGACCAGAACTCTTTGGTCCCCAAACCTTGCCCTTTTAGCCTCAGATGAACCCAACT
CAGAACTAGTCTGTGATGCTTTTCGTTTCTTACCTCTTGGAGAGAGAATCTCTTTCCGTG
AGCCTGATGAGGAAGCACGGCCGACATGTCCTTGATCGTGAAAGTTCATGGAAGTGGCAA
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BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4B343JQ U 1
AF RR4AU09JQ U 2
BS 1 801 RR4B343JQ
BS 802 804 RR4AU09JQ

RD RR4B343JQ 801 0 0
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CCTCATCTTGTCTTCCCTCCAACCTCTTTAGCTCACATTCCCATTCCTTTTGAGTTTTGT
CACGTAGAAAAGAGCCAAGTAATTTAAGGCCCAAAGGAAGACAGCCGGTTAGTTCGACTG
CAAGGACCGAGAGCTGCTCGAAATTTGCTGGAGGATACTGCTTCTGGAACGCGCATTCAC
TGAAGAGCTCAAGAGCCTCGTCGTATTTCAGACAGTCCATTTCGTAGACATGTTCAACTC
CACAATCTAAGAGCAAACTCTTGTCTTGTGTGGTTATTACTATAACTCTACTTCCTGGAC
CAAGGCATTTCGCATCTTTCATGATCTCTCCTAACTGTTCGATATTCTCAACGTTGTCGA
CTATGACCAGAACTCTTTGGTCCCCAAACCTTGCCCTTTTAGCCTCAGATGAACCCAACT
CAGAACTAGTCTGTGATGCTTTTCGTTTCTTACCTCTTGGAGAGAGAATCTCTTTCCGTG
AGCCTGATGAGGAAGCACGGCCGACATGTCCTTGATCGTGAAAGTTCATGGAAGTGGCAA
GCAAACAATGGTTTTGAAATGCTGGGGTTAATTGCTGGCAAAGACTGCTCCCAATGCTTA
TTTTGCCAATACTTTGAGTGC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR4AU09JQ 803 0 0
GTTTTACAAGATATCATACAAACAATATAATAGAAGTGGGTTTACAAAGGAAACTAGTCC
TGGTGATGTGGTATAATCTTCAATATTATAACAATGGCTTTATCTTTTCTTTCTACTGCT
GTTGTTTCTAGCCTCTTTGGGTCTGTCTTGTGCTTTAAGCTTTGATAGTTCGACAATGGC
CTCATCTTGTCTTCCCTCCAACCTCTTTAGCTCACATTCCCATTCCTTTTGAGTTTTGTC
ACGTAGAAAAGAGCCAAGTAATTTAAGGCCCAAAGGAAGACAGCCGGTTAGTTCGACTGC
AAGGACCGAGAGCTGCTCGAAATTTGCTGGAGGATACTGCTTCTGGAACGCGCATTCACT
GAAGAGCTCAAGAGCCTCGTCGTATTTCAGACAGTCCATTTCGTAGACATGTTCAACTCC
ACAATCTAAGAGCAAACTCTTGTCTTGTGTGGTTATTACTATAACTCTACTTCCTGGACC
AAGGCATTTCGCATCTTTCATGATCTCTCCTAACTGTTCGATATTCTCAACGTTGTCGAC
TATGACCAGAACTCTTTGGTCCCCAAACCTTGCCCTTTTAGCCTCAGATGAACCCAACTC
AGAACTAGTCTGTGATGCTTTTCGTTTCTTACCTCTTGGAGAGAGAATCTCTTTCCGTGA
GCCTGATGAGGAAGCACGGCCGACATGTCCTTGATCGTGAAAGTTCATGGAAGTGGCAAG
CAAACAATGGTTTTGAAATGCTGGGGTTAATTGCTGGCAAAGACTGCTCCCAATGCTTAT
TTTGCCAATACTTTGAGTGCCTG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL8723Contig1 887 2 6 U
GGGGGGGTTTGCTTCTTTTCCCATCCTTTCTCTTACCTTTCATTACATATATACTCTCTC
CATATCTTATATATATACCAATAGTATTGTGTGTATAAACAAATACAATCATAACTAAAT
ACAGAGAGAGGTAGATACTTAGACATATAAACCAAACCCACCAAACATTATTTGATACTT
CTCACCATAAATACATATCTCTAGTGTTCTTGTAACAGGGCCAAATTCAGAAACGAAGGA
TCATGACAAGTTTTCACGAGGAGACGCGTCTAGTACTCCTCACCAAGGGGAAACGAACCA
AACGTCCTCGATCTGCGTCTCCTCACATGAACGCAGACGCAGTGTCCGGCGTTTGCAGCG
AGGACCGATCACTAGAGGCAAAAGAAGAAGGAGCAGGTGAAGTTGAATTCCAGGGAGCTA
CTGAAGAAGACCAAGACATGGCGAATTGTCTGATGCTATTGTCGCAGGGACATAAAGCAA
AGAGTAGTGGAGATCATCTATTGACGCAGAAGATTGGTTTCTTGAGCAACAAGAAACAGA
AACCGGTGGCTTCTTCTCTAGGTTTAGGGCTAGATGGTGTATACCCGTGCAAAACGTGTG
ATAAAAGCTTCCACTCGTTTCAAGCACTAGGAGGACACAGGGCTAGCCATAAGAAGCCCA
AACGCGACGAGAGGAACTCTTCGTCTGCGGTTGAAACGGTGGAAACTGCGGAAGCTGTAG
GAAGCTTTCTTTCTCTGCAAGTAAGTAGCGGTGATGGTAGCAGGAAGCCGGAAAAAACAC
ATGAATGCTCAATCTGCAAAGCTGAGTTTTCTTCAGGACAAGCGTTAGGAGGTCATATGA
GGAGACATAGAGGTTTAACCGTAAACGCAAACGCTACTTCAGTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A644TF U 1
AF RR4A644JQ C 320
BS 1 776 RR4A644TF
BS 777 777 RR4A644JQ
BS 778 820 RR4A644TF
BS 821 821 RR4A644JQ
BS 822 837 RR4A644TF
BS 838 887 RR4A644JQ

RD RR4A644TF 837 0 0
GGGGGGGTTTGCTTCTTTTCCCATCCTTTCTCTTACCTTTCATTACATATATACTCTCTC
CATATCTTATATATATACCAATAGTATTGTGTGTATAAACAAATACAATCATAACTAAAT
ACAGAGAGAGGTAGATACTTAGACATATAAACCAAACCCACCAAACATTATTTGATACTT
CTCACCATAAATACATATCTCTAGTGTTCTTGTAACAGGGCCAAATTCAGAAACGAAGGA
TCATGACAAGTTTTCACGAGGAGACGCGTCTAGTACTCCTCACCAAGGGGAAACGAACCA
AACGTCCTCGATCTGCGTCTCCTCACATGAACGCAGACGCAGTGTCCGGCGTTTGCAGCG
AGGACCGATCACTAGAGGCAAAAGAAGAAGGAGCAGGTGAAGTTGAATTCCAGGGAGCTA
CTGAAGAAGACCAAGACATGGCGAATTGTCTGATGCTATTGTCGCAGGGACATAAAGCAA
AGAGTAGTGGAGATCATCTATTGACGCAGAAGATTGGTTTCTTGAGCAACAAGAAACAGA
AACCGGTGGCTTCTTCTCTAGGTTTAGGGCTAGATGGTGTATACCCGTGCAAAACGTGTG
ATAAAAGCTTCCACTCGTTTCAAGCACTAGGAGGACACAGGGCTAGCCATAAGAAGCCCA
AACGCGACGAGAGGAACTCTTCGTCTGCGGTTGAAACGGTGGAAACTGCGGAAGCTGTAG
GAAGCTTTCTTTCTCTGCAAGTAAGTAGCGGTGATGGTAGCAGGAAGCCGGAAAAA*CAC
ATGAATGCTCAATCTGCAAAGCTGAGTTTTCTTCAGGACA*GCGTTAGGAGGTCATA

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR4A644JQ 568 0 0
TCCTCACATGAACGCAGACGCAGTGTCCGGCGTTTGCAGCGAGGACCGATCACTAGAGGC
AAAAGAAGAAGGAGCAGGTGAAGTTGAATTCCAGGGAGCTACTGAAGAAGACCAAGACAT
GGCGAATTGTCTGATGCTATTGTCGCAGGGACATAAAGCAAAGAGTAGTGGAGATCATCT
ATTGACGCAGAAGATTGGTTTCTTGAGCAACAAGAAACAGAAACCGGTGGCTTCTTCTCT
AGGTTTAGGGCTAGATGGTGTATACCCGTGCAAAACGTGTGATAAAAGCTTCCACTCGTT
TCAAGCACTAGGAGGACACAGGGCTAGCCATAAGAAGCCCAAACGCGACGAGAGGAACTC
TTCGTCTGCGGTTGAAACGGTGGAAACTGCGGAAGCTGTAGGAAGCTTTCTTTCTCTGCA
AGTAAGTAGCGGTGATGGTAGCAGGAAGCCGGAAAAAACACATGAATGCTCAATCTGCAA
AGCTGAGTTTTCTTCAGGACAAGCGTTAGGAGGTCATATGAGGAGACATAGAGGTTTAAC
CGTAAACGCAAACGCTACTTCAGTAAGC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL8724Contig1 875 2 2 U
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AGTTGTGGTTCTGGATCATGACGTTGTAGTCCAGCGAGACTTATCTCCTCTCTGGGAGCT
TGATATGGAAGGAAAAGTGAATGGCGCAGTGAAGTCGTGCTCTGTGAGATTGGGTCAGCT
AAAGAGTCTCAAGAGAGGAAGTTTTGATACTAATGCTTGTCTCTGGATGTCTGGATTGAA
TGTCATTGATCTTGCCAGATGGAGGGAATTGGGAGTTTCAGAAACCTACCTGAAATTTTT
CAAACAGATTAGTGGTGGAGGTGCGCCGCGAGAAGCAATTGCATTGCAAGCAACTTTGCT
TACGTTTCAAGACAAAGTTTATGGTCTTGACGACAAATGGGCTGTATCAGGGCTTGGTTA
TGACTACTACATCAACACGCAAGGATAAGAAACGCAGCCACATTGCACTACAATGGGAAC
ATGAAGCCGTGGCTAGAGCTAGGGATCCCACAGTACAAAAATTATTGGAGAAAGCATCTG
AACCGGGAAGATCGGTTCTTGAGTGACTGTAACGTGAATCCCTGATGAGAAGGTAAAAGA
AACTACGCTGGGCCAATGCTTTAGAAGCATATTTACACGCAAAAGAAAAAGATTTAGAGA
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GGGGAAAGAGACGCACGCAGAAGGTGGGTTAAAAAGTGATTTAGCTAATTGATTTTTTAA
GAGAGACATGATATGAAGATGATCGAAAATCAGCTTTAATATTGATATAAGTAGAATGTG
ACGAGACTTTAATGTTGTATATGATTTTTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EY15TF U 1
AF RR4EY15JQ C 105
BS 1 636 RR4EY15TF
BS 637 875 RR4EY15JQ

RD RR4EY15TF 636 0 0
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AGTTGTGGTTCTGGATCATGACGTTGTAGTCCAGCGAGACTTATCTCCTCTCTGGGAGCT
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AAAGAGTCTCAAGAGAGGAAGTTTTGATACTAATGCTTGTCTCTGGATGTCTGGATTGAA
TGTCATTGATCTTGCCAGATGGAGGGAATTGGGAGTTTCAGAAACCTACCTGAAATTTTT
CAAACAGATTAGTGGTGGAGGTGCGCCGCGAGAAGCAATTGCATTGCAAGCAACTTTGCT
TACGTTTCAAGACAAAGTTTATGGTCTTGACGACAAATGGGCTGTATCAGGGCTTGGTTA
TGACTACTACATCAACACGCAAGGATAAGAAACGCAGCCACATTGCACTACAATGGGAAC
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AACCGGGAAGATCGGTTCTTGAGTGACTGTAACGTGAATCCCTGATGAGAAGGTAAAAGA
AACTACGCTGGGCCAATGCTTTAGAAGCATATTTAC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4EY15JQ 771 0 0
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GGATGTCTGGATTGAATGTCATTGATCTTGCCAGATGGAGGGAATTGGGAGTTTCAGAAA
CCTACCTGAAATTTTTCAAACAGATTAGTGGTGGAGGTGCGCCGCGAGAAGCAATTGCAT
TGCAAGCAACTTTGCTTACGTTTCAAGACAAAGTTTATGGTCTTGACGACAAATGGGCTG
TATCAGGGCTTGGTTATGACTACTACATCAACACGCAAGGATAAGAAACGCAGCCACATT
GCACTACAATGGGAACATGAAGCCGTGGCTAGAGCTAGGGATCCCACAGTACAAAAATTA
TTGGAGAAAGCATCTGAACCGGGAAGATCGGTTCTTGAGTGACTGTAACGTGAATCCCTG
ATGAGAAGGTAAAAGAAACTACGCTGGGCCAATGCTTTAGAAGCATATTTACACGCAAAA
GAAAAAGATTTAGAGAGGTGGTTAAGCGACATCTCATTTTTTTGGAGAAGGGGTGAATAA
ACCCGAATGCATTGCAGGGGAAAGAGACGCACGCAGAAGGTGGGTTAAAAAGTGATTTAG
CTAATTGATTTTTTAAGAGAGACATGATATGAAGATGATCGAAAATCAGCTTTAATATTG
ATATAAGTAGAATGTGACGAGACTTTAATGTTGTATATGATTTTTTTGGCT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL8725Contig1 817 2 4 U
GGGGTGGTGGCGCAGTAGACAAAGAAGTAGACTACGCTAATTACTTCTGCACATACTCAT
TCCTGTACCACCAGAAAGACATGCTCTCGGACCGTGTCCGTATGGACGCTTACTTCAACG
CCGTCTTCGAGAACAAACATCACTTCGCCGGCAAGACGGTGTTGGATGTCGGAACCGGGA
GTGGGATTCTAGCGATTTGGTCGGCTCAAGCTGGTGCGAGGAAAGTGTATGCAGTGGAAG
CTACCACGATGGCTGACCACGCTCGTGCTCTTGTCAAAGCCAATGGTCTCGAACATGTTG
TTGAAGTGATTCAAGGCTCTGTCGAAGATATTTCTTTGCCTGAGAAAGTTGATTAATTAT
CTCGGAGTGGATGGGATACTTCCTTCTGCGTGAGTCCATGTTTGATTCTGTTATATCTGC
TCGTGACCGTTGGTTAAAGCCCACCGGTGTCATGTACCCAAGTCATGCACGCATGTGGCT
TGCACCCATCAAATCTACTTTGTCAGATCGGAAGAAGAATGATTTGGATGGTGCGATGGC
GGATTGGGACAACAGGTTTTCATTTTGTCAAATCCTATAAATGTTGAGGAAGGAGATAAT
CTGAATCTCGGTTTGGTAATGAGCCGGTCCAAAGAAAACCATAGACTGATGGAGGTTGAG
CTTAATTGCGAGATCAAAGAGGCTTCTGGCAACCCTAAGGAATCATTCAAGAAGACTTAT
TTCATAGAATGATTATACGGATGCATGGAGCTTGGTGGTTCTGTATCGAATGAATGAACC
CAAATGTAATGTTTTACTATTTGTTGTTTCCAACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
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AF RR4C295TF U 1
AF RR4C295JQ C 111
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CTCGGAGTGGATGGGATACTTCCTTCTGCGTGAGTCCATGTTTGATTCTGTTATATCTGC
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QA 1 655 1 655
DS 

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TTATATCTGCTCGTGACCGTTGGTTAAAGCCCACCGGTGTCATGTACCCAAGTCATGCAC
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GTGCGATGGCGGATTGGGACAACAGGTTTTCATTTTGTCAAATCCTATAAATGTTGAGGA
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TGAATGAACCCAAATGTAATGTTTTACTATTTGTTGTTTCCAACTTT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL8726Contig1 584 2 2 U
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CAACACGGCCACATAGTTGTCTTCAAACTCAAAAACCAGATACTTGTCTTTGCACATGTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CE10TF C 1
AF RR4CE10JQ U 48
BS 1 47 RR4CE10TF
BS 48 584 RR4CE10JQ

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CCCAGTAGCTTCCATCTGGCGGGTTTTTTTTTTGTTTCTCTGAACCCTTCCTTATGCCCA
CACCAGTCCATCGAAGCCAATTTCTAGATTTGACACAGGGCTGTCTCCAAAACCTTGGTT
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AATGAGGTGTGCCAAGTGATGGATGTTTCTTATATGAGTTCCCT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR4CE10JQ 537 0 0
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TCTTATGGCAAATTTTCAATCAAGTTCTAGTCCCTAGAGATCTGAAGAAAGAATGAACTG
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CAAAACCTTGGTTAAGTGCCTGGGTGTCATCAACTGGATCTACATATGGATCACGCAGAT
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AAGCTTCTCTCTCCAACACGGCCACATAGTTGTCTTCAAACTCAAAAACCAGATACTTGT
CTTTGCACATGTCAATGAGGTGTGCCAAGTGATGGATGTTTCTTATATGAGTTCCCT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

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TCTGACTTGGGATTTTTGATGTAAAGCTTCACAGTAGAAAGATAACCATCTTTATCCC


BQ
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AF RR4A848JQ C 1
AF RR4A848TF U 1
BS 1 538 RR4A848TF

RD RR4A848JQ 538 0 0
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AGGTCCAGTGATAGCAAATCCCCGATGGTTAAGAAAGCAAGTGGTGCAAACAAAAGTAGC
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CACAAGAGATCACATTTCATTGGAAATCATGGACACAGGATCAAACACAAAGCAGCAGCT
GATATGCCTATCGATCTCAATCTCCCTGCTCAGGATATTGATGAATGAATCATAACCTGA
ATAAAATGTTTTCTTGGTTTTGTTCATATAAAGCTTTATCACTTAGCTGGTTCTTTTCTT
TCTGACTTGGGATTTTTGATGTAAAGCTTCACAGTAGAAAGATAACCATCTTTATCCC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4A848TF 538 0 0
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AAGAATGGTGATGATCTTGGGGTCAAGGAGGGAGGATCAAAGTATGAGCTGCGCAAAAGC
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AGGTCCAGTGATAGCAAATCCCCGATGGTTAAGAAAGCAAGTGGTGCAAACAAAAGTAGC
AAAGTTCACGAGTGTCCAGTTTGCTTCAGGGTGTTTAAATCGGGACAAGCTTTAGGTGGT
CACAAGAGATCACATTTCATTGGAAATCATGGACACAGGATCAAACACAAAGCAGCAGCT
GATATGCCTATCGATCTCAATCTCCCTGCTCAGGATATTGATGAATGAATCATAACCTGA
ATAAAATGTTTTCTTGGTTTTGTTCATATAAAGCTTTATCACTTAGCTGGTTCTTTTCTT
TCTGACTTGGGATTTTTGATGTAAAGCTTCACAGTAGAAAGATAACCATCTTTATCCC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL8728Contig1 836 2 2 U
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TCCCAAAAAATTCAACAAGAATCAATCATGAAAGAGAATTCCAAGAAGACGATGACGAAG
CAGATAACCGCGAGGCGTGACGACACGCCGTTACACACGGCGGTCAGAGAAGGCAAAACA
GAGATTCTCTTGGAGCTATCTTCAACGTTCCGGGCCAGTACACGGATGATCCTAAAAACG
TTCCACCAGGGTATACACTGGGAGAAGCGAGAGCAGCTTCGAGACCCGAGTTCTTGATCT
TTGTCGTGTTTGATTCTTTCGCGCTATTCATCTCTTTGGCAGTGGTTGTGGTTCAGACAT
CGGTGGTGGTTATAGAGAGGAAAGCTAAGAAGCAAATGATGGCGATTATCAACAAGCTAA
TGTGGATGGCTTGCATAATGATCTCGGTGGCCTTCTTATCGCTGTCTTTTGTTGTTGTGG
GAGATAAGCAGAGGCCATTGGCGATTGGTATAACCGCCATTGGAGCTTTGATCATGGTTT
CAACACTTGGAACTATGTGTTATTGGGTGGTTGCTAATCGGATTGAAGGGTCTAAGTCGT
CTCCAGCTTCAATGATGTCAGATGCTGAGTTAGTTGATCACAAGCATAACCGGAAGCTTT
ATGCGGTTTGATTAGAGTGAAGGAAAGGAGCAGTTAAGAAACCGTTTTAAGAACAGAGAG
ACTTTTGTATCCAGAAATAAAGGAGATCTCCTTGTTTAAGGTTCTGTACTTCTGTTTATA
TGTAAGAAATGAAAAATAGTATATATCAATATATCATTGTATAAGCTTTTACATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CTATTCATCTCTTTGGCAGTGGTTGTGGTTCAGACATCGGTGGTGGTTATAGAGAGGAAA
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TCGGTGGCCTTCTTATCGCTGTCTTTTGTTGTTGTGGGAGATAAGCAGAGGCCATTGGCG
ATTGGTATAACCGCCATTGGAGCTTTGATCATGGTTTCAACACTTGGAACTATGTGTTAT
TGGGTGGTTGCTAATCGGATTGAAGGGTTTAAGTCGTCTCCAGCTTCAATGATGTCAGAT
GCTGAGTTAGTTGATCACAAGCATAACCGGAAGCTTTATGCGGTTTGATTAGAGTGAAGG
AAAGGAGCAGTTAAGAAACCGTTTTAAGAACAGAGAGACTTTTGTATCCAGAAATAAAGG
AGATCTCCTTGTTTAAGGTTCTGTACTTCTGTTTATATGTAAGAAATGAAAAATAGTATA
TATCAATATATCATTGTATAAGCTTTTACATGG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GW69TF U 1
AF RR4GW69JQ C 9
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AAGCTGAAAGCTGGTCTCAGCTCCGCACAACACCTTCAACGCCGGCTTACCTCCGATATC
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TAAATATCGTTTTTCTTC

QA 1 558 1 558
DS 

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TTCAGCCGCAGATGTCCCCGTAGACGGTGCGCGAGTTGAAGAGAAACGGCTTACCTCTTT
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TCGCTCTTGAACCCGCTGAGTTGAAAAAAGCGAGTTGGATTATCCAATGATAACTGTATA
TAGTTTCGGTGTAATATAGTCATATGTGTGATTATTAGAAGGTCAAAATAAATAAATATC
GTTTTTCTTC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL8730Contig1 860 2 2 U
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ATATATTCCGCAACTACAATAATCAAAACAACAAGCATGATATTGGATGGATCTAGTAGA
AAAATAAAAAATCAAATAATTTGGTTTCTAGGTCAAGTGTCATCAGTGTTAGATTAACCT
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CAAAAAGATGCTTAAAGTGC


BQ
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AF RR4A427TF U 1
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AAGGAGATGAACGTGAATTGGTGAAGATCAAAGATGGGGGTCATGAAGGTCTTCCTGTCG
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AAACTAACCCGATCGCATTCAAAATCTAGTAGTGTAAACTTATATATATTCCGCAACTAC
AATAATCAAAACAACAAGCATGATATTGGATGGATCTAGTAGAAAAATAAAAAATCAAAT
AATTTGGTTTCTAGGTCAAGTGTCATCAGTGTTAGATTAACCTCACAACTATACAACAAC
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TGC

QA 1 663 1 663
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BQ
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AF RR4F558JQ C 1
AF RR4F558TF U 1
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DS 

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QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AV56TF U 1
AF RR4AT63TF U 1
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CAAAT

QA 1 725 1 725
DS 

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CCGATTAAGAGGGCTGATGATTTTTTGCATGTTTGAGATCTGTGCTGATTCTGAGAAGTC
TCCCTCCCCTGCTCTCTCCCCGTCGCCTCTCTCTTCAAATCGTCAGGAGATCTTCCCAGT
CCCCACCACCTCCACCTTCACCTTCCGACACCGACCACAGCATACCATTCCCTTCCCATA
CCACTGGCAGCATCAGCTCAACTTCCAACACCGACCACAGCATACCATTCCCTTCCCACA
CCACTGGCAGCATCAGCTCAACTTCCAACACCAACCACATCATACCATTCCCTTCCCACA
CCACGTCACTGTGTCAGGAGTTGTCACACAATTTGCACTTGGAGTGTGAAGATGCGTGGA
AGATTGTGATCAAGTGTCTCGATTCTGGCGAACACCTGTACATCACTGTGACTGCTGTCA
CAACTAGAGGCTATAAGGTCTATTTCAGATCCTTGAAAGGATTTCTCCCCTATAACCAAC
TTGAGCCTCCTAGTGAATTTGGGTCCTTTCAAGCATGGGCAAAACCCGACTTTAAGGACC
CAAATAGGCTACAGAAGATGTCCACCGTGCGCAGTTATGTTGGAAAGACCATGCGTGTCC
GTGTACTGACTGCTGACAAGTCACGTGACACATTAATCTTGACTAT

QA 1 826 1 826
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGTGGAAGAAGATAGATTCGATTCACTTCAGAGAATTGTAGATTGATCGAAGAAGATGAA
CACTGACATCACTGCCTTGGAGAAGCCCCAATACCCCGTCGTCGATCGGAATCCACCATT
CACTAAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGG
CGTTTCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATTAAGCCTGGGATCAAAGGACCTTCGAT
GGTGACGGGAGGATTGATCGGACTCATGGGTGGGTTCATGTATGCGTACCAGAACTCGGC
GGGGAGGCTCATGGGTTTCTTCCCTAACGAAGGCGAGGTCGCTAGTTACCAGAAGCGCGG
TGGGTTCTCCAAATGAGAGTCTCTATTGCTGGATCTCTGGGTTCCAATTCGAAAAAGAAC
TCTCTTTTTTTTTTTGCTACTCCTTTTGTTTGTTTGAGGATAATGTTTGCCTCTGTTTGT
TACAACTTATGATGTTGATGATCAATAAATATTTGAGCTTGCTCAAAAATTGTTTGTC


BQ
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AF RR4FL19JQ C 1
AF RR4FL19TF U 1
BS 1 538 RR4FL19TF

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CACTAAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGG
CGTTTCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATTAAGCCTGGGATCAAAGGACCTTCGAT
GGTGACGGGAGGATTGATCGGACTCATGGGTGGGTTCATGTATGCGTACCAGAACTCGGC
GGGGAGGCTCATGGGTTTCTTCCCTAACGAAGGCGAGGTCGCTAGTTACCAGAAGCGCGG
TGGGTTCTCCAAATGAGAGTCTCTATTGCTGGATCTCTGGGTTCCAATTCGAAAAAGAAC
TCTCTTTTTTTTTTTGCTACTCCTTTTGTTTGTTTGAGGATAATGTTTGCCTCTGTTTGT
TACAACTTATGATGTTGATGATCAATAAATATTTGAGCTTGCTCAAAAATTGTTTGTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4FL19TF 538 0 0
GGTGGAAGAAGATAGATTCGATTCACTTCAGAGAATTGTAGATTGATCGAAGAAGATGAA
CACTGACATCACTGCCTTGGAGAAGCCCCAATACCCCGTCGTCGATCGGAATCCACCATT
CACTAAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGG
CGTTTCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATTAAGCCTGGGATCAAAGGACCTTCGAT
GGTGACGGGAGGATTGATCGGACTCATGGGTGGGTTCATGTATGCGTACCAGAACTCGGC
GGGGAGGCTCATGGGTTTCTTCCCTAACGAAGGCGAGGTCGCTAGTTACCAGAAGCGCGG
TGGGTTCTCCAAATGAGAGTCTCTATTGCTGGATCTCTGGGTTCCAATTCGAAAAAGAAC
TCTCTTTTTTTTTTTGCTACTCCTTTTGTTTGTTTGAGGATAATGTTTGCCTCTGTTTGT
TACAACTTATGATGTTGATGATCAATAAATATTTGAGCTTGCTCAAAAATTGTTTGTC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

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CAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGAGGATCTGCCTGGAATGGGCCAGTTCTACTGCCTACACT
GCGATCGGTACTTCTCTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCATTTTAAGACCAAGAAGCACA
AGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGATGCTGATTTGG
CTGCTGGGATGGGAATGCCCGACAATGGTCCAAAGCTCATGGCTTCTTAAGTTCACTTTC
AGTTTTTTTCTTCTTCTCTTTCTTAATAGTTCACAGTTAACGGAACCTTTGGATTGTTGT
TGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATATAAGCTAAATGCTATAAGTTTTTTTTCC


BQ
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AF RR4BV93JQ C 1
AF RR4BV93TF U 1
BS 1 538 RR4BV93TF

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GATGCCCGACAAGAAAGGTGAAGAAGAGGCGATTGTCTCACAAAACAGCTCGTCGTGACA
AATTCGAAGTCAAAGGCGACGATTTAGTGTACACTGAGCTGCGCAAATCAGAGACGGAGA
CAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGAGGATCTGCCTGGAATGGGCCAGTTCTACTGCCTACACT
GCGATCGGTACTTCTCTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCATTTTAAGACCAAGAAGCACA
AGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGATGCTGATTTGG
CTGCTGGGATGGGAATGCCCGACAATGGTCCAAAGCTCATGGCTTCTTAAGTTCACTTTC
AGTTTTTTTCTTCTTCTCTTTCTTAATAGTTCACAGTTAACGGAACCTTTGGATTGTTGT
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QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4BV93TF 538 0 0
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AATTCGAAGTCAAAGGCGACGATTTAGTGTACACTGAGCTGCGCAAATCAGAGACGGAGA
CAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGAGGATCTGCCTGGAATGGGCCAGTTCTACTGCCTACACT
GCGATCGGTACTTCTCTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCATTTTAAGACCAAGAAGCACA
AGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGATGCTGATTTGG
CTGCTGGGATGGGAATGCCCGACAATGGTCCAAAGCTCATGGCTTCTTAAGTTCACTTTC
AGTTTTTTTCTTCTTCTCTTTCTTAATAGTTCACAGTTAACGGAACCTTTGGATTGTTGT
TGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATATAAGCTAAATGCTATAAGTTTTTTTTCC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

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CTCCTGCCTTCATGGGAGTGACATTGTAAGTGGAGACTCCGGTTATTGGAGCTGAACTTT
TGTTTTCAGCAGTGTAAAAGGCGAGCGCGATTTCTCCTGGCTTTACTCTCACCTCTCTTT
GAGTAGGAGTGAACTTCCACTGCATCCCATCAGCAACATCAGCATTGAACTGCACCACAA
TCTCCCTTTCAGTGACGGTACCAAATTCTGAATGCCTAGCAATCTTCTCCTCAACAGTCT
CTTTGCGTTGAACAGTACCCCCATATCCAGTAGCTTGGCAGAAGGTTCTATACAACGGCA
CAGCGGCGTAAGTTAGCCCAACCATGCCAAAGACGACAGCAGTGAGGTAATAGAGCATTT
TCTTCGATTTGGTTTCTGTTATCGACTGAGTAGAAGAATAGTGGCGATGAGCAGTACTAA
GCAACACCGATTTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAATGAGAATTCAAAGTGAAAAACG
AAGATGAGCTTCCCAAAAGCCCTCTCTTGTTTCGGAGATTATGCTGATTGCCATTACAAG
CTCCATGAGTGTAATAACGAGAGCTAGGCACAAGAGGCACAGTCCTCGACGATGTCCGAT
GAAGATTCTCTAAATATGAAGCAATTCGAGTCCCTCTACATGCCTTCGACCACGACATGG
CCGAAGATTAATTATCTCAATCGATCGACACAGTGAGGAAACACTACACAACTTACTACT
GATCGGTAACGGAACGGCGTCGTTGTATCGTCGGCGTAAGAGAAATCAAAGACGGCACAT
GAAATGAATACCGAAGAGGACAGAACAAGTCAAACAACTTGTTTTCAACTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F722JQ U 1
AF RR4AX19TF C 72
BS 1 141 RR4F722JQ
BS 142 142 RR4AX19TF
BS 143 249 RR4F722JQ
BS 250 893 RR4AX19TF

RD RR4F722JQ 249 0 0
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CTCCTGCCTTCATGGGAGTGACATTGTAAGTGGAGACTCCGGTTATTGGAGCTGAACTTT
TGTTTTCAGCAGTGTAAAAGGGGAGCGCGATTTCTCCTGGCTTTACTCTCACCTCTCTTT
GAGTAGGAGTGAACTTCCACTGCATCCCATCAGCAACATCAGCATTGAACTGCACCACAA
TCTCCCTTT

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR4AX19TF 822 0 0
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AACTTCCACTGCATCCCATCAGCAACATCAGCATTGAACTGCACCACAATCTCCCTTTCA
GTGACGGTACCAAATTCTGAATGCCTAGCAATCTTCTCCTCAACAGTCTCTTTGCGTTGA
ACAGTACCCCCATATCCAGTAGCTTGGCAGAAGGTTCTATACAACGGCACAGCGGCGTAA
GTTAGCCCAACCATGCCAAAGACGACAGCAGTGAGGTAATAGAGCATTTTCTTCGATTTG
GTTTCTGTTATCGACTGAGTAGAAGAATAGTGGCGATGAGCAGTACTAAGCAACACCGAT
TTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAATGAGAATTCAAAGTGAAAAACGAAGATGAGCTT
CCCAAAAGCCCTCTCTTGTTTCGGAGATTATGCTGATTGCCATTACAAGCTCCATGAGTG
TAATAACGAGAGCTAGGCACAAGAGGCACAGTCCTCGACGATGTCCGATGAAGATTCTCT
AAATATGAAGCAATTCGAGTCCCTCTACATGCCTTCGACCACGACATGGCCGAAGATTAA
TTATCTCAATCGATCGACACAGTGAGGAAACACTACACAACTTACTACTGATCGGTAACG
GAACGGCGTCGTTGTATCGTCGGCGTAAGAGAAATCAAAGACGGCACATGAAATGAATAC
CGAAGAGGACAGAACAAGTCAAACAACTTGTTTTCAACTTCC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL8737Contig1 536 2 1 U
GGACAGTCAAAATCATCATATCAATCTAAACTCCAATCGAGAAAGAAGTTCCAAATGTCA
GGAAGAGGGAAAGGAGGAAAGGGACTGGGCAAAGGAGGAGCGAAGAGGCACAGGAAGGTT
CTGAGAGACAACATCCAAGGAATCACAAAGCCTGCGATCAGGCGGCTTGCTCGCAGAGGA
GGAGTGAAGAGGATCAGCGGGTTGATCTACGAAGAGACGAGAGGGGTTCTGAAGATCTTT
CTCGAGAACGTGATTAGAGACGCCGTGACTTACACGGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTG
ACGGCGATGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGTCGCACTCTCTATGGGTTCGGT
GGTTAAAACCTGTTTAATATTATTTTCTTTTCGGTTTGGTCCTGTTGCTAGTTGCTACTG
ATATTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATCTAAGTAGGTTTAGGCTTCTACTCCTTTGCTGGTT
CGTTTCTTTGTCTGTATCAATGATCTTATGAAAATTCCATTATCAAATATTCTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CD67JQ C 1
AF RR4CD67TF U 1
BS 1 536 RR4CD67TF

RD RR4CD67JQ 536 0 0
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CTGAGAGACAACATCCAAGGAATCACAAAGCCTGCGATCAGGCGGCTTGCTCGCAGAGGA
GGAGTGAAGAGGATCAGCGGGTTGATCTACGAAGAGACGAGAGGGGTTCTGAAGATCTTT
CTCGAGAACGTGATTAGAGACGCCGTGACTTACACGGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTG
ACGGCGATGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGTCGCACTCTCTATGGGTTCGGT
GGTTAAAACCTGTTTAATATTATTTTCTTTTCGGTTTGGTCCTGTTGCTAGTTGCTACTG
ATATTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATCTAAGTAGGTTTAGGCTTCTACTCCTTTGCTGGTT
CGTTTCTTTGTCTGTATCAATGATCTTATGAAAATTCCATTATCAAATATTCTCCC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4CD67TF 536 0 0
GGACAGTCAAAATCATCATATCAATCTAAACTCCAATCGAGAAAGAAGTTCCAAATGTCA
GGAAGAGGGAAAGGAGGAAAGGGACTGGGCAAAGGAGGAGCGAAGAGGCACAGGAAGGTT
CTGAGAGACAACATCCAAGGAATCACAAAGCCTGCGATCAGGCGGCTTGCTCGCAGAGGA
GGAGTGAAGAGGATCAGCGGGTTGATCTACGAAGAGACGAGAGGGGTTCTGAAGATCTTT
CTCGAGAACGTGATTAGAGACGCCGTGACTTACACGGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTG
ACGGCGATGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGTCGCACTCTCTATGGGTTCGGT
GGTTAAAACCTGTTTAATATTATTTTCTTTTCGGTTTGGTCCTGTTGCTAGTTGCTACTG
ATATTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATCTAAGTAGGTTTAGGCTTCTACTCCTTTGCTGGTT
CGTTTCTTTGTCTGTATCAATGATCTTATGAAAATTCCATTATCAAATATTCTCCC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL8738Contig1 876 2 2 U
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GCTAATCAAGATTAGGCGGAGAGGAGTTGACGTCTGTGAAGAACAGAGCGACAGAAGCTG
CTAGAGGACGACTGAATCGTTTAGTAAATAATATGGAGTTCTGTCCTACTTGTGGGAACT
TGCTGCGTTACGTTCCTTCCCAGTTCTTCTGCTCCACTTGTCCCTACATTGCCCGCATCG
AAAGACAGGTTGAGATAAAGAAGAAGCAATTGCTGGTTAAGAAATCAATTGACCCTGTTT
TGAAGAAAGATGATATACCTACTGGACCTGAAACTGAAGGTATTTGGTTAATAAGATTTA
GTATTATAAAATCTATATCATGACCGGTTGCGAGTGTCAGTGCGATAACACTTGAATACT
TAGTTTACTCATTGAGCAACCAGGGTAACAAGTACATTGATCTCTCTCTCTCTTAGCAAT
AGTATTGTTTTGCTGGAATTGCTTCCATCTTCGATCATATCTTTTTTTGGTTGGATTGTT
TGTTTATTATCAGCACCATGCCCAAGATGCGGACACGATAAGGCATACTTCAAAACAATG
CAGATTCGTTCAGCGGACGAGCCAGAATCTAGATTTTACAGATGCGTCAAGTGCGAGCAA
ACTTGGCGCGAAGAATGATCACCACCCCCCTTGTGTCTCTCATTTCTTTTCTTTTTTTTT
GGTTCCGCTAAATCCATCTAAACATTTAATGTCGCTCGCTCTTCGATTGGGCATATGCTT
GGTTTTGTTCTGCCATTGGCAATGTCAGCAAATTTGTTTGGGATGTTTCTCAGCTCAATG
AGTCTGTGATTTATGCAATTTTGATTTCCATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G348TF U 1
AF RR4G348JQ C 489
BS 1 634 RR4G348TF
BS 635 876 RR4G348JQ

RD RR4G348TF 634 0 0
GGACGGTGACAATTATAGTCTCAAATCAATAATAATAATTAAAAAAAAAATATAGGGCTT
GCTAATCAAGATTAGGCGGAGAGGAGTTGACGTCTGTGAAGAACAGAGCGACAGAAGCTG
CTAGAGGACGACTGAATCGTTTAGTAAATAATATGGAGTTCTGTCCTACTTGTGGGAACT
TGCTGCGTTACGTTCCTTCCCAGTTCTTCTGCTCCACTTGTCCCTACATTGCCCGCATCG
AAAGACAGGTTGAGATAAAGAAGAAGCAATTGCTGGTTAAGAAATCAATTGACCCTGTTT
TGAAGAAAGATGATATACCTACTGGACCTGAAACTGAAGGTATTTGGTTAATAAGATTTA
GTATTATAAAATCTATATCATGACCGGTTGCGAGTGTCAGTGCGATAACACTTGAATACT
TAGTTTACTCATTGAGCAACCAGGGTAACAAGTACATTGATCTCTCTCTCTCTTAGCAAT
AGTATTGTTTTGCTGGAATTGCTTCCATCTTCGATCATATCTTTTTTTGGTTGGATTGTT
TGTTTATTATCAGCACCATGCCCAAGATGCGGACACGATAAGGCATACTTCAAAACAATG
CAGATTCGTTCAGCGGACGAGCCAGAATCTAGAT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4G348JQ 388 0 0
TTTGCTGGAATTGCTTCCATCTTCGATCATATCTTTTTTTGGTTGGATTGTTTGTTTATT
ATCAGCACCATGCCCAAGATGCGGACACGATAAGGCATACTTCAAAACAATGCAGATTCG
TTCAGCGGACGAGCCAGAATCTAGATTTTACAGATGCGTCAAGTGCGAGCAAACTTGGCG
CGAAGAATGATCACCACCCCCCTTGTGTCTCTCATTTCTTTTCTTTTTTTTTGGTTCCGC
TAAATCCATCTAAACATTTAATGTCGCTCGCTCTTCGATTGGGCATATGCTTGGTTTTGT
TCTGCCATTGGCAATGTCAGCAAATTTGTTTGGGATGTTTCTCAGCTCAATGAGTCTGTG
ATTTATGCAATTTTGATTTCCATGTTCC

QA 1 388 1 388
DS 



AS 1 2

CO CL8739Contig1 691 2 3 U
GGACTCCGCCCGCCTTCAATCCATCAGAAAATGGAGGTTTCGCTGTTGGGTTCCTCACGG
AGTTTCCAGCTATACCCCAAGACACAGACACCGAAACTCGCAAGCTCTTTGACAGAAAGA
GACTCAGGTTGTCTGAAAATGAGAGTTGGTAATCCATTTAGATCCTTCAAGTGCAGGTCT
GTCTCTGAGGACTTCGTTGAGAGAAGTAGCCCACTTGAGGTTAAGAAAGAGCTAGAGACT
TGCTTTGACCTCATACATAAGCTCGGGAGAGGAATCCTCTACTTAGGTTCCGCCAGGATC
CAACCAAACCATTCACATTACCTTCAATCACAAGAGTTGAGCAGACAAGCAGCGAGTCTG
TTGGACTGTACTACATGGTCTGGAGCTGGACCAGGACTCATGGATGCTGCCACTAAAGGT
GCTTTGGAAGCTGATAAACCCGTCGGCGGCATCAAAATAGAGAAAGAAGCTGGTGAATGG
ACCGCTTCCAAGGTCCATCCTTATCTCCCTCCTCAAAACTATCACACTTGCAGGTTTTTC
TCGGCGAGAAAGCATGGACTGGTGGACGCAGTGGTTAGAAACAATGTTTCCGACAAGACA
GCGGTGATTGCATTGCCAGGAGGCATTGGCACGCTTGATGAGATGTTCGAGATTTTGGCA
TTGATTCAGCTCAAAAGGATTGGTTCCGTGT


BQ
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AF RR4H851TF U 125
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BS 615 615 RR4H851TF
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DS 



AS 1 2

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AF RR4FB71TF U 1
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CATGTGGGGCTGGTTGCAGAATACTGTACGGGTGAACCCTGGACCTTGATTCTCCTCTTC
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TCAGAGATTAGTGTTTCATGTTTTTTGAATCAAAACCCTGTATACAAGAAAGAACCAAAC
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QA 1 736 1 736
DS 

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TTTTTGAAATCACAAATTGATTCAGAGAGATAAAAACGAAGAAGCTGGAACAAAGATCCT
TGAACCGGATGACAAGTCAAGCACAATTC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK27TF U 1
AF RR4BY54TF U 178
BS 1 493 RR4DK27TF
BS 494 494 RR4BY54TF
BS 495 564 RR4DK27TF
BS 565 565 RR4BY54TF
BS 566 617 RR4DK27TF
BS 618 618 RR4BY54TF
BS 619 706 RR4DK27TF
BS 707 707 RR4BY54TF
BS 708 740 RR4DK27TF
BS 741 920 RR4BY54TF

RD RR4DK27TF 740 0 0
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ATCTTTCTTCTTTTCTGAAAAAGAAACTTATAAATATCTTTCTTTGATTACTTTCCAGCA
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TCTTTCTCTCTATCTCTGAGATGGGTTTGTTTGGGACGAAGAAGATCGGCAAGTACGAGA
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GACTAAGTGCAGTTCCTAAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4BY54TF 743 0 0
GG
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TTCTTTCTCTCTATCTCTGAGATGGGTTTGTTTGGGACGAAGAAGATCGGCAAGTACGAG
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AATGGTACCTACGTTGCTGTCAAAATCATAGACAAGGCTCTGGTTATCCAAAAGGGTCTA
CAGTCTCAAGTCCAAAGAGAGATACGTACCATGAAGCTTCTAAACCATCCCAACATCGTG
CAGATACACGAGGTGATTGGGACCAAGACAAAGATCTGTATTGTGATGGAATATGTTGCA
GGTGGTCAGCTTTCAGACAAACTTTGTAGACATAAGATGAAAGAATCAGATGCCAGAAAG
CTTTTCCAACAGTT*ATTAATGCTGTTGATTATTGTCATAACAGAGGAGTTTACCACAGA
GACCTTAAGCCACAAAACTTGCTTTTAGATTCAAAGGGTAATCTCAAAGTCTCTGACTTT
GGACTAAGTGCAGTTCCTAAATCAGGGGATATGCTTTCTACAGCTTGTGGATCTCCATGC
TATATAGCACCTGAGCTGATTATGAACAAAGGCTACTCAGGAGCAGCAGTGGGATGTGTG
GTCTTGTGGAGTATTCTATTTGAGTTGCTTGCTGGCTATCCACCGTTTGATGATCATACA
CTTGTGGTTTTGTATAAGAAG

QA 3 743 3 743
DS 



AS 1 2

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AGTTACAACAACATATCACATCTTTAATCATTACAGAACAATATAGTTACTTTTATTACC
GAACTGGACATAAAATAAAAGGTATCTGTCACATCCAAAACCCAAAAATTGGAACAAACC
CTATCTTGCAAAGGAAGCAACATAGTCGGTACAGTGCTAGTTCCCTCCACGTTTGTTTTT
TCTCCACTCCCATGGCTTCTCTGGATTTTTAGCCGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGCTT
AGCCTCATTTTCCCACTTTGCAAGCTCTGGACGCTTGTCATAGGCTAAATAATGCCAAGC
AAGACCTTTCTTTAACATAACTTCTTGTACAAACTTTCCATTACAGTATATATCTCCTAC
ACATCTTCCATAACGATCCTCTGCATAAACTAACACCTTCAAAACTTTCCCTTCAACCAT
CTTAAGCAGCTCATCACGTGACTCTTTTCCAAACGGCATTTTACTTTCCGGTGCATCAAT
TCCCCTTAGTCTTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTCTTTGTTCTGAACATTTATCAT
CCTGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G014JQ U 1
AF RR4C626JQ U 70
BS 1 192 RR4G014JQ
BS 193 193 RR4C626JQ
BS 194 197 RR4G014JQ
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BS 219 225 RR4G014JQ
BS 226 226 RR4C626JQ
BS 227 407 RR4G014JQ
BS 408 408 RR4C626JQ
BS 409 507 RR4G014JQ
BS 508 508 RR4C626JQ
BS 509 522 RR4G014JQ
BS 523 523 RR4C626JQ
BS 524 639 RR4G014JQ
BS 640 668 RR4C626JQ

RD RR4G014JQ 639 0 0
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TTTTCAGTTACAAAAAAAATATACTTATCAATACATGAAACATGTACAGAGTGCTCTTAC
AGTTACAACAACATATCACATCTTTAATCATTACAGAACAATATAGTTACTTTTATTACC
GAACTGGACATAGAATAGAAGGTATCTGTCACATCCAGAACCCAAGAATTGGAACAAACC
CTATCTTGCAAAGGAAGCAACATAGTCGGTACAGTGCTAGTTCCCTCCACGTTTGTTTTT
TCTCCACTCCCATGGCTTCTCTGGATTTTTAGCCGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGCTT
AGCCTCATTTTCCCACTTTGCAAGCTCTGGACGCTTGTCATAGGCTAGATAATGCCAAGC
AAGACCTTTCTTTAACATAACTTCTTGTACAAACTTTCCATTACAGTATATATCTCCTAC
ACATCTTCCATAACGATCCTCTGCATAGACTAACACCTTCAAGACTTTCCCTTCAACCAT
CTTAAGCAGCTCATCACGTGACTCTTTTCCAAACGGCATTTTACTTTCCGGTGCATCAAT
TCCCCTTAGTCTTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4C626JQ 599 0 0
AT
AAAAAAAATATACTTATCAATACATGAAACATGTACAGAGTGCTCTTACAGTTACAACAA
CATATCACATCTTTAATCATTACAGAACAATATAGTTACTTTTATTACCGAACTGGACAT
AAAATAAAAGGTATCTGTCACATCCAAAACCCAAAAATTGGAACAAACCCTATCTTGCAA
AGGAAGCAACATAGTCGGTACAGTGCTAGTTCCCTCCACGTTTGTTTTTTCTCCACTCCC
ATGGCTTCTCTGGATTTTTAGCCGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGCTTAGCCTCATTTT
CCCACTTTGCAAGCTCTGGACGCTTGTCATAGGCTAAATAATGCCAAGCAAGACCTTTCT
TTAACATAACTTCTTGTACAAACTTTCCATTACAGTATATATCTCCTACACATCTTCCAT
AACGATCCTCTGCATAAACTAACACCTTCAAAACTTTCCCTTCAACCATCTTAAGCAGCT
CATCATGTGACTCTTTTCCAAACGGCATTTTACTTTCCGGTGCATCAATTCCCCTTAGTC
TTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTCTTTGTTCTGAACATTTATCATCCTGTAAC

QA 3 599 3 599
DS 



AS 1 2

CO CL8743Contig1 915 2 6 U
GGGTGGTATCTGTTCGGGTCGTTACAAAAAAAAAATATCTCTGTGGTTCTCTTCTGACAC
TCCCTCGCTACTCTCTGTCTCCTTTTTTTTTTTCAAATCTTTTGTTTTTTCTTATCCTTT
GATTTTTTTGAATTAGCATCTGATCTTTGCGATCTTTCTCCAGTTCCTCAAGACAATTTT
ATCTGTCTGTTTCTTTTTTTGAAACTCCTACACAGATCAACACCAGTCCTCGATCCAGAC
ATCCGAAGTAGGATAAATGCTAGATCACACCGAGAAAATCTCCGATTCAGAAGTGATGAA
AAGAAGCAAGTTCGCATCCAAATACGCAACTGAAGAAGAAATCAGCAGCAGCAGTGATGG
AGGAGGAGGAGGTATCAACAACGAGAAGAAGAGTTGCGCCATTTGCGGTACTAGCAAAAC
CCCTCTTTGGCGAAGCGGTCCCACCGGTCCCAAGTCGCTATGTAACGCATGCGGGATCAG
GAACAAGAAGAAGAAAAGTACTGTGAAGAATAAGAAGAAGAATCACACTAGTAGGAATAA
TCCAAAGCTTGGTGACTCGTTGAAGCAGAGACTGTTGGAGTTAGGGAGAGAAGTCATGAT
GCAGCGATCCACTGCTGGAGGAGATCAACGGCGGAAGAAGCTCGGCGAGGAAGAGCAAGC
TGCTGTGCTGCTCATGGCTCTCTCTTATGCCTCTTCTGTTTATGCTTAACGAATCATCTC
TCTCGATCTCACCGATTTGGAGTTTAATAATTAATTAATTAATTTCAGTATATTTTTTTC
AAATTCTGAGAGTATTATTATTAGCTAACGAGTTAGTTTGTGATTCTTGTTTAATTTACT
CTTTTTTTGTATTTGGTTTATGTGATATGTAGTAGAAAACCGAAAGATCAAGAAACAAGA
TGGTTTTTCAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CA14TF U 1
AF RR4CA14JQ C 235
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ATCTGTCTGTTTCTTTTTTTGAAACTCCTACACAGATCAACACCAGTCCTCGATCCAGAC
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AAAT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4CA14JQ 681 0 0
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GATGAAAAGAAGCAAGTTCGCATCCAAATACGCAACTGAAGAAGAAATCAGCAGCAGCAG
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GATCAGGAACAAGAAGAAGAAAAGTACTGTGAAGAATAAGAAGAAGAATCACACTAGTAG
GAATAATCCAAAGCTTGGTGACTCGTTGAAGCAGAGACTGTTGGAGTTAGGGAGAGAAGT
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GCAAGCTGCTGTGCTGCTCATGGCTCTCTCTTATGCCTCTTCTGTTTATGCTTAACGAAT
CATCTCTCTCGATCTCACCGATTTGGAGTTTAATAATTAATTAATTAATTTCAGTATATT
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QA 1 681 1 681
DS 



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BQ
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AF RR4DG81JQ C 1
AF RR4DG81TF U 1
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QA 1 167 1 167
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4A613TF U 1
AF RR4A613JQ C 157
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BS 750 750 RR4A613JQ
BS 751 827 RR4A613TF
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RD RR4A613TF 864 0 0
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TGGGTTAGGGCTGACAGCATTTGGAGTCTTTTTCTCCTTTTTGGGAGTTGTCTTTGTCTT
TGATAAGGGTTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTTCATCTCTGGGGTTAGTCTTACCAT
TGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCGTCAAAACTATAAGGGAACAATCTC
TTTTGGTGCTGGCTTCTTCTTTGTTGTCATTGGATGGCCTATCCTCGGAATGATGTTGGA
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AAAGATACCCTTTCTCGGTTGGATCATTCAGCAACCTTATATAAGATCGTTCTTTGACAA
GTACCGGGGCAAGCGTGTGCCCGTCTAGTCACCGCCCAAGTTGAGAGAAAATTCACTGAG
CTAGATGCAGCAGAGCAAACGATTAAAATATTTTGGAAGGAGAGGTTGGTATACTTGTCC
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A*GTTCTTTTTTAATTTTTGATTG

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR4A613JQ 727 0 0
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CTTTTTGGGAGTTGTCTTTGTCTTTGATAAGGGTTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTT
CATCTCTGGGGTTAGTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCG
TCAAAACTATAAGGGAACAATCTCTTTTGGTGCTGGCTTCTTCTTTGTTGTCATTGGATG
GCCTATCCTCGGAATGATGTTGGAGACCTATGGTTTTTTTGTACTCTTCAGCGGCTTCTG
GCCAACCTTGGCAGTTTTCGCACAAAAGATACCCTTTCTCGGTTGGATCATTCAGCAACC
TTATATAAGATCGTTCTTTGACAAGTACCGGGGCAAGCGTGTGCCCGTCTAGTCACCGCC
CAAGTTGAGAGAAAATTCACTGAGCTAGATGCAGCAGAGCAAACGATTAAAATATTTTGG
AAGGAGAGGTTGGTATACTTGTCCACAACTTTGGTATAAACGTAAACCCGTAGGAGAAAG
AAAATAGCGTGGAGCAACTTGAAGATTTGTACTTTTAAAAGACTAACTCAGTGACTTAAT
GATGGATTATAATCGTTTTGGTTCAAGTTCTTTTTTAATTTTTGATTGCATACATATAAC
AAAATTG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL8747Contig1 541 2 1 U
TGGCTTGTTCGATCACATTCTTCTCCTGCCTCTTCCTCTCTCTGCTATCCCTCTCCACCG
CTTTCAATCTCAACCGTCCATCTCTCGACGCCGGCGTCGACGTCCACGATCTCCTCCCTC
GCTACGGATTCCCGAAAGGTCTTCTTCCGGATAACGTCAAATGTACACTCTCTCCGACGG
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TTTCTACGACAAGAAGATCGCCGGGAAGCTCAGCGTCGGATCCGTGAAAGACGTGGAAGG
AATCAAAGCTAAAGAACTCTTCATCTGGGCATCGATCACGGCGATGAAATCTGATCCGAG
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CGTCAATGTTCCCTCTTGCTCCAAAACACTTAGTCTTGAAGCTTAATAACCTCAATGTGT
AAAAATCATCCCTTATGTGTGTTACAAATCAAAGAAAACAAAATGTCAATAATGATTTGG
T


BQ
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20 

AF RR4BR38JQ C 1
AF RR4BR38TF U 1
BS 1 541 RR4BR38TF

RD RR4BR38JQ 541 0 0
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T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR4BR38TF 541 0 0
TGGCTTGTTCGATCACATTCTTCTCCTGCCTCTTCCTCTCTCTGCTATCCCTCTCCACCG
CTTTCAATCTCAACCGTCCATCTCTCGACGCCGGCGTCGACGTCCACGATCTCCTCCCTC
GCTACGGATTCCCGAAAGGTCTTCTTCCGGATAACGTCAAATGTACACTCTCTCCGACGG
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TTTCTACGACAAGAAGATCGCCGGGAAGCTCAGCGTCGGATCCGTGAAAGACGTGGAAGG
AATCAAAGCTAAAGAACTCTTCATCTGGGCATCGATCACGGCGATGAAATCTGATCCGAG
CTCTGGAGATATTGTCTTCTCCGTCGGATTCGTGTCCAAGTCTTTGCCCGCGTCTATGTT
CGTCAATGTTCCCTCTTGCTCCAAAACACTTAGTCTTGAAGCTTAATAACCTCAATGTGT
AAAAATCATCCCTTATGTGTGTTACAAATCAAAGAAAACAAAATGTCAATAATGATTTGG
T

QA 1 541 1 541
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8749Contig1 905 2 6 U
GCATCTATTCTTTAGCCCTATAACTATATAGTATACACATATAAACCTTTATAATAAGAT
TATATTATAGATTTTACAAAGCCCTAACTTGGGTCCTGCGTCTTTATTTGAACTAGTATT
TTTCTGTGTGTTTTTGGTATATTAAATATGAATAAAACTGGACTGGGATCTTCGACAAGC
AACTCGTCTGTTTCGACGATCGGTTTACAAAACTCCTGTTCGGAATCTGATCTCCGACAA
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ATCGAGGCGGAGAACTCCATTCTCAGAGCTCAGCTCCTGGAGCTCAGCCACCGCCTTGAT
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TTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4DB96TF U 1
AF RR4DB96JQ C 236
BS 1 745 RR4DB96TF
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TATATTATAGATTTTACAAAGCCCTAACTTGGGTCCTGCGTCTTTATTTGAACTAGTATT
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AACTCGTCTGTTTCGACGATCGGTTTACAAAACTCCTGTTCGGAATCTGATCTCCGACAA
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A

QA 1 781 1 781
DS 

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TCACTATCGAGGCGGAGAACTCCATTCTCAGAGCTCAGCTCCTGGAGCTCAGCCACCGCC
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TTCAGGGAGGAGAACTAATTGACTACGGTGGCCCCAGCGGCGGAGGTGGATTTTACGACG
GGCTGATGAACACTCTCAATCTAGGGTTTTATAACCAACCAATCATGGCTTCTGCTTCTA
CTGCTGGTGATGTTTTCAACTGTTGACATCATCGTGAGTGTGACGAATATGAATGACATC
AAGGGTAATCATGTAACTCTATATTATATAAGTGATGTTATGTTTTTTTAGTTTGTAAGA
TAAAAAGTTAATTAACGCTTAATAAGTGTTTAAAAATGCGATATCATGAAGATGATGATG
TGTTGCTGTAAGTGGGAAATATTTTAAGTTTTTATATATATATATCAAAACGGAGAAATA
TCATTTTGCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8751Contig1 667 2 2 U
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GGATTGGCTGATAGTTTACACAGATGCTGAGGATGATATGATGCTTGTTGGTGACGATCC
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TTACACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ35TF U 1
AF RR4GQ35JQ C 72
BS 1 607 RR4GQ35TF
BS 608 667 RR4GQ35JQ

RD RR4GQ35TF 607 0 0
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CTGCAGGCTTTTTGGCATTGCACTGGTCAACAACGTGAATGGGACAGATTCACCGAGAAA
CAATTTCAATGATACTGCGGGGCTTTCGCAGATAGCATCTCCAAGGGTTCAGGATCTTTC
TGATCAGTCAAAATCGACAACTGATCATCGTGAGCAGGGAAGACCATTCCAGGTTAAGAA
TCACCATCCGAAGGACGTTCATACTAAATCAAACTCAAGTAGGAGTTGTACAAAGGTTCA
CAAGCAGGGGATTGCACTCGGCCGGTCTGTGGATCTCTCAAAGTTCCAGAACTACGAGGA
GTTGATAGCTGAACTGGATAGTATGTTTGAGTTCAACGGAGAGTTGATGGCTCCTAAAAA
GGATTGGCTGATAGTTTACACAGATGCTGAGGATGATATGATGCTTGTTGGTGACGATCC
CTGGCAGGAGTTTTGTGGGATGGTTCGAAAGATCTCCATATACACGAAAGAGGAAGTGAG
GAAGATGAACCCGGGAACTCTAAGCTGTAGGAGCGAGGAAGAAGCAGTTGTTGGGGAAGG
ATCAGAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4GQ35JQ 596 0 0
TTGGCATTGCACTGGTCAACAACGTGAATGGGACAGATTCACCGAGAAACAATTTCAATG
ATACTGCGGGGCTTTCGCAGATAGCATCTCCAAGGGTTCAGGATCTTTCTGATCAGTCAA
AATCGACAACTGATCATCGTGAGCAGGGAAGACCATTCCAGGTTAAGAATCACCATCCGA
AGGACGTTCATACTAAATCAAACTCAAGTAGGAGTTGTACAAAGGTTCACAAGCAGGGGA
TTGCACTCGGCCGGTCTGTGGATCTCTCAAAGTTCCAGAACTACGAGGAGTTGATAGCTG
AACTGGATAGTATGTTTGAGTTCAACGGAGAGTTGATGGCTCCTAAAAAGGATTGGCTGA
TAGTTTACACAGATGCTGAGGATGATATGATGCTTGTTGGTGACGATCCCTGGCAGGAGT
TTTGTGGGATGGTTCGAAAGATCTCCATATACACGAAAGAGGAAGTGAGGAAGATGAACC
CGGGAACTCTAAGCTGTAGGAGCGAGGAAGAAGCAGTTGTTGGGGAAGGATCAGATCCAA
AGGACGCCAAGTCTGCTTCGAATCCTTCACTGTCCAGCGCCTGAAACTCTTACACC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL8752Contig1 847 2 2 U
GGATATTCTCTTTTCCGAGAATCTCGGGAGTATTTTCGTTGTGATATTCTCACTTTTCGT
GATTCAGATTCGTTCGTTAGGAAACCAGATCGACATGGCAGCTTCAGGAGATTCGTATGA
GGAGGCGTTGGCTGCTTTGTCTTCTCTGATAACGAAGAGAAGTCGTGCTGATAAGAGAAA
CAAAGGGGATCGCTTCGAGCTTGTCTTTGATTATCTTAAGATACTTGACCTGGAAGAAGA
CATGTTAAAGATGAAAGTTATTCATGTCGCTGGAACCAAAGGCAAGGGATCCACATGTGC
CTTTACTGAGTCTATTTTACGAAGCTATGGCTTCCGAACTGGACTCTTCACTTCACCTCA
CCTCATTGATGTCCGTGAAAGGTTTCGCTTGGATGGTAAGGACATTAGCGAGGAGAAATT
TTTGTGTTATTTCTGGTGGTGCTATAACAGGCTTAAGGAGAGGACTAACGAGGAGATACC
AATGCCTACATATTTCCGCTTCCTTGCATTGCTAGCTTTTAAAATATTTGCTGCAGAAGA
GGTAGATGCTGCTATATTGGAGGTTGGATTAGGGTGGGAAGTTTGATGCCACCAATGCGG
TTCAGAAACCTGTGGTGTGTGGTATTTCTTCACTTGGATATGACCACATGGAAATTCTAG
GTGACACACTTGGCAAAATTGCTGGTGAGAAGGCTGGAATTTTCAAGCCTGGAGTTCCAG
CTTTCACCGTACCTCAACCTGATGAAGCCATGCGTGTCCTTGAAGAGAAAGCTTCTGAAT
TAAATGTACGCCTAATTTTAATAACTGTACATTAAATTTGGCAGAATTAATTTAACATTT
AAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DV70TF U 1
AF RR4DV70JQ C 4
BS 1 689 RR4DV70TF
BS 690 847 RR4DV70JQ

RD RR4DV70TF 689 0 0
GGATATTCTCTTTTCCGAGAATCTCGGGAGTATTTTCGTTGTGATATTCTCACTTTTCGT
GATTCAGATTCGTTCGTTAGGAAACCAGATCGACATGGCAGCTTCAGGAGATTCGTATGA
GGAGGCGTTGGCTGCTTTGTCTTCTCTGATAACGAAGAGAAGTCGTGCTGATAAGAGAAA
CAAAGGGGATCGCTTCGAGCTTGTCTTTGATTATCTTAAGATACTTGACCTGGAAGAAGA
CATGTTAAAGATGAAAGTTATTCATGTCGCTGGAACCAAAGGCAAGGGATCCACATGTGC
CTTTACTGAGTCTATTTTACGAAGCTATGGCTTCCGAACTGGACTCTTCACTTCACCTCA
CCTCATTGATGTCCGTGAAAGGTTTCGCTTGGATGGTAAGGACATTAGCGAGGAGAAATT
TTTGTGTTATTTCTGGTGGTGCTATAACAGGCTTAAGGAGAGGACTAACGAGGAGATACC
AATGCCTACATATTTCCGCTTCCTTGCATTGCTAGCTTTTAAAATATTTGCTGCAGAAGA
GGTAGATGCTGCTATATTGGAGGTTGGATTAGGGTGGGAAGTTTGATGCCACCAATGCGG
TTCAGAAACCTGTGGTGTGTGGTATTTCTTCACTTGGATATGACCACATGGAAATTCTAG
GTGACACACTTGGCAAAATTGCTGGTGAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4DV70JQ 844 0 0
GATATCTC
TTTCCGAGAATCTCGGGAGTATTTTCGTTGTGATAT*CTCACTTTTCGTGATTCAGATTC
GTTCGTTAGGAAACCAGATCGACATGGCAGCTTCAGGAGATTCGTATGAGGAGGCGTTGG
CTGCTTTGTCTTCTCTGATAACGAAGAGAAGTCGTGCTGATAAGAGAAACAAAGGGGATC
GCTTCGAGCTTGTCTTTGATTATCTTAAGATACTTGACCTGGAAGAAGACATGTTAAAGA
TGAAAGTTATTCATGTCGCTGGAACCAAAGGCAAGGGATCCACATGTGCCTTTACTGAGT
CTATTTTACGAAGCTATGGCTTCCGAACTGGACTCTTCACTTCACCTCACCTCATTGATG
TCCGTGAAAGGTTTCGCTTGGATGGTAAGGACATTAGCGAGGAGAAATTTTTGTGTTATT
TCTGGTGGTGCTATAACAGGCTTAAGGAGAGGACTAACGAGGAGATACCAATGCCTACAT
ATTTCCGCTTCCTTGCATTGCTAGCTTTTAAAATATTTGCTGCAGAAGAGGTAGATGCTG
CTATATTGGAGGTTGGATTAGG*TGGGAAGTTTGATGCCACCAATGCGGTTCAGAAACCT
GTGGTGTGTGGTATTTCTTCACTTGGATATGACCACATGGAAATTCTAGGTGACACACTT
GGCAAAATTGCTGGTGAGAAGGCTGGAATTTTCAAGCCTGGAGTTCCAGCTTTCACCGTA
CCTCAACCTGATGAAGCCATGCGTGTCCTTGAAGAGAAAGCTTCTGAATTAAATGTACGC
CTAATTTTAATAACTGTACATTAAATTTGGCAGAATTAATTTAACATTTAAACCCC

QA 9 844 9 844
DS 



AS 1 2

CO CL8753Contig1 862 2 2 U
TCAACGGTAGTATTCTTCAACAAATGCAGATACCCAGTGTGGCCAGGGATCCAGCCCAGC
GCCGGCCAAAACATACTCGCCGACGGTGGATTTAAGCTACCGTCTAACAAAGCCTACACC
CTTCAGCTCCCACCGCTTTGGTCCGGCCGCTTCTGGGGTCGTCACGGCTGCACATTCGAC
AGATCTGGCCGTGGTCGCTGCGCCACCGGTGATTGCGGCGGTTCTCTCAACTGCAACGGA
TCCGGCGGTTCACCTCCGGCCACTCTGGCGGAAATCACTCTAGGCCAACAGCTTGACTTC
TATGACGTCAGCCTCGTCGACGGTTATAACCTCGCGATGTCGATAATGCCGGTGAAAGGT
GGAGGTCAGTGTAGCTACGCCGGTTGTGTAAGCGATCTAAACCGGATGTGCCCGGTTGGG
TTACAAGTCCGGTCACGCAACGGGAAACGGGTGTTAGCCTGTAAAAGCGCTTGCTCTGCC
TTCAATTCACCGCAGTACTGTTGTACCGGCACGTTCGGTAACCCACTCACCTGCAAGCCA
ACGTCTTATTCCAGAATCTTCAAGGTCGCTTGCCCTAAAGCTTACTCTTATGCTTACGAC
GACCCAACCAGCATCGCAACTTGTTCCAAGGCTAACTACATTGTCACCTTTTGCCCTCAC
CATCGCCGTTAAGATCACAATTGTTAAGAGTTAAGCATTTCTCTATTAGCATGTGTTATG
TAGTTCTGAATCTTTGGAGTTTATTATGTCTCTACAATTGTAACACTCATGAAATGCAAA
ATCCTATAACAAGATCAGTATCAAACTAATAATGCATTTGTTCTTGATTGGATCAACTCT
TCTTAAATAATAACAGTTTTCC


BQ
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AF RR4DG60TF U 1
AF RR4DG60JQ C 151
BS 1 686 RR4DG60TF
BS 687 862 RR4DG60JQ

RD RR4DG60TF 686 0 0
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GCCGGCCAAAACATACTCGCCGACGGTGGATTTAAGCTACCGTCTAACAAAGCCTACACC
CTTCAGCTCCCACCGCTTTGGTCCGGCCGCTTCTGGGGTCGTCACGGCTGCACATTCGAC
AGATCTGGCCGTGGTCGCTGCGCCACCGGTGATTGCGGCGGTTCTCTCAACTGCAACGGA
TCCGGCGGTTCACCTCCGGCCACTCTGGCGGAAATCACTCTAGGCCAACAGCTTGACTTC
TATGACGTCAGCCTCGTCGACGGTTATAACCTCGCGATGTCGATAATGCCGGTGAAAGGT
GGAGGTCAGTGTAGCTACGCCGGTTGTGTAAGCGATCTAAACCGGATGTGCCCGGTTGGG
TTACAAGTCCGGTCACGCAACGGGAAACGGGTGTTAGCCTGTAAAAGCGCTTGCTCTGCC
TTCAATTCACCGCAGTACTGTTGTACCGGCACGTTCGGTAACCCACTCACCTGCAAGCCA
ACGTCTTATTCCAGAATCTTCAAGGTCGCTTGCCCTAAAGCTTACTCTTATGCTTACGAC
GACCCAACCAGCATCGCAACTTGTTCCAAGGCTAACTACATTGTCACCTTTTGCCCTCAC
CATCGCCGTTAAGATCACAATTGTTA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DG60JQ 712 0 0
TTCTGGGGTCGTCACGGCTGCACATTCGACAGATCTGGCCGTGGTCGCTGCGCCACCGGT
GATTGCGGCGGTTCTCTCAACTGCAACGGATCCGGCGGTTCACCTCCGGCCACTCTGGCG
GAAATCACTCTAGGCCAACAGCTTGACTTCTATGACGTCAGCCTCGTCGACGGTTATAAC
CTCGCGATGTCGATAATGCCGGTGAAAGGTGGAGGTCAGTGTAGCTACGCCGGTTGTGTA
AGCGATCTAAACCGGATGTGCCCGGTTGGGTTACAAGTCCGGTCACGCAACGGGAAACGG
GTGTTAGCCTGTAAAAGCGCTTGCTCTGCCTTCAATTCACCGCAGTACTGTTGTACCGGC
ACGTTCGGTAACCCACTCACCTGCAAGCCAACGTCTTATTCCAGAATCTTCAAGGTCGCT
TGCCCTAAAGCTTACTCTTATGCTTACGACGACCCAACCAGCATCGCAACTTGTTCCAAG
GCTAACTACATTGTCACCTTTTGCCCTCACCATCGCCGTTAAGATCACAATTGTTAAGAG
TTAAGCATTTCTCTATTAGCATGTGTTATGTAGTTCTGAATCTTTGGAGTTTATTATGTC
TCTACAATTGTAACACTCATGAAATGCAAAATCCTATAACAAGATCAGTATCAAACTAAT
AATGCATTTGTTCTTGATTGGATCAACTCTTCTTAAATAATAACAGTTTTCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL8754Contig1 503 2 1 U
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CTCGCTGGTGAGCACATTGGATCGTGGATTGTTTCTTGTCAATGGAAGGGGGAGTGGTGA
GCCATAGGGTGTGTGTAGCTTGAGGGAGGTTTGGAGGAGCGTTATTCAAGGGCAATGGCG
AAAATTCTTCTGGTGGTGGCTGGTTATGTGAATAGTTTTGTTACGACTAACTCAGCTTTT
TCATAACTCTTTCGATTAGCCATCTACCATGAGTTATTCCACTTGTAGTCATTCGTCAGT
GAGTCGTAGTTTGGATCTCTTTGGTGGCTGATGCAATGGTGTATTTTGTTTTCAACTCTC
CGAATTTATGTTGAGTTCTGTTGTTATGGTAGTCTCGGCGGGGGTTGTATGGTTGTTGAC
GGTAATTTACTTGTGTGGCTAGATTCCCATGGTTTTTTTTGTAGTCTGTTGTGAGTTAGT
TGCAATAAGATTTTTATTCTCTG


BQ
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AF RR4F488TF U 1
AF RR4FB75TF U 1
BS 1 503 RR4F488TF

RD RR4F488TF 503 0 0
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CTCGCTGGTGAGCACATTGGATCGTGGATTGTTTCTTGTCAATGGAAGGGGGAGTGGTGA
GCCATAGGGTGTGTGTAGCTTGAGGGAGGTTTGGAGGAGCGTTATTCAAGGGCAATGGCG
AAAATTCTTCTGGTGGTGGCTGGTTATGTGAATAGTTTTGTTACGACTAACTCAGCTTTT
TCATAACTCTTTCGATTAGCCATCTACCATGAGTTATTCCACTTGTAGTCATTCGTCAGT
GAGTCGTAGTTTGGATCTCTTTGGTGGCTGATGCAATGGTGTATTTTGTTTTCAACTCTC
CGAATTTATGTTGAGTTCTGTTGTTATGGTAGTCTCGGCGGGGGTTGTATGGTTGTTGAC
GGTAATTTACTTGTGTGGCTAGATTCCCATGGTTTTTTTTGTAGTCTGTTGTGAGTTAGT
TGCAATAAGATTTTTATTCTCTG

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR4FB75TF 503 0 0
GGATGTCCAATCAATTGAAGATAAGCTCCAATGCATTTTCTTAAAAGCGAATATTCTTCT
CTCGCTGGTGAGCACATTGGATCGTGGATTGTTTCTTGTCAATGGAAGGGGGAGTGGTGA
GCCATAGGGTGTGTGTAGCTTGAGGGAGGTTTGGAGGAGCGTTATTCAAGGGCAATGGCG
AAAATTCTTCTGGTGGTGGCTGGTTATGTGAATAGTTTTGTTACGACTAACTCAGCTTTT
TCATAACTCTTTCGATTAGCCATCTACCATGAGTTATTCCACTTGTAGTCATTCGTCAGT
GAGTCGTAGTTTGGATCTCTTTGGTGGCTGATGCAATGGTGTATTTTGTTTTCAACTCTC
CGAATTTATGTTGAGTTCTGTTGTTATGGTAGTCTCGGCGGGGGTTGTATGGTTGTTGAC
GGTAATTTACTTGTGTGGCTAGATTCCCATGGTTTTTTTTGTAGTCTGTTGTGAGTTAGT
TGCAATAAGATTTTTATTCTCTG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8756Contig1 1039 2 4 U
GTGCAGACCTCGCATCTTCCAACATGACGTTGCTTAAAGCCTCTGGCGATTTCCAAAACG
CTACACCTGAAGGAAGGAACCTCAGGTTTGGTGTTAGGGAACACGGTATGGGAGCTATCT
GCAACGGCATTGCCCTTCACAGTCCTGGTTTCATCCCTTACTGCGCAACGTTCTTTGTGT
TTACTGACTACATGAGAGCTGCGATGAGAATCTCTGCTCTGTCTGAAGCTGGTGTTATAT
ACGTCATGACACATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGACGGACCGACTCACCAACCTATCG
AACACTTGTCCAGTTTCCGCGCCATGCCTAATATCATGATGTTCCGTCCTGCTGACGGGA
ACGAAACAGCCGGTGCATACAAAATCGCTGTCACCAGACGGAACACACCTTCGGTTTTAG
CCTTGTCTAGACAAAAGCTGCCTCAACTTCCAGGAACGTCTATTGAAAACGTCGAGAGAG
GTGGATACACCGTTTCTGATAACTCTAACGGTAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGGA
CTGGTTCGGAGCTAGAGATTGCTGCTCAAGCTGGAGAGGAGTTGAGGAAAGAAGGGAAGA
CTGTGAGAGTCGTTTCTTTTGTGTGTTGGGAACTGTTTGATGAGCAAACGGATGAATACA
AGGAAAGTGTGTTGCCATCAGATGTGTCAGCTAGAGTTAGTATTGAAGCTGGAACGACAT
TTGGATGGGGGAAGATTGTTGGAGGGAAAGGGAAATCGATTGGAGTTGATTCGTTTGGGG
CAAGTGCACCAGCAGGGAAGCTTTATAAAGAGTTTGGTATCACCGTTGAAGCTGTGGTTG
CAGCAGCTAAGTCACTTATCTAAAGAGTACCTTCAGGTGAGGGTTTGGTTTTGAAGTGAG
AGATGTTCTTCCTTAAACATTTGTCTTCTTTGTCCAAGTAGTAAAATGTAAAGAAGACGG
AAAATAAAATAAAAAATTGTCTCATAAGTTAAGTTGTAACTGAAACCATAAACACAAATA
TTAATACATTATGTTCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CZ57TF U 1
AF RR4CZ57JQ C 177
BS 1 559 RR4CZ57TF
BS 560 560 RR4CZ57JQ
BS 561 577 RR4CZ57TF
BS 578 1039 RR4CZ57JQ

RD RR4CZ57TF 577 0 0
GTGCAGACCTCGCATCTTCCAACATGACGTTGCTTAAAGCCTCTGGCGATTTCCAAAACG
CTACACCTGAAGGAAGGAACCTCAGGTTTGGTGTTAGGGAACACGGTATGGGAGCTATCT
GCAACGGCATTGCCCTTCACAGTCCTGGTTTCATCCCTTACTGCGCAACGTTCTTTGTGT
TTACTGACTACATGAGAGCTGCGATGAGAATCTCTGCTCTGTCTGAAGCTGGTGTTATAT
ACGTCATGACACATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGACGGACCGACTCACCAACCTATCG
AACACTTGTCCAGTTTCCGCGCCATGCCTAATATCATGATGTTCCGTCCTGCTGACGGGA
ACGAAACAGCCGGTGCATACAAAATCGCTGTCACCAGACGGAACACACCTTCGGTTTTAG
CCTTGTCTAGACAAAAGCTGCCTCAACTTCCAGGAACGTCTATTGAAAACGTCGAGAGAG
GTGGATACACCGTTTCTGATAACTCTAACGGTAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGGA
CTGGTTCGGAGCTAGAGAT*GCTGCTCAAGCTGGAGA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4CZ57JQ 863 0 0
TGTG
TTACTGACTACATGAGAGCTGCGATGAGAATCTCTGCTCTGTCTGAAGCTGGTGTTATAT
ACGTCATGACACATGACTCCATTGGTCTTG*AGAAGACGGACCGACTCACCAACCTATCG
AACACTTGTCCAGTTTCCGCGCCATGCCTAATATCATGATGTTCCGTCCTGCTGACGGGA
ACGAAACAGCCGGTGCATACAAAATCGCTGTCACCAGACGGAACACACCTTCGGTTTTAG
CCTTGTCTAGACAAAAGCTGCCTCAACTTCCAGGAACGTCTATTGAAAACGTCGAGAGAG
GTGGATACACCGTTTCTGATAACTCTAACGGTAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGGA
CTGGTTCGGAGCTAGAGATTGCTGCTCAAGCTGGAGAGGAGTTGAGGAAAGAAGGGAAGA
CTGTGAGAGTCGTTTCTTTTGTGTGTTGGGAACTGTTTGATGAGCAAACGGATGAATACA
AGGAAAGTGTGTTGCCATCAGATGTGTCAGCTAGAGTTAGTATTGAAGCTGGAACGACAT
TTGGATGGGGGAAGATTGTTGGAGGGAAAGGGAAATCGATTGGAGTTGATTCGTTTGGGG
CAAGTGCACCAGCAGGGAAGCTTTATAAAGAGTTTGGTATCACCGTTGAAGCTGTGGTTG
CAGCAGCTAAGTCACTTATCTAAAGAGTACCTTCAGGTGAGGGTTTGGTTTTGAAGTGAG
AGATGTTCTTCCTTAAACATTTGTCTTCTTTGTCCAAGTAGTAAAATGTAAAGAAGACGG
AAAATAAAATAAAAAATTGTCTCATAAGTTAAGTTGTAACTGAAACCATAAACACAAATA
TTAATACATTATGTTCGAG

QA 5 863 5 863
DS 



AS 1 2

CO CL8757Contig1 770 2 2 U
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TCCGTGCGCTCTTCCTCTCGTGTTCGATCTCTCTTGCGAAATTGCTAATTTCATCATCTC
TTCTTCAAATGTTTATAACATAATCTGAGATGGCATCAATCCGGCGAACTCTCTCGCCGG
TGTACCACGACCGTCCGTACGAAAACGGAGGCGCAACGTTCTCCCCTTCCTCCACATCAT
CCCCCTCCTCTCAGAAGAGCAACAGCAAACACAACTCCTCCTCCGATCCCATCAAAACCT
CCCGCAGAGGTCCATGGCGGCGGCCGTTTTACCAATTCCTCGCTTTCTTCCTCATCGGAT
TCCTATTAGGTATGACACCTTACGGTCAAATCGAAGACGCGAACCGTAGTACCGATCGGT
TCAGCTTCGAGATCAAACCTCCAAACGTCGAAGAAGATCGAACCAGGGTAGCCGTAGACG
GAGTAAGCTTCTCGTCGGAAACGACGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGAGGAGATCGATT
TCGTGCCGAGGAAGCTTGTGATCGTGGTGACGCCGACGTACAATCGAGCGATGCAGGCGT
ATTACTTGAACAGAGTTTCTCAGACGCTGAGGCTGGTGGAGCCTCCCGTGCTGTGGATAG
TGGTGGAAGGGAACGCGGCGTCGTTCGAGACGTCGGAGATTCTGAGGAAGACTGGGGTGA
TGTATAGGCACTTGGTTTGCAAGAGGAACACCACGACGAGTGTCAAGGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A386TF U 1
AF RR4A386TFB U 1
BS 1 693 RR4A386TF
BS 694 770 RR4A386TFB

RD RR4A386TF 693 0 0
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TCCGTGCGCTCTTCCTCTCGTGTTCGATCTCTCTTGCGAAATTGCTAATTTCATCATCTC
TTCTTCAAATGTTTATAACATAATCTGAGATGGCATCAATCCGGCGAACTCTCTCGCCGG
TGTACCACGACCGTCCGTACGAAAACGGAGGCGCAACGTTCTCCCCTTCCTCCACATCAT
CCCCCTCCTCTCAGAAGAGCAACAGCAAACACAACTCCTCCTCCGATCCCATCAAAACCT
CCCGCAGAGGTCCATGGCGGCGGCCGTTTTACCAATTCCTCGCTTTCTTCCTCATCGGAT
TCCTATTAGGTATGACACCTTACGGTCAAATCGAAGACGCGAACCGTAGTACCGATCGGT
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QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4A386TFB 770 0 0
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TTCTTCAAATGTTTATAACATAATCTGAGATGGCATCAATCCGGCGAACTCTCTCGCCGG
TGTACCACGACCGTCCGTACGAAAACGGAGGCGCAACGTTCTCCCCTTCCTCCACATCAT
CCCCCTCCTCTCAGAAGAGCAACAGCAAACACAACTCCTCCTCCGATCCCATCAAAACCT
CCCGCAGAGGTCCATGGCGGCGGCCGTTTTACCAATTCCTCGCTTTCTTCCTCATCGGAT
TCCTATTAGGTATGACACCTTACGGTCAAATCGAAGACGCGAACCGTAGTACCGATCGGT
TCAGCTTCGAGATCAAACCTCCAAACGTCGAAGAAGATCGAACCAGGGTAGCCGTAGACG
GAGTAAGCTTCTCGTCGGAAACGACGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGAGGAGATCGATT
TCGTGCCGAGGAAGCTTGTGATCGTGGTGACGCCGACGTACAATCGAGCGATGCAGGCGT
ATTACTTGAACAGAGTTTCTCAGACGCTGAGGCTGGTGGAGCCTCCCGTGCTGTGGATAG
TGGTGGAAGGGAACGCGGCGTCGTTCGAGACGTCGGAGATTCTGAGGAAGACTGGGGTGA
TGTATAGGCACTTGGTTTGCAAGAGGAACACCACGACGAGTGTCAAGGAC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGACACATCACACTATCCCTCAAACAAACAACACATATAAAAACTCCCTTCTTCTACTAT
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AGGTTTCAAATCCAAGAAAGAGTACTTATTCGGAAGAATCGACATGCAGCTCAAGCTCGT
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ATTCGCTAATGGTGAATCACAAGTGGCTAACGAGCTTAATGCTTATGGGAGAAGAAGATT
GAGATGGGTTCAAAAGTATTTCATGATTTATGATTATTGCTCTGATGTTAAAAGGTTTCC
TCAAGGATTCCCACCGGAGTGTAGGAGGTCTAGAGTCTAGAGTCTAACAAACAATTATTC
CTATCTATCTTGTTGTTTAGTGCAAATTCTCTTTGTTGTTGCTCTCTTTTTTTTTAATAA
ATTGATTTTCTTCATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GW47TF U 1
AF RR4GW47JQ C 368
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BS 676 676 RR4GW47JQ
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RD RR4GW47TF 776 0 0
GGACACATCACACTATCCCTCAAACAAACAACACATATAAAAACTCCCTTCTTCTACTAT
TTTTGAAATAAACCCCTTAACTTTCAATTCTATCATCTAGCCCCCCCCCCCTCTCCTACT
CTAAATGGGTCAGTTCTTGAACCTCGCCGTGTTGGCGACCGTTCTTGTTCTAACAATGGT
TGGAACTGCTTACTCTGGAAGCTTCAACGAAGAGTTCGACTTGACATGGGGTGAACACAG
AGGCAAAATCTTCAGCGGAGGGAAAATGCTCTCACTGTCACTAGACCGGGTTTCCGGGAC
AGGTTTCAAATCCAAGAAAGAGTACTTATTCGGAAGAATCGACATGCAGCTCAAGCTCGT
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CGACGAGATAGACTTTGAGTTTCTTGGTAACGAGACAGGGAAGCCTTATGTTCTTCACAC
TAATGTCTTTGCACAAGGAAAAGGAAACAGAGAGCAACAGTTTTACCTCTGGTTCGACCC
AACCAAGAACTTCCACACTTACTCTCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTTATTGT
AGATAATGTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGTGTTCCGTTTCCCAA
GAAGCAACCAATGAG*ATCTACTCGAGCCTATGGAATGCTGATGACTGGGCCACGAGAG*
TGGTTTGGTCA*GACAGAT*GGTCTAAAGCTCCTTTCACTGCTTACTACAGAG
CTT

QA 1 773 1 773
DS 

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ATAGACTTTGAGTTTCTTGGTAACGAGACAGGGAAGCCTTATGTTCTTCACACTAATGTC
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AACTTCCACACTTACTCTCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTTATTGTAGATAAT
GTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGTGTTCCGTTTCCCAAGAAGCAA
CCAATGAGGATCTACTCGAGCCTATGGAATGCTGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGTTTG
GTCAAGACAGATTGGTCTAAAGCTCCTTTCACTGCTTACTACAGAGGCTTCAACGCTGCG
GCTTGTACCGTTTCGTCAGGGTCCTCTTACTGTGATCCTAAGTTCAGGAGCACATTCGCT
AATGGTGAATCACAAGTGGCTAACGAGCTTAATGCTTATGGGAGAAGAAGATTGAGATGG
GTTCAAAAGTATTTCATGATTTATGATTATTGCTCTGATGTTAAAAGGTTTCCTCAAGGA
TTCCCACCGGAGTGTAGGAGGTCTAGAGTCTAGAGTCTAACAAACAATTATTCCTATCTA
TCTTGTTGTTTAGTGCAAATTCTCTTTGTTGTTGCTCTCTTTTTTTTTAATAAATTGATT
TTCTTCATTGG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AA69JQ C 1
AF RR4AA69TF U 1
BS 1 388 RR4AA69TF

RD RR4AA69JQ 388 0 0
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AGAACCAGAATCCATGATCTTTGTTCTTCTCTGATTGTTTCCCGGGGAGGTATGATGAGG
ATTCGATCGATCATACCTGAGTATCTTGCGTTTGTTCGTTGTAAGTGGGTTTGTTTAGTG
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AATTACAGAGGATATAATCAAGTTAAGAATTTTTTTTTAATTTAGTTGTTGCAGTGAATG
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QA 1 388 1 388
DS 

RD RR4AA69TF 388 0 0
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AGAACCAGAATCCATGATCTTTGTTCTTCTCTGATTGTTTCCCGGGGAGGTATGATGAGG
ATTCGATCGATCATACCTGAGTATCTTGCGTTTGTTCGTTGTAAGTGGGTTTGTTTAGTG
GATTCATGATTTAGCCTTGTTCAAGTCTCGTAATTAGTTCTTGTTTATGTCCTAAGTTAT
AATTACAGAGGATATAATCAAGTTAAGAATTTTTTTTTAATTTAGTTGTTGCAGTGAATG
AAATCTGTTAAAAAAAAATTTTTAATGTCTTGATTCTTGTTCTGTTTGTAATGGAGTTTA
AAATGTTAAAAAGTTCGTGTTCTCGTTC

QA 1 388 1 388
DS 



AS 1 2

CO CL8761Contig1 788 2 4 U
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CTGATGTTGAGGTAGTTTTATATACAAACAAAGGAAAAAACAACAACAGAATACTACTTA
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CTTGTTCCTGAAACCTCTTTTCCTGCTAAACGCAGTTTCCACTGGCTGACCCGTCCTCAC
TGCTTCACGGATTGCTTCAACTAAGTCACGGTTAGCCTCAGTGTATAGACTTGTCACCGT
TCCGTATTGCCCAGCTCTAGCTGTTCGACCTATCCTATGAAGAAAATCCACCGCAAAACT
AGAAAAATCCGCCTGAATAACGTGTGAGACGTTAGGAACATCAACTCCACGTGCAGCTGC
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TTCAAGTGTATGATTCTTATGATAACGATAGCACTGGATACTAGCTTTCTCCAGTACATC
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GTTGTTGTTGTTGTTTACAGCCTATATGAGAGCATCGACTTGTGTGTCTACTGTGACTTC
AACCCATTTCTGCTTGAGTCTAGGACTGTTTCGGTGAAGAAAGCTTCCGCTAACCCAGAC
AGCATCTTGGGAACATATGTTTCAAAGTCCTCCAGCAGTTTTCTTCCCGTTGACTGGAAG
CGTGGCCG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GK14JQ U 1
AF RR4H130JQ U 1
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BS 625 746 RR4GK14JQ
BS 747 788 RR4H130JQ

RD RR4GK14JQ 750 0 0
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AGCTCGCACAGCTTGAGACTCCTTCGCTTCTCCTGCTTTCAAGAAAGCTCTCTTCTTTAG
CTTGTTCCTGAAACCTCTTTTCCTGCTAAACGCAGTTTCCACTGGCTGACCCGTCCTCAC
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AGAAAAATCCGCCTGAATAACGTGTGAGACGTTAGGAACATCAACTCCACGTGCAGCTGC
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GGCTACTGCTTCAACCGCCTCAACTGTATTAGCAAACACCATCGTCCTGTCTATGCTACT
GTTGTTGTTGTTGTTTACAGCCTCTATGAGAGCATCGACTTGTGTGTCTACTGTGACTTC
AACCCATTTCTGCTTGAGTCTAGGACTGTTTCGGTGAAGAAAGCTTCCGCTAACCCAGAC
AGCATCTTGGGAACATATGTTTCAAA
AGTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR4H130JQ 788 0 0
GG
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GATGTTGAGGTAGTTTTATATACAAACAAAGGAAAAAACAACAACAGAATACTACTTAAG
CTCGCACAGCTTGAGACTCCTTCGCTTCTCCTGCTTTCAAGAAAGCTCTCTTCTTTAGCT
TGTTCCTGAAACCTCTTTTCCTGCTAAACGCAGTTTCCACTGGCTGACCCGTCCTCACTG
CTTCACGGATTGCTTCAACTAAGTCACGGTTAGCCTCAGTGTATAGACTTGTCACCGTTC
CGTATTGCCCAGCTCTAGCTGTTCGACCTATCCTATGAAGAAAATCCACCGCAGAACTAG
AAAAATCCGCCTGAATAACGTGTGAGACGTTAGGAACATCAACTCCACGTGCAGCTGCGT
CAGTACAGACAAAGACACCACCGTTTTCTCTGAAGTCCGCTAATATATTAGCACGCTCTT
CAAGTGTATGGTTCTTATGATAACGATAGCACTGGATACTAGCTTTCTTCAGTACATCGG
CTACTGCTTCAACCGCCTCAACTGTATTAGCAAACACCATCGTCCTGTCTATGCTACTGT
TGTTGTTGTTGTTTACAGCCTATATGAGAGCATCGACTTGTGTGTCTACTGTGACTTCAA
CCCATTTCTGCTTGAGTCTAGGACTGTTTCGGTGAAGAAAGCTTCCGCTAACCCAGACAG
CATCTTGG*AACATATGTTTCAAAGTCCTCCAGCAGTTTTCTTCCCGTTGACTGGAAGCG
TGGCCG

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 2

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TCCTAATACGAGCTGCAACTTGGTATTATATTTCAGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTATAG
AAGCGAAGGGAATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTACTCAATCCTTTTGGAGGATAATC
CACTCGATCAAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACAGGGAAAACCTT
CCCTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCGT
GGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCT
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TTCTCTATACGATTGGTGGACTTGAAAATCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCAGCAA
CCATAGACTTAACAGGTGGTAAAAGCACAAGAGCCCTCCTCGGAATATGCTTGTGTGGAT
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AGCTTCAGTCTCTAGCTGCAACTGCATTGGAGAAAGAGTACAAGCAAAAGCTCCAGCCAA
ACTCACCTCCTCACGTCTGCGTTAGAAGCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FW06TF U 1
AF RR4GA18TF U 5
BS 1 680 RR4FW06TF
BS 681 681 RR4GA18TF
BS 682 750 RR4FW06TF

RD RR4FW06TF 750 0 0
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TGGTATGCATATCTGCGCTGATGAAAGTTGGGCTTCGCAAGGCGTCTAGTTTACCTTTGA
TCCTAATACGAGCTGCAACTTGGTATTATATTTCAGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTATAG
AAGCGAAGGGAATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTACTCAATCCTTTTGGAGGATAATC
CACTCGATCAAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACAGGGAAAACCTT
CCCTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCGT
GGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCT
ACGAGGAGCTCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATACGCTGATA
TTCTCTATACGATTGGTGGACTTGAAAATCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCAGCAA
CCATAGACTTAACAGGTGGTAAAAGCACAAGAGCCCTCCTCGGAATATGCTTGTGTGGAT
CAGCAATCGCACAGCTCTCAAGAGGCAGGAACAAAGAGGACAAGGACATGGCTGCACCAG
AGCTTCAGTCTCTAGCTGCA*CTGCATTGGAGAAAGAGTACAAGCAAAAGCTCCAGCCAA
ACTCACCTCCTCACGTCTGCGTTAGAAGCT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4GA18TF 734 0 0
TAAGCTTTGTTTATTCACTAGTCCTTACAGGTTTTTGACTATTTTGGAGTATTCTTTGGT
ATGCATATCTGCGCTGATGAAAGTTGGGCTTCGCAAGGCGTCTAGTTTACCTTTGATCCT
AATACGAGCTGCAACTTGGTATTATATTTCAGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTATAGAAGC
GAAGGGAATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTACTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACT
CGATCAAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACAGGGAAAACCTTCCCT
AGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCGTGGAG
AGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTACGA
GGAGCTCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATACGCTGATATTCT
CTATACGATTGGTGGACTTGAAAATCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCAGCAACCAT
AGACTTAACAGGTGGTAAAAGCACAAGAGCCCTCCTCGGAATATGCTTGTGTGGATCAGC
AATCGCACAGCTCTCAAGAGGCAGGAACAAAGAGGACAAGGACATGGCTGCACCAGAGCT
TCAGTCTCTAGCTGCAACTGCATTGGAGAAAGAGTACAAGCAAAAGCTCCAGCCAA*CTC
ACCTCCTCACGTCT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL8763Contig1 957 2 2 U
CAATACAAGAAACCTCAAATCCAATCCAAACAGAAACCAAATATCTTCGTTTGTCTGAAT
GGAGAGAAGTTCAATGAAAGCTGAGTACGATCTTGATCATCCTCATCAAAGCTTCTATGG
AGATTATTCAAAACCTTTGGTTCCCAAGAATAAGAACTCCCAGATCATTACCAAGATCAA
GCCTAAGATTCGTATCATCCATATATTTGCGCCGGAGATTATCAACACAGACGTCAAAAA
CTTCCGTACACTCGTCCAAAGTCTGACCGGAAAACCGGAGATCACCAAAACCACCAGTCC
TAAGGACAAGACAAATATTCCTGCGCCACCGCCTCCACCGCAAGAATCTAGCCATGAACA
TACGGGGGAGCTGGTCAACAATATTTTAGGGAGCCACGTAGTGAAGGACGAATGGGAATC
AGGTTCGAACACAAACACATACTTTGATTTAGATGGTTTGATTGATCTTGACGAAGACGA
CAACATATTCTCAAGTCGATGGTTTGATCTTCAAGTGCAATAAACTAAAGTAATCACACT
TTGCCCTAATATCTTGGGCTTCTGCTAAAATTGTAATGGTTCCTTTTGGTTCTGATGATT
TAATCATACGGTCGACTTGGGATGTAACAAGACATGGTTTGAGACATTGACCATCGTGAT
GCCCCACTTGAGACATATAGGTTGGGGTATGTACATGATTTATATAGATATCATGTACAC
TAATACACATGTTTGGATTGTTTTGGGTGCCCTTTGGCTGACTTTGCCAATAAAGAGTGT
GCAATGAAGAGTTTAACTTGGAGGACTGATTTTGCCATGAGAAGTAAGAGTTTGAGTTAT
GTAAAAACTCAACTTAAAATTGGTGTAACATGTTGTACTCACGCGTGCGTGTATTAATTA
TTTTGATGTATTTGTCATTGACTTTTTCGTTGCACAAGTTTATATATAAAAACGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BR36TF U 1
AF RR4BR36JQ C 290
BS 1 681 RR4BR36TF
BS 682 957 RR4BR36JQ

RD RR4BR36TF 681 0 0
CAATACAAGAAACCTCAAATCCAATCCAAACAGAAACCAAATATCTTCGTTTGTCTGAAT
GGAGAGAAGTTCAATGAAAGCTGAGTACGATCTTGATCATCCTCATCAAAGCTTCTATGG
AGATTATTCAAAACCTTTGGTTCCCAAGAATAAGAACTCCCAGATCATTACCAAGATCAA
GCCTAAGATTCGTATCATCCATATATTTGCGCCGGAGATTATCAACACAGACGTCAAAAA
CTTCCGTACACTCGTCCAAAGTCTGACCGGAAAACCGGAGATCACCAAAACCACCAGTCC
TAAGGACAAGACAAATATTCCTGCGCCACCGCCTCCACCGCAAGAATCTAGCCATGAACA
TACGGGGGAGCTGGTCAACAATATTTTAGGGAGCCACGTAGTGAAGGACGAATGGGAATC
AGGTTCGAACACAAACACATACTTTGATTTAGATGGTTTGATTGATCTTGACGAAGACGA
CAACATATTCTCAAGTCGATGGTTTGATCTTCAAGTGCAATAAACTAAAGTAATCACACT
TTGCCCTAATATCTTGGGCTTCTGCTAAAATTGTAATGGTTCCTTTTGGTTCTGATGATT
TAATCATACGGTCGACTTGGGATGTAACAAGACATGGTTTGAGACATTGACCATCGTGAT
GCCCCACTTGAGACATATAGG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4BR36JQ 668 0 0
ACCACCAGTCCTAAGGACAAGACAAATATTCCTGCGCCACCGCCTCCACCGCAAGAATCT
AGCCATGAACATACGGGGGAGCTGGTCAACAATATTTTAGGGAGCCACGTAGTGAAGGAC
GAATGGGAATCAGGTTCGAACACAAACACATACTTTGATTTAGATGGTTTGATTGATCTT
GACGAAGACGACAACATATTCTCAAGTCGATGGTTTGATCTTCAAGTGCAATAAACTAAA
GTAATCACACTTTGCCCTAATATCTTGGGCTTTTGCTAAAATTGTAATGGTTCCTTTTGG
TTCTGATGATTTAATCATACGGTCGACTTGGGATGTAACAAGACATGGTTTGAGACATTG
ACCATCGTGATGCCCCACTTGAGACATATAGGTTGGGGTATGTACATGATTTATATAGAT
ATCATGTACACTAATACACATGTTTGGATTGTTTTGGGTGCCCTTTGGCTGACTTTGCCA
ATAAAGAGTGTGCAATGAAGAGTTTAACTTGGAGGACTGATTTTGCCATGAGAAGTAAGA
GTTTGAGTTATGTAAAAACTCAACTTAAAATTGGTGTAACATGTTGTACTCACGCGTGCG
TGTATTAATTATTTTGATGTATTTGTCATTGACTTTTTCGTTGCACAAGTTTATATATAA
AAACGCGA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL8764Contig1 632 2 3 U
TAGCTCCCGGTTCAGCTAAACCAAACATCATCAATCTGAAGCAACAATCTTACGGAGCAA
TAACACAGCCCCAGTTCGTGTTGCGTTGTCAAGAAAGACGATCTCTTTCGATAAACTGCT
CAAGCAGTGGCAACAACAACGGCAGTGAAGAGAAGGTCTTTCAGCCGTTGGATGGAGCGG
AGATAAGATTCAAACGAGGGTCAAGAAGGAGAATGAGGGAAGGAGGTTCAGGAGAAGGGC
AAAACGGGAAGAAAGCAGAGAAAAGTGTTCAGAAGCCGTGGGAAGAGATGACGTTGAACG
AGGAAGCGTTGGAGCTTTATGTCGGAGAGAAAGGTTTGTTGTTTTGGCTGAACAAATTGG
CTTATGCTTCAATCTACATTGTGATTGGTGGTTGGATTCTTTTCCGGTTTGTTGGACCGG
CTCTGAATCTTTATCAGCTTGATACGCCTCCTCTTGATCCTAAAAACATTTTGAAGGGCT
AAACAAGCTTTTAGCTTTTCTGTGTTATAAAACATTTTGAAGGCTTATATTCTTGCCAGT
TTCGAGTAATGTGTACCCCAAATCAAACAAGGTTGTAATGACAGTAAAAGAACACTCTTT
TTGATTCTTTAAGATTGTGCTGGAGTTATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GS17JQ C 1
AF RR4GS17TF U 233
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BS 233 627 RR4GS17TF
BS 628 632 RR4GS17JQ

RD RR4GS17JQ 632 0 0
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TAACACAGCCCCAGTTCGTGTTGCGTTGTCAAGAAAGACGATCTCTTTCGATAAACTGCT
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AAAACGGGAAGAAAGCAGAGAAAAGTGTTCAGAAGCCGTGGGAAGAGATGACGTTGAACG
AGGAAGCGTTGGAGCTTTATGTCGGAGAGAAAGGTTTGTTGTTTTGGCTGAACAAATTGG
CTTATGCTTCAATCTACATTGTGATTGGTGGTTGGATTCTTTTCCGGTTTGTTGGACCGG
CTCTGAATCTTTATCAGCTTGATACGCCTCCTCTTGATCCTAAAAACATTTTGAAGGGCT
AAACAAGCTTTTAGCTTTTTTGTGTTATAAAACATTTTGAAGGCTTATATTCTTGCCAGT
TTCGAGTAATGTGTACCCCAAATCAAACAAGGTTGTAATGACAGTAAAAGAACCCTCTTT
TTGATTCTTTAAGATTGTGCTGGAGTTATGGT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4GS17TF 395 0 0
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GTTGAACGAGGAAGCGTTGGAGCTTTATGTCGGAGAGAAAGGTTTGTTGTTTTGGCTGAA
CAAATTGGCTTATGCTTCAATCTACATTGTGATTGGTGGTTGGATTCTTTTCCGGTTTGT
TGGACCGGCTCTGAATCTTTATCAGCTTGATACGCCTCCTCTTGATCCTAAAAACATTTT
GAAGGGCTAAACAAGCTTTTAGCTTTTCTGTGTTATAAAACATTTTGAAGGCTTATATTC
TTGCCAGTTTCGAGTAATGTGTACCCCAAATCAAACAAGGTTGTAATGACAGTAAAAGAA
CACTCTTTTTGATTCTTTAAGATTGTGCTGGAGTT

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL8765Contig1 1133 2 6 U
GGCTGGCAGTGACTTTAGCTCTTGCGTGGCTTTGTATCAAGAGATGGATGAGAAGGGGCT
TGAGGTTCCGTCTCATGCGTATAGTTTAGTGATCGGAGGGCTTTGCAAGGAAGGGAAGTT
GAACGAAGGGTACGCTGTTTTCGAGAGTATGATCCGTAAAGGTGTTAAACCGAACGTGGC
TGTATACATTGTTTTGATTGACGGTTATGTGAAGTTCGGAAGCGTTGAAGATGCGTTGAG
GCTTTTAGAGAGAATGATAAGAGAAGGGTTTGAGCCTGATGTGGTGACTTATTCGGTTGT
TGTGAACGGTTTGTGTAAAAACGGGAGAGTGGAAGAGGCGTTGGTGTATTTCGAGACTTG
CCGGGTTATCAAAGGGTTGGCTATCAACTCCATGTTTTACTCTAGTCTTATAGACGGGTT
AGGAAAAGCGGGCCGAGTAGATGAAGCTGAGAGGCTTTTCGAAGAGATGTCTGAGAAGGG
GCGCACTAGAGACTCGTACTGTTACAATGCCCTGATAGATGCGTTCACAAAGTGTGGGAG
GGTTGAGGAAGCGTTGGCGCTGTTTAAGAGGATGGAGGAAGAAGAAGGCTGTGATCAAAC
GGTTTATACGTACACTATACTCATATCAGGAATGTTTAAAGAGCGTGAAACGAAGAGGCG
TTGAAGCTCTGGGAGATGATGATAGACAAGGGTATTACACCGACCGCAGCTTGCTTCAGG
GCTTTGTCGACTGGACTTTGTTTGTCGGGGAAAGTGGGGAGAGCATGTAAGATACTGGAT
GAGTTAGCTCCGATGGGTGTGATTCTTGATGCAGCGTGTGAAGATATGATTAACACGCTG
TGTAAAGCTGGTAGGATCAAGGAAGCTTGTAAGTTAGCTGATGGGATCACTGAGAGAGGG
AGAGAAGTGCCTGGGAGGATCCGTACTGTTATGATAAATGCTTTGAGGAAAGTTGGGAAG
TCTGATTTGGCTATGAAGCTGATGCACAGCAAGATTGGGATTGGGTATGAGAGGATGGGT
AGTATTAAGAGGCGTGTCAAGTTTAGAACTTTACTTGAAAGCTTTGATCATGATGACTTT
TAAAGCGTTAATGTTTTTTTTTTTTTTTGCCTAAATATAGCTTCCGGTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E034TF U 1
AF RR4E034JQ C 347
BS 1 629 RR4E034TF
BS 630 630 RR4E034JQ
BS 631 720 RR4E034TF
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BS 722 743 RR4E034TF
BS 744 1133 RR4E034JQ

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TGAGGTTCCGTCTCATGCGTATAGTTTAGTGATCGGAGGGCTTTGCAAGGAAGGGAAGTT
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TGTATACATTGTTTTGATTGACGGTTATGTGAAGTTCGGAAGCGTTGAAGATGCGTTGAG
GCTTTTAGAGAGAATGATAAGAGAAGGGTTTGAGCCTGATGTGGTGACTTATTCGGTTGT
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GCGCACTAGAGACTCGTACTGTTACAATGCCCTGATAGATGCGTTCACAAAGTGTGGGAG
GGTTGAGGAAGCGTTGGCGCTGTTTAAGAGGATGGAGGAAGAAGAAGGCTGTGATCAAAC
GGTTTATACGTACACTATACTCATATCAG*AATGTTTAAAGAGCGTGAAACGAAGAGGCG
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*CTTTGTCGACTGGACTTTGTTT

QA 1 743 1 743
DS 

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CTTATAGACGGGTTAGGAAAAGCGGGCCGAGTAGATGAAGCTGAGAGGCTTTTCGAAGAG
ATGTCTGAGAAGGGGCGCACTAGAGACTCGTACTGTTACAATGCCCTGATAGATGCGTTC
ACAAAGTGTGGGAGGGTTGAGGAAGCGTTGGCGCTGTTTAAGAGGATGGAGGAAGAAGAA
GGCTGTGATCAAACGGTTTATACGTACACTATACTCATATCAGGAATGTTTAAAGAGCGT
GAAACGAAGAGGCGTTGAAGCTCTGGGAGATGATGATAGACAAGGGTATTACACCGACCG
CAGCTTGCTTCAGGGCTTTGTCGACTGGACTTTGTTTGTCGGGGAAAGTGGGGAGAGCAT
GTAAGATACTGGATGAGTTAGCTCCGATGGGTGTGATTCTTGATGCAGCGTGTGAAGATA
TGATTAACACGCTGTGTAAAGCTGGTAGGATCAAGGAAGCTTGTAAGTTAGCTGATGGGA
TCACTGAGAGAGGGAGAGAAGTGCCTGGGAGGATCCGTACTGTTATGATAAATGCTTTGA
GGAAAGTTGGGAAGTCTGATTTGGCTATGAAGCTGATGCACAGCAAGATTGGGATTGGGT
ATGAGAGGATGGGTAGTATTAAGAGGCGTGTCAAGTTTAGAACTTTACTTGAAAGCTTTG
ATCATGATGACTTTTAAAGCGTTAATGTTTTTTTTTTTTTTTGCCTAAATATAGCTTCCG
GTTTGGC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL8766Contig1 804 2 2 U
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GAAGCTCTCTAATCCTTCTTTTGGTGACCTTAACCACCTCATCTCAGCTACCATGAGTGG
TGTCACATGCTGTCTCCGTTTCCCTGGTCAGTTAAACTCCGACCTTAGAAAGCTCGCTGT
CAATCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCGCCTTTGACGTC
GAGAGGGTCTCAACAGTACAGCGCCTTGAGCGTTCCCGAGCTAACCCAGCAGATGTGGGA
CGCCAAAAACATGATGTGCGCAGCTGATCCTCGCCACGGCCGTTACTTGACAGCCTCTGC
TGTGTTCCGTGGGAAGATGAGTACCAAGGAGGTCGATGAACAGATGATGAATGTGCAGAA
CAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGGATTCCGAACAACGTGAAATCGAGCGTGTGCGA
TATAGCTCCTACGGGTTTGAAGATGGCGTCGACTTTCATAGGGAACTCGACTTCGATACA
GGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCT
TCATTGGTACACGGGAGAAGGGATGGATGAGATGGAGTTCACGGAAGCTAAGAAAAACAT
GATTGATTACTACTTTTGTAAGGGCTTCACACAAGCAACAAGTCGTTCTTTTATCTCTAT
TTTATGTTTGAGAATTTTCTTTCTTTTGTGCTTTGGGAGTCTTGTTATAGAATCTATTCT
AAAAAAATGAAAAACTAAAACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AN71TF U 1
AF RR4AN71JQ C 30
BS 1 722 RR4AN71TF
BS 723 804 RR4AN71JQ

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GAAGCTCTCTAATCCTTCTTTTGGTGACCTTAACCACCTCATCTCAGCTACCATGAGTGG
TGTCACATGCTGTCTCCGTTTCCCTGGTCAGTTAAACTCCGACCTTAGAAAGCTCGCTGT
CAATCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCGCCTTTGACGTC
GAGAGGGTCTCAACAGTACAGCGCCTTGAGCGTTCCCGAGCTAACCCAGCAGATGTGGGA
CGCCAAAAACATGATGTGCGCAGCTGATCCTCGCCACGGCCGTTACTTGACAGCCTCTGC
TGTGTTCCGTGGGAAGATGAGTACCAAGGAGGTCGATGAACAGATGATGAATGTGCAGAA
CAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGGATTCCGAACAACGTGAAATCGAGCGTGTGCGA
TATAGCTCCTACGGGTTTGAAGATGGCGTCGACTTTCATAGGGAACTCGACTTCGATACA
GGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCT
TCATTGGTACACGGGAGAAGGGATGGATGAGATGGAGTTCACGGAAGCTAAGAAAAACAT
GATTGATTACTACTTTTGTAAGGGCTTCACACAAGCAACAAGTCGTTCTTTTATCTCTAT
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4AN71JQ 775 0 0
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AGTTAAACTCCGACCTTAGAAAGCTCGCTGTCAATCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACT
TCTTCATGGTGGGTTTTGCGCCTTTGACGTCGAGAGGGTCTCAACAGTACAGCGCCTTGA
GCGTTCCCGAGCTAACCCAGCAGATGTGGGACGCCAAAAACATGATGTGCGCAGCTGATC
CTCGCCACGGCCGTTACTTGACAGCCTCTGCTGTGTTCCGTGGGAAGATGAGTACCAAGG
AGGTCGATGAACAGATGATGAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGGA
TTCCGAACAACGTGAAATCGAGCGTGTGCGATATAGCTCCTACGGGTTTGAAGATGGCGT
CGACTTTCATAGGGAACTCGACTTCGATACAGGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGT
TCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACGGGAGAAGGGATGGATG
AGATGGAGTTCACGGAAGCTAAGAAAAACATGATTGATTACTACTTTTGTAAGGGCTTCA
CACAAGCAACAAGTCGTTCTTTTATCTCTATTTTATGTTTGAGAATTTTCTTTCTTTTGT
GCTTTGGGAGTCTTGTTATAGAATCTATTCTAAAAAAATGAAAAACTAAAACACC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL8767Contig1 754 2 5 U
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GTTCAATGTTTACAAAAGAGAGAAAAGAAGTTAAAACTCCTCCAAGCTCCATATGCAAAA
ATCTCCAAAAAAAAAAAACAATTTCATCATTTCCACTCAAGTCTGTTCGGTTTTACCGTT
GGCTTCAGCTAACATCAGCTCCAGTTCTCCTTTCCTGTTCAGCTTCACTGTATCTGTGCA
GCCACCAATGTGCTTGCCTCCTACGAACACATTAGGAACAGTGCGTTGCCCAGAAAGTCT
TTCCAGTACCTTCTGCAGTTGTGGCCCTTGTGGACCGAGTTGATCCAATTCAATCACAAG
TGGCTGAACACCAATTCTCTTGAACAGTGTCTTCACTTCAAAACAGTATGGGCACCAAGT
TTTGGAGTAAACAACGACAGTGTTATCATTCACAGTTTTCTTCACGCTCTCCTCCATTCT
CGATCCGAAGGAAGAAGATGAATCAGCCGAAGACATGGCTCGAACAGAACATGTCTGCTT
TAGACATCTCTTGAAAGGAGACCCCACGGAGTTTTGATGCCGACGCTTATCAGAGACACC
GAGTAAGAAGATGAAGAAGAGACTGAAGGAAACGAATCTAGAGGCGACGATGCAAGTTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4E923JQ U 20
AF RR4E923TF C 1
BS 1 19 RR4E923TF
BS 20 243 RR4E923JQ
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BS 426 754 RR4E923TF

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QA 1 406 1 406
DS 

RD RR4E923TF 754 0 0
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TTTGGAGTAAACAACGACAGTGTTATCATTCACAGTTTTCTTCACGCTCTCCTCCATTCT
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GAGTAAGAAGATGAAGAAGAGACTGAAGGAAACGAATCTAGAGGCGACGATGCAAGTTTC
AATGTGTTCAATGCTGTGACTGCCATGGCTACTTTTCGGACCCCTTGGATTCTCGGAAAG
CCAGACAGATTCTTGGAACTTATTGTTTGAGTCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL8768Contig1 1328 2 2 U
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GGGCTCCTGGTGACGTTCTTGAGGTTTTTCAAAGCTGTTCCTGGAAGATGGCTATCGTTT
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ACAAGCTCAATGCATCTGATGTACTTTCGAGAAAAGGTCCAAATAAACGGACCTATTCTT
TGGTTACACCACAGAATCAAACTACACAAGTCGAAGAAGAAGACAGAGAGAGTGTTGCTT
CTTCTGTTGGTAGTTGTGGCACGGACATGGATGGTTTAACTACTGTATCTTTCACTCCCG
TAGAAACCGGTGACTCCAGTGACACAGAGTCATCATCTTGTCGCTATAGAAGCAAGTCTG
GCTTTCCAGGGAAAGGCTCAGAAGCTGCTGATGTTCATAAGCTAGAGTTGGATGAATACA
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AAGCTGTGTTGTTACATAGAATAAAAAAAACTTTAAGGGTAAGATTGTACAAAAGTCGCT
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ATTCCTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GN42TF U 1
AF RR4GN42JQ C 554
BS 1 618 RR4GN42TF
BS 619 1328 RR4GN42JQ

RD RR4GN42TF 618 0 0
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DS 

RD RR4GN42JQ 775 0 0
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TTGTGGCACGGACATGGATGGTTTAACTACTGTATCTTTCACTCCCGTAGAAACCGGTGA
CTCCAGTGACACAGAGTCATCATCTTGTCGCTATAGAAGCAAGTCTGGCTTTCCAGGGAA
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GAGATTGCACGCATCTGGGCCTATTATAACGTGGGAACAAGAAACGTGGATCACAAACCT
CCGTCTGAGACTGAACATCTCAAATGAGGAACATCTGATGCAAATAAGAGACCTTATCTC
TGACGATAAAAGTACAACATACAGATAGCAGCATCATTAACAACTACAAGCTGTGTTGTT
ACATAGAATAAAAAAAACTTTAAGGGTAAGATTGTACAAAAGTCGCTCTATTTTCAAACA
AAGCTATTTGATTTTTGTTGTCGAGCTTGTAAATGTCAATTTGAAGGATTCCTGC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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TTGTTTTCTCTCAGGTTGGACTTCCTCCACGCGTGCTCCCGAGGTTTTCACCAGAAAACT
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GCTAGCTTTTCGACCTAGACGCATAAATGAATCCTATGCGTGATCAATCAGGCAGCCCTT
ATGGAGATTCAACTCCTCGTAGTCCATTTTCTCCCTTCTCTGGAGATGAAAGGCATAGAA
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TATCTGGAGATGAAAGGCACAGAACTCTCGCAGAATCCAAATTCCAGCAAGCCCTCACCT
GTTCCGATCCATCATCCCCTGGATCAATGCATCATGGTGGACACAAGTTTCATGAGGTTT
TCCAGATGAAACAAGGACGTTATGATCTTCAAGCTTCAAAGATTTCTGAAATGATGAAAT
CAAATAGCTTAGATAATGCACCAACGCAGTCACTTCTAAGCGTCGTGAATGGGATTCTAG
ATGAAAGTATTGAAAGAAAGAACGGTGAAATCCCTCAGAGAGTGGCATGCCTGTTGAGAA
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TAGCATCAGGAAGTGGTAAAGAAAGTGAGATTGCTACACAACAGCTTCGACAAATTAAGA
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TCAAAGAGAATTGTCAATACGACCTTGAAATCTCTGCGTTGAGGCAAGAACTGGAGACAA
CTAAACGAGAATATAAGCAACAATGCTCTCAAATGGAAAGTCAAACAATGACAGAGAAGA
CAAAGTGGGAAGAACAGTGGAAGAACGAAGAGGAAGATATGGCCAAGTTATC


BQ
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AF RR4EP38TF U 1
AF RR4EP38JQ C 345
BS 1 661 RR4EP38TF
BS 662 662 RR4EP38JQ
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RD RR4EP38TF 765 0 0
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TCGTCTGGATTTTTCTAGGAGTTGAATGATCCAGTTTTGGGTTTTCAAGTATTTCCATAA
GCTAGCTTTTCGACCTAGACGCATAAATGAATCCTATGCGTGATCAATCAGGCAGCCCTT
ATGGAGATTCAACTCCTCGTAGTCCATTTTCTCCCTTCTCTGGAGATGAAAGGCATAGAA
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TATCTGGAGATGAAAGGCACAGAACTCTCGCAGAATCCAAATTCCAGCAAGCCCTCACCT
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TCCAGATGAAACAAGGACGTTATGATCTTCAAGCTTCAAAGATTTCTGAAATGATGAAAT
CAAATAGCTTAGATAATGCACCAACGCAGTCACTTCTAAGCGTCGTGAATGGGATTCTAG
ATGAAAGTATTGAAAGAAAGAACGGTGAAATCCCTCAGAGAGTGGCATGCCTGTTGAGAA
A*GTTGTGCAAGAGATTGAGAGACGCATCTCAACTCAAGCTGAGCATCTAAGA*CGCAAA
C**ATATTTTCAAA*CTCGAGAGGAGAAGTAC
AGTCAAGATCACG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4EP38JQ 728 0 0
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AAGTTTCATGAGGTTTTCCAGATGAAACAAGGACGTTATGATCTTCAAGCTTCAAAGATT
TCTGAAATGATGAAATCAAATAGCTTAGATAATGCACCAACGCAGTCACTTCTAAGCGTC
GTGAATGGGATTCTAGATGAAAGTATTGAAAGAAAGAACGGTGAAATCCCTCAGAGAGTG
GCATGCCTGTTGAGAAAAGTTGTGCAAGAGATTGAGAGACGCATCTCAACTCAAGCTGAG
CATCTAAGAACGCAAAACAATATTTTCAAAACTCGAGAGGAGAAGTACCAGTCAAGGATC
AACGTCCTTGAAGCCTTAGCATCAGGAAGTGGTAAAGAAAGTGAGATTGCTACACAACAG
CTTCGACAAATTAAGACAGAGAAGTCAACCTGGGAAGAAAAGAAGAAGAACGGAGAAGAG
GATATGCTTAAGCTACTCAAAGAGAATTGTCAATACGACCTTGAAATCTCTGCGTTGAGG
CAAGAACTGGAGACAACTAAACGAGAATATAAGCAACAATGCTCTCAAATGGAAAGTCAA
ACAATGACAGAGAAGACAAAGTGGGAAGAACAGTGGAAGAACGAAGAGGAAGATATGGCC
AAGTTATC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL8770Contig1 796 2 2 U
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TTCAGCTGTTGGAGGGTTTGAAGTACCTTCATAGCAACTGGATCATCCACAGGGATCTGA
AGCCATCGAATCTTCTGCTGAACAACAGCGGGGAGCTGAAAATATGCGATTTTGTAATGG
CTAGGCAATATGGGAGTCCTATCAAGCCCTACACGCAGTTGGTTGTAACACAGTGGTACA
GGTCCCCGGAGCTTCTTCTAGGAACAAAGGAGTACTCAACCGCAGTGGATATGTGGTCGA
TCGGTTGCATTATGGATTTTTGCGGTTCTTGGAACACCGAGTGAGACAACATGGCCTGGA
TTCACTTCGCTGCCAGGTTCCAAAGCCAAGTTTCGTAAGCAACCGTACAATTTACTACGT
TATTGAGTGTTGACCCTGAGAAGCGCCTTACAGTTGACGAGGCTCTTAACCATGCCTGGT
TCAATGAAGTACCTCTCCAGAAATCCAAGGAGTTGATGCCTACATTTCCCTCAAAGCGTA
ACTGAAAGATCTAAATCTTTTGTATCTTTTCGTGATTACTCTTTTACTTTGTGATTCTTG
ACATGGATTTTCAAGATAGAGGAGATTGGGAAGCGTTGATGAAGTTGCATCCATGTATAT
ATATGAATGTTCCATGAAACTGCAAGGTGTGTGGGTCTTCCTCTCTTATTGTCTCTCTCT
CTCTCTTCTCCTTGACTTTCATTTAGTTCCCTGTGTATCATACAGTCTTAAAATTAATCA
AGAGATGTTGACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C435TF U 1
AF RR4C435JQ C 35
BS 1 727 RR4C435TF
BS 728 796 RR4C435JQ

RD RR4C435TF 727 0 0
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TTCACTTCGCTGCCAGGTTCCAAAGCCAAGTTTCGTAAGCAACCGTACAATTTACTACGT
TATTGAGTGTTGACCCTGAGAAGCGCCTTACAGTTGACGAGGCTCTTAACCATGCCTGGT
TCAATGAAGTACCTCTCCAGAAATCCAAGGAGTTGATGCCTACATTTCCCTCAAAGCGTA
ACTGAAAGATCTAAATCTTTTGTATCTTTTCGTGATTACTCTTTTACTTTGTGATTCTTG
ACATGGATTTTCAAGATAGAGGAGATTGGGAAGCGTTGATGAAGTTGCATCCATGTATAT
ATATGAATGTTCCATGAAACTGCAAGGTGTGTGGGTCTTCCTCTCTTATTGTCTCTCTCT
CTCTCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR4C435JQ 762 0 0
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CTCAACCGCAGTGGATATGTGGTCGATCGGTTGCATTATGGATTTTTGCGGTTCTTGGAA
CACCGAGTGAGACAACATGGCCTGGATTCACTTCGCTGCCAGGTTCCAAAGCCAAGTTTC
GTAAGCAACCGTACAATTTACTACGTTATTGAGTGTTGACCCTGAGAAGCGCCTTACAGT
TGACGAGGCTCTTAACCATGCCTGGTTCAATGAAGTACCTCTCCAGAAATCCAAGGAGTT
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ATTACTCTTTTACTTTGTGATTCTTGACATGGATTTTCAAGATAGAGGAGATTGGGAAGC
GTTGATGAAGTTGCATCCATGTATATATATGAATGTTCCATGAAACTGCAAGGTGTGTGG
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QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

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TCTATACCAGTTACAATTCCCCATCTTAAATTCCTTCTTAAATGATCGCCCACGATTTAC
CTTGAATGCGAGTTTCTTCATGCAAGGCGGTTGGATTTTGATTATAAAAAGACCGACGAT
GCTCCTCCCCGTTCAAGTCCGGTTGTTCAGCTTCTGGGAGGCCAGGAACGTACATGGGAG
TGGATATGCTTCTACTAAATTCTCTGGAGCGAGATGGAGGGCTACGAGCAAGCGGCGGAG
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AGAGATAGGCTCTCGGATTACATGGGAGTTTGATAGGCTCTCGGACAGAGGAGTGCTGAG
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AACTATCAAAAGAAAACTTTGTAATAATACGAGCGCTCATGTACATTGCATTTGTAAATA
ATGATAATTTCAGCTTAAGCACATATTAGATATACACCTCTGTAACTTTCAGTCTGTTTA
AACTTAGAAGTAATTGTCTCTCTTTGTATATCACAGTTACCGAATATTGATGGAAGTTTG
GTGTTTGTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EJ36TF U 1
AF RR4EJ36JQ C 266
BS 1 657 RR4EJ36TF
BS 658 853 RR4EJ36JQ

RD RR4EJ36TF 657 0 0
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TCTATACCAGTTACAATTCCCCATCTTAAATTCCTTCTTAAATGATCGCCCACGATTTAC
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AGAGATAGGCTCTCGGATTACATGGGAGTTTGATAGGCTCTCGGACAGAGGAGTGCTGAG
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TGTATAGCTTGCGATTGAATGGGAGTAAGTGGAAAGACTTCGGCCAGTGGAAAACCG

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DS 

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AATACGAGCGCTCATGTACATTGCATTTGTAAATAATGATAATTTCAGCTTAAGCACATA
TTAGATATACACCTCTGTAACTTTCAGTCTGTTTAAACTTAGAAGTAATTGTCTCTCTTT
GTATATCACAGTTACCGAATATTGATGGAAGTTTGGTGTTTGTTGACT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL8772Contig1 915 2 2 U
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CAGGAGGAGGTGTGGCTCTTCTATACGCAGCGAGAGAGTTGGAGAAACTTCCAACAGCCA
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CAATTGCTTCAAACGCTGGCGTCGAAGGTGCTGTTATCGTTGGAAAGCTCTTGGAGCAAG
ATAACACAGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAAGCTG
GTATCATAGATCCTCTGAAAGTGATCAGGACGGCTCTGGTTGATGCTGCTAGTGTGTCAT
CTCTGTTGACGACAACTGAAGCTGTAGTTGTGGATCTTCCCAAAGGTGAAAGCGAGTCAG
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AACTCTTTTGTTTTTATTCACCAATCATCACCTTAACTTGAGAAAAGAGAGACTATTCGT
TTAGGAGTCTTTTGTCCTTTGCCTGTGTTTTACGAAATAATAACAATTAAACAGGACATC
ATTGCCTGTTTAACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F156TF U 1
AF RR4F156JQ C 238
BS 1 625 RR4F156TF
BS 626 915 RR4F156JQ

RD RR4F156TF 625 0 0
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ATTTAAGCATGCTAGGGACCTGCAAAAGGGTTACTGTCTCCAAGGACGACACTGTTATTC
TTGACGGTGCTGGCGACAAGACAGCCATTGAGGAAAGATGCGAGCAGATTAGGTCAGCAG
TTGAACTGAGCACCTCAGATTACGACAAGGAGAAACTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTCT
CTGGAGGAGTTGCTGTTTTGAAGATTGGGGGAGCAAGTGAAGCTGAGGTTGGTGAAAAGA
AAGACAGAGTTACAGATGCTTTGAATGCCACTAAAGCAGCTGTTGAAGAGGGTATTTTAC
CAGGAGGAGGTGTGGCTCTTCTATACGCAGCGAGAGAGTTGGAGAAACTTCCAACAGCCA
ACTTCGACCAGAAGATTGGTGTGCAGATCATTCAGAACGCTTTGAAGACACCTGTTCACA
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ATAACACAGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAAGCTG
GTATCATAGATCCTCTGAAAGTGAT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4F156JQ 678 0 0
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AGAAAGACAGAGTTACAGATGCTTTGAATGCCACTAAAGCAGCTGTTGAAGAGGGTATTT
TACCAGGAGGAGGTGTGGCTCTTCTATACGCAGCGAGAGAGTTGGAGAAACTTCCAACAG
CCAACTTCGACCAGAAGATTGGTGTGCAGATCATTCAGAACGCTTTGAAGACACCTGTTC
ACACAATTGCTTCAAACGCTGGCGTCGAAGGTGCTGTTATCGTTGGAAAGCTCTTGGAGC
AAGATAACACAGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAAG
CTGGTATCATAGATCCTCTGAAAGTGATCAGGACGGCTCTGGTTGATGCTGCTAGTGTGT
CATCTCTGTTGACGACAACTGAAGCTGTAGTTGTGGATCTTCCCAAAGGTGAAAGCGAGT
CAGCAGGAGCTGGAGCAGGCATGGGTGGAATGGGAGGCATGGATTATTAGTTACATTTAC
TAAAACTCTTTTGTTTTTATTCACCAATCATCACCTTAACTTGAGAAAAGAGAGACTATT
CGTTTAGGAGTCTTTTGTCCTTTGCCTGTGTTTTACGAAATAATAACAATTAAACAGGAC
ATCATTGCCTGTTTAACT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL8773Contig1 762 2 1 U
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ATATACCGAACGATGTCAAGGCTAAGGAGATGAAAGGGGTGAAGCCGGATTGTATTACGG
TTCAGAAGAAGTTTAGTAGGGATAGGGAGAGGGTTGTGACTGCTTATGAGGTTAGGGATA
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TTGGGTTCTTCTTGCGGTTTGAAGATGATAGTATTGAATCAGCCAAGACGGTGAAGCAGT
GGAATGTGAAGATTATCTCGATTAGTAAGAATAAGCGGCATCAAGACCGGGCAGCAGCAT
TAGAAGTCTGGGAAAAACTAGGGGAGTTTGTTCGGTCTCGGTCACATTCTTAGCATCTAG
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TTCTATTAAATGGTGAGTTAAATTGTTCATCAGCTTTGTTTG


BQ
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AF RR4BJ54TF U 1
AF RR4BJ54JQ C 46
BS 1 762 RR4BJ54TF

RD RR4BJ54TF 762 0 0
GGGGAGCTGAGGAGAGAGGGATCGTGGGGTTTAATGATGATTCTTCTGGCTACGACGCGG
GGAACCCTAAGTCTAAGATGAGGAAGATTGGGGAAGGTGTGCCGATTATTCTTGTCCCCA
GTGCGTTTCAGACGCTGATTACTATTTACAATGTGAAGGAGTTTCTTGAGGATGGGGTTT
ATATACCGAACGATGTCAAGGCTAAGGAGATGAAAGGGGTGAAGCCGGATTGTATTACGG
TTCAGAAGAAGTTTAGTAGGGATAGGGAGAGGGTTGTGACTGCTTATGAGGTTAGGGATA
AGCCTTCTGCTTTGAAGCCTGATGATTGGGACCGTGTTGTTGCGGTTTTTGTCTTGGGGA
AGGATTGGCAGTTCAAGGATTGGCCTTTCAAGGACCATGTTGAGATTTTCAATAAGATAA
TTGGGTTCTTCTTGCGGTTTGAAGATGATAGTATTGAATCAGCCAAGACGGTGAAGCAGT
GGAATGTGAAGATTATCTCGATTAGTAAGAATAAGCGGCATCAAGACCGGGCAGCAGCAT
TAGAAGTCTGGGAAAAACTAGGGGAGTTTGTTCGGTCTCGGTCACATTCTTAGCATCTAG
CAGCTGTAGAAATTCACTTTATGTATCATCGTCTTTCATTCTTGTTACTTGATTATCTTT
ATTACTTTCTGTAACATTAGCGAGATAAACACAGTGAACATGTTCTGCAGTGTGATTGTT
TTCTATTAAATGGTGAGTTAAATTGTTCATCAGCTTTGTTTG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4BJ54JQ 717 0 0
CTGGCTACGACGCGGGGAACCCTAAGTCTAAGATGAGGAAGATTGGGGAAGGTGTGCCGA
TTATTCTTGTCCCCAGTGCGTTTCAGACGCTGATTACTATTTACAATGTGAAGGAGTTTC
TTGAGGATGGGGTTTATATACCGAACGATGTCAAGGCTAAGGAGATGAAAGGGGTGAAGC
CGGATTGTATTACGGTTCAGAAGAAGTTTAGTAGGGATAGGGAGAGGGTTGTGACTGCTT
ATGAGGTTAGGGATAAGCCTTTTGCTTTGAAGCCTGATGATTGGGACCGTGTTGTTGCGG
TTTTTGTCTTGGGGAAGGATTGGCAGTTCAAGGATTGGCCTTTCAAGGACCATGTTGAGA
TTTTCAATAAGATAATTGGGTTTTTCTTGCGGTTTGAAGATGATAGTATTGAATCAGCCA
AGACGGTGAAGCAGTGGAATGTGAAGATTATCTCGATTAGTAAGAATAAGCGGCATCAAG
ACCGGGCAGCAGCATTAGAAGTTTGGGAAAAACTAGGGGAGTTTGTTCGGTTTCGGTCAC
ATTCTTAGCATTTAGCAGCTGTAGAAATTCACTTTATGTATCATCGTCTTTCATTCTTGT
TACTTGATTATCTTTATTACTTTCTGTAACATTAGCGAGATAAACACAGTGAACATGTTT
TGCAGTGTGATTGTTTTCTATTAAATGGTGAGTTAAATTGTTCATCAGCTTTGTTTG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8775Contig1 1012 2 2 U
GGGGGAGATGATACAGTGCTGTATCTGTGAGGATTGGTTTCACGATGAGCATCTCGCTCT
CAAACCTTCAGACGGTGTTACTAGCCTGATTCCAAAGGATGAGGAAGGAGTGCCGGTTTA
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GAAAATGTGGGCTGATGCTGCTAAAGTTGATTCCAATGATTCTGCTAATGCTTGTTCAGA
CACTACCGAGTCAAACCAAACCCCCACAGCTACTCAACCTGTTAAGCCTGAGAACAGTAC
TGAAGCTGAAAAATCTGTTTTGAGAGGATGCACTGGGAAGCTCGCCGAACCTGAACCCTT
TCCTGCGGCTGGTTGTGCTATTGCAACAGGTCTAACCTCGTGTATTGAGTTTGAGAAGAA
ACCGCTGTTTTTAGCCAAAAACTGGAGGAGCATGCTGTGCAAATGCGAGACGTGCCTTGA
GATGTACAGCGAGAGAAAGGTTAGCTACTTACTTGATGCGGAGGACACGATTGCTGAATA
CGAGAATAAGGCAAAGGAGAAAAGAACATAGAAACTGGAGAAACAGGAAGGCGAAGCACT
TGATCGTTTGAACAATCTCGACCATGTTACTAAAGTTGAGTTCTGTCACCGCGTCAATAA
CTTCAAAGAAGGGCTACGGAGTTTGCTGGAGTCTGTTGGTACTTCAAGGGCGATAACGTC
GGAAGATGTTGAGCAGATGTTCACAAAGCTGAAAAATAAACGCCAAAGGATGGAGTGAGT
CTAGTAGTCAATGATGAGAGGAGAGGTATGAGAATAAAAGTATTAAAGTCGTTTCTTTTC
CATATCTCATGTTAACTTTCTTTAGATATGTGTGCTTCGTTGTTTCGTCTCTGCCCTTTT
GACTATCTTTAGCTCCTAAGTTATGCATACAACTTTGTACTTCAGTGTATGGAGTTTGAA
GCATTTGTGTAACAGCAGACTATTATCTATATAAACTACTAGTTTAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DT30TF U 1
AF RR4DT30JQ C 283
BS 1 666 RR4DT30TF
BS 667 1012 RR4DT30JQ

RD RR4DT30TF 672 0 0
GGGGGAGATGATACAGTGCTGTATCTGTGAGGATTGGTTTCACGATGAGCATCTCGCTCT
CAAACCTTCAGACGGTGTTACTAGCCTGATTCCAAAGGATGAGGAAGGAGTGCCGGTTTA
TGAGGATTTCATTTGTCAAAACTGCTCCCCAGTTTGTTCGTTTCTCACACTTTATCCCGA
GAAAATGTGGGCTGATGCTGCTAAAGTTGATTCCAATGATTCTGCTAATGCTTGTTCAGA
CACTACCGAGTCAAACCAAACCCCCACAGCTACTCAACCTGTTAAGCCTGAGAACAGTAC
TGAAGCTGAAAAATCTGTTTTGAGAGGATGCACTGGGAAGCTCGCCGAACCTGAACCCTT
TCCTGCGGCTGGTTGTGCTATTGCAACAGGTCTAACCTCGTGTATTGAGTTTGAGAAGAA
ACCGCTGTTTTTAGCCAAAAACTGGAGGAGCATGCTGTGCAAATGCGAGACGTGCCTTGA
GATGTACAGCGAGAGAAAGGTTAGCTACTTACTTGATGCGGAGGACACGATTGCTGAATA
CGAGAATAAGGCAAAGGAGAAAAGAACATAGAAACTGGAGAAACAGGAAGGCGAAGCACT
TGATCGTTTGAACAATCTCGACCATGTTACTAAAGTTGAGTTCTGTCACCGCGTCAATAA
CTTCAA
GAAGGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4DT30JQ 730 0 0
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CGCCGAACCTGAACCCTTTCCTGCGGCTGGTTGTGCTATTGCAACAGGTCTAACCTCGTG
TATTGAGTTTGAGAAGAAACCGCTGTTTTTAGCCAAAAACTGGAGGAGCATGCTGTGCAA
ATGCGAGACGTGCCTTGAGATGTACAGCGAGAGAAAGGTTAGCTACTTACTTGATGCGGA
GGACACGATTGCTGAATACGAGAATAAGGCAAAGGAGAAAAGAACATAGAAACTGGAGAA
ACAGGAAGGCGAAGCACTTGATCGTTTGAACAATCTCGACCATGTTACTAAAGTTGAGTT
CTGTCACCGCGTCAATAACTTCAAAGAAGGGCTACGGAGTTTGCTGGAGTCTGTTGGTAC
TTCAAGGGCGATAACGTCGGAAGATGTTGAGCAGATGTTCACAAAGCTGAAAAATAAACG
CCAAAGGATGGAGTGAGTCTAGTAGTCAATGATGAGAGGAGAGGTATGAGAATAAAAGTA
TTAAAGTCGTTTCTTTTCCATATCTCATGTTAACTTTCTTTAGATATGTGTGCTTCGTTG
TTTCGTCTCTGCCCTTTTGACTATCTTTAGCTCCTAAGTTATGCATACAACTTTGTACTT
CAGTGTATGGAGTTTGAAGCATTTGTGTAACAGCAGACTATTATCTATATAAACTACTAG
TTTAATGTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL8776Contig1 1052 2 8 U
GTCACCGTGTTGCCTGCGTTACAGCTACTTTCATGTGCTCTCGTTGAAGAGATTCCTAGC
AACGAACCGTTGCCTGAGCTGCTGGATTCGAACGAGTTTGAAGAGAAGAGCAAGATGAGC
AATGACACATATCCAGACACGAAAAGGTCCAACACAAGAAGAAGGAAAGGGCAGAAGAAA
GGTAAGAAAGGAGCTTCCAGTGGTAAGAGCGAGACAACACAGAAGAAGCAATCGAAGTCT
TTAGCTTCAAAGTTGTTCCAGTCACTGAAAACAGCCGCTTTGGAATTATGTCGTGCGTTC
AAGCAACCGATCATTTTGAGACCAATGGCGTGGTTTTTCATAGCGCATATCACTGTGCCA
AATCTCTCTACTGTCATGTTCTATTACCAAACCGAGGTGTTGCTGTTAGACGCTTCTTTC
CTAGGAACAGCCCGTGTTGTTGGTTGGTTAGGTCTCATGCTTGGAACCTTTATCTACAAC
CGCTATCTCACTAATGTGACTCTACGCAAATCTCTCTTGTTTGCTCACATCGGGCTGTCT
ATAACCATACTCCTCGATATGGTCTTGGTGTCTAGAGCAAATGTAGGTTATGGAGTATCA
GACAAGACAATGGTTCTCTTCGGATCTGCTTTAGGTGATGCCATCAATCAACTCAAATTC
ATGCCGTTCTTGATCTTGTCTGGTCGTCTATGTCCTCCTGGGATTGAAGGAACACTGTTT
GCGCTGTTTATGTCGATAAACAACCTTGGAAACACAGTTGGGTCATTTATGGGAGCAGGA
TTGGCTTCACTTCTTGGAATCTCTTCAGGGTCCTTTGAGAATATGTTTGTGGGCTTAGCC
ATTCAAGTGTTTTGCACCTATATTCCTGTATTGTTTCTTTTCTTGATACCCAAGGAAGCT
ACAGGAGTATCAGCTTCCTAGGCTAGAGAGCAAAGATAGTTTCTCATATAAAAGTTTTTG
AGATCAAAGTTTTTGGATTTTTTTTGGCGTCATTTGTTGATTTAAAGGCTTTTGAAACTG
ACACACATCAGACAACAATAGAAAGTTATATA


BQ
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AF RR4CO38TF U 1
AF RR4CO38JQ C 339
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RD RR4CO38TF 737 0 0
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TTAGCTTCAAAGTTGTTCCAGTCACTGAAAACAGCCGCTTTGGAATTATGTCGTGCGTTC
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AATCTCTCTACTGTCATGTTCTATTACCAAACCGAGGTGTTGCTGTTAGACGCTTCTTTC
CTAGGAACAGCCCGTGTTGTTGGTTGGTTAGGTCTCATGCTTGGAACCTTTATCTACAAC
CGCTATCTCACTAATGTGACTCTACGCAAATCTCTCTTGTTTGCTCACATCGGGCTGTCT
ATAACCATACTCCTCGATATGGTCTTGGTGTCTAGAGCAAATGTAGGTTATGGAGTATCA
GACAAGACAATGGTTCTCTTCGGATCTGCTTTAGGTGATGCCATCAATCAACTCAA*TTC
ATGCCGTTCTTGATCTTGTCTGGTCGTCTATGTCCTCCTGGGAT*GAAG*AACACTGTTT
GCGCTGTTTATGTCGAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4CO38JQ 714 0 0
CATAGCGCATATCACTGTGCCAAATCTCTCTACTGTCATGTTCTATTACCAAACCGAGGT
GTTGCTGTTAGACGCTTCTTTCCTAGGAACAGCCCGTGTTGTTGGTTGGTTAGGTCTCAT
GCTTGGAACCTTTATCTACAACCGCTATCTCACTAATGTGACTCTACGCAAATCTCTCTT
GTTTGCTCACATCGGGCTGTCTATAACCATACTCCTCGATATGGTCTTGGTGTCTAGAGC
AAATGTAGGTTATGGAGTATCAGACAAGACAATGGTTCTCTTCGGATCTGCTTTAGGTGA
TGCCATCAATCAACTCAAATTCATGCCGTTCTTGATCTTGTCTGGTCGTCTATGTCCTCC
TGGGATTGAAGGAACACTGTTTGCGCTGTTTATGTCGATAAACAACCTTGGAAACACAGT
TGGGTCATTTATGGGAGCAGGATTGGCTTCACTTCTTGGAATCTCTTCAGGGTCCTTTGA
GAATATGTTTGTGGGCTTAGCCATTCAAGTGTTTTGCACCTATATTCCTGTATTGTTTCT
TTTCTTGATACCCAAGGAAGCTACAGGAGTATCAGCTTCCTAGGCTAGAGAGCAAAGATA
GTTTCTCATATAAAAGTTTTTGAGATCAAAGTTTTTGGATTTTTTTTGGCGTCATTTGTT
GATTTAAAGGCTTTTGAAACTGACACACATCAGACAACAATAGAAAGTTATATA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL8777Contig1 413 2 1 U
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CTTAAAAAGAAACAGTTTGAGAAGGTTCAATTATCCGAAATGAATTTTTAGATCTGTCTA
TTTAGCTTTATCAAATTCGTAAAAAAGAAAGAACCAAAAAAAATTATCAAAAGCCTTTTT
GTCTCTCTTTAGACTTTCGATTCCTTTTCGACCAGGTGTCAGGAATTACTTGTCTGATAG
TCCTAATCCTAGTATGTATATTAAGACGAATTCATTTTATCCCCTTTTCTTTATTTTTCA
ATACAAATTTGTATTGAAAAATGGGAGGGGGTGTAATGTAACTCTGTCGTTAGTGACCAA
TTGAAATTGATAGAATGTATCAATAATCAAGAGTTTTTTTGTAATTAGAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4F625TF U 1
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BS 1 413 RR4F625TF

RD RR4F625TF 413 0 0
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CTTAAAAAGAAACAGTTTGAGAAGGTTCAATTATCCGAAATGAATTTTTAGATCTGTCTA
TTTAGCTTTATCAAATTCGTAAAAAAGAAAGAACCAAAAAAAATTATCAAAAGCCTTTTT
GTCTCTCTTTAGACTTTCGATTCCTTTTCGACCAGGTGTCAGGAATTACTTGTCTGATAG
TCCTAATCCTAGTATGTATATTAAGACGAATTCATTTTATCCCCTTTTCTTTATTTTTCA
ATACAAATTTGTATTGAAAAATGGGAGGGGGTGTAATGTAACTCTGTCGTTAGTGACCAA
TTGAAATTGATAGAATGTATCAATAATCAAGAGTTTTTTTGTAATTAGAATGG

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR4F625JQ 395 0 0
TTTTTT
TTAGGATCGGTTGTTTTGGCACAAATCTTTTTGGTTTTTAAAAAGAAACAGTTTGAGAAG
GTTCAATTATCCGAAATGAATTTTTAGATCTGTCTATTTAGCTTTATCAAATTCGTAAAA
AAGAAAGAACCAAAAAAAATTATCAAAAGCCTTTTTGTCTCTCTTTAGACTTTCGATTCC
TTTTCGACCAGGTGTCAGGAATTACTTGTCTGATAGTCCTAATCCTAGTATGTATATTAA
GACGAATTCATTTTATCCCCTTTTCTTTATTTTTCAATACAAATTTGTATTGAAAAATGG
GAGGGGGTGTAATGTAACTCTGTCGTTAGTGACCAATTGAAATTGATAGAATGTATCAAT
AATCAAGAGTTTTTTTGTAATTAGAATGG

QA 7 395 7 395
DS 



AS 1 2

CO CL8778Contig1 1031 2 10 U
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TCTCTTCTCTTTCGGGTCAACAATGGCGAGAGGAGGAACAAAGAGAAAGATCGAGATCAA
GAAACGCGAAACCAAAGAACAACGATCGGTGACTTGCTCCAAACGCCGTAAAACGCTCTT
CTCCAAATCCGCCGAGCTCTGCCGTTTGTTCGGTTCAAACATCGCCGTCTTCGCAACTTC
TCCGGGAGATAAAACTAGTCTCGCCTCCTCCTTCTCCGGTCACGCCTCTGCCTCCGAGAT
CGTTGACTGTTACTTGAGCGACACGCTTCCTCCGACGATTAGTGTTCCCGAATCCGAATT
AGGGTTTTGGTGGACGGATCCCGATCTTTACAGTTCTTGCGATGATCTCTCGCAGTTGGA
TGTGATCGAGGATCTTATTAAGAGGACTAAGAAGGATTTGATGGATTGCCTTGGGAAGCA
AGAAGACTCTAGGGTTTCTTGTTTTGATCGTGGCGAATCTTTAACACAGCATGCATCCGA
TTCCCATCGAAACCCTAGCTCCTCTTCACAAGCCGTCACTATGTATCAGAATATTAGCGA
CCCACTCGACGGATCTTCACAAGTAATCTATGGCGGTGAGTTATCTTCAGGTCAATCTCG
TTACTTGGTGAACAAGGATTCTGGTAGTTTTATATGTGAGACAGAGAAAGAGAATAACCA
AATTAGGAGCGTACCCCAAGAAACAGAACAAACACAGTCGATTGTCAACGTGGATGGTGT
TGATGAGGATCAGAGCTTTTGGGATGAACTCTTATATTACGAAGATGGGTTTGGTCTTAA
TAACGGTGAAGACGATGTCATGATCGACATTGGAGAATTTCTCAACGATATAGAGAGTGG
ATGAAATTAAGTCACTTCACAGCTTTAATTGTTCAAGGTGGGGTTGATTATGGTTATAGT
ACTATTTTTTTTATGAATATGTAATGACGATGTTGAAACTATTTCCATTTTGGGAAGCTA
ATTTTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS78TF U 1
AF RR4FS78JQ C 334
BS 1 650 RR4FS78TF
BS 651 651 RR4FS78JQ
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RD RR4FS78TF 740 0 0
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GAAACGCGAAACCAAAGAACAACGATCGGTGACTTGCTCCAAACGCCGTAAAACGCTCTT
CTCCAAATCCGCCGAGCTCTGCCGTTTGTTCGGTTCAAACATCGCCGTCTTCGCAACTTC
TCCGGGAGATAAAACTAGTCTCGCCTCCTCCTTCTCCGGTCACGCCTCTGCCTCCGAGAT
CGTTGACTGTTACTTGAGCGACACGCTTCCTCCGACGATTAGTGTTCCCGAATCCGAATT
AGGGTTTTGGTGGACGGATCCCGATCTTTACAGTTCTTGCGATGATCTCTCGCAGTTGGA
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TTCCCATCGAAACCCTAGCTCCTCTTCACAAGCCGTCACTATGTATCAGAATATTAGCGA
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TTACTTGGTGAACAAG*ATTCTGGTAGTTTTATATGTGAGACAGAGAAAGAGA*TAACCA
AATTAG*AGCGTACCC
AAGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR4FS78JQ 698 0 0
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TTCTTGCGATGATCTCTCGCAGTTGGATGTGATCGAGGATCTTATTAAGAGGACTAAGAA
GGATTTGATGGATTGCCTTGGGAAGCAAGAAGACTCTAGGGTTTCTTGTTTTGATCGTGG
CGAATCTTTAACACAGCATGCATCCGATTCCCATCGAAACCCTAGCTCCTCTTCACAAGC
CGTCACTATGTATCAGAATATTAGCGACCCACTCGACGGATCTTCACAAGTAATCTATGG
CGGTGAGTTATCTTCAGGTCAATCTCGTTACTTGGTGAACAAGGATTCTGGTAGTTTTAT
ATGTGAGACAGAGAAAGAGAATAACCAAATTAGGAGCGTACCCCAAGAAACAGAACAAAC
ACAGTCGATTGTCAACGTGGATGGTGTTGATGAGGATCAGAGCTTTTGGGATGAACTCTT
ATATTACGAAGATGGGTTTGGTCTTAATAACGGTGAAGACGATGTCATGATCGACATTGG
AGAATTTCTCAACGATATAGAGAGTGGATGAAATTAAGTCACTTCACAGCTTTAATTGTT
CAAGGTGGGGTTGATTATGGTTATAGTACTATTTTTTTTATGAATATGTAATGACGATGT
TGAAACTATTTCCATTTTGGGAAGCTAATTTTTCTCCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGAGGATAGTGAAGAGGAAGGAGGAGGAGAAGGCTAAGAAGCAGGCGAAGAAGGATGAAA
AGGTTAATGCAAAGAAGAAGCTGGAAGATGAGGCTGCTGCAGCTATCGAGGAAGAGAAGA
GGCGGAAAGAAGAGGAAGCTAAGCTCGCTGCAGAGGCTGCTGTGCAGCAGAAGAAGAACA
AGGAAAAGGAGAAGAAGCTTCGTTCCAAGGAGCGAAGTCGGCTCAGGACTCTATCTGCAC
CTGTTCTGTCTCAGCGTCTGCTTGGCATCTCTGTTGCATACGTGGAGGATCTGTGCATGT
CGCTTAGCACCGAGGAGCTGAGGAGTCTGTGCGACAAGATGGAGAACAAGGAAGGGCTGA
AGCTGGCAAAGGTGCTCAAGAATGGGAACAATGATGAAGCTGAGAGTGAAGAAGAAGTGG
TGGTGGTTGCTAAGCAGAATGGTCATGTAGAAGCCAATGGATTTGCCATGGTAGATTCTG
CTACTCAGAGCCCTCGAGCTTCTGCAATGGTTCGAGGGTTTTGGTTTTGACAGAGCAGAG
AAGAGCCTTCAGACTCAATTTTTGTTTGCTACGTTTCATATTTTTCATATACATCATTGA
TGATGCTACTCTCCTTACATCCGTGAGTGTTTTGACAAACAAACGAATTATTCTTATTTT
ATCTTATTTTGTTGTAATTTTATTGATTTCTGTGTCTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ED45TF U 1
AF RR4ED45JQ C 186
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BS 720 720 RR4ED45JQ
BS 721 729 RR4ED45TF
BS 730 763 RR4ED45JQ

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GGCGGAAAGAAGAGGAAGCTAAGCTCGCTGCAGAGGCTGCTGTGCAGCAGAAGAAGAACA
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CTGTTCTGTCTCAGCGTCTGCTTGGCATCTCTGTTGCATACGTGGAGGATCTGTGCATGT
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TGGTGGTTGCTAAGCAGAATGGTCATGTAGAAGCCAATGGATTTGCCATGGTAGATTCTG
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AAGAGCCTTCAGACTCAATTTTTGTTTGCTACGTTTCATATTTTTCATATACATCATTGA
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ATCTTATTT
GT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR4ED45JQ 578 0 0
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AAGGAGAAGAAGCTTCGTTCCAAGGAGCGAAGTCGGCTCAGGACTCTATCTGCACCTGTT
CTGTCTCAGCGTCTGCTTGGCATCTCTGTTGCATACGTGGAGGATCTGTGCATGTCGCTT
AGCACCGAGGAGCTGAGGAGTCTGTGCGACAAGATGGAGAACAAGGAAGGGCTGAAGCTG
GCAAAGGTGCTCAAGAATGGGAACAATGATGAAGCTGAGAGTGAAGAAGAAGTGGTGGTG
GTTGCTAAGCAGAATGGTCATGTAGAAGCCAATGGATTTGCCATGGTAGATTCTGCTACT
CAGAGCCCTCGAGCTTCTGCAATGGTTCGAGGGTTTTGGTTTTGACAGAGCAGAGAAGAG
CCTTCAGACTCAATTTTTGTTTGCTACGTTTCATATTTTTCATATACATCATTGATGATG
CTACTCTCCTTACATCCGTGAGTGTTTTGACAAACAAACGAATTATTCTTATTTTATCTT
ATTTTGTTGTAATTTTATTGATTTCTGTGTCTTCACCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGACCCGTCCATCTAGTATGCAGAACCCAGCAGTCTCAAGAAGACGTTAACTCCGCCGTC
TCCCGTCGTCTTGCCCTCACCTTCCTCGTCGGTGCTGCAGCCGTCGGATCCAAAGTCTCT
CCTGCTGATGCTGCCTGTGGTGAAGCCGCAAATGTATTTGGTAAGCCAAAGAAGAACACA
GACTTCATGCCGTACAATGGAGAAGGATTCAAAATAGAGATCCCATCAAAGTGGAACCCA
AGCAAAGAAGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTAAGGTTTGAAGACAACTTTGATGCCACC
AGTAACGTCTCTGTAATGATCACTCCTACAGACAAGAAAACCATTACTGATTACGGTTCT
CCTGAACAGTTCCTTTCTCAGGTCAGTTATCTCCTTGGGAAGCAAGCTTACTTTGGCGAA
ACAGCCTCTGAGGGAGGGTTTGATGCAAATGCAGTAGCAACTGCAAACATTGGAGACATC
TACACAAGAGATTGGTGGGAAAAAGTACTATTACTTGTCGGTTTTGACAAGAACAGCTGA
TGGAGATGAAGGCGGGAAGCATCAGCTGATCACAGCCACTGTGAATGGTGGAAAGCTTTA
CATTTGCAAAGCACAAGCAGGAGACAAGAGGTGGTTTAAAGGAGCTAGGAAGTTCGTCGA
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GAATGTTCTGTTAGTTTGTTGTCTTCTTCTCCATTGTCTCTTGAATAAAAAAGTGGATCA
AGAAAACAAAACAAACATTTGAGAGCTATGAGTTTACGATAAAACGATTGTTCAAGTCTA
GCGTGATGAAGCCTT


BQ
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AF RR4D585TF U 1
AF RR4D585JQ C 356
BS 1 740 RR4D585TF
BS 741 975 RR4D585JQ

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ACCTCCTCCACCGCACGATCATCTTTCTTCCCCTCTTCCCTTCGTCACATGTCCTTCTCA
AGACCCGTCCATCTAGTATGCAGAACCCAGCAGTCTCAAGAAGACGTTAACTCCGCCGTC
TCCCGTCGTCTTGCCCTCACCTTCCTCGTCGGTGCTGCAGCCGTCGGATCCAAAGTCTCT
CCTGCTGATGCTGCCTGTGGTGAAGCCGCAAATGTATTTGGTAAGCCAAAGAAGAACACA
GACTTCATGCCGTACAATGGAGAAGGATTCAAAATAGAGATCCCATCAAAGTGGAACCCA
AGCAAAGAAGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTAAGGTTTGAAGACAACTTTGATGCCACC
AGTAACGTCTCTGTAATGATCACTCCTACAGACAAGAAAACCATTACTGATTACGGTTCT
CCTGAACAGTTCCTTTCTCAGGTCAGTTATCTCCTTGGGAAGCAAGCTTACTTTGGCGAA
ACAGCCTCTGAGGGAGGGTTTGATGCAAATGCAGTAGCAACTGCAAACATTGGAGACATC
TACACAAGAGATTGGTGGGAAAAAGTACTATTACTTGTCGGTTTTGACAAGAACAGCTGA
TGGAGATGAAGGCGGGAAGCATCAGCTGATCACAGCCACTGTGAATGGTGGAAAGCTTTA
CATTTGCAAAGCACAAGCAG
A

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4D585JQ 620 0 0
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ACATCTACACAAGAGATTGGTGGGAAAAAGTACTATTACTTGTCGGTTTTGACAAGAACA
GCTGATGGAGATGAAGGCGGGAAGCATCAGCTGATCACAGCCACTGTGAATGGTGGAAAG
CTTTACATTTGCAAAGCACAAGCAGGAGACAAGAGGTGGTTTAAAGGAGCTAGGAAGTTC
GTCGAGAATGCTGCTACTTCCTTTAGCGTCGCTTGAAACTAACTAAATCAACAAACATAT
TAATGGAATGTTCTGTTAGTTTGTTGTCTTCTTCTCCATTGTCTCTTGAATAAAAAAGTG
GATCAAGAAAACAAAACAAACATTTGAGAGCTATGAGTTTACGATAAAACGATTGTTCAA
GTCTAGCGTGATGAAGCCTT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

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GAATTACTGGGAGCAAGTGAGTGAATCAGGGGGTTTTGATATCGAACATATCTCAGCACC
GCCAATGGGACTCTTGACTTACGATTGTGAAGACAAGAGGAATCTGTTTCCTAATCGTCT
GTTGGTTAATCTCTACGCTAGACTCGGTCTCCATCGTTACAACCTCTCTAAGGGAACAAA
TTTAAAGTTCCACCACCTGAAGAAGTTCAACATGACTAATAACTGTATCTCCTCATACCG
CATCACTTTGGTTGCTTATGATCCAGCGACCACTTCGCTGGTAACCTTTCTGGTTGGAAT
CTCTGAGGAGGAATATGCTCGTTTGAATTTGATGCTCTTCATTGCCAGACCTCAAGCTGA
TAAGCCTCACCTCCAAGAACCAGTTAGGCCAATTGGTTCCACCATTTATCCCTTGAGACC
GGATGCATGTGATGACAAGGGATTACCTTTCTGGCCGACCGATTTTGAGGATACATCACG
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ACTTGCTCTTTGTTCAAATGATAGGAACATTCCCGAAAGCCATGTATCCCTGCTACAGAT
TGTGAGAGTTGCAAGGGAAACTATTGATCATGTGGACGCCACAAGTGCCATTTTATACAT
AACGTTTAAAGGCTTGCCCGTGGCTCGGGTTGGTGAGGATGGTGAGCTTGTTGAGCGCAG
AGTCATAATTAGAACGTTTGAGGATCCATCTACCGGATACTTCACTCTCATGGGTGGGTT
TGGGTTCTCGGTCGGCGAAGACACTAGTCATCGCCGCCCTATGACTCGCCCTCAGAGCAT
TGATGAAATTTGCGCTGAGCAGAGGAGGCTGCACTTTACGCCTCCCCCATGTCCACCCAC
CTACATGGCTGATTGGTGGAAATGCTAGATCATTGACCTCAGCTTTGTGTTGTTGGTTTC
TTTCCTCTTGGTTGTTTTTAAGAATTAAAATCCTTGTTGTATCTTGTTGACTTCAGCTGA
CAATGAGTATGGAACTCCTCATGTCTTTGTTTTCG


BQ
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AF RR4F414TF U 1
AF RR4F414JQ C 452
BS 1 677 RR4F414TF
BS 678 1175 RR4F414JQ

RD RR4F414TF 678 0 0
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ATCAATCATGTCTTCTGGTATTCCTGTTCAAGATAGCCAGGAGTTCCTCCGTAGTCAGAT
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GCCAATGGGACTCTTGACTTACGATTGTGAAGACAAGAGGAATCTGTTTCCTAATCGTCT
GTTGGTTAATCTCTACGCTAGACTCGGTCTCCATCGTTACAACCTCTCTAAGGGAACAAA
TTTAAAGTTCCACCACCTGAAGAAGTTCAACATGACTAATAACTGTATCTCCTCATACCG
CATCACTTTGGTTGCTTATGATCCAGCGACCACTTCGCTGGTAACCTTTCTGGTTGGAAT
CTCTGAGGAGGAATATGCTCGTTTGAATTTGATGCTCTTCATTGCCAGACCTCAAGCTGA
TAAGCCTCACCTCCAAGAACCAGTTAGGCCAATTGGTTCCACCATTTATCCCTTGAGACC
GGATGCATGTGATGACAAGGGATTACCTTTCTGGCCGACCGATTTTGAGGATACATCACG
TTTCCGCCTGCTGAATGAATCAGAGTTGCAAGGCAACGACTGGATTCGTCTATACTTGGA
ACTTGCTCTTTGTTCAA
T

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4F414JQ 724 0 0
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ATTGGTTCCACCATTTATCCCTTGAGACCGGATGCATGTGATGACAAGGGATTACCTTTC
TGGCCGACCGATTTTGAGGATACATCACGTTTCCGCCTGCTGAATGAATCAGAGTTGCAA
GGCAACGACTGGATTCGTCTATACTTGGAACTTGCTCTTTGTTCAAATGATAGGAACATT
CCCGAAAGCCATGTATCCCTGCTACAGATTGTGAGAGTTGCAAGGGAAACTATTGATCAT
GTGGACGCCACAAGTGCCATTTTATACATAACGTTTAAAGGCTTGCCCGTGGCTCGGGTT
GGTGAGGATGGTGAGCTTGTTGAGCGCAGAGTCATAATTAGAACGTTTGAGGATCCATCT
ACCGGATACTTCACTCTCATGGGTGGGTTTGGGTTCTCGGTCGGCGAAGACACTAGTCAT
CGCCGCCCTATGACTCGCCCTCAGAGCATTGATGAAATTTGCGCTGAGCAGAGGAGGCTG
CACTTTACGCCTCCCCCATGTCCACCCACCTACATGGCTGATTGGTGGAAATGCTAGATC
ATTGACCTCAGCTTTGTGTTGTTGGTTTCTTTCCTCTTGGTTGTTTTTAAGAATTAAAAT
CCTTGTTGTATCTTGTTGACTTCAGCTGACAATGAGTATGGAACTCCTCATGTCTTTGTT
TTCG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL8784Contig1 385 2 1 U
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TCGTGGAAGAAGCCCAGAGAGAAGGTCCGAGAGAAGGTATCAACCACCCCGTGGCTCGAG
ATGACCTGTTTAGGTCTCTTGACGAAGGAATTTTATGTTGTTGATTTAGTTTGTATGATT
ATTGATCATTATCATCTTTAAATAGTAAAGAGATTCTGTTTGGAGACAGTTATGGCTTTA
TGTGTCTTTTTCTCTTATGTATGCTGCGGAACACAGTGAATGTGAAACTTACAATGTAAT
AGCTTCTCTATGCTACTTTTGTTTT


BQ
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AF RR4FJ56JQ C 1
AF RR4FJ56TF U 1
BS 1 385 RR4FJ56TF

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TCGTGGAAGAAGCCCAGAGAGAAGGTCCGAGAGAAGGTATCAACCACCCCGTGGCTCGAG
ATGACCTGTTTAGGTCTCTTGACGAAGGAATTTTATGTTGTTGATTTAGTTTGTATGATT
ATTGATCATTATCATCTTTAAATAGTAAAGAGATTCTGTTTGGAGACAGTTATGGCTTTA
TGTGTCTTTTTCTCTTATGTATGCTGCGGAACACAGTGAATGTGAAACTTACAATGTAAT
AGCTTCTCTATGCTACTTTTGTTTT

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR4FJ56TF 385 0 0
GTATGATCGTGATGATTCTGGACATCGTAGGTCACCAAGACGTGACTTCTCACCTCGTGA
TCATGGAAGGAGGTCACCTCGTGGTGGAAGAAGCTCTAGAAGAGATCGGTCTTACTCTCC
TCGTGGAAGAAGCCCAGAGAGAAGGTCCGAGAGAAGGTATCAACCACCCCGTGGCTCGAG
ATGACCTGTTTAGGTCTCTTGACGAAGGAATTTTATGTTGTTGATTTAGTTTGTATGATT
ATTGATCATTATCATCTTTAAATAGTAAAGAGATTCTGTTTGGAGACAGTTATGGCTTTA
TGTGTCTTTTTCTCTTATGTATGCTGCGGAACACAGTGAATGTGAAACTTACAATGTAAT
AGCTTCTCTATGCTACTTTTGTTTT

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 2

CO CL8785Contig1 803 2 2 U
GACTTTAATGTTCTTCATCGGCATCTGAGCTCCACGTTTCCGGTGCAGGCTCGACGGTGA
AGGCGATGAAGCAACCTATCCTCTTCTCTGTGGTACGTGGCGTGGTATCTTTCGGAAGCG
ATCGATTTAATGCTCCAAGGCCCCGATGACTGTTCTATGGTAGTGTAAGGTGTCTCCTTG
GCGCTCGAGGACGGCGTCAGAACCCTTCCTCTTCCAAGGCAGTTAATCAAAGTCTAGAGC
AGTCGAGACTTTTCCGGTGAGTTTTGGTGGGTAGCGCCTTTGTTTGATGTTGAGCCGTGA
GTGCAGAAGCTTGAGACACCGTGGATGGCGGTTTCCCGCGGCAGCGCTCGATTCTATTAC
TCTCGTTTCAACTCAAACCGGATAGAAGGTATAGGTTGTGTGGTGTTTCAGATCTGTGTG
TCGGCGTTTAGATTTGTGATGAAACGGCTCAGATCTGTGTGTCGGTCTCGCTACCTTAGG
AGATCGGTTTTGTTGGCTGCGGGCTTGGCTCCGAGAGCTTATGGGTCTTCCTGGAGCCTT
CGTGAAAAGCCTCTGCGGGTCGGATTTGGACGACCTGGCCATCAGAGTCATTTTTCCGGC
GAATCGGTTTAATCCTCCGCTCTAGTCCAACGGAGTAGCGTTTGGCTTCATCACCTACGC
TTGAAAGCTTCTTTCCCTTCCACATTTGAGTTTGTTTTTGATGTTTTTCAGTTGTATGAG
CCTAAACTATTTCTGTAACCCACTGTTTTTCTGAGCTCATGCCGGAGAGTTCACTGTTCC
GGCGCCCTTTCCGGGATGATGAT


BQ
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AF RR4FQ14TF U 1
AF RR4FQ14JQ C 210
BS 1 595 RR4FQ14TF
BS 596 803 RR4FQ14JQ

RD RR4FQ14TF 595 0 0
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ATCGATTTAATGCTCCAAGGCCCCGATGACTGTTCTATGGTAGTGTAAGGTGTCTCCTTG
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AGTCGAGACTTTTCCGGTGAGTTTTGGTGGGTAGCGCCTTTGTTTGATGTTGAGCCGTGA
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TCTCGTTTCAACTCAAACCGGATAGAAGGTATAGGTTGTGTGGTGTTTCAGATCTGTGTG
TCGGCGTTTAGATTTGTGATGAAACGGCTCAGATCTGTGTGTCGGTCTCGCTACCTTAGG
AGATCGGTTTTGTTGGCTGCGGGCTTGGCTCCGAGAGCTTATGGGTCTTCCTGGAGCCTT
CGTGAAAAGCCTCTGCGGGTCGGATTTGGACGACCTGGCCATCAGAGTCATTTTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4FQ14JQ 594 0 0
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GGTTTCCCGCGGCAGCGCTCGATTCTATTACTCTCGTTTCAACTCAAACCGGATAGAAGG
TATAGGTTGTGTGGTGTTTCAGATCTGTGTGTCGGCGTTTAGATTTGTGATGAAACGGCT
CAGATCTGTGTGTCGGTCTCGCTACCTTAGGAGATCGGTTTTGTTGGCTGCGGGCTTGGC
TCCGAGAGCTTATGGGTCTTCCTGGAGCCTTCGTGAAAAGCCTCTGCGGGTCGGATTTGG
ACGACCTGGCCATCAGAGTCATTTTTCCGGCGAATCGGTTTAATCCTCCGCTCTAGTCCA
ACGGAGTAGCGTTTGGCTTCATCACCTACGCTTGAAAGCTTCTTTCCCTTCCACATTTGA
GTTTGTTTTTGATGTTTTTCAGTTGTATGAGCCTAAACTATTTCTGTAACCCACTGTTTT
TCTGAGCTCATGCCGGAGAGTTCACTGTTCCGGCGCCCTTTCCGGGATGATGAT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL8786Contig1 386 2 1 U
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ACTATTACTCAGCTACGACCCCTCGCCCTTCCCCTTACATGATTGGCTATCTTCCTTGTT
GAGATTGTATTCTTTATGATATTTCTGTAAATTAATTACTTGGTTTTAAAAAGTTTAATG
TAAATTATATACTTTCTTTGTTTCTTTCAACATCATGTATTATACGGATATAAACCTGGT
CGGGGATGTTGCACCAGCTATAACAC


BQ
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AF RR4A857JQ C 1
AF RR4A857TF U 1
BS 1 386 RR4A857TF

RD RR4A857JQ 386 0 0
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CAAAAGGCTTTTTGAGGCACGCTCCTCAGGCTCCGCCCGCTCTCCTCCGCCAAGGCCCCT
ACTATTACTCAGCTACGACCCCTCGCCCTTCCCCTTACATGATTGGCTATCTTCCTTGTT
GAGATTGTATTCTTTATGATATTTCTGTAAATTAATTACTTGGTTTTAAAAAGTTTAATG
TAAATTATATACTTTCTTTGTTTCTTTCAACATCATGTATTATACGGATATAAACCTGGT
CGGGGATGTTGCACCAGCTATAACAC

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR4A857TF 386 0 0
GGGGAGAAAAGGGAAAGAAAAAGAAAAAGAAGAGAGGATCAATGTTGATAAAAAGAATAG
AGCTCTGTATAGAGATAGTGAAGACAACAATGGATTTTGTAGTGGTGGTGACTGAAGCCG
CAAAAGGCTTTTTGAGGCACGCTCCTCAGGCTCCGCCCGCTCTCCTCCGCCAAGGCCCCT
ACTATTACTCAGCTACGACCCCTCGCCCTTCCCCTTACATGATTGGCTATCTTCCTTGTT
GAGATTGTATTCTTTATGATATTTCTGTAAATTAATTACTTGGTTTTAAAAAGTTTAATG
TAAATTATATACTTTCTTTGTTTCTTTCAACATCATGTATTATACGGATATAAACCTGGT
CGGGGATGTTGCACCAGCTATAACAC

QA 1 386 1 386
DS 



AS 1 2

CO CL8787Contig1 984 2 8 U
GGGAAGAAGAAGAAGATCTTCGTAAACTCTCACGATGTCGATTAGAGAGGAAGACTCGTT
GCTTTCTCGCCGATTCTGGCGGCGGTGCTGTTCCTGCTGACGGTTAACCACGGCGAAGCC
ATATGGTTGACGATTCCGCCGACGGGAGGGACGAAGTGCGTCTCCGAGGAGATACAGAGC
AACGTCGTCGTCTTGGCTGATTACTACGTCGTCGATGAGCATGATCCTGAACACACGGCT
ACTATTTCTTCTAAGGTAACATCTCCTTATGGGAACAATCTGCATCACCAAGACAATGTG
ACGCATGGTCAGTTTGCGTTCACAACTCAAGAAACTGGGAATTACTTGGCTTGCTTCTGG
GTTGATTCCAGTCGTCCGCAAGTTAATCCACTGACTCTTGGGATTGATTGGAAGATTGGT
ATCGCAGCTAAAGATTGGGACTCTGTTGCTAAAAAGGAAAAGATCGAGGGTGTTGAGCTT
CAGTTGAGGAGACTTGACGGGTTAGTGCAGTCGATTCGTGAGAACATCAATTATATAAAA
GACAGGGAAGCCGAGATGAGAGAAGTGAGTGAGACAACCAACTCGAGAGTGGCTTGGTTC
AGTATAATGTCACTCGGGGTTTGCCTTTCCGCGGGTTCACAGATATGGTACCTGAAGCGA
TATTTCCACAAGAAGAAACTCATTTAAAGACTTGGTCTGAAGGACTTGCTATATAGAGTA
ACACATCCCCACCTTGAAAGAGGGGATAAGCAGAGTCGATTGGTTAAAAATGGAAGAACG
CATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGAATATCATAAGGATAGTTGAGTTTGTTGTGCACAGA
TCACTTTGTGTTTTGATTGATCTCTGTTGGAGTAGGAAAACGGATATATGTGGCAATGTA
CCAAAGCAATTATCCTAGTATCCAAAAATTTGAAACGTTTACGAATTTATAAATATCATC
ATGGTGCTAATAAAACATGATTAG


BQ
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AF RR4CV61TF U 1
AF RR4CV61JQ C 360
BS 1 702 RR4CV61TF
BS 703 703 RR4CV61JQ
BS 704 720 RR4CV61TF
BS 721 721 RR4CV61JQ
BS 722 748 RR4CV61TF
BS 749 749 RR4CV61JQ
BS 750 764 RR4CV61TF
BS 765 984 RR4CV61JQ

RD RR4CV61TF 764 0 0
GGGAAGAAGAAGAAGATCTTCGTAAACTCTCACGATGTCGATTAGAGAGGAAGACTCGTT
GCTTTCTCGCCGATTCTGGCGGCGGTGCTGTTCCTGCTGACGGTTAACCACGGCGAAGCC
ATATGGTTGACGATTCCGCCGACGGGAGGGACGAAGTGCGTCTCCGAGGAGATACAGAGC
AACGTCGTCGTCTTGGCTGATTACTACGTCGTCGATGAGCATGATCCTGAACACACGGCT
ACTATTTCTTCTAAGGTAACATCTCCTTATGGGAACAATCTGCATCACCAAGACAATGTG
ACGCATGGTCAGTTTGCGTTCACAACTCAAGAAACTGGGAATTACTTGGCTTGCTTCTGG
GTTGATTCCAGTCGTCCGCAAGTTAATCCACTGACTCTTGGGATTGATTGGAAGATTGGT
ATCGCAGCTAAAGATTGGGACTCTGTTGCTAAAAAGGAAAAGATCGAGGGTGTTGAGCTT
CAGTTGAGGAGACTTGACGGGTTAGTGCAGTCGATTCGTGAGAACATCAATTATATAAAA
GACAGGGAAGCCGAGATGAGAGAAGTGAGTGAGACAACCAACTCGAGAGTGGCTTGGTTC
AGTATAATGTCACTCGGGGTTTGCCTTTCCGCGGGTTCACAGATATGGTACCTGAAGCGA
TATTTCCACAAGAAGAAACTCATTTAAAGACTTGGTCTGAAG*ACTTGCTATATAGAGTA
*CACATCCCCACCTTGAAAGAGGGGATA*GCAGAGTCGATTGGT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR4CV61JQ 625 0 0
GGTTGATTCCAGTCGTCCGCAAGTTAATCCACTGACTCTTGGGATTGATTGGAAGATTGG
TATCGCAGCTAAAGATTGGGACTCTGTTGCTAAAAAGGAAAAGATCGAGGGTGTTGAGCT
TCAGTTGAGGAGACTTGACGGGTTAGTGCAGTCGATTCGTGAGAACATCAATTATATAAA
AGACAGGGAAGCCGAGATGAGAGAAGTGAGTGAGACAACCAACTCGAGAGTGGCTTGGTT
CAGTATAATGTCACTCGGGGTTTGCCTTTCCGCGGGTTCACAGATATGGTACCTGAAGCG
ATATTTCCACAAGAAGAAACTCATTTAAAGACTTGGTCTGAAGGACTTGCTATATAGAGT
AACACATCCCCCCCTTGAAAGAGGGGATAAGCAGAGTCGATTGGTTAAAAATGGAAGAAC
GCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGAATATCATAAGGATAGTTGAGTTTGTTGTGCACAG
ATCACTTTGTGTTTTGATTGATCTCTGTTGGAGTAGGAAAACGGATATATGTGGCAATGT
ACCAAAGCAATTATCCTAGTATCCAAAAATTTGAAACGTTTACGAATTTATAAATATCAT
CATGGTGCTAATAAAACATGATTAG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL8788Contig1 1305 2 4 U
GGTCGTCACCTTCTCTCGTGAGCTCACTCAAGGGTCCAAAAAGTGTTTCTTTACTCTTTT
GTTGTTCTTTCTCCTTTCTCGTTTTCTGAGAGAAGAGATACATAAGAGATGGGAAGGACT
CCGTGTTGTGAGAAAATAGGACTTAAGAGAGGGAGATGGACCGCGGAGGAAGATGAGACC
CTCACTAACTATATTCAAATCAATGGTGAAGGTTCTTGGCGGTCTTTGCCTAAGAAAGCT
GGATTGTTGAGGTGTGGAAAGAGCTGTAGACTAAGGTGGATAAATTATTTGAGGATGACT
TGAAAAGAGGAAATATTACGGCCGAGGAAGATGAGACAATCGTCAAGTTGCATTCCCTTC
TTGGCAATAGATGGTCGCTTATTGCAACACATCTACCTGGAAGAACAGACAACGAAATTA
AAAACTACTGGAACTCACATCTTAGCCGCAAAATCTACGCATTCACTGCCGCCCGCAGAG
ATGAGCACGGTCTAAACGTCACCGACTTAGTTATGAATAAATCTTTTTCTTCGTCTTCTT
TTTCTTCCTCGCGAGCCAAGAAGAAGAAAGGAAGAACTAGTAGGGCATCCATGAAGAAAC
ACAAGCAAAGGTTGACGGCCTCGCAATGTACCCCACAACTGAAAGAGCTGGAGAGTGATA
TCAGTGAGGAAGGGCACAATGGTAATTTCGAAGGAAAGTCTTTGGAGCCTTATGAGTGGT
TGGATGGTGAGATAGAGCGGCTCATGGGTAGTTCTGTCTGGGAATGTACTAACGAAGAGA
CTGTGGTTGAAGTAAATCACGATGATTCTGTTGAGAACAAGGTGTGTGAGAGTGGGGACA
ATAGTAGTTGTTGTGTGGGTTTGTTTGAGGAAGAACATGGAAAGCTTGGTAACCTAGAGG
TTGATCATGACATGAATGTGGAAAAGGAAAGAGAGGGGAGTGGTCTTAGTTCGAATTCAA
ATGAAAATGGTGATAAAGATTGGTGGGTTGATCTATGTGATTCTTTAGAAATTGGATTTG
GGATTGATTATGAGTTGCTTGGTTGGGAGTTTCAAGGTGATGTACCTTGTCAAAGTGATG
ATCTCTGGGATCTCTCAGATTTTAGAGAAATACCGCAGGTGGACCGTATATGAGAAGGTC
TATTAACCTGATAAAGCATCGATCTAATAATTGTAGGGTATATTGTTTTGTTTGGAGTGG
ATCTAAATGTTATATATATCAGCTTGTTGGAGTGTGTTAGGATAAATATATAGCCTCCAG
TTTAAATCAGTTTGAAGCACATTGTTTTTTAATCTAACTTTCTGC


BQ
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AF RR4B790TF U 1
AF RR4B790JQ C 447
BS 1 821 RR4B790TF
BS 822 822 RR4B790JQ
BS 823 838 RR4B790TF
BS 839 1305 RR4B790JQ

RD RR4B790TF 838 0 0
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GTTGTTCTTTCTCCTTTCTCGTTTTCTGAGAGAAGAGATACATAAGAGATGGGAAGGACT
CCGTGTTGTGAGAAAATAGGACTTAAGAGAGGGAGATGGACCGCGGAGGAAGATGAGACC
CTCACTAACTATATTCAAATCAATGGTGAAGGTTCTTGGCGGTCTTTGCCTAAGAAAGCT
GGATTGTTGAGGTGTGGAAAGAGCTGTAGACTAAGGTGGATAAATTATTTGAGGATGACT
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TTGGCAATAGATGGTCGCTTATTGCAACACATCTACCTGGAAGAACAGACAACGAAATTA
AAAACTACTGGAACTCACATCTTAGCCGCAAAATCTACGCATTCACTGCCGCCCGCAGAG
ATGAGCACGGTCTAAACGTCACCGACTTAGTTATGAATAAATCTTTTTCTTCGTCTTCTT
TTTCTTCCTCGCGAGCCAAGAAGAAGAAAGGAAGAACTAGTAGGGCATCCATGAAGAAAC
ACAAGCAAAGGTTGACGGCCTCGCAATGTACCCCACAACTGAAAGAGCTGGAGAGTGATA
TCAGTGAGGAAGGGCACAATGGTAATTTCGAAGGAAAGTCTTTGGAGCCTTATGAGTGGT
TGGATGGTGAGATAGAGCGGCTCATGGGTAGTTCTGTCTGGGAATGTACTAACGAAGAGA
CTGTGGTTGAAGTAAATCACGATGATTCTGTTGAGAACAAG*TGTGTGAGAGTGGGGA

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR4B790JQ 859 0 0
CGCAAAATCTACGCATTCACTGCCGCCCGCAGAGATGAGCACGGTCTAAACGTCACCGAC
TTAGTTATGAATAAATCTTTTTCTTCGTCTTCTTTTTCTTCCTCGCGAGCCAAGAAGAAG
AAAGGAAGAACTAGTAGGGCATCCATGAAGAAACACAAGCAAAGGTTGACGGCCTCGCAA
TGTACCCCACAACTGAAAGAGCTGGAGAGTGATATCAGTGAGGAAGGGCACAATGGTAAT
TTCGAAGGAAAGTCTTTGGAGCCTTATGAGTGGTTGGATGGTGAGATAGAGCGGCTCATG
GGTAGTTCTGTCTGGGAATGTACTAACGAAGAGACTGTGGTTGAAGTAAATCACGATGAT
TCTGTTGAGAACAAGGTGTGTGAGAGTGGGGACAATAGTAGTTGTTGTGTGGGTTTGTTT
GAGGAAGAACATGGAAAGCTTGGTAACCTAGAGGTTGATCATGACATGAATGTGGAAAAG
GAAAGAGAGGGGAGTGGTCTTAGTTCGAATTCAAATGAAAATGGTGATAAAGATTGGTGG
GTTGATCTATGTGATTCTTTAGAAATTGGATTTGGGATTGATTATGAGTTGCTTGGTTGG
GAGTTTCAAGGTGATGTACCTTGTCAAAGTGATGATCTCTGGGATCTCTCAGATTTTAGA
GAAATACCGCAGGTGGACCGTATATGAGAAGGTCTATTAACCTGATAAAGCATCGATCTA
ATAATTGTAGGGTATATTGTTTTGTTTGGAGTGGATCTAAATGTTATATATATCAGCTTG
TTGGAGTGTGTTAGGATAAATATATAGCCTCCAGTTTAAATCAGTTTGAAGCACATTGTT
TTTTAATCTAACTTTCTGC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

CO CL8789Contig1 1120 2 8 U
GGATGCTTTGATGTTGCTGTAGATTGACGCCATGAGTCATCTCAACCCGATCGCCATGAG
ATCGGTGACGATGGTGAAGCTCGCCATGAGAGCTTAGCCGGAGTCAAGCTCGAAGCTATT
CGTTTATCATCTTGTTATTCTCTGTTCTATCTTGTAATCTGTGTTGAGTGATCAATAAGA
AGAGTTCATAGAGTTCTAGATATCAATACTCTATCATTGGTGCGGTGATACTGGTTCGGA
TTCAACGCGGTGCTGCGACTGTGTGACGGAGCGGAGAAGACGAAGCGATTTGATTCTGTG
GAGAAGCAGATCGCACCGATCGGAATGGCAGAGAAACTGGAGGATTCAAGTCCCGTCAAT
GGAATCGTTACGGTTCCAGTGTTTCCGGATGTAGGCTTGAGGCAGTGGATTTCGTGGATG
GAGCATTACTTTGCTCGGAAGGGACTCTCAGACTTTGAGAAGTTACACATGGCGTATGGA
TTCATTGTGGATGAACCTGAGAGGTATATCATTCGTATTGATTCATTGATGCCTATTAGA
AACTGGAAACATATGAAAGAAACGTTGTTGTGGAAATTTGGAGCTGATGATGATCCTGAT
AAGATTAGGTTACAAATAGAATCTGATAGATGCCATGAGTATCTTATGAATTGGAAGCCA
CGGAGAAAGTATGAAACGACCCAAGATGATGTGAGTTCTAGTGATTGGCATGTTTCAAGT
TCGGAGGCTGCTCAAGACTCAGATGTAGAGCTTAAGCCTGCGTCACTTCAGGAGATGGAG
CATCAGAGTGGTGTAAAACGTGAGATATCAGCAAAGTCTTGTGTGGAGCAGTCTGATTCA
TCTCTGGAGACAGTTTCAAATTTTTCTCGGGTTGTAGAGAAGCTGACTGACGGATTGAAT
TCAAGTAAAGAATTTGTTCATGAGATTGGTTTGGTGCAGGAGGCAGAGGCACATTCAGCA
ATTATACAATCTCATGATAGGCATCAAACAGTAGCTTAGTGCTTTGAGTTGTTGTTGAGA
GTTTCGGCGCTGCTGCTGCCAAACGTTCCGGTGACCAAGAGTTGCTCAATTACTATTTGT
CACAATTCCATCAGATTAGACTATCTGGCGATAGTGTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F731TF U 1
AF RR4F731JQ C 437
BS 1 726 RR4F731TF
BS 727 727 RR4F731JQ
BS 728 734 RR4F731TF
BS 735 735 RR4F731JQ
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BS 772 772 RR4F731JQ
BS 773 792 RR4F731TF
BS 793 1120 RR4F731JQ

RD RR4F731TF 792 0 0
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ATCGGTGACGATGGTGAAGCTCGCCATGAGAGCTTAGCCGGAGTCAAGCTCGAAGCTATT
CGTTTATCATCTTGTTATTCTCTGTTCTATCTTGTAATCTGTGTTGAGTGATCAATAAGA
AGAGTTCATAGAGTTCTAGATATCAATACTCTATCATTGGTGCGGTGATACTGGTTCGGA
TTCAACGCGGTGCTGCGACTGTGTGACGGAGCGGAGAAGACGAAGCGATTTGATTCTGTG
GAGAAGCAGATCGCACCGATCGGAATGGCAGAGAAACTGGAGGATTCAAGTCCCGTCAAT
GGAATCGTTACGGTTCCAGTGTTTCCGGATGTAGGCTTGAGGCAGTGGATTTCGTGGATG
GAGCATTACTTTGCTCGGAAGGGACTCTCAGACTTTGAGAAGTTACACATGGCGTATGGA
TTCATTGTGGATGAACCTGAGAGGTATATCATTCGTATTGATTCATTGATGCCTATTAGA
AACTGGAAACATATGAAAGAAACGTTGTTGTGGAAATTTGGAGCTGATGATGATCCTGAT
AAGATTAGGTTACAAATAGAATCTGATAGATGCCATGAGTATCTTATGAATTGGAAGCCA
CGGAGAAAGTATGAAACGACCCAAGATGATGTGAGTTCTAGTGATTGGCATGTTTCAAGT
TCGGAG*CTGCTCA*GACTCAGATGTAGAGCTTAAGCCTGCGTCACTTCAG*AGATGGAG
CATCAGAGTGGT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR4F731JQ 684 0 0
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CTGAGAGGTATATCATTCGTATTGATTCATTGATGCCTATTAGAAACTGGAAACATATGA
AAGAAACGTTGTTGTGGAAATTTGGAGCTGATGATGATCCTGATAAGATTAGGTTACAAA
TAGAATCTGATAGATGCCATGAGTATCTTATGAATTGGAAGCCACGGAGAAAGTATGAAA
CGACCCAAGATGATGTGAGTTCTAGTGATTGGCATGTTTCAAGTTCGGAGGCTGCTCAAG
ACTCAGATGTAGAGCTTAAGCCTGCGTCACTTCAGGAGATGGAGCATCAGAGTGGTGTAA
AACGTGAGATATCAGCAAAGTCTTGTGTGGAGCAGTCTGATTCATCTCTGGAGACAGTTT
CAAATTTTTCTCGGGTTGTAGAGAAGCTGACTGACGGATTGAATTCAAGTAAAGAATTTG
TTCATGAGATTGGTTTGGTGCAGGAGGCAGAGGCACATTCAGCAATTATACAATCTCATG
ATAGGCATCAAACAGTAGCTTAGTGCTTTGAGTTGTTGTTGAGAGTTTCGGCGCTGCTGC
TGCCAAACGTTCCGGTGACCAAGAGTTGCTCAATTACTATTTGTCACAATTCCATCAGAT
TAGACTATCTGGCGATAGTGTTTC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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GCTTTTATCAGAAAAGAATCTATCCCGTGATCCTGCTCGTCGTATCAATAATATTCGATC
ACTGATTTGGAGATGGACAAGTACGAGGTCGTGAAGGATCTGGGGACTGGAAACTTCGGT
GTGGCTCGCCTTCTAAGGCACAAGGAAACCAATGAGCTCGTCGCCATGAAATACATCGAG
AGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAATCACAGATCACTTAAG
CATCCTAATATCATTCGATTCAAGGAGGTGATTCTGACCCCTACGCATCTTGCCATTGTG
ATGGAGTATGCTTCTGGAGGAGAGCTCTTTGAGAGGATCTGCACTGCCGGTAGATTCAGT
GAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGTCGACTACTGCCACTCC
TTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAGAACACACTGCTTGATGGTAGCCCTGCT
CCGCTTTTGAAAATCTGTGATTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACATTCCATTCCT
AAATCGACTGTTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAATAT
GATGGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES81TF U 1
AF RR4AR75TF U 40
BS 1 252 RR4ES81TF
BS 253 255 RR4AR75TF
BS 256 439 RR4ES81TF
BS 440 668 RR4AR75TF

RD RR4ES81TF 439 0 0
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GCTTTTATCAGAAAAGAATCTATCCCGTGATCCTGCTCGTCGTATCAATAATATTCGATC
ACTGATTTGGAGATGGACAAGTACGAGGTCGTGAAGGATCTGGGGACTGGAAACTTCGGT
GTGGCTCGCCTTCTAAGGCACAAGGAAACCAATGAGCTCGTCGCCATGAAATACATCGAG
AGAGGCCGAAAG***GATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAATCACAGATCACTTAAG
CATCCTAATATCATTCGATTCAAGGAGGTGATTCTGACCCCTACGCATCTTGCCATTGTG
ATGGAGTATGCTTCTGGAGGAGAGCTCTTTGAGAGGATCTGCACTGCCGGTAGATTCAGT
GAAGCTGAGGCTAAGTACT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR4AR75TF 629 0 0
G
AAAAGTCATTCGAAATCGCTGCTTTTATCAGAAAAGAATCTATCCCGTGATCCTGCTCGT
CGTATCAATAATATTCGATCACTGATTTGGAGATGGACAAGTACGAGGTCGTGAAGGATC
TGGGGACTGGAAACTTCGGTGTGGCTCGCCTTCTAAGGCACAAGGAAACCAATGAGCTCG
TCGCCATGAAATACATCGAGAGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTA
TCAATCACAGATCACTTAAGCATCCTAATATCATTCGATTCAAGGAGGTGATTCTGACCC
CTACGCATCTTGCCATTGTGATGGAGTATGCTTCTGGAGGAGAGCTCTTTGAGAGGATCT
GCACTGCCGGTAGATTCAGTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTG
GCGTCGACTACTGCCACTCCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAGAACACAC
TGCTTGATGGTAGCCCTGCTCCGCTTTTGAAAATCTGTGATTTTGGTTACTCCAAGTCAT
CTATACTACATTCCATTCCTAAATCGACTGTTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAG
TTCTTTCCCGTAAAGAATATGATGGCAA

QA 2 629 2 629
DS 



AS 1 2

CO CL8791Contig1 1097 2 2 U
GGGACCAAAGTCAAAACTTCTTAAACTTGGTTTCAGATCTGAAAAGGGCTTCATCGAACT
CTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCCCTTCTTCTTCTTCTTCGTTATCTCTTTACTTA
GGACTAAGTAAAGCTGACAACACAATCTGGTTTGAAGACGGGTCCTTTTAATTTTCACTC
CCAAAGAACATTTCAAGTGCTCTTATGAACATGGATTCAGCAAACAGTGAGTTCAACAAA
CGCGCTAGATTGTTTGAGGATCGTGAAAACAAAGACTCCAAGGTGATTCATTCAATGATC
CCTGAATCTACCACACCCCGGTATGACGCTTCTACAACCACTCAAAACTTGTTCGCTGAA
TCAAAACCTGAAGCTACGACGCCAAAAGTACTTAAGAAGAGAGGAAGGAAGAAGAAGAAT
CCTAATCCCGAGGAGGAAACAAACTCGTCAACTCCACGTTGAGAGGACTCAGAGAACCGC
TCAAAGTTCTATGAAAGTGCTTCTGCAAGAATGCGAACTGCAACTGCAGAGGAAAGAGAG
AGAGCCATCACTGCATCCAAAACCTGCGAACCAACCAATCCATTCTTTAGAGTTGTTCTG
CGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCATGTACTTGCCTTCTGGGTTTGCTGAGAAG
TACTTAAGCGGGATATCTGGCTTCATCAAGATCCAGCCAGGGGAGAAACAATGGCCAGTG
AGGTGTCTTTACAAGGCAGGGAGAGCTAAGTTCAGCCAAGGATGGTATGAGTTCACGCTT
GAGAACAATATAGGTGAAGGGGATGTTTGTGTGTTTGAGCTTCTCAGTACTCGGGACTTC
GTTCTGAAAGTCACTGCCTTTCGCGTCAACCAGTACGTGTGACTCTCCATGAGCGGTCTT
CGTTCAAAAATTTCATGCAGGGTCTTTTATCTGTTTGTTCTGAGTGAAATTTCAGGTTAC
CGTGCTTTCAATGTGATTAAGTATTCGAAGATTGAGTGAAAAACTCTGTATGAATGGGTA
GTTAGGGTCAAAAGTAGAAGATGTTATTACTTTTATGTGAATGTTGACTATGATGTGGTT
TAAGGGTTTTGGCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GK91TF U 1
AF RR4GK91JQ C 321
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BS 706 1097 RR4GK91JQ

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CTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCCCTTCTTCTTCTTCTTCGTTATCTCTTTACTTA
GGACTAAGTAAAGCTGACAACACAATCTGGTTTGAAGACGGGTCCTTTTAATTTTCACTC
CCAAAGAACATTTCAAGTGCTCTTATGAACATGGATTCAGCAAACAGTGAGTTCAACAAA
CGCGCTAGATTGTTTGAGGATCGTGAAAACAAAGACTCCAAGGTGATTCATTCAATGATC
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TCAAAACCTGAAGCTACGACGCCAAAAGTACTTAAGAAGAGAGGAAGGAAGAAGAAGAAT
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AGAGCCATCACTGCATCCAAAACCTGCGAACCAACCAATCCATTCTTTAGAGTTGTTCTG
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TACTTAAGCGGGATATCTGGCTTCATCAAGATCCAGCCAGGGGAG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR4GK91JQ 777 0 0
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TTCTGCAAGAATGCGAACTGCAACTGCAGAGGAAAGAGAGAGAGCCATCACTGCATCCAA
AACCTGCGAACCAACCAATCCATTCTTTAGAGTTGTTCTGCGACCATCTTATCTCTACAG
AGGCTGCATCATGTACTTGCCTTCTGGGTTTGCTGAGAAGTACTTAAGCGGGATATCTGG
CTTCATCAAGATCCAGCCAGGGGAGAAACAATGGCCAGTGAGGTGTCTTTACAAGGCAGG
GAGAGCTAAGTTCAGCCAAGGATGGTATGAGTTCACGCTTGAGAACAATATAGGTGAAGG
GGATGTTTGTGTGTTTGAGCTTCTCAGTACTCGGGACTTCGTTCTGAAAGTCACTGCCTT
TCGCGTCAACCAGTACGTGTGACTCTCCATGAGCGGTCTTCGTTCAAAAATTTCATGCAG
GGTCTTTTATCTGTTTGTTCTGAGTGAAATTTCAGGTTACCGTGCTTTCAATGTGATTAA
GTATTCGAAGATTGAGTGAAAAACTCTGTATGAATGGGTAGTTAGGGTCAAAAGTAGAAG
ATGTTATTACTTTTATGTGAATGTTGACTATGATGTGGTTTAAGGGTTTTGGCTCCG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GJ83JQ U 1
AF RR4GK73JQ U 1
BS 1 709 RR4GJ83JQ

RD RR4GJ83JQ 709 0 0
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QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4GK73JQ 693 0 0
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AACAAGACTGCAAAAACGCTGGAACGTTGCACGTTTGATTGGAAGGAGAAAAGACATGTT
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GTTGTGGTACTGTAATTGAATCCCTCGGGAGCAGCTCCTTGAGTACGTGACGAGTGAAGC
TGTTTCCTCACCTGAGTAGCCAGAACTTTTCCTAGCTCAACTCCCCACTGGTCAAACGAA
TTGATACCCCACACAAACCCTTGAACCGCCACTCTGTGTTCATAGATTGCCAGCAACTGG
CCAACATTGTAAGCACTCAGTTCCGGAAGTAGAAGGCTAAGAGAAGGTCGGTTGCCGGTG
AATGTCTTGTGAGGAATGAGATTTTCTGAAACATTCTCTTTCTGCAGCTGTTCAGGTGTT
TTTCCATATGCAAGAGCATCAGGCTGAGCAAAAAAGTTGGACATGAGCTCGTCATGGTTA
CTAACAACCTCTCCTTCCAAGTAGACAGGTTGCTGACTCTTCACAGTGCCAATGAAATCA
CAAGGGATTACTCGTCCCTGGTGAATGAGTTGG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8793Contig1 1084 2 8 U
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TTTCCCTTTCCCTTCCTCATCTTATCGTCTTCGGTCGACCTTTGATCCTGCGTTCGATTC
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GTTCCCAGAGAAACGTTCCCTCTCGTGGATCCGGAAGCTCAAAGAGATCGGCGAAAATGA
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ATTG


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4D854TF U 1
AF RR4EW24TF U 408
BS 1 419 RR4D854TF
BS 420 420 RR4EW24TF
BS 421 463 RR4D854TF
BS 464 464 RR4EW24TF
BS 465 578 RR4D854TF
BS 579 579 RR4EW24TF
BS 580 600 RR4D854TF
BS 601 1084 RR4EW24TF

RD RR4D854TF 606 0 0
GGAAGATAGGGTGAAGATCAAACCACATCCATCTGTTTTCTTCATTTCTCTCTCTTTCTC
TTTCCCTTTCCCTTCCTCATCTTATCGTCTTCGGTCGACCTTTGATCCTGCGTTCGATTC
CGGAAGTCATGGCTATGGCCACAAGGGTGATGTCTCAATCTACTCCACTGTCTCTGGCCT
GTTCCCAGAGAAACGTTCCCTCTCGTGGATCCGGAAGCTCAAAGAGATCGGCGAAAATGA
TGTGCACTCAGCTACAAGTCTCTGGTTCAAGAATGCAAGGTTTTATGGGGTTGCGTGGGA
ACAATGTCTTAGACACTCTAGGGAGATCCCGTCAGAGTTTCGGTGGTAAGGTGCGGCATG
CGATGAGTGTGCCCAAGGGGAAAGGTAGCCGGGGTGTGGTCAAAGCAATGTTTGAGAGGT
TTACTGAGAAAGCTATCAAGGTTATTATGCTTGCTCAGGAGGAGGCTAGGAGATTAGGCC
ACAATTTCGTGGGGACCGAGCAGATTCTTCTTGGTCTTATTGGTGAGGGTACTGGGATTG
CTGCTAAGGTTTTGAAGTCCATGGGGATTAACCTTAAG*ATGCGCGTGTGGAGGTTGAGA
GATTAT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4EW24TF 677 0 0
GG
GTTTGAGAGGCTTACTGAGAAAGCTATCAAGGTTATTATGCTTGCTCAGGAGGAAGCTAG
GAGATTAGGCCACAATTTCGTGGGGACCGAGCAGATTCTTCTTGGTCTTATTGGTGAGGG
TACTGGGATTGCTGCTAAGGTTTTGAAGTCCGTGGGGATTAACCTTAAGGATGCGCGTGT
GGAGGTTGAGAAGATTATTGGAAGGGGAAGTGGGTTTGTTGCTGTTGAGATCCCGTTTAC
TCCTCGTGCGAAGCGTGTTCTTGAACTCTCACTGGAAGAAGCTCGTCAGCTCGGTCACAA
TTACATCGGTTCCGAGCACCTTCTTCTTGGGTTGCTACGTGAAGGCGAAGGTGTTGCTGC
TCGAGTCCTTGAGAATTTAGGAGCAGATCCTAGTAATATTCGCACTCAGGTGATACGCAT
GGTGGGTGAGAACAATGAGGTCACTGCTAATGTTGGTGGAGGAAGCGGCAGCAATAAGAT
ACCAACTCTTGAAGAGTACGGGACAAACTTAACGAAACTGGCTGAGGAGGGTAAATTGGA
CCCAGTTGTTGGTAGGCAGCCGCAAATAGAACGTGTGGTGCAAATTCTTGGCAGAGAACC
AAGAACAACCCCTGTCTCATTGGGGAACCCGGTGTTGGTAAGACAGCTATTGCCGAAGAC
TAGCACAGCGTATTG

QA 3 677 3 677
DS 



AS 1 2

CO CL8794Contig1 854 2 14 U
GGGAACATATTCTATGATATAGCTACCGAACTTCTTTTTCCTATAAAATAAATAGGTGGG
TAGGGCAAAAGAGAAGAGCCTCCTCATATCACCCAATTGTTGTTGTTATACCCAAAGAAG
AAGCAAAAACCATTAGTCACTGATTGTTTCAGAAAGAGAGATGGAGAGAGCAACCACCAT
TTCTCCGAGCCTGAGTCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTCACCACGCGCAT
CCACTCCTTCTCTACTACTCGGAGCTTATCGCCATCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAGGT
TCAGCATTCCTCCTCTTCTGTATCTTCCTGTTTCATCAATGCCCGAACCTCCCTTACTCG
TTGCAACGCCGTCCTCTCCAATTCGTCTTCCAGTAGTACGGAGGTAGCAGACATAGATTG
GGACAACATCGGGTTCGGTCTGAAACCGACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACCT
TAACGGGGAGTTCTCAAAGGGTGAACTGCAACGTTTTGGGAACATCGAAGTCAGCCCCTC
TGCTGGTGTCCTCAACTATGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCA
AGACGGTAAAAACATCCTCCTCTTTCGTCCTCAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAAATGG
TGCCGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTGAAAGC
AACCGTGTTAGCAAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAGTAAAGGTTCTTTGTATATTAGA
CCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCTGCCCAGATATACTTTCCTT
GTCTATGTTTCTCT


BQ
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AF RR4DK25TF U 1
AF RR4CR27TF U 115
BS 1 236 RR4DK25TF
BS 237 237 RR4CR27TF
BS 238 238 RR4DK25TF
BS 239 239 RR4CR27TF
BS 240 253 RR4DK25TF
BS 254 254 RR4CR27TF
BS 255 256 RR4DK25TF
BS 257 257 RR4CR27TF
BS 258 505 RR4DK25TF
BS 506 506 RR4CR27TF
BS 507 658 RR4DK25TF
BS 659 659 RR4CR27TF
BS 660 741 RR4DK25TF
BS 742 854 RR4CR27TF

RD RR4DK25TF 741 0 0
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TAGGGCAAAAGAGAAGAGCCTCCTCATATCACCCAATTGTTGTTGTTATACCCAAAGAAG
AAGCAAAAACCATTAGTCACTGATTGTTTCAGAAAGAGAGATGGAGAGAGCAACCACCAT
TTCTCCGAGCCTGAGTCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTCACCACGCTCCT
CCACTCCTTCTCTGCTTCTCGGAGCTTATCGCCATCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAGGT
TCAGCATTCCTCCTCTTCTGTATCTTCCTGTTTCATCAATGCCCGAACCTCCCTTACTCG
TTGCAACGCCGTCCTCTCCAATTCGTCTTCCAGTAGTACGGAGGTAGCAGACATAGATTG
GGACAACATCGGGTTCGGTCTGAAACCGACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACCT
TAACGGGGAGTTCTCAAAGGGTGAATTGCAACGTTTTGGGAACATCGAAGTCAGCCCCTC
TGCTGGTGTCCTCAACTATGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCA
AGACGGTAAAAACATCCTCCTCTTTCGTCCTCAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAAATTG
TGCCGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTGAAAGC
AACCGTGTTAGCAAACAAACG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR4CR27TF 740 0 0
GG
GAAGAAGCAAAAACCATTAGTCACTGATTGTTTCAGAAAGAGAGATGGAGAGAGCAACCA
CCATTTCTCCGAGCCTGAGTCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGTCTTCACCACGC
GCATCCACTCCTTCTCTACTACTCGGAGCTTATCGCCATCATCTTCCTCCTCCTCCATCA
AGGTTCAGCATTCCTCCTCTTCTGTATCTTCCTGTTTCATCAATGGCGGAACCTCCCTTA
CTCGTTTCAACGCCGTCCTCTCCAATTCGTCTTCCAGTA***CGGAGGTAGCAGACATAG
ATTGGGACAACATCGGGTTCGGTCTGAAACCGACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCA
ACCTTAACGGGGAGTTCTCAAAGGGTGAACTGCAACGTTTTGGGAACATCGAAGTCAGCC
CCTCTGCTGGTGTCCTCAACTATGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAA
AGCAAGACGGTAAAAACATCCTCCTCTTTCGTCCTGAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAA
ATGGTGCCGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTGA
AAGCAACCGTGTTAGCTAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAGTAAAGGTTCTTTGTATAT
TAGACCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCTGCCCAGATATACTTT
CCTTGTCTATGTTTCTCT

QA 3 740 3 740
DS 



AS 1 2

CO CL8795Contig1 1012 2 10 U
GGACGAAGAGGCTTGCGAGAAAGTCTCGTTTTCAGATCATCTTGGATATTGTTTCTCGGG
CGATCGAGACAATTGTTGTTCTGGTTACGGTTGCTAAGCTCTGCTACCAGCTCGTTGTGG
CGTTTCATTACTCTGGTGTCGCCGCGGTTATACTCGCAAACCGTAATCTCGCGTTTGTTG
TGGGAAACGCGATAGTCATTGCTCTAATCGCGAAATCCGGCCTTCTCTCGAATCAAGAAG
CTGTTCCGAAGTACAAAAGCAACGATCTTTACGAGGAGTTTGTTCGGGAGAGCTCAAAGA
GAGAAGGAGGTCAACGGTCCGAGATGAGAAACAGAGAAAAACAGAGCGAAGCAGAGAACG
AGGCTAAGCATAGCATAACCGAAACCAGACCAAAACAGAGTGAAGCAGAGAAAGAAACAC
AGAGCATAACTGAGAACATGGCAAAACAGAGCAATTCCGACCAGGGAGAGGGACAGGTTG
TAATTGAGAAGAAGACAAAGAAGAGCATTTCTGAGAAGAGAGTGAAAAGGAGCAAACATG
AGAAGCTAACAGAACAGAGCACTTCAGTGAAGAAGATGGAGGAACAGAACTTGGCTGAGG
AGATGCAGCAAATACAGAGTTACCAACGAAGCAAGTCAGAGAATATGAAGGGTTTAAAGA
AGAGTTATTGTGGAAGATTAAGGAGATCGGAGACGGATGCTTCTTCTGAAAGATTTGATT
CTGACGATGAACTCCGATACAAGATCGAGTCTTTCATTGCCAAGCAGAGGAGGAATCAAA
ATGATGACTAGTTTGGTGTATATTTATACATGAAAATATATTAATATATGCAACAAAATA
ACGTTAGTTTTTGCAAATATCATTCACGTTAAATTCTCATGTTGTTGTGTTTGCCTTTGG
AAAACAGAGTATATTTCTCTCAACTAACGCCATGTGGTAGGTGAAAACCATTCTTAACAA
GGTCTGCGTAGAGAATAAACCTTCGGTTTTGTTTGCTTAACATAAACAAGCG


BQ
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AF RR4DG31TF U 1
AF RR4DG31JQ C 182
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*TGATGACTAGTTTGGTG

QA 1 798 1 798
DS 

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TGGG
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CCGAAGTACAAAAGCAACGATCTTTACGAGGAGTTTGTTCGGGAGAGCTCAAAGAGAGAA
GGAGGTCAACGGTCCGAGATGAGAAACAGAGAAAAACAGAGCGAAGCAGAGAACGAGGCT
AAGCATAGCATAACCGAAACCAGACCAAAACAGAGTGAAGCAGAGAAAGAAACACAGAGC
ATAACTGAGAACATGGCAAAACAGAGCAATTCCGACCAGGGAGAGGGACAGGTTGTAATT
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AGTTTTTGCAAATATCATTCACGTTAAATTCTCATGTTGTTGTGTTTGCCTTTGGAAAAC
AGAGTATATTTCTCTCAACTAACGCCATGTGGTAGGTGAAAACCATTCTTAACAAGGTCT
GCGTAGAGAATAAACCTTCGGTTTTGTTTGCTTAACATAAACAAGCG

QA 5 831 5 831
DS 



AS 1 2

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ACAAAGCCACTGCTCCTTCAGAAGCTGCTAAAGCCTAAAGCAAATATAAGCAAAACAGAA
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TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTCCCGCGGATTTTCATGGCGAAAAGGACGGTG
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BQ
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AF RR4CQ46JQ C 1
AF RR4CQ46TF U 50
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ACAAAGCCACTGCTCCTTCAGAAGCTGCTAAAGCCTAAAGCAAATATAAGCAAAACAGAA
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TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTCCCGCGGATTTTCATGGCGAAAAGGACGGTG
TT*GCTTGTTTTGTAATTTGTGTGGAGATATAAAAAGAAAAGCCCGTAATGTAGAG

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DS 

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CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTCCCGCGGATTTTCATGGCGA
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TGTAGAG

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTTTGGTTGTGTACATGAGCTTCTATTAAAACCTTATTGAAACGTTTGATATTTGCAAT
GCTTTTAAGCAAGTAGTTGGCTATTATAATGATTAAAGCGAGTCGTTTCC


BQ
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AF RR4C377JQ C 1
AF RR4C377TF U 1
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RD RR4C377JQ 590 0 0
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ACCACTGGCAAGCAACTATTATGGGTCCCACTGATAGCCCATTCGCCGGAGGTGTCTTTC
TTGTTTCCATTCACTTCCCTCTGGTTCCTGAAATAGCTAACATCTACAAGGCAGACCGTA
CCAAGTACGAGAACACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGGT
TGGCACTAATGATTCGCACCAGTAAATTGCGCATTCGTTTTAAGAATTGGAGAAATAAAA
AAAAACATGAATTTGGCTTTAGCTTGGTTGCTTGATTTAATTATCTTATTATTAAGCCAT
GTTTTGGTTGTGTACATGAGCTTCTATTAAAACCTTATTGAAACGTTTGATATTTGCAAT
GCTTTTAAGCAAGTAGTTGGCTATTATAATGATTAAAGCGAGTCGTTTCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4C377TF 590 0 0
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ACCACTGGCAAGCAACTATTATGGGTCCCACTGATAGCCCATTCGCCGGAGGTGTCTTTC
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CCAAGTACGAGAACACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGGT
TGGCACTAATGATTCGCACCAGTAAATTGCGCATTCGTTCTAAGAATTGGAGAAATAAAA
AAAAACATGAATTTGGCTTTAGCTTGGTTGCTTGATTTAATTATCTTATTATTAAGCCAT
GTTTTGGTTGTGTACATGAGCTTCTATTAAAACCTTATTGAAACGTTTGATATTTGCAAT
GCTTTTAAGCAAGTAGTTGGCTATTATAATGATTAAAGCGAGTCGTTTCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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CAGAAGATATCCACCGTTGTCTCTCCCAGTTCTCAAAGGCTTCAGACTCTCACCGTTTTC
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AACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAAT
GTGATCGGCGCTCTTCCCTACCTGAAAGTCAACCGAAAGGCGACTTAAGCAGAGCCGGCT
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TTGTTTTGTGATTTTTTGGTCAATTAGTTGATCCTTCTTCCACCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AP96JQ C 1
AF RR4AP96TF U 1
BS 1 586 RR4AP96TF

RD RR4AP96JQ 586 0 0
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TCCGTTAACATCACCTTCTCTCCTTTACGCTCGTCCCCAAAGGTTTCCGTTCAATTCCCT
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4AP96TF 586 0 0
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AACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAAT
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TGATTCCTTTTCTTACCTGCATTTCTCATTTTGTAATCTAAGTTATGATAATACTCTCTT
TTGTTTTGTGATTTTTTGGTCAATTAGTTGATCCTTCTTCCACCAT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL8800Contig1 716 2 3 U
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TTTGAAGATTACTTGGAACCCTTAAAGCTATACCTTGCCAGGTACAGGGAGTTGGAGGGG
GATAATAAGGGCTCAGGAAAGAGCGGGGAGAGTAACAATAGAGATGCGGCTGGGGGTGCT
TCCGGTGAAGATTTGCCGAGCTGGTGAGGCGAGAAGTTTCAAGTGAACTCTTTAGAAATA
AAGAACAACACCAACATGATCAAGGGATAGCAGAGATCAGTGTTGTTGTCTTTACATTTG
AGCTCATGGTCGAATTTCGGTTATGTGATAACTTGAGAATTTTGGTTATCTGTTTCCGGT
TTAGTTGGTTGTAGTTGAAGATATGAGAAGTATTTGAAAGTAGAAAAATTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GT37TF U 65
AF RR4GT37JQ C 1
BS 1 64 RR4GT37JQ
BS 65 646 RR4GT37TF
BS 647 716 RR4GT37JQ

RD RR4GT37TF 589 0 0
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AAGATTACTTGGAACCCTTAAAGCTATACCTTGCCAGGTACAGGGAGTTGGAGGGGGATA
ATAAGGGCTCAGGAAAGAGCGGGGAGAGTAACAATAGAGATGCGGCTGGGGGTGCTTCCG
GTGAAGATTTGCCGAGCTGGTGAGGCGAGAAGTTTCAAGTGAACTCTTTAGAAATAAAGA
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CATGGTCGAATTTCGGTTATGTGATAACTTGAGAATTTTGGT
ATCTGTT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4GT37JQ 716 0 0
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GAAAGCGGCGGTTCGGTTAGGGAGCAGGACCGGTACCTACCAATAGCTAACATAAGCAGG
ATCATGAAGAGAGCTTTGCCTCCCAACGGAAAGATCGGGAAAGATGCTAAAGACACTGTC
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AAAGAGAAAAGGAAAACTGTGAACGGCGAGGATTTGTTGTGGGCAATGACAACGTTAGGA
TTTGAAGATTACTTGGAACCCTTAAAGCTATACCTTGCCAGGTACAGGGAGTTGGAGGGG
GATAATAAGGGCTCAGGAAAGAGCGGGGAGAGTAACAATAGAGATGCGGCTGGGGGTGCT
TCCGGTGAAGATTTGCCGAGCTGGTGAGGCGAGAAGTTTCAAGTGAACTCTTTAGAAATA
AAGAACAACACCAACATGATCAAGGGATAGCAGAGATCAGTGTTGTTGTCTTTACATTTG
AGCTCATGGTCGAATTTCGGTTATGTGATAACTTGAGAATTTTGGTTATCTGTTTCCGGT
TTAGTTGGTTGTAGTTGAAGATATGAGAAGTATTTGAAAGTAGAAAAATTTTCTCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL8801Contig1 916 2 6 U
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CTTCTTGCTCTAGCTGATTTAGGGGATGAGCTTGATGTTGATAAGCTTTTGCTTGAGATA
GAAAATCCCCTTTTCAAAAGCATTCATGAGAATGAGAACATTGTGTTTTATTCAGTTGAT
GGAGATAGAGTTGACTACTTTGTTAAAACCTCGTTTGAACCTGTAGTTGACTTTGTCTTT
CCACCAAATGCATTTGATTCTCATGACCATTTGAACCTCAAAGAGCATCTCATGATTCAT
GATACATCTTTAGTGAAGCTCTTTGATGAAAAATCTGTCTATTACCTATGGACAGTAGTG
TGCTCCTTTGCGCATTTGGTTTCTTGTTCTTGTAGGAGAAGGACCAAAGGTGCATTGGCT
CAGCCCTTTGATACTTATGATTAGCATGCACACAAAGTCAAGCTAGAGACTTAAAACAAG
CTCACTTGGGAGGAAGTCCCATGTTTATCCATTGTATATATTTCTTTATCTTTCTTTCTT
TTTAAGTTGTTTAATAAGTATGGTTGAGGTTGTTCAGGTTGGGTCTAAAGCAAGATAAGT
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CATGTCTACTGGTGCAACGAACAAGAGGCCAAGGGTCCTCTACCACCCAATTCAGCCAAT
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TTTAGATTTCTTCCTTGAGCTTACTCTCACACAAGGGACTGTGTGAAGTAAGTTTGGGGG
AGAGTCTACTATCTCACATTGTTTTCTGTTTTGTTTTCTTGTCATGAGTCTCATGCATTG
TGCACTTATTTGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY32TF U 1
AF RR4GY32JQ C 134
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BS 741 916 RR4GY32JQ

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GGAGATAGAGTTGACTACTTTGTTAAAACCTCGTTTGAACCTGTAGTTGACTTTGTCTTT
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GATACATCTTTAGTGAAGCTCTTTGATGAAAAATCTGTCTATTACCTATGGACAGTAGTG
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TACTCCAAGTAAGTGTCACT

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DS 

RD RR4GY32JQ 783 0 0
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CTTGAGCTTACTCTCACACAAGGGACTGTGTGAAGTAAGTTTGGGGGAGAGTCTACTATC
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ATC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AG39JQ C 1
AF RR4AG39TF U 1
BS 1 590 RR4AG39TF

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QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4AG39TF 590 0 0
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AAAGACGAGATAGAGAAGATGGTGCAAGGGGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAAGAG
CATAAGAAGAAGGTTGAGGCCAAGAACGCGCTCGAGAACTATGCTTACAACATGAGGAAC
ACGATTCGAGATGAGAAGATTGGCGAGAAGCTCCCTGCTGCGGACAAGAAGAAGATTGAG
GATTCGGTTGAGGAGGCGATCCAGTGGCTTGATGGGAACCAGACGGCTGAAGCAGACGAG
TTTGAAGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTCTGCAATCCCATCATAGCTAAGATGTAT
CAAGGAGCTGGTGGTGAAGCAGGTGGAAGGATGATGATGAAGCTCCTCCTTCTACAGGAG
GTGCTGGCCCCAAGATTGAGGAAGTCGATTAAGCTCTGGTGCATTCTTTAAGCCTTTGAT
GGTCTAAATTTCTGTGTGTTTTTTTGTGTGTTTGCTTGCGATGGGCTCTCTCTATTATCT
TGTGAACCTTTTTTTTATTTATTTCTAATCAAGTTGCAGTTTCGAACTTG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL8803Contig1 800 2 2 U
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TCCTCATGTGGTTTCCTAGTTAAAAAAAAAACAACATAAAACCACATGATGACTTCTTTT
TCTTACATGCACAAATAATCTCCCTTAGAAAAGAAAGAACAACAATGAAGCAAATTCAAG
AAAAATGGGTAAAACTAAAGAATCTCTAGTAAAAAAATAAATAAAAAACAGACAGAGAGA
TGATAAAGAGAACATGACCGTAGCTTTCCCACAAGTTCCGACAAAACTTGAAGAGTTACT
ATAAAAAGATATACAACTTTACAGGAGACAAAAGGGATCGGTGGTGTCCAAACGAACAAT
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TGCCGAAGAAGCTGGCGGTTTATGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTCAGATCTCCT
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BQ
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AF RR4BC46TF C 1
AF RR4BC46JQ U 5
BS 1 4 RR4BC46TF
BS 5 800 RR4BC46JQ

RD RR4BC46TF 767 0 0
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TCTTACATGCACAAATAATCTCCCTTAGAAAAGAAAGAACAACAATGAAGCAAATTCAAG
AAAAATGGGTAAAACTAAAGAATCTCTAGTAAAAAAATAAATAAAAAACAGACAGAGAGA
TGATAAAGAGAACATGACCGTAGCTTTCCCACAAGTTCCGACAAAACTTGAAGAGTTACT
ATAAAAAGATATACAACTTTACAGGAGACAAAAGGGATCGGTGGTGTCCAAACGAACAAT
ACTGATGATGATGATGACGGGATGGATATTACCATACCATGAAGATTAAAGCTGTAATTG
ACCAGGTCCTTTCCTTGAGGATCTTGATGGAGGTCGATTGATGTCCGCAACTGATGGTGA
TGCCGAAGAAGCTGGCGGTTTATGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTCAGATCTCCT
CACCTCCTTCGATGCAGAAGTAGATGAAGTGTTATATGAGTAGTTCACTTTATTCCTTGC
CTGCCCACGATGCTGATTCTGTACGTTCTCAAACTGTTGCAGCCGTGCAGCAAAATTGAT
TACTTGGTGAGAATTGTTGATGTTATTGTCTTCCGCGTCACCGTCCTCGCGGTGATGCAT
ATACTGAGAGAAAGGAACTCCTGAAGATGCTCTGCTTATTTGGCCTC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BC46JQ 796 0 0
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CATGTGGTTTCCTAGTTAAAAAAAAAACAACATAAAACCACATGATGACTTCTTTTTCTT
ACATGCACAAATAATCTCCCTTAGAAAAGAAAGAACAACAATGAAGCAAATTCAAGAAAA
ATGGGTAAAACTAAAGAATCTCTAGTAAAAAAATAAATAAAAAACAGACAGAGAGATGAT
AAAGAGAACATGACCGTAGCTTTCCCACAAGTTCCGACAAAACTTGAAGAGTTACTATAA
AAAGATATACAACTTTACAGGAGACAAAAGGGATCGGTGGTGTCCAAACGAACAATACTG
ATGATGATGATGACGGGATGGATATTACCATACCATGAAGATTAAAGCTGTAATTGACCA
GGTCCTTTCCTTGAGGATCTTGATGGAGGTCGATTGATGTCCGCAACTGATGGTGATGCC
GAAGAAGCTGGCGGTTTATGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTCAGATCTCCTCACC
TCCTTCGATGCAGAAGTAGATGAAGTGTTATATGAGTAGTTCACTTTATTCCTTGCCTGC
CCACGATGCTGATTCTGTACGTTCTCAAACTGTTGCAGCCGTGCAGCAAAATTGATTACT
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TGAGAGAAAGGAACTCCTGAAGATGCTCTGCTTATTTGGCCTCCACCACTGAATGAGTAT
GTTGGCACAGTTTTGA

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL8804Contig1 586 2 1 U
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CTAGATTGATAGGAATTGGCTGCCTTGGTTTGAATTCTTGCTTGGTAAGTTGATTTCTAG
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GAAAATTGAAATTTAAAATTCCATGAAAGTTAAAAAATATAGCTTATGATCTAAGAAGAC
GCATTAATTATATGACTTGATATTCTTGAAGTTACTTAACACTTTT


BQ
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AF RR4DL19JQ C 1
AF RR4DL19TF U 1
BS 1 586 RR4DL19TF

RD RR4DL19JQ 586 0 0
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GAAAATTGAAATTTAAAATTCCATGAAAGTTAAAAAATATAGCTTATGATCTAAGAAGAC
GCATTAATTATATGACTTGATATTCTTGAAGTTACTTAACACTTTT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4DL19TF 586 0 0
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GTTCTAGTCTAGAGTGACGAGATTTTCTGTTCAAAGGATCTTTAATCAGGGTAGTTCATA
CCACCTCCTCTTGATTATTACTTCTTTTTGTATATCTTCCCTTATTCTTCAATGTTTATG
CTAGATTGATAGGAATTGGCTGCCTTGGTTTGAATTCTTGCTTGGTAAGTTGATTTCTAG
ACATCATAGCGGACTGCCACCGCCGACGTCGTCTTCACGGAATCGTACGCTTCCAATTTA
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GAAAATTGAAATTTAAAATTCCATGAAAGTTAAAAAATATAGCTTATGATCTAAGAAGAC
GCATTAATTATATGACTTGATATTCTTGAAGTTACTTAACACTTTT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL8805Contig1 461 2 2 U
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GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTTATATATTGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGACCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTTCCTAAA
TAAGTCCTTTTTTCAAAATCGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CW81TF U 1
AF RR4E338TF U 252
BS 1 459 RR4CW81TF
BS 460 461 RR4E338TF

RD RR4CW81TF 459 0 0
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GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTTATATATTGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGACCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTTCCTAAA
TAAGTCCTTTTTTCAAAATCGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTG

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR4E338TF 210 0 0
G
GATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTAGTGAGAAATA
ATAAACCGACCGACCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTTCCTAAATAAGTCCTTTTT
TCAAAATCGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAATCTTCTAGAA
AAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGAT

QA 2 210 2 210
DS 



AS 1 2

CO CL8806Contig1 828 2 2 U
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TCACATGGCGCCCCCATTTCTCTGAATCACACTTCTGTAGCTTGAGCTTGAGGTTGGAAA
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AGTAGAAAACAAACAAGCTCAGAAGGTAATGGTTCAATCTAGCTAGCCAAACGAAATGGT
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ACTTTTCTTCCGGATTGCTAAGAAGCTCCCTTCTGTCCAGATACTGAGAGAGTGTACTAA
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CAACACTATTAGTAATGCCTTAAAGGAAAAAGGATATTCTCTTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B667TF U 1
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DS 

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CATCTTCGACCTTCACATCAACATCCACACGTTCAGGTTCAAGCTCCTCTGCAACAACAA
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QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BW36TF U 1
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QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B792TF U 1
AF RR4BH63TF U 1
BS 1 768 RR4B792TF

RD RR4B792TF 768 0 0
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AATTGTTGAAAGGATACCTCCACCTCCCGAAACTGCAGAAAAACCCTTCAGAGCCTTAAT
TTTTGACAGTTATTATGATCCATATCGTGGTGTCATCGTATACTTCCGAGTCATCGATGG
GAAAGTGAAGAAAGGCGACAGGATTCTATTCATGGCAAGCGGAAAGGATTATTTCGCAGA
TGAAATCGGCGTTCTATCTCCAAATCAAATTCAAGTGGATGAGTTATATGCTGGTGAGGT
GGGGTACATTTCTGCTTCTATAAGATCGGTTGCAGATGCCAGGGCAGGAGACACAATAAC
AAATTTTAGCAGAAAGGCAGAAAGCTCCTTACCCGGTTACGAGGAAGCTACCCCTATGGT
GTTCTGTGGCCTGTTCCCAGTTGACGCTGACCAATTTCCTGATCTTCGAGATGCGTTAGA
AAAACTGCAACTCAATGATGCCGCTCTGAAGTTTGAGCCTGAGACTTCAAGTGCCATGGG
TTTTGGCTTTAGGTGCGGTTTCTTGGGTCTTCTCCACATGGAAATTGT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4BH63TF 768 0 0
GGAGGGTGCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCCAGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGCCAA
CGTTTATTTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAGATAATTCCTGTTGTGAATAAGATTGACCT
TCCAGGCGCCGAGCCAGAGCAAGTTCTCAGGGAGATTGAGGAGGTTATTGGGTTAGACTG
TAGCAAAACAATACTCTGCTCGGCAAAGGAGGGAATTGGTATAACGGAGATATTGAATGC
AATTGTTGAAAGGATACCTCCACCTCCCGAAACTGCAGAAAAACCCTTCAGAGCCTTAAT
TTTTGACAGTTATTATGATCCATATCGTGGTGTCATCGTATACTTCCGAGTCATCGATGG
GAAAGTGAAGAAAGGCGACAGGATTCTATTCATGGCAAGCGGAAAGGATTATTTCGCAGA
TGAAATCGGCGTTCTATCTCCAAATCAAATTCAAGTGGATGAGTTATATGCTGGTGAGGT
GGGGTACATTTCTGCTTCTATAAGATCGGTTGCAGATGCCAGGGCAGGAGACACAATAAC
AAATTTTAGCAGAAAGGCAGAAAGCTCCTTACCCGGTTACGAGGAAGCTACCCCTATGGT
GTTCTGTGGCCTGTTCCCAGTTGACGCTGACCAATTTCCTGATCTTCGAGATGCGTTAGA
AAAACTGCAACTCAATGATGCCGCTCTGAAGTTTGAGCCTGAGACTTCAAGTGCCATGGG
TTTTGGCTTTAG*TGCGGTTTCTTGGGTCTTCTCCACATGGAAATTGT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL8809Contig1 1001 2 2 U
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AATGTATGACTGCTCTTGTCACCGGTGGAACCAAGGGAATTGGGTATGCAATAGTGGAGG
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AATGCTTAAGTGAATGGCAAATTAAAGGTTTTCAAGTCAGTGGTTCAGTTTGTGATGTTA
CCTCTCGACCTCAGAGAGAGCAATTGATACAGACTGTTTCTTCTCTATTTGGTTCCAAAC
TCAACATCCTTGTAAACAATGTTGGCAAGTTCATGTTAAAGCCAACTTTAGAAAGTACAG
CAGAAGATTTCTCAAGTTTGATAGCTACAAATTTGGAATCTGCTTACCATATCTCCCAAT
TGGCACATCCTCTGCTTAAAGCCTCGGGAAACGGTAGTATCGTATTCATTTCCTCTGTAT
CAGGGATTGTCTCTGGCACTGTCCCCATATATGGTGCAACAAAAGGAGCCATGAATCAAC
TGGGAAGAAACTTGGCCTGTGAATGGGCAAGTGATAGCATAAGGGTTAACTCTGTAGCTC
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AACAATACGTTATGTTTTACAGTTTAGTATTTTGTATTCCTTTTTTTTTGTAACAATTTT
GTGTTCCTTTTATAAACTCGATTACTTCATTGTGTCCAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B323TF U 1
AF RR4B323JQ C 495
BS 1 680 RR4B323TF
BS 681 1001 RR4B323JQ

RD RR4B323TF 680 0 0
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AATGTATGACTGCTCTTGTCACCGGTGGAACCAAGGGAATTGGGTATGCAATAGTGGAGG
AGCTTGCAAGTTTTGGTGCAAGAGTACACACGTGTGATATAGACAAAACTTCGCTTGACG
AATGCTTAAGTGAATGGCAAATTAAAGGTTTTCAAGTCAGTGGTTCAGTTTGTGATGTTA
CCTCTCGACCTCAGAGAGAGCAATTGATACAGACTGTTTCTTCTCTATTTGGTTCCAAAC
TCAACATCCTTGTAAACAATGTTGGCAAGTTCATGTTAAAGCCAACTTTAGAAAGTACAG
CAGAAGATTTCTCAAGTTTGATAGCTACAAATTTGGAATCTGCTTACCATATCTCCCAAT
TGGCACATCCTCTGCTTAAAGCCTCGGGAAACGGTAGTATCGTATTCATTTCCTCTGTAT
CAGGGATTGTCTCTGGCACTGTCCCCATATATGGTGCAACAAAAGGAGCCATGAATCAAC
TGGGAAGAAACTTGGCCTGTGAATGGGCAAGTGATAGCATAAGGGTTAACTCTGTAGCTC
CTTGGGTCACTGCAACTTCACTTGTCAGAAAATATCTTGATGACAAGAAATTCGCTGATG
CTATGTTCTCAAGAACCCCA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4B323JQ 507 0 0
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GCCTGTGAATGGGCAAGTGATAGCATAAGGGTTAACTTTGTAGCTCCTTGGGTCACTGCA
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ACCCCATTAGGCCGTGCATGTGAACCGCGTGAGGTTGGGTCGTTAGTTACATTTTTTTGT
CTCCCTGCAGCTTTTTATATAACAGGACAAACCATCTGTGTTGATGGAGGTTTCATTGTT
AATGGCTTTTCCTACAAGCCAGAGGTGTAAAACCCTTGAAAACATTTTTAGAACAACATT
GTTGTAATGTATGAATAATACGTTATGTTTACAGTTTAGTATTTTGAACAATACGTTATG
TTTTACAGTTTAGTATTTTGTATTCCTTTTTTTTTGTAACAATTTTGTGTTCCTTTTATA
AACTCGATTACTTCATTGTGTCCAAGT

QA 1 507 1 507
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8811Contig1 740 2 4 U
GGGACGGAAGCTTCGACTATAAATCTATGAGTTCTCTCACTGCCTTTTTCTCTGATAAAT
TTCTTTTTTGGTTGCTCGATTTTCTTGGATGGGCCAGACAGTTTCTGAGAAATTAATTGG
GTTTTATACTGTCTGTGCAAATAAACCCAATGTTAGGTTTCTTCCTTCTCGATAATGGAG
ATGGAGAACAGAAACGTCATGCCTTTTCAGATCACACCGTCTCTGACGACTATGTAACGG
CTGCAATTATCATTTAGTAGTTTTCTTAGACTTTTATGTAAGCCATGGTTCTTTTCAATT
TTTCAGATTTTTTTTTTAAACATTTCAGATTTTTACCATTAATCTTTCCATGTATTGGAT
TTCTATTCAGTCTTCACGAATCTCACCAAAAAAATCCTTCACAAAATCATATTTGGAAAC
ATCTTCTGCTTCTTGGAAGGGTTTGTCTTGATGATTTATGTTTCGAATCTATGATTGGAA
GATCTACAGATATACCGGACAAGCTATTGATGGATACAGTGGACAGGAGGGTGGAATCAC
ATTTTTGGGTTCGTCAGTTCGTGGACCATGTTTGCAACTTCTACCACAATTAAACCTTAT
TAGTAATTATTACATTCACGTGTTTACAGATGTCTTCTAATTTTCTTAAGCTCCACTAAA
GTGTTTTTTTTAAATCTCAGCTTATTGTTTCTTCAAATGTGTTGTTAATTTCCACCATCT
TAATAAAAAAAAGGTTTAGC


BQ
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AF RR4BW41TF U 1
AF RR4BW41JQ C 45
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BS 672 722 RR4BW41TF
BS 723 740 RR4BW41JQ

RD RR4BW41TF 726 0 0
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TTCTTTTTTGGTTGCTCGATTTTCTTGGATGGGCCAGACAGTTTCTGAGAAATTAATTGG
GTTTTATACTGTCTGTGCAAATAAACCCAATGTTAGGTTTCTTCCTTCTCGATAATGGAG
ATGGAGAACAGAAACGTCATGCCTTTTCAGATCACACCGTCTCTGACGACTATGTAACGG
CTGCAATTATCATTTAGTAGTTTTCTTAGACTTTTATGTAAGCCATGGTTCTTTTCAATT
TTTCAGATTTTTTTTTTAAACATTTCAGATTTTTACCATTAATCTTTCCATGTATTGGAT
TTCTATTCAGTCTTCACGAATCTCACCAAAAAAATCCTTCACAAAATCATATTTGGAAAC
ATCTTCTGCTTCTTGGAAGGGTTTGTCTTGATGATTTATGTTTCGAATCTATGATTGGAA
GATCTACAGATATACCGGACAAGCTATTGATGGATACAGTGGACAGGAGGGTGGAATCAC
ATTTTTGGGTTCGTCAGTTCGTGGACCATGTTTGCAACTTCTACCACAATTAAACCTTAT
TAGTAATTATTACATTCACGTGTTTACAGATGTCTTCTAATTTTCTTAAGCTCCACTAAA
GTGTTTTTTT*AAATCTCAGCTTATTGTTTCTTCAAATGTGTTGTTAATTTCCACCATCT
TA
TAAA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4BW41JQ 696 0 0
TTTTTCTCTGATAAATTTCTTTTTTGGTTGCTCGATTTTCTTGGATGGGCCAGACAGTTT
CTGAGAAATTAATTGGGTTTTATACTGTCTGTGCAAATAAACCCAATGTTAGGTTTCTTC
CTTCTCGATAATGGAGATGGAGAACAGAAACGTCATGCCTTTTCAGATCACACCGTTTCT
GACGACTATGTAACGGCTGCAATTATCATTTAGTAGTTTTCTTAGACTTTTATGTAAGCC
ATGGTTCTTTTCAATTTTTCAGATTTTTTTTTTAAACATTTCAGATTTTTACCATTAATC
TTTCCATGTATTGGATTTCTATTCAGTCTTCACGAATCTCACCAAAAAAATCCTTCACAA
AATCATATTTGGAAACATCTTCTGCTTCTTGGAAGGGTTTGTCTTGATGATTTATGTTTC
GAATCTATGATTGGAAGATCTACAGATATACCGGACAAGCTATTGATGGATACAGTGGAC
AGGAGGGTGGAATCACATTTTTGGGTTCGTCAGTTCGTGGACCATGTTTGCAACTTCTAC
CACAATTAAACCTTATTAGTAATTATTACATTCACGTGTTTACAGATGTCTTCTAATTTT
CTTAAGCTCCACTAAAGTGTTTTTTTTAAATCTCAGCTTATTGTTTCTTCAAATGTGTTG
TTAATTTCCACCATCTTAATAAAAAAAAGGTTTAGC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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ATAAGGAAAGTGATGATAGCAGTTTAAGCCCCCCTGCTTCTCAAGGAAATGAAGAGTTTG
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AATACATTGTGGACTTAGCTTCTCAGGATGCTTGTGGCGGCTATTCGATTCCTGATGAAA
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GAGAACCTGAAGCTCCAGTGTCCTCTGAGGAGAAGCGTCTCTTGTTACCTGGTCTACCAG
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TAGTTCATTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AV90TF U 1
AF RR4AV90JQ C 222
BS 1 776 RR4AV90TF
BS 777 777 RR4AV90JQ
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RD RR4AV90TF 853 0 0
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CCCAAAAAAAAAAACAGGATTCACGGTCTGTTCACTCTTCTCTGTACATTGTCTTTGATA
GATAATAATGTGGGCGGATTTTAGCAACATACGAACATGACCAGCATCCTTAACAG*AAA
CATTTGTTCATTAAATGGATTGTAGATTCATGACTAAATCTATCATTGATCTTCTCTATA
TAGTTCATTAGTT

QA 1 853 1 853
DS 

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TATTCGATTCCTGATGAAAAGAAGTTTGATAATGATGGTAAGGTGGCTGCTGGAACAAGC
AGAAACGTAGAGAGTATAAGAGAACCTGAAGCTCCAGTGTCCTTTGAGGAGAAGGGTTTC
TTGTTACCTGGTTTACCAGCCGTCCGAACTTCATGGTTAAGTTGCTGCAGTTTGTTTGAT
GCACTGACTGGATTTGACATTTAAAAACACTGGAGTTAGATAAAGTTGGACGTGCATGAC
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CTGTACATTGTCTTTGATAGATAATAATGTGGGCGGATTTTAGCAACATACGAACATGAC
CAGCATCCTTAACAGGAAACATTTGTTCATTAAATGGATTGTAGATTCATGACTAAATCT
ATCATTGATTTTCTCTATATAGTTCATTAGTT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL8813Contig1 1053 2 2 U
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TCTAATGGCTGACTCATCGGTTTATCTTGCACTGGCCACTGTTCTTTCACTTGATGTGCG
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ATAGAACCTGAGTCATCACCACCACGTACTGGAGAAGGATCCGGTGAGAAGATTTGGACA
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AAAAAAGGATTATGATTTAAAACAGTCTTTGGAAGAACAATTAGTCTCAACGACAAAGAA
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AAGAGATCCAAAGATTAATTTGAGCCTTCATTGCTGGCTGAGAAGGATAGAGAGATGACG
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AGAAGTTGAAAAAAAAGGAAAATACAGAAGAATAAAATATTACAGAGATAAAACTGCTTA
TGAAATGTTTATAATAGACAAACATACTGCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A406TF U 1
AF RR4A406JQ C 172
BS 1 758 RR4A406TF
BS 759 1053 RR4A406JQ

RD RR4A406TF 762 0 0
GGAAGAACGTATTTATGATTATCGTTTCTCTTCGGAATCGGTGGATGGGACGATCCAGTT
CCTGTAACGGTTTTCGTGGTGATTAATCGTCTTAAATCCTCTTAATTCGTGAGCCCACCT
CGAAGCTTTTGTTTGTGATGTTCGTCGGCGAGTTCTGGTATAAATAAGTTACGATCTTTT
CTCTGCGAATCGCGATCTCTACATCTCAATTCTACTCATCTCACTCACATACATCTCGAT
CCACACACATCGCGTTGGCTGAGATGTTCGTTCTTCCACTGTCGAGGTGCAATTGATCAG
TCTAATGGCTGACTCATCGGTTTATCTTGCACTGGCCACTGTTCTTTCACTTGATGTGCG
AGTTCTCAGATCTGGGAGGCGAGGAACATGAAAAGCTGTGGCGAGTTAATTGGGTCTGAA
CATGCTTCTTGATGTAAAGATTCTTCTTCCTTGATCAGAGAACATGGTATCTAGATCACC
ATAGAACCTGAGTCATCACCACCACGTACTGGAGAAGGATCCGGTGAGAAGATTTGGACA
TCAGACTGAACTTAGTGTGATGTTGGATGAAGATTTAGTAGACTACAATGGAAATAATAT
AAAGAGATGATGTAGCTTATGGTGGAATCTGTAAGGAAACAATCCCTGGAGCTGCATGAG
AAAAAAGGATTATGATTTAAAACAGTCTTTGGAAGAACAATTAGTCTCAACGACAAAGAA
ATGTGAAAAGCAAAAGAGAGAGCTTCAAGTTAGAAGGA
CTTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4A406JQ 882 0 0
CGATCTTTTCTCTGCGAATCGCGATCTCTACATCTCAATTCTACTCATCTCACTCACATA
CATCTCGATCCACACACATCGCGTTGGCTGAGATGTTCGTTCTTCCACTGTCGAGGTGCA
ATTGATCAGTCTAATGGCTGACTCATCGGTTTATCTTGCACTGGCCACTGTTCTTTCACT
TGATGTGCGAGTTCTCAGATCTGGGAGGCGAGGAACATGAAAAGCTGTGGCGAGTTAATT
GGGTCTGAACATGCTTCTTGATGTAAAGATTCTTCTTCCTTGATCAGAGAACATGGTATC
TAGATCACCATAGAACCTGAGTCATCACCACCACGTACTGGAGAAGGATCCGGTGAGAAG
ATTTGGACATCAGACTGAACTTAGTGTGATGTTGGATGAAGATTTAGTAGACTACAATGG
AAATAATATAAAGAGATGATGTAGCTTATGGTGGAATCTGTAAGGAAACAATCCCTGGAG
CTGCATGAGAAAAAAGGATTATGATTTAAAACAGTCTTTGGAAGAACAATTAGTCTCAAC
GACAAAGAAATGTGAAAAGCAAAAGAGAGAGCTTCAAGTTAGAAGGAACTTGAAGGAGAA
GAACTTGAAGAAAGAGAGGAAGAGCTTAAATGGAAGGAGGTTGAACAATCATAACTAGCT
GAGAATAGAAAGAGATCCAAAGATTAATTTGAGCCTTCATTGCTGGCTGAGAAGGATAGA
GAGATGACGATCCTACAAGAATAGACTCAATCAGTCAATTGTTTTTAGTTTTCTCTAGAC
CATAACAGAAGAAGTTGAAAAAAAAGGAAAATACAGAAGAATAAAATATTACAGAGATAA
AACTGCTTATGAAATGTTTATAATAGACAAACATACTGCTCC

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 2

CO CL8814Contig1 793 2 2 U
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AGTTATGTCCGAGTGAACAACAAAGACATCGAGATGGGTCAACGCTTAGAAGTCAAAGGG
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GAGCCATTTGACACGAGCTACACATACAAGCCGTTAGATTTGTGTAGAGTGAAAGGTTCG
AACGTAACAGGTGGTGTAGGACCTTTTGGTCTGATCACATTGGCCACCCCTGATTTGGAA
GAGTACACTCCTATCTTCTTTAGAGTCTTCAAAGACACTTCCACAAATAAGCCTAAGGTT
CTCATGTGCTCTGATGCTAGACCTTCGTCCTTAGAGCAAGACAGGGGTCCACTCCAACAA
GATAGGATGTACAAACCACCATTTGCTGGTTTTGTTGATGTTGATCTAGCTGATGGAAGG
ATCTCTCTAAGGAGTTTGATTGACCATTCGGTAGTAGAGAGCTTTGGAGCTTTGGGGAAA
ACAGTGATAACGTCAAGAGTGTAGCAGTGAAAGCAGTGAAAGAGAATGCACATTTGTATG
TGTTCAACAATGGAACACAAACTGTGAACGTAGAGAGTCTAGACGCTTGGAGCATGGAGA
GGCCTTTGAAAATGAATAACGGAGCTACTTAATTATTAGGTAGTTGTTGATGTGTCATTT
AATAAAAAGAGAAACTTAGGAATATTTTGTTTTTTTTTTTCCAATTTGATTAGTGAAATC
CATGTTTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BP05TF U 1
AF RR4BP05JQ C 133
BS 1 695 RR4BP05TF
BS 696 793 RR4BP05JQ

RD RR4BP05TF 695 0 0
GCATCAAACAAGAAGCAACTAGTGTTTTGGCCTATTGAAGAAATAGAGTCACTAAGAAGT
AGTTATGTCCGAGTGAACAACAAAGACATCGAGATGGGTCAACGCTTAGAAGTCAAAGGG
ATCACTCCAGCTCAGGCGGATGTGGAAGTGACATTTAACGTTGGAAGTCTAGAGAAAGCT
GAGCCATTTGACACGAGCTACACATACAAGCCGTTAGATTTGTGTAGAGTGAAAGGTTCG
AACGTAACAGGTGGTGTAGGACCTTTTGGTCTGATCACATTGGCCACCCCTGATTTGGAA
GAGTACACTCCTATCTTCTTTAGAGTCTTCAAAGACACTTCCACAAATAAGCCTAAGGTT
CTCATGTGCTCTGATGCTAGACCTTCGTCCTTAGAGCAAGACAGGGGTCCACTCCAACAA
GATAGGATGTACAAACCACCATTTGCTGGTTTTGTTGATGTTGATCTAGCTGATGGAAGG
ATCTCTCTAAGGAGTTTGATTGACCATTCGGTAGTAGAGAGCTTTGGAGCTTTGGGGAAA
ACAGTGATAACGTCAAGAGTGTAGCAGTGAAAGCAGTGAAAGAGAATGCACATTTGTATG
TGTTCAACAATGGAACACAAACTGTGAACGTAGAGAGTCTAGACGCTTGGAGCATGGAGA
GGCCTTTGAAAATGAATAACGGAGCTACTTAATTA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4BP05JQ 661 0 0
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ACGAGCTACACATACAAGCCGTTAGATTTGTGTAGAGTGAAAGGTTCGAACGTAACAGGT
GGTGTAGGACCTTTTGGTCTGATCACATTGGCCACCCCTGATTTGGAAGAGTACACTCCT
ATCTTCTTTAGAGTTTTCAAAGACACTTCCACAAATAAGCCTAAGGTTTTCATGTGCTTT
GATGCTAGACCTTCGTCCTTAGAGCAAGACAGGGGTCCACTCCAACAAGATAGGATGTAC
AAACCACCATTTGCTGGTTTTGTTGATGTTGATCTAGCTGATGGAAGGATCTCTTTAAGG
AGTTTGATTGACCATTCGGTAGTAGAGAGCTTTGGAGCTTTGGGGAAAACAGTGATAACG
TCAAGAGTGTAGCAGTGAAAGCAGTGAAAGAGAATGCACATTTGTATGTGTTCAACAATG
GAACACAAACTGTGAACGTAGAGAGTCTAGACGCTTGGAGCATGGAGAGGCCTTTGAAAA
TGAATAACGGAGCTACTTAATTATTAGGTAGTTGTTGATGTGTCATTTAATAAAAAGAGA
AACTTAGGAATATTTTGTTTTTTTTTTTCCAATTTGATTAGTGAAATCCATGTTTTTATA
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL8815Contig1 626 2 5 U
GGAATGAGATAAAAAAAATATAAATTAAAAATATCTTTGTTTTTCTTCTTCCTTCTTCTT
CTTTCATATTGATGTGTACTCTTCACCTCTAAGTTTTGACCAAAAAAGCTTCGTCCTTTT
CTCTTTGGAACATACCCAAGATTGCGTTACAACTTGAGATTCACTCTTCATATCTCGTCT
TCGTGATGAATTATCATCAATGGAGATGATGAGCTCTTCTTCTTCTTCTACTACACAAGT
TGTACCGTTCAGAGAGATTGGGATGTATGAACCGTTCCAACAGTTGTCTGGTTGGGAAAA
TGCTTTCAACATTATAGGTAGTACTAGTAATCAGAACAACAACAATCCGAGTTCTTCCAC
AGTTCCTGAGGTGGATGCTAGACCAGAAGCAGATGATCACAATAAGGCGAATTATACTTC
TATGTATAATAACTCTGTTGAAGCCGAACCTTCTAGTAATAATGATCAGGACGAAGACCA
AGTCAATGATAAGATGAAACGGCGCTTGGCCCAGAACCGAGAGGCTGCTCGCAAAAGCCG
TTTGAGAAAGAAGGCACATGTTCAGCAGTTAGAAGAAAGCACGCTAAAGTTATCACAGCT
CGAGCAGAACTTGCAAGAGCTAGCAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GC04TF U 1
AF RR4CM12TF U 2
BS 1 155 RR4GC04TF
BS 156 156 RR4CM12TF
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BS 554 554 RR4CM12TF
BS 555 626 RR4GC04TF

RD RR4GC04TF 626 0 0
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CTTTCATATTGATGTGTACTCTTCACCTCTAAGTTTTGACCAAAAAAGCTTCGTCCTTTT
CTCTTTGGAACATACCCAAGATTGCGTTACAACTTTAGATTCACTCTTCATATCTCGTCT
TCGTGATGAATTATCATCAATGGAGATGATGAGCTCTTCTTCTTCTTCTACTACACAAGT
TGTACCGTTCAGAGAGATTGGGATGTATGAACCGTTCCAACAGTTGTCTGGTTGGGAAAA
TGCTTTCAACATTATAGGTAGTACTAGTAATCAGAACAACAACAATCCGAGTTCTTCCAC
AGTTCCTGAGGTGGATGCTAGACCAGAAGCAGATGATCACAATAAGGCGAATTATACTTC
TATGTATAATAACTCTGTTGAAGCCGAACCTTCTAGTAATAATGATCAGGACGAAGACCA
AGTCAATGATAAGATGAAACGGCGCTTGGCCCAGAACCGAGAGGCTGCTCGCAAAAGCCG
TTTGAGAAAGAAG*CACATGTTCAGCAGTTAGAAGAAAGCACGCTAAAGTTATCACAGCT
CGAGCAGAACTTGCAAGAGCTAGCAG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4CM12TF 602 0 0
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TTTCATATTGATGTGTACTCTTCACCTCTAAGTTTTGACCAAAAAAGCTTCGTCCTTTTC
TCTTTGGAACATACCCAAGATTGCGTTACAACTTGAGATTCACTCTTCATATCTCGTCTT
CGTGATGAATTATCATCAATGGAGATGATGAGCTCTTCTTCTTCTTCTACTACACAAGTT
GTACCGTTCAGAGAGATTGGGATGTATGAACCGTTCCAACAGTTGTCTGGTTGGGAAAAT
GCTTTCAACATTATAGGTAGTACTAGTAATCAGAACAACAACAATCCGAGTTCTTCCACA
GTTCCTGAGGTGGATGCTAGACCAGAAGCAGATGATCACAATAAGGCGAATTATACTTCT
ATGTATAATAACTCTGTTGAAGCCGAACCTTCTAGTAATAATGATCAGGACGAAGACCAA
GTCAATGATAAGATGAAACGGCGCTTGGCCCAGAACCGAGAGGCTGCTCGCAAAAGCCGT
TTGAGAAAGAAGGCACATGTTCAGCAGTTAGAAGAAAGCAGGCTAAAGTTATCACAGCTC
GA

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL8816Contig1 689 2 4 U
GGATGCATGTAATAGCTTCTCTCTCTAATTCCGATTCTCCTTTCGAACTCTCTTCTTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTGAGACGCCAAGCAAAGTCATTTTCTTTGTGGATATACAAAGATGA
CAACAATCGAAACAGGTCCAAAAACTCAAAAGCCATCATCTCCTTCCACTACTCTCAAGC
AACCATCTTCTTCTTCATCGTTTAAAAGGTGGGGAAGGAGACACCCTTTTGTTAGATACG
GACTTCCCATGATCTCTCTCACTGTTTTTGGAGCCCTTGGACTCAGCCAACTCCTCCAAG
GCAGTAAGGACATTGCAAAGGTAAAAGACGACCAGGAATGGGAGATTATTGAGACGAGAA
AGGCTCTTTCTAGAACTGGACCTGTCGATGCTTACAAACCTAAAAACACTTCCATCGAAG
ACGAGCTCAAGGCTATTCAAGGGAAGGTGGACATAAACTCTTACGAATACAAGAAAATCC
CAAAGCTAAACGAAGGCAAGTCGAGTTGAGTGAAATCTTGTAACGAATAATTTTACTGTA
TCAGAATCTTCTTTCTTCTTAGATGCGTTTCTTGTTTTAGCTTTATGAAGACAAGTAGAA
TGCCAAGTAAGATTTTTGACCTTTCCTAAACCATTAACAGAGATGGGTTGATATATTTGA
TAAAAATACTTGTGTTCATCTACAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4BN22JQ C 1
AF RR4BN22TF U 7
BS 1 6 RR4BN22JQ
BS 7 665 RR4BN22TF
BS 666 666 RR4BN22JQ
BS 667 689 RR4BN22TF

RD RR4BN22JQ 689 0 0
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TCTCTCTCTCTCTCTGAGACGCCAAGCAAAGTCATTTTCTTTGTGGATATACAAAGATGA
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AACCATCTTCTTCTTCATCGTTTAAAAGGTGGGGAAGGAGACACCCTTTTGTTAGATACG
GACTTCCCATGATCTCTCTCACTGTTTTTGGAGCCCTTGGACTCAGCCAACTCCTCCAAG
GCAGTAAGGACATTGCAAAGGTAAAAGACGACCAGGAATGGGAGATTATTGAGACGAGAA
AGGCTCTTTCTAGAACTGGACCTGTCGATGCTTACAAACCTAAAAACACTTCCATCGAAG
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CAAAGCTAAACGAAGGCAAGTCGAGTTGAGTGAAATCTTGTAACGAATAATTTTACTGTA
TCAGAATCTTCTTTCTTCTTAGATGCGTTTCTTGTTTTAGCTTTATGAAGACAAGTAGAA
TGCCAAGTAAGATTTTTGACCTTTCCTAAACCATTAACAGAGATGGGTTGATATATTTGA
TAAAAATACTTGTGTTCATCTACAACTCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR4BN22TF 683 0 0
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TCTCTCTCTGAGACGCCAAGCAAAGTCATTTTCTTTGTGGATATACAAAGATGACAACAA
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CTTCTTCTTCATCGTTTAAAAGGTGGGGAAGGAGACACCCTTTTGTTAGATACGGACTTC
CCATGATCTCTCTCACTGTTTTTGGAGCCCTTGGACTCAGCCAACTCCTCCAAGGCAGTA
AGGACATTGCAAAGGTAAAAGACGACCAGGAATGGGAGATTATTGAGACGAGAAAGGCTC
TTTCTAGAACTGGACCTGTCGATGCTTACAAACCTAAAAACACTTCCATCGAAGACGAGC
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TAAACGAAGGCAAGTCGAGTTGAGTGAAATCTTGTAACGAATAATTTTACTGTATCAGAA
TCTTCTTTCTTCTTAGATGCGTTTCTTGTTTTAGCTTTATGAAGACAAGTAGAATGCCAA
GTAAGATTTTTGACCTTTCCTAAACCATTAACAGAGATGGGTTGATATATTTGATAAAA*
TACTTGTGTTCATCTACAACTCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL8817Contig1 785 2 1 U
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GATCTTAATCCAGATAACGGAACGGCATTTCTTGAGGGGTTACTGGTTAACGGCTGGCTC
ACAAAACTGATCTTGACGTGTGCACGTGTGGAAACGATCATATGCAAATGGACGCTTGAT
ATGTTGTTGTATTCACCAAAAGAAGACCTAAGGTCTTCTGCTTGTGACTTCTGGTGTTCC
ATACTCTTATCACATAACGAGGTGATGGAGCTCCTGTTGAGATCCAATGGCTTCCTAACT
ATCAGATATTTAAAGAAGCTCTTGAATCATATGGGTTCAGATTCATTCATCACAAAATAC
TGAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4G231TF U 1
AF RR4FS17TF U 1
BS 1 785 RR4FS17TF

RD RR4G231TF 678 0 0
GGACCACCTTCACTTACATTCGCGCTTCCCAAAAGTTTCAGAGGGTTTTGGTCTCTCGAC
GAAGAAGAAGAAACGATGAATATGGACGGGTCTCTTGATTTCGAGAACGAAGATCCTCTT
GTTAACCCTCCACCATCTGCTGAGAAAAGGAAGAAAGTGATTGAGTTAGATGATCTTGTC
TCCGATTTTTGCAAAGAGAAGAGCAAACTCATAGACAAACGAAACAGGAAACGCAAAGCC
TCCTCTAAGCTTTACGATTCTGATGATGATGATGATGATAAACATGGCCAACAAGCTTTG
CTTTCCATTGTTAATAACTGTCGTAATCAGATGAATGAGATATGCAGCGAAGAAGATATC
CAAGAGTGGGGTTTATCTATGTTTGGAGATCAGAAAGCTCCAACTCATTCACTGCTTGCT
GATCTCGACAACTGCTACTTGTTGAAAGAGTTTATGAGTAGTCAGCTAAACTCGGTGGTG
GATCTTAATCCAGATAACGGAACGGCATTTCTTGAGGGGTTACTGGTTAACGGCTGGCTC
ACAAAACTGATCTTGACGTGTGCACGTGTGGAAACGATCATATGCAAATGGACGCTTGAT
ATGTTGTTGTATTCACCAAAAGAAGACCTAAGGTCTTCTGCTTGTGACTTCTGGTGTTCC
ATACTCTTATCACATAAC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4FS17TF 785 0 0
GGACCACCTTCACTTACATTCGCGCTTCCCAAAAGTTTCAGAGGGTTTTGGTCTCTCGAC
GAAGAAGAAGAAACGATGAATATGGACGGGTCTCTTGATTTCGAGAACGAAGATCCTCTT
GTTAACCCTCCACCATCTGCTGAGAAAAGGAAGAAAGTGATTGAGTTAGATGATCTTGTC
TCCGATTTTTGCAAAGAGAAGAGCAAACTCATAGACAAACGAAACAGGAAACGCAAAGCC
TCCTCTAAGCTTTACGATTCTGATGATGATGATGATGATAAACATGGCCAACAAGCTTTG
CTTTCCATTGTTAATAACTGTCGTAATCAGATGAATGAGATATGCAGCGAAGAAGATATC
CAAGAGTGGGGTTTATCTATGTTTGGAGATCAGAAAGCTCCAACTCATTCACTGCTTGCT
GATCTCGACAACTGCTACTTGTTGAAAGAGTTTATGAGTAGTCAGCTAAACTCGGTGGTG
GATCTTAATCCAGATAACGGAACGGCATTTCTTGAGGGGTTACTGGTTAACGGCTGGCTC
ACAAAACTGATCTTGACGTGTGCACGTGTGGAAACGATCATATGCAAATGGACGCTTGAT
ATGTTGTTGTATTCACCAAAAGAAGACCTAAGGTCTTCTGCTTGTGACTTCTGGTGTTCC
ATACTCTTATCACATAACGAGGTGATGGAGCTCCTGTTGAGATCCAATGGCTTCCTAACT
ATCAGATATTTAAAGAAGCTCTTGAATCATATGGGTTCAGATTCATTCATCACAAAATAC
TGAGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL8818Contig1 706 2 2 U
GTGGAAGAATCCGATCACAACGGTCTTGATCCATCTCTTGTTCATCATCCTTGTTGTCTA
CCCTGAGCTGATCTTGCCAACCATCTTTCTTTACCTCTTCCTTATTGGTATCTGGTACTA
CCGTTGGAGACCGAGGCATCCTCCCCACATGGACACGCGTCTCTCACACGCTGACTCGGC
TCACCCGGACGAGCTGGATGAGGAGTTTGATACTTTCCCTACTTCAAGACCCTCTGATAT
CGTCAGGATGAGGTATGACAGGCTGAGGAGTATCGCTGGGAGGATTCAGACGGTGGTTGG
TGATCTCGCAACGCAAGGAGAGAGGCTTCAGTCTTTGCTGAGCTGGCGTGATCCGCGTGC
GACGGCGCTGTTTGTATTGTTCTGTTTGATCGCTGCTGTTGTTCTGTATGTGACGCCTTT
TCAGGTTGTGGCGCTTCTGGTTGGGATCTATGTTCTGAGACATCGGAGGTTTAGGTACAG
GCTTCCGTCGGTTCCTCTCAATTTCTTCAGGAGGCTTCCTGCAAGAACTGATTGCATGCT
CTGAGCTCAAAGAACGGATCGTCCCTTTCGGACTTGTTAGTTTGTTTCTTGTTTTTTAAA
AGGTCATGATGACTCTTTTGCTTGTTGATGATTATGATGTCGTTTGGTTTTTAACATTAT
CAAGACTTTGTTTGAAATTAGTGAATTAGGATCTGTGTGTGGCTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C147TF U 1
AF RR4C147JQ C 1
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BS 586 706 RR4C147JQ

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CTGAGCTCAAAGAACGGATCGTCCCTTTCGGACTTGTTAGTTTGT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4C147JQ 706 0 0
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CCGTTGGAGACCGAGGCATCCTCCCCACATGGACACGCGTCTCTCACACGCTGACTCGGC
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CGTCAGGATGAGGTATGACAGGCTGAGGAGTATCGCTGGGAGGATTCAGACGGTGGTTGG
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TCAGGTTGTGGCGCTTCTGGTTGGGATCTATGTTCTGAGACATCGGAGGTTTAGGTACAG
GCTTCCGTCGGTTCCTCTCAATTTCTTCAGGAGGCTTCCTGCAAGAACTGATTGCATGCT
CTGAGCTCAAAGAACGGATCGTCCCTTTCGGACTTGTTAGTTTGTTTCTTGTTTTTTAAA
AGGTCATGATGACTCTTTTGCTTGTTGATGATTATGATGTCGTTTGGTTTTTAACATTAT
CAAGACTTTGTTTGAAATTAGTGAATTAGGATCTGTGTGTGGCTTT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL8819Contig1 718 2 1 U
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GATGGGTGTGACCAACAAGACTCCAGAGTTCCTCAAGATGAATCCTTTGGGAAAGGTTCC
TGTACTTGAGACTCCCGAGGGTCCCATATTTGAGAGCAACGCCATTGCCCGTTATGTAAG
CCGGTTGAACGGTGAGAACTCCTTGAACGGTTCCTCTCTGATCGAATACGCACACGTTGA
GCAATGGAGCGATTTCTCCACGTTGGAGATATATGGTAACATCTTGAAGTGGTTCGGCCC
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TGTAACCCTTGCTGATATCATCACTGTCTGCAACTTGAACCTTGGATTTGCCACTGTCAT
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BQ
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AF RR4CK63TF U 1
AF RR4BY33TF U 1
BS 1 718 RR4BY33TF

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QA 1 133 1 133
DS 

RD RR4BY33TF 718 0 0
GGAGGAGAGGGGAATACACTACGAATATAAAAACCCTAATTCTATAGCTCTCTCCGCCTC
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GGAGTCCGTCTGAGCAATGGCTTTGGTGTTGCACACATACAAGGGAAACAAAAATGCTGA
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TGTACTTGAGACTCCCGAGGGTCCCATATTTGAGAGCAACGCCATTGCCCGTTATGTAAG
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TACCAAGAGCTTTACCTCTGCATTCCCTCATGTTGAGAGATACTTCTGGACCGTTATC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

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TCAGAGAAATCGTGCAGCGCCTGACAGGTCCAACAGAGAACAACGTAGCAGCAGTAACAG
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ATGAGAGAAGGCAATGCATGATGAGGCCAAAGCTTGAAATTGTCAAACCTCCTCTGAGCT
TTAAGCCCACTGGTACAACACCATCATCTAAATCTGGTAATACCAACCTTTTAACAAGTC
CAGTGGGCACCCCTTCTACATTGCTCTCTAACCTGTCCTTGATAGAAGGAGGAGATAAAG
CAGACCAAGATAGTTGTACAACAAACACCGGAGAAGAAGAAGAGAAAGCCATTAAAGAAA
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TTACTTTGTTCCCTTTAACATCTCCCAGTTCCAGTGGCAGATCATAAAAATTCCGCAAGA
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CTCAATCAAGATTTGTCTCTGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4CR75TF U 1
AF RR4CR75JQ C 100
BS 1 639 RR4CR75TF
BS 640 640 RR4CR75JQ
BS 641 682 RR4CR75TF

RD RR4CR75TF 682 0 0
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GTCAGAACGTTGCAACTTGCAAGCCCGTCACAACGTTCGTCCATACTGACACCAACACTT
TCAGAGAAATCGTGCAGCGCCTGACAGGTCCAACAGAGAACAACGTAGCAGCAGTAACAG
TGCCACCAGAAGCAACAACGATAAAAACCGCCACACAGAAGAAGCCAACTTCTAAGCTCC
ATGAGAGAAGGCAATGCATGATGAGGCCAAAGCTTGAAATTGTCAAACCTCCTCTGAGCT
TTAAGCCCACTGGTACAACACCATCATCTAAATCTGGTAATACCAACCTTTTAACAAGTC
CAGTGGGCACCCCTTCTACATTGCTCTCTAACCTGTCCTTGATAGAAGGAGGAGATAAAG
CAGACCAAGATAGTTGTACAACAAACACCGGAGAAGAAGAAGAGAAAGCCATTAAAGAAA
GACGTTTCTACTTGCATCCGTCGCCAAGGGCTAAACCACGGTATACAGAACCAGAGTTGC
TTACTTTGTTCCCTTTAACATCTCCCAGTTCCAGTGGCAGATCATAAAAATTCCGCAAGA
GTTATCCTTAAGCTTGTTCTCTACCTTACTATCCCAAAG*ACATGTACATGTAACATTAT
CTCAATCAAGATTTGTCTCTGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4CR75JQ 583 0 0
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AGAAGCCAACTTTTAAGCTCCATGAGAGAAGGCAATGCATGATGAGGCCAAAGCTTGAAA
TTGTCAAACCTCCTTTGAGCTTTAAGCCCACTGGTACAACACCATCATCTAAATCTGGTA
ATACCAACCTTTTAACAAGTCCAGTGGGCACCCCTTTTACATTGCTCTTTAACCTGTCCT
TGATAGAAGGAGGAGATAAAGCAGACCAAGATAGTTGTACAACAAACACCGGAGAAGAAG
AAGAGAAAGCCATTAAAGAAAGACGTTTTTACTTGCATCCGTCGCCAAGGGCTAAACCAC
GGTATACAGAACCAGAGTTGCTTACTTTGTTCCCTTTAACATCTCCCAGTTCCAGTGGCA
GATCATAAAAATTCCGCAAGAGTTATCCTTAAGCTTGTTCTCTACCTTACTATCCCAAAG
GACATGTACATGTAACATTATCTCAATCAAGATTTGTCTCTGT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8821Contig1 621 2 1 U
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GAGACCAGAACCATCTCACATGAACATGACCACTCCATTACGCCCACCTTCTATTTCTTC
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TCTGGTGACTCCTAATGCAATGAAAAGCAGCAGCAGATTCAATAAGAGCCCTGTTGTAGG
AGGAGGAGGCAGCTCGTGGAAGCCGACACATCCCACGGTGGTAGCACTGCAGAAGAAGGC
TGTGGTTTGGAGTCCGCTTAAGTTCAGGAACAGAAGGCCTTCCTTCACACCGAGGCGAGC
TTCCTCTGTTGCCACCGATTTGGTCCGGAGGGAACAGTAGTGGTCTTTTGTTCACTGTCT
TTGTGAAAGTGTTTGGTCCAAGTCGAAGTTAAAATAGGATCCTATGCTGCTTTTTTTTCT
TTAATTGGTCTTCATTCGAAGTGTTTAACTACAACAACTCTATTTAGAGAGATCTTTTGT
GTTATGGATTTGATGAAATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BB05JQ C 1
AF RR4BB05TF U 1
BS 1 621 RR4BB05TF

RD RR4BB05JQ 621 0 0
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ATTCCGTGGTGGTAACCCGAGGAAGGCAAGATATTCCAATTTATTCGCTCCGGATCGCAA
TTTGGTGACTCCTAATGCAATGAAAAGCAGCAGCAGATTCAATAAGAGCCCTGTTGTAGG
AGGAGGAGGCAGCTCGTGGAAGCCGACACATCCCACGGTGGTAGCACTGCAGAAGAAGGC
TGTGGTTTGGAGTCCGCTTAAGTTCAGGAACAGAAGGCCTTCCTTCACACCGAGGCGAGC
TTCCTCTGTTGCCACCGATTTGGTCCGGAGGGAACAGTAGTGGTTTTTTGTTCACTGTCT
TTGTGAAAGTGTTTGGTCCAAGTTGAAGTTAAAATAGGATCCTATGCTGCTTTTTTTTCT
TTAATTGGTCTTCATTCGAAGTGTTTAACTACAACAACTTTATTTAGAGAGATTTTTTGT
GTTATGGATTTGATGAAATTT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4BB05TF 621 0 0
GGCACTAATGAAACCAAGAAGAAGCTCAATCGCATTCAGACCAGCTCCTCCTCCATTAGC
CATTGCAACAGGCAACAATAAAACACTCCAGCCGAGAAGGAGAGTCTCTATTGCAACGTT
GAGACCAGAACCATCTCACATGAACATGACCACTCCATTACGCCCACCTTCTATTTCTTC
ATTCCGTGGTGGTAACCCGAGGAAGGCAAGATATTCCAATCTATTCGCTCCGGATCGCAA
TCTGGTGACTCCTAATGCAATGAAAAGCAGCAGCAGATTCAATAAGAGCCCTGTTGTAGG
AGGAGGAGGCAGCTCGTGGAAGCCGACACATCCCACGGTGGTAGCACTGCAGAAGAAGGC
TGTGGTTTGGAGTCCGCTTAAGTTCAGGAACAGAAGGCCTTCCTTCACACCGAGGCGAGC
TTCCTCTGTTGCCACCGATTTGGTCCGGAGGGAACAGTAGTGGTCTTTTGTTCACTGTCT
TTGTGAAAGTGTTTGGTCCAAGTCGAAGTTAAAATAGGATCCTATGCTGCTTTTTTTTCT
TTAATTGGTCTTCATTCGAAGTGTTTAACTACAACAACTCTATTTAGAGAGATCTTTTGT
GTTATGGATTTGATGAAATTT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL8822Contig1 610 2 1 U
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ACACCATTTACAGCATCCTCTTCATCGTCTTCATCATCCTCTTGATCGTCACCGCGTTTA
TAACCGTCGCCCTTACTTACTTCCAGCTTGCAGCTGAAGGTCACGAATGGTGGTGGAGAT
CATTCCTATGCGGTGGATCGACTGGTTTGTTCATCTACGCCTACTGCTTATACTATTACT
ACGCGAGATCAGACATGTCTGGTTTCATGCAAACCTCTTTCTTCTTCGGTTACATGGCTT
GTATTTGTTACGGTTTCTTCCTCATGCTCGGAACAGTTGGCTTCCGTGCAGCTCTCCTCT
TCGTCCGCCACATTTACAGGTCGATTAAATGCGAGTAAACATGTTGCTGCCAAACTACAC
TCCCCTCTCACTTGCGATTTTTGGTAGAACGAAGAAGATCCGTTGTGTAGGTAATGTTCC
TATGAAGCTCGTGTGTTGTTTAGGCGAGTCTCTCTTTGATATGATAATAGTGTCTTCTCT
CTTTTTTGGTTAATTAATTAACTACATTGTATCTTTTTCTCATATCTTATATATTAAAAT
ATTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H571TF U 1
AF RR4H571JQB C 27
BS 1 610 RR4H571TF

RD RR4H571TF 610 0 0
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ACACCATTTACAGCATCCTCTTCATCGTCTTCATCATCCTCTTGATCGTCACCGCGTTTA
TAACCGTCGCCCTTACTTACTTCCAGCTTGCAGCTGAAGGTCACGAATGGTGGTGGAGAT
CATTCCTATGCGGTGGATCGACTGGTTTGTTCATCTACGCCTACTGCTTATACTATTACT
ACGCGAGATCAGACATGTCTGGTTTCATGCAAACCTCTTTCTTCTTCGGTTACATGGCTT
GTATTTGTTACGGTTTCTTCCTCATGCTCGGAACAGTTGGCTTCCGTGCAGCTCTCCTCT
TCGTCCGCCACATTTACAGGTCGATTAAATGCGAGTAAACATGTTGCTGCCAAACTACAC
TCCCCTCTCACTTGCGATTTTTGGTAGAACGAAGAAGATCCGTTGTGTAGGTAATGTTCC
TATGAAGCTCGTGTGTTGTTTAGGCGAGTCTCTCTTTGATATGATAATAGTGTCTTCTCT
CTTTTTTGGTTAATTAATTAACTACATTGTATCTTTTTCTCATATCTTATATATTAAAAT
ATTTCTTCCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4H571JQB 584 0 0
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GTCTTCATCATCCTCTTGATCGTCACCGCGTTTATAACCGTCGCCCTTACTTACTTCCAG
CTTGCAGCTGAAGGTCACGAATGGTGGTGGAGATCATTCCTATGCGGTGGATCGACTGGT
TTGTTCATCTACGCCTACTGCTTATACTATTACTACGCGAGATCAGACATGTCTGGTTTC
ATGCAAACCTCTTTCTTCTTCGGTTACATGGCTTGTATTTGTTACGGTTTCTTCCTCATG
CTCGGAACAGTTGGCTTCCGTGCAGCTCTCCTCTTCGTCCGCCACATTTACAGGTCGATT
AAATGCGAGTAAACATGTTGCTGCCAAACTACACTCCCCTCTCACTTGCGATTTTTGGTA
GAACGAAGAAGATCCGTTGTGTAGGTAATGTTCCTATGAAGCTCGTGTGTTGTTTAGGCG
AGTCTCTCTTTGATATGATAATAGTGTCTTCTCTCTTTTTTGGTTAATTAATTAACTACA
TTGTATCTTTTTCTCATATCTTATATATTAAAATATTTCTTCCC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8823Contig1 964 2 2 U
GGGACAGATAACAGAAAAAGGTTGAAACTGTGAAAGTTTGGTGGGAAGGAAAAGCTTCTC
ATATTATTGGTTAATTACCCTTCCCGGAGGAGATCGGAGATAATGGCTGCTAATTTCTGG
GAATCGTCTCAATGCAAACGGCTTCTGGAACAAGAAGAAGTGGATGCAGTTCACCCTCTC
GACAAAGAACGTGGAATTACAGTTGAGGATTTCAAGCTCATCAAGTTCCTTATGTCTAAT
CATATAACGAAATTGGCTCAGCACATTAAAGTCCGACAAAGGGTTGTGGCTACCGCAATT
ACGTATATGAGACAGGTTTATACCAAGAAGAGCATGGTGGAGTTTGATCCGCGTCTTGTT
GCTATTACATGCTTGTACCTGGCTTCCAAAGCTGAAGAGAGCATAGTCCAGGCCAGGAAT
CTTGTCTTTTACATCAAAAGATTGTATCCGGATGAGTACAAGTATGAACTAAAAGATCTA
TTGGGAATGGAGATGAAGGTCTTAGAAGCACTCAACTATTCTCTGGTTGTGTTTCACCCT
TACCGCTCTTTATCTGATTTTTTGCAAGATGCTGCATTGAACGATGTAAATATGAACCAG
ATGACATGGGGAATTGTGAACGATACATATAAGATGGACCTGATTCTTGTACACCCGCCG
TATCGCATAGCGCTAGCGTGCATATACATAGCAAGTGTCCACAGAGAGAAAGACATCACT
GCATGGTTCCAAGATCTTAGCGAGGACATGAACTTGGTGAAGAACATTGCCATGGAACAA
ACTGACTATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCCATCTCCATGATTTATTTGATGC
TCTCATCTTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGACATGTAT
GTAACATTGTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGATAACTTCATCTATTCTTTTG
GGGC


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4BI87TF U 1
AF RR4BI87JQ C 668
BS 1 767 RR4BI87TF
BS 768 964 RR4BI87JQ

RD RR4BI87TF 767 0 0
GGGACAGATAACAGAAAAAGGTTGAAACTGTGAAAGTTTGGTGGGAAGGAAAAGCTTCTC
ATATTATTGGTTAATTACCCTTCCCGGAGGAGATCGGAGATAATGGCTGCTAATTTCTGG
GAATCGTCTCAATGCAAACGGCTTCTGGAACAAGAAGAAGTGGATGCAGTTCACCCTCTC
GACAAAGAACGTGGAATTACAGTTGAGGATTTCAAGCTCATCAAGTTCCTTATGTCTAAT
CATATAACGAAATTGGCTCAGCACATTAAAGTCCGACAAAGGGTTGTGGCTACCGCAATT
ACGTATATGAGACAGGTTTATACCAAGAAGAGCATGGTGGAGTTTGATCCGCGTCTTGTT
GCTATTACATGCTTGTACCTGGCTTCCAAAGCTGAAGAGAGCATAGTCCAGGCCAGGAAT
CTTGTCTTTTACATCAAAAGATTGTATCCGGATGAGTACAAGTATGAACTAAAAGATCTA
TTGGGAATGGAGATGAAGGTCTTAGAAGCACTCAACTATTCTCTGGTTGTGTTTCACCCT
TACCGCTCTTTATCTGATTTTTTGCAAGATGCTGCATTGAACGATGTAAATATGAACCAG
ATGACATGGGGAATTGTGAACGATACATATAAGATGGACCTGATTCTTGTACACCCGCCG
TATCGCATAGCGCTAGCGTGCATATACATAGCAAGTGTCCACAGAGAGAAAGACATCACT
GCATGGTTCCAAGATCTTAGCGAGGACATGAACTTGGTGAAGAACAT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4BI87JQ 297 0 0
TAGCGCTAGCGTGCATATACATAGCAAGTGTCCACAGAGAGAAAGACATCACTGCATGGT
TCCAAGATCTTAGCGAGGACATGAACTTGGTGAAGAACATTGCCATGGAACAAACTGACT
ATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCCATCTCCATGATTTATTTGATGCTCTCATC
TTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGACATGTATGTAACAT
TGTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGATAACTTCATCTATTCTTTTGGGGC

QA 1 297 1 297
DS 



AS 1 2

CO CL8824Contig1 803 2 2 U
GGATCTCCTTTCTTGCAGATTTCTCTCCGTTGACTATGGCTCTAGATACTTCACAGCATC
CAGACAAACGCGACTTCAAAGAACGCTTCCTGACAAATATAACGAATGGCATCAAGCCCC
CCAAGAAAAGAAGCAGGAAGCGAAGAAGGAGGAAGATCGTCTTGAAACAGAACCTGCACC
TCCAAAACACGAAATCTACGGGTTCGGTAACGAGATCAAGTCACTGGAGAACTTCTTGCT
GGACCAGAAGGTTTACAAAGAGTTCAAGAGTCTCGTCATTGTCGGAGAATACGGTGTCGG
GAAGACAGCCTTGTGCCAGAAGATTTTCAACAAAGAACAAGTCAAGAGTGTTTACGCTCC
AAGGATTTGGGTCTCTATGCATAGCAACGAAACAACAAGAGAAGGAGAGGACAAGAAGAT
ATCTGTGTTGAAGAGGCTCTTGAAGGATCTTGGAGTTGAAGATGAGATGTTAAGATCCAT
CCATGAGGCTGCTGTAGAAGAATTTTCAACGGAGATGGAGCGTGGGGGAGCTGGTGGAGA
GACGGTGGAAGAGAAGGAGCGTTCTGCTCTACTGTACGCGCTTCACTTGAATTTGAGGTG
GAAGAAGTATCTGATTGTGTTTGACGATGTTAGAGAAGAGGACGAGTGGGACGAGAAGCT
GGATGAGAAGCTCAAGAGGATGTGAAATGGGGAAAGCATCTTTCAGATGGGTTCCCTAAA
GGGTCTGGGGGGGAGAGTCATATACACGACCAGGATAGACGTGGCGGAGAAGCTGGTGCG
AGAGACATGAGATCCATCGTCTT


BQ
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AF RR4BZ42TF U 1
AF RR4CN33TF U 13
BS 1 597 RR4BZ42TF
BS 598 803 RR4CN33TF

RD RR4BZ42TF 601 0 0
GGATCTCCTTTCTTGCAGATTTCTCTCCGTTGACTATGGCTCTAGATACTTCACAGCATC
CAGACAAACGCGACTTCAAAGAACGCTTCCTGACAAATATAACGAATGGCATCAAGCCCC
CCAAGAAAAGAAGCAGGAAGCGAAGAAGGAGGAAGATCGTCTTGAAACAGAACCTGCACC
TCCAAAACACGAAATCTACGGGTTCGGTAACGAGATCAAGTCACTGGAGAACTTCTTGCT
GGACCAGAAGGTTTACAAAGAGTTCAAGAGTCTCGTCATTGTCGGAGAATACGGTGTCGG
GAAGACAGCCTTGTGCCAGAAGATTTTCAACAAAGAACAAGTCAAGAGTGTTTACGCTCC
AAGGATTTGGGTCTCTATGCATAGCAACGAAACAACAAGAGAAGGAGAGGACAAGAAGAT
ATCTGTGTTGAAGAGGCTCTTGAAGGATCTTGGAGTTGAAGATGAGATGTTAAGATCCAT
CCATGAGGCTGCTGTAGAAGAATTTTCAACGGAGATGGAGCGTGGGGGAGCTGGTGGAGA
GACGGTGGAAGAGAAGGAGCGTTCTGCTCTACTGTACGCGCTTCACTTGAATTTGAG
TGGA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR4CN33TF 791 0 0
TTGCAGATTTCTCTCCGTTGACTATGGCTCTAGATACTTCACAGCATCCAGACAAACGCG
ACTTCAAAGAACGCTTCCTGACAAATATAACGAATGGCATCAAGCCCCCCAAGAAAAGAA
GCAGGAAGCGAAGAAGGAGGAAGATCGTCTTGAAACAGAACCTGCACCTCCAAAACACGA
AATCTACGGGTTCGGTAACGAGATCAAGTCACTGGAGAACTTCTTGCTGGACCAGAAGGT
TTACAAAGAGTTCAAGAGTCTCGTCATTGTCGGAGAATACGGTGTCGGGAAGACAGCCTT
GTGCCAGAAGATTTTCAACAAAGAACAAGTCAAGAGTGTTTACGCTCCAAGGATTTGGGT
CTCTATGCATAGCAACGAAACAACAAGAGAAGGAGAGGACAAGAAGATATCTGTGTTGAA
GAGGCTCTTGAAGGATCTTGGAGTTGAAGATGAGATGTTAAGATCCATCCATGAGGCTGC
TGTAGAAGAATTTTCAACGGAGATGGAGCGTGGGGGAGCTGGTGGAGAGACGGTGGAAGA
GAAGGAGCGTTCTGCTCTACTGTACGCGCTTCACTTGAATTTGAGGTGGAAGAAGTATCT
GATTGTGTTTGACGATGTTAGAGAAGAGGACGAGTGGGACGAGAAGCTGGATGAGAAGCT
CAAGAGGATGTGAAATGGGGAAAGCATCTTTCAGATGGGTTCCCTAAAGGGTCTGGGGGG
GAGAGTCATATACACGACCAGGATAGACGTGGCGGAGAAGCTGGTGCGAGAGACATGAGA
TCCATCGTCTT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL8825Contig1 585 2 1 U
AGGGTTTGACTTCTTTTCGGGTTATGGATTCATCTCGTGAAGCTAAACACGAGCAGGAGG
AGGAGAGAAGAGAAGATGTAGCAGCTGCTTCTTTGGTGGATGTAAATCTCATGGTGGTGC
TTCTCTCCCAGCTTTGTACGAAGGACGACGAAGATGATAAGAATCTGGAGAAAGAGAGAA
GAGATCATGTTGCGCATGAGACTCGTGAATCCAGAGCACGTGCAAACAAGAGGTTTACGA
AGGAAACAAAGCTGATGGAGAAAAGGACACACGTACTTCAACCCATGGCTAAGGAATTCA
GGCATTCCAGGAGAATGTGAAGGATCATCATGACAGGCGATCTTGTATACGTGTTCGCCC
TAGAATCTGAAAGCAATCATCTTTTTGTTTATTGCAATCAAAATTTTGGTATTATTGAGC
ATTACGAAAAGATGGAAAAGATGAAGAGTGTTTTCCCATAATTGTAATATTTTAAGTATT
CACTTTGTAAAGAACGTGTATTATTTGTATCACTACAGCTGAGATGCAATTTTCTTTTCT
ATCCTAACATGGAAAAGAGGTCACCGATATTTTGTATTATTTGGT


BQ
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AF RR4F054JQ C 1
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QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EK83TF C 1
AF RR4EK83JQ U 6
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BS 6 683 RR4EK83JQ

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QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

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AC


BQ
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20 20 

AF RR4DK06JQ C 1
AF RR4DK06TF U 1
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AC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR4DK06TF 542 0 0
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AC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL8828Contig1 706 2 2 U
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AAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAGGTTGAAAGCAGCGACACCATCGACAAT
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ATAATTAAAATATAAAATTTTAGTATTGATAAATTTAAAATTTACG


BQ
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AF RR4DJ72TF U 1
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ATAATTAAAATATAAAATTTTAGTATTGATAAATTTAAAATTTACG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CE76TF C 1
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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4BQ33TF U 1
AF RR4CD22TF U 1
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QA 1 585 1 585
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GAGAAACTCGGAGAGCCTGGTCAATCCCATGACGACTTTGCAGCGAGTCTTCCAGCTGAT
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AAGATCTTCTTCGTTGCATGGTCTCCGGACACGGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTAC
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QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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TATCCACGATATTAATAAAAACCATTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A604TF U 1
AF RR4A604JQ C 82
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CTCCCACACCAATTGTATCTCCATCTGCAAAGGATCTTATTAGCCAGATGCTTGTCAAGG
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TATCCACGATATTAATA

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DS 

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GAGATATCAAACCAGAGAATCTGTTAATCGGTGCTCAGGGTGAGCTCAAGATTGCGGACT
TTGGTTGGTCAGTACACACATTTAACCGCAGAAGGACCATGTGTGGCACGCTCGATTACC
TTCCTCCTGAGATGGTTGAAAGCGTAGAGCATGATGCAAGTGTAGATATCTGGAGCCTAG
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CATCTGCAAAGGATCTTATTAGCCAGATGCTTGTCAAGGAGTCTGCAAAACGGCTGCCTC
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ATGTAGAACAAACAAAAAAAATCCTTCATGACGCGACCATATCCACGATATTAATAAAAA
CCATTTTGC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4EG33JQ C 1
AF RR4EG33TF U 1
BS 1 587 RR4EG33TF

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CTGAGCTCTCTTTATCTATGGATCAGTTTGATTTGATTTAACCGTCC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EG33TF 587 0 0
GGAGCTCCTAAACGATCATCGCTTTCTTCCTCTTTAAGGTACTGATCGAATCGCCATGGC
TAAGAACTCCTTCAAGCTCTCTAATCCTCTTGAGGTAAGAATGGCTGAATCTAGTCGTAT
CAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCCGTGATTGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGATGT
TCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTACCAACTGATCTAACCGTTGGGCAATTCGT
ATACGTTGTGAGGAAAAGAATCAAGCTTGGAGCCGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAA
GAACACGTTACCTCCAACTGCGGCGTTGATGTCTGCAACCTATGAAGAACACAAAGACGA
AGATGGGTTTCTCTACATGACTTACAGTGGAGAGAACACATTTGGATCTGCATGCTAATC
AGCTCTGCTTTTGACAGTTTGATCTTGATCATGATGATGATTGTACATTCCTTTCCCTCT
CTAGCGTTTGCTCTGTTTCGTCGACTTCAATAATGTCTTTTACTTTCTGGGATTTATGTT
CTGAGCTCTCTTTATCTATGGATCAGTTTGATTTGATTTAACCGTCC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL8834Contig1 865 2 2 U
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AAAACAATAAGGAGAACTCAGCTAGGAAGGAGAATAAAAAATCAGGGAAGAAGGATTCTC
CGGTTACTACTACTCAAACCACAGAGTGTCAAGAGAGTAGTAATGTGAATCAGAACAGTA
GCCTGGGGTTACCAAGCTATATGCAAGCGACTAAATCCGCAAAAGCAAAGCTGAGGCTAC
AAGGCTCTTCTACCCCTAAGCAACAAGTGACTGAGAAAACTACTAGACGTTACTCGCTAC
CATCTTCAGGTAATAACGCAAGAGTCACTTCTGATTCTCCTAAAACAACGAGAGTCTCAA
ACTCTGGTGGTAAGACCGGGAAGAAGACCGAGAAGCCTCTTCTTAACGGGAAGACAACTC
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ATTTTAACTACAAAATTTAGGTGTT


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AS28TF U 1
AF RR4AS28JQ C 1
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BS 769 865 RR4AS28JQ

RD RR4AS28TF 768 0 0
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QA 1 768 1 768
DS 

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GCCTGGGGTTACCAAGCTATATGCAAGCGACTAAATCCGCAAAAGCAAAGCTGAGGCTAC
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CATCTTCAGGTAATAACGCAAGAGTCACTTTTGATTCTCCTAAAACAACGAGAGTCTCAA
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QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BW33TF U 1
AF RR4BW33JQ C 31
BS 1 642 RR4BW33TF

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QA 1 642 1 642
DS 

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TAATACTTTTTG

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL8836Contig1 1221 2 2 U
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CAATACTCATATCTATTTTTA


BQ
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AF RR4DV55TF U 1
AF RR4DV55JQ C 507
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BS 692 1221 RR4DV55JQ

RD RR4DV55TF 691 0 0
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GGATTATAGGGTTTTCTTGATGAGATTCAATCTTTCCAACAAATCATCATGTGTAGTAGA
GCGTGAAGCTAAGCTTATTGGCCCAGACGGTTCAGATCAAATCGATGTGCGTGAAATCTT
TCATTGCGACGGTTTATTGTTATGTATTCTCAAAGATGATCACTCCAGGCTCGTGGTTTG
GAACCCTTATTGGGGGCAAACCAGGTGGATCGAGCAGACACACGACTGCCACTTAGTGGA
CCAGTATACGTATGCTATCGGTTACGACAGTAACAGTAAGTCCCATAAAGTCTTGAGATT
TATTGATTTTATATCTAGTTTTGTCGAGTTCAAAATCTACGACTTAAGTTCTGATTCGTG
GAGGATTATTCTTGACCTCCACCCTCGAAACTCCTGGATGGTAAGATATGGTGAACGTGG
CCTATCTTTAAAGGGAAACACCTACTGGTTTGCTTCAGACGTAGAATCTGGCGATGGTTT
GTTAGCCTGTTTTGATTTCACAAGAGAGACA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4DV55JQ 715 0 0
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TATCTAGTGTTGGAGAAGATCAGCTTGTGGTTTTATTCCAGACCACTAATATATTGACGT
TTGAGATCTGGATCTCCACTAAGATTGGTGATGACGACCCTAACGCCGTGTCCTGGAACA
ACAAGTTTTTCTTATCAGCGAATATCAAACAACTCCTTCACCCTCAGTGGCAGTTTCCTA
TATCTGCGGGTTTCTTCATTGACGAGGAGAAGAAAGTCGCCGTGGTTTTTGATAAAGACG
CAGATATAAATAACCCCACTCGCGAAGTAGCTTACATCTTTGGAGTAGATGGATCCTTGA
AAGAAGCAGCAGATGTCAGAGAATGTGCAGACAATATTTATGATGCATTTGTTTGCTCAT
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GTTTTGTTTCCTCTCATCGAAAGACTAGTGTACTCAATACTCATATCTATTTTTA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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TAGGTGCTGCGATGCAACTTCTCGGTAACATCTTGGAACACATCATTCTATTTCTCTTTA
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ATATTTCCAATCATCTAGAGATCACAAAGGTCTCTCTGCGTACAAACC


BQ
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AF RR4CZ24JQ C 1
AF RR4CZ24TF U 1
BS 1 588 RR4CZ24TF

RD RR4CZ24JQ 588 0 0
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GATCAATTTACGTGCACGACAATAGAAACAAAGATAAGAAAAAGTGTGTAAGTCCCCATA
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TCAAAAACTGAAAGCAAGTTTGCTCATGTAAGCATTCATTATCTTGGATTAAAATATTTG
CTAGTTGTGTAATCTTTTTATGCCTGGCGATCAAACACATCGCTATATAAGAAAAGCAAG
CAGAGGCTTTTCTAATGATGACTGAAAGTCTGAAACACTTGTTAAACTTTTTTTTTATAT
ATATTTCCAATCATCTAGAGATCACAAAGGTCTCTCTGCGTACAAACC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4CZ24TF 588 0 0
GGGATGGCCTCAAAGAGAAGCTTCAAGCTGCTTTCTCTCTCTCTGGTCCTGATTCGCTCC
ACCACGTTACTCTTCAGGTAAGAGATATCACTACAAATCCTGAGTGGGAAATGGCTTATC
AGTATGAGATGCCAGTCCTGGCCAAAGAGAATGCTGATGGCACAGAGGAGATTTTGCCAA
GGTTGTCTCCACGTTTAAGCGTGGAAATTATACATAAGAAGTTACTTGCTGCTTTTAGTT
GATCAATTTACGTGCACGACAATAGAAACAAAGATAAGAAAAAGTGTGTAAGTCCCCATA
TAGGTGCTGCGATGCAACTTCTCGGTAACATCTTGGAACACATCATTCTATTTCTCTTTA
TCAAAAACTGAAAGCAAGTTTGCTCATGTAAGCATTCATTATCTTGGATTAAAATATTTG
CTAGTTGTGTAATCTTTTTATGCCTGGCGATCAAACACATCGCTATATAAGAAAAGCAAG
CAGAGGCTTTTCTAATGATGACTGAAAGTCTGAAACACTTGTTAAACTTTTTTTTTATAT
ATATTTCCAATCATCTAGAGATCACAAAGGTCTCTCTGCGTACAAACC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL8838Contig1 972 2 10 U
GGAGATATATATGTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGCAGTCTCAGCAATTCATGGC
CAACATTCTCCGGCGACATGTTCTCCTTTTAACGGTGGCCACCGTGTTGTTATTCTCAAC
CGTTCCGGTTTCAAACTCTATTCCATTTATACTGTTCCACGGAATTGGAGATAAATGCTC
TGGTGGAGTTAGTAACTTCACGCAACTCCTAAGCAACCTCTCTGGCTCACCTGGCTCTTG
CTTAGAAATAGGAAACGGAGAAACAGACTCATGGTTCATGCCACTAACGCAACAAACGAG
TTTAGCGTGTGAGAAAGTGAAGATGATGAAAGAGCTGAGTCAAGGTTACAACATTGTTGC
ACAGTCTCAAGGAAACTTAGTAGCTAGAGGTCTAATTGAGTTTTGCGACGATGCTCCTCC
TCTCACCAACTATGTTTCCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATTTCCGCAATCCCCAAATG
CTCTGATCATATTGCTCCTAGTGGTTTTGTCAAGATCCCTGGTGAAATGACAAAGTATTT
GGGACACTCCAAGTATCTACCAAAGCTTAACAATGAGAGACCTGACCAAAGAAACTCCAC
TTTTAAAGACCGTTTCGTGAGCTTGCATAACTTGGTTCTTGTCATGTTCCAGAACGACAC
AACACTGATCCCTAAAGAAACTTCTTGGTTTGGATATTATTCAGATGATGGGTTTGATTC
TCTGTTGTCAACTCAACAGACAAAACTATACAGAGAAGACTGGATCGGTCTGAAAGCATT
AGATGCTGTCGGAAAAGTGAAGTTTGTGAGTGTCTCAGGGGACCACCTTATGATATCGTA
CAAGGACGTTGTGAAATACGTTGTGCCTTACTTGATGCAGACAAGTTTGTAAATTCTTTA
ACATGCGACTCTCACTGTCATTTTATAAGAAAACATATTTGATCCCAAATCCAAATATAA
TTGATAATATTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL27TF U 1
AF RR4CL27JQ C 213
BS 1 730 RR4CL27TF
BS 731 731 RR4CL27JQ
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BS 746 779 RR4CL27TF
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BS 781 795 RR4CL27TF
BS 796 796 RR4CL27JQ
BS 797 818 RR4CL27TF
BS 819 972 RR4CL27JQ

RD RR4CL27TF 818 0 0
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CGTTCCGGTTTCAAACTCTATTCCATTTATACTGTTCCACGGAATTGGAGATAAATGCTC
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CTTAGAAATAGGAAACGGAGAAACAGACTCATGGTTCATGCCACTAACGCAACAAACGAG
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TCTCACCAACTATGTTTCCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATTTCCGCAATCCCCAAATG
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GGGACACTCCAAGTATCTACCAAAGCTTAACAATGAGAGACCTGACCAAAGAAACTCCAC
TTTTAAAGACCGTTTCGTGAGCTTGCATAACTTGGTTCTTGTCATGTTCCAGAACGACAC
AACACTGATCCCTAAAGAAACTTCTTGGTTTGGATATTATTCAGATGATGGGTTTGATTC
TCTGTTGTCA*CTCAACAGACAAA*CTATACAGAGAAGACTGGATCGGTCTGAAAGCAT*
AGATGCTGTCGGAAA*GTGAAGTTTGTGAGTGTCTCAG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR4CL27JQ 760 0 0
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AGCTGAGTCAAGGTTACAACATTGTTGCACAGTCTCAAGGAAACTTAGTAGCTAGAGGTC
TAATTGAGTTTTGCGACGATGCTCCTCCTCTCACCAACTATGTTTCCTTAGGAGGACCTC
ATGCTGGCATTTCCGCAATCCCCAAATGCTCTGATCATATTGCTCCTAGTGGTTTTGTCA
AGATCCCTGGTGAAATGACAAAGTATTTGGGACACTCCAAGTATCTACCAAAGCTTAACA
ATGAGAGACCTGACCAAAGAAACTCCACTTTTAAAGACCGTTTCGTGAGCTTGCATAACT
TGGTTCTTGTCATGTTCCAGAACGACACAACACTGATCCCTAAAGAAACTTCTTGGTTTG
GATATTATTCAGATGATGGGTTTGATTCTCTGTTGTCAACTCAACAGACAAAACTATACA
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TCTCAGGGGACCACCTTATGATATCGTACAAGGACGTTGTGAAATACGTTGTGCCTTACT
TGATGCAGACAAGTTTGTAAATTCTTTAACATGCGACTCTCACTGTCATTTTATAAGAAA
ACATATTTGATCCCAAATCCAAATATAATTGATAATATTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL8839Contig1 743 2 3 U
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TCTGATGTGATTGGATTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G141JQ U 9
AF RR4G141TF C 1
BS 1 8 RR4G141TF
BS 9 671 RR4G141JQ
BS 672 743 RR4G141TF

RD RR4G141JQ 663 0 0
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CCA

QA 1 663 1 663
DS 

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AAACATATGGACGAAAGAGAACAAAGTTTCAAACACCTAGAAGAGAAACTTAGCAGAGGT
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TCTCATCCGCAGCATCATCCTGCATGTCGGATGTCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGGAGAA
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TCGCGTCATCAAAGGCCTGTTTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGGATCT
CGTAGTAGAACACAGAGAAGTTCAATGCCAGACCTAGACGGATCGGGTGAGTTGGTGCGA
GCTCTGCATTCGCAATATCCTGAACTCCACCATCTCCTCGTACCTCTCCGCTTGCTCCGC
GAGCTTGGCCATGTACACGAACTCCTCGCGCGCAGAAACCGCCATCTTCTTCTTCAGAGA
TCTGATGTGATTGGATTCTTTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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ATGCTGTTATCATGCATCCCTTACCTAGATTGGATGAAATCACTCCAGATGTTGACGCTG
ATCCAAGGGCTGCCTACTTCAGACAAGCAAAGAATGGTGTTCATTAGAATGGCTCTTCTT
AAGTTACTGCTTGTCGGTTGGTAAAAAGATGGTCTAAAATTAAAAGATCCTCCTTCAGTG
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CG12JQ C 1
AF RR4CG12TF U 1
BS 1 591 RR4CG12TF
BS 592 592 RR4CG12JQ
BS 593 605 RR4CG12TF
BS 606 631 RR4CG12JQ

RD RR4CG12JQ 631 0 0
GGAAGATATACTTTGTTTCCCCTGAAATTGTTAAGATGAAGGATGATATAAAAGAGTATT
TGACATCAAATGGTGTGGAATGGGAAGAAAGCTCAGATTTAATGGAAGTAGCATCCAAGT
GTGACGTAGTTTACCAGACCAGAATCCAGAGAGAGCGGTTTGGAGAAAGGCTTGACCTTT
ACGAAGCAGCTCGTGGGAAGTATATTGTAGACAAGGCACTGTTAGGAGTGATGCAGAAAA
ATGCTGTTATCATGCATCCCTTACCTAGATTGGATGAAATCACTCCAGATGTTGACGCTG
ATCCAAGGGCTGCCTACTTCAGACAAGCAAAGAATGGTGTTCATTAGAATGGCTCTTCTT
AAGTTACTGCTTGTCGGTTGGTAAAAAGATGGTCTAAAATTAAAAGATCCTCCTTCAGTG
TACCGAAGCTTGTGTGACACCAGAGACGTATCATCAGCGTAAGGTCTCGCAATAAATAAA
ATTTGAAACTCAAACTCAGTGTTTGTGTGTTCAGCATGATGTTACTCCAAAGAAGATAAT
GATGGTTGGTTTGTTGATCTTGACATTACATTAATCGACCTTATCCGAGGAAGTGTTGTT
GTTAAGCTTTATGAATAAATTGATTATGAGG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4CG12TF 605 0 0
GGAAGATATACTTTGTTTCCCCTGAAATTGTTAAGATGAAGGATGATATAAAAGAGTATT
TGACATCAAATGGTGTGGAATGGGAAGAAAGCTCAGATTTAATGGAAGTAGCATCCAAGT
GTGACGTAGTTTACCAGACCAGAATCCAGAGAGAGCGGTTTGGAGAAAGGCTTGACCTTT
ACGAAGCAGCTCGTGGGAAGTATATCGTAAACAAGGCACTGTTAGGAGTGATGCAGAAAA
ATGCTGTTATCATGCATCCCTTACCTAGATTGGATGAAATCACTCCAGATGTTGACGCTG
ATCCAAGGGCTGCCTACTTCAGACAAGCAAAGAATGGTGTTCATTAGAATGGCTCTTCTT
AAGTTACTGCTTGTCGGTTGGTAAAAAGATGGTCTAAAATTAAAAGATCCTCCTTCAGTG
TACCGAAGCTTGTGTGACACCAGAGACGTATCATCAGCGTAAGGTCTCGCAATAAATAAA
ATCTGAAACTCAAACTCAGTGTTTGTGTGTTCAGCATGATGTTACTCCAAAGAAGATAAT
GATGGTTGGTTTGTTGATCTTGACATTACATTAATCGACCTTATCCGAGGA*GTGTTGTT
GTTAA

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL8841Contig1 588 2 1 U
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ATCAGAGTCAGCCAAAGAAACTGCCTTTGCTCTTGCTGCTCTCATGGAGATTCCCTTTCA
GTATCAAGCAGCAACCGAACTCAGCTTACTCGGGAAAACAACGGGCTTAGCTAAGAAAAT
AAACCCGAGGCCAGCACCTATTCCTTACACGCCTACTATTCGTACTGAACTACCATCACC
TGCATCAGACGAACATACACAGAATTGCCCAATTTGTCTGACTAGCCGGAAAGACGTGGC
TTTTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCAT
CTGCAGAGTACCGATCACAAGCCGGCTAAGGCTTTACACGTGACCGGTGCCTTTGCCCAT
AACAAAAACACTTGCACATACTGTCTTTCTCCATCTCAGAATCTCCGGTTTGGTGTTTAT
CAAGTGTCTCTTACATTGTTCCAGAATCAGCTCGTACCATTCAGTTTCCTATGTACTATA
AATATTAGTTAGCTTTGCAAGCAAGAATGATGAAGATTGGCAATGTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CG72JQ C 1
AF RR4CG72TF U 1
BS 1 588 RR4CG72TF

RD RR4CG72JQ 588 0 0
GAAGCGTGAGTTCGACAACTTTCAGTTTGTGAATTTCACAGAGATCATGAAGAGAGATTC
ATCAGAGTCAGCCAAAGAAACTGCCTTTGCTCTTGCTGCTCTCATGGAGATTCCCTTTCA
GTATCAAGCAGCAACCGAACTCAGCTTACTCGGGAAAACAACGGGCTTAGCTAAGAAAAT
AAACCCGAGGCCAGCACCTATTCCTTACACGCCTACTATTCGTACTGAACTACCATCACC
TGCATCAGACGAACATACACAGAATTGCCCAATTTGTCTGACTAGCCGGAAAGACGTGGC
TTTTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCAT
CTGCAGAGTACCGATCACAAGCCGGCTAAGGCTTTACACGTGACCGGTGCCTTTGCCCAT
AACAAAAACACTTGCACATACTGTCTTTCTCCATCTCAGAATCTCCGGTTTGGTGTTTAT
CAAGTGTCTCTTACATTGTTCCAGAATCAGCTCGTACCATTCAGTTTCCTATGTACTATA
AATATTAGTTAGCTTTGCAAGCAAGAATGATGAAGATTGGCAATGTAC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4CG72TF 588 0 0
GAAGCGTGAGTTCGACAACTTTCAGTTTGTGAATTTCACAGAGATCATGAAGAGAGATTC
ATCAGAGTCAGCCAAAGAAACTGCCTTTGCTCTTGCTGCTCTCATGGAGATTCCCTTTCA
GTATCAAGCAGCAACCGAACTCAGCTTACTCGGGAAAACAACGGGCTTAGCTAAGAAAAT
AAACCCGAGGCCAGCACCTATTCCTTACACGCCTACTATTCGTACTGAACTACCATCACC
TGCATCAGACGAACATACACAGAATTGCCCAATTTGTCTGACTAGCCGGAAAGACGTGGC
TTTTGGCTGTGGTCACATGACGTGTAGAGATTGCGGATCCAGGATATCAAACTGTCCCAT
CTGCAGAGTACCGATCACAAGCCGGCTAAGGCTTTACACGTGACCGGTGCCTTTGCCCAT
AACAAAAACACTTGCACATACTGTCTTTCTCCATCTCAGAATCTCCGGTTTGGTGTTTAT
CAAGTGTCTCTTACATTGTTCCAGAATCAGCTCGTACCATTCAGTTTCCTATGTACTATA
AATATTAGTTAGCTTTGCAAGCAAGAATGATGAAGATTGGCAATGTAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL8842Contig1 1183 2 4 U
GGATAGTATTTAAGCTAGAATCAAGAAAGGGAAAACACCATCAAAATTCTCAGAATCAAG
AAATGGGTTCAAACTCTCTTCTTCCTCTTTCAGATTTTATTCAACTCCCAGTTATTGATT
TCTCGGATCAAACCCTGACATCAGGAACCTCAAAGTGGGACAAAGTGAAGGCTGATGTTC
GCAAAGCTTTAGAAGACTATGGCTGTTTTGAAGCTCTCTTTCCCAAAGTGTCTTCTGAGC
TTGATAAGTCTGTTTTCGAAGCCATAGAAGAACTTTTCGGTTTACCGATTCAGGCCAAAG
AGAGAAATGTGTCGCCAAAACCCTATCATGGATATCTAAGCCGAGATCTTTACGAGAGTT
TTGGGATAGATGATGCTAATCTTGCGGAGAGAGTCAACGACTTTACTCAACAGCTGTGGC
CTGACCATGGAAACAAGAGAATAAGTGAGACGATGCATGGGGTTTCGGATAAATTAGCAG
AACTGGATGTGATGGTGAGGAGAATGATACTGGAGAGTTTTGGGATAGAGAAATATATTG
ACGAACATCTTGACTCTACCAATTACCTTTTTCGCATGATGAAGTATACACCACCTCCTC
CTCATGATGGTGCGGATGAAGAGACAAAGTTAGGTTTACCTTGTCATACGGATAAAAACA
TCATGACAATACTTCATCAGTATCAAATTGAGGGTTTGGAAATTCAGACCAAAGACAAAA
AATGGTTCAAAGTGAAGCCATCTCATCATTTTTCTTTCATAGTAATGGTTGGAGATTCTA
TGTGTGCTTTTTTGAATGGCCGATTGTCTTCTACATATCACCGAGTCCTGATGACGGCAA
AGAAGACAAGGTATTCGACTGCACTGTTCTCGACTCCCAAAACAGGAGTTATCATTGATT
CAGCTGAAGAACTTATAGATGAAGAACATCCACGTGTGTTCAAACCCTTTGAATTCAATG
ATTACCGTGACTTCTATAACACGGAAGATGGGTATGCAGCTCAGTCTACTCTCCATGCTT
TCTGTGCTCTATGAAGCATTACTCTATTCGCAGCAAGGAATGTGATAGTGGCTTTATGTT
TGATTGTTTAAATTTGATTGTTTAAATCCATCCAATAATGTTTTGTGTGTTTCGGTTTGA
TGTATTTTTCTTTTCGTGTGGCGACCAATCTGCATTTGTTATT


BQ
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AF RR4DJ19TF U 1
AF RR4DJ19JQ C 447
BS 1 721 RR4DJ19TF
BS 722 722 RR4DJ19JQ
BS 723 774 RR4DJ19TF
BS 775 1183 RR4DJ19JQ

RD RR4DJ19TF 774 0 0
GGATAGTATTTAAGCTAGAATCAAGAAAGGGAAAACACCATCAAAATTCTCAGAATCAAG
AAATGGGTTCAAACTCTCTTCTTCCTCTTTCAGATTTTATTCAACTCCCAGTTATTGATT
TCTCGGATCAAACCCTGACATCAGGAACCTCAAAGTGGGACAAAGTGAAGGCTGATGTTC
GCAAAGCTTTAGAAGACTATGGCTGTTTTGAAGCTCTCTTTCCCAAAGTGTCTTCTGAGC
TTGATAAGTCTGTTTTCGAAGCCATAGAAGAACTTTTCGGTTTACCGATTCAGGCCAAAG
AGAGAAATGTGTCGCCAAAACCCTATCATGGATATCTAAGCCGAGATCTTTACGAGAGTT
TTGGGATAGATGATGCTAATCTTGCGGAGAGAGTCAACGACTTTACTCAACAGCTGTGGC
CTGACCATGGAAACAAGAGAATAAGTGAGACGATGCATGGGGTTTCGGATAAATTAGCAG
AACTGGATGTGATGGTGAGGAGAATGATACTGGAGAGTTTTGGGATAGAGAAATATATTG
ACGAACATCTTGACTCTACCAATTACCTTTTTCGCATGATGAAGTATACACCACCTCCTC
CTCATGATGGTGCGGATGAAGAGACAAAGTTAGGTTTACCTTGTCATACGGATAAAAACA
TCATGACAATACTTCATCAGTATCAAATTGAGGGTTTGGAAATTCAGACCAAAGACAAAA
A*TGGTTCAAAGTGAAGCCATCTCATCATTTTTCTTTCATAGTAATGGTTGGAG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4DJ19JQ 737 0 0
GAGACGATGCATGGGGTTTCGGATAAATTAGCAGAACTGGATGTGATGGTGAGGAGAATG
ATACTGGAGAGTTTTGGGATAGAGAAATATATTGACGAACATCTTGACTCTACCAATTAC
CTTTTTCGCATGATGAAGTATACACCACCTCCTCCTCATGATGGTGCGGATGAAGAGACA
AAGTTAGGTTTACCTTGTCATACGGATAAAAACATCATGACAATACTTCATCAGTATCAA
ATTGAGGGTTTGGAAATTCAGACCAAAGACAAAAAATGGTTCAAAGTGAAGCCATCTCAT
CATTTTTCTTTCATAGTAATGGTTGGAGATTCTATGTGTGCTTTTTTGAATGGCCGATTG
TCTTCTACATATCACCGAGTCCTGATGACGGCAAAGAAGACAAGGTATTCGACTGCACTG
TTCTCGACTCCCAAAACAGGAGTTATCATTGATTCAGCTGAAGAACTTATAGATGAAGAA
CATCCACGTGTGTTCAAACCCTTTGAATTCAATGATTACCGTGACTTCTATAACACGGAA
GATGGGTATGCAGCTCAGTCTACTCTCCATGCTTTCTGTGCTCTATGAAGCATTACTCTA
TTCGCAGCAAGGAATGTGATAGTGGCTTTATGTTTGATTGTTTAAATTTGATTGTTTAAA
TCCATCCAATAATGTTTTGTGTGTTTCGGTTTGATGTATTTTTCTTTTCGTGTGGCGACC
AATCTGCATTTGTTATT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8844Contig1 940 2 2 U
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ATCCAAAGCTTCCTCTTCGTTTTATTAGAACCAATCTTCATATCTTTCCTGAGTTAGCAA
TGGCCGTTGGTGAGGTCATGAGGATGGATATTCCAGCCGGTGGAGATTTAACAGTTACTT
CGCCGGAGTTACATGTTCTCGCCGTTGATGATAGTATTGTGGATCGTAAGGTCATTGAGA
GATTGCTAAGAATCTCTGCTTGTAAAGTGACTACTGTAGAGAGTGGGGCTATGGCTTTGC
AGTACCTTGGCTTAGATGGAGACAAGGGAGCTTCTGGTCTTAAGGATTTGAAGGTGAATT
TGATAGTGACGGATTACTCAATGCCAGGACTAACAGGATATGATCTTCTCAAGAAGATTA
AGGAATCTTCTGTTTTCAGAGAAATACCAGTTGTGATTATGTCATCTGAGAACATCTTAC
CTCGTATAGAACAATGTCTGAGAGAAGGAGCAGAGGATTTTCTGTTAAAACCGGTGAAAC
TAGCTGATGTAAAGCGAATAAAAGAACTTATAATGAGAAATGAATCAGATGATTGCAAAA
CCTTAAGCCATTCTAACAAAAGAAAACTTGCAGAAGACATTGATGATACAGCATCGCCAT
CATCATCATCATCATCATCATCATCAAGTCCTGATGATTCTTCTGTCGAGGACATTCCAT
CTTCAAAACGGATGAAATCAGAGCTTTCTCTCCTTTGAAATATATATAGAGCCAAGACCT
TAGCTAATGTCTGTTAATATTCATCATCTATGTTTTCGTTCATTAATTTTGTTTTCGGGT
CAATACAAAGACAGTGTTGAGAGTCATCTCACAACTCATTTTTTGTTGGTAAACATAAAA
AAAAATGGCAGTTCTTAAAAAGAAATAGTTTGTTTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DM25TF U 1
AF RR4DM25JQ C 130
BS 1 722 RR4DM25TF
BS 723 940 RR4DM25JQ

RD RR4DM25TF 722 0 0
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GATTGCTAAGAATCTCTGCTTGTAAAGTGACTACTGTAGAGAGTGGGGCTATGGCTTTGC
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TGATAGTGACGGATTACTCAATGCCAGGACTAACAGGATATGATCTTCTCAAGAAGATTA
AGGAATCTTCTGTTTTCAGAGAAATACCAGTTGTGATTATGTCATCTGAGAACATCTTAC
CTCGTATAGAACAATGTCTGAGAGAAGGAGCAGAGGATTTTCTGTTAAAACCGGTGAAAC
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CATCATCATCATCATCATCATCATCAAGTCCTGATGATTCTTCTGTCGAGGACATTCCAT
CT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR4DM25JQ 811 0 0
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CGGATTACTCAATGCCAGGACTAACAGGATATGATCTTCTCAAGAAGATTAAGGAATCTT
CTGTTTTCAGAGAAATACCAGTTGTGATTATGTCATCTGAGAACATCTTACCTCGTATAG
AACAATGTCTGAGAGAAGGAGCAGAGGATTTTCTGTTAAAACCGGTGAAACTAGCTGATG
TAAAGCGAATAAAAGAACTTATAATGAGAAATGAATCAGATGATTGCAAAACCTTAAGCC
ATTCTAACAAAAGAAAACTTGCAGAAGACATTGATGATACAGCATCGCCATCATCATCAT
CATCATCATCATCATCAAGTCCTGATGATTCTTCTGTCGAGGACATTCCATCTTCAAAAC
GGATGAAATCAGAGCTTTCTCTCCTTTGAAATATATATAGAGCCAAGACCTTAGCTAATG
TCTGTTAATATTCATCATCTATGTTTTCGTTCATTAATTTTGTTTTCGGGTCAATACAAA
GACAGTGTTGAGAGTCATCTCACAACTCATTTTTTGTTGGTAAACATAAAAAAAAATGGC
AGTTCTTAAAAAGAAATAGTTTGTTTGGTTC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL8845Contig1 1232 2 4 U
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CGCTTGGAGCAAAACAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTT
CACAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTTATC
TTCTTCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTC
CATCATTGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGTAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAAT
AGGAACAGGTGTGTGTGTGGGAGGAGCCATGGCAACGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACT
GCTCAACGCCCTGTTAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCT
TCTCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAGGTTCCAATTGCTAATCA
TTGTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTT
CTTCATGGCCCTCGCCTTAGGCAACACTGACTTAACGTCCTGGAAGCTTGATTCCTCATT
GAAACTCTCCTGCTGCGTTTACTCTGGACTCCAGTTGGCAGTGTCTTTCTTTCTACAAGC
TTGGTGCGTGTCGCGGAAAGGACCTCTTTTCTCTGCACTCTTCAACCCTCTTTCTACGGT
CATTGTCACTTTCTTCGGCGCTCTGTATCTAAACGAGCAGACTTACCTTGGGAGCTTGCT
GGGGGCTTTGGCTATCATCGTTGGTCTCTACATTGTTCTCTGGGGCAAAACCGAAGACTA
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CTTTGTTCCCATTCTGATTGGCGACAGGGCTTTTAGTAGTTCTGAGCTCTTAGAACCTCT
TCCCATGTAAACTCTTATCAAAAGTCAAAATTCTAGATGGGTGTAGGGATAAGTTTTTGA
CAGAGTAAAAATGAAATGGGCACTTGTTTCGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ14TF U 1
AF RR4GQ14JQ C 542
BS 1 643 RR4GQ14TF
BS 644 644 RR4GQ14JQ
BS 645 740 RR4GQ14TF
BS 741 1232 RR4GQ14JQ

RD RR4GQ14TF 753 0 0
GGATTTGTAGTAAGATACATTAAATCTTAAAATAAGAAAGAGAGATAGGGAGAAAAGTGC
GCAAGAGATGGAGATGGAGAAATACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTTAC
ATCTGCAGGAGTTGCACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAATCCCACCGT
CTTCGTAGTTTACCGTCAAGCCATCGCTACTCTCTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTC
CGCTTGGAGCAAAACAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTT
CACAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTTATC
TTCTTCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTC
CATCATTGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGTAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAAT
AGGAACAGGTGTGTGTGTGGGAGGAGCCATGGCAACGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACT
GCTCAACGCCCTGTTAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCT
TCTCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAG*TTCCAATTGCTAATCA
TTGTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTT
CTTCATGGCCCTCGCCTTAG
CACACTGACTTAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4GQ14JQ 691 0 0
CTCAACGCCCTGTTAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTT
CTCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAGGTTCCAATTGCTAATCAT
TGTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTTC
TTCATGGCCCTCGCCTTAGGCAACACTGACTTAACGTCCTGGAAGCTTGATTCCTCATTG
AAACTCTCCTGCTGCGTTTACTCTGGACTCCAGTTGGCAGTGTCTTTCTTTCTACAAGCT
TGGTGCGTGTCGCGGAAAGGACCTCTTTTCTCTGCACTCTTCAACCCTCTTTCTACGGTC
ATTGTCACTTTCTTCGGCGCTCTGTATCTAAACGAGCAGACTTACCTTGGGAGCTTGCTG
GGGGCTTTGGCTATCATCGTTGGTCTCTACATTGTTCTCTGGGGCAAAACCGAAGACTAT
CAAGAAGAAGCAACAGACCTGAAACTGCAAAATGAATACAGCACTAGCTCCCAATCTGAC
TTTGTTCCCATTCTGATTGGCGACAGGGCTTTTAGTAGTTCTGAGCTCTTAGAACCTCTT
CCCATGTAAACTCTTATCAAAAGTCAAAATTCTAGATGGGTGTAGGGATAAGTTTTTGAC
AGAGTAAAAATGAAATGGGCACTTGTTTCGC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8846Contig1 843 2 3 U
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AAACAAAAAAAAAAAAGTAAATTCATTTGAAAACTGATATTTTCTCACTCAGTTGTCTTC
TCCAAGAGTAAAATCGAAAAACGTCCTGACTTTGATGTTTTCACCACAAGAGTTGCCACA
GTTTGCTCCACAAGATCCTTTACCAAGACACTGTCATCTTCAATGCAAGGCTGCTCATGC
AACTTCCTCTTCATTTTTGGTTTCTGGAACTGAAGGAACATCTGGCGTTTCCTCAGTCTT
CTCCACCTCTTCAACCTCAGCTGCTGCAGCACGTGTCTCCGTTTGCTCTACTGTCTCCTG
TGAAGCATCTTCAGCTTTGGTCTCTATCACTTCTTCTTCTTCCACCTTGGGAGTTTCTGA
TGAGACAACCTCTTCACTCACAGGCTCTATTGGTTTCTCAGCTTCTTCTTCCCTCTTGTC
AAGAAACGAAGCTATCTCTTCATTCTTTCTAAAAGCAAGCACAAACGGATTCGTGGCCGT
ATGCACAGCCCCTTGACTAAACGTCTCATCGAACTTACCATCATCTTCCTCTTTCATCGT
CAAAGTAACACGTCCTCTGGCTATCCGCAACACACGAACCTTAACCTCTTGTCCAGCTTG
CAAAGAAGAGCCACCACCCATCATCATGCTCCCAATCCCATCATCTGCCTCCTCATTCGT
AGGTAGAAACCCTTCTTCACCTTCTCCTATCGTTATAAACGCTCCTGACCTCGTTAAGTT
CTTCACCGTTCATCTAACATCTGCCCTTTCACATACTTTGAGCTGAACCCATCTTCTTTG
AGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 

AF RR4EL26JQ U 2
AF RR4C328JQ U 1
BS 1 134 RR4C328JQ
BS 135 135 RR4EL26JQ
BS 136 843 RR4C328JQ

RD RR4EL26JQ 663 0 0
A
ACAAATTAACTACAGCTCTAGTTAAAGGTTGTGAATACTGAAGATTGTCTACAAAACAAA
ACAAAAAAAAAA**GTAAATTCATTTGAAAACTGATATTTTCTCACTCAGTTGTCTTCTC
CAAGAGTAAACTCGAAAAACGTCCTGACTTTGATGTTTTCACCACAAGAGTTGCCACAGT
TTGCTCCACAAGATCCTTTACCAAGACACTGTCATCTTCAATGCAAGGCTGCTCATGCAA
CTTCCTCTTCATTTTTGGTTTCTGGAACTGAAGGAACATCTGGCGTTTCCTCAGTCTTCT
CCACCTCTTCAACCTCAGCTGCTGCAGCACGTGTCTCCGTTTGCTCTACTGTCTCCTGTG
AAGCATCTTCAGCTTTGGTCTCTATCACTTCTTCTTCTTCCACCTTGGGAGTTTCTGATG
AGACAACCTCTTCACTCACAGGCTCTATTGGTTTCTCAGCTTCTTCTTCCCTCTTGTCAA
GAAACGAAGCTATCTCTTCATTCTTTCTAAAAGCAAGCACAAACGGATTCGTGGCCGTAT
GCACAGCCCCTTGACTAAACGTCTCATCGAACTTACCATCATCTTCCTCTTTCATCGTCA
AAGTAACACGTCCTCTGGCTATCCGCAACACACGAACCTTAACCTCTTGTCCAGCTTGCA
AA

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR4C328JQ 843 0 0
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AAACAAAAAAAAAAAAGTAAATTCATTTGAAAACTGATATTTTCTCACTCAGTTGTCTTC
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GTTTGCTCCACAAGATCCTTTACCAAGACACTGTCATCTTCAATGCAAGGCTGCTCATGC
AACTTCCTCTTCATTTTTGGTTTCTGGAACTGAAGGAACATCTGGCGTTTCCTCAGTCTT
CTCCACCTCTTCAACCTCAGCTGCTGCAGCACGTGTCTCCGTTTGCTCTACTGTCTCCTG
TGAAGCATCTTCAGCTTTGGTCTCTATCACTTCTTCTTCTTCCACCTTGGGAGTTTCTGA
TGAGACAACCTCTTCACTCACAGGCTCTATTGGTTTCTCAGCTTCTTCTTCCCTCTTGTC
AAGAAACGAAGCTATCTCTTCATTCTTTCTAAAAGCAAGCACAAACGGATTCGTGGCCGT
ATGCACAGCCCCTTGACTAAACGTCTCATCGAACTTACCATCATCTTCCTCTTTCATCGT
CAAAGTAACACGTCCTCTGGCTATCCGCAACACACGAACCTTAACCTCTTGTCCAGCTTG
CAAAGAAGAGCCACCACCCATCATCATGCTCCCAATCCCATCATCTGCCTCCTCATTCGT
AGGTAGAAACCCTTCTTCACCTTCTCCTATCGTTATAAACGCTCCTGACCTCGTTAAGTT
CTTCACCGTTCATCTAACATCTGCCCTTTCACATACTTTGAGCTGAACCCATCTTCTTTG
AGC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 2

CO CL8847Contig1 894 2 2 U
GATACCAATTACTTGCTTGGTTAAGCTTGATTAGTTTCAAAAATGGTTTATCGTAAAACA
CTTCCCATAGTCTTTTTCTTTGCATTTGTCACTCTATACTTTGCTATCTTAGCAGATGCG
ACTACGTTCACAGTAAGGAACAATTGCCCATATGTTGTGTGGGCTGCCGCATCTGCTCCG
GGAACGCCTGGCGGTGGGAAGCGACTCAATCAAGGCGAAACGTGGATCGTTAATGGTAAT
CCAGGTACCACCCAGGCTCGGATTTGGGGTCGTACCAACTGCAACTTCGATGCCTCTGGA
AGAGGTGGATGCCAAACTGGAGACTGTAATGGTGTACTTGAGTGCAAATCTTATGGACGC
GCACCAAATACATTGGCAGAATATGCTCTTAAACAATATGCAGACCAAGATTTCATCGAT
ATTTCTGTGATCGATGGATTCAATATTCCAATGGAATTCAGTTCTGCATCTGGACAATGC
ACCCGCAAAATTAGGTGTACCGGAGATATTATAGCTCAATGTCCAGGCCAACTAAGAATG
GACGGCGCTTGCAACGGACCGTGTCCGGTGTTGAAGACGGAGGAACATTGTTGCAACTCT
GGTAATTGTGGACCGACCCCACTCTCTATGTTTTTCAAGCAGCGTTGTCCAGATGCCTAT
AGTTATCCTAAGGATGATCCCACCAGCCTTTTCACTTGCCCTAGCGGAACCAACTACAAT
GTCATTTTCTGTCCGTGAATGGAAGTGTGATTATCAAGAGGCTGGAATATCATAGAGCAA
CGCAAAACCCAATAATAATCAATATGATATGATCCATACTAGCTGCTCTGAATAAAATCT
AAGAGTTTGCATGTTTCATATCTGGTTTATTAATAATAAAGATTTCATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A760TF U 1
AF RR4A760JQ C 78
BS 1 754 RR4A760TF
BS 755 894 RR4A760JQ

RD RR4A760TF 754 0 0
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CTTCCCATAGTCTTTTTCTTTGCATTTGTCACTCTATACTTTGCTATCTTAGCAGATGCG
ACTACGTTCACAGTAAGGAACAATTGCCCATATGTTGTGTGGGCTGCCGCATCTGCTCCG
GGAACGCCTGGCGGTGGGAAGCGACTCAATCAAGGCGAAACGTGGATCGTTAATGGTAAT
CCAGGTACCACCCAGGCTCGGATTTGGGGTCGTACCAACTGCAACTTCGATGCCTCTGGA
AGAGGTGGATGCCAAACTGGAGACTGTAATGGTGTACTTGAGTGCAAATCTTATGGACGC
GCACCAAATACATTGGCAGAATATGCTCTTAAACAATATGCAGACCAAGATTTCATCGAT
ATTTCTGTGATCGATGGATTCAATATTCCAATGGAATTCAGTTCTGCATCTGGACAATGC
ACCCGCAAAATTAGGTGTACCGGAGATATTATAGCTCAATGTCCAGGCCAACTAAGAATG
GACGGCGCTTGCAACGGACCGTGTCCGGTGTTGAAGACGGAGGAACATTGTTGCAACTCT
GGTAATTGTGGACCGACCCCACTCTCTATGTTTTTCAAGCAGCGTTGTCCAGATGCCTAT
AGTTATCCTAAGGATGATCCCACCAGCCTTTTCACTTGCCCTAGCGGAACCAACTACAAT
GTCATTTTCTGTCCGTGAATGGAAGTGTGATTAT

QA 1 754 1 754
DS 

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GAACAATTGCCCATATGTTGTGTGGGCTGCCGCATCTGCTCCGGGAACGCCTGGCGGTGG
GAAGCGACTCAATCAAGGCGAAACGTGGATCGTTAATGGTAATCCAGGTACCACCCAGGC
TCGGATTTGGGGTCGTACCAACTGCAACTTCGATGCCTCTGGAAGAGGTGGATGCCAAAC
TGGAGACTGTAATGGTGTACTTGAGTGCAAATCTTATGGACGCGCACCAAATACATTGGC
AGAATATGCTCTTAAACAATATGCAGACCAAGATTTCATCGATATTTCTGTGATCGATGG
ATTCAATATTCCAATGGAATTCAGTTCTGCATCTGGACAATGCACCCGCAAAATTAGGTG
TACCGGAGATATTATAGCTCAATGTCCAGGCCAACTAAGAATGGACGGCGCTTGCAACGG
ACCGTGTCCGGTGTTGAAGACGGAGGAACATTGTTGCAACTCTGGTAATTGTGGACCGAC
CCCACTCTCTATGTTTTTCAAGCAGCGTTGTCCAGATGCCTATAGTTATCCTAAGGATGA
TCCCACCAGCCTTTTCACTTGCCCTAGCGGAACCAACTACAATGTCATTTTCTGTCCGTG
AATGGAAGTGTGATTATCAAGAGGCTGGAATATCATAGAGCAACGCAAAACCCAATAATA
ATCAATATGATATGATCCATACTAGCTGCTCTGAATAAAATCTAAGAGTTTGCATGTTTC
ATATCTGGTTTATTAATAATAAAGATTTCATATTTGC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL8848Contig1 783 2 2 U
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AAAAACATGTCATAAAATCATCCAAAAGGTGTTTTGAATTAAGCTAATCTAGCAGCGACG
TGCAATGGAAATAGTTATACAGGTAATCCTCATCACTACCGAAGAATCTTCTAAAAATTA
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GCTCGGTTTTCAGATCATTGCCTAGTTGACTGAACATGATGCCGATATCCATTCCTTGAT
TCATAGTTGGTATGACTTGTGAGTAAGGGCATTGTTTGGAAAAGCCGACCTTTTTGTTTT
TGGATTGTTTAATCGATTTGCTAAGCCTGCTTAGGCATTGCTTGAACTTCTTATGGCAGC
TTATGTTAGTCATACCTTTAGAATCAACGCAGTTGTCATGAGCCATACAACAAGCATCAA
GATCATCACAAGGTTCCTCACCAGGACATCCAAAGTGTCCAATCCCACAATACTTGCCAT
ATCGTATAGAAAGTGTGTCACAATTCTGGGCAATGCAGGTTCTTGTGCACTCCTCGCTGC
GAGCAACGTCGAAGAGGAAGAGGGCAACGAACAAAGCAGCCTTCATAAAACGCATCAAAG
AAAAGCGAATCATCATCTTCCCTGGTCGTCTCTCTCTTTTTCTTTTAGTAGAAAGAAGCT
TCTGGATTTGATTTCTTTTTTTTTTGATCAAAAGCTTCTAGATTTGATTTAACGCTAAGA
TTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RR4AK44TF C 1
AF RR4AK44JQ U 5
BS 1 4 RR4AK44TF
BS 5 783 RR4AK44JQ

RD RR4AK44TF 636 0 0
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GCTCGGTTTTCAGATCATTGCCTAGTTGACTGAACATGATGCCGATATCCATTCCTTGAT
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TTATGTTAGTCATACCTTTAGAATCAACGCAGTTGTCATGAGCCATACAACAAGCATCAA
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ATCGTATAGAAAGTGTGTCACAATTCTGGGCAATGCAGGTTCTTGTGCACTCCTCGCTGC
GAGCAACGTCGAAGAGGAAGAGGGCAACGAACAAAG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4AK44JQ 779 0 0
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TTGTTTAATCGATTTGCTAAGCCTGCTTAGGCATTGCTTGAACTTCTTATGGCAGCTTAT
GTTAGTCATACCTTTAGAATCAACGCAGTTGTCATGAGCCATACAACAAGCATCAAGATC
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TATAGAAAGTGTGTCACAATTCTGGGCAATGCAGGTTCTTGTGCACTCCTCGCTGCGAGC
AACGTCGAAGAGGAAGAGGGCAACGAACAAAGCAGCCTTCATAAAACGCATCAAAGAAAA
GCGAATCATCATCTTCCCTGGTCGTCTCTCTCTTTTTCTTTTAGTAGAAAGAAGCTTCTG
GATTTGATTTCTTTTTTTTTTGATCAAAAGCTTCTAGATTTGATTTAACGCTAAGATTT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL8849Contig1 828 2 4 U
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CTTGCTTGCCAATGGCGAATAATAATCAAGCAAGTCTTCTTCTCCAGAAGCAGCTCAAAG
ATCTGTGCAAGAACCCGGTCGATGGTTTCTCAGCTGGTCTCCTTGACGAGAGTAACGTTT
TTCAATGGAGCGTCTCCATCATGGGTCCTCCTGATACCTTGTATGAAGGGGGATTCTTTA
ATGCAATTATGACGTTTCCAGATAATTATCCTAATCAGCCACCAACTGTGCAGTTCACTT
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GCTAACGTGGACGCTGCAAAAGAGTGGAGAGACAACAGAGCAGAGTTTAGGAAGAAAGTG
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TTGGTTTTGGAGTTGGCTTTAAGGTTTGGAATATTGTGGTGGAATCAAATCCAATCCACC
TTTTAGGATTATAATCGTACTCTCGTTAATGGATTCGTTTTCACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB66TF U 1
AF RR4GB66JQ C 43
BS 1 678 RR4GB66TF
BS 679 679 RR4GB66JQ
BS 680 715 RR4GB66TF
BS 716 828 RR4GB66JQ

RD RR4GB66TF 734 0 0
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CTTGCTTGCCAATGGCGAATAATAATCAAGCAAGTCTTCTTCTCCAGAAGCAGCTCAAAG
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TTCAATGGAGCGTCTCCATCATGGGTCCTCCTGATACCTTGTATGAAGGGGGATTCTTTA
ATGCAATTATGACGTTTCCAGATAATTATCCTAATCAGCCACCAACTGTGCAGTTCACTT
CCGAGATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTAAAGTTTGCATATCGATTCTTCATC
CTCCTGGTGACGATCCTAATGGATACGAGCTTGCCTCTGAACGTTGGACCTGTCCAAACG
GTAGAAAGCATTGTGTTGAGTATCATATCCATGCTCTCGGGTCCCAACGATGAGTCACCG
GCTAACGTGGACGCTGCAAAAGAGTGGAGAGACAACAGAGCAGAGTTTAGGAAGAAAGTG
AGTCGCTGTGTTAGAAAATCGCAGGAGATGCTATGAGCGTCTCTCTCCTGCGTTTTTATG
TGTTCTAGAAATTTTTCTCCTAAGCTAAGAGAGAGAGCGAGCGAGCGTAAGAAGCATCCT
CAATCATCAAGAAGCAGC*AGATGAATCTGTGTGCTCAAAAGCTTGTTTTTTTTT
CTTTGGTTTTGGAGTTGGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4GB66JQ 786 0 0
CTCGCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTTGCCAATGGCGAATAATAATCAAGCAAGTCTTCTTC
TCCAGAAGCAGCTCAAAGATCTGTGCAAGAACCCGGTCGATGGTTTCTCAGCTGGTCTCC
TTGACGAGAGTAACGTTTTTCAATGGAGCGTCTCCATCATGGGTCCTCCTGATACCTTGT
ATGAAGGGGGATTCTTTAATGCAATTATGACGTTTCCAGATAATTATCCTAATCAGCCAC
CAACTGTGCAGTTCACTTCCGAGATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTAAAGTTT
GCATATCGATTCTTCATCCTCCTGGTGACGATCCTAATGGATACGAGCTTGCCTCTGAAC
GTTGGACCTGTCCAAACGGTAGAAAGCATTGTGTTGAGTATCATATCCATGCTCTCGGGT
CCCAACGATGAGTCACCGGCTAACGTGGACGCTGCAAAAGAGTGGAGAGACAACAGAGCA
GAGTTTAGGAAGAAAGTGAGTCGCTGTGTTAGAAAATCGCAGGAGATGCTATGAGCGTCT
CTCTCCTGCGTTTTTATGTGTTCTAGAAATTTTTCTCCTAAGCTAAGAGAGAGAGCGAGC
GAGCGTAAGAAGCATCCTCAATCATCAAGAAGCAGCCAGATGAATCTGTGTGCTCAAAAG
CTTGTTTTTTTTTTTCTTTTGGTTTTGGAGTTGGCTTTAAGGTTTGGAATATTGTGGTGG
AATCAAATCCAATCCACCTTTTAGGATTATAATCGTACTCTCGTTAATGGATTCGTTTTC
ACATCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL8850Contig1 919 2 2 U
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AGAGTTTTCGGCGCGAAAAAGAACACAGAACCTCCTCCCTCCATTCAGGATGCCTCCGAT
CGGATAAATAAAAGGGGAGAATCAGTGGAAGAGAAGATAAAGAAGGCTGATGTTGAGCTC
TGCAAATACAGAGAACAGATTCAAAAGACGCGACCGGGTCCTGCTCAACAAGCTCTCAAA
GCTCGTGCTATGAGGCTTCTCAAGCAGAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTC
TATAATCAAACATTCAATCTCGATCAAGTCTCTTTCGCTGCTGAAGGCCTCAAAGATGCT
CAACAGACTATGACGGCGCTAAAGTCTGCTAACAAGGAGCTGAAAGGGATGATGAAAACC
GTTCAGATTCAAGATATCGATAATTTGCAAGATGAGATGATGGATCTGATGGATGTGAGT
TCTGAGATTCAAGATACGCTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGGTCTCGACGAGGAT
GATCTCATGGGAGAGCTGGAGGCTCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGACAGAAGCAGAT
GGAGTGCCTTCTTATCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGAACTTAACTTG
CCTTCAGTACCCATAGGACAGACTGGAGCTCCACCTGGTCGAGTTCAGGCTGAGGATGAG
TTTGGATTGCCGGCCGTACCACGAGCTTCTCTCCGGGGATAAAAGTTTCTGGCGATTCTC
TTTGTGGAGTGGAGCTAATACTAAGCTCTTTTTTTGGGCTTAGGCTTCTGAATCACTTTG
TTCATAACATTTTCAACTCTTCTTTTGGCTCTGTAATGAATTTACAATAATTGTGTGTTT
TATGGATGGCTCTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EK25TF U 1
AF RR4EK25JQ C 75
BS 1 660 RR4EK25TF
BS 661 919 RR4EK25JQ

RD RR4EK25TF 660 0 0
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TGCAAATACAGAGAACAGATTCAAAAGACGCGACCGGGTCCTGCTCAACAAGCTCTCAAA
GCTCGTGCTATGAGGCTTCTCAAGCAGAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTC
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CAACAGACTATGACGGCGCTAAAGTCTGCTAACAAGGAGCTGAAAGGGATGATGAAAACC
GTTCAGATTCAAGATATCGATAATTTGCAAGATGAGATGATGGATCTGATGGATGTGAGT
TCTGAGATTCAAGATACGCTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGGTCTCGACGAGGAT
GATCTCATGGGAGAGCTGGAGGCTCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGACAGAAGCAGAT
GGAGTGCCTTCTTATCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGAACTTAACTTG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4EK25JQ 845 0 0
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GCTTCTCAAGCAGAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTCTATAATCAAACATT
CAATCTCGATCAAGTCTCTTTCGCTGCTGAAGGCCTCAAAGATGCTCAACAGACTATGAC
GGCGCTAAAGTCTGCTAACAAGGAGCTGAAAGGGATGATGAAAACCGTTCAGATTCAAGA
TATCGATAATTTGCAAGATGAGATGATGGATCTGATGGATGTGAGTTCTGAGATTCAAGA
TACGCTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGGTCTCGACGAGGATGATCTCATGGGAGA
GCTGGAGGCTCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGACAGAAGCAGATGGAGTGCCTTCTTA
TCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGAACTTAACTTGCCTTCAGTACCCAT
AGGACAGACTGGAGCTCCACCTGGTCGAGTTCAGGCTGAGGATGAGTTTGGATTGCCGGC
CGTACCACGAGCTTCTCTCCGGGGATAAAAGTTTCTGGCGATTCTCTTTGTGGAGTGGAG
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AACTCTTCTTTTGGCTCTGTAATGAATTTACAATAATTGTGTGTTTTATGGATGGCTCTT
TTCTT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL8851Contig1 803 2 2 U
GGGTCGCGACTTCTCTCCTCCTCCCTTTCTCCGAGTGTCTCCTCTGCGAAATCAAACCGT
CGTTCAACTGTCCATCGATTTTCAAGTTTATGTTGGTTGGTGTGCAGATATAATGTGGAA
GCAAGTGGTTGGCAAGTATTCTATAAGTAAAGCAGTTTATGGAAATAACAGAGCAAAGCT
TCAACCTTTCTTATGTCAAACCAGTTGTGGGTTTTCACAATGGACGAACGGTTCATGCAC
CGAGAAGCTTCTTTGGCGTAGAAGACTACGTGGACGACGACACAAGCCGACCATACACAT
ACCAAAAGGAGAAAAAATCAAAGAACCCAGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGAACAG
TCGCATACATGGAGCCCTTCACACTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTCGTCTCAGCGT
CCCTCACCCACCGTGTCACATGTAAGCAAGTCGCTGTCGCGGGAACGAACTCTAAAGACG
TGAAAGCGGTTTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCAGCGTGTATGTCCATAGGGAGGATCC
TGTCTGAGCGTGCGAAAGAGGCTGATGTGTACACAGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAG
ACAAGTTCGAAGGGAAGATCAGAGCTGTTGTCCAGTCTCTTATTGATAACGGGATCGATG
TCAAAATCTATCTGGATTAGAGTCATCTAGACGCAAGTGAGTCACTGCTCATTGTTCATT
TCATGACAATTTCGTTTCATATCGTAATTGTGACGAATTGAAAGTTCTTATAAAGCAGTG
ATATAAAACCATTTTTCCTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ52TF U 1
AF RR4DQ52JQ C 88
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BS 676 803 RR4DQ52JQ

RD RR4DQ52TF 675 0 0
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CGTTCAACTGTCCATCGATTTTCAAGTTTATGTTGGTTGGTGTGCAGATATAATGTGGAA
GCAAGTGGTTGGCAAGTATTCTATAAGTAAAGCAGTTTATGGAAATAACAGAGCAAAGCT
TCAACCTTTCTTATGTCAAACCAGTTGTGGGTTTTCACAATGGACGAACGGTTCATGCAC
CGAGAAGCTTCTTTGGCGTAGAAGACTACGTGGACGACGACACAAGCCGACCATACACAT
ACCAAAAGGAGAAAAAATCAAAGAACCCAGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGAACAG
TCGCATACATGGAGCCCTTCACACTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTCGTCTCAGCGT
CCCTCACCCACCGTGTCACATGTAAGCAAGTCGCTGTCGCGGGAACGAACTCTAAAGACG
TGAAAGCGGTTTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCAGCGTGTATGTCCATAGGGAGGATCC
TGTCTGAGCGTGCGAAAGAGGCTGATGTGTACACAGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAG
ACAAGTTCGAAGGGAAGATCAGAGCTGTTGTCCAGTCTCTTATTGATAACGGGATCGATG
TCAAAATCTATCTGG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4DQ52JQ 716 0 0
TTATGTTGGTTGGTGTGCAGATATAATGTGGAAGCAAGTGGTTGGCAAGTATTCTATAAG
TAAAGCAGTTTATGGAAATAACAGAGCAAAGCTTCAACCTTTCTTATGTCAAACCAGTTG
TGGGTTTTCACAATGGACGAACGGTTCATGCACCGAGAAGCTTCTTTGGCGTAGAAGACT
ACGTGGACGACGACACAAGCCGACCATACACATACCAAAAGGAGAAAAAATCAAAGAACC
CAGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGAACAGTCGCATACATGGAGCCCTTCACACTCG
ACGTCTTCATCTCAAAACGTTTCGTCTCAGCGTCCCTCACCCACCGTGTCACATGTAAGC
AAGTCGCTGTCGCGGGAACGAACTCTAAAGACGTGAAAGCGGTTTTGAGGTCGAGATGCG
ATATCCCAGCGTGTATGTCCATAGGGAGGATCCTGTCTGAGCGTGCGAAAGAGGCTGATG
TGTACACAGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAGACAAGTTCGAAGGGAAGATCAGAGCTG
TTGTCCAGTCTCTTATTGATAACGGGATCGATGTCAAAATCTATCTGGATTAGAGTCATC
TAGACGCAAGTGAGTCACTGCTCATTGTTCATTTCATGACAATTTCGTTTCATATCGTAA
TTGTGACGAATTGAAAGTTCTTATAAAGCAGTGATATAAAACCATTTTTCCTGGAT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL8852Contig1 637 2 10 U
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GCTGCCAATCTAAGAAGAGGCTTGAGCTTAAGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTGCTCA
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GGCCTTCCTCAAAAGTCATCATCAAGTTTCTTATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACATTG
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GTTGGACTGCTCGTTTGCTTCCTTCCCGACAGTTCGGGTACATCGTGTTGACTACTTCAG
CTGGGATTATGGACCATGAAGAAGCGAGGAGAAAGAACGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGTT
TCTTCTATTGAAGTTCTCTGTGAGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATT
GTTATCAATTTGTCTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTC
CCTTTTTAATCTTGACTGCTTGAAAGATTCATTTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR4DV30TF U 1
AF RR4GK77TF U 5
BS 1 253 RR4DV30TF
BS 254 254 RR4GK77TF
BS 255 457 RR4DV30TF
BS 458 458 RR4GK77TF
BS 459 503 RR4DV30TF
BS 504 504 RR4GK77TF
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BS 608 609 RR4GK77TF
BS 610 633 RR4DV30TF
BS 634 637 RR4GK77TF

RD RR4DV30TF 633 0 0
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GGCCTTCCTCAAAAGTCATCATCAAGTTTCTTATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACATTG
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GTTGGACTGCTCGTTTGCTTCCTTCCCGACAGTTCGGGTACATCGTGTTGACTACTTCAG
CTGGGATTATGGACCATGAAGAAGCGAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGTT
TCTTCTATTGAAGTTCTCTGTGATGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATT
GTTATCAATTTGTCTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTC
CCTTTTTGGTCTTGACTGCTTGAAAGATTCATT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR4GK77TF 633 0 0
GGGCTTCTC
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CGTCGATGACCACCGATCCGGCAAAATCGTTGTGGAATTGAACGGGAGGTTGAACAAGTG
TGGTGTTATCAGTCCTCGTTTTGATGTTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCTCG
TTTGCTTCCTTCCCGACAGTTCGGGTACATCGTGTTGACTATTTCAGCTGGGATTATGGA
CCATGAAGAAGCTAGGAGAAAGAACGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGTTTCTTCTATTGAAG
TTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATTGTTATCAATTTGT
CTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTCCCTTTTTAATCTT
GAGTGCTTGAAAGATTCATTTGGA

QA 10 633 10 633
DS 



AS 1 2

CO CL8853Contig1 830 2 4 U
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TCTCCGCGGTATCCGGTCAGCAGTTAGTAGCTTCCGGCGAAGTCCGGGTGGTGGAGCCGA
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CAGACAATGGGCCTATCACGCTGCTGAAGAAATGGATTCATTTGGGTTATATTGGGCTTT
GGACGGGCCAGAGATTCGCAATGTTTAATGATGAGTTTACCCTCCTTGTTGTAGAGGCTT
TCCCGGACAAGAAGAGTAAAGTGCTTGTCGCGTGTGGTGAAGGACTCAGGTCGTTGATGG
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ACAGAGCAACCGAAGGAGATTTCTCAGAGATTGAAGGACCAGAAGAGCTTAAGTTTGCAA
CTATAGGTGGCGCATCATACTATTTCCTCAAACTACTTGTATTGTTGCAGAGCTTTGGCA
AAGAGAACCGCTGAATTTCAATTCAATAACAAAAAAAAATTGAAATTAAATGTGTCCGGT
TTATCCAGTTGAATCGGTTACGACGCCGTTCTGTTGTTTTATTACCAATCATTTCGCTTC
GGACAGATTGTCTTCAGACATAATACTCCAACTAGAGTGTGCGGGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DT14TF U 1
AF RR4DT14JQ C 107
BS 1 606 RR4DT14TF
BS 607 607 RR4DT14JQ
BS 608 698 RR4DT14TF
BS 699 830 RR4DT14JQ

RD RR4DT14TF 698 0 0
GGCTCTAGAAAAAAAGAAAAGAGGAGATGACGACACTTCTTCTTCCTCAATCAAACCGTA
TCTACAAGCCACTAACAGTATCAAACCAACGCCTCCGAAAGCCGTACAGACTTCCAGCGA
TCTCCGCGGTATCCGGTCAGCAGTTAGTAGCTTCCGGCGAAGTCCGGGTGGTGGAGCCGA
GAGAAGCGAAAACAGTGGTATCGTCGGAGGGATACGTGCTGTTAGACGTGAGGCCGGCTT
GGGAAAGAGAAAAGGCACATGTGAAAGGATCATTACACGTGCCACTGTTCGTGGAGGATC
CAGACAATGGGCCTATCACGCTGCTGAAGAAATGGATTCATTTGGGTTATATTGGGCTTT
GGACGGGCCAGAGATTCGCAATGTTTAATGATGAGTTTACCCTCCTTGTTGTAGAGGCTT
TCCCGGACAAGAAGAGTAAAGTGCTTGTCGCGTGTGGTGAAGGACTCAGGTCGTTGATGG
CAATATCTAAACTGCATAGAGAAGGTTACAAAAGCTTAGGATGGTTAACCGGAGGGTTTA
ACAGAGCAACCGAAGGAGATTTCTCAGAGATTGAAGGACCAGAAGAGCTTAAGTTTGCAA
CTATAG*TGGCGCATCATACTATTTCCTCAAACTACTTGTATTGTTGCAGAGCTTTGGCA
AAGAGAACCGCTGAATTTCAATTCAATAACAAAAAAAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR4DT14JQ 724 0 0
CAGACTTCCAGCGATCTCCGCGGTATCCGGTCAGCAGTTAGTAGCTTCCGGCGAAGTCCG
GGTGGTGGAGCCGAGAGAAGCGAAAACAGTGGTATCGTCGGAGGGATACGTGCTGTTAGA
CGTGAGGCCGGCTTGGGAAAGAGAAAAGGCACATGTGAAAGGATCATTACACGTGCCACT
GTTCGTGGAGGATCCAGACAATGGGCCTATCACGCTGCTGAAGAAATGGATTCATTTGGG
TTATATTGGGCTTTGGACGGGCCAGAGATTCGCAATGTTTAATGATGAGTTTACCCTCCT
TGTTGTAGAGGCTTTCCCGGACAAGAAGAGTAAAGTGCTTGTCGCGTGTGGTGAAGGACT
CAGGTCGTTGATGGCAATATCTAAACTGCATAGAGAAGGTTACAAAAGCTTAGGATGGTT
AACCGGAGGGTTTAACAGAGCAACCGAAGGAGATTTCTCAGAGATTGAAGGACCAGAAGA
GCTTAAGTTTGCAACTATAGGTGGCGCATCATACTATTTCCTCAAACTACTTGTATTGTT
GCAGAGCTTTGGCAAAGAGAACCGCTGAATTTCAATTCAATAACAAAAAAAAATTGAAAT
TAAATGTGTCCGGTTTATCCAGTTGAATCGGTTACGACGCCGTTCTGTTGTTTTATTACC
AATCATTTCGCTTCGGACAGATTGTCTTCAGACATAATACTCCAACTAGAGTGTGCGGGT
TTTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL8854Contig1 836 2 8 U
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ACATAATAAATCATGGAGAAACCTCTTCTTCATCCATCACTTATCTTCTTCTTAGCAACT
CTCCTCCCATTAATATTGACCGTCCACTCCCAACCCTCTCCATTACCATCAGACGATTCA
GATTTCATCCGTACGAGCTGCAACGCAACCTTGTACCCTGACCTCTGCGTCTCCTCTCTT
TCAAACTTCTCAAGCTCCGTCAACAACGACTCAGCTCTCTTGGCTCGAGCCGCAATCTCC
GTCACTCTCACCAAGGCTCTCGAGCTAGGCTCATACCTCTCCAACGTTACCGCTCTCCTC
AAGAGCCAGGAGGACAATGGGGGCCACCCAACCGCAGCCGCCGTCTTCCATGACTGCTTT
GAGAATCTTAAAGACGCCGTGAGTGAAATGAAAGACTCGATGAAACAGATGAGGGACTTG
GTCTCCACTGGCTCGCTTGAGTCGTTCAGGTTCCGGATGAGCAACGTGCAGACTTGGCTT
AGTGCGGCTTTAACCGATGAGGAGACTTGTACAGATGGGTTTAAAGACGTTCAAGATGAG
CCGAGAAAAGATGAGGTGTGCGCTCGGGTTGATGACGTCAAGAAGTTGACTAGTAATGCG
TTGGCTCTAGTTAACCGATGCGTTGATAAGGCGATACATTGATTTTTATTCATCAAATAT
TCTTCTTTCTTTTGATCAATTGAAACAAAAAAAATTATTGCTTTTATGTTTTGTTTGTCA
CGCGTGCATGATATATGTGTATAACAAGATAAGTCTGTTAGTTATTGGCTGAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FK18TF U 1
AF RR4FK18JQ C 144
BS 1 671 RR4FK18TF
BS 672 672 RR4FK18JQ
BS 673 690 RR4FK18TF
BS 691 691 RR4FK18JQ
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BS 708 744 RR4FK18TF
BS 745 836 RR4FK18JQ

RD RR4FK18TF 746 0 0
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ACATAATAAATCATGGAGAAACCTCTTCTTCATCCATCACTTATCTTCTTCTTAGCAACT
CTCCTCCCATTAATATTGACCGTCCACTCCCAACCCTCTCCATTACCATCAGACGATTCA
GATTTCATCCGTACGAGCTGCAACGCAACCTTGTACCCTGACCTCTGCGTCTCCTCTCTT
TCAAACTTCTCAAGCTCCGTCAACAACGACTCAGCTCTCTTGGCTCGAGCCGCAATCTCC
GTCACTCTCACCAAGGCTCTCGAGCTAGGCTCATACCTCTCCAACGTTACCGCTCTCCTC
AAGAGCCAGGAGGACAATGGGGGCCACCCAACCGCAGCCGCCGTCTTCCATGACTGCTTT
GAGAATCTTAAAGACGCCGTGAGTGAAATGAAAGACTCGATGAAACAGATGAGGGACTTG
GTCTCCACTGGCTCGCTTGAGTCGTTCAGGTTCCGGATGAGCAACGTGCAGACTTGGCTT
AGTGCGGCTTTAACCGATGAGGAGACTTGTACAGATGGGTTTAAAGACGTTCAAGATGAG
CCGAGAAAAGATGAGGTGTGCGCTCGGGTTGATGACGTCAAGAAGTTGACTAGTAATGCG
TTGGCTCTAGT*AACCGATGCGTTGATAAG*CGATACATTGATTTT*ATTCATCAAATAT
TCTTCTTTCTTTTGATCAATTGAA
CA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR4FK18JQ 693 0 0
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CCACCCAACCGCAGCCGCCGTCTTCCATGACTGCTTTGAGAATCTTAAAGACGCCGTGAG
TGAAATGAAAGACTCGATGAAACAGATGAGGGACTTGGTCTCCACTGGCTCGCTTGAGTC
GTTCAGGTTCCGGATGAGCAACGTGCAGACTTGGCTTAGTGCGGCTTTAACCGATGAGGA
GACTTGTACAGATGGGTTTAAAGACGTTCAAGATGAGCCGAGAAAAGATGAGGTGTGCGC
TCGGGTTGATGACGTCAAGAAGTTGACTAGTAATGCGTTGGCTCTAGTTAACCGATGCGT
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ACAAGATAAGTCTGTTAGTTATTGGCTGAAAGG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8855Contig1 581 2 1 U
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AGAGCCAAAGTATGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAGCACTGGCGTCGG
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AAGAACTTTGGAACCAAGGACGATTACGAAAAAGAGCATTAATTCTTGTTTTACTTGCTG
TTGAGACAACTCTCTTTGGCTTGGTCTCTTCTTATTTTGCAGACGACAATGTGAGCATGA
CAAAACCCCTTCTAGATTTTTCACAGTATTTGTGACCATAATAATCTGTCTTTGCCTTGC
CATGTTGTTAGACCAAATGAAATCTTTCCAAATTAAGACAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FE14JQ C 1
AF RR4FE14TF U 1
BS 1 581 RR4FE14TF

RD RR4FE14JQ 581 0 0
GGGTAAAACACCCTGAGTAGTCAGATCAATTGCAGACAAAGGCCAAAACTCACCCTCTCT
AGTCTCATCTTCTTCGTTGTTTGCGATCCTTCTGATATCGCTAAGTGGACTGATTCACCG
GATCAAATCTAAGAAGAAATGGGAGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGAAGGCGGCGATTTC
AGAGCCAAAGTATGGAGCATGTTTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAGCACTGGCGTCGG
AACACCGCCTTTGCAATGCTCGGCGTTTTCCTTGTCTGCATCCCCATTGCCATGAAATCT
GCCGAGCTCGAGCAAAGGCCGCACATGCCCGTACGTCCAATTCCTTCGCAGATTTGGTGC
AAGAACTTTGGAACCAAGGACGATTACGAAAAAGAGCATTAATTCTTGTTTTACTTGCTG
TTGAGACAACTCTCTTTGGCTTGGTCTCTTCTTATTTTGCAGACGACAATGTGAGCATGA
CAAAACCCCTTTTAGATTTTTCACAGTATTTGTGACCATAATAATCTGTCTTTGCCTTGC
CATGTTGTTAGACCAAATGAAATCTTTCCAAATTAAGACAG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4FE14TF 581 0 0
GGGTAAAACACCCTGAGTAGTCAGATCAATTGCAGACAAAGGCCAAAACTCACCCTCTCT
AGTCTCATCTTCTTCGTTGTTTGCGATCCTTCTGATATCGCTAAGTGGACTGATTCACCG
GATCAAATCTAAGAAGAAATGGGAGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGAAGGCGGCGATTTC
AGAGCCAAAGTATGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAGCACTGGCGTCGG
AACACCGCCTTTGCAATGCTCGGCGTTTTCCTTGTCTGCATCCCCATTGCCATGAAATCT
GCCGAGCTCGAGCAAAGGCCGCACATGCCCGTACGTCCAATTCCTTCGCAGATTTGGTGC
AAGAACTTTGGAACCAAGGACGATTACGAAAAAGAGCATTAATTCTTGTTTTACTTGCTG
TTGAGACAACTCTCTTTGGCTTGGTCTCTTCTTATTTTGCAGACGACAATGTGAGCATGA
CAAAACCCCTTCTAGATTTTTCACAGTATTTGTGACCATAATAATCTGTCTTTGCCTTGC
CATGTTGTTAGACCAAATGAAATCTTTCCAAATTAAGACAG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8856Contig1 700 2 4 U
GATAGTCTGGACTCCTCTCCCTGTTGTCTCTTGGTTGGCTCCTTTCATTGGCCATGTTGG
TCTTTGCAGAGAAGACGGAGTCATCTTGGACTTTGCTGGTTCTAACTTCATCAGTGTTGA
TGATTTCTCTTTTGGTCCTCCTGCTCGCTATCTCCAACTCGATCGAAAACAGTGTTGCAT
GCCACCGAACTTGGGTGGGCACACTTGCAAGTACGGGTACAAACACACGGAGTTTGGGAC
CTCGGTTACATGGGACGATGCACTGAGCGCGAGCGCGCGTAGCTGTGAACATAAAACTTA
CAACCTCTTCACCTGTAACTGCCACTCGTTCGTTGCTAACTGTCTCAACCGTCTTTGCTA
CGGCGGTTCGATGGAGTGTAAGATGGTGAATGTTGCTGTTCTGATTCTCACGAGAGGGAA
ATGGGTCAGCGCGTCATCGGTAGTCCGGTCGTTTCTGCCCTGTGCTGTGGTTACGTGTCT
TGGTGTGTTGCTTGTGGGGTGGCCCTTCTTGATCGGCCTCTTCTCTTTCTCGATGTTACT
CGTTGCCTGGTTCATAATTGCTACTTACTGTTTTAAGAACATAATGGGTTAGAACCAGTA
GAAAAAAAAAACTCATTTATATTATCTTTGAGTTGTTCTCTTTTCGTTTCGACATTTTGT
AGCTTTCAACTCCATTATATATATTACTTCTCATTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGGGTCAGCGCGTCATCGGTAGTCCGGTCGTTTTTGCCCTGTGCTGTGGTTACGTGTCTT
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GTTGCCTGGTTCATAATTGCTACTTACTGTTTTAAGAACATAATGGGTTAGAACCAGTAG
AAAAAAAAAACTCATTTATATTATCTTTGAGTTGTTCTCTTTTCGTTTCGACATTTTGTA
GCTTTCAACTCCATTATATATATTACTTCTCATTGGACC

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BQ
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AF RR4ET54TF U 1
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AA**TCAG*TCGCTTTCTGTTTCTGTTT
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QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ61TF U 1
AF RR4EQ61JQ C 133
BS 1 615 RR4EQ61TF
BS 616 616 RR4EQ61JQ
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BS 719 787 RR4EQ61JQ

RD RR4EQ61TF 718 0 0
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GGTCTAGAAACTCAACCACCATCACTTCTATCTCCGCCAACTACTCCACCATGAATCGTC
TTCATCTCTGTTTTCCTCCACACCTCCGTCGTGTTCGTCACTGTCATCGGCAAAGAAGAA
GAACTCGATTTCCCCTGGGTCCTCCACCATAAATCGAGTTACTTGAATCTGTATGGCTTC
TTCTTCGGGTGAACGTCATTATGTGTTCCATTACTCTCCCCTCAATATGAATTAAAAGAT
GCAGTTGTAAGTCACGATAAAAATGGACCATGTGTTGTTGAATGAAAAGTAAAAGGAAGA
AGACGACAAAGAACGACATTGGCCTTGAAGCATGGATGTGAGCTGCATTGGCCTTGTACG
TGGAACGGGATCACACGGCCATGTTATCTGTTTGCAACGAAGTTTCATCCTGATGCTCTC
GACACATTGGTCAACCTCTTCCATGACTACACAAGCACAGCCCTTTGAGAGAGGATTCTT
GAGCTGAAACACTTGCTATTCTTGGACCTAATTATATTCTTGGCTCTCTTAGATACTGTA
ATTTTTTTGAAAAAA*TAAACTGAAACAATTCTTGGAAGTTGATGCTTATTCACAATTAG
AGCAGAAAGTTTTGGTTAAAGAGTTTCATTTTTTTTT*GCTTTCGTTCGGTCTCTTAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4EQ61JQ 655 0 0
TTCCTCCACACCTCCGTCGTGTTCGTCACTGTCATCGGCAAAGAAGAAGAACTCGATTTC
CCCTGGGTCCTCCACCATAAATCGAGTTACTTGAATCTGTATGGCTTCTTCTTCGGGTGA
ACGTCATTATGTGTTCCATTACTCTCCCCTCAATATGAATTAAAAGATGCAGTTGTAAGT
CACGATAAAAATGGACCATGTGTTGTTGAATGAAAAGTAAAAGGAAGAAGACGACAAAGA
ACGACATTGGCCTTGAAGCATGGATGTGAGCTGCATTGGCCTTGTACGTGGAACGGGATC
ACACGGCCATGTTATCTGTTTGCAACGAAGTTTCATCCTGATGCTCTCGACACATTGGTC
AACCTCTTCCATGACTACACAAGCACAGCCCTTTGAGAGAGGATTCTTGAGCTGAAACAC
TTGCTATTCTTGGACCTAATTATATTCTTGGCTCTCTTAGATACTGTAATTTTTTTGAAA
AAAATAAACTGAAACAATTCTTGGAAGTTGATGCTTATTCACAATTAGAGCAGAAAGTTT
TGGTTAAAGAGTTTCATTTTTTTTTTGCTTTCGTTCGGTCTCTTATCTATAGGTTTATTT
TTCATGAACATTGTAGTAAACTTAAGCCATCATGAACACAGAGTCTTGGAATCTT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL8859Contig1 896 2 10 U
GCAAAACGGAAATGTCTCCGGCGAGACCCCGACGACGACGACGACGAGCTCCGTACCTTC
TAACGAACACATTAAGACCGAGCCTGCTGAGACCGAGACTTCTGATCAAGCGGCGGTGGA
GAAGCAGAACAATCGGTGTGGCAAGAGGAAAGATTTCGACAAGAAGGCTAAAGGCTCGTC
AAAGAAGAACAAAAGCTCTGAAGAGAACGAGAAGCTGCCGTATGTTCATGTTAGAGCTCG
ACGTGGTCAAGCAACAGATAGTCATAGCTTAGCTGAACGAGCAAGAAGGGAGAAGATTAA
TGCAAGAATGAAGCTGCTACAAGAACTGGTCCCGGGCTGTGATAAGATTCAGGGTACCGC
GTTGGTGCTGGATGAAATCATTAACCATGTCCAGTCATTACAACGTCAAGTGGAGATGCT
ATCAATGAGACTTGCTTCTGTAAACCCTAGGATTGATTTCAATCTCGACACTATATTGAG
TTCAGAAAACGGTTCTTTAATGGATGGGAACTTCAACGGTGCAGCAATGCAGCTTGCTTG
GCCTCATCAAGTGATGGAGACAGAACAGTCCTATCATCACCGGCAACTGCAACAACCACC
ACCGCAACAATGGCCTTTCGATGGCTTGAACCAGCCTGTTTGGGGAAGAGAAGAGGATCA
AGATCATGGTAATGACCACAACAGTTTGATGGTTGGTTCTGCTAGTTTGCACCCAAACCA
AGTCAAAACGGAGTTGTAAGTTTGGGGGAAAACAGTAGACTATGGTGTAAATATATCGTG
TAAGCCTGTTTTTACATATATAATTAACAAAAATATATAATAATTAGATATTTGTTAAGA
ATGTATCAGTCATTTGATTCAGAGAGACAACTGGTATATGATTATTTTTTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ17TF U 1
AF RR4EZ17JQ C 173
BS 1 680 RR4EZ17TF
BS 681 681 RR4EZ17JQ
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RD RR4EZ17TF 789 0 0
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ACGTGGTCAAGCAACAGATAGTCATAGCTTAGCTGAACGAGCAAGAAGGGAGAAGATTAA
TGCAAGAATGAAGCTGCTACAAGAACTGGTCCCGGGCTGTGATAAGATTCAGGGTACCGC
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ATCAATGAGACTTGCTTCTGTAAACCCTAGGATTGATTTCAATCTCGACACTATATTGAG
TTCAGAAAACGGTTCTTTAATGGATGGGAACTTCAACGGTGCAGCAATGCAGCTTGCTTG
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ACCGCAACAATGGCCTTTCGATGGCTTGAACCAGCCTGTTTGGGGAAGAGAAGAGGATCA
AGATCATGGTAATGACCACA*CAGTTTGATGGTTGGTTCTGCTAGTTTGCACCCAAACCA
AGTCAAA*CGGAGTTGTAAGTTTGGGGGAAA*CAGTAGACTATGGTGTAA*TATATCGTG
TAAGC
TGTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR4EZ17JQ 724 0 0
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AGAGCTCGACGTGGTCAAGCAACAGATAGTCATAGCTTAGCTGAACGAGCAAGAAGGGAG
AAGATTAATGCAAGAATGAAGCTGCTACAAGAACTGGTCCCGGGCTGTGATAAGATTCAG
GGTACCGCGTTGGTGCTGGATGAAATCATTAACCATGTCCAGTCATTACAACGTCAAGTG
GAGATGCTATCAATGAGACTTGCTTCTGTAAACCCTAGGATTGATTTCAATCTCGACACT
ATATTGAGTTCAGAAAACGGTTCTTTAATGGATGGGAACTTCAACGGTGCAGCAATGCAG
CTTGCTTGGCCTCATCAAGTGATGGAGACAGAACAGTCCTATCATCACCGGCAACTGCAA
CAACCACCACCGCAACAATGGCCTTTCGATGGCTTGAACCAGCCTGTTTGGGGAAGAGAA
GAGGATCAAGATCATGGTAATGACCACAACAGTTTGATGGTTGGTTTTGCTAGTTTGCCC
CCAAACCAAGTCAAAACGGAGTTGTAAGTTTGGGGGAAAACAGTAGACTATGGTGTAAAT
ATATCGTGTAAGCCTGTTTTTACATATATAATTAACAAAAATATATAATAATTAGATATT
TGTTAAGAATGTATCAGTCATTTGATTCAGAGAGACAACTGGTATATGATTATTTTTTAC
TTTT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL8860Contig1 719 2 2 U
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CAAGACTCTTCACATACTGGACGAGTGATGCTTACCAAGCTACTGGCTGCTACAATCTCC
TTTGTTCCGGTTTTATACAAATCAACAGCCAAATAGCAATGGGAGCTAGTATCTCTCCTG
TATCTGGCTTCCATAACTCGCAATACGATATCAGCATTACCATTTGGAAGGATCCGAAAG
AAGGGCACTGGTGGATGCAGTTTGGAGACGGATACGTGTTGGGGTACTGGCCGAGCTTTC
TGTTCTCGTACTTAGCAGACAGTGCGTCGATAGTGGAATGGGGTGGGGAAGTAGTGAACA
TGGAGGAAGACGGTCACCACACCACCACTCAAATGGGAAGCGGTCTGTTTCCTGATGCAG
GGTTCTCGAGAGCAAGTTACTTTCGGAATGTTCAAGTTGTTGATCGGTCTAATAACCTGA
AAGAACCAAAAGGGCTCAACACTTTCACCGAGAAGTCTAATTGCTATGATGTTGAGGTTG
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GTCAGTAGATGGTGAACAGAAGAAAGAAAATGATGATGATGATGATGAAGATGCAGAGTG
ACACTTGTGCTGGATGTTTCCTTATGTTTATGTGAAGTGTGGAAATATCGTTTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E187TF U 1
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GTCAGTAGATGGTGAACAGAAGAAAGAAAATGATGATGATGATGATGAAGATGCAGAGTG
ACACTTGTGCTGGATGTTTCCTTATGTTTATGTGAAGT

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AAGGATCCGAAAGAAGGGCACTGGTGGATGCAGTTTGGAGACGGATACGTGTTGGGGTAC
TGGCCGAGCTTTCTGTTCTCGTACTTAGCAGACAGTGCGTCGATAGTGGAATGGGGTGGG
GAAGTAGTGAACATGGAGGAAGACGGTCACCACACCACCACTCAAATGGGAAGCGGTCTG
TTTCCTGATGCAGGGTTCTCGAGAGCAAGTTACTTTCGGAATGTTCAAGTTGTTGATCGG
TCTAATAACCTGAAAGAACCAAAAGGGCTCAACACTTTCACCGAGAAGTCTAATTGCTAT
GATGTTGAGGTTGGTAAGAATGATGACTGGGGGCATTATTTTTACTACGGTGGCCCTGGA
AGGAACCCTAGTTGTCAGTAGATGGTGAACAGAAGAAAGAAAATGATGATGATGATGATG
AAGATGCAGAGTGACACTTGTGCTGGATGTTTCCTTATGTTTATGTGAAGTGTGGAAATA
TCGTTTTTGTTG

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

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GTTTGTGAAATAAAAATTACTAAGCTTTTGC


BQ
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AF RR4DB73JQ C 1
AF RR4DB73TF U 1
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BS 497 511 RR4DB73JQ

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GTTTGTGAAATAAAAA

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL8862Contig1 587 2 1 U
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CTTTCTTCAACTCTGCTTATCGATTTGGAACTGTTGGATCTATGTTTTGTTATTCCCATT
AAGTTTTATTATGTGATCTCCACTCTCTTCATGACAATTACGCATTTTCTTGGAATCTCC
CTCTTGTATCATTCCCTTTGAGCAATCAGATGCTAAATTAACTACGC


BQ
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AF RR4E459JQ C 1
AF RR4E459TF U 1
BS 1 587 RR4E459TF

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ACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGTTAATCTTACTCTTCCTTGG
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CTCTTGTATCATTCCCTTTGAGCAATCAGATGCTAAATTAACTACGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4E459TF 587 0 0
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TAACGCCTGCAGAAAGAAGGTACATAGAGCAGAAGCAGAGACTTGATGTACATAAGCTAG
CCAAGGAAGCGAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAGTACCTGGCTA
ACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGTTAATCTTACTCTTCCTTGG
CTTTCTTCAACTCTGCTTATCGATTTGGAACTGTTGGATCTATGTTTTGTTATTCCCATT
AAGTTTTATTATGTGATCTCCACTCTCTTCATGACAATTACGCATTTTCTTGGAATCTCC
CTCTTGTATCATTCCCTTTGAGCAATCAGATGCTAAATTAACTACGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL8863Contig1 713 2 2 U
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GCTACGAACTTGATTTCACCGGAGGATCTAAAGGCTTTACTTACGGTTACAACTCCATTA
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AGGAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAGGTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAG
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TTATGTTGATGTAATGTTTTATATTTTCGTGTATATATGATTATGTGATTTGGAACAAGT
TTTTGTGTATGCAATGTTTTATATTTTCATCAATCTGATTCTGAGGTTTCAGC


BQ
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AGGAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAGGTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAG
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GACGTGGTTGTTGGTGGTCATGGCGGTGGTATCTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACA
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CGTTTTAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTTTTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTAT
TTATGTTGATGTAATGTTTTATATTTTCGTGTATATATGATTATGTGATTTGGA

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DS 

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GCTACGAACTTGATTTCACCGGAGGATCTAAAGGCTTTACTTACGGTTACAACTCCATTA
GCCACAGCCAGGTATCGTCATCCTCACTGGAAGTGGGAGTGGTGCCAGATGGAGGCTCTG
TGGGCGACGTTTCATACCCTTACGGAGGTGCTGCGACCAGTGTAACCGATCCGGGAACTC
AGAGGGCAGTTCCGCTAACGGCAGCGGAGAGAGGCGAGAGTAATGAGGTACAGAGAGAAG
AGGAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAGGTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAG
ATGAGACCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAAGCGGACTGATTCGAATGAGAGCAGCAAC
GACGTGGTTGTTGGTGGTCATGGCGGTGGTATCTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACA
TTTTAGAGAGATTGCTGAGTGAGTGAGAGACTCTTAATATGTGGGTACTTTGTTTGGTGT
CGTTTTAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTTTTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTAT
TTATGTTGATGTAATGTTTTATATTTTCGTGTATATATGATTATGTGATTTGGAACAAGT
TTTTGTGTATGCAATGTTTTATATTTTCATCAATCTGATTCTGAGGTTTCAGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GU89TF C 1
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QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AF51TF U 1
AF RR4AF51JQ C 174
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CGCCCATAAATTGTTTGGAGTAAGCAATATAAAGTTCATCAAAGGAGTTGAAGAATGTCA
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TTTGGGAGTTTTCAAAATCATGCTTGATCTCAAGCACCAGATTGCTTGTGCTCAGGCTGA
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TGCCTGCTATTCGTACGGAGATCTATTAGAACAAGGAGACCAATACCTTAATATTGATGG
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QA 1 855 1 855
DS 

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AGCAACTTGCCTGCTATTCGTACGGAGATCTATTAGAACAAGGAGACCAATACCTTAATA
TTGATGGTCATGTTCATCAAGAGATAATGCATAAGCAGAGTCCGCTGAACTACGAGATGT
TTATGGAGATGCCTATCAAGCTTGAGAAGGAAAAAATCTCTATTCCAGGACACAAGAATG
CGGTGAACCAGATAGCTATGCCGTCGCAAGTGATTTAGTAGTTTTAAGTCCGGTTTCTAG
TTCCAAAGTTTAGGTTAGTTTGTTTTCTTGATTACCACTGCTTTTTTCTTTGTTTTAGTT
TTACAAATTGTCCAAATCTATCCTCGTAATAGCTACTAGAACTTTCACAAGGAGTATTTT
TTTACCATTTTACAGATTTAGTTTTGGTGTTCAGTTTTTTTAGGTTCTTGTGACTTCCAA
GCTTTTCCTCCTTTTAACGTTTCTATAATTTTTCATTAAAC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL8866Contig1 583 2 1 U
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BQ
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AF RR4DN86JQ C 1
AF RR4DN86TF U 1
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QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4DN86TF 583 0 0
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CTGCTGTCCTCTGTAAACTTTTCAATAAAGAATGTTTCGTTCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

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AACATTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EG10JQ C 1
AF RR4EG10TF U 1
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AACATTC

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DS 

RD RR4EG10TF 487 0 0
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AACATTC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL8868Contig1 753 2 3 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G988JQ U 110
AF RR4G988TF C 1
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TCCTCCATTGAAAAACTGGGAGGAGCAGGCTCATCAAACAGTGAACTGTACCGTGATTCT
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GTGGAGCAAACATGATCCTCTTGGGGTACTTGAGGGACAACAACAACCTCAGATTCTTTA
GGTTTCTTGAAGACAAAACGTATCCGTAGAGGATTACCAGTTACAGGCGTAGCTTTAATA
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QA 1 587 1 587
DS 

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CAATGAAAAAATTCCCACTTCAGACAGAAACTGCGAGCTAGGAAAACAGGACTCCCCCGA
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CTGCCGCCTTGCACTAAGAAGCCAGTCATCATCGCTGTTGCTACCGTCTTCCTCCATTGA
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ATGTTTCTTTTTCTTCTTTGATTCAGAAAGAATAGCAGCAGTCTTGTCACTCTCAAGAGA
AGTCGAGAGCAGATTCTCTTCATGACCTAAGAGTTGATCAGTCCCTGAGGTGGAGCAAAC
ATGATCCTCTTGGGGTACTTGAGGGACAACAACAACCTCAGATTCTTTAGGTTTCTTGAA
GACAAAACGTATCCGTAGAGGATTACCAGTTACAGGCGTAGCTTTAATATTACTCTCAAC
AGCAGGAGAAGCTTCCCTTCTTCTCTTCTTACTGTCTTGGCTACCATCAGACAGATACTT
GTCATGTTCTTCTGTCAAACAAGACCTCTCAAGTTGTTCGGATTCATCGCACACTTGCTT
GGTACGTAGATATAGATGTTCAATGGTTTTCTC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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CACGCATGTATCTCTCCTTCTGAGAACGGACTTATCAACGGAAAGATACTAATTGGATTA
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GTTGAAGTTGTATTAACTGACACTTCTGAGAAGATGAAAGTGGAAACCTATGTATGGGCT
AACAAGGATGATCCTGATATGTATGGAGAATGGGGTTTCGAGGAATGGAAGAGGCTTCAC
ATGGAGAAATTCATAGAAGCGGCCAAGAAATTTACGGAATGGAAGAAGAATCCGGATGGG
CAATCAAGGGAGGAGTTTGAGAAATTTGTACATGAAGATCCTCATGTGGCCTGAAGAATC
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BQ
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AF RR4H114TF U 1
AF RR4H114JQ C 51
BS 1 637 RR4H114TF

RD RR4H114TF 637 0 0
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CACGCATGTATCTCTCCTTCTGAGAACGGACTTATCAACGGAAAGATACTAATTGGATTA
ACAGATGCTCAGCTAGAGAACTTAGATATGATTGAAGGAGATGACTACGTGAGGAAGACT
GTTGAAGTTGTATTAACTGACACTTCTGAGAAGATGAAAGTGGAAACCTATGTATGGGCT
AACAAGGATGATCCTGATATGTATGGAGAATGGGGTTTCGAGGAATGGAAGAGGCTTCAC
ATGGAGAAATTCATAGAAGCGGCCAAGAAATTTACGGAATGGAAGAAGAATCCGGATGGG
CAATCAAGGGAGGAGTTTGAGAAATTTGTACATGAAGATCCTCATGTGGCCTGAAGAATC
TATGTGCTTTTCTTTTGTTTCCCATCGACATGTGTGTTGAAATCACTCTCGTTATCTATA
TCTTCTACTGCAAGTAAGAGTTTTATGAGTGGAGAGC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR4H114JQ 587 0 0
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GAGGAAGACTGTTGAAGTTGTATTAACTGACACTTCTGAGAAGATGAAAGTGGAAACCTA
TGTATGGGCTAACAAGGATGATCCTGATATGTATGGAGAATGGGGTTTCGAGGAATGGAA
GAGGCTTCACATGGAGAAATTCATAGAAGCGGCCAAGAAATTTACGGAATGGAAGAAGAA
TCCGGATGGGCAATCAAGGGAGGAGTTTGAGAAATTTGTACATGAAGATCCTCATGTGGC
CTGAAGAATCTATGTGCTTTTCTTTTGTTTCCCATCGACATGTGTGTTGAAATCACTCTC
GTTATCTATATCTTCTACTGCAAGTAAGAGTTTTATGAGTGGAGAGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL8870Contig1 1063 2 2 U
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GAGAATCGAGAAGGAGATAGTCGAAGGCCAGATATTCCCGAGCTGGATGCTTTTGAGAAC
TCTGCTCCTCGCAAACTTCAAATGCAGAGCACTAGCTGGGATGGAGAGAGCGTTCGCTTT
GTTTAAAAAGCACGGATACAAACCCGACATGGCGATATTCAACTCGATGCTCTCCATCTT
CACAAGGAACAACATGTATGACCAAGGACACGAGATCCTACAGTCTATCCGCGACCACGA
GCTGACACCGGATCTTGTAACCTACAACAGCCTCATGGACATGTACGTGAGAAGAGGAGA
GTGTTGGAAAGCGTAAGAAATCCTCAAGAGTCTAGAGAAATCGAAGCTAAGACCGGACCT
GGTCTCTTACAACACGGTGATCAAAGGTTTCTGCAGGAAAGGGTTGATGCAAGAAGCGGT
TAGGATGCTGTCGGAGATGACGGAGCGTGGAATCAGACCGTGTATATTCACTTACAACAC
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BQ
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AF RR4GW83TF U 1
AF RR4GW83JQ C 338
BS 1 634 RR4GW83TF
BS 635 1063 RR4GW83JQ

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CTGGAGATCGGGAGAGAATGTGATCTCCGACATGAAAAGCAAAGGTTTCAAACCAACAGA
AACATCTTACTCATTGATGCTTCAGTGTTATGCCAAGGGAGGGAGCGTTCTAGGGATTGA
GAGAATCGAGAAGGAGATAGTCGAAGGCCAGATATTCCCGAGCTGGATGCTTTTGAGAAC
TCTGCTCCTCGCAAACTTCAAATGCAGAGCACTAGCTGGGATGGAGAGAGCGTTCGCTTT
GTTTAAAAAGCACGGATACAAACCCGACATGGCGATATTCAACTCGATGCTCTCCATCTT
CACAAGGAACAACATGTATGACCAAGGACACGAGATCCTACAGTCTATCCGCGACCACGA
GCTGACACCGGATCTTGTAACCTACAACAGCCTCATGGACATGTACGTGAGAAGAGGAGA
GTGTTGGAAAGCGTAAGAAATCCTCAAGAGTCTAGAGAAATCGAAGCTAAGACCGGACCT
GGTCTCTTACAACACGGTGATCAAAGGTTTCTGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR4GW83JQ 726 0 0
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TTCAACTCGATGCTCTCCATCTTCACAAGGAACAACATGTATGACCAAGGACACGAGATC
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GAGATAGAGGATGTGATTGAGTGTATGGCGAAGAATAAGTGCAGACCAAATGAGTTGACG
TATAAAATGGTTGTGGATGGTTATTGCAGAGGAGGGAGATATAGTGAAGCTATGGAGTTT
GTGTCAAAGATTAGATCCCTTGATGCTTACTTTGATGATCACTCCATCCAGCGGCTAGCT
GTTCGAGTACGTGAGAATTTAGAATCCTAAGTCAATTATATATTTGCTTTTCTTTCTTTT
TGTAGATTTGTGAGTTTTTGTATTGAAATTTACATTTTACATGAAATAAAATAAGCAACT
TTGTCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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GAAGAGATTGACCGTTTCTTCTCCTCCGTCTATAGTGACACGTCGAGGACGACGAGACGG
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TACAGTTTTACTGGAAATACCGTAAAATCATTATAGTATAAATTTAAAAGCTTCTTATAA
AGTATTTTTAATTTTATAAAATGGATGGATAATTTTCTACAGCCGCT


BQ
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AF RR4G447JQ C 1
AF RR4G447TF U 1
BS 1 587 RR4G447TF

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GAAGAGATTGACCGTTTCTTCTCCTCCGTCTATAGTGACACGTCGAGGACGACGAGACGG
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QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4G447TF 587 0 0
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GACATGGATGATCTTGAGTTATTACAAGATCTGTCCAAATTCAACTTCCCAGCAACCATC
AAGACCCCATCTAAGACCTCTAAAGACAACAAAGACGGCGATGATGACAACGACGAGGGT
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CCTCCCCCGCCGCGTAAACCTCGTGCACTGCCTTCAAAACCGTTGCCAACAGCGGCTCTG
ATGATCAGATCGTGTAAGAGGAAGCTCTTAGTGTCCACTCCTGAGATTATCATGAACAAG
GAAGAGATTGACCGTTTCTTCTCCTCCGTCTATAGTGACACGTCGAGGACGACGAGACGG
CGGAGACGTTATCTTTATCGTGCACGAAGATGAGCCTTTAGTTCAAGATTTACATTTCTC
TACAGTTTTACTGGAAATACCGTAAAATCATTATAGTATAAATTTAAAAGCTTCTTATAA
AGTATTTTTAATTTTATAAAATGGATGGATAATTTTCTACAGCCGCT

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL8872Contig1 680 2 1 U
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ACCATATGTACAATCCAAATTCAAGAAAACACATTGTGTTTATGCGAAATGGAAAAGTAG
GTATGAACTTGTTAAAGAGC


BQ
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AF RR4BD88JQ C 1
AF RR4BD88TF U 1
BS 1 680 RR4BD88TF

RD RR4BD88JQ 680 0 0
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QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4BD88TF 680 0 0
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GAACTCGTTAGTGACTCATGATGAGTTCTGATATAATGAAGATTCTCTCCGGTCAGAAAT
TTCTAGTCATTGTATGAAGAAGAGAGGGAGAGAATAAATAAGAGATTTTTATGTCTTGGT
TTGGCTGGTTCTTCCTCTTCTTCTCTTTGTTTGTTTGAAACATTTTTAATGTTAGGTTCT
ACCATATGTACAATCCAAATTCAAGAAAACACATTGTGTTTATGCGAAATGGAAAAGTAG
GTATGAACTTGTTAAAGAGC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL8873Contig1 893 2 4 U
TTTGCCCCTTCTCTTCCTTCTTCCCCAGCTTTCTCACCTTCTTCCACATCTCTCTCTATC
TCTCTTGTGTTCTTTTGTATTTGCAAAATTCACTGAACAGATCCGATGAAGGAGATTACT
GACTTGGTCGATCCCAGGAGGATCATGTTCAAGCATCAATCCCTTATGCAGGGTTATCAT
GACTTGAGAAAGGAAACAGAGTATAAGATGAGGAAACTGGAGATGATGAAACGAAAACGA
TCGGCCCTTGATGCACAAGTTAGGTTCTTGAGACGCAGATACAAACACTTGAAGCAAGAC
CAATCTCATGAAACATCTCCCAACAACATGTTGAGATTGTCGGAACCAAGAGGAGCTTTG
AAGGTGTCGAATAATGGCAAAAGAAAGAAGAGCTCTGGTCAGGGAGCATCCTTTGATTTG
AAACTAAAGGATACAGTTTGCGATGACAAGAAGGAATTGTCAGCTAAAAGGAGCGAGGTT
TTGACAAGCTCTACTCCACTTCCTGATCTTAACGACAACAACACTCTGGTCACCAACAAA
GTCTCAGGATTTGACCTAAACCTGATCTCGAGAGAAGAAGAGGATCCTGAAGCGAATGGT
GGTGAAGCAACAAAGAACGGAATGATTGGCAATGGAATCGATTGCGAGATGAAGTTGCCG
ATTTGCAGAGACGTGGAGAAAGAGATAAGCCGAGCAGTGAAGAGGAAAGTGGTTTCGTGG
CAAGATCCAGTTGCTTTAAGGGTTTGATGTTTTATTACTAAAGAGTATCAAGTAGGATTT
GAGATTATGATTTTAGCCTATTATGCACGTATACAAGTATTGATGATGAGTCAGCAAGTT
ATAAAACTTTCATATCTTCCAAATTATTTATCAATCCAATTTGGCGATTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AB43TF U 1
AF RR4AB43JQ C 43
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BS 776 776 RR4AB43JQ
BS 777 836 RR4AB43TF
BS 837 893 RR4AB43JQ

RD RR4AB43TF 846 0 0
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TCTCTTGTGTTCTTTTGTATTTGCAAAATTCACTGAACAGATCCGATGAAGGAGATTACT
GACTTGGTCGATCCCAGGAGGATCATGTTCAAGCATCAATCCCTTATGCAGGGTTATCAT
GACTTGAGAAAGGAAACAGAGTATAAGATGAGGAAACTGGAGATGATGAAACGAAAACGA
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GTATAAACTT

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DS 

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CTTATGCAGGGTTATCATGACTTGAGAAAGGAAACAGAGTATAAGATGAGGAAACTGGAG
ATGATGAAACGAAAACGATCGGCCCTTGATGCACAAGTTAGGTTCTTGAGACGCAGATAC
AAACACTTGAAGCAAGACCAATCTCATGAAACATCTCCCAACAACATGTTGAGATTGTCG
GAACCAAGAGGAGCTTTGAAGGTGTCGAATAATGGCAAAAGAAAGAAGAGCTCTGGTCAG
GGAGCATCCTTTGATTTGAAACTAAAGGATACAGTTTGCGATGACAAGAAGGAATTGTCA
GCTAAAAGGAGCGAGGTTTTGACAAGCTCTACTCCACTTCCTGATCTTAACGACAACAAC
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GATCCTGAAGCGAATGGTGGTGAAGCAACAAAGAACGGAATGATTGGCAATGGAATCGAT
TGCGAGATGAAGTTGCCGATTTGCAGAGACGTGGAGAAAGAGATAAGCCGAGCAGTGAAG
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GAGTATCAAGTAGGATTTGAGATTATGATTTTAGCCTATTATGCACGTATACAAGTATTG
ATGATGAGTCAGCAAGTTATAAAACTTTCATATCTTCCAAATTATTTATCAATCCAATTT
GGCGATTGCAC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL8874Contig1 1002 2 2 U
GGACGGCTCTTCGTATTCTCGAGCTTGGAATAGACCAAATTACAATGGAGGTTCTGGAAT
ATAAGTGTCGTCTTCGTTTCTGTCGTTTTGTTTGCCGTTCATCTCCCCCGATTCGTTACG
GGATGAAGTGCTCCATGGTCATTAATATCCTTCTCTAACTCATTGAACCCACACAACCAC
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GGGAGGATGGGACTTTACTCAATTCTGCCATTACTTCAAACTGCTTTATGGATTTGTCAT
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GGTGTGTGTTGAGTATAAATAGATTTTATGACTCAGGAGGATGATAAAACTTAGGCTCCG
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GAGAAACAGGAGAAGAGGGAGAGGAAGCAGAGAGCTTTGAAGGAGAAAGAGCTGGATAAT
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AATGTGAGAGAGAAACAGAAACATGAAGAGGTGAAGCGTTTAAAGGGGGAGTGCTGAGAC
AAAGAGGAATCACATTGAAGAATAAGAAGAAGAGACCCGAGTGAGATCAGACCGTCAAGA
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GGGAACTGAGAGGATATACAAGATACATGTCAGTGAAGATGTTAACTAAACTGAATGTGA
TTTTTATATTTATACTTCCTTTAATTTAGTTTACGTTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AN25TF U 1
AF RR4AN25JQ C 158
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BS 740 1002 RR4AN25JQ

RD RR4AN25TF 739 0 0
GGACGGCTCTTCGTATTCTCGAGCTTGGAATAGACCAAATTACAATGGAGGTTCTGGAAT
ATAAGTGTCGTCTTCGTTTCTGTCGTTTTGTTTGCCGTTCATCTCCCCCGATTCGTTACG
GGATGAAGTGCTCCATGGTCATTAATATCCTTCTCTAACTCATTGAACCCACACAACCAC
GATTCGTCATTCAATGCTCTTATCTACCTTTCACGCGGTGGAACTCAACCTATAAAAAGA
TTGACAAAGCCTACTCGCTTGATTTCATGGAAATTGGGAGTGTTGTATTTCAGTCGAAAA
GGGAGGATGGGACTTTACTCAATTCTGCCATTACTTCAAACTGCTTTATGGATTTGTCAT
AGATCCCATTGATTACTCTCCCACGATGTGTCTTCGATGTGCTGATAAGATTTGGGAGGC
GGTGTGTGTTGAGTATAAATAGATTTTATGACTCAGGAGGATGATAAAACTTAGGCTCCG
GATGATGGGATGGTTGTGAAAGAGCTGAGGTAGAGAAGAAACAGAACTGGAATCGAGTAT
GAGAAACAGGAGAAGAGGGAGAGGAAGCAGAGAGCTTTGAAGGAGAAAGAGCTGGATAAT
ACTGCATACAAGGACTTCAAAGCTTCTATTAAGCATTACTCCAAAAGGGCATTAGATATC
AATGTGAGAGAGAAACAGAAACATGAAGAGGTGAAGCGTTTAAAGGGGGAGTGCTGAGAC
AAAGAGGAATCACATTGAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AN25JQ 845 0 0
ACTCATTGAACCCACACAACCACGATTCGTCATTCAATGCTCTTATCTACCTTTCACGCG
GTGGAACTCAACCTATAAAAAGATTGACAAAGCCTACTCGCTTGATTTCATGGAAATTGG
GAGTGTTGTATTTCAGTCGAAAAGGGAGGATGGGACTTTACTCAATTCTGCCATTACTTC
AAACTGCTTTATGGATTTGTCATAGATCCCATTGATTACTCTCCCACGATGTGTCTTCGA
TGTGCTGATAAGATTTGGGAGGCGGTGTGTGTTGAGTATAAATAGATTTTATGACTCAGG
AGGATGATAAAACTTAGGCTCCGGATGATGGGATGGTTGTGAAAGAGCTGAGGTAGAGAA
GAAACAGAACTGGAATCGAGTATGAGAAACAGGAGAAGAGGGAGAGGAAGCAGAGAGCTT
TGAAGGAGAAAGAGCTGGATAATACTGCATACAAGGACTTCAAAGCTTCTATTAAGCATT
ACTCCAAAAGGGCATTAGATATCAATGTGAGAGAGAAACAGAAACATGAAGAGGTGAAGC
GTTTAAAGGGGGAGTGCTGAGACAAAGAGGAATCACATTGAAGAATAAGAAGAAGAGACC
CGAGTGAGATCAGACCGTCAAGATGCAGTGAGAGAGAGAGAAGCTGCTAGACTGTGAACT
ACAAGAACAGGCACCTCATCTTGATGTATCTGATAAAGAACCTGATGCTACACATGAAAG
ACTTTGGAGTGAAGATTTGACAAGGGAACTGAGAGGATATACAAGATACATGTCAGTGAA
GATGTTAACTAAACTGAATGTGATTTTTATATTTATACTTCCTTTAATTTAGTTTACGTT
GGTTT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL8875Contig1 1377 2 2 U
GGACTCATCTCAGTTCCAACAGCAAGAGTCGCGGTTCATCATCTCCGTCCAAACAACATG
GACTGCACTGGAATAGTGCCTTTTAGGATGGACGGGATACCTGATTCTCCTCAAACTTTT
CCTGGATTCAAGTGTTGTGACAGTGTTGATGAGAATCTTTGCCATTCAGTTAAGGAGAAA
ATGGAACTTAAACATGACAATATCTTCGTGGACAGTTTCTTAGGCCTCGGTATGGAAAAT
ATGGGAATAAACTCTAAGATGGATGAGTTTTCACTTGGACTAACTGACTTTAGCTTTCTC
CCAGATGTTTATGGTGGTGGACTAGATCCTTGGAGCAAGCAAGATGGGGAAGCAGGTTTA
AAGCCAGAAATTCTTGATGGTTTTCTGGATGAAGTTGAGGAAGTGGAACACATCTACGCA
TCGCACCATCCTTCTTCTACTGCTAATCATTCCCTTCTCGAAACACAAGTCAAAAAGGAA
TCATCTGAATTAGATGGTGAACCTTATGGTCTTATGAACTTCAGCTCAGAAACTTATTCT
CCTATGACCTCAGGCCTCGGAAAGAACCTTTGGAGAATTACGTTCATCATACAACGGAGA
ATACATTATCATCTGAGAGCGAAGATGATTTATCAGTAACAATCAAATCCAAGAGCAGAG
GTGGCAGGAGAAAGCATCAGAGGATGTGGACTATTGATGAAGTGGTGAAGTTGCTTGATG
GTATCTCTCACTTTGGTCTTGGCAAATGGACTGATATAAAGAACTCCTTCTTTCATTCTT
CATCGCACCGCACGCCTGTCGATATCAGAGACAAATGGCGTAATCTACTGAAAGCAAGTC
ACAGTAACAAGCATAATGGTGATGAAGAGGGTGAAGAAAAACGACGGTGGTCAGCGGGTC
GCACTATCCCTAAGAATATACTACATAGGGTAAGAGAGCTTGCTTCACTCCACTCCAAGT
CCAAGCCATTGTGTGACGCTCATGGCTCCTCAAGAAGCTCAAGTACTTCAAGGAAGAAGA
AGAAGAAGAAAAAGTGGAGTTGAGTCTTGATAGAGAAAGTCTAGTTATCAAGATCGATAC
TATTGGAAACTCTTGCAGTAATCGATGTCTACCATTATTGGAAACTCTACTTTTACAAAT
TGGAAACAAGAAAACATGTTGGCTAAAATAGAAAGTTCTCATCATTTGCATATACGTTTC
CATAAATGCGGTGTTCTTGGTTCATCTTCAGATAAGTTTACATAAAGGATGTGTTCTTGG
TTCATTTCCAGATAAGTTTGCATAAATATGTTTTTTTTTGGAAATTTCGTTATGATTCTG
AATATGTGTGGTAGATTGTAATTATTTTCGATTTTTTAAAAAACTTTTATTTGGGCC


BQ
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AF RR4CM01TF U 1
AF RR4CM01JQ C 573
BS 1 636 RR4CM01TF
BS 637 1377 RR4CM01JQ

RD RR4CM01TF 636 0 0
GGACTCATCTCAGTTCCAACAGCAAGAGTCGCGGTTCATCATCTCCGTCCAAACAACATG
GACTGCACTGGAATAGTGCCTTTTAGGATGGACGGGATACCTGATTCTCCTCAAACTTTT
CCTGGATTCAAGTGTTGTGACAGTGTTGATGAGAATCTTTGCCATTCAGTTAAGGAGAAA
ATGGAACTTAAACATGACAATATCTTCGTGGACAGTTTCTTAGGCCTCGGTATGGAAAAT
ATGGGAATAAACTCTAAGATGGATGAGTTTTCACTTGGACTAACTGACTTTAGCTTTCTC
CCAGATGTTTATGGTGGTGGACTAGATCCTTGGAGCAAGCAAGATGGGGAAGCAGGTTTA
AAGCCAGAAATTCTTGATGGTTTTCTGGATGAAGTTGAGGAAGTGGAACACATCTACGCA
TCGCACCATCCTTCTTCTACTGCTAATCATTCCCTTCTCGAAACACAAGTCAAAAAGGAA
TCATCTGAATTAGATGGTGAACCTTATGGTCTTATGAACTTCAGCTCAGAAACTTATTCT
CCTATGACCTCAGGCCTCGGAAAGAACCTTTGGAGAATTACGTTCATCATACAACGGAGA
ATACATTATCATCTGAGAGCGAAGATGATTTATCAG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4CM01JQ 805 0 0
GAGAATTACGTTCATCATACAACGGAGAATACATTATCATCTGAGAGCGAAGATGATTTA
TCAGTAACAATCAAATCCAAGAGCAGAGGTGGCAGGAGAAAGCATCAGAGGATGTGGACT
ATTGATGAAGTGGTGAAGTTGCTTGATGGTATCTCTCACTTTGGTCTTGGCAAATGGACT
GATATAAAGAACTCCTTCTTTCATTCTTCATCGCACCGCACGCCTGTCGATATCAGAGAC
AAATGGCGTAATCTACTGAAAGCAAGTCACAGTAACAAGCATAATGGTGATGAAGAGGGT
GAAGAAAAACGACGGTGGTCAGCGGGTCGCACTATCCCTAAGAATATACTACATAGGGTA
AGAGAGCTTGCTTCACTCCACTCCAAGTCCAAGCCATTGTGTGACGCTCATGGCTCCTCA
AGAAGCTCAAGTACTTCAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGTGGAGTTGAGTCTTGATA
GAGAAAGTCTAGTTATCAAGATCGATACTATTGGAAACTCTTGCAGTAATCGATGTCTAC
CATTATTGGAAACTCTACTTTTACAAATTGGAAACAAGAAAACATGTTGGCTAAAATAGA
AAGTTCTCATCATTTGCATATACGTTTCCATAAATGCGGTGTTCTTGGTTCATCTTCAGA
TAAGTTTACATAAAGGATGTGTTCTTGGTTCATTTCCAGATAAGTTTGCATAAATATGTT
TTTTTTTGGAAATTTCGTTATGATTCTGAATATGTGTGGTAGATTGTAATTATTTTCGAT
TTTTTAAAAAACTTTTATTTGGGCC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL8876Contig1 475 2 1 U
GCGGACAGATTACAGAGAAAGCAGATGTGTACTCTTTTGGGTTTGTCTTAGTTGAGCTTA
TCACAGGAAGAAAAGCTATGGACATTAAACGTCCTAAAGGTCAACAATGTCTCACCGAAT
GGGCAAGACCGTTGTTGCAGAAACAAGCCATTAAGGAGCTTCTTGATCCGCGTCTAATGA
ATTGTTACTCTGAGCAAGAAGTTTACTGTATGGCGCTATGTGCTTACCTTTGCATTCGCC
GTGACCCTAACTCAAGGCCACGAATGTCTCAGGTGTTGCGGATGTTAGAAGGAGACGTTG
TCATGAATCAAGTCTAGAATCTTCACAGGGAAAAGAGTCTGCTCTTGGAGTTTGTAGAGT
ATTTAGAGTTTGTTAATGAGTATTGTTTCTGTTATATGTACAAGTTTGTTAATGAGACAA
AGATTCATGTCGAAGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGAGAATTTTGTGTAGATG


BQ
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AF RR4D238JQ C 1
AF RR4D238TF U 1
BS 1 475 RR4D238TF

RD RR4D238JQ 475 0 0
GCGGACAGATTACAGAGAAAGCAGATGTGTACTCTTTTGGGTTTGTCTTAGTTGAGCTTA
TCACAGGAAGAAAAGCTATGGACATTAAACGTCCTAAAGGTCAACAATGTCTCACCGAAT
GGGCAAGACCGTTGTTGCAGAAACAAGCCATTAAGGAGCTTCTTGATCCGCGTCTAATGA
ATTGTTACTCTGAGCAAGAAGTTTACTGTATGGCGCTATGTGCTTACCTTTGCATTCGCC
GTGACCCTAACTCAAGGCCACGAATGTCTCAGGTGTTGCGGATGTTAGAAGGAGACGTTG
TCATGAATCAAGTCTAGAATCTTCACAGGGAAAAGAGTCTGCTCTTGGAGTTTGTAGAGT
ATTTAGAGTTTGTTAATGAGTATTGTTTCTGTTATATGTACAAGTTTGTTAATGAGACAA
AGATTCATGTCGAAGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGAGAATTTTGTGTAGATG

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR4D238TF 475 0 0
GCGGACAGATTACAGAGAAAGCAGATGTGTACTCTTTTGGGTTTGTCTTAGTTGAGCTTA
TCACAGGAAGAAAAGCTATGGACATTAAACGTCCTAAAGGTCAACAATGTCTCACCGAAT
GGGCAAGACCGTTGTTGCAGAAACAAGCCATTAAGGAGCTTCTTGATCCGCGTCTAATGA
ATTGTTACTCTGAGCAAGAAGTTTACTGTATGGCGCTATGTGCTTACCTTTGCATTCGCC
GTGACCCTAACTCAAGGCCACGAATGTCTCAGGTGTTGCGGATGTTAGAAGGAGACGTTG
TCATGAATCAAGTCTAGAATCTTCACAGGGAAAAGAGTCTGCTCTTGGAGTTTGTAGAGT
ATTTAGAGTTTGTTAATGAGTATTGTTTCTGTTATATGTACAAGTTTGTTAATGAGACAA
AGATTCATGTCGAAGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGAGAATTTTGTGTAGATG

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL8877Contig1 1191 2 2 U
CTCTTCGTCGCCATTAGCTTAAAGAGAATCATCGTCATCATCATCCACCTCAACTACTCC
ATCCCCAAGAAGAAGTAGATTCGCGTGGAGCTCTTTCTTCTTCGAGGTCTCCCAAGCTCT
CTCTCACCTAACTGCCATGGCTACTAACAACAACAACAACCATAACCTCTCGGATCAACA
ACCTCCTTCCGACGATTTCTTCGAGCAGATCCTCGGAATCTCCAACTTCTCCGCGTCTTC
CAGCTCCGGTGGGCTTTCTGCACTCCCCGGAGGGTTAAGCGGACCGCCGCCGATGATGCT
TCAGCTCGGTTCCGGGGAAGAAGGGAGTCATAATAATCATATGGGTGGTGGTGGTGGTGG
GCCTCTAGGGTTTCACAACGGGATGTTTCCGTTGGGGTTGAGCCTCGATCAAGGGAAAGG
AGGAGGACAAGGCTTTCTTAAACCCGATGGAAGTGGTGGAAAACGTTTCCAAGATGATGT
TGTTGGTGTTGATAATCGATGTTCCTCCATGAAACCTGTTTACCATGGGCAGCCAATGTC
ACAGCCACCTCCACCAATGCCGCATCAACAATCTTCAATCCGGCCTAGAGTTAGGGCTAG
GCGAGGTCAGGCCACTGATCCTCATAGCATCGCTGAGCGGCTGCGTAGGGAAAGAATAGC
AGAACGGATCAGGGCGTTGCAGGAACTTGTACCTACTGTCAACAAGACTGATAGGGCTGC
TATGATCGATGAGATTGTCGATTATGTAAAGTTTCTCAGGCTCCAAGTTAAGGTCTTAGC
ATGAGTCGTCTTGGTGGGGCCGGTGCTGTTGCTCCACTAGTCACTGAAATGCCATTGTCT
TCATCAATTGAGGATGAGACACAAGCAGTGTGGGAGAAATGGTCAGACGATGGGACAGAG
CGTCAAGTGGCTAAGCTGATGGAAGAAAACGTTGGAGCAGCGATGCAGCTTTTGCAGTCA
AAGGCGCTTTGCATAATGCCAGTCTCATTGGCGATGGCTATTTACCATTTTCAGCCACCT
GACACGTCTTCATCGGTCGTGAAACCGGAGATGAATCCTCCTCAGTAGATCTTTGCATCT
AATTGGTCGTCGTCAGCTTCTTTGTTCCTTTTCCCTCCCCCACTACTACTACCACTTTTG
CGACTGATGAATTCGAGATGGAATCAAATTAGGATTTGTGCAGTAAGAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EC90TF U 1
AF RR4EC90JQ C 419
BS 1 579 RR4EC90TF
BS 580 1191 RR4EC90JQ

RD RR4EC90TF 579 0 0
CTCTTCGTCGCCATTAGCTTAAAGAGAATCATCGTCATCATCATCCACCTCAACTACTCC
ATCCCCAAGAAGAAGTAGATTCGCGTGGAGCTCTTTCTTCTTCGAGGTCTCCCAAGCTCT
CTCTCACCTAACTGCCATGGCTACTAACAACAACAACAACCATAACCTCTCGGATCAACA
ACCTCCTTCCGACGATTTCTTCGAGCAGATCCTCGGAATCTCCAACTTCTCCGCGTCTTC
CAGCTCCGGTGGGCTTTCTGCACTCCCCGGAGGGTTAAGCGGACCGCCGCCGATGATGCT
TCAGCTCGGTTCCGGGGAAGAAGGGAGTCATAATAATCATATGGGTGGTGGTGGTGGTGG
GCCTCTAGGGTTTCACAACGGGATGTTTCCGTTGGGGTTGAGCCTCGATCAAGGGAAAGG
AGGAGGACAAGGCTTTCTTAAACCCGATGGAAGTGGTGGAAAACGTTTCCAAGATGATGT
TGTTGGTGTTGATAATCGATGTTCCTCCATGAAACCTGTTTACCATGGGCAGCCAATGTC
ACAGCCACCTCCACCAATGCCGCATCAACAATCTTCAAT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4EC90JQ 773 0 0
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GTTGTTGGTGTTGATAATCGATGTTCCTCCATGAAACCTGTTTACCATGGGCAGCCAATG
TCACAGCCACCTCCACCAATGCCGCATCAACAATCTTCAATCCGGCCTAGAGTTAGGGCT
AGGCGAGGTCAGGCCACTGATCCTCATAGCATCGCTGAGCGGCTGCGTAGGGAAAGAATA
GCAGAACGGATCAGGGCGTTGCAGGAACTTGTACCTACTGTCAACAAGACTGATAGGGCT
GCTATGATCGATGAGATTGTCGATTATGTAAAGTTTCTCAGGCTCCAAGTTAAGGTCTTA
GCATGAGTCGTCTTGGTGGGGCCGGTGCTGTTGCTCCACTAGTCACTGAAATGCCATTGT
CTTCATCAATTGAGGATGAGACACAAGCAGTGTGGGAGAAATGGTCAGACGATGGGACAG
AGCGTCAAGTGGCTAAGCTGATGGAAGAAAACGTTGGAGCAGCGATGCAGCTTTTGCAGT
CAAAGGCGCTTTGCATAATGCCAGTCTCATTGGCGATGGCTATTTACCATTTTCAGCCAC
CTGACACGTCTTCATCGGTCGTGAAACCGGAGATGAATCCTCCTCAGTAGATCTTTGCAT
CTAATTGGTCGTCGTCAGCTTCTTTGTTCCTTTTCCCTCCCCCACTACTACTACCACTTT
TGCGACTGATGAATTCGAGATGGAATCAAATTAGGATTTGTGCAGTAAGAGGC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL8878Contig1 710 2 12 U
CAGACATAACAACCCTTATTAAACCATCACTGCATGCAGTGTTTGAACATGAAGCAACAA
CAACACATTATGTAAATAATACAGTAAATACTAGGTGGAGTTTCGGAGTTTTGCATAAAG
TCTTGACAGTTGAACGAAAACAACATACAGTATCATCTCTTCTCTTCTACTATCGTACTC
TCCCATGCACAACCTGAAGTCTCGTATTTGCCTTCCCACCTGTTTGCTTCGGTTTCAGGG
GTAAGAAGCTCAATATCACCCTCCAAGGGCTCAAACACCAAGTTGATCTTCTCCTCAGCT
ACCTCATCCAACGTCGCTGGATACCAATTGGGAGAATTGTCATAGTCTATGGTCAGAGCT
CTTATACCCTCATACACGTCAGGTGATATGATGCTCCTCAAAATATTCACAGTGATTCTA
AACTCCTTCTTGAGGCAATCACTCAGTGTTTGTTTCCTACCTTCACGAATCGATCTTAGC
GTTATTTTCAACCCTGTGGGAGATGAACGTTTGAGACCTTTGATGATTGGAGTTATACAC
TCATTTCCCTCTTTGCTCCCTTCAGCTTCAAATGCTTGTATGATCTGCTTCACACTTTCT
TTTGAGAAACACTCATCAATTATTGACTGCTTGTTAAGGATGCTGTTTTTGTCGAGGTCT
ACTTTCTCGGCGAACTCTTCAATTGTGGACCGAACTACATCCATGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4ET21JQ U 1
AF RR4BR58TF C 18
BS 1 62 RR4ET21JQ
BS 63 63 RR4BR58TF
BS 64 75 RR4ET21JQ
BS 76 76 RR4BR58TF
BS 77 341 RR4ET21JQ
BS 342 342 RR4BR58TF
BS 343 343 RR4ET21JQ
BS 344 344 RR4BR58TF
BS 345 536 RR4ET21JQ
BS 537 537 RR4BR58TF
BS 538 631 RR4ET21JQ
BS 632 710 RR4BR58TF

RD RR4ET21JQ 631 0 0
CAGACATAACAACCCTTATTAAACCATCACTGCATGCAGTGTTTGAACATGAAGCAACAA
CAGCACATTATGTAA*TAATACAGTAAATACTAGGTGGAGTTTCGGAGTTTTGCATAAAG
TCTTGACAGTTGAACGAAAACAACATACAGTATCATCTCTTCTCTTCTACTATCGTACTC
TCCCATGCACAACCTGAAGTCTCGTATTTGCCTTCCCACCTGTTTGCTTCGGTTTCAGGG
GTAAGAAGCTCAATATCACCCTCCAAGGGCTCAAACACCAAGTTGATCTTCTCCTCAGCT
ACCTCATCCAACGTCGCTGGATACCAATTGGGAGAATTGTCTTTGTCTATGGTCAGAGCT
CTTATACCCTCATACACGTCAGGTGATATGATGCTCCTCAAAATATTCACAGTGATTCTA
AACTCCTTCTTGAGGCAATCACTCAGTGTTTGTTTCCTACCTTCACGAATCGATCTTAGC
GTTATTTTCAACCCTGTGGGAGATGAACGTTTGAGACCTTTGATGATTGGAGTTATCCAC
TCATTTCCCTCTTTGCTCCCTTCAGCTTCAAATGCTTGTATGATCTGCTTCACACTTTCT
TTTGAGAAACACTCATCAATTATTGACTGCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4BR58TF 693 0 0
ATTAAACCATCACTGCATGCAGTGTTTGAACATGAAGCAACAACAACACATTATGTAAAT
AATACAGTAAATACTAGGTGGAGTTTCGGAGTTTTGCATAAAGTCTTGACAGTTGAACGA
AAACAACATACAGTATCATCTCTTCTCTTCTACTATCGTACTCTCTCATGCACAACCTGA
AGTCTCGTATTTGCCTTCCCACCTGTTTGCTTCGGTTTCAGGGGTAAGAAGCTCAATATC
ACCCTCCAAGGGCTCAAACACCAAGTTGATCTTCTCCTCAGCTACCTCATCCAACGTCGC
TGGATTCCAATTGGGAGAATTGTCATAGTCTATGGTCAGAGCTCTTATACCCTCATACAC
GTCAGGTGATATGATGCTCCTCAAAATATTCACGGTGATTCTAAACTCCTTCTTGAGGCA
ATCACTCAGTGTTTGTTTCCTACCTTCACGAATCGATCTTAGCGTTATTTTCAACCCTGT
GGGAGATGAACGTTTGAGACCTTTGATGATTGGAGTTATACACTCATTTCCCTCTTTGCT
CCCTTCAGCTTCAAATGCTTGTATGATCTGCTTCACACTTTCTTTTGAGAAACACTCATC
AATTATTGACTGCTTGTTAAGGATGCTGTTTTTGTCGAGGTCTACTTTCTCGGCGAACTC
TTCAATTGTGGACCGAACTACATCCATGTCTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8879Contig1 581 2 1 U
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GTCGGATATAGGGAATATGGATCCAATGCAGCTTGCTAGTATGGGTAAGAGGTTAGACGA
AGAGGAAGAAGATTATGACGAGGAGGAAGTTTGAGAGATGCTGAGACCCCATGTTTTAGT
ACGAAACATGATGTAGGATTAAATAGGGGTTAGCAGTGTTTAACAGTCTCTGTTTATGTA
GAAGATGTATCATATGGTTCTTCTTGCTCTCCTCTTCCTGTATGGAGAAAATATTGTAAG
GCCCTCTTTAACTATTATTTCTAGAAGTTTGAAACTTGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DA17JQ C 1
AF RR4DA17TF U 1
BS 1 581 RR4DA17TF

RD RR4DA17JQ 581 0 0
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QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4DA17TF 581 0 0
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GCCCTCTTTAACTATTATTTCTAGAAGTTTGAAACTTGATT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8880Contig1 737 2 1 U
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AGATATGTTGGACTGTAACACTAAGAAGTTCCATGAAAAGTTTGGCGTTTAAAAGAGGTT
TAAAAAAGTGATCTCTTCTCTCTAGTTTTTGCTTCTTCATTAGTCTCTCTCTTTCTTTGT
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TATATTTGCATTTTTCC


BQ
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AF RR4AK86JQ C 1
AF RR4AK86TF U 1
BS 1 737 RR4AK86TF

RD RR4AK86JQ 737 0 0
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AGATATGTTGGACTGTAACACTAAGAAGTTCCATGAAAAGTTTGGCGTTTAAAAGAGGTT
TAAAAAAGTGATCTCTTCTCTCTAGTTTTTGCTTCTTCATTAGTCTCTCTCTTTCTTTGT
AAGCTATATTTTCAGCTCGTTGCACCAATCCTGTTTAGTTATGTATCATTGATTCCATAT
TATATTTGCATTTTTCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4AK86TF 737 0 0
GACTCCTTTTCAACCCGAGGCTCATCAGCTACGGGATCGAGACCAAGCTGGCTGTTATTG
TGAGCTTCCTCGCTAGCCTCGGGCTTGATAAAGATAATGGTGTGATCGGTCAGGTTCTTG
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CGCAGGTCGTGTGCATAGACGTTGGGAAGATACTCAGACCGAACTACGAGTATTTGAAGG
AGTGTGGGTTTGGCGATGCGCAGATTGCGAGTATGGTTGCTGGTTATCCACCTGTTTTGA
TCAAGAGTGTTGGGAACTCGCTGAGGCCTAGGATCAGGTTCCTGGTGGATGTGATGGGGA
GGGGGTTGGATGAGGGTGGGTTGGTTATCCTCAGTTTTTTCAACATGGGTTGAAGAAGAA
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TAAAAAAGTGATCTCTTCTCTCTAGTTTTTGCTTCTTCATTAGTCTCTCTCTTTCTTTGT
AAGCTATATTTTCAGCTCGTTGCACCAATCCTGTTTAGTTATGTATCATTGATTCCATAT
TATATTTGCATTTTTCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL8881Contig1 582 2 1 U
GGTATATGCAAAGCGGTAGAGCGACTGAGAAGACCGATGTTTACAGTTTCGGAGTTTTGG
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TTAAACCCTTTCATTTCTTCTGAATGTGGAACTAAAATGTATATGATTATTGTAGAAAAC
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BQ
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AF RR4B193JQ C 1
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DS 

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GGTATATGCAAAGCGGTAGAGCGACTGAGAAGACCGATGTTTACAGTTTCGGAGTTTTGG
TTCTTGAAGTCTTGAGTGGTAAGATCCCCATGGATACCTCATTCATCGAGAAAGGCTACA
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GTGTGTCTTCTAGTCCAGACGAGCGGCCAACAATGCTCAGAGTTGTTCAGTTACTTGAAT
CTGAAGTTATGACTCCTTGCCCTAGTGACTTCTACGATTCTGGTTCTGATTGATCCCATT
CACAAGTCGATTTTCTGTTTTATATCACAAAGGTACAATCCATTCATTTTCGGTTTCTCG
TTTTGTGTTTTTTTTTGGCTTTGAGTCTTTTTTTTATATATGATCTTTCCTTGTATTTGG
TTAAACCCTTTCATTTCTTCTGAATGTGGAACTAAAATGTATATGATTATTGTAGAAAAC
ACTGTAATATTTTTATAAGAAGGATCTGAATAAATTTCTGTT

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

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TCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4A527TF U 1
AF RR4A527JQ C 139
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TCTTCTA

QA 1 847 1 847
DS 

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AGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGA
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TCTTTAATGCTTTGTCCCTTTTGACACTCGTTTTGGACCCTCAGCTTCTTTCTCTTGTTT
GGTGTAAAACTTGAGTTTTGGATAATGCTACATCTTTTTTTCTCAAC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

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CCAATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E704TF C 1
AF RR4E704JQ U 4
BS 1 3 RR4E704TF
BS 4 667 RR4E704JQ

RD RR4E704TF 585 0 0
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CTTATTTAAAGTTCTCATTCTCACCCCCAAACTATTAAGTACAACAAATCAAACCCAACC
ACGAAGATAGATGTGGAAGCAGGGAAAATAGAAATGGAGAAACCAATTTTTTCACCAGAA
AACTTCGGCCAAACGTGAGAAAAAATAATTCATTTTTTAAGAATTACGTAAGAGAAGAAA
CTCTATCAGTAAGCTCTGCAACTGTTGTTTCATCCTCTCCTTCCTCAGCTATGGTGTCCT
CTTTGTCGGTTTTAGATTGGACACCAATGCATTTAGAACCGCTGATGCTCGAACTCTTCA
TGAGGTTACGAGCACTGTAACCTCCTCCATTGTCTGCTTCCTCAGTTTCCAAGGTTGAAG
CAGCAGCTGCTCTTTCTTCTGCAGTTTCACTACTCTGAGCAGGGACTCTCTCTCTAGGCA
AGGAAGCATGATGTCTGTGAAGTGCAGTACTTCTTCCTCCTCCTGCTCCTGCTCCTGGTT
TACCTTGATTCTCTTCAAGGTGAGCAAACTGCCTCTTGAATCTAT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4E704JQ 664 0 0
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ATTTAAAGTTCTCATTCTCACCCCCAAACTATTAAGTACAACAAATCAAACCCAACCACG
AAGATAGATGTGGAAGCAGGGAAAATAGAAATGGAGAAACCAATTTTTTCACCAGAAAAC
TTCGGCCAAACGTGAGAAAAAATAATTCATTTTTTAAGAATTACGTAAGAGAAGAAACTC
TATCAGTAAGCTCTGCAACTGTTGTTTCATCCTCTCCTTCCTCAGCTATGGTGTCCTCTT
TGTCGGTTTTAGATTGGACACCAATGCATTTAGAACCGCTGATGCTCGAACTCTTCATGA
GGTTACGAGCACTGTAACCTCCTCCATTGTCTGCTTCCTCAGTTTCCAAGGTTGAAGCAG
CAGCTGCTCTTTCTTCTGCAGTTTCACTACTCTGAGCAGGGACTCTCTCTCTAGGCAAGG
AAGCATGATGTCTGTGAAGTGCAGTACTTCTTCCTCCTCCTGCTCCTGCTCCTGGTTTAC
CTTGATTCTCTTCAAGGTGAGCAAACTGCCTCTTGAATCTATCAACCCCACTAGGGTACA
TGAAGCTAAGCTGATCACCACCGCGCTTGTATTCCTCCAGCATCTGAGGATGATACTCCA
ATAC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL8884Contig1 738 2 2 U
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TAATTAAAGCCGCTTTGTTCATCAGATCTCTCCATCTCCATCTCCGTTCGTCCGCCGCAC
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CGTTGTCTCACCGGATTTCTCGTTTCTTCGAAGTATTTCACCACTGCGTCACCTCACCGT
CCTTTGCCGTTATTCACTGTCGCTCGATGTCTCCCCTCTGCTCTCGGTGCAAAATAATCT
ACAGCCCTTCTCCTCAAGACCTTAATTTTGGCTACTCCCGACCAGGACTCTCTTCCACCT
GAGTCACCAGATCTGTCATATCCCTCTCTTCGCCTAATCCTCCAGTTGTGTGCTCTGCAG
CTTGCATTACAGGCTTAAGAGTTTAGAGCAGCTTTCTCGGTTGAAATTTCCCCAAGCCCT
CCTCCTCTTCTGATTTGCCAGGTTATGCGTCTGTATCATCTTTAGTGTACTAAGTTTTGT
GGTTGTCTTTATTATTGATATTTATGCTTTCTGGCTTGCTACGGTAGCAGCATAGTATTA
GCCAGTTTGATTTTGTTGTATCTTTATTAGAACATCGTCTCTTTCATTGGAAATTAATTG
ATCTATAAATGTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ15TF U 1
AF RR4GQ15JQ C 129
BS 1 710 RR4GQ15TF
BS 711 738 RR4GQ15JQ

RD RR4GQ15TF 710 0 0
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GAGTCACCAGATCTGTCATATCCCTCTCTTCGCCTAATCCTCCAGTTGTGTGCTCTGCAG
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CCTCCTCTTCTGATTTGCCAGGTTATGCGTCTGTATCATCTTTAGTGTACTAAGTTTTGT
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GCCAGTTTGATTTTGTTGTATCTTTATTAGAACATCGTCTCTTTCATTGG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4GQ15JQ 610 0 0
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TCTCCTCAAGACCTTAATTTTGGCTACTCCCGACCAGGACTCTCTTCCACCTGAGTCACC
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TCTGATTTGCCAGGTTATGCGTCTGTATCATCTTTAGTGTACTAAGTTTTGTGGTTGTCT
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ATGTTGTTTG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL8885Contig1 798 2 2 U
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TCGATGGTTTGGTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G674TF U 1
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BS 1 762 RR4G674TF
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RD RR4G674TF 762 0 0
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ATGTCATGCCGTTACGTTATGTCGCAAAAATTTGGTATCCGGATAATTACCAGAACTAGC
GTTATACGTGTGGTGGATTAGAATTTTGATATGCCTTGCACTGTATCCCATCCTATGATT
TTGACCTTCTACGGTTTTAATGTTTCTGTAATCAGCTTTGTCCTCTCTTTTGTTATGGTT
GTTGCATATGTTTCATTAGTACAGCCATCACTACTTTCATTG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4G674JQ 618 0 0
CAAAGACGACGACGACCATGTTACGGCCGCCAGTGAGGAGTTCAACGACGTGGAGGTGTG
GAATACGCTGAGTAATGGCTTCAAGCGTGCGCAACTCGTTCTAGACCAGAATCGTGACTT
GATCCGACGCGTCAACGACAACCATCTGTCCCGAATCCCAGAGAACGTCTCCAGGAACGT
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AGCTGTCGATTTCTCAAAAAAAAATCGAGGAGGCCAAGAGTGGCGACACTACGGCAACCA
CCTCCGGTTCCTATGGCTGTGGACAGAGCTCTTGCGGTTCTTGAGCTCTGTTTTTAGCTG
ATGTCATGCCGTTACGTTATGTCGCAAAAATTTGGTATCCGGATAATTACCAGAACTAGC
GTTATACGTGTGGTGGATTAGAATTTTGATATGCCTTGCACTGTATCCCATCCTATGATT
TTGACCTTCTACGGTTTTAATGTTTCTGTAATCAGCTTTGTCCTCTCTTTTGTTATGGTT
GTTGCATATGTTTCATTAGTACAGCCATCACTACTTTCATTGATTGATAAATAATGCAAT
TCGATGGTTTGGTTGTTT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL8886Contig1 790 2 2 U
GCAACAACAACTTAATCAGGAACTATTCGAGCAAGGTCTACCATTTGAGCGATCTACATC
GTTAACCAGAAATGCATCGGGGCTGAATCTGGATGCATTAAAAAGTCTTAGCATCTCTGA
GTTGCGTGATGCCCAGATGCATTCTTCTGGTAGATTAGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAG
TCATCAGAATCCCCATTTACAATTAGGTGAGCCTCATTTTTCAGAATTGGAACCAAGAAA
AGAACGCTGGCATGGAGCAGATGCACAGCTAGCTGGTGGGTGGGCCGAAACACAATTTCA
AAGATCAAATACTGATGCTGACCATCATAAAATGAGGTCAGAAATAAGGAAACAAAGGCG
GTGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAGGCAGCTTGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCA
AAGTCACTAGCAATCGCCTCATGGGTGAAATTCACCGCGCTGATGACTTTTAGTCTATTC
TGATACCCTTGAGCTCCTTTCAAGCGTTTCTTCTTCTCCCGCGTAATCATGAAAACTTCA
AAGCTGTCTCGCAGACAGGAAAGTTGAGAAGTTTGACAAAAACATTACAGGGAGATGTTT
TGTACCTGAGACAACTACCTCTCTCTTCCAGATCATGAGGGACTGTAACCAGCGGAGATA
CGGCATAAACCGAAGAGTCAAGTTTAGAATTGAATCATTCTTCTGTCTTGTTCATTTTCT
CTTCTTTTAACTATAGAATCCAACTTTCCGTTTACTTGTGCATGTTAATATAATGAAGAG
TATTTTATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GY25TF U 1
AF RR4GY25JQ C 1
BS 1 582 RR4GY25TF
BS 583 790 RR4GY25JQ

RD RR4GY25TF 582 0 0
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AAGCTGTCTCGCAGACAGGAAAGTTGAGAAGTTTGACAAAAA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4GY25JQ 790 0 0
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TCATCAGAATCCCCATTTACAATTAGGTGAGCCTCATTTTTCAGAATTGGAACCAAGAAA
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AAGATCAAATACTGATGCTGACCATCATAAAATGAGGTCAGAAATAAGGAAACAAAGGCG
GTGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAGGCAGCTTGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCA
AAGTCACTAGCAATCGCCTCATGGGTGAAATTCACCGCGCTGATGACTTTTAGTCTATTC
TGATACCCTTGAGCTCCTTTCAAGCGTTTCTTCTTCTCCCGCGTAATCATGAAAACTTCA
AAGCTGTCTCGCAGACAGGAAAGTTGAGAAGTTTGACAAAAACATTACAGGGAGATGTTT
TGTACCTGAGACAACTACCTCTCTCTTCCAGATCATGAGGGACTGTAACCAGCGGAGATA
CGGCATAAACCGAAGAGTCAAGTTTAGAATTGAATCATTCTTCTGTCTTGTTCATTTTCT
CTTCTTTTAACTATAGAATCCAACTTTCCGTTTACTTGTGCATGTTAATATAATGAAGAG
TATTTTATTC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8888Contig1 967 2 6 U
GGGTTACAAAAAAAAAGTCCCAAGTTGACGTTACGTCACTTTCATCTTCAATTCTTCATC
ATCAGTTGCCATTGATCTTGAAACACCCAGCTGATATCACAATATGGATGTGTTCTTCGA
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CAAACAAAAAGATCGAAAAGTATCAACGTATCCCTGTCTCCAAACAGATTCTTTTCTTCC
AAGGCAAGGTTCTTCAAGACGATCACGACATCGAACAATGCGCCATCCTCAACAACTCTC
ATCTACAGATTATCAGCTCTTCTCCTGGTAACAACGACCAACAGCGCAGCAACAATCAAG
TGCTAAAAACCGAGCAATCTCCACCGTCAAACTCAACAGAACAGATCCTTAACGGTCAAG
ATTTGCCTGTGATGATATCTAGGACCCACAACAACAACAACAACAACCCTAAGAAGCTGA
GAGTGATGGTTCTCCCGAAAAGCGGGACAATGAAGATTCCGGTGGAGGTGAACGCGAGTG
ATAACGTGGGAGAGCTGAGGAAGGAGCTGGTTAAGGTTCAACAGAGGTTTCAGTTAAGTC
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TCCGGTGGCACCGTGTTGATAACGGTGATACTATTGAGATTTTCAGTGGAAGTGTTTCTG
GTGGCTCTTAATTAAGTCTTAAATCCAGTTTAGATCTGAGCAACCTTCTCCTTCCTTACA
GCTAATTCCAAAATTGTCTTTTGTTTTCACAGCTTTCTGCAACTAAGATAGCTAATAAGA
TAACATTTGATCTGAAAAAGAGGAACTTGTTGTTATTGACTTACTTCTTGGTGAAATAAA
TAGGTACTCATGCACGCTTCAATTTGAGCTTTGCATAGTGCTTTGAGAAATCGGATGATC
TAATTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BI42TF U 1
AF RR4BI42JQ C 142
BS 1 189 RR4BI42TF
BS 190 190 RR4BI42JQ
BS 191 821 RR4BI42TF
BS 822 822 RR4BI42JQ
BS 823 834 RR4BI42TF
BS 835 967 RR4BI42JQ

RD RR4BI42TF 839 0 0
GGGTTACAAAAAAAAAGTCCCAAGTTGACGTTACGTCACTTTCATCTTCAATTCTTCATC
ATCAGTTGCCATTGATCTTGAAACACCCAGCTGATATCACAATATGGATGTGTTCTTCGA
GGTACAAAGAGGCCCAACGTTCTGCATTGAACTAGGTTACTGGGACACAGTGCTAGAGAT
CAAACAAAA*GATCGAAAAGTATCAACGTATCCCTGTCTCCAAACAGATTCTTTTCTTCC
AAGGCAAGGTTCTTCAAGACGATCACGACATCGAACAATGCGCCATCCTCAACAACTCTC
ATCTACAGATTATCAGCTCTTCTCCTGGTAACAACGACCAACAGCGCAGCAACAATCAAG
TGCTAAAAACCGAGCAATCTCCACCGTCAAACTCAACAGAACAGATCCTTAACGGTCAAG
ATTTGCCTGTGATGATATCTAGGACCCACAACAACAACAACAACAACCCTAAGAAGCTGA
GAGTGATGGTTCTCCCGAAAAGCGGGACAATGAAGATTCCGGTGGAGGTGAACGCGAGTG
ATAACGTGGGAGAGCTGAGGAAGGAGCTGGTTAAGGTTCAACAGAGGTTTCAGTTAAGTC
TGCCTCAAGAAGGTTATTTCTTTATATACAAACAGAATGTGATGGAGGATGACCGGTCTT
TCCGGTGGCACCGTGTTGATAACGGTGATACTATTGAGATTTTCAGTGGAAGTGTTTCTG
GTGGCTCTTAATTAAGTCTTAAATCCAGTTTAGATCTGAGCAACCTTCTCCTTCCTTACA
GCTAATTCCAAAATTGTCTTTTGTTTTCACAGCTTTCTGCA*CTAAGATAGCTA
TAGAT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR4BI42JQ 826 0 0
TCTGCA
TGAACTAGGTTACTGGGACACAGTGCTAGAGATCAAACAAAAAGATCGAAAAGTATCAAC
GTATCCCTGTCTCCAAACAGATTCTTTTCTTCCAAGGCAAGGTTCTTCAAGACGATCACG
ACATCGAACAATGCGCCATCCTCAACAACTCTCATCTACAGATTATCAGCTCTTCTCCTG
GTAACAACGACCAACAGCGCAGCAACAATCAAGTGCTAAAAACCGAGCAATCTCCACCGT
CAAACTCAACAGAACAGATCCTTAACGGTCAAGATTTGCCTGTGATGATATCTAGGACCC
ACAACAACAACAACAACAACCCTAAGAAGCTGAGAGTGATGGTTCTCCCGAAAAGCGGGA
CAATGAAGATTCCGGTGGAGGTGAACGCGAGTGATAACGTGGGAGAGCTGAGGAAGGAGC
TGGTTAAGGTTCAACAGAGGTTTCAGTTAAGTCTGCCTCAAGAAGGTTATTTCTTTATAT
ACAAACAGAATGTGATGGAGGATGACCGGTCTTTCCGGTGGCACCGTGTTGATAACGGTG
ATACTATTGAGATTTTCAGTGGAAGTGTTTCTGGTGGCTCTTAATTAAGTCTTAAATCCA
GTTTAGATCTGAGCAACCTTCTCCTTCCTTACAGCTAATTCCAAAATTGTCTTTTGTTTT
CACAGCTTTCTGCAACTAAGATAGCTAATAAGATAACATTTGATCTGAAAAAGAGGAACT
TGTTGTTATTGACTTACTTCTTGGTGAAATAAATAGGTACTCATGCACGCTTCAATTTGA
GCTTTGCATAGTGCTTTGAGAAATCGGATGATCTAATTAA

QA 7 826 7 826
DS 



AS 1 2

CO CL8889Contig1 244 2 1 U
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ACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGAGAAAAAAAATAGTATTATCATGTAAA
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TATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RR4BG30JQ C 1
AF RR4BG30TF U 1
BS 1 244 RR4BG30TF

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TATT

QA 1 244 1 244
DS 

RD RR4BG30TF 244 0 0
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TTAATAGGCCCCAAGCTTGTATTATAGTGTGTTATTTTCTTAAAATTTAAAATAAAGAGT
TATT

QA 1 244 1 244
DS 



AS 1 2

CO CL8890Contig1 724 2 1 U
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TTAGATATTCAGGTCTTAATAAACGGTTTACAACACTTTGTGCCGACAAATGTGAAACCG
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CACTGGGCAAGGGCTCATCCGGAATATACAAAAGGACAGGTCGTAGGACTTGTGACTTTA
GTAGCCACCATGAAAGGCTGGAAGAGGAAAACGCGGTTAGAAGTTGTGGATAAGATTGAA
TCAGCTGCTGTGTAGAGATCTAAATCTAGAAGCTAGCTTCTAGTACTTTCAGCGACGAGT
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CAAAAGCATTTGTCATTAACAAGTGGTACCATTTAGTGATTATGGATATTACCATTTTGT
GACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 

AF RR4GY02TF U 1
AF RR4GY02JQ C 143
BS 1 724 RR4GY02TF

RD RR4GY02TF 724 0 0
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AAGTTACAGATAGTGGACACATTTATCAAGGCATACTATCTACCAGAGACTGAATATGTC
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GTAGCCACCATGAAAGGCTGGAAGAGGAAAACGCGGTTAGAAGTTGTGGATAAGATTGAA
TCAGCTGCTGTGTAGAGATCTAAATCTAGAAGCTAGCTTCTAGTACTTTCAGCGACGAGT
AATATTTACATGTATCGAGGGCTGTAAATTTGAGGAAAGGCCCTTCTTGGTTACTGTCGT
TGCTTATGGGTTTATGTTAAAGATCCTTCTGAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGACTGTAAC
ACACATTCGCCACCCCATCCCTCCATGTATTGTCAGATCCCTAAACCCGATTATGTAGTG
CAAAAGCATTTGTCATTAACAAGTGGTACCATTTAGTGATTATGGATATTACCATTTTGT
GACC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4GY02JQ 582 0 0
TAAAAAGATGCACAGATGAAGGACGTGCTCTCATGTCATTAGATATTCAGGTCTTAATAA
ACGGTTTACAACACTTTGTGCCGACAAATGTGAAACCGAAGTTACAGATAGTGGACACAT
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AATATACAAAAGGACAGGTCGTAGGACTTGTGACTTTAGTAGCCACCATGAAAGGCTGGA
AGAGGAAAACGCGGTTAGAAGTTGTGGATAAGATTGAATCAGCTGCTGTGTAGAGATCTA
AATCTAGAAGCTAGCTTCTAGTACTTTCAGCGACGAGTAATATTTACATGTATCGAGGGC
TGTAAATTTGAGGAAAGGCCCTTCTTGGTTACTGTCGTTGCTTATGGGTTTATGTTAAAG
ATCCTTCTGAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGACTGTAACACACATTCGCCACCCCATCCCT
CCATGTATTGTCAGATCCCTAAACCCGATTATGTAGTGCAAAAGCATTTGTCATTAACAA
GTGGTACCATTTAGTGATTATGGATATTACCATTTTGTGACC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL8891Contig1 1034 2 6 U
GGACAAAGAGGAGCAAAGGATGATGAAAGAAGAGGAATGGAGAAAGAGGGAAGCTGCAAG
GGTTGATAAAGAGCATTTATTTTGGGCTAAAGAGAGGGAGAGGATGGAAGCTAGGGATGT
AGCTGTGATTGATGCATTGCAGTATTTAACTGGAAAGCAGTTGATAAAGCCATTAGGCTC
GTCCCTAGAAGAAAGGAATGATGAGATCCAAAACAATAATGAGAATGGAAGCGATCAAAC
AATGACTACTAACAATGTTTCTGTTAAAGGAAGTGGTAGATTCTGGGATGAGCAAGAGAT
CATAAAGCTTAGGGAGATTAGAAGTAGCATGGACTCAGCGTTTCAAGAGGTATTGTAAGG
ATGCTCGGATGAGTTTCTATGGGAGGAAGTCGCAGCGAAGTTGACTCAATTAGGGTTTGA
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AGAAAAGAAGCAAATCAACAAGAAAAGGAAGGAGAATTCGTCGAGCTGCGGCGTGTACTA
TCCAAGAACCGAAGAAAGTCAGATCTGCAACAATCAAGAAAGTGGATATAATGATAGTGA
TCAGCATCATCAGACGATGAATGAACAAGGCAATAATGTTGGTTCTTCAACTTCAAACGC
AAACGCAAACGCTGGAAATCCAAGCGGCGCAATGGCGGCTAGTACAAACTGCTTCCCGTT
CTTCATGGGAGATGGAGATCAAAATTTGTGGGAGAGTTATGGTTTGAGGCTAAGTAAAGG
AGAGAATCAGTGACTATAATTTCTCCCAAGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGAAGGTGATCAT
GAGGTTAACTAATTCTTTTGAGTTAACTAGTTCTATATATGAGATAAACCTTGATTCAAC
GGTTATATGTCACATGATGCTTAGAGTGAAGAGATATAAATATTTTGTTGGGGCTTACCG
AATGTTATATCAGCATATATAAGATGAAAGTCAAATTATAGTAGGCTTTAACTTATGATT
ATTATGTTTTCATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G028TF U 1
AF RR4G028JQ C 285
BS 1 707 RR4G028TF
BS 708 708 RR4G028JQ
BS 709 743 RR4G028TF
BS 744 744 RR4G028JQ
BS 745 768 RR4G028TF
BS 769 1034 RR4G028JQ

RD RR4G028TF 768 0 0
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GGTTGATAAAGAGCATTTATTTTGGGCTAAAGAGAGGGAGAGGATGGAAGCTAGGGATGT
AGCTGTGATTGATGCATTGCAGTATTTAACTGGAAAGCAGTTGATAAAGCCATTAGGCTC
GTCCCTAGAAGAAAGGAATGATGAGATCCAAAACAATAATGAGAATGGAAGCGATCAAAC
AATGACTACTAACAATGTTTCTGTTAAAGGAAGTGGTAGATTCTGGGATGAGCAAGAGAT
CATAAAGCTTAGGGAGATTAGAAGTAGCATGGACTCAGCGTTTCAAGAGGTATTGTAAGG
ATGCTCGGATGAGTTTCTATGGGAGGAAGTCGCAGCGAAGTTGACTCAATTAGGGTTTGA
TCAGAGAAGTGCCTTGGTGTGCAAGGAAAAGTGGGAAAGGATCAGCAATGAAAAGATGAA
AGAAAAGAAGCAAATCAACAAGAAAAGGAAGGAGAATTCGTCGAGCTGCGGCGTGTACTA
TCCAAGAACCGAAGAAAGTCAGATCTGCAACAATCAAGAAAGTGGATATAATGATAGTGA
TCAGCATCATCAGACGATGAATGAACAAGGCAATAATGTTGGTTCTTCAACTTCAAACGC
AAACGCAAACGCTGGAAATCCAAGCGGCGCAATGGCGGCTAGTACAA*CTGCTTCCCGTT
CTTCATGGGAGATGGAGATCAAA*TTTGTGGGAGAGTTATGGTTTGAG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4G028JQ 750 0 0
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AAGAGGTATTGTAAGGATGCTCGGATGAGTTTCTATGGGAGGAAGTCGCAGCGAAGTTGA
CTCAATTAGGGTTTGATCAGAGAAGTGCCTTGGTGTGCAAGGAAAAGTGGGAAAGGATCA
GCAATGAAAAGATGAAAGAAAAGAAGCAAATCAACAAGAAAAGGAAGGAGAATTCGTCGA
GCTGCGGCGTGTACTATCCAAGAACCGAAGAAAGTCAGATCTGCAACAATCAAGAAAGTG
GATATAATGATAGTGATCAGCATCATCAGACGATGAATGAACAAGGCAATAATGTTGGTT
CTTCAACTTCAAACGCAAACGCAAACGCTGGAAATCCAAGCGGCGCAATGGCGGCTAGTA
CAAACTGCTTCCCGTTCTTCATGGGAGATGGAGATCAAAATTTGTGGGAGAGTTATGGTT
TGAGGCTAAGTAAAGGAGAGAATCAGTGACTATAATTTCTCCCAAGGAAGCAGCAGCAGC
AGAAGAAGGTGATCATGAGGTTAACTAATTCTTTTGAGTTAACTAGTTCTATATATGAGA
TAAACCTTGATTCAACGGTTATATGTCACATGATGCTTAGAGTGAAGAGATATAAATATT
TTGTTGGGGCTTACCGAATGTTATATCAGCATATATAAGATGAAAGTCAAATTATAGTAG
GCTTTAACTTATGATTATTATGTTTTCATG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL8892Contig1 762 2 1 U
GGTCTCTCAACATCTATCCAACCATCAAAACTGTTTCCAATATAGCAATCATGAGTTCCG
TCGACTACCCTCCTCCTTCTTCTTTCATATGCCTTGTCGTAAAAGGCAAACCAGAATATC
GGGGCCCAGAGAAAACCGTTGGTGAAACAACTTATCTCATCATCGACAACTCTCATATCT
CTGATGTTCAATACGAGAACACTTTAAATTCTCACCATCTCCAACCGGTTCTTGGATGCA
ACAATAAAGAAGGCAAACGAAGCGACAACGAGTGCTGGGCTTGTAGAAGTTATAAAACTG
CCTTCCTTACAAGGTTAAGTATGAGCATGATGAGCATATGCTCACTCTTTCTTATGAGAA
AATTGCTAGTGGCCCTTGTTGGTGCCGAATTTGTGAGGAGACAACAGATCCGAAGAAAGG
ATACTACATATGCGGTGAGTGTAGAGTCACATTCCATACCGAATGTGTACTAGGAAATGA
CATTTATCTGAAGGAAGGACGTGAGCTATATACATTCTACGGACGCAAGGTTGAGATCAT
CCCTAACAACCGTCTCAGCCGACCCATCTGCCATCATTGTCGAAAACGCTGTCAATACAA
TATAGTATTCAAAAATTATCTTGGAAATATATTCTGTTCGTCAATAGAGGTATTATACTC
TATATAATATATTCTGAAAAACTAATGTTCTGTTTTTAGTTATTGTTATATGTACAAAAG
AAAAAAGCTTAATAATAAATAATAAAAAGGTATTGCGTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AO57JQ C 1
AF RR4AO57TF U 1
BS 1 762 RR4AO57TF

RD RR4AO57JQ 762 0 0
GGTCTCTCAACATCTATCCAACCATCAAAACTGTTTCCAATATAGCAATCATGAGTTCCG
TCGACTACCCTCCTCCTTCTTCTTTCATATGCCTTGTCGTAAAAGGCAAACCAGAATATC
GGGGCCCAGAGAAAACCGTTGGTGAAACAACTTATCTCATCATCGACAACTCTCATATCT
CTGATGTTCAATACGAGAACACTTTAAATTCTCACCATCTCCAACCGGTTCTTGGATGCA
ACAATAAAGAAGGCAAACGAAGCGACAACGAGTGCTGGGCTTGTAGAAGTTATAAAACTG
CCTTCCTTACAAGGTTAAGTATGAGCATGATGAGCATATGCTCACTCTTTCTTATGAGAA
AATTGCTAGTGGCCCTTGTTGGTGCCGAATTTGTGAGGAGACAACAGATCCGAAGAAAGG
ATACTACATATGCGGTGAGTGTAGAGTCACATTCCATACCGAATGTGTACTAGGAAATGA
CATTTATCTGAAGGAAGGACGTGAGCTATATACATTCTACGGACGCAAGGTTGAGATCAT
CCCTAACAACCGTCTCAGCCGACCCATCTGCCATCATTGTCGAAAACGCTGTCAATACAA
TATAGTATTCAAAAATTATCTTGGAAATATATTCTGTTCGTCAATAGAGGTATTATACTC
TATATAATATATTCTGAAAAACTAATGTTCTGTTTTTAGTTATTGTTATATGTACAAAAG
AAAAAAGCTTAATAATAAATAATAAAAAGGTATTGCGTTTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4AO57TF 762 0 0
GGTCTCTCAACATCTATCCAACCATCAAAACTGTTTCCAATATAGCAATCATGAGTTCCG
TCGACTACCCTCCTCCTTCTTCTTTCATATGCCTTGTCGTAAAAGGCAAACCAGAATATC
GGGGCCCAGAGAAAACCGTTGGTGAAACAACTTATCTCATCATCGACAACTCTCATATCT
CTGATGTTCAATACGAGAACACTTTAAATTCTCACCATCTCCAACCGGTTCTTGGATGCA
ACAATAAAGAAGGCAAACGAAGCGACAACGAGTGCTGGGCTTGTAGAAGTTATAAAACTG
CCTTCCTTACAAGGTTAAGTATGAGCATGATGAGCATATGCTCACTCTTTCTTATGAGAA
AATTGCTAGTGGCCCTTGTTGGTGCCGAATTTGTGAGGAGACAACAGATCCGAAGAAAGG
ATACTACATATGCGGTGAGTGTAGAGTCACATTCCATACCGAATGTGTACTAGGAAATGA
CATTTATCTGAAGGAAGGACGTGAGCTATATACATTCTACGGACGCAAGGTTGAGATCAT
CCCTAACAACCGTCTCAGCCGACCCATCTGCCATCATTGTCGAAAACGCTGTCAATACAA
TATAGTATTCAAAAATTATCTTGGAAATATATTCTGTTCGTCAATAGAGGTATTATACTC
TATATAATATATTCTGAAAAACTAATGTTCTGTTTTTAGTTATTGTTATATGTACAAAAG
AAAAAAGCTTAATAATAAATAATAAAAAGGTATTGCGTTTTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL8893Contig1 666 2 1 U
GGGATGAGAACGTAAACATAAATTATTAGCTCTCGAGTGTTGTGTTTATCATCACCTGAA
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TCTGCTAAAACTCCGTCTCTCTCCGAGCAATATCATTTGGAGAATGAAGTGAAGCAAGTT
AAAGAGGATCCTAGTGACGAAAACACTAGTGAGGAGACTCCTGATGATATCACGCTTAAG
ACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACCACAAACCAAACGAGGCATTGTTTCACACGT
TACATTGAGTATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGATGCTCCAGAATGCGATAAG
TTTGCAAAGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAA
AGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATGATGAA
TAAGCCCATCCCATCGTCCTCTTTTGCTGTCTGTAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTC
AACAATTTTTTATTACCTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTT
GAGGATCATCCAGTTCTTCTGTTATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCG
AGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4E637TF U 1
AF RR4E637JQ C 83
BS 1 666 RR4E637TF

RD RR4E637TF 666 0 0
GGGATGAGAACGTAAACATAAATTATTAGCTCTCGAGTGTTGTGTTTATCATCACCTGAA
GATTCTCTGTCTTCTCCTCCGATCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTG
TCTGCTAAAACTCCGTCTCTCTCCGAGCAATATCATTTGGAGAATGAAGTGAAGCAAGTT
AAAGAGGATCCTAGTGACGAAAACACTAGTGAGGAGACTCCTGATGATATCACGCTTAAG
ACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACCACAAACCAAACGAGGCATTGTTTCACACGT
TACATTGAGTATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGATGCTCCAGAATGCGATAAG
TTTGCAAAGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAA
AGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATGATGAA
TAAGCCCATCCCATCGTCCTCTTTTGCTGTCTGTAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTC
AACAATTTTTTATTACCTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTT
GAGGATCATCCAGTTCTTCTGTTATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCG
AGCTCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4E637JQ 584 0 0
TCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTGTCTGCTAAAACTCCGTCTCTTT
CCGAGCAATATCATTTGGAGAATGAAGTGAAGCAAGTTAAAGAGGATCCTAGTGACGAAA
ACACTAGTGAGGAGACTCCTGATGATATCACGCTTAAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTT
TCCCGACCACAAACCAAACGAGGCATTGTTTCACACGTTACATTGAGTATCACAGATGTG
TAGCTGCTAAGGGTGACGATGCTCCAGAATGCGATAAGTTTGCAAAGTTTTATCGATCTC
TTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCCCTG
GTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATGATGAATAAGCCCATCCCATCGTCCTCT
TTTGCTGTCTGTAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTCAACAATTTTTTATTACCTCAAA
TTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTTGAGGATCATCCAGTTCTTCTGT
TATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCGAGCTCC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8894Contig1 781 2 2 U
GGAGCAAGACTATGGGAAGTCTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTC
AGAATCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACATAGTCACCCCAAGTCGTCCTTCTTACGCT
CAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCGGGCCATAAGCACCGCACCAGCAATCC
AGCCTCCAGTTGCAGATGAGCTGAATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTGCCTTCGTCC
ATTCGGTGTTGCTACCGGACGGGACACCGGACGTGCATTGGAGAAGAGCGTGCGGTGGAC
AGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTATAGTAAGC
CCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGCTACTTGCATGGTCGAGATTGTAAATG
GAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGAAACTCAAAAGGAAACCAA
AAAACTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAGATTCAACCGGATTGGTCG
TCATACAACAATTACCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAAGAATTTACCTA
TTGATGATCCCGAAAGTTCTACGTGAAAGTACGATCCAGCTGTGAGTTCCGCCACCTGAG
TTCGGATCCCGGCCACTGGGGAATTAACATTTCGGCATCGCCAGGGACAGAGGACCGACA
TGTGGCAACACGTGACTAGTCTGGACCATTTCGGTGGGGCCAGGATACCTCTGTATAATC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RR4GJ44TF U 1
AF RR4GJ44JQ C 113
BS 1 694 RR4GJ44TF
BS 695 781 RR4GJ44JQ

RD RR4GJ44TF 700 0 0
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AGAATCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACATAGTCACCCCAAGTCGTCCTTCTTACGCT
CAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCGGGCCATAAGCACCGCACCAGCAATCC
AGCCTCCAGTTGCAGATGAGCTGAATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTGCCTTCGTCC
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CCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGCTACTTGCATGGTCGAGATTGTAAATG
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AAAACTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAGATTCAACCGGATTGGTCG
TCATACAACAATTACCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAAGAATTTACCTA
TTGATGATCCCGAAAGTTCTACGTGAAAGTACGATCCAGCTGTGAGTTCCGCCACCTGAG
TTCGGATCCCGGCCACTGGGGAATTAACATTTCG
CATCGC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4GJ44JQ 669 0 0
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CTTCGTCCATTCGGTGTTGCTACCGGACGGGACACCGGACGTGCATTGGAGAAGAGCGTG
CGGTGGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTA
TAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGCTACTTGCATGGTCGAGAT
TGTAAATGGAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGAAACTCAAAAG
GAAACCAAAAAACTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAGATTCAACCGG
ATTGGTCGTCATACAACAATTACCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAAGAA
TTTACCTATTGATGATCCCGAAAGTTTTACGTGAAAGTACGATCCAGCTGTGAGTTCCGC
CACCTGAGTTCGGATCCCGGCCACTGGGGAATTAACATTTCGGCATCGCCAGGGACAGAG
GACCGACATGTGGCAACACGTGACTAGTCTGGACCATTTCGGTGGGGCCAGGATACCTCT
GTATAATCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TACTAATTATGCATGTTACAAAGACAATCAAGACTGGAAAACGACCATGTCGAGCAGAGT
TTTTCATCGAGACTCGTACGAAACCTAATGGAAGCTTTGTATGTGAAGAAGCAAAAACAC
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TTCTTCATTTGTGTTTTAGGAAGCACTTACAACGTTGTTGGGTCAAAAATCACATGTGGA
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AGGACGAGTGCGGTGTGTTGGTCGTGGACCTACACCTTCAAAATTAGTGAACCGTTCAAC
TGTTACGAGACAAGAGATAGAGAATTCAGAAATGGTTGTCGTGCTGAAGTCACAAGTGAA
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AACTGGTGAACAGGCAAGAATATGGGCTTCAAGTTTTGCTGTAGCTTTTGCTAACATACC
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BQ
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AF RR4FC09TF U 1
AF RR4FC09JQ C 124
BS 1 703 RR4FC09TF
BS 704 876 RR4FC09JQ

RD RR4FC09TF 703 0 0
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TACTAATTATGCATGTTACAAAGACAATCAAGACTGGAAAACGACCATGTCGAGCAGAGT
TTTTCATCGAGACTCGTACGAAACCTAATGGAAGCTTTGTATGTGAAGAAGCAAAAACAC
GAGCGGTTAGTTTTAGTCAATATTACAATATATTTGTAAGTTAATTCTACTTAGTATTTA
TTCTTCATTTGTGTTTTAGGAAGCACTTACAACGTTGTTGGGTCAAAAATCACATGTGGA
AAACAATGCTATTGCTAGTTTGGATGATGAATATGCACAAGTTTTTGGCCCAGAGCGTCC
AGGACGAGTGCGGTGTGTTGGTCGTGGACCTACACCTTCAAAATTAGTGAACCGTTCAAC
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AGAATTATCAGATCAAGTTAAAGGAATGACTACATTCATCCAACAAGTAATTGGTACTTC
AACTGGTGAACAGGCAAGAATATGGGCTTCAAGTTTTGCTGTAGCTTTTGCTAACATACC
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QA 1 703 1 703
DS 

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TCATCGAGACTCGTACGAAACCTAATGGAAGCTTTGTATGTGAAGAAGCAAAAACACGAG
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TTCATTTGTGTTTTAGGAAGCACTTACAACGTTGTTGGGTCAAAAATCACATGTGGAAAA
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ACGAGTGCGGTGTGTTGGTCGTGGACCTACACCTTCAAAATTAGTGAACCGTTCAACTGT
TACGAGACAAGAGATAGAGAATTCAGAAATGGTTGTCGTGCTGAAGTCACAAGTGAAAGA
ATTATCAGATCAAGTTAAAGGAATGACTACATTCATCCAACAAGTAATTGGTACTTCAAC
TGGTGAACAGGCAAGAATATGGGCTTCAAGTTTTGCTGTAGCTTTTGCTAACATACCAAA
TCCAGCTTTTACCTACGTACCAAGTCCACGAGATCCAAATCAGGAGCGGAGTGATGATGC
TGTTAGAGATTAAGAAGCTTGGACACTGGAAGCAATGGCAGTGGTCTTCAACAACATTAG
TTTTATAATATTTTCAGCAATTTTCAGTTTATTTTATTTTATGACTTTGCATGATGGATT
AGTTATGTGATTTTATTTCTAATACTTTATTTT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL8897Contig1 723 2 2 U
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GTTTCTGGAGAATTACACGAGGTTCACCAAACGCGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTC
CTCCGACGTTGAGGAGTTCATAGCTTCCGATCCCGTTCATGGACCCACCCTGAAAACAGC
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TTTTGCCTGGAAATACTCTAGGAGCCCGCATGGTGCTGCATTGTCCTTCTTAGGAGGAGG
TGTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTTGCGAACCACACTTTGCAACTCTATAAGCT
GGACACAATGGCGGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAATCTCAATGAAG
GTCATGAATCCAAAATAACAAAGACGGTTGCTACCTTCTCCATCAGAGTATCTATATTGC
AATCAGCTTGAAATGTGATAAAAGTTAAATCCATTTCCAGACCTTTTTTTATTATGTTCT
CACTCGTAGAACATGTTTGTTTTTCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATGGAGAGTG
TTTTGAATTGAATTTGAAAGAAACCCAATAATGAAATGGTAAATCTTGGGACTTGAAGAT
GGT


BQ
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10 10 10 

AF RR4DA59TF U 1
AF RR4DA59JQ C 84
BS 1 663 RR4DA59TF
BS 664 723 RR4DA59JQ

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GATGGGAGATTCGAGGTCGTTTGCGGAGGGATTCAAGGGGTTCTGGGAGGAGAGGTTGTC
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CTCCGACGTTGAGGAGTTCATAGCTTCCGATCCCGTTCATGGACCCACCCTGAAAACAGC
CAGGGAAGCTGCGACTTTTGGTGTTGCCGGAGCTGCACTTGGAGCTCTATCTACTGCCGC
TTTTGCCTGGAAATACTCTAGGAGCCCGCATGGTGCTGCATTGTCCTTCTTAGGAGGAGG
TGTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTTGCGAACCACACTTTGCAACTCTATAAGCT
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CACTCGTAGAACATGTTTGTTTTTCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATGGAGAGTG
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

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GCCCGCATGGTGCTGCATTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTGTTTTTGGTTGGACCTTTGGGC
AAGAAGTTGCGAACCACACTTTGCAACTCTATAAGCTGGACACAATGGCGGCTCAAGTTA
AGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAATCTCAATGAAGGTCATGAATCCAAAATAACAAAG
ACGGTTGCTACCTTCTCCATCAGAGTATCTATATTGCAATCAGCTTGAAATGTGATAAAA
GTTAAATCCATTTCCAGACCTTTTTTTATTATGTTCTCACTCGTAGAACATGTTTGTTTT
TCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATGGAGAGTGTTTTGAATTGAATTTGAAAGAAA
CCCAATAATGAAATGGTAAATCTTGGGACTTGAAGATGGT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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ATGGACACGTGGACACTTCGATCACTGCTCAAAAA


BQ
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AF RR4C077TF U 1
AF RR4CE38TF U 1
BS 1 580 RR4C077TF
BS 581 755 RR4CE38TF

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CGGAATCGGAAACTACTCGATTGGGTCGAGGGAGGACGCGAAAGTGGTTGCGGATTACTT
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CGGTATCGATTTCAATATCGAGCTTGGCTCCCCTCAACACTATGATGATCTCGCTAGATT
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ATTTCCAGACAGATTAATGGGAAGTGCACTTGACACCGAACTTTTCGACTACGTTTGGGT
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QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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TGGGGAACAAGTTGTTGTTGCTTCTGCTTCTTTCTCTTGTGCATGCTTATTCAGGAAAAT
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ACAATATTCTCTCCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A307JQ U 1
AF RR4A307JQD U 1
BS 1 588 RR4A307JQ
BS 589 736 RR4A307JQD

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CTTTAAGCACGACTCTGTCACTTCTACGTGGTTCACGTTCCCAAGGGTTTATTATTGGAC
CGTTTGATAAACACCTAATAATGTTAATGCAAATATGATCACAAGAAGGATTTGGGTAGT
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TTCTCAATTATTATGAAACATGAGCAATTGGGTACTATACTCAATAAGCATCTTCATTCA
TTTAAATCTGTAAATGTGTTCGTCCTACACGAGGTTAACTCAAAAATACAAAGAAAACAA
TGGGGAACAAGTTGTTGTTGCTTCTGCTTCTTTCTCTTGTGCATGCTTATTCAGGAAAAT
CTACAGTCAGATATCTTCCTGGTTTCCAAGGCCCTCTTCCTTTCGAGCTTGAAACTGGGT
TCTGTTCTTCATCAGCTCAACTAGTCTTATAAAATAATGAATGAATCTTATGTTCTGATT
TTTTTGACGTATGACATTCAGGTACATTGGTGTTGGTAAGGCAGATGA

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DS 

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GCCCCCTCAATTTTTTAAAATATAAATGTGGCTTAAATCCAATGTGCAAACTTCGACGCA
CTTTAAGCACGACTCTGTCACTTCTACGTGGTTCACGTTCCCAAGGGTTTATTATTGGAC
CGTTTGATAAACACCTAATAATGTTAATGCAAATATGATCACAAGAAGGATTTGGGTAGT
CAAGCCGCATCTGCCTCTGGTGGTGTCCTTTTTAAAAAAAACTATAAATATTCTTCTTGG
TTCTCAATTATTATGAGACATGAGCAATTGGGTACTATACTCAATAAGCATCTTCATTCA
TTTAAATCTGTAAATGTGTTCGTCCTACACGAGGTTAACTCAAAAATACAAAGAAAACAA
TGGGGAACAAGTTGTTGTTGCTTCTGCTTCTTTCTCTTGTGCATGCTTATTCAGGAGAAT
CTACAGTCAGATATCTTCCTGGTTTCCAAGGCCCTCTTCCTTTCGAGCTTGAAACTGGGT
TCTGTTCTTCATCAGCTCAACTAGTCTTATAAAATAATGAATGAATCTTATGTTCTGATT
TTTTTGACGTATGACATTCAGGTACATTGGTGTTGGTAAGGCAGATGAAGAACAATTTTT
CTACTACTTTATCAAATCTGAGAGAAACCCAAAAGAAGACCCTCTTCTTATCTGGTTAGC
CGGAGGACCTGGCTGCCCTTCTATCTCTGGCCTTGTTCTTGAAAATGGTAATATATGTAC
ACAATATTCTCTCCAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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GAGAGATGGGGAATATGTTCGTGAAGAAACCGAAGATCACGGAGGTTGATCGAGCGATCC
TCTCTCTCAAAACCCAAAGGCGCAAGCTTGGTCAATATCAGCAACAGCTTGAGAAAGTAA
TTGAGGCCGAAAAGCAAGCTGCAAGAGACCTAATCCGTGAGAAGCGGAAAGACAGGGCTT
TGTTAGCATTGAAGAAGAAGCGGACCCAAGAAGACTTATTGAAGCAAGTTGATCAGTGGG
TCATCAATGTCGAACAACAATTGGCAGATATTGAACTAACAAGCAAGCAGAAGGCAGTCT
TTGAGAGCTTAAAGCAAGGTAACAGTGCCATTAAGGCGATTCAGAGTGAAGTCAACCTTG
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GTGCCATATTGGGGGAGAAACTATCAGAAGAAGATGAAGAAGAGATCTTAGCAGAATTCG
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TGCGTGAAGAAGACGAGATATTGGATCTCCCTGATGTGCCGACAAAACAACCACTCGCTG
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TTTCTTGTGGGCTCTTGAAGCTCATTTTGTAAAGCTTGCAAAAGAACAAAGTTGTTGGAG
TTTCCTGTGTGACAATGAAAAAAAAAATGTTGATCATTATGGTTTATGAATGTTTTGGTT
GGTTTCGAAAAATCAGATTGTTTGAGCTGAACAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GF43TF U 1
AF RR4GF43JQ C 157
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BS 684 684 RR4GF43JQ
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GAGAGATGGGGAATATGTTCGTGAAGAAACCGAAGATCACGGAGGTTGATCGAGCGATCC
TCTCTCTCAAAACCCAAAGGCGCAAGCTTGGTCAATATCAGCAACAGCTTGAGAAAGTAA
TTGAGGCCGAAAAGCAAGCTGCAAGAGACCTAATCCGTGAGAAGCGGAAAGACAGGGCTT
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CTCCAAGTGCAGAAATCGCTTCA*CAAAGAGAAA*GTACTTGAAGAACCTTTGGAAGCTT
GATTGAGAAGAGAG**ATATGATGGAAGTATATATCAT

QA 1 758 1 758
DS 

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GTGAGAAGCGGAAAGACAGGGCTTTGTTAGCATTGAAGAAGAAGCGGACCCAAGAAGACT
TATTGAAGCAAGTTGATCAGTGGGTCATCAATGTCGAACAACAATTGGCAGATATTGAAC
TAACAAGCAAGCAGAAGGCAGTCTTTGAGAGCTTAAAGCAAGGTAACAGTGCCATTAAGG
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CCAAGGCTTATCAGGATGAGCTGAGTGCCATATTGGGGGAGAAACTATCAGAAGAAGATG
AAGAAGAGATTTTAGCAGAATTCGACAACCTCGAAAGTCAGCTCAATGTTGAAGACATGC
CTGACGTGCCTACAACAGAGCCAGTGCGTGAAGAAGACGAGATATTGGATCTCCCTGATG
TGCCGACAAAACAACCACTCGCTGCTCCAAGTGCAGAAATCGCTTCAACAAAGAGAAAAG
TACTTGAAGAACCTTTGGAAGCTTGATTGAGAAGAGAAGAATATGATGGAAGTATATATC
ATTCTTTCTCTGGACACTTTTTTTTTTCTTGTGGGCTCTTGAAGCTCATTTTGTAAAGCT
TGCAAAAGAACAAAGTTGTTGGAGTTTCCTGTGTGACAATGAAAAAAAAAATGTTGATCA
TTATGGTTTATGAATGTTTTGGTTGGTTTCGAAAAATCAGATTGTTTGAGCTGAACAAGG

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

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TCTAAAACTTCTCGTTCTTGTGGAAGACTTCCGGTCACCGACTCTGGCCGCTTCCACAGG
GCTGGAGTCGGGTTTCGATTTTGTGTTCACATGTTCTTTGGTGTTTCATCTGCTAGTTTG
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TGAGATGGCTTCAAGGTTGGAGTTTCCAGATCGCAAGATCAATGGGTTGGAGATGGGTTT
CTCTGCTGCATGCTCCTCTACTCTATTAATGGTGTCTTTGACTTTACTCTGTCTCGATCA
CGATTCCGTCCTGTTCTCAAGTCGGACTTTGGCCGGAGTAGAGTGATTCGCTCCCTGTCT
TTACCCCAGAGGTATGATCGAATCCTCAACCCTTGCATGCTTCTCAGTTGGCGTTCTCTG
TCGTTCTCGTGATGGATTGATCTCGCCGCTTCCGGTAGAATGTAAAAGAACGAAGTGTTC
TGTTTACCGGGTCCTGAAGCTTAGGTTTTCTGCTCTAATCTGTTTGCACTTATTCACTAT
GGGAGGTTTCCGATTTCGCTGTCTCTTCTTCAAAGACCCGATTGGAGTGTTGGTGTGGTG
TTGCTTAGGAGCTTTTCTTCATCTTCGCTTTTGGTGGTAGCTCTTAATCTTGTGTGTTTT
AATTTCTACCTCATAATCATCATGTAACTAGTAAGTTTGTGTTAGTCTGCTTCCCTTGTT
AGGGCAATACCTCCGAAGAACTTTGGTTCTGTCGGCTTCGTTTCCGGGTTAGTCCGGCAC
ATGTATCAGATATGTATCCCTCTGTGTAATATTACTGGTTTAATATAATTATCTTTAAGG
GTGG


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4EY26TF U 1
AF RR4EY26JQ C 158
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BS 747 747 RR4EY26JQ
BS 748 757 RR4EY26TF
BS 758 904 RR4EY26JQ

RD RR4EY26TF 775 0 0
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TGAGATGGCTTCAAGGTTGGAGTTTCCAGATCGCAAGATCAATGGGTTGGAGATGGGTTT
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CGATTCCGTCCTGTTCTCAAGTCGGACTTTGGCCGGAGTAGAGTGATTCGCTCCCTGTCT
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TGTTTACCGGGTCCTGAAGCTTAGGTTTTCTGCTCTAATCTGTTTGCACTTATTCACTAT
GGGAGGTTTCCGATTTCGCTGTCTCTTCTTCAAAGACCCGATTGGAGTGTTGGTGTGGTG
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RD RR4EY26JQ 747 0 0
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TTGACTTTACTCTGTCTCGATCACGATTCCGTCCTGTTCTCAAGTCGGACTTTGGCCGGA
GTAGAGTGATTCGCTCCCTGTCTTTACCCCAGAGGTATGATCGAATCCTCAACCCTTGCA
TGCTTCTCAGTTGGCGTTCTCTGTCGTTCTCGTGATGGATTGATCTCGCCGCTTCCGGTA
GAATGTAAAAGAACGAAGTGTTCTGTTTACCGGGTCCTGAAGCTTAGGTTTTTTGCTCTA
ATCTGTTTGCACTTATTCACTATGGGAGGTTTCCGATTTCGCTGTCTCTTCTTCAAAGAC
CCGATTGGAGTGTTGGTGTGGTGTTGCTTAGGAGCTTTTCTTCATCTTCGCTTTTGGTGG
TAGCTCTTAATCTTGTGTGTTTTAATTTCTACCTCATAATCATCATGTAACTAGTAAGTT
TGTGTTAGTCTGCTTCCCTTGTTAGGGCAATACCTCCGAAGAACTTTGGTTCTGTCGGCT
TCGTTTCCGGGTTAGTCCGGCACATGTATCAGATATGTATCCCTCTGTGTAATATTACTG
GTTTAATATAATTATCTTTAAGGGTGG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCTCTCCCGTCTCCTCTTTTCAAAGAACATCGATTTCCTAGTTTAGGGTTCTGCAGAAGA
GAAAAAAAAATGATAAAGAGACGATTCTACAAGCTAGAGCATGGTGACAAAGACAGTGGA
TCCGACTCCTCTTGCTTCTCTTCTGATTCTGATCCCGAGTCTGAAGAAGAAGAGTCAGAG
CAATCCGAATCCGAAGACGCCGTTTCACAAGGTTCCGAAGACGACGACGATGACTCCGTC
TCAGAGGGTGAAGAACAAGATGACTCTCCCCTAGCTGCTGATGTTGAAGATGATGATGAC
GATGATGATGACTCTGATGGTGGTGCCTATCGAGGGAGATATGAGAAGACATCGATGCAA
TACGGCTTAGAAGAACCACCGGAAGAGGAGGAAGAGAACTATATTCTTGGTTGTATGATT
AAATGCAAATCTGTTTACAAGTGCAGATATTGCCCAAACACCGTTTGTTTGAATGAGACA
ACTATGCAACAACATGTTTCATCCAAGAAGCATGCTCGCTCTGAGAAACTAATGAAGGAA
GAGAAGCTTAGAACCAATGATGATGATGATGATGATGAAGTTGAGGATCAAGAGAAGCCA
TCTCAGGAGAAGCAGATAAAAGGGAACAGAAGATCACAAAGAAAGGGTAAGAGATCACAA
AAACAAGGAAAGCTCGGAACCCAAGTGGATAACCCAGAGACTCCATCTCAGGAGAAGCAG
GTAAAGGGAAACAGAAAATCACGAAGACAGGGTATGAGTTCACAGAAACAGGAAAAGGAT
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AATATGTTTGCTTGTAACTGATACTATGGTTTTGATTAATTGAGTTTTGAGTTATTTACT


BQ
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AF RR4EI75TF U 1
AF RR4EI75JQ C 381
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BS 666 1080 RR4EI75JQ

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TCTCTCCCGTCTCCTCTTTTCAAAGAACATCGATTTCCTAGTTTAGGGTTCTGCAGAAGA
GAAAAAAAAATGATAAAGAGACGATTCTACAAGCTAGAGCATGGTGACAAAGACAGTGGA
TCCGACTCCTCTTGCTTCTCTTCTGATTCTGATCCCGAGTCTGAAGAAGAAGAGTCAGAG
CAATCCGAATCCGAAGACGCCGTTTCACAAGGTTCCGAAGACGACGACGATGACTCCGTC
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GATGATGATGACTCTGATGGTGGTGCCTATCGAGGGAGATATGAGAAGACATCGATGCAA
TACGGCTTAGAAGAACCACCGGAAGAGGAGGAAGAGAACTATATTCTTGGTTGTATGATT
AAATGCAAATCTGTTTACAAGTGCAGATATTGCCCAAACACCGTTTGTTTGAATGAGACA
ACTATGCAACAACATGTTTCATCCAAGAAGCATGCTCGCTCTGAGAAACTAATGAAGGAA
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TCTCA

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DS 

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ATCCAAGAAGCATGCTCGCTCTGAGAAACTAATGAAGGAAGAGAAGCTTAGAACCAATGA
TGATGATGATGATGATGAAGTTGAGGATCAAGAGAAGCCATCTCAGGAGAAGCAGATAAA
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CCAAGTGGATAACCCAGAGACTCCATCTCAGGAGAAGCAGGTAAAGGGAAACAGAAAATC
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TAAAGCAGATGCGACCCCAAAATCTAGAAAGAAAATGCGTCAAACGAAGGATTGAGACTA
GTGTGTATCTCTCTCCAGCAATATGAAAGATTCATATTGTAGTAGGAGAATTGGTTGCCT
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ATACTATGGTTTTGATTAATTGAGTTTTGAGTTATTTACT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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ATCTCTGCTTGTGCACCTTGTTCTTGCACTTGAATTCCAAAAGTCCTTGTCCTGTTTTCA
AACCAAAGTAAACTTCCTCTGAATTTTCCCTCTCTTTCCTGTAAGGCCAAGCTGATTTCT
CATCGCACACTCCATAAACAATGCATTTGATCTTCTTTGAAAATGCACCTCCAACATGTT
TGCTTTTGAGTTTGATTATAACCTGAAACTTCTTGTTGATATAAATGTAAACACGCTTAG
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CTTCCAATCTAAACTGAAAATTTGAAGGCCAGTGAGAGTCAAAGAAGCTTCTCTCGAAAG
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BQ
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AF RR4BK15JQ U 1
AF RR4CV72JQ U 1
BS 1 581 RR4BK15JQ
BS 582 696 RR4CV72JQ

RD RR4BK15JQ 581 0 0
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QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4CV72JQ 696 0 0
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TGCTTTTGAGTTTGATTATAACCTGAAACTTCTTGTTGATATAAATGTAAACACGCTTAG
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QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AP52JQ C 1
AF RR4AP52TF U 1
BS 1 766 RR4AP52TF
BS 767 768 RR4AP52JQ

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QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4AP52TF 766 0 0
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AAATAAATAAATAGCTTTTTATTGGATCAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAA
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TCCAAACTCGACGGTGGCAACTAAACACGAGGGTTGCACTTGTTGTGGGACTTAACCCGA
CACCTTACGGCACGAGTTGACGACATCCATGTTGAAAGAGTCGGTCTTGAAAACCGAAGT
ATTTTTAGGAACACATTTGGCATGGTTCTAGAACCCTCTTCAGATGTTTTTGCTGGTATT
GATCCAGATTTGGATGCTCAGGTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGCTCCAACT
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QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL8906Contig1 654 2 3 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO60JQ C 1
AF RR4CQ79TF U 38
BS 1 37 RR4EO60JQ
BS 38 617 RR4CQ79TF
BS 618 654 RR4EO60JQ

RD RR4EO60JQ 654 0 0
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CACAAACCGCTAGTGCATGGCAAGAGTTTGTGGTGCTGGTTCTAATCAGCACAGTCTGTT
ACTTCTTCTTCCTCGAGCAATTACTAATTCGGGATCTCAGCACGCAAGCTATCTACATAG
CAGGACCATTCTCCTTAACGTTAGGCCTCTTAGCATCTGTTTTTGCCATTGTCCTAGCTA
TCAGAGAATACATTTGGACATACGCAGCGCTTGAGTTTGCGCTTGTAGGCATTTTGGTTC
ATCTATTATATTCTACAGTGAGACTACCTCCGATCTATTCTATACTATTTGCAGGGATTC
TTGGTTTTGGGATAGCAGTGTGCCTAAACTCCTTGTACCTTCATTATTTCGCTTGGCGTA
TTCGTGTTGCAGAGAACTCAAATCCAGTGTGAATACGCCTATATATCCTTTGGTGTGTGC
TTGTATTCTAGAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTGTTTCATCTGATCCAGCAG
TGACATGTAAAATGTATATATATGTCCACTCTTCTTTAAACGTGTTGTAAGTTGTAAAAG
AGAAACTATTGTATCAGGTGAAAAGAGTTTTAATGTATGTGATCTGTTTGCACC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR4CQ79TF 587 0 0
CAGCAGTCAACAGAATATGCAGTCACAAACCGCTAGTGCATGGCAAGAGTTTGTGGTGCT
GGTTCTAATCAGCACAGTCTGTTACTTCTTCTTCCTCGAGCAATTACTAATTCGGGATCT
CAGCACGCAAGCTATCTACATAGCAGGACCATTCTCCTTAACGTTAGGCCTCTTAGCATC
TGTTTTTGCCATTGTCCTAGCTATCAGAGAATACATTTGGACATACGCAGCGCTTGAGTT
TGCGCTTGTAGGCATTTTGGTTCATCTATTATATTCTACAGTGAGACTACCTCCGATCTA
TTCTATACTATTTGCAGGGATTCTTGGTTTTGGGATAGCAGTGTGCCTAAACTCCTTGTA
CCTTCATTATTTCGCTTGGCGTATTCGTGTTGCAGAGAACTCAAATCCAGTGTGAATACG
CCTATATATCCTTTGGTGTGTGCTTGTATTCTAGAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGGTGTTTCATCTGATCCAGCAGTGACATGTAAAATGTATATATATGTCCACTCTTCTTT
AAACGTGTTGTAAGTTGTAAAAGAGAAACTATTGTATCAG
TGAAAGA

QA 1 580 1 580
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8908Contig1 792 2 4 U
GGGATAATTTCCTTCTTTAAATAAAAAGAAAACAGAAAAAAGAGAAAGCGGAATAAATCG
CGTCTCCTTCTTCACTTTGCTTTCTCTGTGAATTTTCCCCGGAGGTTGAAGATTGAGACA
CGTAATCTCCGGATTCGTCGGGAGAGTTGAGAGATCTGAACGAGTCTCGCCTGATCCGAT
GGGAACGATGCAGACATGGCGTAAAGCTTATGGAGCCCTAAAAGACACCACCAAAGTCGG
CCTTGTCCGCGTCAACAGCGATTACGCCGATTTAGACGTTGCCATCGTCAAAGCCACCAA
CCACGTCGAGTGTCCTCCCAAAGATCGTCATCTCAGAAAAATCTTCGCTGCAACAGTAGT
GACTCGTGCTCGAGCAGATGTTGCTTATTGCATTCACGCCCTTTCTCGCCGCTTGCACAA
AACAAGAAACTGGACGGTTGCGGTGAAGACGCTGATTGTGATTCATCGGCTTCTAAGGGA
AGGAGATCCGACGTTTAGGGAGGAGTTACTTAACTTTTCGCAGAGAGGGAGGATTCTGCA
GCTTTCTAATTTCAAGGATGATTCAAGTCCTATTGCTTGGGATTGCTCAGCTTGGGTGCG
TACTTATGCATTGTTTCTTGAGGAGCGGCTTGAGTGCTTCAAGGTTTTGAAATATGATAC
TGAGGCTGAGCGTCTTCCAAAGGCTACCCCAGGGCAGGATAAGGGGTATAGTAGAACCAG
AGATTTAGATGGGGAAGAAATCTTGGTGCAATTGCCAGCTTTGCAGCAGCTTCTGTATCG
TCTCATTGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DE36TF U 1
AF RR4AP22TF U 48
BS 1 364 RR4DE36TF
BS 365 366 RR4AP22TF
BS 367 639 RR4DE36TF
BS 640 792 RR4AP22TF

RD RR4DE36TF 639 0 0
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CGTCTCCTTCTTCACTTTGCTTTCTCTGTGAATTTTCCCCGGAGGTTGAAGATTGAGACA
CGTAATCTCCGGATTCGTCGGGAGAGTTGAGAGATCTGAACGAGTCTCGCCTGATCCGAT
GGGAACGATGCAGACATGGCGTAAAGCTTATGGAGCCCTAAAAGACACCACCAAAGTCGG
CCTTGTCCGCGTCAACAGCGATTACGCCGATTTAGACGTTGCCATCGTCAAAGCCACCAA
CCACGTCGAGTGTCCTCCCAAAGATCGTCATCTCAGAAAAATCTTCGCTGCAACAGTAGT
GACT**TGCTCGAGCAGATGTTGCTTATTGCATTCACGCCCTTTCTCGCCGCTTGCACAA
AACAAGAAACTGGACGGTTGCGGTGAAGACGCTGATTGTGATTCATCGGCTTCTAAGGGA
AGGAGATCCGACGTTTAGGGAGGAGTTACTTAACTTTTCGCAGAGAGGGAGGATTCTGCA
GCTTTCTAATTTCAAGGATGATTCAAGTCCTATTGCTTGGGATTGCTCAGCTTGGGTGCG
TACTTATGCATTGTTTCTTGAGGAGCGGCTTGAGTGCTT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR4AP22TF 745 0 0
GG
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AGATTGAGACACGTAATCTCCGGATTCGTCGGGAGAGTTGAGAGATCTGAACGAGTCTCG
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AAAGCCACCAACCACGTCGAGTGTCCTCCCAAAGATCGTCATCTCAGAAAAATCTTCGCT
GCAACAGTAGTGACTCGTGCTCGAGCAGATGTTGCTTATTGCATTCACGCCCTTTCTCGC
CGCTTGCACAAAACAAGAAACTGGACGGTTGCGGTGAAGACGCTGATTGTGATTCATCGG
CTTCTAAGGGAAGGAGATCCGACGTTTAGGGAGGAGTTACTTAACTTTTCGCAGAGAGGG
AGGATTCTGCAGCTTTCTAATTTCAAGGATGATTCAAGTCCTATTGCTTGGGATTGCTCA
GCTTGGGTGCGTACTTATGCATTGTTTCTTGAGGAGCGGCTTGAGTGCTTCAAGGTTTTG
AAATATGATACTGAGGCTGAGCGTCTTCCAAAGGCTACCCCAGGGCAGGATAAGGGGTAT
AGTAGAACCAGAGATTTAGATGGGGAAGAAATCTTGGTGCAATTGCCAGCTTTGCAGCAG
CTTCTGTATCGTCTCATTGGTTG

QA 3 745 3 745
DS 



AS 1 2

CO CL8909Contig1 510 2 1 U
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AATCTATCTTCGTCTTCAAACGAACAGAAGGCACGTGGCTCACGTGCCTCGGTCTTTGAG
ACGATGTCGAGTAGTGGGGATAGTATAATGGGAGTAGCTTGATGAAGAAGAAAATGTTTT
TAAAGAAAGAAAAGAATCGTTTGATTAATATTGTTAAGACTAAGATCTGATTATGATTTA
ATGTGAGATTGGAGAAAATTACTTTAGGCTAATTAGATACAACTGTTGATTGGACTCGGC
TAAGTTTTAATTAGTGTGTACATGTTTGTATTCCCCTTCTGGGGGAAGGATGTTTGATGC
AGTAAAACAGCAGGTAGTCTTTATGTGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G907JQ C 1
AF RR4G907TF U 1
BS 1 510 RR4G907TF

RD RR4G907JQ 510 0 0
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GACATCACTCCCGACATAGCACTAGGATCCGTCTGTCCGATCCCTCCGTCGCGCAACATG
GCTGATTTGAATCTTAACAAGAAAACAACGGCGGCGCCGGAGATGTTTCCGTTGTCGATG
AATCTATCTTCGTCTTCAAACGAACAGAAGGCACGTGGCTCACGTGCCTCGGTCTTTGAG
ACGATGTCGAGTAGTGGGGATAGTATAATGGGAGTAGCTTGATGAAGAAGAAAATGTTTT
TAAAGAAAGAAAAGAATCGTTTGATTAATATTGTTAAGACTAAGATCTGATTATGATTTA
ATGTGAGATTGGAGAAAATTACTTTAGGCTAATTAGATACAACTGTTGATTGGACTCGGC
TAAGTTTTAATTAGTGTGTACATGTTTGTATTCCCCTTCTGGGGGAAGGATGTTTGATGC
AGTAAAACAGCAGGTAGTCTTTATGTGTCG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR4G907TF 510 0 0
GAGAAGTACTTCCTCCGCCGTACGAACCAGAATCGCCGCCGTCGCAGATCCAGCCTCTTC
GACATCACTCCCGACATAGCACTAGGATCCGTCTGTCCGATCCCTCCGTCGCGCAACATG
GCTGATTTGAATCTTAACAAGAAAACAACGGCGGCGCCGGAGATGTTTCCGTTGTCGATG
AATCTATCTTCGTCTTCAAACGAACAGAAGGCACGTGGCTCACGTGCCTCGGTCTTTGAG
ACGATGTCGAGTAGTGGGGATAGTATAATGGGAGTAGCTTGATGAAGAAGAAAATGTTTT
TAAAGAAAGAAAAGAATCGTTTGATTAATATTGTTAAGACTAAGATCTGATTATGATTTA
ATGTGAGATTGGAGAAAATTACTTTAGGCTAATTAGATACAACTGTTGATTGGACTCGGC
TAAGTTTTAATTAGTGTGTACATGTTTGTATTCCCCTTCTGGGGGAAGGATGTTTGATGC
AGTAAAACAGCAGGTAGTCTTTATGTGTCG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL8910Contig1 659 2 2 U
TTTTTATGACATCAGTTGCTCACTCATTGTTTTTGTCAGCTAACCATTCAGAAATATGGA
GAATTGCTACTTCGATGGACGATCGCAAGTCTGAGATTGAAAACTGGGACTTGGGTGCTG
GGATTTACATGTCTTTCTATTTACTAAAGAGTTCACTGGAAGAAGATGCTGATACAATGC
TGGAACTGGATTCCCCTGAGAGCAGAAACGAGGCGTGCAGAAGTTTTGTCGGTCGTTTAA
ACGAGTCATTGGCTGTTTGGGGTGATAGATTACCAGTTGAAGCCAGAGTCGCATACTCGA
AGATGGCAGAGGAAATCTGCGAGTTGCTTCTGTCAGGTCTGAGTGAGTATCCTGATCGAG
AGTCTCAGCTGAGCTGTTTTATGACAGCCTTCAAAGCTCCTTTACCAGAAGATGTAAGAT
CTTCACATCTGCAAGATGCTGTCTCTCTCTTCTCTCTATATCTCTCGGAGACAGGCCAAA
CACCAGCATAGTGACCCATTCATTTCGTTGAGGAGGGTCTTGTTTTTTTTACTTGTGGTG
AGTGGAACATATTCAGTTTGCTTTGTCGTGTGTACGTTATATTTAGAAGCGTGAATGATT
TTGATTTGTTCTTGTTTAAAAACTTGCCAAAAATCTTATAAATATTATGTGTTCAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4E981TF U 1
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BS 657 659 RR4E981JQ

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CACCAGCATAGTGACCCATTCATTTCGTTGAGGAGGGTCTTGTTTTTTTTACTTGTGGTG
AGTGGAACATATTCAGTTTGCTTTGTCGTGTGTACGTTATATTTAGAAGCGTGAATGATT
TTGATTTGTTCTTGTTTAAAAACTTGCCAAAAATCTTATAAATATTATGTGTTCAG
TC

QA 1 656 1 656
DS 

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GTCTTTCTATTTACTAAAGAGTTCACTGGAAGAAGATGCTGATACAATGCTGGAACTGGA
TTCCCCTGAGAGCAGAAACGAGGCGTGCAGAAGTTTTGTCGGTCGTTTAAACGAGTCATT
GGCTGTTTGGGGTGATAGATTACCAGTTGAAGCCAGAGTCGCATACTCGAAGATGGCAGA
GGAAATCTGCGAGTTGCTTCTGTCAGGTCTGAGTGAGTATCCTGATCGAGAGTTTCAGCT
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GCAAGATGCTGTCTCTCTCTTCTCTCTATATCTCTCGGAGACAGGCCAAACACCAGCATA
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ATTCAGTTTGCTTTGTCGTGTGTACGTTATATTTAGAAGCGTGAATGATTTTGATTTGTT
CTTGTTTAAAAACTTGCCAAAAATCTTATAAATATTATGTGTTCAGGTC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

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TTGAAGCTTTATAATATGTCATGGAAGACCACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCAT
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BQ
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AF RR4CY20JQ C 1
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TTGAAGCTTTATAATATGTCATGGAAGACCACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCAT
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RD RR4CY20TF 679 0 0
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CACAAACAGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGATGATGATGATAACCACCAC
CACCATGATCATGATCATAACCACGAACACTGCGAATCTGGTGAGGCCTCTTCTTCTAAC
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TTGAAGCTTTATAATATGTCATGGAAGACCACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCAT
GATCTTCTCTTCTTCTACTTGACACAGCAACACTGGTTGGGCTTTATTAGTATATGTACA
TGTAATTTGCATATTGCACTGTAATGATATTATTCATTGCAATGCTGATTTAAACTACTT
AAATCTGTAAAGACAATTATGTGAGAGCATCTTTTCAGTTATGATCGTTTAATACTTACT
AAACCAGCTCCTACGTTGG

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL8912Contig1 788 2 2 U
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TCTTCGATTTCCCCTCTTAACACACACGCTCTGTGCTTAGCTTCCTCAGGATCATCTAGG
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GAAACTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BH84TF U 1
AF RR4BH84JQ C 83
BS 1 666 RR4BH84TF
BS 667 788 RR4BH84JQ

RD RR4BH84TF 666 0 0
GGGGATGTCGATTTTCCAGATTAGGGTCGTCTTCTTCGAGATCCTTCGTACGGAGCGCTT
CCTCTTCCACCGTTTTGTTTTTCGATCATTATGAACCTAAGCACAATCACTGTCGACGTC
GCGAATCAACTTCCTGTAACCTTACCTCCAGCTTCCTATATATTGAGATCTTACATGGCA
GGATCACCTAATAGTGGATCATGGAAAGGAGCAATCTCAGCAGCTTCGCTAGCACCAGGA
CCTTCAGCTGATTTCTCTGATTACCCCTTCTAATAGCACCGCAGGGCGATAATAAAACCC
TAGGCATCATCAACCTGTCCGAACTTCAAAAACACATGATTTTGATTCAAATCTTCTACT
CCTAATTTGTGTGTCATTCTCCTATCATCTATCCACGCCGCGTTCTCTCTCTTTCACTCT
TCTTCGATTTCCCCTCTTAACACACACGCTCTGTGCTTAGCTTCCTCAGGATCATCTAGG
AAGATAGCCTGATGGGTCAACAGGAAAAGTCTAGGAACAATCACAGCTCTAAAAAGAAAG
GAATGGGTAGGAAGGGCCAGAAAGGTGGTCGTGATTTTGATGGAGATAGTAACAAGAGGA
ACCAATCCGGTGGTGAAGCCAATGCAAAGGCAGAACAAACCGAATTTGAGCATCAGAATC
AGTTTG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4BH84JQ 706 0 0
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TACCTCCAGCTTCCTATATATTGAGATCTTACATGGCAGGATCACCTAATAGTGGATCAT
GGAAAGGAGCAATCTCAGCAGCTTCGCTAGCACCAGGACCTTCAGCTGATTTCTCTGATT
ACCCCTTCTAATAGCACCGCAGGGCGATAATAAAACCCTAGGCATCATCAACCTGTCCGA
ACTTCAAAAACACATGATTTTGATTCAAATCTTCTACTCCTAATTTGTGTGTCATTCTCC
TATCATCTATCCACGCCGCGTTCTCTCTCTTTCACTCTTCTTCGATTTCCCCTCTTAACA
CACACGCTCTGTGCTTAGCTTCCTCAGGATCATCTAGGAAGATAGCCTGATGGGTCAACA
GGAAAAGTCTAGGAACAATCACAGCTCTAAAAAGAAAGGAATGGGTAGGAAGGGCCAGAA
AGGTGGTCGTGATTTTGATGGAGATAGTAACAAGAGGAACCAATCCGGTGGTGAAGCCAA
TGCAAAGGCAGAACAAACCGAATTTGAGCATCAGAATCAGTTTGTCAGGTAATTGGAGAC
TTTGAATCGGAGGACTAATTAGATTTGTGTAATTTTTTGTTATTTGTACAAAAAGCTTCT
GGATTATGATAAATTTTTGCAGGAAATATATTGATCCAGAAACTTC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL8913Contig1 604 2 2 U
GGATCCAAAGTTGGACGTGCCACCTTCCATCCCCGCTAAACCGGCCTGCTAATACCAAGT
TTTAGAGAGACACATGGTATTCTTCGTTGTCTCAGTGCTATAAAAAGGGTCGTGGCCATC
TGAGAGACTGAGACAAAACGTCACCTCTAAATTTACTCAAACATCTATTCACACATACGC
ACAAGAAGACATAAATTAGAGTGACTTGGATTCCGATGGAGGAAGAGAGACGAAGCGAAG
AAGAAAGCTCTCATCTTTGGAATCCTTTTCAATTCTTTAACGAAGCTATCAAGAGCTTCC
TGAAGTGTCTTGGTCTTCATATCTCCCCTTCTCCTTCGGCATCTTCGGAGGCTCCAAACG
GCGTGGTGACAACAAGGGGAATGATAGTCAGGTCAAAGCAAAGAGGGAGAGAGACACCTA
GCTCTGGAAGGCCAGGCCGCCACAACTAAGGAGTTGATTTGTTCGTTTGCTGCTATCACC
CATACACGTGGAAAACGGATTACAAGTGCATGCAATTTCACGTTCATTCCTAATCATCGT
AAATGTGTATATATTGTTTCTTCTAATTACCGTTTCACTTCATGAAGTTTTTTCATAAGA
TTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RR4CL82JQ C 1
AF RR4CL82TF U 21
BS 1 20 RR4CL82JQ
BS 21 604 RR4CL82TF

RD RR4CL82JQ 604 0 0
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TTTAGAGAGACACATGGTATTCTTCGTTGTCTCAGTGCTATAAAAAGGGTCGTGGCCATC
TGAGAGACTGAGACAAAACGTCACCTCTAAATTTACTCAAACATCTATTCACACATACGC
ACAAGAAGACATAAATTAGAGTGACTTGGATTCCGATGGAGGAAGAGAGACGAAGCGAAG
AAGAAAGCTCTCATCTTTGGAATCCTTTTCAATTCTTTAACGAAGCTATCAAGAGCTTCC
TGAAGTGTCTTGGTCTTCATATCTCCCCTTCTCCTTCGGCATCTTCGGAGGCTCCAAACG
GCGTGGTGACAACAAGGGGAATGATAGTCAGGTCAAAGCAAAGAGGGAGAGAGACACCTA
GCTCTGGAAGGCCAGGCCGCCACAACTAAGGAGTTGATTTGTTCGTTTGCTGCTATCACC
CATACACGTGGAAAACGGATTACAAGTGCATGCAATTTCACGTTCATTCCTAATCATCGT
AAATGTGTATATATTGTTTCTTCTAATTACCGTTTCACTTCATGAAGTTTTTTCATAAGA
TTCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4CL82TF 584 0 0
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TCTTCGTTGTCTCAGTGCTATAAAAAGGGTCGTGGCCATCTGAGAGACTGAGACAAAACG
TCACCTCTAAATTTACTCAAACATCTATTCACACATACGCACAAGAAGACATAAATTAGA
GTGACTTGGATTCCGATGGAGGAAGAGAGACGAAGCGAAGAAGAAAGCTCTCATCTTTGG
AATCCTTTTCAATTCTTTAACGAAGCTATCAAGAGCTTCCTGAAGTGTCTTGGTCTTCAT
ATCTCCCCTTCTCCTTCGGCATCTTCGGAGGCTCCAAACGGCGTGGTGACAACAAGGGGA
ATGATAGTCAGGTCAAAGCAAAGAGGGAGAGAGACACCTAGCTCTGGAAGGCCAGGCCGC
CACAACTAAGGAGTTGATTTGTTCGTTTGCTGCTATCACCCATACACGTGGAAAACGGAT
TACAAGTGCATGCAATTTCACGTTCATTCCTAATCATCGTAAATGTGTATATATTGTTTC
TTCTAATTACCGTTTCACTTCATGAAGTTTTTTCATAAGATTCT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8914Contig1 732 2 2 U
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CGCCAGTTAATTTTAAAAGTATAATGCACATACATTAAACATTAGTGAGCAATATCTAAT
CTGATTAAAAAAATTATAATATATGTTAAAATCATGCTTCTAGACATGTATATTTATATA
TTTCATTTTTAACAAAAAAAAAAATTATTTCACAAAAAATATATCAAAACACTGTTCAGC
TGAGAACGACAAGTTCATCTAGGTAAATAAATTACATTCGAACCCGACCCTATCTTCGCA
AACTCAAGTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ06JQ U 1
AF RR4DV81JQ U 1
BS 1 679 RR4DQ06JQ
BS 680 732 RR4DV81JQ

RD RR4DQ06JQ 679 0 0
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CGCCAGTTAATTTTAAAAGTATAATGCACATACATTAAACATTAGTGAGCAATATCTAAT
CTGATTAAAAAAATTATAATATATGTTAAAATCATGCTTCTAGACATGTATATTTATATA
TTTCATTTTTAACAAAAAAAAAAATTATTTCACAAAAAATATATCAAAACACTGTTCAGC
TGAGAACGACAAGTTCATC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4DV81JQ 732 0 0
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AACAATGTTATTGTAAGTTAACTTTTCAAAACTTGAACTTCTTGTAAAACCTTGACATAT
ACAGACAGCTAATAGGTTAGCCACGTTCGTGTGTTTTCTCAGTTGTCTCCATCCTCTAAG
ATTCCTCAAGTGCTTGTACAAGTACTGTTTGGTTCATCTCATTGGCGATATCTCGTAGAG
GTAATACAGGCTGCAGCCACATTGAGGGAGAGGTGATCAGGTGAAGCTAAGTGCATCCGC
AACATGTCATCAGGTCAAATAGTATTCCGCCTATTTACGTCATTACGTATGCTATGATTG
TTTGCCAAAAACAAAACAAAAAATTATTCCAAGATATATAAAATTGAGTGATTATCTAAA
CGCCAGTTAATTTTAAAAGTATAATGCACATACATTAAACATTAGTGAGCAATATCTAAT
CTGATTAAAAAAATTATAATATATGTTAAAATCATGCTTCTAGACATGTATATTTATATA
TTTCATTTTTAACAAAAAAAAAAATTATTTCACAAAAAATATATCAAAACACTGTTCAGC
TGAGAACGACAAGTTCATCTAGGTAAATAAATTACATTCGAACCCGACCCTATCTTCGCA
AACTCAAGTCTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL8915Contig1 584 2 1 U
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GTAAAGACGAGGATTCTTTTTTTTTTTTTATAACCCCAATAAATTTTCCACGCCTATACT
ATTATATATAATATGAGAAATTGAAAGATTATCTATGTCCAATTTGAATCGATCTCAAAT
TGATCCCTCCTTACTGCTCAGAGGAGAAAGAATAGGTAGGGATGACAGGAGAAGTCTCAG
ATGATCCTATCATTTGAGGATTCGAACCTGTGACATTTTTGACTCAAAACAAAGGCGCTA
CCAAGCTGCGCTACATCCCTTTCAATTGGTCTACGGTCTCATTGTAGAGAATCCCTGCCC
TCTTTTCCACATCCGAGGAACGCCTCCATCGATATCAAATTTCTCTTGCCATTTTTTCTC
TTTGCTTTTGATTTATATACTCATCATAATCCCGCCCCTCCTACAAACGCTAACTTACTT
ATGAGAAAAAAGGCTGATAAATAATCAGCCCTTTGAATTGAATAAGCGAGGCTTTCCCGA
TAGAAATGCTTGCATGCGAGAGAGATCCCAATTCCGTCTATCCG


BQ
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AF RR4B523JQ C 1
AF RR4B523TF U 1
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DS 

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CCAAGCTGCGCTACATCCCTTTCAATTGGTCTACGGTCTCATTGTAGAGAATCCCTGCCC
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ATGAGAAAAAAGGCTGATAAATAATCAGCCCTTTGAATTGAATAAGCGAGGCTTTCCCGA
TAGAAATGCTTGCATGCGAGAGAGATCCCAATTCCGTCTATCCG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

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AAGAGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FV06TF U 1
AF RR4FV06JQ C 308
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QA 1 732 1 732
DS 

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CTGCAAGTGTGAAATGCCTTATAACCCAGACGATCTCATGGTGCAATGTGAAGGCTGCAA
AGACTGGTACCATCCGGGGTGTGTTGGTATGACGATTGAAGAAGCAAAGAAGCTTGATCA
CTTTGTATGTGCTGAATGCAGTTCTGATGACGATGTCAAGAAGTCGCGGAACGGATTTTC
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QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

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AAGCTAATTATCACGAGAACTACAAATTAATTCCAAAAATGAAGTTAATTTCGTTGATGT
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GCTATGATAATATTGATAGTTGCGCCCGGGGCATATTAAGGAACCCGGACAACGGGGTGA
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TATATTTTTAGCAAAAACAAAAATGTATAATCTACTTTGGATTAACTACCATAAATAAGC
TTTTGTTCTTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G

QA 1 601 1 601
DS 



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BQ
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AF RR4BS07TF U 1
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QA 1 828 1 828
DS 



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AAACCATGGACACAGAAACATGGGACAGGGTGATGCATAATTATTCAC


BQ
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AF RR4H206JQ C 1
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QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4H206TF 588 0 0
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ACAACTATAGCAATAAAGAAGAAGTTCAAGGACACGATATCTGAATTCCAAACTTTAAGA
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GATTTAAAGAAGAAACTCCTTGACCTACAACAGGTGTTTCTTGATATGGCAGTGCTGGTG
GATGCACAGGGAGAGATGCTAGACAACATAGAGAATATGGTCTCAAGCGCTGTGGATCAT
GTTCAATCCGGGAACAACCAACTAACAAAGGCACTAAAGAGACAGAAAAGTTCAAGGAAA
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AAACCATGGACACAGAAACATGGGACAGGGTGATGCATAATTATTCAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

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CTCTTAAAGATGAAAACTACAACATATCTTACCGGAGAATACCATTAACCAGAGAAAGAG
ATGCATTAGCTACTGATTTAGATGCGATCCAGTATTGTAAAGACGATTCCGCTGGGGGTT
ACTTGTTTGTATCGCACACCGGTTTTGGAGGAGCTTCTTACGCAATGGCCATTACCTGTC
TCGTGCTTCAACCTGGTCAGAAGCTTACAGCTACACCAAACTCCGATTCTTCTGCCTTAG
GGGAAGATGATTCGCCTTCACGCGCTTGTGATGAAGAAACGTTGAGTATGGGAGATTACC
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ATGGAATAATCCAACAGTGTGCTGGTGCAGGACATTTGAAGGAAGACATTTGTTACTACA
CCAAAGAACTCAACAAGCTTCCTAATACAAAAGATGAAGACCGTTCATACATCATGGACA
TGGGTGTTAAAGCCTTAAAGCGCTACTTTTATCTGATAACATTCAGATCATACCTCTACT
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AAGACCCTCCGACTGATACAGCAGTTTACTCTGATCAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4F903TF U 1
AF RR4F903JQ C 264
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BS 676 676 RR4F903JQ
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BS 757 998 RR4F903JQ

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ATGGAATAATCCAACAGTGTGCTGGTGCAGGACATTTGAAGGAAGACATTTGTTACTACA
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TGGGTGTTAAAGCCT*AAAGCGCTACTTTTATCTGATAACATTCAGATCATACCTCTACT
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QA 1 756 1 756
DS 

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GTTACAGCTTTTAGTATATATATAAGTTGTACAGCTTTGAGCTTTCTCTCCTGTGTTTGG
TCTGTAGAGAGAGATATCTCGTCTCTAAAGTTTGTTTAAGACCCTCCGACTGATACAGCA
GTTTACTCTGATCAA

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

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ATCGGGGAAATACCGTTGCTGTCCATAGCTCGCCACACGATAACCTCCACTTCTTACACT
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BQ
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AF RR4EH08TF C 1
AF RR4EH08JQ U 4
BS 1 3 RR4EH08TF
BS 4 587 RR4EH08JQ

RD RR4EH08TF 587 0 0
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CGAAACAGTCCCAGAACCAAGAGCCCACAAGAGGCGGCTACTAAAACCCACACCGGGGAC
GACAAACTGAAACAGAACCGAAAGCCCACAGGAAGCGGCCACTAAAACCTACACCAGGAC
TACTGAAACAACACTACTGAAACAACGCTTAGAAATAAAACTGAAACCCATATAAACGAC
TACACATAAGTTTTAAACAACCACAACTCAGCAGACTTTCGAACCAAGTAAAAACCAATG
ATCGGGGAAATACCGTTGCTGTCCATAGCTCGCCACACGATAACCTCCACTTCTTACACT
CACACCACGACTTATCGCTGCTGCCTACGCCCGCCAATCGATAACGTCCAATGAACCAAA
AGCCTGAAACTTCTTAACCCGAGAGGAACCAACACATGGTTCACTACCTTCGGATACATG
GATGCGACGCACTCATAACGTCCACTACCATCGAAAGAAGCTCTATCCAAACACCACGAG
AACGAAGTCTTGCCCATCAAACTCTCCAACGAACTCAAGGAAGAGTC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4EH08JQ 584 0 0
CGCAAATTGAAATTTCATTAAAAAGTAAAAACACTCATACACAAACTGTCGGCATAACGA
AACAGTCCCAGAACCAAGAGCCCACAAGAGGCGGCTACTAAAACCCACACCGGGGACGAC
AAACTGAAACAGAACCGAAAGCCCACAGGAAGCGGCCACTAAAACCTACACCAGGACTAC
TGAAACAACACTACTGAAACAACGCTTAGAAATAAAACTGAAACCCATATAAACGACTAC
ACATAAGTTTTAAACAACCACAACTCAGCAGACTTTCGAACCAAGTAAAAACCAATGATC
GGGGAAATACCGTTGCTGTCCATAGCTCGCCACACGATAACCTCCACTTCTTACACTCAC
ACCACGACTTATCGCTGCTGCCTACGCCCGCCAATCGATAACGTCCAATGAACCAAAAGC
CTGAAACTTCTTAACCCGAGAGGAACCAACACATGGTTCACTACCTTCGGATACATGGAT
GCGACGCACTCATAACGTCCACTACCATCGAAAGAAGCTCTATCCAAACACCACGAGAAC
GAAGTCTTGCCCATCAAACTCTCCAACGAACTCAAGGAAGAGTC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8922Contig1 521 2 2 U
GATCGATATATTTACAAACAGATTAAAAACTGTTAAGAGTTTTCGATTATATTAACAAAT
ATATATACGAGGAAAGCTAACAGTTGAATTTATAGCGGTACTAGCAGTTCCCTGGTCGGT
TATACTTTGGAGGCAGAGATGGACACTGTTCATTCATATGCGTATAAGGTTCCATAGTGT
TGTAACCAGGAAGTTCCATTCTATATTTCCCTAGTATCTGACAGTAAGGAAGCTTCACAT
TGTCATTGTCATTGCACCATTTTGGAAGATGGCTTGCATTGTTCTCGAAGAAGTTTAGCA
TGTAAGCATCTTTCAGCGTGAACTCTGTGACTTGAATAGAATTAGCCAATGAGCCGAATA
GGCCAGCTTCTTTGTACATTTCGAGTATGAAAGCGATGCACGAGGTTGATTTACCATCGC
TGTAGATCCAGTCGTCTTGTTCGGGTACAGTCAGTAACTTGTCAAAAGAAGATCCACGTT
TCTCTACTTATACCAGTACATCTGAAAGACCAAGACCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G880TF C 1
AF RR4G880JQ U 40
BS 1 39 RR4G880TF
BS 40 521 RR4G880JQ

RD RR4G880TF 498 0 0
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ATATATACGAGGAAAGCTAACAGTTGAATTTATAGCGGTACTAGCAGTTCCCTGGTCGGT
TATACTTTGGAGGCAGAGATGGACACTGTTCATTCATATGCGTATAAGGTTCCATAGTGT
TGTAACCAGGAAGTTCCATTCTATATTTCCCTAGTATCTGACAGTAAGGAAGCTTCACAT
TGTCATTGTCATTGCACCATTTTGGAAGATGGCTTGCATTGTTCTCGAAGAAGTTTAGCA
TGTAAGCATCTTTCAGCGTGAACTCTGTGACTTGAATAGAATTAGCCAATGAGCCGAATA
GGCCAGCTTCTTTGTACATTTCGAGTATGAAAGCGATGCACGAGGTTGATTTACCATCGC
TGTAGATCCAGTCGTCTTGTTCGGGTACAGTCAGTAACTTGTCAAAAGAAGATCCACGTT
TCTCTACTTATACCAGTA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR4G880JQ 482 0 0
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ACTAGCAGTTCCCTGGTCGGTTATACTTTGGAGGCAGAGATGGACACTGTTCATTCATAT
GCGTATAAGGTTCCATAGTGTTGTAACCAGGAAGTTCCATTCTATATTTCCCTAGTATCT
GACAGTAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCATTGCACCATTTTGGAAGATGGCTTGCAT
TGTTCTCGAAGAAGTTTAGCATGTAAGCATCTTTCAGCGTGAACTCTGTGACTTGAATAG
AATTAGCCAATGAGCCGAATAGGCCAGCTTCTTTGTACATTTCGAGTATGAAAGCGATGC
ACGAGGTTGATTTACCATCGCTGTAGATCCAGTCGTCTTGTTCGGGTACAGTCAGTAACT
TGTCAAAAGAAGATCCACGTTTCTCTACTTATACCAGTACATCTGAAAGACCAAGACCCT
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL8923Contig1 920 2 4 U
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AAGAGGCTTCATTCTCTGCACTGCTGCAGTACCTGGGGGAAGGTGAAGGAAATGAACAAC
GAGCAAAAGAGTCTGGTATGTGCGACGACATCCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAAT
GTGACCGAGTGATCGTGCCATGTCTGAAGACGATTGAGGAGCTCTTGGATGAAAAGATGT
TTCAGAATCAAGAGGCTTATACGTTGAGTTTCTACAAGGGAGTCGTGGATTCGTTAGCCA
TCGAACTCAGAGCGTCAAAGATATTCGCAAAGTTGGAGGCAGGAGTTGTGATACTTGGGT
ATATTGCTTCAGTCTCGGAGCCCATCAGCAAACAAGCCTTCTCTCAGCTTCTATCATTCC
TTGCTCACCGATACCCAAAGATCAGAGAGAAGGCGGCTGAAGAAGCCTGTCTTGCGCTTG
TTCGAAACAAAACCTTAGTAACAGAGGACAAGAGTGAGAGAGTGAAAGATATAATAACTA
CGCCTTGTTGGGAAGCTGGCATGGAACTAACCCAATCTCAGAAGCTGGAGTTGTGTGAAT
TGGCTGGTTTAGAGCATGGAGTAGTGTTCACGACCAGAAGCAGAACGGTGGCTAAGACCA
TCACGGCTTCTGACGAGAATGCGTCTTACTCAGCTCTGGTCGATTCCTCTGGCTTCTGAT
CGATAAAGCATATGCATGCCTTGTCCTCGAGACGATTTTGAATACTATGTTTTTTGTTTT
GTTTCGTTTCCAAGGTGATGAAACTTAGTAAATTAAATTTATTATGATGTAACATTAAAA
ATATATTATGAGGTCAGATGTAATGTGGTGCGCTTAGCGGTTGAGCTTATGTCTTTTGTA
GTTGTGTGGTATAAAAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK43TF U 1
AF RR4DK43JQ C 162
BS 1 704 RR4DK43TF
BS 705 705 RR4DK43JQ
BS 706 754 RR4DK43TF
BS 755 920 RR4DK43JQ

RD RR4DK43TF 754 0 0
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AAGAGGCTTCATTCTCTGCACTGCTGCAGTACCTGGGGGAAGGTGAAGGAAATGAACAAC
GAGCAAAAGAGTCTGGTATGTGCGACGACATCCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAAT
GTGACCGAGTGATCGTGCCATGTCTGAAGACGATTGAGGAGCTCTTGGATGAAAAGATGT
TTCAGAATCAAGAGGCTTATACGTTGAGTTTCTACAAGGGAGTCGTGGATTCGTTAGCCA
TCGAACTCAGAGCGTCAAAGATATTCGCAAAGTTGGAGGCAGGAGTTGTGATACTTGGGT
ATATTGCTTCAGTCTCGGAGCCCATCAGCAAACAAGCCTTCTCTCAGCTTCTATCATTCC
TTGCTCACCGATACCCAAAGATCAGAGAGAAGGCGGCTGAAGAAGCCTGTCTTGCGCTTG
TTCGAAACAAAACCTTAGTAACAGAGGACAAGAGTGAGAGAGTGAAAGATATAATAACTA
CGCCTTGTTGGGAAGCTGGCATGGAACTAACCCAATCTCAGAAGCTGGAGTTGTGTGAAT
TGGCTGGTTTAGAGCATGGAGTAGTGTTCACGACCAGAAGCAGAACGGTGGCTAAGACCA
TCACGGCTTCTGACGAGAATGCGTCTTACTCAGCTCTGGTCGAT*CCTCTGGCTTCTGAT
CGATAAAGCATATGCATGCCTTGTCCTCGAGACG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR4DK43JQ 759 0 0
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CTCTTGGATGAAAAGATGTTTCAGAATCAAGAGGCTTATACGTTGAGTTTCTACAAGGGA
GTCGTGGATTCGTTAGCCATCGAACTCAGAGCGTCAAAGATATTCGCAAAGTTGGAGGCA
GGAGTTGTGATACTTGGGTATATTGCTTCAGTCTCGGAGCCCATCAGCAAACAAGCCTTC
TCTCAGCTTCTATCATTCCTTGCTCACCGATACCCAAAGATCAGAGAGAAGGCGGCTGAA
GAAGCCTGTCTTGCGCTTGTTCGAAACAAAACCTTAGTAACAGAGGACAAGAGTGAGAGA
GTGAAAGATATAATAACTACGCCTTGTTGGGAAGCTGGCATGGAACTAACCCAATCTCAG
AAGCTGGAGTTGTGTGAATTGGCTGGTTTAGAGCATGGAGTAGTGTTCAGGACCAGAAGC
AGAACGGTGGCTAAGACCATCACGGCTTCTGACGAGAATGCGTCTTACTCAGCTCTGGTC
GATTCCTCTGGCTTCTGATCGATAAAGCATATGCATGCCTTGTCCTCGAGACGATTTTGA
ATACTATGTTTTTTGTTTTGTTTCGTTTCCAAGGTGATGAAACTTAGTAAATTAAATTTA
TTATGATGTAACATTAAAAATATATTATGAGGTCAGATGTAATGTGGTGCGCTTAGCGGT
TGAGCTTATGTCTTTTGTAGTTGTGTGGTATAAAAAGAG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL8924Contig1 1309 2 4 U
GGACATCAGATAAAAATAGCAGACTAGTTGACTTAGGGCTTTGTGTCTCCTGCTTACGCA
GTTTTAAGGAGATGAAGACCAAAGAGAGAATCATCGAGGGATAGTTCTATAGTCTACGAC
TCTTTCACCAAATTCTCTTCATTTTTCACAAGTTTTATTGCTCTTTCCACTTTTTAATCC
CTTTTTGTTTTCTTTTCTTGTAAAAGTTATTCTTTGTTCATATCACAGAGGTTTTTGGTC
GGCTAGATTTCTGTTCTTGTAAAGTTCTTTTTTAAAGGCGAACGCCGCATCTTGTCAAAA
TAAACTTAAAAGGGTTTTGTGAGCTATCTTTAATTTTTTTTCCAGATTTATTTACCAACA
TATTTTCTAGGGAAGTTTTCAGATCTAGTCTTTAGATCTCTCCAAAATATCTTTAAGAAA
CCATTTGTTGGCTTTGGATTCATATCCAAGAAGATGGTGAGAGGGAAGATCGAAATCAAA
AGAATCGAGGACATGACTAGCAGACAAGTCACGTTCTCCAAGCGTAGGAAAGGTCTCCTG
AAGAAGGCTCACGAGCTTTCAGTTCTATGTGATGCTCAAGTAGCCGCCATCGTCTTCTCT
CAGACAGGAAGATTATATGATTTCGCTAGCTCCGACATTCAGAAGATGATAGATAGATGT
GAGATACATAGGGGTGAGTATTTTGGAGCGGAGAGACTCCAAAAACAACAATATGTGCGA
GAGCTCAAGAACGAAATGGCGATAAAGGTGGACAAGATTGAAATTCTTCAACTTCATTGC
CGGAAGCTGATGGGACAAGATTTGGATTCGTGTTCGGTGGAGGAACTCAAGGAGATAACT
ACCAAAATTGAGAAAAGTCTTACTATTGTCAGATCAAGGAAGGCTAAGTTAAATGAAGAT
AACATAGAGAAACTAAAAGCAGAGATTGTAGCAGAGAGAGAGGGCTTGAACGAGAGAAGC
AGGCTGCGCCAAATGGAAAGTAATATGTTATCATTTCAGTTTCAAGAACAACCCTTGTGG
ATGCAGTCAAGGAGCCTAGAGAGTGAGAAGAATGCACATTCCTGTAGTAGTGGAAACATG
GACTTGTCTGATGTGGAAACTGACTTGTCCATCGGATTTCCTCAAAATCGAGTGTAATCA
ACAGGGTTCTTGTTATTATCAGGAGATGTATATATTTCTATTTCTGAATGTTTGAATCGA
TTCTCTCTATGAATGCATCAATAAATATAGTTTGAATCGATTCTCTCTATGAATGCATCA
ATAAATATAGTCGTGTAAATTGTTAAGTATTCTCTACGATATTGCTTTA


BQ
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DS 

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CTTGTCTGATGTGGAAACTGACTTGTCCATCGGATTTCCTCAAAATCGAGTGTAATCAAC
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CTCTCTATGAATGCATCAATAAATATAGTTTGAATCGATTCTCTCTATGAATGCATCAAT
AAATATAGTCGTGTAAATTGTTAAGTATTCTCTACGATATTGCTTTA

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DS 



AS 1 2

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TCCTTT


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10 10 10 10 10 10 

AF RR4EQ16TF U 1
AF RR4BB85TF U 448
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BS 476 476 RR4BB85TF
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AATGCGAGGGTTTTACAGCAGTCACCCCGAGCTTTCAGAAGGAACAACACTTACCGTTCA
GGTTCTTACAACTGGTTCTTGGCCCACACAGCCTGCAGTACCTTGTAATCTCCCAGCTGA
AGTCTCGGTTCTCTGTGAGAAGTTCCGTTCTTACTACCTCGGAACCCATACCGGTAGAAG
ATTGTCATGGCAGACTAACATGGGCACAGCCGATATCAAAGCCGTATTTGGGAAGGGTCA
GAAACACGAACTGAACGTGTCCACTTTCCAGATGTGTGTCCTCATGCTCTTCAACGACTC
TGACCGTCTCAGCTACAAGGAGATCGAGCAGGCTACTGAAATCCCGGCACCAGAGCTTAA
ACGCTGCTTGCAGTCGCTTGCGTGTGTGAAAG*CAAAAACGTTATAAAGAAAGAACCAAT
GAGCAAAGAC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4BB85TF 639 0 0
G
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CTGGCTACTGAAATCCCGGCACCAGAGCTTAAACGCTGCTTGCAGTCGCTTGCGTGTGTG
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TTTGTTGTGAACGACAAGTTCACGAGCAAGTTTTACAAATTGAAGATATGAACGGTGGTG
GCGCAGAAGGAGACGGAACCGGAGAAGCAAGAGACGAGACAGAGAGTAGAGGAAGACAGG
AAGCCTCAGATCGAAGCAGCGATTGTGAGGATCATGAAGTCGAGAAAGATGCTGGACCAT
AACAACATAATAGCAGAAGTGACGAAACAGTTGCAGCCACGGTTCTTGGCTAACCCGACG
GAGATAAAGAAGAGGATCGAGTCGCTCATTGAACGTGATTTCTTGGAAAGGGATAATACG
GACCGGAAACTTTACCGCTATTTAGCTTGATAAGTTGTATACAACAACAAAAAGACCTCC
TCTTTGTTTTATTTGCTTTGTTTTTTTTTTTTCTGTTGGTGTAAAAGCGAACGAACACCG
TATTGATGACGTTAGTCAAATATACATTTGTTTCCTTT

QA 2 639 2 639
DS 



AS 1 2

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GACTCCTCCTTCAGAGAAGCTTTTACGGATGCGATCATCTGTAACACGAAAATTCAGCAC
TTATGCATTGCCAACACCTGTGGAATCAGTTAAAAGTCCCTCATCTGTTACAAGTCTAGG
TAACAACAAGAGCATGGCTTCATCTAATCCTGCAAAGCCAATAGCAAAAAACATTTGGTA
TTCATCCCCACTGGAAACTCGTGGACCTGCAAAGGTTTCCTCCAGACCAATGACAGGCTT
GAAAGAACAAGTTCTGAGAGAGAGTAACAAGAATACATCTTCTCGGTTGCCTCGGCCTTC
GACAGATGGACTCTTGTACTCTCGTATCGGATCACTCAAGAGACGATCCTTTTCTGGTCC
AATTACAAGTAAACCGTTGCCTAACAAGCCTCTCTCTTCAACGCCTCGTTTATACTCGGG
TCCAATCCCAAGGAGTCCAGTCTCCAAGTTACCGAAAGTGTCAACATCGTCTCCAACCGC
TTCCCCTACATTTGTCTCAACCCCGAAAATAAGCGAGCTCCATGAGCTTCCTAGACCACC
ACCACCACCACCAAGCAGCTCTGCTAAGTCTTCGAGGGCATTTGGATATTCAGCACCTCT
GGTTTCAAAGAGCCAATTGCTTAGTAAACCTATTATTTCAACTCCACCATCTCCTCTCCC
AATACCACCCGCAATCACTCGTAGCTTCTCTATACCTACTGGCAACCTTAGAGGAACAGA
GTTAGATATGTCTAAGATGAGTCTGGGTGCTAATAAGTTAAGCACTGCCTCCCCTCCTTT
AACCCCGATGTCATTGGTCCATCCACCTCCATCTGCTATTACGGAGCACGCAGAGCACCT
AGCCATGTCCAAACAAGAGAGGAGGACTTGAAGGTGTAAGTTGTTTGTAGCTCTGCCTAA
AAGCTTGTAGGAGGAGGACGACATTCCCTCTAGTTGCAGATATGTAAATATCTCTCCTGT
TTTGTTCTGACAATGCTGAAGAAAAAAAGAAAGAGAGCCAAACAGTGATAAGGAATTGCC
AAGTAATTTTGATTTTTTTTTATAAATCATTCACAGTGGTTTATAACATTACGATTATTT
ATTGAAGTTATTTATAACATCG


BQ
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AF RR4DS56TF U 1
AF RR4DS56JQ C 278
BS 1 738 RR4DS56TF
BS 739 1102 RR4DS56JQ

RD RR4DS56TF 738 0 0
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TTATGCATTGCCAACACCTGTGGAATCAGTTAAAAGTCCCTCATCTGTTACAAGTCTAGG
TAACAACAAGAGCATGGCTTCATCTAATCCTGCAAAGCCAATAGCAAAAAACATTTGGTA
TTCATCCCCACTGGAAACTCGTGGACCTGCAAAGGTTTCCTCCAGACCAATGACAGGCTT
GAAAGAACAAGTTCTGAGAGAGAGTAACAAGAATACATCTTCTCGGTTGCCTCGGCCTTC
GACAGATGGACTCTTGTACTCTCGTATCGGATCACTCAAGAGACGATCCTTTTCTGGTCC
AATTACAAGTAAACCGTTGCCTAACAAGCCTCTCTCTTCAACGCCTCGTTTATACTCGGG
TCCAATCCCAAGGAGTCCAGTCTCCAAGTTACCGAAAGTGTCAACATCGTCTCCAACCGC
TTCCCCTACATTTGTCTCAACCCCGAAAATAAGCGAGCTCCATGAGCTTCCTAGACCACC
ACCACCACCACCAAGCAGCTCTGCTAAGTCTTCGAGGGCATTTGGATATTCAGCACCTCT
GGTTTCAAAGAGCCAATTGCTTAGTAAACCTATTATTTCAACTCCACCATCTCCTCTCCC
AATACCACCCGCAATCACTCGTAGCTTCTCTATACCTACTGGCAACCTTAGAGGAACAGA
GTTAGATATGTCTAAGAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4DS56JQ 825 0 0
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AAGAGACGATCCTTTTCTGGTCCAATTACAAGTAAACCGTTGCCTAACAAGCCTCTCTCT
TCAACGCCTCGTTTATACTCGGGTCCAATCCCAAGGAGTCCAGTCTCCAAGTTACCGAAA
GTGTCAACATCGTCTCCAACCGCTTCCCCTACATTTGTCTCAACCCCGAAAATAAGCGAG
CTCCATGAGCTTCCTAGACCACCACCACCACCACCAAGCAGCTCTGCTAAGTCTTCGAGG
GCATTTGGATATTCAGCACCTCTGGTTTCAAAGAGCCAATTGCTTAGTAAACCTATTATT
TCAACTCCACCATCTCCTCTCCCAATACCACCCGCAATCACTCGTAGCTTCTCTATACCT
ACTGGCAACCTTAGAGGAACAGAGTTAGATATGTCTAAGATGAGTCTGGGTGCTAATAAG
TTAAGCACTGCCTCCCCTCCTTTAACCCCGATGTCATTGGTCCATCCACCTCCATCTGCT
ATTACGGAGCACGCAGAGCACCTAGCCATGTCCAAACAAGAGAGGAGGACTTGAAGGTGT
AAGTTGTTTGTAGCTCTGCCTAAAAGCTTGTAGGAGGAGGACGACATTCCCTCTAGTTGC
AGATATGTAAATATCTCTCCTGTTTTGTTCTGACAATGCTGAAGAAAAAAAGAAAGAGAG
CCAAACAGTGATAAGGAATTGCCAAGTAATTTTGATTTTTTTTTATAAATCATTCACAGT
GGTTTATAACATTACGATTATTTATTGAAGTTATTTATAACATCG

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

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GGACACAAACAGTAAAATAAAAAGAAAAACAGAGTCAGAAGGGGCTTAAGCCATCCTTAC
AAGCCTCTCCTACTCTGTTTTTTTTTCTTGTATTTTTACAGTTTACAATAAAACATTAAC
TTAAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAATTGTGAAGTTTGATAAA
AAAAAGAAGAAAAAATGGGCTTCGATAAAGGAAACAAGAAGAAGAAATGCATCATCGCTG
GGGTTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAAC
ATGCCCGTACTTGTAATCACAAAAAAGCCGACGCGAATATTAAAATGACCAGCAAGGCAG
TCGAAGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCAACAGCTTCGTGAAAG
CTTCTCCTAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCTTCAACATCACCATTC
AATCCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCCTCTGTAGAGCTCAAAGCCAAGGCAGATGATG
AGACCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGGTTATGAATGACGCTATAGATGATCTGA
CCAAGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAAATTGAGAAATTCGTCGATG
ATCTTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCAACAGACATGCATGGATGCTTTTG
AGGAAGTTAAGTCAACCCTTGCAGAAGACATGAAAAACATCTTCAAACCATCCAAAGAAC
TCACCAGTAACAGTCTTGCAATGATTACCAGTATGTCCAGCATGTTTGGAAAGTCAACAT
CACAGAGCGACCGGGGATCTGGAAACACT


BQ
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AF RR4A926TF U 1
AF RR4AA18TF U 161
BS 1 843 RR4A926TF
BS 844 869 RR4AA18TF

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TTAAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAATTGTGAAGTTTGATAAA
AAAAAGAAGAAAAAATGGGCTTCGATAAAGGAAACAAGAAGAAGAAATGCATCATCGCTG
GGGTTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAAC
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CCAAGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAAATTGAGAAATTCGTCGATG
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TCACCAGTAACAGTCTTGCAATGATTACCAGTATGTCCAGCATGTTTGGAAAGTCAACAT
CAC

QA 1 843 1 843
DS 

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TAAAATGACCAGCAAGGCAGTCGAAGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATG
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CAAAGCCAAGGCAGATGATGAGACCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGGTTATGAA
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AATTGAGAAATTCGTCGATGATCTTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCAACA
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CTTCAAACCATCCAAAGAACTCACCAGTAACAGTCTTGCAATGATTACCAGTATGTCCAG
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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCCTGTTTATTTGACCCTGGGGAAAAGACTTCTGTGGAGGGTCCTGT


BQ
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AF RR4CG58TF U 1
AF RR4CG58JQ C 50
BS 1 633 RR4CG58TF
BS 634 707 RR4CG58JQ

RD RR4CG58TF 633 0 0
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ACAGATGAAGCTTGATACAAATGCTTTGAAACTTCCATTCCTACGATTGGCAAAAATATG
CTTGATGATTTTTCTATTCTATCCTCCATTGATGAGATTCTTTTGTGTTCATCCGCTAAG
CAGTATGTGTTGTTGATTTTAGTTTTTTTTCTGGGTTTCAGTTTGATGAGTTTAGTAAGA
AGCTGTACAGATTGTGAAGCCTGCGGAAGGAACAACCACACCCGCTTTTTTCTTTTGAGG
TGTCATGGTCGCTGCTGATTTTCGGGCTAGGAGAGGAGGCGAATCAATCGAGATGAAGGA
GAAGATTGATGTCAATAAGAAGCCAATGACTAAGATCCCAACACTTGATTTTGCTAAGAT
CCCAATTTCTTTCATTGTATGGTTTTGTTCGTGCTTCCAGTGTCTGGGTTTCTTCTTGCG
TATTGGATATTTTAAGGAAGCCAAACATTGACCCTGTTGTCTGTATTTGTGGATTTGGCT
CAGTTTAATCGTATTTGAGTCTTGATAACCTGA

QA 1 633 1 633
DS 

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CATCCGCTAAGCAGTATGTGTTGTTGATTTTAGTTTTTTTTCTGGGTTTCAGTTTGATGA
GTTTAGTAAGAAGCTGTACAGATTGTGAAGCCTGCGGAAGGAACAACCACACCCGCTTTT
TTCTTTTGAGGTGTCATGGTCGCTGCTGATTTTCGGGCTAGGAGAGGAGGCGAATCAATC
GAGATGAAGGAGAAGATTGATGTCAATAAGAAGCCAATGACTAAGATCCCAACACTTGAT
TTTGCTAAGATCCCAATTTCTTTCATTGTATGGTTTTGTTCGTGCTTCCAGTGTCTGGGT
TTCTTCTTGCGTATTGGATATTTTAAGGAAGCCAAACATTGACCCTGTTGTCTGTATTTG
TGGATTTGGCTCAGTTTAATCGTATTTGAGTCTTGATAACCTGAAAAGGCCGCCATCACA
TTGGTGCTTCTGCCTGTTTATTTGACCCTGGGGAAAAGACTTCTGTGGAGGGTCCTGT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL8930Contig1 828 2 4 U
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ACCTCTCGAGATCCGTCGCATTGATCTCACTATTTCTTCTCCCATTGCTCAGCTTCTCTT
TCTCCGTCGACAATCCGACGGATCGGCGGGTTCTGGTTCTTCTCGACGATCTATCACTCA
AATCCTCTCATTCCATCTTCTTCAACACTCTCAAATCCCGCGGATTCGATCTCGATTTCA
AGCTAGCGGAAGATTCGAAGCTCGCGCTTCAACGGTACGGCCAGTACTTGTACGACGGGC
TCATCATTTTCGCCCCGTCCACAGAGCGGCTTGGAGGATCGTTGGATTCGAAATCGATAG
CTGATTTCGTTGATTCGGGTCGGGACTTGATCTTATCGGCGGATACTTCTGCTTCTGATC
TGATTCGGGGGATTGCCTTGGAGTGTGGGGTTGATTTTGACGAGGATTCTTCGGCTATGG
TTATTGATCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGATGTTGATGGAGACCATACCTTGATTGCTG
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TCTTCAGAGGGGTTGCACATTCATTGAACCCTACTAACAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AJ25TF U 1
AF RR4BH53TF U 34
BS 1 274 RR4AJ25TF
BS 275 275 RR4BH53TF
BS 276 814 RR4AJ25TF
BS 815 828 RR4BH53TF

RD RR4AJ25TF 814 0 0
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ATACTAGTGGGTCACTCGTTTCTATACCCGTGAAAAAACCCTATCTCGCAAATATGACGA
ACCTCTCGAGATCCGTCGCATTGATCTCACTATTTCTTCTCCCATTGCTCAGCTTCTCTT
TCTCCGTCGACAATCCGACGGATCGGCGGGTTCTGGTTCTTCTCGACGATCTATCACTCA
AATCCTCTCATTCCATCTTCTTCAACACTCTCAA*TCCCGCGGATTCGATCTCGATTTCA
AGCTAGCGGAAGATTCGAAGCTCGCGCTTCAACGGTACGGCCAGTACTTGTACGACGGGC
TCATCATTTTCGCCCCGTCCACAGAGCGGCTTGGAGGATCGTTGGATTCGAAATCGATAG
CTGATTTCGTTGATTCGGGTCGGGACTTGATCTTATCGGCGGATACTTCTGCTTCTGATC
TGATTCGGGGGATTGCCTTGGAGTGTGGGGTTGATTTTGACGAGGATTCTTCGGCTATGG
TTATTGATCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGATGTTGATGGAGACCATACCTTGATTGCTG
CTGACGATTTAGTTAAATCAAATGTCATTCTAGGAAAAACCAAGATTGAGGCTCCTGTGC
TCTTCAGAGGGGTTGCACATTCATTGAACCCTACTAACAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTT
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TAACTGGGTCTGCTATTTCGCTAGTTTCGGTCAT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR4BH53TF 795 0 0
GG
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AAACCCTATCTCGCAAATATGACGAACCTCTCGAGATCCGTCGCATTGATCTCACTATTT
CTTCTCCCATTGCTCAGCTTCTCTTTCTCCGTCGACAATCCGACGGATCGGCGGGTTCTG
GTTCTTCTCGACGATCTATCACTCAAATCCTCTCATTCCATCTTCTTCAACACTCTCAAA
TCCCGCGGATTCGATCTCGATTTCAAGCTGGCGGAAGATTCGAAGCTCGCGCTTCAACGG
TACGGCCAGTACTTGTACGACGGGCTCATCATTTTCGCCCCGTCCACAGAGCGGCTTGGA
GGATCGTTGGATTCGAAATCGATAGCTGATTTCGTTGATTCGGGTCGGGACTTGATCTTA
TCGGCGGATACTTCTGCTTCTGATCTGATTCGGGGGATTGCCTTGGAGTGTGGGGTTGAT
TTTGACGAGGATTCTTCGGCTATGGTTATTGATCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGATGTT
GATGGAGACCATACCTTGATTGCTGCTGACGATTTAGTTAAATCAAATGTCATTCTAGGA
AAAACCAAGATTGAGGCTCCTGTGCTCTTCAGAGGGGTTGCACATTCATTGAACCCTACT
AACAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTTCAGCTTCTCCCTCAGCTTATTCTGCTAACCCGAGC
TCGAAGTTGTCGAGTCCCC*TCAGCTAACTGGGTCTGCTATTTCGCTAGTTTCGGTCATG
CAGCCAGACATGC

QA 3 795 3 795
DS 



AS 1 2

CO CL8931Contig1 780 2 5 U
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GATGCTGAGGATGCGATCCGAGCGCTTGATCGCTATGAGTATGGCCGTAAGGGACGCAGA
CTCCGTGTTGAGTAGCCCAGAGAACGGAGCTGTGAGGGACCGTAGTCCAAGAAACGGACG
TGGTGAAAGCAGGAGTCCTCCTCCGTATGAGAAGAGGAGGGAGGGGGAGAGGTCAAGGTC
GAAGTCTAGCCCTGAGAATGGTCAAGTCGAAAGCCCTGGACCGATAATGGAAGAAGAAGA
AGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGAGAGCCACTCTCGTTCGCC
TCCAGCAGAAGAATGATCGGACTTGTCCGTGTATGACCGAGCAGATGATGTCTCTCTCGC
GGAGTAGCTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTTTAGTTACTAGTGTGCTCTT
TCGAGTCTTTGTTCAAGTGCTTTTGCAAACTTCATTTACATTTTGTTTCCAACACATTCG
AATTCGATTATTGTAGTATTGGTTAAAACTGCACTTTTACTTCGGATCATGATTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G131TF U 1
AF RR4G131JQ C 93
BS 1 711 RR4G131TF
BS 712 712 RR4G131JQ
BS 713 747 RR4G131TF
BS 748 748 RR4G131JQ
BS 749 780 RR4G131TF

RD RR4G131TF 780 0 0
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GGGAACTTTGAGTATGATGCTCGTGAAGGTGATCTTGAGAGGCTTTTCAGAAGATACGGC
AAGGTCGACAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTTTTGTCTATATGGAAAACGAAAGG
GATGCTGAGGATGCGATCCGAGCGCTTGATCGCTATGAGTATGGCCGTAAGGGACGCAGA
CTCCGTGTTGAGTAGCCCAGAGAACGGAGCTGTGAGGGACCGTAGTCCAAGAAACGGACG
TGGTGAAAGCAGGAGTCCTCCTCCGTATGAGAAGAGGAGGGAGGGGGAGAGGTCAAGGTC
GAAGTCTAGCCCTGAGAATGGTCAAGTCGAAAGCCCTGGACCGATAATGGAAGAAGAAGA
AGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGAGAGCCACTCTCGTTCGCC
TCCAGCAGAAGAATGATCGGACTTGTCCGTGTATGACCGAGCAGATGATGTCTCTCTCGC
GGAGTAGCTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTTTAGTTACTAGTGTGCTCTT
TCGAGTCTTTGTTCAAGTGCTTTTGCAAACTTCATTTACATTTTGTTTCCA*CACATTCG
AATTCGATTATTGTAGTATTGGTTAAA*CTGCACTTTTACTTCGGATCATGATTTCTCTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4G131JQ 688 0 0
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TCTTGAGAGGCTTTTCAGAAGATACGGCAAGGTCGACAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTT
TGCTTTTGTCTATATGGAAAACGAAAGGGATGCTGAGGATGCGATCCGAGCGCTTGATCG
CTATGAGTATGGCCGTAAGGGACGCAGACTCCGTGTTGAGTAGCCCAGAGAACGGAGCTG
TGAGGGACCGTAGTCCAAGAAACGGACGTGGTGAAAGCAGGAGTCCTCCTCCGTATGAGA
AGAGGAGGGAGGGGGAGAGGTCAAGGTCGAAGTCTAGCCCTGAGAATGGTCAAGTCGAAA
GCCCTGGACCGATAATGGAAGAAGAAGAAGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCAGAAAGCC
CGATACGCGAGAGCCACTCTCGTTCGCCTCCAGCAGAAGAATGATCGGACTTGTCCGTGT
ATGACCGAGCAGATGATGTCTCTCTCGCGGAGTAGCTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGA
TGTTATGTTTAGTTACTAGTGTGCTCTTTCGAGTCTTTGTTCAAGTGCTTTTGCAAACTT
CATTTACATTTTGTTTCCAACACATTCGAATTCGATTATTGTAGTATTGGTTAAAACTGC
ACTTTTACTTCGGATCATGATTTCTCTC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL8932Contig1 636 2 2 U
GGAAGCTGTTTATATATAAACACAAACCTCTATTATCAGGCTTGAATTTAACAAAAAAAA
AAAAACTAACCTTTCTCTCCAACAATGTCTGTGGTCATAAAGTTCTTCATCCTCTTCCTT
TTGGTTGATATATCCACCGCATATTATAGGCCAGCTGATCGGACCTCCGAGGACAAAAAA
GGAATCGGTCTAAATAAGTCAGAGATTGACTATTTCAGTATTTTTAGAGACACAGTTCGA
GGATGGGGAAGAGAAGTAGATGCAAAATACTCGATGTCGGCATCTACCGATTACATGGCC
CGGTCATTATTCCTACAAGACAAAGTTCGACGTTATGTTCAGCTTTGGGGAGAGTGGAAG
AATCATACGGGATACCCATACGTCGACTTGCATAAGAAAATTTATGGTGACTTTTGGCCA
GTAGAATATATTGATTGCCGTCGAACTGAGGGTATAGATCTCTTGATGTATCTTTTATAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH77TF U 1
AF RR4CH77JQ C 23
BS 1 282 RR4CH77TF
BS 283 636 RR4CH77JQ

RD RR4CH77TF 282 0 0
GGAAGCTGTTTATATATAAACACAAACCTCTATTATCAGGCTTGAATTTAACAAAAAAAA
AAAAACTAACCTTTCTCTCCAACAATGTCTGTGGTCATAAAGTTCTTCATCCTCTTCCTT
TTGGTTGATATATCCACCGCATATTATAGGCCAGCTGATCGGACCTCCGAGGACAAAAAA
GGAATCGGTCTAAATAAGTCAGAGATTGACTATTTCAGTATTTTTAGAGACACAGTTCGA
GGATGGGGAAGAGAAGTAGATGCAAAATACTCGATGTCGGCA

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4CH77JQ 614 0 0
CAAACCTCTATTATCAGGCTTGAATTTAACAAAAAAAAAAAAACTAACCTTTCTCTCCAA
CAATGTCTGTGGTCATAAAGTTCTTCATCCTCTTCCTTTTGGTTGATATATCCACCGCAT
ATTATAGGCCAGCTGATCGGACCTCCGAGGACAAAAAAGGAATCGGTTTAAATAAGTCAG
AGATTGACTATTTCAGTATTTTTAGAGACACAGTTCGAGGATGGGGAAGAGAAGTAGATG
CAAAATACTCGATGTCGGCATCTACCGATTACATGGCCCGGTCATTATTCCTACAAGACA
AAGTTCGACGTTATGTTCAGCTTTGGGGAGAGTGGAAGAATCATACGGGATACCCATACG
TCGACTTGCATAAGAAAATTTATGGTGACTTTTGGCCAGTAGAATATATTGATTGCCGTC
GAACTGAGGGTATAGATCTCTTGATGTATCTTTTATATGGCCTTAGTGCAGAATCGGGCA
TGGTTTAGTTGTTTTCTTTTTTGCTTTCGGTTTCAGAATTGTTTTTGTAATTCATTTCTT
TTTCTTGTTTTGGTTTGACTCTTGTTGGAGCTTTTCTTTTCTGTTAAAACTATTATTTTA
CTGATATCTTTTGG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL8933Contig1 909 2 6 U
GGACTTGAACTGAAAGCATGGAGAGATCCAAGTTGACGTAATTGTGCGGAAGAAGCGCGA
GATCTGATACCTCAAGTAGCAAAGCAGAGATTAGACAATGGATAAGATGAATCATGCATT
TGAGAAGATGAAGATGATGGTGGGGATGGAGGTTGAAGAGGAGCAACGAGCTGCGGAGGA
GGAGGACAGCTCGCTCTCTTTCATGGATGATCTTAATCGCGATTGCGCTTTAACCACCAA
GCAGAGATTCTGTGGCTTTGCTATTTGCTTGTCAGCAGGATTGACCTGTACACTTTTGTC
AATGCTTGTTTTCTTCAATCCGGTCAAGTTTGGCGTCACATTCACTCTGGGAAATTTGAT
GGCACTTGGGAGCACAGCATTCCTTATAGGCCCACAGAGGCAGGTGACGATGATGCTTGA
TCCAGCTCGTATCTACGCTACTGCTCTGTATTTAGCAAGCATTGTCATTGCCTTGTTTTG
CGCTCTCTATGTTCGTAACAAGCTGCTGACTCTGCTGGCTATCATTCTTGAGTTCTCTGG
TCTTATTTGGTATAGCTTAAGCTACATCCCTTTTCAAGAACCATGGTTTCAAAGGTCTTC
ATGACTTGTTTTGACACCGAGTTTTAAGCACGCCCTATACAGATCTACTCAAAAGATTTT
TCATTGCGAAACCACTGTGCTCTGATGAATGATTGGTCTATGTTCAAAGCTGGGCCCTGT
TTGAAGAAAGTTGAAAGCGCTAGTGGTCCATCCCCTATGGCTTGGCTTTGGAGCACGCTT
TGGTTTCTGTTTGCTTCTTAACATGAAGTTCCCGTCGTCACAAGTCTTAGCCGAGTTTTT
TTTGTATATTTTGATGTGGAATAAAGTTATAGTAACCAGCAAGGTATTAATATTTCAGAC
ATTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN50TF U 1
AF RR4EN50JQ C 48
BS 1 653 RR4EN50TF
BS 654 654 RR4EN50JQ
BS 655 724 RR4EN50TF
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BS 759 909 RR4EN50JQ

RD RR4EN50TF 758 0 0
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TGAGAAGATGAAGATGATGGTGGGGATGGAGGTTGAAGAGGAGCAACGAGCTGCGGAGGA
GGAGGACAGCTCGCTCTCTTTCATGGATGATCTTAATCGCGATTGCGCTTTAACCACCAA
GCAGAGATTCTGTGGCTTTGCTATTTGCTTGTCAGCAGGATTGACCTGTACACTTTTGTC
AATGCTTGTTTTCTTCAATCCGGTCAAGTTTGGCGTCACATTCACTCTGGGAAATTTGAT
GGCACTTGGGAGCACAGCATTCCTTATAGGCCCACAGAGGCAGGTGACGATGATGCTTGA
TCCAGCTCGTATCTACGCTACTGCTCTGTATTTAGCAAGCATTGTCATTGCCTTGTTTTG
CGCTCTCTATGTTCGTAACAAGCTGCTGACTCTGCTGGCTATCATTCTTGAGTTCTCTGG
TCTTATTTGGTATAGCTTAAGCTACATCCCTTTTCAAGAACCATGGTTTCAAAGGTCTTC
ATGACTTGTTTTGACACCGAGTTTTAAGCACGCCCTATACAGATCTACTCAAA*GATTTT
TCATTGCGAAACCACTGTGCTCTGATGAATGATTGGTCTATGTTCAAAGCTGGGCCCTGT
TTGA*GAAAGTTGAAAGCGCTAGTGGTCCATCCCCTAT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR4EN50JQ 862 0 0
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ATGCATT*GAGAAGATGAAGATGATGGTGGGGATGGAGGTTGAAGAGGAGCAACGAGCTG
CGGAGGAGGAGGACAGCTCGCTCTCTTTCATGGATGATCTTAATCGCGATTGCGCTTTAA
CCACCAAGCAGAGATTCTGTGGCTTTGCTATTTGCTTGTCAGCAGGATTGACCTGTACAC
TTTTGTCAATGCTTGTTTTCTTCAATCCGGTCAAGTTTGGCGTCACATTCACTCTGGGAA
ATTTGATGGCACTTGGGAGCACAGCATTCCTTATAGGCCCACAGAGGCAGGTGACGATGA
TGCTTGATCCAGCTCGTATTTACGCTACTGCTCTGTATTTAGCAAGCATTGTCATTGCCT
TGTTTTGCGCTCTCTATGTTCGTAACAAGCTGCTGACTCTGCTGGCTATCATTCTTGAGT
TCTCTGGTCTTATTTGGTATAGCTTAAGCTACATCCCTTTTCAAGAACCATGGTTTCAAA
GGTCTTCATGACTTGTTTTGACACCGAGTTTTAAGCAGGCCCTATACAGATCTACTCAAA
AGATTTTTCATTGCGAAACCACTGTGCTCTGATGAATGATTGGTCTATGTTCAAAGCTGG
GCCCTGTTTGAAGAAAGTTGAAAGCGCTAGTGGTCCATCCCCTATGGCTTGGCTTTGGAG
CACGCTTTGGTTTCTGTTTGCTTCTTAACATGAAGTTCCCGTCGTCACAAGTCTTAGCCG
AGTTTTTTTTGTATATTTTGATGTGGAATAAAGTTATAGTAACCAGCAAGGTATTAATAT
TTCAGACATTTTGATC

QA 7 862 7 862
DS 



AS 1 2

CO CL8934Contig1 942 2 2 U
GGAGGCGAAGAAGGGGGGGAAGGATAAGGAGGCTATGAGGAGAGCTGAGAAGGAGAGGCT
TAAAGAAGGTGAAGCAGCTGATGAGGCGCAGAAGAAGCTCAAGAAGAAAGCACCTTGTAA
TGGGAATGGGAATGGGAATGGGAAGGAGGCTTCTTCTAGTGTGTCCAAGAATCATGCTTC
TGATGAGGATGACATCAGCCCAAAGCATGATGAGGTGGATGGTGATGAGGATGAAGACGA
TGGTATCCAGTGGCAAACCGACACTTCTAGAGAAGCTGCTGAGAAAAGAATGAAGGAACA
GTTGAGTGCTGTAACTGCCGAAATGGTGATGCTCTCTGTAGAAGAAGAGGAGGAGCCTAA
GAATCTCGTGAAGGTGATGAAAGAGTATCTGATGAAAGATTCACCGATGATCGAGCTCAA
AACTTTCATCTCCTCTCTCTCTGATCATCCTCAAGATGTCATGGACGCACTTGTCAACGC
TCTCTTTGATGGTGTGAGTAGAGGATTCGCTGAAGAAGTGACGAAGAAGAAGTACTTAGC
GGCTGCAACGCAAGAGGATGGTTCACAGATGCATCTGCTCAACTCAATCGGATCATTCTT
TGGAAAAAAAGGAAACGAAGAGGTGGGTAAGGAGGTGGCGCTGGTTCTTAAAGAACTGTA
CGATGAAGACATTGTTGAGGAAGAGTTTGTGTTGGAATGGTACCAGAAGGGTCTGAAGGG
AGTTGACAAAAGCTCGTCTGTTTGGAAATGTTAAGCCTTTTGTGGTGTGGCTCCAGAGTG
CTGAGTCCGAGACCGAAGGGGAGGATTGAGAGATGTTCTGCTCTTGTGACTTTTTCTGTT
TTTAATGGGTGTTTGTTATTTCAGTTATGGTTTTAAAATACTATCTCTCACAACAATTAT
TTGTATAATTGTTGTTTGTTTCATTATAACATTATCTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ED85TF U 1
AF RR4ED85JQ C 264
BS 1 588 RR4ED85TF
BS 589 942 RR4ED85JQ

RD RR4ED85TF 588 0 0
GGAGGCGAAGAAGGGGGGGAAGGATAAGGAGGCTATGAGGAGAGCTGAGAAGGAGAGGCT
TAAAGAAGGTGAAGCAGCTGATGAGGCGCAGAAGAAGCTCAAGAAGAAAGCACCTTGTAA
TGGGAATGGGAATGGGAATGGGAAGGAGGCTTCTTCTAGTGTGTCCAAGAATCATGCTTC
TGATGAGGATGACATCAGCCCAAAGCATGATGAGGTGGATGGTGATGAGGATGAAGACGA
TGGTATCCAGTGGCAAACCGACACTTCTAGAGAAGCTGCTGAGAAAAGAATGAAGGAACA
GTTGAGTGCTGTAACTGCCGAAATGGTGATGCTCTCTGTAGAAGAAGAGGAGGAGCCTAA
GAATCTCGTGAAGGTGATGAAAGAGTATCTGATGAAAGATTCACCGATGATCGAGCTCAA
AACTTTCATCTCCTCTCTCTCTGATCATCCTCAAGATGTCATGGACGCACTTGTCAACGC
TCTCTTTGATGGTGTGAGTAGAGGATTCGCTGAAGAAGTGACGAAGAAGAAGTACTTAGC
GGCTGCAACGCAAGAGGATGGTTCACAGATGCATCTGCTCAACTCAAT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR4ED85JQ 679 0 0
CTTCTAGAGAAGCTGCTGAGAAAAGAATGAAGGAACAGTTGAGTGCTGTAACTGCCGAAA
TGGTGATGCTCTCTGTAGAAGAAGAGGAGGAGCCTAAGAATCTCGTGAAGGTGATGAAAG
AGTATCTGATGAAAGATTCACCGATGATCGAGCTCAAAACTTTCATCTCCTCTCTCTCTG
ATCATCCTCAAGATGTCATGGACGCACTTGTCAACGCTCTCTTTGATGGTGTGAGTAGAG
GATTCGCTGAAGAAGTGACGAAGAAGAAGTACTTAGCGGCTGCAACGCAAGAGGATGGTT
CACAGATGCATCTGCTCAACTCAATCGGATCATTCTTTGGAAAAAAAGGAAACGAAGAGG
TGGGTAAGGAGGTGGCGCTGGTTCTTAAAGAACTGTACGATGAAGACATTGTTGAGGAAG
AGTTTGTGTTGGAATGGTACCAGAAGGGTCTGAAGGGAGTTGACAAAAGCTCGTCTGTTT
GGAAATGTTAAGCCTTTTGTGGTGTGGCTCCAGAGTGCTGAGTCCGAGACCGAAGGGGAG
GATTGAGAGATGTTCTGCTCTTGTGACTTTTTCTGTTTTTAATGGGTGTTTGTTATTTCA
GTTATGGTTTTAAAATACTATCTCTCACAACAATTATTTGTATAATTGTTGTTTGTTTCA
TTATAACATTATCTTATCG

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL8935Contig1 165 2 1 U
GAGGAGCGACAATGGTTTGTTCTTATCTTTGGCTAGCACTAGGACCTCATTTGAGCTAGC
ACTTAGGATGGTTGTTGGGTTTGTAAGCTTGATTTTGATCTTGGGATTGGGGTGTGAGAG
AAAAGTGAAGGAAGTGAACAAAAAGAAAAGAAAACCACTACGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4EL24TF U 1
AF RR4EL24JQ C 36
BS 1 165 RR4EL24TF

RD RR4EL24TF 165 0 0
GAGGAGCGACAATGGTTTGTTCTTATCTTTGGCTAGCACTAGGACCTCATTTGAGCTAGC
ACTTAGGATGGTTGTTGGGTTTGTAAGCTTGATTTTGATCTTGGGATTGGGGTGTGAGAG
AAAAGTGAAGGAAGTGAACAAAAAGAAAAGAAAACCACTACGGAT

QA 1 165 1 165
DS 

RD RR4EL24JQ 130 0 0
GCACTAGGACCTCATTTGAGCTAGCACTTAGGATGGTTGTTGGGTTTGTAAGCTTGATTT
TGATTTTGGGATTGGGGTGTGAGAGAAAAGTGAAGGAAGTGAACAAAAAGAAAAGAAAAC
CCCTACGGAT

QA 1 130 1 130
DS 



AS 1 2

CO CL8936Contig1 959 2 6 U
GGGCCATCTCCGCCGTCTGTAGCTGACGACACTCTCCTTCTCTTTGCTTCCGTCTCGATC
ATCGGCACTAGTCATGTCGGAGAAAGGAGGAAAAGGGTTCAAATCTTCTCTCAAGTCCGC
TTATGGAGCCGGCAAGGACGATAACTCAACCAAGTCCAAGAAGACAAGGAAAGTTCAGTT
TGATCCTCAAGGCCCACGAGAGTCCAAGTACACGTTTCTTCAAGACCCTGATGATCAGAT
CCAAGGTTCTTCTGCTAAAGCTGGGAAGGGAAGCAAGGCTAGGGAGAGTTCTCTGTCTAA
AGAGTCTCAGCCGCTTGAGCTTAAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCTT
GATGGATTGTGAAGCTTTTGAGATTCTACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTGCTATC
TGAAGATCCTAGCTTAAAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTA
TGGTCGTTGCTACATGAATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCCCTGAAAAAGCA
TGGTGTATCTGAAAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGA
AGTCTTTGCTTTTGTTCCGTCCATGAAAGGGGAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTAG
AAGAGGCATTGGCGAAGCTCTCCAAGCTCAAAAGATCTGCTTAATGATATGATGTTATCC
AAGCTGTTTAACCACAGTAGTAAAGTAAGGATGTTTAAGTTGGGCTTGGGTTTTTTTCTT
TGGCATGAAAATGAATTTACTACGCAAGGGTCGGGTGTTGTAAATGATCTAATGATGTGA
CAACAACATCGTTACAAAAAAAAAAAAATGTGACAACAACATTTGATGTAAGTTTTAATC
GTTACTAGACCATGACCTGCCCGACCGGGCGAGTGTTTATTTAATTTTTGATTTACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F869TF U 1
AF RR4F869JQ C 301
BS 1 692 RR4F869TF
BS 693 693 RR4F869JQ
BS 694 757 RR4F869TF
BS 758 758 RR4F869JQ
BS 759 774 RR4F869TF
BS 775 959 RR4F869JQ

RD RR4F869TF 774 0 0
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ATCGGCACTAGTCATGTCGGAGAAAGGAGGAAAAGGGTTCAAATCTTCTCTCAAGTCCGC
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TGATCCTCAAGGCCCACGAGAGTCCAAGTACACGTTTCTTCAAGACCCTGATGATCAGAT
CCAAGGTTCTTCTGCTAAAGCTGGGAAGGGAAGCAAGGCTAGGGAGAGTTCTCTGTCTAA
AGAGTCTCAGCCGCTTGAGCTTAAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCTT
GATGGATTGTGAAGCTTTTGAGATTCTACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTGCTATC
TGAAGATCCTAGCTTAAAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTA
TGGTCGTTGCTACATGAATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCCCTGAAAAAGCA
TGGTGTATCTGAAAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGA
AGTCTTTGCTTTTGTTCCGTCCATGAAAGGGGAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTAG
AAGAGGCATTGGCGAAGCTCTCCAAGCTCAAA*GATCTGCTTAATGATATGATGTTATCC
AAGCTGTTTAACCACAGTAGTAAAGTAAGGATGTTTA*GTTGGGCTTGGGTTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR4F869JQ 659 0 0
AGAGTCTCAGCCGCTTGAGCTTAAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCTT
GATGGATTGTGAAGCTTTTGAGATTCTACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTGCTATC
TGAAGATCCTAGCTTAAAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTA
TGGTCGTTGCTACATGAATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCCCTGAAAAAGCA
TGGTGTATTTGAAAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGA
AGTCTTTGCTTTTGTTCCGTCCATGAA*GGGGAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTAG
AAGAGGCATTGGCGAAGCTCTCCAAGCTCAAAAGATCTGCTTAATGATATGATGTTATCC
AAGCTGTTTAACCACAGTAGTAAAGTAAGGATGTTTAAGTTGGGCTTGGGTTTTTTTCTT
TGGCATGAAAATGAATTTACTACGCAAGGGTCGGGTGTTGTAAATGATCTAATGATGTGA
CAACAACATCGTTACAAAAAAAAAAAAATGTGACAACAACATTTGATGTAAGTTTTAATC
GTTACTAGACCATGACCTGCCCGACCGGGCGAGTGTTTATTTAATTTTTGATTTACACT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL8937Contig1 760 2 13 U
CAACAAAGCTACTCTGATTTGTTTTATTAGCATCACCCCAAAAAAAAGACACAAAGGAGA
AAGAATTATACTATGATATTATAGAATATCTACCTGGTCTTATACAGAGTGTAACATGAT
ACACACAATATAAAGAAAGTGAAACAAATACTCGAATGAAAAATCCAGTTTTTTTTTCAT
ATCCATTGAGACAAGGAAACACTTTTCGATGTTGTTACTAGTTCTTATCAAAATCCTCTA
CGACTACTCGTCCGAAACCATCCTTACATCTTAGCCTGTGAGTACAGGAAAGTTCCTAGA
ATGGCAATGGCAGCACCGAGTGCATTAACTGGTTGAACGGGGGTATGGAAAATGATGATT
GAAGCAACAATGACAGAGATCCTCTTCATCGTATTACCGATACTGAATGTCAACGGTGAA
ATCTGGTCTAAGGACATGTATGAAACTTGATTATACAAATGGTAAAACACACTCTGTGCC
ACTACCCACCAAACAAAGTTTGGTCCGATTTGAGAAACTGCGTTTTCCCAACCAGCAGCC
CACATTTTAGGACCTTCTACAGCTACTGCAAATGGTGTGAGGATCAAAAGAGACATCATC
GATAAGCAAGCGTAGTAATTCATTCCGCTCACGGACTTCCCTTTCATCCCTTTCTTTGAA
AATATGTTCCGAAACACAAATGCTAAATTCGATATCATCGCTCCCATAAACCCAATCATG
TTGAAGTTAAGCTCGGTGACTGCGGCAAGAGCGCAGCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GQ03JQ U 57
AF RR4BF19JQ U 1
BS 1 162 RR4BF19JQ
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BS 164 220 RR4BF19JQ
BS 221 221 RR4GQ03JQ
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RD RR4GQ03JQ 496 0 0
GG
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TACGACTACTCGTCCGAAACCATCCTTACATCTTAGCCTGTGAGTACAGGAAAGTTCCTA
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CCCACATTTTA
TGA

QA 3 493 3 493
DS 

RD RR4BF19JQ 760 0 0
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ATCCATTGAGACAAGGAAACACTTTTCGATGTTGTTACTATTTCTTATCAAAATCCTCTA
CGGCTACTCGTCCGAAACCATCCTTACATCTTAGCCTGTGAGTACAGGAAAGTTCCTAGA
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TTGAAGTTAAGCTCGGTGACTGCGGCAAGAGCGCAGCCTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL8938Contig1 711 2 2 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CY39JQ C 1
AF RR4CY39TF U 1
BS 1 684 RR4CY39TF
BS 685 711 RR4CY39JQ

RD RR4CY39JQ 711 0 0
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CACTGGCTGTTTAGTAGTATTAGACCTCTTGCTTTAATTTTTATTTTTTTGGTTGAAATT
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ATGATCTCTTCTGTACGTAACTAATCTGAAAAATCTGCAGATGCTTGTTCG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4CY39TF 684 0 0
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TTTCTTCTCTTAGCACTTATTGCAGAAGTCTATTACCTTCTGAGATGGAAGAAGCACAAG
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AACGATGGTGGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAGTCTCGAGGAATCAAGATTTGGAGCTTGGC
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CAAGAGGAGGGAGCAGAAACAGGAACTTTCGAATACATCAGAAGGTTCGTTCTTGAAGTT
CATGAGTCCTGCGACGATGAACAGAGAGAAGAAACAGAGTTCTCAAGAAACTCTTGAAAC
GGTGTCGTTTCGTACTTCATCAGGTACAAAATCTTAGAACGTTAGACCAGAAATCATTTG
CACTGGCTGTTTAGTAGTATTAGACCTCTTGCTTTAATTTTTATTTTTTTGGTTGAAATT
TTATAAGAATTTCAATTTTAGTTGTGTGAAGTGTGAGAATCATCTTTCCTTTCTTTGGGA
ATGATCTCTTCTGTACGTAACTAA

QA 1 684 1 684
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8940Contig1 697 2 6 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK67JQ C 1
AF RR4DK67TF U 1
BS 1 637 RR4DK67TF
BS 638 638 RR4DK67JQ
BS 639 670 RR4DK67TF
BS 671 671 RR4DK67JQ
BS 672 688 RR4DK67TF
BS 689 697 RR4DK67JQ

RD RR4DK67JQ 697 0 0
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TTCTTATTTTTATGATTATAAAGTGAAATAAGATTTG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR4DK67TF 688 0 0
GGACATTCATTTCCTCTTCATCATATTTGAAGAAAACATACACAAATAAATTTTCTTGCA
AAGTTCTATACTCTCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAAGGAGAG
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CTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTGATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGA
AGAGTTAGAGCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCTTACGAACATTTCTTT
GAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGT
TGTATGAGAAGATGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGG
AGATGAGTATGGAGGAGCCTACAAGCAAGAAAATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCG
GCAAGTCTTTTCACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGTAACTACTACTTGG
AGAATCCTAAAAAATAAATCGTTTTAAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTT
GCCTTTGTTTTTATTTTAATAGTTGTACTCTTGTAAG*TTGCTTCATTGCAATTACTGAA
TTCTTATTTT*ATGATTATAAAGTGAAA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL8941Contig1 671 2 2 U
GGATGTAAGAATACGTTTTAGAAGCACTATCTAAGAGTAAACAAAATCAAACCCCAAGTT
TCATTAAGAATAATATGGGAGAAACAGAAGAGAAAGAAGTGAAGAAGAATCATGGTGATA
AAGAAGAGGAACACATCAAGGCTGAGAAAGCAGATAAGAAGGAGAAGAAGGATAAAGATA
AGAAGGATAAGAATGAGGACGATAAAAAAGGTGGAGGAGAAGAAGGAGAAGATCAAGAGA
AGAAGAGCAAGAAGAAAGATAAGAAGACGAAGAAAGAGAAGAACCCTGAAGATAAGAAAG
ATCCAGAGAAGTTGAAGATGAAACTTCAGAAGATTGAAGAAAAGATTCAAGCTATGGTCT
TAAAGAAAGATGAGATCGTTAAGCTTATTCATGATGCTGAACAAGCTAAAGGTAGTGCCG
TAGCAGCAGCACCATCACCAACTAATTAACTCAATTTCCAAACACAAATGGATACATACT
ACAATATATAATTCTATATTTTGGTTTTCTTTGGGATCTCGATAAGAAGTGCTGATGAAT
GTTGTTTTCATCGTATTTTTGGTAGGATTTTCTCATTTCTATTTTTCGTTTGTTTAATTT
ATATGTTTGTATATATTGTACAAAAACCATCTGTTTTAAATATAATACTTATCAGCTTGG
TGATTCTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB66TF U 1
AF RR4EB66JQ C 36
BS 1 626 RR4EB66TF
BS 627 671 RR4EB66JQ

RD RR4EB66TF 626 0 0
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AAGAAGAGGAACACATCAAGGCTGAGAAAGCAGATAAGAAGGAGAAGAAGGATAAAGATA
AGAAGGATAAGAATGAGGACGATAAAAAAGGTGGAGGAGAAGAAGGAGAAGATCAAGAGA
AGAAGAGCAAGAAGAAAGATAAGAAGACGAAGAAAGAGAAGAACCCTGAAGATAAGAAAG
ATCCAGAGAAGTTGAAGATGAAACTTCAGAAGATTGAAGAAAAGATTCAAGCTATGGTCT
TAAAGAAAGATGAGATCGTTAAGCTTATTCATGATGCTGAACAAGCTAAAGGTAGTGCCG
TAGCAGCAGCACCATCACCAACTAATTAACTCAATTTCCAAACACAAATGGATACATACT
ACAATATATAATTCTATATTTTGGTTTTCTTTGGGATCTCGATAAGAAGTGCTGATGAAT
GTTGTTTTCATCGTATTTTTGGTAGGATTTTCTCATTTCTATTTTTCGTTTGTTTAATTT
ATATGTTTGTATATATTGTACAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4EB66JQ 636 0 0
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GAAGTGAAGAAGAATCATGGTGATAAAGAAGAGGAACACATCAAGGCTGAGAAAGCAGAT
AAGAAGGAGAAGAAGGATAAAGATAAGAAGGATAAGAATGAGGACGATAAAAAAGGTGGA
GGAGAAGAAGGAGAAGATCAAGAGAAGAAGAGCAAGAAGAAAGATAAGAAGACGAAGAAA
GAGAAGAACCCTGAAGATAAGAAAGATCCAGAGAAGTTGAAGATGAAACTTCAGAAGATT
GAAGAAAAGATTCAAGCTATGGTTTTAAAGAAAGATGAGATCGTTAAGCTTATTCATGAT
GCTGAACAAGCTAAAGGTAGTGCCGTAGCAGCAGCACCATCACCAACTAATTAACTCAAT
TTCCAAACACAAATGGATACATACTACAATATATAATTTTATATTTTGGTTTTCTTTGGG
ATCTCGATAAGAAGTGCTGATGAATGTTGTTTTCATCGTATTTTTGGTAGGATTTTCTCA
TTTCTATTTTTCGTTTGTTTAATTTATATGTTTGTATATATTGTACAAAAACCATCTGTT
TTAAATATAATACTTATCAGCTTGGTGATTCTGATT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

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AAGCCACTTTCGCTGAGCATAATCTGAATGGGTACTCTTTAGGAAAAACCTCTGAGGTAT
GTGGTAGAACTTCGTGTCCTGAGATATATCAGGTATAGTAGTGTGTTTGTCTTCTAGATC
GAGCCTCGGATGACTGCAGCAACAACATCAGATGTTTTTATGCCGGAGATCCTGAAGCTT
CTTTGTAGTTTCTGTGGAAGGATCTTACAGAGACCTGGTGATGGGAAGCTTAGATACATT
GGGGGTGAGATTCATATCATCTTCATATGAAAACATGTTGGATTAAACGAACTGATGCAC
AAGACTAATGATCTGTGCAACCATCCGTATACAATCAAGTATCAGTTACCGGAGAAGATA
TTGATGCGCTTATATCTGTTTGATCGGATGAGGATCTTCTTCATATGGTTGAAGAGGATC
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TCTGCAAGAATCTGGTTTTGGTTTTCTTCAATTTCAACATTTGATTTTAATCATTCATGA
TTGATTGTTGAGAGTTGTAAAGGAGAGTAACGGAGTGTACATACTTAGTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GP87TF U 1
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AAGCCACTTTCGCTGAGCATAATCTGAATGGGTACTCTTTAGGAAAAACCTCTGAGGTAT
GTGGTAGAACTTCGTGTCCTGAGATATATCAGGTATAGTAGTGTGTTTGTCTTCTAGATC
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CTTTGTAGTTTCTGTGGAAGGATCTTACAGAGACCTGGTGATGGGAAGCTTAGATACATT
GGGGGTGAGATTCATATCATCTTCATATGAAAACATGTTGGATTAAACGAACTGATGCAC
AAGACTAATGATCTGTGCAACCATCCGTATACAATCAAGTATCAGTTACCGGAGAAGATA
TTGATGCGCTTATATCTGTTTGATCGGATGAGGATCTTCTTCATATGGTTGAAGAG*ATC
AGGAAGGT

QA 1 668 1 668
DS 

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CTTTACCTGATACATCTCCAGGTTAGCATCTAAGCCACTTTCGCTGAGCATAATCTGAAT
GGGTACTCTTTAGGAAAAACCTCTGAGGTATGTGGTAGAACTTCGTGTCCTGAGATATAT
CAGGTATAGTAGTGTGTTTGTCTTCTAGATCGAGCCTCGGATGACTGCAGCAACAACATC
AGATGTTTTTATGCCGGAGATCCTGAAGCTTCTTTGTAGTTTCTGTGGAAGGATCTTACA
GAGACCTGGTGATGGGAAGCTTAGATACATTGGGGGTGAGATTCATATCATCTTCATATG
AAAACATGTTGGATTAAACGAACTGATGCACAAGACTAATGATCTGTGCAACCATCCGTA
TACAATCAAGTATCAGTTACCGGAGAAGATATTGATGCGCTTATATCTGTTTGATCGGAT
GAGGATCTTCTTCATATGGTTGAAGAGGATCAGGAAGGTAAAAAAAAGAACAAAAATTGA
TAAATTATGTTATTCGATTCACACAGTTTTTTCTGCAAGAATCTGGTTTTGGTTTTCTTC
AATTTCAACATTTGATTTTAATCATTCATGATTGATTGTTGAGAGTTGTAAAGGAGAGTA
ACGGAGTGTACATACTTAGTCTTT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL8943Contig1 695 2 2 U
TTTTTTTTCCCAGAATTTGCATGATCATAATTTTAATATCCATTGATCTTACCAAAAGGT
TGGCCAAACCAAGAACAATTACAGAAGATAACAATAGATTTGACTAAGTAGCAACACACT
CAACCCAAAATGTAAAGACAATGATTATCAAACCATCAAAAGCAGCATGTTACGGAGCTT
TTGTCTTAAACAATGTCTTCTTCTCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAA
GCCGCACAAGTGAGAACGAATCCTTCAGCAATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCA
GACTGGTCAACAGATCCAGACACAACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAAGAACCAGCACGG
CAAGAGTAAGGCAAGTCGATTCCTGCTTCCTCAGCAGCGTCGAGGACGTAAACGTCGTCG
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TGTTTTCTTGATTTTTTTGTGAGTTATGGCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GD43TF C 1
AF RR4GD43JQ U 9
BS 1 8 RR4GD43TF
BS 9 695 RR4GD43JQ

RD RR4GD43TF 695 0 0
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TGGCCAAACCAAGAACAATTACAGAAGATAACAATAGATTTGACTAAGTAGCAACACACT
CAACCCAAAATGTAAAGACAATGATTATCAAACCATCAAAAGCAGCATGTTACGGAGCTT
TTGTCTTAAACAATGTCTTCTTCTCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAA
GCCGCACAAGTGAGAACGAATCCTTCAGCAATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCA
GACTGGTCAACAGATCCAGACACAACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAAGAACCAGCACGG
CAAGAGTAAGGCAAGTCGATTCCTGCTTCCTCAGCAGCGTCGAGGACGTAGACGTCGTCG
TCGCACTCAACCTCTTGCTCTCCTTCAGGAGTGATGAACTTGACCTTGTATGTAGCCATG
GCTGTGACGCGTCCACCGCGTGCTGTGCCAGATTTGAGACCGAAGAGGGATTGAGTGTTG
GCTAAGGGGAGGGAACGGAGGCTGATAGGAGCTGTTTGACGGCGGAGGAAGGATGTTCCG
ACGATGGCGCTTGAGAGAGCTGTTGAGGCCATTTTTTTATGTGCTTAGAAGACTTAGAGA
TGTTTTCTTGATTTTTTTGTGAGTTATGGCTTGTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR4GD43JQ 687 0 0
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CCAAGAACAATTACAGAAGATAACAATAGATTTGACTAAGTAGCAACACACTCAACCCAA
AATGTAAAGACAATGATTATCAAACCATCAAAAGCAGCATGTTACGGAGCTTTTGTCTTA
AACAATGTCTTCTTCTCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAAGCCGCACA
AGTGAGAACGAATCCTTCAGCAATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCAGACTGGTC
AACAGATCCAGACACAACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAAGAACCAGCACGGCAAGAGTA
AGGCAAGTCGATTCCTGCTTCCTCAGCAGCGTCGAGGACGTAAACGTCGTCGTCGCACTC
AACCTCTTGCTCTCCTTCAGGAGTGATGAACTTGACCTTGTATGTAGCCATGGCTGTGAC
GCGTCCACCGCGTGCTGTGCCAGATTTGAGACCGAAAAGGGATTGAGTGTTGGCTAAGGG
GAGGGAACGGAGGCTGATAGGAGCTGTTTGACGGCGGAGGAAGGATGTTCCGACGATGGC
GCTTGAGAGAGCTGTTGAGGCCATTTTTTTATGTGCTTAGAAGACTTAGAGATGTTTTCT
TGATTTTTTTGTGAGTTATGGCTTGTC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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TGGATCAAGAACTCAGCGAGCCTTACTCCATCTTCACTTACCGCTACTTCGTCTATCTCT
GGCCTCATCTCTGCTTCCTGGCGTTTCACAAAGGTAAATGCATAGGAACAGTAGTGTGTA
AGATGGGAGAGCATCGACAGACCTACAGAGGGTACATCGCCATGTTGGTTGTCATCAAAC
CCTATCGTGGCCGGGCTTAGCCACAGAGCTTGTAACAAGATCAATAAAAGCGATGATGGA
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CTATGGGAGACTCGGGTTCATAAGAGCCAAACGGCTACACCACTATTACTTGAATGGGAT
GGATGCTTTTCGGCTTAAGCTTTTGTTCCCAAGGCCTCATGTACCTCAAATGGTTTATGA
AGAGGAACCCCAGCCAGAGCACGAGATTTTCCCAAGGCCTCGTGACTGAAATGACATGAT
GACCCACCACGGTCACTTCCTTTTCATAGTTTCAACCTTGAGGCCTTGGAAAAGAAGATG
TTGTATTGCTTCTCTGTATTCCGGATAGTGAAAACATAACCTAGACTGTGTTTTGTTTCA
TATTCAGGACAACCAAAAAACACTAGTTAATTTTTCGAACATTATGAAATACTTAAAACT
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BQ
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AF RR4DN13TF U 1
AF RR4DN13JQ C 475
BS 1 702 RR4DN13TF
BS 703 880 RR4DN13JQ

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CCTATCGTGGCCGGGCTTAGCCACAGAGCTTGTAACAAGATCAATAAAAGCGATGATGGA
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CTATGGGAGACTCGGGTTCATAAGAGCCAAACGGCTACACCACTATTACTTGAATGGGAT
GGATGCTTTTCGGCTTAAGCTTTTGTTCCCAAGGCCTCATGTACCTCAAATGGTTTATGA
AGAGGAACCCCAGCCAGAGCACGAGATTTTCCCAAGGCCTCGTGACTGAAATGACATGAT
GACCCACCACGGTCACTTCCTTTTCATAGTTTCAACCTTGAG
CCTTGG

QA 1 702 1 702
DS 

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TTATGAAGAGGAACCCCAGCCAGAGCACGAGATTTTCCCAAGGCCTCGTGACTGAAATGA
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AAGATGTTGTATTGCTTCTCTGTATTCCGGATAGTGAAAACATAACCTAGACTGTGTTTT
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AAAACTTGTGGCCATATTTTGGATATGAAATTTAGAATTGTATATT

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 2

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GAGGAATAAGAATAGGAAATGTCATAACTGGAGGTGCAGGAGCCACTCTGGGTTGTTACT
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AAACGTCTGTGCTTTTTGTTTAAATGTATGGTGTGAGCATCTTATCTTATTGTAGGAAAA
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CATAAGATTTTAATGATTT


BQ
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AF RR4FA77JQ C 1
AF RR4FA77TF U 1
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CATAAGATTTTAATGATTT

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DS 

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GTTTAAGTTTCGAAAGGATGTGGTCTGATCTGATGGAGAAGATTGGTTCCGGTCGATCAC
CCTAATTATTGTCAAGCTTGTCTTTGTGGAGTAGCAGTCAATCTTAATAAATTATTATGT
AAACGTCTGTGCTTTTTGTTTAAATGTATGGTGTGAGCATCTTATCTTATTGTAGGAAAA
CGTGTTAGCTTAAATGTGAACAAACATGGAAGCCTAGCTTATGCTTCTTTTGATATTTAA
CATAAGATTTTAATGATTT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

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TTTAGTTTGTTAATTCTTAAAGTCTAGCCCCTAAGTTTGTGTT


BQ
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AF RR4D808JQ C 1
AF RR4D808TF U 1
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QA 1 583 1 583
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AGAAAAAGAGCGTGCCGCTATATTCCTTATGAGGAAGTTGTTTTCCGCTCTATGTTAATG
TTTTTCGCTACCTTTGGATGAATATTGTATTCAAAGGTTTTTTTTCCAAAACTAGAAGCC
CTTGAGGAAAGATCCACCTAAAGTGACACTTTTTTACGTGGATTTATGTAAATCCTGGTT
TTTAGTTTGTTAATTCTTAAAGTCTAGCCCCTAAGTTTGTGTT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8947Contig1 410 2 1 U
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BQ
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AF RR4DV34JQ C 1
AF RR4DV34TF U 1
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TGTTACTTGTTTACTTGTTCCTTACAGTTTTATATAGAATACTCTTTTAT

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DS 

RD RR4DV34TF 410 0 0
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CACTGAAAGGAAGATACAACAACTACAAAGTGATGATTCGTGCCTAAGATGATGGAGAGA
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GATGATGATTCTCTACTTGGAAACTCTTTTTAGTTGTAAGCAGTAATTATATGTGATATC
TGTTACTTGTTTACTTGTTCCTTACAGTTTTATATAGAATACTCTTTTAT

QA 1 410 1 410
DS 



AS 1 2

CO CL8948Contig1 632 2 3 U
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BQ
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AF RR4FK07JQ U 4
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CTGATACTTCTTCACGAAGTGGAGGTAGTTCCTGCGAACGATGATGGTTCTCTGCATCTT
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QA 1 595 1 595
DS 

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TTACATTCCAGTGAATGCCTTCTTAGCAAAGGCGGATGCGCCCGCTGGGATCACCTTCAG
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CCTCTGATACTTCTTCACGAAGTGGAGGTAGTTCCTGCGAACGATGATGGTTCTCTGCAT
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CTTGGAGCTTAGGAAGACCTTGGGTTGCTTAAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCAGCCAT
GGCTACCGGTTGCTGCTGCTGCTCTCTGTTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL8949Contig1 707 2 3 U
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TATCTCCGTCGTCGCCAACGCTGTGCTCCGCATTTTTTTCTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EZ69JQ U 10
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BS 1 9 RR4EZ69TF
BS 10 558 RR4EZ69JQ
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QA 1 549 1 549
DS 

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QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B641JQ C 1
AF RR4B641TF U 1
BS 1 594 RR4B641TF

RD RR4B641JQ 594 0 0
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DS 

RD RR4B641TF 594 0 0
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ACTTGGTAAAAGTTATTTTGATATCCTGTCAATATGACATTCGATTATCTTGGC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL8951Contig1 649 2 1 U
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GCCATGGACATGGGAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGACAAATCATGAGACAAACAAAG
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AAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FB61TF U 1
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DS 



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BQ
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AF RR4A249TF U 1
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR4D422TF C 1
AF RR4D422JQ U 4
BS 1 3 RR4D422TF
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BS 682 684 RR4D422TF

RD RR4D422TF 684 0 0
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ATCACTAAACACCAATTAAGAAAATCTAAGTAACAGAAAAAACCTACAACTAAATTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCTTCTCTTCTTCTTCCTCCTAGTTTAAGGATACCCAA
GTTTTGCTTCAGCTTCTGTATGCACAAGAAGAGTTCCAGTTTATAGCCAGTGCATAAAAG
CGAGCTGGGAGACCACTGCTTGTGTCTCACTTCTCCAGTCCGCATGGTACCTGTGGTGGC
AGAGATGGTAAATGTGGCTGGCTCACTTAGATCTATAGGGTTAGGTGATATATTGACCTC
TTTCACTTCGTTCTCTGTATTCTCCTTAGTTTCATCAAGCTGAAGCTTCATCTTGGCCTT
CACTTTTTCAGCAGCTGACCGTTCAAGAAAGCAACACAACAAGCCCTTAAAAATCAACGT
AAATGACTATCACAAAGCCACGTAAAGAAAAACACAGAATCCAAATCCACGAGCAGCAAT
CGACTATGGAAAGGGTAGGAAGGGAGAGAAAAGGAAAAGAAGAAAGGGAAGAGAAGGGAA
TGGTAGAGCTAGGGTTTTCTGGTGGTACAGAGAGGTGAGAGCGTTGGTTCGGTAGAGAGA
GAAAGAAAAGCGTGTGTGTGTGTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4D422JQ 678 0 0
AATTAAAAAAAGAAATTTTATTTATAAACAAAAATTGGTTTAAAAATTCTGGTTTACATC
ACTAAACACCAATTAAGAAAATCTAAGTAACAGAAAAAACCTACAACTAAATTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTCTTCTTCTCTTCTTCTTCCTCCTAGTTTAAGGATACCCAAGTT
TTGCTTCAGCTTCTGTATGCACAAGAAGAGTTCCAGTTTATAGCCAGTGCATAAAAGCGA
GCTGGGAGACCACTGCTTGTGTCTCACTTCTCCAGTCCGCATGGTACCTGTGGTGGCAGA
AATGGTAAATGTGGCTGGCTCACTTAGATCTATAGGGTTAGGTGATATATTGACCTCTTT
CACTTCGTTCTCTGTATTCTCCTTAGTTTCATCAAGCTGAAGCTTCATCTTGGCCTTCAC
TTTTTCAGCAGCTGACCGTTCAAGAAAGCAACACAACAAGCCCTTAAAAATCAACGTAAA
TGACTATCACAAAGCCACGTAAAGAAAAACACAGAATCCAAATCCACGAGCAGCAATCGA
CTATGGAAAGGGTAGGAAGGGAGAGAAAAGGAAAAGAAGAAAGGGAAGAGAAGGGAATGG
TAGAGCTAGGGTTTTCTGGTGGTACAGAGAGGTGAGAGCGTTGGTTCGGTAGAGAGAGAA
AGAAAAGCGTGTGTGTGT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL8954Contig1 779 2 2 U
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TGCCGGATTTGAAGTACCTGTATCGCCGGTTTCAAGTTACAACAATCTGTATTCCGCAAC
CGAAGACGAGACAAGAGACCCTCCAGCTTTACCCCCACATCTTCAACACTCTCTGTTAGG
CCATACAGGCAGCACGGAATTGCCTTGTTCACCACAGAGTGTCGTCCTCAACCATCTCTA
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CTCGCTTTAGGTTTGGTTGTTTAACCGAATCCACATACATATCTCTATTGACGATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F502TF U 1
AF RR4F502JQ C 100
BS 1 650 RR4F502TF
BS 651 779 RR4F502JQ

RD RR4F502TF 650 0 0
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TGCCGGATTTGAAGTACCTGTATCGCCGGTTTCAAGTTACAACAATCTGTATTCCGCAAC
CGAAGACGAGACAAGAGACCCTCCAGCTTTACCCCCACATCTTCAACACTCTCTGTTAGG
CCATACAGGCAGCACGGAATTGCCTTGTTCACCACAGAGTGTCGTCCTCAACCATCTCTA
TATCGAAAACCGTGACCCACCAAGATCCGTCGTAGCGCTTGGTTTCTCGCATCGGTTCAG
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TTAATTATATGATGATGCATCTTCTTAATAGTGTTGGAATCTTGCTTCTTTGTGGATTCA
GTTTGGTATATGCAAAAAACCAGCTGGTCCGGACTAAATTGTGTCTCAGT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR4F502JQ 680 0 0
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TCTTCAACACTCTCTGTTAGGCCATACAGGCAGCACGGAATTGCCTTGTTCACCACAGAG
TGTCGTCCTCAACCATCTCTATATCGAAAACCGTGACCCACCAAGATCCGTCGTAGCGCT
TGGTTTCTCGCATCGGTTCAGGTCTAAGTATGTCACTGTTGTGATATACAAGCCGGTCCA
AAGAAGAGGAAACGCCAACGTTTAATTATATGATGATGCATCTTCTTAATAGTGTTGGAA
TCTTGCTTCTTTGTGGATTCAGTTTGGTATATGCAAAAAACCAGCTGGTCCGGACTAAAT
TGTGTCTCAGTTTAGGGGATTCGATTGAAATCATCTTTGTCTGGACGTTTATATAAAATG
TTCCTGCGCTGTTTGTAACAACTCGCTTTAGGTTTGGTTGTTTAACCGAATCCACATACA
TATCTCTATTGACGATATGC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL8955Contig1 675 2 1 U
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CAAACGTTGGTTAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AJ76JQ C 1
AF RR4AJ76TF U 1
BS 1 675 RR4AJ76TF

RD RR4AJ76JQ 675 0 0
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TCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCG
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TTTGCATTTAGTGGTTTTTGTTATCTAAATTACAATGATCGTTTTGATCATTTCAATGAA
CAAACGTTGGTTAAG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR4AJ76TF 675 0 0
GGAAACGATCTGATCTCATCAAAACAGTTGGTAGAAACAGTGAAGAAACCCATAGTTCTT
CAGGATGGGTCGTATGCACTCAAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCATACAA
ACGCTCACCCCCGACTTGGCTCAAGACCACCGCTCTAGATGTTGATGAGTCAATATGCAA
GTTCGCAAAGAAAGGTCTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGG
TATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGAATTCTGAAAGCACACGG
TCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCG
CAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTGGA
GAGCAGGATTCACCGTCTTGCTCGTTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCCCCTGTCTG
GAAGTACGAGTCTACTACTGCCTCTACTCTTGTGGCTTAGAGAGAGAGTGAACTGCAATG
GACTTACTATCAAGAAAGACTACCGTTTCTATTTGAGTATCAGTGGACTTAATTACTCTG
TTTGCATTTAGTGGTTTTTGTTATCTAAATTACAATGATCGTTTTGATCATTTCAATGAA
CAAACGTTGGTTAAG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL8956Contig1 942 2 2 U
GGTCCTGGGACTGCTCCAGTGACCATTCCTTCTTCGGCTACGTTCAATAGATACGTTTCG
TCATCGTCTAACTTCTCTGAGCCGAGTAGGAACCCGCTCCCTCCTTTTTCTCCTAAGAGC
ACCAGACGCTCCCCTTCCTCGCAGGACTCTTTGCCTGGGATTGCTTTGTACAAGAGTTCC
AGAAGCGGAGAGTCTCCTTCTGGTGGATTAATGAACCACTACCCTGGCCACAAGCTTACG
AAGGACAGCAAATACGATTCAGGCAGGTTCTCTGGACTGCTGTCTTCTAGTGGCTCACCA
AGATTCGGGTTTTCTAGGAGCCCCAGTAGATTATCTTCCCAAGACGATTTGGATGACCCT
GATTGCTCATGCCCTTTTGATTTCGATGATGTTGACGAGTCTGGACTTCACTACAGCCAA
AGTCTTGACCGGAGGAAAACCTCAAGCTCTATATCGCAGTCGCTACCTATAGGGAGGAAG
TCACAGGACGCAGCGGTTGGAGTCCTGGTTCAGATGCTAAAGACAGCACCGCCATTACGA
CAAGACTCGAGCACTTATATGGCGTCAATGTCTGGGGTTCAGAGAGAAGGTGGTAGTTCA
GTGTCAGGCACAGAATTTGAGCTTTCCATGGCTCGAAGTACATCAGATGCGCTTGAGGAA
CTGAGAAATTACAAGCAGCTGAAAGACTTGCTTCTCTCCAAATCCAAGAGCTTTGGTGGA
GAGACTCGGGTTCACTGAGCCAAAACCAAAAGGGCAATCAAAGTTATTGAGTTAATAATC
TGATGACTGTTTGTAAATATGGATTTGATGACTACTACTTTAGCTCATGTTTTAGTTTCT
GTTGAATTACCTTTGAGAAAAAGAAAAAAAAAAGAGTTTGTAAAATGACTTACCTTTCAA
TATGTACATAAGTACTAATAAAGTTTGAAATCTTTTCATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CB15TF U 1
AF RR4CB15JQ C 164
BS 1 585 RR4CB15TF
BS 586 942 RR4CB15JQ

RD RR4CB15TF 585 0 0
GGTCCTGGGACTGCTCCAGTGACCATTCCTTCTTCGGCTACGTTCAATAGATACGTTTCG
TCATCGTCTAACTTCTCTGAGCCGAGTAGGAACCCGCTCCCTCCTTTTTCTCCTAAGAGC
ACCAGACGCTCCCCTTCCTCGCAGGACTCTTTGCCTGGGATTGCTTTGTACAAGAGTTCC
AGAAGCGGAGAGTCTCCTTCTGGTGGATTAATGAACCACTACCCTGGCCACAAGCTTACG
AAGGACAGCAAATACGATTCAGGCAGGTTCTCTGGACTGCTGTCTTCTAGTGGCTCACCA
AGATTCGGGTTTTCTAGGAGCCCCAGTAGATTATCTTCCCAAGACGATTTGGATGACCCT
GATTGCTCATGCCCTTTTGATTTCGATGATGTTGACGAGTCTGGACTTCACTACAGCCAA
AGTCTTGACCGGAGGAAAACCTCAAGCTCTATATCGCAGTCGCTACCTATAGGGAGGAAG
TCACAGGACGCAGCGGTTGGAGTCCTGGTTCAGATGCTAAAGACAGCACCGCCATTACGA
CAAGACTCGAGCACTTATATGGCGTCAATGTCTGGGGTTCAGAGA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR4CB15JQ 779 0 0
CTTTGTACAAGAGTTCCAGAAGCGGAGAGTCTCCTTCTGGTGGATTAATGAACCACTACC
CTGGCCACAAGCTTACGAAGGACAGCAAATACGATTCAGGCAGGTTCTCTGGACTGCTGT
CTTCTAGTGGCTCACCAAGATTCGGGTTTTCTAGGAGCCCCAGTAGATTATCTTCCCAAG
ACGATTTGGATGACCCTGATTGCTCATGCCCTTTTGATTTCGATGATGTTGACGAGTCTG
GACTTCACTACAGCCAAAGTCTTGACCGGAGGAAAACCTCAAGCTCTATATCGCAGTCGC
TACCTATAGGGAGGAAGTCACAGGACGCAGCGGTTGGAGTCCTGGTTCAGATGCTAAAGA
CAGCACCGCCATTACGACAAGACTCGAGCACTTATATGGCGTCAATGTCTGGGGTTCAGA
GAGAAGGTGGTAGTTCAGTGTCAGGCACAGAATTTGAGCTTTCCATGGCTCGAAGTACAT
CAGATGCGCTTGAGGAACTGAGAAATTACAAGCAGCTGAAAGACTTGCTTCTCTCCAAAT
CCAAGAGCTTTGGTGGAGAGACTCGGGTTCACTGAGCCAAAACCAAAAGGGCAATCAAAG
TTATTGAGTTAATAATCTGATGACTGTTTGTAAATATGGATTTGATGACTACTACTTTAG
CTCATGTTTTAGTTTCTGTTGAATTACCTTTGAGAAAAAGAAAAAAAAAAGAGTTTGTAA
AATGACTTACCTTTCAATATGTACATAAGTACTAATAAAGTTTGAAATCTTTTCATTTC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL8957Contig1 822 2 12 U
GCTGCCGTATCCGAAGCAGGCGAGCTCGTTTTATCATCTTAGCAAAGTTCATGACTCGCA
CAACATTGCTTTCACTTGCAAGGCTTGGGGTATTAGAGCTACTGATCTTAACCAGGGAGT
TGTTTATGGTGTGAAGACTGATTAGACTGAGATGCATGAGGAGCTGCGTAACCGGTTGGA
TTATGATGCTGTGTTTGGTACTGCTCTTAACCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTGTTGGTCA
CCCCTTCGGTTTATGGCAAAGGTGGTCAGACAAGGGGCTACCTTGACATAAGAGACACGG
TCCAATGTGTTGAGCTAGCTATAGCGAACCCTGCAAAGGCTGGTGAGTTCAGGGTATTCA
ACCAGTTCACAGAACAGTTCTCAGTCAACGAGCTGGCGTCGCTGGTGACTAAAGCGGGTT
TGAAGCTGGGGCTTGACGTGACTAAGATGACGGTGCCTAACCCGAGAGTGGAGGCGGAAG
AGCATTACTACAACGCAAAGCACACAAAGCTGATGGAACTTGGACTTGAGCCTCATTATT
TGTCTGAGTCACTTCTTGATTCGTTGCTCAACTTTGCTGTTCAGTTTAAGGACCGTGTGG
ACGCGAAGCAGATCATGCCTAGTGTTTCTTGGAAGAAGATTGGCGTCAAGACTAAGTCCA
TGAACCCCTAAACAGTCCAGATTATTATTAGTACTTGTAAGGGAGATTATTAGATTATAT
GCGAGAGTCGTGTTTGTTTATTATCCTTCAAAACTTAATTTTGTGCGCAAGGAGTTTGTA
CTTTTAGATCGTGATGTTTAATCTTTGAAAACTACATAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E758TF U 1
AF RR4E758JQ C 44
BS 1 677 RR4E758TF
BS 678 678 RR4E758JQ
BS 679 688 RR4E758TF
BS 689 689 RR4E758JQ
BS 690 702 RR4E758TF
BS 703 703 RR4E758JQ
BS 704 707 RR4E758TF
BS 708 708 RR4E758JQ
BS 709 715 RR4E758TF
BS 716 716 RR4E758JQ
BS 717 738 RR4E758TF
BS 739 822 RR4E758JQ

RD RR4E758TF 747 0 0
GCTGCCGTATCCGAAGCAGGCGAGCTCGTTTTATCATCTTAGCAAAGTTCATGACTCGCA
CAACATTGCTTTCACTTGCAAGGCTTGGGGTATTAGAGCTACTGATCTTAACCAGGGAGT
TGTTTATGGTGTGAAGACTGATTAGACTGAGATGCATGAGGAGCTGCGTAACCGGTTGGA
TTATGATGCTGTGTTTGGTACTGCTCTTAACCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTGTTGGTCA
CCCCTTCGGTTTATGGCAAAGGTGGTCAGACAAGGGGCTACCTTGACATAAGAGACACGG
TCCAATGTGTTGAGCTAGCTATAGCGAACCCTGCAAAGGCTGGTGAGTTCAGGGTATTCA
ACCAGTTCACAGAACAGTTCTCAGTCAACGAGCTGGCGTCGCTGGTGACTAAAGCGGGTT
TGAAGCTGGGGCTTGACGTGACTAAGATGACGGTGCCTAACCCGAGAGTGGAGGCGGAAG
AGCATTACTACAACGCAAAGCACACAAAGCTGATGGAACTTGGACTTGAGCCTCATTATT
TGTCTGAGTCACTTCTTGATTCGTTGCTCAACTTTGCTGTTCAGTTTAAGGACCGTGTGG
ACGCGAAGCAGATCATGCCTAGTGTTTCTTGGAAGAAGATTGGCGTCAAGACTAAGTCCA
TGAACCCCTAAACAGTC*AGATTATTAT*AGTACTTGTAAGG*AGAT*ATTAGAT*ATAT
GCGAGAGTCGTGTTTGTT
ATATCCTTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR4E758JQ 779 0 0
AAAGTTCATGACTCGCACAACATTGCTTTCACTTGCAAGGCTTGGGGTATTAGAGCTACT
GATCTTAACCAGGGAGTTGTTTATGGTGTGAAGACTGATTAGACTGAGATGCATGAGGAG
CTGCGTAACCGGTTGGATTATGATGCTGTGTTTGGTACTGCTCTTAACCGGTTCTGTGTT
CAAGCTGCTGTTGGTCACCCCTTCGGTTTATGGCAAAGGTGGTCAGACAAGGGGCTACCT
TGACATAAGAGACACGGTCCAATGTGTTGAGCTAGCTATAGCGAACCCTGCAAAGGCTGG
TGAGTTCAGGGTATTCAACCAGTTCACAGAACAGTTCTCAGTCAACGAGCTGGCGTCGCT
GGTGACTAAAGCGGGTTTGAAGCTGGGGCTTGACGTGACTAAGATGACGGTGCCTAACCC
GAGAGTGGAGGCGGAAGAGCATTACTACAACGCAAAGCACACAAAGCTGATGGAACTTGG
ACTTGAGCCTCATTATTTGTCTGAGTCACTTCTTGATTCGTTGCTCAACTTTGCTGTTCA
GTTTAAGGACCGTGTGGACGCGAAGCAGATCATGCCTAGTGTTTCTTGGAAGAAGATTGG
CGTCAAGACTAAGTCCATGAACCCCTAAACAGTCCAGATTATTATTAGTACTTGTAAGGG
AGATTATTAGATTATATGCGAGAGTCGTGTTTGTTTATTATCCTTCAAAACTTAATTTTG
TGCGCAAGGAGTTTGTACTTTTAGATCGTGATGTTTAATCTTTGAAAACTACATAAAGG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL8958Contig1 735 2 2 U
GGTCAATAAGAAAAGCTTAACACTCAATTGTTTGACAGATACATAATACATATATCATTG
TTAGTTGCATCCTAAAAATGCTGTAAACTATAAGATATGGAGCAAGCTTCTCCAACTAGT
CTCAACTTCTACATAAGAAAACCTTACAGCAACATACGATCTCTGAGTGTCTGCTCGTCA
CTTCGGTCTTCAGACTAGAACCACAGTTAAAACCGCTTCAACAGCATAGCGGTTTTGTCC
TGATCTACAATTGAATTCCTAAGAGAAACTAACAGCAAACAACGAGTTTACTCTTGAGAT
CAGTCACTGCTCAAACGGAACTCGTACGAACAACCGACCGTGCATGCTCATGACAGCAGG
TGTGCGAAGCGGGTCGATTCTTGCTGATAAGCCAACAATCTTTTTGAATGGCGTAATGCC
CCAAGGATTGTCAAGCTGCTCAGGCTCGCCTGTTATAATCAGTCGTCCAGCCGGATCTGA
TTGAATATGAATCTCTTTGCGAAGAAGTCCAGGTACCAAAGCATATATCTCAAAGGAATC
CTTAGTTTCTTTGACACTTATCTTCACCCAGTCAGCAAGGGGTCCATCATCAACAACATC
AGCAATCGACTGTTTTTCTGCTTCTTGGGAAAGAACAAGGTCCATGCCAGTTTGTGTTTT
GGGTTTCTGGAAGCCAATGCTTTTGAGTTTCTTTTGCTTTGGGGTTGAGCTTAAGCCCTT
ATCCTCTCCACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CH30JQ U 1
AF RR4CI92JQ U 46
BS 1 638 RR4CH30JQ
BS 639 735 RR4CI92JQ

RD RR4CH30JQ 638 0 0
GGTCAATAAGAAAAGCTTAACACTCAATTGTTTGACAGATACATAATACATATATCATTG
TTAGTTGCATCCTAAAAATGCTGTAAACTATAAGATATGGAGCAAGCTTCTCCAACTAGT
CTCAACTTCTACATAAGAAAACCTTACAGCAACATACGATCTCTGAGTGTCTGCTCGTCA
CTTCGGTCTTCAGACTAGAACCACAGTTAAAACCGCTTCAACAGCATAGCGGTTTTGTCC
TGATCTACAATTGAATTCCTAAGAGAAACTAACAGCAAACAACGAGTTTACTCTTGAGAT
CAGTCACTGCTCAAACGGAACTCGTACGAACAACCGACCGTGCATGCTCATGACAGCAGG
TGTGCGAAGCGGGTCGATTCTTGCTGATAAGCCAACAATCTTTTTGAATGGCGTAATGCC
CCAAGGATTGTCAAGCTGCTCAGGCTCGCCTGTTATAATCAGTCGTCCAGCCGGATCTGA
TTGAATATGAATCTCTTTGCGAAGAAGTCCAGGTACCAAAGCATATATCTCAAAGGAATC
CTTAGTTTCTTTGACACTTATCTTCACCCAGTCAGCAAGGGGTCCATCATCAACAACATC
AGCAATCGACTGTTTTTCTGCTTCTTGGGAAAGAACAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4CI92JQ 690 0 0
ATACATATATCATTGTTAGTTGCATCCTAAAAATGCTGTAAACTATAAGATATGGAGCAA
GCTTCTCCAACTAGTCTCAACTTCTACATAAGAAAACCTTACAGCAACATACGATCTCTG
AGTGTCTGCTCGTCACTTCGGTCTTCAGACTAGAACCACAGTTAAAACCGCTTCAACAGC
ATAGCGGTTTTGTCCTGATCTACAATTGAATTCCTAAGAGAAACTAACAGCAAACAACGA
GTTTACTCTTGAGATCAGTCACTGCTCAAACGGAACTCGTACGAACAACCGACCGTGCAT
GCTCATGACAGCAGGTGTGCGAAGCGGGTCGATTCTTGCTGATAAGCCAACAATCTTTTT
GAATGGCGTAATGCCCCAAGGATTGTCAAGCTGCTCAGGCTCGCCTGTTATAATCAGTCG
TCCAGCCGGATCTGATTGAATATGAATCTCTTTGCGAAGAAGTCCAGGTACCAAAGCATA
TATCTCAAAGGAATCCTTAGTTTCTTTGACACTTATCTTCACCCAGTCAGCAAGGGGTCC
ATCATCAACAACATCAGCAATCGACTGTTTTTCTGCTTCTTGGGAAAGAACAAGGTCCAT
GCCAGTTTGTGTTTTGGGTTTCTGGAAGCCAATGCTTTTGAGTTTCTTTTGCTTTGGGGT
TGAGCTTAAGCCCTTATCCTCTCCACATCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL8959Contig1 920 2 8 U
GGTCCTCGGAGATGCCATCCAGAAGATTGTCCACCTTGCAAAACTCTAGTAAAGAGATCA
TGTCACTGTGGCGCTATGGTGCATGCATTCGAGTGTATTGAGTACAATACATTGTCTGAG
AAGGACCAATCGAAGGCCCGCTCATGCCGTGGACCTTGTCACAGAAAATTACCAAACTGT
ACGCATCTGTGTCCGGAGATATGTCATCCTGGGCAGTGTCCATCGCCAGACAAGTGTGGT
AAAAAGGTGGTTGTTCGTTGCATGTGCCTAACTTTGAAGAAGGAATGGGTATGCAAAGAC
GTTCAAGCAGCACATAGAGCCGCAGGTTCTGATCCTAAAGATGTACAAAAGAACCAGTTT
GGAGTCGGTCTGCTTCCCTGTGATTCCAACTGTAAGAGCAAACTACAGATGGCTGAATCG
GTGTTACAACAACGCAATGTCAAAGCGATTGAGGAGAAGGATGAGCCTAGTGGGAAAAAT
GCAACAAAGCGAAGGAAGAGGCGTGAACGGGGTCAGGACGTTAAGGAGACCTCAAGGCTG
CAGAAACTTATCGTTGCCACAAAAAAGGTAGTGATGGTTGTGATGCTAATTGCTGTTCTG
GTCGCTGTTTCGTACTACGGTTATAAGGGAATCTTGTGGCTTTCCGATTGGATGAATGAA
GTCGAAGAACAAAGACTAAAGTCTAGAAGGTACCCGCGTATCTGAAATCGTTTTTTGAGA
GTTCTTGATTCTCAAAGCTTTGAGCCTGATACTACCGTCCAGTTACAACACAGTTGAAAG
AAAGTTAAAAGAGATTTTCAGTTTGTTTTAATGATTGTACTCTCTGCTTTTAGCATTTTA
AAACAGCAAAACTGCAATACATGCATTTTGTCAGAACTTAAAATTTCATAGTTTTCTATA
GTTTTAGAAAATTTTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C906TF U 1
AF RR4C906JQ C 172
BS 1 687 RR4C906TF
BS 688 688 RR4C906JQ
BS 689 735 RR4C906TF
BS 736 736 RR4C906JQ
BS 737 767 RR4C906TF
BS 768 768 RR4C906JQ
BS 769 779 RR4C906TF
BS 780 920 RR4C906JQ

RD RR4C906TF 782 0 0
GGTCCTCGGAGATGCCATCCAGAAGATTGTCCACCTTGCAAAACTCTAGTAAAGAGATCA
TGTCACTGTGGCGCTATGGTGCATGCATTCGAGTGTATTGAGTACAATACATTGTCTGAG
AAGGACCAATCGAAGGCCCGCTCATGCCGTGGACCTTGTCACAGAAAATTACCAAACTGT
ACGCATCTGTGTCCGGAGATATGTCATCCTGGGCAGTGTCCATCGCCAGACAAGTGTGGT
AAAAAGGTGGTTGTTCGTTGCATGTGCCTAACTTTGAAGAAGGAATGGGTATGCAAAGAC
GTTCAAGCAGCACATAGAGCCGCAGGTTCTGATCCTAAAGATGTACAAAAGAACCAGTTT
GGAGTCGGTCTGCTTCCCTGTGATTCCAACTGTAAGAGCAAACTACAGATGGCTGAATCG
GTGTTACAACAACGCAATGTCAAAGCGATTGAGGAGAAGGATGAGCCTAGTGGGAAAAAT
GCAACAAAGCGAAGGAAGAGGCGTGAACGGGGTCAGGACGTTAAGGAGACCTCAAGGCTG
CAGAAACTTATCGTTGCCACAAAAAAGGTAGTGATGGTTGTGATGCTAATTGCTGTTCTG
GTCGCTGTTTCGTACTACGGTTATAAGGGAATCTTGTGGCTTTCCGATTGGATGAATGAA
GTCGAAGAACAAAGACTAAAGTCTAGA*GGTACCCGCGTATCTGAAATCGTTTTTTGAGA
GTTCTTGATTCTCAA*GCTTTGAGCCTGATACTACCGTCCAGTTACA*CACAGTTGAAA
AAA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4C906JQ 749 0 0
CCAAACTGTACGCATCTGTGTCCGGAGATATGTCATCCTGGGCAGTGTCCATCGCCAGAC
AAGTGTGGTAAAAAGGTGGTTGTTCGTTGCATGTGCCTAACTTTGAAGAAGGAATGGGTA
TGCAAAGACGTTCAAGCAGCACATAGAGCCGCAGGTTCTGATCCTAAAGATGTACAAAAG
AACCAGTTTGGAGTCGGTCTGCTTCCCTGTGATTCCAACTGTAAGAGCAAACTACAGATG
GCTGAATCGGTGTTACAACAACGCAATGTCAAAGCGATTGAGGAGAAGGATGAGCCTAGT
GGGAAAAATGCAACAAAGCGAAGGAAGAGGCGTGAACGGGGTCAGGACGTTAAGGAGACC
TCAAGGCTGCAGAAACTTATCGTTGCCACAAAAAAGGTAGTGATGGTTGTGATGCTAATT
GCTGTTCTGGTCGCTGTTTCGTACTACGGTTATAAGGGAATCTTGTGGCTTTCCGATTGG
ATGAATGAAGTCGAAGAACAAAGACTAAAGTCTAGAAGGTACCCGCGTATCTGAAATCGT
TTTTTGAGAGTTCTTGATTCTCAAAGCTTTGAGCCTGATACTACCGTCCAGTTACAACAC
AGTTGAAAGAAAGTTAAAAGAGATTTTCAGTTTGTTTTAATGATTGTACTCTCTGCTTTT
AGCATTTTAAAACAGCAAAACTGCAATACATGCATTTTGTCAGAACTTAAAATTTCATAG
TTTTCTATAGTTTTAGAAAATTTTGAATC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL8960Contig1 824 2 2 U
GACTCCAAGGAAGATGAAATTGCAACTCAGATAGCTAAAGATTTCCTCTTTGGCTGGATG
TTGAAGCCTTTGGTGTTTGGGGACTATCCTAATGAAATGAAGAGAATCTTGGGGTCTAGG
TTACCTGTTTTCTCAGAGGAAGAGTCAGAGCTAGTTAAAGGATCATCTGACTTTATAGGA
ATTATCTACTACGTGACAGTCTATGTGAAAAACAGTAATCCCACACCTTCTCTGCTTCCC
AGAAGACAAGACTTCTATACAGACATGGGCGCTGTGACGATCTTCATGGGGAATTCTACA
TTCTTTGAGTGGGATGCTATTCCATGGGGTCTTGAAAGTGTTTTGGAGTATATGAAACAG
AGCTATAACAATCCTCCAGTCTACATTCTTGAAAACGGTAGAGGGATGGAACATGGTTCG
ACGCTACAAGACACACCAAGAATTGAATACATTCAAGCTTACATTGGTGCTGTTCTCAAC
GCCATCAAGAATGGATCGGACGCAAGAGGATACTTCGTATGGTCGATGATCGATGTGTAC
GAGTTGTTGAGTGGCTACATGTACAGCTATGGGATGTACGATGTGAATTTCAGCGACCCT
GGTCTCAAGAGGTCACCAAAGCTATCTGCTTCTTGGTACACTGGTTTTCTCAATGGCACA
GTTGATGTTCATCCTCAAGCTATTAGTACGTTAGAGAGAAACATCTCCGGCTACTCTTCA
TTTTAATCTGTTTATATATATAACAACTTTGATCTTGATTTTCGGTAATGGAAATCATAC
TTTATATGGCAAAATTGGTATAATAAGATTTGCATTTGATCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AE94TF U 1
AF RR4AE94JQ C 111
BS 1 784 RR4AE94TF
BS 785 824 RR4AE94JQ

RD RR4AE94TF 784 0 0
GACTCCAAGGAAGATGAAATTGCAACTCAGATAGCTAAAGATTTCCTCTTTGGCTGGATG
TTGAAGCCTTTGGTGTTTGGGGACTATCCTAATGAAATGAAGAGAATCTTGGGGTCTAGG
TTACCTGTTTTCTCAGAGGAAGAGTCAGAGCTAGTTAAAGGATCATCTGACTTTATAGGA
ATTATCTACTACGTGACAGTCTATGTGAAAAACAGTAATCCCACACCTTCTCTGCTTCCC
AGAAGACAAGACTTCTATACAGACATGGGCGCTGTGACGATCTTCATGGGGAATTCTACA
TTCTTTGAGTGGGATGCTATTCCATGGGGTCTTGAAAGTGTTTTGGAGTATATGAAACAG
AGCTATAACAATCCTCCAGTCTACATTCTTGAAAACGGTAGAGGGATGGAACATGGTTCG
ACGCTACAAGACACACCAAGAATTGAATACATTCAAGCTTACATTGGTGCTGTTCTCAAC
GCCATCAAGAATGGATCGGACGCAAGAGGATACTTCGTATGGTCGATGATCGATGTGTAC
GAGTTGTTGAGTGGCTACATGTACAGCTATGGGATGTACGATGTGAATTTCAGCGACCCT
GGTCTCAAGAGGTCACCAAAGCTATCTGCTTCTTGGTACACTGGTTTTCTCAATGGCACA
GTTGATGTTCATCCTCAAGCTATTAGTACGTTAGAGAGAAACATCTCCGGCTACTCTTCA
TTTTAATCTGTTTATATATATAACAACTTTGATCTTGATTTTCGGTAATGGAAATCATAC
TTTA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR4AE94JQ 714 0 0
GGGGTCTAGGTTACCTGTTTTCTCAGAGGAAGAGTCAGAGCTAGTTAAAGGATCATCTGA
CTTTATAGGAATTATCTACTACGTGACAGTCTATGTGAAAAACAGTAATCCCACACCTTC
TCTGCTTCCCAGAAGACAAGACTTCTATACAGACATGGGCGCTGTGACGATCTTCATGGG
GAATTCTACATTCTTTGAGTGGGATGCTATTCCATGGGGTCTTGAAAGTGTTTTGGAGTA
TATGAAACAGAGCTATAACAATCCTCCAGTCTACATTCTTGAAAACGGTAGAGGGATGGA
ACATGGTTCGACGCTACAAGACACACCAAGAATTGAATACATTCAAGCTTACATTGGTGC
TGTTCTCAACGCCATCAAGAATGGATCGGACGCAAGAGGATACTTCGTATGGTCGATGAT
CGATGTGTACGAGTTGTTGAGTGGCTACATGTACAGCTATGGGATGTACGATGTGAATTT
CAGCGACCCTGGTCTCAAGAGGTCACCAAAGCTATCTGCTTCTTGGTACACTGGTTTTCT
CAATGGCACAGTTGATGTTCATCCTCAAGCTATTAGTACGTTAGAGAGAAACATCTCCGG
CTACTCTTCATTTTAATCTGTTTATATATATAACAACTTTGATCTTGATTTTCGGTAATG
GAAATCATACTTTATATGGCAAAATTGGTATAATAAGATTTGCATTTGATCTAG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL8961Contig1 898 2 6 U
GGTGCTGATTTTGAGGGAATAGAGCGTCTTGGATTGGTTACAGGCGGTGAAATCGCTTCC
ACCTTCGACAACCCAGAGTCTGTTAAGCTTGGGCATTGCAAGCTCATCGAAGAGATTATG
ATTGGTGAAGACAAGTTGATCCATTTCTCTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATT
GTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCG
CTGTGTGTACTCTCACAAACAGTGAATGACAGCAGAGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCA
GAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGACGAGCTTGCGAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCG
CATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAAT
GCTGGTTTAGACAGTGCAGAATTGGTGGCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGG
TGTAACGCTGGGATCGATGTCATCTCCGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATC
TATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCCGTTCTGCTTTCAGCGACAGAGGCAGCTGAGATG
ATACTGAGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGA
AGTCCAACACATGCACCTGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATTTACACGATCACACCCT
CCCCAGTGACATTGTTCTGTTCTGTTATTAGATTTGTGTTTTGTATTTGGATCACAAAAC
AGCCTTTAAATGTTTTAGTGTTTTGCTCCCTAAACTTTTCTCTCTTTTTGCGACCTCTTC
GGATATTGTTTTGAATTTTTGATTGTGACAAAATATTAGCTCCAAGGAGTTTGAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DU80TF U 1
AF RR4DU80JQ C 149
BS 1 723 RR4DU80TF
BS 724 724 RR4DU80JQ
BS 725 767 RR4DU80TF
BS 768 768 RR4DU80JQ
BS 769 779 RR4DU80TF
BS 780 898 RR4DU80JQ

RD RR4DU80TF 779 0 0
GGTGCTGATTTTGAGGGAATAGAGCGTCTTGGATTGGTTACAGGCGGTGAAATCGCTTCC
ACCTTCGACAACCCAGAGTCTGTTAAGCTTGGGCATTGCAAGCTCATCGAAGAGATTATG
ATTGGTGAAGACAAGTTGATCCATTTCTCTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATT
GTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCG
CTGTGTGTACTCTCACAAACAGTGAATGACAGCAGAGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCA
GAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGACGAGCTTGCGAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCG
CATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAAT
GCTGGTTTAGACAGTGCAGAATTGGTGGCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGG
TGTAACGCTGGGATCGATGTCATCTCCGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATC
TATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCCGTTCTGCTTTCAGCGACAGAGGCAGCTGAGATG
ATACTGAGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGA
AGTCCAACACATGCACCTGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATTTACACGATCACACCCT
CCC*AGTGACATTGTTCTGTTCTGTTATTAGATTTGTGTTTTGTATT*GGATCACAAAA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR4DU80JQ 750 0 0
CTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTC
TAGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCGCTGTGTGTACTCTCACAAACAGTGAATG
ACAGCAGAGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGACG
AGCTTGCGAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCGCATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTT
TAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCAGAATTGGTGG
TTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGATGTCATTTCCG
GAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATTTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCCG
TTTTGCTTTCAGCGACAGAGGCAGCTGAGATGATACTGAGAGTGGATGAGATCATTACAT
GTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAGTCCAACACATGCACCTGGTGGGAGAG
AGATTTCATGATGATTTACACGATCACACCCTCCCCAGTGACATTGTTTTGTTTTGTTAT
TAGATTTGTGTTTTGTATTTGGATCACAAAACAGCCTTTAAATGTTTTAGTGTTTTGCTC
CCTAAACTTTTCTCTCTTTTTGCGACCTCTTCGGATATTGTTTTGAATTTTTGATTGTGA
CAAAATATTAGCTCCAAGGAGTTTGAACTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL8962Contig1 1099 2 4 U
GGGATCTCCATCTACAATGGGAAACTGTCTAAAACCTTTCAAAGAACAAGCTCCTTCAAC
TTCTCCCAAGCCTCTCACCATCCCTCCAGTTCCAGAGCTAGAAATCGAGAATCTGAGAGT
CTTCAGCTCCAAGGAAGTGAAGAAACTAACAAAGAAATTCGGGCATAATAGGCTTGCAGT
TGGCAATAATGGGTTTGGTCGATCATTCTACCAGGGATACGTTGATGAGACTACATTTTC
TCCATCTAAAAACGGAACAGGAATAGCTGTTTCTGTCATGCACTGTGTTCTAAATAGTTC
AGAGGAACTAGAAGAGTGGAAGGCAGAAATTAGGTGTCTAGGAAAGATTTCTCATCCAAA
TTTGGTCAAACTCTTAGGCTACTGCTGTGAAGTTAAAGAATCCCTCTTGGTTCTTGAATG
TTTCCACAAAGGAAGTCTTGAAGCTCACATTTTTGGAAAAGAAGAAGAGAAACTGCCTTG
GGAAATACGTCTTAAGATAGCCATTGGAACAGCTCAGTGTCTTACATTTCTCCACTCGGT
CAATAACAGAGCGTTATCTCGAGAATTCGGAATGCATGACATTTTCCTTGACGAGCAATA
CAATGCGAAACTGTTTTACCCTGGATCAAACGAGCTACGTTTGTTTGAAGACAGTGTCTC
GACCGCATTCATTGGAAGAACTGATTACACACCTCCTGAATATGTAATCTCAGGTCATTT
GGGGATGAAGAGCGATGTTTATACACTTGGTGTGATCTTGATTGAGCTTTTAACTGGTCT
GAAAGCTTTCCGTAGAGGAGTGAGAGACATAAAAAGTGCCATCTCGGCTAAACCTTTCTT
ATCCGATAAGAATAAAATCCTGAGTATAATCGATCCGAGACTTGGAAACGACTATCCTGT
CAATGCGGTGATACAAATGGGAAAACTCATCAAAAGATGCATCAAGTTGGACACGAAGAA
GCGACCAACGATGCAACAAGTTTTGGATGGTTTGAATGATATTGCAGAGAATAAGGTTTA
ATGCGAAAGAGTTGAAAAATGTTCGAAGTTAATTTGTAATAATCAATTTCATTGTCATCA
ATACATTATCCTCGCTTGG


BQ
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AF RR4FI04TF U 1
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DS 

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QA 1 570 1 570
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4DS71JQ C 1
AF RR4DS71TF U 1
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CTTCCTCACGGACCGGCCTTCTACAAAGGTTCACTCAGCTCCAGGAGGTGGCTCGTCTCT
GAATTACCTCTTTGGTGGTGGTGGCGGCAGCAACTAATAAACGAGGACAACTGTGTCACT
CTCTATCTTCTTATCACCAAGTCCTCCTTCTCAGTCAAAAAAAAAAAGTCCTCCTTCTGT
CATTCTTGTGGAGCTTCTTATTCCTGGCAAAAACTGTCTTTATATGATGTCTTAATATTC
GTATGCATATGTGTTTCTTATGTTGTGTATTCCGTATTTCAAAAATAACCCTGGTGATGA
TAATACCAAATTTCTAAGTTTTCATG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CW85TF U 1
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DS 

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AAGTCATAGCAAAACCAGAGCTAGATGGAATACGCTTAGCCATTCCTTCAGCCACTAGGA
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TCAGAAGGTTCTTTCCG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4BX64JQ C 1
AF RR4BX64TF U 1
BS 1 594 RR4BX64TF

RD RR4BX64JQ 594 0 0
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DS 

RD RR4BX64TF 594 0 0
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CGAACTTCATAACCCAAAATAGACTGATAATTCAAGAAAAAGATGTTATCTTTTTTGGTG
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GGATGATCTATCTTCAACACTGGCATCAAAAATTATCAATTTAACATTTTGTAGCTATTA
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QA 1 594 1 594
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8968Contig1 774 2 4 U
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TCTTTATAGATATTGCCTATCTACAATGATTACCATCAATAAATATGATTCTAC


BQ
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AF RR4GF37TF U 1
AF RR4GF37JQ C 42
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AAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGAAACTTTAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTTGGTATT
CAGGAGCATATTGATTTGGGTATTAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGAC
TTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCACGTCGTAGAAGATGCAAGACT
CGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTGACTAAAGATGATGCTATGAA*TGGTTTCAAGTGAAA
TATGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAGAAATATTGTCTGA
AACATATATGCTCGAACCGGGTTTTCTCAGTTTTGTTTTGTTCTTTAGACATTTGAATTT

QA 1 720 1 720
DS 

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GTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAA
CATCTCCGTTGGTGAGAGTGGAGATCGTCTTACCAGAGCCTCCAAGGTGTTGGAACAATT
GAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAGGCACGGTACACTGTTCGTTCTTTCGGTATCAG
ACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTTACTGTCAGGGGAGACAAGGCAATGCAGCTCCT
TGAGAGTGGACTCAAGGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGAAACTTTAGCGACACTGG
TTGCTTCGGTTTTGGTATTCAGGAGCATATTGATTTGGGTATTAAGTATGACCCGTCGAC
TGGAATCTACGGTATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCACG
TCGTAGAAGATGCAAGACTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTGACTAAAGATGATGCTAT
GAAATGGTTTCAAGTGAAATATGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGG
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TCTTTAGACATTTGAATTTTCTTTATAGATATTGCCTATCTACAATGATTACCATCAATA
AATATGATTCTAC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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AAGAAGGAAGATGCGCGAAGAGAGTTATATCACTTGGAATGGGAGACCCAACACTGTACT
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ATTGTAGCCATATGAACAGTCATTTTATATATTAAAAAAAAGAACACTTTATTTTTGACG
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AACCAAACTAATTTCGAACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AH77TF U 1
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BS 733 861 RR4AH77JQ

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TTATGTTTTTCTCTGCTTTTATTTCCTTTTATAGTTTAACGCCGCCGTCACCACCGTCAA
TCTTTTATAACGCTGCGGTGTATTTGATTACTTTTCTTTGGAAACAAATCTTTGGTAATT
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GTGGTTCTGTTA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4AH77JQ 790 0 0
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TATGCTCCCACCGTTGGTTTTCCTCAAACTCGAAGGGTATTTTCGTCATTTATGTTTTTC
TCTGCTTTTATTTCCTTTTATAGTTTAACGCCGCCGTCACCACCGTCAATCTTTTATAAC
GCTGCGGTGTATTTGATTACTTTTCTTTGGAAACAAATCTTTGGTAATTATTGTAGCCAT
ATGAACAGTCATTTTATATATTAAAAAAAAGAACACTTTATTTTTGACGTCATAAAAAGA
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QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ11TF U 1
AF RR4GJ11JQ C 1
BS 1 592 RR4GJ11TF
BS 593 627 RR4GJ11JQ

RD RR4GJ11TF 592 0 0
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TTGAAGAGAGAGCTGAGACCATTTTGCTCATCCTCAAGCATAGATACCCAGGGATTTCTC
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GAGCTACTCAAGAATACTGGAGAGCTTGGCGTACACGGTACTGTCGAGAATCAACGACGT
TCTAGATGCAGATCGAGCGGTGAGCAAGAGGAGCACGACACCAACGGAATCAGAGGAAGA
GACACTTGTGGGAAGCATGACGTTATCGGATTTCATGGGATGGGACTTCGATCAGGGGAA
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GGCGCGGCATTGATCAGGGCGGACTTTTTTTCATAGTGGAGATAAATTACTACTTATTAG
GGTTCAAACTAAAAAGATGGGTTTTGTAAATTTGTTTCCATTTCTTTTTTAT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4GJ11JQ 627 0 0
GGGATAACAAAACATCGGCTCCGTGGGCCTCAGGCGTGAGTCTAGAGAAGCGAGAGGTTT
TTGAAGAGAGAGCTGAGACCATTTTGCTCATCCTCAAGCATAGATACCCAGGGATTTCTC
AGTCTTTCTAGACATCAGCAAAATCCAATTCAGCAAGGACGTGGGGCAATCGGTGCTGGA
GAGCTACTCAAGAATACTGGAGAGCTTGGCGTACACGGTACTGTCGAGAATCAACGACGT
TCTAGATGCAGATCGAGCGGTGAGCAAGAGGAGCACGACACCAACGGAATCAGAGGAAGA
GACACTTGTGGGAAGCATGACGTTATCGGATTTCATGGGATGGGACTTCGATCAGGGGAA
CGAAGACTCGGATTCGAAGAAAGATACGTCGGATGATCCGTTGGCGAAGGAGAAGCTAAA
TGTCGTCACTACCAAGAAGACGTCATACCTCGATACCCTAGGCGAGGTCAAGAGTCCAAC
GGCGCGGCATTGATCAGGGCGGACTTTTTTTCATAGTGGAGATAAATTACTACTTATTAG
GGTTCAAACTAAAAAGATGGGTTTTGTAAATTTGTTTCCATTTCTTTTTTATCAAAAGCG
GGTTTAATATTAGACCCATTTTATTGT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL8972Contig1 670 2 2 U
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GAGATTGACAGTCACCAAGGAATGAAGATAATTGGAGTAAAACACACTGAGTGTGCTCTT
AAGGTGGATTCAGCTCTGACCGTTGTTGGTAATGCCACGAAAGACGACAGAGGGAATATC
ACCATTCGGGACCCACTGTTTGTTTGTCCATCTGATGTTGACTACAATGTGGCCAAATCG
ACGGTGTTTGGACAGCCGAGTGCATGGGATATTGGGTGGATGGCTGCATTTGCCTTGTCT
GCAGTATTATTCGCGACTGAGAGTCTGAAGAAAATTTCTTTCAGTGAGACTCCCTCTCAT
GTTGCTGATGGTTTGGATTTCCTCTTCAAAGTTGACATACCATAGTGGACTTTGCCTATC
AATAAACAGGATTCTGTCTGCTGCAAGAAAAAGAGTTGACCGAGTCTGTTTTTCCAATCA
TCTTCCACTTCACCACCATTAAGAAGACATGATTCTCTTTTGACATGTTAGTTATCTGAC
ACTAGTATCTAAGTATCCTCTATGATGATGAATCTACTAAGGAACCGTTTGTTTTGTGAG
TATGGTTATGTTTTGCTTGATACATGTTTAGCAGTTAGTTGCATGACCAGTTTTTCTTAA
TGATCTTGCG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DR04TF U 1
AF RR4DR04JQ C 5
BS 1 604 RR4DR04TF
BS 605 670 RR4DR04JQ

RD RR4DR04TF 604 0 0
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GAGATTGACAGTCACCAAGGAATGAAGATAATTGGAGTAAAACACACTGAGTGTGCTCTT
AAGGTGGATTCAGCTCTGACCGTTGTTGGTAATGCCACGAAAGACGACAGAGGGAATATC
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AATAAACAGGATTCTGTCTGCTGCAAGAAAAAGAGTTGACCGAGTCTGTTTTTCCAATCA
TCTTCCACTTCACCACCATTAAGAAGACATGATTCTCTTTTGACATGTTAGTTATCTGAC
ACTAGTATCTAAGTATCCTCTATGATGATGAATCTACTAAGGAACCGTTTGTTTTGTGAG
TATG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4DR04JQ 666 0 0
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TATTATTCGCGACTGAGAGTTTGAAGAAAATTTCTTTCAGTGAGACTCCCTCTCATGTTG
CTGATGGTTTGGATTTCCTCTTCAAAGTTGACATACCATAGTGGACTTTGCCTATCAATA
AACAGGATTCTGTTTGCTGCAAGAAAAAGAGTTGACCGAGTCTGTTTTTCCAATCATCTT
CCACTTCACCACCATTAAGAAGACATGATTCTCTTTTGACATGTTAGTTATCTGACACTA
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GTTATGTTTTGCTTGATACATGTTTAGCAGTTAGTTGCATGACCAGTTTTTCTTAATGAT
CTTGCG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL8973Contig1 895 2 6 U
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TGTTTCCTTGTGCAATAAGGTGGGAGAAGATAAAGCTGAGAGGGGAAACAAATCAGACAT
TGATAAAGATGAGTGTCTTAAATGGCTTGATTCTAAGGAAGGTGGTTCTGTGCTGTACGT
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TTCAGTGTGGTTCTTAGAGAGCGGTTTTGAAGAAAGGGTCAAAGAAAGAGGGCTTCTCAT
TAAAGGATGGGCACCTCAAGTGCTTATCCTTTCACACCCTTCTGTTGGAGGATTCTTGAC
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ATCCAATAATTGATTTATTATATGTCTTTGTTAAAAGAAATATAAACATTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EI52TF U 1
AF RR4EI52JQ C 124
BS 1 674 RR4EI52TF
BS 675 675 RR4EI52JQ
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BS 687 723 RR4EI52TF
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RD RR4EI52TF 728 0 0
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GCCTGCTTATGTCAAAGACTACAAGGAAGTAAGGTCAGGTAAAGCATGGTCCATTGGACC
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TGATAAAGATGAGTGTCTTAAATGGCTTGATTCTAAGGAAGGTGGTTCTGTGCTGTACGT
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TAAAGGATGGGCACCTCAAGTGCTTATCCTTTCACACCCTTCTGTTGGAGGATTCTTGAC
ACACTGTGGATGGAACTCAACTCTTGAAGGGATAACCTCTGGTCTACCACTACTTACTTG
GCCTTTGTTTGCAGAGCAATTCTGCAATGAGAAACTAGTTGTTCAGGTACTAAAAGCCGG
TGTGAAAGTAGGGGTTGAGCAGCCTATGAAATGGGGAGAAGAGGAGAAGATAGGAGTGTT
GGTGGATAAAGAAG*AGTGAAGAAG*CAGTGGAAGAGTTGATGGGTGAGAGTGATGATGC
AAA
GAGTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR4EI52JQ 772 0 0
TTCCTTGTGCAATAAGGTGGGAGAAGATAAAGCTGAGAGGGGAAACAAATCAGACATTGA
TAAAGATGAGTGTCTTAAATGGCTTGATTCTAAGGAAGGTGGTTCTGTGCTGTACGTTTG
TCTTGGAAGTGTCTGCAATCTTCCTTTGTCTCAGCTCAAGGAGCTTGGCCTAGGCTTAGA
AGAATCCCAAAGACCTTTTATTTGGGTCATAAGAACTTGGGAAAAGTATAATGAGCTTTC
AGTGTGGTTCTTAGAGAGCGGTTTTGAAGAAAGGGTCAAAGAAAGAGGGCTTCTCATTAA
AGGATGGGCACCTCAAGTGCTTATCCTTTCACACCCTTCTGTTGGAGGATTCTTGACACA
CTGTGGATGGAACTCAACTCTTGAAGGGATAACCTCTGGTCTACCACTACTTACTTGGCC
TTTGTTTGCAGAGCAATTCTGCAATGAGAAACTAGTTGTTCAGGTACTAAAAGCCGGTGT
GAAAGTAGGGGTTGAGCAGCCTATGAAATGGGGAGAAGAGGAGAAGATAGGAGTGTTGGT
GGATAAAGAAGGAGTGAAGAAGGCAGTGGAAGAGTTGATGGGTGAGAGTGATGATGCAAA
AGAGTGGAGAAGAAGAGCCAAAGAGCTTGGAGAGTTAGCTCACAAGGCTGTGCAAGAAGG
AGGCTCTTCTCATTCTAATATCACTTTACTCTTAGAAGACATAATTCAACTAGCTCAATC
CAATAATTGATTTATTATATGTCTTTGTTAAAAGAAATATAAACATTTATAC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL8974Contig1 596 2 1 U
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CGAACAACCCTAACAGCTGGAAGAAACCTGAAGAGTTTAGACCTGAGAGGTTCTTTGAAG
AAGAGGCGCACGTGGAAGCCAATGGTAATGACTTTAGGTATGTGCCTTTTGGTGTTGGAC
GTAGAAGCTGTCCTGGGATTATATTGGCGTTGCCCATTTTGGGAATCACTATTGGTAGGT
TGGTTCAGAACTTCGAGCTACTTCCTCCTCCGGGACAATCTAAAGTGGATACTACTGAGA
AAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTAACCACTCAACAATCGTAATGAAGCCAAGGA
CCTTTTGAATTTTCTAAATTAAAAAAAAACACAAGAAAATTTAATTTCTGCAAAATGACT
TTTGTAAAGGATGGTTGTGAGATATGCTGAATATTCATTACTTGTTTTGTTTCTTTTGGA
AGGTGTTAATGTGAATGTCGGTAAAGAGGTGGTGCGCTGATTGAAATAACTAGTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EI24JQ C 1
AF RR4EI24TF U 1
BS 1 596 RR4EI24TF

RD RR4EI24JQ 596 0 0
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GTAGAAGCTGTCCTGGGATTATATTGGCGTTGCCCATTTTGGGAATCACTATTGGTAGGT
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AAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTAACCACTCAACAATCGTAATGAAGCCAAGGA
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TTTGTAAAGGATGGTTGTGAGATATGCTGAATATTCATTACTTGTTTTGTTTCTTTTGGA
AGGTGTTAATGTGAATGTCGGTAAAGAGGTGGTGCGCTGATTGAAATAACTAGTGG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR4EI24TF 596 0 0
GGCTTAGACTAAGAATGGCTATTCCTCTCCTCGTGCCTCACATGAACCTCAACGATGCTA
AGCTCGCCGGGTACGACATCCCAGCGGAAAGCAAGATCCTTGTCAATGCCTGGTGGCTAG
CGAACAACCCTAACAGCTGGAAGAAACCTGAAGAGTTTAGACCTGAGAGGTTCTTTGAAG
AAGAGGCGCACGTGGAAGCCAATGGTAATGACTTTAGGTATGTGCCTTTTGGTGTTGGAC
GTAGAAGCTGTCCTGGGATTATATTGGCGTTGCCCATTTTGGGAATCACTATTGGTAGGT
TGGTTCAGAACTTCGAGCTACTTCCTCCTCCGGGACAATCTAAAGTGGATACTACTGAGA
AAGGTGGACAGTTCAGCTTGCACATCCTTAACCACTCAACAATCGTAATGAAGCCAAGGA
CCTTTTGAATTTTCTAAATTAAAAAAAAACACAAGAAAATTTAATTTCTGCAAAATGACT
TTTGTAAAGGATGGTTGTGAGATATGCTGAATATTCATTACTTGTTTTGTTTCTTTTGGA
AGGTGTTAATGTGAATGTCGGTAAAGAGGTGGTGCGCTGATTGAAATAACTAGTGG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL8975Contig1 682 2 6 U
GGGGAATTCAACTCATCTGAAAATGGAGGCTCAAAAGCAAGACAATGAACACATTTTCCG
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CACGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACCTCAGTTGG
ACTAAGAAAAGGTCAGGTAATGGTTGTGGTTCTACCAAACGTGGCCGAGTATGGGATTAT
TGCCCTTGGCATTATGTCCGCCGGTGGAGTTTTCTCCGGCGCTAACCCTACGGCTCTTGT
CTCGGAGATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCTGGTGCCAGAGGAATCATCACTGATTCTAC
TAACTTCGAAAAGGTTAAGAATTTGGGTCTACCGGTAATATTGTTAGGTGAAGAGAAGAT
CGAAGGAGCAGTGAACTGGAAAGATATTCTAGAAGCAGGAGATAAATGTGGAGATAACAA
CAGAGTAGAGATTCTTCAGACAGATCTATGTGCACTTCCTTTCTCTTCAGGCACGACAGG
GTTACAAAAAGGAGTAATGCTCACGCATCGCAACCTCATAGCAAATCTTTGCTCTACTCT
CTTCAGCGTCCGGTCCGAAATG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC80TF U 1
AF RR4H241TF U 2
BS 1 396 RR4EC80TF
BS 397 397 RR4H241TF
BS 398 430 RR4EC80TF
BS 431 431 RR4H241TF
BS 432 610 RR4EC80TF
BS 611 682 RR4H241TF

RD RR4EC80TF 610 0 0
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CAGTCTATATCCATCTGTGCCCATTCCCGACAAGCTTACATTGCCTGAGTTTGTGCTACA
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CACGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACCTCAGTTGG
ACTAAGAAAAGGTCAGGTAATGGTTGTGGTTCTACCAAACGTGGCCGAGTATGGGATTAT
TGCCCTTGGCATTATGTCCGCCGGTGGAGTTTTCTCCGGCGCTAACCCTACGGCTCTTGT
CTCGGAGATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCTGGTGCTAGAGGAATCATCACTGATTCTAC
TAACTTCGAAGAGGTTAAGAATTTGGGTCTACCGGTAATATTGTTAGGTGAAGAGAAGAT
CGAAGGAGCAGTGAACTGGAAAGATATTCTAGAAGCAGGAGATAAATGTGGAGATAACAA
CAGAGTAGAGATTCTTCAGACAGATCTATGTGCACTTCCTTTCTCTTCAGGCACGACAGG
GTTACAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR4H241TF 681 0 0
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AGTCTATATCCATCTGTGCCCATTCCCGACAAGCTTACATTGCCTGAGTTTGTGCTACAA
GGAGTAGAAGAATTCACAGAGAAGGTGGCGTTCGTTGAAGCTGTGACCGGTAAAGCCGTC
ACGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACCTCAGTTGGA
CTAAGAAAAGGTCAGGTAATGGTTGTGGTTCTACCAAACGTGGCCGAGTATGGGATTATT
GCCCTTGGCATTATGTCCGCCGGTGGAGTTTTCTCCGGCGCTAACCCTACGGCTCTTGTC
TCGGAGATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCTGGTGCC*GAGGAATCATCACTGATTCTACT
AACTTCGAAAAGGTTAAGAATTTGGGTCTACCGGTAATATTGTTAGGTGAAGAGAAGATT
GAAGGAGCAGTGAACTGGAAAGATATTCTAGAAGCAGGAGATAAATGTGGAGATAACAAC
AGAGTAGAGATTCTTCAGACAGATCTATGTGCACTTCCTTTCTCTTCAGGCACGACAGGG
TTACAAAAAGGAGTAATGCTCACGCATCGCAACCTCATAGCAAATCTTTGCTCTACTCTC
TTCAGCGTCCGGTCCGAAATG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL8976Contig1 887 2 4 U
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TCTTGCTGCGAGGAATCCATTGCAACCCGAGAACAAGAAGCATGTAGAAGAAGACGATGA
TAATTGCTCCATTGCTTCTTCCATGGCATGTACTTTGAGGAGAGCCAAGTCCGGAGTGAC
TCATGGAAGCGCTCCAACATTTAGGAGTGCTCAGCGTGCTGAGCAACGCAAAGAGTATTA
CCAAAAGCTTGAGGAGAAAAACCAAGCGCTTGAAGCCGAAAGGAACGAGCTTGAACAAAG
GCAAAAGGAAGAACAAGAAGCAGCGTTGAAAAAACTTAGAAAAAATCTCAAGTTCAAGGC
TAAACCGGTCCCTAACTTCTACTACGAGGCGCCTCCTGCCAAACCTGAGCTCAAGAAGCT
TCCTTTGACTCGTCCCAAGTCGCCAAAACTCATCCTTTCTCGGAGAAAAAGCTGCAGCGA
CGCAGTCAGCTCGTCTTCGTCGTCCCGTGAAGAGGTTCCCAAGACAGCATCTAACCGGAA
CCGACACAGCACCGGAACAGTTCAGAACAAGAACACCAATGATGTGCTGCACGACGACAG
CCCTCGTTGCAGATCAGGCAAGGGTAAAAGTGGGCTTAAGCCAGTCAACGAGTCCTTGGA
AGAAGCTTGCGAGGCTTGAAAATGATGGACGATGATGCCTTTGTGTTTGTTGGTCTGTGT
TTTTTTACTCTCTTATCTAACTTTGATCTCACCGGAGAAAATTTAAAATTCAAAAACAAA
GACTCTTTGTTTGTTCGGTTATATCCCGTATATGTGGTTGGTTCACTATGTAACCGTCTT
TCTCGGTTTTTTTTACTTGTAACGTGAAACTTTGATGTTTGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BD73TF U 1
AF RR4BD73JQ C 41
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TCCTTTGACTCGTCCCAAGTCGCCAAAACTCATCCTTTCTCGGAGAAAAAGCTGCAGCGA
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CCCTCGTTGCAGATCAGGCAAGGGTAAAAGTGGGCTTAAGCCAGTCAACGAGTCCTTGGA
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DS 

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TTC
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AACGAGCTTGAACAAAGGCAAAAGGAAGAACAAGAAGCAGCGTTGAAAAAACTTAGAAAA
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CCTGAGCTCAAGAAGCTTCCTTTGACTCGTCCCAAGTCGCCAAAACTCATCCTTTCTCGG
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TGTTTGTTGGTCTGTGTTTTTTTACTCTCTTATCTAACTTTGATCTCACCGGAGAAAATT
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CACTATGTAACCGTCTTTCTCGGTTTTTTTTACTTGTAACGTGAAACTTTGATGTTTGAT
TGTC

QA 4 847 4 847
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CM69JQ C 1
AF RR4CM69TF U 1
BS 1 591 RR4CM69TF

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DS 

RD RR4CM69TF 591 0 0
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ACCACCATTGAACTACAATGATCAAGTTAACTGCGGTTCTACGAGGAAATCATCAGATTG
TACAATAATAACAGCCAGAGCTTGTAATGATAGTTCCAAATATGTTAACTGGGATGGAAT
TCATTACACTGAAGCTGCAAATCGGTTTGTTGCAAAGCACATTCTCTCTGGTAGATATTC
TGAGACGGCCTTGTCATGGAATCTTTAGAACTACTCTATTACATGGACGCATATCTGATA
GTTTTTATGTAAACTGAATATTTATCAAATGCTTCTAGAGGCTTTTGGTGC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL8978Contig1 911 2 2 U
GGTACAAATTCTTCTCAAGGGATTCAAGTCGAGCATTACAATACAGAGTTGCTTTGCAAA
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TTACAATCAAGCAGCGAGTACTAGAACTTTGATGGTTCCTTGGCTATTCGCAGTCAGCAT
CGTGGGACTATCACTCTTCCAGCAAACCGCACTAATAAAGTATGAACCCGCCTCTTCCTC
TGCTTCTTCCATGTCTAGTGATCCAAACCTATGCGATGTCACAGGTCTCGTGATCTCCTT
ATGATATACATATACTTCGTTTGTCTCGCTTCCGCAGGCGAGATACTCGCTATTCACTGT
GAGACCCACAAAGTTCTTCTCGTTAGTGTGTCCTCTAAATGTCCGAACTGGCAAGTTGTC
CTTGACATCCCATAAGCGTAGTGTGCTATCAGTAAACGCAGACGCGAGCTCGTTGTTGGA
CAAAAACTTCACATAGGAGACCGCTTTCTTGTGTCCACTGAAGACATGAAGTGGCTACTT
ATGTTTCTTAGATCGTAATAATGGATGTGATGGTCAGCTGATCCAACCGCAATGAAGTTG
CTTGAGCCAGGATTGTACTTGACACAACATATGTTTGCTTTCATATCAATGTTAAGCACA
CTTGCTTCCTGCCTTGTGCACCAAACTTTAACCTTACAATCGTCACTACCAGATACAAGC
ATAGATGGTTCTGTTCGCGAAAAATCAACGCTCCAGGCACGTTTTTCGTGCTCTTCATAC
TCCATAAGAATCTGTCTAGTAGTTACATCCCATACAGTTACTATTCCTTCATAATCACCG
CTTGCTATATG


BQ
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TTACAATCAAGCAGCGAGTACTAGAACTTTGATGGTTCCTTGGCTATTCGCAGTCAGCAT
CGTGGGACTATCACTCTTCCAGCAAACCGCACTAATAAAGTATGAACCCGCCTCTTCCTC
TGCTTCTTCCATGTCTAGTGATCCAAACCTATGCGATGTCACAGGTCTCGTGATCTCCTT
ATGATATACATATACTTCGTTTGTCTCGCTTCCGCAGGCGAGATACTCGCTATTCACTGT
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CTTGACATCCCATAAGCGTAGTGTGCTATCAGTAGACGCAGACGCGAGCTCGTTGTTGGA
CAAAAACTTCACATAGGAGACCGCTTTCTTGTGTCCACTGAAGACATGAAGTGGCTACTT
ATGTTTCTTAGATCGTAATAATGGATGTGATGGTCAGCTGATCCAACCGCAATGAAGTTG
CTTGAGCCAGGATTGTACTTGACACAACATATGTTTGCTTTCATATCAATGTTAAGCACA
CTTGCTTCCTGCCTTGTGCACCAAACTTTAACCTTACAATCGTCACTACCAGATACAAGC
ATAGATGGTTCTGTTCGCGAAAAATCAACGCTCCAGGCACGTTTTTCGTGCTCTTCATAC
TCCATAAGAATCTGTCTAGTAGTTACATCCCATACAGTTACTATTCCTTCATAATCACCG
CTTGCTATATG

QA 1 911 1 911
DS 



AS 1 2

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CTTATAGCTCATTTGAAACCTGACAAAAGAAGGGATCTTCGACAAAGATCAGTTTCGGAC
AAGAACTCCTCAGCATTGTTGGAAACTGGAAATATTCTTCATTCTCCACTTGATGAAGAA
CTTGTTTTGAAGAGAAAAGCTGAAGAGGTTAAACCGTATTTAAATGGACGATCTATGTAT
CTTGTTGGAATGATGGGTTCCGGGAAGACGACAGTAGGAAAGATCATGGCAAGAGCACTT
GGTTATTCCTTCTTTGATTGTGACACATTGATCGAGGAGGCGATGAATGGAACTTCTGTA
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AAGAAGCTCTCTCTGATGTACCACCAAGTTGTTGTGTCAACTGGTGGAGGTGCTGTTATA
AGACCCATTAATTGGAAGTACATGCATAAAGGTATTAGCATTTGGCTCGATGTTCCCTTA
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AAGATCGGGTACAGAAACGTGTCAGATCTTACCCCAGCTGAAATCGCCATTGAGGCCTTT
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CTTTGATTACTTTTTTTACAATAAGAGAACTTTTCTAC


BQ
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BS 727 1118 RR4AB81JQ

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CTTGTTGGAATGATGGGTTCCGGGAAGACGACAGTAGGAAAGATCATGGCAAGAGCACTT
GGTTATTCCTTCTTTGATTGTGACACATTGATCGAGGAGGCGATGAATGGAACTTCTGTA
ACTGAGATATTTGAGCATTTCGGTGAGAGTGTCTTCAGAGAGAAAGAGACGGAGGCACTA
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GATCAG

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ACCCATTAATTGGAAGTACATGCATAAAGGTATTAGCATTTGGCTCGATGTTCCCTTAGA
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GCTAGTTTTGATGATGACTGCTGTGTACAGTTTTATATGATTGAATAACACTCTGTTTCT
TTGATTACTTTTTTTACAATAAGAGAACTTTTCTAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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AGAGTCCCTCTTGAATGATCTGAAAAATGTTTTGTTAACTTAATTATTTTTTTGCTCTTC
TGGAAAAACAATGCCTCAAGAAAAAAGAGAAATATCCGGATGTGTAATCTATTTACATGC
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TAGTTACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GJ19TF U 1
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ATGACAGATGGGTACTCAGGGAGTGACTTAAAGAATCTTTGCGTGACAGCAGCGCATCTA
CCTATCCGAGAGATACTAGAAAAAGAAAAGAAGGAGAGAAGTGTGGCTAAAGCTGAAAAC
CGACCAACGCCGCAATTATATGATAGTACAAACATCAGGCCTTTGAACATGAATGATTTC
AAGACCGCCCATGAACAGGTTTGTGCGAGTGTGTCGACCGATTCATCAAACATGAACGAG
CTGCAGCAATGGAACGAGCTATATGGAGAAGGAGGGTCAAGGAAGAAGACGTCACTCAGC
TACTTCATGTAAAAGAGAAGACGGATGCAAAAAAAACTCTTTGATCCTTTAAGAGAGAGA
AGAGTCCCTCTTGAATGATCTGAAAAATGTTTTGTTAACTTAATTATTTTTTTGCTCTTC
TGGAAAA*CAATGCCTCAAGAAAAA*GAGAAATATCCGGATGTGTAATCTATTTACATGC
TTAATGATGTACTCTCAACTATGTATATAGG
AGAAT

QA 1 751 1 751
DS 

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ATCTATTTACATGCTTAATGATGTACTCTCAACTATGTATATAGGGAGAATTTTAGATAT
TTTATTAGTAATTTTAGTTACT

QA 1 142 1 142
DS 



AS 1 2

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GGCACGCCGTCGGTTCTCATCCAAAAAGGAGCCATCATCCCCCGCCATCTCTGCTTAAGG
ACAGCTGTGTCCGCCCGTGGCTCCTCTTCTGATGCAGCTATGGTAATTGATAAAGGGAAG
ATTGCAGTAGACATCATGCATGAGATCAGAACGGAAGTCTCAAGAATGAAGGAATCAATT
GGCATGGTTCCTGGATTAGCAGTACTCCATGTTGGGGACACAAAACTCTCCAAACCTTAC
TGGGCATCTTGTGGATTTGTTGGCATCAGATCATTTGAAGTTCATCTAGCCGAAGATACG
ACAGAAGCGAAGACGTTGGAATGTGTCTCAAGCTTCAACGATGATCCTTGTGTCCATGGC
ATCCTTGTTGAGTTGCCTCTACCAACGCATATGGATGAGCACAAGATATTAAATGCGGTT
AGTATAGAGAAAGACATCAAGGGATTTCATCCATTAAATATTGGACTGCTTGCTATGCGC
GGAAGAGAACCCTTTTTCCTTCCACAGACTCCAAAAGCATGCATCGAGCTGTTACACCGG
AACAACATTGAGATCAAAGGAAAGAGAGCTGTTGTTATCGGCAGGAGTAACACTTTTGGT
ATGCCAGCTGCTCTATTACTGCAGAGAGAAGATGCAACTGTTACCATTATCCATTCAAAA
ACCAAGAACCCTCAAGACATTACAAGACAAGCTGACATCATAATCTCTGCCGTTGGTAAA
CCAAACATGGTCAGAGGAAGCTGGATAAAACCGGGAGCAGTCATCGTCGATGTTGGGATT
AGTTATGTTCGAGACCGAAATGCTCGTTATGGCTTTCGATGGGTCGAGATATTTGCTATG
AGAAGGCTTGCGAAGTTGCATCAGCTATCATAACTGATGTTAGTAGCGAGGGACTACTGG
AATCAGACATGCTCCTATCGAACACTTTGACATCAGCCAAGAGACTTCACAACTTCCTGT
GACCTTAAAATTCATGCATAATTTCGTTTCAGTTTTGTAAAATCTTAGGTTTTCTTCTGG
TCGTCCGACATTGCAGATTATCTTATGTTCTAGTGTGTTTTTGTTGAGGTTACCTCATAA
CTTACTGTGACCTTAAATTCATG


BQ
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AF RR4B743TF U 1
AF RR4B743JQ C 263
BS 1 843 RR4B743TF
BS 844 845 RR4B743JQ
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BS 873 1103 RR4B743JQ

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ACAGCTGTGTCCGCCCGTGGCTCCTCTTCTGATGCAGCTATGGTAATTGATAAAGGGAAG
ATTGCAGTAGACATCATGCATGAGATCAGAACGGAAGTCTCAAGAATGAAGGAATCAATT
GGCATGGTTCCTGGATTAGCAGTACTCCATGTTGGGGACACAAAACTCTCCAAACCTTAC
TGGGCATCTTGTGGATTTGTTGGCATCAGATCATTTGAAGTTCATCTAGCCGAAGATACG
ACAGAAGCGAAGACGTTGGAATGTGTCTCAAGCTTCAACGATGATCCTTGTGTCCATGGC
ATCCTTGTTGAGTTGCCTCTACCAACGCATATGGATGAGCACAAGATATTAAATGCGGTT
AGTATAGAGAAAGACATCAAGGGATTTCATCCATTAAATATTGGACTGCTTGCTATGCGC
GGAAGAGAACCCTTTTTCCTTCCACAGACTCCAAAAGCATGCATCGAGCTGTTACACCGG
AACAACATTGAGATCAAAGGAAAGAGAGCTGTTGTTATCGGCAGGAGTAACACTTTTGGT
ATGCCAGCTGCTCTATTACTGCAGAGAGAAGATGCAACTGTTACCATTATCCATTCAAAA
ACCAAGAACCCTCAAGACATTACAAGACAAGCTGACATCATAATCTCTGCCGTTGGTAAA
CCAAACATGGTCAGAGGAAGCTGGATAAAACCGGGAGCAGTCATCGTCGATGTTGGGATT
AGTTATGTTCGAGACCGAAATGCTCGTTATGGCTTTCGATGGGTCGAGATATTTGCTATG
AGA**GCTTGCGAAGT*GCATCAGCTATCATA
CTGA

QA 1 872 1 872
DS 

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GCATCAGATCATTTGAAGTTCATCTAGCCGAAGATACGACAGAAGCGAAGACGTTGGAAT
GTGTCTCAAGCTTCAACGATGATCCTTGTGTCCATGGCATCCTTGTTGAGTTGCCTCTAC
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GATTTCATCCATTAAATATTGGACTGCTTGCTATGCGCGGAAGAGAACCCTTTTTCCTTC
CACAGACTCCAAAAGCATGCATCGAGCTGTTACACCGGAACAACATTGAGATCAAAGGAA
AGAGAGCTGTTGTTATCGGCAGGAGTAACACTTTTGGTATGCCAGCTGCTCTATTACTGC
AGAGAGAAGATGCAACTGTTACCATTATCCATTCAAAAACCAAGAACCCTCAAGACATTA
CAAGACAAGCTGACATCATAATTTCTGCCGTTGGTAAACCAAACATGGTCAGAGGAAGCT
GGATAAAACCGGGAGCAGTCATCGTCGATGTTGGGATTAGTTATGTTCGAGACCGAAATG
CTCGTTATGGCTTTCGATGGGTCGAGATATTTGCTATGAGGAGGCTTGCGAAGTTGCATC
AGCTATCATAACTGATGTTAGTAGCGAGGGACTACTGGAATCAGACATGCTCCTATCGAA
CACTTTGACATCAGCCAAGAGACTTCACAACTTCCTGTGACCTTAAAATTCATGCATAAT
TTCGTTTCAGTTTTGTAAAATCTTAGGTTTTCTTCTGGTCGTCCGACATTGCAGATTATC
TTATGTTCTAGTGTGTTTTTGTTGAGGTTACCTCATAACTTACTGTGACCTTAAATTCAT
G

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL8982Contig1 737 2 8 U
GTGAGAGTCAATAGATGAACAGTTTGTACACACAGACAGTCTTGGAACATTATAATACAA
GAAAACGTTTCTCACTCTGTTTTGCTTACAAGACATGAAAACAGAACCACACTGATCACC
CACCAATATAGGATTTGACTTAGGAAGATGAGATATCCTCAAACCGGAAGGTGACGCCAT
TCTTCTTCTTGAAATCATGTGTGGTGTGATCCACCTCATTTGTGTTGCTCAGCTCCAAGT
TGTAAAAGTCCATTGAGCTGTCTCCGAACAACGGTCCAGCATGCCACGTGCCACGGTTCA
GTTTAACAAACTTCGGTCCTGAAAACCTGAAGACGCGCACCTCCTCAACTGCAGGAGGAA
CGTACAGATGAACACCGGACCCTGACTCTACGTTATCACCAACTCTCTCTCTATCAACAA
CATCTTCGATAAGAGATTGCTTAGCTACACCAAGATACCAAACATGACCTCCTACTGATC
CCAGACACTGTGTCACGTTCGCGTGGTGCGTGATCCTGGAGAAGCCCAAGGTTCGACCTT
CGAGCCGCATAATATAGAATCGTGGGATTCCTCTGGAGAGATCTAACTGAGCATCGTTAG
GACCGAAGCGATCACCATCCGAGGAGGCTTCGATGACTTGGCCATAATCTGCGAAGCTTT
CAGGTGTAGCTTCGGTCGGGACCAGGTTGACTTTCACCGGAGGTTCCGCCATTGTTGCCT
ATTTTTCTCTCACCCCC


BQ
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP59TF C 1
AF RR4CM47JQ U 9
BS 1 10 RR4CP59TF
BS 11 94 RR4CM47JQ
BS 95 95 RR4CP59TF
BS 96 152 RR4CM47JQ
BS 153 153 RR4CP59TF
BS 154 371 RR4CM47JQ
BS 372 372 RR4CP59TF
BS 373 737 RR4CM47JQ

RD RR4CP59TF 718 0 0
GTGAGAGTCAATAGATGAACAGTT*GTACACACAGACAGTCTTGGAGCAT*ATAATACAA
GAAAACGTTTCTCACTCTGTTTTGCTTACAAGACATGAAAACAGAACCACACTGATCACC
CACCAATATAGGATTTGACTTAGGAAGATGAGATATCCTCAAACCGGAAGGTGACGCCAT
TCTTCTTCTTGAAATCATGTGTGGTGTGATCCACCTCATTTGTGTTGCTCAGCTCCAAGT
TGTAGAAGTCCATTGAGCTGTCTCCGAACAACGGTCCAGCATGCCACGTGCCACGGTTCA
GTTTAACAAACTTCGGTCCTGAAAACCTGAAGACGCGCACCTCCTCAACTGCAGGAGGAA
CGTACAGATGAACACCGGACCCTGACTCTACGTTATCACCAACTCTCTCTCTATCAACAA
CATCTTCGATAAGAGATTGCTTAGCTACACCAAGATACCAAACATGACCTCCTACTGATC
CCAGACACTGTGTCACGTTCGCGTGGTGCGTGATCCTGGAGAAGCCCAAGGTTCGACCTT
CGAGCCGCATAATATAGAATCGTGGGATTCCTCTGGAGAGATCTAACTGAGCATCGTTAG
GACCGAAGCGATCACCATCCGAGGAGGCTTCGATGACTTGGCCATAATCTGCTAAGCTTT
CAGGTGTAGCTTCGGTCGGGACCAGGTTGACTTTCACCGGAGGTTCCGCCATTGTTGC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR4CM47JQ 729 0 0
CG
ATAGATGAACAGTTTGTACACACAGACAGTCTTGGAACATTATAATACAAGAAAACGTTT
CTCACTCTGTTTTGCTTACAAGACGTGAAAACAGAACCACACTGATCACCCACCAATATA
GGATTTGACTTAGGAAGATGAGCTATCCTCAAACCGGAAGGTGACGCCATTCTTCTTCTT
GAAATCATGTGTGGTGTGATCCACCTCATTTGTGTTGCTCAGCTCCAAGTTGTAAAAGTC
CATTGAGCTGTCTCCGAACAACGGTCCAGCATGCCACGTGCCACGGTTCAGTTTAACAAA
CTTCGGTCCTGAAAACCTGAAGACGCGCACCTCCTCAACTGCAGGAGGAACGTACAGATG
ACCACCGGACCCTGACTCTACGTTATCACCAACTCTCTCTCTATCAACAACATCTTCGAT
AAGAGATTGCTTAGCTACACCAAGATACCAAACATGACCTCCTACTGATCCCAGACACTG
TGTCACGTTCGCGTGGTGCGTGATCCTGGAGAAGCCCAAGGTTCGACCTTCGAGCCGCAT
AATATAGAATCGTGGGATTCCTCTGGAGAGATCTAACTGAGCATCGTTAGGACCGAAGCG
ATCACCATCCGAGGAGGCTTCGATGACTTGGCCATAATCTGCGAAGCTTTCAGGTGTAGC
TTCGGTCGGGACCAGGTTGACTTTCACCGGAGGTTCCGCCATTGTTGCCTATTTTTCTCT
CACCCCC

QA 3 729 3 729
DS 



AS 1 2

CO CL8983Contig1 327 2 9 U
GATGTGCCTCCGGCGAGAAGCGTGTTTCCGGCGGTTTCTTCAGGGAAGTATATTGTGATA
TATGGTGGGGAGGAGGAGCCGCATGTGCTGATGCATATGGGAGCTGGGAAGTTGTCTGGA
GATGTTTATAGGTTTGTTGGTTCACGGTGGGAATAGTCCGACCAACGAGAGGCTTGATGA
TATGGTGTTTTGGGGTTTCTAGTTTTGTCTTAATTGTCAGTTTATCATCAGTGAGTTGCT
TTTGTGGCTTTGTCGTATGTAAACTGATTAGTGTTTGTTGTTTTAAGGAGTTTGGTGTTT
TAATAATAAAGATCTTGTTGTTAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK80TF U 69
AF RR4BK80JQ C 1
BS 1 68 RR4BK80JQ
BS 69 126 RR4BK80TF
BS 127 127 RR4BK80JQ
BS 128 172 RR4BK80TF
BS 173 173 RR4BK80JQ
BS 174 197 RR4BK80TF
BS 198 198 RR4BK80JQ
BS 199 278 RR4BK80TF
BS 279 327 RR4BK80JQ

RD RR4BK80TF 210 0 0
GGAGGAGGAGCCGCATGTGCTGATGCATATGGGAGCTGGGAAGTTGTCTGGAGATGTT*A
TAGGTTTGTTGGTTCACGGTGGGAATAGTCCGACCAACGAGAGG*TTGATGATATGGTGT
TTTGGGGTT*CTAGTTTTGTCTTAATTGTCAGTTTATCATCAGTGAGTTGCTTTTGTGGC
TTTGTCGTATGTAAACTGATTAGTGTTTGT

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR4BK80JQ 327 0 0
GATGTGCCTCCGGCGAGAAGCGTGTTTCCGGCGGTTTCTTCAGGGAAGTATATTGTGATA
TATGGTGGGGAGGAGGAGCCGCATGTGCTGATGCATATGGGAGCTGGGAAGTTGTCTGGA
GATGTTTATAGGTTTGTTGGTTCACGGTGGGAATAGTCCGACCAACGAGAGGCTTGATGA
TATGGTGTTTTGGGGTTTCTAGTTTTGTCTTAATTGTCAGTTTATCATCAGTGAGTTGCT
TTTGTGGCTTTGTCGTATGTAAACTGATTAGTGTTTGTTGTTTTAAGGAGTTTGGTGTTT
TAATAATAAAGATCTTGTTGTTAGACG

QA 1 327 1 327
DS 



AS 1 2

CO CL8984Contig1 757 2 3 U
GGGGAGAAAACAAAGATGGAAATTATCTCAGAAAACCTGTTCTTCTTTTCCTTTATCCTA
TCATGTTTCTTTATCTTTACCATTGTAAGATTCGGACGGAGCTCTCCCCGATCTGCCATA
CTGCCTCCTGGACCTCCACGGTTACCGATCCTAGGTAACATTCACCAAGTCGGTAAACTC
CCGCACCGTTCATTCGCGGACCTCTCCAGAACATATGGACCAATTATGCACCTAAAGCTT
GGACGTTTGAACACAGTGATCATAACTTCACCAGAAGCTGCAAGAGAAGTTCTAAAAACA
CACGACCCAACCTTGTCTGGCCGTATGTCTCCTAACGCGGTACGGTCCATCAATCATCAC
AAAGTTTCCGTCGCATGGATTCATCCGTCGTCGGCTCGTTGGAGACTATTGAGAAAACTA
TCGGTGACTCACCTGTTCTCGCCGCAGCGTATTGAAGCCACTAAAGCTCTGCGTATGAAA
AAAGTACAAGAGCTTGTGAGGTTCATGGATGAAAGCAGCAAGAGAGAAGAAGCTGTTGAC
ATTTCTCGTGCATCTTTCATCACAATTCTTAATATTATATCAAACATTCTATTCTCGGTT
GATCTTGGTAGTTACGGCTCGGAAAAGTCCAATGGATTTCATGATTCAGTTACTGGATGC
ATGGAAGTTGTTGGGAGTCCAGACCTTTCTAACTTCTTTCCGTTTCTTGAATTTCTTGAT
CTGCAAGGTATCAGCAAGAAGAGTAAATTATTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CZ54TF U 5
AF RR4B142TF U 1
BS 1 391 RR4B142TF
BS 392 392 RR4CZ54TF
BS 393 757 RR4B142TF

RD RR4CZ54TF 609 0 0
G
GAAAACAAAGATGGAAATTATCTCAGAAAACCTGTTCTTCTTTTCCTTTATCCTATCATG
TTTCTTTATCTTTACCATTGTAAGATTCGGACGGAGCTCTCCCCGATCTGCCATACTGCC
TCCTGGACCTCCACGGTTACCGATCCTAGGTAACATTCACCAAGTCGGTAAACTCCCGCA
CCGTTCATTCGCGGACCTCTCCAGAACATATGGACCAATTATTTACCTAAAGCTTGGACG
TTTGAACACAGTGATCATAACTTCACCAGAAGCTGCAAGAGAAGTTCTAAAAACACACGA
CCCAACCTTGTCTGGCCGTATGTCTCCTAACGCGGTACGGTCCATCAATCATCACAAAGT
TTCCGTCGCATGGATTCATCCGTCGTCGGCTCGTTGGAGACTATTGAGAAAACTATCGGT
GACTCACCTGTTCTCGCCGCAGCGTATTGAAGCCACTAAAGCTCTGCGTATGAAAAAAGT
ACAAGAGCTTGTGAGGTTCATGGATGAAAGCAGCAAGAGAGAAGAAGCTGTTGACATTTC
TCGTGCATCTTTCATCACAATTCTTAATATTATATCAAACATTCTATTCTCGTTTGATCT
TGGTAGTT

QA 2 609 2 609
DS 

RD RR4B142TF 757 0 0
GGGGAGAAAACAAAGATGGAAATTATCTCAGAAAACCTGTTCTTCTTTTCCTTTATCCTA
TCATGTTTCTTTATCTTTACCATTGTAAGATTCGGACGGAGCTCTCCCCGATCTGCCATA
CTGCCTCCTGGACCTCCACGGTTACCGATCCTAGGTAACATTCACCAAGTCGGTAAACTC
CCGCACCGTTCATTCGCGGACCTCTCCAGAACATATGGACCAATTATGCACCTAAAGCTT
GGACGTTTGAACACAGTGATCATAACTTCACCAGAAGCTGCAAGAGAAGTTCTAAAAACA
CACGACCCAACCTTGTCTGGCCGTATGTCTCCTAACGCGGTACGGTCCATCAATCATCAC
AAAGTTTCCGTCGCATGGATTCATCCGTCGTTGGCTCGTTGGAGACTATTGAGAAAACTA
TCGGTGACTCACCTGTTCTCGCCGCAGCGTATTGAAGCCACTAAAGCTCTGCGTATGAAA
AAAGTACAAGAGCTTGTGAGGTTCATGGATGAAAGCAGCAAGAGAGAAGAAGCTGTTGAC
ATTTCTCGTGCATCTTTCATCACAATTCTTAATATTATATCAAACATTCTATTCTCGGTT
GATCTTGGTAGTTACGGCTCGGAAAAGTCCAATGGATTTCATGATTCAGTTACTGGATGC
ATGGAAGTTGTTGGGAGTCCAGACCTTTCTAACTTCTTTCCGTTTCTTGAATTTCTTGAT
CTGCAAGGTATCAGCAAGAAGAGTAAATTATTTACAG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL8985Contig1 1055 2 2 U
GGACTGTTCTTTCGTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCCTTTCCTCTCGAATTCTCGTCTCCG
TTAAGGCTTCCACAAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCAACTAAGTATTGGGGGAAAGAGA
TGAGCTTTACTCAGGCCAATTGTTTTAGACCATCCTACCACTCTCCTGTGACGACGAGGA
TACCTAAAGCTAACGGTGTCTCCACCAGTGTACCTGTTAGAGCAACTGCTTCGGTGTCTA
CTCTGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGCAAATGGAAGCAGAGTTCTGCTG
TTTGCTTGTTTGGTGGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGGTGACGAGATATCACCAT
GGAAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCAGTTGAAGATATGTTGCGGGAGCAGA
TACAAAAGAAAGATTTTTATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAACGTTCCTCCACGTGGAG
GAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGATCAGGAGGAGAAGAAGACTCTG
GTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAAACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCTTAGGCTTCATCT
TTTTGGTACAACACACAACTTTCAATAACATTTGAAACTTGGACTATTATGTCTTGCTCT
GATCGAATGTCTTGTTTCGCAGTACACGTACATTATCAATGGGGAGGAGTTGATCAAGCT
TGCGAGAGATTACTTTAGGTTTCTTTCGGGGAAACCTAAGACCGTTCGGTTGACACGAGC
CTTGGATGGTTGGAATAGATTCATGGCTACGATGTCGAAGCCGAAAGAGTACGATGAGTA
CTGGCTAGAGAAGGCGATCATCAACACACCGACCTGGTACGACAGTCCCGAGAAGTACAA
ACAAGTCCTCAAGGCTTATGTCGACTCAAAGACTGAGGAACAGTTCGATTAAACCCCTTT
TCAGTCTCCCTTTTGTTATTCATACCTGTTTACAATCACAATTGAGGTTTTGTTTGGTTT
ATCGTAAGGCTTTCCAATAAAAGATTCTGTTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DY47TF U 1
AF RR4DY47JQ C 321
BS 1 701 RR4DY47TF
BS 702 1055 RR4DY47JQ

RD RR4DY47TF 701 0 0
GGACTGTTCTTTCGTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCCTTTCCTCTCGAATTCTCGTCTCCG
TTAAGGCTTCCACAAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCAACTAAGTATTGGGGGAAAGAGA
TGAGCTTTACTCAGGCCAATTGTTTTAGACCATCCTACCACTCTCCTGTGACGACGAGGA
TACCTAAAGCTAACGGTGTCTCCACCAGTGTACCTGTTAGAGCAACTGCTTCGGTGTCTA
CTCTGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGCAAATGGAAGCAGAGTTCTGCTG
TTTGCTTGTTTGGTGGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGGTGACGAGATATCACCAT
GGAAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCAGTTGAAGATATGTTGCGGGAGCAGA
TACAAAAGAAAGATTTTTATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAACGTTCCTCCACGTGGAG
GAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGATCAGGAGGAGAAGAAGACTCTG
GTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAAACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCTTAGGCTTCATCT
TTTTGGTACAACACACAACTTTCAATAACATTTGAAACTTGGACTATTATGTCTTGCTCT
GATCGAATGTCTTGTTTCGCAGTACACGTACATTATCAATG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR4DY47JQ 735 0 0
AAGGATAAGTCCAATGGTGGTGGTGACGAGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAAGCT
ATGGGGAAGAAGTCAGTTGAAGATATGTTGCGGGAGCAGATACAAAAGAAAGATTTTTAT
GATACTGAAAGCGGCGGCGGCAACGTTCCTCCACGTGGAGGAGGCGGTGGTGGTAACGGT
GGAGAGCGTCCTGAAGGATCAGGAGGAGAAGAAGACTCTGGTGTCGCTGGGATTGCTGAA
GAAACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCTTAGGCTTCATCTTTTTGGTACAACACACAACT
TTCAATAACATTTGAAACTTGGACTATTATGTCTTGCTCTGATCGAATGTCTTGTTTCGC
AGTACACGTACATTATCAATGGGGAGGAGTTGATCAAGCTTGCGAGAGATTACTTTAGGT
TTCTTTCGGGGAAACCTAAGACCGTTCGGTTGACACGAGCCTTGGATGGTTGGAATAGAT
TCATGGCTACGATGTCGAAGCCGAAAGAGTACGATGAGTACTGGCTAGAGAAGGCGATCA
TCAACACACCGACCTGGTACGACAGTCCCGAGAAGTACAAACAAGTCCTCAAGGCTTATG
TCGACTCAAAGACTGAGGAACAGTTCGATTAAACCCCTTTTCAGTCTCCCTTTTGTTATT
CATACCTGTTTACAATCACAATTGAGGTTTTGTTTGGTTTATCGTAAGGCTTTCCAATAA
AAGATTCTGTTCTGG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL8986Contig1 930 2 6 U
GGATACTATTCCCCGATCGACAGAGAATTTGCAAAGATCATCAGAAGTAAATAAAAGATG
CGACGGCGACCAGGAATCGGAGGTCTACAAAAGGCGGCAGCTGCTCGGGATCAGTACAGG
TTATTAGGAGAAAATGTGGCAAAGTTAAGGACTGATATGATGAAAGAGCAGCTCGCCACT
TTCAAGTCTCAGCTTGAAGAGTTCGCTCGTAAACACAAGAATGACATTCGTAAAAATCCA
GCGTTTAGAGCTCAGTTCCATGAAATGTGTGCTAAAGTTGGTGTGGATCCACTTGCTTCC
AACAAGGGCTTCTGGGCTGAGCTCCTTGGGATTGGTGACTTCTACTATGAACTTGGAGTT
CAGATTATTGAAGTTTGCATGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTGATCAGCTTGCAA
GAGCTCTGCAGCCATCTTCGTCAGAGAAGGAAGAAAGACCGTGAAGCTGTTACCGAAGAC
GATTGTCTTCGTGCTATTAGCAAGCTTAAGGTATTGGGTAGCGGATTTGAGGTTATCACG
ATTGGCAAGAAAAAGCTAGTCCGTTCAGTCCCCACTGAGCTCAACAAAGACCATAACCAA
ATCTTGGAGCTGGCTCAGGGTCAAGGCTTTGTTACTGTGGAGGAGGTACAAAGACGTCTC
TCGTGGACATCTGGTCGGGTCATAGATGCTCTCGAAATTTTGTTAGAGGAGGGCCTCGCA
ATGATAGACAATGGCAATAAAGACGGAAAATGTCAGTACTGGTTCCCCTGTGTCTCTTCT
GTTTACTCATTTGTTGGATCTGATACTTAAACTGGTGCATACTCTCCTTTTGTATTTTTG
TTTTATACTCAATACACTCACTCTGTATTGCATATAATTGCGAAAAGATGTATATCATTA
TATTTCTTAAATAAAATTCTTGTGCATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FC47TF U 1
AF RR4FC47JQ C 349
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BS 715 715 RR4FC47JQ
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BS 738 930 RR4FC47JQ

RD RR4FC47TF 737 0 0
GGATACTATTCCCCGATCGACAGAGAATTTGCAAAGATCATCAGAAGTAAATAAAAGATG
CGACGGCGACCAGGAATCGGAGGTCTACAAAAGGCGGCAGCTGCTCGGGATCAGTACAGG
TTATTAGGAGAAAATGTGGCAAAGTTAAGGACTGATATGATGAAAGAGCAGCTCGCCACT
TTCAAGTCTCAGCTTGAAGAGTTCGCTCGTAAACACAAGAATGACATTCGTAAAAATCCA
GCGTTTAGAGCTCAGTTCCATGAAATGTGTGCTAAAGTTGGTGTGGATCCACTTGCTTCC
AACAAGGGCTTCTGGGCTGAGCTCCTTGGGATTGGTGACTTCTACTATGAACTTGGAGTT
CAGATTATTGAAGTTTGCATGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTGATCAGCTTGCAA
GAGCTCTGCAGCCATCTTCGTCAGAGAAGGAAGAAAGACCGTGAAGCTGTTACCGAAGAC
GATTGTCTTCGTGCTATTAGCAAGCTTAAGGTATTGGGTAGCGGATTTGAGGTTATCACG
ATTGGCAAGAAAAAGCTAGTCCGTTCAGTCCCCACTGAGCTCAACAAAGACCATAACCAA
ATCTTGGAGCTGGCTCAGGGTCAAGGCTTTGTTACTGTGGAGGAG*TACAAAGACGTCTC
TCGTGGACATCTGGTCGGGTCATAGATGCTCTCGAAATTTTGTTAGAGGAGGGC*TCGCA
ATGATAGACAATGGCAA

QA 1 737 1 737
DS 

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GAACTTGGAGTTCAGATTATTGAAGTTTGCATGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTG
ATCAGCTTGCAAGAGCTCTGCAGCCATCTTCGTCAGAGAAGGAAGAAAGACCGTGAAGCT
GTTACCGAAGACGATTGTCTTCGTGCTATTAGCAAGCTTAAGGTATTGGGTAGCGGATTT
GAGGTTATCACGATTGGCAAGAAAAAGCTAGTCCGTTCAGTCCCCACTGAGCTCAACAAA
GACCATAACCAAATCTTGGAGCTGGCTCAGGGTCAAGGCTTTGTTACTGTGGAGGAGGTA
CAAAGACGTCTCTCGTGGACATCTGGTCGGGTCATAGATGCTCTCGAAATTTTGTTAGAG
GAGGGCCTCGCAATGATAGACAATGGCAATAAAGACGGAAAATGTCAGTACTGGTTCCCC
TGTGTCTCTTCTGTTTACTCATTTGTTGGATCTGATACTTAAACTGGTGCATACTCTCCT
TTTGTATTTTTGTTTTATACTCAATACACTCACTCTGTATTGCATATAATTGCGAAAAGA
TGTATATCATTATATTTCTTAAATAAAATTCTTGTGCATGCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8988Contig1 693 2 2 U
GGATCAAGCACCGACCTTGAAGAAGCACCACCTTTTGGCTGTGTCCTTTGTAGGGCTTTT
CGAGAATCCATCAGTGGTGAGTCAGAAAACAACTTTTTTTTTAAACAGATTATTCGATAA
TGAAACAATAATATTCCAAAAAGAGCCGAGAAATCAATTATTGTCTGAGAATCCATTGAA
CGTCGATCTTCGATGGATACTTCTGTAACGCAGACGACAAAGACTCTGCCTCCGGAAGAT
GAAGAAGACGATGATGAGTGGGACACTGATGGGTATGTGATTCCAAGCTTGGAGACTGAA
CAAGAAACTGTTAATGATTCACAAGTTGATACATCTTCTCCTAAAATTAAAGCTGAAGAA
AGCATCTACCTAGGACCACGTGGAGGAGCTCCTCCCTCTCAGCTACAAGACGGTAACGCA
TCGAGCAGGAAGCAGCGGTTTAAGCAGAAGCTCAAGGAAGCAGACCAGAAAATGAATGTG
TCTGGTCGAGAAAACAAAGTGGCCAACTTAAGAGAGCTTGTAGGCGGCGTTGAGAAAGGA
ACTGATGTGTCAAAAGGTGTTTCAAGAGACTGGCTTGACCCACATTGCCATGAGTCTATG
TTCGAGAAACGTCAACAACTGTAACGCCTCCTTTTTCTCTTTTGTAAACGTTTTGTATCA
ATACCCAGAGATTTCATCATTATTATCAAACAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G395TF U 1
AF RR4GA02TF U 1
BS 1 674 RR4G395TF
BS 675 693 RR4GA02TF

RD RR4G395TF 674 0 0
GGATCAAGCACCGACCTTGAAGAAGCACCACCTTTTGGCTGTGTCCTTTGTAGGGCTTTT
CGAGAATCCATCAGTGGTGAGTCAGAAAACAACTTTTTTTTTAAACAGATTATTCGATAA
TGAAACAATAATATTCCAAAAAGAGCCGAGAAATCAATTATTGTCTGAGAATCCATTGAA
CGTCGATCTTCGATGGATACTTCTGTAACGCAGACGACAAAGACTCTGCCTCCGGAAGAT
GAAGAAGACGATGATGAGTGGGACACTGATGGGTATGTGATTCCAAGCTTGGAGACTGAA
CAAGAAACTGTTAATGATTCACAAGTTGATACATCTTCTCCTAAAATTAAAGCTGAAGAA
AGCATCTACCTAGGACCACGTGGAGGAGCTCCTCCCTCTCAGCTACAAGACGGTAACGCA
TCGAGCAGGAAGCAGCGGTTTAAGCAGAAGCTCAAGGAAGCAGACCAGAAAATGAATGTG
TCTGGTCGAGAAAACAAAGTGGCCAACTTAAGAGAGCTTGTAGGCGGCGTTGAGAAAGGA
ACTGATGTGTCAAAAGGTGTTTCAAGAGACTGGCTTGACCCACATTGCCATGAGTCTATG
TTCGAGAAACGTCAACAACTGTAACGCCTCCTTTTTCTCTTTTGTAAACGTTTTGTATCA
ATACCCAGAGATTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4GA02TF 693 0 0
GGATCAAGCACCGACCTTGAAGAAGCACCACCTTTTGGCTGTGTCCTTTGTAGGGCTTTT
CGAGAATCCATCAGTGGTGAGTCAGAAAACAACTTTTTTTTTAAACAGATTATTCGATAA
TGAAACAATAATATTCCAAAAAGAGCCGAGAAATCAATTATTGTCTGAGAATCCATTGAA
CGTCGATCTTCGATGGATACTTCTGTAACGCAGACGACAAAGACTCTGCCTCCGGAAGAT
GAAGAAGACGATGATGAGTGGGACACTGATGGGTATGTGATTCCAAGCTTGGAGACTGAA
CAAGAAACTGTTAATGATTCACAAGTTGATACATCTTCTCCTAAAATTAAAGCTGAAGAA
AGCATCTACCTAGGACCACGTGGAGGAGCTCCTCCCTCTCAGCTACAAGACGGTAACGCA
TCGAGCAGGAAGCAGCGGTTTAAGCAGAAGCTCAAGGAAGCAGACCAGAAAATGAATGTG
TCTGGTCGAGAAAACAAAGTGGCCAACTTAAGAGAGCTTGTAGGCGGCGTTGAGAAAGGA
ACTGATGTGTCAAAAGGTGTTTCAAGAGACTGGCTTGACCCACATTGCCATGAGTCTATG
TTCGAGAAACGTCAACAACTGTAACGCCTCCTTTTTCTCTTTTGTAAACGTTTTGTATCA
ATACCCAGAGATTTCATCATTATTATCAAACAA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL8989Contig1 600 2 1 U
GTGGATGCAGCGGATACAGATGGAAATGGGACGTTGAGCTGTGAAGAGTTTGTGACACTG
GCGATACACTTGAAGAGAATGGGTTGTGATGAGCATTTGCAGCAAGCGTTCAAGTATTTT
GACAAGAATGGTAACGGATCTATTGAGCTAGATGAGCTCAAGGAAGCTCTGTTTGATGAT
GATAAGCTAGGCCACGGTGGTGACCAGTGGATCAAAGATATCTTCTTTGACGTTGACCTC
AACAAGGATGGAAGGATAAGCTTTGATGAGTTTAAGGCCATGATGAAATCAGGAACAGAC
TGGAAAATGGCGTCGAGGCAGTACTCAAGGGCGTTGTTGAATGCTTTGAGCATAAAGATG
TTCAAAGAAGATGTTGGAGACAATGGTCCTAAGTCTTATTCCATGGAGTTCCCTGTAGCT
AGGAAAAGCTAAGCTACTTGATGCTCCCAAGAACAAATCAATGGAGCTTGTCCCTTCCAA
AACCTATAGACCCTCAGGTCTAAGAAACTAAACAAGAAAGAATAATCCTTTGATTTTCTT
TTTAATGTATTTTGTTTTTTGGGTGCTACAAGTGACAAAGAAAATGTGATTTAATGGGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FO75JQ C 1
AF RR4FO75TF U 1
BS 1 600 RR4FO75TF

RD RR4FO75JQ 600 0 0
GTGGATGCAGCGGATACAGATGGAAATGGGACGTTGAGCTGTGAAGAGTTTGTGACACTG
GCGATACACTTGAAGAGAATGGGTTGTGATGAGCATTTGCAGCAAGCGTTCAAGTATTTT
GACAAGAATGGTAACGGATCTATTGAGCTAGATGAGCTCAAGGAAGCTCTGTTTGATGAT
GATAAGCTAGGCCACGGTGGTGACCAGTGGATCAAAGATATCTTCTTTGACGTTGACCTC
AACAAGGATGGAAGGATAAGCTTTGATGAGTTTAAGGCCATGATGAAATCAGGAACAGAC
TGGAAAATGGCGTCGAGGCAGTACTCAAGGGCGTTGTTGAATGCTTTGAGCATAAAGATG
TTCAAAGAAGATGTTGGAGACAATGGTCCTAAGTCTTATTCCATGGAGTTCCCTGTAGCT
AGGAAAAGCTAAGCTACTTGATGCTCCCAAGAACAAATCAATGGAGCTTGTCCCTTCCAA
AACCTATAGACCCTCAGGTCTAAGAAACTAAACAAGAAAGAATAATCCTTTGATTTTCTT
TTTAATGTATTTTGTTTTT*GGGTGCTACAAGTGACAAAGAAAATGTGATTTAATGGGGC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4FO75TF 600 0 0
GTGGATGCAGCGGATACAGATGGAAATGGGACGTTGAGCTGTGAAGAGTTTGTGACACTG
GCGATACACTTGAAGAGAATGGGTTGTGATGAGCATTTGCAGCAAGCGTTCAAGTATTTT
GACAAGAATGGTAACGGATCTATTGAGCTAGATGAGCTCAAGGAAGCTCTGTTTGATGAT
GATAAGCTAGGCCACGGTGGTGACCAGTGGATCAAAGATATCTTCTTTGACGTTGACCTC
AACAAGGATGGAAGGATAAGCTTTGATGAGTTTAAGGCCATGATGAAATCAGGAACAGAC
TGGAAAATGGCGTCGAGGCAGTACTCAAGGGCGTTGTTGAATGCTTTGAGCATAAAGATG
TTCAAAGAAGATGTTGGAGACAATGGTCCTAAGTCTTATTCCATGGAGTTCCCTGTAGCT
AGGAAAAGCTAAGCTACTTGATGCTCCCAAGAACAAATCAATGGAGCTTGTCCCTTCCAA
AACCTATAGACCCTCAGGTCTAAGAAACTAAACAAGAAAGAATAATCCTTTGATTTTCTT
TTTAATGTATTTTGTTTTTTGGGTGCTACAAGTGACAAAGAAAATGTGATTTAATGGGGC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL8990Contig1 692 2 5 U
GGAATAAAGTGATCTATTAGAGATTGTCTAACTTGCGGTTTATCTACTTTTCATTCACAC
ATGTTACATGGAATGTGGCGAAGCAGTTCTTTTCACACATATATACATCAGTACATGGGA
ATAAACTTTGCCTTAGTACGTGTATACAAGGAAAGGGAATCAGAACTCAAAAGAGTTATT
AAGCTGGACAGAAAAAGAAGGCCGGCCAATACTTGCTGCTAGAGGAGTATCAGCTCTAAC
AACTATCCCTGCGCGTCCGTTGTTACCATTCCATTTCGACCGACCAAAAGATACAGAGGC
AAAAGCTGAAGGATGTGCGTTGAGTGCGTAGCCATATATCAAGTTCAAGTCATCACTCAG
CGAGTGTATCACTTCCGCTTTCATCCCGGGGTTGCTTCCACCAAACGTGGGACATACACT
GAGTTGAAGTGTAGGCTTCATCAGTAGTCCGGATCTACGCCATGCCAAGCCTTGAGAAAC
TTCAAACGCGAATGATTTGTCAGGCAAATGAACCATTGGTGTGATTCTAGTTCCACGTTT
GTTCTTACAAGAGTAACTAAAACTCATATCGCCTGGATACTGACCCTGTGCTTGAAGAAG
ACCTCCATAGAAAGGCACAAAGGTACTCACTGTCAGCCCCTCGCCAGATACATAGGTCAA
CTGCCCGTTTGGGAACTGCAAATCCATAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4F352JQ U 35
AF RR4FK89JQ U 1
BS 1 192 RR4FK89JQ
BS 193 193 RR4F352JQ
BS 194 247 RR4FK89JQ
BS 248 248 RR4F352JQ
BS 249 692 RR4FK89JQ

RD RR4F352JQ 607 0 0
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ACACATATATACATCAGTACATGGGAATAAACTTTGCCTTAGTACGTGTATACAAGGAAA
GGGAATCAGAACTCAAAAGAGTTATTAAGCTGGACAGAAAAAGAAGGCCGGCCAATACTT
GCTGCTAGAGGAGTATCAGCTCTAACAACTATCCCTGCGCGTCCGTTGTTACCATTCCAT
TTCGACCGACCAAAAGATACAGAGGCAAAAGCTGAAGGATGTGCGTTGAGTGCGTAGCCA
TATATCAAGTTCAAGTCATCACTCAGCGAGTGTATCACTTCCGCTTTCATCCCGGGGTTG
CTTCCACCAAACGTGGGACATACACTGAGTTGAAGTGTAGGCTTCATCAGTAGTCCGGAT
CTACGCCATGCCAAGCCTTGAGAAACTTCAAACGCGAATGATTTGTCAGGCAAATGAACC
ATTGGTGTGATTCTAGTTCCACGTTTGTTCTTACAAGAGTAACTAAACCTCATATCGCCT
GGATACTGACCCTGTGCTTGAAGAAGACCTCCATAGAAAGGCACAAAGGTACTCACTGTC
AGCCCCT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR4FK89JQ 692 0 0
GGAATAAAGTGATCTATTAGAGATTGTCTAACTTGCGGTTTATCTACTTTTCATTCACAC
ATGTTACATGGAATGTGGCGAAGCAGTTCTTTTCACACATATATACATCAGTACATGGGA
ATAAACTTTGCCTTAGTACGTGTATACAAGGAAAGGGAATCAGAACTCAAAAGAGTTATT
AAGCTGGACAGAGAAAGAAGGCCGGCCAATACTTGCTGCTAGAGGAGTATCAGCTCTAAC
AACTATCTCTGCGCGTCCGTTGTTACCATTCCATTTCGACCGACCAAAAGATACAGAGGC
AAAAGCTGAAGGATGTGCGTTGAGTGCGTAGCCATATATCAAGTTCAAGTCATCACTCAG
CGAGTGTATCACTTCCGCTTTCATCCCGGGGTTGCTTCCACCAAACGTGGGACATACACT
GAGTTGAAGTGTAGGCTTCATCAGTAGTCCGGATCTACGCCATGCCAAGCCTTGAGAAAC
TTCAAACGCGAATGATTTGTCAGGCAAATGAACCATTGGTGTGATTCTAGTTCCACGTTT
GTTCTTACAAGAGTAACTAAAACTCATATCGCCTGGATACTGACCCTGTGCTTGAAGAAG
ACCTCCATAGAAAGGCACAAAGGTACTCACTGTCAGCCCCTCGCCAGATACATAGGTCAA
CTGCCCGTTTGGGAACTGCAAATCCATAAAGG

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

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CTCCAAGGGTGCTGACTATAATCTCCCACGTGATGGAGAAGCTAGTCGCACGGAATGAGT
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CGCCTAGCATAAGTATAGGCAAGTACCTTGAGAGGATATATAAGTACACAAAATGTAGCC
CGTCGTGTTTCGTGGTCGGGTATGCGTACATAGACCGGTTGGCTCATAAGCATCCTGGTT
CTCTGGTTCTCTCCTTGAATGTTCATAGACTTCTTGTCACTTGTGTCATGATTGCTTCCA
AGATGCTAGACGACGTGCACTACAACAACGAGTTCTATGCACGGGTGGGAGGTGTGAGCA
ATGCAGACTTGAACCGAATGGAGTTGGAGCTTCTGTTCCTCCTTGACTTCAGAGTTACAG
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GCCATACCTCTTCTCTCCAAGATAATGGACAAGTGCAAGAAACTCTATCAGATGCATCTT
CTTTGGCATCTTTATATGTTTAACCGTTAGCACACACGTTTTCTCTGTTTTTGAACTGTG
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AAAGTATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G174TF U 1
AF RR4G174JQ C 59
BS 1 731 RR4G174TF

RD RR4G174TF 731 0 0
GAACCGGGGACGATGAACCGGACCTGGTCGTGGGACAAGATCTACCAACGGAGGCCGCCA
CTCCAAGGGTGCTGACTATAATCTCCCACGTGATGGAGAAGCTAGTCGCACGGAATGAGT
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CGTCGTGTTTCGTGGTCGGGTATGCGTACATAGACCGGTTGGCTCATAAGCATCCTGGTT
CTCTGGTTCTCTCCTTGAATGTTCATAGACTTCTTGTCACTTGTGTCATGATTGCTTCCA
AGATGCTAGACGACGTGCACTACAACAACGAGTTCTATGCACGGGTGGGAGGTGTGAGCA
ATGCAGACTTGAACCGAATGGAGTTGGAGCTTCTGTTCCTCCTTGACTTCAGAGTTACAG
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GCCATACCTCTTCTCTCCAAGATAATGGACAAGTGCAAGAAACTCTATCAGATGCATCTT
CTTTGGCATCTTTATATGTTTAACCGTTAGCACACACGTTTTCTCTGTTTTTGAACTGTG
TGCGTTTACAGAAAATTTTATCAATTGATCGATATATTAATGTGAAAAAGTTAAATTTTC
AAAGTATAATT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4G174JQ 673 0 0
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CAATGCAGACTTGAACCGAATGGAGTTGGAGCTTCTGTTCCTCCTTGACTTCAGAGTTAC
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TGGCCATACCTCTTCTCTCCAAGATAATGGACAAGTGCAAGAAACTCTATCAGATGCATC
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TGTGCGTTTACAGAAAATTTTATCAATTGATCGATATATTAATGTGAAAAAGTTAAATTT
TCAAAGTATAATT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL8992Contig1 857 2 2 U
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AAGTTCGCAATCCGTTACATACTATCTGGAAGTGCATGGAATAATCTTATTGACAACAAG
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GCACAGAGGACTTTACACGGTCTTCAGAACCAAGAAGGAAAGCAAGATACTTAAGTTCTT
GGGGTTTATGTGGAACCCTCTCTCTTGGGCGATGGAAGCAGCTGCAATCATGGCTATTGC
CTTGGCTAATGGCGATGGACGTCCACCTGATTGGCAAGACTTTGTTGGTATTGTTTGTCT
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GAGTCAGTGGTGAAGCTCAAGGGACTTGACATTGAGACAGCTGGTCACTACACCGTTTGA
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TGATGATAATATCATAAGATGAGAGGGAATAAAATGTTGTTTTAGTTTATGTTTTGTGTT
TAATTCCTCTAAAACTCCTGGGGTTTTTTCTTTCTTCTTCTTCCTTGATTTTAGACTTAA
TTATAATTCTGTTTTCAGTTTGCTCTGTGTTGGAGACAAAAAGATATTATAATATAATAT
TTTCTTAGGTTTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AF44TF U 1
AF RR4AF44JQ C 36
BS 1 816 RR4AF44TF
BS 817 857 RR4AF44JQ

RD RR4AF44TF 816 0 0
GGATGGGCTGGAGTTATTTGGCTTTACAGTATTGTCTTTTATATTCCATTAGACATGCTC
AAGTTCGCAATCCGTTACATACTATCTGGAAGTGCATGGAATAATCTTATTGACAACAAG
ACTGCGTTTACTACTAAGCAAAACTATGGGATAGAGGAGAGAGAGGCACAATGGGCTCTC
GCACAGAGGACTTTACACGGTCTTCAGAACCAAGAAGGAAAGCAAGATACTTAAGTTCTT
GGGGTTTATGTGGAACCCTCTCTCTTGGGCGATGGAAGCAGCTGCAATCATGGCTATTGC
CTTGGCTAATGGCGATGGACGTCCACCTGATTGGCAAGACTTTGTTGGTATTGTTTGTCT
TTTGGTTATTAACTCAACCATCAGCTTTTGGGAAGAAAACAATGCTGGAAACGCTGCTGC
TGCCCTCATGGCTGGTCTTGCTCCCAAAACTAAGGTTCTAAGAGATGGCAAATGGAGTGA
GCAAGAAGCTTCTATTCTTGTTCCTGGAGATATCGTGAGCATCAAGCTAGGTGACATGTA
GAGTCAGTGGTGAAGCTCAAGGGACTTGACATTGAGACAGCTGGTCACTACACCGTTTGA
TAACAAGATGGACTCAGAGAGATGATTAAGGAAGAAGATCGTTTGTTTAAGGGATGATAA
TGATGATAATATCATAAGATGAGAGGGAATAAAATGTTGTTTTAGTTTATGTTTTGTGTT
TAATTCCTCTAAAACTCCTGGGGTTTTTTCTTTCTTCTTCTTCCTTGATTTTAGACTTAA
TTATAATTCTGTTTTCAGTTTGCTCTGTGTTGGAGA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR4AF44JQ 822 0 0
CTTTTATATTCCATTAGACATGCTCAAGTTCGCAATCCGTTACATACTATCTGGAAGTGC
ATGGAATAATCTTATTGACAACAAGACTGCGTTTACTACTAAGCAAAACTATGGGATAGA
GGAGAGAGAGGCACAATGGGCTCTCGCACAGAGGACTTTACACGGTCTTCAGAACCAAGA
AGGAAAGCAAGATACTTAAGTTCTTGGGGTTTATGTGGAACCCTCTCTCTTGGGCGATGG
AAGCAGCTGCAATCATGGCTATTGCCTTGGCTAATGGCGATGGACGTCCACCTGATTGGC
AAGACTTTGTTGGTATTGTTTGTCTTTTGGTTATTAACTCAACCATCAGCTTTTGGGAAG
AAAACAATGCTGGAAACGCTGCTGCTGCCCTCATGGCTGGTCTTGCTCCCAAAACTAAGG
TTCTAAGAGATGGCAAATGGAGTGAGCAAGAAGCTTCTATTCTTGTTCCTGGAGATATCG
TGAGCATCAAGCTAGGTGACATGTAGAGTCAGTGGTGAAGCTCAAGGGACTTGACATTGA
GACAGCTGGTCACTACACCGTTTGATAACAAGATGGACTCAGAGAGATGATTAAGGAAGA
AGATCGTTTGTTTAAGGGATGATAATGATGATAATATCATAAGATGAGAGGGAATAAAAT
GTTGTTTTAGTTTATGTTTTGTGTTTAATTCCTCTAAAACTCCTGGGGTTTTTTCTTTCT
TCTTCTTCCTTGATTTTAGACTTAATTATAATTCTGTTTTCAGTTTGCTCTGTGTTGGAG
ACAAAAAGATATTATAATATAATATTTTCTTAGGTTTATACC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL8993Contig1 652 2 1 U
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ACACAAGCTCTCCTGCAAGGCCCACACCAATTCCTAATGGAATTGAGGCAATGTCAAGAA
GTATAGAAAAGCCAAGAAACATGGAATCTGTTGTTGATAAGCCGAAACCCTTGGAGCTAA
CAGAGATTGTTGATCCCACTCAGTGCAGACAAGTGACAATGCCAGATAGCAAGGATTCTG
TCAGCAAGGTTGCTCGGCTTCTTTATACAAATTCTGGTGTTGGCGTTCTGGCTCTCGGAG
CAAATGGTGTTCAAAGACTATGGAAGTGGAGCCGCAATGAGCAGAATCCTACTGGGAAGG
CAACTGCTAGTGTAAGTCCACAGCATTGGCAGCCTAACAGCGGTCTCATAATGGCAAACG
ATGTTTCTGAGAATCCTGAAGCAGCTGTGCCGTGTATAGCTCTTTCTAAGAATGACTCTT
ACGTGATGTCAGCTTGTGGTGGAAAAGTTTCTTTGTTCAATATGACGACTTTCAAAGTGA
TGACAACTTTCATGCCACCACCACCAGCTTCAACGTTTTTGGCATTTCATCCTCAGGATA
ATAACATTATTGCAATCGGAATGGAAGACTCTAGTATCCATATCTACAACGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4FK53TF U 1
AF RR4FA65TF U 1
BS 1 652 RR4FA65TF

RD RR4FK53TF 599 0 0
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GTATAGAAAAGCCAAGAAACATGGAATCTGTTGTTGATAAGCCGAAACCCTTGGAGCTAA
CAGAGATTGTTGATCCCACTCAGTGCAGACAAGTGACAATGCCAGATAGCAAGGATTCTG
TCAGCAAGGTTGCTCGGCTTCTTTATACAAATTCTGGTGTTGGCGTTCTGGCTCTCGGAG
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CAACTGCTAGTGTAAGTCCACAGCATTGGCAGCCTAACAGCGGTCTCATAATGGCAAACG
ATGTTTCTGAGAATCCTGAAGCAGCTGTGCCGTGTATAGCTCTTTCTAAGAATGACTCTT
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TGACAACTTTCATGCCACCACCACCAGCTTCAACGTTTTTGGCTTTTCATCCTCAGGAT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR4FA65TF 652 0 0
GATCAACTTCCGCAATGGTATCAAGCATGAGCCCAGCTGTTGGTAAAATTGAACACATGG
ACACAAGCTCTCCTGCAAGGCCCACACCAATTCCTAATGGAATTGAGGCAATGTCAAGAA
GTATAGAAAAGCCAAGAAACATGGAATCTGTTGTTGATAAGCCGAAACCCTTGGAGCTAA
CAGAGATTGTTGATCCCACTCAGTGCAGACAAGTGACAATGCCAGATAGCAAGGATTCTG
TCAGCAAGGTTGCTCGGCTTCTTTATACAAATTCTGGTGTTGGCGTTCTGGCTCTCGGAG
CAAATGGTGTTCAAAGACTATGGAAGTGGAGCCGCAATGAGCAGAATCCTACTGGGAAGG
CAACTGCTAGTGTAAGTCCACAGCATTGGCAGCCTAACAGCGGTCTCATAATGGCAAACG
ATGTTTCTGAGAATCCTGAAGCAGCTGTGCCGTGTATAGCTCTTTCTAAGAATGACTCTT
ACGTGATGTCAGCTTGTGGTGGAAAAGTTTCTTTGTTCAATATGACGACTTTCAAAGTGA
TGACAACTTTCATGCCACCACCACCAGCTTCAACGTTTTTGGCATTTCATCCTCAGGATA
ATAACATTATTGCAATCGGAATGGAAGACTCTAGTATCCATATCTACAACGT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL8994Contig1 635 2 2 U
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CATGGCAGCGATTTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATTTTCTACAA
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GCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGCTGTTCTGGCATCGA
CCTTCTCCAAGCTGATACCTTTGATCTCCATTGCTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTT
CTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCCCACATGGAGTGCCTCCTCAGATACATTTATGA
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CGAGCTTTTCGACATCAACCTTTCTCAAGCTGTTCACTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGG
ACGATGATGACCACAAGATTGATTCTCTCACTTCTTTGCCCTTTTGTATGCGACACATTG
CAACAAAACCCATCATTTTTTTTTGTGTTGTTTCATTCTTTTCCCTTACATTTGCTCAGG
AAAGTTGGGCAAAAATTAAAAGACCCTTTGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EY53TF U 1
AF RR4EY53JQ C 1
BS 1 595 RR4EY53TF
BS 596 635 RR4EY53JQ

RD RR4EY53TF 595 0 0
GGGTTCTTCATCGTCCTCGCAGATTTCTCGGTTTGGATCTTTTTGAATAATTTTAGCAGA
CATGGCAGCGATTTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATTTTCTACAA
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GCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGCTGTTCTGGCATCGA
CCTTCTCCAAGCTGATACCTTTGATCTCCATTGCTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTT
CTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCCCACATGGAGTGCCTCCTCAGATACATTTATGA
ACTCTACACTGACTTTGTCCTCAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTG
CGAGCTTTTCGACATCAACCTTTCTCAAGCTGTTCACTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGG
ACGATGATGACCACAAGATTGATTCTCTCACTTCTTTGCCCTTTTGTATGCGACACATTG
CAACAAAACCCATCATTTTTTTTTGTGTTGTTTCATTCTTTTCCCTTACATTTGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR4EY53JQ 635 0 0
GGGTTCTTCATCGTCCTCGCAGATTTCTCGGTTTGGATCTTTTTGAATAATTTTAGCAGA
CATGGCAGCGATTTACAGTCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATTTTCTACAA
GGACTGTGGAACAAAGGGACGGATGGATACGAATGATAGCTTGAGAGTAGCCAGTTTATG
GCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGCTGTTCTGGCATCGA
CCTTCTCCAAGCTGATACCTTTGATCTCCATTGCTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTT
CTTTGTGGTTTGTGAACCTGGAACTCCCCACATGGAGTGCCTCCTCAGATACATTTATGA
ACTCTACACTGACTTTGTCCTCAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTG
CGAGCTTTTCGACATCAACCTTTCTCAAGCTGTTCACTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGG
ACGATGATGACCACAAGATTGATTCTCTCACTTCTTTGCCCTTTTGTATGCGACACATTG
CAACAAAACCCATCATTTTTTTTTGTGTTGTTTCATTCTTTTCCCTTACATTTGCTCAGG
AAAGTTGGGCAAAAATTAAAAGACCCTTTGTTTCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8995Contig1 874 2 8 U
GGCAATCGTTCTTTGAGTGAATAATGCCAGTCCCTCTTGCACCATATCCAACACCTCCGG
CGTCAGCACTGCCTCCCTCGTACACTCCTCCGCTGCCGGTAAATGGTAGTACAGGTGGAC
AGAGCCAGTTAGTGTGTTCAGGTTGCAGAAACCTTCTAATGTATCCCGTCGGAGCAACCT
CTGTCTGCTGCGCCGTCTGTAACGCCGTCACGGCCGTTCCTCCGCCCGGAACAGAGATGG
CTCAGTTAGTGTGTGGAGGCTGCCATACACTTCTAATGTATATTCGTGGAGCTACAAGTG
TTCAATGTTCTTGTTGTCACACCGTTAATCTTGCCCTCGAAGCGAATCAGGTGGCGCATG
TGAATTGCGGAAGCTGCAGGATGCTACTTATGTATCAATATGGAGCAAGATCTGTCAAAT
GTGCTGTTTGTAGCTTTGTCACATCAGTTGGGAGGAAGAATCAAATATTTCTCTCTCTCG
GATCATCCTCTCGATCAAGAATCTGTCAGCGAAAAGAAGAATCTGGCAGCGAGAATGTTA
TGAGTTTGGAACTTTTTTCCGGAGTAAATTAATATTGCATGGATAACTGAGGCAAAAAAG
GTAACTGAGACGAAGATGTCATATGTGAAACTTCTGAATATTTTTTTATATTAACAGATT
CTATTTGATTGCATCTATATAAGAATGATGAAATCTCGAAATAAGTTCTGGAAACTTTGG
CAATGTATGCCTCTGGCTGTATTTGTCAAAAGTTACGTATATGCACTTATTTCCATCCTT
AGTTGCAGATTGAGTATCATATTTGCCAACATATGTATCTTTGAAATTCAATAACGTTTT
TTAGAATTCCAAGAATATAGAGCATTGTTTATGT


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C525TF U 1
AF RR4C525JQ C 195
BS 1 600 RR4C525TF
BS 601 601 RR4C525JQ
BS 602 646 RR4C525TF
BS 647 647 RR4C525JQ
BS 648 750 RR4C525TF
BS 751 751 RR4C525JQ
BS 752 807 RR4C525TF
BS 808 874 RR4C525JQ

RD RR4C525TF 807 0 0
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CGTCAGCACTGCCTCCCTCGTACACTCCTCCGCTGCCGGTAAATGGTAGTACAGGTGGAC
AGAGCCAGTTAGTGTGTTCAGGTTGCAGAAACCTTCTAATGTATCCCGTCGGAGCAACCT
CTGTCTGCTGCGCCGTCTGTAACGCCGTCACGGCCGTTCCTCCGCCCGGAACAGAGATGG
CTCAGTTAGTGTGTGGAGGCTGCCATACACTTCTAATGTATATTCGTGGAGCTACAAGTG
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TGAATTGCGGAAGCTGCAGGATGCTACTTATGTATCAATATGGAGCAAGATCTGTCAAAT
GTGCTGTTTGTAGCTTTGTCACATCAGTTGGGAGGAAGAATCAAATATTTCTCTCTCTCG
GATCATCCTCTCGATCAAGAATCTGTCAGCGAAAAGAAGAATCTGGCAGCGAGAATGTTA
TGAGTTTGGAACTTTTTTCCGGAGTAAATTAATATTGCATGGATAACTGAGGCAAAAAAG
*TAACTGAGACGAAGATGTCATATGTGAAACTTCTGAATATTTTTT*ATATTAACAGATT
CTATTTGATTGCATCTATATAAGAATGATGAAATCTCGAAATAAGTTCTGGAAACTTTGG
CAATGTATGCCTCTGGCTGTATTTGTCAAA*GTTACGTATATGCACTTATTTCCATCCTT
AGTTGCAGATTGAGTATCATATTTGCC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR4C525JQ 680 0 0
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GGAGGCTGCCATACACTTCTAATGTATATTCGTGGAGCTACAAGTGTTCAATGTTCTTGT
TGTCACACCGTTAATCTTGCCCTCGAAGCGAATCAGGTGGCGCATGTGAATTGCGGAAGC
TGCAGGATGCTACTTATGTATCAATATGGAGCAAGATCTGTCAAATGTGCTGTTTGTAGC
TTTGTCACATCAGTTGGGAGGAAGAATCAAATATTTCTCTCTCTCGGATCATCCTCTCGA
TCAAGAATCTGTCAGCGAAAAGAAGAATCTGGCAGCGAGAATGTTATGAGTTTGGAACTT
TTTTCCGGAGTAAATTAATATTGCATGGATAACTGAGGCAAAAAAGGTAACTGAGACGAA
GATGTCATATGTGAAACTTTTGAATATTTTTTTATATTAACAGATTCTATTTGATTGCAT
CTATATAAGAATGATGAAATCTCGAAATAAGTTCTGGAAACTTTGGCAATGTATGCCTCT
GGCTGTATTTGTCAAAAGTTACGTATATGCACTTATTTCCATCCTTAGTTGCAGATTGAG
TATCATATTTGCCAACATATGTATCTTTGAAATTCAATAACGTTTTTTAGAATTCCAAGA
ATATAGAGCATTGTTTATGT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

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CGATCATGGCCGTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAG
ACAACAACAACACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCCGATGATCAGA
GCCCTAAATCCGATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACACCAGATTCCGACGATC
GGACCAATGAGACTGCCGGAAAGGGTCAGACCGCAAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTG
TGAAGGGCGAGATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGG
AGTTTGTTCCTCCTTCGCTGGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAG
GGTTTACTAACGGTTTCACGGCAGCGCAGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCAAT
TCGCCAGAAGGAGAAGGAGCTTTGGTCTCGGCTTGTATCTGTATCATGAGTCGTAGGGCT
GGCTGGTATGCTTACCTTCTTTTTTGGTTGATGCGTCTATCAACTTGTTGGATAGACCCT
TGTGTGAACTGTCATGATGTTCACAAACAAGTTATTAATTAACATCATCATTTTGTATAC


BQ
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AF RR4C605JQ C 1
AF RR4C605TF U 66
BS 1 65 RR4C605JQ
BS 66 660 RR4C605TF

RD RR4C605JQ 660 0 0
GGAACACATTTTGACGAGACATCTGCAACCTCCTAACTCGTTTTCAACTCTCTTTTGGTC
CGATCATGGCCGTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAG
ACAACAACAACACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCCGATGATCAGA
GCCCTAAATCCGATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACACCAGATTCCGACGATC
GGACCAATGAGACTGCCGGAAAGGGTCAGACCGCAAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTG
TGAAGGGCGAGATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGG
AGTTTGTTCCTCCTTCGCTGGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAG
GGTTTACTAACGGTTTCACGGCAGCGCAGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCAAT
TCGCCAGAAGGAGAAGGAGCTTTGGTCTCGGCTTGTATCTGTATCATGAGTCGTAGGGCT
GGCTGGTATGCTTACCTTCTTTTTTGGTTGATGCGTCTATCAACTTGTTGGATAGACCCT
TGTGTGAACTGTCATGATGTTCACAAACAAGTTATTAATTAACATCATCATTTTGTATAC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR4C605TF 595 0 0
ATGGCCGTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAGACAAC
AACAACACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCCGATGATCAGAGCCCT
AAATCCGATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACACCAGATTCCGACGATCGGACC
AATGAGACTGCCGGAAAGGGTCAGACCGCAAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTGTGAAG
GGCGAGATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGGAGTTT
GTTCCTCCTTCGCTGGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAGGGTTT
ACTAACGGTTTCACGGCAGCGCAGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCAATTCGCC
AGAAGGAGAAGGAGCTTTGGTCTCGGCTTGTATCTGTATCATGAGTCGTAGGGCTGGCTG
GTATGCTTACCTTCTTTTTTGGTTGATGCGTCTATCAACTTGTTGGATAGACCCTTGTGT
GAACTGTCATGATGTTCACAAACAAGTTATTAATTAACATCATCATTTTGTATAC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL8997Contig1 891 2 1 U
ATCTTCCAAGAATCAGAGCTTATAATAGTAAAACAACAAACAATGTTTAGATGATGATCC
ATCAAAAACGTTTAACACAACAGATCCGTGTTACTCTACTCACATCTCTTCCTTAAAAAC
CCATTTACATAACCACTTGTAAACAGAAAAAAAAGGAGAAACAAAAGAAACCTTGAAGCC
ATGAATGAATCCAATATGCAAGAACCACAAGGAAGAGAATCAGTTTTGATGGTTGTGAGG
AGGAGCAGCTGTTCCTGAAGACCTCAAGAGTGGTTGAAGAGCTTTTACTACAATGCTCAT
GTTTGGCCTAAACTCTGATTCGTATTGCACACACAAGGCTGCAACCGCTGCAAGCTTTGC
AACTGCTTTAGGAGGGTACTCTCCTTTGAGTTTTGGATCAACACATTGCTTCACTTTGTC
TTCACTCAACCTTGGAGTAGCCCAAGTAACAAGACTTTGTTGACCACGAGGCATAGTATG
ATCAACCGGTTTTCTCCCGGTTAGAAGCTCCAAAAGCACAACTCCAAAACTGTAAACATC
ACTCTTCTGTGTCAACTGTCCTGTCATTGCATATTCTGGTGCGTGATAACCAAATGTCCC
CAAAACTCTAGTGGAATGAAGACGAGCAGCCATATCAGGAGCTTGGTTTGACAGATTGTA
ATCAGCTATCTTGGCTTTGAAATCTTCAAAGAGAAGCACGTTGCTAGAACGAATATCTCT
GTGTATAACAGCAGGTTGTACTTTCTCATGCAAGTATTCTAATCCTTTAGCTGCATCAAC
TGCAACTCTGACTCGTTGCATCCACTCAAGTGTTGGACCAGGTTGTGCTCCTTGGACTCC
CTTCCTTCCGTGTAAGACATCATGCAATGATCCCATTGTTGCAAACTCATA


BQ
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AF RR4B693JQ U 1
AF RR4B420JQ U 1
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T

QA 1 781 1 781
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AGGAGCAGCTGTTCCTGAAGACCTCAAGAGTGGTTGAAGAGCTTTTACTACAATGCTCAT
GTTTGGCCTAAACTCTGATTCGTATTGCACACACAAGGCTGCAACCGCTGCAAGCTTTGC
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ACTCTTCTGTGTCAACTGTCCTGTCATTGCATATTCTGGTGCGTGATAACCAAATGTCCC
CAAAACTCTAGTGGAATGAAGACGAGCAGCCATATCAGGAGCTTGGTTTGACAGATTGTA
ATCAGCTATCTTGGCTTTGAAATCTTCAAAGAGAAGCACGTTGCTAGAACGAATATCTCT
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TGCAACTCTGACTCGTTGCATCCACTCAAGTGTTGGACCAGGTTGTGCTCCTTGGACTCC
CTTCCTTCCGTGTAAGACATCATGCAATGATCCCATTGTTGCAAACTCATA

QA 1 891 1 891
DS 



AS 1 2

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ACAAACTTCGACAACTTGGGGGTACTTTATGAAGAGATTGGGGATGAATTTGAAAAGCAA
GGATATTTCCTTGTAGACGCAGACGGTAACATCCTAGAAGAGCAGAAAGGAGTTGTCAGA
TCTAACTGCATCGACTGTCTTGACCGCACAAATGTTACCCAAATTACATGGCCCAGAAGT
CTCTGAATTTACAACTTCAAAGGATCGGAGTGCTTGATTCCAAAGAGTGTGTATCCATGT
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TCCTCTTTGTATAAGGGATTCTCTGTACCACATTCTTCTTCTTTTTCATATCGTCTGTTT
TCATCTTAAACGTCGTACAAGGTTCTAACAATAATTAAATAAACAGTTGTCGTTATAAGC


BQ
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AF RR4A456TF U 1
AF RR4A456JQ C 293
BS 1 791 RR4A456TF
BS 792 1080 RR4A456JQ

RD RR4A456TF 791 0 0
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ACAAACTTCGACAACTTGGGGGTACTTTATGAAGAGATTGGGGATGAATTTGAAAAGCAA
GGATATTTCCTTGTAGACGCAGACGGTAACATCCTAGAAGAGCAGAAAGGAGTTGTCAGA
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TTGGAGATGATTACACAAAGTTCAGAACAATTTGGGCTGAGCAAGGGGACGAGATTAGCT
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AGGATGGTGTGAGGCAGGATGCTTTGGATCTCATAAGTGGTCGCTACACGGTGGGCGCAA
ACAGCCCTTCACAACTCCAGCCTATTGGAGGATCACAACCCTCTTTTCTGCCAGTAGCAT
CAGCGTTGTTG

QA 1 791 1 791
DS 

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ATCCATGTTTGGAGATGATTACACAAAGTTCAGAACAATTTGGGCTGAGCAAGGGGACGA
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GGGCGCAAACAGCCCTTCACAACTCCAGCCTATTGGAGGATCACAACCCTCTTTTCTGCC
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GGGAAGAAACACGCAGCAGTATCTGGCGTCGGCTTTGTGGGCAGGAGTGACCGCAGGAGT
GGTAGCGATGATCAAGGTCAATGGAAGGCACTTGTGTTCAAGGCCTCGTCTTTGCCATCT
CATTTGATTCCTCTTTGTATAAGGGATTCTCTGTACCACATTCTTCTTCTTTTTCATATC
GTCTGTTTTCATCTTAAACGTCGTACAAGGTTCTAACAATAATTAAATAAACAGTTGTCG
TTATAAGC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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AAGACGATGTTCGAAATTTTCCCATCGACGTCACCCTCTCTCTCTGTTCTCGGCGGGCAA
TGCAGAGTCTCAATTACGTGTTATACTCTGAATCCGAACCTGTTTTCGAGATTGTAGTGT
TAATTTTTTTTTTTGGATTCGAAGAATGGTTGGAAGAAGGGAGCAGCGATCAGAGGCAAA
ATCGTTAAAGAGTTCTCATCTTTACCTAAAGACACGAAGTGATTGGTTACTTGGAGGCCA
AAAAGATCTGAGATTGATATTCCTTGGGATGAGAGCTAGTGTTGAAGCACACAAAGATCT
GAGATTGATATTCCTTGGGACAAGAAACAACGTGAATCGAAGTTAAGAGATAGCTTGAAA
GATCAGAATTCACTCTCTTCAATATGGCAAAAACTGGTAAGCTCATGTTAGTCTATCATA
TAACTCTTTTCTTCTGTCATATACTGAGAAACAAAAGACTAGTTTTTTTTTATCATCATT
ACTTATGCTAAAGATCTATTCTTTTTGACAGTAAAGAACAATGTGTATGGATAAGAGATA
CAGAAAGAAAAAAATGGTCAGTTGGAGAGGTGGGTGAAGGTAGGCGAGGAAGGGAAACGT
GTGCGTGTTGAGTAGAAAGATTTACTAAAAGGATCCACCTCGGTCTTGTCTGCTACACTG
CTTGCTGCTGCTGCTTCCTTGTTCTGTTTCTGTATCAATCCTGTGAGTGCTTCCACTATT
TCTGAAACCTCTGGTCTAAACTCCTCTGCCTGCTTGTTGGAATAAATGATTTTTAAGTTA
TTTGTATTTGCAATGATCCTGAGTGAAGAAGCTTATTGTCCATAATTAATTACCTGAGTG
CATAGAGAGATGATGAATGCGTAGTGTGAGGCGACTCTTATGGAGAATGTTCCGGCTATG
CCTTGATCAATCATCTGTTCTAAGCTTCGCTTGTCATGAAGTCTGGTTGTTGCCCATTTC
ACCAGTAGCTGTTCTCCTTGGGGTCTTGAGCTGG


BQ
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AF RR4AW59TF U 1
AF RR4AW59JQ C 160
BS 1 755 RR4AW59TF
BS 756 994 RR4AW59JQ

RD RR4AW59TF 755 0 0
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GATCAGAATTCACTCTCTTCAATATGGCAAAAACTGGTAAGCTCATGTTAGTCTATCATA
TAACTCTTTTCTTCTGTCATATACTGAGAAACAAAAGACTAGTTTTTTTTTATCATCATT
ACTTATGCTAAAGATCTATTCTTTTTGACAGTAAAGAACAATGTGTATGGATAAGAGATA
CAGAAAGAAAAAAATGGTCAGTTGGAGAGGTGGGTGAAGGTAGGCGAGGAAGGGAAACGT
GTGCGTGTTGAGTAGAAAGATTTACTAAAAGGATCCACCTCGGTCTTGTCTGCTACACTG
CTTGCTGCTGCTGCTTCCTTGTTCTGTTTCTGTATCAATCCTGTGAGTGCTTCCACTATT
TCTGAAACCTCTGGTCTAAACTCCTCTGCCTGCTT

QA 1 755 1 755
DS 

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AATGTGTATGGATAAGAGATACAGAAAGAAAAAAATGGTCAGTTGGAGAGGTGGGTGAAG
GTAGGCGAGGAAGGGAAACGTGTGCGTGTTGAGTAGAAAGATTTACTAAAAGGATCCACC
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CCTGTGAGTGCTTCCACTATTTCTGAAACCTCTGGTCTAAACTCCTCTGCCTGCTTGTTG
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AGTCTGGTTGTTGCCCATTTCACCAGTAGCTGTTCTCCTTGGGGTCTTGAGCTGG

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

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TTTACT


BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4B252JQ C 1
AF RR4B252TF U 1
BS 1 786 RR4B252TF

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TTTACT

QA 1 786 1 786
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TAGTACAAAAGACCGAGGAGTTTACGTTTCACGGGGTTTGAAGTAGTGACTTGTTATCTA
CGTTACGATTAGCTTTGCTTTTGTGGCCACGACGAACAACGGCAATGCGAATAAAGTCTT
TTTTTAATCATCTGTAGTAGTGCTTCGTAAATATATTTCTATTTTTTCTTAATCTTGTGT
TTACAAGAATAACAATAGTTGTCCAGCGTGATGTTTACGAAATATATAACCAGTAAGGTT
TTTACT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL9001Contig1 683 2 1 U
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CAATAAGACCATTTTCGTGATAT


BQ
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AF RR4DD53TF U 1
AF RR4D477TF U 1
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR4G142JQ C 1
AF RR4G142TF U 1
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BS 674 674 RR4G142JQ

RD RR4G142JQ 674 0 0
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TTTGCGGAGTTAAAAGCCTCATATGCACTAGGAAGAAAGCCAAAATGGTGTTTGGATTTG
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TGCTAATTTTTTTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4G142TF 673 0 0
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GAGATCACCAACCCCCGGAGCCACTTGATTTCTTCATATTGACTGTTGAGGATGTTGGAA
CTTGGCTTGAGGAGATAAACCTTGGCAACTACCGTCAGATGTTCAAAGAAAATGGTATCA
ACGGAGAATGTCTAGAAAGAATGTCCGTGTTCACAACCGAACAGATCCTTCACTTCATAA
GGAGGCATCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACCCTCTGTCAAGAACTCAGAAGGATTA
AAGTGGCTTGCTTGAAAGGTGAGCAGAGAGTTCGACGGCCTTGGTGGGCACTGTCATGTC
TCTCAGTAATCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGACAGTCTCGAGTTGTATCTCTCA
AGCTTGAATCTTGACATTTGTTTACCTTCTCTTCCTTTCTTTTTTTTTTGGTTTCGGTTG
TTTGCGGAGTTAAAAGCCTCATATGCACTAGGAAGAAAGCCAAAATGGTGTTTGGATTTG
GTAAAATCTGGCAAAGGGAGAAAGAAAATTATGTTTTGGTACTTTGATGTATACATGAAA
TGCTAATTTTTTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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CCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCAG
ATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4A221TFB U 1
AF RR4A221TF U 86
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QA 1 455 1 455
DS 

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TATTTATAGT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4DP14JQ C 1
AF RR4DP14TF U 1
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DS 

RD RR4DP14TF 478 0 0
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ATTATAGGAGGACATAGTTAATTTAACGTATCTGTTGTTTTATAGATAAAAAGATTTTCT
GTTGTATAAATAAAAAGAAATGCAGAAAATTCAAAATTAAATAAAAACTTTAGGCTTT

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL9006Contig1 972 2 6 U
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CTTTTAGCGCAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BU81TF U 1
AF RR4BU81JQ C 191
BS 1 679 RR4BU81TF
BS 680 680 RR4BU81JQ
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BS 709 730 RR4BU81TF
BS 731 972 RR4BU81JQ

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AGAGGTTTGTTTATCTTCGGAGCTACAGACCGAGCCGTGTCTCTCCTCCTTCTCCTCCGC
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CCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4BU81JQ 782 0 0
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AGCTTTGCTTCTGTAGTTTAAAGCATTTCTACCGTTCAATTCTCATAAGAAAATATTTGT
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AG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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TAAAAATCATCTTTGAATAAAATGTTACAACCGAAACTCGTCTCC


BQ
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AF RR4A810TF U 1
AF RR4A810JQ C 58
BS 1 824 RR4A810TF
BS 825 825 RR4A810JQ

RD RR4A810TF 824 0 0
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GTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTTAAGTTTCTATCTTCCATATGTTTAATATAAAT
TAAAAATCATCTTTGAATAAAATGTTACAACCGAAACTCGTCTC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR4A810JQ 768 0 0
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ACAGAGGAAACCAAGACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGTGGAAGAAACA
AAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGACGTTGTAGAG
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AATTAAAAATCATCTTTGAATAAAATGTTACAACCGAAACTCGTCTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4D470JQ C 1
AF RR4D470TF U 1
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QA 1 341 1 341
DS 

RD RR4D470TF 341 0 0
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TCAGCGCCGTATCGTGGCCCAGCATTTCCTCGAAAAACCCTAAATAAAACACTCTACACC
ATCTTACAGGAATCCATCGGTGATGAGCGTTGCTTGTTACGCAAGTGGTTTTGCTTTCTC
TATTTGCACCCTTTTGGGGTTTTTATGTTGCGTTTCATATGTTATCAATGTTTAAAAGTG
AACATGTAATAATAAAATTGGAAATAAAGTTGATAATACCG

QA 1 341 1 341
DS 



AS 1 2

CO CL9010Contig1 846 2 8 U
GGGGGAGAAGACGAACAAATGGCAATTCTCAGCAACGTCTCGTTTTCCTGCAGCAACATC
TCTCTAAAACCGTCTCTCTCTAAGTCTCTTTATTCTCGTTCTCACTGTCGTCTCATTCGC
TGCTCACAGGAAGGGAAAGGAGTGGTCAGTCCGTTGGTTTGGTCATTAGGAGAAGAGGTT
TCAAAGAGAAGTTTACTTGCACTTGTCTCTGCTTCTCTCTTCTTTGTTGATCCTGCTCTT
GCTTTTAAGGGTGGAGGTCCCTATGGACAAGGAGTCACCAGGGGACAGGACTTATCCGGC
AAGGATTTTAGTGGCCAGACTCTGATCAGACAGGACTTCAAGACGTCAATCCTAAGGCAA
GCCAATTTCAAGGGTGTTAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTTTTTGATGCAGACTTAACAGAT
TTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGCTAACTTGGAAGGAGCAACT
GCTACCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACATTACAGGCGCTGATTTCACTGATGTT
CCTCTAAGAGATGATCAACGAGAATACCTTTGCAAAATCGCCGATGGGGTTAATGCCACC
ACTGGGAATGCCACACGGGACACATTGCTCTGCAACTGAACTTGTCAAGTGTAAACCTTT
GTATCGTTGGGGAGTCTTCTTCTTCCGAGTTTTTGTAAAAGTTTTTGCAGAGTGAGTGTG
TATATAAATATGCTTACTATTCTCAAGTCCGTTAGACATTCAGAGATCATGTATGCTACA
GAACAATATAAAAAACCCCAAACATGATGGTTAAACAGAAAGAAAAAAAAACAGCTGTGT
TTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4CQ41TF U 1
AF RR4CQ41JQ C 95
BS 1 699 RR4CQ41TF
BS 700 702 RR4CQ41JQ
BS 703 727 RR4CQ41TF
BS 728 728 RR4CQ41JQ
BS 729 734 RR4CQ41TF
BS 735 735 RR4CQ41JQ
BS 736 752 RR4CQ41TF
BS 753 846 RR4CQ41JQ

RD RR4CQ41TF 758 0 0
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TCTCTAAAACCGTCTCTCTCTAAGTCTCTTTATTCTCGTTCTCACTGTCGTCTCATTCGC
TGCTCACAGGAAGGGAAAGGAGTGGTCAGTCCGTTGGTTTGGTCATTAGGAGAAGAGGTT
TCAAAGAGAAGTTTACTTGCACTTGTCTCTGCTTCTCTCTTCTTTGTTGATCCTGCTCTT
GCTTTTAAGGGTGGAGGTCCCTATGGACAAGGAGTCACCAGGGGACAGGACTTATCCGGC
AAGGATTTTAGTGGCCAGACTCTGATCAGACAGGACTTCAAGACGTCAATCCTAAGGCAA
GCCAATTTCAAGGGTGTTAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTTTTTGATGCAGACTTAACAGAT
TTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGCTAACTTGGAAGGAGCAACT
GCTACCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACATTACAGGCGCTGATTTCACTGATGTT
CCTCTAAGAGATGATCAACGAGAATACCTTTGCAAAATCGCCGATGGGGTTAATGCCACC
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GTATCGTTGGGGAGTCTTCTTCTTCCGAGTTTTTGTAAAG**TTTTGCAGAGTGAGTGTG
TATATAA*TATGCT*ACTATTCTCAAGTCCGT
AGACAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR4CQ41JQ 752 0 0
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CTCTCTTCTTTGTTGATCCTGCTCTTGCTTTTAAGGGTGGAGGTCCCTATGGACAAGGAG
TCACCAGGGGACAGGACTTATCCGGCAAGGATTTTAGTGGCCAGACTCTGATCAGACAGG
ACTTCAAGACGTCAATCCTAAGGCAAGCCAATTTCAAGGGTGTTAAGTTGTTAGGTGCTA
GCTTTTTTGATGCAGACTTAACAGATTTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAA
CTAACGCTAACTTGGAAGGAGCAACTGCTACCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACA
TTACAGGCGCTGATTTCACTGATGTTCCTTTAAGAGATGATCAACGAGAATACCTTTGCA
AAATCGCCGATGGGGTTAATGCCACCACTGGGAATGCCACACGGGACACATTGCTCTGCA
ACTGAACTTGTCAAGTGTAAACCTTTGTATCGTTGGGGAGTCTTCTTCTTCCGAGTTTTT
GTAAAAGTTTTTGCAGAGTGAGTGTGTATATAAATATGCTTACTATTCTCAAGTCCGTTA
GACATTCAGAGATCATGTATGCTACAGAACAATATAAAAAACCCCAAACATGATGGTTAA
ACAGAAAGAAAAAAAAACAGCTGTGTTTTCCC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL9011Contig1 822 2 2 U
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TCCCCACAAACTGAGTCGAATTCAAGCAGATGTTTTGTGAATCGAAATTGAAAGGCGCTG
ACTTTGTTTGTGCCGGTTCTCTATCTCTCTCTCGCTCTCGGTAAAGGCTTCAGAAACGGT
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GCCTGTGCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAGGCTCTCACGCCATAGC
TCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGA
CAACCATCTCCACGTTTTCGACCTCCACACTCTAACATGGTCCATCTAAGATGGTCATCA
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GCTCCTAATTCTTTGTTTATTAATTTTAGTTTCTTTCCTTGTAAAAGTTAAGATAACAAT
GCTCAGTCCTAGCAATAATGTGTACATTTGCTATTGTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G469TF U 1
AF RR4G469JQ C 101
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BS 703 822 RR4G469JQ

RD RR4G469TF 702 0 0
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TCCCCACAAACTGAGTCGAATTCAAGCAGATGTTTTGTGAATCGAAATTGAAAGGCGCTG
ACTTTGTTTGTGCCGGTTCTCTATCTCTCTCTCGCTCTCGGTAAAGGCTTCAGAAACGGT
CGGCTTTTCAAAGGATCTGCCATGACCAAACGTGGAGCTTACGAGGCTCTCTCTTACATG
GCCTGTGCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAGGCTCTCACGCCATAGC
TCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGA
CAACCATCTCCACGTTTTCGACCTCCACACTCTAACATGGTCCATCTAAGATGGTCATCA
CCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTCTTCCCCGATCAGTTATGGCGGAGGAAGATGTCATCG
CTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTGAGAATGTCGAATCCGAGATCC
AAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACCGGGAAAGCTTCGGGGGCTGTGAC
TTTAAAGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGTAGAGGAACGTGTGTGTTCCCT
AGTAGTATTGTAACGAATCAACCTCTCACCGTTTTTGTATCA

QA 1 702 1 702
DS 

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GTAAAGGCTTCAGAAACGGTCGGCTTTTCAAAGGATCTGCCATGACCAAACGTGGAGCTT
ACGAGGCTCTCTCTTACATGGCCTGTGCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCA
AGAGGCTCTCACGCCATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGGGAGTTC
CAGCCCCGTGTCCCCGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTCCACACTCTAACATGG
TCCATTTAAGATGGTCATCACCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTCTTCCCCGATCAGTTAT
GGCGGAGGAAGATGTCATCGCTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTGA
GAATGTCGAATCCGAGATCCAAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACCGGG
AAAGCTTCGGGGGCTGTGACTTTAAAGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGTA
GAGGAACGTGTGTGTTCCCTAGTAGTATTGTAACGAATCAACCTCTCACCGTTTTTGTAT
CAATTCGGAGAAGATGAACAGCTCCTAATTCTTTGTTTATTAATTTTAGTTTCTTTCCTT
GTAAAAGTTAAGATAACAATGCTCAGTCCTAGCAATAATGTGTACATTTGCTATTGTTTC
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL9012Contig1 783 2 2 U
GGATGGCTAACAACAATGGGGAAATCTACTGCGACAGCTCCAGCTGATGATATCCTGTTT
CCAATTATTATGGTTACTCCAATCGATAATTGTAATCCTCTCCATAATTACCATCGCAAC
ACCGATAATTTTCTCCAATTTTCTCCGCCAGGTACACACTCTCAATTTATAATCTCTATC
CCTATCTCAATGGTTTAGCTTCCCTTCTTCTCATTGTATGCCATATTGCATGGATCGATT
TTGTCTGTAATGAATCTATAATCTCTTTGATATATTTTCCCAAAGTTCCTTCCCTGCAGC
AAATAAGATTGCTGGAACAGAAAACGTCGAGGAAGGAAAAGATGAATAATGCTGCGTACA
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AGCTGGTAGACTGAGAATGAGCCAAGAGAATGTCCGTACTTCCTCTTGACGGACCTGAGA
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TTGATCACGGAAGGTCAAACGGTTACTTAGACTATGCAAAGCACATCAATATATTTTGAT
TTTGTTGGGACAGAACTTTGTGATGGTACAAAACTTTAATTTTTATTAAGTCTTATAAAT
CCC


BQ
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10 10 10 

AF RR4BR32TF U 1
AF RR4BR32JQ C 73
BS 1 666 RR4BR32TF
BS 667 783 RR4BR32JQ

RD RR4BR32TF 666 0 0
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CCAATTATTATGGTTACTCCAATCGATAATTGTAATCCTCTCCATAATTACCATCGCAAC
ACCGATAATTTTCTCCAATTTTCTCCGCCAGGTACACACTCTCAATTTATAATCTCTATC
CCTATCTCAATGGTTTAGCTTCCCTTCTTCTCATTGTATGCCATATTGCATGGATCGATT
TTGTCTGTAATGAATCTATAATCTCTTTGATATATTTTCCCAAAGTTCCTTCCCTGCAGC
AAATAAGATTGCTGGAACAGAAAACGTCGAGGAAGGAAAAGATGAATAATGCTGCGTACA
AGGATTTGGAACTGCTATTAAGCATTACTCCAAAAACGCAATAGCTATCAATGAGAGAGA
TGCAGAAGCAGGAAGGGGTGAAGCGTTTAAAGAGGGAGGTTGCTGAGGCAGAGAGGAAGC
GCATAGAAGAATAAGAAGAAGAGACCTGGGAGAGCTCAGAGCGTCAAGCTCATTGAGAGA
AGCTGGTAGACTGAGAATGAGCCAAGAGAATGTCCGTACTTCCTCTTGACGGACCTGAGA
ACGGACATGATGGTATGTACACATATAAGTTCTACTTTCTTTGTCACTCATTAACTATCT
TTGATC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR4BR32JQ 711 0 0
GTTACTCCAATCGATAATTGTAATCCTCTCCATAATTACCATCGCAACACCGATAATTTT
CTCCAATTTTCTCCGCCAGGTACACACTCTCAATTTATAATCTCTATCCCTATCTCAATG
GTTTAGCTTCCCTTCTTCTCATTGTATGCCATATTGCATGGATCGATTTTGTCTGTAATG
AATCTATAATCTCTTTGATATATTTTCCCAAAGTTCCTTCCCTGCAGCAAATAAGATTGC
TGGAACAGAAAACGTCGAGGAAGGAAAAGATGAATAATGCTGCGTACAAGGATTTGGAAC
TGCTATTAAGCATTACTCCAAAAACGCAATAGCTATCAATGAGAGAGATGCAGAAGCAGG
AAGGGGTGAAGCGTTTAAAGAGGGAGGTTGCTGAGGCAGAGAGGAAGCGCATAGAAGAAT
AAGAAGAAGAGACCTGGGAGAGCTCAGAGCGTCAAGCTCATTGAGAGAAGCTGGTAGACT
GAGAATGAGCCAAGAGAATGTCCGTACTTCCTCTTGACGGACCTGAGAACGGACATGATG
GTATGTACACATATAAGTTCTACTTTCTTTGTCACTCATTAACTATCTTTGATCACGGAA
GGTCAAACGGTTACTTAGACTATGCAAAGCACATCAATATATTTTGATTTTGTTGGGACA
GAACTTTGTGATGGTACAAAACTTTAATTTTTATTAAGTCTTATAAATCCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL9013Contig1 759 2 6 U
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TATGTTTGTTGCTGATGGAGGTGAATGTTTGATAGCTCAAAGTTTTGCCAAAAATATGGG
TCTTTATGGAGAGCGTATTGGCGCTCTTACAATTGTATGCACCTCAGAAGATGTGGCTAG
GAAAGTAAAGAGCCAACTGCTACTTGTTGTGAGACCTATGTATCTTAGCCCACCTATTCA
TGGAGCATCCATCGTTACCACAATTCTTAAAAATAGTGATTTGTACAATGACTGGACGGT
TGAGCTGAAAGGAATGGCTAAACGCATACTTAGTATGCGAAAACAGTTATATGAAGCTTT
ACAAGCTAGAGGCACACCTGGTGACTGGAGTCACATTATCAGACAGATTGGGATGTTTAG
TTTTACGGGGTTGAATGAGAAGCAAGTTCGCTTCATAGCTAAAGAGTATCACATTTACAT
GATTCATAACGGGAGGGTAAGCATTGCAGGTCTAAGTTCTAAGACAGTTTCCCAACTCGC
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TCTTATGAGAAAAAAAGAGTTCTTGACTTCTTGTGTACATTTCATAAGCGAAACAATAAA
GCATATATAATGTAACGTATAATATTGATATGATTTCTTTTCTTTTCTTTCCTGACCGTT
GTTAAACCGAACAAAATAAGAATTGTGATAAGTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EQ70TF U 1
AF RR4EQ70JQ C 39
BS 1 615 RR4EQ70TF
BS 616 616 RR4EQ70JQ
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BS 654 719 RR4EQ70TF
BS 720 759 RR4EQ70JQ

RD RR4EQ70TF 729 0 0
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TATGTTTGTTGCTGATGGAGGTGAATGTTTGATAGCTCAAAGTTTTGCCAAAAATATGGG
TCTTTATGGAGAGCGTATTGGCGCTCTTACAATTGTATGCACCTCAGAAGATGTGGCTAG
GAAAGTAAAGAGCCAACTGCTACTTGTTGTGAGACCTATGTATCTTAGCCCACCTATTCA
TGGAGCATCCATCGTTACCACAATTCTTAAAAATAGTGATTTGTACAATGACTGGACGGT
TGAGCTGAAAGGAATGGCTAAACGCATACTTAGTATGCGAAAACAGTTATATGAAGCTTT
ACAAGCTAGAGGCACACCTGGTGACTGGAGTCACATTATCAGACAGATTGGGATGTTTAG
TTTTACGGGGTTGAATGAGAAGCAAGTTCGCTTCATAGCTAAAGAGTATCACATTTACAT
GATTCATAACGGGAGGGTAAGCATTGCAGGTCTAAGTTCTAAGACAGTTTCCCAACTCGC
TGATGCTATACATGCTGCAGTTACCCGTGTGTCCTAATCTAGCGATTGTGCTCTTTGTTG
TCTTATGAGAAAAAA*GAGTTCTTGACTTCTTGTGTACATTTCATAAGCGAA*CAATAAA
GCATATATAATGTAACGTATAATATTGATATGATTTCTTTTCTTTTCTTTCCTGACCGT
GTAAACCGAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR4EQ70JQ 721 0 0
AGTCAGATGCACAAGCGGTTCGTATGTTTGTTGCTGATGGAGGTGAATGTTTGATAGCTC
AAAGTTTTGCCAAAAATATGGGTCTTTATGGAGAGCGTATTGGCGCTCTTACAATTGTAT
GCACCTCAGAAGATGTGGCTAGGAAAGTAAAGAGCCAACTGCTACTTGTTGTGAGACCTA
TGTATCTTAGCCCACCTATTCATGGAGCATCCATCGTTACCACAATTCTTAAAAATAGTG
ATTTGTACAATGACTGGACGGTTGAGCTGAAAGGAATGGCTAAACGCATACTTAGTATGC
GAAAACAGTTATATGAAGCTTTACAAGCTAGAGGCACACCTGGTGACTGGAGTCACATTA
TCAGACAGATTGGGATGTTTAGTTTTACGGGGTTGAATGAGAAGCAAGTTCGCTTCATAG
CTAAAGAGTATCACATTTACATGATTCATAACGGGAGGGTAAGCATTGCAGGTCTAAGTT
CTAAGACAGTTTCCCAACTCGCTGATGCTATACATGCTGCAGTTACCCGTGTGTCCTAAT
CTAGCGATTGTGCTCTTTGTTGTCTTATGAGAAAAAAAGAGTTCTTGACTTCTTGTGTAC
ATTTCATAAGCGAAACAATAAAGCATATATAATGTAACGTATAATATTGATATGATTTCT
TTTCTTTTCTTTCCTGACCGTTGTTAAACCGAACAAAATAAGAATTGTGATAAGTTTTCT
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL9014Contig1 817 2 10 U
GGAATGAGAGAAAATTAATCCTACAGCATAATCTGAGAAGGGTTTGGTGAGTACCGGCGG
TGGATCCGACGGAGATGGCAAAGAGTGAATTTTTCGATTCGGATCCAACGGTAATTGCCA
AGGCGAAGGAGCTGAAGCGTGAGATGAAAATACTGCTTCGGACCATCGAAGAAGACGATG
ATTTTAGCGTTCGGACAATAGACCAGTTGCAAGAAGCTCTGTCTGCGTTCAAACAAGCGA
AGACGAAGAAGATGGCGAAATCTTCTTCTCTCGAGATGCTCGTGACAGTGTCTTGTCCTG
ATGAGTTTCGTTGTCCTCTGTCTAACGAGCTCATGCGTGATCCCGTCGTTTTGGCTTCTG
GTCAGACGTATGATAAGTTTTACATACAAAAGTGGTTAAGTTCTGGAAACAGAACATGTC
CCAAGACTAAGCAAGTTCTGCCTCACACAGGTTTAACTCCCAATCTTTTAGTCAGTGATA
TGATTTCAAAATGGTGCAAAACGGTTGGGGTAGAGACGATGAATCAATATCAGTCCAACA
CTCTATCAGATCGTGAGGTTTTGAACTCCTTGCTCTGTAAAGTCTCGTCTTCGAATCTTC
AAGATCAAAAATCAGCTGCGAAGGAGCTAAGACTTCTGACCAGGAAAGGCACCTTGTTCC
GAGCTCTTCTCGGCGAATCTTCAAATCAAATCAACCGGTTAGTGAATCCGTTGATGAGCT
TGAACCAAGATGAGAATCTTCAAGAAGATGTGATCACTACCTTGTTGAACATATCCATAC
ACGATGACAACAACAAGAAGCTAGTCTGCGAAAACCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FA09TF U 1
AF RR4FF25TF U 90
BS 1 155 RR4FA09TF
BS 156 156 RR4FF25TF
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BS 686 735 RR4FA09TF
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BS 746 746 RR4FF25TF
BS 747 789 RR4FA09TF
BS 790 817 RR4FF25TF

RD RR4FA09TF 789 0 0
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TGGATCCGACGGAGATGGCAAAGAGTGAATTTTTCGATTCGGATCCAACGGTAATTGCCA
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ATTTTAGCGTTCGGACAATAGACCAGTTGCAAGAAGCTCTGTCTGCGTTCAAACAAGCGA
AGACGAAGAAGATGGCGAAATCTTCTTCTCTCGAGATGCTCGTGACAGTGTCTTGTCCTG
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GTCAGACGTATGATAAGTTTTACATACAAAAGTGGTTAAGTTCTGGAAACAGAACATGTC
CCAAGACTAAGCAAGTTCTGCCTCACACAGGTTTAACTCCCAATCTTTTAGTCAGTGATA
TGATTTCAAAATGGTGCAAAACGGTTGGGGTAGAGACGATGAATCAATATCAGTCCAACA
CTCTATCAGATCGTGAGGTTTTGAACTCCTTGCTCTGTAAAGTCTCGTCTTCGAATCTTC
AAGATCAAAAATCAGCTGCGAAGGAGCTAAGACTTCTGACCAGGAAAGGCACCTTGTTCC
GAGCTCTTCTCGGCGAATCTTCAA*TCAAATCAACCGGTTAGTGAATCCGTTGATGAGCT
TGAACCAAGATGAGA*TCTTCAAGA*GATGTGATCACTACCTTGTTGAACATATCCATAC
ACGATGACA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR4FF25TF 728 0 0
TTTTTCGATTCGGATCCAACGGTAATTGCCAAGGCGAAGGAGCTGAAGCGTGAGATGAAA
ATACTGCTTCGGACCATCGAAGAAGACGATGATTTTAGCGTTCGGACAATAGACCAGTTG
CAAGAAGCTCTGTCTGCGTTCAAACAAGCGAAGACGAAGAAGATGGCGAAATCTTCTTCT
CTCGAGATGCTCGTGACAGTGTCTTGTCCTGATGAGTTTCGTTGTCCTCTGTCTAACGAG
CTCATGCGTGATCCCGTCGTTTTGGCTTCTGGTCAGACGTATGATAAGTTTTACATACAA
AAGTGGTTAAGTTCTGGAAACAGAACATGTCCCAAGACTAAGCAAGTTCTGCCTCACACA
GGTTTAACTCCCAATCTTTTAGTTAGTGATATGATTTCAAAATGGTGCAAAACGGTTGGG
GTAGAGACGATGAATCAATATCAGTCCAACACTCTATCAGATCGTGAGGTTTTGAACTCC
TTGCTCTGTAAAGTCTCGTCTTCGAATCTTCAAGATCAAAAATCAGCTGCGAAGGAGCTA
AGACTTCTGACCAGGAAAGGCACCTTGTTCCGAGCTCTTCTCGGCGAATCTTCAAATCAA
ATCAACCGGTTAGTGAATCCGTTGATGAGCTTGAACCAAGATGGGAATCTTCAAGAAGAT
GTGATCACTACCTTGTTGAACATATCCATACACGATGACAACAACAAGAAGCTAGTCTGC
GAAAACCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL9015Contig1 345 2 1 U
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GCCTTTCAAGGCTGAATCAATCAATCGCGAGAAGGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGGC
TGATGGAAAGCCCCAGAAACCAGTTCTGCGCTCAGATGCACCTGAAGTTTGAGACATTTT
GATCAAAGATATATGGTTTCTTAGTTTGATGATGTATTGCTTCTCTGTATGGATGAGATA
GTAAAAGGAATGCAAGAACGTCTCTCCGCATATTTTATTTCCTTTATTGTTTGTAATGAA
AGATTGATGATACTCTCCCATCAAATAATGATATAAACACGGGTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H695JQB C 1
AF RR4H695TF U 1
BS 1 345 RR4H695TF

RD RR4H695JQB 345 0 0
GATGACGTATATAACCTATTCCAACATCTGCGCGAATCTGGTGAGGAATTGTCTGAAGGA
GCCTTTCAAGGCTGAATCAATCAATCGCGAGAAGGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGGC
TGATGGAAAGCCCCAGAAACCAGTTCTGCGCTCAGATGCACCTGAAGTTTGAGACATTTT
GATCAAAGATATATGGTTTCTTAGTTTGATGATGTATTGCTTCTCTGTATGGATGAGATA
GTAAAAGGAATGCAAGAACGTCTCTCCGCATATTTTATTTCCTTTATTGTTTGTAATGAA
AGATTGATGATACTCTCCCATCAAATAATGATATAAACACGGGTA

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR4H695TF 345 0 0
GATGACGTATATAACCTATTCCAACATCTGCGCGAATCTGGTGAGGAATTGTCTGAAGGA
GCCTTTCAAGGCTGAATCAATCAATCGCGAGAAGGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGGC
TGATGGAAAGCCCCAGAAACCAGTTCTGCGCTCAGATGCACCTGAAGTTTGAGACATTTT
GATCAAAGATATATGGTTTCTTAGTTTGATGATGTATTGCTTCTCTGTATGGATGAGATA
GTAAAAGGAATGCAAGAACGTCTCTCCGCATATTTTATTTCCTTTATTGTTTGTAATGAA
AGATTGATGATACTCTCCCATCAAATAATGATATAAACACGGGTA

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 2

CO CL9016Contig1 687 2 3 U
GAGACGACAAAGGTATCGTTGGAGTATCACTATCTAGAGAACTAACCATTGTTGCTGGTG
ACACGTTGAAGACGAATCTAACCGCACTTGGTCCCCTTGTTCTGCCTTTATCTGAAAAGC
TCCGGTTTATTATCTCTATTGTAAAAAGTAGGCTTTTTAGGTTAAAGAGCAGTCCATATG
TCCCGAATTTTAAACTATGTTTCGAGCACTTCTGTATCCACGCTGGTGGTAGAGCGTTAC
TTGACGCGGTTGAAAAAGGTCTTGGCCTCAGTGAGGCCGATCTCGAGCCGTCTCGGATGA
CTTTGCACCGGTTTGGAAACACTTCAAGCTCGTCTCTGTGGTACGAGCTAGCTTACATAG
AGGCTAAGTGTCGGGTCAAGCATGGAGATCGGGTTTGGCAGTTGGCGTTCGGGTCGGGAT
TTAAATGCAACAGTATTGTGTGGAGTGCATTGAGAACGATTTCGGCGAGCGAGACACTGG
TGGGAAACCCGTGGGGTGACTCGGTTCATAAGTATCCGGTTCATGTGACACAACCTTTGT
AGTGAAGTCACGTGACAAAAGTGTCATATGTCATATCTAGTAAGTGTATCTTTTAATTCA
AGCCGTTACCTAAAATATGTATTAGACGAATCGTCGTCTAAAATGTTCTACGTGTATCTT
TTCTAAAAATATTCAATAATTAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CO21JQ C 1
AF RR4EX73TF U 60
BS 1 59 RR4CO21JQ
BS 60 669 RR4EX73TF
BS 670 687 RR4CO21JQ

RD RR4CO21JQ 687 0 0
GAGACGACAAAGGTATCGTTGGAGTATCACTATCTAGAGAACTAACCATTGTTGCTGGTG
ACACGTTGAAGACGAATCTAACCGCACTTGGTCCCCTTGTTCTGCCTTTATCTGAAAAGC
TCCGGTTTATTATCTCTATTGTAAAGAGTAGGCTTTTTAGGTTAAAGAGCAGTCCATATG
TCCCGAATTTTAAACTATGTTTCGAGCACTTCTGTATCCACGCTGGTGGTAGAGCGTTAC
TTGACGCGGTTGAAAAAGGTCTTGGCCTCAGTGAGGTCGATCTCGAGCCGTCTCGGATGA
CTTTGCACCGGTTTGGAAACACTTCAAGCTCGTCTCTGTGGTACGAGCTAGCTTACATAG
AGGCTAAGTGTCGGGTCAAGCATGGAGATCGGGTTTGGCAGTTGGCGTTCGGGTCGGGAT
TTAAATGCAACAGTATTGTGTGGAGTGCATTGAGAACGATTTCGGCGAGCGAGACACTGG
TGGGAAACCCGTGGGGTGACTCGGTTCATAAGTATCCGGTTCATGTGACATAACTTTTGT
AGTGAAGTCACGTGACAAAAGTGTCATATGTCATATCTAGTAAGTGTATCTTTTAATTCA
AGCCGTTACCTAAAATATGTATTAGACGAATCGTCGTCTAAAATGTTCTACGTGTATCTT
TTCTAAAAATATTCAATAATTAATGCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4EX73TF 610 0 0
GACACGTTGAAGACGAATCTAACCGCACTTGGTCCCCTTGTTCTGCCTTTATCTGAAAAG
CTCCGGTTTATTATCTCTATTGTAAAAAGTAGGCTTTTTAGGTTAAAGAGCAGTCCATAT
GTCCCGAATTTTAAACTATGTTTCGAGCACTTCTGTATCCACGCTGGTGGTAGAGCGTTA
CTTGACGCGGTTGAAAAAGGTCTTGGCCTCAGTGAGGCCGATCTCGAGCCGTCTCGGATG
ACTTTGCACCGGTTTGGAAACACTTCAAGCTCGTCTCTGTGGTACGAGCTAGCTTACATA
GAGGCTAAGTGTCGGGTCAAGCATGGAGATCGGGTTTGGCAGTTGGCGTTCGGGTCGGGA
TTTAAATGCAACAGTATTGTGTGGAGTGCATTGAGAACGATTTCGGCGAGCGAGACACTG
GTGGGAAACCCGTGGGGTGACTCGGTTCATAAGTATCCGGTTCATGTGACACAACCTTTG
TAGTGAAGTCACGTGACAAAAGTGTCATATGTCATATCTAGTAAGTGTATCTTTTAATTC
AAGCCGTTACCTAAAATATGTATTAGACGAATCGTCGTCTAAAATGTTCTACGTGTATCT
TTTCTAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL9017Contig1 1342 2 2 U
GGATCCAGAAAACATGGCGTGGTTAGCCAGATCCATAGCGAATTCTCTCAAGATCGATGA
AGAAGAAGATGACGAGAAGGAGACCATCATCAAGGAAAACCCTATCCAAGATCCCGGTTC
CGATCAACAACCGTCTTCGCCGTCGTCGGCGTTGAAATCACAGTCACCACGAGGCGTGAA
GGAAGACATATCGGAGCTCACGAAGACCTTCAGAAGTCAGCTATGGGGTGTCGCTTCTTT
CCTGGCGCCACCGCCTGAGGAGACTCGAAAGTCATCGGAGGGTGGTGAGGAGGAGGAGGA
TGTGATCGCTGGGATCAGGAGCGATTTCGTGGAGATCGGAGGTAGGTTCAAGACCGGGAT
CTCGAAGCTATCGGGGAACTTGCCTGTATCGGAGATTACGAAGATGGCTTCGAGTTTCTG
GCAAGGAGGGGATTCGAAAGGGGAGCGTGATGATGATGTTGGAGATGTGATTGGTGTGAC
GGAGGAAGTAGTTGGTTTCGCCAAGGATCTTGCTCTTCATCCTGAGACGTGGCTTGATTT
CCCCTTCCCCGAAGAGGATAGTAACTTCGATGACTTTGAGATGACTGATGCTCAGTATGA
GCACGCCCTGGCCGTGGAAAGGGTTGCAACGGGTCTAGCTGCTTTGAGGATCGAGCTTTG
TCCAGCATACATGAGCGAGTATTGCTTCTGGAGGATTTACTTTGTACTTATGCATCCTAA
GTTCGGCAAACATGATGCCTTGCTTCTCTCTACTCCTCAGGTACTTGAATCAAGAGCATT
GTTATCTCATGAGCTGCTGCATAAGAGAAACAAAGCTGCAGTGATGGTTCCAGAGAGTAG
CGGTGATATAGGAACTGCTAGTGCCAATGAGGAACCACTTACTGTCTCTTCACCAGAGCC
AGTCAAGACCATCCCTGTCGAAACAATACATTCGAGTGAGACATCTGAGGTTGAGACGGA
GAAGTACCCAATCGAGAGTAAGGAGATACAAGTTGTTGACAAGCCTGTGATTGAAGAAAA
GCCAGCACCAGCGCCTCAAGACAAGCCAGTCACTGGATCTTCACCTAGAGTTATTGACGT
TCAAGTCGATGATGATGATGATGATGATGTTGATGATTGGTTGAAGGATGAAGATAATGC
TGGAACTGTTAGCTCCACTGTAGGAACCAAACATGTTGTGGATGAGGATGAAGATGTAAC
GTTTAGTGATCTGGAAGAAGATGACGACGATGTGCCAGTGAATTACAAGAAATTATTCTC
CAATCCTCAGACCTAAGAAGTTAAGTTTTATTTAAACGCTGTCTGCTGAAGAAGAATGTG
CCACGGCCGTGATCAGGTAAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DI83TF U 1
AF RR4DI83JQ C 547
BS 1 756 RR4DI83TF
BS 757 1342 RR4DI83JQ

RD RR4DI83TF 756 0 0
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CGATCAACAACCGTCTTCGCCGTCGTCGGCGTTGAAATCACAGTCACCACGAGGCGTGAA
GGAAGACATATCGGAGCTCACGAAGACCTTCAGAAGTCAGCTATGGGGTGTCGCTTCTTT
CCTGGCGCCACCGCCTGAGGAGACTCGAAAGTCATCGGAGGGTGGTGAGGAGGAGGAGGA
TGTGATCGCTGGGATCAGGAGCGATTTCGTGGAGATCGGAGGTAGGTTCAAGACCGGGAT
CTCGAAGCTATCGGGGAACTTGCCTGTATCGGAGATTACGAAGATGGCTTCGAGTTTCTG
GCAAGGAGGGGATTCGAAAGGGGAGCGTGATGATGATGTTGGAGATGTGATTGGTGTGAC
GGAGGAAGTAGTTGGTTTCGCCAAGGATCTTGCTCTTCATCCTGAGACGTGGCTTGATTT
CCCCTTCCCCGAAGAGGATAGTAACTTCGATGACTTTGAGATGACTGATGCTCAGTATGA
GCACGCCCTGGCCGTGGAAAGGGTTGCAACGGGTCTAGCTGCTTTGAGGATCGAGCTTTG
TCCAGCATACATGAGCGAGTATTGCTTCTGGAGGATTTACTTTGTACTTATGCATCCTAA
GTTCGGCAAACATGATGCCTTGCTTCTCTCTACTCC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4DI83JQ 796 0 0
T
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CTGGCCGTGGAAAGGGTTGCAACGGGTCTAGCTGCTTTGAGGATCGAGCTTTGTCCAGCA
TACATGAGCGAGTATTGCTTCTGGAGGATTTACTTTGTACTTATGCATCCTAAGTTCGGC
AAACATGATGCCTTGCTTCTCTCTACTCCTCAGGTACTTGAATCAAGAGCATTGTTATCT
CATGAGCTGCTGCATAAGAGAAACAAAGCTGCAGTGATGGTTCCAGAGAGTAGCGGTGAT
ATAGGAACTGCTAGTGCCAATGAGGAACCACTTACTGTCTCTTCACCAGAGCCAGTCAAG
ACCATCCCTGTCGAAACAATACATTCGAGTGAGACATCTGAGGTTGAGACGGAGAAGTAC
CCAATCGAGAGTAAGGAGATACAAGTTGTTGACAAGCCTGTGATTGAAGAAAAGCCAGCA
CCAGCGCCTCAAGACAAGCCAGTCACTGGATCTTCACCTAGAGTTATTGACGTTCAAGTC
GATGATGATGATGATGATGATGTTGATGATTGGTTGAAGGATGAAGATAATGCTGGAACT
GTTAGCTCCACTGTAGGAACCAAACATGTTGTGGATGAGGATGAAGATGTAACGTTTAGT
GATCTGGAAGAAGATGACGACGATGTGCCAGTGAATTACAAGAAATTATTCTCCAATCCT
CAGACCTAAGAAGTTAAGTTTTATTTAAACGCTGTCTGCTGAAGAAGAATGTGCCACGGC
CGTGATCAGGTAAGC

QA 2 796 2 796
DS 



AS 1 2

CO CL9018Contig1 752 2 6 U
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TTGCTGACTTTGGGATAGCGTGCGAGGAGGAGTGCTGTGATATGTTGGCTGATGATCCAG
GGACCTATAGGTGGATGGCACCTGAAATGATAAGACGTAAGCCGCACGGGAGGAAGGCTG
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CATGAATCCTATTCAAGCTGCTTTTGCAGTAGTGGACAAGAACTTAAGGCCGGTTATCCC
GGGAGATTGTCCAGCAGCAATGAAAGCTCTGATAGAGCGTTGTTGGTCGGTTGCACCGGA
TAAGAGACCCGACTTCTGGCAGATTGTGAAAGTGCTTGAGCAGTTCGAGGCTTCACTGGA
ACGTGAAGGGAACTTGGATCTGGCTTCAAACAAGATCTGCAAGGATACAAGGAAAGGTCT
GAAACACTGGATTCAGAAGCTTGGACCGGTTCATGGAGGCAGCAGCGGCATTGGTGGCTC
GGCGGTCCTGCCTAAGCCTAAATTCGCTTGAGAGATGTTCTTTCTCATTTTGTAAATTTA
ATATATAGTATACAGAAAGGGTTTTGTGTTGTGTTGTGCCATGTTGTTCTGTAATCATGT
CCTGTTTTTGTGGGTTGTGATGTGATCTTTTTTATCTTCTCTTGATATGTTGTGTAATGA
TAATCAAACTAGGGAATGGTTTTGTGATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DH53TF U 1
AF RR4DH53JQ C 137
BS 1 716 RR4DH53TF
BS 717 717 RR4DH53JQ
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BS 734 734 RR4DH53JQ
BS 735 744 RR4DH53TF
BS 745 752 RR4DH53JQ

RD RR4DH53TF 744 0 0
GGGTTCATCGGGATCTTAAGCCGGAAAATGTATTGATCGACGAAGACTTGCAACTGAAGA
TTGCTGACTTTGGGATAGCGTGCGAGGAGGAGTGCTGTGATATGTTGGCTGATGATCCAG
GGACCTATAGGTGGATGGCACCTGAAATGATAAGACGTAAGCCGCACGGGAGGAAGGCTG
ATGTTTACAGCTTTGGACTTCTTTTATGGAAATGGTAGCTGGAGCAACCCCTTATGAGGA
CATGAATCCTATTCAAGCTGCTTTTGCAGTAGTGGACAAGAACTTAAGGCCGGTTATCCC
GGGAGATTGTCCAGCAGCAATGAAAGCTCTGATAGAGCGTTGTTGGTCGGTTGCACCGGA
TAAGAGACCCGACTTCTGGCAGATTGTGAAAGTGCTTGAGCAGTTCGAGGCTTCACTGGA
ACGTGAAGGGAACTTGGATCTGGCTTCAAACAAGATCTGCAAGGATACAAGGAAAGGTCT
GAAACACTGGATTCAGAAGCTTGGACCGGTTCATGGAGGCAGCAGCGGCATTGGTGGCTC
GGCGGTCCTGCCTAAGCCTAAATTCGCTTGAGAGATGTTCTTTCTCATTTTGTAAATTTA
ATATATAGTATACAGAAAGGGTTTTGTGTTGTGTTGTGCCATGTTGTTCTGTAATCATGT
CCTGTTTTTGTGGGTTGTGATGTGATCTTTTTTATCTTCTCTTGATATGTTGTGTA*TGA
TAATCAAACTAGG*AATGGTTTTG

QA 1 744 1 744
DS 

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TGGCA
CTGAAATGATAAGACGTAAGCCGCACGGGAGGAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGACTTC
TTTTATGGAAATGGTAGCTGGAGCAACCCCTTATGAGGACATGAATCCTATTCAAGCTGC
TTTTGCAGTAGTGGACAAGAACTTAAGGCCGGTTATCCCGGGAGATTGTCCAGCAGCAAT
GAAAGCTCTGATAGAGCGTTGTTGGTCGGTTGCACCGGATAAGAGACCCGACTTCTGGCA
GATTGTGAAAGTGCTTGAGCAGTTCGAGGCTTCACTGGAACGTGAAGGGAACTTGGATCT
GGCTTCAAACAAGATCTGCAAGGATACAAGGAAAGGTCTGAAACACTGGATTCAGAAGCT
TGGACCGGTTCATGGAGGCAGCAGCGGCATTGGTGGCTCGGCGGTCCTGCCTAAGCCTAA
ATTCGCTTGAGAGATGTTCTTTCTCATTTTGTAAATTTAATATATAGTATACAGAAAGGG
TTTTGTGTTGTGTTGTGCCATGTTGTTCTGTAATCATGTCCTGTTTTTGTGGGTTGTGAT
GTGATCTTTTTTATCTTCTCTTGATATGTTGTGTAATGATAATCAAACTAGGGAATGGTT
TTGTGATTTAC

QA 6 616 6 616
DS 



AS 1 2

CO CL9019Contig1 789 2 3 U
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GCGTCTCTCTGTCCGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAATCGCCATGAAAG
CTTGAGATCTCTCTCTCCGCCTCTCTCTCTCCGTGTCTCTCTCTCTCCGCGTCTCTCTCT
CTCCGCCTCTCTCTCTCTCTCAGCTTCCAGGGGATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAG
ACCCACCTTCAAAGTCTGTGAGTTCCAGGTTCATGAGAGTTTCCCTTTCTCCATTTCGCT
GGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTGATGCTCAAAATGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCAC
CATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAGTGCCAAGGCGCTCTAACGTTTTACCGC
TCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGATGTGACTGACTTGCAAGCACCTCCA
AAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAATGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTA
GCGTGCCTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCAGTCACGAGTTTGTTTGTTGAGTCTGA
GATCATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGTGGGTTTTAGTTTTGAGAAATGGTGAA
TGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGTTGTGTTTTGTGTTGTTGCTGCAGG
AAATGTAACGATGTATAAAGCTATATTTTGTGGTTTATGTGTAATTGTGTTTATGGCATT
TTAGTATGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AA34TF U 6
AF RR4AA34JQ C 1
BS 1 5 RR4AA34JQ
BS 6 776 RR4AA34TF
BS 777 789 RR4AA34JQ

RD RR4AA34TF 771 0 0
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CCTCTCTCTCTCTCTCAGCTTCCAGGGGATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGACCCA
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CAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAATGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTAGCGTG
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QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AA34JQ 789 0 0
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GCGTCTCTCTGTCCGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAATCGCCATGAAAG
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CTCCGCCTCTCTCTCTCTCTCAGCTTCCAGGGGATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAG
ACCCACCTTCAAAGTCTGTGAGTTCCAGGTTCATGAGAGTTTCCCTTTCTCCATTTCGCT
GGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTGATGCTCAAAATGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCAC
CATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAGTGCCAAGGCGCTCTAACGTTTTACCGC
TCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGATGTGACTGACTTGCAAGCACCTCCA
AAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAATGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTA
GCGTGCCTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCAGTCACGAGTTTGTTTGTTGAGTCTGA
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TGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGTTGTGTTT*GTGTTGTTGCTGCAGG
AAATGTAACGATGTATAAAGCTATATTTTGTGGTTTATGTGTAATTGTGTTTATGGCATT
TTAGTATGT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL9020Contig1 1008 2 6 U
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GGATGCATCCCGTGACTCCAATCTCGTTTTTCGATCACATTATGCGTCGGTACAGCTCCA
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GCAAGAAAAGGATGATGCAACCCTCTAGTCCAACCGGTGTGTTTGATGCATCGTTCAGCT
CTGATAGCTCAAACGAATCATGGGTTGCGTCTGCTTCTGCTTCAGCTTCAGTGTCTGCAT
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CTTCAATAAACAGAATGTTTCTCGATGTGTTCACAAGTAGTCCTCGCTAATAATTTTTAG
AAGCATATAAGATATGTTTTCCCCTGCTTACTCTCGGCTCTTGTGTCTATGGACGGTTTC
AAATGGTGTACTCTTCAGTATTTGATAATTTGAAAGATCTTTTACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CP87TF U 1
AF RR4CP87JQ C 265
BS 1 632 RR4CP87TF
BS 633 633 RR4CP87JQ
BS 634 670 RR4CP87TF
BS 671 671 RR4CP87JQ
BS 672 687 RR4CP87TF
BS 688 1008 RR4CP87JQ

RD RR4CP87TF 687 0 0
CGAAAGAAAACGAGCTAAGGCCGTGTCTTTCCGACAGTGTGTTAGATGAGTTTCTTGTTC
TGTGCCGCGAGAAGGCTCTTGATTGGATCTTTAGAGTGAAAACTTATTATGGGTTTAATG
CGTTGACGGCTCTTCTTGCTGTTAACTACTTCGATAGGTTTCTTACTACCAGGAAGTTTC
AGACAGATAAGCCGTGGATGTCTCAGCTTACAGCTGTGGCTTGTCTGTCTTTAGCTGCTA
AAGTTGAAGAGATCCGTGTTCCGTTGCTCTTAGATCTTCAGGTGGGAGAGCCAAGATATG
TCTTTGAGGCTAAAACCATACAGAGAATGGAGCTTTTGATTCTCTCTACTCTTGAATGGA
GGATGCATCCCGTGACTCCAATCTCGTTTTTCGATCACATTATGCGTCGGTACAGCTCCA
AGTCTCACCAGGACTTGGAGTTCTTGAGTAGGTGCAAATCTCTGCTGCTCTCCGTTGTTA
CTGATTCGAGGTTTCTAAGTTACAGTCCTTCTGTGTTAGCCACTGCAATAATGGTCTCTG
TTGTTAGAGATTTCAAGACGTGTGACGAAGCTGAATACGAATCTCAGCTCATGACTCTAC
TCAAAGTTGATCCGGAGAAAGTAAATAAGTGC*ATGAGTTAGTGTTTGATCACATCCCAA
GCAAGAAAAG*ATGATGCAACCCTCTA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR4CP87JQ 744 0 0
TGCTCTTAGATCTTCAGGTGGGAGAGCCAAGATATGTCTTTGAGGCTAAAACCATACAGA
GAATGGAGCTTTTGATTCTCTCTACTCTTGAATGGAGGATGCATCCCGTGACTCCAATCT
CGTTTTTCGATCACATTATGCGTCGGTACAGCTCCAAGTCTCACCAGGACTTGGAGTTCT
TGAGTAGGTGCAAATCTCTGCTGCTCTCCGTTGTTACTGATTCGAGGTTTTTAAGTTACA
GTCCTTCTGTGTTAGCCACTGCAATAATGGTCTCTGTTGTTAGAGATTTCAAGACGTGTG
ACGAAGCTGAATACGAATCTCAGCTCATGACTCTACTCAAAGTTGATCCGGAGAAAGTAA
ATAAGTGCCATGAGTTAGTGTTTGATCACATCCCAAGCAAGAAAAGGATGATGCAACCCT
CTAGTCCAACCGGTGTGTTTGATGCATCGTTCAGCTCTGATAGCTCAAACGAATCATGGG
TTGCGTCTGCTTCTGCTTCAGCTTCAGTGTCTGCATCACAGTCTCCAGAGCCTCTATTCA
AGAGGAGAAGAGTTCAGGAGCAGCAGATGAAGCTGTCTTCAATAAACAGAATGTTTCTCG
ATGTGTTCACAAGTAGTCCTCGCTAATAATTTTTAGAAGCATATAAGATATGTTTTCCCC
TGCTTACTCTCGGCTCTTGTGTCTATGGACGGTTTCAAATGGTGTACTCTTCAGTATTTG
ATAATTTGAAAGATCTTTTACTCG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL9021Contig1 851 2 2 U
GGAGAATTCTCTCTTTCCTTCCCTGTTCACACATCAACATCTTTTACAGGGAGAAAGAGA
TTTGTGTTTGTTTTTTGTTGTAATATAGTGTTTTCGATCTAAGGATCTATCTTTTGTTTC
TGCTTTGTCAGAATTTCTATCTTCGCAAGGCGATTCAACACTTCGCTATGGCGATTTTGC
TGTTTTTTTTCTTCAGTTCTAACCGGTGCAGTTCTTCAAATTCTTTCTTTTCCCCGGTTT
TGAACTGAGTTCTTTCATCTTCTACGTTTGCATCTTTTAAAATTCCGATGGCTATGTATC
TAAGTTTCCTTTCATTATTCTCAGCTTGCTTCCTTCCATAGATTTTAAATCTCCATGCTT
TATGGCCTGCGAAGAGTGCTTGGCGTGGAGTGTTCTTTGGATGAGAATCAAGAAGATGGG
AGATACTTGCTGGATTGGTGATTAGATTAAGTAAAGCTGGGGTCTCATAGAGTAGACGTC
TCAGTATATAATCTATCTCTCTAATCCTTGAGTTTCTCTAGTACTATACGAAGATGATGA
TAAGGGACTGGTGTAATGAGCTAAGGCGATACCGTAGAGGAACCAGAAGCACATCTTGAA
GCCTTTCGGAGTTGATAGGGAGAGGCGGTGAACCTGGTGGCGGAGAAAAATTCAGAGACG
GTGATGACAGATCGATGGAGATGCATGTGCTGCTTCTTACTCAACTGACACGTGGCCTTA
AAAATCGGTGGGATACAGCTGCTTTAATGCGTGTTGAATTTGTAGTCTTCTTACCGATTA
AGTTTTTGGCTTTTGTAATCTCGTGCTTCTGTATGCTTGCCCATTGGGCTAATGAAATTA
AATATGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C947TF U 1
AF RR4C947JQ C 203
BS 1 649 RR4C947TF
BS 650 851 RR4C947JQ

RD RR4C947TF 656 0 0
GGAGAATTCTCTCTTTCCTTCCCTGTTCACACATCAACATCTTTTACAGGGAGAAAGAGA
TTTGTGTTTGTTTTTTGTTGTAATATAGTGTTTTCGATCTAAGGATCTATCTTTTGTTTC
TGCTTTGTCAGAATTTCTATCTTCGCAAGGCGATTCAACACTTCGCTATGGCGATTTTGC
TGTTTTTTTTCTTCAGTTCTAACCGGTGCAGTTCTTCAAATTCTTTCTTTTCCCCGGTTT
TGAACTGAGTTCTTTCATCTTCTACGTTTGCATCTTTTAAAATTCCGATGGCTATGTATC
TAAGTTTCCTTTCATTATTCTCAGCTTGCTTCCTTCCATAGATTTTAAATCTCCATGCTT
TATGGCCTGCGAAGAGTGCTTGGCGTGGAGTGTTCTTTGGATGAGAATCAAGAAGATGGG
AGATACTTGCTGGATTGGTGATTAGATTAAGTAAAGCTGGGGTCTCATAGAGTAGACGTC
TCAGTATATAATCTATCTCTCTAATCCTTGAGTTTCTCTAGTACTATACGAAGATGATGA
TAAGGGACTGGTGTAATGAGCTAAGGCGATACCGTAGAGGAACCAGAAGCACATCTTGAA
GCCTTTCGGAGTTGATAGGGAGAGGCGGTGAACCTGGTGGCGGAGAAAA
TTCAGAG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR4C947JQ 649 0 0
CCGGTGCAGTTCTTCAAATTCTTTCTTTTCCCCGGTTTTGAACTGAGTTCTTTCATCTTC
TACGTTTGCATCTTTTAAAATTCCGATGGCTATGTATCTAAGTTTCCTTTCATTATTCTC
AGCTTGCTTCCTTCCATAGATTTTAAATCTCCATGCTTTATGGCCTGCGAAGAGTGCTTG
GCGTGGAGTGTTCTTTGGATGAGAATCAAGAAGATGGGAGATACTTGCTGGATTGGTGAT
TAGATTAAGTAAAGCTGGGGTCTCATAGAGTAGACGTCTCAGTATATAATCTATCTCTCT
AATCCTTGAGTTTCTCTAGTACTATACGAAGATGATGATAAGGGACTGGTGTAATGAGCT
AAGGCGATACCGTAGAGGAACCAGAAGCACATCTTGAAGCCTTTCGGAGTTGATAGGGAG
AGGCGGTGAACCTGGTGGCGGAGAAAAATTCAGAGACGGTGATGACAGATCGATGGAGAT
GCATGTGCTGCTTCTTACTCAACTGACACGTGGCCTTAAAAATCGGTGGGATACAGCTGC
TTTAATGCGTGTTGAATTTGTAGTCTTCTTACCGATTAAGTTTTTGGCTTTTGTAATCTC
GTGCTTCTGTATGCTTGCCCATTGGGCTAATGAAATTAAATATGTTGGC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL9022Contig1 631 2 1 U
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACCACTAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAGGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCGA
GAATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTACGACATTCAGACCA
AGAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTGAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G344TF U 1
AF RR4G344JQ C 318
BS 1 631 RR4G344TF

RD RR4G344TF 631 0 0
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACCACTAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAGGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCGA
GAATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTACGACATTCAGACCA
AGAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTGAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR4G344JQ 314 0 0
AAGAAGATCGAGGACAACAACACTTTTGTTTTCATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTACGACATTCAGACCAAGAAAGTTAACACCCTC
ATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTG
GATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATTTAAGTTTTATCTACCTTTACTATTGTGAAACCA
GTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGATATTATTATTTACCATC
ATCGTTTAATGTTG

QA 1 314 1 314
DS 



AS 1 2

CO CL9023Contig1 681 2 1 U
GAAACTGTTCTCAGCTTCGAAGAGTCTCTCTGTATCTTCTTCTTCTTCCTGCAATTTCTC
CGCCTGCGAACCCTAGCGCGCCACTAAGAGTAGAAGACTAGAGAAGCTTCTTTTTTTTTT
TTATGGTGGATAACGAGATGCAATCACTAGATGATGTCCTTAAGGAAGAACCTGAAAAGA
ATCAAAACCCTAGTGAAACCCCCCAGCTCCTCCTTCCCGTGGATGAAGATGGTCAAGCCA
ATGGTCATGAGAAGAAGAATGATGGTGATATTGGAGTTGTTCTCCACTCTGAGAAGAAGA
CAGATACTAAGGTGCAGGCTTCGAGTCCCCGGACTGGAGATGAAAATGGCAAAAAGCGCA
AGACTTGGTTGCTTAGTGATTCTGAGGCCCGAGAAGTTGATGAAGCAGGGACGCTTGAAG
AACAGCAGGCGTTTCTAAGTGAATTGGCCACCTTTCACAGAGAGAACTACCTGGATTACA
AACCTCTTAAATTTTATGGGCAGCCTTTAAACGCTCTCAAGCTATGGCGAGCAGTCGTTA
AACTAGGTGGCCATGAAGTGGTCACCACATCTAAGCTATGGCGGCAAGTTGGAGAATCCT
TCAATCCTCCAAAGACGTGCACAACAATCTCCTACACGTTCCGCAATTTCTATGAGAAGC
ACTTTTGGAGTACGAGAAGAG


BQ
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AF RR4CI92TF U 1
AF RR4CH30TF U 1
BS 1 681 RR4CH30TF

RD RR4CI92TF 653 0 0
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CGCCTGCGAACCCTAGCGCGCCACTAAGAGTAGAAGACTAGAGAAGCTTCTTTTTTTTTT
TTATGGTGGATAACGAGATGCAATCACTAGATGATGTCCTTAAGGAAGAACCTGAAAAGA
ATCAAAACCCTAGTGAAACCCCCCAGCTCCTCCTTCCCGTGGATGAAGATGGTCAAGCCA
ATGGTCATGAGAAGAAGAATGATGGTGATATTGGAGTTGTTCTCCACTCTGAGAAGAAGA
CAGATACTAAGGTGCAGGCTTCGAGTCCCCGGACTGGAGATGAAAATGGCAAAAAGCGCA
AGACTTGGTTGCTTAGTGATTCTGAGGCCCGAGAAGTTGATGAAGCAGGGACGCTTGAAG
AACAGCAGGCGTTTCTAAGTGAATTGGCCACCTTTCACAGAGAGAACTACCTGGATTACA
AACCTCTTAAATTTTATGGGCAGCCTTTAAACGCTCTCAAGCTATGGCGAGCAGTCGTTA
AACTAGGTGGCCATGAAGTGGTCACCACATCTAAGCTATGGCGGCAAGTTGGAGAATCCT
TCAATCCTCCAAAGACGTGCACAACAATCTCCTACACGTTCCGCAATTTCTAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4CH30TF 681 0 0
GAAACTGTTCTCAGCTTCGAAGAGTCTCTCTGTATCTTCTTCTTCTTCCTGCAATTTCTC
CGCCTGCGAACCCTAGCGCGCCACTAAGAGTAGAAGACTAGAGAAGCTTCTTTTTTTTTT
TTATGGTGGATAACGAGATGCAATCACTAGATGATGTCCTTAAGGAAGAACCTGAAAAGA
ATCAAAACCCTAGTGAAACCCCCCAGCTCCTCCTTCCCGTGGATGAAGATGGTCAAGCCA
ATGGTCATGAGAAGAAGAATGATGGTGATATTGGAGTTGTTCTCCACTCTGAGAAGAAGA
CAGATACTAAGGTGCAGGCTTCGAGTCCCCGGACTGGAGATGAAAATGGCAAAAAGCGCA
AGACTTGGTTGCTTAGTGATTCTGAGGCCCGAGAAGTTGATGAAGCAGGGACGCTTGAAG
AACAGCAGGCGTTTCTAAGTGAATTGGCCACCTTTCACAGAGAGAACTACCTGGATTACA
AACCTCTTAAATTTTATGGGCAGCCTTTAAACGCTCTCAAGCTATGGCGAGCAGTCGTTA
AACTAGGTGGCCATGAAGTGGTCACCACATCTAAGCTATGGCGGCAAGTTGGAGAATCCT
TCAATCCTCCAAAGACGTGCACAACAATCTCCTACACGTTCCGCAATTTCTATGAGAAGC
ACTTTTGGAGTACGAGAAGAG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL9024Contig1 774 2 2 U
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CAAGGAAGGCTTGCTGATCCTGGATTTCGTAATCCAAGATGGGCAGATGGCGAGCTTGTT
ATCCTGGATGGCAAGTATGTAAAAGGAGGACCTGTGGTTGGATTTGTATATTGGGCACCT
GAATATCACTTTGTGATGTTCTTCAACCGCCTGAGGCTTCAATCCTAGTTTTTTCCTAAC
CTTCTCGGCTTGCAATTGAGGAATGGTTTTCTTTCTGGCTATAAACATTGTAAGCATACT
CCTCGATACAAAAGACGGTGCTCAGAAAGGTTAACTGAAATGGTTTCATTTCATTATTTC
CAGATTAATGGGGATTGGCTATACCAAATATAAGATTCATGGTTCGTTCTTGTATCTCCG
GGCGCCGGTTATGAGATTACTTGAAGTTGCTGCTGGCTCTCTTCTTGCGGCAAGGTTGAG
CACACCAGAGTACTTACTTTGATTCATGCAGTGAAACTAGTCGGATTCTTGAGGATGCAA
GTCAGAAAAGGAAACCGGATTGTCAGTCAGGTTGGAGAAGTCTCTCTTTCTCTCTAGATA
TGTGTAAGTATTCTCAGAGATTTGTAGTTGGATATAAAAACTTGGTAAGAGTTGCTATTC
TATGTAACTTCCCTTGTATATTTTTCACTTCTCAAATATAATAATAAGATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GB12TF U 1
AF RR4GB12JQ C 84
BS 1 677 RR4GB12TF
BS 678 774 RR4GB12JQ

RD RR4GB12TF 677 0 0
GGAGATCCTTATGTGCCTGCTGGGAAGGTAGCATTTCGTGCAAAGATAGGAAGACGTTAT
GAGCTTCCACATAGAGGTCTCATCCCCGAAGAATTTGGAGTGATTGCTAGATACAAAGGA
CAAGGAAGGCTTGCTGATCCTGGATTTCGTAATCCAAGATGGGCAGATGGCGAGCTTGTT
ATCCTGGATGGCAAGTATGTAAAAGGAGGACCTGTGGTTGGATTTGTATATTGGGCACCT
GAATATCACTTTGTGATGTTCTTCAACCGCCTGAGGCTTCAATCCTAGTTTTTTCCTAAC
CTTCTCGGCTTGCAATTGAGGAATGGTTTTCTTTCTGGCTATAAACATTGTAAGCATACT
CCTCGATACAAAAGACGGTGCTCAGAAAGGTTAACTGAAATGGTTTCATTTCATTATTTC
CAGATTAATGGGGATTGGCTATACCAAATATAAGATTCATGGTTCGTTCTTGTATCTCCG
GGCGCCGGTTATGAGATTACTTGAAGTTGCTGCTGGCTCTCTTCTTGCGGCAAGGTTGAG
CACACCAGAGTACTTACTTTGATTCATGCAGTGAAACTAGTCGGATTCTTGAGGATGCAA
GTCAGAAAAGGAAACCGGATTGTCAGTCAGGTTGGAGAAGTCTCTCTTTCTCTCTAGATA
TGTGTAAGTATTCTCAG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4GB12JQ 691 0 0
CCCCGAAGAATTTGGAGTGATTGCTAGATACAAAGGACAAGGAAGGCTTGCTGATCCTGG
ATTTCGTAATCCAAGATGGGCAGATGGCGAGCTTGTTATCCTGGATGGCAAGTATGTAAA
AGGAGGACCTGTGGTTGGATTTGTATATTGGGCACCTGAATATCACTTTGTGATGTTCTT
CAACCGCCTGAGGCTTCAATCCTAGTTTTTTCCTAACCTTCTCGGCTTGCAATTGAGGAA
TGGTTTTCTTTCTGGCTATAAACATTGTAAGCATACTCCTCGATACAAAAGACGGTGCTC
AGAAAGGTTAACTGAAATGGTTTCATTTCATTATTTCCAGATTAATGGGGATTGGCTATA
CCAAATATAAGATTCATGGTTCGTTCTTGTATCTCCGGGCGCCGGTTATGAGATTACTTG
AAGTTGCTGCTGGCTCTCTTCTTGCGGCAAGGTTGAGCACACCAGAGTACTTACTTTGAT
TCATGCAGTGAAACTAGTCGGATTCTTGAGGATGCAAGTCAGAAAAGGAAACCGGATTGT
CAGTCAGGTTGGAGAAGTCTCTCTTTCTCTCTAGATATGTGTAAGTATTCTCAGAGATTT
GTAGTTGGATATAAAAACTTGGTAAGAGTTGCTATTCTATGTAACTTCCCTTGTATATTT
TTCACTTCTCAAATATAATAATAAGATATAC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL9025Contig1 1083 2 4 U
GGGAAGGGTTTCCATAGTTTCACAAAAAATCTCTCTCGAGTCTTGCAGAAACGGAAAATT
CTCAGATTAGTAAATTTCGCCTGAAACCGAGACGGATTGGTTGAGTTTCTCGCTCGCTCG
TCGTCGTCGTCGAGATTGGATCCAACAGAAGACATCATGGTAACAGGAACAGCCTCCTCG
ATCATTAGCTCATGGGGAGGCGCTAAGGATCTTTACTAAACTAGGAGAGAATCTAAGAAT
ATGCCTCTTCACATTGTTCAGAGGATCATAGCAGAACAAGAGTTCAGTTCAGTTAGCCTC
CCGTGAGTAGAAAGAAGCTGACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGCTAGAACTGAAAGGCA
GAAACTACAAGTGATGAAGCAGTTTGCTGTGATCTTCTTGGTTATGTTTTGAAGCCTGGC
TCCGCATCAAACCGTCCTTTAAGATGATTTCTTTATTTAACACACATCTCATGTCTTGGG
GTTTTGACATCAGTGTTCCTCTTTAACTGGTCTTGTTTTTGAAATTCAACAACGAAGTTA
ACAAAGCCTTTCAGCGCTTTTTGTTTTGTGGTTTTTGTCAACCCAAAGATTTAAAAACCA
AAAAGATCATAGACTGACACTCATCTATAGTGCACTGTCAAATTCTTATTTTTGGAACAC
TGTCCCGTTGCTGCCTCCTTTCGAGATATCAAACTGATCTTTCTAGAGTCGCTCTTCACT
TCTCTGCCTCTTCTCGAGATATCAAACTAATATTTTTGGAATCGTTCTTCTTCACTCTCT
CTTCCTCGCATCTATTCACGGTCAAGGGGAGGGGATGATGGTTTTGTAGCCGTTCGTTTG
TAGTGGGAGAATCGGAGAGGATCGTGGCTTCGATCATCTCAAGGGATGGACTCTGAATCT
GTGCACACTATGGCGCTTCTTGAAGCTCAACGTGAATACATGGATATAGGGATGTCCAAA
CGGGCTACCCGGCCTGTTTACGTCCAAGCCCATATATGTTCAAACTCATTTAATAGATGT
CCATTTAAAGTCCGTTTAAACTAAACCCATTTAAAACCCATTTATATAAGCCCATTTAAC
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

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BQ
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AF RR4D177JQ C 1
AF RR4D177TF U 1
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TAGATGCTGCGATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAGAAACGCCAAGCTGAGTCCT
CCCAGAAGGCTGCTGAATCACGTGCCCAAGAGGTCACAAAAGAGCTCGAAAACACCACAA
AGGTTTTCAAACTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGTATGCAAAAACAGATATCCAAACGCG
ATAACGAGATTAAGCTCTTGGAGTCTATAATCCAAACGCTTGGCGGAAAAGAGCGATTGG
GAAAAAGCGGTGTGAGTGGATGATGCGGTTTTTCACTTGTATAAATTTTGTAACCCGAGT
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QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4B958TF U 1
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RD RR4B958TF 802 0 0
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GTTTCTTCTTTTTCTGTCAAGGAAGAGTTGCCATCTCCTGTGAAACATGAAGCTGCTTCT
TCGCCTAAAGCTTCTAACACCACAGTCGTGCCTAGTACCTTTAAGAAACCTATCGGTGCT
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AATTTATATGAGCAGAAACCAGAAGAA*GTTGCACCGGTGATTCCTGCTGCTGCAACTTC
AACC*AATAACGGTGGAAGCAAATCATCAGGTGGTGGCTCATCATCATATGCCTCTCGGT
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TCTTCTGTCCCCAGGAAATCAAGCTCCAACTCCTCTAAAGCTCAGGTTGAAGAATCAGAT
GAAGCAAGAAAGAAGTTCACAAACGCAAAGTCCATTTCTTCTGCTCAGTACTTTGGTGAT
CAGAACAAGAATGCTGATCTTGAATCTAAAGCTACTCTTTCAGAAGTTTTCAGGCTCAGC
ATCTATCTCAAGCGCTGATTTTTTCGGTCATGGCCAAGACGAGTTCAACGACGATTTAAC
TGCTAGTGATCTCATTAACCGACTTTCTTTCCAGGCACAACAAGATATATCGTCGATAGT
GAACATAGCAG*CGAGACGAAG

QA 1 802 1 802
DS 

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TACGGCGAATTTATATGAGCAGAAACCAGAAAAAAGTTGCACCGGTGATTC*TGCTGCTG
CAACTTCAACCCAATAACGGTGGAAGCAAATCATCAGGTGGTGGCTCATCATCATATGCC
TCTCGGTTTGAGTACAATGACGACTTTCAAGCCGGAGGAGGTAAAAGCATTGGTGGTGGT
ACACAAGTGCTTAACCATGTTGCCCCCACCAAAGTCGTCGAGCTTCTTTTCGGATTTTGG
AATGGACTCTTCTGTCCCCAGGAAATCAAGCTCCAACTCCTCTAAAGCTCAGGTTGAAGA
ATCAGATGAAGCAAGAAAGAAGTTCACAAACGCAAAGTCCATTTCTTCTGCTCAGTACTT
TGGTGATCAGAACAAGAATGCTGATCTTGAATCTAAAGCTACTCTT*CAGAAGTTTTCAG
GCTCAGCATCTATCTCAAGCGCTGATTTTTTCGGTCATGGCCAAGACGAGTTCAACGACG
ATTTAACTGCTAGTGTTCTCATTAACCGACTTTCTTTCCAGGCACAACAAGATATATCGT
CGATAGTGAACATAGCAGGCGAGACGAAGAAGAAGCTGG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

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GTCCTTCCTCTGCTCCCGCTCGAGCTCAATATCGAAGTTGGAGTTCAATCTTGCCTTTCA
ATCGGAGGAGATTCTACTCCCCTAAAACTAAAACTAAAACTATGGCCGATTTAGTCAAAA
CTCACGCTTGGAGAGACGGTGACGGGGAAGAAGGGTTTCAGGCGTTGGAGCAAGAGGCTT
TTATGAATAATCCGCCCAACGATTTGGTCTCAGGGATCAACGCCGTCGCTAATCGTCTGA
GCAAATGGGTTGTCGCTGCTCTGTTTGGATCGGTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAG
CCTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAATTCCGCACTTTCCGTAGCTCTCAAACGCA
TCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAACACTTCGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTC
ATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTTACCCTCTTCTCTCGTAATATCTCTCACC
CTCTCTCTTTCTACTTGCATCATTTGCTCACCTCTCACTTCTTATTTTCCCCCAGTCATT
GACTGGCTTGGAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCATCCTCATCCTTGCTTTGGCT
TCTTACTTTACATGGTTAAGGGTTTCCCAGAAGCTTCACACGGCCAGTCAAGTGGTGGTA
GGTACAATCGTGGGCTCTCTTTACTCCACCTTGTGGTACATTACCTGGAACTCACTTGTT
CTCCAAGCTTTTGCCTCATCATTCTCCGTACAAGTAGCTGTCTTTACAGCTGCTGCTGCG
TCTGCTCTAGGTTTTGCAGTTTATGTGCTACTTAACTGGTTCACAGATGACAGATAGACA
AACAAAATATAGTTAGAGGGTTGGGTTGTAAAACTATTCCTTTTGTTTCACATTTCACTC
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BQ
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AF RR4EQ83TF U 1
AF RR4EQ83JQ C 404
BS 1 681 RR4EQ83TF
BS 682 1012 RR4EQ83JQ

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GTCCTTCCTCTGCTCCCGCTCGAGCTCAATATCGAAGTTGGAGTTCAATCTTGCCTTTCA
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TTATGAATAATCCGCCCAACGATTTGGTCTCAGGGATCAACGCCGTCGCTAATCGTCTGA
GCAAATGGGTTGTCGCTGCTCTGTTTGGATCGGTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAG
CCTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAATTCCGCACTTTCCGTAGCTCTCAAACGCA
TCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAACACTTCGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTC
ATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTTACCCTCTTCTCTCGTAATATCTCTCACC
CTCTCTCTTTCTACTTGCATCATTTGCTCACCTCTCACTTCTTATTTTCCCCCAGTCATT
GACTGGCTTGGAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCATCCTCATCCTTGCTTTGGCT
TCTTACTTTACATGGTTAAGG
TTTCCCA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4EQ83JQ 609 0 0
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TCGTAATATCTCTCACCCTCTCTCTTTCTACTTGCATCATTTGCTCACCTCTCACTTCTT
ATTTTCCCCCAGTCATTGACTGGCTTGGAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCATCC
TCATCCTTGCTTTGGCTTCTTACTTTACATGGTTAAGGGTTTCCCAGAAGCTTCACACGG
CCAGTCAAGTGGTGGTAGGTACAATCGTGGGCTCTCTTTACTCCACCTTGTGGTACATTA
CCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTTTGCCTCATCATTCTCCGTACAAGTAGCTGTCT
TTACAGCTGCTGCTGCGTCTGCTCTAGGTTTTGCAGTTTATGTGCTACTTAACTGGTTCA
CAGATGACAGATAGACAAACAAAATATAGTTAGAGGGTTGGGTTGTAAAACTATTCCTTT
TGTTTCACATTTCACTCGATACTGTTTGAGCTGTATAGCAATCAATATTACCACACTTGT
ATTCTGTTT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

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ACCGTTCTTTACCACTTTGAGATTATGGCAAAGTGTTTTCTCACTCTCTTCTTGGTTCTT
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AAGAACTACCTTGGATACGGTGGCGGGTACTCCGGCATCGGAGACAACGGTTTACCTTTC
GGTGGCGTCGGTGGAGGTGTGGCTGGTCCCGGTGGTAACCTTGGTTTTGGTGGACTTGGT
GGTGTTGGTGGAGGATTAGGCGGTGGCTTAGGAAATGGGATAGGCGGTGGCTTAGGAAAC
GGGATAGGCGGTGGTGTTGGTTCCGGAGTCGGTGGAGGAAGTACCGGAGGAGTTCATTTC
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CTAGCTTAAGATGATGTCAGAGCAACAATAATAATCATGTCTTTTTTTTTCAAAATTTCA
TTAGCTGTTTACGTGCGTTTTAAGTTACTATGGTGTGATGGTGTCCTTAGAATCAGACTC
GTGTCTTTGTCGTGTCGTGGCTTGGTCCAATTTCAAATTCTATTTAACTTCCAGTGTGTC
ACTTAATAAGTTTGCC


BQ
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AF RR4CV87JQ C 1
AF RR4CV87TF U 1
BS 1 676 RR4CV87TF

RD RR4CV87JQ 676 0 0
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TTAGCTGTTTACGTGCGTTTTAAGTTACTATGGTGTGATGGTGTCCTTAGAATCAGACTC
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ACTTAATAAGTTTGCC

QA 1 676 1 676
DS 

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ACCGTTCTTTACCACTTTGAGATTATGGCAAAGTGTTTTCTCACTCTCTTCTTGGTTCTT
GCCCTAGCCTCAGTTTTTGCTTCTGGAGCAAGAAACATCCCAGGAGGACTCTCTGACCAG
AAGAACTACCTTGGATACGGTGGCGGGTACTCCGGCATCGGAGACAACGGTTTACCTTTC
GGTGGCGTCGGTGGAGGTGTGGCTGGTCCCGGTGGTAACCTTGGTTTTGGTGGACTTGGT
GGTGTTGGTGGAGGATTAGGCGGTGGCTTAGGAAATGGGATAGGCGGTGGCTTAGGAAAC
GGGATAGGCGGTGGTGTTGGTTCCGGAGTCGGTGGAGGAAGTACCGGAGGAGTTCATTTC
CCTTGAGTAGTTGAGTTGTTAATTTTGGTTTAAGGATTCGTAAAGGTCCTTGAGCTAGGT
CTAGCTTAAGATGATGTCAGAGCAACAATAATAATCATGTCTTTTTTTTTCAAAATTTCA
TTAGCTGTTTACGTGCGTTTTAAGTTACTATGGTGTGATGGTGTCCTTAGAATCAGACTC
GTGTCTTTGTCGTGTCGTGGCTTGGTCCAATTTCAAATTCTATTTAACTTCCAGTGTGTC
ACTTAATAAGTTTGCC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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CTTTACTGAGATCAGCTTTAACGCACGGTGAGGAAACGCAGAAACTAGAGTATTTGAAAG
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TTAGAAGCATGAAGGCTGAGTTCGATCCTCGGCATATACTCGCTACCGGTCAGAGAATCT
TTCAAAACCCATCTCTGTCTTTGTTTCCTCCACCGTCTTCAGCTTCATGGTGACAGGACG
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BQ
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AF RR4D877TF U 1
AF RR4D877JQ C 29
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BS 622 718 RR4D877JQ

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QA 1 621 1 621
DS 

RD RR4D877JQ 690 0 0
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GGTGGCTCATTATGGAGACAACTGGGATCAGTTTAGAAGCATGAAGGCTGAGTTCGATCC
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ATTATATTCTTCCTGATGTATATATATGACCTAATAGAGAAGCATCAGAGAGATTAGGTT
GGGTTATTTTGTTAGTAACGTTTAAAAATTAGAGTTAGGAAGATTCAAGTTAGTAATATG
TTACTGTTTAATTTTTCTACATCATCACGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL9031Contig1 1103 2 2 U
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ATCTCGGTCGACATAGCTAGACCTCGAGGTTTAGAGGAGCCACCTCCACTTTGCTAACAA
GGCTGCGAACTTAGTTTACATCTGCCTCCCTGGCCCTCCTCAGAGATGATAACTGATATC
CATCATTTTTACATGTTGGAGGAACATGAGCTGCGAAACACTCCTTGGGTTCGTTTGTAT
CTGGATCTTGTACATTGTACCTCGAGTAGGGGTATGTCTGATCTCTCTGATTTCCATATT
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TGCACTGCTCAAGAAACGTTTAGGTGTTTGGGGAGCCTGGCGTTTGAGGCTCGATGTCTA
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TTTTGTGTTTTTTGTGTGGTAAGTGGATTAGTCTTCGCACGTTGTTTAGTTCAGCACTTA
TGTCTTGACTTTTTTTTTCTTAC


BQ
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AF RR4BN83TF U 1
AF RR4BN83JQ C 388
BS 1 703 RR4BN83TF
BS 704 1103 RR4BN83JQ

RD RR4BN83TF 703 0 0
GGATTCGATTGGTTTCCTTGACAGGTTGATGATGATTACTCTGTGGAAAACGATCCGATA
TATCACCCCGAGCTGATGATGATCGATTCGCAAGGAGACTCATCCGTTAGTGATCGTCCA
TTTGATGGCTTTGGTGATTTACCCATGTCTGACACAAGGTTGATGCACTTTAACTATGAG
TACCGTGTTCCTGGGTTTCGAAATCGTGCCTTGGTCTATCGTTATGCCGAGTTGGGGATT
CATCGTTACAATCTCTTGGAGGGTACTGACTGGGAACTTTTTAGCTTGAAAAGTTTCAAC
AAGGGAATGAATCCATGTGCTGCCTCCTACTTTCTTACCATGGAAGCATTCAATCCAGTT
TCTTGGCAGTTACAACCATTCCAGGCTCTAGTCTGTGAAAAAGCTCTTGGTGTTTTAGAT
ATCTCGGTCGACATAGCTAGACCTCGAGGTTTAGAGGAGCCACCTCCACTTTGCTAACAA
GGCTGCGAACTTAGTTTACATCTGCCTCCCTGGCCCTCCTCAGAGATGATAACTGATATC
CATCATTTTTACATGTTGGAGGAACATGAGCTGCGAAACACTCCTTGGGTTCGTTTGTAT
CTGGATCTTGTACATTGTACCTCGAGTAGGGGTATGTCTGATCTCTCTGATTTCCATATT
GTCCAAGTGACCATTGGAAGTCTCGATGATGCAGAGCCACCGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR4BN83JQ 716 0 0
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GGTTTAGAGGAGCCACCTCCACTTTGCTAACAAGGCTGCGAACTTAGTTTACATCTGCCT
CCCTGGCCCTCCTCAGAGATGATAACTGATATCCATCATTTTTACATGTTGGAGGAACAT
GAGCTGCGAAACACTCCTTGGGTTCGTTTGTATCTGGATCTTGTACATTGTACCTCGAGT
AGGGGTATGTCTGATCTCTCTGATTTCCATATTGTCCAAGTGACCATTGGAAGTCTCGAT
GATGCAGAGCCACCGAGAATCAATTCCACAAACGCTGTCGTTTACATTGTCTACAGAAAC
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GACGAGTTTACGAGGTCATTGAGTATCCAGGGTAAGCATTGGAACCCTTCTAAGAAGAAG
GAAAAGAAGAGAGAGAAAGAAAAAGAAGAGATTTGCACTGCTCAAGAAACGTTTAGGTGT
TTGGGGAGCCTGGCGTTTGAGGCTCGATGTCTACAGGAAACAAACGCGCACTCGTTGATC
AGAGTGATTTACCCGAGTACTACTACTATGTTATTTTGTGTTTTTTGTGTGGTAAGTGGA
TTAGTCTTCGCACGTTGTTTAGTTCAGCACTTATGTCTTGACTTTTTTTTTCTTAC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL9032Contig1 765 2 1 U
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AGATGAAGAACCAAGTAGATAATTCTTTAATCTAAAAAATTAAGTTCATAAATACAAATC
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ACAAAAGATGAAAAATAATGTACAACTGAATTTGAAATAAAACATAAGACCTGAAAAATT
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BQ
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AF RR4B609JQ C 1
AF RR4B609TF U 1
BS 1 765 RR4B609TF

RD RR4B609JQ 765 0 0
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QA 1 765 1 765
DS 

RD RR4B609TF 765 0 0
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AGATGAAGAACCAAGTAGATAATTCTTTAATCTAAAAAATTAAGTTCATAAATACAAATC
CATGATTACTTCAAAACCCTAAGTCTGAAAAGTAGTTTATTCAGATATAAAACAAGAAAC
ACAAAAGATGAAAAATAATGTACAACTGAATTTGAAATAAAACATAAGACCTGAAAAATT
TGATATGTGACTAAAAGACTCTAAAAATACATTTTGGTTTTAGAAAGACTCAAAACTGTT
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ATATTCCAACGTTGATCCAATAAAACTGGTACGACCTGAAAATTCGTCATGCCAATCAAT
GTCCAAAATTAAAAGATGTATATGGTCGAATAGCCATTATTCTCAGGAACTAAAGGTTAA
TATCACACATTAAAAGTTACAAAATATTATGTTCCAAATTTTAGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL9033Contig1 880 2 4 U
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AGAAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCAC
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CTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATTATGGCCGGAGATGTGAATCCCACGTACTTGGCGA
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TTGTATCTGACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCGGGTCAGAGCTCTACATGATGAGCT
TTAATTATAGTCTGACTCATAAAGTGGCAGAAGAACTATTTATAAAAAAGTAAATTGGAA
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BQ
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AF RR4GO75TF U 1
AF RR4GO75JQ C 95
BS 1 663 RR4GO75TF
BS 664 664 RR4GO75JQ
BS 665 688 RR4GO75TF
BS 689 880 RR4GO75JQ

RD RR4GO75TF 688 0 0
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TTTCTTTCTTTCATCTTTTCACAGTCTACAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCTCCA
AGAAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCAC
CGGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTCC
TAATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAGA
GCAGAGACATCGATCTTGAAGCCGGAGATTTGAAGCCCGATAAAGCGGTGAAGACTGTAG
CTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATTATGGCCGGAGATGTGAATCCCACGTACTTGGCGA
CGCCGGCGGAAAAAAGCTGTTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGACGTG
AGGGGTAATGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGGGACACATTGAGAA
ACAGAGTACCCGAAGAGAAGAAACAGAGGATCGTCTATTGTGAACAGTTCTTTAGACTGT
TTGTATCTGACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCGGGTCAGAGCTCTACATGATGAGCT
TTA*TTATAGTCTGACTCATAAAGTGGC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4GO75JQ 786 0 0
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AGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACCGGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGAT
GCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTCCTAATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGG
TTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAGAGCAGAGACATCGATCTTGAAGCCGGAGATTTGAA
GCCCGATAAAGCGGTGAAGACTGTAGCTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATTATGGCCGG
AGATGTGAATCCCACGTACTTGGCGACGCCGGCGGAAAAAAGCTGTTTGTGACGATGATG
AAGACGAGGAGGGTGGTGTTGACGTGAGGGGTAATGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTG
AAAGCAACGGTGGGACACATTGAGAAACAGAGTACCCGAAGAGAAGAAACAGAGGATCGT
CTATTGTGAACAGTTCTTTAGACTGTTTGTATCTGACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGT
CGGGTCAGAGCTCTACATGATGAGCTTTAATTATAGTCTGACTCATAAAGTGGCAGAAGA
ACTATTTATAAAAAAGTAAATTGGAATTTATTTTGGATCTTTAGGAAGGTATTAACAATG
TTATTTAATCTTAGCTTTTGCTTCATTAAGTTAATTAGGCTTTTTTGTTTTTAAATTTGT
AATTAGTTTGTAATTCATTAGTATTGTTCCATTTTTAAGTTATGATGAATATATCCAAGA
AACTTT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL9034Contig1 1237 2 6 U
GGCACAACTAAAAGAAAGGAGGAAAAAAAAAATTCAATCGTGGAGAGAAACGAACGAAAA
TGCAGCAGCAAGGGAAGAGTAGTGGATCTGAGATGGAGGTGACTTGGCAGGACCAGCAGA
ACATTAATACCTTCAGCCGCTTCAACAATCGATTCCATGAACTCGAAGACGAAATCAAAT
TCGCCAAGGTACCTCTCTCCCTCCCTCCCTATCATCTAATCCTCCACAATGTTTTGATTT
CAATTGGGGGTTTCTGCTTCATTTCTAGGGTTTTCAACTCAGAGATTAGGTCAAATTCAT
CGGTAATTAGGATTCAAATATTTATCAATTATACCCACCCTACACATCTATAATCCAATA
CAAATTAGTTTAGCTATTGAAAAATGTGTTGACATCTCAGAAACATGTCGTTACTTACGG
TAATGCTCAGTTATGTCTTTTCATAGACCTCTCGTAGTTAATAATTAAGTGTCTGAAAAT
TACTTTCTTACCTGCCGTCTTTGAGGTTCATGCTAGATTCTTTGCATAAAAGACTTTGCA
ATACGTTTTGTTATGTTCCTTCCTGGTTTATTAGGCGAATCAAACAGCACCGTTTTTTTC
CTCATCTAGCTTGGTCCACTCATAAACATAAATAAATTATAAATTCAAATCATGTGATAA
GAGAATCATGTTTACTCAAGCAAAAGCTTTTGTTGGTTTCTTTAAGAGATGAAAACTGGA
TAAACAGTTCTCTGTCTGTTCTAACCCCCCCTCCCGTTTACCAAATCAAACCAAAAGACA
ATTGATCAAATTCTCACCAATTCTGCCTTGGCCTACTCATAAACATATATGGACATTTTC
TGACCCTCTCGAGTTTTTCATTCTTCTACAAGTTCTCATTCATTCTACGTTTGTCTTTTT
ATGCATATATTCTATCTTTGTTTGATTCGCATGTGTTGATAATTGGACTTTGATCATGAA
CTTCTCATGTAAAAAAGGCATTTACTTTGATTAGAATATGTTGTGGTTTTTGTTGTTTTA
TATATCTAAAATGGATATTCTCACAATTTAGCCGGTTATCTAGATAACAAGCATTGTCTC
ATGTTGATAAAAGATACCATCAGAGTATCATAATGCCACAAAATAGGTCAAATCATGTGA
TAAGAGAATCATGAATACTCAAATAAAAGCTTTTGTTAGTATCATTAAGAGATGATGAAC
TGGATAATCAATTATCTATCCCCTACTCTACCAAACC


BQ
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AF RR4GM75TF U 1
AF RR4GM75JQ C 593
BS 1 714 RR4GM75TF
BS 715 715 RR4GM75JQ
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BS 745 748 RR4GM75TF
BS 749 1237 RR4GM75JQ

RD RR4GM75TF 748 0 0
GGCACAACTAAAAGAAAGGAGGAAAAAAAAAATTCAATCGTGGAGAGAAACGAACGAAAA
TGCAGCAGCAAGGGAAGAGTAGTGGATCTGAGATGGAGGTGACTTGGCAGGACCAGCAGA
ACATTAATACCTTCAGCCGCTTCAACAATCGATTCCATGAACTCGAAGACGAAATCAAAT
TCGCCAAGGTACCTCTCTCCCTCCCTCCCTATCATCTAATCCTCCACAATGTTTTGATTT
CAATTGGGGGTTTCTGCTTCATTTCTAGGGTTTTCAACTCAGAGATTAGGTCAAATTCAT
CGGTAATTAGGATTCAAATATTTATCAATTATACCCACCCTACACATCTATAATCCAATA
CAAATTAGTTTAGCTATTGAAAAATGTGTTGACATCTCAGAAACATGTCGTTACTTACGG
TAATGCTCAGTTATGTCTTTTCATAGACCTCTCGTAGTTAATAATTAAGTGTCTGAAAAT
TACTTTCTTACCTGCCGTCTTTGAGGTTCATGCTAGATTCTTTGCATAAAAGACTTTGCA
ATACGTTTTGTTATGTTCCTTCCTGGTTTATTAGGCGAATCAAACAGCACCGTTTTTTTC
CTCATCTAGCTTGGTCCACTCATAAACATAAATAAATTATAAATTCAAATCATGTGATAA
GAGAATCATGTTTACTCAAGCAAAAGCTTTTGTTGGTTTCTTTAAGAGATGAAA*CTGGA
TAAACAGTTCTCTGTCTGTTCTACCCCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4GM75JQ 645 0 0
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TGTGATAAGAGAATCATGTTTACTCAAGCAAAAGCTTTTGTTGGTTTCTTTAAGAGATGA
AAACTGGATAAACAGTTCTCTGTCTGTTCTAACCCCCCCTCCCGTTTACCAAATCAAACC
AAAAGACAATTGATCAAATTCTCACCAATTCTGCCTTGGCCTACTCATAAACATATATGG
ACATTTTCTGACCCTCTCGAGTTTTTCATTCTTCTACAAGTTCTCATTCATTCTACGTTT
GTCTTTTTATGCATATATTCTATCTTTGTTTGATTCGCATGTGTTGATAATTGGACTTTG
ATCATGAACTTCTCATGTAAAAAAGGCATTTACTTTGATTAGAATATGTTGTGGTTTTTG
TTGTTTTATATATCTAAAATGGATATTCTCACAATTTAGCCGGTTATCTAGATAACAAGC
ATTGTCTCATGTTGATAAAAGATACCATCAGAGTATCATAATGCCACAAAATAGGTCAAA
TCATGTGATAAGAGAATCATGAATACTCAAATAAAAGCTTTTGTTAGTATCATTAAGAGA
TGATGAACTGGATAATCAATTATCTATCCCCTACTCTACCAAACC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL9035Contig1 986 2 8 U
GAAGAGGCAAAAAAAAAAACAGAGGAAAAGATTCCAATGTCTGTAGCAGCAGCAACTCAC
ATGAACACGATCAATCATTTGTCGACAACCTGTAAAACATCCAACCTCATCTGCTCCAAT
CACAGATTGGCTCCTCAACCTTTTCATCGTAAACCCAAATCGTTTCCTCAGTTGCTTCCC
CTAAATGGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGCTCTCCTTCGTCTTCCGTCAATCGAAGA
TCGAGATTCAACACTCGCAACAAACGCTTCTCTGTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGCACA
GTGAAGATGGAAGTAGATATACCAGTATCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGTGAA
TCTTTCCCTAAGTGGATGCCTTTCATTTCATCCGTTGAGGTCTCTTTTCATTTCATGAGA
GCTTATTAGCTTTCTTTGCTTTTAGATTTTTTTTAAGTTACTTTGATTTTGTGTTTTGTG
GTTTAGGTGTTAAAGGACAAGCCTGATCTATCACGTTGGTCACTCAAGTACAATGCTTTT
GGCCAAAACATTAAGTATTCTTGGCTTGCTCGCAATCTTCAGCCTACTCCTAATCAGAAA
ATCCATTGGAGATCTCTTGAAGGTCTTCCTAATAAAGGCAGCGTTCGGTTCTTCCCTAAA
GGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAGCTAACTGTATCATATGAAGTCCCTGCGCTTTTGACC
CCTGTGGCATCGGCGCTCCCGCCCTTTTTAGAAAGCTTGCTTAGAGGTGGACTTGAAAGA
TTTGCAACCTTGGCTAAAACCACTTGAAAGAAAGAAAAAAAGGAATCTGTGTGTAATGCA
TCTCTGTGATTCTGGACTTTTAAGAATATATCTTTGGTATATAAATAGTCTGGAACTCGA
TTATGTCCCCCATGATTAAGGAGGGCTCTTTGTAATTCTTAAAGTTACAATCTTTATTTC
TCTTAATAATAACAGAACTTTTGGCT


BQ
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AF RR4BE02TF U 1
AF RR4BE02JQ C 203
BS 1 741 RR4BE02TF
BS 742 742 RR4BE02JQ
BS 743 766 RR4BE02TF
BS 767 767 RR4BE02JQ
BS 768 798 RR4BE02TF
BS 799 799 RR4BE02JQ
BS 800 812 RR4BE02TF
BS 813 986 RR4BE02JQ

RD RR4BE02TF 813 0 0
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ATGAACACGATCAATCATTTGTCGACAACCTGTAAAACATCCAACCTCATCTGCTCCAAT
CACAGATTGGCTCCTCAACCTTTTCATCGTAAACCCAAATCGTTTCCTCAGTTGCTTCCC
CTAAATGGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGCTCTCCTTCGTCTTCCGTCAATCGAAGA
TCGAGATTCAACACTCGCAACAAACGCTTCTCTGTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGCACA
GTGAAGATGGAAGTAGATATACCAGTATCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGTGAA
TCTTTCCCTAAGTGGATGCCTTTCATTTCATCCGTTGAGGTCTCTTTTCATTTCATGAGA
GCTTATTAGCTTTCTTTGCTTTTAGATTTTTTTTAAGTTACTTTGATTTTGTGTTTTGTG
GTTTAGGTGTTAAAGGACAAGCCTGATCTATCACGTTGGTCACTCAAGTACAATGCTTTT
GGCCAAAACATTAAGTATTCTTGGCTTGCTCGCAATCTTCAGCCTACTCCTAATCAGAAA
ATCCATTGGAGATCTCTTGAAGGTCTTCCTAATAAAGGCAGCGTTCGGTTCTTCCCTAAA
GGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAGCTAACTGTATCATATGAAGTCCCTGCGCTTTTGACC
CCTGTGGCATCGGCGCTCCCGGCCTTTTTAGAAAGCTTGCTTAGAG*TGGACTTGAAAGA
TTTGCAACCTTGGCTAAA*CCACTTGAAAGAA
G

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR4BE02JQ 784 0 0
CCTCCTCTCGCTCTCTTTCGTCTTCCGTCAATCGAAGATCGAGATTCAACACTCGCAACA
AACGCTTCTCTGTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGCACAGTGAAGATGGAAGTAGATATAC
CAGTATCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGTGAATCTTTCCCTAAGTGGATGCCTT
TCATTTCATCCGTTGAGGTCTCTTTTCATTTCATGAGAGCTTATTAGCTTTCTTTGCTTT
TAGATTTTTTTTAAGTTACTTTGATTTTGTGTTTTGTGGTTTAGGTGTTAAAGGACAAGC
CTGATCTATCACGTTGGTCACTCAAGTACAATGCTTTTGGCCAAAACATTAAGTATTCTT
GGCTTGCTCGCAATCTTCAGCCTACTCCTAATCAGAAAATCCATTGGAGATCTCTTGAAG
GTCTTCCTAATAAAGGCAGCGTTCGGTTCTTCCCTAAAGGTCCTTCATCTTGCCTCGTTG
AGCTAACTGTATCATATGAAGTCCCTGCGCTTTTGACCCCTGTGGCATCGGCGCTCCGGC
CCTTTTTAGAAAGCTTGCTTAGAGGTGGACTTGAAAGATTTGCAACCTTGGCTAAAACCA
CTTGAAAGAAAGAAAAAAAGGAATCTGTGTGTAATGCATCTCTGTGATTCTGGACTTTTA
AGAATATATCTTTGGTATATAAATAGTCTGGAACTCGATTATGTCCCCCATGATTAAGGA
GGGCTCTTTGTAATTCTTAAAGTTACAATCTTTATTTCTCTTAATAATAACAGAACTTTT
GGCT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL9036Contig1 856 2 2 U
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AAGCAAAGTCATAGAAGGACAATAACTAGAGATAAATAACTGAAGCAAATAAGTTTCAAA
CACAGAAAACTTGTAACGCTGCGTCTTGAATCTGTCTCCTTCCTCAAGAGGAGCGGCGGT
GGGGAACTGCTGTGATCGTTCTGGAGGCACGATGTGCAGGGATTGTTCCTGATGAGCGAC
GCACCGCCGTTCGAACCGCTTCATGACTTGCAGTGATCGTTCGACGCTCTGTCGTCCTCG
TCCTAACCTTCTGATGACTTGTAGTGATTGTTCCTGATGAAAATCGACGTGCCTCAGTCC
GAACGTCTTGACTACTTATAGTGACCGTTCCCGAAAAACGAGTCTCCGACGTCCGGACCT
GCTGACGACTCGTGGTGATCGTTCCCGAGGAAGAGATCCTTATTGAGGAACGGTGCTCAG
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CGCGAACGGCACTGACCACACGCGAGGAACGATGTGTAGTTATCGTTGCCGAAGAACGTC
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GATCTGCAGTGATCGCTCCCGAAGAGGGAAGTACGGTTATGCGACGCTCCCCAAGACCTC
TATTTCTCACTGCCCTGTCGGACATCTTATGCTCTGGAAATGGTTTCTAGTGAACTCTTC
TTCTATGCTTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DW32JQ U 1
AF RR4B525TF C 84
BS 1 618 RR4DW32JQ
BS 619 856 RR4B525TF

RD RR4DW32JQ 618 0 0
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AGGTAAAGCAAAACATAACCTAAAATTACACTTGTTTGGGACTCTTATTCAAAACAACGA
AAGCAAAGTCATAGAAGGACAATAACTAGAGATAAATAACTGAAGCAAATAAGTTTCAAA
CACAGAAAACTTGTAACGCTGCGTCTTGAATCTGTCTCCTTCCTCAAGAGGAGCGGCGGT
GGGGAACTGCTGTGATCGTTCTGGAGGCACGATGTGCAGGGATTGTTCCTGATGAGCGAC
GCACCGCCGTTCGAACCGCTTCATGACTTGCAGTGATCGTTCGACGCTCTGTCGTCCTCG
TCCTAACCTTCTGATGACTTGTAGTGATTGTTCCTGATGAAAATCGACGTGCCTCAGTCC
GAACGTCTTGACTACTTATAGTGACCGTTCCCGAAAAACGAGTCTCCGACGTCCGGACCT
GCTGACGACTCGTGGTGATCGTTCCCGAGGAAGAGATCCTTATTGAGGAACGGTGCTCAG
ACAACTCTCGTGAAGTGATAGCTCCCGAGGAACGACGTGTTGTTGTCGTCTGAAAATTCT
CGCGAACGGCACTGACCA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR4B525TF 773 0 0
AATTACACTTGTTTGGGACTCTTATTCAGAACAACGAAAGCAAAGTCATAGAAGGACAAT
AACTAGAGATAAATAACTGAAGCAAATAAGTTTCAAACACAGAAAACTTGTAACGCTGCG
TCTTGAATCTGTCTCCTTCCTCAAGAGGAGCGGCGGTGGGGAACTGCTGTGATCGTTCTG
GAGGCACGATGTGCAGGGATTGTTCCTGATGAGCGACGCACCGCCGTTCGAACCGCTTCA
TGACTTGCAGTGATCGTTCGACGCTCTGTCGTCCTCGTCCTAACCTTCTGATGACTTGTA
GTGATTGTTCCTGATGAAGATCGACGTGCCTCAGTCCGAACGTCTTGACTACTTATAGTG
ACCGTTCCCGAAGAACGAGTCTCCGACGTCCGGACCTGCTGACGACTCGTGGTGATCGTT
CCCGAGGAAGAGATCCTTCTTGAGGAACGGTGCTCAGACAACTCTCGTGAAGTGATAGCT
CCCGAGGAACGACGTGTTGTTGTCGTCTGAAAATTCTCGCGAACGGCACTGACCACACGC
GAGGAACGATGTGTAGTTATCGTTGCCGAAGAACGTCGTTCTGTGGTCCGAGTCTGGTCA
TGACTTGCAGCTGCCACACGCGAGGAAGGACGGCGGAGATCTGCAGTGATCGCTCCCGAA
GAGGGAAGTACGGTTATGCGACGCTCCCCAAGACCTCTATTTCTCACTGCCCTGTCGGAC
ATCTTATGCTCTGGAAATGGTTTCTAGTGAACTCTTCTTCTATGCTTTCACCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL9037Contig1 732 2 3 U
GGAGAGATCAAACTAGTTGTGTTCTGTCATAAAATAAAAGAACGAAATCGAAAGCATCTG
TTTCCACTTTCGTCTGAAGGAGATCGACTTGTCAAGGGAACACAAACCCCTAGATATGGC
GGAGAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCACAACGGGCAAAAGGTGTTTGA
ATGGGATCAAACACTTGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTC
AAAGGCATTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCC
TCCTTATCTCAATCACGATCTTTGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCT
AGAGGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATC
TCCGATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCT
CATGCTGCAGAGGTTTCAAGAAGAGAACCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCAC
GGGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCCTTCCT
ACTCTTTTTGTTTCCATTATAATAAAACTGCGAAAAGGAAAATGTTCCCATGGCTTGACT
CTCTTCTGTTAATCAATCAAATCATCTCTAAACTATATTTCATTCACTTACGGATAAATG
CGTTTGTCTTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DO69TF U 1
AF RR4DO69JQ C 134
BS 1 712 RR4DO69TF
BS 713 713 RR4DO69JQ
BS 714 732 RR4DO69TF

RD RR4DO69TF 732 0 0
GGAGAGATCAAACTAGTTGTGTTCTGTCATAAAATAAAAGAACGAAATCGAAAGCATCTG
TTTCCACTTTCGTCTGAAGGAGATCGACTTGTCAAGGGAACACAAACCCCTAGATATGGC
GGAGAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCACAACGGGCAAAAGGTGTTTGA
ATGGGATCAAACACTTGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTC
AAAGGCATTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCC
TCCTTATCTCAATCACGATCTTTGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCT
AGAGGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATC
TCCGATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCT
CATGCTGCAGAGGTTTCAAGAAGAGAACCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCAC
GGGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCCTTCCT
ACTCTTTTTGTTTCCATTATAATAAAACTGCGAAAAGGAAAATGTTCCCATGGCTTGACT
CTCTTCTGTTAATCAATCAAATCATCTCTAAACTATATTTCATTCACTTACG*ATAAATG
CGTTTGTCTTGC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR4DO69JQ 599 0 0
CCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCACAACGGGCAAAAGGTGTTTGAATGGGATCAAACA
CTTGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAAGGCATTCCAC
TGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCCTCCTTATCTCAAT
CACGATCTTTGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGATGATATA
ATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCCGATTTTCGGA
CAGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCATGCTGCAGAGG
TTTCAAGAAGAGAACCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGTCCA
GATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCCTTCCTACTCTTTTTGTTT
CCATTATAATAAAACTGCGAAAAGGAAAATGTTCCCATGGCTTGACTCTCTTCTGTTAAT
CAATCAAATCATCTCTAAACTATATTTCATTCACTTACGGATAAATGCGTTTGTCTTGC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL9038Contig1 769 2 10 U
TGCAAAATACGAAACCATACACAAACTGGCAGCAAACCGAAATAGCCCCAGAAACAAAAG
CCCATAAGAAGCGGTAGCTAGAACCCACACTGGGGACGACCAAAACCACATCGGGTGACT
TCAGAACAAACATAAAACAAACAAATTAAAACAACGCTAACACCAAAAGCACGGTTAACA
TCCACAATAGCCACATCAGACCACCTAGCAGATTTTAAAAAGAGCAAATGTCAATGGCCG
GGAATTACCGCTGCTGCATTTAGCCCGCCACCCGAAACTTTCCACTTCTGCACCCAAATA
CACTTATCGCTGCTGCCTCGCCCGCCAAACGATAAGACCAAGACCTAGAGCCTTCATAAC
TCAACAAGGGGAACTCGCTGCTCGGTCCACACACCTTGAATACATAGACACACTACGATC
AAAGAATGAAGCTCACTCAATTACCACCATGAAGCCTTGCCAACCTCTCCAACACTTATA
GGAGAAGAACCAAACAGCTAGCAACCACAAGACACAATAACTCTAGAACAAACCCTGCTA
AGTCATCACCATCAAGACGTTTACACCATGGCCAGATCGATCAAGATTCACGAACCCGAA
GTTACAAGAGCCTGAGACTCAGCACTCCTGACACAATAGAAAGCCGACTACTCCATTTCT
TCACACACCAAAACCAAGATCAGAACATAGGACCGCAACACTGGACGCCAACTTAATCAG
AGTTAAACGCTCAACCAACACTTCAAACACCACAAAGGTCAAAGCCTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK90JQ U 1
AF RR4EP64JQ U 1
BS 1 100 RR4BK90JQ
BS 101 101 RR4EP64JQ
BS 102 237 RR4BK90JQ
BS 238 238 RR4EP64JQ
BS 239 411 RR4BK90JQ
BS 412 412 RR4EP64JQ
BS 413 492 RR4BK90JQ
BS 493 493 RR4EP64JQ
BS 494 704 RR4BK90JQ
BS 705 769 RR4EP64JQ

RD RR4BK90JQ 704 0 0
TGCAAAATACGAAACCATACACAAACTGGCAGCAAACCGAAATAGCCCCAGAAACAAAAG
CCCATAAGAAGCGGTAGCTAGAACCCACACTGGGGACGACTAAAACCACATCGGGTGACT
TCAGAACAAACATAAAACAAACAAATTAAAACAACGCTAACACCAAAAGCACGGTTAACA
TCCACAATAGCCACATCAGACCACCTAGCAGATTTTAAAAAGAGCAAATGTCAATGGTCG
GGAATTACCGCTGCTGCATTTAGCCCGCCACCCGAAACTTTCCACTTCTGCACCCAAATA
CACTTATCGCTGCTGCCTCGCCCGCCAAACGATAAGACCAAGACCTAGAGCCTTCATAAC
TCAACAAGGGGAACTCGCTGCTCGGTCCACACACCTTGAATACATAGACACTCTACGATC
AAAGAATGAAGCTCACTCAATTACCACCATGAAGCCTTGCCAACCTCTCCAACACTTATA
GGAGAAGAACCAGACAGCTAGCAACCACAAGACACAATAACTCTAGAACAAACCCTGCTA
AGTCATCACCATCAAGACGTTTACACCATGGCCAGATCGATCAAGATTCACGAACCCGAA
GTTACAAGAGCCTGAGACTCAGCACTCCTGACACAATAGAAAGCCGACTACTCCATTTCT
TCACACACCAAAACCAAGATCAGAACATAGGACCGCAACACTGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4EP64JQ 769 0 0
TGCAAAATACGAAACCATACACAAACTGGCAGCAAACCGAAATAGCCCCAGAAACAAAAG
CCCATAAGAAGCGGTAGCTAGAACCCACACTGGGGACGACCAAAACCACATCGGGTGACT
TCAGAACAAACATAAAACAAACAGATTAAAACAACGCTAACACCAAAAGCACGGTTAACA
TCCACAATAGCCACATCAGACCACCTAGCAGATTTTAAAAAGAGCAAATGTCAATGGCCG
GGAATTACCGCTGCTGCATTTAGCCCGCCACCCGAAACTTTCCACTTCTGCACCCAAATA
CACTTATCGCTGCTGCCTCGCCCGCCAAACGATAAGACCAAGACCTAGAGCCTTCATAAC
TCAACAAGGGGAACTCGCTGCTCGGTCCACACACCTTGAATACATAGACACACTACGATC
AAAGAATGAAGCTCACTCAATTACCACCATGAAGCCTTGCCAACCTCTCCAACACTTATA
GGAGAAGAACCAAACGGCTAGCAACCACAAGACACAATAACTCTAGAACAAACCCTGCTA
AGTCATCACCATCAAGACGTTTACACCATGGCCAGATCGATCAAGATTCACGAACCCGAA
GTTACAAGAGCCTGAGACTCGGCACTCCTGACACAATAGAAAGCCGACTACTCCATTTCT
TCACACACCAAAACCAAGATCAGAACATAGGACCGCAACACTGGACGCCAACTTAATCAG
AGTTAAACGCTCAACCAACACTTCAAACACCACAAAGGTCAAAGCCTTC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL9039Contig1 880 2 22 U
GGAGATATTAGCATATACAGAACATGTTAAACAACAAGGAGACGGTGATCACGGTTTCCT
CAAGTTATTTCAGAGAAAATACACATCCTCACTTACTATTGGAGTTGCTCTTATAACTTT
GCCTCAACTTGGAGGTCTTAGTGGTTATTCTTTTTACACTGACTCCATTTTCATATCTAC
GTGTGTATCGAGTGATGTTGGATTTATATCGACATCTATAGTTCAGATGCTTGCAGGCGT
TTTAGGTACTGCGCTTGTGGATGTATCCGGAAGACGTTCACTCCTACTGGTTTCTCAAGC
TGGAATGTTCTTGGGTTGTCTTGTCACAGCCATTTCGTTCTTCTTGAAGGAGAACCATTG
CTGGGAAACAGGAACACCTATATTGGCTCTGATTAGTGTCACGTTGTACTTTGGATCATA
TGGATTAGGCATGGGATCAATACCATCGATCATTGCATCAGAGATTTATCCAGTAGATGT
GAAGGGGGCAGCGGGAACAATGTGTGGCTTGGCCAGCTCTATTAGCGCATGGCTCGTTGC
TTACTCTTTCGGTTTCTTGTTTCAGTGGAGTGCCACAGGAACATTTCTGATGTTTACCAC
AGTGACTGGCATTGGATTTGTGTTCATAGCTAAGCTTGTTCCAGAGACTAAAGGAAAATC
TTTAGAAGAAATCCAATCTCTTTTCAGTTTTTAGTAATTCTCCTTGTGAAGATTCTACAA
TATCAACAGACATTTCCCCCAAAATAGAAAAAAAGTATGGGTCTAGCTTTAACCCTTATA
ACCTCGACTGTTTTATTTAATAGGCAATCCACGGAATCAATGTAAAAGCTTCACCATCTT
GTATATGATTTTAATATATAATCTGGAACTGTTAGATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BQ71TF U 1
AF RR4BQ71JQ C 121
BS 1 657 RR4BQ71TF
BS 658 658 RR4BQ71JQ
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BS 755 769 RR4BQ71TF
BS 770 880 RR4BQ71JQ

RD RR4BQ71TF 787 0 0
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TATCA*CAGACATTTCCCC**AAATAGAAAAAA*GTATGGGTCTAGCTT
AAACTATAACTCGACTGT

QA 1 769 1 769
DS 

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TTTAGGTACTGCGCTTGTGGATGTATCCGGAAGACGTTCACTCCTACTGGTTTCTCAAGC
TGGAATGTTCTTGGGTTGTCTTGTCACAGCCATTTCGTTCTTCTTGAAGGAGAACCATTG
CTGGGAAACAGGAACACCTATATTGGCTCTGATTAGTGTCACGTTGTACTTTGGATCATA
TGGATTAGGCATGGGATCAATACCATCGATCATTGCATCAGAGATTTATCCAGTAGATGT
GAAGGGGGCAGCGGGAACAATGTGTGGCTTGGCCAGCTCTATTAGCGCATGGCTCGTTGC
TTACTCTTTCGGTTTCTTGTTTCAGTGGAGTGCCACAGGAACATTTCTGATGTTTACCAC
AGTGACTGGCATTGGATTTGTGTTCATAGCTAAGCTTGTTCCAGAGACTAAAGGAAAATC
TTTAGAAGAAATCCAATCTCTTTTCAGTTTTTAGTAATTCTCCTTGTGAAGATTCTACAA
TATCAACAGACATTTCCCCCAAAATAGAAAAAAAGTATGGGTCTAGCTTTAACCCTTATA
ACCTCGACTGTTTTATTTAATAGGCAATCCACGGAATCAATGTAAAAGCTTCACCATCTT
GTATATGATTTTAATATATAATCTGGAACTGTTAGATATC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

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TATGTAAAGACA


BQ
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AF RR4E707TF U 1
AF RR4E707JQ C 97
BS 1 686 RR4E707TF
BS 687 732 RR4E707JQ

RD RR4E707TF 686 0 0
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TTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAAGTAAGCACAACCAAATCTAGTCATGTTCTTCCAGA
TGGCAGTAGCTCAGCTCGTTCTCCTCCCTTTGTTGTTGCTGACGGTCTTCCTGGGAGTTC
CTCCAGGGAAACAGAAGTTCTGCTCCTTAACTATTTGTTGTTCCATACTTGGGTCGTGAC
TATTCTTCACTTAGACTTCACCGTAGCAAAAGGATGAAGCTGGAAAGCGAATATTACATA
GACGAAGCGAATGGAAACTGGCACCTAAGACGGCAAGCGCAAGAGGGTTTATCAAAGTGA
CTACTAAATCTGAAGCCTTCCGTGAAGTTGAACCATTTATGAACGACTCCAGACTGAATC
TATTACTAAAAGTTGTGTGAGTTTCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4E707JQ 636 0 0
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AACCGATTCGGGTACCGGCTCTCCTGTGTTGACCAAGGTAAGCACAACCAAAGCTGGTGA
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TGATGATGAAAGCACCGAGGCGGATTCCAGTTCTCCTGTGTTGACCAAAGTAAGCACAAC
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TGCTGACGGTCTTCCTGGGAGTTCCTCCAGGGAAACAGAAGTTCTGCTCCTTAACTATTT
GTTGTTCCATACTTGGGTCGTGACTATTCTTCACTTAGACTTCACCGTAGCAAAAGGATG
AAGCTGGAAAGCGAATATTACATAGACGAAGCGAATGGAAACTGGCACCTAAGACGGCAA
GCGCAAGAGGGTTTATCAAAGTGACTACTAAATCTGAAGCCTTCCGTGAAGTTGAACCAT
TTATGAACGACTCCAGACTGAATCTATTACTAAAAGTTGTGTGAGTTTCTTAGACTAATT
TTCTTGTATTACAAAGTGTCTGGATATGTAAAGACA

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL9041Contig1 590 2 1 U
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TAACGCTTTCTACAGGTTTCAAGTGATGAATCCATCGATATGGCAAGGCTTCTTGCCCGT
AAAGAAGGTCTTCTTGTAAGTAATTCACATCTCATAATAAACAAAATCTTTTTCTTGGAC
TTCCCTAGGAGGATCAGTTGTCCGTAGGTTATTAGTTTGGTTGCATATTCTCATGTCATA
GTGGGAAAAGGTTTATAACAAGAAAATCTTTTAAAAAAAAATTGTAGGTGGGAATATCAT
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CTCAATCAAACTGAGTCTTTTGCTCTTTGAAAGAACTCCACTGAACTATTTATCCTACAG
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AAAGAAGCAGAATCCATGACCTTCGAGGCTTGAATAGCTCTCAGAGCTGG


BQ
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AF RR4AJ58JQ C 1
AF RR4AJ58TF U 1
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AAAGAAGCAGAATCCATGACCTTCGAGGCTTGAATAGCTCTCAGAGCTGG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4AJ58TF 590 0 0
GGTATTACTGAATCAGAAACTTTCTACAGTTCTAACTCTCCTTCCCTCCATCCCTGTCTG
TAACGCTTTCTACAGGTTTCAAGTGATGAATCCATCGATATGGCAAGGCTTCTTGCCCGT
AAAGAAGGTCTTCTTGTAAGTAATTCACATCTCATAATAAACAAAATCTTTTTCTTGGAC
TTCCCTAGGAGGATCAGTTGTCCGTAGGTTATTAGTTTGGTTGCATATTCTCATGTCATA
GTGGGAAAAGGTTTATAACAAGAAAATCTTTTAAAAAAAAATTGTAGGTGGGAATATCAT
CAGGTGCAGCAGCTGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAACGCCGGGAAGC
TTTTTGTGGTAAGTTATTTGTATTTATGTCATCACTCTTCACTCCCAAAGCTAAGACAAG
CTCAATCAAACTGAGTCTTTTGCTCTTTGAAAGAACTCCACTGAACTATTTATCCTACAG
GCGGTGTTCCCAAGTTTCGGAGAGAGGTACCTGTCGACCGTACTATTCGATGCCACAAGG
AAAGAAGCAGAATCCATGACCTTCGAGGCTTGAATAGCTCTCAGAGCTGG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GM32JQ C 1
AF RR4GM32TF U 1
BS 1 470 RR4GM32TF

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QA 1 470 1 470
DS 

RD RR4GM32TF 470 0 0
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QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL9043Contig1 842 2 2 U
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CTAGATTAGATTCTAATCGATTCACAGTCGTGAGCAGCAGGGTTTTTGATTCTCGATCCT
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AAAACAGTCATCTCAGTTCTTTCAAATTCGCCAAACTCTTCGATTCAGACGCTTCCTGGG
ACAAGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGGCAAGTTGTTGGATTACTCTGCG
GTTTGCTTTGGGGTGCAATCCCTTTGGTTGGAGGCATCTGGTTACTTCTGTTTCTGGCAA
TTTCTTCAGGGATTGTATACGGTTACTGTGCATTGATTCTGAAGATCGATGAAGAAGACT
ATGGGGGCCATGCAGCTCTGCTCCAGGACGGTCTTTTTGATTCTCTAAGTGTATTCCTGC
TTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGAGAGAGAGACACACACTGTTTTG
CGCTTGAGTTTGCGTTACCCCCCTGCTCGGAAGAAGTTTAGCAGAAGGTGGATTTCATGG
TGTCTCCGGTCCGACGACATTCTTCTTTATATTTGCCTTTGACGCTTTTGTTTTGCTCAA
GATGAGAACTAGCTTTTCTTTGGTTTTGCTCAAGTATATTATCGTTTTATTTTTGCTTAA
TAAATTATGTAGTCTGTTTATGCTACAAAAACGGTATTTCTTCCTGTTTTGGACCAAAGA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RR4C839TF U 1
AF RR4C839JQ C 103
BS 1 643 RR4C839TF
BS 644 842 RR4C839JQ

RD RR4C839TF 643 0 0
GGGGGTGGGTGAATAGATCTGAATCATCAGAATTCAGAACCCTTTTATTAGCAAAGAACC
CTAGATTAGATTCTAATCGATTCACAGTCGTGAGCAGCAGGGTTTTTGATTCTCGATCCT
GTCTTTGCATCGGATCTATCTTCTTTAGAAATCAAAATCGGCAAAAAAAAAATATGAAAG
AAGGGAGATCTGGGAAGTCGAATCAGCATCATCAAGACCACGATGAACATGTTCACCACC
AAAACAGTCATCTCAGTTCTTTCAAATTCGCCAAACTCTTCGATTCAGACGCTTCCTGGG
ACAAGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGGCAAGTTGTTGGATTACTCTGCG
GTTTGCTTTGGGGTGCAATCCCTTTGGTTGGAGGCATCTGGTTACTTCTGTTTCTGGCAA
TTTCTTCAGGGATTGTATACGGTTACTGTGCATTGATTCTGAAGATCGATGAAGAAGACT
ATGGGGGCCATGCAGCTCTGCTCCAGGACGGTCTTTTTGATTCTCTAAGTGTATTCCTGC
TTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGAGAGAGAGACACACACTGTTTTG
CGCTTGAGTTTGCGTTACCCCCCTGCTCGGAAGAAGTTTAGCA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4C839JQ 740 0 0
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AAAAAAAAAATATGAAAGAAGGGAGATCTGGGAAGTCGAATCAGCATCATCAAGACCACG
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ATTCAGACGCTTCCTGGGACAAGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGGCAAG
TTGTTGGATTACTCTGCGGTTTGCTTTGGGGTGCAATCCCTTTGGTTGGAGGCATCTGGT
TACTTCTGTTTCTGGCAATTTCTTCAGGGATTGTATACGGTTACTGTGCATTGATTCTGA
AGATCGATGAAGAAGACTATGGGGGCCATGCAGCTCTGCTCCAGGACGGTCTTTTTGATT
CTCTAAGTGTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGAGAGA
GAGACACACACTGTTTTGCGCTTGAGTTTGCGTTACCCCCCTGCTCGGAAGAAGTTTAGC
AGAAGGTGGATTTCATGGTGTCTCCGGTCCGACGACATTCTTCTTTATATTTGCCTTTGA
CGCTTTTGTTTTGCTCAAGATGAGAACTAGCTTTTCTTTGGTTTTGCTCAAGTATATTAT
CGTTTTATTTTTGCTTAATAAATTATGTAGTCTGTTTATGCTACAAAAACGGTATTTCTT
CCTGTTTTGGACCAAAGAAG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL9044Contig1 566 2 1 U
GGATGTATAAACCTCTGTGGCTGCCGGTCATTTATCTCTCTCTCCCTTCCTCTAAGCTAA
AGCCAAAACATAACAAGAATAAAAGCTATGGCTGGTATGCTTCCAGGAGTTGAGTGCGCG
AGGAGACGGCGCTTCCACGGCGGTGCTCCACCGATTGACTTATCCAACACGGCTTCTGTG
GCTGCAGTAACGGGACACGTATGGACTCGCCGACCATCCTTCTCTCTCTACACTACCAAT
CACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCCTTCTCGGAGAGAAATATTAGGAACAAATCTTAC
GGTGTTGATAACCATGAGAAGCTTGTAGGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGGAC
GAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGGTTTGGTTTGTTTAAACAAGTGTATGATAGCAAA
CCAAGTCCTAATTCACCTTAAAATCCACTGAACCAGCTCAAGCATTTTGCTTTAATTCCA
TGATAATGACGCATGCTGATGTACTATTATCTTTCTAACATGTGGTATCACATGAGCATA
TAATTGTGAGATTGCCTTTTGTCGGC


BQ
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AS 0 0

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BQ
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AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4AP41JQ C 1
AF RR4AP41TF U 1
BS 1 589 RR4AP41TF

RD RR4AP41JQ 589 0 0
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TCCAGTCATTGTCTTGCCAGGTTCAGCTTTGATGGGTTCGGTTTCTATTAGCACAGTCAT
CTTGATTCGACTGGGAAAGTTGAGAGCTTTAGCCAGAACTGGTTAGTCTGCGTTGATCTT
GTTTGCTCCGCGTGAAGCGCATGAAAGGCACTTACTTTATCAAATGCGATGCCACAGAGA
CTGTTTTGGGTGCTAAGAAAAAACTGTTTACTCGATCACCACGATGTCCTTGAAGTGCGG
TGCTAATCTGAATAAGAGAAAGTGTGATTGTGGCAGTGAAGAAAAGGATTAAGCATGTTA
TGCTACTGTTGCTGCAACTTGCAAGTCTCTGGAGACAAGTCTCTAAAGCATTGTATTGAC
TAATGAATGATCTTTATATATTGCATTTGGAATTGGTTTTCTTTTGCGCTCTCTTATGCG
CTTTGTATAGTTTCATACATGACTTATTAGATGCTGGTTTTGTGTTTATCTTGTTAACAA
TGTCGTCTTTTGTTATGGAGTGATGACAGACTTGATATACTTTTTTTCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4AP41TF 589 0 0
GGAGGAGTATTTGGTCCTTGCGTTGTTCACCGGAATCGGCTACGGAAGAAGAGGGGATTG
TCCAGTCATTGTCTTGCCAGGTTCAGCTTTGATGGGTTCGGTTTCTATTAGCACAGTCAT
CTTGATTCGACTGGGAAAGTTGAGAGCTTTAGCCAGAACTGGTTAGTCTGCGTTGATCTT
GTTTGCTCCGCGTGAAGCGCATGAAAGGCACTTACTTTATCAAATGCGATGCCACAGAGA
CTGTTTTGGGTGCTAAGAAAAAACTGTTTACTCGATCACCACGATGTCCTTGAAGTGCGG
TGCTAATCTGAATAAGAGAAAGTGTGATTGTGGCAGTGAAGAAAAGGATTAAGCATGTTA
TGCTACTGTTGCTGCAACTTGCAAGTCTCTGGAGACAAGTCTCTAAAGCATTGTATTGAC
TAATGAATGATCTTTATATATTGCATTTGGAATTGGTTTTCTTTTGCGCTCTCTTATGCG
CTTTGTATAGTTTCATACATGACTTATTAGATGCTGGTTTTGTGTTTATCTTGTTAACAA
TGTCGTCTTTTGTTATGGAGTGATGACAGACTTGATATACTTTTTTTCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL9050Contig1 593 2 1 U
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CATTCCGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCA
CAAGGTTACCCCATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTA
TGACCGTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAA
GACCACGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCCAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCA
CTCCATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATC
ACTTTTCTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGA
TTTCATCTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTT
TTGTATCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCGGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTT
TTACAATCCAATTTTAAATCGACTATATTCATTTCATTATAGAATAATACTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D272JQ C 1
AF RR4D272TF U 1
BS 1 593 RR4D272TF

RD RR4D272JQ 593 0 0
GGAGCAGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAA
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CAAGGTTACCCCATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTA
TGACCGTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAA
GACCACGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCCAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCA
CTCCATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATC
ACTTTTTTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGA
TTTCATCTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTT
TTGTATCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCGGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTT
TTACAATCCAATTTTAAATCGACTATATTCATTTCATTATAGAATAATACTTC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR4D272TF 593 0 0
GGAGCAGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAA
CATTCCGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCA
CAAGGTTACCCCATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTA
TGACCGTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAA
GACCACGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCCAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCA
CTCCATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATC
ACTTTTCTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGA
TTTCATCTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTT
TTGTATCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCGGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTT
TTACAATCCAATTTTAAATCGACTATATTCATTTCATTATAGAATAATACTTC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL9051Contig1 592 2 3 U
GGATTCTCTTCACCATGGCCACTTTTCTCTGTTTCCTTTTTTTCTCTTCGGTAGCCCTGT
CTCTCGCTCTAGTTTCGGTCACAGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTGCGTCATAAAA
AAGAGAAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGCAAAGATCCAA
CTTCTGTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGCTTTGGCCTCA
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GGGCACAAGGGTTTTATGCAGCGGCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTGATGGCTATGA
ACTTCGCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACAGTGTTTGGACGAAACT
CTGTGCTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTTTTTCGATTTG
CTAGAGGTTATGTTCAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAAGACAGGGAACGCTGTTG
TCGAGTATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTATT


BQ
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AF RR4FI38JQ C 1
AF RR4FI38TF U 1
BS 1 82 RR4FI38TF
BS 83 83 RR4FI38JQ
BS 84 592 RR4FI38TF

RD RR4FI38JQ 592 0 0
GGATTCTCTTCACCATGGCCACTTTTCTCTGTTTCCTTTTTTTCTCTTCGGTAGCCCTGT
CTCTCGCTCTAGTTTCGGTCACAGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTGCGTCATAAAA
AAGAGAAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGCAAAGATCCAA
CTTCTGTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGCTTTGGCCTCA
CTCGTATGATTGATAATCCATTAACGTTGTCCCCGGAGTTAAGCTCCAAAATGGTTGGAA
GGGCACAAGGGTTTTATGCAGCGGCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTGATGGCTATGA
ACTTCGCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACAGTGTTTGGACGAAACT
CTGTGCTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTTTTTCGATTTG
CTAGAGGTTATGTTCAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAAGACAGGGAACGCTGTTG
TCGAGTATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTATT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR4FI38TF 592 0 0
GGATTCTCTTCACCATGGCCACTTTTCTCTGTTTCCTTTTTTTCTCTTCGGTAGCCCTGT
CTCTCGCTCTAGTTTCGGTCACGGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTGCGTCATAAAA
AAGAGAAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGCAAAGATCCAA
CTTCTGTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGCTTTGGCCTCA
CTCGTATGATTGATAATCCATTAACGTTGTCCCCGGAGTTAAGCTCCAAAATGGTTGGAA
GGGCACAAGGGTTTTATGCAGCGGCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTGATGGCTATGA
ACTTCGCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACAGTGTTTGGACGAAACT
CTGTGCTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTTTTTCGATTTG
CTAGAGGTTATGTTCAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAAGACAGGGAACGCTGTTG
TCGAGTATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTATT

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL9052Contig1 1052 2 10 U
GGGTGTCTCTAGAGTCGATCTGTGGTGGTCTCGGTTGGGAAGGTGATGTTAGAGGACGGC
ATGTATCTCTCTCCGTGTCTTGCTCCAGTTTTGCTCTGGTGGCTCTGACCAGAAATTTTT
TCTAGATCTCGGTGAACTTTTCGGTTTGGCGGCGCGTGTTTCGTCGGAGAGGCCTTCGGG
TCTCAGATCTGGGTTGCTTGCAACTCCGTTCTCTTCGCTTCAGCTCTGCAACCACTGATG
GTCTTTAGTGGAAGCGCGTGGGGTTCCTTCTTGGAGGCGAGTTCCTCTCCTACTCGAAGG
TGCACTGGTGGCGGCGCGTGGTGATGTGATGGTCCTCGTCTTGTTTCTTCGAGACTTTGT
CGCGGCCCTCTCATCTCAAAGCTGGAGTTTCCGGCGGTGTGGCGTTCACCGTGGTCGACC
TTATCTCCCTGGTGCTTTCTCAGCATCTCTCTAACTGCATCGGAGCGATGAGATTTTGTT
GATTGGAGGCAGGTTTTCAGTTGGGCGCTCAGACTTCTCGCTCTCTCGGTTGAGGCTGCT
CCGGAGGTGGTGGAGCTGTCCGGTCCGCTTGCTCTATATGGGCTCTCGGTTCAACGGGTG
TACACGGTCCCGGTTAAGAGGCAAAGAGGCGGCAATCTCTGAGTCTCCAACCGAACGACG
GCATCGTCGGATAGAACCACTGCCTCGTGCCGCCGGTGTATGTCAAGGTCAGGTGGGTTT
GTGAGTTTGTGCTCGTGATTCTTGGAGTGGTTTGTGTTCTGTTGGTGTTTCGGAAGCTGT
AGGACTTGTAGCATCAAGGTTTGAGGGCGCCTTTCTCTCGGTCCCGTGGCAACTGGCTCG
TCCTTTATGGTCCTTATCATTTTCCCTGGTTCGAGCTTGTCTCGTTGGTCTCCGTCTCTA
ATTGCTCTGTTTCTAGTCTTCGGTCTGAGTTAAAGTTGCTGTGTTTTTCATTATTTGTTT
AGTTTAATTTTCTGCAAATCTGCTACTAGTTTATCTCTTGTAAAGTCTGTCAAAAATCTA
AAACTTGGTATAATAAATTTAACATTTTACCC


BQ
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AF RR4EX62TF U 1
AF RR4EX62JQ C 339
BS 1 669 RR4EX62TF
BS 670 670 RR4EX62JQ
BS 671 695 RR4EX62TF
BS 696 696 RR4EX62JQ
BS 697 712 RR4EX62TF
BS 713 713 RR4EX62JQ
BS 714 727 RR4EX62TF
BS 728 728 RR4EX62JQ
BS 729 745 RR4EX62TF
BS 746 1052 RR4EX62JQ

RD RR4EX62TF 745 0 0
GGGTGTCTCTAGAGTCGATCTGTGGTGGTCTCGGTTGGGAAGGTGATGTTAGAGGACGGC
ATGTATCTCTCTCCGTGTCTTGCTCCAGTTTTGCTCTGGTGGCTCTGACCAGAAATTTTT
TCTAGATCTCGGTGAACTTTTCGGTTTGGCGGCGCGTGTTTCGTCGGAGAGGCCTTCGGG
TCTCAGATCTGGGTTGCTTGCAACTCCGTTCTCTTCGCTTCAGCTCTGCAACCACTGATG
GTCTTTAGTGGAAGCGCGTGGGGTTCCTTCTTGGAGGCGAGTTCCTCTCCTACTCGAAGG
TGCACTGGTGGCGGCGCGTGGTGATGTGATGGTCCTCGTCTTGTTTCTTCGAGACTTTGT
CGCGGCCCTCTCATCTCAAAGCTGGAGTTTCCGGCGGTGTGGCGTTCACCGTGGTCGACC
TTATCTCCCTGGTGCTTTCTCAGCATCTCTCTAACTGCATCGGAGCGATGAGATTTTGTT
GATTGGAGGCAGGTTTTCAGTTGGGCGCTCAGACTTCTCGCTCTCTCGGTTGAGGCTGCT
CCGGAGGTGGTGGAGCTGTCCGGTCCGCTTGCTCTATATGGGCTCTCGGTTCAACGGGTG
TACACGGTCCCGGTTAAGAGGCAAAGAGGCGGCAATCTCTGAGTCTCCAACCGAACGACG
GCATCGTCG*ATAGAACCACTGCCTCGTGCCGCCG*TGTATGTCAAGGTCAG*TGGGTTT
GTGAGTT*GTGCTCGTGATTCTTGG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR4EX62JQ 714 0 0
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GTGGCGTTCACCGTGGTCGACCTTATCTCCCTGGTGCTTTCTCAGCATCTCTCTAACTGC
ATCGGAGCGATGAGATTTTGTTGATTGGAGGCAGGTTTTCAGTTGGGCGCTCAGACTTCT
CGCTCTCTCGGTTGAGGCTGCTCCGGAGGTGGTGGAGCTGTCCGGTCCGCTTGCTCTATA
TGGGCTCTCGGTTCAACGGGTGTACACGGTCCCGGTTAAGAGGCAAAGAGGCGGCAATCT
CTGAGTCTCCAACCGAACGACGGCATCGTCGGATAGAACCACTGCCTCGTGCCGCCGGTG
TATGTCAAGGTCAGGTGGGTTTGTGAGTTTGTGCTCGTGATTCTTGGAGTGGTTTGTGTT
CTGTTGGTGTTTCGGAAGCTGTAGGACTTGTAGCATCAAGGTTTGAGGGCGCCTTTCTCT
CGGTCCCGTGGCAACTGGCTCGTCCTTTATGGTCCTTATCATTTTCCCTGGTTCGAGCTT
GTCTCGTTGGTCTCCGTCTCTAATTGCTCTGTTTCTAGTCTTCGGTCTGAGTTAAAGTTG
CTGTGTTTTTCATTATTTGTTTAGTTTAATTTTCTGCAAATCTGCTACTAGTTTATCTCT
TGTAAAGTCTGTCAAAAATCTAAAACTTGGTATAATAAATTTAACATTTTACCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL9053Contig1 998 2 2 U
GGTGACAAAAAGGAATCATAAAATCTTCATCTCCTATATAAACATCTCCACTCCTCAACG
ATTTATCTTTTAATTAAAAACGTTCCGAAGGAACAAAGATCACAAACAAATGTCTTTGGG
ATCGGTCCCTATCTTGGTCGCGATGGCCATGCAACTCCTCCTTATACCCACCTTTGTTTC
GTCTCTTAACATTACCAATGAGTATCTCCACCATGCATGCAACAACACCCAAGGGAAATA
CAAGCGGGGGAGTGAGTTCGAGAAAAATCTCAACATTGTCATCAAAAACATATCCACCTT
TGATCTGCGTAACGGTTACGCCCTCGACTCTAATATGAAGAGTCCCTATCTTGATATACC
TCCCAATACTGCTTTTGTCATGCTCCAATGCCGTGGTGACTCCTACGGGCCCAAGTGTCA
CTCTTGCCTCGCCGAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCTGGAAACAAAGGAGC
AACAATATGGTATGACCAATGTCTTTTTGATATTTCTACACACAATTCCGTTCAAGAGGA
CCAACCGAACAGAATCCACTATGATAATTATTTATGTATAAGCAATCAAAAATCCTTGAG
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AATCAACAAGACTAGCAGCGATGACGTCAGGGGGCGGGGACCACTGTACGCAACGGGGGA
GACGATGATTGGGACAAAGAAGTTTTATGGAATGCTGCAGTGTACGAACGAGTTATTTGC
GAGTGCTTGCTATGTGTGTCTAGAGTGGCTTGTCTTGGAACATCCATTTTGGGGCTATGA
AAAACAAGGAGCTAGATATTTGTGTAGAAGCTGTAATGCAAGGTTTGAGCTTTACCCTTT
TTTTAGAACTTAAGACTGTTTGATGGGAGCTTTTAATTTGCTTTATGTTTGATTAAGTGC
TATATCATGGAATAAAAATTGTTAACCTCTTTGTGGTT


BQ
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AF RR4AG61TF U 1
AF RR4AG61JQ C 653
BS 1 813 RR4AG61TF
BS 814 998 RR4AG61JQ

RD RR4AG61TF 813 0 0
GGTGACAAAAAGGAATCATAAAATCTTCATCTCCTATATAAACATCTCCACTCCTCAACG
ATTTATCTTTTAATTAAAAACGTTCCGAAGGAACAAAGATCACAAACAAATGTCTTTGGG
ATCGGTCCCTATCTTGGTCGCGATGGCCATGCAACTCCTCCTTATACCCACCTTTGTTTC
GTCTCTTAACATTACCAATGAGTATCTCCACCATGCATGCAACAACACCCAAGGGAAATA
CAAGCGGGGGAGTGAGTTCGAGAAAAATCTCAACATTGTCATCAAAAACATATCCACCTT
TGATCTGCGTAACGGTTACGCCCTCGACTCTAATATGAAGAGTCCCTATCTTGATATACC
TCCCAATACTGCTTTTGTCATGCTCCAATGCCGTGGTGACTCCTACGGGCCCAAGTGTCA
CTCTTGCCTCGCCGAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCTGGAAACAAAGGAGC
AACAATATGGTATGACCAATGTCTTTTTGATATTTCTACACACAATTCCGTTCAAGAGGA
CCAACCGAACAGAATCCACTATGATAATTATTTATGTATAAGCAATCAAAAATCCTTGAG
CGGCGATAAGAAGGTATTCCAAAAGAAGAGGCAGGTTTTCACCGATAAGCTATTATCTGT
AATCAACAAGACTAGCAGCGATGACGTCAGGGGGCGGGGACCACTGTACGCAACGGGGGA
GACGATGATTGGGACAAAGAAGTTTTATGGAATGCTGCAGTGTACGAACGAGTTATTTGC
GAGTGCTTGCTATGTGTGTCTAGAGTGGCTTGT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR4AG61JQ 346 0 0
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ACGGGGGAGACGATGATTGGGACAAAGAAGTTTTATGGAATGCTGCAGTGTACGAACGAG
TTATTTGCGAGTGCTTGCTATGTGTGTTTAGAGTGGCTTGTCTTGGAACATCCATTTTGG
GGCTATGAAAAACAAGGAGCTAGATATTTGTGTAGAAGCTGTAATGCAAGGTTTGAGCTT
TACCCTTTTTTTAGAACTTAAGACTGTTTGATGGGAGCTTTTAATTTGCTTTATGTTTGA
TTAAGTGCTATATCATGGAATAAAAATTGTTAACCTCTTTGTGGTT

QA 1 346 1 346
DS 



AS 1 2

CO CL9054Contig1 588 2 1 U
GGATTTGTAACTTGAGCAACAATCCCTTTTGTTTATCTTTAATCGTTTACCTAAACAAAT
ATCTCAAAACAAAAATCCGTAAAGAAGTTTATAATACAAAAATGGCCTCAAGTTTTATGA
GTTCGTCTTGGACATCTAAACAAAATAAAATCTTCGAGAGGGCTTTAGCCGTTTACGACA
AAGACACTCCCGACCGTTGGCAAAACGTGGCAAAGGCCGTCGGAAGTAAATCGGCAGAGG
AAGTCAAACGTCACTATGACATTCTCGTCGAAGATATTAATAACATCGAACAAGACTTAG
TCCCTTTGCCCAAATACAAGACCATCGATGTTGGAAGTAAATCACGAGGCATCAATGACT
TTGATCTGAGGTTAATGAAGAATATGAGAATCCAGTGAAGCACACATTGATATGAAGCAA
TACTGATATGCAAACATTCAGATGAATATATTCGCTTGCTGATGATTACTGATCATTGTC
TCGTTATCTTTTCACTCTGCTACATATTTATTTGTCTTTCTTTTTTTCACATCAAATAAA
CCAAATTCTGTATCTATTATGGTTTTGTTTTTATTGTTTGATTATTAT


BQ
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AF RR4GK10JQ C 1
AF RR4GK10TF U 1
BS 1 588 RR4GK10TF

RD RR4GK10JQ 588 0 0
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DS 

RD RR4GK10TF 588 0 0
GGATTTGTAACTTGAGCAACAATCCCTTTTGTTTATCTTTAATCGTTTACCTAAACAAAT
ATCTCAAAACAAAAATCCGTAAAGAAGTTTATAATACAAAAATGGCCTCAAGTTTTATGA
GTTCGTCTTGGACATCTAAACAAAATAAAATCTTCGAGAGGGCTTTAGCCGTTTACGACA
AAGACACTCCCGACCGTTGGCAAAACGTGGCAAAGGCCGTCGGAAGTAAATCGGCAGAGG
AAGTCAAACGTCACTATGACATTCTCGTCGAAGATATTAATAACATCGAACAAGACTTAG
TCCCTTTGCCCAAATACAAGACCATCGATGTTGGAAGTAAATCACGAGGCATCAATGACT
TTGATCTGAGGTTAATGAAGAATATGAGAATCCAGTGAAGCACACATTGATATGAAGCAA
TACTGATATGCAAACATTCAGATGAATATATTCGCTTGCTGATGATTACTGATCATTGTC
TCGTTATCTTTTCACTCTGCTACATATTTATTTGTCTTTCTTTTTTTCACATCAAATAAA
CCAAATTCTGTATCTATTATGGTTTTGTTTTTATTGTTTGATTATTAT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

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TGGGGAGCCCGATTTAGGGTTTCATCCATTAATCCATCGATTCACCATCTCATCTCCCCC
TCAAAGCTCCAACACTTTCTCCGTTTGCAGGTTTTAAAGTTAAGACCATGCCTAAAGAGA
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TCTGTATGGAACATCCTCACAACGGAATCCTTCTCGTCTGTTCTTCCTATGATAATGGCT
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AAGCTTCTAAACAGACAGAAGGTGCAGCAGTGGCTTCAGCTTCTGAGGTGACAGTTGTGA
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GGATCATGTCGTTTGATGATGGTGGTTGGCTTACAGTGTTCTTCCTCATCCGCGTGTTTA
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GGTCACATATAGGTGTGAGGAGAAGATCTTCAAGGCTTTGGGGAGAGAGCTATGAAGGTG
GTGATACAGGAACATCAGCAGCTAGAGATGGGGAGAACAATAATCAGTCTTCTGATGGAC
AAGAGTCTGGAACTCAAAGACGCCGTGTCAGAAGAAGATATTACATTGAGGATGATGATG
ATGATGATGAAGAGGCGTAATGGCTCTCTCTCAAAACATACAATTTGGTTTTTTAACTCT
ATGAAACAAAAATATTGGGGGAAACTTTGTATTAATAACCCCCAACTCGTTAAAACCTAT
TCTGTAAAATTTCTTTGCAGATTGAAAAATGTTTCTATTGAGAAACAAAATGCT


BQ
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AF RR4EL38TF U 1
AF RR4EL38JQ C 448
BS 1 736 RR4EL38TF
BS 737 737 RR4EL38JQ
BS 738 799 RR4EL38TF
BS 800 1314 RR4EL38JQ

RD RR4EL38TF 799 0 0
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TGGGGAGCCCGATTTAGGGTTTCATCCATTAATCCATCGATTCACCATCTCATCTCCCCC
TCAAAGCTCCAACACTTTCTCCGTTTGCAGGTTTTAAAGTTAAGACCATGCCTAAAGAGA
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GCCGCGCTCTGAAGCCGAGTGAGAAGCAAGTCAAGGAATGGGAAGAAGCTAGATGTCCTG
TCTGTATGGAACATCCTCACAACGGAATCCTTCTCGTCTGTTCTTCCTATGATAATGGCT
GTAGGCCTTACATGTGTGACACTAGCCACCGCCATTCCAACTGTTTCGATCAGTACCGCA
AAGCTTCTAAACAGACAGAAGGTGCAGCAGTGGCTTCAGCTTCTGAGGTGACAGTTGTGA
ATCCGAGAGAGGATGAAGGTGTTGTGGAGACAGATGCAGGCAAACCGAAGCTTACTTGCC
CGTTATGCCGTGGAGATATAAAAGAATGGGTAGTTGCTGAGCCTGCTCGATGTTTCATGA
ACGCGAAACATAGAAGCTGTTCTTCCGAAACTTGTGAGTTCAGCGGAACCTACTCTGATT
TGAGAAAACACGCGAGGCTGCTGCATCCGGGAGTGAGGCCATCAGAAGCTGATCCGGAGA
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TACAGTCTTCTTTTGGAGT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR4EL38JQ 867 0 0
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TCTGAGGTGACAGTTGTGA*TCCGAGAGAGGATGAAGGTGTTGTGGAGACAGATGCAGGC
AAACCGAAGCTTACTTGCCCGTTATGCCGTGGAGATATAAAAGAATGGGTAGTTGCTGAG
CCTGCTCGATGTTTCATGAACGCGAAACATAGAAGCTGTTCTTCCGAAACTTGTGAGTTC
AGCGGAACCTACTCTGATTTGAGAAAACACGCGAGGCTGCTGCATCCGGGAGTGAGGCCA
TCAGAAGCTGATCCGGAGAGGCAGAGAAGCTGGAGGAGGCTAGAAAGGCAGAGAGACTTG
GGTGATTTGCTTAGCACACTACAGTCTTCTTTTGGAGTAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAGC
AGCAGCAGCAACGAAGATGGGATCATGTCGTTTGATGATGGTGGTTGGCTTACAGTGTTC
TTCCTCATCCGCGTGTTTAGGCCAGAGTCAAGTGGGGTAAGGAGTAGTAGTAGCAGCTGG
TCAGGTACGTCTAGAGCTAGGTCACATATAGGTGTGAGGAGAAGATCTTCAAGGCTTTGG
GGAGAGAGCTATGAAGGTGGTGATACAGGAACATCAGCAGCTAGAGATGGGGAGAACAAT
AATCAGTCTTCTGATGGACAAGAGTCTGGAACTCAAAGACGCCGTGTCAGAAGAAGATAT
TACATTGAGGATGATGATGATGATGATGAAGAGGCGTAATGGCTCTCTCTCAAAACATAC
AATTTGGTTTTTTAACTCTATGAAACAAAAATATTGGGGGAAACTTTGTATTAATAACCC
CCAACTCGTTAAAACCTATTCTGTAAAATTTCTTTGCAGATTGAAAAATGTTTCTATTGA
GAAACAAAATGCT

QA 15 867 15 867
DS 



AS 1 2

CO CL9056Contig1 760 2 2 U
GAGTTTCGTTGGTGGGATCAAATCGACGAGTATCTTCTGATGGGAGCGGTTCCATTTCGT
AAGGACGTTCCGCGACTAAAACAACTAGGCGTTGGTGGCGTAATCACTCTTAATGAACCT
TTCGAGACTTTGGTTCCATCTTCTTTGTACAATGCTTATGAAATGGAACATTTGGTGATA
CCAACACGAGATTACCTCTTTGCGCCTTCCATTGCAGACATAACCCAAGCTGTTGACTTC
ATTCACAAGAATGCTTTGCTCGGTAAAACCACTTACGTCCATTGCAAAGCTGGCCGTGGA
AGAAGTACTACCGTTGTTCTCTGCTATCTGATTGAGCACAAGAGTATGACCGTAGCTGCA
GCTTTTGAACATGTCCGCTTAATAAGACCGCGGGTTTTGCTTCATCCTTCGCAGAGGAAG
GTTGTTGAGGAATTTAAAAGGCTACAAACTCTAGAAACCTCTAATGCCGTAAGTTAAATC
AAAGGCAGAGATTATAAGCTCTCAGCATTTCCAGCAGCTATGGCCATTGTTTGCAAGACT
TCTCTGCTTCCTTTTGGTTCGGTTAAAATCTCCGATTTTGACCATCTGACTCGGTTTGGC
TCCTGCGAAGTTGTGACCGGTCTAATGGTTAATTTATGTATTCATTGTCTCAATTGTCCC
CAAGAAAAAAAAAAAGACAGTTAGATGATTGACCTCTGGTTGATTAACAATTGTTTGTAA
TATAGTTCTACTTACGATATATGTTAATATCCTTCATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BY42TF U 1
AF RR4BY42JQ C 144
BS 1 657 RR4BY42TF
BS 658 760 RR4BY42JQ

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CCAACACGAGATTACCTCTTTGCGCCTTCCATTGCAGACATAACCCAAGCTGTTGACTTC
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AGAAGTACTACCGTTGTTCTCTGCTATCTGATTGAGCACAAGAGTATGACCGTAGCTGCA
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GTTGTTGAGGAATTTAAAAGGCTACAAACTCTAGAAACCTCTAATGCCGTAAGTTAAATC
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TCTCTGCTTCCTTTTGGTTCGGTTAAAATCTCCGATTTTGACCATCTGACTCGGTTTGGC
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DS 

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GCCTTCCATTGCAGACATAACCCAAGCTGTTGACTTCATTCACAAGAATGCTTTGCTCGG
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CTATCTGATTGAGCACAAGAGTATGACCGTAGCTGCAGCTTTTGAACATGTCCGCTTAAT
AAGACCGCGGGTTTTGCTTCATCCTTCGCAGAGGAAGGTTGTTGAGGAATTTAAAAGGCT
ACAAACTCTAGAAACCTCTAATGCCGTAAGTTAAATCAAAGGCAGAGATTATAAGCTCTC
AGCATTTCCAGCAGCTATGGCCATTGTTTGCAAGACTTTTCTGCTTCCTTTTGGTTCGGT
TAAAATCTCCGATTTTGACCATCTGACTCGGTTTGGCTCCTGCGAAGTTGTGACCGGTCT
AATGGTTAATTTATGTATTCATTGTCTCAATTGTCCCCAAGAAAAAAAAAAAGACAGTTA
GATGATTGACCTCTGGTTGATTAACAATTGTTTGTAATATAGTTCTACTTACGATATATG
TTAATATCCTTCATTTC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

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AAATAAAAAATTATTGGAACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACC
CACAAACTCATCGTCCGGTTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGT
CGCAATTATCAACCACTGTTATTGTTTCACCTCAAAACGATGCCGTTGAATACGCTTTTA
TAGTCAAACCGAAGACGGAAAATTCCTCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAA
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TTTTTGAATATCTATAGACATTGTTTTACTTCAGTTCTTGGCATTTTGTTTTGGTTCTGT
TACATGTTATTATTACCTGTTGAAGTACAC


BQ
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AF RR4GN51TF U 1
AF RR4GN51JQ C 90
BS 1 686 RR4GN51TF
BS 687 930 RR4GN51JQ

RD RR4GN51TF 686 0 0
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CGGATCTCAAACGTGGAAATTTTTCTGATGAAGAAGACCAAGTCATCATCAAGCTACATA
GCTTACTCGGCAACAAATGGTCATTGATCGCTGGAAGATTACCAGGAAGAACAGATAATG
AAATAAAAAATTATTGGAACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACC
CACAAACTCATCGTCCGGTTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGT
CGCAATTATCAACCACTGTTATTGTTTCACCTCAAAACGATGCCGTTGAATACGCTTTTA
TAGTCAAACCGAAGACGGAAAATTCCTCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAA
CGGACGAGGATCTCCGACAAAACGGAGATAGTTATTACAGAGATCATTCACGAGATATGG
AGCTGAATCTTGACCTAACTCTCGGG

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DS 

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GCTGGAAGATTACCAGGAAGAACAGATAATGAAATAAAAAATTATTGGAACACTCATATT
AAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACCCACAAACTCATCGTCCGGTTAAAGATAAC
GTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGTCGCAATTATCAACCACTGTTATTGTTTCA
CCTCAAAACGATGCCGTTGAATACGCTTTTATAGTCAAACCGAAGACGGAAAATTCCTCC
GATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAACGGACGAGGATCTCCGACAAAACGGAGAT
AGTTATTACAGAGATCATTCAGGAGATATGGAGCTGAATCTTGACCTAACTCTCGGGTCC
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GCGGCGCGTTTGTCACTCTAGTAAGAATTACGAAACAGCAAAAATCTCCCAAAAATGGGA
TTTTTTTAGATTTTTCTTCTTGTGTGGGTCCTTTTTGAATATCTATAGACATTGTTTTAC
TTCAGTTCTTGGCATTTTGTTTTGGTTCTGTTACATGTTATTATTACCTGTTGAAGTACA
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

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ATATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATCCAGAGTTGTTTTTGATACGGGAAGTGCCG
ATCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGTCCATCCGCATCAAAAGTTCAATC
CCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGGAGTTTTGGATCTTAAATATGAAT
TAATATCTAAACCTCTTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCCTTGCATGATTTTAGTTTCTTG
TATCTTACCATCTTTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACATGACGAT
ATATATTCGTAGTGTAAAGAATGTATGATCCAATGATGTATAATTGTATTGTCCTTTCTT
TTATAATGTCACCTGACAAACGCGTTTATCAATAAATGCATGTATATTAACGG


BQ
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AF RR4F479JQ C 1
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ATATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATCCAGAGTTGTTTTTGATACGGGAAGTGCCG
ATCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGTCCATCCGCATCAAAAGTTCAATC
CCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGGAGTTTTGGATCTTAAATATGAAT
TAATATCTAAACCTCTTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCCTTGCATGATTTTAGTTTCTTG
TATCTTACCATCTTTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACATGACGAT
ATATATTCGTAGTGTAAAGAATGTATGATCCAATGATGTATAATTGTATTGTCCTTTCTT
TTATAATGTCACCTGACAAACGCGTTTATCAATAAATGCATGTATATTAACGG

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GD59TF C 1
AF RR4GD59JQ U 71
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BS 71 659 RR4GD59JQ

RD RR4GD59TF 659 0 0
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ACGGGAAGTGATACTTATACCCAGTGCAATGCATAATAACATCAACCCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GP07TF U 1
AF RR4GP07JQ C 259
BS 1 608 RR4GP07TF
BS 609 609 RR4GP07JQ
BS 610 679 RR4GP07TF
BS 680 952 RR4GP07JQ

RD RR4GP07TF 679 0 0
GACATCATCCATTAACCGCCGCTCAACAGATATAAGCCATCATGTCTGAGTGGTTCACCC
AACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGTACT
CTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGTCCC
TCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCGAAC
CCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTGAGA
TCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGTCTTCGGAGGCAA
AGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGATCACTCACCCCGA
ATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACGACGGGGC
AGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTTTAAACAGAGCTGGAAAAAAGAATGCACCTGC
AGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCGCACCCACACGGTTCGAATTGTCCAG
CCACAAGG*TGCCGGATGGGAAGGTTATAACTTTTCCGGTGAGATAAACTCCAAGGACAA
AATCAAGGCTACAACCACA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4GP07JQ 694 0 0
TACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTGAGATCTACCATCACGAGCCCA
AAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGTCTTCGGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCA
CTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGATCACTCACCCCGAATATGCTCCAAAGGGCGA
GAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACGACGGGGCAGGAGTCACCTTCACGTG
GAAATGGACTTTAAACAGAGCTGGAAAAAAGAATGCACCTGCAGCCACGTATGGTCGTAT
TAAACTGATTTCCGGCGCACCCACACGGTTCGAATTGTCCAGCCACAAGGGTGCCGGATG
GGAAGGTTATAACTTTTCCGGTGAGATAAACTCCAAGGACAAAATCAAGGCTACAACCAC
AGTCGGTGGTAGAAACATTCCACCGATTGACTTCACAAGGTTGGCCGGAACTTGAAGTAT
ACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGACCCTCTACCACTAAATAATTTC
TCGTTGTTTTTTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAATGGATGTTTC
CCTTGTTTATTTGGATTTAGCTTTATTATCTTTAATAGTTTTGTAATATCATTATATTAA
TAAAAGTCTGTATCCTCTTGTGGAGGTCTGACCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL9061Contig1 847 2 4 U
GGACTCCTCAACACACACTCGAATCTGTTTCTCCTTCGACTCCTCCTCTGTGACCGTCTC
CGCCGCTCAAAATCTCCCCCTAACTCGCTAACTACACCGTCTCCGCTTTTGGCTTGTGGA
ATCAAGAGCATGGCCAAGTACTATGACATTGACGACATACTTACAGAGGAAGAGTTTGCT
CCTGTGTTGTTCCATAAGCCAGCAAATGGAGTGACTATTGATCCAAGTGCTGAGACAAAC
TCTGTTGAGCAAGGCGCTAAAGTGGAGTTACCCTTCTGGCTTGCTCACGAGTTGCATTTG
AGACAAGCTGTCTCCATTAACCTTCCTGCCTGTTTCGACCAGAAGACGAGGTTGGAGATA
CAGGCTGATGCAGCATGTGTGGATCTTAGATCACGATGTCCTTACTTCTACGAGTTGGGT
TGCAAGTTACAGCCCTTAGTTGCAGATAGAACGATTGGGATCTTGCTGTCGACTGCGTTT
GAGATCAGATACAAGGAGAGGCTGACAAAAGTTTTCACCGCAACTCATCTAACAGCTTCC
AAGTTCTTGCCATTCTTGACTATTGAAGAAGCAAACTTGTACGAAGCAGCTAACTTGTCT
ATGACAGCCTTCAAGAAATGGAGAACAGGAAGTCCTCGTTTCCAGAGAGCTTCGATACTC
GGAAGAAAACGCAAGGAATCTTGATTAACTTTGACGACCCTAAAAACGCTTTATTGCTTC
ATCATCTTTGTTTGTATCTTTATTGCCCTGAGTTTGGTCTGTATCTCCTTAACACGTACA
TGAAAATCATATTTCACTGGTGGTGGACAAGAATGCATATCAGAATCTGTGGAGGTATTT
TCATCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FC16TF U 1
AF RR4FC16JQ C 50
BS 1 628 RR4FC16TF
BS 629 630 RR4FC16JQ
BS 631 663 RR4FC16TF
BS 664 847 RR4FC16JQ

RD RR4FC16TF 671 0 0
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CGCCGCTCAAAATCTCCCCCTAACTCGCTAACTACACCGTCTCCGCTTTTGGCTTGTGGA
ATCAAGAGCATGGCCAAGTACTATGACATTGACGACATACTTACAGAGGAAGAGTTTGCT
CCTGTGTTGTTCCATAAGCCAGCAAATGGAGTGACTATTGATCCAAGTGCTGAGACAAAC
TCTGTTGAGCAAGGCGCTAAAGTGGAGTTACCCTTCTGGCTTGCTCACGAGTTGCATTTG
AGACAAGCTGTCTCCATTAACCTTCCTGCCTGTTTCGACCAGAAGACGAGGTTGGAGATA
CAGGCTGATGCAGCATGTGTGGATCTTAGATCACGATGTCCTTACTTCTACGAGTTGGGT
TGCAAGTTACAGCCCTTAGTTGCAGATAGAACGATTGGGATCTTGCTGTCGACTGCGTTT
GAGATCAGATACAAGGAGAGGCTGACAAAAGTTTTCACCGCAACTCATCTAACAGCTTCC
AAGTTCTTGCCATTCTTGACTATTGAAGAAGCAAACTTGTACGAAGCAGCTAACTTGTCT
ATGACAGCCTTCAAGAAATGGAGAACAG**AGTCCTCGTTTCCAGAGAGCTTCGATACTC
GGA
GAAACGCA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR4FC16JQ 798 0 0
TGTGA
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TGTGGAATCAAGAGCATGGCCAAGTACTATGACATTGACGACATACTTACAGAGGAAGAG
TTTGCTCCTGTGTTGTTCCATAAGCCAGCAAATGGAGTGACTATTGATCCAAGTGCTGAG
ACAAACTCTGTTGAGCAAGGCGCTAAAGTGGAGTTACCCTTCTGGCTTGCTCACGAGTTG
CATTTGAGACAAGCTGTCTCCATTAACCTTCCTGCCTGTTTCGACCAGAAGACGAGGTTG
GAGATACAGGCTGATGCAGCATGTGTGGATCTTAGATCACGATGTCCTTACTTTTACGAG
TTGGGTTGCAAGTTACAGCCCTTAGTTGCAGATAGAACGATTGGGATCTTGCTGTCGACT
GCGTTTGAGATCAGATACAAGGAGAGGCTGACAAAAGTTTTCACCGCAACTCATCTAACA
GCTTCCAAGTTCTTGCCATTCTTGACTATTGAAGAAGCAAACTTGTACGAAGCAGCTAAC
TTGTCTATGACAGCCTTCAAGAAATGGAGAACAGGAGGTCCTCGTTTCCAGAGAGCTTCG
ATACTCGGAAGAAAACGCAAGGAATCTTGATTAACTTTGACGACCCTAAAAACGCTTTAT
TGCTTCATCATCTTTGTTTGTATCTTTATTGCCCTGAGTTTGGTCTGTATCTCCTTAACA
CGTACATGAAAATCATATTTCACTGGTGGTGGACAAGAATGCATATCAGAATCTGTGGAG
GTATTTTCATCGG

QA 6 798 6 798
DS 



AS 1 2

CO CL9062Contig1 589 2 1 U
GGACCCAACTTTCTCTCCTCTTAACTCTTCGTTCCTCTATCTCTCAATCAGTCTCCGTGA
ATCTAACCTATCTCAATAACCAACACCAACACCTCCGATACCATTACCTCAATCTCCACC
TCCTCGTTCTCCACTTCTCTATCTGATTACTCTTTTTTATTATTTTCTATATGCTCAATG
TTTATTTCTTTTTAGATGCAGATTTAAAACAAGAAGTTATCAGGAAACAGATCGGAAGGG
AGGGAGTAGACGAAACTTGACAGCAGATGAGATAGAAGAGGCTTGATGGCGGAGGAGGCA
TTAGAAGCCTCACGGCGGAGGAGGTGTCGCGAGCATATCAGTTCGTCGCGTCAGCCGTAA
CTTTTAGTGAAACAAAGTTTGAACAGAAAAGCTCTCCAGAGCAACAAAATGGGAAAAGAT
TTCTGTTAGCTTATCATTAAAGCAGTCAAATGACTATATACACTTGTTGTAACAACCTGA
CCCGGGTATCAATATACAAAGACTAAACCAAATATACATAACCGACATTCTAATATATCA
ATATTCCCCCTCAAGATGGAGCATATATGTTAATAATGTTCATCTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4D550JQ C 1
AF RR4D550TF U 1
BS 1 589 RR4D550TF

RD RR4D550JQ 589 0 0
GGACCCAACTTTCTCTCCTCTTAACTCTTCGTTCCTCTATCTCTCAATCAGTCTCCGTGA
ATCTAACCTATCTCAATAACCAACACCAACACCTCCGATACCATTACCTCAATCTCCACC
TCCTCGTTCTCCACTTCTCTATCTGATTACTCTTTTTTATTATTTTCTATATGCTCAATG
TTTATTTCTTTTTAGATGCAGATTTAAAACAAGAAGTTATCAGGAAACAGATCGGAAGGG
AGGGAGTAGACGAAACTTGACAGCAGATGAGATAGAAGAGGCTTGATGGCGGAGGAGGCA
TTAGAAGCCTCACGGCGGAGGAGGTGTCGCGAGCATATCAGTTCGTCGCGTCAGCCGTAA
CTTTTAGTGAAACAAAGTTTGAACAGAAAAGCTCTCCAGAGCAACAAAATGGGAAAAGAT
TTCTGTTAGCTTATCATTAAAGCAGTCAAATGACTATATACACTTGTTGTAACAACCTGA
CCCGGGTATCAATATACAAAGACTAAACCAAATATACATAACCGACATTCTAATATATCA
ATATTCCCCCTCAAGATGGAGCATATATGTTAATAATGTTCATCTTGCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR4D550TF 589 0 0
GGACCCAACTTTCTCTCCTCTTAACTCTTCGTTCCTCTATCTCTCAATCAGTCTCCGTGA
ATCTAACCTATCTCAATAACCAACACCAACACCTCCGATACCATTACCTCAATCTCCACC
TCCTCGTTCTCCACTTCTCTATCTGATTACTCTTTTTTATTATTTTCTATATGCTCAATG
TTTATTTCTTTTTAGATGCAGATTTAAAACAAGAAGTTATCAGGAAACAGATCGGAAGGG
AGGGAGTAGACGAAACTTGACAGCAGATGAGATAGAAGAGGCTTGATGGCGGAGGAGGCA
TTAGAAGCCTCACGGCGGAGGAGGTGTCGCGAGCATATCAGTTCGTCGCGTCAGCCGTAA
CTTTTAGTGAAACAAAGTTTGAACAGAAAAGCTCTCCAGAGCAACAAAATGGGAAAAGAT
TTCTGTTAGCTTATCATTAAAGCAGTCAAATGACTATATACACTTGTTGTAACAACCTGA
CCCGGGTATCAATATACAAAGACTAAACCAAATATACATAACCGACATTCTAATATATCA
ATATTCCCCCTCAAGATGGAGCATATATGTTAATAATGTTCATCTTGCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL9063Contig1 725 2 7 U
GAAAGACAACATACAACTAAAAGGAAATACTCTTGAAATTTGATAAATGGCACCAGCTCA
AAACTCAATCAGTTCGAAACACGTGGCGGTGATCGGAGCCGGAGCATCCGGTTTAATAGC
GGCCAGAGAGCTCCATCGCGAAGGTCACACCGTCGTCATTTTTGAGCGGGAGAAACAAGT
GGGAGGTCTCTGGATTTACTCACCTACAGCTGAGTCCGACCCGCTTGGTCTTGACCCGAG
GAGACCTATAGTTCACTCGAGTGTCTACGAGTCTCTCCGAACCAACCTCCCGAGAGAGTG
TATGGGTTTCAGGGATCTTCCGTTCGTGCCATGTGTTGATGACTTGTCAAGAGACTCGAG
AAGGTATCCGTGCCACAGGGAAGTTCTTGCGTACCTTCAAGACTTTGCGAGAGAGTTTAA
AATAGAGGAGATGGTCCGGTTCGAGACAGAGGTGGTTAGGGTTGAGCCGGTTGAGGGGAA
ATGGAGGGTCCGGTCCAAAAACTCCAGTGATCTCTCGGACGATGAGATCTTTGACGCCGT
CGTTGTTTGCAGTGGGCATTATACCGAACCTTACGTTGCTCGTGTTCCTGGGATAAAATC
ATGGCCAGGAAAGCAGATCCATAGCCACAACTACAGAGTTCCTGGTCCATTCAAAAATGA
GGTGGTGGTGGTCATCGGTAATTTTGCGAGCGGTTCCGATATTAGTAGAGACGTAGCTAA
GTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4GI71TF U 17
AF RR4DZ52TF U 1
BS 1 209 RR4DZ52TF
BS 210 210 RR4GI71TF
BS 211 656 RR4DZ52TF
BS 657 657 RR4GI71TF
BS 658 702 RR4DZ52TF
BS 703 703 RR4GI71TF
BS 704 725 RR4DZ52TF

RD RR4GI71TF 699 0 0
GG
AAAAGGAAATACTCTTGAAATTTGATAAATGGCACCAGCTCAAAACTCAATCAGTTCGAA
ACACGTGGCGGTGATCGGAGCCGGAGCATCCGGTTTAATAGCGGCCAGAGAGCTCCATCG
CGAAGGTCACACCGTCGTCATTTTTGAGCGGGAGAAACAAGTGGGAGGTCTCTGGATTTA
CTCACCTACAGCTGAGTCCGACCCGCTTGGTCTTGACCCGAGGAGACCTATAGTTCACTC
GAGTGTCTACGGGTCTCTCCGAACCAACCTCCCGAGAGAGTGTATGGGTTTCAGGGATTT
TCCGTTCGTGCCATGTGTTGATGACTTGTCAAGAGACTCGAGAAGGTATCCGTGCCACAG
GGAAGTTCTTGCGTACCTTCAAGACTTTGCGAGAGAGTTTAAAATAGAGGAGATGGTCCG
GTTCGAGACAGAGGTGGTTAGGGTTGAGCCGGTTGAGGGGAAATGGAGGGTCCGGTCCAA
AAACTCCAGTGATCTCTCGGACGATGAGATCTTTGACGCCGTCGTTGTTTGCAGTGGGCA
TTATACCGAACCTTACGTTGCTCGTGTTCCTGGGATAAAATCATGGCCAGGAAAGCAGAT
CCATAGCCACAACTACAGAGTTCCTGGTCCATTCAAAAATGAGGTGGTGGTGGTCATCGG
TAATTTTGCGAGCGGTTCCGATATTAGTAGAGACGTA

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR4DZ52TF 725 0 0
GAAAGACAACATACAACTAAAAGGAAATACTCTTGAAATTTGATAAATGGCACCAGCTCA
AAACTCAATCAGTTCGAAACACGTGGCGGTGATCGGAGCCGGAGCATCCGGTTTAATAGC
GGCCAGAGAGCTCCATCGCGAAGGTCACACCGTCGTCATTTTTGAGCGGGAGAAACAAGT
GGGAGGTCTCTGGATTTACTCACCTACAGTTGAGTCCGACCCGCTTGGTCTTGACCCGAG
GAGACCTATAGTTCACTCGAGTGTCTACGAGTCTCTCCGAACCAACCTCCCGAGAGAGTG
TATGGGTTTCAGGGATCTTCCGTTCGTGCCATGTGTTGATGACTTGTCAAGAGACTCGAG
AAGGTATCCGTGCCACAGGGAAGTTCTTGCGTACCTTCAAGACTTTGCGAGAGAGTTTAA
AATAGAGGAGATGGTCCGGTTCGAGACAGAGGTGGTTAGGGTTGAGCCGGTTGAGGGGAA
ATGGAGGGTCCGGTCCAAAAACTCCAGTGATCTCTCGGACGATGAGATCTTTGACGCCGT
CGTTGTTTGCAGTGGGCATTATACCGAACCTTACGTTGCTCGTGTTCCTGGGATAAAATC
ATGGCCAGGAAAGCAGATCCATAGCCACAACTACAGAGTTCCTGGTCCATTCAAAA*TGA
GGTGGTGGTGGTCATCGGTAATTTTGCGAGCGGTTCCGATAT*AGTAGAGACGTAGCTAA
GTCGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL9064Contig1 1182 2 12 U
GGGAAAGGGGAAGACGTGATCGGGAGGTGAAAGAATCTCACTTTCTCCAGTAATCTCCTC
CTAAACCAAACCACTCAACGCATCTATTCAGCCGAATACGGTGGATCTTCGCCGGAGTAT
ATCCCGGGGAAATCGGTTTCATATGGAGAGGGCCGATGAAGGAGCAGGCGAGCCTTCTGG
AGCCGCCATAAGATCGAGGCTCAGTAACAGAGCGGATCCTTTCCTTGTTGTTTGCAGGTG
TTTCAGCTTCATTACCTCTCTTATCGCCATCCTCTGCGTCGTCGTTAACGTTCTCGCCGC
CATTCGCTCCTTCCGAGATAGCCACGATCTGTTCGATGGAATATTCCGGTGCTACGCTGT
GGTGATTGCTTGTTTCGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTC
CAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGTGAGAGGAATGCTTCAGATTTTGTAAGTTACCATCCT
CGAGTGGTTCTTTTATAAATGAAAGTGTTAGGCTTCGGCCAATTCAAGGCCACGTGTCAT
GATTTTGTGTGTCATCATCAGCTTTTCTTGACCTGAAACTTACAATTCCAAGATGCTGCT
GATGAGAGAATTTGAAACCATGTCGTGGTTGTTTTAAAAAAAAACATTTATATGTTTATA
TTTGTTTGATTTGGTCGTTTCAGTGTTGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACTACCTG
GCTCAGAAGAAGGATCTCCTGCTTCTACAGAATATCGCTAGCTACATGCTCCTTTCTTGT
GGTCTTATCTATTTCATCTCAGGAGTTCTGTGCATTGGCTTTTTGAAGCGTGCTCGACAG
CAGAAGGAAATTTCACGAGAACAAGCCGTCAAGGATCTTGAGGAGATAGACCGACGCAGG
GAAGAGCTGGAACAATTGCTCCTGCAGCATCGCAGTAGAGACGACGTGTGATTAACAAGT
ACCAGCTTCAGCTTCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCTTGTTTCTTTCTTCTTTTTTTT
TTTCTTTTTGTAGTAAAGGATTGTGTGAGCTCTCTCTCTGTTTCTGCATCCCTCCCACTT
TGATAAAATCTGTTTCTTTTTTTCTGTCTGTTGAAACGAACCTTTGATACTTAACATGTA
AGAGACGAGCAGTATTGAATATGAATTTTGACGTAGATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BZ86TF U 1
AF RR4BZ86JQ C 416
BS 1 643 RR4BZ86TF
BS 644 644 RR4BZ86JQ
BS 645 699 RR4BZ86TF
BS 700 700 RR4BZ86JQ
BS 701 727 RR4BZ86TF
BS 728 728 RR4BZ86JQ
BS 729 732 RR4BZ86TF
BS 733 733 RR4BZ86JQ
BS 734 751 RR4BZ86TF
BS 752 752 RR4BZ86JQ
BS 753 768 RR4BZ86TF
BS 769 1182 RR4BZ86JQ

RD RR4BZ86TF 768 0 0
GGGAAAGGGGAAGACGTGATCGGGAGGTGAAAGAATCTCACTTTCTCCAGTAATCTCCTC
CTAAACCAAACCACTCAACGCATCTATTCAGCCGAATACGGTGGATCTTCGCCGGAGTAT
ATCCCGGGGAAATCGGTTTCATATGGAGAGGGCCGATGAAGGAGCAGGCGAGCCTTCTGG
AGCCGCCATAAGATCGAGGCTCAGTAACAGAGCGGATCCTTTCCTTGTTGTTTGCAGGTG
TTTCAGCTTCATTACCTCTCTTATCGCCATCCTCTGCGTCGTCGTTAACGTTCTCGCCGC
CATTCGCTCCTTCCGAGATAGCCACGATCTGTTCGATGGAATATTCCGGTGCTACGCTGT
GGTGATTGCTTGTTTCGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTC
CAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGTGAGAGGAATGCTTCAGATTTTGTAAGTTACCATCCT
CGAGTGGTTCTTTTATAAATGAAAGTGTTAGGCTTCGGCCAATTCAAGGCCACGTGTCAT
GATTTTGTGTGTCATCATCAGCTTTTCTTGACCTGAAACTTACAATTCCAAGATGCTGCT
GATGAGAGAATTTGAAACCATGTCGTGGTTGTTTTAAAAAAAA*CATTTATATGTTTATA
TTTGTTTGATTTGGTCGTTTCAGTGTTGCTGTGATGACA*GAGCTTTCCCTGACTACCTG
GCTCAGA*GAAG*ATCTCCTGCTTCTACAGA*TATCGCTAGCTACATG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4BZ86JQ 767 0 0
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ATCCTCGAGTGGTTCTTTTATAAATGAAAGTGTTAGGCTTCGGCCAATTCAAGGCCACGT
GTCATGATTTTGTGTGTCATCATCAGCTTTTCTTGACCTGAAACTTACAATTCCAAGATG
CTGCTGATGAGAGAATTTGAAACCATGTCGTGGTTGTTTTAAAAAAAAACATTTATATGT
TTATATTTGTTTGATTTGGTCGTTTCAGTGTTGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACT
ACCTGGCTCAGAAGAAGGATCTCCTGCTTCTACAGAATATCGCTAGCTACATGCTCCTTT
CTTGTGGTCTTATCTATTTCATCTCAGGAGTTCTGTGCATTGGCTTTTTGAAGCGTGCTC
GACAGCAGAAGGAAATTTCACGAGAACAAGCCGTCAAGGATCTTGAGGAGATAGACCGAC
GCAGGGAAGAGCTGGAACAATTGCTCCTGCAGCATCGCAGTAGAGACGACGTGTGATTAA
CAAGTACCAGCTTCAGCTTCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCTTGTTTCTTTCTTCTTT
TTTTTTTTCTTTTTGTAGTAAAGGATTGTGTGAGCTCTCTCTCTGTTTCTGCATCCCTCC
CACTTTGATAAAATCTGTTTCTTTTTTTCTGTCTGTTGAAACGAACCTTTGATACTTAAC
ATGTAAGAGACGAGCAGTATTGAATATGAATTTTGACGTAGATTATT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL9065Contig1 730 2 3 U
TTTTCTTTCTTAAATCGTTATTATACTAAAAGTAAACTTGAAAATATCACGAAAAAAACT
TGCAAATAAACAATTATTTAAGCATAGAAGGCAAAGAAATTAGCAAACTCACCAATTCTT
TTCCCCTTTGAATAATAATTGCTAAATGAAAAAAGATTCAAATATTTGTATTATATCTTC
ATCTTCTCTTTTCTCAAATCAATAATCACATCTTCTCCCTCTTCACCGGAACCCTACCGT
CGGTACCAGCTAGCATTGCGTACTTATCCTTTCTTGTGAAGTTGGTGCACTCAAACCCTA
AGGTTCCTGCCAAAACCCTCTGTATGTAATTCGCCACCTCTATTGGGGACTTGCCTCCTT
TACACGTCAGCTCAGCCGGGAGCTGTTTAAGGAACGTGATCTCGAACGTTGGAACAGGGT
TCATGAACGCGAAGTAAGGATCAAGAAACTTGTAGCCACGTGTGGTTGTACCATTAAACA
CGCTTTGTTTCGTGTTGATCGCCACGGGAACGATCCTGTCCGTAAGCTCGGCAAAGAGTG
CACTAAACCGGAGAAGGAAAGGTTCACGGCACGTGGTTCCCTCGGGACATATCACGAGGT
CACCTTCCTCCAAGAGACGCTTGATGTTCGCTGCGTCTTTCTCGCGCTGACGAGTCAACG
CAACGGCTTTTATTGGAGAGATTAGCTCAGAGAATTTGCTGATACTGTAAGTGACGCAGC
TAATTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL06JQ U 12
AF RR4DL06TF C 1
BS 1 11 RR4DL06TF
BS 12 687 RR4DL06JQ
BS 688 730 RR4DL06TF

RD RR4DL06JQ 676 0 0
AAATCGTTATTATACTAAAAGTAAACTTGAAAATATCACGAAAAAAACTTGCAAATAAAC
AATTATTTAAGCATAGAAGGCAAAGAAATTAGCAAACTCACCAATTCTTTTCCCCTTTGA
ATAATAATTGCTAAATGAAAAAAGATTCAAATATTTGTATTATATCTTCATCTTCTCTTT
TCTCAAATCAATAATCACATCTTCTCCCTCTTCACCGGAACCCTACCGTCGGTACCAGCT
AGCATTGCGTACTTATCCTTTCTTGTGAAGTTGGTGCACTCAAACCCTAAGGTTCCTGCC
AAAACCCTCTGTATGTAATTCGCCACCTCTATTGGGGACTTGCCTCCTTTACACGTCAGC
TCAGCCGGGAGCTGTTTAAGGAACGTGATCTCGAACGTTGGAACAGGGTTCATGAACGCG
AAGTAAGGATCAAGAAACTTGTAGCCACGTGTGGTTGTACCATTAAACACGCTTTGTTTC
GTGTTGATCGCCACGGGAACGATCCTGTCCGTAAGCTCGGCAAAGAGTGCACTAAACCGG
AGAAGGAAAGGTTCACGGCACGTGGTTCCCTCGGGACATATCACGAGGTCACCTTCCTCC
AAGAGACGCTTGATGTTCGCTGCGTCTTTCTCGCGCTGACGAGTCAACGCAACGGCTTTT
ATTGGAGAGATTAGCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4DL06TF 730 0 0
TTTTCTTTCTTAAATCGTTATTATACTAAAAGTAAACTTGAAAATATCACGAAAAAAACT
TGCAAATAAACAATTATTTAAGCATAGAAGGCAAAGAAATTAGCAAACTCACCAATTCTT
TTCCCCTTTGAATAATAATTGCTAAATGAAAAAAGATTCAAATATTTGTATTATATCTTC
ATCTTCTCTTTTCTCAAATCAATAATCACATCTTCTCCCTCTTCACCGGAACCCTACCGT
CGGTACCAGCTAGCATTGCGTACTTATCCTTTCTTGTGAAGTTGGTGCACTCAAACCCTA
AGGTTCCTGCCAAAACCCTCTGTATGTAATTCGCCACCTCTATTGGGGACTTGCCTCCTT
TACACGTCAGCTCAGCCGGGAGCTGTTTAAGGAACGTGATCTCGAACGTTGGAACAGGGT
TCATGAACGCGAAGTAAGGATCAAGAAACTTGTAGCCACGTGTGGTTGTACCATTAAACA
CGCTTTGTTTCGTGTTGATCGCCACGGGAACGATCCTGTCCGTAAGCTCGGCAAAGAGTG
CACTAAACCGGAGAAGGAAAGGTTCACGGCACGTGGTTCCCTCGGGACATATCACGAGGT
CACCTTCCTCCAAGAGACGCTTGATGTTCGCTGCGTCTTTCTCGCGCTGACGAGTCAACG
CAACGGCTTTTATTGGAGAGATTAGCTCAGAGAATTTGCTGATACTGTAAGTGACGCAGC
TAATTTTCCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL9066Contig1 664 2 1 U
GGACTCTGGATTGGATTAGAGTTTTGTTTTGTATTTTTCTCATTCGATATTTTCAATCTT
GTTTGCATCCCGTCCCTCCCCTTCGTATATAATAATAATCTCAGTCACACAAAAGTGATT
TTATCCGTTGATGATGACGGAGGAGAACAAGAGAAGCAGGTTCAGTAAAGTTTGTGTCTT
TTGCGGAAGCAACTCTGGTAATAGAGAACTTTTCAGTGATGCTGCTATCGAACTCGCCAA
TGAACTCGTGAAGAGGAAGATGACTTGGTTTATGGAGGAGGAAGTGTTGGGTTGATGGAT
ACTATAACAATTTGCTTGCTTTGTTTGACACTGGCGTCCAAGAAGGTTTTATCAAACCAG
GGGCACGTAATATTGTGGTTTCTGCACCAACAGCCAAAGAGCTTATGGAAAAGATGGAGG
AGTACACTCCTTCGCATAAGCATGTTGCATCCCACGAAAGCTGGAATGTTGAAGAACTTG
GAGCTTACCCTGGACAACAGAGCAAGCAGCAATAAAGAAAACAAAATCAAAAAACCATTC
TTATTGATTAGCATATGCTACTTCTTCCATTTCAAGTTTTATTAGTCTCTGATTTTATTT
GCAGAATCAACAATGTGTATAAAAACTCAAAATCTTGTTGCAATTTGATACATCACATTG
GGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR4AI19JQ C 1
AF RR4AI19TF U 1
BS 1 664 RR4AI19TF

RD RR4AI19JQ 664 0 0
GGACTCTGGATTGGATTAGAGTTTTGTTTTGTATTTTTCTCATTCGATATTTTCAATCTT
GTTTGCATCCCGTCCCTCCCCTTCGTATATAATAATAATCTCAGTCACACAAAAGTGATT
TTATCCGTTGATGATGACGGAGGAGAACAAGAGAAGCAGGTTCAGTAAAGTTTGTGTCTT
TTGCGGAAGCAACTCTGGTAATAGAGAACTTTTCAGTGATGCTGCTATCGAACTCGCCAA
TGAACTCGTGAAGAGGAAGATGACTTGGTTTATGGAGGAGGAAGTGTTGGGTTGATGGAT
ACTATAACAATTTGCTTGCTTTGTTTGACACTGGCGTCCAAGAAGGTTTTATCAAACCAG
GGGCACGTAATATTGTGGTTTCTGCACCAACAGCCAAAGAGCTTATGGAAAAGATGGAGG
AGTACACTCCTTCGCATAAGCATGTTGCATCCCACGAAAGCTGGAATGTTGAAGAACTTG
GAGCTTACCCTGGACAACAGAGCAAGCAGCAATAAAGAAAACAAAATCAAAAAACCATTC
TTATTGATTAGCATATGCTACTTCTTCCATTTCAAGTTTTATTAGTCTCTGATTTTATTT
GCAGAATCAACAATGTGTATAAAAACTCAAAATCTTGTTGCAATTTGATACATCACATTG
GGTC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR4AI19TF 664 0 0
GGACTCTGGATTGGATTAGAGTTTTGTTTTGTATTTTTCTCATTCGATATTTTCAATCTT
GTTTGCATCCCGTCCCTCCCCTTCGTATATAATAATAATCTCAGTCACACAAAAGTGATT
TTATCCGTTGATGATGACGGAGGAGAACAAGAGAAGCAGGTTCAGTAAAGTTTGTGTCTT
TTGCGGAAGCAACTCTGGTAATAGAGAACTTTTCAGTGATGCTGCTATCGAACTCGCCAA
TGAACTCGTGAAGAGGAAGATGACTTGGTTTATGGAGGAGGAAGTGTTGGGTTGATGGAT
ACTATAACAATTTGCTTGCTTTGTTTGACACTGGCGTCCAAGAAGGTTTTATCAAACCAG
GGGCACGTAATATTGTGGTTTCTGCACCAACAGCCAAAGAGCTTATGGAAAAGATGGAGG
AGTACACTCCTTCGCATAAGCATGTTGCATCCCACGAAAGCTGGAATGTTGAAGAACTTG
GAGCTTACCCTGGACAACAGAGCAAGCAGCAATAAAGAAAACAAAATCAAAAAACCATTC
TTATTGATTAGCATATGCTACTTCTTCCATTTCAAGTTTTATTAGTCTCTGATTTTATTT
GCAGAATCAACAATGTGTATAAAAACTCAAAATCTTGTTGCAATTTGATACATCACATTG
GGTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL9067Contig1 927 2 4 U
GGAGAGACCATGGAAACCCTTTTCAGAGTCTCACTTCGTCTTCTTCCAGTTTCCGCCGCC
GTGACGTGTCGCGTAATCCGTTTCCCCGTTTCAATACCCTCTTCCTCACACTTTCTGAAC
CGTAGTAGTAGTAGTCTGTATAAGTTTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAGTGAAGACA
AATGCTGGTTGGCTGTTGGGTCTGGGGGACAAGACGAAGAAGAAGCAAACGAATTTACCG
GATATCGTAGCAGCTGGAGACCCGGTTCTGCACGAGAGGCCCGAGAGGTTGACCCGGAAG
AAATCGGGTCGGAGCGTATTCAGAGGATAATTGATGATATGGTCAAAGTCATGAGATTGG
CTCCTGGTGTTGGCCTTGCTGCTCCTCAGATTGGTATCCCCTTAAGAATTATTGTTTTGG
AAGATACAAGAGAGTATATAAGTTACGCACCGAAGGAGGAGGTTCTTGCTCAACAAAGAC
GTCCTTTTGATCTCATGGTAATGGTGAATCCGGAGCTGAAGGGGGTGAGCAACAAGAAAG
CTCTCTTCTTCGAAGGATGTCTGAGTGTTGATGGATTCAGAGCTGTGGTGGAGAGATACC
TTGAAGTGGAAGTCACAGGCTATGATCGTCAAGGGAAACGGATTCAAGTGAATGCTTCGG
GCTGGCAAGCGAGGATTCTGCAGCACGAGTGCGATCATTTGGATGGTAATCTTTATGTGG
ATAAGATGATACCACGCACTTTCAGGACAGTCGACAACTTGGACTTGCCTCTCGCAGATG
GCTGTCCTAAACTCGGTCCTCGATGACCCAGACAGATTCTTTGTTATGTAATGTTTGATT
CTTTTACTTTCTTAAATTTAAAAGTTTGGCCAGAGATTGTCGAACCCATGTCGGTTTGGT
TTATACAGAAAAAAATAAATATTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C157TF U 1
AF RR4C157JQ C 167
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BS 620 676 RR4C157TF
BS 677 927 RR4C157JQ

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CGTAGTAGTAGTAGTCTGTATAAGTTTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAGTGAAGACA
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CTCCTGGTGTTGGCCTTGCTGCTCCTCAGATTGGTATCCCCTTAAGAATTATTGTTTTGG
AAGATACAAGAGAGTATATAAGTTACGCACCGAAGGAGGAGGTTCTTGCTCAACAAAGAC
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GCTGGCAAGCGAGGAT
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DS 

RD RR4C157JQ 761 0 0
CCC
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TCTTTATGTGGATAAGATGATACCACGCACTTTCAGGACAGTCGACAACTTGGACTTGCC
TCTCGCAGATGGCTGTCCTAAACTCGGTCCTCGATGACCCAGACAGATTCTTTGTTATGT
AATGTTTGATTCTTTTACTTTCTTAAATTTAAAAGTTTGGCCAGAGATTGTCGAACCCAT
GTCGGTTTGGTTTATACAGAAAAAAATAAATATTGTCC

QA 4 761 4 761
DS 



AS 1 2

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TGGTTTCTTTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCATAAGTAGAAAAATCTCCTAAATGG
TTATCGAGTCGCCTAAAGTAAGCTAGACCTTCATATTTAGACGAGAAAAAATACATTTGA
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TTTTGGGGTTCCCCAGATATTTTATGTGAACGTAAGCTTACACCTTCTTAGTTAAAATAT
ATATGTACTGACACTGTGTGTCCTAGGTGCAATAGTCACCATTTAAGACCC


BQ
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AF RR4EF84JQ C 1
AF RR4EF84TF U 1
BS 1 591 RR4EF84TF

RD RR4EF84JQ 591 0 0
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TGGTTTCTTTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCATAAGTAGAAAAATCTCCTAAATGG
TTATCGAGTCGCCTAAAGTAAGCTAGACCTTCATATTTAGACGAGAAAAAATACATTTGA
ATCTTGATACCATTAGTTTTTTTTTTGGCCAACAAGCTTTAAAACACTTGCAACCTTTTT
TTTTGGGGTTCCCCAGATATTTTATGTGAACGTAAGCTTACACCTTCTTAGTTAAAATAT
ATATGTACTGACACTGTGTGTCCTAGGTGCAATAGTCACCATTTAAGACCC

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DS 

RD RR4EF84TF 591 0 0
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CATGATGAGCCCATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAGAAGGGTATGTTTCATAC
ATCTTTCAAGGTGCCTGATGTATATGGTGTATTCCAGTTTAAGGTTGAATATGAAAAGCT
AGGCTACACTACATTATCTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGGCCTTACAGACATAATGA
GTATGAGAGATTTATTCCAACTGCGTATCCTTATTATGGAGCCTGCTTTACCACTATGGC
TGGTTTCTTTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCATAAGTAGAAAAATCTCCTAAATGG
TTATCGAGTCGCCTAAAGTAAGCTAGACCTTCATATTTAGACGAGAAAAAATACATTTGA
ATCTTGATACCATTAGTTTTTTTTTTGGCCAACAAGCTTTAAAACACTTGCAACCTTTTT
TTTTGGGGTTCCCCAGATATTTTATGTGAACGTAAGCTTACACCTTCTTAGTTAAAATAT
ATATGTACTGACACTGTGTGTCCTAGGTGCAATAGTCACCATTTAAGACCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL9069Contig1 1054 2 2 U
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TACAAGAACTATTGGCTCAGCTTATGACCTCTACCTCCGGAGTGTGCAGACGTCTTCTAT
GCCATCTGAAGAAGTTGGTCGGTTTAATGGTGTTGGCATGGGAAGACGAGGAGGTGACAG
CGTGATGCCTAGTCCGTCCATGGGTGACCTCATGTCTGGGCGTGGTGGAATCCTGCCTCC
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TAGCCGGGAGCTGCTTCGTCTACCTCCAGATGCATCCAACACTCTTTTTGTTGAAGGACT
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AGAAGTGAGACTTGTGACCAAAGATTCAAAGCAAAGGAATGGAGATCCTATAGTTCTTTG
TTTTGTTGATTTTGAAATTCCTGCATGTGCAGCAACTACTCGTACCGCCCTGCAAGGCTA
TAGAATGGATGAAAATGAACCTGATTCCAAGATTTTGCAAATCCAGTTTTCAAGAAACCC
AGGTCCAAGACCAGGACAACGTGGAGGAAGGAGATGATGATGAGTCGGTGTCCTTAGGAG
TACTCTCACTCAAAGCAATAGAGATGTATGATAGACACAAATGAGTTTGATTGGAATCTC
AAGTCTCTCTCACACCCTCTCTTTTTTTTCCACCACCTTGATAGATTTAGTGCATCATGA
TCTTACAACTGCTATTTATCGAGCCCAAAAAACTTGTTGCAGTCCTTTCCTTTGTATGTG
TGGGGATGATACGATATAGGATTTTGATAGTGCC


BQ
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AF RR4CI44TF U 1
AF RR4CI44JQ C 205
BS 1 530 RR4CI44TF
BS 531 1054 RR4CI44JQ

RD RR4CI44TF 530 0 0
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GGTCTTGCGATTGGTTCCGGCTTCGTCCATGGCGGATGGGTACTGGAACCAGCAGAGACA
CCACCAGCCTCCGATGTCGTCGAACTCACACGGTGGTCCTCAAAAACGTCCCCGTTCTGA
CTTGGGTCATGATATGCATGGTTACGTGTCACGGGATGAGGATCGAGGTAACCCTCAAGA
TACAAGAACTATTGGCTCAGCTTATGACCTCTACCTCCGGAGTGTGCAGACGTCTTCTAT
GCCATCTGAAGAAGTTGGTCGGTTTAATGGTGTTGGCATGGGAAGACGAGGAGGTGACAG
CGTGATGCCTAGTCCGTCCATGGGTGACCTCATGTCTGGGCGTGGTGGAATCCTGCCTCC
AGATTTTGGGCCAAATGGTCGAGCTTTGGGCTTTGGTCAACAAGATTTAGCTGGTAGGCC
TAGCCGGGAGCTGCTTCGTCTACCTCCAGATGCATCCAACACTCTTTTTG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR4CI44JQ 850 0 0
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TGACCTCTACCTCCGGAGTGTGCAGACGTCTTCTATGCCATCTGAAGAAGTTGGTCGGTT
TAATGGTGTTGGCATGGGAAGACGAGGAGGTGACAGCGTGATGCCTAGTCCGTCCATGGG
TGACCTCATGTCTGGGCGTGGTGGAATCCTGCCTCCAGATTTTGGGCCAAATGGTCGAGC
TTTGGGCTTTGGTCAACAAGATTTAGCTGGTAGGCCTAGCCGGGAGCTGCTTCGTCTACC
TCCAGATGCATCCAACACTCTTTTTGTTGAAGGACTTCCTTCTAATTGCTCAAGGCGGGA
AGTATCTCATATATTTAGGCCCTTTTTGGGGTATAAAGAAGTGAGACTTGTGACCAAAGA
TTCAAAGCAAAGGAATGGAGATCCTATAGTTCTTTGTTTTGTTGATTTTGAAATTCCTGC
ATGTGCAGCAACTACTCGTACCGCCCTGCAAGGCTATAGAATGGATGAAAATGAACCTGA
TTCCAAGATTTTGCAAATCCAGTTTTCAAGAAACCCAGGTCCAAGACCAGGACAACGTGG
AGGAAGGAGATGATGATGAGTCGGTGTCCTTAGGAGTACTCTCACTCAAAGCAATAGAGA
TGTATGATAGACACAAATGAGTTTGATTGGAATCTCAAGTCTCTCTCACACCCTCTCTTT
TTTTTCCACCACCTTGATAGATTTAGTGCATCATGATCTTACAACTGCTATTTATCGAGC
CCAAAAAACTTGTTGCAGTCCTTTCCTTTGTATGTGTGGGGATGATACGATATAGGATTT
TGATAGTGCC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 2

CO CL9070Contig1 676 2 1 U
GGGCCGGCAGACTAACAGAAACAAATCATCGGCACCAGTTTAGAGAGAGAGAGAGAACCA
TCCTACTTCTTTCTTTTCGTCTTTTTCTCCTCGGTTAGAGACAATGGGGACCGAATACGA
CCAAGTTCTTCACTCCGTTGCTCAGGTTAAAATCGCCGACAAAACTGGTGATTCCCCCGA
TGTGAATCAAGACGAGGAAGGCGTAAAGGTTTCGTGCTTCACTGAAGTCCTCGATGACGT
CACTCTTCACTTCCAGATCATCCGTCTCGCAAAACAGATTTATGTATGGATCGGTTATAA
TTCCGCCAAATTTGGTAATCTATACGCAGCCGCTTCGACCCGACCGAGTAATACAGTAAG
TGTCACTTCCGTACTTGGTGGAACATCTGATAACACTGGGTCTGGCATTGCCCGTAGATT
AGTGATGAAGACTGGTCTCAATATAATCATGGCTTGCAACATCCCTAAAAACAATCCCTT
GCTTGAGGCAAAAGCTGAGAAAATGTTGATCAGAAAATTGATTGATCTTGGTTACACAAT
GCCAACACCTTTACGAGCAACATAACCGGAAGAGGGAATGGTTTTAGCCAGTTTCTTCAG
TTTGTTTCTCCTTTTTTTCCGGTTTATTTACAGAATCTTGATGATTATTTGGTTATTAAA
TGATGTCAATTATCCG


BQ
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AF RR4BZ07JQ C 1
AF RR4BZ07TF U 1
BS 1 676 RR4BZ07TF

RD RR4BZ07JQ 676 0 0
GGGCCGGCAGACTAACAGAAACAAATCATCGGCACCAGTTTAGAGAGAGAGAGAGAACCA
TCCTACTTCTTTCTTTTCGTCTTTTTCTCCTCGGTTAGAGACAATGGGGACCGAATACGA
CCAAGTTCTTCACTCCGTTGCTCAGGTTAAAATCGCCGACAAAACTGGTGATTCCCCCGA
TGTGAATCAAGACGAGGAAGGCGTAAAGGTTTCGTGCTTCACTGAAGTCCTCGATGACGT
CACTCTTCACTTCCAGATCATCCGTCTCGCAAAACAGATTTATGTATGGATCGGTTATAA
TTCCGCCAAATTTGGTAATCTATACGCAGCCGCTTCGACCCGACCGAGTAATACAGTAAG
TGTCACTTCCGTACTTGGTGGAACATCTGATAACACTGGGTCTGGCATTGCCCGTAGATT
AGTGATGAAGACTGGTCTCAATATAATCATGGCTTGCAACATCCCTAAAAACAATCCCTT
GCTTGAGGCAAAAGCTGAGAAAATGTTGATCAGAAAATTGATTGATCTTGGTTACACAAT
GCCAACACCTTTACGAGCAACATAACCGGAAGAGGGAATGGTTTTAGCCAGTTTCTTCAG
TTTGTTTCTCCTTTTTTTCCGGTTTATTTACAGAATCTTGATGATTATTTGGTTATTAAA
TGATGTCAATTATCCG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR4BZ07TF 676 0 0
GGGCCGGCAGACTAACAGAAACAAATCATCGGCACCAGTTTAGAGAGAGAGAGAGAACCA
TCCTACTTCTTTCTTTTCGTCTTTTTCTCCTCGGTTAGAGACAATGGGGACCGAATACGA
CCAAGTTCTTCACTCCGTTGCTCAGGTTAAAATCGCCGACAAAACTGGTGATTCCCCCGA
TGTGAATCAAGACGAGGAAGGCGTAAAGGTTTCGTGCTTCACTGAAGTCCTCGATGACGT
CACTCTTCACTTCCAGATCATCCGTCTCGCAAAACAGATTTATGTATGGATCGGTTATAA
TTCCGCCAAATTTGGTAATCTATACGCAGCCGCTTCGACCCGACCGAGTAATACAGTAAG
TGTCACTTCCGTACTTGGTGGAACATCTGATAACACTGGGTCTGGCATTGCCCGTAGATT
AGTGATGAAGACTGGTCTCAATATAATCATGGCTTGCAACATCCCTAAAAACAATCCCTT
GCTTGAGGCAAAAGCTGAGAAAATGTTGATCAGAAAATTGATTGATCTTGGTTACACAAT
GCCAACACCTTTACGAGCAACATAACCGGAAGAGGGAATGGTTTTAGCCAGTTTCTTCAG
TTTGTTTCTCCTTTTTTTCCGGTTTATTTACAGAATCTTGATGATTATTTGGTTATTAAA
TGATGTCAATTATCCG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9072Contig1 1220 2 2 U
GGACGTAGATTCATTCTCATATCAAGAGACGTGTACGGCCGCCACTGTGATGTGAGTGAG
TGAGAGATCTGGTGGTGCCTCTCGCTCTCGGTAGCAATGGGAAGCTCGTCGAAGGAAGAG
ACGGCGAGTGACGGAGACACGGCCAGTGGTGGCGCATCGCCTTCCAACGACGGCAGACTC
TTTACGGAGGGCGAGCGTGTTCTCGCCTACCACGGTCCTCGCGTCTACGGAGCCAAGATT
CAAAAAGTGGAGCTTCGGAAGAAGGAGTGGAAGTACTTTGTTCATTACCTCGGTTGGAAC
AAAAATTGGGATGAATGGGTTAGTGCGGATAGGTTGTTGAAACATACGGAGGAGAATCTT
GTGAAACAGAAAGCTCTAGACAAGAAGCAAGGAGTAGAGAAGGGTACCAAGTCTGGGCGT
TCGGCTCAGACTAAAACTAGAAGCTCTGCAGACACAAAGGCTGAGAAAGATGACACGAAA
AACACTGCTGCAAAAGGGAAGAAGCGAAAGAACGAGTCTGGCAATGAGAAGGATAACGTA
TCAGCAGAGAAGCTACTCAAGATCCAAATACCTGCAACACTTAAAAAACAGCTAGTTGAC
GACTGGGAGAATGTTACGCAGAAGGACAAGGTTGTGAAACTTCCGCGTTCACCTAATGTC
GACGAGATATTGTCCAAGTACCTTGAACTCAAAACCAAGAAGGATGGAATGATAACTGAT
GCTGTCGGTGAAATCTTGAAAGGCATAAGGTGTTACTTCGACAAGGCACTACCTATGATG
CTCTTATATAAGAAAGAGCGGCGACAATACGAAGAAGCAGTCGTGGATGATATCTCACCT
TCAACTGTTTATGGCGCCGAGCATCTGCTTCGTCTGTTTGTGAAATTTCCGGAGCTTTTC
TCATATGTAAACATGGAAGAAGAGACATGGAGTCGCATGCATCAAACACTATTAGACTTC
CTCAAATTCATTCAGAAGAACCAGAGCAATTTCTTGTTGTCACCATCAGCATATGAATCT
GATAAGGTGGTTTCAGACGGTAAAGGCAAAGGCAAAGATGAGTGAGAACAAAAAGCCAGC
TCCATAAATTTGTCGGTATAATCAATCGCTGACAAGTTGTCTTGTAACTTTAGGATTCCT
TCAAATTTTTCTGATGGATTTTATGACTGTAACTTACATTTTTCACAACGATTGCTCAAT
CAAAATAAACTTAAATACTC


BQ
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AF RR4H716TF U 1
AF RR4H716JQB C 419
BS 1 624 RR4H716TF
BS 625 1220 RR4H716JQB

RD RR4H716TF 627 0 0
GGACGTAGATTCATTCTCATATCAAGAGACGTGTACGGCCGCCACTGTGATGTGAGTGAG
TGAGAGATCTGGTGGTGCCTCTCGCTCTCGGTAGCAATGGGAAGCTCGTCGAAGGAAGAG
ACGGCGAGTGACGGAGACACGGCCAGTGGTGGCGCATCGCCTTCCAACGACGGCAGACTC
TTTACGGAGGGCGAGCGTGTTCTCGCCTACCACGGTCCTCGCGTCTACGGAGCCAAGATT
CAAAAAGTGGAGCTTCGGAAGAAGGAGTGGAAGTACTTTGTTCATTACCTCGGTTGGAAC
AAAAATTGGGATGAATGGGTTAGTGCGGATAGGTTGTTGAAACATACGGAGGAGAATCTT
GTGAAACAGAAAGCTCTAGACAAGAAGCAAGGAGTAGAGAAGGGTACCAAGTCTGGGCGT
TCGGCTCAGACTAAAACTAGAAGCTCTGCAGACACAAAGGCTGAGAAAGATGACACGAAA
AACACTGCTGCAAAAGGGAAGAAGCGAAAGAACGAGTCTGGCAATGAGAAGGATAACGTA
TCAGCAGAGAAGCTACTCAAGATCCAAATACCTGCAACACTTAAAAAACAGCTAGTTGAC
GACTGGGAGAATGTTACGCAGAAG
ACA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR4H716JQB 802 0 0
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AAAACACTGCTGCAAAAGGGAAGAAGCGAAAGAACGAGTCTGGCAATGAGAAGGATAACG
TATCAGCAGAGAAGCTACTCAAGATCCAAATACCTGCAACACTTAAAAAACAGCTAGTTG
ACGACTGGGAGAATGTTACGCAGAAGGACAAGGTTGTGAAACTTCCGCGTTCACCTAATG
TCGACGAGATATTGTCCAAGTACCTTGAACTCAAAACCAAGAAGGATGGAATGATAACTG
ATGCTGTCGGTGAAATCTTGAAAGGCATAAGGTGTTACTTCGACAAGGCACTACCTATGA
TGCTCTTATATAAGAAAGAGCGGCGACAATACGAAGAAGCAGTCGTGGATGATATCTCAC
CTTCAACTGTTTATGGCGCCGAGCATCTGCTTCGTCTGTTTGTGAAATTTCCGGAGCTTT
TCTCATATGTAAACATGGAAGAAGAGACATGGAGTCGCATGCATCAAACACTATTAGACT
TCCTCAAATTCATTCAGAAGAACCAGAGCAATTTCTTGTTGTCACCATCAGCATATGAAT
CTGATAAGGTGGTTTCAGACGGTAAAGGCAAAGGCAAAGATGAGTGAGAACAAAAAGCCA
GCTCCATAAATTTGTCGGTATAATCAATCGCTGACAAGTTGTCTTGTAACTTTAGGATTC
CTTCAAATTTTTCTGATGGATTTTATGACTGTAACTTACATTTTTCACAACGATTGCTCA
ATCAAAATAAACTTAAATACTC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL9073Contig1 745 2 20 U
GGGGTAATTTGAAATCGATTATTGACATTATTTCTTAACCAATTTGGTGAGATTTTGTCA
ACCACATGTTCTCTTGAATGCTACAGCATTTCTACTTTAAAAAATGTTTTCAAACAATGT
ACTGCTCCAAACTGAAAAAGATGAGTCAGTTTTCGAGACAGAAGTGTCAGCATGTTTATG
TTCAAAGAACAACAACAACGTTTTTAAAAGGCCATAAATCCCAAAGCCTATCCATCAAGT
GCTCCAAGAGCTTTCATGTCTTCTAAGAAAGCAGAATAAGAATCATCAATGCTCTGTGGC
TTTGACGTTGCAGCTGTCTTGGTTGGCTCTACCTTCACCGGTGCAGCAAAAGCCACCATA
GCTCTTGGTTTAAAACTTAAGCTCGTGGCGAACGAAGCCTTTGGCTTTGGTTTGGTTACA
GCTGCGGATTCCCTCCTGACTCGAACCGAGGCAGGTACCATGGATGTAAGCGCAGGTGTG
TGTTGAGCTAGTGGTCTCCTGACAACAGTAGGAGCAGCGGATTTTACATAAGATGGTTTG
CTTGGTACATATGGCCTCATCATTGCTTGACTGTCTTCAAAACTAGACGGTGGTGGTCCC
GGTGGAAGTGGCGGTCTCATCATAGGTGGTGGTCCAGGTGGCGGGCCATAAAGTGGCCTC
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GGAGGTGGAAAACGCATCATTCCTG


BQ
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AF RR4CN18JQ U 1
AF RR4A685JQ U 71
BS 1 100 RR4CN18JQ
BS 101 101 RR4A685JQ
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BS 131 146 RR4CN18JQ
BS 147 147 RR4A685JQ
BS 148 264 RR4CN18JQ
BS 265 265 RR4A685JQ
BS 266 348 RR4CN18JQ
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BS 350 352 RR4CN18JQ
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BS 354 427 RR4CN18JQ
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BS 643 685 RR4CN18JQ
BS 686 745 RR4A685JQ

RD RR4CN18JQ 685 0 0
GGGGTAATTTGAAATCGATTATTGACATTATTTCTTAACCAATTTGGTGAGATTTTGTCA
ACCACATGTTCTCTTGAATGCTACAGCATTTCTACTTTAACAAATGTTTTCAAACAATGT
ATTGCTCCACACTGAAAAAGATGAGTTAGTTTTCGAGACAGAAGTGTCAGCATGTTTATG
TTCAAAGAACAACAACAACGTTTTTAAAAGGCCATAAATCCCAAAGCCTATCCATCAAGT
GCTCCAAGAGCTTTCATGTCTTCTGAGAAAGCAGAATAAGAATCATCAATGCTCTGTGGC
TTTGACGTTGCAGCTGTCTTGGTTGGCTCTACCTTCACCGGTGCAGCAGAAGTCACCATA
GCTCTTGGTTTAAAACTTAAGCTCGTGGCGAACGAAGCCTTTGGCTTTGGTTTGGTTACA
GCTGCGGTTTCCCTCCTGACTCGAACCGAGGCAGGTACCATGGATGTAAGCGCAGGTGTG
TGTTGAGCTAGTGGTCTCCTGACAACAGTAGGAGCAGCGGATTTTACATAAGATGGTTTG
CTTGGTACATATGGCCTCATCATTGCTTGACTGTCTTCAAAACTAGACGGTGGTGGTCCC
GGTGGAAGTGGCGGTCTCATCATAGGTGGTGGTCCAGGTGGTGGGCCATAAAGTGGCCTC
GGGATTAGATGACCACCGTACATTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4A685JQ 675 0 0
CTCTTGAATGCTACAGCATTT*TACTTTAGAAAATGTTTTCAAACAATGTACTGCTCCAA
ACTGAAAAAGATGAGTCCGTTTTCGAGACAGAAGTGTCCGCATGTTTATGTTCAAAGAAC
AACAACAACGTTTTTGAAAGGCCATAAATCCCAAAGCCTATCCATCAAGTGCTCCAAGAG
CTTTCATGTCTTCTAAGAAAGCAGAGTAAGAATCATCAATGCTCTGTGGCTTTGACGTTG
CAGCTGTCTTGGTTGGCTCTACCTTCACCGGTGCAGCAAAAGCCACCATAGCTCTTGGTT
TAAAACTTAAGCTCGTGGCGACCGAAGTCTTTGGCTTTGGTTTGGTTACAGCTGCGGATT
CTCTCCTGACTCGAACCGAGGCAGGTACCATGGATGTAAGCGCAGGTGTGTGTTGAGCTA
GTGGTCTCCTGACAACAGTAGGAGCAGCGGATTTTACATAAGATGGTTTGCTTGGTACAT
ATGGCCTCATCATTGCTTGACTGTCTTCAAAACTAGACGGTGGTGGTCCCGGTGGAAGTG
GCGGTCTCATCATAGGTGGTGGTCCAGGTGGCGGGCCATAAGGTGGCCTCGGGATTAGAT
GACCACCGTACATTCCAGGATGAGGAGGATGTATATCGTGTGGAGGTGGTGGAGGTGGAA
AACGCATCATTCCTG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL9074Contig1 571 2 1 U
GGAGGGATGGGGGTGAGGTTGAGGCTGCGGTTGCCGCGGGATTGGAGAAGGTTAGGAGAG
GTGAGGTTGAGGTGGAGAGTAGTGAGGAGGAGGAGAGTGAGAGTGATGATTCTGATGTTG
ATTCTGAGATTGAGAAGATTATTGCTGAGAGGTATGGTAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGCC
ATGAGTCTGAGTCTGATTCTGGAGATAGGAAGAGAAGGAGATCGAAGAAGCGGAGGACGC
ATAAGAGGAGCAGTGTGAGTGAGTCTGAGGATGAGGAAGAAAGGAGGAGAAAGCGAGATG
ATGATTCTGATGAGGATGATGGCGGGAGACGGGTTAAGAGAAAGAGTAGGAAGGAGAAGA
GGGGGAGGAAAGACTGAAGTCAAGATCGATCCGGTTCTGTATCTCCATTTTATCTCTTCA
TCAGTCTTATGTACAATGTTTAGTAATGAAACCTGCCCATGGGATTTGATTTGTGTTGGA
CTCTTGTGGTCTGCTTGTTTCAAGAATGTATTATTGAGATAGTGTTGTTAGATTGTGTGC
GAGTCTTTTGACTCTTAATGCTTCAGTGATT


BQ
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QA 1 571 1 571
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4E056JQ C 1
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CT

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QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4H764JQB C 1
AF RR4H764TF U 1
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QA 1 599 1 599
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AAACTCAGAAGAAGAACAGGATCCAAGTGTCTAACACCAAGAAACCCCTGTTCTTCTACG
TTAACCTCGCCAAGAGATACATTCAACAACACAACGAGGTCGAGCTTTCTGCACTTGGAA
TGGCGATCACAACAGTGGTTACTATCTCAGAAATTTTGAAGAACAATGGACTTGCAACAG
AGAAGAAAGTTCTGACATCAACAGTGGGAATGAAGGACGAGAACAAAGGGAGAGTAGTTC
AGAAGGCCAAGATTGAGATTGTGTTGCGGAAATCAGACAAATTCGATTCTCTGATGACTC
CGTTGACCAAAGATACGGTGGTGCCGGAGGAGAAAGCGGTGAACACTGAGGAGAAACCAA
TAGAAGCTGAAGTTAAACCTGAAGGCAAGGAGTGATCATGTAAACAAATGTCTACGTGTT
TCGAGTGTTAAACATAAGTTTCTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATGACTAAACT

QA 1 599 1 599
DS 



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ATAATTGTACTTAAAAAAAAAGAGTACAAACATGAATGATCTATTCTCAAATTCATTTAA
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GCTACGAGCTAAGATGGATGCGGACGTAGGTCAGGTCCTTAAGAGGGTTAAAATGATTAA
ACAGAAGCTCGAGGCTCTAGAGAAAGCCAACGCTAATAGCCGTAATGTCCCGGGTTGTGG
ACCCGGTTCGTCTACGGATAGGACTCGGTCCTCTGTGGTTAGCGGTCTTGGGAAGAAGCT
TAAGGATTTGATGGATAGTTTCCAAAGTCTACGTGCACGGATGAACGATGAGTATAAAGA
GACCGTAGAGCGCAGGTATTTTACAATAACAGGAGAACAAGCAGACGAGCAGACAATCGA
TAACTTGATTGCGAGCGGTGAGAGCGAAAACTTTCTCCAAAAAGCGATTCAAGAGCAAGG
AAGAGGTGAAATCATGGACACGATATTTGAGATTCAAGAAAGACATGATGCAGTGAAGGA
GATTGAGAAGAATTTACTGGAGTTGCACCAAGTTTTTTTGGACATGGCGGCTTTAGTGGA
AGCGCAAGGGCAACAGCTGAACAATATAGAGAGCCATGTGGCGAAGGCGAGCTCGTTTGT
GAGAAGAGGGACTGATCAGCTTCAAGACGCGAGGGAGTACCAAAAGAGCTCGAGGAAATG
GACTTGTTACGCTATTATTCTTTTCATCGTTGTGTTTATCCTTCTTTTTATTCCTGCTCT
ACCCCATATTATGCTCATGCTGAAATGAAAATTTTAGAGGTTTTGCACCCAAAAAATAAA
AAAAATATAGAGGATATGATTTTGTAGAAAAAAGTTTTGAAACACCGGATCGTTATTACA
TGTAGAACTTTTATGAAATCCTTACTTTCTACATATTGTCTCCTGTTATGTATTTTAACT
ATGAGGATTAATTTACTAGGTATTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CB03TF U 1
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BS 644 1168 RR4CB03JQ

RD RR4CB03TF 643 0 0
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QA 1 643 1 643
DS 

RD RR4CB03JQ 764 0 0
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CCGGATCGTTATTACATGTAGAACTTTTATGAAATCCTTACTTTCTACATATTGTCTCCT
GTTATGTATTTTAACTATGAGGATTAATTTACTAGGTATTTCAT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4DD48TF U 1
AF RR4DD48JQ C 135
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BS 716 718 RR4DD48JQ

RD RR4DD48TF 715 0 0
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GTTGAAGAAATGAAGGTAAATGTGGAGATAATAACGGGGACATTTATAGATACGGAGGTG
AGTGAGAATGCTACGGTGAAGGAAGGAGAAGATTGCAACTGAGGTGAAGTTATCAGTGAA
GCGTTTGATACTTGTGGTCAAGGATGGAGAGGAGAGTAGAAGACTGGTGAAGGATGATGA
AGATGAAATGAAGCTGATAGATTTAGGAGTGAAAGAAGATTCTCATGTGTATTTGTTCTT
TAAGCATCCTGATTTGGTTTGCAAGGAAGATAGATCTCAAGGAAGAGTAGATGATGCTTC
TGTGGAGGAGGTATCGTCGGAAGCAGAGAGTAAAAGAGGAAACAAAGAAAAAGGTGAAGA
GGCAAAAGAAAAAATAGACGGTGAAGAGGAAGATGTAGGGATAAAGAATGGTGAAGAAGA
TAGAGAAGAAGAGAAAAAGAAGAACAATGGAGAAAAAAGAAAGGATGATCATAATATTGA
AGAAGGAAAAGAGAAAGCAAGAGAGGCTGAAGAAGAAGATGAAATGGATAGAGTTTCCTG
ATTTGGTTTGTTAACTATTCCATATTTATGAACTTTTCTTTTGTGATTTATCTTGTCATA
ATGTTTCTTGTTCTACAAGTAAACAGCTTAATGAAATTTTATGATCTGTTTGGTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4DD48JQ 584 0 0
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TGGTCAAGGATGGAGAGGAGAGTAGAAGACTGGTGAAGGATGATGAAGATGAAATGAAGC
TGATAGATTTAGGAGTGAAAGAAGATTCTCATGTGTATTTGTTCTTTAAGCATCCTGATT
TGGTTTGCAAGGAAGATAGATCTCAAGGAAGAGTAGATGATGCTTCTGTGGAGGAGGTAT
CGTCGGAAGCAGAGAGTAAAAGAGGAAACAAAGAAAAAGGTGAAGAGGCAAAAGAAAAAA
TAGACGGTGAAGAGGAAGATGTAGGGATAAAGAATGGTGAAGAAGATAGAGAAGAAGAGA
AAAAGAAGAACAATGGAGAAAAAAGAAAGGATGATCATAATATTGAAGAAGGAAAAGAGA
AAGCAAGAGAGGCTGAAGAAGAAGATGAAATGGATAGAGTTTCCTGATTTGGTTTGTTAA
CTATTCCATATTTATGAACTTTTCTTTTGTGATTTATCTTGTCATAATGTTTCTTGTTCT
ACAAGTAAACAGCTTAATGAAATTTTATGATCTGTTTGGTTTCG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL9079Contig1 1217 2 4 U
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CAATCAGTTGCTACAATTCTGGGAAGAATGTACTATGACAACGGAGGAAACAGCAAGTGG
CTAGCAACGGTTGTTCAACTTGTAGGCTTTCCTGTTCTGCTTCCATATTACCTCTTGTCA
ATCAAAACACATACAACAACAACTCATATAGATGGCAAAGCAGCCTCACTTAAGAACCGT
GTACTGGTTTACGTAGTTCTTGGAGTTCTTGTAGGAGCAGATTGCTACCTATACTCCATT
GGACTGCTTTACCTTCCTGTTTCAACCTATTCACTGATCTGTGCTTCTCAATTAGCCTTC
AACGCTTTCTTCTCTTATTTCCTCAACTCACAGAAGCTCACTCCCATCATTTTGAATTCT
CTTTTGCTACTAACCATATCTTCCACCCTCCTTGCCTTCAATAACGAGGATTCAAACTCT
CAAAAAGTTACAAAAGCACAGTATGTCACAAGCTTCTTATGCACCATCGGTGCTTCTGCT
GGGTTCGGTCTAGTCTTATCCTTACAACAGCTAGCCTTCCGCAAAGTCCTGAAGAGGCAG
ACTTTCACAGAAGTTATGGATATGATCATCTGCATGAGTCTAGTGGCCAGTTGCGTTAGC
TTGGTGGGGCTTTTCGCCAGCAGCGAGTGGAAAACTCTGAGCAATGAGATGGAAAACTAC
AAGCTTGGGAAAGTATCTTACGTTATGAACCTAGTGTGGACAGCTATAACCTGGCAGGTG
TTCAACATCGGTGGCACGGGACTGATCTTTGAGCTTTCCTCTCTGTTCTCGAATGCAATA
AGCGTACTTGGGCTGCCTGTGGTTCCCATCATAGCTGTCATCATTTTCCATGACAAAATG
AACGGTTTGAAGGTGATTTCTATGATCTTGGCTATTTGGGGTTTCATGTCCTATGTCTAC
CAACACTATCTTGATGACAAAAGCTTGAAGAGAAGTGGTGGAATCCAAAAAGGAGAATAC
TCTGTCCCCCCAGAGGCAGAAAGACCAAATGGGCAAAAGATAGAGACGTCAGCAAGCTGA
TTACAAAACTTCATTGATTATACTTGCGTTTAGAGCAACCAAACATGAGTATTATTACGA
AAAATGTATTTCAACACTGTAAACTTTGTAGCTTTTCTAAGTTACTGTAATGCAATCCAT
GTATGAGGATAGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR49TF U 1
AF RR4GR49JQ C 538
BS 1 656 RR4GR49TF
BS 657 657 RR4GR49JQ
BS 658 669 RR4GR49TF
BS 670 1217 RR4GR49JQ

RD RR4GR49TF 669 0 0
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CAATCAGTTGCTACAATTCTGGGAAGAATGTACTATGACAACGGAGGAAACAGCAAGTGG
CTAGCAACGGTTGTTCAACTTGTAGGCTTTCCTGTTCTGCTTCCATATTACCTCTTGTCA
ATCAAAACACATACAACAACAACTCATATAGATGGCAAAGCAGCCTCACTTAAGAACCGT
GTACTGGTTTACGTAGTTCTTGGAGTTCTTGTAGGAGCAGATTGCTACCTATACTCCATT
GGACTGCTTTACCTTCCTGTTTCAACCTATTCACTGATCTGTGCTTCTCAATTAGCCTTC
AACGCTTTCTTCTCTTATTTCCTCAACTCACAGAAGCTCACTCCCATCATTTTGAATTCT
CTTTTGCTACTAACCATATCTTCCACCCTCCTTGCCTTCAATAACGAGGATTCAAACTCT
CAAAAAGTTACAAAAGCACAGTATGTCACAAGCTTCTTATGCACCATCGGTGCTTCTGCT
GGGTTCGGTCTAGTCTTATCCTTACAACAGCTAGCCTTCCGCAAAGTCCTGAAGAGGCAG
ACTTTCACAGAAGTTATGGATATGATCATCTGCATGAGTCTAGTGGCCAGTTGCGT*AGC
TTGGTGGGG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4GR49JQ 680 0 0
GCTGGGTTCGGTCTAGTCTTATCCTTACAACAGCTAGCCTTCCGCAAAGTCCTGAAGAGG
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AGCTTGGTGGGGCTTTTCGCCAGCAGCGAGTGGAAAACTCTGAGCAATGAGATGGAAAAC
TACAAGCTTGGGAAAGTATCTTACGTTATGAACCTAGTGTGGACAGCTATAACCTGGCAG
GTGTTCAACATCGGTGGCACGGGACTGATCTTTGAGCTTTCCTCTCTGTTCTCGAATGCA
ATAAGCGTACTTGGGCTGCCTGTGGTTCCCATCATAGCTGTCATCATTTTCCATGACAAA
ATGAACGGTTTGAAGGTGATTTCTATGATCTTGGCTATTTGGGGTTTCATGTCCTATGTC
TACCAACACTATCTTGATGACAAAAGCTTGAAGAGAAGTGGTGGAATCCAAAAAGGAGAA
TACTCTGTCCCCCCAGAGGCAGAAAGACCAAATGGGCAAAAGATAGAGACGTCAGCAAGC
TGATTACAAAACTTCATTGATTATACTTGCGTTTAGAGCAACCAAACATGAGTATTATTA
CGAAAAATGTATTTCAACACTGTAAACTTTGTAGCTTTTCTAAGTTACTGTAATGCAATC
CATGTATGAGGATAGTTCCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL9080Contig1 984 2 4 U
AAAAAGTTTCAAACAACACTCATATTCGTAAAATGGCCGGTCTCCGAGTGCAAACGCTCA
TATTCGTTCTGGTGACCTTAGCTATTCTAAATCGCACCGTTGTGGAGGCAAACTTCGACA
AGAATTTTATTGTTACATGGGGTAATCAGCATATTGGTGTGACTGGTGACAACCTTCGAC
TTGTCCTTGACAAATCTGCAGGATCTGCTATTCGCTCAAAGGTGGCTCACTTGTTCGGAA
CTGTAGAAATGCTTATCAAACTTGTGCCAGGGAACTCTGCTGGAACCGTTGCAGCTTATT
ACATGTCGTCCACGGGAACTGCACACGACGAGATAGACTTTGAGTTCCTAGGGAATTCCA
CTGGCGAGCCGTACACGATCCACACCAATATATTTGCTAACGGGAAAGGAGATCGCGAGC
AACAATTCAAACCATGGTTTAACCCGACCAATGGTTTCCACAACTATACCATTCATTGGA
ACCCATCTGAAGTTGTGTGGTTCGTGGATGGAACTCCAATAAGAGTTTATAGGAACTACG
AGAAGGAAGGAATCGCATACCCAAACAAGCAAGGTATGAAAGTGTTTGCGAGTCTATGGA
GCGCAGACGACTGGGCGACACAAGGAGGTCGAGTGAAGACAAACTGGACACAAGCACCGT
TTGTGGCCGAGGGTCGTAGGTACAAGGCAAGAACCTGCGTGTGGCAGGGACCGGCTAGCA
TCAAGCAATGCGCAGATCCAACCATAAAGTCTAATTGGTGGACTTCACCGTCGTTTAGCC
AGCTAACTCGAACGCAAATAGGCAGGATGCAAAAGATACGATCTGGTTTCATGATCTATG
ATTACTGCAACGACACTAACAGGTTTAAAGGTGTCATGCCTCCGGAATGCTCCAAGAGAC
AATTCTAATCAAAGTTTTTTTTTAATATATATTATACTTTCCCTTTTTCTGAATTTCAAT
CGTAATATGTTTTTGTTTGTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CP93TF U 1
AF RR4CP93JQ C 275
BS 1 642 RR4CP93TF
BS 643 643 RR4CP93JQ
BS 644 679 RR4CP93TF
BS 680 984 RR4CP93JQ

RD RR4CP93TF 679 0 0
AAAAAGTTTCAAACAACACTCATATTCGTAAAATGGCCGGTCTCCGAGTGCAAACGCTCA
TATTCGTTCTGGTGACCTTAGCTATTCTAAATCGCACCGTTGTGGAGGCAAACTTCGACA
AGAATTTTATTGTTACATGGGGTAATCAGCATATTGGTGTGACTGGTGACAACCTTCGAC
TTGTCCTTGACAAATCTGCAGGATCTGCTATTCGCTCAAAGGTGGCTCACTTGTTCGGAA
CTGTAGAAATGCTTATCAAACTTGTGCCAGGGAACTCTGCTGGAACCGTTGCAGCTTATT
ACATGTCGTCCACGGGAACTGCACACGACGAGATAGACTTTGAGTTCCTAGGGAATTCCA
CTGGCGAGCCGTACACGATCCACACCAATATATTTGCTAACGGGAAAGGAGATCGCGAGC
AACAATTCAAACCATGGTTTAACCCGACCAATGGTTTCCACAACTATACCATTCATTGGA
ACCCATCTGAAGTTGTGTGGTTCGTGGATGGAACTCCAATAAGAGTTTATAGGAACTACG
AGAAGGAAGGAATCGCATACCCAAACAAGCAAGGTATGAAAGTGTTTGCGAGTCTATGGA
GCGCAGACGACTGGGCGACACAAGGAGGTCGAGTGAAGACAA*CTGGACACAAGCACCGT
TTGTGGCCGAGGGTCGTAG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR4CP93JQ 710 0 0
CTCTGCTGGAACCGTTGCAGCTTATTACATGTCGTCCACGGGAACTGCACACGACGAGAT
AGACTTTGAGTTCCTAGGGAATTCCACTGGCGAGCCGTACACGATCCACACCAATATATT
TGCTAACGGGAAAGGAGATCGCGAGCAACAATTCAAACCATGGTTTAACCCGACCAATGG
TTTCCACAACTATACCATTCATTGGAACCCATCTGAAGTTGTGTGGTTCGTGGATGGAAC
TCCAATAAGAGTTTATAGGAACTACGAGAAGGAAGGAATCGCATACCCAAACAAGCAAGG
TATGAAAGTGTTTGCGAGTCTATGGAGCGCAGACGACTGGGCGACACAAGGAGGTCGAGT
GAAGACAAACTGGACACAAGCACCGTTTGTGGCCGAGGGTCGTAGGTACAAGGCAAGAAC
CTGCGTGTGGCAGGGACCGGCTAGCATCAAGCAATGCGCAGATCCAACCATAAAGTCTAA
TTGGTGGACTTCACCGTCGTTTAGCCAGCTAACTCGAACGCAAATAGGCAGGATGCAAAA
GATACGATCTGGTTTCATGATCTATGATTACTGCAACGACACTAACAGGTTTAAAGGTGT
CATGCCTCCGGAATGCTCCAAGAGACAATTCTAATCAAAGTTTTTTTTTAATATATATTA
TACTTTCCCTTTTTCTGAATTTCAATCGTAATATGTTTTTGTTTGTGTAG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL9081Contig1 1213 2 2 U
GGGAGTCCCCCAGAAACTTCGATTTACCCTAAAGACGATTTGCTTTGCATCTCAGTGTCT
CTATAAAAACTCTCTGTGACTTGTTCCGCGAGACCTAACCTAAATAATGGTGTTTGGACA
GATAGTGATAGGTCCACCTGGTTCAGGCAAGACTACTTACTGCAATGGCATGTCTCAGTT
CCTCTCTCTTATCGGCAGGAAGGTTGCTGTTGTTAATCTGGATCCTGCAAACGATGCATT
ACCGTATGAGTGTGCTGTGAATATAGAAGAACTGATTAAGTTAGAAGTTGTTATGTCTGA
ATCTTCACTTGGTCCTAATGGAGGTCTGCTACACTGTATGGAATACTTGGAGAAGAACAT
TGACTGGCTAGAAGCTAAACTAGAGCCTCTTTCCAAGGACCATTACTTTCTCTTTGATTT
TCCTGGCCAAGTGGAACTCTTCTTCAATCATGACAGTACCAAGAAGGTTCTCACGAAGCT
GACCAAATCCTTGAACCTTAGACTAACGGCTGTGCAACTAATTGATTCCATTCTATGTAG
TGACCCTGGGAACTATGTAAGCGCTCTGCTTCTCTCTTTATCCACTATGCTTCATATGGA
ACTCCCCCATATCAATGTCTTGTCTAAAATCGATCTCATTGGAAACTACGGCAAGCTAGC
TTTCGGTTTAGATTTCTATACCGATGTTCAAGACTTGTCATACTTGCAGCAGTATCTTAA
TCAAGATCCTCGCTCTGCCAAGTACAGGAAACTAACGAGTGAGCTGTGTAGTGTGGTTGA
AGATTACGGTCTTGTTAGTTTTACAACCTTGGATATTCAGGATAAAGAAAGTGTTGGTGA
TCTGGTGAAGCTCATTGATAAGAGCAATGGTTACATATTTGCGGGCATTGATGCAAGTGT
GGTTGAATACAGCAAGATTTCAGTTCGTCAAACTGATTGGGAATATAACAGAGTTGCTGC
CGTGCAAGAGAAGTACATGAAAGACGAGGACATAGAAGACTGAAGACAAAGATTTGCTAA
GGAGAAGAGGAATCATTTGATGATCTATGAACCAAACAGTGCATGCAACGGTTTGTATGA
ACCGCTTTTTGTTTTTTGGGGTTCGGTTTAAGTCCAACAACGTTAGTTACATAACTTACT
GGTTTGTTACATTTCACTGAAATTGACAAATATATATTTGATAACTCGCTAGTTTATAGA
GAGAATGTTTACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BX48TF U 1
AF RR4BX48JQ C 502
BS 1 646 RR4BX48TF
BS 647 1213 RR4BX48JQ

RD RR4BX48TF 646 0 0
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CTATAAAAACTCTCTGTGACTTGTTCCGCGAGACCTAACCTAAATAATGGTGTTTGGACA
GATAGTGATAGGTCCACCTGGTTCAGGCAAGACTACTTACTGCAATGGCATGTCTCAGTT
CCTCTCTCTTATCGGCAGGAAGGTTGCTGTTGTTAATCTGGATCCTGCAAACGATGCATT
ACCGTATGAGTGTGCTGTGAATATAGAAGAACTGATTAAGTTAGAAGTTGTTATGTCTGA
ATCTTCACTTGGTCCTAATGGAGGTCTGCTACACTGTATGGAATACTTGGAGAAGAACAT
TGACTGGCTAGAAGCTAAACTAGAGCCTCTTTCCAAGGACCATTACTTTCTCTTTGATTT
TCCTGGCCAAGTGGAACTCTTCTTCAATCATGACAGTACCAAGAAGGTTCTCACGAAGCT
GACCAAATCCTTGAACCTTAGACTAACGGCTGTGCAACTAATTGATTCCATTCTATGTAG
TGACCCTGGGAACTATGTAAGCGCTCTGCTTCTCTCTTTATCCACTATGCTTCATATGGA
ACTCCCCCATATCAATGTCTTGTCTAAAATCGATCTCATTGGAAAC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR4BX48JQ 712 0 0
ACTAACGGCTGTGCAACTAATTGATTCCATTCTATGTAGTGACCCTGGGAACTATGTAAG
CGCTCTGCTTCTCTCTTTATCCACTATGCTTCATATGGAACTCCCCCATATCAATGTCTT
GTCTAAAATCGATCTCATTGGAAACTACGGCAAGCTAGCTTTCGGTTTAGATTTCTATAC
CGATGTTCAAGACTTGTCATACTTGCAGCAGTATCTTAATCAAGATCCTCGCTCTGCCAA
GTACAGGAAACTAACGAGTGAGCTGTGTAGTGTGGTTGAAGATTACGGTCTTGTTAGTTT
TACAACCTTGGATATTCAGGATAAAGAAAGTGTTGGTGATCTGGTGAAGCTCATTGATAA
GAGCAATGGTTACATATTTGCGGGCATTGATGCAAGTGTGGTTGAATACAGCAAGATTTC
AGTTCGTCAAACTGATTGGGAATATAACAGAGTTGCTGCCGTGCAAGAGAAGTACATGAA
AGACGAGGACATAGAAGACTGAAGACAAAGATTTGCTAAGGAGAAGAGGAATCATTTGAT
GATCTATGAACCAAACAGTGCATGCAACGGTTTGTATGAACCGCTTTTTGTTTTTTGGGG
TTCGGTTTAAGTCCAACAACGTTAGTTACATAACTTACTGGTTTGTTACATTTCACTGAA
ATTGACAAATATATATTTGATAACTCGCTAGTTTATAGAGAGAATGTTTACT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL9082Contig1 1064 2 2 U
GGGATGTCTGGCCGCGGATTGATGTTGATGTTCGTAGCAGTCTTCCTTGTCCTGATTCAG
TCATCGACTTCTCTGATTAGTTCTCCAAGCTCTATCATCAACCCTTCTAAAGTCAAACAA
GTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAGCGGACCTGGAATGTGAT
CATTTGATCTCCCTCGCAAAAGAGAATCTCCAGAGATCTGCGGTTGCTGATAACGACAAT
GGAGAGAGTCAAGTCAGTGACGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTCCAAAGGAAAG
GATCCTATTGTTTCCGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAAGAA
AACGGGGAGGATCTTCAGGTGCTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGACGCTCACTTT
GACTACTTCCACGACAAAGTCAACATCGCCCGTGGTGGACACCGTATAGCAACCGTTCTC
ATGTATCTTTCCAATGTCACAAAGGGTGGAGAAACTGTTTTCCCTGATGCAGTGGAGTCT
TCCCGCCTCAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGACCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAATT
GCTGTGAAACCGAAGAAAGGAGATGCACTGTTGTTCTTCAACCTCCATCAAGACGCAACC
CCAGACACCTTGAGCCTTCACGGAGGTTGTCCTGTGATCGAAGGAGAGAAATGGTCAGCG
ACCAAGTGGATTCACGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTGACGCATGACGGTAGCTGTGCG
GATGCAAACGAGAGCTGTGAAAGATGGGCAGTGCTTGGAGAATGCGCAAAGAACCCTGAG
TATATGGTGGGAACCCCAGAGCTCCCTGGAAACTGCAGGCGTAGCTGTAAAGCTTGTTAA
AGAGTTTAAATTTTTTTCTTATTGCAATGTAACATTAAGTTCTTTTGATATCGCTCTGTT
TTGTCATTTTCTTGTTTCTGATGAGTTGTGTGTTCGTTGATGAGACCATCTCTTGTTCTT
GAATCAGTCAGATTTTTTCTATCACTCTCTATGTCAAGTAGGCC


BQ
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AF RR4AW35TF U 1
AF RR4AW35JQ C 214
BS 1 804 RR4AW35TF
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RD RR4AW35TF 804 0 0
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GATGCAAACGAGAGCTGTGAAAGA

QA 1 804 1 804
DS 

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CTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAATTGCTGTGAAACCGAAGAAAGGAGATGCACTGTTG
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CTTGGAGAATGCGCAAAGAACCCTGAGTATATGGTGGGAACCCCAGAGCTCCCTGGAAAC
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TCGTTGATGAGACCATCTCTTGTTCTTGAATCAGTCAGATTTTTTCTATCACTCTCTATG
TCAAGTAGGCC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4EE86JQ C 1
AF RR4EE86TF U 1
BS 1 586 RR4EE86TF

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GAGGTGGCTGAGAAGAATGCACCTATGCAAAAGTACAGAATCGCAGCTGGTGGGGTAAAG
AAGTTATCAGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTGTTC
TACTGCCACAAAGCGATGATGACGAGCGTTTACGCGGTTCCCCTCGAAGGAGATAACGGG
TTGCGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCAGCGTGGAACCCAAACCAC
TTGGCCTTTAAAGTCCTTAAGGTGAAGCCTGGGAGTGTTCCGGTCTGCCACTTCCTCCCT
GAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTACTAGATATGCTTTCTATGTTATGTAATAATAAAT
AATTTATAAGAAGATCTATACTCTGGGATGTTTTGTATTTATACATATAGTAATGTGTGG
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4EE86TF 586 0 0
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GAGGTGGCTGAGAAGAATGCACCTATGCAAAAGTACAGAATCGCAGCTGGTGGGGTAAAG
AAGTTATCAGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTGTTC
TACTGCCACAAAGCGATGATGACGAGCGTTTACGCGGTTCCCCTCGAAGGAGATAACGGG
TTGCGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCAGCGTGGAACCCAAACCAC
TTGGCCTTTAAAGTCCTTAAGGTGAAGCCTGGGAGTGTTCCGGTCTGCCACTTCCTCCCT
GAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTACTAGATATGCTTTCTATGTTATGTAATAATAAAT
AATTTATAAGAAGATCTATACTCTGGGATGTTTTGTATTTATACATATAGTAATGTGTGG
TTTTCCATATAATCAATGGACCGAAAGCACCTATACGTTTTGCTTT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL9084Contig1 591 2 1 U
TTTTTTCTTTTACTTCTACGATCTCTCTTTCTTCCTCTTTTACAAGTTCTTAGCTCTGAA
TCTGATTATACTTTGTTTCCAGGAGTCTCGAATAAGAATCTGATTGGACTTTGTGTCCAG
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TCAAGTTCCGTGGAGAAGACGACCAGGAACACGACGAGCAAGGTGAAGACGACGAAGACC
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ATGGACGATAAAGAAGAAGAACCATGTCTGGTTGCAACGCCAAAGAAGAAGAACCATGGC
TGGATGCGACGTCGAAGGCATGGAAGGACACGACCAGTACTGAAGTCTGAAGATCAGAAG
CTGATGTACGGCGGCGGCTGGATAGGTTTAGTTAGTAATTAGGTTTAATCTTGGTTTAGG
TTTTTGGTTTATTTGGTTTAGTAAGTTTTGGTTTAAGACTTTTAATTTGTAAATAATATT
GTTTTTGTAAACCTGTTTAATTTTAAATCATTTTATTTAATAAAATAATTT


BQ
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AF RR4H302JQ C 1
AF RR4H302TF U 1
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GTTTTTGTAAACCTGTTTAATTTTAAATCATTTTATTTAATAAAATAATTT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR4H302TF 591 0 0
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TCTGATTATACTTTGTTTCCAGGAGTCTCGAATAAGAATCTGATTGGACTTTGTGTCCAG
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TCAAGTTCCGTGGAGAAGACGACCAGGAACACGACGAGCAAGGTGAAGACGACGAAGACC
AGGGTGGCTCTAGATACGACGCGACAAGTGTGCCTCCTCTCTGCACCCCTCTCAGATCCC
ATGGACGATAAAGAAGAAGAACCATGTCTGGTTGCAACGCCAAAGAAGAAGAACCATGGC
TGGATGCGACGTCGAAGGCATGGAAGGACACGACCAGTACTGAAGTCTGAAGATCAGAAG
CTGATGTACGGCGGCGGCTGGATAGGTTTAGTTAGTAATTAGGTTTAATCTTGGTTTAGG
TTTTTGGTTTATTTGGTTTAGTAAGTTTTGGTTTAAGACTTTTAATTTGTAAATAATATT
GTTTTTGTAAACCTGTTTAATTTTAAATCATTTTATTTAATAAAATAATTT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL9085Contig1 614 2 3 U
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TAAGCCTTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CQ14TF U 1
AF RR4CQ14JQ C 11
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QA 1 614 1 614
DS 

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TATGAGTTTCTTGTAAACAATCTATGAATTGGTTCGTAAAATGATAATAATAAGCCTTTT
ATAT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL9086Contig1 590 2 1 U
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CTAACATTTGGAAGTATTGTGAAGTTGAAAGTCAAAATTATTAAAAGGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BZ93JQ C 1
AF RR4BZ93TF U 1
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QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4BZ93TF 590 0 0
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CGGTTTGGATGCCCGTTTCTCCAAAGCGATTGTTTGATTTTCTTGGAAATGAACGGCTGA
GATCTGAATGGGACATCTTATCCAACGGTGGTCCCATGCAGGAAATGGCCCATATCGCTA
AAGGCCATGACCATTCAAACTCTGTCTCCTTACTCCGTGCCACCGTAAGCTTATATATAC
TCTTTCTTCTCTATGCATTAATTCGGTTTACTTTCGGTTGGTTTAGTTAAACCGGGTTTT
TGGAGGCATTTAATGTTTATCCTATAGTAGCTGTAATGTGAATGGACTTTGCGTTACGTG
ACCCCATAGGATGATGTAGTCATATGAATCTTGTCGCTGTGTGATTAGAAAGTGACAAAT
CTAACATTTGGAAGTATTGTGAAGTTGAAAGTCAAAATTATTAAAAGGCG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL9087Contig1 802 2 4 U
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TCCAATCCCCGGTTCAATTCTTAGCAGTTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGCCGGAA
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GGGTCATCTAGATATCAGCCATAACAGGCTTTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTT
TGATCACCTTGAGGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGAT
GAAGACATGTTAAAGTAATAAATAAGGCAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCA
GTTTGTTTATATTCTTCGCTTTCTTTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAC
TCTGTTCTGCTAGCAACGAATGGCTACACCGATCCAAATCTGTTCCTGGTGTATGGTAGA
TCTTAAATGGCTACACCGATCCAAATCTATACAGCTACTCTGTATCATGTATAAGCAATG
TTATAGATCTTAAATGTTTTAG


BQ
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AF RR4EW15TF U 1
AF RR4EW15JQ C 25
BS 1 744 RR4EW15TF
BS 745 745 RR4EW15JQ
BS 746 793 RR4EW15TF
BS 794 802 RR4EW15JQ

RD RR4EW15TF 797 0 0
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TCCAATCCCCGGTTCAATTCTTAGCAGTTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGCCGGAA
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TTTGTCACACAATAATCTATCGGGTCGGATCCCGGATTCGCTCTCTTCAGCTAAGTTCGT
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TGATCACCTTGAGGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGAT
GAAGACATGTTAAAGTAATAAATAAGGCAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCA
GTTTGTTTATATTCTTCGCTTTCTTTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAC
TCTGTTCTGCTAGCAACGAATGGCTACACCGATCCAAATCTGTTCCTGGTGTATGGTAGA
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TTATAGATCTTAA
TGTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4EW15JQ 778 0 0
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CGAACTCACCGGGTCGATTCCCGGGTCGATCTCGGGTATGAAACGGTTAGCGGATCTGGA
TCTATCCAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACCTGAGTGGATGGGTAAAATGAATGTACT
CTCTGTTTTGAATCTCGATAGCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTCAATTCTTAG
CAGTTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGCCGGAATGCGTTGGAAGGATCCATACCCGA
CGTATTCGGATCCACAACTTATTTCATGTCGCTTGATTTGTCACACAATAATCTATCGGG
TCGGATCCCGGATTCGCTCTCTTCAGCTAAGTTCGTGGGTCATCTAGATATCAGCCATAA
CAGGCTTTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTTTGATCACCTTGAGGCGTCGTCGTT
TAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGACATGTTAAAGTAATAAATA
AGGCAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCAGTTTGTTTATATTCTTCGCTTTCT
TTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTACTCTGTTCTGCTAGCAACGAATGGC
TACACCGATCCAAATCTGTTCCTGGTGTATGGTAGATCTTAAATGGCTACACCGATCCAA
ATCTATACAGCTACTCTGTATCATGTATAAGCAATGTTATAGATCTTAAATGTTTTAG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL9088Contig1 1135 2 6 U
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AAAAAACATCTTCTTGATTCTCTGTTTCCTTTTCTTTCTCCGCTTTTCCTTCTTTCTTAA
TATATCTTTGGGAGGCGAAGAGACGGGCAGTTTCCTCCGATGTCGCGCCGTCTTTTCGCC
TGTTTTCGCGGCAAGAAATCTTCATCCTCCACGAGTAAACCTAACTCCGGTAACAACTCC
GCCGCCGTATCCGATGACGTTCCTGCCGGAGACGGACCCGTCCTCGTCCAGCTTTTCTCG
TCTCAGGGATGCAAAACGTCGCCAGCGGCGGAGATGCTCATGTCCAGGCTCGGCCGAGGT
GATTTCGACGCTCAGATCCGTGGAGGAGAAGACGGTGGTTCTGGATCTCCGGCGATGGTT
CTGGTCTTCCACGTCGATTACTGGGACTACAAGGGCTGGAAGGATCCGTACGGGTCGAGC
CAGTGGACGGTGAGGCAGAAGGCGTACGTGGAGGCGTTGAATCTTGACACGATGTTCACT
CCGCAGCTTGTAATCCAAGGAAGATCTCAACTGGTCGATAACGAGGAAGAGACTCTGCTC
AAATCTATCGTGGAAGCTCCTAGGTTTCCTTCTCCTGCGTTCAAGGCGAGTTTCCAGAGA
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TGCACTGTGAAAGACATAACAGCGAAGAAGTCAGTGTCCGGGACTGCTCATTTCACGCTC
TGGGATGGATTCAACAGCAGCAAATGTGGTGTCGCTGTCTTTCTTCAAAACTCGTCTCTT
CATATCTTTGGTACTCAGAGTTTTAAGTTGCCTGATGAGATTTGAGTTACTCCTTATAAT
CTGAAAACCTTTGGCTTTAAACACGATTTGTTTTTTTTTTTTTCTCTCTGACGCTCATGT
TTTTTCTTGCTTTGTGAATCCATTTCTCCGCAGTGGAATTACTGTTTGTACAGTC


BQ
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AF RR4EH18TF U 1
AF RR4EH18JQ C 307
BS 1 623 RR4EH18TF
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RD RR4EH18TF 714 0 0
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AAAAAACATCTTCTTGATTCTCTGTTTCCTTTTCTTTCTCCGCTTTTCCTTCTTTCTTAA
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GATTTCGACGCTCAGATCCGTGGAGGAGAAGACGGTGGTTCTGGATCTCCGGCGATGGTT
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QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4EH18JQ 829 0 0
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GACGCTCAGATCCGTGGAGGAGAAGACGGTGGTTCTGGATCTCCGGCGATGGTTCTGGTC
TTCCACGTCGATTACTGGGACTACAAGGGCTGGAAGGATCCGTACGGGTCGAGCCAGTGG
ACGGTGAGGCAGAAGGCGTACGTGGAGGCGTTGAATCTTGACACGATGTTCACTCCGCAG
CTTGTAATCCAAGGAAGATCTCAACTGGTCGATAACGAGGAAGAGACTCTGCTCAAATCT
ATCGTGGAAGCTCCTAGGTTTCCTTCTCCTGCGTTCAAGGCGAGTTTCCAGAGACCAACC
TCAGAGACACTGCAAGTATCACTAACGGGAGCTTTGAGGATGAAAGTAGACGGGAACGGA
CTAGACATAATGGTGGCGTTATATGAAACGGGGCTGGTGACAGACTGTGAGAGAGGAGAG
AACGAAGGAAGAATGTTGTCGAATGACTACGTTGTAAGAAAGATGGAGAAGATGTGCACT
GTGAAAGACATAACAGCGAAGAAGTCAGTGTCCGGGACTGCTCATTTCACGCTCTGGGAT
GGATTCAACAGCAGCAAATGTGGTGTCGCTGTCTTTCTTCAAAACTCGTCTCTTCATATC
TTTGGTACTCAGAGTTTTAAGTTGCCTGATGAGATTTGAGTTACTCCTTATAATCTGAAA
ACCTTTGGCTTTAAACACGATTTGTTTTTTTTTTTTTCTCTCTGACGCTCATGTTTTTTC
TTGCTTTGTGAATCCATTTCTCCGCAGTGGAATTACTGTTTGTACAGTC

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL9089Contig1 423 2 1 U
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AGAGGTGCATTGGAAAGGCGTTTACGAGAGGGAACGTGAAGAAAGATACCGATTCAAAAT
GGACAAGAAACGTAAAACTAAGGAGAAACTTTACGATAGAATCAAGAACGGTTACAAGCA
GAAATCACTCGGAAGATGAAAACAGAGAACTACTTGCGGTGCATTCAAAGAAGATCAACG
TGCTCTCTCTCAGTCGCAGACAACACATGAGATTTACACAGAAAGATATCATCGAAAGCA
AAGAGATCACTCTTTTACCATTTTCTGGAGATTATAGGAGAAGAGAGTTTAGATTTAGAA
CCTATTCTTCACCCCCAGTAAAAGTAAAGGTTTCCTTTGTTATTATTTTCTTTGCTGCCA
TAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RR4AT10JQ C 1
AF RR4AT10TF U 1
BS 1 423 RR4AT10TF

RD RR4AT10JQ 423 0 0
GGCAGAATCAGCAGATGATAACGACCATCCAAGAGAGAGATGGTTATGGCCACTAACCGG
AGAGGTGCATTGGAAAGGCGTTTACGAGAGGGAACGTGAAGAAAGATACCGATTCAAAAT
GGACAAGAAACGTAAAACTAAGGAGAAACTTTACGATAGAATCAAGAACGGTTACAAGCA
GAAATCACTCGGAAGATGAAAACAGAGAACTACTTGCGGTGCATTCAAAGAAGATCAACG
TGCTCTCTCTCAGTCGCAGACAACACATGAGATTTACACAGAAAGATATCATCGAAAGCA
AAGAGATCACTCTTTTACCATTTTCTGGAGATTATAGGAGAAGAGAGTTTAGATTTAGAA
CCTATTCTTCACCCCCAGTAAAAGTAAAGGTTTCCTTTGTTATTATTTTCTTTGCTGCCA
TAA

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR4AT10TF 423 0 0
GGCAGAATCAGCAGATGATAACGACCATCCAAGAGAGAGATGGTTATGGCCACTAACCGG
AGAGGTGCATTGGAAAGGCGTTTACGAGAGGGAACGTGAAGAAAGATACCGATTCAAAAT
GGACAAGAAACGTAAAACTAAGGAGAAACTTTACGATAGAATCAAGAACGGTTACAAGCA
GAAATCACTCGGAAGATGAAAACAGAGAACTACTTGCGGTGCATTCAAAGAAGATCAACG
TGCTCTCTCTCAGTCGCAGACAACACATGAGATTTACACAGAAAGATATCATCGAAAGCA
AAGAGATCACTCTTTTACCATTTTCTGGAGATTATAGGAGAAGAGAGTTTAGATTTAGAA
CCTATTCTTCACCCCCAGTAAAAGTAAAGGTTTCCTTTGTTATTATTTTCTTTGCTGCCA
TAA

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL9090Contig1 841 2 2 U
GGGTCTAGCGGCAGCCGTGTGTTCAGGTTGAGGAGAGACGCCATGGGATGAAGACCGGCA
AGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGCAAGCCATACCCTAAATCCCGCTACTGCCGCGGTGTC
CCCGATCCCAAAATCAGGGTCTACGATGTCGGCATGAAGAGGAAAGGAGTCGACGAGTTC
CCATTCTGCGTCCACTTGGTCTCGTGGGAGAAGGAGAACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGAG
GCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCCGGGAAAGACGCTTTCCAC
CTGAGGATTAGGGTTCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCT
GGAGCCGATAGGCTTCAGACCGGTATGAGAGGCGCTTTCGGGAAGGCCTTGGGGACTTGT
GCTAGGGTTGCGATCGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCAC
CATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATT
GTCAGCAGGAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTCACGAAGTTGAGGCAAG
AGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCATGCCATGGGCCTTTGG
CTAACCGTCAGCCCGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTGAAGTTTCAGAGCTCTTG
TCTACTCTCTTTTCCTCCCGTGAAAGATTATTAGTCAGTCTGAAACTTGTCTTTGAAAGT
ACTTGTCTTAAAAAGTTTTTAGTTGGACCTCATTCAGTATCCCGAACCTTTTTGATATGA
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RR4AR86TF U 1
AF RR4AR86JQ C 1
BS 1 783 RR4AR86TF
BS 784 841 RR4AR86JQ

RD RR4AR86TF 783 0 0
GGGTCTAGCGGCAGCCGTGTGTTCAGGTTGAGGAGAGACGCCATGGGATGAAGACCGGCA
AGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGCAAGCCATACCCTAAATCCCGCTACTGCCGCGGTGTC
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GTCAGCAGGAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTCACGAAGTTGAGGCAAG
AGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCATGCCATGGGCCTTTGG
CTAACCGTCAGCCCGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTGAAGTTTCAGAGCTCTTG
TCTACTCTCTTTTCCTCCCGTGAAAGATTATTAGTCAGTCTGAAACTTGTCTTTGAAAGT
ACT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR4AR86JQ 841 0 0
GGGTCTAGCGGCAGCCGTGTGTTCAGGTTGAGGAGAGACGCCATGGGATGAAGACCGGCA
AGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGCAAGCCATACCCTAAATCCCGCTACTGCCGCGGTGTC
CCCGATCCCAAAATCAGGGTCTACGATGTCGGCATGAAGAGGAAAGGAGTCGACGAGTTC
CCATTCTGCGTCCACTTGGTCTCGTGGGAGAAGGAGAACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGAG
GCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCCGGGAAAGACGCTTTCCAC
CTGAGGATTAGGGTTCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCT
GGAGCCGATAGGCTTCAGACCGGTATGAGAGGCGCTTTCGGGAAGGCCTTGGGGACTTGT
GCTAGGGTTGCGATCGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCAC
CATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATT
GTCAGCAGGAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTCACGAAGTTGAGGCAAG
AGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCATGCCATGGGCCTTTGG
CTAACCGTCAGCCCGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACCTATTGAAGTTTCAGAGCTCTTG
TCTACTCTCTTTTCCTCCCGTGAAAGATTATTAGTCAGTCTGAAACTTGTCTTTGAAAGT
ACTTGTCTTAAAAAGTTTTTAGTTGGACCTCATTCAGTATCCCGAACCTTTTTGATATGA
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL9091Contig1 756 2 2 U
GGAACTGGAATCCAAAGTTTCTGTTGTTGGTGGCTCAAAAGAATCACCACACCAAGTTTT
TCCAGACAAACTCTCCTGACAACGTTCCTCCAGGGACAATCATCGACAGCAAAATCTGTC
ACCCAAAGAACAACGATTTCTATCTCTGTGCGCACGCTGGCATGATTGGAACAACACGTC
CTACCCATTACCATGTCCTGTATGATGAGATCCATTTCTCACCTGATGAGCTTCAAGAGC
TCGTCCACTCGCTCTCTTACGTGTACCAAAGAAGCACGACCGCCATCTCTGTTGTTGCAC
CGATCTGCTATGCTCACTTGGCAGCTGCTCAGCTAGGAACGTTCATGAAGTTTGAATATC
AGTCAGAGACGTCCTCAAGCCATGGTGGCGTGACAGCTCCAGGACCAATCTCTGTTGCGC
AGCTCCCTAAACTCAAAGACAACGTCGCCAATTCCATGTTCTTCTGTTAGGTGTAGAAGA
AGAAGAAGAAGTATCTATCTCTCTCTCTAATGTGCAGAAGTCTGTTTTCCACAACTTGGC
TCTTTTTAAGTACTCTAGTAATCGGCTTTTTTATCCTTAGGATCTCTCTCGGCTTTTTAT
AAGTGGATTTAAGGCAACCAAACGATAGACGTGGTATGTATTTTGTGACTTTATTCGCCA
GTCTTGTTGCCTGTAGGGGGCTTGAAATATACTTTTGCCCATCAACTCTTTAAGTTGCTT
TAATTTCTGGGATTACTAGACCCATTATTGCAAACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C172TF U 1
AF RR4C172JQ C 4
BS 1 593 RR4C172TF
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CTACCCATTACCATGTCCTGTATGATGAGATCCATTTCTCACCTGATGAGCTTCAAGAGC
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QA 1 593 1 593
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TCCCTAAACTCAAAGACAACGTCGCCAATTCCATGTTCTTCTGTTAGGTGTAGAAGAAGA
AGAAGAAGTATCTATCTCTCTCTCTAATGTGCAGAAGTCTGTTTTCCACAACTTGGCTCT
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TTTCTGGGATTACTAGACCCATTATTGCAAACT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B973TF U 1
AF RR4B973JQ C 78
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BS 758 825 RR4B973JQ

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GAAAAAGATTTGAAGATTGCGAACGTCATCTGCAAGA

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DS 

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AAGTATCTCTTCTACTGCTACTGAGCTTAGCTCAATTTATGGTAACAGACTTCCTCCTCA
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CCTGAGGTTAGTACAGCTGGATAGAGTAGCAGAAAGTCTGTCACACCATGTTATGGAGCA
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AAGAGATCTTATTGTACACACTCATTCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4H683JQB C 1
AF RR4H683TF U 1
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CAAGGATTTTCGTCATG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR4H683TF 497 0 0
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GTGAGGTTCGAGCATTTATTGAGGCTAATTTCGACCCAGGAGCCAAGACTAAGTACTACA
TCACCTTTGCTGCAAAAGAATCCGACTCTCCTGATGCGCCTCTCGTGGAGTATCAAGCTA
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AACAATAAACATGGGTAGAGGGTAATGCATAGCTTTTAGTTATCACTCTTTGTTGGACTA
GAAGAGAAAATATTAAACATATCATAAGAACCTGCTTGGATTTACTCTTATTTGTGATGC
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CAAGGATTTTCGTCATG

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL9095Contig1 825 2 1 U
GGAAAAAATTTGGAGCTACAAACTGGCAAGTCCGAAAACATGTCGCGTGGGGGGCCAGTT
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GGTAACTATCCTTGTCGTTTGTGCAATGTGGTATACCAGAGTCAAGTTGTCTTTGAGTTT
CATCTCAAGGGTCAGAAGCATGCTTCCATGCTGCTGGGTCAATCAGAGGCGTTCACTGAT
TCTAAGAAGCCTCAAGAGAAAGCTGTCTGGGAGAAGGTTCAACCAAGAGAGCAGAAACTT
GTAAAGACGGAGGATCATGGGTGTCAAGGGGCAGAAGAAGATAAAGAGGAAGTGAAGGAG
ATAAATGCCATATCTGAGAACCTAACGCGTGACTTCGCTGGAATGAGCCAAGAGTCTGGT
ATACCCAAAGAATCGAGAGGATGCTTAGATGTGATTCCTGAGACAGTAAAAGCGCCAGCA
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CCAGTAAAGGACTTTGCAGAACGTAAGGAGCATCCCGGTGAGGCTGCCAAGAAGGAAGAG
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ATGTTTAGTTGGTGTTCCAATGAGGACTGAGGGAATATAACGACGTTAAGTAACGATTTG
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BQ
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AF RR4A421TF U 1
AF RR4A421JQ C 72
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TCTAAGAAGCCTCAAGAGAAAGCTGTCTGGGAGAAGGTTCAACCAAGAGAGCAGAAACTT
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ATACCCAAAGAATCGAGAGGATGCTTAGATGTGATTCCTGAGACAGTAAAAGCGCCAGCA
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GCTAAGGTCCAAGCTGATAACTTGTGGACCAGACTTTGGGGGAAAAAGAGTTAAAGAAAG
CCTTGCTGAGTAATTGTCTGATTTAAAACTGTAGTTTATGGTCAGGTCAACTGTATATCT
ATGTTTAGTTGGTGTTCCAATGAGGACTGAGGGAATATAACGACGTTAAGTAACGATTTG
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DS 

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TTGTCGTTTGTGCAATGTGGTATACCAGAGTCAAGTTGTCTTTGAGTTTCATCTCAAGGG
TCAGAAGCATGCTTCCATGCTGCTGGGTCAATCAGAGGCGTTCACTGATTCTAAGAAGCC
TCAAGAGAAAGCTGTCTGGGAGAAGGTTCAACCAAGAGAGCAGAAACTTGTAAAGACGGA
GGATCATGGGTGTCAAGGGGCAGAAGAAGATAAAGAGGAAGTGAAGGAGATAAATGCCAT
ATCTGAGAACCTAACGCGTGACTTCGCTGGAATGAGCCAAGAGTCTGGTATACCCAAAGA
ATCGAGAGGATGCTTAGATGTGATTCCTGAGACAGTAAAAGCGCCAGCAGATGTGAGTGT
CACAGAGAAGTTGAAAGATGAGTCCAAACATAAACCAACACCATCGAAACCAGTAAAGGA
CTTTGCAGAACGTAAGGAGCATCCCGGTGAGGCTGCCAAGAAGGAAGAGGCTAAGGTCCA
AGCTGATAACTTGTGGACCAGACTTTGGGGGAAAAAGAGTTAAAGAAAGCCTTGCTGAGT
AATTGTCTGATTTAAAACTGTAGTTTATGGTCAGGTCAACTGTATATCTATGTTTAGTTG
GTGTTCCAATGAGGACTGAGGGAATATAACGACGTTAAGTAACGATTTGAACCTAAAGCT
AAACATAATCTAGTTGTAAAGCTCTTCAATAGCC

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DS 



AS 1 2

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ACATGTCCGGTTTCTTCTGTGTGTACTAAGAAAATAACATACCGAGGCCAAGAACGAAGT
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AAAGTGCTTGGCCTTCTTCATTACGACTCCATCTGGACTTTTCTCAGAGATGAAATGAGT
CGTAGGAGATCGATGATCAACGAGCGGAGAAAAGACAAGGAGGTTGGTGCGGCAAATGGC
CATTGATTTTGGGGTTTGTGACCATTTTGGTAAAGGCTCTTTCCTCTTTTCTTCCTTTTT
ATTTTTGATGTCGAAATGATTAGAACGGAGGAAAGCATGATCGTATAATAAGACCTCTTT
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BQ
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AF RR4A748TF U 1
AF RR4A748JQ C 52
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AAATCGAGTGTAACATATATACGACATGTATTGTGAGATCTCTACTTTGTATCATTAGGT
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DS 

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GATGAGAACACATGTCCGGTTTCTTCTGTGTGTACTAAGAAAATAACATACCGAGGCCAA
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GAAATGAGTCGTAGGAGATCGATGATCAACGAGCGGAGAAAAGACAAGGAGGTTGGTGCG
GCAAATGGCCATTGATTTTGGGGTTTGTGACCATTTTGGTAAAGGCTCTTTCCTCTTTTC
TTCCTTTTTATTTTTGATGTCGAAATGATTAGAACGGAGGAAAGCATGATCGTATAATAA
GACCTCTTTATTTAGTTTTGAATCGTTCTCGCCAAAGTAACACCTCTTTATCATATACTA
ATCAAAGAGAAATCGAGTGTAACATATATACGACATGTATTGTGAGATCTCTACTTTGTA
TCATTAGGTCTTAGCAAACCTTGTGATATTCAGAATCGACTATATCATATAATGGGATG

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

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GCGCCTGAAGTTATAATGGAGGAGATTTTGTCTGATGATGATGGAGAGTTTATGGACGAT
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AAGAAATTCAACCTTGCAGAAACTTCTCCAGAAAACTCCTCAGGTCAAAGTGAAGGCAAT
ACATCTGATGAAGGAGATGAGAAGCCACTGTTGGAATCTGATTCTCCAATAAGAGTTCAT
GAGGAACCTCAAGCTGATATTACCACTGCATCAACAGGCCAATTACCTACCGAACTTCCG
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CTATTCAAGAAAGCAGAGCAGAAAACAGTTGGAACTTCGAAGGCCAAATCATCCTCAAAG
GCTGCCCAGAAGAAATAGAGGTCTGCTGTTTCTTTTTGCTGTGAGAATGAACTGTTTTTC
TAGCTCTTTCAGTTATGTTCTGTAAGAGGAATGAGATATTAATTGACTACAAGGCCGATG
ATTATGTTTCAGAAATAATAGGAATGTGATAATGAATTTCACCAAGCTTAG


BQ
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AF RR4C838JQ C 1
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ATTATGTTTCAGAAATAATAGGAATGTGATAATGAATTTCACCAAGCTTAG

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CR24JQ C 1
AF RR4CR24TF U 1
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QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

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BQ
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DS 

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QA 1 260 1 260
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGGTTCTGTTTGATGCAGAAGCTTATTTGAACTTCTAATTGTGACAATCTTACCCGTCAT
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TAAATGATCAAATACAAAGTATTATAGGGTATTACAAATGGCAGCAACAGAAGCTAAAAC
AAAAAAAAATAAGCGTTTACTATGTATTTGATTGATAATCTAAAAACAATGAAACAATAC
TGAAGCGATCTATACTTACATTTCTGTCTGTGAAGGCGGGGATTACTTTCACTTGAATAC
ACCAGCTGGTTTTGAATGATTTCACGTCAGAAAGAATCCAATAAAAGTTGAACCTTGGGT
GTCGATGGGATGAAACATTTATAAATATACAAAGATTTGGTACATATATTGTCTAAGAAT
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QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B033TF U 1
AF RR4B033JQ C 162
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QA 1 756 1 756
DS 

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QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL9102Contig1 771 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AI05TF C 1
AF RR4AI05JQ U 6
BS 1 5 RR4AI05TF
BS 6 771 RR4AI05JQ

RD RR4AI05TF 771 0 0
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AAAACTAAATGTACGAAATCTACATGCATATATATAGAGAGACGAGAACATGGCCAAAAA
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ACTATCATCTGGGGAATAACGATTGCAAGGTTCAACACTCCTATAGCCAAACCTTGACCA
CCGCCGGAATCAGCAGTGACTTCTGCTGTGACAGAGAAAGGGACACTGTATGTGATAGCT
AGAGGAAAACCAAGGAGTGCAAAAACGACTACGGCTGCGGTTCTTGTTGTTTCGTTTCCA
GCTATTATGTGTTCGATTCCTTTAGAGTTATCCCTTAAAGACATCAGGCTAATAACGGCT
GTTCCTGCCATGCATGCGAATACTGTAAAATTGCTCAGAGCCCATACAGCTCGTGCACCC
ATCCGCTGACACATTGGCTCAATCAAGAATGAGCTGATCCCAAGAACAACAGAGTTTAGT
AACAAGCCAAATGAACCTTCCCGAACACCTTGATCATAAAGTTCCACGTCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4AI05JQ 766 0 0
AAAAGAGGTGTATTTGAAAATTTAGAGTCACCTTGTTGTGTCTTTACATTACAACAAAAC
TAAATGTACGAAATCTACATGCATATATATAGAGAGACGAGAACATGGCCAAAAAGAATT
TGAATCTTAAGTCTGTACCTTATGAAAAAAGACTGTGTGGCTCGGTTTTGTATTGGAGTT
CCGGTTTAAAATATTTCACCCGATGTGGAAACCAGTAGACTGGAAAGCACTAGATAGTGT
AGGAAGGCTACGCAAAGCAATAACTCCAGCAGCAAATGCAGCAACAGACGCCAAAACAAA
CGCAGGTAGGTTTCCTCCTCCAAACAATGCATCCCATGGACCAGCTCCAAGCGAGACTAT
CATCTGGGGAATAACGATTGCAAGGTTCAACACTCCTATAGCCAAACCTTGACCACCGCC
GGAATCAGCAGTGACTTCTGCTGTGACAGAGAAAGGGACACTGTATGTGATAGCTAGAGG
AAAACCAAGGAGTGCAAAAACGACTACGGCTGCGGTTCTTGTTGTTTCGTTTCCAGCTAT
TATGTGTTCGATTCCTTTAGAGTTATCCCTTAAAGACATCAGGCTAATAACGGCTGTTCC
TGCCATGCATGCGAATACTGTAAAATTGCTCAGAGCCCATACAGCTCGTGCACCCATCCG
CTGACACATTGGCTCAATCAAGAATGAGCTGATCCCAAGAACAACAGAGTTTAGTAACAA
GCCAAATGAACCTTCCCGAACACCTTGATCATAAAGTTCCACGTCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL9103Contig1 733 2 5 U
GAACCACTGATAATGGTCTTTGTAAACATCTCATAAAATATCTCAACAATAATACAAAAT
CAAAGTATCAATACAATACTATGAGAAACTGGACTTTACTATTAACAATTTAGGGCGGTG
TCCCTAGAGTATCAGAAGCCGTGTCCCTAGTGGGATGCTCACATCTCTTACCGCACTTCA
TTCATATTTCTAAAGCCATCCAGACATGAAACATTCAAGATGATATATGTACTAATCGGT
GAGCAAGTGAAGAATAATAACTCATTTTAAAAAGTATTCCTTGGAAGAAAGCAAAACCTT
GCAAGCCTTGTCACCAAAGAATACTCAAACCCAGATCCTAATGCTGCTACCACGCTGTTG
CGAGAAGTAGTAACTTAATAAAATTATGCAAGTAAATGGCTCCTGAAATCCTGAGACATA
ATCCTTGATATCGAACAGCAAATGTATCCTCTCAACATAAGACTGAAGCGATAAGAGACC
CACCACATCAAACTAAAAAACCTAAGTTTTCATTCTCCATGAAAAACGCTGAGCCAAAGA
TGTAGAGCAGCTCTTCAAAAGCTTTCTCACAATTTCTGTAGCAGTAACTCTAAAATGTCT
ACCCCAACCGGTTACTATATCAATCCCGAGAGGCTGGAACCTGAAATTGGTAAGCTAGTA
GTTGCTGCTCTTCTCTCTTTATCCATCATGAAAAAGTTATTTTCTTCTGCAAATTCTAAA
CAGATCCGGCCTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A695JQ U 2
AF RR4FN68JQ U 1
BS 1 268 RR4FN68JQ
BS 269 269 RR4A695JQ
BS 270 329 RR4FN68JQ
BS 330 330 RR4A695JQ
BS 331 733 RR4FN68JQ

RD RR4A695JQ 688 0 0
AACCACTGATAATGGTTTTTGTAAACATCTCATAAAATATCTCAACAATAATACAAAATC
AAAGTATCAATACAATACTATGAGAAACTGGACTTTACTATTAACAATTTAGGGCGGTGT
CCCTAGAGTATCAGAAGCCGTGTCCCTAGTGGGATGCTCACATCTCTTACCGCACTTCAT
TCATATTTCTAAAGCCATCCAGACATGAAACATTCAAGATGATATATGTACTAATCGGTG
AGCAAGTGAAGAATAATAACTCATTTTAAAAAGTATTCCTTGGAAGAAAGCAAAACCTTG
CAAGCCTTGTCACCAAAGAATACTCAAACCCAGATCCTAATGCTGCTACCACGCTGTTGC
GAGAAGTAGTAACTTAATAAAATTATGCAAGTAAATGGCTCCTGAAATCCTGAGACATAA
TCCTTGATATCGAACAGCAAATGTATCCTCTCAACATAAGACTGAAGCGATAAGAGACCC
ACCACATCAAACTAAAAAACCTAAGTTTTCATTCTCCATGAAAAACGCTGAGCCAAAGAT
GTAGAGCAGCTCTTCAAAAGCTTTCTCACAATTTCTGTAGCAGTAACTCTAAAATGTCTA
CCCCAACCGGTTACTATATCAATCCCGAGAGGCTGGAACCTGAAATTGGTAAGCTAGTAG
TTGCTGCTCTTCTCTCTTTATCCATCAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FN68JQ 733 0 0
GAACCACTGATAATGGTCTTTGTAAACATCTCATAAAATATCTCAACAATAATACAAAAT
CAAAGTATCAATACAATACTATGAGAAACTGGACTTTACTATTAACAATTTAGGGCGGTG
TCCCTAGAGTATCAGAAGCCGTGTCCCTAGTGGGATGCTCACATCTCTTACCGCACTTCA
TTCATATTTCTAAAGCCATCCAGACATGAAACATTCAAGATGATATATGTACTAATCGGT
GAGCAAGTGAAGAATAATAACTCATTTTGAAAAGTATTCCTTGGAAGAAAGCAAAACCTT
GCAAGCCTTGTCACCAAAGAATACTCAAATCCAGATCCTAATGCTGCTACCACGCTGTTG
CGAGAAGTAGTAACTTAATAAAATTATGCAAGTAAATGGCTCCTGAAATCCTGAGACATA
ATCCTTGATATCGAACAGCAAATGTATCCTCTCAACATAAGACTGAAGCGATAAGAGACC
CACCACATCAAACTAAAAAACCTAAGTTTTCATTCTCCATGAAAAACGCTGAGCCAAAGA
TGTAGAGCAGCTCTTCAAAAGCTTTCTCACAATTTCTGTAGCAGTAACTCTAAAATGTCT
ACCCCAACCGGTTACTATATCAATCCCGAGAGGCTGGAACCTGAAATTGGTAAGCTAGTA
GTTGCTGCTCTTCTCTCTTTATCCATCATGAAAAAGTTATTTTCTTCTGCAAATTCTAAA
CAGATCCGGCCTC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL9104Contig1 709 2 2 U
CTTAAACATCAAAACCAGATAAAGAGCGCTTAACTTAGTCATCCTAAAATAAAAAGATGA
GGTAAGTTGCGGCCAACTCACAAAGCATACCAATTCCCAATGCTTGGCGCTGAGTGTTTT
GGTCGTAGGAAGAACACAAATAAATACCAGAAAGACAAAACAACCATACGAAGAAGAGTG
TGATAAAAGTATGTCTAGTCTCCATCCTAAGCTTATCGGATAACTGTATGAGTCCTATCC
CTCCCGTGACCAACGAGACGGTGAATAACGACACAGACACGACATACTCTTGCATGTACT
CTTTATACTTTAAAGGCGAACAGATTACCACATAAAAGGCCAACAACGAGATCAAAAACT
GAGGAATCCTCTTTATAGATGCAGGGAGCTCTTTTTCTACACTTGCAATGAACTCCCTGA
AGGGCTGAAATAGAAAATCTGTGAAGACGAAATACCTGAGTAGCATCACTGCGTAAAATG
TTATAGCACTCACGGCACAGTCTCTAAAGAACCGAGACTTTGATGATTCGCAATTGTCTC
CAAATGGCCAGAGTAAATTGATTGATATGGCTAGGGCCAAGAGCGAGACTAGAGTCATCA
TGTACCATATTCCTCTGCTTACCATCACATCTCTTTTACTCATTATCTCCATCATTCTAT
TTCTTGGTTTTTGAGACTTAACAGGGATGTGAGGAAGTAGGGTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AS09TF C 1
AF RR4AS09JQ U 5
BS 1 4 RR4AS09TF
BS 5 709 RR4AS09JQ

RD RR4AS09TF 709 0 0
CTTAAACATCAAAACCAGATAAAGAGCGCTTAACTTAGTCATC*TAAAATAAAAAGATGA
GGTAAGTTGCGGCCAACTCACAAAGCATACCAATTCCCAATGCTTGGCGCTGAGTGTTTT
GGTCGTAGGAAGAACACAAATAAATACCAGAAAGACAAAACAACCATACGAAGAAGAGTG
TGATAAAAGTATGTCTAGTCTCCATCCTAAGCTTATCGGATAACTGTATGAGTCCTATCC
CTCCCGTGACCAACGAGACGGTGAATAACGACACAGACACGACATACTCTTGCATGTACT
CTTTATACTTTAAAGGCGAACAGATTACCACATAAAAGGCCAACAACGAGATCAAAAACT
GAGGAATCCTCTTTATAGATGCAGGGAGCTCTTTTTCTACACTTGCAATGAACTCCCTGA
AGGGCTGAGATAGAAGATCTGTGAAGACGAAATACCTGAGTAGCATCACTGCGTAGAATG
TTATAGCACTCACGGCACAGTCTCTAAAGAACCGAGACTTTGATGATTCGCAATTGTCTC
CAAATGGCCAGAGTAGATTGATTGATATGGCTAGGGCCAAGAGCGAGACTAGAGTCATCA
TGTACCATATTCCTCTGCTTACCATCACATCTCTTTTACTCATTATCTCCATCATTCTAT
TTCTTGGTTTTTGAGACTTAACAGGGATGTGAGGAAGTAGGGTTTCCCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4AS09JQ 705 0 0
AACATCAAAACCAGATAAAGAGCGCTTAACTTAGTCATCCTAAAATAAAAAGATGAGGTA
AGTTGCGGCCAACTCACAAAGCATACCAATTCCCAATGCTTGGCGCTGAGTGTTTTGGTC
GTAGGAAGAACACAAATAAATACCAGAAAGACAAAACAACCATACGAAGAAGAGTGTGAT
AAAAGTATGTCTAGTCTCCATCCTAAGCTTATCGGATAACTGTATGAGTCCTATCCCTCC
CGTGACCAACGAGACGGTGAATAACGACACAGACACGACATACTCTTGCATGTACTCTTT
ATACTTTAAAGGCGAACAGATTACCACATAAAAGGCCAACAACGAGATCAAAAACTGAGG
AATCCTCTTTATAGATGCAGGGAGCTCTTTTTCTACACTTGCAATGAACTCCCTGAAGGG
CTGAAATAGAAAATCTGTGAAGACGAAATACCTGAGTAGCATCACTGCGTAAAATGTTAT
AGCACTCACGGCACAGTCTCTAAAGAACCGAGACTTTGATGATTCGCAATTGTCTCCAAA
TGGCCAGAGTAAATTGATTGATATGGCTAGGGCCAAGAGCGAGACTAGAGTCATCATGTA
CCATATTCCTCTGCTTACCATCACATCTCTTTTACTCATTATCTCCATCATTCTATTTCT
TGGTTTTTGAGACTTAACAGGGATGTGAGGAAGTAGGGTTTCCCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL9105Contig1 579 2 2 U
GGATATAAAACACATTAAGATAAAAACTGTATGCAGGTAACGTGACAACAATACAACAAC
ACATCACAACACAGTTTACAAGCTTACAAAATTTCAAAGTTGAAACTACGAATTCTATGC
AGCTTGTGGACGTCTTCTACTATGGTGTGGCCAATAGTCTAACACAACAACCTTGTAGCT
TTTTATATATACTTCGGACTACTTTACTGCAATTCTCACTTATCATCAAGGTTCCATAAG
TATTTTCCTGAGGTTTTCATTCCATTTCTTCTCCGTCCAACATCCTGAGTTTACAAGTGA
GGTTAACCAAACTTCATCAGATTTTGTTGGCTCATCGTCATCGTTCCTATGCCAGGTCCA
ATGCGCATGGGTTGAATTCACCATCTGAAGTTCGCCATGTCCAAAGCTTGCTTCCCTGAA
GACTGACCACTCTGGCGACGGATCTTTGTACTTGCGAGCTAGTACTTCTCTGTTTCCTCC
ATCGCCTATGGTTATATGCACAGGACCACATGGATCTGATTTACCATTGTTGACACGTTT
CGTGCGTTCATAAGCATGAACATGACCAGTGAATACAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4DT67JQ U 1
AF RR4E167JQ U 1
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QA 1 569 1 569
DS 

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GGATATAAAACACATTAAGATAAAAACTGTATGCAGGTAACGTGACAACAATACAACAAC
ACATCACAACACAGTTTACAAGCTTACAAAATTTCAAAGTTGAAACTACGAATTCTATGC
AGCTTGTGGACGTCTTCTACTATGGTGTGGCCAATAGTCTAACACAACAACCTTGTAGCT
TTTTATATATACTTCGGACTACTTTACTGCAATTCTCACTTATCATCAAGGTTCCATAAG
TATTTTCCTGAGGTTTTCATTCCATTTCTTCTCCGTCCAACATCCTGAGTTTACAAGTGA
GGTTAACCAAACTTCATCAGATTTTGTTGGCTCATCGTCATCGTTCCTATGCCAGGTCCA
ATGCGCATGGGTTGAATTCACCATCTGAAGTTCGCCATGTCCAAAGCTTGCTTCCCTGAA
GACTGACCACTCTGGCGACGGATCTTTGTACTTGCGAGCTAGTACTTCTCTGTTTCCTCC
ATCGCCTATGGTTATATGCACAGGACCACATGGATCTGATTTACCATTGTTGACACGTTT
CGTGCGTTCATAAGCATGAACATGACCAGTGAATACAAT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL9106Contig1 807 2 2 U
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GCTACTATGTTCCACCATCTCTCCGTGCCAAACTGTCTGTTGGACAGAGAGGGTCTCTCG
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ATAATAATAATGCGGTCAACAGCTATGCTACTCCAAAGGCGAATGCTCCTCCTTACGGTG
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ATGCAAATGCAGCGGTGGGAGGAGGAAGATGGAGTCAAAGGCAGACACAACAACAACCGG
CGATGAAGGCAGGGTGGGTGGGAGAAAGTGGTGACATGTTCCTGAGACCTACACAGCCTC
CCAATCCCTACTCTAGAAGAATCGCTGGTTAATGGCCAAAGGGTCTTTCCTTATGACCCA
CACTCATCATCATCTACTATTACCGGAGTCCAAGTCGAAAGTATGAAAGACTGTTGATTT
ACCTCTTATTTGTGTGTTTCTCCTTTCCTAAACTACCTTGTTTATCTATGGATTCTTCGT
CGTTCTGTTCTTGACTTTTTGAATTTTAAGCGTCGGATGTATGGAGTTTTCTTTTCATTT
CGCGATAAAGCTCTCGACTTTTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H757TF U 1
AF RR4H757JQB C 123
BS 1 691 RR4H757TF
BS 692 807 RR4H757JQB

RD RR4H757TF 691 0 0
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GCTACTATGTTCCACCATCTCTCCGTGCCAAACTGTCTGTTGGACAGAGAGGGTCTCTCG
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CGATGAAGGCAGGGTGGGTGGGAGAAAGTGGTGACATGTTCCTGAGACCTACACAGCCTC
CCAATCCCTACTCTAGAAGAATCGCTGGTTAATGGCCAAAGGGTCTTTCCTTATGACCCA
CACTCATCATCATCTACTATTACCGGAGTCCAAGTCGAAAGTATGAAAGACTGTTGATTT
ACCTCTTATTTGTGTGTTTCTCCTTTCCTAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR4H757JQB 685 0 0
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AACAAGCCTGTGGGAAGTTATCATGTCAGAGATGCTAATAAGTATATACCACCACCTGGA
AGGAAGAGTCCTCCATCTAAGAACAAGAACTGGGTATTTCCTCGTGGGCCATCAGAGAAT
GCAAATGCAGCGGTGGGAGGAGGAAGATGGAGTCAAAGGCAGACACAACAACAACCGGCG
ATGAAGGCAGGGTGGGTGGGAGAAAGTGGTGACATGTTCCTGAGACCTACACAGCCTCCC
AATCCCTACTCTAGAAGAATCGCTGGTTAATGGCCAAAGGGTCTTTCCTTATGACCCACA
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CTCTTATTTGTGTGTTTCTCCTTTCCTAAACTACCTTGTTTATCTATGGATTCTTCGTCG
TTCTGTTCTTGACTTTTTGAATTTTAAGCGTCGGATGTATGGAGTTTTCTTTTCATTTCG
CGATAAAGCTCTCGACTTTTGGACC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL9107Contig1 695 2 2 U
TTTCTTTTATTAAACGATCATAACTGAAAAGATGCTCTCACATAATTGTCTTTACAGATT
TAAGTAGTTTAAATCAGCATTGCAATGAATAATATCATTACAGTGCAATATGCAAATTAC
ATGTACATATACTAATAAAGCCCAACCAGTATTGCTGTGTCAAGTAGAAGAAGAGAAGAT
CATGAGAACCCAAAACCTCAGACGAATAAGTGGTCTTCCATGACATATTATAAAGCTTCA
AATATCTCTATATTATGATGTGAAAAAAACTCTCAATTGATTAATTAGCTGCTTTGGAAC
CGTTAGAAGAAGAGGCCTCACCAGATTCGCAGTGTTCGTGGTTATGATCATGATCATGGT
GGTGGTGGTTATCATCATCATCTTCTTCGCTGTCATCCTCATCAAAGGGCTTCTGTTTGT
GAAAGATGCAACATTTCTTGGAACTCTTCTTCTGCATGAACTCGTTATCAACTGTGCCGT
CTTTCCAGGAGACTTTCTTCTTCTTCCTGTTCAAACGAAGCACTAATCTTTCTGTAGGCT
GTGACTGAGAAACAGGGGTTTCTAAGATGACAGAGGTTGTCGCTGAAGAAGAAGGCCTGG
TCACTGTGCTCATGGCTCAAAATATAGCTTTCTGATACCTTGAAGATGAAGAAGTCGTCT
CGGATGTTCCAATGAACAAGGATGAATAGAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EI12TF C 1
AF RR4EI12JQ U 12
BS 1 11 RR4EI12TF
BS 12 695 RR4EI12JQ

RD RR4EI12TF 695 0 0
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TAAGTAGTTTAAATCAGCATTGCAATGAATAATATCATTACAGTGCAATATGCAAATTAC
ATGTACATATACTAATAAAGCCCAACCAGTATTGCTGTGTCAAGTAGAAGAAGAGAAGAT
CATGAGAACCCAAAACCTCAGACGAATAAGTGGTCTTCCATGACATATTATAAAGCTTCA
AATATCTCTATATTATGATGTGAAAAAAACTCTCAATTGATTAATTAGCTGCTTTGGAAC
CGTTAGAAGAAGAGGCCTCACCAGATTCGCAGTGTTCGTGGTTATGATCATGATCATGGT
GGTGGTGGTTATCATCATCATCTTCTTCGCTGTCATCCTCATCAAAGGGCTTCTGTTTGT
GAAAGATGCAACATTTCTTGGAACTCTTCTTCTGCATGAACTCGTTATCAACTGTGCCGT
CTTTCCAGGAGACTTTCTTCTTCTTCCTGTTCAAACGAAGCACTAATCTTTCTGTAGGCT
GTGACTGAGAAACAGGGGTTTCTAAGATGACAGAGGTTGTCGCTGAAGAAGAAGGCCTGG
TCACTGTGCTCATGGCTCAAAATATAGCTTTCTGATACCTTGAAGATGAAGAAGTCGTCT
CGGATGTTCCAATGAACAAGGATGAATAGAGACCC

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DS 

RD RR4EI12JQ 684 0 0
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AATCAGCATTGCAATGAATAATATCATTACAGTGCAATATGCAAATTACATGTACATATA
CTAATAAAGCCCAACCAGTATTGCTGTGTCAAGTAGAAGAAGAGAAGATCATGAGAACCC
AAAACCTCAGACGAATAAGTGGTCTTCCATGACATATTATAAAGCTTCAAATATCTCTAT
ATTATGATGTGAAAAAAACTCTCAATTGATTAATTAGCTGCTTTGGAACCGTTAGAAGAA
GAGGCCTCACCAGATTCGCAGTGTTCGTGGTTATGATCATGATCATGGTGGTGGTGGTTA
TCATCATCATCTTCTTCGCTGTCATCCTCATCAAAGGGCTTCTGTTTGTGAAAGATGCAA
CATTTCTTGGAACTCTTCTTCTGCATGAACTCGTTATCAACTGTGCCGTCTTTCCAGGAG
ACTTTCTTCTTCTTCCTGTTCAAACGAAGCACTAATCTTTCTGTAGGCTGTGACTGAGAA
ACAGGGGTTTCTAAGATGACAGAGGTTGTCGCTGAAGAAGAAGGCCTGGTCACTGTGCTC
ATGGCTCAAAATATAGCTTTCTGATACCTTGAAGATGAAGAAGTCGTCTCGGATGTTCCA
ATGAACAAGGATGAATAGAGACCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTACGATCCCTAGGAACGTGTATAGAGCTGTTCTCGAGGTTTACGTTTCATTCCACGAG
AAAGATGAGTTTTGGTATAGTAACCTTTACAATGACTTTATTACCGCGAACAATCTCAGC
TCTCCTGGTAACGGACCTTTTAGAGAAGTCGTGGTGACTCTCGACGGCGTAGTCGCCGGT
GCGGTTTGGCCTTTCCCTGTTGTGTTCACCGGAGGGATCAATCCTTTGCTGTGGAGACCG
ATCACAGCTATCGGCTCTTTTGATTTGCCGAGCTATGATATCGAGGTGACGCCTTTCTTG
GGGAGGTTGTTAGATGGAGAGGGTCATAAGGTGGAGTTTAGTGTGACTAACGCGTTGAAT
GTTTGGTACGTTGACGCGAATTTGCATCTTTGGTTGGATAAGGAGAAGGAGGTGGTTGAA
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GGTTTGAATGGTAACTTCACAACCAAGGCGAAAAGATCGGTGCGTTCGATAGGGTTGGTG
AAGTCCTCTCATGGTGACATTATAACCAATGCGAGTCAGGAGTTCACCTATGTAAACAAA
ATGGTTTTAGGAAAAGATGGGAACTTCCAGATCATAGATCAGTTGATCCAAGCTGATGAC
CGTGTTCGGTCCAAGAGAGAGTCAAGAGAAATCTACGCGGCGAGATCAGTCAAGAGCTTT
CCTTTCTACCTATACTCTGACTATTTGGAGGGACAGAATCACACGTCTCGGGAGGTTGCG
AATGTCACGATGGGATTCAATGAGGAGAGATCATGGAGTGATGATGGATCGATGAGAATG
TTTAAGAGCAAGGTGGAGAATAAGCAAGAAGCGCAAGGGGTTATAGTGGTGAAGGATAAT
TTGGTGGTCAGTGGATATGGGGGCACACAACAAGTGTATAACTATGTTGGAAGTGACCAA
TGTTACTTCCGGAACATTAGTAGCTTCAACTACACCATTCTATATGACAAGATTGAAACT
GTTTGCAAGAAGAAAACACTGAAGCTCGGGTTGAGCATCTGACTGCACAGCCGTTGTTGG
CTTGATATATGAGCCAGAGATAGAGACCTCCTCTCTTGCTGTGAGTAACTGTGAAATAGG
AAACACCACAAATAAGTGAAAAAAAGTTTCCTCATGTTTCTTCTCTTATTTTCAGACAAT
GTCTCGGACAGAAGTTTGTATTAATTGTTTTCCCCAGCAGCAAGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY21TF U 1
AF RR4FY21JQ C 513
BS 1 639 RR4FY21TF
BS 640 640 RR4FY21JQ
BS 641 725 RR4FY21TF
BS 726 1307 RR4FY21JQ

RD RR4FY21TF 725 0 0
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GTTACGATCCCTAGGAACGTGTATAGAGCTGTTCTCGAGGTTTACGTTTCATTCCACGAG
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TCTCCTGGTAACGGACCTTTTAGAGAAGTCGTGGTGACTCTCGACGGCGTAGTCGCCGGT
GCGGTTTGGCCTTTCCCTGTTGTGTTCACCGGAGGGATCAATCCTTTGCTGTGGAGACCG
ATCACAGCTATCGGCTCTTTTGATTTGCCGAGCTATGATATCGAGGTGACGCCTTTCTTG
GGGAGGTTGTTAGATGGAGAGGGTCATAAGGTGGAGTTTAGTGTGACTAACGCGTTGAAT
GTTTGGTACGTTGACGCGAATTTGCATCTTTGGTTGGATAAGGAGAAGGAGGTGGTTGAA
GGGAAGGTGTTGGAGGTTGGGGGAAGCTCTCTTGAGATTAGCTCTGTTTCGGACTTTAAA
GGTTTGAATGGTAACTTCACAACCAAGGCGAAAAGATCGGTGCGTTCGATAGGGTTGGTG
AAGTCCTCTCATGGTGACATTATAACCAATGCGAGTCAG*AGTTCACCTATGTAAACAAA
ATGGTTTTAGGAAAAGATGGGAACTTCCAGATCATAGATCAGTTGATCCAAGCTGATGAC
CGTGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR4FY21JQ 795 0 0
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AAGATCGGTGCGTTCGATAGGGTTGGTGAAGTCCTCTCATGGTGACATTATAACCAATGC
GAGTCAGGAGTTCACCTATGTAAACAAAATGGTTTTAGGAAAAGATGGGAACTTCCAGAT
CATAGATCAGTTGATCCAAGCTGATGACCGTGTTCGGTCCAAGAGAGAGTCAAGAGAAAT
CTACGCGGCGAGATCAGTCAAGAGCTTTCCTTTCTACCTATACTCTGACTATTTGGAGGG
ACAGAATCACACGTCTCGGGAGGTTGCGAATGTCACGATGGGATTCAATGAGGAGAGATC
ATGGAGTGATGATGGATCGATGAGAATGTTTAAGAGCAAGGTGGAGAATAAGCAAGAAGC
GCAAGGGGTTATAGTGGTGAAGGATAATTTGGTGGTCAGTGGATATGGGGGCACACAACA
AGTGTATAACTATGTTGGAAGTGACCAATGTTACTTCCGGAACATTAGTAGCTTCAACTA
CACCATTCTATATGACAAGATTGAAACTGTTTGCAAGAAGAAAACACTGAAGCTCGGGTT
GAGCATCTGACTGCACAGCCGTTGTTGGCTTGATATATGAGCCAGAGATAGAGACCTCCT
CTCTTGCTGTGAGTAACTGTGAAATAGGAAACACCACAAATAAGTGAAAAAAAGTTTCCT
CATGTTTCTTCTCTTATTTTCAGACAATGTCTCGGACAGAAGTTTGTATTAATTGTTTTC
CCCAGCAGCAAGGCG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL9110Contig1 668 2 5 U
AATCGCCGTGAGCACTTACATATACGAGCTTTACAACGAGGATACGAAGGCGGGGTCTTT
GTCGGAGAAGAGCTGGGGTCTGTTTAACGCTAATGGTGACCCTGTTTATGTACTGAGGCT
GACTAACTCGGGGTCGGTTCTGTCGAATGATACCACGAACCAGACGTACTGTACTGCGAG
AGAAGGTGCTGATCCTAAGATGCTTCAGGCTGCTCTTGATTGGGCTTGTGGGCCTGGGAA
GATTGATTGTTCGCCTATTAAGCAAGGAGAGGCTTGTTATGACCCTGATAATGTGGTTGC
TCATGCTAACTATGCGTTTGATACTTATTATCATCAGACTGGGAATAATCCCGAAGCTTG
CAACTTCAATGGTGTTGCGAGTATCACCACTACAGATCCGAGTCATGGTTCATGTGTGTT
TGAAGGAAGCCGCGGTGGTGGAAAGAACGGGACCTCTGTGAACATAACGGCACCATCGGC
GAATTCAACGAGCTCTGGAGTGGGGAGTGATTTGTATTACAGTCGGGGAATGTGGAGCGT
TTTTACTATGATTTTGAACCTTGTTGCTTTCTTGTAAGAGAATCTTTCGGACATTGAGCT
TTTTAACTTGTTAGGTGGGAATTGGAGTTAAGATTTGTGTTGGATTCAATTTGTACACAC
GAAACAAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI37TF U 4
AF RR4BS86TF U 1
BS 1 206 RR4BS86TF
BS 207 207 RR4CI37TF
BS 208 486 RR4BS86TF
BS 487 487 RR4CI37TF
BS 488 668 RR4BS86TF

RD RR4CI37TF 599 0 0
G
GCCGTGAGCACTTACATATACGAGCTTTACAACGAGGATACGAGGGCGGGGTCTTTGTCG
GGGAAGAGCTGGGGTCTGTTTAACGCTAATGGTGACCCTGTTTATGTACTGAGGCTGACT
AACTCGGGGTCGGTTCTGTCGAATGATACCACGAACCAGACGTACTGTACTGCGAGAGAA
GGTGCTGATCCTAAGATGCTTCAGGCTGCTCTTGATTGGGCTTGTGGGCCTGGGAAGATT
GATTGTTCGCCTATTAAGCAAGGAGAGGCTTGTTATGACCCTGATAATGTGGTTGCTCAT
GCTAACTATGCGTTTGATACTTATTATCATCAGACTGGGAATAATCCCGAAGCTTGCAAC
TTCAATGGTGTTGCTAGTATCACCACTACAGATCCGAGTCATGGTTCATGTGTGTTTGAA
GGAAGCCGCGGTGGTGGTAAGAACGGGACCTCTGTGAACATAACGGCACCATCGGCGAAT
TCAACGA*CTCTGGAGTGGGGAGTGATTTGTATTACAGTCGGGGAATGTGGAGCGTTTTT
ACTATGATTTTGAACCTTGTTGCTTTCTTGTAAGAGAATCTTTCGGACATTGAGCTTT

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR4BS86TF 668 0 0
AATCGCCGTGAGCACTTACATATACGAGCTTTACAACGAGGATACGAAGGCGGGGTCTTT
GTCGGAGAAGAGCTGGGGTCTGTTTAACGCTAATGGTGACCCTGTTTATGTACTGAGGCT
GACTAACTCGGGGTCGGTTCTGTCGAATGATACCACGAACCAGACGTACTGTACTGCGAG
AGAAGGTGCTGATCCTAAGATGCTTCGGGCTGCTCTTGATTGGGCTTGTGGGCCTGGGAA
GATTGATTGTTCGCCTATTAAGCAAGGAGAGGCTTGTTATGACCCTGATAATGTGGTTGC
TCATGCTAACTATGCGTTTGATACTTATTATCATCAGACTGGGAATAATCCCGAAGCTTG
CAACTTCAATGGTGTTGCGAGTATCACCACTACAGATCCGAGTCATGGTTCATGTGTGTT
TGAAGGAAGCCGCGGTGGTGGAAAGAACGGGACCTCTGTGAACATAACGGCACCATCGGC
GAATTCGACGAGCTCTGGAGTGGGGAGTGATTTGTATTACAGTCGGGGAATGTGGAGCGT
TTTTACTATGATTTTGAACCTTGTTGCTTTCTTGTAAGAGAATCTTTCGGACATTGAGCT
TTTTAACTTGTTAGGTGGGAATTGGAGTTAAGATTTGTGTTGGATTCAATTTGTACACAC
GAAACAAA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL9111Contig1 1316 2 2 U
GGGAGAGCGAGAGAGAGAATCCCGGAGAGAGCGTAACCCTAGCTCCGGCCGCCGTTTGGG
CGTTGCCGGAGGTTTCACCTTCTTTTCTTCCTGTTTTTCTTTTTTTTTGCTCTCTTCTTC
GTAGAACCAAACCAGAATCGATATGCAGGCCTCTCTGACGAAGTTGGACTCTCCGGAACT
GATATGCAGGTCGGTGTTGGTGAACCGTGTGTGGAATGGCGGCGAGGTTCAGGCGAGACT
GTGAAGAAGAGAGTCAGCTTTTAGGAAGACGGGTCTGAACAGATCTAATTTTCCCGATCC
CAGATCTGGTTGAAGACTCGGTTGATGACGGCGTGTGGAGAAGGTTAGAAACCTCCTTTA
TCTCGATTATCCTCCATGAAGTGGTGGTGAGATTGGTAGAGGAGGGGTGCGAGAAACGGT
GGTTAGTGGCATACGGAGAGTTTCGACTCTCATTTAGCCTGAGTCTGTTTCCTGCTTTAT
TGTTTCTGTCATCACTTCCGCTTTTCTTTCCGGATTAGATTTCGGCAGACCTATGACGGA
GGCCACTGGATAACGGCGGTATGACTCAAACCCTGGGTATGCCGTTCGGCGACAACTTTG
AGGGACACAAACTCAACTCTTATTCTAAGGAGCCAGAGGGGACTAAATAAAAAGGATCTC
AGGTTGGGTTATGGTAGCTGAAGTTCGATGGTACTCCCGTTTTGGTCTTTAGGTATCTCA
GTCGGATCTTCTGTCCGCTAGCGAGAGAGGTCTGAATCAAGGAAACACAAAGAACCCAAG
CTTCTACTGGTAAAGCGCCTCTAGGTGAAGATGCTGATGGCTCACATACGTAACTCTTAT
TCAAGGAGGCCATAGCGTGGAGAAAACATAATCATCCGGGAAGGTTTGGGTTTGAGGAAT
CCTTGTTTGTACGACTCTCTTCTCTGCTTTTGGTGTAAGGTTCGGAGACTTCGACCCCGA
TAAGAAGAAGGAGACGCTCGAGCAAGAAGCACCTCCAGTGTTGGTCAGATGATCCGCGTA
CTCCATTCAGATCATCCATTCAGATCAGAAGGTGATCACTGCTTGTTTGTAATTGATGCA
TCGTTGCTCTTTTTTAAATCGGATTAGGTCTAGTCTTTTGTAACTAAGTGGTTTAATTGA
GTGGTTTAAGTGACTGGATGAGATGACATGGTAGCGTAGGAACCAATTAAGTGTTTCTAG
GTGATACTTGTGTCCTCATCCTTATGTCACATTGTGGTTAAAGCCTTTTTTGAGGCATTG
TGGTCACAATTTGATTGTATCAGAATCTTTGTGGTTAATGAAAAGTTGATGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EV15TF U 1
AF RR4EV15JQ C 499
BS 1 653 RR4EV15TF
BS 654 1316 RR4EV15JQ

RD RR4EV15TF 653 0 0
GGGAGAGCGAGAGAGAGAATCCCGGAGAGAGCGTAACCCTAGCTCCGGCCGCCGTTTGGG
CGTTGCCGGAGGTTTCACCTTCTTTTCTTCCTGTTTTTCTTTTTTTTTGCTCTCTTCTTC
GTAGAACCAAACCAGAATCGATATGCAGGCCTCTCTGACGAAGTTGGACTCTCCGGAACT
GATATGCAGGTCGGTGTTGGTGAACCGTGTGTGGAATGGCGGCGAGGTTCAGGCGAGACT
GTGAAGAAGAGAGTCAGCTTTTAGGAAGACGGGTCTGAACAGATCTAATTTTCCCGATCC
CAGATCTGGTTGAAGACTCGGTTGATGACGGCGTGTGGAGAAGGTTAGAAACCTCCTTTA
TCTCGATTATCCTCCATGAAGTGGTGGTGAGATTGGTAGAGGAGGGGTGCGAGAAACGGT
GGTTAGTGGCATACGGAGAGTTTCGACTCTCATTTAGCCTGAGTCTGTTTCCTGCTTTAT
TGTTTCTGTCATCACTTCCGCTTTTCTTTCCGGATTAGATTTCGGCAGACCTATGACGGA
GGCCACTGGATAACGGCGGTATGACTCAAACCCTGGGTATGCCGTTCGGCGACAACTTTG
AGGGACACAAACTCAACTCTTATTCTAAGGAGCCAGAGGGGACTAAATAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR4EV15JQ 818 0 0
CCGC
TTTCTTTCCGGATTAGATTTCGGCAGAC*TATGACGGAGGCCACTGGATAACGGCGGTAT
GACTCAAACCCTGGGTATGCCGTTCGGCGACAACTTTGAGGGACACAAACTCAACTCTTA
TTCTAAGGAGCCAGAGGGGACTAAATAAAAAGGATCTCAGGTTGGGTTATGGTAGCTGAA
GTTCGATGGTACTCCCGTTTTGGTCTTTAGGTATCTCAGTCGGATCTTCTGTCCGCTAGC
GAGAGAGGTCTGAATCAAGGAAACACAAAGAACCCAAGCTTCTACTGGTAAAGCGCCTCT
AGGTGAAGATGCTGATGGCTCACATACGTAACTCTTATTCAAGGAGGCCATAGCGTGGAG
AAAACATAATCATCCGGGAAGGTTTGGGTTTGAGGAATCCTTGTTTGTACGACTCTCTTC
TCTGCTTTTGGTGTAAGGTTCGGAGACTTCGACCCCGATAAGAAGAAGGAGACGCTCGAG
CAAGAAGCACCTCCAGTGTTGGTCAGATGATCCGCGTACTCCATTCAGATCATCCATTCA
GATCAGAAGGTGATCACTGCTTGTTTGTAATTGATGCATCGTTGCTCTTTTTTAAATCGG
ATTAGGTCTAGTCTTTTGTAACTAAGTGGTTTAATTGAGTGGTTTAAGTGACTGGATGAG
ATGACATGGTAGCGTAGGAACCAATTAAGTGTTTCTAGGTGATACTTGTGTCCTCATCCT
TATGTCACATTGTGGTTAAAGCCTTTTTTGAGGCATTGTGGTCACAATTTGATTGTATCA
GAATCTTTGTGGTTAATGAAAAGTTGATGTTGAG

QA 5 818 5 818
DS 



AS 1 2

CO CL9112Contig1 932 2 2 U
CTCTCGTAAACACGCCCGAGTCATCTCGTCACTCACTTTGATTTTGATTTGATCGTCTCT
CTCTAGTTGGGAATTAGGTTTTTTTTTCTTTTCCGAAGATGACGACGGCAGCTAGGCCAA
GTGGGCTCCGGCGAAGGGAGGAAACGAGCAAGGTGGCGCTCGTATCTTCGGCGCGTCTCA
GAAGTACTCGTCCCGTGACGTCGCTGCTCACACAACCTTAAAACCAAGGAGGGAAGGGCA
ACACACTCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAAGAGCGTGAGAG
GAGACACTTCTCTTCTAAAGACAAATCCTACACTGGTGATGATAGAGACCGCAGGAGAGG
GAACCAGCTACTACTGGAAGGCTCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTGTTCCTCGCAG
TGTAGATGCTGATGATTCCGATGTTGATATCAAAAGCGATGATGATAGTGATGACGAAAG
TGATGATGATGACGAGGACGACACCGAAGCCCTTATGGCTGAACTCGACCAGATAAAGAA
AGAAAGGGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGCAGCAGATGGAAGAGCTAAACGC
CAAAGAAGAAGAGCTTTTCAAAGGAAACCCACTGCTGAACAACACTCCAACTTCGTTTAG
TGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGAATCAGGCACGTGGGGAAATGAA
AGCACCTAAGCGATTCATCAATGATACAATCAGGAATGACTTCCACAGAAAGTTCCTACA
CAGATACATGAAGTGATTGAGCAATTTGTTGCTGCATGATGTCTGTATAACGAATGAACT
ATATACAAGGCTTTCGTATTCTGTCTCTTGTACTAAAACAGAAGCTAATCAACGAATGTT
ATATGGTTTATGATTAAAATCTTATGCGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H702TF U 1
AF RR4H702JQB C 432
BS 1 560 RR4H702TF
BS 561 932 RR4H702JQB

RD RR4H702TF 560 0 0
CTCTCGTAAACACGCCCGAGTCATCTCGTCACTCACTTTGATTTTGATTTGATCGTCTCT
CTCTAGTTGGGAATTAGGTTTTTTTTTCTTTTCCGAAGATGACGACGGCAGCTAGGCCAA
GTGGGCTCCGGCGAAGGGAGGAAACGAGCAAGGTGGCGCTCGTATCTTCGGCGCGTCTCA
GAAGTACTCGTCCCGTGACGTCGCTGCTCACACAACCTTAAAACCAAGGAGGGAAGGGCA
ACACACTCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAAGAGCGTGAGAG
GAGACACTTCTCTTCTAAAGACAAATCCTACACTGGTGATGATAGAGACCGCAGGAGAGG
GAACCAGCTACTACTGGAAGGCTCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTGTTCCTCGCAG
TGTAGATGCTGATGATTCCGATGTTGATATCAAAAGCGATGATGATAGTGATGACGAAAG
TGATGATGATGACGAGGACGACACCGAAGCCCTTATGGCTGAACTCGACCAGATAAAGAA
AGAAAGGGTGGAGGAGAGGC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4H702JQB 501 0 0
ATGATTCCGATGTTGATATCAAAAGCGATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGATGATG
ACGAGGACGACACCGAAGCCCTTATGGCTGAACTCGACCAGATAAAGAAAGAAAGGGTGG
AGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGCAGCAGATGGAAGAGCTAAACGCCAAAGAAGAAG
AGCTTTTCAAAGGAAACCCACTGCTGAACAACACTCCAACTTCGTTTAGTGTCAAAAGGA
GGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGAATCAGGCACGTGGGGAAATGAAAGCACCTAAGC
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AGTGATTGAGCAATTTGTTGCTGCATGATGTCTGTATAACGAATGAACTATATACAAGGC
TTTCGTATTCTGTCTCTTGTACTAAAACAGAAGCTAATCAACGAATGTTATATGGTTTAT
GATTAAAATCTTATGCGCTGG

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL9113Contig1 843 2 2 U
GGATACCAACCGGTTTTGCAGTAATTGATGATGATGGTGGTGGTGATGGTTTGGAGGATG
AAAGAGAGATACTAACCGGTTTTACAGAGATTGATGATGGTGGTTTGGAGGATGAAAGGG
AGATAGAGATACTAACCGGTTTTGCAGAAGCTGATATCGATGATGATGACGGTACTTCGG
TCTCTATCTCCATCTCACCGATGATCTCTTCAGAAGGTTTAGCCACAGGGGAAAGAGCAG
AGGGCTCGGGGAATCTCGAGTGGGAAGTCTTGCTGAACTCTCACACGCTAGAGATCAACT
TTGATGTGGAAAACAGAGAGATCTTTATCGGTGGTGGTGATCACGATATTAACATTAATG
CACCCGAGTACGACTTGTTGTTTGAACAGTTTTCTCAAGCCGGTCTTGCCAACCTCCGTC
TCCCTCCAACGTATAGATCTTTCGTCAAGGATCTCCCAATGGTTCAGTTGGTTGCTGGGA
AGGATGAAGGTGCCGTCTGTGCGGTTTGTAAAGATGAGATGAATATGGGTACCGAAGCTG
TTGGGCTGCCTTGTGATCATAAGTACCATGGTGAATGCATTGTACCGTGGCTCAAAACGA
GGAACACATGTCCTGTTTGTCGTTATGAATTGCGTACAGATGATAGACTATGAGCAAAGG
AAGAGCCAGAGAACAACAACTAGTAGCGACAATATATGGTAAATGGATTGGTAAGCATCG
TCTATATATAATTTTGTCTTTATCTTGAAGAATATGTATATTCAATGTTTGGATTGAGTC
AACCTTTATCTTAGTTTATTTTTTATCTTGTATTTTCGCCTCATTGTGTGAGCCATGTGA
TGT


BQ
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10 10 10 

AF RR4FW72TF U 1
AF RR4FW72JQ C 227
BS 1 750 RR4FW72TF
BS 751 843 RR4FW72JQ

RD RR4FW72TF 750 0 0
GGATACCAACCGGTTTTGCAGTAATTGATGATGATGGTGGTGGTGATGGTTTGGAGGATG
AAAGAGAGATACTAACCGGTTTTACAGAGATTGATGATGGTGGTTTGGAGGATGAAAGGG
AGATAGAGATACTAACCGGTTTTGCAGAAGCTGATATCGATGATGATGACGGTACTTCGG
TCTCTATCTCCATCTCACCGATGATCTCTTCAGAAGGTTTAGCCACAGGGGAAAGAGCAG
AGGGCTCGGGGAATCTCGAGTGGGAAGTCTTGCTGAACTCTCACACGCTAGAGATCAACT
TTGATGTGGAAAACAGAGAGATCTTTATCGGTGGTGGTGATCACGATATTAACATTAATG
CACCCGAGTACGACTTGTTGTTTGAACAGTTTTCTCAAGCCGGTCTTGCCAACCTCCGTC
TCCCTCCAACGTATAGATCTTTCGTCAAGGATCTCCCAATGGTTCAGTTGGTTGCTGGGA
AGGATGAAGGTGCCGTCTGTGCGGTTTGTAAAGATGAGATGAATATGGGTACCGAAGCTG
TTGGGCTGCCTTGTGATCATAAGTACCATGGTGAATGCATTGTACCGTGGCTCAAAACGA
GGAACACATGTCCTGTTTGTCGTTATGAATTGCGTACAGATGATAGACTATGAGCAAAGG
AAGAGCCAGAGAACAACAACTAGTAGCGACAATATATGGTAAATGGATTGGTAAGCATCG
TCTATATATAATTTTGTCTTTATCTTGAAG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR4FW72JQ 617 0 0
AGGGGAAAGAGCAGAGGGCTCGGGGAATCTCGAGTGGGAAGTCTTGCTGAACTCTCACAC
GCTAGAGATCAACTTTGATGTGGAAAACAGAGAGATCTTTATCGGTGGTGGTGATCACGA
TATTAACATTAATGCACCCGAGTACGACTTGTTGTTTGAACAGTTTTCTCAAGCCGGTCT
TGCCAACCTCCGTCTCCCTCCAACGTATAGATCTTTCGTCAAGGATCTCCCAATGGTTCA
GTTGGTTGCTGGGAAGGATGAAGGTGCCGTCTGTGCGGTTTGTAAAGATGAGATGAATAT
GGGTACCGAAGCTGTTGGGCTGCCTTGTGATCATAAGTACCATGGTGAATGCATTGTACC
GTGGCTCAAAACGAGGAACACATGTCCTGTTTGTCGTTATGAATTGCGTACAGATGATAG
ACTATGAGCAAAGGAAGAGCCAGAGAACAACAACTAGTAGCGACAATATATGGTAAATGG
ATTGGTAAGCATCGTCTATATATAATTTTGTCTTTATCTTGAAGAATATGTATATTCAAT
GTTTGGATTGAGTCAACCTTTATCTTAGTTTATTTTTTATCTTGTATTTTCGCCTCATTG
TGTGAGCCATGTGATGT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL9114Contig1 704 2 2 U
GCACCGGAAGATTCATTTGATGTTGCACGTAAAGTGAAGGAAATGTACTGCTACACTTGT
TCAGACATCGTTAAGGTAATGCTTAGTGGTTACTGGTTAATGTTTTAAGTTAAACAATAG
TACTATTTTTATTTTAATGATTTTGATTACTGGCTTGTATGCTGAACAATCATATGGTTT
TGGCAGGAGTTTAACAAACACGACAAAGAGCCAGGAAAGTATATTAAACAATGGAAAGGT
GTTAAGCCAAAGACTGGTGCGCCATACACTTGTGACGTGGGATACGAACGTTTCCTTGGA
CCTGAGGTTTGTTACACCATTGTCTCTACTTTTGTTGTTATTAGCGAAGATAATGTTGAG
ATTTTTGTGTGTGTTATTACAGGTCTTCTTTAATCCAGAGATATACAGCAATGATTTTAC
AACTTCTTTACCGGCTGTGATAGACAAATGTATCCAGTCTGCGCCAATTGACACACGGAG
AGCTTTATATAAGGTCTGAAAACACACTGTTTAGTTCGGAGAGTTTTAAGATGTTTTTTA
ATTGGTAATTGATGAATTTGTGAAAAATCATTTTAGAACATAGTACTGTCTGGAGGTTCA
ACTATGTTCAAAGATTTCTGAAGAAGGTTACAAAGGGATCTCAAAAAGATTGTTGATGCT
CGTGTGCTAGCTAATAACGCACGTACCGGTGGTGAAATCACGGT


BQ
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AF RR4FL92TF U 1
AF RR4FL92JQ C 9
BS 1 696 RR4FL92TF
BS 697 704 RR4FL92JQ

RD RR4FL92TF 698 0 0
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TCAGACATCGTTAAGGTAATGCTTAGTGGTTACTGGTTAATGTTTTAAGTTAAACAATAG
TACTATTTTTATTTTAATGATTTTGATTACTGGCTTGTATGCTGAACAATCATATGGTTT
TGGCAGGAGTTTAACAAACACGACAAAGAGCCAGGAAAGTATATTAAACAATGGAAAGGT
GTTAAGCCAAAGACTGGTGCGCCATACACTTGTGACGTGGGATACGAACGTTTCCTTGGA
CCTGAGGTTTGTTACACCATTGTCTCTACTTTTGTTGTTATTAGCGAAGATAATGTTGAG
ATTTTTGTGTGTGTTATTACAGGTCTTCTTTAATCCAGAGATATACAGCAATGATTTTAC
AACTTCTTTACCGGCTGTGATAGACAAATGTATCCAGTCTGCGCCAATTGACACACGGAG
AGCTTTATATAAGGTCTGAAAACACACTGTTTAGTTCGGAGAGTTTTAAGATGTTTTTTA
ATTGGTAATTGATGAATTTGTGAAAAATCATTTTAGAACATAGTACTGTCTGGAGGTTCA
ACTATGTTCAAAGATTTCTGAAGAAGGTTACAAAGGGATCTCAAAAAGATTGTTGATGCT
CGTGTGCTAGCTAATAACGCACGTACCGGTGGTGAA
TC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR4FL92JQ 696 0 0
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CGTTAAGGTAATGCTTAGTGGTTACTGGTTAATGTTTTAAGTTAAACAATAGTACTATTT
TTATTTTAATGATTTTGATTACTGGCTTGTATGCTGAACAATCATATGGTTTTGGCAGGA
GTTTAACAAACACGACAAAGAGCCAGGAAAGTATATTAAACAATGGAAAGGTGTTAAGCC
AAAGACTGGTGCGCCATACACTTGTGACGTGGGATACGAACGTTTCCTTGGACCTGAGGT
TTGTTACACCATTGTCTCTACTTTTGTTGTTATTAGCGAAGATAATGTTGAGATTTTTGT
GTGTGTTATTACAGGTCTTCTTTAATCCAGAGATATACAGCAATGATTTTACAACTTCTT
TACCGGCTGTGATAGACAAATGTATCCAGTTTGCGCCAATTGACACACGGAGAGCTTTAT
ATAAGGTCTGAAAACACACTGTTTAGTTCGGAGAGTTTTAAGATGTTTTTTAATTGGTAA
TTGATGAATTTGTGAAAAATCATTTTAGAACATAGTACTGTCTGGAGGTTCAACTATGTT
CAAAGATTTCTGAAGAAGGTTACAAAGGGATCTCAAAAAGATTGTTGATGCTCGTGTGCT
AGCTAATAACGCACGTACCGGTGGTGAAATCACGGT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL9115Contig1 866 2 2 U
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ATGAATCTGAATATAAAGCACATGGGCAAAATGATCTATCAAGATTCAAGTAGGACAGAA
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GGGGAAGAAAAAGATTTGTCATCTTGTTCATTATCTTCCATGTGTTCATCTGATTTAACA
GAGGAGGAGGATGATGCCTCTTCATCTTTTTCAAATGGACCTCTTGAAGATCTCTCTGAC
CTCATGTTACACCTCCCAATCAAGAGGGGATTGTCAAAGTTTTATGAAGGAAAATCTCAA
TCATTCACATCACTAGCAAATGTTAAAAGTCTTGAAGATCTTATGAAGAGAGGTTTTAAA
AATACAAGTAATAAAGCAAGAAGAAAGGCATGTAAGAGCACCGGAGGAATAATAGATCAA
AGCTACAAAAGGGTTTATAGCCCAAAAGCTACAATCTCCAAGAAAGCCAACAAAACACCT
TCTTTTGTTCTGTCTTCTCTAGCCAGGAAAAAACTTTAGATCCGAGAGGAACATTAGTCT
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TTGAATGTATCAAAGCTTGTTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GZ86TF U 1
AF RR4GZ86JQ C 101
BS 1 632 RR4GZ86TF
BS 633 866 RR4GZ86JQ

RD RR4GZ86TF 632 0 0
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TCTCTTGTTCTGTTTCATATCCTGTTTCAAGAATTCGTTTTTCTTGATTTCTGTTGGAAG
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GGGGAAGAAAAAGATTTGTCATCTTGTTCATTATCTTCCATGTGTTCATCTGATTTAACA
GAGGAGGAGGATGATGCCTCTTCATCTTTTTCAAATGGACCTCTTGAAGATCTCTCTGAC
CTCATGTTACACCTCCCAATCAAGAGGGGATTGTCAAAGTTTTATGAAGGAAAATCTCAA
TCATTCACATCACTAGCAAATGTTAAAAGTCTTGAAGATCTTATGAAGAGAGGTTTTAAA
AATACAAGTAATAAAGCAAGAAGAAAGGCATGTAAGAGCACCGGAGGAATAATAGATCAA
AGCTACAAAAGGGTTTATAGCCCAAAAGCTACAATCTCCAAGAAAGCCAACAAAACACCT
TCTTTTGTTCTGTCTTCTCTAGCCAGGAAAAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR4GZ86JQ 766 0 0
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TGTGTTCATCTGATTTAACAGAGGAGGAGGATGATGCCTCTTCATCTTTTTCAAATGGAC
CTCTTGAAGATCTCTCTGACCTCATGTTACACCTCCCAATCAAGAGGGGATTGTCAAAGT
TTTATGAAGGAAAATCTCAATCATTCACATCACTAGCAAATGTTAAAAGTCTTGAAGATC
TTATGAAGAGAGGTTTTAAAAATACAAGTAATAAAGCAAGAAGAAAGGCATGTAAGAGCA
CCGGAGGAATAATAGATCAAAGCTACAAAAGGGTTTATAGCCCAAAAGCTACAATCTCCA
AGAAAGCCAACAAAACACCTTCTTTTGTTCTGTCTTCTCTAGCCAGGAAAAAACTTTAGA
TCCGAGAGGAACATTAGTCTTTCTTTTATTTTTATTTTTTAAATCCTTTTTACGATTCAC
CAAATCGGTTTCAGTAACATAACCAAAAATAAAACATGTTCACCTTAAATCTTAAGCCTG
TAAGAAAGATATTCGCAGTGTCTTAGTGTAGAAAAGTTAAATATTTGTACACCCTTTTTT
CGGCCTCTGGCTCTGTTTAGTTGAATGTATCAAAGCTTGTTGCTTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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TGGGAGTGATGAAGATGAAGAAATCGATGATGAGTTCCCTGGGCCAGATTCTGATGAAGA
TAACAGCGATAACAATGATGAACGCAACCGCGAAGAGGTTGGATCGGTGGATGAGCATCG
ACAAAGTCAGATGAAGAGTACGATGATCTGGCAATGGAAGACAAGGGTTACTGGACAGAC
AAGGAAGAAGAAGAAGAGACTCGAGACACAATCTCCATGGCGTCTGAAAACAACCACAAG
GAGGCAACAGCGAAGCCCAAGAAAGATGATGACAAATACATCCAAAACCTCGACCTTTTC
CTCAGGACAGTGAACCAACCATTAACTGAATCTCTTGAGCTTACGTGTGAGTACAGGAAC
AGAATGCTTGTAGCAGCTTCGGATAAAGCTAAGATGAGGAAACGTTCACTTAGTATCCCG
GCAGTTGGGAAACACGGTTCAATCATAGATGACCAGATTTTAGAGAACCACACTGATCCA
TTTCTCTTGAATGGCCAGTGACCTCTTTGCCTGTCTTGTTTCTCTTTTCGTCTTTTTTTT
TTTTTGGTTTATTAGTCTATTAAAATAGCTTAGTTTTCTAAAACGATTGAAGTATTTTAA
GCATACTGCACCTTTTCAACAGTTC


BQ
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AF RR4DG75TF U 1
AF RR4DG75JQ C 4
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RD RR4DG75TF 745 0 0
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ACAAAGTCAGATGAAGAGTACGATGATCTGGCAATGGAAGACAAGGGTTACTGGACAGAC
AAGGAAGAAGAAGAAGAGACTCGAGACACAATCTCCATGGCGTCTGAAAACAACCACAAG
GAGGCAACAGCGAAGCCCAAGAAAGATGATGACAAATACATCCAAAACCTCGACCTTTTC
CTCAGGACAGTGAACCAACCATTAACTGAATCTCTTGAGCTTACGTGTGAGTACAGGAAC
AGAATGCTTGTAGCAGCTTCGGATAAAGCTAAGATGAGGAAACGTTCACTTAGTATCCCG
GCAGTTGGGAAACACGGTTCAATCATAGATGACCAGATTTTAGAGAACCACACTGATCCA
TTTCTCTTGAATGGCCAGTGACCTCTTTGCCTGTCTTGTTTCTCTTTTCGTCTTTTTTTT
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GCATACTGCACCTTTTCAACAGTTC

QA 1 745 1 745
DS 

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TTCACCTCGGGTATTTGATGGGCCTTCAAAAGAGCTTAAGGAGGAGCAGTCTGTGAATGG
GAGTGATGAAGATGAAGAAATCGATGATGAGTTCCCTGGGCCAGATTCTGATGAAGATAA
CAGCGATAACAATGATGAACGCAACCGCGAAGAGGTTGGATCGGTGGATGAGCATCGACA
AAGTCAGATGAAGAGTACGATGATCTGGCAATGGAAGACAAGGGTTACTGGACAGACAAG
GAAGAAGAAGAAGAGACTCGAGACACAATCTCCATGGCGTTTGAAAACAACCACAAGGAG
GCAACAGCGAAGCCCAAGAAAGATGATGACAAATACATCCAAAACCTCGACCTTTTCCTC
AGGACAGTGAACCAACCATTAACTGAATTTCTTGAGCTTACGTGTGAGTACAGGAACAGA
ATGCTTGTAGCAGCTTCGGATAAAGCTAAGATGAGGAAACGTTCACTTAGTATCCCGGCA
GTTGGGAAACACGGTTCAATCATAGATGACCAGATTTTAGAGAACCACACTGATCCATTT
TTCTTGAATGGCCAGTGACCTCTTTGCCTGTCTTGTTTCTCTTTTCGTCTTTTTTTTTTT
TTGGTTTATTAGTCTATTAAAATAGCTTAGTTTTCTAAAACGATTGAAGTATTTTAAGCA
TACTGCACCTTTTCAACAGTTC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL9117Contig1 715 2 3 U
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ATGTACAGAGCATGATGGACCGACCAGAGTAGAAAAACCTAGTGATTAATCAGCACAAAG
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TTCTTCTTCTTCCACTCTAATTATGTTTTCTACAACTTCGCACAGGTTTGAGACATCGTT
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CTCCCACTGCTGGATCTCTCTCTGGTACTTGCTTTTGAGCTTCACCAGCGTTCTCTTCTT
CCGCTTCCTTCGATTTCTCTCCTCCACGGCGGAATCTAACCCAGGATCCACCGGATTTGA
TGCTGCTTCTCCAGGGTCCGAGATACGACGGATTCGCTTGTAAACGAACCCGTCTTCGTT
GCGTAGTTCCCAATCTTCGTCTCTTTCCATCGCACAGTGGAGTGAGAAAGATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CA88TF C 1
AF RR4CA88JQ U 22
BS 1 21 RR4CA88TF
BS 22 705 RR4CA88JQ
BS 706 715 RR4CA88TF

RD RR4CA88TF 715 0 0
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TTCTTCTTCTTCCACTCTAATTATGTTTTCTACAACTTCGCACAGGTTTGAGACATCGTT
GATTATCACTTCTTGTGCTTCCGCCATAGAGAGAAGCTCGTCGAGGAAAACAGACGCGGA
AGAATCGTGAAACGACGTCGCTTCGTTCGCGTTTAACCTATCATCACCTCCCTCCTGCGA
CGTCGTTTGAAATCCACCAGCAGCTTTCTCTCGCATAGCATCGAAGCTGTTCGACAGAAT
CTCCCACTGCTGGATCTCTCTCTGGTACTTGCTTTTGAGCTTCACCAGCGTTCTCTTCTT
CCGCTTCCTTCGATTTCTCTCCTCCACGGCGGAATCTAACCCAGGATCCACCGGATTTGA
TGCTGCTTCTCCAGGGTCCGAGATACGACGGATTCGCTTGTAAACGAACCCGTCTTCGTT
GCGTAGTTCCCAATCTTCGTCTCTTTCCATCGCACAGTGGAGTGAGAAAGATTGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CA88JQ 684 0 0
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GACCAGAGTAGAAAAACCTAGTGATTAATCAGCACAAAGCGACGCCATTAGATTTCTAGG
TGAACTCCAAACATCAAGATCAAATAATAACTGCTTCGTTTCTTCTTCTTCCACTCTAAT
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CGCCATAGAGAGAAGCTCGTCGAGGAAAACAGACGCGGAAGAATCGTGAAACGACGTCGC
TTCGTTCGCGTTTAACCTATCATCACCTCCCTCCTGCGACGTCGTTTGAAATCCACCAGC
AGCTTTCTCTCGCATAGCATCGAAGCTGTTCGACAGAATCTCCCACTGCTGGATCTCTCT
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CTCCACGGCGGAATCTAACCCAGGATCCACCGGATTTGATGCTGCTTCTCCAGGGTCCGA
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TCTTTCCATCGCACAGTGGAGTGA

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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GCCTGCTGCGTTTGGTCTTCTCCAAGCAGCTTACTTCTTCATTCACTACCTTTTCGCAAG
CCAAACGGGTCACGTCGGAGCTCTCTTCTCGGCTTTCTTGGCTATGAATATAGCAGCGGG
TGTTCCGGGTGTATTAGCTGCACTTGCGTTGGCGTATAACACCAATCTTTTTGGTGCTTT
GACTCATTACAGTAGCGGTCAAGCCGCTGTCTACTATGGAGCTGGTTATGTTGATCTACC
TGATGTATTCAAGATTGGATTTGTGATGGCAACCATTAATGCTATCATCTGGGGAGTAGT
TGGAACTTTCTGGTGGAAGTTTTTGGGTCTCTATTAAAGAGCTTTACTTAAAATCATCAC
AAGTTGTTCTTCAGAGCTTGCAACGACGTTTAATCTCGTTGATCATTTGGTTACTTTTAG
AGGGTTTTGTTTCCTCTTCTTTTAAGAAAAAATTTACATTCAGAGACTTTACAATGGATC
TGCATTTACTTCATTTTCAGATCTGTTTATGGATGTTATGACTTTTTTCTTATTACTTAC
CTGCATATTCTTAATTTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FN30TF U 1
AF RR4FN30JQ C 2
BS 1 631 RR4FN30TF
BS 632 632 RR4FN30JQ
BS 633 693 RR4FN30TF
BS 694 742 RR4FN30JQ

RD RR4FN30TF 693 0 0
GATACTCCTTCTCCTCGGTGTACTTAACTGGGACGATTGCCTTAGCGAAAAATCAGCTTG
GGACACGTTAGCTTGGTTCGCGGTCTTGGTGGGGATGGCAGGACAGCTGACAAGCCTCGG
TGTTGTGTCATGGATGTCTGATTGCGTAGCCAAAGTTTTGCAGTCTCTCTCATTGAGCTG
GCCTGCTGCGTTTGGTCTTCTCCAAGCAGCTTACTTCTTCATTCACTACCTTTTCGCAAG
CCAAACGGGTCACGTCGGAGCTCTCTTCTCGGCTTTCTTGGCTATGAATATAGCAGCGGG
TGTTCCGGGTGTATTAGCTGCACTTGCGTTGGCGTATAACACCAATCTTTTTGGTGCTTT
GACTCATTACAGTAGCGGTCAAGCCGCTGTCTACTATGGAGCTGGTTATGTTGATCTACC
TGATGTATTCAAGATTGGATTTGTGATGGCAACCATTAATGCTATCATCTGGGGAGTAGT
TGGAACTTTCTGGTGGAAGTTTTTGGGTCTCTATTAAAGAGCTTTACTTAAAATCATCAC
AAGTTGTTCTTCAGAGCTTGCAACGACGTTTAATCTCGTTGATCATTTGGTTACTTTTAG
AGGGTTTTGTTTCCTCTTCTTTTAAGAAAAA*TTTACATTCAGAGACTTTACAATGGATC
TGCATTTACTTCATTTTCAGATCTGTTTATGGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4FN30JQ 741 0 0
GATACT
CTTCTCCTCGGTGTACTTAACTGGGACGATTGCCTTAGCGAAAAATCAGCTTGGGACACG
TTAGCTTGGTTCGCGGTCTTGGTGGGGATGGCAGGACAGCTGACAAGCCTCGGTGTTGTG
TCATGGATGTCTGATTGCGTAGCCAAAGTTTTGCAGTCTCTCTCATTGAGCTGGCCTGCT
GCGTTTGGTCTTCTCCAAGCAGCTTACTTCTTCATTCACTACCTTTTCGCAAGCCAAACG
GGTCACGTCGGAGCTCTCTTCTCGGCTTTCTTGGCTATGAATATAGCAGCGGGTGTTCCG
GGTGTATTAGCTGCACTTGCGTTGGCGTATAACACCAATCTTTTTGGTGCTTTGACTCAT
TACAGTAGCGGTCAAGCCGCTGTCTACTATGGAGCTGGTTATGTTGATCTACCTGATGTA
TTCAAGATTGGATTTGTGATGGCAACCATTAATGCTATCATCTGGGGAGTAGTTGGAACT
TTCTGGTGGAAGTTTTTGGGTCTCTATTAAAGAGCTTTACTTAAAATCATCACAAGTTGT
TCTTCAGAGCTTGCAACGACGTTTAATCTCGTTGATCATTTGGTTACTTTTAGAGGGTTT
TGTTTCCTCTTCTTTTAAGAAAAAATTTACATTCAGAGACTTTACAATGGATCTGCATTT
ACTTCATTTTCAGATCTGTTTATGGATGTTATGACTTTTTTCTTATTACTTACCTGCATA
TTCTTAATTTATGTC

QA 7 741 7 741
DS 



AS 1 2

CO CL9119Contig1 616 2 1 U
GAGGGAAATCTTTACCTTTTCCATATATGTTTTCTTTCAAGATCGAAGACAAGAAGCACA
GAATGCACAGATTCATTAGTGACACTCGTAGTTTGACAGAAGTGATAACCGCAATCCTTC
AGAGACTAGGGAACGATATCGATCCAGACAACCTACCCCAAATTTTGTATGAAGATGAAG
ACCACGATAAAGTGTTGTTGGCCTCAGATAGTGACCTTCAAGCAGCCATAGACCATGTCA
AATCAATTGGCTGGAAGAGTCTGAGATTACATTTGGATGATTCAAGAGAAGGCTAAGGAA
GAAGAAGAGCATCAGGATCAGAAGCAACAGAGTATGTAGAGAGAGACGCTTGGGCTGCTG
CTTACAGTGGAGTTGCGGCTGGTGCAGCATTAGTAGCTGGTCTCGGTTTTATGGCTTTTC
TCAAAAAGTTCGGACGCTGACTCGTACAAAAAAAAAAGACGAATAAATTTTTCTACAGAT
AGATACAAACAAGAAGGAGCGTCATTCAACTGAAAACAGACAGGTCTCGAAGGTTTTGTC
TGAAACATACTTACATACTAATGTAATCTTTAAGATTTCTGCTTTCTTTCATGAAAATCA
AAAGAACAAAATACCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C388JQ C 1
AF RR4C388TF U 1
BS 1 616 RR4C388TF

RD RR4C388JQ 616 0 0
GAGGGAAATCTTTACCTTTTCCATATATGTTTTCTTTCAAGATCGAAGACAAGAAGCACA
GAATGCACAGATTCATTAGTGACACTCGTAGTTTGACAGAAGTGATAACCGCAATCCTTC
AGAGACTAGGGAACGATATCGATCCAGACAACCTACCCCAAATTTTGTATGAAGATGAAG
ACCACGATAAAGTGTTGTTGGCCTCAGATAGTGACCTTCAAGCAGCCATAGACCATGTCA
AATCAATTGGCTGGAAGAGTCTGAGATTACATTTGGATGATTCAAGAGAAGGCTAAGGAA
GAAGAAGAGCATCAGGATCAGAAGCAACAGAGTATGTAGAGAGAGACGCTTGGGCTGCTG
CTTACAGTGGAGTTGCGGCTGGTGCAGCATTAGTAGCTGGTCTCGGTTTTATGGCTTTTC
TCAAAAAGTTCGGACGCTGACTCGTACAAAAAAAAAAGACGAATAAATTTTTTTACAGAT
AGATACAAACAAGAAGGAGCGTCATTCAACTGAAAACAGACAGGTCTCGAAGGTTTTGTC
TGAAACATACTTACATACTAATGTAATCTTTAAGATTTCTGCTTTCTTTCATGAAAATCA
AAAGAACAAAATACCT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4C388TF 616 0 0
GAGGGAAATCTTTACCTTTTCCATATATGTTTTCTTTCAAGATCGAAGACAAGAAGCACA
GAATGCACAGATTCATTAGTGACACTCGTAGTTTGACAGAAGTGATAACCGCAATCCTTC
AGAGACTAGGGAACGATATCGATCCAGACAACCTACCCCAAATTTTGTATGAAGATGAAG
ACCACGATAAAGTGTTGTTGGCCTCAGATAGTGACCTTCAAGCAGCCATAGACCATGTCA
AATCAATTGGCTGGAAGAGTCTGAGATTACATTTGGATGATTCAAGAGAAGGCTAAGGAA
GAAGAAGAGCATCAGGATCAGAAGCAACAGAGTATGTAGAGAGAGACGCTTGGGCTGCTG
CTTACAGTGGAGTTGCGGCTGGTGCAGCATTAGTAGCTGGTCTCGGTTTTATGGCTTTTC
TCAAAAAGTTCGGACGCTGACTCGTACAAAAAAAAAAGACGAATAAATTTTTCTACAGAT
AGATACAAACAAGAAGGAGCGTCATTCAACTGAAAACAGACAGGTCTCGAAGGTTTTGTC
TGAAACATACTTACATACTAATGTAATCTTTAAGATTTCTGCTTTCTTTCATGAAAATCA
AAAGAACAAAATACCT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL9120Contig1 797 2 4 U
TCTTTTGTTCAATGGTGACTATGTTTCAAGAAGACAATGGAACATCCTCTGTAGCTTCAT
CACCACTTCAAGTCTTCTCAACCATATCACTCACAAGACCAACTCTCATCCCTTCTCCCT
CCTCACCGTTCAAAGACCTCAGGCAGCCTCCAAAACGCAAACGCGGCTCTGGAGCAGCTC
TCCCTTCTCTCTTCCCCTGATGGCGACACCATGCAGCGAGTAGCAGCTTACTTCACCGAA
GCGCTCGCTAACATAATCCTCAAGTCGTGGCCTGGTCTCTACAAGGCCCTTAACGCAACC
CAGACAAAAGTTCCAAGAACGTCTCAAGACAGGATGAGAGTGGAGAAGATGCTCTTCGGA
GAGGAGATCAAGAACATCATAGCGTGTGAGGGATGTGAGAGGAGAGAAAGACATGAGAAG
CTAGAAAAATGGAGTCAGAGGATTGATTTGGCTGGTTTTGGGAATGTTCCTCTTAGCTAT
TATGGGATGTTGCAGGGTAGGAGGTTGCTTCAAGGGTATGGTTTTGATGGGTATAGAATC
AAAGAAGAGAGTGGGTGTGCAGTTGTTTGCTGGCAAGATAGACCTCTATACTCGGTTTCA
GCTTGGAGATGCAAGAAGTGAATGATATAAAACACTTCTATACCTCTTTTTGTGTATTTT
CTTTTTTTTTTTTTGGTTTATGAGCAGGGACACAATCTTCCTTGTCTTTCGACTGTGACT
TTCTGTCTCTTTTTTCTTGTTTTTGGGAAATGCTTCTTGCTGCCTTCTGCATATAAAATG
CCTTTTGAGTTTCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FQ15TF U 1
AF RR4FQ15JQ C 116
BS 1 673 RR4FQ15TF
BS 674 674 RR4FQ15JQ
BS 675 688 RR4FQ15TF
BS 689 797 RR4FQ15JQ

RD RR4FQ15TF 696 0 0
TCTTTTGTTCAATGGTGACTATGTTTCAAGAAGACAATGGAACATCCTCTGTAGCTTCAT
CACCACTTCAAGTCTTCTCAACCATATCACTCACAAGACCAACTCTCATCCCTTCTCCCT
CCTCACCGTTCAAAGACCTCAGGCAGCCTCCAAAACGCAAACGCGGCTCTGGAGCAGCTC
TCCCTTCTCTCTTCCCCTGATGGCGACACCATGCAGCGAGTAGCAGCTTACTTCACCGAA
GCGCTCGCTAACATAATCCTCAAGTCGTGGCCTGGTCTCTACAAGGCCCTTAACGCAACC
CAGACAAAAGTTCCAAGAACGTCTCAAGACAGGATGAGAGTGGAGAAGATGCTCTTCGGA
GAGGAGATCAAGAACATCATAGCGTGTGAGGGATGTGAGAGGAGAGAAAGACATGAGAAG
CTAGAAAAATGGAGTCAGAGGATTGATTTGGCTGGTTTTGGGAATGTTCCTCTTAGCTAT
TATGGGATGTTGCAGGGTAGGAGGTTGCTTCAAGGGTATGGTTTTGATGGGTATAGAATC
AAAGAAGAGAGTGGGTGTGCAGTTGTTTGCTGGCAAGATAGACCTCTATACTCGGTTTCA
GCTTGGAGATGCAAGAAGTGAATGATATAAAACACTTCTATACCTCTTTTTGTGTATTTT
CTTTTTTTTTTTT*GGTTTATGAGCAGG
ACACAATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR4FQ15JQ 682 0 0
TCCCTCCTCACCGTTCAAAGACCTCAGGCAGCCTCCAAAACGCAAACGCGGCTCTGGAGC
AGCTCTCCCTTCTCTCTTCCCCTGATGGCGACACCATGCAGCGAGTAGCAGCTTACTTCA
CCGAAGCGCTCGCTAACATAATCCTCAAGTCGTGGCCTGGTCTCTACAAGGCCCTTAACG
CAACCCAGACAAAAGTTCCAAGAACGTCTCAAGACAGGATGAGAGTGGAGAAGATGCTCT
TCGGAGAGGAGATCAAGAACATCATAGCGTGTGAGGGATGTGAGAGGAGAGAAAGACATG
AGAAGCTAGAAAAATGGAGTCAGAGGATTGATTTGGCTGGTTTTGGGAATGTTCCTTTTA
GCTATTATGGGATGTTGCAGGGTAGGAGGTTGCTTCAAGGGTATGGTTTTGATGGGTATA
GAATCAAAGAAGAGAGTGGGTGTGCAGTTGTTTGCTGGCAAGATAGACCTCTATACTCGG
TTTCAGCTTGGAGATGCAAGAAGTGAATGATATAAAACACTTCTATACCTCTTTTTGTGT
ATTTTCTTTTTTTTTTTTTGGTTTATGAGCAGGGACACAATCTTCCTTGTCTTTCGACTG
TGACTTTCTGTCTCTTTTTTCTTGTTTTTGGGAAATGCTTCTTGCTGCCTTCTGCATATA
AAATGCCTTTTGAGTTTCCAGC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL9121Contig1 1047 2 2 U
ACTGAAGCGACGGGCGTTCCCATTAGGGTTTCTCGAGAGTGAGAATCTAAAAAATCATGT
ACGGAGGCGAGTTTGACGGTAACGCCGCTTTCGCCGGTGGTGGTTTCATGTCTTCTCAGT
CAACCACGCAAGCGCCTGAGTCCTCATCTGCTTTCAGGAATCGGGATGCGCGTACCTTGC
TTCCCCTGACGTTGAAGCAATTGAATAGTGTTTCAACAAATGGTGAATCGAATTTCTCCA
TAGACGGCGTTGATATCAACACTGTTGCAATTGTCGGACGAGTTTCTAGAATTGAGAACC
GAATCACACAGGTTGATTTTGTTGTAGATGATGGTACTGGCTGCGTTGAATGCATCAGAT
GGTGTCATGAACGCCAAGAAACTGAAGAAATGGAAGCTGTCAGGTTGGGAATGTATGTTC
GCCTACATGGACACCTGAAAAGCTTTCAGGGGAAGCGATCTATGAATGTTTTCTCAGTCA
GGCCTGTCACTGACTTCAACGAGATTGTACACCACTTTACCGAGTGTATCTATGTCCACA
TGTACAACACTAAGCCACGGGGTGGTTCTGTTACTCAGGCTACGGAAACTCCTAGGCCCC
AAATGCCATACTCAACGACGCCAACCCCTGCAAGGCCATTCCAAACCGGTCCCTCGAACC
AGTTCAATGATCCAATGCATGGCGTAAGGCGGGCAGTCTTAAATTACCTGAATCGTCCTA
TGCACCTGAGATCTGAAGCTGGAGTTCACTGCGATGTGATTGCACGCGACCTCGGGATTC
CGCTGCCTCAAGTCAAGGACGCCTTGGAACAGCTCTCAAACGATGACTGCGTTTTTTCTA
CTAGCGATGAGACTTGCTTCAAATCAACCGCAAACGCATGATCTAAATGGATTTATCTAC
AAACCGATCTTTTTAAGTACGGAAAAATCCTTTGTATAGGCCCTATGGTACGACAGCTTA
TGGCTTTAAGACTACATCTATCTATTAGCTTTTGGATTTGTTAAAATCAACTCAAAGGTT
CAATCAAAATCTTCCCCGTCGTATAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BK62TF U 1
AF RR4BK62JQ C 255
BS 1 574 RR4BK62TF
BS 575 1047 RR4BK62JQ

RD RR4BK62TF 574 0 0
ACTGAAGCGACGGGCGTTCCCATTAGGGTTTCTCGAGAGTGAGAATCTAAAAAATCATGT
ACGGAGGCGAGTTTGACGGTAACGCCGCTTTCGCCGGTGGTGGTTTCATGTCTTCTCAGT
CAACCACGCAAGCGCCTGAGTCCTCATCTGCTTTCAGGAATCGGGATGCGCGTACCTTGC
TTCCCCTGACGTTGAAGCAATTGAATAGTGTTTCAACAAATGGTGAATCGAATTTCTCCA
TAGACGGCGTTGATATCAACACTGTTGCAATTGTCGGACGAGTTTCTAGAATTGAGAACC
GAATCACACAGGTTGATTTTGTTGTAGATGATGGTACTGGCTGCGTTGAATGCATCAGAT
GGTGTCATGAACGCCAAGAAACTGAAGAAATGGAAGCTGTCAGGTTGGGAATGTATGTTC
GCCTACATGGACACCTGAAAAGCTTTCAGGGGAAGCGATCTATGAATGTTTTCTCAGTCA
GGCCTGTCACTGACTTCAACGAGATTGTACACCACTTTACCGAGTGTATCTATGTCCACA
TGTACAACACTAAGCCACGGGGTGGTTCTGTTAC

QA 1 574 1 574
DS 

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ATCAACACTGTTGCAAT*GTCGGACGAGTTTCTAGAATTGAGAACCGAATCACACAGGTT
GATTTTGTTGTAGATGATGGTACTGGCTGCGTTGAATGCATCAGATGGTGTCATGAACGC
CAAGAAACTGAAGAAATGGAAGCTGTCAGGTTGGGAATGTATGTTCGCCTACATGGACAC
CTGAAAAGCTTTCAGGGGAAGCGATCTATGAATGTTTTCTCAGTCAGGCCTGTCACTGAC
TTCAACGAGATTGTACACCACTTTACCGAGTGTATCTATGTCCACATGTACAACACTAAG
CCACGGGGTGGTTCTGTTACTCAGGCTACGGAAACTCCTAGGCCCCAAATGCCATACTCA
ACGACGCCAACCCCTGCAAGGCCATTCCAAACCGGTCCCTCGAACCAGTTCAATGATCCA
ATGCATGGCGTAAGGCGGGCAGTCTTAAATTACCTGAATCGTCCTATGCACCTGAGATCT
GAAGCTGGAGTTCACTGCGATGTGATTGCACGCGACCTCGGGATTCCGCTGCCTCAAGTC
AAGGACGCCTTGGAACAGCTCTCAAACGATGACTGCGTTTTTTCTACTAGCGATGAGACT
TGCTTCAAATCAACCGCAAACGCATGATCTAAATGGATTTATCTACAAACCGATCTTTTT
AAGTACGGAAAAATCCTTTGTATAGGCCCTATGGTACGACAGCTTATGGCTTTAAGACTA
CATCTATCTATTAGCTTTTGGATTTGTTAAAATCAACTCAAAGGTTCAATCAAAATCTTC
CCCGTCGTATAGC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL9122Contig1 1165 2 2 U
GGGAGCACACGCTGCAGAAGTGCGAGGATTTCAAGATGAAAATTAACATGATCCAGGATT
TGAGGGAGATGACAAAGAAGGTGCTTCACTACTACAAAGGAGACTTCTTAGATGAGCTTC
CTGGGCTTGATGATTTCACTGTGGTTCTCAATCTGTCTCCAAGGCAGTTGACTGAAGTGA
AGAAGTTGAGGCGTGAGAAGAGAAAATTCAAGGTTTCGGCTGTGGGGAGTGCAATTTACC
TTCATCCGAGGCTGAACGCTTTCTCTGAAAAGACTGATAGTAAGACTGATAGTGTATCTG
ATTCAACTATGGACGAAATGCTAGAGAAGCTAGATGTGGATGAAGGCGTGAAAGCAAAGT
TCTTCCTAAACTTGATAGACCTGTGTGACTCAGCAGGGGAGAAGCTCTTGGTTTTCAGCC
AGTATCTCGTGCCTCTGAAGTTTCTTGAAAGACTAGCTGCTCTAGCTAAAGGATGGAAGC
TAGGGAAAGAAGTCTTTGTTCTCACAGGAGAATCCAGCTCTGAGCAGCGTGAGTTGTCTA
TGGAAAGGTTCAACAATTCGCCAGACGCCAAAGTGTTCTTCGGTTCGATAAGGGCCTGTG
GAGAAGGTATCTCTCTAGTTGGAGCATCTCGGATACTGATTCTGGATGTTCCTCTAAACC
CTTCAGTGACACGCCAAGCGATAGGGAGAGCTTTTAGACCAGGACAGACGAAGAAAGTGC
ATGCGTACAGATTGATAGCTGGGTCATCACCTGAGGAAGAGGATCACAACACTTGCTTCA
AAAAGGAAGTCATCTCAAAGATGTGGTTCGAGTGGAATGAGTACTGTGGATACCGTAACT
TTGAGGTAGAGACAATCGATGTGGATGATGCTGGTGATCTGTTCCTTGAAAGTCCTCCCT
TACGAGAAGATATAAGAGTTCTCTACAAAAGGTAAACCGAAGAAAATTTACTGATGGAAA
CTTGTTCTTGTGGCTTTGGACATGCTTATGTTTTAGAAACCTGTCAATAAGATGACTTCG
GGTAGGGTCCTTTTGGTTTTTGTGAAAGATTGTTGAATCTTTTGGACGTGCTTGTGGTTT
TGTTTCATTAAGTAGTGAGCTTCTATTGTTCTTTTGATGTGAAAACCTTTGGCCTTATGA
TATGCTAGTTGTCCTCGTTAATTCC


BQ
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AF RR4B155TF U 1
AF RR4B155JQ C 434
BS 1 845 RR4B155TF
BS 846 1165 RR4B155JQ

RD RR4B155TF 854 0 0
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TGAGGGAGATGACAAAGAAGGTGCTTCACTACTACAAAGGAGACTTCTTAGATGAGCTTC
CTGGGCTTGATGATTTCACTGTGGTTCTCAATCTGTCTCCAAGGCAGTTGACTGAAGTGA
AGAAGTTGAGGCGTGAGAAGAGAAAATTCAAGGTTTCGGCTGTGGGGAGTGCAATTTACC
TTCATCCGAGGCTGAACGCTTTCTCTGAAAAGACTGATAGTAAGACTGATAGTGTATCTG
ATTCAACTATGGACGAAATGCTAGAGAAGCTAGATGTGGATGAAGGCGTGAAAGCAAAGT
TCTTCCTAAACTTGATAGACCTGTGTGACTCAGCAGGGGAGAAGCTCTTGGTTTTCAGCC
AGTATCTCGTGCCTCTGAAGTTTCTTGAAAGACTAGCTGCTCTAGCTAAAGGATGGAAGC
TAGGGAAAGAAGTCTTTGTTCTCACAGGAGAATCCAGCTCTGAGCAGCGTGAGTTGTCTA
TGGAAAGGTTCAACAATTCGCCAGACGCCAAAGTGTTCTTCGGTTCGATAAGGGCCTGTG
GAGAAGGTATCTCTCTAGTTGGAGCATCTCGGATACTGATTCTGGATGTTCCTCTAAACC
CTTCAGTGACACGCCAAGCGATAGGGAGAGCTTTTAGACCAGGACAGACGAAGAAAGTGC
ATGCGTACAGATTGATAGCTGGGTCATCACCTGAGGAAGAGGATCACAACACTTGCTTCA
AAAAGGAAGTCATCTCAAAGATGTGGTTCGAGTGGAATGAGTACTGTGGATACCGTAACT
TTGAG
TAGAGACAT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR4B155JQ 732 0 0
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CTTTGTTCTCACAGGAGAATCCAGCTCTGAGCAGCGTGAGTTGTCTATGGAAAGGTTCAA
CAATTCGCCAGACGCCAAAGTGTTCTTCGGTTCGATAAGGGCCTGTGGAGAAGGTATCTC
TCTAGTTGGAGCATCTCGGATACTGATTCTGGATGTTCCTCTAAACCCTTCAGTGACACG
CCAAGCGATAGGGAGAGCTTTTAGACCAGGACAGACGAAGAAAGTGCATGCGTACAGATT
GATAGCTGGGTCATCACCTGAGGAAGAGGATCACAACACTTGCTTCAAAAAGGAAGTCAT
CTCAAAGATGTGGTTCGAGTGGAATGAGTACTGTGGATACCGTAACTTTGAGGTAGAGAC
AATCGATGTGGATGATGCTGGTGATCTGTTCCTTGAAAGTCCTCCCTTACGAGAAGATAT
AAGAGTTCTCTACAAAAGGTAAACCGAAGAAAATTTACTGATGGAAACTTGTTCTTGTGG
CTTTGGACATGCTTATGTTTTAGAAACCTGTCAATAAGATGACTTCGGGTAGGGTCCTTT
TGGTTTTTGTGAAAGATTGTTGAATCTTTTGGACGTGCTTGTGGTTTTGTTTCATTAAGT
AGTGAGCTTCTATTGTTCTTTTGATGTGAAAACCTTTGGCCTTATGATATGCTAGTTGTC
CTCGTTAATTCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL9123Contig1 725 2 4 U
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AGAGAATTTAGCTCGAGATAGTTTTCTGGGTTTGTTGCTCTTGTCCGAGCTTACTATCAA
GTCTCCATCTTTGATTAGGTTTGCTTTTGTGGGCATTTCATAATTTGTATACTCAGGGAG
GAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACAGCAACGCTGTGATAA
ACACGTGTCTTGGAGTATCGTTTGTGGTTCTGGGGCTGAGATCTGATAAACAGCAAAAGT
ATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCTCAAAGTCTAACAAGGATATGAAAG
TTACAATGTGGGAGTGGAGACAACAGCTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGGTGTTTCCG
CGGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAACTCACCACCCAATCTGGTG
AAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCAGGATCATGGTTTGAGAGGATTTTA
GTCTCGTGATTTGCATTTGTAAACATCAAACTGTCTGTTGTTGTGATTCTAAAATAAGGT
AAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTTCATTATTGGACCCATTGGTTGAAA
GTGGGACCTGCATGAAGAATTAATGACTGATAAGGTATATGAAATCAGGAATAAGTGTTG
TTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4DO05TF U 1
AF RR4DO05JQ C 1
BS 1 630 RR4DO05TF
BS 631 631 RR4DO05JQ
BS 632 690 RR4DO05TF
BS 691 725 RR4DO05JQ

RD RR4DO05TF 690 0 0
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QA 1 690 1 690
DS 

RD RR4DO05JQ 725 0 0
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GTCTCCATCTTTGATTAGGTTTGCTTTTGTGGGCATTTCATAATTTGTATACTCAGGGAG
GAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACAGCAACGCTGTGATAA
ACACGTGTCTTGGAGTATCGTTTGTGGTTCTGGGGCTGAGATCTGATAAACAGCAAAAGT
ATGTCGAGGCCTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCTCAAAGTCTAACAAGGATATGAAAG
TTACAATGTGGGAGTGGAGACAACAGCTCTTTGCTGAAGCCACCTCTGCTGGTGTTTCCG
CGGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAACTCACCACCCAATCTGGTG
AAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCAGGATCATGGTTTGAGAGGATTTTA
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AAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTTCATTATTGGACCCATTGGTTGAAA
GTGGGACCTGCATGAAGAATTAATGACTGATAAGGTATATGAAATCAGGAATAAGTGTTG
TTTCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL9124Contig1 569 2 1 U
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GGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATTG
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ATAAGTTTCTCAAAAATTATCTTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACACTAT
CTATCCCATTCATTATCTTGTGAAACAATGTTAAGGTTTTCCATCAGCAATTATTTTTTT
TATATCAAATAATTTTGGGTCGATCACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A507JQ C 1
AF RR4A507TF U 1
BS 1 569 RR4A507TF

RD RR4A507JQ 569 0 0
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GGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATTG
CAGGTGTTGGCGGTCGGGGACATTTCCTTTACGTGATGGGAGTCATATGAAGCACAACAA
AGCTAATGGAGATAACGTTGGCCCTCTCCTTCTTAAAAAGCAGTAGTTTTTTTTTCATTA
ATAAGTTTCTCAAAAATTATCTTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACACTAT
CTATCCCATTCATTATCTTGTGAAACAATGTTAAGGTTTTCCATCAGCAATTATTTTTTT
TATATCAAATAATTTTGGGTCGATCACTC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR4A507TF 569 0 0
GGATAAACACATCTCTGTTCCTCTCTTCACTAAAACACTGCCACACAAACAGAGAGAGAA
AGAGAGAGAGATACCAATGGCTACCAGCATGATCACGTTTGGCGTGGGGATATGTTACAC
CAGCCAGCTTCCATTCAAGCGAGTCACCGTTGAAACGGGGAGGAAGCAGCAGAGAATGGC
GGTGGTGAGAGCAGAAGGCGGAGGAGGAGGAGGAATCAATCCAGAGATCAGAAAAAACTA
GGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATTG
CAGGTGTTGGCGGTCGGGGACATTTCCTTTACGTGATGGGAGTCATATGAAGCACAACAA
AGCTAATGGAGATAACGTTGGCCCTCTCCTTCTTAAAAAGCAGTAGTTTTTTTTTCATTA
ATAAGTTTCTCAAAAATTATCTTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACACTAT
CTATCCCATTCATTATCTTGTGAAACAATGTTAAGGTTTTCCATCAGCAATTATTTTTTT
TATATCAAATAATTTTGGGTCGATCACTC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL9125Contig1 814 2 2 U
GAACCCGTTGGTGTTTCTTCCCCAGCATCTGGATGCACAGCGTGTGGAGCCACGAGTAGC
TCCTCTCCTTCTAGTCACTTGGGCTTGAACGGTACCACAAATCTTCCATCAGCTGCCACA
TCTCTTCCCGGGCTGTTCTTTTCCACCTATGGTTCTTTTCCTTTGCTGTTTGGCTCACCA
AATCTTGCAGCTTATGGTACAACAGCAACTCCAGCAGTCCAAGCGTATCCTATGATGTTT
GTGACACCAAGTTCCACTTCTCAAGGTACAACAGCAACTCCAGCGTTTCAAGCGTTTCCT
ATGATGTTTGGAATACCAAATCTTGCTGCTCAAGGTACGACAGCAACTCCATCAGTTCAA
GCGTATCCTATGATGTTTGGAATACCAAATCTTGCTGCTCAAGGTACAACAACAACAACT
TCAGCGGCTCAGCCCCATCCTATGATGTTTGGAACACCAAGTCTTGCTGCTCAAGGTACA
ACAACAGCTGTTCAGCCCTATCCTACGATGTATGGTACACCAAATTTTGGAGCTCAAGGT
ATGACTCCAGCAGCTCAAGCCTATCCCGTTAATGGTTTAACTCTTCTCCCATTTGCCGCC
ATGAGTCTGCAGTAATCGTGCCTCGCTCTGCATCAAAGTTGTCTCTTTTATCTTGTAGTT
CTAAGGTCTTTGTTTTGCTTAAGAGTCATAAAACCAAGTCTCGTCCGACTTTATGTTTTT
TTTTCTAAGTAAAGATTCAGCTAATCATGGATGTAAACAAGTCTCTTAAAACATCATTAT
TTTGCTTTTATCAATAAAAGCTCCTTTCCTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AA23TF U 1
AF RR4AA23JQ C 88
BS 1 656 RR4AA23TF
BS 657 814 RR4AA23JQ

RD RR4AA23TF 656 0 0
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TCCTCTCCTTCTAGTCACTTGGGCTTGAACGGTACCACAAATCTTCCATCAGCTGCCACA
TCTCTTCCCGGGCTGTTCTTTTCCACCTATGGTTCTTTTCCTTTGCTGTTTGGCTCACCA
AATCTTGCAGCTTATGGTACAACAGCAACTCCAGCAGTCCAAGCGTATCCTATGATGTTT
GTGACACCAAGTTCCACTTCTCAAGGTACAACAGCAACTCCAGCGTTTCAAGCGTTTCCT
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GCGTATCCTATGATGTTTGGAATACCAAATCTTGCTGCTCAAGGTACAACAACAACAACT
TCAGCGGCTCAGCCCCATCCTATGATGTTTGGAACACCAAGTCTTGCTGCTCAAGGTACA
ACAACAGCTGTTCAGCCCTATCCTACGATGTATGGTACACCAAATTTTGGAGCTCAAGGT
ATGACTCCAGCAGCTCAAGCCTATCCCGTTAATGGTTTAACTCTTCTCCCATTTGCCGCC
ATGAGTCTGCAGTAATCGTGCCTCGCTCTGCATCAAAGTTGTCTCTTTTATCTTGT

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DS 

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GCTCAAGGTACGACAGCAACTCCATCAGTTCAAGCGTATCCTATGATGTTTGGAATACCA
AATCTTGCTGCTCAAGGTACAACAACAACAACTTCAGCGGCTCAGCCCCATCCTATGATG
TTTGGAACACCAAGTCTTGCTGCTCAAGGTACAACAACAGCTGTTCAGCCCTATCCTACG
ATGTATGGTACACCAAATTTTGGAGCTCAAGGTATGACTCCAGCAGCTCAAGCCTATCCC
GTTAATGGTTTAACTCTTCTCCCATTTGCCGCCATGAGTCTGCAGTAATCGTGCCTCGCT
CTGCATCAAAGTTGTCTCTTTTATCTTGTAGTTCTAAGGTCTTTGTTTTGCTTAAGAGTC
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TGGATGTAAACAAGTCTCTTAAAACATCATTATTTTGCTTTTATCAATAAAAGCTCCTTT
CCTTCCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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TTTTATCACAAAACCCTCTTAGATTGGTTCTTCTTGCTTCTCTCATTTCATCTTGAACTT
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CTCCTGTACAATAGGAGCGATGCCCATACGGGCCATCTGCTAGCAGCGTCAAGCTCGGTA
ACACCTTTCTCAGCTTCATCAAAGAACATTCTTACTCGCTTAAGCTGCATTTTCATGAAG
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BQ
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AF RR4C753JQ U 5
AF RR4CG13JQ U 1
BS 1 802 RR4CG13JQ

RD RR4C753JQ 571 0 0
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QA 1 571 1 571
DS 

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GAAGCCTTGAGTAGTGATTTAGCATAAGCTAATGGCAAAGCTGCAATTTTCTTGGCTTTC
CCCACATAAGCTCTCTTTGTAAAGTTGTTGTAATCATTCGCTTCAATCTCGTCCAATATC
CTCCTGTACAATAGGAGCGATGCCCATACGGGCCATCTGCTAGCAGCGTCAAGCTCGGTA
ACACCTTTCTCAGCTTCATCAAAGAACATTCTTACTCGCTTAAGCTGCATTTTCATGAAG
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AGTATGTTGGTAAGTTGATTGGCTATACCGAGGGCCAAGGCAGCGTTGTAAACACTCTCG
GTTGTTGCTTTGGACTTAGGATCGATCCCCATAACCGGAACGCTCATCAAACCAACGGTT
CCAGCAACATAGTAGCAGTAAAGGTAGAGATCATCAAAGGAGTTGTATCTAGACTTCCTC
AAATCCATTCTCATTCCTTCTATCATGTCTCTAAATGGCTGAATATCGACAGGGTATGTA
GCAACAGTATCAGAGAGAGCAG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

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ACTACAGAGACATCATAAGGCTCGGAAGGAAGAAGCTTCATCAGAGGTTATCCTTAGAGC
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BQ
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AF RR4FJ73JQ C 1
AF RR4FJ73TF U 1
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BS 649 649 RR4FJ73JQ
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DS 

RD RR4FJ73TF 734 0 0
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ATTTGATAGGTTGAATCTTGGGTGGTATGTGATATCTGTGACTTCCACTCCCGGCAAGGT
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GGAACTGTCATGCATTAAAGAACTTACTTCCTTATACGAAGCTGCTTTAATCGAGGACAT
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TCATCTCTTGTTCT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GW07JQ U 4
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QA 1 577 1 577
DS 

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GAGAGAGAGGGAGAGGGAGATTATTAACAGATTCAGAGACGATGGAACGTCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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AAGATCGCTGTTGCGCACCGTCTTGGACCGGTTCCTGTCGGGGAAACCAGTGTGTTCGTA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G508TF U 1
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GAAGTACATTGACTATGTCAGTGCTCCTCAAGCAGGTGCCATAGCAACATTCTCAGGCAC
CACAGAGACACGTTCGAGGGGAAAACAGTTTTGGAGCTAAGGTACGAAGCATACAAACCA
ATGGCCGCAAGATACCTCAGCTACATATGTGGGGACGCTAGATCGAACTGGGACATCCAC
AAGATCGCTGTTGCGCACCGTCTTGGACCGGTTCCTGTCGGGGAAACCAGTGTGTTCGTA
GCTGTCTCGTCTGTTCACCGTGGGGATGGTTTGGACGCGTGCAAGTTCTTGATCGACGAG
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TTTTCTCTCA*TAAACAAAATGTGTTACAAAAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR4G508JQ 694 0 0
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TGAAGTACATTGACTATGTCAGTGCTCCTCAAGCAGGTGCCATAGCAACATTCTCAGGCA
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AATGGCCGCAAGATACCTCAGCTACATATGTGGGGACGCTAGATCGAACTGGGACATCCA
CAAGATCGCTGTTGCGCACCGTCTTGGACCGGTTCCTGTCGGGGAAACCAGTGTGTTCGT
AGCTGTCTCGTCTGTTCACCGTGGGGATGGTTTGGACGCGTGCAAGTTCTTGATCGACGA
GCTGAAGGCGTCGGTTCCGATATGGAAGAAGGAGGTGTATGATAATGGGGAGGTTTGGAA
GGAGAACTCTGAGTTTATGGAGAAGAGGTTGGAGCTTGCTGAGAAGAGGCTGGAGAATGG
GGAGAGGTTGGTGAAGAAGAAGAGACATGTGGTTGGAAAAGAAGATAAAAGAAGTTGCTG
TGGAAGTAAAGTTAGAGTACAAGAAGATGAAGAGTGATGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTAT
GTTTTCTCTCAATAAACAAAATGTGTTACAAAAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

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GAAACAATGTGAAGTCAAAGCTAGACCTCTCTATCATCTTCATGCCAAGACAAGAAGTTA
TCTGTGCTGTTTGTAACGCCCATCTTGGTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCAACTG
GAAAAAGATATTGCCTCAACAGTGCTGCTCTGAAACTTGAGGCATTGGAGAGAACAAGAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GP43TF U 1
AF RR4GP43JQ C 195
BS 1 634 RR4GP43TF
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RD RR4GP43TF 680 0 0
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TCTCAGCACAAAAAAGGCTCGTCTCCATCTCAAAACAATCTCTCTCTGGATTCGCCTGTC
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CCTTTAACTCTTCTCAGAAATCAGACAACGTCCAAGACCGCGTTGGTAAGAGAGCGTTAT
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TTGACTCATCAACAAAGTTTGATAGTGGAACCGGGTGGCCATCGTATTACCAACCTATTG
GAAACAATGTGAAGTCAAAGCTAGACCTCTCTATCATCTTCATGCCAAGACAAGAAGTTA
TCTGTGCTGTTTGTAACGCCCATCTTGGTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCAACTG
GAAAAAGATATTGCCTCAACAGTGCTGCTCTGAA*CTTGAGGCATTGGAGAGAACA*GAG
ACTGAGAGTTTCTGGTACAA

QA 1 680 1 680
DS 

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AAGTTTGATAGTGGAACCGGGTGGCCATCGTATTACCAACCTATTGGAAACAATGTGAAG
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CTCAACAGTGCTGCTTTGAAACTTGAGGCATTGGAGAGAACAAGAGACTGAGAGTTTTTG
GTACAAAGTATTGTTCATATATTATACAATATAGTTTCATCCTTGTATTGAAAACATTGT
AATCACATGTAATAATACACAGAAGAAGAGTTGATTCCACT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL9131Contig1 795 2 6 U
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AACTCACACTCAAGATGCTACTCCTTTGACCCTAGGACAAGAATTTGGTGGCTATGCTAC
TCAAGTTAAGTATGGACTTAATCGAGTCACATGTACTCTACCCCGCCTCTATCAGCTTGC
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AGCTGCTGCAGTGGCAGAAGAAACAAACCTGCCGTTCGTCACTGCAGAAAACAAGTTCGA
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GTCGTTGATTAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FH38TF U 1
AF RR4F007TF U 187
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BS 246 246 RR4F007TF
BS 247 710 RR4FH38TF
BS 711 711 RR4F007TF
BS 712 768 RR4FH38TF
BS 769 795 RR4F007TF

RD RR4FH38TF 768 0 0
GCAGAGATCTCTGCAGAACTTCGAGATCGGCGGTGAGCGGGAGCGTATGCCCGAACCTAT
CGTCCGCGCTTTTGGCGTCTTGAAGAAGTGCGCTGCCAAGGTAAACATGGAGTATGGACT
CGATCCAACGATTGGGGAAGCGATTATGGAAGCAGCTCAGGAAGTAGCTGAGGGCAAACT
CAATGATCATTTCCCCCTTGTTGTTTGGCAAACTGGTAGTGGCACTCAGAGTAACATGAA
CGCTAGTGAGGTCATTGCTAACAGAGCAGCTGAGATTCTTGGTCGCAAACGTGGTGAAAA
ATGTGTCCACCCTAATGACCATGTCAACCGTTCTCAATCTTCTAACGACACTTTCCCTAC
TGTCATGCACATTGCAGCTACAACCGAGATTAATTCAAGGCTCATCCCTAGTTTGAAAAC
TTTGCATTCCACTCTCGACTCTAAGTCCTTCGAGTTCAAAGATATTGTCAAAATTGGAAG
AACTCACACTCAAGATGCTACTCCTTTGACCCTAGGACAAGAATTTGGTGGCTATGCTAC
TCAAGTTAAGTATGGACTTAATCGAGTCACATGTACTCTACCCCGCCTCTATCAGCTTGC
ACAAGGTGGAACTGCTGTTGGGACAGGACTAAACACCAAGAAAGGGTTTGATGTAAAGAT
AGCTGCTGCAGTGGCAGAAGAAACAAACCTGCCGTTCGTCACTGCAGAAA*CAAGTTCGA
AGCTCTGGCTGCACACGATGCTTGTGTTGAAACCAGTGGGTCACTTAA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4F007TF 609 0 0
G
CATTTCCCCCTTGTTGTTTGGCAAACTGGTAGTGGCACTCAGAGTAACATGAACGCTAAT
GAGGTCATTGCTAACAGAGCAGCTGAGATTCTTGGTCGCAAACGTGGTGAAAAATGTGTC
CACCCTAATGACCATGTCAACCGTTCTCAATCTTCTAACGACACTTTCCCTACTGTCATG
CACATTGCAGCTGCAACCGAGATTAATTCAAGGCTCATCCCTAGTTTGAAAACTTTGCAT
TCCACTCTCGACTCTAAGTCCTTCGAGTTCAAAGATATTGTCAAAATTGGAAGAACTCAC
ACTCAAGATGCTACTCCTTTGACCCTAGGACAAGAATTTGGTGGCTATGCTACTCAAGTT
AAGTATGGACTTAATCGAGTCACATGTACTCTACCCCGCCTCTATCAGCTTGCACAAGGT
GGAACTGCTGTTGGGACAGGACTAAACACCAAGAAAGGGTTTGATGTAAAGATAGCTGCT
GCAGTGGCAGAAGAAACAAACCTGCCGTTCGTCACTGCAGAAAACAAGTTCGAAGCTCTG
GCTGCACACGATGCTTGTGTTGAAACCAGTGGGTCACTTAACACAATCGCCACGTCGTTG
ATTAAAAA

QA 2 609 2 609
DS 



AS 1 2

CO CL9132Contig1 762 2 2 U
TTTTTTACTGCAAAGGAAACATGAGTATTAGTTTTAAATCGGGTACACAATGACGGAAAA
GCTTACACGAGATGCTTAAAGTTCTCCTTCAACTATGTTTTATGTTTGATTTTTTTTCAC
ACGTTTGTCGGGTTCAGTGAAAATACTTTAAAAAGTAACAAAAAATAAAAACTGGACACA
AAGCAAAAAAAGAGACGGAACATGAACTACACAACAGAGCAAGAAACAGGGGAATAAACA
GAGTATGATAATGAAGACATTTAAAATAAAGATAGACAAGTTGATTCCAACCTGAAGACT
CCTGGGAATGGAACCGAACTGAAGTCAAGATTAGCATTCATCAACAAGTACTCAACCCAA
CCCACGTCACCGTTCCGACCAATCTCTCTGCTCCCATATCCAAACGGATAACCTGCGAGC
TGGCTTTTCTCGGACTTGGGCAATGAGAAAAAAGCAACGGCCTCGTGTTCCAGAACAGTG
ACTAGTTCAAAGGAAACGCCGTGGTTAATCACCTTGAAGAACCCAAAGTCTTCACAGGCT
TTGACGAGAGCGTGTTTTGATTCTGGGTCAGAAATATCAATAACCGGGATTGGAGAAAAA
CCGGATTTTGGTTCTGCTGCCGGTTTGGACAAGACCGCCATTGATGTTTTTGAATGTTTC
ACAGAGATTTTATATTTCATGTGAGTGATAGCTTTGAAGGCTGAGACATGGAGGTATGTA
CTCGGACGAGTGTGTATTATATAGCAGAGGAGAGGATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BV34TF C 1
AF RR4BV34JQ U 6
BS 1 11 RR4BV34TF
BS 12 762 RR4BV34JQ

RD RR4BV34TF 737 0 0
TTTTTTACTGCAAAGGAAACATGAGTATTAGTTT*AAATCGGGTACACAATGACGGAAAA
GCTTACACGAGATGCTTAAAGT*CTC*TTCAACTATGTTTTATGTTTGATTTTTTT*CAC
ACGTTTGTCGGGTTCAGTGAAAATACTTTAAAAAGTAACAAAAAATAGAAACTGGACACA
AAGCAGAGAAAGAGACGGAACATGAACTACACAACAGAGCAAGAAACAGGGGAATAAACA
GAGTATGATAATGAAGACATTTAAAATAAAGATAGACAAGTTGATTCCAACCTGAAGACT
CCTGGGAATGGAACCGAACTGAAGTCAAGATTAGCATTCATCAACAAGTACTCAACCCAA
CCCACGTCACCGTTCCGACCAATCTCTCTGCTCCCATATCCAAACGGATAACCTGCGAGC
TGGCTTTTCTCGGACTTGGGCAATGAGAAGAAAGCAACGGCCTCGTGTTCCAGAACAGTG
ACTAGTTCAGAGGAAACGCCGTGGTTAATCACCTTGAAGAACCCAAAGTCTTCACAGGCT
TTGACGAGAGCGTGTTTTGATTCTGGGTCAGAGATATCAATAACCGGGATTGGAGAAAAA
CCGGATTTTGGTTCTGCTGCCGGTTTGGACAAGACCGCCATTGATGTTTTTGAATGTTTC
ACAGAGATTTTATATTTCATGTGAGTGATAGCTTTGAAGGCTGAGACATGGAGGTATGTA
CTCGGACGAGTGTGTAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR4BV34JQ 757 0 0
ACTGCA
AAAGGAAACATGAGTATTAGTTTTAAATCGGGTACACAATGACGGAAAAGCTTACACGAG
ATGCTTAAAGTTCTCCTTCAACTATGTTTTATGTTTGATTTTTTTTCACACGTTTGTCGG
GTTCAGTGAAAATACTTTAAAAAGTAACAAAAAATAAAAACTGGACACAAAGCAAAAAAA
GAGACGGAACATGAACTACACAACAGAGCAAGAAACAGGGGAATAAACAGAGTATGATAA
TGAAGACATTTAAAATAAAGATAGACAAGTTGATTCCAACCTGAAGACTCCTGGGAATGG
AACCGAACTGAAGTCAAGATTAGCATTCATCAACAAGTACTCAACCCAACCCACGTCACC
GTTCCGACCAATCTCTCTGCTCCCATATCCAAACGGATAACCTGCGAGCTGGCTTTTCTC
GGACTTGGGCAATGAGAAAAAAGCAACGGCCTCGTGTTCCAGAACAGTGACTAGTTCAAA
GGAAACGCCGTGGTTAATCACCTTGAAGAACCCAAAGTCTTCACAGGCTTTGACGAGAGC
GTGTTTTGATTCTGGGTCAGAAATATCAATAACCGGGATTGGAGAAAAACCGGATTTTGG
TTCTGCTGCCGGTTTGGACAAGACCGCCATTGATGTTTTTGAATGTTTCACAGAGATTTT
ATATTTCATGTGAGTGATAGCTTTGAAGGCTGAGACATGGAGGTATGTACTCGGACGAGT
GTGTATTATATAGCAGAGGAGAGGATAAAAA

QA 7 757 7 757
DS 



AS 1 2

CO CL9133Contig1 777 2 2 U
AGAAACAAAAATTTCACATTAATCGAGAAATAAGAAGATTCCCAAATATTAGTCGAACTG
ATAAAAAGAAAATGCAAAAATTTAACACTCACAATTAGAGGTATTAATAATGTTTATTTA
TGTTTAAGCAGTTTGTGTTCAAGACTCGCTTTCCTTCCCTCCGTAAATTGTATTTGTATC
TGTGTGCTATAGATATCCAAACAACATTACCTTTTACAGCAACAAGTCTTCTCTCCTGTA
TTCACGAACAATCACAGGTATGCTCGTCGGAGGAATCATTCCATAATCCGTAACGATCAT
AGATATATACTCAGCAGGAGTTGAATCGTACATTAGATTCAGAAACTGGAGGTTTTTGTT
GTTATCCATCGTCTTTGCATGCTTTGTGTTGGGTTTTAATGGCACATTGGCTATGGCGTC
AGGATTCCCAAGTTCGTTAGAGCAGATTGAATCAAGCAGGACTCTTTCATGGAACTTGTA
AGCTTCGCAACACACAATGACTGGGACACTAAACGCGTTTGCAACCATTGCAACACATGC
CGTACCAACTTTTGAGTACAGTTCCATTAGAGAAGATGGACGAAGCCCCAAGAAAGACAC
GCGTAACCTCACCCATGATGTAGGAAACGGCGTTTAATGAGTGTAGGTACAGTCGAGTCC
ACGGGCGACAAGCCTACGGAGTAGCTTTTGACCTTCAAGGTTAGGGCGTGAGTCTACAAC
CACTACACGGAACTTTCTCCCAATCTCATGGGCGTACAAGAGAATCATCTCAACCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4G412JQ U 1
AF RR4G520JQ U 52
BS 1 620 RR4G412JQ
BS 621 777 RR4G520JQ

RD RR4G412JQ 620 0 0
AGAAACAAAAATTTCACATTAATCGAGAAATAAGAAGATTCCCAAATATTAGTCGAACTG
ATAAAAAGAAAATGCAAAAATTTAACACTCACAATTAGAGGTATTAATAATGTTTATTTA
TGTTTAAGCAGTTTGTGTTCAAGACTCGCTTTCCTTCCCTCCGTAAATTGTATTTGTATC
TGTGTGCTATAGATATCCAAACAACATTACCTTTTACAGCAACAAGTCTTCTCTCCTGTA
TTCACGAACAATCACAGGTATGCTCGTCGGAGGAATCATTCCATAATCCGTAACGATCAT
AGATATATACTCAGCAGGAGTTGAATCGTACATTAGATTCAGAAACTGGAGGTTTTTGTT
GTTATCCATCGTCTTTGCATGCTTTGTGTTGGGTTTTAATGGCACATTGGCTATGGCGTC
AGGATTCCCAAGTTCGTTAGAGCAGATTGAATCAAGCAGGACTCTTTCATGGAACTTGTA
AGCTTCGCAACACACAATGACTGGGACACTAAACGCGTTTGCAACCATTGCAACACATGC
CGTACCAACTTTTGAGTACAGTTCCATTAGAGAAGATGGACGAAGCCCCAAGAAAGACAC
GCGTAACCTCACCCATGATG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR4G520JQ 726 0 0
GTCGAACTGATAAAAAGAAAATGCAAAAATTTAACACTCACAATTAGAGGTATTAATAAT
GTTTATTTATGTTTAAGCAGTTTGTGTTCAAGACTCGCTTTCCTTCCCTCCGTAAATTGT
ATTTGTATCTGTGTGCTATAGATATCCAAACAACATTACCTTTTACAGCAACAAGTCTTC
TCTCCTGTATTCACGAACAATCACAGGTATGCTCGTCGGAGGAATCATTCCATAATCCGT
AACGATCATAGATATATACTCAGCAGGAGTTGAATCGTACATTAGATTCAGAAACTGGAG
GTTTTTGTTGTTATCCATCGTCTTTGCATGCTTTGTGTTGGGTTTTAATGGCACATTGGC
TATGGCGTCAGGATTCCCAAGTTCGTTAGAGCAGATTGAATCAAGCAGGACTCTTTCATG
GAACTTGTAAGCTTCGCAACACACAATGACTGGGACACTAAACGCGTTTGCAACCATTGC
AACACATGCCGTACCAACTTTTGAGTACAGTTCCATTAGAGAAGATGGACGAAGCCCCAA
GAAAGACACGCGTAACCTCACCCATGATGTAGGAAACGGCGTTTAATGAGTGTAGGTACA
GTCGAGTCCACGGGCGACAAGCCTACGGAGTAGCTTTTGACCTTCAAGGTTAGGGCGTGA
GTCTACAACCACTACACGGAACTTTCTCCCAATCTCATGGGCGTACAAGAGAATCATCTC
AACCAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL9134Contig1 573 2 1 U
GTGATGGGGTTTGGAGATCATAGGACTTCAAAAATAGTGGAAACCATTGCTGACGAGGAA
ATTGCACATGTGGCTGTTGGTGTAGACTGGTTTCTCTCTGTGTGTCAAAAGATGAACCGT
GCTCCTTGCCCTACGTTTAAAGATTTGATTAAAGAGTATGGTGCTGAGTTAAGGGGACCT
TTTAACCACTCAGCTCGGGAGATAGCTGGCATTCCCCGAGATTGGTATGATTCATCATGT
GGCACCGAAGTGGATGAATGCAGCAACAAACAGAGTGACAAGGAGCAACTTTCTGCGGTT
TACGATAGGCTCACGCACATAATCTCAATGGAGAGTGAGAATTCAAGTCTCGAACGGCCA
GCCAAATGAAATGAATATGAGTGTGTGGCGTTTACTTATTGGGCTCTGAAAGTAGAGAGA
TTAGTAACTTATTGTTAGTATGTTTATGGCTTTGTTGCTTGTGAGTTACAGATGCATTAG
AGTTGATCCAGGGAACAACTTTATGTTATGGTCTTGTTAACATCCAAGATACATTGTTAT
TATGTTCAATAATATCCAAGTTGTTCTTCGTCG


BQ
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AF RR4GL34JQ C 1
AF RR4GL34TF U 1
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RD RR4GL34TF 573 0 0
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QA 1 573 1 573
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RR4F214TF U 1
AF RR4F214JQ C 124
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BS 693 758 RR4F214JQ

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TTTTAATGTATTCGGAAACTTGTGGGAGGCTT

QA 1 692 1 692
DS 

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GCAGCGGCTGCTGCTGCGGCTTCGGCCGCCGCCTCGGCTGCTGCAACGGCCGCAACCAAA
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TGCTGGGGGTAATTTAATTGGGAATAAACTCTTTGTTTTGAGAGTATTTTAGAATCAGTG
GAGGGAGGCTTGGCTGGTGAGAGATTAAAAATATTCAGTTTTTTTTTTTACTAATGTCTT
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TAATGTATTCGGAAACTTGTGGGAGGCTTCTCAGAAGTTTTGGCTCGTACTGTTTCAGGT
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QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL9137Contig1 788 2 4 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AI96TF U 1
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RD RR4AI96TF 710 0 0
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CTTGTCATGCTCACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTCTTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGT
GTTCTCGCCGGCTCTCTTGTTTCCGGTGTCCAGGTTGCTATCTCTGCGTCTAACACTGGT
GGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCTGGTGTATCAGAGCACGCAAAGAGT
CTTGGACCAAAGGGTTCAGAGCCACACAAGGCAGCTGTGATTGGAGACACTATTGGAGAC
CCGTTGAAGGATACTTCAGGACCTTCGTTGAACATCCTGATCAAGCTCATGGCTGTTGAG
TCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGCATCCTTTTCAAGTACCTCTAA
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CATTCTTGTTTTCATTTTGCGTATGTGGTTTTAAAACATTTTGTTTGGACTCATTCCAAA
GAACCAAACCAAAAGATGTTTCTCTCTCTTTTTGTGCTGTCTAGATTTTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR4AI96JQ 767 0 0
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ACCGATGCTTCCATCAAGGAGATGATTCCTCCGGGTTGCCTTGTCATGCTCACACCTCTC
ATTGTTGGTTTCTTCTTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTCTCGCCGGCTCTCTTGTT
TCCGGTGTCCAGGTTGCTATCTCTGCGTCTAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCCAAG
AAATACATCGAGGCTGGTGTATCAGAGCACGCAAAGAGTCTTGGACCAAAGGGTTCAGAG
CCACACAAGGCAGCTGTGATTGGAGACACTATTGGAGACCCGTTGAAGGATACTTCAGGA
CCTTCGTTGAACATCCTGATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTC
TTTGCCACTCACGGTGGCATCCTTTTCAAGTACCTCTAAACTCAACCCTGAGTGAAGAGG
AAAGATGATGATGAAGATGGTTACAATGCCTCTTTTTACCATTCTTGTTTTCATTTTGCG
TAGGTGGTTTTAAAACATTTTGTTTGGACTCATTCCAAAGAACCAAACCAAAAGATGTTT
CTCTCTCTTTTTGTGCTGTCTAGATTTTAGAAATCCACCAAGTACTTTGAGTTATGTTTT
GGTCTTATTCGAGACGAATGAGGTTTAAGTATCAGTCTTTTGTCGGC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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CATCCAACTGAATTCGACTTCTACCTTTGTAGCCACGCTGGTATACAGGGAACAAGCAGG
CCTGCTCATTACCATGTTCTTTGGGATGAGAACAATTTCACAGCGGATGGTATACAGTCT
CTGACTAATAATCTCTGCTATACCTATGCCCGATGCACTCGATCGGTCTCCGTTGTTCCT
CCGGCGTATTATGCGCATCTTGCAGCATTCCGAGCACGTTTCTACATGGAACCGGAGATC
ATGCAAGATAACGGATCGCCGGGGAAAAAGAGCACGAAGACAACTACTAACGGAGATCAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BR34TF U 1
AF RR4BR34JQ C 44
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RD RR4BR34TF 773 0 0
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CTGACTAATAATCTCTGCTATACCTATGCCCGATGCACTCGATCGGTCTCCGTTGTTCCT
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GGCGTTGGTGTGAAGCCGTTACCGGCATTGAAGGAGAATGTGAAGAGAGTCATGTTCTAC
TGCTAAATGAAAAA*CGTTTTTTTAAGACTGTTTCGTTTGTTACTGTTCTTAGTTCGGCC
TTAG*TTTGCTACTGTTTGTAAATATGTTTGGTTCGGCTTAGG*TTCTT*ATTTCTAGAG
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QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4BR34JQ 730 0 0
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CGGATGGTATACAGTCTCTGACTAATAATTTCTGCTATACCTATGCCCGATGCACTCGAT
CGGTCTCCGTTGTTCCTCCGGCGTATTATGCGCATCTTGCAGCATTCCGAGCACGTTTCT
ACATGGAACCGGAGATCATGCAAGATAACGGATCGCCGGGGAAAAAGAGCACGAAGACAA
CTACTAACGGAGATCATGGCGTTGGTGTGAAGCCGTTACCGGCATTGAAGGAGAATGTGA
AGAGAGTCATGTTCTACTGCTAAATGAAAAAACGTTTTTTTAAGACTGTTTCGTTTGTTA
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GTTCTTTATTTCTAGAGTTGTGTGTTTTAGCTCAGGTTTCGATGATAACGTTAATGCAAT
ATGTTTTCTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL9139Contig1 581 2 1 U
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AGCTGTTGACAGACCAAACATTGCACAAGTAGTGTCTATGATCACAACCACGACAGAGCT
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AV85JQ C 1
AF RR4AV85TF U 1
BS 1 581 RR4AV85TF

RD RR4AV85JQ 581 0 0
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GTTGGAGTCTGTGAATCATATGACACAGACTGCGATGTATGGGCGCTAAAGTTTCCACTA
CGCTGAACAGTACAGTGTGGTCACTTCACTTTTAAACACATGATGTGGTTTGTGTTTGGT
TGTTTAAACACATTTGATGTAAATAAAGTTCAGTTTTTGTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4AV85TF 581 0 0
GACAGTACACTTAGGGTTGTTGGAACTATAGGATACATGTCTCCTGAGTATGCATGGACA
GGGATGTTCTCGGAGAAGTCTGACATATGCCTTCGGAGTTCTGCAGTTAGAAATCATAAG
TGGGATGAGGATTTCAAGCTTTGACTGTGGTGGCCAAGGCAAAACTCTTCTTGAATATGC
ATGGGAAACTTGGCTTGAGACTGGTGGAGTGGATCTGTTGGATGAGGCTATTGCCAGCTC
GTGTTCTCCAGATGAAGTGGCGAGATGTGTTCAGATTGGTCTACTCTGCATCCAACAGCA
AGCTGTTGACAGACCAAACATTGCACAAGTAGTGTCTATGATCACAACCACGACAGAGCT
TCCGAGGCCAAAACAACCAGTGTTTGCAGTGCACGTTCAAGATCAGGAGAGTACCGTCTC
GTTGGAGTCTGTGAATCATATGACACAGACTGCGATGTATGGGCGCTAAAGTTTCCACTA
CGCTGAACAGTACAGTGTGGTCACTTCACTTTTAAACACATGATGTGGTTTGTGTTTGGT
TGTTTAAACACATTTGATGTAAATAAAGTTCAGTTTTTGTT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AE22JQ C 1
AF RR4AE22TF U 1
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QA 1 396 1 396
DS 

RD RR4AE22TF 396 0 0
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GAAGGTTTGATAACTTGTCACTTTTACCACATATGATGCAGGATGCAGATATTAGTTTGA
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GTAGTGTTCTCAACAATTATTTTGTAAAATAAAATCCGAAGGTGGCTCAGGCAAATCTCT
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QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 2

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CTTTCTCCCTTCTGTAGAGGCCATGTCGGACAAAGGTCGTCCCTTGCCGAAGTTTGGTGA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D339TF U 1
AF RR4D339JQ C 144
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RD RR4D339TF 730 0 0
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CCATCTCTTTTTTTTCTTCTTTTCTCAGAATCGTTTGTTTCCATTTTTCTTGGGATAAAT
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GTTATTGTGT

QA 1 730 1 730
DS 

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TTGCTTAGACATCTAAAAGCAATGTTCCCTTCTTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGA
AGTACCGACGACAACAAAAGGTTACTAAGATAAGTTGGAGCCACCCCCCTTTAGTATCAC
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QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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AGACTTTGAAGAAGAAGAAGATGATGATGATGATGATGTTGAAGTGGATTACCCATGTCC
GTTTTGCTCCGATGATTATGATTTAGTCGAGTTGTGTCACCATATCGACGAAGAGCATCA
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TCTGTTTTTCTCAGACACTAAAGTAGGTTTAGCTTCGTAATATATAAAGCCAATCCGTTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RR4F442TF U 1
AF RR4F442JQ C 183
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BS 683 683 RR4F442JQ
BS 684 758 RR4F442TF
BS 759 759 RR4F442JQ
BS 760 768 RR4F442TF
BS 769 901 RR4F442JQ

RD RR4F442TF 771 0 0
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CGGTTCTGCTGCGATGGAAGACGATACGTGGGCTGTTTCCCCTTCTGGTTCTTCCAGAAG
CTATCGATCATCGGCAACGACAGCTGCTAAGTATCAATCTGGTTCTTACCTAGATTCGGG
AGACTTTGAAGAAGAAGAAGATGATGATGATGATGATGTTGAAGTGGATTACCCATGTCC
GTTTTGCTCCGATGATTATGATTTAGTCGAGTTGTGTCACCATATCGACGAAGAGCATCA
GCTTGAAGCTACCTATGGGCTATGCCCGGTTTGTAACAAAATGGTGAAGATGGACATGGT
GGATCATATAACCTCATATCATAGAGATGTCTTGAAGAGTGTGCATAAGCAGACATCTTC
TTACATGGACGATCCATACTCATCAGATAAACATCTTCGATCATTTCACGATGACTTTCC
ACCATATACGCATACTTCTAAACCCGTTGTTGCGGACCACTTTTTATCTTTCCTCAACAG
TCCCCCATTGCCAAAGCAAACCAAGCCTGTGCATGAGGTTGATTCAAGTGCAGAAGACAA
GAATTTGACTGAGGCTGATTCCTCTACAGTAAAAGACAGGACATGTTCAACACCTTTATC
GGATACTGAACAACTGGAGAAG*CAAATAAGTGTGAGTTTGTACAGGGACTGTTGTCGTC
AGCCATGTTTGGTGATGGATGCGACTTCTTCTGAGATA*GAAGCCAAA
AAA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4F442JQ 719 0 0
GAC
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GCTCCGATGATTATGATTTAGTCGAGTTGTGTCACCATATCGACGAAGAGCATCAGCTTG
AAGCTACCTATGGGCTATGCCCGGTTTGTAACAAAATGGTGAAGATGGACATGGTGGATC
ATATAACCTCATATCATAGAGATGTCTTGAAGAGTGTGCATAAGCAGACATCTTCTTACA
TGGACGATCCATACTCATCAGATAAACATCTTCGATCATTTCACGATGACTTTCCACCAT
ATACGCATACTTCTAAACCCGTTGTTGCGGACCACTTTTTATCTTTCCTCAACAGTCCCC
CATTGCCAAAGCAAACCAAGCCTGTGCATGAGGTTGATTCAAGTGCAGAAGACAAGAATT
TGACTGAGGCTGATTCCTCTACAGTAAAAGACAGGACATGTTCAACACCTTTATCGGATA
CTGAACAACTGGAGAAGGCAAATAAGTGTGAGTTTGTACAGGGACTGTTGTCGTCAGCCA
TGTTTGGTGATGGATGCGACTTCTTTTGAGATAAGAAGCCAAATAAAGATGTGAAGCCTG
TAATGGCAAAAGGCAGCTTATTGGCATTGTTGTAATTTTGTTCAGTTCTGTTTTATCTGT
TTTTCTCAGACACTAAAGTAGGTTTAGCTTCGTAATATATAAAGCCAATCCGTTTT

QA 4 719 4 719
DS 



AS 1 2

CO CL9143Contig1 571 2 1 U
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TTGAAGTCTTTAAAAAAAAAATGGTGGAAGTGTGGTGGCCACTGTTGGCAGCAGCAGTCC
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TCAAGAGTGCTCGAGGAAGAGAGAAGAGCTCTGATGACATCTTTGTCTGCGAAAGAGTTT
GCACTTCAAAAAGAATGCTCAAAAAAGTTGGAGCTTTCTCTAAAGATCCCATTCCAGACA
CTTGTGTTACCGTCTGCGGCGTGTCTGAGCTCGACGCTTGCTCCGATGCTTGTGCTCAAA
CCGTCTGCGTTAACCAGCATCAAGTTGCTAACTGGAATGACATTTGTCTTAGGAGGTGTC
AGAGTGAGTGTCTCAAGCTCTCTTCTTCTTCTTCTCGCTCTTCTTGATATGTTTTAAGAG
TTTGTTTTTAAGTTTGAGTCTGAATGCTATGATTGGTTCCTTTTGAATCTGAATTTTTTT
TGTAAGTTGAATAACAAACAGCATTATGAGC


BQ
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AF RR4CT50JQ C 1
AF RR4CT50TF U 1
BS 1 571 RR4CT50TF

RD RR4CT50JQ 571 0 0
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CTGCGCTAATCGGAGGCCAAGCGTTGAGGATAAAGAAGAGGCGCGGGGAAGAAGAGAGGA
TCAAGAGTGCTCGAGGAAGAGAGAAGAGCTCTGATGACATCTTTGTCTGCGAAAGAGTTT
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TGTAAGTTGAATAACAAACAGCATTATGAGC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4CT50TF 571 0 0
GACGACAAGCTGTTCCTAAACCGAGAGCCGCGAGAAACAAAACAGCAAGTGTGATAAATT
TTGAAGTCTTTAAAAAAAAAATGGTGGAAGTGTGGTGGCCACTGTTGGCAGCAGCAGTCC
CTGCGCTAATCGGAGGCCAAGCGTTGAGGATAAAGAAGAGGCGCGGGGAAGAAGAGAGGA
TCAAGAGTGCTCGAGGAAGAGAGAAGAGCTCTGATGACATCTTTGTCTGCGAAAGAGTTT
GCACTTCAAAAAGAATGCTCAAAAAAGTTGGAGCTTTCTCTAAAGATCCCATTCCAGACA
CTTGTGTTACCGTCTGCGGCGTGTCTGAGCTCGACGCTTGCTCCGATGCTTGTGCTCAAA
CCGTCTGCGTTAACCAGCATCAAGTTGCTAACTGGAATGACATTTGTCTTAGGAGGTGTC
AGAGTGAGTGTCTCAAGCTCTCTTCTTCTTCTTCTCGCTCTTCTTGATATGTTTTAAGAG
TTTGTTTTTAAGTTTGAGTCTGAATGCTATGATTGGTTCCTTTTGAATCTGAATTTTTTT
TGTAAGTTGAATAACAAACAGCATTATGAGC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL9144Contig1 1010 2 4 U
GGGGAACCATGGGGGCTACTGCTCAAAGTTTGTGGAAGTTCAACGTTGTTCAGACTGGAA
CTCATCACGCTTTAAACCCGGATCCATACAGAGGTGTGTTTGGTTCTGATGGAGAGAAGT
ATGCAAGAGATGTGCAAGATCTCATACAATATGGCACTACAGGACATATTGCTGGTTTCA
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CAGCTTACGACATTGTGAAGAAAGCTGGAGGACTGTTCATTGCTGATGAAGTACAGTCTG
GATTCGCTCGCACTGGCAACTTCTGGGGATTCGAGGCTCACAATGTTGTCCCTGACATAG
TTACCATGGCAAAGGGAATTGGGAATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACAACTCCGG
AGATAGCAGGAGTGTTGACACGCCGATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGCTGTGT
CTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTCTGAATGTGATTGAGAAAGAGAAGCTTCAGGAAAATG
CATCCATGGTCGGATCCTACCTTAAAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACATGAAA
TTATTGGGGATGTAAGGGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTTGTAAGTGATCGCA
AGATCAAGACTCCTGCAACGGCCGAGACTCTACACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGG
GTGTGTTGGTTGGAAAAGGAGGCTATTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACCTTTCT
GCTTCACTAAGGAAGACGCAGATTATCTTGTGGAAGCGATGGACTACTCGATCTCCAAGA
TGTGAAGGAAACAAAAGAAAAGTAGTATAAAATGTCTCTTTGTGGGAGATTAATAAGTTG
TGGTGTAATTATGCTTGTAACTTTGCTTCAAACAACTACAATGATTGATGAGCCAACATC
TCGTTGCTTCTCAATCCCTCTGTTTTCTTAATGAAAAACGTATTTTTCTC


BQ
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AF RR4FK60TF U 1
AF RR4FK60JQ C 188
BS 1 753 RR4FK60TF
BS 754 754 RR4FK60JQ
BS 755 763 RR4FK60TF
BS 764 1010 RR4FK60JQ

RD RR4FK60TF 763 0 0
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CTCATCACGCTTTAAACCCGGATCCATACAGAGGTGTGTTTGGTTCTGATGGAGAGAAGT
ATGCAAGAGATGTGCAAGATCTCATACAATATGGCACTACAGGACATATTGCTGGTTTCA
TCTGTGAAGCTATACAGGGAGTTGGAGGGATTGTGGAACTAGCTCCAGGCTATTTGTCAG
CAGCTTACGACATTGTGAAGAAAGCTGGAGGACTGTTCATTGCTGATGAAGTACAGTCTG
GATTCGCTCGCACTGGCAACTTCTGGGGATTCGAGGCTCACAATGTTGTCCCTGACATAG
TTACCATGGCAAAGGGAATTGGGAATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACAACTCCGG
AGATAGCAGGAGTGTTGACACGCCGATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGCTGTGT
CTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTCTGAATGTGATTGAGAAAGAGAAGCTTCAGGAAAATG
CATCCATGGTCGGATCCTACCTTAAAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACATGAAA
TTATTGGGGATGTAAGGGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTTGTAAGTGATCGCA
AGATCAAGACTCCTGCAACGGCCGAGACTCTACACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGG
GTGTGTTGGTTGGAAAAGGAGGCTATTTTGGAA*CGTGTTTAG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4FK60JQ 823 0 0
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CGACATTGTGAAGAAAGCTGGAGGACTGTTCATTGCTGATGAAGTACAGTCTGGATTCGC
TCGCACTGGCAACTTCTGGGGATTCGAGGCTCACAATGTTGTCCCTGACATAGTTACCAT
GGCAAAGGGAATTGGGAATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACAACTCCGGAGATAGC
AGGAGTGTTGACACGCCGATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGCTGTGTCTACTAC
AGCAGGTCTCGCTGTTCTGAATGTGATTGAGAAAGAGAAGCTTCAGGAAAATGCATCCAT
GGTCGGATCCTACCTTAAAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACATGAAATTATTGG
GGATGTAAGGGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTTGTAAGTGATCGCAAGATCAA
GACTCCTGCAACGGCCGAGACTCTACACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGGGTGTGTT
GGTTGGAAAAGGAGGCTATTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACCTTTCTGCTTCAC
TAAGGAAGACGCAGATTATCTTGTGGAAGCGATGGACTACTCGATCTCCAAGATGTGAAG
GAAACAAAAGAAAAGTAGTATAAAATGTCTCTTTGTGGGAGATTAATAAGTTGTGGTGTA
ATTATGCTTGTAACTTTGCTTCAAACAACTACAATGATTGATGAGCCAACATCTCGTTGC
TTCTCAATCCCTCTGTTTTCTTAATGAAAAACGTATTTTTCTC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL9145Contig1 894 2 2 U
GGACAGTAAAAGAGCAACTCTACTTAAAACTATTTGCTCCTTTCGACAGAGAGATAAAAC
GAGACAATGGGTGCTAATGTTTCTTCGCCAGACCAGAGATATTCAGTGACGTCCGACCTC
CCTTCCAGGAGGCCATGGACACCTCGCTTCGAGTCCCAGATTTTTCCTTACAAAGTCAAC
ATCCCCCTTATTGTGGAAATCAAGAACAAGAATCAGTGGAAATCTCGACTCGACGCTCTC
AAGGACACCAACAATCTGGTAACGTATTATTTCATGCGCTTTCTAACGTAGAATATTTCT
ACTTTTTCTTAATATTTCTTGTGCTACAATGGTGGAGGTTTATATTTTACTAGGATTAGT
TTGAGTATATCATAATGCATCCAATTCTGGTGTTTAATATATAGCTGGTGATCGAGTTCA
CGGCCAAATGGTGTGGACCTTGTAAATCCCTTGAGCCGAAGGTTGAAGAGTTGGCGGCTA
AGTACACCGATGTCGAGTTCGTGAAGATTGATGTCGATGTGTTAATGAGTGTGTGGATGG
AGTATAACCTTCATACTTTGCCTGCGATTGTATTCATGAAGAGAGGCCAAGAAGTAGACA
GAGTTGTGGGTGTGAAGTTTGATGAATTAGAGAGGAAACTCCACAAATACGCACAATCCT
TCTTCTGAGAAATATGAAGCTTTTACTTGCATACCAAACAAAGCTCCTCATGCATGATCA
CCGTATGCCAAGAATAGTATGCTACTATAGATAAATAAATGTAGCTCCTTATGCTTGATC
ACCTAAGCCAAGAATAGTATGCTGCTATATATAAATAAATGTTTGAACGTAGATTCAAGA
AAATAAACATAATTTGAGTGATATAAGGAATTGGAAGTTGGTTTTGCATGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI61TF U 1
AF RR4EI61JQ C 215
BS 1 793 RR4EI61TF
BS 794 894 RR4EI61JQ

RD RR4EI61TF 793 0 0
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ACTTTTTCTTAATATTTCTTGTGCTACAATGGTGGAGGTTTATATTTTACTAGGATTAGT
TTGAGTATATCATAATGCATCCAATTCTGGTGTTTAATATATAGCTGGTGATCGAGTTCA
CGGCCAAATGGTGTGGACCTTGTAAATCCCTTGAGCCGAAGGTTGAAGAGTTGGCGGCTA
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AGTATAACCTTCATACTTTGCCTGCGATTGTATTCATGAAGAGAGGCCAAGAAGTAGACA
GAGTTGTGGGTGTGAAGTTTGATGAATTAGAGAGGAAACTCCACAAATACGCACAATCCT
TCTTCTGAGAAATATGAAGCTTTTACTTGCATACCAAACAAAGCTCCTCATGCATGATCA
CCGTATGCCAAGAATAGTATGCTACTATAGATAAATAAATGTAGCTCCTTATGCTTGATC
ACCTAAGCCAAGA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR4EI61JQ 680 0 0
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TGCGCTTTCTAACGTAGAATATTTCTACTTTTTCTTAATATTTCTTGTGCTACAATGGTG
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TAATATATAGCTGGTGATCGAGTTCACGGCCAAATGGTGTGGACCTTGTAAATCCCTTGA
GCCGAAGGTTGAAGAGTTGGCGGCTAAGTACACCGATGTCGAGTTCGTGAAGATTGATGT
CGATGTGTTAATGAGTGTGTGGATGGAGTATAACCTTCATACTTTGCCTGCGATTGTATT
CATGAAGAGAGGCCAAGAAGTAGACAGAGTTGTGGGTGTGAAGTTTGATGAATTAGAGAG
GAAACTCCACAAATACGCACAATCCTTTTTTTGAGAAATATGAAGCTTTTACTTGCATAC
CAAACAAAGCTCCTCATGCATGATCACCGTATGCCAAGAATAGTATGCTACTATAGATAA
ATAAATGTAGCTCCTTATGCTTGATCACCTAAGCCAAGAATAGTATGCTGCTATATATAA
ATAAATGTTTGAACGTAGATTCAAGAAAATAAACATAATTTGAGTGATATAAGGAATTGG
AAGTTGGTTTTGCATGTACG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9147Contig1 397 2 1 U
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ATTTATTGGTCTAAGCAAAATACGACTTATTTGAAATGGCGGTGGCGAAGGTAATGAAGA
AAGACACAGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAAGCTCTGGAAGTAGGGAGTCTCTTTGTTGT
CTAGACCTGATAAATCAGCCTTTCTTTACTGTTCGTTGGTTCTTTCTGAAATCTTTTCGT
TTAAGCATTGTGAAAACAAAGTTGGTTACAAACACTAGTTTATTTTTCAAATGGTCCTAA
GACATCAGTTTCGATTTTAACAAACGAGCTTTTTTGG


BQ
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AF RR4E180JQ C 1
AF RR4E180TF U 1
BS 1 397 RR4E180TF

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GCTTACTATAACTAGTTATTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCT
ATTTATTGGTCTAAGCAAAATACGACTTATTTGAAATGGCGGTGGCGAAGGTAATGAAGA
AAGACACAGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAAGCTCTGGAAGTAGGGAGTCTCTTTGTTGT
CTAGACCTGATAAATCAGCCTTTCTTTACTGTTCGTTGGTTCTTTTTGAAATCTTTTCGT
TTAAGCATTGTGAAAACAAAGTTGGTTACAAACACTAGTTTATTTTTCAAATGGTCCTAA
GACATCAGTTTCGATTTTAACAAACGAGCTTTTTTGG

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DS 

RD RR4E180TF 397 0 0
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GCTTACTATAACTAGTTATTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCT
ATTTATTGGTCTAAGCAAAATACGACTTATTTGAAATGGCGGTGGCGAAGGTAATGAAGA
AAGACACAGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAAGCTCTGGAAGTAGGGAGTCTCTTTGTTGT
CTAGACCTGATAAATCAGCCTTTCTTTACTGTTCGTTGGTTCTTTCTGAAATCTTTTCGT
TTAAGCATTGTGAAAACAAAGTTGGTTACAAACACTAGTTTATTTTTCAAATGGTCCTAA
GACATCAGTTTCGATTTTAACAAACGAGCTTTTTTGG

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL9148Contig1 757 2 2 U
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TCCTTGTAAGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGAC
AAGAAGGAGCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCACA
ATTCGTTCAAGAAGACTAAACTAGTAGATCAACCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAGC
CTCTACCTTGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTCTATTCAAGAA
CATCAGAGGATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATGA
GTCTAGATCTTGAGCTGAACCTTTCACCTTATTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAGA
TAGATGAATCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTTAAAAATTTGACAA
GCCCGAGGGAGAAGACCACGCTGTCTTGACTTTGCGTTTGACGGTGGTGATGATGATGTT
GATCACAAGGAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATG
CTGTCCACATGAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGTACCCACGTGATCACAGC
TCTACAAAACTGTTTAAACCACCAAATTTGCTATGGCTCCTATGCTAGGCTCTTCAGAGT
TATTGGATATTAATGTTCGTAAGGAATAATATGAGCG


BQ
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AF RR4H994TF U 1
AF RR4H994JQB C 1
BS 1 704 RR4H994TF
BS 705 757 RR4H994JQB

RD RR4H994TF 704 0 0
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TCCTTGTAAGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGAC
AAGAAGGAGCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCACA
ATTCGTTCAAGAAGACTAAACTAGTAGATCAACCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAGC
CTCTACCTTGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTCTATTCAAGAA
CATCAGAGGATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATGA
GTCTAGATCTTGAGCTGAACCTTTCACCTTATTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAGA
TAGATGAATCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTTAAAAATTTGACAA
GCCCGAGGGAGAAGACCACGCTGTCTTGACTTTGCGTTTGACGGTGGTGATGATGATGTT
GATCACAAGGAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATG
CTGTCCACATGAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGTACCCACGTGATCACAGC
TCTACAAAACTGTTTAAACCACCAAATTTGCTATGGCTCCTATG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR4H994JQB 757 0 0
GGAAGACTATCTTCTCATTTCTCACAGGATTGAAGAGAGAGATAGAGAGAGTTTAAACTT
TCCTTGTAAGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGAC
AAGAAGGAGCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCACA
ATTCGTTCAAGAAGACTAAACTAGTAGATCAACCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAGC
CTTTACCTTGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTTTATTCAAGAA
CATCAGAGGATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATGA
GTTTAGATCTTGAGCTGAACCTTTCACCTTATTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAGA
TAGATGAATCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTTAAAAATTTGACAA
GCCCGAGGGAGAAGACCACGCTGTCTTGACTT*GCGTTTGACGGTGGTGATGATGATGTT
GATCACAAGGAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATG
CTGTCCACATGAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGTACCCACGTGATCACAGC
TTTACAAAACTGTTTAAACCACCAAATTTGCTATGGCTCCTATGCTAGGCTCTTCAGAGT
TATTGGATATTAATGTTCGTAAGGAATAATATGAGCG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL9149Contig1 1307 2 12 U
GATTGGAAAATGTGCACATTAGCCCTGTGGATAGACATATCAAAGTAGGGATTCTGGGAA
ATGCTGCTGACTTTTATGGGGATGGTACCAGCAGTAGCAACGCTTACAGTACCATGGACC
GACGACAAATGATGATAGCATTTGACATGAGATGTGTTGGTTTCATGATGGCAAAAATGG
TACTCCAAGAACTGATGGATCCATTAATCTTTGCGAAATTAAAGTCTTTCCTGGCAAAGG
GGAATGATCCTTCTTCTCTACGGGAGTTCTTTGTGACGACGCTCAATATAAACTCTGAAT
CTGGAAATACTGGAGTTCAAATACTTGATAGAAACTGGGGAGCAGGTTGGCACCTTTTAT
CTTCATTGATTGCTACCAGACCTTCTCAACGAATAAGCTGCTTGGATGCTCTTAAACATC
CCTTCTTATGTGGACCAAGATGGCGTGTTGCTCCTTCAATGGATATCATCAGATGGGGTC
TTGGATCAACCGCTGTAAGGATTTCAGAAGAATACATTTATCGCATGCCTCAGCGCCAAA
GACTTGCCCACTTCATTGAACTAATGGAGATGCTGAACCCATGTCCAAAACCAAATTGTT
GGTTGGAGCTGTTACCTGGAAGATGGCGTCTATTATACTCAACAGGAAAACACATTGGTC
TAACTCTGCGTCAGCCCTCTACACGTGCACTAATAGGCAATGTTCATTTAACAATAAGCC
GAGCTTCAGAAGCTGCAAACAGCAATACTTCACTTTCCTTCACCTCTGACATAGGCTTCA
CCGCCATAACCAGCAAAGACTGGCCACACGACAAAACCGGAGCCAAAGGTAAACTACAAA
CGCTCTCTCAGTTCAGACTAGTAGCCGGAAAAAGACTTTACCTCAAAGAAGAGAAAAAGA
ACATTGGTAAGTTCTCTATGGGAGAACCAAACGCTGAGGAAGGCCTAGTCGAGAAACTAG
GAACCAAGAAATGGAAAAAAGTGGTGCCCTTCAAGGAGTTTCCCTCGAGTCTTCCTGTTG
CCAAACTCGTCTCTGGAGAGATCGAAGTAACCATGAGCATGGCGGATCGTATAGAGTCGC
CTGGAACGTGATTGGAGAAGTTAGAAAGCAGATTCCGCAGGAGATGTTTGATTTGTCTAA
GCTTGTGTGTGGTACGTATATAGACAGTAGGTTGCTTGTACTTAGGTGTGTGAATGGTTC
GGCATTGTTGTTTACAAGGTCTAGCTTTGGACAATAAGTCTATGTTGTAACCACTTGTCT
CGGTTCTTATGTGTGTATATATAAACAGTGGAGATTCTTTTTCGGAT


BQ
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AF RR4GO29TF U 1
AF RR4GO29JQ C 533
BS 1 645 RR4GO29TF
BS 646 646 RR4GO29JQ
BS 647 696 RR4GO29TF
BS 697 697 RR4GO29JQ
BS 698 713 RR4GO29TF
BS 714 714 RR4GO29JQ
BS 715 738 RR4GO29TF
BS 739 739 RR4GO29JQ
BS 740 744 RR4GO29TF
BS 745 745 RR4GO29JQ
BS 746 757 RR4GO29TF
BS 758 1307 RR4GO29JQ

RD RR4GO29TF 765 0 0
GATTGGAAAATGTGCACATTAGCCCTGTGGATAGACATATCAAAGTAGGGATTCTGGGAA
ATGCTGCTGACTTTTATGGGGATGGTACCAGCAGTAGCAACGCTTACAGTACCATGGACC
GACGACAAATGATGATAGCATTTGACATGAGATGTGTTGGTTTCATGATGGCAAAAATGG
TACTCCAAGAACTGATGGATCCATTAATCTTTGCGAAATTAAAGTCTTTCCTGGCAAAGG
GGAATGATCCTTCTTCTCTACGGGAGTTCTTTGTGACGACGCTCAATATAAACTCTGAAT
CTGGAAATACTGGAGTTCAAATACTTGATAGAAACTGGGGAGCAGGTTGGCACCTTTTAT
CTTCATTGATTGCTACCAGACCTTCTCAACGAATAAGCTGCTTGGATGCTCTTAAACATC
CCTTCTTATGTGGACCAAGATGGCGTGTTGCTCCTTCAATGGATATCATCAGATGGGGTC
TTGGATCAACCGCTGTAAGGATTTCAGAAGAATACATTTATCGCATGCCTCAGCGCCAAA
GACTTGCCCACTTCATTGAACTAATGGAGATGCTGAACCCATGTCCAAAACCAAATTGTT
GGTTGGAGCTGTTACCTGGAAGATGGCGTCTATTATACTCAACAG*AAAACACATTGGTC
TAACTCTGCGTCAGCCCTCTACACGTGCACTAATAG*CAATGTTCATTTAACA*TAAGCC
GAGCTTCAGAAGCTGCAA*CAGCA*TACTTCACTTTC
TTCACTCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR4GO29JQ 775 0 0
GCGCCAAAGACTTGCCCACTTCATTGAACTAATGGAGATGCTGAACCCATGTCCAAAACC
AAATTGTTGGTTGGAGCTGTTACCTGGAAGATGGCGTCTATTATACTCAACAGGAAAACA
CATTGGTCTAACTCTGCGTCAGCCCTCTACACGTGCACTAATAGGCAATGTTCATTTAAC
AATAAGCCGAGCTTCAGAAGCTGCAAACAGCAATACTTCACTTTCCTTCACCTCTGACAT
AGGCTTCACCGCCATAACCAGCAAAGACTGGCCACACGACAAAACCGGAGCCAAAGGTAA
ACTACAAACGCTCTCTCAGTTCAGACTAGTAGCCGGAAAAAGACTTTACCTCAAAGAAGA
GAAAAAGAACATTGGTAAGTTCTCTATGGGAGAACCAAACGCTGAGGAAGGCCTAGTCGA
GAAACTAGGAACCAAGAAATGGAAAAAAGTGGTGCCCTTCAAGGAGTTTCCCTCGAGTCT
TCCTGTTGCCAAACTCGTCTCTGGAGAGATCGAAGTAACCATGAGCATGGCGGATCGTAT
AGAGTCGCCTGGAACGTGATTGGAGAAGTTAGAAAGCAGATTCCGCAGGAGATGTTTGAT
TTGTCTAAGCTTGTGTGTGGTACGTATATAGACAGTAGGTTGCTTGTACTTAGGTGTGTG
AATGGTTCGGCATTGTTGTTTACAAGGTCTAGCTTTGGACAATAAGTCTATGTTGTAACC
ACTTGTCTCGGTTCTTATGTGTGTATATATAAACAGTGGAGATTCTTTTTCGGAT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL9150Contig1 806 2 2 U
GTGTTGCAGCTCGTCTGCTGTTTTCCGCTTCAAGAACTGGGTCGATTCGTGTCATGGTTC
TGGAACTACATCTGTGTTCCACCGCCTGAGATTTTATATTACGAGAGATCATTATCATCA
TCGTCTTCTTTTTCGATTGTTAATAACCAGAATTACTATCATCTTCATTTGGAGTGACTA
TGTTTTATTACCCCTTATTGTATACTATTAGAATCAAAGTAATCAGGAGATCTTGAGCTT
TTGGTGATGTGTTATAGTTTACTCTTTCGTCCATTTAGGAGTCAAATGAGCGTGTTGTGA
TGTCTTCTTAGGTGTGTATAAAATCTCTTAGTAATAACAAAAAGTAATAAATTACTCTTT
CATGTTTTCAAAGTGTTGTGATCTCTTACAGTTCCTATAAGGATACATGGTACAATCCCT
GGACGTGATGTATGGTTTGAGAAGTTTAATGGAATCCAGTTCAGGATTAACGTTATAAGG
CAGCAGTGTCGTGCCACGAGTTTGGGCCTTCTCCAGTATATAATACGGCCATTGTTCTAG
ATGCAGAGGGTACCTTCTCTCAAGATTTGTTCTAAAGAAGAAAAAGGTTACATATCCCTT
TGTTGGTTGAATCGGTTTGGTTATCATCATGGCTCAACAAGGATCTTTGACTCTGTGCTT
GTAGCAGCATAACATTAGTCTCGTTTTTACTTTCGCCAAATGTAAGTTAAACGAATCTCT
AACTTGGGCCAGTATCCACGTCTGCGGATAGTGTCCATATCTTTTTCTATATGAAGTTCA
CTAGGTTGTATTGTTTTTGAAGACCC


BQ
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AF RR4H545TF U 1
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QA 1 525 1 525
DS 

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QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

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TTATAAAACCCCCACCTGGTTTATTCTTTGTTTATCTACGTGTTTGGAAACGTTGGATAA
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BQ
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AF RR4E511TF U 1
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DS 

RD RR4E511TF 567 0 0
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GCAAAGTTTTTTGGCAGAGGGACGCGCGACTACTCCACCGTTTCCTCATCTTTCTCCGTG
TCGTCAGCCGTGAAAAGACGGTGGCGAGAGCAGAAATTTTCGGGTCTTTTGGTTACATTT
CTTGGTGGATATTGTTTCCACCTTTATTTAAGATTACAGAAGAGAAAAGAGCACTGGCAC
AAAGTGGATAGAATGTACAACGAGGAAACGAAGCGTTCAGACGATCTGTCTAAGAAGTTT
CGACGATATCTCAACGAAGACTATGATGATGTTCCTAAACCCGGGACTGGGAGGAAGAAT
TTATAAAACCCCCACCTGGTTTATTCTTTGTTTATCTACGTGTTTGGAAACGTTGGATAA
TAAACATTAGTACATGACTCATCTCAGATCTGGAAACTTCAACATCAATTCTGTTGCTTG
TTTTTTTGAAGTATGTTAATATCACATGACAAATGGAGAATTTTAGTCTTAATGCTTTCT
TCAACCAGTTTAGAATTAATACATTCA

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL9152Contig1 575 2 2 U
GGGATCGAAATAAAAAATATCTCTGCGCGTCTTCGTTCCGTCCTTCTCTAGGATTTACTC
AAGCTTTCTCCTGCTTCCAGTAATCATGAGGTACAGTAGATTTGAGGATGATACGGTTTA
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TCTTTAGCATCGATTGAATATGAATGTGGCCTTGATGAACTCTTTGTTTAAGCCCTAAAA
AATTGTGGTTATTAGATTTAAATCTGATTGTGTTTTTATGTGAATATTGTTGTTACAGTC
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BQ
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AF RR4DF10JQ C 1
AF RR4DF10TF U 1
BS 1 566 RR4DF10TF
BS 567 575 RR4DF10JQ

RD RR4DF10JQ 575 0 0
GGGATCGAAATAAAAAATATCTCTGCGCGTCTTCGTTCCGTCCTTCTCTAGGATTTACTC
AAGCTTTCTCCTGCTTCCAGTAATCATGAGGTACAGTAGATTTGAGGATGATACGGTTTA
TTCTAGGTTCCTGTAAATGTAGATTTAGACCTAGTGAGTCTGTAACTTGTAATGGTAGTT
TCTTTAGCATCGATTGAATATGAATGTGGCCTTGATGAACTCTTTGTTTAAGCCCTAAAA
AATTGTGGTTATTAGATTTAAATCTGATTGTGTTTTTATGTGAATATTGTTGTTACAGTC
ACCATCCAGAAGTGAAGTGGGCAGAGAGAGAGGATAAGGTTTACTTAACAGTGCTGTTGC
CTGATGCTAAGGATGCGAATGTTAAGCTTGATCCTGAAGGTGTTTTTGATTTTTCTGCCA
AAGCTGGACCAGAGAACCAGCTTTATGAGCTTAAGCTTGAGCTTAATGACAAGGTCAATG
TAGAGGTGAGAGTTACAAAACCAGCTTTATGAGCTTAAGCTTGAGCTTTATAATTTTCTC
ATGCTTTTTTCTTTTTTTGGTGAATTCAGGAAAGC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4DF10TF 566 0 0
GGGATCGAAATAAAAAATATCTCTGCGCGTCTTCGTTCCGTCCTTCTCTAGGATTTACTC
AAGCTTTCTCCTGCTTCCAGTAATCATGAGGTACAGTAGATTTGAGGATGATACGGTTTA
TTCTAGGTTCCTGTAAATGTAGATTTAGACCTAGTGAGTCTGTAACTTGTAATGGTAGTT
TCTTTAGCATCGATTGAATATGAATGTGGCCTTGATGAACTCTTTGTTTAAGCCCTAAAA
AATTGTGGTTATTAGATTTAAATCTGATTGTGTTTTTATGTGAATATTGTTGTTACAGTC
ACCATCCAGAAGTGAAGTGGGCAGAGAGAGAGGATAAGGTTTACTTAACAGTGCTGTTGC
CTGATGCTAAGGATGCGAATGTTAAGCTTGATCCTGAAGGTGTTTTTGATTTCTCTGCCA
AAGCTGGACCAGAGAACCAGCTTTATGAGCTTAAGCTTGAGCTTAATGACAAGGTCAATG
TAGAGGTGAGAGTTACAAAACCAGCTTTATGAGCTTAAGCTTGAGCTTTATAATTTTCTC
ATGCTTTTTTCTTTTTTTGGTGAATT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL9153Contig1 838 2 4 U
GGGCTTCACAAGACTGAAACTCCGTTTACCATAGAGAAGAGAGATTGAAATTTTGAAAGG
AAGTCGTCATGGATGTCTCGGGAAGCTTGACGTGCGTCGTCGTGGCGGTAGATGGAAGCG
AGGTGAGCTTGGAAGCTCTGAAGTGGGCGCTAGACAACCTCAAGCTCTCATCGTCTTCTC
CCGATTCATCATCATCATTCGTCGTCCTACACGTCCAGCTTTCGCCTTCAATCGCCGCCG
GAGTCAACCCCGGCGCAATCCCCTTCGGTGGTCCCAGTGATGTGGAGGTTCCTGCTTTCG
CAGCTGCGATCGAGCAACACCAGAAGAGGATCACGGATGCTATACTCGAGCACGCTCGTC
AAATCTATGCTGATAGATCGGTGAATGTGAAAACGCAAGTGGTTGTTGGAGATCCCAAGG
ATAAGATCTGCGAGACTGTTGAGAATTTGAACGCTGATCTACTTGTCTTGGGTTCTCGTG
CTTATGGCCCTATTAAGAGGATGTTTTTGGGAAGTGTAAGCAACTACTGCACCAACCACG
CTCAGTGTCCTGTTGTAATAATTAAACCCAAGGAGGATTCTCCTGAATGATCAGGAGATA
TGTGTGCATATGCAAAGGGGATATCAAACCCATCTTTGTATGTTTGTGAAGCTATGGAAG
CAAAGCGAAGTATCCGAGGTGTTTTTACATGTTAAGGCATTGGTGTGTGAATGTAAAATT
TAATATCTACAGAAACATTGGGTGCATCATCAGTCTCAGTCTCAGAATTTGTGTTGTACT
CAAATATGTGCTGTACTCATATTCATCGTTTCTATTGACATATGGTGAAAGTTAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DJ74TF U 1
AF RR4DJ74JQ C 116
BS 1 678 RR4DJ74TF
BS 679 679 RR4DJ74JQ
BS 680 692 RR4DJ74TF
BS 693 838 RR4DJ74JQ

RD RR4DJ74TF 692 0 0
GGGCTTCACAAGACTGAAACTCCGTTTACCATAGAGAAGAGAGATTGAAATTTTGAAAGG
AAGTCGTCATGGATGTCTCGGGAAGCTTGACGTGCGTCGTCGTGGCGGTAGATGGAAGCG
AGGTGAGCTTGGAAGCTCTGAAGTGGGCGCTAGACAACCTCAAGCTCTCATCGTCTTCTC
CCGATTCATCATCATCATTCGTCGTCCTACACGTCCAGCTTTCGCCTTCAATCGCCGCCG
GAGTCAACCCCGGCGCAATCCCCTTCGGTGGTCCCAGTGATGTGGAGGTTCCTGCTTTCG
CAGCTGCGATCGAGCAACACCAGAAGAGGATCACGGATGCTATACTCGAGCACGCTCGTC
AAATCTATGCTGATAGATCGGTGAATGTGAAAACGCAAGTGGTTGTTGGAGATCCCAAGG
ATAAGATCTGCGAGACTGTTGAGAATTTGAACGCTGATCTACTTGTCTTGGGTTCTCGTG
CTTATGGCCCTATTAAGAGGATGTTTTTGGGAAGTGTAAGCAACTACTGCACCAACCACG
CTCAGTGTCCTGTTGTAATAATTAAACCCAAGGAGGATTCTCCTGAATGATCAGGAGATA
TGTGTGCATATGCAAAGGGGATATCAAACCCATCTTTGTATGTTTGTGAAGCTATGGAAG
CAAAGCGAAGTATCCGAG*TGTTTTTACATGT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR4DJ74JQ 723 0 0
AAGCGAGGTGAGCTTGGAAGCTCTGAAGTGGGCGCTAGACAACCTCAAGCTCTCATCGTC
TTCTCCCGATTCATCATCATCATTCGTCGTCCTACACGTCCAGCTTTCGCCTTCAATCGC
CGCCGGAGTCAACCCCGGCGCAATCCCCTTCGGTGGTCCCAGTGATGTGGAGGTTCCTGC
TTTCGCAGCTGCGATCGAGCAACACCAGAAGAGGATCACGGATGCTATACTCGAGCACGC
TCGTCAAATCTATGCTGATAGATCGGTGAATGTGAAAACGCAAGTGGTTGTTGGAGATCC
CAAGGATAAGATCTGCGAGACTGTTGAGAATTTGAACGCTGATCTACTTGTCTTGGGTTC
TCGTGCTTATGGCCCTATTAAGAGGATGTTTTTGGGAAGTGTAAGCAACTACTGCACCAA
CCACGCTCAGTGTCCTGTTGTAATAATTAAACCCAAGGAGGATTCTCCTGAATGATCAGG
AGATATGTGTGCATATGCAAAGGGGATATCAAACCCATCTTTGTATGTTTGTGAAGCTAT
GGAAGCAAAGCGAAGTATCCGAGGTGTTTTTACATGTTAAGGCATTGGTGTGTGAATGTA
AAATTTAATATCTACAGAAACATTGGGTGCATCATCAGTCTCAGTCTCAGAATTTGTGTT
GTACTCAAATATGTGCTGTACTCATATTCATCGTTTCTATTGACATATGGTGAAAGTTAA
AGG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL9154Contig1 1137 2 6 U
GCGATGGGTGTGATGCACCGAGATTTGAAGCCTGAGAACTTTCTCTTTCTGAGCAAAGAT
GAGAGCTCGCCGTTGAAAGCTACTGACTTTGGTCTCTCCGTCTTCTTAAAACCAGGAGAT
AAGTTTAAGGATCTTGTTGGAAGTGCGTACTATGTTGCTCCAGAAGTTTTGAAACGGAAC
TATGGACCAGAGGCTGATATCTGGAGTGCCGGTGTGATTCTGTTCATCCTTCTCAGTGGT
GTCCCACCTTTTTGGGGAGAAAATGAGACAGGGATCTTTGATGCCATTCTACAAGGACAG
CTTGATTTTTCAGCTGACCCGTGGCCTGCTGTATCTAATGGTGCCAAAGATCTTGTGAAG
AAAATGCTGACTTATGACCCTAAAGACCGGCTTACAGCTAGTGAAGTGCTAAACCATCCG
TGGATTAAAGAGGACGGAGAGGCGTCAGACAAACCGCTTGACAATGCTGTGTTATCCAGG
AAAACAGTTCCGAGCGATGAACAAACTTAAGAAAATGGCACTCAAGGTCATCGCGGAGAA
CCTGTCGGAAGAAGAAATCATTGGTCTGAAGGAGATGTTCAAAGCTCTAGACACTGATAA
AAACGGAATAGTCACCTTGGAGGAGTTGAGAACTGGTCTCCCCAAACTTGGCAATAAGAT
CTCTGAGGCTGAAATCAAACAGTTAATGGAAGCAGCTGATATGGATGGGAGATGGATCAA
TAGATTACTTGGAGTTTATATCAGCGACAATGCATATGAACAGAATCGAACGTGAGGATC
ACTTGTACACAGCTTTCCAATACTTCGACGAGGATAACAGCGGCTACATAACGATGGACG
AGCTAGAGCAAGCCATGAAGAAATACAACATGGGTGATGACAAGTCCATCAAAGAGATCA
TTGCTGAAGTAGACACCGATCGTGATGGAAAAATCAACTACGAAGAATTCGTGGCGATGA
TGAAGAAGGGACATCCAGAGTTGGTGACAAACAGACGCAGAGTCAATATGTAAAACGACA
ACAAACCCCCTTTCTCTATGTTTATCTGACGAGAGATCTTTTGATGTGTTGGTTTTGGTT
TGTTTTGCTTCTTTTTACTTTGGTTTTTGTTAACAATAAATACAGTATTATTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FY15TF U 1
AF RR4FY15JQ C 387
BS 1 685 RR4FY15TF
BS 686 686 RR4FY15JQ
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BS 691 691 RR4FY15JQ
BS 692 721 RR4FY15TF
BS 722 1137 RR4FY15JQ

RD RR4FY15TF 721 0 0
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GAGAGCTCGCCGTTGAAAGCTACTGACTTTGGTCTCTCCGTCTTCTTAAAACCAGGAGAT
AAGTTTAAGGATCTTGTTGGAAGTGCGTACTATGTTGCTCCAGAAGTTTTGAAACGGAAC
TATGGACCAGAGGCTGATATCTGGAGTGCCGGTGTGATTCTGTTCATCCTTCTCAGTGGT
GTCCCACCTTTTTGGGGAGAAAATGAGACAGGGATCTTTGATGCCATTCTACAAGGACAG
CTTGATTTTTCAGCTGACCCGTGGCCTGCTGTATCTAATGGTGCCAAAGATCTTGTGAAG
AAAATGCTGACTTATGACCCTAAAGACCGGCTTACAGCTAGTGAAGTGCTAAACCATCCG
TGGATTAAAGAGGACGGAGAGGCGTCAGACAAACCGCTTGACAATGCTGTGTTATCCAGG
AAAACAGTTCCGAGCGATGAACAAACTTAAGAAAATGGCACTCAAGGTCATCGCGGAGAA
CCTGTCGGAAGAAGAAATCATTGGTCTGAAGGAGATGTTCAAAGCTCTAGACACTGATAA
AAACGGAATAGTCACCTTGGAGGAGTTGAGAACTGGTCTCCCCAAACTTGGCAATAAGAT
CTCTGAGGCTGAAATCAAACAGTTA*TGGA*GCAGCTGATATGGATGGGAGATGGATCAA
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR4FY15JQ 751 0 0
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AGACAAACCGCTTGACAATGCTGTGTTATCCAGGAAAACAGTTCCGAGCGATGAACAAAC
TTAAGAAAATGGCACTCAAGGTCATCGCGGAGAACCTGTCGGAAGAAGAAATCATTGGTC
TGAAGGAGATGTTCAAAGCTCTAGACACTGATAAAAACGGAATAGTCACCTTGGAGGAGT
TGAGAACTGGTCTCCCCAAACTTGGCAATAAGATCTCTGAGGCTGAAATCAAACAGTTAA
TGGAAGCAGCTGATATGGATGG*AGATGGATCAATAGATTACTTGGAGTTTATATCAGCG
ACAATGCATATGAACAGAATCGAACGTGAGGATCACTTGTACACAGCTTTCCAATACTTC
GACGAGGATAACAGCGGCTACATAACGATGGACGAGCTAGAGCAAGCCATGAAGAAATAC
AACATGGGTGATGACAAGTCCATCAAAGAGATCATTGCTGAAGTAGACACCGATCGTGAT
GGAAAAATCAACTACGAAGAATTCGTGGCGATGATGAAGAAGGGACATCCAGAGTTGGTG
ACAAACAGACGCAGAGTCAATATGTAAAACGACAACAAACCCCCTTTCTCTATGTTTATC
TGACGAGAGATCTTTTGATGTGTTGGTTTTGGTTTGTTTTGCTTCTTTTTACTTTGGTTT
TTGTTAACAATAAATACAGTATTATTTTGCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL9155Contig1 572 2 1 U
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GTCGAATCATGGCAATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGAAAGCCACTTACTTTATCCAAT
GCGATCCGACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAAAAACTGTTTGCCCTCATTGAGCAAC
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CTCTAGCGGAGCAGATGGTTGAGAACGATGCAGTAGTTGCTCTGACTTTGAGGAAAGATG
ATAACGAGTTTGAGAATGTCGACATTGCACAGCCCGCCGACTTCGCAATCTCATGAAGAG
TTTCACTGACTGTATCAGGAGAACCCTTTTACTTTAACAGGAGAAGTATTCTGTTCGAAC
ACAAGGTGGAGTCGCCTTGAAGTTTACTTGTCTCTCTCGCTCTGCTTTGTTTCAACAATG
CCTCTTTAGTTGTTACAAACAATTGTTGCAAGTAAAGATACAGAGATGTTATAGTAATTT
TTTCGTGTGATATATCCCACATGTTTTGTAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B582JQ C 1
AF RR4B582TF U 1
BS 1 572 RR4B582TF

RD RR4B582JQ 572 0 0
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TTTCACTGACTGTATCAGGAGAACCCTTTTACTTTAACAGGAGAAGTATTCTGTTCGAAC
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CCTCTTTAGTTGTTACAAACAATTGTTGCAAGTAAAGATACAGAGATGTTATAGTAATTT
TTTCGTGTGATATATCCCACATGTTTTGTAGT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4B582TF 572 0 0
GGATCCTTAGTTGATCTTAGATCATTCTATTTCATTCGGAATTGAGAAGTGTTCGTCCTT
GTCGAATCATGGCAATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGAAAGCCACTTACTTTATCCAAT
GCGATCCGACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAAAAACTGTTTGCCCTCATTGAGCAAC
CAGCTAGCAATCAGCGGCTTGTCTTGTTTTCTACTGAAGAAGTATTAGAGGATTCGAAAT
CTCTAGCGGAGCAGATGGTTGAGAACGATGCAGTAGTTGCTCTGACTTTGAGGAAAGATG
ATAACGAGTTTGAGAATGTCGACATTGCACAGCCCGCCGACTTCGCAATCTCATGAAGAG
TTTCACTGACTGTATCAGGAGAACCCTTTTACTTTAACAGGAGAAGTATTCTGTTCGAAC
ACAAGGTGGAGTCGCCTTGAAGTTTACTTGTCTCTCTCGCTCTGCTTTGTTTCAACAATG
CCTCTTTAGTTGTTACAAACAATTGTTGCAAGTAAAGATACAGAGATGTTATAGTAATTT
TTTCGTGTGATATATCCCACATGTTTTGTAGT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL9156Contig1 784 2 3 U
CAGCTGGTGCCGGCGGTTACAGAGCTTGTTGTCCCCGAGCTAATGTATCTTCAGTGGCTG
GATCCTAAGGAACCTATATATATTTACATCAACTCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGA
GAGACGGTGAGTTTTTTAACTGTTTTGTGAATGTTTTTTAAAGACCCTTTCTCCCTCTCT
CAGTGTATCTAATATTGGTTCACTGAACAGGTTGGAATGGAATCAAAAGGTTTTGCGATC
TATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTAACGTCGTTTGTTTTATTGGTGGACTTC
TCTTGAAATGCAAACGTGCAAGTAATTAAACTGTGATGAAGGAAACGACTTGAACAGATA
TCAAGATAATATTTGCCCTCCGGAGTGTTTTTTGTGTGAGCAGGTTTGGTCTTTTCTTGT
GCAGGTACATACAGTTTGTGTGGGAGCAGCGATAGGTCACGCATGTCTGTTGCTTTCCGC
GGGAACAAAGGGTAAACGATTTATGATGCCACATTCCAAAGGTAAAAAAAAAACAATGAC
TGCATTCTGGTCAAGTTGATTTGCTCACTTTTGATAATGAGGGTATTCTCAAATGTTGTT
GCAGCAATGATCCAGCAACCTCGTGTGCCTTCTTCTAGTTTGATGCCTGCTAGTGATGTC
CTGATTCGTGCCAAAGAGGTTTTTGATGTTCCTTCTGTTCACTTCGAATCCGGGAAATCA
TATCTAAACTGAGATACTTTCATGATGTTTTTTTTTTTTGCTGATACATATCTCTGATCA
TTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR4A011JQD U 1
AF RR4A011JQ U 1
BS 1 33 RR4A011JQ
BS 34 34 RR4A011JQD
BS 35 784 RR4A011JQ

RD RR4A011JQD 759 0 0
CAGCTGGTGCCGGCGGTTACAGAGCTTGTTGTCCCCGAGCTAATGTATCTTCAGTGGCTG
GATCCTAAGGAACCTATATATATTTACATCAACTCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGA
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CAGTGTATCTAATATTGGTTCACTGAACAGGTTGGAATGGAATCAGAAGGTTTTGCGATC
TATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTAACGTCGTTTGTTTTATTGGTGGACTTC
TCTTGAAATGCAAACGTGCAAGTAATTAAACTGTGATGAAGGAAACGACTTGAACAGATA
TCAAGATAATATTTGCCCTCCGGAGTGTTTTTTGTGTGAGCAGGTTTGGTCTTTTCTTGT
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GGGAACAAAGGGTAAACGATTTATGATGCCACATTCCAAAGGTAAAAAAAAAACAATGAC
TGCATTCTGGTCAAGTTGATTTGCTCACTTTTGATAATGAGGGTATTCTCAAATGTTGTT
GCAGCAATGATCCAGCAACCTCGTGTGCCTTCTTCTAGTTTGATGCCTGCTAGTGATGTC
CTGATTCGTGCCAAAGAGGTTTTTGATGTTCCTTCTGTTCACTTCGAATCCGGGAAATCA
TATCTAAACTGAGATACTTTCATGATGTTTTTTTTTTTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR4A011JQ 784 0 0
CAGCTGGTGCCGGCGGTTACAGAGCTTGTTGTCGCCGAGCTAATGTATCTTCAGTGGCTG
GATCCTAAGGAACCTATATATATTTACATCAACTCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGA
GAGACGGTGAGTTTTTTAACTGTTTTGTGAATGTTTTTTAAAGACCCTTTCTCCCTCTCT
CAGTGTATCTAATATTGGTTCACTGAACAGGTTGGAATGGAATCAAAAGGTTTTGCGATC
TATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTAACGTCGTTTGTTTTATTGGTGGACTTC
TCTTGAAATGCAAACGTGCAAGTAATTAAACTGTGATGAAGGAAACGACTTGAACAGATA
TCAAGATAATATTTGCCCTCCGGAGTGTTTTTTGTGTGAGCAGGTTTGGTCTTTTCTTGT
GCAGGTACATACAGTTTGTGTGGGAGCAGCGATAGGTCACGCATGTCTGTTGCTTTCCGC
GGGAACAAAGGGTAAACGATTTATGATGCCACATTCCAAAGGTAAAAAAAAAACAATGAC
TGCATTCTGGTCAAGTTGATTTGCTCACTTTTGATAATGAGGGTATTCTCAAATGTTGTT
GCAGCAATGATCCAGCAACCTCGTGTGCCTTCTTCTAGTTTGATGCCTGCTAGTGATGTC
CTGATTCGTGCCAAAGAGGTTTTTGATGTTCCTTCTGTTCACTTCGAATCCGGGAAATCA
TATCTAAACTGAGATACTTTCATGATGTTTTTTTTTTTTGCTGATACATATCTCTGATCA
TTTG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL9157Contig1 955 2 4 U
AATGCCTTCCTCTCCTTCACATAGAGACGAGCGTGACACAGTAACAAACCTTCCTCTCTC
TTCTCAGAATACTCTAGGGGAAGGTTCTCTTCAGTCAAACATGCAGCCACCAACTTCTTC
TCTTCCCCGCCAGGTTTCTCCTACAAACAACAGGTCTATACTTGTAACTCTTTCCCTTTT
ATTGTCTGTTTAGTTACATGCAGCCTTACTTTGTTTCACAATACAGGTCTCTTAATCAAT
CTTCTCCAAGTGATCAAGATAGAGCTGGACCATCAGAGCTCCAATCATTTTCAGAGTCTC
TAAAGTCTAGACTAAGCGCTGTCTCAACGAGGTATCACATTTTTATCTAGCTACCTTTGG
TTTGTATATGATTTTCTTTTGTATCAATAATCTTAAGTGATTCCGTATGCACATTGTAGA
TACAAAGAATCGATATCAAAGAACACAAGGAGCTGGAAAGATAGATTCTTTTCACGCAAC
ACGTCCATAGCAGATATTGGCTCTGAGGTTAAAAGAGAGGTCAGTGCGGGGATCGCCACT
GTGTCCCGCTTGATGGAACGTTTAGAAACGAGAGAAAACAGTGGTACTGAGTCTGTATCA
CCAAATGGCTCAGGAAACAACACTCCTGATGAATCAGACAATGAGCGTAATAGAAGATCA
GGAGCAGGTGATGAACATTCTTCGAATGAAAGAGGTGTTAATGGAACATGTGCGGCTGCA
TCTGGTTCTAGCTAATAAAACAAGTGCCAGCAACTTGTTGGCAAAGGTATATACTGGTTC
AGCTTTTGGCTTATCAAGTGGTGGTTGTTCCTCAACATCGAAGATCTTGTTATGCTGTTT
TCTCCTTTCTTTTCAGAGACAAGATGTTTTTATTGTGAATCTATGCTTTATAATAGTAAT
ATACTGAGTTGGAAGTTCAGAGGTGTGGGATCATTAGGAAGAGTTTCTGATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FA95TF U 1
AF RR4FA95JQ C 210
BS 1 613 RR4FA95TF
BS 614 614 RR4FA95JQ
BS 615 657 RR4FA95TF
BS 658 955 RR4FA95JQ

RD RR4FA95TF 657 0 0
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TTCTCAGAATACTCTAGGGGAAGGTTCTCTTCAGTCAAACATGCAGCCACCAACTTCTTC
TCTTCCCCGCCAGGTTTCTCCTACAAACAACAGGTCTATACTTGTAACTCTTTCCCTTTT
ATTGTCTGTTTAGTTACATGCAGCCTTACTTTGTTTCACAATACAGGTCTCTTAATCAAT
CTTCTCCAAGTGATCAAGATAGAGCTGGACCATCAGAGCTCCAATCATTTTCAGAGTCTC
TAAAGTCTAGACTAAGCGCTGTCTCAACGAGGTATCACATTTTTATCTAGCTACCTTTGG
TTTGTATATGATTTTCTTTTGTATCAATAATCTTAAGTGATTCCGTATGCACATTGTAGA
TACAAAGAATCGATATCAAAGAACACAAGGAGCTGGAAAGATAGATTCTTTTCACGCAAC
ACGTCCATAGCAGATATTGGCTCTGAGGTTAAAAGAGAGGTCAGTGCGGGGATCGCCACT
GTGTCCCGCTTGATGGAACGTTTAGAAACGAGAGAAAACAGTGGTACTGAGTCTGTATCA
CCAAATGGCTCAG*AAACAACACTCCTGATGAATCAGACAATGAGCGTAATAGAAGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR4FA95JQ 746 0 0
TTTGTTTCACAATACAGGTCTCTTAATCAATCTTCTCCAAGTGATCAAGATAGAGCTGGA
CCATCAGAGCTCCAATCATTTTCAGAGTCTCTAAAGTCTAGACTAAGCGCTGTCTCAACG
AGGTATCACATTTTTATCTAGCTACCTTTGGTTTGTATATGATTTTCTTTTGTATCAATA
ATCTTAAGTGATTCCGTATGCACATTGTAGATACAAAGAATCGATATCAAAGAACACAAG
GAGCTGGAAAGATAGATTCTTTTCACGCAACACGTCCATAGCAGATATTGGCTCTGAGGT
TAAAAGAGAGGTCAGTGCGGGGATCGCCACTGTGTCCCGCTTGATGGAACGTTTAGAAAC
GAGAGAAAACAGTGGTACTGAGTCTGTATCACCAAATGGCTCAGGAAACAACACTCCTGA
TGAATCAGACAATGAGCGTAATAGAAGATCAGGAGCAGGTGATGAACATTCTTCGAATGA
AAGAGGTGTTAATGGAACATGTGCGGCTGCATCTGGTTCTAGCTAATAAAACAAGTGCCA
GCAACTTGTTGGCAAAGGTATATACTGGTTCAGCTTTTGGCTTATCAAGTGGTGGTTGTT
CCTCAACATCGAAGATCTTGTTATGCTGTTTTCTCCTTTCTTTTCAGAGACAAGATGTTT
TTATTGTGAATCTATGCTTTATAATAGTAATATACTGAGTTGGAAGTTCAGAGGTGTGGG
ATCATTAGGAAGAGTTTCTGATTCTC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL9158Contig1 1270 2 2 U
GAACTCTGTGATTAATATTCTCTTCTCATCTGGAACTACAGGTGAACCGAAAGCTATACC
TTGGACACAGCACTCGCCAATCCGTAGTGCTTGTGATGGATGGGCTCATCTTGATGTCAA
AGTGGGCAACACATATTGTTGGCCTACGAATCTTGGATGGGTGATGGGACCAACTCTTAT
ATTTTCTTGCTTTCTAACCGGTACAACGCTTGCGCTCTATCACGGGTCTCCCCTCGGCCG
CGGTTTTGGAAAGTTTGTTCAGGATGCTGGAGTAACGGTTCTTGGTACTGTTCCAAGCTT
GGTGAAAACTTGGAAGAGGACAAACTGTATGGAAGGCCTTAATTGGACAAAGATAATTTT
CGCCACTACAGGAGAAGCTTCCAATGTTGATGATGTTCTCTGGCTTTCTTCTAAAGCTTA
TTATAAACCTGTGATCGAAGTTTGCGGAGGTACAGAACTCGCTTCTTCCTACATCATTGG
AAGCCCTCTTCAACCTCAGGCGTTTGGAGCGTTTAGCACACCATCCATGACTACTAGAAT
CATCATCTTTGACAAAAACGGCGTCCCTTATTCGGATGATCAACCGTGTACTGGCGAAGT
TGGTTTGTTCCCGCAGCACTTTGGGGCCACGGATAGACTTCTGAACGCAGACCATGAGGA
AGTTTACTTCAAGGGATGCCAATGTATAAAGAAACACGACTTAGAAGACATGGTGACATC
TTAAAGAGAACCGTAGGAGGATATGTCACTGTTCAAGGCAGAGCTGATGATACCATGAAC
CTTGGAGGAATCAAGACAAGTTCTATTGAGATAGAAAGAGTATGTGATCAAGCCGATGAA
TGCCTCTCTGAGACTGCTGCAGTCAGCATAACGCCGCCTAACGGTGGTCCAGAGCTACTG
GCCATATTCGCAGTCTTGAAAGAAGGGTTCAAGAAACAGAGCGAAGAAGAGCTCAAGAGA
AAATTCTCAAGAGCCATTCAAAAAGATCTTAATCCTCTCTTCAAGGTGAGTTTCGTGAAG
ATTGTGGCTGAGTTTCCAAGAACAGCTTCCAACAAGTTACTGAGAAGAGTGTTGAGAGAT
CAAATGAATCAAGAAATACGATCCGTAAGGAGTCGAATATGAAGCTATGGAGAGCAGAGA
TACTATTGGAAAACGTTGGTGTTTTATTGAATATGATCCTATTAATAAATAAGATAACAA
TTATGTTGCAAGAGACCTCTCCTGTTGCTTTTGGGGTAGAAAGTTCTACCAGAGCTTTGA
CTTGAGATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FS86TF U 1
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GGTGAAAACTTGGAAGAGGACAAACTGTATGGAAGGCCTTAATTGGACAAAGATAATTTT
CGCCACTACAGGAGAAGCTTCCAATGTTGATGATGTTCTCTGGCTTTCTTCTAAAGCTTA
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AAGCCCTCTTCAACCTCAGGCGTTTGGAGCGTTTAGCACACCATCCATGACTACTAGAAT
CATCATCTTTGACAAAAA

QA 1 558 1 558
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AGCAGAGATACTATTGGAAAACGTTGGTGTTTTATTGAATATGATCCTATTAATAAATAA
GATAACAATTATGTTGCAAGAGACCTCTCCTGTTGCTTTTGGGGTAGAAAGTTCTACCAG
AGCTTTGACTTGAGATGC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

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CCAGTGTCTGTGATTTTACTCGAAACGGGGAATGCACAAAAGATGCTCGACAGAAGTCCT
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CX37JQ C 1
AF RR4CX37TF U 1
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DS 

RD RR4CX37TF 571 0 0
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CCAGTGTCTGTGATTTTACTCGAAACGGGGAATGCACAAAAGATGCTCGACAGAAGTCCT
CAATGGATATATATCGAGAGAAGAGTTGTTCGAGAAGATGCCACGTGGTTCCATGCTGGT
TCCGTCTCTATTGTCACGTGGATCTCACGTGATGCCTCTTGCCGTTATATTGTTTTTCCC
TCGCAAAGAAAGTTTACCTTCTACCTGAAGC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL9160Contig1 842 2 4 U
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CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RR4AB53TF U 1
AF RR4AB53JQ C 20
BS 1 781 RR4AB53TF
BS 782 782 RR4AB53JQ
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RD RR4AB53TF 835 0 0
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CAGTGGAAGAAGGTTTCATTGCACCAACTGCTCGTCATATCATTGTCTCTGCTTCTTCTG
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AAGGATAAAGCCCAACTGAATTTTTTTCTAAATTGGGTTCCTTGTTGCTTGTAAAACACA
A*TTGACTTTATTTGTGTAGTTTATTCTGTTGTTTTATGTACTTTTAGCATTTTA

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR4AB53JQ 823 0 0
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TGGAGGTCGCCATGCCATCGGGGTTATCCCCAAGACACTTATGCCAAAGGAGATAACAGG
AGAGACAGTGGGAGAAGTGAAGGCAGTAGCAGACATGCACCAAAGGAAAGCTGAGATGGC
TAAGCACTCTGATGCTTTTATCGCTTTACCTGGTGGATATGGGACACTTGAAGAGCTTCT
TGAAGTAATCACTTGGGCACAGCTTGGAATCCATGATAAACCAGTGGGATTACTGAATGT
GGAAGGATACTACGATTCTTTGTTATCATTCATAGACAAGGCAGTGGAAGAAGGTTTCAT
TGCACCAACTGCTCGTCATATCATTGTCTCTGCTTCTTCTGCTAAAGACCTTGTCAAGAA
ACTCGAGGAATATGTACCAAGGCATGAGAAGGTAGCCTCAGAGAAAAGCTGGGAGATGGA
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GTTTATTCTGTTGTTTTATGTACTTTTAGCATTTTACAGTGCC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL9161Contig1 851 2 4 U
GGGTTTACGAGCAGAGGAAAAAAAAATCAATCGCAGATCTGTTTCTTCGCATCTACATTT
TTCCAAATTCCAAACAACACATCATCATGACGATCCCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCG
CCATGTCGGTCTTCATGCTCGTCTCCGCTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCCTGG
TGGTTCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGCGCCGAGCGTGTCCTCGTCT
CCTTCGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGACTGATAAAA
CCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACAAGTCAAGAACATGGGAGAGAC
TTGATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCT
TCTATGGCGCTCCTGCTCTGGTTACTTTCCGTATCCCCACAAAGGCTGTTCTACAGGAAG
CCTACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTAT
TGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGG
TGGTTTTGTTCGTATACTTGATCGCAACACCTTCAAAGCCCAATGCAGCAAAAGCGGGCA
GCAAGAAGAAACGTTAAGTTCGTGGAATGAATTTGAGAAAGGTTGCTGTTACTGTGCTTT
AGTTGTGTGTTAGCAGATTAAAACACAGTTTCAGAACTTGTAAGAATCGTAGAACACACT
TTACTGTTCGCGTTGCAGAGTACTTTTTTATAAGTTATTTTGTTTCTTCGTAATAACATC
GTTTTGAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D564TF U 1
AF RR4D564JQ C 166
BS 1 701 RR4D564TF
BS 702 702 RR4D564JQ
BS 703 742 RR4D564TF
BS 743 851 RR4D564JQ

RD RR4D564TF 742 0 0
GGGTTTACGAGCAGAGGAAAAAAAAATCAATCGCAGATCTGTTTCTTCGCATCTACATTT
TTCCAAATTCCAAACAACACATCATCATGACGATCCCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCG
CCATGTCGGTCTTCATGCTCGTCTCCGCTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCCTGG
TGGTTCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGCGCCGAGCGTGTCCTCGTCT
CCTTCGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGACTGATAAAA
CCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACAAGTCAAGAACATGGGAGAGAC
TTGATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCT
TCTATGGCGCTCCTGCTCTGGTTACTTTCCGTATCCCCACAAAGGCTGTTCTACAGGAAG
CCTACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTAT
TGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGG
TGGTTTTGTTCGTATACTTGATCGCAACACCTTCAAAGCCCAATGCAGCAAAAGCGGGCA
GCAAGAAGAAACGTTAAGTTCGTGGAATGAATTTGAGAAAG*TTGCTGTTACTGTGCTTT
AGTTGTGTGTTAGCAGATTAAA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR4D564JQ 686 0 0
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AGCGTGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGA
CTCTGACTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACAAGTCAA
GAACATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTA
AGGTTAAAGGACCCTTCTATGGCGCTCCTGCTCTGGTTACTTTCCGTATCCCCACAAAGG
CTGTTCTACAGGAAGCCTACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATAC
CTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTT
CAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGATCGCAACACCTTCAAAGCCCAATG
CAGCAAAAGCGGGCAGCAAGAAGAAACGTTAAGTTCGTGGAATGAATTTGAGAAAGGTTG
CTGTTACTGTGCTTTAGTTGTGTGTTAGCAGATTAAAACACAGTTTCAGAACTTGTAAGA
ATCGTAGAACACACTTTACTGTTCGCGTTGCAGAGTACTTTTTTATAAGTTATTTTGTTT
CTTCGTAATAACATCGTTTTGAGAGC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL9162Contig1 853 2 18 U
GGATTCACACAACGAATATCTCTAAAGAAACAATGAGTGAGCTTTTCAACTCTCTCCCTA
CTTGGGATCTCCATAACCTTGGATCACTCTTCAACCAAAACTTCAATTTAGATGCATGTT
ACAACCTCGATGAATCGCCGGAGCATGTACTCCGTTCGCCGGAGGTGGATATTATCGGCG
ACGTATCCACGGGCTACCTCGAAGACGCACTCATCGAATTCAGTGTGAAAAGCAAACGGA
GACGTCTTTCGTTCAACGCCGAGGACAAACCAAATAATCACTTTGACAATTATCAGAATG
ATTGGAGAATCTGTGAGGATCATAGCTGCACGAGTAGTCAGTTTGCAGATGAATCTCCAA
ATTCATCCATCAATATTTTTTCAGAATCTTCAAATCATCCGAAACACTCTTTCGAGCCGT
CTTCATCCACTTCAAAGAAAAATTACTGTGAGAATAAGAAGAGAGTGGTGTATCCATTTG
GAGTGGTGAAACCAGGTGGTCGAGAAGAAGATGTAACCCTAAACGACATAAATAAGAGGA
TTCTCATGCCGTCGGCTCGGCCAGTTCGGCATCCGGTTGGAGCCTTTGCATGCCGTCCGT
GTCTCTCTGCTAATGGACCGGGTCTTTCACGCAAAGCCGTGGTTGCTTTCACAAAGATTC
AAACATCAGGGAGGGGTACAATTACTATAATAAGAACTAAGGGCGATGAGATATGTAATA
CTGGTAACTAGACATGCGATCTTTATAGATAGTGTGTAGTGTGTGCTAGAGATGATGAGA
CAACGTTAATCACTGGTTGGCATGCTTAAACCTGTTGTTGTATATAATAAAAAAATGGTT
ATGTGTTCATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D743TF U 1
AF RR4D743JQ C 202
BS 1 662 RR4D743TF
BS 663 663 RR4D743JQ
BS 664 670 RR4D743TF
BS 671 671 RR4D743JQ
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BS 704 717 RR4D743TF
BS 718 718 RR4D743JQ
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BS 727 727 RR4D743JQ
BS 728 782 RR4D743TF
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BS 789 789 RR4D743JQ
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BS 798 798 RR4D743JQ
BS 799 811 RR4D743TF
BS 812 853 RR4D743JQ

RD RR4D743TF 815 0 0
GGATTCACACAACGAATATCTCTAAAGAAACAATGAGTGAGCTTTTCAACTCTCTCCCTA
CTTGGGATCTCCATAACCTTGGATCACTCTTCAACCAAAACTTCAATTTAGATGCATGTT
ACAACCTCGATGAATCGCCGGAGCATGTACTCCGTTCGCCGGAGGTGGATATTATCGGCG
ACGTATCCACGGGCTACCTCGAAGACGCACTCATCGAATTCAGTGTGAAAAGCAAACGGA
GACGTCTTTCGTTCAACGCCGAGGACAAACCAAATAATCACTTTGACAATTATCAGAATG
ATTGGAGAATCTGTGAGGATCATAGCTGCACGAGTAGTCAGTTTGCAGATGAATCTCCAA
ATTCATCCATCAATATTTTTTCAGAATCTTCAAATCATCCGAAACACTCTTTCGAGCCGT
CTTCATCCACTTCAAAGAAAAATTACTGTGAGAATAAGAAGAGAGTGGTGTATCCATTTG
GAGTGGTGAAACCAGGTGGTCGAGAAGAAGATGTAACCCTAAACGACATAAATAAGAGGA
TTCTCATGCCGTCGGCTCGGCCAGTTCGGCATCCGGTTGGAGCCTTTGCATGCCGTCCGT
GTCTCTCTGCTAATGGACCGGGTCTTTCACGCAAAGCCGTGGTTGCTTTCACAAAGATTC
AA*CATCAGG*AGGGGTACAATTACTATAATAAGAACTAAGG*CGATGAGATATGTA*TA
CTGGTA*CTAGACATGCGATCTTTATAGATAGTGTGTAGTGTGTGCTAGAGATGATGAGA
CA*CGTTA*TCACTGGT*GGCATGCTTAAAC
TGTG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR4D743JQ 652 0 0
AAGACGCACTCATCGAATTCAGTGTGAAAAGCAAACGGAGACGTCTTTCGTTCAACGCCG
AGGACAAACCAAATAATCACTTTGACAATTATCAGAATGATTGGAGAATCTGTGAGGATC
ATAGCTGCACGAGTAGTCAGTTTGCAGATGAATCTCCAAATTCATCCATCAATATTTTTT
CAGAATCTTCAAATCATCCGAAACACTCTTTCGAGCCGTCTTCATCCACTTCAAAGAAAA
ATTACTGTGAGAATAAGAAGAGAGTGGTGTATCCATTTGGAGTGGTGAAACCAGGTGGTC
GAGAAGAAGATGTAACCCTAAACGACATAAATAAGAGGATTCTCATGCCGTCGGCTCGGC
CAGTTCGGCATCCGGTTGGAGCCTTTGCATGCCGTCCGTGTCTCTCTGCTAATGGACCGG
GTCTTTCAGGCAAAGCCGTGGTTGCTTTCACAAAGATTCAAACATCAGGGAGGGGTACAA
TTACTATAATAAGAACTAAGGGCGATGAGATATGTAATACTGGTAACTAGACATGCGATC
TTTATAGATAGTGTGTAGTGTGTGCTAGAGATGATGAGACAACGTTAATCACTGGTTGGC
ATGCTTAAACCTGTTGTTGTATATAATAAAAAAATGGTTATGTGTTCATTCT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL9163Contig1 1054 2 8 U
GAGGGATCAAATGGTTGAAGAAGTGACGTTTGATCGATGCTTTTACATTTATGGTGGTCC
TGAGCAGCTCGAGGAATTAGAGGCATTGTCAAGCCACTATACTCTGTTGTTTAACAGGAG
AAAGGGGAAACTGTCACAAGATGAAAAACTGTTGTATGATGGGAAGCTCAAACAGATCCA
GCAACTATTCAGCTTCGCTGATGAAATGAGTGGAAGTAAAGCAGAATCTGACAAGGGGAA
GAAAATAGATATAAACACCGAAGGCAATGATGATGACATGAAGAATCTGTACAAGTCCAG
CGTCAGCAAAGCTGCTGATATGGCTGCTGGGTTCACAAACGCTTTAGCGGGTCTAAACAT
AAACGACATGATCCAGCGGACCGGTGGCATGCTTGATTCTCTTCACTCGGAAGGAATTCA
TGGACTTTCTGAGATGTGCTGTTTTGCAGTCACTCATCTGCTTATTCTCGGTAAATCAAT
GATATCTCATGCCAACAATGTTCAGAATGAAGACGCTGAGACATTAAAAATCGAGTGGCC
AGAGGATCCTACTGAAAAAGCTAAACTGATTAGAGGCAAGGCAGAGTTGATGGCTGGATA
TGTTGAAGCAGTTTCCTACAGTTTTATAACAGGTATATCAGATGTATCTGAAACATTCGC
AGCTGCTATCAAAGGAGCTGCCGCTGATGATTCCAAAGATGAACTTCTGAAAACATCAAC
CATGGAGGAAAAGGCAAGCACTTTCAACAATAGTCTACGCTCTGACCAAACCACAGCTAT
CACAAAGATCCAGGAAGGACTTCAGTACCTGTCCTTTGTCGTGATAACTACCTCGATGCT
CTCTGCTTGATATTAATAAGAGAGTCAGATTGGTCTTGTTTGTGAATTTTCCTTCCTAAT
ACATGACTCAGGATCCAGTTTAGTTTCCTTTGTAGATATTATCTCTTTCGCCAGCTGCTC
GTATGGCAAGTCATTTCCACTTTAGCACTACTTCTCTGTTGTTTGAATCTTGAAAACTTT
GATTACATCTGAAAACCAAATATTAAAAGAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C938TF U 1
AF RR4C938JQ C 152
BS 1 712 RR4C938TF
BS 713 713 RR4C938JQ
BS 714 731 RR4C938TF
BS 732 733 RR4C938JQ
BS 734 749 RR4C938TF
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BS 751 766 RR4C938TF
BS 767 1054 RR4C938JQ

RD RR4C938TF 782 0 0
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AAAGGGGAAACTGTCACAAGATGAAAAACTGTTGTATGATGGGAAGCTCAAACAGATCCA
GCAACTATTCAGCTTCGCTGATGAAATGAGTGGAAGTAAAGCAGAATCTGACAAGGGGAA
GAAAATAGATATAAACACCGAAGGCAATGATGATGACATGAAGAATCTGTACAAGTCCAG
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AAACGACATGATCCAGCGGACCGGTGGCATGCTTGATTCTCTTCACTCGGAAGGAATTCA
TGGACTTTCTGAGATGTGCTGTTTTGCAGTCACTCATCTGCTTATTCTCGGTAAATCAAT
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AGAGGATCCTACTGAAAAAGCTAAACTGATTAGAGGCAAGGCAGAGTTGATGGCTGGATA
TGTTGAAGCAGTTTCCTACAGTTTTATAACAGGTATATCAGATGTATCTGAAACATTCGC
AGCTGCTATCAAAGGAGCTGCCGCTGATGATTCCAAAGATGAACTTCTGAAA*CATCAAC
CATGGAGGAAA**GCAAGCACTTTCAACA*TAGTCTACGCTCTGAC
AAACACAGCTATCACA

QA 1 766 1 766
DS 

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TGTGTATGAT
GGAAGCTCAAACAGATCCAGCAACTAT*CAGCT*CGCTGATGAAATGAGTG*AAGTAAAG
CAGAATCTGACAAGGG*AAGAAAATAGATATAAACAC*GAAGGCAATGATGATGACATGA
AGAATCTGTACAAGTCCAGCGTCAGCAAAGCTGCTGATATGGCTGCTGGGTTCACAAACG
CTTTAGCGGGTCTAAACATAAACGACATGATCCAGCGGACCGGTGGCATGCTTGATTCTC
TTCACTCGGAAGGAATTCATGGACTTTCTGAGATGTGCTGTTTTGCAGTCACTCATCTGC
TTATTCTCGGTAAATCAATGATATCTCATGCCAACAATGTTCAGAATGAAGACGCTGAGA
CATTAAAAATCGAGTGGCCAGAGGATCCTACTGAAAAAGCTAAACTGATTAGAGGCAAGG
CAGAGTTGATGGCTGGATATGTTGAAGCAGTTTCCTACAGTTTTATAACAGGTATATCAG
ATGTATTTGAAACATTCGCAGCTGCTATCAAAGGAGCTGCCGCTGATGATTCCAAAGATG
AACTTCTGAAAACATCAACCATGGAGGAAAAGGCAAGCACTTTCAACAATAGTTTACGCT
CTGACCAAACCACAGCTATCACAAAGATCCAGGAAGGACTTCAGTACCTGTCCTTTGTCG
TGATAACTACCTCGATGCTCTCTGCTTGATATTAATAAGAGAGTCAGATTGGTCTTGTTT
GTGAATTTTCCTTCCTAATACATGACTCAGGATCCAGTTTAGTTTCCTTTGTAGATATTA
TCTCTTTCGCCAGCTGCTCGTATGGCAAGTCATTTCCACTTTAGCACTACTTCTCTGTTG
TTTGAATCTTGAAAACTTTGATTACATCTGAAAACCAAATATTAAAAGAAGGG

QA 11 903 11 903
DS 



AS 1 2

CO CL9164Contig1 1173 2 2 U
TTTTCTCTGCCGGTAAAGGAAGCTGTGTGGCTTTCCTATCGAACTATCACATGAACGCAC
CTGCGAAAGTTGTGTTCAACAATCGGCATTATACTCTACCTGCTTGGTCCACAGGCATTC
TTCCCGATTGCAGAAACGTTGTTTTCAACACTGCCACGGTTGTGGCAAAGACATCACAAG
TGCAAATGGTTCCATCTGGCTCCATCTTGTACTCGGTAGGTAGATACGATGAAGATATTT
CTACTTATGGAGACCGTGGGACAATCACAGCTTTTGGACTGTTGGAGCAGATTAATGTTA
CACGAGATGCAAGTGATTACCTTTGGTACATAACAAGTGTGGATATCAAGGCATCCGAAT
CTTTCTTGCGTGGAGGAAAATGGCCGACTCTTACGGTGGATTCAGCAGGGCATGCTGTTC
ATGTGTTTGTTAATGGACATTTTTACGGATCTGCCTTTGGGACAAGAGAAAACAGAATCG
CTCTACTAAGCATAGCAGTTGGTTTACCGAATGTTGGACCACATTTTGAGACGTGGGCCA
CGGGGATTGTCGGGTCTGTTGCGCTTCACGGCCTTGACGGGGGTAGCAAAGACTTGAGTC
GACAGAGATGGACCTATCAGGTTGGTCTCCGAGGTGAAGCAATGAATTTGATCTCTCCTT
CAGAAGCTTCCTCTGTTGTTTGGATCAAAGGCTCATTAGCAAAGCAAAACAAACAGCCTT
TGACATGGTACAAGGCCTTCTTTGACGCTCCTAGAGGGAGCGAGCCGGTGGCTTTGGATC
TGAGAAGTATGGGGAAAGGACAAGCTTGGATAAACGGACAAAGTTTAGGGAGATACTGGA
TGGCTTTCGCCAAAGGAAACTGCGGGAGTTGCAACTACGCAGGAACATACAGAGAAGCCA
AATGCCAATCTGGTTGTGGCGAACCAACACAAAGATGGTATCATGTTCCACGTTCGTGGT
TGAAGCCAAGAGGGAACTTGTTAGTGCTCTTTGAAGAACTTGGTGGAGATGTCTCCAAAG
TCTCTGTTGTAAAGAGATCAGTACACTAAAAAGAAACAAAAACTCAATCTTGTGTTGTTC
ATTACACAACAGCATTCCTCATGCTTCTCTTAAGTTATCAATCCATGTTTTGTAATCATA
ACAAGATAAGTTTATAAATACCAAATTTGCACC


BQ
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AF RR4G557TF U 1
AF RR4G557JQ C 552
BS 1 616 RR4G557TF
BS 617 1173 RR4G557JQ

RD RR4G557TF 616 0 0
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CTGCGAAAGTTGTGTTCAACAATCGGCATTATACTCTACCTGCTTGGTCCACAGGCATTC
TTCCCGATTGCAGAAACGTTGTTTTCAACACTGCCACGGTTGTGGCAAAGACATCACAAG
TGCAAATGGTTCCATCTGGCTCCATCTTGTACTCGGTAGGTAGATACGATGAAGATATTT
CTACTTATGGAGACCGTGGGACAATCACAGCTTTTGGACTGTTGGAGCAGATTAATGTTA
CACGAGATGCAAGTGATTACCTTTGGTACATAACAAGTGTGGATATCAAGGCATCCGAAT
CTTTCTTGCGTGGAGGAAAATGGCCGACTCTTACGGTGGATTCAGCAGGGCATGCTGTTC
ATGTGTTTGTTAATGGACATTTTTACGGATCTGCCTTTGGGACAAGAGAAAACAGAATCG
CTCTACTAAGCATAGCAGTTGGTTTACCGAATGTTGGACCACATTTTGAGACGTGGGCCA
CGGGGATTGTCGGGTCTGTTGCGCTTCACGGCCTTGACGGGGGTAGCAAAGACTTGAGTC
GACAGAGATGGACCTA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR4G557JQ 622 0 0
GGGTCTGTTGCGCTTCACGGCCTTGACGGGGGTAGCAAAGACTTGAGTCGACAGAGATGG
ACCTATCAGGTTGGTCTCCGAGGTGAAGCAATGAATTTGATCTCTCCTTCAGAAGCTTCC
TCTGTTGTTTGGATCAAAGGCTCATTAGCAAAGCAAAACAAACAGCCTTTGACATGGTAC
AAGGCCTTCTTTGACGCTCCTAGAGGGAGCGAGCCGGTGGCTTTGGATCTGAGAAGTATG
GGGAAAGGACAAGCTTGGATAAACGGACAAAGTTTAGGGAGATACTGGATGGCTTTCGCC
AAAGGAAACTGCGGGAGTTGCAACTACGCAGGAACATACAGAGAAGCCAAATGCCAATCT
GGTTGTGGCGAACCAACACAAAGATGGTATCATGTTCCACGTTCGTGGTTGAAGCCAAGA
GGGAACTTGTTAGTGCTCTTTGAAGAACTTGGTGGAGATGTCTCCAAAGTCTCTGTTGTA
AAGAGATCAGTACACTAAAAAGAAACAAAAACTCAATCTTGTGTTGTTCATTACACAACA
GCATTCCTCATGCTTCTCTTAAGTTATCAATCCATGTTTTGTAATCATAACAAGATAAGT
TTATAAATACCAAATTTGCACC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL9165Contig1 886 2 2 U
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TTCTCGATCTTTGGAGAGATGTTGAAGCCGTATGCTTCGATGTGGGTAGCACGGTTTGTG
TGGATGAAGGTATCGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTGCTGAAT
GGACTGCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCATTTGAAGAAGCTCTAGCCGCAAGACTTT
CTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATATCTCGCAGAGAGACCCCCGAGAC
TGTCCCCTGGCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATT
TGATATCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATTCCTC
GAGAGAATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTG
ATGAGAACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAACAGATACAAA
AGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGGAGATGGTGCTACTGATCTCGAAGCAC
GTAAACCTGGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTG
TTGCAGCGCAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAAGTCGTTGAACT
AAGTGGAATCTATATAATGATTAGTTTCATTGAGCTAAACTCATTATTGATGATATCTCA
ACATTTGTACTTCTTTTTTCCTTCAAATGTGTGAAACTCCATTGAA


BQ
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AF RR4EM25TF U 1
AF RR4EM25JQ C 172
BS 1 678 RR4EM25TF
BS 679 886 RR4EM25JQ

RD RR4EM25TF 678 0 0
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TGATATCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATTCCTC
GAGAGAATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTG
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GTAAACCTGGTGGCGCAG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR4EM25JQ 715 0 0
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CAAGACTTTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATATCTCGCAGAGAGAC
CCCCGAGACTGTCCCCTGGCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTG
ATGTCTATTTGATATCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTG
GCATTCCTCGAGAGAATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTG
CGGGCTTTGATGAGAACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAAC
AGATACAAAAGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGGAGATGGTGCTACTGATC
TCGAAGCACGTAAACCTGGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTTC
GTGAAGCTGTTGCAGCGCAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAAGT
CGTTGAACTAAGTGGAATCTATATAATGATTAGTTTCATTGAGCTAAACTCATTATTGAT
GATATCTCAACATTTGTACTTCTTTTTTCCTTCAAATGTGTGAAACTCCATTGAA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9167Contig1 938 2 4 U
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GGCTCTCGTGACGAACTTCGAATCAGACAAATCCGCGGAAGAGTATGCAAACATGTACAA
AGAAGATGGGCTCACAGGTGGTCATGTGATAATGCTCGGAGCAGACCCTTTAAGCCAATC
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TTCTGAGAATTGTTTGAGTTATATAGAGGAGGGAGCAAGTCATGTTATTGTCACTTCGTA
TGTGTTTAACAATGGGAAGCTTGATCTTGAGAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGG
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TGGAGGTTTTGCAGATGAGTTTCTGGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGG
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GGGAGGCGTGACAGTGATGGGTGATGTGGAGAGGATTAAAGAAGCAGGGAAGGGACGTGT
GGATGTAACAGTGGGAAGTCCCTTGGACATTTTTGGTGGTAATCTGCCTTACAAAGATGT
TGTTGCTTGGCATCACCAGCAACAAGAACCCTCTTCACCACTCCACTAAAAACCTCATTT
TTCTGTCTTTTGCTTTGTTTTATTTGTCCAATATTCATAATTTTCAACTTAATATTCGTG
AAAGAGTCAAAAAGCCAATAGATGTTGAATTTTTTTTCATGGATTGCTACATTGCTAATT
TGACTTTCTTCTTTCGAATAACATTGAAATTTACAACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CA89TF U 1
AF RR4CA89JQ C 210
BS 1 648 RR4CA89TF
BS 649 649 RR4CA89JQ
BS 650 677 RR4CA89TF
BS 678 938 RR4CA89JQ

RD RR4CA89TF 677 0 0
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GGCTCTCGTGACGAACTTCGAATCAGACAAATCCGCGGAAGAGTATGCAAACATGTACAA
AGAAGATGGGCTCACAGGTGGTCATGTGATAATGCTCGGAGCAGACCCTTTAAGCCAATC
TGCAGCTATTGGAGCTTTACATGCTTATCCCGGCGGTTTGCAGGTTGGAGGTGGGATCAG
TTCTGAGAATTGTTTGAGTTATATAGAGGAGGGAGCAAGTCATGTTATTGTCACTTCGTA
TGTGTTTAACAATGGGAAGCTTGATCTTGAGAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGG
GAAACAAAGATTGATATTGGACCTTAGCTGCAGAAAGAAGGATGGAAGATATGCGATTGT
TACTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGCGACGTCTTGCTTGATGAGAAATCGTTGGACTTTCT
TGGAGGTTTTGCAGATGAGTTTCTGGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGG
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GGATGTAACAGTGGGAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR4CA89JQ 729 0 0
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TCTTGCTTGATGAGAAATCGTTGGACTTTCTTGGAGGTTTTGCAGATGAGTTTCTGGTGC
ATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGATTGATGAAGAGCTTGTTGCATTCCTTG
GCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACTTATGCGGGAGGCGTGACAGTGATGGGTGATGTGG
AGAGGATTAAAGAAGCAGGGAAGGGACGTGTGGATGTAACAGTGGGAAGTCCCTTGGACA
TTTTTGGTGGTAATCTGCCTTACAAAGATGTTGTTGCTTGGCATCACCAGCAACAAGAAC
CCTCTTCACCACTCCACTAAAAACCTCATTTTTCTGTCTTTTGCTTTGTTTTATTTGTCC
AATATTCATAATTTTCAACTTAATATTCGTGAAAGAGTCAAAAAGCCAATAGATGTTGAA
TTTTTTTTCATGGATTGCTACATTGCTAATTTGACTTTCTTCTTTCGAATAACATTGAAA
TTTACAACC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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CGAGATAAAATGTCTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A506JQ U 2
AF RR4A506TF C 1
BS 1 1 RR4A506TF
BS 2 571 RR4A506JQ
BS 572 676 RR4A506TF

RD RR4A506JQ 570 0 0
CGATAAAAGTGAAATAATCTTTTCCAAAGTCCAGAAAAGCAAGTACTGATAAAAACTGAC
GAAGCAAAAAAAAAAAAGGGTCTGATACACAAAAATCCAGAGATTCAAACGACGACAAGA
TAAAACCTAAACAAGAAGGTATCCCTCACTTCTTCTCTTCTTTCTCAGCATCAGCAGCCC
TCTTGGCTCTAGCACCTGCATGTCTCTTGTTTGTACGCTCTAGACGGATCTTGTCATAAG
CATTGAACGATTTCATCTCAGCGGTCAACTTCACTAGCTCAGTTGCTTGCTTCTCACGTA
CGATAGGCATGTAGTCTCCCTGGACTTGAGTGGCATTAGCCAACTCTTCGGCAGTAGAAT
CACCAGCCTTGACCTTCCTGGCACGACGTGGGAAGATGACCAACTTAGCCTTGTAGGTTT
TAAGCCTCTGGCCGTGCACAACAGGGCGGAGAGGTCCAGCGGTGGGACGGGGGAAGATCT
TCACAGCCTTCTTTTGTCTAGCAGCTCTTCTTCTGGTTTTCCTGGCAGGCTGGTTGAACC
ATGTCTTGACATAGTTCTGCCAGTGCTTCT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4A506TF 676 0 0
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CGAAGCAAAAAAAAAAAAGGGTCTGATACACAAAAATCCAGAGATTCAAACGACGACAAG
ATAAAACCTAAACAAGAAGGTATCCCTCACTTCTTCTCTTCTTTCTCAGCATCAGCAGCC
CTCTTGGCTCTAGCACCTGCATGTCTCTTGTTTGTACGCTCTAGACGGATCTTGTCATAA
GCATTGAACGATTTCATCTCAGCGGTCAACTTCACTAGCTCAGTTGCTTGCTTCTCACGT
ACGATAGGCATGTAGTCTCCCTGGACTTGAGTGGCATTAGCCAACTCTTCGGCAGTAGAA
TCACCAGCCTTGACCTTCCTGGCACGACGTGGGAAGATGACCAACTTAGCCTTGTAGGTT
TTAAGCCTCTGGCCGTGCACAACAGGGCGGAGAGGTCCAGCGGTGGGACGGGGGAAGATC
TTCACAGCCTTCTTTTGTCTAGCAGCTCTTCTTCTGGTTTTCCTGGCAGGCTGGTTGAAC
CATGTCTTGACATAGTTCTGCCAGTGCTTCTTGAAATGACCATTCGGGATAACATTGTTG
TGCTTCATTTCTCCACCTCAGAATGTTACTGAAGAGAGCTTCCTTCCTCCTGCGGCGAGA
CGAGATAAAATGTCTC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL9169Contig1 684 2 1 U
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TGCTGTTCCATATATCATTAGATTCAACGATGAGATACCGAATTTAACAAGGTGGGCCTG
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TGGTAAATTTTTAAATTTATTGTTTAAAATTTGATATGATATATTTATATAACTTTATAA
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TAAGTGAACATAAGTGTAAAACAATTAAAATATATAGTTCTAACGATATCAAAGATAGAA
TGCCATGTTCTATTTGTTGACATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AC94JQ C 1
AF RR4AC94TF U 1
BS 1 684 RR4AC94TF

RD RR4AC94JQ 684 0 0
GGACCAAAAAATGAACTATTTTGTACTTTTCATATTAGTGACCTCTACATATTTTGGGCT
AAACGAAGCCTGCAAAAAGAATCAAGTAGAAATTCATAATCAACTTGGTCCGGGTAAAAT
TCTCGAATTTCATTGTCGTTCGGGGGACGACGATCTAGGTGTAAAAACCTTAAACTTCAA
TGCTGTTCCATATATCATTAGATTCAACGATGAGATACCGAATTTAACAAGGTGGGCCTG
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ATATTTTACAAGAAAATTAAGTCAACCATCCGGTTTCGCATTGTCTTGGAATAAAGGATA
ATTTGTGTTTGATCTGCGTGAACACTGTTTCGACTTCTATAGAAGTCAAAATTTGGTTTG
TGGTAAATTTTTAAATTTATTGTTTAAAATTTGATATGATATATTTATATAACTTTATAA
TGTGTATATTATTATACAATATTTTGTAAAATAAGTCATTGCAAGATTGATTAAAGATAT
TAAGTGAACATAAGTGTAAAACAATTAAAATATATAGTTCTAACGATATCAAAGATAGAA
TGCCATGTTCTATTTGTTGACATT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4AC94TF 684 0 0
GGACCAAAAAATGAACTATTTTGTACTTTTCATATTAGTGACCTCTACATATTTTGGGCT
AAACGAAGCCTGCAAAAAGAATCAAGTAGAAATTCATAATCAACTTGGTCCGGGTAAAAT
TCTCGAATTTCATTGTCGTTCGGGGGACGACGATCTAGGTGTAAAAACCTTAAACTTCAA
TGCTGTTCCATATATCATTAGATTCAACGATGAGATACCGAATTTAACAAGGTGGGCCTG
TATTTTAAGGCAAGGACCTAAGATGGAGTATTCTTTTGACGTTGAAGTATACAAAGCAGG
ACCAAGACTTATTCCTCGATGTGGACAGCTACGTGTATGGACTGCCAAAACTGATGGGAT
ATATTTTACAAGAAAATTAAGTCAACCATCCGGTTTCGCATTGTCTTGGAATAAAGGATA
ATTTGTGTTTGATCTGCGTGAACACTGTTTCGACTTCTATAGAAGTCAAAATTTGGTTTG
TGGTAAATTTTTAAATTTATTGTTTAAAATTTGATATGATATATTTATATAACTTTATAA
TGTGTATATTATTATACAATATTTTGTAAAATAAGTCATTGCAAGATTGATTAAAGATAT
TAAGTGAACATAAGTGTAAAACAATTAAAATATATAGTTCTAACGATATCAAAGATAGAA
TGCCATGTTCTATTTGTTGACATT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL9170Contig1 752 2 4 U
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GCGGCTCGCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAACGA
AACCAGTGACATCTCCATGGCCAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGG
ATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGGTCCAGAGCTCGCCGCATGAAGAT
TGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAG
GTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAGAA
GTACCGTGAATCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAA
GGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGTATCCACAAATCCAAGGCAGA
GAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAAGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGC
TAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGA
TGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCACAGGTCCCGGTGAAGAGGTCTAAGAA
GTGAGGAGAGAATAAGCTTTTTTGCTTATAGTAATTTTTTTTTAGCAGTGATTTTTGCAT
GGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CW76TF U 1
AF RR4BL40JQ C 326
BS 1 369 RR4CW76TF
BS 370 370 RR4BL40JQ
BS 371 477 RR4CW76TF
BS 478 752 RR4BL40JQ

RD RR4CW76TF 477 0 0
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GCGGCTCGCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAACGA
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ATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGGTCCAGAGCTCGCCGCATGAAGAT
TGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAG
GTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAGAA
GTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAA
GGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGTATCCACAAATCCAAGGC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR4BL40JQ 427 0 0
G
GGAGGATGAGAGTTTTCAGGCGTCTTCTCAAGAAGTACCGTGAATCCAAGAAGATTGACA
AGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTG
TTTTGATGGAGAGTATCCACAAATCCAAGGCAGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTG
ATCAGTTCGAAGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTA
GAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCC
AAACCGCACAGGTCCCGGTGAAGAGGTCTAAGAAGTGAGGAGAGAATAAGCTTTTTTGCT
TATAGTAATTTTTTTTTAGCAGTGATTTTTGCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAA
ACACCT

QA 2 427 2 427
DS 



AS 1 2

CO CL9171Contig1 684 2 1 U
GGAAAACACAAACACCAAAAAGATCAATCAATCGCCGATGGCTCGTCTCCTCCCTCTCCT
CCTCCTCATCGCCACCATCTCCGCCGTCGCATTCGCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTA
CACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGC
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ACTGATGGGCCCTGACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAG
AGCGCCGTGTTTGCCTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTGACCTCCGACGGCTCCGGCGA
TCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTTTCGACGGCCGGAGTTCACGCTCAGTG
CTCCGCGCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATTAGCT
TACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCCGTGTCGCTTAGGGATAGTGTAAGCCGGGTCGGGTC
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TATTGTATGTTTATCATCGTCTTATGAGTGTAATCTGTGGCCTTTGATTATATGATTCGA
TAAATAAAACTTTTTAGTTACTTC


BQ
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AF RR4AA85JQ C 1
AF RR4AA85TF U 1
BS 1 684 RR4AA85TF

RD RR4AA85JQ 684 0 0
GGAAAACACAAACACCAAAAAGATCAATCAATCGCCGATGGCTCGTCTCCTCCCTCTCCT
CCTCCTCATCGCCACCATCTCCGCCGTCGCATTCGCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTA
CACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGC
TAGAATCTACGACAAGTACGGCGACTACATCGGGATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGG
ACTGATGGGCCCTGACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAG
AGCGCCGTGTTTGCCTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTGACCTCCGACGGCTCCGGCGA
TCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTTTCGACGGCCGGAGTTCACGCTCAGTG
CTCCGCGCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATTAGCT
TACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCCGTGTCGCTTAGGGATAGTGTAAGCCGGGTCGGGTC
GAAGATCCGGAAGCAGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGATGATGAGAGTGTGTGTGATTCG
TATTGTATGTTTATCATCGTCTTATGAGTGTAATCTGTGGCCTTTGATTATATGATTCGA
TAAATAAAACTTTTTAGTTACTTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR4AA85TF 684 0 0
GGAAAACACAAACACCAAAAAGATCAATCAATCGCCGATGGCTCGTCTCCTCCCTCTCCT
CCTCCTCATCGCCACCATCTCCGCCGTCGCATTCGCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTA
CACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGC
TAGAATCTACGACAAGTACGGCGACTACATCGGGATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGG
ACTGATGGGCCCTGACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAG
AGCGCCGTGTTTGCCTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTGACCTCCGACGGCTCCGGCGA
TCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTTTCGACGGCCGGAGTTCACGCTCAGTG
CTCCGCGCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATTAGCT
TACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCCGTGTCGCTTAGGGATAGTGTAAGCCGGGTCGGGTC
GAAGATCCGGAAGCAGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGATGATGAGAGTGTGTGTGATTCG
TATTGTATGTTTATCATCGTCTTATGAGTGTAATCTGTGGCCTTTGATTATATGATTCGA
TAAATAAAACTTTTTAGTTACTTC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9173Contig1 1286 2 14 U
GGACATTTCACAACCACCACCACTCCTGCACTTCCCATTTTAAAGAATACACTTCATCAA
TACATTGTGTTATACAATGCATAAAAATCAATCCCTAAGTATTTTTGTTTTGGTTGTGAT
CGATGGAGAGTTACTTGAAGAAATGGTGCTTAGTTTCTATGTTAGTTTTGTATTTGGGTT
TAAGGTTTAAAGTAAAAGCAGAGCCTCAAGTTCCATGTTATTTCATCTTTGGTGATTCTT
TGGTTGATAATGGAAACAACAATCGTCTTGCCTCTATTGCAAGAGCTGATTATTACCCTT
ACGGCATTGATTTGGGTCGCCCAACCGGCCGCTTTTCCAACGGAAAAACTACCGTTGACG
AGATAGCTGATCTACTTGGATTTGATAACTACATTCCCGCGTATAGTGATGTTAGTGGCG
AGCAGCAACAATTGGGACAAAGGATAACATTTAGTGGACAGGTCCAGAATTATCTGAACA
CAGTGTCACAAGTGGTACAAATTCTTGGAGATGAAAATAGTGCAGCTGATTACCTCAGGC
AGTGCATTTACTCTGTCGGTTTGGGAAGCAATGACTATCTTAATAACTACTTCATGCCTC
AATTCTACTCCACTAGCAGACAGTACACCCCCGAACAATATGCTGATGATCTTATCAATC
GTTACAGAGACCAGCTCAATGCCCTATACAACTATGGCGCTAGAAAGTTTGCACTGGTAG
GAGTGGGAGCCATCGGGTGTAGCCCGAACTCCCTTGCACAGGGCAGCCCCGATGGAACAA
CTTGCGTGGAACGTATCAACTCGGCCAACAGAATCTTCAACAGCAGGCTTAAGTCCATGG
TCCAACAGCTCAACAGCGACCACTCTGATGCTAGGTTTACATACATTAATGCTTATGGCG
TTTTCCAGGACATAATCGCCAATCCCTCTGCTTATGGGTTTAGGGTAACTAACGCTGCGT
GTTGCGGAGTTGGAAGGAATGGAGGTCAGCTTACATGTCTACCAGGACAAGCCCCGTGTC
CGAACAGAGATGAGTACGTGTTTTGGGATGCATTTCATCCAACGGATCGTGCGAACACGA
TCATAGCACAACGATCTTACAATGCGCAATCGTCTGACGACGTTTATCCAATCGATATTT
CAGCGTTAGCACGGCTTTAAAAGAAAAGAGAATAGGAGACTTCTCAACCAAGTGTATGTT
TTCATGTTTTAAATCAGTTGTTTGGAAAAAGATTGTGAAGTTATGTGCTCCCAAATAATG
ACAAAAATAAGGGGTATTAACAGCTT


BQ
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AF RR4B873TF U 1
AF RR4B873JQ C 477
BS 1 819 RR4B873TF
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BS 890 1286 RR4B873JQ

RD RR4B873TF 889 0 0
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TC**ACAGCTCA*CAGCGACCACTCTGATGCTAG*TTTACATACATTAA

QA 1 889 1 889
DS 

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AATGACAAAAATAAGGGGTATTAACAGCTT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL9174Contig1 812 2 3 U
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BQ
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AF RR4AL32TF U 9
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BS 9 584 RR4AL32TF
BS 585 812 RR4AL32JQ

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QA 1 576 1 576
DS 

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GGACATTGAAGGAATCAAGAGAAACTCGATCTACTTTAATGGTTCTGATTCAGTAAATCC
ATATGATGAAAATGATATCTTCATATTCAATCTCGACACAAAGAAGGTTGAACAACCACA
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TGGAGATAATCTCATTTGATTACGCTCGTTTCATTTTATAGTTTCTATGTTTTAAATTCT
CAAGTATGTATCTGATTTTTAATTTGTGCTAC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C918JQ C 1
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TCTTTGGGGGGTCTTGGTGATATGTTGTAAATGATAGATAAAAACTTGAAAAGAAAGACC
CAAAAAAATTGATGCGATGGATTTTTGAGGGTGCT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GW32TF U 1
AF RR4GW32JQ C 103
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TTTCCAGTATGCCACGTCAAAATTTTATATACTTCACATCTTTGATTTGTTTGGT

QA 1 655 1 655
DS 

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CTAGAGATGCATTGGTCAGTGCATCAGATCTCCCTTTGTCAATCCTCATCGTTGGAGTAG
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TGCCTGGAATTTTTCCGTTTTCCAGTATGCCACGTCAAAATTTTATATACTTCACATCTT
TGATTTGTTTGGT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

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AAAAGATGAAGTTTGATAAAGAAACGTTTATCATTTGTGGTCTGGGTCACCTACTCAGAC
TCACAAAGCTAAGGCGGCTTGGGAGGATTTATGCTGTCCAAAGGATGAGGGAGGACTTGG
TATCCGGAAGTTACATGATTCGTCAAAGGTCTTTGCTTTGAGCTTAACTTGGAGGATTTT
TTCGAGCTCTGCATCACTATGGGTCTCTTGGATACAGCAATATCTGCTGAGACAGAACTC
TTTCTGGGATGTGAGGGAGGATTGGAAGGGATCTTGGATTTGGAGGAAGCTGTTAAAATT
GAGATCAGTTGCTTACCAGTTTATCAGGTTTGAGGTAAATGACGGTCACATTGCTTTTTT
CTGGGTTGATGACTGGCTACAGGTAGGGAAGCTATTGGATATCACTGGTGCTGTAGGAAC
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GAGTATACGAGGACATCGAAACCGACATTTTCATGATTTGTATGCCCGCATAAGGAACGA
GCGAGTTCCGCATGATGAATATGGAAGCGACCTGGTACTTTGGAAGTACTCGGAGGACAA
CTATAAACCACATTTCTCATCGAGTAGAACCTATGATCAGATTAGGTTAAGGAGAAGTAG
AGTGGGCTGGAGCAAAAGTGTGTGGTTTTCCCAAGAAGTTCCTAGATACTCATTCATAGT
ATGGCTGGCAGTGAAAAATAGACTATCTACAGGAGATCGTATGAGGGCTTGGGGTATTCA
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TCCGTACACCTTCACTGTTTGGGATACACTTGCTGGTCGGTTAAGTGGTGGTAGAAGTGA
TCCAGATTGGGATACTACCTTGCAGTTTATTACTAACAATGACCTTGAGAGCATCGACAA
GATCCTCATCAAAATGGTTTTTCAGACCTGCATCTATTATATGTGGAAGGAGAGGAATGA
GAGACGTCATCAGCAAGGGTTTCGCACTGTGGACCAAGCTGTTCGAGTCATTGACAAGGC
CATACAAAACCGAATCAGCTCTCTTCAATACAAGGCAGATCATAAGCTAGCAGGCCTAAT
GCGACGCTGGTTTGAAGTGTTCTAAAACGATCATCTTTCATTTTTGATACTGTTACAACC
GTTGTATAGCTTCTGCATTTAGAATCCTATTCTTTGTATATGTTTATTCTTTTTACTCTG
ATCAATAAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAAAGATGAAGTTTGATAAAGAAACGTTTATCATTTGTGGTCTGGGTCACCTACTCAGAC
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TATCCGGAAGTTACATGATTCGTCAAAGGTCTTTGCTTTGAGCTTAACTTGGAGGATTTT
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GAGTATACGAGGACATCGAAACCGACATTTTCATGATTTGTATGCCCGCATAAGGAACGA
GCGAGTTCCGCATGATGAATATGGAAGCGACCTGGTACTTTGGAAGTACTCGGAGGACAA
CTATAAACCACATTTCTCAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4AQ34JQ 791 0 0
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TATGGCTGGCAGTGAAAAATAGACTATCTACAGGAGATCGTATGAGGGCTTGGGGTATTC
AACAGAGTTGTGTGATGTGTGGAGAACCGGATGAGACTAGGGATCATATCTTCTTTGCTT
GTCCGTACACCTTCACTGTTTGGGATACACTTGCTGGTCGGTTAAGTGGTGGTAGAAGTG
ATCCAGATTGGGATACTACCTTGCAGTTTATTACTAACAATGACCTTGAGAGCATCGACA
AGATCCTCATCAAAATGGTTTTTCAGACCTGCATCTATTATATGTGGAAGGAGAGGAATG
AGAGACGTCATCAGCAAGGGTTTCGCACTGTGGACCAAGCTGTTCGAGTCATTGACAAGG
CCATACAAAACCGAATCAGCTCTCTTCAATACAAGGCAGATCATAAGCTAGCAGGCCTAA
TGCGACGCTGGTTTGAAGTGTTCTAAAACGATCATCTTTCATTTTTGATACTGTTACAAC
CGTTGTATAGCTTCTGCATTTAGAATCCTATTCTTTGTATATGTTTATTCTTTTTACTCT
GATCAATAAAT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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AAGAGCTCCTTAAACAAAACAAGAAAGAGAGAAAATCAGATCTGAGGATCAACACAATGT
GTCCGGTGTGTTTATGCGATGAGGAAGAGACAGAGTTAGGGAGACAACAAGCACCCGGAT
CTTGTCCGTATTGTGGAGGTACAGTGCAGATGCTAGATCTCGAAAGAAAATGGATGTTTT
GTTTCGTTCCTCTTTGTTTCAAGATCAAGAGGAAGTATCTTTGTTCTTCTTGCGATCGTC
GTCTCGTTTTGTATCATTAAATTAAAATAAAATATATTATTGATTATTTTAAGAACAACT
AAAGTCCATTGATAGCGTTTTAAATTAAGAAAATATTCTTAATCAGTGGTTTTTGGTGCG
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TTTGATATTATGTACTTTTTCGAGTTTCTT


BQ
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AF RR4E484JQ C 1
AF RR4E484TF U 1
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AAGAATTTTTCTAGAAACAGAGCACAGAGATTTCTCAGGTCAACAAAACAAATATCTACA
AAGAGCTCCTTAAACAAAACAAGAAAGAGAGAAAATCAGATCTGAGGATCAACACAATGT
GTCCGGTGTGTTTATGCGATGAGGAAGAGACAGAGTTAGGGAGACAACAAGCACCCGGAT
CTTGTCCGTATTGTGGAGGTACAGTGCAGATGCTAGATCTCGAAAGAAAATGGATGTTTT
GTTTCGTTCCTCTTTGTTTCAAGATCAAGAGGAAGTATCTTTGTTCTTCTTGCGATCGTC
GTCTCGTTTTGTATCATTAAATTAAAATAAAATATATTATTGATTATTTTAAGAACAACT
AAAGTCCATTGATAGCGTTTTAAATTAAGAAAATATTCTTAATCAGTGGTTTTTGGTGCG
TTTTTAGTATTATCTATGTCATGTAAACCGACATTGGTCTATTATAAGTTAGAGAACTCT
TTTGATATTATGTACTTTTTCGAGTTTCTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR4E484TF 570 0 0
GGATCGATCTTAGAGTCATTGAAAAAAATACTTTAATTTTCAACTTCACAAGAAAAACTC
AAGAATTTTTCTAGAAACAGAGCACAGAGATTTCTCAGGTCAACAAAACAAATATCTACA
AAGAGCTCCTTAAACAAAACAAGAAAGAGAGAAAATCAGATCTGAGGATCAACACAATGT
GTCCGGTGTGTTTATGCGATGAGGAAGAGACAGAGTTAGGGAGACAACAAGCACCCGGAT
CTTGTCCGTATTGTGGAGGTACAGTGCAGATGCTAGATCTCGAAAGAAAATGGATGTTTT
GTTTCGTTCCTCTTTGTTTCAAGATCAAGAGGAAGTATCTTTGTTCTTCTTGCGATCGTC
GTCTCGTTTTGTATCATTAAATTAAAATAAAATATATTATTGATTATTTTAAGAACAACT
AAAGTCCATTGATAGCGTTTTAAATTAAGAAAATATTCTTAATCAGTGGTTTTTGGTGCG
TTTTTAGTATTATCTATGTCATGTAAACCGACATTGGTCTATTATAAGTTAGAGAACTCT
TTTGATATTATGTACTTTTTCGAGTTTCTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL9180Contig1 1189 2 4 U
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CTAGGGTTCCAGATTTACTCTCTTCTCATCGATCTACACATCCTTGGATCTTCAATCTCT
GTACATTTTCAAGGTACGTAGACGACCAAACACAAAAAAGCTAACCATGGCGAAAACTCG
ACCAGGTGTCCCCTCGAAAATCAAAACTGGGAGGAAAGAGCTCGAATCTTACACCATCAA
AGGCACCAACAAACTCGTCAGAGCTGGAGATTGTGTGTTGATGCGCCCCTTAGATGCTGG
CAAGCCACCGTACGTGGCACGTGTCGAGAAGATCGAAGCCGACGCTAGGAACAACGTGAA
GGTGCACTGTCGGTGGTATTACCGCCCCGAGGAGTCACTTGGCGGTAGGAGACAGTTCCA
TGGAGCCAAAGAGCTTTTCTTGTCTGACCATTTCGACGTCCAGAGCGCACACACCATTGA
AGGAAAATGCATTGTTCACACCTTCAAAAACTACACCAGGCTTGAGAACGTTGGCGCTGA
GGATTATTATTGTAGGTTCGAGTACAAGGCTGCTACTGGTGCTTTTACCCCTGACCGTGT
TGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCGTATAATCCAGACGATCTCATGGTGCAATGTGA
AGGCTGCAAAGACTGGTATCATCCTGCGTGTGTAGGCATGACGATTGAAGAAGCAAAGAA
GCTTGACCACTTTGTGTGTGCTGAATGCAGCTCTGATGATGATGTCAAGAAATCGCAGAA
CGGGTTTTCCGCATCTCCAGCTGATGGTGTTGTCAAGGTGGAAACGAAGCGCAGAAAAAG
ATAATGTCGAGGTTTTCATGGGTAACAAAGCCACAGAGGGGGACTGGCAAGTTAGTCATA
ACTTGGGAGCTCTTTGGTGCAGATTTTTAGTAAGTTAGGTTTTTTTTTTTGATTGTCTAT
GTCGTCATGGTTGTGATTAGTGTCTGTATGGTGCTGTTCCAAAACTAAGAGAAGATCGGA
GAGATGATGAAGACAAGTTGTTATGGTGGCAGAGTCAGTTGTATAGACTTCTCCGCGGTG
TCTTAGTTAACTTTAGATATGTTTTATTTTGCGTATGTTGTTTTTGTCTGATGAGAACAG
ATGTGAACATGAAGAGGAGCGCTTATATATATATATAAAGAAATTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CO96TF U 1
AF RR4CO96JQ C 452
BS 1 662 RR4CO96TF
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RD RR4CO96TF 693 0 0
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CTAGGGTTCCAGATTTACTCTCTTCTCATCGATCTACACATCCTTGGATCTTCAATCTCT
GTACATTTTCAAGGTACGTAGACGACCAAACACAAAAAAGCTAACCATGGCGAAAACTCG
ACCAGGTGTCCCCTCGAAAATCAAAACTGGGAGGAAAGAGCTCGAATCTTACACCATCAA
AGGCACCAACAAACTCGTCAGAGCTGGAGATTGTGTGTTGATGCGCCCCTTAGATGCTGG
CAAGCCACCGTACGTGGCACGTGTCGAGAAGATCGAAGCCGACGCTAGGAACAACGTGAA
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TGGAGCCAAAGAGCTTTTCTTGTCTGACCATTTCGACGTCCAGAGCGCACACACCATTGA
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AG*CTGCAAAGACTGGTATCATCCTGCGTGTGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4CO96JQ 738 0 0
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GCTACTGGTGCTTTTACCCCTGACCGTGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCGTAT
AATCCAGACGATCTCATGGTGCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTATCATCCTGCGTGT
GTAGGCATGACGATTGAAGAAGCAAAGAAGCTTGACCACTTTGTGTGTGCTGAATGCAGC
TCTGATGATGATGTCAAGAAATCGCAGAACGGGTTTTCCGCATCTCCAGCTGATGGTGTT
GTCAAGGTGGAAACGAAGCGCAGAAAAAGATAATGTCGAGGTTTTCATGGGTAACAAAGC
CACAGAGGGGGACTGGCAAGTTAGTCATAACTTGGGAGCTCTTTGGTGCAGATTTTTAGT
AAGTTAGGTTTTTTTTTTTGATTGTCTATGTCGTCATGGTTGTGATTAGTGTCTGTATGG
TGCTGTTCCAAAACTAAGAGAAGATCGGAGAGATGATGAAGACAAGTTGTTATGGTGGCA
GAGTCAGTTGTATAGACTTCTCCGCGGTGTCTTAGTTAACTTTAGATATGTTTTATTTTG
CGTATGTTGTTTTTGTCTGATGAGAACAGATGTGAACATGAAGAGGAGCGCTTATATATA
TATATAAAGAAATTCATC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL9181Contig1 726 2 10 U
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GAGAAGAAGCTAACGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTCCTCAACATC
TCCGTCGGCGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTCTTGGAACAGTTGAGT
GGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAAGCAAGGTACACTGCTTCTTTTGGTATCAGACGTAAC
GAGAAGATTGCTTGCTACGTTACCGTCAGGGGAGACAAAGCAATGCAGTTCCTTGAAAGT
GGACTCAAGGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTT
GGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATC
TACGGTATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGA
AGATGCAAGACTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGG
TTCCAAGTTAAATACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGTTAAACA
ACAAAATTGTCTCAGTTAGAGAGATCTGTAATCTGTGTGTTTTGTCCACCCCTGGTTTGA
GTCGTATTTTATCAGTTTTGTTTTTTGCTTCTTTGTCCTTCAGACATTTGAGTTTTCTTT
TTAGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4CI32TF U 1
AF RR4CI32JQ C 1
BS 1 597 RR4CI32TF
BS 598 598 RR4CI32JQ
BS 599 669 RR4CI32TF
BS 670 670 RR4CI32JQ
BS 671 685 RR4CI32TF
BS 686 686 RR4CI32JQ
BS 687 697 RR4CI32TF
BS 698 699 RR4CI32JQ
BS 700 715 RR4CI32TF
BS 716 726 RR4CI32JQ

RD RR4CI32TF 724 0 0
GGCTCCCAGCTTTTGCCTTCTGTCGGAGTGTTCTCGCAACCTTAACCGCAAATGGCGTCG
GAGAAGAAGCTAACGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTCCTCAACATC
TCCGTCGGCGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTCTTGGAACAGTTGAGT
GGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAAGCAAGGTACACTGCTTCTTTTGGTATCAGACGTAAC
GAGAAGATTGCTTGCTACGTTACCGTCAGGGGAGACAAAGCAATGCAGTTCCTTGAAAGT
GGACTCAAGGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTT
GGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATC
TACGGTATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGA
AGATGCAAGACTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGG
TTCCAAGTTAAATACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGTTAA*CA
ACAAAATTGTCTCAGTTAGAGAGATCTGTAATCTGTGTGTTTTGTCCACCCCTGGTTTGA
GTCGTATTT*ATCAGTTTTGTTTTT*GCTTCTTTGTC**TCAGACATTTGAGTTT
CTTTTAGAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4CI32JQ 726 0 0
GGCTCCCAGCTTTTGCCTTCTGTCGGAGTGTTCTCGCAACCTTAACCGCAAATGGCGTCG
GAGAAGAAGCTAACGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTCCTCAACATC
TCCGTCGGCGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTCTTGGAACAGTTGAGT
GGCCAGACTCCTGTTTTTTCCAAAGCAAGGTACACTGCTTCTTTTGGTATCAGACGTAAC
GAGAAGATTGCTTGCTACGTTACCGTCAGGGGAGACAAAGCAATGCAGTTCCTTGAAAGT
GGACTCAAGGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTT
GGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATT
TACGGTATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGA
AGATGCAAGACTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGG
TTCCAAGTTAAATACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGTTAAACA
ACAAAATTGTCTCAGTTAGAGAGATCTGTAATCTGTGTGTTTTGTCCACCCCTGGTTTGA
GTCGTATTTTATCAGTTTTGTTTTTTGCTTCTTTGTTCTTCAGACATTTGAGTTTTCTTT
TTAGAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL9182Contig1 919 2 4 U
GGATGGACCTCCCCCTTCTTACCCACATCTGAAAATTCCTGGTCTTAATGCTCCTATTCC
AAATGGAGCTAGCTTTGGTTATCATGCGGGTGGCTGGGGAAAACCTCCAGTTGATGAGTT
TGGGCGTCCATTGTATGGAGATGTCTTTGGCGTCCAGCAGCAAGATCAGCCTAACTATGA
GGATGAGCCTATTGATAAGAGCAAGCACTGGGGTGATTTGGAGGAGGAAGAAGAAGAAGA
GGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAACAAGAAGAGGAGATGGATGAAGAGGAACTAGAAGACGG
CATGGAATCGGTTGATACAATGTCAAGTACTCCAACTGGCATAGAGACACCAGATGCGAT
TGAACTTCGTAAGGAGCAGAGAAAGGAACCCGATAGGGCTCTATATCAGGTACTTGAAGA
AAAGGGAGAGAGTGTTGCTCCTGGAGCTTTGCTGGCACCCACACACACGTACGTTATTAA
AACTGGTACTCAAGACAAGACTGGAGCGAAAAGGGTTGATCTGCTGAAAGGACAAAAGAC
AGATCGTGTGGACATCAGCTTGCAGCCAGAAGAGCTGGACGCCCTGGAGAATGTGTTGCC
TGCCAAGTATGAGGAAGCAAGAGAAGAGGAGAAACTACGCAATAAGCCAGAGGACTTCAG
TGACATGGTGGCGGAGAATTCGAAGAAAAGGAAGCGTGACAAGGACGGCAAGAAAAAGAA
GGATTTCAAGTTTTGAGGAAGCTTTTTATTCGTGGATGAACCATCATGAACTATGGATTC
TAGACATGAGAAATGTGTTTGGCTTTACGTAACGTTGAGAGAGGAGTTAAGATAGAAAAT
ATTTGTGTTTTTAAGAAACTTAAATGCTGTGGATTCTAGACATGTACTGTGTTTCCTGAA
GTTAAGAAAAAACTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV47TF U 1
AF RR4EV47JQ C 526
BS 1 692 RR4EV47TF
BS 693 693 RR4EV47JQ
BS 694 707 RR4EV47TF
BS 708 919 RR4EV47JQ

RD RR4EV47TF 712 0 0
GGATGGACCTCCCCCTTCTTACCCACATCTGAAAATTCCTGGTCTTAATGCTCCTATTCC
AAATGGAGCTAGCTTTGGTTATCATGCGGGTGGCTGGGGAAAACCTCCAGTTGATGAGTT
TGGGCGTCCATTGTATGGAGATGTCTTTGGCGTCCAGCAGCAAGATCAGCCTAACTATGA
GGATGAGCCTATTGATAAGAGCAAGCACTGGGGTGATTTGGAGGAGGAAGAAGAAGAAGA
GGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAACAAGAAGAGGAGATGGATGAAGAGGAACTAGAAGACGG
CATGGAATCGGTTGATACAATGTCAAGTACTCCAACTGGCATAGAGACACCAGATGCGAT
TGAACTTCGTAAGGAGCAGAGAAAGGAACCCGATAGGGCTCTATATCAGGTACTTGAAGA
AAAGGGAGAGAGTGTTGCTCCTGGAGCTTTGCTGGCACCCACACACACGTACGTTATTAA
AACTGGTACTCAAGACAAGACTGGAGCGAAAAGGGTTGATCTGCTGAAAGGACAAAAGAC
AGATCGTGTGGACATCAGCTTGCAGCCAGAAGAGCTGGACGCCCTGGAGAATGTGTTGCC
TGCCAAGTATGAGGAAGCAAGAGAAGAGGAGAAACTACGCAATAAGCCAGAGGACTTCAG
TGACATGGTGGCGGAGAATTCGAAGAAAAGGA*GCGTGACAAGGACG
CAAGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4EV47JQ 394 0 0
GAAAGGACAAAAGACAGATCGTGTGGACATCAGCTTGCAGCCAGAAGAGCTGGACGCCCT
GGAGAATGTGTTGCCTGCCAAGTATGAGGAAGCAAGAGAAGAGGAGAAATTACGCAATAA
GCCAGAGGACTTCAGTGACATGGTGGCGGAGAATTCGAAGAAAAGGAAGCGTGACAAGGA
CGGCAAGAAAAAGAAGGATTTCAAGTTTTGAGGAAGCTTTTTATTCGTGGATGAACCATC
ATGAACTATGGATTCTAGACATGAGAAATGTGTTTGGCTTTACGTAACGTTGAGAGAGGA
GTTAAGATAGAAAATATTTGTGTTTTTAAGAAACTTAAATGCTGTGGATTCTAGACATGT
ACTGTGTTTCCTGAAGTTAAGAAAAAACTTGTTT

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

CO CL9183Contig1 574 2 2 U
GGAATCGCAAGGCGTTGCAATCTGGTCGCCCATCACTCTTGGGAGGATACTCTGACTCAG
ATGCAAGGACTCTCCTCAAGCCGTCCGATTAAGCGACTCACTTTAATAGCGGTCAAAGCA
ACAATCTACTGGTTATGGAGTGAGCGCAACAGCAGGCTGCATAGAGCTACTTTTAAAGGA
AAAGAGTCTCTCCTCCTCACCATTGATCGGCAAATACGGAACAGGATCTCAGCACTGCGT
GTTTCGCACCCGGCGATATCTGCGGCGATGATGCAGCACTGGTTAGCTACGCCACTGTAG
CGAGGCCTCAGTCATCCTCCTCTACTCCAACCCACCGTTTCCTCTCCCTCAAACGCTCTC
TCTTTCGTGATCAAACTGGCGATGTCAACAATGCTACTGTGCTGGGCTTTTCACATTCTC
ATGGGCTCATCACTCTTCACTACAAATTTGGGCTTATTTTAGTTCTTGCACTATGTGTTT
CCTCTATCTATTATTGGGCTGGGCTCGTAAAAACTTAACCTTTGGGTTGTAAAATTTTTA
TTTTCTTTATGCTTTAAATATGAATGCCATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4CU79JQ C 1
AF RR4CU79TF U 7
BS 1 6 RR4CU79JQ
BS 7 574 RR4CU79TF

RD RR4CU79JQ 574 0 0
GGAATCGCAAGGCGTTGCAATCTGGTCGCCCATCACTCTTGGGAGGATATTCTGACTCAG
ATGCAAGGACTCTCCTCAAGCCGTCCGATTAAGCGACTCACTTTAATAGCGGTCAAAGCA
ACAATCTACTGGTTATGGAGTGAGCGCAACAGCAGGCTGCATAGAGCTACTTTTAAAGGA
AAAGAGTCTCTCCTCCTCACCATTGATCGGCAAATACGGAACAGGATTTCAGCACTGCGT
GTTTCGCACCCGGCGATATCTGCGGCGATGATGCAGCACTGGTTAGCTACGCCACTGTAG
CGAGGCCTCAGTCATCCTCCTCTACTCCAACCCACCGTTTCCTCTCCCTCAAACGCTCTT
TCTTTCGTGATCAAACTGGCGATGTCAACAATGCTACTGTGCTGGGCTTTTCACATTCTC
ATGGGCTCATCACTCTTCACTACAAATTTGGGCTTATTTTAGTTCTTGCACTATGTGTTT
CCTCTATCTATTATTGGGCTGGGCTCGTAAAAACTTAACCTTTGGGTTGTAAAATTTTTA
TTTTCTTTATGCTTTAAATATGAATGCCATTTAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4CU79TF 568 0 0
GCAAGGCGTTGCAATCTGGTCGCCCATCACTCTTGGGAGGATACTCTGACTCAGATGCAA
GGACTCTCCTCAAGCCGTCCGATTAAGCGACTCACTTTAATAGCGGTCAAAGCAACAATC
TACTGGTTATGGAGTGAGCGCAACAGCAGGCTGCATAGAGCTACTTTTAAAGGAAAAGAG
TCTCTCCTCCTCACCATTGATCGGCAAATACGGAACAGGATCTCAGCACTGCGTGTTTCG
CACCCGGCGATATCTGCGGCGATGATGCAGCACTGGTTAGCTACGCCACTGTAGCGAGGC
CTCAGTCATCCTCCTCTACTCCAACCCACCGTTTCCTCTCCCTCAAACGCTCTCTCTTTC
GTGATCAAACTGGCGATGTCAACAATGCTACTGTGCTGGGCTTTTCACATTCTCATGGGC
TCATCACTCTTCACTACAAATTTGGGCTTATTTTAGTTCTTGCACTATGTGTTTCCTCTA
TCTATTATTGGGCTGGGCTCGTAAAAACTTAACCTTTGGGTTGTAAAATTTTTATTTTCT
TTATGCTTTAAATATGAATGCCATTTAC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL9184Contig1 686 2 1 U
GAACCCTACTAGCAGCAATTCAAGAAAACCATTGAGAACAAGTTGGGTTGAAGCTGTTTT
CAGCATTATCAAGTATCAAGTCCAGAAAGCTTCCATAGCTGAAGACAAGGCCTTTGCTTT
TCTTGGGGAAAATAATCACAGTGGTTCATTAACATACTCTGGATTTTGCCAAGCACTTCA
AAAGGTAAATCTAACGGGCATGCCACATGGGCTTAGCTTTCAAGAGACAAAAGAGCTGTG
GGATCGAGCTGATATTGATGAAAATGGTGTCTTCGACTATGAAGAACTTAAGAAAATGTG
GAACATGACAGTGATGGTTCAATCTGAAAACTGCAAAGAGGGCGTGATGGAGAGTAATAA
AGGAGAAGGAGAAGATAAGGAAGAAGAAGAAGCGATTGGACTGAAGGTGAAGAAAGCGGT
TTTGTTTCCGGAAGAAGCAGAGAAAGGGATGTGGCCGGAGAATTACAGTCTCTCCGACCA
CGCTTGTCTCACTGTACAATTCTCTCCGGTCAAAATTCTCTGTAGTTAAGCTTTGTTTGG
CTCTTTGTACATGTAAAGAAGCAAAATGAGATTTGAGAAAAGTTTGTATAGTTTTTGAGA
GAAGATTTTGAACTTTTGTAATAGCATCACTCTGTTTTCAAACAAAATTAAAGAGTTGCT
TTCTGATTGAATCAAACTCTTCAGTG


BQ
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AF RR4GW44JQ C 1
AF RR4GW44TF U 1
BS 1 686 RR4GW44TF

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DS 

RD RR4GW44TF 686 0 0
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CAGCATTATCAAGTATCAAGTCCAGAAAGCTTCCATAGCTGAAGACAAGGCCTTTGCTTT
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GAACATGACAGTGATGGTTCAATCTGAAAACTGCAAAGAGGGCGTGATGGAGAGTAATAA
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TTCTGATTGAATCAAACTCTTCAGTG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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TTTATCGATGTCATTGAAGGCAATCGCAAATATATCAAGTGTGTGTATGTCTACAACAAA
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GGACTTGTGAGAGTTTACTCGAAGCCTCAGGGCCAGCAACCAGATTTCGATGAGCCTTTT
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BQ
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AF RR4AY06TF U 1
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BS 856 946 RR4AY06JQ

RD RR4AY06TF 859 0 0
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TTTATCGATGTCATTGAAGGCAATCGCAAATATATCAAGTGTGTGTATGTCTACAACAAA
ATTGATGTTGTTGGAATTGATGATGTGGATAGACTAGCACGGCAGCCAAATTCCATCGTT
ATTAGCTGTAATCTTAAGCTAAACTTAGACAGACTACTTGCAAGGATGTGGGACGAAATG
GGACTTGTGAGAGTTTACTCGAAGCCTCAGGGCCAGCAACCAGATTTCGATGAGCCTTTT
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ACATTGGTGAAGGATATGAAGTATGCTCTTGTGTGGGGCACAAGCGCAAGGCACAATCCT
CAGAATTGTGGTCTTTCTCAGCATCTTGAAGACGAAGATGTTGTTCAGATTGTCAAGAAA
AAGGAGAGAGACGAAGGAGGAAGAGGCCGGTTCAAGTCACACTCTAATGCCCCTGCTAGA
ATTGCAGACCGAGAGAAGAAAGCTCCTCTTAAGCAATAAACTCAGCTGGTCAGTGATCCC
CATACACACATCTTCACCATCTTATTCATAGATGGTTTCACCTGAGTGTTATGATGTACT
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TCAT

QA 1 855 1 855
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CTAATGCCCCTGCTAGAATTGCAGACCGAGAGAAGAAAGCTCCTCTTAAGCAATAAACTC
AGCTGGTCAGTGATCCCCATACACACATCTTCACCATCTTATTCATAGATGGTTTCACCT
GAGTGTTATGATGTACTATGTTGTATTTCTGAATCATTCTTTTGCCTTCTCTTACCGTAT
AAGTTTTCAAACCAATTGTTTTTTCAAGAATACAATTAGTTCCTATTTACCTTTTCATAA
ACT

QA 1 903 1 903
DS 



AS 1 2

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GAGATCGTTGAGAAGTGTTTGAGGGATTGCGGGGAAGATAGGCCGAGCATGGGGGATGTG
ATCTGGGATCTTGAATACGTTCTACAGCTTCATATGACGCCGGTTCAAAGAGAGCCTCAT
GAGGATAGCACCATGACGATCTCCGGCGTCGGAGGTGGAAACTCGTTGGTGGTTCCGAGG
TTGATGGTGAGTGATTCGTTTAGCGAAAACTCGTTTGTTCAGAAGAAGAGCAGCCATATT
GGAGATTCATCCGAGACTCAGGTTTTCTCCCGGCTGAAGATCTCTGAAGCAAGATAGTAA
ATGGCTTTGCATTAACCGGGTTTCACAAACTTACCGTGTCCATACCGGTTATTTATTTGA
ATGAAAACCGGTATGGAAATCATATCCAACTTTTCCGTTTGGAATTTGTTGATAAAAAAT
AATGAAATAGTTTTCAAAACTTCTCAAAAATACTGAGAGTTTTGTGTAGTGGTTGAATTT
TTTTTCTTTAACAAATGAAATGATTAAGGGTCT


BQ
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AF RR4CC09JQ C 1
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DS 

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AATGAAATAGTTTTCAAAACTTCTCAAAAATACTGAGAGTTTTGTGTAGTGGTTGAATTT
TTTTTCTTTAACAAATGAAATGATTAAGGGTCT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CN67JQ C 1
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CGT

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FY17TF U 1
AF RR4FY17JQ C 127
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BS 695 857 RR4FY17JQ

RD RR4FY17TF 699 0 0
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GTGTAGCTTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTACTTGTATATGATGTCAACTCCATGA
AATCTTTTGAAAACCTCAACAACTGGCGTGAAGAGTTTCTCATCCAGGCTAGTCCATCTG
ATCCAGAGAATTTTCCTTTTGTTCTTATCGGAAACAAGGTCGACGTGGATGGTGGAAACA
GCAGAGTGGTTTCAGAGAAAAAGGCTAAAGCTTGGTGTGCTTCGAAGGGAAACATACCCT
ACTTTGAGACCTCTGCTAAGGAAGGCACCAATGTTGAGGAAGCTTTCCAGTGCATTGCCA
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GGACGAGCAACCAACCGAGATCTTCAGGGTGTGA
TGCTA

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DS 

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TTTTCACTTTACAGATATGGGATACAGCTGGACAGGAAAGGTTCCAGAGCCTTGGTGTAG
CTTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTACTTGTATATGATGTCAACTCCATGAAATCTT
TTGAAAACCTCAACAACTGGCGTGAAGAGTTTTTCATCCAGGCTAGTCCATCTGATCCAG
AGAATTTTCCTTTTGTTCTTATCGGAAACAAGGTCGACGTGGATGGTGGAAACAGCAGAG
TGGTTTCAGAGAAAAAGGCTAAAGCTTGGTGTGCTTCGAAGGGAAACATACCCTACTTTG
AGACCTCTGCTAAGGAAGGCACCAATGTTGAGGAAGCTTTCCAGTGCATTGCCAGTAACG
CGCTCAAGAGCGGCGAAGAGGAAGAGCTATACTCGCCAGACACAATCGACGTGGGGACGA
GCAACCAACCGAGATCTTCAGGGTGTGAATGCTAAAAGGGTTTGTATCTCTCCGAGAAGA
ATGCTTTTGAGTTCAACAATGTGTTTTGGTCTCTCCCATTACCAGCTATCTCTAAAGTTT
TATTACATGCTGTAAAATTTCTTCTTTTGTGTGAAAAATGAATCCTTCCTTAAAAACCAT
TTGATTTGTTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL9189Contig1 1255 2 2 U
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GCATTCCATGAAACGCGTCGGAAAATGGGAAAATACATAAAGAAGAACAAACTCGGCGGA
GAAGCTGCTATAGCTTTGATGGACGTTTCTCCTTCTTCTTCTTCGCTCGGTGTTCTCACT
CGAGCCAAGCCCTTAGCTCTCCAACGCCGCCTCCAAAAACTATCCTCTTCTCCTTCTCCT
AACCCACCGCCGTCGAAACAGAAGATAACTGATTCCTCAGGCAGCTCGTATCTTCAGCTG
CGGAGCCGCCGGCTCCAGAAGAAGCCTCCAATTGTCGTGATTCGCTCAACCAAACGGAGA
AAGCCGTATCAGCAGCGGCAGAGGAGGGAAGATGGGGGAAACCCTAACCCTAATCCCCAA
AATCTCGATTCTTCGGTTCGAGGGTCTGTTAATAATGACTCAATTGGTGATGGGTCTAGG
TCGGATTCGGTTGCAGAGAGTGCTGTGTTTGGGAAAGAGAAGGACTTTAACGGTGGAATC
AACAAAGAGCTTGATGGCAGTGAAAGCTTCAACAGGACCACAAGGGAATCCACACCATGC
AGTTTGATAAGGAAGCAGGAAACCATCACCACAAGCCCTGGATCGTCTACGAAGCTTCTT
AGCAATGGTATCAGTGGCGAGAGCAACCAAAGAGAAGATAGTTTCTCGGAGAGCCATCGT
CACCAACCAACTACACCTGAAATGGACGAGTTTTTCTCGGGTGCTGAAGAAGAACAACAA
AGGCAGTTCATTGAAAAGTACAACTTTGATCCTGTGAACGAACAACCACTACCAGGACGG
TTTGAATGGAAGAAGGTAGATGATTAGAAAACAACGAAAAAGGGTGGTGGGGTGATTAAT
AGTTAATACAAGACTATGTTAACATTATTCCTGCTAATTTATCGGTTTGATCTAATTATC
CATCATCCGTTTTTTTTAACTTTCCCAACATGTAAAGGAACTTAGGAGCGTTTTTTACAT
TGGTGTCTGTAACCATAAGTGGGCTGAAAAAGGGTTTGTGTAACACATAAATGATACCAA
TCCTTTTCAGGTTTAAAACAGATCACCTTAGTATTAGTAGTAGTAGTACTAAACTAATAA
GAGAAATTCTGTCAGGGTTTTAGGGGTTTAGAGTTCTTTTGGTTAATGGAGTGTATTCTG
TTGTTATAACTCTCTGTCCTGTAACCATAATAAAAATCTATCTATTTATGTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BD15TF U 1
AF RR4BD15JQ C 561
BS 1 773 RR4BD15TF
BS 774 1255 RR4BD15JQ

RD RR4BD15TF 777 0 0
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GCATTCCATGAAACGCGTCGGAAAATGGGAAAATACATAAAGAAGAACAAACTCGGCGGA
GAAGCTGCTATAGCTTTGATGGACGTTTCTCCTTCTTCTTCTTCGCTCGGTGTTCTCACT
CGAGCCAAGCCCTTAGCTCTCCAACGCCGCCTCCAAAAACTATCCTCTTCTCCTTCTCCT
AACCCACCGCCGTCGAAACAGAAGATAACTGATTCCTCAGGCAGCTCGTATCTTCAGCTG
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TCGGATTCGGTTGCAGAGAGTGCTGTGTTTGGGAAAGAGAAGGACTTTAACGGTGGAATC
AACAAAGAGCTTGATGGCAGTGAAAGCTTCAACAGGACCACAAGGGAATCCACACCATGC
AGTTTGATAAGGAAGCAGGAAACCATCACCACAAGCCCTGGATCGTCTACGAAGCTTCTT
AGCAATGGTATCAGTGGCGAGAGCAACCAAAGAGAAGATAGTTTCTCGGAGAGCCATCGT
CACCAACCAACTACACCTGAAATGGACGAGTTTTTCTCGGGTGCTGAAGAAGA
CAAC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR4BD15JQ 695 0 0
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AACCATCACCACAAGCCCTGGATCGTCTACGAAGCTTCTTAGCAATGGTATCAGTGGCGA
GAGCAACCAAAGAGAAGATAGTTTCTCGGAGAGCCATCGTCACCAACCAACTACACCTGA
AATGGACGAGTTTTTCTCGGGTGCTGAAGAAGAACAACAAAGGCAGTTCATTGAAAAGTA
CAACTTTGATCCTGTGAACGAACAACCACTACCAGGACGGTTTGAATGGAAGAAGGTAGA
TGATTAGAAAACAACGAAAAAGGGTGGTGGGGTGATTAATAGTTAATACAAGACTATGTT
AACATTATTCCTGCTAATTTATCGGTTTGATCTAATTATCCATCATCCGTTTTTTTTAAC
TTTCCCAACATGTAAAGGAACTTAGGAGCGTTTTTTACATTGGTGTCTGTAACCATAAGT
GGGCTGAAAAAGGGTTTGTGTAACACATAAATGATACCAATCCTTTTCAGGTTTAAAACA
GATCACCTTAGTATTAGTAGTAGTAGTACTAAACTAATAAGAGAAATTCTGTCAGGGTTT
TAGGGGTTTAGAGTTCTTTTGGTTAATGGAGTGTATTCTGTTGTTATAACTCTCTGTCCT
GTAACCATAATAAAAATCTATCTATTTATGTGTAG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9191Contig1 687 2 2 U
GGCCATTTGCCATTCACTGAGAAACAAGTAGTTACTCCAACAGGAGCTGTGTATAGCGGT
GTTGATTTCTGCAAGAAGCTCTGTGGGGTCTCAGTCATTCGAAGTGGTGAAAGCATGGAA
AACGCTTTACGCGCATGCTGCAAAGGGATTAAAATAGGGAAGATTCTTATTCATCGTGTG
GGTGACAATGGAATGCAGCTTATATATGAGAAGCTTCCAAGTGATATCTCCGAGCGCCAT
GTCCTGCTTATGGATCCTGTTCTAGGCACAGGTAACTCGGCAAGTCAAGCGATAGAACTA
CTCATACAGAAAGGAGTTCCTGAATCCCACATTATATTCCTCAATCTTATCTCGGCTCCA
GAAGGAATACATTGCGTCTGCAAACGGTTTCCATTGTTGAAGATTGTGACGTCGGAAATA
GATCTGTGTATAAACGAAGACTTTCGGGTTATACCAGGCTTGGGTGAGTTTGGTGATCGC
TACTTTGGTACTGACGACTAAAAGTACTTTTGTTTGGGAAATCGGCGCAATGGTTTGTTG
TGTCTTTGTGTGTGTAAAGTCTGTGTGTATGGCCATAAAGTTGCGACCATTTTATCATTA
CCTGAAAACACCACGGGATCATTTGGAGTTTCTTGGGTTTTGTACATAGTTTGATTTCGA
ACAACAGACCCCGTTAACACACTTTAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4DL73TF U 1
AF RR4DM81TF U 1
BS 1 686 RR4DL73TF
BS 687 687 RR4DM81TF

RD RR4DL73TF 686 0 0
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GGTGACAATGGAATGCAGCTTATATATGAGAAGCTTCCAAGTGATATCTCCGAGCGCCAT
GTCCTGCTTATGGATCCTGTTCTAGGCACAGGTAACTCGGCAAGTCAAGCGATAGAACTA
CTCATACAGAAAGGAGTTCCTGAATCCCACATTATATTCCTCAATCTTATCTCGGCTCCA
GAAGGAATACATTGCGTCTGCAAACGGTTTCCATTGTTGAAGATTGTGACGTCGGAAATA
GATCTGTGTATAAACGAAGACTTTCGGGTTATACCAGGCTTGGGTGAGTTTGGTGATCGC
TACTTTGGTACTGACGACTAAAAGTACTTTTGTTTGGGAAATCGGCGCAATGGTTTGTTG
TGTCTTTGTGTGTGTAAAGTCTGTGTGTATGGCCATAAAGTTGCGACCATTTTATCATTA
CCTGAAAACACCACGGGATCATTTGGAGTTTCTTGGGTTTTGTACATAGTTTGATTTCGA
ACAACAGACCCCGTTAACACACTTTA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4DM81TF 687 0 0
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GTTGATTTCTGCAAGAAGCTCTGTGGGGTCTCAGTCATTCGAAGTGGTGAAAGCATGGAA
AACGCTTTACGCGCATGCTGCAAAGGGATTAAAATAGGGAAGATTCTTATTCATCGTGTG
GGTGACAATGGAATGCAGCTTATATATGAGAAGCTTCCAAGTGATATCTCCGAGCGCCAT
GTCCTGCTTATGGATCCTGTTCTAGGCACAGGTAACTCGGCAAGTCAAGCGATAGAACTA
CTCATACAGAAAGGAGTTCCTGAATCCCACATTATATTCCTCAATCTTATCTCGGCTCCA
GAAGGAATACATTGCGTCTGCAAACGGTTTCCATTGTTGAAGATTGTGACGTCGGAAATA
GATCTGTGTATAAACGAAGACTTTCGGGTTATACCAGGCTTGGGTGAGTTTGGTGATCGC
TACTTTGGTACTGACGACTAAAAGTACTTTTGTTTGGGAAATCGGCGCAATGGTTTGTTG
TGTCTTTGTGTGTGTAAAGTCTGTGTGTATGGCCATAAAGTTGCGACCATTTTATCATTA
CCTGAAAACACCACGGGATCATTTGGAGTTTCTTGGGTTTTGTACATAGTTTGATTTCGA
ACAACAGACCCCGTTAACACACTTTAT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL9192Contig1 641 2 3 U
TTTTTTTTTGAGAAATACTGAAGCTGAAATAGTTTACGAACCATCTCAACATAGTCTGTC
TTAAACCAAAACTCTTGTCTGTTTTGACAGCAAACACAAAAAAAACCAAAACGGTCTGAT
AACAAAAAGGGAAATGCAACAAACCAAAAACAACTAAATATCTCAAGCAGCCTCTTCTTG
TTATCTTCACTCGTCTTCTTGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTGACAACAATATC
CAGCTGAAAAGCTCTCTCGACGATAGCCTTCCTCTTCTTGGTGGAAACGTTGTGTGCAAT
CTCGGTGCAGTAGGTCCTGTTGTGCATCATCAGCAACTCGAGGTCGCTCGTGTTGTGAAC
AACAAACTTCTTGAACCCATTTGGGAGGTAGTGGCGGGTCTTCTTGTCAAATCCGTAACC
AACATTGGGCATCAACGTGACACCCTTAAACTTCCTTCTGACCCTGGAGTCAATACCCTT
TGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTTACGGTGATTCTGCGGTCGCTCTGGGGCCTGATGAACTT
GGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTAAGCAAAGGAACGGCCATTTTTGCTGCTTC
CTAAGATCGATCTCGATGCGACTGGACTACTCCGTAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FL03TF C 1
AF RR4FL03JQ U 23
BS 1 22 RR4FL03TF
BS 23 603 RR4FL03JQ
BS 604 641 RR4FL03TF

RD RR4FL03TF 641 0 0
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TTAAACCAAAACTCTTGTCTGTTTTGACAGCAAACACAAAAGAAACCAAAACGGTCTGAT
AACAAAAAGGGAAATGCAACAAACCAGAAACAACTAAATATCTCAAGCAGCCTCTTCTTG
TTATCTTCACTCGTCTTCTTGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTGACAACAATATC
CAGCTGAGAAGCTCTCTCGACGATAGCCTTCCTCTTCTTGGTGGAAACGTTGTGTGCAAT
CTCGGTGCAGTAGGTCCTGTTGTGCATCATCAGCAACTCGAGGTCGCTCGTGTTGTGAAC
AACAAACTTCTTGAACCCATTTGGGAGGTAGTGGCGGGTCTTCTTGTCAGATCCGTAACC
AACATTGGGCATCAACGTGACACCCTTAAACTTCCTTCTGACCCTGGAGTCAATACCCTT
TGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTTACGGTGATTCTGCGGTCGCTCTGGGGCCTGATGAACTT
GGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTAAGCAAAGGAACGGCCATTTTTGCTGCTTC
CTAAGATCGATCTCGATGCGACTGGACTACTCCGTAAGCCC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR4FL03JQ 581 0 0
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TTTGACAGCAAACACAAAAAAAACCAAAACGGTCTGATAACAAAAAGGGAAATGCAACAA
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CTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTGACAACAATATCCAGCTGAAAAGCTCTCTCGACG
ATAGCCTTCCTCTTCTTGGTGGAAACGTTGTGTGCAATCTCGGTGCAGTAGGTCCTGTTG
TGCATCATCAGCAACTCGAGGTCGCTCGTGTTGTGAACAACAAACTTCTTGAACCCATTT
GGGAGGTAGTGGCGGGTCTTCTTGTCAAATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTGACA
CCCTTAAACTTCCTTCTGACCCTGGAGTCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTT
ACGGTGATTCTGCGGTCGCTCTGGGGCCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACCACC
TTCTTCGTAAGCAAAGGAACGGCCATTTTTGCTGCTTCCTA

QA 1 581 1 581
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9194Contig1 566 2 2 U
TGGCATTACGGCCGGGGGACCGCAGACGTTCCTGTATTATATTCACCTGTCCCATTTCAG
AACGCTGCAGTGTCTTCTCCTGAGATCAAGTGCAAGGAGATGGTAAAAACAGATCATACA
AGTTGCTGCGTGGTCGAGGTGAAGAGTGAATATCTTCCGCCATGGATTATCAGCAATATT
TGTGCAAACGTGGGTGCTAATGGACAAAACTTTGAAGCCAGCTTTTTGACCGAGCCAACC
TCGGTTAGCTTAAACATGGGTCTACTACCACAAATCTCTGGGAGAGCCGAGACAGAGACT
TCAGCCACCGAAGGCACAGGAGAAAGAGAAACAAAGGATGATAGTACTTCTGGCATTCAC
GGGGCCGTGATCTGCCCTCAGCTTCGATCAGGCTATCTAAAGAGCTTGAAGTATTGCAAC
AACTTGTACACTGTTTCTGTTTCGCTGTCTCCCTCTTGATTATGTATTTGCTTTGGATCC
TCTCTTTTTTAGGTTTCATCGTTATATAAATTATGACCTCCAAAGCCAACTAATCAACGG
AATGTTTATTTTTGTGCAATTTGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4H771JQB C 1
AF RR4H771TF U 1
BS 1 565 RR4H771TF
BS 566 566 RR4H771JQB

RD RR4H771JQB 566 0 0
TGGCATTACGGCCGGGGGACCGCAGACGTTCCTGTATTATATTCACCTGTCCCATTTCAG
AACGCTGCAGTGTCTTCTCCTGAGATCAAGTGCAAGGAGATGGTAAAAACAGATCATACA
AGTTGCTGCGTGGTCGAGGTGAAGAGTGAATATCTTCCGCCATGGATTATCAGCAATATT
TGTGCAAACGTGGGTGCTAATGGACAAAACTTTGAAGCCAGCTTTTTGACCGAGCCAACC
TCGGTTAGCTTAAACATGGGTCTACTACCACAAATCTCTGGGAGAGCCGAGACAGAGACT
TCAGCCACCGAAGGCACAGGAGAAAGAGAAACAAAGGATGATAGTACTTCTGGCATTCAC
GGGGCCGTGATCTGCCCTCAGCTTCGATCAGGCTATCTAAAGAGCTTGAAGTATTGCAAC
AACTTGTACACTGTTTCTGTTTCGCTGTCTCCCTCTTGATTATGTATTTGCTTTGGATCC
TCTCTTTTTTAGGTTTCATCGTTATATAAATTATGACCTCCAAAGCCAACTAATCAACGG
AATGTTTATTTTTGTGCAATTTGGTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4H771TF 565 0 0
TGGCATTACGGCCGGGGGACCGCAGACGTTCCTGTATTATATTCACCTGTCCCATTTCAG
AACGCTGCAGTGTCTTCTCCTGAGATCAAGTGCAAGGAGATGGTAAAAACAGATCATACA
AGTTGCTGCGTGGTCGAGGTGAAGAGTGAATATCTTCCGCCATGGATTATCAGCAATATT
TGTGCAAACGTGGGTGCTAATGGACAAAACTTTGAAGCCAGCTTTTTGACCGAGCCAACC
TCGGTTAGCTTAAACATGGGTCTACTACCACAAATCTCTGGGAGAGCCGAGACAGAGACT
TCAGCCACCGAAGGCACAGGAGAAAGAGAAACAAAGGATGATAGTACTTCTGGCATTCAC
GGGGCCGTGATCTGCCCTCAGCTTCGATCAGGCTATCTAAAGAGCTTGAAGTATTGCAAC
AACTTGTACACTGTTTCTGTTTCGCTGTCTCCCTCTTGATTATGTATTTGCTTTGGATCC
TCTCTTTTTTAGGTTTCATCGTTATATAAATTATGACCTCCAAAGCCAACTAATCAACGG
AATGTTTATTTTTGTGCAATTTGGT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL9195Contig1 586 2 3 U
GGAAAAAAAACTGAATTGAGAAATTTGATTCATATCACAGGTCACCAGATTTTTATATAA
TTGATTCTTCTAGCTAGGTTCCATTTCGAGAGTCCGACATTTTTTTTGAGAGAGACAGTA
AATATGTACAATGCATTTAGCATCTTTCTTCACCCAAACAACAACAACAAAAAAAACGAT
CATCTTCGTTTTACAAAACTTGATTTCGAGGCTGAGACTCTCTCATCCACAATCGCCGTC
CGCTAGTCTCCTTATCCAGATCTATCGCCACATAGCAAATCCTGTTGTGGTTCTTCTTTT
TTTTTTTAGTATAAAAAAAAAGGAGAAGAGCAAACCTGAAATCTGAAAATTCAAATCAGA
TTCAATTACACTCGGTGGCTTTCGACATGATCGATAGCCTGCTCGGACGAGGCTGATACG
CAGCTCTCCTTTTCAGATGATGCGACGAAGGCCTTATCAGAGTCGTCAACGCTCTTCTCA
CCCACTCTCCTTCAACGCCACCGATCCTCACAAGCGAGTTCGTCATCGCAGATCTCCGCA
TATTCAAACTGCTCGTCGGATACGACGACGTAGCGCCTTGACCGTG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4BG31TF C 1
AF RR4BG31JQ U 2
BS 1 3 RR4BG31TF
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BS 569 586 RR4BG31TF

RD RR4BG31TF 586 0 0
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TTGATTCTTCTAGCTAGGTTCCATTTCGAGAGTCCGACATTTTTTTTGAGAGAGACAGTA
AATATGTACAATGCATTTAGCATCTTTCTTCACCCAAACAACAACAACAAAAAAAACGAT
CATCTTCGTTTTACAAAACTTGATTTCGAGGCTGAGACTCTCTCATCCACAATCGCCGTC
CGCTAGTCTCCTTATCCAGATCTATCGCCACATAGCAAATCCTGTTGTGGTTCTTCTTTT
TTTTTTTAGTATAAAAAAAAAGGAGAAGAGCAAACCTGAAATCTGAAAATTCAAATCAGA
TTCAATTACACTCGGTGGCTTTCGACATGATCGATAGCCTGCTCGGACGAGGCTGATACG
CAGCTCTCCTTTTCAGATGATGCGACGAAGGCCTTATCAGAGTCGTCAACGCTCTTCTCA
CCCACTCTCCTTCAACGCCACCGATCCTCACAAGCGAGTTCGTCATCGCAGATCTCCGCA
TATTCAAACTGCTCGTCGGATACGACGACGTAGCGCCTTGACCGTG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR4BG31JQ 567 0 0
GG
AAAAAAACTGAATTGAGAAATTTGATTCATATCACAGGTCACCAGATTTTTATATAATTG
ATTCTTCTAGCTAGGTTCCATTTCGAGAGTCCGACATTTTTTTTGAGAGAGACAGTAAAT
ATGTACAATGCATTTAGCATCTTTCTTCACCCAAACAACAACAACAAAAAAAACGATCAT
CTTCGTTTTACAAAACTTGATTTCGAGGCTGAGACTCTCTCATCCACAATCGCCGTCCGC
TAGTCTCCTTATCCAGATCTATCGCCACATAGCAAATCCTGTTGTGGTTCTTCTTTTTTT
TTTTAGTATAAAAAAAAAGGAGAAGAGCAAACCTGAAATCTGAAAATTCAAATCAGATTC
AATTACACTCGGTGGCTTTCGACATGATCGATAGCCTGCTCGGACGAGGCTGATACGCAG
CTCTCCTTTTCAGATGATGCGACGAAGGCCTTATCAGAGTCGTCAACGCTCTTCTCACCC
ACTCTCCTTCAACGCCACCGATCCTCACAAGCGAGTTCGTCATCGCAGATCTCCGCATAT
TCAAACTGCTCGTCGGATACGACGA

QA 3 567 3 567
DS 



AS 1 2

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CTGGAGATGTCTGTCTTTGATGATGATTCGTTTGTTATACTCGGAGAGGATGCATCTGAG
TCTGTTCCTCCGGTCTCTGCCCAAGTAGATGATTCGATCGATGATGACGTTTTCGCGGCG
CCGTCTCAGACTACGGCGGTTACTCTAACGGAGACGACGGTCCTATCTTGCCTCCTCCTT
CGGAGATGGAGTCTGATGAGTGAGCTGCCCTCAGAGAATGGAGAAGACAGAATGCGATTC
AACTTGAGGAGAAGGAGAAGAGAGAAAAGGAGTTGAGGAACCAAATAATCGAGGAAGCTG
ATCAGTTCAAAGAGGAGTTCCATAAGAAGAGGGAGTTAGCTTGTGAAAACAACAAAGCAG
CCAACAGAGAGAAAGAAAAGCTGTATGTGGAAACCCAAGAGAAGTTTTACGCGGAAGCAA
GCAAGAACTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTAGTGCCTAGAGAGGTTCCAACTATAGAGA
AAACAAGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGATCCCAAGAAGCCTACTACAATCTCTGTGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B268TF U 1
AF RR4B268JQ C 86
BS 1 775 RR4B268TF
BS 776 890 RR4B268JQ

RD RR4B268TF 775 0 0
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CGGAGATGGAGTCTGATGAGTGAGCTGCCCTCAGAGAATGGAGAAGACAGAATGCGATTC
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CCAACAGAGAGAAAGAAAAGCTGTATGTGGAAACCCAAGAGAAGTTTTACGCGGAAGCAA
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AAACAAGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGATCCCAAGAAGCCTACTACAATCTCTGTGA
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QA 1 775 1 775
DS 

RD RR4B268JQ 805 0 0
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CCCCAAACTCACTCCTCAACCTCCTCCATTTGAGGCTCCTCCTCCAAAGAATGTTCCTCA
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QA 1 805 1 805
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGTTGTTTCCTAGTCTCCACTCAACCGGATCCACCCATCTATTCATCATCAACACTAGAA
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CATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RR4EI41TF U 1
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AGCAATCTTGAGAGCAACATTGTGATTTATCAAACTCCCATCCATAGAGTTTGTGGTTTC
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TTCTTGTGGGGTTGTTTATTCGAACAAACCACTTGAATCCATCATCCATCCTCACGCCAC
CTCTCATCCATAGATCCATCAAGTTGGTTATACGACCAAGTGGTGAATCCCATCCTCCAT
TGTTGTTTCCTAGTCTCCACTCAACCGGATCCACCCATCTATTCATCATCAACACTAGAA
CTCTCCATCTCAAACCATCTCTCATCAAACCGGTTCTTGGATTCACTCATCTAGCTCACC
AGTTTGAGAAGGCTCCCTTTGGTGCCTATATCATTTTGGTATCAGAGCCGAAAGGGCTCC
ATATCTGGTTATCTCTTTCCTTTTCATTTAGATCATTTCATTTTGTCAAGAAAAACCCAT
AAAAATATTTGAGTTTTGTCTGCTTTTCTTATTCACCATTGTTGCTAGCTTTGAGTTCTT
AGTTATCTATTGAAAA*GAAAAGAGA
G

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR4EI41JQ 617 0 0
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GTTTGTGGTTTCACCTCGATCCATCTTGATTGCGAGAAACAATCATCTTCATTCCATCAG
TTCATCACTTTGTTCTTGTGGGGTTGTTTATTCGAACAAACCACTTGAATCCATCATCCA
TCCTCACGCCACCTTTCATCCATAGATCCATCAAGTTGGTTATACGACCAAGTGGTGAAT
CCCATCCTCCATTGTTGTTTCCTAGTCTCCACTCAACCGGATCCACCCATCTATTCATCA
TCAACACTAGAACTCTCCATCTCAAACCATCTTTCATCAAACCGGTTCTTGGATTCACTC
ATCTAGCTCACCAGTTTGAGAAGGCTCCCTTTGGTGCCTATATCATTTTGGTATCAGAGC
CGAAAGGGCTCCATATCTGGTTATCTCTTTCCTTTTCATTTAGATCATTTCATTTTGTCA
AGAAAAACCCATAAAAATATTTGAGTTTTGTCTGCTTTTCTTATTCACCATTGTTGCTAG
CTTTGAGTTCTTAGTTATCTATTGAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTCGATTTGATTTGTTGT
TGATCCGCATTACATCC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL9199Contig1 1030 2 8 U
GTGGTAAGGAGTAGAGATAAAGAGCTGCTTCGAACTTTCTATCTCTCTCTCTCTCCACAC
AGTTCTTCATCTTTCTCTCTCTGAATCTGCCGTCACTAGGAAGCTTCTTCTTTACATGCA
TTGTTCTTTCGTCTTCCTCCTCCTCTCTTGAAAAAAAAACCGCTTCTCCGATTCTCTCTG
CTGCGATGGCCACCGCCACTGGTGAAGGGAGGAAGCAGCAATTCGCAGATAGTAACTCAC
CACTCAAGTATCCAAGCTTCAAGCCACCACCTAAGCCTAGCCGCTGCGCCATAGATGTTT
CTCCTCTTCTTCTTGTTAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCTGCATTCCCTTTGCAACAAG
ACACTTCACTTGTCCAAGACGTGTGTACTATCTCAGTCTTACCTGACGAAAGCAATACCC
TCATCCCTCACTTCACTCTCTTGAGCTTCGTCAAGGCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGA
TGTTCATCGATGCCCAACTCAATTGTCAGAAGACTCAGAACCGCATCAATGTTCTGCTTG
GTGGCACTGATTCCTACCAGTCCTGCGTCGTCGACATTAACCTCGAGAAAAGCAACGGTG
GTGAGGCCCACGACGGAGGAGGAGTCCTTGGAAATGTCAAGTCCGAGACTCTACATATGC
AAAAGGTATTGCAGAGACAAGCAAGCATGACCACTGACAAAACTATCTCCGAGAGATGCC
ATGATGCACCGATCAACAGGTGGAGAAGATACAAGCGTGCTGCTTCATTTGATTCTAGGA
AAGTCGTCATCCTTTTCTCCATCTTATCAAGTGTGGGAACGCTGATATTGATCTACCTCA
CACTGAGAGTGAGGCAAAGCGGAGACAGTAGCTTCAATCATATCTAGTCAAAACTGTTAA
CACTGTCCTCCTTTCTTCTTCTTTGCTGTCTCTGTTTTGAATCTCTTTCTCCCACAAAAC
TCAAGTCTTCTGTTCCTAGCTTCATAATGTTGATAAGTCAACACTTTCTCTGTGAATAAC
ACTTGCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4A789TF U 1
AF RR4A789JQ C 571
BS 1 809 RR4A789TF
BS 810 810 RR4A789JQ
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BS 830 849 RR4A789TF
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RD RR4A789TF 849 0 0
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CTGCGATGGCCACCGCCACTGGTGAAGGGAGGAAGCAGCAATTCGCAGATAGTAACTCAC
CACTCAAGTATCCAAGCTTCAAGCCACCACCTAAGCCTAGCCGCTGCGCCATAGATGTTT
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TCATCCCTCACTTCACTCTCTTGAGCTTCGTCAAGGCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGA
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GTGAGGCCCACGACGGAGGAGGAGTCCTTGGAAATGTCAAGTCCGAGACTCTACATATGC
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ATGATGCACCGATCAACAGGTGGAGAAGATACAAGCGTGCTGCTTCATTTGATTCTAGGA
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CACTGAGAG

QA 1 849 1 849
DS 

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GTGTGGGAACGCTGATATTGATCTACCTCACACTGAGAGTGAGGCAAAGCGGAGACAGTA
GCTTCAATCATATCTAGTCAAAACTGTTAACACTGTCCTCCTTTCTTCTTCTTTGCTGTC
TCTGTTTTGAATCTCTTTCTCCCACAAAACTCAAGTCTTCTGTTCCTAGCTTCATAATGT
TGATAAGTCAACACTTTCTCTGTGAATAACACTTGCTGAG

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

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GGATGTTACTGTTGGTTGGGTTCTTGGATGTCTTGGAGAGCTTAACGAAGATGAAACGTC
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GAGGTGATGGTACTGTTGGTTGGGGTGGTTCGTTCCCTTTTGCTTGGAGATCTGCTGTTA
AAAGAACACTCCATCGTGCAAGCATGGGTCCAGTTGCTCGCCTAGATAGCTGGAAGATTC
TAGTGTCAATGCCATCTGGAGAAGTAGTGGATCCTCCTTACTCTTTAAAACCAGCGGAGG
AAAACCAACTTGACGAGGGTTTGGAGGCTGGAGTAGACGCGCCACCAGTGGCGAAGACCT
ATGAAGGAGTGTTCTACAATTACTTAAGCATTGGTATGGATGCTCAAGTTGCGTATGGCT
TCCATCATCTTCGCAACACTAAACCATATCTTGCTCAAGGCCCTATCTCAAACAAGCTTA
TTTATTCTGGCTTTAGTTGCACTCAGGGTTGGTTTTGCACACCTTGTGTCAGTGATCCAG
GTTTAAGGGGACTTGGGAACATATTGAAAATCCACATCAAGAAGGTTAACTGCTCTCAAT
GGGATAGATCGCCGTCCCTAAAAATGTGAGATCAGTTGTGGCATTGAATCTCCAAAGCTA
TGGAAGTGGAAGTCATCCATGGGGTAACTTAAAACCAGACTACCTAGAGAAGAGAGGATT
TGTGGAGGCACATTCTGATGATGGTTTGATAGAAATCTTTGCTTTCAAGCATGGATGGCA
TGCGTCATTTGTCATGACTGAGCTCATTTCAGCCAAGCACATAGCTCAGGCTGCTGCTGT
TAGATTCGAGCTAAGAGGAGGTGACTGGAAAGATGCCTTCTTGCAAATGGATGGAGAGCC
ATGGAAGCAACCTATGAATCCTGAGTACTCAACGTTTGTGGAGATTAAAAAGGTTCCATT
TCAATCTCTGATGATAAATGGTGCATGATTGCTATTCAAAGCTGGATTCTTTTTAGAAAA
AAAAGCTAATTGGTTTGGTAATTTGGATATGATTATTTAGACAGCATAGATAGCTGCTAT
GCTTATTGTGACTGTTGGTTGTTGTAAATCTCTTGTGTTGTGAGAAATGAAGTTTGCGTT
TGTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DB65TF U 1
AF RR4DB65JQ C 553
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BS 581 663 RR4DB65TF
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GTT

QA 1 663 1 663
DS 

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QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4A378JQD C 1
AF RR4A378TFB U 1
BS 1 696 RR4A378TFB

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QA 1 696 1 696
DS 

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CACAAGACATGTTTCAAGTGCGCTCACGGTGGCTGCACGCTGACTCATTCCTCGTACGCT
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GAGTCTTGAAAACAAAAAACATCTTCCGGTGATCAGTTTGTGAGTGATTTGAATTCAATG
TTGCGACCAAAGATTTGATTTAATTTGTAATGAGTTATTGTTTCCATATGGACATTATTT
AATATTTTGTTTTCGTTATTTATACATAATTCACAC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL9202Contig1 905 2 4 U
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TTATGTTTTATTTTCTGTAAAAACTTTATCGTAGCTTTATGTTTGCTTTTGCATGTATTG
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AGTTATAGTTCTAAACTATTACCTTCTTTTTACCGATAAATTACCATCACCCGTCGTGGT
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CAAAAAACTAAATTTTTATTCTATAGTTAATGCAGTGACAAAAAAAATTTTTTTAATGCA
GTGAC


BQ
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10 10 10 10 10 

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TTT

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DS 



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BQ
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G
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BQ
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10 10 10 10 10 10 

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AATAAATTCT

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ACACCCTCAAGGGACATGAGGAGTCAGTAGCAAAACTAAAGGGCTTGGACATTGAAACTC
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ATCTTTTTGCGTTGTTGTTTTCTAGTATTTTTTTTCCTTTTCTCACGACCGCTTGAGGTT
ATTGTGAAAGAACTTGCTATGTTTAGCAAGAGAAGTCTACTAAATTCAAGTTTGCAAGAG
AATAAATTCTTGAACCCGCCAAAAAGTAATATTTTGAAACTTTTATAAATGAAATTGTTT
TTTCCG

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL9205Contig1 1265 2 2 U
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AAATGGATAGTCCGACGAGCATAAGCAGTAAACCTCCACCGGAGACTCTCTCCCCGTGCG
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TAACAAACTCTTCATTCCTTCAAACCGAATCAGATCTTCTCTCCGCCGACGAGCTTTTCC
ACGACGGCGTTCTCCTCCCTCTTGACCTCCTCTCCATCAAATCCGAACCTCAACCCGACC
CGAATGTCTCGGAGTGCGACCCGGATCCATCTCCTTCGACCGATGCTTTGATCACAGAGC
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CGCCGTGTTCCCGTAGCAACTCCACAGGCGAGTCGAAGTCGAGGAAATGGCCGAGCAGTC
CCGGTCGTAACGGCGTGCATCTTGGTCGGAACAGTCCAGTCTGGCAAGTCCGACGTGGAA
GTGGAGCTCCGACAGGGAAAACGATATCCGAGCCGGTGGGTCGGCTTTCGGGTAAAAGGG
AAGTTCCCGAGGCGCGTAGGGGTAAAACTGGAATGGAGAGCAATAAAGCAAAAGTCATAA
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GTGGAAGTAGTAACATTGGGAGTGATGATAATATCGCCAATGTTAATAATAATCCCAATC
CTAATGGTTTATTTGGTCTTCGTAATCTTTTCATTAAGAAAGTTCATTGACTTTGTTTTG
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GCTACTTTTGCTGTTAGTACGATGTGTGGATTTGGGCAAATATTCGTGTTTGCTTATTAT
ATCATGTAAATTAAGAATGAGAAAGCTTTCTAATATAAAATGTTAAACAGTTATACTTAT
CAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR4A463TF U 1
AF RR4A463JQ C 426
BS 1 815 RR4A463TF
BS 816 1265 RR4A463JQ

RD RR4A463TF 820 0 0
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ACGACGGCGTTCTCCTCCCTCTTGACCTCCTCTCCATCAAATCCGAACCTCAACCCGACC
CGAATGTCTCGGAGTGCGACCCGGATCCATCTCCTTCGACCGATGCTTTGATCACAGAGC
AGAAAACCGAAACCGTACCCGGTTTAGGACCCGAGTCGACCCGTGAACCGACGGTTTCGA
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GCTCAGGAGCGGAGCTGAATATCAACATTTGGCCGTTTTCGAGAAGCAGATCCGCTGGCA
ACAACGTGACCCGACCCAGAATGTCGTTTGGGGCTCCGACGACCCGGAAAGTCAGCAGCG
CGCCGTGTTCCCGTAGCAACTCCACAGGCGAGTCGAAGTCGAGGAAATGGCCGAGCAGTC
CCGGTCGTAACGGCGTGCATCTTGGTCGGAACAGTCCAGTCTGGCAAGTCCGACGTGGAA
GTGGAGCTCCGACAGGGAAAACGATATCCGAGCCG
TGGGT

QA 1 815 1 815
DS 

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GACAAAAAGAAGAAAGAGAAGAAGTCCGGTTCGGGTACTACGGGTCCTGGTTCGGGCTCA
GGAGCGGAGCTGAATATCAACATTTGGCCGTTTTCGAGAAGCAGATCCGCTGGCAACAAC
GTGACCCGACCCAGAATGTCGTTTGGGGCTCCGACGACCCGGAAAGTCAGCAGCGCGCCG
TGTTCCCGTAGCAACTCCACAGGCGAGTCGAAGTCGAGGAAATGGCCGAGCAGTCCCGGT
CGTAACGGCGTGCATCTTGGTCGGAACAGTCCAGTCTGGCAAGTCCGACGTGGAAGTGGA
GCTCCGACAGGGAAAACGATATCCGAGCCGGTGGGTCGGCTTTCGGGTAAAAGGGAAGTT
CCCGAGGCGCGTAGGGGTAAAACTGGAATGGAGAGCAATAAAGCAAAAGTCATAAACTTG
AACGTGCCTATGTGCATCGGTTATCGGAGCCGGTTAAGCTGCAGAAACGACCAGAGTGGA
AGTAGTAACATTGGGAGTGATGATAATATCGCCAATGTTAATAATAATCCCAATCCTAAT
GGTTTATTTGGTCTTCGTAATCTTTTCATTAAGAAAGTTCATTGACTTTGTTTTGTAGTA
TTATAGTAAACCCCTATTAATAGTGTCCCCTCAAAGGGTCTATTTATTTTTATTTGCTAC
TTTTGCTGTTAGTACGATGTGTGGATTTGGGCAAATATTCGTGTTTGCTTATTATATCAT
GTAAATTAAGAATGAGAAAGCTTTCTAATATAAAATGTTAAACAGTTATACTTATCAAAC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TAAGAAAGAAGAAGAAAAAGACAGAATCCGCTACAATGGGAGGTGAAGGAGAAGATCTAG
AGCCGCTCTTCGATTACCATCGTGTTCAGCCTCCGAATTTCGTTTGCATTGACGACGATG
ATGATGATGATGATTCTGATGTCTCGGAGGTTCCTGTCAAGAAGAGAGCCAAAGCTTCCC
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CGAGAAGTTTGAACGGGTTTTCAAAATGTACACTGACAAAGTAAAGCTCGACCCGCAAAA
TCTTGTATTTACTTTTGACGGTGACAAGATTGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GV18TF U 1
AF RR4GV18JQ C 172
BS 1 582 RR4GV18TF
BS 583 694 RR4GV18JQ

RD RR4GV18TF 582 0 0
GGGAGTTCCATTCCTCAACAAGCTCCACATCGATCTGGGGTTTCTGATTAGACAGGCGAG
TAAGAAAGAAGAAGAAAAAGACAGAATCCGCTACAATGGGAGGTGAAGGAGAAGATCTAG
AGCCGCTCTTCGATTACCATCGTGTTCAGCCTCCGAATTTCGTTTGCATTGACGACGATG
ATGATGATGATGATTCTGATGTCTCGGAGGTTCCTGTCAAGAAGAGAGCCAAAGCTTCCC
ACACAGTAGTAAAGAAGGATGAAGAAGTGAAAGTGATTGAAGTGGCGGGTGAGAAGACTG
GTTGCTTCCACCGCCAAAGGTTGTCTTCCATAAAACCAAAGCGTCTGGTGAAGATTCCAC
CATTAAAGCTTTGAGATCGAAGAAGATGGAGCTCATGTCATTCACAAAAAACGTAGTAGA
TGTGATGCAGGAAGCAGAGGAGTCTGCTAAAAAGGAAGCTCAAGTATTATCACTCAAACC
ATCTTCGGAAGCTGCTTCTGCTGCTCAGGAACCACCAGGTCCGCCTGTTAATGACAGGCC
CAAGATTGTTATTACAATACAGGACAAATCTGGACAGAAGCA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR4GV18JQ 523 0 0
ACGACGATGATGATGATGATGATTCTGATGTCTCGGAGGTTCCTGTCAAGAAGAGAGCCA
AAGCTTCCCACACAGTAGTAAAGAAGGATGAAGAAGTGAAAGTGATTGAAGTGGCGGGTG
AGAAGACTGGTTGCTTCCACCGCCAAAGGTTGTCTTCCATAAAACCAAAGCGTCTGGTGA
AGATTCCACCATTAAAGCTTTGAGATCGAAGAAGATGGAGCTCATGTCATTCACAAAAAA
CGTAGTAGATGTGATGCAGGAAGCAGAGGAGTCTGCTAAAAAGGAAGCTCAAGTATTATC
ACTCAAACCATCTTCGGAAGCTGCTTCTGCTGCTCAGGAACCACCAGGTCCGCCTGTTAA
TGACAGGCCCAAGATTGTTATTACAATACAGGACAAATCTGGACAGAAGCAGTTCCGGGT
TTTTGCGGACGAGAAGTTTGAACGGGTTTTCAAAATGTACACTGACAAAGTAAAGCTCGA
CCCGCAAAATCTTGTATTTACTTTTGACGGTGACAAGATTGAT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9209Contig1 838 2 12 U
GAACAAAGGCTGTGGCGTGGGTTGGTGAGGCTGGTGGCGCCTACAACAGCGGGCGTAACC
TTGTCTCTAATGCTTTCGTTTATAGTTTCTGGTACCTGGGCCAACTTGGTATGGCATCAG
TTTATGATACAAAAACATATTGTAGACAGTCTCTAATCGGAGGAAACTATGGCCTGCTAA
ATACTACTAATTTCACTCCCAACCCTGACTATTACAGTGCTCTGATCTGGCGACGACTTA
TGGGAAGAAAGGCACTGTTCACAAGCTTTTCCGGAACAAAGAAGATACGTTCATACACCC
ATTGTGCAAGACCATCGAAAGGGATCACAGTTTTACTGATGAACCTTGACAACACCACAA
CAGTTGTTGCGAACGTAGAGCTAAATAACACTTTCAGTCTAAGACACAGGAAGACGTCGT
CTCGGAAAATAGCCAGGACTTCCCAGCTACCTTGGGTCTCCAATGGTGAAACCCAAAGAG
AAGAGTACCATTTGACAGCAAAGGATGGAGATCTACACAGCCAGACTATGCTACTCAACG
GTAATGCACTGCAGGTTAATTCCACTGGTGACATACCTCCACTGGAACCGATATATGTAA
ACTCAGCAGAGCCAATAACAATAGCTCCATACTCCATTGTGTTTGTGCATATGCCGAACG
TTGTTGTGCCTGCATGTGCTTAGGGAGCTGCTGCATGTTGGACTTTTAAGACAGCTCAAT
TCAATTATTTGATTCGAAAAGATAAAAAAAAAGTGTACTTACATATCTTTCAGATAAAAC
GTTATAGACCACAAAATAATTCTGATTCATGGGAAATAATAGAAAGTGTTCAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CE31TF U 1
AF RR4CE31JQ C 194
BS 1 708 RR4CE31TF
BS 709 709 RR4CE31JQ
BS 710 718 RR4CE31TF
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BS 720 733 RR4CE31TF
BS 734 734 RR4CE31JQ
BS 735 739 RR4CE31TF
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BS 741 751 RR4CE31TF
BS 752 752 RR4CE31JQ
BS 753 778 RR4CE31TF
BS 779 838 RR4CE31JQ

RD RR4CE31TF 791 0 0
GAACAAAGGCTGTGGCGTGGGTTGGTGAGGCTGGTGGCGCCTACAACAGCGGGCGTAACC
TTGTCTCTAATGCTTTCGTTTATAGTTTCTGGTACCTGGGCCAACTTGGTATGGCATCAG
TTTATGATACAAAAACATATTGTAGACAGTCTCTAATCGGAGGAAACTATGGCCTGCTAA
ATACTACTAATTTCACTCCCAACCCTGACTATTACAGTGCTCTGATCTGGCGACGACTTA
TGGGAAGAAAGGCACTGTTCACAAGCTTTTCCGGAACAAAGAAGATACGTTCATACACCC
ATTGTGCAAGACCATCGAAAGGGATCACAGTTTTACTGATGAACCTTGACAACACCACAA
CAGTTGTTGCGAACGTAGAGCTAAATAACACTTTCAGTCTAAGACACAGGAAGACGTCGT
CTCGGAAAATAGCCAGGACTTCCCAGCTACCTTGGGTCTCCAATGGTGAAACCCAAAGAG
AAGAGTACCATTTGACAGCAAAGGATGGAGATCTACACAGCCAGACTATGCTACTCAACG
GTAATGCACTGCAGGTTAATTCCACTGGTGACATACCTCCACTGGAACCGATATATGTAA
ACTCAGCAGAGCCAATAACAATAGCTCCATACTCCATTGTGTTTGTGCATATGCCGAACG
TTGTTGTGCCTGCATGTGCTTAGGGAGCTGCTGCATGTTGGACTTTTA*GACAGCTCA*T
TCAATTATTTGAT*CGAAA*GATAAAAAAAA*GTGTACTTACATATCTTTCAGATAAA
CGTATAGACCACA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR4CE31JQ 645 0 0
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ACTGTTCACAAGCTTTTCCGGAACAAAGAAGATACGTTCATACACCCATTGTGCAAGACC
ATCGAAAGGGATCACAGTTTTACTGATGAACCTTGACAACACCACAACAGTTGTTGCGAA
CGTAGAGCTAAATAACACTTTCAGTTTAAGACACAGGAAGACGTCGTCTCGGAAAATAGC
CAGGACTTCCCAGCTACCTTGGGTCTCCAATGGTGAAACCCAAAGAGAAGAGTACCATTT
GACAGCAAAGGATGGAGATCTACACAGCCAGACTATGCTACTCAACGGTAATGCACTGCA
GGTTAATTCCACTGGTGACATACCTCCACTGGAACCGATATATGTAAACTCAGCAGAGCC
AATAACAATAGCTCCATACTCCATTGTGTTTGTGCATATGCCGAACGTTGTTGTGCCTGC
ATGTGCTTAGGGAGCTGCTGCATGTTGGACTTTTAAGACAGCTCAATTCAATTATTTGAT
TCGAAAAGATAAAAAAAAAGTGTACTTACATATCTTTCAGATAAAACGTTATAGACCACA
AAATAATTCTGATTCATGGGAAATAATAGAAAGTGTTCAGAAAAA

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL9210Contig1 500 2 1 U
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AATGAAGTTCTTGTTCCAGTGTCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCA
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GCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGC
AGAGAAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTTTATT
TTAATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGT
CTTTTTTTTGCCAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTA
CTCTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTTCAACGTGATTATGCTTTAATTTTAT
AAAAATCCACTTATGATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FG56TF U 20
AF RR4F112TF U 1
BS 1 500 RR4F112TF

RD RR4FG56TF 443 0 0
GG
GTAAGATAGAGAGAAGGTGATAAGTGAGAGAGAGAGAAAAATGAAGTTCTTGTTCCAGTG
TCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCAGGGTAAACCAAAAGCTGTAGA
TTCAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGAAGCCTGAGAAGAAAGAAGAAAA
GAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAGAGAAGGCCGAGTGAAAGCT
CTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTTTATTTTAATTTCGATGCTATGTGAT
GCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGTCTTTTTTT*GCCAATATGGTT
TATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTACTCTTATGAATTCGTGAAAGC
TATGATTATTGTTTCAACGTG

QA 3 443 3 443
DS 

RD RR4F112TF 500 0 0
GGAGAATGTGTGTGTGAGATTGTAAGATAGAGAGAAGGTGATAAGTGAGAGAGAGAGAAA
AATGAAGTTCTTGTTCCAGTGTCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCA
GGGTAAACCAAAAGCTGTAGATTCAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGAA
GCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGC
AGAGAAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTTTATT
TTAATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGT
CTTTTTTTTGCCAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTA
CTCTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTTCAACGTGATTATGCTTTAATTTTAT
AAAAATCCACTTATGATTAG

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL9211Contig1 738 2 2 U
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GAAAGAGAGAGAACCCAGAAAAAAATACAAAAAGAAAAAGCAACAAGAAGAATCGAATCT
ATCTCTGTTAGTTTTCAAAAGGCAAAATGTTTGATGGTCTGTTTAAACCCAAATTCTACA
CGAAATGCAAGTACTTGGTCAAGATAACGAAAACAAGAGTGGAGACGGTGAAGAGAAAGA
AAAACTCTGTTTGCAAATATTTGAAGAAGGGCATTGTCGATCTTCTCAACAACAGCCTCG
ATTACAATGCATACGGCAGGGCAGAAGGACTTATTGAGGAGAAAAGGAGGTTGTCCTGTT
ATGAGTTGTTGGAGCAATTCTGCGTATGTGTTGCATCCAATGTTTCTCTCTTACAGAGAT
CCAGTAAATGCCCTGAGGAGTGTCGGGAGGCCATCTCTTCCCTTGTATATGCGGCCGCTA
GAGTCTCTGAAGTGCCTGAGCTTCGCGATCTCAGGTCTATGTTTGCTGACAGATACGGGA
GTAATTCACTTGAACAGTTTGTGAACCCTGAGTTTGTGGAGAGCTTCAAAGCAGCGCCCC
CGTCAAAGGAAATGAAGGTAACGCTTCTCCATGAGATTGCCATAGAATACTCCATCAAGT
GGGACGCCAAGTCTTTAGAGCAGAGGCTCTACACACCACCTGCTGCTGCTGCTGCTGAAG
AGCCGCAAAAACAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EM48TF U 1
AF RR4BR39TF U 472
BS 1 614 RR4EM48TF
BS 615 738 RR4BR39TF

RD RR4EM48TF 614 0 0
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GAAAGAGAGAGAACCCAGAAAAAAATACAAAAAGAAAAAGCAACAAGAAGAATCGAATCT
ATCTCTGTTAGTTTTCAAAAGGCAAAATGTTTGATGGTCTGTTTAAACCCAAATTCTACA
CGAAATGCAAGTACTTGGTCAAGATAACGAAAACAAGAGTGGAGACGGTGAAGAGAAAGA
AAAACTCTGTTTGCAAATATTTGAAGAAGGGCATTGTCGATCTTCTCAACAACAGCCTCG
ATTACAATGCATACGGCAGGGCAGAAGGACTTATTGAGGAGAAAAGGAGGTTGTCCTGTT
ATGAGTTGTTGGAGCAATTCTGCGTATGTGTTGCATCCAATGTTTCTCTCTTACAGAGAT
CCAGTAAATGCCCTGAGGAGTGTCGGGAGGCCATCTCTTCCCTTGTATATGCGGCCGCTA
GAGTCTCTGAAGTGCCTGAGCTTCGCGATCTCAGGTCTATGTTTGCTGACAGATACGGGA
GTAATTCACTTGAACAGTTTGTGAACCCTGAGTTTGTGGAGAGCTTCAAAGCAGCGCCCC
CGTCAAAGGAAATG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR4BR39TF 267 0 0
G
GGCCGCTAGAGTCTCTGAAGTGCCTGAGCTTCGCGATCTCAGGTCTATGTTTGCTGACAG
ATACGGGAGTAATTCACTTGAACAGTTTGTGAACCCTGAGTTTGTGGAGAGCTTCAAAGC
AGCGCCTCCGTCAAAGGAAATGAAGGTAACGCTTCTCCATGAGATTGCCATAGAATACTC
CATCAAGTGGGACGCCAAGTCTTTAGAGCAGAGGCTCTACACACCACCTGCTGCTGCTGC
TGCTGAAGAGCCGCAAAAACAAAAAA

QA 2 267 2 267
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9213Contig1 674 2 1 U
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TTCAACATTCTCTCCTCATTTTTCGTATATATAACTCGATCTTTGAAAATGGTTAAGGGA
ATGCCCAAGGCATTGTGGATTGTTGTGGCCACCGTGTTTGCAGTAGCCGCGGCGGTCGCA
CAAGTGGCTTGTGGACAACAAGCACCGTGTTACTTCGTGTTCGGAGCTCTCAATTCGACA
ACGGTAACAACAATGTCTTAGACACCATTGCAAAGGTCAACTATTTACCTTATGGTAAAG
ATTTTCCGGAAGGTCCAACCGGTCGCTTTAGCAACGGACGCAACATTCCAGACGTTATCG
CTGAACTAGCGGGTTTCAATGACTCCATTCCACCATTCGCCACAGCATCACCGGCACAGG
CTAACATCAGACTCAACTATGCTTCCGGTGGCGCTGGGATCCGAGAAGAAACCAGCCAAA
ATTTGGGTGAAAGAATCAGTTTGAGAAGGCAAATAAACAATCATCTGTCGGCGATTATAA
AAGCGGCGGTGCCACGGAGTCAGCTACGACGATGTCTATACACAATCAACATTGGAAGCA
ATGATTACCTTAACAACTACTTCTTGCAACCTACTACCCTAGCTCGTCGCCGTTATAATC
CTGAACAGTTTGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E203TF U 1
AF RR4DT03TF U 1
BS 1 674 RR4DT03TF

RD RR4E203TF 414 0 0
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TTCAACATTCTCTCCTCATTTTTCGTATATATAACTCGATCTTTGAAAATGGTTAAGGGA
ATGCCCAAGGCATTGTGGATTGTTGTGGCCACCGTGTTTGCAGTAGCCGCGGCGGTCGCA
CAAGTGGCTTGTGGACAACAAGCACCGTGTTACTTCGTGTTCGGAGCTCTCAATTCGACA
ACGGTAACAACAATGTCTTAGACACCATTGCAAAGGTCAACTATTTACCTTATGGTAAAG
ATTTTCCGGAAGGTCCAACCGGTCGCTTTAGCAACGGACGCAACATTCCAGACGTTATCG
CTGAACTAGCGGGTTTCAATGACTCCATTCCACCATTCGCCACAGCATCACCGG

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR4DT03TF 674 0 0
GGATACTAATCAGAATTTGAAAATCTCGTTCATCTATATATAATATAAGCGAGCCTTCTC
TTCAACATTCTCTCCTCATTTTTCGTATATATAACTCGATCTTTGAAAATGGTTAAGGGA
ATGCCCAAGGCATTGTGGATTGTTGTGGCCACCGTGTTTGCAGTAGCCGCGGCGGTCGCA
CAAGTGGCTTGTGGACAACAAGCACCGTGTTACTTCGTGTTCGGAGCTCTCAATTCGACA
ACGGTAACAACAATGTCTTAGACACCATTGCAAAGGTCAACTATTTACCTTATGGTAAAG
ATTTTCCGGAAGGTCCAACCGGTCGCTTTAGCAACGGACGCAACATTCCAGACGTTATCG
CTGAACTAGCGGGTTTCAATGACTCCATTCCACCATTCGCCACAGCATCACCGGCACAGG
CTAACATCAGACTCAACTATGCTTCCGGTGGCGCTGGGATCCGAGAAGAAACCAGCCAAA
ATTTGGGTGAAAGAATCAGTTTGAGAAGGCAAATAAACAATCATCTGTCGGCGATTATAA
AAGCGGCGGTGCCACGGAGTCAGCTACGACGATGTCTATACACAATCAACATTGGAAGCA
ATGATTACCTTAACAACTACTTCTTGCAACCTACTACCCTAGCTCGTCGCCGTTATAATC
CTGAACAGTTTGCT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL9214Contig1 858 2 2 U
GCAGCCGAGCTCGAGAAGATGAGGTATAGTATTCCACACTGGAAAGAAAAAGTGATCAAC
GGTACAGAGCAGCGTCTTGAAGGTAACTGCCCCATGACGCCGCGGGAAGCTGCCGTGTTC
CTCAAGGCAATGGGGTTTCCTTCGACCACGAAGATCTACATCGTGGCAGGAGAGATCTAC
GGCGGAAACAGTATGAATGCATTCCACGAAGAGTTCCCAAACGTTTTCTCTCACTCCACA
TTGGCTACAGAGGAAGAGCTTTCCACTATTAAACCATACCAGAACAGATTAGCTGCTCTC
GATTACAATTTAGCCCTCGGAAGCGATGTTTTCGCTTATACTTACGATGGAAACATGGCC
AAAGCGGTTCAGGGTCACCGTCGATTCGAAGGGTTTAGAAAAACTATTAATCCGGATAGG
CTAAGCTTTGTGAAATTGATTGACCGGCTCGATGCGGGACTAATGTCTTGGGAAGATTTC
TCGAGGGAGGTTCGGAGAATACATGGGAAGAGATTAGGAGCTCCGTATGTTAGACGGCCA
GGAAAGGCAGGCTTGAGTCCCAAGTTGGAGGAGAATTTTTATGCTAACCCTCTTCCTGGT
TGCTTGTGTGACACTTCTGATGAACCAACCGGTCTGAACCGGTTTGAAAGACTAGGTTTA
CGAGCACAATCTCTGAGATAACCGGAGGTGGAGTGATGCAAATTGGTGTTTTCAAAATAC
ACGAGAATATCACAAAGATTCTTGTTTTTTTTTTGGGTTTTGATGTAATTAGGTTTATTA
AAAAGTTAATTATAATTATTGTAAGAACTTGGGGATATATAGATAAAGTTGTAGTCTCAG
TCTATTATATATGAAATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B834TF U 1
AF RR4B834JQ C 324
BS 1 749 RR4B834TF
BS 750 858 RR4B834JQ

RD RR4B834TF 749 0 0
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GGTACAGAGCAGCGTCTTGAAGGTAACTGCCCCATGACGCCGCGGGAAGCTGCCGTGTTC
CTCAAGGCAATGGGGTTTCCTTCGACCACGAAGATCTACATCGTGGCAGGAGAGATCTAC
GGCGGAAACAGTATGAATGCATTCCACGAAGAGTTCCCAAACGTTTTCTCTCACTCCACA
TTGGCTACAGAGGAAGAGCTTTCCACTATTAAACCATACCAGAACAGATTAGCTGCTCTC
GATTACAATTTAGCCCTCGGAAGCGATGTTTTCGCTTATACTTACGATGGAAACATGGCC
AAAGCGGTTCAGGGTCACCGTCGATTCGAAGGGTTTAGAAAAACTATTAATCCGGATAGG
CTAAGCTTTGTGAAATTGATTGACCGGCTCGATGCGGGACTAATGTCTTGGGAAGATTTC
TCGAGGGAGGTTCGGAGAATACATGGGAAGAGATTAGGAGCTCCGTATGTTAGACGGCCA
GGAAAGGCAGGCTTGAGTCCCAAGTTGGAGGAGAATTTTTATGCTAACCCTCTTCCTGGT
TGCTTGTGTGACACTTCTGATGAACCAACCGGTCTGAACCGGTTTGAAAGACTAGGTTTA
CGAGCACAATCTCTGAGATAACCGGAGGTGGAGTGATGCAAATTGGTGTTTTCAAAATAC
ACGAGAATATCACAAAGATTCTTGTTTTT

QA 1 749 1 749
DS 

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ATTCGAAGGGTTTAGAAAAACTATTAATCCGGATAGGCTAAGCTTTGTGAAATTGATTGA
CCGGCTCGATGCGGGACTAATGTCTTGGGAAGATTTCTCGAGGGAGGTTCGGAGAATACA
TGGGAAGAGATTAGGAGCTCCGTATGTTAGACGGCCAGGAAAGGCAGGCTTGAGTCCCAA
GTTGGAGGAGAATTTTTATGCTAACCCTCTTCCTGGTTGCTTGTGTGACACTTCTGATGA
ACCAACCGGTCTGAACCGGTTTGAAAGACTAGGTTTACGAGCACAATTTTTGAGATAACC
GGAGGTGGAGTGATGCAAATTGGTGTTTTCAAAATACACGAGAATATCACAAAGATTCTT
GTTTTTTTTTTGGGTTTTGATGTAATTAGGTTTATTAAAAAGTTAATTATAATTATTGTA
AGAACTTGGGGATATATAGATAAAGTTGTAGTCTCAGTCTATTATATATGAAATA

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

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TCACCGTGGTGGTTGCGATCCTCGCTTACTTCCTCCTCTTCTCAGGATTCTTCATCTCGC
GCGATCGGATCCCTCTCTACTGGATCTGGTTCCATTACCTCTCGCTGGTGAAGTACCCTT
ACGAAGGGGTTTTGCAGAACGAGTTCGAGGATACGACCAAGTGTTTCGTCCGAGGGGTTC
AGATATTCGATAACTCGCCGTTGGGGCAGTTTCCGAGCGATGTGAAGATGAGTTTGTTGA
AGAGTATGAGCGGTGTTTTGGGGATTAACGTGACGGCGGAGACGTGTGTGACGACGGGGA
TCGATATTCTGAAGCAGCAGGGGGTCACGGAGATTAGCAAATGGAATTGCTTGTGGATCA
CGGTTGCTTGGGGGTTCTTCTTTAGGATTTTGTTTTACTTCACGTTGATGATTGGAAGTA
AGAACAAACGGAGGTGATGGAACTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTCTTGATTTGTCTTAC
TGTCTGAAAATCATAAAAACATTGTCGTGTTTTATTTTATTTTTTTCAAAGCTAAATATA
TGTATTTCTTCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4C090TF U 1
AF RR4C090JQ C 419
BS 1 612 RR4C090TF

RD RR4C090TF 612 0 0
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TCACCGTGGTGGTTGCGATCCTCGCTTACTTCCTCCTCTTCTCAGGATTCTTCATCTCGC
GCGATCGGATCCCTCTCTACTGGATCTGGTTCCATTACCTCTCGCTGGTGAAGTACCCTT
ACGAAGGGGTTTTGCAGAACGAGTTCGAGGATACGACCAAGTGTTTCGTCCGAGGGGTTC
AGATATTCGATAACTCGCCGTTGGGGCAGTTTCCGAGCGATGTGAAGATGAGTTTGTTGA
AGAGTATGAGCGGTGTTTTGGGGATTAACGTGACGGCGGAGACGTGTGTGACGACGGGGA
TCGATATTCTGAAGCAGCAGGGGGTCACGGAGATTAGCAAATGGAATTGCTTGTGGATCA
CGGTTGCTTGGGGGTTCTTCTTTAGGATTTTGTTTTACTTCACGTTGATGATTGGAAGTA
AGAACAAACGGAGGTGATGGAACTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTCTTGATTTGTCTTAC
TGTCTGAAAATCATAAAAACATTGTCGTGTTTTATTTTATTTTTTTCAAAGCTAAATATA
TGTATTTCTTCG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR4C090JQ 194 0 0
CACGGTTGCTTGGGGGTTCTTCTTTAGGATTTTGTTTTACTTCACGTTGATGATTGGAAG
TAAGAACAAACGGAGGTGATGGAACTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTCTTGATTTGTCTT
ACTGTCTGAAAATCATAAAAACATTGTCGTGTTTTATTTTATTTTTTTCAAAGCTAAATA
TATGTATTTCTTCG

QA 1 194 1 194
DS 



AS 1 2

CO CL9216Contig1 571 2 1 U
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CGTTTTGTCTGTTCGACAAGGATGGAGATGGTTGCATCACTGCTGATGAACTTGCCACTG
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ACCAAAACGGCTACACCTCGGCCAGCGAGTTGAGGCATGTGATGATTAATCTTGGGGAGA
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AAGTCAATTATGATGAATTTGTGAGGATGATGATGACCAGCGGTTAAATTGGAAAACAGT
TTTACCTGTTAATGTATTATCTTTTATAAATTTATCAAATCTTTTTCTATTCTTCCTCTT
CAGAATATCATATTTCACTTATCAGATTAAA


BQ
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AF RR4FK51TF U 1
AF RR4FK51JQ C 70
BS 1 571 RR4FK51TF

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TGATCCGCCCGTTGGATCAGAATCCGACCGAACAAGAACTTCAAGATATGATCAATGAGA
TCGACGCCGATGGTAACGGCACCATCGAGTTCTCTGAGTTCCTCAACCTCATGGCCAACA
AAATCCAGGAAACTGATGCAGATGAGGAGCTGAAAGAAGCATTCAAAGTGTTTGACAAAG
ACCAAAACGGCTACACCTCGGCCAGCGAGTTGAGGCATGTGATGATTAATCTTGGGGAGA
AGCTAACAGATGAAGAAGTTGCTCAAATGATCAAGGAGGCAGATTTGGATGGTGATGGTC
AAGTCAATTATGATGAATTTGTGAGGATGATGATGACCAGCGGTTAAATTGGAAAACAGT
TTTACCTGTTAATGTATTATCTTTTATAAATTTATCAAATCTTTTTCTATTCTTCCTCTT
CAGAATATCATATTTCACTTATCAGATTAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR4FK51JQ 502 0 0
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CGTTGGATCAGAATCCGACCGAACAAGAACTTCAAGATATGATCAATGAGATTGACGCCG
ATGGTAACGGCACCATCGAGTTTTTTGAGTTCCTCAACCTCATGGCCAACAAAATCCAGG
AAACTGATGCAGATGAGGAGCTGAAAGAAGCATTCAAAGTGTTTGACAAAGACCAAAACG
GCTACACCTCGGCCAGCGAGTTGAGGCATGTGATGATTAATTTTGGGGAGAAGCTAACAG
ATGAAGAAGTTGCTCAAATGATCAAGGAGGCAGATTTGGATGGTGATGGTCAAGTCAATT
ATGATGAATTTGTGAGGATGATGATGACCAGCGGTTAAATTGGAAAACAGTTTTACCTGT
TAATGTATTATTTTTTATAAATTTATCAAATCTTTTTTTATTTTTCCTTTTCAGAATATC
ATATTTCACTTATCAGATTAAA

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL9217Contig1 637 2 1 U
GGGTTTTCTTCTTCTTCCTGACCACAATGAATATAGCTGGGAGGATTCGACGAAGTTTCT
TCGGAGATGAGAAGAAGGAACTTCCCAGTGTAAATGGATCATCGAGCGGGAACGAAGATG
ATTTGCTAGGAGTGACTGATGAATTAATCGATCACGTCAGGTCCTTCACCATTGACACGT
TTAAGAACTTCTCTCTCTACGACGAAGAAGCGTGTGTATATCCTTTGGCAGAAGTGAAGA
AGGATTTGTCTGATTGGCAGCAGAGACACGCGGTTCTTGTACTATCCAAATCCAAGGAAC
TCTCACAGCTGAGATTTAAGTTATGCCCACGTCTCTTAAAGGAAGATCAGTTTTGGAAGA
TATACTTCAAACTTGTCAGGAACATTGTTGCCAAATATGAGGCGCTAGCAATCCAACAGG
CTTTAATCAGGACGATCGCCATGGAAGCTTCTGAAACCAAGGGTGTTTATGAAGTTGAAA
TGTCAGAAACCAGGCCACAGGGTTGAGTAGTTCTCGACCTGCAACTCCATGAAATCTTAG
TAGCTTAGGACATGTGTTGTAACTTTTACAGACTAGTAAACTCTTCTTGTAATCTAACTA
TGGCTGCAATTATCTTAAGGATTCAGTAACCAAAACT


BQ
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AF RR4AN14JQ C 1
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DS 

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QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

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AF RR4CF96JQ C 1
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BS 688 690 RR4CF96JQ

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QA 1 687 1 687
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AS 1 2

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AF RR4DA02TF U 1
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CAACCTCTCTCCTCCGCCGAATCAAGTCAGAGATCAGCCTCGGAAGAAGTGTTGCGATGG
TGAAATCGAGCAAAGACACGAGATATGCTAAAGATTCAGTTGTGACGCATGATGGAATTG
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CTTATAACAAGCTTGATGTGATTGGTATTGATGAGGCTCAGTTCTTTGGAGATCTTTATG
AGTTTTGCTGCAAAGTAGCTGATGATGATGGCAAAACTGTGGTTGTTGCAGGCCTTGATG
GTGACTATTTAAGGAGGAGATTTGGTGCTGTCCTTGACATTATACCAATAGCTGATTCTG
TGACAAAGCTAACTGCAAGGTGTGAGGTTTGTGGACAGAAAGCTTTCTTCACTTTGAGAA
AGACTTGTGACACCAAAACCGAGCTGATCGGTGGTGCTGATGTCTATATGCCTGTTTGTC
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DS 

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ACGTTTTCTGGGAAATCAACCTCTCTCCTCCGCCGAATCAAGTCAGAGATCAGCCTCGGA
AGAAGTGTTGCGATGGTGAAATCGAGCAAAGACACGAGATATGCTAAAGATTCAGTTGTG
ACGCATGATGGAATTGGATTCCCTTGTTGGGCTCTTCCAGATCTCATGTCATTTCCCGAC
ATGTTCGTACAAGATGCTTATAACAAGCTTGATGTGATTGGTATTGATGAGGCTCAGTTC
TTTGGAGATCTTTATGAGTTTTGCTGCAAAGTAGCTGATGATGATGGCAAAACTGTGGTT
GTTGCAGGCCTTGATGGTGACTATTTAAGGAGGAGATTTGGTGCTGTCCTTGACATTATA
CCAATAGCTGATTCTGTGACAAAGCTAACTGCAAGGTGTGAGGTTTGTGGACAGAAAGCT
TTCTTCACTTTGAGAAAGACTTGTGACACCAAAACCGAGCTGATCGGTGGTGCTGATGTC
TATATGCCTGTTTGTCGCAAGCACTATGTTAACAATCAGATCGTCCTCAGAGCCTCAAAG
AAAGCGGTGGATTCTGACAAGGCAAGAGCTGAGTCCTGAGCTATGATTGGTTACAGATAT
ATGATAGTGAAATTCTGTTTTTCTGTGTGCTTTCGTTTTACTTGTCTGGGTTTATTATTC
CCAATGTTGTCTTTGAAAAACACTTGTGATGTTTCTTGTGTATATATGTTCAATC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

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TGATAACACCTTGCCGTTAGCTCAGCGCAGGAACTATACCAATGCTTTCCATGCGCTTTA
CCGTATTAGCGCTGATGAAGGAGTCTTAGCACTTTGGAAAGGTTGTGGTCCCACTGTGGT
CAGAGCTATGGCTTTGAACATGGGAATGCTTGCTTCTTATGATCAAAGTGCTGAATACAT
GAGAGATAACCTTGGTCTTGGGGAGACTTCCACTGTCGTAGGAGCAAGTGCTGTTTTGAC
TTTGTCAAAACTCAGATCCAGAAAATGCAACCAGACGCTCAGGGTAAATATCCATACACG
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TTTTTTTTTTGCCGTCGTTGATTGGTCCGTGAACTTTTAAAATTTTTATTTGGTATAAGA
TTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G735TF U 1
AF RR4G735JQ C 107
BS 1 667 RR4G735TF
BS 668 787 RR4G735JQ

RD RR4G735TF 680 0 0
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TGGTGTAATTGGTGCTTGCGTTGGTAGTCCAGCTGATTTGGCGCTTATCAGAATGCAAGC
TGATAACACCTTGCCGTTAGCTCAGCGCAGGAACTATACCAATGCTTTCCATGCGCTTTA
CCGTATTAGCGCTGATGAAGGAGTCTTAGCACTTTGGAAAGGTTGTGGTCCCACTGTGGT
CAGAGCTATGGCTTTGAACATGGGAATGCTTGCTTCTTATGATCAAAGTGCTGAATACAT
GAGAGATAACCTTGGTCTTGGGGAGACTTCCACTGTCGTAGGAGCAAGTGCTGTTTTGAC
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GGTTTCCCTGTTTACTGCGTCAGGATCGCCCCTCACGTCATGATGACATGGATCTTCCTG
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ACCTTTT
AACATATACATGC

QA 1 667 1 667
DS 

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TTCCATGCGCTTTACCGTATTAGCGCTGATGAAGGAGTCTTAGCACTTTGGAAAGGTTGT
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AGTGCTGTTTTGACTTTGTCAAAACTCAGATCCAGAAAATGCAACCAGACGCTCAGGGTA
AATATCCATACACGGGTTCGCTAGACTGTGCCATGCAAACCTTGAAATCAGGGGGACCTC
TGAAATTTTACACAGGTTTCCCTGTTTACTGCGTCAGGATCGCCCCTCACGTCATGATGA
CATGGATCTTCCTGAACCAGATTACAAAGTTCCAAAAGACCATTGGTATGTGATCTTCAA
GCAATCTTTGTGAAGTGCGGAGCCAGTAATAAGATGGGAAGAACGAATTCACAATTTTGG
AATTGTGTTCATTTACCTTTTTAACAATATACATGCCTTAGATGCATTATTGGAGCTGTT
TGAGACCTGAGAGATTTTTTTTTTGCCGTCGTTGATTGGTCCGTGAACTTTTAAAATTTT
TATTTGGTATAAGATTTTTGG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL9221Contig1 600 2 2 U
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AGCATACAAAACTCTCTCTTTTTGGATCTCTGTAAAAGGAATTCAAGAAGTTGAGAGAGT
GTAGCAACAGCAACTGTTTTAAGTATTATTATTCAGATAAGAAAACTGGTTTGTTCCATC


BQ
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AF RR4DX55JQ C 1
AF RR4DX55TF U 1
BS 1 567 RR4DX55TF
BS 568 600 RR4DX55JQ

RD RR4DX55JQ 600 0 0
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ACAAACCTCGATCTTTCTCCACTAGCAACTGATCTACACATCAAACGGTCTCACGCATCT
CTCTGTACAGCTATTATGGCCGCCGTCTCCTCCAACCCTCGCACCGTCGAAGAGGAGGAG
GATGAAGAAGAGGAAGACGAGCATGGAGACACTCTCTGTGGAAGCTGCGGAGGCAACTAC
ACACAAGATGAGTTCTGGATTGGCTGTGATGTCTGTGAACGTTGGTACCATGGCAAATGC
GTGAAGATCACTCCCGCCAAAGCAGACAGCATCAAGCAGTATAAATGCCCACCTTGCTGT
GCAAAGAAAGGAAGACAGTGATCATCATCATCTCCCAGAGACTCTGGTTATCATGTCTTA
ATCGATATATTAATCAACCTTCCTTCTATCTTTTGTTTTTTTTAACCTTATAATTTTAAA
AGCATACAAAACTCTCTCTTTTTGGATCTCTGTAAAAGGAATTCAAGAAGTTGAGAGAGT
GTAGCAACAGCAACTGTTTTAAGTATTATTATTCAGATAAGAAAACTGGTTTGTTCCATC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4DX55TF 567 0 0
GGATAATCTTGTCTTTTCTCTCTCCATGTCCGAACGCATCCTGTCTCAAAAACCATCGAT
ACAAACCTCGATCTTTCTCCACTAGCAACTGATCTACACATCAAACGGTCTCACGCATCT
CTCTGTACAGCTATTATGGCCGCCGTCTCCTCCAACCCTCGCACCGTCGAAGAGGAGGAG
GATGAAGAAGAGGAAGACGAGCATGGAGACACTCTCTGTGGAAGCTGCGGAGGCAACTAC
ACACAAGATGAGTTCTGGATTGGCTGTGATGTCTGTGAACGTTGGTACCATGGCAAATGC
GTGAAGATCACTCCCGCCAAAGCAGACAGCATCAAGCAGTATAAATGCCCACCTTGCTGT
GCAAAGAAAGGAAGACAGTGATCATCATCATCTCCCAGAGACTCTGGTTATCATGTCTTA
ATCGATATATTAATCAACCTTCCTTCTATCTTTTGTTTTTTTTAACCTTATAATTTTAAA
AGCATACAAAACTCTCTCTTTTTGGATCTCTGTAAAAGGAATTCAAGAAGTTGAGAGAGT
GTAGCAACAGCAACTGTTTTAAGTATT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL9222Contig1 691 2 3 U
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GTTCGGTTATGTGATGCCATATATTTATTAGTAGACACAACCCAAAGATGAAAAAGAAGA
TTCAGGCTTCTGTTTGATGTTGTTATTTTTTTAAATGGGATTATTTGTATGCATGAGTTT
TATTATGAACCATCATTAGCATGGTATCTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR4AW25TF U 1
AF RR4B266TF U 1
BS 1 631 RR4AW25TF
BS 632 632 RR4B266TF
BS 633 691 RR4AW25TF

RD RR4AW25TF 691 0 0
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QA 1 691 1 691
DS 

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ATACAGGAGAGGGGACAGTATTAGAAAGCAACTTTTTGTTCAATTACAACATAGTACGTA
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TTCAGGCTTCTGTTTGATGTTGTTATTTTTTTAAATGGGATTATTTGTATGCATGAGTTT
TATTATGAACCATCATTAGCATGGTATCTT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

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CGGAGAGCTCGCGAAACACGCCGTCTCTGAGGGGACCAAGGCGGTTACCAAATTCACAAG
CACTTAGGGTTTGAATCGACTGTGTACCGATTAGTGAGATCCTTTGAATGAACAGGTTTT
CTTGTTAATGAATATCGATTTTCTAGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A941JQ C 1
AF RR4A941TF U 1
BS 1 567 RR4A941TF

RD RR4A941JQ 567 0 0
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CGGAGAGCTCGCGAAACACGCCGTCTCTGAGGGGACCAAGGCGGTTACCAAATTCACAAG
CACTTAGGGTTTGAATCGACTGTGTACCGATTAGTGAGATCCTTTGAATGAACAGGTTTT
CTTGTTAATGAATATCGATTTTCTAGC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4A941TF 567 0 0
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AATCTCGATAATGGCACCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCCAGCCGA
GAAAGCCCCGGCGGAGAAGCGTCCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGGAGGAAG
CGACAAGAAGAAGAAGAAGTCGAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAA
GGTCCTGAAGCAGGTTCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAGGCGATGGGGATCATGAA
CAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACCGGCGCAGGAATCTTCGAAGCTCGCTAGGTA
CAACAAGAAGCCGACGATTACGTCGAGGGAGATCCAGACGGCGGTTAGGCTCGTGTTGCC
CGGAGAGCTCGCGAAACACGCCGTCTCTGAGGGGACCAAGGCGGTTACCAAATTCACAAG
CACTTAGGGTTTGAATCGACTGTGTACCGATTAGTGAGATCCTTTGAATGAACAGGTTTT
CTTGTTAATGAATATCGATTTTCTAGC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL9224Contig1 1386 2 4 U
GGAGTCGCATTGTGTGACATGGCTTCGACACTGTTCTCCAGAACCTTTCTGTCTGCAAGC
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AAGGTATTGGATGCGTCATGGTACATGCCAGATGAGCAGAGGAATCCCATCCAAGAATAT
CAGGTTGCTCATATCCCCGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATCGATCA
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CAGTTTACGATGGCTCGTGGACTGAATGGGCAACACAACCAGACTTGCCCATGGAAGGGG
AGGATTCTTCTACATGAAAAGTTTCCGAGGGAAAGGCTAGCAACAAGATTACTAGCTCCA
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TGAGTAAAAGAGGACTGTGTCTATAGAACTTTGATTTTTTCTTTTTCTTTGGAATAAAGT
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TTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4D181TF U 1
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TTA

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TGTGTCCCTTATCCTCAGTTGTTTGATTCTGCTTCTCAAACAATGTTGCCAGCAGAAGAC
CTGAAGAAACGATTTGAACAAGAAGAGATCTCATTGGACAAGCCTATTATGGCTTCGTGT
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GGGGAGGATTCTTCTACATGAAAAGTTTCCGAGGGAAAGGCTAGCAACAAGATTACTAGC
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GCCTTGAGTAAAAGAGGACTGTGTCTATAGAACTTTGATTTTTTCTTTTTCTTTGGAATA
AAGTCAAACAAACATGAAATTGTTAATGGTCATGATTCATGAAAACAATTATGAACAAGC
TTTTTTTATC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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CACCAGAATATTTGTTCGAGTGTGATTCTTGTTGATGAAGATTTCGACGCGAGGATTGTG
GATTCAGGGCTTGCTAGGCTTATGGTTCCTTCGGATAATAATGAGAGCAGTTTCGTGACC
GGTGACTTGGGTGAGTTTGGGTATGTAGCTCCAGAGTATTCCACCACAATGCTAGCTTCG
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ATTATTAAGTTTGTTGAGGTTGCTTGTAACTGTGTGGCTTCAAGGCCTAAAGAGAGATGG
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BQ
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AF RR4DV23TF U 1
AF RR4DV23JQ C 236
BS 1 628 RR4DV23TF
BS 629 946 RR4DV23JQ

RD RR4DV23TF 628 0 0
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ATTATTAAGTTTGTTGAGGTTGCTTGTA

QA 1 628 1 628
DS 

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CTTCGCTAAAAGGTGACGTGTATGGACTTGGTGTCGTCCTCTTGGAGCTGGCTACAGGGG
TAAAAGCTCTTGGCAAGGAAGGTTTTAAAGGGAGCTTGGTTGATTGGGTGAAACAGCTTG
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AAGAGATTATTAAGTTTGTTGAGGTTGCTTGTAACTGTGTGGCTTCAAGGCCTAAAGAGA
GATGGTCTATGTTTAAGGCGTATCAGTCACTTAGAGCTATGGCTGAGAAACAAGGTTACT
CGTTTACAGAACAAGATGAAGACTTCCCTTTGATTTTCAACACGGAAGAGAATGAGACTG
TTTGAAGTTTAAAAATTCTTATCTTGAGGTATTATTTTGTGTATAGCATCTTGTACTACA
TCCTAGAAGATGATGCATCATTCCCATAAAGCTTCTAAAAATGTATTTGTAGACTTATGT
TATATTGTAAAAGAAAACAAAGTATATATGCTAAGTGTCTTCCCTTGTGCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL9226Contig1 826 2 5 U
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TTGATCCTTCTTTCTTCACTGGAGCTATTACCAGTGGTGAACTCACCCATCAATCTCTGC
AGAGGAGAGATGATCCTTGGTTCGCTGCACTAGGAAGGCGTTGCATCCACATCACTTGGA
AAGACCGAGGAGCTATCTCTTTGGAAGGTCTTGATCTAAACGTTGTGGAGAACGTGGAGG
AAGCTGACTTTGTTTTAGCTCACGGCACTGAAGCCATAGGGCTTCCTTCAGGGGGTGTAT
CTCCCATGCCTCTCGACGAGCTCGAGAAGATCTTGGAGAAATCTGCAGCTAGAAAACTCC
CAATGATCGTTGCCAATCCAGATTACGTGACTGTTGAAGCAAACGCTTTCCACATCATGC
CGGGCACACTGGCTGCCAAGTATGAAGAGCTTGGAGGAGAAGTTAAATGGATGGGGAAGC
CTCACAAGATGATCTATGAGTCGGCTATGGCGATTGCAGGAGTTGATAATCTAGAGGAGG
CTATTGCGGTGGGAGACTCGCTTCACCATGACATAAAGGGAGCTAATGTTGCGGGGATTG
AATCAGTGTTCATCACTGGAGGGATTCATGGTAGTGAGCTTGGTCTCACTTCTTTTGATG
AAACTGCAAGTCTTGACTCGGTCAAGACCCTTACTGCTAAACACAATGCATTCCCATCTT
ATGTTTTGTCTGCGTTTAAATGGTAATGTGCTCATTGTACAAAATCTTGTTATTTGCTTC
TTCAACTAGACATAACACTTGAAAAAAAAAGCAATTTAATAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AN75JQ C 1
AF RR4AN75TF U 68
BS 1 67 RR4AN75JQ
BS 68 784 RR4AN75TF
BS 785 785 RR4AN75JQ
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BS 802 826 RR4AN75JQ

RD RR4AN75JQ 826 0 0
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AAGCTGACTTTGTTTTAGCTCACGGCACTGAAGCCATAGGGCTTCCTTCAGGGGGTGTAT
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CGGGCACACTGGCTGCCAAGTATGAAGAGCTTGGAGGAGAAGTTAAATGGATGGGGAAGC
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CTATTGCGGTGGGAGACTCGCTTCACCATGACATAAAGGGAGCTAATGTTGCGGGGATTG
AATCAGTGTTCATCACTGGAGGGATTCATGGTAGTGAGCTTGGTCTCACTTCTTTTGATG
AAACTGCAAGTCTTGACTCGGTCAAGACCCTTACTGCTAAACACAATGCATTCCCATCTT
ATGTTTTGTCTGCGTTTAAATGGTAATGTGCTCATTGTACAAAATCTTGTTATTTGCTTC
TTCAACTAGACATAACACTTGAAAAAAAAAGCAATTTAATAAGTTC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4AN75TF 734 0 0
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AGATGATCCTTGGTTCGCTGCACTAGGAAGGCGTTGCATCCACATCACTTGGAAAGACCG
AGGAGCTATCTCTTTGGAAGGTCTTGATCTAAACGTTGTGGAGAACGTGGAGGAAGCTGA
CTTTGTTTTAGCTCACGGCACTGAAGCCATAGGGCTTCCTTCAGGGGGTGTATCTCCCAT
GCCTCTCGACGAGCTCGAGAAGATCTTGGAGAAATCTGCAGCTAGAAAACTCCCAATGAT
CGTTGCCAATCCAGATTACGTGACTGTTGAAGCAAACGCTTTCCACATCATGCCGGGCAC
ACTGGCTGCCAAGTATGAAGAGCTTGGAGGAGAAGTTAAATGGATGGGGAAGCCTCACAA
GATGATCTATGAGTCGGCTATGGCGATTGCAGGAGTTGATAATCTAGAGGAGGCTATTGC
GGTGGGAGACTCGCTTCACCATGACATAAAGGGAGCTAATGTTGCGGGGATTGAATCAGT
GTTCATCACTGGAGGGATTCATGGTAGTGAGCTTGGTCTCACTTCTTTTGATGAAACTGC
AAGTCTTGACTCGGTCAAGACCCTTACTGCTAAACACAATGCATTCCCATCTTATGTTTT
GTCTGCGTTTAAATGGTAATGTGCTCATTGTACAAAATCTTGTTATTTGCTTCTTCA*CT
AGACATAACACTTG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL9227Contig1 567 2 1 U
GACAATTCAACTCTAACTTCGATTCATTTTCAGCACCAAACTTTCTCAATCGAAAAAAAA
TGTCGGGTCGCGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGA
AGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCGGCGATTCGGAGGTTGGCTCGTA
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TCTTTTTGGAGAACGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGA
CTGTGACCGCCATGGACGTCGTCTATGCTCTGAAGAGGCAAGGGAGGACTCTCTACGGGT
TCGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGTGTTTCTTTTCTGGGAAT
TTCTAATCGAGTCATGTTTCTCTTTAGCGTTTGCGTTTGAATTATGTTTGGGTACGGGCG
TTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTTTATATGTAATTAGGGCTTTTATTAGCGATGCAA
TGTCGAATCAATCCATGGTTAAGTTTC


BQ
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AF RR4AR18JQ C 1
AF RR4AR18TF U 1
BS 1 567 RR4AR18TF

RD RR4AR18JQ 567 0 0
GACAATTCAACTCTAACTTCGATTCATTTTCAGCACCAAACTTTCTCAATCGAAAAAAAA
TGTCGGGTCGCGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGA
AGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCGGCGATTCGGAGGTTGGCTCGTA
GAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGCGGTCCCATCTACGAGGAGACACGTGGCGTCCTCAAGA
TCTTTTTGGAGAACGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGA
CTGTGACCGCCATGGACGTCGTCTATGCTCTGAAGAGGCAAGGGAGGACTCTCTACGGGT
TCGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGTGTTTCTTTTCTGGGAAT
TTCTAATCGAGTCATGTTTCTCTTTAGCGTTTGCGTTTGAATTATGTTTGGGTACGGGCG
TTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTTTATATGTAATTAGGGCTTTTATTAGCGATGCAA
TGTCGAATCAATCCATGGTTAAGTTTC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4AR18TF 567 0 0
GACAATTCAACTCTAACTTCGATTCATTTTCAGCACCAAACTTTCTCAATCGAAAAAAAA
TGTCGGGTCGCGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGA
AGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCGGCGATTCGGAGGTTGGCTCGTA
GAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGCGGTCCCATCTACGAGGAGACACGTGGCGTCCTCAAGA
TCTTTTTGGAGAACGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGA
CTGTGACCGCCATGGACGTCGTCTATGCTCTGAAGAGGCAAGGGAGGACTCTCTACGGGT
TCGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGTGTTTCTTTTCTGGGAAT
TTCTAATCGAGTCATGTTTCTCTTTAGCGTTTGCGTTTGAATTATGTTTGGGTACGGGCG
TTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTTTATATGTAATTAGGGCTTTTATTAGCGATGCAA
TGTCGAATCAATCCATGGTTAAGTTTC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL9228Contig1 741 2 8 U
AAGATGCTTCCCAAGCAGGGGAAGTGAACATATATCAATAGAACAAACTTACACAAACAA
GAGTTCCCATCACTCGAGTCATCATCATCATCTAAGAACAAATAATATTATATCAAGAAA
ATACAAATATGTCTCTCCCATAACCAAATAGAAAACAACAGACCATCATGACACTGATAA
TAAAGATGGTCCTCTAAACCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGC
AAAACACATCAGAAACATCTTTCTCGAACCCCATGTTGTTAGCGTGCCTGATCTGAGACG
CAATGCCATTGTAATGGTTCAATATCACACGCGACTGTTCACGCCCCCTAGAGATTTTAG
AACAACCCTTGTCTGAGCCTTTGAAGAGCATAACATCGCACATCTCGTCTTTATGGTCCT
CGTGGACAACGAACATGTACTTTCCCTTCCTGTTTGATACAGCCACGTCTGTGTATAACT
CCTTCATTGTCTTCCTGTCTCTGCACACAAGCTTCACCGTCGCACCGGGGACGGGGTAGG
AGGATTCAGCAGTCTCGAAGCCGAACTTGCAAGTGTCACAGTAAGTGATACCTTGAACCA
CCAAGGTGTTCTTACCGATACGTGGCACCTTCGCCGCCATGGCTATCGCCGGCAAGATAC
AGAGAACCATCAGCATCGCTAGTTTCGCCATTTTTGCAAAGAGAAGACGTACAAGGGAGA
GAGAGAGGGATGAGAGGTTCC


BQ
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AF RR4GQ96JQ U 1
AF RR4DU71TF C 1
BS 1 178 RR4GQ96JQ
BS 179 179 RR4DU71TF
BS 180 384 RR4GQ96JQ
BS 385 385 RR4DU71TF
BS 386 481 RR4GQ96JQ
BS 482 482 RR4DU71TF
BS 483 559 RR4GQ96JQ
BS 560 741 RR4DU71TF

RD RR4GQ96JQ 559 0 0
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GAGTTCCCATCACTCGAGTCATCATCATCATCTAAGAACAAATAATATTATATCAAGAAA
ATACAAATATGTCTCTCCCATAACCAAATAGAAAACAACAGACCATCATGACACTGATTA
TAAAGATGGTCCTCTAAACCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGC
AAAACACATCAGAAACATCTTTCTCGAACCCCATGTTGTTAGCGTGCCTGATCTGAGACG
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AACAACCCTTGTCTGAGCCTTTGACGAGCATAACATCGCACATCTCGTCTTTATGGTCCT
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CTTTCATTGTCTTCCTGTCTCTGCACACAAGCTTCACCGTCGCACCGGGGACGGGGTAGG
AGGATTCAGCAGTCTCGAA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR4DU71TF 741 0 0
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GAGTTCCCATCACTCGAGTCATCATCATCATCTAAGAACAAATAATATTATATCAAGAAA
ATACAAATATGTCTCTCCCATAACCAAATAGAAAACAACAGACCATCATGACACTGATAA
TAAAGATGGTCCTCTAAACCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGC
AAAACACATCAGAAACATCTTTCTCGAACCCCATGTTGTTAGCGTGCCTGATCTGAGACG
CAATGCCATTGTAATGGTTCAATATCACACGCGACTGTTCACGCCCCCTAGAGATTTTAG
AACAACCCTTGTCTGAGCTTTTGAAGAGCATAACATCGCACATCTCGTCTTTATGGTCCT
CGTGGACAACGAACATGTACTTTCCCTTCCTGTTTGATACAGCCACGTCTGTGTATAACT
CCTTCATTGTCTTCCTGTCTCTGCACACAAGCTTCACCGTCGCACCGGGGACGGGGTAGG
AGGATTCAGCAGTCTCGAAGCCGAACTTGCAAGTGTCACAGTAAGTGATACCTTGAACCA
CCAAGGTGTTCTTACCGATACGTGGCACCTTCGCCGCCATGGCTATCGCCGGCAAGATAC
AGAGAACCATCAGCATCGCTAGTTTCGCCATTTTTGCAAAGAGAAGACGTACAAGGGAGA
GAGAGAGGGATGAGAGGTTCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL9229Contig1 567 2 1 U
GGCTTCTCAATCGAAGCTGGGCTACTTGCGGAGCGAATTAGCGGCTGCGATCGCCGATCG
GAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGCCATGGGAATCTCCCGAGCTCGATCAAGCACCGTTTGTA
TTCTCCTGATGCTCTCGCTGAGCTTATTATTCTCCTGTGCTTTCTCTAAATCTCCTCGTC
CTATATCCGATGCGGAGATCAGGGAGAAGAAGAACCAATGCTATGCTGATATTGAGAGTG
GGCTATGGGGTTGGCAATGCAAAGCTTCTTCCATAGCAAAAGAGAATTGTGCGCTGCGAT
GCCTTTCTCCCGTTTGCTATGAGCTCATTTATGAGAGTGATCCCCTTGAAGAAGGCGAAA
AAGATTTGATTCGGAGCCAAGAATACAAATATTGTATGTACAAGTCTTCGCTCGGGGAGA
GCTTAGATGGTGTTCGAGGCAGCTTTTTATAGAACCAAAGCCAACAAGACTCTCTTTAAT
TGTGTAGCATTCTGCTCTTCCATGTTTGTAAGACTTCGATTTTGTTTCAAACGCTCATCA
TTTGAAAATAAAATTGCAGTCCTGCAT


BQ
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AF RR4DK61JQ C 1
AF RR4DK61TF U 1
BS 1 567 RR4DK61TF

RD RR4DK61JQ 567 0 0
GGCTTCTCAATCGAAGCTGGGCTACTTGCGGAGCGAATTAGCGGCTGCGATCGCCGATCG
GAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGCCATGGGAATCTCCCGAGCTCGATCAAGCACCGTTTGTA
TTCTCCTGATGCTCTCGCTGAGCTTATTATTCTCCTGTGCTTTCTCTAAATCTCCTCGTC
CTATATCCGATGCGGAGATCAGGGAGAAGAAGAACCAATGCTATGCTGATATTGAGAGTG
GGCTATGGGGTTGGCAATGCAAAGCTTCTTCCATAGCAAAAGAGAATTGTGCGCTGCGAT
GCCTTTCTCCCGTTTGCTATGAGCTCATTTATGAGAGTGATCCCCTTGAAGAAGGCGAAA
AAGATTTGATTCGGAGCCAAGAATACAAATATTGTATGTACAAGTCTTCGCTCGGGGAGA
GCTTAGATGGTGTTCGAGGCAGCTTTTTATAGAACCAAAGCCAACAAGACTCTCTTTAAT
TGTGTAGCATTCTGCTCTTCCATGTTTGTAAGACTTCGATTTTGTTTCAAACGCTCATCA
TTTGAAAATAAAATTGCAGTCCTGCAT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4DK61TF 567 0 0
GGCTTCTCAATCGAAGCTGGGCTACTTGCGGAGCGAATTAGCGGCTGCGATCGCCGATCG
GAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGCCATGGGAATCTCCCGAGCTCGATCAAGCACCGTTTGTA
TTCTCCTGATGCTCTCGCTGAGCTTATTATTCTCCTGTGCTTTCTCTAAATCTCCTCGTC
CTATATCCGATGCGGAGATCAGGGAGAAGAAGAACCAATGCTATGCTGATATTGAGAGTG
GGCTATGGGGTTGGCAATGCAAAGCTTCTTCCATAGCAAAAGAGAATTGTGCGCTGCGAT
GCCTTTCTCCCGTTTGCTATGAGCTCATTTATGAGAGTGATCCCCTTGAAGAAGGCGAAA
AAGATTTGATTCGGAGCCAAGAATACAAATATTGTATGTACAAGTCTTCGCTCGGGGAGA
GCTTAGATGGTGTTCGAGGCAGCTTTTTATAGAACCAAAGCCAACAAGACTCTCTTTAAT
TGTGTAGCATTCTGCTCTTCCATGTTTGTAAGACTTCGATTTTGTTTCAAACGCTCATCA
TTTGAAAATAAAATTGCAGTCCTGCAT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL9230Contig1 707 2 1 U
GGGCCGTAGACCTGAGCAGAGTTACGGATCTGGTGGCTATGGAGGTAGATCGGAGGTTGA
ATCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATGGCCGGAGGCCTGAATCTGGATA
CGGTGGGAGATCGGAGGTCGAATCTGGCGGTTACGGTGGCAGATCGGAGTCTGAGTCTGG
TGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATGGCAGGAGGCCTGAATCCGGATATGGTGG
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AGATGGAGGAGGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGGAGATCTGAGGATCAGGTTGAGAGCTA
CATAAAGCCCAGCAGCTACGGAAGATCTGAGGAAGAGGAAGAGGGAGGCTATAGGAAGCC
TAGCTATGGAAGATTGGAGGAACAGGAGGAAGGGAGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGCCG
TCGCAATGATGATGATGATGATGATGAGGGGCGCAGGAACCGTTCTGGTGATGATGAGGA
AGGGAGCTATGGCCGCAAGAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGATGATGATGAGGAGAA
GAAACAGCATCGTTACAAGCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTGATGAAGACGATGACTA
AAACACTCTCCCATGATGGAGAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4G901TF U 153
AF RR4G026TF U 1
BS 1 707 RR4G026TF

RD RR4G901TF 103 0 0
ACGGTGGCAGATCGGAGTCTGAGTCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATG
GCAGGAGGCCTGAATCCGGATATGGTGGGAGATCGGAGACGGA

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR4G026TF 707 0 0
GGGCCGTAGACCTGAGCAGAGTTACGGATCTGGTGGCTATGGAGGTAGATCGGAGGTTGA
ATCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATGGCCGGAGGCCTGAATCTGGATA
CGGTGGGAGATCGGAGGTCGAATCTGGCGGTTACGGTGGCAGATCGGAGTCTGAGTCTGG
TGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATGGCAGGAGGCCTGAATCCGGATATGGTGG
GAGATCGGAGACGGAGACAGAGTATGAGCGTAAGCCTAGCTATGGGAGGTCTGAGGAGGA
AGATGGAGGAGGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGGAGATCTGAGGATCAGGTTGAGAGCTA
CATAAAGCCCAGCAGCTACGGAAGATCTGAGGAAGAGGAAGAGGGAGGCTATAGGAAGCC
TAGCTATGGAAGATTGGAGGAACAGGAGGAAGGGAGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGCCG
TCGCAATGATGATGATGATGATGATGAGGGGCGCAGGAACCGTTCTGGTGATGATGAGGA
AGGGAGCTATGGCCGCAAGAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGATGATGATGAGGAGAA
GAAACAGCATCGTTACAAGCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTGATGAAGACGATGACTA
AAACACTCTCCCATGATGGAGAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL9231Contig1 792 2 2 U
GCAACCAATAAACATAACCAAACCAGCTCCAGACAGCAACTCAGACCCAAAATCAGAGGT
TTCAAAACTATCAGAGGAGAAAAAGCAGGAACCTGCGCAGGCATCATCGAAAGAGGTACA
AAGCAAGGAAAACAGTTCTACAAGAAGCCGGACCAAGGTGCAAATGCAAGGCGTACCGGT
GGGCAGGGCTGTGGATTTAACAGTACTAAATGGGTACAGTGAGCTTATAGACGACCTTGA
GAAACTGTTTGACATAGAAGGCGAGCTGAAGAGTCGGAATCTTGGGAAATAGTGTTCACA
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CTCCGGAAACTGTTAACGGAAGTTGACACAGCATTAACAACAACAATCTCCAAAACGGAG
AATCATTCCAACTAAGTTCTCTACACTCTCTGTCTCCTTTTTATCTTGTTCTGTCTGTGT
TTTCTCGCGAGAGACAGAGATCAAAAAGTGGCGTAAACAGGAAACCACTTCTTCTTTTCG
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AAGGGCAGACAGAGAGTTTTCTTCTATGGGTAGGCTTCTGTAAGTTTAATTCTTTTTGTG
TGTGTAATATATGCGAAGATGTAACGAACAGAGAAGAAAAAAAATAAGATTGTAAGCCTC
CTTTTCCTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EC70TF U 1
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CTTC

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DS 

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CTTTTCCTATTT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL9232Contig1 1107 2 6 U
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CGCGGAGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACCATGATGAAACGTTCGGTTAAGATC
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GTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAAGTAC
AAGGTCGGTGCTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTAGCCCCAATTGATGTGGTTGTCCAGCCT
GGTAACACCGGTCTCGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACGTTCCAACT
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TGAGACACTTTTTAGCGTTGATTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4FJ34TF U 1
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CGCGGAGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACCATGATGAAACGTTCGGTTAAGATC
CACGCCGAGATTACGGGGAACACTGGGATCCTCAATCTCATGCCCCTCCTTCAGGGAAAT
GTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAAGTAC
AAGGTCGGTGCTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTAGCCCCAATTGATGTGGTTGTCCAGCCT
GGTAACACCGGTCTCGATCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACGTTCCAACT
AAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGTGAC
AAAGTCGGTTCTTCTGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCATAC
GGTCTTGTTGTCCAGTCGGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGAT
CTCACGGAAGATGAC*TTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTGCATGGTCACTTCCTTG
GCTCTAGCTATCTCTTACC*TACCCTTGCTGCTGCCCCGCATATGTTCATCAATGCATAC
AAGAA

QA 1 785 1 785
DS 

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TCCATCCCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACGTTCCAACTAAGATTAACAAGGGAAC
AGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGTGACAAAGTCGGTTCTTCTGA
GGCCGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCATACGGTCTTGTTGTCCAGTC
GGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTTGATCTCACGGAAGATGACCT
TGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTGCATGGTCACTTCCTTGGCTCTAGCTATCTCTTA
CCCTACCCTTGCTGCTGCCCCGCATATGTTCATCAATGCATACAAGAATGCCTTGGCTAT
CTCTGTTGCCACTGAGTACACTTTCCCTCAAGCAGAGAAGGTTAAAGAGTTCTTGAAGGA
TCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGTAGCGGCTGTGTCTGCTGATGCGGGTGGTGGTGCTTC
AGCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTGGTTGAGGAATCAGATGAAGAAGA
CTATGGTGGTTTTGACATGTTCGGTGATGAGTAGATTAATATATGATTTTTTTACACAAA
GACACATTATGACTTCTCTATTACATCAAGAGACGTATTGCATTGAGACACTTTTTAGCG
TTGATTTGTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL9233Contig1 892 2 14 U
GGGACACAAAGCCCATCTTTTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGTCGCGCTCCTCCTCAC
CGACGAAGATCGCGGCCGTATTCTCTATTGCACAACTAGCGGTAGTTTTCAAGATCAACC
ATGAATCCTGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTCATTGGTGATTCTGGTGTCGGC
AAGTCATGCTTGCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGCACC
ATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAACTCCAG
ATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGA
GCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTTACAGACCAAGAAAGTTTCAATAATGTCAAG
CAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTTGTTGGG
AACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCA
GATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAA
GCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAGGAGGG
GCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTAAACCAACAATCAGGCTGCTGC
TCTTCTTAATTCGCTCTGTGAAAAACTTATAAACCATATGTTATCTCCTTCGTATGCATA
TGTAAGACATCTGAACATCGTTTTTCTTTCATCTGGTCTTCTTTGGTTTTTCAGTTTATG
TCCAAAATTTTATAAATTCTTTGTAATCTACTTGCAATAATAAACTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G234TF U 1
AF RR4G234JQ C 181
BS 1 655 RR4G234TF
BS 656 656 RR4G234JQ
BS 657 700 RR4G234TF
BS 701 701 RR4G234JQ
BS 702 712 RR4G234TF
BS 713 713 RR4G234JQ
BS 714 726 RR4G234TF
BS 727 727 RR4G234JQ
BS 728 744 RR4G234TF
BS 745 745 RR4G234JQ
BS 746 752 RR4G234TF
BS 753 754 RR4G234JQ
BS 755 780 RR4G234TF
BS 781 892 RR4G234JQ

RD RR4G234TF 780 0 0
GGGACACAAAGCCCATCTTTTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTGCGTCGCGCTCCTCCTCAC
CGACGAAGATCGCGGCCGTATTCTCTATTGCACAACTAGCGGTAGTTTTCAAGATCAACC
ATGAATCCTGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTCATTGGTGATTCTGGTGTCGGC
AAGTCATGCTTGCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGCACC
ATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAACTCCAG
ATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGA
GCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTTACAGACCAAGAAAGTTTCAATAATGTCAAG
CAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTTGTTGGG
AACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCA
GATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAA
GCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAG*AGGG
GCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTAA*CCAACAATCAG*CTGCTGC
TCTTCT*AATTCGCTCTGTGAAAA*CTTATAA**CATATGTTATCTCCTTCGTATGCATA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR4G234JQ 712 0 0
AAGTCATGCTTGCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGCACC
ATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAACTCCAG
ATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGA
GCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTTACAGACCAAGAAAGTTTCAATAATGTCAAG
CAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTTGTTGGG
AACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCA
GATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAA
GCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAGGAGGG
GCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTAAACCAACAATCAGGCTGCTGC
TCTTCTTAATTCGCTCTGTGAAAAACTTATTAACCATATGTTATCTCCTTCGTATGCATA
TGTAAGACATCTGAACATCGTTTTTCTTTCATCTGGTCTTCTTTGGTTTTTCAGTTTATG
TCCAAAATTTTATAAATTCTTTGTAATCTACTTGCAATAATAAACTTTTCAG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL9234Contig1 741 2 2 U
GGGATCCATCTTTTAACGTTCCAATCGATCGAAATCGGGAATTTCTGTTACTGGGTATCG
TAAAGGAATACACTTTCGTCTTTATCTGAATCGTTGATTGTTCGGGAGAGAAGGAGAAGA
AGAAAGGAAGAGATGGTTGGTGGTGGAAACAGGAGAGACGAAGGATCGATGATGCCGACG
ATTCAAAACACCAACTTGTTCGCCGCTTTGGATACTCGGAGGAAGAAGAAGAAGCAGCAG
TCCGATAAGCCCAAAGCTTCCTCCTCCGAGCCTGAGCCACAGGTCTTCTGGTCACCTACT
CCTCTAAAGGCTAAGGCTTGGGCCGATATCGATAGTGACGATGAAGATGATGACTATTTC
GCTACCACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCCCTTGTGGAGTGCTTCCGATGCTAAAGAG
GAAAGTGAGAGTGAAGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGATGATGATGATGATTTGGAG
GAAGAGCATGAGACACGAGTTCATCCAGAAGCAGAGCCTGAGGTGAAAAAGGCTACTGAA
GTTCCTGCACCACCTAAGGAGGCAGAGAGGCAGCTTTCCAAGAAAGAGAGGAAACAAAAG
GAACAAGCTGAGTTTGATGCTTTGTTGGCAGATTTTGGAGTTACACCCAAAGATAGCAAT
GGTCAAGATAAGCAAGAAAAGAAAGAAGTCAATGGAGATGGAGAGAAGAAGGAGAACACA
ACCGGGGAATCAAAGGCCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EI25TF U 1
AF RR4EI25JQ C 103
BS 1 674 RR4EI25TF
BS 675 741 RR4EI25JQ

RD RR4EI25TF 686 0 0
GGGATCCATCTTTTAACGTTCCAATCGATCGAAATCGGGAATTTCTGTTACTGGGTATCG
TAAAGGAATACACTTTCGTCTTTATCTGAATCGTTGATTGTTCGGGAGAGAAGGAGAAGA
AGAAAGGAAGAGATGGTTGGTGGTGGAAACAGGAGAGACGAAGGATCGATGATGCCGACG
ATTCAAAACACCAACTTGTTCGCCGCTTTGGATACTCGGAGGAAGAAGAAGAAGCAGCAG
TCCGATAAGCCCAAAGCTTCCTCCTCCGAGCCTGAGCCACAGGTCTTCTGGTCACCTACT
CCTCTAAAGGCTAAGGCTTGGGCCGATATCGATAGTGACGATGAAGATGATGACTATTTC
GCTACCACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCCCTTGTGGAGTGCTTCCGATGCTAAAGAG
GAAAGTGAGAGTGAAGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGATGATGATGATGATTTGGAG
GAAGAGCATGAGACACGAGTTCATCCAGAAGCAGAGCCTGAGGTGAAAAAGGCTACTGAA
GTTCCTGCACCACCTAAGGAGGCAGAGAGGCAGCTTTCCAAGAAAGAGAGGAAACAAAAG
GAACAAGCTGAGTTTGATGCTTTGTTGGCAGATTTTGGAGTTACACCCAAAGATAGCAAT
GGTCAAGATAAGCA
GAAAGAAGAGTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR4EI25JQ 639 0 0
CGGGAGAGAAGGAGAAGAAGAAAGGAAGAGATGGTTGGTGGTGGAAACAGGAGAGACGAA
GGATCGATGATGCCGACGATTCAAAACACCAACTTGTTCGCCGCTTTGGATACTCGGAGG
AAGAAGAAGAAGCAGCAGTCCGATAAGCCCAAAGCTTCCTCCTCCGAGCCTGAGCCACAG
GTCTTCTGGTCACCTACTCCTCTAAAGGCTAAGGCTTGGGCCGATATCGATAGTGACGAT
GAAGATGATGACTATTTCGCTACCACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCCCTTGTGGAGT
GCTTCCGATGCTAAAGAGGAAAGTGAGAGTGAAGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGAT
GATGATGATGATTTGGAGGAAGAGCATGAGACACGAGTTCATCCAGAAGCAGAGCCTGAG
GTGAAAAAGGCTACTGAAGTTCCTGCACCACCTAAGGAGGCAGAGAGGCAGCTTTCCAAG
AAAGAGAGGAAACAAAAGGAACAAGCTGAGTTTGATGCTTTGTTGGCAGATTTTGGAGTT
ACACCCAAGGATAGCAATGGTCAAGATAAGCAAGAAAAGAAAGAAGTCAATGGAGATGGA
GAGAAGAAGGAGAACACAACCGGGGAATCAAAGGCCTCG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL9235Contig1 728 2 3 U
GTGGGATAAGAGAAGAAAGAAGGAGAAGAAGATGCAAACGCTTCTCATTCATCCATCTAA
GTCTCTCTTCACTTCCCCGATTCGCAGCTCCGGTGACGTCTGCTTCAAATCATCTGAGAA
AGCTTCGCAGTTTCAGTTTCACAATAGAGCCCTAAGCTTCTCTCCGTTTCGTAGCTTCGC
TCCGTGCCGCGATTTCGCCGTTCGGAGGTTTTGCTCGCGAGACGGCGTTTCCGACGGAAT
TGTGGCGGAGGAGGAGGAGCTCGAGCTACTGAACAAGCCTAATCCTTTACCGAAACAAGA
CGAGGAGGAGGAGGAGAATGAGCGTGGGAAGAAGGAAGCAGACGATGACGAGATTCTTGA
GCCGTTTCTCAAATTCTTCAAGCACGAAGAAGTAGAAGAAGTAGAAGAAGAAGAATCGGA
GGAGGAGACGGAGAGAGTCACCGTTGAGTATTACGATCCCAAGCCGGGAGAGTTCGTGGT
TGGGTGTTGTGGTATCCGGTAACGAGAACAAGATCGATGTGAGCATCGGTGCGGATATGT
TAGGGACGATGCTGACCAAAGAGATACTTCCGTTGTACGATAAAGAGTTGGATTACTTGC
TGTGTATTTGAAGTACGACGCTGAAGAGTTCTTGGTTCACGGTAAAATGGGGATTATTAT
GGATGGTGATGGCGATGGAGAAGTGGGTGTTGAAGTTGCGGAGTTGCGCGGCAAGGGAGA
CTGTGGTG


BQ
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GR30TF U 61
AF RR4GQ05TF U 1
BS 1 483 RR4GQ05TF
BS 484 484 RR4GR30TF
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QA 1 577 1 577
DS 

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GGATGGTGATGGCGATGGAGAAGTGGGTGTTGAAGTTGCGGAGTTGCGCGGCAAGGGAGA
CTGTGGTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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TGAACT


BQ
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20 20 20 20 20 20 

AF RR4BE60TF U 1
AF RR4BE60JQ C 536
BS 1 666 RR4BE60TF

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TTATGTGTGTTTCTTTGCTGTTTTGTTGTCCTGTTTTGAACTGAAACCACGTTGTTGAGG
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TGAACT

QA 1 666 1 666
DS 

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GTTTATGAACT

QA 1 131 1 131
DS 



AS 1 2

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TATGTTACACCAAGATAACAGTTGTTTCAATCTAGCAAAATTATATAAAATTATACTTTT
AATAGACTAGTAACCACAAATTACACTTATTTGTTTTCTATTATATATATTATTTTAATG
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TATATATAGAATCAAGGTTCCTAAACATTACTACATATGGCTGACTCACAATTATAGTTA
CTCAGATATATATACACCATTTTTATAAGAGATGACATATAATGTAATGTTAGAAAAACA
TTGTTTAGGAAAAATATAAAAATGGTTGTCC


BQ
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AF RR4B051TF U 1
AF RR4B051JQ C 171
BS 1 710 RR4B051TF
BS 711 711 RR4B051JQ
BS 712 851 RR4B051TF
BS 852 1051 RR4B051JQ

RD RR4B051TF 867 0 0
GTTGAGTGTTGAAGAATGAAGATTATCTGATGTATTTATCTTCTTTTGATTTCCTTTATG
CAGGGACGTCATTTCAATGTTGAATGTCTAATTAGTTTTTCTTATGTTGCATCTCAATCA
TAAAACGATCAAAGCGGTGCGAAAATGTAAGGTGTATCATTACAAAATTAGGTAAGAAAG
AAAATGTTAAACAAATCTAAGAAGGTTGTTCTTGCAAGTTGATAAAGCTTGCAAAAATTT
TAAAAGAAAAAAGGAATCAAAAAGAGAAACGTTACTATAATATTTAAAACGACAACTTTG
CATGAAAAAATAAAATTCCAAAAAGTTGTTGTCCTTGACATAATCACACACCACCACCAT
TATGTTACACCAAGATAACAGTTGTTTCAATCTAGCAAAATTATATAAAATTATACTTTT
AATAGACTAGTAACCACAAATTACACTTATTTGTTTTCTATTATATATATTATTTTAATG
GAAATGCACTGTCATCTACTCATCTTATGAACCAATATTATTTCGAACATTTCCTTATTT
ATTGAGAACATTTAGTGATAATTTTTTTAAATATTGAGAATCAAAAGTGAGTTGTCTATA
AGACTAGTATCAAGAACTCCACAATGTTGCAAGAGGTGATTATTGCTTGTTTATAATGCG
TCCCTTATTAGATACTCAATAAACATCATTATACTAGAAAGATCATTTAG*CCAGTCTTT
GCCTACACACAAGACAAGTTGTATACATGGTACCTTTATTCTCTCTCCAATGAACGATGG
TTATTTTATATCATGATGCCATTCTTACAGTTTTTGTTGTCTACCCCAAAAGTTTGTTTC
AGTTGCACTAA
GTTTTGATTCGAGATG

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR4B051JQ 881 0 0
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GCAAAAATTTTAAAAGAAAAAAGGAATCAAAAAGAGAAACGTTACTATAATATTTAAAAC
GACAACTTTGCATGAAAAAATAAAATTCCAAAAAGTTGTTGTCCTTGACATAATCACACA
CCACCACCATTATGTTACACCAAGATAACAGTTGTTTCAATCTAGCAAAATTATATAAAA
TTATACTTTTAATAGACTAGTAACCACAAATTACACTTATTTGTTTTCTATTATATATAT
TATTTTAATGGAAATGCACTGTCATCTACTCATCTTATGAACCAATATTATTTCGAACAT
TTCCTTATTTATTGAGAACATTTAGTGATAATTTTTTTAAATATTGAGAATCAAAAGTGA
GTTGTCTATAAGACTAGTATCAAGAACTCCACAATGTTGCAAGAGGTGATTATTGCTTGT
TTATAATGCGTCCCTTATTAGATACTCAATAAACATCATTATACTAGAAAGATCATTTAG
GCCAGTCTTTGCCTACACACAAGACAAGTTGTATACATGGTACCTTTATTCTCTCTCCAA
TGAACGATGGTTATTTTATATCATGATGCCATTCTTACAGTTTTTGTTGTCTACCCCAAA
AGTTTGTTTCAGTTGCACTAAAGTTTTGAATTCGAGATGTCAGGATTCGAGTCAGAACTC
TGACACCGCTTATATATAGAATCAAGGTTCCTAAACATTACTACATATGGCTGACTCACA
ATTATAGTTACTCAGATATATATACACCATTTTTATAAGAGATGACATATAATGTAATGT
TAGAAAAACATTGTTTAGGAAAAATATAAAAATGGTTGTCC

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 2

CO CL9238Contig1 747 2 1 U
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BQ
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AF RR4DU30TF U 1
AF RR4DO39TF U 1
BS 1 747 RR4DO39TF

RD RR4DU30TF 568 0 0
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TGGCAACGGGTTTGGTAACGCCATGAATGTTAAGAGAACAGTCAAGGGATATATCAGAGC
TGGCTTTGCTGGAATCATCATCAACGAT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR4DO39TF 747 0 0
GGAATTTTGTGTTCCGAATCAAAGTGAATCCTTTTCAATGGCGTCACTAAGCTTTTACAC
CTCTTCCCCTCCTCGAATTCTCCATCAACAATCTAAACCCATCCTCTTCCCTCCAGACTT
CACACCCTCCATCAGACATATATATACAAAACCCATCTCTGTCTCAAGGCGATCACATGG
CGCCATTAACGCCACCGCATCAGCTTCCGACTCCTCTGGAAACTCAAACCCATCTTCTCC
GGCGAAGAAACTAAGAGAGATTATGCAGTCCCCTGGTGTCCTTCAAGGTCCTTGCTGCTT
CGATGCTCTTAGTGCCAAACTCGTCGAGCGATCTGGGTTTCCTTACTGCATCACCACTGG
GTTCTCTATTTCGGCGGCCCGGATTGGTTTACCGGATAAAGGACTCATTTCTTACGGAGA
AATGGTTGACCAAGGTCAACAGATCACTCAGTCTGTATCCATTCCGGTGATTGGAGACGG
TGGCAACGGGTTTGGTAACGCCATGAATGTTAAGAGAACAGTCAAGGGATATATCAGAGC
TGGCTTTGCTGGAATCATCATCAACGATCAGGTTTCTTGTAGTGGCGGCGGCGAGAGAAG
AGTGGTTTCTAGAGAGGAGCAGTGATGCGTGTTAAAGCTGCGGTTGATGCGCGGAGGGAG
TGTGGTTCAGACATTGTCATTGTAGCGCAACTGATTCTAGAGAGTGTGTCTCTGGAGATC
GTTTAGTAGGCGAGAGCTTTACAGATG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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CGCCCCTCCAATGTCCTCTCCCTCCCCGAACTCTCCCTATATGAGCAGTTTCAAAGAGAA
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GATGCAACTTTGGCGCATAAGGCTGAAGCCTTGGAGCTGCAGAGGCAGCTAAGGCGGTTA
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GCGCATTATCATTCCGGCGAAGAGGATGGAATCTACTTAGCTTACTCCGATTTTCATGCC
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GAC


BQ
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10 10 10 

AF RR4A301TF U 1
AF RR4A301TFB U 1
BS 1 686 RR4A301TF
BS 687 723 RR4A301TFB

RD RR4A301TF 686 0 0
AGAGGCTGCGATCTAACCGGCGGAAGAAGACGCAAATCGGAGATGAGCGGTGCGAGACTG
TGCTCTCTGGTGGCGGAGCTAGGTTACGAAGGCGCCGGAAAGCTAGACCCGGACAGCTTC
GAATGGCCGTTCCAGTACGACGACGCACGCCCTATCCTCGACTGGATCTGCTCCTCTCTT
CGCCCCTCCAATGTCCTCTCCCTCCCCGAACTCTCCCTATATGAGCAGTTTCAAAGAGAA
GGGAAGCTTTTAGAGGGAGAGGATCTAGACCAGGCTTATGATAGCATATCAGCATTTTCT
TCCAGGAGAAACAACCAGGAGGCAGTTTTTGGAGCGGAAGAAAGCATAAAAGAAGTAAGA
GATGCAACTTTGGCGCATAAGGCTGAAGCCTTGGAGCTGCAGAGGCAGCTAAGGCGGTTA
CAGACTCAATATGATTTTCTAACTGGCCAATCATCATCTCTGATTCAAGGGAGACGTGCG
CGAGTTGCTGCTACTTCTGCTGTCACTGGACAGATAACATCGATAGAAGACAGTTTATCT
GCTAGAAACTTGCAGATGAATGGAGTTCTAGGAAGATTGGCTTCCACTTCTCAAGAGCTG
GCGCATTATCATTCCGGCGAAGAGGATGGAATCTACTTAGCTTACTCCGATTTTCATGCC
TACTTGGCTGGAGATTCAGCCTGCAC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4A301TFB 723 0 0
AGAGGCTGCGATCTAACCGGCGGAAGAAGACGCAAATCGGAGATGAGCGGTGCGAGACTG
TGCTCTCTGGTGGCGGAGCTAGGTTACGAAGGCGCCGGAAAGCTAGACCCGGACAGCTTC
GAATGGCCGTTCCAGTACGACGACGCACGCCCTATCCTCGACTGGATCTGCTCCTCTCTT
CGCCCCTCCAATGTCCTCTCCCTCCCCGAACTCTCCCTATATGAGCAGTTTCAAAGAGAA
GGGAAGCTTTTAGAGGGAGAGGATCTAGACCAGGCTTATGATAGCATATCAGCATTTTCT
TCCAGGAGAAACAACCAGGAGGCAGTTTTTGGAGCGGAAGAAAGCATAAAAGAAGTAAGA
GATGCAACTTTGGCGCATAAGGCTGAAGCCTTGGAGCTGCAGAGGCAGCTAAGGCGGTTA
CAGACTCAATATGATTTTCTAACTGGCCAATCATCATCTCTGATTCAAGGGAGACGTGCG
CGAGTTGCTGCTACTTCTGCTGTCACTGGACAGATAACATCGATAGAAGACAGTTTATCT
GCTAGAAACTTGCAGATGAATGGAGTTCTAGGAAGATTGGCTTCCACTTCTCAAGAGCTG
GCGCATTATCATTCCGGCGAAGAGGATGGAATCTACTTAGCTTACTCCGATTTTCATGCC
TACTTGGCTGGAGATTCAGCCTGCACAAAGGAGCTAAACCAGTGGTTTACTAAGCAGCTG
GAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL9240Contig1 528 2 1 U
GGACATGATGGCGTCGTCCTCCTCGTTCTCAGTGAGAATTGCCTTACTTCTTCTGATATT
CTGCTTGATCGGCTTACGAGCTGCGAATGGTCAAACTGGCGACGACATCTGCGGTGGGGT
TCCGGATCCATTTGCGTGCCCAGTAAACTGTTTCCAAGAGGATCTGGTTTGCGGAGCCGA
TGGGGTCACGTACTCGTGCGGCTGTGAGGACGCAGCGTGCAATGGAGCTCGTGTGGTAAA
AAGAGGAGCTTGCGACGCAGGTAACGCTGGAAGTGATTCTGTACGTGGATAAGCCTTGTT
ATTGATTCATATCGTTTGGCTCTTCTTGCTCGGACTCTCTCTTCTCGTTGGTGCTTTCTG
ATCTCAAGACTTGTGTTTGAGATGTATCAAGCTCTGTATATCGAACATTGAATGTTTTTT
TTCCTTTTGTGTCTGTATGTTCTTAGTTGAGTTGCTGTCTCAACTCAGAGTACACGTGTT
GTGTTTTGTAATTTAATAGTAATAAATAAAGTTTACAAGCTGTTTACT


BQ
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AF RR4BX57JQ C 1
AF RR4BX57TF U 1
BS 1 528 RR4BX57TF

RD RR4BX57JQ 528 0 0
GGACATGATGGCGTCGTCCTCCTCGTTCTCAGTGAGAATTGCCTTACTTCTTCTGATATT
CTGCTTGATCGGCTTACGAGCTGCGAATGGTCAAACTGGGGACGACATTTGCGGTGGGGT
TCCGGATCCATTTGCGTGCCCAGTAAACTGTTTCCAAGAGGATTTGGTTTGCGGAGCCGA
TGGGGTCACGTACTCGTGCGGCTGTGAGGACGCAGCGTGCAATGGAGCTCGTGTGGTAAA
AAGAGGAGCTTGCGACGCAGGTAACGCTGGAAGTGATTCTGTACGTGGATAAGCCTTGTT
ATTGATTCATATCGTTTGGCTCTTCTTGCTCGGACTCTCTCTTCTCGTTGGTGCTTTCTG
ATCTCAAGACTTGTGTTTGAGATGTATCAAGCTCTGTATATCGAACATTGAATGTTTTTT
TTCCTTTTGTGTCTGTATGTTCTTAGTTGAGTTGCTGTCTCAACTCAGAGTACACGTGTT
GTGTTTTGTAATTTAATAGTAATAAATAAAGTTTACAAGCTGTTTACT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR4BX57TF 528 0 0
GGACATGATGGCGTCGTCCTCCTCGTTCTCAGTGAGAATTGCCTTACTTCTTCTGATATT
CTGCTTGATCGGCTTACGAGCTGCGAATGGTCAAACTGGCGACGACATCTGCGGTGGGGT
TCCGGATCCATTTGCGTGCCCAGTAAACTGTTTCCAAGAGGATCTGGTTTGCGGAGCCGA
TGGGGTCACGTACTCGTGCGGCTGTGAGGACGCAGCGTGCAATGGAGCTCGTGTGGTAAA
AAGAGGAGCTTGCGACGCAGGTAACGCTGGAAGTGATTCTGTACGTGGATAAGCCTTGTT
ATTGATTCATATCGTTTGGCTCTTCTTGCTCGGACTCTCTCTTCTCGTTGGTGCTTTCTG
ATCTCAAGACTTGTGTTTGAGATGTATCAAGCTCTGTATATCGAACATTGAATGTTTTTT
TTCCTTTTGTGTCTGTATGTTCTTAGTTGAGTTGCTGTCTCAACTCAGAGTACACGTGTT
GTGTTTTGTAATTTAATAGTAATAAATAAAGTTTACAAGCTGTTTACT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL9241Contig1 1329 2 2 U
GTGACATGTAATTTTGATGTTATCTGTCCAGCATTAAAGCTCTTGCTTGCAAAGGATATA
AGAATAGAAGGATTCTCATTCCCAGGGACCTATCATTAATAATGTTACTTGTCTTACTAC
AGTTCAGGATAAAATCACGGAATGAACTAACAAAAGAACCACACAGTTTACCTTAAACTG
GGCAAATGAAGCAGCATGTGCTTCAAGGGCCTGGCTCCGCTGTTGATCCACAGAGAAAAG
CTGCATATTCCCTTTAACCAATTGTGGTCTCTACAGAAGATAATAATGAAAACGCCGGTC
AAGAACATATAAAATGACTATCATTATGATGTCTCCAATCAGCCTAATATGTGGCGCAGT
AAACCTACCTCAGGAGAGCCAGGAGCAATTCCAATCAGCACCAACCACTTCTCATTAGGA
GAGCACTTGTAGTTAATAATTTGATTGTTTGCCAAATTGGCCGTTCTATCAAACATCTTA
ACTGGCTCAGATTCACCTGGAAATATGCGAGCAAAATTAGAGACAACATATAGAATGTAT
GACGAAGATGACAGTAATTTAAGATTTAGAACCTTCAATCGACCAATGATACACGGAAGT
TTGTGTGACCAGACCCAACATCTTTGGTGTAATCCATTTCCAAAAAGCAACCTATAAAAC
ATGGGCGGTTAATATCCAAAATAAATCTAAGTACAACATGAAAGATACCGAGTAACAAAG
AGTTCGTTTCGGTGCTCACCTGCTCAGGCATCTGATGAGACTTCAACTTTGCTTTTGCTT
CGATGTTAAATATCTGTAGATGATCCTGAGTAGTTCCTGGAACTTGAGCTATACACAAAT
TAAAGAAAAAAAAAGTGAGCAACAAAGTAGGAAACATCCATTACAGACCTAATTGACACA
AACACAACCATGTAAGATATCACATGTCAGAAACCATAGAACTCTACCCTGATGTCTTCG
TTACTGAATTAATATAATAGGGTTTCTATCAAATAATGCATCACAACAGGCACGTACTCG
TTCAAACTAAGTAGGAGTTATCAATGATAGTTCAAGAAAAAAACATCAAAAGGAAACCAT
TCTATGGCACGATTTATTAAAAAAGGAAACAGACAAATACCTTTCAAGGCAAGGATCCTA
GAGTTCGGGTTCATAAGAGCAGAATCTGCAGTGATAGGTCTCCTTAGAGGCTGCATAGGC
ATATTCATATCAATAATCACAACGCTGTTTTGCGGCGCAGTCTCTCGCACACATATGTAC
TTATCAGACTCCATAGTGACATTAGTAAACGTGATGAACTGCTGATTGATCCCAACGCTC
GGTAGCTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EN87TF U 1
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AAACCTACCTCAGGAGAGCCAGGAGCAATTCCAATCAGCACCAACCACTTCTCATTAGGA
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GACGAAGATGACAGTAATTTAAGATTTAGAACCTTCAATCGACCAATGATACACGGAAGT
TTGTGTGACCAGACCCAACATCTTTGGTGTAATCCATTTCCAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 

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CATGAAAGATACCGAGTAACAAAGAGTTCGTTTCGGTGCTCACCTGCTCAGGCATCTGAT
GAGACTTCAACTTTGCTTTTGCTTCGATGTTAAATATCTGTAGATGATCCTGAGTAGTTC
CTGGAACTTGAGCTATACACAAATTAAAGAAAAAAAAAGTGAGCAACAAAGTAGGAAACA
TCCATTACAGACCTAATTGACACAAACACAACCATGTAAGATATCACATGTCAGAAACCA
TAGAACTCTACCCTGATGTCTTCGTTACTGAATTAATATAATAGGGTTTCTATCAAATAA
TGCATCACAACAGGCACGTACTCGTTCAAACTAAGTAGGAGTTATCAATGATAGTTCAAG
AAAAAAACATCAAAAGGAAACCATTCTATGGCACGATTTATTAAAAAAGGAAACAGACAA
ATACCTTTCAAGGCAAGGATCCTAGAGTTCGGGTTCATAAGAGCAGAATCTGCAGTGATA
GGTCTCCTTAGAGGCTGCATAGGCATATTCATATCAATAATCACAACGCTGTTTTGCGGC
GCAGTCTCTCGCACACATATGTACTTATCAGACTCCATAGTGACATTAGTAAACGTGATG
AACTGCTGATTGATCCCAACGCTCGGTAGCTGG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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TAAAAGCTTTAATCTTTCCGACAATCTTTGTCTCCCCTCTCTTCTGAGATTGACGATGTC
AACACCAGCTAGGAAGAGGCTTATGAGGGATTTCAGGAGGTTGCAGCAAGATCCTCCTGC
CGGTATCAGTGGTGCTCCTCATGACAACAACATCTTGCTCTGGAACGCTGTTATCTTCGG
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TTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTTTGTTTCTCGCATGTTTCACCCAAACATCTA
TGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTTACAGAACCAGTGGAGTCCTATCTATGATGT
GGCAGCGATTCTCACATCTATCCAGTCACTGCTCTGTGATCCCAACCCAAACTCGCCTGC
GAACTCAGAAGCCGCTCGCTTATTCAGCGAGAGCAAGCGAGAGTACAACAGACGTGTTAA
GGAGATTGTCGAACAGAGCTGGACCGCTGACTAATTTGTCACACCCCAGTTTGTAATATT
TGAAGTGGAGGCCTGTCAAATTGGTTAAAAACAGTTTGTTTGTTACATGCCTCCGGTTCA
GTATATGTAATGTAATTGACTTATGTAATGTATTACAATTTCCTGATAAGACAATCTTGC
TTGCTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C151TF U 1
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BS 1 282 RR4C151TF
BS 283 727 RR4C151JQ

RD RR4C151TF 282 0 0
GGGAGGTTGACACCTTTGAAGGTGCCGCGGCGACCCAATCAATCCTAACTCTCTTTTATT
TAAAAGCTTTAATCTTTCCGACAATCTTTGTCTCCCCTCTCTTCTGAGATTGACGATGTC
AACACCAGCTAGGAAGAGGCTTATGAGGGATTTCAGGAGGTTGCAGCAAGATCCTCCTGC
CGGTATCAGTGGTGCTCCTCATGACAACAACATCTTGCTCTGGAACGCTGTTATCTTCGG
TCCAGATGATACGCCTTGGGATGGAGGTACTTTTAAGTTGAC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR4C151JQ 679 0 0
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ATTGACGATGTCAACACCAGCTAGGAAGAGGCTTATGAGGGATTTCAGGAGGTTGCAGCA
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TGTTATCTTCGGTCCAGATGATACGCCTTGGGATGGAGGTACTTTTAAGTTGACTCTTCA
ATTCACAGAGGATTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTTTGTTTCTCGCATGTTTCA
CCCAAACATCTATGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTTACAGAACCAGTGGAGTCC
TATCTATGATGTGGCAGCGATTCTCACATCTATCCAGTCACTGCTCTGTGATCCCAACCC
AAACTCGCCTGCGAACTCAGAAGCCGCTCGCTTATTCAGCGAGAGCAAGCGAGAGTACAA
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GTTTGTAATATTTGAAGTGGAGGCCTGTCAAATTGGTTAAAAACAGTTTGTTTGTTACAT
GCCTCCGGTTCAGTATATGTAATGTAATTGACTTATGTAATGTATTACAATTTCCTGATA
AGACAATCTTGCTTGCTTC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL9243Contig1 757 2 9 U
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CTTGTCTTCGACTAGTTCAACAAAAACCTCCACTTGTCAATGGAGTTGTCCGTTTCCATT
TACAAAGATCATCTCATGTTTCTTTATACCGTTTTGGTTTCAACTCAAACCCATTCTGTA
AAACTCAGACCACAAGATTCTCCAAGTATTTACCTCCGAGACTGTCTGATGAACGCAGAG
AAACACAAGTAACTACTGAAGAAGAGGATGTCCAGTTTCAGAGGCTGTTCTCTAACCTTA
ACCAATCAACACTGAAGCGAGAGTCCGGAAGCTTGTCTAGTGCTATCTTCTTGGTTGCTG
GCACTACAGTAGGTGCAGGGATACTTGCAATTCCAGCAGTGACACAAGAATCAGGTTTTC
TAGCCTCTGCAGTCGCTTGCATTCTCTGTTGGGCTTTCATGGCTGTCACAGGTTTGCTTG
TTGCTGAAGTCAATGTCAACACCATGTCTGAGCTAGGCTCTGGAGGAGTATCTCTCGTTT
CGATGGCGAAGAGGACTCTTGGATCTTTTGGAGTTCAAGTTGCATCCTGGTCCTACATTC
TCATACATTATACTCTCCTCGTGGCCTACATTGCTCGGTCTTCAGGCATCCTTACAAACT
TCCTCGGCATTCCAATATGGGAGAGCGCAACTCTGTTCTCACTTGTTCTTGGAGGCATTT
GCTTCTTTGGAAGCCAGAGATTCATCGGTGCAACCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4EC94TF U 22
AF RR4B285TF U 1
BS 1 73 RR4B285TF
BS 74 76 RR4EC94TF
BS 77 167 RR4B285TF
BS 168 168 RR4EC94TF
BS 169 419 RR4B285TF
BS 420 420 RR4EC94TF
BS 421 490 RR4B285TF
BS 491 491 RR4EC94TF
BS 492 757 RR4B285TF

RD RR4EC94TF 619 0 0
GGG
GATCGTAGAGAGATATGTCTGTCTCTATGAGTAACGCTTGTCTTCGACTAGTTCAACAAA
AACCTCCACTTGTCAATGGAGTTGTCCGTTTCCATTTACAAAGATCATCTCATGTTTCTT
TATACCGTTTTGGTTTCAACTCAAACCCATTCTGTAAAACTCAGACCACAAGATTCTCCA
AGTATTTACCTCCGAGACTGTCTGATGAACGCAGAGAAACACAAGTTACTACTGAAGAAG
AGGATGTCGAGTTTCAGAGGCTGTTCTCTAACCTTAACCGATCAACACTGAAGCGAGAGT
CCGGAAGCTTGTCTAGTGCTATCTTCTTGGTTGCTGGCACTACAGTAGGTGCAGGGATAC
TTGCAATTCCAGCAGTGACACAAGAATCAGGTTTTCTAGCCTCTGCAGTCTCTTGCATTC
TCTGTTGGGCTTTCATGGTTGTCACAGGTTTGCTTGTTGCTGAAGTCAATGTCAACACCA
TGTCTGAGCTTGGCTCTGGAGGAGTATCTCTCGTTTCGATGGCGAAGAGGACTCTTGGAT
CTTTTGGAGTTCAAGTTGCATCCTGGTCCTACATTCTCATACATTATACTCTCCTCGTGG
CCTACATTGCTCGGTC

QA 4 619 4 619
DS 

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CTTGTCTTCGACT***TCAACAAAAACCTCCACTTGTCAATGGAGTTGTCCGTTTCCATT
TACAAAGATCATCTCATGTTTCTTTATACCGTTTTGGTTTCAACTCAGACCCATTCTGTA
AAACTCAGACCACAAGATTCTCCAAGTATTTACCTCCGAGACTGTCTGATGAACGCAGAG
AAACACAAGTAACTACTGAAGAAGAGGATGTCCAGTTTCAGAGGCTGTTCTCTAACCTTA
ACCAATCAACACTGAAGCGAGAGTCCGGAAGCTTGTCTAGTGCTATCTTCTTGGTTGCTG
GCACTACAGTAGGTGCAGGGATACTTGCAATTCCAGCAGTGACACAAGAATCAGGTTTTT
TAGCCTCTGCAGTCGCTTGCATTCTCTGTTGGGCTTTCATGGCTGTCACAGGTTTGCTTG
TTGCTGAAGTGAATGTCAACACCATGTCTGAGCTAGGCTCTGGAGGAGTATCTCTCGTTT
CGATGGCGAAGAGGACTCTTGGATCTTTTGGAGTTCAAGTTGCATCCTGGTCCTACATTC
TCATACATTATACTCTCCTCGTGGCCTACATTGCTCGGTCTTCAGGCATCCTTACAAACT
TCCTCGGCATTCCAATATGGGAGAGCGCAACTCTGTTCTCACTTGTTCTTGGAGGCATTT
GCTTCTTTGGAAGCCAGAGATTCATCGGTGCAACCAA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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ATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACGCATAA
CTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCACCTTTCATCCACCATAAAACCTC
CACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATGTTGGAGGGCAGAACTAGAGAGTGACTTTTTCTTA
AGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAAGAGGAAGTATATGATGAGTATGTGA
TAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATGATC
AACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTA
CGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTCTTGGAAGAAGATTCAAATTAAATCTTGTTAAT
GCGTCAGTGTCGCCATGCATATGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4A790JQ C 1
AF RR4A790TF U 1
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GCGTCAGTGTCGCCATGCATATGAAG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR4A790TF 566 0 0
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GACCGTCGTGATTTTTCTCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTATAGG
ATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACGCATAA
CTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCACCTTTCATCCACCATAAAACCTC
CACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATGTTGGAGGGCAGAACTAGAGAGTGACTTTTTCTTA
AGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAAGAGGAAGTATATGATGAGTATGTGA
TAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATGATC
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GCGTCAGTGTCGCCATGCATATGAAG

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL9245Contig1 549 2 1 U
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CTATGGTCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGCGTGAGGTTTGAGACACGTGA
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CCCTTAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4AP58JQ C 1
AF RR4AP58TF U 1
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CCCTTAAAC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR4AP58TF 549 0 0
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CTATGGTCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGCGTGAGGTTTGAGACACGTGA
GATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATTTCTGAATCACTTTCTT
CCCTTAAAC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL9246Contig1 512 2 2 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EV89TF U 1
AF RR4EV89JQ C 1
BS 1 312 RR4EV89TF
BS 313 512 RR4EV89JQ

RD RR4EV89TF 312 0 0
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AGATGGAAAAGTTGAAGCGTATTGTAACTCAGCTGAAGGGTTTGGTTATGGAGTGGTTCA
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GGATTTTGACGG

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR4EV89JQ 512 0 0
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GTGCAGTGACGCAGTCCCTTGCAGCCACATTGTACTCAACAACGTCAATTTAGAAGGCAA
AGATGGAAAAGTTGAAGCGTATTGTAACTCAGCTGAAGGGTTTGGTTATGGAGTGGTTCA
TCCCTTTGCGGATTGTCTGGACTCACATGACAATAAGAGCTTGGACCAAACTAAGTTTGT
CAGAAACTGTCATGGTCGGTGAAGAAGCCGGGAATGCCCACGACGAGCTTTAAGGTGACC
GGATTTTGACGGCTGTCGTAGTGAGAGGGTTGCTGTACACGTAATATAGCTGTACCAATT
CATTTTAGCAACTGACATATATTTATATATAGCTTTTAAATGAAGCACATACAATGAGAT
TGACAAGCATTGTAGTATTTGGTATACAATAAATAACTAGAATATGACCCGCGCCTTGCG
CGGAGTGAAAAAATTAATAAATTATTTTACGC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL9247Contig1 1080 2 2 U
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CTTCTTCTCTATTCTTCTACTATCTTCTGTTTCTTCTTGTGTTATTTGTCTGTGTTTTCA
TGGTCGTGGTGGGTTGAGTTTGATTCGTCATGGGTCAGATCTGGTTTCATCCGTCTAGCT
GTTGACATCAAGGGAGCTCGCGCAGAGTTGGGAAATAGCATGTTTGTGCATGCGGCTTGG
CTATATGTGCGGTTAGCTCTTCTTTTTTGTGCAGGTTCCGGATCTGTAGAGGTCCTTATT
GGTGGCGTGTGTGGTGTCTTTAGGTGGGGGCTGCTAGCTCATCCTCCATCACCCTTCCCG
TGGAAACACATCTGGTGTAGACAAGTGTTCAGCCCATGAGAGACTGCTTTATAGATGAGT
TTCTCTGTGGTTTTTGTTTCATTTGAGTTGGTTATACGGAGCAGCGTTGGTTCTTTGTTT
GATTTGGATTGCTGGTGTTGAAGATTTTTTTATATTGGTGTTGATGGCAACGGTTCAGTC
ATGGTGTTGATTGTGTTTGGAGCTTTGGCTCATGGTTACTTAAACTGTGGGAAGTGTGAA
CTTGATGGCTTTGTACAGTTATGAAACGAAAGCGAATGGTTCTTAGCTTTGTTTCTTGGT
ATAGAGAGGATTTCAACTTCGGTTATGACCATAAACTTAAGTCTTCTCAAGATGTTTTGC
TGGTGTTTGAGCACAAAAAGAGGCGGTCTCGGATAACGTATGATAGTGTTGTGTTTCTAC
GTTTAGCTGCCTCTTCTTGGGTCTTTGATATGCTCTAAAGTTGCAATCTGTGGCATGGTT
GTGGATCAACATTTGCTATCTACTGATAGTGTCGTTTTCCCCTCCTCTTTGGCCATCTTT
GTTATCTTATTTCTTTACTTTCAGTTTCTTTTGCATTTTCCTTCGTTAGATCCGTCCAAC
TGTTGGAGTTTGGATCGTTGGAACAATGTCTTGTATTTTGATTGAATCAAACCCAGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CTTCTTCTCTATTCTTCTACTATCTTCTGTTTCTTCTTGTGTTATTTGTCTGTGTTTTCA
TGGTCGTGGTGGGTTGAGTTTGATTCGTCATGGGTCAGATCTGGTTTCATCCGTCTAGCT
GTTGACATCAAGGGAGCTCGCGCAGAGTTGGGAAATAGCATGTTTGTGCATGCGGCTTGG
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ATGGTGTTGATTGTGTTTGGAGCTTTGGCTCATGGTTACTTAAACTGTG

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TTTTTTTATATTGGTGTTGATGGCAACGGTTCAGTCATGGTGTTGATTGTGTTTGGAGCT
TTGGCTCATGGTTACTTAAACTGTGGGAAGTGTGAACTTGATGGCTTTGTACAGTTATGA
AACGAAAGCGAATGGTTCTTAGCTTTGTTTCTTGGTATAGAGAGGATTTCAACTTCGGTT
ATGACCATAAACTTAAGTCTTCTCAAGATGTTTTGCTGGTGTTTGAGCACAAAAAGAGGC
GGTCTCGGATAACGTATGATAGTGTTGTGTTTCTACGTTTAGCTGCCTCTTCTTGGGTCT
TTGATATGCTCTAAAGTTGCAATCTGTGGCATGGTTGTGGATCAACATTTGCTATCTACT
GATAGTGTCGTTTTCCCCTCCTCTTTGGCCATCTTTGTTATCTTATTTCTTTACTTTCAG
TTTCTTTTGCATTTTCCTTCGTTAGATCCGTCCAACTGTTGGAGTTTGGATCGTTGGAAC
AATGTCTTGTATTTTGATTGAATCAAACCCAGTGTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL9248Contig1 799 2 8 U
GGGTGGATCCGTATTTCAAGACATCAAGGTTATCCTTGTTAGACCGTGGTTTTGTCTACG
TAATTGCACATGTTCGTGGAGGTGGTGAAATGGGGAGACAGTGGTACGAGAACGGGGAGC
TGCTGAAAAAGAAAAACACGTTCACTGATTTTATCGCTTGTGCTGAGTCTTTAATAGAAC
TTAAGTACTGTTCAAAGGAAAAACTGTGTGTGGAAGGAAGAAGTGCTGGTGGGCTGCTGA
TGGGTGCTGTTCTTAACATGAGGCCTGATTTGTTCAAGGTGGTTGTCGCTGGTGTTCCTT
TTGTAGACGCTTTGACAACAATTCTGGATCCAACTATTCCGCTTACGACATCAGAATGGG
AGGAGTGGGGTGACCCTAGGAAGGAAGAATATTACTTCTATATGAAATCGTATTCCCCTG
TTGACAATGTTACAGCGCAGAATTATCCAAATGTTCTTGTAACCGCTGGGTTAAATGATC
CAAGGGTGATGTACTCTGAACCTTCCAAGTTCGTGGCGAAACTGAGAGAAATGAAGACTG
ACAACAACTTGCTTTTGTTCAAATGTGACCTTGGCGCTGGACATTTCTCCAAATCTGGGA
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AAGAGAAAGATCATGTTAG


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TAATTGCACATGTTCGTGGAGGTGGTGAAATGGGGAGACAGTGGTACGAGAACGGGGAGC
TGCTGAAAAAGAAAAACACGTTCACTGATTTTATCGCTTGTGCTGAGTCTTTAATAGAAC
TTAAGTACTGTTCAAAGGAAAAACTGTGTGTGGAAGGAAGAAGTGCTGGTGGGCTGCTGA
TGGGTGCTGTTCTTAACATGAGGCCTGATTTGTTCAAGGTGGTTGTCGCTGGTGTTCCTT
TTGTAGACGCTTTGACAACAATTCTGGATCCAACTATTCCGCTTACGACATCAGAATGGG
AGGAGTGGGGTGACCCTAGGAAGGAAGAATATTACTTCTATATGAAATCGTATTCCCCTG
TTGACAATGTTACAGCGCAGAATTATCCAAATGTTCTTGTAACCGCTGGGTTAAATGATC
CAAGGGTGATGTACTCTGAACCTTCCAAGTTCGTGGCGAAACTGAGAGAAATGAAGACTG
ACAACAACTTGCTTTTGTTCAAATGTGACCTTGGCGCTGGACATTTCTCCAAATCTGGGA
GATTTGAGAAGCTTCAGGAAGATGCATTTACGTTTACTTTCATGATGAAAGTTTTGGACA
TGATTTCTGTTACTGTGTGAGTAGTACTCGCAAGAAAGCCTTTAATAGTTTATCTTCTTT
*ATTTGGTGTTT*GTTTATTCC*TGATCCCTT

QA 1 752 1 752
DS 

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AATAGAACTTAAGTACTGTTCAAAGGAAAAACTGTGTGTGGAAGGAAGAAGTGCTGGTGG
GCTGCTGATGGGTGCTGTTCTTAACATGAGGCCTGATTTGTTCAAGGTGGTTGTCGCTGG
TGTTCCTTTTGTAGACGCTTTGACAACAATTCTGGATCCAACTATTCCGCTTACGACATC
AGAATGGGAGGAGTGGGGTGACCCTAGGAAGGAAGAATATTACTTCTATATGAAATCGTA
TTCCCCTGTTGACAATGTTACAGCGCAGAATTATCCAAATGTTCTTGTAACCGCTGGGTT
AAATGATCCAAGGGTGATGTACTCTGAACCTTCCAAGTTCGTGGCGAAACTGAGAGAAAT
GAAGACTGACAACAACTTGCTTTTGTTCAAATGTGACCTTGGCGCTGGACATTTCTCCAA
ATCTGGGAGATTTGAGAAGCTTCAGGAAGATGCATTTACGTTTACTTTCATGATGAAAGT
TTTGGACATGATTTCTGTTACTGTGTGAGTAGTACTCGCAAGAAAGCCTTTAATAGTTTA
TCTTCTTTTATTTGGTGTTTTGTTTATTCCCTGATCCCTTCTAGAAACATTTTATGCGTT
TGGTAATAAAGAGAAAGATCATGTTAG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL9249Contig1 839 2 2 U
GGATCTTTTCTTACATTCTCAATCAATGACGTGAAAGCTTCACAGTTACCCAAAAAAAAG
TGTGAAAGCTTCTATACGCCTCCCCTAATTAATCAGGTTCAGAGTTGCACAAACATGTAA
GATTATTCTGGCTCTCTCGAAGCTGCTCAGATACTTAGTAGAGACACAAAAGCTTCCAAC
AAAGAGATCTCAGACTGAATTGTGTAGGAATTTGTTGGTCTTCTAGGATTTCGTGTGAGA
TTACTTGAAATCAATCAAGTATTGGAATTAATCCATCACCACCAGGTTCCATATCTTTCT
CCCTCACGACTTCCAATCCATCTTAACCCATCCATTTTTTTCATGCTTTCTTTGGAGCTG
TTTGGTACATGTGTGGTTGCGGAGCTGCAGAAACTGGATAAAGATTATTCCTACACATAA
TCTTCCCTTCCCTTTCTCCCTGCCATATTTATCTATAATTGATAATGTAAGAGGTTAATA
ATGTATAGAATAAGATTATTATCTTAGAAGTTGCAGGTATGGATTCTGTAAAATCAGCAT
ATGAAATTCATTGTATAAATTCTCTTGATCCCGTGCAACAGGTCAAGTGATGGTGGCGGT
GGATTCTGTGATTCCTCCAAGTGTAGGAGTATACGTCTCCCCCATCTTACCCACTCCGCA
ATAAGACGACTCAGACAAATGAGAGAGGTATTATTTACGGAACCTGAAGAAGAAAAAAAT
TGAAACAAGCAAATCAGGAGTCTTAGTGATATCTGAGATGTAACAATCTTTAGTGAAGCT
TTGTCTATGAGCCAAAATCCATACTGTCGATGCACATGTTTTTCTATGTTTAAACAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D374TF U 1
AF RR4D374JQ C 296
BS 1 622 RR4D374TF
BS 623 839 RR4D374JQ

RD RR4D374TF 622 0 0
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TGTGAAAGCTTCTATACGCCTCCCCTAATTAATCAGGTTCAGAGTTGCACAAACATGTAA
GATTATTCTGGCTCTCTCGAAGCTGCTCAGATACTTAGTAGAGACACAAAAGCTTCCAAC
AAAGAGATCTCAGACTGAATTGTGTAGGAATTTGTTGGTCTTCTAGGATTTCGTGTGAGA
TTACTTGAAATCAATCAAGTATTGGAATTAATCCATCACCACCAGGTTCCATATCTTTCT
CCCTCACGACTTCCAATCCATCTTAACCCATCCATTTTTTTCATGCTTTCTTTGGAGCTG
TTTGGTACATGTGTGGTTGCGGAGCTGCAGAAACTGGATAAAGATTATTCCTACACATAA
TCTTCCCTTCCCTTTCTCCCTGCCATATTTATCTATAATTGATAATGTAAGAGGTTAATA
ATGTATAGAATAAGATTATTATCTTAGAAGTTGCAGGTATGGATTCTGTAAAATCAGCAT
ATGAAATTCATTGTATAAATTCTCTTGATCCCGTGCAACAGGTCAAGTGATGGTGGCGGT
GGATTCTGTGATTCCTCCAAGT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR4D374JQ 544 0 0
TTTCTCCCTCACGACTTCCAATCCATCTTAACCCATCCATTTTTTTCATGCTTTCTTTGG
AGCTGTTTGGTACATGTGTGGTTGCGGAGCTGCAGAAACTGGATAAAGATTATTCCTACA
CATAATCTTCCCTTCCCTTTCTCCCTGCCATATTTATCTATAATTGATAATGTAAGAGGT
TAATAATGTATAGAATAAGATTATTATCTTAGAAGTTGCAGGTATGGATTCTGTAAAATC
AGCATATGAAATTCATTGTATAAATTCTCTTGATCCCGTGCAACAGGTCAAGTGATGGTG
GCGGTGGATTCTGTGATTCCTCCAAGTGTAGGAGTATACGTCTCCCCCATCTTACCCACT
CCGCAATAAGACGACTCAGACAAATGAGAGAGGTATTATTTACGGAACCTGAAGAAGAAA
AAAATTGAAACAAGCAAATCAGGAGTCTTAGTGATATCTGAGATGTAACAATCTTTAGTG
AAGCTTTGTCTATGAGCCAAAATCCATACTGTCGATGCACATGTTTTTCTATGTTTAAAC
AAAC

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL9250Contig1 681 2 1 U
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AAAAATGGAGTCATCAAGATTTCAACTTGTTGCCCTTTTCGTCATCTTCTCTCTCGTAAT
TTCTGCCAAATCTCGAGGAGATGATATATTGGAGGGACCGTGCCGCTTGAGGGGAACGTG
CAAACAGGACAGCGACTGTGACGTTCATTGCCATCGAAAGACCGACCCTCCAGGCATGGG
CGGCCACTGCATCTTGGCTAGACCCGCTGGTCCCGTTTGCTGCTGCCTTTTTGATTAATC
CGATATCATTTTTAATTCTTTAACTATCCATGATCAATATTTTTAGCAATAAACAAAAGT
CCCCTGATCAAATAAGTTCTTAATTTATTTACGTCCCAACTCCCAATAAAGCGAATAATA
AATCCACTTCTAAAACAGAGATTTTTTATTTTAGAAAAAATACAGATATAGATTAGAGAT
GGTCTTATAAAGTTTCTCTTTTCTAGAGCTAAAATTAGAGAAATACATTGGAGATCAGTT
TTATAATTTGATTTTTTTTCTTATATTTTGATTTTTTTTTCTTTTTGTTTACCGCACAGA
CAATTGTATCATGTCATGGTAGTTTTTTTTTTCAATTGTAAGAGAATGGCTATTATTAGT
GAACAATTAAATATTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4G218TF U 1
AF RR4G218JQ C 112
BS 1 681 RR4G218TF

RD RR4G218TF 681 0 0
GGAAACACAAGATTTCGAGTTGAACACTTACTACAAAAGCAAACAAAACTGCAAAAAAAA
AAAAATGGAGTCATCAAGATTTCAACTTGTTGCCCTTTTCGTCATCTTCTCTCTCGTAAT
TTCTGCCAAATCTCGAGGAGATGATATATTGGAGGGACCGTGCCGCTTGAGGGGAACGTG
CAAACAGGACAGCGACTGTGACGTTCATTGCCATCGAAAGACCGACCCTCCAGGCATGGG
CGGCCACTGCATCTTGGCTAGACCCGCTGGTCCCGTTTGCTGCTGCCTTTTTGATTAATC
CGATATCATTTTTAATTCTTTAACTATCCATGATCAATATTTTTAGCAATAAACAAAAGT
CCCCTGATCAAATAAGTTCTTAATTTATTTACGTCCCAACTCCCAATAAAGCGAATAATA
AATCCACTTCTAAAACAGAGATTTTTTATTTTAGAAAAAATACAGATATAGATTAGAGAT
GGTCTTATAAAGTTTCTCTTTTCTAGAGCTAAAATTAGAGAAATACATTGGAGATCAGTT
TTATAATTTGATTTTTTTTCTTATATTTTGATTTTTTTTTCTTTTTGTTTACCGCACAGA
CAATTGTATCATGTCATGGTAGTTTTTTTTTTCAATTGTAAGAGAATGGCTATTATTAGT
GAACAATTAAATATTTTTTTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4G218JQ 570 0 0
TCTCGTAATTTCTGCCAAATCTCGAGGAGATGATATATTGGAGGGACCGTGCCGCTTGAG
GGGAACGTGCAAACAGGACAGCGACTGTGACGTTCATTGCCATCGAAAGACCGACCCTCC
AGGCATGGGCGGCCACTGCATCTTGGCTAGACCCGCTGGTCCCGTTTGCTGCTGCCTTTT
TGATTAATCCGATATCATTTTTAATTCTTTAACTATCCATGATCAATATTTTTAGCAATA
AACAAAAGTCCCCTGATCAAATAAGTTCTTAATTTATTTACGTCCCAACTCCCAATAAAG
CGAATAATAAATCCACTTTTAAAACAGAGATTTTTTATTTTAGAAAAAATACAGATATAG
ATTAGAGATGGTCTTATAAAGTTTCTCTTTTCTAGAGCTAAAATTAGAGAAATACATTGG
AGATCAGTTTTATAATTTGATTTTTTTTCTTATATTTTGATTTTTTTTTCTTTTTGTTTA
CCGCACAGACAATTGTATCATGTCATGGTAGTTTTTTTTTTCAATTGTAAGAGAATGGCT
ATTATTAGTGAACAATTAAATATTTTTTTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9252Contig1 693 2 6 U
GCGATGATCTCCGTTGGTGTATCCCTGGGACTTCGATCATCCTCACCGCCACGAACTTCT
GCGCTCCTAATTACGGGTTTGATCCCGACGGTGGTGGTCACTGTAACCCTCCGAACAAAC
ACTTCGTTTTGCCGATCGAAGCGTTTGAGAAGATCGCTATTTGGAAAGCTGGTAACATGC
CCGTTCAGTATCGAAGGATAAACTGTAGAAGGGAAGGGAGCATTAGGTTTACAGTAGATG
GTGGAGGCATTTTCTTTTCGGTTCTGATCACCAATGTTGCTGGTTCTGGCGATATATCAG
CTGTGAAGATCAAAGGGTCGAGAACCGGGTGGTTACCAATGGGTCGTAACTGGGGACAGA
ACTGGCATATCAACGCCGATCTCAAGAACCAAGCTCTCTCGCTTGAAGTGACTTCTAGCG
ACAGATCAACCGTCACAGCTTACAACGTCGCTCCTAGAAACTGGGATTACGGACAAACCT
TCGAAGGTAAACAATTCGAGACTCCGTAAGACACAGAGGATGTCTCGTGATTCTTTTTTG
TTACTGGTGATGAATTTTTTGATAGTCTAAGAAGAGTAGTGATCACACAAACATCACTTT
TGTATCTATTTTGTTGTTTACATTATTACTCTCAAATGCTTAAAGCCAATGGTTACCAAA
AAACCATAAAAAGAATGCATTAATTAAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4DB78TF U 1
AF RR4DB78JQ C 165
BS 1 662 RR4DB78TF
BS 663 663 RR4DB78JQ
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BS 673 683 RR4DB78TF
BS 684 693 RR4DB78JQ

RD RR4DB78TF 683 0 0
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GCGCTCCTAATTACGGGTTTGATCCCGACGGTGGTGGTCACTGTAACCCTCCGAACAAAC
ACTTCGTTTTGCCGATCGAAGCGTTTGAGAAGATCGCTATTTGGAAAGCTGGTAACATGC
CCGTTCAGTATCGAAGGATAAACTGTAGAAGGGAAGGGAGCATTAGGTTTACAGTAGATG
GTGGAGGCATTTTCTTTTCGGTTCTGATCACCAATGTTGCTGGTTCTGGCGATATATCAG
CTGTGAAGATCAAAGGGTCGAGAACCGGGTGGTTACCAATGGGTCGTAACTGGGGACAGA
ACTGGCATATCAACGCCGATCTCAAGAACCAAGCTCTCTCGCTTGAAGTGACTTCTAGCG
ACAGATCAACCGTCACAGCTTACAACGTCGCTCCTAGAAACTGGGATTACGGACAAACCT
TCGAAGGTAAACAATTCGAGACTCCGTAAGACACAGAGGATGTCTCGTGATTCTTTTTTG
TTACTGGTGATGAATTTTTTGATAGTCTAAGAAGAGTAGTGATCACACAAACATCACTTT
TGTATCTATTTTGTTGTTTACATTATTACTCTCAAATGCTTAAAGCCAATGGTTACCAAA
AA*CCATAAAA*GAATGCATTAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR4DB78JQ 529 0 0
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AGGTTTACAGTAGATGGTGGAGGCATTTTCTTTTCGGTTCTGATCACCAATGTTGCTGGT
TCTGGCGATATATCAGCTGTGAAGATCAAAGGGTCGAGAACCGGGTGGTTACCAATGGGT
CGTAACTGGGGACAGAACTGGCATATCAACGCCGATCTCAAGAACCAAGCTCTCTCGCTT
GAAGTGACTTCTAGCGACAGATCAACCGTCACAGCTTACAACGTCGCTCCTAGAAACTGG
GATTACGGACAAACCTTCGAAGGTAAACAATTCGAGACTCCGTAAGACACAGAGGATGTC
TCGTGATTCTTTTTTGTTACTGGTGATGAATTTTTTGATAGTCTAAGAAGAGTAGTGATC
ACACAAACATCACTTTTGTATCTATTTTGTTGTTTACATTATTACTCTCAAATGCTTAAA
GCCAATGGTTACCAAAAAACCATAAAAAGAATGCATTAATTAAAAACCC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL9253Contig1 965 2 6 U
GGCGTGATTTCTCGATAGATTCTAGGGTTTCTATCTTGGAACACTTTCGCTTCCTGGGTG
TTGTTGTTGATCTAGGAGGGTTTAGGATATAAAAAAGTCTGTATCTTTCGTGGAATAAAA
GATGTATGCTGATAGATTGGAGTCTGAGTCTGGAACCAGGAAACTCGTAAAAGATCGAAT
CAATGGCGGTTCTAGCGATAACTCTACTTCCTCCCCGAAAATTGACTGGAAAAAGGCAAA
GGCAGGACGACGATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAA
ATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGCCTC
AAAGCGGCCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAA
TGAGTATGCAACCAAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGA
CTGAAACTGTAACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCAC
AGCAGGCTGGTGCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAA
CAGCTTTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACC
TTAAGGCTATGTTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCA
AACGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCTCGGCTGAACGGTCTCAG
TCAGGAAGTCGTTATTACATTAAGATATTGTCGAAATGATTCCCGGATATGGCTTTCTTT
TTTTCTCGTATTCTTTCAAGGTGGTCAGAATTTTGGCGGTTGACATCTGTAATGTTAAAT
ATAGTGTGACAAACACTACTAGTTTGCACCACTTTTGATGTGAGAAAAGTTTCTAAGTTG
AAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4GK50TF U 1
AF RR4GK50JQ C 189
BS 1 215 RR4GK50TF
BS 216 216 RR4GK50JQ
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BS 695 763 RR4GK50TF
BS 764 965 RR4GK50JQ

RD RR4GK50TF 763 0 0
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TTGTTGTTGATCTAGGAGGGTTTAGGATATAAAAAAGTCTGTATCTTTCGTGGAATAAAA
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CAATGGCGGTTCTAGCGATAACTCTACTTCCTCCC*GAAAATTGACTGGAAAAAGGCAAA
GGCAGGACGACGATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAA
ATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGCCTC
AAAGCGGCCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAA
TGAGTATGCAACCAAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGA
CTGAAACTGTAACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCAC
AGCAGGCTGGTGCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAA
CAGCTTTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACC
TTAAGGCTATGTTTATACCAATGGGCCCGAGGA*GAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCA
AACGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR4GK50JQ 777 0 0
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GACGATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAAATCGCAGA
GTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGCCTCAAAGCGGC
CGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAATGAGTATG
CAACCAAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGACTGAAACT
GTAACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCACAGCAGGCT
GGTGCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTT
CAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACCTTAAGGCT
ATGTTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCAAACGCTAA
TAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCTCGGCTGAACGGTCTCAGTCAGGAAG
TCGTTATTACATTAAGATATTGTCGAAATGATTCCCGGATATGGCTTTCTTTTTTTCTCG
TATTCTTTCAAGGTGGTCAGAATTTTGGCGGTTGACATCTGTAATGTTAAATATAGTGTG
ACAAACACTACTAGTTTGCACCACTTTTGATGTGAGAAAAGTTTCTAAGTTGAAGAC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL9254Contig1 811 2 2 U
GGAGTGGGCTGAAGCTCGCATGAAGATCTCTTCTTTCTTGAGAAAGACTTCCCTACTCTG
CTTGTCTCCAAGGAAGCTGCGGAGATAGCTGCGTTAGCAACTAAGCTGAGGAAAGATCCA
AACCTTTCCGCTGAGGAGATAGTGAGGCTGAAGCTCATGGAAGAGATTCCTACCTTCAGC
GAAGTGTTTCAAGAGAACAAAGCTGTGATCGAAGAAGCAGACAAGTTCTTCTCTGCCTTG
GAGCTCAACAAAGCCAAAGTAGCCTCGCTTAAGTACGAGTACATCGACTTGAAGCACAAG
CTAGGGAGTATCCAGATCGAGGTAGATGAGAACTCTGAGGCGATCCGTCAGATTGATGAG
CAGATAGCTCAGCTTCAAGCGAGAAGGACTGAGCTGAAGAAGCACATTGGTAGCAAGGAG
AAAGAGAGGGTTGATCTGAGCTACGGACAGAAGATGGTGGCGAACTCGATTCCTAAAGTG
GTGCAGGAAGTTCAAGCGGCGAACTCGAAGAAGCCTGAGTGGGAATGCAAGAAAGAGAAT
GCTCTGAAGCGTGAGGAAGAGATCCTCTCTAAGTTCACTCCTCTCAAAGGCTTCTTCCTC
TAAAAGAAATCAAAATCTGGCTCCTTGTGATATCTTAACCTTTTAGCCTGTCTTGGTTGT
ATTATTAATTATGTAGCGGCTTTTTTTTTTCTTTTTGTGGGGTTTATGCCGCAGACTTCT
ATAACCTTTCCTAGGCTTGGGGTTTTTATCTTATGTATGCTTTTTATGTTGGATGTACTT
TGGAAGCTTTTGTTAGTCGTTACTTAGCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BN36TF U 1
AF RR4BN36JQ C 132
BS 1 682 RR4BN36TF
BS 683 811 RR4BN36JQ

RD RR4BN36TF 682 0 0
GGAGTGGGCTGAAGCTCGCATGAAGATCTCTTCTTTCTTGAGAAAGACTTCCCTACTCTG
CTTGTCTCCAAGGAAGCTGCGGAGATAGCTGCGTTAGCAACTAAGCTGAGGAAAGATCCA
AACCTTTCCGCTGAGGAGATAGTGAGGCTGAAGCTCATGGAAGAGATTCCTACCTTCAGC
GAAGTGTTTCAAGAGAACAAAGCTGTGATCGAAGAAGCAGACAAGTTCTTCTCTGCCTTG
GAGCTCAACAAAGCCAAAGTAGCCTCGCTTAAGTACGAGTACATCGACTTGAAGCACAAG
CTAGGGAGTATCCAGATCGAGGTAGATGAGAACTCTGAGGCGATCCGTCAGATTGATGAG
CAGATAGCTCAGCTTCAAGCGAGAAGGACTGAGCTGAAGAAGCACATTGGTAGCAAGGAG
AAAGAGAGGGTTGATCTGAGCTACGGACAGAAGATGGTGGCGAACTCGATTCCTAAAGTG
GTGCAGGAAGTTCAAGCGGCGAACTCGAAGAAGCCTGAGTGGGAATGCAAGAAAGAGAAT
GCTCTGAAGCGTGAGGAAGAGATCCTCTCTAAGTTCACTCCTCTCAAAGGCTTCTTCCTC
TAAAAGAAATCAAAATCTGGCTCCTTGTGATATCTTAACCTTTTAGCCTGTCTTGGTTGT
ATTATTAATTATGTAGCGGCTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4BN36JQ 680 0 0
TGAGGAGATAGTGAGGCTGAAGCTCATGGAAGAGATTCCTACCTTCAGCGAAGTGTTTCA
AGAGAACAAAGCTGTGATCGAAGAAGCAGACAAGTTCTTCTCTGCCTTGGAGCTCAACAA
AGCCAAAGTAGCCTCGCTTAAGTACGAGTACATCGACTTGAAGCACAAGCTAGGGAGTAT
CCAGATCGAGGTAGATGAGAACTCTGAGGCGATCCGTCAGATTGATGAGCAGATAGCTCA
GCTTCAAGCGAGAAGGACTGAGCTGAAGAAGCACATTGGTAGCAAGGAGAAAGAGAGGGT
TGATCTGAGCTACGGACAGAAGATGGTGGCGAACTCGATTCCTAAAGTGGTGCAGGAAGT
TCAAGCGGCGAACTCGAAGAAGCCTGAGTGGGAATGCAAGAAAGAGAATGCTCTGAAGCG
TGAGGAAGAGATCCTCTCTAAGTTCACTCCTCTCAAAGGCTTCTTCCTCTAAAAGAAATC
AAAATCTGGCTCCTTGTGATATCTTAACCTTTTAGCCTGTCTTGGTTGTATTATTAATTA
TGTAGCGGCTTTTTTTTTTCTTTTTGTGGGGTTTATGCCGCAGACTTCTATAACCTTTCC
TAGGCTTGGGGTTTTTATCTTATGTATGCTTTTTATGTTGGATGTACTTTGGAAGCTTTT
GTTAGTCGTTACTTAGCGAC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL9255Contig1 905 2 2 U
GATCCCAAACGCAAGCAACGAGTGCTTCAACGCAATCGCTGATGCCAGCGCCGTTTCCGA
GTATGTCGACGTCTATGATGTTCTCCGAGATCTATGCTACCCATCTATTGTACAGCAAGA
GCTGAGGCTCAAGAAAATGGCTACACACATAAGCATAGGCGTGGATGTTTGTATGACTTA
CGAAAGGAAGTTCTACTTCAATCTCCCAGAGGTCCAACACGCTCTTCACGCCAACCGCAC
TCGTCTGCCTTACGAGTGGTCTATGTGCACCAGCCGGGTAAATTACCGTGGCATTGACTC
GAACATCTCCATGCTTCCGCTTCTTAAGAGAATTATACAGAACAAAACTCCTGCTTGGAT
TTTCAGTGGCGATCAAGATTCTATAATTCCATTTCTTGGTACTAGAACCATCATACGAGA
ACTTGCTCATGATCTTAACTTCCGTACCACACTTCCCTATAGACATTGGTACCACAGAGA
CCAGGTTGCCGGCTGGGTCACGGAGTATGGAAAGCTATTGACGTTTGCAACAGTGAGAGG
AGCGGCTCATATGGTTCCCTATGGGCAGCCCGCACGAGCTCTCCATATGTGTAGTTGCTT
TGTGCGTGGACGAAGATTGCCCAACAACACACATTACCCCGACGATGGGTAAAAAAGAGG
AGATGTCTCATTAATAAAAAGGAGTGTTTGTTGGATAAGTTTGGATTAATAAGTTTCCTT
TTCTTTAATAGTTTTGTGTTTATCTATAAGGAATAGGAAATATGATTTGTGTGATTCCTA
ATAGGTTTAGGATAGTGTGAGTTATATATATGAAGATGCATTGTGTTGTTGCATAACATA
TTGTGTGGGTGATTGCTTTGTGATTGAGCTTTGATATTGAATAAACAAGAGAAGGACTTC
TTGTT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4BB67TF U 1
AF RR4BB67JQ C 57
BS 1 747 RR4BB67TF
BS 748 905 RR4BB67JQ

RD RR4BB67TF 747 0 0
GATCCCAAACGCAAGCAACGAGTGCTTCAACGCAATCGCTGATGCCAGCGCCGTTTCCGA
GTATGTCGACGTCTATGATGTTCTCCGAGATCTATGCTACCCATCTATTGTACAGCAAGA
GCTGAGGCTCAAGAAAATGGCTACACACATAAGCATAGGCGTGGATGTTTGTATGACTTA
CGAAAGGAAGTTCTACTTCAATCTCCCAGAGGTCCAACACGCTCTTCACGCCAACCGCAC
TCGTCTGCCTTACGAGTGGTCTATGTGCACCAGCCGGGTAAATTACCGTGGCATTGACTC
GAACATCTCCATGCTTCCGCTTCTTAAGAGAATTATACAGAACAAAACTCCTGCTTGGAT
TTTCAGTGGCGATCAAGATTCTATAATTCCATTTCTTGGTACTAGAACCATCATACGAGA
ACTTGCTCATGATCTTAACTTCCGTACCACACTTCCCTATAGACATTGGTACCACAGAGA
CCAGGTTGCCGGCTGGGTCACGGAGTATGGAAAGCTATTGACGTTTGCAACAGTGAGAGG
AGCGGCTCATATGGTTCCCTATGGGCAGCCCGCACGAGCTCTCCATATGTGTAGTTGCTT
TGTGCGTGGACGAAGATTGCCCAACAACACACATTACCCCGACGATGGGTAAAAAAGAGG
AGATGTCTCATTAATAAAAAGGAGTGTTTGTTGGATAAGTTTGGATTAATAAGTTTCCTT
TTCTTTAATAGTTTTGTGTTTATCTAT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR4BB67JQ 849 0 0
CCGAGTATGTCGACGTCTATGATGTT*TCCGAGATCTATGCTACCCATCTATTGTACAGC
AAGAGCTGAGGCTCAAGAAAATGGCTACACACATAAGCATAGGCGTGGATGTTTGTATGA
CTTACGAAAGGAAGTTCTACTTCAATCTCCCAGAGGTCCAACACGCTCTTCACGCCAACC
GCACTCGTCTGCCTTACGAGTGGTCTATGTGCACCAGCCGGGTAAATTACCGTGGCATTG
ACTCGAACATCTCCATGCTTCCGCTTCTTAAGAGAATTATACAGAACAAAACTCCTGCTT
GGATTTTCAGTGGCGATCAAGATTCTATAATTCCATTTCTTGGTACTAGAACCATCATAC
GAGAACTTGCTCATGATCTTAACTTCCGTACCACACTTCCCTATAGACATTGGTACCACA
GAGACCAGGTTGCCGGCTGGGTCACGGAGTATGGAAAGCTATTGACGTTTGCAACAGTGA
GAGGAGCGGCTCATATGGTTCCCTATGGGCAGCCCGCACGAGCTCTCCATATGTGTAGTT
GCTTTGTGCGTGGACGAAGATTGCCCAACAACACACATTACCCCGACGATGGGTAAAAAA
GAGGAGATGTCTCATTAATAAAAAGGAGTGTTTGTTGGATAAGTTTGGATTAATAAGTTT
CCTTTTCTTTAATAGTTTTGTGTTTATCTATAAGGAATAGGAAATATGATTTGTGTGATT
CCTAATAGGTTTAGGATAGTGTGAGTTATATATATGAAGATGCATTGTGTTGTTGCATAA
CATATTGTGTGGGTGATTGCTTTGTGATTGAGCTTTGATATTGAATAAACAAGAGAAGGA
CTTCTTGTT

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

CO CL9256Contig1 736 2 4 U
AAGCAAAGGATTATTAGGATCAAAGGCAAAGATAGAACAACGAATATGTTACAACATCCA
TCACAACTCCACACATCATATCCACCAAAGTCCTTCCAGATCCCCAAAAGAATAAGAATA
CATGATTTTGATTTGATGTACATACACATACATTTTTTCTCCTTTTAAAAGAAAAAAACG
AAAAAAAAAACAGAAGAAGAAGAAGCCAAACCGAGTGAGAACTGATCTATGGTTGCTTGT
TTATCATGGCAGATGATGATCCCTGCATCTGAGAGCCTGAGCTTCTTCTATGCGACTGCA
GATGCTTTAACCTTCTGCTGAGGATATCAATATATGTTCTGAGACGGTACCTGTCTGAGT
TTGTGAGCAACAATGGTGGATTCAGAATCAGCATTGGTGCTTCCACTAAAAGGAATACCA
GCAAACGCATCGCTTTTGAATATTGGTTTCCAGCCTTCTCTATCTCTCCCATAACCTCCT
TAACTCCACCAAGCTTTCCAAGATCAAGGGCTGCTTCAAAGATAGTCTCCATTGCATCAG
GCATCATTGCATTTCCAGGTTCGATATTCTTGGAAAGTTCTTCAGCAAGCTCAATCTCCC
GGATAAACTGCCTCTGAATCTGAGAGGATATCTCCTCTGATCCATCATGGCTGAGATCAG
TCATATGTTCGTTTTTTAGGCTGCTGCTTCTACTTCCTCTTAGTTTGTTAATGTCTTGGC
CTGGGCTTCCTTCCAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR4DK53JQ U 1
AF RR4DN04JQ U 1
BS 1 408 RR4DK53JQ
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AAAAAAAAAACAGAAGAAGAAGAAGCCAAACCGAGTGAGAACTGATCTATGGTTGCTTGT
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CTGGGCTTCCTTC

QA 1 733 1 733
DS 

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TCACAACTCCACACATCATATCCACCAAAGTCCTTCCAGATCCCCAAAAGAATAAGAATA
CATGATTTTGATTTGATGTACATACACATACATTTTTTCTCCTTTTAAAAGAAAAAAACG
AAAAAAAAAACAGAAGAAGAAGAAGCCAAACCGAGTGAGAACTGATCTATGGTTGCTTGT
TTATCATGGCAGATGATGATCCCTGCATCTGAGAGCCTGAGCTTCTTCTATGCGACTGCA
GATGCTTTAACCTTCTGCTGAGGATATCAATATATGTTCTGAGACGGTACCTGTCTGAGT
TTGTGAGCAACAATGGTGGATTCAGAATCAGCATTGGTGCTTCCACTAAAAGGAATACCA
GCAAACGCATCGCTTTTGAATATTGGTTTCCAGCCTTCTCTATCTCTCCCATAACCTCCT
TAACTCCACCAAGCTTTCCAAGATCAAGGGCTGCTTCAAAGATAGTCTCCATTGCATCAG
GCATCATTGCATTTCCAGGTTCGATATTCTTGGAAAGTTCTTCAGCAAGCTCAATCTCCC
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CTGGGCTTCCTTCCAA

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AC79TF C 1
AF RR4AC79JQ U 5
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BS 5 694 RR4AC79JQ

RD RR4AC79TF 694 0 0
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TACCAAGGGTGAGAAAGAATGCAGGTAATGCAGCTAGAATGGCAAAGTTTATTTCATTCG
CACGAAGTATCTGCTCTAGTTCAAGCATGGCTGC

QA 1 694 1 694
DS 

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CTCGCCGCTTGTTTTTGCAGGAGTCTCAACAACCCGGTACAAAAGCTCAAGGCTGTATAT
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CTGCATAATTCTCTTTTCAATTTCAACGACAAGTAGCCTCCTGTGGATACGTGCAATTCT
TCCACGTCCTTGAGCTTTGCTATCCTGTTTAACCCATGTCCGAAGCAATGCGAGCATACC
AAGGGTGAGAAAGAATGCAGGTAATGCAGCTAGAATGGCAAAGTTTATTTCATTCGCACG
AAGTATCTGCTCTAGTTCAAGCATGGCTGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL9258Contig1 743 2 3 U
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CCTGAGATAGCAAGATGGTCTCC


BQ
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AF RR4AO13JQ U 276
AF RR4AO13TF C 1
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RD RR4AO13JQ 287 0 0
TAA
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AAGATTTTTATTTGAAAAGTGAATGAATCATACTCAAATGTCGACAAGGTTTTGGTAGAA
AAAACTAGTCAAAGACTTGTTGAAACTTGCAACAAGAATTGTGT

QA 4 287 4 287
DS 

RD RR4AO13TF 743 0 0
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TAATGCAACCCTATCCGGATTTGAATCCCTTTTTGATGGATCTGAGGGTGATTTGGGTTG
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GTTCAGAAACTGAACAAAGGATTCACAAGAACAAAGGAAAGATTTTTATTTGAAAAGTGA
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AAGACTGAGTAATTAAACATCTCCTTGACTTGGTTTGTTGTCGAGATTGGTTCTGGTTTG
AACTGAACCAAGGCTGAGATGGTTTTCTTTAATTTCTTGGTTTGAGATCTTGTAACCGGG
CCTGAGATAGCAAGATGGTCTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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TAGTCTCTAGGACTTTCCTTTGGCCTTGGGCATCTTCATAAATCATAAGGAATTCTTTAT
TTCCTTTGCCCATAGTTTCAATATGTAGATCATTCATATGAATGTCTTTGAAACTTTGAT
AAATTCCACTTTGATTTATGTGGAATGTAATGCATCAGAGATTTTTAGATGTGTGCCTTT
AAGCATCATGAGGTTGGACAAGCCATGACCTTGAATAAAATATCTTTTGTCTCTTAATGT
AACGTGGCTTGGTCCACTATAGAGAACAAAGACAAAGTAAAATGATCTCGAAATCTAATT
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CCTGGTAGAGTTCAATAAGGTGTTTGGGAGTTCTACATCGGTTACCCCAATGATTATTCA
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GAGGTTGTGGACTTTTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAAGGCT
ATTGGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EB58TF U 1
AF RR4EB58JQ C 472
BS 1 638 RR4EB58TF
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RD RR4EB58TF 699 0 0
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QA 1 699 1 699
DS 

RD RR4EB58JQ 499 0 0
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AAAAAGGCTATTGGTTTAT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EV73TF U 1
AF RR4EV73JQ C 1
BS 1 577 RR4EV73TF
BS 578 683 RR4EV73JQ

RD RR4EV73TF 577 0 0
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AAGTTATTAACACCTTTGGCCACGATCTACAATTACTGTCCGTTAATCTGCTTGGAGACG
GTTCTTGCACAATATAAATAGGATGTTCATGTTAACTGCTATGGTTACAGGATCAGGAGG
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GGTCTCCCTTGCTTCGCCTGTCACCCGTTCCGAGTCGCCTTCGGGACAGTCGCGGGTCCA
AGACTGTTCTCCGGTTGAAACATCCGATGATCTCAGTTTGTTTGATGCAGTCCCGGGCAT
CATTTCTATTTTGAGGTCTACTGTATTGAGTATTGGAATCGAATAATCTTATTGTATTGA
GATGCTCTGTTCTTATATGTACAGAGATGATTACAAG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4EV73JQ 683 0 0
TTTTTTTGCCCAAACCCAAACAAAACAGAGGACCACATCGCTTTATCATCTTCATACCTC
GCCATTTTAGGGTTCATAGGACCTGTGCAGATCGGCGTCACGATTGTCTGTTCTCATAAG
GTCCTTTCGACTTCTCTTCATCAATACAGACGGTTAGCTTCTAGATCCATCACATTAAAC
AAGTTATTAACACCTTTGGCCACGATCTACAATTACTGTCCGTTAATCTGCTTGGAGACG
GTTCTTGCACAATATAAATAGGATGTTCATGTTAACTGCTATGGTTACAGGATCAGGAGG
ATGAGGACCATACTTCTCAGGTTCTTCTGTTCTCCACAGATGATGGCCGGACCAAAGCTT
GGTCTCCCTTGCTTCGCCTGTCACCCGTTCCGAGTCGCCTTCGGGACAGTCGCGGGTCCA
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GATGCTCTGTTCTTATATGTACAGAGATGATTACAAGAAAGGTAAGACAATATACAAGAA
GTAATTACAAGATATGTAGCCGTTGATAAACGATGTGATTATGTACTTTCCATACTCTTA
CATACTGAAACCTAATAGTTGCT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL9262Contig1 581 2 1 U
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CGTCTCTCTTTTCGTTATTTCTCCTTTTTCATCTCTATTTAACTCTCATGATTTACACAA
GAACTAAAGTCTTTAAACTATATACTTTTTTCATTAAAAGCAAAAAGAGGATGAAGGAGA
CAATCAGATGCTGCATCGCCTGCATCCTACCATGCCTGCAGCTAAATCTGATAAACGTAA
TGCAAAAGCCGTCAAGAAGCGGTCACAGACTCGTCGGCATGGTGGAGAAGTTGATGATAG
TGGTAATGATAAAAGTTACGACAAGGATGTGTCACCGTTGATCTCTGATCGGTACTTGAC
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TTGGAGGCCGCACTTAGAAAGCATAAATGAAGATTGAGGAAAACGCATCGCTTTTATTTA
ATTACAAGAGTCTCACTCGTTTTTTTTGGTGCTTATCATGTATTTTAGAACATTGGTTCA
TAATAGTTTTTTCATCAAGGGAAAATATCCGAGAGAACGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4GW70JQ C 1
AF RR4GW70TF U 1
BS 1 581 RR4GW70TF

RD RR4GW70JQ 581 0 0
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CAATCAGATGCTGCATCGCCTGCATCCTACCATGCCTGCAGCTAAATTTGATAAACGTAA
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QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4GW70TF 581 0 0
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CAATCAGATGCTGCATCGCCTGCATCCTACCATGCCTGCAGCTAAATCTGATAAACGTAA
TGCAAAAGCCGTCAAGAAGCGGTCACAGACTCGTCGGCATGGTGGAGAAGTTGATGATAG
TGGTAATGATAAAAGTTACGACAAGGATGTGTCACCGTTGATCTCTGATCGGTACTTGAC
GGAGATACTGTCGGAAAAAATCGCGACTCAGAAAGATCGGAGAAAGGGACGCGTTGGCGT
TTGGAGGCCGCACTTAGAAAGCATAAATGAAGATTGAGGAAAACGCATCGCTTTTATTTA
ATTACAAGAGTCTCACTCGTTTTTTTTGGTGCTTATCATGTATTTTAGAACATTGGTTCA
TAATAGTTTTTTCATCAAGGGAAAATATCCGAGAGAACGTT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL9263Contig1 987 2 10 U
GTTGAGCTGTACAGAGGAATCAGAGACTCTCAGCTTGTCGGTCTCTCTGGTTATTCAAAG
GAGGGTCTCCCTGTCATTGCCATTGGTGTGGGGCTTAGCACATATGACAAAGCCTCCGTT
CACTACTATGTACAGTCCCACATTCAAATGAACGAGTACCGGGATCGTGTTGTATTGCCA
TCTGCTACAAAGAAACAAGGACGTCCTATCTGCACTTGTTTGAAAATTTTGGATATGTCT
GGTCTTAAGCTTTCAGCTTTAAGTCAAATTAAGTTAATGACTACTATAACCACAATAGAC
GATTTAAACTATCCAGAGAAGACAGAGACGTATTACATTGTCAATGTCCCCTATATATTC
TCTGCTTGTTGGAAAACCATTAAGCCTCTGCTGCAAGAGAGGACAAAGAAGAAGATTCAA
GTTCTCAAAGGCTGCGGTAAAGACGAGTTGCTTAAGGTAATGGACTATGAATCACTGCCA
CATTTCTGTAGAAGAGAAGGGTCTGGCTCTGGATCTGGTAGGCATATCTCAAATGGAGCA
GAAGACAACTGTTTCTCTTTAGACCACTCTTTCCACCAAGAGTTATACAACTATGTGAAG
CAACAGGCTTTGGTTAAAGGGCCGTCGAGTGCACCCGTCAGACATGGTTCGGTCCACGTT
AGGTTCCCTGAGCCAGCCACGGAAGGCACCAAGATATTTGATACTTTAGAATCCGAGTTC
CAGAAGCTTGGATGTGACCAGAAAGTCTGATTTTCTCTGCGAGTTGCTCTGATGAAAGAT
GAACCAAGAACCAGAGTTTTCTCTGGTTGCAAGTTTCTAAAGTGTATGAGAGCATTGAGC
AGAGTATTTTTAAGATATAAAATTAGCAACTCGAGAGAACTGTATGCAAGTTTTGTTGCA
ACAACAGAAAAAAAAAACAATATCTCCTTCTGTATGGATCTTATGAGTTGTCATCTATTA
TCTACATATATACAAACTCATTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FX74TF U 1
AF RR4FX74JQ C 304
BS 1 685 RR4FX74TF
BS 686 686 RR4FX74JQ
BS 687 728 RR4FX74TF
BS 729 729 RR4FX74JQ
BS 730 738 RR4FX74TF
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BS 772 987 RR4FX74JQ

RD RR4FX74TF 771 0 0
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GAGGGTCTCCCTGTCATTGCCATTGGTGTGGGGCTTAGCACATATGACAAAGCCTCCGTT
CACTACTATGTACAGTCCCACATTCAAATGAACGAGTACCGGGATCGTGTTGTATTGCCA
TCTGCTACAAAGAAACAAGGACGTCCTATCTGCACTTGTTTGAAAATTTTGGATATGTCT
GGTCTTAAGCTTTCAGCTTTAAGTCAAATTAAGTTAATGACTACTATAACCACAATAGAC
GATTTAAACTATCCAGAGAAGACAGAGACGTATTACATTGTCAATGTCCCCTATATATTC
TCTGCTTGTTGGAAAACCATTAAGCCTCTGCTGCAAGAGAGGACAAAGAAGAAGATTCAA
GTTCTCAAAGGCTGCGGTAAAGACGAGTTGCTTAAGGTAATGGACTATGAATCACTGCCA
CATTTCTGTAGAAGAGAAGGGTCTGGCTCTGGATCTGGTAGGCATATCTCAAATGGAGCA
GAAGACAACTGTTTCTCTTTAGACCACTCTTTCCACCAAGAGTTATACAACTATGTGAAG
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AGGTTCCCTGAGCCAGCCACGGAAG*CACCAAGATATTTGATACTTTAGAATCCGAGTTC
CAGAAGCT*GGATGTGAC*AGAAAGTCTGATTT*CTCTGCGAGTTGCTCTG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR4FX74JQ 684 0 0
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GCTTGTTGGAAAACCATTAAGCCTCTGCTGCAAGAGAGGACAAAGAAGAAGATTCAAGTT
CTCAAAGGCTGCGGTAAAGACGAGTTGCTTAAGGTAATGGACTATGAATCACTGCCACAT
TTCTGTAGAAGAGAAGGGTCTGGCTCTGGATCTGGTAGGCATATCTCAAATGGAGCAGAA
GACAACTGTTTCTCTTTAGACCACTCTTTCCACCAAGAGTTATACAACTATGTGAAGCAA
CAGGCTTTGGTTAAAGGGCCGTCGAGTGCACCCGTCAGACATGGTTCGGTCCACGTTAGG
TTCCCTGAGCCAGCCACGGAAGGCACCAAGATATTTGATACTTTAGAATCCGAGTTCCAG
AAGCTTGGATGTGACCAGAAAGTCTGATTTTCTCTGCGAGTTGCTCTGATGAAAGATGAA
CCAAGAACCAGAGTTTTCTCTGGTTGCAAGTTTCTAAAGTGTATGAGAGCATTGAGCAGA
GTATTTTTAAGATATAAAATTAGCAACTCGAGAGAACTGTATGCAAGTTTTGTTGCAACA
ACAGAAAAAAAAAACAATATCTCCTTCTGTATGGATCTTATGAGTTGTCATCTATTATCT
ACATATATACAAACTCATTTCTAC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL9264Contig1 1200 2 8 U
GGCAGTTTCTTTTGACGACTTTAGTAATCCCTCGATTCGCCTCCCTCTCTGATCACTCTC
ATTCCCTCTTCGGCTCTTCGCCATCCTCTTTCACAAACAAACCACAACATCAACAATCAA
TCTCCGATTCACTCACTACCAGCTGATGCCGCCTTCCAAATCCCCAATAACACTCAAACC
ACCATCTACAACAAAGCGGCTTCAAAACCCAGGCCCTGCTGCGTTTAGTCTGATTTCCCG
AAAATATATCGTCTCTATTCTCCTTTCACTATGTCATTTCTCCTCTGATGGACCCTTCCT
ATAGGCCGAGCTTGGTGGAAGGAAACGGCTCGAATACTCAGGTTCTACCAGTCTCTGGCT
CTGACTTACTCTTGCCACGTGGAGACGTAATGTCGTTGATTGATTGAGATTCCGAAGTTG
AGGTAGAAACCAGAAAGTGCACAAAAAGAAAGGTAGAAACCATAAATATTTGGGCTGAAG
ATCCCGCTGGTAAAGTCTGATGATGATTCAAAGAATGCTACCCCAAAGAGTCTGTACGCT
ACCCTCCTAAATTTCACTTGAATGCTGGATGAGAGAGTCTGTCAGGACAGCCATTATAAG
CACTGAAGCCTCTCACCCTTTCACCATCGTTATAAACTCAATTTTGAAGTCCTGTGATAT
GGCGTATATATATACTTTGCGCGCCAGGTTGCTCTAAACCGTTGGGCGGTAGAGCTCAAC
TTTATCCAGGATGGAGTTAACCGAGTGCGCTATTTGCAAGTGTACAGTGAATTAATTTTA
GCCTCTTGCTGTTAATTTTCATAGTCTTTGTTGAATTTCAGGTTTATGTGCTTACCGGCG
GAGTTTTTTGTTTACCGTAACATGATCGACACTTATACTTTCATCAACTTAATTTCTCTG
ATTGGGCTGCAATTACATCACGAGCGCTTTTGCGGTAGGGGTTCTCCTGGTTATGCTGAA
CCGTGGGTTTGCTGTCAGTGTCTTCAATCTTATCATTCTGTTGGAGGGTTTATGGAAGAA
TCTGGAATACGGCAAGAGTGTTTCTTTTCTACCCAATAGAGAGAGCGTTGCTATGTAAAT
GCAAGCTGAAGCTAAACGTAAAAATAGAGCCCAAACTCTTGAGTCTTAAGGTGAACCCCA
AGCCCATAATCACTGATTGTAAGAAAAGTTCTGCACTCTTCGTATCAGAAGCTGCATAGG


BQ
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AF RR4A638TF U 1
AF RR4A638JQ C 329
BS 1 450 RR4A638TF
BS 451 451 RR4A638JQ
BS 452 821 RR4A638TF
BS 822 822 RR4A638JQ
BS 823 886 RR4A638TF
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BS 888 919 RR4A638TF
BS 920 1200 RR4A638JQ

RD RR4A638TF 919 0 0
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TCTCCGATTCACTCACTACCAGCTGATGCCGCCTTCCAAATCCCCAATAACACTCAAACC
ACCATCTACAACAAAGCGGCTTCAAAACCCAGGCCCTGCTGCGTTTAGTCTGATTTCCCG
AAAATATATCGTCTCTATTCTCCTTTCACTATGTCATTTCTCCTCTGATGGACCCTTCCT
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ATCCCGCTGGTAAAGTCTGATGATGATTCAAAGAATGCTACCCCAAAGAGTCTGTACGCT
ACCCTCCTAAATTTCACTTGAATGCTGGATGAGAGAGTCTGTCAGGACAGCCATTATAAG
CACTGAAGCCTCTCACCCTTTCACCATCGTTATAAACTCAATTTTGAAGTCCTGTGATAT
GGCGTATATATATACTTTGCGCGCCAGGTTGCTCTAAACCGTTGGGCGGTAGAGCTCAAC
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GCCTCTTGCTGTTAATTTTCATAGTCTTTGTTGAATTTCAG*TTTATGTGCTTACCGGCG
GAGTTTTTTGTTTACCGTAACATGATCGACACTTATACTTTCATCA*CTTAATTTCTCTG
ATTGGGCTGCAATTACATC

QA 1 919 1 919
DS 

RD RR4A638JQ 872 0 0
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AAAGGTAGAAACCATAAATATTTGGGCTGAAGATCCCGCTGGTAAAGTCTGATGATGATT
CAAAGAATGCTACCCCAAAGAGTCTGTACGCTACCCTCCTAAATTTCACTTGAATGCTGG
ATGAGAGAGTCTGTCAGGACAGCCATTATAAGCACTGAAGCCTCTCACCCTTTCACCATC
GTTATAAACTCAATTTTGAAGTCCTGTGATATGGCGTATATATATACTTTGCGCGCCAGG
TTGCTCTAAACCGTTGGGCGGTAGAGCTCAACTTTATCCAGGATGGAGTTAACCGAGTGC
GCTATTTGCAAGTGTACAGTGAATTAATTTTAGCCTCTTGCTGTTAATTTTCATAGTCTT
TGTTGAATTTCAGGTTTATGTGCTTACCGGCGGAGTTTTTTGTTTACCGTAACATGATCG
ACACTTATACTTTCATCAACTTAATTTCTCTGATTGGGCTGCAATTACATCACGAGCGCT
TTTGCGGTAGGGGTTCTCCTGGTTATGCTGAACCGTGGGTTTGCTGTCAGTGTCTTCAAT
CTTATCATTCTGTTGGAGGGTTTATGGAAGAATCTGGAATACGGCAAGAGTGTTTCTTTT
CTACCCAATAGAGAGAGCGTTGCTATGTAAATGCAAGCTGAAGCTAAACGTAAAAATAGA
GCCCAAACTCTTGAGTCTTAAGGTGAACCCCAAGCCCATAATCACTGATTGTAAGAAAAG
TTCTGCACTCTTCGTATCAGAAGCTGCATAGG

QA 1 872 1 872
DS 



AS 1 2

CO CL9265Contig1 693 2 1 U
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CGAACGGCTAATATCTGAGCACCCGGTCATCATATTCACTAGATCCTCCACCTGCTGCAT
GTGTCACGTCATGAAGAAGCTTCTATCAACCGTTGGAGTCCACCCAACAGTGATCGAGAT
CGACGAGGAAGAGATCGCTTGCCTCGCCGTTCAAACCGCTCCGGTGCTCTTCATAGGTGG
TGCTTGTGTCGGTGGGTTCGAGTCTCTTGTCGCACTTCACCTTAGTGGTCCTCTCATTCC
TAGACTCGTCGAGGTTTGAGCCTTGTGGGAATAGTTGTGTATGTTCAACTTATAACTATT
GAAGAAAATCTGGTAATAATATCCACTGTAAATTTCACGATCTTCTCTTTCTGTTCTTGA
TTCTGAAACATAAAAATGTATTTTTCATTTTCCCTTTTGTACTTTTTTTTATCTTTCACC
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GGGTTGAAAAATGAAAATTGTTCCGATGTTACG


BQ
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AF RR4F530TF U 1
AF RR4F530JQ C 9
BS 1 693 RR4F530TF

RD RR4F530TF 693 0 0
GGGAAACGACAACGTTTCGCTAGACCTGACGTTTCCTCCCCCAGCACCACCACCCATCTC
CTCCTCCACGGCCTCCACTAGCCTATCGTTCGATGAGGAGGAGACCTCAGAGTTGAAGAT
CGAACGGCTAATATCTGAGCACCCGGTCATCATATTCACTAGATCCTCCACCTGCTGCAT
GTGTCACGTCATGAAGAAGCTTCTATCAACCGTTGGAGTCCACCCAACAGTGATCGAGAT
CGACGAGGAAGAGATCGCTTGCCTCGCCGTTCAAACCGCTCCGGTGCTCTTCATAGGTGG
TGCTTGTGTCGGTGGGTTCGAGTCTCTTGTCGCACTTCACCTTAGTGGTCCTCTCATTCC
TAGACTCGTCGAGGTTTGAGCCTTGTGGGAATAGTTGTGTATGTTCAACTTATAACTATT
GAAGAAAATCTGGTAATAATATCCACTGTAAATTTCACGATCTTCTCTTTCTGTTCTTGA
TTCTGAAACATAAAAATGTATTTTTCATTTTCCCTTTTGTACTTTTTTTTATCTTTCACC
ACTTTAGTTTATGTCGTTTAGATTGTCATTTGTGTGAATTATTCCACCATAAATTATCAG
ATTTGTAAATTATTTCCATTTCTTTAATTTCCGTATTGAATTGTAATATAATGTTGATGT
GGGTTGAAAAATGAAAATTGTTCCGATGTTACG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR4F530JQ 685 0 0
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CGGCCTCCACTAGCCTATCGTTCGATGAGGAGGAGACCTCAGAGTTGAAGATCGAACGGC
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TCATGAAGAAGCTTCTATCAACCGTTGGAGTCCACCCAACAGTGATCGAGATCGACGAGG
AAGAGATCGCTTGCCTCGCCGTTCAAACCGCTCCGGTGCTCTTCATAGGTGGTGCTTGTG
TCGGTGGGTTCGAGTCTCTTGTCGCACTTCACCTTAGTGGTCCTCTCATTCCTAGACTCG
TCGAGGTTTGAGCCTTGTGGGAATAGTTGTGTATGTTCAACTTATAACTATTGAAGAAAA
TCTGGTAATAATATCCACTGTAAATTTCACGATCTTCTCTTTCTGTTCTTGATTTTGAAA
CATAAAAATGTATTTTTCATTTTCCCTTTTGTACTTTTTTTTATCTTTCACCACTTTAGT
TTATGTCGTTTAGATTGTCATTTGTGTGAATTATTCCACCATAAATTATCAGATTTGTAA
ATTATTTCCATTTCTTTAATTTCCGTATTGAATTGTAATATAATGTTGATGTGGGTTGAA
AAATGAAAATTGTTCCGATGTTACG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL9266Contig1 707 2 4 U
GGGGTGACGGAGCAGTGGGTAAAACCTGCTTGCTCATTTCTTACACTAGCAACACTTTCC
CTACGGATTATGTTCCGACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGAG
CCACTGTCAACCTTGGCTTGTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGGTTAAGAC
CATTGAGTTACCGTGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCCCCCTCATCAGTAAGGCTA
GTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTCC
CAATTGTTCTTGTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTTGTTGACC
ACCCTGGTGCTGTACCTATTACCACTGCTCAGGGCGAGGAGCTAATGAAGCTAATTGGAG
CTCCTTCGTACATCGAGTGCAGTTCAAAATCACAGGAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATG
CAGCGATTAGAGTGGTACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGGGAAAAGTACAAA
AGGCCTGCTCCATTTTGTAATTTCTCTCTTCTCTCTGCCACTCTCTAGTGAAGTGTTAAG
AAGAAGAAGAAGACAAATTTGGTTGTGATAAAGCTCTCTTAATCCTTGAAAAAGACATGA
TTACTTCTGTTTTACTGATAAATTGTTTTCAGCTTTAGCTGAGACCC


BQ
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AF RR4DS36JQ C 1
AF RR4DS36TF U 1
BS 1 528 RR4DS36TF
BS 529 529 RR4DS36JQ
BS 530 690 RR4DS36TF
BS 691 707 RR4DS36JQ

RD RR4DS36JQ 707 0 0
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CATTGAGTTACCGTGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCCCCCTCATCAGTAAGGCTA
GTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTCC
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CTCCTTCGTACATCGAGTGCAGTTCAAAATCACAGGAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATG
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AGGCCTGCTCCATTTTGTAATTTCTCTCTTCTTTCTGCCACTCTCTAGTGAAGTGTTAAG
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TTACTTCTGTTTTACTGATAAATTGTTTTCAGCTTTAGCTGAGACCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR4DS36TF 690 0 0
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CATTGAGTTACCGTGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCCCCCTCATCAGTAAGGCTA
GTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTCC
CAATTGTTCTTGTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTTGTTGACC
ACCCTGGTGCTGTACCTATTACCACTGCTCAGGGCGAGGAGCTAATGAAGCTAATTGGAG
CTCCTTCGTACATCGAGTGCAGTTCAAAATCACAGGAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATG
CAGCGATTAGAGTGGTACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGG*AAAAGTACAAA
AGGCCTGCTCCATTTTGTAATTTCTCTCTTCTCTCTGCCACTCTCTAGTGAAGTGTTAAG
AAGAAGAAGAAGACAAATTTGGTTGTGATAAAGCTCTCTTAATCCTTGAAAAAGACATGA
TTACTTCTGTTTTACTGATAAATTGTTTTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL9267Contig1 767 2 10 U
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CCAGGAGAGGCCGGTTCAAAGGAACGGAGTTCGGTGACTCTTATGGGTTCCATAAGGTCT
TTCAAGGTCAAGAAACAGTTCCCGCCTACTCAATGACCCCTCCTCATCAGCAGCAGCAGG
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TCCCGTCATCATCAGTCCACGTGTCATCATCACCTTCTTCTGTCTTGATAACCAGCTCGA
ATGGTCTCAACGAGAGTCTGGAAGAACATCACGGAGGTTCAGGCAGGTGCAGGCTGTTGG
TTTCCCACTGAGGGATGATGATGAGCCCACTGAGGTGGTTGGCCCTTGCGTTGAAGGGCA
AAAAGGTGTTTCTGATGTTCAAAGCAGTCATCATCTTCTTCATTCACAGGGGAGGGACAT
GTATGGCATGAGAGATATGTTGCTAGACATTGCTCTCTAGTGGTTTTTTATGTGCGTTTG
TTTGCTTGTGGTTTAAGTAAGTTGATTTATTTTGAAGATGACGTGCTAGCTGAACTTTCG
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ATTAGGTTGGAGTTACAAGAAAAAGAGTATTTTCTTTGTTTTTTATGTGTGGGTCATGTA
TCAACTATTAATTGGATGTATCTTTTTCTCTAAGTTATGTTTTATCT


BQ
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AF RR4EF62TF U 1
AF RR4EF62JQ C 150
BS 1 659 RR4EF62TF
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RD RR4EF62TF 748 0 0
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GTATGGCATGAGAGATATGTTGCTAGACATTGCTCTCTAGTGGTTTTTTATGTGCGTTTG
TTTGCTTGTGGTTTAAGTAAGTTGATTTATTTTGAAGATGACGTGCTAGCTGAACTTTCG
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ATTAG*TTGGAGTTACAAGAAAAAGAGTATTTTCTTTGTTTTT*ATGTGTGGGTCATGTA
TCA*CTATTAATTGGATGTATCTTTTTC

QA 1 748 1 748
DS 

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CTGAGGTGGTTGGCCCTTGCGTTGAAGGGCAAAAAGGTGTTTCTGATGTTCAAAGCAGTC
ATCATCTTCTTCATTCACAGGGGAGGGACATGTATGGCATGAGAGATATGTTGCTAGACA
TTGCTCTCTAGTGGTTTTTTATGTGCGTTTGTTTGCTTGTGGTTTAAGTAAGTTGATTTA
TTTTGAAGATGACGTGCTAGCTGAACTTTCGGATGTCACAAGTTGATGACTTTTGTATTA
TTGGTCGCTTCGTTGTAGGGTTGTTTTTAGGATTAGGTTGGAGTTACAAGAAAAAGAGTA
TTTTCTTTGTTTTTTATGTGTGGGTCATGTATCAACTATTAATTGGATGTATCTTTTTCT
CTAAGTTATGTTTTATCT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL9268Contig1 943 2 4 U
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AGCTGTCAGGAAGAATCTAAAAGCCCGAGGTCTGAAAGGGGATATTGGCTGTGATCGATG
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GAATATGGATTACTTATTCTGGAGAATCAAACCTGCATTGGAAGAACACTATTTTGTGTG
GATACTTTGGTACATTTGGAAAGGGAGAAACAATAAAGTTTTTAGCAATTTAGACATAGA
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AATTTGGTTTATAGAGTTAACATGAGTCTGTAATCTTGCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4C445TF U 1
AF RR4C445JQ C 406
BS 1 570 RR4C445TF
BS 571 571 RR4C445JQ
BS 572 590 RR4C445TF
BS 591 943 RR4C445JQ

RD RR4C445TF 590 0 0
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AGCTGTCAGGAAGAATCTAAAAGCCCGAGGTCTGAAAGGGGATATTGGCTGTGATCGATG
TGGAGCAGATGAGGAATCTGTAAACCATGTATTTTTTGAATGCCCACCAGCAGTTCAGGT
CTGGGCTCTTTCGAAGATCCCTACGAATCCGGCTTACTTTCCAGGACAATCCTTGTTCAC
GAATATGGATTACTTATTCTGGAGAATCAAACCTGCATTGGAAGAACACTATTTTGTGTG
GATACTTTGGTACATTTGGAAAGGGAGAAACAATAAAGTTTTTAGCAATTTAGACATAGA
TCCTCAGGATACTCTCAAACTGGCTATGACTGAATCTTTACTCTGGTCTGATGCCCAACA
AGCTCTAACACAGATAAACCAGGTGCCAGTAGTATCTGAGCCTGATTTACCGCTTAGACC
AGGACGATGGTGTTTTACGGATGGATCATGGAAAGCCGGAGATACCTTTTCTGGGCATGG
TTGGTATAGTACTTTACCAGGTTTCGAAGG*TTGATGGGTGCTAGAAACA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR4C445JQ 538 0 0
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TTTACCGCTTAGACCAGGACGATGGTGTTTTACGGATGGATCATGGAAAGCCGGAGATAC
CTTTTCTGGGCATGGTTGGTATAGTACTTTACCAGGTTTCGAAGGGTTGATGGGTGCTAG
AAACACGAGGGCAAGTCAATCACCTTTACATACGGAAGTGGAAGCCCTCATATGGGCAAT
GGAATGTATGCGGAATTTAAGGCAGTATAATGTTACTTTTGCAACGGATTGTTCTCAATT
GGTGAAGATGGTTTCGGAACCAGAAGAATGGCCGGCTTTTGCAAGTTACTTAGAAGACAT
CAGAAGTCTCAAGAGGAGTTTTCACAGCTCGGAGATTATCCATATATCAAGGACAAAAAA
CAAGAAGGCGGATGGCTTAGCACGTGGTGTGAGGCAACAGACGTCGTTTACTGTCCATAT
GGATACAGAGCAACCAATTTGGTTTATAGAGTTAACATGAGTCTGTAATCTTGCCGAC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL9269Contig1 638 2 1 U
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AACATCTCTCAGTCTTCCTCTTCTTTTGTTTCCTCACACACAGACAACAACTACGACAAC
TAAGATGGCAACAACGACGATGGCAGTCACAATCTCTCACGGGCTTCGACGGGACAACGA
CGACGGCAGTAGACAACTTCTCCGGTGTGGCCAGCTGCCTAAGAAGAAGCTCCAGTTTGG
CGACTGTTAGAAGAAGCTTTGGTGTGACATGATTGACAGCTTCTCCTCAATCGACAACGA
CAATTTCTCCGGTGTGGCCAGACGCCTAAGAAGAAGCTCCGGTGTGGCAAGATCGACGGC
GGTAAAGCTGAGACTATCAGTGGACAGGAAGCACTGACGGCAAAGAGGATTAGGTTTAGG
TTTTTGGTTTACTCTTGGTTTAGTTTAGGCTTATTTGGTTTACTTTTTTATTTATTAGTT
CGGTTTGGTTAGGATAAATGACTTTCTATATATTTTCTTTTTAGCTCTGAGAATGCGTTC
CAGTCAAAACAATGTATATTGGTTTTGTATTCAAAACAAAATAAATCCCCAACGATCTGT
TGCTAAATGTGCTAAACAAATCATTCTTCTTTTGAAGT


BQ
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AF RR4H485TF U 1
AF RR4H485JQB C 54
BS 1 638 RR4H485TF

RD RR4H485TF 638 0 0
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AACATCTCTCAGTCTTCCTCTTCTTTTGTTTCCTCACACACAGACAACAACTACGACAAC
TAAGATGGCAACAACGACGATGGCAGTCACAATCTCTCACGGGCTTCGACGGGACAACGA
CGACGGCAGTAGACAACTTCTCCGGTGTGGCCAGCTGCCTAAGAAGAAGCTCCAGTTTGG
CGACTGTTAGAAGAAGCTTTGGTGTGACATGATTGACAGCTTCTCCTCAATCGACAACGA
CAATTTCTCCGGTGTGGCCAGACGCCTAAGAAGAAGCTCCGGTGTGGCAAGATCGACGGC
GGTAAAGCTGAGACTATCAGTGGACAGGAAGCACTGACGGCAAAGAGGATTAGGTTTAGG
TTTTTGGTTTACTCTTGGTTTAGTTTAGGCTTATTTGGTTTACTTTTTTATTTATTAGTT
CGGTTTGGTTAGGATAAATGACTTTCTATATATTTTCTTTTTAGCTCTGAGAATGCGTTC
CAGTCAAAACAATGTATATTGGTTTTGTATTCAAAACAAAATAAATCCCCAACGATCTGT
TGCTAAATGTGCTAAACAAATCATTCTTCTTTTGAAGT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4H485JQB 585 0 0
TCTCTCAAACATCTCTCAGTCTTCCTCTTCTTTTGTTTCCTCACACACAGACAACAACTA
CGACAACTAAGATGGCAACAACGACGATGGCAGTCACAATCTCTCACGGGCTTTGACGGG
ACAACGACGACGGCAGTAGACAACTTTTCCGGTGTGGCCAGCTGCCTAAGAAGAAGCTCC
AGTTTGGCGACTGTTAGAAGAAGCTTTGGTGTGACATGATTGACAGCTTCTCCTCAATCG
ACAACGACAATTTCTCCGGTGTGGCCAGACGCCTAAGAAGAAGCTCCGGTGTGGCAAGAT
CGACGGCGGTAAAGCTGAGACTATCAGTGGACAGGAAGCACTGACGGCAAAGAGGATTAG
GTTTAGGTTTTTGGTTTACTCTTGGTTTAGTTTAGGCTTATTTGGTTTACTTTTTTATTT
ATTAGTTCGGTTTGGTTAGGATAAATGACTTTCTATATATTTTCTTTTTAGCTCTGAGAA
TGCGTTCCAGTCAAAACAATGTATATTGGTTTTGTATTCAAAACAAAATAAATCCCCAAC
GATCTGTTGCTAAATGTGCTAAACAAATCATTCTTCTTTTGAAGT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL9270Contig1 1204 2 2 U
GGACCACAGACACGATATCTCCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAGCATCGTCCATGGAA
GCTCCTCCACCTTCAAGCGACCCATACAAGTTCCTCAACATAACACTCAACTCAGACGGG
TCTCTCACCAGACACCGCGACTTCCCCAAACTACCCCCAACGGAGCACTCAAAAGACATA
CCCTTAAACCCAAACAACAAAACCTTCATCCGTCTCTTCAAGCCACGGAACATCCCCCCG
GAGTCCAAACTCCCGATCCTCGTCTACTTCCACGGCGGCGGGTTCATTCTCTACAGCGCA
GCCTCCGCTCCTTTCCACGAATCTTGCAGCAAAATGGCCGACCGCCTCCAGACCGTGATC
CTCTCCGTCGAGTACCGTCTAGCTCCCGAGCACCGTCTCCCAGCGGCGTACGACGACGGC
GTCGAAGCGATCCTATGGCTCCGAGACCAAGCCCGCGGCGGAGGAGACTGCGACGCATGG
CTGAAAGACAGCGTAGACTTCTCCAAATGCTTCGTGATGGGGTCAAGCTCCGGCGGGAAC
ATCGTCTACGGCGTCGCGCTGCGTGTCGCGGAGACTGATCTCTCTCCCGTCAAGATCCAA
GGGCTGATAATGAACCAGGCTTTCTTCGGCGGCGTCGACACGTCGGACTCGGAGTCGCGT
CTGAAAGACGACAGGATCTGTCCGTTGACAGCTACTCATTTGCTTTGGTCGCTTTGTTTA
CCTGAGGGTGTAGATCGTGACCACGTGTACAGTAACCCGATTAAGAGCAGTGGTCCGGTG
GAGAGAGCGAAGATGGGACGTTTTCCGTCGACTCTCGTCAACGGTTACGGCGGGGATCCG
TTGGTTGATCGGCAGAGAGACGTGGCGGAGATGTTGAGGTCACGTGGAGTGCACGTGGAG
ACGAGGTTTGATGAAGATGGGTTTCATGCGTGCGAGTTGTTTGATGAGAACAAAGCCAGG
GCTCTGTATGACACCGTTGAGGCGTTTATGAAGAGTTGTTCCACGACTGCACCGTCGTCC
AACATGTAGTAGTCTTCTCCAGTGAAGTCCTTATGAGTTATATCTACCATAAAATGAATT
ATGCATGCAATATGTTGTAAGCGAGTTGCATTGCATGTCGCTCTGTGTCTATCAAAATAT
ATATGTATGATCTGGTACGTAATAATGGTTCTAAATCTATCTAATATTGTACGGTGTTCA
AAAT


BQ
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10 10 10 10 

AF RR4AF36TF U 1
AF RR4AF36JQ C 440
BS 1 739 RR4AF36TF
BS 740 1204 RR4AF36JQ

RD RR4AF36TF 739 0 0
GGACCACAGACACGATATCTCCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAGCATCGTCCATGGAA
GCTCCTCCACCTTCAAGCGACCCATACAAGTTCCTCAACATAACACTCAACTCAGACGGG
TCTCTCACCAGACACCGCGACTTCCCCAAACTACCCCCAACGGAGCACTCAAAAGACATA
CCCTTAAACCCAAACAACAAAACCTTCATCCGTCTCTTCAAGCCACGGAACATCCCCCCG
GAGTCCAAACTCCCGATCCTCGTCTACTTCCACGGCGGCGGGTTCATTCTCTACAGCGCA
GCCTCCGCTCCTTTCCACGAATCTTGCAGCAAAATGGCCGACCGCCTCCAGACCGTGATC
CTCTCCGTCGAGTACCGTCTAGCTCCCGAGCACCGTCTCCCAGCGGCGTACGACGACGGC
GTCGAAGCGATCCTATGGCTCCGAGACCAAGCCCGCGGCGGAGGAGACTGCGACGCATGG
CTGAAAGACAGCGTAGACTTCTCCAAATGCTTCGTGATGGGGTCAAGCTCCGGCGGGAAC
ATCGTCTACGGCGTCGCGCTGCGTGTCGCGGAGACTGATCTCTCTCCCGTCAAGATCCAA
GGGCTGATAATGAACCAGGCTTTCTTCGGCGGCGTCGACACGTCGGACTCGGAGTCGCGT
CTGAAAGACGACAGGATCTGTCCGTTGACAGCTACTCATTTGCTTTGGTCGCTTTGTTTA
CCTGAGGGTGTAGATCGTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR4AF36JQ 765 0 0
TCCGAGACCAAGCCCGCGGCGGAGGAGACTGCGACGCATGGCTGAAAGACAGCGTAGACT
TCTCCAAATGCTTCGTGATGGGGTCAAGCTCCGGCGGGAACATCGTCTACGGCGTCGCGC
TGCGTGTCGCGGAGACTGATCTCTCTCCCGTCAAGATCCAAGGGCTGATAATGAACCAGG
CTTTCTTCGGCGGCGTCGACACGTCGGACTCGGAGTCGCGTCTGAAAGACGACAGGATCT
GTCCGTTGACAGCTACTCATTTGCTTTGGTCGCTTTGTTTACCTGAGGGTGTAGATCGTG
ACCACGTGTACAGTAACCCGATTAAGAGCAGTGGTCCGGTGGAGAGAGCGAAGATGGGAC
GTTTTCCGTCGACTCTCGTCAACGGTTACGGCGGGGATCCGTTGGTTGATCGGCAGAGAG
ACGTGGCGGAGATGTTGAGGTCACGTGGAGTGCACGTGGAGACGAGGTTTGATGAAGATG
GGTTTCATGCGTGCGAGTTGTTTGATGAGAACAAAGCCAGGGCTCTGTATGACACCGTTG
AGGCGTTTATGAAGAGTTGTTCCACGACTGCACCGTCGTCCAACATGTAGTAGTCTTCTC
CAGTGAAGTCCTTATGAGTTATATCTACCATAAAATGAATTATGCATGCAATATGTTGTA
AGCGAGTTGCATTGCATGTCGCTCTGTGTCTATCAAAATATATATGTATGATCTGGTACG
TAATAATGGTTCTAAATCTATCTAATATTGTACGGTGTTCAAAAT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL9271Contig1 853 2 5 U
GGACTACCACCTTCTTCAATCAGCGGCTAAACAAAAACCTTACTCCTCTTCTCCGCACGA
CATTTACAGAGGTTTGAGCCATGGCCGCGGTCGCAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGC
AGCTTACCAACGAAGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTCGATGACGTCTCGGTCACAG
ACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTCCAGCCTGCGAAACACGCAACCTTTGTTCCCC
ACACTGCTGGAAGATACTCTGTAAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATTGTTGAGA
GGCTCACAAACTCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAGAAACTGATGGCTGTGA
GGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCCATTCAAG
TCATCATTGACGCCATTGTTAACAGTGGTCCGCGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTG
CTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTTAGACGTGGGAACCAAGCCA
TCTTCTTGCTCACCACTGGTGCGCGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTG
AGTGTCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGATCTTCCAACAGCTATGCTATCA
AGAAGAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGGATCTTCTTTTGTC
CTGAGTTTGCATTGTATCTCAAAGACCTTTTGTTGTGCTGCTTTCCTTAGCTTTTGGATA
TGTTTCAGACGATACTCGTCTTATCTTTAATGAAGTTTTGACAGTTTAAACCACTTTTGA
TCTTGATCAAATG


BQ
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AF RR4GT26TF U 162
AF RR4BF76TF U 1
BS 1 402 RR4BF76TF
BS 403 403 RR4GT26TF
BS 404 554 RR4BF76TF
BS 555 555 RR4GT26TF
BS 556 853 RR4BF76TF

RD RR4GT26TF 598 0 0
GATGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTCCAGCCTGCGAAA
CACGCAACCTTTGTTCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTGTAAAGAGGTTCAGGAAGGCT
CAGTGCCCTATTGTTGAGAGGCTCACAAACTCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGT
AAGAAACTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACT
GACGCCAACCCCATTCAAGTCATCATTGACGCCATTGTTAACAGTGGTCCGCGTGAAGAT
GCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTT
AGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGCGCGTGAAGCTGCCTTCAGA
AACATCAAGACAATCGCTGAGTGTCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGATCT
TCCAACAGCTATGCTATCAAGAAGAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCTAACCGT
TAAGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTTGCATTGTATCTCAA*GACCTTTTGTTGTGCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4BF76TF 853 0 0
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CATTTACAGAGGTTTGAGCCATGGCCGCGGTCGCAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGC
AGCTTACCAACGAAGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTCGATGACGTCTCGGTCACAG
ACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTCCAGCCTGCGAAACACGCAACCTTTGTTCCCC
ACACTGCTGGAAGATACTCTGTAAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATTGTTGAGA
GGCTCACAAACTCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAGAAACTGATGGCTGTGA
GGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGGCGCCAACCCCATTCAAG
TCATCATTGACGCCATTGTTAACAGTGGTCCGCGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTG
CTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTTAGACGTGGGAACCAAGCCA
TCTTCTTGCTCACCGCTGGTGCGCGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTG
AGTGTCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGATCTTCCAACAGCTATGCTATCA
AGAAGAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGGATCTTCTTTTGTC
CTGAGTTTGCATTGTATCTCAAAGACCTTTTGTTGTGCTGCTTTCCTTAGCTTTTGGATA
TGTTTCAGACGATACTCGTCTTATCTTTAATGAAGTTTTGACAGTTTAAACCACTTTTGA
TCTTGATCAAATG

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL9272Contig1 581 2 1 U
TCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGCTTCTTTCAGGTCTTCT
CCAACAGGTTGAGTCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTACGTTCGAAGATCGAAGC
ACTCGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAGTCTTCTCAGCCCCTCACTGAGGTGGA
GATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATGTTGATGAGATGATCTC
CTCTGCTATTGCTTCTGATCCTCAAGTTCAGACCCTCCTTAGTGGTACTGCTGATGTTTG
GATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCACTGCCTCAATTGGTGA
CGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGAACAACAGCTCGTAAAT
CTTTCTTGCAGAACCTGTTTCTTGTTGTTAAACTCAGTATTGTTCTGTCTTTTTGGCTTC
TCCAGCCTTTTACTTTTATTTTCTTTCTAAATTCAATGTGTCAGCTCTCAGATATTCGAC
GATGGAGGTTTATACAAATTGAATACATCTGTTTATTTTAG


BQ
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AF RR4H622JQB C 1
AF RR4H622TF U 1
BS 1 581 RR4H622TF

RD RR4H622JQB 581 0 0
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CCAACAGGTTGAGTCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTACGTTCGAAGATCGAAGC
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GATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATGTTGATGAGATGATCTC
CTCTGCTATTGCTTCTGATCCTCAAGTTCAGACCCTCCTTAGTGGTACTGCTGATGTTTG
GATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCACTGCCTCAATTGGTGA
CGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGAACAACAGCTCGTAAAT
CTTTCTTGCAGAACCTGTTTCTTGTTGTTAAACTCAGTATTGTTCTGTCTTTTTGGCTTC
TCCAGCCTTTTACTTTTATTTTCTTTCTAAATTCAATGTGTCAGCTCTCAGATATTCGAC
GATGGAGGTTTATACAAATTGAATACATCTGTTTATTTTAG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR4H622TF 581 0 0
TCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGCTTCTTTCAGGTCTTCT
CCAACAGGTTGAGTCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTACGTTCGAAGATCGAAGC
ACTCGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAGTCTTCTCAGCCCCTCACTGAGGTGGA
GATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATGTTGATGAGATGATCTC
CTCTGCTATTGCTTCTGATCCTCAAGTTCAGACCCTCCTTAGTGGTACTGCTGATGTTTG
GATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCACTGCCTCAATTGGTGA
CGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGAACAACAGCTCGTAAAT
CTTTCTTGCAGAACCTGTTTCTTGTTGTTAAACTCAGTATTGTTCTGTCTTTTTGGCTTC
TCCAGCCTTTTACTTTTATTTTCTTTCTAAATTCAATGTGTCAGCTCTCAGATATTCGAC
GATGGAGGTTTATACAAATTGAATACATCTGTTTATTTTAG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL9273Contig1 802 2 2 U
ATCTCTGAACCCAACTCACAGCTTCCATCACCAGTTCCCCCATTCCAATTCTTCATTCCC
TTCACCTCCCAGTTTTCTGCGATGTGGTGGAAATCGCCGTCGTGGGGTCACCATGGCCGC
CGCCGCCGGGAAGGATCACTACAAAACATTGAATGTCGGACGCAACGCCACATTGAAGGA
GATCAAGAGCGCGTACAGAAATCTCGCTCGCAAGTATCATCCGGACATGAACAAGAACCC
TGGTGCTGAAGATAAGTTCAAACAGATCAGTGCTGCTTATGAGGTATTATCTGATGAGGA
GAAGAGGTCTGCTTATGATCGCTTTGGCGAAGCTGGTTTAGATGGAAGTTTCAATGCATC
ACAGGATTCTGCTTCTGAAGGAGTGGATCCATTTGATTTGTATAGTGCCTTCTTTGGAGG
TGGTTCTGATGGTTTCTTTGGAGAAATGGGTGATTCTGGAGGAGGGATGGGGGGTTTTGA
TTTCATGAATAAGAGAAGCCTTGACCTTGACATAAGGTATGATATGCGGTTGAGCTTTGA
AGAGTCTGTTTTTGGAGTAAAGCGTGAGATCGATGTTTCTTATTTAGCAACGTGTGATGG
CTGTGGAGGCACAGGTGCTAAATCTAGTAAGGACGTTAAACAGTGTAGCAATTGTGGTGG
TAAAGGCCGTGTCATGGACACTCAGAGAACTCCCTTTGGAATCATGTCTCAGGTTTCCAC
TTGCTCCAAATGTGGCGGTGAAGGCAAAATCATAACTGATAAATGTCGAATGTGCAATGG
CAACGGGAGACTACGGTCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4BK67TF U 1
AF RR4BK67JQ C 68
BS 1 187 RR4BK67TF
BS 188 802 RR4BK67JQ

RD RR4BK67TF 187 0 0
ATCTCTGAACCCAACTCACAGCTTCCATCACCAGTTCCCCCATTCCAATTCTTCATTCCC
TTCACCTCCCAGTTTTCTGCGATGTGGTGGAAATCGCCGTCGTGGGGTCACCATGGCCGC
CGCCGCCGGGAAGGATCACTACAAAACATTGAATGTCGGACGCAACGCCACATTGAAGGA
GATCAAG

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR4BK67JQ 735 0 0
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GGGAAGGATCACTACAAAACATTGAATGTCGGACGCAACGCCACATTGAAGGAGATCAAG
AGCGCGTACAGAAATCTCGCTCGCAAGTATCATCCGGACATGAACAAGAACCCTGGTGCT
GAAGATAAGTTCAAACAGATCAGTGCTGCTTATGAGGTATTATCTGATGAGGAGAAGAGG
TCTGCTTATGATCGCTTTGGCGAAGCTGGTTTAGATGGAAGTTTCAATGCATCACAGGAT
TCTGCTTCTGAAGGAGTGGATCCATTTGATTTGTATAGTGCCTTCTTTGGAGGTGGTTCT
GATGGTTTCTTTGGAGAAATGGGTGATTCTGGAGGAGGGATGGGGGGTTTTGATTTCATG
AATAAGAGAAGCCTTGACCTTGACATAAGGTATGATATGCGGTTGAGCTTTGAAGAGTCT
GTTTTTGGAGTAAAGCGTGAGATCGATGTTTCTTATTTAGCAACGTGTGATGGCTGTGGA
GGCACAGGTGCTAAATCTAGTAAGGACGTTAAACAGTGTAGCAATTGTGGTGGTAAAGGC
CGTGTCATGGACACTCAGAGAACTCCCTTTGGAATCATGTCTCAGGTTTCCACTTGCTCC
AAATGTGGCGGTGAAGGCAAAATCATAACTGATAAATGTCGAATGTGCAATGGCAACGGG
AGACTACGGTCTAGC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL9274Contig1 760 2 1 U
GTGATCCAGAGGGAAGATTGGGTGAAGCACCAAGGCCTGAGCTACGAGAGCACGGAAGAA
TCTCCGGTGCTTGCTTTGATGCTGCACGTGGCATCATGCCTGGTCTCCAGATCAAAGGAA
CAGACTACAAAACCTCCGATGGAACTTGCGTACGGGATTACATTGACGTCACTGACTTGG
TTGATGCTCATGTTAAGGCTCTCCAAAAAGCAAAACCCCGTAAAGTCGGAATCTACAATG
TTGGTACCGGGAAAGGTAGCTCGGTGAAAGAGTTTGTTGAGGCTTGCAAGAAAGCAACTG
GCGTTGAGATCAAGATCGAGTACTTGCCTAGACGCCCAGGTGACTACGCTGAGGTTTACA
GTGACCCTAGCAAGATCAGGAAAGAACTTAACTGGACGGCTAAGCACACTAATCTCAAGG
AGAGTCTTGAGACTGCTTGGAGATGGCAGAAGCTGCACCGTGATGGCTATGGCTCAACCT
CCTCATCATATCTCTCGGTTTACTGACTTTCTTTTCAGTCCTTTGATGACGAATGGAGAT
TTTGATCCCCAGATGGTACTTTTGTGGAGAAGCTTTAGGAGATGATGATGGTCTATAAAA
AAAATAAAAGATATAATATCCATATTATAAATGAGATTTTGATTGATTAGTGTCACGTTG
ATATTCATTTTGTTAATGGCTTTAGGTTCTGATAGGAAGCAGCCATTCATCATATATGTA
CCTCTCTCACAGTTTTTATTTATTTATTAGTAGTCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AX45TF U 1
AF RR4AX45JQ C 76
BS 1 760 RR4AX45TF

RD RR4AX45TF 760 0 0
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TCTCCGGTGCTTGCTTTGATGCTGCACGTGGCATCATGCCTGGTCTCCAGATCAAAGGAA
CAGACTACAAAACCTCCGATGGAACTTGCGTACGGGATTACATTGACGTCACTGACTTGG
TTGATGCTCATGTTAAGGCTCTCCAAAAAGCAAAACCCCGTAAAGTCGGAATCTACAATG
TTGGTACCGGGAAAGGTAGCTCGGTGAAAGAGTTTGTTGAGGCTTGCAAGAAAGCAACTG
GCGTTGAGATCAAGATCGAGTACTTGCCTAGACGCCCAGGTGACTACGCTGAGGTTTACA
GTGACCCTAGCAAGATCAGGAAAGAACTTAACTGGACGGCTAAGCACACTAATCTCAAGG
AGAGTCTTGAGACTGCTTGGAGATGGCAGAAGCTGCACCGTGATGGCTATGGCTCAACCT
CCTCATCATATCTCTCGGTTTACTGACTTTCTTTTCAGTCCTTTGATGACGAATGGAGAT
TTTGATCCCCAGATGGTACTTTTGTGGAGAAGCTTTAGGAGATGATGATGGTCTATAAAA
AAAATAAAAGATATAATATCCATATTATAAATGAGATTTTGATTGATTAGTGTCACGTTG
ATATTCATTTTGTTAATGGCTTTAGGTTCTGATAGGAAGCAGCCATTCATCATATATGTA
CCTCTCTCACAGTTTTTATTTATTTATTAGTAGTCTTCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR4AX45JQ 685 0 0
TTGATGCTGCACGTGGCATCATGCCTGGTCTCCAGATCAAAGGAACAGACTACAAAACCT
CCGATGGAACTTGCGTACGGGATTACATTGACGTCACTGACTTGGTTGATGCTCATGTTA
AGGCTCTCCAAAAAGCAAAACCCCGTAAAGTCGGAATCTACAATGTTGGTACCGGGAAAG
GTAGCTCGGTGAAAGAGTTTGTTGAGGCTTGCAAGAAAGCAACTGGCGTTGAGATCAAGA
TCGAGTACTTGCCTAGACGCCCAGGTGACTACGCTGAGGTTTACAGTGACCCTAGCAAGA
TCAGGAAAGAACTTAACTGGACGGCTAAGCACACTAATCTCAAGGAGAGTCTTGAGACTG
CTTGGAGATGGCAGAAGCTGCACCGTGATGGCTATGGCTCAACCTCCTCATCATATCTCT
CGGTTTACTGACTTTCTTTTCAGTCCTTTGATGACGAATGGAGATTTTGATCCCCAGATG
GTACTTTTGTGGAGAAGCTTTAGGAGATGATGATGGTCTATAAAAAAAATAAAAGATATA
ATATCCATATTATAAATGAGATTTTGATTGATTAGTGTCACGTTGATATTCATTTTGTTA
ATGGCTTTAGGTTTTGATAGGAAGCAGCCATTCATCATATATGTACCTCTCTCACAGTTT
TTATTTATTTATTAGTAGTCTTCTT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL9275Contig1 826 2 2 U
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GCTCCGTCACCGGTATCTTTCCGTTACTCTCCGGCTCCGGCAACCACCTCCGTAGGATTG
TGTCCGGTGAAGCAGCGCTGCCGGATCCCGAACTCAGGCGTCGCGGCGGCGAATACAGGA
TTCTGTTTGGGAGGTGGTGGTGTGTTAGATTTAAGGAAGAGGATGGGTTCCCGTGTGGTG
AAGTGTAGCTTAGAGACAGTGAATGTCAGTGTCGGCGAGGTGACTGAGGTTGACAAGGAC
ACGTTTTGGCCAATCGTTAAAGCCGCTGGTGATAAGATTGTTGTCCTCGACATGTACACT
CAGTGGTGTGGACCTTGCAAAGTTATGGCTCCTAAATACAAAGAGCTATCAGAGAAGTAC
CAGGACATGGTGTTTCTTAAGCTTGACTGTAACGAAGACAACAAGCCAGTGGCAAAGTAG
CTAGGAATTAAAGTGGTTCCAACCTTTAAGATCTTGAAGGACAGCAAGGTGATAACGGAA
GTGGTCGGGGCTAAATTTGATGAGTTACTTGCAGCTATTGATGCAGCGAGGTCAGGCTGA
GCCTCCTCTCTATATACATATAATATCACTTCTGCTGTAGAGTATTAGGACAAATTCTCC
ATCAACATGTAATTGGTTTGATTCTATATAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGC
TGTTCCTTAACCGGATTCAGTTGTAATGTAACAGTGTATGTATAAACGCTGGAAAGTTGT
GAAATACGCGATGGGCTAAAATGCTTTATATATCAAAAGTTTCACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AO73JQ C 1
AF RR4AO73TF U 1
BS 1 785 RR4AO73TF
BS 786 826 RR4AO73JQ

RD RR4AO73JQ 826 0 0
GGATTCTAAACAAGCTTTTGGATTCGAGCTTCTTCAACTATGACCCTCTGTCTCCGAATC
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TTCTGTTTGGGAGGTGGTGGTGTGTTAGATTTAAGGAAGAGGATGGGTTCCCGTGTGGTG
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ACGTTTTGGCCAATCGTTAAAGCCGCTGGTGATAAGATTGTTGTCCTCGACATGTACACT
CAGTGGTGTGGACCTTGCAAAGTTATGGCTCCTAAATACAAAGAGCTATCAGAGAAGTAC
CAGGACATGGTGTTTCTTAAGCTTGACTGTAACGAAGACAACAAGCCAGTGGCAAAGTAG
CTAGGAATTAAAGTGGTTCCAACCTTTAAGATCTTGAAGGACAGCAAGGTGATAACGGAA
GTGGTCGGGGCTAAATTTGATGAGTTACTTGCAGCTATTGATGCAGCGAGGTCAGGCTGA
GCCTCCTCTCTATATACATATAATATCACTTCTGCTGTAGAGTATTAGGACAAATTCTCC
ATCAACATGTAATTGGTTTGATTCTATATAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGC
TGTTCCTTAACCGGATTCAGTTGTAATGTAACAGTGTATGTATAAACGCTGGAAAGTTGT
GAAATACGCGATGGGCTAAAATGCTTTATATATCAAAAGTTTCACG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4AO73TF 785 0 0
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GCTCCGTCACCGGTATCTTTCCGTTACTCTCCGGCTCCGGCAACCACCTCCGTAGGATTG
TGTCCGGTGAAGCAGCGCTGCCGGATCCCGAACTCAGGCGTCGCGGCGGCGAATACAGGA
TTCTGTTTGGGAGGTGGTGGTGTGTTAGATTTAAGGAAGAGGATGGGTTCCCGTGTGGTG
AAGTGTAGCTTAGAGACAGTGAATGTCAGTGTCGGCGAGGTGACTGAGGTTGACAAGGAC
ACGTTTTGGCCAATCGTTAAAGCCGCTGGTGATAAGATTGTTGTCCTCGACATGTACACT
CAGTGGTGTGGACCTTGCAAAGTTATGGCTCCTAAATACAAAGAGCTATCAGAGAAGTAC
CAGGACATGGTGTTTCTTAAGCTTGACTGTAACGAAGACAACAAGCCAGTGGCAAAGTAG
CTAGGAATTAAAGTGGTTCCAACCTTTAAGATCTTGAAGGACAGCAAGGTGATAACGGAA
GTGGTCGGGGCTAAATTTGATGAGTTACTTGCAGCTATTGATGCAGCGAGGTCAGGCTGA
GCCTCCTCTCTATATACATATAATATCACTTCTGCTGTAGAGTATTAGGACAAATTCTCC
ATCAACATGTAATTGGTTTGATTCTATATAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGC
TGTTCCTTAACCGGATTCAGTTGTAATGTAACAGTGTATGTATAAACGCTGGAAAGTTGT
GAAAT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL9276Contig1 577 2 1 U
GGGAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAGGAAAAAAAAACATCCAATTCCC
ATCGGAAAGAAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTAGGCAAAGGAGGAGCCA
AGCGTCACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAACCGGCGATTAGGA
GGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTG
GAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACG
CCAGGAGGAAGACTGTGACGGCCATGGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGA
CCCTTTACGGGTTTGGCGGTTAAGTGTCTTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTC
ATTTAGGCGTGTTCTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGCTATCCAGTGTTTGCGTTTT
TAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTACATGTAATGTAA
TTACGCATTTTATCTATGAATGTGTTCGAGTTTATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4D916JQ C 1
AF RR4D916TF U 1
BS 1 577 RR4D916TF

RD RR4D916JQ 577 0 0
GGGAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAGGAAAAAAAAACATCCAATTCCC
ATCGGAAAGAAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTAGGCAAAGGAGGAGCCA
AGCGTCACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAACCGGCGATTAGGA
GGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTG
GAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACG
CCAGGAGGAAGACTGTGACGGCCATGGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGA
CCCTTTACGGGTTTGGCGGTTAAGTGTCTTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTC
ATTTAGGCGTGTTCTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGCTATCCAGTGTTTGCGTTTT
TAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTACATGTAATGTAA
TTACGCATTTTATCTATGAATGTGTTCGAGTTTATGT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4D916TF 577 0 0
GGGAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAGGAAAAAAAAACATCCAATTCCC
ATCGGAAAGAAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTAGGCAAAGGAGGAGCCA
AGCGTCACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAACCGGCGATTAGGA
GGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTG
GAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACG
CCAGGAGGAAGACTGTGACGGCCATGGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGA
CCCTTTACGGGTTTGGCGGTTAAGTGTCTTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTC
ATTTAGGCGTGTTCTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGCTATCCAGTGTTTGCGTTTT
TAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTACATGTAATGTAA
TTACGCATTTTATCTATGAATGTGTTCGAGTTTATGT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL9277Contig1 1247 2 2 U
GGAACGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAAGTCGATGGCAGGGATGATGATGCTTGCCAACAG
TGTCCCCCTCCTCCCTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGTTTTCTTCTTCTCGAAGCAG
CAGATCAATCCGAAGAACCACCCTACTAGTCATGTCCAAAGCTTCCTCCGAACCTCCCGA
CTCCCTCTCAGTGTCCACCAAATTCACCGCACCTCCAGGGTACAAGCCTCCCGAGCCGAA
GCGGTTCGCCGTTAAACCGGGGAAGCTCTTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCT
TCTCCGATTCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTACTCTGCTTCTTTCGTGTCCAAGGA
CGTGATCCCAGCTGATCAGTATGCGTTGCGAATTGGCGGGATCACGGTGAAGGAAACGTC
GAAGATCGGGCCTCGTCCTCATAAACCCATTGAGATATATGAGTTCGAGGGCTGTCCCTT
TTGCCGGAAGGTCAGGGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTG
CCCAAGAGGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAACCAGATGGGTGGCAAACTACAGTT
TCCCTACATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGAATCATCAA
ATATCTATCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGTCTATCACTTGGTCCATT
AACGGCTATAGCAGCTGCCTTTGCAACGATTGGTCGTCTAGGAAAGGGTAACTTGTACAC
ACCAGCAAAACTACCACCTAAGCCACTCGTATTCTGGGCATACGAGGGTTCTCCGTTTTG
CAAGCTTGTACGCGAAGTTCTTGTGGAACTAGAGTTACTACACATTCAACGCAGCTGTGC
TCGTGGTAGTCCCAAACGGCAGGAATTGCTTATGAAAGCTGGTTACTTTCAGGTGCCTTA
CCTGGAAGATCCAAACACTGGAGTAAATATGTTTGAGAGTGCAGAAATCATAAAGTATCC
GAAGCAAACTTATGCTGCTTAGTTCAGCTACTTTCGTTTAATAATCTCAACTTAGTTATG
AGTAAGTAAGTGCAGGGTTTAATGATCAAGAAATGTATCTATATATACAAACCAAATATT
ATCGTGTGACATGATTCTCCAAGGTTTGATCTTCTTTCTTGTTGTCATTTTTGTGTAAAA
ATACAATTTGCACTTAAAAACTCAGTTAAATAAAGTTTTAAAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4C632TF U 1
AF RR4C632JQ C 401
BS 1 731 RR4C632TF
BS 732 1247 RR4C632JQ

RD RR4C632TF 731 0 0
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CTCCCTCTCAGTGTCCACCAAATTCACCGCACCTCCAGGGTACAAGCCTCCCGAGCCGAA
GCGGTTCGCCGTTAAACCGGGGAAGCTCTTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCT
TCTCCGATTCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTACTCTGCTTCTTTCGTGTCCAAGGA
CGTGATCCCAGCTGATCAGTATGCGTTGCGAATTGGCGGGATCACGGTGAAGGAAACGTC
GAAGATCGGGCCTCGTCCTCATAAACCCATTGAGATATATGAGTTCGAGGGCTGTCCCTT
TTGCCGGAAGGTCAGGGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTG
CCCAAGAGGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAACCAGATGGGTGGCAAACTACAGTT
TCCCTACATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGAATCATCAA
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AACGGCTATAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR4C632JQ 847 0 0
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GAGTTCGAGGGCTGTCCCTTTTGCCGGAAGGTCAGGGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTT
GATATTCTCTACTATCCTTGCCCAAGAGGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAACCAG
ATGGGTGGCAAACTACAGTTTCCCTACATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTAT
GAATCAGATGGAATCATCAAATATCTATCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTA
AGTCTATCACTTGGTCCATTAACGGCTATAGCAGCTGCCTTTGCAACGATTGGTCGTCTA
GGAAAGGGTAACTTGTACACACCAGCAAAACTACCACCTAAGCCACTCGTATTCTGGGCA
TACGAGGGTTCTCCGTTTTGCAAGCTTGTACGCGAAGTTCTTGTGGAACTAGAGTTACTA
CACATTCAACGCAGCTGTGCTCGTGGTAGTCCCAAACGGCAGGAATTGCTTATGAAAGCT
GGTTACTTTCAGGTGCCTTACCTGGAAGATCCAAACACTGGAGTAAATATGTTTGAGAGT
GCAGAAATCATAAAGTATCCGAAGCAAACTTATGCTGCTTAGTTCAGCTACTTTCGTTTA
ATAATCTCAACTTAGTTATGAGTAAGTAAGTGCAGGGTTTAATGATCAAGAAATGTATCT
ATATATACAAACCAAATATTATCGTGTGACATGATTCTCCAAGGTTTGATCTTCTTTCTT
GTTGTCATTTTTGTGTAAAAATACAATTTGCACTTAAAAACTCAGTTAAATAAAGTTTTA
AAAACTC

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 2

CO CL9278Contig1 734 2 3 U
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CGGTTACAAAGAGTACAAACATGGACCAAACTCAACAACAACAAGAAGAAAAAAAAAGGG
AAACAAACAAACAAAAAAGAAAAGAAGATGGCCAAACTTAAAAGGAAGAGAAGAAGATTA
GAGGGAGATCTCACATGGTGCGTGAAACGTTCTTCCTCGGCAAATCGCTTCCAGATTTTC
TCCAGCGTACGAGCACAGTGGTGACACTTCCACACCAGTTGCATATAAAGGTACGGAATG
TGTTAAGAATCCACCAGCCGCTATGACCCAACGTGTGTGTAGCCATAGAACCAGAAGTCT
CGCGCTTTCTGGCGTGTCAAAGCTCGACCCGTTTGCATTCTTCACCGGGGCAAACTCTTC
CTCCCTCAACACCTCGAAGAGTGCAGTTGAAGGAGCATACGGAAAGCTATCAAATATGAA
CTGTTCTAGTTTCACTCCCTCTATGAAACCATTTATAGACGGTATCTTCTTCTCTGCCAC
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CCTCCTTACAAATC


BQ
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AF RR4E517JQ U 2
AF RR4DJ79TF C 1
BS 1 9 RR4DJ79TF
BS 10 590 RR4E517JQ
BS 591 734 RR4DJ79TF

RD RR4E517JQ 589 0 0
GCTAGTGT
TGTAATAAAATAGGAGTATAACAAACCCATCAGAGACTACTATCTCCTGGCCGGTTACAA
AGAGTACAAACATGGACCAAACTCAACAACAACAAGAAGAAAAAAAAAGGGAAACAAACA
AACAAAAAAGAAAAGAAGATGGCCAAACTTAAAAGGAAGAGAAGAAGATTAGAGGGAGAT
CTCACATGGTGCGTGAAACGTTCTTCCTCGGCAAATCGCTTCCAGATTTTCTCCAGCGTA
CGAGCACAGTGGTGACACTTCCACACCAGTTGCATATAAAGGTACGGAATGTGTTAAGAA
TCCACCAGCCGCTATGACCCAACGTGTGTGTAGCCATAGAACCAGAAGTCTCGCGCTTTC
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TTTCACTCCCTCTATGAAACCATTTATAGACGGTATCTTCTTCTCTGCCACATGATAAAT
GCTGTCTTTTTCCAGTCCGTTTGCAACTTGGTTAAGGAAAT

QA 9 589 9 589
DS 

RD RR4DJ79TF 734 0 0
ATGCTAGTGTGTAATAAAATAGGAGTATAACAAACCCATCAGAGACTACTATCTCCTGGC
CGGTTACAAAGAGTACAAACATGGACCAAACTCAACAACAACAAGAAGAAAAAAAA*GGG
AAACAAACAAACAAAAAAGAAAAGAAGATGGCCAAACTTAAAAGGAAGAGAAGAAGATTA
GAGGGAGATCTCACATGGTGCGTGAAACGTTCTTCCTCGGCAAATCGCTTCCAGATTTTC
TCCAGCGTACGAGCACAGTGGTGACACTTCCACACCAGTTGCATATAAAGGTACGGAATG
TGTTAAGAATCCACCAGCCGCTATGACCCAACGTGTGTGTAGCCGTAGAACCAGAAGTCT
CGCGCTTTCTGGCGTGTCAAAGCTCGACCCGTTTGCATTCTTCACCGGGGCAAACTCTTC
CTCCCTCAACACCTCGAAGAGTGCAGTTGAAGGAGCATACGGAAAGCTATCAAATATGAA
CTGTTCTAGTTTCACTCCCTCTATGAAACCATTTATAGACGGTATCTTCTTCTCTGCCAC
ATGATAAATGCTGTCTTTTTCCAGTCCGTTTGCAACTTGGTTAAGGAAATCCAGAGTGAA
CATGTGTAAGCACACGTTACTCCAGCAATATTGAAGACGTCCTGTTTGTTGATTAGTTGC
AGAAGCCATGGACTCATCAAGCTCTGTGTACTCAACCACGGTCAGTGGCCCACCTTTTCC
CCTCCTTACAAATC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL9279Contig1 862 2 2 U
CTTCCATTTTCTCTCTTAATTTAAAATTACACATATACAGTATCAGATTATCTTAGAAGA
TTCACACAATCTTTTGATTTATAAATAATATATATTTCCTCTGTTTAATCCTTAGATTTT
GCTTCGGCTCAGTTTATCTGAGAGAGTTATGGCGTTCTCAAATGGAGGTGTTCACGGCAA
AGAAGAAGCGTTAGGGTTAGGGTTTGTGAGGATCACAAGAGGATTAGGGAGGAAAAGGAT
TCTGATATCGAAATCCAATCATGAAAACGTTTCGAAATCCGATCAAAATCTGTTGAAGAG
ATCTAAAAGTGAAACAACAGAATCCAATAACTCTGTTCTTGAATCTCTGCATCAAGATAT
TTTGATTCGAGTACTTTGTCATGTGGATCACGGAGACCTAGAGAGACTAAAACGTGTATC
AAAAACAATCAGAAATGCTGTTTTGGAAGCAAAGAAGTCTCATTTTGATTATAGCACACC
TAAAAAGACTATGTCTTTTCGAGACCCATTAGTTATCCTTGACCAAGATTCAAATTCGAA
TGGTTTGAGTGATCAAGAGGTACCTCCTTACGCACCAACTCGAAGGAAGAACGTGAGTCG
TGAATCAGATTTGTCGAAGATCTCTATGGCGTTGTTTAAATGAGGAACAAGTGCAGAACA
TGAAGACACATAGAGTTCGCTTTTGCTTCAATCCTCTTATCATTGAAGCTATTTAAAATT
TAAGTTTATTATATTTACTGATCCATGTGAATATAACAATTATTTGCAGACTTTGTAAGA
TTAAATATTAATCTGTAAATAATTCATTTGGGTTGTGATCAGATTTCAGAGTATCCTAAG
TATTGATTTTGTCCTTTTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AB05TF U 1
AF RR4AB05JQ C 23
BS 1 826 RR4AB05TF
BS 827 862 RR4AB05JQ

RD RR4AB05TF 826 0 0
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GCTTCGGCTCAGTTTATCTGAGAGAGTTATGGCGTTCTCAAATGGAGGTGTTCACGGCAA
AGAAGAAGCGTTAGGGTTAGGGTTTGTGAGGATCACAAGAGGATTAGGGAGGAAAAGGAT
TCTGATATCGAAATCCAATCATGAAAACGTTTCGAAATCCGATCAAAATCTGTTGAAGAG
ATCTAAAAGTGAAACAACAGAATCCAATAACTCTGTTCTTGAATCTCTGCATCAAGATAT
TTTGATTCGAGTACTTTGTCATGTGGATCACGGAGACCTAGAGAGACTAAAACGTGTATC
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TGGTTTGAGTGATCAAGAGGTACCTCCTTACGCACCAACTCGAAGGAAGAACGTGAGTCG
TGAATCAGATTTGTCGAAGATCTCTATGGCGTTGTTTAAATGAGGAACAAGTGCAGAACA
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QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4AB05JQ 840 0 0
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AAATAATATATATTTCCTCTGTTTAATCCTTAGATTTTGCTTCGGCTCAGTTTATCTGAG
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GAAAACGTTTCGAAATCCGATCAAAATCTGTTGAAGAGATCTAAAAGTGAAACAACAGAA
TCCAATAACTCTGTTCTTGAATCTCTGCATCAAGATATTTTGATTCGAGTACTTTGTCAT
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TTGGAAGCAAAGAAGTCTCATTTTGATTATAGCACACCTAAAAAGACTATGTCTTTTCGA
GACCCATTAGTTATCCTTGACCAAGATTCAAATTCGAATGGTTTGAGTGATCAAGAGGTA
CCTCCTTACGCACCAACTTGAAGGAAGAACGTGAGTCGTGAATCAGATTTGTCGAAGATC
TCTATGGCGTTGTTTAAATGAGGAACAAGTGCAGAACATGAAGACACATAGAGTTCGCTT
TTGCTTCAATCCTCTTATCATTGAAGCTATTTAAAATTTAAGTTTATTATATTTACTGAT
CCATGTGAATATAACAATTATTTGCAGACTTTGTAAGATTAAATATTAATCTGTAAATAA
TTCATTTGGGTTGTGATCAGATTTCAGAGTATCCTAAGTATTGATTTTGTCCTTTTCAAT

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

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AG


BQ
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10 10 

AF RR4G958TF U 1
AF RR4G958JQ C 1
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BS 712 722 RR4G958JQ

RD RR4G958TF 711 0 0
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TGCTCGACTGCCCTCAGCTCGATCGATCACTTCTCCGTCGCGTCTCTTCCCAGTCACTAG
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ATTCTCTCCTCTCTGCGTGCGTGATTCCAAAGCAGCTGAAGTTACACAAAGTTCGTGGGA
GAACTCGGTCCTGAAAAGCGAAACGCCAGTGCTAGTAGAATTCTACACGAGCTGGTGCGG
TCCATGCAGGATGGTCCACCGGATAATCAACGAAATCGCAGGCGACTATGCTGGAAAGCT
AAACTGCTATGTCTTGGATGCAGACAGTGACTCGTTGGTGGCTGAAGAGTACGAGATAAA
GGCTGTACCTGTAGTTCTCCTCTTCAAGAACGGTGAGAAACGAGAGTCGATCGTGGGTAC
AATGCCCAAAGAGTTTTACATTTCCGCCATTGAAAGAGTCTTGAACTCGTGAAGAAGGTA
AACATCATTCATGAGAATTTGATATGGGTTAATATCTCATTGATACCCAAGGACGTGTCT
TTTGTCTTCGGTCTGAACCTCTTTTGAGTTTTCTTTCTTCTTTTGTCTTCTGTGAATATA
ACTGTTGGATTTGTGGAAAGATGACTCGGGGATTATTGTGAATACACACTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR4G958JQ 722 0 0
CTTGAGAAAACCCAAAAACTCTTCTTCAATGGCTTCGTCTTCTATGTCTAGTTTCAGCGC
TGCTCGACTGCCCTCAGCTCGATCGATCACTTCTCCGTCGCGTCTCTTCCCAGTCACTAG
CTTCTCCCCTCGCTCACCACTACGATCCCTCGTATCTTCTTCCTCTGGCTCTCGCCTCCG
ATTCTCTCCTCTCTGCGTGCGTGATTCCAAAGCAGCTGAAGTTACACAAAGTTCGTGGGA
GAACTCGGTCCTGAAAAGCGAAACGCCAGTGCTAGTAGAATTCTACACGAGCTGGTGCGG
TCCATGCAGGATGGTCCACCGGATAATCAACGAAATCGCAGGCGACTATGCTGGAAAGCT
AAACTGCTATGTCTTGGATGCAGACAGTGACTCGTTGGTGGCTGAAGAGTACGAGATAAA
GGCTGTACCTGTAGTTCTCCTCTTCAAGAACGGTGAGAAACGAGAGTCGATCGTGGGTAC
AATGCCCAAAGAGTTTTACATTTCCGCCATTGAAAGAGTCTTGAACTCGTGAAGAAGGTA
AACATCATTCATGAGAATTTGATATGGGTTAATATCTCATTGATACCCAAGGACGTGTCT
TTTGTCTTCGGTCTGAACCTCTTTTGAGTTTTCTTTCTTCTTTTGTCTTCTGTGAATATA
ACTGTTGGATTTGTGGAAAGATGACTCGGGGATTATTGTGAATACACACTTTCCATCTTC
AG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL9281Contig1 761 2 7 U
AACGCTATGATTATGTTGGAACTAAAGTATTCTTGAAGCACAGATCATATGAGGCAGAGG
TGATGTTTGAAGAAGCAGAGAACGCTAAAGTTTCACCACTCACGCGGAGTAAGACATGGC
CATTTCGAAGTACAACAAGATCAGAGAAGATACTATGTCGTGCGAAATGCAGCGTTTGTA
GCAGCAAGGCAGAGGATGGGAATACTACACGTGCGTGTCAAGAGAAAACAAGATGGTGTA
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GGGAACCTTTGAACTTTGAGTTTGTGGAATATCACAAGACACGAGCGTTCACGTTTACTT
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AAACATGCATGTGAATATGGTCGGACCTAAGTGGAACCTTATATGAGACTGAAACTAGAT
AATTAAGTATGATAATGGAGATGGCAATAATATCATTCTAAAAGGGATTCAATGTATGTA
AACGTTACTAATTCAATATATGAACTCAGCGCTTCCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4GF38JQ C 1
AF RR4FI87TF U 172
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CGTTTACTTCGATTGGGGAAGCAGAGAGTGTGTGGAACTTAGATGGAGAGATCTTTGAGG
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QA 1 588 1 588
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AS 0 0

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FE80JQ U 42
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BS 42 621 RR4FE80JQ
BS 622 727 RR4FE80TF

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DS 

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TCAGTAACAGGCCACACACTGTTCCTGGGCCTCCGAATATCTTCTTCATCTAACCCTAAA
CCCAGAAACTCCGATCAAATCAGCGAGGAACAAGTAATCTAGAAACCCTAGCTTTTTTTT
TATAATTTTCGGAATCAAAAAGCTACATTTGCTTAAGGAGGAGTTTTTTTTGGCGGGGAA
TAGCAAATGTAGATGGAACTTGGACTCTAGAGGAGTTTCCCGAAACTGATCTTAGCTTCA
ATTATCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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ACTGTTGGTGGCACTTAGTGTGGAATCAGGACATCTAAAGAACTGGTCCAAGCCAAAACC
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CGTCTTTCTAGCGGCGGGACTTTACCTAACGGCTCTTCAAGCACATAGAATCTCTAAAGA
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TATAGTACTGTATAATGTATATAATAATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BA44TF U 1
AF RR4BA44JQ C 188
BS 1 755 RR4BA44TF
BS 756 869 RR4BA44JQ

RD RR4BA44TF 755 0 0
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CAAAACGTGCGTGTACAACGGTAGCGGTAAAACACCGTTATTGTGCGGTGCCATCGCGTT
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CTCGTCGCCTCTTGTTCTGGATACATGGGATCCTGACTCTGTTCCTGCGAAGACACTCAC
TTTTCAAGCAGCCTTCTTCCTCGTCTCAACGTGGCTTTGCTTTGGTGTTGGAGAGGTTCT
ACTGTTGGTGGCACTTAGTGTGGAATCAGGACATCTAAAGAACTGGTCCAAGCCAAAACC
TAGTTGTCTAGTGATTCGACAAGGCCTGTTCTCAGCCGCAGGTGTGTTCTCACTCTTAAC
CGTCTTTCTAGCGGCGGGACTTTACCTAACGGCTCTTCAAGCACATAGAATCTCTAAAGA
TCTTGAAAATACACATAGAGAAATTCTCGAAGCATCCGTTCTTTATGCATCTCCTCCAAG
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QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4BA44JQ 682 0 0
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CTAGTGATTCGACAAGGCCTGTTTTCAGCCGCAGGTGTGTTCTCACTCTTAACCGTCTTT
CTAGCGGCGGGACTTTACCTAACGGCTCTTCAAGCACATAGAATCTCTAAAGATCTTGAA
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GTCTTTGGGATACCTTGTTTCTTTAAAGCAACTTCCATATATAGTATAGACCGTATAGTA
CTGTATAATGTATATAATAATT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4AQ80TF C 1
AF RR4AQ80JQ U 2
BS 1 1 RR4AQ80TF
BS 2 752 RR4AQ80JQ

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TATGCTGTTGCTTCTTCTTGGACTCGGTTTTGATCCATAGATGGATTCCCTCCTGTTTAA
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AATCTTGTTTACTGTAACCCGAGCTCGTTCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E116TF U 1
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TATGTCT

QA 1 787 1 787
DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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QA 1 578 1 578
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4B271TF C 1
AF RR4B271JQ U 39
BS 1 38 RR4B271TF
BS 39 619 RR4B271JQ

RD RR4B271TF 619 0 0
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CATGTTATATGATCATTACGAAACAGAAACCAAAACTAAAACAAACTAAAGCGACTAGCG
AGTGAGAATCACGCGCCTCCTTGAAAACATAGCATCAATAACTCCGCCGTTGCATCACCC
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TCCACAATTACGGACAAGAAACTCATCTCCGGTCGACTCCAGCTCAGCCAGCGCCACATT
CCGTAACCAGGCTCAGATCCAGATGAAGCCGAGCGGACAGGCCACCAACAGGTCGCCGAA
GGCATCGGTCAATCTCTAGCTTGATTCTGGAAGTGAAGTGAGTCTTGTCTCTCTAATGCT
AGTGTGGCGAATGATGTCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4B271JQ 581 0 0
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AAACAAACTAAAGCGACTAGCGAGTGAGAATCACGCGCCTCCTTGAAAACATAGCATCAA
TAACTCCGCCGTTGCATCACCCACTAGCATTCGGTGGAAACAGACCAATGGAAGATAAAA
GTACCAAGGAAAAGCAAAAAATTAATAAGAGACGAACAAAAAAAAAAACAAAAGTTTCCA
GCAGTTGAGTAAACAAAAACAAAACAAAATCTTAAGTGAAATTCAAAATCAGACGGCGCA
GCCATAGAAGAAAAAGAAGAAACCGAGCATGGAGACCAAAGCCACTGACTCGAACGCTGT
TACCACTTTCCACACCACGTCGTCCACAATTACGGACAAGAAACTCATCTCCGGTCGACT
CCAGCTCAGCCAGCGCCACATTCCGTAACCAGGCTCAGATCCAGATGAAGCCGAGCGGAC
AGGCCACCAACAGGTCGCCGAAGGCATCGGTCAATCTCTAGCTTGATTCTGGAAGTGAAG
TGAGTCTTGTCTCTCTAATGCTAGTGTGGCGAATGATGTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL9290Contig1 854 2 10 U
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CTCTCTTCATCTGTATTGTCGTCGATTCCTCCATAAAAGATCCGATCTCGCAGCTTAGAG
AGTAAAGGGGCGATCGATCATGTCATCTCCGGATCAGACGAAGACAGCGAATTCCGATTC
CCAATCTCGAATCAACGAAGCTCCTCCTCCGTCGGAGGAGCTAGGAGATTCGTCAACTGT
TTGGAGAGATCCAGTAGAGTCCGGATCTCCAAACGAAGAAGAAGAGTCGAAGCAAGGAGG
AGAGGAGGAAGAGGAAGGAGAGTGCGGGTTTTGCTTGTTCATGAAAGGAGGGGGATGCAA
AGAGTCGTTCACGGCATGGGAAGTGTGCGTGGAGGAAGCTGAGAAGAACAAGGAAGACAT
CGTCACCAAGTGTATGGAAATCACTAGTACCTTGAAGAAGTGTATGGATGAGCATTCCGA
TTACTACCAGCCGATTCTCGCTGCGGAGAGAGCTGCCGAGCAACAGGTGAAGAAGGAGCT
CGAGGCTGACAAGGAGAAGGAGGAGAAGATCTCTGAAGAAGAAGCGGCGGCGATGAAGCT
AGCTCAGGGTTAAAAACTGAGAGGAGATTTAGGTAATTTTACCAGAGAATGTTGTTTAGA
TTCACTACCACTGATCATGGTCGAGTTTCTTTACCTAATTATAATCTGTTACTTTGTGTG
GGGGAATAAGTGGATTGATTGAGATCAGTTGAACCTTTTCTATCTGATTGAATACTTTGT
TTTTTAAAACAGATTGTTTCCTCTTTAAAGGTCACTTCTTTGTTGATGGTCAAGAAGTTC
TTTTTTTTCTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AT53TF U 1
AF RR4AT53JQ C 215
BS 1 632 RR4AT53TF
BS 633 633 RR4AT53JQ
BS 634 725 RR4AT53TF
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BS 785 786 RR4AT53JQ
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BS 822 854 RR4AT53JQ

RD RR4AT53TF 823 0 0
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AGAGTCGTTCACGGCATGGGAAGTGTGCGTGGAGGAAGCTGAGAAGAACAAGGAAGACAT
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GGGGATTAAGTGGATTGATTGAGATCAGTTGAACCTTTTCTATCTGATTGAATACTTTGT
TTTT**AAACAGATTGTTTCCTCTTTAAAG*TCACTTCTTT
TG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR4AT53JQ 640 0 0
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TTGTTCATGAAAGGAGGGGGATGCAAAGAGTCGTTCACGGCATGGGAAGTGTGCGTGGAG
GAAGCTGAGAAGAACAAGGAAGACATCGTCACCAAGTGTATGGAAATCACTAGTCCCTTG
AAGAAGTGTATGGATGAGCATTCCGATTACTACCAGCCGATTCTCGCTGCGGAGAGAGCT
GCCGAGCAACAGGTGAAGAAGGAGCTCGAGGCTGACAAGGAGAAGGAGGAGAAGATTTCT
GAAGAAGAAGCGGCGGCGATGAAGCTAGCTCAGGGTTAAAAACTGAGAGGAGATTTAGGT
AATTTTACCAGAGAATGTTGTTTAGATTCACTACCACTGATCATGGTCGAGTTTCTTTAC
CTAATTATAATCTGTTACTTTGTGTGGGGGAATAAGTGGATTGATTGAGATCAGTTGAAC
CTTTTCTATCTGATTGAATACTTTGTTTTTTAAAACAGATTGTTTCCTCTTTAAAGGTCA
CTTCTTTGTTGATGGTCAAGAAGTTCTTTTTTTTCTGGTC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL9291Contig1 683 2 2 U
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CCTTCCGGCTACGAAGTCCCAGTCTAAACACTCTTCGTCTCCAGCGTATCTTCGACCATT
CGACAAAAACAAAGACGGATTCATCACCGTCGAAGAACTGAGTCAAGCCCTCTCACGACT
TGGGCTCAATGCGGACATCTCCGAGCTCAAACCAACCATAGAATCTTTCATCAAACCGGA
TGAAACCGGACTCCGGTTCGACGGTTTCGAAGCACTTCACAAAACACTAGACGAATCTTT
CTTCGGAGGAGACTTAGAGTGCGACGGGTCGCCGGATTCAGATCTGGAAGAAGCTTTCAA
CGTGTTTGATGAAGACGGTGATGGTTTTATCTCTCCCGTGGAACTTCAGAAAGTTTTGAA
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TGATAGCAATCACGATGGCCGCGTTGACTTTTTTGAGTTCAAGAATATGATACAATCTGT
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AATGCTGAACAATTTCAAGATTATTGTGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTCTTCATAAGAAT
CCAATCCATGATGTCTCTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DF07TF U 1
AF RR4DF07JQ C 298
BS 1 652 RR4DF07TF
BS 653 683 RR4DF07JQ

RD RR4DF07TF 652 0 0
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TGGGCTCAATGCGGACATCTCCGAGCTCAAACCAACCATAGAATCTTTCATCAAACCGGA
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TGATAGCAATCACGATGGCCGCGTTGACTTTTTTGAGTTCAAGAATATGATACAATCTGT
TCTTGTGCCTTCCTCTTGAATCTTCAGCTAGAATTTCTCGTTTGGTTTCTTTCCTTGATT
AATGCTGAACAATTTCAAGATTATTGTGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTCTTC

QA 1 652 1 652
DS 

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CAACGTGTTTGATGAAGACGGTGATGGTTTTATCTCTCCCGTGGAACTTCAGAAAGTTTT
GAAGAAGTTAGGGCTTCCTGAAGCAGGAGAGATTGAACACGTGGAGAAGATGATTGTCTC
TGTTGATAGCAATCACGATGGCCGCGTTGACTTTTTTGAGTTCAAGAATATGATACAATC
TGTTCTTGTGCCTTCCTCTTGAATCTTCAGCTAGAATTTCTCGTTTGGTTTCTTTCCTTG
ATTAATGCTGAACAATTTCAAGATTATTGTGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTCTTCATAAG
AATCCAATCCATGATGTCTCTTTGAC

QA 1 386 1 386
DS 



AS 1 2

CO CL9292Contig1 681 2 1 U
GGAGATTTCGTCTCCTCGTCGTCTCAGGGATCTAGAAGTGAGCGGAGAGAAGATGGCAGG
CAAGGGAGGGAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAGGACAAAGACAA
GGGCAAGATGAAACCCATCTCTCGATCTTCTCGTGCCGGTATTCAGTTTCCAGTGGGTCG
TATCCATAGGCAACTCAAGACCAGGGCTTCAGCACACGGAAGAGTTGGTGCCACTGCTGC
TGTTTACACTGCTTCGATTCTGGAGTACTTGACTGCAGAAGTTCTTGAGTTAGCTGGAAA
CGCAAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATTTGCAGTTGGCAATCAG
AGGAGACGAGGAGCTTGACACGCTCATCAAAGGAACCATTGCCGGAGGTGGTGTCATCCC
TCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAAAGTGAT
CTTTGCTAGTTAGTTGCTCATCGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTTTTC
CCTTCCTTTATTAGTGTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTGTATATGAGTTAATTTGA
ACTCTTCTGCTTCTCTGTTTAGCAATTCTTGTCTTTGCATACTCTTGTGGTTTAGCTTCT
TTCAAGTAAATCAGTTTAAGC


BQ
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AF RR4A923JQ C 1
AF RR4A923TF U 1
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QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4B959TF U 1
AF RR4B959JQ C 178
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QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

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AGTTTTATTTGTTTCTTTTTTGTAGTTGATTTGTACCACATAAGCAATATTATATAAATA
CTGAATTAATCGTTGTTTTTTTCC


BQ
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AF RR4B079TF U 1
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BS 1 682 RR4B079TF
BS 683 684 RR4B079JQ

RD RR4B079TF 682 0 0
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TTTCATTGTCAGGAAGAAACTGTGGCTCACCAGTGAAAGCCTTAGGAACACTGAGTGATT
AAATGAAAAGCAGAAGAGAAAAAAAGAAACAAATTGTTTTATTCCCACAAGTTTTCATAT
AGTTTTATTTGTTTCTTTTTTGTAGTTGATTTGTACCACATAAGCAATATTATATAAATA
CTGAATTAATCGTTGTTTTTTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4B079JQ 587 0 0
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TACCCTCGAACATACGATTTCTTGCACGCATGGACTGTCTTTTCAGACATTAGAAGCAAA
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ATCATCATCAGAGATAAGGAGAGCATTGTTGAATCAATCAAGAAGTATATGAAGGCTCTG
CATTGGGAGGTTGTGGCGTCAGAGAAGGTAACTACAGGTTCAGAACTTGACCAAGACAGT
GACGATGGTGAGAACAATGTCATTTTCATTGTCAGGAAGAAACTGTGGCTCACCAGTGAA
AGCCTTAGGAACACTGAGTGATTAAATGAAAAGCAGAAGAGAAAAAAAGAAACAAATTGT
TTTATTCCCACAAGTTTTCATATAGTTTTATTTGTTTCTTTTTTGTAGTTGATTTGTACC
ACATAAGCAATATTATATAAATACTGAATTAATCGTTGTTTTTTTCC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GF02JQ C 1
AF RR4GF02TF U 1
BS 1 681 RR4GF02TF

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TATGTACGTTTGAAATTTCTGGTGATTTGTTACTTTTTCTTGTCAGAATTTGGGTTACAA
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QA 1 681 1 681
DS 

RD RR4GF02TF 681 0 0
GGGATCTTCTTCAGAGATTTGTGGGAAGCTCACAAGATGGAATGCGTGCTCTGGAGACGA
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GGAGGATGAGTAACGTTCAAGCAGGCACAACTGTTGTCTCATTCCTCCTGGGAGTTTCAT
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TGCTGCGGGTGCGGGGTTTATTGTCAACCCATTAGCTGAAACTCGACCAGTTCATGGATC
TGCAGGTATTCCTCACAATTAAAAGGAAGAAGAGGAAACAAAAAAACTTTCAAAGATTCT
CCGAGACTTAGAAACCACTGTGTGTGTGAGAATGTGGTGATTCATACTTATTACCAAGTT
ATATATATTACTACTACCACTACCCTAAGTTTTCAACCATTGTAGTATTTCTTTTTCCTT
GAAGAATATGTTGTACTAAAATCCTTAAAAGAAAATTAGATTGTGATCAGCAGTATTCAA
TATGTACGTTTGAAATTTCTGGTGATTTGTTACTTTTTCTTGTCAGAATTTGGGTTACAA
TGTAAATGAATATTCAGTTTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL9296Contig1 758 2 10 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4GB30TF U 1
AF RR4GB30JQ C 242
BS 1 615 RR4GB30TF
BS 616 616 RR4GB30JQ
BS 617 674 RR4GB30TF
BS 675 675 RR4GB30JQ
BS 676 696 RR4GB30TF
BS 697 697 RR4GB30JQ
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BS 715 716 RR4GB30JQ
BS 717 735 RR4GB30TF
BS 736 758 RR4GB30JQ

RD RR4GB30TF 735 0 0
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AAAAGCCCTAGTTGTCGCGCACCAGAAAGAATCGTTGATCATGACCGAGTGCTTTGGCTT
GGAGATTTGAATTACAGAGTTGCTTTAACCTATGAAGAGACGAGAGTGTTACTAGAAGAC
AATGATTGGGATACTCTTCTTGAGAAAGACCAGCTTAACATGGAGAGAGGAGCGGGAAGA
GTCTTCTCTGGATTTCAAGAAGGTCAAATCTTCTTTGCACCAACGTATAAATACACTCAA
AACTCAGATGCTTACGCCGAGAAACCACCAAGTCCAAGAAAAAACGACGTTCCTGCTTGG
TGTGATCGGATTCTGTGGAGAGGAGAAGGAATAGAACAGCTTTCTTACATTCGAGGAGAG
TCACGGTTCTCAGATCACAGACCGGTTTGTGCAATCTTTGCAGTAGAGGTTGATGTGAAG
AGTCTGAACAAAGGTAGATTCAGGAAAGGTTATTCTAGTGCAGCTGCAAGATTGGTTGAA
GATGACACTCCAAAACGACATAGTTTTTATGACTAAAAGATTTATTACCCATTCTTTTTT
TTTGAACAAAAAAAA*TGGATTAAAAGAAAATATTATTTCTTGAGATTGTATAGCTTTTG
GATCAAACAACAAA*TGTTTTTCCTCTGTTTATTAT*CTCTTAACTCTGTTTTT**ATAC
ATTGTAACTAGAGAG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4GB30JQ 517 0 0
TTTTT
TCTGGATTTCAAGAAGGTCAAATTTTCTTTGCACCAACGTATAAATACACTCAAAACTCA
GATGCTTACGCCGAGAAACCACCAAGTCCAAGAAAAAACGACGTTCCTGCTTGGTGTGAT
CGGATTCTGTGGAGAGGAGAAGGAATAGAACAGCTTTCTTACATTCGAGGAGAGTCACGG
TTCTCAGATCACAGACCGGTTTGTGCAATCTTTGCAGTAGAGGTTGATGTGAAGAGTCTG
AACAAAGGTAGATTCAGGAAAGGTTATTCTAGTGCAGCTGCAAGATTGGTTGAAGATGAC
ACTCCAAAACGACATAGTTTTTATGACTAAAAGATTTATTACCCATTCTTTTTTTTTGAA
CAAAAAAAAATGGATTAAAAGAAAATATTATTTCTTGAGATTGTATAGCTTTTGGATCAA
ACAACAAAATGTTTTTCCTCTGTTTATTATTCTCTTAACTCTGTTTTTTAATACATTGTA
ACTAGAGAGCTTTTTTCAATCTTGAGACATGT

QA 6 517 6 517
DS 



AS 1 2

CO CL9297Contig1 730 2 6 U
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CTTGCTCTTCTTCTACTCCCACTCGTCACTCCATCTTCACAATCCTCAATCCGAACCCTC
CTTGAAGCTCGTGGTTTACCAGGTGGTTTATTTCCAGACAACGTGGAGAGTTACAGTCTG
GACGTAAAGACAGGGGAGCTGAAGTTCAGTTACAAAATCCTTGTTTTGCTCGTTTCGAAA
ACAGAGTATACTTTGACAGTGTGATTAAAGCAAATCTTAGCTACGGTGGGCTTGTTGGGC
TTCAGGGTTTGACACAAGAAGAGCTTTTCTTTGGTTACCAGTCAAAGGCATCGCAGTGAA
TGATTCTTCTTCTGGACTTGTTCTTTTCGATATCGGTGTTGCTCATAAACAAATCTCTCG
CTCTCTATTTGAAGATCCACCTGTTTGCTATCCACCTGGATCTATTATGGAGAAGATAGA
GAAGAGAAAGATGGATATTCAACTCCAGAGATAAGAGAGTTTATTCGGGGTGTATGAGAT
TCAAAACTTAAATCTTCTGTCTCTGAAAACGTGAACAAAATAAGTGTTTACTTCTTTTCT
TTGGGGCTGGGCTGTTTTGTGAAAACTAAAATGTTGGGGGAAATTTGTAAAATATGGAAA
GAAGAGGGGAAAATTTTGTAACTTTGTATAAACTATGGGATCCACAAAGTAATCAATTTT
GTCACTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H740TF U 1
AF RR4H740JQB C 66
BS 1 624 RR4H740TF
BS 625 625 RR4H740JQB
BS 626 630 RR4H740TF
BS 631 631 RR4H740JQB
BS 632 651 RR4H740TF
BS 652 730 RR4H740JQB

RD RR4H740TF 654 0 0
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CTTGCTCTTCTTCTACTCCCACTCGTCACTCCATCTTCACAATCCTCAATCCGAACCCTC
CTTGAAGCTCGTGGTTTACCAGGTGGTTTATTTCCAGACAACGTGGAGAGTTACAGTCTG
GACGTAAAGACAGGGGAGCTGAAGTTCAGTTACAAAATCCTTGTTTTGCTCGTTTCGAAA
ACAGAGTATACTTTGACAGTGTGATTAAAGCAAATCTTAGCTACGGTGGGCTTGTTGGGC
TTCAGGGTTTGACACAAGAAGAGCTTTTCTTTGGTTACCAGTCAAAGGCATCGCAGTGAA
TGATTCTTCTTCTGGACTTGTTCTTTTCGATATCGGTGTTGCTCATAAACAAATCTCTCG
CTCTCTATTTGAAGATCCACCTGTTTGCTATCCACCTGGATCTATTATGGAGAAGATAGA
GAAGAGAAAGATGGATATTCAACTCCAGAGATAAGAGAGTTTATTCGGGGTGTATGAGAT
TCAAAACTTAAATCTTCTGTCTCTGAAAACGTGAACAAAATAAGTGTTTACTTCTTTTCT
TTGGGGCTGGGCTGTTTTGTGAAA*CTAAA*TGTTGGGGGAAATTTGTAAA
TAT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4H740JQB 665 0 0
TCTTCTTCTACTCCCACTCGTCACTCCATCTTCACAATCCTCAATCCGAACCCTCCTTGA
AGCTCGTGGTTTACCAGGTGGTTTATTTCCAGACAACGTGGAGAGTTACAGTCTGGACGT
AAAGACAGGGGAGCTGAAGTTCAGTTACAAAATCCTTGTTTTGCTCGTTTCGAAAACAGA
GTATACTTTGACAGTGTGATTAAAGCAAATCTTAGCTACGGTGGGCTTGTTGGGCTTCAG
GGTTTGACACAAGAAGAGCTTTTCTTTGGTTACCAGTCAAAGGCATCGCAGTGAATGATT
CTTCTTCTGGACTTGTTCTTTTCGATATCGGTGTTGCTCATAAACAAATCTCTCGCTCTC
TATTTGAAGATCCACCTGTTTGCTATCCACCTGGATCTATTATGGAGAAGATAGAGAAGA
GAAAGATGGATATTCAACTCCAGAGATAAGAGAGTTTATTCGGGGTGTATGAGATTCAAA
ACTTAAATCTTCTGTCTCTGAAAACGTGAACAAAATAAGTGTTTACTTCTTTTCTTTGGG
GCTGGGCTGTTTTGTGAAAACTAAAATGTTGGGGGAAATTTGTAAAATATGGAAAGAAGA
GGGGAAAATTTTGTAACTTTGTATAAACTATGGGATCCACAAAGTAATCAATTTTGTCAC
TTGCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL9298Contig1 651 2 1 U
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CCGCCAAAGTTCTCTTAAGAGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTCGTGTCGAAGACTC
TTCTGCTCTACCATGTCAGGAAGAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGAC
AAGGGTGTGCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTAC
GATCAGTTGCTCAACCTTGTCTTGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGAT
CCTTTGACGACCACTGACCAGACGAGACCCCTCGGTTTAATTGTATGCCGTGGAACTGCG
GTGATGCTCGTCTCACCAACGGATTGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACA
GAAGCTCTCTAAAGAGTTTCTTCCAAAACCATTATGCATCTCTCTATTAGTTCAACTTGG
AGTTTAGAGAGTTATGTATCTGCTGAGTATCTACCATAACATTGGAAACTAATGTTTTCT
TTATATACCTATTTTGGAACATCATAGGCTCCATCTTCGTGTCTTTGTTATAACTTTTCC
GACCAAACCTAAATTCAGTTGCTGTAATAAAATCAAGTAACTTCTCCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4G727TF U 1
AF RR4G727JQ C 73
BS 1 651 RR4G727TF

RD RR4G727TF 651 0 0
GGACTAAAGATTCTCCGACTCTCTCTCGACTTTACAACATCGTCCCTCCGATTTGCTTCG
CCGCCAAAGTTCTCTTAAGAGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTCGTGTCGAAGACTC
TTCTGCTCTACCATGTCAGGAAGAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGAC
AAGGGTGTGCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTAC
GATCAGTTGCTCAACCTTGTCTTGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGAT
CCTTTGACGACCACTGACCAGACGAGACCCCTCGGTTTAATTGTATGCCGTGGAACTGCG
GTGATGCTCGTCTCACCAACGGATTGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACA
GAAGCTCTCTAAAGAGTTTCTTCCAAAACCATTATGCATCTCTCTATTAGTTCAACTTGG
AGTTTAGAGAGTTATGTATCTGCTGAGTATCTACCATAACATTGGAAACTAATGTTTTCT
TTATATACCTATTTTGGAACATCATAGGCTCCATCTTCGTGTCTTTGTTATAACTTTTCC
GACCAAACCTAAATTCAGTTGCTGTAATAAAATCAAGTAACTTCTCCGACC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR4G727JQ 579 0 0
TCTTAAGAGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTCGTGTCGAAGACTCTTCTGCTCTACC
ATGTCAGGAAGAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGACAAGGGTGTGCAA
GTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTACGATCAGTTGCTC
AACCTTGTCTTGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGATCCTTTGACGACC
ACTGACCAGACGAGACCCCTCGGTTTAATTGTATGCCGTGGAACTGCGGTGATGCTCGTC
TCACCAACGGATTGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACAGAAGCTCTCTAA
AGAGTTTCTTCCAAAACCATTATGCATCTCTCTATTAGTTCAACTTGGAGTTTAGAGAGT
TATGTATCTGCTGAGTATCTACCATAACATTGGAAACTAATGTTTTCTTTATATACCTAT
TTTGGAACATCATAGGCTCCATCTTCGTGTCTTTGTTATAACTTTTCCGACCAAACCTAA
ATTCAGTTGCTGTAATAAAATCAAGTAACTTCTCCGACC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL9299Contig1 762 2 2 U
TACAACGAAATGATAATTTTATTCAATACTTCATTAAACCATCCCAAAGGGCATATACAT
AACTTAGTACAGTGTTCATACAGATCGTAATACAGGTGCCTGGGGAAAAAAAAACACGAG
GGCTCTGGCAAAAAAAAACAACAACAAATAAAAAACTCTATAATAGAGTGAGTTTGTTGC
AACAAAAGCCAGAGCAAACCTCTAAGAAAGAACCCATGGCAACCTGAACAAGAATCTTGA
ACACGTACACATCACACAAAAGACCCTTTCGAGGAAAACCAAACTTCAACAAGACAAAAG
CAACGCATAAAACAAACCAAACAGGAGATGATAAACCCTAAAATCTCAGGTAATACCCGG
GTAAGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGAGTTAGC
CCTGATCAAAGGGAAACTCTGCAAAAACAACATTGACTGGAAAAAGAAACCGGAAGCCGA
ACCACTTGGAAAAACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGACACACCTGAAAAGGAA
GCTGACACTTAACTTGGAACGGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAAC
TGGTGGATCAGGAGAGTAGGTCGCATTTGTAAAGCCGCTCGACTAAGAAGTCGACAGTGG
AAGTGGAAATGGATCGGCACTGTTGGAGATTTAATCCGAGTAAAGTCGAACCCAGCTTAA
GGATTGCTGGTAAGCTCTTGTCGGTGACCATAGAGCAACCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4B350TF C 1
AF RR4B350JQ U 2
BS 1 1 RR4B350TF
BS 2 762 RR4B350JQ

RD RR4B350TF 762 0 0
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AACTTAGTACAGTGTTCATACAGATCGTAATACAGGTGCCTGGGGAAAAAAAAACACGAG
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AACAAAAGCCAGAGCAAACCTCTAAGAAAGAACCCATGGCAACCTGAACAAGAATCTTGA
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GTAAGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGAGTTAGC
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ACCACTTGGAAAAACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGACACACCTGAAAAGGAA
GCTGACACTTAACTTGGAACGGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAAC
TGGTGGATCAGGAGAGTAGGTCGCATTTGTAAAGCCGCTCGACTAAGAAGTCGACAGTGG
AAGTGGAAATGGATCGGCACTGTTGGAGATTTAATCCGAGTAAAGTCGAACCCAGCTTAA
GGATTGCTGGTAAGCTCTTGTCGGTGACCATAGAGCAACCCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR4B350JQ 761 0 0
ACAACGAAATGATAATTTTATTCAATACTTCATTAAACCATCCCAAAGGGCATATACATA
ACTTAGTACAGTGTTCATACAGATCGTAATACAGGTGCCTGGGGAAAAAAAAACACGAGG
GCTCTGGCAAAAAAAAACAACAACAAATAAAAAACTCTATAATAGAGTGAGTTTGTTGCA
ACAAAAGCCAGAGCAAACCTCTAAGAAAGAACCCATGGCAACCTGAACAAGAATCTTGAA
CACGTACACATCACACAAAAGACCCTTTCGAGGAAAACCAAACTTCAACAAGACAAAAGC
AACGCATAAAACAAACCAAACAGGAGATGATAAACCCTAAAATCTCAGGTAATACCCGGG
TAAGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGAGTTAGCC
CTGATCAAAGGGAAACTCTGCAAAAACAACATTGACTGGAAAAAGAAACCGGAAGCCGAA
CCACTTGGAAAAACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGACACACCTGAAAAGGAAG
CTGACACTTAACTTGGAACGGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAACT
GGTGGATCAGGAGAGTAGGTCGCATTTGTAAAGCCGCTCGACTAAGAAGTCGACAGTGGA
AGTGGAAATGGATCGGCACTGTTGGAGATTTAATCCGAGTAAAGTCGAACCCAGCTTAAG
GATTGCTGGTAAGCTCTTGTCGGTGACCATAGAGCAACCCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL9300Contig1 1176 2 6 U
GACTCTGATGACATAAGGTTCTGTCTGCTTGTCATCATCAACGCTTACGTTAGACCGGTT
CCCGTGTTGCAGAACCTGAGATCCAAAGGGTTCTCGACGCTTGGTTGTATGGTTAAAAAC
TGTGGACCTCAGATTTTGAACTGTCTCTTGGATCCCAACTGTCGGAAAGCTCTTCAGTGT
TTGAACAAATGTAGTCCTGTGGACCAAGTTTGTAGCTACAGATGCATTGCTTCTTACGAG
AGTCCGTACTTTGAAGCCTTCTCTCTTTGTGTACTACAGAAACACAATTGTCTTGAACTT
GATGCAAAGATCCCTGATAAGCCTTATGTGCCTCCCATGACGAGTTTTCGAGGGAAGGAG
TTATGTCATGAGACAGCAGAAGACCTATTTGTTGGATGGTTAGGGGACTTGGATTGGAGC
TGGCGTGTGGCGGCTGGACAGAACCCTGCTTATGATCAGTTCCCGTGTCAGTACCAGCTT
TTCTACCGTGGGAAAGGGAAGTCATCGTTTTGGTATGAACCTGTGTTTCAGGTGAGGACG
CTTGAAGGGAACCTGGTGTGGAGGAGGAGACGATACTCGGTTAAGAGAGGAAAGACTCCT
GCAACCTTCCGTCTCAGTGTTTTAGACAATGGTGTGGTTTCAAATGAGTTTTGGACTATT
GTGGATGTGTCTGATGATCTGAGTTGGGGACTGTTCCATTACAATGGAGCAGCTCGTGTT
GCAGGACAGTCTTACACTGGGGCTGTGCTCGTGACACCTGATGGTTCGTACCCGGAAGAG
AAGGAGAGGGAAAGGTTGCAGTCTGCATTGGAGAAATGTGGGATTAAAGAGTGGGAGCTC
TTTGCTGTTGATAACTGTTCTTGTGAGAATCCGCCTCTGGGGATACCTGAAGGTTCTAGA
CTGCATTCGAAAATCAGCATCACCAAGGAACCAGACTTGTTTCAGGGCGTAGAGATGTAA
AATCTATAGAAAGATACAACATCAATAGAGAAGAAAGTTATGAGATTATAAGCTTTTTCT
CACGTTAATAACTTGTATACATGTACAAAAATTTAATCTCAAACACAATCACTCTGCTGT
TTTTGTCTGACAATGTTCTAGTCCAAGTCATGTGGAGAATAATTCTGTGAATGACTGTTC
TCCACTTCATCAATCTTAAGTTCTCCAGCTCTACAC


BQ
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AF RR4FW43TF U 1
AF RR4FW43JQ C 450
BS 1 724 RR4FW43TF
BS 725 725 RR4FW43JQ
BS 726 732 RR4FW43TF
BS 733 733 RR4FW43JQ
BS 734 756 RR4FW43TF
BS 757 1176 RR4FW43JQ

RD RR4FW43TF 756 0 0
GACTCTGATGACATAAGGTTCTGTCTGCTTGTCATCATCAACGCTTACGTTAGACCGGTT
CCCGTGTTGCAGAACCTGAGATCCAAAGGGTTCTCGACGCTTGGTTGTATGGTTAAAAAC
TGTGGACCTCAGATTTTGAACTGTCTCTTGGATCCCAACTGTCGGAAAGCTCTTCAGTGT
TTGAACAAATGTAGTCCTGTGGACCAAGTTTGTAGCTACAGATGCATTGCTTCTTACGAG
AGTCCGTACTTTGAAGCCTTCTCTCTTTGTGTACTACAGAAACACAATTGTCTTGAACTT
GATGCAAAGATCCCTGATAAGCCTTATGTGCCTCCCATGACGAGTTTTCGAGGGAAGGAG
TTATGTCATGAGACAGCAGAAGACCTATTTGTTGGATGGTTAGGGGACTTGGATTGGAGC
TGGCGTGTGGCGGCTGGACAGAACCCTGCTTATGATCAGTTCCCGTGTCAGTACCAGCTT
TTCTACCGTGGGAAAGGGAAGTCATCGTTTTGGTATGAACCTGTGTTTCAGGTGAGGACG
CTTGAAGGGAACCTGGTGTGGAGGAGGAGACGATACTCGGTTAAGAGAGGAAAGACTCCT
GCAACCTTCCGTCTCAGTGTTTTAGACAATGGTGTGGTTTCAAATGAGTTTTGGACTATT
GTGGATGTGTCTGATGATCTGAGTTGGGGACTGTTCCATTACAATGGAGCAGCTCGTGTT
GCAG*ACAGTCT*ACACTGGGGCTGTGCTCGTGACA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR4FW43JQ 727 0 0
TTATGATCAGTTCCCGTGTCAGTACCAGCTTTTCTACCGTGGGAAAGGGAAGTCATCGTT
TTGGTATGAACCTGTGTTTCAGGTGAGGACGCTTGAAGGGAACCTGGTGTGGAGGAGGAG
ACGATACTCGGTTAAGAGAGGAAAGACTCCTGCAACCTTCCGTCTCAGTGTTTTAGACAA
TGGTGTGGTTTCAAATGAGTTTTGGACTATTGTGGATGTGTCTGATGATCTGAGTTGGGG
ACTGTTCCATTACAATGGAGCAGCTCGTGTTGCAGGACAGTCTTACACTGGGGCTGTGCT
CGTGACACCTGATGGTTCGTACCCGGAAGAGAAGGAGAGGGAAAGGTTGCAGTCTGCATT
GGAGAAATGTGGGATTAAAGAGTGGGAGCTCTTTGCTGTTGATAACTGTTCTTGTGAGAA
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ACCAGACTTGTTTCAGGGCGTAGAGATGTAAAATCTATAGAAAGATACAACATCAATAGA
GAAGAAAGTTATGAGATTATAAGCTTTTTCTCACGTTAATAACTTGTATACATGTACAAA
AATTTAATCTCAAACACAATCACTCTGCTGTTTTTGTCTGACAATGTTCTAGTCCAAGTC
ATGTGGAGAATAATTCTGTGAATGACTGTTCTCCACTTCATCAATCTTAAGTTCTCCAGC
TCTACAC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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TCTCAAATGCCTCCGTTGATGAAAAAAGGAAGACACGGAAACTGGGCGGACCTTCCGCCT
GAACTAACGTCTTCGATCTTGCTCCGTATTGGCGCGATTGAGATACTCGAAAACGCACAG
AGGGTGTGCAGGTCGTGGCGTCGCGTTTGTAAAGACCCCTCGATGTGGCGTAAGATCGAC
ATGAACAACCACGGAGACTTTGATTACGATCTCGAGATCATGTGTCGTCACGCGGTCGAT
CGCAGCCAAGGCGGCTTGGAAGAGATCGACATTTGGTACTTCGGTACTGATGACCTCCTC
AACTACATCGCCGTTAGGTCGAGTAAGCTGAAAAGCCTTAGGCTTTTAATGTGTGATGCA
TTAACAGACGAGGGGTTTATGGAGGCAGTTGTGAAATTTCCTTTGCTTGAAAAACTTGAA
GTGTCGTATTGCTCATTGTCAGAAGGGTCTCTGAAAGCTGCAGGCCAGTCTTGTCCCAAC
CTGCAGACATTGAAGCTAAACAACGAACCTAGGTTCAAGTATGATGATGATGATGAAGCT
CTAGCAATTGCAGAAACCATGCCTGGACTACGCCACCTCCAGTTTTTTGGAACCAGGTTA
ACCAACACGGGATTGAACGCTATTCTTGACGCTTGTCCTCGCCTAGTACATCTTGACATA
CGCAAGTGTTTCCGTGTTGACTTTGATGGGGAGACAGCGAAACGATGTCTTGAGAGGGTC
AAAGAGTTGAGACAGCCTTGCGACCCAACCGATGATTTCCCTTTTGATGGTTTTGAGATG
ACCATAGAAGAAGAGGAAAAAGAAGGTCTAGAGGAAGGTTACTCATATGACAGCGATGAG
TACGTCTATGATGTCGATAATTGTTCTGACAGGTATGACTCGGGTGATGACTAGACAAGG
TTAGGAGGTGGGATCGTTTTGAATAATGAAATAATGATATGATATCTGTAGCAAGTAGTG
TTAATGAAACTCGTTGTTGACCTCTTTTCGTGTTAGTTGGTTGTTTCAGTGGGACGTGTG
TGTCCCTCTTTCTATGTCTTAGTCTATAGCTTCTGAGTGTGTATTCCTCGACTGAGTAAG
AACATATTTAACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4EM17TF U 1
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AGGGTGTGCAGGTCGTGGCGTCGCGTTTGTAAAGACCCCTCGATGTGGCGTAAGATCGAC
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AAAGAGTTGAGAC

QA 1 793 1 793
DS 

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AAAGCC
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CCAGTTTTTTGGAACCAGGTTAACCAACACGGGATTGAACGCTATTCTTGACGCTTGTCC
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QA 7 763 7 763
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AL72JQ C 1
AF RR4AL72TF U 1
BS 1 680 RR4AL72TF

RD RR4AL72JQ 680 0 0
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GCATCACCTCGCATATAGTAGTGTCCAGATTCTTGTGAAGATTCCCAACCGTATGAGTTT
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AGATCATCGATTCTCTCTTGTCCTCTTACTCTACAGATCCATAAGTTTGTTGCAGACTGA
AGTGGCATAGGTGGAAAGATTGTGTTGGAAACAAAGACAGATCCCTGAGAAAATCAAGTT
GTTGGGGACGTCTTCAAGAAACACACTTAGTTGCTTTATTGTCTGATTGCAAGATTACCA
TTGATTTCCCTTCCATGAAAGTGCAGAGTCAAGACTGACTGTTTTCCTCATTCTTGTCCT
TAGCTTTCATTCTTTTCACTCCACTTGATTTTTTTTTGTATATTTCTTTTGGAAGTCCGG
TTGAGATGAGAGGGTTGACCGGCGAAAGATGGGAGATGGAACGGACGGGGAGAATAGGAG
GACGATAAGACCATCTCCAATATATTTCTCTATTTCTATCTCTAAAATAGAGATGTGTTT
CTCTCCAATGTATTTTTCTATTTCTACCTCTAAAAAAGAATATTTTCAAAAGATTCTATT
TTTATTTTACAATAAGTACC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4AL72TF 680 0 0
GGGACTTACAAAGCCAAAGCAAAAGACAGATGATTCGGATCCAGTCTACAACCGTACAAG
GCATCACCTCGCATATAGTAGTGTCCAGATTCTTGTGAAGATTCCCAACCGTATGAGTTT
CAAACATGAGGAAGCAAAGTGGCTAATTTTTATCTTTTCTCGGGTACTTTCTTGGCAAAA
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AGTGGCATAGGTGGAAAGATTGTGTTGGAAACAAAGACAGATCCCTGAGAAAATCAAGTT
GTTGGGGACGTCTTCAAGAAACACACTTAGTTGCTTTATTGTCTGATTGCAAGATTACCA
TTGATTTCCCTTCCATGAAAGTGCAGAGTCAAGACTGACTGTTTTCCTCATTCTTGTCCT
TAGCTTTCATTCTTTTCACTCCACTTGATTTTTTTTTGTATATTTCTTTTGGAAGTCCGG
TTGAGATGAGAGGGTTGACCGGCGAAAGATGGGAGATGGAACGGACGGGGAGAATAGGAG
GACGATAAGACCATCTCCAATATATTTCTCTATTTCTATCTCTAAAATAGAGATGTGTTT
CTCTCCAATGTATTTTTCTATTTCTACCTCTAAAAAAGAATATTTTCAAAAGATTCTATT
TTTATTTTACAATAAGTACC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL9303Contig1 635 2 2 U
GGACTCCTCTCTCTTTCCGCTTGCCAATGGCTCTCTATCTCCGATCTCTCTCCATCATCC
TCTTTCTCCTCCTCCCCTCCTCCACCGCGATGTGGTGCGTTGCTCGGTTTGATGTTACGA
GCCAGGCGCTTCAGGCGGCTCTAGACTACGCATGTGCCGCTGGAGCCGACTGTGCTCCAA
TCCAGCCCACTGGTCTATGTTTCCTCCCAAACACCGTTCAGGCTCACGCATCTTACGCTT
TCAACAGCTATTTTCAGCGTAGAGCCATGGCTCCTGGTTCTTGCAACTTTGCCGGCACCT
CCACCATCGCCAAAACTGATCCAAGTTATGGATCATGCGTGTACCCAAGTTCTTTGAGTA
ACGCTGGAGGATCAGCTTCGACCACAACGGTAGGTGGAACGCCGACAGCAACCGCCGGAA
ACATTCCAGTGACGTCACTGAGGCCACCGTCTGGCACCACGTCATCCCCGTTTGGAATAG
GTGGCAATGGTCTAATTCCGCCGGGAATCACTAACACTGATGAATCCGGAGCTTATGCAA
ACACGAGTACTGTCTCAATAGTATTATTGGTGGTCTCCGTTTTGTGGTTTATATAGGTTT
CTGATTTCTGTATGCATTGTATGGGCTCAACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DQ01TF U 1
AF RR4DQ01JQ C 52
BS 1 587 RR4DQ01TF
BS 588 635 RR4DQ01JQ

RD RR4DQ01TF 587 0 0
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GCCAGGCGCTTCAGGCGGCTCTAGACTACGCATGTGCCGCTGGAGCCGACTGTGCTCCAA
TCCAGCCCACTGGTCTATGTTTCCTCCCAAACACCGTTCAGGCTCACGCATCTTACGCTT
TCAACAGCTATTTTCAGCGTAGAGCCATGGCTCCTGGTTCTTGCAACTTTGCCGGCACCT
CCACCATCGCCAAAACTGATCCAAGTTATGGATCATGCGTGTACCCAAGTTCTTTGAGTA
ACGCTGGAGGATCAGCTTCGACCACAACGGTAGGTGGAACGCCGACAGCAACCGCCGGAA
ACATTCCAGTGACGTCACTGAGGCCACCGTCTGGCACCACGTCATCCCCGTTTGGAATAG
GTGGCAATGGTCTAATTCCGCCGGGAATCACTAACACTGATGAATCCGGAGCTTATGCAA
ACACGAGTACTGTCTCAATAGTATTATTGGTGGTCTCCGTTTTGTGG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR4DQ01JQ 584 0 0
CCATCATCCTCTTTCTCCTCCTCCCCTCCTCCACCGCGATGTGGTGCGTTGCTCGGTTTG
ATGTTACGAGCCAGGCGCTTCAGGCGGCTCTAGACTACGCATGTGCCGCTGGAGCCGACT
GTGCTCCAATCCAGCCCACTGGTCTATGTTTCCTCCCAAACACCGTTCAGGCTCACGCAT
CTTACGCTTTCAACAGCTATTTTCAGCGTAGAGCCATGGCTCCTGGTTCTTGCAACTTTG
CCGGCACCTCCACCATCGCCAAAACTGATCCAAGTTATGGATCATGCGTGTACCCAAGTT
CTTTGAGTAACGCTGGAGGATCAGCTTCGACCACAACGGTAGGTGGAACGCCGACAGCAA
CCGCCGGAAACATTCCAGTGACGTCACTGAGGCCACCGTCTGGCACCACGTCATCCCCGT
TTGGAATAGGTGGCAATGGTCTAATTCCGCCGGGAATCACTAACACTGATGAATCCGGAG
CTTATGCAAACACGAGTACTGTCTCAATAGTATTATTGGTGGTCTCCGTTTTGTGGTTTA
TATAGGTTTCTGATTTCTGTATGCATTGTATGGGCTCAACATTT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL9304Contig1 687 2 4 U
ACTAAAGAAGACATAACTTAAATCTGATTCATTAAACACATTGCATAGATGTTTTGTGTG
TTTCTGAAAATAATTTATAAAACAAAAACGGTTTAACAATTTCAGAATTCAAACCATTAC
GGTTTTATCCGGCCCTACAATCTGAGTTGCAAAGCCACAAATTGCAGCATTATTATTATT
CTCGTACTTGCCTTGCCTTGCCTACCTCACTTCTTTTTTGTTCCAAGACTTTTCTCTATT
ATTCTTTGATAGTATTGTGTACAAACTCAATATTCAACCCCGCCTGCTTAATGAAGCATT
TGACCACCAACTTTAACCCTTCCACAATGCTTCCCTCGTTAAATTTGTTCAGCCTCATAA
CATGAATAAGTTTTTAAATCTCCAAGGATTGTTTTGGAGATAGCTGAACCAATGGGGAAG
TCTTTGGAGATCTGCTCAACATTCACCACTGCTCCTTCAACGTTCTCTCCGTTTTCTTTG
GCCACGTGAATTGTCACTGCTCTTTTTCCGCCTGAAAAAAGTGTCCACGTAAAGAATGAA
CTCTATAGTTTTCATATTCTTTTTTATTATATGTCAGAAAGTCTTGTTTGTATTTTGTTA
CAGTGTTAATGAAGTAATCTTGGTTGTTCTTCCATTGATCCTGCGTGAAGGGCTGAAGAG
ATGGACTCGCAACTTCTAATTGGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H253TF C 1
AF RR4H055JQ U 20
BS 1 19 RR4H253TF
BS 20 203 RR4H055JQ
BS 204 207 RR4H253TF
BS 208 687 RR4H055JQ

RD RR4H253TF 455 0 0
ACTAAAGAAGACATAACTTAAATCTGATTCATTAAACACATTGCATAGATGTTTTGTGTG
TTTCTGAAAATAATTTATAAAACAAAAACGGTTTAACAATTTGAGAATTCAAACCATTAC
GGTTTTATCCGGCCCTACAATCTGAGTTGCAAAGCCACAAATTGCAGCATTATTATTATT
CTCGTACTTGCCTTGCCTTGCCTACCTCACTTCTTTTTTGTTCCAAGACTTTTCTCTATT
ATTCTTTGATAGTATTGTGTACAAACTCAATATTCAACCCCGCCTGCTTAATGAAGCATT
TGACCACCAACTTTAACCCTTCCACAGTGCTTCCCTCGTTAGATTTGTTCAGCCTCATAA
CATGAATAAGTTTTTAAATCTCCAAGGATTGTTTTGGAGATAGCTGAACCAATGGGGAAG
TCTTTGGAGATCTGCTCAACATTCACCACTGCTCC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR4H055JQ 668 0 0
AAATCTGATTCATTAAACACATTGCATAGATGTTTTGTGTGTTTCTGAAAATAATTTATA
AAACAAAAACGGTTTAACAATTTCAGAATTCAAACCATTACGGTTTTATCCGGCCCTACA
ATCTGAGTTGCAAAGCCACAAATTGCAGCATTATTATTATTCTCGTACTTGCCTTGCCTT
GCCT****CACTTCTTTTTTGTTCCAAGACTTTTCTCTATTATTCTTTGATAGTATTGTG
TACAAACTCAATATTCAACCCCGCCTGCTTAATGAAGCATTTGACCACCAACTTTAACCC
TTCCACAATGCTTCCCTCGTTAAATTTGTTCAGCCTCATAACATGAATAAGTTTTTAAAT
CTCCAAGGATTGTTTTGGAGATAGCTGAACCAATGGGGAAGTCTTTGGAGATCTGCTCAA
CATTCACCACTGCTCCTTCAACGTTCTCTCCGTTTTCTTTGGCCACGTGAATTGTCACTG
CTCTTTTTCCGCCTGAAAAAAGTGTCCACGTAAAGAATGAACTCTATAGTTTTCATATTC
TTTTTTATTATATGTCAGAAAGTCTTGTTTGTATTTTGTTACAGTGTTAATGAAGTAATC
TTGGTTGTTCTTCCATTGATCCTGCGTGAAGGGCTGAAGAGATGGACTCGCAACTTCTAA
TTGGGTTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL9305Contig1 1236 2 4 U
GGGGTCACTCTGGAAAATTTTGAATCCATTTTATTCTCGTCGTCTGTCCCTCACAATCAA
ATCGGGTGCTGTTGCTGCTGCTCGTAAAAATTAGGAGATGGAAGCTCTCTACGCCAAGCT
CTACGACAAATACACCACCCTCAAGACGAGGAAGTTTTCGGAACTGGATGAGATCAATAG
GGAACAAGAAGAGAAGTTCCTTAACTTTGTTAAAGCCTCAGAGGCGTTGACGCAGCATTT
GAGAAGCGAAAACCAGAATTTGAGGGATGAGAACACTGAAATCAGATCCACCAGGGACGA
GGAGCGTCTTGAGCTTCAAAAGCGTCTTTTGGAAGAAGAACTAAAGAACAAGGCACTTTC
CTACCAAGTTGAGAAACTTAAAGAGCTTATCTCAGAGGGAGTTCCTCCTCACAACCACAA
AGATCAAAGTGGAACAAAACGAAAGACTCCAGAATCTCCTCAAGTTACAACGAGGAGCAT
GAGGAAACGTACAAGAGCAGTCTGAGGATAATAATATGGTGGAAACAGACACGGTATCAC
CCACGAGGAGCTCGAGGAGACGTAGCAGGCAGCTCACAGAGGATATCATGGTATCACCTC
ACATTAGCATACCTCGTGAATCAACCACGGAAACTCTCTTGGTTTCTCAACCCCAATGCT
GTGGATCAAGCAACTCTGCTCGTTGTCCATTTCAAGCTCTGGGCGAACACTTGATAGGAA
TGAAACTGTCGACTAATAATGAAAGCGAACGAGACTGCATTGTTGCCACTCATCCATCAA
GTGGTTTGTCATTCACCTTGACTTGGGTAAATAACTCAACCGGTGAAGAAGAAGAAGATG
AGCTGCTCTACAAGGTTGAGTCATTGGGGACGTTTCAAAGAGTTGTGCCTGAATGGATGA
GAGATGTTATCAAGTTTAGCACAAGTATGATTCCTGTCTTCTTCGAAAGAGTCTCTCGGG
TCATTAAGCCCCGAGATTGATCGGTATCTACATCTGCCGCCCTTAACTTCGGCCATCATC
TTTAAATGGCTTCTTCTTAGTTTGGTGTTTATCAGTAGGTCAAAAAGGGGTAGGGAAGTT
ACTTGTGTCTATAGAAATGTTTGTATCCCTCTTTTTAGCTTTGCCGTTGGTTATGAAGAC
TTAATTGTAATCCTTTTCAATGTGTCAAGATGTTTAATTGTCCTTCTCTCTCTTGTAAGT
TCCCTTTACTATTTGATCTTAATGTGCATTTGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AU30TF U 1
AF RR4AU30JQ C 418
BS 1 810 RR4AU30TF
BS 811 811 RR4AU30JQ
BS 812 826 RR4AU30TF
BS 827 1236 RR4AU30JQ

RD RR4AU30TF 845 0 0
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ATCGGGTGCTGTTGCTGCTGCTCGTAAAAATTAGGAGATGGAAGCTCTCTACGCCAAGCT
CTACGACAAATACACCACCCTCAAGACGAGGAAGTTTTCGGAACTGGATGAGATCAATAG
GGAACAAGAAGAGAAGTTCCTTAACTTTGTTAAAGCCTCAGAGGCGTTGACGCAGCATTT
GAGAAGCGAAAACCAGAATTTGAGGGATGAGAACACTGAAATCAGATCCACCAGGGACGA
GGAGCGTCTTGAGCTTCAAAAGCGTCTTTTGGAAGAAGAACTAAAGAACAAGGCACTTTC
CTACCAAGTTGAGAAACTTAAAGAGCTTATCTCAGAGGGAGTTCCTCCTCACAACCACAA
AGATCAAAGTGGAACAAAACGAAAGACTCCAGAATCTCCTCAAGTTACAACGAGGAGCAT
GAGGAAACGTACAAGAGCAGTCTGAGGATAATAATATGGTGGAAACAGACACGGTATCAC
CCACGAGGAGCTCGAGGAGACGTAGCAGGCAGCTCACAGAGGATATCATGGTATCACCTC
ACATTAGCATACCTCGTGAATCAACCACGGAAACTCTCTTGGTTTCTCAACCCCAATGCT
GTGGATCAAGCAACTCTGCTCGTTGTCCATTTCAAGCTCTGGGCGAACACTTGATAGGAA
TGAAACTGTCGACTAATAATGAAAGCGAACGAGACTGCATTGTTGCCACTCATCCATCAA
GTGGTTTGTCATTCACCTTGACTTGGGTAA*TAACTCAACCGGTGA
GAGAGAGATGAGCTGCTCT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR4AU30JQ 819 0 0
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CTCACATTAGCATACCTCGTGAATCAACCACGGAAACTCTCTTGGTTTCTCAACCCCAAT
GCTGTGGATCAAGCAACTCTGCTCGTTGTCCATTTCAAGCTCTGGGCGAACACTTGATAG
GAATGAAACTGTCGACTAATAATGAAGGCGAACGAGACTGCATTGTTGCCACTCATCCAT
CAAGTGGTTTGTCATTCACCTTGACTTGGGTAAATAACTCAACCGGTGAAGAAGAAGAAG
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TGAGAGATGTTATCAAGTTTAGCACAAGTATGATTCCTGTCTTCTTCGAAAGAGTCTCTC
GGGTCATTAAGCCCCGAGATTGATCGGTATCTACATCTGCCGCCCTTAACTTCGGCCATC
ATCTTTAAATGGCTTCTTCTTAGTTTGGTGTTTATCAGTAGGTCAAAAAGGGGTAGGGAA
GTTACTTGTGTCTATAGAAATGTTTGTATCCCTCTTTTTAGCTTTGCCGTTGGTTATGAA
GACTTAATTGTAATCCTTTTCAATGTGTCAAGATGTTTAATTGTCCTTCTCTCTCTTGTA
AGTTCCCTTTACTATTTGATCTTAATGTGCATTTGTGCG

QA 1 819 1 819
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9307Contig1 583 2 1 U
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AAAACAGGGGAGCATTGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTAGATACCGTCATGGGATC
TACATTCCGACCCCAAGTTGGCTACTTTGTCGAGTATTTAAAGGTCCAAAACGACTACAA
AGTCATAAACATGGACCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAGTTTCCC
GGATATGTCGGAATACAATCCAGGGCTTGCATGGCCGTTGCTTCTCAACAATTTCGTGGA
GTGGATTCGTGAAAAACAAGTCTGAGAAAAGCTTAAAACATCTTTATGAATCCCCTCCAA
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GAATATGTGATTATTAACTTCAAAAGAGGGGAAATACATTTTAAGTTTTGAAACGTTACA
TCCTGTTGTATTATTAGCTAATGCTGAATTGGTCCAATGTGAC


BQ
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AF RR4GF31JQ C 1
AF RR4GF31TF U 1
BS 1 583 RR4GF31TF

RD RR4GF31JQ 583 0 0
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GGATATGTCGGAATACAATCCAGGGCTTGCATGGCCGTTGCTTCTCAACAATTTCGTGGA
GTGGATTCGTGAAAAACAAGTCTGAGAAAAGCTTAAAACATCTTTATGAATCCCCTCCAA
GTCATTTACTTGGGATTCTTGGGCTCAAACAAACAGATTCAGCAAAAAAAGTTATTTCAG
TTCTCATCCTTAAAAACTTCATCACAGAAAAAAACACATTATATGTTTTCTGTTAAATGT
GAATATGTGATTATTAACTTCAAAAGAGGGGAAATACATTTTAAGTTTTGAAACGTTACA
TCCTGTTGTATTATTAGCTAATGCTGAATTGGTCCAATGTGAC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR4GF31TF 583 0 0
GGCTTCAGAATGTTGTAGCAGGAGAGCATCTTACCATGGATCAGGATCAGGATCAGAGGA
AAAACAGGGGAGCATTGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTAGATACCGTCATGGGATC
TACATTCCGACCCCAAGTTGGCTACTTTGTCGAGTATTTAAAGGTCCAAAACGACTACAA
AGTCATAAACATGGACCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAGTTTCCC
GGATATGTCGGAATACAATCCAGGGCTTGCATGGCCGTTGCTTCTCAACAATTTCGTGGA
GTGGATTCGTGAAAAACAAGTCTGAGAAAAGCTTAAAACATCTTTATGAATCCCCTCCAA
GTCATTTACTTGGGATTCTTGGGCTCAAACAAACAGATTCAGCAAAAAAAGTTATTTCAG
TTCTCATCCTTAAAAACTTCATCACAGAAAAAAACACATTATATGTTTTCTGTTAAATGT
GAATATGTGATTATTAACTTCAAAAGAGGGGAAATACATTTTAAGTTTTGAAACGTTACA
TCCTGTTGTATTATTAGCTAATGCTGAATTGGTCCAATGTGAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL9308Contig1 702 2 3 U
TTTTTGCAAGAGAAGATTCATAATCTTAAGTCGTCTATAATCCTATTCACAAAATCTTGC
TGCTACATACAAAAAAAAAGGAAGAGAATGAATGATAATAATAATTTCAGTGGTAAAATC
CTCAGTAAGAGAACTCATGGCCACGTAGAGAAATGTATTTCTTAACCCATATAGCAATAT
CTTCGGCGCAGGCCTGTGCCTGAGGAGTCTTGAGAAGCATATCAAGCGTTGCAAACTCAT
GAACCGCGTCTTTGTATTCTAAAACCGGAGAATCTACGTTTACCTTTCTCAGCTCCTCTG
CATAGGCAATGGCTCGATCTCTCATCCAGTCGTGCTCTGCCACTACTGTGAGAGTTGGAG
GCATTAGCTTCAGAGGTGGTCCGCTGCGGTTATGGGCTAGTGGGTTTGCTGCCGGGTGGT
CAAAGTCGAACTCTTTCTCTGGTAAGAAGAGTTTCCAGGCGAGAACAGAGACGGGCTTGT
CGTAAAAGTAGGAGTTTGCCAGCTTTATCTCGGATTGTGTCGGGTTGTTTCCGATGAAAA
ATGGGTACATTAGAACCTGTGCAACGACCTTAACCGGCTCTAGAAGTTTCCCAGCTTCCA
CTGCTTTCCGCGCTACATAATCTGCTATGTTCCCACCACAGCTCACCCCCAAAAGAACAC
ATCTGGAAGGATCAGCATGAGCAGCGAGCCAAGGCTCAACCC


BQ
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AF RR4DU69TF C 1
AF RR4DU69JQ U 6
BS 1 5 RR4DU69TF
BS 6 689 RR4DU69JQ
BS 690 702 RR4DU69TF

RD RR4DU69TF 702 0 0
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TGCTACATACAAAAAAAAAGGAAGAGAATGAATGATAATAATAATTTCAGTGGTAAAATC
CTCAGTAAGAGAACTCATGGCCACGTAGAGAAATGTATTTCTTAACCCATATAGCAATAT
CTTCGGCGCAGGCCTGTGCCTGAGGAGTCTTGAGAAGCATATCAAGCGTTGCAAACTCAT
GAACCGCGTCTTTGTATTCTAAAACCGGAGAATCTACGTTTACCTTTCTCAGCTCCTCTG
CATAGGCAATGGCTCGATCTCTCATCCAGTCGTGCTCTGCCACTACTGTGAGAGTTGGAG
GCATTAGCTTCAGAGGTGGTCCGCTGCGGTTATGGGCTAGTGGGTTTGCTGCCGGGTGGT
CAAAGTCGAACTCTTTCTCTGGTAAGAAGAGTTTCCAGGCGAGAACAGAGACGGGCTTGT
CGTAGAAGTAGGAGTTTGCCAGCTTTATCTCGGATTGTGTCGGGTTGTTTCCGATGAAAA
ATGGGTACATTAGAACCTGTGCAACGACCTTAACCGGCTCTAGAAGTTTCCCAGCTTCCA
CTGCTTTCCGCGCTACATAATCTGCTATGTTCCCACCACAGCTCACCCCCAAAAGAACAC
ATCTGGAAGGATCAGCATGAGCAGCGAGCCAAGGCTCAACCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR4DU69JQ 684 0 0
GCAAGAGAAGATTCATAATCTTAAGTCGTCTATAATCCTATTCACAAAATCTTGCTGCTA
CATACAAAAAAAAAGGAAGAGAATGAATGATAATAATAATTTCAGTGGTAAAATCCTCAG
TAAGAGAACTCATGGCCACGTAGAGAAATGTATTTCTTAACCCATATAGCAATATCTTCG
GCGCAGGCCTGTGCCTGAGGAGTCTTGAGAAGCATATCAAGCGTTGCAAACTCATGAACC
GCGTCTTTGTATTCTAAAACCGGAGAATCTACGTTTACCTTTCTCAGCTCCTCTGCATAG
GCAATGGCTCGATCTCTCATCCAGTCGTGCTCTGCCACTACTGTGAGAGTTGGAGGCATT
AGCTTCAGAGGTGGTCCGCTGCGGTTATGGGCTAGTGGGTTTGCTGCCGGGTGGTCAAAG
TCGAACTCTTTCTCTGGTAAGAAGAGTTTCCAGGCGAGAACAGAGACGGGCTTGTCGTAA
AAGTAGGAGTTTGCCAGCTTTATCTCGGATTGTGTCGGGTTGTTTCCGATGAAAAATGGG
TACATTAGAACCTGTGCAACGACCTTAACCGGCTCTAGAAGTTTCCCAGCTTCCACTGCT
TTCCGCGCTACATAATCTGCTATGTTCCCACCACAGCTCACCCCCAAAAGAACACATCTG
GAAGGATCAGCATGAGCAGCGAGC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL9309Contig1 1161 2 2 U
GGATCAGTTCTATTGCTCTTCTCCGGACCATCCTCGGTTTCATCGTCACAGCCTTAAGAC
AGGATTCTTGCGGAAAATGGCTACAATTGTGTCTCATCAATTGATCGGCTCTATTGCTTC
TCATTCACCTTCCACCAATTCCAAAGCTTCTCTCTTTCCAACGGAGTCTTTCAATGTTCC
TCTGAAGTTCAGACAGAACCGTTTCAAGATCGAAGCAGCAGCAACAACCGCATCTCAAAC
TCCTGTCCTCGACCCTCTCTTGTCTCCTTCAAAAACCACCACCCTTTCCAAGAAAAAATC
AAATGAAGCATCATTGATATTGATTAGGCATGGAGAATCGTTATGGAACGAGAAGAACCT
CTTCACAGGCTGTGTCGATGTTCCTTTAACCGAGAAAGGTGTGGCCGAAGCTATCCAAGC
GGGGAAGAGGATCAGCACCATCCCCGTCGATCTCATCTTCACTTCCTCTCTCATCCGTGC
TCAGATGACAGCTATGCTCGCCATGACTCAGCACCGCTGCAAGAAGGTTCCCATCATCTT
GCACGACGAGAGCGAGAAAGCGCAGACTTGGAGTCATGTTTTCAGCGAAGAGACTAGGAA
GCAGTCCATTCCTGTTATAGCTGCTTGGCAACTGAATGAGAGAATGTATGGAGAGCTGCA
GGGTTTAAACAAGGAAGAAACAGCTGAGAGATACGGAACACGGCAAGTTCATGAGTGGCG
TAGGAGTTACCACATCCCTCCTCCTAAAGGAGAGAGCTTGTAGATGTGTGCTGAGAGAGC
AGTTGCTTATTTTGAAGACAATATTCAACCAGAGCTTGCGTTAGGGAATAATGTGTTGAT
TGCTGCTCATGGGAACTCGTTGCGGTCTATCATTATGTATCTTGATAAATTAACTTCTCA
AGAGGTTACGAGTTTAGAGCTGTCTACTGGTTTGCCGTTGCTCTACATCTTCAAAGACAG
GAAGTTCATGAGACGTGGAAGCCCTGTTGGTCCTACAGAAGCTGGTGTCTATGCTTATAC
TAAGATATTGGCACAATACAGACAGAAGCTTGATGAGAGCCTTAACTAAAATATGTCCCC
TTTTGTTTTTTTGTTGTTTTTTCACTTTATCAAGAACAGTTTTAAGATATGTATTAGATT
TTACACAAATCACGTTTCATC


BQ
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AF RR4DA29TF U 1
AF RR4DA29JQ C 386
BS 1 578 RR4DA29TF
BS 579 1161 RR4DA29JQ

RD RR4DA29TF 578 0 0
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AGGATTCTTGCGGAAAATGGCTACAATTGTGTCTCATCAATTGATCGGCTCTATTGCTTC
TCATTCACCTTCCACCAATTCCAAAGCTTCTCTCTTTCCAACGGAGTCTTTCAATGTTCC
TCTGAAGTTCAGACAGAACCGTTTCAAGATCGAAGCAGCAGCAACAACCGCATCTCAAAC
TCCTGTCCTCGACCCTCTCTTGTCTCCTTCAAAAACCACCACCCTTTCCAAGAAAAAATC
AAATGAAGCATCATTGATATTGATTAGGCATGGAGAATCGTTATGGAACGAGAAGAACCT
CTTCACAGGCTGTGTCGATGTTCCTTTAACCGAGAAAGGTGTGGCCGAAGCTATCCAAGC
GGGGAAGAGGATCAGCACCATCCCCGTCGATCTCATCTTCACTTCCTCTCTCATCCGTGC
TCAGATGACAGCTATGCTCGCCATGACTCAGCACCGCTGCAAGAAGGTTCCCATCATCTT
GCACGACGAGAGCGAGAAAGCGCAGACTTGGAGTCATG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4DA29JQ 776 0 0
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GTCGATCTCATCTTCACTTCCTCTCTCATCCGTGCTCAGATGACAGCTATGCTCGCCATG
ACTCAGCACCGCTGCAAGAAGGTTCCCATCATCTTGCACGACGAGAGCGAGAAGGCGCAG
ACTTGGAGTCATGTTTTCAGCGAAGAGACTAGGAAGCAGTCCATTCCTGTTATAGCTGCT
TGGCAACTGAATGAGAGAATGTATGGAGAGCTGCAGGGTTTAAACAAGGAAGAAACAGCT
GAGAGATACGGAACACGGCAAGTTCATGAGTGGCGTAGGAGTTACCACATCCCTCCTCCT
AAAGGAGAGAGCTTGTAGATGTGTGCTGAGAGAGCAGTTGCTTATTTTGAAGACAATATT
CAACCAGAGCTTGCGTTAGGGAATAATGTGTTGATTGCTGCTCATGGGAACTCGTTGCGG
TCTATCATTATGTATCTTGATAAATTAACTTCTCAAGAGGTTACGAGTTTAGAGCTGTCT
ACTGGTTTGCCGTTGCTCTACATCTTCAAAGACAGGAAGTTCATGAGACGTGGAAGCCCT
GTTGGTCCTACAGAAGCTGGTGTCTATGCTTATACTAAGATATTGGCACAATACAGACAG
AAGCTTGATGAGAGCCTTAACTAAAATATGTCCCCTTTTGTTTTTTTGTTGTTTTTTCAC
TTTATCAAGAACAGTTTTAAGATATGTATTAGATTTTACACAAATCACGTTTCATC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL9310Contig1 1279 2 4 U
TTTTGAAAAGAAAAAAAGCGGAAGAAAGAGAGAAACCATGACTATTAGCTTAAGGTTTAT
AATAGCTTCTGGTCTTATTCTTTTCCTTGCCTCTCGATATGCTACAGGTCAAGCCATAAT
GAGAATCCCACTCAAAACGAAAACTTTGTGGAACAAGGACGATGTAAGTTTAACAAATGT
TAATGACAATACTTACTTCGGGCAAATTATGGTAGGAACTCCGGGTCAGCCTTTCAACGT
GTTGTTTGACACCGGGAGTTACGACCTGTGGGTTCCTTCTTTAAAATGGCCTAAACCGAG
AGGCAAAAAGTATAGATCAAGCGCATCAAAAACTTTCATACCCAATGGGAAGAAAGCAGA
AATCAGATATGGAGCAGGTTCTCTGAAGGGGTTCATAAGCAACGATACGATCGAGATAGG
CGGGTTACGCGTCAGGTACCAAGAGCTCATCGAGGCAACTGAATCTCCGGGTAAACAGAT
TTACCAAAGGCCGTGGGATGGCATATTTGGACTTTCAGGCATATCGAAATCGACCATTAC
AGGAATTCGTCCCGTCTGGAGAACGATGATGGATAAAGGGGTGGTTACAAAGAAAGTGTT
CTCGATATGGCTTCGACGGTATAGTGATTCTGCTGAAGACGGTGGAGAAATAGTCTTTGG
AGGTACAGACCCACAGCACTTCACGGGAGCTCATACCTACGTTGTTGCTGAAGGGACTCT
TAACACATTCAAGATGTACTCCTTTTTTGTGGGCAAAATTGACACCAAAGTTTGCTCCAA
GGGATGCAATGTTGTTGTGGACTCGGGGAGTACATACATTCGTGGTCCACCTAATTTGAT
CGTCAAGATTAATAAGCAAATCGGAGTAGCAGCAGACTGCTCTAATTATGACAAGCTGTC
TGAAGTTATAAGCTTCACAATAGCTGCAAAGACTTTTACCCTCACACCACGCGATTACAT
TGAGAGAAAGAATGGGAAATGCAAGAGTGTATTCTCGGATAGTGCGACTAATTTTTGGCA
ACTTGGCACGCCATTCATTCGAGCATTTCATACTGTTTGGGACTACCAGACTCCAGGAAC
TGTTAAAGTTGGATTCGCCAAGTCCAAATAATTTTTTCTTATTATTTCCTACACTTTGGT
GGTATACTCTATAATTTATTATAATTAAAATAAAAAGAAATATCGGCAATATTTCTCTTG
TAGTTTCTTTTCGGTTCGTTAAATCAAGAGATGTATGACTTATTATAAACTACTTACAAG
AGAGTATAACTATTGCTAT


BQ
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AGGAATTCGTCCCGTCTGGAGAACGATGATGGATAAAGGGGTGGTTACAAAGAAAGTGTT
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TTTTTGTGGGCAAAATTGACACCAAAGTTTGCTCCAAGGGATGCAATGTTGTTGTGGACT
CGGGGAGTACATACATTCGTGGTCCACCTAATTTGATCGTCAAGATTAATAAGCAAATCG
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QA 1 776 1 776
DS 



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BQ
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DS 

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ATGCATCAAGCCATATAAAGTGAGCATAGATATTCCCGTCTAAGAATGATAAAGGGTCAT
GATCCAGACATAGACCATCCTAAGAGATTATGTATAGACCACCACAATAATATGTGCCGT
CTAGGATGGAACCTCATAAAAAGATGAGATAAGATTGGGAATATATGTTGGATATGAGAA
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CAGGTTTACGGATTGCATGATTAAATCCGACTATCCAACATCAGGGGGAGAAAGAAATAA
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GGACCAGAGAATATGATTTAAGACGTCCAAAGAAAGATCATACAAAGCTAGCTAAAAGAA
TGCCAGACAAATTTGACCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL9312Contig1 803 2 4 U
TTTTTTATGACGTTGATCCGTCAGATGTACGGAAACAAAAGGGAGACTTCGGGGTCGCAT
TTGAGAAATCCTGTGATGGTGAAACAGAGGAACGTAAGCGGAGATGGACCGAAGCTTTGA
CATCTATAGCAACCATAGCTGGAGAACACTCTTGTAACTGGAAGGATGAAGCTGCGATGC
TCGAAAAAATTTCCATAGATATGATGAGAAAACTAAAAGCGAAATTGATGAAGGAAGAAT
TTCAGACTATAGACTTAGACCACGATGGTTTCATAACTGCACCAGAACTTCGATATGTGC
TAACAAAAGATGGGGACACGGTAACCGACGAGCATGTTCGCTACTTCATCCAAGAATGTG
ATGTTGATGGTGATGGTCGGATAAGCTATGAAGAATTCGTCAAAGTCATTGAAAAGATTG
AGGCAGAAGAAGCTGCCATGGTCGGAAAGTATACAACAAATGTTAAACTGTCATGGGAGG
AACAGAAAGAAACTGCTCAATCCTTTATGGCTTTAGATGTAGACCAAAATGGTTATATTA
CTGCAGCAGACTATAAATATATGCTGGAAAGTAGTGGGGAAAAGGTAACGGATGAGGAAA
TTTCTGATTTCATAGGAGCATTTGATATTGATGGCGATGGTCGGGTCAGCTATGATGAAT
TTGTCAACCTGACGAAGTGATGCAGCGCATGCTTATCTTATTGGGAGAATACTTATTTGT
GTTTGTATTTTTTTTTTTTTGAATTGTAAAATTTGTTTCAGTAAAAAAAACATCGTTACA
ATAATAGATGTGTCTTTGTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EO94TF U 1
AF RR4EO94JQ C 51
BS 1 708 RR4EO94TF
BS 709 709 RR4EO94JQ
BS 710 735 RR4EO94TF
BS 736 803 RR4EO94JQ

RD RR4EO94TF 735 0 0
TTTTTTATGACGTTGATCCGTCAGATGTACGGAAACAAAAGGGAGACTTCGGGGTCGCAT
TTGAGAAATCCTGTGATGGTGAAACAGAGGAACGTAAGCGGAGATGGACCGAAGCTTTGA
CATCTATAGCAACCATAGCTGGAGAACACTCTTGTAACTGGAAGGATGAAGCTGCGATGC
TCGAAAAAATTTCCATAGATATGATGAGAAAACTAAAAGCGAAATTGATGAAGGAAGAAT
TTCAGACTATAGACTTAGACCACGATGGTTTCATAACTGCACCAGAACTTCGATATGTGC
TAACAAAAGATGGGGACACGGTAACCGACGAGCATGTTCGCTACTTCATCCAAGAATGTG
ATGTTGATGGTGATGGTCGGATAAGCTATGAAGAATTCGTCAAAGTCATTGAAAAGATTG
AGGCAGAAGAAGCTGCCATGGTCGGAAAGTATACAACAAATGTTAAACTGTCATGGGAGG
AACAGAAAGAAACTGCTCAATCCTTTATGGCTTTAGATGTAGACCAAAATGGTTATATTA
CTGCAGCAGACTATAAATATATGCTGGAAAGTAGTGGGGAAAAGGTAACGGATGAGGAAA
TTTCTGATTTCATAGGAGCATTTGATATTGATGGCGATGGTCGGGTCAGCTATGATGAAT
TTGTCAACCTGACGAAGTGATGCAGCGCATGCTTATCTTATTGGGAGA*TACTTATTTGT
GTTTGTATTTTTTTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR4EO94JQ 753 0 0
GGGGTCGCATTTGAGAAATCCTGTGATGGTGAAACAGAGGAACGTAAGCGGAGATGGACC
GAAGCTTTGACATCTATAGCAACCATAGCTGGAGAACACTCTTGTAACTGGAAGGATGAA
GCTGCGATGCTCGAAAAAATTTCCATAGATATGATGAGAAAACTAAAAGCGAAATTGATG
AAGGAAGAATTTCAGACTATAGACTTAGACCACGATGGTTTCATAACTGCACCAGAACTT
CGATATGTGCTAACAAAAGATGGGGACACGGTAACCGACGAGCATGTTCGCTACTTCATC
CAAGAATGTGATGTTGATGGTGATGGTCGGATAAGCTATGAAGAATTCGTCAAAGTCATT
GAAAAGATTGAGGCAGAAGAAGCTGCCATGGTCGGAAAGTATACAACAAATGTTAAACTG
TCATGGGAGGAACAGAAAGAAACTGCTCAATCCTTTATGGCTTTAGATGTAGACCAAAAT
GGTTATATTACTGCAGCAGACTATAAATATATGCTGGAAAGTAGTGGGGAAAAGGTAACG
GATGAGGAAATTTCTGATTTCATAGGAGCATTTGATATTGATGGCGATGGTCGGGTCAGC
TATGATGAATTTGTCAACCTGACGAAGTGATGCAGCGCATGCTTATCTTATTGGGAGAAT
ACTTATTTGTGTTTGTATTTTTTTTTTTTTGAATTGTAAAATTTGTTTCAGTAAAAAAAA
CATCGTTACAATAATAGATGTGTCTTTGTTATT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL9313Contig1 579 2 1 U
GGAACACCTCGACCGCTTATTTTGCCCAAGGATAAAAGCTTTTGGGGACCTAAAGACGAA
ACTATTCCTTTACCGTCATGGCTAACGGAGGAAGATGTTGCTTACTATGTTAGCAAGTTT
CAAGAGAAAGGTTACACTGGTGGAGTTAATTACTACCGCAATTTCGACCTAAACAATGAG
CTGTTGGGTCCATGGGTAGGATGCAAAATCCAGGTACCTACAAAATTTGTGATTGGGGAC
CAGGATCTGGTCTACTATTTTCCGGGTGCGAAGGAATACATACATGGTCCCAAGTTCAAG
GAAGATGTTCCTTTGCTCGAAGAGCCTGTGGTCATGGAGGGGGTTGCTCACTTCATTAAC
CAAGAGAAGCCACAAGAGATCCTCCAAATTATCGTTGACTTCATCTCCAAATTCTAGTCT
TGCTTTCCTCAAGCCACCTTGTAAGTTCCATACCTGAAGAGCATATATGCTTAATAAGTT
GAACAATGAGGGTTATGGTTATATGTATTATAAAGTTGTTGTGTACGTTTTACGGAAGTT
TTTTTTTTCTAAAGACCCGTTATAAAAATATTTCTGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GP46JQ C 1
AF RR4GP46TF U 1
BS 1 579 RR4GP46TF

RD RR4GP46JQ 579 0 0
GGAACACCTCGACCGCTTATTTTGCCCAAGGATAAAAGCTTTTGGGGACCTAAAGACGAA
ACTATTCCTTTACCGTCATGGCTAACGGAGGAAGATGTTGCTTACTATGTTAGCAAGTTT
CAAGAGAAAGGTTACACTGGTGGAGTTAATTACTACCGCAATTTCGACCTAAACAATGAG
CTGTTGGGTCCATGGGTAGGATGCAAAATCCAGGTACCTACAAAATTTGTGATTGGGGAC
CAGGATCTGGTCTACTATTTTCCGGGTGCGAAGGAATACATACATGGTCCCAAGTTCAAG
GAAGATGTTCCTTTGCTCGAAGAGCCTGTGGTCATGGAGGGGGTTGCTCACTTCATTAAC
CAAGAGAAGCCACAAGAGATCCTCCAAATTATCGTTGACTTCATCTCCAAATTCTAGTCT
TGCTTTCCTCAAGCCACCTTGTAAGTTCCATACCTGAAGAGCATATATGCTTAATAAGTT
GAACAATGAGGGTTATGGTTATATGTATTATAAAGTTGTTGTGTACGTTTTACGGAAGTT
TTTTTTTTCTAAAGACCCGTTATAAAAATATTTCTGTTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4GP46TF 579 0 0
GGAACACCTCGACCGCTTATTTTGCCCAAGGATAAAAGCTTTTGGGGACCTAAAGACGAA
ACTATTCCTTTACCGTCATGGCTAACGGAGGAAGATGTTGCTTACTATGTTAGCAAGTTT
CAAGAGAAAGGTTACACTGGTGGAGTTAATTACTACCGCAATTTCGACCTAAACAATGAG
CTGTTGGGTCCATGGGTAGGATGCAAAATCCAGGTACCTACAAAATTTGTGATTGGGGAC
CAGGATCTGGTCTACTATTTTCCGGGTGCGAAGGAATACATACATGGTCCCAAGTTCAAG
GAAGATGTTCCTTTGCTCGAAGAGCCTGTGGTCATGGAGGGGGTTGCTCACTTCATTAAC
CAAGAGAAGCCACAAGAGATCCTCCAAATTATCGTTGACTTCATCTCCAAATTCTAGTCT
TGCTTTCCTCAAGCCACCTTGTAAGTTCCATACCTGAAGAGCATATATGCTTAATAAGTT
GAACAATGAGGGTTATGGTTATATGTATTATAAAGTTGTTGTGTACGTTTTACGGAAGTT
TTTTTTTTCTAAAGACCCGTTATAAAAATATTTCTGTTC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL9314Contig1 726 2 3 U
CTTAAGCGGTGGCGGTGGTGCATCAGCTGTTTTGAACGGGACGACGTTGTTGTTCTGCGT
GGCGAAAGCTGATGCTGATGATGATAAGTTGGAGGACGGTTTGAACTGGGCTTGTGGACA
GGGCCGAGCTAACTGCGCTGCGCTTTAACCGGGAGAACCGTGTTATCTACCGAACGATAT
CAAGAGCCATGCTTCTTTTGCTTATAATGATTATTACCAGAAGATGAAGAGTGCTGGTGG
GACTTGTGACTTGATGGTACTGCCATCACTACCCCTAGAGATCCTAGCTATAGAACATGT
GCTTATACGGGAAGCTTAAACGCAAACGGAACGGGAGGAAACTTTCCTCCTGCGTTAGGA
CCCGCGAGTCAAGTGGGAGGGAACGCAAACGCACTTATCGTTTCTATCTGCCATCTTCCT
TTCTTGGCAACGTTTGCTCTCACGCTACTACTACTAGTACTGTAACTTTCAGTGTTGTAG
TAACCGGAGAAGTGTATGTACCGGCGGGTCTGGTTATATCCGGTTATCGGTATTATTTGT
TTTAGTACTTTGGTTGTAGTGTTTTTTAAGTGTAGCTAGAGAGGGAGAGATTACATGTTC
TCATTCTTTTTTTGTTTTCATCTTTGAACTGAAAATCTTTTGAATTAGAGTGATTTAAAA
TTTAATTATCAAGTGAATTATGTGTCTTGTATTTATTGAAAATTATGAAAAAACTACCGT
TATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RR4DK73TF U 13
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GTGGGAGGGAACGCAAACGCACTTATCGTTTCTATCTGCCATCTTCCTTTCTTGGCAACG
TTTGCTCTCACGCTACTACTACTAGTACTGTAACTTTCAGTGTTGTAGTAACCGGAGAAG
TGTATGTACCGGCGGGTCTGGTTATATCCGGTTATCGGTATTATTTGTTTTAGTACTTTG
GTTGTAGTGTTTTTTAAGTGTAGCTAGAGAGGGAGAGATTACATGTTCTCATTCTTTTTT
TGTTTTCATCTTTGAACTGAAAATCTTTTGAATTAGAGTGATTTAAAATTTAATTATCAA
GTGAATTATGTGTCTTGTAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR4DK73JQ 726 0 0
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GGCGAAAGCTGATGCTGATGATGATAAGTTGGAGGACGGTTTGAACTGGGCTTGTGGACA
GGGCCGAGCTAACTGCGCTGCGCTTTAACCGGGAGAACCGTGTTATCTACCGAACGATAT
CAAGAGCCATGCTTCTTTTGCTTATAATGATTATTACCAGAAGATGAAGAGTGCTGGTGG
GACTTGTGACTTGATGGTACTGCCATCACTACCCCTAGAGATCCTAGCTATAGAACATGT
GCTTATACGGGAAGCTTAAACGCAAACGGAACGGGAGGAAACTTTCCTCCTGCGTTAGGA
CCCGCGAGTCAAGTGGGAGGGAACGCAAACGCACTTATCGTTTCTATCTGCCATCTTCCT
TTCTTGGCAACGTTTGCTCTCACGCTACTACTACTAGTACTGTAACTTTCAGTGTTGTAG
TAACCGGAGAAGTGTATGTACCGGCGGGTCTGGTTATATCCGGTTATCGGTATTATTTGT
TTTAGTACTTTGGTTGTAGTGTTTTTTAAGTGTAGCTAGAGAGGGAGAGATTACATGTTC
TCATTCTTTTTTTGTTTTCATCTTTGAACTGAAAATCTTTTGAATTAGAGTGATTTAAAA
TTTAATTATCAAGTGAATTATGTGTCTTGTATTTATTGAAAATTATGAAAAAACTACCGT
TATTCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL9315Contig1 976 2 4 U
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AATGGCAAAGAACACGATCTGAAAGTTGTGGGCGATAGAAATCTCTTGAAATTGTGATTA
AAAACCAAGATTTTATTGGATGCAACTACAAGATTTCATGATATTCTCACTTTGCTTACC
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TCATCAGCTCATCCTGAAATTAACAGAATAGTAATTTTTAAAAGCTCTACAATGACTTAG
CACTGTATATCAACATATCAACCCCTTAACAGAAATCGAACGGTATATTTTTAAGAAGCT
CCCGCAGAAAATACGACAACCAGATCAAAACAAGATACTAACCAAGCAGTCCAGGCGAGT
GTTAATAGTTTCAATATCTTTCAGGGGCTGCAACAAATTGGCACGAAGAAGCCTAGTCCT
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AAATCATGGAAGAACATTGCTATGAAGATTACAATTTGAATTCTGAACTACCAAACTCAT
ATACAGTATTTTTGGCAAAGAGGAACTATTACTAGTAATTTAACTATTAAAAAGAAAGTG
TTTCCAGATACCCGCCAACTGTTTTTGTTGTCTTTAACATCTGGAACAGACTCCTCTTCT
TATTGTTAGTGCCCAAAAGAGCATTATGGAATGGATCAATGATTTCCAGATTCTCAACAC
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AAAGGTTACCTACACATAGGCAGCACAATCAATAAAATGCCATCAGCAGAACCAAAGAAG
AAACAGATGGATACCC


BQ
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AF RR4HA67TF U 1
AF RR4HA67JQB C 281
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AGTCTCTTTTGGAAATTTACGTAAAACCTGTGAAAGCCCATAGAATAGTTGTTCATTTGC
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CACTGTATATCAACATATCAACCCCTTAACAGAAATCGAACGGTATATTTTTAAGAAGCT
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QA 1 492 1 492
DS 

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TTCAATGGACTAGGAAGATAAATAATATCACAGTACTCATACCTAGTTGCATCGATATTC
ATGTGACTAAAGGATCCATTAAAGGTTACCTACACATAGGCAGCACAATCAATAAAATGC
CATCAGCAGAACCAAAGAAGAAACAGATGGATACCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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GATCACCAGTAAGCTGCAAAGTAATTGTATGATCGGATACGTCAACAGTTTTAGCCCTGA
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CGAGTTTATAAAGCTGTTGCACCAGTTTGCTGACTGATTCATCTGTTGCAGGAACAACTG
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ATCCCCTCCGAGCGAAAACACCAGTTACAAGATTAAGGACTCCTGGTACATCGTTTACAA
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GAGCGTCAAGAACATGATGTACCATTAGGTCAGAAGTTGGCTCA


BQ
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AF RR4GC88JQ U 1
AF RR4GS90JQ U 1
BS 1 761 RR4GC88JQ
BS 762 764 RR4GS90JQ

RD RR4GC88JQ 761 0 0
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TATCACGATCTTTGGGTTGGCTAATGAACTTTTATATTCAGAAGCCTTTTTGCTGTTCCA
TGGATACAGTTTTGTATCCTACTCTGCTATTGGGTTATTAACTTGATAAGGGGAAGGAGT
ATCCACGAAGATAATTAGAGTCCACTCCTGATTCACGAGCCAATGCCACACGCCTGGTTC
TTGCAACCTCGCAGATACCGTAGGGCTCCAACAACCTTTGCAGTGCAACCATCTTGTCAA
GATCACCAGTAAGCTGCAAAGTAATTGTATGATCGGATACGTCAACAGTTTTAGCCCTGA
AAACACTAGCAATGTCAAGGACATCTCTTCTTGCAGCAGCGTTCACAGCAATCTTAATCA
GCATCAGTTCTCTTTCAGCAAATGGTAAGTGAGTAAGATCACGGACCTCATGCACATCAA
CGAGTTTATAAAGCTGTTGCACCAGTTTGCTGACTGATTCATCTGTTGCAGGAACAACTG
TTGTAATGCGTGAAATGCCCTCTGTTTCAGCATGTCCTACAGCCAAGCTCTGAATATTGT
ATCCCCTCCGAGCGAAAACACCAGTTACAAGATTAAGGACTCCTGGTACATCGTTTACAA
GCAAAGATAGAGTATGTGATCGTAGTCCACTCGTATCTTCGTCCGTGAGAAGTCCCCAGT
GAGCGTCAAGAACATGATGTACCATTAGGTCAGAAGTTGGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4GS90JQ 764 0 0
AAAATCCAAAACCTACTAATTATAAAATAAACAAAGCCCCAAACATATCCACAGTCTCTT
TATCACGATCTTTGGGTTGGCTAATGAACTTTTATATTCAGAAGCCTTTTTGCTGTTCCA
TGGATACAGTTTTGTATCCTACTCTGCTATTGGGTTATTAACTTGATAAGGGGAAGGAGT
ATCCACGAAGATAATTAGAGTCCACTCCTGATTCACGAGCCAATGCCACACGCCTGGTTC
TTGCAACCTCGCAGATACCGTAGGGCTCCAACAACCTTTGCAGTGCAACCATCTTGTCAA
GATCACCAGTAAGCTGCAAAGTAATTGTATGATCGGATACGTCAACAGTTTTAGCCCTGA
AAACACTAGCAATGTCAAGGACATCTCTTCTTGCAGCAGCGTTCACAGCAATCTTAATCA
GCATCAGTTCTCTTTCAGCAAATGGTAAGTGAGTAAGATCACGGACCTCATGCACATCAA
CGAGTTTATAAAGCTGTTGCACCAGTTTGCTGACTGATTCATCTGTTGCAGGAACAACTG
TTGTAATGCGTGAAATGCCCTCTGTTTCAGCATGTCCTACAGCCAAGCTCTGAATATTGT
ATCCCCTCCGAGCGAAAACACCAGTTACAAGATTAAGGACTCCTGGTACATCGTTTACAA
GCAAAGATAGAGTATGTGATCGTAGTCCACTCGTATCTTCGTCCGTGAGAAGTCCCCAGT
GAGCGTCAAGAACATGATGTACCATTAGGTCAGAAGTTGGCTCA

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL9317Contig1 662 2 2 U
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GTATCACCCGTATATCACTTGCGAGAGGTACAAACTGTTCAAGGAAGATCCGGACATGTC
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AGAGAAATCTGAAGGGTGTAACCATGTGCTGTGCCGGTGTGGGAAGCACATTTGCTGGGT
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TGGAATAGGCATCTTCGATGGCCTCGGCATCCCCATGCTTTGATGTTTGAAAACTGGAAC
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TTGGGTTCATATGTACATATGTCGAGATACTGTGGTTCAGTAGTACTACTTTAACCGATC
ATAACAGGAAAGAGTCTGAACTCTGAAGACATTATTAACCTGATATGAATGTTTTTATTA
CC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RR4GD67TF U 1
AF RR4GD67JQ C 1
BS 1 578 RR4GD67TF
BS 579 662 RR4GD67JQ

RD RR4GD67TF 578 0 0
GCTAGATGAGCTCTTCAGAGCATCCCTGTCCTCTTTCGTAACAACCAGTGATGGTAACTT
CCGGTTTTGCTCCACACCTGATTGCCCTGCCGTTTACCGTGTAGCCGGTCCTCGAGAATC
AGGGGAGCCGTTCATCTGCGGAGCTTGTAACGCAGAGACATGCAGAAAGTGCCACCTGGA
GTATCACCCGTATATCACTTGCGAGAGGTACAAACTGTTCAAGGAAGATCCGGACATGTC
GTTGAAAGACTGGGCAAAGGGAAAGAACGTGAAGGATTGTCCGTTTTGCAAGTCGACGAT
AGAGAAATCTGAAGGGTGTAACCATGTGCTGTGCCGGTGTGGGAAGCACATTTGCTGGGT
CTGTTTAGACTTCTTCACTCATCAAGAACCTTGTTATGAGCATATGAGAGCAGTCCATGG
TGGAATAGGCATCTTCGATGGCCTCGGCATCCCCATGCTTTGATGTTTGAAAACTGGAAC
TCTTCAGCGTCAAATTAGTCTTTAAGCCAAGTCTTTGTATCTATATTATGTAACATCTGG
TTGGGTTCATATGTACATATGTCGAGATACTGTGGTTC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4GD67JQ 662 0 0
GCTAGATGAGCTCTTCAGAGCATCCCTGTCCTCTTTCGTAACAACCAGTGATGGTAACTT
CCGGTTTTGCTCCACACCTGATTGCCCTGCCGTTTACCGTGTAGCCGGTCCTCGAGAATC
AGGGGAGCCGTTCATCTGCGGAGCTTGTAACGCAGAGACATGCAGAAAGTGCCACCTGGA
GTATCACCCGTATATCACTTGCGAGAGGTACAAACTGTTCAAGGAAGATCCGGACATGTC
GTTGAAAGACTGGGCAAAGGGAAAGAACGTGAAGGATTGTCCGTTTTGCAAGTCGACGAT
AGAGAAATCTGAAGGGTGTAACCATGTGCTGTGCCGGTGTGGGAAGCACATTTGCTGGGT
CTGTTTAGACTTCTTCACTCATCAAGAACCTTGTTATGAGCATATGAGAGCAGTCCATGG
TGGAATAGGCATCTTCGATGGCCTCGGCATCCCCATGCTTTGATGTTTGAAAACTGGAAC
TCTTCAGCGTCAAATTAGTCTTTAAGCCAAGTCTTTGTATCTATATTATGTAACATCTGG
TTGGGTTCATATGTACATATGTCGAGATACTGTGGTTCAGTAGTACTACTTTAACCGATC
ATAACAGGAAAGAGTCTGAACTCTGAAGACATTATTAACCTGATATGAATGTTTTTATTA
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL9318Contig1 741 2 9 U
GGGAACAAGACTAAGAACAACCAAAGAGATTATTTCCTTCATTCTCTTCGAACAGACATT
TCCGAATCGGAGAGTTATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTC
CAGTTTCTCACGCTCCGGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAATTCTGTTCGTTTAG
GTCATCTGATCTATCCCATGTCACTCAAAGACGTTACTCTATCAAATCCCTAAAGGCTGA
GTCACATACACGCAACGACTCTATGGTTACTCGTGCTTCCACCCTTATCACTCCTGAAGT
GGAAGAGAAAGAAGAAGAGGTTGAGGATTTCGAGCAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGC
TTCACCACTTGAAATCATGGACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGC
TTTCAGTGGGGCTGAAGATGTTGCACTGATCGAATACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTT
CAGGGTTTTCAGCTTAGACACGGGGAGACTAAACCCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGC
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AAGCTTTGGTGAGGAACAAGGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTT
GCCGTGTGAGGAAAGTAAGACCTCTGCGTCGCGCTCTTAAGGGTCTCAAAGCTTGATCAC
AGGACAGAGGAAAGATCAGTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RR4A610TF U 2
AF RR4DS19TF U 1
BS 1 196 RR4DS19TF
BS 197 197 RR4A610TF
BS 198 296 RR4DS19TF
BS 297 297 RR4A610TF
BS 298 508 RR4DS19TF
BS 509 509 RR4A610TF
BS 510 702 RR4DS19TF
BS 703 703 RR4A610TF
BS 704 741 RR4DS19TF

RD RR4A610TF 718 0 0
GGAACAAGACTAAGAACAACCAAAGAGATTATTTCCTTCATTCTCTTTGAACAGACATTT
CCGAATCGGAGAGTTATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCC
AGTTTCTCACGCTCCGGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAATTCTGTTCGTTTAGG
TCATCTGATCTATCCCATGTCACTCAAAGACGTTACTCTATCAAATCCCTAAAGGCTGAG
TCACATACACGCAACGACTCTATGGTTACTCTTGCTTCCACCCTTATCACTCCTGAAGTG
GAAGAGAAAGAAGAAGAGGTTGAGGATTTCGAGCGACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGCT
TCACCACTTGAAATCATGGACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGCT
TTCAGTGGGGCTGAAGATGTTGCACTGATCGAATACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTTC
AGGGTTTTCAGCTTAGACACGGGGAGACTAAACCCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGCA
GTGGAGAAGCAGTACGGG*ATTCGGATCGAGTACACGTTCCCTGATGCGGTCGAGGTTCA
AGCTTTGGTGAGGAACAAGGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTTG
CCGTGTGAGGAAAGTAAGACCTCTGCGTCGCGCTCTTAAGGGTCTCAAAGCTTG
GATC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR4DS19TF 741 0 0
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TCCGAATCGGAGAGTTATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTC
CAGTTTCTCACGCTCCGGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAATTCTGTTCGTTTAG
GTCATCTGATCTATCCTATGTCACTCAAAGACGTTACTCTATCAAATCCCTAAAGGCTGA
GTCACATACACGCAACGACTCTATGGTTACTCGTGCTTCCACCCTTATCACTCCTGTAGT
GGAAGAGAAAGAAGAAGAGGTTGAGGATTTCGAGCAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGC
TTCACCACTTGAAATCATGGACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGC
TTTCAGTGGGGCTGAAGATGTTGCACTGATCGAATACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTT
CAGGGTTTTCAGCTTAGACACGGGGAGATTAAACCCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGC
AGTGGAGAAGCAGTACGGGGATTCGGATCGAGTACACGTTCCCTGATGCGGTCGAGGTTC
AAGCTTTGGTGAGGAACAAGGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTT
GCCGTGTGAGGAAAGTAAGACCTCTGCGTCGCGCTCTTAAGG*TCTCAAAGCTTGATCAC
AGGACAGAGGAAAGATCAGTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL9319Contig1 998 2 12 U
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GCAAGCAAAGGATCTGATTTTACAAATCATTGGTGAAATATCTGTTGCGGGTGCAACTTA
CAAGACGATGGAGTTCAGTGGCACAACTATTGAAAGTCTGACTATGGAAGAAAGAATGAC
ATTGTGCAACATGGTTGTGGAAGCTGGGGGAAAGAATGGTGTTATCCCTCCTGATGCGAC
GACATTTAACTACGTTGAGAACAGGACATCTGTACCCTTTGAGGCCGTATATAGTGATGG
AAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGATTTGACGTGTCAAAGCTGGAGCCTGTGGTGGC
TAAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAAAATTGA
CAGAGTATACATTGGTTCTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGCAGCTAA
ACTTCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCA
GAAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGCGGAAAAACGTGTGC
ACAGATATTCGAAGAAGCAGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCT
TGGTGGCCCAGCAGATACCTATGCTCGCCTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAAC
AAACAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAAGGCAGATTTACTTGGCTTCGCC
TTACACCGCTGCAGCCTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCA
GTAAGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCTAAATGCTGAATCAAGAGAGAGCTAAAACGAT
GAGCATTGTGAACTATATGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAACTTCTTAGTTTCAA
ACATTGTTAAACTTTTGATGTTTCGAGTTTGAAATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4AM34TF U 1
AF RR4AM34JQ C 235
BS 1 861 RR4AM34TF
BS 862 862 RR4AM34JQ
BS 863 895 RR4AM34TF
BS 896 896 RR4AM34JQ
BS 897 906 RR4AM34TF
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BS 930 942 RR4AM34TF
BS 943 998 RR4AM34JQ

RD RR4AM34TF 945 0 0
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GCAAGCAAAGGATCTGATTTTACAAATCATTGGTGAAATATCTGTTGCGGGTGCAACTTA
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ATTGTGCAACATGGTTGTGGAAGCTGGGGGAAAGAATGGTGTTATCCCTCCTGATGCGAC
GACATTTAACTACGTTGAGAACAGGACATCTGTACCCTTTGAGGCCGTATATAGTGATGG
AAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGATTTGACGTGTCAAAGCTGGAGCCTGTGGTGGC
TAAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAAAATTGA
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GAAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGCGGAAAAACGTGTGC
ACAGATATTCGAAGAAGCAGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCT
TGGTGGCCCAGCAGATACCTATGCTCGCCTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAAC
AAACAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAAGGCAGATTTACTTGGCTTCGCC
TTACACCGCTGCAGCCTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCA
GTAAGATAGCTTTGTCCAAAA*CAAACCTAAATGCTGAATCAAGAGAGAGCTAAA*CGAT
GAGCAT*GTGA*CTATATGTATGTATTT*CGTACTTTGCTGT
GAA

QA 1 942 1 942
DS 

RD RR4AM34JQ 764 0 0
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TGATGGAAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGATTTGACGTGTCAAAGCTGGAGCCTGT
GGTGGCTAAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAA
AATTGACAGAGTATACATTGGTTCTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGC
AGCTAAACTTCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGC
TACCCAGAAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGCGGAAAAAC
GTGTGCACAGATATTCGAAGAAGCAGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGC
CTGCCTTGGTGGCCCAGCAGATACCTATGCTCGCCTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTC
GACAACAAACAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGC
TTCGCCTTACACCGCTGCAGCCTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTT
CTTGCAGTAAGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCTAAATGCTGAATCAAGAGAGAGCTAA
AACGATGAGCATTGTGAACTATATGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAACTTCTTAG
TTTCAAACATTGTTAAACTTTTGATGTTTCGAGTTTGAAATAAT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL9320Contig1 606 2 1 U
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CGGATATGGCACAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTAC
GGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAAACGGCTTCT
CTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAAC
ATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGTTGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTA
GCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTATT
GCTGCATGGGCAACCCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTG
GTCATTCTTCTGCCTTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAA
TATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTGAATTTGTTGCT
GGAAATATTATATATGTAATTGATCAGATTAATGTAATCATATTGCATTGCATTTTATTT
AATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR4FM45TF U 1
AF RR4FM45JQ C 29
BS 1 606 RR4FM45TF

RD RR4FM45TF 606 0 0
GGGGGAAATTGCGTAAGAAGCAACCTAAGAGATTTCAGAGGAAGACAATCGATGGATCCT
CGGATATGGCACAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTAC
GGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAAACGGCTTCT
CTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAAC
ATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGTTGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTA
GCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTATT
GCTGCATGGGCAACCCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTG
GTCATTCTTCTGCCTTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAA
TATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTGAATTTGTTGCT
GGAAATATTATATATGTAATTGATCAGATTAATGTAATCATATTGCATTGCATTTTATTT
AATACC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR4FM45JQ 578 0 0
GAGATTTCAGAGGAAGACAATCGATGGATCCTCGGATATGGCACAAAGTCGCCGCCGTTT
CTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTACGGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACC
CTTCTTACAAACAGGTGTGGCAAACGGCTTCTCTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTC
TTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAACATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGA
TTGTTGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTAGCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTA
CCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTATTGCTGCATGGGCAACCCTACTTTTTTAAA
GAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTGGTCATTCTTCTGCCTTATCCTACCTATG
AACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAATATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTT
AACTATATGCTTCGCTTGTTGAATTTGTTGCTGGAAATATTATATATGTAATTGATCAGA
TTAATGTAATCATATTGCATTGCATTTTATTTAATACC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL9321Contig1 822 2 8 U
GGGTGACGTTAAATATCTACAAAAGCTTCTTCTTCCATCACTGCTTCTACCAATTTCCCA
AGAAAAAAACGATGGCAGTTGGAGATTTATCCTCTTCTTCCTCGGAGTTACATGTTCTGG
CTGTCGACGATAGTATTGTTGATCGTAAGGTTATTGAGAGGTTGCTTAGGATCTCTGCTT
GTAAAGTGACGATTGTTGAGAGTGGGACTAGGGCTCTTCAGTATCTTGGTCTAGATGGAG
ACAAAGGATCTCCTGGTCTTAATGATTTGAAGGTGAACTTGATAGTGACAGATTACTCTA
TGCCGGGACTAACAGGTTATGAACTTCTCAAGAAGATCAAAGAGTCTTCAGCGTTCAGAG
AAATACCAGTAGTGATAATGTCGTCTGAGAACATACAACCTCGTATAGAACAATGCATGA
CAGAAGGAGCAGAGGATTTTCTGCTAAAACCGGTGAAATTAGCAGATGTGAAGCGGCTCA
AAGAACTTATAATGAGATTGAGAGGTGGTGAAGCTGAAGAAGAGAAAACCAGTAACCTTA
GTCCTAAGAGAATCCTTCAAAACGACATCTTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCATTATCA
CCACCATTGCCATATTCATTGTCTAATGTTGTTTCCTCTCCGGGAAGATGACACTCAATC
TTCCAAAAGGATGAAATTAGGATCATGATTGCGCTAAAAACTTCTTCTCTGTTTTTCTTT
TAGTTTTCTTGGTTTCTGTAATATACAATTAAGCCAATAGGTGGGGTAAGTTTTTGTTTT
GGGTATATGCAAGGTTTAGAGCCTGATGCTCACCATATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4EF06TF U 1
AF RR4EF06JQ C 260
BS 1 669 RR4EF06TF
BS 670 670 RR4EF06JQ
BS 671 699 RR4EF06TF
BS 700 700 RR4EF06JQ
BS 701 715 RR4EF06TF
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BS 717 740 RR4EF06TF
BS 741 822 RR4EF06JQ

RD RR4EF06TF 742 0 0
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AGAAAAAAACGATGGCAGTTGGAGATTTATCCTCTTCTTCCTCGGAGTTACATGTTCTGG
CTGTCGACGATAGTATTGTTGATCGTAAGGTTATTGAGAGGTTGCTTAGGATCTCTGCTT
GTAAAGTGACGATTGTTGAGAGTGGGACTAGGGCTCTTCAGTATCTTGGTCTAGATGGAG
ACAAAGGATCTCCTGGTCTTAATGATTTGAAGGTGAACTTGATAGTGACAGATTACTCTA
TGCCGGGACTAACAGGTTATGAACTTCTCAAGAAGATCAAAGAGTCTTCAGCGTTCAGAG
AAATACCAGTAGTGATAATGTCGTCTGAGAACATACAACCTCGTATAGAACAATGCATGA
CAGAAGGAGCAGAGGATTTTCTGCTAAAACCGGTGAAATTAGCAGATGTGAAGCGGCTCA
AAGAACTTATAATGAGATTGAGAGGTGGTGAAGCTGAAGAAGAGAAAACCAGTAACCTTA
GTCCTAAGAGAATCCTTCAAAACGACATCTTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCATTATCA
CCACCATTGCCATATTCATTGTCTAATGTTGTTTCCTCTCCGGGAAGATGACACTCAATC
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TAGTTTTCTTGGTTTCTGTA
TA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR4EF06JQ 563 0 0
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TGAACTTCTCAAGAAGATCAAAGAGTCTTCAGCGTTCAGAGAAATACCAGTAGTGATAAT
GTCGTCTGAGAACATACAACCTCGTATAGAACAATGCATGACAGAAGGAGCAGAGGATTT
TCTGCTAAAACCGGTGAAATTAGCAGATGTGAAGCGGCTCAAAGAACTTATAATGAGATT
GAGAGGTGGTGAAGCTGAAGAAGAGAAAACCAGTAACCTTAGTCCTAAGAGAATCCTTCA
AAACGACATCTTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCATTATCACCACCATTGCCATATTCAT
TGTCTAATGTTGTTTCCTCTCCGGGAAGATGACACTCAATCTTCCAAAAGGATGAAATTA
GGATCATGATTGCGCTAAAAACTTCTTCTCTGTTTTTCTTTTAGTTTTCTTGGTTTCTGT
AATATACAATTAAGCCAATAGGTGGGGTAAGTTTTTGTTTTGGGTATATGCAAGGTTTAG
AGCCTGATGCTCACCATATGACC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL9322Contig1 857 2 2 U
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CATGGCAAATGAGGAATATATTAATAGTAACAATAAGGTTACAACATTTCAAGCTTTAAC
TGGGTTTCTTTGGAAATCACGGTGTGAGGCGCTACAGTTTAAACCCGACCAACGAGTTAA
ACTTCTTTTCGCGGCTGATGGACGACCGAGATTCATTCCTCCTCTCCCCAAAGGGTATTG
CGGGAATGGGATTGTACTGACCGGTTTGGTGACTTCATCGGGAGAATTGGTTGGAAACCC
TCTTTCTCGTTCGGTTAGTCTGGTTAAGAATGTGGTCGAGTTGGTTACCGACAGTTTCAT
TAGATCAGCTATTGATTACTTGGAGGTGAATCGGACAAGACCGAGTATGACGGCAACACT
TCTGACTACGTCGTGGTCAAGATTGTCACTACATAAACTGGATTTTGGCTGGGGAGAACC
AATTTTCTCTGGACCAGTTGGGTTACCAGGGAGGGAAGTGATCCTGTTTCTACCTGGTCT
CGACGATACGAATAGTATCAATGTGTTCCTTGGACTTCCTGCCTCGGCTATGAAGGTTTT
TGAAGAGCTTATGAAGATCTGAAAAGAATTATATAATCACAATGAAATTGTGATTTATTT
ATATGAATTAATTATATACAATCACAAGAAGAAAATATGATGCCTAAGTATTATTTATAC
ATGTTTCTATATCAATTTAAAATTTATGTAATTTCAGAAAATGATAGGTCAATATAAGAA
ATCATTTGTAATGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AU65TF U 1
AF RR4AU65JQ C 64
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BS 851 857 RR4AU65JQ

RD RR4AU65TF 856 0 0
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AGAGAAACTCGTCTACAAATCGTTCCTCTTCCAACCGCAAAAACTAGAGAAGCTCAAGAC
CATGGCAAATGAGGAATATATTAATAGTAACAATAAGGTTACAACATTTCAAGCTTTAAC
TGGGTTTCTTTGGAAATCACGGTGTGAGGCGCTACAGTTTAAACCCGACCAACGAGTTAA
ACTTCTTTTCGCGGCTGATGGACGACCGAGATTCATTCCTCCTCTCCCCAAAGGGTATTG
CGGGAATGGGATTGTACTGACCGGTTTGGTGACTTCATCGGGAGAATTGGTTGGAAACCC
TCTTTCTCGTTCGGTTAGTCTGGTTAAGAATGTGGTCGAGTTGGTTACCGACAGTTTCAT
TAGATCAGCTATTGATTACTTGGAGGTGAATCGGACAAGACCGAGTATGACGGCAACACT
TCTGACTACGTCGTGGTCAAGATTGTCACTACATAAACTGGATTTTGGCTGGGGAGAACC
AATTTTCTCTGGACCAGTTGGGTTACCAGGGAGGGAAGTGATCCTGTTTCTACCTGGTCT
CGACGATACGAATAGTATCAATGTGTTCCTTGGACTTCCTGCCTCGGCTATGAAGGTTTT
TGAAGAGCTTATGAAGATCTGAAAAGAATTATATAATCACAATGAAATTGTGATTTATTT
ATATGAATTAATTATATACAATCACAAGAAGAAAATATGATGCCTAAGTATTATTTATAC
ATGTTTCTATATCAATTTAAAATTTATGTAATTTCAGAAAATGATAGGTCAATATAAGAA
ATCATTTGTA
TGAACC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR4AU65JQ 794 0 0
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GGCAAATGAGGAATATATTAATAGTAACAATAAGGTTACAACATTTCAAGCTTTAACTGG
GTTTCTTTGGAAATCACGGTGTGAGGCGCTACAGTTTAAACCCGACCAACGAGTTAAACT
TCTTTTCGCGGCTGATGGACGACCGAGATTCATTCCTCCTCTCCCCAAAGGGTATTGCGG
GAATGGGATTGTACTGACCGGTTTGGTGACTTCATCGGGAGAATTGGTTGGAAACCCTCT
TTCTCGTTCGGTTAGTCTGGTTAAGAATGTGGTCGAGTTGGTTACCGACAGTTTCATTAG
ATCAGCTATTGATTACTTGGAGGTGAATCGGACAAGACCGAGTATGACGGCAACACTTCT
GACTACGTCGTGGTCAAGATTGTCACTACATAAACTGGATTTTGGCTGGGGAGAACCAAT
TTTCTCTGGACCAGTTGGGTTACCAGGGAGGGAAGTGATCCTGTTTCTACCTGGTCTCGA
CGATACGAATAGTATCAATGTGTTCCTTGGACTTCCTGCCTCGGCTATGAAGGTTTTTGA
AGAGCTTATGAAGATCTGAAAAGAATTATATAATCACAATGAAATTGTGATTTATTTATA
TGAATTAATTATATACAATCACAAGAAGAAAATATGATGCCTAAGTATTATTTATACATG
TTTCTATATCAATTTAAAATTTATGTAATTTCAGAAAATGATAGGTCAATATAAGAAATC
ATTTGTAATGAACC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL9323Contig1 577 2 1 U
GGCAGATCACCTGAATCTTCATGACATACACACAATGCCTTGACTTGACCCTCACCTGAT
AGTTTCAAACCTAGATTGAGAGAAGGAGAAATCGGAAGAAGGATCAAAATCATATGAATC
TTCATTCCTTCTTACAATATGTAATTTTGTGTCATCTGTACTCTCTAGATTGTATTAGGA
GTGACAAAAAAACTTATGATTAATTCTTGTATTGCCTCTAAACTTTGATGCTGTATTATG
ATATAAACAATCTGCCCGGTGTCTGAGCTTCCTCAAGGTTTTGTGTATTTGAATTATGAT
AGGTTGCAAGAAGCAAGAGAAAACTGCGACCAGGGTGATGTCTGTTGAGTCTGGTATCCC
TGACCTACCGAGCAAGAGAATCCGCTCAAGCCTAAGCGTTGGTCAAGATTTTGGACATTT
TGTGAAATGTGCAGAGTTGTGAGTGGAGTTACTGATGAGGGATTGAGCCAATGATCTTTG
GGTGGAACAATCTTATATTCTTATGCTATATAGCGTGTGAAGTAAATTCATAAGATCATT
CAATCTTTTCACTCAATTTTCAGAGAATGTTCGACCC


BQ
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AF RR4H071JQ C 1
AF RR4H071TF U 1
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QA 1 577 1 577
DS 

RD RR4H071TF 577 0 0
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TTCATTCCTTCTTACAATATGTAATTTTGTGTCATCTGTACTCTCTAGATTGTATTAGGA
GTGACAAAAAAACTTATGATTAATTCTTGTATTGCCTCTAAACTTTGATGCTGTATTATG
ATATAAACAATCTGCCCGGTGTCTGAGCTTCCTCAAGGTTTTGTGTATTTGAATTATGAT
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TGACCTACCGAGCAAGAGAATCCGCTCAAGCCTAAGCGTTGGTCAAGATTTTGGACATTT
TGTGAAATGTGCAGAGTTGTGAGTGGAGTTACTGATGAGGGATTGAGCCAATGATCTTTG
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CAATCTTTTCACTCAATTTTCAGAGAATGTTCGACCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

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TATACCATATTAGCTCCTGTATTA


BQ
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AF RR4A640TF U 1
AF RR4A640JQ C 167
BS 1 694 RR4A640TF
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BS 696 842 RR4A640TF
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BS 865 874 RR4A640TF
BS 875 924 RR4A640JQ

RD RR4A640TF 892 0 0
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GAAAGTCTCTGAAACATCTAGCATCTGAGTTCCTAGGGGCCGACATTCAAAACGGAGAGC
ACTGTCCTATTGATGACGCACGAGCTGCAATGCTGCTTTACCAGAAGAACAGAAGAGAGT
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ATAGCTGAAAAGTTTTGTTCGTCTCTTCCATTTTTGATGTGGGATTTGAATTACCCTTTA
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QA 1 874 1 874
DS 

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QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

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TTCGGCTGCTCAAGAAGTTAAACCGAAGAGTGATGTGATTCCTCGCCAATCAATCTTTTC
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TGTTGTTGTTGACGACCTTAATATTAGCTTACTTTAATTATCCAAGTGT


BQ
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AF RR4D323TF U 1
AF RR4D323JQ C 629
BS 1 747 RR4D323TF
BS 748 1189 RR4D323JQ

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TTCTTCCTCGTCCCCTGGTGGAGTCAAGGAAGAAGTCGATAAGATCATGGATACTAAATC
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AATTGCTAGAAGAGCTTCACTTCATCG

QA 1 747 1 747
DS 

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ACCGAAGCATCTTCCAAGCCTAACACATCTTGGCTCGGTTCCCAGTAATCTCCTTGAGTT
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AAACATCAGTTTCTTATTTATTTATTTTTGGTTGTTGTTGTTGACGACCTTAATATTAGC
TTACTTTAATTATCCAAGTGT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

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CTGTGCTGGAAAAACCAGTGTCGTTAACCGTACGGAGAATGAAATCTGGCCAAGAACAAG
AAGAAACCGGTTCGTGAAGAACCAGACAATCTTTTTCTTATTTGATTTGAAAGTTTAAAA
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TCTTTGATTTTCTGGCCGTTTCTAAATGAAAATATATGGTTTACCT


BQ
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AF RR4F742JQ C 1
AF RR4F742TF U 1
BS 1 466 RR4F742TF

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TTGCTGAGAGGATTGCCGGTTTACCAACAAGAACCGATGTCTGGAACAGCGTTAATGTCT
CTGTGCTGGAAAAACCAGTGTCGTTAACCGTACGGAGAATGAAATCTGGCCAAGAACAAG
AAGAAACCGGTTCGTGAAGAACCAGACAATCTTTTTCTTATTTGATTTGAAAGTTTAAAA
TATCTCCCCTTTTATTGTGCAAAAATAGAGAGACTATGCAGAAAAAAAGGCCCTAGAATT
TCTTTGATTTTCTGGCCGTTTCTAAATGAAAATATATGGTTTACCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR4F742TF 466 0 0
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GCCGTGGCTCTGTTGCGTGGGTCGGCTCAGGTCCAGAGTTCTTCATCAGTCTAGCAAACC
ACCACGAATGGAAGCAATCTTACACTGTTTTCGGCTCTGTTTTGCCCGAAGACATGGAGG
TTGCTGAGAGGATTGCCGGTTTACCAACAAGAACCGATGTCTGGAACAGCGTTAATGTCT
CTGTGCTGGAAAAACCAGTGTCGTTAACCGTACGGAGAATGAAATCTGGCCAAGAACAAG
AAGAAACCGGTTCGTGAAGAACCAGACAATCTTTTTCTTATTTGATTTGAAAGTTTAAAA
TATCTCCCCTTTTATTGTGCAAAAATAGAGAGACTATGCAGAAAAAAAGGCCCTAGAATT
TCTTTGATTTTCTGGCCGTTTCTAAATGAAAATATATGGTTTACCT

QA 1 466 1 466
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATGCAAACAAGTACCTGAAGAAGGTTGGATTAGGGCGTACGATATGTTCTTTTGGAAACA
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GACTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAGCCGAGACCAAAGGAGGAGAGAGAATTGGC
GCATTTGTATGAGCGGCGTGAGTTTCCTTATCCAGGTGATACGGAGGCCATGGAGGATTT
TGTTGCAAAGGGAGGAATGATCGGGACGGCCATTGGGCCTAAAGGGGTTGTTGAGTCGGA
AGGTGAAGGTGATAATTACCAGAAAGAGGTGGAGAAGAAGAAGTTTGACAAAGAGGCTCA
GAAACTGTGGTTGAGGATGAGGAATGAGGTTATGACTGAGCTTCAAGAGAAAGGGTATGA
TCTTGAATAAAGGTACTATAAAAGAGTTGTGATACAAATAAACTTGTGTAATTTAGGCTG
TGTGTCTGTTAGATGGAAAGTTACTTAAACCATTGGTACAAACAAGTGTTTCTACCGACA
TATCCTTTTTAAATTGTAGAGGAAAGTAC


BQ
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AF RR4DZ01TF U 1
AF RR4DZ01JQ C 11
BS 1 588 RR4DZ01TF
BS 589 689 RR4DZ01JQ

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GACTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAGCCGAGACCAAAGGAGGAGAGAGAATTGGC
GCATTTGTATGAGCGGCGTGAGTTTCCTTATCCAGGTGATACGGAGGCCATGGAGGATTT
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TCTTGAATAAAGGTACTATAAAAGAGTTGTGATACAAATAAACTTGTG

QA 1 588 1 588
DS 

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AGATGGAAAGTTACTTAAACCATTGGTACAAACAAGTGTTTCTACCGACATATCCTTTTT
AAATTGTAGAGGAAAGTAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL9329Contig1 578 2 1 U
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BQ
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AF RR4H767JQB C 1
AF RR4H767TF U 1
BS 1 578 RR4H767TF

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QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4H767TF 578 0 0
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CTCAGTGATATTAGATAAATTAATTAATGTTGATTTGC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL9330Contig1 560 2 1 U
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GATTTTCTGACAATATGTACGACATTCAAGTGTTTTGGTCATTTAGACAACATCATCAAT
CAATGTTTTTTACTTCGGTC


BQ
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AF RR4BQ06JQ C 1
AF RR4BQ06TF U 1
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QA 1 560 1 560
DS 

RD RR4BQ06TF 560 0 0
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GATTTTCTGACAATATGTACGACATTCAAGTGTTTTGGTCATTTAGACAACATCATCAAT
CAATGTTTTTTACTTCGGTC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL9331Contig1 843 2 2 U
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GAT


BQ
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10 10 10 

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QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FW81JQ C 1
AF RR4FW81TF U 1
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DS 

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QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4C433TF U 45
AF RR4C433JQ C 1
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TAATTCAATTCCCGTTGAAGTTTCAAAGAGTTGTCAAATAGTTGAAATTTGGTCTAGTCT
TTGAAGCTCCTTCGTTTTATTAATGATGATGACTAACAAACGGATATGTTTTTTTGTTAA
TGACTGTAATGCAAAAATGTGGCGTCTAGTAAGGGTTAGTTGGTCACGCACACCCTTGAA
TGTTCCCCTACTGAGACTTTGAAAGACTACACGCTTTGTTGCTTTTAGTAAGTTTCATTA
CTTGCATCACACATTGAAGTTAAGAATTCCTCTTCAGCTGAATGAAAAACATAAGGTTTT
TACATATTATTGATCTTTACTACTTAAATTAGCTGGTTTGAAAGTGGAGCAACCAGAGAA
GATCTAACTTTCTGGATGTTTGCTAATGGGATGTACATTATGGGTCTCTCTGTCGTCCCT
TGGCTGGCTCAGAAGATTAATAACTGGCTGTGGTTCTGCGGAGAAGATGAACGGGAGTTG
CATGATGATCGATTAATAGCTGACAATTGTTTTT
AAACAGTC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4C433JQ 752 0 0
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GAAGTTTCAAAGAGTTGTCAAATAGTTGAAATTTGGTCTAGTCTTTGAAGCTCCTTCGTT
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ATGTGGCGTCTAGTAAGGGTTAGTTGGTCACGCACACCCTTGAATGTTCCCCTACTGAGA
CTTTGAAAGACTACACGCTTTGTTGCTTTTAGTAAGTTTCATTACTTGCATCACACATTG
AAGTTAAGAATTCCTCTTCAGCTGAATGAAAAACATAAGGTTTTTACATATTATTGATCT
TTACTACTTAAATTAGCTGGTTTGAAAGTGGAGCAACCAGAGAAGATCTAACTTTCTGGA
TGTTTGCTAATGGGATGTACATTATGGGTCTCTCTGTCGTCCCTTGGCTGGCTCAGAAGA
TTAATAACTGGCTGTGGTTCTGCGGAGAAGATGAACGGGAGTTGCATGATGATCGATTAA
TAGCTGACAATTGTTTTTTAAACAGTCATTCCGGTGGATTTTTTTTTCCAGTTCTGTAAA
GCTCGATCTTTGTTTACTCCCGGCATTTATGAAGGCTGTGTTCCCATTTATTGTGTATCT
GAAATACTCTACAAGATCTATAGGTTTTACAC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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AGATGGGGTGGGAAAATGCCAGAAGGTCATGACTACTTCGAGAACGGTTTTCTGGACGTT
TTCAGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAACCCAGTATGTTTTATGAGACTGAACTCTGAC
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CCGTATGAGCTACATGCAGAAAGAAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTAT
TCAATCATATGAATTAATGAGGGTGTATTGGAGACTGGTTCTATGGTAATCTTGTGAACT
CGATAAAAATAATGGTAACTGAATAAGATTTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGG
TAATAATTGAATAAAACTGCTGTCTTGTGTTGTAAAACATATAATGGAATAAAATGTTGT
CTTGTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G992TF U 1
AF RR4G992JQ C 1
BS 1 554 RR4G992TF
BS 555 727 RR4G992JQ

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AGATGGGGTGGGAAAATGCCAGAAGGTCATGACTACTTCGAGAACGGTTTTCTGGACGTT
TTCAGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAACCCAGTATGTTTTATGAGACTGAACTCTGAC
AACTCCGGTATAACACCCGGGTGGTATGTGGAATACATGGATGTTACAACGAGCAAATTT
GGAAGCCCGAGCACACATATACGCTTTAGTGTGCAGCAATGGCTTGCCATCGATAGTAGC
CCGTATGAGCTACATGCAGAAAGAAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTAT
TCAATCATATGAAT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR4G992JQ 727 0 0
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GATTGCATATACACTATCAAAGTCCAAACCGGCACAAGAGGGTCCTCCGGAACAGATTCC
ATCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGCACATAGAAATTAAAGACATTGAG
AGATGGGGTGGGAAAATGCCAGAAGGTCATGACTACTTCGAGAACGGTTTTCTGGACGTT
TTCAGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAACCCAGTATGTTTTATGAGACTGAACTCTGAC
AACTCCGGTATAACACCCGGGTGGTATGTGGAATACATGGATGTTACAACGAGCAAATTT
GGAAGCCCGAGCACACATATACGCTTTAGTGTGCAGCAATGGCTTGCCATCGATAGTAGC
CCGTATGAGCTACATGCAGAAAGAAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTAT
TCAATCATATGAATTAATGAGGGTGTATTGGAGACTGGTTCTATGGTAATCTTGTGAACT
CGATAAAAATAATGGTAACTGAATAAGATTTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGG
TAATAATTGAATAAAACTGCTGTCTTGTGTTGTAAAACATATAATGGAATAAAATGTTGT
CTTGTCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL9335Contig1 578 2 1 U
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TGCTACTAGGATGTACGTTGAGATGAGTAAAGGCAAGAAGAGCGAAAGCTATGTCGTTGA
GACGGTTGAAATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTTCATCTGGAGAGCCCTCTGCTCTTGAT
CCTCGCTCTTAGAAAGTTCTTAACAAGAGTGCGCAAAAACTCTGCAGAGACAGAGCTTTC
TCAGAAGCTCTTGTTAGCACTTAAAGAAACATAAGCAAACTCTGCTGAAATCTGAGAATT
GCATAATAGATTTTGGAACATGAAGATTGGACTTCTTTCTGCAGGCATGTTTAATACTCG
ACTGAATCAAAATTCAATTGTTATTGTTACTGAGTGGTGCAGTGGTTATCAAGGGGGATA
TACTAAATTGATTTAAATAATCTAAAATATTTGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GA21JQ C 1
AF RR4GA21TF U 1
BS 1 578 RR4GA21TF

RD RR4GA21JQ 578 0 0
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ACTGAATCAAAATTCAATTGTTATTGTTACTGAGTGGTGCAGTGGTTATCAAGGGGGATA
TACTAAATTGATTTAAATAATCTAAAATATTTGTTTCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4GA21TF 578 0 0
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GGATTGTAATACAAATATCTCACTTGTCTTCGGAGAGAAAGATGTAAAATTCAAGAAAAT
TGCTACTAGGATGTACGTTGAGATGAGTAAAGGCAAGAAGAGCGAAAGCTATGTCGTTGA
GACGGTTGAAATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTTCATCTGGAGAGCCCTCTGCTCTTGAT
CCTCGCTCTTAGAAAGTTCTTAACAAGAGTGCGCAAAAACTCTGCAGAGACAGAGCTTTC
TCAGAAGCTCTTGTTAGCACTTAAAGAAACATAAGCAAACTCTGCTGAAATCTGAGAATT
GCATAATAGATTTTGGAACATGAAGATTGGACTTCTTTCTGCAGGCATGTTTAATACTCG
ACTGAATCAAAATTCAATTGTTATTGTTACTGAGTGGTGCAGTGGTTATCAAGGGGGATA
TACTAAATTGATTTAAATAATCTAAAATATTTGTTTCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL9336Contig1 1119 2 2 U
GGTCCAGGACTAAGATGTTCACATGCCATAGCACAAGTAGGAAACAAGATTTACTCATTT
GGTGGCGAGCTCATACCAAATCAGCCTATCGACAAAGACCTTTACGTCTTTGACCTTGAG
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AAATACAACGGGTTCTACTCTTTTGACACGACCAAGAACGAGTGGAAATTGCTAACTCCG
GTCGAAGAAGGACCCATTCCTCGTAGCTTCCACTCTATGGCAGCCGATGAGAACAACGTT
TATGTTTTTGGTGGAGTGAGTGCTACGGAGCGGCTCAAGAACCTAGACGCTTACAACATC
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GCCGGGCTTGAAGTGGTGCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGGATTCAACGGGTGTGAA
GTAGATGATGTTCATTACTACGATCCTGTTGAAGACAAATGGACACAGGTGGAAACGTTC
GGAGAGAAACCTTCAGCGAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGTTGGCAAACACATTGTG
ATATTTGGAGGTGAGGTTGCGATGGATCCAAAATCTCACGTAGGCCCGGGACAATTGATA
GGTGGGACCTTTGCGCTGGACGCAGAGACATTGAAGTGGGAGAGGTTGGATAAGTTAGGT
GAAGACGAGGAGACTCCAGATATTAGGGGATGGTCGGCTTCCACAAGTGGAACCATTGAT
GGTAAGAAAGGGCTGGTGATGCACGGTGGGAAAGCTCAGACCAATGGCCGTTTTGATGAT
CTTTTCTTTTATGGGATTGAGTCTGCTTAAACGCTTTAAAAAGTCGTTTGGTGATAACTG
TTTGCGTTGTGCTGTGTGTATGTGATTCAATAAGGGAGGATCGTGATGGTTGCTACTATA
TGATCCTTTATCAGCTTGTTTGTTACTTTATATTTAATTTTCAGTCTCTGCGTGTTTGTT
TCATGGTTCGTGTTGTATCAATAAATTGCTTATTTTCTC


BQ
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AF RR4GY11TF U 1
AF RR4GY11JQ C 470
BS 1 644 RR4GY11TF
BS 645 1119 RR4GY11JQ

RD RR4GY11TF 644 0 0
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GGTGGCGAGCTCATACCAAATCAGCCTATCGACAAAGACCTTTACGTCTTTGACCTTGAG
ACCCGGACATGGTCCATTTCTCCAGCTACAGGAGACATTCCCCACCTTTCTTGCTTAGGC
GTCCGCATGGTGTCTATTGGATCAAACCTATATGTCTTCGGAGGCCGAGACGCCTCCAGA
AAATACAACGGGTTCTACTCTTTTGACACGACCAAGAACGAGTGGAAATTGCTAACTCCG
GTCGAAGAAGGACCCATTCCTCGTAGCTTCCACTCTATGGCAGCCGATGAGAACAACGTT
TATGTTTTTGGTGGAGTGAGTGCTACGGAGCGGCTCAAGAACCTAGACGCTTACAACATC
GTTGATCAGAAGTGGATGACGTGTTCGACTCCTGGAGAATTGGTTAGCATAAGAGGAGGA
GCCGGGCTTGAAGTGGTGCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGGATTCAACGGGTGTGAA
GTAGATGATGTTCATTACTACGATCCTGTTGAAGACAAATGGACACAGGTGGAAACGTTC
GGAGAGAAACCTTCAGCGAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR4GY11JQ 650 0 0
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ACGGGTGTGAAGTAGATGATGTTCATTACTACGATCCTGTTGAAGACAAATGGACACAGG
TGGAAACGTTCGGAGAGAAACCTTCAGCGAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGTTGGCA
AACACATTGTGATATTTGGAGGTGAGGTTGCGATGGATCCAAAATCTCACGTAGGCCCGG
GACAATTGATAGGTGGGACCTTTGCGCTGGACGCAGAGACATTGAAGTGGGAGAGGTTGG
ATAAGTTAGGTGAAGACGAGGAGACTCCAGATATTAGGGGATGGTCGGCTTCCACAAGTG
GAACCATTGATGGTAAGAAAGGGCTGGTGATGCACGGTGGGAAAGCTCAGACCAATGGCC
GTTTTGATGATCTTTTCTTTTATGGGATTGAGTCTGCTTAAACGCTTTAAAAAGTCGTTT
GGTGATAACTGTTTGCGTTGTGCTGTGTGTATGTGATTCAATAAGGGAGGATCGTGATGG
TTGCTACTATATGATCCTTTATCAGCTTGTTTGTTACTTTATATTTAATTTTCAGTCTCT
GCGTGTTTGTTTCATGGTTCGTGTTGTATCAATAAATTGCTTATTTTCTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL9337Contig1 733 2 2 U
GGATGAATGATGATTCTAATATCAGCTAATACGAGATCTCTTTGCCTAATTATAGCTCCC
TTTCTTTTCCTTTTTCTTACGGTTCTCGCCTCCACCGAGCCACCTCCGACTCCCGTATTG
AGACATGACAACCAAAGCAGCGACCTAGTCTCTGCCATAGCCGACATGGTTAGGGAATCT
TATAACGGTTTTGGCACCCTACTCCTTCTCCATGCCCTCAACGATACAAACTTCTACAAG
AACCAAGAGATTACTTTCTTGATGCCTAGCGACGACCATCTTTCTCAAGCGGACATGAGC
CAAGAGAGTCTCGAGACATTTATACTAAGACATACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCAAC
CACATGCTTCGCTTCCCAAACAAAACTCTTGTTCCTTGAAGCATCCCTGATAAAATGTTC
ATCATCACAAAATCTGGTAGGTCGGGGGGACTGTATGTGAACAATGCGAGGATCGTTTCT
CCTAATATTTGTCGGAACTCTCGCGTAGCTTGCCATGGAGTCAGCAACGTTATTACATTC
AGCGAAGACTCCTTTTCAAAGGCAATGTTATCATCAGTTCGTGAAAGAATCACATCGTCC
AGGCACTGAAGCTCTCTATGTCTTTACCAATCTACCACACAAATTTGAAAGGTGTGGGGG
TATTATCTTCTAAAGTCATAAAAAAGGTTGTAGATTTTTCTCAAAGTCATGTTGTTTGCA
AATTTATATTTCC


BQ
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AF RR4FT77TF U 1
AF RR4FT77JQ C 109
BS 1 685 RR4FT77TF
BS 686 733 RR4FT77JQ

RD RR4FT77TF 685 0 0
GGATGAATGATGATTCTAATATCAGCTAATACGAGATCTCTTTGCCTAATTATAGCTCCC
TTTCTTTTCCTTTTTCTTACGGTTCTCGCCTCCACCGAGCCACCTCCGACTCCCGTATTG
AGACATGACAACCAAAGCAGCGACCTAGTCTCTGCCATAGCCGACATGGTTAGGGAATCT
TATAACGGTTTTGGCACCCTACTCCTTCTCCATGCCCTCAACGATACAAACTTCTACAAG
AACCAAGAGATTACTTTCTTGATGCCTAGCGACGACCATCTTTCTCAAGCGGACATGAGC
CAAGAGAGTCTCGAGACATTTATACTAAGACATACGATCCCTGCGTGGCTTATGATCAAC
CACATGCTTCGCTTCCCAAACAAAACTCTTGTTCCTTGAAGCATCCCTGATAAAATGTTC
ATCATCACAAAATCTGGTAGGTCGGGGGGACTGTATGTGAACAATGCGAGGATCGTTTCT
CCTAATATTTGTCGGAACTCTCGCGTAGCTTGCCATGGAGTCAGCAACGTTATTACATTC
AGCGAAGACTCCTTTTCAAAGGCAATGTTATCATCAGTTCGTGAAAGAATCACATCGTCC
AGGCACTGAAGCTCTCTATGTCTTTACCAATCTACCACACAAATTTGAAAGGTGTGGGGG
TATTATCTTCTAAAGTCATAAAAAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR4FT77JQ 625 0 0
ACTCCCGTATTGAGACATGACAACCAAAGCAGCGACCTAGTCTCTGCCATAGCCGACATG
GTTAGGGAATCTTATAACGGTTTTGGCACCCTACTCCTTCTCCATGCCCTCAACGATACA
AACTTCTACAAGAACCAAGAGATTACTTTCTTGATGCCTAGCGACGACCATCTTTCTCAA
GCGGACATGAGCCAAGAGAGTCTCGAGACATTTATATTAAGACATACGATCCCTGCGTGG
CTTATGATCAACCACATGCTTCGCTTCCCAAACAAAACTCTTGTTCCTTGAAGCATCCCT
GATAAAATGTTCATCATCACAAAATCTGGTAGGTCGGGGGGACTGTATGTGAACAATGCG
AGGATCGTTTCTCCTAATATTTGTCGGAACTCTCGCGTAGCTTGCCATGGAGTCAGCAAC
GTTATTACATTCAGCGAAGACTCCTTTTCAAAGGCAATGTTATCATCAGTTCGTGAAAGA
ATCACATCGTCCAGGCACTGAAGCTCTCTATGTCTTTACCAATCTACCACACAAATTTGA
AAGGTGTGGGGGTATTATCTTCTAAAGTCATAAAAAAGGTTGTAGATTTTTCTCAAAGTC
ATGTTGTTTGCAAATTTATATTTCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL9338Contig1 771 2 2 U
GCCCAAAAGAATTTCCCCATCGACTGGCTGCAGCCAGACGCATAAAGGACACCCATATTA
GAAGACAATTAATTTGGCAAGAAAAACAGGCATTACATCATCTTCAAGTTAAAAAAGCTA
CACATTATGTCCAGCGTAAAGCACCGTAGCAACATGTGACGGAGACTAAGGCACCAAAAA
ACTTTAGGGAGGAGAACTATGTATTTTTTCAGGCAGCAATTCCGGAACAACTACGTTTTC
CATGATGATATAGAATAATTTTTAAATGTTAGAAAAAAACATCCTTTCTTCAATTTCCTT
TTTTTTTGAAATGCTTAGATTAAGTCTATGCAATTACTAGATCTGATTCCAACACTCCAA
CAAGTATAGAAGTTCCTTAACACTGCCAAAGCTACCTATGAAGTGAAACGATATAAACCA
TTTGTAAGGGACGCACGTGCTTACGATATAAGATTTTCAGACAAATTATGGATGTTCTTC
TAAATCATCTTCTCCTTAACACAACAAAATGATGAACCACCTCATAATATTTTCCCCCAA
TGGGATTTCTTCCATCATGTGAAATGTGCTTCTAAACCCTACTACTACCCCATCCATATA
CAAGTTTGAAAGTACATTAAAGGACAAAACAAATCGAAGTGACAAAACACCTATGTTACC
TATTTTTGTTCAAGCATGTAAAAGATAATGAGACTTTCTATGCTCTATGTTGAATTCAAC
AGGCTAGGTTAGGCAGTCTCATGCAGTTAAGCAAATAGATAGACAAGCAAC


BQ
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BQ
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TCATTCAGAGGATTCAAAGAGCTCTTGTGGAGCTGCGGGACTTGAGGAACCAGTTTAATG
CTATTCTTAGGGAAATGGAGCTCGAAGTGGTAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGAGG
AAGCGGAATCATCAGTGGAGGATCCAGAAGACGACGACTCTGACTGATTCTTAGTTAATT
AGGATGTTTTATGTTTCAATCTCTGTCCTGATATGATTCTTTTGTTCTAGACTCTACTCT
AGTGTGTGTGTTAGCTTTGTCTCTTTTTAAGTCTAGATCATCAAAACTAGTAGCCTTGTT
CCTCTCTTGTTTTTAAACTGAGAATCTTGGTCC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4AL68TF 573 0 0
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CACTCGCGACTCCTCTTTGTCCATCTCCACCGCTCAAAACCTCCCGCTAATCGCTAATCA
CACCGTCTCCGATGGAAGACATTGATGCTGTCCAAAAACCAGTTGTTGTTGACCCTCCTT
TATATAACGAAGCTCCTCCTCCGGTGGTCGCCGGCGTAGCTCAGCCGGCGGAGTTTCATC
TCATTCAGAGGATTCAAAGAGCTCTTGTGGAGCTGCGGGACTTGAGGAACCAGTTTAATG
CTATTCTTAGGGAAATGGAGCTCGAAGTGGTAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGAGG
AAGCGGAATCATCAGTGGAGGATCCAGAAGACGACGACTCTGACTGATTCTTAGTTAATT
AGGATGTTTTATGTTTCAATCTCTGTCCTGATATGATTCTTTTGTTCTAGACTCTACTCT
AGTGTGTGTGTTAGCTTTGTCTCTTTTTAAGTCTAGATCATCAAAACTAGTAGCCTTGTT
CCTCTCTTGTTTTTAAACTGAGAATCTTGGTCC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL9341Contig1 934 2 8 U
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TTAGAAGCAAGCAGCAGCTTCGGAAGCAGCGGCCGTAGAAACTTCCCGGCGAAGTTCGAA
GCTGTTAATAACGGGAAGTACCACCAGCGAAGGCAATCTAAGCGGATAAGGTTACCAGCA
GAGTTGCCTCTAGAACCGCTAATGAATAATGTTCAGACGAGAGCAGCTATTATGGAGACA
TCAACCAGCTCAGGGCTAGGTCCTCTTCAGCTGGAAGCAAGAAGCGCGTTTCAGACTAGC
CGTGCAATGTCGGGATCAGGTGGTGGTGTTATGGTGACGTCTTCGCCAGAGAGCAGCTTA
GACTCACATGACATTCAGCCTTTTAGAGTTTCCTCTGAAGCAGAGGACTCAGCGCAGCTT
AATGGGTTTTCTTCAGCTGTTGGTCTGATGAGTCAACAGAGAGGACAGCAACAGCAGTCA
ATGATGATGAATATGATGCCATTGTCAAGGTCAACGAGTGATGGCTACGATGCCTCTGGT
GGAGAAGACAGTGATCAGGTTCCTTCTAGAAACATTCACAAATCAAGATGAGAAGTGTAA
TAAGTTTTGAGCTTTTTAAGAGTGGCATTCTTTGATATATGCTTGTGGTCACATTCAAGA
AAAGTCAACATTCTTAGAGAAATGTTTAAAGGGGCTCTCTTACAGTGTCTGGCAAGAGCT
CTTAGAAGAAGGTATCAGAAAGAGTTGTGGATTCTGAAGATTTTTTATTTTTATTTTAAG
GTAATGAGAACAGTTTGAACGTAATCTTTTTAGGGTTTGACCAGAAGTTTCATTTCTTGT
TTTGTAAGGAAAAAATCTTGTTTTTTTTATTTTCATGAAAAGAATGTCAAGTTGCACAAT
TCATATGTTGTTAATCTCAAATTCCTGCAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4FP49TF U 1
AF RR4FP49JQ C 175
BS 1 693 RR4FP49TF
BS 694 694 RR4FP49JQ
BS 695 714 RR4FP49TF
BS 715 715 RR4FP49JQ
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BS 733 761 RR4FP49TF
BS 762 934 RR4FP49JQ

RD RR4FP49TF 761 0 0
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TTAGAAGCAAGCAGCAGCTTCGGAAGCAGCGGCCGTAGAAACTTCCCGGCGAAGTTCGAA
GCTGTTAATAACGGGAAGTACCACCAGCGAAGGCAATCTAAGCGGATAAGGTTACCAGCA
GAGTTGCCTCTAGAACCGCTAATGAATAATGTTCAGACGAGAGCAGCTATTATGGAGACA
TCAACCAGCTCAGGGCTAGGTCCTCTTCAGCTGGAAGCAAGAAGCGCGTTTCAGACTAGC
CGTGCAATGTCGGGATCAGGTGGTGGTGTTATGGTGACGTCTTCGCCAGAGAGCAGCTTA
GACTCACATGACATTCAGCCTTTTAGAGTTTCCTCTGAAGCAGAGGACTCAGCGCAGCTT
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ATGATGATGAATATGATGCCATTGTCAAGGTCAACGAGTGATGGCTACGATGCCTCTGGT
GGAGAAGACAGTGATCAGGTTCCTTCTAGAAACATTCACAAATCAAGATGAGAAGTGTAA
TAAGTTTTGAGCTTTTTAAGAGTGGCATTCTTTGATATATGCTTGTGGTCACATTCAAGA
AAAGTCAACATTCTTAGAGAAATGTTTAAAGGG*CTCTCTTACAGTGTCTGGCA*GAGCT
CTTAGAAGAAG*TATCAGAAAGAGTTGTGGATTCTGAAGAT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR4FP49JQ 760 0 0
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CAGCTTAATGGGTTTTCTTCAGCTGTTGGTCTGATGAGTCAACAGAGAGGACAGCAACAG
CAGTCAATGATGATGAATATGATGCCATTGTCAAGGTCAACGAGTGATGGCTACGATGCC
TCTGGTGGAGAAGACAGTGATCAGGTTCCTTCTAGAAACATTCACAAATCAAGATGAGAA
GTGTAATAAGTTTTGAGCTTTTTAAGAGTGGCATTCTTTGATATATGCTTGTGGTCACAT
TCAAGAAAAGTCAACATTCTTAGAGAAATGTTTAAAGGGGCTCTCTTACAGTGTCTGGCA
AGAGCTCTTAGAAGAAGGTATCAGAAAGAGTTGTGGATTCTGAAGATTTTTTATTTTTAT
TTTAAGGTAATGAGAACAGTTTGAACGTAATCTTTTTAGGGTTTGACCAGAAGTTTCATT
TCTTGTTTTGTAAGGAAAAAATCTTGTTTTTTTTATTTTCATGAAAAGAATGTCAAGTTG
CACAATTCATATGTTGTTAATCTCAAATTCCTGCAAACCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL9342Contig1 893 2 4 U
GGGACCGCTGGGATGCTTCTTGTGATAGTATGGGATCCCCAAATCAGCATTCTTTCTACC
TCTGCTTTACAACGGATCATTATGATTGCTGAATCAGTGTGTGCTGGCTTCTTCATGAGT
TTATATATAGGTTATGTGCATCAATACAATTCCGTTAATTCCAGGCCAGATGTCTTGAAG
TCGTTATACTCTCCTCTTCAACCGTCAAGTTCTATGGACGGCTTGAGGTATTATGAAGGC
CGACTTTCTGATCAACAAACGGCTTTGTTACAACATCAGCGAGAAAACCTCCATTTTCTA
AGCGAGGAGATTCTGTCTTTGCAAGAGAAACTAAGCAAATATGAACAATCTGATGATGGA
AGAACCCCTCAGGTTGATCTGGCACATCTTTTAGCTTCTCGAGATCAGGAGTTGAGGACC
CTTTCAGCTGAGATGAATCAACTTCAGTCTGAGCTACGGCTTGCTCGTTCTTTGATAGCA
GAGAGAGATGCAGAGGCGCAGCGTGTCAACAATACCAACAGTCAGTATATTGAAGAAAAC
GAAAGGCTGAGGGCGATACTGAGTGAATGGAGCATGCGAGCAGCAAATCTTGAGAGAGCT
TTGGAAGTGGAGCGTATGTCTAACTCGGAACTACAGAAAGAAGTGGCAGCTAGGCGTAGA
AAGCAGATGGTAGAGGCATCTGAGCAATCTCCATTGTAAAAATGACAAACAAAGCTTAGG
TTCTATCAAGGTTGGTTTTGTAACTAGAGATGATGGAATCTCAGAAGTTGGTGCTTTTTT
CATGGAATCAAAGCTGCTTGGTTTTTTTTTTCTCCTATAAATGCTCTCTATCATTTACTT
CCTTGTAAATTACGACAGCTTTTTGTTTGCGGTTGAAATGAAGCTATTTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DH73TF U 1
AF RR4DH73JQ C 64
BS 1 719 RR4DH73TF
BS 720 720 RR4DH73JQ
BS 721 755 RR4DH73TF
BS 756 893 RR4DH73JQ

RD RR4DH73TF 755 0 0
GGGACCGCTGGGATGCTTCTTGTGATAGTATGGGATCCCCAAATCAGCATTCTTTCTACC
TCTGCTTTACAACGGATCATTATGATTGCTGAATCAGTGTGTGCTGGCTTCTTCATGAGT
TTATATATAGGTTATGTGCATCAATACAATTCCGTTAATTCCAGGCCAGATGTCTTGAAG
TCGTTATACTCTCCTCTTCAACCGTCAAGTTCTATGGACGGCTTGAGGTATTATGAAGGC
CGACTTTCTGATCAACAAACGGCTTTGTTACAACATCAGCGAGAAAACCTCCATTTTCTA
AGCGAGGAGATTCTGTCTTTGCAAGAGAAACTAAGCAAATATGAACAATCTGATGATGGA
AGAACCCCTCAGGTTGATCTGGCACATCTTTTAGCTTCTCGAGATCAGGAGTTGAGGACC
CTTTCAGCTGAGATGAATCAACTTCAGTCTGAGCTACGGCTTGCTCGTTCTTTGATAGCA
GAGAGAGATGCAGAGGCGCAGCGTGTCAACAATACCAACAGTCAGTATATTGAAGAAAAC
GAAAGGCTGAGGGCGATACTGAGTGAATGGAGCATGCGAGCAGCAAATCTTGAGAGAGCT
TTGGAAGTGGAGCGTATGTCTAACTCGGAACTACAGAAAGAAGTGGCAGCTAGGCGTAGA
AAGCAGATGGTAGAGGCATCTGAGCAATCTCCATTGTAAAAATGACAAACAAAGCTTAG*
TTCTATCAAGGTTGGTTTTGTAACTAGAGATGATG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR4DH73JQ 830 0 0
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TATATAGGTTATGTGCATCAATACAATTCCGTTAATTCCAGGCCAGATGTCTTGAAGTCG
TTATACTCTCCTCTTCAACCGTCAAGTTCTATGGACGGCTTGAGGTATTATGAAGGCCGA
CTTTCTGATCAACAAACGGCTTTGTTACAACATCAGCGAGAAAACCTCCATTTTCTAAGC
GAGGAGATTCTGTCTTTGCAAGAGAAACTAAGCAAATATGAACAATCTGATGATGGAAGA
ACCCCTCAGGTTGATCTGGCACATCTTTTAGCTTCTCGAGATCAGGAGTTGAGGACCCTT
TCAGCTGAGATGAATCAACTTCAGTCTGAGCTACGGCTTGCTCGTTCTTTGATAGCAGAG
AGAGATGCAGAGGCGCAGCGTGTCAACAATACCAACAGTCAGTATATTGAAGAAAACGAA
AGGCTGAGGGCGATACTGAGTGAATGGAGCATGCGAGCAGCAAATCTTGAGAGAGCTTTG
GAAGTGGAGCGTATGTCTAACTCGGAACTACAGAAGGAAGTGGCAGCTAGGCGTAGAAAG
CAGATGGTAGAGGCATCTGAGCAATCTCCATTGTAAAAATGACAAACAAAGCTTAGGTTC
TATCAAGGTTGGTTTTGTAACTAGAGATGATGGAATCTCAGAAGTTGGTGCTTTTTTCAT
GGAATCAAAGCTGCTTGGTTTTTTTTTTCTCCTATAAATGCTCTCTATCATTTACTTCCT
TGTAAATTACGACAGCTTTTTGTTTGCGGTTGAAATGAAGCTATTTGTAC

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL9343Contig1 655 2 4 U
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GTCTCTCCTCTGAAACGAAGAATGGCTATGTATCTTCTCTACGAGTCATCTTCTGGCTAT
GGCCTCTTCGAGGCGCACGGTCTTGATGAGATCGGACAAAACACAGAGGCCGTACGGAGC
TCAGTCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGCTGACCGCTTTTCATCCCTTC
GAGTCTGCCCTCGATGCCCTCAACCAAGTTAACGCGGTCTCTGAAGGGGTTATGACTGAC
GAGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTCAAAGAAGGCAAGAAGCCCAAG
TTCAGCTTAGGAACCTCCGAGCCTAAACTCGGTTCCCATACCTTGGAGGCCACTAAAATC
CCCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTCGAGCTTCTCCGTGGTGTTCGCCTTCATTTTGAC
AGGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAATCTCAACTTGGGTTAGCTCAC
AGCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGTGTGGACAACATGGTTATTCAA
GCCATTTTCCTCCTTGACACTCTTGATAAGATATCAACTCCTTTGCCATGAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DU21TF U 1
AF RR4GQ41TF U 41
BS 1 446 RR4DU21TF
BS 447 447 RR4GQ41TF
BS 448 625 RR4DU21TF
BS 626 655 RR4GQ41TF

RD RR4DU21TF 625 0 0
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GTCTCTCCTCTGAAACGAAGAATGGCTATGTATCTTCTCTACGAGTCATCTTCTGGCTAT
GGCCTCTTCGAGGCGCACGGTCTTGATGAGATCGGACAAAACACAGAGGCCGTACGGAGC
TCAGTCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGCTGACCGCTTTTCATCCCTTC
GAGTCTGCCCTCGATGCCCTCAACCAAGTTAACGCGGTCTCTGAAGGGGTTATGACTGAC
GAGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTCAAAGAAGGCAAGAAGCCCAAG
TTCAGCTTAGGAACCTCCGAGCCTAAACTCGGTTCCCATACCTTGGAGGCCACTAAAATC
CCCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTTGAGCTTCTCCGTGGTGTTCGCCTTCATTTTGAC
AGGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAATCTCAACTTGGGTTAGCTCAC
AGCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGTGTGGACAACATGGTTATTCAA
GCCATTTTCCTCCTTGACACTCTTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR4GQ41TF 615 0 0
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ACGAGTCATCTTCTGGCTATGGCCTCTTCGAGGCGCACGGTCTTGATGAGATCGGACAGA
ACACAGAGGCCGTACGGAGCTCAGTCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGC
TGACCGCTTTTCATCCCTTCGAGTCTGCCCTCGATGCCCTCAACCAAGTTAACGCGGTCT
CTGAAGGGGTTATGACTGACGAGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTCA
AAGAAGGCAAGAAGCCCAAGTTCAGCTTAGGAACCTCCGAGCCTAAACTCGGTTCCCATA
TCTTGGAGGCCACTAAAATCCCCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTCGAGCTTCTCCGTG
GTGTTCGCCTTCATTTTGACAGGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAAT
CTCAACTTGGGTTAGCTCACAGCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGTG
TGGACAACATGGTTATTCAAGCCATTTTCCTCCTTGACACTCTTGATAAGATATCAACTC
CTTTGCCATGAGAGT

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL9344Contig1 614 2 2 U
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AGCTTCATTGTTCAACAATGGCGACAAAGATCTGTGGTGGTGGCGTCCCTCTTGTGTGCA
GGTCGTTTCCTTGTCGGCTCGTGGAATGGTCTGTTCTCAGATCTTGTCCCGACCTTCCTT
CCCAACCTCCGGTTACAGCCCTCCAGCTGGAAGGAAAACTCATTGACATATCTTGTCTGT
TGAATCTGATCTTGACGGGTATTGGTCTCCCAATTGTCTCCTGTTTGGAGTTGGTTCTCT
TCCCAATATTTCTTCTTGTATGGAGTGAAATGGAAGATAAAGCGTTGCTGGTACTCAAAG
GATCTTCCTCCCAGCTAATGCTTCCCTCTGTTGTTGATGCAGTGTTTGTGACCATTTGGG
TTACACTTGGTACGATTATTAAAGAAGCTTATGAAATTGTTGTCATGCGATTTTTATGGT
TTCTTTTTGTGATTTGTATCAATTTTATCTTTTGTGTTATCAGTTTATCACTTTGGTTGG
TTCCTTGTAGCCTTGTTGTATCCTCCTCTAATGGAGTTTAAACTCTTTTAAGATAAATGC
AGGTCTGGTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4G531TF U 1
AF RR4G531JQ C 26
BS 1 598 RR4G531TF
BS 599 614 RR4G531JQ

RD RR4G531TF 598 0 0
GCATCCGCGTCACCTCCGCTAAGCCTTCTCTTCAAGCTCTTACCCACACCCTTGATTTAA
AGCTTCATTGTTCAACAATGGCGACAAAGATCTGTGGTGGTGGCGTCCCTCTTGTGTGCA
GGTCGTTTCCTTGTCGGCTCGTGGAATGGTCTGTTCTCAGATCTTGTCCCGACCTTCCTT
CCCAACCTCCGGTTACAGCCCTCCAGCTGGAAGGAAAACTCATTGACATATCTTGTCTGT
TGAATCTGATCTTGACGGGTATTGGTCTCCCAATTGTCTCCTGTTTGGAGTTGGTTCTCT
TCCCAATATTTCTTCTTGTATGGAGTGAAATGGAAGATAAAGCGTTGCTGGTACTCAAAG
GATCTTCCTCCCAGCTAATGCTTCCCTCTGTTGTTGATGCAGTGTTTGTGACCATTTGGG
TTACACTTGGTACGATTATTAAAGAAGCTTATGAAATTGTTGTCATGCGATTTTTATGGT
TTCTTTTTGTGATTTGTATCAATTTTATCTTTTGTGTTATCAGTTTATCACTTTGGTTGG
TTCCTTGTAGCCTTGTTGTATCCTCCTCTAATGGAGTTTAAACTCTTTTAAGATAAAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR4G531JQ 589 0 0
TTCTCTTCAAGCTCTTACCCACACCCTTGATTTAAAGCTTCATTGTTCAACAATGGCGAC
AAAGATCTGTGGTGGTGGCGTCCCTCTTGTGTGCAGGTCGTTTCCTTGTCGGCTCGTGGA
ATGGTCTGTTCTCAGATCTTGTCCCGACCTTCCTTCCCAACCTCCGGTTACAGCCCTCCA
GCTGGAAGGAAAACTCATTGACATATCTTGTCTGTTGAATCTGATCTTGACGGGTATTGG
TCTCCCAATTGTCTCCTGTTTGGAGTTGGTTCTCTTCCCAATATTTCTTCTTGTATGGAG
TGAAATGGAAGATAAAGCGTTGCTGGTACTCAAAGGATCTTCCTCCCAGCTAATGCTTCC
CTCTGTTGTTGATGCAGTGTTTGTGACCATTTGGGTTACACTTGGTACGATTATTAAAGA
AGCTTATGAAATTGTTGTCATGCGATTTTTATGGTTTCTTTTTGTGATTTGTATCAATTT
TATCTTTTGTGTTATCAGTTTATCACTTTGGTTGGTTCCTTGTAGCCTTGTTGTATCCTC
CTCTAATGGAGTTTAAACTCTTTTAAGATAAATGCAGGTCTGGTTTGAC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL9345Contig1 382 2 2 U
CTGAAAGTAGTATCTCCTCTAACCATAATACATCTCAGACAACTGTATTTAATTTACAAG
TCGGCTAACACATCGCCAATCAAGTTTGTAGAAGAAAGAAACCATAAATATAGTTAAGCA
GAAAAGAAGCCGTTAGAGACGGCAAGAGCAAACTGAGACTTGGCTTCAAACTTCCTCTTT
AAACTACTCTCAATCTTCTTTTCCTCACTACCAAACATCTTCATCCTCGCCGGAAAATAA
TTCCATCCCCCGACCTCCGCCGAGTTTGACCCTTTCTCCGACTTTAGCTTCCCCATCCGC
TCGTATTCCTCCCCCACTAGCAGTGCTATGTCAGCCATTTTTTTCAATCTCTCTATTGGT
TATCTTCCAATCTTTATGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4EZ45TF C 1
AF RR4EZ45JQ U 160
BS 1 159 RR4EZ45TF
BS 160 382 RR4EZ45JQ

RD RR4EZ45TF 288 0 0
CTGAAAGTAGTATCTCCTCTAACCATAATACATCTCAGACAACTGTATTTAATTTACAAG
TCGGCTAACACATCGCCAATCAAGTTTGTAGAAGAAAGAAACCATAAATATAGTTAAGCA
GAAAAGAAGCCGTTAGAGACGGCAAGAGCAAACTGAGACTTGGCTTCAAACTTCCTCTTT
AGACTACTCTCAATCTTCTTTTCCTCACTACCAAACATCTTCATCCTCGCCGGAAAATAA
TTCCATCCCCCGACCTCCGCCGAGTTTGACGCTTTCTCCGACTTTAGC

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR4EZ45JQ 223 0 0
TTGGCTTCAAACTTCCTCTTTAAACTACTCTCAATCTTCTTTTCCTCACTACCAAACATC
TTCATCCTCGCCGGAAAATAATTCCATCCCCCGACCTCCGCCGAGTTTGACCCTTTCTCC
GACTTTAGCTTCCCCATCCGCTCGTATTCCTCCCCCACTAGCAGTGCTATGTCAGCCATT
TTTTTCAATCTCTCTATTGGTTATCTTCCAATCTTTATGACCC

QA 1 223 1 223
DS 



AS 1 2

CO CL9346Contig1 1054 2 6 U
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ACATGGGCGTTCTTCTTAGCAAGAATTATTGCAGTAGGATAATGGCTAGGAGGATTTGAA
AGGCATTATGACATTAAGATTTCCAAGGTTTAGCCAAGGCTTAGCTCAGGACCCCACTAC
TCGTCGTATTTGGTTTGGTATTGCTACCGCACATGACTTCGAGAGTCATGATGATATTAC
TGAAGAACGTCTTTATCAGAATATTTTTGCTTCTCATTTCGGGCAATTAGCAATAATTTT
TCTGTGGACTTCCGGAAATTTGTTTCATGTAGCTTGGCAAGGAAATTTTGAGACATGGAT
ACAAGACCCTTTACATGTAAGACCGATTGCTCATGCTATTTGGGATCCTCATTTTGGTCA
ACCGGCTGTGGAAGCATTTACTCGAGGAGGTGCTCTTGGCCCGGTGAATATAGCTTATTC
TGGTGTTTATCAGTGGTGGTATACAATCGGTTTACGTACTAATGAAGATCTTTATACTGG
AGCTCTTTTTCTATTATTTCTTTCTGCCCTATCCTTAATAGGGGGTTGGTTACACCTACA
ACCAAAATGGAAACCAAGAGTTTCATGGTTCAAAAATGCTGAATCTCGTCTGAATCATCA
TTTGTCAGGACTATTCGGGGTAAGCTCCTTGGCTTGGACAGGTCATTTAGTACATGTTGC
TATTCCTGCATCCAGGGGGGAATATGTTCGATGGAATAATTTCTTAAGTGTATTACCGCA
TCCCCAAGGGTTAGGCCCGCTTTTTACGGGTCAGTGGAGTATTAGCTATAACTGTTTTAC
CTTCACCACCACCGGACGCACCTACCTTGAAGACAGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTA
TATTATGTTTTATTTTCTTTATGAACTCGTGATCAAATACAGTACTATTGCGCAAAACTG
CAAGACCCAAAAGCAAAAAAATAGAAAAGAACAGAAGATGATAAAGTCTAATAAGCTTGG
GTTGTCTGTATTTCACCTTTTCTTTAGTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D618TF U 1
AF RR4BV59TF U 401
BS 1 668 RR4D618TF
BS 669 669 RR4BV59TF
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BS 681 694 RR4D618TF
BS 695 1054 RR4BV59TF

RD RR4D618TF 698 0 0
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TCGTCGTATTTGGTTTGGTATTGCTACCGCACATGACTTCGAGAGTCATGATGATATTAC
TGAAGAACGTCTTTATCAGAATATTTTTGCTTCTCATTTCGGGCAATTAGCAATAATTTT
TCTGTGGACTTCCGGAAATTTGTTTCATGTAGCTTGGCAAGGAAATTTTGAGACATGGAT
ACAAGACCCTTTACATGTAAGACCGATTGCTCATGCTATTTGGGATCCTCATTTTGGTCA
ACCGGCTGTGGAAGCATTTACTCGAGGAGGTGCTCTTGGCCCGGTGAATATAGCTTATTC
TGGTGTTTATCAGTGGTGGTATACAATCGGTTTACGTACTAATGAAGATCTTTATACTGG
AGCTCTTTTTCTATTATTTCTTTCTGCCCTATCCTTAATAGGGGGTTGGTTACACCTACA
ACCAAAATGGAAACCAAGAGTTTCATGGTTCAAAAATGCTGAATCTCGTCTGAATCATCA
TTTGTCAG*ACTATTCGGG*TAAGCTCCTTGGCT
GGAC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR4BV59TF 654 0 0
G
GGGATCCTCATTTTGGTCAACCGGCTGTGGAAGCATTTACTCGAGGAGGTGCTCTTGGCC
CGGTGAATATAGCTTATTCTGGTGTTTATCAGTGGTGGTATACAATCGGTTTACGTACTG
ATGAAGATCTTTATACTGGAGCTCTTTTTCTATTATTTCTTTCTGCCCTATCCTTAATAG
GGGGTTGGTTACACCTACAACCAAAATGGAAACCAAGAGTTTCATGGTTCAAAAATGCTG
AATCTCGTCTGAATCATCATTTGTCAGGACTATTCGGGGTAAGCTCCTTGGCTTGGACAG
GTCATTTAGTACATGTTGCTATTCCTGCATCCAGGGGGGAATATGTTCGATGGAATAATT
TCTTAAGTGTATTACCGCATCCCCAAGGGTTAGGCCCGCTTTTTACGGGTCAGTGGAGTA
TTAGCTATAACTGTTTTACCTTCACCACCACCGGACGCACCTACCTTGAAGACAGGAGCC
ATGGGATTCCATTAGTTTATATTATGTTTTATTTTCTTTATGAACTCGTGATCAAATACA
GTACTATTGCGCAAAACTGCAAGACCCAAAAGCAAAAAAATAGAAAAGAACAGAAGATGA
TAAAGTCTAATAAGCTTGGGTTGTCTGTATTTCACCTTTTCTTTAGTTTCTTG

QA 2 654 2 654
DS 



AS 1 2

CO CL9347Contig1 1036 2 2 U
GGAACAAATTCAGAATTAAAGAGACCGATCTTCTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCCCTCTTG
TCCCTATGGAAACCCAACTCTCAAACGCAGACACTGATTCCCTCCAGCAACTCTTAAATT
TGAGCCTCGGAGCTAAAGACAGCACCACCAAAATCGTCGTCAACGGATCACGATCCGCAA
ACTCCACCAATAATCCACAGTACCAGCCTTTGGACATCGAGTTCGTGGAGAAGATCTTGA
ACTACAAGTTCAAAGACAAGAGTTTGCTGCTGCAAGCGTTCACAGACGCTACTTTCGATG
AAAACTGTGTTTCGTATGAACGCCTTGAGTTCTTAGGAGACACAGTCTTAAATATGGTTA
TAACCAAATATTTATATAATCGCTACGGTGATTGTTCTCCAGGTTTGTTGACCAATCTCC
GAGCGGTCAACGTTGATACAGAGAAACTTGCTCGAGTCGCCGTAAAACACAACCTCCATC
GCTGTCTCCGTCATAAAAAAACCCTTGCTTGAGGACCAAATTTTGGAATTTACAAAAGCA
ATGGAAAAATATCCATTACATTCGCGTGGTCTATTGAAAGTCCCTAAATCTCTAGCAGAC
ATAGTAGAGTCTACCATTGGAGCTCTATACACCGACTGTGACTCCTTCGAGACCGTGTGG
AAGGTGGTAATGCCCTTGTTGGAGCCGATTATCTTTGGATAATCTGGAGAACCATCCAAT
GACAGAACTCCATGAAATGTGTCAGAAGAAGAACTTGAAATTGAGGTTCGACGACAGTAC
TTGGGAAGTTGACAAGAGGGTTCTTGTCTTTATTGAGGAACATCAGGTTGGACGTGGACA
TCATCTGGCCAAGAAAGACAGTGCTAAAAATTGCGCTGCAAAAGATGCTCTCGACAATTT
TTCCTATTTCTTTACAAAGATGTAATATCATATTGTAAATTTGTATGAATTCTCTTGTAA
AGATTGTATTGTTTCTTTCTATTTGAATCAACATGAATACAATTGAGCTACTAGCCCACC
ATGTCAAATTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4D833TF U 1
AF RR4D833JQ C 245
BS 1 661 RR4D833TF
BS 662 1036 RR4D833JQ

RD RR4D833TF 661 0 0
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TCCCTATGGAAACCCAACTCTCAAACGCAGACACTGATTCCCTCCAGCAACTCTTAAATT
TGAGCCTCGGAGCTAAAGACAGCACCACCAAAATCGTCGTCAACGGATCACGATCCGCAA
ACTCCACCAATAATCCACAGTACCAGCCTTTGGACATCGAGTTCGTGGAGAAGATCTTGA
ACTACAAGTTCAAAGACAAGAGTTTGCTGCTGCAAGCGTTCACAGACGCTACTTTCGATG
AAAACTGTGTTTCGTATGAACGCCTTGAGTTCTTAGGAGACACAGTCTTAAATATGGTTA
TAACCAAATATTTATATAATCGCTACGGTGATTGTTCTCCAGGTTTGTTGACCAATCTCC
GAGCGGTCAACGTTGATACAGAGAAACTTGCTCGAGTCGCCGTAAAACACAACCTCCATC
GCTGTCTCCGTCATAAAAAAACCCTTGCTTGAGGACCAAATTTTGGAATTTACAAAAGCA
ATGGAAAAATATCCATTACATTCGCGTGGTCTATTGAAAGTCCCTAAATCTCTAGCAGAC
ATAGTAGAGTCTACCATTGGAGCTCTATACACCGACTGTGACTCCTTCGAGACCGTGTGG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR4D833JQ 792 0 0
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CTGTGTTTCGTATGAACGCCTTGAGTTCTTAGGAGACACAGTCTTAAATATGGTTATAAC
CAAATATTTATATAATCGCTACGGTGATTGTTCTCCAGGTTTGTTGACCAATCTCCGAGC
GGTCAACGTTGATACAGAGAAACTTGCTCGAGTCGCCGTAAAACACAACCTCCATCGCTG
TCTCCGTCATAAAAAAACCCTTGCTTGAGGACCAAATTTTGGAATTTACAAAAGCAATGG
AAAAATATCCATTACATTCGCGTGGTCTATTGAAAGTCCCTAAATCTCTAGCAGACATAG
TAGAGTCTACCATTGGAGCTCTATACACCGACTGTGACTCCTTCGAGACCGTGTGGAAGG
TGGTAATGCCCTTGTTGGAGCCGATTATCTTTGGATAATCTGGAGAACCATCCAATGACA
GAACTCCATGAAATGTGTCAGAAGAAGAACTTGAAATTGAGGTTCGACGACAGTACTTGG
GAAGTTGACAAGAGGGTTCTTGTCTTTATTGAGGAACATCAGGTTGGACGTGGACATCAT
CTGGCCAAGAAAGACAGTGCTAAAAATTGCGCTGCAAAAGATGCTCTCGACAATTTTTCC
TATTTCTTTACAAAGATGTAATATCATATTGTAAATTTGTATGAATTCTCTTGTAAAGAT
TGTATTGTTTCTTTCTATTTGAATCAACATGAATACAATTGAGCTACTAGCCCACCATGT
CAAATTTTATAT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL9348Contig1 1216 2 2 U
GGAGACGATGTCTTATCGTCTCTAACAGTTCGTCTTCTTCAATTGAAAACCATCAAAACT
GAGTTTTGATCGAGCCACTTCTAAATCATCAATATTCTACTTTATTTCCATCAATCAATA
CCTTTTTAATGAATTCGTTTCATCTCCTTCTTTATATACCAATCTTCTTTCCTTTCTACA
AACCAAAACCTTAGAACCGCTCAAAGCTCAATCCATGGCGATGAAACCAAATGGGAAATC
CCCTGTCTCCTCCGCCTCTGATAAAAAAAGAATGAAGGCGATCGTCATCTTTAGCCAAGC
ACGTCAGAGGTTCTGTAACTCCGAGAAGAGTGTATGAAGATGAGGTTCTTATTATAGTTC
AAGGAACTATCCACCACTTGACTTTATCCTTCCCACTGGTTTCCACTCCAGTGCTCGAAT
CCACATCATGTCTATAACTCTCCTTAAAGTTGAAAACCAGTCATGGTGCAAGCAAAATCT
GGTACAGGTTCTGCAACACGATACACTAAGAGCAAATATAAGAAACATGTAGACATTAAG
AGATGGATAAATGGAGGTTCACATATAAGTGAAGCTCACAAAAGAGAGATTCTCAAATGT
TGTTAAGTTCTTGCCTGAAATCAACGCTCCAATGATTTATCGGATCGACCTTCCTGCTTA
TGCAGAGTTCTGTGGGATTGAGGTTGATTACAACCATGACATATCAAGACATCACAGGCT
TCACGTTGGTGAAGGAGTTCAGATAGGTTCTTGAGCAGAACGGGACTGTTCGAGAAGTTA
GGCGCTAATTAACTGGGCTAGAGACAAAGCAATTGTGTATGTTGAGCTTAACTTTTCAAG
AACAAGAGCTTGCGGAGTTTGTATATTGATGGGAACCGGTTCTAGAGCATTGGTCAAGAG
GATTTTCTTTACCCGATTTGAAACCCGTCAGTGTAGACATACTTTTGTCATATGGCTTCT
ATATTTCTGGAAAGAGAACAAGAAGTTGCTCCCAGACATTATCATTGTAAGGAAGCAGAT
GTACAGAGAAAATTTAAGGAAGAACAAGCCAGGAAGAAGCTGTCTTGATAACTGTTGCAT
TACATGCTACTACAAGCAGATGAGAAAGTTATAGGTTTCAATCTGAACACAACATAGCTA
CCATTTCCCTGCAACATCTCACATACCTGTTTCAACATTTTTGTTTTTACTAATTTCAAA
TAAACTAAATTTCTAC


BQ
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AF RR4BZ22TF U 1
AF RR4BZ22JQ C 447
BS 1 536 RR4BZ22TF
BS 537 1216 RR4BZ22JQ

RD RR4BZ22TF 536 0 0
GGAGACGATGTCTTATCGTCTCTAACAGTTCGTCTTCTTCAATTGAAAACCATCAAAACT
GAGTTTTGATCGAGCCACTTCTAAATCATCAATATTCTACTTTATTTCCATCAATCAATA
CCTTTTTAATGAATTCGTTTCATCTCCTTCTTTATATACCAATCTTCTTTCCTTTCTACA
AACCAAAACCTTAGAACCGCTCAAAGCTCAATCCATGGCGATGAAACCAAATGGGAAATC
CCCTGTCTCCTCCGCCTCTGATAAAAAAAGAATGAAGGCGATCGTCATCTTTAGCCAAGC
ACGTCAGAGGTTCTGTAACTCCGAGAAGAGTGTATGAAGATGAGGTTCTTATTATAGTTC
AAGGAACTATCCACCACTTGACTTTATCCTTCCCACTGGTTTCCACTCCAGTGCTCGAAT
CCACATCATGTCTATAACTCTCCTTAAAGTTGAAAACCAGTCATGGTGCAAGCAAAATCT
GGTACAGGTTCTGCAACACGATACACTAAGAGCAAATATAAGAAACATGTAGACAT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR4BZ22JQ 770 0 0
AAGTTGAAAACCAGTCATGGTGCAAGCAAAATCTGGTACAGGTTCTGCAACACGATACAC
TAAGAGCAAATATAAGAAACATGTAGACATTAAGAGATGGATAAATGGAGGTTCACATAT
AAGTGAAGCTCACAAAAGAGAGATTCTCAAATGTTGTTAAGTTCTTGCCTGAAATCAACG
CTCCAATGATTTATCGGATCGACCTTCCTGCTTATGCAGAGTTCTGTGGGATTGAGGTTG
ATTACAACCATGACATATCAAGACATCACAGGCTTCACGTTGGTGAAGGAGTTCAGATAG
GTTCTTGAGCAGAACGGGACTGTTCGAGAAGTTAGGCGCTAATTAACTGGGCTAGAGACA
AAGCAATTGTGTATGTTGAGCTTAACTTTTCAAGAACAAGAGCTTGCGGAGTTTGTATAT
TGATGGGAACCGGTTCTAGAGCATTGGTCAAGAGGATTTTCTTTACCCGATTTGAAACCC
GTCAGTGTAGACATACTTTTGTCATATGGCTTCTATATTTCTGGAAAGAGAACAAGAAGT
TGCTCCCAGACATTATCATTGTAAGGAAGCAGATGTACAGAGAAAATTTAAGGAAGAACA
AGCCAGGAAGAAGCTGTCTTGATAACTGTTGCATTACATGCTACTACAAGCAGATGAGAA
AGTTATAGGTTTCAATCTGAACACAACATAGCTACCATTTCCCTGCAACATCTCACATAC
CTGTTTCAACATTTTTGTTTTTACTAATTTCAAATAAACTAAATTTCTAC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL9349Contig1 578 2 1 U
GGTCAGAGGAACCCGGTGGGTCAAGGGAACAGTTGAGGGAGCGAAAGAATGATAGACTTG
CACGGGTTACATGTTAGTGAAGCACTCGAGGTGTTGAAGCACGAACTGAGCGTGTTGAGG
AGCACAGCTCGAGCAACACAAGAGAGGCTTCAGGTTTACATATGCGTTGGGACTGGCCAC
CACACAAGAGGCTCCCGCACAATGGCTAGACTCCCAGTTGCTGTACAGCGCTACCTACTC
GAAGAAGAAGGCCTTGACTTCTCCGAGCCTCAGTCTGGTCTCCTTAGAGTCATCTTATAC
TGACCAGGTACTCTTATATAGGAACCCAGCGATACACAACCGGAAAGGAAAACCAAAAAA
AGAAAAAAAAACGACCACGCTATTCATTTTGTTGTATCTGTTCTGTACATGGGAAGGCTT
ATATGCTAAAATGTTTTAGGTTTGTTAAGAAGAAAATACTTTTTGTAGCATTAGAGGATC
AACCAGACCTCTTTATCTGTTTTTTTGTGGGGCTTTATCTGATGTTTTGTTGATTCTCTA
TGCTTTTACAGTTTTACTGTTATATACACTCCTCCTTC


BQ
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AF RR4FV77JQ C 1
AF RR4FV77TF U 1
BS 1 578 RR4FV77TF

RD RR4FV77JQ 578 0 0
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CACACAAGAGGCTCCCGCACAATGGCTAGACTCCCAGTTGCTGTACAGCGCTACCTACTC
GAAGAAGAAGGCCTTGACTTTTCCGAGCCTCAGTCTGGTCTCCTTAGAGTCATCTTATAC
TGACCAGGTACTCTTATATAGGAACCCAGCGATACACAACCGGAAAGGAAAACCAAAAAA
AGAAAAAAAAACGACCACGCTATTCATTTTGTTGTATCTGTTCTGTACATGGGAAGGCTT
ATATGCTAAAATGTTTTAGGTTTGTTAAGAAGAAAATACTTTTTGTAGCATTAGAGGATC
AACCAGACCTCTTTATCTGTTTTTTTGTGGGGCTTTATCTGATGTTTTGTTGATTCTCTA
TGCTTTTACAGTTTTACTGTTATATACACTCCTCCTTC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR4FV77TF 578 0 0
GGTCAGAGGAACCCGGTGGGTCAAGGGAACAGTTGAGGGAGCGAAAGAATGATAGACTTG
CACGGGTTACATGTTAGTGAAGCACTCGAGGTGTTGAAGCACGAACTGAGCGTGTTGAGG
AGCACAGCTCGAGCAACACAAGAGAGGCTTCAGGTTTACATATGCGTTGGGACTGGCCAC
CACACAAGAGGCTCCCGCACAATGGCTAGACTCCCAGTTGCTGTACAGCGCTACCTACTC
GAAGAAGAAGGCCTTGACTTCTCCGAGCCTCAGTCTGGTCTCCTTAGAGTCATCTTATAC
TGACCAGGTACTCTTATATAGGAACCCAGCGATACACAACCGGAAAGGAAAACCAAAAAA
AGAAAAAAAAACGACCACGCTATTCATTTTGTTGTATCTGTTCTGTACATGGGAAGGCTT
ATATGCTAAAATGTTTTAGGTTTGTTAAGAAGAAAATACTTTTTGTAGCATTAGAGGATC
AACCAGACCTCTTTATCTGTTTTTTTGTGGGGCTTTATCTGATGTTTTGTTGATTCTCTA
TGCTTTTACAGTTTTACTGTTATATACACTCCTCCTTC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL9350Contig1 924 2 4 U
GGGAGGCAGCAGCAGCAGCAGCACTAGTACTCGTTTTCACTTTGGGGAGAAATATGATGA
AGCAAGCTCGCACTCTGCTCTCCGGGAGCCTTTTGAACCAAAGCAGCTCACTTTTCGAAG
GAATCTCTAAGTCTTCCGCTTCGCGTGGTCTCTCAACCTGGACTGATTCCTCCTCCTCTA
CCACTAAACGTGGTGATACTGCTAAGCCTAGTTGTCGTGTGTTCGCACCATACGCTATCT
TCAAAGGAAGAGCTGCTCTCTCTGTTGAACCTGTCCTCCCCACTTTCACCAAAATCGATC
CTGGGAGTCTCAGGATAGACCGTCGTGGATCCGTGATGATGACTTTTATGCCTGCTGTTA
GCGAACGCAAGTACGACTGGGAGAAGAAACAGCTGTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTG
GATCCGTGATCAGCATGGGTCCTCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGA
AATCAAGTAATGCTGGTCAAGTCAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCACTCGCAGATTCTA
CCGGCTACTTCTTTCAATTGACCGTTGCCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTG
TGGTTCCTGTCTCCAAAGCTGAATTTGCAGTGCTGAAGAGTGCTTTCAGTTTTGCCCTTC
CACACATCCTGGGCTGGGATCAGATAACAGGAGGTGACGTTGGTATTGCTGCCCAGGGGT
TTGCTTCACTTCCAAAGGCTGATCCGATGCAGTTGGAGCTGGAGTGGGATAAAGAGTAAA
GACTGATTTGAGAGTAGCAATGTGGAGTAAATTGACAATGCATGTGTTCCTTGTTTTTCT
GGAGTTTGTTTGGCGTACACAAAACTTGGCATGATACTCTGTTCTTGAATCTTAACATGT
CCTCTCTAAGACTACTTCTAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CE71TF U 1
AF RR4CE71JQ C 215
BS 1 737 RR4CE71TF
BS 738 738 RR4CE71JQ
BS 739 748 RR4CE71TF
BS 749 924 RR4CE71JQ

RD RR4CE71TF 748 0 0
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AGCAAGCTCGCACTCTGCTCTCCGGGAGCCTTTTGAACCAAAGCAGCTCACTTTTCGAAG
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CCACTAAACGTGGTGATACTGCTAAGCCTAGTTGTCGTGTGTTCGCACCATACGCTATCT
TCAAAGGAAGAGCTGCTCTCTCTGTTGAACCTGTCCTCCCCACTTTCACCAAAATCGATC
CTGGGAGTCTCAGGATAGACCGTCGTGGATCCGTGATGATGACTTTTATGCCTGCTGTTA
GCGAACGCAAGTACGACTGGGAGAAGAAACAGCTGTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTG
GATCCGTGATCAGCATGGGTCCTCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGA
AATCAAGTAATGCTGGTCAAGTCAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCACTCGCAGATTCTA
CCGGCTACTTCTTTCAATTGACCGTTGCCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTG
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TTGCTTCACTTCCAAAG*CTGATCCGAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR4CE71JQ 710 0 0
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GTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTGGATCCGTGATCAGCATGGGTCCTCAGGACAGCTC
TGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAAGTAATGCTGGTCAAGTCAGGAAGTCACT
GTCCATTAAGCCACTCGCAGATTCTACCGGCTACTTCTTTCAATTGACCGTTGCCGATAA
CATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTCCTGTCTCCAAAGCTGAATTTGCAGTGCT
GAAGAGTGCTTTCAGTTTTGCCCTTCCACACATCCTGGGCTGGGATCAGATAACAGGAGG
TGACGTTGGTATTGCTGCCCAGGGGTTTGCTTCACTTCCAAAGGCTGATCCGATGCAGTT
GGAGCTGGAGTGGGATAAAGAGTAAAGACTGATTTGAGAGTAGCAATGTGGAGTAAATTG
ACAATGCATGTGTTCCTTGTTTTTCTGGAGTTTGTTTGGCGTACACAAAACTTGGCATGA
TACTCTGTTCTTGAATCTTAACATGTCCTCTCTAAGACTACTTCTAATTT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL9351Contig1 753 2 2 U
GGGAGTTATGGATTTTACAAACTGGAGGTTCTCCAGCCCATCCAGTCGCGAGTATCAGCC
TTTAGAAGATGATTTCAGCCAAACCATGAAGCGGCCCTTTCCAGAATCAATTATGGGTTT
CAAGAGGGAATTATTATCTATCCAGAGAGTCCATAATCAGGCGAATTGGTTCAGGGAATA
CCAAGATACAATCAATTTCCCAAAACCGATCAAACCGACATTATTTTGGGAAAGTTGCCA
ACCAATTCGATTTGGTCCAAACCAGACTTATCTATGGAAGCCAGGAGATCATCTTAACCA
TCCAGAAGTCATCCAAGACGTCCTCAGCTGCACCAGCACCCAGGAGATCAGGAGGATCTT
CATTTGCACAAACCTTCCATTTTTGGCAGCATGGACACTAAATGGTTTCAATGAGTTTCT
TCTTGAAATCCTTCAAGACCAACGGCCATATTCTACATTAAAGACATTCAGAGACATATC
AGGAAGACTTCAAGATCATGGCCACGTCCAGAAGCTGTCTAGGTACAAGATCATCCAAGT
TTCCCCATTGAAGACACAAATCAAGCTAAAGGCAAGATTCCATGGAGCCATCAAAGCCTT
TGCTTCCAAGATTTTTTATTTCAAGTTTATTTCTTTCCTTTAGTCATTTTTAGACTGTTA
GAGAGTCCCAAGGTCGAGCCTATATAAGCTCAGTAGTTGTCTTTGTAATAATCACCCTTG
AATTTTATGAATGAATATGCAGTTTTTCTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4H551TF U 1
AF RR4H551JQB C 82
BS 1 518 RR4H551TF
BS 519 753 RR4H551JQB

RD RR4H551TF 518 0 0
GGGAGTTATGGATTTTACAAACTGGAGGTTCTCCAGCCCATCCAGTCGCGAGTATCAGCC
TTTAGAAGATGATTTCAGCCAAACCATGAAGCGGCCCTTTCCAGAATCAATTATGGGTTT
CAAGAGGGAATTATTATCTATCCAGAGAGTCCATAATCAGGCGAATTGGTTCAGGGAATA
CCAAGATACAATCAATTTCCCAAAACCGATCAAACCGACATTATTTTGGGAAAGTTGCCA
ACCAATTCGATTTGGTCCAAACCAGACTTATCTATGGAAGCCAGGAGATCATCTTAACCA
TCCAGAAGTCATCCAAGACGTCCTCAGCTGCACCAGCACCCAGGAGATCAGGAGGATCTT
CATTTGCACAAACCTTCCATTTTTGGCAGCATGGACACTAAATGGTTTCAATGAGTTTCT
TCTTGAAATCCTTCAAGACCAACGGCCATATTCTACATTAAAGACATTCAGAGACATATC
AGGAAGACTTCAAGATCATGGCCACGTCCAGAAGCTGT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR4H551JQB 672 0 0
AACCATGAAGCGGCCCTTTCCAGAATCAATTATGGGTTTCAAGAGGGAATTATTATCTAT
CCAGAGAGTCCATAATCAGGCGAATTGGTTCAGGGAATACCAAGATACAATCAATTTCCC
AAAACCGATCAAACCGACATTATTTTGGGAAAGTTGCCAACCAATTCGATTTGGTCCAAA
CCAGACTTATCTATGGAAGCCAGGAGATCATCTTAACCATCCAGAAGTCATCCAAGACGT
CCTCAGCTGCACCAGCACCCAGGAGATCAGGAGGATCTTCATTTGCACAAACCTTCCATT
TTTGGCAGCATGGACACTAAATGGTTTCAATGAGTTTCTTCTTGAAATCCTTCAAGACCA
ACGGCCATATTCTACATTAAAGACATTCAGAGACATATCAGGAAGACTTCAAGATCATGG
CCACGTCCAGAAGCTGTCTAGGTACAAGATCATCCAAGTTTCCCCATTGAAGACACAAAT
CAAGCTAAAGGCAAGATTCCATGGAGCCATCAAAGCCTTTGCTTCCAAGATTTTTTATTT
CAAGTTTATTTCTTTCCTTTAGTCATTTTTAGACTGTTAGAGAGTCCCAAGGTCGAGCCT
ATATAAGCTCAGTAGTTGTCTTTGTAATAATCACCCTTGAATTTTATGAATGAATATGCA
GTTTTTCTAGCT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL9352Contig1 817 2 2 U
GGCCCCGAAAAAAAAAAAAAAACCCTAGTCTGGTTTGGTCTCAGGAAAGCTAGGCGACTT
CGAATGTCTTTTTCTCTCTTGTTTCAGATCTATTTCTCCTTCTCTCTGAAATCTTGCTAG
TCTCTTCACCATCGACCTTATCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATG
TTTATCTCTCCCACTGAAATCTCTGACCGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTC
CTGAAACAAGGATGAGAGAAACAAAGATGATAGAAGCAAATTACGTCATAGCGTTCTCAT
TCTCAGGGTTTACCCCCACCTCCACCTCTACCCCCTAACATCGTTCCACATTCTATGGCC
TCTAAAGATTTTCTTTTTGTGGATGGTGATACAGGTTTCAGGTTGAGTTCATAGTTAAAG
GAGGAACTATATAAACGGATGGCTACACTTCAAGATATTGTTGAATCAGTTAGAAGTTCT
TGGCTCATACAAAACGGGGCTTTATCTTCCAACAAGTGATATCGATCTTATATCACTGGT
CTTAACCAAGCTGGATCTGATGGTCTCAACGCTAAGTCCAAGGACGATGAAGACTGTGTA
TGAACAACCTTACTCTTTTACACTTCAATCGTGGAAGTCTGAGTATTGGAGGATGTGAGT
GCAATCTTTGGGTAACATGTAACAAATCAACTTAGTTTAGGTCAAGTGAGCTCAAGACTT
CTGTCCATTGTTGGTTTTAGATTTAGTTTTGTTTTATAGGTTTTGTTATTTTGTAAACAA
TTTTGATATATTAAATTTTAAAATATTTTTATTTTGC


BQ
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AF RR4FV95TF U 1
AF RR4FV95JQ C 76
BS 1 579 RR4FV95TF
BS 580 817 RR4FV95JQ

RD RR4FV95TF 579 0 0
GGCCCCGAAAAAAAAAAAAAAACCCTAGTCTGGTTTGGTCTCAGGAAAGCTAGGCGACTT
CGAATGTCTTTTTCTCTCTTGTTTCAGATCTATTTCTCCTTCTCTCTGAAATCTTGCTAG
TCTCTTCACCATCGACCTTATCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATG
TTTATCTCTCCCACTGAAATCTCTGACCGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTC
CTGAAACAAGGATGAGAGAAACAAAGATGATAGAAGCAAATTACGTCATAGCGTTCTCAT
TCTCAGGGTTTACCCCCACCTCCACCTCTACCCCCTAACATCGTTCCACATTCTATGGCC
TCTAAAGATTTTCTTTTTGTGGATGGTGATACAGGTTTCAGGTTGAGTTCATAGTTAAAG
GAGGAACTATATAAACGGATGGCTACACTTCAAGATATTGTTGAATCAGTTAGAAGTTCT
TGGCTCATACAAAACGGGGCTTTATCTTCCAACAAGTGATATCGATCTTATATCACTGGT
CTTAACCAAGCTGGATCTGATGGTCTCAACGCTAAGTCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR4FV95JQ 742 0 0
CTCTTGTTTCAGATCTATTTCTC*TTCTCTCTGAAATCTTGCTAGTCTCTTCACCATCGA
CCTTATCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATGTTTATCTCTCCCACT
GAAATCTCTGACCGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTCCTGAAACAAGGATGA
GAGAAACAAAGATGATAGAAGCAAATTACGTCATAGCGTTCTCATTCTCAGGGTTTACCC
CCACCTCCACCTCTACCCCCTAACATCGTTCCACATTCTATGGCCTCTAAAGATTTTCTT
TTTGTGGATGGTGATACAGGTTTCAGGTTGAGTTCATAGTTAAAGGAGGAACTATATAAA
CGGATGGCTACACTTCAAGATATTGTTGAATCAGTTAGAAGTTCTTGGCTCATACAAAAC
GGGGCTTTATCTTCCAACAAGTGATATCGATCTTATATCACTGGTCTTAACCAAGCTGGA
TCTGATGGTCTCAACGCTAAGTCCAAGGACGATGAAGACTGTGTATGAACAACCTTACTC
TTTTACACTTCAATCGTGGAAGTCTGAGTATTGGAGGATGTGAGTGCAATCTTTGGGTAA
CATGTAACAAATCAACTTAGTTTAGGTCAAGTGAGCTCAAGACTTCTGTCCATTGTTGGT
TTTAGATTTAGTTTTGTTTTATAGGTTTTGTTATTTTGTAAACAATTTTGATATATTAAA
TTTTAAAATATTTTTATTTTGC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL9353Contig1 1385 2 2 U
GGTGTTGGAGGCGGCTTGCGCGTTGTCTGGGTTTGGGTTCCCTTGGAACAGGCTCGGGAG
GTTGTATAGAGAGGAAAGGTCTGTTTTTTTGCGGAGTGGGGATGAGATTGGTTCGATGCT
GGTTAGGTTTAGTGGTGTTGGGTTTAGCACGGTGGCTGTGGCTGGGATTTGTTTAGCGTT
TCCGAGTGTTCTGTGTGGTGGTGGTGCGGAGGTTGGTTGTTTGTTTGTGATGCTGAAGAG
ACTGTTTGAAGAGTTTGGTGCGGAGGAGGATGTTGTTGTTGATGAGAATGTGGAGTCTTG
GTACGTGTTTGGTAGGAAAGTTAGGGTGTTTTACGATTTGGGGTTTGAGAGTGAGGAGAT
GTGGGAGTTGATGGGTAGAAACAGATTACTTTTTATGGAATGTTCTGAAGATGATCTGAT
GGGAAAGACTGAGTATTTTTCTAGATTTGGTGTTGGGAAAGAGGAAGCTGCTCTTTTGAT
TCTACGGAATCCGGAGGTTATGAGTTTCGATGTTGAGAAGCAGCCTGTGATGTCAGTTAA
GGGAATGCTTAATCATTTTGGGTTGAGTCAGGATGAAGTGGATGCTCTTTCTCTGAAACA
CCCTTACGTTTTTGGTAGGAACAGAATGAAGAATCTGCCTCATGTGGTTAGAGCGTTAGG
TTTACATGAAAGGATATTCGGAAGGTTGAAGAATGGGACTTATCATTTACTCAGTAGCTA
TTCGTTGTTGGATCCCGAAGAAGATATAGACAGCGAATATCAGCAAGGCCTGGAGGAGAT
TCAACATTTGAGGTGTAAAACACACAGTTTTCAAAAACTTGATTTCCTTCATCAAATAGG
TTTTGGCGAAAACGGTTTGACCATGAAGATACTACAGCACGTCCATGGCACCGCCGTGGA
AATACAGGAAAGATTCCAAATCCTACTAGGCAACGGCATTGATTTCTCGAAGGCGTGCAT
GTTGATAAGGTCATCACCGAAGAGCTTGAACCAGAAACCGCATAGCATACAAGAGAAGAT
AAGGTTCCTTTGTGAAGAAATGGGAGATTCTTTGGAGTATCTTGAGGTTTATCCAGCGTA
TCTCTGTTTCGACCTGGAGAACAGAATCAGTCCAAGGTTCAGGTTCCATAAATGGCTCGT
GGAGAAAGGGTTAAGCGATAAAAACTATTCGATCGCGAGCATCGTAGCAACCAGCGAAAA
GGCTTTCATAGCTCGTTTATATGGGATTCATCCAGCGATCCCTAAACACTATTTCGAACG
TTTCTCTTACAGAAAAGACAGATCAACTGTTTCCTAACTTGACAGAAAGTGAAAGATTGT
ACAATGTTGTGGTTACCTTTGTAAATTTTCTTTTCAGAGAACTTATCACAACCTGCTTCG
GTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RR4EZ19TF U 1
AF RR4EZ19JQ C 610
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GTTGTATAGAGAGGAAAGGTCTGTTTTTTTGCGGAGTGGGGATGAGATTGGTTCGATGCT
GGTTAGGTTTAGTGGTGTTGGGTTTAGCACGGTGGCTGTGGCTGGGATTTGTTTAGCGTT
TCCGAGTGTTCTGTGTGGTGGTGGTGCGGAGGTTGGTTGTTTGTTTGTGATGCTGAAGAG
ACTGTTTGAAGAGTTTGGTGCGGAGGAGGATGTTGTTGTTGATGAGAATGTGGAGTCTTG
GTACGTGTTTGGTAGGAAAGTTAGGGTGTTTTACGATTTGGGGTTTGAGAGTGAGGAGAT
GTGGGAGTTGATGGGTAGAAACAGATTACTTTTTATGGAATGTTCTGAAGATGATCTGAT
GGGAAAGACTGAGTATTTTTCTAGATTTGGTGTTGGGAAAGAGGAAGCTGCTCTTTTGAT
TCTACGGAATCCGGAGGTTATGAGTTTCGATGTTGAGAAGCAGCCTGTGATGTCAGTTAA
GGGAATGCTTAATCATTTTGGGTTGAGTCAGGATGAAGTGGATGCTCTTTCTCTGAAACA
CCCTTACGTTTTTGGTAGGAACAGAATGAAGAATCTGCCTCATGTGGTTAGAGCGTTAGG
TTTACATGA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR4EZ19JQ 776 0 0
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AAGATTCCAAATCCTACTAGGCAACGGCATTGATTTCTCGAAGGCGTGCATGTTGATAAG
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TTGTGAAGAAATGGGAGATTCTTTGGAGTATCTTGAGGTTTATCCAGCGTATCTCTGTTT
CGACCTGGAGAACAGAATCAGTCCAAGGTTCAGGTTCCATAAATGGCTCGTGGAGAAAGG
GTTAAGCGATAAAAACTATTCGATCGCGAGCATCGTAGCAACCAGCGAAAAGGCTTTCAT
AGCTCGTTTATATGGGATTCATCCAGCGATCCCTAAACACTATTTCGAACGTTTCTCTTA
CAGAAAAGACAGATCAACTGTTTCCTAACTTGACAGAAAGTGAAAGATTGTACAATGTTG
TGGTTACCTTTGTAAATTTTCTTTTCAGAGAACTTATCACAACCTGCTTCGGTTTG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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ACATAACAAATATCACTGATTGTGAGGAGCTTTTGATGGCAAGAGTTCGAAAGCTGACGA
TAAGCCAGAGCGAGAGGTACCTTGGGAGCAGCTACAGTAGTTTCGGGGACAGTAACGGTA
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ACGCCGTTGATCACAGCCCCGAAGATATGCCGGAACCGTTCGGCGCGTGGAGTTCACGCG
ACGCGGTGATGAGGAACGGGCGCGTGTGTGGAGGCCTATCCCTGGCCTTCGAGGACATGT
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BQ
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AF RR4CG63TF U 1
AF RR4CG63JQ C 69
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ACATAACAAATATCACTGATTGTGAGGAGCTTTTGATGGCAAGAGTTCGAAAGCTGACGA
TAAGCCAGAGCGAGAGGTACCTTGGGAGCAGCTACAGTAGTTTCGGGGACAGTAACGGTA
ACGGAAACAGAAACTCCGTCACAGACGAATCAGAGCTCACGGAAGAGGACGTCTGGTCAC
ACGCCGTTGATCACAGCCCCGAAGATATGCCGGAACCGTTCGGCGCGTGGAGTTCACGCG
ACGCGGTGATGAGGAACGGGCGCGTGTGTGGAGGCCTATCCCTGGCCTTCGAGGACATGT
CATCGTCTCCGACGATCGTGCATCAGATACGCGGCGGAGGAGATATTGGCGGGTGGAGAA
GGGGGAGGAGGAGGAGGACAAGCACAGCGGCAGCTAGCGTCGTCAGCGCCGGTGAACGTG
CCGGACTGGAGTAAAATATACCGGGTCAACTCGGTTGAGTCGATACACGAGTCGGAGGAA
GAGGAGGATTAAGAGTCCGGGATGATGCCGCCGCACGAGTACCTAGCTAAGAGTCAAAAG
CGGCGGAGCAG*AAATCCGGCGGCGGCGCGTCG*TGTTCGAAGGAGTTGGAAAGACTCTC
AAAGGACGAGA
CTGAGCGCGTCGAGACGC

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DS 

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AGCGAGAGGTAC*TTGGGAGCAGCTACAGTAGTTTCGGGGACAGTAACGGTAACGGAAAC
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ATGAGGAACGGGCGCGTGTGTGGAGGCCTATCCCTGGCCTTCGAGGACATGTCATCGTCT
CCGACGATCGTGCATCAGATACGCGGCGGAGGAGATATTGGCGG*TGGAGAAGGGGGAGG
AGGAGGAGGACAAGCACAGCGGCAGCTAGCGTCGTCAGCGCCGGTGAACGTGCCGGACTG
GAGTAAAATATACCGGGTCAACTCGGTTGAGTCGATACACGAGTCGGAGGAAGAGGAGGA
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AGAACTGAGGCGCGTTCGAGACGCGATTTGGAGCCAAACAGGGTTCTACGGCTAATTAAG
TAGCAATATATAATTTAAGAAAAACATTTAAAATTTTCAGCTGAAAAGGTTTGGAACAAA
AAAAAAGGTTGCTTATTTGTGTAGAAATTAGTTTTGAAACTTTTCTTGAATCCCAAGCGT
GAGATGTATAAGACTTATTTGGCTTCCCGCGGCCATGCATAATGTTTTT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

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ACACTCAAGTCACTTTGTCAATTGCTTCATGTGATTTGTTCCTTTTTTTTCATTTGTCTT
TCCTTTTCTTCACTTGTCTATTAGTTTTCATTTGCTCTCTTAATTTTGTCATTTATTTCT
CTTTGATTACGAAATTATAGATTATTTCGTCTTATGGAGTGAAGCATGTTTGGTGTATTT
CATATACTCCTTGCTTTCTGAAGCAAATAAAGTACATGATATGACTGATGAAAACCGTTC
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TATTCTTCCAAATTAGTTAACAATTCAACATTCTGAAAACAGTCTTTTTGCGTTATCGTT
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CTTTCATCGGTACACGATACATATGTATGCATATATAATGGAGATATTTTCTATACATAC
AACATAATAGCAATATATAGGTTGTGAATTGTGATTGATGGAGATATATATCAGCTTGGA
ACAAAATGGTGGCTCCTCTTTAACTTTGCATCCACGTTCTCTCGTTCATAGCACACTGAA
AAGTTGTTATCTTTACCCTGTAGTCAGTTGTTAATCAAAAGCTGTTACCAAGGCAAAAAT
AATAATATGAAAACACATTTATAAACAGAAATATTGGAAAATTACAAAAAGGAAAAATAA
TACTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4E383TF U 1
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BS 735 849 RR4E383JQ

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TCCTTTTCTTCACTTGTCTATTAGTTTTCATTTGCTCTCTTAATTTTGTCATTTATTTCT
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TATTCTTCCAAATTAGTTAACAATTCAACATTCTGAAAACAGTCTTTTTGCGTTATCGTT
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GATATATATCAGCTTGGAACAAAATGGTGGCTCCTCTTTAACTTTGCATCCACGTTCTCT
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DS 



AS 1 2

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CTTTTTTTTTTTCCGGTGAGTTTCTCCGGTGTTCAGAAAGTTGTTTTAGGTGTGTTGTTT
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BQ
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AF RR4FA22JQ C 1
AF RR4FA22TF U 1
BS 1 600 RR4FA22TF

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DS 

RD RR4FA22TF 600 0 0
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GGAAGGTTATATACGGTATAGGAGGAGTAGAGCTAGTGGTGTGGGGTTTATGGGCGGCTT
TAACGTCGCATCCATCGAAGTGGAAGCTAAGAGCTTTCTTTGTCTCGAGCATACTCACAA
TGTGTCTGAGAATGCTAGACTTCCCTCCTTACAAAGGCTATGTTGATGCTCATGCTCTTT
GGCGAGCCGCAGGGATCCCTCTCTCTTATCTTTGGTGGAGTTTTATCCGTGACGATGCCG
TTTTTAGAACCACTGTTCTTCTCAAGAAAGCAAAGTGATGATTCAAGACAGTTTTATCTT
CTTTTTTTTTTTCCGGTGAGTTTCTCCGGTGTTCAGAAAGTTGTTTTAGGTGTGTTGTTT
TCGCAGAAGAAGCAAAGTGTTTTGTTCTTCTGTGGTGAATCTTGTTAGTTGTTTTGGAGT
CTTGTGCTCTTTATGTTTTGTGTTTTTTTTTTCTCTCTAAGGCTCGTTGCCGGAGAGTTT
TATGATGACTTTTAAAAGTCCTTTTTTCTCAATGTAAAAAAGAAAAAAAGAGTTATGTCC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL9357Contig1 979 2 4 U
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BQ
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AF RR4DG29TF U 1
AF RR4DG29JQ C 203
BS 1 704 RR4DG29TF
BS 705 705 RR4DG29JQ
BS 706 782 RR4DG29TF
BS 783 979 RR4DG29JQ

RD RR4DG29TF 786 0 0
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CCGATTCTTGTCGACACGACGCCGTTTACGCCACTCGCCTCTCGCCGGGTTTAATTGAGG
AGCTTGGCATGTATCTGGTTTCGTTTGACCGACCCGGTTACGGAGAGAGCGACCCGGATC
CGAACCGTACCCCAAAGAGCTTGGCTTTAGACGTTCAAGAGCTTGCAGATCAGTTGCATC
TTGGAGAGAAGTTCTACGTGGTCGGTTACTCCATGGGAGGACAAGCTACATGGGGATGTC
TCAAGTACATCCCTCACCGGCTAGCCGGAGTGACTCTCGTTGCTCCGGTGGTTAACTACT
GGTGGAAGAACTTGCCTTTGAATGTTTCCACTCAAGGTTACACCTTGCAACCAAAGAGAG
ATCAGTGGGCGGTTCGTGTTGCTCACTACGCTCCTTGGCTTATCTACTGGTGGAACAGTC
AGAAGTGGTTCCCCGGTTCGAGTGTCGCGAACCGAGATGGTAGTAGCTTCTCACAGCCGG
ATAAAGATATCGTTTTGAAGCTTGGTTCTTCTAGGAAACCGCATTTGGCGGAAGTGAGGC
CACAAGGGTTGCATGAGAGTATTAACCGTGACATGGTTGTTGGGTTTGGGAGTTGGGAGT
TTGATCCTATTGAACTCGAGGATCCGTTTTTAAGAGCCATCGAG*CTCTGTTCATCTGTG
GCAAGGAGATGATGATATGTTAGTGCCTGTGATGCCGCAGCGTTACATTGCTGAGAAGCT
TC
GTGG

QA 1 782 1 782
DS 

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TGGC
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TACTCCATGGGAGGACAAGCTACATGGGGATGTCTCAAGTACATCCCTCACCGGCTAGCC
GGAGTGACTCTCGTTGCTCCGGTGGTTAACTACTGGTGGAAGAACTTGCCTTTGAATGTT
TCCACTCAAGGTTACACCTTGCAACCAAAGAGAGATCAGTGGGCGGTTCGTGTTGCTCAC
TACGCTCCTTGGCTTATCTACTGGTGGAACAGTCAGAAGTGGTTCCCCGGTTCGAGTGTC
GCGAACCGAGATGGTAGTAGCTTCTCACAGCCGGATAAAGATATCGTTTTGAAGCTTGGT
TCTTCTAGGAAACCGCATTTGGCGGAAGTGAGGCCACAAGGGTTGCATGAGAGTATTAAC
CGTGACATGGTTGTTGGGTTTGGGAGTTGGGAGTTTGATCCTATTGAACTCGAGGATCCG
TTTTTAAGAGCCATCGAGGCTCTGTTCATCTGTGGCAAGGAGATGATGATATGTTAGTGC
CTGTGATGCCGCAGCGTTACATTGCTGAGAAGCTTCCGTGGATTCACTATCACGAGGTTC
CGGGAAGTGGCCACTTCCTCCACTACAGTGAAGGTATGGTTGATGACATTGTAAAGACGC
TCTTCAAAACCGATACTGAGAACTGATGAACTACCACAATGGTCTGAAAATGAAATGTTT
GTATTTTGTTGTATTTGTAAGATCCAATAATAAAGTTAAGTGTTTACAGTTGC

QA 5 777 5 777
DS 



AS 1 2

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GGAGTTCTCATTTCTTCCCAGCAATCATATGGCTCATGGCTTGTTGATGATAGCAACAAC
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TGAAGAACTCTTCTCACGAGATGATCTGTGGTTTTGATGATACGATTCCCTTTCGTGGCT
ACGTCGTTTGGTCCTTGTGATGATTTCATCGTCTCTTCGATCACTGCTCTTGTATGATC


BQ
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AF RR4DK92TF C 1
AF RR4DK92JQ U 9
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BS 9 700 RR4DK92JQ
BS 701 719 RR4DK92TF

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GCGAAACATTCACAACTTTTCTTATCACAGGTAGTTCGTTTAACCTTCTTACCATTGTAT
GACATTCTTCAACGCTTGTAATCTCTCTCTTCAGCTAGGGTCAAGCCCGGCTCTGCTTGT
GGAGTTCTCATTTCTTCCCAGCAATCATATGGCTCATGGCTTGTTGATGATAGCAACAAC
ACAGTTTGACTTAACTTCAATCTGTCAAAAACGGGACGAGAAAAGTAACACTGAAAAATG
ATATAGACAGGAGCGGTAACCACACTGAATCTATAAACCTAAAGGACTTTGAGAAATAGC
TAGAAACTTGAGTATCAAAAGATAAGGTTTTGATCAACACTTAAATGCATAGAAGAAGGT
AAAAAAAATCAGGGTTAAAGGATACAAAAGAGGATACGGATTCACACAAAACTGCAGATG
CTCCTCTTCTCTTAAACTTCAATCTCTTTCTAATGGATTGTATCTATTTTCAATAGAGTT
TTGCTTCCTAGGTTCCCCACTGCGGCGTCCATAACCATCATCCCTTTTGGTTTTGTAATT
TGAAGAACTCTTCTCACGAGATGATCTGTGGTTTTGATGATACGATTCCCTTTCGTGGCT
ACGTCGTTTGGTCCTTGTGATGATTTCATCGTCTCTTCGATCACTGCTCTTGTATGATC

QA 1 719 1 719
DS 

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TTCACAACTTTTCTTATCACAGGTAGTTCGTTTAACCTTCTTACCATTGTATGACATTCT
TCAACGCTTGTAATCTCTCTCTTCAGCTAGGGTCAAGCCCGGCTCTGCTTGTGGAGTTCT
CATTTCTTCCCAGCAATCATATGGCTCATGGCTTGTTGATGATAGCAACAACACAGTTTG
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AGGAGCGGTAACCACACTGAATCTATAAACCTAAAGGACTTTGAGAAATAGCTAGAAACT
TGAGTATCAAAAGATAAGGTTTTGATCAACACTTAAATGCATAGAAAAAGGTAAAAAAAA
TCAGGGTTAAAGGATACAAAAGAGGATACGGATTCACACAAAACTGCAGATGCTCCTCTT
CTCTTAAACTTCAATCTCTTTCTAATGGATTGTATCTATTTTCAATAGAGTTTTGCTTCC
TAGGTTCCCCACTGCGGCGTCCATAACCATCATCCCTTTTGGTTTTGTAATTTGAAGAAC
TCTTCTCACGAGATGATCTGTGGTTTTGATGATACGATTCCCTTTCGTGGCTACGTCGTT
TGGTCCTTGTGATGATTTCATCGTCTCTTCGA

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL9359Contig1 825 2 10 U
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ACGTGGCAACGATTCAGAACCTCACATTAATTTTTTCCCTAAAAATATGTTTTTTCAAAA
GCACTTAAAAGATTAAAAACTGAAACACACGATGTGCGTATATGCTACGTAGAGCAGACT
ACAGTTGTTCAATCGTCTTCACCTTTGGCATCATTGCTCGGATGGTTGTGTTTCTGAGCT
TGGTACATATCAGCAATCTGTTCAGATGATGTTGCGTCCTCTGGCTTCTTGTCTTCTCGT
ACACGGAGTAAACGAGGGAAACCGTAGAGATATCCCCTTATCAGGGTCGACAATGCCGGT
AGCTGCACGATGTACAGGGCTAATTGTCAAGTCAGCTGCCTTTACTTCCCAGACCTCAGT
GGGTTCGAACCAAACATCTGGATTGAGGCTGTCTCCAACTCGGTAGTATTGTTTCGGAGT
AGCAATCACTCTAGAGCAAAGACTGGTAGACCGCTCTTCAAGTACGGCTTCAGAAAATCC
AGCACCTATTTTACAAATGCTCTGGAATTCTTCCTTGTCAGGATCGTAGCAAGCTAGCAA
AAATGCACCAAAGACACCTGTGCGTTTGCCACGTCCATGGAAAGCAGCAATTGGTACAAG
ATCCACAGAGTCCCCAATACTGTCCATATAGTCTTTCTTCAGTTTTAGCCAATTATTCGA
TCGCTTTGCAGGCTCATAGGTAGCATCTGAATTCAATGTTTTAATGATCAACCCTTCACA
TCCAATATCAACGGACGCATCTAGAAACTTTTGTATTTCATCAAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4DL77JQ U 1
AF RR4G569JQ U 64
BS 1 161 RR4DL77JQ
BS 162 162 RR4G569JQ
BS 163 317 RR4DL77JQ
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BS 319 542 RR4DL77JQ
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BS 730 730 RR4G569JQ
BS 731 768 RR4DL77JQ
BS 769 825 RR4G569JQ

RD RR4DL77JQ 768 0 0
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ACGTGGCAACGATTCAGAACCTCACATTAATTTTTTCCCTAAAAATATGTTTTTTCAAAA
GCACTTAAAAGATTAAAAACTGAAACACACGATGTGCGTATGTGCTACGTAGAGCAGACT
ACAGTTGTTCAATCGTCTTCACCTTTGGCATCATTGCTCGGATGGTTGTGTTTCTGAGCT
TGGTACATATCAGCAATCTGTTCAGATGATGTTGCGTCCTCTGGCTTCTTGTCTTCTCGT
ACACGGAGTAAACGAGG*AAACCGTAGAGATATCCCCTTATCAGGGTCGACAATGCCGGT
AGCTGCACGATGTACAGGGCTAATTGTCAAGTCAGCTGCCTTTACTTCCCAGACCTCAGT
GGGTTCGAACCAAACATCTGGATTGAGGCTGTCTCCAACTCGGTAGTATTGTTTCGGAGT
AGCAATCACTCTAGAGCAAAGACTGGTAGACCGCTCTTCAAGTACGGCTTCAGAAAATCC
AGTACCTATTTTACAAATGCTCTGGAATTCTTCCTTGTCAGGATCGTAGCAAGCTAGCAA
AAATGCACCAAAGACACCTGTGCGTTTGCCACGTCCATGGAAAGCAGCAATTGGTACAAG
ATCCACAGAGTCCCCAATACTGTCCATATAGTCTTTCTTCAGTTTTAGCCAATTATTCGA
TCGCTTTGC*GGCTCATAGGTAGCATCTGAATTCAATGTTTTAATGAT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR4G569JQ 762 0 0
A
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TTAAAAGATTAAAAACTGAAACACACGATGTGCGTATATGCTACGTAGAGCAGACTACAG
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ACATATCAGCAATCTGTTCAGATGATGTTGCGTCCTCTGGCTTCTTGTCTTCTCGTACAC
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GCACGATGTACAGGGCTAATTGTCAAGTCAGCTGCCTTTACTTCCCAGACCTCAGTGGGT
TCGAACCAAACATCTGGATTGAGGCTGTCTCCAACTCGGTAGTATTGTTTCGGAGTAGCA
ATCACTCTAGAGCGAAGACTGGTAGACCGCTCTTCAAGTACGGCTTCAGAAAATCCAGCA
CCTATTTTACAAATGCTCTGGAATTCTTCCTTGTCAGGATCGTAGCAAGCTAGCAAAAAT
GCACCAAAGACACCTGTGCGTTTGCCACGTCCATGGAAAGCAGCAATTGGTACAAGATCC
ACAGAGTCCCCAATACTGTCCATATAGTCTTTCTTCAGTTTTAGCCAATTATTCGATCGC
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QA 2 762 2 762
DS 



AS 1 2

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TTAAACACTTAAGATCACTAAAATAGATGCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4GF20JQ C 1
AF RR4GF20TF U 1
BS 1 572 RR4GF20TF

RD RR4GF20JQ 572 0 0
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TTAAACACTTAAGATCACTAAAATAGATGCTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR4GF20TF 572 0 0
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AATTTTGTTTCTATGTACTTCTTTTTTCAATCTATGCTTAAAATAAGATACGCAAATGAC
AATAATTATTGGTATTTTCTCCGACGACACCGGCTTTGTCAAATCTGATGCCTCCGATCA
CACTTGCGGAGAAGGTGACATAATTTCTCTATACGCCAACAAGGTTGCTCCAATTCACAA
TCCAAGGCAGACGATTCGTCCAAATCGGGCTGGATCGAGTGATGTGGTTCGAGCATGATT
AATAAAGTGGTTGGGTCTTCTCAGTTCAATCGATGAAAGATAACAGCGGCTGAAGATCCA
TCGTTGGTTGTGTTTTGCAAAACTTGTCCCTATTTTTTGTATATTTTCATTTTGACCCCT
AACTTTACAATATTGCAGATTTATCCTAGTTTTTGGTCCAAAATTTCTGGTTTTGTACTC
CAAGTCCATATGTATGCAAAATGTACATATACAGCTCCTAATAACGTCTACATGCAATAT
TTAAACACTTAAGATCACTAAAATAGATGCTT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL9361Contig1 764 2 2 U
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GCAGCAGAGGAAAACGACGGCGGCGGGTAGGCCAAGTGGCACCGATGGATCTGATTTCTC
GTACCGAATGGTCGTTGACTCTCGTTACACGAAGGTCACTAAAGGGAGATCTCGTCTCCG
TCTCTTGATCCTTGTTCAAGCTACGATATATCTGATTGGACTCACGTGTGCATTCATGAC
AAGTACTAAAGATGACGAGAAGAACACACTTGGGATTGCATCTGCTGCTATTGGCTTACT
CTTTTCACTCATTGCAGATTTTGGTTGCAGACGCAGCAGAGTAAACCTTTTGAGGCTCTA
CACGGCTGCCTCCACCGTTGTCATGGTTCTTTCTGTGTTTTCTGCTGTTAGGAGCAGATT
AACAATGGAGGAACGGAATAGCTCTGGAACAGCAGCTAAGCTTGAGCTCTTAGGGTTCAT
CTCTGCTCAATTGGGAGCGGTGGTGCAGATATTAGCAATCATCGTTACGGGTTCCCTTGT
CAATAATATGTCTCCGCCTACGAAGACAGAATAGAGAAGGCAAGAGAGTTTGTGGTACTG
GCATGTGTGATTCTGCTACATGAGGAAGACATTAAGAATTTTGTAGTTTTCGTTCCACCA
AATGAATAGTTGTTTACTTCAGTATTTTCTTTCATTATTCGAGAAGATTCGAAAGCAACA
GACGTGTATGGCTGTTTGGCATTGCGTTTTGGCTCCTTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H024TF U 1
AF RR4H024JQ C 268
BS 1 638 RR4H024TF
BS 639 764 RR4H024JQ

RD RR4H024TF 638 0 0
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CTTTTCACTCATTGCAGATTTTGGTTGCAGACGCAGCAGAGTAAACCTTTTGAGGCTCTA
CACGGCTGCCTCCACCGTTGTCATGGTTCTTTCTGTGTTTTCTGCTGTTAGGAGCAGATT
AACAATGGAGGAACGGAATAGCTCTGGAACAGCAGCTAAGCTTGAGCTCTTAGGGTTCAT
CTCTGCTCAATTGGGAGCGGTGGTGCAGATATTAGCAATCATCGTTACGGGTTCCCTTGT
CAATAATATGTCTCCGCCTACGAAGACAGAATAGAGAAGGCAAGAGAGTTTGTGGTACTG
GCATGTGTGATTCTGCTACATGAGGAAGACATTAAGAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR4H024JQ 497 0 0
ACTTGGGATTGCATCTGCTGCTATTGGCTTACTCTTTTCACTCATTGCAGATTTTGGTTG
CAGACGCAGCAGAGTAAACCTTTTGAGGCTCTACACGGCTGCCTCCACCGTTGTCATGGT
TCTTTCTGTGTTTTCTGCTGTTAGGAGCAGATTAACAATGGAGGAACGGAATAGCTCTGG
AACAGCAGCTAAGCTTGAGCTCTTAGGGTTCATCTCTGCTCAATTGGGAGCGGTGGTGCA
GATATTAGCAATCATCGTTACGGGTTCCCTTGTCAATAATATGTCTCCGCCTACGAAGAC
AGAATAGAGAAGGCAAGAGAGTTTGTGGTACTGGCATGTGTGATTCTGCTACATGAGGAA
GACATTAAGAATTTTGTAGTTTTCGTTCCACCAAATGAATAGTTGTTTACTTCAGTATTT
TCTTTCATTATTCGAGAAGATTCGAAAGCAACAGACGTGTATGGCTGTTTGGCATTGCGT
TTTGGCTCCTTCGTCCC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL9362Contig1 572 2 1 U
GGACTAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAAGGACAGCCCTAAAAATGGCAAGC
TTATCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACCCCGAGAGTTTTCTCT
TCCGTCCCCACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAA
GCCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCC
GAGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAG
GTGAAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAAG
GAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAA
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AATCAAATAAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGT
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BQ
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TCCGTCCCCACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAA
GCCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCC
GAGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAG
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GAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAA
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TTTGTTTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

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BQ
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GG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAGTTTCTGACTTCGGTTTATCCAAAACCGGACCGAACATGAACCAAGGTCATGTCACGA
CCGTTGTCAAAGGAAGTTTCGGGTACTTAGATCCAGAGTACTTTAGGAGACAGCAGTTAA
CCGAGAAGTCAGATGTGTACTCTTTTGGAGTTGTTCTGTTCGAGATCTTATGCGCTAGAC
CGGCTTTAAACCCTAGCTTGCCTAAGGAGCAAGTCAGTCTTGGAGACTGGGCGATGAACT
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TTGAGTGTTTGAAGAAGTTTGCGGACACGGCGGAGAAGTGCCTCTCCGATAGTGGTTTAG
ATCGGCCGACGATGGGAGATGTTTTGTGGAATCTTGAGTTTGCGTTTCAGCTGCAAGAAA
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GAG*TGGTGGTATGGAGGT
AACGTCG

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ACA
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GAGACAGCAGTTAACCGAGAAGTCAGATGTGTACTCTTTTGGAGTTGTTCTGTTCGAGAT
CTTATGCGCTAGACCGGCTTTAAACCCTAGCTTGCCTAAGGAGCAAGTCAGTCTTGGAGA
CTGGGCGATGAACTGTAAAAGGAAGGGGACGTTGGAGGATATCATTGATCCTAATCTTAA
AGGAAAGATTAATCTTGAGTGTTTGAAGAAGTTTGCGGACACGGCGGAGAAGTGCCTCTC
CGATAGTGGTTTAGATCGGCCGACGATGGGAGATGTTTTGTGGAATCTTGAGTTTGCGTT
TCAGCTGCAAGAAACTGCTGATGGGTCGCGTCAACCAACGCCTAGTCGTGGAGGTGAGTC
AGAGGATTTAGCCGGAGGTGGTGGTATGGAGGTTAACGTCGTCGGCGCCGGAGAACATGA
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AGGGCGATAAGATAATTTCACGACCGAGCAAAAAAAAAGATATCCAGTTCTTTTTTTGTG
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CTTTATGTT

QA 4 792 4 792
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4D537JQ U 13
AF RR4D537TF C 1
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DS 

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QA 1 598 1 598
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAAGACTTCTATTTTTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4DC90TF U 1
AF RR4DC90JQ C 106
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TATGTGGCTCCACACTCATCTCATTGAAGACATGATCTCGATTTGCCGCCAAACATTCAA
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CTTGTGCTCTACGGGCGGTCCCGCTGTTGATTTCAAGAACCCTATCAACCCTATTGAGAA
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AGCAGCTTTCGCTTTGCCTACTTTCCTTAGAAGAGAAGTGGCTTCACTTCTGTCTTCTTC
TTGACTTATGTTTGTCTTAAACATTTTACTATATCCAATCATATAAAAACCTCTGTAAAA
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AAAGACTTCTATTTTTAT

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DS 

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CTCGGATATGCACAGAGCAGCTTTCGCTTTGCCTACTTTCCTTAGAAGAGAAGTGGCTTC
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CTCCTTTTAATATTTAAAGACTTCTATTTTTAT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL9368Contig1 323 2 3 U
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ACGTAACTTTGACTGCTGTTCCAGTACGAGTAACGGAACCGCCACACTTTCCCCGTCCTG
TCTTCCAAATTAATCAAAACGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4CE41JQ U 2
AF RR4CE41TF C 1
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AAATGTTGACCCCGAAAAGCCTAACCACACTCCGAACCGGCGTA

QA 1 104 1 104
DS 

RD RR4CE41TF 323 0 0
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ACCACATCTCCGGCTCGGAGATTCTTCTCCTTAACGAACCGGCTCCATCCCTTGGTCAAC
ACGTAACTTTGACTGCTGTTCCAGTACGAGTAACGGAACCGCCACACTTTCCCCGTCCTG
TCTTCCAAATTAATCAAAACGCC

QA 1 323 1 323
DS 



AS 1 2

CO CL9369Contig1 709 2 2 U
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GCATTGTGTTTCGAGGACTAAGAATTGTTTTAATGGATTTATTTTGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FI96JQ C 1
AF RR4FI96TF U 1
BS 1 683 RR4FI96TF
BS 684 709 RR4FI96JQ

RD RR4FI96JQ 709 0 0
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CTTCTCTGGGGCTTGATCCGTCTGCTGCAGTGGACCGTGCGAGAAGCAAGTCGAGAGGGA
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AGATGCGCGTGAGGTCGAAGTCGAGGTCTATGTCGATATCGAGGTCACAGCCGAGGCCAC
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GCATCTTTTGTGGTTTTTCTACAGACATCATCAAATGAAACATAGTAGCTTCTTCTGCGA
GCATTGTGTTTCGAGGACTAAGAATTGTTTTAATGGATTTATTTTGATC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR4FI96TF 683 0 0
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CTTCTCTGGGGCTTGATCCGTCTGCTGCAGTGGACCGTGCGAGAAGCAAGTCGAGAGGGA
GGAAGAGGGACCGTTCAGAAGATGCAATGGATGTGGATGATGAGCAAGACTCGAACAAGA
AGATGCGCGTGAGGTCGAAGTCGAGGTCTATGTCGATATCGAGGTCACAGCCGAGGCCAC
CTCCTCATGAAGTTGTGCCTGGTGAAGGGTTCAAAGACTCTACTCAGAAGAAGGCGGCGC
TTAAGATTAGCAATAGCTCTCACAAGAAGAGAGACAAGAATGCAAGACGTGGTGAAGCTG
TGCTGCTGAAGATGAGTACTCTGACTGAGGAAGGTGTGATGGCTGTGAAGAGGGGTAAAG
GAAAGACAGATAGGCGTTGATGAAACCAAACAAGGGAAAACAAATGCTGGATCTATTGAA
GAACATGTCTCAAGTTTTGGATTATGCTTTAGTTTTTGCTTACTATTATTATTATGTTAT
GCATCTTTTGTGGTTTTTCTACAGACATCATCAAATGAAACATAGTAGCTTCTTCTGCGA
GCATTGTGTTTCGAGGACTAAGA

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL9370Contig1 662 2 1 U
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CATCACCAAGTCGATGACTAACATCGTCAAATCGCTGGAGTCTTCCCTTGCCACAGGCAA
CCTACAGAAGATGTCAGAGACGATGGATTCATTTGAGAAGCAGTTTGTGAACATGGAGGT
GCAAGCTGAGTTCATGGAGAATGCCATGGCTGGTTCAACATCATTGTCCACTCCAGAAGG
CGACGTCAACAACCTGATGCAGCAGGTGGCAGATGACTACGGTCTTGAAGTCTCTGTTGG
ACTTCCTCAGGCTGCTGGCCATACCATCCCTACTGCTACAGAGGAGAAAGTCGATGAGGA
TGATCTGTCAAGGAGGCTTGCAGAGCTCAAGGCCAGAGGATGAACAATCTACCACTTAGG
ACAAGATCCTTATCGAAATGTTGCTACTATTATCTGCGAACACTGACGCATTTGTGTATA
TTGCTCACTTTGAGACATGCTGTCTACTAACTTTATATTAAAATATTTTTGTTTGTTTTA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR4FK44TF U 1
AF RR4FK44JQ C 87
BS 1 662 RR4FK44TF

RD RR4FK44TF 662 0 0
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CATCACCAAGTCGATGACTAACATCGTCAAATCGCTGGAGTCTTCCCTTGCCACAGGCAA
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CGACGTCAACAACCTGATGCAGCAGGTGGCAGATGACTACGGTCTTGAAGTCTCTGTTGG
ACTTCCTCAGGCTGCTGGCCATACCATCCCTACTGCTACAGAGGAGAAAGTCGATGAGGA
TGATCTGTCAAGGAGGCTTGCAGAGCTCAAGGCCAGAGGATGAACAATCTACCACTTAGG
ACAAGATCCTTATCGAAATGTTGCTACTATTATCTGCGAACACTGACGCATTTGTGTATA
TTGCTCACTTTGAGACATGCTGTCTACTAACTTTATATTAAAATATTTTTGTTTGTTTTA
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR4FK44JQ 576 0 0
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TTGCTCGCTTAGACACTCAGGCTAAGATGGCGACCATCACCAAGTCGATGACTAACATCG
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TGGCTGGTTCAACATCATTGTCCACTCCAGAAGGCGACGTCAACAACCTGATGCAGCAGG
TGGCAGATGACTACGGTCTTGAAGTTTCTGTTGGACTTCCTCAGGCTGCTGGCCATACCA
TCCCTACTGCTACAGAGGAGAAAGTCGATGAGGATGATCTGTCAAGGAGGCTTGCAGAGC
TCAAGGCCAGAGGATGAACAATCTACCACTTAGGACAAGATCCTTATCGAAATGTTGCTA
CTATTATCTGCGAACACTGACGCATTTGTGTATATTGCTCACTTTGAGACATGCTGTCTA
CTAACTTTATATTAAAATATTTTTGTTTGTTTTACC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL9371Contig1 830 2 2 U
TGGCAGGCATCAAAGTTCATGGAGTTCCCATATCCACGACCACAATGCGCGTTCTCGCTA
CTCTTTACGAGAAGGGTCTCGATTTCGAGTTAGTCCCCGTCGACATGAAAGGCGGTGCTC
ACAAGCAGGAGCCTCTTATTTCTCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCTAGACG
GTGATTTGACGCTTTTCGAGTCCAGAGCCATCACAGAGTACATAGCAGAGGAGTACAGCG
ACAAAGGCGAGAAGCTTCTCTGCCAAGGCTACAAGAAACTGAAGGCCATCACAAAGGTGT
GGCTTCAAGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCTAAGTTAGCCTACGAGCGTG
TCTTCAAAGGCATGCTTGGCATGACCACTGATCCAGCCGCTGCGGAAGAGCTCGAAGCTA
AGTTGGTCAAGGTCTTGGATATCTACGAGGCCAGGCTCTCCAAATCCCCCTTCTTGGCTG
GTGATTGCTTCACTCTGGCTGATCTCCACCACCTCCCAATCATCTATTACTTGATGGGCA
CTGAATCCAAGAAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTTAGGTTAGCGAGTGTATCAAGAAGATCA
CTGCAAGGCCTGCTTGGGTTAAGGTTCTTAACCTCCAAAAGAAGTGACATGGTGCTTTTG
TAACATCCCTGAGATATTTTCCTTGGTTTGACATAAATGATTTGTTCCTTGTTGCTTAAT
TATCATTATTATTAGGTTATGTACCTCTTACTCTCTTTTCTCTTGTGTTATGCGTTTACT
GTGCAACAAAAACAACAAAGATTATGTATCTAAACAATAAGCGTTATCAC


BQ
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TATCATTATTATTAGGTTATGTACCTCTTACTCTCTTTTCTCTTGTGTTATGCGTTTACT
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ACCACTGATCCAGCCGCTGCGGAAGAGCTCGAAGCTAAGTTGGTCAAGGTCTTGGATATC
TACGAGGCCAGGCTCTCCAAATCCCCCTTCTTGGCTGGTGATTGCTTCACTCTGGCTGAT
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BQ
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AF RR4BQ51JQ C 1
AF RR4BQ51TF U 1
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TGGTTTTGTGATGATCTCTATTACCTTAGAAAACCTATATGTTTACTTATATCGTTTGTT
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GTCCATCGCCGTTTCCTTTCTCCTCGCGCTCATAGTTTCCTCCGCCATAGCTCAGGCTCC
GGGACCATCTCCGACAAGGTCTCCTCTTCCAGCCACTCCTCCTATATCTCAGCCTCCGAG
AACCGCCGCACCAACTCCATCACGCGCCACCACTCCTCCGCCGTCCGTCACTCCCATGGC
AGCTCCTACTTCTCCTCCGGTTGGCTCACCGACCTCCACCGTCGCTTCACCGCCGGCTCC
TCCGACATCTCTTACACCCGATGGAGTTCCTGACGCAAATGCCCCTTCTGGCCCGACTGG
ATCTACTCCTAATGACAACAACAACAACGCCGCTGCACTCTCCGCCGGATCTTTCCTTGG
TTTTACATTCGTCGCCGCTTTGTTGCTTTAATTTGGTGTTTAGATTATGTATTAATAATT
CGAGAGTTTAGCGATGGACGGTAGATATTCGATCTGTTGTTTTGTTTAGAGATTTATTTG
TGGTTT*GTGATGATCTCTATTACCTTAGAAAACCTATATGTTTACTTATATCGTTTGTT
ATTGTTACTCATGGTTTTAATTAGCACATTTATCTGG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

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ATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTC
AGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTCTTCCTCAA
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AF RR4AN21JQ C 1
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QA 1 573 1 573
DS 

RD RR4AN21TF 573 0 0
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TAATCTCGCAGTGATTTTTTGGGAAGGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATC
TGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATAT
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ATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTC
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ATTGTTTCTTAGTAAAGTTGTTTTGATTCTCCT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4GD69JQ C 1
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QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

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ATCC


BQ
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20 20 20 20 

AF RR4CT74TF U 1
AF RR4CT74JQ C 393
BS 1 604 RR4CT74TF

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TTTCCCCTGAAAGTCTAAAATAGCAATAATGATGAAAATAAAATCTTCCAACATTTTTAG
ATCC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR4CT74JQ 212 0 0
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QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4AE16JQ C 1
AF RR4AE16TF U 1
BS 1 636 RR4AE16TF

RD RR4AE16JQ 636 0 0
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TGCTCCTTCCTCTCTTCATCTCTCTCCCTATCCTCTACATTTTCTGGTTTGTCCATAGCA
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CGCAGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATTTCTGTCCTAAGTCCAACCCTAGCAGCGGCAAA
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CCGCCAGATGATACAATGACGAACAGATGAGCTATTTTCTGTATTTTAACTCCTTATGTA
TTCTTGATTCTTTTATAGAATCAATGTTCTTGAGAC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4AE16TF 636 0 0
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GCTTCCAACGCCGGGAAGATTAGCGTCCCTTCTGCTTCGCTTTCTCTCCGCTCTGGTTCG
AGACGGAGTCAGTTTTCTCTCGGCTGCTCTTCCGCCTCAGCTTCTTCTCAGCTGCTCCAT
TGCTCCTTCCTCTCTTCATCTCTCTCCCTATCCTCTACATTTTCTGGTTTGTCCATAGCA
TTTGATGTCAGCAGTGGAACGAGTGGCTTGAACGGGCAGAAGAAACGAAGAGGGTTTGTT
GTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACAAAGAGAAGCAGGTCAAGAAAATCTCTG
GCTAGGACTCATGGTTTCCGTCTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTCGAGCCACCATCAAG
CGCAGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGTCCTAAGTCCAACCCTAGCAGCGGCAAA
CGCGCTTGAAGACTCTTTCCTTTCCCTCGTTCTCTCTCTCTCTGTATTCTTGTTTTTTTT
CCGCCAGATGATACAATGACGAACAGATGAGCTATTTTCTGTATTTTAACTCCTTATGTA
TTCTTGATTCTTTTATAGAATCAATGTTCTTGAGAC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL9377Contig1 687 2 2 U
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TTCCTCATTAACAACGGTGGCTACACCATTGAAGTAGAGATTCATGATGGTCCATACAAC
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TTCACTTTTCAACTCTTGGTTTTAGTTTGCTTTTGGAGTTATTATGTTGTTTCTTCCAAT
TAGTAGTACGAATAAATTATGTTGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4ET13TF U 1
AF RR4ET13JQ C 95
BS 1 669 RR4ET13TF
BS 670 687 RR4ET13JQ

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DS 

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CGGTGGAAGCGATTAAGACAGCCACATTGGAGAAGAAGGATTCTCTTTGTTTCATTGAAG
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CTGCTAATGGCCGTCCTCCCAACCCTCAGTAAGCAAAGATTATCTAAAGAAACGAATCGT
TTAGTACTACTCTTGCTGTTTTTTTTTTCACTTTTCAACTCTTGGTTTTAGTTTGCTTTT
GGAGTTATTATGTTGTTTCTTCCAATTAGTAGTACGAATAAATTATGTTGGGC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL9378Contig1 1064 2 2 U
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AGACAAGACCTGTGTTTACATCTTCTTGTAAAGTTTGTTTAGCTTCAGGAGATTCTTTCC
TGTTGTTGTGATTGTTGATTGGGAATGTAATGTAACCATAGAGGGAGGAAAAAATTGTTA
ATGTTTGTTTGTAATGATATACATCTTATAAGAATGTTCCGAGT


BQ
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AF RR4DY35TF U 1
AF RR4DY35JQ C 297
BS 1 767 RR4DY35TF
BS 768 1064 RR4DY35JQ

RD RR4DY35TF 767 0 0
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CCACCTGAGTATCTAAGAAATGGAAGAGTGACACCTGAAAGTGTTACTTACAGCTTTGGA
ACTGTGCTTCTTGATTTACTTAGCGGCAAACACATCCCTCCAAGCCATGCTCTGGATATG
ATACGTGGCAAGAATATTATCCAGTTGATGGATTCACACCTTGAGGGTAAGTTCTCAACG
GAAGAAGCTACCGTAGTTGTCGAACTCGCCTCTCAGTGTCTGCAATACGAGCCTCGAGAG
AGACCTAACACAAAAGATCTCGTCGCCACACTTGCACCGTTACAAACTAAACCAGATGTT
CCTTCTTGTGTAATGCTTGGAATAAAGAAGCAAGAAGAGACACCTCCAACGCCACAGAGG
CCACTTTCGCCGTTAGGTGAAGCTTGCTCAAGAATGGATCTCACAGCTATTCACCAGATC
TTGGTCATGACACATTACAGAGATGACGAAGGGACCAACGAGTTATCTTTCCAGGAATGG
ACACAACAGATAAAAGATATGCTTGATGCAAGGAAACGTGGTGATCAAGCTTTCCGTGAT
AAAGATTTCAAAACCGCCATAGACTGTTACTCACAGTTTGTAGACGTTGGAACAATGGTG
TCACCAACTGTGTTTGTTCGGAGAAGTCTATGCTACTTGCTGTGCGATCAGCCAGACGCA
GCACTACGCGACGCGATGCAAGCGCAATGCGTGTATCCTGACTGGCC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR4DY35JQ 768 0 0
GAGAGAGA
CTAACACAAAAGATCTCGTCGCCACACTTGCACCGTTACAAACTAAACCAGATGTTCCTT
CTTGTGTAATGCTTGGAATAAAGAAGCAAGAAGAGACACCTCCAACGCCACAGAGGCCAC
TTTCGCCGTTAGGTGAAGCTTGCTCAAGAATGGATCTCACAGCTATTCACCAGATCTTGG
TCATGACACATTACAGAGATGACGAAGGGACCAACGAGTTATCTTTCCAGGAATGGACAC
AACAGATAAAAGATATGCTTGATGCAAGGAAACGTGGTGATCAAGCTTTCCGTGATAAAG
ATTTCAAAACCGCCATAGACTGTTACTCACAGTTTGTAGACGTTGGAACAATGGTGTCAC
CAACTGTGTTTGTTCGGAGAAGTCTATGCTACTTGCTGTGCGATCAGCCAGACGCAGCAC
TACGCGACGCGATGCAAGCGCAATGCGTGTATCCTGACTGGCCAACGGCTTTCTACATGC
AGTCCGTGGCATTAGCGAAGCTGAATATGAACACAGACGCAGCTGATATGTTGAACGAAG
CATCTCAGCTTGAAGAGAAGAGACAACGAGGAGGCGGCAAAGGATCTTGATTCTTGAGAC
AAGACCTGTGTTTACATCTTCTTGTAAAGTTTGTTTAGCTTCAGGAGATTCTTTCCTGTT
GTTGTGATTGTTGATTGGGAATGTAATGTAACCATAGAGGGAGGAAAAAATTGTTAATGT
TTGTTTGTAATGATATACATCTTATAAGAATGTTCCGAGT

QA 9 768 9 768
DS 



AS 1 2

CO CL9379Contig1 878 2 8 U
TTTTTTGAGTCTCAGATCTCAAAAGATGGCGACGAAAATCTCTCAGCTTGCGTGTTTCTC
CTCCACCACCAATCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGACCGTTTCAATGCCTTAGGTCTCG
CCCCGAGTCTTTTGTAGTTAGAAGCGTTGATGGGAATAGCTCACAAACACCACCTTCTCT
GAGCTATACAGCAGCTGAAGTTTCTAAACCTTTTGTTGAGAAAACACCAGAACCGGTAGA
GGAACATGTTGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGG
CATTCCTTATGGTGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTTGATTTGCGTTTTCACGGAA
CCTAACAAGTTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGCCCTTCTAGCTCTTAGTACTTT
GAGCTTAAAGATTTGGCGACAGGGAAAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGT
GCTTTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCACAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTT
TCCTGCTGGGATTTTTGCTGTCGTTAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGT
GCTCTCTGGAGGAAACCCACCTCCGAAGAAATTGAAACCCTCATCTGGTAGCCCTTCATA
CTGAAGAAGCTTCCCATAGGTTAGATTAAAGACATGGGAGATGTCAGTCTTTTACGACTG
GTGTCTTGGATTCCTGGTGTAATTTTACACTGTCATAATACAAAATATTTGAAGTTTTGT
TTACTGGTGAGATGCTATGATTGTTATCTTCAATGAATGTGAAATACTCTGATGTAAATT
AGATATCTATGTTGGCTTACTCAAAAGTCAAGAACCTT


BQ
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AF RR4G038TF U 1
AF RR4G038JQ C 137
BS 1 398 RR4G038TF
BS 399 399 RR4G038JQ
BS 400 686 RR4G038TF
BS 687 687 RR4G038JQ
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BS 714 724 RR4G038TF
BS 725 878 RR4G038JQ

RD RR4G038TF 724 0 0
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CTCCACCACCAATCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGACCGTTTCAATGCCTTAGGTCTCG
CCCCGAGTCTTTTGTAGTTAGAAGCGTTGATGGGAATAGCTCACAAACACCACCTTCTCT
GAGCTATACAGCAGCTGAAGTTTCTAAACCTTTTGTTGAGAAAACACCAGAACCGGTAGA
GGAACATGTTGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGG
CATTCCTTATGGTGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTTGATTTGCGTTTTCACGGAA
CCTAACAAGTTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGCCTTCTAGCTCTTAGTACTTT
GAGCTTAAAGATTTGGCGACAGGGAAAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGT
GCTTTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCACAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTT
TCCTGCTGGGATTTTTGCTGTCGTTAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGT
GCTCTCTGGAGGAAACCCACCTCCGAAGAAATTGAAACCCTCATCTGGTAGCCCTTCATA
CTGAAGAAGCTTCCCATAGGTTAGAT*AAAGACATGGGAGATGTCAGTCTTT*ACGACTG
GTGT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR4G038JQ 742 0 0
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GCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCATTCCTTATGGTGGT
CTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTTGATTTGCGTTTTCACGGAACCTAACAAGTTTAAGT
ACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGCCCTTCTAGCTCTTAGTACTTTGAGCTTAAAGATTTGG
CGACAGGGAAAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGTGCTTTCAGCTGTCGTC
TTCTGGAAGAACTTCACAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCCTGCTGGGATTTTT
GCTGTCGTTAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCTCTCTGGAGGAAAC
CCACCTCCGAAGAAATTGAAACCCTCATCTGGTAGCCCTTCATACTGAAGAAGCTTCCCA
TAGGTTAGATTAAAGACATGGGAGATGTCAGTCTTTTACGACTGGTGTCTTGGATTCCTG
GTGTAATTTTACACTGTCATAATACAAAATATTTGAAGTTTTGTTTACTGGTGAGATGCT
ATGATTGTTATCTTCAATGAATGTGAAATACTCTGATGTAAATTAGATATCTATGTTGGC
TTACTCAAAAGTCAAGAACCTT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL9380Contig1 790 2 1 U
GGTTTATAAGTATCATTTTTCCAAACAAAACTACAAACAATTTATCAAATATAATCGTTT
GTAAATAAGTTGACTATATAAGGTAGAACTAGAGTGACACCAAAAAAAATGTTCAGACTC
AAAGTCACATAAAAAAGGCCAAAAATAATCAATTAGGGTTCTTTGTGCTCCTTTGAACTG
CAAATACACTCTGGGTATGGATTCTCATAAAAGGCTTCTTCAGTTCTAAACCTAGCACGC
CCTTTGATCCCCTGTGCTGGTCCCCTCCTTGTCCTCGGTGCACCTTGCATGTCTTGATGC
ATTGCCTTTACAAGATTCGAAAACTTTGCTCCCTCTTTTATCTGTCCTCTCTCCACCTTA
TTGAACAGTTTCACAAGTCCTTTCCTGTCTGGAGTGATTGTTCTGCGATGCCCTAGAAAC
CTGCGGTGACCTTCAACAGCTCTCGCCATGTTACCAGAATGTGAAGGAACGAACACATCA
CTCTCAACAGATATTATATAATCAAGAGCAGCCGTTTTAGTAGCATGGCCTGTGAAGCCT
TTTAACTCTTCTTCCCCAGCAAGCGTTTCCTTGAAGACTAGGTTAGGGAAACGAGATTTA
AGCTCCAAGAGTCTATCATCACCACCATAGATCTCCCCTGCTGCAATATAAATGACTGTT
GACTCAGGATAACCAAGACCTTTCAGGAATATCCCCACTTCTTTTGGAGTCAATGGACAC
AGCCCTTCCTCTCTCTGCTCTGTTGAGTTTATACTTTTGATCTTCCAATGGCTTGTACTC
TCCCTCATAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H434JQB U 1
AF RR4GZ12JQ U 1
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QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4GZ12JQ 790 0 0
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AAAGTCACATAAAAAAGGCCAAAAATAATCAATTAGGGTTCTTTGTGCTCCTTTGAACTG
CAAATACACTCTGGGTATGGATTCTCATAAAAGGCTTCTTCAGTTCTAAACCTAGCACGC
CCTTTGATCCCCTGTGCTGGTCCCCTCCTTGTCCTCGGTGCACCTTGCATGTCTTGATGC
ATTGCCTTTACAAGATTCGAAAACTTTGCTCCCTCTTTTATCTGTCCTCTCTCCACCTTA
TTGAACAGTTTCACAAGTCCTTTCCTGTCTGGAGTGATTGTTCTGCGATGCCCTAGAAAC
CTGCGGTGACCTTCAACAGCTCTCGCCATGTTACCAGAATGTGAAGGAACGAACACATCA
CTCTCAACAGATATTATATAATCAAGAGCAGCCGTTTTAGTAGCATGGCCTGTGAAGCCT
TTTAACTCTTCTTCCCCAGCAAGCGTTTCCTTGAAGACTAGGTTAGGGAAACGAGATTTA
AGCTCCAAGAGTCTATCATCACCACCATAGATCTCCCCTGCTGCAATATAAATGACTGTT
GACTCAGGATAACCAAGACCTTTCAGGAATATCCCCACTTCTTTTGGAGTCAATGGACAC
AGCCCTTCCTCTCTCTGCTCTGTTGAGTTTATACTTTTGATCTTCCAATGGCTTGTACTC
TCCCTCATAA

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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AACAAGATCCTTAAGGTCATCCGGAAGAACCTAGTGAAGAAGTGCCTGGAGCTCTTCTTT
GAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTACGAAGCTTTCTCCAAGAATCTG
AAGCTCGGTATTCACGAGGACTCTCAGAATCGGACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTAC
CACTCCACCAAGAGCGGTGATGATCTCACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAG
GATGGTCAGAACGATATCTTCTACATCACCGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCT
CCCTTCCTAGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGGTATGAAGTTCTGTACATGGTTGATGCGATC
GACGAGTATGCTATTGGCCAGCTCAAGGAGTTCGAAGGGAAGAAGCTTGTATCCGCAACC
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GTTATCGTATCTGACCGTGTGGTTGACTCACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATACGGG
TGGACAGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCACAGGCTTTGAGAGATAGCAGCATGGCT
GGATACATGTCGAGCAAGAAGACGATGGAGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGAGGAG
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CTGTTTGAGACTGCCCTACTCACATCTGGTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACCTTCGGG
AGCAGGATCCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGAAGACGATTCTGCCGAA
GCTGATGCAGAGATGCCTCCTCTTGAGGATGACGCTGATGCTGAGGGAAGCAAGATGGAA
GAAGTGGATTAAGAAGTTGACCAAGGGTTGTAGTTAATAATGGGTTTTTCTTGATTTTTC
TCGTTTTTTTTTCATTGTTGGAACTATTATGTCAGAGTTTTATCTCTTCTTCTAGAGAGT
ATTATTAATGGTTTTTGAC


BQ
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AF RR4BO14TF U 1
AF RR4BO14JQ C 477
BS 1 598 RR4BO14TF
BS 599 1159 RR4BO14JQ

RD RR4BO14TF 598 0 0
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AACAAGATCCTTAAGGTCATCCGGAAGAACCTAGTGAAGAAGTGCCTGGAGCTCTTCTTT
GAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTACGAAGCTTTCTCCAAGAATCTG
AAGCTCGGTATTCACGAGGACTCTCAGAATCGGACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTAC
CACTCCACCAAGAGCGGTGATGATCTCACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAG
GATGGTCAGAACGATATCTTCTACATCACCGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCT
CCCTTCCTAGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGGTATGAAGTTCTGTACATGGTTGATGCGATC
GACGAGTATGCTATTGGCCAGCTCAAGGAGTTCGAAGGGAAGAAGCTTGTATCCGCAACC
AAGGAAGGTTTGAAACTTGACGAGTCTGAGGACGAGAAGAAGAAGAAGGAAGAGCTAAAG
GAGAAGTTTGAAGGACTGTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAAGTGGAGA

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DS 

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AAAGGAGAAGTTTGAAGGACTGTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAAGTGGA
GAAGGTTATCGTATCTGACCGTGTGGTTGACTCACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATA
CGGGTGGACAGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCACAGGCTTTGAGAGATAGCAGCAT
GGCTGGATACATGTCGAGCAAGAAGACGATGGAGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGA
GGAGCTGAGGAAAAGAGCTGAAGCTGACAAGAATGACAAGTCTGTTAAGGATCTCGTTCT
TCTCCTGTTTGAGACTGCCCTACTCACATCTGGTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACCTT
CGGGAGCAGGATCCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGAAGACGATTCTGC
CGAAGCTGATGCAGAGATGCCTCCTCTTGAGGATGACGCTGATGCTGAGGGAAGCAAGAT
GGAAGAAGTGGATTAAGAAGTTGACCAAGGGTTGTAGTTAATAATGGGTTTTTCTTGATT
TTTCTCGTTTTTTTTTCATTGTTGGAACTATTATGTCAGAGTTTTATCTCTTCTTCTAGA
GAGTATTATTAATGGTTTTTGAC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL9382Contig1 738 2 1 U
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TCCCAAAACATTGGATATATATTCTCATAAGTTTAGAAATTGTTTTTTTTTTGTTGGCAA
TGAGTTGCAATGGATGTAGAGTTCTTCGAAAAGGTTGCAGCGAAACATGCATCCTTCGTC
CTTGCCTTCAATGGATCGAATCCGCCGAGTCACAAGGCCACTCCACCGTTTTTGTGGCTA
AATTCTTTGGCCGTGCCGGTCTAATGTCTTTCATCTCCGCCGTACCTGAAGCAAACCGCC
CTGCTTTGTTTCAGTCTTTGTTGTTTGAAGCGTGTGGGAGGACAGTGAATCCGGTTAACG
GAGCGGTTGGTATGTTATGGACTGGGAACTGGCACGTGTGCCAAGCGGCTGTTGAAACCG
TTCTTCGTGGCGGAACTTTAAGACCTATGTCAGATCTACTCGAATCTCCTTCTTTGAACT
CCTCAGATGAGTCTACCGAGATCTGGCGGATGCAGCGTCCAGGCGGTTCCCGGAACGACG
AGAACGGTAGAAACCACCATTACTCAAGATCCAAGCTTACTACGACGGGGATGAAGGAGT
CTCCTGTCAACCGTAAACGATCTAAGACCGAGCGGTCTGATTTGGAACTGAACCACGGGT
TAGCTCTAACCGGTCCGGTTGACCCGGCTCCTTTTCTTCCACCGCCGCCGTTCGGTAAGG
CTGTTAACAGTGATCATC


BQ
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AF RR4A145TFB U 1
AF RR4A145TF U 1
BS 1 738 RR4A145TF

RD RR4A145TFB 648 0 0
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QA 1 648 1 648
DS 

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TCCCAAAACATTGGATATATATTCTCATAAGTTTAGAAATTGTTTTTTTTTTGTTGGCAA
TGAGTTGCAATGGATGTAGAGTTCTTCGAAAAGGTTGCAGCGAAACATGCATCCTTCGTC
CTTGCCTTCAATGGATCGAATCCGCCGAGTCACAAGGCCACTCCACCGTTTTTGTGGCTA
AATTCTTTGGCCGTGCCGGTCTAATGTCTTTCATCTCCGCCGTACCTGAAGCAAACCGCC
CTGCTTTGTTTCAGTCTTTGTTGTTTGAAGCGTGTGGGAGGACAGTGAATCCGGTTAACG
GAGCGGTTGGTATGTTATGGACTGGGAACTGGCACGTGTGCCAAGCGGCTGTTGAAACCG
TTCTTCGTGGCGGAACTTTAAGACCTATGTCAGATCTACTCGAATCTCCTTCTTTGAACT
CCTCAGATGAGTCTACCGAGATCTGGCGGATGCAGCGTCCAGGCGGTTCCCGGAACGACG
AGAACGGTAGAAACCACCATTACTCAAGATCCAAGCTTACTACGACGGGGATGAAGGAGT
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CTGTTAACAGTGATCATC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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TACATTGATCCGATAAGGGATTTATGATGTCAATCCGAATCCCTTGGGGCTCTTGGGATT
TTAGAGGCTTCGCATTATGTATCATCTTCCTCGGCTCGTTCCCAGGAACAATACGAACAC
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CCAATGTCTCTTACTCTTTCAAAGGCCAAGAATCTTGGCAGCCACTAACCGAACTTAACG
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TATTAATAGAGTCAATACTTGTTTAAGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AU50TF U 1
AF RR4AU50JQ C 220
BS 1 634 RR4AU50TF
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RD RR4AU50TF 789 0 0
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TTAGAGGCTTCGCATTATGTATCATCTTCCTCGGCTCGTTCCCAGGAACAATACGAACAC
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GTGACGAA
T

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR4AU50JQ 773 0 0
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AGCCACTAACCGAACTTAACGGAACAAAATGCAAGAGATGTGGGATCTATGAGGACGACA
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GTAGATACACACACGCCAAGGACAAAGAATTCAATGCTACTTTTTTCTGCCATGGATGCT
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GAATGCATCCTGCAATCGTTGTACTGATTGTACTAGTTGTATTAGGTGTAGTCACGGTGG
GGCTTGTTGTAGGTTACAAGTATTGGCGAAAGAAGAAGCGGCAACAAGAACAAGCCCGGT
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CCTCTCTGTGTACATACACAGCTCCTTGATCTCACAAAAGGAAATCACAGTGCTTAACAT
ACACAGTTACAATCATTTGCTTATTAATAGAGTCAATACTTGTTTAAGGTTTT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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AGGAGGTGGCGACACTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCTCTTAAGG
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ATTTTTGTTCTTTTATTACGATCATTTGCTATGTT


BQ
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AF RR4FM22JQ C 1
AF RR4FM22TF U 1
BS 1 575 RR4FM22TF

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QA 1 575 1 575
DS 

RD RR4FM22TF 575 0 0
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TCCTCCTCCAAGGCCGTTACGCCGGCAAGAAGGCGGTGATCATCCGGTCCTTCGACGACG
GGAACCGCGAGCGACCATACGGACACTGCCTCGTCGCGGGACTGAAGAAGTACCCGAGCA
AGGTGATCCGCAAGGACTCGGCCAAGAAGACGACGAAGAAGTCGAGGGTCAAGTGCTTCA
TCAAGGTCGTGAACTACCAGCATCTTATGCCTACTCGTTACACGCTCGACGTGGATCTGA
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AGGCCAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACTGGGAAGAACAGGTGGTTCTTCACCA
AGCTCAGGTTTTGAGAAAGTTTTATCGTTTTTGTAACGGAATCTACAGTATGCTTTTTGT
AGTTTGTCGGAACATGTTTTGGATGGTTTAAGACTTATGGTTTGATATTTGATTCTTGGA
ATTTTTGTTCTTTTATTACGATCATTTGCTATGTT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL9385Contig1 1038 2 4 U
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GTGAAGGCCAGCAACATTTTGCTTGACTCTAAACTTGTCCCAAAAGTTTCTGATTTTGGG
CTCGCAAAACTATACGATGACAAGAAAAGCCACATAAGTACCCGAGTGGCAGGGACCATT
GGATATCTTGCGCCAGAGTATGCCGTGCGTGGACACCTAACAGAGAAAGCAGATGTATAT
GCCTTTGGTATTGTGGCTCTTGAGCTGGTGAGTGGAAGAAAAAACTCTGATGTGAACCTG
GAGAATGAAAAAAAATATCTTCTTCAGTGGGCATGGAATCTACACCAGGATGACCGAGAA
GCTGAACTAATCGATCATGAGCTGACTGGATTCAACATGGAAGAAGTAAAACGTGTGATA
GGCATTGCTCTGCTATGCACATATCATCTCATTCCTTGAGGCCACCAATGTCAAGAGTGG
TGGCTATGCTTTCAGGAGATGTTGAGGTCAGTAACGTAACCTTTCAGCTAGGCTACCTAA
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GAAACACGAATGCCTCCTGAGTTAGTGCGCTGGTGAAATAAAACACTCTCCTGTATGTTT
TCTTTGGTTCTCTATGTTTTCTTTGGTTGGAGAAACATATTTCACTTTAAGTCAATAGTA
GATTTTGATCCGCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4H575TF U 1
AF RR4H575JQB C 552
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GTGAAGGCCAGCAACATTTTGCTTGACTCTAAACTTGTCCCAAAAGTTTCTGATTTTGGG
CTCGCAAAACTATACGATGACAAGAAAAGCCACATAAGTACCCGAGTGGCAGGGACCATT
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TGGCTATGCTT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR4H575JQB 487 0 0
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TCAGGAGATGTTGAGGTCAGTAACGTAACCTTTCAGCTAGGCTACCTAACTGACTGGAGA
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AAGATCAAAGAGGGAAGATGATAATGGCTCATCTATCTATGATGTCTATACATATATAGA
CCTTTGTGGGAGATGACAATGTCTCCTCTATCTTTTTCTTTTTCTTTTTGAAACACGAAT
GCCTCCTGAGTTAGTGCGCTGGTGAAATAAAACACTCTCCTGTATGTTTTCTTTGGTTCT
CTATGTTTTCTTTGGTTGGAGAAACATATTTCACTTTAAGTCAATAGTAGATTTTGATCC
GCTTTCC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL9386Contig1 686 2 5 U
AACATAATCAGTTACAATCACACTTAACACAAAAATTATAACAAGTAAAAAAAACTAAAA
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GTAGTGAAGAAAAACCTGTTACCTAACTACTCGCTTCCAAGGTTATCATAACTGAAACCT
TCAGATATGGTCTCCAATCTCTTGTTATCTCCTTGATATTCTCCCCTGTCGCAGGAGTCC
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AAGAACCCAAAAGTAGCAGCTTCTGCATCAAGAACCGTCTCACTGAGAGGTTGTTGGTTG
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CTTTCACCATCACCATACATGAATGAAGAAGCAGGGTTGTTTGTAAAGGCAGTCTCAGAC
TTGATCATCCCTCGTCCTCCTCCTCC


BQ
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AF RR4EO40JQ U 1
AF RR4BX39JQ U 69
BS 1 229 RR4EO40JQ
BS 230 230 RR4BX39JQ
BS 231 249 RR4EO40JQ
BS 250 250 RR4BX39JQ
BS 251 686 RR4EO40JQ

RD RR4EO40JQ 686 0 0
AACATAATCAGTTACAATCACACTTAACACAAAAATTATAACAAGTAAAAAAAACTAAAA
CAGTAGAGAAAAGATGCAAAATCACACTGAAAATTACATATGATCATCTCAAACTTATTA
ACTCTAAGCTAAAGTAATAATGTTAAAATATAAAATCCCATTTTATACACCCACCCAATA
GTCTTTGTTGCAAGGAAAAAAGATCAGAGGCCTGAATATGTTACACACCGAACGGTATGA
GTAGTGAAGCAAAACCTGTTACCTAACTACTCGCTTCCAAGGTTATCATAACTGAAACCT
TCAGATATGGTCTCCAATCTCTTGTTATCTCCTTGATATTCTCCCCTGTCGCAGGAGTCC
AGGAAATTTTCAGCATCTGGCACAAGGAAGGGTGACTTATCATAGCTCTCCAGAATCTCT
GAGCTCTGAGAAAAATCAGCTGTCAGATCAGAGAGGCTGAAGTTCCGAGGGATTTGACCT
AAGAACCCAAAAGTAGCAGCTTCTGCATCAAGAACCGTCTCACTGAGAGGTTGTTGGTTG
TTACCAAAAGAAGGGATCGAAGTGTCTCCTCTAACTGTGGAATGCCCTTCCAAGGCGTTC
CTTTCACCATCACCATACATGAATGAAGAAGCAGGGTTGTTTGTAAAGGCAGTCTCAGAC
TTGATCATCCCTCGTCCTCCTCCTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR4BX39JQ 604 0 0
GG
AAGATGCAAAATCACACTGAAAATTACATATGATCATCTCAAACTTATTAACTCTAAGCT
AAAGTAATAATGTTAAAATATAAAATCCCATTTTATACACCCACCCAATAGTCTTTGTTG
CAAGGAAAAA*GATCAGAGGCCTGAATATGTTACACACCAAACGGTATGAGTAGTGAAGA
AAAACCTGTTACCTAACTACTCGCTTCCAAGGTTATCATAACTGAAACCTTCAGATATGG
TCTCCAATCTCTTGTTATCTCCTTGATATTCTCCCCTGTCGCAGGAGTCCAGGAAATTTT
CAGCATCTGGCACAAGGAAGGGTGACTTATCATAGCTCTCCAGAATCTCTGAGCTCTGAG
AAAAATCAGCTGTCAGATCAGAGAGGCTGAAGTTCCGAGGGATTTGACCTAAGAACCCAA
AAGTAGCAGCTTCTGCATCAAGAACCGTCTCACTGAGAGGTTGTTGGTTGTTACCAAAAG
AAGGGATCGAAGTGTCTCCTCTAACTGTGGAATGCCCTTCCAAGGCGTTCCTTTCACCAT
CA***TACATGAATGAAGAAGCAGGGTTGTTTGTAAAGGCAGTCTCAGACTTGATCATCC
CT

QA 3 604 3 604
DS 



AS 1 2

CO CL9387Contig1 705 2 2 U
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GAATCCGCTAGGCCTTCTAAGGCTTCATGTGATTAGAGGTGTTAATCTCGCCATTAGAGA
TTCTAAAAGTAGCGATCCTTACGTCATTGTTCGTATGGGTCAACAGAAATTACGAACTCG
TGTGGTGAAAAAGAATTTGAATCCAGACTGGAACGAGGACTTGACACTCTCTATTTCTGA
TCCAACTCTTCCTATCAAAATCATGGTTTACGATAGGGACTGGTTGTCAAGGGATGATAA
GATGGGAGATGCGGTTTTTCACATTGACCCATTCCTTGAAGTCATCAGGATGAAAAACCA
GTTCGGAGGACTCCCCGAAGGAACCGTAATAATGAAGATACAGGCAAGCAGGCAGAACTG
TCTATCAGAAGAGAGCAAGATTGTGTGGAACAAAGGAAAGATTGTCCAGAATATGTTCCT
TAGGCTCCAGAACGTTGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTTCAGCTTGAGTGGATAGATGTCCC
AGGTCTTGAGCATGAGGATGTTGCTTACTAGATCTATTTTTATATTACAGGAAGTTTGTT
AGAAAGTTTTTTAGTACATGACTTTTAGAGAAATTTCTTGTTTCAAATCAGCTAGAGTTT
TCAATTTTCAATTCTAAAATATATTAACTTTTTATGTTATATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4ES41TF U 1
AF RR4ES41JQ C 218
BS 1 538 RR4ES41TF
BS 539 705 RR4ES41JQ

RD RR4ES41TF 538 0 0
GGGGACCAAAGCTTCTTACTCTGAAGAAAAGAGAGAGGAAAAAAACAAAAACAAAATGGA
GAATCCGCTAGGCCTTCTAAGGCTTCATGTGATTAGAGGTGTTAATCTCGCCATTAGAGA
TTCTAAAAGTAGCGATCCTTACGTCATTGTTCGTATGGGTCAACAGAAATTACGAACTCG
TGTGGTGAAAAAGAATTTGAATCCAGACTGGAACGAGGACTTGACACTCTCTATTTCTGA
TCCAACTCTTCCTATCAAAATCATGGTTTACGATAGGGACTGGTTGTCAAGGGATGATAA
GATGGGAGATGCGGTTTTTCACATTGACCCATTCCTTGAAGTCATCAGGATGAAAAACCA
GTTCGGAGGACTCCCCGAAGGAACCGTAATAATGAAGATACAGGCAAGCAGGCAGAACTG
TCTATCAGAAGAGAGCAAGATTGTGTGGAACAAAGGAAAGATTGTCCAGAATATGTTCCT
TAGGCTCCAGAACGTTGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTTCAGCTTGAGTGGATAGATGTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR4ES41JQ 488 0 0
GACTTGACACTCTCTATTTCTGATCCAACTCTTCCTATCAAAATCATGGTTTACGATAGG
GACTGGTTGTCAAGGGATGATAAGATGGGAGATGCGGTTTTTCACATTGACCCATTCCTT
GAAGTCATCAGGATGAAAAACCAGTTCGGAGGACTCCCCGAAGGAACCGTAATAATGAAG
ATACAGGCAAGCAGGCAGAACTGTCTATCAGAAGAGAGCAAGATTGTGTGGAACAAAGGA
AAGATTGTCCAGAATATGTTCCTTAGGCTCCAGAACGTTGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTT
CAGCTTGAGTGGATAGATGTCCCAGGTCTTGAGCATGAGGATGTTGCTTACTAGATCTAT
TTTTATATTACAGGAAGTTTGTTAGAAAGTTTTTTAGTACATGACTTTTAGAGAAATTTC
TTGTTTCAAATCAGCTAGAGTTTTCAATTTTCAATTCTAAAATATATTAACTTTTTATGT
TATATCCC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL9388Contig1 617 2 1 U
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TCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTCATGGTGGGCT
CCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAACAACAGCAGCTCCTCA
GCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTGTCTCACGGAGGAGAAG
GCTAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCAT
TCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGATGAACGAATAACCCGGA
TCGGGTCACGGGTTCTCTAATCGTTATACATACATAAATAATAATAGTCCCATCCAACTA
AAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCAAAAGCCGTTGGATAGTGTATCGTCGTTTGTG
TTTGTACGGTCTAGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGTCAACCGTTGGATTCTCAATTAG
TTTAGCTTTATTTCAACAATTATACAGTACTGATATACGTTGACAAAAAAATATAGTACT
AATTTGGAAGTTTAAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A739JQ C 1
AF RR4A739TF U 1
BS 1 617 RR4A739TF

RD RR4A739JQ 617 0 0
GGACGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCACTCTCCCTTCGATCCGTGCA
TCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTCATGGTGGGCT
CCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAACAACAGCAGCTCCTCA
GCGAATCGGGAATCAGATTTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTGTCTCACGGAGGAGAAG
GCTAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCAT
TCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTTTGACGTGTCCGTTCGGATGAACGAATAACCCGGA
TCGGGTCACGGGTTCTCTAATCGTTATACATACATAAATAATAATAGTCCCATCCAACTA
AAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCAAAAGCCGTTGGATAGTGTATCGTCGTTTGTG
TTTGTACGGTCTAGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGTCAACCGTTGGATTCTCAATTAG
TTTAGCTTTATTTCAACAATTATACAGTACTGATATACGTTGACAAAAAAATATAGTACT
AATTTGGAAGTTTAAAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR4A739TF 617 0 0
GGACGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCACTCTCCCTTCGATCCGTGCA
TCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTCATGGTGGGCT
CCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAACAACAGCAGCTCCTCA
GCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTGTCTCACGGAGGAGAAG
GCTAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCAT
TCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGATGAACGAATAACCCGGA
TCGGGTCACGGGTTCTCTAATCGTTATACATACATAAATAATAATAGTCCCATCCAACTA
AAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCAAAAGCCGTTGGATAGTGTATCGTCGTTTGTG
TTTGTACGGTCTAGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGTCAACCGTTGGATTCTCAATTAG
TTTAGCTTTATTTCAACAATTATACAGTACTGATATACGTTGACAAAAAAATATAGTACT
AATTTGGAAGTTTAAAG

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL9389Contig1 738 2 3 U
TTTTTTTCGGTAAAAGAACAGTTTATAGAAAAGGATAAAAGAAATTACATGGAGATCGAT
GTTCTTATTTAAAGTTCTCATTCTCACCCCCAAACTATTAAATACAACAAATCAAACCCA
ACCACGAAGATAGATGTGGAAGCAGGGAAAATAGAAATGGAGAAACCAATTTTTTCACCA
AAAAACTTCGGCCAAACGTGAGAAAAAATAATTCCTTTTTTAAGAATTACGTAAGAGAAG
CAACTCTATCAGTAAGCTCTGCAACTGTTTCATCCTCTCCTTCCTCAGCTATGGTGTCCT
CTTTGTCGGTTTTAGATTGGACACCGATGCATTTAAAACCGCTGATGCTCGAACTCTTCA
TGAGGTTACGAGCACTGTAACCTCCTCCATTGTCTGCTTCCTCAGTTTCCAAGGTTGAAG
CAGCAGCTGCTCTTTCTTCTTCCTCCTCCTGCTCTCTCTAGGCAAGGTCAGATTGATCGG
TGGGATTAGAAAAAGTGGGTTCGTGATTATGATTATTATTGGAAGAAGAAGAAGGACGCT
GAAAAAGCCAACGACGAACACCGTCGACGAGATTGCCACCACCACCCATCTACTTAGATT
AGAAAAAAAACAGTTTAAAGATTTGCTAATTTACGATATTGGGTCTCCGATTCTCCTTCT
CAGCCAATTGATTCTCAGTCAAAATCACCTTCTTTCTCGGATCCTCTCTCCCTTTTGTCC
TTCCTTCCCAGTTGCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CL23JQ U 7
AF RR4CL23TF C 1
BS 1 11 RR4CL23TF
BS 12 599 RR4CL23JQ
BS 600 738 RR4CL23TF

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CGGTA
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GCACTGTAACCTCCTCCATTGTCTGCTTCCTCAGTTTCCAAGGTTGAAGCAGCAGCTGCT
CTTTCTTCTTCCTCCTCCTGCTCTCTCTAGGCAAGGTCAGATTGATCGGTGGGATTAGAA
AAAGTGGGTTCGTGATTATGATTATTATTGGAAGAAGAAGAAGGACGCTGAAAAAGCCAA
CGACGAACACCGTCGACGAGATTGCCACCACCACCCATCTACTTAGAT

QA 6 593 6 593
DS 

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ACCACGAAGATAGATGTGGAAGCAGGGAAAATAGAAATGGAGAAACCAATTTTTTCACCA
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CTTTGTCGGTTTTAGATTGGACACCGATGCATTTAGAACCGCTGATGCTCGAACTCTTCA
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CAGCAGCTGCTCTTTCTTCTTCCTCCTCCTGCTCTCTCTAGGCAAGGTCAGATTGATCGG
TGGGATTAGAAAAAGTGGGTTCGTGATTATGATTATTATTGGAAGAAGAAGAAGGACGCT
GAAAAAGCCAACGACGAACACCGTCGACGAGATTGCCACCACCACCCATCTACTTAGATT
AGAAAAAAAACAGTTTAAAGATTTGCTAATTTACGATATTGGGTCTCCGATTCTCCTTCT
CAGCCAATTGATTCTCAGTCAAAATCACCTTCTTTCTCGGATCCTCTCTCCCTTTTGTCC
TTCCTTCCCAGTTGCTCA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4FL06TF U 1
AF RR4GS34TF U 82
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RD RR4FL06TF 693 0 0
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TCTCTTCACACTCACCCAGATTCAGCCCAGAGTTGTCTCTTTCGAGGAACAGGCACTTGT
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QA 1 693 1 693
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TCAGATTGAAAACGCCAAATAGGGATG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4AZ82TF U 1
AF RR4AZ82JQ C 122
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TATTCCAAATGAGAGTGAGGATGAAGAACTTGATGGGTGTTATGGAAGGAGGATCCATTC
CTGCACTAAGCGAGCTCGAGGACGCAATGAAAGCAGAACAAAAGGCTCCACCTGGAACCG
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ATCCAGGTCCTCGTGGCTTTGGCAACTAAACCACCACTTGAATCATCATTAGAAAA*CAT
ATAAAAGCTTCCTCTTTATTCCTTATATCAGA

QA 1 812 1 812
DS 

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GCTTTCTTTTGTAGAGAAGGCAGAAGAAGTTATGCGTCAAGAAGATGCTGAAGATCTACA
GAAGAAGATAATGAGTGCAAAGTTCGACTTCAACGATTTCCTAAAGCAGACTCGTGCTGT
TGCCAAAATGGGTTCGATGACACGAGTTCTTGGAATGATTCCCGGTATGGGGAAAGTGAG
TCCAGCGCAGATACGAGACGCTGAGAAGAGTCTTGTAGTCATGGAAGCAATGATCGAAGC
CATGACACCTGAGGAAAGAGAGAAGCCAGAGTTACTAGCAGAATCTCCAGAGAGAAGGAA
AAGAGTTGCTGAAGATTCAGGAAAAACAGAACAACAGGTGAGCCAACTTGTGGCACAAAT
ATTCCAAATGAGAGTGAGGATGAAGAACTTGATGGGTGTTATGGAAGGAGGATCCATTCC
TGCACTAAGCGAGCTCGAGGACGCAATGAAAGCAGAACAAAAGGCTCCACCTGGAACCGC
AAGGAGGAAGAAGAGAAAGGCGGACTCAAGGAAGACATTTGTGGAGTCTGCATCAAGCAA
TCCAGGTCCTCGTGGCTTTGGCAACTAAACCACCACTTGAATCATCATTAGAAAAACATA
TAAAAGCTTCCTCTTTATTCCTTATATCAGATCAAAACCATTAGAAATCAAATAAAAATT
GTGCAACTACATTTACTTAAAAAGAGTTTTTCATTAC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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GTGATGCTTACTGACTTCGACCTCTCCCTGAGGTGTACCGTTAGCCCTACAGTGGTCAGA
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GCTTGCATCCAACAGCCATCTTGCATGTCTGCTCCGACAACATGCTTTTCTCCACGGTTT
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GAATTTGAGAGTGCTCCTCCTACTCCTGCACCAGCCACATCTACCAGTGTCAAGTCTGAT
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GAATTTTTAGTTCTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RR4B153TF U 1
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BS 816 919 RR4B153JQ

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GAATCTCCAGTTGTCAGTTTTGCTGCTAGGGATTTGATTAGGAGTCTGCTTGTGAAGGAG
CCTCAGCATAGATTAGCGTACAAGCGTGGTGCAACCGAGATTAAGCAGCATCCTTTCTTT
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GAATTTGAGAGTGCTCCTCCTACTCCTGCACCAGCCACATCTACCAGTGTCAAGTCTGAT
CAGAGTAGCTATCTGGACTTTGATTTCTTTTGATA

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DS 

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AGAGTGCTCCTCCTACTCCTGCACCAGCCACATCTACCAGTGTCAAGTCTGATCAGAGTA
GCTATCTGGACTTTGATTTCTTTTGATATTTTTCAGTAAGAAAACTGCCATTAGATTATC
TTATTGATTATCAAACCTTTATCAACAATGTGCAACTCAGTTTAATACTTGAAGAATTTT
TAGTTCTTTGCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

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TGAATGCCAAGAAGCTGCGAAAGTTCTCTTGACTGCATCTGGGAACAGCGAGCTGGAACC
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AAATGGAACATGGATTGATACATTTCTATTGTACCAACAATTTGACAATACGTAATGTAA
ATCATTTATCTTTT


BQ
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AF RR4BS35TF U 1
AF RR4BS35JQ C 18
BS 1 568 RR4BS35TF
BS 569 569 RR4BS35JQ
BS 570 600 RR4BS35TF
BS 601 734 RR4BS35JQ

RD RR4BS35TF 600 0 0
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TGAATGCCAAGAAGCTGCGAAAGTTCTCTTGACTGCATCTGGGAACAGCGAGCTGGAACC
TACCTTGTCCAATGTTGGGCATGCGGTCTATGAAGCTCACAAGCATGAGCTGAAACCGGT
GTTAGCTAGAAGAGCGGAGCATTATTTCTCGGAAAACATGCGGGTTACTAAAGGATTGGA
AGCGTGGGCTACAGGCAATCTTGAAGAATTTGGAAAGTTAATTTCAGCGTCAGGCTTGAG
CTCTATTGAGAACTACGAATGCGGTGCGGAGCCACTGATTCAGCTGTACAAGATTCTACT
AAAGGCACCGGGTGTATATGGAGCACGGTTCAGTGGTGCAGGCTTCAGGGGATGTTGTGT
GGCCTTTGTGGATGCAGAAACAGCTGAGGAAGCTGCTTCATATGTGAAGGATGAATATGA
AAAGGCCCAACCCGAGTTTGCGAAGAAACTGAAAGGAAAACCTGTTCTCATCTGTGAAGC
AGGTGACTCTGCTCGTGTTCTCTGATCACACTCGAAGTCTTGTTCCCTCGAGTTCTCTGT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR4BS35JQ 717 0 0
GACAGGCGTTGACCACCAACCCAGGATATAATCTGCGAGTTTCTGAATGCCAAGAAGCTG
CGAAAGTTCTCTTGACTGCATCTGGGAACAGCGAGCTGGAACCTACCTTGTCCAATGTTG
GGCATGCGGTCTATGAAGCTCACAAGCATGAGCTGAAACCGGTGTTAGCTAGAAGAGCGG
AGCATTATTTCTCGGAAAACATGCGGGTTACTAAAGGATTGGAAGCGTGGGCTACAGGCA
ATCTTGAAGAATTTGGAAAGTTAATTTCAGCGTCAGGCTTGAGCTCTATTGAGAACTACG
AATGCGGTGCGGAGCCACTGATTCAGCTGTACAAGATTCTACTAAAGGCACCGGGTGTAT
ATGGAGCACGGTTCAGTGGTGCAGGCTTCAGGGGATGTTGTGTGGCCTTTGTGGATGCAG
AAACAGCTGAGGAAGCTGCTTCATATGTGAAGGATGAATATGAAAAGGCCCAACCCGAGT
TTGCGAAGAAACTGAAAGGAAAACCTGTTTTCATCTGTGAAGCAGGTGACTCTGCTCGTG
TTCTCTGATCAAACTCGAAGTCTTGTTCCCTCGAGTTCTCTGTTATGCTTGTTGATTCTT
ATTTTTATTATTCTCTCTCTGTGAGATTCTTTGGTCCCTGTAGAAATGGAACATGGATTG
ATACATTTCTATTGTACCAACAATTTGACAATACGTAATGTAAATCATTTATCTTTT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL9394Contig1 600 2 2 U
GGGCAGAGGACGCAGCAGTCGTGGTGGTGGTCGAGGAGGAAGAGGAGGAGGGTACAATGG
TCCTCAGAATGAGTATGATGCACCGCAAGACGAAGGTTACGGTTATGATGTTCCTCAAGA
ACACCGTGGATATGATGACCGTGGCGGCTACGATGCTCCTCAGCGTCGTGGTGGTTACAA
TGGAGGTCGTGGAAGAGGAGGGGGTCGCGGTGGTGGTGGTGGATTCAACAACAGATCAGA
TGGACCACCAGTCCAGGCAGTTGCTTGAGCGTGAGGTTTCTATGTTACACAAAACATAAA
AAAAGAAAAGAAAAAAAAGGCCAAGAGTCGTTTGATGTTTTGTTCTATCTCCTTGCTATC
TCTCTCCCTCTATGTTTTGATTCTGTCCACGAAGAAGACATGTTTGCCATAAAGTGTATC
TCCTTTTTTTTTGTTTTATTCCATTGATCCACAGTTTTTTTTTAGTTGGTGACTGTTTTT
CTTTAAAGTCGCTTTAGGGTTTAAATGTTCATTTTCTTAGAGATTTTACCTTCTCTGTTT
ATTTGCTTTGTTATTTTGTAGTCTTGTTTAGGTGAGAGAGTAAGAGTGAATTAATAATTT


BQ
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AF RR4E175TF U 1
AF RR4EB51TF U 1
BS 1 567 RR4E175TF
BS 568 600 RR4EB51TF

RD RR4E175TF 567 0 0
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TCCTCAGAATGAGTATGATGCACCGCAAGACGAAGGTTACGGTTATGATGTTCCTCAAGA
ACACCGTGGATATGATGACCGTGGCGGCTACGATGCTCCTCAGCGTCGTGGTGGTTACAA
TGGAGGTCGTGGAAGAGGAGGGGGTCGCGGTGGTGGTGGTGGATTCAACAACAGATCAGA
TGGACCACCAGTCCAGGCAGTTGCTTGAGCGTGAGGTTTCTATGTTACACAAAACATAAA
AAAAGAAAAGAAAAAAAAGGCCAAGAGTCGTTTGATGTTTTGTTCTATCTCCTTGCTATC
TCTCTCCCTCTATGTTTTGATTCTGTCCACGAAGAAGACATGTTTGCCATAAAGTGTATC
TCCTTTTTTTTTGTTTTATTCCATTGATCCACAGTTTTTTTTTAGTTGGTGACTGTTTTT
CTTTAAAGTCGCTTTAGGGTTTAAATGTTCATTTTCTTAGAGATTTTACCTTCTCTGTTT
ATTTGCTTTGTTATTTTGTAGTCTTGT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR4EB51TF 600 0 0
GGGCAGAGGACGCAGCAGTCGTGGTGGTGGTCGAGGAGGAAGAGGAGGAGGGTACAATGG
TCCTCAGAATGAGTATGATGCACCGCAAGACGAAGGTTACGGTTATGATGTTCCTCAAGA
ACACCGTGGATATGATGACCGTGGCGGCTACGATGCTCCTCAGCGTCGTGGTGGTTACAA
TGGAGGTCGTGGAAGAGGAGGGGGTCGCGGTGGTGGTGGTGGATTCAACAACAGATCAGA
TGGACCACCAGTCCAGGCAGTTGCTTGAGCGTGAGGTTTCTATGTTACACAAAACATAAA
AAAAGAAAAGAAAAAAAAGGCCAAGAGTCGTTTGATGTTTTGTTCTATCTCCTTGCTATC
TCTCTCCCTCTATGTTTTGATTCTGTCCACGAAGAAGACATGTTTGCCATAAAGTGTATC
TCCTTTTTTTTTGTTTTATTCCATTGATCCACAGTTTTTTTTTAGTTGGTGACTGTTTTT
CTTTAAAGTCGCTTTAGGGTTTAAATGTTCATTTTCTTAGAGATTTTACCTTCTCTGTTT
ATTTGCTTTGTTATTTTGTAGTCTTGTTTAGGTGAGAGAGTAAGAGTGAATTAATAATTT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL9395Contig1 1174 2 2 U
GGAGGTCCGAACAGTTCTTCATCTCCGCCGTACCAAAGCTAAACTCGATCTAGGGTTTTG
ACGGCATTCTTTCATCTTCTACCTAAAAATCTTCATTCAAAGCATCTCCCCTCTCTACAA
GGCGGTGGATACCAAGCTATAAAAAGTTTTCACGAGACAATTTGTGTCTGCTCGATTTCT
ACTCCGGCAACCTTCTCTGAGAAACTGTCAAAGTTTGATAAGGAATAGGAAAGGCAGAGG
AAATTGCAACAACAACTCAGCGTTGTTGATGTTGTTCGCGAGGAAGCTTTGCGCATCTAC
AGATTTGCAGAAATGAAACCAAAAATTCTTACATCTATGTTTAGTAAATGACTTTCAGTG
TGTATATATATTTAGAGAGAGGGAGAGAGGCTTCAACATCGGTGTCTTTTGTTTGATTTT
TGTATCAGATGGTCTTCATTGCAGCTTTAATTGGTCCTTCAAAATCTCCACTCAGTGATG
TGTGCCTTCTGAGATGCCTCTCCAACTCCTCTATTTCCAACAAATTTCTCGCTTTCTTTC
TCATAATGGCAACGAAGCTTTGGGTTGAACGGAGACCACTTTAGACAAGTAGTCAAGAAG
AGATTGGGGGGCCTGGAATGTAAAGAATGGGGGGGGGGGGTGAGTTGATGAGTGTGTATG
TGCTTCTGCTTGATGGTAAGGTGTAGAATCTCAACTGATGAAGGCTTAGATCGAGATGTT
TAATCTCACTCTAAAGATACAACTGGCGTTTCGGTGAGTTATCAGTTATCACACAATTAT
GGAATGATCACATACATCTATGGATTTCCCAGAATAGAACTCGCTTGAGAGTAGGAGCGA
TGACTATGAAATATTGGTTTCCCGAGAGAGAGTTATGCGCACTCCAAGCCGCACCGCAAT
TAGTGAAATCATTCAACCAGGAAGCCCCGACGTCGCAATCTTCTAAAATGGTGAAATCTT
CAGTTTCTTCAGTTTGAGTTGAAGGCTGGTCGGTGTAAGGAGACTATTGTACCCGTCTCT
TCAGTTTCTAGAAAGCTAGGAATGTGGAAAAGGTGTTGCAGACACAGATTGTCAGTCTTC
ACTTGCATTACACTACACATTGACAGTAAGCATATATGATTTTATTTCTTACTCACATCA
GACGTTTGAGAACAGCATAGAGAGGAGTGTTTCT


BQ
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AF RR4DM60TF U 1
AF RR4DM60JQ C 510
BS 1 636 RR4DM60TF
BS 637 1174 RR4DM60JQ

RD RR4DM60TF 636 0 0
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ACGGCATTCTTTCATCTTCTACCTAAAAATCTTCATTCAAAGCATCTCCCCTCTCTACAA
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ACTCCGGCAACCTTCTCTGAGAAACTGTCAAAGTTTGATAAGGAATAGGAAAGGCAGAGG
AAATTGCAACAACAACTCAGCGTTGTTGATGTTGTTCGCGAGGAAGCTTTGCGCATCTAC
AGATTTGCAGAAATGAAACCAAAAATTCTTACATCTATGTTTAGTAAATGACTTTCAGTG
TGTATATATATTTAGAGAGAGGGAGAGAGGCTTCAACATCGGTGTCTTTTGTTTGATTTT
TGTATCAGATGGTCTTCATTGCAGCTTTAATTGGTCCTTCAAAATCTCCACTCAGTGATG
TGTGCCTTCTGAGATGCCTCTCCAACTCCTCTATTTCCAACAAATTTCTCGCTTTCTTTC
TCATAATGGCAACGAAGCTTTGGGTTGAACGGAGACCACTTTAGACAAGTAGTCAAGAAG
AGATTGGGGGGCCTGGAATGTAAAGAATGGGGGGGG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR4DM60JQ 665 0 0
TCTATTTCCAACAAATTTCTCGCTTTCTTTCTCATAATGGCAACGAAGCTTTGGGTTGAA
CGGAGACCACTTTAGACAAGTAGTCAAGAAGAGATTGGGGGGCCTGGAATGTAAAGAATG
GGGGGGGGGGGTGAGTTGATGAGTGTGTATGTGCTTCTGCTTGATGGTAAGGTGTAGAAT
CTCAACTGATGAAGGCTTAGATCGAGATGTTTAATCTCACTCTAAAGATACAACTGGCGT
TTCGGTGAGTTATCAGTTATCACACAATTATGGAATGATCACATACATCTATGGATTTCC
CAGAATAGAACTCGCTTGAGAGTAGGAGCGATGACTATGAAATATTGGTTTCCCGAGAGA
GAGTTATGCGCACTCCAAGCCGCACCGCAATTAGTGAAATCATTCAACCAGGAAGCCCCG
ACGTCGCAATCTTCTAAAATGGTGAAATCTTCAGTTTCTTCAGTTTGAGTTGAAGGCTGG
TCGGTGTAAGGAGACTATTGTACCCGTCTCTTCAGTTTCTAGAAAGCTAGGAATGTGGAA
AAGGTGTTGCAGACACAGATTGTCAGTCTTCACTTGCATTACACTACACATTGACAGTAA
GCATATATGATTTTATTTCTTACTCACATCAGACGTTTGAGAACAGCATAGAGAGGAGTG
TTTCT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL9396Contig1 793 2 4 U
GGACTGCATGTAATAGTTACCTTCTTCCGATCGTATTCAATATTCATAGCACACAAGAGA
AGGTCATACACATTTTACAAAGTTTTTTTTGTTTGTTTGACTTCTTCCGTCATGAGATAT
GCGATAGTTGGTGTGTTGTTTATGTTCTCTTCGGTCGTCTTGGAGTTGAGCAATGCCATG
GCACCTTCTGTTTCGTATGAATGGGTTGCCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGAGCC
CACAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCA
GGCGATGTAGTAAATGTCAATATTTTCAACCGTTTGACCGAACCCTTTCTCATGACCTGG
AATGGGTTGCAAATGAGGAAAAACTCATGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCC
ATACTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGTTAC
TTTTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATTCGGGTCAATTAGAGTC
TACAGTCCAGAACTGGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATCTTG
ATCGGAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGTCTC
AGTTTAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTCTTT
GCATTTCAACCAGGTAAAACATATAGGCTGAGAATATCAAACGTGGGTCTCAAGACATCC
TTAAACTTCACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D333TF U 1
AF RR4AE59TF U 23
BS 1 208 RR4D333TF
BS 209 209 RR4AE59TF
BS 210 715 RR4D333TF
BS 716 793 RR4AE59TF

RD RR4D333TF 715 0 0
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GCGATAGTTGGTGTGTTGTTTATGTTCTCTTCGGTCGTCTTGGAGTTGAGCAATGCCATG
GCACCTTCTGTTTCGTATGAATGGGTTGTCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGAGCC
CACAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCA
GGCGATGTAGTAAATGTCAATATTTTCAACCGTTTGACCGAACCCTTTCTCATGACCTGG
AATGGGTTGCAAATGAGGAAAAACTCATGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCC
ATACTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGTTAC
TTTTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATTCGGGTCAATTAGAGTC
TACAGTCCAGAACTGGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATCTTG
ATCGGAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGTCTC
AGTTTAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR4AE59TF 771 0 0
GT
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TTTTT*GTTTGTTTGACTTCTTCCGTCATGAGATATGCGATAGTTGGTGTGTTGTTTATG
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GTTGCCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGAGCCCACAAGCAGGTCATAGTGATCAAC
GACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCAGGCGATGTAGTAAATGTCAATATT
TTCAACCGTTTGACCGAACCCTTTCTCATGACCTGGAATGGGTTGCAAATGAGGAAAAAC
TCATGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCCATACTACCGGGAACAAATTGGACG
TACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGTTACTTTTACTTCCCGACACTTCTGTTC
CAAAAGGCGGCCGGAGGATTCGGGTCAATTAGAGTCTACAGTCCAGAACTGGTCCCGGTT
CCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATCTTGATCGGAGACTGGTTCAATAATGAC
TATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGTCTCAGTTTAGCAACTCCTGATGGTATT
CTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTCTTTGCATTTCAACCAGGTAAAACATAT
AGGCTGAGAATATCAAACGTGGGTCTCAAGACATCCTTAAACTTCACGA

QA 3 771 3 771
DS 



AS 1 2

CO CL9397Contig1 883 2 6 U
GGGACAACACAAAATATTACTTATAAACCAAAGAAAAACAGAGCAACTACAAAGAAAAAA
GAGAGTGAAAGAGAGAATGGCTAACTTTGGAACAGAACGAGTTTACCAAGAATTCGAGCC
TGCAACTAGATGGACCTCTGAACCAGGCGCCGAGGTCCTTGTCGCTGATCTCCCAGGATT
CAAGTAAGAACAGGTTAAGGTGGCTGTAACCTCAACAAGGAAGCTGAGACTAACGGGAGA
ACGTCCAACTGGTGGAAACAAATGGATTCGTTTCCACCGGGAGATACCCGTTCCTCTGAC
CGTTGATATCGACTCTGTTTCAGCTATGTTCAAAGATTACAAACTCTACATCAGACATCC
CAAAGTCAAGACAGAAACCCCTCAAACTAAGCCACCACCATCACCGGTCAAACCACCGGT
GGTCACAAAACCCCATGATCAACATGAGGCAAAACAAAGCCAAGGTTCTAAGCCAAACGA
TCAGCTGAAACATAATGATGCAGAGCAAAAAGCAGGGGAAGTAAAGAGTGACAAAGAGGG
ATTAGTTGGTGAGCCTAAAGGAACTTTGAGCTCCAAGGACGAGGAGAAGGACAGAGTTGG
AGCCAAATGGTTTGAGAAGTACAAAGAGGCAACTGGAAACGTGGTAAAGGAAGCTAAAAG
CAAAAGGCAGTTACTCTGCAATTTGACTGCTTCGATTGTATTGGTTCTGCTAATCCTACT
GTATGCTAGAAATGCAGTACGTTCATCCCTGTTCTGGAACTCCGAGGAATGATTTACATT
TGCCTCTCATTGATGTATAAGATTTGCTTATGCACATAAAAACAAATAAATATTTGAAAA
TTACCCTATTTATATATATTCATGTACACAAATTTGTGATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4CW74TF U 1
AF RR4CW74JQ C 140
BS 1 666 RR4CW74TF
BS 667 667 RR4CW74JQ
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RD RR4CW74TF 730 0 0
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GAGAGTGAAAGAGAGAATGGCTAACTTTGGAACAGAACGAGTTTACCAAGAATTCGAGCC
TGCAACTAGATGGACCTCTGAACCAGGCGCCGAGGTCCTTGTCGCTGATCTCCCAGGATT
CAAGTAAGAACAGGTTAAGGTGGCTGTAACCTCAACAAGGAAGCTGAGACTAACGGGAGA
ACGTCCAACTGGTGGAAACAAATGGATTCGTTTCCACCGGGAGATACCCGTTCCTCTGAC
CGTTGATATCGACTCTGTTTCAGCTATGTTCAAAGATTACAAACTCTACATCAGACATCC
CAAAGTCAAGACAGAAACCCCTCAAACTAAGCCACCACCATCACCGGTCAAACCACCGGT
GGTCACAAAACCCCATGATCAACATGAGGCAAAACAAAGCCAAGGTTCTAAGCCAAACGA
TCAGCTGAAACATAATGATGCAGAGCAAAAAGCAGGGGAAGTAAAGAGTGACAAAGAGGG
ATTAGTTGGTGAGCCTAAAGGAACTTTGAGCTCCAAGGACGAGGAGAAGGACAGAGTTGG
AGCCAAATGGTTTGAGAAGTACAAAGAGGCAACTGGAAACGTGGTAAAGGAAGCTAAAAG
CAAAAG*CAGT*ACTCTGCAATTTGACTGCTTCGATTGTATTGGTTCTGCTAATCCTACT
GTATGCTAGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR4CW74JQ 744 0 0
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CCTCAAATTAAGCCACCACCATCACCGGTCAAACCACCGGTGGTCACAAAACCCCATGAT
CAACATGAGGCAAAACAAAGCCAAGGTTTTAAGCCAAACGATCAGCTGAAACATAATGAT
GCAGAGCAAAAAGCAGGGGAAGTAAAGAGTGACAAAGAGGGATTAGTTGGTGAGCCTAAA
GGAACTTTGAGCTCCAAGGACGAGGAGAAGGACAGAGTTGGAGCCAAATGGTTTGAGAAG
TACAAAGAGGCAACTGGAAACGTGGTAAAGGAAGCTAAAAGCAAAAGGCAGTTACTCTGC
AATTTGACTGCTTCGATTGTATTGGTTCTGCTAATCCTACTGTATGCTAGAAATGCAGTA
CGTTCATCCCTGTTCTGGAACTCCGAGGAATGATTTACATTTGCCTCTCATTGATGTATA
AGATTTGCTTATGCACATAAAAACAAATAAATATTTGAAAATTACCCTATTTATATATAT
TCATGTACACAAATTTGTGATGAG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL9398Contig1 574 2 1 U
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TAGTTGGAACGAGACACAGAGCAAGAAAGGAAGACAAGTATATTTAGGTGCGTATGACGA
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TCACATGATCCTTGTTTATTTCACAATCTTTCTTGCCTACATGTATTTTTATAAACAGAA
TACAAAGAAAGAAGAAGAGCATGTTTACAATTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RR4FG51JQ C 1
AF RR4FG51TF U 1
BS 1 574 RR4FG51TF

RD RR4FG51JQ 574 0 0
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QA 1 574 1 574
DS 

RD RR4FG51TF 574 0 0
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TACAAAGAAAGAAGAAGAGCATGTTTACAATTAG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL9399Contig1 734 2 4 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR4A454TF C 1
AF RR4A454JQ U 47
BS 1 46 RR4A454TF
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BS 135 135 RR4A454TF
BS 136 734 RR4A454JQ

RD RR4A454TF 734 0 0
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GTAAGTGAAAGTTGCTCCAATTGGATCTATCACAGATTCATCTTGCTCTTCTGTTTCCTC
CTGTTTCACTTCAGGCTCCTCTTCTTCTGAAGCATCTGCTTGATCATCTTTGGCCTCAGT
TAGAGGGGAGTCATCTGCTGGGCTGGAGCTAGTAGATCTTCTTGTAGGAGAGGTATCAGG
TGTTTTCTTATTCCCAGCAACGAGAACTTGAGAGGGAGCAGCCACTGCTGCTGCTCTCTG
TGAAGCCTGACCCG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR4A454JQ 688 0 0
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CCATTGGTGTTTGAGTGATTTTAGAACAAGTCAAACTTCTTCTTAAACAGATCTTGCTTC
CAACGTGGTAAGTTGTTGAATGCTTCTTTCTCCATCCCAAACACACTTCGGAACTCTTCC
TCAGATAGATAAGCCTCTCTGCGCTTGTTATCTATTCCAGTCACAGGGTCCTCAGAATTA
GCTTTCAGCTGCTCGTAAGTGAAAGTTGCTCCAATTGGATCTATCACAGATTCATCTTGC
TCTTCTGTTTCCTCCTGTTTCACTTCAGGCTCCTCTTCTTCTGAAGCATCTGCTTGATCA
TCTTTGGCCTCAGTTAGAGGGGAGTCATCTGCTGGGCTGGAGCTAGTAGATCTTCTTGTA
GGAGAGGTATCAGGTGTTTTCTTATTCCCAGCAACGAGAACTTGAGAGGGAGCAGCCACT
GCTGCTGCTCTCTGTGAAGCCTGACCCG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL9400Contig1 664 2 3 U
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TCTGTTCCTTCCTTAGGGAAATGACCACTGGAGTAGAAGTCATTGAGAAGCCTGTCTTTG
AGCTGGAACGTGTCCATTAACCAATCATTGATTTCTTTTTCTTGATTTGGGATTTGGCTT
TGGTTGATTCGACGGATGTGGATGTGCACTTCTGATGGTTCGATACCGTAGACATTGCCT
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CAGCTCAGTTCTTGCAAGCATGAGACGAAACCTTTAGTCCTTGGAAGCAGGACGTTGTTC
AGTACCGGTAAGCCATGCTCAGACGCAAACTTCTTGCTCCTTTCGCATTTAGCCTCCGTG
TAAT


BQ
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GG
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TAAT

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DS 



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QA 1 574 1 574
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AS 1 2

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BQ
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AF RR4F555TF U 1
AF RR4F555JQ C 75
BS 1 648 RR4F555TF
BS 649 740 RR4F555JQ

RD RR4F555TF 648 0 0
GGAGGAAGAGTTGAGCTGGGATATTGATGATGAAGAGGAGACTAGCAGCAGTGAGATAGT
TGTTGAAAGCGCTGCCAAAGATGTTTCCAGATTGAAACTTGAAGGGAGTAATGATGATGA
TATGGGTAGTGGAGGAGATGTTAGCAAGACTGCGAAAGATGATGATCAAGTGAGCAATGT
TGGTTTGAAGACAGACACAGATTCACAAGTTCCAGAAGAATCAAAACCAGTTGTTGAAGA
GTCGCCTACTCCTCCTACCTCTGATGAGGCTCCAATCCAAGATGCGGTCAAACCAGAAGA
AGCTGTTCCCAAATCCGAGGAGAGTGCTGCTCCATCAGCTAAACCAGATGGTGCAGCTTC
TTCATCAACTCAGGAAGAGGATATGGGATGGGACGAGATTGAGGATATGAGCAGCATCGA
TGGTAAAGAAGCGAGTGGAAGTCCAGAAAACAGAGCTGAGCTGCGTAAACGCCTGAGTGC
TGCAGAGGAAGAAGATGAAGAAGACTTGAGTTGGGACATTGAAGATGATGATGACGAGGA
AGAAACATCACCATCAACAAAAGCTTAATGCAGTCTTAAGTGTTGTGCTTTTTTAATTTC
TCTCCTACTTAATCATCATTATTATCTTGTTTTCTCTTTAAACGTTCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR4F555JQ 666 0 0
CCAAAGATGTTTCCAGATTGAAACTTGAAGGGAGTAATGATGATGATATGGGTAGTGGAG
GAGATGTTAGCAAGACTGCGAAAGATGATGATCAAGTGAGCAATGTTGGTTTGAAGACAG
ACACAGATTCACAAGTTCCAGAAGAATCAAAACCAGTTGTTGAAGAGTCGCCTACTCCTC
CTACCTCTGATGAGGCTCCAATCCAAGATGCGGTCAAACCAGAAGAAGCTGTTCCCAAAT
CCGAGGAGAGTGCTGCTCCATCAGCTAAACCAGATGGTGCAGCTTCTTCATCAACTCAGG
AAGAGGATATGGGATGGGACGAGATTGAGGATATGAGCAGCATCGATGGTAAAGAAGCGA
GTGGAAGTCCAGAAAACAGAGCTGAGCTGCGTAAACGCCTGAGTGCTGCAGAGGAAGAAG
ATGAAGAAGACTTGAGTTGGGACATTGAAGATGATGATGACGAGGAAGAAACATCACCAT
CAACAAAAGCTTAATGCAGTCTTAAGTGTTGTGCTTTTTTAATTTCTCTCCTACTTAATC
ATCATTATTATCTTGTTTTCTCTTTAAACGTTCTGTTTTATTTCATTTGAAAATCATATG
CTTGATTTGATGATGTAGTGTTCCAAACTTGCCAATTCGATTGAAAATTGAAATATTAAT
AATACC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL9403Contig1 882 2 4 U
GGGATCGGAACGCAGCGACGAATCGTTAATCATTATGTCAATAGGAACGATGCAGGAGAT
CGAAGAGACTTCTCCTTTGCTTGACGATTCTCAACCCGAAGGCCAATCGAGATCGCAATC
CGCGACGACGAAGGTGCCGGAGGTGGAGATCCACATGTATCGGTGCGGGAAAGGTCCGAT
CGACGTGTTCAAGTAGAATCTCGGAGGCTGGGAGCAGGATCAGCTCGAGGTTCGACCTAT
CCTCGATAAATACGGATTGAAATCGATCTTCACTTTCAACGTCGAGAAAGGTCGTGGCGT
CCCGATCCGCTTTAATCCTAGGAACGGTCGGTCTATGCTGACGTATAGAGATGGTGCCGT
CGTATACATCGACGGCGAACCTCAGGACTCTATGATCCAACCCATCACAAGGATCGTGCT
CGGAGTCGTGATTGCTACGCTGTTGATAACGTTTCTTATGAAGGACCCTCCGGCGTGGAT
CAAGAACAACATCTCCCTTGGGAACTTCCCTCCGTGGGTGCTTGCGTGCATAGTTATAGT
GTTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGGGACTTTTTCAGGAAGTATGGCTGGTAGTATCA
CACAGACACTGACACCCGTCTGGCTTGAAAATTTGGTCGAAATTGTAGTCCTCCAATCGA
CCATTTAGAGAGATGTTTTCTTGTCTCAACCCAACAAGTTCCCTTCCTTTGTTAACCACC
ATTTGTTTCTTTGATAAGGCCTCATGCGCCAATTTGCTTGCTTTCAGAACCAAGAGAGAG
AGAGAGATAGAGCAATCATTGTCTCCGTTTTGCATTCTTGTTGAACTTGATAGTTTTATG
AATTTTCATGTGTTTGCGACGTGCAAACTGATACTACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4D340TF U 1
AF RR4D340JQ C 155
BS 1 688 RR4D340TF
BS 689 689 RR4D340JQ
BS 690 733 RR4D340TF
BS 734 882 RR4D340JQ

RD RR4D340TF 733 0 0
GGGATCGGAACGCAGCGACGAATCGTTAATCATTATGTCAATAGGAACGATGCAGGAGAT
CGAAGAGACTTCTCCTTTGCTTGACGATTCTCAACCCGAAGGCCAATCGAGATCGCAATC
CGCGACGACGAAGGTGCCGGAGGTGGAGATCCACATGTATCGGTGCGGGAAAGGTCCGAT
CGACGTGTTCAAGTAGAATCTCGGAGGCTGGGAGCAGGATCAGCTCGAGGTTCGACCTAT
CCTCGATAAATACGGATTGAAATCGATCTTCACTTTCAACGTCGAGAAAGGTCGTGGCGT
CCCGATCCGCTTTAATCCTAGGAACGGTCGGTCTATGCTGACGTATAGAGATGGTGCCGT
CGTATACATCGACGGCGAACCTCAGGACTCTATGATCCAACCCATCACAAGGATCGTGCT
CGGAGTCGTGATTGCTACGCTGTTGATAACGTTTCTTATGAAGGACCCTCCGGCGTGGAT
CAAGAACAACATCTCCCTTGGGAACTTCCCTCCGTGGGTGCTTGCGTGCATAGTTATAGT
GTTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGGGACTTTTTCAGGAAGTATGGCTGGTAGTATCA
CACAGACACTGACACCCGTCTGGCTTGAAAATTTGGTCGAAATTGTAGTCCTCCAATCGA
CCATTTAGAGAGATGTTTTCTTGTCTCA*CCCAACAAGTTCCCTTCCTTTGTTAACCACC
ATTTGTTTCTTTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR4D340JQ 728 0 0
ATGTATCGGTGCGGGAAAGGTCCGATCGACGTGTTCAAGTAGAATCTCGGAGGCTGGGAG
CAGGATCAGCTCGAGGTTCGACCTATCCTCGATAAATACGGATTGAAATCGATCTTCACT
TTCAACGTCGAGAAAGGTCGTGGCGTCCCGATCCGCTTTAATCCTAGGAACGGTCGGTCT
ATGCTGACGTATAGAGATGGTGCCGTCGTATACATCGACGGCGAACCTCAGGACTCTATG
ATCCAACCCATCACAAGGATCGTGCTCGGAGTCGTGATTGCTACGCTGTTGATAACGTTT
CTTATGAAGGACCCTCCGGCGTGGATCAAGAACAACATCTCCCTTGGGAACTTCCCTCCG
TGGGTGCTTGCGTGCATAGTTATAGTGTTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGGGACTTT
TTCAGGAAGTATGGCTGGTAGTATCACACAGACACTGACACCCGTCTGGCTTGAAAATTT
GGTCGAAATTGTAGTCCTCCAATCGACCATTTAGAGAGATGTTTTCTTGTCTCAACCCAA
CAAGTTCCCTTCCTTTGTTAACCACCATTTGTTTCTTTGATAAGGCCTCATGCGCCAATT
TGCTTGCTTTCAGAACCAAGAGAGAGAGAGAGATAGAGCAATCATTGTCTCCGTTTTGCA
TTCTTGTTGAACTTGATAGTTTTATGAATTTTCATGTGTTTGCGACGTGCAAACTGATAC
TACCTTCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL9404Contig1 809 2 4 U
TTATATGCCTTGCTCTCAAGATGTGGCTTTAAAGGAATGGATTCAGGGTTGGCTTCTGTA
ACCACTATTGCATCAACATTTGACTACTCATCCTCAGGAACACTCCTCAAATACCTATTA
CCCGTGAAAGAGCCAGCCCAAGCACTTAACGTGTCTGCCTTACCAATTGATACAATGCTA
GAGATGGCTCACCCTCTAATATGTCGTCCTCCCTATGCTTTGTCTTGGCTAACTACTAAT
ATCTCTGCTCCTCAAATGATGGACCCTGAAGTGATTGAGAAGCTTGTTTTGAACAGCTTA
TGCCCCGTACCAACTAAGCTTCTGTATCAGCTAGCAACATTCGTGGACAAAGGTGGGCTG
CGTGACAGAACCGGTAGTTTCTATTACAAGGATCATATAAGCACAACCAATGTCCCAATT
TTAGCTCTTGCAGGGGACTGGGACATAGTCTGCCCTCCTGATGCAGTATATGAGACTGTA
AAGCTGATCCCACAACATATAGCCAATTTTAAAGTTTTTGGTTCACCTGGAGGTCCACAT
TATGGCCACCAGGATATGATCTCTGGTCGAACGGCCCGGAGCGAGATATATCCATTGGTT
ATTCAATTTCTTCAGCGCCATGATCAGAGTTAATCAGTGAAAAATCAAATGGAATTTGAT
TCTTATGTTTCTGTAAAAGAAAGTATATATAACATTCCACACATACATTCATTCATGTAT
ACAATTTTCACACATTTATCAGGTTTATCTGGGACCTCAAAAACAGTATTGTAAAAATAT
AGTAGTCTTATAAACATCTTTCATTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BF01TF U 1
AF RR4BF01JQ C 100
BS 1 742 RR4BF01TF
BS 743 743 RR4BF01JQ
BS 744 798 RR4BF01TF
BS 799 809 RR4BF01JQ

RD RR4BF01TF 798 0 0
TTATATGCCTTGCTCTCAAGATGTGGCTTTAAAGGAATGGATTCAGGGTTGGCTTCTGTA
ACCACTATTGCATCAACATTTGACTACTCATCCTCAGGAACACTCCTCAAATACCTATTA
CCCGTGAAAGAGCCAGCCCAAGCACTTAACGTGTCTGCCTTACCAATTGATACAATGCTA
GAGATGGCTCACCCTCTAATATGTCGTCCTCCCTATGCTTTGTCTTGGCTAACTACTAAT
ATCTCTGCTCCTCAAATGATGGACCCTGAAGTGATTGAGAAGCTTGTTTTGAACAGCTTA
TGCCCCGTACCAACTAAGCTTCTGTATCAGCTAGCAACATTCGTGGACAAAGGTGGGCTG
CGTGACAGAACCGGTAGTTTCTATTACAAGGATCATATAAGCACAACCAATGTCCCAATT
TTAGCTCTTGCAGGGGACTGGGACATAGTCTGCCCTCCTGATGCAGTATATGAGACTGTA
AAGCTGATCCCACAACATATAGCCAATTTTAAAGTTTTTGGTTCACCTGGAGGTCCACAT
TATGGCCACCAGGATATGATCTCTGGTCGAACGGCCCGGAGCGAGATATATCCATTGGTT
ATTCAATTTCTTCAGCGCCATGATCAGAGTTAATCAGTGAAAAATCAAATGGAATTTGAT
TCTTATGTTTCTGTAAAAGAAAGTATATATAACATTCCACACATACATTCATTCATGTAT
ACAATTTTCACACATTTATCAG*TTTATCTGGGACCTCAAAAACAGTATTGTAAAAATAT
AGTAGTCTTATAAACATC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR4BF01JQ 710 0 0
ACACTCCTCAAATACCTATTACCCGTGAAAGAGCCAGCCCAAGCACTTAACGTGTCTGCC
TTACCAATTGATACAATGCTAGAGATGGCTCACCCTCTAATATGTCGTCCTCCCTATGCT
TTGTCTTGGCTAACTACTAATATCTCTGCTCCTCAAATGATGGACCCTGAAGTGATTGAG
AAGCTTGTTTTGAACAGCTTATGCCCCGTACCAACTAAGCTTCTGTATCAGCTAGCAACA
TTCGTGGACAAAGGTGGGCTGCGTGACAGAACCGGTAGTTTTTATTACAAGGATCATATA
AGCACAACCAATGTCCCAATTTTAGCTCTTGCAGGGGACTGGGACATAGTCTGCCCTCCT
GATGCAGTATATGAGACTGTAAAGCTGATCCCACAACATATAGCCAATTTTAAAGTTTTT
GGTTCACCTGGAGGTCCACATTATGGCCACCAGGATATGATCTCTGGTCGAACGGCCCGG
AGCGAGATATATCCATTGGTTATTCAATTTTTTCAGCGCCATGATCAGAGTTAATCAGTG
AAAAATCAAATGGAATTTGATTCTTATGTTTCTGTAAAAGAAGGTATATATAACATTCCA
CACATACATTCATTCATGTATACAATTTTCACACATTTATCAGGTTTATCTGGGACCTCA
AAAACAGTATTGTAAAAATATAGTAGTCTTATAAACATCTTTCATTGATG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL9405Contig1 907 2 2 U
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TTCCCCATCCCACCGGCACCGATAATAGCAGGCAATGTCACCAATGTCACCACCACACCA
GCACCGATAACAGCATGCAATGTCACCAATGTCACCACCGCACCAGGCAATGGTTGCAAG
TCAAGCTCCTTCAAAATTCTTATTGTGTTCGCCGCCTATATTATGTTGTTCTAGTGTCAC
GTTTCATGTTCTAGTCTAGTGCTCACTTAATTATTAAATGTAAGAACTGAAGTATTTAAC
CAAAGATCGTTTCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGGTTTCTTAGAGAGCAAGGCGTTCTC
GTGAGCCGTCTCAAGAGTGACGAAGAAGCTGCTGAGATGTGGAACGGTATGAGCAAGTCT
GTGAGGCTGACCAAGGTTGGGTTCTTGGATAAGACTATTGAGGATGTGAACCGGTATTAT
ACCGGACGGTGGATGGTTAAGATTGGAAGATTTGTTGACGTTTATGTTTATGGTTCGTGG
AAGATTTTGGCATTTTTGGGGGCGGTTTTGTTGTTGATTCTGGTTTCGTTGCAAGTGCTC
TCGTTGGTGTTTAGCTCCTTGAGGCTGCTTGGATTGAGAACCGGTTAGGCATAACTGCAT
TTGGCGATGCTGTGATTTGGATTTGATATGGTTTACTGTGATTCTCTTTTGGTTTGGGTA
CATTTAATTAGGGCTGGGATATTGAACCGAATCGAACTTGCCAATCTGAATCAAAATGTT
TTTGGTTAATTTGGTTAGGAGTTTGGTTCAATTCGATAAATTTTCTGAAAAAATCTACTT
TCTGGTTCTGTTTGGCAATTATTTATTTTAATTCTTTAAACAAAAAATCTATACTAATAA
AGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4BK71TF U 1
AF RR4BK71JQ C 283
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BS 713 907 RR4BK71JQ

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GTTTCATGTTCTAGTCTAGTGCTCACTTAATTATTAAATGTAAGAACTGAAGTATTTAAC
CAAAGATCGTTTCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGGTTTCTTAGAGAGCAAGGCGTTCTC
GTGAGCCGTCTCAAGAGTGACGAAGAAGCTGCTGAGATGTGGAACGGTATGAGCAAGTCT
GTGAGGCTGACCAAGGTTGGGTTCTTGGATAAGACTATTGAGGATGTGAACCGGTATTAT
ACCGGACGGTGGATGGTTAAGATTGGAAGATTTGTTGACGTTTATGTTTATGGTTCGTGG
AAGATTTTGGCATTTTTGGGGGCGGTTTTGTTGTTGATTCTGGTTTCGTTGCAAGTGCTC
TCGTTGGTGTTTAGCTCCTTGAGGCTGCTTGGATTGAGAACCGGTTAGGCATAACTGCAT
TTGGCGATGCTGTGATTTGGATTTGATATGGTTTACTGTGATTCTCTTTTGG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR4BK71JQ 625 0 0
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AGAGAGCAAGGCGTTCTCGTGAGCCGTCTCAAGAGTGACGAAGAAGCTGCTGAGATGTGG
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GATGTGAACCGGTATTATACCGGACGGTGGATGGTTAAGATTGGAAGATTTGTTGACGTT
TATGTTTATGGTTCGTGGAAGATTTTGGCATTTTTGGGGGCGGTTTTGTTGTTGATTCTG
GTTTCGTTGCAAGTGCTCTCGTTGGTGTTTAGCTCCTTGAGGCTGCTTGGATTGAGAACC
GGTTAGGCATAACTGCATTTGGCGATGCTGTGATTTGGATTTGATATGGTTTACTGTGAT
TCTCTTTTGGTTTGGGTACATTTAATTAGGGCTGGGATATTGAACCGAATCGAACTTGCC
AATCTGAATCAAAATGTTTTTGGTTAATTTGGTTAGGAGTTTGGTTCAATTCGATAAATT
TTCTGAAAAAATCTACTTTCTGGTTCTGTTTGGCAATTATTTATTTTAATTCTTTAAACA
AAAAATCTATACTAATAAAGTTGAG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

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ATTATTAGCATGGAGTGCTCTATCAATGATGACGTTACTCAATTGATAGGTAACACTCCA
ATGGTGTATCTGAACAACATCGTAGATGGTTGTGTTGCCCGTATCGCCGCTAAGCTTGAG
ATGATGGAGCCTTGCTCTAGTGTCAAGGAACGAATTGCATATGGCATGATTAAAGATGCA
GAAGACAAGGGACTTATTACTCCCGGCAAGAGCACATTGATTGAGCCAACTTCTGGCAAC
ACTGGGATCGGTTTAGCATTTGTTGGGGCAGCTAGAGGCTACAAGGTTGTGCTCACAATG
CCTGAAACAATGAGCCTTGAAAGAAAGGTCATTCTATTAGCATTAGGTGCAGAGGTTCAC
CTCACAGACACGAAAACTGGCGTTCCAGTATTACTCGACAAAGCCGAGGAGATATTAAGC
AAGACTCCAGATGGTATCATACTACACCAGTTCAAGAATCCTTCAAACCCACAAACTCAT
TATCGAACCACGGGTCCAGAGATATGGAGAGACTCTGCAGGGGAAGTAGATATATTGGTG
GCCGGTGTTGGGACCGGTGGAACCATTTCCGGATCAGGAAAGTTCCTCAAAGAGAAGAAT
AAAGACTTAAAGGTTTATGGAGTGGAACCTACAGAGAGTGCAGTACTCAGTGGAGGCCAA
CCTGGTCCACATTTGATCCAAGGTATTGGAGCTGGTATCGTACCGGACAATTTGGATTTC
AACGTTGTTGATGAAATCATTCAAGTTACAAGCGTGGAAGCTATTGAAACAGTCAGACTT
CTTGCCTTAAAAGAAGGATTACTGGTGGGTATATCTTCCGGAGCTGCTGCAGCCGCTGCA
ATTAAGGTGGCTAAACGGCCAGAAAACGCCGGGAAGCTCATAGTTGTGGTTTTCCCTAGC
GGCGGGGAACGTTATTTGTCGACTCAATTGTTCGACTCAGTGAGACGTGAAGCAGAGAGT
TTGACATATGAATGAGGCTTATACACAACAACCACTACCTGGCTTGGTGCGGTTTGGTAT
TTATTTCCTCTCTGGTTTAGTTTCCCTTTAGACCATTGTTTCTTGATATTTCAAACGATT
ATCACCCAAACCATATTCATTTTTTTAAAATATTTATTGAATTACAACATTATTAGTTAT


BQ
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AAGACTCCAGATGGTATCATACTACACCAGTTCAAGAATCCTTCAAACCCACAAACTCAT
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DS 

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TTCAAGTTACAAGCGTGGAAGCTATTGAAACAGTCAGACTTCTTGCCTTAAAAGAAGGAT
TACTGGTGGGTATATCTTCCGGAGCTGCTGCAGCCGCTGCAATTAAGGTGGCTAAACGGC
CAGAAAACGCCGGGAAGCTCATAGTTGTGGTTTTCCCTAGCGGCGGGGAACGTTATTTGT
CGACTCAATTGTTCGACTCAGTGAGACGTGAAGCAGAGAGTTTGACATATGAATGAGGCT
TATACACAACAACCACTACCTGGCTTGGTGCGGTTTGGTATTTATTTCCTCTCTGGTTTA
GTTTCCCTTTAGACCATTGTTTCTTGATATTTCAAACGATTATCACCCAAACCATATTCA
TTTTTTTAAAATATTTATTGAATTACAACATTATTAGTTAT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

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GGTGAGATTGCCGAATGATGGAGAGAAGATTTGGTGGCAAGAATTTGATGTCACACCTCG
ACAACTGGAGGATGTTAGCAACCAAATGCTTGAGCTCTATGAGCAAAACCATGTTCCAGC
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GTCAAAAGTTACAGAAAACCAGAGGAAAGATAATGGGAGTGGTGAGGCAGGTAGTGTCAT
TACCGAGCATACAGAAAACCATCCAGCCGATATGTCTAGACCGGGAGTTGAGGAACCTGG
GAAGGACAACACAGAGAGTATAGTTGCACGTCCTCCGGATGATAGCGTCGCTCGTGATAA
ATCTAGAAGCGTTATTACAAGTGATGTTCCGGTCAGCCAATCGCCGAAAGACATAAAATT
GCTTAGAGATAAGGTGAAGGCTAAACTAGAGGCTAAGAAGCTCCAAGGGGAAAGGACGAG
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AGCTGTTGACGATGACAAAGATAACCAGAAGAAGAATTCCAAAACCAATCATATGGATAC
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GGTTGATGATGTTTCTTTAACATTGCCTAGCCGGAAGCGGAAAATGGAAAGCCCTTGTGA
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TCACAAGACAAGCCGAGAAGGAAGTAGCCATAATAGTCATGGTGACCGAGAGCTAAAAAG
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CATTTAGAAAAAAACTTTTGATTCCCAGCCATGGTGCAAACGATCTCAGTGTATTTATCA
CACTTCGTATTTTTTTTTGGCACTTGTACTATACAATCCAACGGTTGAGAAACAAAACCG
GGTTTCCATTGATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR4C572TF U 1
AF RR4C572JQ C 421
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BS 690 1154 RR4C572JQ

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DS 

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CATTTAGAAAAAAACTTTTGATTCCCAGCCATGGTGCAAACGATCTCAGTGTATTTATCA
CACTTCGTATTTTTTTTTGGCACTTGTACTATACAATCCAACGGTTGAGAAACAAAACCG
GGTTTCCATTGATC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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AAGGAGTAGAAAATTTTAAAGCTTGAACAAATCAACAAAGGAAAGCAAAACAGCACTCCT
AAAATTTAACATGCATAATAGCCCACGCAACTTCAGTCAGCACATAGTCTCAGAATCTCT
TTAGCCGTTCTTAGCCGGAAGTATGGCATATGTTCATGGCTGAAGTATAGCCACAGCCCT
CTACTGAAGAAGTCGATGTACTTAAGCATAAACATTCCACAGTCATACCCATTTTGTTGT
TGGGGAAGGTCTTCAACAAATTCCATGTCCCACTCACTCACATCAATGTCTTTTCCACTT
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CCATTTAGTGAATCGAGATACAAGAACTTGCGATCCCTGTTGTTAATAACTGCCAAGGTC
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AACTTTCTCTGCGTAGTCCATCTTCTAACAGCTTTATAATTATAACCAGAGTCGCTTACT
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BQ
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AF RR4AH80JQ U 1
AF RR4AH73JQ U 1
BS 1 808 RR4AH73JQ

RD RR4AH80JQ 682 0 0
CTGGTTAATTCTAATTCGTACTTCAGTTTTAATAGATCACAAGATGCTTTCACTGCCTAA
AAGGAGTAGAAAATTTTAAAGCTTGAACAAATCAACAAAGGAAAGCAAAACAGCACTCCT
AAAATTTAACATGCATAATAGCCCACGCAACTTCAGTCAGCACATAGTCTCAGAATCTCT
TTAGCCGTTCTTAGCCGGAAGTATGGCATATGTTCATGGCTGAAGTATAGCCACAGCCCT
CTACTGAAGAAGTCGATGTACTTAAGCATAAACATTCCACAGTCATACCCATTTTGTTGT
TGGGGAAGGTCTTCAACAAATTCCATGTCCCACTCACTCACATCAATGTCTTTTCCACTT
TTTTCCTTAGATTCATCGGTCAAATATTTCGCCAGAGCATTCAAAATCTTGGAATCAACT
CCATTTAGTGAATCGAGATACAAGAACTTGCGATCCCTGTTGTTAATAACTGCCAAGGTC
CAATGTACACCCCTGTGGATGGGAACAAATATCATGTCACAGTCAATAAGAGCATATCCC
AACTTTCTCTGCGTAGTCCATCTTCTAACAGCTTTATAATTATAACCAGAGTCGCTTACT
AGCTTTTTGTAGAAAAAAGTATTAAAGAAATGACACTTCAAATACTTTTTGGGCTCTCTG
GTTTCTCTTTCTTTGAGTAGTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR4AH73JQ 808 0 0
CTGGTTAATTCTAATTCGTACTTCAGTTTTAATAGATCACAAGATGCTTTCACTGCCTAA
AAGGAGTAGAAAATTTTAAAGCTTGAACAAATCAACAAAGGAAAGCAAAACAGCACTCCT
AAAATTTAACATGCATAATAGCCCACGCAACTTCAGTCAGCACATAGTCTCAGAATCTCT
TTAGCCGTTCTTAGCCGGAAGTATGGCATATGTTCATGGCTGAAGTATAGCCACAGCCCT
CTACTGAAGAAGTCGATGTACTTAAGCATAAACATTCCACAGTCATACCCATTTTGTTGT
TGGGGAAGGTCTTCAACAAATTCCATGTCCCACTCACTCACATCAATGTCTTTTCCACTT
TTTTCCTTAGATTCATCGGTCAAATATTTCGCCAGAGCATTCAAAATCTTGGAATCAACT
CCATTTAGTGAATCGAGATACAAGAACTTGCGATCCCTGTTGTTAATAACTGCCAAGGTC
CAATGTACACCCCTGTGGATGGGAACAAATATCATGTCACAGTCAATAAGAGCATATCCC
AACTTTCTCTGCGTAGTCCATCTTCTAACAGCTTTATAATTATAACCAGAGTCGCTTACT
AGCTTTTTGTAGAAAAAAGTATTAAAGAAATGACACTTCAAATACTTTTTGGGCTCTCTG
GTTTCTCTTTCTTTGAGTAGTTCGAGATAGACATTGATAACCTCATCGTTTAGCCATGCA
GATGGTGTAAGACATTGAAGAACTTCACCAGTAACATCAATGTTTGAATTCGCATGAGTA
ACCAAGACTTTCCTTCTATTTTTACCAG

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL9409Contig1 1085 2 2 U
GGGATTTCAAACCCCTCTCTCTCTCTAATGGCGGCGACGATGAGCAGAGACCAATACGTC
TACATGGCGAAACTCGCCGAGCAAGCGGAGCGTTACGAAGAGATGGTCCAGTTCATGGAA
AGTCTCGTGACCTCCTCCACACCGTCCAGCGAGCTCACCGTAGAGGAGAGGAACCTTCTC
TCCGTGGCTTACAAGAACGTGATCGGATCTCTTCGTGCGGCGTGGAGGATCGTGTCGTCG
ATCGAGCAGAAGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAACACGTGTCGCTCGTCAAGGACTACA
GATCTAAGGTCGAGACGGAGCTCTCCACGATCTGCTCGGGGATCCTCAGGCTGCTCGACA
CGCATCTGATCCCTTCGGCTACCGCTAGCGAGTCCAAGGTGTTTTACTTGAAGATGAAGG
GTGATTACCATCGGTACATGGCTGAGTTCAAATCTGGTGACGAGAGTAAGACAGCTGCTG
AAGATACTATGATCGCTTACAAGGCTGCTCAGGACGTTGCGGTTGCTGATCTAGCGCCTA
CGCATCCCATCAGGCTGGGACTGGCTCTGAACTTCTCGGTGTTTTACTACGAGATTCTCA
ACTCTTCGGAGAAAGCTTGTAGCATGGCCAAACAGGCTTTTGAGGAAGCTATTGCGGAGC
TGGACACATTGGGAGAGGAGTCATACAAAGACAGCACTCTCATCATGCAGTTGCTAAGGG
ACAATCTAACCCTCTGGACTTCCGATATGCAGGAGCAGATGGATGAGGCCTGAAGATCTT
ATGGAAGAACGTACGCTTATGTAATGTCCTCACAACCGTGACTGAGTTCAAAAACCCAAA
AAAAAAAAACCTTTGCTCTAAAACTTGTCGAAACAAAAAAATGTGTGTTTATGACAGAGC
ATGTGCACAGCTTTGGTGTTATCTGCTGCTCTGTTCCAACTCTGTTTTTCTTTTTCTTAG
CTTCTTTTGTACACAGTAATTTATATATTGCAAACTATTTAGTGTCCCCATCTTAGCTGG
GAGAGTCTCAAGACTGTCAAACCTTACAGTCTTTTAAACTCTCCAATGCTGTGATGAACG
CTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RR4DY38TF U 1
AF RR4DY38JQ C 499
BS 1 619 RR4DY38TF
BS 620 1085 RR4DY38JQ

RD RR4DY38TF 619 0 0
GGGATTTCAAACCCCTCTCTCTCTCTAATGGCGGCGACGATGAGCAGAGACCAATACGTC
TACATGGCGAAACTCGCCGAGCAAGCGGAGCGTTACGAAGAGATGGTCCAGTTCATGGAA
AGTCTCGTGACCTCCTCCACACCGTCCAGCGAGCTCACCGTAGAGGAGAGGAACCTTCTC
TCCGTGGCTTACAAGAACGTGATCGGATCTCTTCGTGCGGCGTGGAGGATCGTGTCGTCG
ATCGAGCAGAAGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAACACGTGTCGCTCGTCAAGGACTACA
GATCTAAGGTCGAGACGGAGCTCTCCACGATCTGCTCGGGGATCCTCAGGCTGCTCGACA
CGCATCTGATCCCTTCGGCTACCGCTAGCGAGTCCAAGGTGTTTTACTTGAAGATGAAGG
GTGATTACCATCGGTACATGGCTGAGTTCAAATCTGGTGACGAGAGTAAGACAGCTGCTG
AAGATACTATGATCGCTTACAAGGCTGCTCAGGACGTTGCGGTTGCTGATCTAGCGCCTA
CGCATCCCATCAGGCTGGGACTGGCTCTGAACTTCTCGGTGTTTTACTACGAGATTCTCA
ACTCTTCGGAGAAAGCTTG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR4DY38JQ 587 0 0
ACAAGGCTGCTCAGGACGTTGCGGTTGCTGATCTAGCGCCTACGCATCCCATCAGGCTGG
GACTGGCTCTGAACTTCTCGGTGTTTTACTACGAGATTCTCAACTCTTCGGAGAAAGCTT
GTAGCATGGCCAAACAGGCTTTTGAGGAAGCTATTGCGGAGCTGGACACATTGGGAGAGG
AGTCATACAAAGACAGCACTCTCATCATGCAGTTGCTAAGGGACAATCTAACCCTCTGGA
CTTCCGATATGCAGGAGCAGATGGATGAGGCCTGAAGATCTTATGGAAGAACGTACGCTT
ATGTAATGTCCTCACAACCGTGACTGAGTTCAAAAACCCAAAAAAAAAAAACCTTTGCTC
TAAAACTTGTCGAAACAAAAAAATGTGTGTTTATGACAGAGCATGTGCACAGCTTTGGTG
TTATCTGCTGCTCTGTTCCAACTCTGTTTTTCTTTTTCTTAGCTTCTTTTGTACACAGTA
ATTTATATATTGCAAACTATTTAGTGTCCCCATCTTAGCTGGGAGAGTCTCAAGACTGTC
AAACCTTACAGTCTTTTAAACTCTCCAATGCTGTGATGAACGCTACC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL9410Contig1 855 2 2 U
GCGGAGGTTTCTTACAACGGATACTCTAACACGGAGATATCTGAAGACTCCAACGGTAGA
GAAGAAGACAACAAGAACAGACCAAGAAGTAGAAAAGGTAGCGAGTCTGGTTCCACGGAG
GTGACAACGAGGTCCTCTACTGATGGAAACGAAGATCAAGGGAAGTTATTAGAAGTTTGG
GTTAATGGACATCTTATACCCGAAGAGCTAGTTAGCAGTGCTGAGAAGTTAGCTGGACCA
GTCCAAGCTGGAAAGTATTGGTATGACTACAGAGCAGGGTTCTGGGGTGTAATGGGGAAA
CCGTGTCTCGGTATAATACCTCCATTTATTGATGAGTTTAGCCATCATCCAATGCCGGAT
AACTGCGCAGCAGGGAACACAGAAGTGTATGTGAATGGAAGAGAGCTTCACAAGAGAGAC
TTGGAGTTACTAGTGCGTCGTGGACTTCCACGAGACAAAAACCGTTCTTACATTCTTGAT
ATATCAGGAAGAATCCTTGATGGAGATTCAGGGGAAGAGCTTAAAAGTCTTGGCAAATTA
GCCCCAACGGTTGATAAGGTGAAGCATGGATTTGGTATGAGAGTTCCAAGATCACTAGCT
TCGTGATAGGTCTCACGCAAGTAACAACACAACCAAAATGGTTTTGTTTCTATAAATGTA
AAGCGTGTTTTTTTTTTTTTTACTCAGTGACATTGGTTAGGTAATTTTTTACTTACACGA
ACCGGGTTATGTCGGTATAATGTTTGTTGTAATATTTTTTCTTTCTTTTATGTTCCAAGC
AGACCAAACCGTTTTGTGATTCTTGGTCGATGTTTGTTATAGATTGTGTGTAATGAAATA
GATTGTTTGCTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 



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BQ
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TGTTTATATATTTTGCTTTGGTTTCGTTTCTATGCTTTGGTTTGAAGAGAACTGAAGAAA
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TTTAATATTTTTTCTTTTTGGAAAGGAAATGGATAAGACGAACATCTCCACGCAGTCATC
AATTCACCATGTCACAATCTTTTTGTTATAACAGAACAATCTTTTTCTTGTTGATGATTT
CCCCAACTATAGCAATATGGAAAAAATCATAAATTACTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RR4CW12JQ C 1
AF RR4CW12TF U 1
BS 1 684 RR4CW12TF
BS 685 691 RR4CW12JQ

RD RR4CW12JQ 691 0 0
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DS 



